MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1982033 1982034 CFF8240_0001 CFF8240_0002 dnaA dnaN TRUE 0.821 138.000 0.328 1.000 Y NA
 1982034 1982035 CFF8240_0002 CFF8240_0003 dnaN gyrB TRUE 0.990 9.000 0.114 1.000 Y NA
 1982035 1982036 CFF8240_0003 CFF8240_0004 gyrB   TRUE 0.940 0.000 0.006 NA N NA
 1982036 1982037 CFF8240_0004 CFF8240_0005   queF TRUE 0.949 3.000 0.015 NA   NA
 1982037 1982038 CFF8240_0005 CFF8240_0006 queF   TRUE 0.891 10.000 0.013 NA   NA
 1982038 1982039 CFF8240_0006 CFF8240_0007     FALSE 0.129 151.000 0.010 NA   NA
 1982040 1982041 CFF8240_0008 CFF8240_0009     TRUE 0.998 -3.000 0.341 NA Y NA
 1982041 1982042 CFF8240_0009 CFF8240_0010     TRUE 0.802 58.000 0.184 NA   NA
 1982043 1982044 CFF8240_0011 CFF8240_0012     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1982044 1982045 CFF8240_0012 CFF8240_0013   typA TRUE 0.610 -40.000 0.000 NA   NA
 1982045 1982046 CFF8240_0013 CFF8240_0014 typA   TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1982047 1982048 CFF8240_0015 CFF8240_0016   rnhB TRUE 0.909 8.000 0.009 NA   NA
 1982048 1982049 CFF8240_0016 CFF8240_0017 rnhB   TRUE 0.799 -7.000 0.000 1.000   NA
 1982051 1982052 CFF8240_0019 CFF8240_0020     FALSE 0.077 122.000 0.000 1.000   NA
 1982053 1982054 CFF8240_0021 CFF8240_0022 nrdD   FALSE 0.029 213.000 0.000 1.000 N NA
 1982054 1982055 CFF8240_0022 CFF8240_0023     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1982055 1982056 CFF8240_0023 CFF8240_0024     TRUE 0.970 -6.000 0.076 NA   NA
 1982057 1982058 CFF8240_0025 CFF8240_0026     TRUE 0.993 0.000 0.125 0.008   NA
 1982058 1982059 CFF8240_0026 CFF8240_0027     TRUE 0.983 9.000 0.105 0.008   NA
 1982059 1982060 CFF8240_0027 CFF8240_0028     FALSE 0.021 376.000 0.000 NA   NA
 1982061 1982062 CFF8240_0029 CFF8240_0030     TRUE 0.957 -10.000 0.071 1.000   NA
 1982062 1982063 CFF8240_0030 CFF8240_0031   pcm TRUE 0.712 58.000 0.099 1.000   NA
 1982063 1982064 CFF8240_0031 CFF8240_0032 pcm   FALSE 0.119 75.000 0.000 1.000 N NA
 1982064 1982065 CFF8240_0032 CFF8240_0033   rpsJ FALSE 0.016 456.000 0.000 1.000 N NA
 1982065 1982066 CFF8240_0033 CFF8240_0034 rpsJ rplC TRUE 0.993 19.000 0.467 0.040 Y NA
 1982066 1982067 CFF8240_0034 CFF8240_0035 rplC rplD TRUE 0.998 -3.000 0.361 0.030 Y NA
 1982067 1982068 CFF8240_0035 CFF8240_0036 rplD rplW TRUE 0.999 3.000 0.513 1.000 Y NA
 1982068 1982069 CFF8240_0036 CFF8240_0037 rplW rplB TRUE 1.000 2.000 0.849 1.000 Y NA
 1982069 1982070 CFF8240_0037 CFF8240_0038 rplB rpsS TRUE 1.000 3.000 0.820 0.040 Y NA
 1982070 1982071 CFF8240_0038 CFF8240_0039 rpsS rplV TRUE 0.999 10.000 0.769 0.040 Y NA
 1982071 1982072 CFF8240_0039 CFF8240_0040 rplV rpsC TRUE 0.999 2.000 0.719 0.040 Y NA
 1982072 1982073 CFF8240_0040 CFF8240_0041 rpsC rplP TRUE 1.000 3.000 0.828 0.040 Y NA
 1982073 1982074 CFF8240_0041 CFF8240_0042 rplP rpmC TRUE 0.999 -13.000 0.802 0.030 Y NA
 1982074 1982075 CFF8240_0042 CFF8240_0043 rpmC rpsQ TRUE 0.999 11.000 0.828 0.030 Y NA
 1982075 1982076 CFF8240_0043 CFF8240_0044 rpsQ rplN TRUE 1.000 0.000 0.791 0.040 Y NA
 1982076 1982077 CFF8240_0044 CFF8240_0045 rplN rplX TRUE 1.000 0.000 0.810 0.040 Y NA
 1982077 1982078 CFF8240_0045 CFF8240_0046 rplX   TRUE 0.999 3.000 0.758 0.030 Y NA
 1982078 1982079 CFF8240_0046 CFF8240_0047   rpsN TRUE 0.999 2.000 0.496 0.030 Y NA
 1982079 1982080 CFF8240_0047 CFF8240_0048 rpsN rpsH TRUE 0.997 11.000 0.473 0.030 Y NA
 1982080 1982081 CFF8240_0048 CFF8240_0049 rpsH   TRUE 0.965 122.000 0.808 0.030 Y NA
 1982081 1982082 CFF8240_0049 CFF8240_0050   rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.030 Y NA
 1982082 1982083 CFF8240_0050 CFF8240_0051 rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.040 Y NA
 1982083 1982084 CFF8240_0051 CFF8240_0052 rpsE rplO TRUE 0.992 10.000 0.148 0.040 Y NA
 1982084 1982085 CFF8240_0052 CFF8240_0053 rplO   TRUE 0.998 0.000 0.730 1.000 N NA
 1982085 1982086 CFF8240_0053 CFF8240_0054   map TRUE 0.965 2.000 0.026 1.000 N NA
 1982086 1982087 CFF8240_0054 CFF8240_0055 map infA FALSE 0.307 249.000 0.051 1.000 Y NA
 1982087 1982088 CFF8240_0055 CFF8240_0056 infA rpsM TRUE 0.411 277.000 0.075 0.029 Y NA
 1982088 1982089 CFF8240_0056 CFF8240_0057 rpsM rpsK TRUE 0.999 10.000 0.810 0.030 Y NA
 1982089 1982090 CFF8240_0057 CFF8240_0058 rpsK rpsD TRUE 0.989 28.000 0.509 0.040 Y NA
 1982090 1982091 CFF8240_0058 CFF8240_0059 rpsD rpoA TRUE 0.987 13.000 0.549 1.000 N NA
 1982091 1982092 CFF8240_0059 CFF8240_0060 rpoA rplQ TRUE 0.992 19.000 0.873 1.000 N NA
 1982092 1982093 CFF8240_0060 CFF8240_0061 rplQ   FALSE 0.063 225.000 0.006 1.000 N NA
 1982093 1982094 CFF8240_0061 CFF8240_0062     TRUE 0.969 -10.000 0.107 1.000   NA
 1982094 1982095 CFF8240_0062 CFF8240_0063   murE TRUE 0.923 -19.000 0.057 1.000   NA
 1982095 1982096 CFF8240_0063 CFF8240_0064 murE panD TRUE 0.637 20.000 0.005 1.000 N NA
 1982096 1982097 CFF8240_0064 CFF8240_0065 panD   FALSE 0.015 488.000 0.000 1.000 N NA
 1982097 1982098 CFF8240_0065 CFF8240_0066     FALSE 0.170 66.000 0.000 NA   NA
 1982098 1982099 CFF8240_0066 CFF8240_0067     TRUE 0.948 2.000 0.010 NA   NA
 1982099 1982100 CFF8240_0067 CFF8240_0068     TRUE 0.989 -3.000 0.167 1.000   NA
 1982100 1982101 CFF8240_0068 CFF8240_0069   tkt TRUE 0.993 6.000 0.375 1.000 N NA
 1982101 1982102 CFF8240_0069 CFF8240_0070 tkt   FALSE 0.081 149.000 0.000 0.059 N NA
 1982103 1982104 CFF8240_0071 CFF8240_0072     TRUE 0.976 -16.000 0.229 NA   NA
 1982105 1982106 CFF8240_0073 CFF8240_0074 thiS thiF TRUE 0.505 227.000 0.346 1.000   NA
 1982106 1982107 CFF8240_0074 CFF8240_0075 thiF thiG TRUE 0.971 -7.000 0.054 0.039   NA
 1982107 1982108 CFF8240_0075 CFF8240_0076 thiG thiH TRUE 0.985 22.000 0.277 0.006 Y NA
 1982110 1982111 CFF8240_0078 CFF8240_0079 galU pgi TRUE 0.898 -13.000 0.023 1.000 N NA
 1982111 1982112 CFF8240_0079 CFF8240_0080 pgi   FALSE 0.084 205.000 0.011 1.000 N NA
 1982113 1982114 CFF8240_0081 CFF8240_0082     FALSE 0.144 163.000 0.017 NA   NA
 1982114 1982115 CFF8240_0082 CFF8240_0083   bioD TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1982115 1982116 CFF8240_0083 CFF8240_0084 bioD   TRUE 0.965 -3.000 0.030 1.000   NA
 1982116 1982117 CFF8240_0084 CFF8240_0085     TRUE 0.953 -10.000 0.065 NA   NA
 1982117 1982118 CFF8240_0085 CFF8240_0086     TRUE 0.986 -19.000 0.389 NA   NA
 1982119 1982120 CFF8240_0087 CFF8240_0088   thiL TRUE 0.643 -21.000 0.000 NA   NA
 1982120 1982121 CFF8240_0088 CFF8240_0089 thiL truD TRUE 0.872 -22.000 0.022 1.000   NA
 1982122 1982123 CFF8240_0090 CFF8240_0091   fliS TRUE 0.575 14.000 0.000 NA   NA
 1982123 1982124 CFF8240_0091 CFF8240_0092 fliS   TRUE 0.998 11.000 0.608 0.005 Y NA
 1982124 1982125 CFF8240_0092 CFF8240_0093     TRUE 0.991 4.000 0.092 NA Y NA
 1982126 1982127 CFF8240_0094 CFF8240_0095     TRUE 0.911 -16.000 0.032 NA   NA
 1982127 1982128 CFF8240_0095 CFF8240_0096   flgI FALSE 0.358 62.000 0.012 1.000 N NA
 1982128 1982129 CFF8240_0096 CFF8240_0097 flgI   TRUE 0.998 1.000 0.569 NA   NA
 1982129 1982130 CFF8240_0097 CFF8240_0098     TRUE 0.925 57.000 0.469 NA   NA
 1982130 1982131 CFF8240_0098 CFF8240_0099     TRUE 0.980 40.000 0.677 0.005   NA
 1982131 1982132 CFF8240_0099 CFF8240_0100   flgK TRUE 0.998 2.000 0.558 0.005   NA
 1982132 1982133 CFF8240_0100 CFF8240_0101 flgK   TRUE 0.980 3.000 0.084 1.000   NA
 1982133 1982134 CFF8240_0101 CFF8240_0102     FALSE 0.146 74.000 0.000 1.000   NA
 1982134 1982135 CFF8240_0102 CFF8240_0103     TRUE 0.955 -3.000 0.023 1.000 N NA
 1982135 1982136 CFF8240_0103 CFF8240_0104     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1982136 1982137 CFF8240_0104 CFF8240_0105   gltX FALSE 0.109 93.000 0.000 NA   NA
 1982137 1982138 CFF8240_0105 CFF8240_0106 gltX   TRUE 0.980 -3.000 0.088 NA   NA
 1982138 1982139 CFF8240_0106 CFF8240_0107     TRUE 0.803 29.000 0.080 NA   NA
 1982139 1982140 CFF8240_0107 CFF8240_0108     FALSE 0.018 574.000 0.000 NA   NA
 1982140 1982141 CFF8240_0108 CFF8240_0109     TRUE 0.981 -3.000 0.094 NA   NA
 1982141 1982142 CFF8240_0109 CFF8240_0110     TRUE 0.997 0.000 0.391 NA   NA
 1982142 1982143 CFF8240_0110 CFF8240_0111   luxS FALSE 0.141 109.000 0.000 0.024 N NA
 1982144 1982145 CFF8240_0112 CFF8240_0113 ung rplT FALSE 0.252 40.000 0.000 1.000 N NA
 1982145 1982146 CFF8240_0113 CFF8240_0114 rplT rpmI TRUE 0.985 87.000 0.928 0.030 Y NA
 1982147 1982148 CFF8240_0115 CFF8240_0116     TRUE 0.999 1.000 0.618 0.038 Y NA
 1982149 1982150 CFF8240_0117 CFF8240_0118     TRUE 0.990 -7.000 0.241 0.038 N NA
 1982150 1982151 CFF8240_0118 CFF8240_0119     TRUE 0.999 0.000 0.945 1.000 N NA
 1982151 1982152 CFF8240_0119 CFF8240_0120     TRUE 0.486 130.000 0.145 1.000   NA
 1982152 1982153 CFF8240_0120 CFF8240_0121   ccoG TRUE 0.998 -7.000 0.818 1.000   NA
 1982155 1982156 CFF8240_0123 CFF8240_0124     TRUE 0.995 3.000 0.360 NA   NA
 1982156 1982157 CFF8240_0124 CFF8240_0125     TRUE 0.989 -3.000 0.188 NA   NA
 1982157 1982158 CFF8240_0125 CFF8240_0126     TRUE 0.996 0.000 0.133 1.000 Y NA
 1982158 1982159 CFF8240_0126 CFF8240_0127     TRUE 0.994 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 1982159 1982160 CFF8240_0127 CFF8240_0128     TRUE 0.994 0.000 0.048 0.015 Y NA
 1982162 1982163 CFF8240_0129 CFF8240_0131     TRUE 0.992 2.000 0.064 1.000 Y NA
 1982163 1982164 CFF8240_0131 CFF8240_0132     TRUE 0.996 1.000 0.176 1.000 Y NA
 1982164 1982165 CFF8240_0132 CFF8240_0133     TRUE 0.999 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 1982166 1982167 CFF8240_0134 CFF8240_0135     TRUE 0.605 13.000 0.000 NA   NA
 1982167 1982168 CFF8240_0135 CFF8240_0136     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 1982168 1982169 CFF8240_0136 CFF8240_0137     TRUE 0.998 -6.000 0.667 0.004   NA
 1982169 1982170 CFF8240_0137 CFF8240_0138     TRUE 0.998 10.000 1.000 NA   NA
 1982170 1982171 CFF8240_0138 CFF8240_0139     TRUE 0.998 9.000 1.000 NA N NA
 1982171 1982172 CFF8240_0139 CFF8240_0140     TRUE 0.998 -10.000 0.667 1.000 Y NA
 1982174 1982175 CFF8240_0142 CFF8240_0143 moaC   TRUE 0.960 -7.000 0.057 NA   NA
 1982175 1982176 CFF8240_0143 CFF8240_0144     TRUE 0.940 10.000 0.047 NA   NA
 1982177 1982178 CFF8240_0145 CFF8240_0146   dcuB FALSE 0.104 98.000 0.000 NA   NA
 1982179 1982180 CFF8240_0147 CFF8240_0148     TRUE 0.897 8.000 0.008 1.000 N NA
 1982184 1982185 CFF8240_0152 CFF8240_0153 rrsC   FALSE 0.059 145.000 0.000 NA   NA
 1982185 1982186 CFF8240_0153 CFF8240_0154   rrlC FALSE 0.017 698.000 0.000 NA   NA
 1982186 1982187 CFF8240_0154 CFF8240_0155 rrlC rrfC FALSE 0.019 444.000 0.000 NA   NA
 1982187 1982188 CFF8240_0155 CFF8240_0156 rrfC   FALSE 0.024 304.000 0.000 NA   NA
 1982188 1982189 CFF8240_0156 CFF8240_0157   nuoA FALSE 0.021 393.000 0.000 NA   NA
 1982189 1982190 CFF8240_0157 CFF8240_0158 nuoA   TRUE 0.998 -9.000 0.377 0.008 Y NA
 1982190 1982191 CFF8240_0158 CFF8240_0159     TRUE 0.980 -7.000 0.014 0.008 Y NA
 1982191 1982192 CFF8240_0159 CFF8240_0160     TRUE 0.995 -3.000 0.097 0.014 Y NA
 1982192 1982193 CFF8240_0160 CFF8240_0161     TRUE 0.984 -13.000 0.061 0.014 Y NA
 1982193 1982194 CFF8240_0161 CFF8240_0162   nuoG TRUE 0.987 0.000 0.056 0.015   NA
 1982194 1982195 CFF8240_0162 CFF8240_0163 nuoG   TRUE 0.980 -3.000 0.040 0.015   NA
 1982195 1982196 CFF8240_0163 CFF8240_0164     TRUE 0.986 -10.000 0.053 0.015 Y NA
 1982196 1982197 CFF8240_0164 CFF8240_0165     TRUE 0.993 0.000 0.034 0.015 Y NA
 1982197 1982198 CFF8240_0165 CFF8240_0166   nuoK TRUE 0.997 -7.000 0.306 0.008 Y NA
 1982198 1982199 CFF8240_0166 CFF8240_0167 nuoK   TRUE 0.999 -10.000 0.790 0.015 Y NA
 1982199 1982200 CFF8240_0167 CFF8240_0168     TRUE 0.997 -3.000 0.198 0.005 Y NA
 1982200 1982201 CFF8240_0168 CFF8240_0169     TRUE 0.992 -3.000 0.033 0.005 Y NA
 1982201 1982202 CFF8240_0169 CFF8240_0170     FALSE 0.027 222.000 0.000 NA N NA
 1982202 1982203 CFF8240_0170 CFF8240_0171     TRUE 0.998 1.000 0.388 NA Y NA
 1982203 1982204 CFF8240_0171 CFF8240_0172     TRUE 0.961 -3.000 0.025 NA   NA
 1982204 1982205 CFF8240_0172 CFF8240_0173     TRUE 0.771 -9.000 0.000 NA   NA
 1982205 1982206 CFF8240_0173 CFF8240_0174     TRUE 0.995 -3.000 0.153 1.000 Y NA
 1982206 1982207 CFF8240_0174 CFF8240_0175   topA FALSE 0.070 115.000 0.000 1.000 N NA
 1982207 1982208 CFF8240_0175 CFF8240_0176 topA   TRUE 0.899 8.000 0.009 1.000 N NA
 1982208 1982209 CFF8240_0176 CFF8240_0177     TRUE 0.845 -19.000 0.017 1.000 N NA
 1982209 1982210 CFF8240_0177 CFF8240_0178   gltA FALSE 0.311 82.000 0.019 1.000 N NA
 1982210 1982211 CFF8240_0178 CFF8240_0179 gltA cysQ TRUE 0.952 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1982211 1982212 CFF8240_0179 CFF8240_0180 cysQ pstS FALSE 0.259 110.000 0.000 1.000 Y NA
 1982212 1982213 CFF8240_0180 CFF8240_0181 pstS pstC TRUE 0.879 63.000 0.086 0.004 Y NA
 1982213 1982214 CFF8240_0181 CFF8240_0182 pstC pstA TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.004 Y NA
 1982214 1982215 CFF8240_0182 CFF8240_0183 pstA pstB TRUE 0.998 11.000 0.526 0.004 Y NA
 1982215 1982216 CFF8240_0183 CFF8240_0184 pstB   FALSE 0.067 119.000 0.000 1.000 N NA
 1982216 1982217 CFF8240_0184 CFF8240_0185     FALSE 0.025 242.000 0.000 1.000 N NA
 1982218 1982219 CFF8240_0186 CFF8240_0187     FALSE 0.057 149.000 0.000 NA   NA
 1982219 1982220 CFF8240_0187 CFF8240_0188     TRUE 0.963 -3.000 0.026 1.000   NA
 1982220 1982221 CFF8240_0188 CFF8240_0189     FALSE 0.339 72.000 0.013 1.000   NA
 1982221 1982222 CFF8240_0189 CFF8240_0190     FALSE 0.055 136.000 0.000 1.000 N NA
 1982222 1982223 CFF8240_0190 CFF8240_0191     FALSE 0.021 372.000 0.000 NA   NA
 1982223 1982224 CFF8240_0191 CFF8240_0192     TRUE 0.553 15.000 0.000 NA   NA
 1982224 1982225 CFF8240_0192 CFF8240_0193     TRUE 0.999 2.000 0.501 1.000 Y NA
 1982225 1982226 CFF8240_0193 CFF8240_0194     FALSE 0.259 38.000 0.000 NA N NA
 1982227 1982228 CFF8240_0195 CFF8240_0196 leuC   TRUE 0.780 12.000 0.007 NA N NA
 1982228 1982229 CFF8240_0196 CFF8240_0197     TRUE 0.938 -3.000 0.014 NA N NA
 1982230 1982231 CFF8240_0198 CFF8240_0199     TRUE 0.992 14.000 0.788 NA   NA
 1982231 1982232 CFF8240_0199 CFF8240_0200   eno TRUE 0.979 -3.000 0.080 1.000   NA
 1982232 1982233 CFF8240_0200 CFF8240_0201 eno recA TRUE 0.972 0.000 0.033 1.000 N NA
 1982234 1982235 CFF8240_0202 CFF8240_0203   fliQ TRUE 0.983 0.000 0.068 NA   NA
 1982235 1982236 CFF8240_0203 CFF8240_0204 fliQ murB TRUE 0.973 -3.000 0.066 1.000 N NA
 1982236 1982237 CFF8240_0204 CFF8240_0206 murB   FALSE 0.050 162.000 0.000 NA   NA
 1982237 1982238 CFF8240_0206 CFF8240_0207     TRUE 0.492 19.000 0.000 NA   NA
 1982238 1982239 CFF8240_0207 CFF8240_0208     TRUE 0.826 5.000 0.000 NA   NA
 1982239 1982240 CFF8240_0208 CFF8240_0209   cdsA FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 1982240 1982241 CFF8240_0209 CFF8240_0210 cdsA dxr TRUE 0.995 -3.000 0.372 1.000   NA
 1982241 1982242 CFF8240_0210 CFF8240_0211 dxr   TRUE 0.870 0.000 0.000 1.000 N NA
 1982242 1982243 CFF8240_0211 CFF8240_0212   uraA TRUE 0.717 -10.000 0.000 1.000 N NA
 1982243 1982244 CFF8240_0212 CFF8240_0213 uraA   TRUE 0.844 4.000 0.000 1.000   NA
 1982244 1982245 CFF8240_0213 CFF8240_0214     TRUE 0.912 14.000 0.079 1.000   NA
 1982245 1982246 CFF8240_0214 CFF8240_0215     TRUE 0.935 -3.000 0.008 1.000   NA
 1982246 1982247 CFF8240_0215 CFF8240_0217     FALSE 0.186 63.000 0.000 1.000   NA
 1982249 1982250 CFF8240_0218 CFF8240_0219     TRUE 0.762 48.000 0.100 NA   NA
 1982250 1982251 CFF8240_0219 CFF8240_0220     TRUE 0.994 -7.000 0.476 NA   NA
 1982251 1982252 CFF8240_0220 CFF8240_0221   moaA TRUE 0.977 0.000 0.042 NA   NA
 1982252 1982253 CFF8240_0221 CFF8240_0222 moaA   TRUE 0.970 0.000 0.028 1.000 N NA
 1982255 1982256 CFF8240_0224 CFF8240_0225     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1982256 1982257 CFF8240_0225 CFF8240_0226     TRUE 0.810 7.000 0.000 NA   NA
 1982257 1982258 CFF8240_0226 CFF8240_0227     TRUE 0.977 -3.000 0.070 NA   NA
 1982258 1982259 CFF8240_0227 CFF8240_0228     TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1982259 1982260 CFF8240_0228 CFF8240_0229     TRUE 0.638 -22.000 0.000 NA   NA
 1982260 1982261 CFF8240_0229 CFF8240_0230     FALSE 0.261 72.000 0.006 1.000 N NA
 1982261 1982262 CFF8240_0230 CFF8240_0231     TRUE 0.990 9.000 0.119 1.000 Y NA
 1982262 1982263 CFF8240_0231 CFF8240_0232     FALSE 0.067 137.000 0.000 1.000   NA
 1982263 1982264 CFF8240_0232 CFF8240_0233   ndk FALSE 0.248 104.000 0.015 1.000   NA
 1982264 1982265 CFF8240_0233 CFF8240_0234 ndk   TRUE 0.847 16.000 0.033 NA   NA
 1982265 1982266 CFF8240_0234 CFF8240_0235   rpmF TRUE 0.971 2.000 0.032 NA   NA
 1982266 1982267 CFF8240_0235 CFF8240_0236 rpmF plsX TRUE 0.990 10.000 0.418 1.000 N NA
 1982267 1982268 CFF8240_0236 CFF8240_0237 plsX   TRUE 0.990 8.000 0.058 0.007 Y NA
 1982268 1982269 CFF8240_0237 CFF8240_0238     FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 1982269 1982270 CFF8240_0238 CFF8240_0239     TRUE 0.980 -3.000 0.089 NA   NA
 1982270 1982271 CFF8240_0239 CFF8240_0240     TRUE 0.900 10.000 0.016 NA   NA
 1982271 1982272 CFF8240_0240 CFF8240_0241     TRUE 0.968 -3.000 0.040 1.000   NA
 1982272 1982273 CFF8240_0241 CFF8240_0242     TRUE 0.420 79.000 0.043 1.000 N NA
 1982273 1982274 CFF8240_0242 CFF8240_0243     TRUE 0.945 63.000 0.375 1.000 Y NA
 1982274 1982275 CFF8240_0243 CFF8240_0244     TRUE 0.849 47.000 0.194 1.000   NA
 1982275 1982276 CFF8240_0244 CFF8240_0245     TRUE 0.999 0.000 0.806 1.000   NA
 1982277 1982278 CFF8240_0246 CFF8240_0247     TRUE 0.937 2.000 0.003 NA   NA
 1982278 1982279 CFF8240_0247 CFF8240_0248     TRUE 0.956 -3.000 0.021 NA   NA
 1982279 1982280 CFF8240_0248 CFF8240_0249     TRUE 0.997 -3.000 0.523 NA   NA
 1982280 1982281 CFF8240_0249 CFF8240_0250     TRUE 0.929 10.000 0.029 NA   NA
 1982281 1982282 CFF8240_0250 CFF8240_0251   accD TRUE 0.975 0.000 0.035 NA   NA
 1982283 1982284 CFF8240_0252 CFF8240_0253     FALSE 0.078 121.000 0.000 1.000   NA
 1982285 1982286 CFF8240_0254 CFF8240_0255 serC xseA TRUE 0.796 12.000 0.010 1.000 N NA
 1982286 1982287 CFF8240_0255 CFF8240_0256 xseA ubiE TRUE 0.942 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1982287 1982288 CFF8240_0256 CFF8240_0257 ubiE   TRUE 0.948 1.000 0.008 NA   NA
 1982288 1982289 CFF8240_0257 CFF8240_0258     FALSE 0.045 176.000 0.000 NA   NA
 1982290 1982291 CFF8240_0259 CFF8240_0260     TRUE 0.966 -16.000 0.145 1.000   NA
 1982291 1982292 CFF8240_0260 CFF8240_0261     TRUE 0.941 -10.000 0.042 1.000   NA
 1982292 1982293 CFF8240_0261 CFF8240_0262     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 1982294 1982295 CFF8240_0263 CFF8240_0264   dxs FALSE 0.290 83.000 0.017 1.000 N NA
 1982295 1982296 CFF8240_0264 CFF8240_0265 dxs   TRUE 0.965 4.000 0.052 1.000 N NA
 1982296 1982297 CFF8240_0265 CFF8240_0266   fliG TRUE 0.998 -3.000 0.308 0.008 Y NA
 1982297 1982298 CFF8240_0266 CFF8240_0267 fliG fliF TRUE 0.999 0.000 0.477 0.012 Y NA
 1982298 1982299 CFF8240_0267 CFF8240_0268 fliF hisC TRUE 0.968 7.000 0.084 1.000 N NA
 1982299 1982300 CFF8240_0268 CFF8240_0269 hisC pheA TRUE 0.986 3.000 0.028 1.000 Y NA
 1982300 1982301 CFF8240_0269 CFF8240_0270 pheA   TRUE 0.893 -13.000 0.021 1.000 N NA
 1982301 1982302 CFF8240_0270 CFF8240_0271   lysA TRUE 0.955 0.000 0.015 1.000 N NA
 1982302 1982303 CFF8240_0271 CFF8240_0272 lysA   FALSE 0.117 213.000 0.021 1.000   NA
 1982304 1982305 CFF8240_0273 CFF8240_0274     FALSE 0.248 49.000 0.000 NA   NA
 1982305 1982306 CFF8240_0274 CFF8240_0275     FALSE 0.025 285.000 0.000 NA   NA
 1982306 1982307 CFF8240_0275 CFF8240_0276     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 1982307 1982308 CFF8240_0276 CFF8240_0277     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1982308 1982309 CFF8240_0277 CFF8240_0278     TRUE 0.639 11.000 0.000 1.000 N NA
 1982309 1982310 CFF8240_0278 CFF8240_0279     TRUE 0.997 -13.000 0.571 1.000 Y NA
 1982310 1982311 CFF8240_0279 CFF8240_0280     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 1982311 1982312 CFF8240_0280 CFF8240_0281     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 1982312 1982313 CFF8240_0281 CFF8240_0282   exbB TRUE 0.686 11.000 0.000 1.000   NA
 1982313 1982314 CFF8240_0282 CFF8240_0283 exbB expD TRUE 1.000 -3.000 0.815 0.053 Y NA
 1982314 1982315 CFF8240_0283 CFF8240_0284 expD   TRUE 0.771 8.000 0.000 1.000 N NA
 1982315 1982316 CFF8240_0284 CFF8240_0285   lys FALSE 0.037 182.000 0.000 1.000 N NA
 1982316 1982317 CFF8240_0285 CFF8240_0286 lys   TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982317 1982318 CFF8240_0286 CFF8240_0287   rpmE FALSE 0.193 61.000 0.000 NA   NA
 1982318 1982319 CFF8240_0287 CFF8240_0288 rpmE   TRUE 0.957 5.000 0.031 1.000   NA
 1982319 1982320 CFF8240_0288 CFF8240_0289     TRUE 0.678 37.000 0.031 1.000   NA
 1982320 1982321 CFF8240_0289 CFF8240_0290     TRUE 0.416 80.000 0.033 NA   NA
 1982321 1982322 CFF8240_0290 CFF8240_0291     TRUE 0.998 -6.000 0.882 NA   NA
 1982322 1982323 CFF8240_0291 CFF8240_0292     TRUE 0.964 10.000 0.098 NA   NA
 1982323 1982324 CFF8240_0292 CFF8240_0293     TRUE 0.981 -3.000 0.018 1.000 Y NA
 1982324 1982325 CFF8240_0293 CFF8240_0294     TRUE 0.931 2.000 0.004 1.000 N NA
 1982325 1982326 CFF8240_0294 CFF8240_0295   trx TRUE 0.400 73.000 0.027 1.000 N NA
 1982326 1982327 CFF8240_0295 CFF8240_0296 trx trxB TRUE 0.524 118.000 0.035 1.000 Y NA
 1982327 1982328 CFF8240_0296 CFF8240_0297 trxB   FALSE 0.114 92.000 0.000 1.000   NA
 1982328 1982329 CFF8240_0297 CFF8240_0298   dapB FALSE 0.041 195.000 0.000 1.000   NA
 1982329 1982330 CFF8240_0298 CFF8240_0299 dapB purF TRUE 0.960 2.000 0.022 1.000 N NA
 1982331 1982332 CFF8240_0300 CFF8240_0301     TRUE 0.999 0.000 0.867 NA   NA
 1982332 1982333 CFF8240_0301 CFF8240_0302   hisIE FALSE 0.291 77.000 0.010 NA   NA
 1982333 1982334 CFF8240_0302 CFF8240_0303 hisIE   TRUE 0.904 10.000 0.022 NA N NA
 1982334 1982335 CFF8240_0303 CFF8240_0304   ilvE TRUE 0.897 18.000 0.098 NA N NA
 1982335 1982336 CFF8240_0304 CFF8240_0305 ilvE   FALSE 0.130 83.000 0.000 1.000   NA
 1982337 1982338 CFF8240_0306 CFF8240_0307     TRUE 0.802 8.000 0.000 NA   NA
 1982338 1982339 CFF8240_0307 CFF8240_0308     TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1982339 1982340 CFF8240_0308 CFF8240_0309     TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1982340 1982341 CFF8240_0309 CFF8240_0310     FALSE 0.062 140.000 0.000 NA   NA
 1982341 1982342 CFF8240_0310 CFF8240_0311     TRUE 0.950 1.000 0.008 1.000   NA
 1982344 1982345 CFF8240_0313 CFF8240_0314   fabZ FALSE 0.080 606.000 0.035 NA   NA
 1982345 1982346 CFF8240_0314 CFF8240_0315 fabZ lpxA TRUE 0.983 10.000 0.264 1.000 N NA
 1982346 1982347 CFF8240_0315 CFF8240_0316 lpxA clpX TRUE 0.969 0.000 0.027 1.000 N NA
 1982347 1982348 CFF8240_0316 CFF8240_0317 clpX mreB TRUE 0.853 14.000 0.034 1.000 N NA
 1982348 1982349 CFF8240_0317 CFF8240_0318 mreB   TRUE 0.969 38.000 0.689 1.000 N NA
 1982349 1982350 CFF8240_0318 CFF8240_0319   carB TRUE 0.957 0.000 0.016 1.000 N NA
 1982350 1982351 CFF8240_0319 CFF8240_0320 carB   TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1982351 1982352 CFF8240_0320 CFF8240_0321     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA N NA
 1982352 1982353 CFF8240_0321 CFF8240_0322     FALSE 0.081 102.000 0.000 NA N NA
 1982354 1982355 CFF8240_0323 CFF8240_0324     TRUE 0.799 -7.000 0.000 1.000   NA
 1982355 1982356 CFF8240_0324 CFF8240_0325   surE TRUE 0.973 3.000 0.051 1.000   NA
 1982357 1982358 CFF8240_0326 CFF8240_0327 lpxB   TRUE 0.676 37.000 0.042 1.000 N NA
 1982358 1982359 CFF8240_0327 CFF8240_0328   argC TRUE 0.896 9.000 0.011 1.000 N NA
 1982359 1982360 CFF8240_0328 CFF8240_0329 argC   TRUE 0.957 -3.000 0.021 1.000   NA
 1982360 1982361 CFF8240_0329 CFF8240_0330     TRUE 0.964 -7.000 0.065 1.000   NA
 1982361 1982362 CFF8240_0330 CFF8240_0331     TRUE 0.990 11.000 0.147 0.012 Y NA
 1982362 1982363 CFF8240_0331 CFF8240_0332     TRUE 0.992 10.000 0.137 0.018 Y NA
 1982363 1982364 CFF8240_0332 CFF8240_0333   serB TRUE 0.908 9.000 0.015 1.000 N NA
 1982364 1982365 CFF8240_0333 CFF8240_0334 serB tal TRUE 0.860 13.000 0.029 1.000 N NA
 1982365 1982366 CFF8240_0334 CFF8240_0335 tal pilT TRUE 0.984 10.000 0.273 1.000 N NA
 1982366 1982367 CFF8240_0335 CFF8240_0336 pilT   FALSE 0.383 61.000 0.014 1.000 N NA
 1982367 1982368 CFF8240_0336 CFF8240_0337   pth TRUE 0.999 0.000 0.496 0.045 Y NA
 1982368 1982369 CFF8240_0337 CFF8240_0338 pth nspC FALSE 0.122 74.000 0.000 1.000 N NA
 1982369 1982370 CFF8240_0338 CFF8240_0339 nspC   FALSE 0.106 84.000 0.000 1.000 N NA
 1982370 1982371 CFF8240_0339 CFF8240_0340   selD TRUE 0.693 59.000 0.104 1.000 N NA
 1982371 1982372 CFF8240_0340 CFF8240_0341 selD   TRUE 0.851 10.000 0.005 1.000 N NA
 1982372 1982373 CFF8240_0341 CFF8240_0342   flhB TRUE 0.639 11.000 0.000 1.000 N NA
 1982374 1982375 CFF8240_0343 CFF8240_0344 nhaA uvrA FALSE 0.018 354.000 0.000 1.000 N NA
 1982376 1982377 CFF8240_0345 CFF8240_0346     FALSE 0.081 117.000 0.000 NA   NA
 1982378 1982379 CFF8240_0347 CFF8240_0348     TRUE 0.566 22.000 0.000 0.070   NA
 1982380 1982381 CFF8240_0349 CFF8240_0350     FALSE 0.041 192.000 0.000 NA   NA
 1982381 1982382 CFF8240_0350 CFF8240_0351     TRUE 0.989 -3.000 0.019 0.001 Y NA
 1982382 1982383 CFF8240_0351 CFF8240_0352   trpF TRUE 0.989 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 1982383 1982384 CFF8240_0352 CFF8240_0353 trpF trpB TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.003 Y NA
 1982384 1982385 CFF8240_0353 CFF8240_0354 trpB trpA TRUE 0.997 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 1982385 1982386 CFF8240_0354 CFF8240_0355 trpA   FALSE 0.165 149.000 0.017 NA   NA
 1982386 1982387 CFF8240_0355 CFF8240_0356   fliN TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA   NA
 1982387 1982388 CFF8240_0356 CFF8240_0357 fliN   TRUE 0.997 -3.000 0.531 NA   NA
 1982389 1982390 CFF8240_0358 CFF8240_0359   modB FALSE 0.383 26.000 0.000 NA   NA
 1982390 1982391 CFF8240_0359 CFF8240_0360 modB   TRUE 0.992 -3.000 0.286 1.000 N NA
 1982391 1982392 CFF8240_0360 CFF8240_0361     TRUE 0.970 -3.000 0.045 1.000   NA
 1982392 1982393 CFF8240_0361 CFF8240_0362   modA TRUE 0.992 0.000 0.098 0.002   NA
 1982393 1982394 CFF8240_0362 CFF8240_0363 modA   FALSE 0.267 144.000 0.015 0.002   NA
 1982395 1982396 CFF8240_0364 CFF8240_0365   ttg2D TRUE 0.998 3.000 0.684 NA N NA
 1982396 1982397 CFF8240_0365 CFF8240_0367 ttg2D   TRUE 0.994 0.000 0.263 NA   NA
 1982399 1982400 CFF8240_0368 CFF8240_0369     TRUE 0.925 3.000 0.006 1.000 N NA
 1982400 1982401 CFF8240_0369 CFF8240_0370   purA TRUE 0.964 11.000 0.161 1.000 N NA
 1982401 1982402 CFF8240_0370 CFF8240_0371 purA   TRUE 0.946 -3.000 0.014 NA   NA
 1982402 1982403 CFF8240_0371 CFF8240_0372     TRUE 0.987 -3.000 0.147 NA   NA
 1982403 1982404 CFF8240_0372 CFF8240_0373     TRUE 0.462 127.000 0.120 NA   NA
 1982404 1982405 CFF8240_0373 CFF8240_0374   carA TRUE 0.976 0.000 0.041 NA   NA
 1982405 1982406 CFF8240_0374 CFF8240_0375 carA   TRUE 0.955 0.000 0.011 NA   NA
 1982406 1982407 CFF8240_0375 CFF8240_0376     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982407 1982408 CFF8240_0376 CFF8240_0377     TRUE 0.994 -7.000 0.133 0.014 Y NA
 1982408 1982409 CFF8240_0377 CFF8240_0378   ccoN FALSE 0.241 157.000 0.062 1.000 N NA
 1982409 1982410 CFF8240_0378 CFF8240_0379 ccoN ccoO TRUE 0.987 11.000 0.283 0.003 N NA
 1982410 1982411 CFF8240_0379 CFF8240_0380 ccoO   TRUE 0.996 11.000 0.738 0.003 N NA
 1982411 1982412 CFF8240_0380 CFF8240_0381   ccoP TRUE 0.995 -3.000 0.286 0.003 N NA
 1982412 1982413 CFF8240_0381 CFF8240_0382 ccoP   TRUE 0.998 2.000 0.579 NA   NA
 1982413 1982414 CFF8240_0382 CFF8240_0383     TRUE 0.824 116.000 0.526 NA   NA
 1982414 1982415 CFF8240_0383 CFF8240_0384     TRUE 0.981 4.000 0.102 NA   NA
 1982415 1982416 CFF8240_0384 CFF8240_0385     TRUE 0.942 -19.000 0.091 NA   NA
 1982416 1982417 CFF8240_0385 CFF8240_0386     TRUE 0.995 -3.000 0.117 0.044 Y NA
 1982417 1982418 CFF8240_0386 CFF8240_0387   rplM FALSE 0.250 79.000 0.009 1.000 N NA
 1982418 1982419 CFF8240_0387 CFF8240_0388 rplM rpsI TRUE 0.997 3.000 0.231 0.028 Y NA
 1982419 1982420 CFF8240_0388 CFF8240_0389 rpsI   FALSE 0.020 300.000 0.000 1.000 N NA
 1982420 1982421 CFF8240_0389 CFF8240_0390     TRUE 0.939 6.000 0.000 NA Y NA
 1982421 1982422 CFF8240_0390 CFF8240_0391     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 1982422 1982423 CFF8240_0391 CFF8240_0392   nifJ FALSE 0.212 190.000 0.056 1.000   NA
 1982423 1982424 CFF8240_0392 CFF8240_0393 nifJ   FALSE 0.087 112.000 0.000 NA   NA
 1982424 1982425 CFF8240_0393 CFF8240_0394     FALSE 0.368 27.000 0.000 NA   NA
 1982425 1982426 CFF8240_0394 CFF8240_0395     TRUE 0.963 -13.000 0.108 NA   NA
 1982426 1982427 CFF8240_0395 CFF8240_0396     FALSE 0.034 218.000 0.000 NA   NA
 1982427 1982428 CFF8240_0396 CFF8240_0397     FALSE 0.026 277.000 0.000 NA   NA
 1982428 1982429 CFF8240_0397 CFF8240_0398     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 1982429 1982430 CFF8240_0398 CFF8240_0399     FALSE 0.059 145.000 0.000 NA   NA
 1982430 1982431 CFF8240_0399 CFF8240_0400     FALSE 0.085 275.000 0.000 NA Y NA
 1982431 1982432 CFF8240_0400 CFF8240_0401     TRUE 0.999 3.000 0.771 0.036 Y NA
 1982432 1982433 CFF8240_0401 CFF8240_0402     TRUE 0.996 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1982433 1982434 CFF8240_0402 CFF8240_0403     TRUE 0.999 -3.000 0.381 0.022 Y NA
 1982434 1982435 CFF8240_0403 CFF8240_0404     TRUE 0.794 71.000 0.280 1.000 N NA
 1982435 1982436 CFF8240_0404 CFF8240_0406     TRUE 0.882 67.000 0.400 NA   NA
 1982437 1982438 CFF8240_0405 CFF8240_0407     TRUE 0.813 21.000 0.052 1.000 N NA
 1982438 1982439 CFF8240_0407 CFF8240_0408     FALSE 0.234 80.000 0.006 1.000 N NA
 1982439 1982440 CFF8240_0408 CFF8240_0409     TRUE 0.916 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1982441 1982442 CFF8240_0410 CFF8240_0411 thiC mrp TRUE 0.950 -3.000 0.021 1.000 N NA
 1982442 1982443 CFF8240_0411 CFF8240_0412 mrp   FALSE 0.133 221.000 0.036 1.000 N NA
 1982443 1982444 CFF8240_0412 CFF8240_0413     TRUE 0.611 13.000 0.000 1.000   NA
 1982445 1982446 CFF8240_0414 CFF8240_0415     TRUE 0.989 -28.000 0.153 0.004 Y NA
 1982446 1982447 CFF8240_0415 CFF8240_0416     TRUE 0.996 -3.000 0.128 0.004 Y NA
 1982447 1982448 CFF8240_0416 CFF8240_0417   lgt FALSE 0.058 261.000 0.010 1.000 N NA
 1982448 1982449 CFF8240_0417 CFF8240_0418 lgt   TRUE 0.891 -7.000 0.003 NA   NA
 1982449 1982450 CFF8240_0418 CFF8240_0419     FALSE 0.206 58.000 0.000 NA   NA
 1982450 1982451 CFF8240_0419 CFF8240_0420     TRUE 0.860 3.000 0.000 NA   NA
 1982451 1982452 CFF8240_0420 CFF8240_0421     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 1982452 1982453 CFF8240_0421 CFF8240_0422     TRUE 0.968 -3.000 0.040 1.000   NA
 1982454 1982455 CFF8240_0423 CFF8240_0424     FALSE 0.243 52.000 0.000 NA   NA
 1982455 1982456 CFF8240_0424 CFF8240_0425     TRUE 0.616 26.000 0.010 NA   NA
 1982456 1982457 CFF8240_0425 CFF8240_0426     FALSE 0.117 204.000 0.022 1.000 N NA
 1982457 1982458 CFF8240_0426 CFF8240_0427     FALSE 0.291 144.000 0.000 0.002 Y NA
 1982460 1982461 CFF8240_0429 CFF8240_0430     TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1982461 1982462 CFF8240_0430 CFF8240_0431     FALSE 0.074 123.000 0.000 NA   NA
 1982462 1982463 CFF8240_0431 CFF8240_0432     TRUE 0.955 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1982463 1982464 CFF8240_0432 CFF8240_0433     FALSE 0.162 69.000 0.000 1.000   NA
 1982464 1982465 CFF8240_0433 CFF8240_0434     TRUE 0.817 11.000 0.000 0.006   NA
 1982465 1982466 CFF8240_0434 CFF8240_0435     FALSE 0.040 168.000 0.000 1.000 N NA
 1982466 1982467 CFF8240_0435 CFF8240_0436     FALSE 0.132 82.000 0.000 1.000   NA
 1982467 1982468 CFF8240_0436 CFF8240_0437     FALSE 0.058 150.000 0.000 1.000   NA
 1982468 1982469 CFF8240_0437 CFF8240_0438     TRUE 0.998 -6.000 0.750 0.010   NA
 1982469 1982470 CFF8240_0438 CFF8240_0439     FALSE 0.045 175.000 0.000 NA   NA
 1982470 1982471 CFF8240_0439 CFF8240_0440     FALSE 0.277 42.000 0.000 NA   NA
 1982471 1982472 CFF8240_0440 CFF8240_0441     TRUE 0.646 127.000 0.281 NA   NA
 1982472 1982473 CFF8240_0441 CFF8240_0442     TRUE 0.983 -3.000 0.102 NA   NA
 1982473 1982474 CFF8240_0442 CFF8240_0443     TRUE 0.992 -7.000 0.364 1.000   NA
 1982474 1982475 CFF8240_0443 CFF8240_0444     TRUE 0.998 3.000 0.545 0.027   NA
 1982475 1982476 CFF8240_0444 CFF8240_0445     TRUE 0.997 -3.000 0.375 0.014   NA
 1982476 1982477 CFF8240_0445 CFF8240_0446     TRUE 0.992 5.000 0.222 0.023   NA
 1982477 1982478 CFF8240_0446 CFF8240_0447     TRUE 0.611 13.000 0.000 1.000   NA
 1982478 1982479 CFF8240_0447 CFF8240_0448     FALSE 0.198 60.000 0.000 NA   NA
 1982479 1982480 CFF8240_0448 CFF8240_0449     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982480 1982481 CFF8240_0449 CFF8240_0450     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 1982482 1982483 CFF8240_0451 CFF8240_0452     TRUE 0.998 5.000 0.571 1.000 Y NA
 1982483 1982484 CFF8240_0452 CFF8240_0453     TRUE 0.529 14.000 0.000 1.000 N NA
 1982484 1982485 CFF8240_0453 CFF8240_0454     TRUE 0.869 -7.000 0.000 0.054   NA
 1982485 1982486 CFF8240_0454 CFF8240_0455     TRUE 0.997 10.000 0.686 0.014   NA
 1982486 1982487 CFF8240_0455 CFF8240_0456     FALSE 0.025 300.000 0.000 1.000   NA
 1982487 1982488 CFF8240_0456 CFF8240_0457     FALSE 0.025 288.000 0.000 1.000   NA
 1982488 1982489 CFF8240_0457 CFF8240_0458     TRUE 0.995 -10.000 0.357 1.000 Y NA
 1982489 1982490 CFF8240_0458 CFF8240_0459     TRUE 0.999 0.000 0.765 0.012   NA
 1982490 1982491 CFF8240_0459 CFF8240_0460     TRUE 0.936 -13.000 0.052 NA   NA
 1982493 1982494 CFF8240_0462 CFF8240_0463     FALSE 0.024 305.000 0.000 1.000   NA
 1982494 1982495 CFF8240_0463 CFF8240_0464     FALSE 0.033 230.000 0.000 1.000   NA
 1982496 1982497 CFF8240_0465 CFF8240_0466     FALSE 0.053 155.000 0.000 NA   NA
 1982498 1982499 CFF8240_0467 CFF8240_0468 ssrA   FALSE 0.310 37.000 0.000 NA   NA
 1982500 1982501 CFF8240_0469 CFF8240_0470 panB   TRUE 0.639 -16.000 0.000 NA N NA
 1982501 1982502 CFF8240_0470 CFF8240_0471   ruvB TRUE 0.700 10.000 0.000 NA N NA
 1982502 1982503 CFF8240_0471 CFF8240_0472 ruvB   TRUE 0.930 -7.000 0.019 NA   NA
 1982503 1982504 CFF8240_0472 CFF8240_0473     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982504 1982505 CFF8240_0473 CFF8240_0474     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982505 1982506 CFF8240_0474 CFF8240_0475     TRUE 0.999 -10.000 0.912 NA Y NA
 1982506 1982507 CFF8240_0475 CFF8240_0476     TRUE 0.992 -3.000 0.258 NA   NA
 1982508 1982509 CFF8240_0477 CFF8240_0478     FALSE 0.020 418.000 0.000 NA   NA
 1982509 1982510 CFF8240_0478 CFF8240_0479     FALSE 0.031 233.000 0.000 NA   NA
 1982510 1982511 CFF8240_0479 CFF8240_0480     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1982511 1982512 CFF8240_0480 CFF8240_0481     FALSE 0.030 246.000 0.000 NA   NA
 1982513 1982514 CFF8240_0482 CFF8240_0483     TRUE 0.732 -12.000 0.000 NA   NA
 1982518 1982519 CFF8240_0487 CFF8240_0488     FALSE 0.022 334.000 0.000 NA   NA
 1982519 1982520 CFF8240_0488 CFF8240_0489     FALSE 0.269 44.000 0.000 NA   NA
 1982521 1982522 CFF8240_0490 CFF8240_0491     FALSE 0.023 326.000 0.000 1.000   NA
 1982522 1982523 CFF8240_0491 CFF8240_0492     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.020 Y NA
 1982523 1982524 CFF8240_0492 CFF8240_0493     TRUE 0.860 3.000 0.000 NA   NA
 1982524 1982525 CFF8240_0493 CFF8240_0494     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1982525 1982526 CFF8240_0494 CFF8240_0495     TRUE 0.995 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 1982527 1982528 CFF8240_0496 CFF8240_0497     TRUE 0.854 -28.000 0.000 1.000 Y NA
 1982529 1982530 CFF8240_0498 CFF8240_0499 radA ftsY TRUE 0.972 0.000 0.015 0.023 N NA
 1982530 1982531 CFF8240_0499 CFF8240_0500 ftsY   TRUE 0.939 0.000 0.005 1.000 N NA
 1982532 1982533 CFF8240_0501 CFF8240_0502     TRUE 0.906 -67.000 0.059 1.000   NA
 1982533 1982534 CFF8240_0502 CFF8240_0503     TRUE 0.778 13.000 0.006 NA   NA
 1982534 1982535 CFF8240_0503 CFF8240_0504     TRUE 0.980 9.000 0.156 NA   NA
 1982535 1982536 CFF8240_0504 CFF8240_0505     TRUE 0.981 -3.000 0.094 NA   NA
 1982536 1982537 CFF8240_0505 CFF8240_0506   rrsD FALSE 0.019 471.000 0.000 NA   NA
 1982537 1982538 CFF8240_0506 CFF8240_0507 rrsD   FALSE 0.059 145.000 0.000 NA   NA
 1982538 1982539 CFF8240_0507 CFF8240_0508   rrlD FALSE 0.017 698.000 0.000 NA   NA
 1982539 1982540 CFF8240_0508 CFF8240_0509 rrlD rrfD FALSE 0.019 444.000 0.000 NA   NA
 1982540 1982541 CFF8240_0509 CFF8240_0510 rrfD   FALSE 0.022 359.000 0.000 NA   NA
 1982541 1982542 CFF8240_0510 CFF8240_0511     FALSE 0.038 204.000 0.000 1.000   NA
 1982542 1982543 CFF8240_0511 CFF8240_0513   bioA FALSE 0.103 101.000 0.000 1.000   NA
 1982545 1982546 CFF8240_0514 CFF8240_0515   fbaA TRUE 0.927 10.000 0.036 1.000 N NA
 1982546 1982547 CFF8240_0515 CFF8240_0516 fbaA   FALSE 0.367 89.000 0.027 1.000   NA
 1982547 1982548 CFF8240_0516 CFF8240_0517     TRUE 0.969 -13.000 0.133 1.000   NA
 1982548 1982549 CFF8240_0517 CFF8240_0518     TRUE 0.960 -10.000 0.093 1.000 N NA
 1982549 1982550 CFF8240_0518 CFF8240_0519   hisD TRUE 0.863 24.000 0.020 1.000 Y NA
 1982550 1982551 CFF8240_0519 CFF8240_0520 hisD   FALSE 0.396 57.000 0.007 1.000   NA
 1982553 1982554 CFF8240_0522 CFF8240_0523   flgG TRUE 0.992 19.000 0.377 0.009 Y NA
 1982554 1982555 CFF8240_0523 CFF8240_0524 flgG   FALSE 0.020 298.000 0.000 NA N NA
 1982555 1982556 CFF8240_0524 CFF8240_0525     TRUE 0.996 -3.000 0.238 NA Y NA
 1982556 1982557 CFF8240_0525 CFF8240_0526     TRUE 0.637 173.000 0.386 NA   NA
 1982557 1982558 CFF8240_0526 CFF8240_0527     TRUE 0.975 5.000 0.089 NA   NA
 1982558 1982559 CFF8240_0527 CFF8240_0528     TRUE 0.945 -13.000 0.080 NA N NA
 1982559 1982560 CFF8240_0528 CFF8240_0529     TRUE 0.988 3.000 0.175 NA N NA
 1982560 1982561 CFF8240_0529 CFF8240_0530     TRUE 0.960 -3.000 0.023 1.000   NA
 1982561 1982562 CFF8240_0530 CFF8240_0531     FALSE 0.150 72.000 0.000 NA   NA
 1982562 1982563 CFF8240_0531 CFF8240_0532     TRUE 0.956 -3.000 0.025 NA N NA
 1982563 1982564 CFF8240_0532 CFF8240_0533     TRUE 0.955 -3.000 0.020 1.000   NA
 1982565 1982566 CFF8240_0534 CFF8240_0535 gltS   FALSE 0.114 92.000 0.000 1.000   NA
 1982566 1982567 CFF8240_0535 CFF8240_0536     TRUE 0.934 -24.000 0.085 1.000   NA
 1982567 1982568 CFF8240_0536 CFF8240_0537     TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1982568 1982569 CFF8240_0537 CFF8240_0538     TRUE 0.995 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 1982570 1982571 CFF8240_0539 CFF8240_0540     TRUE 0.844 4.000 0.000 1.000   NA
 1982571 1982572 CFF8240_0540 CFF8240_0541     TRUE 0.748 10.000 0.000 1.000   NA
 1982572 1982573 CFF8240_0541 CFF8240_0542     FALSE 0.253 49.000 0.000 1.000   NA
 1982573 1982574 CFF8240_0542 CFF8240_0543     TRUE 0.941 -13.000 0.068 1.000 N NA
 1982574 1982575 CFF8240_0543 CFF8240_0545     TRUE 0.909 11.000 0.033 NA   NA
 1982576 1982577 CFF8240_0544 CFF8240_0546     FALSE 0.019 441.000 0.000 NA   NA
 1982577 1982578 CFF8240_0546 CFF8240_0547     TRUE 0.994 -3.000 0.323 NA   NA
 1982578 1982579 CFF8240_0547 CFF8240_0548     TRUE 0.797 40.000 0.102 1.000   NA
 1982579 1982580 CFF8240_0548 CFF8240_0549   amt FALSE 0.169 67.000 0.000 1.000   NA
 1982580 1982581 CFF8240_0549 CFF8240_0550 amt   TRUE 0.706 10.000 0.000 1.000 N NA
 1982582 1982583 CFF8240_0551 CFF8240_0552 rpmH rnpA TRUE 0.988 21.000 0.787 1.000   NA
 1982583 1982584 CFF8240_0552 CFF8240_0553 rnpA   FALSE 0.171 335.000 0.105 1.000 N NA
 1982584 1982585 CFF8240_0553 CFF8240_0554     TRUE 0.952 -10.000 0.061 NA   NA
 1982585 1982586 CFF8240_0554 CFF8240_0555   trmE TRUE 0.970 -3.000 0.049 NA   NA
 1982586 1982587 CFF8240_0555 CFF8240_0556 trmE purL TRUE 0.701 19.000 0.008 1.000   NA
 1982587 1982588 CFF8240_0556 CFF8240_0557 purL   TRUE 0.957 0.000 0.011 1.000   NA
 1982588 1982589 CFF8240_0557 CFF8240_0558   purH TRUE 0.555 28.000 0.005 1.000   NA
 1982589 1982590 CFF8240_0558 CFF8240_0559 purH   FALSE 0.114 146.000 0.002 NA   NA
 1982590 1982591 CFF8240_0559 CFF8240_0560     TRUE 0.995 -7.000 0.500 NA   NA
 1982591 1982592 CFF8240_0560 CFF8240_0561     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 1982592 1982593 CFF8240_0561 CFF8240_0562     TRUE 0.646 90.000 0.167 NA   NA
 1982596 1982597 CFF8240_0564 CFF8240_0566     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1982597 1982598 CFF8240_0566 CFF8240_0567   mraW TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982599 1982600 CFF8240_0568 CFF8240_0569     FALSE 0.276 121.000 0.029 1.000   NA
 1982600 1982601 CFF8240_0569 CFF8240_0570   ftsA TRUE 0.986 6.000 0.184 1.000   NA
 1982601 1982602 CFF8240_0570 CFF8240_0571 ftsA ftsZ TRUE 0.972 14.000 0.114 1.000 Y NA
 1982604 1982605 CFF8240_0573 CFF8240_0574     TRUE 0.997 -3.000 0.529 NA   NA
 1982607 1982608 CFF8240_0576 CFF8240_0577 secA   TRUE 0.983 -7.000 0.201 NA N NA
 1982609 1982610 CFF8240_0578 CFF8240_0579     TRUE 0.606 -43.000 0.000 NA   NA
 1982610 1982611 CFF8240_0579 CFF8240_0580     TRUE 0.492 19.000 0.000 NA   NA
 1982611 1982612 CFF8240_0580 CFF8240_0581     TRUE 0.805 23.000 0.053 NA   NA
 1982612 1982613 CFF8240_0581 CFF8240_0582     TRUE 0.937 4.000 0.012 1.000   NA
 1982613 1982614 CFF8240_0582 CFF8240_0583     TRUE 0.942 10.000 0.048 1.000   NA
 1982614 1982615 CFF8240_0583 CFF8240_0584     TRUE 0.946 10.000 0.053 1.000   NA
 1982616 1982617 CFF8240_0585 CFF8240_0586   glmS TRUE 0.981 11.000 0.312 1.000 N NA
 1982617 1982618 CFF8240_0586 CFF8240_0587 glmS   FALSE 0.066 138.000 0.000 1.000   NA
 1982618 1982619 CFF8240_0587 CFF8240_0588     TRUE 0.999 0.000 0.844 1.000   NA
 1982619 1982620 CFF8240_0588 CFF8240_0589     TRUE 0.810 7.000 0.000 NA   NA
 1982621 1982622 CFF8240_0590 CFF8240_0591 murI   TRUE 0.809 4.000 0.000 NA N NA
 1982623 1982624 CFF8240_0592 CFF8240_0593 rrsE   FALSE 0.047 170.000 0.000 NA   NA
 1982624 1982625 CFF8240_0593 CFF8240_0594   rrlE FALSE 0.017 679.000 0.000 NA   NA
 1982625 1982626 CFF8240_0594 CFF8240_0595 rrlE rrfE FALSE 0.019 444.000 0.000 NA   NA
 1982626 1982627 CFF8240_0595 CFF8240_0596 rrfE   FALSE 0.022 359.000 0.000 NA   NA
 1982627 1982628 CFF8240_0596 CFF8240_0597     FALSE 0.028 256.000 0.000 NA   NA
 1982628 1982629 CFF8240_0597 CFF8240_0598     TRUE 0.553 15.000 0.000 NA   NA
 1982629 1982630 CFF8240_0598 CFF8240_0599     TRUE 0.636 12.000 0.000 NA   NA
 1982630 1982631 CFF8240_0599 CFF8240_0600     TRUE 0.636 12.000 0.000 NA   NA
 1982631 1982632 CFF8240_0600 CFF8240_0601     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 1982632 1982633 CFF8240_0601 CFF8240_0602     TRUE 0.605 13.000 0.000 NA   NA
 1982633 1982634 CFF8240_0602 CFF8240_0603     TRUE 0.636 12.000 0.000 NA   NA
 1982634 1982635 CFF8240_0603 CFF8240_0604     FALSE 0.302 38.000 0.000 NA   NA
 1982635 1982636 CFF8240_0604 CFF8240_0605     TRUE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1982636 1982637 CFF8240_0605 CFF8240_0606     FALSE 0.076 121.000 0.000 NA   NA
 1982637 1982638 CFF8240_0606 CFF8240_0607     FALSE 0.316 37.000 0.000 1.000   NA
 1982639 1982640 CFF8240_0608 CFF8240_0609     TRUE 0.528 17.000 0.000 NA   NA
 1982641 1982642 CFF8240_0610 CFF8240_0611 ileS   TRUE 0.439 100.000 0.008 1.000 Y NA
 1982642 1982643 CFF8240_0611 CFF8240_0612   guaB TRUE 0.952 5.000 0.032 1.000 N NA
 1982643 1982644 CFF8240_0612 CFF8240_0613 guaB metX TRUE 0.955 0.000 0.015 1.000 N NA
 1982644 1982645 CFF8240_0613 CFF8240_0614 metX   TRUE 0.920 -9.000 0.019 1.000   NA
 1982645 1982646 CFF8240_0614 CFF8240_0615     TRUE 0.949 -7.000 0.032 1.000   NA
 1982646 1982647 CFF8240_0615 CFF8240_0616   murC TRUE 0.940 2.000 0.004 1.000   NA
 1982647 1982648 CFF8240_0616 CFF8240_0617 murC   TRUE 0.945 -3.000 0.014 NA   NA
 1982648 1982649 CFF8240_0617 CFF8240_0619     TRUE 0.840 4.000 0.000 NA   NA
 1982650 1982651 CFF8240_0618 CFF8240_0620     TRUE 0.945 32.000 0.167 1.000 Y NA
 1982651 1982652 CFF8240_0620 CFF8240_0621     TRUE 0.999 2.000 0.652 0.034 Y NA
 1982652 1982653 CFF8240_0621 CFF8240_0622     TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1982653 1982654 CFF8240_0622 CFF8240_0623     TRUE 0.945 18.000 0.226 1.000 N NA
 1982655 1982656 CFF8240_0624 CFF8240_0625     TRUE 0.444 67.000 0.029 1.000 N NA
 1982656 1982657 CFF8240_0625 CFF8240_0626     TRUE 0.976 10.000 0.182 1.000 N NA
 1982657 1982658 CFF8240_0626 CFF8240_0627   dapE TRUE 0.982 3.000 0.018 1.000 Y NA
 1982658 1982659 CFF8240_0627 CFF8240_0628 dapE   FALSE 0.132 82.000 0.000 1.000   NA
 1982659 1982660 CFF8240_0628 CFF8240_0629     TRUE 0.846 -16.000 0.009 1.000   NA
 1982660 1982661 CFF8240_0629 CFF8240_0630   pyk FALSE 0.205 59.000 0.000 1.000   NA
 1982661 1982662 CFF8240_0630 CFF8240_0631 pyk   TRUE 0.544 16.000 0.000 1.000   NA
 1982662 1982663 CFF8240_0631 CFF8240_0632     TRUE 0.961 -10.000 0.084 1.000   NA
 1982663 1982664 CFF8240_0632 CFF8240_0633     FALSE 0.023 259.000 0.000 1.000 N NA
 1982666 1982667 CFF8240_0635 CFF8240_0636     TRUE 0.927 10.000 0.028 NA   NA
 1982667 1982668 CFF8240_0636 CFF8240_0637     TRUE 0.949 -3.000 0.016 NA   NA
 1982668 1982669 CFF8240_0637 CFF8240_0638     TRUE 0.967 -6.000 0.064 NA   NA
 1982669 1982670 CFF8240_0638 CFF8240_0639     TRUE 0.639 111.000 0.228 NA   NA
 1982670 1982671 CFF8240_0639 CFF8240_0640   trpC TRUE 0.970 -3.000 0.044 1.000   NA
 1982671 1982672 CFF8240_0640 CFF8240_0641 trpC   TRUE 0.968 0.000 0.026 1.000 N NA
 1982672 1982673 CFF8240_0641 CFF8240_0642     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982673 1982674 CFF8240_0642 CFF8240_0643     FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 1982674 1982675 CFF8240_0643 CFF8240_0644     FALSE 0.016 1783.000 0.000 NA   NA
 1982675 1982676 CFF8240_0644 CFF8240_0645     TRUE 0.608 -42.000 0.000 NA   NA
 1982676 1982677 CFF8240_0645 CFF8240_0646     FALSE 0.284 41.000 0.000 NA   NA
 1982677 1982678 CFF8240_0646 CFF8240_0647     TRUE 0.656 -19.000 0.000 NA   NA
 1982679 1982680 CFF8240_0648 CFF8240_0649     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982680 1982681 CFF8240_0649 CFF8240_0650     FALSE 0.098 104.000 0.000 NA   NA
 1982682 1982683 CFF8240_0651 CFF8240_0652     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1982683 1982684 CFF8240_0652 CFF8240_0653     TRUE 0.753 -10.000 0.000 NA   NA
 1982684 1982685 CFF8240_0653 CFF8240_0654     FALSE 0.034 220.000 0.000 NA   NA
 1982685 1982686 CFF8240_0654 CFF8240_0655     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1982686 1982687 CFF8240_0655 CFF8240_0656     TRUE 0.753 -10.000 0.000 NA   NA
 1982687 1982688 CFF8240_0656 CFF8240_0658     FALSE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 1982690 1982691 CFF8240_0659 CFF8240_0660 cas   FALSE 0.384 268.000 0.273 NA   NA
 1982691 1982692 CFF8240_0660 CFF8240_0661     TRUE 0.995 -16.000 0.778 NA   NA
 1982692 1982693 CFF8240_0661 CFF8240_0662   cas5h TRUE 0.993 -3.000 0.295 NA   NA
 1982693 1982694 CFF8240_0662 CFF8240_0663 cas5h cas TRUE 0.793 153.000 0.629 NA   NA
 1982694 1982695 CFF8240_0663 CFF8240_0664 cas   TRUE 0.990 -3.000 0.194 NA   NA
 1982695 1982696 CFF8240_0664 CFF8240_0665   cas TRUE 0.961 42.000 0.324 NA Y NA
 1982696 1982697 CFF8240_0665 CFF8240_0666 cas cas TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA Y NA
 1982697 1982698 CFF8240_0666 CFF8240_0667 cas   FALSE 0.018 550.000 0.000 NA   NA
 1982698 1982699 CFF8240_0667 CFF8240_0668     FALSE 0.018 580.000 0.000 NA   NA
 1982699 1982700 CFF8240_0668 CFF8240_0669     FALSE 0.017 833.000 0.000 NA   NA
 1982702 1982703 CFF8240_0671 CFF8240_0672     TRUE 0.632 -24.000 0.000 NA   NA
 1982703 1982704 CFF8240_0672 CFF8240_0673     FALSE 0.284 41.000 0.000 NA   NA
 1982705 1982706 CFF8240_0674 CFF8240_0675     FALSE 0.055 151.000 0.000 NA   NA
 1982707 1982708 CFF8240_0676 CFF8240_0677     TRUE 0.981 7.000 0.133 NA   NA
 1982708 1982709 CFF8240_0677 CFF8240_0678     TRUE 0.718 -13.000 0.000 NA   NA
 1982709 1982710 CFF8240_0678 CFF8240_0679     TRUE 0.509 57.000 0.022 1.000   NA
 1982710 1982711 CFF8240_0679 CFF8240_0680   pdxJ FALSE 0.270 45.000 0.000 1.000   NA
 1982711 1982712 CFF8240_0680 CFF8240_0681 pdxJ pdxA TRUE 0.993 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 1982712 1982713 CFF8240_0681 CFF8240_0682 pdxA   FALSE 0.348 66.000 0.014 1.000 N NA
 1982713 1982714 CFF8240_0682 CFF8240_0683     FALSE 0.128 72.000 0.000 1.000 N NA
 1982714 1982715 CFF8240_0683 CFF8240_0684     TRUE 0.726 62.000 0.145 1.000 N NA
 1982715 1982716 CFF8240_0684 CFF8240_0685     FALSE 0.165 67.000 0.000 NA   NA
 1982716 1982717 CFF8240_0685 CFF8240_0686     TRUE 0.995 -7.000 0.514 NA   NA
 1982717 1982718 CFF8240_0686 CFF8240_0687     TRUE 0.972 1.000 0.030 NA   NA
 1982718 1982719 CFF8240_0687 CFF8240_0688   hemA TRUE 0.992 0.000 0.051 1.000 Y NA
 1982719 1982720 CFF8240_0688 CFF8240_0689 hemA proS TRUE 0.975 -3.000 0.040 0.046 N NA
 1982720 1982721 CFF8240_0689 CFF8240_0690 proS   TRUE 0.958 -3.000 0.022 1.000   NA
 1982721 1982722 CFF8240_0690 CFF8240_0691   hemC TRUE 0.815 13.000 0.013 1.000   NA
 1982723 1982724 CFF8240_0692 CFF8240_0693     TRUE 0.932 10.000 0.031 1.000   NA
 1982724 1982725 CFF8240_0693 CFF8240_0694     TRUE 0.996 2.000 0.404 NA   NA
 1982726 1982727 CFF8240_0695 CFF8240_0696     FALSE 0.019 448.000 0.000 NA   NA
 1982727 1982728 CFF8240_0696 CFF8240_0697   mgtE TRUE 0.951 9.000 0.042 1.000   NA
 1982728 1982729 CFF8240_0697 CFF8240_0698 mgtE   TRUE 0.923 -15.000 0.036 1.000   NA
 1982731 1982732 CFF8240_0700 CFF8240_0701 groS groL TRUE 0.991 18.000 0.356 0.008 Y NA
 1982732 1982733 CFF8240_0701 CFF8240_0703 groL hemH FALSE 0.043 158.000 0.000 1.000 N NA
 1982734 1982735 CFF8240_0702 CFF8240_0704   fliE TRUE 0.995 0.000 0.303 1.000 N NA
 1982735 1982736 CFF8240_0704 CFF8240_0705 fliE flgC TRUE 0.998 4.000 0.271 0.006 Y NA
 1982736 1982737 CFF8240_0705 CFF8240_0706 flgC flgB TRUE 0.999 10.000 0.804 0.006 Y NA
 1982737 1982738 CFF8240_0706 CFF8240_0707 flgB aat TRUE 0.417 46.000 0.006 1.000 N NA
 1982738 1982739 CFF8240_0707 CFF8240_0708 aat   TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982739 1982740 CFF8240_0708 CFF8240_0709     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982740 1982741 CFF8240_0709 CFF8240_0710   clpS TRUE 0.998 0.000 0.596 NA   NA
 1982741 1982742 CFF8240_0710 CFF8240_0711 clpS   TRUE 0.925 -10.000 0.024 NA   NA
 1982742 1982743 CFF8240_0711 CFF8240_0712   smpB TRUE 0.728 18.000 0.009 1.000   NA
 1982743 1982744 CFF8240_0712 CFF8240_0713 smpB   FALSE 0.126 213.000 0.028 1.000 N NA
 1982744 1982745 CFF8240_0713 CFF8240_0714   csrA TRUE 0.963 -3.000 0.036 1.000 N NA
 1982745 1982746 CFF8240_0714 CFF8240_0715 csrA truB TRUE 0.943 -16.000 0.046 0.021 N NA
 1982746 1982747 CFF8240_0715 CFF8240_0716 truB   TRUE 0.966 -3.000 0.046 1.000 N NA
 1982749 1982750 CFF8240_0717 CFF8240_0719     TRUE 0.969 10.000 0.115 NA   NA
 1982750 1982751 CFF8240_0719 CFF8240_0720     TRUE 0.569 90.000 0.023 1.000 Y NA
 1982752 1982753 CFF8240_0721 CFF8240_0722 metK   FALSE 0.022 272.000 0.000 1.000 N NA
 1982753 1982754 CFF8240_0722 CFF8240_0723     TRUE 0.999 -13.000 0.894 1.000 Y NA
 1982754 1982755 CFF8240_0723 CFF8240_0724     TRUE 0.999 -25.000 0.857 0.096 Y NA
 1982755 1982756 CFF8240_0724 CFF8240_0726     TRUE 0.920 -19.000 0.000 0.006 Y NA
 1982758 1982759 CFF8240_0727 CFF8240_0728 yajC secD TRUE 0.985 -7.000 0.068 NA Y NA
 1982759 1982760 CFF8240_0728 CFF8240_0729 secD secF TRUE 0.999 0.000 0.436 0.001 Y NA
 1982760 1982761 CFF8240_0729 CFF8240_0730 secF   TRUE 0.995 10.000 0.667 NA   NA
 1982761 1982762 CFF8240_0730 CFF8240_0731   leuS TRUE 0.930 9.000 0.021 NA   NA
 1982762 1982763 CFF8240_0731 CFF8240_0732 leuS   TRUE 0.970 2.000 0.031 NA   NA
 1982763 1982764 CFF8240_0732 CFF8240_0733     TRUE 0.988 -19.000 0.455 NA   NA
 1982764 1982765 CFF8240_0733 CFF8240_0734   folC TRUE 0.986 0.000 0.104 1.000 N NA
 1982765 1982766 CFF8240_0734 CFF8240_0735 folC   TRUE 0.758 -10.000 0.000 1.000   NA
 1982766 1982767 CFF8240_0735 CFF8240_0736     TRUE 0.605 -51.000 0.000 NA   NA
 1982767 1982768 CFF8240_0736 CFF8240_0737   mfd TRUE 0.868 -19.000 0.023 NA N NA
 1982768 1982769 CFF8240_0737 CFF8240_0738 mfd   TRUE 0.927 -3.000 0.003 NA   NA
 1982769 1982770 CFF8240_0738 CFF8240_0739     TRUE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1982770 1982771 CFF8240_0739 CFF8240_0740     TRUE 0.911 -10.000 0.018 NA   NA
 1982771 1982772 CFF8240_0740 CFF8240_0741     FALSE 0.224 56.000 0.000 NA   NA
 1982772 1982773 CFF8240_0741 CFF8240_0742     FALSE 0.155 70.000 0.000 NA   NA
 1982773 1982774 CFF8240_0742 CFF8240_0743   ilvA TRUE 0.910 -16.000 0.030 NA   NA
 1982774 1982775 CFF8240_0743 CFF8240_0744 ilvA   FALSE 0.030 252.000 0.000 1.000   NA
 1982775 1982776 CFF8240_0744 CFF8240_0745     TRUE 0.993 1.000 0.231 NA   NA
 1982777 1982778 CFF8240_0746 CFF8240_0747   truA TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982778 1982779 CFF8240_0747 CFF8240_0748 truA   TRUE 0.974 -3.000 0.059 1.000   NA
 1982779 1982780 CFF8240_0748 CFF8240_0749   pilD TRUE 0.976 0.000 0.039 1.000   NA
 1982780 1982781 CFF8240_0749 CFF8240_0750 pilD uppS TRUE 0.958 0.000 0.017 1.000 N NA
 1982781 1982782 CFF8240_0750 CFF8240_0751 uppS   TRUE 0.944 3.000 0.012 NA   NA
 1982782 1982783 CFF8240_0751 CFF8240_0752   coaBC TRUE 0.960 -3.000 0.024 NA   NA
 1982783 1982784 CFF8240_0752 CFF8240_0753 coaBC   TRUE 0.895 -10.000 0.016 1.000 N NA
 1982786 1982787 CFF8240_0754 CFF8240_0756     TRUE 0.406 24.000 0.000 1.000   NA
 1982787 1982788 CFF8240_0756 CFF8240_0757   nadA FALSE 0.040 199.000 0.000 1.000   NA
 1982789 1982790 CFF8240_0758 CFF8240_0759     TRUE 0.994 -3.000 0.258 0.089 N NA
 1982790 1982791 CFF8240_0759 CFF8240_0760     TRUE 0.987 3.000 0.152 1.000 N NA
 1982791 1982792 CFF8240_0760 CFF8240_0761     TRUE 0.884 1.000 0.000 NA   NA
 1982793 1982794 CFF8240_0762 CFF8240_0763     TRUE 0.999 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 1982794 1982795 CFF8240_0763 CFF8240_0764     TRUE 0.758 87.000 0.294 1.000 N NA
 1982796 1982797 CFF8240_0765 CFF8240_0766     TRUE 0.974 12.000 0.282 1.000 N NA
 1982797 1982798 CFF8240_0766 CFF8240_0767     TRUE 0.961 6.000 0.056 1.000 N NA
 1982798 1982799 CFF8240_0767 CFF8240_0768     TRUE 0.907 13.000 0.000 0.002 Y NA
 1982799 1982800 CFF8240_0768 CFF8240_0769     FALSE 0.198 60.000 0.000 NA   NA
 1982800 1982801 CFF8240_0769 CFF8240_0770     FALSE 0.146 73.000 0.000 NA   NA
 1982801 1982802 CFF8240_0770 CFF8240_0771   atpB TRUE 0.459 54.000 0.011 1.000   NA
 1982802 1982803 CFF8240_0771 CFF8240_0772 atpB   TRUE 0.922 5.000 0.009 NA   NA
 1982803 1982804 CFF8240_0772 CFF8240_0773     TRUE 0.624 -28.000 0.000 NA   NA
 1982804 1982805 CFF8240_0773 CFF8240_0774   gatB FALSE 0.319 58.000 0.002 1.000 N NA
 1982805 1982806 CFF8240_0774 CFF8240_0775 gatB   TRUE 0.802 12.000 0.011 1.000 N NA
 1982806 1982807 CFF8240_0775 CFF8240_0777     TRUE 0.960 -3.000 0.011 0.008 N NA
 1982808 1982809 CFF8240_0776 CFF8240_0778   rarD TRUE 0.799 -7.000 0.000 1.000   NA
 1982809 1982810 CFF8240_0778 CFF8240_0779 rarD   TRUE 0.642 12.000 0.000 1.000   NA
 1982810 1982811 CFF8240_0779 CFF8240_0780     TRUE 0.928 9.000 0.000 1.000 Y NA
 1982811 1982812 CFF8240_0780 CFF8240_0781     TRUE 0.993 23.000 0.594 0.028 Y NA
 1982812 1982813 CFF8240_0781 CFF8240_0782   pgsA FALSE 0.058 129.000 0.000 1.000 N NA
 1982813 1982814 CFF8240_0782 CFF8240_0783 pgsA   TRUE 0.981 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 1982814 1982815 CFF8240_0783 CFF8240_0784   dapA TRUE 0.993 0.000 0.238 1.000 N NA
 1982815 1982816 CFF8240_0784 CFF8240_0785 dapA   TRUE 0.990 -3.000 0.217 1.000   NA
 1982816 1982817 CFF8240_0785 CFF8240_0786   pyrD TRUE 0.977 1.000 0.048 1.000   NA
 1982817 1982818 CFF8240_0786 CFF8240_0787 pyrD   TRUE 0.478 52.000 0.017 1.000 N NA
 1982818 1982819 CFF8240_0787 CFF8240_0788   cysS TRUE 0.955 -3.000 0.013 0.096 N NA
 1982819 1982820 CFF8240_0788 CFF8240_0789 cysS mviN TRUE 0.907 -16.000 0.027 1.000   NA
 1982820 1982821 CFF8240_0789 CFF8240_0790 mviN   FALSE 0.075 122.000 0.000 NA   NA
 1982822 1982823 CFF8240_0791 CFF8240_0792     FALSE 0.037 207.000 0.000 NA   NA
 1982823 1982824 CFF8240_0792 CFF8240_0793   mobB FALSE 0.017 715.000 0.000 NA   NA
 1982824 1982825 CFF8240_0793 CFF8240_0794 mobB fbp TRUE 0.808 -16.000 0.005 1.000 N NA
 1982825 1982826 CFF8240_0794 CFF8240_0795 fbp   FALSE 0.034 221.000 0.000 NA   NA
 1982826 1982827 CFF8240_0795 CFF8240_0796   metG TRUE 0.492 19.000 0.000 NA   NA
 1982827 1982828 CFF8240_0796 CFF8240_0797 metG   TRUE 0.978 0.000 0.046 1.000   NA
 1982828 1982829 CFF8240_0797 CFF8240_0798     TRUE 0.544 16.000 0.000 1.000   NA
 1982829 1982830 CFF8240_0798 CFF8240_0799     FALSE 0.056 129.000 0.000 NA N NA
 1982830 1982831 CFF8240_0799 CFF8240_0800     TRUE 0.636 12.000 0.000 NA   NA
 1982833 1982834 CFF8240_0802 CFF8240_0804     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982835 1982836 CFF8240_0803 CFF8240_0805 cheR   TRUE 0.987 -7.000 0.231 1.000   NA
 1982837 1982838 CFF8240_0806 CFF8240_0807   ruvA TRUE 0.976 3.000 0.007 NA Y NA
 1982838 1982839 CFF8240_0807 CFF8240_0808 ruvA   TRUE 0.931 9.000 0.014 0.095 N NA
 1982839 1982840 CFF8240_0808 CFF8240_0809     FALSE 0.382 69.000 0.018 NA   NA
 1982840 1982841 CFF8240_0809 CFF8240_0810     TRUE 0.946 -10.000 0.052 NA   NA
 1982841 1982842 CFF8240_0810 CFF8240_0811     TRUE 0.978 -7.000 0.129 NA   NA
 1982843 1982844 CFF8240_0812 CFF8240_0813 ackA   TRUE 0.993 1.000 0.080 1.000 Y NA
 1982845 1982846 CFF8240_0814 CFF8240_0815 flgH   FALSE 0.044 185.000 0.000 1.000   NA
 1982846 1982847 CFF8240_0815 CFF8240_0816   ilvB FALSE 0.044 185.000 0.000 1.000   NA
 1982847 1982848 CFF8240_0816 CFF8240_0817 ilvB ilvN TRUE 0.998 4.000 0.249 0.001 Y NA
 1982848 1982849 CFF8240_0817 CFF8240_0818 ilvN lpxD TRUE 0.977 0.000 0.052 1.000 N NA
 1982849 1982850 CFF8240_0818 CFF8240_0820 lpxD   TRUE 0.962 -3.000 0.026 NA   NA
 1982852 1982853 CFF8240_0821 CFF8240_0822 nadC purU FALSE 0.032 201.000 0.000 1.000 N NA
 1982853 1982854 CFF8240_0822 CFF8240_0823 purU   TRUE 0.966 1.000 0.025 1.000 N NA
 1982854 1982855 CFF8240_0823 CFF8240_0824     TRUE 0.873 -12.000 0.009 NA   NA
 1982855 1982856 CFF8240_0824 CFF8240_0825     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1982856 1982857 CFF8240_0825 CFF8240_0826   glyS FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 1982857 1982858 CFF8240_0826 CFF8240_0827 glyS   TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1982859 1982860 CFF8240_0828 CFF8240_0829     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982860 1982861 CFF8240_0829 CFF8240_0830     FALSE 0.104 98.000 0.000 NA   NA
 1982861 1982862 CFF8240_0830 CFF8240_0831     TRUE 0.444 69.000 0.033 1.000 N NA
 1982862 1982863 CFF8240_0831 CFF8240_0832     TRUE 0.975 -13.000 0.176 1.000   NA
 1982863 1982864 CFF8240_0832 CFF8240_0833     TRUE 0.992 -3.000 0.250 1.000   NA
 1982864 1982865 CFF8240_0833 CFF8240_0834     TRUE 0.986 33.000 1.000 NA   NA
 1982865 1982866 CFF8240_0834 CFF8240_0835     TRUE 0.997 -7.000 0.800 NA   NA
 1982866 1982867 CFF8240_0835 CFF8240_0836     TRUE 0.984 -10.000 0.250 NA   NA
 1982868 1982869 CFF8240_0837 CFF8240_0838     FALSE 0.161 68.000 0.000 NA   NA
 1982869 1982870 CFF8240_0838 CFF8240_0839     FALSE 0.177 64.000 0.000 NA   NA
 1982870 1982871 CFF8240_0839 CFF8240_0840     TRUE 0.884 1.000 0.000 NA   NA
 1982871 1982872 CFF8240_0840 CFF8240_0841     TRUE 0.998 -10.000 0.600 1.000 Y NA
 1982872 1982873 CFF8240_0841 CFF8240_0842   argG FALSE 0.077 150.000 0.000 0.095 N NA
 1982873 1982874 CFF8240_0842 CFF8240_0843 argG   FALSE 0.149 65.000 0.000 1.000 N NA
 1982874 1982875 CFF8240_0843 CFF8240_0844     FALSE 0.171 152.000 0.024 1.000 N NA
 1982875 1982876 CFF8240_0844 CFF8240_0845   murG TRUE 0.989 -3.000 0.200 1.000 N NA
 1982876 1982877 CFF8240_0845 CFF8240_0846 murG   FALSE 0.040 167.000 0.000 1.000 N NA
 1982877 1982878 CFF8240_0846 CFF8240_0847   exbB FALSE 0.025 243.000 0.000 1.000 N NA
 1982878 1982879 CFF8240_0847 CFF8240_0848 exbB expD TRUE 1.000 3.000 0.815 0.039 Y NA
 1982879 1982880 CFF8240_0848 CFF8240_0849 expD   TRUE 0.972 -7.000 0.074 0.088 N NA
 1982880 1982881 CFF8240_0849 CFF8240_0850     FALSE 0.265 38.000 0.000 1.000 N NA
 1982881 1982882 CFF8240_0850 CFF8240_0851     TRUE 0.855 -16.000 0.011 NA   NA
 1982882 1982883 CFF8240_0851 CFF8240_0852     TRUE 0.951 -7.000 0.039 NA   NA
 1982883 1982884 CFF8240_0852 CFF8240_0853   rpoN TRUE 0.977 0.000 0.044 1.000   NA
 1982884 1982885 CFF8240_0853 CFF8240_0854 rpoN aroB FALSE 0.103 87.000 0.000 1.000 N NA
 1982885 1982886 CFF8240_0854 CFF8240_0855 aroB   TRUE 0.965 -3.000 0.041 1.000 N NA
 1982886 1982887 CFF8240_0855 CFF8240_0856     TRUE 0.972 -3.000 0.063 1.000 N NA
 1982887 1982888 CFF8240_0856 CFF8240_0857     TRUE 0.916 -22.000 0.067 1.000 N NA
 1982888 1982889 CFF8240_0857 CFF8240_0858     TRUE 0.895 -10.000 0.017 1.000 N NA
 1982890 1982891 CFF8240_0859 CFF8240_0860   rseP TRUE 0.925 -3.000 0.002 NA   NA
 1982892 1982893 CFF8240_0861 CFF8240_0863 rpe   TRUE 0.970 13.000 0.279 1.000 N NA
 1982894 1982895 CFF8240_0862 CFF8240_0864 priA   TRUE 0.948 8.000 0.016 0.095   NA
 1982895 1982896 CFF8240_0864 CFF8240_0865     TRUE 0.565 27.000 0.000 0.003   NA
 1982896 1982897 CFF8240_0865 CFF8240_0866     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1982897 1982898 CFF8240_0866 CFF8240_0867     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 1982898 1982899 CFF8240_0867 CFF8240_0868     FALSE 0.042 189.000 0.000 NA   NA
 1982899 1982900 CFF8240_0868 CFF8240_0869     FALSE 0.121 87.000 0.000 NA   NA
 1982900 1982901 CFF8240_0869 CFF8240_0870     TRUE 0.998 -3.000 0.714 NA   NA
 1982902 1982903 CFF8240_0871 CFF8240_0872 uvrB   FALSE 0.021 362.000 0.000 NA   NA
 1982903 1982904 CFF8240_0872 CFF8240_0873     TRUE 0.822 27.000 0.083 NA   NA
 1982904 1982905 CFF8240_0873 CFF8240_0874     FALSE 0.032 324.000 0.000 0.088 N NA
 1982905 1982906 CFF8240_0874 CFF8240_0875   ppk FALSE 0.072 113.000 0.000 1.000 N NA
 1982906 1982907 CFF8240_0875 CFF8240_0876 ppk   FALSE 0.017 697.000 0.000 NA   NA
 1982907 1982908 CFF8240_0876 CFF8240_0877   metE FALSE 0.134 79.000 0.000 NA   NA
 1982908 1982909 CFF8240_0877 CFF8240_0878 metE   TRUE 0.400 58.000 0.009 1.000   NA
 1982909 1982910 CFF8240_0878 CFF8240_0879     FALSE 0.017 768.000 0.000 NA   NA
 1982910 1982911 CFF8240_0879 CFF8240_0880     FALSE 0.021 360.000 0.000 NA   NA
 1982912 1982913 CFF8240_0881 CFF8240_0882     TRUE 0.963 -3.000 0.027 NA   NA
 1982913 1982914 CFF8240_0882 CFF8240_0883     TRUE 0.964 -3.000 0.027 1.000   NA
 1982915 1982916 CFF8240_0884 CFF8240_0885     TRUE 0.999 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 1982916 1982917 CFF8240_0885 CFF8240_0886     TRUE 0.991 -7.000 0.209 0.002   NA
 1982919 1982920 CFF8240_0888 CFF8240_0889 murA   TRUE 0.863 12.000 0.024 1.000 N NA
 1982920 1982921 CFF8240_0889 CFF8240_0891     TRUE 0.814 4.000 0.000 1.000 N NA
 1982921 1982922 CFF8240_0891 CFF8240_0892   coaD TRUE 0.814 4.000 0.000 1.000 N NA
 1982922 1982923 CFF8240_0892 CFF8240_0893 coaD tmk TRUE 0.950 -6.000 0.034 1.000 N NA
 1982923 1982924 CFF8240_0893 CFF8240_0894 tmk hisS TRUE 0.962 -3.000 0.018 0.094 N NA
 1982924 1982925 CFF8240_0894 CFF8240_0895 hisS speA TRUE 0.950 -3.000 0.021 1.000 N NA
 1982925 1982926 CFF8240_0895 CFF8240_0896 speA cysE TRUE 0.988 4.000 0.055 1.000 Y NA
 1982926 1982927 CFF8240_0896 CFF8240_0897 cysE   TRUE 0.991 6.000 0.102 1.000 Y NA
 1982927 1982928 CFF8240_0897 CFF8240_0898     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA N NA
 1982928 1982929 CFF8240_0898 CFF8240_0899     FALSE 0.083 115.000 0.000 NA   NA
 1982930 1982931 CFF8240_0900 CFF8240_0901     FALSE 0.056 150.000 0.000 NA   NA
 1982932 1982933 CFF8240_0902 CFF8240_0903     TRUE 0.996 -3.000 0.426 NA   NA
 1982933 1982934 CFF8240_0903 CFF8240_0904     FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 1982934 1982935 CFF8240_0904 CFF8240_0905     FALSE 0.106 97.000 0.000 NA   NA
 1982936 1982937 CFF8240_0906 CFF8240_0907     TRUE 0.998 -3.000 0.324 0.002 Y NA
 1982937 1982938 CFF8240_0907 CFF8240_0908     TRUE 1.000 2.000 0.771 0.002 Y NA
 1982938 1982939 CFF8240_0908 CFF8240_0909     TRUE 0.995 12.000 0.316 0.002 Y NA
 1982939 1982940 CFF8240_0909 CFF8240_0910   sucD TRUE 0.972 13.000 0.097 1.000 Y NA
 1982940 1982941 CFF8240_0910 CFF8240_0911 sucD   TRUE 0.994 10.000 0.169 0.001 Y NA
 1982941 1982942 CFF8240_0911 CFF8240_0912     TRUE 0.547 95.000 0.022 1.000 Y NA
 1982942 1982943 CFF8240_0912 CFF8240_0913     TRUE 0.987 2.000 0.025 1.000 Y NA
 1982943 1982944 CFF8240_0913 CFF8240_0914     FALSE 0.036 187.000 0.000 1.000 N NA
 1982944 1982945 CFF8240_0914 CFF8240_0915     FALSE 0.300 39.000 0.000 1.000   NA
 1982945 1982946 CFF8240_0915 CFF8240_0916     TRUE 0.970 -7.000 0.091 NA   NA
 1982946 1982947 CFF8240_0916 CFF8240_0917     FALSE 0.047 171.000 0.000 NA   NA
 1982947 1982948 CFF8240_0917 CFF8240_0918   hcp FALSE 0.230 120.000 0.000 1.000 Y NA
 1982949 1982950 CFF8240_0919 CFF8240_0920     TRUE 0.556 33.000 0.010 NA   NA
 1982950 1982951 CFF8240_0920 CFF8240_0922   cysK TRUE 0.997 11.000 1.000 NA   NA
 1982952 1982953 CFF8240_0921 CFF8240_0923 acpS fliL TRUE 0.967 -3.000 0.047 1.000 N NA
 1982953 1982954 CFF8240_0923 CFF8240_0924 fliL   FALSE 0.118 76.000 0.000 1.000 N NA
 1982954 1982955 CFF8240_0924 CFF8240_0925     TRUE 0.864 1.000 0.000 1.000 N NA
 1982955 1982956 CFF8240_0925 CFF8240_0926     TRUE 0.968 3.000 0.037 NA   NA
 1982956 1982957 CFF8240_0926 CFF8240_0927     FALSE 0.103 99.000 0.000 NA   NA
 1982959 1982960 CFF8240_0929 CFF8240_0930   hypE TRUE 0.912 14.000 0.080 1.000   NA
 1982960 1982961 CFF8240_0930 CFF8240_0931 hypE hypD TRUE 0.952 -16.000 0.019 1.000 Y NA
 1982961 1982962 CFF8240_0931 CFF8240_0932 hypD hypC TRUE 0.995 0.000 0.123 NA Y NA
 1982962 1982963 CFF8240_0932 CFF8240_0933 hypC hypB TRUE 0.999 0.000 0.463 NA Y NA
 1982963 1982964 CFF8240_0933 CFF8240_0934 hypB   TRUE 0.847 24.000 0.015 1.000 Y NA
 1982964 1982965 CFF8240_0934 CFF8240_0935   hypF TRUE 0.783 14.000 0.015 1.000 N NA
 1982965 1982966 CFF8240_0935 CFF8240_0936 hypF   TRUE 0.893 -13.000 0.018 NA   NA
 1982966 1982967 CFF8240_0936 CFF8240_0937     TRUE 0.971 -3.000 0.049 NA   NA
 1982967 1982968 CFF8240_0937 CFF8240_0938   cybH TRUE 0.996 5.000 0.277 1.000 Y NA
 1982968 1982969 CFF8240_0938 CFF8240_0939 cybH   TRUE 0.994 11.000 0.270 0.041 Y NA
 1982969 1982970 CFF8240_0939 CFF8240_0940     TRUE 1.000 4.000 0.951 0.001 Y NA
 1982970 1982971 CFF8240_0940 CFF8240_0941     FALSE 0.036 178.000 0.000 NA N NA
 1982971 1982972 CFF8240_0941 CFF8240_0942     TRUE 1.000 0.000 0.915 NA Y NA
 1982972 1982973 CFF8240_0942 CFF8240_0943     FALSE 0.042 157.000 0.000 NA N NA
 1982974 1982975 CFF8240_0944 CFF8240_0945   purC TRUE 0.911 11.000 0.045 1.000 N NA
 1982975 1982976 CFF8240_0945 CFF8240_0946 purC purS TRUE 0.883 129.000 0.460 1.000 Y NA
 1982976 1982977 CFF8240_0946 CFF8240_0947 purS purQ TRUE 0.999 3.000 0.656 0.002 Y NA
 1982977 1982978 CFF8240_0947 CFF8240_0948 purQ   TRUE 0.485 69.000 0.038 NA   NA
 1982978 1982979 CFF8240_0948 CFF8240_0949     TRUE 0.996 -16.000 0.846 NA   NA
 1982979 1982980 CFF8240_0949 CFF8240_0950   crcB TRUE 0.974 -3.000 0.038 0.087 N NA
 1982981 1982982 CFF8240_0951 CFF8240_0952     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 1982982 1982983 CFF8240_0952 CFF8240_0953     FALSE 0.161 68.000 0.000 NA   NA
 1982983 1982984 CFF8240_0953 CFF8240_0954     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 1982984 1982985 CFF8240_0954 CFF8240_0955     FALSE 0.052 287.000 0.000 0.005   NA
 1982985 1982986 CFF8240_0955 CFF8240_0956     TRUE 0.996 10.000 0.500 0.005   NA
 1982986 1982987 CFF8240_0956 CFF8240_0957     TRUE 0.996 9.000 0.421 0.005   NA
 1982991 1982992 CFF8240_0961 CFF8240_0962     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 1982993 1982994 CFF8240_0963 CFF8240_0964     FALSE 0.028 257.000 0.000 NA   NA
 1982996 1982997 CFF8240_0966 CFF8240_0967 valS   TRUE 0.948 -3.000 0.007 0.093 N NA
 1982997 1982998 CFF8240_0967 CFF8240_0968     TRUE 0.999 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 1983000 1983001 CFF8240_0970 CFF8240_0971   rpmB FALSE 0.087 97.000 0.000 NA N NA
 1983001 1983002 CFF8240_0971 CFF8240_0972 rpmB   TRUE 0.771 20.000 0.025 1.000 N NA
 1983002 1983003 CFF8240_0972 CFF8240_0973   argJ TRUE 0.921 -7.000 0.019 1.000 N NA
 1983003 1983004 CFF8240_0973 CFF8240_0974 argJ   TRUE 0.406 62.000 0.015 NA   NA
 1983004 1983005 CFF8240_0974 CFF8240_0975     FALSE 0.233 198.000 0.077 NA   NA
 1983006 1983007 CFF8240_0976 CFF8240_0977 trmA   TRUE 0.863 3.000 0.000 1.000   NA
 1983007 1983008 CFF8240_0977 CFF8240_0978     TRUE 0.942 -3.000 0.012 NA   NA
 1983008 1983009 CFF8240_0978 CFF8240_0979     TRUE 0.860 3.000 0.000 NA   NA
 1983010 1983011 CFF8240_0980 CFF8240_0981 tgt   TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000   NA
 1983012 1983013 CFF8240_0982 CFF8240_0983 dnaB ispG TRUE 0.900 -7.000 0.011 1.000 N NA
 1983013 1983014 CFF8240_0983 CFF8240_0984 ispG   FALSE 0.069 132.000 0.000 1.000   NA
 1983014 1983015 CFF8240_0984 CFF8240_0985     TRUE 0.992 -7.000 0.375 1.000   NA
 1983015 1983016 CFF8240_0985 CFF8240_0986     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983016 1983017 CFF8240_0986 CFF8240_0987     TRUE 0.992 0.000 0.182 NA   NA
 1983017 1983018 CFF8240_0987 CFF8240_0988     FALSE 0.353 28.000 0.000 NA   NA
 1983018 1983019 CFF8240_0988 CFF8240_0989     TRUE 0.753 -10.000 0.000 NA   NA
 1983019 1983020 CFF8240_0989 CFF8240_0990   hsdM TRUE 0.413 23.000 0.000 NA   NA
 1983020 1983021 CFF8240_0990 CFF8240_0991 hsdM   TRUE 0.994 6.000 0.291 0.032   NA
 1983024 1983025 CFF8240_0994 CFF8240_0995     FALSE 0.016 971.000 0.000 NA   NA
 1983025 1983026 CFF8240_0995 CFF8240_0996     FALSE 0.042 188.000 0.000 NA   NA
 1983030 1983031 CFF8240_1000 CFF8240_1001 rplI   TRUE 0.972 0.000 0.034 1.000 N NA
 1983031 1983032 CFF8240_1001 CFF8240_1002   hslU TRUE 0.999 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 1983032 1983033 CFF8240_1002 CFF8240_1003 hslU era TRUE 0.972 -3.000 0.051 1.000   NA
 1983033 1983034 CFF8240_1003 CFF8240_1004 era   TRUE 0.466 68.000 0.029 NA   NA
 1983034 1983035 CFF8240_1004 CFF8240_1005     TRUE 0.995 0.000 0.308 NA   NA
 1983035 1983036 CFF8240_1005 CFF8240_1006     TRUE 0.995 -3.000 0.385 NA   NA
 1983036 1983037 CFF8240_1006 CFF8240_1007     TRUE 0.973 -22.000 0.250 NA   NA
 1983037 1983038 CFF8240_1007 CFF8240_1008     TRUE 0.996 -3.000 0.458 1.000   NA
 1983038 1983039 CFF8240_1008 CFF8240_1009     TRUE 0.950 20.000 0.250 1.000   NA
 1983039 1983040 CFF8240_1009 CFF8240_1010     TRUE 0.611 13.000 0.000 1.000   NA
 1983040 1983041 CFF8240_1010 CFF8240_1011     TRUE 0.999 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 1983041 1983042 CFF8240_1011 CFF8240_1012     FALSE 0.181 64.000 0.000 1.000   NA
 1983042 1983043 CFF8240_1012 CFF8240_1013     TRUE 0.860 3.000 0.000 NA   NA
 1983043 1983044 CFF8240_1013 CFF8240_1014     FALSE 0.140 75.000 0.000 NA   NA
 1983045 1983046 CFF8240_1015 CFF8240_1016 rsc   TRUE 0.936 3.000 0.007 1.000   NA
 1983046 1983047 CFF8240_1016 CFF8240_1017     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 1983047 1983048 CFF8240_1017 CFF8240_1018     TRUE 0.978 -40.000 0.325 NA   NA
 1983048 1983049 CFF8240_1018 CFF8240_1019     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983049 1983050 CFF8240_1019 CFF8240_1020   leuB TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 1983050 1983051 CFF8240_1020 CFF8240_1021 leuB   TRUE 0.956 25.000 0.089 0.002 Y NA
 1983051 1983052 CFF8240_1021 CFF8240_1022     TRUE 0.774 43.000 0.019 1.000 Y NA
 1983052 1983053 CFF8240_1022 CFF8240_1023     TRUE 0.958 9.000 0.000 0.003 Y NA
 1983055 1983056 CFF8240_1025 CFF8240_1026 ansB   FALSE 0.090 110.000 0.000 NA   NA
 1983059 1983060 CFF8240_1029 CFF8240_1030 alaS   TRUE 0.943 -3.000 0.011 1.000   NA
 1983060 1983061 CFF8240_1030 CFF8240_1031     TRUE 0.964 -3.000 0.028 NA   NA
 1983061 1983062 CFF8240_1031 CFF8240_1032     TRUE 0.957 -3.000 0.026 NA N NA
 1983063 1983064 CFF8240_1033 CFF8240_1034   rplS FALSE 0.178 108.000 0.003 NA   NA
 1983064 1983065 CFF8240_1034 CFF8240_1035 rplS trmD TRUE 0.999 -3.000 0.567 1.000 Y NA
 1983065 1983066 CFF8240_1035 CFF8240_1036 trmD rimM TRUE 0.999 4.000 0.672 1.000 Y NA
 1983066 1983067 CFF8240_1036 CFF8240_1037 rimM   TRUE 0.988 -10.000 0.324 1.000   NA
 1983067 1983068 CFF8240_1037 CFF8240_1038   rpsP TRUE 0.994 6.000 0.385 1.000   NA
 1983068 1983069 CFF8240_1038 CFF8240_1039 rpsP ffh TRUE 0.836 71.000 0.361 1.000 N NA
 1983070 1983071 CFF8240_1040 CFF8240_1041     FALSE 0.178 80.000 0.000 0.086 N NA
 1983072 1983073 CFF8240_1042 CFF8240_1043     TRUE 0.969 10.000 0.133 1.000 N NA
 1983075 1983076 CFF8240_1045 CFF8240_1046     TRUE 0.968 18.000 0.342 NA   NA
 1983076 1983077 CFF8240_1046 CFF8240_1047   glyQ TRUE 0.968 -3.000 0.041 NA   NA
 1983077 1983078 CFF8240_1047 CFF8240_1048 glyQ   TRUE 0.482 47.000 0.011 NA   NA
 1983078 1983079 CFF8240_1048 CFF8240_1049   purE TRUE 0.857 12.000 0.019 NA   NA
 1983079 1983080 CFF8240_1049 CFF8240_1050 purE   FALSE 0.164 141.000 0.018 1.000 N NA
 1983080 1983081 CFF8240_1050 CFF8240_1051     TRUE 0.976 -3.000 0.068 NA   NA
 1983082 1983083 CFF8240_1052 CFF8240_1053     FALSE 0.020 414.000 0.000 NA   NA
 1983083 1983084 CFF8240_1053 CFF8240_1054   glnA TRUE 0.530 89.000 0.017 1.000 Y NA
 1983085 1983086 CFF8240_1055 CFF8240_1056     FALSE 0.059 145.000 0.000 NA   NA
 1983086 1983087 CFF8240_1056 CFF8240_1057     FALSE 0.379 112.000 0.061 NA   NA
 1983087 1983088 CFF8240_1057 CFF8240_1058     FALSE 0.028 257.000 0.000 NA   NA
 1983088 1983089 CFF8240_1058 CFF8240_1059     TRUE 0.617 -33.000 0.000 NA   NA
 1983089 1983090 CFF8240_1059 CFF8240_1060   lon FALSE 0.027 266.000 0.000 NA   NA
 1983090 1983091 CFF8240_1060 CFF8240_1061 lon   TRUE 0.960 9.000 0.062 NA   NA
 1983092 1983093 CFF8240_1062 CFF8240_1063     FALSE 0.027 227.000 0.000 1.000 N NA
 1983093 1983094 CFF8240_1063 CFF8240_1064     TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1983094 1983095 CFF8240_1064 CFF8240_1065     TRUE 0.869 21.000 0.095 1.000 N NA
 1983095 1983096 CFF8240_1065 CFF8240_1066   fucP TRUE 0.984 11.000 0.364 1.000 N NA
 1983096 1983097 CFF8240_1066 CFF8240_1067 fucP   FALSE 0.389 26.000 0.000 1.000   NA
 1983097 1983098 CFF8240_1067 CFF8240_1068     FALSE 0.090 110.000 0.000 NA   NA
 1983098 1983099 CFF8240_1068 CFF8240_1069     FALSE 0.353 28.000 0.000 NA   NA
 1983099 1983100 CFF8240_1069 CFF8240_1070     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1983100 1983101 CFF8240_1070 CFF8240_1071     TRUE 0.997 0.000 0.400 NA   NA
 1983101 1983102 CFF8240_1071 CFF8240_1072     TRUE 0.651 44.000 0.040 NA   NA
 1983104 1983105 CFF8240_1074 CFF8240_1075     TRUE 0.833 -16.000 0.006 NA   NA
 1983105 1983106 CFF8240_1075 CFF8240_1077     TRUE 0.585 12.000 0.000 NA N NA
 1983108 1983109 CFF8240_1078 CFF8240_1079 nadE   TRUE 0.918 14.000 0.098 1.000 N NA
 1983109 1983110 CFF8240_1079 CFF8240_1080   lpxK TRUE 0.976 -7.000 0.024 1.000 Y NA
 1983110 1983111 CFF8240_1080 CFF8240_1081 lpxK argB TRUE 0.600 26.000 0.012 1.000 N NA
 1983111 1983112 CFF8240_1081 CFF8240_1082 argB   TRUE 0.974 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 1983112 1983113 CFF8240_1082 CFF8240_1083   kdsB TRUE 0.944 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1983113 1983114 CFF8240_1083 CFF8240_1084 kdsB   TRUE 0.440 53.000 0.009 NA   NA
 1983114 1983115 CFF8240_1084 CFF8240_1085     FALSE 0.049 165.000 0.000 NA   NA
 1983115 1983116 CFF8240_1085 CFF8240_1086     TRUE 0.740 35.000 0.000 0.005 Y NA
 1983119 1983120 CFF8240_1089 CFF8240_1090 dnaK grpE TRUE 0.885 39.000 0.029 0.008 Y NA
 1983120 1983121 CFF8240_1090 CFF8240_1091 grpE   TRUE 0.963 -3.000 0.038 NA N NA
 1983123 1983124 CFF8240_1093 CFF8240_1094     TRUE 0.988 -3.000 0.154 NA   NA
 1983124 1983125 CFF8240_1094 CFF8240_1095   flhA TRUE 0.967 10.000 0.106 1.000   NA
 1983125 1983126 CFF8240_1095 CFF8240_1096 flhA   TRUE 0.753 27.000 0.053 NA N NA
 1983127 1983128 CFF8240_1097 CFF8240_1098 rpsO   FALSE 0.375 27.000 0.000 1.000   NA
 1983128 1983129 CFF8240_1098 CFF8240_1099     TRUE 0.966 -34.000 0.219 1.000   NA
 1983130 1983131 CFF8240_1100 CFF8240_1101     TRUE 0.982 -16.000 0.111 1.000 Y NA
 1983131 1983132 CFF8240_1101 CFF8240_1102     TRUE 0.999 2.000 0.360 0.026 Y NA
 1983132 1983133 CFF8240_1102 CFF8240_1103     TRUE 0.999 -3.000 0.774 0.026   NA
 1983133 1983134 CFF8240_1103 CFF8240_1104     TRUE 0.993 -3.000 0.290 1.000   NA
 1983134 1983135 CFF8240_1104 CFF8240_1105     FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1983135 1983136 CFF8240_1105 CFF8240_1106     FALSE 0.052 156.000 0.000 NA   NA
 1983136 1983137 CFF8240_1106 CFF8240_1107     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983137 1983138 CFF8240_1107 CFF8240_1108     TRUE 0.816 6.000 0.000 NA   NA
 1983138 1983139 CFF8240_1108 CFF8240_1109     FALSE 0.150 72.000 0.000 NA   NA
 1983139 1983140 CFF8240_1109 CFF8240_1110   ribF TRUE 0.974 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 1983140 1983141 CFF8240_1110 CFF8240_1111 ribF rrmJ TRUE 0.825 -31.000 0.018 1.000 N NA
 1983141 1983142 CFF8240_1111 CFF8240_1112 rrmJ ligA TRUE 0.938 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1983142 1983143 CFF8240_1112 CFF8240_1113 ligA   TRUE 0.940 1.000 0.006 1.000 N NA
 1983143 1983144 CFF8240_1113 CFF8240_1114     TRUE 0.973 -3.000 0.054 1.000   NA
 1983144 1983145 CFF8240_1114 CFF8240_1115     TRUE 0.956 9.000 0.053 NA   NA
 1983145 1983146 CFF8240_1115 CFF8240_1116     TRUE 0.978 0.000 0.050 NA   NA
 1983146 1983147 CFF8240_1116 CFF8240_1117     TRUE 0.976 0.000 0.051 1.000 N NA
 1983148 1983149 CFF8240_1118 CFF8240_1119     TRUE 0.404 56.000 0.011 1.000 N NA
 1983149 1983150 CFF8240_1119 CFF8240_1120   tatC TRUE 0.999 0.000 0.535 NA Y NA
 1983150 1983151 CFF8240_1120 CFF8240_1121 tatC queA TRUE 0.963 -3.000 0.036 NA N NA
 1983151 1983152 CFF8240_1121 CFF8240_1123 queA   TRUE 0.862 10.000 0.004 NA   NA
 1983153 1983154 CFF8240_1122 CFF8240_1124     TRUE 0.894 8.000 0.008 NA N NA
 1983154 1983155 CFF8240_1124 CFF8240_1125     TRUE 0.985 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 1983155 1983156 CFF8240_1125 CFF8240_1126     TRUE 0.893 -16.000 0.022 1.000   NA
 1983156 1983157 CFF8240_1126 CFF8240_1127   ilvC TRUE 0.957 1.000 0.013 1.000   NA
 1983158 1983159 CFF8240_1128 CFF8240_1129     TRUE 0.984 -3.000 0.122 NA N NA
 1983159 1983160 CFF8240_1129 CFF8240_1130     TRUE 0.933 -7.000 0.024 1.000 N NA
 1983160 1983161 CFF8240_1130 CFF8240_1131   rpsF FALSE 0.350 73.000 0.020 1.000 N NA
 1983161 1983162 CFF8240_1131 CFF8240_1132 rpsF   TRUE 0.764 22.000 0.033 1.000 N NA
 1983162 1983163 CFF8240_1132 CFF8240_1133   rpsR TRUE 0.868 13.000 0.034 1.000 N NA
 1983165 1983166 CFF8240_1135 CFF8240_1136     TRUE 0.998 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 1983166 1983167 CFF8240_1136 CFF8240_1137   recR TRUE 0.821 -19.000 0.011 1.000 N NA
 1983168 1983169 CFF8240_1138 CFF8240_1139 aroE   TRUE 0.966 0.000 0.020 NA   NA
 1983169 1983170 CFF8240_1139 CFF8240_1140     TRUE 0.987 11.000 0.387 NA   NA
 1983170 1983171 CFF8240_1140 CFF8240_1141   glyA TRUE 0.994 0.000 0.271 NA   NA
 1983171 1983172 CFF8240_1141 CFF8240_1142 glyA lysS TRUE 0.966 -3.000 0.044 1.000 N NA
 1983172 1983173 CFF8240_1142 CFF8240_1143 lysS   TRUE 0.877 11.000 0.022 1.000 N NA
 1983173 1983174 CFF8240_1143 CFF8240_1144   cvpA TRUE 0.955 4.000 0.023 1.000   NA
 1983174 1983175 CFF8240_1144 CFF8240_1145 cvpA pilT TRUE 0.955 0.000 0.010 1.000   NA
 1983175 1983176 CFF8240_1145 CFF8240_1146 pilT gatC TRUE 0.924 4.000 0.010 1.000 N NA
 1983177 1983178 CFF8240_1147 CFF8240_1148     TRUE 0.860 3.000 0.000 NA   NA
 1983178 1983179 CFF8240_1148 CFF8240_1149     TRUE 0.810 7.000 0.000 NA   NA
 1983179 1983180 CFF8240_1149 CFF8240_1150     TRUE 0.901 -13.000 0.021 NA   NA
 1983180 1983181 CFF8240_1150 CFF8240_1151   hisG TRUE 0.905 -12.000 0.023 1.000 N NA
 1983181 1983182 CFF8240_1151 CFF8240_1152 hisG brnQ TRUE 0.928 9.000 0.000 1.000 Y NA
 1983182 1983183 CFF8240_1152 CFF8240_1153 brnQ   TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 1983183 1983184 CFF8240_1153 CFF8240_1154   psd TRUE 0.980 -3.000 0.089 1.000   NA
 1983185 1983186 CFF8240_1155 CFF8240_1156     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983186 1983187 CFF8240_1156 CFF8240_1157     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983187 1983188 CFF8240_1157 CFF8240_1158   napB TRUE 0.989 3.000 0.174 1.000   NA
 1983188 1983189 CFF8240_1158 CFF8240_1159 napB   TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 1983189 1983190 CFF8240_1159 CFF8240_1160     TRUE 0.999 -3.000 0.795 0.019   NA
 1983190 1983191 CFF8240_1160 CFF8240_1161   napA TRUE 0.995 3.000 0.270 0.039   NA
 1983191 1983192 CFF8240_1161 CFF8240_1162 napA   FALSE 0.017 400.000 0.000 1.000 N NA
 1983192 1983193 CFF8240_1162 CFF8240_1163     TRUE 1.000 3.000 0.947 0.009 Y NA
 1983193 1983194 CFF8240_1163 CFF8240_1164     TRUE 0.999 0.000 0.400 0.026 Y NA
 1983194 1983195 CFF8240_1164 CFF8240_1165     TRUE 0.994 16.000 0.594 1.000 Y NA
 1983195 1983196 CFF8240_1165 CFF8240_1166   ychF FALSE 0.030 212.000 0.000 1.000 N NA
 1983196 1983197 CFF8240_1166 CFF8240_1167 ychF   TRUE 0.968 0.000 0.026 1.000 N NA
 1983197 1983198 CFF8240_1167 CFF8240_1168     TRUE 0.975 -19.000 0.250 NA   NA
 1983198 1983199 CFF8240_1168 CFF8240_1169   apt TRUE 0.963 3.000 0.026 NA   NA
 1983199 1983200 CFF8240_1169 CFF8240_1170 apt   TRUE 0.860 14.000 0.028 1.000   NA
 1983200 1983201 CFF8240_1170 CFF8240_1171   rpiB TRUE 0.978 -6.000 0.103 1.000   NA
 1983201 1983202 CFF8240_1171 CFF8240_1172 rpiB   TRUE 0.401 55.000 0.004 1.000   NA
 1983202 1983203 CFF8240_1172 CFF8240_1173   lepB TRUE 0.973 -7.000 0.055 0.019   NA
 1983203 1983204 CFF8240_1173 CFF8240_1174 lepB   TRUE 0.983 -3.000 0.117 1.000 N NA
 1983205 1983206 CFF8240_1175 CFF8240_1176   hemL TRUE 0.990 -3.000 0.212 1.000   NA
 1983206 1983207 CFF8240_1176 CFF8240_1177 hemL   TRUE 0.996 -3.000 0.462 1.000   NA
 1983207 1983208 CFF8240_1177 CFF8240_1178     TRUE 0.985 -10.000 0.269 NA   NA
 1983208 1983209 CFF8240_1178 CFF8240_1179     TRUE 0.753 -10.000 0.000 NA   NA
 1983209 1983210 CFF8240_1179 CFF8240_1180     TRUE 0.972 -19.000 0.227 NA   NA
 1983210 1983211 CFF8240_1180 CFF8240_1181     TRUE 0.986 2.000 0.104 NA   NA
 1983212 1983213 CFF8240_1182 CFF8240_1183     TRUE 0.969 -3.000 0.043 NA   NA
 1983213 1983214 CFF8240_1183 CFF8240_1184     TRUE 0.762 21.000 0.023 NA   NA
 1983214 1983215 CFF8240_1184 CFF8240_1185     TRUE 0.944 7.000 0.023 1.000   NA
 1983215 1983216 CFF8240_1185 CFF8240_1186     TRUE 0.964 4.000 0.041 NA   NA
 1983216 1983217 CFF8240_1186 CFF8240_1187     TRUE 0.853 -18.000 0.013 NA   NA
 1983217 1983218 CFF8240_1187 CFF8240_1188     TRUE 0.831 15.000 0.023 NA   NA
 1983218 1983219 CFF8240_1188 CFF8240_1189   hisB TRUE 0.953 -3.000 0.018 1.000   NA
 1983219 1983220 CFF8240_1189 CFF8240_1190 hisB   TRUE 0.962 1.000 0.022 NA N NA
 1983220 1983221 CFF8240_1190 CFF8240_1191     TRUE 0.787 47.000 0.115 NA   NA
 1983221 1983222 CFF8240_1191 CFF8240_1192     TRUE 0.942 9.000 0.028 NA   NA
 1983222 1983223 CFF8240_1192 CFF8240_1193     TRUE 0.936 -3.000 0.013 NA N NA
 1983223 1983224 CFF8240_1193 CFF8240_1194     TRUE 0.698 66.000 0.141 1.000 N NA
 1983224 1983225 CFF8240_1194 CFF8240_1195     TRUE 0.949 -10.000 0.066 1.000 N NA
 1983226 1983227 CFF8240_1196 CFF8240_1197 aspS   TRUE 0.968 -3.000 0.025 0.090 N NA
 1983227 1983228 CFF8240_1197 CFF8240_1198   ppa TRUE 0.926 5.000 0.015 1.000 N NA
 1983229 1983230 CFF8240_1199 CFF8240_1200     FALSE 0.248 49.000 0.000 NA   NA
 1983230 1983231 CFF8240_1200 CFF8240_1201     FALSE 0.118 88.000 0.000 NA   NA
 1983231 1983232 CFF8240_1201 CFF8240_1202     TRUE 0.923 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 1983232 1983233 CFF8240_1202 CFF8240_1203     TRUE 0.871 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 1983233 1983234 CFF8240_1203 CFF8240_1204     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983234 1983235 CFF8240_1204 CFF8240_1205     TRUE 0.995 -7.000 0.500 NA   NA
 1983235 1983236 CFF8240_1205 CFF8240_1206     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 1983238 1983239 CFF8240_1208 CFF8240_1209     TRUE 0.948 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1983239 1983240 CFF8240_1209 CFF8240_1210     FALSE 0.194 194.000 0.050 1.000   NA
 1983240 1983241 CFF8240_1210 CFF8240_1211   tyrS TRUE 0.977 0.000 0.043 1.000   NA
 1983241 1983242 CFF8240_1211 CFF8240_1212 tyrS   TRUE 0.971 2.000 0.045 1.000 N NA
 1983242 1983243 CFF8240_1212 CFF8240_1213   rpoZ TRUE 0.966 -16.000 0.039 1.000 Y NA
 1983243 1983244 CFF8240_1213 CFF8240_1214 rpoZ pyrH TRUE 0.866 13.000 0.033 1.000 N NA
 1983244 1983245 CFF8240_1214 CFF8240_1215 pyrH   FALSE 0.384 56.000 0.009 1.000 N NA
 1983245 1983246 CFF8240_1215 CFF8240_1216     TRUE 0.861 36.000 0.045 NA Y NA
 1983246 1983247 CFF8240_1216 CFF8240_1217     TRUE 0.893 62.000 0.431 NA N NA
 1983247 1983248 CFF8240_1217 CFF8240_1218     TRUE 0.928 -15.000 0.044 1.000   NA
 1983248 1983249 CFF8240_1218 CFF8240_1219     TRUE 0.981 0.000 0.060 NA   NA
 1983249 1983250 CFF8240_1219 CFF8240_1220     TRUE 0.898 -19.000 0.031 NA   NA
 1983256 1983257 CFF8240_1226 CFF8240_1227     FALSE 0.064 174.000 0.000 0.083 N NA
 1983257 1983258 CFF8240_1227 CFF8240_1228     FALSE 0.022 337.000 0.000 NA   NA
 1983258 1983259 CFF8240_1228 CFF8240_1229   putP FALSE 0.051 161.000 0.000 NA   NA
 1983260 1983261 CFF8240_1230 CFF8240_1231     TRUE 0.988 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 1983261 1983262 CFF8240_1231 CFF8240_1232     TRUE 0.990 16.000 0.385 1.000 Y NA
 1983262 1983263 CFF8240_1232 CFF8240_1233     TRUE 0.780 28.000 0.000 0.001 Y NA
 1983263 1983264 CFF8240_1233 CFF8240_1234     FALSE 0.265 38.000 0.000 1.000 N NA
 1983264 1983265 CFF8240_1234 CFF8240_1235     TRUE 0.948 1.000 0.011 1.000 N NA
 1983267 1983268 CFF8240_1237 CFF8240_1239     TRUE 0.799 -7.000 0.000 1.000   NA
 1983269 1983270 CFF8240_1238 CFF8240_1240     FALSE 0.099 105.000 0.000 1.000   NA
 1983271 1983272 CFF8240_1241 CFF8240_1242   putP TRUE 0.984 4.000 0.141 1.000 N NA
 1983272 1983273 CFF8240_1242 CFF8240_1243 putP   FALSE 0.024 250.000 0.000 1.000 N NA
 1983273 1983274 CFF8240_1243 CFF8240_1244   nrfA TRUE 0.699 16.000 0.000 0.001 N NA
 1983277 1983278 CFF8240_1247 CFF8240_1248 efp serA TRUE 0.717 15.000 0.007 1.000 N NA
 1983278 1983279 CFF8240_1248 CFF8240_1249 serA   TRUE 0.956 4.000 0.025 NA   NA
 1983279 1983280 CFF8240_1249 CFF8240_1250     TRUE 0.992 8.000 0.343 NA   NA
 1983280 1983281 CFF8240_1250 CFF8240_1251   ispH TRUE 0.526 101.000 0.118 1.000 N NA
 1983281 1983282 CFF8240_1251 CFF8240_1252 ispH aroA TRUE 0.927 -10.000 0.032 1.000 N NA
 1983282 1983283 CFF8240_1252 CFF8240_1253 aroA pheT TRUE 0.959 -3.000 0.028 1.000 N NA
 1983283 1983284 CFF8240_1253 CFF8240_1254 pheT pheS TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 1983286 1983287 CFF8240_1256 CFF8240_1257     TRUE 0.439 22.000 0.000 1.000   NA
 1983287 1983288 CFF8240_1257 CFF8240_1258     TRUE 0.929 10.000 0.028 1.000   NA
 1983288 1983289 CFF8240_1258 CFF8240_1259     TRUE 0.988 -3.000 0.165 1.000   NA
 1983289 1983290 CFF8240_1259 CFF8240_1260     TRUE 0.923 20.000 0.149 NA   NA
 1983290 1983291 CFF8240_1260 CFF8240_1261   purD TRUE 0.950 -3.000 0.017 NA   NA
 1983291 1983292 CFF8240_1261 CFF8240_1262 purD hemD FALSE 0.023 257.000 0.000 1.000 N NA
 1983292 1983293 CFF8240_1262 CFF8240_1263 hemD   TRUE 0.792 5.000 0.000 NA N NA
 1983293 1983294 CFF8240_1263 CFF8240_1264     TRUE 0.499 15.000 0.000 NA N NA
 1983295 1983296 CFF8240_1265 CFF8240_1266   uvrC TRUE 0.894 -13.000 0.018 NA   NA
 1983296 1983297 CFF8240_1266 CFF8240_1267 uvrC   FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 1983297 1983298 CFF8240_1267 CFF8240_1268     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983298 1983299 CFF8240_1268 CFF8240_1269     TRUE 0.999 7.000 0.636 0.008 Y NA
 1983301 1983302 CFF8240_1271 CFF8240_1272     TRUE 0.763 56.000 0.120 NA   NA
 1983302 1983303 CFF8240_1272 CFF8240_1273     TRUE 0.981 -3.000 0.092 NA   NA
 1983303 1983304 CFF8240_1273 CFF8240_1274     TRUE 0.748 10.000 0.000 1.000   NA
 1983304 1983305 CFF8240_1274 CFF8240_1275     FALSE 0.187 62.000 0.000 NA   NA
 1983305 1983306 CFF8240_1275 CFF8240_1276     FALSE 0.024 302.000 0.000 NA   NA
 1983306 1983307 CFF8240_1276 CFF8240_1277     TRUE 0.976 -3.000 0.067 NA   NA
 1983308 1983309 CFF8240_1278 CFF8240_1279     FALSE 0.102 86.000 0.000 NA N NA
 1983310 1983311 CFF8240_1280 CFF8240_1281     FALSE 0.091 111.000 0.000 1.000   NA
 1983311 1983312 CFF8240_1281 CFF8240_1282     FALSE 0.332 32.000 0.000 NA   NA
 1983314 1983315 CFF8240_1284 CFF8240_1285     FALSE 0.092 93.000 0.000 1.000 N NA
 1983315 1983316 CFF8240_1285 CFF8240_1286     FALSE 0.174 65.000 0.000 NA   NA
 1983316 1983317 CFF8240_1286 CFF8240_1287     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 1983317 1983318 CFF8240_1287 CFF8240_1289     FALSE 0.074 123.000 0.000 NA   NA
 1983320 1983321 CFF8240_1290 CFF8240_1291     FALSE 0.018 641.000 0.000 NA   NA
 1983321 1983322 CFF8240_1291 CFF8240_1292     FALSE 0.031 233.000 0.000 NA   NA
 1983322 1983323 CFF8240_1292 CFF8240_1293     FALSE 0.359 28.000 0.000 1.000   NA
 1983323 1983324 CFF8240_1293 CFF8240_1294   pckA FALSE 0.316 157.000 0.016 1.000 Y NA
 1983324 1983325 CFF8240_1294 CFF8240_1295 pckA argH FALSE 0.094 164.000 0.006 1.000 N NA
 1983325 1983326 CFF8240_1295 CFF8240_1296 argH   FALSE 0.040 168.000 0.000 1.000 N NA
 1983326 1983327 CFF8240_1296 CFF8240_1297   feoB TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983327 1983328 CFF8240_1297 CFF8240_1298 feoB feoB TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 1983328 1983329 CFF8240_1298 CFF8240_1299 feoB   FALSE 0.174 66.000 0.000 1.000   NA
 1983329 1983330 CFF8240_1299 CFF8240_1300     FALSE 0.023 326.000 0.000 NA   NA
 1983330 1983331 CFF8240_1300 CFF8240_1301     FALSE 0.031 237.000 0.000 NA   NA
 1983332 1983333 CFF8240_1302 CFF8240_1303     FALSE 0.071 127.000 0.000 NA   NA
 1983333 1983334 CFF8240_1303 CFF8240_1304     FALSE 0.072 125.000 0.000 NA   NA
 1983340 1983341 CFF8240_1310 CFF8240_1311   fusA FALSE 0.236 54.000 0.000 NA   NA
 1983341 1983342 CFF8240_1311 CFF8240_1312 fusA rpsG TRUE 0.995 13.000 0.579 1.000 Y NA
 1983342 1983343 CFF8240_1312 CFF8240_1313 rpsG rpsL TRUE 0.980 67.000 0.620 0.004 Y NA
 1983345 1983346 CFF8240_1314 CFF8240_1316 rpoC rpoB TRUE 0.999 -7.000 0.851 0.001   NA
 1983346 1983347 CFF8240_1316 CFF8240_1317 rpoB rplL TRUE 0.669 101.000 0.223 1.000   NA
 1983347 1983348 CFF8240_1317 CFF8240_1318 rplL   TRUE 0.996 33.000 0.884 0.020 Y NA
 1983348 1983349 CFF8240_1318 CFF8240_1319   rplA TRUE 0.903 106.000 0.302 0.027 Y NA
 1983349 1983350 CFF8240_1319 CFF8240_1320 rplA rplK TRUE 0.990 60.000 0.838 0.027 Y NA
 1983350 1983351 CFF8240_1320 CFF8240_1321 rplK nusG TRUE 0.987 18.000 0.681 1.000 N NA
 1983351 1983352 CFF8240_1321 CFF8240_1322 nusG secE TRUE 0.997 10.000 0.843 1.000   NA
 1983352 1983353 CFF8240_1322 CFF8240_1323 secE   TRUE 0.575 14.000 0.000 NA   NA
 1983353 1983354 CFF8240_1323 CFF8240_1324   rpmG FALSE 0.368 27.000 0.000 NA   NA
 1983354 1983355 CFF8240_1324 CFF8240_1325 rpmG tuf TRUE 0.886 48.000 0.099 1.000 Y NA
 1983355 1983356 CFF8240_1325 CFF8240_1326 tuf   FALSE 0.138 76.000 0.000 NA   NA
 1983356 1983357 CFF8240_1326 CFF8240_1327     FALSE 0.063 139.000 0.000 NA   NA
 1983357 1983358 CFF8240_1327 CFF8240_1328     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 1983358 1983359 CFF8240_1328 CFF8240_1329     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 1983359 1983360 CFF8240_1329 CFF8240_1330   sodC FALSE 0.041 190.000 0.000 NA   NA
 1983360 1983361 CFF8240_1330 CFF8240_1331 sodC   FALSE 0.070 128.000 0.000 NA   NA
 1983361 1983362 CFF8240_1331 CFF8240_1332   pyrF FALSE 0.206 58.000 0.000 NA   NA
 1983362 1983363 CFF8240_1332 CFF8240_1333 pyrF nusB TRUE 0.965 0.000 0.023 1.000 N NA
 1983363 1983364 CFF8240_1333 CFF8240_1334 nusB ribH TRUE 0.971 2.000 0.045 1.000 N NA
 1983364 1983365 CFF8240_1334 CFF8240_1335 ribH   FALSE 0.363 54.000 0.003 1.000 N NA
 1983365 1983366 CFF8240_1335 CFF8240_1336     TRUE 0.999 0.000 0.600 0.048 Y NA
 1983366 1983367 CFF8240_1336 CFF8240_1337   kdsA TRUE 0.903 5.000 0.005 1.000 N NA
 1983367 1983368 CFF8240_1337 CFF8240_1338 kdsA   TRUE 0.626 22.000 0.004 1.000   NA
 1983369 1983370 CFF8240_1339 CFF8240_1340   aroK TRUE 0.758 -10.000 0.000 1.000   NA
 1983370 1983371 CFF8240_1340 CFF8240_1341 aroK trpS TRUE 0.882 4.000 0.000 0.088 N NA
 1983371 1983372 CFF8240_1341 CFF8240_1342 trpS serS TRUE 0.967 10.000 0.010 0.041 Y NA
 1983372 1983373 CFF8240_1342 CFF8240_1343 serS   TRUE 0.902 10.000 0.016 1.000   NA
 1983374 1983375 CFF8240_1344 CFF8240_1345 leuA pssA FALSE 0.251 163.000 0.073 1.000 N NA
 1983375 1983376 CFF8240_1345 CFF8240_1346 pssA psd TRUE 0.998 5.000 0.466 1.000 Y NA
 1983376 1983377 CFF8240_1346 CFF8240_1347 psd   TRUE 0.967 3.000 0.043 1.000 N NA
 1983377 1983378 CFF8240_1347 CFF8240_1348   prmA TRUE 0.979 -10.000 0.217 1.000 N NA
 1983378 1983379 CFF8240_1348 CFF8240_1349 prmA   TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1983379 1983380 CFF8240_1349 CFF8240_1350     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1983380 1983381 CFF8240_1350 CFF8240_1351   hisA FALSE 0.170 66.000 0.000 NA   NA
 1983381 1983382 CFF8240_1351 CFF8240_1352 hisA hisH TRUE 0.996 0.000 0.091 0.005 Y NA
 1983382 1983383 CFF8240_1352 CFF8240_1353 hisH   TRUE 0.981 -16.000 0.273 1.000   NA
 1983383 1983384 CFF8240_1353 CFF8240_1354     TRUE 0.993 2.000 0.242 1.000   NA
 1983384 1983385 CFF8240_1354 CFF8240_1355     TRUE 0.994 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 1983387 1983388 CFF8240_1357 CFF8240_1358   murD FALSE 0.109 93.000 0.000 NA   NA
 1983388 1983389 CFF8240_1358 CFF8240_1359 murD mraY TRUE 0.999 4.000 0.647 0.005 Y NA
 1983390 1983391 CFF8240_1360 CFF8240_1361 gpmI fabG TRUE 0.655 25.000 0.018 1.000 N NA
 1983391 1983392 CFF8240_1361 CFF8240_1362 fabG acpP TRUE 0.960 61.000 0.321 0.005 Y NA
 1983392 1983393 CFF8240_1362 CFF8240_1363 acpP   TRUE 0.928 22.000 0.066 1.000 Y NA
 1983393 1983394 CFF8240_1363 CFF8240_1364   accA TRUE 0.991 0.000 0.046 1.000 Y NA
 1983395 1983396 CFF8240_1365 CFF8240_1366     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983396 1983397 CFF8240_1366 CFF8240_1367     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 1983397 1983398 CFF8240_1367 CFF8240_1368     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 1983398 1983399 CFF8240_1368 CFF8240_1369   prfB TRUE 0.435 46.000 0.004 NA   NA
 1983400 1983401 CFF8240_1370 CFF8240_1371 panC   TRUE 0.937 2.000 0.008 1.000 N NA
 1983401 1983402 CFF8240_1371 CFF8240_1373     TRUE 0.893 -12.000 0.019 1.000 N NA
 1983403 1983404 CFF8240_1372 CFF8240_1374     TRUE 0.974 -13.000 0.172 NA   NA
 1983404 1983405 CFF8240_1374 CFF8240_1375     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 1983405 1983406 CFF8240_1375 CFF8240_1376     TRUE 0.896 67.000 0.462 NA   NA
 1983406 1983407 CFF8240_1376 CFF8240_1377   miaB TRUE 0.909 -16.000 0.029 NA   NA
 1983407 1983408 CFF8240_1377 CFF8240_1378 miaB   TRUE 0.966 -3.000 0.033 NA   NA
 1983410 1983411 CFF8240_1380 CFF8240_1381     TRUE 0.960 9.000 0.074 1.000 N NA
 1983411 1983412 CFF8240_1381 CFF8240_1382     TRUE 0.991 -7.000 0.128 1.000 Y NA
 1983412 1983413 CFF8240_1382 CFF8240_1383     TRUE 0.963 5.000 0.045 1.000   NA
 1983413 1983414 CFF8240_1383 CFF8240_1384     TRUE 0.987 -16.000 0.375 1.000   NA
 1983414 1983415 CFF8240_1384 CFF8240_1385     TRUE 0.997 -3.000 0.167 0.014 Y NA
 1983415 1983416 CFF8240_1385 CFF8240_1386     TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.014 Y NA
 1983416 1983417 CFF8240_1386 CFF8240_1387     TRUE 0.535 17.000 0.000 1.000   NA
 1983417 1983418 CFF8240_1387 CFF8240_1388     FALSE 0.054 155.000 0.000 1.000   NA
 1983419 1983420 CFF8240_1389 CFF8240_1390     TRUE 0.826 5.000 0.000 NA   NA
 1983420 1983421 CFF8240_1390 CFF8240_1391     FALSE 0.118 88.000 0.000 NA   NA
 1983422 1983423 CFF8240_1392 CFF8240_1393 galE   FALSE 0.156 63.000 0.000 1.000 N NA
 1983423 1983424 CFF8240_1393 CFF8240_1394     FALSE 0.134 79.000 0.000 NA   NA
 1983424 1983425 CFF8240_1394 CFF8240_1395     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983425 1983426 CFF8240_1395 CFF8240_1396     TRUE 0.958 -3.000 0.026 1.000 N NA
 1983426 1983427 CFF8240_1396 CFF8240_1397     TRUE 0.951 10.000 0.008 1.000 Y NA
 1983427 1983428 CFF8240_1397 CFF8240_1398     FALSE 0.241 42.000 0.000 1.000 N NA
 1983429 1983430 CFF8240_1399 CFF8240_1400 rfaC   TRUE 0.994 -7.000 0.231 1.000 Y NA
 1983430 1983431 CFF8240_1400 CFF8240_1401     TRUE 0.988 -3.000 0.050 NA Y NA
 1983431 1983432 CFF8240_1401 CFF8240_1403     TRUE 0.988 -3.000 0.050 NA Y NA
 1983433 1983434 CFF8240_1402 CFF8240_1404     FALSE 0.014 1120.000 0.000 1.000 N NA
 1983434 1983435 CFF8240_1404 CFF8240_1405     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983435 1983436 CFF8240_1405 CFF8240_1406     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983436 1983437 CFF8240_1406 CFF8240_1407     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983437 1983438 CFF8240_1407 CFF8240_1408     TRUE 0.624 -28.000 0.000 NA   NA
 1983439 1983440 CFF8240_1409 CFF8240_1411   rfaF TRUE 0.850 29.000 0.025 1.000 Y NA
 1983441 1983442 CFF8240_1410 CFF8240_1412 gmhA   TRUE 0.706 10.000 0.000 1.000 N NA
 1983442 1983443 CFF8240_1412 CFF8240_1413     TRUE 0.940 6.000 0.000 1.000 Y NA
 1983443 1983444 CFF8240_1413 CFF8240_1414   rfaD TRUE 0.993 -7.000 0.096 0.007 Y NA
 1983444 1983445 CFF8240_1414 CFF8240_1415 rfaD   TRUE 0.979 -3.000 0.093 1.000 N NA
 1983449 1983450 CFF8240_1419 CFF8240_1420     TRUE 0.999 3.000 0.713 NA Y NA
 1983451 1983452 CFF8240_1421 CFF8240_1423 rho   TRUE 0.904 10.000 0.009 0.087 N NA
 1983453 1983454 CFF8240_1422 CFF8240_1424     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983456 1983457 CFF8240_1426 CFF8240_1427   tpiA TRUE 0.908 18.000 0.071 0.038 N NA
 1983457 1983458 CFF8240_1427 CFF8240_1428 tpiA pgk TRUE 0.476 115.000 0.022 1.000 Y NA
 1983458 1983459 CFF8240_1428 CFF8240_1429 pgk gap TRUE 0.991 2.000 0.020 0.004 Y NA
 1983460 1983461 CFF8240_1430 CFF8240_1431 nadD   TRUE 0.982 -10.000 0.221 NA   NA
 1983464 1983465 CFF8240_1433 CFF8240_1435 argS   TRUE 0.950 0.000 0.011 1.000 N NA
 1983465 1983466 CFF8240_1435 CFF8240_1436     FALSE 0.234 44.000 0.000 1.000 N NA
 1983466 1983467 CFF8240_1436 CFF8240_1437     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983467 1983468 CFF8240_1437 CFF8240_1438   fliR FALSE 0.177 64.000 0.000 NA   NA
 1983470 1983471 CFF8240_1440 CFF8240_1441   tsf TRUE 0.949 3.000 0.019 1.000 N NA
 1983471 1983472 CFF8240_1441 CFF8240_1442 tsf rpsB TRUE 0.999 0.000 0.748 1.000 Y NA
 1983472 1983473 CFF8240_1442 CFF8240_1443 rpsB   FALSE 0.054 153.000 0.000 NA   NA
 1983473 1983474 CFF8240_1443 CFF8240_1444     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983474 1983475 CFF8240_1444 CFF8240_1445   ribE TRUE 0.853 -16.000 0.011 NA   NA
 1983478 1983479 CFF8240_1448 CFF8240_1449 petA   TRUE 0.987 11.000 0.093 0.002 Y NA
 1983479 1983480 CFF8240_1449 CFF8240_1450     TRUE 0.996 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 1983482 1983483 CFF8240_1452 CFF8240_1453     TRUE 0.605 13.000 0.000 NA   NA
 1983484 1983485 CFF8240_1454 CFF8240_1455     FALSE 0.038 201.000 0.000 NA   NA
 1983485 1983486 CFF8240_1455 CFF8240_1456   hemE TRUE 0.944 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1983486 1983487 CFF8240_1456 CFF8240_1457 hemE   TRUE 0.718 21.000 0.016 NA   NA
 1983487 1983488 CFF8240_1457 CFF8240_1458   asd TRUE 0.401 75.000 0.025 NA   NA
 1983488 1983489 CFF8240_1458 CFF8240_1459 asd   TRUE 0.434 65.000 0.025 1.000 N NA
 1983489 1983490 CFF8240_1459 CFF8240_1460     TRUE 0.987 5.000 0.205 NA   NA
 1983490 1983491 CFF8240_1460 CFF8240_1461     TRUE 0.994 15.000 0.900 NA   NA
 1983491 1983492 CFF8240_1461 CFF8240_1462   gyrA TRUE 0.479 42.000 0.008 NA   NA
 1983492 1983493 CFF8240_1462 CFF8240_1463 gyrA   FALSE 0.070 115.000 0.000 1.000 N NA
 1983493 1983494 CFF8240_1463 CFF8240_1464     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983494 1983495 CFF8240_1464 CFF8240_1465     FALSE 0.064 138.000 0.000 NA   NA
 1983495 1983496 CFF8240_1465 CFF8240_1466     TRUE 0.489 128.000 0.093 0.038   NA
 1983496 1983497 CFF8240_1466 CFF8240_1467     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983497 1983498 CFF8240_1467 CFF8240_1468     FALSE 0.044 182.000 0.000 NA   NA
 1983498 1983499 CFF8240_1468 CFF8240_1469     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 1983499 1983500 CFF8240_1469 CFF8240_1470     TRUE 0.985 0.000 0.091 NA   NA
 1983500 1983501 CFF8240_1470 CFF8240_1471     TRUE 0.988 10.000 0.333 NA   NA
 1983501 1983502 CFF8240_1471 CFF8240_1472     TRUE 0.967 -3.000 0.036 NA   NA
 1983502 1983503 CFF8240_1472 CFF8240_1473   lepA TRUE 0.515 31.000 0.002 1.000   NA
 1983503 1983504 CFF8240_1473 CFF8240_1474 lepA   FALSE 0.068 212.000 0.006 1.000 N NA
 1983505 1983506 CFF8240_1475 CFF8240_1476 pyrB   TRUE 0.998 4.000 0.452 1.000 Y NA
 1983508 1983509 CFF8240_1478 CFF8240_1479     FALSE 0.040 197.000 0.000 NA   NA
 1983509 1983510 CFF8240_1479 CFF8240_1480     TRUE 0.413 23.000 0.000 NA   NA
 1983510 1983511 CFF8240_1480 CFF8240_1481     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1983514 1983515 CFF8240_1484 CFF8240_1485     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 1983515 1983516 CFF8240_1485 CFF8240_1486   gltD FALSE 0.099 102.000 0.000 NA   NA
 1983516 1983517 CFF8240_1486 CFF8240_1487 gltD gltB TRUE 0.998 2.000 0.188 0.001 Y NA
 1983517 1983518 CFF8240_1487 CFF8240_1488 gltB ribD FALSE 0.053 139.000 0.000 1.000 N NA
 1983518 1983519 CFF8240_1488 CFF8240_1489 ribD   FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 1983521 1983522 CFF8240_1491 CFF8240_1492   rbfA TRUE 0.966 -3.000 0.033 NA   NA
 1983522 1983523 CFF8240_1492 CFF8240_1493 rbfA infB TRUE 0.999 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 1983523 1983524 CFF8240_1493 CFF8240_1494 infB   TRUE 0.974 -13.000 0.171 NA   NA
 1983524 1983525 CFF8240_1494 CFF8240_1495   thrB TRUE 0.629 52.000 0.044 NA   NA
 1983525 1983526 CFF8240_1495 CFF8240_1496 thrB   TRUE 0.945 9.000 0.032 NA   NA
 1983526 1983527 CFF8240_1496 CFF8240_1497   lpxC TRUE 0.671 39.000 0.035 NA   NA
 1983527 1983528 CFF8240_1497 CFF8240_1498 lpxC   FALSE 0.150 73.000 0.000 1.000   NA
 1983528 1983529 CFF8240_1498 CFF8240_1499     FALSE 0.235 55.000 0.000 1.000   NA
 1983529 1983530 CFF8240_1499 CFF8240_1500     FALSE 0.376 61.000 0.013 1.000 N NA
 1983532 1983533 CFF8240_1502 CFF8240_1503   sppA TRUE 0.887 1.000 0.000 1.000   NA
 1983533 1983534 CFF8240_1503 CFF8240_1504 sppA   TRUE 0.922 -12.000 0.035 1.000 N NA
 1983535 1983536 CFF8240_1505 CFF8240_1506 aroQ   TRUE 0.993 -7.000 0.168 1.000 Y NA
 1983536 1983537 CFF8240_1506 CFF8240_1507   folK TRUE 0.957 4.000 0.033 1.000 N NA
 1983537 1983538 CFF8240_1507 CFF8240_1508 folK   TRUE 0.972 0.000 0.035 1.000 N NA
 1983538 1983539 CFF8240_1508 CFF8240_1509     TRUE 0.986 -16.000 0.382 1.000 N NA
 1983539 1983540 CFF8240_1509 CFF8240_1510     TRUE 0.949 14.000 0.159 NA   NA
 1983540 1983541 CFF8240_1510 CFF8240_1511     TRUE 0.945 -28.000 0.112 NA   NA
 1983541 1983542 CFF8240_1511 CFF8240_1512   fliM TRUE 0.988 0.000 0.118 1.000 N NA
 1983542 1983543 CFF8240_1512 CFF8240_1513 fliM   TRUE 0.995 -7.000 0.142 0.002 Y NA
 1983544 1983545 CFF8240_1514 CFF8240_1515   mtnN TRUE 0.965 -3.000 0.042 1.000 N NA
 1983545 1983546 CFF8240_1515 CFF8240_1516 mtnN fabD TRUE 0.964 -3.000 0.037 1.000 N NA
 1983546 1983547 CFF8240_1516 CFF8240_1517 fabD   TRUE 0.874 9.000 0.004 1.000 N NA
 1983547 1983548 CFF8240_1517 CFF8240_1518     TRUE 0.942 21.000 0.233 1.000   NA
 1983548 1983549 CFF8240_1518 CFF8240_1519     TRUE 0.998 4.000 0.794 1.000   NA
 1983549 1983550 CFF8240_1519 CFF8240_1520     TRUE 0.911 87.000 0.702 1.000 N NA
 1983550 1983551 CFF8240_1520 CFF8240_1521     TRUE 0.990 -3.000 0.213 NA   NA
 1983551 1983552 CFF8240_1521 CFF8240_1522     TRUE 0.995 2.000 0.343 NA   NA
 1983552 1983553 CFF8240_1522 CFF8240_1523     TRUE 0.999 -13.000 0.944 0.035 Y NA
 1983553 1983554 CFF8240_1523 CFF8240_1524   atpC TRUE 0.971 1.000 0.036 1.000 N NA
 1983554 1983555 CFF8240_1524 CFF8240_1525 atpC atpD TRUE 0.998 18.000 0.837 0.005 Y NA
 1983555 1983556 CFF8240_1525 CFF8240_1526 atpD atpG TRUE 0.997 18.000 0.724 0.005 Y NA
 1983556 1983557 CFF8240_1526 CFF8240_1527 atpG atpA TRUE 0.999 10.000 0.846 0.005 Y NA
 1983557 1983558 CFF8240_1527 CFF8240_1528 atpA atpH TRUE 0.998 15.000 0.864 0.005 Y NA
 1983558 1983559 CFF8240_1528 CFF8240_1529 atpH   TRUE 0.997 0.000 0.132 0.005 Y NA
 1983559 1983560 CFF8240_1529 CFF8240_1530     TRUE 0.991 10.000 0.110 0.005 Y NA
 1983560 1983561 CFF8240_1530 CFF8240_1531     TRUE 0.427 74.000 0.037 1.000 N NA
 1983561 1983562 CFF8240_1531 CFF8240_1532   soj TRUE 0.998 3.000 0.827 1.000 N NA
 1983562 1983563 CFF8240_1532 CFF8240_1533 soj   TRUE 0.964 -3.000 0.040 1.000 N NA
 1983563 1983564 CFF8240_1533 CFF8240_1534   fmt TRUE 0.884 -19.000 0.029 1.000 N NA
 1983564 1983565 CFF8240_1534 CFF8240_1535 fmt proB TRUE 0.939 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1983565 1983566 CFF8240_1535 CFF8240_1536 proB   TRUE 0.463 166.000 0.206 1.000   NA
 1983566 1983567 CFF8240_1536 CFF8240_1537   rpmA TRUE 0.805 86.000 0.335 1.000   NA
 1983567 1983568 CFF8240_1537 CFF8240_1538 rpmA rplU TRUE 0.998 11.000 0.667 0.019 Y NA
 1983568 1983569 CFF8240_1538 CFF8240_1539 rplU   FALSE 0.030 209.000 0.000 1.000 N NA
 1983569 1983570 CFF8240_1539 CFF8240_1540     FALSE 0.033 409.000 0.000 0.018 N NA
 1983570 1983571 CFF8240_1540 CFF8240_1541     TRUE 0.989 15.000 0.444 0.001   NA
 1983571 1983572 CFF8240_1541 CFF8240_1542     FALSE 0.248 49.000 0.000 NA   NA
 1983572 1983573 CFF8240_1542 CFF8240_1543     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983573 1983574 CFF8240_1543 CFF8240_1544     TRUE 0.544 130.000 0.200 NA   NA
 1983574 1983575 CFF8240_1544 CFF8240_1545     TRUE 0.996 -3.000 0.412 1.000   NA
 1983576 1983577 CFF8240_1546 CFF8240_1547 selA selB TRUE 0.997 -7.000 0.569 0.001 N NA
 1983577 1983578 CFF8240_1547 CFF8240_1548 selB   TRUE 0.622 46.000 0.031 1.000   NA
 1983578 1983579 CFF8240_1548 CFF8240_1549     FALSE 0.158 70.000 0.000 1.000   NA
 1983579 1983580 CFF8240_1549 CFF8240_1550     FALSE 0.369 23.000 0.000 1.000 N NA
 1983580 1983581 CFF8240_1550 CFF8240_1551     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 1983581 1983582 CFF8240_1551 CFF8240_1552     FALSE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 1983582 1983583 CFF8240_1552 CFF8240_1553     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983583 1983584 CFF8240_1553 CFF8240_1554     TRUE 0.913 -3.000 0.000 0.040   NA
 1983584 1983585 CFF8240_1554 CFF8240_1555     TRUE 0.748 10.000 0.000 1.000   NA
 1983585 1983586 CFF8240_1555 CFF8240_1556     TRUE 0.620 -37.000 0.000 1.000   NA
 1983587 1983588 CFF8240_1557 CFF8240_1558     FALSE 0.265 108.000 0.020 NA   NA
 1983588 1983589 CFF8240_1558 CFF8240_1559   upp TRUE 0.900 8.000 0.005 NA   NA
 1983589 1983590 CFF8240_1559 CFF8240_1560 upp   FALSE 0.043 398.000 0.008 1.000 N NA
 1983590 1983591 CFF8240_1560 CFF8240_1561     FALSE 0.024 250.000 0.000 1.000 N NA
 1983591 1983592 CFF8240_1561 CFF8240_1562   gltX FALSE 0.055 135.000 0.000 1.000 N NA
 1983594 1983595 CFF8240_1564 CFF8240_1565 accC accB TRUE 0.994 -3.000 0.071 0.002 Y NA
 1983596 1983597 CFF8240_1566 CFF8240_1567 dcd   TRUE 0.639 11.000 0.000 1.000 N NA
 1983598 1983599 CFF8240_1568 CFF8240_1569     TRUE 0.922 1.000 0.000 0.037 N NA
 1983599 1983600 CFF8240_1569 CFF8240_1570     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983600 1983601 CFF8240_1570 CFF8240_1571   hemN TRUE 0.453 21.000 0.000 NA   NA
 1983601 1983602 CFF8240_1571 CFF8240_1572 hemN   TRUE 0.997 0.000 0.419 NA   NA
 1983602 1983603 CFF8240_1572 CFF8240_1573   argF TRUE 0.942 -7.000 0.025 NA   NA
 1983603 1983604 CFF8240_1573 CFF8240_1574 argF hemB TRUE 0.919 9.000 0.020 1.000 N NA
 1983605 1983606 CFF8240_1575 CFF8240_1576 ribA gidB TRUE 0.860 -16.000 0.017 1.000 N NA
 1983606 1983607 CFF8240_1576 CFF8240_1577 gidB   TRUE 0.919 -6.000 0.009 1.000   NA
 1983607 1983608 CFF8240_1577 CFF8240_1578     TRUE 0.993 -3.000 0.281 NA   NA
 1983608 1983609 CFF8240_1578 CFF8240_1579     TRUE 0.939 -3.000 0.010 NA   NA
 1983610 1983611 CFF8240_1580 CFF8240_1581 alr   TRUE 0.977 -7.000 0.119 NA   NA
 1983611 1983612 CFF8240_1581 CFF8240_1582     TRUE 0.899 13.000 0.052 NA   NA
 1983613 1983614 CFF8240_1583 CFF8240_1584     FALSE 0.158 69.000 0.000 NA   NA
 1983614 1983615 CFF8240_1584 CFF8240_1585     TRUE 0.732 -12.000 0.000 NA   NA
 1983615 1983616 CFF8240_1585 CFF8240_1586     TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.021   NA
 1983616 1983617 CFF8240_1586 CFF8240_1587     TRUE 0.790 9.000 0.000 1.000   NA
 1983617 1983618 CFF8240_1587 CFF8240_1588     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983618 1983619 CFF8240_1588 CFF8240_1589     TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1983619 1983620 CFF8240_1589 CFF8240_1590     TRUE 0.983 -3.000 0.060 0.038   NA
 1983620 1983621 CFF8240_1590 CFF8240_1591     TRUE 0.814 7.000 0.000 1.000   NA
 1983621 1983622 CFF8240_1591 CFF8240_1592     TRUE 0.892 0.000 0.000 1.000   NA
 1983622 1983623 CFF8240_1592 CFF8240_1593     TRUE 0.920 -3.000 0.000 0.021   NA
 1983623 1983624 CFF8240_1593 CFF8240_1594     TRUE 0.986 0.000 0.056 0.038   NA
 1983624 1983625 CFF8240_1594 CFF8240_1595     FALSE 0.343 29.000 0.000 NA   NA
 1983625 1983626 CFF8240_1595 CFF8240_1596     TRUE 0.753 -10.000 0.000 NA   NA
 1983626 1983627 CFF8240_1596 CFF8240_1597     TRUE 0.656 -19.000 0.000 NA   NA
 1983627 1983628 CFF8240_1597 CFF8240_1598     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 1983628 1983629 CFF8240_1598 CFF8240_1599     TRUE 0.815 -6.000 0.000 NA   NA
 1983629 1983630 CFF8240_1599 CFF8240_1600     TRUE 0.860 -9.000 0.000 0.037   NA
 1983630 1983631 CFF8240_1600 CFF8240_1601     TRUE 0.906 4.000 0.000 0.037   NA
 1983631 1983632 CFF8240_1601 CFF8240_1602     TRUE 0.980 1.000 0.057 1.000   NA
 1983632 1983633 CFF8240_1602 CFF8240_1603     TRUE 0.553 15.000 0.000 NA   NA
 1983633 1983634 CFF8240_1603 CFF8240_1604     TRUE 0.636 12.000 0.000 NA   NA
 1983634 1983635 CFF8240_1604 CFF8240_1605     FALSE 0.325 33.000 0.000 NA   NA
 1983635 1983636 CFF8240_1605 CFF8240_1606     TRUE 0.528 17.000 0.000 NA   NA
 1983636 1983637 CFF8240_1606 CFF8240_1607     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 1983637 1983638 CFF8240_1607 CFF8240_1608     FALSE 0.034 214.000 0.000 NA   NA
 1983638 1983639 CFF8240_1608 CFF8240_1609     TRUE 0.926 -3.000 0.003 NA   NA
 1983639 1983640 CFF8240_1609 CFF8240_1610     TRUE 0.638 -22.000 0.000 NA   NA
 1983640 1983641 CFF8240_1610 CFF8240_1611   asnB TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1983641 1983642 CFF8240_1611 CFF8240_1612 asnB   TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1983642 1983643 CFF8240_1612 CFF8240_1613     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983643 1983644 CFF8240_1613 CFF8240_1614     TRUE 0.687 -16.000 0.000 NA   NA
 1983644 1983645 CFF8240_1614 CFF8240_1615     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1983645 1983646 CFF8240_1615 CFF8240_1616     TRUE 0.973 -3.000 0.056 NA   NA
 1983646 1983647 CFF8240_1616 CFF8240_1617   asnB TRUE 0.992 -12.000 0.500 1.000 N NA
 1983647 1983648 CFF8240_1617 CFF8240_1618 asnB   TRUE 0.976 -3.000 0.066 NA   NA
 1983648 1983649 CFF8240_1618 CFF8240_1619     TRUE 0.875 -13.000 0.012 NA   NA
 1983649 1983650 CFF8240_1619 CFF8240_1620     TRUE 0.776 -9.000 0.000 1.000   NA
 1983650 1983651 CFF8240_1620 CFF8240_1621     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1983651 1983652 CFF8240_1621 CFF8240_1622     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983652 1983653 CFF8240_1622 CFF8240_1623     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983653 1983654 CFF8240_1623 CFF8240_1624     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983654 1983655 CFF8240_1624 CFF8240_1625     FALSE 0.115 89.000 0.000 NA   NA
 1983655 1983656 CFF8240_1625 CFF8240_1626     TRUE 0.629 -25.000 0.000 NA   NA
 1983656 1983657 CFF8240_1626 CFF8240_1627     FALSE 0.375 27.000 0.000 1.000   NA
 1983657 1983658 CFF8240_1627 CFF8240_1628     TRUE 0.413 23.000 0.000 NA   NA
 1983658 1983659 CFF8240_1628 CFF8240_1629     FALSE 0.036 212.000 0.000 NA   NA
 1983659 1983660 CFF8240_1629 CFF8240_1630     TRUE 0.991 -3.000 0.261 1.000 N NA
 1983660 1983661 CFF8240_1630 CFF8240_1631     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000   NA
 1983661 1983662 CFF8240_1631 CFF8240_1632     TRUE 0.998 -3.000 0.679 1.000   NA
 1983662 1983663 CFF8240_1632 CFF8240_1633     TRUE 0.442 41.000 0.000 0.014   NA
 1983663 1983664 CFF8240_1633 CFF8240_1634     FALSE 0.324 35.000 0.000 1.000   NA
 1983665 1983666 CFF8240_1635 CFF8240_1636     FALSE 0.204 199.000 0.000 0.002 Y NA
 1983666 1983667 CFF8240_1636 CFF8240_1637     FALSE 0.040 198.000 0.000 1.000   NA
 1983667 1983668 CFF8240_1637 CFF8240_1638     TRUE 0.575 14.000 0.000 NA   NA
 1983668 1983669 CFF8240_1638 CFF8240_1639     FALSE 0.112 91.000 0.000 NA   NA
 1983670 1983671 CFF8240_1640 CFF8240_1641     TRUE 0.884 1.000 0.000 NA   NA
 1983671 1983672 CFF8240_1641 CFF8240_1642     TRUE 0.999 -3.000 0.647 0.005 Y NA
 1983672 1983673 CFF8240_1642 CFF8240_1643   aspA FALSE 0.024 253.000 0.000 1.000 N NA
 1983673 1983674 CFF8240_1643 CFF8240_1644 aspA   TRUE 0.432 142.000 0.127 1.000   NA
 1983674 1983675 CFF8240_1644 CFF8240_1645     FALSE 0.023 344.000 0.000 1.000   NA
 1983676 1983677 CFF8240_1646 CFF8240_1647     TRUE 0.950 11.000 0.095 NA   NA
 1983677 1983678 CFF8240_1647 CFF8240_1648     FALSE 0.046 174.000 0.000 NA   NA
 1983679 1983680 CFF8240_1649 CFF8240_1650 exbB expD TRUE 0.999 -16.000 0.815 0.035 Y NA
 1983680 1983681 CFF8240_1650 CFF8240_1651 expD   TRUE 0.990 -3.000 0.148 0.078 N NA
 1983681 1983682 CFF8240_1651 CFF8240_1652     FALSE 0.055 135.000 0.000 1.000 N NA
 1983682 1983683 CFF8240_1652 CFF8240_1653     TRUE 0.999 0.000 0.412 0.024 Y NA
 1983683 1983684 CFF8240_1653 CFF8240_1654     TRUE 0.999 3.000 0.647 0.024 Y NA
 1983684 1983685 CFF8240_1654 CFF8240_1655     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1983685 1983686 CFF8240_1655 CFF8240_1657     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983688 1983689 CFF8240_1658 CFF8240_1659     TRUE 0.988 -3.000 0.161 NA   NA
 1983689 1983690 CFF8240_1659 CFF8240_1660     FALSE 0.182 63.000 0.000 NA   NA
 1983690 1983691 CFF8240_1660 CFF8240_1661     TRUE 0.512 18.000 0.000 NA   NA
 1983691 1983692 CFF8240_1661 CFF8240_1662     TRUE 0.870 0.000 0.000 1.000 N NA
 1983692 1983693 CFF8240_1662 CFF8240_1663   hprA FALSE 0.249 113.000 0.000 1.000 Y NA
 1983693 1983694 CFF8240_1663 CFF8240_1664 hprA   TRUE 0.958 3.000 0.021 NA   NA
 1983694 1983695 CFF8240_1664 CFF8240_1665     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 1983695 1983696 CFF8240_1665 CFF8240_1666     FALSE 0.118 88.000 0.000 NA   NA
 1983697 1983698 CFF8240_1667 CFF8240_1668     TRUE 0.985 -3.000 0.139 1.000 N NA
 1983698 1983699 CFF8240_1668 CFF8240_1669     TRUE 0.994 3.000 0.111 1.000 Y NA
 1983699 1983700 CFF8240_1669 CFF8240_1670     TRUE 0.944 0.000 0.008 1.000 N NA
 1983700 1983701 CFF8240_1670 CFF8240_1671     TRUE 0.945 -3.000 0.013 NA   NA
 1983702 1983703 CFF8240_1672 CFF8240_1673     FALSE 0.026 276.000 0.000 NA   NA
 1983703 1983704 CFF8240_1673 CFF8240_1674     FALSE 0.146 73.000 0.000 NA   NA
 1983704 1983705 CFF8240_1674 CFF8240_1675     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983705 1983706 CFF8240_1675 CFF8240_1676     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983706 1983707 CFF8240_1676 CFF8240_1677     TRUE 0.753 -10.000 0.000 NA   NA
 1983707 1983708 CFF8240_1677 CFF8240_1678     TRUE 0.979 -3.000 0.080 NA   NA
 1983708 1983709 CFF8240_1678 CFF8240_1679     TRUE 0.979 -3.000 0.080 NA   NA
 1983709 1983710 CFF8240_1679 CFF8240_1680     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 1983711 1983712 CFF8240_1681 CFF8240_1682     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983712 1983713 CFF8240_1682 CFF8240_1683     FALSE 0.230 55.000 0.000 NA   NA
 1983713 1983714 CFF8240_1683 CFF8240_1684     FALSE 0.392 25.000 0.000 NA   NA
 1983714 1983715 CFF8240_1684 CFF8240_1685     TRUE 0.826 5.000 0.000 NA   NA
 1983715 1983716 CFF8240_1685 CFF8240_1686     FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 1983716 1983717 CFF8240_1686 CFF8240_1687   purN TRUE 0.893 -7.000 0.009 1.000 N NA
 1983717 1983718 CFF8240_1687 CFF8240_1688 purN   TRUE 0.731 -9.000 0.000 NA N NA
 1983718 1983719 CFF8240_1688 CFF8240_1689     TRUE 0.827 -3.000 0.000 NA N NA
 1983719 1983720 CFF8240_1689 CFF8240_1690   def TRUE 0.970 -3.000 0.054 1.000 N NA
 1983720 1983721 CFF8240_1690 CFF8240_1691 def   TRUE 0.981 1.000 0.076 1.000 N NA
 1983721 1983722 CFF8240_1691 CFF8240_1692   clpP TRUE 0.792 12.000 0.009 1.000 N NA
 1983722 1983723 CFF8240_1692 CFF8240_1693 clpP tig TRUE 0.998 0.000 0.351 1.000 Y NA
 1983724 1983725 CFF8240_1694 CFF8240_1695 folE fliI TRUE 0.996 -3.000 0.378 0.039 N NA
 1983725 1983726 CFF8240_1695 CFF8240_1696 fliI   FALSE 0.233 197.000 0.086 1.000 N NA
 1983726 1983727 CFF8240_1696 CFF8240_1697     TRUE 0.638 22.000 0.011 1.000 N NA
 1983727 1983728 CFF8240_1697 CFF8240_1698     FALSE 0.019 312.000 0.000 1.000 N NA
 1983728 1983729 CFF8240_1698 CFF8240_1699     FALSE 0.042 162.000 0.000 1.000 N NA
 1983730 1983731 CFF8240_1700 CFF8240_1701   infC FALSE 0.044 183.000 0.000 NA   NA
 1983731 1983732 CFF8240_1701 CFF8240_1702 infC thrS TRUE 0.990 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 1983732 1983733 CFF8240_1702 CFF8240_1703 thrS   FALSE 0.028 253.000 0.000 NA   NA
 1983735 1983736 CFF8240_1705 CFF8240_1706     TRUE 0.815 -6.000 0.000 NA   NA
 1983736 1983737 CFF8240_1706 CFF8240_1707     FALSE 0.031 240.000 0.000 NA   NA
 1983737 1983738 CFF8240_1707 CFF8240_1708     FALSE 0.016 1047.000 0.000 NA   NA
 1983738 1983739 CFF8240_1708 CFF8240_1709     FALSE 0.127 83.000 0.000 NA   NA
 1983739 1983740 CFF8240_1709 CFF8240_1710     FALSE 0.081 117.000 0.000 NA   NA
 1983740 1983741 CFF8240_1710 CFF8240_1711     TRUE 0.686 11.000 0.000 1.000   NA
 1983741 1983742 CFF8240_1711 CFF8240_1712     FALSE 0.067 132.000 0.000 NA   NA
 1983742 1983743 CFF8240_1712 CFF8240_1713     FALSE 0.025 291.000 0.000 NA   NA
 1983743 1983744 CFF8240_1713 CFF8240_1714     FALSE 0.236 54.000 0.000 NA   NA
 1983744 1983745 CFF8240_1714 CFF8240_1715     FALSE 0.177 64.000 0.000 NA   NA
 1983745 1983746 CFF8240_1715 CFF8240_1716   lspA TRUE 0.969 0.000 0.023 NA   NA
 1983746 1983747 CFF8240_1716 CFF8240_1717 lspA glmM TRUE 0.948 -7.000 0.042 1.000 N NA
 1983748 1983749 CFF8240_1718 CFF8240_1719 rpsT prfA TRUE 0.861 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1983749 1983750 CFF8240_1719 CFF8240_1720 prfA   FALSE 0.383 26.000 0.000 NA   NA
 1983751 1983752 CFF8240_1721 CFF8240_1722   xth TRUE 0.662 18.000 0.003 1.000 N NA
 1983753 1983754 CFF8240_1723 CFF8240_1724     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 1983754 1983755 CFF8240_1724 CFF8240_1726     FALSE 0.270 45.000 0.000 1.000   NA
 1983758 1983759 CFF8240_1727 CFF8240_1729     TRUE 0.999 -3.000 0.616 0.083 Y NA
 1983759 1983760 CFF8240_1729 CFF8240_1730     TRUE 0.962 -3.000 0.025 1.000   NA
 1983760 1983761 CFF8240_1730 CFF8240_1731     TRUE 0.989 -3.000 0.174 1.000   NA
 1983762 1983763 CFF8240_1732 CFF8240_1733     TRUE 0.669 -18.000 0.000 NA   NA
 1983763 1983764 CFF8240_1733 CFF8240_1734     FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 1983764 1983765 CFF8240_1734 CFF8240_1735     TRUE 0.922 32.000 0.308 1.000 N NA
 1983765 1983766 CFF8240_1735 CFF8240_1736     TRUE 0.559 13.000 0.000 1.000 N NA
 1983766 1983767 CFF8240_1736 CFF8240_1737     TRUE 0.934 -37.000 0.105 1.000 N NA
 1983767 1983768 CFF8240_1737 CFF8240_1738     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 1983768 1983769 CFF8240_1738 CFF8240_1739     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1983769 1983770 CFF8240_1739 CFF8240_1740     TRUE 0.656 -19.000 0.000 NA   NA
 1983771 1983772 CFF8240_1741 CFF8240_1742 aroC rnc TRUE 0.960 -3.000 0.030 1.000 N NA
 1983772 1983773 CFF8240_1742 CFF8240_1743 rnc rnhA TRUE 0.942 -7.000 0.032 1.000 N NA
 1983773 1983774 CFF8240_1743 CFF8240_1744 rnhA   TRUE 0.773 -22.000 0.005 1.000 N NA
 1983775 1983776 CFF8240_1745 CFF8240_1746 dnaG   TRUE 0.963 -3.000 0.035 1.000 N NA
 1983776 1983777 CFF8240_1746 CFF8240_1747     FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 1983777 1983778 CFF8240_1747 CFF8240_1748     FALSE 0.230 55.000 0.000 NA   NA
 1983779 1983780 CFF8240_1749 CFF8240_1750     FALSE 0.125 85.000 0.000 NA   NA
 1983780 1983781 CFF8240_1750 CFF8240_1751   algI TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 1983782 1983783 CFF8240_1752 CFF8240_1753 ilvD   FALSE 0.026 239.000 0.000 1.000 N NA
 1983783 1983784 CFF8240_1753 CFF8240_1754   pyrG FALSE 0.189 141.000 0.000 1.000 Y NA
 1983784 1983785 CFF8240_1754 CFF8240_1755 pyrG recJ TRUE 0.944 -6.000 0.026 1.000 N NA
 1983785 1983786 CFF8240_1755 CFF8240_1756 recJ nhaA TRUE 0.864 1.000 0.000 1.000 N NA
 1983786 1983787 CFF8240_1756 CFF8240_1757 nhaA   TRUE 0.940 -10.000 0.000 0.045 Y NA
 1983787 1983788 CFF8240_1757 CFF8240_1758     FALSE 0.292 98.000 0.000 1.000 Y NA
 1983788 1983789 CFF8240_1758 CFF8240_1759     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1983789 1983790 CFF8240_1759 CFF8240_1760     FALSE 0.118 88.000 0.000 NA   NA
 1983790 1983791 CFF8240_1760 CFF8240_1761     TRUE 0.944 -10.000 0.000 0.024 Y NA
 1983791 1983792 CFF8240_1761 CFF8240_1762     TRUE 0.997 0.000 0.226 1.000 Y NA
 1983792 1983793 CFF8240_1762 CFF8240_1763     TRUE 0.994 3.000 0.113 1.000 Y NA
 1983793 1983794 CFF8240_1763 CFF8240_1764     FALSE 0.027 272.000 0.000 1.000   NA
 1983795 1983796 CFF8240_1765 CFF8240_1766     TRUE 0.704 -15.000 0.000 NA   NA
 1983796 1983797 CFF8240_1766 CFF8240_1767     FALSE 0.043 187.000 0.000 NA   NA
 1983799 1983800 CFF8240_1769 CFF8240_1770 flgE   FALSE 0.055 154.000 0.000 1.000   NA
 1983800 1983801 CFF8240_1770 CFF8240_1771   dapF TRUE 0.746 17.000 0.010 1.000   NA
 1983801 1983802 CFF8240_1771 CFF8240_1772 dapF coaE TRUE 0.841 -19.000 0.016 1.000 N NA
 1983802 1983803 CFF8240_1772 CFF8240_1773 coaE   FALSE 0.157 62.000 0.000 NA N NA
 1983805 1983806 CFF8240_1775 CFF8240_1776     TRUE 0.723 -13.000 0.000 1.000   NA
 1983806 1983807 CFF8240_1776 CFF8240_1777     TRUE 0.879 2.000 0.000 1.000   NA
 1983807 1983808 CFF8240_1777 CFF8240_1778     FALSE 0.229 56.000 0.000 1.000   NA
 1983808 1983809 CFF8240_1778 CFF8240_1779     TRUE 0.445 78.000 0.040 NA   NA
 1983809 1983810 CFF8240_1779 CFF8240_1780   pyrE TRUE 0.971 0.000 0.025 NA   NA
 1983810 1983811 CFF8240_1780 CFF8240_1781 pyrE frr TRUE 0.959 3.000 0.026 1.000 N NA
 1983811 1983812 CFF8240_1781 CFF8240_1782 frr   TRUE 0.862 -10.000 0.007 1.000 N NA
 1983812 1983813 CFF8240_1782 CFF8240_1783     TRUE 0.465 39.000 0.007 1.000 N NA
 1983813 1983814 CFF8240_1783 CFF8240_1784     FALSE 0.292 100.000 0.007 0.045   NA
 1983814 1983815 CFF8240_1784 CFF8240_1785     FALSE 0.025 283.000 0.000 NA   NA
 1983815 1983816 CFF8240_1785 CFF8240_1786     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 1983816 1983817 CFF8240_1786 CFF8240_1787     TRUE 0.453 21.000 0.000 NA   NA
 1983817 1983818 CFF8240_1787 CFF8240_1788     TRUE 0.400 24.000 0.000 NA   NA
 1983818 1983819 CFF8240_1788 CFF8240_1789     TRUE 0.680 11.000 0.000 NA   NA
 1983820 1983821 CFF8240_1790 CFF8240_1791     FALSE 0.038 203.000 0.000 NA   NA
 1983822 1983823 CFF8240_1792 CFF8240_1793     FALSE 0.085 114.000 0.000 NA   NA
 1983825 1983826 CFF8240_1795 CFF8240_1796     FALSE 0.020 400.000 0.000 NA   NA
 1983826 1983827 CFF8240_1796 CFF8240_1797     FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 1983827 1983828 CFF8240_1797 CFF8240_1798     FALSE 0.029 250.000 0.000 NA   NA
 1983828 1983829 CFF8240_1798 CFF8240_1799     TRUE 0.512 18.000 0.000 NA   NA
 1983829 1983830 CFF8240_1799 CFF8240_1800   thyX FALSE 0.018 545.000 0.000 NA   NA
 1983830 1983831 CFF8240_1800 CFF8240_1801 thyX   TRUE 0.467 35.000 0.000 0.004 N NA
 1983831 1983832 CFF8240_1801 CFF8240_1802     TRUE 0.972 28.000 0.600 NA   NA
 1983832 1983833 CFF8240_1802 CFF8240_1803     TRUE 0.753 -10.000 0.000 NA   NA
 1983833 1983834 CFF8240_1803 CFF8240_1804     FALSE 0.155 70.000 0.000 NA   NA
 1983834 1983835 CFF8240_1804 CFF8240_1805     FALSE 0.087 112.000 0.000 NA   NA
 1983835 1983836 CFF8240_1805 CFF8240_1806     TRUE 0.420 23.000 0.000 1.000   NA
 1983836 1983837 CFF8240_1806 CFF8240_1807     FALSE 0.277 42.000 0.000 NA   NA
 1983837 1983838 CFF8240_1807 CFF8240_1808     FALSE 0.193 61.000 0.000 NA   NA
 1983838 1983839 CFF8240_1808 CFF8240_1809     FALSE 0.368 27.000 0.000 NA   NA
 1983839 1983840 CFF8240_1809 CFF8240_1810     TRUE 0.990 0.000 0.167 1.000 N NA
 1983840 1983841 CFF8240_1810 CFF8240_1811     TRUE 0.991 -3.000 0.222 1.000   NA
 1983841 1983842 CFF8240_1811 CFF8240_1812     TRUE 0.946 -7.000 0.028 1.000   NA
 1983842 1983843 CFF8240_1812 CFF8240_1813     FALSE 0.286 33.000 0.000 1.000 N NA
 1983844 1983845 CFF8240_1814 CFF8240_1815 hisF   TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1983845 1983846 CFF8240_1815 CFF8240_1816     TRUE 0.961 -3.000 0.010 0.024   NA
 1983846 1983847 CFF8240_1816 CFF8240_1817     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 1983849 1983850 CFF8240_1819 CFF8240_1820 purB   TRUE 0.549 77.000 0.012 1.000 Y NA
 1983850 1983851 CFF8240_1820 CFF8240_1821   lysP FALSE 0.027 229.000 0.000 1.000 N NA