MicrobesOnline Operon Predictions for Mycoplasma agalactiae PG2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3504191 3504192 MAG0010 MAG0020 dnaA dnaN TRUE 0.239 134.000 0.004 1.000 Y NA
 3504192 3504193 MAG0020 MAGt01 dnaN   FALSE 0.025 292.000 0.000 NA   NA
 3504193 3504194 MAGt01 MAGt02     TRUE 0.933 4.000 0.000 NA   NA
 3504194 3504195 MAGt02 MAG0030   lip TRUE 0.176 83.000 0.000 NA   NA
 3504195 3504196 MAG0030 MAG0040 lip lip TRUE 0.948 2.000 0.000 0.048   NA
 3504197 3504198 MAG0050 MAG0060     FALSE 0.019 335.000 0.000 1.000 N NA
 3504198 3504199 MAG0060 MAG0070   lplA FALSE 0.007 70.000 0.000 0.007 Y NA
 3504199 3504200 MAG0070 MAG0080 lplA   TRUE 0.999 -22.000 0.107 1.000 N NA
 3504200 3504201 MAG0080 MAG0090   gcdH TRUE 1.000 2.000 0.214 1.000 N NA
 3504201 3504202 MAG0090 MAG0100 gcdH   TRUE 1.000 -16.000 0.571 NA N NA
 3504204 3504205 MAG0120 MAG0130     FALSE 0.087 122.000 0.000 NA   NA
 3504206 3504207 MAG0140 MAG0150     TRUE 1.000 -7.000 0.438 1.000   NA
 3504207 3504208 MAG0150 MAG0160     TRUE 1.000 0.000 0.720 0.050   NA
 3504208 3504209 MAG0160 MAG0170   dgk FALSE 0.022 297.000 0.000 1.000   NA
 3504209 3504210 MAG0170 MAG0180 dgk dgk TRUE 0.999 2.000 0.400 0.004 Y NA
 3504211 3504212 MAG0190 MAG0200     FALSE 0.025 281.000 0.000 NA   NA
 3504212 3504213 MAG0200 MAG0210     TRUE 0.152 90.000 0.000 NA   NA
 3504213 3504214 MAG0210 MAG0220     FALSE 0.029 228.000 0.000 NA   NA
 3504214 3504215 MAG0220 MAG0230     FALSE 0.024 681.000 0.000 NA   NA
 3504215 3504216 MAG0230 MAG0240     TRUE 0.385 44.000 0.000 NA   NA
 3504216 3504217 MAG0240 MAG0250     FALSE 0.046 161.000 0.000 NA   NA
 3504217 3504218 MAG0250 MAG0260     TRUE 0.998 2.000 0.019 NA N NA
 3504219 3504220 MAG0270 MAG0280     TRUE 0.431 40.000 0.000 NA   NA
 3504220 3504221 MAG0280 MAG0290     TRUE 0.854 182.000 0.667 NA   NA
 3504221 3504222 MAG0290 MAG0300     FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 3504222 3504223 MAG0300 MAG0310     TRUE 0.957 -40.000 0.000 NA   NA
 3504223 3504224 MAG0310 MAG0320     TRUE 0.230 67.000 0.000 NA   NA
 3504224 3504225 MAG0320 MAG0330     TRUE 0.448 39.000 0.000 NA   NA
 3504226 3504227 MAG0340 MAG0350 oppF oppD TRUE 1.000 -7.000 0.769 0.008 N NA
 3504227 3504228 MAG0350 MAG0360 oppD oppC TRUE 0.998 8.000 0.692 1.000 Y NA
 3504228 3504229 MAG0360 MAG0370 oppC oppB TRUE 0.999 2.000 1.000 0.048 Y NA
 3504229 3504230 MAG0370 MAG0380 oppB oppA TRUE 0.997 9.000 0.167 0.048 Y NA
 3504230 3504231 MAG0380 MAG0390 oppA   TRUE 0.998 15.000 0.167 1.000   NA
 3504232 3504233 MAG0400 MAG0410 cysS   TRUE 0.794 47.000 0.009 1.000 Y NA
 3504233 3504234 MAG0410 MAG0420     TRUE 0.845 11.000 0.000 1.000   NA
 3504234 3504235 MAG0420 MAG0430   rpmG TRUE 0.263 55.000 0.000 1.000   NA
 3504235 3504236 MAG0430 MAG0440 rpmG nusG FALSE 0.025 242.000 0.000 1.000   NA
 3504236 3504237 MAG0440 MAG0450 nusG   FALSE 0.065 132.000 0.000 1.000   NA
 3504237 3504238 MAG0450 MAG0460   pyrH FALSE 0.032 190.000 0.000 1.000   NA
 3504238 3504239 MAG0460 MAG0470 pyrH rrf TRUE 1.000 0.000 0.626 NA N NA
 3504239 3504240 MAG0470 MAGt03 rrf   TRUE 0.152 90.000 0.000 NA   NA
 3504240 3504241 MAGt03 MAGt04     TRUE 0.913 7.000 0.000 NA   NA
 3504242 3504243 MAG0480 MAG0490     TRUE 0.992 -75.000 0.002 NA   NA
 3504243 3504244 MAG0490 MAG0500   gpsA TRUE 0.152 90.000 0.000 NA   NA
 3504244 3504245 MAG0500 MAG0510 gpsA ksgA TRUE 0.758 16.000 0.000 1.000 N NA
 3504245 3504246 MAG0510 MAG0520 ksgA   TRUE 0.994 -31.000 0.003 NA N NA
 3504246 3504247 MAG0520 MAG0530   trme TRUE 0.981 9.000 0.003 NA   NA
 3504249 3504250 MAG0550 MAG0560 gap serS FALSE 0.038 159.000 0.000 1.000 N NA
 3504250 3504251 MAG0560 MAG0570 serS epsG TRUE 0.581 28.000 0.000 NA N NA
 3504252 3504253 MAG7500 MAG0580 rpmH rnpA TRUE 0.998 14.000 0.787 1.000   NA
 3504253 3504254 MAG0580 MAG0590 rnpA   TRUE 0.983 15.000 0.007 1.000 N NA
 3504254 3504255 MAG0590 MAG0600   lplA FALSE 0.039 156.000 0.000 1.000 N NA
 3504255 3504256 MAG0600 MAG0610 lplA lip TRUE 1.000 3.000 0.400 0.046   NA
 3504256 3504257 MAG0610 MAG0620 lip   TRUE 0.889 9.000 0.000 NA   NA
 3504257 3504258 MAG0620 MAG0630     TRUE 0.952 -192.000 0.000 NA   NA
 3504258 3504259 MAG0630 MAG0640   asnA TRUE 0.998 -7.000 0.011 NA   NA
 3504259 3504260 MAG0640 MAG0650 asnA polC FALSE 0.060 127.000 0.000 0.091 N NA
 3504260 3504261 MAG0650 MAGt05 polC   TRUE 0.133 97.000 0.000 NA   NA
 3504261 3504262 MAGt05 MAGt06     TRUE 0.224 68.000 0.000 NA   NA
 3504262 3504263 MAGt06 MAG0660     TRUE 0.141 94.000 0.000 NA   NA
 3504263 3504264 MAG0660 MAG0670   pheS TRUE 0.995 0.000 0.004 1.000 N NA
 3504264 3504265 MAG0670 MAG0680 pheS ung TRUE 0.994 -10.000 0.003 1.000 N NA
 3504265 3504266 MAG0680 MAG0690 ung pheT TRUE 0.999 2.000 0.125 1.000 N NA
 3504266 3504267 MAG0690 MAG0700 pheT glyA TRUE 0.995 9.000 0.019 1.000 N NA
 3504267 3504268 MAG0700 MAG0710 glyA pip TRUE 0.861 10.000 0.000 1.000   NA
 3504268 3504269 MAG0710 MAG0720 pip nifS TRUE 0.926 4.000 0.000 1.000   NA
 3504269 3504270 MAG0720 MAG0730 nifS nifU TRUE 0.989 26.000 0.053 1.000 N NA
 3504270 3504271 MAG0730 MAG0740 nifU mucB TRUE 0.997 -10.000 0.008 1.000 N NA
 3504271 3504272 MAG0740 MAG0750 mucB nadD TRUE 0.990 7.000 0.006 1.000 N NA
 3504272 3504273 MAG0750 MAG0760 nadD rluB TRUE 0.959 15.000 0.002 1.000 N NA
 3504273 3504274 MAG0760 MAG0770 rluB   TRUE 0.963 -18.000 0.000 NA   NA
 3504274 3504275 MAG0770 MAG0780   fba FALSE 0.024 302.000 0.000 NA   NA
 3504275 3504276 MAG0780 MAG0790 fba   TRUE 0.901 85.000 0.048 1.000 N NA
 3504276 3504277 MAG0790 MAG0800   rplK FALSE 0.026 197.000 0.000 1.000 N NA
 3504277 3504278 MAG0800 MAG0810 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 1.000 Y NA
 3504279 3504280 MAG0820 MAG0830     TRUE 0.964 -13.000 0.000 NA   NA
 3504280 3504281 MAG0830 MAG0840     TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 3504282 3504283 MAG0850 MAG0860 cspR   TRUE 0.996 -15.000 0.014 0.008 Y NA
 3504283 3504284 MAG0860 MAG0870     TRUE 0.222 240.000 0.005 1.000   NA
 3504284 3504285 MAG0870 MAG0880     TRUE 0.568 30.000 0.000 NA   NA
 3504285 3504286 MAG0880 MAG0890   hprK FALSE 0.067 135.000 0.000 NA   NA
 3504286 3504287 MAG0890 MAG0900 hprK lgt TRUE 0.999 -7.000 0.064 1.000 N NA
 3504287 3504288 MAG0900 MAG0910 lgt trxB TRUE 0.999 2.000 0.101 1.000 N NA
 3504290 3504291 MAG0930 MAG0940 pdhA pdhB TRUE 0.984 36.000 0.458 0.004 Y NA
 3504291 3504292 MAG0940 MAG0950 pdhB pdhC FALSE 0.020 364.000 0.000 0.055   NA
 3504292 3504293 MAG0950 MAG0960 pdhC pdhD TRUE 0.952 2.000 0.000 1.000   NA
 3504293 3504294 MAG0960 MAG0970 pdhD rpmB FALSE 0.027 194.000 0.000 1.000 N NA
 3504295 3504296 MAG0980 MAG0990     TRUE 0.819 15.000 0.000 NA   NA
 3504297 3504298 MAG1000 MAG1010   oppB TRUE 0.526 32.000 0.000 NA   NA
 3504298 3504299 MAG1010 MAG1020 oppB oppC TRUE 0.999 0.000 0.889 0.046 Y NA
 3504299 3504300 MAG1020 MAG1030 oppC oppD TRUE 0.995 16.000 0.875 1.000 Y NA
 3504300 3504301 MAG1030 MAG1040 oppD oppF TRUE 0.999 -10.000 0.312 0.008 Y NA
 3504301 3504302 MAG1040 MAG1050 oppF   TRUE 0.873 10.000 0.000 NA   NA
 3504302 3504303 MAG1050 MAG1060     TRUE 0.161 87.000 0.000 NA   NA
 3504303 3504304 MAG1060 MAG1070     TRUE 0.185 79.000 0.000 NA   NA
 3504304 3504305 MAG1070 MAG1080     TRUE 0.345 47.000 0.000 NA   NA
 3504309 3504310 MAG1120 MAG1130     TRUE 0.961 1.000 0.000 NA   NA
 3504310 3504311 MAG1130 MAG1140     TRUE 0.180 82.000 0.000 NA   NA
 3504311 3504312 MAG1140 MAG1150     TRUE 0.625 27.000 0.000 NA   NA
 3504312 3504313 MAG1150 MAG1160   cdd TRUE 0.993 3.000 0.004 NA   NA
 3504313 3504314 MAG1160 MAG1170 cdd era TRUE 0.988 12.000 0.009 1.000   NA
 3504314 3504315 MAG1170 MAG1180 era pepP TRUE 0.471 35.000 0.000 1.000   NA
 3504315 3504316 MAG1180 MAG1190 pepP proS FALSE 0.077 117.000 0.000 1.000 N NA
 3504316 3504317 MAG1190 MAG1200 proS   TRUE 0.273 57.000 0.000 NA   NA
 3504317 3504318 MAG1200 MAG1210     TRUE 0.326 49.000 0.000 NA   NA
 3504318 3504319 MAG1210 MAG1220     TRUE 0.926 101.000 0.121 NA   NA
 3504319 3504320 MAG1220 MAG1230     FALSE 0.033 187.000 0.000 1.000   NA
 3504322 3504323 MAG1250 MAG1260 potA potB TRUE 0.999 -16.000 0.928 0.045 Y NA
 3504323 3504324 MAG1260 MAG1270 potB potC TRUE 0.999 -7.000 0.492 0.045 Y NA
 3504324 3504325 MAG1270 MAG1280 potC   TRUE 0.998 -13.000 0.010 NA   NA
 3504325 3504326 MAG1280 MAG1290   rpmF FALSE 0.029 224.000 0.000 NA   NA
 3504326 3504327 MAG1290 MAG1300 rpmF   TRUE 0.244 64.000 0.000 NA   NA
 3504327 3504328 MAG1300 MAG1310   thiI TRUE 0.995 2.000 0.005 NA   NA
 3504329 3504330 MAG1320 MAG1330     TRUE 0.402 43.000 0.000 NA   NA
 3504330 3504331 MAG1330 MAG1340     FALSE 0.024 303.000 0.000 NA   NA
 3504331 3504332 MAG1340 MAG1350     FALSE 0.113 109.000 0.000 NA   NA
 3504333 3504334 MAG1360 MAG1370   valS FALSE 0.049 155.000 0.000 NA   NA
 3504334 3504335 MAG1370 MAG1380 valS folD TRUE 0.993 3.000 0.004 1.000 N NA
 3504335 3504336 MAG1380 MAG1390 folD pta FALSE 0.107 100.000 0.000 1.000 N NA
 3504336 3504337 MAG1390 MAG1400 pta ackA TRUE 0.998 4.000 0.111 1.000 Y NA
 3504337 3504338 MAG1400 MAG1410 ackA coaD TRUE 0.981 8.000 0.002 1.000 N NA
 3504338 3504339 MAG1410 MAG1420 coaD engB TRUE 0.994 0.000 0.002 1.000   NA
 3504339 3504340 MAG1420 MAG1430 engB   TRUE 0.649 26.000 0.000 NA   NA
 3504340 3504341 MAG1430 MAG1440   pyk FALSE 0.056 146.000 0.000 NA   NA
 3504344 3504345 MAG1470 MAG1480 gidA   FALSE 0.056 146.000 0.000 NA   NA
 3504345 3504346 MAG1480 MAG1490   ldhD FALSE 0.054 148.000 0.000 NA   NA
 3504346 3504347 MAG1490 MAG1500 ldhD lip FALSE 0.021 408.000 0.000 1.000   NA
 3504347 3504348 MAG1500 MAG1510 lip   FALSE 0.026 273.000 0.000 NA   NA
 3504348 3504349 MAG1510 MAG1520     FALSE 0.026 272.000 0.000 NA   NA
 3504349 3504350 MAG1520 MAG1530     TRUE 0.951 -34.000 0.000 0.087   NA
 3504350 3504351 MAG1530 MAG1540   tig FALSE 0.063 128.000 0.000 1.000 N NA
 3504351 3504352 MAG1540 MAG1550 tig   FALSE 0.024 354.000 0.000 NA   NA
 3504353 3504354 MAG1560 MAG1570     FALSE 0.056 146.000 0.000 NA   NA
 3504355 3504356 MAG1580 MAG1590     TRUE 0.959 -30.000 0.000 NA   NA
 3504356 3504357 MAG1590 MAG1600     TRUE 0.956 -69.000 0.000 NA   NA
 3504357 3504358 MAG1600 MAG1610     FALSE 0.048 144.000 0.000 0.011   NA
 3504358 3504359 MAG1610 MAG1620     TRUE 0.239 65.000 0.000 NA   NA
 3504360 3504361 MAG1630 MAG1640     TRUE 0.966 -7.000 0.000 NA   NA
 3504362 3504363 MAG1650 MAG1660 polA dnaE TRUE 0.999 2.000 0.119 0.015 Y NA
 3504365 3504366 MAG1680 MAG1690     TRUE 0.131 99.000 0.000 NA   NA
 3504366 3504367 MAG1690 MAG1700     FALSE 0.026 271.000 0.000 NA   NA
 3504367 3504368 MAG1700 MAG1710     FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 3504368 3504369 MAG1710 MAG1720     FALSE 0.107 112.000 0.000 NA   NA
 3504369 3504370 MAG1720 MAG1730     FALSE 0.025 284.000 0.000 NA   NA
 3504371 3504372 MAG1740 MAG1750 gidA   TRUE 0.998 -13.000 0.010 NA   NA
 3504372 3504373 MAG1750 MAG1760     TRUE 0.345 47.000 0.000 NA   NA
 3504373 3504374 MAG1760 MAG1770     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 3504374 3504375 MAG1770 MAG1780     FALSE 0.052 149.000 0.000 NA   NA
 3504377 3504378 MAG1800 MAG1810 def   TRUE 0.873 10.000 0.000 NA   NA
 3504378 3504379 MAG1810 MAG1820   parE FALSE 0.120 105.000 0.000 NA   NA
 3504379 3504380 MAG1820 MAG1830 parE parC TRUE 0.996 16.000 0.552 0.007 Y NA
 3504380 3504381 MAG1830 MAG1840 parC   FALSE 0.054 144.000 0.000 1.000   NA
 3504381 3504382 MAG1840 MAG1850   rnhB TRUE 0.761 134.000 0.040 1.000   NA
 3504382 3504383 MAG1850 MAGt35 rnhB   FALSE 0.063 138.000 0.000 NA   NA
 3504383 3504384 MAGt35 MAGt36     FALSE 0.024 664.000 0.000 NA   NA
 3504385 3504386 MAG1860 MAG1870 gidB prs TRUE 0.997 -16.000 0.009 1.000 N NA
 3504386 3504387 MAG1870 MAG1880 prs   FALSE 0.030 216.000 0.000 NA   NA
 3504387 3504388 MAG1880 MAG1890     FALSE 0.024 619.000 0.000 NA   NA
 3504388 3504389 MAG1890 MAG1900     FALSE 0.025 280.000 0.000 NA   NA
 3504389 3504390 MAG1900 MAG1910     FALSE 0.067 135.000 0.000 NA   NA
 3504390 3504391 MAG1910 MAG1920   bsn FALSE 0.026 266.000 0.000 NA   NA
 3504396 3504397 MAG1970 MAG1980     TRUE 0.998 12.000 0.222 NA   NA
 3504397 3504398 MAG1980 MAG1990   hit TRUE 0.999 2.000 0.032 NA   NA
 3504398 3504399 MAG1990 MAG2000 hit   FALSE 0.091 120.000 0.000 NA   NA
 3504402 3504403 MAG2030 MAG2040   ftsY TRUE 0.999 -10.000 0.081 1.000   NA
 3504403 3504404 MAG2040 MAG2050 ftsY   TRUE 0.204 69.000 0.000 1.000   NA
 3504404 3504405 MAG2050 MAG2060   metS TRUE 0.933 25.000 0.003 0.081   NA
 3504405 3504406 MAG2060 MAG2070 metS   TRUE 0.996 4.000 0.011 1.000   NA
 3504406 3504407 MAG2070 MAG2080   vacB TRUE 0.956 21.000 0.004 1.000   NA
 3504408 3504409 MAG2090 MAG2100   gmk FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 3504409 3504410 MAG2100 MAG2110 gmk   TRUE 0.993 6.000 0.008 1.000 N NA
 3504410 3504411 MAG2110 MAG2120   pknB TRUE 0.990 24.000 0.130 1.000 Y NA
 3504411 3504412 MAG2120 MAG2130 pknB engC TRUE 0.995 11.000 0.024 1.000   NA
 3504412 3504413 MAG2130 MAG2140 engC rpe TRUE 0.998 -13.000 0.012 1.000   NA
 3504414 3504415 MAG2150 MAG2160     TRUE 0.165 86.000 0.000 NA   NA
 3504415 3504416 MAG2160 MAG2170     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 3504416 3504417 MAG2170 MAG2180     TRUE 0.760 143.000 0.047 NA   NA
 3504418 3504419 MAGt07 MAGt08     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 3504419 3504420 MAGt08 MAGt09     TRUE 0.902 8.000 0.000 NA   NA
 3504420 3504421 MAGt09 MAGt10     TRUE 0.625 27.000 0.000 NA   NA
 3504421 3504422 MAGt10 MAGt11     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 3504422 3504423 MAGt11 MAGt12     TRUE 0.568 30.000 0.000 NA   NA
 3504423 3504424 MAGt12 MAGt13     TRUE 0.925 5.000 0.000 NA   NA
 3504424 3504425 MAGt13 MAGt14     TRUE 0.925 5.000 0.000 NA   NA
 3504425 3504426 MAGt14 MAG2190   pyrG TRUE 0.138 95.000 0.000 NA   NA
 3504426 3504427 MAG2190 MAG2200 pyrG ileS FALSE 0.110 244.000 0.002 1.000 N NA
 3504427 3504428 MAG2200 MAG2210 ileS lsp TRUE 0.998 2.000 0.019 1.000 N NA
 3504428 3504429 MAG2210 MAG2220 lsp   FALSE 0.038 184.000 0.000 NA   NA
 3504429 3504430 MAG2220 MAGt15     FALSE 0.036 189.000 0.000 NA   NA
 3504430 3504431 MAGt15 MAGt16     TRUE 0.921 6.000 0.000 NA   NA
 3504431 3504432 MAGt16 MAGt17     TRUE 0.925 5.000 0.000 NA   NA
 3504432 3504433 MAGt17 MAGt18     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 3504433 3504434 MAGt18 MAGt19     TRUE 0.889 9.000 0.000 NA   NA
 3504434 3504435 MAGt19 MAG2230   ruvA FALSE 0.024 349.000 0.000 NA   NA
 3504435 3504436 MAG2230 MAG2240 ruvA ruvB TRUE 0.999 -19.000 0.549 0.007 Y NA
 3504436 3504437 MAG2240 MAG2250 ruvB secD TRUE 0.825 37.000 0.002 1.000   NA
 3504437 3504438 MAG2250 MAG2260 secD truB TRUE 0.188 74.000 0.000 1.000   NA
 3504438 3504439 MAG2260 MAG2270 truB   TRUE 0.999 -7.000 0.022 1.000   NA
 3504439 3504440 MAG2270 MAG2280   ribF TRUE 0.979 32.000 0.037 1.000   NA
 3504440 3504441 MAG2280 MAG2290 ribF rpsO TRUE 0.763 93.000 0.013 1.000 N NA
 3504441 3504442 MAG2290 MAG2300 rpsO lip FALSE 0.048 149.000 0.000 1.000   NA
 3504442 3504443 MAG2300 MAG2310 lip gtsA FALSE 0.065 132.000 0.000 1.000   NA
 3504443 3504444 MAG2310 MAG2320 gtsA gtsB TRUE 0.245 59.000 0.000 NA N NA
 3504444 3504445 MAG2320 MAG2330 gtsB gtsC TRUE 0.770 -13.000 0.000 NA Y NA
 3504445 3504446 MAG2330 MAG2340 gtsC   FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 3504448 3504449 MAG2360 MAG2370   rplI TRUE 0.999 -19.000 0.119 1.000 N NA
 3504449 3504450 MAG2370 MAG2380 rplI dnaB TRUE 0.999 -10.000 0.100 1.000 N NA
 3504450 3504451 MAG2380 MAG2390 dnaB   TRUE 0.999 0.000 0.024 1.000   NA
 3504451 3504452 MAG2390 MAGt20     FALSE 0.109 111.000 0.000 NA   NA
 3504452 3504453 MAGt20 MAG2400     FALSE 0.041 174.000 0.000 NA   NA
 3504453 3504454 MAG2400 MAG2410     FALSE 0.064 137.000 0.000 NA   NA
 3504454 3504455 MAG2410 MAG2420     FALSE 0.044 165.000 0.000 NA   NA
 3504455 3504456 MAG2420 MAG2430     FALSE 0.031 205.000 0.000 NA   NA
 3504458 3504459 MAG2450 MAG2460   nox FALSE 0.024 341.000 0.000 NA   NA
 3504459 3504460 MAG2460 MAG2470 nox   TRUE 0.999 -7.000 0.085 1.000   NA
 3504461 3504462 MAG2480 MAG2490 rmuC   FALSE 0.091 120.000 0.000 NA   NA
 3504462 3504463 MAG2490 MAG2500     TRUE 0.958 -34.000 0.000 NA   NA
 3504463 3504464 MAG2500 MAG2510     TRUE 0.958 -36.000 0.000 NA   NA
 3504464 3504465 MAG2510 MAG2520     TRUE 0.735 20.000 0.000 NA   NA
 3504465 3504466 MAG2520 MAG2530     TRUE 0.649 26.000 0.000 NA   NA
 3504466 3504467 MAG2530 MAG2540     TRUE 0.311 53.000 0.000 NA   NA
 3504468 3504469 MAG2550 MAG2560     TRUE 0.944 -70.000 0.000 0.010   NA
 3504469 3504470 MAG2560 MAG2570     TRUE 1.000 0.000 0.146 1.000   NA
 3504470 3504471 MAG2570 MAG2580     TRUE 0.992 20.000 0.043 0.003   NA
 3504471 3504472 MAG2580 MAG2590   rpsB FALSE 0.023 276.000 0.000 1.000   NA
 3504472 3504473 MAG2590 MAG2600 rpsB tsf TRUE 0.969 53.000 0.748 1.000 Y NA
 3504474 3504475 MAG2610 MAG2620     TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 3504475 3504476 MAG2620 MAG2630   nox FALSE 0.024 348.000 0.000 NA   NA
 3504476 3504477 MAG2630 MAG2640 nox   FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 3504477 3504478 MAG2640 MAG2650   rpoD TRUE 0.997 6.000 0.016 NA   NA
 3504478 3504479 MAG2650 MAG2660 rpoD dnaG TRUE 1.000 -7.000 0.205 1.000 N NA
 3504479 3504480 MAG2660 MAG2670 dnaG glyS TRUE 0.949 42.000 0.019 1.000 N NA
 3504480 3504481 MAG2670 MAG2680 glyS   FALSE 0.101 114.000 0.000 NA   NA
 3504482 3504483 MAG2690 MAG2700 phnD   TRUE 1.000 0.000 0.467 1.000   NA
 3504483 3504484 MAG2700 MAG2710   phnB TRUE 0.999 -36.000 0.385 1.000 Y NA
 3504485 3504486 MAG2720 MAG2730   secA TRUE 0.146 92.000 0.000 NA   NA
 3504489 3504490 MAG2760 MAG2770 rpsF ssb TRUE 0.412 38.000 0.000 1.000 N NA
 3504490 3504491 MAG2770 MAG2780 ssb rpsR TRUE 0.713 19.000 0.000 1.000 N NA
 3504492 3504493 MAG2790 MAG2800   deoB TRUE 0.134 92.000 0.000 1.000   NA
 3504493 3504494 MAG2800 MAG2810 deoB   FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 3504495 3504496 MAG2820 MAG2830 ligA   FALSE 0.034 193.000 0.000 NA   NA
 3504496 3504497 MAG2830 MAG2840     TRUE 0.597 29.000 0.000 NA   NA
 3504497 3504498 MAG2840 MAG2850     TRUE 0.189 78.000 0.000 NA   NA
 3504498 3504499 MAG2850 MAG2860     FALSE 0.031 208.000 0.000 NA   NA
 3504499 3504500 MAG2860 MAG2870     TRUE 0.568 30.000 0.000 NA   NA
 3504500 3504501 MAG2870 MAG2880     TRUE 0.251 63.000 0.000 NA   NA
 3504501 3504502 MAG2880 MAG2890     TRUE 1.000 -13.000 0.500 NA   NA
 3504502 3504503 MAG2890 MAG2900     TRUE 1.000 0.000 0.500 NA   NA
 3504503 3504504 MAG2900 MAG2910     TRUE 1.000 0.000 1.000 NA   NA
 3504504 3504505 MAG2910 MAG2920     TRUE 1.000 -10.000 0.375 NA   NA
 3504505 3504506 MAG2920 MAG2930   atpA TRUE 0.999 4.000 0.429 NA   NA
 3504506 3504507 MAG2930 MAG2940 atpA atpD TRUE 0.999 0.000 1.000 0.017 Y NA
 3504507 3504508 MAG2940 MAG2950 atpD   TRUE 0.692 22.000 0.000 NA   NA
 3504509 3504510 MAG2960 MAG2970     TRUE 0.212 71.000 0.000 NA   NA
 3504510 3504511 MAG2970 MAG2980     TRUE 0.780 17.000 0.000 NA   NA
 3504511 3504512 MAG2980 MAG2990   pcrA TRUE 0.977 16.000 0.005 NA   NA
 3504512 3504513 MAG2990 MAG3000 pcrA   TRUE 0.979 26.000 0.015 NA   NA
 3504513 3504514 MAG3000 MAG3010     TRUE 1.000 2.000 0.500 NA   NA
 3504514 3504515 MAG3010 MAG3020   asnS TRUE 0.989 10.000 0.007 NA   NA
 3504516 3504517 MAG3030 MAG3040     TRUE 0.716 21.000 0.000 NA   NA
 3504519 3504520 MAG3060 MAG3070     TRUE 1.000 3.000 0.600 NA   NA
 3504522 3504523 MAG3090 MAGt21     TRUE 0.311 53.000 0.000 NA   NA
 3504524 3504525 MAG3100 MAG3110     TRUE 0.999 -7.000 0.800 0.008 Y NA
 3504525 3504526 MAG3110 MAG3120     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 3504526 3504527 MAG3120 MAG3130   msrA TRUE 0.448 39.000 0.000 NA   NA
 3504527 3504528 MAG3130 MAG3140 msrA   TRUE 0.156 89.000 0.000 NA   NA
 3504528 3504529 MAG3140 MAG3150   mutM TRUE 0.995 -16.000 0.003 NA   NA
 3504529 3504530 MAG3150 MAG3160 mutM pgiB TRUE 0.933 3.000 0.000 1.000 N NA
 3504530 3504531 MAG3160 MAG3170 pgiB pgiB TRUE 0.372 2.000 0.000 0.003 Y NA
 3504531 3504532 MAG3170 MAG3180 pgiB rpsA TRUE 0.960 0.000 0.000 1.000   NA
 3504532 3504533 MAG3180 MAG3190 rpsA eno FALSE 0.048 149.000 0.000 1.000   NA
 3504534 3504535 MAG3200 MAG3210 tufA   FALSE 0.029 196.000 0.000 1.000   NA
 3504535 3504536 MAG3210 MAG3220     TRUE 1.000 0.000 0.217 1.000   NA
 3504536 3504537 MAG3220 MAG3230   gcp TRUE 0.995 2.000 0.012 0.003 Y NA
 3504537 3504538 MAG3230 MAG3240 gcp   TRUE 0.675 24.000 0.000 NA   NA
 3504540 3504541 MAG3260 MAG3270     TRUE 0.961 -22.000 0.000 NA   NA
 3504542 3504543 MAG3280 MAG3290     FALSE 0.034 193.000 0.000 NA   NA
 3504543 3504544 MAG3290 MAG3300     TRUE 0.965 -10.000 0.000 NA   NA
 3504544 3504545 MAG3300 MAG3310     FALSE 0.056 146.000 0.000 NA   NA
 3504545 3504546 MAG3310 MAG3320   ptsG FALSE 0.022 499.000 0.000 1.000   NA
 3504546 3504547 MAG3320 MAG3330 ptsG   TRUE 0.236 66.000 0.000 NA   NA
 3504547 3504548 MAG3330 MAG3340     TRUE 0.914 96.000 0.091 NA   NA
 3504548 3504549 MAG3340 MAG3350     FALSE 0.024 462.000 0.000 NA   NA
 3504549 3504550 MAG3350 MAG3360     FALSE 0.101 114.000 0.000 NA   NA
 3504550 3504551 MAG3360 MAG3370     FALSE 0.037 187.000 0.000 NA   NA
 3504551 3504552 MAG3370 MAG3380     FALSE 0.024 460.000 0.000 NA   NA
 3504552 3504553 MAG3380 MAG3390     FALSE 0.096 116.000 0.000 NA   NA
 3504553 3504554 MAG3390 MAG3400     FALSE 0.024 740.000 0.000 NA   NA
 3504554 3504555 MAG3400 MAG3410     TRUE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3504555 3504556 MAG3410 MAG3420     FALSE 0.028 237.000 0.000 NA   NA
 3504557 3504558 MAG3430 MAG3440 trpS thrS TRUE 0.990 8.000 0.014 0.071 Y NA
 3504558 3504559 MAG3440 MAG3450 thrS   TRUE 0.966 -7.000 0.000 NA   NA
 3504560 3504561 MAG3460 MAG3470   p30 FALSE 0.024 903.000 0.000 NA   NA
 3504561 3504562 MAG3470 MAG3480 p30   FALSE 0.024 337.000 0.000 NA   NA
 3504563 3504564 MAG3490 MAG3500   atpB TRUE 0.996 1.000 0.005 NA   NA
 3504564 3504565 MAG3500 MAG3510 atpB atpE TRUE 0.998 10.000 0.085 0.016   NA
 3504565 3504566 MAG3510 MAG3520 atpE atpF TRUE 0.998 15.000 0.500 0.016   NA
 3504566 3504567 MAG3520 MAG3530 atpF atpH TRUE 0.997 3.000 0.022 0.016 Y NA
 3504567 3504568 MAG3530 MAG3540 atpH atpA TRUE 0.999 -7.000 0.864 0.016 Y NA
 3504568 3504569 MAG3540 MAG3550 atpA atpG TRUE 0.999 -7.000 0.846 0.016 Y NA
 3504569 3504570 MAG3550 MAG3560 atpG atpD TRUE 0.965 54.000 0.724 0.016 Y NA
 3504570 3504571 MAG3560 MAG3570 atpD atpC TRUE 0.996 15.000 0.837 0.016 Y NA
 3504571 3504572 MAG3570 MAG3580 atpC   FALSE 0.084 123.000 0.000 NA   NA
 3504572 3504573 MAG3580 MAG3590     FALSE 0.025 281.000 0.000 NA   NA
 3504573 3504574 MAG3590 MAG3600     FALSE 0.024 560.000 0.000 NA   NA
 3504575 3504576 MAG3610 MAG3620     FALSE 0.035 191.000 0.000 NA   NA
 3504576 3504577 MAG3620 MAG3630   lon FALSE 0.116 101.000 0.000 1.000   NA
 3504577 3504578 MAG3630 MAG3640 lon leuS TRUE 0.124 209.000 0.002 1.000 N NA
 3504578 3504579 MAG3640 MAG3650 leuS   TRUE 0.943 22.000 0.003 NA   NA
 3504579 3504580 MAG3650 MAG3660   upp TRUE 0.996 -31.000 0.006 NA   NA
 3504580 3504581 MAG3660 MAG3670 upp ssb FALSE 0.071 122.000 0.000 1.000 N NA
 3504581 3504582 MAG3670 MAG3680 ssb pepO TRUE 0.847 10.000 0.000 1.000 N NA
 3504582 3504583 MAG3680 MAG3690 pepO   TRUE 0.873 10.000 0.000 NA   NA
 3504585 3504586 MAG3710 MAG3720 ftsZ   TRUE 0.477 37.000 0.000 NA   NA
 3504586 3504587 MAG3720 MAG3730   mraW TRUE 0.507 34.000 0.000 NA   NA
 3504587 3504588 MAG3730 MAG3740 mraW mraZ TRUE 1.000 2.000 0.635 NA   NA
 3504588 3504589 MAG3740 MAG3750 mraZ ktrA FALSE 0.039 182.000 0.000 NA   NA
 3504590 3504591 MAG3760 MAG3770 ktrB   TRUE 0.836 13.000 0.000 NA   NA
 3504591 3504592 MAG3770 MAG3780   uvrB FALSE 0.104 113.000 0.000 NA   NA
 3504592 3504593 MAG3780 MAG3790 uvrB uvrA TRUE 0.999 2.000 0.154 0.005 Y NA
 3504593 3504594 MAG3790 MAG3800 uvrA   TRUE 0.796 16.000 0.000 NA   NA
 3504594 3504595 MAG3800 MAG3810     TRUE 0.960 -28.000 0.000 NA   NA
 3504595 3504596 MAG3810 MAG3820     TRUE 0.363 46.000 0.000 NA   NA
 3504596 3504597 MAG3820 MAGt22     TRUE 0.836 13.000 0.000 NA   NA
 3504597 3504598 MAGt22 MAG3830     TRUE 0.122 103.000 0.000 NA   NA
 3504599 3504600 MAG3840 MAG3850 hpt greA TRUE 0.999 -10.000 0.032 1.000 N NA
 3504600 3504601 MAG3850 MAG3860 greA   FALSE 0.024 909.000 0.000 NA   NA
 3504601 3504602 MAG3860 MAG3870     FALSE 0.041 172.000 0.000 NA   NA
 3504602 3504603 MAG3870 MAG3880     FALSE 0.024 336.000 0.000 NA   NA
 3504603 3504604 MAG3880 MAG3890     FALSE 0.024 351.000 0.000 NA   NA
 3504604 3504605 MAG3890 MAG3900     TRUE 1.000 3.000 0.667 NA   NA
 3504605 3504606 MAG3900 MAG3910     TRUE 0.984 43.000 1.000 NA   NA
 3504606 3504607 MAG3910 MAG3920     FALSE 0.047 159.000 0.000 NA   NA
 3504607 3504608 MAG3920 MAG3930     FALSE 0.024 327.000 0.000 NA   NA
 3504608 3504609 MAG3930 MAG3940     TRUE 0.952 -235.000 0.000 NA   NA
 3504611 3504612 MAG3960 MAG3970     FALSE 0.067 135.000 0.000 NA   NA
 3504612 3504613 MAG3970 MAG3980     FALSE 0.031 208.000 0.000 NA   NA
 3504613 3504614 MAG3980 MAG3990     FALSE 0.111 110.000 0.000 NA   NA
 3504614 3504615 MAG3990 MAG4000     TRUE 0.465 38.000 0.000 NA   NA
 3504615 3504616 MAG4000 MAG4010     TRUE 0.962 -19.000 0.000 NA   NA
 3504616 3504617 MAG4010 MAG4020     FALSE 0.024 330.000 0.000 NA   NA
 3504617 3504618 MAG4020 MAG4030     TRUE 0.913 7.000 0.000 NA   NA
 3504618 3504619 MAG4030 MAG4040     FALSE 0.025 246.000 0.000 1.000   NA
 3504619 3504620 MAG4040 MAG4050     FALSE 0.028 238.000 0.000 NA   NA
 3504620 3504621 MAG4050 MAG4060     TRUE 0.933 4.000 0.000 NA   NA
 3504622 3504623 MAG4070 MAG4080     FALSE 0.030 223.000 0.000 NA   NA
 3504623 3504624 MAG4080 MAG4090     TRUE 0.692 22.000 0.000 NA   NA
 3504624 3504625 MAG4090 MAG4100     FALSE 0.104 113.000 0.000 NA   NA
 3504625 3504626 MAG4100 MAG4110     FALSE 0.026 271.000 0.000 NA   NA
 3504627 3504628 MAG4120 MAG4130     FALSE 0.024 259.000 0.000 1.000   NA
 3504628 3504629 MAG4130 MAG4140     FALSE 0.025 288.000 0.000 NA   NA
 3504629 3504630 MAG4140 MAG4150     TRUE 0.996 -10.000 0.004 NA   NA
 3504630 3504631 MAG4150 MAG4160   alaS TRUE 0.999 -7.000 0.032 1.000 N NA
 3504631 3504632 MAG4160 MAG4170 alaS trmU TRUE 0.974 11.000 0.007 0.067 Y NA
 3504633 3504634 MAG4180 MAG4190 deoD   FALSE 0.040 178.000 0.000 NA   NA
 3504635 3504636 MAG4200 MAG4210     TRUE 0.954 -96.000 0.000 NA   NA
 3504638 3504639 MAG4230 MAG4240     FALSE 0.041 172.000 0.000 NA   NA
 3504640 3504641 MAG4250 MAG4260     TRUE 0.956 -61.000 0.000 NA   NA
 3504641 3504642 MAG4260 MAG4270     TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 3504643 3504644 MAG4280 MAG4290 adhT   FALSE 0.030 223.000 0.000 NA   NA
 3504644 3504645 MAG4290 MAG4300     TRUE 0.952 -321.000 0.000 NA   NA
 3504645 3504646 MAG4300 MAG4310     FALSE 0.024 384.000 0.000 NA   NA
 3504646 3504647 MAG4310 MAG4320     TRUE 0.953 -127.000 0.000 NA   NA
 3504647 3504648 MAG4320 MAG4330     FALSE 0.028 243.000 0.000 NA   NA
 3504648 3504649 MAG4330 MAG4340   adhT FALSE 0.024 307.000 0.000 NA   NA
 3504653 3504654 MAG4380 MAG4390   rnc TRUE 0.808 67.000 0.009 1.000 N NA
 3504654 3504655 MAG4390 MAG4400 rnc plsX TRUE 0.999 -7.000 0.020 1.000 N NA
 3504655 3504656 MAG4400 MAG4410 plsX   TRUE 0.997 7.000 0.021 1.000   NA
 3504656 3504657 MAG4410 MAG4420     TRUE 0.966 -7.000 0.000 NA   NA
 3504658 3504659 MAG4430 MAG4440     FALSE 0.089 115.000 0.000 1.000   NA
 3504659 3504660 MAG4440 MAG4450     TRUE 0.998 15.000 0.583 0.009   NA
 3504660 3504661 MAG4450 MAG4460     FALSE 0.057 139.000 0.000 1.000   NA
 3504661 3504662 MAG4460 MAG4470   glpK FALSE 0.024 271.000 0.000 1.000   NA
 3504662 3504663 MAG4470 MAG4480 glpK glpF TRUE 0.999 8.000 0.125 1.000 N NA
 3504664 3504665 MAG4490 MAG4500 aspS hisS TRUE 0.922 76.000 0.161 0.065 Y NA
 3504666 3504667 MAG4510 MAG4520     TRUE 0.338 46.000 0.000 NA N NA
 3504667 3504668 MAG4520 MAG4530     TRUE 0.194 77.000 0.000 NA   NA
 3504668 3504669 MAG4530 MAG4540     FALSE 0.033 188.000 0.000 1.000   NA
 3504669 3504670 MAG4540 MAGs647   rnpB TRUE 0.913 7.000 0.000 NA   NA
 3504670 3504671 MAGs647 MAG4550 rnpB rplM FALSE 0.035 191.000 0.000 NA   NA
 3504671 3504672 MAG4550 MAG4560 rplM rpsI TRUE 0.999 2.000 0.601 0.052 Y NA
 3504672 3504673 MAG4560 MAGt23 rpsI   TRUE 0.251 63.000 0.000 NA   NA
 3504673 3504674 MAGt23 MAG4570     TRUE 0.169 85.000 0.000 NA   NA
 3504674 3504675 MAG4570 MAG4580   gtaB TRUE 0.963 -16.000 0.000 NA   NA
 3504675 3504676 MAG4580 MAGt24 gtaB   FALSE 0.035 190.000 0.000 NA   NA
 3504676 3504677 MAGt24 MAG4590     FALSE 0.118 107.000 0.000 NA   NA
 3504677 3504678 MAG4590 MAG4600     FALSE 0.027 246.000 0.000 NA   NA
 3504678 3504679 MAG4600 MAG4610     TRUE 0.945 3.000 0.000 NA   NA
 3504679 3504680 MAG4610 MAG4620     TRUE 0.200 76.000 0.000 NA   NA
 3504680 3504681 MAG4620 MAG4630     TRUE 0.965 -10.000 0.000 NA   NA
 3504681 3504682 MAG4630 MAG4640     TRUE 0.965 -10.000 0.000 NA   NA
 3504684 3504685 MAG4660 MAG4670   nusB TRUE 0.992 20.000 0.041 NA   NA
 3504687 3504688 MAG4690 MAG4700 ptsH oppB TRUE 0.573 27.000 0.000 1.000 N NA
 3504688 3504689 MAG4700 MAG4710 oppB   TRUE 0.953 1.000 0.000 0.034   NA
 3504689 3504690 MAG4710 MAG4720     TRUE 0.933 4.000 0.000 NA   NA
 3504690 3504691 MAG4720 MAG4730     TRUE 0.507 34.000 0.000 NA   NA
 3504693 3504694 MAG4750 MAG4760 infC rpmI TRUE 0.999 -19.000 0.652 1.000 Y NA
 3504694 3504695 MAG4760 MAG4770 rpmI rplT TRUE 0.987 27.000 0.928 0.051 Y NA
 3504696 3504697 MAG4780 MAG4790     FALSE 0.029 227.000 0.000 NA   NA
 3504697 3504698 MAG4790 MAG4800   licA TRUE 0.263 60.000 0.000 NA   NA
 3504699 3504700 MAG4810 MAG4820 lepA   FALSE 0.023 87.000 0.000 NA Y NA
 3504700 3504701 MAG4820 MAG4830     TRUE 0.143 88.000 0.000 NA N NA
 3504701 3504702 MAG4830 MAG4840     TRUE 0.159 84.000 0.000 1.000   NA
 3504702 3504703 MAG4840 MAG4850     TRUE 0.402 43.000 0.000 NA   NA
 3504703 3504704 MAG4850 MAG4860     FALSE 0.082 125.000 0.000 NA   NA
 3504704 3504705 MAG4860 MAG4870     TRUE 0.956 -69.000 0.000 NA   NA
 3504706 3504707 MAG4880 MAG4890 argS   FALSE 0.103 109.000 0.000 1.000   NA
 3504707 3504708 MAG4890 MAG4900   ldh FALSE 0.034 186.000 0.000 1.000   NA
 3504708 3504709 MAG4900 MAG4910 ldh   FALSE 0.031 205.000 0.000 NA   NA
 3504710 3504711 MAG4920 MAG4930 pta ackA TRUE 0.200 18.000 0.000 1.000 Y NA
 3504711 3504712 MAG4930 MAG4940 ackA   TRUE 0.861 10.000 0.000 1.000   NA
 3504712 3504713 MAG4940 MAG4950     TRUE 0.230 67.000 0.000 NA   NA
 3504713 3504714 MAG4950 MAG4960     TRUE 0.933 4.000 0.000 NA   NA
 3504714 3504715 MAG4960 MAG4970   uhpT FALSE 0.026 266.000 0.000 NA   NA
 3504715 3504716 MAG4970 MAG4980 uhpT   FALSE 0.061 141.000 0.000 NA   NA
 3504716 3504717 MAG4980 MAG4990   nfo TRUE 0.952 2.000 0.000 1.000   NA
 3504717 3504718 MAG4990 MAG5000 nfo   TRUE 0.526 32.000 0.000 NA   NA
 3504718 3504719 MAG5000 MAG5010   trxA TRUE 0.796 16.000 0.000 NA   NA
 3504719 3504720 MAG5010 MAG5020 trxA uvrC TRUE 0.921 6.000 0.000 NA   NA
 3504720 3504721 MAG5020 MAG5030 uvrC   FALSE 0.024 702.000 0.000 NA   NA
 3504721 3504722 MAG5030 MAG5040     TRUE 0.212 71.000 0.000 NA   NA
 3504722 3504723 MAG5040 MAG5050     TRUE 0.999 9.000 0.200 1.000 N NA
 3504723 3504724 MAG5050 MAG5060     TRUE 1.000 -16.000 0.611 0.033 N NA
 3504724 3504725 MAG5060 MAG5070     TRUE 0.999 -61.000 0.204 0.033 Y NA
 3504725 3504726 MAG5070 MAG5080     FALSE 0.024 302.000 0.000 NA   NA
 3504727 3504728 MAG5090 MAG5100     FALSE 0.098 112.000 0.000 1.000   NA
 3504729 3504730 MAG5110 MAG5120 deoD deoA TRUE 0.978 21.000 0.022 1.000 Y NA
 3504730 3504731 MAG5120 MAG5130 deoA deoC TRUE 0.991 19.000 0.106 1.000 Y NA
 3504734 3504735 MAG5160 MAG5170     TRUE 0.999 -7.000 0.095 1.000 Y NA
 3504735 3504736 MAG5170 MAG5180     TRUE 0.999 -9.000 0.713 0.027 Y NA
 3504736 3504737 MAG5180 MAG5190   rplQ TRUE 0.705 170.000 0.074 1.000 N NA
 3504737 3504738 MAG5190 MAG5200 rplQ rpoA TRUE 1.000 0.000 0.873 1.000 N NA
 3504738 3504739 MAG5200 MAG5210 rpoA rpsK TRUE 0.997 19.000 0.308 1.000 N NA
 3504739 3504740 MAG5210 MAG5220 rpsK rpsM TRUE 0.993 21.000 0.810 0.050 Y NA
 3504740 3504741 MAG5220 MAG5230 rpsM   TRUE 0.672 135.000 0.075 0.044 Y NA
 3504741 3504742 MAG5230 MAG5240   map TRUE 0.996 7.000 0.051 1.000 Y NA
 3504742 3504743 MAG5240 MAG5250 map adk TRUE 0.967 42.000 0.041 1.000 N NA
 3504743 3504744 MAG5250 MAG5260 adk secY TRUE 0.973 30.000 0.019 1.000 N NA
 3504744 3504745 MAG5260 MAGr03 secY   FALSE 0.024 353.000 0.000 NA   NA
 3504745 3504746 MAGr03 MAGr04     FALSE 0.024 311.000 0.000 NA   NA
 3504746 3504747 MAGr04 MAGr05     FALSE 0.025 288.000 0.000 NA   NA
 3504747 3504748 MAGr05 MAGr06     FALSE 0.024 311.000 0.000 NA   NA
 3504750 3504751 MAG5280 MAG5290   rplO FALSE 0.070 128.000 0.000 1.000   NA
 3504751 3504752 MAG5290 MAG5300 rplO rpsE TRUE 0.991 21.000 0.148 0.069 Y NA
 3504752 3504753 MAG5300 MAG5310 rpsE rplR TRUE 0.999 3.000 0.814 0.069 Y NA
 3504753 3504754 MAG5310 MAG5320 rplR rplF TRUE 0.991 25.000 0.815 0.049 Y NA
 3504754 3504755 MAG5320 MAG5330 rplF rpsH TRUE 0.998 10.000 0.808 0.049 Y NA
 3504755 3504756 MAG5330 MAG5340 rpsH rpsN TRUE 0.999 2.000 0.473 0.049 Y NA
 3504756 3504757 MAG5340 MAG5350 rpsN rplE TRUE 0.999 3.000 0.496 0.049 Y NA
 3504757 3504758 MAG5350 MAG5360 rplE rplX TRUE 0.999 3.000 0.758 0.049 Y NA
 3504758 3504759 MAG5360 MAG5370 rplX rplN TRUE 0.997 13.000 0.810 0.069 Y NA
 3504759 3504760 MAG5370 MAG5380 rplN rpsQ TRUE 0.999 4.000 0.791 0.069 Y NA
 3504760 3504761 MAG5380 MAG7510 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.049 Y NA
 3504761 3504762 MAG7510 MAG5390 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.049 Y NA
 3504762 3504763 MAG5390 MAG5400 rplP rpsC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.069 Y NA
 3504763 3504764 MAG5400 MAG5410 rpsC rplV TRUE 0.999 3.000 0.719 0.069 Y NA
 3504764 3504765 MAG5410 MAG5420 rplV rpsS TRUE 0.999 3.000 0.769 0.069 Y NA
 3504765 3504766 MAG5420 MAG5430 rpsS rplB TRUE 0.999 0.000 0.820 0.069 Y NA
 3504766 3504767 MAG5430 MAG5440 rplB rplW TRUE 0.935 72.000 0.849 1.000 Y NA
 3504767 3504768 MAG5440 MAG5450 rplW rplD TRUE 0.997 0.000 0.013 1.000 Y NA
 3504768 3504769 MAG5450 MAG5460 rplD rplC TRUE 0.953 21.000 0.010 0.049 Y NA
 3504769 3504770 MAG5460 MAG5470 rplC rpsJ TRUE 0.962 56.000 0.467 0.069 Y NA
 3504772 3504773 MAG5480 MAG5490     TRUE 0.998 -43.000 0.014 0.016   NA
 3504774 3504775 MAG5500 MAG5510 recA   TRUE 0.694 86.000 0.006 1.000   NA
 3504778 3504779 MAG5540 MAG5550 rpmA rplU TRUE 0.999 7.000 0.667 0.049 Y NA
 3504779 3504780 MAG5550 MAG5560 rplU   FALSE 0.037 187.000 0.000 NA   NA
 3504780 3504781 MAG5560 MAG5570   mscL TRUE 0.138 95.000 0.000 NA   NA
 3504781 3504782 MAG5570 MAG5580 mscL grpE FALSE 0.026 204.000 0.000 1.000 N NA
 3504782 3504783 MAG5580 MAG5590 grpE hrcA TRUE 1.000 -16.000 0.286 1.000 N NA
 3504783 3504784 MAG5590 MAG7490 hrcA rpmE FALSE 0.035 170.000 0.000 1.000 N NA
 3504784 3504785 MAG7490 MAG5610 rpmE rpsD TRUE 0.870 22.000 0.003 0.069 Y NA
 3504785 3504786 MAG5610 MAG5620 rpsD   FALSE 0.025 284.000 0.000 NA   NA
 3504786 3504787 MAG5620 MAG5630   gyrA TRUE 0.943 19.000 0.002 NA   NA
 3504787 3504788 MAG5630 MAG5640 gyrA hsdS FALSE 0.019 802.000 0.000 1.000 N NA
 3504788 3504789 MAG5640 MAG5650 hsdS hsdM TRUE 0.992 4.000 0.011 0.063 Y NA
 3504790 3504791 MAG5660 MAG5670     FALSE 0.045 163.000 0.000 NA   NA
 3504791 3504792 MAG5670 MAG5680     FALSE 0.027 260.000 0.000 NA   NA
 3504792 3504793 MAG5680 MAG5690     TRUE 0.741 16.000 0.000 0.063 N NA
 3504794 3504795 MAG5700 MAG5710     TRUE 0.999 -75.000 0.059 0.004   NA
 3504795 3504796 MAG5710 MAG5720   hsdS TRUE 0.881 8.000 0.000 0.013   NA
 3504796 3504797 MAG5720 MAG5730 hsdS hsdM TRUE 0.920 4.000 0.000 0.063   NA
 3504799 3504800 MAG5750 MAG5760     TRUE 0.952 2.000 0.000 1.000   NA
 3504800 3504801 MAG5760 MAG5770     TRUE 0.990 31.000 1.000 0.008   NA
 3504802 3504803 MAG5780 MAG5790 gltX   TRUE 0.966 -9.000 0.000 NA   NA
 3504804 3504805 MAG5800 MAG5810 metK   FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 3504805 3504806 MAG5810 MAG5820   ffh TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 3504806 3504807 MAG5820 MAG5830 ffh   TRUE 0.670 22.000 0.000 1.000   NA
 3504812 3504813 MAG5870 MAG5880     TRUE 0.345 47.000 0.000 NA   NA
 3504816 3504817 MAG5910 MAG5920   fusA FALSE 0.038 159.000 0.000 1.000 N NA
 3504817 3504818 MAG5920 MAG5930 fusA rpsG TRUE 0.990 30.000 0.579 1.000 Y NA
 3504818 3504819 MAG5930 MAG5940 rpsG rpsL TRUE 0.985 31.000 0.224 0.011 Y NA
 3504820 3504821 MAG5950 MAG5960     TRUE 0.424 39.000 0.000 1.000   NA
 3504821 3504822 MAG5960 MAG5970     FALSE 0.022 319.000 0.000 1.000   NA
 3504822 3504823 MAG5970 MAG5980     FALSE 0.029 225.000 0.000 NA   NA
 3504823 3504824 MAG5980 MAGt26     FALSE 0.065 136.000 0.000 NA   NA
 3504824 3504825 MAGt26 MAGt27     TRUE 0.568 30.000 0.000 NA   NA
 3504826 3504827 MAG5990 MAG6000     TRUE 0.996 12.000 1.000 0.007 Y NA
 3504827 3504828 MAG6000 MAG6010     FALSE 0.029 224.000 0.000 NA   NA
 3504828 3504829 MAG6010 MAG6020     TRUE 0.488 36.000 0.000 NA   NA
 3504829 3504830 MAG6020 MAG6030     FALSE 0.024 590.000 0.000 NA   NA
 3504830 3504831 MAG6030 MAG6040     FALSE 0.025 290.000 0.000 NA   NA
 3504831 3504832 MAG6040 MAG6050     TRUE 0.961 -22.000 0.000 NA   NA
 3504832 3504833 MAG6050 MAG6060     FALSE 0.024 394.000 0.000 NA   NA
 3504835 3504836 MAG6080 MAG6090     TRUE 0.270 58.000 0.000 NA   NA
 3504836 3504837 MAG6090 MAG6100     FALSE 0.024 394.000 0.000 NA   NA
 3504837 3504838 MAG6100 MAG6110   rpoC FALSE 0.046 151.000 0.000 1.000   NA
 3504838 3504839 MAG6110 MAG6120 rpoC rpoB TRUE 1.000 -7.000 0.851 0.003   NA
 3504840 3504841 MAG6130 MAG6140     FALSE 0.024 657.000 0.000 NA   NA
 3504841 3504842 MAG6140 MAG6150     FALSE 0.024 450.000 0.000 NA   NA
 3504842 3504843 MAG6150 MAG6160     TRUE 0.194 77.000 0.000 NA   NA
 3504843 3504844 MAG6160 MAG6170     FALSE 0.024 384.000 0.000 NA   NA
 3504845 3504846 MAG6180 MAG6190 rplL rplJ TRUE 0.988 27.000 0.884 0.048 Y NA
 3504849 3504850 MAG6220 MAG6230     TRUE 0.351 45.000 0.000 1.000   NA
 3504850 3504851 MAG6230 MAG6240   clp FALSE 0.062 129.000 0.000 1.000 N NA
 3504851 3504852 MAG6240 MAG6250 clp rpsP FALSE 0.060 131.000 0.000 1.000 N NA
 3504852 3504853 MAG6250 MAG6260 rpsP trmD TRUE 0.997 4.000 0.033 1.000 Y NA
 3504853 3504854 MAG6260 MAG6270 trmD rplS TRUE 1.000 -10.000 0.567 1.000 Y NA
 3504859 3504860 MAG6320 MAG6330     TRUE 0.913 7.000 0.000 NA   NA
 3504860 3504861 MAG6330 MAG6340     TRUE 0.999 2.000 0.750 1.000 Y NA
 3504861 3504862 MAG6340 MAG6350     TRUE 0.999 -25.000 0.750 1.000 Y NA
 3504862 3504863 MAG6350 MAG6360     TRUE 0.990 18.000 0.066 1.000 Y NA
 3504863 3504864 MAG6360 MAG6370   sgaB TRUE 0.999 0.000 0.279 0.003 Y NA
 3504864 3504865 MAG6370 MAG6380 sgaB   TRUE 0.944 103.000 0.431 0.011   NA
 3504865 3504866 MAG6380 MAG6390     TRUE 0.970 54.000 0.118 1.000   NA
 3504868 3504869 MAG6410 MAG6420     TRUE 0.256 62.000 0.000 NA   NA
 3504870 3504871 MAG6430 MAG6440     FALSE 0.025 290.000 0.000 NA   NA
 3504871 3504872 MAG6440 MAG6450     TRUE 0.945 3.000 0.000 NA   NA
 3504874 3504875 MAG6470 MAG6480     TRUE 0.847 12.000 0.000 NA   NA
 3504875 3504876 MAG6480 MAG6490     TRUE 0.953 -100.000 0.000 NA   NA
 3504876 3504877 MAG6490 MAG6500     FALSE 0.024 406.000 0.000 NA   NA
 3504877 3504878 MAG6500 MAG6510     TRUE 0.374 45.000 0.000 NA   NA
 3504879 3504880 MAG6520 MAG6530   gtsC TRUE 0.970 61.000 1.000 NA   NA
 3504880 3504881 MAG6530 MAG6540 gtsC gtsB TRUE 0.999 -10.000 1.000 NA Y NA
 3504881 3504882 MAG6540 MAG6550 gtsB gtsA TRUE 0.960 -28.000 0.000 NA   NA
 3504882 3504883 MAG6550 MAG6560 gtsA gtsA TRUE 0.961 1.000 0.000 NA   NA
 3504883 3504884 MAG6560 MAG6570 gtsA   FALSE 0.031 184.000 0.000 1.000 N NA
 3504884 3504885 MAG6570 MAG6580     FALSE 0.114 95.000 0.000 1.000 N NA
 3504885 3504886 MAG6580 MAG6590     TRUE 0.993 3.000 0.003 NA   NA
 3504886 3504887 MAG6590 MAG6600   nadE TRUE 0.998 3.000 0.015 NA   NA
 3504887 3504888 MAG6600 MAG6610 nadE   FALSE 0.098 115.000 0.000 NA   NA
 3504888 3504889 MAG6610 MAG6620   lip TRUE 0.957 2.000 0.000 NA   NA
 3504889 3504890 MAG6620 MAG6630 lip   TRUE 0.526 32.000 0.000 NA   NA
 3504890 3504891 MAG6630 MAG6640   dnaI TRUE 0.362 44.000 0.000 1.000   NA
 3504891 3504892 MAG6640 MAG6650 dnaI   TRUE 0.889 9.000 0.000 NA   NA
 3504892 3504893 MAG6650 MAG6660     TRUE 0.913 50.000 0.013 NA   NA
 3504893 3504894 MAG6660 MAG6670     TRUE 0.994 3.000 0.005 NA   NA
 3504894 3504895 MAG6670 MAGt28     TRUE 0.244 64.000 0.000 NA   NA
 3504897 3504898 MAG6690 MAG6700     TRUE 1.000 -18.000 0.182 NA   NA
 3504898 3504899 MAG6700 MAG6710     TRUE 0.963 -18.000 0.000 NA   NA
 3504899 3504900 MAG6710 MAG6720     TRUE 0.996 2.000 0.007 NA   NA
 3504900 3504901 MAG6720 MAG6730   rnhB FALSE 0.023 272.000 0.000 1.000   NA
 3504901 3504902 MAG6730 MAG6740 rnhB   TRUE 0.572 29.000 0.000 1.000   NA
 3504902 3504903 MAG6740 MAG6750     TRUE 0.722 47.000 0.002 1.000   NA
 3504903 3504904 MAG6750 MAG6760   chrA TRUE 0.453 34.000 0.000 1.000 N NA
 3504904 3504905 MAG6760 MAG6770 chrA chrA TRUE 0.999 0.000 0.273 0.003 Y NA
 3504905 3504906 MAG6770 MAG6780 chrA   TRUE 0.926 4.000 0.000 1.000   NA
 3504906 3504907 MAG6780 MAG6790     TRUE 0.854 54.000 0.007 NA   NA
 3504909 3504910 MAG6810 MAG6820     FALSE 0.027 246.000 0.000 NA   NA
 3504910 3504911 MAG6820 MAG6830     TRUE 0.125 102.000 0.000 NA   NA
 3504911 3504912 MAG6830 MAG6840   dnaH TRUE 0.999 -7.000 0.016 1.000   NA
 3504912 3504913 MAG6840 MAG6850 dnaH tmk TRUE 1.000 0.000 0.254 1.000 N NA
 3504913 3504914 MAG6850 MAG6860 tmk recR TRUE 0.987 17.000 0.015 1.000 N NA
 3504914 3504915 MAG6860 MAG6870 recR dnaX TRUE 0.157 310.000 0.009 0.014 Y NA
 3504916 3504917 MAG6880 MAG6890   pgm FALSE 0.080 126.000 0.000 NA   NA
 3504917 3504918 MAG6890 MAG6900 pgm   TRUE 0.940 3.000 0.000 1.000   NA
 3504918 3504919 MAG6900 MAG6910     FALSE 0.034 193.000 0.000 NA   NA
 3504921 3504922 MAG6920 MAG6930   pgsA TRUE 0.964 -13.000 0.000 NA   NA
 3504923 3504924 MAG6940 MAG6950 cdsA   TRUE 0.448 39.000 0.000 NA   NA
 3504924 3504925 MAG6950 MAG6960   apt FALSE 0.059 144.000 0.000 NA   NA
 3504925 3504926 MAG6960 MAG6970 apt infB TRUE 0.903 29.000 0.003 1.000 N NA
 3504926 3504927 MAG6970 MAG6980 infB   TRUE 1.000 -21.000 0.171 NA N NA
 3504927 3504928 MAG6980 MAG6990   nusA TRUE 0.999 -25.000 0.323 NA Y NA
 3504928 3504929 MAG6990 MAG7000 nusA   TRUE 0.989 43.000 0.759 NA   NA
 3504929 3504930 MAG7000 MAG7010   tdk FALSE 0.052 149.000 0.000 NA   NA
 3504930 3504931 MAG7010 MAG7020 tdk pepA TRUE 0.158 78.000 0.000 1.000 N NA
 3504934 3504935 MAG7050 MAG7060 vpmaV vpmaW FALSE 0.033 194.000 0.000 NA   NA
 3504937 3504938 MAG7080 MAG7090 vpmaY vpmaU FALSE 0.024 389.000 0.000 NA   NA
 3504940 3504941 MAG7110 MAGt30 xer1   TRUE 0.146 92.000 0.000 NA   NA
 3504941 3504942 MAGt30 MAG7120     FALSE 0.042 171.000 0.000 NA   NA
 3504942 3504943 MAG7120 MAG7130     FALSE 0.024 336.000 0.000 NA   NA
 3504943 3504944 MAG7130 MAG7140     FALSE 0.091 120.000 0.000 NA   NA
 3504945 3504946 MAG7150 MAG7160   gatB FALSE 0.044 166.000 0.000 NA   NA
 3504946 3504947 MAG7160 MAG7170 gatB gatA TRUE 0.999 -7.000 0.492 0.004 Y NA
 3504947 3504948 MAG7170 MAG7180 gatA   TRUE 1.000 0.000 0.643 0.004   NA
 3504948 3504949 MAG7180 MAG7190   rluC TRUE 0.993 6.000 0.007 1.000   NA
 3504949 3504950 MAG7190 MAG7200 rluC spcB TRUE 0.990 12.000 0.011 NA N NA
 3504950 3504951 MAG7200 MAG7210 spcB scpA TRUE 1.000 -10.000 0.570 NA   NA
 3504951 3504952 MAG7210 MAG7220 scpA plsC TRUE 0.999 -7.000 0.019 NA   NA
 3504952 3504953 MAG7220 MAG7230 plsC acpS TRUE 0.991 10.000 0.020 1.000 Y NA
 3504953 3504954 MAG7230 MAG7240 acpS engA FALSE 0.046 151.000 0.000 1.000   NA
 3504954 3504955 MAG7240 MAG7250 engA cmk TRUE 0.999 3.000 0.060 1.000   NA
 3504955 3504956 MAG7250 MAG7260 cmk   TRUE 0.183 80.000 0.000 NA   NA
 3504956 3504957 MAG7260 MAG7270     TRUE 0.283 55.000 0.000 NA   NA
 3504957 3504958 MAG7270 MAG7280   dnaJ FALSE 0.033 195.000 0.000 NA   NA
 3504959 3504960 MAGt31 MAG7290   rbfA TRUE 0.176 83.000 0.000 NA   NA
 3504961 3504962 MAGt32 MAG7300   tyrS TRUE 0.294 54.000 0.000 NA   NA
 3504962 3504963 MAG7300 MAG7310 tyrS   TRUE 0.845 11.000 0.000 1.000   NA
 3504965 3504966 MAGt33 MAG7330     TRUE 0.568 30.000 0.000 NA   NA
 3504966 3504967 MAG7330 MAG7340     TRUE 0.406 40.000 0.000 1.000   NA
 3504967 3504968 MAG7340 MAG7350   prfA TRUE 0.999 0.000 0.081 0.056 Y NA
 3504968 3504969 MAG7350 MAG7360 prfA   FALSE 0.049 153.000 0.000 NA   NA
 3504970 3504971 MAG7370 MAG7380 gyrB trxA FALSE 0.067 125.000 0.000 1.000 N NA
 3504971 3504972 MAG7380 MAG7390 trxA smpB FALSE 0.032 53.000 0.000 1.000 Y NA
 3504974 3504975 MAG7410 MAGt34     TRUE 0.902 8.000 0.000 NA   NA
 3504976 3504977 MAG7420 MAG7430 mgtA   FALSE 0.069 123.000 0.000 1.000 N NA
 3504977 3504978 MAG7430 MAG7440     TRUE 0.999 8.000 0.333 1.000   NA
 3504978 3504979 MAG7440 MAG7450   ftsH TRUE 0.294 183.000 0.006 0.052   NA
 3504979 3504980 MAG7450 MAG7460 ftsH   TRUE 0.927 71.000 0.051 1.000 N NA
 3504980 3504981 MAG7460 MAG7470   pth TRUE 0.999 0.000 0.025 0.071 N NA
 3504981 3504982 MAG7470 MAG7480 pth recD TRUE 0.996 0.000 0.006 1.000   NA