MicrobesOnline Operon Predictions for Bordetella avium 197N

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5517087 5517088 BAV0001 BAV0002 gidA gidB TRUE 0.989 -3.000 0.466 1.000 N NA
 5517088 5517089 BAV0002 BAV0003 gidB parA TRUE 0.986 -3.000 0.339 1.000 N NA
 5517089 5517090 BAV0003 BAV0004 parA parB TRUE 0.889 69.000 0.827 1.000 N NA
 5517090 5517091 BAV0004 BAV0005 parB ansB TRUE 0.758 -7.000 0.004 1.000 N NA
 5517091 5517092 BAV0005 BAVt01 ansB tRNA-Tyr(GTA) FALSE 0.233 86.000 0.000 NA   NA
 5517092 5517093 BAVt01 BAVt02 tRNA-Tyr(GTA) tRNA-Gly(TCC) FALSE 0.139 120.000 0.000 NA   NA
 5517093 5517094 BAVt02 BAVt03 tRNA-Gly(TCC) tRNA-Thr(GGT) TRUE 0.851 7.000 0.000 NA   NA
 5517094 5517095 BAVt03 BAV0006 tRNA-Thr(GGT) tuf FALSE 0.306 59.000 0.000 NA   NA
 5517095 5517096 BAV0006 BAVt04 tuf tRNA-Trp(CCA) FALSE 0.063 160.000 0.000 NA   NA
 5517096 5517097 BAVt04 BAV0007 tRNA-Trp(CCA) prlG FALSE 0.306 59.000 0.000 NA   NA
 5517097 5517098 BAV0007 BAV0008 prlG nusG TRUE 0.992 9.000 0.843 1.000 N NA
 5517098 5517099 BAV0008 BAV0009 nusG relC TRUE 0.891 57.000 0.681 1.000 N NA
 5517099 5517100 BAV0009 BAV0010 relC rplA TRUE 0.998 3.000 0.838 0.023 Y NA
 5517100 5517101 BAV0010 BAV0011 rplA rplJ FALSE 0.414 244.000 0.302 0.023 Y NA
 5517101 5517102 BAV0011 BAV0012 rplJ rplL TRUE 0.966 85.000 0.884 0.017 Y NA
 5517102 5517103 BAV0012 BAV0013 rplL groN FALSE 0.446 137.000 0.223 1.000   NA
 5517103 5517104 BAV0013 BAV0014 groN rpoC TRUE 0.997 0.000 0.851 0.001   NA
 5517104 5517105 BAV0014 BAV0015 rpoC   FALSE 0.003 843.000 0.000 1.000   NA
 5517106 5517107 BAV0016 BAV0017     TRUE 0.934 12.000 0.086 1.000   NA
 5517107 5517108 BAV0017 BAV0018     TRUE 0.781 39.000 0.138 1.000   NA
 5517109 5517110 BAV0019 BAV0020   rpsL FALSE 0.004 435.000 0.000 1.000 N NA
 5517110 5517111 BAV0020 BAV0021 rpsL rpsG TRUE 0.800 169.000 0.620 0.003 Y NA
 5517111 5517112 BAV0021 BAV0022 rpsG far1 TRUE 0.899 19.000 0.003 1.000 Y NA
 5517112 5517113 BAV0022 BAV0023 far1 tuf TRUE 0.975 77.000 1.000 0.002 Y NA
 5517113 5517114 BAV0023 BAV0024 tuf nusE TRUE 0.591 64.000 0.003 1.000 Y NA
 5517114 5517115 BAV0024 BAV0025 nusE rplC FALSE 0.124 468.000 0.307 0.023 Y NA
 5517115 5517116 BAV0025 BAV0026 rplC rplD TRUE 0.997 5.000 0.486 0.017 Y NA
 5517116 5517117 BAV0026 BAV0027 rplD rplW TRUE 0.996 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5517117 5517118 BAV0027 BAV0028 rplW rplB TRUE 0.997 1.000 0.849 1.000 Y NA
 5517118 5517119 BAV0028 BAV0029 rplB rpsS TRUE 0.997 13.000 0.820 0.023 Y NA
 5517119 5517120 BAV0029 BAV0030 rpsS rplV TRUE 0.998 4.000 0.769 0.023 Y NA
 5517120 5517121 BAV0030 BAV0031 rplV rpsC TRUE 0.997 10.000 0.719 0.023 Y NA
 5517121 5517122 BAV0031 BAV0032 rpsC rplP TRUE 0.998 3.000 0.828 0.023 Y NA
 5517122 5517123 BAV0032 BAV0033 rplP rpmC TRUE 0.997 12.000 0.802 0.017 Y NA
 5517123 5517124 BAV0033 BAV0034 rpmC rpsQ TRUE 0.998 3.000 0.828 0.017 Y NA
 5517124 5517125 BAV0034 BAV0035 rpsQ   FALSE 0.002 650.000 0.000 NA N NA
 5517125 5517126 BAV0035 BAV0036     FALSE 0.275 54.000 0.000 NA N NA
 5517126 5517127 BAV0036 BAV0037     FALSE 0.256 81.000 0.000 1.000   NA
 5517127 5517128 BAV0037 BAV0038     TRUE 0.849 8.000 0.000 NA   NA
 5517128 5517129 BAV0038 BAV0039     TRUE 0.665 22.000 0.000 NA   NA
 5517129 5517130 BAV0039 BAV0040     FALSE 0.241 85.000 0.000 1.000   NA
 5517130 5517131 BAV0040 BAV0041     FALSE 0.471 33.000 0.000 1.000 N NA
 5517133 5517134 BAV0043 BAV0044   rplN FALSE 0.004 415.000 0.000 1.000 N NA
 5517134 5517135 BAV0044 BAV0045 rplN rplX TRUE 0.998 11.000 0.810 0.023 Y NA
 5517135 5517136 BAV0045 BAV0046 rplX rplE TRUE 0.997 13.000 0.758 0.017 Y NA
 5517136 5517137 BAV0046 BAV0047 rplE rpsN TRUE 0.995 10.000 0.309 0.017 Y NA
 5517137 5517138 BAV0047 BAV0048 rpsN rpsH TRUE 0.994 11.000 0.295 0.017 Y NA
 5517138 5517139 BAV0048 BAV0049 rpsH rplF TRUE 0.998 11.000 0.808 0.017 Y NA
 5517139 5517140 BAV0049 BAV0050 rplF rplR TRUE 0.995 19.000 0.815 0.017 Y NA
 5517140 5517141 BAV0050 BAV0051 rplR rpsE TRUE 0.996 16.000 0.814 0.023 Y NA
 5517141 5517142 BAV0051 BAV0052 rpsE rpmD TRUE 0.998 4.000 0.789 0.023 Y NA
 5517142 5517143 BAV0052 BAV0053 rpmD rplO TRUE 0.997 10.000 0.653 0.003 Y NA
 5517143 5517144 BAV0053 BAV0054 rplO prlA TRUE 0.985 15.000 0.730 1.000 N NA
 5517144 5517145 BAV0054 BAV0055 prlA infA TRUE 0.935 10.000 0.083 1.000 N NA
 5517145 5517146 BAV0055 BAV0056 infA rpmJ TRUE 0.770 36.000 0.104 1.000   NA
 5517146 5517147 BAV0056 BAV0057 rpmJ rpsM TRUE 0.859 43.000 0.194 0.017   NA
 5517147 5517148 BAV0057 BAV0058 rpsM rpsK TRUE 0.996 16.000 0.810 0.017 Y NA
 5517148 5517149 BAV0058 BAV0059 rpsK ramA TRUE 0.996 12.000 0.509 0.023 Y NA
 5517149 5517150 BAV0059 BAV0060 ramA rpoA FALSE 0.418 173.000 0.549 1.000 N NA
 5517150 5517151 BAV0060 BAV0061 rpoA rplQ TRUE 0.578 163.000 0.873 1.000 N NA
 5517153 5517154 BAV0063 BAV0064 cutA   TRUE 0.768 12.000 0.010 1.000 N NA
 5517155 5517156 BAV0065 BAV0066 hemB engB TRUE 0.917 -3.000 0.024 1.000   NA
 5517157 5517158 BAV0067 BAV0068     FALSE 0.202 83.000 0.000 NA N NA
 5517158 5517159 BAV0068 BAV0069     TRUE 0.995 -3.000 0.399 NA Y NA
 5517163 5517164 BAV0073 BAV0074 aroK aroB TRUE 0.993 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 5517164 5517165 BAV0074 BAV0075 aroB   TRUE 0.827 20.000 0.060 1.000 N NA
 5517166 5517167 BAV0076 BAV0077     FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 5517167 5517168 BAV0077 BAV0078   uvrA FALSE 0.466 24.000 0.003 1.000 N NA
 5517169 5517170 BAV0079 BAV0080   ssb FALSE 0.014 255.000 0.000 NA N NA
 5517170 5517171 BAV0080 BAV0081 ssb   FALSE 0.025 226.000 0.000 1.000   NA
 5517171 5517172 BAV0081 BAV0082     FALSE 0.149 116.000 0.000 NA   NA
 5517172 5517173 BAV0082 BAV0083     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517173 5517174 BAV0083 BAV0084     TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 5517174 5517175 BAV0084 BAV0085     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517175 5517176 BAV0085 BAV0086     FALSE 0.018 249.000 0.000 NA   NA
 5517176 5517177 BAV0086 BAV0087     FALSE 0.253 80.000 0.000 NA   NA
 5517177 5517178 BAV0087 BAV0088     TRUE 0.857 6.000 0.000 1.000   NA
 5517178 5517179 BAV0088 BAV0089     TRUE 0.867 3.000 0.000 1.000   NA
 5517180 5517181 BAV0090 BAV0091 bplL bplJ TRUE 0.880 66.000 0.667 NA   NA
 5517181 5517182 BAV0091 BAV0092 bplJ bplH TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517182 5517183 BAV0092 BAV0093 bplH bplG TRUE 0.623 90.000 0.027 NA Y NA
 5517183 5517184 BAV0093 BAV0094 bplG bplF TRUE 0.995 -3.000 0.382 NA Y NA
 5517184 5517185 BAV0094 BAV0095 bplF bplE FALSE 0.429 145.000 0.065 1.000 Y NA
 5517185 5517186 BAV0095 BAV0096 bplE bplC TRUE 0.913 18.000 0.006 1.000 Y NA
 5517186 5517187 BAV0096 BAV0097 bplC bplB TRUE 0.972 11.000 0.048 1.000 Y NA
 5517187 5517188 BAV0097 BAV0098 bplB bplA TRUE 0.958 8.000 0.114 1.000   NA
 5517189 5517190 BAV0099 BAV0100     TRUE 0.986 23.000 0.515 1.000 Y NA
 5517190 5517191 BAV0100 BAV0101     FALSE 0.191 126.000 0.000 0.070 N NA
 5517191 5517192 BAV0101 BAV0102     TRUE 0.950 91.000 0.688 0.070 Y NA
 5517192 5517193 BAV0102 BAV0103     TRUE 0.992 -7.000 0.585 0.070 N NA
 5517193 5517194 BAV0103 BAV0104     FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 5517195 5517196 BAV0105 BAV0106 glcB   FALSE 0.004 441.000 0.000 NA   NA
 5517196 5517197 BAV0106 BAV0107     FALSE 0.024 230.000 0.000 NA   NA
 5517197 5517198 BAV0107 BAV0108     TRUE 0.813 18.000 0.007 0.019 N NA
 5517199 5517200 BAV0109 BAV0110   dapA1 FALSE 0.010 275.000 0.000 NA N NA
 5517200 5517201 BAV0110 BAV0111 dapA1   FALSE 0.019 450.000 0.000 1.000 Y NA
 5517201 5517202 BAV0111 BAV0112     FALSE 0.361 94.000 0.047 NA   NA
 5517202 5517203 BAV0112 BAV0113     FALSE 0.041 173.000 0.007 NA   NA
 5517203 5517204 BAV0113 BAV0114     TRUE 0.975 3.000 0.190 NA   NA
 5517204 5517205 BAV0114 BAV0115   aspS TRUE 0.620 40.000 0.057 NA   NA
 5517205 5517206 BAV0115 BAV0116 aspS   FALSE 0.142 103.000 0.004 NA   NA
 5517206 5517207 BAV0116 BAV0117   ybhO TRUE 0.985 -3.000 0.294 NA   NA
 5517208 5517209 BAV0118 BAV0119     TRUE 0.992 12.000 1.000 NA   NA
 5517209 5517210 BAV0119 BAV0120     TRUE 0.860 31.000 0.150 NA   NA
 5517213 5517214 BAV0123 BAV0124 rfbD rfbC TRUE 0.851 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5517214 5517215 BAV0124 BAV0125 rfbC rfaC TRUE 0.587 116.000 0.000 0.003 Y NA
 5517215 5517216 BAV0125 BAV0126 rfaC kdtA TRUE 0.968 10.000 0.028 1.000 Y NA
 5517217 5517218 BAV0127 BAV0128   baf TRUE 0.771 15.000 0.000 NA   NA
 5517218 5517219 BAV0128 BAV0129 baf birA TRUE 0.971 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5517220 5517221 BAV0130 BAV0131     TRUE 0.998 0.000 0.922 NA Y NA
 5517221 5517222 BAV0131 BAV0132     TRUE 0.997 -13.000 0.750 NA Y NA
 5517222 5517223 BAV0132 BAV0133     TRUE 0.978 5.000 0.239 NA   NA
 5517223 5517224 BAV0133 BAV0134     FALSE 0.522 33.000 0.000 NA   NA
 5517224 5517225 BAV0134 BAV0135   dacC FALSE 0.108 133.000 0.000 NA   NA
 5517225 5517226 BAV0135 BAV0136 dacC dat FALSE 0.454 152.000 0.390 1.000 N NA
 5517226 5517227 BAV0136 BAV0137 dat   TRUE 0.722 52.000 0.155 NA   NA
 5517227 5517228 BAV0137 BAV0138   lipB TRUE 0.977 4.000 0.219 NA   NA
 5517228 5517229 BAV0138 BAV0139 lipB lipA TRUE 0.952 54.000 0.319 0.001 Y NA
 5517232 5517233 BAV0142 BAV0143 hslU hslV TRUE 0.987 27.000 0.752 1.000 Y NA
 5517233 5517234 BAV0143 BAV0144 hslV dksA FALSE 0.004 373.000 0.011 1.000 N NA
 5517234 5517235 BAV0144 BAV0145 dksA   FALSE 0.245 119.000 0.045 NA   NA
 5517235 5517236 BAV0145 BAV0146     FALSE 0.007 341.000 0.000 NA   NA
 5517237 5517238 BAV0147 BAV0148     TRUE 0.996 -3.000 0.465 1.000 Y NA
 5517238 5517239 BAV0148 BAV0149     TRUE 0.996 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5517239 5517240 BAV0149 BAV0150     TRUE 0.926 6.000 0.050 NA   NA
 5517240 5517241 BAV0150 BAV0151     TRUE 0.989 -3.000 0.420 NA   NA
 5517241 5517242 BAV0151 BAV0152     FALSE 0.366 96.000 0.048 1.000   NA
 5517243 5517244 BAV0153 BAV0154 xerC   TRUE 0.993 0.000 0.714 NA   NA
 5517244 5517245 BAV0154 BAV0155   dapF TRUE 0.860 33.000 0.175 NA   NA
 5517245 5517246 BAV0155 BAV0156 dapF htrB1 FALSE 0.353 39.000 0.009 1.000 N NA
 5517246 5517247 BAV0156 BAV0157 htrB1 htrB2 TRUE 0.996 -3.000 0.255 0.001 Y NA
 5517248 5517249 BAV0158 BAV0159 metK   FALSE 0.021 198.000 0.003 NA   NA
 5517249 5517250 BAV0159 BAV0160     FALSE 0.319 77.000 0.020 NA   NA
 5517250 5517251 BAV0160 BAV0161   acyH FALSE 0.015 248.000 0.000 1.000 N NA
 5517251 5517252 BAV0161 BAV0162 acyH   FALSE 0.444 61.000 0.042 NA   NA
 5517252 5517253 BAV0162 BAV0163   metF TRUE 0.963 0.000 0.109 NA   NA
 5517253 5517254 BAV0163 BAV0164 metF   FALSE 0.004 441.000 0.000 NA   NA
 5517254 5517255 BAV0164 BAV0165     TRUE 0.995 -3.000 0.914 NA   NA
 5517255 5517256 BAV0165 BAV0166     TRUE 0.978 -13.000 0.271 NA   NA
 5517258 5517259 BAV0168 BAV0169 slt cca TRUE 0.929 -3.000 0.034 1.000   NA
 5517260 5517261 BAV0170 BAV0171   rhlE FALSE 0.291 52.000 0.007 NA   NA
 5517261 5517262 BAV0171 BAV0172 rhlE ung FALSE 0.065 261.000 0.000 1.000 Y NA
 5517262 5517263 BAV0172 BAV0173 ung mtn FALSE 0.334 43.000 0.000 1.000 N NA
 5517263 5517264 BAV0173 BAV0174 mtn   TRUE 0.807 -42.000 0.000 1.000 N NA
 5517266 5517267 BAV0176 BAV0177 nhaA   FALSE 0.052 160.000 0.000 1.000 N NA
 5517267 5517268 BAV0177 BAV0178     TRUE 0.882 -3.000 0.010 1.000   NA
 5517268 5517269 BAV0178 BAV0179     TRUE 0.912 -3.000 0.022 NA   NA
 5517269 5517270 BAV0179 BAV0180     FALSE 0.274 80.000 0.015 NA   NA
 5517270 5517271 BAV0180 BAV0181   paaK FALSE 0.270 75.000 0.000 1.000   NA
 5517271 5517272 BAV0181 BAV0182 paaK   TRUE 0.950 26.000 0.479 1.000 N NA
 5517272 5517273 BAV0182 BAV0183     TRUE 0.993 0.000 0.250 NA Y NA
 5517273 5517274 BAV0183 BAV0184     TRUE 0.903 66.000 0.326 NA Y NA
 5517274 5517275 BAV0184 BAV0185     TRUE 0.995 13.000 0.556 0.070 Y NA
 5517275 5517276 BAV0185 BAV0186     TRUE 0.988 18.000 0.421 1.000 Y NA
 5517276 5517277 BAV0186 BAV0187     TRUE 0.987 3.000 0.474 1.000 N NA
 5517280 5517281 BAV0190 BAV0191 lysG   FALSE 0.009 288.000 0.000 1.000 N NA
 5517282 5517283 BAV0192 BAV0193     TRUE 0.706 101.000 0.333 NA   NA
 5517284 5517285 BAV0194 BAV0195     TRUE 0.841 137.000 0.667 1.000 Y NA
 5517286 5517287 BAV0196 BAV0197   hmgcL TRUE 0.869 11.000 0.021 NA   NA
 5517287 5517288 BAV0197 BAV0198 hmgcL smf FALSE 0.266 40.000 0.003 1.000 N NA
 5517288 5517289 BAV0198 BAV0199 smf   FALSE 0.226 76.000 0.000 1.000 N NA
 5517289 5517290 BAV0199 BAV0200   alsB FALSE 0.281 171.000 0.000 0.021 Y NA
 5517291 5517292 BAV0201 BAV0202   def FALSE 0.178 104.000 0.015 1.000 N NA
 5517292 5517293 BAV0202 BAV0203 def fmt TRUE 0.733 118.000 0.105 0.027 Y NA
 5517294 5517295 BAV0204 BAV0205     TRUE 0.838 12.000 0.015 1.000   NA
 5517295 5517296 BAV0205 BAV0206     FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 5517296 5517297 BAV0206 BAV0207     FALSE 0.007 345.000 0.000 NA   NA
 5517297 5517298 BAV0207 BAV0208     FALSE 0.216 125.000 0.000 0.032 N NA
 5517298 5517299 BAV0208 BAV0209     FALSE 0.067 148.000 0.000 1.000 N NA
 5517300 5517301 BAV0210 BAV0211     TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000   NA
 5517301 5517302 BAV0211 BAV0212     TRUE 0.638 141.000 0.667 1.000 N NA
 5517302 5517303 BAV0212 BAV0213     TRUE 0.956 38.000 1.000 1.000   NA
 5517303 5517304 BAV0213 BAV0214     TRUE 0.956 14.000 0.188 NA   NA
 5517304 5517305 BAV0214 BAV0215     TRUE 0.966 16.000 0.312 NA   NA
 5517305 5517306 BAV0215 BAV0216     TRUE 0.977 -3.000 0.200 1.000 N NA
 5517307 5517308 BAV0217 BAV0218     FALSE 0.435 39.000 0.000 1.000   NA
 5517308 5517309 BAV0218 BAV0219     TRUE 0.831 5.000 0.000 1.000 N NA
 5517311 5517312 BAV0221 BAV0222     TRUE 0.975 12.000 0.333 1.000 N NA
 5517312 5517313 BAV0222 BAV0223     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 5517313 5517314 BAV0223 BAV0224     TRUE 0.740 17.000 0.000 NA   NA
 5517315 5517316 BAV0225 BAV0226     TRUE 0.867 3.000 0.000 1.000   NA
 5517318 5517319 BAV0228 BAV0229 rsmB   TRUE 0.672 43.000 0.094 NA   NA
 5517319 5517320 BAV0229 BAV0230     TRUE 0.994 -3.000 0.810 NA   NA
 5517320 5517321 BAV0230 BAV0231     TRUE 0.987 12.000 0.605 1.000   NA
 5517321 5517322 BAV0231 BAV0232   trkA TRUE 0.911 -3.000 0.020 1.000   NA
 5517322 5517323 BAV0232 BAV0233 trkA trkH TRUE 0.949 24.000 0.028 0.002 Y NA
 5517323 5517324 BAV0233 BAV0234 trkH   FALSE 0.006 368.000 0.000 1.000   NA
 5517326 5517327 BAV0236 BAV0237     FALSE 0.387 51.000 0.017 1.000   NA
 5517328 5517329 BAV0238 BAV0239   gpsA TRUE 0.758 37.000 0.102 1.000   NA
 5517329 5517330 BAV0239 BAV0240 gpsA secB TRUE 0.896 17.000 0.097 1.000 N NA
 5517330 5517331 BAV0240 BAV0241 secB grxC TRUE 0.743 57.000 0.221 1.000 N NA
 5517331 5517332 BAV0241 BAV0242 grxC   TRUE 0.741 65.000 0.269 NA N NA
 5517333 5517334 BAV0243 BAV0244 gpm   TRUE 0.910 5.000 0.043 1.000 N NA
 5517334 5517335 BAV0244 BAV0245   ctpA TRUE 0.970 22.000 0.408 0.022 N NA
 5517335 5517336 BAV0245 BAV0246 ctpA thiF TRUE 0.954 -3.000 0.082 1.000 N NA
 5517336 5517337 BAV0246 BAV0247 thiF   FALSE 0.241 62.000 0.010 1.000 N NA
 5517337 5517338 BAV0247 BAV0248     TRUE 0.992 7.000 0.857 1.000 N NA
 5517343 5517344 BAV0253 BAV0254     FALSE 0.167 147.000 0.000 0.021   NA
 5517346 5517347 BAV0256 BAV0257 proB   TRUE 0.694 79.000 0.206 1.000   NA
 5517347 5517348 BAV0257 BAV0258   rpmA FALSE 0.308 183.000 0.335 1.000   NA
 5517348 5517349 BAV0258 BAV0259 rpmA rplU TRUE 0.987 33.000 0.667 0.017 Y NA
 5517350 5517351 BAV0260 BAVt05 cel tRNA-Pro(CGG) FALSE 0.233 86.000 0.000 NA   NA
 5517352 5517353 BAV0261 BAV0262     TRUE 0.816 12.000 0.000 NA   NA
 5517353 5517354 BAV0262 BAV0263   bdhA FALSE 0.379 44.000 0.000 1.000   NA
 5517354 5517355 BAV0263 BAV0264 bdhA adc TRUE 0.915 48.000 0.235 1.000 Y NA
 5517356 5517357 BAV0265 BAV0266     TRUE 0.927 52.000 0.920 NA   NA
 5517357 5517358 BAV0266 BAV0267     TRUE 0.609 61.000 0.104 NA   NA
 5517358 5517359 BAV0267 BAV0268     TRUE 0.988 9.000 0.556 NA   NA
 5517359 5517360 BAV0268 BAV0269     TRUE 0.962 17.000 0.300 NA   NA
 5517360 5517361 BAV0269 BAV0270     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 5517361 5517362 BAV0270 BAV0271     TRUE 0.979 3.000 0.233 NA   NA
 5517362 5517363 BAV0271 BAV0272     TRUE 0.961 -7.000 0.116 NA   NA
 5517363 5517364 BAV0272 BAV0273     TRUE 0.993 0.000 0.714 NA   NA
 5517364 5517365 BAV0273 BAV0274     TRUE 0.981 -3.000 0.217 NA   NA
 5517365 5517366 BAV0274 BAV0275     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5517366 5517367 BAV0275 BAV0276     TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5517367 5517368 BAV0276 BAV0277     TRUE 0.897 44.000 0.583 1.000 N NA
 5517368 5517369 BAV0277 BAV0278     TRUE 0.697 95.000 0.000 0.002 Y NA
 5517369 5517370 BAV0278 BAV0279     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517370 5517371 BAV0279 BAV0280     TRUE 0.567 42.000 0.047 NA   NA
 5517371 5517372 BAV0280 BAV0281     TRUE 0.994 -3.000 0.744 NA   NA
 5517372 5517373 BAV0281 BAV0282     TRUE 0.899 34.000 0.300 NA   NA
 5517373 5517374 BAV0282 BAV0283     TRUE 0.977 -3.000 0.176 NA   NA
 5517374 5517375 BAV0283 BAV0284     FALSE 0.227 125.000 0.044 NA   NA
 5517376 5517377 BAV0285 BAV0286     FALSE 0.428 48.000 0.032 NA N NA
 5517378 5517379 BAV0287 BAV0288     FALSE 0.338 97.000 0.051 1.000 N NA
 5517379 5517380 BAV0288 BAV0289     TRUE 0.996 11.000 0.564 0.069 Y NA
 5517380 5517381 BAV0289 BAV0290     TRUE 0.965 14.000 0.056 1.000 Y NA
 5517381 5517382 BAV0290 BAV0291     TRUE 0.996 2.000 0.375 0.035 Y NA
 5517383 5517384 BAV0292 BAV0293     FALSE 0.485 35.000 0.000 NA   NA
 5517385 5517386 BAV0294 BAV0295     FALSE 0.006 364.000 0.000 NA   NA
 5517388 5517389 BAV0296 BAV0297 hemA prfA TRUE 0.689 93.000 0.171 0.044 N NA
 5517389 5517390 BAV0297 BAV0298 prfA hemK TRUE 0.991 6.000 0.229 1.000 Y NA
 5517390 5517391 BAV0298 BAV0299 hemK   TRUE 0.728 41.000 0.124 1.000 N NA
 5517391 5517392 BAV0299 BAV0300   ubiX TRUE 0.974 4.000 0.211 1.000 N NA
 5517393 5517394 BAV0301 BAV0302   cysI TRUE 0.973 9.000 0.207 NA   NA
 5517394 5517395 BAV0302 BAV0303 cysI   FALSE 0.115 215.000 0.000 1.000 Y NA
 5517395 5517396 BAV0303 BAV0304     FALSE 0.025 224.000 0.000 NA   NA
 5517396 5517397 BAV0304 BAV0305   catD2 TRUE 0.989 4.000 0.500 NA   NA
 5517397 5517398 BAV0305 BAV0306 catD2   TRUE 0.968 5.000 0.150 NA   NA
 5517398 5517399 BAV0306 BAV0307   catC2 TRUE 0.955 15.000 0.200 NA   NA
 5517399 5517400 BAV0307 BAV0308 catC2 catJ TRUE 0.762 74.000 0.333 1.000 N NA
 5517400 5517401 BAV0308 BAV0309 catJ catI TRUE 0.991 3.000 0.077 0.001 Y NA
 5517401 5517402 BAV0309 BAV0310 catI   FALSE 0.165 204.000 0.000 0.080 Y NA
 5517402 5517403 BAV0310 BAV0311     TRUE 0.987 16.000 0.333 1.000 Y NA
 5517403 5517404 BAV0311 BAV0312     TRUE 0.903 70.000 0.333 1.000 Y NA
 5517404 5517405 BAV0312 BAV0313     FALSE 0.018 236.000 0.000 1.000 N NA
 5517405 5517406 BAV0313 BAV0314     FALSE 0.364 156.000 0.000 0.005 Y NA
 5517406 5517407 BAV0314 BAV0315     FALSE 0.428 144.000 0.000 0.005 Y NA
 5517407 5517408 BAV0315 BAV0316     TRUE 0.690 92.000 0.000 0.005 Y NA
 5517408 5517409 BAV0316 BAV0317   ilvD FALSE 0.074 143.000 0.000 1.000 N NA
 5517412 5517413 BAV0320 BAV0321 ppc   FALSE 0.081 139.000 0.000 1.000 N NA
 5517414 5517415 BAV0322 BAV0323     FALSE 0.258 78.000 0.000 NA   NA
 5517415 5517416 BAV0323 BAV0324     FALSE 0.223 94.000 0.000 1.000   NA
 5517416 5517417 BAV0324 BAV0325     TRUE 0.938 17.000 0.111 0.069 N NA
 5517417 5517418 BAV0325 BAV0326     TRUE 0.884 21.000 0.111 1.000 N NA
 5517419 5517420 BAV0327 BAV0328     FALSE 0.318 95.000 0.034 NA   NA
 5517420 5517421 BAV0328 BAV0329     FALSE 0.429 79.000 0.052 NA   NA
 5517421 5517422 BAV0329 BAV0330   kch FALSE 0.144 108.000 0.012 NA N NA
 5517423 5517424 BAV0331 BAV0332   gspF TRUE 0.957 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5517425 5517426 BAV0333 BAV0334 gspD gspE TRUE 0.998 -3.000 0.776 0.004 Y NA
 5517427 5517428 BAV0335 BAV0336 gspN gspM TRUE 0.992 2.000 0.649 1.000   NA
 5517428 5517429 BAV0336 BAV0337 gspM gspL TRUE 0.949 -3.000 0.061 1.000   NA
 5517429 5517430 BAV0337 BAV0338 gspL gspK TRUE 0.981 -3.000 0.136 0.058   NA
 5517430 5517431 BAV0338 BAV0339 gspK gspJ TRUE 0.979 -3.000 0.034 NA Y NA
 5517431 5517432 BAV0339 BAV0340 gspJ gspI TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517432 5517433 BAV0340 BAV0341 gspI gspH TRUE 0.931 -13.000 0.000 0.004   NA
 5517433 5517434 BAV0341 BAV0342 gspH gspG TRUE 0.924 -28.000 0.010 0.004   NA
 5517434 5517435 BAV0342 BAV0343 gspG gspC FALSE 0.151 113.000 0.010 NA   NA
 5517435 5517436 BAV0343 BAV0344 gspC   FALSE 0.018 253.000 0.000 NA   NA
 5517436 5517437 BAV0344 BAV0345     FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 5517438 5517439 BAV0346 BAV0348 tyrdC tyrP FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5517439 5517440 BAV0348 BAV0349 tyrP   TRUE 0.757 16.000 0.000 NA   NA
 5517440 5517441 BAV0349 BAV0350     TRUE 0.785 14.000 0.000 NA   NA
 5517441 5517442 BAV0350 BAV0351     FALSE 0.004 389.000 0.000 1.000 N NA
 5517443 5517444 BAV0352 BAV0353     FALSE 0.029 353.000 0.000 NA Y NA
 5517444 5517445 BAV0353 BAV0354   blc FALSE 0.245 64.000 0.000 1.000 N NA
 5517445 5517446 BAV0354 BAV0355 blc   TRUE 0.596 95.000 0.158 1.000   NA
 5517446 5517447 BAV0355 BAV0356     FALSE 0.005 412.000 0.000 1.000   NA
 5517447 5517448 BAV0356 BAV0357     FALSE 0.277 70.000 0.000 1.000   NA
 5517448 5517449 BAV0357 BAV0358     FALSE 0.003 587.000 0.000 NA   NA
 5517449 5517450 BAV0358 BAV0359     FALSE 0.215 95.000 0.000 NA   NA
 5517450 5517451 BAV0359 BAV0360     TRUE 0.695 20.000 0.000 NA   NA
 5517451 5517452 BAV0360 BAV0361     TRUE 0.851 7.000 0.000 NA   NA
 5517452 5517453 BAV0361 BAV0362     TRUE 0.862 65.000 0.583 NA   NA
 5517455 5517456 BAV0364 BAV0365     FALSE 0.012 287.000 0.000 NA   NA
 5517456 5517457 BAV0365 BAV0366     TRUE 0.980 0.000 0.222 NA   NA
 5517457 5517458 BAV0366 BAV0367     FALSE 0.227 90.000 0.000 NA   NA
 5517458 5517459 BAV0367 BAV0368     TRUE 0.987 -15.000 0.514 NA   NA
 5517459 5517460 BAV0368 BAV0369     FALSE 0.065 158.000 0.000 NA   NA
 5517460 5517461 BAV0369 BAV0370     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517461 5517462 BAV0370 BAV0371     TRUE 0.754 106.000 0.500 NA   NA
 5517462 5517463 BAV0371 BAV0372   virB6 FALSE 0.007 341.000 0.000 NA   NA
 5517463 5517464 BAV0372 BAV0373 virB6 traG TRUE 0.979 2.000 0.227 NA   NA
 5517464 5517465 BAV0373 BAV0374 traG   TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 5517465 5517466 BAV0374 BAV0375   traF TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5517466 10712359 BAV0375 BAV0376 traF   TRUE 0.836 -69.000 0.000 NA   NA
 10712359 5517467 BAV0376 BAV0377     FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 5517467 5517468 BAV0377 BAV0378   traR TRUE 0.857 5.000 0.000 NA   NA
 5517468 5517469 BAV0378 BAV0379 traR   TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517469 10712360 BAV0379 BAV0380     TRUE 0.834 -263.000 0.000 NA   NA
 10712360 5517470 BAV0380 BAV0381     FALSE 0.043 183.000 0.000 NA   NA
 5517470 5517471 BAV0381 BAV0382     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517473 5517474 BAV0384 BAV0385     FALSE 0.005 402.000 0.000 NA   NA
 5517474 5517475 BAV0385 BAV0386     TRUE 0.978 18.000 0.088 0.002 Y NA
 5517475 5517476 BAV0386 BAV0387     TRUE 0.983 2.000 0.028 0.045 Y NA
 5517476 5517477 BAV0387 BAV0388     FALSE 0.004 462.000 0.000 NA   NA
 5517477 5517478 BAV0388 BAV0389     FALSE 0.292 62.000 0.000 NA   NA
 5517478 5517479 BAV0389 BAV0391     FALSE 0.011 289.000 0.000 NA   NA
 5517479 5517480 BAV0391 BAV0392     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517480 5517481 BAV0392 BAV0393     FALSE 0.227 90.000 0.000 NA   NA
 5517481 5517482 BAV0393 BAV0394     FALSE 0.043 183.000 0.000 NA   NA
 5517482 5517483 BAV0394 BAV0395     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517483 5517484 BAV0395 BAV0396     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517484 5517485 BAV0396 BAV0397     TRUE 0.816 12.000 0.000 NA   NA
 5517485 5517486 BAV0397 BAV0398   recT FALSE 0.256 79.000 0.000 NA   NA
 5517486 5517487 BAV0398 BAV0399 recT   TRUE 0.970 -3.000 0.119 NA   NA
 5517487 5517488 BAV0399 BAV0400     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5517488 5517489 BAV0400 BAV0401     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517489 5517490 BAV0401 BAV0402     FALSE 0.320 55.000 0.000 NA   NA
 5517492 5517493 BAV0404 BAV0405     FALSE 0.333 52.000 0.000 NA   NA
 5517493 5517494 BAV0405 BAV0406     FALSE 0.538 32.000 0.000 NA   NA
 5517494 5517495 BAV0406 BAV0407     FALSE 0.205 99.000 0.000 NA   NA
 5517497 5517498 BAV0409 BAV0410     FALSE 0.232 159.000 0.000 NA Y NA
 5517498 5517499 BAV0410 BAV0411     FALSE 0.003 877.000 0.000 NA   NA
 5517500 5517501 BAV0412 BAV0412A     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517501 5517502 BAV0412A BAV0413     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517502 5517503 BAV0413 BAV0414     TRUE 0.846 -13.000 0.000 NA   NA
 5517503 5517504 BAV0414 BAV0415     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517504 5517505 BAV0415 BAV0416     FALSE 0.062 161.000 0.000 1.000   NA
 5517505 5517506 BAV0416 BAV0417     FALSE 0.247 82.000 0.000 NA   NA
 5517506 5517507 BAV0417 BAV0418     TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5517507 5517508 BAV0418 BAV0419     TRUE 0.857 5.000 0.000 NA   NA
 5517508 5517509 BAV0419 BAV0420     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517509 5517510 BAV0420 BAV0421     FALSE 0.136 121.000 0.000 NA   NA
 5517510 5517511 BAV0421 BAV0422     TRUE 0.969 2.000 0.143 NA   NA
 5517511 5517512 BAV0422 BAV0423     TRUE 0.808 87.000 0.500 NA   NA
 5517512 5517513 BAV0423 BAV0424     TRUE 0.988 -25.000 0.583 NA   NA
 5517513 5517514 BAV0424 BAV0425     TRUE 0.986 14.000 0.667 NA   NA
 5517514 5517515 BAV0425 BAV0426     TRUE 0.962 19.000 0.364 NA   NA
 5517515 5517516 BAV0426 BAV0427     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 5517516 5517517 BAV0427 BAV0428     FALSE 0.264 75.000 0.000 NA   NA
 5517517 5517518 BAV0428 BAV0429     TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5517518 5517519 BAV0429 BAV0430     TRUE 0.816 12.000 0.000 NA   NA
 5517519 5517520 BAV0430 BAV0431     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 5517520 5517521 BAV0431 BAV0432     TRUE 0.846 -13.000 0.000 NA   NA
 5517521 5517522 BAV0432 BAV0433     FALSE 0.061 161.000 0.000 NA   NA
 5517522 5517523 BAV0433 BAV0434     TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5517523 5517524 BAV0434 BAV0435     FALSE 0.405 41.000 0.000 NA   NA
 5517524 5517525 BAV0435 BAV0436     TRUE 0.991 5.000 0.667 NA   NA
 5517525 5517526 BAV0436 BAV0437     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 5517527 5517528 BAV0438 BAV0438A     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517528 5517529 BAV0438A BAV0438B     TRUE 0.638 24.000 0.000 NA   NA
 5517529 5517530 BAV0438B BAV0439     FALSE 0.247 82.000 0.000 NA   NA
 5517530 5517531 BAV0439 BAV0439A     FALSE 0.242 83.000 0.000 NA   NA
 5517531 5517532 BAV0439A BAV0440     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 5517532 5517533 BAV0440 BAV0441     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5517533 5517534 BAV0441 BAV0442     FALSE 0.502 34.000 0.000 NA   NA
 5517534 5517535 BAV0442 BAV0443     FALSE 0.320 55.000 0.000 NA   NA
 5517535 5517536 BAV0443 BAVt07   tRNA-Leu(CAA) FALSE 0.113 131.000 0.000 NA   NA
 5517536 5517537 BAVt07 BAV0444 tRNA-Leu(CAA)   FALSE 0.222 92.000 0.000 NA   NA
 5517537 5517538 BAV0444 BAV0445   katB FALSE 0.302 60.000 0.000 NA   NA
 5517538 5517539 BAV0445 BAV0446 katB   FALSE 0.030 193.000 0.000 1.000 N NA
 5517541 5517542 BAV0448 BAV0449   ampD TRUE 0.726 16.000 0.013 NA N NA
 5517542 5517543 BAV0449 BAV0450 ampD   FALSE 0.476 37.000 0.013 NA   NA
 5517543 5517544 BAV0450 BAV0451     TRUE 0.919 6.000 0.044 NA   NA
 5517546 5517547 BAV0453 BAV0454 thiS pip TRUE 0.896 8.000 0.027 1.000   NA
 5517547 5517548 BAV0454 BAV0455 pip yggH TRUE 0.545 27.000 0.006 1.000   NA
 5517550 5517551 BAV0456 BAV0457   hutG FALSE 0.038 320.000 0.000 1.000 Y NA
 5517551 5517552 BAV0457 BAV0458 hutG arcB FALSE 0.029 357.000 0.000 1.000 Y NA
 5517553 5517554 BAV0459 BAV0460     FALSE 0.008 297.000 0.000 1.000 N NA
 5517554 5517555 BAV0460 BAV0461     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517555 5517556 BAV0461 BAV0462     TRUE 0.992 -3.000 0.588 NA   NA
 5517559 5517560 BAV0465 BAV0466     FALSE 0.047 179.000 0.000 1.000   NA
 5517560 5517561 BAV0466 BAV0467     FALSE 0.008 340.000 0.000 1.000   NA
 5517561 5517562 BAV0467 BAV0468     TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5517563 5517564 BAV0469 BAV0470     FALSE 0.268 73.000 0.000 NA   NA
 5517564 5517565 BAV0470 BAV0471     FALSE 0.394 42.000 0.000 NA   NA
 5517566 5517567 BAV0472 BAV0473 metG   FALSE 0.080 176.000 0.036 NA   NA
 5517568 5517569 BAV0474 BAV0475 mrp   TRUE 0.827 3.000 0.010 1.000 N NA
 5517569 5517570 BAV0475 BAV0476     TRUE 0.992 -3.000 0.575 NA   NA
 5517570 5517571 BAV0476 BAV0477   dcd FALSE 0.339 49.000 0.010 NA   NA
 5517573 5517574 BAV0479 BAV0480   adiA FALSE 0.110 157.000 0.035 NA   NA
 5517574 5517575 BAV0480 BAV0481 adiA   FALSE 0.254 61.000 0.007 NA   NA
 5517577 5517578 BAV0483 BAV0484     TRUE 0.684 53.000 0.000 NA Y NA
 5517578 5517579 BAV0484 BAV0485     TRUE 0.987 13.000 0.538 0.066 N NA
 5517579 5517580 BAV0485 BAV0486     TRUE 0.987 -16.000 0.357 0.033 N NA
 5517580 5517581 BAV0486 BAV0487   dad TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5517581 5517582 BAV0487 BAV0488 dad   TRUE 0.790 14.000 0.000 1.000   NA
 5517582 5517583 BAV0488 BAV0489   gldA TRUE 0.980 -3.000 0.143 0.077 N NA
 5517583 5517584 BAV0489 BAV0490 gldA   TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5517584 5517585 BAV0490 BAV0491   gcvT FALSE 0.007 358.000 0.000 1.000   NA
 5517585 5517586 BAV0491 BAV0492 gcvT gcvH TRUE 0.936 77.000 0.317 0.001 Y NA
 5517586 5517587 BAV0492 BAV0493 gcvH gcvP TRUE 0.910 52.000 0.249 1.000 Y NA
 5517588 5517589 BAV0494 BAV0495     FALSE 0.021 237.000 0.000 NA   NA
 5517589 5517590 BAV0495 BAV0496     FALSE 0.052 170.000 0.000 NA   NA
 5517590 5517591 BAV0496 BAV0497     FALSE 0.166 112.000 0.000 NA   NA
 5517591 5517592 BAV0497 BAV0498     TRUE 0.922 47.000 0.750 NA   NA
 5517592 5517593 BAV0498 BAV0499     TRUE 0.993 4.000 0.800 1.000   NA
 5517593 5517594 BAV0499 BAV0500     TRUE 0.998 3.000 1.000 0.066 Y NA
 5517594 5517595 BAV0500 BAV0501     TRUE 0.968 82.000 1.000 0.066 Y NA
 5517595 5517596 BAV0501 BAV0502     TRUE 0.806 74.000 0.400 NA   NA
 5517596 5517597 BAV0502 BAV0503   mmsA FALSE 0.417 103.000 0.080 NA   NA
 5517597 5517598 BAV0503 BAV0504 mmsA   TRUE 0.847 45.000 0.360 1.000 N NA
 5517600 5517601 BAV0506 BAV0507 folA thyA TRUE 0.964 3.000 0.134 1.000 N NA
 5517601 5517602 BAV0507 BAV0508 thyA   FALSE 0.263 44.000 0.006 1.000 N NA
 5517603 5517604 BAV0509 BAV0510     FALSE 0.002 762.000 0.000 1.000 N NA
 5517604 5517605 BAV0510 BAV0511   wbpO TRUE 0.567 90.000 0.012 1.000 Y NA
 5517605 5517606 BAV0511 BAV0512 wbpO wbpP TRUE 0.973 22.000 0.212 1.000 Y NA
 5517606 5517607 BAV0512 BAV0513 wbpP   TRUE 0.889 2.000 0.018 1.000   NA
 5517607 5517608 BAV0513 BAV0514     TRUE 0.991 1.000 0.600 1.000   NA
 5517608 5517609 BAV0514 BAV0515   wbpS TRUE 0.903 8.000 0.042 1.000 N NA
 5517609 5517610 BAV0515 BAV0516 wbpS   TRUE 0.926 -3.000 0.042 1.000 N NA
 5517610 5517611 BAV0516 BAV0517   wbpT TRUE 0.988 8.000 0.087 0.018 Y NA
 5517611 5517612 BAV0517 BAV0518 wbpT wbnL TRUE 0.991 -3.000 0.089 0.018 Y NA
 5517613 5517614 BAV0519 BAV0520 pgi pgm TRUE 0.966 7.000 0.017 1.000 Y NA
 5517615 5517616 BAV0521 BAV0522     FALSE 0.323 56.000 0.000 1.000   NA
 5517616 5517617 BAV0522 BAV0523     TRUE 0.981 5.000 0.333 1.000 N NA
 5517617 5517618 BAV0523 BAV0524     TRUE 0.996 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5517618 5517619 BAV0524 BAV0525     FALSE 0.013 259.000 0.000 1.000 N NA
 5517619 5517620 BAV0525 BAV0526     FALSE 0.207 83.000 0.000 1.000 N NA
 5517621 5517622 BAV0527 BAV0528 fah hmgA TRUE 0.887 54.000 0.188 1.000 Y NA
 5517624 5517625 BAV0530 BAV0531     TRUE 0.989 12.000 0.681 NA   NA
 5517625 5517626 BAV0531 BAV0532     TRUE 0.704 97.000 0.297 1.000   NA
 5517626 5517627 BAV0532 BAV0533   fpg FALSE 0.114 113.000 0.003 1.000   NA
 5517628 5517629 BAV0534 BAV0535     TRUE 0.970 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5517629 5517630 BAV0535 BAV0536   ispE TRUE 0.962 10.000 0.157 1.000 N NA
 5517630 5517631 BAV0536 BAVt09 ispE tRNA-Gln(TTG) TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5517631 5517632 BAVt09 BAV0537 tRNA-Gln(TTG) prs FALSE 0.077 151.000 0.000 NA   NA
 5517632 5517633 BAV0537 BAV0538 prs rplY FALSE 0.416 114.000 0.122 1.000 N NA
 5517633 5517634 BAV0538 BAV0539 rplY pth TRUE 0.964 49.000 0.496 0.025 Y NA
 5517634 5517635 BAV0539 BAV0540 pth   TRUE 0.815 0.000 0.003 NA   NA
 5517635 5517636 BAV0540 BAV0541   engD FALSE 0.098 116.000 0.002 NA   NA
 5517637 5517638 BAV0542 BAV0543   hsdR FALSE 0.227 90.000 0.000 NA   NA
 5517638 5517639 BAV0543 BAV0544 hsdR prrC TRUE 0.978 -3.000 0.178 NA   NA
 5517639 5517640 BAV0544 BAV0545 prrC hsdS TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5517640 5517641 BAV0545 BAV0546 hsdS hsdM TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.044 Y NA
 5517641 5517642 BAV0546 BAV0547 hsdM   FALSE 0.044 236.000 0.000 0.044   NA
 5517642 5517643 BAV0547 BAV0548     FALSE 0.004 504.000 0.000 1.000   NA
 5517644 5517645 BAV0549 BAV0550   amnB TRUE 0.847 64.000 0.500 NA   NA
 5517645 5517646 BAV0550 BAV0551 amnB amnA TRUE 0.978 35.000 1.000 0.001   NA
 5517646 5517647 BAV0551 BAV0552 amnA amnC TRUE 0.656 54.000 0.111 1.000   NA
 5517647 5517648 BAV0552 BAV0553 amnC amnE TRUE 0.978 5.000 0.269 NA N NA
 5517651 5517652 BAV0556 BAV0557     TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5517652 5517653 BAV0557 BAV0558     FALSE 0.268 73.000 0.000 NA   NA
 5517654 5517655 BAV0559 BAV0560     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517656 5517657 BAV0561 BAV0562 benE   TRUE 0.896 -3.000 0.015 NA   NA
 5517657 5517658 BAV0562 BAV0563   coaD TRUE 0.615 52.000 0.088 NA   NA
 5517658 5517659 BAV0563 BAV0564 coaD   TRUE 0.950 22.000 0.367 1.000 N NA
 5517661 5517662 BAV0566 BAV0567     FALSE 0.015 268.000 0.000 1.000   NA
 5517662 5517663 BAV0567 BAV0568     TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5517664 5517665 BAV0569 BAV0570 ribB ribH TRUE 0.986 10.000 0.051 0.002 Y NA
 5517665 5517666 BAV0570 BAV0571 ribH nusB TRUE 0.981 8.000 0.347 1.000 N NA
 5517666 5517667 BAV0571 BAV0572 nusB thiL TRUE 0.627 16.000 0.004 1.000 N NA
 5517667 5517668 BAV0572 BAV0573 thiL pgpA FALSE 0.167 90.000 0.008 1.000 N NA
 5517668 5517669 BAV0573 BAV0574 pgpA   TRUE 0.973 -3.000 0.141 NA   NA
 5517670 5517671 BAV0575 BAV0576 pyrF ndh TRUE 0.790 6.000 0.007 1.000 N NA
 5517671 5517672 BAV0576 BAV0577 ndh dgkA TRUE 0.678 71.000 0.200 1.000 N NA
 5517672 5517673 BAV0577 BAV0578 dgkA brkB FALSE 0.031 202.000 0.000 1.000   NA
 5517673 5517674 BAV0578 BAV0579 brkB cpn60 FALSE 0.217 162.000 0.125 1.000   NA
 5517674 5517675 BAV0579 BAV0580 cpn60 cpn10 TRUE 0.982 34.000 0.750 1.000 Y NA
 5517675 5517676 BAV0580 BAV0581 cpn10   FALSE 0.003 742.000 0.000 NA   NA
 5517676 5517677 BAV0581 BAV0582     FALSE 0.003 703.000 0.000 NA   NA
 5517678 5517679 BAV0583 BAV0584   arsR FALSE 0.184 200.000 0.000 0.050 Y NA
 5517679 5517680 BAV0584 BAV0585 arsR   TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517680 5517681 BAV0585 BAV0586   arsC TRUE 0.560 30.000 0.000 NA   NA
 5517681 5517682 BAV0586 BAV0587 arsC arsH TRUE 0.974 -7.000 0.200 NA   NA
 5517683 5517684 BAV0588 BAV0589     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517685 5517686 BAV0590 BAV0591     TRUE 0.925 25.000 0.268 1.000 N NA
 5517686 5517687 BAV0591 BAV0592     FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 5517687 5517688 BAV0592 BAV0593   bpdF FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5517688 5517689 BAV0593 BAV0594 bpdF bpdE FALSE 0.056 164.000 0.000 NA   NA
 5517689 5517690 BAV0594 BAV0595 bpdE   FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 5517690 5517691 BAV0595 BAV0596     TRUE 0.917 8.000 0.000 0.058   NA
 5517691 5517692 BAV0596 BAV0597     FALSE 0.275 71.000 0.000 1.000   NA
 5517692 5517693 BAV0597 BAV0598   bphE FALSE 0.038 179.000 0.000 1.000 N NA
 5517693 5517694 BAV0598 BAV0599 bphE bphG TRUE 0.650 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5517694 5517695 BAV0599 BAV0600 bphG bphF TRUE 0.993 0.000 0.778 1.000 N NA
 5517695 5517696 BAV0600 BAV0601 bphF   TRUE 0.824 7.000 0.000 1.000 N NA
 5517696 5517697 BAV0601 BAV0602     FALSE 0.010 287.000 0.000 1.000 N NA
 5517697 5517698 BAV0602 BAV0603     FALSE 0.314 94.000 0.000 0.065 N NA
 5517698 5517699 BAV0603 BAV0604     FALSE 0.324 54.000 0.000 NA   NA
 5517699 5517700 BAV0604 BAV0605     FALSE 0.405 41.000 0.000 NA   NA
 5517700 5517701 BAV0605 BAV0606     FALSE 0.333 52.000 0.000 NA   NA
 5517701 5517702 BAV0606 BAV0607     FALSE 0.216 97.000 0.000 1.000   NA
 5517702 5517703 BAV0607 BAV0608     FALSE 0.028 196.000 0.000 1.000 N NA
 5517703 5517704 BAV0608 BAV0609     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517704 5517705 BAV0609 BAV0610     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5517705 5517706 BAV0610 BAV0611     TRUE 0.749 14.000 0.000 1.000 N NA
 5517706 5517707 BAV0611 BAV0612   phtD FALSE 0.349 50.000 0.000 1.000   NA
 5517707 5517708 BAV0612 BAV0613 phtD phnG TRUE 0.849 8.000 0.000 NA   NA
 5517708 5517709 BAV0613 BAV0614 phnG   TRUE 0.985 12.000 0.158 NA Y NA
 5517709 5517710 BAV0614 BAV0615     TRUE 0.766 13.000 0.000 1.000 N NA
 5517711 5517712 BAV0616 BAV0617     TRUE 0.868 1.000 0.000 NA   NA
 5517713 5517714 BAV0618 BAV0619     TRUE 0.771 15.000 0.000 NA   NA
 5517715 5517716 BAV0620 BAV0621     FALSE 0.326 55.000 0.000 1.000   NA
 5517716 5517717 BAV0621 BAV0622     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.035 Y NA
 5517717 5517718 BAV0622 BAV0623     TRUE 0.897 9.000 0.000 0.076 N NA
 5517718 5517719 BAV0623 BAV0624     TRUE 0.619 22.000 0.000 1.000 N NA
 5517720 5517721 BAV0625 BAV0626 acnA1   TRUE 0.763 31.000 0.077 1.000 N NA
 5517721 5517722 BAV0626 BAV0627     FALSE 0.452 34.000 0.000 1.000 N NA
 5517722 5517723 BAV0627 BAV0628     TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 5517726 5517727 BAV0631 BAV0632     FALSE 0.233 86.000 0.000 NA   NA
 5517727 5517728 BAV0632 BAV0633     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517728 5517729 BAV0633 BAV0634     TRUE 0.978 3.000 0.222 NA   NA
 5517729 5517730 BAV0634 BAV0635   fecR FALSE 0.469 112.000 0.000 NA Y NA
 5517730 5517731 BAV0635 BAV0636 fecR fecI TRUE 0.990 -3.000 0.556 NA N NA
 5517731 5517732 BAV0636 BAV0637 fecI   FALSE 0.120 129.000 0.000 NA   NA
 5517732 5517733 BAV0637 BAV0638     FALSE 0.055 166.000 0.000 NA   NA
 5517733 5517734 BAV0638 BAV0639   cysD1 TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5517734 5517735 BAV0639 BAV0640 cysD1   FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000 N NA
 5517735 5517736 BAV0640 BAV0641     FALSE 0.024 229.000 0.000 NA   NA
 5517736 5517737 BAV0641 BAV0642     FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 5517737 5517738 BAV0642 BAV0643     TRUE 0.956 -3.000 0.090 NA N NA
 5517738 5517739 BAV0643 BAV0644     TRUE 0.995 -3.000 0.385 NA Y NA
 5517739 5517740 BAV0644 BAV0645     TRUE 0.993 -3.000 0.219 1.000 Y NA
 5517740 5517741 BAV0645 BAV0646     TRUE 0.981 -3.000 0.219 1.000   NA
 5517741 5517742 BAV0646 BAV0647     TRUE 0.984 -3.000 0.118 0.001   NA
 5517743 5517744 BAV0648 BAV0649 rimJ kdgT FALSE 0.026 223.000 0.000 1.000   NA
 5517744 5517745 BAV0649 BAV0650 kdgT   TRUE 0.969 -3.000 0.118 NA   NA
 5517745 5517746 BAV0650 BAV0651   pdxA1 TRUE 0.963 -3.000 0.098 NA   NA
 5517746 5517747 BAV0651 BAV0652 pdxA1   TRUE 0.963 9.000 0.158 1.000 N NA
 5517749 5517750 BAV0654 BAV0655     TRUE 0.989 0.000 0.500 1.000 N NA
 5517750 5517751 BAV0655 BAV0656     TRUE 0.850 59.000 0.500 1.000 N NA
 5517751 5517752 BAV0656 BAV0657     TRUE 0.992 15.000 0.500 1.000 Y NA
 5517752 5517753 BAV0657 BAV0658     TRUE 0.966 15.000 0.150 0.002 N NA
 5517753 5517754 BAV0658 BAV0659     TRUE 0.966 3.000 0.000 NA Y NA
 5517754 5517755 BAV0659 BAV0660     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5517755 5517756 BAV0660 BAV0661     TRUE 0.953 -3.000 0.069 NA   NA
 5517756 5517757 BAV0661 BAV0662   hpaH TRUE 0.551 31.000 0.000 NA   NA
 5517757 5517758 BAV0662 BAV0663 hpaH hpaI TRUE 0.985 6.000 0.439 1.000 N NA
 5517758 5517759 BAV0663 BAV0664 hpaI   FALSE 0.247 83.000 0.000 1.000   NA
 5517760 5517761 BAV0665 BAV0666     TRUE 0.849 9.000 0.000 1.000   NA
 5517761 5517762 BAV0666 BAV0667     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5517762 5517763 BAV0667 BAV0668     FALSE 0.133 122.000 0.000 NA   NA
 5517764 5517765 BAV0669 BAV0669A     TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5517765 5517766 BAV0669A BAV0670   dbpA FALSE 0.041 185.000 0.000 NA   NA
 5517766 5517767 BAV0670 BAV0671 dbpA   FALSE 0.244 84.000 0.000 1.000   NA
 5517768 5517769 BAV0672 BAV0673     TRUE 0.848 0.000 0.000 1.000 N NA
 5517772 5517773 BAV0676 BAV0677     FALSE 0.309 48.000 0.000 1.000 N NA
 5517773 5517774 BAV0677 BAV0678     TRUE 0.971 20.000 0.156 1.000 Y NA
 5517774 5517775 BAV0678 BAV0679     TRUE 0.990 0.000 0.156 1.000 Y NA
 5517775 5517776 BAV0679 BAV0680     TRUE 0.996 11.000 0.455 0.010 Y NA
 5517776 5517777 BAV0680 BAV0681     TRUE 0.565 91.000 0.000 1.000 Y NA
 5517777 5517778 BAV0681 BAV0682     TRUE 0.958 24.000 0.077 0.075 Y NA
 5517778 5517779 BAV0682 BAV0683     TRUE 0.836 -6.000 0.000 1.000 N NA
 5517779 5517780 BAV0683 BAV0684     TRUE 0.577 25.000 0.000 1.000 N NA
 5517782 5517783 BAV0686 BAV0687   tam FALSE 0.030 212.000 0.000 1.000   NA
 5517784 5517785 BAV0688 BAV0689 tas   FALSE 0.113 131.000 0.000 NA   NA
 5517787 5517788 BAV0691 BAV0692     FALSE 0.079 143.000 0.008 NA   NA
 5517788 5517789 BAV0692 BAV0693     TRUE 0.992 0.000 0.642 NA   NA
 5517790 5517791 BAV0694 BAV0695 imp surA TRUE 0.974 -3.000 0.168 1.000 N NA
 5517791 5517792 BAV0695 BAV0696 surA ksgA TRUE 0.815 15.000 0.028 1.000 N NA
 5517795 5517796 BAV0699 BAV0700   def FALSE 0.090 144.000 0.000 1.000   NA
 5517796 5517797 BAV0700 BAV0701 def gloA FALSE 0.036 186.000 0.014 1.000 N NA
 5517797 5517798 BAV0701 BAV0702 gloA citB FALSE 0.157 111.000 0.009 NA   NA
 5517798 5517799 BAV0702 BAV0703 citB   TRUE 0.990 -10.000 0.618 NA   NA
 5517799 5517800 BAV0703 BAV0704     FALSE 0.352 79.000 0.039 1.000 N NA
 5517800 5517801 BAV0704 BAV0705     TRUE 0.821 5.000 0.006 NA   NA
 5517801 5517802 BAV0705 BAV0706     TRUE 0.950 -13.000 0.099 NA   NA
 5517802 5517803 BAV0706 BAV0707     TRUE 0.979 4.000 0.279 1.000 N NA
 5517803 5517804 BAV0707 BAV0708   glyS TRUE 0.967 -3.000 0.123 1.000 N NA
 5517804 5517805 BAV0708 BAV0709 glyS glyQ TRUE 0.998 2.000 0.651 0.001 Y NA
 5517806 5517807 BAV0710 BAV0711 caiD fumA FALSE 0.217 68.000 0.009 1.000 N NA
 5517809 5517810 BAV0713 BAV0714     TRUE 0.835 25.000 0.081 NA   NA
 5517810 5517811 BAV0714 BAV0715   citE TRUE 0.990 0.000 0.500 1.000   NA
 5517811 5517812 BAV0715 BAV0716 citE   TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 5517812 5517813 BAV0716 BAV0717     FALSE 0.156 114.000 0.000 NA   NA
 5517814 5517815 BAV0718 BAV0719   folK FALSE 0.229 74.000 0.000 1.000 N NA
 5517815 5517816 BAV0719 BAV0720 folK pcnB TRUE 0.981 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5517816 5517817 BAV0720 BAV0721 pcnB   TRUE 0.846 0.000 0.011 1.000 N NA
 5517817 5517818 BAV0721 BAV0722     TRUE 0.895 -3.000 0.015 NA   NA
 5517820 5517821 BAV0724 BAV0725 miaA mutL TRUE 0.972 3.000 0.188 1.000 N NA
 5517823 5517824 BAV0727 BAV0728   poxB FALSE 0.216 97.000 0.000 1.000   NA
 5517824 5517825 BAV0728 BAV0729 poxB mqo TRUE 0.852 8.000 0.000 1.000   NA
 5517825 5517826 BAV0729 BAV0730 mqo   TRUE 0.890 20.000 0.099 1.000   NA
 5517826 5517827 BAV0730 BAV0731   amiC FALSE 0.003 896.000 0.000 1.000   NA
 5517827 5517828 BAV0731 BAV0732 amiC   TRUE 0.730 33.000 0.063 NA   NA
 5517831 5517832 BAV0735 BAV0736     FALSE 0.142 120.000 0.000 1.000   NA
 5517834 5517835 BAV0738 BAV0739     TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5517835 5517836 BAV0739 BAV0740     TRUE 0.998 -3.000 0.876 1.000 Y NA
 5517836 5517837 BAV0740 BAV0741     TRUE 0.979 13.000 0.112 NA Y NA
 5517837 5517838 BAV0741 BAV0742     FALSE 0.235 66.000 0.000 NA N NA
 5517838 5517839 BAV0742 BAV0743   mipA FALSE 0.030 189.000 0.000 NA N NA
 5517839 5517840 BAV0743 BAV0744 mipA   FALSE 0.016 259.000 0.000 NA   NA
 5517845 5517846 BAV0749 BAV0750     TRUE 0.992 -7.000 0.717 NA   NA
 5517846 5517847 BAV0750 BAV0751     TRUE 0.993 -3.000 0.679 1.000   NA
 5517847 5517848 BAV0751 BAV0752     TRUE 0.979 -3.000 0.195 NA   NA
 5517851 5517852 BAV0755 BAV0756     FALSE 0.207 83.000 0.000 1.000 N NA
 5517852 5517853 BAV0756 BAV0757   cadR FALSE 0.202 85.000 0.000 1.000 N NA
 5517855 10712361 BAV0759 BAV0760     TRUE 0.832 -701.000 0.000 NA   NA
 10712361 5517856 BAV0760 BAV0761     FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 5517857 5517858 BAV0762 BAV0763     FALSE 0.107 134.000 0.000 1.000   NA
 5517860 5517861 BAV0765 BAV0766     FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 5517863 5517864 BAV0768 BAV0769     FALSE 0.238 84.000 0.000 NA   NA
 5517864 5517865 BAV0769 BAV0770     TRUE 0.868 1.000 0.000 NA   NA
 5517867 5517868 BAV0772 BAV0773     TRUE 0.876 17.000 0.062 1.000   NA
 5517869 5517870 BAV0774 BAV0775 add   FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000 N NA
 5517870 5517871 BAV0775 BAV0776   ggt TRUE 0.998 3.000 1.000 1.000 Y NA
 5517871 5517872 BAV0776 BAV0777 ggt   TRUE 0.849 8.000 0.000 NA   NA
 5517873 5517874 BAV0778 BAV0779     FALSE 0.038 191.000 0.000 1.000   NA
 5517875 5517876 BAV0780 BAV0781     FALSE 0.049 174.000 0.000 NA   NA
 5517876 5517877 BAV0781 BAV0782     FALSE 0.011 291.000 0.000 NA   NA
 5517877 5517878 BAV0782 BAV0783     TRUE 0.827 93.000 0.197 1.000 Y NA
 5517878 5517879 BAV0783 BAV0784   cyoA FALSE 0.011 270.000 0.000 1.000 N NA
 5517879 5517880 BAV0784 BAV0785 cyoA cyoB TRUE 0.998 1.000 0.615 0.008 Y NA
 5517880 5517881 BAV0785 BAV0786 cyoB cyoC TRUE 0.996 7.000 0.444 0.056 Y NA
 5517881 5517882 BAV0786 BAV0787 cyoC cyoD TRUE 0.997 0.000 0.444 0.056 Y NA
 5517884 5517885 BAV0789 BAV0790     FALSE 0.226 76.000 0.000 1.000 N NA
 5517885 5517886 BAV0790 BAV0791     FALSE 0.313 57.000 0.000 NA   NA
 5517887 5517888 BAV0792 BAV0793     FALSE 0.381 43.000 0.000 NA   NA
 5517888 5517889 BAV0793 BAV0794     TRUE 0.993 -3.000 0.714 NA   NA
 5517889 5517890 BAV0794 BAV0795     TRUE 0.975 18.000 0.556 NA   NA
 5517890 5517891 BAV0795 BAV0796     TRUE 0.978 -10.000 0.258 NA   NA
 5517891 5517892 BAV0796 BAV0797     TRUE 0.993 -3.000 0.710 NA N NA
 5517892 5517893 BAV0797 BAV0798     TRUE 0.956 13.000 0.160 NA   NA
 5517893 5517894 BAV0798 BAV0799     TRUE 0.985 -3.000 0.300 NA   NA
 5517894 5517895 BAV0799 BAV0800   srfC TRUE 0.954 10.000 0.111 NA   NA
 5517895 5517896 BAV0800 BAV0801 srfC srfB TRUE 0.958 6.000 0.111 NA   NA
 5517896 5517897 BAV0801 BAV0802 srfB srfA TRUE 0.740 17.000 0.000 NA   NA
 5517898 5517899 BAV0804 BAV0805     FALSE 0.221 93.000 0.000 NA   NA
 5517899 5517900 BAV0805 BAV0806     TRUE 0.951 13.000 0.143 NA   NA
 5517900 5517901 BAV0806 BAV0807     TRUE 0.997 -3.000 0.619 NA Y NA
 5517902 5517903 BAV0808 BAV0809     FALSE 0.410 62.000 0.034 NA   NA
 5517905 5517906 BAV0811 BAV0812     FALSE 0.161 113.000 0.000 NA   NA
 5517906 5517907 BAV0812 BAV0813     FALSE 0.026 221.000 0.000 NA   NA
 5517907 5517908 BAV0813 BAV0814   fdsD TRUE 0.567 30.000 0.000 1.000   NA
 5517908 5517909 BAV0814 BAV0815 fdsD fdhD TRUE 0.920 25.000 0.104 0.003   NA
 5517909 5517910 BAV0815 BAV0816 fdhD fdhF TRUE 0.914 19.000 0.049 0.003   NA
 5517910 5517911 BAV0816 BAV0817 fdhF fdsB TRUE 0.990 12.000 0.466 0.003   NA
 5517911 5517912 BAV0817 BAV0818 fdsB fdsG TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.003 Y NA
 5517913 5517914 BAV0819 BAV0820   moaA TRUE 0.673 29.000 0.040 NA N NA
 5517914 5517915 BAV0820 BAV0821 moaA chlB TRUE 0.980 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 5517916 5517917 BAV0822 BAV0823 moeA moaB TRUE 0.983 -3.000 0.009 0.003 Y NA
 5517917 5517918 BAV0823 BAV0824 moaB moaE TRUE 0.986 -3.000 0.018 0.003 Y NA
 5517918 5517919 BAV0824 BAV0825 moaE moaD TRUE 0.997 3.000 0.501 0.003 Y NA
 5517919 5517920 BAV0825 BAV0826 moaD moaC TRUE 0.993 -19.000 0.175 0.003 Y NA
 5517921 5517922 BAV0827 BAV0828     FALSE 0.107 134.000 0.000 1.000   NA
 5517922 5517923 BAV0828 BAV0829     FALSE 0.491 58.000 0.065 NA N NA
 5517924 5517925 BAV0830 BAV0831   bioB TRUE 0.840 -3.000 0.004 NA   NA
 5517926 5517927 BAV0832 BAV0833     TRUE 0.707 84.000 0.250 NA   NA
 5517928 5517929 BAVt10 BAVt11 tRNA-Asp(GTC) tRNA-Glu(TTC) FALSE 0.394 42.000 0.000 NA   NA
 5517929 5517930 BAVt11 BAVt12 tRNA-Glu(TTC) tRNA-Ala(GGC) TRUE 0.585 28.000 0.000 NA   NA
 5517930 5517931 BAVt12 BAVt13 tRNA-Ala(GGC) tRNA-Asp(GTC) FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5517931 5517932 BAVt13 BAVt14 tRNA-Asp(GTC) tRNA-Glu(TTC) FALSE 0.394 42.000 0.000 NA   NA
 5517932 5517933 BAVt14 BAVt15 tRNA-Glu(TTC) tRNA-Ala(GGC) TRUE 0.585 28.000 0.000 NA   NA
 5517933 5517934 BAVt15 BAV0834 tRNA-Ala(GGC)   FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 5517935 5517936 BAV0835 BAV0836     TRUE 0.980 -3.000 0.220 1.000 N NA
 5517936 5517937 BAV0836 BAV0837     TRUE 0.990 -3.000 0.457 NA   NA
 5517937 5517938 BAV0837 BAV0838   corC FALSE 0.422 126.000 0.150 NA   NA
 5517938 5517939 BAV0838 BAV0839 corC cutE TRUE 0.948 -3.000 0.071 NA N NA
 5517941 5517942 BAVt16 BAVt17 tRNA-Ala(GGC) tRNA-Glu(TTC) TRUE 0.596 27.000 0.000 NA   NA
 5517942 5517943 BAVt17 BAVt18 tRNA-Glu(TTC) tRNA-Asp(GTC) FALSE 0.394 42.000 0.000 NA   NA
 5517944 5517945 BAV0841 BAV0842 secF secD TRUE 0.943 67.000 0.332 0.001 Y NA
 5517945 5517946 BAV0842 BAV0843 secD   TRUE 0.787 64.000 0.083 NA Y NA
 5517946 5517947 BAV0843 BAV0844   tgt FALSE 0.447 144.000 0.325 NA N NA
 5517947 5517948 BAV0844 BAV0845 tgt queA TRUE 0.997 -3.000 0.360 0.001 Y NA
 5517949 5517950 BAV0846 BAV0847   upp FALSE 0.192 57.000 0.004 1.000 N NA
 5517952 5517953 BAV0849 BAV0850     TRUE 0.839 84.000 0.600 NA   NA
 5517953 5517954 BAV0850 BAV0851     FALSE 0.454 57.000 0.040 NA   NA
 5517954 5517955 BAV0851 BAV0852     TRUE 0.888 0.000 0.016 NA   NA
 5517956 5517957 BAV0853 BAV0854   ubiD FALSE 0.058 162.000 0.000 NA   NA
 5517959 5517960 BAV0856 BAV0857     FALSE 0.117 130.000 0.000 NA   NA
 5517961 5517962 BAV0858 BAV0859   maeB1 FALSE 0.442 145.000 0.286 NA   NA
 5517962 5517963 BAV0859 BAV0860 maeB1   TRUE 0.888 -19.000 0.026 1.000   NA
 5517963 5517964 BAV0860 BAV0861     TRUE 0.918 -3.000 0.026 NA   NA
 5517966 5517967 BAV0863 BAV0864 tkt gap TRUE 0.945 17.000 0.033 1.000 Y NA
 5517967 5517968 BAV0864 BAV0865 gap pgk TRUE 0.635 111.000 0.017 0.004 Y NA
 5517968 5517969 BAV0865 BAV0866 pgk   FALSE 0.189 92.000 0.000 1.000 N NA
 5517970 5517971 BAV0867 BAV0868 envM ackA TRUE 0.937 -3.000 0.054 1.000 N NA
 5517971 5517972 BAV0868 BAV0869 ackA pta TRUE 0.994 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 5517972 5517973 BAV0869 BAV0870 pta   FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 5517973 5517974 BAV0870 BAV0871     FALSE 0.100 138.000 0.000 NA   NA
 5517974 5517975 BAV0871 BAV0872     FALSE 0.261 58.000 0.000 NA N NA
 5517976 5517977 BAV0873 BAV0874 cbpA   TRUE 0.986 3.000 0.388 NA   NA
 5517977 5517978 BAV0874 BAV0875     FALSE 0.354 51.000 0.013 NA   NA
 5517978 5517979 BAV0875 BAV0876     TRUE 0.995 -3.000 0.915 NA   NA
 5517981 5517982 BAV0878 BAV0879 chlG   FALSE 0.289 56.000 0.008 NA   NA
 5517982 5517983 BAV0879 BAV0880     TRUE 0.894 -3.000 0.015 NA   NA
 5517984 5517985 BAV0881 BAV0882   infA FALSE 0.264 75.000 0.000 NA   NA
 5517985 5517986 BAV0882 BAV0883 infA   FALSE 0.007 350.000 0.000 1.000   NA
 5517988 5517989 BAV0885 BAV0886     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 5517992 5517993 BAV0889 BAV0890 cbbA purC FALSE 0.188 134.000 0.055 1.000 N NA
 5517993 5517994 BAV0890 BAV0891 purC purE FALSE 0.263 169.000 0.038 1.000 Y NA
 5517994 5517995 BAV0891 BAV0892 purE purK TRUE 0.891 97.000 0.201 0.001 Y NA
 5517995 5517996 BAV0892 BAV0893 purK   TRUE 0.905 -7.000 0.041 NA N NA
 5517996 5517997 BAV0893 BAV0894     FALSE 0.099 128.000 0.000 NA N NA
 5517997 5517998 BAV0894 BAV0895     FALSE 0.003 480.000 0.000 1.000 N NA
 5517998 5517999 BAV0895 BAV0896     TRUE 0.984 35.000 1.000 1.000 Y NA
 5517999 5518000 BAV0896 BAV0897     TRUE 0.757 16.000 0.000 NA   NA
 5518000 5518001 BAV0897 BAV0898     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5518001 5518002 BAV0898 BAV0899     FALSE 0.426 161.000 0.111 1.000 Y NA
 5518002 5518003 BAV0899 BAV0900     FALSE 0.003 848.000 0.000 NA   NA
 5518004 5518005 BAV0901 BAV0902 gcdH ilvB FALSE 0.424 59.000 0.043 1.000 N NA
 5518006 5518007 BAV0903 BAV0904   xerD TRUE 0.778 2.000 0.004 1.000 N NA
 5518007 5518008 BAV0904 BAV0905 xerD   TRUE 0.852 11.000 0.015 1.000   NA
 5518008 5518009 BAV0905 BAV0906     FALSE 0.226 63.000 0.004 1.000   NA
 5518009 5518010 BAV0906 BAV0907     TRUE 0.686 74.000 0.188 NA   NA
 5518012 5518013 BAV0910 BAVt19   tRNA-Arg(CCT) FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 5518013 5518014 BAVt19 BAV0911 tRNA-Arg(CCT)   FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 5518014 5518015 BAV0911 BAV0911A     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518015 5518016 BAV0911A BAV0912     FALSE 0.333 52.000 0.000 NA   NA
 5518016 5518017 BAV0912 BAV0913     TRUE 0.955 4.000 0.098 NA   NA
 5518017 5518018 BAV0913 BAVs01     FALSE 0.156 114.000 0.000 NA   NA
 5518018 5518019 BAVs01 BAV0914   dnaX FALSE 0.090 143.000 0.000 NA   NA
 5518019 5518020 BAV0914 BAV0915 dnaX   TRUE 0.904 38.000 0.411 NA   NA
 5518020 5518021 BAV0915 BAV0916   recR TRUE 0.975 20.000 0.604 NA   NA
 5518022 5518023 BAV0917 BAV0918   carB FALSE 0.278 55.000 0.000 1.000 N NA
 5518023 5518024 BAV0918 BAV0919 carB carA TRUE 0.996 11.000 0.345 0.001 Y NA
 5518026 5518027 BAV0921 BAV0922 gpmB   TRUE 0.987 -7.000 0.500 1.000 N NA
 5518027 5518028 BAV0922 BAV0923     TRUE 0.978 21.000 0.800 1.000 N NA
 5518028 5518029 BAV0923 BAV0924     TRUE 0.993 4.000 0.625 0.063 N NA
 5518029 5518030 BAV0924 BAV0925     TRUE 0.958 68.000 0.625 0.063 Y NA
 5518030 5518031 BAV0925 BAV0926     FALSE 0.233 86.000 0.000 NA   NA
 5518032 5518033 BAV0927 BAV0928 pyrP greA FALSE 0.003 598.000 0.000 1.000 N NA
 5518035 5518036 BAV0930 BAV0931 ftsJ ftsH FALSE 0.193 152.000 0.095 NA N NA
 5518036 5518037 BAV0931 BAV0932 ftsH dhpS TRUE 0.960 17.000 0.325 1.000 N NA
 5518037 5518038 BAV0932 BAV0933 dhpS glmM TRUE 0.982 -3.000 0.260 1.000 N NA
 5518038 5518039 BAV0933 BAV0934 glmM   FALSE 0.039 187.000 0.000 NA   NA
 5518042 10712362 BAV0937 BAV0938     TRUE 0.832 -764.000 0.000 NA   NA
 5518043 5518044 BAV0939 BAV0940 phoS phoW TRUE 0.658 132.000 0.072 0.002 Y NA
 5518044 5518045 BAV0940 BAV0941 phoW phoT TRUE 0.995 15.000 0.537 0.002 Y NA
 5518045 5518046 BAV0941 BAV0942 phoT phoT TRUE 0.989 28.000 0.526 0.002 Y NA
 5518046 5518047 BAV0942 BAVt20 phoT tRNA-Pro(TGG) FALSE 0.143 118.000 0.000 NA   NA
 5518048 5518049 BAV0943 BAV0944     TRUE 0.989 2.000 0.500 NA   NA
 5518050 5518051 BAV0945 BAV0946     TRUE 0.955 17.000 0.273 1.000 N NA
 5518051 5518052 BAV0946 BAV0947     TRUE 0.995 3.000 0.455 1.000 Y NA
 5518052 5518053 BAV0947 BAV0948     TRUE 0.997 3.000 0.571 0.062 Y NA
 5518053 5518054 BAV0948 BAV0949     TRUE 0.996 -7.000 0.643 1.000 Y NA
 5518054 5518055 BAV0949 BAV0950     TRUE 0.998 -3.000 0.533 0.031 Y NA
 5518055 5518056 BAV0950 BAV0951   leuC1 TRUE 0.966 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5518056 5518057 BAV0951 BAV0952 leuC1 leuD1 TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5518057 5518058 BAV0952 BAV0953 leuD1 hyuB TRUE 0.985 11.000 0.133 1.000 Y NA
 5518058 5518059 BAV0953 BAV0954 hyuB hyuA TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.001 Y NA
 5518059 5518060 BAV0954 BAV0955 hyuA   TRUE 0.997 2.000 0.737 1.000 Y NA
 5518060 5518061 BAV0955 BAV0956     TRUE 0.974 -3.000 0.161 1.000 N NA
 5518061 5518062 BAV0956 BAV0957     TRUE 0.969 14.000 0.323 1.000 N NA
 5518063 5518064 BAV0958 BAV0959   dan FALSE 0.014 270.000 0.000 1.000   NA
 5518064 5518065 BAV0959 BAV0960 dan dadA1 TRUE 0.561 26.000 0.000 1.000 N NA
 5518065 5518066 BAV0960 BAV0961 dadA1   TRUE 0.995 4.000 0.400 1.000 Y NA
 5518066 5518067 BAV0961 BAV0962     TRUE 0.991 -3.000 0.600 1.000 N NA
 5518067 5518068 BAV0962 BAV0963     FALSE 0.008 297.000 0.000 NA N NA
 5518068 5518069 BAV0963 BAV0964     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518069 5518070 BAV0964 BAV0965   ribH TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5518070 5518071 BAV0965 BAV0966 ribH   FALSE 0.174 58.000 0.002 1.000 N NA
 5518071 5518072 BAV0966 BAV0967     TRUE 0.987 -3.000 0.357 NA   NA
 5518072 5518073 BAV0967 BAV0968   gabD FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 5518073 5518074 BAV0968 BAV0969 gabD hpaC FALSE 0.197 103.000 0.000 1.000   NA
 5518074 5518075 BAV0969 BAV0970 hpaC   TRUE 0.893 70.000 0.800 NA   NA
 5518077 5518078 BAV0972 BAV0973     FALSE 0.172 109.000 0.000 NA   NA
 5518078 5518079 BAV0973 BAV0974     FALSE 0.005 427.000 0.000 NA   NA
 5518079 5518080 BAV0974 BAV0975     TRUE 0.637 21.000 0.000 1.000 N NA
 5518080 5518081 BAV0975 BAV0976     TRUE 0.816 12.000 0.000 NA   NA
 5518081 5518082 BAV0976 BAV0977     TRUE 0.864 3.000 0.000 NA   NA
 5518082 5518083 BAV0977 BAV0978     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518083 5518084 BAV0978 BAV0979     TRUE 0.830 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5518084 5518085 BAV0979 BAV0980     TRUE 0.987 -7.000 0.069 0.031 Y NA
 5518085 5518086 BAV0980 BAV0981     TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5518086 5518087 BAV0981 BAV0982     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.062 Y NA
 5518087 5518088 BAV0982 BAV0983     TRUE 0.675 56.000 0.000 1.000 Y NA
 5518090 5518091 BAV0987 BAV0988     FALSE 0.394 42.000 0.000 NA   NA
 5518092 5518093 BAV0989 BAV0990     FALSE 0.015 264.000 0.000 NA   NA
 5518093 5518094 BAV0990 BAV0991   cydA1 FALSE 0.003 638.000 0.000 NA   NA
 5518094 5518095 BAV0991 BAV0992 cydA1 cydB1 TRUE 0.997 3.000 0.600 0.055 Y NA
 5518095 5518096 BAV0992 BAV0993 cydB1   TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5518096 5518097 BAV0993 BAV0994     FALSE 0.277 67.000 0.000 NA   NA
 5518097 5518098 BAV0994 BAV0995     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 5518099 5518100 BAV0996 BAV0997   appF TRUE 0.812 10.000 0.000 1.000 N NA
 5518100 5518101 BAV0997 BAV0998 appF appD TRUE 0.997 -3.000 0.462 0.004 Y NA
 5518101 5518102 BAV0998 BAV0999 appD appC TRUE 0.996 10.000 0.600 1.000 Y NA
 5518102 5518103 BAV0999 BAV1000 appC   TRUE 0.988 21.000 0.375 0.062 Y NA
 5518103 5518104 BAV1000 BAV1001     TRUE 0.975 34.000 0.375 0.062 Y NA
 5518104 5518105 BAV1001 BAV1002     TRUE 0.794 49.000 0.231 NA   NA
 5518105 5518106 BAV1002 BAV1003     FALSE 0.008 322.000 0.000 NA   NA
 5518106 5518107 BAV1003 BAV1004     FALSE 0.007 348.000 0.000 NA   NA
 5518107 5518108 BAV1004 BAV1005     FALSE 0.128 126.000 0.000 NA   NA
 5518108 5518109 BAV1005 BAV1006     FALSE 0.133 122.000 0.000 NA   NA
 5518109 5518110 BAV1006 BAV1007     FALSE 0.012 286.000 0.000 NA   NA
 5518110 5518111 BAV1007 BAV1008     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5518111 5518112 BAV1008 BAV1009     TRUE 0.992 -10.000 0.750 NA   NA
 5518112 5518113 BAV1009 BAV1010     TRUE 0.993 -13.000 0.889 NA   NA
 5518113 5518114 BAV1010 BAV1011     TRUE 0.993 2.000 0.778 NA   NA
 5518114 5518115 BAV1011 BAV1012     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 5518117 5518118 BAV1014 BAV1015   marC TRUE 0.868 1.000 0.000 NA   NA
 5518118 5518119 BAV1015 BAV1016 marC   TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA N NA
 5518119 5518120 BAV1016 BAV1017   acnA2 FALSE 0.195 89.000 0.000 1.000 N NA
 5518121 5518122 BAV1018 BAV1019 tpm   FALSE 0.133 122.000 0.000 NA   NA
 5518122 5518123 BAV1019 BAV1020     FALSE 0.081 148.000 0.000 NA   NA
 5518123 5518124 BAV1020 BAV1021   cheW TRUE 0.997 6.000 0.600 0.004 Y NA
 5518124 5518125 BAV1021 BAV1022 cheW cheR TRUE 0.997 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 5518125 5518126 BAV1022 BAV1023 cheR   TRUE 0.996 0.000 0.558 1.000 Y NA
 5518126 5518127 BAV1023 BAV1024   cheA TRUE 0.998 -3.000 0.587 0.009 Y NA
 5518127 5518128 BAV1024 BAV1025 cheA cheB TRUE 0.996 -3.000 0.324 0.009 Y NA
 5518128 5518129 BAV1025 BAV1026 cheB wspR TRUE 0.996 12.000 0.480 0.013 Y NA
 5518129 5518130 BAV1026 BAV1027 wspR   FALSE 0.023 206.000 0.000 NA N NA
 5518131 5518132 BAV1028 BAV1029   aat TRUE 0.632 25.000 0.000 1.000   NA
 5518133 5518134 BAV1030 BAV1031     FALSE 0.054 158.000 0.000 1.000 N NA
 5518135 5518136 BAV1032 BAV1033     TRUE 0.969 18.000 0.429 NA   NA
 5518136 5518137 BAV1033 BAV1034     TRUE 0.897 39.000 0.400 1.000   NA
 5518138 5518139 BAV1035 BAV1036     FALSE 0.281 68.000 0.000 1.000   NA
 5518139 5518140 BAV1036 BAV1037     TRUE 0.653 42.000 0.022 0.009   NA
 5518141 5518142 BAV1038 BAV1039     TRUE 0.912 -3.000 0.022 NA   NA
 5518142 5518143 BAV1039 BAV1040     TRUE 0.899 2.000 0.033 NA N NA
 5518144 5518145 BAV1041 BAV1042   nuoA FALSE 0.025 196.000 0.009 1.000 N NA
 5518145 5518146 BAV1042 BAV1043 nuoA nuoB TRUE 0.987 31.000 0.507 0.003 Y NA
 5518146 5518147 BAV1043 BAV1044 nuoB nuoC TRUE 0.940 66.000 0.328 0.003 Y NA
 5518147 5518148 BAV1044 BAV1045 nuoC nuoD TRUE 0.997 3.000 0.483 0.007 Y NA
 5518148 5518149 BAV1045 BAV1046 nuoD nuoE TRUE 0.964 42.000 0.355 0.007 Y NA
 5518149 5518150 BAV1046 BAV1047 nuoE nuoF TRUE 0.997 -3.000 0.343 0.007 Y NA
 5518150 5518151 BAV1047 BAV1048 nuoF nuoG TRUE 0.993 16.000 0.395 0.007 Y NA
 5518151 5518152 BAV1048 BAV1049 nuoG nuoH TRUE 0.997 0.000 0.515 0.007 Y NA
 5518152 5518153 BAV1049 BAV1050 nuoH nuoI TRUE 0.991 22.000 0.500 0.007 Y NA
 5518153 5518154 BAV1050 BAV1051 nuoI nuoJ TRUE 0.992 18.000 0.442 0.007 Y NA
 5518154 5518155 BAV1051 BAV1052 nuoJ nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.484 0.003 Y NA
 5518155 5518156 BAV1052 BAV1053 nuoK nuoL TRUE 0.992 18.000 0.451 0.007 Y NA
 5518156 5518157 BAV1053 BAV1054 nuoL nuoM TRUE 0.995 -3.000 0.175 0.007 Y NA
 5518157 5518158 BAV1054 BAV1055 nuoM nuoN TRUE 0.995 10.000 0.340 0.007 Y NA
 5518158 5518159 BAV1055 BAV1056 nuoN   TRUE 0.980 -3.000 0.202 NA   NA
 5518159 5518160 BAV1056 BAV1057     FALSE 0.004 507.000 0.000 NA   NA
 5518160 5518161 BAV1057 BAV1058     FALSE 0.026 221.000 0.000 NA   NA
 5518162 5518163 BAV1059 BAV1060 ispF ispD TRUE 0.996 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 5518164 5518165 BAV1061 BAV1062 mfd serB TRUE 0.583 26.000 0.014 1.000 N NA
 5518166 5518167 BAV1063 BAV1064 ahpD ahpC FALSE 0.505 59.000 0.058 NA   NA
 5518167 5518168 BAV1064 BAV1065 ahpC risS FALSE 0.341 63.000 0.027 1.000 N NA
 5518168 5518169 BAV1065 BAV1066 risS risA TRUE 0.991 -13.000 0.241 1.000 Y NA
 5518170 5518171 BAV1067 BAV1068     FALSE 0.011 234.000 0.002 1.000 N NA
 5518173 5518174 BAV1070 BAV1071     FALSE 0.537 45.000 0.006 0.010   NA
 5518174 5518175 BAV1071 BAV1072   dnaL TRUE 0.833 0.000 0.004 1.000   NA
 5518176 5518177 BAV1073 BAV1074     TRUE 0.774 40.000 0.162 NA N NA
 5518177 5518178 BAV1074 BAV1075   ispZ TRUE 0.963 2.000 0.133 NA N NA
 5518178 5518179 BAV1075 BAV1076 ispZ msrB TRUE 0.970 -3.000 0.136 1.000 N NA
 5518180 5518181 BAV1077 BAV1078     TRUE 0.997 -3.000 0.729 1.000 Y NA
 5518181 5518182 BAV1078 BAV1079     TRUE 0.833 39.000 0.211 NA   NA
 5518182 5518183 BAV1079 BAV1080     FALSE 0.026 222.000 0.000 NA   NA
 5518183 5518184 BAV1080 BAV1081     TRUE 0.724 116.000 0.167 NA Y NA
 5518184 5518185 BAV1081 BAV1082     TRUE 0.991 4.000 0.125 0.062 Y NA
 5518185 5518186 BAV1082 BAV1083     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.031 Y NA
 5518187 5518188 BAV1084 BAV1085 plcN1 ilvE FALSE 0.064 151.000 0.000 1.000 N NA
 5518188 5518189 BAV1085 BAV1086 ilvE   FALSE 0.052 284.000 0.000 1.000 Y NA
 5518189 5518190 BAV1086 BAV1087     TRUE 0.991 -3.000 0.091 0.062 Y NA
 5518190 5518191 BAV1087 BAV1088     TRUE 0.699 94.000 0.068 NA Y NA
 5518191 5518192 BAV1088 BAV1089     TRUE 0.767 60.000 0.059 NA Y NA
 5518192 5518193 BAV1089 BAV1090     TRUE 0.998 -3.000 0.716 0.031 Y NA
 5518193 5518194 BAV1090 BAV1091   nth FALSE 0.020 228.000 0.000 1.000 N NA
 5518194 5518195 BAV1091 BAV1092 nth   TRUE 0.912 7.000 0.048 1.000 N NA
 5518195 5518196 BAV1092 BAV1093   phaZ FALSE 0.297 55.000 0.014 1.000 N NA
 5518196 5518197 BAV1093 BAV1094 phaZ fpr FALSE 0.130 138.000 0.029 1.000 N NA
 5518197 5518198 BAV1094 BAV1095 fpr fdxA TRUE 0.952 20.000 0.029 0.054 Y NA
 5518199 5518200 BAV1096 BAV1097 pncB   FALSE 0.341 41.000 0.011 NA N NA
 5518201 5518202 BAV1098 BAV1099     TRUE 0.896 -3.000 0.015 NA   NA
 5518203 5518204 BAV1100 BAV1101 relA argE FALSE 0.260 105.000 0.039 1.000 N NA
 5518204 5518205 BAV1101 BAV1102 argE trpB FALSE 0.317 137.000 0.008 1.000 Y NA
 5518205 5518206 BAV1102 BAV1103 trpB trpA TRUE 0.996 7.000 0.344 0.001 Y NA
 5518206 5518207 BAV1103 BAV1104 trpA accD TRUE 0.878 33.000 0.232 1.000 N NA
 5518207 5518208 BAV1104 BAV1105 accD   FALSE 0.029 214.000 0.000 1.000   NA
 5518209 5518210 BAV1106 BAV1107     TRUE 0.614 99.000 0.214 1.000 N NA
 5518210 5518211 BAV1107 BAV1108   ams FALSE 0.027 198.000 0.000 1.000 N NA
 5518212 5518213 BAV1109 BAV1110 rluC   TRUE 0.986 2.000 0.389 1.000   NA
 5518213 5518214 BAV1110 BAV1111     FALSE 0.194 105.000 0.013 1.000   NA
 5518214 5518215 BAV1111 BAV1112     TRUE 0.993 12.000 0.790 0.054   NA
 5518216 5518217 BAV1113 BAV1114     TRUE 0.895 4.000 0.021 1.000   NA
 5518217 5518218 BAV1114 BAV1115     TRUE 0.966 -3.000 0.107 NA   NA
 5518219 5518220 BAV1116 BAV1117   rpmF TRUE 0.889 53.000 0.599 NA   NA
 5518220 5518221 BAV1117 BAV1118 rpmF plsX TRUE 0.853 49.000 0.418 1.000 N NA
 5518221 5518222 BAV1118 BAV1119 plsX fabH TRUE 0.997 0.000 0.380 0.004 Y NA
 5518222 5518223 BAV1119 BAV1120 fabH fabD TRUE 0.918 60.000 0.182 0.004 Y NA
 5518223 5518224 BAV1120 BAV1121 fabD fabG TRUE 0.997 1.000 0.432 0.004 Y NA
 5518224 5518225 BAV1121 BAV1122 fabG acpP FALSE 0.523 217.000 0.321 0.004 Y NA
 5518225 5518226 BAV1122 BAV1123 acpP fabF TRUE 0.568 175.000 0.346 1.000 Y NA
 5518226 5518227 BAV1123 BAV1124 fabF   TRUE 0.845 -3.000 0.005 NA   NA
 5518227 5518228 BAV1124 BAV1125   rpoE TRUE 0.871 -3.000 0.009 NA   NA
 5518228 5518229 BAV1125 BAV1126 rpoE rseA TRUE 0.986 13.000 0.705 NA N NA
 5518229 5518230 BAV1126 BAV1127 rseA rseB TRUE 0.998 0.000 0.856 NA Y NA
 5518230 5518231 BAV1127 BAV1128 rseB mucD TRUE 0.778 46.000 0.218 NA N NA
 5518231 5518232 BAV1128 BAV1129 mucD lepA FALSE 0.021 203.000 0.008 1.000 N NA
 5518232 5518233 BAV1129 BAV1130 lepA lepB TRUE 0.921 21.000 0.187 1.000 N NA
 5518233 5518234 BAV1130 BAV1131 lepB rnc TRUE 0.956 6.000 0.117 1.000 N NA
 5518234 5518235 BAV1131 BAV1132 rnc erA TRUE 0.968 -3.000 0.058 0.047   NA
 5518235 5518236 BAV1132 BAV1133 erA recO TRUE 0.928 -7.000 0.049 1.000   NA
 5518237 5518238 BAV1134 BAV1135     FALSE 0.212 101.000 0.014 NA   NA
 5518238 5518239 BAV1135 BAV1136   holC TRUE 0.618 24.000 0.009 NA   NA
 5518239 5518240 BAV1136 BAV1137 holC pepA TRUE 0.972 17.000 0.494 1.000 N NA
 5518243 5518244 BAV1140 BAV1141     TRUE 0.812 58.000 0.375 NA N NA
 5518244 5518245 BAV1141 BAV1143     FALSE 0.003 482.000 0.000 1.000 N NA
 5518245 5518246 BAV1143 BAV1144     FALSE 0.018 251.000 0.000 NA   NA
 5518248 5518249 BAV1146 BAV1147 prpE   TRUE 0.948 -3.000 0.060 NA   NA
 5518249 5518250 BAV1147 BAV1148     TRUE 0.850 3.000 0.009 NA   NA
 5518250 5518251 BAV1148 BAV1149   acs FALSE 0.075 140.000 0.006 NA   NA
 5518251 5518252 BAV1149 BAV1150 acs ltaE FALSE 0.005 369.000 0.000 1.000 N NA
 5518253 5518254 BAV1151 BAV1152   etf FALSE 0.072 133.000 0.007 1.000 N NA
 5518255 5518256 BAV1153 BAV1154   lpsI FALSE 0.282 109.000 0.042 NA   NA
 5518256 5518257 BAV1154 BAV1155 lpsI lpsJ TRUE 0.997 13.000 0.789 0.001 Y NA
 5518257 5518258 BAV1155 BAV1156 lpsJ   FALSE 0.050 196.000 0.034 1.000 N NA
 5518258 5518259 BAV1156 BAV1157     TRUE 0.984 -3.000 0.292 1.000 N NA
 5518259 5518260 BAV1157 BAV1158     TRUE 0.606 38.000 0.042 1.000   NA
 5518260 5518261 BAV1158 BAV1159     FALSE 0.370 78.000 0.033 1.000   NA
 5518261 5518262 BAV1159 BAV1160     TRUE 0.975 51.000 0.803 0.061 Y NA
 5518262 5518263 BAV1160 BAV1161     TRUE 0.997 8.000 0.689 0.061 Y NA
 5518263 5518264 BAV1161 BAV1162   dmpA TRUE 0.941 43.000 0.354 NA Y NA
 5518264 5518265 BAV1162 BAV1163 dmpA dppA TRUE 0.985 13.000 0.190 NA Y NA
 5518265 5518266 BAV1163 BAV1164 dppA   TRUE 0.947 15.000 0.022 NA Y NA
 5518266 5518267 BAV1164 BAV1165   pyrG FALSE 0.021 223.000 0.000 1.000 N NA
 5518267 5518268 BAV1165 BAV1166 pyrG eno FALSE 0.087 187.000 0.068 1.000 N NA
 5518268 5518269 BAV1166 BAV1167 eno ftsB TRUE 0.711 74.000 0.241 1.000 N NA
 5518270 5518271 BAV1168 BAV1169   hslO FALSE 0.241 60.000 0.005 NA   NA
 5518271 5518272 BAV1169 BAV1170 hslO   TRUE 0.650 39.000 0.061 1.000   NA
 5518272 5518273 BAV1170 BAV1171     TRUE 0.857 6.000 0.012 1.000   NA
 5518273 5518274 BAV1171 BAV1172     FALSE 0.058 162.000 0.000 NA   NA
 5518274 5518275 BAV1172 BAV1173     FALSE 0.007 340.000 0.000 NA   NA
 5518277 5518278 BAV1175 BAV1176     FALSE 0.017 226.000 0.004 NA   NA
 5518278 5518279 BAV1176 BAV1177     TRUE 0.754 22.000 0.029 NA   NA
 5518279 5518280 BAV1177 BAV1178   prpC FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 5518280 5518281 BAV1178 BAV1179 prpC prpB TRUE 0.833 69.000 0.502 1.000 N NA
 5518281 5518282 BAV1179 BAV1180 prpB mdh FALSE 0.026 191.000 0.008 1.000 N NA
 5518283 5518284 BAV1181 BAV1182   sdhC FALSE 0.459 121.000 0.185 1.000 N NA
 5518284 5518285 BAV1182 BAV1183 sdhC sdhD TRUE 0.997 0.000 0.453 0.001 Y NA
 5518285 5518286 BAV1183 BAV1184 sdhD sdhA TRUE 0.998 4.000 0.705 0.002 Y NA
 5518286 5518287 BAV1184 BAV1185 sdhA sdhB TRUE 0.996 14.000 0.604 0.002 Y NA
 5518287 5518288 BAV1185 BAV1186 sdhB   TRUE 0.888 26.000 0.151 NA   NA
 5518288 5518289 BAV1186 BAV1187   gltA TRUE 0.910 21.000 0.136 NA   NA
 5518290 5518291 BAV1188 BAV1189     FALSE 0.002 765.000 0.000 1.000 N NA
 5518292 5518293 BAV1190 BAV1191     TRUE 0.993 11.000 0.857 0.061 N NA
 5518293 5518294 BAV1191 BAV1192   phnX TRUE 0.896 6.000 0.024 1.000   NA
 5518294 5518295 BAV1192 BAV1193 phnX   FALSE 0.413 54.000 0.024 1.000   NA
 5518295 5518296 BAV1193 BAV1194     FALSE 0.489 74.000 0.078 1.000 N NA
 5518297 5518298 BAV1195 BAV1196   piuC FALSE 0.202 100.000 0.000 NA   NA
 5518298 5518299 BAV1196 BAV1197 piuC piuA TRUE 0.869 2.000 0.000 1.000   NA
 5518299 5518300 BAV1197 BAV1198 piuA   FALSE 0.040 186.000 0.000 NA   NA
 5518302 5518303 BAV1200 BAV1201 maeB aceE FALSE 0.412 156.000 0.043 0.071 Y NA
 5518304 5518305 BAV1202 BAV1203   odhA FALSE 0.006 369.000 0.000 NA   NA
 5518305 5518306 BAV1203 BAV1204 odhA odhB TRUE 0.963 47.000 0.667 1.000 Y NA
 5518306 5518307 BAV1204 BAV1205 odhB odhL TRUE 0.887 68.000 0.253 1.000 Y NA
 5518307 5518308 BAV1205 BAV1206 odhL   TRUE 0.558 78.000 0.103 NA   NA
 5518308 5518309 BAV1206 BAV1207   fecI FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 5518309 5518310 BAV1207 BAV1208 fecI fecR TRUE 0.990 -7.000 0.667 NA N NA
 5518310 5518311 BAV1208 BAV1209 fecR bfrH TRUE 0.826 113.000 0.333 NA Y NA
 5518311 5518312 BAV1209 BAV1210 bfrH   TRUE 0.694 97.000 0.286 NA   NA
 5518312 5518313 BAV1210 BAV1211     TRUE 0.993 -3.000 0.625 NA   NA
 5518313 5518314 BAV1211 BAV1212     TRUE 0.985 -3.000 0.300 NA   NA
 5518314 5518315 BAV1212 BAV1213   trpS FALSE 0.300 74.000 0.017 NA   NA
 5518318 5518319 BAV1216 BAV1217     FALSE 0.277 70.000 0.000 1.000   NA
 5518319 5518320 BAV1217 BAV1218     FALSE 0.006 948.000 0.000 0.010   NA
 5518321 5518322 BAV1219 BAV1220 rluD   TRUE 0.969 -12.000 0.168 NA   NA
 5518322 5518323 BAV1220 BAV1221   phbC FALSE 0.079 139.000 0.006 NA   NA
 5518323 5518324 BAV1221 BAV1222 phbC phbB TRUE 0.858 57.000 0.049 0.001 Y NA
 5518324 5518325 BAV1222 BAV1223 phbB phbF TRUE 0.567 91.000 0.130 NA   NA
 5518325 5518326 BAV1223 BAV1224 phbF   FALSE 0.059 170.000 0.016 NA   NA
 5518326 5518327 BAV1224 BAV1225     TRUE 0.986 3.000 0.386 NA   NA
 5518327 5518328 BAV1225 BAV1226     TRUE 0.991 11.000 0.775 NA   NA
 5518328 5518329 BAV1226 BAV1227     TRUE 0.911 26.000 0.233 NA N NA
 5518329 5518330 BAV1227 BAV1228     FALSE 0.345 75.000 0.025 NA   NA
 5518331 5518332 BAV1229 BAV1230     TRUE 0.577 67.000 0.100 NA   NA
 5518332 5518333 BAV1230 BAV1231     TRUE 0.838 31.000 0.120 NA   NA
 5518333 5518334 BAV1231 BAV1232   cphA1 FALSE 0.003 807.000 0.000 NA   NA
 5518334 5518335 BAV1232 BAV1233 cphA1 cphA2 TRUE 0.968 69.000 0.871 0.096 Y NA
 5518336 5518337 BAV1234 BAV1235     TRUE 0.993 5.000 0.848 NA   NA
 5518339 5518340 BAV1237 BAV1238     TRUE 0.666 25.000 0.016 1.000   NA
 5518340 5518341 BAV1238 BAV1239     FALSE 0.007 332.000 0.000 1.000 N NA
 5518343 5518344 BAV1241 BAV1242     FALSE 0.184 105.000 0.000 NA   NA
 5518345 5518346 BAV1243 BAV1244 rfbB rfbA FALSE 0.407 154.000 0.018 0.003 Y NA
 5518346 5518347 BAV1244 BAV1245 rfbA   FALSE 0.139 120.000 0.000 NA   NA
 5518347 5518348 BAV1245 BAV1246     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 5518348 5518349 BAV1246 BAV1247     TRUE 0.967 -3.000 0.111 NA   NA
 5518349 5518350 BAV1247 BAV1248     TRUE 0.927 0.000 0.040 1.000   NA
 5518350 5518351 BAV1248 BAV1249     TRUE 0.997 0.000 0.480 0.001 Y NA
 5518351 5518352 BAV1249 BAV1250     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5518352 5518353 BAV1250 BAV1251     TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5518353 5518354 BAV1251 BAV1252     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5518354 5518355 BAV1252 BAV1253     TRUE 0.864 3.000 0.000 NA   NA
 5518355 5518356 BAV1253 BAV1254   rfbG FALSE 0.075 152.000 0.000 NA   NA
 5518356 5518357 BAV1254 BAV1255 rfbG rfbF TRUE 0.996 -13.000 0.624 1.000 Y NA
 5518357 5518358 BAV1255 BAV1256 rfbF   TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5518358 5518359 BAV1256 BAV1257     FALSE 0.003 684.000 0.000 NA   NA
 5518359 5518360 BAV1257 BAV1258     FALSE 0.363 46.000 0.000 NA   NA
 5518360 5518361 BAV1258 BAV1261   hpaI FALSE 0.003 653.000 0.000 NA   NA
 5518361 5518362 BAV1261 BAV1262 hpaI hpaH TRUE 0.642 32.000 0.038 1.000 N NA
 5518362 5518363 BAV1262 BAV1263 hpaH hpaF TRUE 0.975 10.000 0.282 NA N NA
 5518363 5518364 BAV1263 BAV1264 hpaF hpaG' TRUE 0.939 0.000 0.068 NA N NA
 5518364 5518365 BAV1264 BAV1265 hpaG' hpaG TRUE 0.998 -3.000 0.618 0.001 Y NA
 5518365 5518366 BAV1265 BAV1266 hpaG hpaE FALSE 0.452 51.000 0.000 0.070 N NA
 5518366 5518367 BAV1266 BAV1267 hpaE   TRUE 0.583 24.000 0.000 NA N NA
 5518367 5518368 BAV1267 BAV1268     TRUE 0.971 -3.000 0.000 NA Y NA
 5518368 5518369 BAV1268 BAV1269     FALSE 0.359 40.000 0.000 NA N NA
 5518369 5518370 BAV1269 BAV1270     FALSE 0.074 143.000 0.000 1.000 N NA
 5518370 5518371 BAV1270 BAV1271     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5518371 5518372 BAV1271 BAV1272     TRUE 0.933 -3.000 0.000 0.030 N NA
 5518372 5518373 BAV1272 BAV1273     TRUE 0.904 -10.000 0.000 0.060 N NA
 5518373 5518374 BAV1273 BAV1274     TRUE 0.971 -3.000 0.000 NA Y NA
 5518374 5518375 BAV1274 BAV1275     FALSE 0.032 200.000 0.000 NA   NA
 5518375 5518376 BAV1275 BAV1276     FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 5518377 5518378 BAV1277 BAV1277A     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5518379 5518380 BAV1278 BAV1279     TRUE 0.560 30.000 0.000 NA   NA
 5518380 5518381 BAV1279 BAV1280     FALSE 0.011 290.000 0.000 NA   NA
 5518381 5518382 BAV1280 BAV1281     TRUE 0.836 -48.000 0.000 NA   NA
 5518382 5518383 BAV1281 BAV1282     FALSE 0.538 32.000 0.000 NA   NA
 5518383 5518384 BAV1282 BAV1283     TRUE 0.876 -2.000 0.000 NA   NA
 5518384 5518385 BAV1283 BAV1284     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5518385 5518386 BAV1284 BAV1285     TRUE 0.868 1.000 0.000 NA   NA
 5518386 5518387 BAV1285 BAV1286     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518387 5518388 BAV1286 BAV1287     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518388 5518389 BAV1287 BAV1289     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 5518389 5518390 BAV1289 BAV1290     TRUE 0.864 3.000 0.000 NA   NA
 5518390 5518391 BAV1290 BAV1291     TRUE 0.973 1.000 0.167 NA   NA
 5518391 5518392 BAV1291 BAV1292     FALSE 0.166 112.000 0.000 NA   NA
 5518392 5518393 BAV1292 BAV1293     FALSE 0.199 101.000 0.000 NA   NA
 5518393 5518394 BAV1293 BAVt21   tRNA-Arg(TCT) FALSE 0.132 123.000 0.000 NA   NA
 5518394 5518395 BAVt21 BAV1294 tRNA-Arg(TCT)   FALSE 0.004 472.000 0.000 NA   NA
 5518395 5518396 BAV1294 BAV1295     FALSE 0.125 127.000 0.000 NA   NA
 5518396 5518397 BAV1295 BAV1296     FALSE 0.184 105.000 0.000 NA   NA
 5518397 5518398 BAV1296 BAV1297     TRUE 0.709 19.000 0.000 NA   NA
 5518398 5518399 BAV1297 BAV1298     TRUE 0.665 22.000 0.000 NA   NA
 5518399 5518400 BAV1298 BAV1299     TRUE 0.841 -16.000 0.000 NA   NA
 5518400 5518401 BAV1299 BAV1300     TRUE 0.585 28.000 0.000 NA   NA
 5518402 5518403 BAV1301 BAV1302     TRUE 0.771 15.000 0.000 NA   NA
 5518403 5518404 BAV1302 BAV1303     TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5518404 5518405 BAV1303 BAV1304     TRUE 0.966 -3.000 0.105 NA   NA
 5518405 5518406 BAV1304 BAV1305     TRUE 0.846 -13.000 0.000 NA   NA
 5518406 5518407 BAV1305 BAV1306     TRUE 0.846 -13.000 0.000 NA   NA
 5518407 5518408 BAV1306 BAV1307     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518408 5518409 BAV1307 BAV1308     FALSE 0.405 41.000 0.000 NA   NA
 5518409 5518410 BAV1308 BAV1309     TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 5518410 5518411 BAV1309 BAV1310     TRUE 0.724 18.000 0.000 NA   NA
 5518411 5518412 BAV1310 BAV1311     FALSE 0.324 54.000 0.000 NA   NA
 5518413 5518414 BAV1312 BAV1312A     TRUE 0.880 -16.000 0.022 NA   NA
 5518415 5518416 BAV1313 BAV1314     TRUE 0.885 -19.000 0.026 NA   NA
 5518416 5518417 BAV1314 BAV1315     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518417 5518418 BAV1315 BAV1316     TRUE 0.980 -55.000 0.333 NA   NA
 5518418 5518419 BAV1316 BAV1317     TRUE 0.965 -7.000 0.130 NA   NA
 5518419 5518420 BAV1317 BAV1318     TRUE 0.953 3.000 0.087 NA   NA
 5518420 5518421 BAV1318 BAV1319     TRUE 0.973 16.000 0.400 NA   NA
 5518421 5518422 BAV1319 BAV1320     TRUE 0.774 110.000 0.600 NA   NA
 5518422 5518423 BAV1320 BAV1321     TRUE 0.989 2.000 0.500 NA   NA
 5518423 5518424 BAV1321 BAV1322     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 5518424 5518425 BAV1322 BAV1323     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 5518425 5518426 BAV1323 BAV1324     TRUE 0.986 -19.000 0.500 NA   NA
 5518426 5518427 BAV1324 BAV1325     TRUE 0.966 9.000 0.154 NA   NA
 5518427 5518428 BAV1325 BAV1326     TRUE 0.826 60.000 0.385 NA   NA
 5518428 5518429 BAV1326 BAV1327     TRUE 0.992 12.000 1.000 NA   NA
 5518429 5518430 BAV1327 BAV1328     FALSE 0.368 45.000 0.000 NA   NA
 5518430 5518431 BAV1328 BAV1329     TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5518431 5518432 BAV1329 BAV1330     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518432 5518433 BAV1330 BAV1331     TRUE 0.848 -12.000 0.000 NA   NA
 5518433 5518434 BAV1331 BAV1332     TRUE 0.994 -10.000 1.000 NA   NA
 5518434 5518435 BAV1332 BAV1333     TRUE 0.992 -15.000 0.833 NA   NA
 5518435 5518436 BAV1333 BAV1334     TRUE 0.994 -3.000 0.833 NA   NA
 5518436 5518437 BAV1334 BAV1335     TRUE 0.994 -7.000 1.000 NA   NA
 5518437 5518438 BAV1335 BAV1336     TRUE 0.987 -3.000 0.364 NA   NA
 5518438 5518439 BAV1336 BAV1337     TRUE 0.864 3.000 0.000 NA   NA
 5518439 5518440 BAV1337 BAV1337A     TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5518440 5518441 BAV1337A BAV1337B     FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 5518441 5518442 BAV1337B BAV1338     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5518442 5518443 BAV1338 BAV1339A     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518444 5518445 BAV1340 BAV1341     FALSE 0.502 34.000 0.000 NA   NA
 5518445 5518446 BAV1341 BAV1342     FALSE 0.317 56.000 0.000 NA   NA
 5518446 5518447 BAV1342 BAVs02   ssrA FALSE 0.034 197.000 0.000 NA   NA
 5518447 5518448 BAVs02 BAV1343 ssrA   FALSE 0.359 47.000 0.000 NA   NA
 5518448 5518449 BAV1343 BAV1344   gph FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 5518449 5518450 BAV1344 BAV1345 gph pufX TRUE 0.984 -3.000 0.259 1.000   NA
 5518450 5518451 BAV1345 BAV1346 pufX ompA FALSE 0.467 75.000 0.071 1.000 N NA
 5518452 5518453 BAV1347 BAV1348 gyrA pdxF TRUE 0.926 8.000 0.067 1.000 N NA
 5518453 5518454 BAV1348 BAV1349 pdxF pheA TRUE 0.987 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 5518454 5518455 BAV1349 BAV1350 pheA hisC1 TRUE 0.959 20.000 0.098 1.000 Y NA
 5518455 5518456 BAV1350 BAV1351 hisC1 tyrA TRUE 0.992 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 5518456 5518457 BAV1351 BAV1352 tyrA aroA TRUE 0.986 0.000 0.100 1.000 Y NA
 5518457 5518458 BAV1352 BAV1353 aroA cmk TRUE 0.936 19.000 0.209 1.000 N NA
 5518458 5518459 BAV1353 BAV1354 cmk rpsA FALSE 0.111 259.000 0.281 1.000 N NA
 5518459 5518460 BAV1354 BAV1355 rpsA himD TRUE 0.980 3.000 0.292 1.000 N NA
 5518460 5518461 BAV1355 BAV1356 himD   FALSE 0.208 165.000 0.129 NA   NA
 5518461 5518462 BAV1356 BAV1357     TRUE 0.871 35.000 0.229 NA   NA
 5518462 5518463 BAV1357 BAV1358   hldE' TRUE 0.906 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5518463 5518464 BAV1358 BAV1359 hldE' hldD TRUE 0.995 -3.000 0.191 0.010 Y NA
 5518464 5518465 BAV1359 BAV1360 hldD   FALSE 0.193 104.000 0.000 1.000   NA
 5518465 5518466 BAV1360 BAV1361   cysM FALSE 0.290 64.000 0.000 1.000   NA
 5518468 5518469 BAV1363 BAV1364   etfB1 FALSE 0.444 71.000 0.065 NA N NA
 5518469 5518470 BAV1364 BAV1365 etfB1 etfA1 TRUE 0.998 3.000 0.600 0.015 Y NA
 5518470 5518471 BAV1365 BAV1366 etfA1 aspT FALSE 0.009 316.000 0.000 1.000   NA
 5518471 5518472 BAV1366 BAV1367 aspT   FALSE 0.349 50.000 0.000 1.000   NA
 5518472 5518473 BAV1367 BAV1368     FALSE 0.219 102.000 0.021 1.000 N NA
 5518473 5518474 BAV1368 BAV1369     FALSE 0.094 140.000 0.000 NA   NA
 5518474 5518475 BAV1369 BAV1370     FALSE 0.041 185.000 0.000 NA   NA
 5518475 5518476 BAV1370 BAV1371     FALSE 0.163 108.000 0.009 NA   NA
 5518478 5518479 BAV1373 BAV1374 rplS   FALSE 0.085 163.000 0.027 1.000   NA
 5518480 5518481 BAV1375 BAV1376 hyi engC TRUE 0.616 26.000 0.000 1.000   NA
 5518481 5518482 BAV1376 BAV1377 engC   TRUE 0.939 -3.000 0.046 1.000   NA
 5518485 5518486 BAV1380 BAV1381 paaA paaB TRUE 0.917 60.000 0.920 NA   NA
 5518486 5518487 BAV1381 BAV1382 paaB paaC TRUE 0.993 10.000 0.943 NA   NA
 5518487 5518488 BAV1382 BAV1383 paaC paaD TRUE 0.995 -3.000 0.919 NA   NA
 5518488 5518489 BAV1383 BAV1384 paaD paaE TRUE 0.986 12.000 0.571 NA   NA
 5518489 5518490 BAV1384 BAV1385 paaE paaZ TRUE 0.812 54.000 0.075 1.000 Y NA
 5518490 5518491 BAV1385 BAV1386 paaZ paaG TRUE 0.969 11.000 0.139 0.068 N NA
 5518491 5518492 BAV1386 BAV1387 paaG paaI TRUE 0.975 0.000 0.204 NA N NA
 5518492 5518493 BAV1387 BAV1388 paaI paaK FALSE 0.346 64.000 0.031 NA N NA
 5518494 5518495 BAV1389 BAV1390     FALSE 0.068 156.000 0.000 NA   NA
 5518498 5518499 BAV1393 BAV1394 thrS fit TRUE 0.857 72.000 0.186 1.000 Y NA
 5518499 5518500 BAV1394 BAV1395 fit gsh-II FALSE 0.211 156.000 0.003 1.000 Y NA
 5518500 5518501 BAV1395 BAV1396 gsh-II   TRUE 0.869 14.000 0.048 1.000 N NA
 5518501 5518502 BAV1396 BAV1397   phbH TRUE 0.920 85.000 0.261 0.001 Y NA
 5518502 5518503 BAV1397 BAV1398 phbH ptsI TRUE 0.976 29.000 0.205 0.001 Y NA
 5518505 5518506 BAV1400 BAV1401     TRUE 0.694 98.000 0.071 NA Y NA
 5518507 5518508 BAV1402 BAV1403 dnaS   FALSE 0.323 39.000 0.002 NA   NA
 5518508 5518509 BAV1403 BAV1404     TRUE 0.960 12.000 0.167 NA   NA
 5518510 5518511 BAV1405 BAV1406   pepE TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 5518514 5518515 BAV1409 BAV1410 coaBC lspA FALSE 0.394 49.000 0.024 1.000 N NA
 5518515 5518516 BAV1410 BAV1411 lspA ileS TRUE 0.939 3.000 0.071 1.000 N NA
 5518516 5518517 BAV1411 BAV1412 ileS ribF TRUE 0.976 -10.000 0.254 1.000 N NA
 5518518 5518519 BAV1413 BAV1414 purN   TRUE 0.684 40.000 0.099 NA N NA
 5518521 5518522 BAV1416 BAV1417   mutU TRUE 0.852 -3.000 0.010 1.000 N NA
 5518523 5518524 BAV1418 BAV1419     TRUE 0.868 -3.000 0.007 1.000   NA
 5518524 5518525 BAV1419 BAV1420   dapE TRUE 0.954 7.000 0.115 1.000 N NA
 5518525 5518526 BAV1420 BAV1421 dapE dapD TRUE 0.992 0.000 0.109 0.003 Y NA
 5518526 5518527 BAV1421 BAV1422 dapD dapC TRUE 0.961 24.000 0.149 1.000 Y NA
 5518529 5518530 BAV1423 BAV1423A     TRUE 0.837 -30.000 0.000 NA   NA
 5518530 5518531 BAV1423A BAV1423B     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518531 5518532 BAV1423B BAV1423C     FALSE 0.485 35.000 0.000 NA   NA
 5518532 5518533 BAV1423C BAV1424   recT FALSE 0.256 79.000 0.000 NA   NA
 5518533 5518534 BAV1424 BAV1425 recT   TRUE 0.970 -3.000 0.119 NA   NA
 5518534 5518535 BAV1425 BAV1426     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5518535 5518536 BAV1426 BAV1427     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518536 5518537 BAV1427 BAV1428     FALSE 0.271 70.000 0.000 NA   NA
 5518539 5518540 BAV1430 BAV1431     FALSE 0.333 52.000 0.000 NA   NA
 5518540 5518541 BAV1431 BAV1432     FALSE 0.538 32.000 0.000 NA   NA
 5518541 5518542 BAV1432 BAV1434     FALSE 0.005 428.000 0.000 NA   NA
 5518542 5518543 BAV1434 BAV1435     TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5518543 5518544 BAV1435 BAV1436     FALSE 0.016 259.000 0.000 NA   NA
 5518545 5518546 BAV1437 BAV1438     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5518550 5518551 BAV1442 BAV1442A     TRUE 0.816 12.000 0.000 NA   NA
 5518551 5518552 BAV1442A BAV1443     FALSE 0.153 115.000 0.000 NA   NA
 5518552 5518553 BAV1443 BAV1444     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518553 5518554 BAV1444 BAV1445     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518554 5518555 BAV1445 BAV1446     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518555 5518556 BAV1446 BAV1447     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518556 5518557 BAV1447 BAV1448     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5518559 5518560 BAV1450 BAV1451     TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5518560 5518561 BAV1451 BAV1452     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 5518563 5518564 BAV1454 BAV1454A     FALSE 0.313 57.000 0.000 NA   NA
 5518565 5518566 BAV1455 BAV1456     TRUE 0.981 -13.000 0.333 NA   NA
 5518567 10712363 BAV1457 BAV1458     TRUE 0.835 -185.000 0.000 NA   NA
 10712363 5518568 BAV1458 BAV1459     FALSE 0.023 233.000 0.000 NA   NA
 5518568 5518569 BAV1459 BAV1460     TRUE 0.980 1.000 0.240 NA   NA
 5518569 5518570 BAV1460 BAV1461     TRUE 0.972 2.000 0.160 NA   NA
 5518570 5518571 BAV1461 BAV1462     TRUE 0.988 -3.000 0.385 NA   NA
 5518571 5518572 BAV1462 BAV1463     TRUE 0.978 9.000 0.262 NA   NA
 5518572 5518573 BAV1463 BAV1464     TRUE 0.976 13.000 0.357 NA   NA
 5518573 5518574 BAV1464 BAV1465     TRUE 0.955 8.000 0.107 NA   NA
 5518574 5518575 BAV1465 BAV1466     TRUE 0.958 11.000 0.133 NA   NA
 5518575 5518576 BAV1466 BAV1467     TRUE 0.979 -3.000 0.200 NA   NA
 5518576 5518577 BAV1467 BAV1468     TRUE 0.946 -7.000 0.077 NA   NA
 5518577 5518578 BAV1468 BAV1469     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518578 5518579 BAV1469 BAV1470     FALSE 0.269 72.000 0.000 NA   NA
 5518579 5518580 BAV1470 BAV1471     TRUE 0.876 34.000 0.222 NA   NA
 5518580 5518581 BAV1471 BAV1472     TRUE 0.990 0.000 0.531 NA   NA
 5518581 5518582 BAV1472 BAV1473     TRUE 0.906 23.000 0.156 NA   NA
 5518582 5518583 BAV1473 BAV1474     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518583 5518584 BAV1474 BAV1475     TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5518584 5518585 BAV1475 BAV1476     TRUE 0.851 7.000 0.000 NA   NA
 5518585 5518586 BAV1476 BAV1477     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518586 5518587 BAV1477 BAV1478     TRUE 0.868 1.000 0.000 NA   NA
 5518587 5518588 BAV1478 BAV1479     TRUE 0.857 5.000 0.000 NA   NA
 5518588 5518589 BAV1479 BAV1480     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 5518593 5518594 BAV1483 BAV1484     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 5518595 5518596 BAV1485 BAV1486     FALSE 0.037 191.000 0.000 NA   NA
 5518596 5518597 BAV1486 BAV1487     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518599 5518600 BAV1489 BAV1490     FALSE 0.004 467.000 0.000 NA   NA
 5518601 5518602 BAV1491 BAV1492   cspA1 FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5518602 5518603 BAV1492 BAV1493 cspA1   FALSE 0.013 278.000 0.000 1.000   NA
 5518603 5518604 BAV1493 BAV1494   cspA2 FALSE 0.017 256.000 0.000 1.000   NA
 5518606 5518607 BAV1496 BAV1497 tig clpP TRUE 0.994 3.000 0.351 1.000 Y NA
 5518607 5518608 BAV1497 BAV1498 clpP clpX TRUE 0.859 104.000 0.352 1.000 Y NA
 5518608 5518609 BAV1498 BAV1499 clpX capR FALSE 0.540 175.000 0.201 0.091 Y NA
 5518612 5518613 BAV1502 BAV1503 sotB exra FALSE 0.003 446.000 0.000 NA N NA
 5518613 5518614 BAV1503 BAV1504 exra tyrB FALSE 0.009 301.000 0.013 1.000 N NA
 5518615 5518616 BAV1505 BAV1506 uvrB ptpA FALSE 0.011 250.000 0.006 1.000 N NA
 5518616 5518617 BAV1506 BAV1507 ptpA   FALSE 0.052 190.000 0.032 1.000 N NA
 5518617 5518618 BAV1507 BAV1508   iscS TRUE 0.906 22.000 0.160 1.000 N NA
 5518618 5518619 BAV1508 BAV1509 iscS iscU TRUE 0.907 37.000 0.448 1.000 N NA
 5518619 5518620 BAV1509 BAV1510 iscU iscA TRUE 0.992 2.000 0.359 0.001   NA
 5518620 5518621 BAV1510 BAV1511 iscA hscB TRUE 0.989 4.000 0.500 1.000   NA
 5518621 5518622 BAV1511 BAV1512 hscB hscA TRUE 0.997 0.000 0.634 1.000 Y NA
 5518622 5518623 BAV1512 BAV1513 hscA fdx TRUE 0.991 9.000 0.794 1.000 N NA
 5518623 5518624 BAV1513 BAV1514 fdx   TRUE 0.992 0.000 0.625 1.000   NA
 5518624 5518625 BAV1514 BAV1515   mgsA FALSE 0.141 115.000 0.009 1.000   NA
 5518626 5518627 BAV1516 BAV1517   asuD TRUE 0.785 14.000 0.000 NA   NA
 5518627 5518628 BAV1517 BAV1518 asuD   TRUE 0.857 7.000 0.012 1.000   NA
 5518628 5518629 BAV1518 BAV1519   prfB FALSE 0.326 51.000 0.010 1.000   NA
 5518629 5518630 BAV1519 BAV1520 prfB recJ FALSE 0.219 107.000 0.028 1.000 N NA
 5518630 5518631 BAV1520 BAV1521 recJ   TRUE 0.770 -18.000 0.002 NA   NA
 5518632 5518633 BAV1522 BAV1523 lolE lolD TRUE 0.990 -7.000 0.620 1.000 N NA
 5518633 5518634 BAV1523 BAV1524 lolD   TRUE 0.931 3.000 0.061 NA N NA
 5518634 5518635 BAV1524 BAV1525     FALSE 0.094 140.000 0.000 NA   NA
 5518635 5518636 BAV1525 BAV1526     FALSE 0.529 33.000 0.000 1.000   NA
 5518637 5518638 BAV1527 BAV1528     TRUE 0.735 43.000 0.148 1.000 N NA
 5518638 5518639 BAV1528 BAV1529     TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 5518639 5518640 BAV1529 BAV1530     TRUE 0.934 36.000 0.571 NA   NA
 5518640 5518641 BAV1530 BAV1531   maiA1 TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 5518642 5518643 BAV1532 BAV1533   iorA TRUE 0.920 88.000 0.360 0.050 Y NA
 5518643 5518644 BAV1533 BAV1534 iorA   TRUE 0.994 -3.000 0.160 0.015 Y NA
 5518644 5518645 BAV1534 BAV1535     FALSE 0.257 61.000 0.000 1.000 N NA
 5518646 5518647 BAV1536 BAV1537     FALSE 0.086 270.000 0.000 0.058 Y NA
 5518648 5518649 BAV1538 BAV1539     TRUE 0.757 16.000 0.000 NA   NA
 5518649 5518650 BAV1539 BAV1540     FALSE 0.125 127.000 0.000 NA   NA
 5518650 5518651 BAV1540 BAV1541     FALSE 0.013 278.000 0.000 1.000   NA
 5518653 5518654 BAV1543 BAV1544     FALSE 0.477 33.000 0.007 NA   NA
 5518654 5518655 BAV1544 BAV1545   greB FALSE 0.496 50.000 0.007 0.038   NA
 5518655 5518656 BAV1545 BAV1546 greB purL FALSE 0.004 391.000 0.000 1.000 N NA
 5518658 5518659 BAV1549 BAV1550     FALSE 0.292 62.000 0.000 NA   NA
 5518659 5518660 BAV1550 BAV1551     FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 5518660 5518661 BAV1551 BAV1552     FALSE 0.234 89.000 0.000 1.000   NA
 5518661 5518662 BAV1552 BAV1553     TRUE 0.866 12.000 0.025 NA   NA
 5518663 5518664 BAV1554 BAV1555     TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5518664 5518665 BAV1555 BAV1556     FALSE 0.222 92.000 0.000 NA   NA
 5518665 5518666 BAV1556 BAV1557     TRUE 0.984 -3.000 0.278 NA   NA
 5518666 5518667 BAV1557 BAV1558     TRUE 0.966 0.000 0.118 NA   NA
 5518667 5518668 BAV1558 BAV1559     TRUE 0.982 0.000 0.294 1.000 N NA
 5518668 5518669 BAV1559 BAV1560     TRUE 0.982 34.000 0.750 1.000 Y NA
 5518669 5518670 BAV1560 BAV1561     TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.003 Y NA
 5518670 5518671 BAV1561 BAV1562     TRUE 0.997 -3.000 0.636 1.000 Y NA
 5518671 5518672 BAV1562 BAV1563     TRUE 0.998 -3.000 0.818 0.057 Y NA
 5518672 5518673 BAV1563 BAV1564     TRUE 0.992 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 5518673 5518674 BAV1564 BAV1565     TRUE 0.983 11.000 0.471 1.000 N NA
 5518674 5518675 BAV1565 BAV1566     FALSE 0.020 239.000 0.000 NA   NA
 5518676 5518677 BAV1567 BAV1568 guaB guaA TRUE 0.889 95.000 0.190 0.001 Y NA
 5518677 5518678 BAV1568 BAV1569 guaA   FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 5518681 5518682 BAV1574 BAV1575   cutS FALSE 0.027 271.000 0.000 0.050   NA
 5518682 5518683 BAV1575 BAV1576 cutS cutM TRUE 0.997 -3.000 0.429 0.002 Y NA
 5518683 5518684 BAV1576 BAV1577 cutM cutL TRUE 0.998 -3.000 0.632 0.002 Y NA
 5518684 5518685 BAV1577 BAV1578 cutL   FALSE 0.045 168.000 0.000 1.000 N NA
 5518685 5518686 BAV1578 BAV1579     TRUE 0.946 38.000 0.283 NA Y NA
 5518686 5518687 BAV1579 BAV1580     TRUE 0.629 67.000 0.000 NA Y NA
 5518688 5518689 BAV1581 BAV1582     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518689 5518690 BAV1582 BAV1583     TRUE 0.866 40.000 0.312 1.000   NA
 5518690 5518691 BAV1583 BAV1584     TRUE 0.944 50.000 0.714 0.001 N NA
 5518693 5518694 BAV1586 BAV1587     FALSE 0.292 62.000 0.000 NA   NA
 5518696 5518697 BAV1589 BAV1590     FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 5518697 5518698 BAV1590 BAV1591     TRUE 0.947 0.000 0.017 0.012   NA
 5518698 5518699 BAV1591 BAV1592   cho TRUE 0.946 -3.000 0.000 0.012   NA
 5518700 5518701 BAV1593 BAV1594   metE FALSE 0.078 181.000 0.037 1.000   NA
 5518701 5518702 BAV1594 BAV1595 metE   TRUE 0.975 24.000 0.775 NA   NA
 5518702 5518703 BAV1595 BAV1596     FALSE 0.006 362.000 0.000 NA   NA
 5518703 5518704 BAV1596 BAV1597     FALSE 0.229 91.000 0.000 1.000   NA
 5518704 5518705 BAV1597 BAV1598   folE FALSE 0.013 277.000 0.000 1.000   NA
 5518705 5518706 BAV1598 BAV1599 folE   FALSE 0.435 39.000 0.000 1.000   NA
 5518707 5518708 BAV1600 BAV1601   pdxK TRUE 0.571 29.000 0.000 NA   NA
 5518711 5518712 BAV1605 BAV1606     FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 5518712 5518713 BAV1606 BAV1607     TRUE 0.980 -3.000 0.200 1.000   NA
 5518713 5518714 BAV1607 BAV1608     FALSE 0.037 190.000 0.000 NA   NA
 5518714 5518715 BAV1608 BAV1609     TRUE 0.902 70.000 1.000 NA N NA
 5518716 5518717 BAV1610 BAV1611 lysP   FALSE 0.012 263.000 0.000 NA N NA
 5518717 5518718 BAV1611 BAV1612     FALSE 0.004 510.000 0.000 NA   NA
 5518719 5518720 BAV1613 BAV1614     FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 5518722 5518723 BAV1616 BAV1617     FALSE 0.398 79.000 0.000 0.066   NA
 5518725 5518726 BAV1619 BAV1620   aroG1 FALSE 0.290 64.000 0.000 1.000   NA
 5518726 5518727 BAV1620 BAV1621 aroG1   TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5518727 5518728 BAV1621 BAV1622   gor TRUE 0.585 28.000 0.000 NA   NA
 5518728 5518729 BAV1622 BAV1623 gor   FALSE 0.122 117.000 0.000 1.000 N NA
 5518732 5518733 BAV1626 BAV1627 pckG   TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5518733 5518734 BAV1627 BAV1628     TRUE 0.846 -3.000 0.005 NA   NA
 5518734 5518735 BAV1628 BAV1629     TRUE 0.850 -10.000 0.000 NA   NA
 5518735 5518736 BAV1629 BAV1630     FALSE 0.054 168.000 0.000 NA   NA
 5518737 5518738 BAVt23 BAV1631 tRNA-Ala(CGC) xthA FALSE 0.324 54.000 0.000 NA   NA
 5518738 5518739 BAV1631 BAV1632 xthA cadA FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000 N NA
 5518740 5518741 BAV1633 BAV1634 cadR   FALSE 0.082 131.000 0.008 1.000 N NA
 5518743 5518744 BAV1636 BAV1637   nadE FALSE 0.462 37.000 0.017 1.000 N NA
 5518744 5518745 BAV1637 BAV1638 nadE glnB TRUE 0.875 36.000 0.288 1.000 N NA
 5518746 10712364 BAV1640 BAV1639     TRUE 0.833 -699.000 0.000 NA   NA
 10712364 5518747 BAV1639 BAV1641   sphB1 FALSE 0.002 2594.000 0.000 NA   NA
 5518747 5518748 BAV1641 BAV1642 sphB1   FALSE 0.007 356.000 0.000 1.000   NA
 5518749 5518750 BAV1643 BAV1644 ggt   TRUE 0.899 34.000 0.073 1.000 Y NA
 5518750 5518751 BAV1644 BAV1645     TRUE 0.839 70.000 0.088 0.057 Y NA
 5518751 5518752 BAV1645 BAV1646     TRUE 0.998 -3.000 0.762 0.057 Y NA
 5518752 5518753 BAV1646 BAV1647     TRUE 0.873 19.000 0.071 1.000   NA
 5518759 5518760 BAV1653 BAV1654 acrA acrB TRUE 0.953 13.000 0.174 1.000 N NA
 5518760 5518761 BAV1654 BAV1655 acrB   TRUE 0.990 0.000 0.375 0.057 N NA
 5518761 5518762 BAV1655 BAV1656     FALSE 0.149 190.000 0.000 1.000 Y NA
 5518763 5518764 BAV1657 BAV1658     TRUE 0.792 37.000 0.125 1.000   NA
 5518764 5518765 BAV1658 BAV1659   opdA FALSE 0.008 335.000 0.000 1.000   NA
 5518765 5518766 BAV1659 BAV1660 opdA folD FALSE 0.473 139.000 0.318 1.000 N NA
 5518766 5518767 BAV1660 BAV1661 folD   TRUE 0.988 -3.000 0.404 1.000 N NA
 5518767 5518768 BAV1661 BAV1662     TRUE 0.998 -3.000 0.632 0.015 Y NA
 5518769 5518770 BAV1663 BAV1664 aceE aceF TRUE 0.960 18.000 0.075 1.000 Y NA
 5518770 5518771 BAV1664 BAV1665 aceF lpd TRUE 0.990 16.000 0.463 1.000 Y NA
 5518771 5518772 BAV1665 BAV1666 lpd   FALSE 0.054 158.000 0.000 1.000 N NA
 5518772 5518773 BAV1666 BAV1667     FALSE 0.522 33.000 0.000 NA   NA
 5518774 5518775 BAV1668 BAV1669 fliC flaD FALSE 0.037 182.000 0.012 1.000 N NA
 5518776 5518777 BAV1670 BAV1671 flbB flaI TRUE 0.984 29.000 1.000 0.001   NA
 5518777 5518778 BAV1671 BAV1672 flaI motA FALSE 0.162 153.000 0.061 1.000   NA
 5518778 5518779 BAV1672 BAV1673 motA motB TRUE 0.968 19.000 0.122 1.000 Y NA
 5518779 5518780 BAV1673 BAV1674 motB cheY TRUE 0.964 -25.000 0.176 1.000 N NA
 5518780 5518781 BAV1674 BAV1675 cheY cheA TRUE 0.945 33.000 0.176 1.000 Y NA
 5518781 5518782 BAV1675 BAV1676 cheA cheW TRUE 0.987 14.000 0.128 0.004 Y NA
 5518782 5518783 BAV1676 BAV1677 cheW   TRUE 0.773 58.000 0.000 0.008 Y NA
 5518783 5518784 BAV1677 BAV1678   cheR TRUE 0.962 8.000 0.000 1.000 Y NA
 5518784 5518785 BAV1678 BAV1679 cheR cheB TRUE 0.947 17.000 0.037 1.000 Y NA
 5518785 5518786 BAV1679 BAV1680 cheB cheY TRUE 0.928 45.000 0.150 0.012 Y NA
 5518786 5518787 BAV1680 BAV1681 cheY cheZ TRUE 0.996 9.000 0.741 1.000 Y NA
 5518787 5518788 BAV1681 BAV1682 cheZ flhB FALSE 0.239 158.000 0.012 1.000 Y NA
 5518788 5518789 BAV1682 BAV1683 flhB flhA TRUE 0.995 4.000 0.287 0.008 Y NA
 5518789 5518790 BAV1683 BAV1684 flhA flhF TRUE 0.984 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 5518791 5518792 BAV1685 BAV1686 flgN flgM TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 5518792 5518793 BAV1686 BAV1687 flgM flgA TRUE 0.775 127.000 0.330 NA Y NA
 5518794 5518795 BAV1688 BAV1689 flbA flaW TRUE 0.996 21.000 1.000 0.003 Y NA
 5518795 5518796 BAV1689 BAV1690 flaW flaV TRUE 0.964 12.000 0.035 NA Y NA
 5518796 5518797 BAV1690 BAV1691 flaV flaK TRUE 0.672 81.000 0.035 NA Y NA
 5518797 5518798 BAV1691 BAV1692 flaK flaX TRUE 0.995 17.000 0.600 0.003 Y NA
 5518798 5518799 BAV1692 BAV1693 flaX flaL TRUE 0.920 47.000 0.119 0.003 Y NA
 5518799 5518800 BAV1693 BAV1694 flaL flaY TRUE 0.997 -3.000 0.463 0.006 Y NA
 5518800 5518801 BAV1694 BAV1695 flaY flaM TRUE 0.984 5.000 0.037 0.007 Y NA
 5518801 5518802 BAV1695 BAV1696 flaM flaZ TRUE 0.983 0.000 0.018 0.007 Y NA
 5518802 5518803 BAV1696 BAV1697 flaZ flaS TRUE 0.966 76.000 0.705 0.003 Y NA
 5518803 5518804 BAV1697 BAV1698 flaS flaT TRUE 0.985 17.000 0.142 0.002 Y NA
 5518804 5518805 BAV1698 BAV1699 flaT   TRUE 0.600 81.000 0.000 1.000 Y NA
 5518805 5518806 BAV1699 BAV1700     TRUE 0.654 105.000 0.000 0.002 Y NA
 5518806 5518807 BAV1700 BAV1701     FALSE 0.538 32.000 0.000 NA   NA
 5518807 5518808 BAV1701 BAV1702     FALSE 0.166 112.000 0.000 NA   NA
 5518808 5518809 BAV1702 BAV1703     TRUE 0.640 105.000 0.000 0.004 Y NA
 5518810 5518811 BAV1704 BAV1705 flaP flaQ TRUE 0.992 6.000 0.125 0.002 Y NA
 5518811 5518812 BAV1705 BAV1706 flaQ flaR TRUE 0.996 18.000 0.827 0.008 Y NA
 5518812 5518813 BAV1706 BAV1707 flaR flaP TRUE 0.989 10.000 0.203 1.000 Y NA
 5518813 5518814 BAV1707 BAV1708 flaP flaN TRUE 0.995 7.000 0.443 1.000 Y NA
 5518814 5518815 BAV1708 BAV1709 flaN CheC2 TRUE 0.998 -7.000 0.741 0.001 Y NA
 5518815 5518816 BAV1709 BAV1710 CheC2 cheC1 TRUE 0.984 3.000 0.018 0.001 Y NA
 5518816 5518817 BAV1710 BAV1711 cheC1 flaE FALSE 0.348 140.000 0.019 1.000 Y NA
 5518817 5518818 BAV1711 BAV1712 flaE flaO TRUE 0.991 17.000 0.317 0.006 Y NA
 5518818 5518819 BAV1712 BAV1713 flaO flaC TRUE 0.981 -7.000 0.070 1.000 Y NA
 5518819 5518820 BAV1713 BAV1714 flaC fliH TRUE 0.989 -3.000 0.115 1.000 Y NA
 5518820 5518821 BAV1714 BAV1715 fliH fliG TRUE 0.996 -7.000 0.320 0.004 Y NA
 5518821 5518822 BAV1715 BAV1716 fliG fliF TRUE 0.994 -10.000 0.220 0.006 Y NA
 5518824 5518825 BAV1718 BAV1719     TRUE 0.890 8.000 0.025 NA   NA
 5518825 5518826 BAV1719 BAV1720     TRUE 0.979 9.000 0.279 1.000   NA
 5518826 5518827 BAV1720 BAV1721   fliT TRUE 0.945 4.000 0.070 1.000   NA
 5518827 5518828 BAV1721 BAV1722 fliT fliS TRUE 0.550 42.000 0.041 1.000   NA
 5518828 5518829 BAV1722 BAV1723 fliS flaV TRUE 0.976 14.000 0.041 0.003 Y NA
 5518829 5518830 BAV1723 BAV1724 flaV flaG FALSE 0.102 134.000 0.011 NA   NA
 5518831 5518832 BAV1725 BAV1726 dedC dedD FALSE 0.432 108.000 0.100 NA   NA
 5518832 5518833 BAV1726 BAV1727 dedD cvpA TRUE 0.950 -3.000 0.066 NA   NA
 5518833 5518834 BAV1727 BAV1728 cvpA purF TRUE 0.833 43.000 0.262 1.000   NA
 5518837 5518838 BAV1731 BAV1732 dsbB glnD FALSE 0.194 171.000 0.000 1.000 Y NA
 5518838 5518839 BAV1732 BAV1733 glnD map TRUE 0.973 25.000 0.817 1.000 N NA
 5518840 5518841 BAV1734 BAV1735 rpsB tsf TRUE 0.809 152.000 0.748 1.000 Y NA
 5518841 5518842 BAV1735 BAV1736 tsf pyrH FALSE 0.060 195.000 0.047 1.000 N NA
 5518842 5518843 BAV1736 BAV1737 pyrH frr TRUE 0.891 13.000 0.058 1.000 N NA
 5518843 5518844 BAV1737 BAV1738 frr rth FALSE 0.251 203.000 0.409 1.000 N NA
 5518844 5518845 BAV1738 BAV1739 rth cdsA TRUE 0.972 32.000 0.400 1.000 Y NA
 5518845 5518846 BAV1739 BAV1740 cdsA dxr TRUE 0.995 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 5518846 5518847 BAV1740 BAV1741 dxr ecfE TRUE 0.836 76.000 0.568 1.000 N NA
 5518847 5518848 BAV1741 BAV1742 ecfE   TRUE 0.895 53.000 0.204 1.000 Y NA
 5518848 5518849 BAV1742 BAV1743   ompH FALSE 0.530 185.000 0.354 1.000 Y NA
 5518849 5518850 BAV1743 BAV1744 ompH firA TRUE 0.997 7.000 0.814 1.000 Y NA
 5518850 5518851 BAV1744 BAV1745 firA fabZ TRUE 0.873 81.000 0.796 1.000 N NA
 5518851 5518852 BAV1745 BAV1746 fabZ lpxA TRUE 0.993 1.000 0.850 1.000 N NA
 5518852 5518853 BAV1746 BAV1747 lpxA lpxB TRUE 0.994 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 5518853 5518854 BAV1747 BAV1748 lpxB rnhB TRUE 0.967 -13.000 0.186 1.000 N NA
 5518854 5518855 BAV1748 BAV1749 rnhB   TRUE 0.962 -3.000 0.046 0.015 N NA
 5518855 5518856 BAV1749 BAV1749A     TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5518858 5518859 BAV1751 BAV1752 ppsA   FALSE 0.034 247.000 0.048 NA N NA
 5518859 5518860 BAV1752 BAV1753     TRUE 0.908 34.000 0.091 NA Y NA
 5518860 5518861 BAV1753 BAV1754     TRUE 0.622 34.000 0.042 1.000 N NA
 5518863 5518864 BAV1756 BAV1757     TRUE 0.933 -10.000 0.063 NA   NA
 5518864 5518865 BAV1757 BAV1758     FALSE 0.045 193.000 0.019 NA   NA
 5518865 5518866 BAV1758 BAV1759     TRUE 0.982 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 5518866 5518867 BAV1759 BAV1760   mmsB TRUE 0.956 58.000 0.687 1.000 Y NA
 5518867 5518868 BAV1760 BAV1761 mmsB   FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 5518870 5518871 BAV1763 BAV1764   tmk TRUE 0.980 -3.000 0.209 NA   NA
 5518871 5518872 BAV1764 BAV1765 tmk holB TRUE 0.979 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5518872 5518873 BAV1765 BAV1766 holB   TRUE 0.943 27.000 0.110 NA Y NA
 5518873 5518874 BAV1766 BAV1767     TRUE 0.566 42.000 0.046 NA   NA
 5518877 5518878 BAV1771 BAV1772 fabF   TRUE 0.787 17.000 0.020 NA   NA
 5518878 5518879 BAV1772 BAV1773     FALSE 0.193 103.000 0.000 NA   NA
 5518879 5518880 BAV1773 BAV1774   lpfC TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5518880 5518881 BAV1774 BAV1775 lpfC lpfB TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5518881 5518882 BAV1775 BAV1776 lpfB   TRUE 0.899 22.000 0.000 1.000 Y NA
 5518882 5518883 BAV1776 BAV1777     FALSE 0.522 128.000 0.000 0.004 Y NA
 5518883 5518884 BAV1777 BAV1778     TRUE 0.775 39.000 0.133 NA   NA
 5518884 5518885 BAV1778 BAV1779     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5518885 5518886 BAV1779 BAV1780   rcsC FALSE 0.279 101.000 0.000 0.094 N NA
 5518886 5518887 BAV1780 BAV1781 rcsC   FALSE 0.013 333.000 0.000 0.075 N NA
 5518888 5518889 BAV1782 BAV1783 nagI nagK TRUE 0.876 56.000 0.167 1.000 Y NA
 5518889 5518890 BAV1783 BAV1784 nagK nagL TRUE 0.986 -3.000 0.360 1.000 N NA
 5518890 5518891 BAV1784 BAV1785 nagL   TRUE 0.757 16.000 0.000 NA   NA
 5518891 5518892 BAV1785 BAV1786   nagM TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5518892 5518893 BAV1786 BAV1787 nagM   FALSE 0.207 100.000 0.000 1.000   NA
 5518893 5518894 BAV1787 BAV1788     FALSE 0.317 56.000 0.000 NA   NA
 5518895 5518896 BAV1789 BAV1790     FALSE 0.175 108.000 0.000 NA   NA
 5518897 5518898 BAV1791 BAV1792   ppiC FALSE 0.263 78.000 0.000 1.000   NA
 5518899 5518900 BAV1793 BAV1794     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518900 5518901 BAV1794 BAV1795     TRUE 0.757 16.000 0.000 NA   NA
 5518902 5518903 BAV1796 BAV1797 slyX   TRUE 0.771 15.000 0.000 NA   NA
 5518903 5518904 BAV1797 BAV1798     FALSE 0.081 148.000 0.000 NA   NA
 5518904 5518905 BAV1798 BAV1799     FALSE 0.035 194.000 0.000 NA   NA
 5518905 5518906 BAV1799 BAV1800     FALSE 0.104 127.000 0.000 1.000 N NA
 5518909 5518910 BAV1803 BAV1804 plcN2   FALSE 0.022 234.000 0.000 NA   NA
 5518911 5518912 BAV1805 BAV1806 adhB   TRUE 0.980 -7.000 0.139 0.007   NA
 5518912 5518913 BAV1806 BAV1807     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5518913 5518914 BAV1807 BAV1808   mgtC FALSE 0.039 187.000 0.000 NA   NA
 5518914 5518915 BAV1808 BAV1809 mgtC   FALSE 0.355 49.000 0.000 1.000   NA
 5518916 5518917 BAV1810 BAV1810A     FALSE 0.415 40.000 0.000 NA   NA
 5518917 5518918 BAV1810A BAV1811     FALSE 0.313 57.000 0.000 NA   NA
 5518919 5518920 BAV1812 BAV1813     TRUE 0.987 -3.000 0.259 0.094 N NA
 5518920 5518921 BAV1813 BAV1814     TRUE 0.982 0.000 0.171 0.094   NA
 5518921 5518922 BAV1814 BAV1815     TRUE 0.993 4.000 0.500 0.004   NA
 5518922 5518923 BAV1815 BAV1816     FALSE 0.445 38.000 0.000 NA   NA
 5518923 5518924 BAV1816 BAV1817     FALSE 0.021 237.000 0.000 NA   NA
 5518926 5518927 BAV1819 BAV1820     FALSE 0.003 661.000 0.000 NA   NA
 5518927 5518928 BAV1820 BAV1821     FALSE 0.193 103.000 0.000 NA   NA
 5518929 5518930 BAV1822 BAV1823   kgtP FALSE 0.172 100.000 0.000 1.000 N NA
 5518934 5518935 BAV1827 BAV1828   arsC FALSE 0.233 86.000 0.000 NA   NA
 5518935 5518936 BAV1828 BAV1829 arsC   TRUE 0.698 38.000 0.073 1.000   NA
 5518939 5518940 BAV1832 BAV1833     FALSE 0.199 101.000 0.000 NA   NA
 5518940 5518941 BAV1833 BAV1834     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5518941 5518942 BAV1834 BAV1835     TRUE 0.626 40.000 0.059 NA   NA
 5518943 5518944 BAV1836 BAV1837 gdhA   FALSE 0.021 425.000 0.000 1.000 Y NA
 5518945 5518946 BAV1838 BAV1839     FALSE 0.269 72.000 0.000 NA   NA
 5518947 5518948 BAV1840 BAV1841   cysA TRUE 0.815 28.000 0.086 NA   NA
 5518950 5518951 BAV1843 BAV1844 ssuE   FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 5518951 5518952 BAV1844 BAV1845     TRUE 0.971 -3.000 0.000 NA Y NA
 5518952 5518953 BAV1845 BAV1846     TRUE 0.963 6.000 0.000 NA Y NA
 5518953 5518954 BAV1846 BAV1847     TRUE 0.785 14.000 0.000 NA   NA
 5518954 5518955 BAV1847 BAV1848     TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5518955 5518956 BAV1848 BAV1849     TRUE 0.995 -3.000 0.250 0.056 Y NA
 5518956 5518957 BAV1849 BAV1850     TRUE 0.996 10.000 0.417 0.056 Y NA
 5518958 5518959 BAV1851 BAV1852     TRUE 0.789 15.000 0.014 NA   NA
 5518960 5518961 BAV1853 BAV1854 bfeB bfeA TRUE 0.959 0.000 0.097 NA   NA
 5518963 5518964 BAV1856 BAV1857     TRUE 0.649 23.000 0.000 NA   NA
 5518964 5518965 BAV1857 BAV1858     TRUE 0.841 -16.000 0.000 NA   NA
 5518966 5518967 BAV1859 BAV1860   icd FALSE 0.010 303.000 0.000 NA   NA
 5518967 5518968 BAV1860 BAV1861 icd   FALSE 0.013 271.000 0.000 NA   NA
 5518968 5518969 BAV1861 BAV1862     TRUE 0.849 8.000 0.000 NA   NA
 5518969 5518970 BAV1862 BAV1863     FALSE 0.003 561.000 0.000 NA   NA
 5518970 5518971 BAV1863 BAV1864     FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 5518972 5518973 BAV1865 BAV1866     TRUE 0.993 8.000 0.364 1.000 Y NA
 5518973 5518974 BAV1866 BAV1867     TRUE 0.987 25.000 0.461 0.056 Y NA
 5518976 5518977 BAV1869 BAV1870     FALSE 0.297 61.000 0.000 NA   NA
 5518980 5518981 BAV1873 BAV1874     FALSE 0.011 291.000 0.000 NA   NA
 5518981 5518982 BAV1874 BAV1875   bvgA FALSE 0.035 427.000 0.000 0.012 Y NA
 5518982 5518983 BAV1875 BAV1876 bvgA bvgS TRUE 0.998 4.000 0.667 0.012 Y NA
 5518983 5518984 BAV1876 BAV1877 bvgS   TRUE 0.834 -272.000 0.000 NA   NA
 5518984 5518985 BAV1877 BAV1878     FALSE 0.180 106.000 0.000 NA   NA
 5518985 5518986 BAV1878 BAV1879     FALSE 0.014 254.000 0.000 NA N NA
 5518986 5518987 BAV1879 BAV1880   ilvG FALSE 0.057 156.000 0.000 1.000 N NA
 5518987 5518988 BAV1880 BAV1881 ilvG   FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5518988 5518989 BAV1881 BAV1882   psd FALSE 0.296 77.000 0.017 NA   NA
 5518989 5518990 BAV1882 BAV1883 psd lctD FALSE 0.034 184.000 0.011 1.000 N NA
 5518991 5518992 BAV1884 BAV1885     FALSE 0.181 94.000 0.000 NA N NA
 5518992 5518993 BAV1885 BAV1886   hslR TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5518994 5518995 BAV1887 BAV1888     TRUE 0.812 6.000 0.005 NA   NA
 5518995 5518996 BAV1888 BAV1889   gst FALSE 0.227 92.000 0.000 1.000   NA
 5518996 5518997 BAV1889 BAV1890 gst   FALSE 0.014 255.000 0.000 1.000 N NA
 5518998 5518999 BAV1891 BAV1892 livF livG TRUE 0.998 1.000 0.967 0.028 Y NA
 5518999 5519000 BAV1892 BAV1893 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5519000 5519001 BAV1893 BAV1894 livM livH TRUE 0.997 0.000 0.574 0.055 Y NA
 5519001 5519002 BAV1894 BAV1895 livH livJ1 TRUE 0.827 104.000 0.250 1.000 Y NA
 5519002 5519003 BAV1895 BAV1896 livJ1   FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5519003 5519004 BAV1896 BAV1897     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519004 5519005 BAV1897 BAV1898   proC TRUE 0.883 -3.000 0.012 NA   NA
 5519006 5519007 BAV1899 BAV1900 ugpB ugpA TRUE 0.558 259.000 0.793 0.055 Y NA
 5519007 5519008 BAV1900 BAV1901 ugpA ugpE TRUE 0.987 28.000 0.559 0.055 Y NA
 5519008 5519009 BAV1901 BAV1902 ugpE ugpC TRUE 0.963 47.000 0.464 0.055 Y NA
 5519012 5519013 BAV1905 BAV1906 dps   FALSE 0.277 67.000 0.000 NA   NA
 5519013 5519014 BAV1906 BAV1907   betA TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519014 5519015 BAV1907 BAV1908 betA betB TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5519015 5519016 BAV1908 BAV1909 betB   TRUE 0.743 14.000 0.000 NA N NA
 5519016 5519017 BAV1909 BAV1910     TRUE 0.981 27.000 0.500 NA Y NA
 5519017 5519018 BAV1910 BAV1911     TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5519018 5519019 BAV1911 BAV1912     TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA N NA
 5519019 5519020 BAV1912 BAV1913     FALSE 0.359 40.000 0.000 NA N NA
 5519020 5519021 BAV1913 BAV1914     TRUE 0.864 3.000 0.000 NA   NA
 5519021 5519022 BAV1914 BAV1915     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 5519026 5519027 BAV1919 BAV1920 oxyR recG TRUE 0.846 56.000 0.117 1.000 Y NA
 5519027 5519028 BAV1920 BAV1921 recG   TRUE 0.919 12.000 0.076 NA N NA
 5519028 5519029 BAV1921 BAV1922   fpr FALSE 0.003 593.000 0.000 NA N NA
 5519030 5519031 BAV1923 BAV1924     TRUE 0.648 106.000 0.026 0.055 Y NA
 5519031 5519032 BAV1924 BAV1925     TRUE 0.873 5.000 0.021 1.000 N NA
 5519033 5519034 BAV1926 BAV1927     TRUE 0.708 38.000 0.081 NA   NA
 5519036 5519037 BAV1929 BAV1930 glnG glnL TRUE 0.997 0.000 0.587 0.074 Y NA
 5519037 5519038 BAV1930 BAV1931 glnL glnA FALSE 0.350 94.000 0.053 1.000 N NA
 5519038 5519039 BAV1931 BAV1932 glnA hemN FALSE 0.058 182.000 0.002 0.035 N NA
 5519039 5519040 BAV1932 BAV1933 hemN   TRUE 0.968 11.000 0.218 1.000 N NA
 5519042 5519043 BAV1935 BAV1936   rph FALSE 0.011 271.000 0.000 1.000 N NA
 5519044 5519045 BAV1937 BAV1938     FALSE 0.014 266.000 0.000 NA   NA
 5519045 5519046 BAV1938 BAV1939     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519047 5519048 BAV1940 BAV1941   secA1 TRUE 0.990 6.000 0.429 0.092   NA
 5519048 5519049 BAV1941 BAV1942 secA1   TRUE 0.978 2.000 0.214 1.000   NA
 5519049 5519050 BAV1942 BAV1943     TRUE 0.981 10.000 0.333 NA   NA
 5519050 5519051 BAV1943 BAV1944     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5519051 5519052 BAV1944 BAV1945     TRUE 0.665 22.000 0.000 NA   NA
 5519052 5519053 BAV1945 BAV1946     FALSE 0.230 88.000 0.000 NA   NA
 5519053 5519054 BAV1946 BAV1947     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5519054 5519055 BAV1947 BAV1948     TRUE 0.816 12.000 0.000 NA   NA
 5519055 5519056 BAV1948 BAV1949     FALSE 0.022 236.000 0.000 NA   NA
 5519056 5519057 BAV1949 BAV1950     TRUE 0.998 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 5519057 5519058 BAV1950 BAV1951     FALSE 0.018 253.000 0.000 1.000   NA
 5519058 5519059 BAV1951 BAV1952   amn FALSE 0.279 69.000 0.000 1.000   NA
 5519062 5519063 BAV1955 BAV1956 gmK rpoZ TRUE 0.933 32.000 0.471 1.000 N NA
 5519063 5519064 BAV1956 BAV1957 rpoZ spoT TRUE 0.976 24.000 0.291 1.000 Y NA
 5519065 5519066 BAV1958 BAV1959 glnQ glnP TRUE 0.993 -3.000 0.244 1.000 Y NA
 5519066 5519067 BAV1959 BAV1960 glnP glnH TRUE 0.754 81.000 0.038 0.063 Y NA
 5519067 5519068 BAV1960 BAV1961 glnH fhaC FALSE 0.018 231.000 0.000 NA N NA
 5519068 5519069 BAV1961 BAV1962 fhaC fhaE TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5519069 5519070 BAV1962 BAV1963 fhaE fhaA TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5519070 5519071 BAV1963 BAV1964 fhaA fhaD TRUE 0.993 13.000 0.500 1.000 Y NA
 5519071 5519072 BAV1964 BAV1965 fhaD fimA TRUE 0.828 129.000 0.500 1.000 Y NA
 5519072 5519073 BAV1965 BAV1966 fimA fhaB FALSE 0.016 523.000 0.000 1.000 Y NA
 5519073 5519074 BAV1966 BAV1967 fhaB   FALSE 0.003 451.000 0.000 1.000 N NA
 5519077 5519078 BAV1970 BAV1971 ugpQ   TRUE 0.834 10.000 0.010 NA   NA
 5519079 5519080 BAV1972 BAV1973     TRUE 0.782 73.000 0.204 0.007 N NA
 5519080 5519081 BAV1973 BAV1974     FALSE 0.079 154.000 0.021 1.000 N NA
 5519083 5519084 BAV1976 BAV1977 rumA   FALSE 0.161 113.000 0.000 NA   NA
 5519084 5519085 BAV1977 BAV1978     FALSE 0.247 104.000 0.024 NA   NA
 5519085 5519086 BAV1978 BAV1979     TRUE 0.900 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5519086 5519087 BAV1979 BAV1980   pcm TRUE 0.702 18.000 0.014 1.000 N NA
 5519087 5519088 BAV1980 BAV1981 pcm surE TRUE 0.982 -15.000 0.353 1.000   NA
 5519091 5519092 BAV1984 BAV1985     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5519092 5519093 BAV1985 BAV1986   trxC FALSE 0.467 112.000 0.011 NA Y NA
 5519094 5519095 BAV1987 BAV1988     TRUE 0.655 23.000 0.000 1.000   NA
 5519095 5519096 BAV1988 BAV1989     TRUE 0.928 -3.000 0.000 0.055 N NA
 5519096 5519097 BAV1989 BAV1990     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.055 Y NA
 5519097 5519098 BAV1990 BAV1991     TRUE 0.945 29.000 0.130 1.000 Y NA
 5519098 5519099 BAV1991 BAV1992     FALSE 0.137 164.000 0.021 0.028   NA
 5519099 5519100 BAV1992 BAV1993   ldcA FALSE 0.069 200.000 0.056 NA   NA
 5519100 5519101 BAV1993 BAV1994 ldcA   TRUE 0.964 -3.000 0.115 NA N NA
 5519101 5519102 BAV1994 BAV1995     TRUE 0.860 -7.000 0.012 NA   NA
 5519102 5519103 BAV1995 BAV1996     FALSE 0.345 86.000 0.035 NA   NA
 5519103 5519104 BAV1996 BAV1997   phaG FALSE 0.234 107.000 0.024 NA   NA
 5519104 5519105 BAV1997 BAV1998 phaG phaF TRUE 0.998 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 5519105 5519106 BAV1998 BAV1999 phaF phaE TRUE 0.998 0.000 0.937 0.047 Y NA
 5519106 5519107 BAV1999 BAV2000 phaE phaD TRUE 0.998 2.000 0.944 1.000 Y NA
 5519107 5519108 BAV2000 BAV2001 phaD phaC TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 5519108 5519109 BAV2001 BAV2002 phaC phaAB TRUE 0.998 2.000 0.881 0.006 Y NA
 5519109 5519110 BAV2002 BAV2003 phaAB   FALSE 0.005 387.000 0.000 NA   NA
 5519110 5519111 BAV2003 BAV2004     TRUE 0.985 -3.000 0.312 NA   NA
 5519111 5519112 BAV2004 BAV2005   dadA2 FALSE 0.310 41.000 0.007 1.000 N NA
 5519113 5519114 BAV2006 BAV2007 lrp   FALSE 0.007 353.000 0.012 NA   NA
 5519114 5519115 BAV2007 BAV2008     FALSE 0.327 84.000 0.029 NA   NA
 5519115 5519116 BAV2008 BAV2009   murA TRUE 0.560 30.000 0.000 NA   NA
 5519116 5519117 BAV2009 BAV2010 murA glpR FALSE 0.048 162.000 0.000 1.000 N NA
 5519117 5519118 BAV2010 BAV2011 glpR glpD TRUE 0.616 29.000 0.024 1.000 N NA
 5519118 5519119 BAV2011 BAV2012 glpD   FALSE 0.445 38.000 0.000 NA   NA
 5519119 5519120 BAV2012 BAV2013     TRUE 0.853 2.000 0.009 NA   NA
 5519120 5519121 BAV2013 BAV2014     FALSE 0.103 131.000 0.009 NA   NA
 5519125 5519126 BAV2018 BAV2019     FALSE 0.197 88.000 0.000 1.000 N NA
 5519126 5519127 BAV2019 BAV2020     TRUE 0.850 29.000 0.139 1.000 N NA
 5519127 5519128 BAV2020 BAV2021   slyA FALSE 0.020 225.000 0.000 1.000 N NA
 5519128 5519129 BAV2021 BAV2022 slyA   TRUE 0.984 -3.000 0.261 NA   NA
 5519129 5519130 BAV2022 BAV2023     TRUE 0.970 6.000 0.174 NA   NA
 5519130 5519131 BAV2023 BAV2024     TRUE 0.985 5.000 0.375 NA   NA
 5519131 5519132 BAV2024 BAV2025     TRUE 0.947 29.000 0.375 0.092 N NA
 5519134 5519135 BAV2027 BAV2028     TRUE 0.892 86.000 1.000 NA   NA
 5519135 5519136 BAV2028 BAV2029   dnaE2 TRUE 0.988 16.000 1.000 1.000   NA
 5519137 5519138 BAV2030 BAV2031 dadA3   FALSE 0.195 116.000 0.033 NA N NA
 5519138 5519139 BAV2031 BAV2032   hmp TRUE 0.752 26.000 0.056 NA N NA
 5519144 5519145 BAV2037 BAV2038   mrcA FALSE 0.166 122.000 0.028 1.000 N NA
 5519147 5519148 BAV2040 BAV2041     TRUE 0.985 -3.000 0.300 NA   NA
 5519148 5519149 BAV2041 BAV2042     FALSE 0.022 236.000 0.000 NA   NA
 5519149 5519150 BAV2042 BAV2043     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5519151 5519152 BAV2044 BAV2045 pmi   TRUE 0.776 131.000 1.000 NA   NA
 5519152 5519153 BAV2045 BAV2046     TRUE 0.660 157.000 1.000 NA   NA
 5519153 5519154 BAV2046 BAV2047   irlS FALSE 0.026 221.000 0.000 NA   NA
 5519154 5519155 BAV2047 BAV2048 irlS irlR TRUE 0.999 -3.000 0.889 0.001 Y NA
 5519156 5519157 BAV2049 BAV2050     TRUE 0.977 14.000 0.409 NA   NA
 5519158 5519159 BAV2051 BAV2052     TRUE 0.757 16.000 0.000 NA   NA
 5519159 5519160 BAV2052 BAV2053     FALSE 0.049 173.000 0.000 NA   NA
 5519161 5519162 BAV2054 BAV2055     FALSE 0.348 49.000 0.000 NA   NA
 5519162 5519163 BAV2055 BAV2056     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519163 5519164 BAV2056 BAV2057   betT FALSE 0.077 151.000 0.000 NA   NA
 5519165 5519166 BAV2058 BAV2058A     FALSE 0.003 656.000 0.000 NA   NA
 5519166 5519167 BAV2058A BAV2059     FALSE 0.045 181.000 0.000 NA   NA
 5519167 5519168 BAV2059 BAV2060     FALSE 0.023 232.000 0.000 NA   NA
 5519168 5519169 BAV2060 BAV2061     FALSE 0.348 49.000 0.000 NA   NA
 5519169 5519170 BAV2061 BAV2062     FALSE 0.083 147.000 0.000 NA   NA
 5519172 5519173 BAVt24 BAV2064 tRNA-Pro(GGG)   FALSE 0.006 366.000 0.000 NA   NA
 5519173 5519174 BAV2064 BAV2065   ihfA TRUE 0.860 58.000 0.535 1.000 N NA
 5519174 5519175 BAV2065 BAV2066 ihfA pheT TRUE 0.974 3.000 0.208 1.000 N NA
 5519175 5519176 BAV2066 BAV2067 pheT pheS TRUE 0.996 13.000 0.574 0.001 Y NA
 5519176 5519177 BAV2067 BAV2068 pheS rplT TRUE 0.864 73.000 0.202 1.000 Y NA
 5519177 5519178 BAV2068 BAV2069 rplT rpmI TRUE 0.997 16.000 0.928 0.013 Y NA
 5519178 5519179 BAV2069 BAV2070 rpmI comM FALSE 0.006 353.000 0.000 1.000 N NA
 5519179 5519180 BAV2070 BAV2071 comM   FALSE 0.012 277.000 0.010 NA   NA
 5519181 5519182 BAV2072 BAV2073   glnK FALSE 0.003 627.000 0.000 1.000   NA
 5519182 5519183 BAV2073 BAV2074 glnK amtB TRUE 0.566 36.000 0.034 1.000 N NA
 5519184 5519185 BAV2075 BAV2076     TRUE 0.990 3.000 0.533 NA   NA
 5519185 5519186 BAV2076 BAV2077     TRUE 0.978 5.000 0.240 NA   NA
 5519186 5519187 BAV2077 BAV2078     TRUE 0.986 -3.000 0.323 NA   NA
 5519187 5519188 BAV2078 BAV2079     TRUE 0.983 -3.000 0.247 NA   NA
 5519188 5519189 BAV2079 BAV2080   cfa TRUE 0.933 24.000 0.258 NA   NA
 5519189 5519190 BAV2080 BAV2081 cfa   TRUE 0.977 3.000 0.213 NA   NA
 5519190 5519191 BAV2081 BAV2082     TRUE 0.994 -3.000 0.722 NA   NA
 5519193 5519194 BAV2084 BAV2085 poaA   TRUE 0.717 145.000 1.000 NA   NA
 5519194 5519195 BAV2085 BAV2086   pqiB TRUE 0.994 5.000 1.000 NA   NA
 5519195 5519196 BAV2086 BAV2087 pqiB pqiA TRUE 0.653 32.000 0.032 NA   NA
 5519196 5519197 BAV2087 BAV2088 pqiA clpA TRUE 0.832 3.000 0.006 NA   NA
 5519197 5519198 BAV2088 BAV2089 clpA pbpC FALSE 0.227 54.000 0.006 1.000 N NA
 5519198 5519199 BAV2089 BAV2090 pbpC   TRUE 0.981 18.000 0.711 1.000   NA
 5519199 5519200 BAV2090 BAV2091   clpS FALSE 0.053 161.000 0.008 NA   NA
 5519201 5519202 BAV2092 BAV2093 cspD   FALSE 0.110 130.000 0.010 NA   NA
 5519203 5519204 BAV2094 BAV2095 paaJ msrB TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519204 5519205 BAV2095 BAV2096 msrB sodB TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5519205 5519206 BAV2096 BAV2097 sodB xseA FALSE 0.301 93.000 0.037 1.000 N NA
 5519207 5519208 BAV2098 BAV2099 exbB2 exbD2 TRUE 0.998 -3.000 0.746 0.062 Y NA
 5519208 5519209 BAV2099 BAV2100 exbD2 lpxK TRUE 0.958 -3.000 0.096 1.000 N NA
 5519209 5519210 BAV2100 BAV2101 lpxK   TRUE 0.919 28.000 0.263 NA   NA
 5519210 5519211 BAV2101 BAV2102   kdsB TRUE 0.984 -3.000 0.265 NA   NA
 5519211 5519212 BAV2102 BAV2103 kdsB adk FALSE 0.352 96.000 0.056 1.000 N NA
 5519212 5519213 BAV2103 BAV2104 adk   FALSE 0.278 80.000 0.021 1.000 N NA
 5519213 5519214 BAV2104 BAV2105   mviN FALSE 0.257 61.000 0.006 1.000   NA
 5519214 5519215 BAV2105 BAV2106 mviN   FALSE 0.020 245.000 0.000 NA   NA
 5519215 5519216 BAV2106 BAV2107   rpsT FALSE 0.014 202.000 0.002 NA N NA
 5519216 5519217 BAV2107 BAV2108 rpsT   FALSE 0.277 67.000 0.000 NA   NA
 5519217 5519218 BAV2108 BAV2109     FALSE 0.473 36.000 0.000 NA   NA
 5519220 5519221 BAV2111 BAV2112 argD argF TRUE 0.811 54.000 0.074 1.000 Y NA
 5519221 5519222 BAV2112 BAV2113 argF argG TRUE 0.701 103.000 0.088 1.000 Y NA
 5519223 5519224 BAV2114 BAV2115   kup FALSE 0.229 89.000 0.000 NA   NA
 5519224 5519225 BAV2115 BAV2116 kup   TRUE 0.989 -16.000 0.500 0.091 N NA
 5519225 5519226 BAV2116 BAV2117     TRUE 0.885 107.000 0.500 1.000 Y NA
 5519226 5519227 BAV2117 BAV2118   exbD1 FALSE 0.382 95.000 0.067 1.000 N NA
 5519227 5519228 BAV2118 BAV2119 exbD1 exbB1 TRUE 0.993 0.000 0.156 0.061 Y NA
 5519228 5519229 BAV2119 BAV2120 exbB1 tonB TRUE 0.822 20.000 0.000 0.009 N NA
 5519229 5519230 BAV2120 BAVt25 tonB tRNA-Val(TAC) FALSE 0.005 432.000 0.000 NA   NA
 5519230 5519231 BAVt25 BAV2121 tRNA-Val(TAC) hopd FALSE 0.161 113.000 0.000 NA   NA
 5519231 5519232 BAV2121 BAV2122 hopd   FALSE 0.007 316.000 0.000 1.000 N NA
 5519232 5519233 BAV2122 BAV2123     FALSE 0.219 46.000 0.003 1.000 N NA
 5519233 5519234 BAV2123 BAV2124   rnr TRUE 0.656 99.000 0.147 0.015 N NA
 5519237 5519238 BAVt27 BAVt28 tRNA-Leu(CAG) tRNA-Leu(CAG) FALSE 0.073 153.000 0.000 NA   NA
 5519240 5519241 BAV2127 BAV2128 arsB   FALSE 0.309 58.000 0.000 NA   NA
 5519243 5519244 BAV2130 BAV2131     FALSE 0.271 57.000 0.000 1.000 N NA
 5519244 5519245 BAV2131 BAVt29   tRNA-Met(CAT) FALSE 0.046 179.000 0.000 NA   NA
 5519245 5519246 BAVt29 BAV2132 tRNA-Met(CAT)   FALSE 0.002 1689.000 0.000 NA   NA
 5519246 5519247 BAV2132 BAV2133     TRUE 0.799 51.000 0.000 0.005 Y NA
 5519248 5519249 BAV2134 BAV2135   speG FALSE 0.333 52.000 0.000 NA   NA
 5519249 5519250 BAV2135 BAV2136 speG pncA TRUE 0.780 21.000 0.000 0.063 N NA
 5519250 5519251 BAV2136 BAV2137 pncA   FALSE 0.476 29.000 0.004 NA   NA
 5519251 5519252 BAV2137 BAV2138     FALSE 0.003 724.000 0.000 NA   NA
 5519253 5519254 BAV2139 BAV2140     FALSE 0.400 66.000 0.035 NA   NA
 5519255 5519256 BAV2141 BAV2142   purB FALSE 0.167 62.000 0.003 1.000 N NA
 5519258 5519259 BAV2144 BAV2145   trmU FALSE 0.201 80.000 0.005 1.000   NA
 5519260 5519261 BAV2146 BAV2147 nntA1 nntA2 TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5519261 5519262 BAV2147 BAV2148 nntA2 nntB TRUE 0.986 -3.000 0.144 0.001   NA
 5519263 5519264 BAV2149 BAV2150 glcF glcE TRUE 0.973 11.000 0.013 0.029 Y NA
 5519264 5519265 BAV2150 BAV2151 glcE glcD1 TRUE 0.976 10.000 0.013 0.012 Y NA
 5519265 5519266 BAV2151 BAV2152 glcD1 glcD2 FALSE 0.420 172.000 0.070 0.012 Y NA
 5519266 5519267 BAV2152 BAV2153 glcD2 aroG2 FALSE 0.040 193.000 0.021 1.000 N NA
 5519267 5519268 BAV2153 BAV2154 aroG2 tldD FALSE 0.015 263.000 0.000 NA   NA
 5519271 5519272 BAV2157 BAV2158 pepN fbp TRUE 0.930 9.000 0.071 1.000 N NA
 5519273 10712365 BAV2159 BAV2160     TRUE 0.833 -584.000 0.000 NA   NA
 10712365 5519274 BAV2160 BAV2161     FALSE 0.005 385.000 0.000 NA   NA
 5519274 5519275 BAV2161 BAV2162   thrC FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5519275 5519276 BAV2162 BAV2163 thrC hom TRUE 0.990 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 5519276 5519277 BAV2163 BAV2164 hom   TRUE 0.992 -3.000 0.202 1.000 Y NA
 5519278 5519279 BAV2165 BAV2166     TRUE 0.909 -3.000 0.020 NA   NA
 5519279 5519280 BAV2166 BAV2167     FALSE 0.494 50.000 0.050 1.000 N NA
 5519280 5519281 BAV2167 BAV2168   pdxA2 FALSE 0.086 151.000 0.020 1.000 N NA
 5519281 5519282 BAV2168 BAV2169 pdxA2   FALSE 0.423 87.000 0.060 1.000   NA
 5519283 5519284 BAV2170 BAV2171 dnaB   TRUE 0.873 -3.000 0.015 NA N NA
 5519284 5519285 BAV2171 BAV2172   rplI FALSE 0.084 113.000 0.003 NA N NA
 5519285 5519286 BAV2172 BAV2173 rplI rpsR TRUE 0.994 15.000 0.499 0.013 Y NA
 5519286 5519287 BAV2173 BAV2174 rpsR priB FALSE 0.533 93.000 0.128 1.000 N NA
 5519287 5519288 BAV2174 BAV2175 priB rpsF TRUE 0.653 53.000 0.122 1.000 N NA
 5519288 5519289 BAV2175 BAV2176 rpsF   FALSE 0.024 232.000 0.000 1.000   NA
 5519289 5519290 BAV2176 BAV2177   dxs FALSE 0.190 150.000 0.069 1.000   NA
 5519290 5519291 BAV2177 BAV2178 dxs ispA TRUE 0.925 43.000 0.246 1.000 Y NA
 5519291 5519292 BAV2178 BAV2179 ispA xseB TRUE 0.966 9.000 0.177 1.000 N NA
 5519293 5519294 BAV2180 BAV2181     FALSE 0.142 120.000 0.000 1.000   NA
 5519295 5519296 BAV2182 BAV2183     TRUE 0.634 32.000 0.025 1.000   NA
 5519298 5519299 BAV2185 BAV2186   hcz FALSE 0.028 217.000 0.000 NA   NA
 5519299 5519300 BAV2186 BAV2187 hcz   TRUE 0.690 32.000 0.042 1.000   NA
 5519301 5519302 BAV2188 BAV2189   marR TRUE 0.668 53.000 0.115 1.000   NA
 5519302 5519303 BAV2189 BAV2190 marR   FALSE 0.525 121.000 0.250 1.000 N NA
 5519303 5519304 BAV2190 BAV2191   emrA TRUE 0.981 10.000 0.250 0.090 N NA
 5519304 5519305 BAV2191 BAV2192 emrA emrB TRUE 0.982 -3.000 0.231 1.000   NA
 5519306 5519307 BAV2193 BAV2194     TRUE 0.770 60.000 0.059 1.000 Y NA
 5519308 5519309 BAV2195 BAV2196     TRUE 0.934 92.000 0.500 0.054 Y NA
 5519309 5519310 BAV2196 BAV2197     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.054 Y NA
 5519310 5519311 BAV2197 BAV2198     TRUE 0.992 11.000 0.833 1.000   NA
 5519311 5519312 BAV2198 BAV2199   goaG1 TRUE 0.989 3.000 0.500 1.000   NA
 5519312 5519313 BAV2199 BAV2200 goaG1   TRUE 0.910 19.000 0.118 NA   NA
 5519313 5519314 BAV2200 BAV2201   aphA1 TRUE 0.874 21.000 0.088 NA   NA
 5519314 5519315 BAV2201 BAV2202 aphA1 amaB TRUE 0.985 16.000 0.833 NA N NA
 5519315 5519316 BAV2202 BAV2203 amaB   TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 5519316 5519317 BAV2203 BAV2204   aldH TRUE 0.988 -3.000 0.429 1.000 N NA
 5519319 5519320 BAV2206 BAV2206A     FALSE 0.006 366.000 0.000 NA   NA
 5519320 5519321 BAV2206A BAV2207     FALSE 0.184 105.000 0.000 NA   NA
 5519321 5519322 BAV2207 BAV2208   purD FALSE 0.386 68.000 0.034 NA   NA
 5519322 5519323 BAV2208 BAV2209 purD hemF TRUE 0.927 -3.000 0.043 1.000 N NA
 5519323 5519324 BAV2209 BAV2210 hemF nadD TRUE 0.984 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 5519324 5519325 BAV2210 BAV2211 nadD   TRUE 0.611 38.000 0.044 NA   NA
 5519325 5519326 BAV2211 BAV2212     TRUE 0.982 4.000 0.307 NA   NA
 5519326 5519327 BAV2212 BAV2213     TRUE 0.945 5.000 0.074 NA   NA
 5519328 5519329 BAV2214 BAV2215     TRUE 0.866 2.000 0.000 NA   NA
 5519329 5519330 BAV2215 BAV2216     TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5519330 5519331 BAV2216 BAV2217     TRUE 0.956 -3.000 0.074 NA   NA
 5519331 5519332 BAV2217 BAV2218   dctA FALSE 0.046 164.000 0.000 1.000 N NA
 5519333 5519334 BAV2219 BAV2220 dctB dctD TRUE 0.997 0.000 0.615 0.085 Y NA
 5519335 5519336 BAV2221 BAV2222 tdcB   FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5519336 5519337 BAV2222 BAV2223     FALSE 0.097 139.000 0.000 NA   NA
 5519338 5519339 BAV2224 BAV2225     FALSE 0.011 292.000 0.000 1.000   NA
 5519339 5519340 BAV2225 BAV2226   aphA2 TRUE 0.956 17.000 0.250 NA   NA
 5519340 5519341 BAV2226 BAV2227 aphA2   FALSE 0.005 368.000 0.000 NA N NA
 5519342 5519343 BAVr01 BAVr02     FALSE 0.247 82.000 0.000 NA   NA
 5519343 5519344 BAVr02 BAVt30   tRNA-Ala(TGC) FALSE 0.008 335.000 0.000 NA   NA
 5519344 5519345 BAVt30 BAVt31 tRNA-Ala(TGC) tRNA-Ile(GAT) TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5519345 5519346 BAVt31 BAVr03 tRNA-Ile(GAT)   FALSE 0.215 95.000 0.000 NA   NA
 5519349 5519350 BAV2230 BAV2231 rfaF   TRUE 0.791 14.000 0.013 NA   NA
 5519350 5519351 BAV2231 BAV2232     TRUE 0.904 -3.000 0.018 NA   NA
 5519352 5519353 BAV2233 BAV2234 rfaG   TRUE 0.874 8.000 0.025 1.000 N NA
 5519353 5519354 BAV2234 BAV2235     FALSE 0.535 28.000 0.000 1.000 N NA
 5519354 5519355 BAV2235 BAV2236   waaE TRUE 0.972 -3.000 0.014 NA Y NA
 5519355 5519356 BAV2236 BAV2237 waaE   TRUE 0.883 -3.000 0.018 NA N NA
 5519356 5519357 BAV2237 BAV2238     TRUE 0.980 -3.000 0.222 1.000 N NA
 5519357 5519358 BAV2238 BAV2239   dnaE TRUE 0.779 0.000 0.003 1.000 N NA
 5519361 5519362 BAV2242 BAV2243 argA   FALSE 0.441 110.000 0.123 NA N NA
 5519363 5519364 BAV2244 BAV2245   phoU FALSE 0.111 121.000 0.000 NA N NA
 5519364 5519365 BAV2245 BAV2246 phoU rpiA FALSE 0.082 154.000 0.024 NA N NA
 5519365 5519366 BAV2246 BAV2247 rpiA   FALSE 0.233 86.000 0.000 NA   NA
 5519368 5519369 BAV2249 BAV2250     TRUE 0.817 2.000 0.008 1.000 N NA
 5519369 5519370 BAV2250 BAV2251   potI TRUE 0.840 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5519370 5519371 BAV2251 BAV2252 potI potH TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.053 Y NA
 5519371 5519372 BAV2252 BAV2253 potH potG TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5519372 5519373 BAV2253 BAV2254 potG potF TRUE 0.988 7.000 0.158 1.000 Y NA
 5519373 5519374 BAV2254 BAV2255 potF   FALSE 0.080 141.000 0.013 1.000 N NA
 5519374 5519375 BAV2255 BAV2256     TRUE 0.854 -10.000 0.012 1.000   NA
 5519375 5519376 BAV2256 BAV2257     TRUE 0.962 0.000 0.102 1.000   NA
 5519377 5519378 BAV2258 BAV2259     TRUE 0.834 60.000 0.115 NA Y NA
 5519378 5519379 BAV2259 BAV2260     TRUE 0.985 34.000 1.000 NA Y NA
 5519379 5519380 BAV2260 BAV2261   fmdA FALSE 0.008 306.000 0.000 1.000 N NA
 5519380 5519381 BAV2261 BAV2262 fmdA fmdB TRUE 0.925 11.000 0.065 NA   NA
 5519381 5519382 BAV2262 BAV2263 fmdB tehA FALSE 0.005 385.000 0.000 NA   NA
 5519383 5519384 BAVt32 BAV2264 tRNA-Val(GAC) trpF FALSE 0.108 133.000 0.000 NA   NA
 5519384 5519385 BAV2264 BAV2265 trpF asuC TRUE 0.706 47.000 0.139 1.000 N NA
 5519385 5519386 BAV2265 BAV2266 asuC   TRUE 0.894 7.000 0.025 NA   NA
 5519386 5519387 BAV2266 BAV2267   asd FALSE 0.073 181.000 0.034 NA   NA
 5519387 5519388 BAV2267 BAV2268 asd leuB TRUE 0.750 133.000 0.196 0.034 Y NA
 5519388 5519389 BAV2268 BAV2269 leuB leuD2 TRUE 0.915 56.000 0.141 0.002 Y NA
 5519389 5519390 BAV2269 BAV2270 leuD2 leuC2 TRUE 0.989 14.000 0.141 0.001 Y NA
 5519390 5519391 BAV2270 BAV2271 leuC2   FALSE 0.227 90.000 0.000 NA   NA
 5519391 5519392 BAV2271 BAV2272     FALSE 0.328 53.000 0.000 NA   NA
 5519392 5519393 BAV2272 BAV2273   aroC TRUE 0.654 15.000 0.005 1.000 N NA
 5519393 5519394 BAV2273 BAV2274 aroC   FALSE 0.260 39.000 0.002 1.000 N NA
 5519396 5519397 BAV2276 BAV2277     FALSE 0.060 151.000 0.006 NA   NA
 5519398 5519399 BAV2278 BAV2279     FALSE 0.237 65.000 0.006 1.000   NA
 5519401 5519402 BAV2281 BAV2282 thrB   TRUE 0.716 67.000 0.209 NA   NA
 5519403 5519404 BAV2283 BAV2284     TRUE 0.995 -3.000 0.381 NA Y NA
 5519404 5519405 BAV2284 BAV2285     TRUE 0.996 -3.000 0.452 NA Y NA
 5519405 5519406 BAV2285 BAV2286     TRUE 0.990 0.000 0.154 1.000 Y NA
 5519406 5519407 BAV2286 BAV2287     TRUE 0.990 -3.000 0.125 NA Y NA
 5519407 5519408 BAV2287 BAV2288     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5519408 5519409 BAV2288 BAV2289     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5519409 5519410 BAV2289 BAV2290     TRUE 0.984 -3.000 0.273 NA   NA
 5519410 5519411 BAV2290 BAV2291     TRUE 0.984 -3.000 0.273 NA   NA
 5519412 5519413 BAV2292 BAV2293   capR TRUE 0.995 -3.000 0.385 NA Y NA
 5519414 5519415 BAV2294 BAV2295 ecnB   TRUE 0.892 20.000 0.100 1.000   NA
 5519415 5519416 BAV2295 BAV2296   ppa FALSE 0.016 245.000 0.000 1.000 N NA
 5519416 5519417 BAV2296 BAV2297 ppa hemY FALSE 0.426 36.000 0.006 1.000   NA
 5519417 5519418 BAV2297 BAV2298 hemY hemX TRUE 0.877 5.000 0.016 1.000   NA
 5519418 5519419 BAV2298 BAV2299 hemX hemD TRUE 0.973 37.000 0.600 1.000 Y NA
 5519419 5519420 BAV2299 BAV2300 hemD hemC TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 5519420 5519421 BAV2300 BAV2301 hemC   FALSE 0.088 113.000 0.003 1.000 N NA
 5519421 5519422 BAV2301 BAV2302     TRUE 0.751 126.000 0.150 0.045 Y NA
 5519422 5519423 BAV2302 BAV2303   sucD FALSE 0.073 279.000 0.220 1.000 N NA
 5519423 5519424 BAV2303 BAV2304 sucD sucC TRUE 0.980 22.000 0.151 0.001 Y NA
 5519424 5519425 BAV2304 BAV2305 sucC   TRUE 0.935 11.000 0.076 NA   NA
 5519425 5519426 BAV2305 BAV2306   metE FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 5519428 5519429 BAV2308 BAV2309 recX recA TRUE 0.936 25.000 0.296 1.000   NA
 5519430 5519431 BAV2310 BAV2311     TRUE 0.929 104.000 0.812 1.000 Y NA
 5519431 5519432 BAV2311 BAV2312     FALSE 0.102 180.000 0.070 1.000 N NA
 5519432 5519433 BAV2312 BAV2313   rdgC FALSE 0.003 527.000 0.000 1.000 N NA
 5519434 5519435 BAV2314 BAV2315 pyrB   FALSE 0.167 85.000 0.003 NA   NA
 5519435 5519436 BAV2315 BAV2316     TRUE 0.993 10.000 1.000 NA   NA
 5519436 5519437 BAV2316 BAV2317   ecnA TRUE 0.751 98.000 0.400 NA   NA
 5519437 5519438 BAV2317 BAV2318 ecnA   FALSE 0.097 139.000 0.000 NA   NA
 5519438 5519439 BAV2318 BAVt33   tRNA-Met(CAT) FALSE 0.064 159.000 0.000 NA   NA
 5519439 5519440 BAVt33 BAV2319 tRNA-Met(CAT)   TRUE 0.837 -38.000 0.000 NA   NA
 5519443 5519444 BAV2322 BAV2323     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 5519446 5519447 BAV2325 BAV2326     FALSE 0.003 607.000 0.000 NA   NA
 5519448 5519449 BAV2327 BAV2328 cspA3   FALSE 0.077 151.000 0.000 NA   NA
 5519449 5519450 BAV2328 BAVt34   tRNA-Met(CAT) FALSE 0.025 224.000 0.000 NA   NA
 5519450 5519451 BAVt34 BAV2329 tRNA-Met(CAT) rpoD TRUE 0.849 8.000 0.000 NA   NA
 5519451 5519452 BAV2329 BAV2330 rpoD dnaG FALSE 0.021 837.000 0.299 1.000 N NA
 5519452 5519453 BAV2330 BAV2331 dnaG rpsU TRUE 0.857 18.000 0.067 1.000 N NA
 5519453 5519454 BAV2331 BAV2332 rpsU gpt FALSE 0.009 310.000 0.000 1.000   NA
 5519454 5519455 BAV2332 BAV2333 gpt adeK FALSE 0.215 127.000 0.042 1.000   NA
 5519455 5519456 BAV2333 BAV2334 adeK hisZ TRUE 0.635 76.000 0.161 1.000 N NA
 5519456 5519457 BAV2334 BAV2335 hisZ hflC FALSE 0.010 370.000 0.045 1.000 N NA
 5519457 5519458 BAV2335 BAV2336 hflC hflK TRUE 0.996 19.000 0.947 0.009 Y NA
 5519458 5519459 BAV2336 BAV2337 hflK hflX TRUE 0.979 -34.000 0.184 0.045   NA
 5519459 5519460 BAV2337 BAV2338 hflX hfq FALSE 0.416 88.000 0.058 1.000   NA
 5519460 5519461 BAV2338 BAV2339 hfq hisC2 FALSE 0.070 161.000 0.015 1.000   NA
 5519461 5519462 BAV2339 BAV2340 hisC2 engA TRUE 0.837 -3.000 0.003 1.000   NA
 5519462 5519463 BAV2340 BAV2341 engA   TRUE 0.904 27.000 0.203 NA   NA
 5519463 5519464 BAV2341 BAV2342     TRUE 0.988 3.000 0.492 NA   NA
 5519464 5519465 BAV2342 BAV2343   hisS TRUE 0.981 3.000 0.259 1.000   NA
 5519465 5519466 BAV2343 BAV2344 hisS gcpE TRUE 0.769 47.000 0.207 1.000 N NA
 5519466 5519467 BAV2344 BAV2345 gcpE   TRUE 0.967 13.000 0.233 1.000   NA
 5519467 5519468 BAV2345 BAV2346     TRUE 0.910 -3.000 0.020 1.000   NA
 5519468 5519469 BAV2346 BAV2347   ndk TRUE 0.826 36.000 0.156 1.000   NA
 5519471 5519472 BAV2349 BAV2350 trmD rimM TRUE 0.997 0.000 0.672 1.000 Y NA
 5519472 5519473 BAV2350 BAV2351 rimM   FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 5519473 5519474 BAV2351 BAV2352   rpsP TRUE 0.849 8.000 0.000 NA   NA
 5519475 5519476 BAV2353 BAV2354     FALSE 0.145 117.000 0.000 NA   NA
 5519477 5519478 BAV2355 BAV2356   alaS TRUE 0.895 -13.000 0.006 0.034 N NA
 5519478 5519479 BAV2356 BAV2357 alaS   FALSE 0.180 78.000 0.002 NA   NA
 5519479 5519480 BAV2357 BAV2358     TRUE 0.976 -3.000 0.167 NA   NA
 5519480 5519481 BAV2358 BAV2359     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5519481 5519482 BAV2359 BAV2360     TRUE 0.993 -7.000 0.800 NA   NA
 5519482 5519483 BAV2360 BAV2361     TRUE 0.857 -7.000 0.000 NA   NA
 5519483 5519484 BAV2361 BAV2362     TRUE 0.841 -16.000 0.000 NA   NA
 5519484 5519485 BAV2362 BAV2363     TRUE 0.981 -7.000 0.286 NA   NA
 5519485 5519486 BAV2363 BAV2364     TRUE 0.974 -3.000 0.143 NA   NA
 5519486 5519487 BAV2364 BAV2365     FALSE 0.003 570.000 0.000 NA   NA
 5519487 5519488 BAV2365 BAV2366   dadA4 TRUE 0.981 5.000 0.333 1.000 N NA
 5519488 5519489 BAV2366 BAV2367 dadA4   FALSE 0.022 245.000 0.020 1.000 N NA
 5519489 5519490 BAV2367 BAV2368   panD FALSE 0.207 52.000 0.004 1.000 N NA
 5519492 5519493 BAV2370 BAV2371   thpD FALSE 0.170 112.000 0.000 1.000   NA
 5519493 5519494 BAV2371 BAV2372 thpD ectC TRUE 0.873 15.000 0.046 1.000   NA
 5519494 5519495 BAV2372 BAV2373 ectC ectB TRUE 0.992 -3.000 0.572 1.000   NA
 5519495 5519496 BAV2373 BAV2374 ectB ectA TRUE 0.903 103.000 0.793 0.001   NA
 5519496 5519497 BAV2374 BAV2375 ectA   TRUE 0.933 -3.000 0.039 1.000   NA
 5519497 5519498 BAV2375 BAV2376   parC FALSE 0.022 218.000 0.000 1.000 N NA
 5519498 5519499 BAV2376 BAV2377 parC   TRUE 0.713 14.000 0.003 NA   NA
 5519499 5519500 BAV2377 BAV2378   nfxD TRUE 0.844 0.000 0.006 NA   NA
 5519501 5519502 BAV2379 BAV2380 fipA nitA FALSE 0.372 114.000 0.087 1.000   NA
 5519504 5519505 BAV2382 BAV2383 glnE   FALSE 0.278 55.000 0.007 NA   NA
 5519508 5519509 BAV2386 BAV2387 clcD   TRUE 0.788 34.000 0.117 1.000 N NA
 5519509 5519510 BAV2387 BAV2388   polA FALSE 0.077 117.000 0.003 1.000 N NA
 5519511 5519512 BAV2389 BAV2390     FALSE 0.229 89.000 0.000 NA   NA
 5519513 5519514 BAV2391 BAV2392 bipA truB TRUE 0.760 17.000 0.020 1.000 N NA
 5519514 5519515 BAV2392 BAV2393 truB rbfA TRUE 0.936 43.000 0.318 1.000 Y NA
 5519515 5519516 BAV2393 BAV2394 rbfA infB TRUE 0.983 26.000 0.530 1.000 Y NA
 5519516 5519517 BAV2394 BAV2395 infB nusA TRUE 0.762 77.000 0.342 1.000 N NA
 5519517 5519518 BAV2395 BAV2396 nusA   TRUE 0.994 -3.000 0.759 NA   NA
 5519518 5519519 BAV2396 BAV2397   rluB FALSE 0.003 450.000 0.004 NA   NA
 5519519 5519520 BAV2397 BAV2398 rluB   FALSE 0.017 351.000 0.074 NA N NA
 5519521 5519522 BAVt35 BAV2399 tRNA-Met(CAT) tpr FALSE 0.292 62.000 0.000 NA   NA
 5519522 5519523 BAV2399 BAV2400 tpr   FALSE 0.020 240.000 0.000 NA   NA
 5519524 5519525 BAV2401 BAVt36   tRNA-Asn(GTT) FALSE 0.538 32.000 0.000 NA   NA
 5519525 5519526 BAVt36 BAVt37 tRNA-Asn(GTT) tRNA-Thr(CGT) FALSE 0.035 194.000 0.000 NA   NA
 5519526 5519527 BAVt37 BAV2402 tRNA-Thr(CGT) maaI FALSE 0.161 113.000 0.000 NA   NA
 5519527 5519528 BAV2402 BAV2403 maaI ispH FALSE 0.269 63.000 0.014 1.000 N NA
 5519528 5519529 BAV2403 BAV2404 ispH fkpB TRUE 0.991 0.000 0.626 1.000 N NA
 5519530 5519531 BAV2405 BAV2406 radC   TRUE 0.669 102.000 0.273 1.000   NA
 5519531 5519532 BAV2406 BAV2407     FALSE 0.296 93.000 0.025 1.000   NA
 5519532 5519533 BAV2407 BAV2408   rpmE2 FALSE 0.030 176.000 0.006 1.000 N NA
 5519533 5519534 BAV2408 BAV2409 rpmE2   FALSE 0.126 161.000 0.067 NA N NA
 5519534 5519535 BAV2409 BAV2410   norM TRUE 0.972 -3.000 0.154 NA N NA
 5519536 5519537 BAV2411 BAV2412     FALSE 0.092 160.000 0.027 NA   NA
 5519537 5519538 BAV2412 BAV2413   radA FALSE 0.223 62.000 0.003 1.000   NA
 5519540 5519541 BAV2415 BAV2416   alnB TRUE 0.607 116.000 0.333 1.000 N NA
 5519542 5519543 BAV2417 BAV2418     TRUE 0.994 -3.000 0.118 0.001 Y NA
 5519543 5519544 BAV2418 BAV2419     TRUE 0.972 -3.000 0.130 1.000   NA
 5519545 5519546 BAV2420 BAV2421 crcB   TRUE 0.756 14.000 0.008 NA   NA
 5519546 5519547 BAV2421 BAV2422     FALSE 0.030 204.000 0.000 NA   NA
 5519550 5519551 BAV2425 BAV2426 btr   TRUE 0.981 7.000 0.300 NA   NA
 5519552 5519553 BAV2427 BAV2428   nudF TRUE 0.801 -3.000 0.004 1.000 N NA
 5519553 5519554 BAV2428 BAV2429 nudF   FALSE 0.279 69.000 0.000 1.000   NA
 5519556 5519557 BAV2431 BAV2432     FALSE 0.267 71.000 0.011 NA   NA
 5519558 5519559 BAV2433 BAV2434     FALSE 0.390 64.000 0.032 NA   NA
 5519565 5519566 BAV2440 BAV2441     TRUE 0.724 18.000 0.000 NA   NA
 5519566 5519567 BAV2441 BAV2442     FALSE 0.088 145.000 0.000 1.000   NA
 5519567 5519568 BAV2442 BAV2443     FALSE 0.484 94.000 0.095 NA   NA
 5519569 5519570 BAV2444 BAV2445 hndJ hndI TRUE 0.962 -3.000 0.048 0.083   NA
 5519570 5519571 BAV2445 BAV2446 hndI ohr FALSE 0.060 153.000 0.000 1.000 N NA
 5519571 5519572 BAV2446 BAV2447 ohr ohrR FALSE 0.098 130.000 0.000 1.000 N NA
 5519572 5519573 BAV2447 BAV2448 ohrR bioA FALSE 0.233 70.000 0.000 1.000 N NA
 5519574 5519575 BAV2449 BAV2450 bioF bioH TRUE 0.971 -3.000 0.128 NA   NA
 5519575 5519576 BAV2450 BAV2451 bioH bioCD TRUE 0.899 -3.000 0.016 NA   NA
 5519579 5519580 BAV2454 BAV2455   pgsA FALSE 0.062 130.000 0.003 NA N NA
 5519580 5519581 BAV2455 BAV2456 pgsA uvrC TRUE 0.799 43.000 0.227 1.000 N NA
 5519581 5519582 BAV2456 BAV2457 uvrC nagZ FALSE 0.242 53.000 0.007 1.000 N NA
 5519582 5519583 BAV2457 BAV2458 nagZ acpS TRUE 0.930 11.000 0.081 1.000 N NA
 5519583 5519584 BAV2458 BAV2459 acpS pdxJ FALSE 0.087 116.000 0.004 1.000 N NA
 5519584 5519585 BAV2459 BAV2460 pdxJ   TRUE 0.794 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5519585 5519586 BAV2460 BAV2461     TRUE 0.983 -3.000 0.176 0.052 N NA
 5519586 5519587 BAV2461 BAV2462     TRUE 0.687 61.000 0.176 1.000 N NA
 5519587 5519588 BAV2462 BAV2463     FALSE 0.040 188.000 0.000 1.000   NA
 5519588 5519589 BAV2463 BAV2464     FALSE 0.003 611.000 0.000 NA   NA
 5519591 5519592 BAV2466 BAV2467 modC modB TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5519592 5519593 BAV2467 BAV2468 modB modA TRUE 0.997 11.000 0.583 0.001 Y NA
 5519593 5519594 BAV2468 BAV2469 modA   FALSE 0.188 105.000 0.000 1.000   NA
 5519594 5519595 BAV2469 BAV2470     TRUE 0.993 2.000 0.771 1.000   NA
 5519595 5519596 BAV2470 BAV2471     TRUE 0.835 82.000 0.562 NA   NA
 5519598 5519599 BAV2473 BAV2474 sodC   FALSE 0.106 125.000 0.000 NA N NA
 5519601 5519602 BAV2476 BAV2477     FALSE 0.113 132.000 0.000 1.000   NA
 5519602 5519603 BAV2477 BAV2478   proV FALSE 0.035 196.000 0.000 1.000   NA
 5519603 5519604 BAV2478 BAV2479 proV proW TRUE 0.997 -3.000 0.485 0.087 Y NA
 5519604 5519605 BAV2479 BAV2480 proW proX TRUE 0.826 85.000 0.100 0.052 Y NA
 5519605 5519606 BAV2480 BAV2481 proX   FALSE 0.040 186.000 0.000 NA   NA
 5519606 5519607 BAV2481 BAV2482     FALSE 0.196 102.000 0.000 NA   NA
 5519607 5519608 BAV2482 BAV2483     FALSE 0.189 104.000 0.000 NA   NA
 5519609 5519610 BAV2484 BAV2485 bcr rpmB FALSE 0.008 303.000 0.000 1.000 N NA
 5519610 5519611 BAV2485 BAV2486 rpmB rpmG TRUE 0.929 78.000 0.332 0.012 Y NA
 5519611 5519612 BAV2486 BAV2487 rpmG   FALSE 0.034 153.000 0.002 NA N NA
 5519614 5519615 BAV2489 BAV2490 bph2   FALSE 0.499 131.000 0.250 1.000   NA
 5519615 5519616 BAV2490 BAV2491     TRUE 0.948 -3.000 0.071 NA N NA
 5519616 5519617 BAV2491 BAV2492   leuS FALSE 0.142 76.000 0.003 NA N NA
 5519617 5519618 BAV2492 BAV2493 leuS   TRUE 0.968 6.000 0.182 NA N NA
 5519618 5519619 BAV2493 BAV2494   holA TRUE 0.974 0.000 0.199 NA N NA
 5519619 5519620 BAV2494 BAV2495 holA proA TRUE 0.702 29.000 0.047 1.000 N NA
 5519620 5519621 BAV2495 BAV2496 proA   TRUE 0.786 9.000 0.003 NA   NA
 5519621 5519622 BAV2496 BAV2497     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 5519624 5519625 BAV2499 BAV2500     TRUE 0.873 3.000 0.014 NA   NA
 5519626 5519627 BAVr04 BAVr05     FALSE 0.247 82.000 0.000 NA   NA
 5519627 5519628 BAVr05 BAVt38   tRNA-Ala(TGC) FALSE 0.008 335.000 0.000 NA   NA
 5519628 5519629 BAVt38 BAVt39 tRNA-Ala(TGC) tRNA-Ile(GAT) TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5519629 5519630 BAVt39 BAVr06 tRNA-Ile(GAT)   FALSE 0.215 95.000 0.000 NA   NA
 5519630 5519631 BAVr06 BAV2501     FALSE 0.002 1110.000 0.000 NA   NA
 5519632 5519633 BAV2502 BAV2503     FALSE 0.332 53.000 0.018 1.000 N NA
 5519634 5519635 BAV2504 BAV2505   eamA TRUE 0.960 -3.000 0.083 1.000   NA
 5519637 5519638 BAV2507 BAV2508     TRUE 0.857 5.000 0.000 NA   NA
 5519643 5519644 BAV2513 BAV2514   acnA3 FALSE 0.021 238.000 0.000 NA   NA
 5519646 5519647 BAV2516 BAV2517     TRUE 0.902 8.000 0.033 NA   NA
 5519647 5519648 BAV2517 BAV2518   efp FALSE 0.221 143.000 0.074 NA   NA
 5519648 5519649 BAV2518 BAV2519 efp   FALSE 0.015 268.000 0.000 1.000   NA
 5519650 5519651 BAV2520 BAV2521     FALSE 0.106 125.000 0.000 NA N NA
 5519653 5519654 BAV2523 BAV2524     FALSE 0.272 97.000 0.023 NA   NA
 5519654 5519655 BAV2524 BAV2525b     FALSE 0.196 102.000 0.000 NA   NA
 5519655 5519656 BAV2525b BAV2525A     FALSE 0.161 113.000 0.000 NA   NA
 5519656 10712366 BAV2525A BAV2525     TRUE 0.836 -69.000 0.000 NA   NA
 10712366 5519657 BAV2525 BAV2526     TRUE 0.596 27.000 0.000 NA   NA
 5519657 5519658 BAV2526 BAV2527     TRUE 0.847 64.000 0.500 NA   NA
 5519658 5519659 BAV2527 BAV2528     FALSE 0.024 229.000 0.000 NA   NA
 5519659 5519660 BAV2528 BAV2529     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519660 10712367 BAV2529 BAV2530     TRUE 0.832 -809.000 0.000 NA   NA
 10712367 5519661 BAV2530 BAV2531     FALSE 0.017 254.000 0.000 NA   NA
 5519661 5519662 BAV2531 BAV2532     TRUE 0.993 -3.000 0.696 1.000   NA
 5519662 5519663 BAV2532 BAV2533     TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5519663 5519664 BAV2533 BAV2534     FALSE 0.205 99.000 0.000 NA   NA
 5519664 5519665 BAV2534 BAV2535     FALSE 0.087 133.000 0.000 NA N NA
 5519666 5519667 BAV2536 BAV2537     FALSE 0.014 270.000 0.000 NA   NA
 5519667 5519668 BAV2537 BAV2538     TRUE 0.571 29.000 0.000 NA   NA
 5519669 5519670 BAV2539 BAV2540     TRUE 0.981 -3.000 0.216 1.000   NA
 5519670 5519671 BAV2540 BAV2541     TRUE 0.998 6.000 0.738 0.052 Y NA
 5519671 5519672 BAV2541 BAV2542     TRUE 0.997 -7.000 0.619 0.052 Y NA
 5519672 5519673 BAV2542 BAV2543     FALSE 0.427 77.000 0.061 1.000 N NA
 5519673 5519674 BAV2543 BAV2544     TRUE 0.928 31.000 0.400 1.000 N NA
 5519674 5519675 BAV2544 BAV2545     FALSE 0.278 56.000 0.012 1.000 N NA
 5519678 5519679 BAV2548 BAV2549 goaG2 gabD TRUE 0.639 76.000 0.167 1.000 N NA
 5519679 5519680 BAV2549 BAV2550 gabD suhB1 FALSE 0.351 117.000 0.100 1.000 N NA
 5519681 5519682 BAV2551 BAV2552 cobB srpH TRUE 0.724 16.000 0.012 1.000 N NA
 5519683 5519684 BAV2553 BAV2554 phbB   TRUE 0.995 10.000 0.588 1.000 Y NA
 5519684 5519685 BAV2554 BAV2555     FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 5519686 5519687 BAVt40 BAV2556 tRNA-Arg(ACG) morB FALSE 0.363 46.000 0.000 NA   NA
 5519687 5519688 BAV2556 BAV2557 morB   TRUE 0.915 25.000 0.224 1.000 N NA
 5519688 5519689 BAV2557 BAVt41   tRNA-Arg(ACG) FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 5519689 5519690 BAVt41 BAVt42 tRNA-Arg(ACG) tRNA-Arg(ACG) FALSE 0.100 138.000 0.000 NA   NA
 5519690 5519691 BAVt42 BAVt43 tRNA-Arg(ACG) tRNA-Ser(GCT) FALSE 0.016 259.000 0.000 NA   NA
 5519691 5519692 BAVt43 BAV2558 tRNA-Ser(GCT) ask FALSE 0.263 76.000 0.000 NA   NA
 5519692 5519693 BAV2558 BAV2559 ask mesJ FALSE 0.250 93.000 0.023 1.000 N NA
 5519693 5519694 BAV2559 BAV2560 mesJ accA TRUE 0.905 19.000 0.123 1.000 N NA
 5519694 5519695 BAV2560 BAV2561 accA aidA TRUE 0.637 37.000 0.059 1.000 N NA
 5519695 5519696 BAV2561 BAV2562 aidA cysS TRUE 0.846 14.000 0.036 1.000 N NA
 5519697 5519698 BAV2563 BAV2564   ppiB FALSE 0.167 132.000 0.031 1.000   NA
 5519698 5519699 BAV2564 BAV2565 ppiB lpxH TRUE 0.966 -7.000 0.136 1.000   NA
 5519700 5519701 BAV2566 BAV2567 bacA   TRUE 0.654 28.000 0.020 1.000   NA
 5519701 5519702 BAV2567 BAV2568   suhB2 FALSE 0.046 161.000 0.005 1.000   NA
 5519703 5519704 BAV2569 BAV2570 lasT   FALSE 0.229 89.000 0.000 NA   NA
 5519704 5519705 BAV2570 BAV2571     TRUE 0.857 5.000 0.000 NA   NA
 5519705 5519706 BAV2571 BAV2572     TRUE 0.833 -575.000 0.000 NA   NA
 5519709 5519710 BAV2575 BAV2576     FALSE 0.317 56.000 0.000 NA   NA
 5519710 5519711 BAV2576 BAV2577     TRUE 0.850 -10.000 0.000 NA   NA
 5519711 5519712 BAV2577 BAV2578     TRUE 0.993 -3.000 0.713 NA   NA
 5519712 5519713 BAV2578 BAV2579     TRUE 0.988 -3.000 0.436 NA N NA
 5519714 5519715 BAV2580 BAV2581     TRUE 0.998 4.000 0.700 0.051 Y NA
 5519715 5519716 BAV2581 BAV2582     TRUE 0.984 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 5519716 5519717 BAV2582 BAV2583     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519717 5519718 BAV2583 BAV2584     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519718 5519719 BAV2584 BAV2585     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5519721 5519722 BAV2587 BAV2588     FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 5519724 5519725 BAV2590 BAV2591 mutS   TRUE 0.840 -3.000 0.004 NA   NA
 5519726 5519727 BAV2592 BAV2593     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 5519727 5519728 BAV2593 BAV2594   dapA2 TRUE 0.929 17.000 0.014 NA Y NA
 5519728 5519729 BAV2594 BAV2595 dapA2   FALSE 0.221 80.000 0.007 1.000   NA
 5519729 5519730 BAV2595 BAV2596     TRUE 0.652 51.000 0.104 NA   NA
 5519731 5519732 BAV2597 BAV2598     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 5519732 5519733 BAV2598 BAV2599     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 5519734 5519735 BAV2600 BAV2601     FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 5519735 5519736 BAV2601 BAV2602     TRUE 0.834 -212.000 0.000 NA   NA
 5519736 5519737 BAV2602 BAV2603     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5519741 5519742 BAV2606 BAV2607     FALSE 0.238 84.000 0.000 NA   NA
 5519742 5519743 BAV2607 BAVt45   tRNA-Arg(TCT) FALSE 0.004 440.000 0.000 NA   NA
 5519744 5519745 BAV2608 BAV2609     FALSE 0.233 86.000 0.000 NA   NA
 5519746 5519747 BAV2610 BAV2611     FALSE 0.128 115.000 0.000 1.000 N NA
 5519747 5519748 BAV2611 BAV2612     FALSE 0.492 35.000 0.000 1.000   NA
 5519748 5519749 BAV2612 BAV2613     TRUE 0.990 -3.000 0.474 1.000   NA
 5519749 5519750 BAV2613 BAV2614     TRUE 0.997 -3.000 0.474 0.051 Y NA
 5519750 5519751 BAV2614 BAV2615     FALSE 0.468 35.000 0.009 1.000   NA
 5519751 5519752 BAV2615 BAV2616     FALSE 0.052 172.000 0.000 1.000   NA
 5519752 5519753 BAV2616 BAV2617     FALSE 0.394 42.000 0.000 NA   NA
 5519753 5519754 BAV2617 BAV2618     FALSE 0.077 151.000 0.000 NA   NA
 5519754 10712368 BAV2618 BAV2619     TRUE 0.835 -120.000 0.000 NA   NA
 5519755 5519756 BAV2620 BAV2621 hdeA gadA1 FALSE 0.275 68.000 0.000 NA   NA
 5519756 10712369 BAV2621 BAV2622 gadA1   TRUE 0.832 -1138.000 0.000 NA   NA
 5519757 5519758 BAV2623 BAV2624 wssI wssH TRUE 0.989 12.000 0.714 NA   NA
 5519758 5519759 BAV2624 BAV2625 wssH wssG TRUE 0.878 76.000 0.714 NA   NA
 5519759 5519760 BAV2625 BAV2626 wssG wssF TRUE 0.974 16.000 0.429 NA   NA
 5519760 5519761 BAV2626 BAV2627 wssF bscS TRUE 0.557 31.000 0.000 1.000   NA
 5519761 5519762 BAV2627 BAV2628 bscS bcsZ TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5519762 5519763 BAV2628 BAV2629 bcsZ bcsB2 TRUE 0.988 -3.000 0.375 1.000   NA
 5519763 5519764 BAV2629 BAV2630 bcsB2 bcsB2 TRUE 0.944 3.000 0.000 0.002   NA
 5519764 5519765 BAV2630 BAV2631 bcsB2 bcsA TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.002   NA
 5519765 5519766 BAV2631 BAV2632 bcsA wssA TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA N NA
 5519766 5519767 BAV2632 BAV2633 wssA   TRUE 0.983 -3.000 0.250 NA   NA
 5519767 5519768 BAV2633 BAV2634   acsD TRUE 0.908 40.000 0.500 NA   NA
 5519769 5519770 BAV2635 BAV2636 algA   TRUE 0.961 8.000 0.000 NA Y NA
 5519771 5519772 BAV2637 BAV2638     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519773 5519774 BAV2639 BAV2640     FALSE 0.347 42.000 0.000 1.000 N NA
 5519774 5519775 BAV2640 BAV2641     TRUE 0.933 16.000 0.000 1.000 Y NA
 5519775 5519776 BAV2641 BAV2642     TRUE 0.949 -3.000 0.071 1.000 N NA
 5519776 5519777 BAV2642 BAV2643     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519778 5519779 BAV2644 BAV2645     TRUE 0.709 19.000 0.000 NA   NA
 5519779 5519780 BAV2645 BAV2646     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519780 5519781 BAV2646 BAV2647     TRUE 0.961 8.000 0.000 NA Y NA
 5519781 5519782 BAV2647 BAV2648     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519782 5519783 BAV2648 BAV2649     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519783 5519784 BAV2649 BAV2650     TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA N NA
 5519784 5519785 BAV2650 BAV2651     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5519785 5519786 BAV2651 BAV2652     FALSE 0.006 336.000 0.000 1.000 N NA
 5519786 5519787 BAV2652 BAV2653     TRUE 0.843 -15.000 0.000 NA   NA
 5519787 5519788 BAV2653 BAVt46   tRNA-Leu(GAG) FALSE 0.004 523.000 0.000 NA   NA
 5519788 5519789 BAVt46 BAV2654 tRNA-Leu(GAG)   FALSE 0.094 140.000 0.000 NA   NA
 5519789 5519790 BAV2654 BAV2655     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 5519790 5519791 BAV2655 BAV2656     TRUE 0.998 -7.000 0.870 0.051 Y NA
 5519791 5519792 BAV2656 BAV2657     TRUE 0.994 1.000 0.356 1.000 Y NA
 5519792 5519793 BAV2657 BAV2658   secG FALSE 0.016 241.000 0.000 1.000 N NA
 5519793 5519794 BAV2658 BAV2659 secG tpiA TRUE 0.914 22.000 0.184 1.000 N NA
 5519794 5519795 BAV2659 BAV2660 tpiA   FALSE 0.267 134.000 0.099 1.000 N NA
 5519796 5519797 BAVt47 BAV2661 tRNA-Ser(TGA)   FALSE 0.003 636.000 0.000 NA   NA
 5519797 5519798 BAV2661 BAV2661A     TRUE 0.585 28.000 0.000 NA   NA
 5519798 5519799 BAV2661A BAV2662     TRUE 0.757 16.000 0.000 NA   NA
 5519799 5519800 BAV2662 BAV2663     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5519801 5519802 BAV2664 BAV2665 tdcB   TRUE 0.797 12.000 0.009 NA   NA
 5519804 5519805 BAV2667 BAV2668 pnp rpsO TRUE 0.882 90.000 0.335 1.000 Y NA
 5519807 5519808 BAV2670 BAV2671 pssA ilvC FALSE 0.082 170.000 0.041 1.000 N NA
 5519808 5519809 BAV2671 BAV2672 ilvC brnP TRUE 0.872 65.000 0.092 0.002 Y NA
 5519809 5519810 BAV2672 BAV2673 brnP ilvI1 TRUE 0.996 11.000 0.371 0.002 Y NA
 5519812 5519813 BAV2675 BAV2676   hbdH TRUE 0.648 20.000 0.007 NA   NA
 5519815 5519816 BAV2677 BAV2678     TRUE 0.833 23.000 0.083 NA N NA
 5519816 5519817 BAV2678 BAV2679     FALSE 0.184 106.000 0.000 1.000   NA
 5519818 5519819 BAV2680 BAV2681     FALSE 0.009 307.000 0.000 NA   NA
 5519822 5519823 BAV2684 BAV2685   serS FALSE 0.005 431.000 0.000 NA   NA
 5519824 5519825 BAV2686 BAV2687 arcD1 adiA TRUE 0.942 50.000 0.429 1.000 Y NA
 5519825 5519826 BAV2687 BAV2688 adiA arcD2 TRUE 0.987 19.000 0.429 1.000 Y NA
 5519826 5519827 BAV2688 BAV2689 arcD2   FALSE 0.053 169.000 0.000 NA   NA
 5519827 5519828 BAV2689 BAV2690     FALSE 0.003 543.000 0.000 NA   NA
 5519828 5519829 BAV2690 BAV2691     FALSE 0.125 127.000 0.000 NA   NA
 5519832 5519833 BAV2694 BAV2695 lolA ftsK TRUE 0.965 0.000 0.130 1.000 N NA
 5519834 5519835 BAV2696 BAV2697 trxB   TRUE 0.923 -13.000 0.053 NA   NA
 5519835 5519836 BAV2697 BAV2698   qacH TRUE 0.939 -3.000 0.047 NA   NA
 5519837 5519838 BAV2699 BAV2700     TRUE 0.994 0.000 0.916 NA   NA
 5519839 5519840 BAV2701 BAV2702 kdpA kdpB TRUE 0.976 20.000 0.091 0.001 Y NA
 5519840 5519841 BAV2702 BAV2703 kdpB kdpC TRUE 0.996 19.000 0.877 0.001 Y NA
 5519841 5519842 BAV2703 BAV2704 kdpC kdpD TRUE 0.936 16.000 0.100 0.085 N NA
 5519842 5519843 BAV2704 BAV2705 kdpD kdpE TRUE 0.983 6.000 0.096 1.000 Y NA
 5519843 5519844 BAV2705 BAV2706 kdpE   FALSE 0.156 114.000 0.000 NA   NA
 5519844 5519845 BAV2706 BAV2707     FALSE 0.266 74.000 0.000 NA   NA
 5519845 5519846 BAV2707 BAV2708   dapA3 TRUE 0.864 3.000 0.000 NA   NA
 5519848 5519849 BAV2710 BAV2711     FALSE 0.166 112.000 0.000 NA   NA
 5519849 5519850 BAV2711 BAV2712     TRUE 0.986 6.000 0.431 NA   NA
 5519853 5519854 BAV2715 BAV2716 dnaJ dnaK TRUE 0.862 113.000 0.236 0.003 Y NA
 5519854 5519855 BAV2716 BAV2717 dnaK   FALSE 0.262 80.000 0.012 1.000   NA
 5519855 5519856 BAV2717 BAV2718   grpE TRUE 0.938 26.000 0.333 1.000   NA
 5519856 5519857 BAV2718 BAV2719 grpE   FALSE 0.216 118.000 0.033 NA   NA
 5519857 5519858 BAV2719 BAV2720   hemH TRUE 0.657 31.000 0.029 NA   NA
 5519858 5519859 BAV2720 BAV2721 hemH hrcA FALSE 0.498 48.000 0.048 1.000 N NA
 5519860 5519861 BAV2722 BAV2723 nadK radB TRUE 0.925 19.000 0.170 1.000 N NA
 5519863 5519864 BAV2725 BAV2726 omlA dapB TRUE 0.830 18.000 0.049 1.000 N NA
 5519867 5519868 BAV2728 BAV2729 dsbG ccmG TRUE 0.997 3.000 0.667 NA Y NA
 5519868 5519869 BAV2729 BAV2730 ccmG   FALSE 0.024 230.000 0.000 NA   NA
 5519870 5519871 BAV2731 BAV2732   acnA4 TRUE 0.887 -3.000 0.018 1.000 N NA
 5519871 5519872 BAV2732 BAV2733 acnA4   TRUE 0.923 45.000 0.733 NA   NA
 5519872 5519873 BAV2733 BAV2734     FALSE 0.247 82.000 0.000 NA   NA
 5519873 5519874 BAV2734 BAVt50   tRNA-Gly(GCC) FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 5519875 5519876 BAV2735 BAV2736   cutL TRUE 0.962 -3.000 0.095 NA   NA
 5519876 5519877 BAV2736 BAV2737 cutL coxS TRUE 0.988 -13.000 0.095 0.044 Y NA
 5519877 5519878 BAV2737 BAV2738 coxS coxM TRUE 0.995 -10.000 0.286 0.002 Y NA
 5519878 5519879 BAV2738 BAV2739 coxM   TRUE 0.972 12.000 0.286 1.000 N NA
 5519879 5519880 BAV2739 BAV2740     TRUE 0.987 10.000 0.500 1.000   NA
 5519880 5519881 BAV2740 BAV2741     FALSE 0.004 565.000 0.000 1.000   NA
 5519881 5519882 BAV2741 BAV2742     TRUE 0.967 33.000 1.000 NA   NA
 5519882 5519883 BAV2742 BAV2743     TRUE 0.992 4.000 0.667 NA   NA
 5519883 5519884 BAV2743 BAV2744   maiA2 TRUE 0.987 13.000 0.667 NA   NA
 5519884 5519885 BAV2744 BAV2745 maiA2   TRUE 0.935 27.000 0.333 1.000   NA
 5519885 5519886 BAV2745 BAV2746     FALSE 0.011 292.000 0.000 1.000   NA
 5519887 5519888 BAVt51 BAV2747 tRNA-Cys(GCA)   FALSE 0.086 145.000 0.000 NA   NA
 5519890 5519891 BAV2749 BAV2750     TRUE 0.810 11.000 0.013 1.000 N NA
 5519891 5519892 BAV2750 BAV2751   aat TRUE 0.939 -3.000 0.058 1.000 N NA
 5519892 5519893 BAV2751 BAV2752 aat ate TRUE 0.950 37.000 0.285 1.000 Y NA
 5519893 5519894 BAV2752 BAV2753 ate pyrD TRUE 0.684 30.000 0.044 1.000 N NA
 5519897 5519898 BAV2756 BAV2757     FALSE 0.156 115.000 0.000 1.000   NA
 5519898 5519899 BAV2757 BAV2758     TRUE 0.883 -3.000 0.011 1.000   NA
 5519901 5519902 BAV2760 BAV2761 rhlE   FALSE 0.118 153.000 0.034 NA   NA
 5519902 5519903 BAV2761 BAV2762     TRUE 0.988 0.000 0.434 NA   NA
 5519904 5519905 BAV2763 BAV2764     TRUE 0.822 23.000 0.065 NA   NA
 5519905 5519906 BAV2764 BAV2765     FALSE 0.206 130.000 0.044 NA   NA
 5519909 5519910 BAV2768 BAV2769 mgtA   FALSE 0.023 231.000 0.000 NA   NA
 5519913 5519914 BAV2772 BAV2773 pepP ubiH TRUE 0.892 38.000 0.396 1.000 N NA
 5519914 5519915 BAV2773 BAV2774 ubiH dusB FALSE 0.343 106.000 0.019 0.011 N NA
 5519915 5519916 BAV2774 BAV2775 dusB fis FALSE 0.231 44.000 0.003 1.000 N NA
 5519916 5519917 BAV2775 BAV2776 fis purH FALSE 0.163 67.000 0.003 1.000 N NA
 5519917 5519918 BAV2776 BAV2777 purH ruvC TRUE 0.889 0.000 0.023 1.000 N NA
 5519918 5519919 BAV2777 BAV2778 ruvC ruvA TRUE 0.940 84.000 0.451 0.007 Y NA
 5519922 5519923 BAV2781 BAV2782 recQ   FALSE 0.193 83.000 0.005 NA   NA
 5519924 5519925 BAV2783 BAV2784 ompB envZ TRUE 0.996 5.000 0.667 1.000 Y NA
 5519926 5519927 BAV2785 BAV2786     TRUE 0.999 -3.000 0.886 0.044 Y NA
 5519928 5519929 BAV2787 BAV2788 glnS minC FALSE 0.031 173.000 0.006 1.000 N NA
 5519929 5519930 BAV2788 BAV2789 minC minD TRUE 0.899 96.000 0.466 1.000 Y NA
 5519930 5519931 BAV2789 BAV2790 minD minE TRUE 0.996 4.000 0.618 NA Y NA
 5519932 5519933 BAV2791 BAV2792 osmB   FALSE 0.033 189.000 0.008 NA   NA
 5519933 5519934 BAV2792 BAV2793     FALSE 0.323 43.000 0.005 1.000   NA
 5519934 5519935 BAV2793 BAV2794   glsA FALSE 0.204 101.000 0.000 1.000   NA
 5519935 5519936 BAV2794 BAV2795 glsA   TRUE 0.892 46.000 0.155 1.000 Y NA
 5519937 5519938 BAV2796 BAV2797 hdeB gadA2 FALSE 0.270 71.000 0.000 NA   NA
 5519941 5519942 BAV2800 BAV2801     TRUE 0.995 -3.000 0.205 0.003 Y NA
 5519942 5519943 BAV2801 BAV2802     TRUE 0.991 8.000 0.233 1.000 Y NA
 5519943 5519944 BAV2802 BAV2803     TRUE 0.996 0.000 0.375 0.050 Y NA
 5519944 5519945 BAV2803 BAV2804     TRUE 0.918 67.000 0.250 0.050 Y NA
 5519945 5519946 BAV2804 BAV2805     FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5519949 5519950 BAV2808 BAV2809   pabB TRUE 0.809 6.000 0.009 1.000 N NA
 5519950 5519951 BAV2809 BAV2810 pabB   TRUE 0.990 8.000 0.219 1.000 Y NA
 5519952 5519953 BAV2811 BAV2812     TRUE 0.848 0.000 0.000 1.000 N NA
 5519953 5519954 BAV2812 BAV2813   macB TRUE 0.988 -3.000 0.303 0.084 N NA
 5519954 5519955 BAV2813 BAV2814 macB macA TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5519955 10712370 BAV2814 BAV2815 macA   TRUE 0.835 -126.000 0.000 NA   NA
 10712370 5519956 BAV2815 BAV2816     FALSE 0.079 150.000 0.000 NA   NA
 5519958 5519959 BAV2818 BAV2819 hagA2 hagB2 FALSE 0.268 73.000 0.000 NA   NA
 5519959 5519960 BAV2819 BAV2820 hagB2 purU FALSE 0.009 322.000 0.000 1.000   NA
 5519960 5519961 BAV2820 BAV2821 purU   TRUE 0.625 29.000 0.018 1.000   NA
 5519961 5519962 BAV2821 BAV2822     TRUE 0.937 5.000 0.018 0.027   NA
 5519962 5519963 BAV2822 BAV2823   pdxH TRUE 0.925 7.000 0.006 0.004   NA
 5519963 5519964 BAV2823 BAV2824 pdxH hagA1 FALSE 0.095 130.000 0.000 NA N NA
 5519966 5519967 BAV2826 BAV2827     TRUE 0.947 -3.000 0.070 NA N NA
 5519967 5519968 BAV2827 BAV2828     FALSE 0.011 293.000 0.000 1.000   NA
 5519970 5519971 BAV2830 BAV2831 cysD2   FALSE 0.005 367.000 0.000 1.000 N NA
 5519972 5519973 BAV2832 BAV2833     TRUE 0.928 81.000 0.558 1.000 Y NA
 5519973 5519974 BAV2833 BAV2834     TRUE 0.998 1.000 0.617 0.050 Y NA
 5519974 5519975 BAV2834 BAV2835     TRUE 0.983 -7.000 0.085 1.000 Y NA
 5519975 5519976 BAV2835 BAV2836     TRUE 0.994 -3.000 0.154 0.025 Y NA
 5519977 5519978 BAV2837 BAV2838     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000 N NA
 5519978 5519979 BAV2838 BAV2839     FALSE 0.220 95.000 0.000 1.000   NA
 5519981 5519982 BAV2841 BAV2842     FALSE 0.297 61.000 0.000 NA   NA
 5519982 5519983 BAV2842 BAV2843     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA   NA
 5519983 5519984 BAV2843 BAV2844     FALSE 0.294 63.000 0.000 1.000   NA
 5519985 5519986 BAV2845 BAV2846     FALSE 0.052 160.000 0.000 1.000 N NA
 5519987 5519988 BAVt52 BAV2847 tRNA-Lys(CTT)   FALSE 0.054 168.000 0.000 NA   NA
 5519988 5519989 BAV2847 BAV2848   tag FALSE 0.069 131.000 0.006 NA N NA
 5519993 5519994 BAVt53 BAV2852 tRNA-Lys(TTT) metQ FALSE 0.133 122.000 0.000 NA   NA
 5519994 5519995 BAV2852 BAV2853 metQ metI TRUE 0.838 44.000 0.073 NA Y NA
 5519995 5519996 BAV2853 BAV2854 metI metN TRUE 0.997 11.000 0.914 1.000 Y NA
 5519996 5519997 BAV2854 BAV2855 metN   FALSE 0.046 200.000 0.034 1.000 N NA
 5519997 5519998 BAV2855 BAV2856     FALSE 0.015 248.000 0.000 1.000 N NA
 5520003 5520004 BAV2861 BAV2862     FALSE 0.303 81.000 0.020 NA   NA
 5520004 5520005 BAV2862 BAV2863     TRUE 0.800 13.000 0.018 NA N NA
 5520005 5520006 BAV2863 BAV2864   pagP FALSE 0.009 308.000 0.000 1.000   NA
 5520007 5520008 BAV2865 BAV2866   grp FALSE 0.440 162.000 0.500 NA N NA
 5520010 5520011 BAV2868 BAV2869   secA2 TRUE 0.848 3.000 0.009 NA   NA
 5520011 5520012 BAV2869 BAV2870 secA2   FALSE 0.242 146.000 0.111 1.000 N NA
 5520014 5520015 BAV2872 BAV2873   asmB FALSE 0.258 78.000 0.000 NA   NA
 5520015 5520016 BAV2873 BAV2874 asmB ftsZ FALSE 0.072 249.000 0.134 1.000 N NA
 5520016 5520017 BAV2874 BAV2875 ftsZ divA TRUE 0.593 183.000 0.460 1.000 Y NA
 5520017 5520018 BAV2875 BAV2876 divA ftsQ TRUE 0.984 5.000 0.389 NA N NA
 5520018 5520019 BAV2876 BAV2877 ftsQ ddl TRUE 0.993 9.000 0.372 NA Y NA
 5520019 5520020 BAV2877 BAV2878 ddl murC TRUE 0.994 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 5520020 5520021 BAV2878 BAV2879 murC murG TRUE 0.994 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 5520021 5520022 BAV2879 BAV2880 murG ftsW TRUE 0.992 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5520022 5520023 BAV2880 BAV2881 ftsW murD TRUE 0.991 -3.000 0.297 0.002 N NA
 5520023 5520024 BAV2881 BAV2882 murD mraY TRUE 0.998 -3.000 0.647 0.004 Y NA
 5520024 5520025 BAV2882 BAV2883 mraY murE TRUE 0.924 26.000 0.011 0.004 Y NA
 5520025 5520026 BAV2883 BAV2884 murE ftsI TRUE 0.987 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 5520026 5520027 BAV2884 BAV2885 ftsI ftsL TRUE 0.967 -3.000 0.124 1.000 N NA
 5520027 5520028 BAV2885 BAV2886 ftsL mraW TRUE 0.978 0.000 0.227 1.000 N NA
 5520028 5520029 BAV2886 BAV2887 mraW mraZ TRUE 0.990 9.000 0.635 NA   NA
 5520029 5520030 BAV2887 BAVs03 mraZ   FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5520032 5520033 BAV2889 BAV2890 pyrC   TRUE 0.769 13.000 0.007 1.000   NA
 5520035 5520036 BAV2892 BAV2892a     FALSE 0.006 362.000 0.000 NA   NA
 5520036 5520037 BAV2892a BAVr07     FALSE 0.247 82.000 0.000 NA   NA
 5520037 5520038 BAVr07 BAVt54   tRNA-Ala(TGC) FALSE 0.008 335.000 0.000 NA   NA
 5520038 5520039 BAVt54 BAVt55 tRNA-Ala(TGC) tRNA-Ile(GAT) TRUE 0.831 11.000 0.000 NA   NA
 5520039 5520040 BAVt55 BAVr08 tRNA-Ile(GAT)   FALSE 0.215 95.000 0.000 NA   NA
 5520040 5520041 BAVr08 BAV2893   alsB FALSE 0.003 954.000 0.000 NA   NA
 5520043 5520044 BAV2895 BAV2896 msrA   TRUE 0.795 22.000 0.054 1.000 N NA
 5520046 5520047 BAV2898 BAV2899     FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 5520047 5520048 BAV2899 BAV2900     TRUE 0.833 0.000 0.005 NA   NA
 5520049 5520050 BAV2901 BAV2902     TRUE 0.665 22.000 0.000 NA   NA
 5520050 5520051 BAV2902 BAV2903   glxR FALSE 0.011 293.000 0.000 NA   NA
 5520053 5520054 BAV2905 BAV2906     FALSE 0.204 101.000 0.000 1.000   NA
 5520055 5520056 BAV2907 BAV2908     TRUE 0.994 17.000 0.900 1.000 Y NA
 5520056 5520057 BAV2908 BAV2909   nudH TRUE 0.710 14.000 0.007 1.000 N NA
 5520058 5520059 BAV2910 BAV2911 drpA   FALSE 0.253 54.000 0.004 1.000   NA
 5520059 5520060 BAV2911 BAV2912   tolQ TRUE 0.991 3.000 0.593 1.000   NA
 5520060 5520061 BAV2912 BAV2913 tolQ tolR TRUE 0.997 0.000 0.556 0.056 Y NA
 5520061 5520062 BAV2913 BAV2914 tolR tolA TRUE 0.899 8.000 0.000 0.083 N NA
 5520062 5520063 BAV2914 BAV2915 tolA tolB TRUE 0.922 8.000 0.000 0.005 N NA
 5520063 5520064 BAV2915 BAV2916 tolB excC TRUE 0.946 32.000 0.592 1.000 N NA
 5520064 5520065 BAV2916 BAV2917 excC   TRUE 0.642 83.000 0.167 1.000   NA
 5520065 5520066 BAV2917 BAV2918     FALSE 0.205 99.000 0.000 NA   NA
 5520067 5520068 BAV2919 BAV2920 far   FALSE 0.004 393.000 0.000 1.000 N NA
 5520068 5520069 BAV2920 BAV2921     TRUE 0.653 88.000 0.200 NA   NA
 5520069 5520070 BAV2921 BAV2922     TRUE 0.673 82.000 0.200 NA   NA
 5520071 5520072 BAV2923 BAV2924     TRUE 0.830 22.000 0.025 0.083   NA
 5520075 5520076 BAV2927 BAV2928 arnT gtrB TRUE 0.981 -3.000 0.048 NA Y NA
 5520078 5520079 BAV2930 BAVt56   tRNA-Val(CAC) FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5520079 5520080 BAVt56 BAV2931 tRNA-Val(CAC) dnaQ FALSE 0.328 53.000 0.000 NA   NA
 5520080 5520081 BAV2931 BAV2932 dnaQ   TRUE 0.593 20.000 0.007 NA N NA
 5520081 5520082 BAV2932 BAV2933     TRUE 0.987 15.000 0.900 NA N NA
 5520082 5520083 BAV2933 BAV2934   dasF FALSE 0.065 141.000 0.008 1.000 N NA
 5520083 5520084 BAV2934 BAV2935 dasF   FALSE 0.224 61.000 0.003 1.000   NA
 5520085 5520086 BAV2936 BAV2937 gloB mltD TRUE 0.976 8.000 0.233 1.000   NA
 5520086 5520087 BAV2937 BAV2938 mltD envM FALSE 0.414 56.000 0.037 1.000 N NA
 5520087 5520088 BAV2938 BAV2939 envM   FALSE 0.394 42.000 0.000 NA   NA
 5520089 5520090 BAV2940 BAV2941   nadC FALSE 0.214 75.000 0.005 1.000   NA
 5520090 5520091 BAV2941 BAV2942 nadC   FALSE 0.199 99.000 0.010 1.000   NA
 5520091 5520092 BAV2942 BAV2943     FALSE 0.179 108.000 0.000 1.000   NA
 5520093 5520094 BAV2944 BAV2945     FALSE 0.522 33.000 0.000 NA   NA
 5520098 5520099 BAV2949 BAV2950     FALSE 0.328 53.000 0.000 NA   NA
 5520102 5520103 BAVt57 BAV2953 tRNA-Ser(GGA)   FALSE 0.026 223.000 0.000 NA   NA
 5520103 5520104 BAV2953 BAV2954     TRUE 0.994 -3.000 0.761 NA   NA
 5520104 5520105 BAV2954 BAV2955     TRUE 0.986 14.000 0.683 NA   NA
 5520105 5520106 BAV2955 BAV2956   ribE FALSE 0.006 346.000 0.000 NA N NA
 5520106 5520107 BAV2956 BAV2957 ribE ribD TRUE 0.994 11.000 0.456 1.000 Y NA
 5520108 5520109 BAV2958 BAV2959     TRUE 0.990 0.000 0.596 1.000 N NA
 5520110 5520111 BAV2960 BAV2961 ribX glyA FALSE 0.174 147.000 0.069 NA N NA
 5520111 5520112 BAV2961 BAV2962 glyA   FALSE 0.032 200.000 0.000 NA   NA
 5520112 5520113 BAV2962 BAV2963   tyrS FALSE 0.304 44.000 0.005 NA   NA
 5520114 5520115 BAV2964 BAV2965     TRUE 0.972 2.000 0.184 1.000 N NA
 5520116 5520117 BAV2966 BAV2967     FALSE 0.182 88.000 0.005 NA   NA
 5520117 5520118 BAV2967 BAV2968   argC FALSE 0.482 29.000 0.004 NA   NA
 5520118 5520119 BAV2968 BAV2969 argC rpsI FALSE 0.122 142.000 0.032 1.000 N NA
 5520119 5520120 BAV2969 BAV2970 rpsI rplM TRUE 0.997 10.000 0.601 0.012 Y NA
 5520120 5520121 BAV2970 BAV2971 rplM   FALSE 0.015 247.000 0.000 NA N NA
 5520121 5520122 BAV2971 BAV2972     FALSE 0.224 91.000 0.000 NA   NA
 5520122 5520123 BAV2972 BAV2973   pmbA FALSE 0.009 307.000 0.000 NA   NA
 5520124 5520125 BAV2974 BAV2975   estB TRUE 0.849 8.000 0.000 NA   NA
 5520128 5520129 BAV2978 BAV2979     FALSE 0.532 53.000 0.058 NA   NA
 5520129 5520130 BAV2979 BAV2980     FALSE 0.145 170.000 0.083 NA   NA
 5520131 5520132 BAV2981 BAV2982   nrdA FALSE 0.008 302.000 0.000 1.000 N NA
 5520132 5520133 BAV2982 BAV2983 nrdA nrdB TRUE 0.993 22.000 0.564 0.001 Y NA
 5520133 5520134 BAV2983 BAV2984 nrdB bph1 FALSE 0.010 304.000 0.000 1.000   NA
 5520137 5520138 BAV2987 BAV2988 dltA dltB TRUE 0.982 11.000 0.435 NA N NA
 5520138 5520139 BAV2988 BAV2989 dltB   TRUE 0.825 11.000 0.010 NA   NA
 5520139 5520140 BAV2989 BAV2990   dltD TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 5520140 5520141 BAV2990 BAV2991 dltD   TRUE 0.901 -19.000 0.036 NA   NA
 5520141 5520142 BAV2991 BAV2992   slyB FALSE 0.015 266.000 0.000 1.000   NA
 5520142 5520143 BAV2992 BAV2993 slyB adoK FALSE 0.035 182.000 0.011 1.000 N NA
 5520143 5520144 BAV2993 BAV2994 adoK   TRUE 0.837 10.000 0.011 NA   NA
 5520144 5520145 BAV2994 BAV2995   prmA TRUE 0.586 22.000 0.004 NA   NA
 5520145 5520146 BAV2995 BAV2996 prmA accC TRUE 0.571 91.000 0.152 1.000 N NA
 5520146 5520147 BAV2996 BAV2997 accC accB TRUE 0.995 9.000 0.275 0.001 Y NA
 5520147 5520148 BAV2997 BAV2998 accB aroQ TRUE 0.674 91.000 0.254 1.000 N NA
 5520148 5520149 BAV2998 BAV2999 aroQ   FALSE 0.318 76.000 0.019 1.000   NA
 5520150 5520151 BAV3000 BAV3001 mpl   TRUE 0.932 11.000 0.072 NA   NA
 5520151 5520152 BAV3001 BAV3002     TRUE 0.702 48.000 0.122 NA   NA
 5520152 5520153 BAV3002 BAV3003     TRUE 0.753 55.000 0.225 1.000 N NA
 5520153 5520154 BAV3003 BAV3004   aroE TRUE 0.936 -3.000 0.054 1.000 N NA
 5520154 5520155 BAV3004 BAV3005 aroE mtgA TRUE 0.552 83.000 0.107 1.000   NA
 5520155 5520156 BAV3005 BAV3006 mtgA   FALSE 0.339 90.000 0.005 0.042   NA
 5520156 5520157 BAV3006 BAV3007   apaH FALSE 0.297 48.000 0.005 1.000   NA
 5520158 5520159 BAV3008 BAV3009   pyrC TRUE 0.931 -3.000 0.047 1.000 N NA
 5520159 5520160 BAV3009 BAV3010 pyrC pyrB TRUE 0.995 3.000 0.452 1.000 Y NA
 5520160 5520161 BAV3010 BAV3011 pyrB yqgF TRUE 0.878 4.000 0.022 1.000 N NA
 5520161 5520162 BAV3011 BAV3012 yqgF   TRUE 0.978 -7.000 0.263 NA N NA
 5520162 5520163 BAV3012 BAV3013   rub FALSE 0.155 86.000 0.006 NA N NA
 5520164 5520165 BAV3014 BAV3015 thiD thiE TRUE 0.993 -3.000 0.209 1.000 Y NA
 5520165 5520166 BAV3015 BAV3016 thiE hemL TRUE 0.989 5.000 0.173 1.000 Y NA
 5520166 5520167 BAV3016 BAV3017 hemL   FALSE 0.022 221.000 0.000 1.000 N NA
 5520168 5520169 BAV3018 BAV3019     TRUE 0.955 17.000 0.243 NA   NA
 5520169 5520170 BAV3019 BAV3020     TRUE 0.972 0.000 0.146 1.000   NA
 5520170 5520171 BAV3020 BAV3021     TRUE 0.955 39.000 0.378 1.000 Y NA
 5520171 5520172 BAV3021 BAV3022     TRUE 0.997 4.000 0.742 1.000 Y NA
 5520172 5520173 BAV3022 BAV3023     TRUE 0.979 17.000 0.113 0.057 Y NA
 5520173 5520174 BAV3023 BAV3024     TRUE 0.968 -3.000 0.068 0.026 N NA
 5520174 5520175 BAV3024 BAV3025     FALSE 0.081 139.000 0.000 1.000 N NA
 5520175 5520176 BAV3025 BAV3026     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5520176 5520177 BAV3026 BAV3027     TRUE 0.962 34.000 0.911 NA   NA
 5520177 5520178 BAV3027 BAV3028     TRUE 0.901 22.000 0.133 NA   NA
 5520178 5520179 BAV3028 BAV3029     FALSE 0.009 292.000 0.000 1.000 N NA
 5520179 5520180 BAV3029 BAV3030     TRUE 0.998 -6.000 1.000 0.025 Y NA
 5520180 5520181 BAV3030 BAV3031     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5520181 5520182 BAV3031 BAV3032     TRUE 0.997 8.000 0.667 0.049 Y NA
 5520182 5520183 BAV3032 BAV3033     TRUE 0.959 63.000 0.833 1.000 Y NA
 5520184 5520185 BAV3034 BAV3035     FALSE 0.536 48.000 0.049 NA   NA
 5520185 5520186 BAV3035 BAV3036   argJ FALSE 0.159 89.000 0.003 NA   NA
 5520186 5520187 BAV3036 BAV3037 argJ   FALSE 0.121 164.000 0.056 1.000   NA
 5520187 5520188 BAV3037 BAV3038     TRUE 0.923 -7.000 0.045 1.000   NA
 5520188 5520189 BAV3038 BAV3039     FALSE 0.081 139.000 0.000 1.000 N NA
 5520190 5520191 BAV3040 BAV3041     TRUE 0.990 -3.000 0.556 NA N NA
 5520191 5520192 BAV3041 BAV3042     TRUE 0.997 -3.000 0.741 NA Y NA
 5520192 5520193 BAV3042 BAV3043     TRUE 0.961 7.000 0.143 NA N NA
 5520193 5520194 BAV3043 BAV3044     FALSE 0.063 177.000 0.021 NA   NA
 5520194 5520195 BAV3044 BAV3045   coaE TRUE 0.688 46.000 0.110 NA   NA
 5520195 5520196 BAV3045 BAV3046 coaE   TRUE 0.945 12.000 0.122 1.000 N NA
 5520198 5520199 BAV3048 BAV3049 panC   TRUE 0.573 33.000 0.018 NA   NA
 5520199 5520200 BAV3049 BAV3050     TRUE 0.792 23.000 0.048 NA   NA
 5520201 5520202 BAV3051 BAV3052   glpK TRUE 0.818 -10.000 0.006 1.000   NA
 5520203 5520204 BAV3053 BAV3054     TRUE 0.879 18.000 0.071 NA   NA
 5520204 5520205 BAV3054 BAV3055   aapP FALSE 0.156 134.000 0.028 1.000   NA
 5520205 5520206 BAV3055 BAV3056 aapP aapM TRUE 0.751 50.000 0.028 1.000 Y NA
 5520206 5520207 BAV3056 BAV3057 aapM aapQ TRUE 0.996 2.000 0.375 0.007 Y NA
 5520207 5520208 BAV3057 BAV3058 aapQ aapJ TRUE 0.899 105.000 0.375 0.049 Y NA
 5520209 5520210 BAV3059 BAV3060 ftsE ftsX TRUE 0.978 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 5520210 5520211 BAV3060 BAV3061 ftsX   FALSE 0.013 261.000 0.000 1.000 N NA
 5520217 5520218 BAV3067 BAV3068 btuB btuF TRUE 0.752 16.000 0.016 1.000 N NA
 5520218 5520219 BAV3068 BAV3069 btuF thiG FALSE 0.007 265.000 0.003 1.000 N NA
 5520219 5520220 BAV3069 BAV3070 thiG thiD TRUE 0.981 -3.000 0.003 0.003 Y NA
 5520220 5520221 BAV3070 BAV3071 thiD pcm FALSE 0.214 71.000 0.009 1.000 N NA
 5520221 5520222 BAV3071 BAV3072 pcm tolC TRUE 0.874 6.000 0.023 1.000 N NA
 5520223 5520224 BAV3073 BAV3074 aut   TRUE 0.638 38.000 0.051 1.000   NA
 5520224 5520225 BAV3074 BAV3075   aarF FALSE 0.037 183.000 0.007 1.000   NA
 5520225 5520226 BAV3075 BAV3076 aarF   TRUE 0.989 -3.000 0.432 1.000   NA
 5520226 5520227 BAV3076 BAV3077     FALSE 0.261 79.000 0.000 1.000   NA
 5520227 5520228 BAV3077 BAV3078     TRUE 0.971 -3.000 0.000 NA Y NA
 5520228 5520229 BAV3078 BAV3079     TRUE 0.864 3.000 0.000 NA   NA
 5520229 5520230 BAV3079 BAV3080     TRUE 0.867 3.000 0.000 1.000   NA
 5520230 5520231 BAV3080 BAV3081     TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5520231 5520232 BAV3081 BAV3082     TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5520232 5520233 BAV3082 BAV3083     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.026 Y NA
 5520233 5520234 BAV3083 BAV3084     TRUE 0.956 11.000 0.000 NA Y NA
 5520234 5520235 BAV3084 BAV3085     TRUE 0.981 -3.000 0.219 NA   NA
 5520235 5520236 BAV3085 BAV3086     TRUE 0.860 -7.000 0.000 1.000   NA
 5520236 5520237 BAV3086 BAV3087     TRUE 0.966 2.000 0.000 NA Y NA
 5520237 5520238 BAV3087 BAV3088     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5520238 5520239 BAV3088 BAV3089   ubiE FALSE 0.158 145.000 0.044 1.000   NA
 5520240 5520241 BAV3090 BAV3091 phoB phoR TRUE 0.995 13.000 0.453 0.013 Y NA
 5520241 5520242 BAV3091 BAV3092 phoR   FALSE 0.092 141.000 0.000 NA   NA
 5520242 5520243 BAV3092 BAV3093   serA FALSE 0.073 153.000 0.000 NA   NA
 5520245 5520246 BAV3095 BAV3096   kipI TRUE 0.720 22.000 0.020 NA   NA
 5520246 5520247 BAV3096 BAV3097 kipI kipA TRUE 0.986 -3.000 0.085 NA Y NA
 5520247 5520248 BAV3097 BAV3098 kipA   TRUE 0.965 -3.000 0.101 NA   NA
 5520249 5520250 BAV3099 BAV3100     TRUE 0.574 31.000 0.020 1.000 N NA
 5520250 5520251 BAV3100 BAV3101     FALSE 0.246 115.000 0.039 NA   NA
 5520254 5520255 BAV3104 BAV3105     FALSE 0.080 149.000 0.000 NA   NA
 5520256 5520257 BAV3106 BAV3107 apt cydC FALSE 0.176 63.000 0.004 1.000 N NA
 5520257 5520258 BAV3107 BAV3108 cydC cydD TRUE 0.998 2.000 0.631 0.003 Y NA
 5520258 5520259 BAV3108 BAV3109 cydD   TRUE 0.893 -3.000 0.014 NA   NA
 5520259 5520260 BAV3109 BAV3110   cydB2 TRUE 0.960 15.000 0.230 NA   NA
 5520260 5520261 BAV3110 BAV3111 cydB2 cydA2 TRUE 0.996 18.000 0.953 0.043 Y NA
 5520261 5520262 BAV3111 BAV3112 cydA2   FALSE 0.528 57.000 0.071 1.000 N NA
 5520262 5520263 BAV3112 BAV3113   purT FALSE 0.014 259.000 0.013 1.000 N NA
 5520264 5520265 BAV3114 BAV3115 kdsD kdsC TRUE 0.992 -3.000 0.598 1.000   NA
 5520265 5520266 BAV3115 BAV3116 kdsC   TRUE 0.990 6.000 0.617 NA   NA
 5520266 5520267 BAV3116 BAV3117     TRUE 0.990 -3.000 0.459 NA   NA
 5520267 5520268 BAV3117 BAV3118     TRUE 0.928 37.000 0.543 NA   NA
 5520269 5520270 BAV3119 BAV3120   ada FALSE 0.017 237.000 0.000 1.000 N NA
 5520270 5520271 BAV3120 BAV3121 ada aidD FALSE 0.391 94.000 0.068 NA N NA
 5520271 5520272 BAV3121 BAV3122 aidD   FALSE 0.202 83.000 0.000 NA N NA
 5520273 5520274 BAV3123 BAV3124     TRUE 0.986 4.000 0.400 1.000   NA
 5520274 5520275 BAV3124 BAV3125     TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000   NA
 5520275 5520276 BAV3125 BAV3126     FALSE 0.004 427.000 0.000 1.000 N NA
 5520276 5520277 BAV3126 BAV3127     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 5520277 5520278 BAV3127 BAV3128     TRUE 0.955 34.000 0.750 NA   NA
 5520278 5520279 BAV3128 BAV3129     TRUE 0.662 51.000 0.107 1.000   NA
 5520280 5520281 BAV3130 BAV3131 bhuV bhuU TRUE 0.994 0.000 0.292 1.000 Y NA
 5520281 5520282 BAV3131 BAV3132 bhuU bhuT TRUE 0.997 -16.000 0.852 1.000 Y NA
 5520282 5520283 BAV3132 BAV3133 bhuT bhuS TRUE 0.994 8.000 0.384 1.000 Y NA
 5520283 5520284 BAV3133 BAV3134 bhuS bhuR TRUE 0.688 57.000 0.016 1.000 Y NA
 5520284 5520285 BAV3134 BAV3135 bhuR hurR FALSE 0.287 196.000 0.111 NA Y NA
 5520285 5520286 BAV3135 BAV3136 hurR hurI TRUE 0.983 -3.000 0.286 NA N NA
 5520287 5520288 BAV3137 BAV3138     TRUE 0.980 -16.000 0.320 NA   NA
 5520288 5520289 BAV3138 BAV3139     TRUE 0.989 7.000 0.600 NA N NA
 5520290 5520291 BAV3140 BAV3141     FALSE 0.400 42.000 0.012 NA   NA
 5520292 10712371 BAV3142 BAV3143B fdnG   TRUE 0.709 19.000 0.000 NA   NA
 10712371 10712372 BAV3143B BAV3143     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA   NA
 10712372 10712373 BAV3143 BAV3143A     FALSE 0.003 709.000 0.000 NA   NA
 10712373 5520293 BAV3143A BAV3144   fdnH TRUE 0.551 31.000 0.000 NA   NA
 5520293 5520294 BAV3144 BAV3145 fdnH fdnI TRUE 0.996 -7.000 0.333 0.001 Y NA
 5520294 5520295 BAV3145 BAV3146 fdnI fdhE TRUE 0.639 80.000 0.182 NA N NA
 5520295 5520296 BAV3146 BAV3147 fdhE selA TRUE 0.953 -3.000 0.083 NA N NA
 5520296 5520297 BAV3147 BAV3148 selA SelB(TCA) TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.001 N NA
 5520297 5520298 BAV3148 BAVt58 SelB(TCA)   TRUE 0.845 9.000 0.000 NA   NA
 5520298 5520299 BAVt58 BAV3149   fdhB FALSE 0.343 50.000 0.000 NA   NA
 5520302 5520303 BAV3152 BAV3153 trpC trpD TRUE 0.994 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 5520303 5520304 BAV3153 BAV3154 trpD pabA TRUE 0.969 17.000 0.105 1.000 Y NA
 5520305 5520306 BAV3155 BAV3155A     FALSE 0.268 73.000 0.000 NA   NA
 5520306 5520307 BAV3155A BAV3156   ptsN TRUE 0.872 0.000 0.000 NA   NA
 5520307 5520308 BAV3156 BAV3157 ptsN hprK TRUE 0.983 14.000 0.177 1.000 Y NA
 5520308 5520309 BAV3157 BAV3158 hprK   TRUE 0.611 99.000 0.194 NA   NA
 5520309 5520310 BAV3158 BAV3159     TRUE 0.851 -3.000 0.006 NA   NA
 5520311 5520312 BAV3160 BAV3161 ogt   TRUE 0.846 -3.000 0.004 1.000   NA
 5520313 5520314 BAV3162 BAV3163   gmhA TRUE 0.836 35.000 0.187 1.000 N NA
 5520314 5520315 BAV3163 BAV3164 gmhA   TRUE 0.991 0.000 0.613 NA   NA
 5520315 5520316 BAV3164 BAV3165     TRUE 0.899 -3.000 0.017 NA   NA
 5520318 5520319 BAV3167 BAV3168 argB   TRUE 0.949 0.000 0.069 1.000   NA
 5520319 5520320 BAV3168 BAV3169     TRUE 0.846 30.000 0.122 1.000   NA
 5520320 5520321 BAV3169 BAV3170     FALSE 0.060 153.000 0.000 1.000 N NA
 5520321 5520322 BAV3170 BAV3171   ldh TRUE 0.959 11.000 0.156 1.000 N NA
 5520323 5520324 BAV3172 BAV3173 mrdB mrdA TRUE 0.950 -3.000 0.073 1.000 N NA
 5520324 5520325 BAV3173 BAV3174 mrdA mreD TRUE 0.980 12.000 0.108 1.000 Y NA
 5520325 5520326 BAV3174 BAV3175 mreD mreC TRUE 0.984 35.000 0.550 0.002 Y NA
 5520326 5520327 BAV3175 BAV3176 mreC envB TRUE 0.849 85.000 0.689 1.000 N NA
 5520328 5520329 BAV3177 BAV3178 gatC gatA TRUE 0.998 4.000 0.643 0.002 Y NA
 5520329 5520330 BAV3178 BAV3179 gatA gatB TRUE 0.997 3.000 0.492 0.002 Y NA
 5520331 5520332 BAV3180 BAV3181 pyrE crc FALSE 0.492 99.000 0.118 1.000 N NA
 5520336 5520337 BAV3185 BAV3186 ampG metW FALSE 0.187 114.000 0.018 NA   NA
 5520337 5520338 BAV3186 BAV3187 metW metX TRUE 0.991 -3.000 0.509 NA   NA
 5520339 5520340 BAV3188 BAV3189 gshA   FALSE 0.512 34.000 0.018 1.000 N NA
 5520340 5520341 BAV3189 BAV3190     FALSE 0.018 234.000 0.000 1.000 N NA
 5520341 5520342 BAV3190 BAV3191     FALSE 0.113 132.000 0.000 1.000   NA
 5520345 5520346 BAV3193 BAV3194 dcaH   TRUE 0.799 36.000 0.143 1.000 N NA
 5520346 5520347 BAV3194 BAV3195   dcaA TRUE 0.838 109.000 1.000 1.000 N NA
 5520347 5520348 BAV3195 BAV3196 dcaA   TRUE 0.985 6.000 0.429 1.000 N NA
 5520349 5520350 BAV3197 BAV3198   dcaE TRUE 0.949 -3.000 0.060 1.000   NA
 5520352 5520353 BAV3200 BAV3201     FALSE 0.167 91.000 0.004 NA   NA
 5520353 5520354 BAV3201 BAV3202     FALSE 0.016 259.000 0.000 NA   NA
 5520354 5520355 BAV3202 BAV3203     FALSE 0.072 291.000 0.000 0.048 Y NA
 5520355 5520356 BAV3203 BAV3204     TRUE 0.995 9.000 0.333 0.048 Y NA
 5520356 5520357 BAV3204 BAV3205     TRUE 0.997 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 5520357 5520358 BAV3205 BAV3206     TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.003 Y NA
 5520358 5520359 BAV3206 BAV3207     TRUE 0.834 3.000 0.006 NA   NA
 5520359 5520360 BAV3207 BAV3208     TRUE 0.552 26.000 0.006 NA   NA
 5520361 5520362 BAV3209 BAV3210 rep priA TRUE 0.751 53.000 0.005 0.032 Y NA
 5520362 5520363 BAV3210 BAV3211 priA hemE FALSE 0.007 327.000 0.000 1.000 N NA
 5520363 5520364 BAV3211 BAV3212 hemE   FALSE 0.260 77.000 0.000 NA   NA
 5520364 5520365 BAV3212 BAV3213   atpC FALSE 0.043 183.000 0.000 NA   NA
 5520365 5520366 BAV3213 BAV3214 atpC atpD TRUE 0.998 10.000 0.837 0.003 Y NA
 5520366 5520367 BAV3214 BAV3215 atpD atpG TRUE 0.985 38.000 0.724 0.003 Y NA
 5520367 5520368 BAV3215 BAV3216 atpG atpA TRUE 0.961 99.000 0.846 0.003 Y NA
 5520368 5520369 BAV3216 BAV3217 atpA atpH TRUE 0.987 38.000 0.864 0.003 Y NA
 5520369 5520370 BAV3217 BAV3218 atpH atpF TRUE 0.993 13.000 0.242 0.003 Y NA
 5520370 5520371 BAV3218 BAV3219 atpF atpE TRUE 0.803 130.000 0.666 0.003   NA
 5520371 5520372 BAV3219 BAV3220 atpE atpB TRUE 0.818 116.000 0.557 0.003   NA
 5520372 5520373 BAV3220 BAV3221 atpB atpI TRUE 0.785 67.000 0.330 1.000   NA
 5520373 5520374 BAV3221 BAV3222 atpI   FALSE 0.004 459.000 0.000 1.000   NA
 5520377 5520378 BAV3225 BAV3226 folB   TRUE 0.884 3.000 0.025 NA N NA
 5520379 5520380 BAV3227 BAV3228     FALSE 0.008 326.000 0.000 NA   NA
 5520380 5520381 BAV3228 BAV3229   dsbC TRUE 0.683 36.000 0.059 1.000   NA
 5520381 5520382 BAV3229 BAV3230 dsbC visC TRUE 0.971 27.000 0.814 1.000   NA
 5520382 5520383 BAV3230 BAV3231 visC mltA TRUE 0.867 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5520383 5520384 BAV3231 BAV3232 mltA apaG TRUE 0.904 12.000 0.063 NA N NA
 5520385 5520386 BAV3233 BAV3234 cbbeP cbbzC TRUE 0.972 8.000 0.192 1.000   NA
 5520386 5520387 BAV3234 BAV3235 cbbzC trpE FALSE 0.132 240.000 0.233 1.000   NA
 5520388 5520389 BAV3236 BAV3237     TRUE 0.807 7.000 0.005 NA   NA
 5520389 5520390 BAV3237 BAV3238   csiD FALSE 0.008 323.000 0.000 NA   NA
 5520392 5520393 BAV3240 BAV3241     TRUE 0.636 101.000 0.250 1.000 N NA
 5520395 5520396 BAV3243 BAV3244     TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 5520396 5520397 BAV3244 BAV3245     FALSE 0.245 71.000 0.008 NA   NA
 5520399 5520400 BAV3247 BAV3248     TRUE 0.805 20.000 0.000 0.042 N NA
 5520400 5520401 BAV3248 BAV3249     TRUE 0.888 17.000 0.000 0.001   NA
 5520401 5520402 BAV3249 BAV3250     FALSE 0.005 396.000 0.000 NA   NA
 5520403 5520404 BAV3251 BAV3252     FALSE 0.003 944.000 0.000 NA   NA
 5520404 5520405 BAV3252 BAV3253     FALSE 0.067 158.000 0.000 1.000   NA
 5520406 5520407 BAV3254 BAV3255     TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA N NA
 5520407 5520408 BAV3255 BAV3256     TRUE 0.553 26.000 0.000 NA N NA
 5520408 5520409 BAV3256 BAV3257     TRUE 0.734 43.000 0.000 1.000 Y NA
 5520409 5520410 BAV3257 BAV3258     FALSE 0.374 83.000 0.000 0.026 N NA
 5520411 5520412 BAV3259 BAV3260     FALSE 0.349 50.000 0.000 1.000   NA
 5520412 5520413 BAV3260 BAV3261     FALSE 0.271 74.000 0.000 1.000   NA
 5520414 5520415 BAV3262 BAV3263     TRUE 0.971 -3.000 0.000 NA Y NA
 5520416 5520417 BAV3264 BAV3265   etfB2 TRUE 0.599 108.000 0.000 0.042 Y NA
 5520417 5520418 BAV3265 BAV3266 etfB2 etfA2 TRUE 0.942 21.000 0.000 0.012 Y NA
 5520418 5520419 BAV3266 BAV3267 etfA2   FALSE 0.213 98.000 0.000 1.000   NA
 5520419 5520420 BAV3267 BAV3268   bcpA TRUE 0.867 3.000 0.000 1.000   NA
 5520420 5520421 BAV3268 BAV3269 bcpA   FALSE 0.004 503.000 0.000 1.000   NA
 5520424 5520425 BAV3272 BAV3273   rkpK TRUE 0.985 -3.000 0.073 1.000 Y NA
 5520425 5520426 BAV3273 BAV3274 rkpK   TRUE 0.852 69.000 0.600 1.000 N NA
 5520426 5520427 BAV3274 BAV3275   glmU TRUE 0.796 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5520427 5520428 BAV3275 BAV3276 glmU   FALSE 0.226 60.000 0.003 NA   NA
 5520428 5520429 BAV3276 BAV3277     TRUE 0.883 -3.000 0.000 NA   NA
 5520431 5520432 BAV3279 BAV3280   cyoE TRUE 0.588 25.000 0.007 1.000   NA
 5520432 5520433 BAV3280 BAV3281 cyoE   TRUE 0.970 29.000 0.321 1.000 Y NA
 5520437 5520438 BAV3285 BAV3286 fam   FALSE 0.196 102.000 0.000 NA   NA
 5520438 5520439 BAV3286 BAV3287     FALSE 0.199 101.000 0.000 NA   NA
 5520439 5520440 BAV3287 BAV3288     FALSE 0.409 59.000 0.029 NA   NA
 5520440 5520441 BAV3288 BAV3289   adhC TRUE 0.895 2.000 0.019 1.000   NA
 5520442 5520443 BAV3290 BAV3291   aspB FALSE 0.008 342.000 0.015 1.000   NA
 5520443 5520444 BAV3291 BAV3292 aspB aspB TRUE 0.995 9.000 0.236 0.001 Y NA
 5520444 5520445 BAV3292 BAV3293 aspB hyuB FALSE 0.218 162.000 0.000 1.000 Y NA
 5520445 5520446 BAV3293 BAV3294 hyuB hyuA TRUE 0.996 11.000 0.357 0.001 Y NA
 5520446 5520447 BAV3294 BAV3295 hyuA   TRUE 0.786 50.000 0.250 1.000 N NA
 5520448 5520449 BAV3296 BAV3297     FALSE 0.201 187.000 0.219 NA N NA
 5520449 5520450 BAV3297 BAV3298     TRUE 0.998 -10.000 0.886 0.003 Y NA
 5520450 5520451 BAV3298 BAV3299   accC TRUE 0.946 -3.000 0.067 1.000 N NA
 5520451 5520452 BAV3299 BAV3300 accC accB TRUE 0.942 4.000 0.067 1.000   NA
 5520452 5520453 BAV3300 BAV3301 accB   TRUE 0.850 39.000 0.242 1.000   NA
 5520454 5520455 BAV3302 BAV3303   ompW FALSE 0.107 126.000 0.000 1.000 N NA
 5520455 5520456 BAV3303 BAV3304 ompW   FALSE 0.005 380.000 0.000 1.000 N NA
 5520456 5520457 BAV3304 BAV3305     TRUE 0.996 -3.000 0.530 NA Y NA
 5520457 5520458 BAV3305 BAV3306   vpsC TRUE 0.984 13.000 0.562 NA   NA
 5520458 5520459 BAV3306 BAV3307 vpsC vacJ FALSE 0.369 73.000 0.031 NA   NA
 5520459 5520460 BAV3307 BAV3308 vacJ   TRUE 0.810 31.000 0.111 NA N NA
 5520460 5520461 BAV3308 BAV3309     FALSE 0.137 132.000 0.028 NA N NA
 5520461 5520462 BAV3309 BAV3310     TRUE 0.995 -3.000 0.236 0.076 Y NA
 5520462 5520463 BAV3310 BAV3311     TRUE 0.946 4.000 0.088 NA N NA
 5520463 5520464 BAV3311 BAV3312   murA TRUE 0.965 0.000 0.129 NA N NA
 5520464 5520465 BAV3312 BAV3313 murA hisG TRUE 0.967 -3.000 0.123 1.000 N NA
 5520465 5520466 BAV3313 BAV3314 hisG hisD TRUE 0.995 10.000 0.254 0.003 Y NA
 5520466 5520467 BAV3314 BAV3315 hisD hisC3 TRUE 0.995 -3.000 0.165 0.003 Y NA
 5520467 5520468 BAV3315 BAV3316 hisC3 hisB TRUE 0.996 2.000 0.341 0.003 Y NA
 5520468 5520469 BAV3316 BAV3317 hisB hisH TRUE 0.982 17.000 0.111 0.003 Y NA
 5520469 5520470 BAV3317 BAV3318 hisH hisA TRUE 0.750 64.000 0.008 0.003 Y NA
 5520470 5520471 BAV3318 BAV3319 hisA hisF TRUE 0.981 -3.000 0.003 0.003 Y NA
 5520471 5520472 BAV3319 BAV3320 hisF hisI TRUE 0.997 3.000 0.430 0.003 Y NA
 5520472 5520473 BAV3320 BAV3321 hisI hisE TRUE 0.994 -3.000 0.152 0.003 Y NA
 5520473 5520474 BAV3321 BAV3322 hisE   TRUE 0.936 9.000 0.079 1.000 N NA
 5520474 5520475 BAV3322 BAV3323   tatA TRUE 0.893 16.000 0.080 1.000 N NA
 5520475 5520476 BAV3323 BAV3324 tatA tatB TRUE 0.894 52.000 0.098 0.005 Y NA
 5520476 5520477 BAV3324 BAV3325 tatB tatC TRUE 0.982 -3.000 0.051 NA Y NA
 5520481 5520482 BAV3329 BAV3330 petA petB TRUE 0.911 51.000 0.108 0.001 Y NA
 5520482 5520483 BAV3330 BAV3331 petB petC TRUE 0.998 -3.000 0.630 0.001 Y NA
 5520483 5520484 BAV3331 BAV3332 petC ssp FALSE 0.457 148.000 0.370 NA N NA
 5520484 5520485 BAV3332 BAV3333 ssp sspB TRUE 0.992 9.000 0.831 NA   NA
 5520485 5520486 BAV3333 BAVt60 sspB tRNA-Thr(TGT) FALSE 0.306 59.000 0.000 NA   NA
 5520486 5520487 BAVt60 BAV3334 tRNA-Thr(TGT)   FALSE 0.067 157.000 0.000 NA   NA
 5520487 5520488 BAV3334 BAVt61   tRNA-Asn(GTT) FALSE 0.175 108.000 0.000 NA   NA
 5520488 5520489 BAVt61 BAV3335 tRNA-Asn(GTT)   FALSE 0.016 260.000 0.000 NA   NA
 5520489 5520490 BAV3335 BAV3336     TRUE 0.993 -7.000 0.904 NA   NA
 5520490 5520491 BAV3336 BAV3337     FALSE 0.023 234.000 0.000 1.000   NA
 5520491 5520492 BAV3337 BAV3338     TRUE 0.912 83.000 0.290 0.048 Y NA
 5520492 5520493 BAV3338 BAV3339     TRUE 0.988 9.000 0.097 0.048 Y NA
 5520493 5520494 BAV3339 BAV3340     TRUE 0.929 10.000 0.061 1.000   NA
 5520495 5520496 BAV3341 BAV3342     FALSE 0.318 59.000 0.013 NA   NA
 5520497 5520498 BAV3343 BAV3344 rhlE   TRUE 0.705 22.000 0.024 1.000 N NA
 5520498 5520499 BAV3344 BAV3345   miaD FALSE 0.464 26.000 0.005 1.000 N NA
 5520499 5520500 BAV3345 BAV3346 miaD   FALSE 0.379 37.000 0.005 NA   NA
 5520504 5520505 BAV3350 BAV3351   leuA2 FALSE 0.007 357.000 0.000 NA   NA
 5520507 5520508 BAV3353 BAV3354     TRUE 0.977 21.000 0.761 1.000 N NA
 5520508 5520509 BAV3354 BAV3355     TRUE 0.995 0.000 0.870 0.048 N NA
 5520509 5520510 BAV3355 BAV3356     TRUE 0.998 2.000 0.660 0.048 Y NA
 5520510 5520511 BAV3356 BAV3357     TRUE 0.998 -3.000 0.632 0.048 Y NA
 5520511 5520512 BAV3357 BAV3358     TRUE 0.969 17.000 0.382 1.000   NA
 5520513 5520514 BAV3359 BAV3360     TRUE 0.646 83.000 0.176 NA   NA
 5520515 5520516 BAV3361 BAV3362 argS   TRUE 0.921 9.000 0.062 NA N NA
 5520516 5520517 BAV3362 BAV3363   dsbA TRUE 0.867 62.000 0.573 NA   NA
 5520517 5520518 BAV3363 BAV3364 dsbA rtn FALSE 0.189 104.000 0.000 NA   NA
 5520522 5520523 BAV3368 BAV3369   ivd FALSE 0.447 119.000 0.166 1.000 N NA
 5520523 5520524 BAV3369 BAV3370 ivd   FALSE 0.408 117.000 0.007 1.000 Y NA
 5520524 5520525 BAV3370 BAV3371     TRUE 0.556 90.000 0.009 1.000 Y NA
 5520525 5520526 BAV3371 BAV3372     TRUE 0.959 26.000 0.158 1.000 Y NA
 5520527 5520528 BAV3373 BAV3374   argM FALSE 0.321 60.000 0.014 NA   NA
 5520528 5520529 BAV3374 BAV3375 argM   FALSE 0.490 119.000 0.032 NA Y NA
 5520530 5520531 BAV3376 BAV3377 hemC   FALSE 0.083 147.000 0.000 NA   NA
 5520531 5520532 BAV3377 BAV3378     FALSE 0.313 50.000 0.008 NA   NA
 5520534 5520535 BAV3380 BAV3381 topB   FALSE 0.123 135.000 0.025 NA N NA
 5520535 5520536 BAV3381 BAV3382     TRUE 0.978 -3.000 0.034 NA Y NA
 5520536 5520537 BAV3382 BAV3383     TRUE 0.964 12.000 0.034 1.000 Y NA
 5520537 5520538 BAV3383 BAV3384   idnO TRUE 0.962 0.000 0.118 1.000 N NA
 5520538 5520539 BAV3384 BAV3385 idnO   FALSE 0.522 33.000 0.000 NA   NA
 5520539 5520540 BAV3385 BAV3386     TRUE 0.625 25.000 0.000 NA   NA
 5520544 5520545 BAV3390 BAVs04     FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 5520545 5520546 BAVs04 BAV3391   htrP FALSE 0.205 99.000 0.000 NA   NA
 5520547 5520548 BAV3392 BAV3393     TRUE 0.826 15.000 0.024 NA   NA
 5520548 5520549 BAV3393 BAV3394     FALSE 0.215 95.000 0.000 NA   NA
 5520550 5520551 BAV3395 BAV3396     TRUE 0.992 -3.000 0.591 1.000   NA
 5520551 5520552 BAV3396 BAV3397     TRUE 0.995 -3.000 0.864 1.000   NA
 5520552 5520553 BAV3397 BAV3398     TRUE 0.995 11.000 0.976 0.048   NA
 5520553 5520554 BAV3398 BAV3399   codA TRUE 0.941 16.000 0.151 1.000   NA
 5520555 5520556 BAV3400 BAV3401   lctD FALSE 0.231 72.000 0.000 1.000 N NA
 5520558 5520559 BAV3403 BAV3404     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 5520559 5520560 BAV3404 BAV3405     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.042 Y NA
 5520560 5520561 BAV3405 BAV3406     FALSE 0.010 304.000 0.000 NA   NA
 5520565 5520566 BAV3410 BAV3411 gyrB dnaN TRUE 0.789 83.000 0.114 1.000 Y NA
 5520566 5520567 BAV3411 BAV3412 dnaN dnaA TRUE 0.995 -3.000 0.328 1.000 Y NA
 5520568 5520569 BAV3413 BAV3414 rimA rnpA TRUE 0.778 121.000 0.787 1.000   NA
 5520569 5520570 BAV3414 BAV3415 rnpA   TRUE 0.991 -3.000 0.540 NA   NA
 5520570 5520571 BAV3415 BAV3416   oxaA TRUE 0.873 49.000 0.461 NA   NA
 5520572 5520573 BAV3417 BAV3418 katG   FALSE 0.003 652.000 0.000 1.000   NA
 5520574 5520575 BAV3419 BAV3420 mnmE   FALSE 0.012 285.000 0.000 1.000   NA
 5520579 5520580 BAV3424 BAV3425 cspC   FALSE 0.041 185.000 0.000 NA   NA
 5520580 5520581 BAV3425 BAV3426     FALSE 0.005 416.000 0.000 NA   NA
 5520581 5517087 BAV3426 BAV0001   gidA FALSE 0.009 321.000 0.000 NA   NA