MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter hominis ATCC BAA-381

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3539010 3539011 CHAB381_0001 CHAB381_0002 dnaA   TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539011 3539012 CHAB381_0002 CHAB381_0003   dnaN TRUE 0.569 14.000 0.000 NA   NA
 3539012 3539013 CHAB381_0003 CHAB381_0004 dnaN gyrB TRUE 0.981 11.000 0.114 1.000 Y NA
 3539013 3539014 CHAB381_0004 CHAB381_0005 gyrB   TRUE 0.977 0.000 0.006 1.000 N NA
 3539014 3539015 CHAB381_0005 CHAB381_0006     TRUE 0.981 2.000 0.015 1.000   NA
 3539015 3539016 CHAB381_0006 CHAB381_0007     TRUE 0.979 -3.000 0.013 NA   NA
 3539020 3539021 CHAB381_0010 CHAB381_0011     TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3539021 3539022 CHAB381_0011 CHAB381_0012     TRUE 0.874 10.000 0.000 1.000 N NA
 3539022 3539023 CHAB381_0012 CHAB381_0013     TRUE 0.994 -3.000 0.105 NA N NA
 3539023 3539024 CHAB381_0013 CHAB381_0014     TRUE 0.789 -13.000 0.000 NA   NA
 3539024 3539025 CHAB381_0014 CHAB381_0015     FALSE 0.031 215.000 0.000 NA   NA
 3539025 3539026 CHAB381_0015 CHAB381_0016   tig FALSE 0.118 94.000 0.000 NA   NA
 3539026 3539027 CHAB381_0016 CHAB381_0017 tig clpP TRUE 0.996 0.000 0.351 1.000 Y NA
 3539027 3539028 CHAB381_0017 CHAB381_0018 clpP def TRUE 0.990 -3.000 0.030 1.000 N NA
 3539028 3539029 CHAB381_0018 CHAB381_0019 def   TRUE 0.993 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3539029 3539030 CHAB381_0019 CHAB381_0020     TRUE 0.973 -3.000 0.006 NA N NA
 3539030 3539031 CHAB381_0020 CHAB381_0021   purN TRUE 0.907 -18.000 0.014 NA N NA
 3539031 3539032 CHAB381_0021 CHAB381_0022 purN   FALSE 0.027 259.000 0.000 1.000   NA
 3539032 3539033 CHAB381_0022 CHAB381_0023   ttdA TRUE 0.354 28.000 0.000 1.000   NA
 3539033 3539034 CHAB381_0023 CHAB381_0024 ttdA fumB TRUE 0.987 11.000 0.262 0.002 Y NA
 3539034 3539035 CHAB381_0024 CHAB381_0025 fumB   FALSE 0.013 407.000 0.000 NA   NA
 3539035 3539036 CHAB381_0025 CHAB381_0026     FALSE 0.169 66.000 0.000 NA   NA
 3539036 3539037 CHAB381_0026 CHAB381_0027     TRUE 0.297 33.000 0.000 NA   NA
 3539037 3539038 CHAB381_0027 CHAB381_0028   nhaA FALSE 0.144 84.000 0.000 NA   NA
 3539038 3539039 CHAB381_0028 CHAB381_0029 nhaA ribH TRUE 0.816 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3539039 3539040 CHAB381_0029 CHAB381_0030 ribH nusB TRUE 0.992 2.000 0.045 1.000 N NA
 3539040 3539041 CHAB381_0030 CHAB381_0031 nusB pyrF TRUE 0.988 -3.000 0.023 1.000 N NA
 3539042 3539043 CHAB381_0032 CHAB381_0033     FALSE 0.024 316.000 0.000 0.074   NA
 3539043 3539044 CHAB381_0033 CHAB381_0034     FALSE 0.033 267.000 0.000 0.074   NA
 3539044 3539045 CHAB381_0034 CHAB381_0035     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539046 3539047 CHAB381_0036 CHAB381_0037 moaC   TRUE 0.958 -22.000 0.057 NA   NA
 3539047 3539048 CHAB381_0037 CHAB381_0038     TRUE 0.981 10.000 0.047 NA   NA
 3539048 3539049 CHAB381_0038 CHAB381_0039   rpsU FALSE 0.172 65.000 0.000 NA   NA
 3539049 3539050 CHAB381_0039 CHAB381_0040 rpsU   TRUE 0.282 95.000 0.008 1.000   NA
 3539050 3539051 CHAB381_0040 CHAB381_0041   folE FALSE 0.019 317.000 0.000 1.000   NA
 3539051 3539052 CHAB381_0041 CHAB381_0042 folE nifS FALSE 0.188 72.000 0.000 1.000 N NA
 3539052 3539053 CHAB381_0042 CHAB381_0043 nifS   TRUE 0.915 14.000 0.034 1.000 N NA
 3539055 3539056 CHAB381_0045 CHAB381_0046     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3539056 3539057 CHAB381_0046 CHAB381_0047     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 3539060 3539061 CHAB381_0050 CHAB381_0051 trpS   TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3539061 3539062 CHAB381_0051 CHAB381_0052   aroK TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3539062 3539063 CHAB381_0052 CHAB381_0053 aroK   TRUE 0.855 -10.000 0.000 1.000   NA
 3539064 3539065 CHAB381_0054 CHAB381_0055   kdsA TRUE 0.940 10.000 0.007 NA   NA
 3539065 3539066 CHAB381_0055 CHAB381_0056 kdsA   FALSE 0.067 135.000 0.000 1.000   NA
 3539066 3539067 CHAB381_0056 CHAB381_0057     TRUE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 3539067 3539068 CHAB381_0057 CHAB381_0058     FALSE 0.064 127.000 0.000 NA   NA
 3539068 3539069 CHAB381_0058 CHAB381_0059     FALSE 0.152 80.000 0.000 NA   NA
 3539069 3539070 CHAB381_0059 CHAB381_0060     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539072 3539073 CHAB381_1798 CHAB381_1799 rrlH rrfE FALSE 0.035 203.000 0.000 NA   NA
 3539074 3539075 CHAB381_0063 CHAB381_0064     TRUE 0.949 3.000 0.000 0.020   NA
 3539075 3539076 CHAB381_0064 CHAB381_0065     TRUE 0.840 11.000 0.000 0.005   NA
 3539077 3539078 CHAB381_0066 CHAB381_0067     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 3539078 3539079 CHAB381_0067 CHAB381_0068     FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 3539079 3539080 CHAB381_0068 CHAB381_0069     FALSE 0.013 412.000 0.000 NA   NA
 3539081 3539082 CHAB381_0070 CHAB381_0071     TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3539082 3539083 CHAB381_0071 CHAB381_0072   uvrA FALSE 0.159 76.000 0.000 NA   NA
 3539084 3539085 CHAB381_0073 CHAB381_0074     TRUE 0.979 -12.000 0.063 NA   NA
 3539085 3539086 CHAB381_0074 CHAB381_0075     TRUE 0.993 2.000 0.085 NA   NA
 3539086 3539087 CHAB381_0075 CHAB381_0076     TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3539087 3539088 CHAB381_0076 CHAB381_1800   rrsA FALSE 0.008 740.000 0.000 NA   NA
 3539088 3539089 CHAB381_1800 CHAB381_0077 rrsA   FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 3539089 3539090 CHAB381_0077 CHAB381_0078     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 3539090 3539091 CHAB381_0078 CHAB381_0079     FALSE 0.007 870.000 0.000 NA   NA
 3539095 3539096 CHAB381_0083 CHAB381_0084 rpsJ rplC TRUE 0.988 11.000 0.467 0.047 Y NA
 3539096 3539097 CHAB381_0084 CHAB381_0085 rplC rplD TRUE 0.997 -3.000 0.361 0.035 Y NA
 3539097 3539098 CHAB381_0085 CHAB381_0086 rplD rplW TRUE 0.996 2.000 0.513 1.000 Y NA
 3539098 3539099 CHAB381_0086 CHAB381_0087 rplW rplB TRUE 0.997 2.000 0.849 1.000 Y NA
 3539099 3539100 CHAB381_0087 CHAB381_0088 rplB rpsS TRUE 0.997 0.000 0.820 0.047 Y NA
 3539100 3539101 CHAB381_0088 CHAB381_0089 rpsS rplV TRUE 0.994 10.000 0.769 0.047 Y NA
 3539101 3539102 CHAB381_0089 CHAB381_0090 rplV rpsC TRUE 0.997 3.000 0.719 0.047 Y NA
 3539102 3539103 CHAB381_0090 CHAB381_0091 rpsC rplP TRUE 0.997 3.000 0.828 0.047 Y NA
 3539103 3539104 CHAB381_0091 CHAB381_0092 rplP rpmC TRUE 0.990 -13.000 0.802 0.035 Y NA
 3539104 3539105 CHAB381_0092 CHAB381_0093 rpmC rpsQ TRUE 0.989 11.000 0.828 0.035 Y NA
 3539105 3539106 CHAB381_0093 CHAB381_0094 rpsQ rplN TRUE 0.997 0.000 0.791 0.047 Y NA
 3539106 3539107 CHAB381_0094 CHAB381_0095 rplN rplX TRUE 0.997 0.000 0.810 0.047 Y NA
 3539107 3539108 CHAB381_0095 CHAB381_0096 rplX   TRUE 0.997 4.000 0.758 0.035 Y NA
 3539108 3539109 CHAB381_0096 CHAB381_0097   rpsN TRUE 0.997 2.000 0.496 0.035 Y NA
 3539109 3539110 CHAB381_0097 CHAB381_0098 rpsN rpsH TRUE 0.993 10.000 0.473 0.035 Y NA
 3539110 3539111 CHAB381_0098 CHAB381_0099 rpsH   TRUE 0.836 76.000 0.808 0.035 Y NA
 3539111 3539112 CHAB381_0099 CHAB381_0100   rplR TRUE 0.994 10.000 0.815 0.035 Y NA
 3539112 3539113 CHAB381_0100 CHAB381_0101 rplR rpsE TRUE 0.994 10.000 0.814 0.047 Y NA
 3539113 3539114 CHAB381_0101 CHAB381_0102 rpsE rplO TRUE 0.984 11.000 0.148 0.047 Y NA
 3539114 3539115 CHAB381_0102 CHAB381_0103 rplO   TRUE 0.997 0.000 0.730 1.000 N NA
 3539115 3539116 CHAB381_0103 CHAB381_0104   map TRUE 0.990 0.000 0.026 1.000 N NA
 3539116 3539117 CHAB381_0104 CHAB381_0105 map ybaK TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3539117 3539118 CHAB381_0105 CHAB381_0106 ybaK   TRUE 0.368 27.000 0.000 1.000   NA
 3539119 3539120 CHAB381_0107 CHAB381_0108 dapF coaE TRUE 0.904 -25.000 0.016 1.000 N NA
 3539123 3539124 CHAB381_0111 CHAB381_0112 gltX   TRUE 0.987 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3539124 3539125 CHAB381_0112 CHAB381_0113   pncB TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3539125 3539126 CHAB381_0113 CHAB381_0114 pncB aroC FALSE 0.024 288.000 0.000 1.000 N NA
 3539126 3539127 CHAB381_0114 CHAB381_0115 aroC   FALSE 0.172 65.000 0.000 NA   NA
 3539128 3539129 CHAB381_0116 CHAB381_0117 moaE   TRUE 0.996 2.000 0.501 1.000   NA
 3539130 3539131 CHAB381_0118 CHAB381_0119 nspC   FALSE 0.050 155.000 0.000 NA   NA
 3539132 3539133 CHAB381_0120 CHAB381_0121   dxr TRUE 0.971 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3539133 3539134 CHAB381_0121 CHAB381_0122 dxr cdsA TRUE 0.995 -6.000 0.372 1.000 Y NA
 3539134 3539135 CHAB381_0122 CHAB381_0123 cdsA   TRUE 0.435 42.000 0.004 NA   NA
 3539136 3539137 CHAB381_0124 CHAB381_0125 leuC   TRUE 0.972 3.000 0.007 NA N NA
 3539137 3539138 CHAB381_0125 CHAB381_0126     TRUE 0.981 -3.000 0.014 NA N NA
 3539139 3539140 CHAB381_0127 CHAB381_0128     FALSE 0.023 274.000 0.000 NA   NA
 3539140 3539141 CHAB381_0128 CHAB381_0129   nrfA FALSE 0.015 346.000 0.000 NA   NA
 3539141 3539142 CHAB381_0129 CHAB381_0130 nrfA nrfH TRUE 0.890 18.000 0.029 0.002 N NA
 3539142 3539143 CHAB381_0130 CHAB381_0131 nrfH ribD FALSE 0.073 130.000 0.000 1.000 N NA
 3539143 3539144 CHAB381_0131 CHAB381_0132 ribD efp TRUE 0.295 84.000 0.002 1.000 N NA
 3539144 3539145 CHAB381_0132 CHAB381_0133 efp recJ TRUE 0.257 50.000 0.000 1.000 N NA
 3539145 3539146 CHAB381_0133 CHAB381_0134 recJ pyrG TRUE 0.971 -10.000 0.026 1.000 N NA
 3539146 3539147 CHAB381_0134 CHAB381_0135 pyrG   FALSE 0.035 221.000 0.000 1.000 N NA
 3539148 3539149 CHAB381_0136 CHAB381_0137     TRUE 0.249 42.000 0.000 NA   NA
 3539149 3539150 CHAB381_0137 CHAB381_0138     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539150 3539151 CHAB381_0138 CHAB381_0139     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3539151 3539152 CHAB381_0139 CHAB381_0140     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3539152 3539153 CHAB381_0140 CHAB381_0141     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539153 3539154 CHAB381_0141 CHAB381_0142     TRUE 0.902 8.000 0.000 NA   NA
 3539154 3539155 CHAB381_0142 CHAB381_0143     TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3539155 3539156 CHAB381_0143 CHAB381_0144     FALSE 0.066 122.000 0.000 NA   NA
 3539156 3539157 CHAB381_0144 CHAB381_0145     FALSE 0.009 629.000 0.000 NA   NA
 3539157 3539158 CHAB381_0145 CHAB381_0146     TRUE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 3539158 3539159 CHAB381_0146 CHAB381_0147     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539161 3539162 CHAB381_0149 CHAB381_0150     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539163 3539164 CHAB381_0151 CHAB381_0152     FALSE 0.121 93.000 0.000 NA   NA
 3539164 3539165 CHAB381_0152 CHAB381_0153     TRUE 0.288 34.000 0.000 NA   NA
 3539165 3539166 CHAB381_0153 CHAB381_0154     FALSE 0.144 84.000 0.000 NA   NA
 3539166 3539167 CHAB381_0154 CHAB381_0155     TRUE 0.661 -28.000 0.000 NA   NA
 3539167 3539168 CHAB381_0155 CHAB381_0156     TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3539168 3539169 CHAB381_0156 CHAB381_0157     TRUE 0.746 -16.000 0.000 NA   NA
 3539169 3539170 CHAB381_0157 CHAB381_0158     FALSE 0.111 97.000 0.000 NA   NA
 3539170 3539171 CHAB381_0158 CHAB381_0159     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539171 3539172 CHAB381_0159 CHAB381_0160     FALSE 0.089 107.000 0.000 NA   NA
 3539172 3539173 CHAB381_0160 CHAB381_0162     FALSE 0.148 82.000 0.000 NA   NA
 3539173 3539174 CHAB381_0162 CHAB381_0163     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3539174 3539175 CHAB381_0163 CHAB381_0164     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3539175 3539176 CHAB381_0164 CHAB381_0165     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3539176 3539177 CHAB381_0165 CHAB381_0166     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3539177 3539178 CHAB381_0166 CHAB381_0167     TRUE 0.474 18.000 0.000 NA   NA
 3539178 3539179 CHAB381_0167 CHAB381_0168     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3539179 3539180 CHAB381_0168 CHAB381_0169     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539180 3539181 CHAB381_0169 CHAB381_0170     TRUE 0.995 -3.000 0.143 NA   NA
 3539181 3539182 CHAB381_0170 CHAB381_0171     TRUE 0.985 -10.000 0.095 NA   NA
 3539182 3539183 CHAB381_0171 CHAB381_0172   virB TRUE 0.995 -3.000 0.167 NA   NA
 3539183 3539184 CHAB381_0172 CHAB381_0173 virB   TRUE 0.948 4.000 0.000 0.029   NA
 3539184 3539185 CHAB381_0173 CHAB381_0174     TRUE 0.906 9.000 0.000 1.000   NA
 3539185 3539186 CHAB381_0174 CHAB381_0175   virB TRUE 0.994 -7.000 1.000 NA Y NA
 3539186 3539187 CHAB381_0175 CHAB381_0176 virB   TRUE 0.996 5.000 0.600 NA Y NA
 3539187 3539188 CHAB381_0176 CHAB381_0177     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3539188 3539189 CHAB381_0177 CHAB381_0178     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3539189 3539190 CHAB381_0178 CHAB381_0179     TRUE 0.953 16.000 0.600 NA   NA
 3539190 3539191 CHAB381_0179 CHAB381_0180     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3539192 3539193 CHAB381_0181 CHAB381_0182     TRUE 0.986 -18.000 0.571 0.005 Y NA
 3539193 3539194 CHAB381_0182 CHAB381_0183     TRUE 0.998 0.000 0.703 0.005 Y NA
 3539194 3539195 CHAB381_0183 CHAB381_0184   nuoD TRUE 0.997 0.000 0.650 0.013 Y NA
 3539195 3539196 CHAB381_0184 CHAB381_0185 nuoD   TRUE 0.997 -3.000 0.650 0.013   NA
 3539196 3539197 CHAB381_0185 CHAB381_0186     TRUE 0.997 -3.000 0.464 0.013   NA
 3539197 3539198 CHAB381_0186 CHAB381_0187     TRUE 0.997 2.000 0.444 0.013   NA
 3539198 3539199 CHAB381_0187 CHAB381_0188     TRUE 0.992 -7.000 0.065 0.013 Y NA
 3539199 3539200 CHAB381_0188 CHAB381_0189     TRUE 0.995 9.000 0.500 0.013 Y NA
 3539200 3539201 CHAB381_0189 CHAB381_0190   nuoJ TRUE 0.995 -7.000 0.442 0.013 Y NA
 3539201 3539202 CHAB381_0190 CHAB381_0191 nuoJ nuoK TRUE 0.995 -3.000 0.064 0.005 Y NA
 3539202 3539203 CHAB381_0191 CHAB381_0192 nuoK   TRUE 0.995 0.000 0.056 0.013 Y NA
 3539203 3539204 CHAB381_0192 CHAB381_0193     TRUE 0.989 10.000 0.056 0.003 Y NA
 3539204 3539205 CHAB381_0193 CHAB381_0194     TRUE 0.997 -3.000 0.389 0.003 Y NA
 3539205 3539206 CHAB381_0194 CHAB381_0195     TRUE 0.564 16.000 0.000 1.000 N NA
 3539206 3539207 CHAB381_0195 CHAB381_0196   pcm TRUE 0.988 -10.000 0.227 1.000 N NA
 3539207 3539208 CHAB381_0196 CHAB381_0197 pcm   FALSE 0.050 175.000 0.000 1.000 N NA
 3539208 3539209 CHAB381_0197 CHAB381_0198     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 3539209 3539210 CHAB381_0198 CHAB381_0199   panD TRUE 0.569 14.000 0.000 NA   NA
 3539210 3539211 CHAB381_0199 CHAB381_0200 panD   TRUE 0.987 4.000 0.029 NA   NA
 3539211 3539212 CHAB381_0200 CHAB381_0201     TRUE 0.910 -12.000 0.003 NA   NA
 3539212 3539213 CHAB381_0201 CHAB381_0202   tkt TRUE 0.996 4.000 0.375 1.000 N NA
 3539213 3539214 CHAB381_0202 CHAB381_0203 tkt   TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 3539215 3539216 CHAB381_0204 CHAB381_0205 rplQ rpoA TRUE 0.997 -3.000 0.873 1.000 N NA
 3539216 3539217 CHAB381_0205 CHAB381_0206 rpoA rpsD TRUE 0.970 13.000 0.549 1.000 N NA
 3539217 3539218 CHAB381_0206 CHAB381_0207 rpsD rpsK TRUE 0.942 22.000 0.509 0.045 Y NA
 3539218 3539219 CHAB381_0207 CHAB381_0208 rpsK rpsM TRUE 0.953 4.000 0.000 0.034 Y NA
 3539219 3539220 CHAB381_0208 CHAB381_0209 rpsM infA FALSE 0.033 290.000 0.000 0.031 Y NA
 3539222 3539223 CHAB381_0211 CHAB381_0212 pyrE   FALSE 0.013 486.000 0.000 1.000   NA
 3539223 3539224 CHAB381_0212 CHAB381_0213     TRUE 0.991 -10.000 0.412 0.056   NA
 3539224 3539225 CHAB381_0213 CHAB381_0214   trxB FALSE 0.169 91.000 0.000 0.056   NA
 3539225 3539226 CHAB381_0214 CHAB381_0215 trxB trx TRUE 0.640 67.000 0.035 1.000 Y NA
 3539226 3539227 CHAB381_0215 CHAB381_0216 trx   TRUE 0.589 62.000 0.027 1.000 N NA
 3539227 3539228 CHAB381_0216 CHAB381_0217     TRUE 0.968 5.000 0.004 1.000 N NA
 3539228 3539229 CHAB381_0217 CHAB381_0218     TRUE 0.987 0.000 0.018 1.000 Y NA
 3539229 3539230 CHAB381_0218 CHAB381_0219     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3539230 3539231 CHAB381_0219 CHAB381_0220     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3539231 3539232 CHAB381_0220 CHAB381_0221     TRUE 0.982 -7.000 0.033 NA   NA
 3539232 3539233 CHAB381_0221 CHAB381_0222     TRUE 0.758 31.000 0.031 1.000   NA
 3539233 3539234 CHAB381_0222 CHAB381_0223   rpmE TRUE 0.990 1.000 0.031 1.000   NA
 3539235 3539236 CHAB381_0224 CHAB381_0225     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 3539236 3539237 CHAB381_0225 CHAB381_0226     TRUE 0.767 67.000 0.333 NA   NA
 3539238 3539239 CHAB381_0227 CHAB381_0228   accA FALSE 0.012 455.000 0.000 NA   NA
 3539239 3539240 CHAB381_0228 CHAB381_0229 accA fabF TRUE 0.993 2.000 0.046 1.000 Y NA
 3539240 3539241 CHAB381_0229 CHAB381_0230 fabF acpP TRUE 0.987 10.000 0.066 1.000 Y NA
 3539241 3539242 CHAB381_0230 CHAB381_0231 acpP fabG TRUE 0.862 53.000 0.321 0.009 Y NA
 3539243 3539244 CHAB381_0232 CHAB381_0233 fprA purD FALSE 0.026 281.000 0.000 1.000 N NA
 3539244 3539245 CHAB381_0233 CHAB381_0234 purD   TRUE 0.970 -7.000 0.017 NA   NA
 3539245 3539246 CHAB381_0234 CHAB381_0235     TRUE 0.986 -10.000 0.149 NA   NA
 3539246 3539247 CHAB381_0235 CHAB381_0236     TRUE 0.995 -3.000 0.165 1.000   NA
 3539247 3539248 CHAB381_0236 CHAB381_0237     TRUE 0.989 -3.000 0.028 1.000   NA
 3539248 3539249 CHAB381_0237 CHAB381_0238     TRUE 0.848 12.000 0.005 1.000   NA
 3539249 3539250 CHAB381_0238 CHAB381_0239     FALSE 0.064 140.000 0.000 1.000   NA
 3539250 3539251 CHAB381_0239 CHAB381_0240   dapE TRUE 0.986 1.000 0.018 1.000 Y NA
 3539251 3539252 CHAB381_0240 CHAB381_0241 dapE   FALSE 0.032 234.000 0.000 1.000 N NA
 3539252 3539253 CHAB381_0241 CHAB381_0242     TRUE 0.979 10.000 0.033 1.000 N NA
 3539253 3539254 CHAB381_0242 CHAB381_0243   rpsR TRUE 0.929 13.000 0.034 1.000 N NA
 3539254 3539255 CHAB381_0243 CHAB381_0244 rpsR   TRUE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 3539255 3539256 CHAB381_0244 CHAB381_0245     TRUE 0.979 -3.000 0.013 NA   NA
 3539256 3539257 CHAB381_0245 CHAB381_0246     TRUE 0.978 0.000 0.008 1.000 N NA
 3539257 3539258 CHAB381_0246 CHAB381_0247     TRUE 0.800 11.000 0.000 1.000 N NA
 3539259 3539260 CHAB381_0248 CHAB381_0249     FALSE 0.024 258.000 0.000 NA   NA
 3539261 3539262 CHAB381_0250 CHAB381_0251     TRUE 0.856 -9.000 0.000 NA   NA
 3539262 3539263 CHAB381_0251 CHAB381_0252     TRUE 0.243 51.000 0.000 1.000   NA
 3539263 3539264 CHAB381_0252 CHAB381_0253     FALSE 0.035 215.000 0.000 1.000   NA
 3539264 3539265 CHAB381_0253 CHAB381_0254     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539265 3539266 CHAB381_0254 CHAB381_0255     TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3539266 3539267 CHAB381_0255 CHAB381_0256     FALSE 0.127 90.000 0.000 NA   NA
 3539267 3539268 CHAB381_0256 CHAB381_0257     TRUE 0.639 88.000 0.087 NA   NA
 3539268 3539269 CHAB381_0257 CHAB381_0258     FALSE 0.207 55.000 0.000 NA   NA
 3539269 3539270 CHAB381_0258 CHAB381_0259     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3539270 3539271 CHAB381_0259 CHAB381_0260     FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 3539271 3539272 CHAB381_0260 CHAB381_0261     FALSE 0.150 81.000 0.000 NA   NA
 3539272 3539273 CHAB381_0261 CHAB381_0262     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539274 3539275 CHAB381_0263 CHAB381_0264     FALSE 0.081 111.000 0.000 NA   NA
 3539275 3539276 CHAB381_0264 CHAB381_0265     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539276 3539277 CHAB381_0265 CHAB381_0266     TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3539277 3539278 CHAB381_0266 CHAB381_0267     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539279 3539280 CHAB381_0268 CHAB381_0269     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3539280 3539281 CHAB381_0269 CHAB381_0270     TRUE 0.239 46.000 0.000 NA   NA
 3539281 3539282 CHAB381_0270 CHAB381_0271     TRUE 0.221 51.000 0.000 NA   NA
 3539282 3539283 CHAB381_0271 CHAB381_0272     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3539283 3539284 CHAB381_0272 CHAB381_0273     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3539284 3539285 CHAB381_0273 CHAB381_0274     TRUE 0.993 -7.000 0.500 NA   NA
 3539285 3539286 CHAB381_0274 CHAB381_0275     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539286 3539287 CHAB381_0275 CHAB381_0276     TRUE 0.789 -13.000 0.000 NA   NA
 3539287 3539288 CHAB381_0276 CHAB381_0277     TRUE 0.474 18.000 0.000 NA   NA
 3539288 3539289 CHAB381_0277 CHAB381_0278     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3539289 3539290 CHAB381_0278 CHAB381_0279     FALSE 0.062 132.000 0.000 NA   NA
 3539290 3539291 CHAB381_0279 CHAB381_0280     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539291 3539292 CHAB381_0280 CHAB381_0281     TRUE 0.920 5.000 0.000 NA   NA
 3539292 3539293 CHAB381_0281 CHAB381_0282     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3539293 3539294 CHAB381_0282 CHAB381_0283     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3539294 3539295 CHAB381_0283 CHAB381_0284     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539295 3539296 CHAB381_0284 CHAB381_0285     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539296 3539297 CHAB381_0285 CHAB381_0286     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539297 3539298 CHAB381_0286 CHAB381_0287     TRUE 0.927 2.000 0.000 NA   NA
 3539298 3539299 CHAB381_0287 CHAB381_0288     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3539299 3539300 CHAB381_0288 CHAB381_0289     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3539300 3539301 CHAB381_0289 CHAB381_0290     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3539301 3539302 CHAB381_0290 CHAB381_0291     FALSE 0.066 122.000 0.000 NA   NA
 3539305 3539306 CHAB381_0294 CHAB381_0295 ppa   FALSE 0.105 235.000 0.015 1.000 N NA
 3539306 3539307 CHAB381_0295 CHAB381_0296   aspS TRUE 0.988 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3539308 3539309 CHAB381_0297 CHAB381_0298     TRUE 0.993 5.000 0.066 1.000 N NA
 3539309 3539310 CHAB381_0298 CHAB381_0299     TRUE 0.305 85.000 0.005 NA Y NA
 3539310 3539311 CHAB381_0299 CHAB381_0300     TRUE 0.956 10.000 0.015 NA   NA
 3539311 3539312 CHAB381_0300 CHAB381_0301     TRUE 0.803 35.000 0.062 NA   NA
 3539312 3539313 CHAB381_0301 CHAB381_0302   hisB TRUE 0.985 2.000 0.022 NA N NA
 3539313 3539314 CHAB381_0302 CHAB381_0303 hisB   TRUE 0.984 -3.000 0.018 1.000   NA
 3539314 3539315 CHAB381_0303 CHAB381_0304     TRUE 0.991 -9.000 0.617 NA   NA
 3539315 3539316 CHAB381_0304 CHAB381_0305     TRUE 0.979 -18.000 0.459 NA   NA
 3539316 3539317 CHAB381_0305 CHAB381_0306     TRUE 0.991 -3.000 0.041 NA   NA
 3539317 3539318 CHAB381_0306 CHAB381_0307     TRUE 0.983 -6.000 0.023 1.000   NA
 3539318 3539319 CHAB381_0307 CHAB381_0308     TRUE 0.905 -33.000 0.023 NA   NA
 3539319 3539320 CHAB381_0308 CHAB381_0309   mrdA TRUE 0.991 -3.000 0.043 NA   NA
 3539320 3539321 CHAB381_0309 CHAB381_0310 mrdA   TRUE 0.694 -22.000 0.000 NA   NA
 3539321 3539322 CHAB381_0310 CHAB381_0311     FALSE 0.032 214.000 0.000 NA   NA
 3539323 3539324 CHAB381_0312 CHAB381_0313   modB TRUE 0.273 36.000 0.000 NA   NA
 3539324 3539325 CHAB381_0313 CHAB381_0314 modB   TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539325 3539326 CHAB381_0314 CHAB381_0315     FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 3539326 3539327 CHAB381_0315 CHAB381_0316     TRUE 0.992 -3.000 0.045 1.000   NA
 3539327 3539328 CHAB381_0316 CHAB381_0317   modA TRUE 0.892 -10.000 0.000 0.003   NA
 3539328 3539329 CHAB381_0317 CHAB381_0318 modA   TRUE 0.525 21.000 0.000 0.003   NA
 3539330 3539331 CHAB381_0319 CHAB381_0320   ttg2D TRUE 0.996 2.000 0.684 NA N NA
 3539331 3539332 CHAB381_0320 CHAB381_0321 ttg2D   TRUE 0.995 -3.000 0.263 NA   NA
 3539332 3539333 CHAB381_0321 CHAB381_0322     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3539333 3539334 CHAB381_0322 CHAB381_0323     TRUE 0.345 30.000 0.000 1.000   NA
 3539334 3539335 CHAB381_0323 CHAB381_0324     FALSE 0.117 101.000 0.000 1.000 N NA
 3539335 3539336 CHAB381_0324 CHAB381_0325     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3539336 3539337 CHAB381_0325 CHAB381_0326   moaA TRUE 0.985 -7.000 0.042 NA   NA
 3539337 3539338 CHAB381_0326 CHAB381_0327 moaA   TRUE 0.990 0.000 0.028 1.000 N NA
 3539338 3539339 CHAB381_0327 CHAB381_0328     TRUE 0.995 1.000 0.139 1.000 N NA
 3539339 3539340 CHAB381_0328 CHAB381_0329     FALSE 0.008 862.000 0.000 NA   NA
 3539340 3539341 CHAB381_0329 CHAB381_0330     FALSE 0.007 2342.000 0.000 NA   NA
 3539341 3539342 CHAB381_0330 CHAB381_0331     TRUE 0.269 37.000 0.000 NA   NA
 3539342 3539343 CHAB381_0331 CHAB381_0332     TRUE 0.308 31.000 0.000 NA   NA
 3539343 3539344 CHAB381_0332 CHAB381_0333     FALSE 0.008 778.000 0.000 NA   NA
 3539344 3539345 CHAB381_0333 CHAB381_0334   arsB FALSE 0.010 587.000 0.000 NA   NA
 3539345 3539346 CHAB381_0334 CHAB381_0335 arsB   TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3539346 3539347 CHAB381_0335 CHAB381_0336     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 3539347 3539348 CHAB381_0336 CHAB381_0337     FALSE 0.041 182.000 0.000 NA   NA
 3539348 3539349 CHAB381_0337 CHAB381_0338     FALSE 0.130 88.000 0.000 NA   NA
 3539350 3539351 CHAB381_0339 CHAB381_0340 murB   TRUE 0.971 5.000 0.009 NA   NA
 3539351 3539352 CHAB381_0340 CHAB381_0341     FALSE 0.013 398.000 0.000 NA   NA
 3539353 3539354 CHAB381_0342 CHAB381_0343     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 3539355 3539356 CHAB381_0344 CHAB381_0345     TRUE 0.305 35.000 0.000 1.000   NA
 3539356 3539357 CHAB381_0345 CHAB381_0346     TRUE 0.973 -7.000 0.020 NA   NA
 3539357 3539358 CHAB381_0346 CHAB381_0347   ung FALSE 0.014 389.000 0.000 NA   NA
 3539358 3539359 CHAB381_0347 CHAB381_0348 ung   TRUE 0.945 0.000 0.000 1.000 N NA
 3539359 3539360 CHAB381_0348 CHAB381_0349     TRUE 0.997 -3.000 0.609 0.007 N NA
 3539360 3539361 CHAB381_0349 CHAB381_0350     TRUE 0.996 -3.000 0.547 1.000   NA
 3539361 3539362 CHAB381_0350 CHAB381_0351     TRUE 0.996 -3.000 0.545 1.000   NA
 3539362 3539363 CHAB381_0351 CHAB381_0352     FALSE 0.018 307.000 0.000 NA   NA
 3539363 3539364 CHAB381_0352 CHAB381_0353     TRUE 0.789 -13.000 0.000 NA   NA
 3539364 3539365 CHAB381_0353 CHAB381_0354     TRUE 0.995 -3.000 0.176 1.000   NA
 3539365 3539366 CHAB381_0354 CHAB381_0355     TRUE 0.974 -22.000 0.250 1.000   NA
 3539366 3539367 CHAB381_0355 CHAB381_0356     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 3539367 3539368 CHAB381_0356 CHAB381_0357     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3539368 3539369 CHAB381_0357 CHAB381_0358     FALSE 0.014 387.000 0.000 NA   NA
 3539369 3539370 CHAB381_0358 CHAB381_0359     FALSE 0.121 93.000 0.000 NA   NA
 3539370 3539371 CHAB381_0359 CHAB381_0360     TRUE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 3539371 3539372 CHAB381_0360 CHAB381_0361   frr FALSE 0.007 891.000 0.000 NA   NA
 3539372 3539373 CHAB381_0361 CHAB381_0362 frr secG TRUE 0.492 66.000 0.017 1.000 N NA
 3539373 3539374 CHAB381_0362 CHAB381_0363 secG   TRUE 0.229 114.000 0.007 0.066   NA
 3539374 3539375 CHAB381_0363 CHAB381_0364     FALSE 0.192 57.000 0.000 NA   NA
 3539375 3539376 CHAB381_0364 CHAB381_0365     TRUE 0.712 -19.000 0.000 NA   NA
 3539377 3539378 CHAB381_1801 CHAB381_1802 rrlI rrfF FALSE 0.035 203.000 0.000 NA   NA
 3539379 3539380 CHAB381_0367 CHAB381_0368     TRUE 0.943 0.000 0.000 1.000   NA
 3539380 3539381 CHAB381_0368 CHAB381_0369     FALSE 0.026 244.000 0.000 NA   NA
 3539383 3539384 CHAB381_0371 CHAB381_0372     TRUE 0.980 -7.000 0.024 1.000 N NA
 3539384 3539385 CHAB381_0372 CHAB381_0373     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539386 3539387 CHAB381_0374 CHAB381_0375 ilvC   TRUE 0.981 1.000 0.013 1.000   NA
 3539387 3539388 CHAB381_0375 CHAB381_0376     TRUE 0.941 -16.000 0.022 1.000   NA
 3539388 3539389 CHAB381_0376 CHAB381_0377     TRUE 0.990 0.000 0.026 1.000 Y NA
 3539390 3539391 CHAB381_0378 CHAB381_0379     FALSE 0.009 717.000 0.000 NA   NA
 3539391 3539392 CHAB381_0379 CHAB381_0380     TRUE 0.994 -3.000 0.083 NA   NA
 3539393 3539394 CHAB381_0381 CHAB381_0382     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3539394 3539395 CHAB381_0382 CHAB381_0383     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3539395 3539396 CHAB381_0383 CHAB381_0384     FALSE 0.011 507.000 0.000 NA   NA
 3539396 3539397 CHAB381_0384 CHAB381_0385     FALSE 0.007 995.000 0.000 NA   NA
 3539397 3539398 CHAB381_0385 CHAB381_0386     TRUE 0.895 9.000 0.000 NA   NA
 3539398 3539399 CHAB381_0386 CHAB381_0388     FALSE 0.055 144.000 0.000 NA   NA
 3539401 3539402 CHAB381_0389 CHAB381_0390     FALSE 0.010 599.000 0.000 NA   NA
 3539402 3539403 CHAB381_0390 CHAB381_0391     FALSE 0.009 604.000 0.000 NA   NA
 3539404 3539405 CHAB381_0392 CHAB381_0393   cas FALSE 0.016 340.000 0.000 NA   NA
 3539405 3539406 CHAB381_0393 CHAB381_0394 cas cas TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539406 3539407 CHAB381_0394 CHAB381_0395 cas   TRUE 0.895 9.000 0.000 NA   NA
 3539407 3539408 CHAB381_0395 CHAB381_0396     FALSE 0.113 96.000 0.000 NA   NA
 3539408 3539409 CHAB381_0396 CHAB381_0397   cas5h TRUE 0.815 -12.000 0.000 NA   NA
 3539409 3539410 CHAB381_0397 CHAB381_0398 cas5h   TRUE 0.995 -3.000 0.295 NA   NA
 3539410 3539411 CHAB381_0398 CHAB381_0399     TRUE 0.993 -7.000 0.778 NA   NA
 3539411 3539412 CHAB381_0399 CHAB381_0400   cas TRUE 0.995 1.000 0.273 NA   NA
 3539412 3539413 CHAB381_0400 CHAB381_0401 cas   FALSE 0.034 204.000 0.000 NA   NA
 3539413 3539414 CHAB381_0401 CHAB381_0402     FALSE 0.025 326.000 0.000 0.066 N NA
 3539414 3539415 CHAB381_0402 CHAB381_0403     TRUE 0.994 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 3539415 3539416 CHAB381_0403 CHAB381_0404     TRUE 0.833 -12.000 0.000 1.000   NA
 3539416 3539417 CHAB381_0404 CHAB381_0405   pstB TRUE 0.899 -7.000 0.000 1.000   NA
 3539417 3539418 CHAB381_0405 CHAB381_0406 pstB pstA TRUE 0.994 10.000 0.526 0.004 Y NA
 3539418 3539419 CHAB381_0406 CHAB381_0407 pstA pstC TRUE 0.997 0.000 0.537 0.004 Y NA
 3539419 3539420 CHAB381_0407 CHAB381_0408 pstC pstS TRUE 0.757 79.000 0.086 0.004 Y NA
 3539421 3539422 CHAB381_0409 CHAB381_0410     TRUE 0.622 -37.000 0.000 NA   NA
 3539422 3539423 CHAB381_0410 CHAB381_0411     TRUE 0.669 -27.000 0.000 NA   NA
 3539423 3539424 CHAB381_0411 CHAB381_0412     TRUE 0.993 2.000 0.070 NA   NA
 3539427 3539428 CHAB381_0414 CHAB381_0416     TRUE 0.308 31.000 0.000 NA   NA
 3539428 3539429 CHAB381_0416 CHAB381_0417     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539430 3539431 CHAB381_0418 CHAB381_0419     TRUE 0.816 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3539431 3539432 CHAB381_0419 CHAB381_0420     TRUE 0.910 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3539434 3539435 CHAB381_0422 CHAB381_0423     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3539435 3539436 CHAB381_0423 CHAB381_0424     TRUE 0.396 22.000 0.000 NA   NA
 3539436 3539437 CHAB381_0424 CHAB381_0425     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3539437 3539438 CHAB381_0425 CHAB381_0426     FALSE 0.021 306.000 0.000 1.000 N NA
 3539438 3539439 CHAB381_0426 CHAB381_0427     TRUE 0.596 104.000 0.122 1.000 N NA
 3539439 3539440 CHAB381_0427 CHAB381_0428     FALSE 0.055 143.000 0.000 NA   NA
 3539440 3539441 CHAB381_0428 CHAB381_0429     FALSE 0.028 227.000 0.000 NA   NA
 3539442 3539443 CHAB381_0430 CHAB381_0431 rnhB   TRUE 0.965 7.000 0.009 NA   NA
 3539444 3539445 CHAB381_0432 CHAB381_0433     TRUE 0.991 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 3539445 3539446 CHAB381_0433 CHAB381_0434     TRUE 0.959 15.000 0.385 1.000 Y NA
 3539446 3539447 CHAB381_0434 CHAB381_0435     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3539447 3539448 CHAB381_0435 CHAB381_0436   thiE TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539448 3539449 CHAB381_0436 CHAB381_0437 thiE   TRUE 0.931 -13.000 0.011 1.000 N NA
 3539449 3539450 CHAB381_0437 CHAB381_0438     FALSE 0.037 215.000 0.000 1.000 N NA
 3539451 3539452 CHAB381_0439 CHAB381_0440     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3539452 3539453 CHAB381_0440 CHAB381_0441   feoB TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3539453 3539454 CHAB381_0441 CHAB381_0442 feoB   TRUE 0.980 -13.000 0.075 1.000 Y NA
 3539454 3539455 CHAB381_0442 CHAB381_0443     FALSE 0.056 141.000 0.000 NA   NA
 3539455 3539456 CHAB381_0443 CHAB381_0444     FALSE 0.032 213.000 0.000 NA   NA
 3539456 3539457 CHAB381_0444 CHAB381_0445     TRUE 0.792 22.000 0.023 1.000   NA
 3539457 3539458 CHAB381_0445 CHAB381_0446     TRUE 0.945 0.000 0.000 1.000 N NA
 3539458 3539459 CHAB381_0446 CHAB381_0447     TRUE 0.982 -10.000 0.040 0.065 N NA
 3539459 3539460 CHAB381_0447 CHAB381_0448     TRUE 0.994 -3.000 0.089 NA   NA
 3539460 3539461 CHAB381_0448 CHAB381_0449     TRUE 0.779 65.000 0.386 NA   NA
 3539461 3539462 CHAB381_0449 CHAB381_0450     TRUE 0.956 14.000 0.238 NA Y NA
 3539462 3539463 CHAB381_0450 CHAB381_0451     FALSE 0.011 518.000 0.000 NA   NA
 3539466 3539467 CHAB381_0454 CHAB381_0455     TRUE 0.303 32.000 0.000 NA   NA
 3539467 3539468 CHAB381_0455 CHAB381_1803   rrsB FALSE 0.007 998.000 0.000 NA   NA
 3539468 3539469 CHAB381_1803 CHAB381_0456 rrsB   FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 3539469 3539470 CHAB381_0456 CHAB381_0457     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 3539470 3539471 CHAB381_0457 CHAB381_0458     FALSE 0.008 837.000 0.000 NA   NA
 3539471 3539472 CHAB381_0458 CHAB381_0459     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 3539472 3539473 CHAB381_0459 CHAB381_0460     FALSE 0.015 353.000 0.000 NA   NA
 3539473 3539474 CHAB381_0460 CHAB381_1804   rrlJ FALSE 0.009 699.000 0.000 NA   NA
 3539474 3539475 CHAB381_1804 CHAB381_1805 rrlJ rrfG FALSE 0.035 203.000 0.000 NA   NA
 3539475 3539476 CHAB381_1805 CHAB381_0462 rrfG   FALSE 0.118 94.000 0.000 NA   NA
 3539476 3539477 CHAB381_0462 CHAB381_0463     FALSE 0.015 352.000 0.000 NA   NA
 3539477 3539478 CHAB381_0463 CHAB381_0464     FALSE 0.008 826.000 0.000 NA   NA
 3539478 3539479 CHAB381_0464 CHAB381_0465     FALSE 0.045 167.000 0.000 NA   NA
 3539480 3539481 CHAB381_0466 CHAB381_0467     TRUE 0.972 -7.000 0.018 NA   NA
 3539481 3539482 CHAB381_0467 CHAB381_0468     TRUE 0.327 67.000 0.005 NA   NA
 3539482 3539483 CHAB381_0468 CHAB381_0469   mfd TRUE 0.913 -13.000 0.006 1.000   NA
 3539483 3539484 CHAB381_0469 CHAB381_0470 mfd   TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3539484 3539485 CHAB381_0470 CHAB381_0471     TRUE 0.777 -16.000 0.000 1.000 N NA
 3539485 3539486 CHAB381_0471 CHAB381_0472     TRUE 0.994 -3.000 0.084 NA   NA
 3539486 3539487 CHAB381_0472 CHAB381_0473   leuS TRUE 0.989 -3.000 0.031 NA   NA
 3539487 3539488 CHAB381_0473 CHAB381_0474 leuS   TRUE 0.965 10.000 0.021 NA   NA
 3539488 3539489 CHAB381_0474 CHAB381_0475   secF TRUE 0.991 10.000 0.667 NA   NA
 3539489 3539490 CHAB381_0475 CHAB381_0476 secF secD TRUE 0.997 0.000 0.436 0.001 Y NA
 3539490 3539491 CHAB381_0476 CHAB381_0477 secD yajC TRUE 0.989 -7.000 0.068 NA Y NA
 3539492 3539493 CHAB381_0478 CHAB381_0479 lnt   FALSE 0.026 243.000 0.000 NA   NA
 3539494 3539495 CHAB381_0480 CHAB381_0481 serA   TRUE 0.757 18.000 0.010 1.000 N NA
 3539497 3539498 CHAB381_0483 CHAB381_0484 ispH aroA TRUE 0.975 -10.000 0.032 1.000 N NA
 3539498 3539499 CHAB381_0484 CHAB381_0485 aroA pheT TRUE 0.989 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3539499 3539500 CHAB381_0485 CHAB381_0486 pheT pheS TRUE 0.997 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 3539501 3539502 CHAB381_0487 CHAB381_0488   prmA FALSE 0.077 123.000 0.000 1.000 N NA
 3539502 3539503 CHAB381_0488 CHAB381_0489 prmA   TRUE 0.995 3.000 0.217 1.000 N NA
 3539503 3539504 CHAB381_0489 CHAB381_0490   pssA TRUE 0.980 -3.000 0.007 0.064 N NA
 3539504 3539505 CHAB381_0490 CHAB381_0491 pssA leuA TRUE 0.990 -7.000 0.073 1.000 N NA
 3539507 3539508 CHAB381_0493 CHAB381_0494 rpmI rplT TRUE 0.767 100.000 0.928 0.022 Y NA
 3539509 3539510 CHAB381_0495 CHAB381_0496     FALSE 0.007 912.000 0.000 NA   NA
 3539510 3539511 CHAB381_0496 CHAB381_0497     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3539511 3539512 CHAB381_0497 CHAB381_0498     FALSE 0.015 344.000 0.000 NA   NA
 3539512 3539513 CHAB381_0498 CHAB381_0499     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3539513 3539514 CHAB381_0499 CHAB381_0500   prfB TRUE 0.755 14.000 0.004 NA   NA
 3539515 3539516 CHAB381_0501 CHAB381_0502 panC   TRUE 0.975 2.000 0.008 1.000 N NA
 3539516 3539517 CHAB381_0502 CHAB381_0504     TRUE 0.926 -19.000 0.019 1.000 N NA
 3539518 3539519 CHAB381_0503 CHAB381_0505     FALSE 0.192 57.000 0.000 NA   NA
 3539519 3539520 CHAB381_0505 CHAB381_0506   miaB TRUE 0.940 -19.000 0.029 NA   NA
 3539520 3539521 CHAB381_0506 CHAB381_0507 miaB   TRUE 0.990 -3.000 0.033 NA   NA
 3539522 3539523 CHAB381_0508 CHAB381_0509 nusA   FALSE 0.026 255.000 0.000 NA N NA
 3539523 3539524 CHAB381_0509 CHAB381_0510     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539524 3539525 CHAB381_0510 CHAB381_0511     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539525 3539526 CHAB381_0511 CHAB381_0512     TRUE 0.996 -3.000 0.222 1.000 N NA
 3539526 3539527 CHAB381_0512 CHAB381_0513     TRUE 0.994 -3.000 0.111 NA   NA
 3539528 3539529 CHAB381_0514 CHAB381_0515     TRUE 0.769 -16.000 0.000 1.000   NA
 3539530 3539531 CHAB381_0516 CHAB381_0517     TRUE 0.293 45.000 0.000 1.000 Y NA
 3539531 3539532 CHAB381_0517 CHAB381_0518     TRUE 0.995 -7.000 0.616 0.090 Y NA
 3539532 3539533 CHAB381_0518 CHAB381_0519   bcp FALSE 0.032 231.000 0.000 1.000 N NA
 3539533 3539534 CHAB381_0519 CHAB381_0520 bcp   FALSE 0.214 58.000 0.000 1.000 N NA
 3539535 3539536 CHAB381_0521 CHAB381_0522   pgi FALSE 0.061 134.000 0.000 NA   NA
 3539536 3539537 CHAB381_0522 CHAB381_0523 pgi galU TRUE 0.957 -13.000 0.023 1.000 N NA
 3539540 3539541 CHAB381_0526 CHAB381_0527     TRUE 0.375 67.000 0.010 NA   NA
 3539541 3539542 CHAB381_0527 CHAB381_0528     TRUE 0.990 10.000 0.400 NA   NA
 3539542 3539543 CHAB381_0528 CHAB381_0529     TRUE 0.991 -10.000 0.600 1.000 Y NA
 3539545 3539546 CHAB381_0531 CHAB381_0532     FALSE 0.022 281.000 0.000 NA   NA
 3539547 3539548 CHAB381_0533 CHAB381_0534 nifR   TRUE 0.672 33.000 0.021 NA   NA
 3539548 3539549 CHAB381_0534 CHAB381_0535   dksA TRUE 0.984 11.000 0.523 NA   NA
 3539549 3539550 CHAB381_0535 CHAB381_0536 dksA   TRUE 0.974 10.000 0.029 NA   NA
 3539550 3539551 CHAB381_0536 CHAB381_0537   accD TRUE 0.983 -7.000 0.035 NA   NA
 3539551 3539552 CHAB381_0537 CHAB381_0538 accD   FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 3539552 3539553 CHAB381_0538 CHAB381_0539     TRUE 0.983 10.000 0.057 NA   NA
 3539553 3539554 CHAB381_0539 CHAB381_0540     FALSE 0.144 84.000 0.000 NA   NA
 3539554 3539555 CHAB381_0540 CHAB381_0541     TRUE 0.995 -3.000 0.153 1.000   NA
 3539555 3539556 CHAB381_0541 CHAB381_0542     TRUE 0.994 -3.000 0.083 NA   NA
 3539556 3539557 CHAB381_0542 CHAB381_0543     TRUE 0.995 -3.000 0.200 NA   NA
 3539563 3539564 CHAB381_0549 CHAB381_0550 lon   TRUE 0.984 10.000 0.062 NA   NA
 3539565 3539566 CHAB381_0551 CHAB381_0552 proC   FALSE 0.157 77.000 0.000 NA   NA
 3539566 3539567 CHAB381_0552 CHAB381_0553     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3539567 3539568 CHAB381_0553 CHAB381_0554     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539568 3539569 CHAB381_0554 CHAB381_0555     TRUE 0.913 14.000 0.040 NA   NA
 3539569 3539570 CHAB381_0555 CHAB381_0556   ffh FALSE 0.034 213.000 0.000 NA N NA
 3539570 3539571 CHAB381_0556 CHAB381_0557 ffh rpsP TRUE 0.799 62.000 0.361 1.000 N NA
 3539571 3539572 CHAB381_0557 CHAB381_0558 rpsP   TRUE 0.996 3.000 0.385 1.000   NA
 3539572 3539573 CHAB381_0558 CHAB381_0559   rimM TRUE 0.993 -7.000 0.324 1.000   NA
 3539573 3539574 CHAB381_0559 CHAB381_0560 rimM trmD TRUE 0.997 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 3539574 3539575 CHAB381_0560 CHAB381_0561 trmD rplS TRUE 0.997 -3.000 0.567 1.000 Y NA
 3539575 3539576 CHAB381_0561 CHAB381_0562 rplS   FALSE 0.008 1138.000 0.000 1.000   NA
 3539577 3539578 CHAB381_0563 CHAB381_0564     TRUE 0.994 -7.000 0.241 0.012 N NA
 3539578 3539579 CHAB381_0564 CHAB381_0565     TRUE 0.997 0.000 0.945 1.000 N NA
 3539579 3539580 CHAB381_0565 CHAB381_0566     TRUE 0.518 120.000 0.145 1.000   NA
 3539581 3539582 CHAB381_0567 CHAB381_0568 groS groL TRUE 0.963 16.000 0.356 0.009 Y NA
 3539585 3539586 CHAB381_0571 CHAB381_0572     FALSE 0.008 746.000 0.000 NA   NA
 3539586 3539587 CHAB381_0572 CHAB381_0573   ruvA TRUE 0.835 14.000 0.009 0.089 N NA
 3539587 3539588 CHAB381_0573 CHAB381_0574 ruvA   TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3539588 3539589 CHAB381_0574 CHAB381_0575     TRUE 0.995 -3.000 0.258 NA   NA
 3539589 3539590 CHAB381_0575 CHAB381_0576     TRUE 0.996 3.000 0.912 NA Y NA
 3539590 3539591 CHAB381_0576 CHAB381_0577     TRUE 0.997 -3.000 0.912 NA Y NA
 3539592 3539593 CHAB381_0578 CHAB381_0579 mviN cysS TRUE 0.960 -13.000 0.027 1.000   NA
 3539593 3539594 CHAB381_0579 CHAB381_0580 cysS   TRUE 0.984 -3.000 0.013 0.089 N NA
 3539594 3539595 CHAB381_0580 CHAB381_0581   pyrD TRUE 0.481 70.000 0.017 1.000 N NA
 3539595 3539596 CHAB381_0581 CHAB381_0582 pyrD   TRUE 0.993 1.000 0.048 1.000   NA
 3539596 3539597 CHAB381_0582 CHAB381_0583   dapA TRUE 0.995 3.000 0.217 1.000   NA
 3539597 3539598 CHAB381_0583 CHAB381_0584 dapA   TRUE 0.996 0.000 0.238 1.000 N NA
 3539598 3539599 CHAB381_0584 CHAB381_0585   pgsA TRUE 0.987 0.000 0.017 1.000 Y NA
 3539600 3539601 CHAB381_0586 CHAB381_0587     TRUE 0.396 22.000 0.000 NA   NA
 3539601 3539602 CHAB381_0587 CHAB381_0588     FALSE 0.070 119.000 0.000 NA   NA
 3539602 3539603 CHAB381_0588 CHAB381_0589     FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 3539603 3539604 CHAB381_0589 CHAB381_0590     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3539604 3539605 CHAB381_0590 CHAB381_0591     FALSE 0.071 118.000 0.000 NA   NA
 3539605 3539606 CHAB381_0591 CHAB381_0592     FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 3539606 3539607 CHAB381_0592 CHAB381_0593     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539607 3539608 CHAB381_0593 CHAB381_0594     FALSE 0.081 111.000 0.000 NA   NA
 3539608 3539609 CHAB381_0594 CHAB381_0595     TRUE 0.650 -31.000 0.000 NA   NA
 3539609 3539610 CHAB381_0595 CHAB381_0596     FALSE 0.095 103.000 0.000 NA   NA
 3539610 3539611 CHAB381_0596 CHAB381_0597     FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 3539611 3539612 CHAB381_0597 CHAB381_0598     TRUE 0.246 43.000 0.000 NA   NA
 3539612 3539613 CHAB381_0598 CHAB381_0599     FALSE 0.025 245.000 0.000 NA   NA
 3539613 3539614 CHAB381_0599 CHAB381_0600     TRUE 0.279 35.000 0.000 NA   NA
 3539614 3539615 CHAB381_0600 CHAB381_0601     FALSE 0.216 52.000 0.000 NA   NA
 3539615 3539616 CHAB381_0601 CHAB381_0602     FALSE 0.033 210.000 0.000 NA   NA
 3539616 3539617 CHAB381_0602 CHAB381_0603     TRUE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 3539617 3539618 CHAB381_0603 CHAB381_0604     TRUE 0.326 28.000 0.000 NA   NA
 3539618 3539619 CHAB381_0604 CHAB381_0605     FALSE 0.180 61.000 0.000 NA   NA
 3539620 3539621 CHAB381_0606 CHAB381_0607   rseP TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3539621 3539622 CHAB381_0607 CHAB381_0608 rseP   TRUE 0.985 -3.000 0.021 NA   NA
 3539622 3539623 CHAB381_0608 CHAB381_0609     FALSE 0.026 239.000 0.000 NA   NA
 3539625 3539626 CHAB381_0611 CHAB381_0612 thrS infC TRUE 0.994 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 3539626 3539627 CHAB381_0612 CHAB381_0613 infC   FALSE 0.030 221.000 0.000 NA   NA
 3539628 3539629 CHAB381_0614 CHAB381_0615     FALSE 0.155 78.000 0.000 NA   NA
 3539629 3539630 CHAB381_0615 CHAB381_0616     TRUE 0.995 -3.000 0.323 NA   NA
 3539630 3539631 CHAB381_0616 CHAB381_0617     TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3539631 3539632 CHAB381_0617 CHAB381_0618     TRUE 0.978 -13.000 0.068 1.000 N NA
 3539632 3539633 CHAB381_0618 CHAB381_0619     TRUE 0.976 3.000 0.009 1.000   NA
 3539633 3539634 CHAB381_0619 CHAB381_0620   cydB FALSE 0.014 428.000 0.000 1.000   NA
 3539634 3539635 CHAB381_0620 CHAB381_0621 cydB cydA TRUE 0.997 2.000 0.962 0.036 Y NA
 3539635 3539636 CHAB381_0621 CHAB381_0622 cydA   TRUE 0.996 -3.000 0.887 NA   NA
 3539636 3539637 CHAB381_0622 CHAB381_0623     FALSE 0.036 202.000 0.000 NA   NA
 3539639 3539640 CHAB381_0625 CHAB381_0626     FALSE 0.059 150.000 0.000 1.000   NA
 3539641 3539642 CHAB381_0627 CHAB381_0628     TRUE 0.985 -16.000 0.294 0.005 Y NA
 3539643 3539644 CHAB381_0629 CHAB381_0630     TRUE 0.748 52.000 0.067 NA   NA
 3539644 3539645 CHAB381_0630 CHAB381_0631     TRUE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 3539645 3539646 CHAB381_0631 CHAB381_0632     TRUE 0.633 -36.000 0.000 NA   NA
 3539646 3539647 CHAB381_0632 CHAB381_0633     TRUE 0.694 -22.000 0.000 NA   NA
 3539647 3539648 CHAB381_0633 CHAB381_0634     FALSE 0.130 88.000 0.000 NA   NA
 3539648 3539649 CHAB381_0634 CHAB381_0635     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3539649 3539650 CHAB381_0635 CHAB381_0636     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539650 3539651 CHAB381_0636 CHAB381_0637     FALSE 0.048 163.000 0.000 NA   NA
 3539651 3539652 CHAB381_0637 CHAB381_0638     FALSE 0.033 209.000 0.000 NA   NA
 3539652 3539653 CHAB381_0638 CHAB381_0639     FALSE 0.187 58.000 0.000 NA   NA
 3539654 3539655 CHAB381_0640 CHAB381_0641   uvrC TRUE 0.941 -13.000 0.018 NA   NA
 3539655 3539656 CHAB381_0641 CHAB381_0642 uvrC   FALSE 0.080 120.000 0.000 1.000 N NA
 3539656 3539657 CHAB381_0642 CHAB381_0643     TRUE 0.997 5.000 0.636 0.005 Y NA
 3539657 3539658 CHAB381_0643 CHAB381_0644     FALSE 0.056 142.000 0.000 NA   NA
 3539659 3539660 CHAB381_0645 CHAB381_0646     FALSE 0.207 55.000 0.000 NA   NA
 3539660 3539661 CHAB381_0646 CHAB381_0647     FALSE 0.027 258.000 0.000 1.000   NA
 3539661 3539662 CHAB381_0647 CHAB381_0648     TRUE 0.950 -45.000 0.085 1.000   NA
 3539663 3539664 CHAB381_0649 CHAB381_0650 rpmH   TRUE 0.635 114.000 0.787 1.000   NA
 3539664 3539665 CHAB381_0650 CHAB381_0651     TRUE 0.996 -3.000 0.540 NA   NA
 3539665 3539666 CHAB381_0651 CHAB381_0652     TRUE 0.996 0.000 0.461 NA   NA
 3539666 3539667 CHAB381_0652 CHAB381_0653     TRUE 0.968 -16.000 0.061 NA   NA
 3539667 3539668 CHAB381_0653 CHAB381_0654   trmE TRUE 0.986 -7.000 0.049 NA   NA
 3539668 3539669 CHAB381_0654 CHAB381_0655 trmE   TRUE 0.285 52.000 0.000 0.045   NA
 3539669 3539670 CHAB381_0655 CHAB381_0656     TRUE 0.984 -3.000 0.017 NA Y NA
 3539670 3539671 CHAB381_0656 CHAB381_0657     TRUE 0.988 -3.000 0.025 NA Y NA
 3539671 3539672 CHAB381_0657 CHAB381_0658     TRUE 0.900 -7.000 0.000 NA Y NA
 3539672 3539673 CHAB381_0658 CHAB381_0659     TRUE 0.862 -9.000 0.000 NA N NA
 3539673 3539674 CHAB381_0659 CHAB381_0660     TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3539674 3539675 CHAB381_0660 CHAB381_0661     TRUE 0.789 -13.000 0.000 NA   NA
 3539675 3539676 CHAB381_0661 CHAB381_0662     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539676 3539677 CHAB381_0662 CHAB381_0663     TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3539677 3539678 CHAB381_0663 CHAB381_0664     TRUE 0.957 10.000 0.014 NA N NA
 3539678 3539679 CHAB381_0664 CHAB381_0665     TRUE 0.789 -13.000 0.000 NA   NA
 3539679 3539680 CHAB381_0665 CHAB381_0666     FALSE 0.096 109.000 0.000 1.000   NA
 3539680 3539681 CHAB381_0666 CHAB381_0667   purL TRUE 0.719 12.000 0.000 1.000 N NA
 3539681 3539682 CHAB381_0667 CHAB381_0668 purL   TRUE 0.812 15.000 0.011 1.000 N NA
 3539682 3539683 CHAB381_0668 CHAB381_0669     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3539683 3539684 CHAB381_0669 CHAB381_0670   purH FALSE 0.155 78.000 0.000 NA   NA
 3539684 3539685 CHAB381_0670 CHAB381_0671 purH   FALSE 0.016 330.000 0.000 NA   NA
 3539685 3539686 CHAB381_0671 CHAB381_0672   thiC TRUE 0.239 46.000 0.000 NA   NA
 3539686 3539687 CHAB381_0672 CHAB381_0673 thiC   TRUE 0.986 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3539689 3539690 CHAB381_0675 CHAB381_0676     FALSE 0.152 80.000 0.000 NA   NA
 3539690 3539691 CHAB381_0676 CHAB381_0677   proB TRUE 0.995 -3.000 0.206 1.000   NA
 3539691 3539692 CHAB381_0677 CHAB381_0678 proB fmt TRUE 0.960 10.000 0.014 1.000 N NA
 3539692 3539693 CHAB381_0678 CHAB381_0679 fmt   TRUE 0.920 -37.000 0.029 1.000 N NA
 3539693 3539694 CHAB381_0679 CHAB381_0680     TRUE 0.992 -3.000 0.040 1.000 N NA
 3539694 3539695 CHAB381_0680 CHAB381_0681   spo0J TRUE 0.997 -3.000 0.827 1.000 N NA
 3539695 3539696 CHAB381_0681 CHAB381_0682 spo0J   TRUE 0.652 62.000 0.037 1.000 N NA
 3539696 3539697 CHAB381_0682 CHAB381_0683     TRUE 0.991 10.000 0.110 0.005 Y NA
 3539697 3539698 CHAB381_0683 CHAB381_0684   atpH TRUE 0.996 2.000 0.132 0.005 Y NA
 3539698 3539699 CHAB381_0684 CHAB381_0685 atpH atpA TRUE 0.990 11.000 0.864 0.005 Y NA
 3539699 3539700 CHAB381_0685 CHAB381_0686 atpA atpG TRUE 0.994 10.000 0.846 0.005 Y NA
 3539700 3539701 CHAB381_0686 CHAB381_0687 atpG atpD TRUE 0.989 11.000 0.724 0.005 Y NA
 3539701 3539702 CHAB381_0687 CHAB381_0688 atpD atpC TRUE 0.979 13.000 0.837 0.005 Y NA
 3539702 3539703 CHAB381_0688 CHAB381_0689 atpC   TRUE 0.991 1.000 0.036 1.000 N NA
 3539703 3539704 CHAB381_0689 CHAB381_0690     TRUE 0.998 0.000 0.944 0.024 Y NA
 3539704 3539705 CHAB381_0690 CHAB381_0691     TRUE 0.992 5.000 0.057 NA N NA
 3539705 3539706 CHAB381_0691 CHAB381_0692     TRUE 0.981 10.000 0.043 NA N NA
 3539706 3539707 CHAB381_0692 CHAB381_0693     TRUE 0.800 66.000 0.702 NA N NA
 3539707 3539708 CHAB381_0693 CHAB381_0694     TRUE 0.996 2.000 0.794 1.000   NA
 3539710 3539711 CHAB381_0696 CHAB381_0697   fabD TRUE 0.980 4.000 0.013 1.000 N NA
 3539711 3539712 CHAB381_0697 CHAB381_0698 fabD mtnN TRUE 0.992 -3.000 0.037 1.000 N NA
 3539712 3539713 CHAB381_0698 CHAB381_0699 mtnN   TRUE 0.991 -3.000 0.042 NA N NA
 3539713 3539714 CHAB381_0699 CHAB381_0700     FALSE 0.020 300.000 0.000 NA N NA
 3539714 3539715 CHAB381_0700 CHAB381_0701     TRUE 0.812 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3539715 3539716 CHAB381_0701 CHAB381_0702     TRUE 0.730 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 3539716 3539717 CHAB381_0702 CHAB381_0703     FALSE 0.061 133.000 0.000 NA   NA
 3539718 3539719 CHAB381_0704 CHAB381_0705     TRUE 0.978 -16.000 0.133 1.000 N NA
 3539719 3539720 CHAB381_0705 CHAB381_0706     TRUE 0.995 0.000 0.122 NA   NA
 3539720 3539721 CHAB381_0706 CHAB381_0707     TRUE 0.990 10.000 0.342 NA   NA
 3539721 3539722 CHAB381_0707 CHAB381_0708   glyQ TRUE 0.929 13.000 0.041 NA   NA
 3539722 3539723 CHAB381_0708 CHAB381_0709 glyQ   TRUE 0.411 21.000 0.000 NA   NA
 3539723 3539724 CHAB381_0709 CHAB381_0710     TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3539725 3539726 CHAB381_0711 CHAB381_0712 bioB ribE TRUE 0.910 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3539726 3539727 CHAB381_0712 CHAB381_0713 ribE   TRUE 0.844 -36.000 0.011 NA   NA
 3539727 3539728 CHAB381_0713 CHAB381_0714     FALSE 0.039 190.000 0.000 NA   NA
 3539730 3539731 CHAB381_0716 CHAB381_0717     TRUE 0.991 -3.000 0.037 NA   NA
 3539731 3539732 CHAB381_0717 CHAB381_0718     TRUE 0.949 -10.000 0.014 NA   NA
 3539732 3539733 CHAB381_0718 CHAB381_0719     TRUE 0.927 2.000 0.000 NA   NA
 3539733 3539734 CHAB381_0719 CHAB381_0720     TRUE 0.982 -7.000 0.032 NA   NA
 3539734 3539735 CHAB381_0720 CHAB381_0721     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3539735 3539736 CHAB381_0721 CHAB381_0722     TRUE 0.914 14.000 0.035 1.000   NA
 3539736 3539737 CHAB381_0722 CHAB381_0723   atpB TRUE 0.415 67.000 0.011 1.000   NA
 3539738 3539739 CHAB381_0724 CHAB381_0725     TRUE 0.232 48.000 0.000 NA   NA
 3539739 3539740 CHAB381_0725 CHAB381_0726     TRUE 0.895 9.000 0.000 NA   NA
 3539740 3539741 CHAB381_0726 CHAB381_0727   metG TRUE 0.992 1.000 0.046 1.000   NA
 3539741 3539742 CHAB381_0727 CHAB381_0728 metG   TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3539742 3539743 CHAB381_0728 CHAB381_0729   fbp TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539743 3539744 CHAB381_0729 CHAB381_0730 fbp mobB TRUE 0.513 41.000 0.008 1.000 N NA
 3539749 3539750 CHAB381_0735 CHAB381_0736 panB   FALSE 0.121 99.000 0.000 1.000   NA
 3539750 3539751 CHAB381_0736 CHAB381_0737   ruvB TRUE 0.922 6.000 0.000 1.000   NA
 3539751 3539752 CHAB381_0737 CHAB381_0738 ruvB   TRUE 0.944 -13.000 0.019 NA   NA
 3539752 3539753 CHAB381_0738 CHAB381_0739     FALSE 0.056 141.000 0.000 NA   NA
 3539754 3539755 CHAB381_0740 CHAB381_0741     FALSE 0.017 329.000 0.000 NA   NA
 3539755 3539756 CHAB381_0741 CHAB381_0742     FALSE 0.046 166.000 0.000 NA   NA
 3539756 3539757 CHAB381_0742 CHAB381_0743     TRUE 0.521 16.000 0.000 NA   NA
 3539758 3539759 CHAB381_0744 CHAB381_0745     FALSE 0.112 101.000 0.000 1.000   NA
 3539759 3539760 CHAB381_0745 CHAB381_0746     TRUE 0.621 114.000 0.375 1.000 Y NA
 3539760 3539761 CHAB381_0746 CHAB381_0747     FALSE 0.177 395.000 0.194 1.000   NA
 3539761 3539762 CHAB381_0747 CHAB381_0748     TRUE 0.997 0.000 0.806 1.000   NA
 3539763 3539764 CHAB381_0749 CHAB381_0750     FALSE 0.061 145.000 0.000 1.000   NA
 3539764 3539765 CHAB381_0750 CHAB381_0751     FALSE 0.010 531.000 0.000 NA   NA
 3539765 3539766 CHAB381_0751 CHAB381_0752     FALSE 0.049 159.000 0.000 NA   NA
 3539766 3539767 CHAB381_0752 CHAB381_0753     FALSE 0.050 155.000 0.000 NA   NA
 3539767 3539768 CHAB381_0753 CHAB381_0754     FALSE 0.015 362.000 0.000 NA   NA
 3539768 3539769 CHAB381_0754 CHAB381_0755     TRUE 0.608 -40.000 0.000 NA   NA
 3539769 3539770 CHAB381_0755 CHAB381_0756     FALSE 0.165 70.000 0.000 NA   NA
 3539770 3539771 CHAB381_0756 CHAB381_0757     TRUE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 3539771 3539772 CHAB381_0757 CHAB381_0758     FALSE 0.180 61.000 0.000 NA   NA
 3539772 3539773 CHAB381_0758 CHAB381_0759     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 3539773 3539774 CHAB381_0759 CHAB381_0760     TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3539776 3539777 CHAB381_0762 CHAB381_0763     FALSE 0.081 111.000 0.000 NA   NA
 3539777 3539778 CHAB381_0763 CHAB381_0764     TRUE 0.920 5.000 0.000 NA   NA
 3539779 3539780 CHAB381_0765 CHAB381_0766 selA selB TRUE 0.995 -7.000 0.569 0.001 N NA
 3539781 3539782 CHAB381_0767 CHAB381_0768 lepA   TRUE 0.229 56.000 0.000 1.000 N NA
 3539782 3539783 CHAB381_0768 CHAB381_0769   rpe TRUE 0.990 10.000 0.279 1.000 N NA
 3539784 3539785 CHAB381_0770 CHAB381_0771 rpmB   TRUE 0.842 19.000 0.025 1.000 N NA
 3539785 3539786 CHAB381_0771 CHAB381_0772   argJ TRUE 0.975 -7.000 0.019 1.000 N NA
 3539789 3539790 CHAB381_0775 CHAB381_0776     FALSE 0.060 148.000 0.000 1.000   NA
 3539791 3539792 CHAB381_0777 CHAB381_0778 gap pgk TRUE 0.884 16.000 0.020 0.004 Y NA
 3539792 3539793 CHAB381_0778 CHAB381_0779 pgk tpiA TRUE 0.989 0.000 0.022 1.000 Y NA
 3539793 3539794 CHAB381_0779 CHAB381_0780 tpiA   TRUE 0.995 -3.000 0.071 0.030 N NA
 3539794 3539795 CHAB381_0780 CHAB381_0781     TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3539795 3539796 CHAB381_0781 CHAB381_0782     TRUE 0.828 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3539796 3539797 CHAB381_0782 CHAB381_0783   galE TRUE 0.784 20.000 0.017 1.000 N NA
 3539798 3539799 CHAB381_0784 CHAB381_0785     FALSE 0.038 191.000 0.000 NA   NA
 3539799 3539800 CHAB381_0785 CHAB381_0786     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539800 3539801 CHAB381_0786 CHAB381_0787     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3539801 3539802 CHAB381_0787 CHAB381_0788     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3539802 3539803 CHAB381_0788 CHAB381_0789     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539803 3539804 CHAB381_0789 CHAB381_0790     TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3539804 3539805 CHAB381_0790 CHAB381_0791     FALSE 0.012 459.000 0.000 NA   NA
 3539807 3539808 CHAB381_0793 CHAB381_0794     TRUE 0.555 56.000 0.013 0.006 N NA
 3539810 3539811 CHAB381_0796 CHAB381_0798     FALSE 0.077 114.000 0.000 NA   NA
 3539811 3539812 CHAB381_0798 CHAB381_0799     FALSE 0.114 152.000 0.004 NA   NA
 3539812 3539813 CHAB381_0799 CHAB381_0800     TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3539814 3539815 CHAB381_0801 CHAB381_0802     TRUE 0.995 0.000 0.133 NA   NA
 3539815 3539816 CHAB381_0802 CHAB381_0803     TRUE 0.457 19.000 0.000 NA   NA
 3539816 3539817 CHAB381_0803 CHAB381_0804   nhaA FALSE 0.008 813.000 0.000 NA   NA
 3539819 3539820 CHAB381_0806 CHAB381_0807   recG FALSE 0.017 317.000 0.000 NA   NA
 3539821 3539822 CHAB381_0808 CHAB381_0809     TRUE 0.895 9.000 0.000 NA   NA
 3539822 3539823 CHAB381_0809 CHAB381_0810     FALSE 0.014 460.000 0.000 1.000 N NA
 3539824 3539825 CHAB381_0811 CHAB381_0812     TRUE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 3539825 3539826 CHAB381_0812 CHAB381_0813     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3539827 3539828 CHAB381_0814 CHAB381_0815     FALSE 0.022 277.000 0.000 NA   NA
 3539828 3539829 CHAB381_0815 CHAB381_0816     TRUE 0.906 7.000 0.000 NA   NA
 3539829 3539830 CHAB381_0816 CHAB381_0817     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3539830 3539831 CHAB381_0817 CHAB381_0818   mraW TRUE 0.988 3.000 0.031 NA   NA
 3539832 3539833 CHAB381_0819 CHAB381_0820     TRUE 0.305 135.000 0.029 1.000   NA
 3539833 3539834 CHAB381_0820 CHAB381_0821   ftsA TRUE 0.992 -7.000 0.184 1.000   NA
 3539834 3539835 CHAB381_0821 CHAB381_0822 ftsA ftsZ TRUE 0.970 12.000 0.114 1.000 Y NA
 3539835 3539836 CHAB381_0822 CHAB381_0823 ftsZ   TRUE 0.252 49.000 0.000 1.000   NA
 3539836 3539837 CHAB381_0823 CHAB381_0824     TRUE 0.354 60.000 0.002 1.000   NA
 3539837 3539838 CHAB381_0824 CHAB381_0825     FALSE 0.175 77.000 0.000 NA Y NA
 3539839 3539840 CHAB381_0826 CHAB381_0827     FALSE 0.159 76.000 0.000 NA   NA
 3539840 3539841 CHAB381_0827 CHAB381_0828     FALSE 0.049 158.000 0.000 NA   NA
 3539841 3539842 CHAB381_0828 CHAB381_0829     FALSE 0.020 291.000 0.000 NA   NA
 3539842 3539843 CHAB381_0829 CHAB381_0830   glmS TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3539843 3539844 CHAB381_0830 CHAB381_0831 glmS   FALSE 0.127 90.000 0.000 NA   NA
 3539845 3539846 CHAB381_0832 CHAB381_0833     TRUE 0.984 0.000 0.016 1.000   NA
 3539846 3539847 CHAB381_0833 CHAB381_0834     TRUE 0.982 0.000 0.012 1.000   NA
 3539847 3539848 CHAB381_0834 CHAB381_0835     TRUE 0.953 -25.000 0.053 NA   NA
 3539848 3539849 CHAB381_0835 CHAB381_0837     TRUE 0.902 24.000 0.237 NA   NA
 3539850 3539851 CHAB381_0836 CHAB381_0838     FALSE 0.042 192.000 0.000 1.000   NA
 3539851 3539852 CHAB381_0838 CHAB381_0839   tsf TRUE 0.984 3.000 0.019 1.000 N NA
 3539852 3539853 CHAB381_0839 CHAB381_0840 tsf rpsB TRUE 0.997 0.000 0.748 1.000 Y NA
 3539853 3539854 CHAB381_0840 CHAB381_0841 rpsB   FALSE 0.060 148.000 0.000 1.000   NA
 3539854 3539855 CHAB381_0841 CHAB381_0842     FALSE 0.153 79.000 0.000 NA   NA
 3539855 3539856 CHAB381_0842 CHAB381_0843     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA N NA
 3539856 3539857 CHAB381_0843 CHAB381_0844     TRUE 0.977 12.000 0.846 NA   NA
 3539857 3539858 CHAB381_0844 CHAB381_0845   purQ TRUE 0.987 -6.000 0.038 NA   NA
 3539858 3539859 CHAB381_0845 CHAB381_0846 purQ purS TRUE 0.997 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 3539859 3539860 CHAB381_0846 CHAB381_0847 purS purC TRUE 0.986 11.000 0.460 1.000 Y NA
 3539860 3539861 CHAB381_0847 CHAB381_0848 purC   TRUE 0.850 25.000 0.045 1.000 N NA
 3539863 3539864 CHAB381_0850 CHAB381_0851   rarD TRUE 0.963 -7.000 0.011 NA   NA
 3539865 3539866 CHAB381_0852 CHAB381_0853     TRUE 0.941 1.000 0.000 1.000 N NA
 3539866 3539867 CHAB381_0853 CHAB381_0854     TRUE 0.920 5.000 0.000 NA   NA
 3539867 3539868 CHAB381_0854 CHAB381_0855   lgt TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539868 3539869 CHAB381_0855 CHAB381_0856 lgt   TRUE 0.393 57.000 0.005 1.000 N NA
 3539869 3539870 CHAB381_0856 CHAB381_0857     TRUE 0.892 20.000 0.034 0.002 Y NA
 3539870 3539871 CHAB381_0857 CHAB381_0858     TRUE 0.994 -7.000 0.153 0.002 Y NA
 3539871 3539872 CHAB381_0858 CHAB381_0859     FALSE 0.073 378.000 0.022 1.000   NA
 3539872 3539873 CHAB381_0859 CHAB381_0860     TRUE 0.993 -9.000 0.750 0.008   NA
 3539873 3539874 CHAB381_0860 CHAB381_0861     FALSE 0.077 120.000 0.000 1.000   NA
 3539874 3539875 CHAB381_0861 CHAB381_0862     TRUE 0.997 3.000 0.951 0.001 Y NA
 3539875 3539876 CHAB381_0862 CHAB381_0863   cybH TRUE 0.938 21.000 0.270 0.034 Y NA
 3539876 3539877 CHAB381_0863 CHAB381_0864 cybH   TRUE 0.996 1.000 0.277 1.000 Y NA
 3539877 3539878 CHAB381_0864 CHAB381_0865     TRUE 0.996 -3.000 0.488 NA   NA
 3539878 3539879 CHAB381_0865 CHAB381_0866   hypF TRUE 0.962 -16.000 0.043 NA   NA
 3539880 3539881 CHAB381_0867 CHAB381_0868     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3539882 3539883 CHAB381_0869 CHAB381_0870     FALSE 0.047 165.000 0.000 NA   NA
 3539883 3539884 CHAB381_0870 CHAB381_0871   hypB FALSE 0.094 275.000 0.015 1.000 Y NA
 3539884 3539885 CHAB381_0871 CHAB381_0872 hypB   TRUE 0.996 0.000 0.463 NA Y NA
 3539885 3539886 CHAB381_0872 CHAB381_0873   hypD TRUE 0.977 -16.000 0.123 NA Y NA
 3539886 3539887 CHAB381_0873 CHAB381_0874 hypD   TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3539888 3539889 CHAB381_0875 CHAB381_0876     TRUE 0.239 46.000 0.000 NA   NA
 3539889 3539890 CHAB381_0876 CHAB381_0877     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539890 3539891 CHAB381_0877 CHAB381_0878     TRUE 0.379 27.000 0.000 1.000 N NA
 3539891 3539892 CHAB381_0878 CHAB381_0879   expD TRUE 0.991 -7.000 0.074 0.059 N NA
 3539892 3539893 CHAB381_0879 CHAB381_0880 expD exbB TRUE 0.997 -3.000 0.815 0.023 Y NA
 3539895 3539896 CHAB381_0882 CHAB381_0883     TRUE 0.601 -42.000 0.000 NA   NA
 3539898 3539899 CHAB381_0885 CHAB381_0886     TRUE 0.694 -22.000 0.000 NA   NA
 3539899 3539900 CHAB381_0886 CHAB381_0887     FALSE 0.018 308.000 0.000 NA   NA
 3539900 3539901 CHAB381_0887 CHAB381_0888     FALSE 0.144 84.000 0.000 NA   NA
 3539901 3539902 CHAB381_0888 CHAB381_0889   cysK TRUE 0.902 8.000 0.000 NA   NA
 3539902 3539903 CHAB381_0889 CHAB381_0890 cysK   TRUE 0.992 10.000 1.000 NA N NA
 3539903 3539904 CHAB381_0890 CHAB381_0891     TRUE 0.977 -3.000 0.010 NA N NA
 3539905 3539906 CHAB381_0892 CHAB381_0893     TRUE 0.994 -3.000 0.091 NA   NA
 3539906 3539907 CHAB381_0893 CHAB381_0894     TRUE 0.408 159.000 0.143 NA   NA
 3539907 3539908 CHAB381_0894 CHAB381_0895     TRUE 0.972 3.000 0.009 NA   NA
 3539908 3539909 CHAB381_0895 CHAB381_0896   hemA TRUE 0.994 0.000 0.051 1.000 Y NA
 3539909 3539910 CHAB381_0896 CHAB381_0897 hemA proS TRUE 0.982 -10.000 0.040 0.041 N NA
 3539910 3539911 CHAB381_0897 CHAB381_0898 proS   TRUE 0.982 -6.000 0.022 1.000   NA
 3539911 3539912 CHAB381_0898 CHAB381_0899   hemC TRUE 0.981 -3.000 0.013 1.000   NA
 3539912 3539913 CHAB381_0899 CHAB381_0900 hemC   TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3539913 3539914 CHAB381_0900 CHAB381_0901     FALSE 0.162 73.000 0.000 NA   NA
 3539914 3539915 CHAB381_0901 CHAB381_0902     TRUE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3539919 3539920 CHAB381_0906 CHAB381_0907 ileS   TRUE 0.323 91.000 0.008 1.000 Y NA
 3539920 3539921 CHAB381_0907 CHAB381_0908   guaB TRUE 0.987 6.000 0.032 1.000 N NA
 3539921 3539922 CHAB381_0908 CHAB381_0909 guaB metX TRUE 0.984 0.000 0.015 1.000 N NA
 3539922 3539923 CHAB381_0909 CHAB381_0910 metX   TRUE 0.955 -12.000 0.019 1.000   NA
 3539923 3539924 CHAB381_0910 CHAB381_0911     TRUE 0.990 -3.000 0.032 1.000   NA
 3539924 3539925 CHAB381_0911 CHAB381_0912     TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3539925 3539926 CHAB381_0912 CHAB381_0913     FALSE 0.118 94.000 0.000 NA   NA
 3539926 3539927 CHAB381_0913 CHAB381_0914     FALSE 0.021 287.000 0.000 NA   NA
 3539928 3539929 CHAB381_0915 CHAB381_0916     TRUE 0.318 121.000 0.027 1.000   NA
 3539929 3539930 CHAB381_0916 CHAB381_0917     TRUE 0.960 -13.000 0.027 1.000   NA
 3539930 3539931 CHAB381_0917 CHAB381_0918     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3539932 3539933 CHAB381_0919 CHAB381_0920 murA   TRUE 0.988 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3539933 3539934 CHAB381_0920 CHAB381_0921     TRUE 0.288 34.000 0.000 NA   NA
 3539934 3539935 CHAB381_0921 CHAB381_0922     TRUE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3539935 3539936 CHAB381_0922 CHAB381_0923   coaD TRUE 0.991 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 3539936 3539937 CHAB381_0923 CHAB381_0924 coaD tmk TRUE 0.988 -6.000 0.034 1.000 N NA
 3539937 3539938 CHAB381_0924 CHAB381_0925 tmk hisS TRUE 0.987 -3.000 0.018 0.082 N NA
 3539938 3539939 CHAB381_0925 CHAB381_0926 hisS speA TRUE 0.987 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3539939 3539940 CHAB381_0926 CHAB381_0927 speA cysE TRUE 0.993 5.000 0.055 1.000 Y NA
 3539940 3539941 CHAB381_0927 CHAB381_0928 cysE   TRUE 0.824 45.000 0.102 1.000 Y NA
 3539941 3539942 CHAB381_0928 CHAB381_0929     FALSE 0.105 100.000 0.000 NA   NA
 3539942 3539943 CHAB381_0929 CHAB381_0930     TRUE 0.980 -10.000 0.052 NA   NA
 3539943 3539944 CHAB381_0930 CHAB381_0931     TRUE 0.993 -6.000 0.129 1.000   NA
 3539944 3539945 CHAB381_0931 CHAB381_0932     TRUE 0.800 11.000 0.000 1.000 N NA
 3539945 3539946 CHAB381_0932 CHAB381_0933     FALSE 0.013 400.000 0.000 NA   NA
 3539947 3539948 CHAB381_0934 CHAB381_0935     TRUE 0.995 0.000 0.154 NA   NA
 3539948 3539949 CHAB381_0935 CHAB381_0936     TRUE 0.992 -3.000 0.048 NA   NA
 3539950 3539951 CHAB381_0937 CHAB381_0938 rpsO secA FALSE 0.111 103.000 0.000 1.000 N NA
 3539951 3539952 CHAB381_0938 CHAB381_0939 secA   TRUE 0.396 205.000 0.201 0.058 N NA
 3539955 3539956 CHAB381_0942 CHAB381_0943     FALSE 0.011 502.000 0.000 NA   NA
 3539956 3539957 CHAB381_0943 CHAB381_0944     TRUE 0.980 -3.000 0.011 1.000 N NA
 3539957 3539958 CHAB381_0944 CHAB381_0945     FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 3539958 3539959 CHAB381_0945 CHAB381_0946   hisA TRUE 0.411 21.000 0.000 NA   NA
 3539959 3539960 CHAB381_0946 CHAB381_0947 hisA hisH TRUE 0.996 0.000 0.091 0.005 Y NA
 3539960 3539961 CHAB381_0947 CHAB381_0948 hisH   TRUE 0.994 -6.000 0.273 1.000   NA
 3539961 3539962 CHAB381_0948 CHAB381_0949     TRUE 0.994 -6.000 0.242 1.000   NA
 3539962 3539963 CHAB381_0949 CHAB381_0950     TRUE 0.995 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 3539963 3539964 CHAB381_0950 CHAB381_0951     TRUE 0.724 61.000 0.070 1.000   NA
 3539964 3539965 CHAB381_0951 CHAB381_0952     TRUE 0.978 -13.000 0.074 1.000   NA
 3539965 3539966 CHAB381_0952 CHAB381_0953     TRUE 0.992 -7.000 0.128 1.000 Y NA
 3539966 3539967 CHAB381_0953 CHAB381_0954     FALSE 0.192 64.000 0.000 1.000   NA
 3539967 3539968 CHAB381_0954 CHAB381_0955     TRUE 0.809 -13.000 0.000 1.000   NA
 3539968 3539969 CHAB381_0955 CHAB381_0956     TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.011 Y NA
 3539969 3539970 CHAB381_0956 CHAB381_0957     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539970 3539971 CHAB381_0957 CHAB381_0958     TRUE 0.746 -16.000 0.000 NA   NA
 3539971 3539972 CHAB381_0958 CHAB381_0959     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539972 3539973 CHAB381_0959 CHAB381_0960     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539973 3539974 CHAB381_0960 CHAB381_0961     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3539974 3539975 CHAB381_0961 CHAB381_0962     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3539975 3539976 CHAB381_0962 CHAB381_0963     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3539977 3539978 CHAB381_0964 CHAB381_0965 pyrB   TRUE 0.996 3.000 0.452 1.000 Y NA
 3539979 3539980 CHAB381_0966 CHAB381_0967     FALSE 0.038 191.000 0.000 NA   NA
 3539981 3539982 CHAB381_0968 CHAB381_0969 glmU coaBC TRUE 0.984 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3539982 3539983 CHAB381_0969 CHAB381_0970 coaBC uppS TRUE 0.977 -3.000 0.009 1.000 N NA
 3539983 3539984 CHAB381_0970 CHAB381_0971 uppS   TRUE 0.727 25.000 0.017 1.000 N NA
 3539984 3539985 CHAB381_0971 CHAB381_0972     TRUE 0.985 -7.000 0.039 1.000   NA
 3539985 3539986 CHAB381_0972 CHAB381_0973     TRUE 0.970 -16.000 0.059 1.000   NA
 3539987 3539988 CHAB381_0974 CHAB381_0975     TRUE 0.993 4.000 0.056 1.000 N NA
 3539988 3539989 CHAB381_0975 CHAB381_0976     TRUE 0.983 11.000 0.282 1.000 N NA
 3539990 3539991 CHAB381_0977 CHAB381_0978     TRUE 0.749 84.000 0.294 1.000 N NA
 3539991 3539992 CHAB381_0978 CHAB381_0979     TRUE 0.997 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 3539994 3539995 CHAB381_0981 CHAB381_0982     FALSE 0.063 129.000 0.000 NA   NA
 3539996 3539997 CHAB381_0983 CHAB381_0984     TRUE 0.983 -6.000 0.026 NA N NA
 3539997 3539998 CHAB381_0984 CHAB381_0985     TRUE 0.988 -3.000 0.028 NA   NA
 3539998 3539999 CHAB381_0985 CHAB381_0986   alaS TRUE 0.980 -3.000 0.011 1.000   NA
 3540000 3540001 CHAB381_0987 CHAB381_0988   hemH TRUE 0.965 -6.000 0.005 1.000   NA
 3540002 3540003 CHAB381_0989 CHAB381_0990     FALSE 0.173 64.000 0.000 NA   NA
 3540003 3540004 CHAB381_0990 CHAB381_0991     FALSE 0.077 114.000 0.000 NA   NA
 3540005 3540006 CHAB381_0992 CHAB381_0993     TRUE 0.669 -27.000 0.000 NA   NA
 3540007 3540008 CHAB381_0994 CHAB381_0995 pgpA dnaB FALSE 0.043 197.000 0.000 1.000 N NA
 3540008 3540009 CHAB381_0995 CHAB381_0996 dnaB ispG TRUE 0.965 -7.000 0.011 1.000 N NA
 3540009 3540010 CHAB381_0996 CHAB381_0997 ispG   FALSE 0.201 63.000 0.000 1.000 N NA
 3540011 3540012 CHAB381_0998 CHAB381_0999     TRUE 0.994 0.000 0.051 1.000 N NA
 3540012 3540013 CHAB381_0999 CHAB381_1000     TRUE 0.993 0.000 0.050 NA   NA
 3540013 3540014 CHAB381_1000 CHAB381_1001     TRUE 0.992 -3.000 0.053 NA   NA
 3540014 3540015 CHAB381_1001 CHAB381_1002     TRUE 0.993 -3.000 0.054 1.000   NA
 3540015 3540016 CHAB381_1002 CHAB381_1003     FALSE 0.010 521.000 0.000 NA   NA
 3540017 3540018 CHAB381_1004 CHAB381_1005     FALSE 0.045 167.000 0.000 NA   NA
 3540018 3540019 CHAB381_1005 CHAB381_1006     FALSE 0.022 280.000 0.000 NA   NA
 3540019 3540020 CHAB381_1006 CHAB381_1007     FALSE 0.217 110.000 0.007 1.000 N NA
 3540020 3540021 CHAB381_1007 CHAB381_1008     TRUE 0.280 39.000 0.000 1.000   NA
 3540022 3540023 CHAB381_1009 CHAB381_1797 truD   FALSE 0.211 54.000 0.000 NA   NA
 3540024 3540025 CHAB381_1011 CHAB381_1012     FALSE 0.161 75.000 0.000 NA   NA
 3540025 3540026 CHAB381_1012 CHAB381_1013     FALSE 0.011 518.000 0.000 NA   NA
 3540026 3540027 CHAB381_1013 CHAB381_1014   ribF TRUE 0.983 -10.000 0.051 1.000 Y NA
 3540027 3540028 CHAB381_1014 CHAB381_1015 ribF   TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3540028 3540029 CHAB381_1015 CHAB381_1016   rrmJ TRUE 0.903 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3540029 3540030 CHAB381_1016 CHAB381_1017 rrmJ ligA TRUE 0.982 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3540030 3540031 CHAB381_1017 CHAB381_1018 ligA   TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540031 3540032 CHAB381_1018 CHAB381_1019   kdsB TRUE 0.975 -3.000 0.009 NA   NA
 3540032 3540033 CHAB381_1019 CHAB381_1020 kdsB thrC TRUE 0.984 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3540033 3540034 CHAB381_1020 CHAB381_1021 thrC   TRUE 0.869 10.000 0.000 1.000   NA
 3540034 3540035 CHAB381_1021 CHAB381_1022   argB TRUE 0.933 4.000 0.000 1.000   NA
 3540035 3540036 CHAB381_1022 CHAB381_1023 argB lpxK TRUE 0.683 25.000 0.012 1.000 N NA
 3540036 3540037 CHAB381_1023 CHAB381_1024 lpxK   TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3540037 3540038 CHAB381_1024 CHAB381_1025   nadE TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3540040 3540041 CHAB381_1027 CHAB381_1028     TRUE 0.990 -7.000 0.084 1.000   NA
 3540041 3540042 CHAB381_1028 CHAB381_1029     TRUE 0.995 -3.000 0.130 1.000   NA
 3540042 3540043 CHAB381_1029 CHAB381_1030     FALSE 0.012 494.000 0.000 NA N NA
 3540043 3540044 CHAB381_1030 CHAB381_1031     TRUE 0.996 2.000 0.313 NA Y NA
 3540044 3540045 CHAB381_1031 CHAB381_1032     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3540045 3540046 CHAB381_1032 CHAB381_1033     TRUE 0.995 -3.000 0.269 NA   NA
 3540046 3540047 CHAB381_1033 CHAB381_1034   hemL TRUE 0.996 -3.000 0.462 NA   NA
 3540047 3540048 CHAB381_1034 CHAB381_1035 hemL   TRUE 0.995 -3.000 0.212 1.000   NA
 3540049 3540050 CHAB381_1036 CHAB381_1037   lepB TRUE 0.995 1.000 0.117 1.000 N NA
 3540050 3540051 CHAB381_1037 CHAB381_1038 lepB   FALSE 0.148 82.000 0.000 NA   NA
 3540051 3540052 CHAB381_1038 CHAB381_1039     FALSE 0.034 205.000 0.000 NA   NA
 3540052 3540053 CHAB381_1039 CHAB381_1040     FALSE 0.041 182.000 0.000 NA   NA
 3540053 3540054 CHAB381_1040 CHAB381_1041     TRUE 0.457 19.000 0.000 NA   NA
 3540054 3540055 CHAB381_1041 CHAB381_1042   rpiB FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 3540055 3540056 CHAB381_1042 CHAB381_1043 rpiB   TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540056 3540057 CHAB381_1043 CHAB381_1044   apt TRUE 0.815 -12.000 0.000 NA   NA
 3540057 3540058 CHAB381_1044 CHAB381_1045 apt   TRUE 0.987 1.000 0.026 NA   NA
 3540058 3540059 CHAB381_1045 CHAB381_1046     TRUE 0.972 -22.000 0.250 NA   NA
 3540059 3540060 CHAB381_1046 CHAB381_1047   ychF TRUE 0.989 0.000 0.026 1.000 N NA
 3540061 3540062 CHAB381_1048 CHAB381_1049     TRUE 0.925 20.000 0.200 1.000 N NA
 3540062 3540063 CHAB381_1049 CHAB381_1050     TRUE 0.273 62.000 0.000 0.005 Y NA
 3540063 3540064 CHAB381_1050 CHAB381_1051     FALSE 0.051 172.000 0.000 1.000 N NA
 3540064 3540065 CHAB381_1051 CHAB381_1052     TRUE 0.997 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 3540065 3540066 CHAB381_1052 CHAB381_1053     TRUE 0.994 5.000 0.188 NA   NA
 3540066 3540067 CHAB381_1053 CHAB381_1054     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540067 3540068 CHAB381_1054 CHAB381_1055     TRUE 0.992 -7.000 0.167 1.000   NA
 3540068 3540069 CHAB381_1055 CHAB381_1056     TRUE 0.993 -7.000 0.458 1.000   NA
 3540069 3540070 CHAB381_1056 CHAB381_1057     TRUE 0.972 -22.000 0.250 NA   NA
 3540070 3540071 CHAB381_1057 CHAB381_1058     TRUE 0.996 -3.000 0.385 NA   NA
 3540071 3540072 CHAB381_1058 CHAB381_1059     TRUE 0.990 -10.000 0.692 NA   NA
 3540072 3540073 CHAB381_1059 CHAB381_1060   era TRUE 0.684 56.000 0.044 NA   NA
 3540073 3540074 CHAB381_1060 CHAB381_1061 era hslU TRUE 0.994 -3.000 0.051 0.081   NA
 3540074 3540075 CHAB381_1061 CHAB381_1062 hslU   TRUE 0.997 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 3540075 3540076 CHAB381_1062 CHAB381_1063   rplI TRUE 0.992 0.000 0.034 1.000 N NA
 3540076 3540077 CHAB381_1063 CHAB381_1064 rplI argG TRUE 0.715 20.000 0.009 1.000 N NA
 3540077 3540078 CHAB381_1064 CHAB381_1065 argG   FALSE 0.073 125.000 0.000 1.000   NA
 3540079 3540080 CHAB381_1066 CHAB381_1067     TRUE 0.871 -16.000 0.003 NA   NA
 3540080 3540081 CHAB381_1067 CHAB381_1068     TRUE 0.947 -7.000 0.003 NA   NA
 3540082 3540083 CHAB381_1069 CHAB381_1070     FALSE 0.180 64.000 0.000 NA N NA
 3540083 3540084 CHAB381_1070 CHAB381_1071     TRUE 0.984 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3540084 3540085 CHAB381_1071 CHAB381_1072     TRUE 0.952 -37.000 0.067 1.000 N NA
 3540085 3540086 CHAB381_1072 CHAB381_1073     TRUE 0.994 -3.000 0.063 1.000 N NA
 3540086 3540087 CHAB381_1073 CHAB381_1074   aroB TRUE 0.992 -3.000 0.041 1.000 N NA
 3540087 3540088 CHAB381_1074 CHAB381_1075 aroB   TRUE 0.674 50.000 0.031 1.000   NA
 3540089 3540090 CHAB381_1076 CHAB381_1078     FALSE 0.211 54.000 0.000 NA   NA
 3540091 3540092 CHAB381_1077 CHAB381_1079     TRUE 0.317 30.000 0.000 NA   NA
 3540093 3540094 CHAB381_1080 CHAB381_1081     TRUE 0.996 -3.000 0.258 0.057 N NA
 3540094 3540095 CHAB381_1081 CHAB381_1082     TRUE 0.994 5.000 0.152 1.000 N NA
 3540097 3540098 CHAB381_1084 CHAB381_1085     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540100 3540101 CHAB381_1087 CHAB381_1089     FALSE 0.040 183.000 0.000 NA   NA
 3540104 3540105 CHAB381_1091 CHAB381_1092 queA tatC TRUE 0.976 -10.000 0.036 NA N NA
 3540105 3540106 CHAB381_1092 CHAB381_1093 tatC   TRUE 0.994 -7.000 0.535 NA Y NA
 3540107 3540108 CHAB381_1094 CHAB381_1095     TRUE 0.650 -31.000 0.000 NA   NA
 3540108 3540109 CHAB381_1095 CHAB381_1096     FALSE 0.013 407.000 0.000 NA   NA
 3540109 3540110 CHAB381_1096 CHAB381_1097     TRUE 0.608 -40.000 0.000 NA   NA
 3540110 3540111 CHAB381_1097 CHAB381_1098     TRUE 0.902 8.000 0.000 NA   NA
 3540112 3540113 CHAB381_1099 CHAB381_1100     FALSE 0.090 106.000 0.000 NA   NA
 3540114 3540115 CHAB381_1101 CHAB381_1102     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540117 3540118 CHAB381_1104 CHAB381_1105     TRUE 0.628 54.000 0.023 1.000 Y NA
 3540118 3540119 CHAB381_1105 CHAB381_1106     TRUE 0.903 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3540119 3540120 CHAB381_1106 CHAB381_1107     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540120 3540121 CHAB381_1107 CHAB381_1108     TRUE 0.569 59.000 0.026 NA   NA
 3540121 3540122 CHAB381_1108 CHAB381_1109     TRUE 0.993 -3.000 0.046 1.000 N NA
 3540122 3540123 CHAB381_1109 CHAB381_1110     TRUE 0.974 -3.000 0.005 1.000 N NA
 3540123 3540124 CHAB381_1110 CHAB381_1111   smpB TRUE 0.990 0.000 0.028 1.000 N NA
 3540124 3540125 CHAB381_1111 CHAB381_1112 smpB   TRUE 0.977 1.000 0.009 1.000   NA
 3540125 3540126 CHAB381_1112 CHAB381_1113   clpS TRUE 0.988 0.000 0.024 NA   NA
 3540126 3540127 CHAB381_1113 CHAB381_1114 clpS   TRUE 0.996 0.000 0.596 NA   NA
 3540127 3540128 CHAB381_1114 CHAB381_1115     TRUE 0.816 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3540128 3540129 CHAB381_1115 CHAB381_1116     FALSE 0.209 60.000 0.000 1.000 N NA
 3540129 3540130 CHAB381_1116 CHAB381_1117     TRUE 0.996 3.000 0.713 NA Y NA
 3540130 3540131 CHAB381_1117 CHAB381_1118     FALSE 0.111 97.000 0.000 NA   NA
 3540132 3540133 CHAB381_1119 CHAB381_1120 dnaK grpE TRUE 0.639 74.000 0.029 0.008 Y NA
 3540133 3540134 CHAB381_1120 CHAB381_1121 grpE   TRUE 0.991 -3.000 0.038 NA N NA
 3540134 3540135 CHAB381_1121 CHAB381_1122     FALSE 0.014 382.000 0.000 NA   NA
 3540136 3540137 CHAB381_1123 CHAB381_1124     TRUE 0.369 100.000 0.020 1.000   NA
 3540137 3540138 CHAB381_1124 CHAB381_1125     FALSE 0.031 230.000 0.000 1.000   NA
 3540138 3540139 CHAB381_1125 CHAB381_1126     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540139 3540140 CHAB381_1126 CHAB381_1127     FALSE 0.014 396.000 0.000 NA   NA
 3540141 3540142 CHAB381_1128 CHAB381_1129     FALSE 0.042 180.000 0.000 NA   NA
 3540144 3540145 CHAB381_1131 CHAB381_1132     FALSE 0.095 103.000 0.000 NA   NA
 3540145 3540146 CHAB381_1132 CHAB381_1133     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3540147 3540148 CHAB381_1134 CHAB381_1135     TRUE 0.311 100.000 0.016 NA   NA
 3540148 3540149 CHAB381_1135 CHAB381_1136     TRUE 0.989 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 3540149 3540150 CHAB381_1136 CHAB381_1137     TRUE 0.988 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 3540150 3540151 CHAB381_1137 CHAB381_1138   sucD TRUE 0.997 0.000 0.169 0.001 Y NA
 3540151 3540152 CHAB381_1138 CHAB381_1139 sucD   TRUE 0.988 10.000 0.097 1.000 Y NA
 3540152 3540153 CHAB381_1139 CHAB381_1140     TRUE 0.996 5.000 0.316 0.002 Y NA
 3540153 3540154 CHAB381_1140 CHAB381_1141     TRUE 0.997 3.000 0.771 0.002 Y NA
 3540154 3540155 CHAB381_1141 CHAB381_1142     TRUE 0.997 -3.000 0.324 0.002 Y NA
 3540156 3540157 CHAB381_1143 CHAB381_1144     TRUE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3540157 3540158 CHAB381_1144 CHAB381_1145   recR FALSE 0.015 344.000 0.000 NA   NA
 3540158 3540159 CHAB381_1145 CHAB381_1146 recR   TRUE 0.951 -10.000 0.011 1.000 N NA
 3540159 3540160 CHAB381_1146 CHAB381_1147     TRUE 0.996 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 3540161 3540162 CHAB381_1148 CHAB381_1149 dnaJ   FALSE 0.051 154.000 0.000 NA   NA
 3540163 3540164 CHAB381_1150 CHAB381_1151     TRUE 0.269 37.000 0.000 NA   NA
 3540164 3540165 CHAB381_1151 CHAB381_1152     TRUE 0.622 -37.000 0.000 NA   NA
 3540166 3540167 CHAB381_1153 CHAB381_1154     FALSE 0.041 181.000 0.000 NA   NA
 3540167 3540168 CHAB381_1154 CHAB381_1155     FALSE 0.192 57.000 0.000 NA   NA
 3540169 3540170 CHAB381_1156 CHAB381_1157     FALSE 0.165 70.000 0.000 NA   NA
 3540170 3540171 CHAB381_1157 CHAB381_1158     FALSE 0.007 1028.000 0.000 NA   NA
 3540171 3540172 CHAB381_1158 CHAB381_1159     TRUE 0.411 21.000 0.000 NA   NA
 3540172 3540173 CHAB381_1159 CHAB381_1160     TRUE 0.326 28.000 0.000 NA   NA
 3540173 3540174 CHAB381_1160 CHAB381_1161     FALSE 0.079 112.000 0.000 NA   NA
 3540174 3540175 CHAB381_1161 CHAB381_1162   ackA FALSE 0.045 168.000 0.000 NA   NA
 3540175 3540176 CHAB381_1162 CHAB381_1163 ackA   TRUE 0.995 0.000 0.080 1.000 Y NA
 3540177 3540178 CHAB381_1164 CHAB381_1165   ilvB FALSE 0.012 463.000 0.000 NA   NA
 3540178 3540179 CHAB381_1165 CHAB381_1166 ilvB ilvN TRUE 0.992 10.000 0.249 0.001 Y NA
 3540179 3540180 CHAB381_1166 CHAB381_1167 ilvN lpxD TRUE 0.994 0.000 0.052 1.000 N NA
 3540180 3540181 CHAB381_1167 CHAB381_1168 lpxD   FALSE 0.013 490.000 0.000 1.000 N NA
 3540181 3540182 CHAB381_1168 CHAB381_1169     TRUE 0.960 13.000 0.222 NA N NA
 3540182 3540183 CHAB381_1169 CHAB381_1170     TRUE 0.993 4.000 0.064 NA N NA
 3540183 3540184 CHAB381_1170 CHAB381_1171     TRUE 0.899 -7.000 0.000 1.000   NA
 3540186 3540187 CHAB381_1173 CHAB381_1174 dcuB   TRUE 0.594 -48.000 0.000 NA   NA
 3540188 3540189 CHAB381_1175 CHAB381_1176   thiH TRUE 0.993 -7.000 0.128 0.003 Y NA
 3540189 3540190 CHAB381_1176 CHAB381_1177 thiH thiG TRUE 0.996 4.000 0.277 0.003 Y NA
 3540190 3540191 CHAB381_1177 CHAB381_1178 thiG thiF TRUE 0.994 2.000 0.054 0.021   NA
 3540191 3540192 CHAB381_1178 CHAB381_1179 thiF thiS TRUE 0.996 -3.000 0.346 1.000   NA
 3540192 3540193 CHAB381_1179 CHAB381_1180 thiS   TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3540193 3540194 CHAB381_1180 CHAB381_1181     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540195 3540196 CHAB381_1182 CHAB381_1183 brnQ radA FALSE 0.033 230.000 0.000 1.000 N NA
 3540197 3540198 CHAB381_1184 CHAB381_1185     TRUE 0.498 165.000 1.000 NA   NA
 3540198 3540199 CHAB381_1185 CHAB381_1186     FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 3540199 3540200 CHAB381_1186 CHAB381_1187     TRUE 0.226 50.000 0.000 NA   NA
 3540200 3540201 CHAB381_1187 CHAB381_1188     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540201 3540202 CHAB381_1188 CHAB381_1189     FALSE 0.095 103.000 0.000 NA   NA
 3540202 3540203 CHAB381_1189 CHAB381_1190     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540203 3540204 CHAB381_1190 CHAB381_1191     FALSE 0.025 246.000 0.000 NA   NA
 3540204 3540205 CHAB381_1191 CHAB381_1192     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540205 3540206 CHAB381_1192 CHAB381_1193     TRUE 0.569 14.000 0.000 NA   NA
 3540206 3540207 CHAB381_1193 CHAB381_1194     FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 3540207 3540208 CHAB381_1194 CHAB381_1195     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540208 3540209 CHAB381_1195 CHAB381_1196     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 3540209 3540210 CHAB381_1196 CHAB381_1197     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 3540210 3540211 CHAB381_1197 CHAB381_1198     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540211 3540212 CHAB381_1198 CHAB381_1199     FALSE 0.098 102.000 0.000 NA   NA
 3540212 3540213 CHAB381_1199 CHAB381_1200     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3540213 3540214 CHAB381_1200 CHAB381_1201     FALSE 0.081 111.000 0.000 NA   NA
 3540214 3540215 CHAB381_1201 CHAB381_1202     TRUE 0.474 18.000 0.000 NA   NA
 3540215 3540216 CHAB381_1202 CHAB381_1203     FALSE 0.098 102.000 0.000 NA   NA
 3540216 3540217 CHAB381_1203 CHAB381_1204     FALSE 0.016 340.000 0.000 NA   NA
 3540217 3540218 CHAB381_1204 CHAB381_1205     FALSE 0.011 479.000 0.000 NA   NA
 3540218 3540219 CHAB381_1205 CHAB381_1206   trmU TRUE 0.288 34.000 0.000 NA   NA
 3540219 3540220 CHAB381_1206 CHAB381_1207 trmU   TRUE 0.979 -3.000 0.012 NA   NA
 3540220 3540221 CHAB381_1207 CHAB381_1208     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3540221 3540222 CHAB381_1208 CHAB381_1209   folK TRUE 0.969 3.000 0.003 1.000 N NA
 3540222 3540223 CHAB381_1209 CHAB381_1210 folK   TRUE 0.991 -3.000 0.033 1.000 N NA
 3540223 3540224 CHAB381_1210 CHAB381_1211   aroQ TRUE 0.992 -7.000 0.168 1.000 Y NA
 3540225 3540226 CHAB381_1212 CHAB381_1213   sppA TRUE 0.973 -12.000 0.035 1.000 N NA
 3540226 3540227 CHAB381_1213 CHAB381_1214 sppA   TRUE 0.229 49.000 0.000 NA   NA
 3540227 3540228 CHAB381_1214 CHAB381_1215     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540229 3540230 CHAB381_1216 CHAB381_1217 hisD   TRUE 0.761 25.000 0.020 1.000 Y NA
 3540230 3540231 CHAB381_1217 CHAB381_1218     TRUE 0.992 6.000 0.060 1.000 N NA
 3540231 3540232 CHAB381_1218 CHAB381_1219     TRUE 0.988 -10.000 0.250 1.000   NA
 3540232 3540233 CHAB381_1219 CHAB381_1220   fbaA TRUE 0.974 10.000 0.027 1.000   NA
 3540233 3540234 CHAB381_1220 CHAB381_1221 fbaA   TRUE 0.948 12.000 0.036 1.000 N NA
 3540237 3540238 CHAB381_1224 CHAB381_1225     FALSE 0.030 217.000 0.000 NA   NA
 3540238 3540239 CHAB381_1225 CHAB381_1226     TRUE 0.782 47.000 0.067 1.000   NA
 3540239 3540240 CHAB381_1226 CHAB381_1227   valS TRUE 0.327 74.000 0.003 1.000   NA
 3540240 3540241 CHAB381_1227 CHAB381_1228 valS   TRUE 0.933 3.000 0.000 1.000   NA
 3540241 3540242 CHAB381_1228 CHAB381_1229     TRUE 0.994 -7.000 0.347 0.033   NA
 3540242 3540243 CHAB381_1229 CHAB381_1230     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540243 3540244 CHAB381_1230 CHAB381_1231     TRUE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 3540244 3540245 CHAB381_1231 CHAB381_1232     FALSE 0.081 111.000 0.000 NA   NA
 3540245 3540246 CHAB381_1232 CHAB381_1233     FALSE 0.064 127.000 0.000 NA   NA
 3540246 3540247 CHAB381_1233 CHAB381_1234     TRUE 0.996 3.000 0.511 1.000 Y NA
 3540248 3540249 CHAB381_1235 CHAB381_1236     FALSE 0.117 118.000 0.000 0.006 Y NA
 3540249 3540250 CHAB381_1236 CHAB381_1237     TRUE 0.996 3.000 0.103 0.002 Y NA
 3540250 3540251 CHAB381_1237 CHAB381_1238   petA TRUE 0.991 10.000 0.093 0.002 Y NA
 3540252 3540253 CHAB381_1239 CHAB381_1240     FALSE 0.187 58.000 0.000 NA   NA
 3540253 3540254 CHAB381_1240 CHAB381_1241     FALSE 0.071 118.000 0.000 NA   NA
 3540254 3540255 CHAB381_1241 CHAB381_1242     FALSE 0.009 610.000 0.000 NA   NA
 3540256 3540257 CHAB381_1243 CHAB381_1244 asd gyrA TRUE 0.911 -13.000 0.005 1.000 N NA
 3540259 3540260 CHAB381_1246 CHAB381_1247 glyS   TRUE 0.569 14.000 0.000 NA   NA
 3540260 3540261 CHAB381_1247 CHAB381_1248     TRUE 0.975 -3.000 0.009 NA   NA
 3540261 3540262 CHAB381_1248 CHAB381_1249   purU TRUE 0.989 0.000 0.025 1.000 N NA
 3540263 3540264 CHAB381_1250 CHAB381_1251   gmk TRUE 0.928 10.000 0.002 NA   NA
 3540264 3540265 CHAB381_1251 CHAB381_1252 gmk   TRUE 0.949 10.000 0.009 1.000 N NA
 3540265 3540266 CHAB381_1252 CHAB381_1253     TRUE 0.470 27.000 0.000 0.007 Y NA
 3540266 3540267 CHAB381_1253 CHAB381_1254   argS TRUE 0.978 4.000 0.011 1.000 N NA
 3540267 3540268 CHAB381_1254 CHAB381_1255 argS   TRUE 0.956 0.000 0.000 0.078 N NA
 3540268 3540269 CHAB381_1255 CHAB381_1256     TRUE 0.257 50.000 0.000 1.000 N NA
 3540269 3540270 CHAB381_1256 CHAB381_1257     FALSE 0.013 399.000 0.000 NA   NA
 3540270 3540271 CHAB381_1257 CHAB381_1258     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3540272 3540273 CHAB381_1259 CHAB381_1260     FALSE 0.031 216.000 0.000 NA   NA
 3540273 3540274 CHAB381_1260 CHAB381_1261     FALSE 0.090 106.000 0.000 NA   NA
 3540274 3540275 CHAB381_1261 CHAB381_1262     TRUE 0.962 -40.000 0.325 NA   NA
 3540275 3540276 CHAB381_1262 CHAB381_1263     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540276 3540277 CHAB381_1263 CHAB381_1264   leuB TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540277 3540278 CHAB381_1264 CHAB381_1265 leuB   TRUE 0.990 10.000 0.089 0.002 Y NA
 3540278 3540279 CHAB381_1265 CHAB381_1266     TRUE 0.580 55.000 0.019 1.000 Y NA
 3540280 3540281 CHAB381_1267 CHAB381_1268   hemE TRUE 0.235 47.000 0.000 NA   NA
 3540281 3540282 CHAB381_1268 CHAB381_1270 hemE   TRUE 0.984 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3540283 3540284 CHAB381_1269 CHAB381_1271     TRUE 0.995 5.000 0.391 NA   NA
 3540284 3540285 CHAB381_1271 CHAB381_1272     TRUE 0.986 -9.000 0.094 NA   NA
 3540286 3540287 CHAB381_1273 CHAB381_1274 trpF trpB TRUE 0.876 51.000 0.375 0.002 Y NA
 3540287 3540288 CHAB381_1274 CHAB381_1275 trpB trpA TRUE 0.994 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 3540288 3540289 CHAB381_1275 CHAB381_1276 trpA   TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3540290 3540291 CHAB381_1277 CHAB381_1278     TRUE 0.987 0.000 0.020 1.000 N NA
 3540291 3540292 CHAB381_1278 CHAB381_1279     TRUE 0.968 -16.000 0.050 1.000   NA
 3540292 3540293 CHAB381_1279 CHAB381_1280   tyrS TRUE 0.982 10.000 0.043 1.000   NA
 3540293 3540294 CHAB381_1280 CHAB381_1281 tyrS   TRUE 0.971 11.000 0.045 1.000 N NA
 3540294 3540295 CHAB381_1281 CHAB381_1282   rpoZ TRUE 0.948 -28.000 0.039 1.000 Y NA
 3540295 3540296 CHAB381_1282 CHAB381_1283 rpoZ pyrH TRUE 0.925 13.000 0.033 1.000 N NA
 3540296 3540297 CHAB381_1283 CHAB381_1284 pyrH   TRUE 0.252 51.000 0.000 1.000 N NA
 3540297 3540298 CHAB381_1284 CHAB381_1285     TRUE 0.946 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3540298 3540299 CHAB381_1285 CHAB381_1286     TRUE 0.996 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 3540299 3540300 CHAB381_1286 CHAB381_1287     TRUE 0.976 -12.000 0.044 1.000   NA
 3540300 3540301 CHAB381_1287 CHAB381_1288     TRUE 0.993 0.000 0.060 NA   NA
 3540301 3540302 CHAB381_1288 CHAB381_1289     TRUE 0.922 -34.000 0.031 NA   NA
 3540304 3540305 CHAB381_1291 CHAB381_1292   serC FALSE 0.144 91.000 0.000 1.000 N NA
 3540305 3540306 CHAB381_1292 CHAB381_1293 serC xseA TRUE 0.952 10.000 0.010 1.000 N NA
 3540306 3540307 CHAB381_1293 CHAB381_1294 xseA   TRUE 0.461 71.000 0.016 1.000 N NA
 3540307 3540308 CHAB381_1294 CHAB381_1295     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540308 3540309 CHAB381_1295 CHAB381_1296     TRUE 0.232 48.000 0.000 NA   NA
 3540309 3540310 CHAB381_1296 CHAB381_1297   dxs TRUE 0.477 68.000 0.017 1.000 N NA
 3540310 3540311 CHAB381_1297 CHAB381_1298 dxs hisC TRUE 0.970 5.000 0.006 1.000 N NA
 3540311 3540312 CHAB381_1298 CHAB381_1299 hisC pheA TRUE 0.990 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 3540312 3540313 CHAB381_1299 CHAB381_1300 pheA   TRUE 0.942 -16.000 0.021 1.000 N NA
 3540313 3540314 CHAB381_1300 CHAB381_1301   lysA TRUE 0.983 -3.000 0.015 1.000 N NA
 3540314 3540315 CHAB381_1301 CHAB381_1302 lysA   FALSE 0.213 157.000 0.021 1.000   NA
 3540315 3540316 CHAB381_1302 CHAB381_1303   pth TRUE 0.990 -3.000 0.031 1.000   NA
 3540316 3540317 CHAB381_1303 CHAB381_1304 pth   TRUE 0.995 9.000 0.496 0.030 Y NA
 3540317 3540318 CHAB381_1304 CHAB381_1305     TRUE 0.456 66.000 0.014 1.000 N NA
 3540318 3540319 CHAB381_1305 CHAB381_1306   tal TRUE 0.995 3.000 0.273 1.000 N NA
 3540319 3540320 CHAB381_1306 CHAB381_1307 tal serB TRUE 0.982 -7.000 0.029 1.000 N NA
 3540320 3540321 CHAB381_1307 CHAB381_1308 serB   TRUE 0.474 18.000 0.000 NA   NA
 3540321 3540322 CHAB381_1308 CHAB381_1309   argC TRUE 0.962 -10.000 0.021 NA   NA
 3540322 3540323 CHAB381_1309 CHAB381_1310 argC   TRUE 0.924 11.000 0.011 1.000 N NA
 3540323 3540324 CHAB381_1310 CHAB381_1311   lpxB TRUE 0.501 102.000 0.042 1.000 N NA
 3540325 3540326 CHAB381_1312 CHAB381_1313   surE TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540326 3540327 CHAB381_1313 CHAB381_1314 surE   TRUE 0.971 -15.000 0.051 1.000   NA
 3540333 3540334 CHAB381_1320 CHAB381_1321     TRUE 0.975 -3.000 0.006 1.000   NA
 3540334 3540335 CHAB381_1321 CHAB381_1322     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3540335 3540336 CHAB381_1322 CHAB381_1323   trpC TRUE 0.992 -3.000 0.044 1.000   NA
 3540336 3540337 CHAB381_1323 CHAB381_1324 trpC   TRUE 0.988 2.000 0.026 1.000 N NA
 3540337 3540338 CHAB381_1324 CHAB381_1325     TRUE 0.564 16.000 0.000 1.000 N NA
 3540339 3540340 CHAB381_1326 CHAB381_1327   ftsY FALSE 0.070 119.000 0.000 NA   NA
 3540340 3540341 CHAB381_1327 CHAB381_1328 ftsY   TRUE 0.973 0.000 0.003 1.000   NA
 3540342 3540343 CHAB381_1329 CHAB381_1330     TRUE 0.952 -34.000 0.059 1.000   NA
 3540343 3540344 CHAB381_1330 CHAB381_1331     TRUE 0.956 9.000 0.006 NA   NA
 3540344 3540345 CHAB381_1331 CHAB381_1332     TRUE 0.995 0.000 0.156 NA   NA
 3540346 3540347 CHAB381_1333 CHAB381_1334     FALSE 0.159 76.000 0.000 NA   NA
 3540347 3540348 CHAB381_1334 CHAB381_1335     FALSE 0.033 207.000 0.000 NA   NA
 3540348 3540349 CHAB381_1335 CHAB381_1336     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540350 3540351 CHAB381_1337 CHAB381_1338     FALSE 0.157 77.000 0.000 NA   NA
 3540353 3540354 CHAB381_1340 CHAB381_1341 rplU rpmA TRUE 0.983 12.000 0.667 0.019 Y NA
 3540354 3540355 CHAB381_1341 CHAB381_1342 rpmA   FALSE 0.042 177.000 0.000 NA   NA
 3540355 3540356 CHAB381_1342 CHAB381_1343     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540356 3540357 CHAB381_1343 CHAB381_1344   rho FALSE 0.118 94.000 0.000 NA   NA
 3540362 3540363 CHAB381_1349 CHAB381_1350   carB TRUE 0.698 25.000 0.016 NA N NA
 3540363 3540364 CHAB381_1350 CHAB381_1351 carB   TRUE 0.985 0.000 0.016 1.000 N NA
 3540364 3540365 CHAB381_1351 CHAB381_1352   mreB TRUE 0.994 -7.000 0.689 1.000 N NA
 3540365 3540366 CHAB381_1352 CHAB381_1353 mreB clpX TRUE 0.990 -6.000 0.034 0.077 N NA
 3540366 3540367 CHAB381_1353 CHAB381_1354 clpX lpxA TRUE 0.990 0.000 0.027 1.000 N NA
 3540367 3540368 CHAB381_1354 CHAB381_1355 lpxA fabZ TRUE 0.996 0.000 0.264 1.000 N NA
 3540368 3540369 CHAB381_1355 CHAB381_1356 fabZ   TRUE 0.748 34.000 0.035 NA   NA
 3540370 3540371 CHAB381_1357 CHAB381_1358   dapB TRUE 0.345 30.000 0.000 1.000   NA
 3540371 3540372 CHAB381_1358 CHAB381_1359 dapB purF TRUE 0.917 -30.000 0.022 1.000 N NA
 3540372 3540373 CHAB381_1359 CHAB381_1360 purF   FALSE 0.009 651.000 0.000 NA   NA
 3540374 3540375 CHAB381_1361 CHAB381_1362     FALSE 0.018 313.000 0.000 NA   NA
 3540375 3540376 CHAB381_1362 CHAB381_1363     TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.005 Y NA
 3540376 3540377 CHAB381_1363 CHAB381_1364     TRUE 0.973 -3.000 0.007 NA   NA
 3540377 3540378 CHAB381_1364 CHAB381_1365   carA TRUE 0.977 -3.000 0.011 NA   NA
 3540378 3540379 CHAB381_1365 CHAB381_1366 carA   TRUE 0.992 0.000 0.041 NA   NA
 3540379 3540380 CHAB381_1366 CHAB381_1367     TRUE 0.273 36.000 0.000 NA   NA
 3540380 3540381 CHAB381_1367 CHAB381_1368     TRUE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 3540382 3540383 CHAB381_1369 CHAB381_1370   purA TRUE 0.995 -3.000 0.161 1.000 N NA
 3540383 3540384 CHAB381_1370 CHAB381_1371 purA   FALSE 0.013 409.000 0.000 NA   NA
 3540385 3540386 CHAB381_1372 CHAB381_1373   ilvA TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540386 3540387 CHAB381_1373 CHAB381_1374 ilvA trmA TRUE 0.975 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3540387 3540388 CHAB381_1374 CHAB381_1375 trmA   TRUE 0.993 -3.000 0.056 1.000 N NA
 3540388 3540389 CHAB381_1375 CHAB381_1376     TRUE 0.992 1.000 0.047 1.000   NA
 3540391 3540392 CHAB381_1378 CHAB381_1379     TRUE 0.963 -22.000 0.080 NA   NA
 3540392 3540393 CHAB381_1379 CHAB381_1380   gltX TRUE 0.994 -3.000 0.088 1.000   NA
 3540394 3540395 CHAB381_1381 CHAB381_1382 mscL   TRUE 0.973 -3.000 0.007 NA N NA
 3540395 3540396 CHAB381_1382 CHAB381_1383     TRUE 0.927 2.000 0.000 NA   NA
 3540396 3540397 CHAB381_1383 CHAB381_1384   psd TRUE 0.994 -3.000 0.089 1.000   NA
 3540397 3540398 CHAB381_1384 CHAB381_1385 psd   TRUE 0.229 56.000 0.000 1.000 N NA
 3540398 3540399 CHAB381_1385 CHAB381_1386   priA TRUE 0.977 7.000 0.016 1.000 N NA
 3540399 3540400 CHAB381_1386 CHAB381_1387 priA   FALSE 0.009 617.000 0.000 NA   NA
 3540400 3540401 CHAB381_1387 CHAB381_1389     TRUE 0.351 26.000 0.000 NA   NA
 3540404 3540405 CHAB381_1391 CHAB381_1392     TRUE 0.996 -3.000 0.117 0.033 Y NA
 3540405 3540406 CHAB381_1392 CHAB381_1393     TRUE 0.994 0.000 0.091 NA   NA
 3540406 3540407 CHAB381_1393 CHAB381_1394     TRUE 0.994 -3.000 0.102 NA   NA
 3540407 3540408 CHAB381_1394 CHAB381_1395     TRUE 0.634 108.000 0.526 NA   NA
 3540408 3540409 CHAB381_1395 CHAB381_1396     TRUE 0.975 12.000 0.579 NA   NA
 3540409 3540410 CHAB381_1396 CHAB381_1397     TRUE 0.996 4.000 0.286 0.002 N NA
 3540410 3540411 CHAB381_1397 CHAB381_1398   ccoO TRUE 0.969 15.000 0.738 0.002 N NA
 3540411 3540412 CHAB381_1398 CHAB381_1399 ccoO ccoN TRUE 0.980 12.000 0.283 0.002 N NA
 3540412 3540413 CHAB381_1399 CHAB381_1400 ccoN   FALSE 0.017 346.000 0.000 1.000   NA
 3540413 3540414 CHAB381_1400 CHAB381_1401     TRUE 0.714 -40.000 0.000 0.002   NA
 3540416 3540417 CHAB381_1403 CHAB381_1404     FALSE 0.157 77.000 0.000 NA   NA
 3540417 3540418 CHAB381_1404 CHAB381_1405     FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 3540418 3540419 CHAB381_1405 CHAB381_1406     FALSE 0.015 376.000 0.000 NA   NA
 3540419 3540420 CHAB381_1406 CHAB381_1407     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540420 3540421 CHAB381_1407 CHAB381_1408     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3540421 3540422 CHAB381_1408 CHAB381_1409     FALSE 0.025 246.000 0.000 NA   NA
 3540422 3540423 CHAB381_1409 CHAB381_1410     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540423 3540424 CHAB381_1410 CHAB381_1411     FALSE 0.038 191.000 0.000 NA   NA
 3540424 3540425 CHAB381_1411 CHAB381_1412     FALSE 0.057 139.000 0.000 NA   NA
 3540425 3540426 CHAB381_1412 CHAB381_1413     FALSE 0.200 56.000 0.000 NA   NA
 3540426 3540427 CHAB381_1413 CHAB381_1414     FALSE 0.020 290.000 0.000 NA   NA
 3540427 3540428 CHAB381_1414 CHAB381_1415     TRUE 0.906 7.000 0.000 NA   NA
 3540428 3540429 CHAB381_1415 CHAB381_1416     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3540429 3540430 CHAB381_1416 CHAB381_1417     TRUE 0.906 7.000 0.000 NA   NA
 3540430 3540431 CHAB381_1417 CHAB381_1418     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3540431 3540432 CHAB381_1418 CHAB381_1419     FALSE 0.009 625.000 0.000 NA   NA
 3540432 3540433 CHAB381_1419 CHAB381_1420     FALSE 0.027 238.000 0.000 NA   NA
 3540433 3540434 CHAB381_1420 CHAB381_1421   acnB FALSE 0.207 55.000 0.000 NA   NA
 3540435 3540436 CHAB381_1422 CHAB381_1423     FALSE 0.051 153.000 0.000 NA   NA
 3540437 3540438 CHAB381_1424 CHAB381_1425     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3540439 3540440 CHAB381_1426 CHAB381_1427     TRUE 0.947 10.000 0.010 NA   NA
 3540440 3540441 CHAB381_1427 CHAB381_1428   acpS TRUE 0.941 1.000 0.000 1.000 N NA
 3540441 3540442 CHAB381_1428 CHAB381_1429 acpS   FALSE 0.072 127.000 0.000 1.000   NA
 3540442 3540443 CHAB381_1429 CHAB381_1430     FALSE 0.186 86.000 0.000 0.039   NA
 3540443 3540444 CHAB381_1430 CHAB381_1431     FALSE 0.081 111.000 0.000 NA   NA
 3540444 3540445 CHAB381_1431 CHAB381_1432     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 3540445 3540446 CHAB381_1432 CHAB381_1433     TRUE 0.283 297.000 1.000 NA   NA
 3540446 3540447 CHAB381_1433 CHAB381_1434     FALSE 0.105 100.000 0.000 NA   NA
 3540447 3540448 CHAB381_1434 CHAB381_1435     TRUE 0.256 39.000 0.000 NA   NA
 3540448 3540449 CHAB381_1435 CHAB381_1436     FALSE 0.166 68.000 0.000 NA   NA
 3540449 3540450 CHAB381_1436 CHAB381_1437     TRUE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 3540450 3540451 CHAB381_1437 CHAB381_1438     FALSE 0.144 84.000 0.000 NA   NA
 3540451 3540452 CHAB381_1438 CHAB381_1439     FALSE 0.105 100.000 0.000 NA   NA
 3540452 3540453 CHAB381_1439 CHAB381_1440     TRUE 0.288 34.000 0.000 NA   NA
 3540453 3540454 CHAB381_1440 CHAB381_1441     FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 3540455 3540456 CHAB381_1442 CHAB381_1443     FALSE 0.007 1000.000 0.000 NA   NA
 3540456 3540457 CHAB381_1443 CHAB381_1444     TRUE 0.746 -16.000 0.000 NA   NA
 3540457 3540458 CHAB381_1444 CHAB381_1445     FALSE 0.027 261.000 0.000 1.000   NA
 3540458 3540459 CHAB381_1445 CHAB381_1446     TRUE 0.995 -7.000 0.429 0.006 N NA
 3540459 3540460 CHAB381_1446 CHAB381_1447   hisIE FALSE 0.010 751.000 0.000 1.000 N NA
 3540460 3540461 CHAB381_1447 CHAB381_1448 hisIE   TRUE 0.721 30.000 0.022 1.000 N NA
 3540461 3540462 CHAB381_1448 CHAB381_1449   ilvE TRUE 0.992 9.000 0.098 1.000 N NA
 3540462 3540463 CHAB381_1449 CHAB381_1450 ilvE   FALSE 0.122 100.000 0.000 1.000 N NA
 3540463 3540464 CHAB381_1450 CHAB381_1451     FALSE 0.009 633.000 0.000 NA   NA
 3540464 3540465 CHAB381_1451 CHAB381_1452     FALSE 0.016 341.000 0.000 NA   NA
 3540465 3540466 CHAB381_1452 CHAB381_1453     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3540466 3540467 CHAB381_1453 CHAB381_1454     FALSE 0.008 729.000 0.000 NA   NA
 3540467 3540468 CHAB381_1454 CHAB381_1455     FALSE 0.017 318.000 0.000 NA   NA
 3540469 3540470 CHAB381_1456 CHAB381_1457     FALSE 0.021 282.000 0.000 NA   NA
 3540470 3540471 CHAB381_1457 CHAB381_1458     FALSE 0.113 96.000 0.000 NA   NA
 3540471 3540472 CHAB381_1458 CHAB381_1459     FALSE 0.012 461.000 0.000 NA   NA
 3540474 3540475 CHAB381_1461 CHAB381_1462     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 3540475 3540476 CHAB381_1462 CHAB381_1463     TRUE 0.746 -16.000 0.000 NA   NA
 3540476 3540477 CHAB381_1463 CHAB381_1464     TRUE 0.569 14.000 0.000 NA   NA
 3540477 3540478 CHAB381_1464 CHAB381_1466     FALSE 0.157 77.000 0.000 NA   NA
 3540482 3540483 CHAB381_1469 CHAB381_1470     TRUE 0.246 43.000 0.000 NA   NA
 3540483 3540484 CHAB381_1470 CHAB381_1471     FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 3540484 3540485 CHAB381_1471 CHAB381_1472     TRUE 0.995 -3.000 0.148 NA   NA
 3540486 3540487 CHAB381_1473 CHAB381_1474     FALSE 0.070 165.000 0.000 0.010   NA
 3540487 3540488 CHAB381_1474 CHAB381_1475     TRUE 0.299 56.000 0.000 0.010 Y NA
 3540488 3540489 CHAB381_1475 CHAB381_1476     TRUE 0.368 27.000 0.000 1.000   NA
 3540489 3540490 CHAB381_1476 CHAB381_1477     TRUE 0.815 -12.000 0.000 NA   NA
 3540490 3540491 CHAB381_1477 CHAB381_1478     FALSE 0.058 137.000 0.000 NA   NA
 3540491 3540492 CHAB381_1478 CHAB381_1479     TRUE 0.941 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3540492 3540493 CHAB381_1479 CHAB381_1480     TRUE 0.900 -7.000 0.000 NA Y NA
 3540493 3540494 CHAB381_1480 CHAB381_1481     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540494 3540495 CHAB381_1481 CHAB381_1482     FALSE 0.026 269.000 0.000 1.000   NA
 3540495 3540496 CHAB381_1482 CHAB381_1483   hemD TRUE 0.298 36.000 0.000 1.000   NA
 3540496 3540497 CHAB381_1483 CHAB381_1484 hemD argH TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3540497 3540498 CHAB381_1484 CHAB381_1485 argH   TRUE 0.661 -28.000 0.000 NA   NA
 3540498 3540499 CHAB381_1485 CHAB381_1486   pckA TRUE 0.837 -25.000 0.005 NA   NA
 3540500 3540501 CHAB381_1487 CHAB381_1488     TRUE 0.390 86.000 0.015 1.000   NA
 3540501 3540502 CHAB381_1488 CHAB381_1489     TRUE 0.986 -6.000 0.033 NA   NA
 3540502 3540503 CHAB381_1489 CHAB381_1490   rpmF TRUE 0.915 13.000 0.032 NA   NA
 3540503 3540504 CHAB381_1490 CHAB381_1491 rpmF plsX TRUE 0.996 2.000 0.418 1.000 N NA
 3540504 3540505 CHAB381_1491 CHAB381_1492 plsX   TRUE 0.994 6.000 0.058 0.005 Y NA
 3540505 3540506 CHAB381_1492 CHAB381_1493     FALSE 0.010 768.000 0.000 1.000 N NA
 3540506 3540507 CHAB381_1493 CHAB381_1494     TRUE 0.985 11.000 0.625 1.000   NA
 3540507 3540508 CHAB381_1494 CHAB381_1495     TRUE 0.996 -3.000 0.740 NA   NA
 3540508 3540509 CHAB381_1495 CHAB381_1496     FALSE 0.122 92.000 0.000 NA   NA
 3540509 3540510 CHAB381_1496 CHAB381_1497     TRUE 0.792 11.000 0.000 1.000   NA
 3540510 3540511 CHAB381_1497 CHAB381_1498   thiD TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3540511 3540512 CHAB381_1498 CHAB381_1499 thiD   FALSE 0.011 533.000 0.000 1.000   NA
 3540513 3540514 CHAB381_1500 CHAB381_1501 purE   TRUE 0.985 -3.000 0.018 1.000 N NA
 3540516 3540517 CHAB381_1503 CHAB381_1504 folB   TRUE 0.992 0.000 0.040 1.000   NA
 3540517 3540518 CHAB381_1504 CHAB381_1505     TRUE 0.582 38.000 0.016 NA   NA
 3540518 3540519 CHAB381_1505 CHAB381_1506     FALSE 0.192 57.000 0.000 NA   NA
 3540519 3540520 CHAB381_1506 CHAB381_1507     TRUE 0.622 -37.000 0.000 NA   NA
 3540520 3540521 CHAB381_1507 CHAB381_1508     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540521 3540522 CHAB381_1508 CHAB381_1509     FALSE 0.010 546.000 0.000 NA   NA
 3540522 3540523 CHAB381_1509 CHAB381_1510     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 3540523 3540524 CHAB381_1510 CHAB381_1806   rrsC FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 3540525 3540526 CHAB381_1511 CHAB381_1512     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3540526 3540527 CHAB381_1512 CHAB381_1513     FALSE 0.011 481.000 0.000 NA   NA
 3540527 3540528 CHAB381_1513 CHAB381_1514     TRUE 0.687 14.000 0.000 0.030 Y NA
 3540529 3540530 CHAB381_1515 CHAB381_1516     FALSE 0.012 474.000 0.000 NA   NA
 3540530 3540531 CHAB381_1516 CHAB381_1517     FALSE 0.095 103.000 0.000 NA   NA
 3540531 3540532 CHAB381_1517 CHAB381_1518     TRUE 0.661 -28.000 0.000 NA   NA
 3540532 3540533 CHAB381_1518 CHAB381_1519     TRUE 0.927 2.000 0.000 NA   NA
 3540533 3540534 CHAB381_1519 CHAB381_1520     FALSE 0.192 57.000 0.000 NA   NA
 3540534 3540535 CHAB381_1520 CHAB381_1521     TRUE 0.789 -13.000 0.000 NA   NA
 3540535 3540536 CHAB381_1521 CHAB381_1522     TRUE 0.297 33.000 0.000 NA   NA
 3540536 3540537 CHAB381_1522 CHAB381_1523     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3540537 3540538 CHAB381_1523 CHAB381_1524     TRUE 0.297 33.000 0.000 NA   NA
 3540538 3540539 CHAB381_1524 CHAB381_1525     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3540539 3540540 CHAB381_1525 CHAB381_1526     TRUE 0.297 33.000 0.000 NA   NA
 3540540 3540541 CHAB381_1526 CHAB381_1527     FALSE 0.127 90.000 0.000 NA   NA
 3540541 3540542 CHAB381_1527 CHAB381_1528     FALSE 0.011 499.000 0.000 NA   NA
 3540542 3540543 CHAB381_1528 CHAB381_1529     FALSE 0.008 773.000 0.000 NA   NA
 3540543 3540544 CHAB381_1529 CHAB381_1530     TRUE 0.927 2.000 0.000 NA   NA
 3540544 3540545 CHAB381_1530 CHAB381_1531     FALSE 0.025 251.000 0.000 NA   NA
 3540545 3540546 CHAB381_1531 CHAB381_1532     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 3540546 3540547 CHAB381_1532 CHAB381_1533     TRUE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 3540547 3540548 CHAB381_1533 CHAB381_1534     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540548 3540549 CHAB381_1534 CHAB381_1535     FALSE 0.048 164.000 0.000 NA   NA
 3540549 3540550 CHAB381_1535 CHAB381_1536     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3540550 3540551 CHAB381_1536 CHAB381_1537     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540552 3540553 CHAB381_1538 CHAB381_1539     FALSE 0.045 168.000 0.000 NA   NA
 3540555 3540556 CHAB381_1541 CHAB381_1542     TRUE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 3540556 3540557 CHAB381_1542 CHAB381_1543     TRUE 0.235 47.000 0.000 NA   NA
 3540557 3540558 CHAB381_1543 CHAB381_1545     FALSE 0.029 224.000 0.000 NA   NA
 3540559 3540560 CHAB381_1544 CHAB381_1546     FALSE 0.216 52.000 0.000 NA   NA
 3540560 3540561 CHAB381_1546 CHAB381_1547     FALSE 0.008 787.000 0.000 NA   NA
 3540561 3540562 CHAB381_1547 CHAB381_1548   gltA TRUE 0.987 -3.000 0.022 1.000 N NA
 3540562 3540563 CHAB381_1548 CHAB381_1549 gltA   TRUE 0.506 66.000 0.019 1.000 N NA
 3540563 3540564 CHAB381_1549 CHAB381_1550     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3540564 3540565 CHAB381_1550 CHAB381_1551   topA TRUE 0.961 -7.000 0.009 1.000   NA
 3540565 3540566 CHAB381_1551 CHAB381_1552 topA dcd TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3540567 3540568 CHAB381_1553 CHAB381_1554 accB accC TRUE 0.996 0.000 0.071 0.003 Y NA
 3540568 3540569 CHAB381_1554 CHAB381_1555 accC   FALSE 0.027 272.000 0.000 1.000 N NA
 3540569 3540570 CHAB381_1555 CHAB381_1556     TRUE 0.795 56.000 0.195 1.000   NA
 3540573 3540574 CHAB381_1559 CHAB381_1560     FALSE 0.016 331.000 0.000 NA   NA
 3540575 3540576 CHAB381_1561 CHAB381_1562     FALSE 0.056 148.000 0.000 NA N NA
 3540576 3540577 CHAB381_1562 CHAB381_1563     FALSE 0.150 81.000 0.000 NA   NA
 3540578 3540579 CHAB381_1564 CHAB381_1565     FALSE 0.187 58.000 0.000 NA   NA
 3540580 3540581 CHAB381_1566 CHAB381_1567     TRUE 0.712 -19.000 0.000 NA   NA
 3540581 3540582 CHAB381_1567 CHAB381_1568     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540582 3540583 CHAB381_1568 CHAB381_1569     FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 3540583 3540584 CHAB381_1569 CHAB381_1570     FALSE 0.180 61.000 0.000 NA   NA
 3540584 3540585 CHAB381_1570 CHAB381_1571     TRUE 0.539 15.000 0.000 NA   NA
 3540585 3540586 CHAB381_1571 CHAB381_1572     TRUE 0.925 4.000 0.000 NA   NA
 3540586 3540587 CHAB381_1572 CHAB381_1573     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3540587 3540588 CHAB381_1573 CHAB381_1574     TRUE 0.245 44.000 0.000 NA   NA
 3540588 3540589 CHAB381_1574 CHAB381_1575     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540589 3540590 CHAB381_1575 CHAB381_1576     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3540590 3540591 CHAB381_1576 CHAB381_1577     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540591 3540592 CHAB381_1577 CHAB381_1578     TRUE 0.252 41.000 0.000 NA   NA
 3540594 3540595 CHAB381_1580 CHAB381_1581     FALSE 0.012 466.000 0.000 NA   NA
 3540595 3540596 CHAB381_1581 CHAB381_1582     TRUE 0.985 11.000 0.750 NA   NA
 3540596 3540597 CHAB381_1582 CHAB381_1583     TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3540597 3540598 CHAB381_1583 CHAB381_1584     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540599 3540600 CHAB381_1585 CHAB381_1586     TRUE 0.279 35.000 0.000 NA   NA
 3540600 3540601 CHAB381_1586 CHAB381_1587     FALSE 0.009 637.000 0.000 NA   NA
 3540601 3540602 CHAB381_1587 CHAB381_1588     TRUE 0.239 46.000 0.000 NA   NA
 3540602 3540603 CHAB381_1588 CHAB381_1589     FALSE 0.169 66.000 0.000 NA   NA
 3540603 3540604 CHAB381_1589 CHAB381_1590     TRUE 0.539 15.000 0.000 NA   NA
 3540605 3540606 CHAB381_1591 CHAB381_1592     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540608 3540609 CHAB381_1594 CHAB381_1595 mraY murD TRUE 0.997 4.000 0.647 0.005 Y NA
 3540611 3540612 CHAB381_1597 CHAB381_1598 rplM rpsI TRUE 0.996 3.000 0.231 0.018 Y NA
 3540612 3540613 CHAB381_1598 CHAB381_1599 rpsI   TRUE 0.440 96.000 0.024 1.000 N NA
 3540613 3540614 CHAB381_1599 CHAB381_1600     TRUE 0.704 67.000 0.068 1.000   NA
 3540614 3540615 CHAB381_1600 CHAB381_1601   nifJ TRUE 0.676 75.000 0.056 1.000   NA
 3540615 3540616 CHAB381_1601 CHAB381_1602 nifJ   FALSE 0.017 537.000 0.000 0.010 Y NA
 3540619 3540620 CHAB381_1605 CHAB381_1606     FALSE 0.100 101.000 0.000 NA   NA
 3540620 3540621 CHAB381_1606 CHAB381_1607     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3540621 3540622 CHAB381_1607 CHAB381_1608     TRUE 0.640 -34.000 0.000 NA   NA
 3540622 3540623 CHAB381_1608 CHAB381_1609     TRUE 0.239 46.000 0.000 NA   NA
 3540623 3540624 CHAB381_1609 CHAB381_1610   dnaG TRUE 0.991 -3.000 0.035 1.000 N NA
 3540625 3540626 CHAB381_1611 CHAB381_1612   rnhA TRUE 0.856 -22.000 0.005 1.000   NA
 3540626 3540627 CHAB381_1612 CHAB381_1613 rnhA rnc TRUE 0.989 4.000 0.032 1.000 N NA
 3540627 3540628 CHAB381_1613 CHAB381_1614 rnc   TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540628 3540629 CHAB381_1614 CHAB381_1615   glcD TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3540629 3540630 CHAB381_1615 CHAB381_1616 glcD   FALSE 0.025 294.000 0.000 1.000 Y NA
 3540630 3540631 CHAB381_1616 CHAB381_1617     TRUE 0.929 5.000 0.000 1.000   NA
 3540632 3540633 CHAB381_1618 CHAB381_1619 prfA rpsT TRUE 0.990 1.000 0.029 1.000 Y NA
 3540633 3540634 CHAB381_1619 CHAB381_1620 rpsT   FALSE 0.079 121.000 0.000 1.000 N NA
 3540634 3540635 CHAB381_1620 CHAB381_1621     TRUE 0.723 51.000 0.042 1.000 N NA
 3540635 3540636 CHAB381_1621 CHAB381_1622     TRUE 0.996 2.000 0.827 NA Y NA
 3540637 3540638 CHAB381_1623 CHAB381_1624     FALSE 0.205 82.000 0.000 0.029   NA
 3540639 3540640 CHAB381_1625 CHAB381_1626   mgtE TRUE 0.965 -15.000 0.036 1.000   NA
 3540640 3540641 CHAB381_1626 CHAB381_1627 mgtE   TRUE 0.969 11.000 0.042 1.000 N NA
 3540642 3540643 CHAB381_1628 CHAB381_1629   xth TRUE 0.925 3.000 0.000 NA   NA
 3540643 3540644 CHAB381_1629 CHAB381_1630 xth   FALSE 0.128 98.000 0.000 1.000 N NA
 3540644 3540645 CHAB381_1630 CHAB381_1631     TRUE 0.489 19.000 0.000 1.000   NA
 3540646 3540647 CHAB381_1632 CHAB381_1633     TRUE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 3540648 3540649 CHAB381_1634 CHAB381_1635   pyk TRUE 0.548 105.000 0.073 1.000   NA
 3540650 3540651 CHAB381_1636 CHAB381_1637   hisG FALSE 0.036 201.000 0.000 NA   NA
 3540651 3540652 CHAB381_1637 CHAB381_1638 hisG   TRUE 0.989 0.000 0.023 1.000 N NA
 3540652 3540653 CHAB381_1638 CHAB381_1639     TRUE 0.946 -13.000 0.021 NA   NA
 3540653 3540654 CHAB381_1639 CHAB381_1640     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3540654 3540655 CHAB381_1640 CHAB381_1641     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540656 3540657 CHAB381_1642 CHAB381_1643 gatC pilT TRUE 0.883 12.000 0.010 1.000 N NA
 3540657 3540658 CHAB381_1643 CHAB381_1644 pilT cvpA TRUE 0.980 0.000 0.010 1.000   NA
 3540658 3540659 CHAB381_1644 CHAB381_1645 cvpA   TRUE 0.972 10.000 0.023 1.000   NA
 3540659 3540660 CHAB381_1645 CHAB381_1646   lysS TRUE 0.988 0.000 0.022 1.000 N NA
 3540660 3540661 CHAB381_1646 CHAB381_1647 lysS glyA TRUE 0.992 3.000 0.044 1.000 N NA
 3540661 3540662 CHAB381_1647 CHAB381_1648 glyA   FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 3540662 3540663 CHAB381_1648 CHAB381_1649   aroE TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 3540663 3540664 CHAB381_1649 CHAB381_1650 aroE   FALSE 0.007 879.000 0.000 NA   NA
 3540664 3540665 CHAB381_1650 CHAB381_1651     TRUE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3540665 3540666 CHAB381_1651 CHAB381_1652     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 3540666 3540667 CHAB381_1652 CHAB381_1653     TRUE 0.381 24.000 0.000 NA   NA
 3540669 3540670 CHAB381_1655 CHAB381_1656     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540670 3540671 CHAB381_1656 CHAB381_1657   ansB FALSE 0.015 404.000 0.000 1.000   NA
 3540672 3540673 CHAB381_1658 CHAB381_1659 fusA rpsG TRUE 0.992 10.000 0.579 1.000 Y NA
 3540673 3540674 CHAB381_1659 CHAB381_1660 rpsG rpsL TRUE 0.841 72.000 0.620 0.004 Y NA
 3540674 3540675 CHAB381_1660 CHAB381_1661 rpsL   TRUE 0.246 90.000 0.003 NA   NA
 3540675 3540676 CHAB381_1661 CHAB381_1662   rpoC TRUE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 3540676 3540677 CHAB381_1662 CHAB381_1663 rpoC rpoB TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3540677 3540678 CHAB381_1663 CHAB381_1664 rpoB rplL TRUE 0.279 35.000 0.000 NA   NA
 3540678 3540679 CHAB381_1664 CHAB381_1665 rplL   TRUE 0.974 14.000 0.884 0.017 Y NA
 3540679 3540680 CHAB381_1665 CHAB381_1666   rplA TRUE 0.716 101.000 0.302 0.023 Y NA
 3540680 3540681 CHAB381_1666 CHAB381_1667 rplA rplK TRUE 0.879 55.000 0.838 0.023 Y NA
 3540681 3540682 CHAB381_1667 CHAB381_1668 rplK nusG TRUE 0.942 20.000 0.681 1.000 N NA
 3540682 3540683 CHAB381_1668 CHAB381_1669 nusG secE TRUE 0.992 10.000 0.843 1.000   NA
 3540683 3540684 CHAB381_1669 CHAB381_1670 secE   TRUE 0.569 14.000 0.000 NA   NA
 3540684 3540685 CHAB381_1670 CHAB381_1671   rpmG TRUE 0.521 16.000 0.000 NA   NA
 3540685 3540686 CHAB381_1671 CHAB381_1672 rpmG tuf TRUE 0.812 49.000 0.099 1.000 Y NA
 3540686 3540687 CHAB381_1672 CHAB381_1673 tuf   FALSE 0.163 72.000 0.000 NA   NA
 3540687 3540688 CHAB381_1673 CHAB381_1674     FALSE 0.084 110.000 0.000 NA   NA
 3540688 3540689 CHAB381_1674 CHAB381_1675     TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 3540689 3540690 CHAB381_1675 CHAB381_1676     TRUE 0.262 38.000 0.000 NA   NA
 3540690 3540691 CHAB381_1676 CHAB381_1677     FALSE 0.040 185.000 0.000 NA   NA
 3540691 3540692 CHAB381_1677 CHAB381_1678   rbfA TRUE 0.982 -7.000 0.033 NA   NA
 3540692 3540693 CHAB381_1678 CHAB381_1679 rbfA   TRUE 0.997 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 3540693 3540694 CHAB381_1679 CHAB381_1680     TRUE 0.839 -10.000 0.000 NA   NA
 3540694 3540695 CHAB381_1680 CHAB381_1681   thrB TRUE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3540695 3540696 CHAB381_1681 CHAB381_1682 thrB   TRUE 0.976 10.000 0.032 NA   NA
 3540696 3540697 CHAB381_1682 CHAB381_1683   lpxC TRUE 0.771 31.000 0.035 NA   NA
 3540697 3540698 CHAB381_1683 CHAB381_1684 lpxC   TRUE 0.650 47.000 0.022 1.000 Y NA
 3540698 3540699 CHAB381_1684 CHAB381_1685     TRUE 0.446 66.000 0.013 1.000 N NA
 3540701 3540702 CHAB381_1687 CHAB381_1688     FALSE 0.088 108.000 0.000 NA   NA
 3540702 3540703 CHAB381_1688 CHAB381_1689     TRUE 0.995 -3.000 0.217 NA   NA
 3540703 3540704 CHAB381_1689 CHAB381_1690   murC TRUE 0.980 -3.000 0.014 NA   NA
 3540705 3540706 CHAB381_1691 CHAB381_1692     FALSE 0.115 95.000 0.000 NA   NA
 3540706 3540707 CHAB381_1692 CHAB381_1693     FALSE 0.163 72.000 0.000 NA   NA
 3540707 3540708 CHAB381_1693 CHAB381_1694     FALSE 0.026 243.000 0.000 NA   NA
 3540709 3540710 CHAB381_1695 CHAB381_1696 hemN   TRUE 0.996 0.000 0.419 NA   NA
 3540710 3540711 CHAB381_1696 CHAB381_1697   argF TRUE 0.988 0.000 0.025 NA   NA
 3540711 3540712 CHAB381_1697 CHAB381_1698 argF hemB TRUE 0.917 12.000 0.020 1.000 N NA
 3540713 3540714 CHAB381_1699 CHAB381_1700 ribA gidB TRUE 0.919 -19.000 0.017 1.000 N NA
 3540714 3540715 CHAB381_1700 CHAB381_1701 gidB   TRUE 0.939 -10.000 0.009 NA   NA
 3540715 3540716 CHAB381_1701 CHAB381_1702     TRUE 0.995 -3.000 0.281 NA   NA
 3540716 3540717 CHAB381_1702 CHAB381_1703     FALSE 0.021 282.000 0.000 NA   NA
 3540718 3540719 CHAB381_1704 CHAB381_1705     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540719 3540720 CHAB381_1705 CHAB381_1706     FALSE 0.091 105.000 0.000 NA   NA
 3540721 3540722 CHAB381_1707 CHAB381_1708 uvrB   FALSE 0.021 288.000 0.000 NA   NA
 3540722 3540723 CHAB381_1708 CHAB381_1709     FALSE 0.159 76.000 0.000 NA   NA
 3540723 3540724 CHAB381_1709 CHAB381_1710   glnA FALSE 0.033 223.000 0.000 1.000   NA
 3540725 3540726 CHAB381_1711 CHAB381_1712     TRUE 0.276 41.000 0.000 1.000   NA
 3540726 3540727 CHAB381_1712 CHAB381_1713     TRUE 0.944 10.000 0.007 1.000   NA
 3540728 3540729 CHAB381_1714 CHAB381_1715 pdxJ pdxA TRUE 0.995 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 3540729 3540730 CHAB381_1715 CHAB381_1716 pdxA napA FALSE 0.173 81.000 0.000 1.000 N NA
 3540730 3540731 CHAB381_1716 CHAB381_1717 napA   TRUE 0.996 3.000 0.270 0.029   NA
 3540731 3540732 CHAB381_1717 CHAB381_1718     TRUE 0.997 0.000 0.795 0.015   NA
 3540732 3540733 CHAB381_1718 CHAB381_1719   napB TRUE 0.996 -3.000 0.385 NA Y NA
 3540733 3540734 CHAB381_1719 CHAB381_1720 napB   TRUE 0.995 1.000 0.174 NA   NA
 3540734 3540735 CHAB381_1720 CHAB381_1721     TRUE 0.992 -3.000 0.047 NA   NA
 3540735 3540736 CHAB381_1721 CHAB381_1722     TRUE 0.994 -3.000 0.111 NA   NA
 3540736 3540737 CHAB381_1722 CHAB381_1723     FALSE 0.037 194.000 0.000 NA   NA
 3540739 3540740 CHAB381_1725 CHAB381_1726     FALSE 0.095 111.000 0.000 1.000 N NA
 3540744 3540745 CHAB381_1730 CHAB381_1731   putP TRUE 0.938 2.000 0.000 1.000 N NA
 3540745 3540746 CHAB381_1731 CHAB381_1732 putP   TRUE 0.992 -3.000 0.048 NA   NA
 3540747 3540748 CHAB381_1733 CHAB381_1734     FALSE 0.019 300.000 0.000 NA   NA
 3540748 3540749 CHAB381_1734 CHAB381_1735     TRUE 0.712 -19.000 0.000 NA   NA
 3540749 3540750 CHAB381_1735 CHAB381_1736     TRUE 0.815 -12.000 0.000 NA   NA
 3540750 3540751 CHAB381_1736 CHAB381_1737     TRUE 0.887 -7.000 0.000 NA   NA
 3540751 3540752 CHAB381_1737 CHAB381_1738     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540752 3540753 CHAB381_1738 CHAB381_1739     TRUE 0.920 5.000 0.000 NA   NA
 3540753 3540754 CHAB381_1739 CHAB381_1740   purB FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 3540756 3540757 CHAB381_1742 CHAB381_1743     FALSE 0.009 669.000 0.000 NA   NA
 3540757 3540758 CHAB381_1743 CHAB381_1744     TRUE 0.978 -3.000 0.011 NA   NA
 3540758 3540759 CHAB381_1744 CHAB381_1745   hisF TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540760 3540761 CHAB381_1746 CHAB381_1747 ksgA   TRUE 0.951 -16.000 0.028 1.000   NA
 3540761 3540762 CHAB381_1747 CHAB381_1748     TRUE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 3540762 3540763 CHAB381_1748 CHAB381_1749   kpsF TRUE 0.927 2.000 0.000 NA   NA
 3540763 3540764 CHAB381_1749 CHAB381_1750 kpsF   TRUE 0.954 14.000 0.167 1.000 N NA
 3540766 3540767 CHAB381_1752 CHAB381_1753     FALSE 0.039 190.000 0.000 NA   NA
 3540767 3540768 CHAB381_1753 CHAB381_1754     FALSE 0.155 78.000 0.000 NA   NA
 3540768 3540769 CHAB381_1754 CHAB381_1755     TRUE 0.269 37.000 0.000 NA   NA
 3540769 3540770 CHAB381_1755 CHAB381_1756     FALSE 0.023 271.000 0.000 NA   NA
 3540777 3540778 CHAB381_1763 CHAB381_1764     FALSE 0.029 226.000 0.000 NA   NA
 3540779 3540780 CHAB381_1765 CHAB381_1766     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 3540781 3540782 CHAB381_1767 CHAB381_1768     FALSE 0.200 56.000 0.000 NA   NA
 3540782 3540783 CHAB381_1768 CHAB381_1769   ilvD TRUE 0.854 10.000 0.000 NA   NA
 3540784 3540785 CHAB381_1770 CHAB381_1771     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 3540785 3540786 CHAB381_1771 CHAB381_1772     TRUE 0.994 -7.000 1.000 NA N NA
 3540786 3540787 CHAB381_1772 CHAB381_1773     TRUE 0.874 40.000 0.833 NA N NA
 3540787 3540788 CHAB381_1773 CHAB381_1774     TRUE 0.995 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 3540788 3540789 CHAB381_1774 CHAB381_1775   miaA FALSE 0.015 523.000 0.000 0.069 N NA
 3540790 3540791 CHAB381_1776 CHAB381_1777     FALSE 0.010 522.000 0.000 NA   NA
 3540791 3540792 CHAB381_1777 CHAB381_1778   selD FALSE 0.039 203.000 0.000 1.000   NA
 3540792 3540793 CHAB381_1778 CHAB381_1779 selD   TRUE 0.995 -3.000 0.104 1.000 N NA
 3540793 3540794 CHAB381_1779 CHAB381_1780     TRUE 0.576 59.000 0.023 1.000 N NA
 3540794 3540795 CHAB381_1780 CHAB381_1781     TRUE 0.221 51.000 0.000 NA   NA
 3540795 3540796 CHAB381_1781 CHAB381_1782     TRUE 0.994 2.000 0.107 NA   NA
 3540798 3540799 CHAB381_1784 CHAB381_1785     TRUE 0.996 -3.000 0.788 NA   NA
 3540799 3540800 CHAB381_1785 CHAB381_1786   eno TRUE 0.994 -3.000 0.080 NA   NA
 3540800 3540801 CHAB381_1786 CHAB381_1787 eno recA TRUE 0.991 0.000 0.033 1.000 N NA
 3540801 3540802 CHAB381_1787 CHAB381_1788 recA   TRUE 0.497 17.000 0.000 NA   NA
 3540803 3540804 CHAB381_1789 CHAB381_1790 glmM lspA TRUE 0.987 -7.000 0.042 1.000 N NA
 3540804 3540805 CHAB381_1790 CHAB381_1791 lspA   TRUE 0.986 -3.000 0.023 NA   NA
 3540806 3540807 CHAB381_1792 CHAB381_1793     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3540807 3540808 CHAB381_1793 CHAB381_1794   ruvC TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 3540809 3540810 CHAB381_A0001 CHAB381_A0002     TRUE 0.746 -16.000 0.000 NA   NA
 3540812 3540813 CHAB381_A0004 CHAB381_A0005     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 3540813 3540809 CHAB381_A0005 CHAB381_A0001     FALSE 0.161 75.000 0.000 NA   NA