MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus agalactiae CJB111

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
2442711	2442712	SAM_1148	SAM_1147			TRUE	0.273	73.000	0.000	NA	N	NA
2442713	2442714	SAM_1146	SAM_1145			TRUE	0.629	-55.000	0.000	NA		NA
2442714	2442715	SAM_1145	SAM_1144			FALSE	0.015	439.000	0.000	NA		NA
2442716	2442717	SAM_1143	SAM_1142			FALSE	0.120	149.000	0.000	NA		NA
2442717	2442718	SAM_1142	SAM_1141			FALSE	0.249	74.000	0.000	NA		NA
2442718	2442719	SAM_1141	SAM_1140		opuD	FALSE	0.167	143.000	0.000	1.000	N	NA
2442721	2442722	SAM_1138	SAM_1137			FALSE	0.058	197.000	0.000	NA		NA
2442722	2442723	SAM_1137	SAM_1136		thrB	TRUE	0.987	2.000	0.036	1.000	Y	NA
2442723	2442724	SAM_1136	SAM_1135	thrB	rarD	TRUE	0.894	-13.000	0.005	1.000		NA
2442724	2442725	SAM_1135	SAM_1134	rarD	folC	TRUE	0.908	2.000	0.000	1.000		NA
2442725	2442726	SAM_1134	SAM_1133	folC	folE	TRUE	0.982	19.000	0.057	1.000	Y	NA
2442726	2442727	SAM_1133	SAM_1132	folE	folP	TRUE	0.990	4.000	0.073	1.000	Y	NA
2442727	2442728	SAM_1132	SAM_1131	folP	folB	TRUE	0.991	2.000	0.094	1.000	Y	NA
2442728	2442729	SAM_1131	SAM_1130	folB	folK	TRUE	0.991	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
2442729	2442730	SAM_1130	SAM_1128	folK	murB	TRUE	0.312	144.000	0.010	1.000	N	NA
2442730	2442731	SAM_1128	SAM_1129	murB		TRUE	0.589	-342.000	0.000	NA		NA
2442731	2442732	SAM_1129	SAM_1127		potA	FALSE	0.012	609.000	0.000	NA		NA
2442732	2442733	SAM_1127	SAM_1126	potA	potB	TRUE	0.998	-16.000	0.928	0.053	Y	NA
2442733	2442734	SAM_1126	SAM_1125	potB	potC	TRUE	0.998	-3.000	0.492	0.053	Y	NA
2442734	2442735	SAM_1125	SAM_1124	potC		TRUE	0.995	-7.000	0.253	0.053	Y	NA
2442735	2442736	SAM_1124	SAM_1123			TRUE	0.490	109.000	0.033	1.000	N	NA
2442738	2442739	SAM_1121	SAM_1120			FALSE	0.020	345.000	0.000	NA		NA
2442739	2442740	SAM_1120	SAM_1119			TRUE	0.557	101.000	0.071	1.000		NA
2442740	2442741	SAM_1119	SAM_1118			FALSE	0.122	163.000	0.000	1.000	N	NA
2442741	2442742	SAM_1118	SAM_1117			FALSE	0.199	91.000	0.000	NA		NA
2442742	2442743	SAM_1117	SAM_1116			TRUE	0.484	96.000	0.046	NA		NA
2442744	2442745	SAM_1115	SAM_1114			TRUE	0.339	161.000	0.083	NA		NA
2442745	2442746	SAM_1114	SAM_1113			TRUE	0.983	2.000	0.166	NA		NA
2442746	2442747	SAM_1113	SAM_1112		prsA	TRUE	0.991	4.000	0.089	1.000	Y	NA
2442747	2442748	SAM_1112	SAM_1111	prsA		TRUE	0.381	177.000	0.145	1.000		NA
2442749	2442750	SAM_1110	SAM_1109			TRUE	0.681	-25.000	0.000	NA		NA
2442750	2442751	SAM_1109	SAM_1108			FALSE	0.245	75.000	0.000	NA		NA
2442751	2442752	SAM_1108	SAM_1107		rluD	TRUE	0.979	-3.000	0.150	NA		NA
2442752	2442753	SAM_1107	SAM_1106	rluD	pta	TRUE	0.941	26.000	0.067	1.000	N	NA
2442753	2442754	SAM_1106	SAM_1105	pta		TRUE	0.775	62.000	0.031	0.067		NA
2442754	2442755	SAM_1105	SAM_1104			FALSE	0.176	135.000	0.000	1.000		NA
2442755	2442756	SAM_1104	SAM_1103			TRUE	0.891	11.000	0.000	NA		NA
2442758	2442759	SAM_1101	SAM_1099		guaC	FALSE	0.066	203.000	0.000	1.000		NA
2442761	2442762	SAM_1098	SAM_1097	xpt	pbuX	TRUE	0.988	0.000	0.046	1.000	Y	NA
2442763	2442764	SAM_1096	SAM_1095			FALSE	0.198	99.000	0.000	NA		NA
2442764	2442765	SAM_1095	SAM_1094			TRUE	0.988	24.000	0.588	NA		NA
2442765	2442766	SAM_1094	SAM_1093		apbE	TRUE	0.982	18.000	0.243	NA		NA
2442766	2442767	SAM_1093	SAM_1092	apbE		TRUE	0.554	149.000	0.189	1.000		NA
2442768	2442769	SAM_1091	SAM_1090		prfA	TRUE	0.890	35.000	0.062	1.000	N	NA
2442769	2442770	SAM_1090	SAM_1089	prfA	hemK	TRUE	0.994	0.000	0.084	0.059	Y	NA
2442770	2442771	SAM_1089	SAM_1088	hemK		TRUE	0.975	-7.000	0.029	NA	Y	NA
2442771	2442772	SAM_1088	SAM_1087		glyA	TRUE	0.419	92.000	0.015	NA	N	NA
2442772	2442773	SAM_1087	SAM_1086	glyA		TRUE	0.978	5.000	0.103	NA		NA
2442773	2442774	SAM_1086	SAM_1085			TRUE	0.980	2.000	0.128	NA		NA
2442774	2442775	SAM_1085	SAM_1084			TRUE	0.970	12.000	0.053	NA		NA
2442775	2442776	SAM_1084	SAM_1083			TRUE	0.999	1.000	0.895	0.008	Y	NA
2442777	2442778	SAM_1082	SAM_1081	manB		TRUE	0.544	110.000	0.098	NA		NA
2442778	2442779	SAM_1081	SAM_1080			TRUE	0.743	46.000	0.019	NA		NA
2442779	2442780	SAM_1080	SAM_1079		dfp	TRUE	0.939	-7.000	0.013	1.000		NA
2442781	2442782	SAM_1078	SAM_1077		noxB-2	TRUE	0.947	-7.000	0.019	1.000	N	NA
2442782	2442783	SAM_1077	SAM_1076	noxB-2		TRUE	0.990	-3.000	0.100	1.000	Y	NA
2442783	2442784	SAM_1076	SAM_1075		gcvH	TRUE	0.985	29.000	0.571	1.000	N	NA
2442784	2442785	SAM_1075	SAM_1074	gcvH		TRUE	0.964	-7.000	0.107	NA		NA
2442785	2442786	SAM_1074	SAM_1073			TRUE	0.955	-31.000	0.286	NA		NA
2442786	2442787	SAM_1073	SAM_1072			TRUE	0.972	27.000	0.250	1.000	N	NA
2442787	2442788	SAM_1072	SAM_1071		fhs	TRUE	0.720	89.000	0.200	1.000	N	NA
2442788	2442789	SAM_1071	SAM_1070	fhs	cls	TRUE	0.572	119.000	0.094	1.000	N	NA
2442789	2442790	SAM_1070	SAM_1069	cls		FALSE	0.014	685.000	0.000	1.000		NA
2442790	2442791	SAM_1069	SAM_1068		asd	FALSE	0.038	260.000	0.000	1.000		NA
2442791	2442792	SAM_1068	SAM_1067	asd	nrdD	FALSE	0.237	170.000	0.020	1.000		NA
2442792	2442793	SAM_1067	SAM_1066	nrdD		FALSE	0.189	131.000	0.000	1.000		NA
2442793	2442794	SAM_1066	SAM_1065			TRUE	0.425	52.000	0.000	NA		NA
2442794	2442795	SAM_1065	SAM_1064		pyrF	FALSE	0.047	213.000	0.000	NA		NA
2442795	2442796	SAM_1064	SAM_1063	pyrF	pyrE	TRUE	0.992	13.000	0.133	1.000	Y	NA
2442796	2442797	SAM_1063	SAM_1062	pyrE	pyrC	TRUE	0.981	12.000	0.003	1.000	Y	NA
2442797	2442798	SAM_1062	SAM_1061	pyrC	pyrB	TRUE	0.802	165.000	0.452	1.000	Y	NA
2442798	2442799	SAM_1061	SAM_1060	pyrB	carA	TRUE	0.983	14.000	0.014	1.000	Y	NA
2442799	2442800	SAM_1060	SAM_1059	carA	carB	TRUE	0.987	31.000	0.117	0.003	Y	NA
2442800	2442801	SAM_1059	SAM_1058	carB		FALSE	0.172	126.000	0.000	NA		NA
2442801	2442802	SAM_1058	SAM_1057			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2442802	2442803	SAM_1057	SAM_1056			FALSE	0.183	117.000	0.000	NA		NA
2442803	2442804	SAM_1056	SAM_1055			FALSE	0.087	168.000	0.000	NA		NA
2442804	2442805	SAM_1055	SAM_1054			TRUE	0.559	82.000	0.061	NA		NA
2442805	2442806	SAM_1054	SAM_1053			TRUE	0.989	9.000	0.286	NA		NA
2442806	2442807	SAM_1053	SAM_1052			TRUE	0.965	-16.000	0.237	NA		NA
2442807	2442808	SAM_1052	SAM_1051			TRUE	0.996	0.000	0.833	NA		NA
2442808	2442809	SAM_1051	SAM_1050			TRUE	0.995	7.000	0.623	NA		NA
2442809	2442810	SAM_1050	SAM_1049			TRUE	0.965	13.000	0.038	NA		NA
2442810	2442811	SAM_1049	SAM_1048			TRUE	0.893	9.000	0.000	NA		NA
2442811	2442812	SAM_1048	SAM_1047			TRUE	0.888	0.000	0.000	NA		NA
2442812	2442813	SAM_1047	SAM_1046			TRUE	0.895	6.000	0.000	NA		NA
2442813	2442814	SAM_1046	SAM_1045			TRUE	0.714	29.000	0.000	NA		NA
2442814	2442815	SAM_1045	SAM_1044			FALSE	0.031	264.000	0.000	NA		NA
2442815	2442816	SAM_1044	SAM_1043			TRUE	0.724	-18.000	0.000	NA		NA
2442816	2442817	SAM_1043	SAM_1042			TRUE	0.895	6.000	0.000	NA		NA
2442817	2442818	SAM_1042	SAM_1041			TRUE	0.891	11.000	0.000	NA		NA
2442818	2442819	SAM_1041	SAM_1040			FALSE	0.058	197.000	0.000	NA		NA
2442819	2442820	SAM_1040	SAM_1039			FALSE	0.199	91.000	0.000	NA		NA
2442820	2442821	SAM_1039	SAM_1038			TRUE	0.516	44.000	0.000	NA		NA
2442821	2442822	SAM_1038	SAM_1037			TRUE	0.996	6.000	0.667	NA		NA
2442824	2442825	SAM_1035	SAM_1034			FALSE	0.014	517.000	0.000	NA		NA
2442825	2442826	SAM_1034	SAM_1033			FALSE	0.025	303.000	0.000	NA		NA
2442826	2442827	SAM_1033	SAM_1032			TRUE	0.894	5.000	0.000	NA		NA
2442827	2442828	SAM_1032	SAM_1031			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2442828	2442829	SAM_1031	SAM_1030			FALSE	0.015	429.000	0.000	NA		NA
2442829	2442830	SAM_1030	SAM_1029			FALSE	0.209	87.000	0.000	NA		NA
2442830	2442831	SAM_1029	SAM_1028			FALSE	0.013	548.000	0.000	NA		NA
2442831	2442832	SAM_1028	SAM_1027			TRUE	0.999	12.000	0.538	0.018	Y	NA
2442832	2442833	SAM_1027	SAM_1026			TRUE	0.555	156.000	0.050	1.000	Y	NA
2442833	2442834	SAM_1026	SAM_1025			FALSE	0.057	201.000	0.000	NA		NA
2442834	2442835	SAM_1025	SAM_1024			FALSE	0.029	276.000	0.000	NA		NA
2442835	2442836	SAM_1024	SAM_1023		rnhB	TRUE	0.962	-13.000	0.148	1.000		NA
2442836	2442837	SAM_1023	SAM_1022	rnhB		TRUE	0.913	21.000	0.003	1.000		NA
2442837	2442838	SAM_1022	SAM_1021			FALSE	0.048	238.000	0.000	1.000		NA
2442838	2442839	SAM_1021	SAM_1020			TRUE	0.999	-3.000	0.870	0.052	Y	NA
2442839	2442840	SAM_1020	SAM_1019			TRUE	0.998	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
2442840	2442841	SAM_1019	SAM_1018			TRUE	0.793	62.000	0.012	1.000	Y	NA
2442841	2442842	SAM_1018	SAM_1017		dprA	FALSE	0.181	138.000	0.000	1.000	N	NA
2442842	2442843	SAM_1017	SAM_1016	dprA	topA	TRUE	0.858	95.000	0.238	1.000	Y	NA
2442843	2442844	SAM_1016	SAM_1015	topA		FALSE	0.185	137.000	0.000	1.000	N	NA
2442844	2442845	SAM_1015	SAM_1014			TRUE	0.992	12.000	0.438	NA		NA
2442846	2442847	SAM_0270	SAM_0271			TRUE	0.996	3.000	0.713	NA	N	NA
2442847	2442848	SAM_0271	SAM_0272			FALSE	0.031	264.000	0.000	NA		NA
2442848	2442849	SAM_0272	SAM_0273			TRUE	0.951	21.000	0.069	NA		NA
2442850	2442851	SAM_0274	SAM_0275		nagA	FALSE	0.029	278.000	0.000	NA		NA
2442851	2442852	SAM_0275	SAM_0276	nagA		FALSE	0.181	119.000	0.000	NA		NA
2442852	2442853	SAM_0276	SAM_0277			FALSE	0.186	111.000	0.000	NA		NA
2442853	2442854	SAM_0277	SAM_0278		glyQ	FALSE	0.019	424.000	0.000	1.000		NA
2442854	2442855	SAM_0278	SAM_0279	glyQ		TRUE	0.914	0.000	0.000	1.000	N	NA
2442855	2442856	SAM_0279	SAM_0280		glyS	TRUE	0.919	4.000	0.000	1.000	N	NA
2442856	2442857	SAM_0280	SAM_0281	glyS		TRUE	0.960	12.000	0.020	NA		NA
2442857	2442858	SAM_0281	SAM_0282			TRUE	0.671	32.000	0.000	NA		NA
2442858	2442859	SAM_0282	SAM_0283		glpK	FALSE	0.183	115.000	0.000	NA		NA
2442859	2442860	SAM_0283	SAM_0284	glpK	glpD	TRUE	0.999	13.000	0.500	0.002	Y	NA
2442860	2442861	SAM_0284	SAM_0285	glpD		TRUE	0.995	12.000	0.500	1.000	N	NA
2442861	2442862	SAM_0285	SAM_0286			TRUE	0.691	145.000	0.364	1.000		NA
2442862	2442863	SAM_0286	SAM_0287			TRUE	0.993	9.000	0.462	NA		NA
2442863	2442864	SAM_0287	SAM_0288		tkt	FALSE	0.039	239.000	0.000	NA		NA
2442864	2442865	SAM_0288	SAM_0289	tkt		FALSE	0.051	207.000	0.000	NA		NA
2442865	2442866	SAM_0289	SAM_0290			TRUE	0.967	20.000	0.136	NA		NA
2442866	2442867	SAM_0290	SAM_0291			TRUE	0.991	4.000	0.341	NA		NA
2442869	2442870	SAM_0293	SAM_0294	proB	proA	TRUE	0.998	10.000	0.281	0.002	Y	NA
2442870	2442871	SAM_0294	SAM_0295	proA	mraW	TRUE	0.319	134.000	0.003	1.000	N	NA
2442871	2442872	SAM_0295	SAM_0296	mraW		TRUE	0.974	15.000	0.077	1.000	N	NA
2442872	2442873	SAM_0296	SAM_0297			TRUE	0.994	4.000	0.456	1.000	N	NA
2442873	2442874	SAM_0297	SAM_0298		mraY	TRUE	0.988	2.000	0.038	1.000	Y	NA
2442874	2442875	SAM_0298	SAM_0299	mraY		TRUE	0.417	98.000	0.007	1.000	N	NA
2442875	2442876	SAM_0299	SAM_0300			TRUE	0.414	138.000	0.036	1.000	N	NA
2442876	2442877	SAM_0300	SAM_0302			TRUE	0.878	95.000	0.143	0.051	Y	NA
2442879	2442880	SAM_0303	SAM_0304			TRUE	0.771	98.000	0.364	NA		NA
2442880	2442881	SAM_0304	SAM_0305		trxB	TRUE	0.680	69.000	0.117	NA		NA
2442881	2442882	SAM_0305	SAM_0306	trxB		TRUE	0.281	158.000	0.017	1.000	N	NA
2442882	2442883	SAM_0306	SAM_0307		nadE	TRUE	0.997	-3.000	0.194	0.004	Y	NA
2442883	2442884	SAM_0307	SAM_0308	nadE	pepC	TRUE	0.441	113.000	0.017	1.000	N	NA
2442885	2442886	SAM_0309	SAM_0310			TRUE	0.926	47.000	0.319	1.000		NA
2442887	2442888	SAM_0311	SAM_0312			TRUE	0.710	-19.000	0.000	NA		NA
2442888	2442889	SAM_0312	SAM_0313			TRUE	0.842	18.000	0.000	NA		NA
2442889	2442890	SAM_0313	SAM_0314			FALSE	0.014	470.000	0.000	NA		NA
2442890	2442891	SAM_0314	SAM_0315			TRUE	0.961	13.000	0.029	NA		NA
2442895	2442896	SAM_0319	SAM_0320			TRUE	0.710	-19.000	0.000	NA		NA
2442896	2442897	SAM_0320	SAM_0321			TRUE	0.956	-13.000	0.136	NA		NA
2442897	2442898	SAM_0321	SAM_0322			TRUE	0.982	27.000	0.500	NA		NA
2442898	2442899	SAM_0322	SAM_0323			TRUE	0.999	2.000	0.857	0.018	Y	NA
2442899	2442900	SAM_0323	SAM_0324			TRUE	0.450	50.000	0.000	NA		NA
2442900	2442901	SAM_0324	SAM_0325			FALSE	0.089	167.000	0.000	NA		NA
2442901	2442902	SAM_0325	SAM_0326			TRUE	0.987	23.000	0.471	1.000	N	NA
2442902	2442903	SAM_0326	SAM_0327		priA	TRUE	0.703	74.000	0.032	0.073	N	NA
2442903	2442904	SAM_0327	SAM_0328	priA	fmt	TRUE	0.819	47.000	0.052	1.000	N	NA
2442904	2442905	SAM_0328	SAM_0329	fmt	sun	TRUE	0.991	-10.000	0.305	1.000	Y	NA
2442905	2442906	SAM_0329	SAM_0330	sun		TRUE	0.882	38.000	0.074	1.000	N	NA
2442906	2442907	SAM_0330	SAM_0331			TRUE	0.967	66.000	0.704	1.000	Y	NA
2442907	2442908	SAM_0331	SAM_0332			TRUE	0.280	161.000	0.039	NA		NA
2442908	2442909	SAM_0332	SAM_0333			TRUE	0.995	-3.000	0.679	NA		NA
2442909	2442910	SAM_0333	SAM_0334		vraR	TRUE	0.999	-7.000	0.853	0.018	Y	NA
2442910	2442911	SAM_0334	SAM_0335	vraR		TRUE	0.904	42.000	0.164	1.000		NA
2442911	2442912	SAM_0335	SAM_0336			TRUE	0.957	-16.000	0.151	1.000		NA
2442914	2442915	SAM_0338	SAM_0339			TRUE	0.888	119.000	0.188	0.044	Y	NA
2442915	2442916	SAM_0339	SAM_0340			FALSE	0.252	204.000	0.091	1.000	N	NA
2442916	2442917	SAM_0340	SAM_0341		celA	TRUE	0.999	17.000	0.889	0.015	Y	NA
2442917	2442918	SAM_0341	SAM_0342	celA	celB	TRUE	0.999	2.000	0.889	0.015	Y	NA
2442920	2442921	SAM_0344	SAM_0345			TRUE	0.993	10.000	0.368	1.000	N	NA
2442921	2442922	SAM_0345	SAM_0346		gldA	TRUE	0.807	68.000	0.211	1.000	N	NA
2442923	2442924	SAM_0347	SAM_0348	cysK		TRUE	0.488	91.000	0.033	1.000		NA
2442925	2442926	SAM_0349	SAM_0350	comFA		TRUE	0.982	0.000	0.130	1.000		NA
2442926	2442927	SAM_0350	SAM_0351			TRUE	0.598	77.000	0.080	NA		NA
2442927	2442928	SAM_0351	SAM_0352			FALSE	0.010	6590.000	0.000	NA		NA
2442928	2442929	SAM_0352	SAM_0353			TRUE	0.320	64.000	0.000	NA		NA
2442929	2442930	SAM_0353	SAM_0354			TRUE	0.995	19.000	1.000	NA		NA
2442930	2442931	SAM_0354	SAM_0355			TRUE	0.892	10.000	0.000	NA		NA
2442933	2442934	SAM_0357	SAM_0358			TRUE	0.892	3.000	0.000	NA		NA
2442934	2442935	SAM_0358	SAM_0359			FALSE	0.017	573.000	0.000	1.000	N	NA
2442935	2442936	SAM_0359	SAM_0360			TRUE	0.667	100.000	0.000	0.016	Y	NA
2442936	2442937	SAM_0360	SAM_0361			TRUE	0.899	43.000	0.000	0.016	Y	NA
2442938	2442939	SAM_0362	SAM_0363			TRUE	0.989	-3.000	0.333	NA		NA
2442941	2442942	SAM_0365	SAM_0366			TRUE	0.780	24.000	0.000	NA		NA
2442943	2442944	SAM_0913	SAM_0912			TRUE	0.994	3.000	0.502	NA		NA
2442945	2442946	SAM_0911	SAM_0910			TRUE	0.996	0.000	0.796	1.000		NA
2442947	2442948	SAM_0909	SAM_0908			TRUE	0.714	98.000	0.200	1.000	N	NA
2442948	2442949	SAM_0908	SAM_0907		aceF	TRUE	0.880	60.000	0.091	1.000	Y	NA
2442951	2442952	SAM_0905	SAM_0904		pdhA	TRUE	0.968	135.000	0.769	0.001	Y	NA
2442952	2442953	SAM_0904	SAM_0903	pdhA		FALSE	0.139	150.000	0.000	1.000		NA
2442955	2442956	SAM_0901	SAM_0900			TRUE	0.913	13.000	0.000	1.000	N	NA
2442956	2442957	SAM_0900	SAM_0899		rexB	TRUE	0.987	-10.000	0.070	0.072	Y	NA
2442957	2442958	SAM_0899	SAM_0898	rexB		TRUE	0.942	-3.000	0.008	NA		NA
2442960	2442961	SAM_0896	SAM_0895	pheT		TRUE	0.648	54.000	0.007	1.000		NA
2442961	2442962	SAM_0895	SAM_0894		pheS	TRUE	0.445	83.000	0.009	1.000		NA
2442962	2442963	SAM_0894	SAM_0893	pheS		FALSE	0.033	292.000	0.000	1.000		NA
2442963	2442964	SAM_0893	SAM_0892			TRUE	0.760	75.000	0.237	NA		NA
2442964	2442965	SAM_0892	SAM_0891		murA	TRUE	0.956	-10.000	0.110	NA		NA
2442965	2442966	SAM_0891	SAM_0890	murA	atpC	FALSE	0.026	358.000	0.000	1.000	N	NA
2442966	2442967	SAM_0890	SAM_0889	atpC	atpD	TRUE	0.999	13.000	0.837	0.004	Y	NA
2442967	2442968	SAM_0889	SAM_0888	atpD	atpG	TRUE	0.980	74.000	0.724	0.004	Y	NA
2442968	2442969	SAM_0888	SAM_0887	atpG	atpA	TRUE	0.999	16.000	0.846	0.004	Y	NA
2442969	2442970	SAM_0887	SAM_0886	atpA	atpH	TRUE	0.999	16.000	0.864	0.004	Y	NA
2442970	2442971	SAM_0886	SAM_0885	atpH	atpF	TRUE	0.998	0.000	0.222	0.004	Y	NA
2442971	2442972	SAM_0885	SAM_0884	atpF	atpB	TRUE	0.991	18.000	0.032	0.006	Y	NA
2442972	2442973	SAM_0884	SAM_0883	atpB		TRUE	0.973	33.000	0.189	0.006		NA
2442973	2442974	SAM_0883	SAM_0882			FALSE	0.026	332.000	0.000	1.000		NA
2442974	2442975	SAM_0882	SAM_0881		glgD	TRUE	0.996	-3.000	0.395	1.000	Y	NA
2442975	2442976	SAM_0881	SAM_0880	glgD	glgC	TRUE	0.999	-10.000	0.810	0.002	Y	NA
2442976	2442977	SAM_0880	SAM_0879	glgC	glgB	TRUE	0.987	42.000	0.317	0.002	Y	NA
2442977	2442978	SAM_0879	SAM_0878	glgB		TRUE	0.580	206.000	0.067	0.007	Y	NA
2442978	2442979	SAM_0878	SAM_0877			TRUE	0.980	4.000	0.088	1.000	N	NA
2442979	2442980	SAM_0877	SAM_0876		ligA	TRUE	0.963	12.000	0.013	1.000	N	NA
2442980	2442981	SAM_0876	SAM_0875	ligA		FALSE	0.240	152.000	0.010	NA		NA
2442983	2442984	SAM_0873	SAM_0872		map	TRUE	0.992	2.000	0.373	1.000		NA
2442984	2442985	SAM_0872	SAM_0871	map		TRUE	0.687	131.000	0.235	1.000	N	NA
2442985	2442986	SAM_0871	SAM_0870			TRUE	0.987	-7.000	0.342	1.000	N	NA
2442986	2442987	SAM_0870	SAM_0869		murA	TRUE	0.578	84.000	0.052	1.000	N	NA
2442987	2442988	SAM_0869	SAM_0868	murA	thiE	FALSE	0.215	127.000	0.000	1.000	N	NA
2442988	2442989	SAM_0868	SAM_0867	thiE	thiM	TRUE	0.995	14.000	0.061	0.004	Y	NA
2442989	2442990	SAM_0867	SAM_0866	thiM	thiD	TRUE	0.994	2.000	0.032	0.004	Y	NA
2442990	2442991	SAM_0866	SAM_0865	thiD		TRUE	0.994	2.000	0.478	1.000	N	NA
2442991	2442992	SAM_0865	SAM_0864			FALSE	0.256	84.000	0.000	1.000		NA
2442992	2442993	SAM_0864	SAM_0863			TRUE	0.596	-253.000	0.000	NA		NA
2442993	2442994	SAM_0863	SAM_0862			FALSE	0.183	116.000	0.000	NA		NA
2442994	2442995	SAM_0862	SAM_0861			TRUE	0.894	4.000	0.000	NA		NA
2442995	2442996	SAM_0861	SAM_0860			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2442996	2442997	SAM_0860	SAM_0859			FALSE	0.017	396.000	0.000	NA		NA
2442997	2442998	SAM_0859	SAM_0858			TRUE	0.295	67.000	0.000	NA		NA
2442998	2442999	SAM_0858	SAM_0857		metK	FALSE	0.013	520.000	0.000	NA		NA
2443001	2443002	SAM_0855	SAM_0854		dnaX	TRUE	0.529	89.000	0.067	NA		NA
2443002	2443003	SAM_0854	SAM_0853	dnaX		TRUE	0.965	0.000	0.030	NA	N	NA
2443003	2443004	SAM_0853	SAM_0852		udk	FALSE	0.227	87.000	0.000	NA	N	NA
2443006	2443007	SAM_0850	SAM_0849			TRUE	0.377	140.000	0.028	1.000	N	NA
2443007	2443008	SAM_0849	SAM_0848		ptsI	TRUE	0.357	150.000	0.035	1.000	N	NA
2443008	2443009	SAM_0848	SAM_0847	ptsI		TRUE	0.997	14.000	0.240	0.015	Y	NA
2443010	2443011	SAM_0846	SAM_0845	nrdH		TRUE	0.889	78.000	0.562	1.000	N	NA
2443011	2443012	SAM_0845	SAM_0844			TRUE	0.856	203.000	0.500	0.003	Y	NA
2443012	2443013	SAM_0844	SAM_0843			FALSE	0.037	241.000	0.000	NA		NA
2443014	2443015	SAM_0842	SAM_0841			TRUE	0.979	3.000	0.115	NA		NA
2443015	2443016	SAM_0841	SAM_0840			TRUE	0.952	45.000	0.500	NA		NA
2443016	2443017	SAM_0840	SAM_0839			FALSE	0.016	422.000	0.000	NA		NA
2443017	2443018	SAM_0839	SAM_0838			FALSE	0.206	88.000	0.000	NA		NA
2443018	2443019	SAM_0838	SAM_0837		alaS	FALSE	0.228	82.000	0.000	NA		NA
2443019	2443020	SAM_0837	SAM_0836	alaS		TRUE	0.579	-1221.000	0.000	NA		NA
2443020	2443021	SAM_0836	SAM_0835			FALSE	0.011	869.000	0.000	NA		NA
2443021	2443022	SAM_0835	SAM_0834			FALSE	0.037	242.000	0.000	NA		NA
2443023	2443024	SAM_0782	SAM_0781	ftsW	ppc	TRUE	0.482	106.000	0.028	1.000	N	NA
2443026	2443027	SAM_0779	SAM_0778			TRUE	0.967	-16.000	0.250	NA		NA
2443030	2443031	SAM_0775	SAM_0774			TRUE	0.919	22.000	0.018	NA		NA
2443034	2443035	SAM_0771	SAM_0770	ribH	ribBA	TRUE	0.994	15.000	0.054	0.003	Y	NA
2443035	2443036	SAM_0770	SAM_0769	ribBA	ribE	TRUE	0.983	18.000	0.051	1.000	Y	NA
2443036	2443037	SAM_0769	SAM_0768	ribE	ribD	TRUE	0.997	5.000	0.456	1.000	Y	NA
2443039	2443040	SAM_0766	SAM_0765			FALSE	0.177	124.000	0.000	NA		NA
2443040	2443041	SAM_0765	SAM_0764			FALSE	0.169	127.000	0.000	NA		NA
2443041	2443042	SAM_0764	SAM_0763			TRUE	0.889	130.000	0.156	0.003	Y	NA
2443044	2443045	SAM_0761	SAM_0760			TRUE	0.984	-3.000	0.206	NA		NA
2443045	2443046	SAM_0760	SAM_0759		lgt	TRUE	0.969	15.000	0.079	NA		NA
2443046	2443047	SAM_0759	SAM_0758	lgt	hprK	TRUE	0.991	-7.000	0.494	1.000	N	NA
2443047	2443048	SAM_0758	SAM_0757	hprK		FALSE	0.183	116.000	0.000	NA		NA
2443048	2443049	SAM_0757	SAM_0756			TRUE	0.695	-22.000	0.000	NA		NA
2443049	2443050	SAM_0756	SAM_0755			TRUE	0.544	81.000	0.051	NA		NA
2443050	2443051	SAM_0755	SAM_0754		tex	TRUE	0.939	-55.000	0.215	NA		NA
2443051	2443052	SAM_0754	SAM_0753	tex		TRUE	0.826	24.000	0.000	1.000	N	NA
2443053	2443054	SAM_0752	SAM_0751			TRUE	0.980	6.000	0.114	NA		NA
2443054	2443055	SAM_0751	SAM_0750			TRUE	0.996	0.000	0.841	NA		NA
2443056	2443057	SAM_0749	SAM_0748	ftsY		TRUE	0.975	0.000	0.007	0.098		NA
2443057	2443058	SAM_0748	SAM_0747			TRUE	0.994	0.000	0.250	0.024		NA
2443058	2443059	SAM_0747	SAM_0746			FALSE	0.232	91.000	0.000	1.000		NA
2443059	2443060	SAM_0746	SAM_0745			TRUE	0.332	188.000	0.120	1.000	N	NA
2443060	2443061	SAM_0745	SAM_0744			FALSE	0.145	176.000	0.002	NA		NA
2443061	2443062	SAM_0744	SAM_0743			TRUE	0.954	3.000	0.011	NA		NA
2443062	2443063	SAM_0743	SAM_0742			TRUE	0.972	4.000	0.038	1.000		NA
2443063	2443064	SAM_0742	SAM_0741		drrA	TRUE	0.998	-7.000	0.597	0.018	Y	NA
2443065	2443066	SAM_0740	SAM_0739			TRUE	0.994	12.000	0.185	1.000	Y	NA
2443066	2443067	SAM_0739	SAM_0738		glnP	TRUE	0.998	13.000	0.400	0.049	Y	NA
2443070	2443071	SAM_0735	SAM_0734			FALSE	0.089	167.000	0.000	NA		NA
2443071	2443072	SAM_0734	SAM_0733			FALSE	0.198	98.000	0.000	NA		NA
2443072	2443073	SAM_0733	SAM_0732		thrS	FALSE	0.050	240.000	0.000	1.000	N	NA
2443073	2443074	SAM_0732	SAM_0731	thrS		FALSE	0.019	457.000	0.000	1.000	N	NA
2443074	2443075	SAM_0731	SAM_0730			TRUE	0.998	2.000	0.413	0.013	Y	NA
2443075	2443076	SAM_0730	SAM_0729			TRUE	0.818	45.000	0.037	1.000	N	NA
2443076	2443077	SAM_0729	SAM_0728		ccpA	TRUE	0.457	132.000	0.041	1.000	N	NA
2443079	2443080	SAM_0726	SAM_0725			TRUE	0.948	16.000	0.012	1.000		NA
2443080	2443081	SAM_0725	SAM_0724			TRUE	0.331	153.000	0.035	1.000		NA
2443081	2443082	SAM_0724	SAM_0723			TRUE	0.777	124.000	0.364	1.000	N	NA
2443082	2443083	SAM_0723	SAM_0722		uxaC	TRUE	0.998	18.000	0.533	0.001	Y	NA
2443083	2443084	SAM_0722	SAM_0721	uxaC		TRUE	0.996	17.000	0.467	1.000	Y	NA
2443084	2443085	SAM_0721	SAM_0720			TRUE	0.859	117.000	0.583	1.000	N	NA
2443085	2443086	SAM_0720	SAM_0719			TRUE	0.974	29.000	0.333	1.000	N	NA
2443086	2443087	SAM_0719	SAM_0718			TRUE	0.955	17.000	0.000	1.000	Y	NA
2443087	2443088	SAM_0718	SAM_0717			TRUE	0.576	67.000	0.000	NA	Y	NA
2443088	2443089	SAM_0717	SAM_0716			FALSE	0.058	206.000	0.000	NA	N	NA
2443089	2443090	SAM_0716	SAM_0715			TRUE	0.983	14.000	0.158	1.000		NA
2443091	2443092	SAM_0714	SAM_0713			TRUE	0.615	-81.000	0.000	NA		NA
2443093	2443094	SAM_0712	SAM_0711			FALSE	0.092	164.000	0.000	NA		NA
2443094	2443095	SAM_0711	SAM_0710			TRUE	0.976	-3.000	0.127	NA		NA
2443098	2443099	SAM_2083	SAM_2082	gidA		TRUE	0.563	67.000	0.011	1.000	N	NA
2443099	2443100	SAM_2082	SAM_2081			TRUE	0.982	6.000	0.119	1.000		NA
2443100	2443101	SAM_2081	SAM_2080		rplI	TRUE	0.949	-13.000	0.007	0.026		NA
2443101	2443102	SAM_2080	SAM_2079	rplI	dnaC	TRUE	0.571	43.000	0.000	1.000		NA
2443102	2443103	SAM_2079	SAM_2078	dnaC	dnaC	FALSE	0.229	189.000	0.000	0.001		NA
2443103	2443104	SAM_2078	SAM_2077	dnaC		TRUE	0.971	12.000	0.053	NA		NA
2443104	2443105	SAM_2077	SAM_2076		rpsD	FALSE	0.022	330.000	0.000	NA		NA
2443106	2443107	SAM_2075	SAM_2074			FALSE	0.085	170.000	0.000	NA		NA
2443107	2443108	SAM_2074	SAM_2073			FALSE	0.011	677.000	0.000	NA		NA
2443108	2443109	SAM_2073	SAM_2072			FALSE	0.032	255.000	0.000	NA		NA
2443110	2443111	SAM_2071	SAM_2070			TRUE	0.862	16.000	0.000	NA		NA
2443111	2443112	SAM_2070	SAM_2069			FALSE	0.040	236.000	0.000	NA		NA
2443112	2443113	SAM_2069	SAM_2068			FALSE	0.256	72.000	0.000	NA		NA
2443113	2443114	SAM_2068	SAM_2067			FALSE	0.130	143.000	0.000	NA		NA
2443114	2443115	SAM_2067	SAM_2066			FALSE	0.241	77.000	0.000	NA		NA
2443115	2443116	SAM_2066	SAM_2065			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443116	2443117	SAM_2065	SAM_2064			TRUE	0.995	3.000	0.667	NA		NA
2443117	2443118	SAM_2064	SAM_2063			FALSE	0.021	342.000	0.000	NA		NA
2443118	2443119	SAM_2063	SAM_2062			TRUE	0.996	1.000	0.714	NA		NA
2443119	2443120	SAM_2062	SAM_2061			TRUE	0.989	12.000	0.286	NA		NA
2443120	2443121	SAM_2061	SAM_2060			FALSE	0.010	878.000	0.000	NA		NA
2443121	2443122	SAM_2060	SAM_2059			FALSE	0.253	73.000	0.000	NA		NA
2443122	2443123	SAM_2059	SAM_2058			TRUE	0.557	40.000	0.000	NA		NA
2443123	2443124	SAM_2058	SAM_2057			TRUE	0.681	-25.000	0.000	NA		NA
2443124	2443125	SAM_2057	SAM_2056			TRUE	0.271	69.000	0.000	NA		NA
2443125	2443126	SAM_2056	SAM_2055			TRUE	0.994	-10.000	1.000	NA		NA
2443126	2443127	SAM_2055	SAM_2054			FALSE	0.014	484.000	0.000	NA		NA
2443131	2443132	SAM_2050	SAM_2049		est-1	FALSE	0.153	134.000	0.000	NA		NA
2443132	2443133	SAM_2049	SAM_2048	est-1		TRUE	0.929	23.000	0.035	NA		NA
2443134	2443135	SAM_2047	SAM_2046	proX		TRUE	0.662	93.000	0.036	0.049	N	NA
2443135	2443136	SAM_2046	SAM_2045		proV	TRUE	0.998	3.000	0.382	0.004	Y	NA
2443136	2443137	SAM_2045	SAM_2044	proV		FALSE	0.058	222.000	0.000	1.000	N	NA
2443137	2443138	SAM_2044	SAM_2043			TRUE	0.894	-3.000	0.000	1.000		NA
2443139	2443140	SAM_2042	SAM_2041	argF	arcC	TRUE	0.968	12.000	0.000	1.000	Y	NA
2443140	2443141	SAM_2041	SAM_2040	arcC		FALSE	0.231	94.000	0.000	1.000		NA
2443142	2443143	SAM_2039	SAM_2038			TRUE	0.992	-16.000	0.492	1.000	Y	NA
2443143	2443144	SAM_2038	SAM_2037			FALSE	0.251	85.000	0.000	1.000		NA
2443145	2443146	SAM_2036	SAM_2035			TRUE	0.982	33.000	0.750	NA		NA
2443147	2443148	SAM_2034	SAM_2033			FALSE	0.105	156.000	0.000	NA		NA
2443148	2443149	SAM_2033	SAM_2032			TRUE	0.759	90.000	0.333	NA		NA
2443149	2443150	SAM_2032	SAM_2031			TRUE	0.991	-7.000	0.500	1.000		NA
2443150	2443151	SAM_2031	SAM_2030			TRUE	0.804	124.000	0.500	NA		NA
2443151	2443152	SAM_2030	SAM_2029			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA		NA
2443152	2443153	SAM_2029	SAM_2028			TRUE	0.993	0.000	0.500	NA		NA
2443153	2443154	SAM_2028	SAM_2027			FALSE	0.055	203.000	0.000	NA		NA
2443154	2443155	SAM_2027	SAM_2026			FALSE	0.028	321.000	0.000	1.000		NA
2443155	2443156	SAM_2026	SAM_2025			TRUE	0.952	51.000	0.571	1.000		NA
2443156	2443157	SAM_2025	SAM_2024			TRUE	0.997	12.000	0.875	NA	N	NA
2443157	2443158	SAM_2024	SAM_2023		rpmG	FALSE	0.030	293.000	0.000	NA	N	NA
2443158	2443159	SAM_2023	SAM_2022	rpmG	rpmF	TRUE	0.989	16.000	0.012	0.034	Y	NA
2443160	2443161	SAM_2021	SAM_2020	hisS	aspS	TRUE	0.885	93.000	0.161	0.055	Y	NA
2443161	2443162	SAM_2020	SAM_2019	aspS		TRUE	0.917	-10.000	0.016	NA		NA
2443162	2443163	SAM_2019	SAM_2018			TRUE	0.506	108.000	0.062	NA		NA
2443164	2443165	SAM_2017	SAM_2016		argS	TRUE	0.460	88.000	0.032	NA		NA
2443166	2443167	SAM_2015	SAM_2014	argR	mutS	TRUE	0.645	57.000	0.008	1.000	N	NA
2443169	2443170	SAM_2012	SAM_2011		hexB	FALSE	0.175	125.000	0.000	NA		NA
2443170	2443171	SAM_2011	SAM_2010	hexB		TRUE	0.843	32.000	0.006	1.000		NA
2443171	2443172	SAM_2010	SAM_2009		ruvA	TRUE	0.954	2.000	0.005	1.000		NA
2443172	2443173	SAM_2009	SAM_2008	ruvA		TRUE	0.965	23.000	0.012	1.000	Y	NA
2443173	2443174	SAM_2008	SAM_2007			TRUE	0.421	89.000	0.011	1.000		NA
2443174	2443175	SAM_2007	SAM_2006		recA	TRUE	0.640	74.000	0.083	1.000		NA
2443175	2443176	SAM_2006	SAM_2005	recA		FALSE	0.115	216.000	0.004	1.000	N	NA
2443176	2443177	SAM_2005	SAM_2004			FALSE	0.163	202.000	0.032	NA		NA
2443177	2443178	SAM_2004	SAM_2003			TRUE	0.994	9.000	0.537	NA		NA
2443178	2443179	SAM_2003	SAM_2002			TRUE	0.987	26.000	0.651	NA		NA
2443179	2443180	SAM_2002	SAM_2001			FALSE	0.224	83.000	0.000	NA		NA
2443180	2443181	SAM_2001	SAM_2000			TRUE	0.689	31.000	0.000	NA		NA
2443182	2443183	SAM_0152	SAM_0153			TRUE	0.987	3.000	0.192	1.000		NA
2443183	2443184	SAM_0153	SAM_0154			TRUE	0.996	-10.000	0.673	1.000	Y	NA
2443185	2443186	SAM_0155	SAM_0156		tyrS	FALSE	0.015	579.000	0.000	1.000		NA
2443187	2443188	SAM_0157	SAM_0158		rpoB	FALSE	0.017	524.000	0.000	1.000	N	NA
2443188	2443189	SAM_0158	SAM_0159	rpoB		TRUE	0.981	87.000	0.851	0.002	Y	NA
2443189	2443190	SAM_0159	SAM_0160			TRUE	0.343	114.000	0.007	NA		NA
2443190	2443191	SAM_0160	SAM_0161		gspE	TRUE	0.296	173.000	0.083	NA		NA
2443191	2443192	SAM_0161	SAM_0162	gspE	pilC	TRUE	0.877	89.000	0.639	1.000		NA
2443192	2443193	SAM_0162	SAM_0163	pilC		TRUE	0.998	-3.000	0.861	1.000	Y	NA
2443193	2443194	SAM_0163	SAM_0164			TRUE	0.886	-25.000	0.040	NA		NA
2443194	2443195	SAM_0164	SAM_0165			TRUE	0.947	-28.000	0.214	NA		NA
2443195	2443196	SAM_0165	SAM_0166			TRUE	0.748	83.000	0.250	NA		NA
2443196	2443197	SAM_0166	SAM_0167			TRUE	0.956	-22.000	0.232	NA		NA
2443197	2443198	SAM_0167	SAM_0168			TRUE	0.522	115.000	0.087	NA		NA
2443198	2443199	SAM_0168	SAM_0169		ackA	TRUE	0.937	32.000	0.130	1.000	N	NA
2443199	2443200	SAM_0169	SAM_0170	ackA		TRUE	0.438	152.000	0.094	1.000	N	NA
2443200	2443201	SAM_0170	SAM_0171			TRUE	0.369	59.000	0.000	NA		NA
2443201	2443202	SAM_0171	SAM_0172			TRUE	0.545	41.000	0.000	NA		NA
2443202	2443203	SAM_0172	SAM_0173			TRUE	0.271	69.000	0.000	NA		NA
2443204	2443205	SAM_0174	SAM_0175	proC		TRUE	0.613	70.000	0.041	1.000	N	NA
2443205	2443206	SAM_0175	SAM_0176			FALSE	0.069	185.000	0.000	NA		NA
2443207	2443208	SAM_0177	SAM_0178			TRUE	0.978	-3.000	0.140	NA		NA
2443208	2443209	SAM_0178	SAM_0179		pheT	TRUE	0.953	33.000	0.239	1.000		NA
2443211	2443212	SAM_0181	SAM_0182	ssbB		TRUE	0.605	40.000	0.000	1.000		NA
2443212	2443213	SAM_0182	SAM_0183			TRUE	0.774	27.000	0.000	1.000		NA
2443213	2443214	SAM_0183	SAM_0184			TRUE	0.996	-19.000	0.538	0.017	Y	NA
2443214	2443215	SAM_0184	SAM_0185			TRUE	0.446	170.000	0.178	1.000		NA
2443215	2443216	SAM_0185	SAM_0186			TRUE	0.997	2.000	0.869	1.000		NA
2443218	2443219	SAM_0188	SAM_0189			TRUE	0.614	113.000	0.000	0.048	Y	NA
2443219	2443220	SAM_0189	SAM_0190		dppC	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.048	Y	NA
2443220	2443221	SAM_0190	SAM_0191	dppC		TRUE	0.996	12.000	0.333	1.000	Y	NA
2443221	2443222	SAM_0191	SAM_0192			TRUE	0.997	-16.000	0.750	0.035	Y	NA
2443222	2443223	SAM_0192	SAM_0193			FALSE	0.038	283.000	0.000	1.000	N	NA
2443223	2443224	SAM_0193	SAM_0194			TRUE	0.741	222.000	0.650	1.000	Y	NA
2443224	2443225	SAM_0194	SAM_0195			FALSE	0.061	216.000	0.000	1.000	N	NA
2443225	2443226	SAM_0195	SAM_0196			TRUE	0.993	3.000	0.156	0.014	N	NA
2443226	2443227	SAM_0196	SAM_0197			TRUE	0.993	13.000	0.182	0.020		NA
2443227	2443228	SAM_0197	SAM_0198		tkt	TRUE	0.991	3.000	0.333	1.000		NA
2443228	2443229	SAM_0198	SAM_0199	tkt		TRUE	0.999	-3.000	0.742	0.002	Y	NA
2443231	2443232	SAM_0201	SAM_0202		rpsO	FALSE	0.258	88.000	0.000	1.000	N	NA
2443232	2443233	SAM_0202	SAM_0203	rpsO	pnp	TRUE	0.367	381.000	0.335	1.000	Y	NA
2443233	2443234	SAM_0203	SAM_0204	pnp		TRUE	0.951	2.000	0.009	NA		NA
2443234	2443235	SAM_0204	SAM_0205		cysE	TRUE	0.977	9.000	0.097	NA		NA
2443235	2443236	SAM_0205	SAM_0206	cysE		TRUE	0.892	10.000	0.000	NA		NA
2443236	2443237	SAM_0206	SAM_0207		cysS	TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443237	2443238	SAM_0207	SAM_0208	cysS		TRUE	0.971	-7.000	0.129	1.000		NA
2443238	2443239	SAM_0208	SAM_0209			TRUE	0.804	103.000	0.150	0.006		NA
2443239	2443240	SAM_0209	SAM_0210			TRUE	0.974	-3.000	0.109	NA		NA
2443240	2443241	SAM_0210	SAM_0211			TRUE	0.462	93.000	0.036	NA		NA
2443241	2443242	SAM_0211	SAM_0212			FALSE	0.020	345.000	0.000	NA		NA
2443242	2443243	SAM_0212	SAM_0213		rplM	FALSE	0.016	417.000	0.000	NA		NA
2443243	2443244	SAM_0213	SAM_0214	rplM	rpsI	TRUE	0.998	21.000	0.601	0.025	Y	NA
2443245	2443246	SAM_0215	SAM_0216			TRUE	0.365	64.000	0.000	1.000		NA
2443247	2443248	SAM_0217	SAM_0218			TRUE	0.766	136.000	0.500	NA		NA
2443248	2443249	SAM_0218	SAM_0219			TRUE	0.994	11.000	0.500	NA		NA
2443249	2443250	SAM_0219	SAM_0220			TRUE	0.997	13.000	1.000	NA		NA
2443250	2443251	SAM_0220	SAM_0221			TRUE	0.996	4.000	0.667	NA		NA
2443251	2443252	SAM_0221	SAM_0222			FALSE	0.064	190.000	0.000	NA		NA
2443252	2443253	SAM_0222	SAM_0223			TRUE	0.594	36.000	0.000	NA		NA
2443255	2443256	SAM_0225	SAM_0226	pre		TRUE	0.808	168.000	1.000	NA		NA
2443257	2443258	SAM_0227	SAM_0228			TRUE	0.987	-10.000	0.500	NA		NA
2443259	2443260	SAM_0968	SAM_0967			TRUE	0.278	153.000	0.024	NA		NA
2443260	2443261	SAM_0967	SAM_0966			TRUE	0.960	16.000	0.039	NA	N	NA
2443261	2443262	SAM_0966	SAM_0965		gyrA	TRUE	0.959	7.000	0.013	NA	N	NA
2443264	2443265	SAM_0963	SAM_0962		rbsC-2	FALSE	0.064	205.000	0.000	1.000		NA
2443265	2443266	SAM_0962	SAM_0961	rbsC-2	rbsC-1	TRUE	0.998	2.000	0.720	0.047		NA
2443266	2443267	SAM_0961	SAM_0960	rbsC-1	rbsA-1	TRUE	0.989	-7.000	0.438	1.000		NA
2443267	2443268	SAM_0960	SAM_0959	rbsA-1	tmbC	TRUE	0.370	145.000	0.036	1.000		NA
2443268	2443269	SAM_0959	SAM_0958	tmbC	cdd	TRUE	0.855	65.000	0.300	1.000		NA
2443269	2443270	SAM_0958	SAM_0957	cdd		FALSE	0.035	299.000	0.000	1.000	N	NA
2443271	2443272	SAM_0956	SAM_0955		rpsT	TRUE	0.651	60.000	0.014	1.000	N	NA
2443273	2443274	SAM_0954	SAM_0953	glnH		TRUE	0.968	-58.000	0.154	1.000	Y	NA
2443274	2443275	SAM_0953	SAM_0952		glnP	TRUE	0.992	10.000	0.130	1.000	Y	NA
2443275	2443276	SAM_0952	SAM_0951	glnP	phnA	TRUE	0.384	135.000	0.018	1.000	N	NA
2443276	2443277	SAM_0951	SAM_0950	phnA	glmS	FALSE	0.232	163.000	0.008	1.000	N	NA
2443279	2443280	SAM_0948	SAM_0947		pyk	TRUE	0.317	171.000	0.072	1.000		NA
2443280	2443281	SAM_0947	SAM_0946	pyk		TRUE	0.652	253.000	0.261	0.006	Y	NA
2443281	2443282	SAM_0946	SAM_0945		dnaE	TRUE	0.653	81.000	0.098	1.000	N	NA
2443283	2443284	SAM_0944	SAM_0943			TRUE	0.993	1.000	0.412	1.000	N	NA
2443284	2443285	SAM_0943	SAM_0942			TRUE	0.993	12.000	0.471	NA		NA
2443288	2443289	SAM_0939	SAM_0938			TRUE	0.906	0.000	0.000	1.000		NA
2443289	2443290	SAM_0938	SAM_0937			TRUE	0.941	22.000	0.000	0.002		NA
2443290	2443291	SAM_0937	SAM_0936			FALSE	0.139	150.000	0.000	1.000		NA
2443291	2443292	SAM_0936	SAM_0935			TRUE	0.906	0.000	0.000	1.000		NA
2443292	2443293	SAM_0935	SAM_0934			TRUE	0.959	9.000	0.010	1.000		NA
2443293	2443294	SAM_0934	SAM_0933			FALSE	0.230	100.000	0.000	1.000		NA
2443294	2443295	SAM_0933	SAM_0932			TRUE	0.966	7.000	0.000	0.014		NA
2443295	2443296	SAM_0932	SAM_0931		lepA	FALSE	0.042	247.000	0.000	1.000		NA
2443296	2443297	SAM_0931	SAM_0930	lepA		TRUE	0.308	136.000	0.003	1.000	N	NA
11477352	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	575.000	0.000	NA		NA
11619715	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	575.000	0.000	NA		NA
11762107	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	575.000	0.000	NA		NA
11477353	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	594.000	0.000	NA		NA
11619716	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	594.000	0.000	NA		NA
11762108	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	594.000	0.000	NA		NA
11477354	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	624.000	0.000	NA		NA
11619717	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	624.000	0.000	NA		NA
11762109	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	624.000	0.000	NA		NA
11477355	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	660.000	0.000	NA		NA
11619718	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	660.000	0.000	NA		NA
11762110	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	660.000	0.000	NA		NA
11477356	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	690.000	0.000	NA		NA
11619719	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	690.000	0.000	NA		NA
11762111	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	690.000	0.000	NA		NA
11477357	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	726.000	0.000	NA		NA
11619720	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	726.000	0.000	NA		NA
11762112	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	726.000	0.000	NA		NA
11477358	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	756.000	0.000	NA		NA
11619721	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	756.000	0.000	NA		NA
11762113	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	756.000	0.000	NA		NA
11477359	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	792.000	0.000	NA		NA
11619722	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	792.000	0.000	NA		NA
11762114	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	792.000	0.000	NA		NA
11477360	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	822.000	0.000	NA		NA
11619723	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	822.000	0.000	NA		NA
11762115	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	822.000	0.000	NA		NA
11477361	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	858.000	0.000	NA		NA
11619724	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	858.000	0.000	NA		NA
11762116	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	858.000	0.000	NA		NA
11477362	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	888.000	0.000	NA		NA
11619725	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	888.000	0.000	NA		NA
11762117	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	888.000	0.000	NA		NA
11477363	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	924.000	0.000	NA		NA
11619726	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	924.000	0.000	NA		NA
11762118	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	924.000	0.000	NA		NA
11477364	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	954.000	0.000	NA		NA
11619727	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	954.000	0.000	NA		NA
11762119	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	954.000	0.000	NA		NA
11477365	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	990.000	0.000	NA		NA
11619728	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	990.000	0.000	NA		NA
11762120	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	990.000	0.000	NA		NA
11477366	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1019.000	0.000	NA		NA
11619729	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1019.000	0.000	NA		NA
11762121	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1019.000	0.000	NA		NA
11477367	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1055.000	0.000	NA		NA
11619730	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1055.000	0.000	NA		NA
11762122	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1055.000	0.000	NA		NA
11477368	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1085.000	0.000	NA		NA
11619731	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1085.000	0.000	NA		NA
11762123	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1085.000	0.000	NA		NA
11477369	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1121.000	0.000	NA		NA
11619732	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1121.000	0.000	NA		NA
11762124	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1121.000	0.000	NA		NA
11477370	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1151.000	0.000	NA		NA
11619733	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1151.000	0.000	NA		NA
11762125	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1151.000	0.000	NA		NA
11477371	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1187.000	0.000	NA		NA
11619734	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1187.000	0.000	NA		NA
11762126	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1187.000	0.000	NA		NA
11477372	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1217.000	0.000	NA		NA
11619735	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1217.000	0.000	NA		NA
11762127	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1217.000	0.000	NA		NA
11477373	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1253.000	0.000	NA		NA
11619736	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1253.000	0.000	NA		NA
11762128	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1253.000	0.000	NA		NA
11477374	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1283.000	0.000	NA		NA
11619737	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1283.000	0.000	NA		NA
11762129	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1283.000	0.000	NA		NA
11477375	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1319.000	0.000	NA		NA
11619738	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1319.000	0.000	NA		NA
11762130	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1319.000	0.000	NA		NA
11477376	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1349.000	0.000	NA		NA
11619739	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1349.000	0.000	NA		NA
11762131	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1349.000	0.000	NA		NA
11477377	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1385.000	0.000	NA		NA
11619740	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1385.000	0.000	NA		NA
11762132	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1385.000	0.000	NA		NA
11477378	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1415.000	0.000	NA		NA
11619741	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1415.000	0.000	NA		NA
11762133	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1415.000	0.000	NA		NA
11477379	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1451.000	0.000	NA		NA
11619742	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1451.000	0.000	NA		NA
11762134	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1451.000	0.000	NA		NA
11477380	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1481.000	0.000	NA		NA
11619743	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1481.000	0.000	NA		NA
11762135	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1481.000	0.000	NA		NA
11477381	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1517.000	0.000	NA		NA
11619744	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1517.000	0.000	NA		NA
11762136	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1517.000	0.000	NA		NA
11477382	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1547.000	0.000	NA		NA
11619745	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1547.000	0.000	NA		NA
11762137	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1547.000	0.000	NA		NA
11477383	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1583.000	0.000	NA		NA
11619746	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1583.000	0.000	NA		NA
11762138	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1583.000	0.000	NA		NA
11477384	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1613.000	0.000	NA		NA
11619747	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1613.000	0.000	NA		NA
11762139	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1613.000	0.000	NA		NA
11477385	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1649.000	0.000	NA		NA
11619748	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1649.000	0.000	NA		NA
11762140	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1649.000	0.000	NA		NA
11477386	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1679.000	0.000	NA		NA
11619749	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1679.000	0.000	NA		NA
11762141	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1679.000	0.000	NA		NA
11477387	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1715.000	0.000	NA		NA
11619750	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1715.000	0.000	NA		NA
11762142	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1715.000	0.000	NA		NA
11477388	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1745.000	0.000	NA		NA
11619751	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1745.000	0.000	NA		NA
11762143	2443297		SAM_0930			FALSE	NA	1745.000	0.000	NA		NA
2443299	2443300	SAM_0928	SAM_0927		cas2	TRUE	0.972	-13.000	0.253	NA		NA
2443300	2443301	SAM_0927	SAM_0926	cas2	cas1	TRUE	0.997	12.000	0.876	NA		NA
2443301	2443302	SAM_0926	SAM_0925	cas1		TRUE	0.994	2.000	0.546	NA		NA
2443302	2443303	SAM_0925	SAM_0924			FALSE	0.018	388.000	0.000	NA		NA
2443303	2443304	SAM_0924	SAM_0923			TRUE	0.963	-25.000	0.330	NA		NA
2443304	2443305	SAM_0923	SAM_0922			TRUE	0.975	1.000	0.055	1.000	N	NA
2443305	2443306	SAM_0922	SAM_0921			TRUE	0.977	4.000	0.060	1.000	N	NA
2443306	2443307	SAM_0921	SAM_0920			FALSE	0.198	92.000	0.000	NA		NA
2443307	2443308	SAM_0920	SAM_0919			TRUE	0.956	25.000	0.143	NA		NA
2443308	2443309	SAM_0919	SAM_0918		glmM	FALSE	0.179	123.000	0.000	NA		NA
2443309	2443310	SAM_0918	SAM_0917	glmM		TRUE	0.825	54.000	0.150	NA		NA
2443311	2443312	SAM_1453	SAM_1452			FALSE	0.059	196.000	0.000	NA		NA
2443312	2443313	SAM_1452	SAM_1451			TRUE	0.496	133.000	0.007	0.069	N	NA
2443313	2443314	SAM_1451	SAM_1450		vacB	TRUE	0.545	113.000	0.064	1.000	N	NA
2443314	2443315	SAM_1450	SAM_1449	vacB	smpB	TRUE	0.992	3.000	0.143	0.027	N	NA
2443316	2443317	SAM_1448	SAM_1447			FALSE	0.181	129.000	0.000	NA	N	NA
2443317	2443318	SAM_1447	SAM_1446		gloA	FALSE	0.181	129.000	0.000	NA	N	NA
2443318	2443319	SAM_1446	SAM_1445	gloA		TRUE	0.439	88.000	0.009	1.000	N	NA
2443320	2443321	SAM_1444	SAM_1443		rsuA	FALSE	0.075	191.000	0.000	1.000		NA
2443321	2443322	SAM_1443	SAM_1442	rsuA	nylA	TRUE	0.506	85.000	0.000	1.000	Y	NA
2443322	2443323	SAM_1442	SAM_1441	nylA		TRUE	0.442	110.000	0.000	0.011		NA
2443325	2443326	SAM_1439	SAM_1438		obg	TRUE	0.572	61.000	0.011	NA		NA
2443326	2443327	SAM_1438	SAM_1437	obg		TRUE	0.878	26.000	0.009	NA		NA
2443328	2443329	SAM_1436	SAM_1435		glnQ	FALSE	0.120	149.000	0.000	NA		NA
2443329	2443330	SAM_1435	SAM_1434	glnQ		TRUE	0.996	0.000	0.326	1.000	Y	NA
2443331	2443332	SAM_1433	SAM_1432		uvrB	TRUE	0.350	61.000	0.000	NA		NA
2443333	2443334	SAM_1431	SAM_1430			TRUE	0.823	102.000	0.500	NA		NA
2443334	2443335	SAM_1430	SAM_1429			TRUE	0.876	69.000	0.500	NA		NA
2443336	2443337	SAM_1428	SAM_1427	clfB		FALSE	0.022	331.000	0.000	NA		NA
2443337	2443338	SAM_1427	SAM_1426			TRUE	0.893	9.000	0.000	NA		NA
2443338	2443339	SAM_1426	SAM_1425			TRUE	0.985	-3.000	0.000	0.003	Y	NA
2443339	2443340	SAM_1425	SAM_1424			TRUE	0.973	-10.000	0.000	0.003	Y	NA
2443340	2443341	SAM_1424	SAM_1423		V	TRUE	0.710	-19.000	0.000	NA		NA
2443341	2443342	SAM_1423	SAM_1422	V		TRUE	0.350	61.000	0.000	NA		NA
2443342	2443343	SAM_1422	SAM_1421		secY	FALSE	0.177	124.000	0.000	NA		NA
2443343	2443344	SAM_1421	SAM_1420	secY		TRUE	0.948	0.000	0.007	NA		NA
2443344	2443345	SAM_1420	SAM_1419			TRUE	0.894	7.000	0.000	NA		NA
2443345	2443346	SAM_1419	SAM_1418			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443346	2443347	SAM_1418	SAM_1417		secA	TRUE	0.770	-13.000	0.000	NA		NA
2443347	2443348	SAM_1417	SAM_1416	secA		TRUE	0.907	14.000	0.000	1.000	N	NA
2443348	2443349	SAM_1416	SAM_1415			TRUE	0.977	-7.000	0.200	NA		NA
2443349	2443350	SAM_1415	SAM_1414			TRUE	0.891	11.000	0.000	NA		NA
2443350	2443351	SAM_1414	SAM_1413			FALSE	0.220	84.000	0.000	NA		NA
2443352	2443353	SAM_1412	SAM_1411			TRUE	0.627	68.000	0.000	0.001		NA
2443353	2443354	SAM_1411	SAM_1410		malG	FALSE	0.112	231.000	0.000	0.044		NA
2443354	2443355	SAM_1410	SAM_1409	malG	malF	TRUE	0.999	0.000	0.793	0.044	Y	NA
2443355	2443356	SAM_1409	SAM_1408	malF		TRUE	0.965	98.000	0.690	0.044	Y	NA
2443358	2443359	SAM_0571	SAM_0572			TRUE	0.966	-7.000	0.094	1.000		NA
2443359	2443360	SAM_0572	SAM_0573		rplS	FALSE	0.033	580.000	0.006	1.000	N	NA
2443362	2443363	SAM_0575	SAM_0576			FALSE	0.095	162.000	0.000	NA		NA
2443363	2443364	SAM_0576	SAM_0577			TRUE	0.799	22.000	0.000	NA		NA
2443364	2443365	SAM_0577	SAM_0578			TRUE	0.416	126.000	0.000	0.011		NA
2443367	2443368	SAM_0580	SAM_0581			TRUE	0.997	10.000	0.917	1.000	N	NA
2443368	2443369	SAM_0581	SAM_0582			TRUE	0.995	0.000	0.542	1.000	N	NA
2443369	2443370	SAM_0582	SAM_0583			TRUE	0.815	97.000	0.409	1.000	N	NA
2443370	2443371	SAM_0583	SAM_0584			TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
2443373	2443374	SAM_0586	SAM_0587			TRUE	0.535	42.000	0.000	NA		NA
2443374	2443375	SAM_0587	SAM_0588		mreB-2	FALSE	0.016	425.000	0.000	NA		NA
2443375	2443376	SAM_0588	SAM_0589	mreB-2	pgp	TRUE	0.779	119.000	0.385	1.000		NA
2443376	2443377	SAM_0589	SAM_0590	pgp	gyrB	TRUE	0.428	91.000	0.013	1.000		NA
2443377	2443378	SAM_0590	SAM_0591	gyrB		TRUE	0.432	94.000	0.011	1.000	N	NA
2443378	2443379	SAM_0591	SAM_0592		serB	TRUE	0.422	94.000	0.009	1.000	N	NA
2443380	2443381	SAM_0593	SAM_0594			TRUE	0.887	13.000	0.000	NA		NA
2443384	2443385	SAM_0597	SAM_0598	aroA	aroK	TRUE	0.974	-7.000	0.012	1.000	Y	NA
2443385	2443386	SAM_0598	SAM_0599	aroK		TRUE	0.786	57.000	0.111	NA	N	NA
2443386	2443387	SAM_0599	SAM_0600			TRUE	0.565	101.000	0.093	NA	N	NA
2443387	2443388	SAM_0600	SAM_0601			FALSE	0.013	522.000	0.000	NA		NA
2443389	2443390	SAM_0602	SAM_0603			FALSE	0.228	82.000	0.000	NA		NA
2443390	2443391	SAM_0603	SAM_0604			FALSE	0.011	688.000	0.000	NA		NA
2443393	2443394	SAM_0606	SAM_0607	tetM		FALSE	0.018	377.000	0.000	NA		NA
2443394	2443395	SAM_0607	SAM_0608			TRUE	0.872	15.000	0.000	NA		NA
2443395	2443396	SAM_0608	SAM_0609			TRUE	0.609	-91.000	0.000	NA		NA
2443396	2443397	SAM_0609	SAM_0610			TRUE	0.586	-439.000	0.000	NA		NA
2443397	2443398	SAM_0610	SAM_0611			TRUE	0.892	3.000	0.000	NA		NA
2443398	2443399	SAM_0611	SAM_0612			TRUE	0.741	-16.000	0.000	NA		NA
2443399	2443400	SAM_0612	SAM_0613			TRUE	0.681	-25.000	0.000	NA		NA
2443400	2443401	SAM_0613	SAM_0614			FALSE	0.183	117.000	0.000	NA		NA
2443401	2443402	SAM_0614	SAM_0615			TRUE	0.523	43.000	0.000	NA		NA
2443402	2443403	SAM_0615	SAM_0616			FALSE	0.089	178.000	0.000	1.000		NA
2443403	2443404	SAM_0616	SAM_0617			TRUE	0.714	29.000	0.000	NA		NA
2443404	2443405	SAM_0617	SAM_0618			TRUE	0.862	16.000	0.000	NA		NA
2443405	2443406	SAM_0618	SAM_0619			FALSE	0.015	450.000	0.000	NA		NA
2443406	2443407	SAM_0619	SAM_0620			FALSE	0.237	79.000	0.000	NA		NA
2443409	2443410	SAM_1315	SAM_1314		pfoS/R	TRUE	0.447	137.000	0.059	1.000		NA
2443410	2443411	SAM_1314	SAM_1313	pfoS/R	panE	TRUE	0.991	13.000	0.333	1.000		NA
2443411	2443412	SAM_1313	SAM_1312	panE		FALSE	0.058	212.000	0.000	1.000		NA
2443412	2443413	SAM_1312	SAM_1311			FALSE	0.153	144.000	0.000	1.000		NA
2443413	2443414	SAM_1311	SAM_1310		lacR	FALSE	0.204	131.000	0.000	1.000	N	NA
2443414	2443415	SAM_1310	SAM_1309	lacR		TRUE	0.998	-3.000	0.721	1.000	Y	NA
2443415	2443416	SAM_1309	SAM_1308		fruA-2	TRUE	0.991	36.000	0.816	1.000	Y	NA
2443416	2443417	SAM_1308	SAM_1307	fruA-2		FALSE	0.065	189.000	0.000	NA		NA
2443417	2443418	SAM_1307	SAM_1306			TRUE	0.440	51.000	0.000	NA		NA
2443418	2443419	SAM_1306	SAM_1305			TRUE	0.622	72.000	0.083	NA		NA
2443419	2443420	SAM_1305	SAM_1304			TRUE	0.970	0.000	0.056	NA		NA
2443420	2443421	SAM_1304	SAM_1303		pcnA	FALSE	0.069	185.000	0.000	NA		NA
2443421	2443422	SAM_1303	SAM_1302	pcnA		TRUE	0.974	11.000	0.056	1.000		NA
2443422	2443423	SAM_1302	SAM_1301			TRUE	0.947	-3.000	0.006	1.000		NA
2443423	2443424	SAM_1301	SAM_1300			TRUE	0.578	67.000	0.013	1.000	N	NA
2443424	2443425	SAM_1300	SAM_1299			TRUE	0.999	5.000	0.846	0.007	Y	NA
2443427	2443428	SAM_1297	SAM_1296	gdhA	def	TRUE	0.642	70.000	0.056	1.000	N	NA
2443430	2443431	SAM_1294	SAM_1293			TRUE	0.928	47.000	0.296	1.000	N	NA
2443431	2443432	SAM_1293	SAM_1292			TRUE	0.999	-10.000	1.000	0.007	Y	NA
2443432	2443433	SAM_1292	SAM_1291			FALSE	0.224	108.000	0.000	1.000		NA
2443433	2443434	SAM_1291	SAM_1290			TRUE	0.996	2.000	0.800	1.000		NA
2443434	2443435	SAM_1290	SAM_1289			TRUE	0.997	0.000	0.533	1.000	Y	NA
2443435	2443436	SAM_1289	SAM_1288		mvk	FALSE	0.231	116.000	0.000	1.000	N	NA
2443436	2443437	SAM_1288	SAM_1287	mvk	mvaD	TRUE	0.994	-18.000	0.281	0.004	Y	NA
2443437	2443438	SAM_1287	SAM_1286	mvaD		TRUE	0.997	-7.000	0.312	0.005	Y	NA
2443438	2443439	SAM_1286	SAM_1285			TRUE	0.977	-3.000	0.097	1.000	N	NA
2443439	2443440	SAM_1285	SAM_1284			TRUE	0.283	68.000	0.000	NA		NA
2443441	2443442	SAM_1283	SAM_1282			FALSE	0.214	101.000	0.000	NA	N	NA
2443442	2443443	SAM_1282	SAM_1281			TRUE	0.654	87.000	0.135	1.000		NA
2443443	2443444	SAM_1281	SAM_1280			TRUE	0.644	86.000	0.146	NA		NA
2443444	2443445	SAM_1280	SAM_1279			TRUE	0.420	92.000	0.020	NA		NA
2443445	2443446	SAM_1279	SAM_1278			TRUE	0.994	2.000	0.183	1.000	Y	NA
2443447	2443448	SAM_1277	SAM_1276	thyA	folA	TRUE	0.806	80.000	0.295	1.000	N	NA
2443448	2443449	SAM_1276	SAM_1275	folA		TRUE	0.945	18.000	0.030	NA		NA
2443449	2443450	SAM_1275	SAM_1274		clpX	TRUE	0.856	30.000	0.012	NA		NA
2443450	2443451	SAM_1274	SAM_1273	clpX		TRUE	0.972	11.000	0.043	1.000		NA
2443453	2443454	SAM_1271	SAM_1270			TRUE	0.644	-39.000	0.000	NA		NA
2443454	2443455	SAM_1270	SAM_1269			TRUE	0.425	52.000	0.000	NA		NA
2443455	2443456	SAM_1269	SAM_1268			FALSE	0.101	158.000	0.000	NA		NA
2443456	2443457	SAM_1268	SAM_1267			FALSE	0.163	130.000	0.000	NA		NA
2443457	2443458	SAM_1267	SAM_1266			TRUE	0.952	-97.000	0.093	1.000	Y	NA
2443461	2443462	SAM_0001	SAM_0002		prsA	TRUE	0.567	124.000	0.107	1.000		NA
2443462	2443463	SAM_0002	SAM_0003	prsA	aspB-3	TRUE	0.712	108.000	0.048	1.000	Y	NA
2443463	2443464	SAM_0003	SAM_0004	aspB-3	recO	TRUE	0.936	20.000	0.012	1.000	N	NA
2443464	2443465	SAM_0004	SAM_0006	recO		FALSE	0.200	90.000	0.000	NA		NA
2443467	2443468	SAM_0007	SAM_0008	plsX		TRUE	0.889	-19.000	0.017	1.000		NA
2443468	2443469	SAM_0008	SAM_0009			TRUE	0.700	-21.000	0.000	NA		NA
2443469	2443470	SAM_0009	SAM_0010		purC	TRUE	0.379	124.000	0.017	NA		NA
2443470	2443471	SAM_0010	SAM_0011	purC		TRUE	0.900	48.000	0.043	1.000	Y	NA
2443471	2443472	SAM_0011	SAM_0012		purF	TRUE	0.274	234.000	0.024	1.000	Y	NA
2443472	2443473	SAM_0012	SAM_0013	purF	purM	TRUE	0.985	28.000	0.248	1.000	Y	NA
2443473	2443474	SAM_0013	SAM_0014	purM	purN	TRUE	0.846	168.000	0.238	0.002	Y	NA
2443474	2443475	SAM_0014	SAM_0015	purN		TRUE	0.900	23.000	0.003	1.000		NA
2443475	2443476	SAM_0015	SAM_0016		purH	TRUE	0.916	20.000	0.002	1.000		NA
2443476	2443477	SAM_0016	SAM_0017	purH		FALSE	0.074	193.000	0.000	1.000		NA
2443477	2443478	SAM_0017	SAM_0018			FALSE	0.146	147.000	0.000	1.000		NA
2443478	2443479	SAM_0018	SAM_0019			FALSE	0.024	355.000	0.000	1.000		NA
2443479	2443480	SAM_0019	SAM_0020			TRUE	0.777	47.000	0.000	1.000	Y	NA
2443480	2443481	SAM_0020	SAM_0021			TRUE	0.650	88.000	0.000	0.043	Y	NA
2443481	2443482	SAM_0021	SAM_0022			TRUE	0.999	10.000	1.000	0.043	Y	NA
2443482	2443483	SAM_0022	SAM_0023			TRUE	0.994	13.000	0.250	NA	Y	NA
2443483	2443484	SAM_0023	SAM_0024			TRUE	0.822	20.000	0.000	NA		NA
2443484	2443485	SAM_0024	SAM_0025			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443485	2443486	SAM_0025	SAM_0026		xylR-2	TRUE	0.885	17.000	0.000	1.000	N	NA
2443486	2443487	SAM_0026	SAM_0027	xylR-2		TRUE	0.982	8.000	0.105	1.000	N	NA
2443489	2443490	SAM_0029	SAM_0030	purD	purE	TRUE	0.431	185.000	0.044	1.000	Y	NA
2443490	2443491	SAM_0030	SAM_0031	purE	purK	TRUE	0.993	-13.000	0.136	0.001	Y	NA
2443491	2443492	SAM_0031	SAM_0032	purK		TRUE	0.407	54.000	0.000	NA		NA
2443492	2443493	SAM_0032	SAM_0033		purB	TRUE	0.766	25.000	0.000	NA		NA
2443493	2443494	SAM_0033	SAM_0034	purB		FALSE	0.245	152.000	0.005	1.000		NA
2443494	2443495	SAM_0034	SAM_0036		ruvB	FALSE	0.048	339.000	0.002	1.000		NA
2443497	2443498	SAM_0037	SAM_0038			TRUE	0.961	7.000	0.019	NA		NA
2443498	2443499	SAM_0038	SAM_0040			TRUE	0.989	-3.000	0.351	NA		NA
2443499	2443500	SAM_0040	SAM_0039			TRUE	0.581	-553.000	0.000	NA		NA
2443500	2443501	SAM_0039	SAM_0041			FALSE	0.010	1495.000	0.000	NA		NA
2443502	2443503	SAM_0623	SAM_0624			FALSE	0.259	71.000	0.000	NA		NA
2443503	2443504	SAM_0624	SAM_0625			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443504	2443505	SAM_0625	SAM_0626			TRUE	0.750	26.000	0.000	NA		NA
2443505	2443506	SAM_0626	SAM_0627			TRUE	0.283	68.000	0.000	NA		NA
2443506	2443507	SAM_0627	SAM_0628			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443507	2443508	SAM_0628	SAM_0629			TRUE	0.991	-7.000	0.545	NA		NA
2443508	2443509	SAM_0629	SAM_0630			TRUE	0.990	14.000	0.364	NA		NA
2443509	2443510	SAM_0630	SAM_0631			TRUE	0.986	-3.000	0.250	NA		NA
2443510	2443511	SAM_0631	SAM_0632			FALSE	0.022	331.000	0.000	NA		NA
2443511	2443512	SAM_0632	SAM_0633			TRUE	0.990	9.000	0.308	NA		NA
2443512	2443513	SAM_0633	SAM_0634			TRUE	0.982	3.000	0.148	NA		NA
2443513	2443514	SAM_0634	SAM_0635			TRUE	0.978	12.000	0.111	NA		NA
2443514	2443515	SAM_0635	SAM_0636			TRUE	0.271	69.000	0.000	NA		NA
2443515	2443516	SAM_0636	SAM_0637			FALSE	0.161	131.000	0.000	NA		NA
2443516	2443517	SAM_0637	SAM_0638			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443517	2443518	SAM_0638	SAM_0639			TRUE	0.996	0.000	0.750	NA		NA
2443518	2443519	SAM_0639	SAM_0641			TRUE	0.985	13.000	0.200	NA		NA
2443521	2443522	SAM_0642	SAM_0643			TRUE	0.890	2.000	0.000	NA		NA
2443522	2443523	SAM_0643	SAM_0644			FALSE	0.133	141.000	0.000	NA		NA
2443523	2443524	SAM_0644	SAM_0646			FALSE	0.025	308.000	0.000	NA		NA
2443524	2443525	SAM_0646	SAM_0645			TRUE	0.593	-258.000	0.000	NA		NA
2443525	2443526	SAM_0645	SAM_0647			FALSE	0.010	886.000	0.000	NA		NA
2443526	2443527	SAM_0647	SAM_0648			FALSE	0.263	70.000	0.000	NA		NA
2443527	2443528	SAM_0648	SAM_0649			TRUE	0.974	14.000	0.095	NA		NA
2443528	2443529	SAM_0649	SAM_0650			FALSE	0.033	250.000	0.000	NA		NA
2443529	2443530	SAM_0650	SAM_0651		aphA	TRUE	0.389	118.000	0.017	NA		NA
2443530	2443531	SAM_0651	SAM_0652	aphA		FALSE	0.023	321.000	0.000	NA		NA
2443534	2443535	SAM_0655	SAM_0656			TRUE	0.997	17.000	0.333	0.060	Y	NA
2443537	2443538	SAM_0658	SAM_0659			TRUE	0.929	-36.000	0.010	0.004		NA
2443538	2443539	SAM_0659	SAM_0660			FALSE	0.073	194.000	0.000	1.000		NA
2443540	2443541	SAM_0661	SAM_0662			TRUE	0.467	89.000	0.000	0.011		NA
2443541	2443542	SAM_0662	SAM_0663			TRUE	0.890	2.000	0.000	NA		NA
2443542	2443543	SAM_0663	SAM_0664			TRUE	0.994	-43.000	1.000	NA	Y	NA
2443543	2443544	SAM_0664	SAM_0665			TRUE	0.886	82.000	0.667	NA		NA
2443544	2443545	SAM_0665	SAM_0666			FALSE	0.030	275.000	0.000	NA		NA
2443545	2443546	SAM_0666	SAM_0667			FALSE	0.033	249.000	0.000	NA		NA
2443546	2443547	SAM_0667	SAM_0668			FALSE	0.013	521.000	0.000	NA		NA
2443549	2443550	SAM_0670	SAM_0671			FALSE	0.180	122.000	0.000	NA		NA
2443550	2443551	SAM_0671	SAM_0672			FALSE	0.010	1119.000	0.000	NA		NA
2443551	2443552	SAM_0672	SAM_0673			TRUE	0.350	61.000	0.000	NA		NA
2443552	2443553	SAM_0673	SAM_0674		drrA	FALSE	0.069	200.000	0.000	1.000		NA
2443553	2443554	SAM_0674	SAM_0675	drrA		TRUE	0.892	3.000	0.000	NA		NA
2443554	2443555	SAM_0675	SAM_0676			FALSE	0.058	197.000	0.000	NA		NA
2443556	2443557	SAM_0420	SAM_0421		ychF	FALSE	0.069	244.000	0.002	NA		NA
2443557	2443558	SAM_0421	SAM_0422	ychF	pth	TRUE	0.852	84.000	0.184	1.000	Y	NA
2443558	2443559	SAM_0422	SAM_0423	pth		TRUE	0.982	-3.000	0.137	1.000	N	NA
2443559	2443560	SAM_0423	SAM_0424			FALSE	0.096	291.000	0.024	1.000	N	NA
2443560	2443561	SAM_0424	SAM_0425			TRUE	0.943	-13.000	0.053	1.000	N	NA
2443561	2443562	SAM_0425	SAM_0426			TRUE	0.952	3.000	0.009	NA		NA
2443562	2443563	SAM_0426	SAM_0427			TRUE	0.977	0.000	0.105	NA		NA
2443563	2443564	SAM_0427	SAM_0428			TRUE	0.964	2.000	0.014	1.000	N	NA
2443564	2443565	SAM_0428	SAM_0429		hpt	TRUE	0.988	5.000	0.067	0.047	N	NA
2443565	2443566	SAM_0429	SAM_0430	hpt	ftsH	TRUE	0.974	23.000	0.192	1.000	N	NA
2443567	2443568	SAM_0431	SAM_0432			TRUE	0.466	84.000	0.025	NA		NA
2443569	2443570	SAM_0433	SAM_0434			FALSE	0.037	269.000	0.000	1.000		NA
2443570	2443571	SAM_0434	SAM_0435			FALSE	0.154	143.000	0.000	1.000		NA
2443571	2443572	SAM_0435	SAM_0436			FALSE	0.080	188.000	0.000	1.000		NA
2443572	2443573	SAM_0436	SAM_0437			FALSE	0.049	210.000	0.000	NA		NA
2443573	2443574	SAM_0437	SAM_0438			FALSE	0.013	552.000	0.000	NA		NA
2443574	2443575	SAM_0438	SAM_0439		nrdI	TRUE	0.998	1.000	0.643	NA	Y	NA
2443575	2443576	SAM_0439	SAM_0440	nrdI		TRUE	0.999	2.000	1.000	NA	Y	NA
2443576	2443577	SAM_0440	SAM_0441			TRUE	0.332	63.000	0.000	NA		NA
2443577	2443578	SAM_0441	SAM_0442			TRUE	0.985	13.000	0.200	NA		NA
2443579	2443580	SAM_0443	SAM_0444			FALSE	0.039	239.000	0.000	NA		NA
2443580	2443581	SAM_0444	SAM_0445			TRUE	0.889	1.000	0.000	NA		NA
2443581	2443582	SAM_0445	SAM_0446			FALSE	0.036	243.000	0.000	NA		NA
2443582	2443583	SAM_0446	SAM_0447			TRUE	0.952	28.000	0.167	NA		NA
2443583	2443584	SAM_0447	SAM_0448			TRUE	0.890	2.000	0.000	NA		NA
2443584	2443585	SAM_0448	SAM_0449			TRUE	0.988	10.000	0.095	0.053		NA
2443585	2443586	SAM_0449	SAM_0450			TRUE	0.980	7.000	0.095	1.000		NA
2443586	2443587	SAM_0450	SAM_0451			TRUE	0.962	0.000	0.000	0.018		NA
2443587	2443588	SAM_0451	SAM_0452			TRUE	0.424	110.000	0.000	0.018		NA
2443588	2443589	SAM_0452	SAM_0453			FALSE	0.052	206.000	0.000	NA		NA
2443592	2443593	SAM_0831	SAM_0830		gph	TRUE	0.401	110.000	0.012	1.000		NA
2443593	2443594	SAM_0830	SAM_0829	gph	pepF	FALSE	0.072	195.000	0.000	1.000		NA
2443594	2443595	SAM_0829	SAM_0828	pepF		TRUE	0.982	16.000	0.204	NA		NA
2443595	2443596	SAM_0828	SAM_0827			TRUE	0.752	52.000	0.056	NA		NA
2443596	2443597	SAM_0827	SAM_0826		rsuA	TRUE	0.552	73.000	0.020	1.000	N	NA
2443599	2443600	SAM_0824	SAM_0823	nagB		TRUE	0.372	151.000	0.071	NA		NA
2443601	2443602	SAM_0822	SAM_0821	queA		TRUE	0.287	81.000	0.000	1.000	N	NA
2443603	2443604	SAM_0820	SAM_0819		gntP	FALSE	0.230	101.000	0.000	1.000		NA
2443604	2443605	SAM_0819	SAM_0817	gntP		TRUE	0.977	25.000	0.095	1.000	Y	NA
2443606	2443607	SAM_0818	SAM_0816			FALSE	0.011	850.000	0.000	NA		NA
2443608	2443609	SAM_0815	SAM_0814			TRUE	0.994	17.000	0.318	1.000	Y	NA
2443609	2443610	SAM_0814	SAM_0813			TRUE	0.983	-7.000	0.259	1.000		NA
2443610	2443611	SAM_0813	SAM_0812			FALSE	0.026	338.000	0.000	1.000		NA
2443611	2443612	SAM_0812	SAM_0811			TRUE	0.492	80.000	0.012	1.000	N	NA
2443612	2443613	SAM_0811	SAM_0810			FALSE	0.159	147.000	0.000	1.000	N	NA
2443615	2443616	SAM_0808	SAM_0807			TRUE	0.987	11.000	0.200	1.000		NA
2443616	2443617	SAM_0807	SAM_0806			TRUE	0.389	126.000	0.000	0.020		NA
2443617	2443618	SAM_0806	SAM_0805		comEA	TRUE	0.972	-7.000	0.130	1.000		NA
2443618	2443619	SAM_0805	SAM_0804	comEA		TRUE	0.447	100.000	0.014	1.000	N	NA
2443620	2443621	SAM_0803	SAM_0802			TRUE	0.980	-7.000	0.209	1.000		NA
2443622	2443623	SAM_0801	SAM_0800			FALSE	0.046	235.000	0.000	NA	N	NA
2443623	2443624	SAM_0800	SAM_0799			TRUE	0.995	16.000	0.400	NA	Y	NA
2443624	2443625	SAM_0799	SAM_0798			TRUE	0.983	-7.000	0.067	1.000	Y	NA
2443625	2443626	SAM_0798	SAM_0797			FALSE	0.180	121.000	0.000	NA		NA
2443626	2443627	SAM_0797	SAM_0796		prfC	TRUE	0.360	86.000	0.003	NA		NA
2443627	2443628	SAM_0796	SAM_0795	prfC		FALSE	0.091	177.000	0.000	1.000		NA
2443628	2443629	SAM_0795	SAM_0794			TRUE	0.906	0.000	0.000	1.000		NA
2443630	2443631	SAM_1537	SAM_1536		clpP	TRUE	0.340	125.000	0.010	NA		NA
2443631	2443632	SAM_1536	SAM_1535	clpP		TRUE	0.846	40.000	0.065	NA		NA
2443632	2443633	SAM_1535	SAM_1534		livJ	TRUE	0.402	154.000	0.109	NA		NA
2443633	2443634	SAM_1534	SAM_1533	livJ		TRUE	0.604	175.000	0.150	1.000	Y	NA
2443634	2443635	SAM_1533	SAM_1532		livM	TRUE	0.998	3.000	0.363	0.042	Y	NA
2443635	2443636	SAM_1532	SAM_1531	livM	livG	TRUE	0.996	1.000	0.349	1.000	Y	NA
2443636	2443637	SAM_1531	SAM_1530	livG	livF	TRUE	0.996	0.000	0.128	0.030	Y	NA
2443637	2443638	SAM_1530	SAM_1529	livF	guaB-1	TRUE	0.980	19.000	0.214	1.000		NA
2443638	2443639	SAM_1529	SAM_1528	guaB-1	tmk	TRUE	0.398	89.000	0.006	1.000		NA
2443639	2443640	SAM_1528	SAM_1527	tmk	dnaZX	TRUE	0.983	20.000	0.254	1.000	N	NA
2443640	2443641	SAM_1527	SAM_1526	dnaZX		TRUE	0.888	31.000	0.038	NA		NA
2443641	2443642	SAM_1526	SAM_1525			TRUE	0.969	6.000	0.043	NA		NA
2443642	2443643	SAM_1525	SAM_1524			TRUE	0.327	122.000	0.005	NA		NA
2443645	2443646	SAM_1522	SAM_1521	serC		TRUE	0.536	68.000	0.012	1.000		NA
2443646	2443647	SAM_1521	SAM_1520		serA	TRUE	0.739	63.000	0.013	0.053		NA
2443647	2443648	SAM_1520	SAM_1519	serA	ogt	TRUE	0.651	57.000	0.009	1.000	N	NA
2443648	2443649	SAM_1519	SAM_1518	ogt		TRUE	0.975	2.000	0.050	1.000	N	NA
2443650	2443651	SAM_1517	SAM_1516	xth		TRUE	0.279	77.000	0.000	1.000		NA
2443651	2443652	SAM_1516	SAM_1515			TRUE	0.989	-16.000	0.714	1.000		NA
2443655	2443656	SAM_1512	SAM_1511	metS	brnQ	FALSE	0.084	190.000	0.000	1.000	N	NA
2443656	2443657	SAM_1511	SAM_1510	brnQ		FALSE	0.019	366.000	0.000	NA		NA
2443657	2443658	SAM_1510	SAM_1509			TRUE	0.925	51.000	0.429	NA		NA
2443658	2443659	SAM_1509	SAM_1508			TRUE	0.985	-46.000	0.857	NA		NA
2443659	2443660	SAM_1508	SAM_1507			TRUE	0.984	7.000	0.167	NA		NA
2443660	2443661	SAM_1507	SAM_1506			TRUE	0.490	140.000	0.131	NA		NA
2443661	2443662	SAM_1506	SAM_1505			FALSE	0.035	246.000	0.000	NA		NA
2443662	2443663	SAM_1505	SAM_1504			FALSE	0.034	248.000	0.000	NA		NA
2443663	2443664	SAM_1504	SAM_1503			FALSE	0.200	90.000	0.000	NA		NA
2443664	2443665	SAM_1503	SAM_1502			TRUE	0.993	-7.000	0.710	NA		NA
2443665	2443666	SAM_1502	SAM_1501			FALSE	0.108	239.000	0.022	NA		NA
2443666	2443667	SAM_1501	SAM_1500			TRUE	0.963	-3.000	0.043	NA		NA
2443667	2443668	SAM_1500	SAM_1499			FALSE	0.237	89.000	0.000	1.000		NA
2443668	2443669	SAM_1499	SAM_1498			TRUE	0.993	13.000	0.500	NA		NA
2443669	2443670	SAM_1498	SAM_1497		glmU	FALSE	0.036	244.000	0.000	NA		NA
2443670	2443671	SAM_1497	SAM_1496	glmU		TRUE	0.936	21.000	0.015	1.000	N	NA
2443671	2443672	SAM_1496	SAM_1495			TRUE	0.961	0.000	0.025	NA		NA
2443672	2443673	SAM_1495	SAM_1494			TRUE	0.968	10.000	0.041	NA		NA
2443676	2443677	SAM_0514	SAM_0513			TRUE	0.290	186.000	0.079	1.000	N	NA
2443677	2443678	SAM_0513	SAM_0512			TRUE	0.727	64.000	0.114	NA		NA
2443679	2443680	SAM_0511	SAM_0510	ileS		FALSE	0.074	284.000	0.012	NA	N	NA
2443680	2443681	SAM_0510	SAM_0509			TRUE	0.995	10.000	0.579	NA		NA
2443681	2443682	SAM_0509	SAM_0508			TRUE	0.990	2.000	0.287	1.000		NA
2443682	2443683	SAM_0508	SAM_0507			TRUE	0.991	3.000	0.370	NA		NA
2443683	2443684	SAM_0507	SAM_0506			TRUE	0.943	12.000	0.002	NA		NA
2443684	2443685	SAM_0506	SAM_0505			TRUE	0.945	6.000	0.002	NA		NA
2443685	2443686	SAM_0505	SAM_0504		ftsA	TRUE	0.994	22.000	0.460	1.000	Y	NA
2443686	2443687	SAM_0504	SAM_0503	ftsA		TRUE	0.322	271.000	0.389	NA	N	NA
2443687	2443688	SAM_0503	SAM_0502			TRUE	0.989	4.000	0.072	NA	Y	NA
2443688	2443689	SAM_0502	SAM_0501		murD	TRUE	0.990	3.000	0.060	1.000	Y	NA
2443689	2443690	SAM_0501	SAM_0500	murD		TRUE	0.307	130.000	0.006	NA		NA
2443690	2443691	SAM_0500	SAM_0499		typA	TRUE	0.739	45.000	0.015	NA		NA
2443691	2443692	SAM_0499	SAM_0498	typA		FALSE	0.092	232.000	0.003	NA	N	NA
2443692	2443693	SAM_0498	SAM_0497			TRUE	0.974	12.000	0.064	NA	N	NA
2443693	2443694	SAM_0497	SAM_0496			TRUE	0.992	-3.000	0.496	NA		NA
2443696	2443697	SAM_0494	SAM_0493	nth		FALSE	0.233	113.000	0.000	1.000	N	NA
2443697	2443698	SAM_0493	SAM_0492		atoB	TRUE	0.996	-7.000	0.576	1.000	Y	NA
2443698	2443699	SAM_0492	SAM_0491	atoB		TRUE	0.943	-10.000	0.058	NA		NA
2443700	2443701	SAM_0490	SAM_0489	bioB		TRUE	0.970	1.000	0.000	0.002		NA
2443702	2443703	SAM_0488	SAM_0487	trpG		FALSE	0.213	128.000	0.000	1.000	N	NA
2443703	2443704	SAM_0487	SAM_0486			TRUE	0.999	-10.000	0.911	0.006	Y	NA
2443704	2443705	SAM_0486	SAM_0485			TRUE	0.366	196.000	0.045	NA	Y	NA
2443705	2443706	SAM_0485	SAM_0484			TRUE	0.953	0.000	0.012	NA		NA
2443706	2443707	SAM_0484	SAM_0483			TRUE	0.686	51.000	0.016	NA		NA
2443707	2443708	SAM_0483	SAM_0482			TRUE	0.830	69.000	0.347	NA		NA
2443708	2443709	SAM_0482	SAM_0481			TRUE	0.548	75.000	0.023	1.000	N	NA
2443709	2443710	SAM_0481	SAM_0480		coaD	TRUE	0.950	-10.000	0.052	1.000	N	NA
2443710	2443711	SAM_0480	SAM_0479	coaD		TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443711	2443712	SAM_0479	SAM_0478			TRUE	0.890	12.000	0.000	NA		NA
2443715	2443716	SAM_0229	SAM_0230	mod_1	res_1	TRUE	0.988	-16.000	0.400	0.059		NA
2443716	2443717	SAM_0230	SAM_0231	res_1		FALSE	0.012	604.000	0.000	NA		NA
2443717	2443718	SAM_0231	SAM_0232			FALSE	0.231	81.000	0.000	NA		NA
2443718	2443719	SAM_0232	SAM_0233			TRUE	0.997	0.000	1.000	NA		NA
2443719	2443720	SAM_0233	SAM_0234			TRUE	0.842	18.000	0.000	NA		NA
2443720	2443721	SAM_0234	SAM_0235			TRUE	0.671	-27.000	0.000	NA		NA
2443721	2443722	SAM_0235	SAM_0236			TRUE	0.756	-15.000	0.000	NA		NA
2443722	2443723	SAM_0236	SAM_0237			TRUE	0.623	34.000	0.000	NA		NA
2443723	2443724	SAM_0237	SAM_0238			FALSE	0.199	91.000	0.000	NA		NA
2443724	2443725	SAM_0238	SAM_0239			FALSE	0.015	428.000	0.000	NA		NA
2443725	2443726	SAM_0239	SAM_0240			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443726	2443727	SAM_0240	SAM_0241			TRUE	0.888	0.000	0.000	NA		NA
2443727	2443728	SAM_0241	SAM_0242			TRUE	0.764	73.000	0.200	1.000		NA
2443729	2443730	SAM_0243	SAM_0244			TRUE	0.998	1.000	0.619	0.003	N	NA
2443730	2443731	SAM_0244	SAM_0245			TRUE	0.998	3.000	0.650	0.041		NA
2443731	2443732	SAM_0245	SAM_0246		proW-1	TRUE	0.899	-15.000	0.000	0.041		NA
2443732	2443733	SAM_0246	SAM_0247	proW-1	proV	TRUE	0.996	0.000	0.450	0.080		NA
2443733	2443734	SAM_0247	SAM_0248	proV		FALSE	0.035	5637.000	0.000	1.000	Y	NA
2443735	2443736	SAM_0249	SAM_0250		fad-3	TRUE	0.450	176.000	0.083	0.052		NA
2443736	2443737	SAM_0250	SAM_0251	fad-3		TRUE	0.606	96.000	0.098	1.000	N	NA
2443737	2443738	SAM_0251	SAM_0252		fabH	TRUE	0.977	0.000	0.070	1.000	N	NA
2443738	2443739	SAM_0252	SAM_0253	fabH		TRUE	0.993	10.000	0.019	0.006	Y	NA
2443739	2443740	SAM_0253	SAM_0254		fabK	TRUE	0.383	155.000	0.072	1.000		NA
2443740	2443741	SAM_0254	SAM_0255	fabK	fabD	TRUE	0.965	20.000	0.099	1.000		NA
2443741	2443742	SAM_0255	SAM_0256	fabD	fabG	TRUE	0.999	9.000	0.432	0.006	Y	NA
2443742	2443743	SAM_0256	SAM_0257	fabG	fabF	TRUE	0.986	16.000	0.056	1.000	Y	NA
2443743	2443744	SAM_0257	SAM_0258	fabF	accB	TRUE	0.958	-34.000	0.074	1.000	Y	NA
2443744	2443745	SAM_0258	SAM_0259	accB	fabZ	TRUE	0.994	-3.000	0.047	0.006	Y	NA
2443745	2443746	SAM_0259	SAM_0260	fabZ	accC	TRUE	0.933	38.000	0.045	1.000	Y	NA
2443746	2443747	SAM_0260	SAM_0261	accC	accD	TRUE	0.996	9.000	0.090	0.002	Y	NA
2443747	2443748	SAM_0261	SAM_0262	accD	accA	TRUE	0.996	-7.000	0.234	0.002	Y	NA
2443748	2443749	SAM_0262	SAM_0263	accA		FALSE	0.014	470.000	0.000	NA		NA
2443752	2443753	SAM_0266	SAM_0267			FALSE	0.023	321.000	0.000	NA		NA
2443753	2443754	SAM_0267	SAM_0268			TRUE	0.646	179.000	0.583	NA		NA
2443754	2443755	SAM_0268	SAM_0269			TRUE	0.999	15.000	0.812	0.017	Y	NA
2443756	2443757	SAM_1386	SAM_1385			TRUE	0.993	-3.000	0.568	NA		NA
2443757	2443758	SAM_1385	SAM_1384			TRUE	0.833	-7.000	0.000	NA		NA
2443758	2443759	SAM_1384	SAM_1383			FALSE	0.263	70.000	0.000	NA		NA
2443759	2443760	SAM_1383	SAM_1382			TRUE	0.902	3.000	0.000	NA	N	NA
2443760	2443761	SAM_1382	SAM_1381			TRUE	0.917	3.000	0.000	1.000	N	NA
2443761	2443762	SAM_1381	SAM_1380			TRUE	0.963	2.000	0.000	NA	Y	NA
2443762	2443763	SAM_1380	SAM_1379			TRUE	0.956	30.000	0.222	NA		NA
2443763	2443764	SAM_1379	SAM_1378			TRUE	0.890	2.000	0.000	NA		NA
2443764	2443765	SAM_1378	SAM_1377			TRUE	0.888	0.000	0.000	NA		NA
2443765	2443766	SAM_1377	SAM_1376			TRUE	0.894	-3.000	0.000	1.000		NA
2443766	2443767	SAM_1376	SAM_1375			TRUE	0.827	-10.000	0.000	1.000		NA
2443769	2443770	SAM_1373	SAM_1372			TRUE	0.432	123.000	0.000	0.008		NA
2443770	2443771	SAM_1372	SAM_1371			FALSE	0.217	112.000	0.000	1.000		NA
2443771	2443772	SAM_1371	SAM_1370			TRUE	0.999	0.000	0.909	NA	Y	NA
2443772	2443773	SAM_1370	SAM_1369			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443773	2443774	SAM_1369	SAM_1368			FALSE	0.026	301.000	0.000	NA		NA
2443774	2443775	SAM_1368	SAM_1367			TRUE	0.983	-19.000	0.600	NA		NA
2443775	2443776	SAM_1367	SAM_1366			TRUE	0.524	93.000	0.050	1.000		NA
2443776	2443777	SAM_1366	SAM_1365			TRUE	0.988	-7.000	0.408	1.000		NA
2443777	2443778	SAM_1365	SAM_1364			FALSE	0.191	180.000	0.023	NA		NA
2443778	2443779	SAM_1364	SAM_1363			TRUE	0.555	68.000	0.028	NA		NA
2443779	2443780	SAM_1363	SAM_1362			TRUE	0.453	117.000	0.023	1.000	N	NA
2443780	2443781	SAM_1362	SAM_1361			TRUE	0.610	60.000	0.015	NA		NA
2443782	2443783	SAM_1360	SAM_1359			TRUE	0.999	-3.000	0.857	0.040	Y	NA
2443783	2443784	SAM_1359	SAM_1358			TRUE	0.992	16.000	0.179	1.000	Y	NA
2443784	2443785	SAM_1358	SAM_1357			TRUE	0.997	24.000	0.889	1.000	Y	NA
2443785	2443786	SAM_1357	SAM_1356		murE	TRUE	0.380	156.000	0.062	1.000	N	NA
2443787	2443788	SAM_1355	SAM_1354		pepT	FALSE	0.176	135.000	0.000	1.000		NA
2443788	2443789	SAM_1354	SAM_1353	pepT		TRUE	0.908	29.000	0.051	NA		NA
2443790	2443791	SAM_1805	SAM_1806	purA		FALSE	0.020	371.000	0.000	NA	N	NA
2443792	2443793	SAM_1807	SAM_1808			TRUE	0.982	33.000	0.750	NA		NA
2443793	2443794	SAM_1808	SAM_1809			FALSE	0.197	101.000	0.000	NA		NA
2443794	2443795	SAM_1809	SAM_1810			FALSE	0.085	170.000	0.000	NA		NA
2443797	2443798	SAM_1812	SAM_1813			TRUE	0.996	-3.000	0.818	NA		NA
2443798	2443799	SAM_1813	SAM_1814			FALSE	0.148	140.000	0.000	NA	N	NA
2443799	2443800	SAM_1814	SAM_1815			TRUE	0.922	-16.000	0.034	1.000	N	NA
2443800	2443801	SAM_1815	SAM_1816		dck	TRUE	0.380	121.000	0.005	1.000	N	NA
2443801	2443802	SAM_1816	SAM_1817	dck		TRUE	0.907	14.000	0.000	1.000	N	NA
2443803	2443804	SAM_1818	SAM_1819	clpC-1		TRUE	0.984	-3.000	0.188	NA	N	NA
2443806	2443807	SAM_1821	SAM_1822	tsf	rpsB	TRUE	0.945	94.000	0.748	1.000	Y	NA
2443808	2443809	SAM_1823	SAM_1824	ahpC		TRUE	0.996	18.000	0.551	1.000	Y	NA
2443810	2443811	SAM_1825	SAM_1826			TRUE	0.890	2.000	0.000	NA		NA
2443815	2443816	SAM_1830	SAM_1831			TRUE	0.609	-91.000	0.000	NA		NA
2443817	2443818	SAM_1832	SAM_1833		def	TRUE	0.647	66.000	0.034	1.000	N	NA
2443819	2443820	SAM_1834	SAM_1835			TRUE	0.871	79.000	0.562	NA		NA
2443820	2443821	SAM_1835	SAM_1836			TRUE	0.812	80.000	0.375	NA		NA
2443821	2443822	SAM_1836	SAM_1837			TRUE	0.998	-13.000	0.933	0.017	Y	NA
2443822	2443823	SAM_1837	SAM_1838			TRUE	0.996	36.000	0.933	0.017	Y	NA
2443823	2443824	SAM_1838	SAM_1839			TRUE	0.887	55.000	0.267	1.000		NA
2443824	2443825	SAM_1839	SAM_1840			TRUE	0.985	3.000	0.160	1.000		NA
2443826	2443827	SAM_0564	SAM_0563		add	TRUE	0.708	59.000	0.034	1.000	N	NA
2443828	2443829	SAM_0562	SAM_0561		rpmE	TRUE	0.481	85.000	0.020	1.000		NA
2443830	2443831	SAM_0560	SAM_0559			TRUE	0.648	142.000	0.250	1.000	N	NA
2443831	2443832	SAM_0559	SAM_0558			TRUE	0.956	15.000	0.015	1.000		NA
2443832	2443833	SAM_0558	SAM_0557			TRUE	0.992	-3.000	0.470	NA		NA
2443833	2443834	SAM_0557	SAM_0556			TRUE	0.984	-3.000	0.214	NA		NA
2443835	2443836	SAM_0555	SAM_0554			FALSE	0.047	246.000	0.000	1.000	N	NA
2443836	2443837	SAM_0554	SAM_0553			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443838	2443839	SAM_0552	SAM_0551	asnS		TRUE	0.959	21.000	0.068	1.000	N	NA
2443839	2443840	SAM_0551	SAM_0550			TRUE	0.511	86.000	0.028	1.000	N	NA
2443840	2443841	SAM_0550	SAM_0549		fabG	FALSE	0.241	108.000	0.000	1.000	N	NA
2443842	2443843	SAM_0548	SAM_0547			TRUE	0.937	-3.000	0.004	NA		NA
2443844	2443845	SAM_0546	SAM_0545	ftsX	ftsE	TRUE	0.991	-16.000	0.431	1.000	Y	NA
2443845	2443846	SAM_0545	SAM_0544	ftsE	prfB	TRUE	0.981	19.000	0.053	0.014	N	NA
2443846	2443847	SAM_0544	SAM_0543	prfB		FALSE	0.170	187.000	0.006	1.000	N	NA
2443847	2443848	SAM_0543	SAM_0542		fbp	TRUE	0.471	90.000	0.018	1.000	N	NA
2443850	2443851	SAM_0540	SAM_0539			FALSE	0.020	344.000	0.000	NA		NA
2443852	2443853	SAM_0538	SAM_0537			TRUE	0.580	71.000	0.035	1.000		NA
2443853	2443854	SAM_0537	SAM_0536			TRUE	0.954	-15.000	0.125	1.000		NA
2443854	2443855	SAM_0536	SAM_0535			TRUE	0.997	13.000	0.133	0.001	Y	NA
2443855	2443856	SAM_0535	SAM_0534			TRUE	0.998	19.000	0.467	0.009	Y	NA
2443857	2443858	SAM_1731	SAM_1730			TRUE	0.636	127.000	0.156	1.000	N	NA
2443859	2443860	SAM_1729	SAM_1728			FALSE	0.097	161.000	0.000	NA		NA
2443861	2443862	SAM_1727	SAM_1726			FALSE	0.017	408.000	0.000	NA		NA
2443862	2443863	SAM_1726	SAM_1725			FALSE	0.221	109.000	0.000	1.000		NA
2443863	2443864	SAM_1725	SAM_1724			TRUE	0.535	42.000	0.000	NA		NA
2443865	2443866	SAM_1723	SAM_1722			TRUE	0.829	-124.000	0.000	0.017		NA
2443866	2443867	SAM_1722	SAM_1721			TRUE	0.895	6.000	0.000	NA		NA
2443868	2443869	SAM_1720	SAM_1719			TRUE	0.646	33.000	0.000	NA		NA
2443869	2443870	SAM_1719	SAM_1718			FALSE	0.049	211.000	0.000	NA		NA
2443870	2443871	SAM_1718	SAM_1717		fruA-1	TRUE	0.964	14.000	0.000	0.012	N	NA
2443871	2443872	SAM_1717	SAM_1716	fruA-1		TRUE	0.997	14.000	0.179	0.012	Y	NA
2443872	2443873	SAM_1716	SAM_1715		fruA-2	TRUE	0.985	13.000	0.000	0.012	Y	NA
2443873	2443874	SAM_1715	SAM_1714	fruA-2		TRUE	0.995	12.000	0.273	1.000	Y	NA
2443874	2443875	SAM_1714	SAM_1713			TRUE	0.976	18.000	0.000	0.019	Y	NA
2443875	2443876	SAM_1713	SAM_1712		tkt	TRUE	0.975	49.000	0.500	1.000	Y	NA
2443876	2443877	SAM_1712	SAM_1711	tkt		FALSE	0.141	138.000	0.000	NA		NA
2443879	2443880	SAM_1709	SAM_1708			FALSE	0.016	409.000	0.000	NA		NA
2443880	2443881	SAM_1708	SAM_1706		ndh	TRUE	0.990	13.000	0.261	1.000	N	NA
2443883	2443884	SAM_1705	SAM_1704	appC	cydB	TRUE	0.999	1.000	0.950	0.018	Y	NA
2443884	2443885	SAM_1704	SAM_1703	cydB		TRUE	0.989	0.000	0.061	1.000	Y	NA
2443885	2443886	SAM_1703	SAM_1702			TRUE	0.995	-7.000	0.168	0.006	Y	NA
2443887	2443888	SAM_1701	SAM_1700	ispB		TRUE	0.498	46.000	0.000	NA		NA
2443888	2443889	SAM_1700	SAM_1699			TRUE	0.972	4.000	0.054	NA		NA
2443889	2443890	SAM_1699	SAM_1698			TRUE	0.950	24.000	0.081	1.000		NA
2443892	2443893	SAM_0369	SAM_0370			FALSE	0.031	302.000	0.000	1.000		NA
2443894	2443895	SAM_0371	SAM_0372			TRUE	0.787	90.000	0.400	NA		NA
2443895	2443896	SAM_0372	SAM_0373			TRUE	0.519	103.000	0.068	NA		NA
2443896	2443897	SAM_0373	SAM_0374			TRUE	0.407	83.000	0.008	NA		NA
2443897	2443898	SAM_0374	SAM_0375			TRUE	0.855	-46.000	0.033	NA		NA
2443898	2443899	SAM_0375	SAM_0376			TRUE	0.989	9.000	0.283	NA		NA
2443900	2443901	SAM_0377	SAM_0378		pkcI	TRUE	0.968	-3.000	0.063	NA		NA
2443904	2443905	SAM_0381	SAM_0382			TRUE	0.985	2.000	0.167	NA	N	NA
2443905	2443906	SAM_0382	SAM_0383			TRUE	0.775	58.000	0.107	NA	N	NA
2443906	2443907	SAM_0383	SAM_0384			TRUE	0.965	-10.000	0.154	NA		NA
2443907	2443908	SAM_0384	SAM_0385			FALSE	0.025	583.000	0.004	NA		NA
2443908	2443909	SAM_0385	SAM_0386		nusA	TRUE	0.964	48.000	0.759	NA		NA
2443909	2443910	SAM_0386	SAM_0387	nusA		TRUE	0.991	22.000	0.323	NA	Y	NA
2443910	2443911	SAM_0387	SAM_0388			TRUE	0.988	-7.000	0.408	NA	N	NA
2443911	2443912	SAM_0388	SAM_0389		infB	TRUE	0.870	77.000	0.223	NA	Y	NA
2443912	2443913	SAM_0389	SAM_0390	infB	rbfA	TRUE	0.919	109.000	0.530	1.000	Y	NA
2443915	2443916	SAM_0392	SAM_0393			TRUE	0.976	13.000	0.064	1.000	N	NA
2443916	2443917	SAM_0393	SAM_0394		pacS	TRUE	0.967	41.000	0.048	0.003	Y	NA
2443917	2443918	SAM_0394	SAM_0395	pacS		FALSE	0.187	110.000	0.000	NA		NA
2443918	2443919	SAM_0395	SAM_0396			TRUE	0.963	15.000	0.047	NA		NA
2443919	2443920	SAM_0396	SAM_0397			FALSE	0.216	113.000	0.000	1.000		NA
2443920	2443921	SAM_0397	SAM_0398			TRUE	0.857	30.000	0.005	1.000		NA
2443921	2443922	SAM_0398	SAM_0399		fur-3	TRUE	0.453	82.000	0.010	1.000		NA
2443922	2443923	SAM_0399	SAM_0400	fur-3		FALSE	0.133	153.000	0.000	1.000		NA
2443923	2443924	SAM_0400	SAM_0401			TRUE	0.761	113.000	0.333	1.000		NA
2443924	2443925	SAM_0401	SAM_0402			TRUE	0.997	2.000	0.500	1.000	Y	NA
2443928	2443929	SAM_1454	SAM_1455		natA	TRUE	0.982	-10.000	0.385	NA		NA
2443929	2443930	SAM_1455	SAM_1456	natA		FALSE	0.221	125.000	0.000	1.000	N	NA
2443930	2443931	SAM_1456	SAM_1457		mutM	TRUE	0.958	-9.000	0.066	1.000	N	NA
2443931	2443932	SAM_1457	SAM_1458	mutM		FALSE	0.253	149.000	0.004	1.000		NA
2443933	2443934	SAM_1459	SAM_1460			TRUE	0.594	36.000	0.000	NA		NA
2443935	2443936	SAM_1461	SAM_1462			FALSE	0.061	193.000	0.000	NA		NA
2443936	2443937	SAM_1462	SAM_1463		era	FALSE	0.010	1845.000	0.000	NA		NA
2443937	2443938	SAM_1463	SAM_1464	era		TRUE	0.850	42.000	0.063	1.000		NA
2443938	2443939	SAM_1464	SAM_1465			TRUE	0.894	-19.000	0.035	NA		NA
2443939	2443940	SAM_1465	SAM_1466			FALSE	0.017	394.000	0.000	NA		NA
2443940	2443941	SAM_1466	SAM_1467			FALSE	0.025	323.000	0.000	NA	N	NA
2443943	2443944	SAM_1469	SAM_1470			TRUE	0.312	124.000	0.004	NA		NA
2443944	2443945	SAM_1470	SAM_1471			FALSE	0.103	157.000	0.000	NA		NA
2443945	2443946	SAM_1471	SAM_1472		msrA	TRUE	0.973	-3.000	0.080	1.000		NA
2443946	2443947	SAM_1472	SAM_1473	msrA		TRUE	0.345	138.000	0.016	1.000		NA
2443947	2443948	SAM_1473	SAM_1474		frr	TRUE	0.391	118.000	0.012	1.000		NA
2443948	2443949	SAM_1474	SAM_1475	frr		TRUE	0.995	15.000	0.626	1.000	N	NA
2443949	2443950	SAM_1475	SAM_1476			FALSE	0.228	121.000	0.000	1.000	N	NA
2443950	2443951	SAM_1476	SAM_1477			TRUE	0.996	-13.000	0.500	0.028	Y	NA
2443951	2443952	SAM_1477	SAM_1478			TRUE	0.925	69.000	0.353	1.000	Y	NA
2443952	2443953	SAM_1478	SAM_1479			TRUE	0.998	0.000	0.353	0.002	Y	NA
2443953	2443954	SAM_1479	SAM_1480			TRUE	0.993	-13.000	0.167	0.002	Y	NA
2443954	2443955	SAM_1480	SAM_1481		rplA	FALSE	0.023	392.000	0.000	1.000	N	NA
2443955	2443956	SAM_1481	SAM_1482	rplA	rplK	TRUE	0.973	104.000	0.838	0.027	Y	NA
2443956	2443957	SAM_1482	SAM_1483	rplK		FALSE	0.059	211.000	0.000	1.000		NA
2443957	2443958	SAM_1483	SAM_1484			TRUE	0.911	8.000	0.000	1.000		NA
2443960	2443961	SAM_1486	SAM_1487	pabB/C		FALSE	0.228	82.000	0.000	NA		NA
2443964	2443965	SAM_1233	SAM_1232	miaA		TRUE	0.471	91.000	0.027	1.000		NA
2443965	2443966	SAM_1232	SAM_1231			TRUE	0.939	-7.000	0.014	1.000		NA
2443966	2443967	SAM_1231	SAM_1230			TRUE	0.797	42.000	0.022	1.000		NA
2443967	2443968	SAM_1230	SAM_1229			TRUE	0.977	2.000	0.074	1.000		NA
2443968	2443969	SAM_1229	SAM_1228		recJ	TRUE	0.957	-3.000	0.016	1.000		NA
2443969	2443970	SAM_1228	SAM_1227	recJ		FALSE	0.263	70.000	0.000	NA		NA
2443970	2443971	SAM_1227	SAM_1226			TRUE	0.741	-16.000	0.000	NA		NA
2443971	2443972	SAM_1226	SAM_1225		apt	FALSE	0.195	123.000	0.000	NA	N	NA
2443972	2443973	SAM_1225	SAM_1224	apt		TRUE	0.346	118.000	0.005	NA	N	NA
2443973	2443974	SAM_1224	SAM_1223			TRUE	0.381	104.000	0.012	NA		NA
2443974	2443975	SAM_1223	SAM_1222			TRUE	0.977	-10.000	0.283	NA		NA
2443975	2443976	SAM_1222	SAM_1221			TRUE	0.961	9.000	0.021	NA		NA
2443976	2443977	SAM_1221	SAM_1220		rfbA	TRUE	0.750	59.000	0.059	1.000	N	NA
2443977	2443978	SAM_1220	SAM_1219	rfbA		TRUE	0.993	0.000	0.149	1.000	Y	NA
2443978	2443979	SAM_1219	SAM_1218		rfbB	TRUE	0.637	207.000	0.350	1.000	Y	NA
2443981	2443982	SAM_1216	SAM_1215			TRUE	0.717	-31.000	0.000	1.000	N	NA
2443982	2443983	SAM_1215	SAM_1214			FALSE	0.198	92.000	0.000	NA		NA
2443983	2443984	SAM_1214	SAM_1213			TRUE	0.938	-10.000	0.048	NA		NA
2443984	2443985	SAM_1213	SAM_1212			TRUE	0.443	110.000	0.022	1.000		NA
2443985	2443986	SAM_1212	SAM_1211		budA	TRUE	0.971	14.000	0.044	1.000	N	NA
2443988	2443989	SAM_1209	SAM_1208			TRUE	0.991	13.000	0.368	NA		NA
2443991	2443992	SAM_0704	SAM_0703			FALSE	0.048	212.000	0.000	NA		NA
2443992	2443993	SAM_0703	SAM_0702			TRUE	0.893	9.000	0.000	NA		NA
2443993	2443994	SAM_0702	SAM_0701			TRUE	0.609	35.000	0.000	NA		NA
2443994	2443995	SAM_0701	SAM_0700			TRUE	0.892	10.000	0.000	NA		NA
2443995	2443996	SAM_0700	SAM_0699			FALSE	0.177	124.000	0.000	NA		NA
2443996	2443997	SAM_0699	SAM_0698			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2443997	2443998	SAM_0698	SAM_0697			TRUE	0.609	35.000	0.000	NA		NA
2443998	2443999	SAM_0697	SAM_0696			TRUE	0.609	35.000	0.000	NA		NA
2443999	2444000	SAM_0696	SAM_0695		pepO	TRUE	0.671	32.000	0.000	NA		NA
2444000	2444001	SAM_0695	SAM_0694	pepO	pepO	TRUE	0.965	-3.000	0.000	0.002		NA
2444001	2444002	SAM_0694	SAM_0693	pepO		TRUE	0.946	21.000	0.000	0.002		NA
2444002	2444003	SAM_0693	SAM_0692			FALSE	0.084	184.000	0.000	1.000		NA
2444003	2444004	SAM_0692	SAM_0691			TRUE	0.547	46.000	0.000	1.000		NA
2444004	2444005	SAM_0691	SAM_0690			TRUE	0.425	52.000	0.000	NA		NA
2444005	2444006	SAM_0690	SAM_0689			TRUE	0.623	34.000	0.000	NA		NA
2444006	2444007	SAM_0689	SAM_0688			FALSE	0.021	343.000	0.000	NA		NA
2444007	2444008	SAM_0688	SAM_0687			TRUE	0.654	-31.000	0.000	NA		NA
2444008	2444009	SAM_0687	SAM_0686			TRUE	0.919	5.000	0.000	1.000	N	NA
2444009	2444010	SAM_0686	SAM_0685			TRUE	0.902	-3.000	0.000	1.000	N	NA
2444010	2444011	SAM_0685	SAM_0684			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444011	2444012	SAM_0684	SAM_0683			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444012	2444013	SAM_0683	SAM_0682		drrA	TRUE	0.994	-7.000	0.849	NA		NA
2444013	2444014	SAM_0682	SAM_0681	drrA	fabZ	TRUE	0.813	-10.000	0.000	NA	N	NA
2444014	2444015	SAM_0681	SAM_0680	fabZ	acpP-1	TRUE	0.955	-16.000	0.167	NA		NA
2444017	2444018	SAM_0678	SAM_0677			FALSE	0.010	930.000	0.000	NA		NA
2444019	2444020	SAM_2124	SAM_2123			TRUE	0.975	-3.000	0.111	NA		NA
2444020	2444021	SAM_2123	SAM_2122		dnaN	TRUE	0.888	25.000	0.003	1.000		NA
2444021	2444022	SAM_2122	SAM_2121	dnaN	dnaA	TRUE	0.784	155.000	0.328	1.000	Y	NA
2444022	2444023	SAM_2121	SAM_2120	dnaA		FALSE	0.117	209.000	0.002	1.000	N	NA
2444023	2444024	SAM_2120	SAM_2119		htrA	TRUE	0.452	98.000	0.015	1.000	N	NA
2444026	2444027	SAM_2117	SAM_2116			TRUE	0.443	123.000	0.040	NA		NA
2444027	2444028	SAM_2116	SAM_2115			TRUE	0.582	66.000	0.027	NA		NA
2444029	2444030	SAM_2114	SAM_2113		trpS	FALSE	0.224	108.000	0.000	1.000		NA
2444031	2444032	SAM_2112	SAM_2111	arcC	arcD	TRUE	0.982	21.000	0.091	1.000	Y	NA
2444032	2444033	SAM_2111	SAM_2110	arcD	argF	TRUE	0.833	63.000	0.042	1.000	Y	NA
2444033	2444034	SAM_2110	SAM_2109	argF		TRUE	0.974	16.000	0.104	1.000		NA
2444034	2444035	SAM_2109	SAM_2108		arcA	TRUE	0.975	6.000	0.056	1.000		NA
2444035	2444036	SAM_2108	SAM_2107	arcA		FALSE	0.031	267.000	0.000	NA		NA
2444037	2444038	SAM_2106	SAM_2105			TRUE	0.962	10.000	0.000	0.035	N	NA
2444038	2444039	SAM_2105	SAM_2104		guaB	FALSE	0.133	157.000	0.000	1.000	N	NA
2444039	2444040	SAM_2104	SAM_2103	guaB		TRUE	0.284	75.000	0.000	1.000		NA
2444040	2444041	SAM_2103	SAM_2102			FALSE	0.248	86.000	0.000	1.000		NA
2444042	2444043	SAM_2101	SAM_2100	recF		TRUE	0.988	3.000	0.209	1.000		NA
2444044	2444045	SAM_2099	SAM_2098			TRUE	0.999	2.000	0.872	0.004		NA
2444046	2444047	SAM_0122	SAM_0123	rpmB		TRUE	0.413	132.000	0.044	NA		NA
2444047	2444048	SAM_0123	SAM_0124			TRUE	0.976	33.000	0.567	NA		NA
2444048	2444049	SAM_0124	SAM_0125			TRUE	0.268	148.000	0.006	1.000		NA
2444050	2444051	SAM_0126	SAM_0127			FALSE	0.019	368.000	0.000	NA		NA
2444052	2444053	SAM_0128	SAM_0129			FALSE	0.060	195.000	0.000	NA		NA
2444054	2444055	SAM_0130	SAM_0131	glnQ	glnP	TRUE	0.998	10.000	0.758	1.000	Y	NA
2444056	2444057	SAM_0132	SAM_0133			TRUE	0.851	46.000	0.118	NA		NA
2444057	2444058	SAM_0133	SAM_0134			TRUE	0.302	192.000	0.132	NA	N	NA
2444060	2444061	SAM_0136	SAM_0137			FALSE	0.246	165.000	0.013	1.000	N	NA
2444061	2444062	SAM_0137	SAM_0138			TRUE	0.959	37.000	0.139	1.000	Y	NA
2444062	2444063	SAM_0138	SAM_0139			TRUE	0.996	2.000	0.606	1.000	N	NA
2444063	2444064	SAM_0139	SAM_0140		nifU	TRUE	0.978	-13.000	0.292	1.000	N	NA
2444064	2444065	SAM_0140	SAM_0141	nifU		TRUE	0.839	100.000	0.152	0.001	N	NA
2444066	2444067	SAM_0142	SAM_0143	pbp4		TRUE	0.875	153.000	0.231	0.002	Y	NA
2444068	2444069	SAM_0144	SAM_0145		oppB	TRUE	0.616	119.000	0.000	0.039	Y	NA
2444069	2444070	SAM_0145	SAM_0146	oppB	oppC-1	TRUE	0.991	10.000	0.134	0.039		NA
2444070	2444071	SAM_0146	SAM_0147	oppC-1		TRUE	0.990	13.000	0.286	1.000		NA
2444071	2444072	SAM_0147	SAM_0148		oppF	TRUE	0.999	0.000	0.619	0.001	Y	NA
2444073	2444074	SAM_1999	SAM_1998		nrdD	TRUE	0.469	125.000	0.057	NA		NA
2444074	2444075	SAM_1998	SAM_1997	nrdD		TRUE	0.584	75.000	0.062	NA		NA
2444075	2444076	SAM_1997	SAM_1996			TRUE	0.966	13.000	0.041	NA		NA
2444076	2444077	SAM_1996	SAM_1995			TRUE	0.972	9.000	0.041	1.000		NA
2444077	2444078	SAM_1995	SAM_1994		nrdG	TRUE	0.734	73.000	0.159	1.000		NA
2444079	2444080	SAM_1993	SAM_1992			TRUE	0.403	82.000	0.007	NA		NA
2444081	2444082	SAM_1991	SAM_1990			FALSE	0.014	465.000	0.000	NA		NA
2444082	2444083	SAM_1990	SAM_1989			FALSE	0.137	139.000	0.000	NA		NA
2444083	2444084	SAM_1989	SAM_1988			TRUE	0.984	5.000	0.143	1.000		NA
2444084	2444085	SAM_1988	SAM_1987		groES	FALSE	0.226	175.000	0.020	1.000		NA
2444085	2444086	SAM_1987	SAM_1986	groES		TRUE	0.831	96.000	0.032	0.006	Y	NA
2444088	2444089	SAM_1984	SAM_1983	udp		TRUE	0.931	21.000	0.015	1.000		NA
2444089	2444090	SAM_1983	SAM_1982			TRUE	0.994	-7.000	0.333	0.001		NA
2444090	2444091	SAM_1982	SAM_1981		deoC	TRUE	0.986	30.000	0.333	1.000	Y	NA
2444091	2444092	SAM_1981	SAM_1980	deoC	deoB	TRUE	0.560	67.000	0.000	0.043	N	NA
2444092	2444093	SAM_1980	SAM_1979	deoB		FALSE	0.085	170.000	0.000	NA		NA
2444095	2444096	SAM_1977	SAM_1976		rpmG	TRUE	0.849	49.000	0.111	1.000	N	NA
2444096	2444097	SAM_1976	SAM_1975	rpmG		TRUE	0.892	36.000	0.080	1.000	N	NA
2444097	2444098	SAM_1975	SAM_1974			FALSE	0.029	311.000	0.000	1.000		NA
2444098	2444099	SAM_1974	SAM_1973			TRUE	0.735	-22.000	0.000	1.000		NA
2444099	2444100	SAM_1973	SAM_1972		nusG	FALSE	0.063	206.000	0.000	1.000		NA
2444100	2444101	SAM_1972	SAM_1971	nusG		FALSE	0.167	138.000	0.000	1.000		NA
2444102	2444103	SAM_1899	SAM_1898			TRUE	0.949	54.000	0.610	1.000		NA
2444103	2444104	SAM_1898	SAM_1897		agrA	FALSE	0.029	312.000	0.000	1.000		NA
2444104	2444105	SAM_1897	SAM_1896	agrA		TRUE	0.996	-3.000	0.444	1.000	Y	NA
2444107	2444108	SAM_1894	SAM_1893			TRUE	0.895	6.000	0.000	NA		NA
2444110	2444111	SAM_1891	SAM_1890			FALSE	0.034	247.000	0.000	NA		NA
2444111	2444112	SAM_1890	SAM_1889			TRUE	0.999	18.000	0.786	0.016	Y	NA
2444112	2444113	SAM_1889	SAM_1888			TRUE	0.999	16.000	0.778	0.019	Y	NA
2444113	2444114	SAM_1888	SAM_1887			TRUE	0.999	-3.000	0.778	0.019	Y	NA
2444114	2444115	SAM_1887	SAM_1886			TRUE	0.756	138.000	0.222	0.060	N	NA
2444115	2444116	SAM_1886	SAM_1885			TRUE	0.997	4.000	0.500	0.014		NA
2444116	2444117	SAM_1885	SAM_1884			TRUE	0.995	12.000	0.571	1.000		NA
2444118	2444119	SAM_1883	SAM_1882			TRUE	0.958	0.000	0.018	NA		NA
2444119	2444120	SAM_1882	SAM_1881		nrdI	TRUE	0.965	11.000	0.027	NA	N	NA
2444120	2444121	SAM_1881	SAM_1880	nrdI	cpdB	TRUE	0.463	157.000	0.022	NA	Y	NA
2444122	2444123	SAM_1879	SAM_1878	relA	dtd	TRUE	0.987	10.000	0.177	1.000	N	NA
2444123	2444124	SAM_1878	SAM_1877	dtd		FALSE	0.042	255.000	0.000	1.000	N	NA
2444124	2444125	SAM_1877	SAM_1876			TRUE	0.737	27.000	0.000	NA		NA
2444127	2444128	SAM_1595	SAM_1596	brnQ		TRUE	0.456	114.000	0.000	1.000	Y	NA
2444129	2444130	SAM_1597	SAM_1598			TRUE	0.999	-3.000	0.938	1.000	Y	NA
2444130	2444131	SAM_1598	SAM_1599			TRUE	0.870	-7.000	0.000	1.000	N	NA
2444131	2444132	SAM_1599	SAM_1600			FALSE	0.167	134.000	0.000	NA	N	NA
2444132	2444133	SAM_1600	SAM_1601			FALSE	0.146	141.000	0.000	NA	N	NA
2444133	2444134	SAM_1601	SAM_1602			FALSE	0.229	102.000	0.000	1.000		NA
2444134	2444135	SAM_1602	SAM_1603			TRUE	0.850	-6.000	0.000	NA		NA
2444135	2444136	SAM_1603	SAM_1604			TRUE	0.469	48.000	0.000	NA		NA
2444136	2444137	SAM_1604	SAM_1605			FALSE	0.213	118.000	0.000	1.000		NA
2444137	2444138	SAM_1605	SAM_1606			TRUE	0.996	10.000	0.625	1.000		NA
2444139	2444140	SAM_1607	SAM_1608			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444140	2444141	SAM_1608	SAM_1609			TRUE	0.989	38.000	0.316	0.002	Y	NA
2444141	2444142	SAM_1609	SAM_1610			TRUE	0.979	0.000	0.099	1.000		NA
2444142	2444143	SAM_1610	SAM_1611			TRUE	0.998	10.000	0.857	0.060		NA
2444144	2444145	SAM_1612	SAM_1613			TRUE	0.320	139.000	0.000	0.049	N	NA
2444145	2444146	SAM_1613	SAM_1614			TRUE	0.426	93.000	0.023	NA		NA
2444146	2444147	SAM_1614	SAM_1615			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444147	2444148	SAM_1615	SAM_1616			TRUE	0.790	23.000	0.000	NA		NA
2444148	2444149	SAM_1616	SAM_1617			TRUE	0.682	66.000	0.085	NA		NA
2444149	2444150	SAM_1617	SAM_1618			TRUE	0.950	2.000	0.008	NA		NA
2444150	2444151	SAM_1618	SAM_1619			TRUE	0.651	63.000	0.024	1.000	N	NA
2444151	2444152	SAM_1619	SAM_1620		nadD	TRUE	0.993	-3.000	0.199	1.000	Y	NA
2444152	2444153	SAM_1620	SAM_1621	nadD		TRUE	0.588	130.000	0.150	NA	N	NA
2444153	2444154	SAM_1621	SAM_1622			TRUE	0.524	93.000	0.068	NA		NA
2444154	2444155	SAM_1622	SAM_1623		yqeG	TRUE	0.995	0.000	0.555	1.000		NA
2444155	2444156	SAM_1623	SAM_1624	yqeG		TRUE	0.418	111.000	0.015	1.000		NA
2444156	2444157	SAM_1624	SAM_1625		gatB	FALSE	0.212	157.000	0.002	1.000		NA
2444157	2444158	SAM_1625	SAM_1626	gatB	gatA	TRUE	0.999	0.000	0.492	0.001	Y	NA
2444158	2444159	SAM_1626	SAM_1627	gatA	gatC	TRUE	0.999	0.000	0.643	0.001	Y	NA
2444159	2444160	SAM_1627	SAM_1628	gatC	ppdK	TRUE	0.281	138.000	0.002	1.000		NA
2444162	2444163	SAM_1568	SAM_1569			TRUE	0.990	24.000	0.125	0.038	Y	NA
2444163	2444164	SAM_1569	SAM_1570		nylA	FALSE	0.126	161.000	0.000	1.000	N	NA
2444164	2444165	SAM_1570	SAM_1571	nylA		FALSE	0.245	104.000	0.000	1.000	N	NA
2444165	2444166	SAM_1571	SAM_1572			TRUE	0.642	73.000	0.079	1.000		NA
2444166	2444167	SAM_1572	SAM_1573			TRUE	0.635	87.000	0.120	1.000		NA
2444167	2444168	SAM_1573	SAM_1574		murC	TRUE	0.455	86.000	0.014	1.000		NA
2444168	2444169	SAM_1574	SAM_1575	murC		TRUE	0.955	10.000	0.013	NA		NA
2444169	2444170	SAM_1575	SAM_1576			TRUE	0.894	5.000	0.000	NA		NA
2444170	2444171	SAM_1576	SAM_1577			TRUE	0.332	63.000	0.000	NA		NA
2444171	2444172	SAM_1577	SAM_1578			FALSE	0.230	155.000	0.004	1.000		NA
2444174	2444175	SAM_1580	SAM_1581			TRUE	0.998	-3.000	0.817	NA	Y	NA
2444175	2444176	SAM_1581	SAM_1582			TRUE	0.979	0.000	0.109	NA	N	NA
2444176	2444177	SAM_1582	SAM_1583			FALSE	0.252	149.000	0.007	NA	N	NA
2444177	2444178	SAM_1583	SAM_1584			TRUE	0.996	-10.000	0.438	0.075	Y	NA
2444178	2444179	SAM_1584	SAM_1585			FALSE	0.103	235.000	0.014	NA		NA
2444179	2444180	SAM_1585	SAM_1586			FALSE	0.137	180.000	0.002	NA		NA
2444180	2444181	SAM_1586	SAM_1587			TRUE	0.975	21.000	0.222	NA		NA
2444182	2444183	SAM_1588	SAM_1589	gidB	ktrB	TRUE	0.951	15.000	0.006	1.000	N	NA
2444183	2444184	SAM_1589	SAM_1590	ktrB	ktrA	TRUE	0.999	13.000	0.490	0.004	Y	NA
2444185	2444186	SAM_1591	SAM_1592			TRUE	0.991	-7.000	0.530	1.000		NA
2444186	2444187	SAM_1592	SAM_1593			TRUE	0.989	17.000	0.435	NA		NA
2444188	2444189	SAM_1900	SAM_1901	hpkA	drrA	TRUE	0.984	-7.000	0.075	1.000	Y	NA
2444189	2444190	SAM_1901	SAM_1902	drrA		TRUE	0.992	0.000	0.429	NA	N	NA
2444190	2444191	SAM_1902	SAM_1903		pstB	TRUE	0.993	-3.000	0.203	NA	Y	NA
2444191	2444192	SAM_1903	SAM_1904	pstB	pstA	TRUE	0.998	-7.000	0.428	0.003	Y	NA
2444192	2444193	SAM_1904	SAM_1905	pstA	pstC	TRUE	0.998	2.000	0.219	0.003	Y	NA
2444193	2444194	SAM_1905	SAM_1906	pstC		TRUE	0.893	15.000	0.000	1.000		NA
2444194	2444195	SAM_1906	SAM_1907			FALSE	0.057	201.000	0.000	NA		NA
2444195	2444196	SAM_1907	SAM_1908			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444196	2444197	SAM_1908	SAM_1909		prmA	TRUE	0.987	0.000	0.227	NA		NA
2444197	2444198	SAM_1909	SAM_1910	prmA		TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444200	2444201	SAM_1912	SAM_1913			TRUE	0.897	-28.000	0.048	1.000		NA
2444201	2444202	SAM_1913	SAM_1914			TRUE	0.951	-7.000	0.048	NA		NA
2444202	2444203	SAM_1914	SAM_1915			TRUE	0.852	43.000	0.100	NA		NA
2444203	2444204	SAM_1915	SAM_1916			FALSE	0.249	74.000	0.000	NA		NA
2444204	2444205	SAM_1916	SAM_1917			TRUE	0.615	-81.000	0.000	NA		NA
2444205	2444206	SAM_1917	SAM_1918			TRUE	0.892	3.000	0.000	NA		NA
2444207	2444208	SAM_1919	SAM_1920			TRUE	0.959	-7.000	0.047	1.000	N	NA
2444209	2444210	SAM_1921	SAM_1922			TRUE	0.741	-16.000	0.000	NA		NA
2444210	2444211	SAM_1922	SAM_1923			TRUE	0.994	-12.000	1.000	NA		NA
2444211	2444212	SAM_1923	SAM_1924			TRUE	0.888	0.000	0.000	NA		NA
2444212	2444213	SAM_1924	SAM_1925			TRUE	0.890	2.000	0.000	NA		NA
2444214	2444215	SAM_1926	SAM_1927			FALSE	0.018	375.000	0.000	NA		NA
2444215	2444216	SAM_1927	SAM_1928			FALSE	0.193	107.000	0.000	NA		NA
2444216	2444217	SAM_1928	SAM_1929			FALSE	0.019	358.000	0.000	NA		NA
2444217	2444218	SAM_1929	SAM_1930			FALSE	0.197	101.000	0.000	NA		NA
2444218	2444219	SAM_1930	SAM_1931			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444219	2444220	SAM_1931	SAM_1932			FALSE	0.074	178.000	0.000	NA		NA
2444220	2444221	SAM_1932	SAM_1933			TRUE	0.766	25.000	0.000	NA		NA
2444221	2444222	SAM_1933	SAM_1934			FALSE	0.200	90.000	0.000	NA		NA
2444222	2444223	SAM_1934	SAM_1935			FALSE	0.033	250.000	0.000	NA		NA
2444223	2444224	SAM_1935	SAM_1936			TRUE	0.982	33.000	0.750	NA		NA
2444225	2444226	SAM_1937	SAM_1938			FALSE	0.073	179.000	0.000	NA		NA
2444226	2444227	SAM_1938	SAM_1939			FALSE	0.015	442.000	0.000	NA		NA
2444227	2444228	SAM_1939	SAM_1940			TRUE	0.983	-13.000	0.486	NA		NA
2444228	2444229	SAM_1940	SAM_1941			FALSE	0.016	522.000	0.000	1.000		NA
2444230	2444231	SAM_1009	SAM_1008			TRUE	0.846	34.000	0.033	NA		NA
2444231	2444232	SAM_1008	SAM_1007			TRUE	0.968	13.000	0.049	NA		NA
2444232	2444233	SAM_1007	SAM_1006		truB	FALSE	0.189	131.000	0.000	1.000		NA
2444233	2444234	SAM_1006	SAM_1005	truB	ribF	TRUE	0.991	13.000	0.308	1.000	N	NA
2444234	2444235	SAM_1005	SAM_1004	ribF		TRUE	0.792	43.000	0.017	1.000	N	NA
2444235	2444236	SAM_1004	SAM_1003			TRUE	0.937	-28.000	0.169	NA		NA
2444236	2444237	SAM_1003	SAM_1002			TRUE	0.981	-10.000	0.337	NA		NA
2444237	2444238	SAM_1002	SAM_1001			TRUE	0.283	68.000	0.000	NA		NA
2444238	2444239	SAM_1001	SAM_1000			FALSE	0.071	183.000	0.000	NA		NA
2444239	2444240	SAM_1000	SAM_0999		pstC	TRUE	0.956	46.000	0.206	1.000	Y	NA
2444240	2444241	SAM_0999	SAM_0997	pstC	pstA	TRUE	0.999	-10.000	0.907	0.003	Y	NA
2444243	2444244	SAM_0996	SAM_0995	pstB	pstB	TRUE	0.859	213.000	0.542	0.001	Y	NA
2444244	2444245	SAM_0995	SAM_0994	pstB		TRUE	0.982	34.000	0.413	NA	Y	NA
2444245	2444246	SAM_0994	SAM_0993			TRUE	0.404	146.000	0.067	NA	N	NA
2444246	2444247	SAM_0993	SAM_0992			TRUE	0.352	162.000	0.061	1.000	N	NA
2444247	2444248	SAM_0992	SAM_0991			TRUE	0.994	-16.000	0.606	1.000	Y	NA
2444248	2444249	SAM_0991	SAM_0990			FALSE	0.216	113.000	0.000	1.000		NA
2444249	2444250	SAM_0990	SAM_0989		ffh	TRUE	0.977	18.000	0.151	1.000		NA
2444250	2444251	SAM_0989	SAM_0988	ffh		TRUE	0.454	67.000	0.002	NA		NA
2444251	2444252	SAM_0988	SAM_0987			TRUE	0.976	-10.000	0.250	NA		NA
2444255	2444256	SAM_0984	SAM_0983			TRUE	0.998	-3.000	0.812	1.000	Y	NA
2444257	2444258	SAM_1782	SAM_1783			FALSE	0.043	246.000	0.000	1.000		NA
2444258	2444259	SAM_1783	SAM_1784			TRUE	0.994	19.000	0.177	0.074	Y	NA
2444259	2444260	SAM_1784	SAM_1785		xfp	FALSE	0.020	444.000	0.000	1.000	N	NA
2444260	2444261	SAM_1785	SAM_1786	xfp		FALSE	0.200	90.000	0.000	NA		NA
2444261	2444262	SAM_1786	SAM_1787			FALSE	0.188	317.000	0.231	NA		NA
2444262	2444263	SAM_1787	SAM_1788			FALSE	0.141	138.000	0.000	NA		NA
2444263	2444264	SAM_1788	SAM_1789		gntK	TRUE	0.941	20.000	0.035	NA		NA
2444264	2444265	SAM_1789	SAM_1790	gntK		TRUE	0.350	66.000	0.000	1.000		NA
2444265	2444266	SAM_1790	SAM_1791			TRUE	0.969	22.000	0.154	1.000		NA
2444266	2444267	SAM_1791	SAM_1792			TRUE	0.647	98.000	0.133	1.000	N	NA
2444267	2444268	SAM_1792	SAM_1793			TRUE	0.972	19.000	0.133	1.000		NA
2444268	2444269	SAM_1793	SAM_1794			FALSE	0.050	235.000	0.000	1.000		NA
2444269	2444270	SAM_1794	SAM_1795			FALSE	0.120	164.000	0.000	1.000	N	NA
2444270	2444271	SAM_1795	SAM_1796			TRUE	0.968	11.000	0.000	1.000	Y	NA
2444271	2444272	SAM_1796	SAM_1797			TRUE	0.998	2.000	0.700	1.000	Y	NA
2444272	2444273	SAM_1797	SAM_1798			TRUE	0.998	4.000	0.536	1.000	Y	NA
2444273	2444274	SAM_1798	SAM_1799			TRUE	0.873	113.000	0.328	1.000	Y	NA
2444274	2444275	SAM_1799	SAM_1800			TRUE	0.958	67.000	0.279	0.011	Y	NA
2444275	2444276	SAM_1800	SAM_1801			TRUE	0.989	28.000	0.431	0.016		NA
2444276	2444277	SAM_1801	SAM_1802			FALSE	0.087	168.000	0.000	NA		NA
2444279	2444280	SAM_0077	SAM_0078			TRUE	0.812	-9.000	0.000	NA		NA
2444280	2444281	SAM_0078	SAM_0079			FALSE	0.263	70.000	0.000	NA		NA
2444281	2444282	SAM_0079	SAM_0080			FALSE	0.010	915.000	0.000	NA		NA
2444282	2444283	SAM_0080	SAM_0081			FALSE	0.045	220.000	0.000	NA		NA
2444285	2444286	SAM_0083	SAM_0084			FALSE	0.211	122.000	0.000	1.000		NA
2444286	2444287	SAM_0084	SAM_0085			TRUE	0.984	-3.000	0.174	1.000	N	NA
2444287	2444288	SAM_0085	SAM_0086			TRUE	0.984	-3.000	0.174	1.000	N	NA
2444288	2444289	SAM_0086	SAM_0087		hrcA	TRUE	0.424	95.000	0.009	1.000	N	NA
2444289	2444290	SAM_0087	SAM_0088	hrcA	grpE	TRUE	0.975	3.000	0.051	1.000	N	NA
2444290	2444291	SAM_0088	SAM_0089	grpE		TRUE	0.593	181.000	0.026	0.006	Y	NA
2444291	2444292	SAM_0089	SAM_0090			TRUE	0.573	289.000	0.196	0.003	Y	NA
2444292	2444293	SAM_0090	SAM_0091			FALSE	0.232	114.000	0.000	1.000	N	NA
2444293	2444294	SAM_0091	SAM_0092		truA	TRUE	0.319	71.000	0.000	1.000	N	NA
2444294	2444295	SAM_0092	SAM_0093	truA		TRUE	0.903	-37.000	0.058	1.000	N	NA
2444295	2444296	SAM_0093	SAM_0094			TRUE	0.989	10.000	0.276	NA		NA
2444296	2444297	SAM_0094	SAM_0095			TRUE	0.979	-3.000	0.149	NA		NA
2444299	2444300	SAM_0097	SAM_0098	tig		FALSE	0.152	189.000	0.005	1.000		NA
2444300	2444301	SAM_0098	SAM_0099			TRUE	0.860	-81.000	0.000	0.003		NA
2444301	2444302	SAM_0099	SAM_0100		pyrG	FALSE	0.036	273.000	0.000	1.000		NA
2444302	2444303	SAM_0100	SAM_0101	pyrG		TRUE	0.335	109.000	0.002	NA	N	NA
2444304	2444305	SAM_2137	SAM_2138			TRUE	0.966	-3.000	0.057	NA		NA
2444305	2444306	SAM_2138	SAM_2139			TRUE	0.425	52.000	0.000	NA		NA
2444306	2444307	SAM_2139	SAM_2140			FALSE	0.021	343.000	0.000	NA		NA
2444307	2444308	SAM_2140	SAM_2141			TRUE	0.879	66.000	0.125	0.002		NA
2444308	2444309	SAM_2141	SAM_2142			FALSE	0.013	716.000	0.000	1.000		NA
2444309	2444310	SAM_2142	SAM_2143		metK	TRUE	0.667	-67.000	0.000	1.000		NA
2444310	2444311	SAM_2143	SAM_2144	metK		TRUE	0.469	48.000	0.000	NA		NA
2444311	2444312	SAM_2144	SAM_2145			FALSE	0.089	167.000	0.000	NA		NA
2444312	2444313	SAM_2145	SAM_2146			TRUE	0.978	-7.000	0.182	1.000		NA
2444313	2444314	SAM_2146	SAM_2147			TRUE	0.984	-19.000	0.636	NA		NA
2444314	2444315	SAM_2147	SAM_2148			FALSE	0.103	303.000	0.067	NA		NA
2444316	2444317	SAM_2149	SAM_2150			TRUE	0.681	-25.000	0.000	NA		NA
2444317	2444318	SAM_2150	SAM_2151			TRUE	0.977	-7.000	0.200	NA		NA
2444318	2444319	SAM_2151	SAM_2152			TRUE	0.977	5.000	0.095	NA		NA
2444319	2444320	SAM_2152	SAM_2153			TRUE	0.852	17.000	0.000	NA		NA
2444320	2444321	SAM_2153	SAM_2154			TRUE	0.450	50.000	0.000	NA		NA
2444323	2444324	SAM_2156	SAM_2157			TRUE	0.603	-112.000	0.000	NA		NA
2444325	2444326	SAM_2158	SAM_2159			FALSE	0.039	239.000	0.000	NA		NA
2444326	2444327	SAM_2159	SAM_2160			TRUE	0.770	-13.000	0.000	NA		NA
2444327	2444328	SAM_2160	SAM_2161			FALSE	0.029	313.000	0.000	1.000		NA
2444331	2444332	SAM_1346	SAM_1345		aroD	TRUE	0.962	21.000	0.125	NA		NA
2444332	2444333	SAM_1345	SAM_1344	aroD	aroB	TRUE	0.705	94.000	0.000	0.002	Y	NA
2444333	2444334	SAM_1344	SAM_1343	aroB	aroC	TRUE	0.996	1.000	0.110	0.002	Y	NA
2444334	2444335	SAM_1343	SAM_1342	aroC		TRUE	0.381	84.000	0.005	NA		NA
2444335	2444336	SAM_1342	SAM_1341			FALSE	0.174	175.000	0.010	NA		NA
2444338	2444339	SAM_1339	SAM_1338		thiI	TRUE	0.890	62.000	0.349	1.000	N	NA
2444339	2444340	SAM_1338	SAM_1337	thiI		TRUE	0.446	102.000	0.014	1.000	N	NA
2444342	2444343	SAM_1335	SAM_1334		rpmA	TRUE	0.987	22.000	0.203	NA	Y	NA
2444343	2444344	SAM_1334	SAM_1333	rpmA		FALSE	0.061	216.000	0.000	1.000	N	NA
2444344	2444345	SAM_1333	SAM_1332		lspA	TRUE	0.983	9.000	0.119	1.000	N	NA
2444345	2444346	SAM_1332	SAM_1331	lspA	rluD	TRUE	0.942	-16.000	0.082	1.000	N	NA
2444346	2444347	SAM_1331	SAM_1330	rluD		FALSE	0.197	176.000	0.008	1.000	N	NA
2444347	2444348	SAM_1330	SAM_1329		carA	TRUE	0.759	49.000	0.000	1.000	Y	NA
2444348	2444349	SAM_1329	SAM_1328	carA		TRUE	0.840	56.000	0.013	0.002		NA
2444349	2444350	SAM_1328	SAM_1327			FALSE	0.060	209.000	0.000	1.000		NA
2444351	2444352	SAM_1752	SAM_1753	fusA		TRUE	0.809	40.000	0.000	0.013		NA
2444352	2444353	SAM_1753	SAM_1754		rpsG	FALSE	0.128	155.000	0.000	1.000		NA
2444353	2444354	SAM_1754	SAM_1755	rpsG	rpsL	TRUE	0.995	22.000	0.224	0.004	Y	NA
2444354	2444355	SAM_1755	SAM_1756	rpsL	purR	FALSE	0.059	219.000	0.000	1.000	N	NA
2444355	2444356	SAM_1756	SAM_1757	purR		TRUE	0.529	97.000	0.052	1.000		NA
2444356	2444357	SAM_1757	SAM_1758			TRUE	0.927	-10.000	0.030	NA		NA
2444357	2444358	SAM_1758	SAM_1759			TRUE	0.963	2.000	0.030	NA		NA
2444358	2444359	SAM_1759	SAM_1760		rpe	TRUE	0.978	-7.000	0.166	1.000	N	NA
2444359	2444360	SAM_1760	SAM_1761	rpe		TRUE	0.988	7.000	0.213	1.000		NA
2444360	2444361	SAM_1761	SAM_1762			FALSE	0.125	156.000	0.000	1.000		NA
2444361	2444362	SAM_1762	SAM_1763		ksgA	TRUE	0.911	4.000	0.000	1.000		NA
2444362	2444363	SAM_1763	SAM_1764	ksgA		TRUE	0.868	28.000	0.002	1.000	N	NA
2444363	2444364	SAM_1764	SAM_1765			TRUE	0.919	4.000	0.000	1.000	N	NA
2444364	2444365	SAM_1765	SAM_1766			TRUE	0.971	-13.000	0.058	NA	Y	NA
2444365	2444366	SAM_1766	SAM_1767			FALSE	0.187	110.000	0.000	NA		NA
2444366	2444367	SAM_1767	SAM_1768			TRUE	0.830	19.000	0.000	NA		NA
2444367	2444368	SAM_1768	SAM_1769			TRUE	0.812	-9.000	0.000	NA		NA
2444368	2444369	SAM_1769	SAM_1770			TRUE	0.888	0.000	0.000	NA		NA
2444369	2444370	SAM_1770	SAM_1771		dltD	FALSE	0.079	175.000	0.000	NA		NA
2444370	2444371	SAM_1771	SAM_1772	dltD	dltC	TRUE	0.987	-7.000	0.409	NA		NA
2444371	2444372	SAM_1772	SAM_1773	dltC		TRUE	0.990	15.000	0.387	NA		NA
2444372	2444373	SAM_1773	SAM_1774		dltA	TRUE	0.992	-3.000	0.435	NA	N	NA
2444373	2444374	SAM_1774	SAM_1775	dltA		FALSE	0.162	146.000	0.000	1.000	N	NA
2444374	2444375	SAM_1775	SAM_1776			TRUE	0.967	0.000	0.000	1.000	Y	NA
2444376	2444377	SAM_1696	SAM_1695			TRUE	0.958	18.000	0.043	1.000		NA
2444377	2444378	SAM_1695	SAM_1694			FALSE	0.214	190.000	0.031	1.000	N	NA
2444380	2444381	SAM_1692	SAM_1691			TRUE	0.969	-18.000	0.326	NA		NA
2444382	2444383	SAM_1690	SAM_1689		pfl	FALSE	0.230	100.000	0.000	1.000		NA
2444385	2444386	SAM_1687	SAM_1686			TRUE	0.470	113.000	0.050	NA		NA
2444386	2444387	SAM_1686	SAM_1685			TRUE	0.556	129.000	0.099	1.000	N	NA
2444387	2444388	SAM_1685	SAM_1684		rnhC	TRUE	0.972	16.000	0.080	1.000	N	NA
2444389	2444390	SAM_1683	SAM_1682		cvpA	TRUE	0.960	3.000	0.019	NA		NA
2444390	2444391	SAM_1682	SAM_1681	cvpA	mutS2	TRUE	0.585	85.000	0.070	1.000		NA
2444391	2444392	SAM_1681	SAM_1680	mutS2		TRUE	0.322	133.000	0.005	1.000		NA
2444392	2444393	SAM_1680	SAM_1679		trx	TRUE	0.580	81.000	0.053	1.000		NA
2444394	2444395	SAM_1678	SAM_1677		mutY	FALSE	0.172	177.000	0.002	1.000	N	NA
2444396	2444397	SAM_0102	SAM_0103	dut	radA	TRUE	0.276	162.000	0.028	1.000		NA
2444397	2444398	SAM_0103	SAM_0104	radA		TRUE	0.338	136.000	0.009	1.000	N	NA
2444398	2444399	SAM_0104	SAM_0105		lpdA-1	FALSE	0.142	154.000	0.000	1.000	N	NA
2444399	2444400	SAM_0105	SAM_0106	lpdA-1	gltX	FALSE	0.057	227.000	0.000	1.000	N	NA
2444401	2444402	SAM_0107	SAM_0108	rbsB	rbsC	TRUE	0.993	53.000	0.847	0.002	Y	NA
2444402	2444403	SAM_0108	SAM_0109	rbsC	rbsA	TRUE	0.998	11.000	0.358	0.002	Y	NA
2444403	2444404	SAM_0109	SAM_0110	rbsA	rbsD	TRUE	0.994	16.000	0.243	1.000	Y	NA
2444404	2444405	SAM_0110	SAM_0111	rbsD	rbsK	TRUE	0.977	-25.000	0.183	1.000	Y	NA
2444405	2444406	SAM_0111	SAM_0112	rbsK		TRUE	0.985	-7.000	0.281	1.000	N	NA
2444406	2444407	SAM_0112	SAM_0113			TRUE	0.375	58.000	0.000	NA		NA
2444408	2444409	SAM_0114	SAM_0115			TRUE	0.995	0.000	0.591	1.000	N	NA
2444409	2444410	SAM_0115	SAM_0116			TRUE	0.943	31.000	0.133	1.000	N	NA
2444410	2444411	SAM_0116	SAM_0117			TRUE	0.996	-7.000	0.500	1.000	Y	NA
2444411	2444412	SAM_0117	SAM_0118		argG	FALSE	0.142	154.000	0.000	1.000	N	NA
2444412	2444413	SAM_0118	SAM_0119	argG	argH	TRUE	0.992	19.000	0.278	1.000	Y	NA
2444413	2444414	SAM_0119	SAM_0120	argH	fba	FALSE	0.171	141.000	0.000	1.000	N	NA
2444416	2444417	SAM_1856	SAM_1857			FALSE	0.241	77.000	0.000	NA		NA
2444417	2444418	SAM_1857	SAM_1858		mae	FALSE	0.063	191.000	0.000	NA		NA
2444418	2444419	SAM_1858	SAM_1859	mae		TRUE	0.992	25.000	0.432	1.000	Y	NA
2444420	2444421	SAM_1860	SAM_1861			TRUE	0.993	2.000	0.154	1.000	Y	NA
2444422	2444423	SAM_1862	SAM_1863	galE	malA	FALSE	0.258	88.000	0.000	1.000	N	NA
2444423	2444424	SAM_1863	SAM_1864	malA		TRUE	0.794	129.000	0.171	1.000	Y	NA
2444424	2444425	SAM_1864	SAM_1865			TRUE	0.573	101.000	0.071	1.000	N	NA
2444425	2444426	SAM_1865	SAM_1866			FALSE	0.248	95.000	0.000	1.000	N	NA
2444426	2444427	SAM_1866	SAM_1867		lacD	TRUE	0.718	54.000	0.000	1.000	Y	NA
2444427	2444428	SAM_1867	SAM_1868	lacD	lacC	TRUE	0.988	2.000	0.000	0.001	Y	NA
2444428	2444429	SAM_1868	SAM_1869	lacC	lacB	TRUE	0.968	11.000	0.000	1.000	Y	NA
2444429	2444430	SAM_1869	SAM_1870	lacB	lacA	TRUE	0.978	21.000	0.000	0.001	Y	NA
2444430	2444431	SAM_1870	SAM_1871	lacA		FALSE	0.042	247.000	0.000	1.000		NA
2444431	2444432	SAM_1871	SAM_1872			FALSE	0.045	241.000	0.000	1.000		NA
2444432	2444433	SAM_1872	SAM_1873			TRUE	0.912	40.000	0.000	0.015	Y	NA
2444433	2444434	SAM_1873	SAM_1874			TRUE	0.998	2.000	0.429	0.011	Y	NA
2444435	2444436	SAM_1966	SAM_1967	leuS		TRUE	0.591	-286.000	0.000	NA		NA
2444437	2444438	SAM_1965	SAM_1964			TRUE	0.664	-28.000	0.000	NA		NA
2444438	2444439	SAM_1964	SAM_1963			TRUE	0.490	93.000	0.049	NA		NA
2444439	2444440	SAM_1963	SAM_1962			TRUE	0.998	-3.000	0.889	1.000	Y	NA
2444440	2444441	SAM_1962	SAM_1961			FALSE	0.056	233.000	0.000	1.000	N	NA
2444444	2444445	SAM_1958	SAM_1957		metE	FALSE	0.019	370.000	0.000	NA		NA
2444445	2444446	SAM_1957	SAM_1956	metE		TRUE	0.903	45.000	0.030	1.000	Y	NA
2444446	2444447	SAM_1956	SAM_1955			FALSE	0.020	347.000	0.000	NA		NA
2444448	2444449	SAM_1954	SAM_1953			FALSE	0.074	201.000	0.000	1.000	N	NA
2444450	2444451	SAM_1186	SAM_1185			TRUE	0.894	4.000	0.000	NA		NA
2444451	2444452	SAM_1185	SAM_1184			TRUE	0.833	-7.000	0.000	NA		NA
2444452	2444453	SAM_1184	SAM_1183			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444453	2444454	SAM_1183	SAM_1182			TRUE	0.963	-3.000	0.033	1.000		NA
2444454	2444455	SAM_1182	SAM_1181			TRUE	0.906	0.000	0.000	1.000		NA
2444455	2444456	SAM_1181	SAM_1180			TRUE	0.943	77.000	0.549	1.000	Y	NA
2444456	2444457	SAM_1180	SAM_1179			TRUE	0.954	-3.000	0.013	1.000		NA
2444457	2444458	SAM_1179	SAM_1178			TRUE	0.961	11.000	0.013	1.000		NA
2444458	2444459	SAM_1178	SAM_1177			FALSE	0.184	114.000	0.000	NA		NA
2444459	2444460	SAM_1177	SAM_1176		ung	FALSE	0.198	99.000	0.000	NA		NA
2444462	2444463	SAM_1174	SAM_1173	parE	parC	TRUE	0.956	134.000	0.552	0.002	Y	NA
2444463	2444464	SAM_1173	SAM_1172	parC	ilvE	TRUE	0.570	113.000	0.086	1.000	N	NA
2444464	2444465	SAM_1172	SAM_1171	ilvE		TRUE	0.595	83.000	0.095	NA		NA
2444465	2444466	SAM_1171	SAM_1170			FALSE	0.126	146.000	0.000	NA		NA
2444467	2444468	SAM_1207	SAM_1206			TRUE	0.997	0.000	0.895	NA		NA
2444468	2444469	SAM_1206	SAM_1205			FALSE	0.088	296.000	0.026	1.000		NA
2444469	2444470	SAM_1205	SAM_1204			TRUE	0.982	3.000	0.143	NA		NA
2444470	2444471	SAM_1204	SAM_1203			TRUE	0.906	33.000	0.100	NA		NA
2444471	2444472	SAM_1203	SAM_1202			TRUE	0.696	90.000	0.217	NA		NA
2444472	2444473	SAM_1202	SAM_1201		rpiA	FALSE	0.052	238.000	0.000	1.000	N	NA
2444473	2444474	SAM_1201	SAM_1200	rpiA	deoB	TRUE	0.835	57.000	0.018	1.000	Y	NA
2444474	2444475	SAM_1200	SAM_1199	deoB	arsC	TRUE	0.837	51.000	0.108	1.000	N	NA
2444475	2444476	SAM_1199	SAM_1198	arsC		TRUE	0.895	39.000	0.108	1.000	N	NA
2444476	2444477	SAM_1198	SAM_1197			TRUE	0.266	86.000	0.000	1.000	N	NA
2444477	2444478	SAM_1197	SAM_1196		deoD	TRUE	0.916	-16.000	0.027	1.000	N	NA
2444478	2444479	SAM_1196	SAM_1195	deoD		TRUE	0.978	9.000	0.107	NA		NA
2444481	2444482	SAM_1193	SAM_1192			TRUE	0.996	6.000	0.583	1.000	N	NA
2444482	2444483	SAM_1192	SAM_1191			TRUE	0.998	9.000	0.636	1.000	Y	NA
2444483	2444484	SAM_1191	SAM_1190			TRUE	0.997	11.000	0.800	1.000	N	NA
2444484	2444485	SAM_1190	SAM_1189			TRUE	0.977	13.000	0.067	1.000	N	NA
2444487	2444488	SAM_1261	SAM_1260			TRUE	0.428	85.000	0.000	0.052		NA
2444489	2444490	SAM_1259	SAM_1258			FALSE	0.013	536.000	0.000	NA		NA
2444490	2444491	SAM_1258	SAM_1257			TRUE	0.822	41.000	0.000	0.003		NA
2444491	2444492	SAM_1257	SAM_1256			FALSE	0.049	236.000	0.000	1.000		NA
2444492	2444493	SAM_1256	SAM_1255			TRUE	0.996	13.000	0.800	NA		NA
2444494	2444495	SAM_1254	SAM_1253			TRUE	0.876	32.000	0.000	0.009		NA
2444495	2444496	SAM_1253	SAM_1252			FALSE	0.101	158.000	0.000	NA		NA
2444496	2444497	SAM_1252	SAM_1251			FALSE	0.044	224.000	0.000	NA		NA
2444497	2444498	SAM_1251	SAM_1250			TRUE	0.922	108.000	0.667	0.052		NA
2444498	2444499	SAM_1250	SAM_1249			FALSE	0.065	189.000	0.000	NA		NA
2444500	2444501	SAM_0042	SAM_0043	adhP		TRUE	0.348	120.000	0.003	1.000		NA
2444501	2444502	SAM_0043	SAM_0044			FALSE	0.159	147.000	0.000	1.000	N	NA
2444502	2444503	SAM_0044	SAM_0045		rpsJ	FALSE	0.069	206.000	0.000	1.000	N	NA
2444503	2444504	SAM_0045	SAM_0046	rpsJ	rplC	TRUE	0.948	105.000	0.467	0.025	Y	NA
2444504	2444505	SAM_0046	SAM_0047	rplC	rplD	TRUE	0.997	24.000	0.544	0.019	Y	NA
2444505	2444506	SAM_0047	SAM_0048	rplD	rplW	TRUE	0.998	0.000	0.307	0.019	Y	NA
2444506	2444507	SAM_0048	SAM_0049	rplW	rplB	TRUE	0.999	18.000	0.849	0.023	Y	NA
2444507	2444508	SAM_0049	SAM_0050	rplB	rpsS	TRUE	0.973	99.000	0.820	0.025	Y	NA
2444508	2444509	SAM_0050	SAM_0051	rpsS	rplV	TRUE	0.999	16.000	0.769	0.025	Y	NA
2444509	2444510	SAM_0051	SAM_0052	rplV	rpsC	TRUE	0.994	40.000	0.719	0.025	Y	NA
2444510	2444511	SAM_0052	SAM_0053	rpsC	rplP	TRUE	0.999	4.000	0.828	0.025	Y	NA
2444513	2444514	SAM_0055	SAM_0056	rpmC	rpsQ	TRUE	0.998	26.000	0.828	0.019	Y	NA
2444514	2444515	SAM_0056	SAM_0057	rpsQ	rplN	TRUE	0.998	25.000	0.791	0.025	Y	NA
2444515	2444516	SAM_0057	SAM_0058	rplN	rplX	TRUE	0.977	80.000	0.810	0.025	Y	NA
2444516	2444517	SAM_0058	SAM_0059	rplX		TRUE	0.998	24.000	0.758	0.019	Y	NA
2444517	2444518	SAM_0059	SAM_0060		rpsN	TRUE	0.993	33.000	0.496	0.019	Y	NA
2444518	2444519	SAM_0060	SAM_0061	rpsN	rpsH	TRUE	0.906	155.000	0.473	0.019	Y	NA
2444519	2444520	SAM_0061	SAM_0062	rpsH	rplF	TRUE	0.971	110.000	0.808	0.019	Y	NA
2444520	2444521	SAM_0062	SAM_0063	rplF	rplR	TRUE	0.973	101.000	0.815	0.019	Y	NA
2444521	2444522	SAM_0063	SAM_0064	rplR	rpsE	TRUE	0.999	19.000	0.814	0.025	Y	NA
2444524	2444525	SAM_0066	SAM_0067	rpmD	rplO	TRUE	0.967	125.000	0.653	0.003	Y	NA
2444525	2444526	SAM_0067	SAM_0068	rplO		TRUE	0.993	21.000	0.730	1.000	N	NA
2444526	2444527	SAM_0068	SAM_0069			TRUE	0.733	95.000	0.241	1.000		NA
2444528	2444529	SAM_1841	SAM_1842			TRUE	0.983	17.000	0.197	1.000	N	NA
2444529	2444530	SAM_1842	SAM_1843			TRUE	0.975	26.000	0.094	1.000	Y	NA
2444530	2444531	SAM_1843	SAM_1844			TRUE	0.994	12.000	0.167	1.000	Y	NA
2444532	2444533	SAM_1845	SAM_1846			FALSE	0.183	133.000	0.000	1.000		NA
2444533	2444534	SAM_1846	SAM_1847		polC	TRUE	0.429	126.000	0.020	1.000	N	NA
2444534	2444535	SAM_1847	SAM_1848	polC		FALSE	0.226	123.000	0.000	1.000	N	NA
2444535	2444536	SAM_1848	SAM_1849		proS	FALSE	0.221	125.000	0.000	1.000	N	NA
2444536	2444537	SAM_1849	SAM_1850	proS		TRUE	0.600	92.000	0.095	1.000	N	NA
2444537	2444538	SAM_1850	SAM_1851		cdsA	TRUE	0.907	31.000	0.040	1.000	N	NA
2444538	2444539	SAM_1851	SAM_1852	cdsA	uppS	TRUE	0.990	15.000	0.113	1.000	Y	NA
2444539	2444540	SAM_1852	SAM_1853	uppS		FALSE	0.089	167.000	0.000	NA		NA
2444541	2444542	SAM_1236	SAM_1238			FALSE	0.191	135.000	0.000	1.000	N	NA
2444544	2444545	SAM_1239	SAM_1240			FALSE	0.103	169.000	0.000	1.000		NA
2444545	2444546	SAM_1240	SAM_1241			TRUE	0.883	15.000	0.000	NA	N	NA
2444546	2444547	SAM_1241	SAM_1242		pepV	TRUE	0.462	97.000	0.031	NA	N	NA
2444547	2444548	SAM_1242	SAM_1243	pepV		TRUE	0.898	47.000	0.179	1.000	N	NA
2444552	2444553	SAM_1247	SAM_1248			TRUE	0.986	-3.000	0.036	0.002		NA
2444554	2444555	SAM_0405	SAM_0406			TRUE	0.371	107.000	0.004	1.000		NA
2444555	2444556	SAM_0406	SAM_0407		bioY	TRUE	0.972	7.000	0.039	1.000		NA
2444556	2444557	SAM_0407	SAM_0408	bioY		TRUE	0.380	139.000	0.033	1.000		NA
2444557	2444558	SAM_0408	SAM_0409			TRUE	0.981	0.000	0.013	0.017		NA
2444558	2444559	SAM_0409	SAM_0410			FALSE	0.196	102.000	0.000	NA		NA
2444559	2444560	SAM_0410	SAM_0411		pgi	TRUE	0.594	36.000	0.000	NA		NA
2444560	2444561	SAM_0411	SAM_0412	pgi		FALSE	0.030	322.000	0.000	1.000	N	NA
2444561	2444562	SAM_0412	SAM_0413			TRUE	0.946	-9.000	0.037	1.000		NA
2444562	2444563	SAM_0413	SAM_0414		tmbC	FALSE	0.186	132.000	0.000	1.000		NA
2444564	2444565	SAM_0415	SAM_0416	galU		TRUE	0.848	37.000	0.032	1.000	N	NA
2444566	2444567	SAM_0417	SAM_0418	rnpA		TRUE	0.975	13.000	0.052	1.000	N	NA
2444567	2444568	SAM_0418	SAM_0419			TRUE	0.910	-58.000	0.106	1.000		NA
2444569	2444570	SAM_1748	SAM_1747	olpA	pgk	TRUE	0.296	135.000	0.003	1.000		NA
2444570	2444571	SAM_1747	SAM_1746	pgk		FALSE	0.060	263.000	0.002	NA		NA
2444571	2444572	SAM_1746	SAM_1745			TRUE	0.684	80.000	0.154	NA		NA
2444572	2444573	SAM_1745	SAM_1744		glnA	TRUE	0.939	34.000	0.179	1.000	N	NA
2444573	2444574	SAM_1744	SAM_1743	glnA		FALSE	0.122	148.000	0.000	NA		NA
2444575	2444576	SAM_1742	SAM_1741			TRUE	0.940	54.000	0.576	NA		NA
2444577	2444578	SAM_1740	SAM_1739		rimI	TRUE	0.988	2.000	0.209	1.000		NA
2444578	2444579	SAM_1739	SAM_1738	rimI	gcp	TRUE	0.543	76.000	0.030	1.000		NA
2444579	2444580	SAM_1738	SAM_1737	gcp		FALSE	0.230	118.000	0.000	1.000	N	NA
2444585	2444586	SAM_1555	SAM_1554			FALSE	0.211	175.000	0.014	1.000		NA
2444586	2444587	SAM_1554	SAM_1553			TRUE	0.956	-15.000	0.002	0.001		NA
2444587	2444588	SAM_1553	SAM_1552			TRUE	0.964	-3.000	0.034	1.000		NA
2444588	2444589	SAM_1552	SAM_1551			TRUE	0.868	-18.000	0.005	1.000		NA
2444589	2444590	SAM_1551	SAM_1550			TRUE	0.959	-3.000	0.034	NA		NA
2444590	2444591	SAM_1550	SAM_1549			TRUE	0.906	-49.000	0.111	NA		NA
2444591	2444592	SAM_1549	SAM_1548			TRUE	0.957	0.000	0.017	NA		NA
2444592	2444593	SAM_1548	SAM_1547			TRUE	0.994	-3.000	0.570	NA		NA
2444593	2444594	SAM_1547	SAM_1546		rluB	TRUE	0.975	-10.000	0.224	NA	N	NA
2444594	2444595	SAM_1546	SAM_1545	rluB		TRUE	0.961	0.000	0.014	1.000		NA
2444599	2444600	SAM_1541	SAM_1540			FALSE	0.106	173.000	0.000	1.000	N	NA
2444600	2444601	SAM_1540	SAM_1539			FALSE	0.187	136.000	0.000	1.000	N	NA
2444601	2444602	SAM_1539	SAM_1538			TRUE	0.358	111.000	0.004	1.000		NA
2444603	2444604	SAM_0528	SAM_0527		recN	TRUE	0.339	113.000	0.006	NA		NA
2444604	2444605	SAM_0527	SAM_0526	recN		TRUE	0.972	12.000	0.037	1.000	N	NA
2444605	2444606	SAM_0526	SAM_0525			TRUE	0.940	-13.000	0.048	1.000	N	NA
2444606	2444607	SAM_0525	SAM_0524		ispA	TRUE	0.962	-7.000	0.058	1.000	N	NA
2444607	2444608	SAM_0524	SAM_0523	ispA	xseB	TRUE	0.980	0.000	0.100	1.000	N	NA
2444608	2444609	SAM_0523	SAM_0522	xseB	xseA	TRUE	0.995	-22.000	0.412	0.001	Y	NA
2444609	2444610	SAM_0522	SAM_0521	xseA		TRUE	0.331	126.000	0.005	NA	N	NA
2444610	2444611	SAM_0521	SAM_0520		folD	TRUE	0.433	120.000	0.030	NA	N	NA
2444611	2444612	SAM_0520	SAM_0519	folD	manB	TRUE	0.339	139.000	0.013	1.000	N	NA
2444612	2444613	SAM_0519	SAM_0517	manB	glnQ	FALSE	0.038	278.000	0.000	1.000	N	NA
2444613	2444614	SAM_0517	SAM_0516	glnQ	glnP	TRUE	0.833	-7.000	0.000	NA		NA
2444615	2444616	SAM_1150	SAM_1151			TRUE	0.969	-6.000	0.111	NA		NA
2444616	2444617	SAM_1151	SAM_1152			TRUE	0.894	5.000	0.000	NA		NA
2444617	2444618	SAM_1152	SAM_1153			TRUE	0.500	164.000	0.238	NA		NA
2444618	2444619	SAM_1153	SAM_1154			TRUE	0.799	22.000	0.000	NA		NA
2444619	2444620	SAM_1154	SAM_1155			TRUE	0.484	47.000	0.000	NA		NA
2444620	2444621	SAM_1155	SAM_1156			TRUE	0.731	56.000	0.060	NA		NA
2444621	2444622	SAM_1156	SAM_1157			TRUE	0.982	10.000	0.143	NA		NA
2444622	2444623	SAM_1157	SAM_1158			TRUE	0.872	15.000	0.000	NA		NA
2444623	2444624	SAM_1158	SAM_1159			TRUE	0.700	48.000	0.000	0.056		NA
2444624	2444625	SAM_1159	SAM_1160		pcrA	FALSE	0.028	319.000	0.000	1.000		NA
2444625	2444626	SAM_1160	SAM_1161	pcrA		FALSE	0.210	106.000	0.000	NA	N	NA
2444626	2444627	SAM_1161	SAM_1162		uraA	FALSE	0.170	133.000	0.000	NA	N	NA
2444629	2444630	SAM_1653	SAM_1652			TRUE	0.905	68.000	0.235	1.000	Y	NA
2444630	2444631	SAM_1652	SAM_1651		manA	TRUE	0.874	118.000	0.333	1.000	Y	NA
2444631	2444632	SAM_1651	SAM_1650	manA	secA	TRUE	0.512	109.000	0.042	1.000	N	NA
2444632	2444633	SAM_1650	SAM_1649	secA	aroG	FALSE	0.218	126.000	0.000	1.000	N	NA
2444633	2444634	SAM_1649	SAM_1648	aroG	acpS	TRUE	0.814	25.000	0.000	1.000	N	NA
2444634	2444635	SAM_1648	SAM_1647	acpS	alr	TRUE	0.976	-3.000	0.093	1.000	N	NA
2444635	2444636	SAM_1647	SAM_1646	alr		FALSE	0.231	93.000	0.000	1.000		NA
2444636	2444637	SAM_1646	SAM_1645			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444638	2444639	SAM_0475	SAM_0474			TRUE	0.329	115.000	0.005	NA		NA
2444639	2444640	SAM_0474	SAM_0473			FALSE	0.193	160.000	0.005	NA		NA
2444640	2444641	SAM_0473	SAM_0472			TRUE	0.629	161.000	0.375	1.000		NA
2444643	2444644	SAM_0470	SAM_0469	valS		TRUE	0.950	0.000	0.008	NA		NA
2444644	2444645	SAM_0469	SAM_0468			TRUE	0.959	-3.000	0.033	NA		NA
2444645	2444646	SAM_0468	SAM_0467			TRUE	0.660	98.000	0.022	0.011		NA
2444646	2444647	SAM_0467	SAM_0466			FALSE	0.014	622.000	0.000	1.000		NA
2444648	2444649	SAM_0981	SAM_0980			TRUE	0.890	2.000	0.000	NA		NA
2444649	2444650	SAM_0980	SAM_0979			TRUE	0.919	26.000	0.033	1.000		NA
2444650	2444651	SAM_0979	SAM_0978			TRUE	0.613	69.000	0.000	0.001		NA
2444653	2444654	SAM_0976	SAM_0975			FALSE	0.156	133.000	0.000	NA		NA
2444654	2444655	SAM_0975	SAM_0974		gid	TRUE	0.276	78.000	0.000	1.000		NA
2444655	2444656	SAM_0974	SAM_0973	gid		FALSE	0.232	114.000	0.000	1.000	N	NA
2444659	2444660	SAM_1667	SAM_1666			TRUE	0.994	2.000	0.500	NA		NA
2444660	2444661	SAM_1666	SAM_1665		pepQ	FALSE	0.197	100.000	0.000	NA		NA
2444661	2444662	SAM_1665	SAM_1664	pepQ		TRUE	0.966	12.000	0.018	1.000	N	NA
2444662	2444663	SAM_1664	SAM_1663			FALSE	0.026	302.000	0.000	NA		NA
2444663	2444664	SAM_1663	SAM_1662			TRUE	0.726	28.000	0.000	NA		NA
2444664	2444665	SAM_1662	SAM_1661			FALSE	0.012	636.000	0.000	NA		NA
2444665	2444666	SAM_1661	SAM_1660			FALSE	0.028	284.000	0.000	NA		NA
2444666	2444667	SAM_1660	SAM_1659			FALSE	0.017	406.000	0.000	NA		NA
2444667	2444668	SAM_1659	SAM_1658		efp	FALSE	0.011	728.000	0.000	NA		NA
2444668	2444669	SAM_1658	SAM_1657	efp		TRUE	0.455	89.000	0.031	NA		NA
2444669	2444670	SAM_1657	SAM_1656		nusB	TRUE	0.982	-7.000	0.265	NA		NA
2444671	2444672	SAM_1655	SAM_1654		cscA	TRUE	0.995	2.000	0.571	1.000	N	NA
2444673	2444674	SAM_1629	SAM_1630			TRUE	0.972	13.000	0.065	NA		NA
2444674	2444675	SAM_1630	SAM_1631			TRUE	0.976	11.000	0.089	NA		NA
2444677	2444678	SAM_1633	SAM_1634	entB		TRUE	0.706	67.000	0.083	1.000	N	NA
2444678	2444679	SAM_1634	SAM_1635			TRUE	0.414	126.000	0.015	1.000	N	NA
2444683	2444684	SAM_0793	SAM_0792		oxlT-2	FALSE	0.166	129.000	0.000	NA		NA
2444684	2444685	SAM_0792	SAM_0791	oxlT-2	murF	FALSE	0.049	241.000	0.000	1.000	N	NA
2444685	2444686	SAM_0791	SAM_0790	murF		TRUE	0.756	147.000	0.046	0.008	Y	NA
2444686	2444687	SAM_0790	SAM_0789		recR	TRUE	0.320	141.000	0.010	1.000	N	NA
2444687	2444688	SAM_0789	SAM_0788	recR		TRUE	0.956	15.000	0.013	1.000	N	NA
2444688	2444689	SAM_0788	SAM_0787			FALSE	0.211	129.000	0.000	1.000	N	NA
2444689	2444690	SAM_0787	SAM_0786		tpiA	FALSE	0.233	177.000	0.000	1.000	Y	NA
2444691	2444692	SAM_2162	SAM_2163			TRUE	0.974	64.000	0.884	0.019		NA
2444692	2444693	SAM_2163	SAM_2164			FALSE	0.018	429.000	0.000	1.000		NA
2444693	2444694	SAM_2164	SAM_2165			TRUE	0.991	14.000	0.400	NA		NA
2444694	2444695	SAM_2165	SAM_2166			TRUE	0.934	52.000	0.500	NA		NA
2444695	2444696	SAM_2166	SAM_2167			FALSE	0.041	235.000	0.000	NA		NA
2444696	2444697	SAM_2167	SAM_2168			TRUE	0.888	0.000	0.000	NA		NA
2444697	2444698	SAM_2168	SAM_2169			TRUE	0.320	64.000	0.000	NA		NA
2444698	2444699	SAM_2169	SAM_2170			TRUE	0.271	310.000	0.400	NA		NA
2444700	2444701	SAM_2095	SAM_2094		pgsA	FALSE	0.210	123.000	0.000	1.000		NA
2444701	2444702	SAM_2094	SAM_2093	pgsA		TRUE	0.962	0.000	0.015	1.000		NA
2444702	2444703	SAM_2093	SAM_2092			TRUE	0.642	84.000	0.014	0.026		NA
2444703	2444704	SAM_2092	SAM_2091			TRUE	0.926	-24.000	0.007	0.026		NA
2444704	2444705	SAM_2091	SAM_2090			TRUE	0.988	-7.000	0.136	1.000	Y	NA
2444705	2444706	SAM_2090	SAM_2089		lytN	FALSE	0.056	216.000	0.000	1.000		NA
2444706	2444707	SAM_2089	SAM_2088	lytN		TRUE	0.414	133.000	0.000	0.003		NA
2444708	2444709	SAM_2087	SAM_2086	sdhA	sdhB	TRUE	0.941	84.000	0.221	0.001	Y	NA
2444710	2444711	SAM_2085	SAM_2084	trmU		TRUE	0.827	32.000	0.005	NA	N	NA
2444712	2444713	SAM_1952	SAM_1951			FALSE	0.081	173.000	0.000	NA		NA
2444714	2444715	SAM_1950	SAM_1949			FALSE	0.025	305.000	0.000	NA		NA
2444715	2444716	SAM_1949	SAM_1948			TRUE	0.973	-3.000	0.104	NA		NA
2444717	2444718	SAM_1947	SAM_1946			FALSE	0.040	249.000	0.000	1.000		NA
2444718	2444719	SAM_1946	SAM_1945			TRUE	0.984	2.000	0.167	NA		NA
2444719	2444720	SAM_1945	SAM_1944			TRUE	0.619	84.000	0.118	NA		NA
2444720	2444721	SAM_1944	SAM_1943			TRUE	0.978	32.000	0.569	NA		NA
2444721	2444722	SAM_1943	SAM_1942			TRUE	0.320	64.000	0.000	NA		NA
2444727	2444728	SAM_1402	SAM_1403			FALSE	0.058	415.000	0.000	1.000	Y	NA
2444728	2444729	SAM_1403	SAM_1404			TRUE	0.995	12.000	0.289	0.017		NA
2444732	2444733	SAM_1394	SAM_1393			TRUE	0.989	8.000	0.209	1.000	N	NA
2444733	2444734	SAM_1393	SAM_1392			TRUE	0.468	109.000	0.044	NA		NA
2444734	2444735	SAM_1392	SAM_1391		rfbD	TRUE	0.636	90.000	0.152	NA		NA
2444735	2444736	SAM_1391	SAM_1390	rfbD		TRUE	0.834	117.000	0.212	1.000	Y	NA
2444736	2444737	SAM_1390	SAM_1389			TRUE	0.978	-10.000	0.289	NA		NA
2444739	2444740	SAM_2185	SAM_2186			FALSE	0.055	203.000	0.000	NA		NA
2444740	2444741	SAM_2186	SAM_2187			FALSE	0.196	102.000	0.000	NA		NA
2444741	2444742	SAM_2187	SAM_2188			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444742	2444743	SAM_2188	SAM_2189			TRUE	0.782	177.000	1.000	NA		NA
2444746	2444747	SAM_1490	SAM_1491	psaC		TRUE	0.992	2.000	0.130	1.000	Y	NA
2444747	2444748	SAM_1491	SAM_1492			TRUE	0.390	171.000	0.135	1.000		NA
2444749	2444750	SAM_1558	SAM_1557			TRUE	0.601	-123.000	0.000	NA		NA
2444752	2444753	SAM_1560	SAM_1561			TRUE	0.283	68.000	0.000	NA		NA
2444753	2444754	SAM_1561	SAM_1562			TRUE	0.458	146.000	0.123	NA		NA
2444754	2444755	SAM_1562	SAM_1563			TRUE	0.850	38.000	0.043	1.000		NA
2444756	2444757	SAM_1564	SAM_1565			TRUE	0.286	217.000	0.154	1.000	N	NA
2444760	2444761	SAM_1641	SAM_1642	aroE		FALSE	0.231	98.000	0.000	1.000		NA
2444761	2444762	SAM_1642	SAM_1643		recG	FALSE	0.072	291.000	0.008	1.000		NA
2444762	2444763	SAM_1643	SAM_1644	recG		FALSE	0.234	80.000	0.000	NA		NA
2444764	2444765	SAM_0458	SAM_0459			FALSE	0.011	712.000	0.000	NA		NA
2444765	2444766	SAM_0459	SAM_0460			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444766	2444767	SAM_0460	SAM_0461			FALSE	0.112	153.000	0.000	NA		NA
2444772	2444773	SAM_0074	SAM_0075	rpsK		TRUE	0.919	50.000	0.308	1.000	N	NA
2444773	2444774	SAM_0075	SAM_0076		rplQ	TRUE	0.997	15.000	0.873	1.000	N	NA
2444775	2444776	SAM_1672	SAM_1670			TRUE	0.937	25.000	0.072	NA		NA
2444780	2444781	SAM_0566	SAM_0567			FALSE	0.017	393.000	0.000	NA		NA
2444781	2444782	SAM_0567	SAM_0568			TRUE	0.396	55.000	0.000	NA		NA
2444782	2444783	SAM_0568	SAM_0569			TRUE	0.724	-18.000	0.000	NA		NA
2444783	2444784	SAM_0569	SAM_0570			FALSE	0.238	78.000	0.000	NA		NA
2444789	2444790	SAM_2130	SAM_2131			TRUE	0.361	60.000	0.000	NA		NA
2444790	2444791	SAM_2131	SAM_2132			FALSE	0.017	403.000	0.000	NA		NA
2444791	2444792	SAM_2132	SAM_2133			TRUE	0.396	61.000	0.000	1.000		NA
2444792	2444793	SAM_2133	SAM_2134			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		NA
2444793	2444794	SAM_2134	SAM_2135			FALSE	0.068	186.000	0.000	NA		NA
2444794	2444795	SAM_2135	SAM_2136			TRUE	0.710	-19.000	0.000	NA		NA
2444796	2444797	SAM_1321	SAM_1320			FALSE	0.116	151.000	0.000	NA		NA
2444797	2444798	SAM_1320	SAM_1319			TRUE	0.967	-10.000	0.008	0.002		NA
2444798	2444799	SAM_1319	SAM_1318		trmD	TRUE	0.990	-13.000	0.672	1.000		NA
2444799	2444800	SAM_1318	SAM_1317	trmD		TRUE	0.868	-19.000	0.007	1.000		NA
2444801	2444802	SAM_1322	SAM_1323		rpsP	TRUE	0.992	10.000	0.385	1.000		NA
2444802	2444803	SAM_1323	SAM_1324	rpsP		FALSE	0.211	129.000	0.000	1.000	N	NA
2444803	2444804	SAM_1324	SAM_1325			TRUE	0.999	15.000	0.923	1.000	Y	NA
2444804	2444805	SAM_1325	SAM_1326			TRUE	0.997	3.000	0.923	NA		NA
2444806	2444807	SAM_1167	SAM_1166			TRUE	0.271	69.000	0.000	NA		NA
2444807	2444808	SAM_1166	SAM_1165			TRUE	0.942	-19.000	0.121	1.000		NA
2444808	2444809	SAM_1165	SAM_1164			FALSE	0.119	159.000	0.000	1.000		NA
2444811	2444812	SAM_2126	SAM_2127			TRUE	0.619	-79.000	0.000	NA		NA
2444812	2444813	SAM_2127	SAM_2128			FALSE	0.183	117.000	0.000	NA		NA
2444813	2444814	SAM_2128	SAM_2129		mod_1	FALSE	0.014	501.000	0.000	NA		NA
2444815	2444816	SAM_1406	SAM_1405		malQ	TRUE	0.820	121.000	0.538	NA		NA
2444817	2444818	SAM_2174	SAM_2175			TRUE	0.993	18.000	0.667	NA		NA
2444818	2444819	SAM_2175	SAM_2176			TRUE	0.994	4.000	0.500	NA		NA
2444821	2444822	SAM_0785	SAM_0784	tuf		FALSE	0.024	352.000	0.000	1.000		NA
2444822	2444823	SAM_0784	SAM_0783			TRUE	0.504	83.000	0.000	0.007		NA
2444824	2444825	SAM_0073	SAM_0072		rpsM	TRUE	0.997	18.000	0.810	0.018		NA
2444825	2444826	SAM_0072	SAM_0071	rpsM	infA	TRUE	0.719	160.000	0.075	0.022	Y	NA
2444826	2444827	SAM_0071	SAM_0070	infA		TRUE	0.534	116.000	0.059	1.000	N	NA
2444829	2444830	SAM_1751	SAM_1750	gap		FALSE	0.050	209.000	0.000	NA		NA
2444831	2444832	SAM_1676	SAM_1675	rpsF		TRUE	0.962	12.000	0.012	1.000	N	NA
2444832	2444833	SAM_1675	SAM_1674		rpsR	TRUE	0.766	45.000	0.012	1.000	N	NA
2444833	2444834	SAM_1674	SAM_1673	rpsR		FALSE	0.141	138.000	0.000	NA		NA
2444839	2444840	SAM_0531	SAM_0530			TRUE	0.986	-25.000	0.828	NA		NA
2444840	2444841	SAM_0530	SAM_0529			TRUE	0.949	-25.000	0.203	NA		NA
2444843	2444844	SAM_1187	SAM_1188	V		TRUE	0.973	0.000	0.052	1.000		NA
2444852	2444853	SAM_2192	SAM_2193			TRUE	0.484	47.000	0.000	NA		NA
2444858	2444859	SAM_0707	SAM_0706			TRUE	0.634	-49.000	0.000	NA		NA
2444863	2444864	SAM_1387	SAM_1388			TRUE	0.403	117.000	0.023	NA		NA
2444865	2444866	SAM_2223	SAM_2224			TRUE	0.982	33.000	0.750	NA		NA
2444869	2444870	SAM_2229	SAM_2230			TRUE	0.893	9.000	0.000	NA		NA
2444875	2444876	SAM_1779	SAM_1780	rpmH		FALSE	0.070	184.000	0.000	NA		NA
2444876	2444877	SAM_1780	SAM_1781			TRUE	0.664	-28.000	0.000	NA		NA
2444888	2444889	SAM_2227	SAM_2228			TRUE	0.664	-28.000	0.000	NA		NA
2444891	2444892	SAM_2190	SAM_2191			TRUE	0.890	12.000	0.000	NA		NA
2444895	2444896	SAM_1169	SAM_1168			TRUE	0.271	69.000	0.000	NA		NA
2444907	2444908	SAM_2206	SAM_2207			TRUE	0.584	-450.000	0.000	NA		NA
2444910	2444911	SAM_1777	SAM_1778			TRUE	0.888	0.000	0.000	NA		NA
2444912	2444913	SAM_2200	SAM_2201			FALSE	0.180	121.000	0.000	NA		NA