MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas putida F1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6982074 6982075 Pput_0001 Pput_0002 dnaA   TRUE 0.943 41.000 0.328 1.000 Y NA
 6982075 6982076 Pput_0002 Pput_0003   recF TRUE 0.976 16.000 0.318 1.000 Y NA
 6982076 6982077 Pput_0003 Pput_0004 recF gyrB TRUE 0.995 5.000 0.249 0.004 Y NA
 6982077 6982078 Pput_0004 Pput_0005 gyrB   FALSE 0.002 837.000 0.000 NA   NA
 6982078 6982079 Pput_0005 Pput_0006     TRUE 0.695 -19.000 0.000 NA   NA
 6982079 6982080 Pput_0006 Pput_0007     TRUE 0.828 -3.000 0.000 1.000   NA
 6982080 6982081 Pput_0007 Pput_0008     FALSE 0.122 76.000 0.000 NA   NA
 6982081 6982082 Pput_0008 Pput_0009     FALSE 0.197 57.000 0.000 NA   NA
 6982082 6982083 Pput_0009 Pput_0010     FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 6982084 6982085 Pput_0011 Pput_0012     TRUE 0.977 -10.000 0.333 NA   NA
 6982085 6982086 Pput_0012 Pput_0013     TRUE 0.989 10.000 0.750 1.000   NA
 6982086 6982087 Pput_0013 Pput_0014     TRUE 0.728 -10.000 0.000 NA   NA
 6982087 6982088 Pput_0014 Pput_0015     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6982088 6982089 Pput_0015 Pput_0016     FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 6982090 6982091 Pput_0017 Pput_0018     TRUE 0.999 0.000 0.800 0.003 Y NA
 6982091 6982092 Pput_0018 Pput_0019     FALSE 0.301 37.000 0.000 NA   NA
 6982092 6982093 Pput_0019 Pput_0020     FALSE 0.405 87.000 0.133 NA   NA
 6982093 6982094 Pput_0020 Pput_0021     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 6982094 6982095 Pput_0021 Pput_0022     TRUE 0.983 -3.000 0.333 1.000 N NA
 6982095 6982096 Pput_0022 Pput_0023     TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 6982096 6982097 Pput_0023 Pput_0024     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 6982098 6982099 Pput_0025 Pput_0026     TRUE 0.990 -3.000 0.457 NA   NA
 6982099 6982100 Pput_0026 Pput_0027     FALSE 0.385 26.000 0.000 NA   NA
 6982100 6982101 Pput_0027 Pput_0028     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6982101 6982102 Pput_0028 Pput_0029     FALSE 0.015 266.000 0.000 1.000   NA
 6982102 6982103 Pput_0029 Pput_0030     FALSE 0.037 338.000 0.000 0.003   NA
 6982103 6982104 Pput_0030 Pput_0031     FALSE 0.041 185.000 0.000 NA   NA
 6982105 6982106 Pput_0032 Pput_0033     FALSE 0.005 394.000 0.000 NA   NA
 6982108 6982109 Pput_0035 Pput_0036     FALSE 0.008 311.000 0.000 NA   NA
 6982109 6982110 Pput_0036 Pput_0037     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6982110 6982111 Pput_0037 Pput_0038     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6982113 6982114 Pput_0040 Pput_0041     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 6982116 6982117 Pput_0043 Pput_0044     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 6982120 6982121 Pput_0047 Pput_0048     TRUE 0.959 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 6982121 6982122 Pput_0048 Pput_0049     TRUE 0.708 -34.000 0.000 1.000   NA
 6982123 6982124 Pput_0050 Pput_0051     FALSE 0.010 211.000 0.000 NA N NA
 6982124 6982125 Pput_0051 Pput_0052     FALSE 0.442 20.000 0.000 NA   NA
 6982125 6982126 Pput_0052 Pput_0053     FALSE 0.065 145.000 0.000 NA   NA
 6982126 6982127 Pput_0053 Pput_0054     FALSE 0.073 128.000 0.000 NA   NA
 6982128 6982129 Pput_0055 Pput_0056     FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 6982129 6982130 Pput_0056 Pput_0057     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 6982130 6982131 Pput_0057 Pput_0058     TRUE 0.921 25.000 0.421 1.000 N NA
 6982131 6982132 Pput_0058 Pput_0059     TRUE 0.893 69.000 0.368 1.000 Y NA
 6982133 6982134 Pput_0060 Pput_0061     FALSE 0.004 489.000 0.000 1.000   NA
 6982134 6982135 Pput_0061 Pput_0062     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6982136 6982137 Pput_0063 Pput_0064     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 6982137 6982138 Pput_0064 Pput_0065     TRUE 0.572 13.000 0.000 NA   NA
 6982138 6982139 Pput_0065 Pput_0066     FALSE 0.003 691.000 0.000 NA   NA
 6982139 6982140 Pput_0066 Pput_0067     FALSE 0.071 132.000 0.000 NA   NA
 6982141 6982142 Pput_0068 Pput_0069     TRUE 0.812 41.000 0.230 1.000   NA
 6982142 6982143 Pput_0069 Pput_0070     TRUE 0.963 -3.000 0.122 1.000   NA
 6982145 6982146 Pput_0072 Pput_0073     FALSE 0.257 98.000 0.094 1.000 N NA
 6982147 6982148 Pput_0074 Pput_0075     TRUE 0.801 47.000 0.310 1.000 N NA
 6982148 6982149 Pput_0075 Pput_0076   glyS TRUE 0.932 4.000 0.123 1.000 N NA
 6982149 6982150 Pput_0076 Pput_0077 glyS glyQ TRUE 0.999 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 6982151 6982152 Pput_0078 Pput_0079     FALSE 0.271 42.000 0.017 1.000 N NA
 6982153 6982154 Pput_0080 Pput_0081   trkA TRUE 0.684 12.000 0.008 1.000   NA
 6982154 6982155 Pput_0081 Pput_0082 trkA   TRUE 0.759 24.000 0.122 1.000 N NA
 6982155 6982156 Pput_0082 Pput_0083   fmt TRUE 0.994 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 6982156 6982157 Pput_0083 Pput_0084 fmt def TRUE 0.888 61.000 0.105 0.017 Y NA
 6982158 6982159 Pput_0085 Pput_0086     FALSE 0.275 43.000 0.023 NA N NA
 6982159 6982160 Pput_0086 Pput_0087     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 6982162 6982163 Pput_0089 Pput_0090   aroE TRUE 0.706 26.000 0.093 1.000 N NA
 6982164 6982165 Pput_0091 Pput_0092     TRUE 0.568 145.000 0.259 0.066 N NA
 6982165 6982166 Pput_0092 Pput_0093     TRUE 0.897 15.000 0.218 1.000 N NA
 6982170 6982171 Pput_0097 Pput_0098 trpA   TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 6982174 6982175 Pput_0101 Pput_0102     FALSE 0.201 101.000 0.049 NA   NA
 6982177 6982178 Pput_0104 Pput_0105     FALSE 0.211 76.000 0.026 NA   NA
 6982179 6982180 Pput_0106 Pput_0107     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6982182 6982183 Pput_0109 Pput_0110     TRUE 0.876 -3.000 0.016 1.000   NA
 6982184 6982185 Pput_0111 Pput_0112     TRUE 0.969 -3.000 0.173 NA   NA
 6982185 6982186 Pput_0112 Pput_0113     FALSE 0.372 125.000 0.173 NA   NA
 6982186 6982187 Pput_0113 Pput_0114     FALSE 0.071 71.000 0.000 1.000 N NA
 6982187 6982188 Pput_0114 Pput_0115     FALSE 0.004 304.000 0.000 1.000 N NA
 6982188 6982189 Pput_0115 Pput_0116     TRUE 0.535 193.000 0.241 1.000 Y NA
 6982190 6982191 Pput_0117 Pput_0118     FALSE 0.073 112.000 0.000 NA   NA
 6982192 6982193 Pput_0119 Pput_0120     TRUE 0.988 44.000 0.741 0.003 Y NA
 6982193 6982194 Pput_0120 Pput_0121     TRUE 0.954 10.000 0.268 1.000 N NA
 6982194 6982195 Pput_0121 Pput_0122     TRUE 0.957 17.000 0.536 1.000 N NA
 6982197 6982198 Pput_0124 Pput_0125     TRUE 0.989 -31.000 0.722 NA   NA
 6982198 6982199 Pput_0125 Pput_0126     TRUE 0.959 10.000 0.255 NA   NA
 6982199 6982200 Pput_0126 Pput_0127     TRUE 0.990 -15.000 0.321 1.000 Y NA
 6982200 6982201 Pput_0127 Pput_0128     TRUE 0.957 -3.000 0.099 1.000   NA
 6982202 6982203 Pput_0129 Pput_0130     TRUE 0.964 65.000 0.867 NA Y NA
 6982203 6982204 Pput_0130 Pput_0131     TRUE 0.996 0.000 0.469 1.000 Y NA
 6982206 6982207 Pput_0133 Pput_0134     FALSE 0.173 127.000 0.037 1.000   NA
 6982207 6982208 Pput_0134 Pput_0135     TRUE 0.997 -7.000 0.755 1.000 Y NA
 6982208 6982209 Pput_0135 Pput_0136     TRUE 0.994 -3.000 0.309 1.000 Y NA
 6982211 6982212 Pput_0138 Pput_0139     TRUE 0.605 70.000 0.204 NA   NA
 6982215 6982216 Pput_0142 Pput_0143     TRUE 0.895 32.000 0.000 0.012 Y NA
 6982216 6982217 Pput_0143 Pput_0144     FALSE 0.030 152.000 0.000 1.000 N NA
 6982217 6982218 Pput_0144 Pput_0145     TRUE 0.904 13.000 0.162 NA   NA
 6982218 6982219 Pput_0145 Pput_0146     TRUE 0.793 28.000 0.147 NA   NA
 6982219 6982220 Pput_0146 Pput_0147     TRUE 0.680 74.000 0.350 1.000 N NA
 6982220 6982221 Pput_0147 Pput_0148     FALSE 0.210 191.000 0.200 NA N NA
 6982222 6982223 Pput_0149 Pput_0150     TRUE 0.996 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 6982224 6982225 Pput_0151 Pput_0152     FALSE 0.047 173.000 0.000 NA   NA
 6982225 6982226 Pput_0152 Pput_0153     FALSE 0.265 44.000 0.000 NA   NA
 6982226 6982227 Pput_0153 Pput_0154     TRUE 0.954 3.000 0.140 NA   NA
 6982227 6982228 Pput_0154 Pput_0155   gltP FALSE 0.002 744.000 0.000 NA   NA
 6982228 6982229 Pput_0155 Pput_0156 gltP   FALSE 0.172 148.000 0.047 1.000   NA
 6982230 6982231 Pput_0157 Pput_0158     TRUE 0.974 -3.000 0.201 NA   NA
 6982231 6982232 Pput_0158 Pput_0159     TRUE 0.996 4.000 0.650 NA Y NA
 6982232 6982233 Pput_0159 Pput_0160     TRUE 0.996 -3.000 0.491 NA Y NA
 6982233 6982234 Pput_0160 Pput_0161     FALSE 0.118 202.000 0.075 NA   NA
 6982234 6982235 Pput_0161 Pput_0162     FALSE 0.340 94.000 0.109 NA   NA
 6982235 6982236 Pput_0162 Pput_0163     TRUE 0.947 31.000 0.600 1.000   NA
 6982236 6982237 Pput_0163 Pput_0164     FALSE 0.074 283.000 0.000 1.000 Y NA
 6982237 6982238 Pput_0164 Pput_0165     TRUE 0.569 70.000 0.085 0.081 N NA
 6982240 6982241 Pput_0167 Pput_0168     TRUE 0.989 6.000 0.647 NA   NA
 6982241 6982242 Pput_0168 Pput_0169     TRUE 0.947 37.000 0.727 NA   NA
 6982242 6982243 Pput_0169 Pput_0170     TRUE 0.830 90.000 0.800 NA   NA
 6982243 6982244 Pput_0170 Pput_0171     FALSE 0.008 312.000 0.000 NA   NA
 6982244 6982245 Pput_0171 Pput_0172     FALSE 0.004 434.000 0.000 NA   NA
 6982245 6982246 Pput_0172 Pput_0173     FALSE 0.382 187.000 0.077 1.000 Y NA
 6982246 6982247 Pput_0173 Pput_0174     TRUE 0.985 3.000 0.144 0.001   NA
 6982247 6982248 Pput_0174 Pput_0175     TRUE 0.995 12.000 0.829 0.001   NA
 6982248 6982249 Pput_0175 Pput_0176     FALSE 0.002 420.000 0.000 1.000 N NA
 6982250 6982251 Pput_0177 Pput_0178     TRUE 0.861 14.000 0.143 1.000 N NA
 6982251 6982252 Pput_0178 Pput_R0001     FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 6982252 6982253 Pput_R0001 Pput_R0002     FALSE 0.011 281.000 0.000 NA   NA
 6982253 6982254 Pput_R0002 Pput_R0003     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 6982254 6982255 Pput_R0003 Pput_R0004     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 6982256 6982257 Pput_0179 Pput_0180     TRUE 0.670 94.000 0.160 NA Y NA
 6982257 6982258 Pput_0180 Pput_0181     TRUE 0.980 5.000 0.444 NA N NA
 6982258 6982259 Pput_0181 Pput_0182     TRUE 0.610 89.000 0.000 0.059 Y NA
 6982260 6982261 Pput_0183 Pput_0184     TRUE 0.957 11.000 0.273 NA   NA
 6982262 6982263 Pput_0185 Pput_0186     TRUE 0.989 -10.000 0.447 0.081 N NA
 6982264 6982265 Pput_0187 Pput_0188     FALSE 0.010 293.000 0.000 NA   NA
 6982265 6982266 Pput_0188 Pput_0189     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 6982266 6982267 Pput_0189 Pput_0190     FALSE 0.033 199.000 0.000 NA   NA
 6982267 6982268 Pput_0190 Pput_0191     TRUE 0.963 18.000 0.647 NA N NA
 6982268 6982269 Pput_0191 Pput_0192     TRUE 0.994 7.000 0.553 NA Y NA
 6982269 6982270 Pput_0192 Pput_0193     TRUE 0.992 15.000 0.795 1.000 Y NA
 6982272 6982273 Pput_0195 Pput_0196     FALSE 0.031 208.000 0.000 1.000   NA
 6982273 6982274 Pput_0196 Pput_0197     TRUE 0.990 -3.000 0.444 NA   NA
 6982274 6982275 Pput_0197 Pput_0198     TRUE 0.986 -3.000 0.353 NA   NA
 6982275 6982276 Pput_0198 Pput_0199     TRUE 0.992 -3.000 0.529 NA   NA
 6982276 6982277 Pput_0199 Pput_0200     TRUE 0.994 -3.000 0.800 1.000 N NA
 6982277 6982278 Pput_0200 Pput_0201     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 6982278 6982279 Pput_0201 Pput_0202     FALSE 0.107 81.000 0.000 NA   NA
 6982280 6982281 Pput_0203 Pput_0204     TRUE 0.598 70.000 0.200 NA   NA
 6982284 6982285 Pput_0207 Pput_0208   hemC FALSE 0.109 119.000 0.032 1.000 N NA
 6982285 6982286 Pput_0208 Pput_0209 hemC   TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 6982286 6982287 Pput_0209 Pput_0210     TRUE 0.966 46.000 0.600 1.000 Y NA
 6982287 6982288 Pput_0210 Pput_0211     TRUE 0.998 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 6982288 6982289 Pput_0211 Pput_0212     FALSE 0.043 223.000 0.042 1.000 N NA
 6982289 6982290 Pput_0212 Pput_0213     FALSE 0.091 232.000 0.133 1.000 N NA
 6982294 6982295 Pput_0217 Pput_0218     TRUE 0.955 0.000 0.108 NA   NA
 6982295 6982296 Pput_0218 Pput_0219     FALSE 0.123 199.000 0.075 NA   NA
 6982297 6982298 Pput_0220 Pput_0221     TRUE 0.994 -3.000 0.330 NA Y NA
 6982299 6982300 Pput_0222 Pput_0223     TRUE 0.876 62.000 0.600 NA   NA
 6982300 6982301 Pput_0223 Pput_0224     FALSE 0.144 70.000 0.000 NA   NA
 6982302 6982303 Pput_0225 Pput_0226     FALSE 0.055 171.000 0.000 1.000   NA
 6982303 6982304 Pput_0226 Pput_R0005     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 6982305 6982306 Pput_0227 Pput_0228   gabD FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 6982306 6982307 Pput_0228 Pput_0229 gabD   FALSE 0.342 183.000 0.303 1.000 N NA
 6982307 6982308 Pput_0229 Pput_0230     FALSE 0.324 138.000 0.182 1.000 N NA
 6982309 6982310 Pput_0231 Pput_0232     FALSE 0.501 100.000 0.294 1.000 N NA
 6982312 6982313 Pput_0234 Pput_0235     TRUE 0.987 -10.000 0.222 1.000 Y NA
 6982313 6982314 Pput_0235 Pput_0236     TRUE 0.998 2.000 0.800 NA Y NA
 6982314 6982315 Pput_0236 Pput_0237     TRUE 0.976 -7.000 0.346 NA N NA
 6982315 6982316 Pput_0237 Pput_0238     TRUE 0.987 0.000 0.452 NA N NA
 6982316 6982317 Pput_0238 Pput_0239     TRUE 0.908 142.000 0.500 0.006 Y NA
 6982317 6982318 Pput_0239 Pput_0240     FALSE 0.004 318.000 0.000 1.000 N NA
 6982318 6982319 Pput_0240 Pput_0241     TRUE 0.986 3.000 0.150 1.000 Y NA
 6982319 6982320 Pput_0241 Pput_0242     TRUE 0.992 -3.000 0.100 0.083 Y NA
 6982321 6982322 Pput_0243 Pput_0244     FALSE 0.006 271.000 0.000 1.000 N NA
 6982323 6982324 Pput_0245 Pput_0246 tauD   TRUE 0.950 7.000 0.214 1.000 N NA
 6982324 6982325 Pput_0246 Pput_0247   tauB TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 6982325 6982326 Pput_0247 Pput_0248 tauB   TRUE 0.938 14.000 0.058 1.000 Y NA
 6982327 6982328 Pput_0249 Pput_0250     FALSE 0.060 166.000 0.000 1.000   NA
 6982328 6982329 Pput_0250 Pput_0251     FALSE 0.050 219.000 0.028 1.000   NA
 6982329 6982330 Pput_0251 Pput_0252     FALSE 0.498 86.000 0.193 1.000   NA
 6982330 6982331 Pput_0252 Pput_0253     TRUE 0.593 60.000 0.176 1.000 N NA
 6982331 6982332 Pput_0253 Pput_0254     TRUE 0.939 11.000 0.226 1.000 N NA
 6982332 6982333 Pput_0254 Pput_0255   ssuB TRUE 0.996 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 6982333 6982334 Pput_0255 Pput_0256 ssuB   TRUE 0.771 28.000 0.161 1.000 N NA
 6982335 6982336 Pput_0257 Pput_0258     TRUE 0.656 0.000 0.000 1.000 N NA
 6982336 6982337 Pput_0258 Pput_0259     FALSE 0.102 139.000 0.036 NA N NA
 6982337 6982338 Pput_0259 Pput_0260     TRUE 0.865 0.000 0.036 NA N NA
 6982339 6982340 Pput_0261 Pput_0262 ompR   TRUE 0.994 14.000 0.584 0.036 Y NA
 6982341 6982342 Pput_0263 Pput_0264     TRUE 0.946 -3.000 0.102 1.000 N NA
 6982345 6982346 Pput_0267 Pput_0268 hslO   FALSE 0.088 180.000 0.048 1.000 N NA
 6982346 6982347 Pput_0268 Pput_0269     FALSE 0.011 282.000 0.000 NA   NA
 6982348 6982349 Pput_0270 Pput_0271     FALSE 0.034 197.000 0.000 NA   NA
 6982349 6982350 Pput_0271 Pput_0272     TRUE 0.998 6.000 0.571 0.003 Y NA
 6982353 6982354 Pput_0275 Pput_0276 nudE   TRUE 0.988 -3.000 0.373 1.000   NA
 6982355 6982356 Pput_0277 Pput_0278     TRUE 0.905 0.000 0.035 NA   NA
 6982356 6982357 Pput_0278 Pput_0279     TRUE 0.995 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 6982357 6982358 Pput_0279 Pput_0280     TRUE 0.618 43.000 0.111 1.000 N NA
 6982359 6982360 Pput_0281 Pput_0282     FALSE 0.256 195.000 0.214 NA   NA
 6982363 6982364 Pput_0285 Pput_0286     FALSE 0.008 246.000 0.000 1.000 N NA
 6982364 6982365 Pput_0286 Pput_0287     TRUE 0.998 2.000 0.800 1.000 Y NA
 6982368 6982369 Pput_0290 Pput_0291     TRUE 0.814 42.000 0.250 NA   NA
 6982369 6982370 Pput_0291 Pput_0292     FALSE 0.004 421.000 0.000 NA   NA
 6982371 6982372 Pput_0293 Pput_R0006     FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 6982372 6982373 Pput_R0006 Pput_0294     FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 6982374 6982375 Pput_0295 Pput_0296     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6982376 6982377 Pput_0297 Pput_0298     FALSE 0.181 112.000 0.046 NA   NA
 6982377 6982378 Pput_0298 Pput_0299     TRUE 0.995 0.000 0.195 0.012 Y NA
 6982378 6982379 Pput_0299 Pput_0300     TRUE 0.911 55.000 0.169 0.083 Y NA
 6982379 6982380 Pput_0300 Pput_0301     TRUE 0.995 12.000 0.824 1.000 Y NA
 6982382 6982383 Pput_0303 Pput_0304     FALSE 0.038 188.000 0.000 NA   NA
 6982383 6982384 Pput_0304 Pput_R0007     FALSE 0.049 171.000 0.000 NA   NA
 6982384 6982385 Pput_R0007 Pput_0305     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6982385 6982386 Pput_0305 Pput_0306     TRUE 0.957 -3.000 0.150 NA N NA
 6982386 6982387 Pput_0306 Pput_0307     TRUE 0.859 -3.000 0.033 NA N NA
 6982388 6982389 Pput_0308 Pput_0309   hisB FALSE 0.020 231.000 0.000 NA   NA
 6982389 6982390 Pput_0309 Pput_0310 hisB hisH TRUE 0.994 1.000 0.111 0.003 Y NA
 6982390 6982391 Pput_0310 Pput_0311 hisH   TRUE 0.934 1.000 0.069 NA   NA
 6982391 6982392 Pput_0311 Pput_0312     FALSE 0.464 28.000 0.016 NA   NA
 6982392 6982393 Pput_0312 Pput_0313     TRUE 0.995 11.000 0.433 0.003 Y NA
 6982394 6982395 Pput_0314 Pput_0315     TRUE 0.998 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 6982395 6982396 Pput_0315 Pput_0316     TRUE 0.892 85.000 0.328 0.064 Y NA
 6982397 6982398 Pput_0317 Pput_0318     FALSE 0.002 502.000 0.000 1.000 N NA
 6982401 6982402 Pput_0321 Pput_0322     TRUE 0.973 11.000 0.419 NA   NA
 6982402 6982403 Pput_0322 Pput_0323     TRUE 0.641 171.000 0.608 1.000   NA
 6982403 6982404 Pput_0323 Pput_0324     FALSE 0.255 124.000 0.074 1.000   NA
 6982406 6982407 Pput_0326 Pput_0327     FALSE 0.136 72.000 0.000 NA   NA
 6982407 6982408 Pput_0327 Pput_0328     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6982409 6982410 Pput_0329 Pput_0330     TRUE 0.884 77.000 0.868 1.000   NA
 6982410 6982411 Pput_0330 Pput_0331     TRUE 0.983 16.000 0.912 1.000   NA
 6982411 6982412 Pput_0331 Pput_0332     TRUE 0.868 179.000 0.574 0.048 Y NA
 6982412 6982413 Pput_0332 Pput_0333     TRUE 0.997 0.000 0.667 1.000 Y NA
 6982413 6982414 Pput_0333 Pput_0334     TRUE 0.997 11.000 0.776 0.019 Y NA
 6982414 6982415 Pput_0334 Pput_0335     FALSE 0.003 601.000 0.000 NA   NA
 6982417 6982418 Pput_0337 Pput_0338     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 6982420 6982421 Pput_0340 Pput_0341     TRUE 0.866 -3.000 0.017 NA   NA
 6982421 6982422 Pput_0341 Pput_0342     FALSE 0.008 322.000 0.005 NA   NA
 6982424 6982425 Pput_0344 Pput_0345     TRUE 0.979 16.000 0.357 1.000 Y NA
 6982425 6982426 Pput_0345 Pput_0346     TRUE 0.997 15.000 0.824 0.001 Y NA
 6982426 6982427 Pput_0346 Pput_0347     TRUE 0.998 -3.000 0.824 0.001   NA
 6982427 6982428 Pput_0347 Pput_0348     TRUE 0.851 171.000 0.778 0.001   NA
 6982428 6982429 Pput_0348 Pput_0349     TRUE 0.948 12.000 0.303 1.000 N NA
 6982429 6982430 Pput_0349 Pput_0350     FALSE 0.036 302.000 0.103 1.000 N NA
 6982436 6982437 Pput_0356 Pput_0357     FALSE 0.195 148.000 0.085 1.000 N NA
 6982437 6982438 Pput_0357 Pput_0358     TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 6982438 6982439 Pput_0358 Pput_0359     FALSE 0.485 108.000 0.311 NA N NA
 6982440 6982441 Pput_0360 Pput_0361     TRUE 0.953 4.000 0.000 NA Y NA
 6982441 6982442 Pput_0361 Pput_0362     FALSE 0.107 115.000 0.032 1.000 N NA
 6982442 6982443 Pput_0362 Pput_0363     FALSE 0.003 322.000 0.000 1.000 N NA
 6982443 6982444 Pput_0363 Pput_0364   aceE TRUE 0.964 14.000 0.167 1.000 Y NA
 6982445 6982446 Pput_0365 Pput_0366     FALSE 0.016 235.000 0.014 1.000 N NA
 6982446 6982447 Pput_0366 Pput_0367     TRUE 0.996 1.000 0.205 0.001 Y NA
 6982447 6982448 Pput_0367 Pput_0368     TRUE 0.991 0.000 0.217 1.000 Y NA
 6982448 6982449 Pput_0368 Pput_0369     TRUE 0.980 -3.000 0.241 1.000   NA
 6982449 6982450 Pput_0369 Pput_0370     TRUE 0.986 0.000 0.133 0.002   NA
 6982450 6982451 Pput_0370 Pput_0371     TRUE 0.973 -3.000 0.027 0.002   NA
 6982451 6982452 Pput_0371 Pput_0372     TRUE 0.969 0.000 0.019 0.002   NA
 6982453 6982454 Pput_0373 Pput_0374     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6982454 6982455 Pput_0374 Pput_0375     TRUE 0.989 -3.000 0.417 NA   NA
 6982455 6982456 Pput_0375 Pput_0376     TRUE 0.797 57.000 0.333 NA   NA
 6982456 6982457 Pput_0376 Pput_0377     TRUE 0.552 254.000 0.600 NA Y NA
 6982457 6982458 Pput_0377 Pput_0378     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 6982458 6982459 Pput_0378 Pput_0379     FALSE 0.054 204.000 0.039 1.000 N NA
 6982459 6982460 Pput_0379 Pput_0380     TRUE 0.986 -3.000 0.392 1.000 N NA
 6982464 6982465 Pput_0384 Pput_0385     FALSE 0.250 65.000 0.020 NA   NA
 6982465 6982466 Pput_0385 Pput_0386     FALSE 0.091 159.000 0.019 NA   NA
 6982466 6982467 Pput_0386 Pput_0387     FALSE 0.304 50.000 0.009 1.000   NA
 6982468 6982469 Pput_0388 Pput_0389     TRUE 0.995 2.000 0.168 0.001 Y NA
 6982469 6982470 Pput_0389 Pput_0390     TRUE 0.938 -7.000 0.092 1.000   NA
 6982470 6982471 Pput_0390 Pput_0391     TRUE 0.944 -19.000 0.163 1.000   NA
 6982471 6982472 Pput_0391 Pput_0392   bioD TRUE 0.984 11.000 0.063 0.001 Y NA
 6982472 6982473 Pput_0392 Pput_0393 bioD   FALSE 0.227 212.000 0.244 NA   NA
 6982473 6982474 Pput_0393 Pput_0394     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 6982474 6982475 Pput_0394 Pput_0395     FALSE 0.072 302.000 0.227 1.000 N NA
 6982475 6982476 Pput_0395 Pput_0396     FALSE 0.432 125.000 0.250 1.000 N NA
 6982478 6982479 Pput_0398 Pput_0399     FALSE 0.101 148.000 0.016 1.000   NA
 6982480 6982481 Pput_0400 Pput_0401     TRUE 0.913 -34.000 0.088 1.000   NA
 6982481 6982482 Pput_0401 Pput_0402     TRUE 0.989 2.000 0.211 0.002   NA
 6982482 6982483 Pput_0402 Pput_0403     TRUE 0.992 -3.000 0.246 0.002   NA
 6982483 6982484 Pput_0403 Pput_0404     TRUE 0.871 163.000 0.825 0.002   NA
 6982484 6982485 Pput_0404 Pput_0405     FALSE 0.048 310.000 0.000 0.002   NA
 6982485 6982486 Pput_0405 Pput_0406     TRUE 0.919 12.000 0.161 1.000   NA
 6982486 6982487 Pput_0406 Pput_0407     TRUE 0.928 15.000 0.258 1.000   NA
 6982487 6982488 Pput_0407 Pput_0408     FALSE 0.043 313.000 0.161 1.000 N NA
 6982491 6982492 Pput_0411 Pput_0412     TRUE 0.829 9.000 0.032 NA   NA
 6982492 6982493 Pput_0412 Pput_0413     TRUE 0.713 -13.000 0.000 NA   NA
 6982494 6982495 Pput_0414 Pput_0415     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 6982496 6982497 Pput_0416 Pput_0417     FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6982498 6982499 Pput_0419 Pput_R0008     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 6982499 6982500 Pput_R0008 Pput_0420     FALSE 0.478 17.000 0.000 NA   NA
 6982500 6982501 Pput_0420 Pput_0421     FALSE 0.061 128.000 0.013 1.000 N NA
 6982501 6982502 Pput_0421 Pput_0422   dnaG TRUE 0.679 68.000 0.299 1.000 N NA
 6982502 6982503 Pput_0422 Pput_0423 dnaG rpsU FALSE 0.024 305.000 0.067 1.000 N NA
 6982506 6982507 Pput_0426 Pput_0427     TRUE 0.995 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 6982508 6982509 Pput_0428 Pput_0429 cca   FALSE 0.362 56.000 0.032 NA   NA
 6982509 6982510 Pput_0429 Pput_0430     TRUE 0.995 -3.000 0.761 NA   NA
 6982510 6982511 Pput_0430 Pput_0431     TRUE 0.712 156.000 0.683 NA   NA
 6982511 6982512 Pput_0431 Pput_0432   glpE FALSE 0.004 283.000 0.000 NA N NA
 6982512 6982513 Pput_0432 Pput_0433 glpE apaH TRUE 0.757 15.000 0.045 1.000   NA
 6982513 6982514 Pput_0433 Pput_0434 apaH apaG TRUE 0.980 0.000 0.267 NA   NA
 6982514 6982515 Pput_0434 Pput_0435 apaG ksgA FALSE 0.098 198.000 0.078 NA N NA
 6982515 6982516 Pput_0435 Pput_0436 ksgA pdxA TRUE 0.968 -3.000 0.197 1.000 N NA
 6982516 6982517 Pput_0436 Pput_0437 pdxA   TRUE 0.991 -3.000 0.561 1.000 N NA
 6982517 6982518 Pput_0437 Pput_0438     TRUE 0.873 -19.000 0.070 1.000 N NA
 6982519 6982520 Pput_0439 Pput_0440     TRUE 0.993 -3.000 0.642 NA   NA
 6982520 6982521 Pput_0440 Pput_0441     TRUE 0.930 2.000 0.091 1.000 N NA
 6982523 6982524 Pput_0443 Pput_0444     TRUE 0.997 11.000 0.667 0.035 Y NA
 6982524 6982525 Pput_0444 Pput_0445     FALSE 0.040 296.000 0.111 1.000 N NA
 6982525 6982526 Pput_0445 Pput_0446     TRUE 0.968 41.000 0.556 1.000 Y NA
 6982526 6982527 Pput_0446 Pput_0447     TRUE 0.876 61.000 0.108 0.064 Y NA
 6982527 6982528 Pput_0447 Pput_0448     TRUE 0.985 11.000 0.145 0.064 Y NA
 6982528 6982529 Pput_0448 Pput_0449     FALSE 0.042 150.000 0.007 1.000 N NA
 6982529 6982530 Pput_0449 Pput_0450     TRUE 0.962 -3.000 0.120 1.000   NA
 6982530 6982531 Pput_0450 Pput_0451     TRUE 0.650 70.000 0.233 1.000   NA
 6982533 6982534 Pput_0453 Pput_0454   trpD TRUE 0.972 10.000 0.105 1.000 Y NA
 6982534 6982535 Pput_0454 Pput_0455 trpD trpC TRUE 0.994 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 6982535 6982536 Pput_0455 Pput_0456 trpC   FALSE 0.054 147.000 0.013 1.000 N NA
 6982539 6982540 Pput_0459 Pput_0460     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6982540 6982541 Pput_0460 Pput_0461     FALSE 0.161 66.000 0.018 1.000 N NA
 6982541 6982542 Pput_0461 Pput_0462     FALSE 0.225 64.000 0.008 1.000   NA
 6982542 6982543 Pput_0462 Pput_0463     FALSE 0.452 68.000 0.000 0.048   NA
 6982543 6982544 Pput_0463 Pput_0464     FALSE 0.503 29.000 0.024 NA   NA
 6982545 6982546 Pput_0465 Pput_0466 argC   FALSE 0.157 100.000 0.031 NA   NA
 6982547 6982548 Pput_0467 Pput_0468 anmK   TRUE 0.949 4.000 0.184 NA N NA
 6982549 6982550 Pput_0469 Pput_R0009     FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 6982550 6982551 Pput_R0009 Pput_R0010     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6982551 6982552 Pput_R0010 Pput_R0011     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6982552 6982553 Pput_R0011 Pput_R0012     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 6982553 6982554 Pput_R0012 Pput_R0013     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6982554 6982555 Pput_R0013 Pput_0470     FALSE 0.042 182.000 0.000 NA   NA
 6982555 6982556 Pput_0470 Pput_0471     TRUE 0.935 -10.000 0.147 1.000 N NA
 6982556 6982557 Pput_0471 Pput_0472     TRUE 0.761 8.000 0.012 NA   NA
 6982557 6982558 Pput_0472 Pput_R0014     FALSE 0.060 153.000 0.000 NA   NA
 6982558 6982559 Pput_R0014 Pput_R0015     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6982559 6982560 Pput_R0015 Pput_R0016     FALSE 0.351 30.000 0.000 NA   NA
 6982560 6982561 Pput_R0016 Pput_0473     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6982561 6982562 Pput_0473 Pput_R0017     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6982562 6982563 Pput_R0017 Pput_0474   secE FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6982563 6982564 Pput_0474 Pput_0475 secE nusG TRUE 0.989 10.000 0.843 1.000 N NA
 6982564 6982565 Pput_0475 Pput_0476 nusG rplK TRUE 0.730 120.000 0.681 1.000 N NA
 6982565 6982566 Pput_0476 Pput_0477 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.014 Y NA
 6982566 6982567 Pput_0477 Pput_0478 rplA rplJ TRUE 0.857 111.000 0.302 0.014 Y NA
 6982567 6982568 Pput_0478 Pput_0479 rplJ rplL TRUE 0.974 77.000 0.884 0.010 Y NA
 6982568 6982569 Pput_0479 Pput_0480 rplL rpoB FALSE 0.200 221.000 0.223 1.000   NA
 6982569 6982570 Pput_0480 Pput_0481 rpoB   TRUE 0.962 65.000 0.851 0.001   NA
 6982570 6982571 Pput_0481 Pput_0482   rpsL FALSE 0.111 212.000 0.122 1.000 N NA
 6982571 6982572 Pput_0482 Pput_0483 rpsL   TRUE 0.940 107.000 0.620 0.002 Y NA
 6982572 6982573 Pput_0483 Pput_0484     TRUE 0.977 31.000 0.579 1.000 Y NA
 6982573 6982574 Pput_0484 Pput_0485     TRUE 0.986 28.000 0.400 0.001 Y NA
 6982574 6982575 Pput_0485 Pput_0486   rpsJ TRUE 0.744 142.000 0.318 1.000 Y NA
 6982575 6982576 Pput_0486 Pput_0487 rpsJ rplC TRUE 0.903 81.000 0.307 0.014 Y NA
 6982576 6982577 Pput_0487 Pput_0488 rplC rplD TRUE 0.994 13.000 0.486 0.010 Y NA
 6982577 6982578 Pput_0488 Pput_0489 rplD rplW TRUE 0.997 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 6982578 6982579 Pput_0489 Pput_0490 rplW rplB TRUE 0.993 15.000 0.849 1.000 Y NA
 6982579 6982580 Pput_0490 Pput_0491 rplB rpsS TRUE 0.995 17.000 0.820 0.014 Y NA
 6982580 6982581 Pput_0491 Pput_0492 rpsS rplV TRUE 0.997 12.000 0.769 0.014 Y NA
 6982581 6982582 Pput_0492 Pput_0493 rplV rpsC TRUE 0.996 14.000 0.719 0.014 Y NA
 6982582 6982583 Pput_0493 Pput_0494 rpsC rplP TRUE 0.997 13.000 0.828 0.014 Y NA
 6982583 6982584 Pput_0494 Pput_0495 rplP   TRUE 0.999 0.000 0.802 0.010 Y NA
 6982584 6982585 Pput_0495 Pput_0496   rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.010 Y NA
 6982585 6982586 Pput_0496 Pput_0497 rpsQ rplN TRUE 0.993 24.000 0.791 0.014 Y NA
 6982586 6982587 Pput_0497 Pput_0498 rplN rplX TRUE 0.997 12.000 0.810 0.014 Y NA
 6982587 6982588 Pput_0498 Pput_0499 rplX rplE TRUE 0.994 21.000 0.758 0.010 Y NA
 6982588 6982589 Pput_0499 Pput_0500 rplE rpsN TRUE 0.989 14.000 0.309 0.010 Y NA
 6982589 6982590 Pput_0500 Pput_0501 rpsN rpsH TRUE 0.683 209.000 0.295 0.010 Y NA
 6982590 6982591 Pput_0501 Pput_0502 rpsH rplF TRUE 0.997 13.000 0.808 0.010 Y NA
 6982591 6982592 Pput_0502 Pput_0503 rplF rplR TRUE 0.998 11.000 0.815 0.010 Y NA
 6982592 6982593 Pput_0503 Pput_0504 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.014 Y NA
 6982593 6982594 Pput_0504 Pput_0505 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.014 Y NA
 6982594 6982595 Pput_0505 Pput_0506 rpmD rplO TRUE 0.998 4.000 0.653 0.002 Y NA
 6982595 6982596 Pput_0506 Pput_0507 rplO secY TRUE 0.993 1.000 0.730 1.000 N NA
 6982596 6982597 Pput_0507 Pput_0508 secY   TRUE 0.792 -22.000 0.036 1.000 N NA
 6982597 6982598 Pput_0508 Pput_0509   rpsM TRUE 0.724 132.000 0.086 0.010 Y NA
 6982598 6982599 Pput_0509 Pput_0510 rpsM   TRUE 0.995 19.000 0.810 0.010 Y NA
 6982599 6982600 Pput_0510 Pput_0511   rpsD TRUE 0.993 16.000 0.509 0.014 Y NA
 6982600 6982601 Pput_0511 Pput_0512 rpsD   TRUE 0.946 23.000 0.549 1.000 N NA
 6982601 6982602 Pput_0512 Pput_0513   rplQ TRUE 0.947 43.000 0.873 1.000 N NA
 6982602 6982603 Pput_0513 Pput_0514 rplQ   FALSE 0.029 173.000 0.004 1.000 N NA
 6982603 6982604 Pput_0514 Pput_0515     FALSE 0.415 164.000 0.052 1.000 Y NA
 6982606 6982607 Pput_0517 Pput_0518     TRUE 0.601 10.000 0.015 NA N NA
 6982609 6982610 Pput_0520 Pput_0521     FALSE 0.454 22.000 0.000 1.000   NA
 6982610 6982611 Pput_0521 Pput_0522     FALSE 0.072 148.000 0.000 1.000   NA
 6982611 6982612 Pput_0522 Pput_0523     TRUE 0.984 13.000 0.400 0.003   NA
 6982612 6982613 Pput_0523 Pput_0524     TRUE 0.987 0.000 0.128 0.001   NA
 6982613 6982614 Pput_0524 Pput_0525     TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.001 Y NA
 6982614 6982615 Pput_0525 Pput_0526     TRUE 0.905 5.000 0.091 NA N NA
 6982615 6982616 Pput_0526 Pput_0527     FALSE 0.191 140.000 0.083 NA N NA
 6982616 6982617 Pput_0527 Pput_0528     TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.001 N NA
 6982618 6982619 Pput_0529 Pput_0530     TRUE 0.776 64.000 0.095 1.000 Y NA
 6982621 6982622 Pput_0532 Pput_0533     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6982623 6982624 Pput_0535 Pput_0536     TRUE 0.981 -7.000 0.100 1.000 Y NA
 6982627 6982628 Pput_0539 Pput_0540     FALSE 0.212 110.000 0.060 NA   NA
 6982628 6982629 Pput_0540 Pput_0541     FALSE 0.309 106.000 0.114 NA   NA
 6982629 6982630 Pput_0541 Pput_0542     TRUE 0.997 0.000 0.605 NA Y NA
 6982630 6982631 Pput_0542 Pput_0543     TRUE 0.984 1.000 0.336 NA   NA
 6982633 6982634 Pput_0545 Pput_0546     FALSE 0.486 32.000 0.022 1.000   NA
 6982634 6982635 Pput_0546 Pput_0547     TRUE 0.986 4.000 0.462 NA   NA
 6982636 6982637 Pput_0548 Pput_0549 nrdR   TRUE 0.971 3.000 0.277 NA N NA
 6982637 6982638 Pput_0549 Pput_0550     TRUE 0.958 43.000 0.456 1.000 Y NA
 6982638 6982639 Pput_0550 Pput_0551     TRUE 0.919 19.000 0.065 1.000 Y NA
 6982639 6982640 Pput_0551 Pput_0552   ribH TRUE 0.748 92.000 0.049 0.002 Y NA
 6982640 6982641 Pput_0552 Pput_0553 ribH nusB TRUE 0.984 -3.000 0.347 1.000 N NA
 6982641 6982642 Pput_0553 Pput_0554 nusB   TRUE 0.877 19.000 0.225 1.000 N NA
 6982642 6982643 Pput_0554 Pput_0555     TRUE 0.970 -3.000 0.206 1.000 N NA
 6982643 6982644 Pput_0555 Pput_0556     TRUE 0.617 17.000 0.018 1.000   NA
 6982644 6982645 Pput_0556 Pput_0557   ribA FALSE 0.075 182.000 0.020 1.000   NA
 6982645 6982646 Pput_0557 Pput_0558 ribA   TRUE 0.928 -3.000 0.050 NA   NA
 6982646 6982647 Pput_0558 Pput_0559     TRUE 0.937 0.000 0.066 NA   NA
 6982648 6982649 Pput_0560 Pput_0561     FALSE 0.045 348.000 0.009 1.000 Y NA
 6982649 6982650 Pput_0561 Pput_0562     TRUE 0.594 178.000 0.246 1.000 Y NA
 6982650 6982651 Pput_0562 Pput_0563     TRUE 0.964 -3.000 0.177 1.000 N NA
 6982651 6982652 Pput_0563 Pput_0564   ribB FALSE 0.008 249.000 0.000 1.000 N NA
 6982654 6982655 Pput_0566 Pput_0567     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 6982655 6982656 Pput_0567 Pput_0568     TRUE 0.997 0.000 0.600 1.000 Y NA
 6982658 6982659 Pput_0570 Pput_0571     FALSE 0.072 129.000 0.000 NA   NA
 6982659 6982660 Pput_0571 Pput_0572     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 6982660 6982661 Pput_0572 Pput_0573     TRUE 0.989 10.000 0.750 1.000   NA
 6982661 6982662 Pput_0573 Pput_0574     FALSE 0.031 322.000 0.000 0.004 N NA
 6982662 6982663 Pput_0574 Pput_0575     FALSE 0.012 277.000 0.000 NA   NA
 6982663 6982664 Pput_0575 Pput_0576     FALSE 0.003 508.000 0.000 NA   NA
 6982664 6982665 Pput_0576 Pput_0577     FALSE 0.019 187.000 0.000 1.000 N NA
 6982665 6982666 Pput_0577 Pput_0578     FALSE 0.144 93.000 0.022 NA   NA
 6982666 6982667 Pput_0578 Pput_0579     TRUE 0.618 21.000 0.030 NA   NA
 6982667 6982668 Pput_0579 Pput_0580     FALSE 0.111 218.000 0.100 NA   NA
 6982668 6982669 Pput_0580 Pput_0581     FALSE 0.196 108.000 0.047 1.000   NA
 6982669 6982670 Pput_0581 Pput_0582     TRUE 0.999 9.000 0.859 0.001 Y NA
 6982670 6982671 Pput_0582 Pput_0583     TRUE 0.946 47.000 0.407 1.000 Y NA
 6982671 6982672 Pput_0583 Pput_0584     FALSE 0.010 228.000 0.000 1.000 N NA
 6982673 6982674 Pput_0585 Pput_0586     FALSE 0.163 67.000 0.020 1.000 N NA
 6982674 6982675 Pput_0586 Pput_0587     TRUE 0.974 -3.000 0.235 1.000 N NA
 6982675 6982676 Pput_0587 Pput_0588     TRUE 0.943 -3.000 0.070 NA   NA
 6982677 6982678 Pput_0589 Pput_0590     TRUE 0.627 28.000 0.043 1.000   NA
 6982678 6982679 Pput_0590 Pput_0591     FALSE 0.078 136.000 0.000 1.000   NA
 6982679 6982680 Pput_0591 Pput_0592     TRUE 0.675 29.000 0.062 1.000   NA
 6982680 6982681 Pput_0592 Pput_0593     TRUE 0.988 -3.000 0.375 1.000   NA
 6982681 6982682 Pput_0593 Pput_0594     TRUE 0.992 34.000 0.804 0.001 Y NA
 6982682 6982683 Pput_0594 Pput_0595     TRUE 0.899 23.000 0.141 0.084   NA
 6982685 6982686 Pput_0597 Pput_0598     TRUE 0.987 18.000 0.275 0.001 Y NA
 6982686 6982687 Pput_0598 Pput_0599     FALSE 0.456 101.000 0.254 1.000 N NA
 6982687 6982688 Pput_0599 Pput_0600   dipZ FALSE 0.033 180.000 0.010 1.000 N NA
 6982688 6982689 Pput_0600 Pput_0601 dipZ   FALSE 0.292 190.000 0.273 1.000 N NA
 6982689 6982690 Pput_0601 Pput_0602     FALSE 0.442 244.000 0.350 1.000 Y NA
 6982691 6982692 Pput_0603 Pput_0604     TRUE 0.943 3.000 0.101 NA   NA
 6982692 6982693 Pput_0604 Pput_0605     FALSE 0.195 57.000 0.017 1.000 N NA
 6982693 6982694 Pput_0605 Pput_0606     FALSE 0.072 151.000 0.023 1.000 N NA
 6982694 6982695 Pput_0606 Pput_0607     FALSE 0.024 171.000 0.000 1.000 N NA
 6982699 6982700 Pput_0611 Pput_0612     FALSE 0.033 93.000 0.000 NA N NA
 6982701 6982702 Pput_0613 Pput_0614     TRUE 0.693 120.000 0.600 1.000 N NA
 6982702 6982703 Pput_0614 Pput_0615     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 6982703 6982704 Pput_0615 Pput_0616     TRUE 0.949 20.000 0.455 NA   NA
 6982704 6982705 Pput_0616 Pput_0617     TRUE 0.764 23.000 0.087 NA   NA
 6982705 6982706 Pput_0617 Pput_0618     TRUE 0.952 -3.000 0.088 NA   NA
 6982706 6982707 Pput_0618 Pput_0619     FALSE 0.237 79.000 0.036 NA   NA
 6982707 6982708 Pput_0619 Pput_0620   fabG TRUE 0.991 3.000 0.263 1.000 Y NA
 6982709 6982710 Pput_0621 Pput_0622     FALSE 0.047 90.000 0.000 1.000 N NA
 6982711 6982712 Pput_0623 Pput_0624     FALSE 0.025 168.000 0.000 1.000 N NA
 6982712 6982713 Pput_0624 Pput_0625     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.004 N NA
 6982713 6982714 Pput_0625 Pput_0626     TRUE 0.879 53.000 0.500 NA   NA
 6982715 6982716 Pput_0627 Pput_0628     FALSE 0.317 108.000 0.161 1.000 N NA
 6982716 6982717 Pput_0628 Pput_0629     FALSE 0.018 241.000 0.000 NA   NA
 6982717 6982718 Pput_0629 Pput_0630     FALSE 0.011 285.000 0.000 NA   NA
 6982719 6982720 Pput_0631 Pput_0632     FALSE 0.133 77.000 0.000 1.000   NA
 6982720 6982721 Pput_0632 Pput_0633     FALSE 0.006 369.000 0.000 1.000   NA
 6982721 6982722 Pput_0633 Pput_0634     TRUE 0.782 10.000 0.019 1.000   NA
 6982722 6982723 Pput_0634 Pput_0635     TRUE 0.675 91.000 0.045 0.091 Y NA
 6982724 6982725 Pput_0636 Pput_0637     TRUE 0.748 74.000 0.455 1.000 N NA
 6982725 6982726 Pput_0637 Pput_R0018     FALSE 0.002 988.000 0.000 NA   NA
 6982726 6982727 Pput_R0018 Pput_R0019     FALSE 0.011 281.000 0.000 NA   NA
 6982727 6982728 Pput_R0019 Pput_R0020     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 6982728 6982729 Pput_R0020 Pput_0638     FALSE 0.018 240.000 0.000 NA   NA
 6982729 6982730 Pput_0638 Pput_0639     TRUE 0.932 -13.000 0.114 NA   NA
 6982730 6982731 Pput_0639 Pput_0640     TRUE 0.992 -16.000 0.840 NA   NA
 6982733 6982734 Pput_0642 Pput_0643     FALSE 0.396 101.000 0.169 1.000   NA
 6982734 6982735 Pput_0643 Pput_0644   ileS TRUE 0.977 -3.000 0.254 1.000 N NA
 6982735 6982736 Pput_0644 Pput_0645 ileS lspA TRUE 0.941 -7.000 0.147 1.000 N NA
 6982736 6982737 Pput_0645 Pput_0646 lspA   TRUE 0.981 -7.000 0.417 1.000 N NA
 6982737 6982738 Pput_0646 Pput_0647   ispH TRUE 0.970 15.000 0.626 1.000 N NA
 6982740 6982741 Pput_0649 Pput_0650     TRUE 0.993 -3.000 0.615 NA   NA
 6982741 6982742 Pput_0650 Pput_0651     TRUE 0.898 2.000 0.038 NA   NA
 6982742 6982743 Pput_0651 Pput_0652     FALSE 0.395 55.000 0.061 NA N NA
 6982744 6982745 Pput_0653 Pput_0654     TRUE 0.925 2.000 0.083 1.000 N NA
 6982745 6982746 Pput_0654 Pput_0655     TRUE 0.660 114.000 0.188 1.000 Y NA
 6982746 6982747 Pput_0655 Pput_0656     TRUE 0.998 0.000 0.571 0.019 Y NA
 6982747 6982748 Pput_0656 Pput_0657     TRUE 0.997 0.000 0.536 1.000 Y NA
 6982748 6982749 Pput_0657 Pput_0658     TRUE 0.995 2.000 0.246 0.063 Y NA
 6982749 6982750 Pput_0658 Pput_0659     TRUE 0.849 66.000 0.230 NA Y NA
 6982750 6982751 Pput_0659 Pput_0660     FALSE 0.451 91.000 0.222 NA N NA
 6982751 6982752 Pput_0660 Pput_0661     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 6982752 6982753 Pput_0661 Pput_0662     FALSE 0.125 93.000 0.015 NA   NA
 6982754 6982755 Pput_0663 Pput_0664     TRUE 0.969 -3.000 0.168 NA   NA
 6982755 6982756 Pput_0664 Pput_0665     FALSE 0.077 251.000 0.108 NA   NA
 6982756 6982757 Pput_0665 Pput_R0021     FALSE 0.004 445.000 0.000 NA   NA
 6982757 6982758 Pput_R0021 Pput_R0022     TRUE 0.728 5.000 0.000 NA   NA
 6982758 6982759 Pput_R0022 Pput_R0023     TRUE 0.716 6.000 0.000 NA   NA
 6982759 6982760 Pput_R0023 Pput_R0024     FALSE 0.247 47.000 0.000 NA   NA
 6982760 6982761 Pput_R0024 Pput_R0025     TRUE 0.716 6.000 0.000 NA   NA
 6982762 6982763 Pput_0666 Pput_0667     TRUE 0.811 85.000 0.667 NA   NA
 6982763 6982764 Pput_0667 Pput_0668     FALSE 0.377 133.000 0.182 NA   NA
 6982764 6982765 Pput_0668 Pput_0669     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6982767 6982768 Pput_0671 Pput_0672   coaE TRUE 0.911 -3.000 0.033 1.000   NA
 6982768 6982769 Pput_0672 Pput_0673 coaE   TRUE 0.950 0.000 0.122 1.000 N NA
 6982769 6982770 Pput_0673 Pput_0674     TRUE 0.995 3.000 0.454 1.000 Y NA
 6982771 6982772 Pput_0675 Pput_R0026     FALSE 0.136 72.000 0.000 NA   NA
 6982772 6982773 Pput_R0026 Pput_0676     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 6982773 6982774 Pput_0676 Pput_0677     FALSE 0.002 1344.000 0.000 NA   NA
 6982774 6982775 Pput_0677 Pput_0678     FALSE 0.116 78.000 0.000 NA   NA
 6982775 6982776 Pput_0678 Pput_0679     FALSE 0.073 123.000 0.000 NA   NA
 6982776 6982777 Pput_0679 Pput_0680     FALSE 0.025 216.000 0.000 NA   NA
 6982777 6982778 Pput_0680 Pput_0681     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6982778 6982779 Pput_0681 Pput_0682     FALSE 0.036 191.000 0.000 NA   NA
 6982780 6982781 Pput_0683 Pput_R0027     FALSE 0.082 98.000 0.000 NA   NA
 6982783 6982784 Pput_0685 Pput_0686     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6982785 6982786 Pput_0687 Pput_0688     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6982786 6982787 Pput_0688 Pput_0689     FALSE 0.074 108.000 0.000 NA   NA
 6982788 6982789 Pput_0690 Pput_0691     TRUE 0.992 -3.000 0.394 0.062 N NA
 6982790 6982791 Pput_0692 Pput_0693     FALSE 0.284 168.000 0.000 1.000 Y NA
 6982791 6982792 Pput_0693 Pput_0694     FALSE 0.515 143.000 0.077 1.000 Y NA
 6982792 6982793 Pput_0694 Pput_0695     FALSE 0.529 46.000 0.077 1.000 N NA
 6982793 6982794 Pput_0695 Pput_0696     FALSE 0.281 25.000 0.003 1.000 N NA
 6982794 6982795 Pput_0696 Pput_0697     TRUE 0.726 -3.000 0.005 1.000 N NA
 6982795 6982796 Pput_0697 Pput_0698     FALSE 0.098 199.000 0.074 1.000 N NA
 6982796 6982797 Pput_0698 Pput_0699     TRUE 0.853 13.000 0.111 1.000 N NA
 6982797 6982798 Pput_0699 Pput_0700     FALSE 0.244 17.000 0.000 NA N NA
 6982799 6982800 Pput_0701 Pput_0702   glyA FALSE 0.005 289.000 0.000 1.000 N NA
 6982800 6982801 Pput_0702 Pput_0703 glyA   FALSE 0.102 306.000 0.333 1.000 N NA
 6982802 6982803 Pput_0704 Pput_0705     FALSE 0.009 303.000 0.000 NA   NA
 6982803 6982804 Pput_0705 Pput_0706     FALSE 0.025 223.000 0.000 1.000   NA
 6982805 6982806 Pput_0707 Pput_0708     FALSE 0.320 68.000 0.041 NA   NA
 6982806 6982807 Pput_0708 Pput_0709     FALSE 0.166 216.000 0.182 NA   NA
 6982807 6982808 Pput_0709 Pput_0710     FALSE 0.512 72.000 0.149 NA   NA
 6982809 6982810 Pput_0711 Pput_0712     FALSE 0.264 163.000 0.132 NA   NA
 6982810 6982811 Pput_0712 Pput_0713     FALSE 0.146 190.000 0.082 NA   NA
 6982811 6982812 Pput_0713 Pput_0714     FALSE 0.061 218.000 0.041 NA   NA
 6982812 6982813 Pput_0714 Pput_0715     FALSE 0.233 86.000 0.043 NA   NA
 6982814 6982815 Pput_0716 Pput_0717     FALSE 0.117 85.000 0.004 NA   NA
 6982815 6982816 Pput_0717 Pput_0718     FALSE 0.039 160.000 0.007 1.000 N NA
 6982817 6982818 Pput_0719 Pput_0720   rplU TRUE 0.707 -15.000 0.000 NA   NA
 6982818 6982819 Pput_0720 Pput_0721 rplU rpmA TRUE 0.988 39.000 0.667 0.010 Y NA
 6982819 6982820 Pput_0721 Pput_0722 rpmA obgE FALSE 0.400 189.000 0.335 1.000   NA
 6982820 6982821 Pput_0722 Pput_0723 obgE   FALSE 0.517 86.000 0.206 1.000   NA
 6982821 6982822 Pput_0723 Pput_0724     TRUE 0.867 -3.000 0.017 NA   NA
 6982823 6982824 Pput_0725 Pput_0726     TRUE 0.967 33.000 0.950 NA   NA
 6982824 6982825 Pput_0726 Pput_0727     TRUE 0.994 -10.000 0.947 NA   NA
 6982826 6982827 Pput_0728 Pput_0729     TRUE 0.892 -3.000 0.027 NA   NA
 6982827 6982828 Pput_0729 Pput_0730     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6982831 6982832 Pput_R0028 Pput_0733     FALSE 0.084 96.000 0.000 NA   NA
 6982833 6982834 Pput_0734 Pput_0735     FALSE 0.047 325.000 0.000 NA Y NA
 6982835 6982836 Pput_0736 Pput_0737     FALSE 0.467 -13.000 0.000 NA N NA
 6982837 6982838 Pput_0738 Pput_0739     FALSE 0.300 48.000 0.028 1.000 N NA
 6982838 6982839 Pput_0739 Pput_0740     FALSE 0.080 57.000 0.000 NA N NA
 6982840 6982841 Pput_0741 Pput_0742     FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 6982841 6982842 Pput_0742 Pput_0743     FALSE 0.356 14.000 0.000 1.000 N NA
 6982842 6982843 Pput_0743 Pput_0744     FALSE 0.332 93.000 0.100 NA   NA
 6982844 6982845 Pput_0745 Pput_0746     FALSE 0.084 107.000 0.000 1.000   NA
 6982845 6982846 Pput_0746 Pput_0747     FALSE 0.329 37.000 0.000 1.000   NA
 6982846 6982847 Pput_0747 Pput_0748     FALSE 0.278 42.000 0.000 NA   NA
 6982847 6982848 Pput_0748 Pput_0749     TRUE 0.963 4.000 0.200 NA   NA
 6982848 6982849 Pput_0749 Pput_0750     TRUE 0.977 -3.000 0.260 1.000 N NA
 6982849 6982850 Pput_0750 Pput_0751     TRUE 0.982 -10.000 0.407 NA   NA
 6982851 6982852 Pput_0752 Pput_0753     FALSE 0.128 175.000 0.002 0.077 N NA
 6982852 6982853 Pput_0753 Pput_0754     TRUE 0.941 25.000 0.184 1.000 Y NA
 6982853 6982854 Pput_0754 Pput_0755     TRUE 0.940 80.000 0.496 0.016 Y NA
 6982854 6982855 Pput_0755 Pput_0756     FALSE 0.271 119.000 0.122 1.000 N NA
 6982855 6982856 Pput_0756 Pput_R0029     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6982856 6982857 Pput_R0029 Pput_0757   ipk FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6982857 6982858 Pput_0757 Pput_0758 ipk lolB TRUE 0.893 5.000 0.072 1.000 N NA
 6982858 6982859 Pput_0758 Pput_0759 lolB   TRUE 0.893 5.000 0.072 1.000 N NA
 6982860 6982861 Pput_0760 Pput_0761 hemA prfA TRUE 0.983 -3.000 0.171 0.038 N NA
 6982861 6982862 Pput_0761 Pput_0762 prfA   TRUE 0.992 0.000 0.229 1.000 Y NA
 6982862 6982863 Pput_0762 Pput_0763     TRUE 0.903 -6.000 0.068 1.000 N NA
 6982863 6982864 Pput_0763 Pput_0764     TRUE 0.714 -7.000 0.013 1.000 N NA
 6982864 6982865 Pput_0764 Pput_0765     FALSE 0.072 161.000 0.004 1.000   NA
 6982866 6982867 Pput_0766 Pput_0767     FALSE 0.121 81.000 0.000 1.000   NA
 6982867 6982868 Pput_0767 Pput_0768     TRUE 0.732 -9.000 0.017 1.000 N NA
 6982868 6982869 Pput_0768 Pput_0769     TRUE 0.922 -10.000 0.083 NA   NA
 6982869 6982870 Pput_0769 Pput_0770     FALSE 0.115 104.000 0.017 NA   NA
 6982871 6982872 Pput_0771 Pput_0772   hemH TRUE 0.682 14.000 0.020 1.000   NA
 6982873 6982874 Pput_0773 Pput_0774   upp TRUE 0.982 3.000 0.101 1.000 Y NA
 6982875 6982876 Pput_0775 Pput_0776     TRUE 0.886 3.000 0.036 NA   NA
 6982876 6982877 Pput_0776 Pput_0777     TRUE 0.643 52.000 0.138 NA   NA
 6982877 6982878 Pput_0777 Pput_0778     TRUE 0.675 69.000 0.261 NA   NA
 6982884 6982885 Pput_0784 Pput_0785     TRUE 0.986 0.000 0.364 NA   NA
 6982885 6982886 Pput_0785 Pput_0786     TRUE 0.937 16.000 0.320 NA   NA
 6982886 6982887 Pput_0786 Pput_0787     FALSE 0.032 228.000 0.017 NA   NA
 6982888 6982889 Pput_0788 Pput_0789     FALSE 0.013 269.000 0.000 NA   NA
 6982889 6982890 Pput_0789 Pput_0790     FALSE 0.341 55.000 0.042 1.000 N NA
 6982891 6982892 Pput_0791 Pput_0792     FALSE 0.007 332.000 0.000 NA   NA
 6982892 6982893 Pput_0792 Pput_0793     TRUE 0.972 26.000 0.889 NA   NA
 6982893 6982894 Pput_0793 Pput_0794     FALSE 0.113 327.000 0.375 NA   NA
 6982894 6982895 Pput_0794 Pput_0795     FALSE 0.028 160.000 0.000 1.000 N NA
 6982895 6982896 Pput_0795 Pput_0796     TRUE 0.990 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 6982896 6982897 Pput_0796 Pput_0797     FALSE 0.233 55.000 0.000 1.000   NA
 6982897 6982898 Pput_0797 Pput_0798     FALSE 0.172 86.000 0.021 1.000   NA
 6982899 6982900 Pput_0799 Pput_0800     TRUE 0.710 32.000 0.094 NA   NA
 6982901 6982902 Pput_0801 Pput_0802     FALSE 0.425 146.000 0.036 1.000 Y NA
 6982904 6982905 Pput_0804 Pput_0805     FALSE 0.022 226.000 0.000 NA   NA
 6982905 6982906 Pput_0805 Pput_0806     FALSE 0.494 16.000 0.000 NA   NA
 6982906 6982907 Pput_0806 Pput_0807     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6982911 6982912 Pput_0811 Pput_0812     FALSE 0.236 89.000 0.048 NA   NA
 6982912 6982913 Pput_0812 Pput_0813     TRUE 0.993 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 6982914 6982915 Pput_0814 Pput_0815     TRUE 0.725 3.000 0.017 NA N NA
 6982916 6982917 Pput_0816 Pput_0817     TRUE 0.985 1.000 0.101 1.000 Y NA
 6982917 6982918 Pput_0817 Pput_0818     TRUE 0.997 -3.000 0.562 1.000 Y NA
 6982921 6982922 Pput_0821 Pput_0822     FALSE 0.468 201.000 0.500 1.000   NA
 6982922 6982923 Pput_0822 Pput_0823     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6982923 6982924 Pput_0823 Pput_0824     FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 6982924 6982925 Pput_0824 Pput_0825     TRUE 0.974 -3.000 0.200 NA   NA
 6982925 6982926 Pput_0825 Pput_0826     FALSE 0.096 89.000 0.000 NA   NA
 6982926 6982927 Pput_0826 Pput_0827     FALSE 0.014 205.000 0.000 1.000 N NA
 6982927 6982928 Pput_0827 Pput_0828     TRUE 0.924 -3.000 0.000 0.076 N NA
 6982928 6982929 Pput_0828 Pput_0829     TRUE 0.667 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6982929 6982930 Pput_0829 Pput_0830     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6982930 6982931 Pput_0830 Pput_0831     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 6982932 6982933 Pput_0832 Pput_0833     FALSE 0.012 457.000 0.000 0.059 N NA
 6982933 6982934 Pput_0833 Pput_0834     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6982934 6982935 Pput_0834 Pput_0835     FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 6982935 6982936 Pput_0835 Pput_0836     TRUE 0.994 4.000 0.200 0.004 Y NA
 6982936 6982937 Pput_0836 Pput_0837     TRUE 0.995 4.000 0.258 0.004 Y NA
 6982937 6982938 Pput_0837 Pput_0838     TRUE 0.996 0.000 0.273 0.059 Y NA
 6982938 6982939 Pput_0838 Pput_0839     TRUE 0.910 12.000 0.064 0.076 N NA
 6982939 6982940 Pput_0839 Pput_0840     FALSE 0.004 310.000 0.000 1.000 N NA
 6982940 6982941 Pput_0840 Pput_0841     FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 6982941 6982942 Pput_0841 Pput_0842     FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 6982942 6982943 Pput_0842 Pput_0843     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 6982943 6982944 Pput_0843 Pput_0844     FALSE 0.104 57.000 0.000 1.000 N NA
 6982944 6982945 Pput_0844 Pput_0845     TRUE 0.599 -3.000 0.000 NA N NA
 6982945 6982946 Pput_0845 Pput_0846     FALSE 0.484 77.000 0.000 NA Y NA
 6982946 6982947 Pput_0846 Pput_0847     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6982947 6982948 Pput_0847 Pput_0848     FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6982949 6982950 Pput_0849 Pput_0850     TRUE 0.975 0.000 0.214 NA   NA
 6982951 6982952 Pput_0851 Pput_0852     FALSE 0.046 332.000 0.000 1.000 Y NA
 6982952 6982953 Pput_0852 Pput_0853     TRUE 0.992 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 6982955 6982956 Pput_0855 Pput_0856     TRUE 0.987 -3.000 0.357 NA   NA
 6982957 6982958 Pput_0857 Pput_0858     FALSE 0.055 171.000 0.000 1.000   NA
 6982959 6982960 Pput_0859 Pput_0860     FALSE 0.003 561.000 0.000 NA   NA
 6982960 6982961 Pput_0860 Pput_0861     FALSE 0.042 80.000 0.000 NA N NA
 6982963 6982964 Pput_0862 Pput_0863 queA tgt TRUE 0.998 -3.000 0.360 0.001 Y NA
 6982964 6982965 Pput_0863 Pput_0864 tgt yajC TRUE 0.823 43.000 0.325 NA N NA
 6982965 6982966 Pput_0864 Pput_0865 yajC secD TRUE 0.666 64.000 0.031 NA Y NA
 6982966 6982967 Pput_0865 Pput_0866 secD secF TRUE 0.990 11.000 0.171 0.001 Y NA
 6982967 6982968 Pput_0866 Pput_0867 secF   FALSE 0.197 134.000 0.050 1.000   NA
 6982970 6982971 Pput_0869 Pput_0870     TRUE 0.958 4.000 0.208 1.000 N NA
 6982971 6982972 Pput_0870 Pput_0871     FALSE 0.455 123.000 0.271 1.000 N NA
 6982972 6982973 Pput_0871 Pput_0872     TRUE 0.858 46.000 0.424 1.000 N NA
 6982973 6982974 Pput_0872 Pput_0873     TRUE 0.866 47.000 0.448 1.000 N NA
 6982974 6982975 Pput_0873 Pput_0874     TRUE 0.962 29.000 0.359 0.001   NA
 6982975 6982976 Pput_0874 Pput_0875   hscB TRUE 0.983 9.000 0.500 1.000   NA
 6982976 6982977 Pput_0875 Pput_0876 hscB hscA TRUE 0.970 44.000 0.634 1.000 Y NA
 6982977 6982978 Pput_0876 Pput_0877 hscA   TRUE 0.992 4.000 0.794 1.000 N NA
 6982978 6982979 Pput_0877 Pput_0878     TRUE 0.984 11.000 0.625 1.000   NA
 6982979 6982980 Pput_0878 Pput_0879     FALSE 0.154 89.000 0.017 1.000   NA
 6982980 6982981 Pput_0879 Pput_0880     TRUE 0.800 29.000 0.156 1.000   NA
 6982981 6982982 Pput_0880 Pput_0881     TRUE 0.836 15.000 0.086 1.000   NA
 6982982 6982983 Pput_0881 Pput_0882     TRUE 0.976 -3.000 0.204 1.000   NA
 6982983 6982984 Pput_0882 Pput_0883   ispG TRUE 0.970 4.000 0.233 1.000   NA
 6982984 6982985 Pput_0883 Pput_0884 ispG hisS TRUE 0.829 26.000 0.207 1.000 N NA
 6982985 6982986 Pput_0884 Pput_0885 hisS   TRUE 0.834 40.000 0.259 1.000   NA
 6982986 6982987 Pput_0885 Pput_0886     TRUE 0.990 1.000 0.492 1.000   NA
 6982987 6982988 Pput_0886 Pput_0887   engA FALSE 0.425 117.000 0.203 1.000   NA
 6982988 6982989 Pput_0887 Pput_0888 engA   FALSE 0.081 152.000 0.006 1.000   NA
 6982989 6982990 Pput_0888 Pput_0889     TRUE 0.931 -12.000 0.099 1.000   NA
 6982991 6982992 Pput_0890 Pput_0891     FALSE 0.305 254.000 0.068 0.020 Y NA
 6982993 6982994 Pput_0892 Pput_0893     TRUE 0.972 4.000 0.250 1.000   NA
 6982996 6982997 Pput_0895 Pput_0896     TRUE 0.957 21.000 0.625 NA N NA
 6982997 6982998 Pput_0896 Pput_0897     TRUE 0.713 109.000 0.250 NA Y NA
 6982999 6983000 Pput_0898 Pput_0899     TRUE 0.998 -3.000 0.903 1.000 Y NA
 6983000 6983001 Pput_0899 Pput_0900     TRUE 0.990 -3.000 0.313 0.061 N NA
 6983001 6983002 Pput_0900 Pput_0901     TRUE 0.973 14.000 0.403 0.061 N NA
 6983004 6983005 Pput_0903 Pput_0904     TRUE 0.919 53.000 0.714 NA   NA
 6983005 6983006 Pput_0904 Pput_0905     TRUE 0.939 34.000 0.600 NA   NA
 6983006 6983007 Pput_0905 Pput_0906     FALSE 0.086 65.000 0.000 1.000 N NA
 6983007 6983008 Pput_0906 Pput_0907     FALSE 0.003 703.000 0.000 NA   NA
 6983009 6983010 Pput_0908 Pput_0909     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 6983010 6983011 Pput_0909 Pput_0910     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983011 6983012 Pput_0910 Pput_0911     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983012 6983013 Pput_0911 Pput_0912     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983013 6983014 Pput_0912 Pput_0913     FALSE 0.158 41.000 0.000 1.000 N NA
 6983014 6983015 Pput_0913 Pput_0914     FALSE 0.122 76.000 0.000 NA   NA
 6983015 6983016 Pput_0914 Pput_0915     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6983016 6983017 Pput_0915 Pput_0916     TRUE 0.604 3.000 0.000 1.000 N NA
 6983018 6983019 Pput_0917 Pput_0918 dppF   TRUE 0.998 0.000 0.377 0.001 Y NA
 6983019 6983020 Pput_0918 Pput_0919     TRUE 0.993 11.000 0.560 1.000 Y NA
 6983020 6983021 Pput_0919 Pput_0920     TRUE 0.997 11.000 0.779 0.061 Y NA
 6983021 6983022 Pput_0920 Pput_0921     TRUE 0.670 92.000 0.036 0.061 Y NA
 6983022 6983023 Pput_0921 Pput_0922     TRUE 0.899 79.000 0.714 0.079   NA
 6983023 6983024 Pput_0922 Pput_0923     TRUE 0.592 229.000 0.714 0.079   NA
 6983024 6983025 Pput_0923 Pput_0924     FALSE 0.497 148.000 0.000 0.061 Y NA
 6983025 6983026 Pput_0924 Pput_0925     FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 6983027 6983028 Pput_0926 Pput_0927     TRUE 0.998 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 6983028 6983029 Pput_0927 Pput_0928     FALSE 0.036 109.000 0.000 1.000 N NA
 6983029 6983030 Pput_0928 Pput_0929     TRUE 0.995 -3.000 0.833 NA   NA
 6983030 6983031 Pput_0929 Pput_0930     TRUE 0.814 45.000 0.273 NA   NA
 6983031 6983032 Pput_0930 Pput_0931     TRUE 0.986 2.000 0.412 NA   NA
 6983032 6983033 Pput_0931 Pput_0932     FALSE 0.348 52.000 0.021 1.000   NA
 6983035 6983036 Pput_0934 Pput_0935     TRUE 0.990 -3.000 0.437 1.000   NA
 6983037 6983038 Pput_0936 Pput_0937     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 6983041 6983042 Pput_0940 Pput_0941     TRUE 0.951 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 6983042 6983043 Pput_0941 Pput_0942     FALSE 0.036 108.000 0.000 1.000 N NA
 6983043 6983044 Pput_0942 Pput_0943     TRUE 0.992 7.000 0.833 1.000   NA
 6983044 6983045 Pput_0943 Pput_0944     TRUE 0.989 0.000 0.455 NA   NA
 6983046 6983047 Pput_0945 Pput_0946     FALSE 0.321 13.000 0.000 NA N NA
 6983047 6983048 Pput_0946 Pput_0947     FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 6983048 6983049 Pput_0947 Pput_0948     TRUE 0.991 3.000 0.620 NA   NA
 6983049 6983050 Pput_0948 Pput_0949     TRUE 0.970 20.000 0.713 NA   NA
 6983050 6983051 Pput_0949 Pput_0950     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 6983051 6983052 Pput_0950 Pput_0951     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6983052 6983053 Pput_0951 Pput_0952     FALSE 0.066 142.000 0.000 NA   NA
 6983053 6983054 Pput_0952 Pput_0953     FALSE 0.124 160.000 0.057 NA N NA
 6983054 6983055 Pput_0953 Pput_0954     FALSE 0.015 217.000 0.004 1.000 N NA
 6983055 6983056 Pput_0954 Pput_0955     FALSE 0.017 272.000 0.009 1.000   NA
 6983057 6983058 Pput_0956 Pput_0957     FALSE 0.463 50.000 0.066 1.000 N NA
 6983058 6983059 Pput_0957 Pput_0958     TRUE 0.556 74.000 0.192 NA   NA
 6983060 6983061 Pput_0959 Pput_0960     TRUE 0.914 18.000 0.310 1.000 N NA
 6983063 6983064 Pput_0962 Pput_0963     TRUE 0.982 0.000 0.286 NA   NA
 6983065 6983066 Pput_0964 Pput_0965     TRUE 0.695 -19.000 0.000 NA   NA
 6983066 6983067 Pput_0965 Pput_0966     FALSE 0.144 70.000 0.000 NA   NA
 6983067 6983068 Pput_0966 Pput_0967     FALSE 0.494 57.000 0.000 0.076   NA
 6983069 6983070 Pput_0968 Pput_0969     TRUE 0.819 61.000 0.417 NA   NA
 6983070 6983071 Pput_0969 Pput_0970   gatB FALSE 0.092 129.000 0.010 NA   NA
 6983071 6983072 Pput_0970 Pput_0971 gatB gatA TRUE 0.996 12.000 0.492 0.001 Y NA
 6983072 6983073 Pput_0971 Pput_0972 gatA gatC TRUE 0.995 16.000 0.643 0.001 Y NA
 6983074 6983075 Pput_0973 Pput_0974     FALSE 0.432 226.000 0.689 1.000 N NA
 6983075 6983076 Pput_0974 Pput_0975     TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 6983076 6983077 Pput_0975 Pput_0976     TRUE 0.781 33.000 0.206 NA N NA
 6983077 6983078 Pput_0976 Pput_0977     TRUE 0.820 55.000 0.417 NA N NA
 6983078 6983079 Pput_0977 Pput_0978     TRUE 0.594 89.000 0.296 NA   NA
 6983079 6983080 Pput_0978 Pput_0979     TRUE 0.974 9.000 0.358 NA   NA
 6983080 6983081 Pput_0979 Pput_0980     TRUE 0.975 3.000 0.259 NA   NA
 6983083 6983084 Pput_0982 Pput_0983     FALSE 0.022 246.000 0.010 NA   NA
 6983084 6983085 Pput_0983 Pput_0984   fumC TRUE 0.899 -10.000 0.058 NA   NA
 6983085 6983086 Pput_0984 Pput_0985 fumC   FALSE 0.002 377.000 0.000 1.000 N NA
 6983086 6983087 Pput_0985 Pput_0986     TRUE 0.990 12.000 0.464 1.000 Y NA
 6983088 6983089 Pput_0987 Pput_0988     TRUE 0.869 19.000 0.182 NA   NA
 6983089 6983090 Pput_0988 Pput_0989     TRUE 0.964 3.000 0.186 NA   NA
 6983090 6983091 Pput_0989 Pput_0990     TRUE 0.979 13.000 0.728 NA N NA
 6983091 6983092 Pput_0990 Pput_0991     TRUE 0.837 80.000 0.820 NA N NA
 6983092 6983093 Pput_0991 Pput_0992     FALSE 0.261 176.000 0.163 1.000   NA
 6983093 6983094 Pput_0992 Pput_0993     TRUE 0.991 1.000 0.543 NA   NA
 6983094 6983095 Pput_0993 Pput_0994     TRUE 0.983 -13.000 0.459 NA   NA
 6983095 6983096 Pput_0994 Pput_0995     TRUE 0.987 9.000 0.617 NA   NA
 6983096 6983097 Pput_0995 Pput_0996     TRUE 0.978 13.000 0.598 1.000   NA
 6983098 6983099 Pput_0997 Pput_0998     TRUE 0.996 0.000 0.530 NA Y NA
 6983099 6983100 Pput_0998 Pput_0999     TRUE 0.992 0.000 0.562 NA   NA
 6983100 6983101 Pput_0999 Pput_1000     TRUE 0.905 10.000 0.091 NA   NA
 6983101 6983102 Pput_1000 Pput_1001     TRUE 0.937 18.000 0.353 NA   NA
 6983102 6983103 Pput_1001 Pput_1002     FALSE 0.228 118.000 0.067 NA   NA
 6983103 6983104 Pput_1002 Pput_1003     TRUE 0.866 24.000 0.258 NA N NA
 6983104 6983105 Pput_1003 Pput_1004   hisG FALSE 0.320 92.000 0.123 1.000 N NA
 6983105 6983106 Pput_1004 Pput_1005 hisG hisD FALSE 0.437 287.000 0.254 0.003 Y NA
 6983106 6983107 Pput_1005 Pput_1006 hisD   TRUE 0.992 3.000 0.087 0.003 Y NA
 6983109 6983110 Pput_1008 Pput_1009     TRUE 0.918 14.000 0.250 1.000 N NA
 6983110 6983111 Pput_1009 Pput_1010     FALSE 0.185 110.000 0.048 NA   NA
 6983111 6983112 Pput_1010 Pput_1011     TRUE 0.849 -7.000 0.026 NA   NA
 6983115 6983116 Pput_1014 Pput_1015   valS FALSE 0.056 179.000 0.003 1.000   NA
 6983116 6983117 Pput_1015 Pput_1016 valS   FALSE 0.042 199.000 0.009 NA   NA
 6983117 6983118 Pput_1016 Pput_1017     TRUE 0.854 6.000 0.034 NA   NA
 6983118 6983119 Pput_1017 Pput_1018     TRUE 0.864 51.000 0.494 1.000 N NA
 6983120 6983121 Pput_1019 Pput_1020     TRUE 0.995 -7.000 0.631 0.075   NA
 6983122 6983123 Pput_1021 Pput_1022     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6983123 6983124 Pput_1022 Pput_1023     FALSE 0.003 358.000 0.000 1.000 N NA
 6983124 6983125 Pput_1023 Pput_1024     TRUE 0.829 28.000 0.013 1.000 Y NA
 6983125 6983126 Pput_1024 Pput_1025     FALSE 0.384 107.000 0.006 1.000 Y NA
 6983126 6983127 Pput_1025 Pput_1026     TRUE 0.980 12.000 0.249 1.000 Y NA
 6983127 6983128 Pput_1026 Pput_1027     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 6983128 6983129 Pput_1027 Pput_1028     TRUE 0.981 -7.000 0.367 NA   NA
 6983129 6983130 Pput_1028 Pput_1029     TRUE 0.990 -3.000 0.450 NA   NA
 6983130 6983131 Pput_1029 Pput_1030     TRUE 0.799 17.000 0.080 NA   NA
 6983132 6983133 Pput_1031 Pput_1032     TRUE 0.959 -10.000 0.200 NA   NA
 6983134 6983135 Pput_1033 Pput_1034     FALSE 0.363 128.000 0.000 1.000 Y NA
 6983135 6983136 Pput_1034 Pput_1035     FALSE 0.362 153.000 0.200 NA   NA
 6983136 6983137 Pput_1035 Pput_1036     TRUE 0.586 57.000 0.121 NA   NA
 6983137 6983138 Pput_1036 Pput_1037     TRUE 0.731 186.000 0.483 1.000 Y NA
 6983138 6983139 Pput_1037 Pput_1038     TRUE 0.743 70.000 0.100 1.000 Y NA
 6983139 6983140 Pput_1038 Pput_1039     TRUE 0.959 34.000 0.375 1.000 Y NA
 6983142 6983143 Pput_1041 Pput_1042     TRUE 0.622 55.000 0.132 NA   NA
 6983143 6983144 Pput_1042 Pput_1043     FALSE 0.246 222.000 0.074 NA Y NA
 6983144 6983145 Pput_1043 Pput_1044     TRUE 0.590 126.000 0.122 NA Y NA
 6983145 6983146 Pput_1044 Pput_1045     TRUE 0.849 89.000 1.000 NA N NA
 6983146 6983147 Pput_1045 Pput_1046     FALSE 0.002 375.000 0.000 1.000 N NA
 6983147 6983148 Pput_1046 Pput_1047     FALSE 0.002 379.000 0.000 1.000 N NA
 6983149 6983150 Pput_1048 Pput_1049   glk TRUE 0.978 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 6983150 6983151 Pput_1049 Pput_1050 glk   TRUE 0.917 22.000 0.364 1.000 N NA
 6983151 6983152 Pput_1050 Pput_1051     TRUE 0.997 -19.000 0.909 1.000 Y NA
 6983152 6983153 Pput_1051 Pput_1052     FALSE 0.031 216.000 0.026 1.000 N NA
 6983153 6983154 Pput_1052 Pput_1053     FALSE 0.476 108.000 0.043 1.000 Y NA
 6983154 6983155 Pput_1053 Pput_1054     TRUE 0.863 134.000 0.367 0.061 Y NA
 6983155 6983156 Pput_1054 Pput_1055     TRUE 0.998 -7.000 0.816 0.061 Y NA
 6983156 6983157 Pput_1055 Pput_1056     TRUE 0.998 4.000 0.723 0.061 Y NA
 6983157 6983158 Pput_1056 Pput_1057     TRUE 0.813 41.000 0.135 0.061 N NA
 6983158 6983159 Pput_1057 Pput_1058     FALSE 0.079 118.000 0.021 1.000 N NA
 6983161 6983162 Pput_1060 Pput_1061     TRUE 0.982 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 6983162 6983163 Pput_1061 Pput_1062     TRUE 0.921 18.000 0.064 1.000 Y NA
 6983163 6983164 Pput_1062 Pput_1063     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 6983164 6983165 Pput_1063 Pput_1064     TRUE 0.728 5.000 0.000 NA   NA
 6983166 6983167 Pput_1065 Pput_1066     FALSE 0.002 468.000 0.000 1.000 N NA
 6983167 6983168 Pput_1066 Pput_1067   xseA TRUE 0.817 4.000 0.032 1.000 N NA
 6983168 6983169 Pput_1067 Pput_1068 xseA   FALSE 0.023 194.000 0.006 1.000 N NA
 6983170 6983171 Pput_1069 Pput_1070     TRUE 0.533 48.000 0.064 NA   NA
 6983171 6983172 Pput_1070 Pput_1071     FALSE 0.119 87.000 0.008 NA   NA
 6983172 6983173 Pput_1071 Pput_1072   guaA TRUE 0.719 79.000 0.190 0.001 N NA
 6983174 6983175 Pput_1073 Pput_1074     TRUE 0.828 -3.000 0.000 1.000   NA
 6983176 6983177 Pput_1075 Pput_1076     TRUE 0.892 0.000 0.045 1.000 N NA
 6983179 6983180 Pput_1078 Pput_1079     TRUE 0.815 4.000 0.016 NA   NA
 6983181 6983182 Pput_1080 Pput_1081     TRUE 0.994 -3.000 0.314 NA Y NA
 6983182 6983183 Pput_1081 Pput_1082     TRUE 0.958 0.000 0.000 0.007   NA
 6983186 6983187 Pput_1085 Pput_1086     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983187 6983188 Pput_1086 Pput_1087     TRUE 0.745 4.000 0.000 NA   NA
 6983188 6983189 Pput_1087 Pput_1088     TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 6983189 6983190 Pput_1088 Pput_1089     TRUE 0.996 4.000 0.653 1.000 Y NA
 6983190 6983191 Pput_1089 Pput_1090     TRUE 0.994 18.000 0.599 0.003 Y NA
 6983191 6983192 Pput_1090 Pput_1091     TRUE 0.964 3.000 0.029 0.003   NA
 6983192 6983193 Pput_1091 Pput_1092     TRUE 0.968 -3.000 0.015 0.003   NA
 6983193 6983194 Pput_1092 Pput_1093     TRUE 0.992 -3.000 0.569 NA   NA
 6983194 6983195 Pput_1093 Pput_1094     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983195 6983196 Pput_1094 Pput_1095     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983196 6983197 Pput_1095 Pput_1096     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983198 6983199 Pput_1097 Pput_1098     TRUE 0.961 -7.000 0.223 NA N NA
 6983199 6983200 Pput_1098 Pput_1099     FALSE 0.071 90.000 0.014 NA N NA
 6983202 6983203 Pput_1101 Pput_1102     FALSE 0.012 283.000 0.000 1.000   NA
 6983207 6983208 Pput_1106 Pput_1107     TRUE 0.754 24.000 0.085 NA   NA
 6983208 6983209 Pput_1107 Pput_1108     TRUE 0.998 -3.000 0.613 0.097 Y NA
 6983209 6983210 Pput_1108 Pput_1109     TRUE 0.628 69.000 0.129 0.097 N NA
 6983210 6983211 Pput_1109 Pput_1110     TRUE 0.988 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 6983211 6983212 Pput_1110 Pput_1111     TRUE 0.999 1.000 0.933 0.011 Y NA
 6983212 6983213 Pput_1111 Pput_1112     TRUE 0.667 146.000 0.083 0.060 Y NA
 6983215 6983216 Pput_1114 Pput_1115 glpD   FALSE 0.009 293.000 0.016 1.000 N NA
 6983216 6983217 Pput_1115 Pput_1116   glpK TRUE 0.912 -3.000 0.055 1.000 N NA
 6983217 6983218 Pput_1116 Pput_1117 glpK   FALSE 0.248 52.000 0.023 1.000 N NA
 6983220 6983221 Pput_1119 Pput_1120     TRUE 0.975 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 6983222 6983223 Pput_1121 Pput_1122     TRUE 0.795 -31.000 0.039 1.000 N NA
 6983224 6983225 Pput_1123 Pput_1124     TRUE 0.541 200.000 0.286 NA Y NA
 6983227 6983228 Pput_1126 Pput_1127     TRUE 0.925 -3.000 0.068 1.000 N NA
 6983229 6983230 Pput_1128 Pput_1129     FALSE 0.005 593.000 0.013 1.000   NA
 6983233 6983234 Pput_1132 Pput_1133     FALSE 0.101 105.000 0.012 NA   NA
 6983234 6983235 Pput_1133 Pput_1134     FALSE 0.030 153.000 0.000 1.000 N NA
 6983235 6983236 Pput_1134 Pput_1135     TRUE 0.999 -3.000 0.924 0.058 Y NA
 6983236 6983237 Pput_1135 Pput_1136     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 6983237 6983238 Pput_1136 Pput_1137   metG FALSE 0.095 107.000 0.027 1.000 N NA
 6983241 6983242 Pput_1140 Pput_1141 dcd   FALSE 0.120 95.000 0.014 NA   NA
 6983243 6983244 Pput_1142 Pput_1143     TRUE 0.990 -3.000 0.460 1.000   NA
 6983244 6983245 Pput_1143 Pput_1144     FALSE 0.170 68.000 0.000 1.000   NA
 6983245 6983246 Pput_1144 Pput_1145     FALSE 0.082 114.000 0.000 1.000   NA
 6983246 6983247 Pput_1145 Pput_1146     TRUE 0.994 -3.000 0.751 1.000 N NA
 6983247 6983248 Pput_1146 Pput_1147     FALSE 0.082 127.000 0.000 1.000   NA
 6983248 6983249 Pput_1147 Pput_1148     FALSE 0.086 104.000 0.000 1.000   NA
 6983250 6983251 Pput_1149 Pput_1150     TRUE 0.932 -3.000 0.056 NA   NA
 6983251 6983252 Pput_1150 Pput_1151     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983252 6983253 Pput_1151 Pput_1152     TRUE 0.599 -3.000 0.000 NA N NA
 6983254 6983255 Pput_1153 Pput_1154     TRUE 0.942 8.000 0.163 NA   NA
 6983255 6983256 Pput_1154 Pput_1155     TRUE 0.951 -27.000 0.200 NA   NA
 6983256 6983257 Pput_1155 Pput_1156     TRUE 0.985 3.000 0.407 NA   NA
 6983258 6983259 Pput_1157 Pput_1158     TRUE 0.919 90.000 0.400 0.004 Y NA
 6983259 6983260 Pput_1158 Pput_1159     FALSE 0.197 99.000 0.045 NA   NA
 6983262 6983263 Pput_1161 Pput_1162 dinG   FALSE 0.212 80.000 0.029 1.000   NA
 6983263 6983264 Pput_1162 Pput_1163     TRUE 0.978 11.000 0.467 1.000   NA
 6983264 6983265 Pput_1163 Pput_1164     TRUE 0.740 100.000 0.667 1.000 N NA
 6983265 6983266 Pput_1164 Pput_1165     FALSE 0.481 20.000 0.023 1.000 N NA
 6983269 6983270 Pput_1168 Pput_1169     FALSE 0.013 278.000 0.000 1.000   NA
 6983270 6983271 Pput_1169 Pput_1170     FALSE 0.159 80.000 0.017 NA   NA
 6983271 6983272 Pput_1170 Pput_1171     FALSE 0.195 89.000 0.034 NA   NA
 6983272 6983273 Pput_1171 Pput_1172   livG TRUE 0.999 1.000 0.967 0.018 Y NA
 6983273 6983274 Pput_1172 Pput_1173 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 6983274 6983275 Pput_1173 Pput_1174 livM   TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.060 Y NA
 6983275 6983276 Pput_1174 Pput_1175     FALSE 0.233 186.000 0.000 1.000 Y NA
 6983277 6983278 Pput_1176 Pput_1177     FALSE 0.035 193.000 0.000 NA   NA
 6983279 6983280 Pput_1178 Pput_1179     FALSE 0.005 277.000 0.000 1.000 N NA
 6983281 6983282 Pput_1180 Pput_1181     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6983282 6983283 Pput_1181 Pput_1182     TRUE 0.587 68.000 0.182 NA   NA
 6983283 6983284 Pput_1182 Pput_1183     FALSE 0.370 136.000 0.182 NA   NA
 6983284 6983285 Pput_1183 Pput_1184     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983285 6983286 Pput_1184 Pput_1185     TRUE 0.953 -13.000 0.185 NA   NA
 6983286 6983287 Pput_1185 Pput_1186     TRUE 0.958 13.000 0.353 NA   NA
 6983287 6983288 Pput_1186 Pput_1187     FALSE 0.022 224.000 0.000 NA   NA
 6983289 6983290 Pput_1188 Pput_1189     TRUE 0.832 52.000 0.000 0.009 Y NA
 6983290 6983291 Pput_1189 Pput_1190     FALSE 0.005 282.000 0.000 1.000 N NA
 6983292 6983293 Pput_R0031 Pput_R0032     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6983293 6983294 Pput_R0032 Pput_R0033     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6983294 6983295 Pput_R0033 Pput_R0034     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 6983295 6983296 Pput_R0034 Pput_R0035     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6983296 6983297 Pput_R0035 Pput_1191     FALSE 0.003 626.000 0.000 NA   NA
 6983297 6983298 Pput_1191 Pput_1192     FALSE 0.005 438.000 0.000 1.000   NA
 6983298 6983299 Pput_1192 Pput_1193     TRUE 0.824 11.000 0.042 NA   NA
 6983299 6983300 Pput_1193 Pput_1194     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983300 6983301 Pput_1194 Pput_1195     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6983301 6983302 Pput_1195 Pput_1196     FALSE 0.046 175.000 0.000 NA   NA
 6983302 6983303 Pput_1196 Pput_1197     TRUE 0.917 28.000 0.439 1.000 N NA
 6983303 6983304 Pput_1197 Pput_1198     FALSE 0.251 109.000 0.105 1.000 N NA
 6983305 6983306 Pput_1199 Pput_1200     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6983306 6983307 Pput_1200 Pput_1201     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6983307 6983308 Pput_1201 Pput_1202     TRUE 0.998 1.000 0.905 NA Y NA
 6983308 6983309 Pput_1202 Pput_1203     TRUE 0.964 67.000 0.947 NA Y NA
 6983309 6983310 Pput_1203 Pput_1204     TRUE 0.898 65.000 0.350 NA Y NA
 6983310 6983311 Pput_1204 Pput_1205     TRUE 0.976 23.000 0.450 NA Y NA
 6983311 6983312 Pput_1205 Pput_1206     FALSE 0.003 558.000 0.000 1.000   NA
 6983313 6983314 Pput_1207 Pput_1208     FALSE 0.343 31.000 0.000 NA   NA
 6983315 6983316 Pput_1209 Pput_1210     FALSE 0.280 1202.000 0.564 0.001 Y NA
 6983317 6983318 Pput_1211 Pput_1212     TRUE 0.992 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 6983319 6983320 Pput_1213 Pput_1214     FALSE 0.186 248.000 0.069 1.000 Y NA
 6983321 6983322 Pput_1215 Pput_1216     FALSE 0.226 195.000 0.180 1.000   NA
 6983322 6983323 Pput_1216 Pput_1217     TRUE 0.998 -3.000 0.940 1.000 Y NA
 6983323 6983324 Pput_1217 Pput_1218     FALSE 0.003 350.000 0.000 1.000 N NA
 6983324 6983325 Pput_1218 Pput_1219     FALSE 0.042 183.000 0.000 NA   NA
 6983326 6983327 Pput_1220 Pput_1221     TRUE 0.818 7.000 0.025 NA   NA
 6983327 6983328 Pput_1221 Pput_1222     FALSE 0.452 50.000 0.043 NA   NA
 6983328 6983329 Pput_1222 Pput_1223     FALSE 0.422 87.000 0.139 1.000   NA
 6983330 6983331 Pput_1224 Pput_1225     FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 6983331 6983332 Pput_1225 Pput_1226     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983332 6983333 Pput_1226 Pput_1227     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6983336 6983337 Pput_1230 Pput_1231     TRUE 0.969 0.000 0.176 NA   NA
 6983337 6983338 Pput_1231 Pput_R0036     FALSE 0.014 262.000 0.000 NA   NA
 6983338 6983339 Pput_R0036 Pput_R0037     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6983339 6983340 Pput_R0037 Pput_R0038     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6983342 6983343 Pput_1233 Pput_1234     FALSE 0.522 21.000 0.013 NA   NA
 6983343 6983344 Pput_1234 Pput_1235     FALSE 0.064 161.000 0.000 1.000   NA
 6983345 6983346 Pput_1236 Pput_1237     TRUE 0.892 2.000 0.035 NA   NA
 6983348 6983349 Pput_1239 Pput_1240     FALSE 0.007 387.000 0.014 NA   NA
 6983349 6983350 Pput_1240 Pput_1241     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6983350 6983351 Pput_1241 Pput_1242   aspS FALSE 0.139 94.000 0.020 NA   NA
 6983351 6983352 Pput_1242 Pput_1243 aspS   FALSE 0.165 115.000 0.039 NA   NA
 6983352 6983353 Pput_1243 Pput_1244   ruvC FALSE 0.349 186.000 0.277 NA   NA
 6983353 6983354 Pput_1244 Pput_1245 ruvC ruvA TRUE 0.906 110.000 0.451 0.008 Y NA
 6983354 6983355 Pput_1245 Pput_1246 ruvA ruvB TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.002 Y NA
 6983355 6983356 Pput_1246 Pput_1247 ruvB   FALSE 0.269 126.000 0.082 1.000   NA
 6983356 6983357 Pput_1247 Pput_1248     TRUE 0.991 3.000 0.593 1.000   NA
 6983357 6983358 Pput_1248 Pput_1249     TRUE 0.993 15.000 0.556 0.077 Y NA
 6983358 6983359 Pput_1249 Pput_1250     TRUE 0.990 0.000 0.460 1.000   NA
 6983359 6983360 Pput_1250 Pput_1251   tolB TRUE 0.934 27.000 0.215 0.007   NA
 6983360 6983361 Pput_1251 Pput_1252 tolB   TRUE 0.881 55.000 0.592 1.000 N NA
 6983361 6983362 Pput_1252 Pput_1253     TRUE 0.970 7.000 0.278 1.000   NA
 6983362 6983363 Pput_1253 Pput_1254     FALSE 0.163 169.000 0.059 1.000   NA
 6983363 6983364 Pput_1254 Pput_1255     TRUE 0.918 18.000 0.270 1.000   NA
 6983364 6983365 Pput_1255 Pput_R0039     FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 6983366 6983367 Pput_1256 Pput_1257     FALSE 0.032 143.000 0.000 1.000 N NA
 6983367 6983368 Pput_1257 Pput_1258     FALSE 0.081 67.000 0.000 1.000 N NA
 6983369 6983370 Pput_1259 Pput_1260     FALSE 0.012 275.000 0.000 NA   NA
 6983371 6983372 Pput_1261 Pput_1262     FALSE 0.016 258.000 0.000 1.000   NA
 6983373 6983374 Pput_1263 Pput_1264     TRUE 0.814 21.000 0.121 NA   NA
 6983375 6983376 Pput_1265 Pput_1266     TRUE 0.857 12.000 0.102 NA N NA
 6983377 6983378 Pput_1267 Pput_1268     TRUE 0.938 16.000 0.088 NA Y NA
 6983378 6983379 Pput_1268 Pput_1269     TRUE 0.866 1.000 0.022 NA   NA
 6983379 6983380 Pput_1269 Pput_1270     FALSE 0.493 31.000 0.021 1.000   NA
 6983380 6983381 Pput_1270 Pput_R0040     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6983382 6983383 Pput_1271 Pput_1272     FALSE 0.003 654.000 0.000 NA   NA
 6983383 6983384 Pput_1272 Pput_1273     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 6983385 6983386 Pput_1274 Pput_1275     TRUE 0.685 9.000 0.000 NA   NA
 6983386 6983387 Pput_1275 Pput_1276     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983389 6983390 Pput_1278 Pput_1279     FALSE 0.007 328.000 0.000 NA   NA
 6983393 6983394 Pput_1282 Pput_1283     TRUE 0.928 3.000 0.097 1.000 N NA
 6983394 6983395 Pput_1283 Pput_1284     FALSE 0.348 152.000 0.091 0.079 N NA
 6983395 6983396 Pput_1284 Pput_1285     TRUE 0.903 47.000 0.215 1.000 Y NA
 6983396 6983397 Pput_1285 Pput_1286     TRUE 0.888 24.000 0.046 1.000 Y NA
 6983401 6983402 Pput_1290 Pput_1291   moaA FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6983407 6983408 Pput_1296 Pput_1297     FALSE 0.059 178.000 0.006 1.000   NA
 6983408 6983409 Pput_1297 Pput_1298     TRUE 0.945 -3.000 0.073 NA   NA
 6983409 6983410 Pput_1298 Pput_1299     TRUE 0.914 3.000 0.056 NA   NA
 6983412 6983413 Pput_1301 Pput_1302     FALSE 0.472 42.000 0.034 NA   NA
 6983413 6983414 Pput_1302 Pput_1303     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 6983415 6983416 Pput_1304 Pput_1305     FALSE 0.284 72.000 0.034 1.000   NA
 6983416 6983417 Pput_1305 Pput_1306     FALSE 0.003 608.000 0.000 1.000   NA
 6983418 6983419 Pput_1307 Pput_1308     TRUE 0.754 15.000 0.048 NA   NA
 6983419 6983420 Pput_1308 Pput_1309     TRUE 0.863 10.000 0.053 NA   NA
 6983422 6983423 Pput_1311 Pput_1312     TRUE 0.872 10.000 0.055 1.000   NA
 6983423 6983424 Pput_1312 Pput_1313     TRUE 0.996 0.000 0.909 1.000   NA
 6983424 6983425 Pput_1313 Pput_1314     TRUE 0.998 -3.000 0.909 NA Y NA
 6983426 6983427 Pput_1315 Pput_1316     TRUE 0.962 14.000 0.431 NA   NA
 6983427 6983428 Pput_1316 Pput_1317     FALSE 0.094 188.000 0.041 NA   NA
 6983429 6983430 Pput_1318 Pput_1319     FALSE 0.057 174.000 0.025 1.000 N NA
 6983430 6983431 Pput_1319 Pput_1320     FALSE 0.385 26.000 0.000 NA   NA
 6983431 6983432 Pput_1320 Pput_1321     FALSE 0.073 117.000 0.000 NA   NA
 6983433 6983434 Pput_1322 Pput_1323     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6983439 6983440 Pput_1328 Pput_1329     FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 6983440 6983441 Pput_1329 Pput_1330     TRUE 0.904 0.000 0.031 1.000   NA
 6983443 6983444 Pput_1332 Pput_1333     FALSE 0.037 190.000 0.000 NA   NA
 6983444 6983445 Pput_1333 Pput_1334     TRUE 0.698 45.000 0.149 NA   NA
 6983445 6983446 Pput_1334 Pput_1335     TRUE 0.671 22.000 0.045 NA   NA
 6983446 6983447 Pput_1335 Pput_1336     TRUE 0.919 0.000 0.045 NA   NA
 6983448 6983449 Pput_1337 Pput_1338     TRUE 0.842 35.000 0.046 1.000 Y NA
 6983450 6983451 Pput_1339 Pput_1340     FALSE 0.139 320.000 0.000 0.000 Y NA
 6983452 6983453 Pput_1341 Pput_1342     TRUE 0.984 25.000 0.667 1.000 Y NA
 6983453 6983454 Pput_1342 Pput_1343     TRUE 0.621 71.000 0.222 NA   NA
 6983455 6983456 Pput_1344 Pput_1345     FALSE 0.120 124.000 0.036 1.000 N NA
 6983459 6983460 Pput_1348 Pput_1349     TRUE 0.566 63.000 0.171 1.000 N NA
 6983460 6983461 Pput_1349 Pput_1350     TRUE 0.977 -6.000 0.286 NA   NA
 6983461 6983462 Pput_1350 Pput_1351     TRUE 0.869 14.000 0.118 NA   NA
 6983463 6983464 Pput_1352 Pput_1353     TRUE 0.749 97.000 0.600 NA   NA
 6983464 6983465 Pput_1353 Pput_1354     FALSE 0.017 256.000 0.000 1.000   NA
 6983467 6983468 Pput_1356 Pput_1357     FALSE 0.074 108.000 0.000 NA   NA
 6983468 6983469 Pput_1357 Pput_1358     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 6983470 6983471 Pput_1359 Pput_1360     TRUE 0.953 3.000 0.133 NA   NA
 6983471 6983472 Pput_1360 Pput_1361     TRUE 0.981 2.000 0.309 NA   NA
 6983472 6983473 Pput_1361 Pput_1362     TRUE 0.986 -3.000 0.353 NA   NA
 6983473 6983474 Pput_1362 Pput_1363     FALSE 0.368 28.000 0.000 NA   NA
 6983474 6983475 Pput_1363 Pput_1364     FALSE 0.161 70.000 0.000 1.000   NA
 6983475 6983476 Pput_1364 Pput_1365     TRUE 0.572 54.000 0.087 1.000   NA
 6983476 6983477 Pput_1365 Pput_1366     FALSE 0.341 113.000 0.136 1.000   NA
 6983477 6983478 Pput_1366 Pput_1367     FALSE 0.010 206.000 0.000 NA N NA
 6983478 6983479 Pput_1367 Pput_1368     TRUE 0.967 28.000 0.400 NA Y NA
 6983479 6983480 Pput_1368 Pput_1369     TRUE 0.965 11.000 0.375 1.000 N NA
 6983481 6983482 Pput_1370 Pput_1371     FALSE 0.003 514.000 0.000 NA   NA
 6983482 6983483 Pput_1371 Pput_1372     FALSE 0.004 461.000 0.000 NA   NA
 6983483 6983484 Pput_1372 Pput_1373     FALSE 0.004 459.000 0.000 NA   NA
 6983486 6983487 Pput_1375 Pput_1376     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 6983491 6983492 Pput_1380 Pput_1381     TRUE 0.975 -22.000 0.364 NA   NA
 6983492 6983493 Pput_1381 Pput_1382     FALSE 0.119 77.000 0.000 NA   NA
 6983493 6983494 Pput_1382 Pput_1383     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 6983496 6983497 Pput_1385 Pput_1386     FALSE 0.073 125.000 0.000 NA   NA
 6983498 6983499 Pput_1387 Pput_1388     TRUE 0.667 133.000 0.200 1.000 Y NA
 6983500 6983501 Pput_1389 Pput_1390     FALSE 0.392 99.000 0.200 1.000 N NA
 6983501 6983502 Pput_1390 Pput_1391     FALSE 0.298 65.000 0.031 NA   NA
 6983503 6983504 Pput_1392 Pput_1393     FALSE 0.008 312.000 0.000 NA   NA
 6983504 6983505 Pput_1393 Pput_1394     TRUE 0.907 8.000 0.077 NA   NA
 6983506 6983507 Pput_1395 Pput_1396     FALSE 0.231 152.000 0.024 0.053 N NA
 6983510 6983511 Pput_1399 Pput_1400     FALSE 0.137 221.000 0.154 NA   NA
 6983517 6983518 Pput_1406 Pput_1407     TRUE 0.788 59.000 0.333 NA   NA
 6983518 6983519 Pput_1407 Pput_1408     FALSE 0.382 161.000 0.227 NA   NA
 6983519 6983520 Pput_1408 Pput_1409     TRUE 0.572 13.000 0.000 NA   NA
 6983520 6983521 Pput_1409 Pput_1410     FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6983521 6983522 Pput_1410 Pput_1411     TRUE 0.973 2.000 0.224 NA   NA
 6983523 6983524 Pput_1412 Pput_1413     TRUE 0.967 -22.000 0.281 NA   NA
 6983524 6983525 Pput_1413 Pput_1414     TRUE 0.916 -3.000 0.040 NA   NA
 6983525 6983526 Pput_1414 Pput_1415     TRUE 0.917 -13.000 0.083 NA   NA
 6983526 6983527 Pput_1415 Pput_1416     FALSE 0.091 266.000 0.210 NA N NA
 6983527 6983528 Pput_1416 Pput_1417     FALSE 0.001 638.000 0.000 1.000 N NA
 6983531 6983532 Pput_1420 Pput_1421     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6983532 6983533 Pput_1421 Pput_1422     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 6983533 6983534 Pput_1422 Pput_1423   phhB FALSE 0.073 109.000 0.000 NA   NA
 6983534 6983535 Pput_1423 Pput_1424 phhB phhA TRUE 0.754 40.000 0.203 1.000 N NA
 6983537 6983538 Pput_1426 Pput_1427     FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 6983539 6983540 Pput_1428 Pput_1429 acsA   FALSE 0.001 537.000 0.000 1.000 N NA
 6983540 6983541 Pput_1429 Pput_1430     TRUE 0.950 89.000 0.714 0.059 Y NA
 6983541 6983542 Pput_1430 Pput_1431     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.011 Y NA
 6983542 6983543 Pput_1431 Pput_1432     TRUE 0.958 23.000 0.250 1.000 Y NA
 6983543 6983544 Pput_1432 Pput_1433     TRUE 0.665 99.000 0.500 1.000 N NA
 6983544 6983545 Pput_1433 Pput_1434   argD FALSE 0.002 373.000 0.000 1.000 N NA
 6983545 6983546 Pput_1434 Pput_1435 argD   TRUE 0.831 148.000 0.533 1.000 Y NA
 6983546 6983547 Pput_1435 Pput_1436     TRUE 0.980 79.000 1.000 0.000 Y NA
 6983547 6983548 Pput_1436 Pput_1437   astD TRUE 0.966 1.000 0.205 1.000 N NA
 6983548 6983549 Pput_1437 Pput_1438 astD   TRUE 0.890 24.000 0.306 1.000 N NA
 6983549 6983550 Pput_1438 Pput_1439     TRUE 0.809 15.000 0.072 NA   NA
 6983550 6983551 Pput_1439 Pput_1440     TRUE 0.990 11.000 0.909 NA   NA
 6983551 6983552 Pput_1440 Pput_1441   alaS FALSE 0.004 316.000 0.000 1.000 N NA
 6983552 6983553 Pput_1441 Pput_1442 alaS   FALSE 0.189 103.000 0.065 1.000 N NA
 6983553 6983554 Pput_1442 Pput_1443     FALSE 0.157 167.000 0.079 1.000 N NA
 6983554 6983555 Pput_1443 Pput_R0041     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983555 6983556 Pput_R0041 Pput_R0042     FALSE 0.074 107.000 0.000 NA   NA
 6983556 6983557 Pput_R0042 Pput_R0043     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983557 6983558 Pput_R0043 Pput_R0044     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 6983558 6983559 Pput_R0044 Pput_R0045     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6983559 6983560 Pput_R0045 Pput_1444     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 6983562 6983563 Pput_1446 Pput_R0046     FALSE 0.073 112.000 0.000 NA   NA
 6983564 6983565 Pput_1447 Pput_1448     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 6983567 6983568 Pput_1450 Pput_1451     TRUE 0.985 3.000 0.143 1.000 Y NA
 6983568 6983569 Pput_1451 Pput_1452     TRUE 0.986 1.000 0.036 0.078 Y NA
 6983569 6983570 Pput_1452 Pput_1453     TRUE 0.998 2.000 0.558 0.078 Y NA
 6983571 6983572 Pput_1454 Pput_1455     FALSE 0.022 175.000 0.000 1.000 N NA
 6983572 6983573 Pput_1455 Pput_1456     TRUE 0.645 133.000 0.462 NA   NA
 6983574 6983575 Pput_1457 Pput_1458     FALSE 0.364 80.000 0.121 1.000 N NA
 6983575 6983576 Pput_1458 Pput_1459     TRUE 0.971 50.000 0.361 0.001 Y NA
 6983576 6983577 Pput_1459 Pput_1460   flgA TRUE 0.725 165.000 0.371 NA Y NA
 6983578 6983579 Pput_1461 Pput_1462     TRUE 0.973 53.000 0.838 1.000 Y NA
 6983579 6983580 Pput_1462 Pput_1463     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6983580 6983581 Pput_1463 Pput_1464   flgB FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983581 6983582 Pput_1464 Pput_1465 flgB flgC TRUE 0.999 3.000 0.800 0.002 Y NA
 6983582 6983583 Pput_1465 Pput_1466 flgC flgD TRUE 0.962 16.000 0.207 NA Y NA
 6983583 6983584 Pput_1466 Pput_1467 flgD   TRUE 0.985 32.000 0.875 NA Y NA
 6983584 6983585 Pput_1467 Pput_1468     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983585 6983586 Pput_1468 Pput_1469   flgF FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983586 6983587 Pput_1469 Pput_1470 flgF flgG TRUE 0.954 49.000 0.207 0.001 Y NA
 6983587 6983588 Pput_1470 Pput_1471 flgG flgH TRUE 0.988 37.000 0.632 0.005 Y NA
 6983588 6983589 Pput_1471 Pput_1472 flgH flgI TRUE 0.983 13.000 0.128 0.006 Y NA
 6983589 6983590 Pput_1472 Pput_1473 flgI flgJ TRUE 0.994 12.000 0.405 0.006 Y NA
 6983590 6983591 Pput_1473 Pput_1474 flgJ flgK TRUE 0.997 13.000 0.705 0.002 Y NA
 6983591 6983592 Pput_1474 Pput_1475 flgK flgL TRUE 0.975 14.000 0.057 0.001 Y NA
 6983592 6983593 Pput_1475 Pput_1476 flgL   FALSE 0.329 128.000 0.182 NA N NA
 6983593 6983594 Pput_1476 Pput_1477     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6983594 6983595 Pput_1477 Pput_1478     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6983595 6983596 Pput_1478 Pput_1479     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983596 6983597 Pput_1479 Pput_1480     TRUE 0.997 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 6983597 6983598 Pput_1480 Pput_1481     TRUE 0.990 -7.000 0.247 1.000 Y NA
 6983598 6983599 Pput_1481 Pput_1482     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6983599 6983600 Pput_1482 Pput_1483     FALSE 0.059 155.000 0.000 NA   NA
 6983600 6983601 Pput_1483 Pput_1484     TRUE 0.912 0.000 0.059 1.000 N NA
 6983601 6983602 Pput_1484 Pput_1485     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983602 6983603 Pput_1485 Pput_1486     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983603 6983604 Pput_1486 Pput_1487     FALSE 0.140 71.000 0.000 NA   NA
 6983604 6983605 Pput_1487 Pput_1488     FALSE 0.025 215.000 0.000 NA   NA
 6983605 6983606 Pput_1488 Pput_1489     FALSE 0.007 253.000 0.000 1.000 N NA
 6983606 6983607 Pput_1489 Pput_1490     TRUE 0.584 72.000 0.025 NA Y NA
 6983607 6983608 Pput_1490 Pput_1491     TRUE 0.677 82.000 0.117 NA Y NA
 6983608 6983609 Pput_1491 Pput_1492   fliS TRUE 0.811 139.000 0.194 0.002 Y NA
 6983609 6983610 Pput_1492 Pput_1493 fliS   TRUE 0.963 15.000 0.478 NA   NA
 6983610 6983611 Pput_1493 Pput_1494     FALSE 0.147 170.000 0.056 NA   NA
 6983611 6983612 Pput_1494 Pput_1495     TRUE 0.851 141.000 0.377 0.094 Y NA
 6983612 6983613 Pput_1495 Pput_1496     TRUE 0.998 0.000 0.679 0.094 Y NA
 6983613 6983614 Pput_1496 Pput_1497   fliE FALSE 0.411 195.000 0.446 1.000 N NA
 6983614 6983615 Pput_1497 Pput_1498 fliE fliF TRUE 0.997 16.000 0.910 0.005 Y NA
 6983615 6983616 Pput_1498 Pput_1499 fliF fliG TRUE 0.994 -7.000 0.189 0.005 Y NA
 6983616 6983617 Pput_1499 Pput_1500 fliG fliH TRUE 0.700 163.000 0.320 NA Y NA
 6983617 6983618 Pput_1500 Pput_1501 fliH fliI TRUE 0.979 -10.000 0.115 NA Y NA
 6983618 6983619 Pput_1501 Pput_1502 fliI fliJ TRUE 0.972 7.000 0.070 1.000 Y NA
 6983619 6983620 Pput_1502 Pput_1503 fliJ   FALSE 0.008 308.000 0.022 NA N NA
 6983620 6983621 Pput_1503 Pput_1504     TRUE 0.992 9.000 0.429 NA Y NA
 6983621 6983622 Pput_1504 Pput_1505     TRUE 0.882 58.000 0.250 NA Y NA
 6983622 6983623 Pput_1505 Pput_1506     FALSE 0.312 71.000 0.069 NA N NA
 6983623 6983624 Pput_1506 Pput_1507   fliL FALSE 0.263 220.000 0.075 1.000 Y NA
 6983624 6983625 Pput_1507 Pput_1508 fliL fliM TRUE 0.991 10.000 0.171 0.001 Y NA
 6983625 6983626 Pput_1508 Pput_1509 fliM fliN TRUE 0.988 48.000 0.741 0.001 Y NA
 6983626 6983627 Pput_1509 Pput_1510 fliN   TRUE 0.987 13.000 0.443 1.000 Y NA
 6983627 6983628 Pput_1510 Pput_1511   fliP TRUE 0.982 0.000 0.061 1.000 Y NA
 6983628 6983629 Pput_1511 Pput_1512 fliP fliQ TRUE 0.996 22.000 1.000 0.011 Y NA
 6983629 6983630 Pput_1512 Pput_1513 fliQ fliR TRUE 0.999 8.000 1.000 0.001 Y NA
 6983630 6983631 Pput_1513 Pput_1514 fliR flhB TRUE 0.984 3.000 0.129 1.000 Y NA
 6983631 6983632 Pput_1514 Pput_1515 flhB   FALSE 0.322 225.000 0.205 0.011   NA
 6983633 6983634 Pput_1516 Pput_1517     TRUE 0.667 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6983634 6983635 Pput_1517 Pput_1518     TRUE 0.754 11.000 0.022 NA   NA
 6983635 6983636 Pput_1518 Pput_1519     FALSE 0.320 34.000 0.000 NA   NA
 6983636 6983637 Pput_1519 Pput_1520     TRUE 0.890 -25.000 0.000 0.030 N NA
 6983640 6983641 Pput_1523 Pput_1524 flhA flhF TRUE 0.973 12.000 0.178 1.000 Y NA
 6983641 6983642 Pput_1524 Pput_1525 flhF   FALSE 0.469 94.000 0.241 1.000 N NA
 6983642 6983643 Pput_1525 Pput_1526   fliA TRUE 0.989 -3.000 0.482 1.000 N NA
 6983643 6983644 Pput_1526 Pput_1527 fliA   FALSE 0.505 96.000 0.283 1.000 N NA
 6983644 6983645 Pput_1527 Pput_1528     TRUE 0.981 22.000 0.516 1.000 Y NA
 6983645 6983646 Pput_1528 Pput_1529     TRUE 0.984 13.000 0.341 1.000 Y NA
 6983646 6983647 Pput_1529 Pput_1530     TRUE 0.965 47.000 0.327 0.012 Y NA
 6983647 6983648 Pput_1530 Pput_1531   motC TRUE 0.988 0.000 0.153 1.000 Y NA
 6983648 6983649 Pput_1531 Pput_1532 motC   TRUE 0.989 4.000 0.248 1.000 Y NA
 6983649 6983650 Pput_1532 Pput_1533     FALSE 0.140 224.000 0.199 1.000 N NA
 6983650 6983651 Pput_1533 Pput_1534     TRUE 0.990 0.000 0.454 1.000   NA
 6983651 6983652 Pput_1534 Pput_1535     TRUE 0.978 42.000 0.886 0.011   NA
 6983652 6983653 Pput_1535 Pput_1536     TRUE 0.993 2.000 0.743 NA   NA
 6983654 6983655 Pput_1537 Pput_1538     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6983655 6983656 Pput_1538 Pput_1539     TRUE 0.983 -3.000 0.286 1.000   NA
 6983657 6983658 Pput_1540 Pput_1541     TRUE 0.994 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 6983658 6983659 Pput_1541 Pput_1542     TRUE 0.914 47.000 0.051 0.001 Y NA
 6983659 6983660 Pput_1542 Pput_1543     TRUE 0.990 -3.000 0.501 1.000 N NA
 6983660 6983661 Pput_1543 Pput_1544     TRUE 0.984 -3.000 0.344 1.000 N NA
 6983661 6983662 Pput_1544 Pput_1545     TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 6983662 6983663 Pput_1545 Pput_1546     TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 6983663 6983664 Pput_1546 Pput_1547     TRUE 0.991 -3.000 0.196 NA Y NA
 6983664 6983665 Pput_1547 Pput_1548     TRUE 0.995 -7.000 0.522 NA Y NA
 6983665 6983666 Pput_1548 Pput_1549     TRUE 0.981 13.000 0.667 NA   NA
 6983666 6983667 Pput_1549 Pput_1550     FALSE 0.003 617.000 0.000 NA   NA
 6983667 6983668 Pput_1550 Pput_1551     FALSE 0.357 29.000 0.000 NA   NA
 6983668 6983669 Pput_1551 Pput_1552     FALSE 0.245 52.000 0.000 1.000   NA
 6983669 6983670 Pput_1552 Pput_1553     FALSE 0.170 68.000 0.000 1.000   NA
 6983670 6983671 Pput_1553 Pput_1554     FALSE 0.341 35.000 0.000 1.000   NA
 6983671 6983672 Pput_1554 Pput_1555     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 6983672 6983673 Pput_1555 Pput_1556     FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6983674 6983675 Pput_1557 Pput_1558     TRUE 0.969 17.000 0.714 NA N NA
 6983675 6983676 Pput_1558 Pput_1559     FALSE 0.002 497.000 0.000 1.000 N NA
 6983677 6983678 Pput_1560 Pput_1561     TRUE 0.778 2.000 0.000 NA   NA
 6983680 6983681 Pput_1563 Pput_1564     FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 6983682 6983683 Pput_1565 Pput_1566     FALSE 0.215 210.000 0.030 1.000 Y NA
 6983683 6983684 Pput_1566 Pput_1567     FALSE 0.326 46.000 0.030 1.000 N NA
 6983684 6983685 Pput_1567 Pput_1568     FALSE 0.075 206.000 0.063 1.000 N NA
 6983685 6983686 Pput_1568 Pput_1569     TRUE 0.989 -3.000 0.148 1.000 Y NA
 6983686 6983687 Pput_1569 Pput_1570     FALSE 0.092 241.000 0.154 1.000 N NA
 6983687 6983688 Pput_1570 Pput_1571     TRUE 0.582 153.000 0.492 1.000 N NA
 6983688 6983689 Pput_1571 Pput_1572     TRUE 0.874 55.000 0.495 1.000   NA
 6983693 6983694 Pput_1576 Pput_1577     FALSE 0.038 353.000 0.000 NA Y NA
 6983694 6983695 Pput_1577 Pput_1578     FALSE 0.333 141.000 0.200 NA N NA
 6983695 6983696 Pput_1578 Pput_1579     FALSE 0.153 230.000 0.192 1.000   NA
 6983696 6983697 Pput_1579 Pput_1580     TRUE 0.911 45.000 0.538 1.000   NA
 6983697 6983698 Pput_1580 Pput_1581     TRUE 0.699 50.000 0.176 NA   NA
 6983698 6983699 Pput_1581 Pput_1582     TRUE 0.953 0.000 0.097 NA   NA
 6983702 6983703 Pput_1585 Pput_1586     FALSE 0.030 150.000 0.000 1.000 N NA
 6983704 6983705 Pput_1587 Pput_1588     TRUE 0.927 11.000 0.203 NA N NA
 6983705 6983706 Pput_1588 Pput_1589     FALSE 0.497 173.000 0.463 NA N NA
 6983706 6983707 Pput_1589 Pput_1590     TRUE 0.996 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 6983708 6983709 Pput_1591 Pput_1592     TRUE 0.692 4.000 0.010 1.000 N NA
 6983709 6983710 Pput_1592 Pput_1593   zipA TRUE 0.538 206.000 0.115 0.009 Y NA
 6983710 6983711 Pput_1593 Pput_1594 zipA ligA FALSE 0.075 236.000 0.106 1.000 N NA
 6983711 6983712 Pput_1594 Pput_R0047 ligA ffs FALSE 0.024 218.000 0.000 NA   NA
 6983714 6983715 Pput_1596 Pput_1597     FALSE 0.002 886.000 0.000 NA   NA
 6983717 6983718 Pput_1599 Pput_1600     TRUE 0.806 64.000 0.411 NA   NA
 6983718 6983719 Pput_1600 Pput_1601   recR FALSE 0.241 296.000 0.604 NA   NA
 6983720 6983721 Pput_1602 Pput_1603     FALSE 0.188 56.000 0.016 1.000 N NA
 6983721 6983722 Pput_1603 Pput_1604     FALSE 0.127 187.000 0.084 1.000 N NA
 6983722 6983723 Pput_1604 Pput_1605     FALSE 0.210 106.000 0.051 1.000   NA
 6983723 6983724 Pput_1605 Pput_1606     TRUE 0.600 80.000 0.266 NA   NA
 6983724 6983725 Pput_1606 Pput_1607     TRUE 0.996 -21.000 0.713 NA Y NA
 6983725 6983726 Pput_1607 Pput_1608     FALSE 0.389 137.000 0.197 NA   NA
 6983726 6983727 Pput_1608 Pput_1609     TRUE 0.841 16.000 0.111 NA   NA
 6983727 6983728 Pput_1609 Pput_1610     FALSE 0.066 294.000 0.000 1.000 Y NA
 6983728 6983729 Pput_1610 Pput_1611     TRUE 0.966 -3.000 0.030 0.003 N NA
 6983729 6983730 Pput_1611 Pput_1612     TRUE 0.953 6.000 0.045 0.003 N NA
 6983730 6983731 Pput_1612 Pput_1613     TRUE 0.997 0.000 0.833 0.003 N NA
 6983731 6983732 Pput_1613 Pput_1614     TRUE 0.778 2.000 0.000 NA   NA
 6983732 6983733 Pput_1614 Pput_1615     FALSE 0.008 310.000 0.000 NA   NA
 6983733 6983734 Pput_1615 Pput_1616     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.003   NA
 6983734 6983735 Pput_1616 Pput_1617     TRUE 0.996 6.000 0.800 0.003   NA
 6983735 6983736 Pput_1617 Pput_1618     TRUE 0.985 14.000 0.556 0.003 N NA
 6983738 6983739 Pput_1620 Pput_1621     FALSE 0.296 75.000 0.049 NA   NA
 6983743 6983744 Pput_1625 Pput_1626     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 6983744 6983745 Pput_1626 Pput_1627   dsbG FALSE 0.002 828.000 0.000 NA   NA
 6983745 6983746 Pput_1627 Pput_1628 dsbG   TRUE 0.961 2.000 0.000 NA Y NA
 6983746 6983747 Pput_1628 Pput_1629     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.002 Y NA
 6983748 6983749 Pput_1630 Pput_1631     TRUE 0.992 -7.000 0.167 0.055 Y NA
 6983749 6983750 Pput_1631 Pput_1632     TRUE 0.997 3.000 0.452 0.017 Y NA
 6983750 6983751 Pput_1632 Pput_1633     TRUE 0.916 4.000 0.097 NA N NA
 6983751 6983752 Pput_1633 Pput_1634     TRUE 0.957 -3.000 0.103 NA   NA
 6983753 6983754 Pput_1635 Pput_1636     FALSE 0.410 23.000 0.000 NA   NA
 6983754 6983755 Pput_1636 Pput_1637     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 6983756 6983757 Pput_1638 Pput_1639     TRUE 0.998 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 6983757 6983758 Pput_1639 Pput_1640     FALSE 0.003 327.000 0.000 1.000 N NA
 6983759 6983760 Pput_1641 Pput_1642     FALSE 0.185 65.000 0.000 1.000   NA
 6983760 6983761 Pput_1642 Pput_1643     TRUE 0.958 17.000 0.188 1.000 Y NA
 6983762 6983763 Pput_1644 Pput_1645     FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 6983763 6983764 Pput_1645 Pput_1646     FALSE 0.051 169.000 0.000 NA   NA
 6983764 6983765 Pput_1646 Pput_1647     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983765 6983766 Pput_1647 Pput_1648     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6983766 6983767 Pput_1648 Pput_1649     TRUE 0.994 3.000 0.857 NA   NA
 6983769 6983770 Pput_1651 Pput_1652     TRUE 0.992 1.000 0.100 0.017 Y NA
 6983770 6983771 Pput_1652 Pput_1653     FALSE 0.062 76.000 0.000 1.000 N NA
 6983771 6983772 Pput_1653 Pput_1654     TRUE 0.990 10.000 0.818 NA   NA
 6983772 6983773 Pput_1654 Pput_1655     TRUE 0.994 -3.000 0.692 NA   NA
 6983773 6983774 Pput_1655 Pput_1656     TRUE 0.579 85.000 0.308 1.000 N NA
 6983774 6983775 Pput_1656 Pput_1657     TRUE 0.761 65.000 0.333 NA   NA
 6983775 6983776 Pput_1657 Pput_1658     FALSE 0.126 130.000 0.025 NA   NA
 6983776 6983777 Pput_1658 Pput_1659     TRUE 0.564 31.000 0.037 NA   NA
 6983779 6983780 Pput_1661 Pput_1662     TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 6983780 6983781 Pput_1662 Pput_1663   sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 6983781 6983782 Pput_1663 Pput_1664 sdhA sdhB TRUE 0.997 12.000 0.604 0.001 Y NA
 6983782 6983783 Pput_1664 Pput_1665 sdhB sucA FALSE 0.186 247.000 0.067 1.000 Y NA
 6983783 6983784 Pput_1665 Pput_1666 sucA   TRUE 0.973 43.000 0.667 1.000 Y NA
 6983784 6983785 Pput_1666 Pput_1667     TRUE 0.761 94.000 0.253 1.000 Y NA
 6983785 6983786 Pput_1667 Pput_1668   sucC FALSE 0.417 172.000 0.069 1.000 Y NA
 6983786 6983787 Pput_1668 Pput_1669 sucC   TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 6983787 6983788 Pput_1669 Pput_1670     FALSE 0.002 404.000 0.000 1.000 N NA
 6983788 6983789 Pput_1670 Pput_1671     FALSE 0.061 236.000 0.060 NA   NA
 6983790 6983791 Pput_1672 Pput_1673     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983792 6983793 Pput_1674 Pput_1675     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.002 Y NA
 6983793 6983794 Pput_1675 Pput_1676     TRUE 0.963 13.000 0.000 0.002 Y NA
 6983794 6983795 Pput_1676 Pput_1677     TRUE 0.996 -3.000 0.182 0.002 Y NA
 6983795 6983796 Pput_1677 Pput_1678     FALSE 0.004 309.000 0.000 1.000 N NA
 6983797 6983798 Pput_1679 Pput_1680     FALSE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 6983798 6983799 Pput_1680 Pput_1681     FALSE 0.333 207.000 0.100 1.000 Y NA
 6983799 6983800 Pput_1681 Pput_1682     TRUE 0.702 -16.000 0.000 NA   NA
 6983800 6983801 Pput_1682 Pput_1683     FALSE 0.119 77.000 0.000 NA   NA
 6983801 6983802 Pput_1683 Pput_1684     TRUE 0.981 -3.000 0.314 1.000 N NA
 6983802 6983803 Pput_1684 Pput_1685     TRUE 0.995 1.000 0.943 1.000 N NA
 6983803 6983804 Pput_1685 Pput_1686     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983805 6983806 Pput_1687 Pput_1688     TRUE 0.998 -3.000 0.845 NA Y NA
 6983806 6983807 Pput_1688 Pput_1689     FALSE 0.084 70.000 0.007 NA N NA
 6983807 6983808 Pput_1689 Pput_1690     FALSE 0.128 64.000 0.008 1.000 N NA
 6983811 6983812 Pput_1693 Pput_1694     TRUE 0.989 12.000 0.451 1.000 Y NA
 6983812 6983813 Pput_1694 Pput_1695     FALSE 0.013 208.000 0.000 1.000 N NA
 6983813 6983814 Pput_1695 Pput_1696     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983814 6983815 Pput_1696 Pput_1697     TRUE 0.989 0.000 0.444 NA   NA
 6983816 6983817 Pput_1698 Pput_1699 gpsA   TRUE 0.844 37.000 0.273 NA   NA
 6983817 6983818 Pput_1699 Pput_1700     TRUE 0.959 -3.000 0.114 NA   NA
 6983818 6983819 Pput_1700 Pput_1701     FALSE 0.062 151.000 0.000 NA   NA
 6983819 6983820 Pput_1701 Pput_1702     FALSE 0.464 18.000 0.000 NA   NA
 6983820 6983821 Pput_1702 Pput_1703     TRUE 0.954 -3.000 0.096 NA   NA
 6983821 6983822 Pput_1703 Pput_1704     FALSE 0.307 110.000 0.118 NA   NA
 6983822 6983823 Pput_1704 Pput_1705     TRUE 0.970 13.000 0.478 NA   NA
 6983823 6983824 Pput_1705 Pput_1706     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 6983824 6983825 Pput_1706 Pput_1707     TRUE 0.965 10.000 0.071 0.001   NA
 6983825 6983826 Pput_1707 Pput_1708     TRUE 0.985 10.000 0.059 0.001 Y NA
 6983826 6983827 Pput_1708 Pput_1709     TRUE 0.998 11.000 0.877 0.001 Y NA
 6983827 6983828 Pput_1709 Pput_1710     FALSE 0.066 150.000 0.020 1.000 N NA
 6983828 6983829 Pput_1710 Pput_1711     TRUE 0.997 -3.000 0.621 1.000 Y NA
 6983830 6983831 Pput_1712 Pput_1713     FALSE 0.071 71.000 0.000 1.000 N NA
 6983833 6983834 Pput_1715 Pput_1716     TRUE 0.996 2.000 1.000 1.000   NA
 6983834 6983835 Pput_1716 Pput_1717     TRUE 0.998 2.000 1.000 0.058   NA
 6983835 6983836 Pput_1717 Pput_1718     TRUE 0.998 2.000 1.000 0.058   NA
 6983836 6983837 Pput_1718 Pput_1719     TRUE 0.994 -3.000 0.159 0.058 Y NA
 6983837 6983838 Pput_1719 Pput_1720     FALSE 0.148 110.000 0.049 1.000 N NA
 6983838 6983839 Pput_1720 Pput_1721     FALSE 0.484 101.000 0.233 1.000   NA
 6983840 6983841 Pput_1722 Pput_1723   rnhA TRUE 0.585 16.000 0.009 1.000   NA
 6983841 6983842 Pput_1723 Pput_1724 rnhA   TRUE 0.903 51.000 0.248 1.000 Y NA
 6983842 6983843 Pput_1724 Pput_1725     FALSE 0.014 266.000 0.019 1.000 N NA
 6983847 6983848 Pput_1729 Pput_1730     TRUE 0.604 13.000 0.000 1.000   NA
 6983848 6983849 Pput_1730 Pput_1731     TRUE 0.748 -7.000 0.000 NA   NA
 6983852 6983853 Pput_1734 Pput_1735     TRUE 0.997 8.000 0.437 0.001 Y NA
 6983853 6983854 Pput_1735 Pput_1736     TRUE 0.989 41.000 0.713 0.001 Y NA
 6983854 6983855 Pput_1736 Pput_1737     TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 6983855 6983856 Pput_1737 Pput_1738     TRUE 0.996 4.000 0.269 0.002 Y NA
 6983856 6983857 Pput_1738 Pput_1739     TRUE 0.995 11.000 0.428 0.004 Y NA
 6983857 6983858 Pput_1739 Pput_1740     TRUE 0.994 12.000 0.423 0.004 Y NA
 6983858 6983859 Pput_1740 Pput_1741     TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 6983859 6983860 Pput_1741 Pput_1742     TRUE 0.799 133.000 0.180 0.004 Y NA
 6983860 6983861 Pput_1742 Pput_1743     TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 6983861 6983862 Pput_1743 Pput_1744     TRUE 0.997 3.000 0.407 0.004 Y NA
 6983862 6983863 Pput_1744 Pput_1745     TRUE 0.965 80.000 0.691 0.002 Y NA
 6983863 6983864 Pput_1745 Pput_1746     TRUE 0.996 10.000 0.377 0.002 Y NA
 6983864 6983865 Pput_1746 Pput_1747     FALSE 0.006 384.000 0.000 1.000   NA
 6983865 6983866 Pput_1747 Pput_1748     FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000   NA
 6983866 6983867 Pput_1748 Pput_1749     FALSE 0.004 491.000 0.000 1.000   NA
 6983868 6983869 Pput_1750 Pput_1751     FALSE 0.215 54.000 0.000 NA   NA
 6983869 6983870 Pput_1751 Pput_1752     FALSE 0.116 84.000 0.000 1.000   NA
 6983871 6983872 Pput_1753 Pput_1754     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6983874 6983875 Pput_1756 Pput_1757     FALSE 0.412 181.000 0.375 1.000 N NA
 6983876 6983877 Pput_1758 Pput_1759     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6983877 6983878 Pput_1759 Pput_1760     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 6983880 6983881 Pput_1762 Pput_1763     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983881 6983882 Pput_1763 Pput_1764     FALSE 0.083 108.000 0.000 1.000   NA
 6983882 6983883 Pput_1764 Pput_1765     TRUE 0.610 64.000 0.036 0.027   NA
 6983883 6983884 Pput_1765 Pput_1766   uvrC TRUE 0.958 7.000 0.086 0.027 N NA
 6983884 6983885 Pput_1766 Pput_1767 uvrC   TRUE 0.804 34.000 0.227 1.000 N NA
 6983885 6983886 Pput_1767 Pput_R0048     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6983889 6983890 Pput_1770 Pput_1771     FALSE 0.004 449.000 0.000 NA   NA
 6983891 6983892 Pput_1772 Pput_1773     TRUE 0.799 57.000 0.000 0.027 Y NA
 6983893 6983894 Pput_1774 Pput_1775     TRUE 0.995 -3.000 0.205 0.076 Y NA
 6983894 6983895 Pput_1775 Pput_1776     TRUE 0.987 4.000 0.189 1.000 Y NA
 6983895 6983896 Pput_1776 Pput_1777     TRUE 0.970 20.000 0.316 1.000 Y NA
 6983897 6983898 Pput_1778 Pput_1779     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6983902 6983903 Pput_1783 Pput_1784     TRUE 0.806 155.000 0.544 0.003   NA
 6983903 6983904 Pput_1784 Pput_1785     TRUE 0.994 -3.000 0.115 0.003 Y NA
 6983905 6983906 Pput_1786 Pput_1787     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 6983906 6983907 Pput_1787 Pput_1788     FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 6983907 6983908 Pput_1788 Pput_1789     TRUE 0.605 135.000 0.417 NA   NA
 6983908 6983909 Pput_1789 Pput_1790     TRUE 0.691 15.000 0.031 NA   NA
 6983909 6983910 Pput_1790 Pput_1791     TRUE 0.995 -3.000 0.141 0.003 Y NA
 6983910 6983911 Pput_1791 Pput_1792     TRUE 0.996 -3.000 0.204 0.003 Y NA
 6983911 6983912 Pput_1792 Pput_1793   glgA TRUE 0.994 15.000 0.917 1.000 Y NA
 6983912 6983913 Pput_1793 Pput_1794 glgA   FALSE 0.003 649.000 0.000 NA   NA
 6983914 6983915 Pput_1795 Pput_1796     TRUE 0.984 -3.000 0.073 1.000 Y NA
 6983915 6983916 Pput_1796 Pput_1797     FALSE 0.363 116.000 0.000 1.000 Y NA
 6983916 6983917 Pput_1797 Pput_1798     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 6983917 6983918 Pput_1798 Pput_1799     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983919 6983920 Pput_1800 Pput_1801     TRUE 0.978 1.000 0.301 1.000 N NA
 6983920 6983921 Pput_1801 Pput_1802     FALSE 0.135 114.000 0.043 1.000 N NA
 6983922 6983923 Pput_1803 Pput_1804     FALSE 0.473 50.000 0.069 1.000 N NA
 6983924 6983925 Pput_1805 Pput_1806     FALSE 0.110 88.000 0.000 1.000   NA
 6983925 6983926 Pput_1806 Pput_1807   nhaB FALSE 0.031 147.000 0.000 1.000 N NA
 6983927 6983928 Pput_1808 Pput_1809   nudC FALSE 0.344 37.000 0.025 1.000 N NA
 6983929 6983930 Pput_1810 Pput_1811     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 6983930 6983931 Pput_1811 Pput_1812     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 6983931 6983932 Pput_1812 Pput_1813     FALSE 0.046 186.000 0.000 1.000   NA
 6983932 6983933 Pput_1813 Pput_1814     FALSE 0.017 193.000 0.000 1.000 N NA
 6983933 6983934 Pput_1814 Pput_1815     FALSE 0.031 209.000 0.000 1.000   NA
 6983934 6983935 Pput_1815 Pput_1816     TRUE 0.956 -7.000 0.167 NA   NA
 6983935 6983936 Pput_1816 Pput_1817     FALSE 0.192 82.000 0.029 NA   NA
 6983936 6983937 Pput_1817 Pput_1818     FALSE 0.275 111.000 0.093 NA   NA
 6983937 6983938 Pput_1818 Pput_1819   mnmA TRUE 0.971 -3.000 0.180 NA   NA
 6983938 6983939 Pput_1819 Pput_1820 mnmA   TRUE 0.568 60.000 0.158 1.000 N NA
 6983939 6983940 Pput_1820 Pput_1821     FALSE 0.043 207.000 0.032 1.000 N NA
 6983943 6983944 Pput_1824 Pput_1825 clpS   TRUE 0.944 31.000 0.596 NA   NA
 6983945 6983946 Pput_1826 Pput_1827 infA   FALSE 0.220 102.000 0.078 1.000 N NA
 6983946 6983947 Pput_1827 Pput_1828   aat TRUE 0.900 57.000 0.285 1.000 Y NA
 6983948 6983949 Pput_1829 Pput_1830   lolA TRUE 0.717 63.000 0.305 1.000 N NA
 6983949 6983950 Pput_1830 Pput_1831 lolA   TRUE 0.890 13.000 0.167 1.000 N NA
 6983950 6983951 Pput_1831 Pput_1832     TRUE 0.830 -3.000 0.027 NA N NA
 6983951 6983952 Pput_1832 Pput_1833     FALSE 0.382 31.000 0.028 NA N NA
 6983952 6983953 Pput_1833 Pput_1834     TRUE 0.848 1.000 0.031 1.000 N NA
 6983954 6983955 Pput_1835 Pput_1836     FALSE 0.167 95.000 0.051 NA N NA
 6983955 6983956 Pput_1836 Pput_1837     TRUE 0.925 -3.000 0.072 NA N NA
 6983956 6983957 Pput_1837 Pput_1838     TRUE 0.994 -3.000 0.317 NA Y NA
 6983957 6983958 Pput_1838 Pput_1839     TRUE 0.998 0.000 0.804 NA Y NA
 6983958 6983959 Pput_1839 Pput_1840     TRUE 0.997 2.000 0.790 NA Y NA
 6983959 6983960 Pput_1840 Pput_1841     FALSE 0.080 57.000 0.000 NA N NA
 6983960 6983961 Pput_1841 Pput_1842     FALSE 0.009 315.000 0.000 1.000   NA
 6983966 6983967 Pput_1846 Pput_1847     TRUE 0.988 4.000 0.541 NA   NA
 6983967 6983968 Pput_1847 Pput_1848     FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 6983968 6983969 Pput_1848 Pput_1849     FALSE 0.369 107.000 0.000 1.000 Y NA
 6983969 6983970 Pput_1849 Pput_1850     FALSE 0.111 328.000 0.000 0.004 Y NA
 6983970 6983971 Pput_1850 Pput_1851     FALSE 0.073 109.000 0.000 NA   NA
 6983973 6983974 Pput_1853 Pput_1854     TRUE 0.554 104.000 0.364 1.000 N NA
 6983974 6983975 Pput_1854 Pput_1855     FALSE 0.442 20.000 0.000 NA   NA
 6983976 6983977 Pput_1856 Pput_1857     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6983977 6983978 Pput_1857 Pput_1858     FALSE 0.026 165.000 0.000 1.000 N NA
 6983982 6983983 Pput_1862 Pput_1863     FALSE 0.006 352.000 0.000 NA   NA
 6983983 6983984 Pput_1863 Pput_1864     FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   NA
 6983985 6983986 Pput_1865 Pput_1866     TRUE 0.533 157.000 0.438 NA N NA
 6983987 6983988 Pput_1867 Pput_1868     FALSE 0.348 137.000 0.000 1.000 Y NA
 6983988 6983989 Pput_1868 Pput_1869     FALSE 0.022 548.000 0.000 1.000 Y NA
 6983989 6983990 Pput_1869 Pput_1870     FALSE 0.003 368.000 0.000 1.000 N NA
 6983990 6983991 Pput_1870 Pput_1871     TRUE 0.997 9.000 0.487 0.001 Y NA
 6983993 6983994 Pput_1873 Pput_1874     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983994 6983995 Pput_1874 Pput_1875     TRUE 0.967 -3.000 0.000 NA Y NA
 6983995 6983996 Pput_1875 Pput_1876     FALSE 0.486 76.000 0.143 1.000   NA
 6983997 6983998 Pput_1877 Pput_1878     FALSE 0.428 70.000 0.114 1.000 N NA
 6983998 6983999 Pput_1878 Pput_1879     TRUE 0.933 45.000 0.160 0.057 Y NA
 6983999 6984000 Pput_1879 Pput_1880     TRUE 0.915 49.000 0.120 0.057 Y NA
 6984000 6984001 Pput_1880 Pput_1881     TRUE 0.896 62.000 0.158 0.057 Y NA
 6984001 6984002 Pput_1881 Pput_1882     TRUE 0.994 12.000 0.692 1.000 Y NA
 6984002 6984003 Pput_1882 Pput_1883     TRUE 0.997 12.000 0.733 0.017 Y NA
 6984003 6984004 Pput_1883 Pput_1884     FALSE 0.208 29.000 0.000 1.000 N NA
 6984009 6984010 Pput_1889 Pput_1890     TRUE 0.998 -3.000 0.519 0.017 Y NA
 6984010 6984011 Pput_1890 Pput_1891     FALSE 0.018 438.000 0.120 1.000 N NA
 6984011 6984012 Pput_1891 Pput_1892     FALSE 0.498 71.000 0.130 NA   NA
 6984013 6984014 Pput_1893 Pput_1894     TRUE 0.977 -3.000 0.222 NA   NA
 6984014 6984015 Pput_1894 Pput_1895     TRUE 0.981 14.000 0.750 NA   NA
 6984015 6984016 Pput_1895 Pput_1896     TRUE 0.928 16.000 0.065 NA Y NA
 6984016 6984017 Pput_1896 Pput_1897     FALSE 0.403 56.000 0.065 NA N NA
 6984017 6984018 Pput_1897 Pput_1898     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6984018 6984019 Pput_1898 Pput_1899     FALSE 0.002 810.000 0.000 NA   NA
 6984022 6984023 Pput_1902 Pput_1903     FALSE 0.030 153.000 0.000 1.000 N NA
 6984023 6984024 Pput_1903 Pput_1904     FALSE 0.073 127.000 0.000 NA   NA
 6984024 6984025 Pput_1904 Pput_1905     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6984025 6984026 Pput_1905 Pput_1906     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6984027 6984028 Pput_1907 Pput_1908     FALSE 0.050 170.000 0.000 NA   NA
 6984029 6984030 Pput_1909 Pput_1910     TRUE 0.704 37.000 0.115 NA   NA
 6984030 6984031 Pput_1910 Pput_1911     FALSE 0.041 184.000 0.000 NA   NA
 6984031 6984032 Pput_1911 Pput_1912     TRUE 0.771 57.000 0.344 NA N NA
 6984033 6984034 Pput_1913 Pput_R0050     FALSE 0.059 155.000 0.000 NA   NA
 6984035 6984036 Pput_1914 Pput_1915     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6984036 6984037 Pput_1915 Pput_1916     FALSE 0.005 378.000 0.000 NA   NA
 6984037 6984038 Pput_1916 Pput_1917     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 6984038 6984039 Pput_1917 Pput_1918     FALSE 0.003 675.000 0.000 NA   NA
 6984039 6984040 Pput_1918 Pput_1919     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 6984040 6984041 Pput_1919 Pput_1920     TRUE 0.988 -25.000 0.667 NA   NA
 6984041 6984042 Pput_1920 Pput_1921     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 6984042 6984043 Pput_1921 Pput_1922     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984043 6984044 Pput_1922 Pput_1923     TRUE 0.941 -3.000 0.068 NA   NA
 6984045 6984046 Pput_1924 Pput_1925     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6984046 6984047 Pput_1925 Pput_1926     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 6984047 6984048 Pput_1926 Pput_1927     FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 6984048 6984049 Pput_1927 Pput_1928     FALSE 0.003 725.000 0.000 NA   NA
 6984052 6984053 Pput_1931 Pput_1932     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6984055 6984056 Pput_1934 Pput_R0051     FALSE 0.227 51.000 0.000 NA   NA
 6984057 6984058 Pput_1935 Pput_1936     TRUE 0.972 6.000 0.000 0.091 Y NA
 6984058 6984059 Pput_1936 Pput_1937     TRUE 0.918 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6984060 6984061 Pput_1938 Pput_1939     FALSE 0.007 254.000 0.000 1.000 N NA
 6984061 6984062 Pput_1939 Pput_1940     FALSE 0.206 58.000 0.021 1.000 N NA
 6984062 6984063 Pput_1940 Pput_1941     TRUE 0.997 2.000 0.308 0.001 Y NA
 6984063 6984064 Pput_1941 Pput_1942     TRUE 0.999 0.000 0.660 0.001 Y NA
 6984064 6984065 Pput_1942 Pput_1943     FALSE 0.193 83.000 0.026 1.000   NA
 6984065 6984066 Pput_1943 Pput_1944     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6984066 6984067 Pput_1944 Pput_1945     TRUE 0.941 8.000 0.156 NA   NA
 6984068 6984069 Pput_1946 Pput_1947     FALSE 0.412 78.000 0.100 1.000   NA
 6984069 6984070 Pput_1947 Pput_1948     TRUE 0.998 -3.000 0.371 0.011 Y NA
 6984070 6984071 Pput_1948 Pput_1949     FALSE 0.009 237.000 0.000 1.000 N NA
 6984071 6984072 Pput_1949 Pput_1950     FALSE 0.129 98.000 0.035 1.000 N NA
 6984073 6984074 Pput_1951 Pput_1952     FALSE 0.029 156.000 0.000 1.000 N NA
 6984074 6984075 Pput_1952 Pput_1953     TRUE 0.995 18.000 0.815 0.057 Y NA
 6984075 6984076 Pput_1953 Pput_1954     TRUE 0.998 7.000 0.852 0.057 Y NA
 6984076 6984077 Pput_1954 Pput_1955     TRUE 0.997 -3.000 0.304 0.057 Y NA
 6984077 6984078 Pput_1955 Pput_1956     FALSE 0.003 331.000 0.000 1.000 N NA
 6984081 6984082 Pput_1959 Pput_1960     FALSE 0.377 27.000 0.000 NA   NA
 6984082 6984083 Pput_1960 Pput_1961     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6984083 6984084 Pput_1961 Pput_1962     TRUE 0.982 -3.000 0.273 NA   NA
 6984084 6984085 Pput_1962 Pput_1963     TRUE 0.634 58.000 0.000 1.000 Y NA
 6984085 6984086 Pput_1963 Pput_1964     FALSE 0.377 27.000 0.000 NA   NA
 6984087 6984088 Pput_1965 Pput_1966     TRUE 0.997 -3.000 0.512 1.000 Y NA
 6984088 6984089 Pput_1966 Pput_1967     TRUE 0.999 0.000 0.814 0.091 Y NA
 6984089 6984090 Pput_1967 Pput_1968     TRUE 0.996 -3.000 0.484 1.000 Y NA
 6984090 6984091 Pput_1968 Pput_1969     TRUE 0.945 17.000 0.387 NA   NA
 6984091 6984092 Pput_1969 Pput_1970     TRUE 0.987 -3.000 0.360 NA   NA
 6984092 6984093 Pput_1970 Pput_1971     TRUE 0.980 -3.000 0.250 NA   NA
 6984093 6984094 Pput_1971 Pput_1972     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 6984094 6984095 Pput_1972 Pput_1973     FALSE 0.044 178.000 0.000 NA   NA
 6984097 6984098 Pput_1975 Pput_1976   pbpG FALSE 0.031 202.000 0.000 NA   NA
 6984098 6984099 Pput_1976 Pput_1977 pbpG   FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 6984102 6984103 Pput_1980 Pput_1981     FALSE 0.003 533.000 0.000 NA   NA
 6984104 6984105 Pput_1982 Pput_1983     FALSE 0.034 195.000 0.000 NA   NA
 6984105 6984106 Pput_1983 Pput_1984     FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 6984106 6984107 Pput_1984 Pput_1985     FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 6984107 6984108 Pput_1985 Pput_1986     TRUE 0.949 12.000 0.050 1.000 Y NA
 6984108 6984109 Pput_1986 Pput_1987     FALSE 0.001 910.000 0.000 1.000 N NA
 6984115 6984116 Pput_1993 Pput_1994     TRUE 0.647 95.000 0.400 NA   NA
 6984118 6984119 Pput_1996 Pput_1997     FALSE 0.082 98.000 0.000 NA   NA
 6984119 6984120 Pput_1997 Pput_1998     FALSE 0.022 225.000 0.000 NA   NA
 6984121 6984122 Pput_1999 Pput_2000     FALSE 0.170 68.000 0.000 1.000   NA
 6984124 6984125 Pput_2002 Pput_2003     TRUE 0.976 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 6984125 6984126 Pput_2003 Pput_2004     TRUE 0.989 -3.000 0.416 1.000   NA
 6984126 6984127 Pput_2004 Pput_2005     TRUE 0.983 -6.000 0.353 1.000   NA
 6984127 6984128 Pput_2005 Pput_2006     TRUE 0.976 45.000 0.462 0.025 Y NA
 6984129 6984130 Pput_2007 Pput_2008     TRUE 0.957 13.000 0.400 1.000 N NA
 6984130 6984131 Pput_2008 Pput_2009     TRUE 0.962 14.000 0.154 1.000 Y NA
 6984135 6984136 Pput_2013 Pput_2014     FALSE 0.368 28.000 0.000 NA   NA
 6984136 6984137 Pput_2014 Pput_2015     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 6984137 6984138 Pput_2015 Pput_2016   glcF TRUE 0.907 -7.000 0.057 NA   NA
 6984138 6984139 Pput_2016 Pput_2017 glcF glcE TRUE 0.983 10.000 0.074 0.042 Y NA
 6984139 6984140 Pput_2017 Pput_2018 glcE   TRUE 0.992 0.000 0.070 0.014 Y NA
 6984145 6984146 Pput_2023 Pput_2024     FALSE 0.255 103.000 0.000 0.070   NA
 6984146 6984147 Pput_2024 Pput_2025     FALSE 0.005 394.000 0.000 1.000   NA
 6984148 6984149 Pput_2026 Pput_2027     TRUE 0.956 13.000 0.128 0.000 N NA
 6984150 6984151 Pput_2028 Pput_2029     TRUE 0.993 0.000 0.680 NA N NA
 6984151 6984152 Pput_2029 Pput_2030     TRUE 0.989 -10.000 0.627 NA   NA
 6984154 6984155 Pput_2032 Pput_2033     TRUE 0.740 74.000 0.125 1.000 Y NA
 6984155 6984156 Pput_2033 Pput_2034     TRUE 0.997 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 6984156 6984157 Pput_2034 Pput_2035     TRUE 0.997 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 6984157 6984158 Pput_2035 Pput_2036     FALSE 0.251 197.000 0.250 1.000 N NA
 6984158 6984159 Pput_2036 Pput_2037     FALSE 0.009 239.000 0.000 1.000 N NA
 6984159 6984160 Pput_2037 Pput_2038     TRUE 0.964 34.000 0.429 1.000 Y NA
 6984160 6984161 Pput_2038 Pput_2039     TRUE 0.968 18.000 0.714 1.000 N NA
 6984161 6984162 Pput_2039 Pput_2040     TRUE 0.983 -7.000 0.231 0.029 N NA
 6984162 6984163 Pput_2040 Pput_2041   alr FALSE 0.177 35.000 0.000 1.000 N NA
 6984163 6984164 Pput_2041 Pput_2042 alr   FALSE 0.236 25.000 0.000 1.000 N NA
 6984164 6984165 Pput_2042 Pput_2043     TRUE 0.585 -7.000 0.000 1.000 N NA
 6984165 6984166 Pput_2043 Pput_2044     FALSE 0.324 38.000 0.000 1.000   NA
 6984166 6984167 Pput_2044 Pput_2045     FALSE 0.004 537.000 0.000 1.000   NA
 6984167 6984168 Pput_2045 Pput_2046     TRUE 0.861 35.000 0.333 1.000 N NA
 6984168 6984169 Pput_2046 Pput_2047     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 N NA
 6984169 6984170 Pput_2047 Pput_2048     FALSE 0.029 154.000 0.000 1.000 N NA
 6984170 6984171 Pput_2048 Pput_2049     FALSE 0.036 116.000 0.000 1.000 N NA
 6984172 6984173 Pput_2050 Pput_2051     TRUE 0.976 -19.000 0.417 1.000 N NA
 6984173 6984174 Pput_2051 Pput_2052     FALSE 0.008 246.000 0.000 1.000 N NA
 6984175 6984176 Pput_2053 Pput_2054     TRUE 0.893 18.000 0.250 1.000 N NA
 6984176 6984177 Pput_2054 Pput_2055     TRUE 0.823 44.000 0.057 1.000 Y NA
 6984177 6984178 Pput_2055 Pput_2056     FALSE 0.082 118.000 0.000 1.000   NA
 6984178 6984179 Pput_2056 Pput_2057     FALSE 0.064 161.000 0.000 1.000   NA
 6984183 6984184 Pput_2061 Pput_2062     FALSE 0.028 160.000 0.000 1.000 N NA
 6984184 6984185 Pput_2062 Pput_2063     FALSE 0.500 163.000 0.409 1.000 N NA
 6984187 6984188 Pput_2065 Pput_2066 pssA   FALSE 0.036 120.000 0.000 1.000 N NA
 6984189 6984190 Pput_2067 Pput_2068     FALSE 0.025 214.000 0.000 NA   NA
 6984193 6984194 Pput_2071 Pput_2072     FALSE 0.006 271.000 0.000 1.000 N NA
 6984194 6984195 Pput_2072 Pput_2073     TRUE 0.843 29.000 0.250 1.000 N NA
 6984195 6984196 Pput_2073 Pput_2074     FALSE 0.063 162.000 0.000 1.000   NA
 6984197 6984198 Pput_2075 Pput_2076     FALSE 0.002 379.000 0.000 1.000 N NA
 6984199 6984200 Pput_2077 Pput_2078     TRUE 0.806 58.000 0.000 0.009 Y NA
 6984201 6984202 Pput_2079 Pput_2080     FALSE 0.030 152.000 0.000 1.000 N NA
 6984202 6984203 Pput_2080 Pput_2081     TRUE 0.853 3.000 0.039 1.000 N NA
 6984203 6984204 Pput_2081 Pput_2082     FALSE 0.370 89.000 0.105 1.000   NA
 6984204 6984205 Pput_2082 Pput_2083     FALSE 0.120 187.000 0.053 1.000   NA
 6984205 6984206 Pput_2083 Pput_2084     TRUE 0.952 13.000 0.143 0.042   NA
 6984206 6984207 Pput_2084 Pput_2085     TRUE 0.969 -3.000 0.164 1.000   NA
 6984207 6984208 Pput_2085 Pput_2086     TRUE 0.846 69.000 0.582 NA   NA
 6984208 6984209 Pput_2086 Pput_2087     FALSE 0.013 265.000 0.000 NA   NA
 6984209 6984210 Pput_2087 Pput_2088     FALSE 0.107 81.000 0.000 NA   NA
 6984210 6984211 Pput_2088 Pput_2089     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6984213 6984214 Pput_2091 Pput_2092     FALSE 0.009 231.000 0.000 1.000 N NA
 6984214 6984215 Pput_2092 Pput_2093     FALSE 0.497 -58.000 0.000 1.000 N NA
 6984216 6984217 Pput_2094 Pput_2095     FALSE 0.436 99.000 0.200 NA   NA
 6984217 6984218 Pput_2095 Pput_2096     TRUE 0.949 -3.000 0.113 1.000 N NA
 6984218 6984219 Pput_2096 Pput_2097     TRUE 0.984 -13.000 0.189 1.000 Y NA
 6984219 6984220 Pput_2097 Pput_2098     TRUE 0.998 0.000 0.973 1.000 Y NA
 6984221 6984222 Pput_2099 Pput_2100     FALSE 0.137 76.000 0.000 1.000   NA
 6984225 6984226 Pput_2103 Pput_2104     FALSE 0.046 186.000 0.000 1.000   NA
 6984228 6984229 Pput_2106 Pput_2107     TRUE 0.685 9.000 0.000 NA   NA
 6984229 6984230 Pput_2107 Pput_2108     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 6984230 6984231 Pput_2108 Pput_2109     FALSE 0.169 209.000 0.000 1.000 Y NA
 6984232 6984233 Pput_2110 Pput_2111     TRUE 0.990 19.000 0.500 0.053 Y NA
 6984233 6984234 Pput_2111 Pput_2112     TRUE 0.999 0.000 0.875 0.000 Y NA
 6984236 6984237 Pput_2114 Pput_2115     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6984237 6984238 Pput_2115 Pput_2116     TRUE 0.748 -7.000 0.000 NA   NA
 6984238 6984239 Pput_2116 Pput_2117     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984239 6984240 Pput_2117 Pput_2118     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6984240 6984241 Pput_2118 Pput_2119     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 6984241 6984242 Pput_2119 Pput_2120     TRUE 0.993 2.000 0.673 NA   NA
 6984242 6984243 Pput_2120 Pput_2121     TRUE 0.919 56.000 0.765 NA   NA
 6984243 6984244 Pput_2121 Pput_2122     TRUE 0.996 -3.000 0.862 NA   NA
 6984244 6984245 Pput_2122 Pput_2123     TRUE 0.991 -3.000 0.510 NA   NA
 6984245 6984246 Pput_2123 Pput_2124     TRUE 0.991 -36.000 0.863 NA   NA
 6984246 6984247 Pput_2124 Pput_2125     TRUE 0.988 4.000 0.552 NA   NA
 6984247 6984248 Pput_2125 Pput_2126     TRUE 0.993 -3.000 0.627 NA   NA
 6984248 6984249 Pput_2126 Pput_2127     TRUE 0.977 18.000 0.821 NA   NA
 6984250 6984251 Pput_2128 Pput_2129     TRUE 0.990 -12.000 0.711 NA   NA
 6984251 6984252 Pput_2129 Pput_2130     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 6984254 6984255 Pput_2132 Pput_2133     FALSE 0.259 175.000 0.167 NA   NA
 6984255 6984256 Pput_2133 Pput_2134     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984256 6984257 Pput_2134 Pput_2135     TRUE 0.990 -3.000 0.464 NA   NA
 6984257 6984258 Pput_2135 Pput_2136   bcsA TRUE 0.990 -3.000 0.545 NA N NA
 6984258 6984259 Pput_2136 Pput_2137 bcsA   TRUE 0.831 36.000 0.045 0.001   NA
 6984259 6984260 Pput_2137 Pput_2138     TRUE 0.636 12.000 0.000 1.000   NA
 6984260 6984261 Pput_2138 Pput_2139     TRUE 0.745 -12.000 0.000 1.000   NA
 6984261 6984262 Pput_2139 Pput_2140     FALSE 0.007 338.000 0.000 1.000   NA
 6984262 6984263 Pput_2140 Pput_2141   amiE FALSE 0.046 186.000 0.000 1.000   NA
 6984263 6984264 Pput_2141 Pput_2142 amiE   TRUE 0.729 56.000 0.222 1.000   NA
 6984264 6984265 Pput_2142 Pput_2143     TRUE 0.775 22.000 0.083 1.000   NA
 6984265 6984266 Pput_2143 Pput_2144     TRUE 0.934 -3.000 0.083 NA N NA
 6984266 6984267 Pput_2144 Pput_2145     TRUE 0.774 13.000 0.040 NA   NA
 6984268 6984269 Pput_2146 Pput_2147     FALSE 0.149 73.000 0.000 1.000   NA
 6984270 6984271 Pput_2148 Pput_2149     FALSE 0.006 271.000 0.000 1.000 N NA
 6984271 6984272 Pput_2149 Pput_2150     FALSE 0.001 742.000 0.000 1.000 N NA
 6984272 6984273 Pput_2150 Pput_2151     TRUE 0.659 22.000 0.042 NA   NA
 6984274 6984275 Pput_2152 Pput_2153     FALSE 0.003 293.000 0.000 NA N NA
 6984277 6984278 Pput_2155 Pput_2156     FALSE 0.005 291.000 0.000 1.000 N NA
 6984279 6984280 Pput_2157 Pput_2158     FALSE 0.109 45.000 0.000 NA N NA
 6984280 6984281 Pput_2158 Pput_2159     FALSE 0.025 138.000 0.000 NA N NA
 6984283 6984284 Pput_2161 Pput_2162     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 6984284 6984285 Pput_2162 Pput_2163     FALSE 0.116 78.000 0.000 NA   NA
 6984285 6984286 Pput_2163 Pput_2164     FALSE 0.008 317.000 0.000 NA   NA
 6984286 6984287 Pput_2164 Pput_2165     TRUE 0.976 71.000 0.778 0.002 Y NA
 6984287 6984288 Pput_2165 Pput_2166     TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.002 Y NA
 6984288 6984289 Pput_2166 Pput_2167     TRUE 0.990 51.000 1.000 0.002 Y NA
 6984289 6984290 Pput_2167 Pput_2168     TRUE 0.609 95.000 0.333 1.000   NA
 6984290 6984291 Pput_2168 Pput_2169     TRUE 0.823 0.000 0.003 NA   NA
 6984291 6984292 Pput_2169 Pput_2170     FALSE 0.005 393.000 0.000 NA   NA
 6984292 6984293 Pput_2170 Pput_2171     FALSE 0.360 141.000 0.182 NA   NA
 6984293 6984294 Pput_2171 Pput_2172     TRUE 0.984 -70.000 0.562 NA   NA
 6984295 6984296 Pput_2173 Pput_2174     TRUE 0.576 55.000 0.146 NA N NA
 6984296 6984297 Pput_2174 Pput_2175     FALSE 0.005 269.000 0.000 NA N NA
 6984297 6984298 Pput_2175 Pput_2176     TRUE 0.958 23.000 0.250 1.000 Y NA
 6984298 6984299 Pput_2176 Pput_2177     TRUE 0.927 17.000 0.067 1.000 Y NA
 6984299 6984300 Pput_2177 Pput_2178     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.010 Y NA
 6984300 6984301 Pput_2178 Pput_2179     TRUE 0.686 152.000 0.111 0.056 Y NA
 6984301 6984302 Pput_2179 Pput_2180     TRUE 0.904 23.000 0.333 1.000 N NA
 6984303 6984304 Pput_2181 Pput_2182     FALSE 0.026 164.000 0.000 1.000 N NA
 6984304 6984305 Pput_2182 Pput_2183     FALSE 0.035 384.000 0.000 1.000 Y NA
 6984307 6984308 Pput_2185 Pput_2186     FALSE 0.004 348.000 0.007 1.000 N NA
 6984308 6984309 Pput_2186 Pput_2187     TRUE 0.992 -3.000 0.619 NA N NA
 6984309 6984310 Pput_2187 Pput_2188     TRUE 0.998 -3.000 0.741 NA Y NA
 6984310 6984311 Pput_2188 Pput_2189     TRUE 0.990 -3.000 0.556 NA N NA
 6984311 6984312 Pput_2189 Pput_2190     FALSE 0.446 131.000 0.267 1.000 N NA
 6984313 6984314 Pput_2191 Pput_2192     FALSE 0.012 275.000 0.000 NA   NA
 6984315 6984316 Pput_2193 Pput_2194     FALSE 0.057 79.000 0.000 1.000 N NA
 6984316 6984317 Pput_2194 Pput_2195     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA N NA
 6984317 6984318 Pput_2195 Pput_2196     TRUE 0.922 68.000 0.500 NA Y NA
 6984320 6984321 Pput_2198 Pput_2199     FALSE 0.157 178.000 0.000 0.074   NA
 6984322 6984323 Pput_2200 Pput_2201     TRUE 0.986 0.000 0.425 NA N NA
 6984324 6984325 Pput_2202 Pput_2203     TRUE 0.975 -7.000 0.279 NA   NA
 6984326 6984327 Pput_2204 Pput_2205     FALSE 0.327 101.000 0.158 1.000 N NA
 6984327 6984328 Pput_2205 Pput_2206     FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 6984329 6984330 Pput_2207 Pput_2208     FALSE 0.293 107.000 0.148 NA N NA
 6984333 6984334 Pput_2211 Pput_2212     FALSE 0.249 207.000 0.250 NA   NA
 6984334 6984335 Pput_2212 Pput_2213     FALSE 0.341 35.000 0.000 1.000   NA
 6984335 6984336 Pput_2213 Pput_2214     FALSE 0.082 127.000 0.000 1.000   NA
 6984336 6984337 Pput_2214 Pput_2215     FALSE 0.044 94.000 0.000 1.000 N NA
 6984337 6984338 Pput_2215 Pput_2216     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.056 Y NA
 6984338 6984339 Pput_2216 Pput_2217     FALSE 0.042 96.000 0.000 1.000 N NA
 6984341 6984342 Pput_2219 Pput_2220     FALSE 0.004 274.000 0.000 NA N NA
 6984342 6984343 Pput_2220 Pput_2221     TRUE 0.917 78.000 0.600 1.000 Y NA
 6984344 6984345 Pput_2222 Pput_2223     TRUE 0.993 10.000 0.280 0.031 Y NA
 6984345 6984346 Pput_2223 Pput_2224     FALSE 0.131 181.000 0.000 0.050 N NA
 6984346 6984347 Pput_2224 Pput_2225     TRUE 0.695 31.000 0.111 1.000 N NA
 6984347 6984348 Pput_2225 Pput_2226     TRUE 0.996 -3.000 0.900 1.000   NA
 6984348 6984349 Pput_2226 Pput_2227     FALSE 0.003 929.000 0.000 1.000   NA
 6984350 6984351 Pput_2228 Pput_2229     TRUE 0.779 63.000 0.000 0.016 Y NA
 6984351 6984352 Pput_2229 Pput_2230     FALSE 0.101 58.000 0.000 1.000 N NA
 6984352 6984353 Pput_2230 Pput_2231     TRUE 0.825 51.000 0.385 1.000 N NA
 6984353 6984354 Pput_2231 Pput_2232     FALSE 0.524 122.000 0.300 NA   NA
 6984356 6984357 Pput_2234 Pput_2235     TRUE 0.571 20.000 0.035 1.000 N NA
 6984357 6984358 Pput_2235 Pput_2236     TRUE 0.657 76.000 0.000 0.080 Y NA
 6984359 6984360 Pput_2237 Pput_2238     FALSE 0.032 145.000 0.000 1.000 N NA
 6984360 6984361 Pput_2238 Pput_2239     FALSE 0.141 45.000 0.000 1.000 N NA
 6984364 6984365 Pput_2242 Pput_2243     FALSE 0.094 90.000 0.000 NA   NA
 6984365 6984366 Pput_2243 Pput_2244     TRUE 0.696 8.000 0.000 NA   NA
 6984366 6984367 Pput_2244 Pput_2245     FALSE 0.244 17.000 0.000 NA N NA
 6984368 6984369 Pput_2246 Pput_2247     FALSE 0.063 149.000 0.000 NA   NA
 6984371 6984372 Pput_2249 Pput_2250     TRUE 0.702 -16.000 0.000 NA   NA
 6984374 6984375 Pput_2252 Pput_2253     FALSE 0.065 145.000 0.000 NA   NA
 6984375 6984376 Pput_2253 Pput_2254     FALSE 0.007 331.000 0.000 NA   NA
 6984377 6984378 Pput_2255 Pput_2256     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 6984379 6984380 Pput_2257 Pput_2258     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 6984381 6984382 Pput_2259 Pput_2260     FALSE 0.031 149.000 0.000 1.000 N NA
 6984382 6984383 Pput_2260 Pput_2261     TRUE 0.993 14.000 0.357 0.000 Y NA
 6984383 6984384 Pput_2261 Pput_2262     FALSE 0.029 155.000 0.000 1.000 N NA
 6984386 6984387 Pput_2264 Pput_2265     FALSE 0.077 137.000 0.000 1.000   NA
 6984387 6984388 Pput_2265 Pput_2266     FALSE 0.048 172.000 0.000 NA   NA
 6984388 6984389 Pput_2266 Pput_2267     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984390 6984391 Pput_2268 Pput_2269   cobN TRUE 0.975 4.000 0.274 1.000   NA
 6984391 6984392 Pput_2269 Pput_2270 cobN   TRUE 0.981 2.000 0.070 1.000 Y NA
 6984392 6984393 Pput_2270 Pput_2271     TRUE 0.909 78.000 0.568 NA Y NA
 6984396 6984397 Pput_2274 Pput_2275     FALSE 0.022 215.000 0.019 NA N NA
 6984401 6984402 Pput_2279 Pput_2280     TRUE 0.984 17.000 0.500 1.000 Y NA
 6984403 6984404 Pput_2281 Pput_2282     TRUE 0.929 19.000 0.333 NA   NA
 6984404 6984405 Pput_2282 Pput_2283     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 6984405 6984406 Pput_2283 Pput_2284     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.053   NA
 6984406 6984407 Pput_2284 Pput_2285     TRUE 0.997 6.000 1.000 0.053   NA
 6984407 6984408 Pput_2285 Pput_2286     TRUE 0.604 13.000 0.000 1.000   NA
 6984408 6984409 Pput_2286 Pput_2287     FALSE 0.017 253.000 0.000 1.000   NA
 6984409 6984410 Pput_2287 Pput_2288     TRUE 0.751 61.000 0.333 1.000 N NA
 6984410 6984411 Pput_2288 Pput_2289     TRUE 0.987 -16.000 0.600 NA   NA
 6984411 6984412 Pput_2289 Pput_2290     TRUE 0.987 2.000 0.444 NA   NA
 6984412 6984413 Pput_2290 Pput_2291     TRUE 0.975 -13.000 0.333 NA   NA
 6984413 6984414 Pput_2291 Pput_2292     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 6984414 6984415 Pput_2292 Pput_2293     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 6984415 6984416 Pput_2293 Pput_2294     TRUE 0.991 -3.000 0.200 NA Y NA
 6984416 6984417 Pput_2294 Pput_2295     TRUE 0.991 6.000 0.350 NA Y NA
 6984417 6984418 Pput_2295 Pput_2296     TRUE 0.985 -25.000 0.231 NA Y NA
 6984418 6984419 Pput_2296 Pput_2297     TRUE 0.935 -3.000 0.059 NA   NA
 6984419 6984420 Pput_2297 Pput_2298     TRUE 0.994 -3.000 0.723 NA   NA
 6984420 6984421 Pput_2298 Pput_2299     TRUE 0.674 35.000 0.085 NA   NA
 6984421 6984422 Pput_2299 Pput_2300     FALSE 0.148 69.000 0.000 NA   NA
 6984422 6984423 Pput_2300 Pput_2301     FALSE 0.006 343.000 0.000 NA   NA
 6984423 6984424 Pput_2301 Pput_2302     TRUE 0.971 2.000 0.125 0.088 N NA
 6984424 6984425 Pput_2302 Pput_2303     TRUE 0.984 -10.000 0.438 1.000   NA
 6984425 6984426 Pput_2303 Pput_2304     TRUE 0.983 -7.000 0.385 1.000   NA
 6984427 6984428 Pput_2305 Pput_2306     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 6984429 6984430 Pput_2307 Pput_2308     TRUE 0.945 49.000 0.857 1.000   NA
 6984430 6984431 Pput_2308 Pput_2309     TRUE 0.996 2.000 1.000 1.000   NA
 6984431 6984432 Pput_2309 Pput_2310     TRUE 0.956 32.000 0.750 NA   NA
 6984432 6984433 Pput_2310 Pput_2311     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6984434 6984435 Pput_2312 Pput_2313 mobA   FALSE 0.093 62.000 0.000 1.000 N NA
 6984435 6984436 Pput_2313 Pput_2314     TRUE 0.988 12.000 1.000 1.000 N NA
 6984437 6984438 Pput_2315 Pput_2316     TRUE 0.987 7.000 0.250 1.000 Y NA
 6984438 6984439 Pput_2316 Pput_2317     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 6984439 6984440 Pput_2317 Pput_2318     FALSE 0.043 181.000 0.000 NA   NA
 6984441 6984442 Pput_2319 Pput_2320     FALSE 0.222 52.000 0.000 NA   NA
 6984442 6984443 Pput_2320 Pput_2321     FALSE 0.073 111.000 0.000 NA   NA
 6984444 6984445 Pput_2322 Pput_2323     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 6984445 6984446 Pput_2323 Pput_2324     FALSE 0.242 48.000 0.000 NA   NA
 6984449 6984450 Pput_2327 Pput_2328     FALSE 0.320 34.000 0.000 NA   NA
 6984452 6984453 Pput_2330 Pput_2331     FALSE 0.072 130.000 0.000 NA   NA
 6984455 6984456 Pput_2333 Pput_2334     FALSE 0.057 79.000 0.000 1.000 N NA
 6984456 6984457 Pput_2334 Pput_2335     TRUE 0.649 81.000 0.080 1.000 Y NA
 6984457 6984458 Pput_2335 Pput_2336     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.055 N NA
 6984458 6984459 Pput_2336 Pput_2337     TRUE 0.986 13.000 0.923 1.000 N NA
 6984459 6984460 Pput_2337 Pput_2338     FALSE 0.134 190.000 0.000 0.012 N NA
 6984460 6984461 Pput_2338 Pput_2339     TRUE 0.993 12.000 0.333 0.003 Y NA
 6984462 6984463 Pput_2340 Pput_2341     FALSE 0.046 175.000 0.000 NA   NA
 6984463 6984464 Pput_2341 Pput_2342     FALSE 0.121 307.000 0.000 0.016 Y NA
 6984464 6984465 Pput_2342 Pput_2343     TRUE 0.980 -31.000 0.062 0.088 Y NA
 6984466 6984467 Pput_2344 Pput_2345     FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 6984467 6984468 Pput_2345 Pput_2346     TRUE 0.788 112.000 0.364 1.000 Y NA
 6984469 6984470 Pput_2347 Pput_2348     FALSE 0.012 214.000 0.000 1.000 N NA
 6984471 6984472 Pput_2349 Pput_2350     TRUE 0.950 14.000 0.000 0.024 Y NA
 6984472 6984473 Pput_2350 Pput_2351     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 6984473 6984474 Pput_2351 Pput_2352     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 6984474 6984475 Pput_2352 Pput_2353     TRUE 0.768 35.000 0.025 0.007   NA
 6984475 6984476 Pput_2353 Pput_2354     TRUE 0.961 0.000 0.132 NA   NA
 6984476 6984477 Pput_2354 Pput_2355     TRUE 0.987 10.000 0.684 NA   NA
 6984477 6984478 Pput_2355 Pput_2356     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA   NA
 6984479 6984480 Pput_2357 Pput_2358     FALSE 0.421 22.000 0.000 NA   NA
 6984480 6984481 Pput_2358 Pput_2359     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 6984481 6984482 Pput_2359 Pput_2360     FALSE 0.009 297.000 0.000 NA   NA
 6984483 6984484 Pput_2361 Pput_2362     FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 6984484 6984485 Pput_2362 Pput_2363     FALSE 0.050 170.000 0.000 NA   NA
 6984485 6984486 Pput_2363 Pput_2364     FALSE 0.072 129.000 0.000 NA   NA
 6984486 6984487 Pput_2364 Pput_2365     TRUE 0.988 -34.000 0.333 0.002   NA
 6984487 6984488 Pput_2365 Pput_2366     TRUE 0.974 16.000 0.667 NA   NA
 6984488 6984489 Pput_2366 Pput_2367     TRUE 0.968 33.000 1.000 NA   NA
 6984489 6984490 Pput_2367 Pput_2368     FALSE 0.014 261.000 0.000 NA   NA
 6984490 6984491 Pput_2368 Pput_2369     TRUE 0.991 0.000 0.500 NA   NA
 6984491 6984492 Pput_2369 Pput_2370     TRUE 0.965 15.000 0.500 NA   NA
 6984492 6984493 Pput_2370 Pput_2371     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6984493 6984494 Pput_2371 Pput_2372     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6984494 6984495 Pput_2372 Pput_2373     FALSE 0.011 283.000 0.000 NA   NA
 6984495 6984496 Pput_2373 Pput_2374     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6984497 6984498 Pput_2375 Pput_2376     TRUE 0.998 4.000 0.895 0.001   NA
 6984498 6984499 Pput_2376 Pput_2377     TRUE 0.994 7.000 0.579 0.001 N NA
 6984499 6984500 Pput_2377 Pput_2378     FALSE 0.006 267.000 0.000 1.000 N NA
 6984500 6984501 Pput_2378 Pput_2379     TRUE 0.707 65.000 0.263 NA   NA
 6984501 6984502 Pput_2379 Pput_2380     TRUE 0.989 -7.000 0.571 NA   NA
 6984502 6984503 Pput_2380 Pput_2381     TRUE 0.971 -37.000 0.095 NA Y NA
 6984503 6984504 Pput_2381 Pput_2382     TRUE 0.989 11.000 1.000 NA N NA
 6984505 6984506 Pput_2383 Pput_2384     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6984506 6984507 Pput_2384 Pput_2385     TRUE 0.746 131.000 0.667 NA   NA
 6984508 6984509 Pput_2386 Pput_2387     TRUE 0.992 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 6984510 6984511 Pput_2388 Pput_2389     FALSE 0.041 97.000 0.000 1.000 N NA
 6984511 6984512 Pput_2389 Pput_2390     FALSE 0.070 63.000 0.000 NA N NA
 6984520 6984521 Pput_2398 Pput_2399     FALSE 0.030 99.000 0.000 NA N NA
 6984522 6984523 Pput_2400 Pput_2401     TRUE 0.632 76.000 0.172 0.073 N NA
 6984523 6984524 Pput_2401 Pput_2402     TRUE 0.945 28.000 0.400 0.073 N NA
 6984524 6984525 Pput_2402 Pput_2403     TRUE 0.989 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 6984525 6984526 Pput_2403 Pput_2404     TRUE 0.976 15.000 0.308 1.000 Y NA
 6984527 6984528 Pput_2405 Pput_2406     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984529 6984530 Pput_2407 Pput_2408     FALSE 0.312 35.000 0.000 NA   NA
 6984531 6984532 Pput_2409 Pput_2410     FALSE 0.002 391.000 0.000 1.000 N NA
 6984532 6984533 Pput_2410 Pput_2411     FALSE 0.017 245.000 0.000 NA   NA
 6984533 6984534 Pput_2411 Pput_2412     FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 6984534 6984535 Pput_2412 Pput_2413     FALSE 0.136 72.000 0.000 NA   NA
 6984535 6984536 Pput_2413 Pput_2414     FALSE 0.004 403.000 0.000 NA   NA
 6984537 6984538 Pput_2415 Pput_2416     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 6984539 6984540 Pput_2417 Pput_2418     FALSE 0.144 70.000 0.000 NA   NA
 6984540 6984541 Pput_2418 Pput_2419     TRUE 0.955 15.000 0.152 NA Y NA
 6984541 6984542 Pput_2419 Pput_2420     FALSE 0.012 287.000 0.000 1.000   NA
 6984542 6984543 Pput_2420 Pput_2421     FALSE 0.004 503.000 0.000 1.000   NA
 6984543 6984544 Pput_2421 Pput_2422     TRUE 0.899 -3.000 0.047 1.000 N NA
 6984544 6984545 Pput_2422 Pput_2423     FALSE 0.311 73.000 0.073 NA N NA
 6984545 6984546 Pput_2423 Pput_2424     TRUE 0.995 -3.000 0.857 NA N NA
 6984546 6984547 Pput_2424 Pput_2425     TRUE 0.747 78.000 0.500 1.000 N NA
 6984549 6984550 Pput_2427 Pput_2428     FALSE 0.306 36.000 0.000 NA   NA
 6984550 6984551 Pput_2428 Pput_2429     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 6984551 6984552 Pput_2429 Pput_2430     FALSE 0.130 78.000 0.000 1.000   NA
 6984552 6984553 Pput_2430 Pput_2431     FALSE 0.015 256.000 0.000 NA   NA
 6984555 6984556 Pput_2433 Pput_2434     TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 6984556 6984557 Pput_2434 Pput_2435     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.052 Y NA
 6984557 6984558 Pput_2435 Pput_2436     FALSE 0.040 99.000 0.000 1.000 N NA
 6984560 6984561 Pput_2438 Pput_2439     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 6984562 6984563 Pput_2440 Pput_2441     FALSE 0.368 28.000 0.000 NA   NA
 6984563 6984564 Pput_2441 Pput_2442     FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 6984564 6984565 Pput_2442 Pput_2443     FALSE 0.016 259.000 0.000 1.000   NA
 6984566 6984567 Pput_2444 Pput_2445   potE TRUE 0.949 49.000 0.444 1.000 Y NA
 6984569 6984570 Pput_2447 Pput_2448     TRUE 0.948 2.000 0.104 NA   NA
 6984570 6984571 Pput_2448 Pput_2449     FALSE 0.073 112.000 0.000 NA   NA
 6984575 6984576 Pput_2453 Pput_2454     FALSE 0.027 162.000 0.000 1.000 N NA
 6984576 6984577 Pput_2454 Pput_2455     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6984578 6984579 Pput_2456 Pput_2457     FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6984579 6984580 Pput_2457 Pput_2458     FALSE 0.357 29.000 0.000 NA   NA
 6984581 6984582 Pput_2459 Pput_2460     FALSE 0.002 330.000 0.000 NA N NA
 6984585 6984586 Pput_2463 Pput_2464     FALSE 0.207 60.000 0.000 1.000   NA
 6984587 6984588 Pput_2465 Pput_2466     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6984588 6984589 Pput_2466 Pput_2467     FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6984589 6984590 Pput_2467 Pput_2468     TRUE 0.568 -9.000 0.000 1.000 N NA
 6984593 6984594 Pput_2471 Pput_2472     TRUE 0.707 -15.000 0.000 NA   NA
 6984595 6984596 Pput_2473 Pput_2474     TRUE 0.921 -3.000 0.044 NA   NA
 6984597 6984598 Pput_2475 Pput_2476     TRUE 0.966 35.000 0.215 0.003 Y NA
 6984598 6984599 Pput_2476 Pput_2477     TRUE 0.979 2.000 0.063 1.000 Y NA
 6984599 6984600 Pput_2477 Pput_2478     TRUE 0.747 -7.000 0.022 NA N NA
 6984600 6984601 Pput_2478 Pput_2479     TRUE 0.639 -7.000 0.009 NA N NA
 6984601 6984602 Pput_2479 Pput_2480     FALSE 0.148 122.000 0.049 1.000 N NA
 6984602 6984603 Pput_2480 Pput_2481   paaA FALSE 0.062 227.000 0.047 1.000   NA
 6984603 6984604 Pput_2481 Pput_2482 paaA paaB TRUE 0.973 26.000 0.920 NA   NA
 6984604 6984605 Pput_2482 Pput_2483 paaB   TRUE 0.992 9.000 0.943 NA   NA
 6984605 6984606 Pput_2483 Pput_2484     TRUE 0.993 -13.000 0.919 NA   NA
 6984606 6984607 Pput_2484 Pput_2485     TRUE 0.968 16.000 0.571 NA   NA
 6984607 6984608 Pput_2485 Pput_2486     FALSE 0.102 142.000 0.019 NA   NA
 6984608 6984609 Pput_2486 Pput_2487     TRUE 0.995 -3.000 0.826 NA   NA
 6984609 6984610 Pput_2487 Pput_2488     TRUE 0.625 40.000 0.000 0.070   NA
 6984610 6984611 Pput_2488 Pput_2489     FALSE 0.324 38.000 0.000 1.000   NA
 6984612 6984613 Pput_2490 Pput_2491     FALSE 0.052 167.000 0.000 NA   NA
 6984616 6984617 Pput_2494 Pput_2495     TRUE 0.989 -3.000 0.417 NA   NA
 6984617 6984618 Pput_2495 Pput_2496     TRUE 0.993 -3.000 0.636 NA   NA
 6984618 6984619 Pput_2496 Pput_2497     TRUE 0.986 0.000 0.357 NA   NA
 6984619 6984620 Pput_2497 Pput_2498     FALSE 0.357 29.000 0.000 NA   NA
 6984621 6984622 Pput_2499 Pput_2500     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984623 6984624 Pput_2501 Pput_2502 ligD   FALSE 0.311 41.000 0.000 1.000   NA
 6984624 6984625 Pput_2502 Pput_2503     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984625 6984626 Pput_2503 Pput_2504     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 6984626 6984627 Pput_2504 Pput_2505     TRUE 0.988 -3.000 0.409 NA   NA
 6984628 6984629 Pput_2506 Pput_2507     FALSE 0.113 86.000 0.000 1.000   NA
 6984629 6984630 Pput_2507 Pput_2508     FALSE 0.219 57.000 0.000 1.000   NA
 6984630 6984631 Pput_2508 Pput_2509     TRUE 0.732 7.000 0.000 1.000   NA
 6984631 6984632 Pput_2509 Pput_2510     TRUE 0.979 0.000 0.250 NA   NA
 6984632 6984633 Pput_2510 Pput_2511     FALSE 0.012 275.000 0.000 NA   NA
 6984633 6984634 Pput_2511 Pput_2512     FALSE 0.063 148.000 0.000 NA   NA
 6984634 6984635 Pput_2512 Pput_2513     TRUE 0.994 5.000 0.500 NA Y NA
 6984635 6984636 Pput_2513 Pput_2514     FALSE 0.035 90.000 0.000 NA N NA
 6984639 6984640 Pput_2517 Pput_2518     FALSE 0.464 18.000 0.000 NA   NA
 6984642 6984643 Pput_2520 Pput_2521     TRUE 0.685 9.000 0.000 NA   NA
 6984645 6984646 Pput_2523 Pput_2524     FALSE 0.057 160.000 0.000 NA   NA
 6984646 6984647 Pput_2524 Pput_2525     FALSE 0.083 120.000 0.000 1.000   NA
 6984647 6984648 Pput_2525 Pput_2526     TRUE 0.994 -3.000 0.316 1.000 Y NA
 6984649 6984650 Pput_2527 Pput_2528     TRUE 0.902 5.000 0.081 1.000 N NA
 6984650 6984651 Pput_2528 Pput_2529   codB TRUE 0.957 -3.000 0.140 1.000 N NA
 6984651 6984652 Pput_2529 Pput_2530 codB   FALSE 0.010 229.000 0.000 1.000 N NA
 6984652 6984653 Pput_2530 Pput_2531     TRUE 0.984 -3.000 0.073 NA Y NA
 6984654 6984655 Pput_2532 Pput_2533     TRUE 0.934 56.000 0.857 1.000   NA
 6984655 6984656 Pput_2533 Pput_2534     FALSE 0.118 82.000 0.000 1.000   NA
 6984656 6984657 Pput_2534 Pput_2535     FALSE 0.202 61.000 0.000 1.000   NA
 6984660 6984661 Pput_2538 Pput_2539     FALSE 0.128 142.000 0.050 NA N NA
 6984662 6984663 Pput_2540 Pput_2541     FALSE 0.045 176.000 0.000 NA   NA
 6984663 6984664 Pput_2541 Pput_2542     FALSE 0.422 73.000 0.000 0.040   NA
 6984664 6984665 Pput_2542 Pput_2543     TRUE 0.593 96.000 0.000 0.040 Y NA
 6984666 6984667 Pput_2544 Pput_2545     FALSE 0.029 101.000 0.000 NA N NA
 6984667 6984668 Pput_2545 Pput_2546     FALSE 0.148 69.000 0.000 NA   NA
 6984668 6984669 Pput_2546 Pput_2547     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 6984669 6984670 Pput_2547 Pput_2548     TRUE 0.957 55.000 0.800 0.067   NA
 6984670 6984671 Pput_2548 Pput_2549     TRUE 0.556 146.000 0.114 1.000 Y NA
 6984671 6984672 Pput_2549 Pput_2550     FALSE 0.203 30.000 0.000 1.000 N NA
 6984672 6984673 Pput_2550 Pput_2551   benD TRUE 0.652 58.000 0.209 1.000 N NA
 6984673 6984674 Pput_2551 Pput_2552 benD   FALSE 0.495 194.000 0.574 1.000 N NA
 6984674 6984675 Pput_2552 Pput_2553     TRUE 0.905 73.000 0.672 0.051 N NA
 6984675 6984676 Pput_2553 Pput_2554     TRUE 0.998 -3.000 0.953 0.000 N NA
 6984676 6984677 Pput_2554 Pput_2555     FALSE 0.084 160.000 0.031 1.000 N NA
 6984677 6984678 Pput_2555 Pput_2556     FALSE 0.009 300.000 0.000 NA   NA
 6984678 6984679 Pput_2556 Pput_2557     FALSE 0.039 187.000 0.000 NA   NA
 6984680 6984681 Pput_2558 Pput_2559     FALSE 0.007 257.000 0.000 1.000 N NA
 6984682 6984683 Pput_2560 Pput_2561     FALSE 0.015 253.000 0.000 NA   NA
 6984683 6984684 Pput_2561 Pput_2562     FALSE 0.073 127.000 0.000 NA   NA
 6984686 6984687 Pput_2564 Pput_2565     FALSE 0.039 187.000 0.000 NA   NA
 6984688 6984689 Pput_2566 Pput_2567     TRUE 0.928 82.000 0.750 1.000 Y NA
 6984689 6984690 Pput_2567 Pput_2568     TRUE 0.991 14.000 0.667 1.000 Y NA
 6984690 6984691 Pput_2568 Pput_2569     FALSE 0.066 141.000 0.000 NA   NA
 6984694 6984695 Pput_2572 Pput_2573     FALSE 0.252 178.000 0.000 1.000 Y NA
 6984695 6984696 Pput_2573 Pput_2574     TRUE 0.978 0.000 0.043 NA Y NA
 6984696 6984697 Pput_2574 Pput_2575     TRUE 0.992 -3.000 0.222 NA Y NA
 6984697 6984698 Pput_2575 Pput_2576     FALSE 0.478 17.000 0.000 NA   NA
 6984698 6984699 Pput_2576 Pput_2577     TRUE 0.666 10.000 0.000 NA   NA
 6984699 6984700 Pput_2577 Pput_2578     TRUE 0.909 6.000 0.070 NA   NA
 6984700 6984701 Pput_2578 Pput_2579     TRUE 0.961 9.000 0.250 NA   NA
 6984701 6984702 Pput_2579 Pput_2580     TRUE 0.778 2.000 0.000 NA   NA
 6984702 6984703 Pput_2580 Pput_2581     FALSE 0.417 26.000 0.000 1.000   NA
 6984703 6984704 Pput_2581 Pput_2582     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984704 6984705 Pput_2582 Pput_2583     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6984706 6984707 Pput_2584 Pput_2585     TRUE 0.716 6.000 0.000 NA   NA
 6984707 6984708 Pput_2585 Pput_2586     FALSE 0.085 106.000 0.000 1.000   NA
 6984709 6984710 Pput_2587 Pput_2588     TRUE 0.831 12.000 0.074 1.000 N NA
 6984710 6984711 Pput_2588 Pput_2589     FALSE 0.475 20.000 0.000 1.000   NA
 6984711 6984712 Pput_2589 Pput_2590     FALSE 0.427 25.000 0.000 1.000   NA
 6984712 6984713 Pput_2590 Pput_2591     FALSE 0.001 688.000 0.000 1.000 N NA
 6984713 6984714 Pput_2591 Pput_2592     FALSE 0.060 77.000 0.000 1.000 N NA
 6984714 6984715 Pput_2592 Pput_2593     TRUE 0.730 43.000 0.000 1.000 Y NA
 6984715 6984716 Pput_2593 Pput_2594     TRUE 0.980 36.000 0.352 0.001 Y NA
 6984717 6984718 Pput_2595 Pput_2596     TRUE 0.745 -12.000 0.000 1.000   NA
 6984719 6984720 Pput_2597 Pput_2598   dnaE2 FALSE 0.047 535.000 0.000 0.047 Y NA
 6984720 6984721 Pput_2598 Pput_2599 dnaE2   TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 6984721 6984722 Pput_2599 Pput_2600     TRUE 0.989 7.000 0.667 NA   NA
 6984722 6984723 Pput_2600 Pput_2601     TRUE 0.987 0.000 0.381 NA   NA
 6984725 6984726 Pput_2603 Pput_2604     FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6984726 6984727 Pput_2604 Pput_2605     TRUE 0.975 0.000 0.214 NA   NA
 6984727 6984728 Pput_2605 Pput_2606     TRUE 0.983 -3.000 0.167 0.040 N NA
 6984730 6984731 Pput_2608 Pput_2609     FALSE 0.448 65.000 0.100 1.000 N NA
 6984731 6984732 Pput_2609 Pput_2610     TRUE 0.987 -3.000 0.429 1.000 N NA
 6984732 6984733 Pput_2610 Pput_2611     TRUE 0.718 84.000 0.429 1.000   NA
 6984733 6984734 Pput_2611 Pput_2612     FALSE 0.247 47.000 0.000 NA   NA
 6984734 6984735 Pput_2612 Pput_2613     FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 6984735 6984736 Pput_2613 Pput_2614     TRUE 0.572 13.000 0.000 NA   NA
 6984736 6984737 Pput_2614 Pput_2615     TRUE 0.728 5.000 0.000 NA   NA
 6984737 6984738 Pput_2615 Pput_2616     TRUE 0.922 7.000 0.095 NA   NA
 6984738 6984739 Pput_2616 Pput_2617     TRUE 0.691 35.000 0.095 NA   NA
 6984739 6984740 Pput_2617 Pput_2618     TRUE 0.991 11.000 1.000 NA   NA
 6984740 6984741 Pput_2618 Pput_2619     FALSE 0.003 633.000 0.000 NA   NA
 6984742 6984743 Pput_2620 Pput_2621     FALSE 0.003 579.000 0.000 NA   NA
 6984743 6984744 Pput_2621 Pput_2622     FALSE 0.408 65.000 0.060 NA   NA
 6984744 6984745 Pput_2622 Pput_2623     TRUE 0.984 15.000 0.920 NA   NA
 6984745 6984746 Pput_2623 Pput_2624     TRUE 0.647 27.000 0.050 NA   NA
 6984746 6984747 Pput_2624 Pput_2625     TRUE 0.958 0.000 0.117 NA   NA
 6984747 6984748 Pput_2625 Pput_2626     TRUE 0.977 -36.000 0.412 NA   NA
 6984748 6984749 Pput_2626 Pput_2627     TRUE 0.953 -3.000 0.093 NA   NA
 6984749 6984750 Pput_2627 Pput_2628     TRUE 0.650 25.000 0.047 NA   NA
 6984750 6984751 Pput_2628 Pput_2629     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 6984751 6984752 Pput_2629 Pput_2630     TRUE 0.949 -3.000 0.081 NA   NA
 6984752 6984753 Pput_2630 Pput_2631     TRUE 0.696 31.000 0.081 NA   NA
 6984753 6984754 Pput_2631 Pput_2632     TRUE 0.954 -3.000 0.094 NA   NA
 6984754 6984755 Pput_2632 Pput_2633     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 6984755 6984756 Pput_2633 Pput_2634     FALSE 0.207 144.000 0.067 NA   NA
 6984756 6984757 Pput_2634 Pput_2635     FALSE 0.160 96.000 0.029 NA   NA
 6984757 6984758 Pput_2635 Pput_2636     FALSE 0.052 168.000 0.000 NA   NA
 6984758 6984759 Pput_2636 Pput_2637     FALSE 0.102 85.000 0.000 NA   NA
 6984759 6984760 Pput_2637 Pput_2638     TRUE 0.993 -3.000 0.578 NA   NA
 6984760 6984761 Pput_2638 Pput_2639     FALSE 0.076 104.000 0.000 NA   NA
 6984763 6984764 Pput_2641 Pput_2642     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 6984764 6984765 Pput_2642 Pput_2643     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 6984765 6984766 Pput_2643 Pput_2644     FALSE 0.003 555.000 0.000 NA   NA
 6984766 6984767 Pput_2644 Pput_2645     FALSE 0.206 81.000 0.028 1.000   NA
 6984767 6984768 Pput_2645 Pput_2646     FALSE 0.196 143.000 0.056 1.000   NA
 6984768 6984769 Pput_2646 Pput_2647     TRUE 0.950 -3.000 0.000 0.054   NA
 6984769 6984770 Pput_2647 Pput_2648     TRUE 0.948 0.000 0.000 0.054   NA
 6984770 6984771 Pput_2648 Pput_2649     FALSE 0.207 60.000 0.000 1.000   NA
 6984771 6984772 Pput_2649 Pput_2650     FALSE 0.010 225.000 0.000 1.000 N NA
 6984772 6984773 Pput_2650 Pput_2651     TRUE 0.953 11.000 0.288 1.000 N NA
 6984773 6984774 Pput_2651 Pput_2652     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6984774 6984775 Pput_2652 Pput_2653     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6984775 6984776 Pput_2653 Pput_2654     FALSE 0.174 88.000 0.023 1.000   NA
 6984776 6984777 Pput_2654 Pput_2655     FALSE 0.082 128.000 0.000 1.000   NA
 6984779 6984780 Pput_2657 Pput_2658     FALSE 0.483 83.000 0.214 1.000 N NA
 6984782 6984783 Pput_2660 Pput_2661     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984784 6984785 Pput_2662 Pput_2663     FALSE 0.140 71.000 0.000 NA   NA
 6984785 6984786 Pput_2663 Pput_2664     FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 6984786 6984787 Pput_2664 Pput_2665     TRUE 0.918 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6984787 6984788 Pput_2665 Pput_2666     TRUE 0.772 -7.000 0.000 1.000   NA
 6984788 6984789 Pput_2666 Pput_2667     TRUE 0.979 16.000 0.800 NA   NA
 6984789 6984790 Pput_2667 Pput_2668     TRUE 0.954 22.000 0.545 NA   NA
 6984790 6984791 Pput_2668 Pput_2669     TRUE 0.953 39.000 0.818 NA   NA
 6984791 6984792 Pput_2669 Pput_2670     FALSE 0.116 78.000 0.000 NA   NA
 6984794 6984795 Pput_2672 Pput_2673     TRUE 0.795 -3.000 0.020 NA N NA
 6984795 6984796 Pput_2673 Pput_2674     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA N NA
 6984796 6984797 Pput_2674 Pput_2675     FALSE 0.383 128.000 0.182 NA   NA
 6984797 6984798 Pput_2675 Pput_2676     TRUE 0.888 55.000 0.545 1.000   NA
 6984798 6984799 Pput_2676 Pput_2677     TRUE 0.885 14.000 0.182 1.000 N NA
 6984803 6984804 Pput_2681 Pput_2682     FALSE 0.049 171.000 0.000 NA   NA
 6984804 6984805 Pput_2682 Pput_2683     FALSE 0.073 116.000 0.000 NA   NA
 6984805 6984806 Pput_2683 Pput_2684     FALSE 0.073 109.000 0.000 NA   NA
 6984807 6984808 Pput_2685 Pput_2686     TRUE 0.761 44.000 0.200 NA   NA
 6984808 6984809 Pput_2686 Pput_2687     TRUE 0.991 -3.000 0.511 NA   NA
 6984810 6984811 Pput_2688 Pput_2689     FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 6984811 6984812 Pput_2689 Pput_2690     FALSE 0.032 141.000 0.000 1.000 N NA
 6984812 6984813 Pput_2690 Pput_2691     TRUE 0.957 5.000 0.014 1.000 Y NA
 6984813 6984814 Pput_2691 Pput_2692     TRUE 0.829 -3.000 0.022 1.000 N NA
 6984814 6984815 Pput_2692 Pput_2693     TRUE 0.994 -3.000 0.476 0.071 N NA
 6984815 6984816 Pput_2693 Pput_2694     TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 6984816 6984817 Pput_2694 Pput_2695     TRUE 0.918 -3.000 0.042 NA   NA
 6984818 6984819 Pput_2696 Pput_2697     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 6984820 6984821 Pput_2698 Pput_2699     FALSE 0.015 420.000 0.000 0.040 N NA
 6984822 6984823 Pput_2700 Pput_2701     FALSE 0.250 115.000 0.077 NA   NA
 6984824 6984825 Pput_2702 Pput_2703     FALSE 0.077 138.000 0.000 1.000   NA
 6984825 6984826 Pput_2703 Pput_2704     TRUE 0.810 47.000 0.111 0.040   NA
 6984829 6984830 Pput_2707 Pput_2708     FALSE 0.009 302.000 0.000 NA   NA
 6984830 6984831 Pput_2708 Pput_2709     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984835 6984836 Pput_2713 Pput_2714     TRUE 0.632 14.000 0.015 NA   NA
 6984838 6984839 Pput_2716 Pput_2717     TRUE 0.755 4.000 0.020 1.000 N NA
 6984840 6984841 Pput_2718 Pput_2719     FALSE 0.273 119.000 0.000 0.040   NA
 6984842 6984843 Pput_2720 Pput_2721     FALSE 0.520 113.000 0.000 0.077 Y NA
 6984843 6984844 Pput_2721 Pput_2722     TRUE 0.725 48.000 0.188 NA   NA
 6984846 6984847 Pput_2724 Pput_2725     TRUE 0.532 83.000 0.217 NA   NA
 6984847 6984848 Pput_2725 Pput_2726     FALSE 0.215 54.000 0.000 NA   NA
 6984848 6984849 Pput_2726 Pput_2727     FALSE 0.084 190.000 0.032 1.000   NA
 6984849 6984850 Pput_2727 Pput_2728     FALSE 0.477 89.000 0.188 1.000   NA
 6984850 6984851 Pput_2728 Pput_2729     TRUE 0.900 42.000 0.174 0.000   NA
 6984851 6984852 Pput_2729 Pput_2730     TRUE 0.954 -3.000 0.087 1.000   NA
 6984852 6984853 Pput_2730 Pput_2731     TRUE 0.951 14.000 0.333 1.000   NA
 6984856 6984857 Pput_2734 Pput_2735     TRUE 0.965 51.000 0.657 1.000 Y NA
 6984858 6984859 Pput_2736 Pput_2737     FALSE 0.302 92.000 0.080 NA   NA
 6984859 6984860 Pput_2737 Pput_2738     TRUE 0.782 26.000 0.120 NA   NA
 6984860 6984861 Pput_2738 Pput_2739     TRUE 0.991 -10.000 0.667 1.000   NA
 6984861 6984862 Pput_2739 Pput_2740     FALSE 0.211 70.000 0.018 NA   NA
 6984862 6984863 Pput_2740 Pput_2741     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 6984864 6984865 Pput_2742 Pput_2743     TRUE 0.993 -3.000 0.333 0.016   NA
 6984865 6984866 Pput_2743 Pput_2744     TRUE 0.948 -3.000 0.111 1.000 N NA
 6984867 6984868 Pput_2745 Pput_2746     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 6984870 6984871 Pput_2748 Pput_2749     TRUE 0.748 -7.000 0.000 NA   NA
 6984871 6984872 Pput_2749 Pput_2750     FALSE 0.119 77.000 0.000 NA   NA
 6984874 6984875 Pput_2752 Pput_2753     FALSE 0.002 902.000 0.000 NA   NA
 6984875 6984876 Pput_2753 Pput_2754     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 6984876 6984877 Pput_2754 Pput_2755     FALSE 0.327 33.000 0.000 NA   NA
 6984877 6984878 Pput_2755 Pput_2756     FALSE 0.064 176.000 0.014 NA   NA
 6984882 6984883 Pput_2760 Pput_2761     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6984883 6984884 Pput_2761 Pput_2762     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984884 6984885 Pput_2762 Pput_2763     FALSE 0.237 185.000 0.000 1.000 Y NA
 6984885 6984886 Pput_2763 Pput_2764     TRUE 0.967 33.000 0.444 1.000 Y NA
 6984890 6984891 Pput_2768 Pput_2769     TRUE 0.994 -3.000 0.748 NA   NA
 6984892 6984893 Pput_2770 Pput_2771     TRUE 0.999 -3.000 0.886 0.004 Y NA
 6984893 6984894 Pput_2771 Pput_2772     FALSE 0.190 93.000 0.032 1.000   NA
 6984895 6984896 Pput_2773 Pput_2774     FALSE 0.041 192.000 0.000 1.000   NA
 6984896 6984897 Pput_2774 Pput_2775     FALSE 0.054 173.000 0.000 1.000   NA
 6984897 6984898 Pput_2775 Pput_2776     TRUE 0.666 10.000 0.000 NA   NA
 6984899 6984900 Pput_2777 Pput_2778     FALSE 0.028 159.000 0.000 1.000 N NA
 6984900 6984901 Pput_2778 Pput_2779     FALSE 0.016 196.000 0.000 1.000 N NA
 6984901 6984902 Pput_2779 Pput_2780     FALSE 0.049 88.000 0.000 1.000 N NA
 6984902 6984903 Pput_2780 Pput_2781     FALSE 0.070 151.000 0.000 1.000   NA
 6984903 6984904 Pput_2781 Pput_2782     FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 6984905 6984906 Pput_2783 Pput_2784     FALSE 0.510 75.000 0.000 1.000 Y NA
 6984906 6984907 Pput_2784 Pput_2785     TRUE 0.998 -22.000 0.857 0.029 Y NA
 6984908 6984909 Pput_2786 Pput_2787 cysS   TRUE 0.977 10.000 0.032 0.032 Y NA
 6984910 6984911 Pput_2788 Pput_2789     TRUE 0.979 -3.000 0.237 1.000   NA
 6984915 6984916 Pput_2793 Pput_2794     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 6984916 6984917 Pput_2794 Pput_2795     TRUE 0.661 66.000 0.222 NA   NA
 6984917 6984918 Pput_2795 Pput_2796     TRUE 0.642 96.000 0.400 NA   NA
 6984919 6984920 Pput_2797 Pput_2798     TRUE 0.902 51.000 0.575 NA   NA
 6984920 6984921 Pput_2798 Pput_2799     FALSE 0.466 44.000 0.033 1.000   NA
 6984923 6984924 Pput_2801 Pput_2802     TRUE 0.997 -3.000 0.525 NA Y NA
 6984925 6984926 Pput_2803 Pput_2804     TRUE 0.996 -3.000 0.719 0.050 N NA
 6984926 6984927 Pput_2804 Pput_2805     FALSE 0.040 82.000 0.000 NA N NA
 6984927 6984928 Pput_2805 Pput_2806     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 6984928 6984929 Pput_2806 Pput_2807     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6984930 6984931 Pput_2808 Pput_2809     TRUE 0.966 30.000 0.400 1.000 Y NA
 6984932 6984933 Pput_2810 Pput_2811     TRUE 0.713 -13.000 0.000 NA   NA
 6984935 6984936 Pput_2813 Pput_2814 ampC   FALSE 0.009 301.000 0.000 NA   NA
 6984937 6984938 Pput_2815 Pput_2816     FALSE 0.004 469.000 0.000 NA   NA
 6984938 6984939 Pput_2816 Pput_2817     FALSE 0.140 71.000 0.000 NA   NA
 6984939 6984940 Pput_2817 Pput_2818     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 6984940 6984941 Pput_2818 Pput_2819     TRUE 0.921 23.000 0.400 1.000 N NA
 6984942 6984943 Pput_2820 Pput_2821     TRUE 0.872 40.000 0.400 1.000 N NA
 6984943 6984944 Pput_2821 Pput_2822     FALSE 0.054 81.000 0.000 1.000 N NA
 6984946 6984947 Pput_2824 Pput_2825     TRUE 0.903 -7.000 0.053 NA   NA
 6984948 6984949 Pput_2826 Pput_2827     TRUE 0.858 -7.000 0.029 NA   NA
 6984950 6984951 Pput_2828 Pput_2829     FALSE 0.009 550.000 0.070 1.000 N NA
 6984951 6984952 Pput_2829 Pput_2830     TRUE 0.992 -3.000 0.242 NA Y NA
 6984952 6984953 Pput_2830 Pput_2831     FALSE 0.009 298.000 0.000 NA   NA
 6984953 6984954 Pput_2831 Pput_2832     TRUE 0.988 2.000 0.455 NA   NA
 6984954 6984955 Pput_2832 Pput_2833     TRUE 0.913 50.000 0.625 NA   NA
 6984955 6984956 Pput_2833 Pput_2834     TRUE 0.922 62.000 0.875 NA   NA
 6984956 6984957 Pput_2834 Pput_2835     TRUE 0.927 46.000 0.667 NA   NA
 6984957 6984958 Pput_2835 Pput_2836     TRUE 0.817 47.000 0.292 NA   NA
 6984958 6984959 Pput_2836 Pput_2837     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 6984959 6984960 Pput_2837 Pput_2838     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6984961 6984962 Pput_2839 Pput_2840     FALSE 0.014 269.000 0.000 1.000   NA
 6984962 6984963 Pput_2840 Pput_2841     TRUE 0.996 12.000 0.550 0.002 Y NA
 6984963 6984964 Pput_2841 Pput_2842     TRUE 0.970 0.000 0.016 NA Y NA
 6984964 6984965 Pput_2842 Pput_2843   ureE TRUE 0.864 19.000 0.010 NA Y NA
 6984965 6984966 Pput_2843 Pput_2844 ureE ureC TRUE 0.985 10.000 0.315 0.001 N NA
 6984966 6984967 Pput_2844 Pput_2845 ureC ureB TRUE 0.998 -3.000 0.486 0.001 Y NA
 6984967 6984968 Pput_2845 Pput_2846 ureB ureA TRUE 0.998 -16.000 0.595 0.001 Y NA
 6984968 6984969 Pput_2846 Pput_2847 ureA   TRUE 0.993 10.000 0.664 0.002 N NA
 6984969 6984970 Pput_2847 Pput_2848     FALSE 0.006 273.000 0.000 1.000 N NA
 6984972 6984973 Pput_2850 Pput_2851     TRUE 0.980 -3.000 0.254 NA   NA
 6984973 6984974 Pput_2851 Pput_2852     FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 6984974 6984975 Pput_2852 Pput_2853     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6984975 6984976 Pput_2853 Pput_2854     TRUE 0.946 -3.000 0.000 0.070   NA
 6984976 6984977 Pput_2854 Pput_2855     FALSE 0.173 36.000 0.000 1.000 N NA
 6984977 6984978 Pput_2855 Pput_2856     FALSE 0.031 147.000 0.000 1.000 N NA
 6984978 6984979 Pput_2856 Pput_2857     TRUE 0.890 28.000 0.000 0.076 Y NA
 6984980 6984981 Pput_2858 Pput_2859     FALSE 0.062 67.000 0.000 NA N NA
 6984982 6984983 Pput_2860 Pput_2861     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6984983 6984984 Pput_2861 Pput_2862     FALSE 0.003 518.000 0.000 NA   NA
 6984985 6984986 Pput_2863 Pput_2864     FALSE 0.015 268.000 0.000 1.000   NA
 6984986 6984987 Pput_2864 Pput_2865     FALSE 0.003 614.000 0.000 NA   NA
 6984989 6984990 Pput_2867 Pput_2868     TRUE 0.975 15.000 0.750 1.000 N NA
 6984990 6984991 Pput_2868 Pput_2869     TRUE 0.992 -3.000 0.375 0.053 N NA
 6984991 6984992 Pput_2869 Pput_2870     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 6984993 6984994 Pput_2871 Pput_2872     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.023 Y NA
 6984994 6984995 Pput_2872 Pput_2873     FALSE 0.012 214.000 0.000 1.000 N NA
 6984995 6984996 Pput_2873 Pput_2874     TRUE 0.986 11.000 0.778 1.000 N NA
 6984996 6984997 Pput_2874 Pput_2875     FALSE 0.367 108.000 0.000 1.000 Y NA
 6984997 6984998 Pput_2875 Pput_2876     FALSE 0.083 122.000 0.000 1.000   NA
 6984998 6984999 Pput_2876 Pput_2877     TRUE 0.949 16.000 0.375 1.000   NA
 6984999 6985000 Pput_2877 Pput_2878     TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000   NA
 6985000 6985001 Pput_2878 Pput_2879     TRUE 0.979 0.000 0.250 NA   NA
 6985001 6985002 Pput_2879 Pput_2880     TRUE 0.942 9.000 0.208 NA N NA
 6985002 6985003 Pput_2880 Pput_2881     TRUE 0.829 111.000 0.600 0.004 N NA
 6985003 6985004 Pput_2881 Pput_2882     TRUE 0.555 97.000 0.286 1.000   NA
 6985004 6985005 Pput_2882 Pput_2883     FALSE 0.417 26.000 0.000 1.000   NA
 6985009 6985010 Pput_2887 Pput_2888     FALSE 0.002 392.000 0.000 1.000 N NA
 6985010 6985011 Pput_2888 Pput_2889     FALSE 0.387 13.000 0.000 1.000 N NA
 6985011 6985012 Pput_2889 Pput_2890     TRUE 0.995 14.000 1.000 1.000 Y NA
 6985012 6985013 Pput_2890 Pput_2891     TRUE 0.991 11.000 1.000 NA   NA
 6985013 6985014 Pput_2891 Pput_2892     TRUE 0.832 118.000 1.000 NA   NA
 6985014 6985015 Pput_2892 Pput_2893     FALSE 0.470 121.000 0.286 1.000 N NA
 6985015 6985016 Pput_2893 Pput_2894     TRUE 0.979 -3.000 0.286 NA N NA
 6985016 6985017 Pput_2894 Pput_2895     TRUE 0.958 11.000 0.333 NA N NA
 6985017 6985018 Pput_2895 Pput_2896     TRUE 0.993 -3.000 0.600 1.000   NA
 6985018 6985019 Pput_2896 Pput_2897     TRUE 0.983 13.000 0.375 0.004   NA
 6985019 6985020 Pput_2897 Pput_2898     TRUE 0.991 11.000 0.625 0.004 N NA
 6985020 6985021 Pput_2898 Pput_2899     TRUE 0.938 33.000 0.286 0.005   NA
 6985021 6985022 Pput_2899 Pput_2900   prpE FALSE 0.032 207.000 0.000 1.000   NA
 6985022 6985023 Pput_2900 Pput_2901 prpE   TRUE 0.699 48.000 0.000 1.000 Y NA
 6985023 6985024 Pput_2901 Pput_2902     TRUE 0.854 37.000 0.333 1.000 N NA
 6985024 6985025 Pput_2902 Pput_2903     FALSE 0.007 344.000 0.000 1.000   NA
 6985025 6985026 Pput_2903 Pput_2904     TRUE 0.932 55.000 0.500 0.039   NA
 6985026 6985027 Pput_2904 Pput_2905     TRUE 0.628 51.000 0.035 0.039 N NA
 6985028 6985029 Pput_2906 Pput_2907     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 6985030 6985031 Pput_2908 Pput_2909     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6985032 6985033 Pput_2910 Pput_2911     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6985033 6985034 Pput_2911 Pput_2912     FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 6985034 6985035 Pput_2912 Pput_2913     FALSE 0.219 114.000 0.064 NA   NA
 6985035 6985036 Pput_2913 Pput_2914     TRUE 0.889 4.000 0.064 1.000 N NA
 6985036 6985037 Pput_2914 Pput_2915     TRUE 0.545 15.000 0.000 1.000   NA
 6985037 6985038 Pput_2915 Pput_2916     FALSE 0.478 17.000 0.000 NA   NA
 6985038 6985039 Pput_2916 Pput_2917     TRUE 0.761 -6.000 0.000 NA   NA
 6985039 6985040 Pput_2917 Pput_2918     FALSE 0.061 152.000 0.000 NA   NA
 6985040 6985041 Pput_2918 Pput_2919     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 6985041 6985042 Pput_2919 Pput_2920     TRUE 0.970 6.000 0.273 NA   NA
 6985044 6985045 Pput_2922 Pput_2923     FALSE 0.092 98.000 0.000 1.000   NA
 6985045 6985046 Pput_2923 Pput_2924     FALSE 0.036 192.000 0.000 NA   NA
 6985046 6985047 Pput_2924 Pput_2925     FALSE 0.005 386.000 0.000 NA   NA
 6985047 6985048 Pput_2925 Pput_2926     TRUE 0.740 68.000 0.333 NA   NA
 6985048 6985049 Pput_2926 Pput_2927     TRUE 0.829 67.000 0.500 NA   NA
 6985049 6985050 Pput_2927 Pput_2928     TRUE 0.834 66.000 0.500 NA   NA
 6985050 6985051 Pput_2928 Pput_2929     FALSE 0.072 131.000 0.000 NA   NA
 6985051 6985052 Pput_2929 Pput_2930     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985052 6985053 Pput_2930 Pput_2931     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6985053 6985054 Pput_2931 Pput_2932     TRUE 0.993 -18.000 1.000 NA   NA
 6985054 6985055 Pput_2932 Pput_2933     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 6985055 6985056 Pput_2933 Pput_2934     TRUE 0.992 10.000 1.000 NA   NA
 6985056 6985057 Pput_2934 Pput_2935     TRUE 0.966 35.000 1.000 NA   NA
 6985060 6985061 Pput_2938 Pput_2939     FALSE 0.003 534.000 0.000 NA   NA
 6985062 6985063 Pput_2940 Pput_2941     TRUE 0.982 -13.000 0.429 NA   NA
 6985063 6985064 Pput_2941 Pput_2942     TRUE 0.984 16.000 1.000 NA   NA
 6985064 6985065 Pput_2942 Pput_2943     TRUE 0.993 8.000 1.000 NA   NA
 6985065 6985066 Pput_2943 Pput_2944     TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 6985066 6985067 Pput_2944 Pput_2945     TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 6985067 6985068 Pput_2945 Pput_2946     TRUE 0.994 -10.000 1.000 NA   NA
 6985068 6985069 Pput_2946 Pput_2947     TRUE 0.993 -37.000 1.000 NA   NA
 6985069 6985070 Pput_2947 Pput_2948     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 6985071 6985072 Pput_2949 Pput_2950     TRUE 0.698 -18.000 0.000 NA   NA
 6985072 6985073 Pput_2950 Pput_2951     TRUE 0.989 -10.000 0.667 1.000 N NA
 6985074 6985075 Pput_2952 Pput_2953     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 6985075 6985076 Pput_2953 Pput_2954     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 6985076 6985077 Pput_2954 Pput_2955     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985077 6985078 Pput_2955 Pput_2956     TRUE 0.666 10.000 0.000 NA   NA
 6985078 6985079 Pput_2956 Pput_2957     FALSE 0.002 833.000 0.000 NA   NA
 6985079 6985080 Pput_2957 Pput_2958     FALSE 0.030 204.000 0.000 NA   NA
 6985080 6985081 Pput_2958 Pput_2959     FALSE 0.100 86.000 0.000 NA   NA
 6985082 6985083 Pput_2960 Pput_2961     FALSE 0.073 125.000 0.000 NA   NA
 6985085 6985086 Pput_2963 Pput_2964     TRUE 0.748 -7.000 0.000 NA   NA
 6985086 6985087 Pput_2964 Pput_2965     TRUE 0.728 -10.000 0.000 NA   NA
 6985088 6985089 Pput_2966 Pput_2967     FALSE 0.329 167.000 0.193 1.000   NA
 6985090 6985091 Pput_2968 Pput_2969     TRUE 0.951 34.000 0.722 NA   NA
 6985091 6985092 Pput_2969 Pput_2970     FALSE 0.227 51.000 0.000 NA   NA
 6985092 6985093 Pput_2970 Pput_2971     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6985093 6985094 Pput_2971 Pput_2972     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.069 Y NA
 6985094 6985095 Pput_2972 Pput_2973     FALSE 0.485 10.000 0.000 1.000 N NA
 6985095 6985096 Pput_2973 Pput_2974     TRUE 0.622 39.000 0.000 0.013 N NA
 6985096 6985097 Pput_2974 Pput_2975     TRUE 0.997 -3.000 0.333 0.013 Y NA
 6985097 6985098 Pput_2975 Pput_2976     TRUE 0.986 -3.000 0.105 NA Y NA
 6985098 6985099 Pput_2976 Pput_2977     TRUE 0.961 2.000 0.000 NA Y NA
 6985099 6985100 Pput_2977 Pput_2978     TRUE 0.927 12.000 0.013 1.000 Y NA
 6985100 6985101 Pput_2978 Pput_2979     FALSE 0.007 333.000 0.000 1.000   NA
 6985102 6985103 Pput_2980 Pput_2981     FALSE 0.247 47.000 0.000 NA   NA
 6985103 6985104 Pput_2981 Pput_2982     TRUE 0.979 9.000 0.467 1.000 N NA
 6985104 6985105 Pput_2982 Pput_2983     FALSE 0.072 131.000 0.000 NA   NA
 6985106 6985107 Pput_2984 Pput_2985     TRUE 0.883 68.000 0.333 NA Y NA
 6985107 6985108 Pput_2985 Pput_2986     TRUE 0.997 13.000 0.857 0.052 Y NA
 6985108 6985109 Pput_2986 Pput_2987     TRUE 0.996 -24.000 0.750 1.000 Y NA
 6985109 6985110 Pput_2987 Pput_2988     FALSE 0.485 10.000 0.000 1.000 N NA
 6985110 6985111 Pput_2988 Pput_2989     FALSE 0.420 12.000 0.000 1.000 N NA
 6985111 6985112 Pput_2989 Pput_2990     TRUE 0.570 27.000 0.029 1.000   NA
 6985114 6985115 Pput_2992 Pput_2993     TRUE 0.997 2.000 0.429 0.052 Y NA
 6985115 6985116 Pput_2993 Pput_2994     TRUE 0.996 -22.000 0.778 1.000 Y NA
 6985116 6985117 Pput_2994 Pput_2995     TRUE 0.992 -3.000 0.222 NA Y NA
 6985117 6985118 Pput_2995 Pput_2996     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA Y NA
 6985118 6985119 Pput_2996 Pput_2997     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985119 6985120 Pput_2997 Pput_2998     TRUE 0.666 10.000 0.000 NA   NA
 6985120 6985121 Pput_2998 Pput_2999     FALSE 0.007 348.000 0.000 1.000   NA
 6985121 6985122 Pput_2999 Pput_3000     FALSE 0.012 284.000 0.000 1.000   NA
 6985122 6985123 Pput_3000 Pput_3001     TRUE 0.798 117.000 0.400 NA Y NA
 6985123 6985124 Pput_3001 Pput_3002     TRUE 0.614 60.000 0.000 NA Y NA
 6985124 6985125 Pput_3002 Pput_3003     TRUE 0.851 19.000 0.000 NA Y NA
 6985125 6985126 Pput_3003 Pput_3004     TRUE 0.998 5.000 0.846 0.052 Y NA
 6985126 6985127 Pput_3004 Pput_3005     TRUE 0.998 -3.000 0.917 1.000 Y NA
 6985127 6985128 Pput_3005 Pput_3006     TRUE 0.828 -3.000 0.000 1.000   NA
 6985128 6985129 Pput_3006 Pput_3007     FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6985130 6985131 Pput_3008 Pput_3009     FALSE 0.042 96.000 0.000 1.000 N NA
 6985131 6985132 Pput_3009 Pput_3010     FALSE 0.043 189.000 0.000 1.000   NA
 6985132 6985133 Pput_3010 Pput_3011     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985133 6985134 Pput_3011 Pput_3012     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6985136 6985137 Pput_3014 Pput_3015     FALSE 0.076 104.000 0.000 NA   NA
 6985137 6985138 Pput_3015 Pput_3016     TRUE 0.992 -3.000 0.533 NA   NA
 6985138 6985139 Pput_3016 Pput_3017     TRUE 0.981 7.000 0.217 0.039   NA
 6985139 6985140 Pput_3017 Pput_3018     TRUE 0.994 -3.000 0.722 NA   NA
 6985140 6985141 Pput_3018 Pput_3019     TRUE 0.969 -28.000 0.311 NA   NA
 6985141 6985142 Pput_3019 Pput_3020     TRUE 0.992 0.000 0.588 NA   NA
 6985143 6985144 Pput_3021 Pput_3022     TRUE 0.960 -3.000 0.120 NA   NA
 6985144 6985145 Pput_3022 Pput_3023     TRUE 0.754 9.000 0.013 NA   NA
 6985145 6985146 Pput_3023 Pput_3024     TRUE 0.865 -3.000 0.016 NA   NA
 6985146 6985147 Pput_3024 Pput_3025     TRUE 0.984 3.000 0.395 NA   NA
 6985148 6985149 Pput_3026 Pput_3027     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6985149 6985150 Pput_3027 Pput_3028     FALSE 0.084 96.000 0.000 NA   NA
 6985150 6985151 Pput_3028 Pput_3029     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 6985153 6985154 Pput_3031 Pput_3032     FALSE 0.050 170.000 0.000 NA   NA
 6985154 6985155 Pput_3032 Pput_3033     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985155 6985156 Pput_3033 Pput_3034     FALSE 0.084 96.000 0.000 NA   NA
 6985156 6985157 Pput_3034 Pput_3035     TRUE 0.931 22.000 0.429 1.000 N NA
 6985157 6985158 Pput_3035 Pput_3036     TRUE 0.698 29.000 0.103 1.000 N NA
 6985158 6985159 Pput_3036 Pput_3037     TRUE 0.876 14.000 0.128 NA   NA
 6985160 6985161 Pput_3038 Pput_3039     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 6985161 6985162 Pput_3039 Pput_3040     TRUE 0.786 3.000 0.000 1.000   NA
 6985162 6985163 Pput_3040 Pput_3041     TRUE 0.900 -3.000 0.027 1.000   NA
 6985163 6985164 Pput_3041 Pput_3042     TRUE 0.985 -13.000 0.500 NA   NA
 6985164 6985165 Pput_3042 Pput_3043     TRUE 0.987 9.000 0.610 NA   NA
 6985165 6985166 Pput_3043 Pput_3044     TRUE 0.994 -10.000 0.923 NA   NA
 6985166 6985167 Pput_3044 Pput_3045     FALSE 0.073 117.000 0.000 NA   NA
 6985167 6985168 Pput_3045 Pput_3046     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985168 6985169 Pput_3046 Pput_3047     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6985169 6985170 Pput_3047 Pput_3048     FALSE 0.385 26.000 0.000 NA   NA
 6985170 6985171 Pput_3048 Pput_3049     TRUE 0.994 2.000 0.750 1.000   NA
 6985173 6985174 Pput_3051 Pput_3052     FALSE 0.049 87.000 0.000 1.000 N NA
 6985175 6985176 Pput_3053 Pput_3054     TRUE 0.965 27.000 0.775 NA   NA
 6985176 6985177 Pput_3054 Pput_3055     TRUE 0.625 26.000 0.037 1.000   NA
 6985177 6985178 Pput_3055 Pput_3056     FALSE 0.091 99.000 0.000 1.000   NA
 6985180 6985181 Pput_3058 Pput_3059     TRUE 0.977 14.000 0.744 1.000 N NA
 6985181 6985182 Pput_3059 Pput_3060     TRUE 0.634 56.000 0.186 1.000 N NA
 6985182 6985183 Pput_3060 Pput_3061     TRUE 0.842 27.000 0.200 NA   NA
 6985183 6985184 Pput_3061 Pput_3062     TRUE 0.931 3.000 0.075 NA   NA
 6985184 6985185 Pput_3062 Pput_3063     TRUE 0.607 28.000 0.042 NA   NA
 6985185 6985186 Pput_3063 Pput_3064     FALSE 0.320 34.000 0.000 NA   NA
 6985186 6985187 Pput_3064 Pput_3065     FALSE 0.082 98.000 0.000 NA   NA
 6985187 6985188 Pput_3065 Pput_3066     TRUE 0.993 4.000 0.805 NA   NA
 6985188 6985189 Pput_3066 Pput_3067     TRUE 0.987 -3.000 0.365 NA   NA
 6985189 6985190 Pput_3067 Pput_3068     TRUE 0.695 74.000 0.383 NA N NA
 6985190 6985191 Pput_3068 Pput_3069     FALSE 0.002 355.000 0.000 NA N NA
 6985191 6985192 Pput_3069 Pput_3070     TRUE 0.767 35.000 0.000 1.000 Y NA
 6985192 6985193 Pput_3070 Pput_3071     FALSE 0.369 36.000 0.028 1.000 N NA
 6985195 6985196 Pput_3073 Pput_3074     TRUE 0.667 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6985196 6985197 Pput_3074 Pput_3075     FALSE 0.077 103.000 0.000 NA   NA
 6985197 6985198 Pput_3075 Pput_3076     TRUE 0.995 0.000 0.778 NA   NA
 6985198 6985199 Pput_3076 Pput_3077     FALSE 0.116 78.000 0.000 NA   NA
 6985200 6985201 Pput_3078 Pput_3079     FALSE 0.003 499.000 0.000 NA   NA
 6985201 6985202 Pput_3079 Pput_3080     TRUE 0.910 -16.000 0.108 1.000 N NA
 6985202 6985203 Pput_3080 Pput_3081     FALSE 0.105 90.000 0.000 1.000   NA
 6985203 6985204 Pput_3081 Pput_3082     TRUE 0.646 52.000 0.000 0.002   NA
 6985204 6985205 Pput_3082 Pput_3083     FALSE 0.083 108.000 0.000 1.000   NA
 6985205 6985206 Pput_3083 Pput_3084     FALSE 0.016 318.000 0.048 1.000 N NA
 6985206 6985207 Pput_3084 Pput_3085     FALSE 0.130 196.000 0.071 1.000   NA
 6985207 6985208 Pput_3085 Pput_3086     TRUE 0.957 39.000 0.857 NA   NA
 6985208 6985209 Pput_3086 Pput_3087     TRUE 0.943 9.000 0.175 NA   NA
 6985209 6985210 Pput_3087 Pput_3088     TRUE 0.990 6.000 0.786 1.000 N NA
 6985211 6985212 Pput_3089 Pput_3090     TRUE 0.559 67.000 0.154 NA   NA
 6985213 6985214 Pput_3091 Pput_3092     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.029 Y NA
 6985215 6985216 Pput_3093 Pput_3094     TRUE 0.947 31.000 0.615 NA   NA
 6985216 6985217 Pput_3094 Pput_3095     TRUE 0.974 -3.000 0.189 1.000   NA
 6985217 6985218 Pput_3095 Pput_3096     TRUE 0.998 -3.000 0.635 0.083 Y NA
 6985218 6985219 Pput_3096 Pput_3097     FALSE 0.004 485.000 0.000 1.000   NA
 6985219 6985220 Pput_3097 Pput_3098     FALSE 0.006 375.000 0.000 1.000   NA
 6985220 6985221 Pput_3098 Pput_3099     FALSE 0.186 106.000 0.065 1.000 N NA
 6985221 6985222 Pput_3099 Pput_3100     TRUE 0.719 78.000 0.130 1.000 Y NA
 6985222 6985223 Pput_3100 Pput_3101     FALSE 0.099 59.000 0.000 1.000 N NA
 6985225 6985226 Pput_3103 Pput_3104     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 6985226 6985227 Pput_3104 Pput_3105     FALSE 0.056 162.000 0.000 NA   NA
 6985232 6985233 Pput_3110 Pput_3111     TRUE 0.984 -3.000 0.317 NA   NA
 6985234 6985235 Pput_3112 Pput_3113     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 6985235 6985236 Pput_3113 Pput_3114     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6985236 6985237 Pput_3114 Pput_3115     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985239 6985240 Pput_3117 Pput_3118     TRUE 0.966 5.000 0.273 1.000 N NA
 6985240 6985241 Pput_3118 Pput_3119     TRUE 0.962 -15.000 0.227 NA   NA
 6985241 6985242 Pput_3119 Pput_3120     TRUE 0.845 42.000 0.308 NA   NA
 6985242 6985243 Pput_3120 Pput_3121     FALSE 0.006 243.000 0.000 NA N NA
 6985244 6985245 Pput_3122 Pput_3123     TRUE 0.778 30.000 0.143 NA   NA
 6985245 6985246 Pput_3123 Pput_3124     FALSE 0.432 139.000 0.222 1.000   NA
 6985248 6985249 Pput_3126 Pput_3127     FALSE 0.030 153.000 0.000 1.000 N NA
 6985249 6985250 Pput_3127 Pput_3128     FALSE 0.185 195.000 0.176 1.000 N NA
 6985250 6985251 Pput_3128 Pput_3129     FALSE 0.150 43.000 0.000 1.000 N NA
 6985252 6985253 Pput_3130 Pput_3131     FALSE 0.029 155.000 0.000 1.000 N NA
 6985253 6985254 Pput_3131 Pput_3132     FALSE 0.034 137.000 0.000 1.000 N NA
 6985256 6985257 Pput_3134 Pput_3135     TRUE 0.696 8.000 0.000 NA   NA
 6985260 6985261 Pput_3138 Pput_3139     TRUE 0.903 12.000 0.130 NA   NA
 6985261 6985262 Pput_3139 Pput_3140     TRUE 0.970 0.000 0.182 NA   NA
 6985262 6985263 Pput_3140 Pput_3141     TRUE 0.982 -3.000 0.286 NA   NA
 6985266 6985267 Pput_3144 Pput_3145     FALSE 0.278 42.000 0.000 NA   NA
 6985268 6985269 Pput_3146 Pput_3147     FALSE 0.005 262.000 0.000 NA N NA
 6985269 6985270 Pput_3147 Pput_3148     FALSE 0.122 76.000 0.000 NA   NA
 6985273 6985274 Pput_3151 Pput_3152     FALSE 0.024 217.000 0.000 NA   NA
 6985275 6985276 Pput_3153 Pput_3154     FALSE 0.303 161.000 0.000 1.000 Y NA
 6985277 6985278 Pput_3155 Pput_3156     TRUE 0.995 7.000 0.667 0.006   NA
 6985278 6985279 Pput_3156 Pput_3157     TRUE 0.952 2.000 0.000 0.006   NA
 6985279 6985280 Pput_3157 Pput_3158     FALSE 0.012 216.000 0.000 1.000 N NA
 6985280 6985281 Pput_3158 Pput_3159     FALSE 0.290 18.000 0.000 1.000 N NA
 6985281 6985282 Pput_3159 Pput_3160     TRUE 0.636 12.000 0.000 1.000   NA
 6985285 6985286 Pput_3163 Pput_3164     FALSE 0.036 125.000 0.000 1.000 N NA
 6985286 6985287 Pput_3164 Pput_3165     FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 6985287 6985288 Pput_3165 Pput_3166     FALSE 0.092 98.000 0.002 NA   NA
 6985288 6985289 Pput_3166 Pput_3167     TRUE 0.851 15.000 0.158 NA N NA
 6985290 6985291 Pput_3168 Pput_3169     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6985292 6985293 Pput_3170 Pput_3171     FALSE 0.010 298.000 0.000 1.000   NA
 6985294 6985295 Pput_3172 Pput_3173     FALSE 0.013 268.000 0.000 NA   NA
 6985295 6985296 Pput_3173 Pput_3174     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6985299 6985300 Pput_3177 Pput_3178     FALSE 0.025 168.000 0.000 1.000 N NA
 6985300 6985301 Pput_3178 Pput_3179     FALSE 0.073 127.000 0.000 NA   NA
 6985301 6985302 Pput_3179 Pput_3180     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6985307 6985308 Pput_3185 Pput_3186     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6985308 6985309 Pput_3186 Pput_3187     FALSE 0.073 111.000 0.000 NA   NA
 6985313 6985314 Pput_3191 Pput_3192     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6985319 6985320 Pput_3197 Pput_3198     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6985321 6985322 Pput_3199 Pput_3200     TRUE 0.959 22.000 0.571 1.000   NA
 6985322 6985323 Pput_3200 Pput_3201     FALSE 0.081 132.000 0.000 1.000   NA
 6985325 6985326 Pput_3203 Pput_3204     TRUE 0.986 -3.000 0.353 NA   NA
 6985326 6985327 Pput_3204 Pput_3205     TRUE 0.979 3.000 0.309 NA   NA
 6985328 6985329 Pput_3206 Pput_3207     FALSE 0.140 71.000 0.000 NA   NA
 6985329 6985330 Pput_3207 Pput_3208     TRUE 0.707 -15.000 0.000 NA   NA
 6985330 6985331 Pput_3208 Pput_3209     FALSE 0.063 149.000 0.000 NA   NA
 6985332 6985333 Pput_3210 Pput_3211     FALSE 0.004 486.000 0.000 NA   NA
 6985333 6985334 Pput_3211 Pput_3212     FALSE 0.061 152.000 0.000 NA   NA
 6985335 6985336 Pput_3213 Pput_3214     FALSE 0.091 99.000 0.000 1.000   NA
 6985336 6985337 Pput_3214 Pput_3215     FALSE 0.002 399.000 0.000 1.000 N NA
 6985337 6985338 Pput_3215 Pput_3216     FALSE 0.252 46.000 0.000 NA   NA
 6985340 6985341 Pput_R0052 Pput_3218     FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 6985341 6985342 Pput_3218 Pput_3219   ihfA TRUE 0.982 -19.000 0.535 1.000 N NA
 6985342 6985343 Pput_3219 Pput_3220 ihfA pheT TRUE 0.954 5.000 0.208 1.000 N NA
 6985343 6985344 Pput_3220 Pput_3221 pheT pheS TRUE 0.990 32.000 0.574 0.000 Y NA
 6985344 6985345 Pput_3221 Pput_3222 pheS rplT TRUE 0.677 110.000 0.202 1.000 Y NA
 6985345 6985346 Pput_3222 Pput_3223 rplT rpmI TRUE 0.994 28.000 0.928 0.008 Y NA
 6985346 6985347 Pput_3223 Pput_3224 rpmI infC TRUE 0.954 61.000 0.652 1.000 Y NA
 6985347 6985348 Pput_3224 Pput_3225 infC thrS TRUE 0.990 0.000 0.186 1.000 Y NA
 6985349 6985350 Pput_3226 Pput_3227     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 6985353 6985354 Pput_3230 Pput_3231     FALSE 0.195 65.000 0.025 1.000 N NA
 6985354 6985355 Pput_3231 Pput_3232     TRUE 0.977 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 6985355 6985356 Pput_3232 Pput_3233     TRUE 0.954 16.000 0.484 1.000 N NA
 6985356 6985357 Pput_3233 Pput_3234     TRUE 0.959 5.000 0.226 1.000 N NA
 6985357 6985358 Pput_3234 Pput_3235     TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.001 Y NA
 6985358 6985359 Pput_3235 Pput_3236     TRUE 0.974 21.000 0.132 0.001 Y NA
 6985362 6985363 Pput_3239 Pput_3240     TRUE 0.711 64.000 0.048 1.000 Y NA
 6985363 6985364 Pput_3240 Pput_3241     FALSE 0.036 191.000 0.000 NA   NA
 6985364 6985365 Pput_3241 Pput_3242     TRUE 0.982 7.000 0.455 NA   NA
 6985366 6985367 Pput_3243 Pput_3244     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 6985367 6985368 Pput_3244 Pput_R0053     FALSE 0.071 132.000 0.000 NA   NA
 6985368 6985369 Pput_R0053 Pput_R0054     FALSE 0.047 173.000 0.000 NA   NA
 6985373 6985374 Pput_3248 Pput_3249     TRUE 0.714 29.000 0.083 NA   NA
 6985375 6985376 Pput_3250 Pput_3251     FALSE 0.040 98.000 0.000 1.000 N NA
 6985376 6985377 Pput_3251 Pput_3252     FALSE 0.096 89.000 0.000 NA   NA
 6985378 6985379 Pput_3253 Pput_3254     FALSE 0.094 90.000 0.000 NA   NA
 6985379 6985380 Pput_3254 Pput_3255     FALSE 0.421 22.000 0.000 NA   NA
 6985380 6985381 Pput_3255 Pput_3256     TRUE 0.856 125.000 0.551 1.000 Y NA
 6985384 6985385 Pput_3259 Pput_3260     FALSE 0.030 152.000 0.000 1.000 N NA
 6985386 6985387 Pput_3261 Pput_3262     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 6985387 6985388 Pput_3262 Pput_3263     FALSE 0.478 17.000 0.000 NA   NA
 6985389 6985390 Pput_3264 Pput_3265     TRUE 0.815 49.000 0.000 0.073 Y NA
 6985390 6985391 Pput_3265 Pput_3266     TRUE 0.848 52.000 0.448 1.000 N NA
 6985397 6985398 Pput_3272 Pput_3273     FALSE 0.073 119.000 0.000 NA   NA
 6985398 6985399 Pput_3273 Pput_3274     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6985399 6985400 Pput_3274 Pput_3275     FALSE 0.006 371.000 0.000 1.000   NA
 6985400 6985401 Pput_3275 Pput_3276     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6985401 6985402 Pput_3276 Pput_3277     FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 6985402 6985403 Pput_3277 Pput_3278     TRUE 0.998 0.000 0.958 1.000 Y NA
 6985403 6985404 Pput_3278 Pput_3279     TRUE 0.995 -3.000 0.391 1.000 Y NA
 6985406 6985407 Pput_3281 Pput_3282     FALSE 0.186 60.000 0.000 NA   NA
 6985407 6985408 Pput_3282 Pput_3283     FALSE 0.158 144.000 0.000 0.098 N NA
 6985408 6985409 Pput_3283 Pput_3284     FALSE 0.021 181.000 0.000 1.000 N NA
 6985410 6985411 Pput_3285 Pput_3286     TRUE 0.942 17.000 0.421 1.000 N NA
 6985411 6985412 Pput_3286 Pput_3287     TRUE 0.993 -7.000 0.368 1.000 Y NA
 6985413 6985414 Pput_3288 Pput_3289     TRUE 0.997 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 6985415 6985416 Pput_3290 Pput_3291     TRUE 0.842 -10.000 0.028 NA   NA
 6985417 6985418 Pput_3292 Pput_3293     TRUE 0.998 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 6985418 6985419 Pput_3293 Pput_3294     FALSE 0.186 165.000 0.069 1.000   NA
 6985419 6985420 Pput_3294 Pput_3295     TRUE 0.693 15.000 0.031 NA   NA
 6985421 6985422 Pput_3296 Pput_3297     TRUE 0.994 -7.000 0.914 NA   NA
 6985422 6985423 Pput_3297 Pput_3298     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 6985423 6985424 Pput_3298 Pput_3299     TRUE 0.666 10.000 0.000 NA   NA
 6985424 6985425 Pput_3299 Pput_3300     FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 6985425 6985426 Pput_3300 Pput_3301     FALSE 0.330 98.000 0.000 0.008   NA
 6985426 6985427 Pput_3301 Pput_3302     FALSE 0.126 79.000 0.000 1.000   NA
 6985427 6985428 Pput_3302 Pput_3303     FALSE 0.062 67.000 0.000 NA N NA
 6985431 6985432 Pput_3306 Pput_3307     TRUE 0.925 3.000 0.069 NA   NA
 6985432 6985433 Pput_3307 Pput_3308     FALSE 0.289 40.000 0.000 NA   NA
 6985433 6985434 Pput_3308 Pput_3309     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 6985434 6985435 Pput_3309 Pput_3310     FALSE 0.063 148.000 0.000 NA   NA
 6985435 6985436 Pput_3310 Pput_3311     TRUE 0.994 -3.000 0.651 NA   NA
 6985436 6985437 Pput_3311 Pput_3312     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985440 6985441 Pput_3315 Pput_3316     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6985441 6985442 Pput_3316 Pput_3317     FALSE 0.079 134.000 0.000 1.000   NA
 6985442 6985443 Pput_3317 Pput_3318     FALSE 0.300 59.000 0.020 1.000   NA
 6985443 6985444 Pput_3318 Pput_3319     FALSE 0.112 196.000 0.059 1.000   NA
 6985445 6985446 Pput_3320 Pput_3321 metH   FALSE 0.227 170.000 0.115 NA   NA
 6985447 6985448 Pput_3322 Pput_3323     FALSE 0.412 86.000 0.136 NA   NA
 6985449 6985450 Pput_3324 Pput_3325     TRUE 0.944 -16.000 0.165 NA   NA
 6985452 6985453 Pput_3327 Pput_3328 dkgB   TRUE 0.716 6.000 0.000 NA   NA
 6985453 6985454 Pput_3328 Pput_3329     FALSE 0.287 163.000 0.000 NA Y NA
 6985454 6985455 Pput_3329 Pput_3330     TRUE 0.598 37.000 0.087 NA N NA
 6985455 6985456 Pput_3330 Pput_3331     FALSE 0.032 142.000 0.000 1.000 N NA
 6985457 6985458 Pput_3332 Pput_3333     TRUE 0.995 -3.000 0.848 NA   NA
 6985458 6985459 Pput_3333 Pput_3334     TRUE 0.994 13.000 0.879 NA Y NA
 6985459 6985460 Pput_3334 Pput_3335     TRUE 0.852 41.000 0.312 NA   NA
 6985460 6985461 Pput_3335 Pput_3336     TRUE 0.973 4.000 0.269 NA   NA
 6985461 6985462 Pput_3336 Pput_3337     TRUE 0.821 19.000 0.115 NA   NA
 6985462 6985463 Pput_3337 Pput_3338     TRUE 0.868 31.000 0.273 NA   NA
 6985464 6985465 Pput_3339 Pput_3340     TRUE 0.980 16.000 0.395 1.000 Y NA
 6985465 6985466 Pput_3340 Pput_3341     TRUE 0.979 14.000 0.140 0.022 Y NA
 6985468 6985469 Pput_3342 Pput_3343     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 6985469 6985470 Pput_3343 Pput_3344     FALSE 0.076 104.000 0.000 NA   NA
 6985473 6985474 Pput_3347 Pput_3348     FALSE 0.051 320.000 0.000 1.000 Y NA
 6985474 6985475 Pput_3348 Pput_3349     TRUE 0.998 -3.000 0.882 1.000 Y NA
 6985475 6985476 Pput_3349 Pput_3350     TRUE 0.994 1.000 0.762 1.000   NA
 6985476 6985477 Pput_3350 Pput_3351     TRUE 0.997 0.000 0.619 0.001   NA
 6985478 6985479 Pput_3352 Pput_3353     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 6985480 6985481 Pput_3354 Pput_3355     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985481 6985482 Pput_3355 Pput_3356     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6985483 6985484 Pput_3357 Pput_3358     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6985485 6985486 Pput_3359 Pput_3360     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985486 6985487 Pput_3360 Pput_3361     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 6985487 6985488 Pput_3361 Pput_3362     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6985488 6985489 Pput_3362 Pput_3363     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6985489 6985490 Pput_3363 Pput_3364     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985490 6985491 Pput_3364 Pput_3365     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6985491 6985492 Pput_3365 Pput_3366     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 6985492 6985493 Pput_3366 Pput_3367     FALSE 0.224 188.000 0.167 NA   NA
 6985493 6985494 Pput_3367 Pput_3368     TRUE 0.580 56.000 0.111 NA   NA
 6985494 6985495 Pput_3368 Pput_3369     FALSE 0.004 428.000 0.000 NA   NA
 6985495 6985496 Pput_3369 Pput_3370     TRUE 0.927 58.000 0.857 NA   NA
 6985496 6985497 Pput_3370 Pput_3371     TRUE 0.921 60.000 0.833 NA   NA
 6985497 6985498 Pput_3371 Pput_3372     TRUE 0.983 -3.000 0.294 NA   NA
 6985498 6985499 Pput_3372 Pput_3373     TRUE 0.978 3.000 0.294 NA   NA
 6985499 6985500 Pput_3373 Pput_3374     TRUE 0.982 4.000 0.375 NA   NA
 6985500 6985501 Pput_3374 Pput_3375     FALSE 0.289 40.000 0.000 NA   NA
 6985501 6985502 Pput_3375 Pput_3376     TRUE 0.728 5.000 0.000 NA   NA
 6985502 6985503 Pput_3376 Pput_3377     TRUE 0.572 13.000 0.000 NA   NA
 6985503 6985504 Pput_3377 Pput_3378     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6985504 6985505 Pput_3378 Pput_3379     TRUE 0.728 -10.000 0.000 NA   NA
 6985505 6985506 Pput_3379 Pput_3380     TRUE 0.685 9.000 0.000 NA   NA
 6985506 6985507 Pput_3380 Pput_3381     TRUE 0.936 -13.000 0.125 NA   NA
 6985507 6985508 Pput_3381 Pput_3382     TRUE 0.950 32.000 0.667 NA   NA
 6985508 6985509 Pput_3382 Pput_3383     FALSE 0.008 308.000 0.000 NA   NA
 6985509 6985510 Pput_3383 Pput_3384     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985512 6985513 Pput_3386 Pput_3387     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 6985513 6985514 Pput_3387 Pput_3388     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 6985514 6985515 Pput_3388 Pput_3389     TRUE 0.605 140.000 0.429 NA   NA
 6985515 6985516 Pput_3389 Pput_3390     TRUE 0.982 0.000 0.286 NA   NA
 6985516 6985517 Pput_3390 Pput_3391     FALSE 0.036 191.000 0.000 NA   NA
 6985517 6985518 Pput_3391 Pput_3392     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6985518 6985519 Pput_3392 Pput_3393     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6985519 6985520 Pput_3393 Pput_3394     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985520 6985521 Pput_3394 Pput_3395     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985521 6985522 Pput_3395 Pput_3396     FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 6985522 6985523 Pput_3396 Pput_3397     FALSE 0.368 28.000 0.000 NA   NA
 6985524 6985525 Pput_3398 Pput_3399     FALSE 0.012 272.000 0.000 NA   NA
 6985525 6985526 Pput_3399 Pput_3400     TRUE 0.972 -9.000 0.273 NA   NA
 6985528 6985529 Pput_3402 Pput_3403     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985529 6985530 Pput_3403 Pput_3404     FALSE 0.005 376.000 0.000 NA   NA
 6985530 6985531 Pput_3404 Pput_3405     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985531 6985532 Pput_3405 Pput_3406     FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6985532 6985533 Pput_3406 Pput_3407     FALSE 0.421 22.000 0.000 NA   NA
 6985533 6985534 Pput_3407 Pput_3408     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985534 6985535 Pput_3408 Pput_3409     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985535 6985536 Pput_3409 Pput_3410     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 6985536 6985537 Pput_3410 Pput_3411     TRUE 0.980 -3.000 0.250 NA   NA
 6985537 6985538 Pput_3411 Pput_3412     TRUE 0.696 8.000 0.000 NA   NA
 6985538 6985539 Pput_3412 Pput_3413     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 6985542 6985543 Pput_3416 Pput_3417     FALSE 0.054 164.000 0.000 NA   NA
 6985544 6985545 Pput_3418 Pput_3419     FALSE 0.003 507.000 0.000 NA   NA
 6985547 6985548 Pput_3421 Pput_3422     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985548 6985549 Pput_3422 Pput_3423     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985549 6985550 Pput_3423 Pput_3424     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985550 6985551 Pput_3424 Pput_3425     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985551 6985552 Pput_3425 Pput_3426     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 6985552 6985553 Pput_3426 Pput_3427     FALSE 0.075 105.000 0.000 NA   NA
 6985553 6985554 Pput_3427 Pput_3428     FALSE 0.152 64.000 0.014 1.000 N NA
 6985555 6985556 Pput_3429 Pput_3430     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6985558 6985559 Pput_3432 Pput_3433 prpD   FALSE 0.137 172.000 0.053 NA   NA
 6985559 6985560 Pput_3433 Pput_3434     TRUE 0.733 152.000 0.733 NA   NA
 6985560 6985561 Pput_3434 Pput_3435     TRUE 0.696 159.000 0.289 1.000 Y NA
 6985561 6985562 Pput_3435 Pput_3436   prpB TRUE 0.838 61.000 0.502 1.000 N NA
 6985562 6985563 Pput_3436 Pput_3437 prpB   TRUE 0.935 -3.000 0.080 1.000 N NA
 6985564 6985565 Pput_3438 Pput_3439     TRUE 0.942 6.000 0.141 NA   NA
 6985565 6985566 Pput_3439 Pput_3440     TRUE 0.996 0.000 0.923 NA   NA
 6985566 6985567 Pput_3440 Pput_3441     FALSE 0.074 209.000 0.042 1.000   NA
 6985567 6985568 Pput_3441 Pput_3442     FALSE 0.479 81.000 0.003 1.000 Y NA
 6985569 6985570 Pput_3443 Pput_3444 cysB   FALSE 0.219 129.000 0.085 1.000 N NA
 6985570 6985571 Pput_3444 Pput_3445     FALSE 0.168 125.000 0.059 1.000 N NA
 6985575 6985576 Pput_3449 Pput_3450     TRUE 0.748 114.000 0.667 NA   NA
 6985576 6985577 Pput_3450 Pput_3451     TRUE 0.546 29.000 0.031 NA   NA
 6985578 6985579 Pput_3452 Pput_3453     TRUE 0.995 6.000 0.535 1.000 Y NA
 6985580 6985581 Pput_3454 Pput_3455 greB   TRUE 0.735 12.000 0.024 NA   NA
 6985581 6985582 Pput_3455 Pput_3456     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 6985582 6985583 Pput_3456 Pput_3457     TRUE 0.638 112.000 0.444 NA   NA
 6985584 6985585 Pput_3458 Pput_3459     FALSE 0.217 128.000 0.089 NA N NA
 6985585 6985586 Pput_3459 Pput_3460     TRUE 0.670 76.000 0.312 NA   NA
 6985587 6985588 Pput_3461 Pput_3462     FALSE 0.430 77.000 0.116 NA   NA
 6985588 6985589 Pput_3462 Pput_3463     TRUE 0.786 15.000 0.062 NA   NA
 6985591 6985592 Pput_3465 Pput_3466     FALSE 0.071 182.000 0.017 1.000   NA
 6985592 6985593 Pput_3466 Pput_3467     FALSE 0.108 153.000 0.040 1.000 N NA
 6985593 6985594 Pput_3467 Pput_3468   clpX TRUE 0.716 165.000 0.201 0.079 Y NA
 6985594 6985595 Pput_3468 Pput_3469 clpX clpP TRUE 0.784 109.000 0.352 1.000 Y NA
 6985595 6985596 Pput_3469 Pput_3470 clpP tig TRUE 0.820 92.000 0.351 1.000 Y NA
 6985596 6985597 Pput_3470 Pput_3471 tig   FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 6985597 6985598 Pput_3471 Pput_R0056     FALSE 0.038 189.000 0.000 NA   NA
 6985598 6985599 Pput_R0056 Pput_R0057     FALSE 0.301 37.000 0.000 NA   NA
 6985599 6985600 Pput_R0057 Pput_R0058     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6985600 6985601 Pput_R0058 Pput_R0059     FALSE 0.278 42.000 0.000 NA   NA
 6985603 6985604 Pput_3473 Pput_3474     TRUE 0.571 40.000 0.056 NA   NA
 6985604 6985605 Pput_3474 Pput_3475     TRUE 0.986 13.000 0.854 NA   NA
 6985605 6985606 Pput_3475 Pput_3476     TRUE 0.999 4.000 0.922 0.049 Y NA
 6985606 6985607 Pput_3476 Pput_3477     TRUE 0.999 -3.000 0.847 0.049 Y NA
 6985607 6985608 Pput_3477 Pput_3478     TRUE 0.999 0.000 0.865 0.002 Y NA
 6985610 6985611 Pput_3480 Pput_3481     TRUE 0.991 14.000 0.667 1.000 Y NA
 6985612 6985613 Pput_3482 Pput_3483     FALSE 0.010 228.000 0.000 1.000 N NA
 6985613 6985614 Pput_3483 Pput_3484     TRUE 0.590 45.000 0.102 1.000 N NA
 6985614 6985615 Pput_3484 Pput_3485     TRUE 0.993 17.000 0.571 0.004 Y NA
 6985615 6985616 Pput_3485 Pput_3486     FALSE 0.060 153.000 0.000 NA   NA
 6985618 6985619 Pput_3488 Pput_3489     FALSE 0.032 143.000 0.000 1.000 N NA
 6985620 6985621 Pput_3490 Pput_3491     TRUE 0.626 113.000 0.429 NA   NA
 6985621 6985622 Pput_3491 Pput_3492     TRUE 0.959 13.000 0.429 NA N NA
 6985623 6985624 Pput_3493 Pput_3494     FALSE 0.082 126.000 0.000 1.000   NA
 6985625 6985626 Pput_3495 Pput_3496     FALSE 0.073 61.000 0.000 NA N NA
 6985628 6985629 Pput_3498 Pput_R0060     FALSE 0.038 188.000 0.000 NA   NA
 6985629 6985630 Pput_R0060 Pput_R0061     FALSE 0.073 114.000 0.000 NA   NA
 6985630 6985631 Pput_R0061 Pput_R0062     FALSE 0.017 242.000 0.000 NA   NA
 6985631 6985632 Pput_R0062 Pput_R0063     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6985632 6985633 Pput_R0063 Pput_R0064     FALSE 0.102 85.000 0.000 NA   NA
 6985638 6985639 Pput_3503 Pput_3504     TRUE 0.961 -16.000 0.221 1.000   NA
 6985640 6985641 Pput_3505 Pput_3506     FALSE 0.118 82.000 0.000 1.000   NA
 6985644 6985645 Pput_3509 Pput_3510     FALSE 0.077 150.000 0.026 1.000 N NA
 6985645 6985646 Pput_3510 Pput_3511     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.004 Y NA
 6985646 6985647 Pput_3511 Pput_3512     TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.004 Y NA
 6985647 6985648 Pput_3512 Pput_3513     TRUE 0.998 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 6985648 6985649 Pput_3513 Pput_3514     TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.061 Y NA
 6985649 6985650 Pput_3514 Pput_3515     TRUE 0.998 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 6985651 6985652 Pput_3516 Pput_3517     TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 6985652 6985653 Pput_3517 Pput_3518     FALSE 0.007 332.000 0.000 NA   NA
 6985653 6985654 Pput_3518 Pput_3519     FALSE 0.044 178.000 0.000 NA   NA
 6985656 6985657 Pput_3521 Pput_3522     TRUE 0.972 14.000 0.222 1.000 Y NA
 6985657 6985658 Pput_3522 Pput_3523     TRUE 0.994 9.000 0.529 1.000 Y NA
 6985658 6985659 Pput_3523 Pput_3524     TRUE 0.992 12.000 0.575 1.000 Y NA
 6985659 6985660 Pput_3524 Pput_3525     TRUE 0.973 14.000 0.100 0.066 Y NA
 6985660 6985661 Pput_3525 Pput_3526     FALSE 0.083 120.000 0.000 1.000   NA
 6985661 6985662 Pput_3526 Pput_3527     FALSE 0.072 147.000 0.000 1.000   NA
 6985662 6985663 Pput_3527 Pput_3528     FALSE 0.316 201.000 0.000 0.071 Y NA
 6985664 6985665 Pput_3529 Pput_3530     TRUE 0.733 35.000 0.030 0.066   NA
 6985667 6985668 Pput_3532 Pput_3533     FALSE 0.013 264.000 0.000 NA   NA
 6985668 6985669 Pput_3533 Pput_3534     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6985669 6985670 Pput_3534 Pput_3535     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6985670 6985671 Pput_3535 Pput_3536     FALSE 0.172 76.000 0.016 NA   NA
 6985672 6985673 Pput_3537 Pput_3538     TRUE 0.844 14.000 0.087 NA   NA
 6985673 6985674 Pput_3538 Pput_3539     FALSE 0.271 43.000 0.000 NA   NA
 6985674 6985675 Pput_3539 Pput_3540     TRUE 0.638 23.000 0.039 NA   NA
 6985675 6985676 Pput_3540 Pput_3541     FALSE 0.059 156.000 0.000 NA   NA
 6985676 6985677 Pput_3541 Pput_3542     TRUE 0.863 26.000 0.031 1.000 Y NA
 6985679 6985680 Pput_3544 Pput_3545     FALSE 0.442 228.000 0.286 1.000 Y NA
 6985686 6985687 Pput_3551 Pput_3552     TRUE 0.989 -3.000 0.175 0.002   NA
 6985687 6985688 Pput_3552 Pput_3553     TRUE 0.991 -3.000 0.466 1.000   NA
 6985688 6985689 Pput_3553 Pput_3554     TRUE 0.999 -6.000 0.870 0.008 Y NA
 6985689 6985690 Pput_3554 Pput_3555     FALSE 0.002 402.000 0.000 NA N NA
 6985690 6985691 Pput_3555 Pput_3556     FALSE 0.027 123.000 0.000 NA N NA
 6985691 6985692 Pput_3556 Pput_3557     FALSE 0.020 184.000 0.000 1.000 N NA
 6985692 6985693 Pput_3557 Pput_3558     FALSE 0.161 70.000 0.000 1.000   NA
 6985693 6985694 Pput_3558 Pput_3559     FALSE 0.152 72.000 0.000 1.000   NA
 6985694 6985695 Pput_3559 Pput_3560     TRUE 0.862 28.000 0.226 1.000   NA
 6985696 6985697 Pput_3561 Pput_3562     TRUE 0.609 100.000 0.424 1.000 N NA
 6985697 6985698 Pput_3562 Pput_3563     FALSE 0.328 82.000 0.000 0.065   NA
 6985698 6985699 Pput_3563 Pput_3564     FALSE 0.077 137.000 0.000 1.000   NA
 6985700 6985701 Pput_3565 Pput_3566     TRUE 0.828 -3.000 0.000 1.000   NA
 6985701 6985702 Pput_3566 Pput_3567     FALSE 0.004 439.000 0.000 NA   NA
 6985702 6985703 Pput_3567 Pput_3568     FALSE 0.039 187.000 0.000 NA   NA
 6985708 6985709 Pput_3573 Pput_3574     FALSE 0.103 157.000 0.039 1.000 N NA
 6985709 6985710 Pput_3574 Pput_3575     FALSE 0.043 180.000 0.000 NA   NA
 6985711 6985712 Pput_3576 Pput_3577     TRUE 0.995 -3.000 0.408 NA Y NA
 6985715 6985716 Pput_3580 Pput_3581     TRUE 0.591 123.000 0.375 NA   NA
 6985717 6985718 Pput_3582 Pput_3583 queF   FALSE 0.270 69.000 0.027 1.000   NA
 6985719 6985720 Pput_3584 Pput_3585     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.002 Y NA
 6985721 6985722 Pput_3586 Pput_3587     TRUE 0.921 61.000 0.620 0.063 N NA
 6985722 6985723 Pput_3587 Pput_3588     TRUE 0.928 -7.000 0.025 0.063 N NA
 6985724 6985725 Pput_3589 Pput_3590     TRUE 0.810 32.000 0.192 NA   NA
 6985726 6985727 Pput_3591 Pput_3592     FALSE 0.033 205.000 0.021 1.000 N NA
 6985727 6985728 Pput_3592 Pput_3593     FALSE 0.021 180.000 0.000 1.000 N NA
 6985729 6985730 Pput_3594 Pput_3595     TRUE 0.888 10.000 0.071 NA   NA
 6985730 6985731 Pput_3595 Pput_3596     TRUE 0.927 5.000 0.091 NA   NA
 6985732 6985733 Pput_3597 Pput_3598     FALSE 0.059 178.000 0.028 1.000 N NA
 6985734 6985735 Pput_3599 Pput_3600     TRUE 0.846 14.000 0.122 1.000 N NA
 6985736 6985737 Pput_3601 Pput_3602     TRUE 0.641 51.000 0.130 NA   NA
 6985737 6985738 Pput_3602 Pput_3603     TRUE 0.542 16.000 0.007 NA   NA
 6985738 6985739 Pput_3603 Pput_3604     FALSE 0.093 101.000 0.007 NA   NA
 6985739 6985740 Pput_3604 Pput_3605   fadA FALSE 0.355 76.000 0.070 NA   NA
 6985740 6985741 Pput_3605 Pput_3606 fadA fadB TRUE 0.977 32.000 0.607 1.000 Y NA
 6985741 6985742 Pput_3606 Pput_3607 fadB   FALSE 0.003 612.000 0.000 NA   NA
 6985746 6985747 Pput_3611 Pput_3612     TRUE 0.600 56.000 0.116 1.000   NA
 6985748 6985749 Pput_3613 Pput_3614     FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 6985749 6985750 Pput_3614 Pput_3615     TRUE 0.992 -10.000 0.190 0.027 Y NA
 6985753 6985754 Pput_3618 Pput_3619     TRUE 0.991 -7.000 0.073 0.002 Y NA
 6985755 6985756 Pput_3620 Pput_R0065     FALSE 0.107 81.000 0.000 NA   NA
 6985757 6985758 Pput_3621 Pput_3622     FALSE 0.036 121.000 0.000 1.000 N NA
 6985760 6985761 Pput_3624 Pput_3625     FALSE 0.137 61.000 0.009 1.000 N NA
 6985761 6985762 Pput_3625 Pput_3626     FALSE 0.007 793.000 0.047 NA   NA
 6985763 6985764 Pput_3627 Pput_3628 acnA   FALSE 0.010 251.000 0.004 1.000 N NA
 6985765 6985766 Pput_3629 Pput_3630     FALSE 0.520 31.000 0.030 NA   NA
 6985766 6985767 Pput_3630 Pput_3631     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6985767 6985768 Pput_3631 Pput_3632     FALSE 0.073 109.000 0.000 NA   NA
 6985768 6985769 Pput_3632 Pput_3633     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6985770 6985771 Pput_3634 Pput_3635     TRUE 0.838 10.000 0.040 NA   NA
 6985771 6985772 Pput_3635 Pput_3636     TRUE 0.939 -3.000 0.065 NA   NA
 6985772 6985773 Pput_3636 Pput_3637     FALSE 0.301 58.000 0.024 NA   NA
 6985773 6985774 Pput_3637 Pput_3638     FALSE 0.005 283.000 0.000 1.000 N NA
 6985774 6985775 Pput_3638 Pput_3639     TRUE 0.980 9.000 0.037 0.021 Y NA
 6985775 6985776 Pput_3639 Pput_3640     FALSE 0.410 42.000 0.024 NA   NA
 6985776 6985777 Pput_3640 Pput_3641     FALSE 0.047 201.000 0.016 NA   NA
 6985778 6985779 Pput_3642 Pput_3643   rlmL FALSE 0.067 95.000 0.010 1.000 N NA
 6985782 6985783 Pput_3646 Pput_3647     TRUE 0.923 12.000 0.218 NA N NA
 6985783 6985784 Pput_3647 Pput_3648     FALSE 0.020 185.000 0.000 1.000 N NA
 6985784 6985785 Pput_3648 Pput_3649     TRUE 0.966 10.000 0.337 1.000 N NA
 6985785 6985786 Pput_3649 Pput_3650     TRUE 0.594 28.000 0.057 1.000 N NA
 6985787 6985788 Pput_3651 Pput_3652     FALSE 0.211 112.000 0.080 1.000 N NA
 6985788 6985789 Pput_3652 Pput_3653     FALSE 0.513 114.000 0.279 1.000   NA
 6985789 6985790 Pput_3653 Pput_3654     TRUE 0.974 3.000 0.256 NA   NA
 6985790 6985791 Pput_3654 Pput_3655     FALSE 0.344 88.000 0.093 NA   NA
 6985791 6985792 Pput_3655 Pput_3656     TRUE 0.679 28.000 0.093 NA N NA
 6985792 6985793 Pput_3656 Pput_3657     FALSE 0.023 359.000 0.113 NA N NA
 6985793 6985794 Pput_3657 Pput_3658     FALSE 0.191 67.000 0.029 NA N NA
 6985799 6985800 Pput_3663 Pput_3664     FALSE 0.010 228.000 0.000 1.000 N NA
 6985800 6985801 Pput_3664 Pput_3665     TRUE 0.989 6.000 0.750 NA N NA
 6985801 6985802 Pput_3665 Pput_3666     FALSE 0.352 111.000 0.000 NA Y NA
 6985802 6985803 Pput_3666 Pput_3667     FALSE 0.008 308.000 0.000 NA   NA
 6985803 6985804 Pput_3667 Pput_3668     TRUE 0.991 0.000 0.500 NA   NA
 6985806 6985807 Pput_3670 Pput_3671     FALSE 0.273 20.000 0.000 1.000 N NA
 6985807 6985808 Pput_3671 Pput_3672     FALSE 0.234 109.000 0.094 1.000 N NA
 6985808 6985809 Pput_3672 Pput_3673     FALSE 0.024 170.000 0.000 1.000 N NA
 6985809 6985810 Pput_3673 Pput_3674     FALSE 0.037 104.000 0.000 1.000 N NA
 6985810 6985811 Pput_3674 Pput_3675     TRUE 0.601 202.000 0.600 0.095 N NA
 6985811 6985812 Pput_3675 Pput_3676     TRUE 0.983 -10.000 0.429 1.000   NA
 6985812 6985813 Pput_3676 Pput_3677     FALSE 0.175 67.000 0.000 1.000   NA
 6985814 6985815 Pput_3678 Pput_3679     TRUE 0.988 -3.000 0.435 1.000 N NA
 6985816 6985817 Pput_3680 Pput_3681     FALSE 0.064 147.000 0.000 NA   NA
 6985818 6985819 Pput_3682 Pput_3683     TRUE 0.862 64.000 0.333 0.061   NA
 6985819 6985820 Pput_3683 Pput_3684     TRUE 0.798 115.000 0.385 1.000 Y NA
 6985820 6985821 Pput_3684 Pput_3685     TRUE 0.748 72.000 0.385 NA   NA
 6985822 6985823 Pput_3686 Pput_3687     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 6985826 6985827 Pput_3690 Pput_3691     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6985827 6985828 Pput_3691 Pput_3692     TRUE 0.970 0.000 0.185 NA   NA
 6985828 6985829 Pput_3692 Pput_3693     TRUE 0.648 34.000 0.094 1.000 N NA
 6985829 6985830 Pput_3693 Pput_3694     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 6985831 6985832 Pput_3695 Pput_3696     FALSE 0.038 102.000 0.000 1.000 N NA
 6985833 6985834 Pput_3697 Pput_3698     TRUE 0.748 -7.000 0.000 NA   NA
 6985834 6985835 Pput_3698 Pput_3699     TRUE 0.946 0.000 0.080 NA   NA
 6985835 6985836 Pput_3699 Pput_3700     TRUE 0.991 11.000 1.000 NA   NA
 6985838 6985839 Pput_3702 Pput_3703     TRUE 0.632 63.000 0.222 NA N NA
 6985839 6985840 Pput_3703 Pput_3704     TRUE 0.982 15.000 0.400 1.000 Y NA
 6985841 6985842 Pput_3705 Pput_3706     TRUE 0.825 45.000 0.333 1.000 N NA
 6985842 6985843 Pput_3706 Pput_3707     FALSE 0.031 149.000 0.000 1.000 N NA
 6985843 6985844 Pput_3707 Pput_3708     FALSE 0.075 60.000 0.000 NA N NA
 6985846 6985847 Pput_3710 Pput_3711     TRUE 0.959 -7.000 0.179 NA   NA
 6985847 6985848 Pput_3711 Pput_3712     TRUE 0.991 -3.000 0.484 NA   NA
 6985848 6985849 Pput_3712 Pput_3713     TRUE 0.969 -7.000 0.233 NA   NA
 6985849 6985850 Pput_3713 Pput_3714     TRUE 0.978 -3.000 0.233 NA   NA
 6985850 6985851 Pput_3714 Pput_3715     TRUE 0.980 -3.000 0.258 NA   NA
 6985853 6985854 Pput_3717 Pput_3718     TRUE 0.993 -3.000 0.669 1.000 N NA
 6985854 6985855 Pput_3718 Pput_3719     TRUE 0.718 -3.000 0.009 NA N NA
 6985856 6985857 Pput_3720 Pput_3721     FALSE 0.319 123.000 0.125 NA   NA
 6985857 6985858 Pput_3721 Pput_3722     TRUE 0.925 -46.000 0.125 NA   NA
 6985858 6985859 Pput_3722 Pput_3723     FALSE 0.061 152.000 0.000 NA   NA
 6985859 6985860 Pput_3723 Pput_3724     TRUE 0.994 -3.000 0.409 0.060   NA
 6985860 6985861 Pput_3724 Pput_3725   pepN FALSE 0.014 272.000 0.000 1.000   NA
 6985861 6985862 Pput_3725 Pput_3726 pepN   TRUE 0.798 14.000 0.059 NA   NA
 6985862 6985863 Pput_3726 Pput_3727     TRUE 0.969 -3.000 0.168 NA   NA
 6985863 6985864 Pput_3727 Pput_3728     TRUE 0.873 14.000 0.124 NA   NA
 6985864 6985865 Pput_3728 Pput_3729     TRUE 0.965 -3.000 0.131 1.000   NA
 6985865 6985866 Pput_3729 Pput_3730   ppnK TRUE 0.923 0.000 0.045 1.000   NA
 6985867 6985868 Pput_3731 Pput_3732     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 6985869 6985870 Pput_3733 Pput_3734     FALSE 0.090 237.000 0.040 0.065 N NA
 6985870 6985871 Pput_3734 Pput_3735     FALSE 0.006 264.000 0.000 1.000 N NA
 6985871 6985872 Pput_3735 Pput_3736     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 6985872 6985873 Pput_3736 Pput_3737     FALSE 0.011 287.000 0.000 NA   NA
 6985874 6985875 Pput_3738 Pput_3739     FALSE 0.351 30.000 0.000 NA   NA
 6985875 6985876 Pput_3739 Pput_3740     FALSE 0.026 213.000 0.000 NA   NA
 6985877 6985878 Pput_3741 Pput_3742     FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 6985879 6985880 Pput_3743 Pput_3744     TRUE 0.708 32.000 0.000 0.036   NA
 6985880 6985881 Pput_3744 Pput_3745     TRUE 0.964 44.000 0.667 0.036   NA
 6985883 6985884 Pput_3747 Pput_3748     TRUE 0.777 26.000 0.105 1.000   NA
 6985884 6985885 Pput_3748 Pput_3749     FALSE 0.156 71.000 0.000 1.000   NA
 6985885 6985886 Pput_3749 Pput_3750     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.021 Y NA
 6985886 6985887 Pput_3750 Pput_3751     TRUE 0.650 85.000 0.000 0.021 Y NA
 6985887 6985888 Pput_3751 Pput_3752     TRUE 0.934 70.000 0.333 0.021 Y NA
 6985888 6985889 Pput_3752 Pput_3753     FALSE 0.483 118.000 0.250 1.000   NA
 6985889 6985890 Pput_3753 Pput_3754     TRUE 0.911 72.000 1.000 1.000   NA
 6985890 6985891 Pput_3754 Pput_3755     TRUE 0.941 84.000 0.875 1.000 Y NA
 6985891 6985892 Pput_3755 Pput_3756     FALSE 0.054 173.000 0.000 1.000   NA
 6985892 6985893 Pput_3756 Pput_3757     TRUE 0.947 -13.000 0.154 1.000   NA
 6985894 6985895 Pput_3758 Pput_R0066     FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 6985895 6985896 Pput_R0066 Pput_R0067     FALSE 0.066 142.000 0.000 NA   NA
 6985896 6985897 Pput_R0067 Pput_R0068     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 6985897 6985898 Pput_R0068 Pput_R0069     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6985898 6985899 Pput_R0069 Pput_3759     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 6985899 6985900 Pput_3759 Pput_3760     TRUE 0.870 -3.000 0.033 1.000 N NA
 6985900 6985901 Pput_3760 Pput_3761     TRUE 0.835 17.000 0.153 1.000 N NA
 6985901 6985902 Pput_3761 Pput_3762     TRUE 0.823 43.000 0.262 1.000   NA
 6985902 6985903 Pput_3762 Pput_3763     FALSE 0.160 198.000 0.116 NA   NA
 6985903 6985904 Pput_3763 Pput_3764     TRUE 0.958 -16.000 0.216 NA   NA
 6985904 6985905 Pput_3764 Pput_3765     TRUE 0.985 0.000 0.383 1.000 N NA
 6985905 6985906 Pput_3765 Pput_3766     FALSE 0.016 221.000 0.007 1.000 N NA
 6985906 6985907 Pput_3766 Pput_3767   truA FALSE 0.528 62.000 0.139 1.000 N NA
 6985907 6985908 Pput_3767 Pput_3768 truA   TRUE 0.870 0.000 0.035 1.000 N NA
 6985908 6985909 Pput_3768 Pput_3769     FALSE 0.131 72.000 0.017 1.000 N NA
 6985909 6985910 Pput_3769 Pput_3770     FALSE 0.055 1100.000 0.025 0.000 Y NA
 6985910 6985911 Pput_3770 Pput_3771     TRUE 0.911 64.000 0.196 0.030 Y NA
 6985911 6985912 Pput_3771 Pput_3772     FALSE 0.252 55.000 0.026 1.000 N NA
 6985912 6985913 Pput_3772 Pput_3773   leuD FALSE 0.170 117.000 0.060 1.000 N NA
 6985913 6985914 Pput_3773 Pput_3774 leuD   TRUE 0.998 -3.000 0.463 0.001 Y NA
 6985915 6985916 Pput_3775 Pput_3776     TRUE 0.558 62.000 0.163 1.000 N NA
 6985917 6985918 Pput_3777 Pput_3778     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6985918 6985919 Pput_3778 Pput_3779     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 6985919 6985920 Pput_3779 Pput_3780     FALSE 0.388 52.000 0.029 1.000   NA
 6985920 6985921 Pput_3780 Pput_3781     FALSE 0.244 104.000 0.070 NA   NA
 6985921 6985922 Pput_3781 Pput_3782     TRUE 0.697 16.000 0.035 NA   NA
 6985922 6985923 Pput_3782 Pput_R0070     FALSE 0.049 171.000 0.000 NA   NA
 6985923 6985924 Pput_R0070 Pput_R0071     FALSE 0.271 43.000 0.000 NA   NA
 6985924 6985925 Pput_R0071 Pput_R0072     FALSE 0.177 62.000 0.000 NA   NA
 6985925 6985926 Pput_R0072 Pput_R0073     FALSE 0.271 43.000 0.000 NA   NA
 6985926 6985927 Pput_R0073 Pput_R0074     FALSE 0.222 52.000 0.000 NA   NA
 6985927 6985928 Pput_R0074 Pput_R0075     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6985928 6985929 Pput_R0075 Pput_3783   gltX FALSE 0.006 346.000 0.000 NA   NA
 6985930 6985931 Pput_3784 Pput_3785     TRUE 0.969 -10.000 0.250 1.000   NA
 6985933 6985934 Pput_3787 Pput_R0076     FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 6985935 6985936 Pput_3788 Pput_3789     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 6985936 6985937 Pput_3789 Pput_3790     TRUE 0.860 11.000 0.062 NA   NA
 6985937 6985938 Pput_3790 Pput_3791     TRUE 0.711 67.000 0.286 NA   NA
 6985938 6985939 Pput_3791 Pput_3792     FALSE 0.179 257.000 0.357 1.000 N NA
 6985939 6985940 Pput_3792 Pput_3793     FALSE 0.001 984.000 0.000 NA N NA
 6985940 6985941 Pput_3793 Pput_3794     TRUE 0.900 31.000 0.110 NA Y NA
 6985941 6985942 Pput_3794 Pput_3795   tmk TRUE 0.978 -7.000 0.211 0.078 N NA
 6985942 6985943 Pput_3795 Pput_3796 tmk   TRUE 0.949 10.000 0.209 NA   NA
 6985943 6985944 Pput_3796 Pput_3797     TRUE 0.960 5.000 0.204 NA   NA
 6985944 6985945 Pput_3797 Pput_3798     TRUE 0.965 0.000 0.187 1.000 N NA
 6985945 6985946 Pput_3798 Pput_3799     TRUE 0.644 188.000 0.346 1.000 Y NA
 6985946 6985947 Pput_3799 Pput_3800   fabG TRUE 0.746 204.000 0.321 0.002 Y NA
 6985947 6985948 Pput_3800 Pput_3801 fabG   TRUE 0.992 16.000 0.432 0.002 Y NA
 6985948 6985949 Pput_3801 Pput_3802     TRUE 0.767 128.000 0.106 0.002 Y NA
 6985949 6985950 Pput_3802 Pput_3803   rpmF TRUE 0.893 34.000 0.418 1.000 N NA
 6985950 6985951 Pput_3803 Pput_3804 rpmF   TRUE 0.974 14.000 0.599 NA   NA
 6985953 6985954 Pput_3806 Pput_3807     TRUE 0.940 7.000 0.134 1.000   NA
 6985954 6985955 Pput_3807 Pput_3808     TRUE 0.983 4.000 0.389 1.000   NA
 6985957 6985958 Pput_3810 Pput_3811 murB   TRUE 0.906 -3.000 0.050 1.000 N NA
 6985958 6985959 Pput_3811 Pput_3812     TRUE 0.902 0.000 0.050 1.000 N NA
 6985959 6985960 Pput_3812 Pput_3813     TRUE 0.981 -3.000 0.265 NA   NA
 6985960 6985961 Pput_3813 Pput_3814   lpxK TRUE 0.807 45.000 0.263 NA   NA
 6985961 6985962 Pput_3814 Pput_3815 lpxK   TRUE 0.941 0.000 0.096 1.000 N NA
 6985962 6985963 Pput_3815 Pput_3816     TRUE 0.999 -3.000 0.746 0.062 Y NA
 6985963 6985964 Pput_3816 Pput_3817     FALSE 0.190 117.000 0.045 1.000   NA
 6985966 6985967 Pput_3819 Pput_3820     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.077 Y NA
 6985967 6985968 Pput_3820 Pput_3821     FALSE 0.121 134.000 0.039 1.000 N NA
 6985969 6985970 Pput_3822 Pput_3823 fadE   FALSE 0.369 80.000 0.090 NA   NA
 6985970 6985971 Pput_3823 Pput_3824     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6985971 6985972 Pput_3824 Pput_3825     TRUE 0.976 56.000 1.000 1.000 Y NA
 6985973 6985974 Pput_3826 Pput_3827     FALSE 0.136 72.000 0.000 NA   NA
 6985974 6985975 Pput_3827 Pput_3828     FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 6985975 6985976 Pput_3828 Pput_3829     FALSE 0.009 301.000 0.000 NA   NA
 6985976 6985977 Pput_3829 Pput_3830     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6985977 6985978 Pput_3830 Pput_3831     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6985978 6985979 Pput_3831 Pput_3832     FALSE 0.047 174.000 0.000 NA   NA
 6985980 6985981 Pput_3833 Pput_3834     TRUE 0.728 5.000 0.000 NA   NA
 6985981 6985982 Pput_3834 Pput_3835     FALSE 0.012 271.000 0.000 NA   NA
 6985982 6985983 Pput_3835 Pput_3836     TRUE 0.986 0.000 0.111 1.000 Y NA
 6985984 6985985 Pput_R0077 Pput_R0078     FALSE 0.100 86.000 0.000 NA   NA
 6985985 6985986 Pput_R0078 Pput_R0079     TRUE 0.745 4.000 0.000 NA   NA
 6985986 6985987 Pput_R0079 Pput_R0080     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 6985987 6985988 Pput_R0080 Pput_R0081     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6985990 6985991 Pput_3838 Pput_3839     TRUE 0.856 1.000 0.019 NA   NA
 6985993 6985994 Pput_3841 Pput_3842     TRUE 0.926 14.000 0.036 1.000 Y NA
 6985995 6985996 Pput_3843 Pput_3844     FALSE 0.007 293.000 0.008 1.000 N NA
 6985999 6986000 Pput_3847 Pput_3848     FALSE 0.003 352.000 0.000 1.000 N NA
 6986005 6986006 Pput_3853 Pput_3854     TRUE 0.870 59.000 0.086 0.069 Y NA
 6986006 6986007 Pput_3854 Pput_3855     FALSE 0.471 141.000 0.314 1.000 N NA
 6986008 6986009 Pput_3856 Pput_3857     TRUE 0.563 49.000 0.074 NA   NA
 6986014 6986015 Pput_3862 Pput_3863     FALSE 0.025 216.000 0.000 NA   NA
 6986015 6986016 Pput_3863 Pput_3864     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 6986018 6986019 Pput_3865 Pput_3866     FALSE 0.364 120.000 0.000 1.000 Y NA
 6986019 6986020 Pput_3866 Pput_3867     FALSE 0.395 69.000 0.022 0.093 N NA
 6986023 6986024 Pput_3870 Pput_3871     FALSE 0.046 175.000 0.000 NA   NA
 6986024 6986025 Pput_3871 Pput_3872     FALSE 0.204 207.000 0.200 NA   NA
 6986025 6986026 Pput_3872 Pput_3873     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 6986028 6986029 Pput_3875 Pput_3876     TRUE 0.677 61.000 0.211 NA   NA
 6986031 6986032 Pput_3878 Pput_3879     TRUE 0.894 0.000 0.026 1.000   NA
 6986032 6986033 Pput_3879 Pput_3880     FALSE 0.164 164.000 0.055 1.000   NA
 6986034 6986035 Pput_3881 Pput_3882     TRUE 0.655 66.000 0.219 NA   NA
 6986035 6986036 Pput_3882 Pput_3883     FALSE 0.012 273.000 0.000 NA   NA
 6986038 6986039 Pput_3885 Pput_3886     TRUE 0.602 86.000 0.292 NA   NA
 6986039 6986040 Pput_3886 Pput_3887     FALSE 0.004 564.000 0.008 NA   NA
 6986040 6986041 Pput_3887 Pput_3888   folE FALSE 0.169 71.000 0.008 NA   NA
 6986041 6986042 Pput_3888 Pput_3889 folE   FALSE 0.463 60.000 0.090 1.000 N NA
 6986053 6986054 Pput_3900 Pput_3901     FALSE 0.009 296.000 0.000 NA   NA
 6986055 6986056 Pput_3902 Pput_3903     TRUE 0.978 14.000 0.306 NA Y NA
 6986056 6986057 Pput_3903 Pput_3904     TRUE 0.896 55.000 0.257 NA Y NA
 6986057 6986058 Pput_3904 Pput_3905     TRUE 0.924 20.000 0.086 NA Y NA
 6986058 6986059 Pput_3905 Pput_3906     TRUE 0.621 117.000 0.000 0.001 Y NA
 6986059 6986060 Pput_3906 Pput_3907     FALSE 0.032 402.000 0.000 1.000 Y NA
 6986060 6986061 Pput_3907 Pput_3908     TRUE 0.687 50.000 0.000 1.000 Y NA
 6986061 6986062 Pput_3908 Pput_3909     TRUE 0.910 30.000 0.018 0.029 Y NA
 6986064 6986065 Pput_3911 Pput_3912     FALSE 0.009 302.000 0.000 NA   NA
 6986065 6986066 Pput_3912 Pput_3913     TRUE 0.995 -60.000 0.315 0.001 Y NA
 6986066 6986067 Pput_3913 Pput_3914     TRUE 0.971 -3.000 0.176 1.000   NA
 6986067 6986068 Pput_3914 Pput_3915     TRUE 0.988 8.000 0.392 0.064   NA
 6986068 6986069 Pput_3915 Pput_3916     TRUE 0.918 5.000 0.000 0.064   NA
 6986069 6986070 Pput_3916 Pput_3917     TRUE 0.821 0.000 0.000 1.000   NA
 6986070 6986071 Pput_3917 Pput_3918     TRUE 0.745 4.000 0.000 NA   NA
 6986071 6986072 Pput_3918 Pput_3919     FALSE 0.002 1104.000 0.000 NA   NA
 6986073 6986074 Pput_3920 Pput_3921     TRUE 0.978 10.000 0.259 0.012 N NA
 6986075 6986076 Pput_3922 Pput_3923     FALSE 0.003 504.000 0.000 NA   NA
 6986076 6986077 Pput_3923 Pput_3924     TRUE 0.975 0.000 0.028 1.000 Y NA
 6986077 6986078 Pput_3924 Pput_3925     TRUE 0.990 -10.000 0.155 0.077 Y NA
 6986078 6986079 Pput_3925 Pput_3926     TRUE 0.732 7.000 0.000 1.000   NA
 6986079 6986080 Pput_3926 Pput_3927     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 6986080 6986081 Pput_3927 Pput_3928     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6986081 6986082 Pput_3928 Pput_3929     TRUE 0.970 3.000 0.035 NA Y NA
 6986082 6986083 Pput_3929 Pput_3930     TRUE 0.671 -10.000 0.015 NA N NA
 6986083 6986084 Pput_3930 Pput_3931     TRUE 0.753 5.000 0.000 1.000   NA
 6986085 6986086 Pput_3932 Pput_3933     TRUE 0.742 37.000 0.150 NA   NA
 6986086 6986087 Pput_3933 Pput_3934     TRUE 0.993 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 6986087 6986088 Pput_3934 Pput_3935     TRUE 0.994 -3.000 0.084 0.002 Y NA
 6986088 6986089 Pput_3935 Pput_3936     FALSE 0.094 261.000 0.000 1.000 Y NA
 6986089 6986090 Pput_3936 Pput_3937     TRUE 0.562 84.000 0.041 1.000 Y NA
 6986090 6986091 Pput_3937 Pput_3938     TRUE 0.787 85.000 0.250 1.000 Y NA
 6986091 6986092 Pput_3938 Pput_3939     FALSE 0.053 135.000 0.009 1.000 N NA
 6986092 6986093 Pput_3939 Pput_3940     FALSE 0.077 103.000 0.000 NA   NA
 6986093 6986094 Pput_3940 Pput_3941   ihfB TRUE 0.738 22.000 0.069 NA   NA
 6986094 6986095 Pput_3941 Pput_3942 ihfB rpsA FALSE 0.031 608.000 0.292 1.000 N NA
 6986095 6986096 Pput_3942 Pput_3943 rpsA cmk FALSE 0.465 125.000 0.281 1.000 N NA
 6986096 6986097 Pput_3943 Pput_3944 cmk   TRUE 0.952 6.000 0.209 1.000 N NA
 6986097 6986098 Pput_3944 Pput_3945     FALSE 0.392 159.000 0.035 1.000 Y NA
 6986098 6986099 Pput_3945 Pput_3946     TRUE 0.985 2.000 0.121 1.000 Y NA
 6986099 6986100 Pput_3946 Pput_3947     FALSE 0.183 113.000 0.067 1.000 N NA
 6986100 6986101 Pput_3947 Pput_3948   mtnA FALSE 0.004 363.000 0.007 1.000 N NA
 6986102 6986103 Pput_3949 Pput_3950     TRUE 0.976 3.000 0.259 1.000   NA
 6986103 6986104 Pput_3950 Pput_3951     FALSE 0.497 98.000 0.098 0.064   NA
 6986105 6986106 Pput_3952 Pput_3953     TRUE 0.968 1.000 0.222 NA N NA
 6986106 6986107 Pput_3953 Pput_3954     FALSE 0.056 289.000 0.158 1.000 N NA
 6986107 6986108 Pput_3954 Pput_3955     TRUE 0.981 -7.000 0.407 1.000 N NA
 6986108 6986109 Pput_3955 Pput_3956     TRUE 0.879 4.000 0.038 NA   NA
 6986109 6986110 Pput_3956 Pput_3957     FALSE 0.060 228.000 0.049 NA   NA
 6986110 6986111 Pput_3957 Pput_3958     TRUE 0.852 11.000 0.056 NA   NA
 6986113 6986114 Pput_3960 Pput_3961     FALSE 0.497 18.000 0.000 1.000   NA
 6986114 6986115 Pput_3961 Pput_3962     FALSE 0.018 237.000 0.000 NA   NA
 6986116 6986117 Pput_3963 Pput_3964 mnmC   FALSE 0.376 131.000 0.007 1.000 Y NA
 6986117 6986118 Pput_3964 Pput_3965     TRUE 0.986 4.000 0.514 1.000 N NA
 6986118 6986119 Pput_3965 Pput_3966     FALSE 0.519 171.000 0.471 1.000 N NA
 6986119 6986120 Pput_3966 Pput_3967     FALSE 0.242 84.000 0.045 NA   NA
 6986121 6986122 Pput_3968 Pput_3969     FALSE 0.250 121.000 0.071 1.000   NA
 6986124 6986125 Pput_3971 Pput_3972     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 6986125 6986126 Pput_3972 Pput_3973     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6986126 6986127 Pput_3973 Pput_3974     TRUE 0.663 75.000 0.286 1.000   NA
 6986127 6986128 Pput_3974 Pput_3975     FALSE 0.148 69.000 0.000 NA   NA
 6986128 6986129 Pput_3975 Pput_3976   actP FALSE 0.060 154.000 0.000 NA   NA
 6986129 6986130 Pput_3976 Pput_3977 actP   TRUE 0.994 -3.000 0.733 NA   NA
 6986130 6986131 Pput_3977 Pput_3978     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 6986134 6986135 Pput_3981 Pput_3982     TRUE 0.964 -7.000 0.204 NA   NA
 6986136 6986137 Pput_3983 Pput_3984     FALSE 0.219 146.000 0.069 1.000   NA
 6986138 6986139 Pput_3985 Pput_3986 minC   TRUE 0.833 110.000 0.466 1.000 Y NA
 6986139 6986140 Pput_3986 Pput_3987   minE TRUE 0.996 4.000 0.618 NA Y NA
 6986140 6986141 Pput_3987 Pput_3988 minE   FALSE 0.035 152.000 0.008 NA N NA
 6986141 6986142 Pput_3988 Pput_3989     FALSE 0.057 169.000 0.022 1.000 N NA
 6986142 6986143 Pput_3989 Pput_3990     FALSE 0.100 138.000 0.016 NA   NA
 6986143 6986144 Pput_3990 Pput_3991     TRUE 0.887 45.000 0.444 NA   NA
 6986146 6986147 Pput_3993 Pput_3994     TRUE 0.679 115.000 0.500 1.000   NA
 6986147 6986148 Pput_3994 Pput_3995     TRUE 0.968 9.000 0.290 1.000   NA
 6986148 6986149 Pput_3995 Pput_3996     TRUE 0.996 -10.000 0.774 0.048   NA
 6986149 6986150 Pput_3996 Pput_3997     TRUE 0.997 2.000 0.360 0.048 Y NA
 6986150 6986151 Pput_3997 Pput_3998     TRUE 0.969 15.000 0.222 1.000 Y NA
 6986153 6986154 Pput_4000 Pput_4001     FALSE 0.090 118.000 0.029 NA N NA
 6986155 6986156 Pput_4002 Pput_4003     TRUE 0.992 -3.000 0.562 NA   NA
 6986156 6986157 Pput_4003 Pput_4004     TRUE 0.672 115.000 0.500 NA   NA
 6986157 6986158 Pput_4004 Pput_4005     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 6986158 6986159 Pput_4005 Pput_4006     FALSE 0.005 287.000 0.000 1.000 N NA
 6986160 6986161 Pput_4007 Pput_4008     FALSE 0.472 198.000 0.500 NA   NA
 6986163 6986164 Pput_4010 Pput_4011     FALSE 0.050 221.000 0.050 1.000 N NA
 6986164 6986165 Pput_4011 Pput_4012     TRUE 0.838 19.000 0.032 0.063   NA
 6986165 6986166 Pput_4012 Pput_4013     TRUE 0.785 25.000 0.024 0.063   NA
 6986167 6986168 Pput_4014 Pput_4015     TRUE 0.997 0.000 0.656 0.000 N NA
 6986168 6986169 Pput_4015 Pput_4016     FALSE 0.152 280.000 0.000 0.045 Y NA
 6986171 6986172 Pput_R0083 Pput_R0084     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6986172 6986173 Pput_R0084 Pput_R0085     FALSE 0.049 171.000 0.000 NA   NA
 6986173 6986174 Pput_R0085 Pput_R0086     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6986175 6986176 Pput_4018 Pput_4019 rdgC   FALSE 0.002 395.000 0.000 1.000 N NA
 6986177 6986178 Pput_4020 Pput_4021     FALSE 0.206 158.000 0.000 0.063   NA
 6986178 6986179 Pput_4021 Pput_4022     TRUE 0.916 16.000 0.235 1.000   NA
 6986179 6986180 Pput_4022 Pput_4023     TRUE 0.552 95.000 0.326 1.000 N NA
 6986181 6986182 Pput_4024 Pput_4025     FALSE 0.073 127.000 0.000 NA   NA
 6986183 6986184 Pput_4026 Pput_4027     FALSE 0.004 431.000 0.000 NA   NA
 6986185 6986186 Pput_4028 Pput_4029     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 6986186 6986187 Pput_4029 Pput_4030     FALSE 0.351 147.000 0.182 NA   NA
 6986190 6986191 Pput_4033 Pput_4034     FALSE 0.336 47.000 0.017 NA   NA
 6986191 6986192 Pput_4034 Pput_4035     TRUE 0.926 -3.000 0.049 NA   NA
 6986192 6986193 Pput_4035 Pput_4036     TRUE 0.621 64.000 0.220 NA N NA
 6986193 6986194 Pput_4036 Pput_4037     FALSE 0.195 63.000 0.000 1.000   NA
 6986194 6986195 Pput_4037 Pput_4038   cobS FALSE 0.065 160.000 0.000 1.000   NA
 6986195 6986196 Pput_4038 Pput_4039 cobS   TRUE 0.795 2.000 0.021 1.000 N NA
 6986196 6986197 Pput_4039 Pput_4040   cobT TRUE 0.941 -3.000 0.090 1.000 N NA
 6986197 6986198 Pput_4040 Pput_4041 cobT cobU TRUE 0.988 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 6986198 6986199 Pput_4041 Pput_4042 cobU   TRUE 0.982 2.000 0.079 1.000 Y NA
 6986199 6986200 Pput_4042 Pput_4043     TRUE 0.965 -3.000 0.033 0.006 N NA
 6986200 6986201 Pput_4043 Pput_4044   cobD TRUE 0.993 -7.000 0.463 0.006 N NA
 6986201 6986202 Pput_4044 Pput_4045 cobD   TRUE 0.910 -3.000 0.053 1.000 N NA
 6986202 6986203 Pput_4045 Pput_4046     TRUE 0.929 -3.000 0.071 1.000 N NA
 6986203 6986204 Pput_4046 Pput_4047     TRUE 0.992 -3.000 0.054 0.006 Y NA
 6986204 6986205 Pput_4047 Pput_4048     FALSE 0.001 463.000 0.000 NA N NA
 6986205 6986206 Pput_4048 Pput_4049     TRUE 0.909 140.000 0.909 NA Y NA
 6986206 6986207 Pput_4049 Pput_4050     FALSE 0.047 128.000 0.010 NA N NA
 6986207 6986208 Pput_4050 Pput_4051     FALSE 0.151 240.000 0.217 NA   NA
 6986208 6986209 Pput_4051 Pput_4052     TRUE 0.771 22.000 0.087 NA   NA
 6986210 6986211 Pput_4053 Pput_4054   purN TRUE 0.997 0.000 0.230 0.001 Y NA
 6986211 6986212 Pput_4054 Pput_4055 purN   TRUE 0.888 9.000 0.065 NA   NA
 6986212 6986213 Pput_4055 Pput_4056     FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 6986214 6986215 Pput_4057 Pput_4058     TRUE 0.984 -3.000 0.312 NA   NA
 6986215 6986216 Pput_4058 Pput_4059     TRUE 0.968 5.000 0.250 NA   NA
 6986216 6986217 Pput_4059 Pput_4060     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 6986217 6986218 Pput_4060 Pput_4061   mazG FALSE 0.459 27.000 0.013 NA   NA
 6986218 6986219 Pput_4061 Pput_4062 mazG   FALSE 0.166 125.000 0.035 1.000   NA
 6986219 6986220 Pput_4062 Pput_4063   rumA FALSE 0.160 97.000 0.047 1.000 N NA
 6986220 6986221 Pput_4063 Pput_4064 rumA cysM TRUE 0.871 1.000 0.039 1.000 N NA
 6986221 6986222 Pput_4064 Pput_4065 cysM   FALSE 0.058 103.000 0.010 1.000 N NA
 6986222 6986223 Pput_4065 Pput_4066     TRUE 0.992 4.000 0.333 1.000 Y NA
 6986224 6986225 Pput_4067 Pput_4068     FALSE 0.127 77.000 0.020 1.000 N NA
 6986225 6986226 Pput_4068 Pput_4069     FALSE 0.458 32.000 0.020 NA   NA
 6986226 6986227 Pput_4069 Pput_4070     TRUE 0.964 -3.000 0.135 NA   NA
 6986229 6986230 Pput_4072 Pput_4073     TRUE 0.982 -3.000 0.112 0.045   NA
 6986230 6986231 Pput_4073 Pput_4074     TRUE 0.991 -7.000 0.657 NA   NA
 6986232 6986233 Pput_4075 Pput_4076     TRUE 0.668 5.000 0.015 NA N NA
 6986234 6986235 Pput_4077 Pput_4078     FALSE 0.132 132.000 0.028 NA   NA
 6986238 6986239 Pput_4081 Pput_4082     TRUE 0.652 74.000 0.316 1.000 N NA
 6986239 6986240 Pput_4082 Pput_4083     FALSE 0.074 179.000 0.022 NA   NA
 6986244 6986245 Pput_4087 Pput_4088 recX recA TRUE 0.912 22.000 0.296 1.000   NA
 6986245 6986246 Pput_4088 Pput_4089 recA   FALSE 0.266 104.000 0.082 NA   NA
 6986246 6986247 Pput_4089 Pput_4090     FALSE 0.197 57.000 0.000 NA   NA
 6986249 6986250 Pput_4092 Pput_4093     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986250 6986251 Pput_4093 Pput_4094     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6986251 6986252 Pput_4094 Pput_4095     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6986252 6986253 Pput_4095 Pput_4096     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986253 6986254 Pput_4096 Pput_4097     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 6986254 6986255 Pput_4097 Pput_4098     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6986255 6986256 Pput_4098 Pput_4099     FALSE 0.265 44.000 0.000 NA   NA
 6986256 6986257 Pput_4099 Pput_4100     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 6986257 6986258 Pput_4100 Pput_4101     TRUE 0.685 -28.000 0.000 NA   NA
 6986258 6986259 Pput_4101 Pput_4102     FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 6986259 6986260 Pput_4102 Pput_4103     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986260 6986261 Pput_4103 Pput_4104     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6986261 6986262 Pput_4104 Pput_4105     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6986262 6986263 Pput_4105 Pput_4106     TRUE 0.946 24.000 0.500 NA   NA
 6986263 6986264 Pput_4106 Pput_4107     TRUE 0.990 9.000 0.778 NA   NA
 6986264 6986265 Pput_4107 Pput_4108     TRUE 0.547 66.000 0.135 NA   NA
 6986265 6986266 Pput_4108 Pput_4109     TRUE 0.993 -3.000 0.635 NA   NA
 6986266 6986267 Pput_4109 Pput_4110     TRUE 0.960 -7.000 0.186 NA   NA
 6986267 6986268 Pput_4110 Pput_4111     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986268 6986269 Pput_4111 Pput_4112     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 6986269 6986270 Pput_4112 Pput_4113     TRUE 0.970 -13.000 0.286 NA   NA
 6986270 6986271 Pput_4113 Pput_4114     TRUE 0.957 15.000 0.429 NA   NA
 6986271 6986272 Pput_4114 Pput_4115     FALSE 0.524 48.000 0.060 NA   NA
 6986272 6986273 Pput_4115 Pput_4116     FALSE 0.516 57.000 0.080 NA   NA
 6986273 6986274 Pput_4116 Pput_4117     TRUE 0.921 3.000 0.064 NA   NA
 6986274 6986275 Pput_4117 Pput_4118     FALSE 0.124 146.000 0.026 1.000   NA
 6986275 6986276 Pput_4118 Pput_4119     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6986276 6986277 Pput_4119 Pput_4120     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6986277 6986278 Pput_4120 Pput_4121     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986278 6986279 Pput_4121 Pput_4122     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6986279 6986280 Pput_4122 Pput_4123     FALSE 0.057 160.000 0.000 NA   NA
 6986280 6986281 Pput_4123 Pput_4124     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6986281 6986282 Pput_4124 Pput_4125     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986282 6986283 Pput_4125 Pput_4126     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986283 6986284 Pput_4126 Pput_4127     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986284 6986285 Pput_4127 Pput_4128     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986285 6986286 Pput_4128 Pput_4129     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6986286 6986287 Pput_4129 Pput_4130     TRUE 0.753 -10.000 0.000 1.000   NA
 6986290 6986291 Pput_4133 Pput_4134     FALSE 0.072 131.000 0.000 NA   NA
 6986291 6986292 Pput_4134 Pput_4135     FALSE 0.442 20.000 0.000 NA   NA
 6986292 6986293 Pput_4135 Pput_4136     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986293 6986294 Pput_4136 Pput_4137     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6986294 6986295 Pput_4137 Pput_4138     FALSE 0.007 321.000 0.000 NA   NA
 6986295 6986296 Pput_4138 Pput_4139     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 6986296 6986297 Pput_4139 Pput_4140     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986297 6986298 Pput_4140 Pput_4141     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6986298 6986299 Pput_4141 Pput_4142     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986299 6986300 Pput_4142 Pput_4143     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 6986300 6986301 Pput_4143 Pput_4144     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986301 6986302 Pput_4144 Pput_4145     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986302 6986303 Pput_4145 Pput_4146     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986303 6986304 Pput_4146 Pput_4147     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986304 6986305 Pput_4147 Pput_4148     FALSE 0.020 231.000 0.000 NA   NA
 6986305 6986306 Pput_4148 Pput_4149     TRUE 0.698 -18.000 0.000 NA   NA
 6986306 6986307 Pput_4149 Pput_4150     TRUE 0.572 13.000 0.000 NA   NA
 6986309 6986310 Pput_4152 Pput_4153     FALSE 0.070 141.000 0.020 1.000 N NA
 6986311 6986312 Pput_4154 Pput_4155     FALSE 0.214 109.000 0.081 1.000 N NA
 6986312 6986313 Pput_4155 Pput_4156   pcm FALSE 0.005 307.000 0.007 1.000 N NA
 6986313 6986314 Pput_4156 Pput_4157 pcm surE TRUE 0.986 0.000 0.353 1.000   NA
 6986314 6986315 Pput_4157 Pput_4158 surE truD TRUE 0.966 -12.000 0.235 1.000   NA
 6986315 6986316 Pput_4158 Pput_4159 truD ispF TRUE 0.971 -3.000 0.173 1.000   NA
 6986316 6986317 Pput_4159 Pput_4160 ispF   FALSE 0.108 113.000 0.012 1.000   NA
 6986317 6986318 Pput_4160 Pput_4161     TRUE 0.986 9.000 0.567 1.000   NA
 6986320 6986321 Pput_4163 Pput_4164 ispD   TRUE 0.966 -3.000 0.185 1.000 N NA
 6986321 6986322 Pput_4164 Pput_4165   eno FALSE 0.337 166.000 0.241 1.000 N NA
 6986322 6986323 Pput_4165 Pput_4166 eno   FALSE 0.235 155.000 0.125 1.000 N NA
 6986323 6986324 Pput_4166 Pput_4167   pyrG TRUE 0.938 4.000 0.138 1.000 N NA
 6986324 6986325 Pput_4167 Pput_4168 pyrG   FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 6986325 6986326 Pput_4168 Pput_4169     FALSE 0.252 46.000 0.000 NA   NA
 6986326 6986327 Pput_4169 Pput_4170     FALSE 0.201 170.000 0.123 1.000 N NA
 6986327 6986328 Pput_4170 Pput_4171   dnaE FALSE 0.285 101.000 0.122 1.000 N NA
 6986328 6986329 Pput_4171 Pput_4172 dnaE rnhB FALSE 0.417 187.000 0.104 1.000 Y NA
 6986329 6986330 Pput_4172 Pput_4173 rnhB lpxB TRUE 0.960 2.000 0.186 1.000 N NA
 6986330 6986331 Pput_4173 Pput_4174 lpxB   TRUE 0.992 2.000 0.289 1.000 Y NA
 6986331 6986332 Pput_4174 Pput_4175   fabZ TRUE 0.995 -3.000 0.850 1.000 N NA
 6986332 6986333 Pput_4175 Pput_4176 fabZ lpxD TRUE 0.761 115.000 0.796 1.000 N NA
 6986333 6986334 Pput_4176 Pput_4177 lpxD   TRUE 0.998 2.000 0.814 1.000 Y NA
 6986334 6986335 Pput_4177 Pput_4178     TRUE 0.808 45.000 0.050 1.000 Y NA
 6986335 6986336 Pput_4178 Pput_4179     TRUE 0.552 74.000 0.014 1.000 Y NA
 6986336 6986337 Pput_4179 Pput_4180     TRUE 0.801 73.000 0.568 1.000 N NA
 6986337 6986338 Pput_4180 Pput_4181     TRUE 0.992 -15.000 0.372 1.000 Y NA
 6986338 6986339 Pput_4181 Pput_4182     TRUE 0.995 0.000 0.400 1.000 Y NA
 6986339 6986340 Pput_4182 Pput_4183   frr TRUE 0.944 16.000 0.409 1.000 N NA
 6986340 6986341 Pput_4183 Pput_4184 frr pyrH TRUE 0.858 -3.000 0.030 1.000 N NA
 6986341 6986342 Pput_4184 Pput_4185 pyrH tsf FALSE 0.040 182.000 0.017 1.000 N NA
 6986342 6986343 Pput_4185 Pput_4186 tsf rpsB TRUE 0.820 186.000 0.748 1.000 Y NA
 6986344 6986345 Pput_4187 Pput_4188   glnD TRUE 0.924 42.000 0.651 1.000 N NA
 6986345 6986346 Pput_4188 Pput_4189 glnD   TRUE 0.839 31.000 0.257 1.000 N NA
 6986348 6986349 Pput_4191 Pput_4192     TRUE 0.932 9.000 0.136 NA   NA
 6986349 6986350 Pput_4192 Pput_4193     FALSE 0.082 116.000 0.000 1.000   NA
 6986350 6986351 Pput_4193 Pput_4194     TRUE 0.599 32.000 0.069 1.000 N NA
 6986351 6986352 Pput_4194 Pput_4195     TRUE 0.788 82.000 0.244 1.000 Y NA
 6986352 6986353 Pput_4195 Pput_4196     TRUE 0.959 -3.000 0.116 NA   NA
 6986355 6986356 Pput_4198 Pput_4199     FALSE 0.036 191.000 0.018 1.000 N NA
 6986356 6986357 Pput_4199 Pput_4200     TRUE 0.863 0.000 0.033 1.000 N NA
 6986357 6986358 Pput_4200 Pput_4201     TRUE 0.795 18.000 0.083 NA   NA
 6986360 6986361 Pput_4203 Pput_4204     FALSE 0.295 77.000 0.052 NA   NA
 6986361 6986362 Pput_4204 Pput_4205     TRUE 0.556 34.000 0.042 NA   NA
 6986363 6986364 Pput_4206 Pput_4207     TRUE 0.971 7.000 0.354 NA N NA
 6986368 6986369 Pput_4211 Pput_4212     TRUE 0.950 0.000 0.090 NA   NA
 6986369 6986370 Pput_4212 Pput_4213     TRUE 0.577 29.000 0.037 NA   NA
 6986370 6986371 Pput_4213 Pput_4214     TRUE 0.923 4.000 0.074 NA   NA
 6986371 6986372 Pput_4214 Pput_4215     FALSE 0.089 132.000 0.008 NA   NA
 6986372 6986373 Pput_4215 Pput_4216   adk FALSE 0.012 272.000 0.019 1.000 N NA
 6986373 6986374 Pput_4216 Pput_4217 adk   FALSE 0.007 258.000 0.000 1.000 N NA
 6986375 6986376 Pput_4218 Pput_4219     FALSE 0.010 292.000 0.000 NA   NA
 6986376 6986377 Pput_4219 Pput_4220     TRUE 0.823 51.000 0.333 NA   NA
 6986378 6986379 Pput_4221 Pput_4222     TRUE 0.970 -3.000 0.174 NA   NA
 6986379 6986380 Pput_4222 Pput_4223     TRUE 0.625 35.000 0.065 NA   NA
 6986380 6986381 Pput_4223 Pput_4224     FALSE 0.356 89.000 0.104 NA   NA
 6986381 6986382 Pput_4224 Pput_4225     TRUE 0.880 31.000 0.304 NA   NA
 6986382 6986383 Pput_4225 Pput_4226   lysS FALSE 0.066 179.000 0.012 1.000   NA
 6986383 6986384 Pput_4226 Pput_4227 lysS   TRUE 0.806 94.000 0.162 0.029 Y NA
 6986384 6986385 Pput_4227 Pput_4228     FALSE 0.004 319.000 0.002 1.000 N NA
 6986385 6986386 Pput_4228 Pput_4229     TRUE 0.972 52.000 0.480 0.021 Y NA
 6986386 6986387 Pput_4229 Pput_4230     TRUE 0.997 -3.000 0.324 0.010 Y NA
 6986387 6986388 Pput_4230 Pput_4231     TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.010 Y NA
 6986388 6986389 Pput_4231 Pput_4232     TRUE 0.997 -3.000 0.558 1.000 Y NA
 6986389 6986390 Pput_4232 Pput_4233     TRUE 0.997 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 6986390 6986391 Pput_4233 Pput_4234     TRUE 0.998 6.000 0.600 0.008 Y NA
 6986391 6986392 Pput_4234 Pput_4235     FALSE 0.076 171.000 0.018 NA   NA
 6986393 6986394 Pput_4236 Pput_4237     TRUE 0.911 151.000 0.609 0.047 Y NA
 6986394 6986395 Pput_4237 Pput_4238     TRUE 0.998 2.000 0.643 0.047 Y NA
 6986395 6986396 Pput_4238 Pput_4239     TRUE 0.998 -10.000 0.821 0.047 Y NA
 6986396 6986397 Pput_4239 Pput_4240     TRUE 0.749 18.000 0.081 1.000 N NA
 6986397 6986398 Pput_4240 Pput_4241     FALSE 0.030 204.000 0.000 NA   NA
 6986398 6986399 Pput_4241 Pput_4242     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986400 6986401 Pput_4243 Pput_4244     FALSE 0.002 471.000 0.002 1.000 N NA
 6986401 6986402 Pput_4244 Pput_4245     TRUE 0.766 9.000 0.011 1.000   NA
 6986403 6986404 Pput_4246 Pput_4247     TRUE 0.799 21.000 0.103 NA   NA
 6986405 6986406 Pput_4248 Pput_4249     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 6986406 6986407 Pput_4249 Pput_4250     FALSE 0.081 131.000 0.000 1.000   NA
 6986407 6986408 Pput_4250 Pput_4251     TRUE 0.814 60.000 0.125 1.000 Y NA
 6986408 6986409 Pput_4251 Pput_4252     FALSE 0.140 84.000 0.029 1.000 N NA
 6986409 6986410 Pput_4252 Pput_4253   xerD FALSE 0.076 154.000 0.026 1.000 N NA
 6986412 6986413 Pput_4255 Pput_4256   rplS FALSE 0.044 95.000 0.004 NA N NA
 6986413 6986414 Pput_4256 Pput_4257 rplS trmD TRUE 0.967 43.000 0.567 1.000 Y NA
 6986414 6986415 Pput_4257 Pput_4258 trmD rimM TRUE 0.997 4.000 0.672 1.000 Y NA
 6986415 6986416 Pput_4258 Pput_4259 rimM rpsP TRUE 0.996 6.000 0.342 0.007 Y NA
 6986416 6986417 Pput_4259 Pput_4260 rpsP   FALSE 0.178 259.000 0.361 1.000 N NA
 6986418 6986419 Pput_4261 Pput_4262     TRUE 0.971 10.000 0.349 NA   NA
 6986419 6986420 Pput_4262 Pput_4263     FALSE 0.016 271.000 0.008 NA   NA
 6986421 6986422 Pput_4264 Pput_4265 purT   FALSE 0.182 77.000 0.019 NA   NA
 6986422 6986423 Pput_4265 Pput_4266     FALSE 0.049 197.000 0.016 NA   NA
 6986423 6986424 Pput_4266 Pput_4267     TRUE 0.904 -10.000 0.062 NA   NA
 6986424 6986425 Pput_4267 Pput_4268     TRUE 0.611 45.000 0.078 1.000   NA
 6986426 6986427 Pput_4269 Pput_4270     TRUE 0.716 23.000 0.065 NA   NA
 6986427 6986428 Pput_4270 Pput_4271     FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 6986428 6986429 Pput_4271 Pput_4272     TRUE 0.965 28.000 0.800 NA   NA
 6986430 6986431 Pput_4273 Pput_4274     TRUE 0.855 2.000 0.020 NA   NA
 6986432 6986433 Pput_4275 Pput_4276     FALSE 0.032 296.000 0.000 0.047 N NA
 6986433 6986434 Pput_4276 Pput_4277     TRUE 0.891 31.000 0.375 1.000 N NA
 6986434 6986435 Pput_4277 Pput_4278     FALSE 0.002 530.000 0.000 1.000 N NA
 6986435 6986436 Pput_4278 Pput_4279     FALSE 0.146 152.000 0.041 NA   NA
 6986436 6986437 Pput_4279 Pput_4280     FALSE 0.150 90.000 0.021 NA   NA
 6986437 6986438 Pput_4280 Pput_4281     TRUE 0.984 -3.000 0.315 NA   NA
 6986440 6986441 Pput_4283 Pput_4284     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 6986442 6986443 Pput_4285 Pput_4286   recO TRUE 0.561 62.000 0.166 1.000 N NA
 6986443 6986444 Pput_4286 Pput_4287 recO era FALSE 0.229 170.000 0.109 1.000   NA
 6986444 6986445 Pput_4287 Pput_4288 era rnc TRUE 0.976 -7.000 0.127 0.042   NA
 6986445 6986446 Pput_4288 Pput_4289 rnc   FALSE 0.207 164.000 0.117 1.000 N NA
 6986446 6986447 Pput_4289 Pput_4290     TRUE 0.945 6.000 0.187 1.000 N NA
 6986447 6986448 Pput_4290 Pput_4291     FALSE 0.039 190.000 0.020 1.000 N NA
 6986448 6986449 Pput_4291 Pput_4292     FALSE 0.038 176.000 0.017 NA N NA
 6986449 6986450 Pput_4292 Pput_4293     TRUE 0.994 13.000 0.856 NA Y NA
 6986450 6986451 Pput_4293 Pput_4294   algU TRUE 0.941 34.000 0.705 NA N NA
 6986453 6986454 Pput_4296 Pput_4297     TRUE 0.820 -16.000 0.027 NA   NA
 6986455 6986456 Pput_4298 Pput_4299     FALSE 0.409 50.000 0.034 NA   NA
 6986457 6986458 Pput_4300 Pput_4301     TRUE 0.985 -7.000 0.163 1.000 Y NA
 6986459 6986460 Pput_4302 Pput_4303     TRUE 0.674 47.000 0.128 1.000   NA
 6986460 6986461 Pput_4303 Pput_4304     FALSE 0.297 200.000 0.277 NA   NA
 6986461 6986462 Pput_4304 Pput_4305     TRUE 0.995 2.000 0.857 NA   NA
 6986462 6986463 Pput_4305 Pput_4306     TRUE 0.985 -7.000 0.429 NA   NA
 6986463 6986464 Pput_4306 Pput_4307     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6986468 6986469 Pput_4311 Pput_4312     TRUE 0.952 -7.000 0.148 NA   NA
 6986469 6986470 Pput_4312 Pput_4313     TRUE 0.948 9.000 0.189 NA   NA
 6986470 6986471 Pput_4313 Pput_4314     TRUE 0.716 6.000 0.000 NA   NA
 6986471 6986472 Pput_4314 Pput_4315     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6986472 6986473 Pput_4315 Pput_R0087     FALSE 0.073 112.000 0.000 NA   NA
 6986473 6986474 Pput_R0087 Pput_4316     FALSE 0.027 211.000 0.000 NA   NA
 6986474 6986475 Pput_4316 Pput_4317     FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 6986476 6986477 Pput_4318 Pput_4319     FALSE 0.053 166.000 0.000 NA   NA
 6986478 6986479 Pput_4320 Pput_4321     FALSE 0.258 88.000 0.074 1.000 N NA
 6986479 6986480 Pput_4321 Pput_4322     TRUE 0.997 -6.000 0.419 0.074 Y NA
 6986480 6986481 Pput_4322 Pput_4323     FALSE 0.040 255.000 0.065 1.000 N NA
 6986481 6986482 Pput_4323 Pput_4324     FALSE 0.009 301.000 0.000 NA   NA
 6986482 6986483 Pput_4324 Pput_4325     FALSE 0.193 120.000 0.050 NA   NA
 6986484 6986485 Pput_4326 Pput_4327     TRUE 0.888 50.000 0.500 NA   NA
 6986488 6986489 Pput_4330 Pput_4331     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 6986495 6986496 Pput_4337 Pput_4338     TRUE 0.987 4.000 0.565 1.000 N NA
 6986496 6986497 Pput_4338 Pput_4339     TRUE 0.992 -3.000 0.385 0.046 N NA
 6986497 6986498 Pput_4339 Pput_4340     FALSE 0.019 403.000 0.000 0.060   NA
 6986498 6986499 Pput_4340 Pput_4341     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 6986500 6986501 Pput_4342 Pput_4343     TRUE 0.933 11.000 0.174 1.000   NA
 6986501 6986502 Pput_4343 Pput_4344     TRUE 0.852 12.000 0.063 1.000   NA
 6986502 6986503 Pput_4344 Pput_4345     TRUE 0.795 10.000 0.042 1.000 N NA
 6986503 6986504 Pput_4345 Pput_4346     FALSE 0.084 188.000 0.051 1.000 N NA
 6986504 6986505 Pput_4346 Pput_4347     FALSE 0.003 327.000 0.000 1.000 N NA
 6986505 6986506 Pput_4347 Pput_4348     FALSE 0.003 321.000 0.000 1.000 N NA
 6986507 6986508 Pput_4349 Pput_4350     FALSE 0.010 295.000 0.000 NA   NA
 6986510 6986511 Pput_4352 Pput_4353     FALSE 0.061 166.000 0.023 1.000 N NA
 6986511 6986512 Pput_4353 Pput_4354     TRUE 0.961 -7.000 0.182 1.000   NA
 6986512 6986513 Pput_4354 Pput_4355     TRUE 0.944 -3.000 0.071 NA   NA
 6986515 6986516 Pput_4357 Pput_4358     TRUE 0.685 -28.000 0.000 NA   NA
 6986517 6986518 Pput_4359 Pput_4360 sbcB   FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6986518 6986519 Pput_4360 Pput_4361     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 6986521 6986522 Pput_4363 Pput_4364 groEL groES TRUE 0.923 51.000 0.177 0.074 Y NA
 6986522 6986523 Pput_4364 Pput_4365 groES fxsA FALSE 0.036 244.000 0.028 1.000   NA
 6986523 6986524 Pput_4365 Pput_4366 fxsA   FALSE 0.283 66.000 0.026 1.000   NA
 6986524 6986525 Pput_4366 Pput_4367     FALSE 0.143 83.000 0.014 NA   NA
 6986526 6986527 Pput_4368 Pput_4369     TRUE 0.674 44.000 0.120 NA   NA
 6986528 6986529 Pput_4370 Pput_4371     FALSE 0.013 211.000 0.000 1.000 N NA
 6986529 6986530 Pput_4371 Pput_4372     FALSE 0.119 117.000 0.021 NA   NA
 6986531 6986532 Pput_4373 Pput_4374     FALSE 0.482 38.000 0.049 1.000 N NA
 6986532 6986533 Pput_4374 Pput_4375     TRUE 0.954 2.000 0.030 0.074   NA
 6986534 6986535 Pput_4376 Pput_4377     TRUE 0.667 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6986535 6986536 Pput_4377 Pput_4378   argJ FALSE 0.046 156.000 0.011 1.000 N NA
 6986536 6986537 Pput_4378 Pput_4379 argJ secA FALSE 0.153 183.000 0.102 1.000 N NA
 6986539 6986540 Pput_4381 Pput_4382 lpxC   FALSE 0.284 113.000 0.134 1.000 N NA
 6986540 6986541 Pput_4382 Pput_4383     TRUE 0.941 56.000 0.460 1.000 Y NA
 6986541 6986542 Pput_4383 Pput_4384     TRUE 0.943 15.000 0.389 NA N NA
 6986542 6986543 Pput_4384 Pput_4385   ddl TRUE 0.992 6.000 0.372 NA Y NA
 6986543 6986544 Pput_4385 Pput_4386 ddl murC TRUE 0.995 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 6986544 6986545 Pput_4386 Pput_4387 murC murG TRUE 0.991 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 6986545 6986546 Pput_4387 Pput_4388 murG   TRUE 0.988 -10.000 0.647 1.000 N NA
 6986546 6986547 Pput_4388 Pput_4389   murD TRUE 0.992 -3.000 0.297 0.002 N NA
 6986547 6986548 Pput_4389 Pput_4390 murD mraY TRUE 0.999 1.000 0.647 0.003 Y NA
 6986548 6986549 Pput_4390 Pput_4391 mraY   TRUE 0.997 0.000 0.309 0.003 Y NA
 6986549 6986550 Pput_4391 Pput_4392   murE TRUE 0.998 -7.000 0.569 0.001 Y NA
 6986550 6986551 Pput_4392 Pput_4393 murE   TRUE 0.984 -3.000 0.073 1.000 Y NA
 6986551 6986552 Pput_4393 Pput_4394     TRUE 0.959 -3.000 0.153 1.000 N NA
 6986552 6986553 Pput_4394 Pput_4395   mraW TRUE 0.974 -3.000 0.227 1.000 N NA
 6986553 6986554 Pput_4395 Pput_4396 mraW   TRUE 0.993 -3.000 0.635 NA   NA
 6986554 6986555 Pput_4396 Pput_R0088     FALSE 0.007 325.000 0.000 NA   NA
 6986555 6986556 Pput_R0088 Pput_4398     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 6986557 6986558 Pput_4399 Pput_4400     TRUE 0.968 0.000 0.172 NA   NA
 6986558 6986559 Pput_4400 Pput_4401   gmhA FALSE 0.428 87.000 0.187 1.000 N NA
 6986559 6986560 Pput_4401 Pput_4402 gmhA   TRUE 0.993 -3.000 0.613 NA   NA
 6986561 6986562 Pput_4403 Pput_4404     TRUE 0.989 11.000 0.831 NA   NA
 6986562 6986563 Pput_4404 Pput_4405     TRUE 0.537 117.000 0.370 NA N NA
 6986563 6986564 Pput_4405 Pput_4406     TRUE 0.999 0.000 0.630 0.001 Y NA
 6986564 6986565 Pput_4406 Pput_4407     TRUE 0.997 -3.000 0.233 0.001 Y NA
 6986565 6986566 Pput_4407 Pput_4408   rpsI FALSE 0.009 263.000 0.006 1.000 N NA
 6986566 6986567 Pput_4408 Pput_4409 rpsI rplM TRUE 0.995 15.000 0.601 0.007 Y NA
 6986568 6986569 Pput_4410 Pput_4411     FALSE 0.037 107.000 0.000 1.000 N NA
 6986570 6986571 Pput_4412 Pput_4413     FALSE 0.084 213.000 0.061 NA   NA
 6986571 6986572 Pput_4413 Pput_4414     TRUE 0.670 25.000 0.048 1.000   NA
 6986575 6986576 Pput_4417 Pput_4418     FALSE 0.073 113.000 0.000 NA   NA
 6986576 6986577 Pput_4418 Pput_4420     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986578 6986579 Pput_4421 Pput_4422     TRUE 0.928 17.000 0.096 0.000 N NA
 6986579 6986580 Pput_4422 Pput_4423     FALSE 0.045 224.000 0.030 NA   NA
 6986582 6986583 Pput_4425 Pput_4426     TRUE 0.995 11.000 0.734 1.000 Y NA
 6986583 6986584 Pput_4426 Pput_4427     TRUE 0.998 11.000 0.815 0.008 Y NA
 6986584 6986585 Pput_4427 Pput_4428     TRUE 0.960 68.000 0.548 0.046 Y NA
 6986586 6986587 Pput_4429 Pput_4430     FALSE 0.167 101.000 0.031 1.000   NA
 6986588 6986589 Pput_4431 Pput_4432     TRUE 0.998 3.000 0.501 0.002 Y NA
 6986589 6986590 Pput_4432 Pput_4433   moaC TRUE 0.995 0.000 0.175 0.002 Y NA
 6986590 6986591 Pput_4433 Pput_4434 moaC   FALSE 0.097 79.000 0.013 1.000 N NA
 6986591 6986592 Pput_4434 Pput_4435     FALSE 0.005 282.000 0.000 1.000 N NA
 6986593 6986594 Pput_4436 Pput_4437     FALSE 0.002 838.000 0.000 NA   NA
 6986594 6986595 Pput_4437 Pput_4438     FALSE 0.116 78.000 0.000 NA   NA
 6986595 6986596 Pput_4438 Pput_4439     TRUE 0.788 38.000 0.200 NA   NA
 6986596 6986597 Pput_4439 Pput_4440     TRUE 0.976 11.000 0.455 NA   NA
 6986597 6986598 Pput_4440 Pput_4441     TRUE 0.989 -3.000 0.417 NA   NA
 6986598 6986599 Pput_4441 Pput_4442     TRUE 0.960 23.000 0.625 NA   NA
 6986599 6986600 Pput_4442 Pput_4443     TRUE 0.968 14.000 0.500 NA   NA
 6986600 6986601 Pput_4443 Pput_4444   algL TRUE 0.985 9.000 0.562 NA   NA
 6986601 6986602 Pput_4444 Pput_4445 algL   FALSE 0.426 199.000 0.438 NA   NA
 6986602 6986603 Pput_4445 Pput_4446     TRUE 0.989 12.000 0.889 NA   NA
 6986603 6986604 Pput_4446 Pput_4447     TRUE 0.977 21.000 0.889 NA   NA
 6986604 6986605 Pput_4447 Pput_4448     TRUE 0.904 33.000 0.400 NA   NA
 6986607 6986608 Pput_4450 Pput_4451     TRUE 0.738 122.000 0.636 NA   NA
 6986609 6986610 Pput_4452 Pput_4453     TRUE 0.992 -3.000 0.423 0.089 N NA
 6986610 6986611 Pput_4453 Pput_4454     TRUE 0.980 -13.000 0.385 1.000   NA
 6986611 6986612 Pput_4454 Pput_4455     TRUE 0.599 136.000 0.400 1.000   NA
 6986614 6986615 Pput_4457 Pput_4458     TRUE 0.964 11.000 0.318 NA   NA
 6986615 6986616 Pput_4458 Pput_4459     TRUE 0.955 -10.000 0.182 NA   NA
 6986616 6986617 Pput_4459 Pput_4460     TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 6986618 6986619 Pput_4461 Pput_4462     FALSE 0.473 174.000 0.429 1.000 N NA
 6986622 6986623 Pput_4465 Pput_4466     FALSE 0.418 177.000 0.085 NA Y NA
 6986623 6986624 Pput_4466 Pput_4467     TRUE 0.991 -3.000 0.588 NA N NA
 6986624 6986625 Pput_4467 Pput_4468     TRUE 0.977 -3.000 0.222 NA   NA
 6986625 6986626 Pput_4468 Pput_4469     TRUE 0.981 0.000 0.278 NA   NA
 6986626 6986627 Pput_4469 Pput_4470     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986628 6986629 Pput_4471 Pput_4472     FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 6986631 6986632 Pput_4474 Pput_4475     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 6986632 6986633 Pput_4475 Pput_4476     FALSE 0.006 356.000 0.000 NA   NA
 6986636 6986637 Pput_4479 Pput_4480     TRUE 0.941 13.000 0.077 0.001 N NA
 6986637 6986638 Pput_4480 Pput_4481     TRUE 0.986 4.000 0.188 1.000 Y NA
 6986640 6986641 Pput_4483 Pput_4484     FALSE 0.005 393.000 0.000 NA   NA
 6986641 6986642 Pput_4484 Pput_4485     FALSE 0.022 177.000 0.000 1.000 N NA
 6986642 6986643 Pput_4485 Pput_4486     TRUE 0.993 5.000 0.840 1.000   NA
 6986646 6986647 Pput_4489 Pput_4490     TRUE 0.723 60.000 0.250 NA   NA
 6986649 6986650 Pput_4492 Pput_4493     TRUE 0.729 34.000 0.120 NA   NA
 6986650 6986651 Pput_4493 Pput_4494     TRUE 0.666 10.000 0.000 NA   NA
 6986651 6986652 Pput_4494 Pput_4495     TRUE 0.955 -3.000 0.097 NA   NA
 6986653 6986654 Pput_4496 Pput_4497     FALSE 0.065 144.000 0.000 NA   NA
 6986658 6986659 Pput_4501 Pput_4502     FALSE 0.316 78.000 0.062 NA   NA
 6986659 6986660 Pput_4502 Pput_4503     TRUE 0.857 18.000 0.156 NA   NA
 6986661 6986662 Pput_4504 Pput_4505     FALSE 0.013 264.000 0.000 NA   NA
 6986666 6986667 Pput_4509 Pput_4510     FALSE 0.115 97.000 0.030 1.000 N NA
 6986668 6986669 Pput_4511 Pput_4512     TRUE 0.666 10.000 0.000 NA   NA
 6986669 6986670 Pput_4512 Pput_4513     TRUE 0.979 4.000 0.000 0.044 Y NA
 6986671 6986672 Pput_4514 Pput_4515     FALSE 0.032 200.000 0.000 NA   NA
 6986672 6986673 Pput_4515 Pput_4516     TRUE 0.940 -3.000 0.062 1.000   NA
 6986674 6986675 Pput_4517 Pput_4518     TRUE 0.998 11.000 0.782 0.000 Y NA
 6986676 6986677 Pput_4519 Pput_4520     FALSE 0.048 172.000 0.000 NA   NA
 6986678 6986679 Pput_4521 Pput_4522     FALSE 0.036 118.000 0.000 1.000 N NA
 6986679 6986680 Pput_4522 Pput_4523     FALSE 0.339 184.000 0.250 1.000   NA
 6986685 6986686 Pput_4528 Pput_4529     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 6986687 6986688 Pput_4530 Pput_4531     TRUE 0.996 11.000 1.000 0.001 N NA
 6986690 6986691 Pput_4533 Pput_4534     TRUE 0.980 8.000 0.475 1.000 N NA
 6986691 6986692 Pput_4534 Pput_4535     TRUE 0.990 -3.000 0.475 NA   NA
 6986692 6986693 Pput_4535 Pput_4536     FALSE 0.104 101.000 0.011 NA   NA
 6986693 6986694 Pput_4536 Pput_4537     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 6986694 6986695 Pput_4537 Pput_4538     TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 6986695 6986696 Pput_4538 Pput_R0089     FALSE 0.007 330.000 0.000 NA   NA
 6986696 6986697 Pput_R0089 Pput_R0090     FALSE 0.073 114.000 0.000 NA   NA
 6986697 6986698 Pput_R0090 Pput_R0091     FALSE 0.017 242.000 0.000 NA   NA
 6986698 6986699 Pput_R0091 Pput_R0092     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6986699 6986700 Pput_R0092 Pput_R0093     FALSE 0.102 85.000 0.000 NA   NA
 6986700 6986701 Pput_R0093 Pput_4539     FALSE 0.002 732.000 0.000 NA   NA
 6986701 6986702 Pput_4539 Pput_4540     TRUE 0.997 0.000 0.790 0.044   NA
 6986702 6986703 Pput_4540 Pput_4541     FALSE 0.214 80.000 0.029 1.000   NA
 6986703 6986704 Pput_4541 Pput_4542     FALSE 0.112 151.000 0.041 1.000 N NA
 6986704 6986705 Pput_4542 Pput_4543   ilvH TRUE 0.911 57.000 0.092 0.001 Y NA
 6986705 6986706 Pput_4543 Pput_4544 ilvH   TRUE 0.998 2.000 0.371 0.001 Y NA
 6986706 6986707 Pput_4544 Pput_4545     FALSE 0.004 409.000 0.000 NA   NA
 6986707 6986708 Pput_4545 Pput_4546     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6986708 6986709 Pput_4546 Pput_4547     FALSE 0.527 16.000 0.000 1.000   NA
 6986710 6986711 Pput_4548 Pput_4549     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 6986712 6986713 Pput_4550 Pput_4551   hmuV FALSE 0.123 105.000 0.021 NA   NA
 6986713 6986714 Pput_4551 Pput_4552 hmuV   TRUE 0.993 0.000 0.292 1.000 Y NA
 6986714 6986715 Pput_4552 Pput_4553     TRUE 0.998 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 6986717 6986718 Pput_4555 Pput_4556     TRUE 0.909 0.000 0.038 NA   NA
 6986719 6986720 Pput_4557 Pput_4558     TRUE 0.774 49.000 0.231 1.000   NA
 6986720 6986721 Pput_4558 Pput_4559     FALSE 0.043 245.000 0.042 NA   NA
 6986721 6986722 Pput_4559 Pput_4560     TRUE 0.972 -16.000 0.312 NA   NA
 6986722 6986723 Pput_4560 Pput_4561     TRUE 0.989 5.000 0.453 0.073 N NA
 6986723 6986724 Pput_4561 Pput_4562     FALSE 0.001 969.000 0.000 1.000 N NA
 6986724 6986725 Pput_4562 Pput_4563     TRUE 0.974 -3.000 0.234 1.000 N NA
 6986725 6986726 Pput_4563 Pput_4564   panB FALSE 0.204 263.000 0.117 1.000 Y NA
 6986726 6986727 Pput_4564 Pput_4565 panB panC TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.000 Y NA
 6986727 6986728 Pput_4565 Pput_4566 panC pgi FALSE 0.021 209.000 0.010 1.000 N NA
 6986728 6986729 Pput_4566 Pput_4567 pgi   FALSE 0.193 181.000 0.146 1.000 N NA
 6986729 6986730 Pput_4567 Pput_4568     TRUE 0.656 42.000 0.088 1.000   NA
 6986730 6986731 Pput_4568 Pput_4569     FALSE 0.126 79.000 0.000 1.000   NA
 6986734 6986735 Pput_4572 Pput_4573     FALSE 0.014 262.000 0.000 NA   NA
 6986735 6986736 Pput_4573 Pput_4574   rpsO FALSE 0.411 251.000 0.335 1.000 Y NA
 6986736 6986737 Pput_4574 Pput_4575 rpsO   TRUE 0.654 148.000 0.211 1.000 Y NA
 6986737 6986738 Pput_4575 Pput_4576   rbfA TRUE 0.992 4.000 0.318 1.000 Y NA
 6986738 6986739 Pput_4576 Pput_4577 rbfA infB TRUE 0.851 117.000 0.530 1.000 Y NA
 6986739 6986740 Pput_4577 Pput_4578 infB nusA TRUE 0.892 28.000 0.342 1.000 N NA
 6986740 6986741 Pput_4578 Pput_4579 nusA   TRUE 0.910 60.000 0.759 NA   NA
 6986741 6986742 Pput_4579 Pput_R0094     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6986742 6986743 Pput_R0094 Pput_R0095     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 6986743 6986744 Pput_R0095 Pput_4580   secG FALSE 0.421 22.000 0.000 NA   NA
 6986744 6986745 Pput_4580 Pput_4581 secG tpiA TRUE 0.947 5.000 0.184 1.000 N NA
 6986745 6986746 Pput_4581 Pput_4582 tpiA   TRUE 0.750 66.000 0.082 1.000 Y NA
 6986746 6986747 Pput_4582 Pput_4583     TRUE 0.902 17.000 0.260 1.000 N NA
 6986747 6986748 Pput_4583 Pput_4584     TRUE 0.966 9.000 0.325 1.000 N NA
 6986748 6986749 Pput_4584 Pput_4585     FALSE 0.072 207.000 0.066 NA N NA
 6986751 6986752 Pput_4587 Pput_4588   greA TRUE 0.765 -22.000 0.014 NA   NA
 6986752 6986753 Pput_4588 Pput_4589 greA carB TRUE 0.975 -3.000 0.241 1.000 N NA
 6986753 6986754 Pput_4589 Pput_4590 carB   TRUE 0.871 160.000 0.345 0.000 Y NA
 6986754 6986755 Pput_4590 Pput_4591     FALSE 0.083 303.000 0.034 1.000 Y NA
 6986755 6986756 Pput_4591 Pput_4592     TRUE 0.687 14.000 0.041 1.000 N NA
 6986756 6986757 Pput_4592 Pput_4593   dnaK FALSE 0.426 288.000 0.236 0.002 Y NA
 6986757 6986758 Pput_4593 Pput_4594 dnaK   TRUE 0.698 102.000 0.049 0.005 Y NA
 6986765 6986766 Pput_4601 Pput_4602   lldD TRUE 0.728 63.000 0.055 1.000 Y NA
 6986766 6986767 Pput_4602 Pput_4603 lldD   TRUE 0.743 76.000 0.145 1.000 Y NA
 6986767 6986768 Pput_4603 Pput_4604     FALSE 0.007 475.000 0.029 NA   NA
 6986768 6986769 Pput_4604 Pput_R0096     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 6986769 6986770 Pput_R0096 Pput_4605     FALSE 0.036 192.000 0.000 NA   NA
 6986770 6986771 Pput_4605 Pput_4606     FALSE 0.002 965.000 0.000 NA   NA
 6986771 6986772 Pput_4606 Pput_4607     TRUE 0.941 -16.000 0.154 NA   NA
 6986772 6986773 Pput_4607 Pput_4608     TRUE 0.973 -22.000 0.333 NA   NA
 6986773 6986774 Pput_4608 Pput_4609     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986775 6986776 Pput_4610 Pput_4611     FALSE 0.351 30.000 0.000 NA   NA
 6986776 6986777 Pput_4611 Pput_4612     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.040 Y NA
 6986777 6986778 Pput_4612 Pput_4613     TRUE 0.851 3.000 0.023 NA   NA
 6986778 6986779 Pput_4613 Pput_4614     TRUE 0.745 4.000 0.000 NA   NA
 6986779 6986780 Pput_4614 Pput_4615     FALSE 0.011 801.000 0.000 0.040   NA
 6986780 6986781 Pput_4615 Pput_4616     TRUE 0.987 0.000 0.390 NA   NA
 6986781 6986782 Pput_4616 Pput_4617     TRUE 0.993 -3.000 0.579 NA   NA
 6986782 6986783 Pput_4617 Pput_4618     TRUE 0.897 14.000 0.171 NA   NA
 6986783 6986784 Pput_4618 Pput_4619     FALSE 0.003 598.000 0.000 NA   NA
 6986784 6986785 Pput_4619 Pput_4620     TRUE 0.995 -3.000 0.759 NA   NA
 6986785 6986786 Pput_4620 Pput_4621     FALSE 0.002 824.000 0.000 NA   NA
 6986786 6986787 Pput_4621 Pput_4622     FALSE 0.009 304.000 0.000 NA   NA
 6986789 6986790 Pput_4624 Pput_4625     FALSE 0.004 489.000 0.000 NA   NA
 6986790 6986791 Pput_4625 Pput_4626     FALSE 0.004 479.000 0.000 NA   NA
 6986791 6986792 Pput_4626 Pput_4627     FALSE 0.036 191.000 0.000 NA   NA
 6986792 6986793 Pput_4627 Pput_4628     FALSE 0.014 418.000 0.000 0.057 N NA
 6986793 6986794 Pput_4628 Pput_4629     TRUE 0.681 95.000 0.500 1.000 N NA
 6986796 6986797 Pput_4631 Pput_4632     TRUE 0.619 20.000 0.049 NA N NA
 6986799 6986800 Pput_4634 Pput_4635     FALSE 0.060 165.000 0.000 1.000   NA
 6986800 6986801 Pput_4635 Pput_4636     TRUE 0.934 -3.000 0.052 1.000   NA
 6986801 6986802 Pput_4636 Pput_4637     FALSE 0.105 150.000 0.042 NA N NA
 6986803 6986804 Pput_4638 Pput_4639     FALSE 0.001 499.000 0.000 NA N NA
 6986804 6986805 Pput_4639 Pput_4640     FALSE 0.153 149.000 0.043 NA   NA
 6986806 6986807 Pput_4641 Pput_4642     FALSE 0.325 56.000 0.041 1.000 N NA
 6986807 6986808 Pput_4642 Pput_4643     FALSE 0.036 119.000 0.000 1.000 N NA
 6986808 6986809 Pput_4643 Pput_4644     TRUE 0.724 10.000 0.010 NA   NA
 6986809 6986810 Pput_4644 Pput_4645     FALSE 0.139 162.000 0.043 NA   NA
 6986811 6986812 Pput_4646 Pput_4647     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6986814 6986815 Pput_4649 Pput_4650     TRUE 0.601 23.000 0.031 NA   NA
 6986817 6986818 Pput_4652 Pput_4653     TRUE 0.537 54.000 0.077 NA   NA
 6986819 6986820 Pput_4654 Pput_4655     TRUE 0.714 7.000 0.019 1.000 N NA
 6986820 6986821 Pput_4655 Pput_4656     FALSE 0.514 19.000 0.026 1.000 N NA
 6986821 6986822 Pput_4656 Pput_4657     FALSE 0.205 212.000 0.250 1.000 N NA
 6986823 6986824 Pput_4658 Pput_4659   thiE TRUE 0.970 14.000 0.209 1.000 Y NA
 6986824 6986825 Pput_4659 Pput_4660 thiE   TRUE 0.955 17.000 0.173 1.000 Y NA
 6986825 6986826 Pput_4660 Pput_4661     FALSE 0.023 245.000 0.008 1.000   NA
 6986828 6986829 Pput_4663 Pput_4664     TRUE 0.986 -7.000 0.457 NA   NA
 6986829 6986830 Pput_4664 Pput_4665     TRUE 0.807 26.000 0.150 NA   NA
 6986830 6986831 Pput_4665 Pput_4666   lnt TRUE 0.982 9.000 0.557 NA N NA
 6986832 6986833 Pput_4667 Pput_4668     TRUE 0.622 135.000 0.435 NA   NA
 6986834 6986835 Pput_4669 Pput_4670 leuS   TRUE 0.578 62.000 0.182 NA N NA
 6986835 6986836 Pput_4670 Pput_4671   holA TRUE 0.737 40.000 0.199 NA N NA
 6986836 6986837 Pput_4671 Pput_4672 holA   FALSE 0.029 218.000 0.007 NA   NA
 6986837 6986838 Pput_4672 Pput_4673     TRUE 0.566 61.000 0.123 NA   NA
 6986839 6986840 Pput_4674 Pput_4675     FALSE 0.043 99.000 0.005 NA N NA
 6986840 6986841 Pput_4675 Pput_4676   lipB TRUE 0.997 3.000 0.319 0.000 Y NA
 6986841 6986842 Pput_4676 Pput_4677 lipB   TRUE 0.976 0.000 0.219 NA   NA
 6986842 6986843 Pput_4677 Pput_4678     FALSE 0.380 74.000 0.074 NA   NA
 6986843 6986844 Pput_4678 Pput_4679     TRUE 0.615 170.000 0.241 NA Y NA
 6986844 6986845 Pput_4679 Pput_4680     TRUE 0.993 0.000 0.298 NA Y NA
 6986845 6986846 Pput_4680 Pput_4681     TRUE 0.764 18.000 0.096 NA N NA
 6986846 6986847 Pput_4681 Pput_4682     TRUE 0.738 0.000 0.008 1.000 N NA
 6986847 6986848 Pput_4682 Pput_4683     FALSE 0.526 17.000 0.007 NA   NA
 6986848 6986849 Pput_4683 Pput_4684     TRUE 0.962 11.000 0.307 NA   NA
 6986849 6986850 Pput_4684 Pput_4685   nadD TRUE 0.961 -13.000 0.221 NA   NA
 6986850 6986851 Pput_4685 Pput_4686 nadD proA TRUE 0.929 -31.000 0.170 1.000 N NA
 6986852 6986853 Pput_4687 Pput_4688     TRUE 0.852 3.000 0.019 1.000   NA
 6986854 6986855 Pput_4689 Pput_4690     TRUE 0.809 10.000 0.027 1.000   NA
 6986855 6986856 Pput_4690 Pput_4691     TRUE 0.995 -3.000 0.818 1.000   NA
 6986857 6986858 Pput_4692 Pput_4693   prmA FALSE 0.036 117.000 0.000 1.000 N NA
 6986858 6986859 Pput_4693 Pput_4694 prmA   FALSE 0.323 43.000 0.009 NA   NA
 6986859 6986860 Pput_4694 Pput_4695     FALSE 0.033 208.000 0.005 NA   NA
 6986860 6986861 Pput_4695 Pput_4696   fis TRUE 0.961 -3.000 0.161 1.000 N NA
 6986861 6986862 Pput_4696 Pput_4697 fis purH FALSE 0.326 82.000 0.101 1.000 N NA
 6986862 6986863 Pput_4697 Pput_4698 purH   TRUE 0.679 147.000 0.238 1.000 Y NA
 6986863 6986864 Pput_4698 Pput_4699     FALSE 0.199 139.000 0.010 0.073 N NA
 6986864 6986865 Pput_4699 Pput_4700     FALSE 0.113 76.000 0.020 NA N NA
 6986866 6986867 Pput_4701 Pput_4702     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6986867 6986868 Pput_4702 Pput_4703     FALSE 0.186 60.000 0.000 NA   NA
 6986868 6986869 Pput_4703 Pput_4704     FALSE 0.206 93.000 0.042 NA   NA
 6986869 6986870 Pput_4704 Pput_4705     TRUE 0.992 3.000 0.097 0.006 Y NA
 6986870 6986871 Pput_4705 Pput_4706   cobH TRUE 0.995 0.000 0.191 0.006 Y NA
 6986871 6986872 Pput_4706 Pput_4707 cobH   TRUE 0.942 -7.000 0.149 1.000 N NA
 6986873 6986874 Pput_4708 Pput_4709   cbiD TRUE 0.987 -7.000 0.043 0.006 Y NA
 6986874 6986875 Pput_4709 Pput_4710 cbiD   TRUE 0.994 -3.000 0.123 0.006 Y NA
 6986875 6986876 Pput_4710 Pput_4711     FALSE 0.027 129.000 0.000 NA N NA
 6986876 6986877 Pput_4711 Pput_4712     TRUE 0.959 27.000 0.313 NA Y NA
 6986877 6986878 Pput_4712 Pput_4713     FALSE 0.012 272.000 0.000 NA   NA
 6986878 6986879 Pput_4713 Pput_4714     TRUE 0.729 48.000 0.190 NA   NA
 6986879 6986880 Pput_4714 Pput_4715     TRUE 0.882 23.000 0.238 NA   NA
 6986880 6986881 Pput_4715 Pput_4716     FALSE 0.249 67.000 0.023 NA   NA
 6986881 6986882 Pput_4716 Pput_4717     FALSE 0.351 57.000 0.029 1.000   NA
 6986882 6986883 Pput_4717 Pput_4718     FALSE 0.026 222.000 0.000 1.000   NA
 6986883 6986884 Pput_4718 Pput_4719     FALSE 0.141 297.000 0.000 0.008 Y NA
 6986884 6986885 Pput_4719 Pput_4720     TRUE 0.821 174.000 0.654 1.000 Y NA
 6986885 6986886 Pput_4720 Pput_4721     TRUE 0.999 0.000 0.758 0.045 Y NA
 6986886 6986887 Pput_4721 Pput_4722     TRUE 0.995 -3.000 0.823 1.000   NA
 6986887 6986888 Pput_4722 Pput_4723     TRUE 0.844 155.000 0.731 0.013   NA
 6986888 6986889 Pput_4723 Pput_4724     FALSE 0.192 32.000 0.000 1.000 N NA
 6986890 6986891 Pput_4725 Pput_4726     TRUE 0.989 3.000 0.512 NA   NA
 6986893 6986894 Pput_4728 Pput_4729     FALSE 0.268 70.000 0.031 NA   NA
 6986894 6986895 Pput_4729 Pput_4730     FALSE 0.436 64.000 0.067 NA   NA
 6986898 6986899 Pput_4733 Pput_4734     FALSE 0.291 44.000 0.000 1.000   NA
 6986901 6986902 Pput_4736 Pput_4737     FALSE 0.094 90.000 0.000 NA   NA
 6986902 6986903 Pput_4737 Pput_4738     FALSE 0.116 53.000 0.000 1.000 N NA
 6986903 6986904 Pput_4738 Pput_4739     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6986905 6986906 Pput_4740 Pput_4741     FALSE 0.003 594.000 0.000 1.000   NA
 6986906 6986907 Pput_4741 Pput_4742     TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.013 Y NA
 6986907 6986908 Pput_4742 Pput_4743     TRUE 0.993 -3.000 0.268 1.000 Y NA
 6986908 6986909 Pput_4743 Pput_4744     TRUE 0.995 3.000 0.263 0.045 Y NA
 6986909 6986910 Pput_4744 Pput_4745     TRUE 0.596 155.000 0.175 1.000 Y NA
 6986911 6986912 Pput_4746 Pput_4747   nadE TRUE 0.968 4.000 0.033 1.000 Y NA
 6986915 6986916 Pput_4750 Pput_4751     FALSE 0.011 285.000 0.000 NA   NA
 6986917 6986918 Pput_4752 Pput_4753     TRUE 0.778 2.000 0.000 NA   NA
 6986919 6986920 Pput_4754 Pput_4755   rplI FALSE 0.203 114.000 0.074 1.000 N NA
 6986920 6986921 Pput_4755 Pput_4756 rplI   TRUE 0.636 21.000 0.034 NA   NA
 6986921 6986922 Pput_4756 Pput_4757   rpsR FALSE 0.520 34.000 0.034 NA   NA
 6986922 6986923 Pput_4757 Pput_4758 rpsR rpsF TRUE 0.979 29.000 0.319 0.007 Y NA
 6986923 6986924 Pput_4758 Pput_4759 rpsF   FALSE 0.081 290.000 0.017 1.000 Y NA
 6986924 6986925 Pput_4759 Pput_4760     TRUE 0.983 -3.000 0.147 0.010 N NA
 6986926 6986927 Pput_R0097 Pput_R0098     FALSE 0.096 89.000 0.000 NA   NA
 6986927 6986928 Pput_R0098 Pput_4761     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 6986928 6986929 Pput_4761 Pput_4762     TRUE 0.998 0.000 0.529 0.045 Y NA
 6986930 6986931 Pput_4763 Pput_4764     FALSE 0.041 185.000 0.000 NA   NA
 6986931 6986932 Pput_4764 Pput_4765     FALSE 0.004 342.000 0.007 1.000 N NA
 6986932 6986933 Pput_4765 Pput_4766   hisZ TRUE 0.587 57.000 0.161 1.000 N NA
 6986933 6986934 Pput_4766 Pput_4767 hisZ   FALSE 0.018 302.000 0.045 1.000 N NA
 6986934 6986935 Pput_4767 Pput_4768     TRUE 0.999 0.000 0.947 0.007 Y NA
 6986935 6986936 Pput_4768 Pput_4769     TRUE 0.607 97.000 0.184 0.056   NA
 6986936 6986937 Pput_4769 Pput_4770   hfq TRUE 0.900 13.000 0.141 1.000   NA
 6986937 6986938 Pput_4770 Pput_4771 hfq miaA TRUE 0.732 95.000 0.531 1.000   NA
 6986938 6986939 Pput_4771 Pput_4772 miaA mutL TRUE 0.979 2.000 0.188 0.072 N NA
 6986939 6986940 Pput_4772 Pput_4773 mutL   TRUE 0.858 -3.000 0.030 1.000 N NA
 6986940 6986941 Pput_4773 Pput_4774     TRUE 0.776 12.000 0.033 NA   NA
 6986941 6986942 Pput_4774 Pput_4775     TRUE 0.936 -12.000 0.118 NA   NA
 6986944 6986945 Pput_4777 Pput_4778     FALSE 0.124 92.000 0.013 NA   NA
 6986947 6986948 Pput_4780 Pput_4781 motB   TRUE 0.997 4.000 0.722 1.000 Y NA
 6986949 6986950 Pput_4782 Pput_4783     TRUE 0.706 45.000 0.156 NA   NA
 6986950 6986951 Pput_4783 Pput_4784   psd TRUE 0.906 10.000 0.125 1.000 N NA
 6986954 6986955 Pput_4787 Pput_4788     FALSE 0.098 128.000 0.012 NA   NA
 6986955 6986956 Pput_4788 Pput_4789     TRUE 0.743 11.000 0.016 1.000   NA
 6986956 6986957 Pput_4789 Pput_4790     TRUE 0.908 -3.000 0.034 NA   NA
 6986957 6986958 Pput_4790 Pput_4791     TRUE 0.855 -3.000 0.012 NA   NA
 6986958 6986959 Pput_4791 Pput_4792     TRUE 0.812 36.000 0.217 NA   NA
 6986959 6986960 Pput_4792 Pput_4793     FALSE 0.272 242.000 0.427 NA   NA
 6986960 6986961 Pput_4793 Pput_4794     TRUE 0.709 86.000 0.433 NA   NA
 6986961 6986962 Pput_4794 Pput_4795     TRUE 0.989 -3.000 0.443 NA   NA
 6986964 6986965 Pput_4797 Pput_4798     FALSE 0.037 166.000 0.007 1.000 N NA
 6986967 6986968 Pput_4800 Pput_4801     TRUE 0.674 12.000 0.028 1.000 N NA
 6986969 6986970 Pput_4802 Pput_4803     TRUE 0.639 89.000 0.400 1.000 N NA
 6986970 6986971 Pput_4803 Pput_4804     TRUE 0.996 -3.000 0.441 1.000 Y NA
 6986971 6986972 Pput_4804 Pput_4805     TRUE 0.787 59.000 0.324 1.000   NA
 6986973 6986974 Pput_4806 Pput_4807     FALSE 0.083 131.000 0.023 1.000 N NA
 6986974 6986975 Pput_4807 Pput_4808     FALSE 0.450 16.000 0.017 NA N NA
 6986977 6986978 Pput_4810 Pput_4811     FALSE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 6986978 6986979 Pput_4811 Pput_4812     TRUE 0.754 66.000 0.333 NA   NA
 6986979 6986980 Pput_4812 Pput_4813     TRUE 0.680 49.000 0.154 NA   NA
 6986980 6986981 Pput_4813 Pput_4814     TRUE 0.987 -30.000 0.625 NA   NA
 6986981 6986982 Pput_4814 Pput_4815     TRUE 0.983 0.000 0.312 NA   NA
 6986982 6986983 Pput_4815 Pput_4816     TRUE 0.988 -16.000 0.409 0.012 N NA
 6986983 6986984 Pput_4816 Pput_4817     FALSE 0.035 193.000 0.000 NA   NA
 6986984 6986985 Pput_4817 Pput_4818     FALSE 0.074 107.000 0.000 NA   NA
 6986988 6986989 Pput_4821 Pput_4822     FALSE 0.334 32.000 0.000 NA   NA
 6986989 6986990 Pput_4822 Pput_4823     TRUE 0.977 0.000 0.233 NA   NA
 6986990 6986991 Pput_4823 Pput_4824     FALSE 0.457 110.000 0.235 NA   NA
 6986991 6986992 Pput_4824 Pput_4825     TRUE 0.823 -34.000 0.029 1.000   NA
 6986992 6986993 Pput_4825 Pput_4826     FALSE 0.096 123.000 0.011 NA   NA
 6986993 6986994 Pput_4826 Pput_4827     FALSE 0.033 212.000 0.009 NA   NA
 6986997 6986998 Pput_4830 Pput_4831     TRUE 0.774 13.000 0.040 NA   NA
 6986998 6986999 Pput_4831 Pput_4832     TRUE 0.905 1.000 0.040 NA   NA
 6986999 6987000 Pput_4832 Pput_4833     FALSE 0.012 213.000 0.000 1.000 N NA
 6987000 6987001 Pput_4833 Pput_4834     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 6987001 6987002 Pput_4834 Pput_4835     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6987002 6987003 Pput_4835 Pput_4836   pgk TRUE 0.825 0.000 0.004 NA   NA
 6987003 6987004 Pput_4836 Pput_4837 pgk   TRUE 0.978 13.000 0.070 0.003 Y NA
 6987004 6987005 Pput_4837 Pput_4838     TRUE 0.580 191.000 0.285 1.000 Y NA
 6987006 6987007 Pput_4839 Pput_4840     TRUE 0.586 19.000 0.036 1.000 N NA
 6987007 6987008 Pput_4840 Pput_4841   ligB FALSE 0.012 230.000 0.004 1.000 N NA
 6987008 6987009 Pput_4841 Pput_4842 ligB   FALSE 0.247 133.000 0.079 NA   NA
 6987012 6987013 Pput_4845 Pput_4846     TRUE 0.872 29.000 0.267 NA   NA
 6987016 6987017 Pput_4849 Pput_4850     FALSE 0.127 167.000 0.061 1.000 N NA
 6987017 6987018 Pput_4850 Pput_4851     FALSE 0.113 94.000 0.010 NA   NA
 6987018 6987019 Pput_4851 Pput_4852     FALSE 0.277 170.000 0.167 NA   NA
 6987019 6987020 Pput_4852 Pput_4853     FALSE 0.011 219.000 0.000 1.000 N NA
 6987021 6987022 Pput_4854 Pput_4855     TRUE 0.950 33.000 0.676 NA   NA
 6987022 6987023 Pput_4855 Pput_4856     FALSE 0.153 200.000 0.032 0.043 N NA
 6987024 6987025 Pput_4857 Pput_4858     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 6987025 6987026 Pput_4858 Pput_4859     FALSE 0.149 149.000 0.041 NA   NA
 6987027 6987028 Pput_4860 Pput_4861     FALSE 0.031 208.000 0.000 1.000   NA
 6987028 6987029 Pput_4861 Pput_4862     TRUE 0.974 -7.000 0.087 0.009   NA
 6987029 6987030 Pput_4862 Pput_4863     TRUE 0.995 13.000 0.554 0.009 Y NA
 6987030 6987031 Pput_4863 Pput_4864     TRUE 0.997 12.000 0.795 0.008 Y NA
 6987031 6987032 Pput_4864 Pput_4865     TRUE 0.993 -3.000 0.266 1.000 Y NA
 6987032 6987033 Pput_4865 Pput_4866     TRUE 0.959 48.000 0.296 0.020 Y NA
 6987034 6987035 Pput_4867 Pput_4868     FALSE 0.271 92.000 0.089 1.000 N NA
 6987035 6987036 Pput_4868 Pput_4869     FALSE 0.126 165.000 0.064 NA N NA
 6987036 6987037 Pput_4869 Pput_4870     TRUE 0.976 0.000 0.263 NA N NA
 6987037 6987038 Pput_4870 Pput_4871     TRUE 0.566 50.000 0.109 1.000 N NA
 6987038 6987039 Pput_4871 Pput_4872   pyrB TRUE 0.977 13.000 0.247 1.000 Y NA
 6987039 6987040 Pput_4872 Pput_4873 pyrB pyrC TRUE 0.996 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 6987040 6987041 Pput_4873 Pput_4874 pyrC   FALSE 0.002 472.000 0.000 1.000 N NA
 6987041 6987042 Pput_4874 Pput_4875   hslU TRUE 0.938 77.000 0.752 1.000 Y NA
 6987042 6987043 Pput_4875 Pput_4876 hslU   FALSE 0.294 89.000 0.070 NA   NA
 6987043 6987044 Pput_4876 Pput_4877     FALSE 0.013 269.000 0.000 NA   NA
 6987044 6987045 Pput_4877 Pput_4878     TRUE 0.973 -3.000 0.190 NA   NA
 6987045 6987046 Pput_4878 Pput_4879     TRUE 0.632 50.000 0.119 NA   NA
 6987046 6987047 Pput_4879 Pput_4880     TRUE 0.864 13.000 0.123 1.000 N NA
 6987048 6987049 Pput_4881 Pput_4882     TRUE 0.985 11.000 0.667 NA   NA
 6987052 6987053 Pput_4885 Pput_4886 ubiE   TRUE 0.965 0.000 0.145 1.000   NA
 6987053 6987054 Pput_4886 Pput_4887     TRUE 0.990 -3.000 0.432 1.000   NA
 6987054 6987055 Pput_4887 Pput_4888   hisI FALSE 0.212 73.000 0.018 1.000   NA
 6987055 6987056 Pput_4888 Pput_4889 hisI hisE TRUE 0.994 2.000 0.152 0.002 Y NA
 6987056 6987057 Pput_4889 Pput_4890 hisE tatA FALSE 0.408 26.000 0.021 1.000 N NA
 6987057 6987058 Pput_4890 Pput_4891 tatA tatB TRUE 0.993 4.000 0.157 0.005 Y NA
 6987058 6987059 Pput_4891 Pput_4892 tatB   TRUE 0.994 -3.000 0.314 NA Y NA
 6987059 6987060 Pput_4892 Pput_4893     TRUE 0.947 -3.000 0.076 NA   NA
 6987060 6987061 Pput_4893 Pput_4894     FALSE 0.077 102.000 0.000 NA   NA
 6987061 6987062 Pput_4894 Pput_4895     FALSE 0.063 460.000 0.000 0.008 Y NA
 6987063 6987064 Pput_4896 Pput_4897     TRUE 0.995 -7.000 0.536 1.000 Y NA
 6987064 6987065 Pput_4897 Pput_4898     TRUE 0.846 80.000 0.179 0.045 Y NA
 6987065 6987066 Pput_4898 Pput_4899     FALSE 0.002 338.000 0.000 NA N NA
 6987066 6987067 Pput_4899 Pput_4900   mdoG TRUE 0.865 -7.000 0.052 NA N NA
 6987067 6987068 Pput_4900 Pput_4901 mdoG   FALSE 0.006 264.000 0.000 1.000 N NA
 6987068 6987069 Pput_4901 Pput_4902     TRUE 0.966 -3.000 0.026 0.027   NA
 6987069 6987070 Pput_4902 Pput_4903     FALSE 0.057 170.000 0.000 1.000   NA
 6987070 6987071 Pput_4903 Pput_4904     TRUE 0.722 11.000 0.031 1.000 N NA
 6987071 6987072 Pput_4904 Pput_4905     FALSE 0.427 16.000 0.010 1.000 N NA
 6987072 6987073 Pput_4905 Pput_4906     FALSE 0.360 158.000 0.022 1.000 Y NA
 6987073 6987074 Pput_4906 Pput_4907     TRUE 0.888 109.000 0.315 0.000 Y NA
 6987074 6987075 Pput_4907 Pput_4908     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 6987075 6987076 Pput_4908 Pput_4909     TRUE 0.972 -3.000 0.189 NA   NA
 6987078 6987079 Pput_4911 Pput_4912     TRUE 0.976 -3.000 0.208 1.000   NA
 6987079 6987080 Pput_4912 Pput_4913     FALSE 0.113 228.000 0.119 1.000   NA
 6987080 6987081 Pput_4913 Pput_4914     TRUE 0.941 4.000 0.103 1.000   NA
 6987081 6987082 Pput_4914 Pput_4915     FALSE 0.300 238.000 0.032 0.008 Y NA
 6987084 6987085 Pput_4917 Pput_4918     FALSE 0.040 186.000 0.000 NA   NA
 6987085 6987086 Pput_4918 Pput_4919     FALSE 0.058 129.000 0.011 1.000 N NA
 6987087 6987088 Pput_4920 Pput_4921     FALSE 0.341 149.000 0.005 1.000 Y NA
 6987088 6987089 Pput_4921 Pput_4922     FALSE 0.006 268.000 0.000 1.000 N NA
 6987089 6987090 Pput_4922 Pput_4923     TRUE 0.998 -3.000 0.587 0.072 Y NA
 6987093 6987094 Pput_4926 Pput_4927     TRUE 0.772 40.000 0.221 1.000 N NA
 6987094 6987095 Pput_4927 Pput_4928     TRUE 0.952 2.000 0.166 NA N NA
 6987096 6987097 Pput_4929 Pput_4930     FALSE 0.302 141.000 0.170 1.000 N NA
 6987097 6987098 Pput_4930 Pput_4931     FALSE 0.405 235.000 0.408 0.016 N NA
 6987098 6987099 Pput_4931 Pput_4932     TRUE 0.955 9.000 0.210 1.000   NA
 6987100 6987101 Pput_4933 Pput_4934     FALSE 0.027 211.000 0.000 NA   NA
 6987102 6987103 Pput_4935 Pput_4936     TRUE 0.892 40.000 0.459 1.000 N NA
 6987103 6987104 Pput_4936 Pput_4937     TRUE 0.801 78.000 0.634 1.000 N NA
 6987106 6987107 Pput_4939 Pput_4940     TRUE 0.876 36.000 0.379 1.000 N NA
 6987107 6987108 Pput_4940 Pput_4941     FALSE 0.103 163.000 0.028 NA   NA
 6987108 6987109 Pput_4941 Pput_4942     FALSE 0.084 131.000 0.006 NA   NA
 6987110 6987111 Pput_4943 Pput_4944     FALSE 0.244 77.000 0.054 1.000 N NA
 6987113 6987114 Pput_4946 Pput_4947   hemE FALSE 0.073 119.000 0.000 NA   NA
 6987114 6987115 Pput_4947 Pput_4948 hemE gltD FALSE 0.041 195.000 0.024 1.000 N NA
 6987115 6987116 Pput_4948 Pput_4949 gltD gltB TRUE 0.843 124.000 0.214 0.001 Y NA
 6987116 6987117 Pput_4949 Pput_4950 gltB   FALSE 0.013 374.000 0.037 NA   NA
 6987117 6987118 Pput_4950 Pput_4951   aroB TRUE 0.618 16.000 0.020 NA   NA
 6987118 6987119 Pput_4951 Pput_4952 aroB aroK FALSE 0.417 97.000 0.008 1.000 Y NA
 6987119 6987120 Pput_4952 Pput_4953 aroK   TRUE 0.661 5.000 0.009 1.000 N NA
 6987120 6987121 Pput_4953 Pput_4954     TRUE 0.945 -76.000 0.017 NA Y NA
 6987121 6987122 Pput_4954 Pput_4955     TRUE 0.994 12.000 0.770 NA Y NA
 6987122 6987123 Pput_4955 Pput_4956     TRUE 0.997 -3.000 0.616 NA Y NA
 6987125 6987126 Pput_4958 Pput_4959     FALSE 0.198 169.000 0.119 1.000 N NA
 6987126 6987127 Pput_4959 Pput_4960     TRUE 0.788 3.000 0.023 1.000 N NA
 6987128 6987129 Pput_4961 Pput_4962   argS FALSE 0.168 188.000 0.036 0.072 N NA
 6987129 6987130 Pput_4962 Pput_4963 argS   TRUE 0.884 2.000 0.052 NA N NA
 6987134 6987135 Pput_4967 Pput_4968     TRUE 0.743 39.000 0.158 NA   NA
 6987135 6987136 Pput_4968 Pput_4969     TRUE 0.797 11.000 0.029 1.000   NA
 6987136 6987137 Pput_4969 Pput_4970   metX FALSE 0.117 100.000 0.012 1.000   NA
 6987137 6987138 Pput_4970 Pput_4971 metX   TRUE 0.981 8.000 0.509 NA N NA
 6987138 6987139 Pput_4971 Pput_4972     TRUE 0.781 23.000 0.100 NA   NA
 6987139 6987140 Pput_4972 Pput_4973     TRUE 0.928 -3.000 0.050 NA   NA
 6987140 6987141 Pput_4973 Pput_4974     TRUE 0.972 -3.000 0.218 1.000 N NA
 6987141 6987142 Pput_4974 Pput_4975     TRUE 0.729 10.000 0.011 NA   NA
 6987143 6987144 Pput_4976 Pput_4977 trmB thiG TRUE 0.879 10.000 0.060 1.000   NA
 6987144 6987145 Pput_4977 Pput_4978 thiG   TRUE 0.839 55.000 0.130 1.000 Y NA
 6987145 6987146 Pput_4978 Pput_4979     FALSE 0.217 103.000 0.058 NA   NA
 6987148 6987149 Pput_4981 Pput_4982     FALSE 0.158 112.000 0.054 1.000 N NA
 6987149 6987150 Pput_4982 Pput_4983     TRUE 0.978 -3.000 0.035 1.000 Y NA
 6987150 6987151 Pput_4983 Pput_4984     TRUE 0.969 3.000 0.117 0.072 N NA
 6987152 6987153 Pput_4985 Pput_4986     TRUE 0.995 -7.000 0.598 0.004   NA
 6987153 6987154 Pput_4986 Pput_4987     TRUE 0.944 0.000 0.070 1.000   NA
 6987154 6987155 Pput_4987 Pput_4988     FALSE 0.124 91.000 0.008 1.000   NA
 6987155 6987156 Pput_4988 Pput_4989     TRUE 0.995 -7.000 0.598 0.004   NA
 6987156 6987157 Pput_4989 Pput_4990     FALSE 0.202 61.000 0.000 1.000   NA
 6987158 6987159 Pput_4991 Pput_4992     FALSE 0.005 295.000 0.000 1.000 N NA
 6987159 6987160 Pput_4992 Pput_4993     FALSE 0.293 36.000 0.017 1.000 N NA
 6987161 6987162 Pput_4994 Pput_4995     TRUE 0.962 11.000 0.308 NA   NA
 6987162 6987163 Pput_4995 Pput_4996     TRUE 0.977 21.000 0.886 NA   NA
 6987163 6987164 Pput_4996 Pput_4997   coaD FALSE 0.057 113.000 0.011 1.000 N NA
 6987164 6987165 Pput_4997 Pput_4998 coaD   FALSE 0.272 108.000 0.088 NA   NA
 6987166 6987167 Pput_4999 Pput_5000     TRUE 0.687 4.000 0.015 NA N NA
 6987168 6987169 Pput_5001 Pput_5002     FALSE 0.014 271.000 0.000 1.000   NA
 6987173 6987174 Pput_5006 Pput_5007     TRUE 0.994 -7.000 0.904 NA   NA
 6987175 6987176 Pput_5008 Pput_5009     TRUE 0.990 19.000 0.500 0.045 Y NA
 6987176 6987177 Pput_5009 Pput_5010     TRUE 0.997 2.000 0.857 0.045 N NA
 6987177 6987178 Pput_5010 Pput_5011     FALSE 0.258 232.000 0.417 1.000 N NA
 6987178 6987179 Pput_5011 Pput_5012     TRUE 0.876 10.000 0.083 1.000 N NA
 6987182 6987183 Pput_5015 Pput_5016     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 6987183 6987184 Pput_5016 Pput_5017     FALSE 0.002 757.000 0.000 NA   NA
 6987185 6987186 Pput_5018 Pput_5019     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6987188 6987189 Pput_5021 Pput_5022     TRUE 0.997 7.000 0.463 0.001 Y NA
 6987189 6987190 Pput_5022 Pput_5023     FALSE 0.004 282.000 0.000 NA N NA
 6987190 6987191 Pput_5023 Pput_5024     TRUE 0.802 86.000 0.750 NA N NA
 6987191 6987192 Pput_5024 Pput_5025     TRUE 0.996 -3.000 0.688 0.059 N NA
 6987192 6987193 Pput_5025 Pput_5026     TRUE 0.706 108.000 0.625 1.000 N NA
 6987193 6987194 Pput_5026 Pput_5027     FALSE 0.046 175.000 0.000 NA   NA
 6987194 6987195 Pput_5027 Pput_5028     FALSE 0.421 22.000 0.000 NA   NA
 6987195 6987196 Pput_5028 Pput_5029     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6987196 6987197 Pput_5029 Pput_5030     FALSE 0.035 193.000 0.000 NA   NA
 6987197 6987198 Pput_5030 Pput_5031     TRUE 0.540 -13.000 0.000 1.000 N NA
 6987204 6987205 Pput_5037 Pput_5038     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 6987205 6987206 Pput_5038 Pput_5039     FALSE 0.421 22.000 0.000 NA   NA
 6987206 6987207 Pput_5039 Pput_5040     TRUE 0.995 3.000 1.000 NA   NA
 6987207 6987208 Pput_5040 Pput_5041     TRUE 0.952 31.000 0.667 NA   NA
 6987208 6987209 Pput_5041 Pput_5042     FALSE 0.003 548.000 0.000 NA   NA
 6987209 6987210 Pput_5042 Pput_5043     FALSE 0.084 96.000 0.000 NA   NA
 6987210 6987211 Pput_5043 Pput_5044     TRUE 0.828 -3.000 0.003 NA   NA
 6987211 6987212 Pput_5044 Pput_5045     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 6987212 6987213 Pput_5045 Pput_5046     TRUE 0.951 3.000 0.000 0.003   NA
 6987213 6987214 Pput_5046 Pput_5047     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.003   NA
 6987214 6987215 Pput_5047 Pput_5048     FALSE 0.059 89.000 0.003 1.000 N NA
 6987215 6987216 Pput_5048 Pput_5049     TRUE 0.627 52.000 0.164 1.000 N NA
 6987216 6987217 Pput_5049 Pput_5050     TRUE 0.676 17.000 0.030 1.000   NA
 6987219 6987220 Pput_5052 Pput_5053     TRUE 0.736 23.000 0.097 1.000 N NA
 6987222 6987223 Pput_5055 Pput_5056     FALSE 0.280 70.000 0.034 NA   NA
 6987225 6987226 Pput_5058 Pput_5059     TRUE 0.675 91.000 0.417 NA   NA
 6987226 6987227 Pput_5059 Pput_5060     FALSE 0.076 203.000 0.041 NA   NA
 6987227 6987228 Pput_5060 Pput_5061     TRUE 0.653 27.000 0.071 1.000 N NA
 6987232 6987233 Pput_5065 Pput_5066     TRUE 0.803 -13.000 0.019 NA   NA
 6987239 6987240 Pput_5072 Pput_5073     TRUE 0.875 26.000 0.294 NA N NA
 6987240 6987241 Pput_5073 Pput_5074     TRUE 0.818 65.000 0.444 NA   NA
 6987241 6987242 Pput_5074 Pput_5075     FALSE 0.027 211.000 0.000 NA   NA
 6987242 6987243 Pput_5075 Pput_5076     TRUE 0.996 4.000 0.587 1.000 Y NA
 6987243 6987244 Pput_5076 Pput_5077     TRUE 0.995 12.000 0.935 0.000 N NA
 6987244 6987245 Pput_5077 Pput_5078     FALSE 0.312 186.000 0.066 0.001 N NA
 6987245 6987246 Pput_5078 Pput_5079     TRUE 0.707 51.000 0.188 NA   NA
 6987246 6987247 Pput_5079 Pput_5080     FALSE 0.019 234.000 0.000 NA   NA
 6987247 6987248 Pput_5080 Pput_5081     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 6987248 6987249 Pput_5081 Pput_5082     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.008 Y NA
 6987251 6987252 Pput_5084 Pput_5085     TRUE 0.993 -3.000 0.094 0.044 Y NA
 6987252 6987253 Pput_5085 Pput_5086     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 6987253 6987254 Pput_5086 Pput_5087     TRUE 0.917 71.000 0.500 1.000 Y NA
 6987254 6987255 Pput_5087 Pput_5088     TRUE 0.892 157.000 0.500 0.013 Y NA
 6987255 6987256 Pput_5088 Pput_5089     FALSE 0.211 169.000 0.130 1.000 N NA
 6987256 6987257 Pput_5089 Pput_5090     TRUE 0.739 49.000 0.239 1.000 N NA
 6987259 6987260 Pput_5092 Pput_5093     TRUE 0.706 125.000 0.051 0.002 Y NA
 6987263 6987264 Pput_5096 Pput_5097     FALSE 0.159 185.000 0.082 NA   NA
 6987264 6987265 Pput_5097 Pput_5098     FALSE 0.217 89.000 0.041 NA   NA
 6987266 6987267 Pput_5099 Pput_5100     FALSE 0.526 197.000 0.249 1.000 Y NA
 6987267 6987268 Pput_5100 Pput_5101   gcvT TRUE 0.965 52.000 0.317 0.001 Y NA
 6987268 6987269 Pput_5101 Pput_5102 gcvT   FALSE 0.071 128.000 0.017 1.000 N NA
 6987269 6987270 Pput_5102 Pput_5103     TRUE 0.938 153.000 0.844 0.044 Y NA
 6987270 6987271 Pput_5103 Pput_5104     FALSE 0.310 194.000 0.312 1.000 N NA
 6987271 6987272 Pput_5104 Pput_5105     TRUE 0.926 4.000 0.079 NA   NA
 6987272 6987273 Pput_5105 Pput_5106     TRUE 0.918 -3.000 0.042 NA   NA
 6987273 6987274 Pput_5106 Pput_5107     TRUE 0.986 -3.000 0.396 1.000 N NA
 6987274 6987275 Pput_5107 Pput_5108     TRUE 0.918 22.000 0.329 NA   NA
 6987276 6987277 Pput_5109 Pput_5110     TRUE 0.930 -3.000 0.053 NA   NA
 6987277 6987278 Pput_5110 Pput_5111     FALSE 0.016 322.000 0.034 NA   NA
 6987280 6987281 Pput_5113 Pput_5114     FALSE 0.107 96.000 0.009 NA   NA
 6987281 6987282 Pput_5114 Pput_5115     TRUE 0.982 -3.000 0.143 0.086   NA
 6987282 6987283 Pput_5115 Pput_5116     TRUE 0.992 2.000 0.333 0.004   NA
 6987284 6987285 Pput_5117 Pput_5118     FALSE 0.067 155.000 0.000 1.000   NA
 6987287 6987288 Pput_5120 Pput_5121     FALSE 0.006 247.000 0.000 NA N NA
 6987288 6987289 Pput_5121 Pput_5122     TRUE 0.977 0.000 0.039 NA Y NA
 6987289 6987290 Pput_5122 Pput_5123   rho FALSE 0.031 208.000 0.025 NA N NA
 6987290 6987291 Pput_5123 Pput_5124 rho   FALSE 0.094 228.000 0.087 1.000   NA
 6987299 6987300 Pput_5132 Pput_5133     FALSE 0.064 147.000 0.000 NA   NA
 6987300 6987301 Pput_5133 Pput_5134   cyaY TRUE 0.778 2.000 0.000 NA   NA
 6987302 6987303 Pput_5135 Pput_5136     TRUE 0.888 10.000 0.071 NA   NA
 6987303 6987304 Pput_5136 Pput_5137   dapF TRUE 0.992 5.000 0.104 0.001 Y NA
 6987304 6987305 Pput_5137 Pput_5138 dapF   TRUE 0.899 14.000 0.175 NA   NA
 6987305 6987306 Pput_5138 Pput_5139   xerC TRUE 0.994 0.000 0.714 NA   NA
 6987306 6987307 Pput_5139 Pput_5140 xerC   TRUE 0.987 -3.000 0.367 1.000   NA
 6987308 6987309 Pput_5141 Pput_5142     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 6987309 6987310 Pput_5142 Pput_5143     TRUE 0.620 48.000 0.135 1.000 N NA
 6987311 6987312 Pput_5144 Pput_5145     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6987314 6987315 Pput_5147 Pput_5148     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6987315 6987316 Pput_5148 Pput_5149     FALSE 0.002 762.000 0.000 NA   NA
 6987317 6987318 Pput_5150 Pput_5151     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.019   NA
 6987320 6987321 Pput_5153 Pput_5154     FALSE 0.065 74.000 0.000 1.000 N NA
 6987322 6987323 Pput_5155 Pput_5156     FALSE 0.010 229.000 0.000 1.000 N NA
 6987323 6987324 Pput_5156 Pput_5157     FALSE 0.003 688.000 0.000 NA   NA
 6987326 6987327 Pput_5159 Pput_5160     FALSE 0.031 208.000 0.000 1.000   NA
 6987327 6987328 Pput_5160 Pput_5161     TRUE 0.947 2.000 0.100 NA   NA
 6987329 6987330 Pput_5162 Pput_5163     FALSE 0.074 200.000 0.033 1.000   NA
 6987330 6987331 Pput_5163 Pput_5164     TRUE 0.572 41.000 0.059 NA   NA
 6987331 6987332 Pput_5164 Pput_5165     FALSE 0.204 118.000 0.056 NA   NA
 6987334 6987335 Pput_5167 Pput_5168     TRUE 0.934 8.000 0.173 1.000 N NA
 6987336 6987337 Pput_5169 Pput_5170     FALSE 0.030 204.000 0.000 NA   NA
 6987341 6987342 Pput_5174 Pput_5175     FALSE 0.177 65.000 0.020 1.000 N NA
 6987343 6987344 Pput_5176 Pput_5177     FALSE 0.290 228.000 0.123 1.000 Y NA
 6987344 6987345 Pput_5177 Pput_5178     FALSE 0.156 137.000 0.057 1.000 N NA
 6987345 6987346 Pput_5178 Pput_5179   dadX FALSE 0.338 57.000 0.046 1.000 N NA
 6987346 6987347 Pput_5179 Pput_5180 dadX   FALSE 0.218 145.000 0.099 1.000 N NA
 6987352 6987353 Pput_5185 Pput_5186     TRUE 0.620 61.000 0.200 1.000 N NA
 6987354 6987355 Pput_5187 Pput_5188     FALSE 0.465 111.000 0.292 NA N NA
 6987356 6987357 Pput_5189 Pput_5190     FALSE 0.377 27.000 0.000 NA   NA
 6987358 6987359 Pput_5191 Pput_5192 rpmG rpmB TRUE 0.993 12.000 0.332 0.007 Y NA
 6987362 6987363 Pput_5195 Pput_5196   dut TRUE 0.950 6.000 0.201 1.000 N NA
 6987363 6987364 Pput_5196 Pput_5197 dut   FALSE 0.124 112.000 0.039 1.000 N NA
 6987364 6987365 Pput_5197 Pput_5198     FALSE 0.513 31.000 0.044 1.000 N NA
 6987368 6987369 Pput_5201 Pput_5202   rph FALSE 0.517 24.000 0.018 NA   NA
 6987370 6987371 Pput_5203 Pput_5204   gmk TRUE 0.937 14.000 0.276 NA   NA
 6987372 6987373 Pput_5206 Pput_5207     TRUE 0.765 54.000 0.250 1.000   NA
 6987373 6987374 Pput_5207 Pput_5208     TRUE 0.753 5.000 0.000 1.000   NA
 6987375 6987376 Pput_5209 Pput_5210   rpoZ FALSE 0.116 241.000 0.000 1.000 Y NA
 6987376 6987377 Pput_5210 Pput_5211 rpoZ   TRUE 0.896 60.000 0.291 1.000 Y NA
 6987377 6987378 Pput_5211 Pput_5212     TRUE 0.840 24.000 0.215 NA N NA
 6987378 6987379 Pput_5212 Pput_5213     FALSE 0.447 57.000 0.056 NA   NA
 6987381 6987382 Pput_5215 Pput_5216     TRUE 0.998 4.000 0.810 0.057 Y NA
 6987382 6987383 Pput_5216 Pput_5217     TRUE 0.978 -3.000 0.143 0.085 N NA
 6987383 6987384 Pput_5217 Pput_5218     FALSE 0.098 95.000 0.023 1.000 N NA
 6987384 6987385 Pput_5218 Pput_5219     TRUE 0.982 4.000 0.117 1.000 Y NA
 6987385 6987386 Pput_5219 Pput_5220     FALSE 0.171 79.000 0.038 NA N NA
 6987387 6987388 Pput_5221 Pput_5222     FALSE 0.484 149.000 0.290 1.000   NA
 6987388 6987389 Pput_5222 Pput_5223     FALSE 0.302 188.000 0.229 1.000   NA
 6987389 6987390 Pput_5223 Pput_5224     TRUE 0.899 17.000 0.208 1.000   NA
 6987391 6987392 Pput_5225 Pput_5226   ubiA TRUE 0.992 0.000 0.248 NA Y NA
 6987394 6987395 Pput_5228 Pput_5229     TRUE 0.973 49.000 0.453 0.025 Y NA
 6987395 6987396 Pput_5229 Pput_5230     FALSE 0.107 174.000 0.037 NA   NA
 6987397 6987398 Pput_5231 Pput_5232     FALSE 0.031 147.000 0.000 1.000 N NA
 6987398 6987399 Pput_5232 Pput_5233     FALSE 0.063 164.000 0.027 NA N NA
 6987399 6987400 Pput_5233 Pput_5234     TRUE 0.774 102.000 0.330 NA Y NA
 6987400 6987401 Pput_5234 Pput_5235     TRUE 0.962 73.000 0.511 0.001 Y NA
 6987401 6987402 Pput_5235 Pput_5236     TRUE 0.974 18.000 0.489 0.085   NA
 6987402 6987403 Pput_5236 Pput_5237     TRUE 0.584 139.000 0.211 0.057   NA
 6987403 6987404 Pput_5237 Pput_5238     FALSE 0.074 237.000 0.020 0.057 N NA
 6987405 6987406 Pput_5239 Pput_5240     FALSE 0.146 72.000 0.025 NA N NA
 6987407 6987408 Pput_5241 Pput_5242     TRUE 0.832 49.000 0.333 NA   NA
 6987408 6987409 Pput_5242 Pput_5243     FALSE 0.203 109.000 0.050 1.000   NA
 6987409 6987410 Pput_5243 Pput_5244     TRUE 0.989 11.000 0.136 0.000 Y NA
 6987413 6987414 Pput_5247 Pput_5248 aspA   FALSE 0.009 231.000 0.000 1.000 N NA
 6987414 6987415 Pput_5248 Pput_5249     FALSE 0.142 297.000 0.429 NA N NA
 6987415 6987416 Pput_5249 Pput_5250     TRUE 0.990 0.000 0.571 NA N NA
 6987418 6987419 Pput_5252 Pput_5253     TRUE 0.825 12.000 0.047 1.000   NA
 6987419 6987420 Pput_5253 Pput_5254     TRUE 0.993 8.000 0.556 0.006   NA
 6987421 6987422 Pput_5255 Pput_5256     TRUE 0.977 12.000 0.354 0.058 N NA
 6987425 6987426 Pput_5259 Pput_5260   uvrD FALSE 0.012 215.000 0.000 1.000 N NA
 6987426 6987427 Pput_5260 Pput_5261 uvrD   FALSE 0.102 92.000 0.000 1.000   NA
 6987427 6987428 Pput_5261 Pput_5262     FALSE 0.111 114.000 0.018 NA   NA
 6987433 6987434 Pput_5267 Pput_5268     TRUE 0.533 41.000 0.048 NA   NA
 6987434 6987435 Pput_5268 Pput_5269     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 6987441 6987442 Pput_5275 Pput_5276     TRUE 0.999 -3.000 0.812 0.001 Y NA
 6987442 6987443 Pput_5276 Pput_5277     TRUE 0.952 19.000 0.188 NA Y NA
 6987443 6987444 Pput_5277 Pput_5278     TRUE 0.639 68.000 0.264 NA N NA
 6987445 6987446 Pput_5279 Pput_5280     FALSE 0.016 247.000 0.000 NA   NA
 6987447 6987448 Pput_5281 Pput_5282     FALSE 0.028 215.000 0.000 1.000   NA
 6987448 6987449 Pput_5282 Pput_5283     FALSE 0.036 124.000 0.000 1.000 N NA
 6987449 6987450 Pput_5283 Pput_5284     FALSE 0.003 615.000 0.000 NA   NA
 6987450 6987451 Pput_5284 Pput_5285     FALSE 0.334 32.000 0.000 NA   NA
 6987452 6987453 Pput_5286 Pput_5287     TRUE 0.843 120.000 0.500 1.000 Y NA
 6987453 6987454 Pput_5287 Pput_5288     FALSE 0.036 109.000 0.000 1.000 N NA
 6987454 6987455 Pput_5288 Pput_5289     FALSE 0.002 454.000 0.000 1.000 N NA
 6987455 6987456 Pput_5289 Pput_5290     TRUE 0.997 9.000 0.487 0.001 Y NA
 6987457 6987458 Pput_5291 Pput_5292     TRUE 0.981 4.000 0.412 1.000 N NA
 6987458 6987459 Pput_5292 Pput_5293     FALSE 0.028 191.000 0.010 1.000 N NA
 6987459 6987460 Pput_5293 Pput_5294   atpC FALSE 0.187 119.000 0.067 1.000 N NA
 6987460 6987461 Pput_5294 Pput_5295 atpC   TRUE 0.990 44.000 0.837 0.002 Y NA
 6987461 6987462 Pput_5295 Pput_5296     TRUE 0.993 28.000 0.724 0.002 Y NA
 6987462 6987463 Pput_5296 Pput_5297     TRUE 0.989 49.000 0.846 0.002 Y NA
 6987463 6987464 Pput_5297 Pput_5298     TRUE 0.995 22.000 0.864 0.002 Y NA
 6987464 6987465 Pput_5298 Pput_5299     TRUE 0.990 13.000 0.242 0.002 Y NA
 6987465 6987466 Pput_5299 Pput_5300     TRUE 0.955 57.000 0.666 0.002   NA
 6987466 6987467 Pput_5300 Pput_5301     TRUE 0.829 145.000 0.557 0.002   NA
 6987467 6987468 Pput_5301 Pput_5302     TRUE 0.987 17.000 0.291 0.002 Y NA
 6987468 6987469 Pput_5302 Pput_5303     FALSE 0.141 150.000 0.056 1.000 N NA
 6987469 6987470 Pput_5303 Pput_5304     TRUE 0.989 10.000 0.827 1.000 N NA
 6987470 6987471 Pput_5304 Pput_5305   gidB TRUE 0.921 19.000 0.339 1.000 N NA
 6987471 6987472 Pput_5305 Pput_5306 gidB   TRUE 0.989 -3.000 0.466 1.000 N NA
 6987472 6987473 Pput_5306 Pput_5307     FALSE 0.007 327.000 0.000 NA   NA
 6987473 6987474 Pput_5307 Pput_5308   trmE FALSE 0.119 77.000 0.000 NA   NA
 6987474 6987475 Pput_5308 Pput_5309 trmE   TRUE 0.684 89.000 0.221 0.054   NA
 6987475 6987476 Pput_5309 Pput_5310     TRUE 0.987 3.000 0.461 NA   NA
 6987476 6987477 Pput_5310 Pput_5311   rnpA TRUE 0.988 -7.000 0.540 NA   NA