MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudoalteromonas atlantica T6c

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3499794 3499795 Patl_0001 Patl_0002     TRUE 0.990 21.000 0.328 1.000 Y NA
 3499795 3499796 Patl_0002 Patl_0003     TRUE 0.988 23.000 0.318 1.000 Y NA
 3499796 3499797 Patl_0003 Patl_0004     TRUE 0.998 5.000 0.249 0.005 Y NA
 3499797 3499798 Patl_0004 Patl_0005     FALSE 0.101 115.000 0.000 1.000 N NA
 3499799 3499800 Patl_0006 Patl_0007     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3499800 3499801 Patl_0007 Patl_0008     TRUE 0.541 37.000 0.009 NA   NA
 3499801 3499802 Patl_0008 Patl_0009   glyQ TRUE 0.999 4.000 0.651 0.001 Y NA
 3499804 3499805 Patl_0011 Patl_0012     TRUE 0.997 9.000 0.679 NA   NA
 3499805 3499806 Patl_0012 Patl_0013     FALSE 0.003 478.000 0.000 NA   NA
 3499810 3499811 Patl_0017 Patl_0018     TRUE 0.902 41.000 0.231 NA   NA
 3499811 3499812 Patl_0018 Patl_0019     FALSE 0.012 256.000 0.000 NA   NA
 3499812 3499813 Patl_0019 Patl_0020   trkA FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3499813 3499814 Patl_0020 Patl_0021 trkA   TRUE 0.782 48.000 0.122 1.000 N NA
 3499814 3499815 Patl_0021 Patl_0022     TRUE 0.999 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 3499815 3499816 Patl_0022 Patl_0023     TRUE 0.992 10.000 0.105 0.023 Y NA
 3499817 3499818 Patl_0024 Patl_0025     TRUE 0.519 25.000 0.000 1.000   NA
 3499818 3499819 Patl_0025 Patl_0026     TRUE 0.988 2.000 0.124 NA   NA
 3499819 3499820 Patl_0026 Patl_0027     TRUE 0.915 57.000 0.331 NA   NA
 3499820 3499821 Patl_0027 Patl_0028     TRUE 0.752 69.000 0.137 NA N NA
 3499821 3499822 Patl_0028 Patl_0029     TRUE 0.964 4.000 0.058 NA N NA
 3499822 3499823 Patl_0029 Patl_0030     FALSE 0.017 203.000 0.000 1.000 N NA
 3499823 3499824 Patl_0030 Patl_0031     FALSE 0.051 147.000 0.000 1.000 N NA
 3499824 3499825 Patl_0031 Patl_0032     TRUE 0.986 -3.000 0.078 NA   NA
 3499827 3499828 Patl_R0001 Patl_R0002     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3499828 3499829 Patl_R0002 Patl_R0003     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3499829 3499830 Patl_R0003 Patl_R0004     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3499830 3499831 Patl_R0004 Patl_R0005     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3499832 3499833 Patl_0034 Patl_0035     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3499833 3499834 Patl_0035 Patl_0036     TRUE 0.970 10.000 0.111 1.000   NA
 3499836 3499837 Patl_0038 Patl_0039     TRUE 0.976 22.000 0.429 NA   NA
 3499837 3499838 Patl_0039 Patl_0040     FALSE 0.014 244.000 0.000 NA   NA
 3499838 3499839 Patl_0040 Patl_0041     TRUE 0.624 48.000 0.038 NA   NA
 3499840 3499841 Patl_0042 Patl_0043     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 3499842 3499843 Patl_0044 Patl_0045 slmA   FALSE 0.422 63.000 0.016 1.000 N NA
 3499844 3499845 Patl_0046 Patl_0047     FALSE 0.074 128.000 0.000 NA N NA
 3499845 3499846 Patl_0047 Patl_0048     FALSE 0.054 140.000 0.000 NA N NA
 3499846 3499847 Patl_0048 Patl_0049     TRUE 0.996 13.000 0.332 0.015 Y NA
 3499847 3499848 Patl_0049 Patl_0050     FALSE 0.093 151.000 0.003 NA   NA
 3499848 3499849 Patl_0050 Patl_0051     TRUE 0.520 41.000 0.010 NA   NA
 3499850 3499851 Patl_0052 Patl_0053   coaD FALSE 0.121 105.000 0.000 1.000 N NA
 3499851 3499852 Patl_0053 Patl_0054 coaD   FALSE 0.327 49.000 0.000 NA   NA
 3499852 3499853 Patl_0054 Patl_0055     FALSE 0.113 127.000 0.000 NA   NA
 3499856 3499857 Patl_0058 Patl_0059     TRUE 0.997 2.000 0.458 NA   NA
 3499857 3499858 Patl_0059 Patl_0060     TRUE 0.986 3.000 0.125 1.000   NA
 3499858 3499859 Patl_0060 Patl_0061     FALSE 0.094 147.000 0.007 1.000 N NA
 3499859 3499860 Patl_0061 Patl_0062   tdh TRUE 0.998 -3.000 0.547 1.000 N NA
 3499860 3499861 Patl_0062 Patl_0063 tdh   TRUE 0.908 16.000 0.089 1.000 N NA
 3499861 3499862 Patl_0063 Patl_0064     TRUE 0.996 4.000 0.405 1.000   NA
 3499864 3499865 Patl_0066 Patl_0067     TRUE 0.968 41.000 0.248 NA Y NA
 3499865 3499866 Patl_0067 Patl_0068     FALSE 0.299 38.000 0.000 1.000 N NA
 3499869 3499870 Patl_0071 Patl_0072     FALSE 0.258 137.000 0.053 1.000 N NA
 3499870 3499871 Patl_0072 Patl_0073     FALSE 0.142 98.000 0.000 1.000 N NA
 3499871 3499872 Patl_0073 Patl_0074     FALSE 0.013 255.000 0.000 1.000   NA
 3499872 3499873 Patl_0074 Patl_R0006     FALSE 0.002 757.000 0.000 NA   NA
 3499873 3499874 Patl_R0006 Patl_0075     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3499874 3499875 Patl_0075 Patl_0076     TRUE 0.590 114.000 0.150 NA N NA
 3499876 3499877 Patl_0077 Patl_0078     FALSE 0.346 81.000 0.004 1.000   NA
 3499877 3499878 Patl_0078 Patl_0079     TRUE 0.958 0.000 0.010 1.000   NA
 3499878 3499879 Patl_0079 Patl_0080   glgA FALSE 0.174 119.000 0.008 1.000 N NA
 3499879 3499880 Patl_0080 Patl_0081 glgA   FALSE 0.002 509.000 0.000 1.000 N NA
 3499880 3499881 Patl_0081 Patl_0082     FALSE 0.135 217.000 0.000 1.000 Y NA
 3499883 3499884 Patl_0084 Patl_0085 dipZ   FALSE 0.245 47.000 0.000 NA N NA
 3499885 3499886 Patl_0086 Patl_0087     TRUE 0.494 26.000 0.000 NA   NA
 3499887 3499888 Patl_0088 Patl_0089     TRUE 0.874 60.000 0.254 1.000 N NA
 3499888 3499889 Patl_0089 Patl_0090     TRUE 0.994 15.000 0.275 0.001 Y NA
 3499893 3499894 Patl_0094 Patl_0095     FALSE 0.009 285.000 0.000 NA   NA
 3499895 3499896 Patl_0096 Patl_0097     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3499896 3499897 Patl_0097 Patl_0098     FALSE 0.007 307.000 0.000 NA   NA
 3499900 3499901 Patl_0101 Patl_0102     FALSE 0.005 380.000 0.000 1.000   NA
 3499901 3499902 Patl_0102 Patl_0103     TRUE 0.999 1.000 0.674 NA   NA
 3499904 3499905 Patl_0105 Patl_0106     TRUE 0.995 3.000 0.065 0.006 Y NA
 3499906 3499907 Patl_0107 Patl_0108     FALSE 0.002 457.000 0.000 1.000 N NA
 3499908 3499909 Patl_0109 Patl_0110     TRUE 0.876 13.000 0.024 NA   NA
 3499911 3499912 Patl_0112 Patl_0113     FALSE 0.383 40.000 0.000 1.000   NA
 3499915 3499916 Patl_0116 Patl_0117     TRUE 0.996 -3.000 0.061 0.046 Y NA
 3499916 3499917 Patl_0117 Patl_0118     TRUE 0.969 13.000 0.017 1.000 Y NA
 3499917 3499918 Patl_0118 Patl_0119     TRUE 0.729 80.000 0.000 1.000 Y NA
 3499918 3499919 Patl_0119 Patl_0120     TRUE 0.976 57.000 0.400 1.000 Y NA
 3499920 3499921 Patl_0121 Patl_0122     FALSE 0.006 293.000 0.000 1.000 N NA
 3499921 3499922 Patl_0122 Patl_0123     TRUE 0.888 70.000 0.286 1.000   NA
 3499922 3499923 Patl_0123 Patl_0124     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3499923 3499924 Patl_0124 Patl_0125     TRUE 0.525 41.000 0.021 NA N NA
 3499924 3499925 Patl_0125 Patl_0126     TRUE 0.962 -3.000 0.021 NA N NA
 3499925 3499926 Patl_0126 Patl_0127     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA N NA
 3499926 3499927 Patl_0127 Patl_0128     FALSE 0.227 59.000 0.000 1.000 N NA
 3499927 3499928 Patl_0128 Patl_0129     TRUE 0.981 3.000 0.105 1.000 N NA
 3499928 3499929 Patl_0129 Patl_0130     TRUE 0.977 33.000 0.667 1.000 N NA
 3499929 3499930 Patl_0130 Patl_0131     FALSE 0.210 67.000 0.000 1.000 N NA
 3499930 3499931 Patl_0131 Patl_0132     FALSE 0.005 370.000 0.000 NA   NA
 3499931 3499932 Patl_0132 Patl_0133     TRUE 0.993 15.000 0.667 NA   NA
 3499932 3499933 Patl_0133 Patl_0134     FALSE 0.028 194.000 0.000 NA   NA
 3499933 3499934 Patl_0134 Patl_0135     TRUE 0.953 21.000 0.222 NA   NA
 3499935 3499936 Patl_0136 Patl_0137     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3499936 3499937 Patl_0137 Patl_0138   nudE TRUE 0.997 0.000 0.373 1.000   NA
 3499938 3499939 Patl_0139 Patl_0140     FALSE 0.050 167.000 0.000 1.000   NA
 3499939 3499940 Patl_0140 Patl_0141     FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 3499940 3499941 Patl_0141 Patl_0142     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3499941 3499942 Patl_0142 Patl_0143     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 3499943 3499944 Patl_0144 Patl_0145     TRUE 0.985 -7.000 0.077 NA   NA
 3499944 3499945 Patl_0145 Patl_0146     TRUE 0.716 17.000 0.004 NA   NA
 3499946 3499947 Patl_0147 Patl_0148     FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 3499947 3499948 Patl_0148 Patl_0149     FALSE 0.002 593.000 0.000 1.000 N NA
 3499948 3499949 Patl_0149 Patl_0150     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 3499950 3499951 Patl_0151 Patl_0152     TRUE 0.997 -7.000 0.062 0.001 Y NA
 3499951 3499952 Patl_0152 Patl_0153     FALSE 0.055 143.000 0.000 1.000 N NA
 3499952 3499953 Patl_0153 Patl_0154     TRUE 0.816 11.000 0.000 0.081 N NA
 3499953 3499954 Patl_0154 Patl_0155     FALSE 0.402 26.000 0.000 1.000 N NA
 3499954 3499955 Patl_0155 Patl_0156     FALSE 0.426 34.000 0.000 1.000   NA
 3499955 3499956 Patl_0156 Patl_0157     TRUE 0.781 15.000 0.000 0.061   NA
 3499956 3499957 Patl_0157 Patl_0158     TRUE 0.995 15.000 0.824 1.000   NA
 3499957 3499958 Patl_0158 Patl_0159     TRUE 0.854 7.000 0.000 1.000   NA
 3499958 3499959 Patl_0159 Patl_0160     TRUE 0.932 5.000 0.000 0.001   NA
 3499962 3499963 Patl_0163 Patl_0164 argD   TRUE 0.999 6.000 0.640 1.000 Y NA
 3499963 3499964 Patl_0164 Patl_0165     TRUE 0.505 71.000 0.027 NA   NA
 3499964 3499965 Patl_0165 Patl_0166     FALSE 0.012 253.000 0.000 NA   NA
 3499965 3499966 Patl_0166 Patl_0167     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3499966 3499967 Patl_0167 Patl_0168     TRUE 0.992 -3.000 0.148 NA   NA
 3499967 3499968 Patl_0168 Patl_0169     TRUE 0.986 2.000 0.115 NA   NA
 3499968 3499969 Patl_0169 Patl_0170     TRUE 0.988 -10.000 0.102 NA   NA
 3499969 3499970 Patl_0170 Patl_0171     TRUE 0.999 5.000 0.846 1.000 Y NA
 3499970 3499971 Patl_0171 Patl_0172     TRUE 0.984 -3.000 0.062 1.000   NA
 3499971 3499972 Patl_0172 Patl_0173     TRUE 0.985 -3.000 0.066 1.000   NA
 3499972 3499973 Patl_0173 Patl_0174     TRUE 1.000 -7.000 0.740 1.000 Y NA
 3499973 3499974 Patl_0174 Patl_0175     TRUE 0.951 4.000 0.026 NA   NA
 3499974 3499975 Patl_0175 Patl_0176     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3499975 3499976 Patl_0176 Patl_0177     FALSE 0.173 104.000 0.000 NA   NA
 3499976 3499977 Patl_0177 Patl_0178     FALSE 0.247 83.000 0.000 NA   NA
 3499977 3499978 Patl_0178 Patl_0179     TRUE 0.994 -10.000 0.200 1.000   NA
 3499978 3499979 Patl_0179 Patl_0180     TRUE 0.999 0.000 0.871 NA   NA
 3499979 3499980 Patl_0180 Patl_0181     TRUE 0.998 -10.000 0.548 NA   NA
 3499980 3499981 Patl_0181 Patl_0182     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3499981 3499982 Patl_0182 Patl_0183     FALSE 0.011 266.000 0.000 NA   NA
 3499982 3499983 Patl_0183 Patl_0184     TRUE 0.967 51.000 0.689 1.000 N NA
 3499983 3499984 Patl_0184 Patl_0185     TRUE 1.000 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 3499984 3499985 Patl_0185 Patl_0186     TRUE 0.945 20.000 0.206 NA N NA
 3499985 3499986 Patl_0186 Patl_0187     TRUE 0.997 -10.000 0.417 NA N NA
 3499986 3499987 Patl_0187 Patl_0188     TRUE 0.996 -3.000 0.296 NA   NA
 3499987 3499988 Patl_0188 Patl_0189     TRUE 0.997 -7.000 0.358 NA   NA
 3499988 3499989 Patl_0189 Patl_0190     TRUE 0.996 -7.000 0.259 NA   NA
 3499990 3499991 Patl_0191 Patl_0192     TRUE 0.963 6.000 0.058 NA   NA
 3499993 3499994 Patl_0194 Patl_0195     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3499996 3499997 Patl_0197 Patl_0198     TRUE 0.993 -19.000 0.022 NA Y NA
 3499997 3499998 Patl_0198 Patl_0199     FALSE 0.063 135.000 0.000 NA N NA
 3499998 3499999 Patl_0199 Patl_0200     FALSE 0.400 96.000 0.024 1.000   NA
 3500000 3500001 Patl_0201 Patl_0202 fadB fadA TRUE 0.995 22.000 0.607 1.000 Y NA
 3500003 3500004 Patl_0204 Patl_0205     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3500005 3500006 Patl_0206 Patl_0207     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 3500006 3500007 Patl_0207 Patl_0208     FALSE 0.012 230.000 0.000 1.000 N NA
 3500008 3500009 Patl_0209 Patl_0210     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 3500010 3500011 Patl_0211 Patl_0212     FALSE 0.014 244.000 0.000 1.000   NA
 3500013 3500014 Patl_0214 Patl_0215     FALSE 0.164 124.000 0.003 NA   NA
 3500014 3500015 Patl_0215 Patl_0216     TRUE 0.574 82.000 0.051 NA   NA
 3500015 3500016 Patl_0216 Patl_0217     FALSE 0.305 57.000 0.000 NA   NA
 3500016 3500017 Patl_0217 Patl_0218     TRUE 0.999 0.000 0.566 1.000 Y NA
 3500017 3500018 Patl_0218 Patl_0219     TRUE 0.557 106.000 0.094 1.000   NA
 3500018 3500019 Patl_0219 Patl_0220     TRUE 0.996 11.000 0.556 0.001   NA
 3500019 3500020 Patl_0220 Patl_0221     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3500022 3500023 Patl_0223 Patl_0224     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3500024 3500025 Patl_0225 Patl_0226 ompR envZ TRUE 0.993 26.000 0.584 1.000 Y NA
 3500026 3500027 Patl_0227 Patl_0228 hslO   FALSE 0.449 33.000 0.003 1.000 N NA
 3500028 3500029 Patl_0229 Patl_0230     FALSE 0.079 145.000 0.000 1.000   NA
 3500029 3500030 Patl_0230 Patl_0231     TRUE 0.999 6.000 0.575 0.007 Y NA
 3500030 3500031 Patl_0231 Patl_0232     TRUE 1.000 3.000 0.776 0.007 Y NA
 3500031 3500032 Patl_0232 Patl_0233     TRUE 1.000 2.000 0.653 0.007 Y NA
 3500032 3500033 Patl_0233 Patl_0234     TRUE 1.000 0.000 0.599 0.007 Y NA
 3500033 3500034 Patl_0234 Patl_0235     TRUE 0.957 43.000 0.425 0.007   NA
 3500034 3500035 Patl_0235 Patl_0236     TRUE 0.999 -3.000 0.605 0.007   NA
 3500035 3500036 Patl_0236 Patl_0237     TRUE 0.999 -13.000 0.569 0.007   NA
 3500036 3500037 Patl_0237 Patl_0238     TRUE 0.999 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 3500037 3500038 Patl_0238 Patl_0239     TRUE 0.982 80.000 0.537 0.066 Y NA
 3500038 3500039 Patl_0239 Patl_0240     TRUE 1.000 2.000 0.811 1.000 Y NA
 3500039 3500040 Patl_0240 Patl_0241     TRUE 0.999 -3.000 0.649 1.000   NA
 3500042 3500043 Patl_0243 Patl_0244     FALSE 0.308 60.000 0.000 1.000   NA
 3500044 3500045 Patl_0245 Patl_0246     FALSE 0.036 252.000 0.040 1.000 N NA
 3500046 3500047 Patl_0247 Patl_0248     TRUE 0.756 50.000 0.112 NA N NA
 3500047 3500048 Patl_0248 Patl_0249     TRUE 0.956 -10.000 0.009 NA   NA
 3500048 3500049 Patl_0249 Patl_0250     FALSE 0.220 89.000 0.000 NA   NA
 3500050 3500051 Patl_0251 Patl_0252     TRUE 0.585 110.000 0.000 1.000 Y NA
 3500053 3500054 Patl_0254 Patl_0255     TRUE 0.998 0.000 0.619 NA   NA
 3500054 3500055 Patl_0255 Patl_0256     TRUE 0.994 -10.000 0.209 NA   NA
 3500055 3500056 Patl_0256 Patl_0257     TRUE 0.996 1.000 0.333 1.000   NA
 3500057 3500058 Patl_0258 Patl_0259     FALSE 0.063 154.000 0.000 NA   NA
 3500058 3500059 Patl_0259 Patl_0260     TRUE 0.511 124.000 0.000 NA Y NA
 3500059 3500060 Patl_0260 Patl_0261     TRUE 0.998 -3.000 0.575 NA   NA
 3500060 3500061 Patl_0261 Patl_0262     FALSE 0.011 267.000 0.000 NA   NA
 3500061 3500062 Patl_0262 Patl_0263     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 3500062 3500063 Patl_0263 Patl_0264     FALSE 0.046 169.000 0.000 NA   NA
 3500063 3500064 Patl_0264 Patl_0265     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 3500065 3500066 Patl_0266 Patl_0267     FALSE 0.268 102.000 0.007 NA   NA
 3500066 3500067 Patl_0267 Patl_0268     FALSE 0.092 158.000 0.006 NA   NA
 3500067 3500068 Patl_0268 Patl_0269     TRUE 0.582 100.000 0.101 1.000 N NA
 3500068 3500069 Patl_0269 Patl_0270     TRUE 0.886 30.000 0.161 1.000 N NA
 3500069 3500070 Patl_0270 Patl_0271     FALSE 0.007 312.000 0.000 NA   NA
 3500073 3500074 Patl_0274 Patl_0275     FALSE 0.155 112.000 0.000 1.000   NA
 3500074 3500075 Patl_0275 Patl_0276     FALSE 0.060 179.000 0.000 0.080   NA
 3500075 3500076 Patl_0276 Patl_0277     FALSE 0.443 31.000 0.000 NA   NA
 3500076 3500077 Patl_0277 Patl_0278     FALSE 0.002 838.000 0.000 NA   NA
 3500077 3500078 Patl_0278 Patl_0279     FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 3500078 3500079 Patl_0279 Patl_0280     FALSE 0.082 143.000 0.000 1.000   NA
 3500079 3500080 Patl_0280 Patl_0281     TRUE 0.494 26.000 0.000 NA   NA
 3500080 3500081 Patl_0281 Patl_0282     FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 3500081 3500082 Patl_0282 Patl_0283     TRUE 0.999 -7.000 0.351 1.000 Y NA
 3500082 3500083 Patl_0283 Patl_0284     TRUE 0.999 0.000 0.714 1.000 N NA
 3500084 3500085 Patl_0285 Patl_0286     FALSE 0.204 95.000 0.000 NA   NA
 3500085 3500086 Patl_0286 Patl_0287     FALSE 0.264 45.000 0.000 1.000 N NA
 3500086 3500087 Patl_0287 Patl_0288     FALSE 0.003 476.000 0.000 NA   NA
 3500087 3500088 Patl_0288 Patl_0289     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500088 3500089 Patl_0289 Patl_0290     TRUE 0.769 12.000 0.000 1.000   NA
 3500089 3500090 Patl_0290 Patl_0291     TRUE 0.590 52.000 0.031 1.000   NA
 3500092 3500093 Patl_0293 Patl_0294     FALSE 0.003 451.000 0.000 NA   NA
 3500093 3500094 Patl_0294 Patl_0295     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3500095 3500096 Patl_0296 Patl_0297     TRUE 0.962 3.000 0.031 NA   NA
 3500096 3500097 Patl_0297 Patl_0298     TRUE 0.984 8.000 0.172 NA   NA
 3500097 3500098 Patl_0298 Patl_0299     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3500098 3500099 Patl_0299 Patl_0300     TRUE 0.997 -3.000 0.333 NA   NA
 3500099 3500100 Patl_0300 Patl_0301     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3500100 3500101 Patl_0301 Patl_0302     TRUE 0.920 -16.000 0.000 NA   NA
 3500102 3500103 Patl_0303 Patl_0304     FALSE 0.234 86.000 0.000 NA   NA
 3500103 3500104 Patl_0304 Patl_0305     TRUE 0.984 1.000 0.087 NA   NA
 3500105 3500106 Patl_0306 Patl_0307     TRUE 0.991 -6.000 0.145 NA N NA
 3500107 3500108 Patl_0308 Patl_0309     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 3500111 3500112 Patl_0312 Patl_0313     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500114 3500115 Patl_0315 Patl_0316     FALSE 0.245 106.000 0.000 0.060   NA
 3500115 3500116 Patl_0316 Patl_0317     FALSE 0.305 61.000 0.000 1.000   NA
 3500116 3500117 Patl_0317 Patl_0318     TRUE 0.848 85.000 0.061 1.000 Y NA
 3500117 3500118 Patl_0318 Patl_0319     TRUE 0.990 43.000 0.600 0.080 Y NA
 3500118 3500119 Patl_0319 Patl_0320     TRUE 0.733 13.000 0.000 NA   NA
 3500119 3500120 Patl_0320 Patl_0321     TRUE 0.861 74.000 0.239 NA   NA
 3500120 3500121 Patl_0321 Patl_0322     TRUE 0.875 33.000 0.000 0.080 Y NA
 3500123 3500124 Patl_0324 Patl_0325     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 3500125 3500126 Patl_0326 Patl_0327     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3500126 3500127 Patl_0327 Patl_0328     TRUE 0.921 -13.000 0.000 NA   NA
 3500127 3500128 Patl_0328 Patl_0329     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500128 3500129 Patl_0329 Patl_R0007     FALSE 0.020 215.000 0.000 NA   NA
 3500130 3500131 Patl_0330 Patl_0331     FALSE 0.084 139.000 0.000 NA   NA
 3500132 3500133 Patl_0332 Patl_0333     TRUE 0.866 13.000 0.017 1.000   NA
 3500134 3500135 Patl_0334 Patl_0335     TRUE 0.533 153.000 0.200 0.063   NA
 3500135 3500136 Patl_0335 Patl_0336     TRUE 0.984 10.000 0.200 1.000   NA
 3500136 3500137 Patl_0336 Patl_0337     TRUE 0.983 110.000 1.000 NA Y NA
 3500138 3500139 Patl_0338 Patl_0339     TRUE 0.867 2.000 0.000 1.000 N NA
 3500139 3500140 Patl_0339 Patl_0340     TRUE 1.000 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 3500140 3500141 Patl_0340 Patl_0341     TRUE 0.999 1.000 0.600 1.000 Y NA
 3500141 3500142 Patl_0341 Patl_0342     TRUE 0.998 4.000 0.205 0.002 Y NA
 3500142 3500143 Patl_0342 Patl_0343     FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000   NA
 3500143 3500144 Patl_0343 Patl_0344     TRUE 0.466 28.000 0.000 NA   NA
 3500144 3500145 Patl_0344 Patl_0345     FALSE 0.043 174.000 0.000 NA   NA
 3500145 3500146 Patl_0345 Patl_0346     TRUE 0.599 47.000 0.030 NA   NA
 3500147 3500148 Patl_0347 Patl_0348     TRUE 0.875 105.000 0.471 1.000 N NA
 3500148 3500149 Patl_0348 Patl_0349     TRUE 0.849 141.000 0.291 1.000 Y NA
 3500149 3500150 Patl_0349 Patl_0350     TRUE 0.942 22.000 0.215 NA N NA
 3500150 3500151 Patl_0350 Patl_0351     FALSE 0.330 194.000 0.057 NA Y NA
 3500151 3500152 Patl_0351 Patl_0352     FALSE 0.305 37.000 0.000 1.000 N NA
 3500152 3500153 Patl_0352 Patl_0353     FALSE 0.017 203.000 0.000 1.000 N NA
 3500153 3500154 Patl_0353 Patl_0354     TRUE 0.955 -7.000 0.007 NA   NA
 3500154 3500155 Patl_0354 Patl_0355     FALSE 0.321 51.000 0.000 NA   NA
 3500155 3500156 Patl_0355 Patl_0356     FALSE 0.290 37.000 0.000 NA N NA
 3500157 3500158 Patl_0357 Patl_0358     TRUE 0.999 2.000 1.000 NA   NA
 3500162 3500163 Patl_0362 Patl_0363     FALSE 0.327 49.000 0.000 NA   NA
 3500163 3500164 Patl_0363 Patl_0364     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500164 3500165 Patl_0364 Patl_0365     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500165 3500166 Patl_0365 Patl_0366     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500166 3500167 Patl_0366 Patl_0367     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500167 3500168 Patl_0367 Patl_0368     FALSE 0.159 107.000 0.000 NA   NA
 3500169 3500170 Patl_0369 Patl_0370     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500170 3500171 Patl_0370 Patl_0371     FALSE 0.009 285.000 0.000 NA   NA
 3500171 3500172 Patl_0371 Patl_0372     FALSE 0.104 132.000 0.000 NA   NA
 3500172 3500173 Patl_0372 Patl_0373     FALSE 0.131 102.000 0.000 1.000 N NA
 3500177 3500178 Patl_0377 Patl_0378     TRUE 0.468 133.000 0.000 1.000 Y NA
 3500178 3500179 Patl_0378 Patl_0379     FALSE 0.329 67.000 0.000 0.056 N NA
 3500179 3500180 Patl_0379 Patl_0380     FALSE 0.428 56.000 0.000 0.059   NA
 3500180 3500181 Patl_0380 Patl_0381     FALSE 0.184 103.000 0.000 1.000   NA
 3500181 3500182 Patl_0381 Patl_0382     TRUE 0.604 14.000 0.000 NA N NA
 3500182 3500183 Patl_0382 Patl_0383     FALSE 0.009 244.000 0.000 NA N NA
 3500183 3500184 Patl_0383 Patl_0384     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 3500184 3500185 Patl_0384 Patl_0385     FALSE 0.309 55.000 0.000 NA   NA
 3500190 3500191 Patl_0390 Patl_0391     FALSE 0.225 60.000 0.000 1.000 N NA
 3500191 3500192 Patl_0391 Patl_0392     TRUE 0.924 -16.000 0.000 1.000   NA
 3500192 3500193 Patl_0392 Patl_0393     TRUE 0.999 -24.000 0.627 0.062   NA
 3500193 3500194 Patl_0393 Patl_0394     TRUE 0.594 83.000 0.060 NA   NA
 3500194 3500195 Patl_0394 Patl_0395     TRUE 0.626 96.000 0.098 NA   NA
 3500195 3500196 Patl_0395 Patl_0396     TRUE 0.784 22.000 0.041 1.000 N NA
 3500199 3500200 Patl_R0008 Patl_R0009     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3500200 3500201 Patl_R0009 Patl_R0010     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3500201 3500202 Patl_R0010 Patl_R0011     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3500202 3500203 Patl_R0011 Patl_R0012     FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 3500203 3500204 Patl_R0012 Patl_0399     FALSE 0.002 1115.000 0.000 NA   NA
 3500205 3500206 Patl_0400 Patl_0401     FALSE 0.004 400.000 0.000 NA   NA
 3500206 3500207 Patl_0401 Patl_0402     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3500207 3500208 Patl_0402 Patl_0403     FALSE 0.010 239.000 0.000 NA N NA
 3500208 3500209 Patl_0403 Patl_0404     TRUE 0.760 9.000 0.000 NA N NA
 3500210 3500211 Patl_0405 Patl_0406     FALSE 0.271 72.000 0.000 NA   NA
 3500211 3500212 Patl_0406 Patl_0407     FALSE 0.007 307.000 0.000 NA   NA
 3500212 3500213 Patl_0407 Patl_0408     FALSE 0.122 123.000 0.000 NA   NA
 3500215 3500216 Patl_0410 Patl_0411     TRUE 0.748 69.000 0.000 1.000 Y NA
 3500218 3500219 Patl_0413 Patl_0414     FALSE 0.009 286.000 0.000 NA   NA
 3500219 3500220 Patl_0414 Patl_0415     FALSE 0.016 207.000 0.000 1.000 N NA
 3500220 3500221 Patl_0415 Patl_0416     FALSE 0.027 200.000 0.000 1.000   NA
 3500222 3500223 Patl_0417 Patl_0418     FALSE 0.015 244.000 0.004 1.000 N NA
 3500225 3500226 Patl_0420 Patl_0421     TRUE 0.915 1.000 0.000 1.000   NA
 3500227 3500228 Patl_0422 Patl_0423     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA N NA
 3500228 3500229 Patl_0423 Patl_0424     FALSE 0.173 209.000 0.000 0.096 Y NA
 3500229 3500230 Patl_0424 Patl_0425     FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 3500230 3500231 Patl_0425 Patl_0426     TRUE 0.538 139.000 0.185 NA   NA
 3500232 3500233 Patl_0427 Patl_0428     FALSE 0.042 157.000 0.000 1.000 N NA
 3500236 3500237 Patl_0431 Patl_0432     TRUE 0.997 -16.000 0.443 NA   NA
 3500237 3500238 Patl_0432 Patl_0433     TRUE 0.985 16.000 0.433 NA   NA
 3500238 3500239 Patl_0433 Patl_0434     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500239 3500240 Patl_0434 Patl_0435     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 3500240 3500241 Patl_0435 Patl_0436     FALSE 0.316 53.000 0.000 NA   NA
 3500242 3500243 Patl_0437 Patl_0438     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3500246 3500247 Patl_0441 Patl_0442     TRUE 0.905 70.000 0.082 0.039 Y NA
 3500247 3500248 Patl_0442 Patl_0443     FALSE 0.177 85.000 0.000 1.000 N NA
 3500248 3500249 Patl_0443 Patl_0444     FALSE 0.122 123.000 0.000 NA   NA
 3500249 3500250 Patl_0444 Patl_0445     TRUE 0.840 8.000 0.000 NA   NA
 3500251 3500252 Patl_0446 Patl_0447     TRUE 0.856 14.000 0.030 1.000 N NA
 3500253 3500254 Patl_0448 Patl_0449     TRUE 0.478 46.000 0.017 NA N NA
 3500254 3500255 Patl_0449 Patl_0450     FALSE 0.194 98.000 0.000 NA   NA
 3500255 3500256 Patl_0450 Patl_0451     FALSE 0.201 96.000 0.000 NA   NA
 3500256 3500257 Patl_0451 Patl_0452     FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 3500257 3500258 Patl_0452 Patl_0453     TRUE 0.995 4.000 0.083 0.002 Y NA
 3500258 3500259 Patl_0453 Patl_0454     TRUE 0.999 -10.000 0.324 0.002 Y NA
 3500259 3500260 Patl_0454 Patl_0455     TRUE 0.996 12.000 0.312 0.002 Y NA
 3500260 3500261 Patl_0455 Patl_0456     TRUE 0.992 5.000 0.038 0.002 Y NA
 3500261 3500262 Patl_0456 Patl_0457     TRUE 0.972 25.000 0.116 0.002 Y NA
 3500262 3500263 Patl_0457 Patl_0458     TRUE 0.922 88.000 0.519 1.000 N NA
 3500263 3500264 Patl_0458 Patl_0459     TRUE 0.964 35.000 0.481 NA   NA
 3500264 3500265 Patl_0459 Patl_0460     TRUE 0.537 96.000 0.063 NA   NA
 3500265 3500266 Patl_0460 Patl_0461     FALSE 0.270 106.000 0.011 NA   NA
 3500266 3500267 Patl_0461 Patl_0462     FALSE 0.428 79.000 0.014 NA   NA
 3500268 3500269 Patl_0463 Patl_0464     FALSE 0.037 182.000 0.000 1.000   NA
 3500269 3500270 Patl_0464 Patl_0465     FALSE 0.007 274.000 0.000 1.000 N NA
 3500270 3500271 Patl_0465 Patl_0466     FALSE 0.051 147.000 0.000 1.000 N NA
 3500271 3500272 Patl_0466 Patl_0467     FALSE 0.044 155.000 0.000 1.000 N NA
 3500273 3500274 Patl_0468 Patl_0469     TRUE 0.992 19.000 0.307 0.018 Y NA
 3500274 3500275 Patl_0469 Patl_0470   rplD TRUE 0.995 19.000 0.486 0.014 Y NA
 3500275 3500276 Patl_0470 Patl_0471 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3500276 3500277 Patl_0471 Patl_0472 rplW rplB TRUE 0.998 15.000 0.849 1.000 Y NA
 3500277 3500278 Patl_0472 Patl_0473 rplB   TRUE 0.998 16.000 0.820 0.018 Y NA
 3500278 3500279 Patl_0473 Patl_0474   rplV TRUE 0.999 11.000 0.769 0.018 Y NA
 3500279 3500280 Patl_0474 Patl_0475 rplV rpsC TRUE 0.999 10.000 0.719 0.018 Y NA
 3500280 3500281 Patl_0475 Patl_0476 rpsC rplP TRUE 1.000 3.000 0.828 0.018 Y NA
 3500281 3500282 Patl_0476 Patl_0477 rplP   TRUE 0.995 0.000 0.029 0.014 Y NA
 3500282 3500283 Patl_0477 Patl_0478     TRUE 0.995 0.000 0.029 0.014 Y NA
 3500285 3500286 Patl_0480 Patl_0481     FALSE 0.072 133.000 0.000 1.000 N NA
 3500287 3500288 Patl_0482 Patl_0483     FALSE 0.309 55.000 0.000 NA   NA
 3500288 3500289 Patl_0483 Patl_0484     TRUE 0.996 2.000 0.385 NA   NA
 3500291 3500292 Patl_0486 Patl_0487     FALSE 0.126 104.000 0.000 1.000 N NA
 3500293 3500294 Patl_0488 Patl_0489     TRUE 0.531 130.000 0.158 1.000 N NA
 3500296 3500297 Patl_0491 Patl_0492     TRUE 0.968 21.000 0.339 1.000 N NA
 3500297 3500298 Patl_0492 Patl_0493     FALSE 0.058 301.000 0.000 NA Y NA
 3500299 3500300 Patl_0494 Patl_0495     FALSE 0.415 45.000 0.008 1.000 N NA
 3500300 3500301 Patl_0495 Patl_0496     TRUE 0.470 55.000 0.021 1.000 N NA
 3500303 3500304 Patl_0498 Patl_0499     FALSE 0.020 221.000 0.000 1.000   NA
 3500304 3500305 Patl_0499 Patl_0500     FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000   NA
 3500307 3500308 Patl_0502 Patl_0503     FALSE 0.180 102.000 0.000 NA   NA
 3500308 3500309 Patl_0503 Patl_0504     FALSE 0.007 309.000 0.000 NA   NA
 3500309 3500310 Patl_0504 Patl_0505     TRUE 0.922 -12.000 0.000 NA   NA
 3500313 3500314 Patl_0508 Patl_0509     FALSE 0.284 83.000 0.005 1.000 N NA
 3500314 3500315 Patl_0509 Patl_0510     FALSE 0.216 63.000 0.000 1.000 N NA
 3500315 3500316 Patl_0510 Patl_0511     TRUE 0.839 9.000 0.000 1.000   NA
 3500317 3500318 Patl_0512 Patl_0513     FALSE 0.018 227.000 0.000 1.000   NA
 3500320 3500321 Patl_0515 Patl_0516     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3500321 3500322 Patl_0516 Patl_0517     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 3500322 3500323 Patl_0517 Patl_0518     TRUE 0.696 82.000 0.117 1.000 N NA
 3500323 3500324 Patl_0518 Patl_0519     FALSE 0.014 246.000 0.000 1.000   NA
 3500324 3500325 Patl_0519 Patl_0520     FALSE 0.037 182.000 0.000 1.000   NA
 3500326 3500327 Patl_0521 Patl_0522     TRUE 0.992 20.000 0.909 1.000 N NA
 3500329 3500330 Patl_0524 Patl_0525     TRUE 0.997 11.000 0.916 NA   NA
 3500330 3500331 Patl_0525 Patl_0526     FALSE 0.027 197.000 0.000 NA   NA
 3500331 3500332 Patl_0526 Patl_0527     FALSE 0.424 33.000 0.000 NA   NA
 3500332 3500333 Patl_0527 Patl_0528     FALSE 0.119 229.000 0.000 1.000 Y NA
 3500333 3500334 Patl_0528 Patl_0529     TRUE 0.893 33.000 0.184 1.000 N NA
 3500334 3500335 Patl_0529 Patl_0530     FALSE 0.070 151.000 0.000 1.000   NA
 3500336 3500337 Patl_0531 Patl_0532     TRUE 0.500 67.000 0.023 1.000   NA
 3500337 3500338 Patl_0532 Patl_0533     TRUE 0.855 46.000 0.017 1.000 Y NA
 3500338 3500339 Patl_0533 Patl_0534     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 3500339 3500340 Patl_0534 Patl_0535     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3500341 3500342 Patl_0536 Patl_0537     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3500345 3500346 Patl_0540 Patl_0541     FALSE 0.086 138.000 0.000 NA   NA
 3500348 3500349 Patl_0543 Patl_0544     FALSE 0.007 310.000 0.000 NA   NA
 3500349 3500350 Patl_0544 Patl_0545     FALSE 0.218 115.000 0.007 NA   NA
 3500351 3500352 Patl_0546 Patl_0547     TRUE 0.772 40.000 0.085 NA   NA
 3500352 3500353 Patl_0547 Patl_0548     FALSE 0.002 606.000 0.000 NA   NA
 3500353 3500354 Patl_0548 Patl_0549     FALSE 0.011 231.000 0.000 1.000 N NA
 3500355 3500356 Patl_0550 Patl_0551     FALSE 0.330 108.000 0.026 NA   NA
 3500357 3500358 Patl_0552 Patl_0553     FALSE 0.426 94.000 0.029 NA   NA
 3500358 3500359 Patl_0553 Patl_0554     FALSE 0.297 178.000 0.000 0.002 Y NA
 3500360 3500361 Patl_0555 Patl_0556     TRUE 0.860 70.000 0.258 NA N NA
 3500361 3500362 Patl_0556 Patl_0557     TRUE 0.969 28.000 0.453 NA   NA
 3500362 3500363 Patl_0557 Patl_0558     TRUE 0.971 1.000 0.035 NA   NA
 3500363 3500364 Patl_0558 Patl_0559     TRUE 0.650 32.000 0.021 NA   NA
 3500364 3500365 Patl_0559 Patl_0560     TRUE 0.991 14.000 0.562 NA   NA
 3500365 3500366 Patl_0560 Patl_0561     TRUE 0.999 1.000 0.530 NA Y NA
 3500367 3500368 Patl_0562 Patl_0563     TRUE 0.988 7.000 0.226 1.000 N NA
 3500368 3500369 Patl_0563 Patl_0564     TRUE 0.961 0.000 0.013 1.000   NA
 3500369 3500370 Patl_0564 Patl_0565     TRUE 0.963 -3.000 0.012 NA   NA
 3500370 3500371 Patl_0565 Patl_0566     TRUE 0.955 41.000 0.459 NA   NA
 3500371 3500372 Patl_0566 Patl_0567     TRUE 0.998 0.000 0.543 NA   NA
 3500372 3500373 Patl_0567 Patl_0568     TRUE 0.604 123.000 0.163 1.000   NA
 3500373 3500374 Patl_0568 Patl_0569     TRUE 0.988 26.000 0.820 NA N NA
 3500374 3500375 Patl_0569 Patl_0570     TRUE 0.992 16.000 0.728 NA N NA
 3500375 3500376 Patl_0570 Patl_0571     TRUE 0.991 3.000 0.186 NA   NA
 3500376 3500377 Patl_0571 Patl_0572     TRUE 0.994 -3.000 0.182 NA   NA
 3500378 3500379 Patl_0573 Patl_0574     FALSE 0.065 136.000 0.000 1.000 N NA
 3500379 3500380 Patl_0574 Patl_0575     TRUE 0.789 146.000 0.543 NA   NA
 3500380 3500381 Patl_0575 Patl_0576     TRUE 0.998 -9.000 0.568 NA   NA
 3500381 3500382 Patl_0576 Patl_0577     TRUE 0.997 5.000 0.541 NA   NA
 3500385 3500386 Patl_0580 Patl_0581     FALSE 0.216 91.000 0.000 NA   NA
 3500386 3500387 Patl_0581 Patl_0582     FALSE 0.115 126.000 0.000 NA   NA
 3500389 3500390 Patl_0584 Patl_0585     TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 3500390 3500391 Patl_0585 Patl_0586     TRUE 0.825 52.000 0.000 0.010 Y NA
 3500391 3500392 Patl_0586 Patl_0587     FALSE 0.212 65.000 0.000 1.000 N NA
 3500392 3500393 Patl_0587 Patl_0588     FALSE 0.365 29.000 0.000 1.000 N NA
 3500395 3500396 Patl_0590 Patl_0591     FALSE 0.422 23.000 0.000 NA N NA
 3500396 3500397 Patl_0591 Patl_R0013     FALSE 0.025 201.000 0.000 NA   NA
 3500397 3500398 Patl_R0013 Patl_0592     FALSE 0.012 256.000 0.000 NA   NA
 3500398 3500399 Patl_0592 Patl_0593     TRUE 0.999 3.000 0.843 1.000 N NA
 3500399 3500400 Patl_0593 Patl_0594     FALSE 0.202 402.000 0.681 1.000 N NA
 3500400 3500401 Patl_0594 Patl_0595   rplA TRUE 1.000 4.000 0.838 0.018 Y NA
 3500401 3500402 Patl_0595 Patl_0596 rplA rplJ FALSE 0.260 365.000 0.302 1.000 Y NA
 3500402 3500403 Patl_0596 Patl_0597 rplJ rplL TRUE 0.992 56.000 0.884 1.000 Y NA
 3500403 3500404 Patl_0597 Patl_0598 rplL   FALSE 0.123 278.000 0.223 1.000 N NA
 3500404 3500405 Patl_0598 Patl_0599     TRUE 0.990 91.000 0.851 0.001 Y NA
 3500405 3500406 Patl_0599 Patl_0600   rpsL FALSE 0.137 210.000 0.122 1.000 N NA
 3500406 3500407 Patl_0600 Patl_0601 rpsL   TRUE 0.987 77.000 0.620 0.003 Y NA
 3500407 3500408 Patl_0601 Patl_0602     TRUE 0.998 13.000 0.579 1.000 Y NA
 3500408 3500409 Patl_0602 Patl_0603     TRUE 0.979 64.000 0.400 0.001 Y NA
 3500409 3500410 Patl_0603 Patl_0604     FALSE 0.001 887.000 0.000 1.000 N NA
 3500411 3500412 Patl_0605 Patl_0606     FALSE 0.016 233.000 0.000 NA   NA
 3500413 3500414 Patl_0607 Patl_0608     FALSE 0.018 198.000 0.000 1.000 N NA
 3500416 3500417 Patl_0610 Patl_0611     FALSE 0.061 158.000 0.000 1.000   NA
 3500420 3500421 Patl_0614 Patl_0615     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3500422 3500423 Patl_0616 Patl_0617     FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000   NA
 3500423 3500424 Patl_0617 Patl_0618     FALSE 0.004 413.000 0.000 1.000   NA
 3500424 3500425 Patl_0618 Patl_0619     TRUE 0.996 0.000 0.300 NA N NA
 3500425 3500426 Patl_0619 Patl_0620     FALSE 0.045 150.000 0.000 NA N NA
 3500426 3500427 Patl_0620 Patl_0621     FALSE 0.424 33.000 0.000 NA   NA
 3500427 3500428 Patl_0621 Patl_0622     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 3500428 3500429 Patl_0622 Patl_0623     FALSE 0.024 204.000 0.000 NA   NA
 3500429 3500430 Patl_0623 Patl_0624     FALSE 0.019 221.000 0.000 NA   NA
 3500430 3500431 Patl_0624 Patl_0625     TRUE 0.999 0.000 0.371 0.001 Y NA
 3500432 3500433 Patl_0626 Patl_0627     FALSE 0.167 111.000 0.004 1.000 N NA
 3500433 3500434 Patl_0627 Patl_0628     FALSE 0.079 128.000 0.000 1.000 N NA
 3500434 3500435 Patl_0628 Patl_0629     TRUE 0.891 10.000 0.018 1.000 N NA
 3500435 3500436 Patl_0629 Patl_0630     FALSE 0.169 106.000 0.000 1.000   NA
 3500436 3500437 Patl_0630 Patl_0631     FALSE 0.123 125.000 0.000 1.000   NA
 3500437 3500438 Patl_0631 Patl_0632     FALSE 0.195 100.000 0.000 1.000   NA
 3500438 3500439 Patl_0632 Patl_0633     TRUE 0.580 78.000 0.049 NA   NA
 3500439 3500440 Patl_0633 Patl_0634     TRUE 0.971 1.000 0.035 NA   NA
 3500440 3500441 Patl_0634 Patl_0635     TRUE 0.992 2.000 0.198 1.000   NA
 3500444 3500445 Patl_0638 Patl_0639     FALSE 0.003 492.000 0.000 NA   NA
 3500446 3500447 Patl_0640 Patl_0641     TRUE 0.991 -3.000 0.125 NA   NA
 3500447 3500448 Patl_0641 Patl_0642     TRUE 0.988 -10.000 0.100 NA   NA
 3500448 3500449 Patl_0642 Patl_0643     TRUE 0.991 -13.000 0.143 NA   NA
 3500449 3500450 Patl_0643 Patl_0644     TRUE 0.986 99.000 0.875 1.000 Y NA
 3500451 3500452 Patl_0645 Patl_0646     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500453 3500454 Patl_0647 Patl_0648     TRUE 0.995 5.000 0.370 0.001 N NA
 3500454 3500455 Patl_0648 Patl_0649     FALSE 0.176 198.000 0.000 1.000 Y NA
 3500455 3500456 Patl_0649 Patl_0650     TRUE 0.994 4.000 0.333 1.000 N NA
 3500456 3500457 Patl_0650 Patl_0651   argD TRUE 0.992 22.000 0.429 1.000 Y NA
 3500457 3500458 Patl_0651 Patl_0652 argD   FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 3500458 3500459 Patl_0652 Patl_0653     FALSE 0.410 80.000 0.013 NA   NA
 3500460 3500461 Patl_0654 Patl_0655     TRUE 0.993 26.000 0.500 0.020 Y NA
 3500461 3500462 Patl_0655 Patl_0656     TRUE 0.643 21.000 0.000 0.016 N NA
 3500462 3500463 Patl_0656 Patl_0657     FALSE 0.029 175.000 0.000 1.000 N NA
 3500464 3500465 Patl_0658 Patl_0659     TRUE 0.685 24.000 0.022 1.000 N NA
 3500466 3500467 Patl_0660 Patl_0661     FALSE 0.015 238.000 0.000 NA   NA
 3500467 3500468 Patl_0661 Patl_0662     TRUE 0.994 6.000 0.346 NA   NA
 3500469 3500470 Patl_0663 Patl_0664     FALSE 0.210 93.000 0.000 NA   NA
 3500470 3500471 Patl_0664 Patl_0665     FALSE 0.045 187.000 0.002 NA   NA
 3500471 3500472 Patl_0665 Patl_0666     TRUE 0.971 33.000 0.208 1.000 Y NA
 3500472 3500473 Patl_0666 Patl_0667     FALSE 0.255 235.000 0.319 1.000 N NA
 3500473 3500474 Patl_0667 Patl_0668     TRUE 1.000 -7.000 0.668 NA Y NA
 3500474 3500475 Patl_0668 Patl_0669     TRUE 1.000 -3.000 0.680 NA Y NA
 3500475 3500476 Patl_0669 Patl_0670     TRUE 1.000 1.000 0.770 NA Y NA
 3500476 3500477 Patl_0670 Patl_0671     TRUE 0.999 -12.000 0.616 NA Y NA
 3500479 3500480 Patl_0673 Patl_0674     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 3500480 3500481 Patl_0674 Patl_0675     FALSE 0.101 133.000 0.000 NA   NA
 3500481 3500482 Patl_0675 Patl_0676     FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 3500482 3500483 Patl_0676 Patl_0677     FALSE 0.156 108.000 0.000 NA   NA
 3500483 3500484 Patl_0677 Patl_0678     TRUE 0.680 15.000 0.000 NA   NA
 3500485 3500486 Patl_0679 Patl_0680     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3500486 3500487 Patl_0680 Patl_0681     FALSE 0.277 68.000 0.000 NA   NA
 3500487 3500488 Patl_0681 Patl_0682     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500488 3500489 Patl_0682 Patl_0683     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500489 3500490 Patl_0683 Patl_0684     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3500490 3500491 Patl_0684 Patl_0685     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3500491 3500492 Patl_0685 Patl_0686     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500492 3500493 Patl_0686 Patl_0687     TRUE 0.993 -3.000 0.167 NA   NA
 3500493 3500494 Patl_0687 Patl_0688     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3500496 3500497 Patl_0690 Patl_0691     FALSE 0.294 61.000 0.000 NA   NA
 3500500 3500501 Patl_0694 Patl_0695     TRUE 0.998 1.000 0.636 NA   NA
 3500502 3500503 Patl_0696 Patl_0697     FALSE 0.321 55.000 0.000 1.000   NA
 3500503 3500504 Patl_0697 Patl_0698     TRUE 0.706 95.000 0.138 1.000   NA
 3500504 3500505 Patl_0698 Patl_0699     TRUE 0.921 110.000 0.568 0.001   NA
 3500505 3500506 Patl_0699 Patl_0700     TRUE 0.999 0.000 0.659 NA   NA
 3500506 3500507 Patl_0700 Patl_0701     TRUE 0.999 -7.000 0.848 NA   NA
 3500507 3500508 Patl_0701 Patl_0702     TRUE 0.995 16.000 0.848 NA   NA
 3500508 3500509 Patl_0702 Patl_0703     TRUE 0.999 4.000 0.939 NA   NA
 3500509 3500510 Patl_0703 Patl_0704     TRUE 0.985 1.000 0.094 NA   NA
 3500510 3500511 Patl_0704 Patl_0705     TRUE 0.998 -3.000 0.429 NA   NA
 3500511 3500512 Patl_0705 Patl_0706     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3500512 3500513 Patl_0706 Patl_0707     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 3500513 3500514 Patl_0707 Patl_0708     TRUE 0.972 21.000 0.344 NA   NA
 3500514 3500515 Patl_0708 Patl_0709     FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 3500515 3500516 Patl_0709 Patl_0710     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500516 3500517 Patl_0710 Patl_0711     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3500517 3500518 Patl_0711 Patl_0712     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500518 3500519 Patl_0712 Patl_0713     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500519 3500520 Patl_0713 Patl_0714     TRUE 0.999 -7.000 0.738 NA   NA
 3500520 3500521 Patl_0714 Patl_0715     TRUE 0.999 -3.000 0.738 NA   NA
 3500521 3500522 Patl_0715 Patl_0716     TRUE 0.993 -10.000 0.182 NA   NA
 3500522 3500523 Patl_0716 Patl_0717     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500523 3500524 Patl_0717 Patl_0718     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3500524 3500525 Patl_0718 Patl_0719     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3500525 3500526 Patl_0719 Patl_0720     TRUE 0.998 0.000 0.529 NA   NA
 3500526 3500527 Patl_0720 Patl_0721     TRUE 0.998 -10.000 0.588 NA   NA
 3500527 3500528 Patl_0721 Patl_0722     TRUE 0.996 -6.000 0.250 NA   NA
 3500528 3500529 Patl_0722 Patl_0723     FALSE 0.003 571.000 0.000 NA   NA
 3500529 3500530 Patl_0723 Patl_0724     FALSE 0.276 190.000 0.200 1.000 N NA
 3500530 3500531 Patl_0724 Patl_R0014   rnpB FALSE 0.016 235.000 0.000 NA   NA
 3500531 3500532 Patl_R0014 Patl_0725 rnpB   FALSE 0.084 139.000 0.000 NA   NA
 3500532 3500533 Patl_0725 Patl_0726     FALSE 0.018 226.000 0.000 1.000   NA
 3500534 3500535 Patl_0727 Patl_0728     FALSE 0.002 708.000 0.000 NA   NA
 3500535 3500536 Patl_0728 Patl_0729     TRUE 0.940 18.000 0.152 NA   NA
 3500536 3500537 Patl_0729 Patl_0730     TRUE 0.990 -3.000 0.130 1.000 N NA
 3500537 3500538 Patl_0730 Patl_0731     TRUE 0.560 151.000 0.250 NA   NA
 3500539 3500540 Patl_0732 Patl_0733     FALSE 0.011 269.000 0.000 1.000   NA
 3500540 3500541 Patl_0733 Patl_0734     TRUE 0.921 -13.000 0.000 NA   NA
 3500541 3500542 Patl_0734 Patl_0735     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA   NA
 3500545 3500546 Patl_0738 Patl_0739     TRUE 0.930 13.000 0.080 1.000 N NA
 3500546 3500547 Patl_0739 Patl_0740     FALSE 0.006 347.000 0.000 NA   NA
 3500549 3500550 Patl_0742 Patl_0743     FALSE 0.003 393.000 0.000 1.000 N NA
 3500551 3500552 Patl_0744 Patl_0745     FALSE 0.441 105.000 0.048 1.000   NA
 3500552 3500553 Patl_0745 Patl_0746     FALSE 0.051 165.000 0.000 1.000   NA
 3500554 3500555 Patl_0747 Patl_0748     TRUE 0.959 100.000 0.444 NA Y NA
 3500557 3500558 Patl_0750 Patl_0751     TRUE 0.936 51.000 0.143 NA Y NA
 3500558 3500559 Patl_0751 Patl_0752     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500559 3500560 Patl_0752 Patl_0753     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3500560 3500561 Patl_0753 Patl_0754     FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000 N NA
 3500561 3500562 Patl_0754 Patl_0755     FALSE 0.136 97.000 0.000 NA N NA
 3500563 3500564 Patl_0756 Patl_0757     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3500566 3500567 Patl_0759 Patl_0760     FALSE 0.005 383.000 0.000 NA   NA
 3500569 3500570 Patl_0762 Patl_0763     TRUE 0.991 -3.000 0.125 NA   NA
 3500572 3500573 Patl_0765 Patl_0766     FALSE 0.004 431.000 0.000 1.000   NA
 3500573 3500574 Patl_0766 Patl_0767     FALSE 0.022 507.000 0.000 1.000 Y NA
 3500574 3500575 Patl_0767 Patl_0768     TRUE 0.604 120.000 0.154 1.000   NA
 3500577 3500578 Patl_0770 Patl_0771     TRUE 0.997 3.000 0.176 NA Y NA
 3500578 3500579 Patl_0771 Patl_0772     TRUE 0.996 3.000 0.143 NA Y NA
 3500579 3500580 Patl_0772 Patl_0773     FALSE 0.174 86.000 0.000 1.000 N NA
 3500580 3500581 Patl_0773 Patl_0774     TRUE 0.792 112.000 0.300 NA   NA
 3500581 3500582 Patl_0774 Patl_0775     FALSE 0.006 343.000 0.000 NA   NA
 3500584 3500585 Patl_0777 Patl_0778     FALSE 0.003 510.000 0.000 NA   NA
 3500585 3500586 Patl_0778 Patl_0779     TRUE 0.995 10.000 0.615 NA N NA
 3500589 3500590 Patl_0782 Patl_0783     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3500590 3500591 Patl_0783 Patl_0784     FALSE 0.048 166.000 0.000 NA   NA
 3500591 3500592 Patl_0784 Patl_0785     FALSE 0.086 140.000 0.000 1.000   NA
 3500592 3500593 Patl_0785 Patl_0786     FALSE 0.263 171.000 0.000 NA Y NA
 3500593 3500594 Patl_0786 Patl_0787     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA N NA
 3500594 3500595 Patl_0787 Patl_0788     FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 3500595 3500596 Patl_0788 Patl_0789     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 3500596 3500597 Patl_0789 Patl_0790     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 3500598 3500599 Patl_0791 Patl_0792     TRUE 0.756 40.000 0.047 0.015   NA
 3500599 3500600 Patl_0792 Patl_0793     FALSE 0.195 100.000 0.000 1.000   NA
 3500600 3500601 Patl_0793 Patl_0794     FALSE 0.152 113.000 0.000 1.000   NA
 3500601 3500602 Patl_0794 Patl_R0015     FALSE 0.002 617.000 0.000 NA   NA
 3500604 3500605 Patl_0796 Patl_0797     FALSE 0.002 592.000 0.000 1.000 N NA
 3500605 3500606 Patl_0797 Patl_0798     TRUE 0.976 0.000 0.040 1.000   NA
 3500606 3500607 Patl_0798 Patl_0799     TRUE 0.793 11.000 0.000 1.000   NA
 3500609 3500610 Patl_0801 Patl_0802     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 3500610 3500611 Patl_0802 Patl_0803     TRUE 0.919 -22.000 0.000 NA   NA
 3500611 3500612 Patl_0803 Patl_0804     FALSE 0.006 342.000 0.000 NA   NA
 3500612 3500613 Patl_0804 Patl_0805     TRUE 0.838 13.000 0.000 0.009   NA
 3500614 3500615 Patl_0806 Patl_0807     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 3500615 3500616 Patl_0807 Patl_0808     FALSE 0.216 91.000 0.000 NA   NA
 3500616 3500617 Patl_0808 Patl_0809     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3500618 3500619 Patl_0810 Patl_0811     FALSE 0.343 45.000 0.000 NA   NA
 3500619 3500620 Patl_0811 Patl_0812     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500620 3500621 Patl_0812 Patl_0813     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3500622 3500623 Patl_0814 Patl_0815     TRUE 0.813 10.000 0.000 NA   NA
 3500623 3500624 Patl_0815 Patl_0816     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 3500624 3500625 Patl_0816 Patl_0817     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500627 3500628 Patl_0819 Patl_0820     TRUE 0.951 16.000 0.000 0.005 Y NA
 3500628 3500629 Patl_0820 Patl_0821     TRUE 0.853 3.000 0.000 1.000 N NA
 3500630 3500631 Patl_0822 Patl_0823     FALSE 0.052 162.000 0.000 NA   NA
 3500631 3500632 Patl_0823 Patl_0824     TRUE 0.498 42.000 0.000 0.026   NA
 3500634 3500635 Patl_0826 Patl_0827     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3500635 3500636 Patl_0827 Patl_0828     TRUE 0.818 5.000 0.000 1.000 N NA
 3500636 3500637 Patl_0828 Patl_0829     FALSE 0.262 46.000 0.000 1.000 N NA
 3500638 3500639 Patl_0830 Patl_0831     FALSE 0.332 51.000 0.000 1.000   NA
 3500640 3500641 Patl_0832 Patl_0833     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3500641 3500642 Patl_0833 Patl_0834     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3500642 3500643 Patl_0834 Patl_0835     TRUE 0.743 13.000 0.000 1.000   NA
 3500643 3500644 Patl_0835 Patl_0836     TRUE 0.546 23.000 0.000 1.000   NA
 3500644 3500645 Patl_0836 Patl_0837     TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 3500650 3500651 Patl_0842 Patl_0843     TRUE 0.592 122.000 0.000 0.009 Y NA
 3500651 3500652 Patl_0843 Patl_0844     FALSE 0.002 645.000 0.000 1.000 N NA
 3500655 3500656 Patl_0847 Patl_0848     FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 3500656 3500657 Patl_0848 Patl_0849     FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3500657 3500658 Patl_0849 Patl_0850     FALSE 0.018 199.000 0.000 1.000 N NA
 3500662 3500663 Patl_0854 Patl_0855     TRUE 0.980 0.000 0.053 NA   NA
 3500663 3500664 Patl_0855 Patl_0856     TRUE 0.541 57.000 0.027 NA   NA
 3500664 3500665 Patl_0856 Patl_0857     TRUE 0.994 11.000 0.526 NA   NA
 3500665 3500666 Patl_0857 Patl_0858     TRUE 0.998 6.000 0.737 NA   NA
 3500666 3500667 Patl_0858 Patl_0859     TRUE 0.998 -3.000 0.529 0.053 N NA
 3500667 3500668 Patl_0859 Patl_0860     FALSE 0.002 623.000 0.000 NA   NA
 3500668 3500669 Patl_0860 Patl_0861     FALSE 0.197 97.000 0.000 NA   NA
 3500670 3500671 Patl_0862 Patl_0863     FALSE 0.012 328.000 0.000 0.008   NA
 3500672 3500673 Patl_0864 Patl_0865     FALSE 0.002 1407.000 0.000 NA   NA
 3500675 3500676 Patl_0867 Patl_0868     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 3500676 3500677 Patl_0868 Patl_0869     FALSE 0.340 46.000 0.000 NA   NA
 3500677 3500678 Patl_0869 Patl_0870     FALSE 0.016 207.000 0.000 1.000 N NA
 3500679 3500680 Patl_0871 Patl_0872     FALSE 0.372 27.000 0.000 NA N NA
 3500681 3500682 Patl_0873 Patl_0874     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3500684 3500685 Patl_0876 Patl_0877     FALSE 0.004 399.000 0.000 NA   NA
 3500685 3500686 Patl_0877 Patl_0878     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 3500686 3500687 Patl_0878 Patl_0879     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3500687 3500688 Patl_0879 Patl_0880     FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 3500688 3500689 Patl_0880 Patl_0881     TRUE 0.546 23.000 0.000 1.000   NA
 3500689 3500690 Patl_0881 Patl_0882     FALSE 0.003 470.000 0.000 NA   NA
 3500690 3500691 Patl_0882 Patl_0883     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 3500692 3500693 Patl_0884 Patl_0885     FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 3500693 3500694 Patl_0885 Patl_0886     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA   NA
 3500694 3500695 Patl_0886 Patl_0887     FALSE 0.159 107.000 0.000 NA   NA
 3500696 3500697 Patl_0888 Patl_0889     TRUE 0.787 76.000 0.000 0.005 Y NA
 3500697 3500698 Patl_0889 Patl_0890     FALSE 0.071 148.000 0.000 NA   NA
 3500698 3500699 Patl_0890 Patl_0891     FALSE 0.048 166.000 0.000 NA   NA
 3500699 3500700 Patl_0891 Patl_0892     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000   NA
 3500700 3500701 Patl_0892 Patl_0893     TRUE 0.998 0.000 0.600 NA   NA
 3500701 3500702 Patl_0893 Patl_0894     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 3500702 3500703 Patl_0894 Patl_0895     FALSE 0.238 54.000 0.000 1.000 N NA
 3500703 3500704 Patl_0895 Patl_0896     FALSE 0.005 415.000 0.000 0.074 N NA
 3500704 3500705 Patl_0896 Patl_0897     TRUE 0.990 0.000 0.118 0.074 N NA
 3500705 3500706 Patl_0897 Patl_0898     TRUE 0.804 6.000 0.000 1.000 N NA
 3500706 3500707 Patl_0898 Patl_0899     TRUE 0.882 67.000 0.072 1.000 Y NA
 3500707 3500708 Patl_0899 Patl_0900     FALSE 0.111 131.000 0.000 1.000   NA
 3500708 3500709 Patl_0900 Patl_0901     FALSE 0.059 159.000 0.000 1.000   NA
 3500710 3500711 Patl_0902 Patl_0903     FALSE 0.007 321.000 0.000 NA   NA
 3500711 3500712 Patl_0903 Patl_0904     TRUE 0.652 16.000 0.000 NA   NA
 3500713 3500714 Patl_0905 Patl_0906     FALSE 0.305 61.000 0.000 1.000   NA
 3500714 3500715 Patl_0906 Patl_0907     FALSE 0.039 180.000 0.000 1.000   NA
 3500716 3500717 Patl_0908 Patl_0909     FALSE 0.069 149.000 0.000 NA   NA
 3500718 3500719 Patl_0910 Patl_0911     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 3500722 3500723 Patl_0914 Patl_0915     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3500724 3500725 Patl_0916 Patl_0917     FALSE 0.002 688.000 0.000 NA   NA
 3500725 3500726 Patl_0917 Patl_0918     TRUE 0.985 -7.000 0.077 NA   NA
 3500726 3500727 Patl_0918 Patl_0919     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 3500727 3500728 Patl_0919 Patl_0920     FALSE 0.002 1330.000 0.000 NA   NA
 3500728 3500729 Patl_0920 Patl_0921     TRUE 0.908 130.000 0.775 NA   NA
 3500731 3500732 Patl_0923 Patl_0924     FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 3500732 3500733 Patl_0924 Patl_0925     FALSE 0.002 433.000 0.000 1.000 N NA
 3500733 3500734 Patl_0925 Patl_0926     TRUE 0.962 101.000 0.466 1.000 Y NA
 3500734 3500735 Patl_0926 Patl_0927     TRUE 0.999 0.000 0.618 NA Y NA
 3500736 3500737 Patl_0928 Patl_0929     FALSE 0.234 86.000 0.000 NA   NA
 3500739 3500740 Patl_0931 Patl_0932     FALSE 0.043 174.000 0.000 NA   NA
 3500740 3500741 Patl_0932 Patl_0933     FALSE 0.002 843.000 0.000 NA   NA
 3500741 3500742 Patl_0933 Patl_0934     FALSE 0.343 167.000 0.159 NA   NA
 3500742 3500743 Patl_0934 Patl_0935     FALSE 0.052 188.000 0.000 0.058   NA
 3500743 3500744 Patl_0935 Patl_0936     TRUE 0.549 117.000 0.000 1.000 Y NA
 3500744 3500745 Patl_0936 Patl_0937     TRUE 0.998 3.000 0.667 1.000 N NA
 3500745 3500746 Patl_0937 Patl_0938     FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 3500746 3500747 Patl_0938 Patl_0939     FALSE 0.031 189.000 0.000 NA   NA
 3500748 3500749 Patl_0940 Patl_0941     TRUE 0.994 6.000 0.385 1.000 N NA
 3500752 3500753 Patl_0944 Patl_0945     TRUE 0.979 8.000 0.133 NA   NA
 3500756 3500757 Patl_0948 Patl_0949     TRUE 0.973 12.000 0.185 1.000 N NA
 3500757 3500758 Patl_0949 Patl_0950     TRUE 0.811 94.000 0.051 1.000 Y NA
 3500758 3500759 Patl_0950 Patl_0951     TRUE 0.999 3.000 0.687 1.000 Y NA
 3500759 3500760 Patl_0951 Patl_0952   fabG TRUE 0.965 60.000 0.293 1.000 Y NA
 3500760 3500761 Patl_0952 Patl_0953 fabG   FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 3500761 3500762 Patl_0953 Patl_0954     FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 3500763 3500764 Patl_0955 Patl_0956     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 3500765 3500766 Patl_0957 Patl_0958     FALSE 0.009 281.000 0.000 NA   NA
 3500766 3500767 Patl_0958 Patl_0959     TRUE 0.925 0.000 0.000 1.000   NA
 3500767 3500768 Patl_0959 Patl_0960     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3500772 3500773 Patl_0964 Patl_0965     FALSE 0.343 93.000 0.011 NA   NA
 3500774 3500775 Patl_0966 Patl_0967     FALSE 0.019 217.000 0.000 NA   NA
 3500775 3500776 Patl_0967 Patl_0968     FALSE 0.002 457.000 0.000 1.000 N NA
 3500776 3500777 Patl_0968 Patl_0969     FALSE 0.030 313.000 0.071 1.000 N NA
 3500778 3500779 Patl_0970 Patl_0971     TRUE 0.997 2.000 0.163 1.000 Y NA
 3500779 3500780 Patl_0971 Patl_0972     TRUE 0.995 10.000 0.202 1.000 Y NA
 3500780 3500781 Patl_0972 Patl_0973     TRUE 0.989 3.000 0.012 1.000 Y NA
 3500781 3500782 Patl_0973 Patl_0974     TRUE 0.985 6.000 0.013 1.000 Y NA
 3500783 3500784 Patl_0975 Patl_0976     FALSE 0.280 66.000 0.000 NA   NA
 3500784 3500785 Patl_0976 Patl_0977     FALSE 0.261 78.000 0.000 NA   NA
 3500785 3500786 Patl_0977 Patl_0978     TRUE 0.909 24.000 0.004 1.000 Y NA
 3500786 3500787 Patl_0978 Patl_0979     TRUE 0.999 0.000 0.278 1.000 Y NA
 3500787 3500788 Patl_0979 Patl_0980     TRUE 0.891 36.000 0.025 1.000 Y NA
 3500788 3500789 Patl_0980 Patl_0981     TRUE 0.994 10.000 0.171 1.000 Y NA
 3500789 3500790 Patl_0981 Patl_0982   argC TRUE 0.997 -3.000 0.097 0.002 Y NA
 3500791 3500792 Patl_0983 Patl_0984     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3500792 3500793 Patl_0984 Patl_0985   mgsA FALSE 0.286 63.000 0.000 NA   NA
 3500795 3500796 Patl_0987 Patl_0988     TRUE 0.995 -3.000 0.035 1.000 Y NA
 3500796 3500797 Patl_0988 Patl_0989     FALSE 0.017 202.000 0.000 1.000 N NA
 3500797 3500798 Patl_0989 Patl_0990     FALSE 0.211 66.000 0.000 1.000 N NA
 3500800 3500801 Patl_0992 Patl_0993     FALSE 0.282 71.000 0.000 1.000   NA
 3500801 3500802 Patl_0993 Patl_0994     FALSE 0.178 140.000 0.019 1.000   NA
 3500802 3500803 Patl_0994 Patl_0995     TRUE 0.989 3.000 0.147 0.017 N NA
 3500805 3500806 Patl_0997 Patl_0998     FALSE 0.036 163.000 0.000 1.000 N NA
 3500806 3500807 Patl_0998 Patl_0999     FALSE 0.002 534.000 0.000 1.000 N NA
 3500807 3500808 Patl_0999 Patl_1000   rplX TRUE 0.999 13.000 0.810 0.017 Y NA
 3500808 3500809 Patl_1000 Patl_1001 rplX rplE TRUE 0.998 16.000 0.758 0.013 Y NA
 3500809 3500810 Patl_1001 Patl_1002 rplE   TRUE 0.998 11.000 0.496 0.013 Y NA
 3500810 3500811 Patl_1002 Patl_1003   rpsH TRUE 0.997 13.000 0.473 0.013 Y NA
 3500811 3500812 Patl_1003 Patl_1004 rpsH rplF TRUE 0.999 11.000 0.808 0.013 Y NA
 3500812 3500813 Patl_1004 Patl_1005 rplF   TRUE 0.999 13.000 0.815 0.013 Y NA
 3500813 3500814 Patl_1005 Patl_1006   rpsE TRUE 0.999 10.000 0.814 0.017 Y NA
 3500814 3500815 Patl_1006 Patl_1007 rpsE   TRUE 1.000 1.000 0.789 0.017 Y NA
 3500815 3500816 Patl_1007 Patl_1008   rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 3500816 3500817 Patl_1008 Patl_1009 rplO secY TRUE 0.998 6.000 0.730 1.000 N NA
 3500817 3500818 Patl_1009 Patl_1010 secY   TRUE 0.862 25.000 0.089 1.000   NA
 3500818 3500819 Patl_1010 Patl_1011   rpsM TRUE 0.688 126.000 0.194 0.013   NA
 3500819 3500820 Patl_1011 Patl_1012 rpsM   TRUE 0.999 13.000 0.810 0.013 Y NA
 3500820 3500821 Patl_1012 Patl_1013   rpsD TRUE 0.994 25.000 0.509 0.017 Y NA
 3500821 3500822 Patl_1013 Patl_1014 rpsD   TRUE 0.980 23.000 0.549 1.000 N NA
 3500822 3500823 Patl_1014 Patl_1015   rplQ TRUE 0.983 38.000 0.873 1.000 N NA
 3500825 3500826 Patl_R0016 Patl_R0017     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3500826 3500827 Patl_R0017 Patl_R0018     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3500827 3500828 Patl_R0018 Patl_R0019     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3500828 3500829 Patl_R0019 Patl_R0020     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3500829 3500830 Patl_R0020 Patl_1017     FALSE 0.002 606.000 0.000 NA   NA
 3500831 3500832 Patl_1018 Patl_1019     TRUE 0.940 -16.000 0.008 1.000 N NA
 3500833 3500834 Patl_1020 Patl_1021     TRUE 0.982 -16.000 0.077 1.000 N NA
 3500834 3500835 Patl_1021 Patl_1022     TRUE 0.999 3.000 0.315 0.001 Y NA
 3500835 3500836 Patl_1022 Patl_1023     FALSE 0.144 97.000 0.000 1.000 N NA
 3500838 3500839 Patl_1025 Patl_1026 glnA   FALSE 0.146 170.000 0.044 NA   NA
 3500839 3500840 Patl_1026 Patl_1027     TRUE 0.806 84.000 0.188 NA   NA
 3500840 3500841 Patl_1027 Patl_1028     TRUE 1.000 -3.000 0.587 0.089 Y NA
 3500843 3500844 Patl_1030 Patl_1031     TRUE 0.857 33.000 0.121 NA   NA
 3500844 3500845 Patl_1031 Patl_1032     FALSE 0.260 122.000 0.022 NA   NA
 3500845 3500846 Patl_1032 Patl_1033     FALSE 0.003 450.000 0.000 NA   NA
 3500846 3500847 Patl_1033 Patl_1034     TRUE 0.971 38.000 0.500 0.001   NA
 3500847 3500848 Patl_1034 Patl_1035     FALSE 0.004 422.000 0.000 1.000   NA
 3500848 3500849 Patl_1035 Patl_1036     FALSE 0.005 375.000 0.000 1.000   NA
 3500849 3500850 Patl_1036 Patl_1037     TRUE 0.997 6.000 0.680 NA N NA
 3500851 3500852 Patl_1038 Patl_1039     TRUE 0.612 146.000 0.299 1.000 N NA
 3500852 3500853 Patl_1039 Patl_1040     FALSE 0.382 155.000 0.137 1.000   NA
 3500853 3500854 Patl_1040 Patl_1041   rpsU TRUE 0.821 85.000 0.173 0.020   NA
 3500857 3500858 Patl_1044 Patl_1045     TRUE 0.994 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 3500858 3500859 Patl_1045 Patl_1046     TRUE 0.990 -3.000 0.125 1.000 N NA
 3500859 3500860 Patl_1046 Patl_1047     TRUE 0.548 25.000 0.005 1.000 N NA
 3500861 3500862 Patl_1048 Patl_1049     FALSE 0.376 41.000 0.000 1.000   NA
 3500864 3500865 Patl_1051 Patl_1052 rdgC   TRUE 0.943 100.000 0.750 1.000 N NA
 3500866 3500867 Patl_1053 Patl_1054     TRUE 0.980 62.000 0.453 0.089 Y NA
 3500867 3500868 Patl_1054 Patl_1055     FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 3500868 3500869 Patl_1055 Patl_1056     TRUE 0.917 68.000 0.373 NA   NA
 3500873 3500874 Patl_1060 Patl_1061     TRUE 0.998 8.000 0.933 NA   NA
 3500874 3500875 Patl_1061 Patl_1062     TRUE 0.993 12.000 0.455 0.017   NA
 3500875 3500876 Patl_1062 Patl_1063     TRUE 0.960 31.000 0.333 0.068   NA
 3500876 3500877 Patl_1063 Patl_1064     TRUE 0.998 4.000 0.786 1.000 N NA
 3500877 3500878 Patl_1064 Patl_1065     TRUE 0.968 12.000 0.143 1.000   NA
 3500878 3500879 Patl_1065 Patl_1066     FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000   NA
 3500879 3500880 Patl_1066 Patl_1067     TRUE 0.536 120.000 0.000 1.000 Y NA
 3500880 3500881 Patl_1067 Patl_1068     FALSE 0.003 503.000 0.000 NA   NA
 3500881 3500882 Patl_1068 Patl_1069     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500884 3500885 Patl_1071 Patl_1072     TRUE 0.977 24.000 0.474 1.000   NA
 3500885 3500886 Patl_1072 Patl_1073     TRUE 0.996 18.000 0.581 1.000 Y NA
 3500886 3500887 Patl_1073 Patl_1074     TRUE 0.996 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 3500887 3500888 Patl_1074 Patl_1075     TRUE 0.971 -9.000 0.027 1.000   NA
 3500889 3500890 Patl_1076 Patl_1077     TRUE 0.982 -3.000 0.051 NA   NA
 3500890 3500891 Patl_1077 Patl_1078     FALSE 0.020 215.000 0.000 NA   NA
 3500891 3500892 Patl_1078 Patl_1079     FALSE 0.015 240.000 0.000 NA   NA
 3500892 3500893 Patl_1079 Patl_1080     TRUE 0.774 22.000 0.029 NA   NA
 3500894 3500895 Patl_1081 Patl_1082     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 3500898 3500899 Patl_1085 Patl_1086     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3500900 3500901 Patl_1087 Patl_1088     FALSE 0.094 247.000 0.000 1.000 Y NA
 3500901 3500902 Patl_1088 Patl_1089     TRUE 0.990 10.000 0.070 0.014 Y NA
 3500902 3500903 Patl_1089 Patl_1090     TRUE 0.999 4.000 0.667 0.014 Y NA
 3500903 3500904 Patl_1090 Patl_1091     TRUE 0.982 15.000 0.333 NA   NA
 3500904 3500905 Patl_1091 Patl_1092     TRUE 0.992 -3.000 0.143 NA   NA
 3500907 3500908 Patl_1094 Patl_1095     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3500909 3500910 Patl_1096 Patl_1097     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA   NA
 3500911 3500912 Patl_1098 Patl_1099     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 3500912 3500913 Patl_1099 Patl_1100     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 3500913 3500914 Patl_1100 Patl_1101     FALSE 0.004 432.000 0.000 NA   NA
 3500914 3500915 Patl_1101 Patl_1102     FALSE 0.006 348.000 0.000 NA   NA
 3500916 3500917 Patl_1103 Patl_1104     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3500917 3500918 Patl_1104 Patl_1105     FALSE 0.068 150.000 0.000 NA   NA
 3500918 3500919 Patl_1105 Patl_1106     FALSE 0.141 115.000 0.000 NA   NA
 3500920 3500921 Patl_1107 Patl_1108     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3500921 3500922 Patl_1108 Patl_1109     FALSE 0.008 291.000 0.000 NA   NA
 3500923 3500924 Patl_1110 Patl_1111     FALSE 0.002 919.000 0.000 1.000   NA
 3500924 3500925 Patl_1111 Patl_1112     FALSE 0.010 283.000 0.000 1.000   NA
 3500927 3500928 Patl_1114 Patl_1115     TRUE 0.991 3.000 0.013 0.073 Y NA
 3500929 3500930 Patl_1116 Patl_1117     FALSE 0.003 516.000 0.000 1.000   NA
 3500930 3500931 Patl_1117 Patl_1118     FALSE 0.007 276.000 0.000 1.000 N NA
 3500931 3500932 Patl_1118 Patl_1119     TRUE 0.628 17.000 0.000 NA   NA
 3500932 3500933 Patl_1119 Patl_1120     TRUE 0.989 21.000 0.689 NA   NA
 3500933 3500934 Patl_1120 Patl_1121     FALSE 0.013 250.000 0.000 NA   NA
 3500935 3500936 Patl_1122 Patl_1123     FALSE 0.004 333.000 0.000 1.000 N NA
 3500936 3500937 Patl_1123 Patl_1124     TRUE 0.577 66.000 0.051 1.000 N NA
 3500937 3500938 Patl_1124 Patl_1125     TRUE 0.933 74.000 0.175 1.000 Y NA
 3500938 3500939 Patl_1125 Patl_1126     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 3500939 3500940 Patl_1126 Patl_1127     TRUE 0.569 109.000 0.108 NA   NA
 3500940 3500941 Patl_1127 Patl_1128     TRUE 0.687 94.000 0.143 1.000 N NA
 3500943 3500944 Patl_1130 Patl_1131     TRUE 0.793 140.000 0.463 0.005 N NA
 3500944 3500945 Patl_1131 Patl_1132     TRUE 0.736 23.000 0.029 1.000 N NA
 3500945 3500946 Patl_1132 Patl_1133     TRUE 0.594 15.000 0.000 1.000 N NA
 3500946 3500947 Patl_1133 Patl_1134     TRUE 0.953 0.000 0.014 1.000 N NA
 3500947 3500948 Patl_1134 Patl_1135     TRUE 0.994 5.000 0.078 0.005 Y NA
 3500948 3500949 Patl_1135 Patl_1136     TRUE 0.936 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3500949 3500950 Patl_1136 Patl_1137     TRUE 0.837 42.000 0.155 1.000 N NA
 3500950 3500951 Patl_1137 Patl_1138     TRUE 0.822 86.000 0.043 1.000 Y NA
 3500951 3500952 Patl_1138 Patl_1139     TRUE 0.931 36.000 0.049 0.005 Y NA
 3500952 3500953 Patl_1139 Patl_1140     FALSE 0.010 239.000 0.000 1.000 N NA
 3500953 3500954 Patl_1140 Patl_1141     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3500954 3500955 Patl_1141 Patl_R0021     FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 3500956 3500957 Patl_1142 Patl_1143     TRUE 0.581 147.000 0.250 NA   NA
 3500958 3500959 Patl_1144 Patl_R0022     FALSE 0.004 394.000 0.000 NA   NA
 3500962 3500963 Patl_1147 Patl_1148     FALSE 0.011 270.000 0.000 1.000   NA
 3500963 3500964 Patl_1148 Patl_1149     FALSE 0.004 439.000 0.000 1.000   NA
 3500964 3500965 Patl_1149 Patl_1150     TRUE 0.896 28.000 0.000 0.027 Y NA
 3500965 3500966 Patl_1150 Patl_1151     TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.027 Y NA
 3500966 3500967 Patl_1151 Patl_1152     FALSE 0.011 233.000 0.000 1.000 N NA
 3500967 3500968 Patl_1152 Patl_1153     TRUE 0.988 -10.000 0.120 NA N NA
 3500968 3500969 Patl_1153 Patl_1154     TRUE 0.845 83.000 0.263 NA N NA
 3500969 3500970 Patl_1154 Patl_1155     FALSE 0.003 391.000 0.000 1.000 N NA
 3500970 3500971 Patl_1155 Patl_1156     FALSE 0.069 134.000 0.000 1.000 N NA
 3500978 3500979 Patl_1163 Patl_1164     FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 3500979 3500980 Patl_1164 Patl_1165     FALSE 0.017 228.000 0.000 NA   NA
 3500982 3500983 Patl_1167 Patl_1168     TRUE 0.981 0.000 0.057 1.000   NA
 3500983 3500984 Patl_1168 Patl_1169     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3500984 3500985 Patl_1169 Patl_1170     TRUE 0.993 30.000 0.633 1.000 Y NA
 3500986 3500987 Patl_1171 Patl_1172     TRUE 0.950 3.000 0.029 NA N NA
 3500987 3500988 Patl_1172 Patl_1173     TRUE 0.817 22.000 0.043 1.000   NA
 3500988 3500989 Patl_1173 Patl_1174     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3500989 3500990 Patl_1174 Patl_1175     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3500991 3500992 Patl_1176 Patl_1177     TRUE 0.690 29.000 0.026 NA   NA
 3500992 3500993 Patl_1177 Patl_1178     TRUE 0.967 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3500994 3500995 Patl_1179 Patl_1180     FALSE 0.101 133.000 0.000 NA   NA
 3500995 3500996 Patl_1180 Patl_1181     FALSE 0.424 33.000 0.000 NA   NA
 3500997 3500998 Patl_1182 Patl_1183     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500998 3500999 Patl_1183 Patl_1184     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA N NA
 3500999 3501000 Patl_1184 Patl_1185     FALSE 0.030 168.000 0.000 NA N NA
 3501000 3501001 Patl_1185 Patl_1186     FALSE 0.051 144.000 0.000 NA N NA
 3501001 3501002 Patl_1186 Patl_1187     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3501002 3501003 Patl_1187 Patl_1188     TRUE 0.986 -3.000 0.077 1.000   NA
 3501003 3501004 Patl_1188 Patl_1189     FALSE 0.347 44.000 0.000 NA   NA
 3501004 3501005 Patl_1189 Patl_1190     FALSE 0.204 95.000 0.000 NA   NA
 3501005 3501006 Patl_1190 Patl_1191     TRUE 0.939 26.000 0.222 1.000   NA
 3501006 3501007 Patl_1191 Patl_1192     TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000   NA
 3501007 3501008 Patl_1192 Patl_1193     TRUE 0.997 4.000 0.500 1.000   NA
 3501008 3501009 Patl_1193 Patl_1194     TRUE 0.979 14.000 0.300 1.000 N NA
 3501009 3501010 Patl_1194 Patl_1195     TRUE 0.552 74.000 0.036 1.000   NA
 3501010 3501011 Patl_1195 Patl_1196     TRUE 0.978 -3.000 0.036 1.000   NA
 3501011 3501012 Patl_1196 Patl_1197     TRUE 0.988 0.000 0.100 1.000   NA
 3501012 3501013 Patl_1197 Patl_1198     TRUE 0.995 4.000 0.120 NA Y NA
 3501013 3501014 Patl_1198 Patl_1199     TRUE 0.934 31.000 0.250 NA   NA
 3501014 3501015 Patl_1199 Patl_1200     TRUE 0.980 8.000 0.143 NA   NA
 3501015 3501016 Patl_1200 Patl_1201     FALSE 0.390 37.000 0.000 NA   NA
 3501016 3501017 Patl_1201 Patl_1202     FALSE 0.068 152.000 0.000 1.000   NA
 3501017 3501018 Patl_1202 Patl_1203     FALSE 0.017 227.000 0.000 NA   NA
 3501018 3501019 Patl_1203 Patl_1204     FALSE 0.005 377.000 0.000 NA   NA
 3501019 3501020 Patl_1204 Patl_1205     FALSE 0.447 32.000 0.000 1.000   NA
 3501020 3501021 Patl_1205 Patl_1206     FALSE 0.213 92.000 0.000 NA   NA
 3501021 3501022 Patl_1206 Patl_1207     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501023 3501024 Patl_1208 Patl_1209     FALSE 0.077 144.000 0.000 NA   NA
 3501024 3501025 Patl_1209 Patl_1210     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3501025 3501026 Patl_1210 Patl_1211     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3501026 3501027 Patl_1211 Patl_1212     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501028 3501029 Patl_1213 Patl_1214     TRUE 0.793 99.000 0.250 1.000 N NA
 3501029 3501030 Patl_1214 Patl_1215     FALSE 0.008 264.000 0.000 1.000 N NA
 3501032 3501033 Patl_1217 Patl_1218     FALSE 0.245 116.000 0.013 NA   NA
 3501033 3501034 Patl_1218 Patl_1219     FALSE 0.438 68.000 0.013 NA   NA
 3501034 3501035 Patl_1219 Patl_1220     TRUE 0.964 9.000 0.079 NA   NA
 3501035 3501036 Patl_1220 Patl_1221     TRUE 0.949 9.000 0.045 NA   NA
 3501036 3501037 Patl_1221 Patl_1222     TRUE 0.965 27.000 0.379 NA   NA
 3501037 3501038 Patl_1222 Patl_1223     TRUE 0.997 2.000 0.455 NA   NA
 3501038 3501039 Patl_1223 Patl_1224     FALSE 0.274 178.000 0.143 NA   NA
 3501039 3501040 Patl_1224 Patl_1225     TRUE 0.995 16.000 0.911 NA   NA
 3501041 3501042 Patl_1226 Patl_1227     FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 3501042 3501043 Patl_1227 Patl_1228     TRUE 0.802 181.000 0.360 0.001 Y NA
 3501043 3501044 Patl_1228 Patl_1229   yajC TRUE 0.945 31.000 0.325 NA N NA
 3501044 3501045 Patl_1229 Patl_1230 yajC secD TRUE 0.779 78.000 0.009 NA Y NA
 3501045 3501046 Patl_1230 Patl_1231 secD   TRUE 0.987 11.000 0.045 0.001 Y NA
 3501048 3501049 Patl_1233 Patl_1234     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3501049 3501050 Patl_1234 Patl_1235     FALSE 0.434 32.000 0.000 NA   NA
 3501050 3501051 Patl_1235 Patl_1236     TRUE 0.991 3.000 0.208 1.000 N NA
 3501051 3501052 Patl_1236 Patl_1237     TRUE 0.694 126.000 0.271 1.000 N NA
 3501052 3501053 Patl_1237 Patl_1238     TRUE 0.980 17.000 0.424 1.000 N NA
 3501053 3501054 Patl_1238 Patl_1239     TRUE 0.927 64.000 0.448 1.000 N NA
 3501054 3501055 Patl_1239 Patl_1240     TRUE 0.973 26.000 0.359 0.001   NA
 3501055 3501056 Patl_1240 Patl_1241   hscB TRUE 0.817 135.000 0.500 1.000   NA
 3501056 3501057 Patl_1241 Patl_1242 hscB   TRUE 0.996 21.000 0.634 1.000 Y NA
 3501057 3501058 Patl_1242 Patl_1243     TRUE 0.975 47.000 0.794 1.000 N NA
 3501058 3501059 Patl_1243 Patl_1244     FALSE 0.084 139.000 0.000 NA   NA
 3501060 3501061 Patl_1245 Patl_1246     FALSE 0.405 111.000 0.046 1.000   NA
 3501061 3501062 Patl_1246 Patl_1247     FALSE 0.097 136.000 0.000 1.000   NA
 3501062 3501063 Patl_1247 Patl_1248     TRUE 0.542 148.000 0.243 1.000 N NA
 3501064 3501065 Patl_1249 Patl_1250   tsf TRUE 0.962 133.000 0.748 1.000 Y NA
 3501065 3501066 Patl_1250 Patl_1251 tsf pyrH FALSE 0.244 268.000 0.416 1.000 N NA
 3501066 3501067 Patl_1251 Patl_1252 pyrH   TRUE 0.990 16.000 0.626 1.000 N NA
 3501067 3501068 Patl_1252 Patl_1253     TRUE 0.984 15.000 0.409 1.000 N NA
 3501068 3501069 Patl_1253 Patl_1254     TRUE 0.978 50.000 0.400 1.000 Y NA
 3501069 3501070 Patl_1254 Patl_1255     TRUE 0.999 0.000 0.372 1.000 Y NA
 3501070 3501071 Patl_1255 Patl_1256     TRUE 0.998 0.000 0.568 1.000 N NA
 3501071 3501072 Patl_1256 Patl_1257     TRUE 0.835 62.000 0.026 1.000 Y NA
 3501072 3501073 Patl_1257 Patl_1258     TRUE 0.917 55.000 0.104 1.000 Y NA
 3501073 3501074 Patl_1258 Patl_1259     TRUE 0.993 43.000 0.814 1.000 Y NA
 3501074 3501075 Patl_1259 Patl_1260     TRUE 0.978 42.000 0.796 1.000 N NA
 3501075 3501076 Patl_1260 Patl_1261     TRUE 0.999 2.000 0.850 1.000 N NA
 3501076 3501077 Patl_1261 Patl_1262     TRUE 0.998 4.000 0.289 1.000 Y NA
 3501077 3501078 Patl_1262 Patl_1263     TRUE 0.992 1.000 0.186 1.000 N NA
 3501078 3501079 Patl_1263 Patl_1264     TRUE 0.996 1.000 0.104 1.000 Y NA
 3501079 3501080 Patl_1264 Patl_1265     TRUE 0.781 49.000 0.122 1.000 N NA
 3501080 3501081 Patl_1265 Patl_1266     TRUE 0.645 97.000 0.123 1.000 N NA
 3501081 3501082 Patl_1266 Patl_1267     FALSE 0.039 160.000 0.000 1.000 N NA
 3501083 3501084 Patl_1268 Patl_1269     FALSE 0.009 298.000 0.000 1.000   NA
 3501085 3501086 Patl_1270 Patl_1271     FALSE 0.111 109.000 0.000 1.000 N NA
 3501086 3501087 Patl_1271 Patl_1272     FALSE 0.204 72.000 0.000 1.000 N NA
 3501087 3501088 Patl_1272 Patl_1273     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3501089 3501090 Patl_1274 Patl_1275     TRUE 0.493 27.000 0.000 1.000   NA
 3501090 3501091 Patl_1275 Patl_1276     FALSE 0.009 285.000 0.000 1.000   NA
 3501091 3501092 Patl_1276 Patl_1277     TRUE 0.499 95.000 0.048 NA   NA
 3501095 3501096 Patl_1280 Patl_1281     FALSE 0.035 186.000 0.000 1.000   NA
 3501096 3501097 Patl_1281 Patl_1282     TRUE 0.840 8.000 0.000 NA   NA
 3501097 3501098 Patl_1282 Patl_1283     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501099 3501100 Patl_1284 Patl_1285     FALSE 0.147 115.000 0.000 1.000   NA
 3501100 3501101 Patl_1285 Patl_1286     FALSE 0.003 549.000 0.000 1.000   NA
 3501101 3501102 Patl_1286 Patl_1287     FALSE 0.200 136.000 0.020 1.000   NA
 3501102 3501103 Patl_1287 Patl_1288     FALSE 0.399 81.000 0.020 1.000 N NA
 3501104 3501105 Patl_1289 Patl_1290     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3501105 3501106 Patl_1290 Patl_1291     TRUE 0.999 3.000 0.480 0.003 Y NA
 3501106 3501107 Patl_1291 Patl_1292     TRUE 0.999 -3.000 0.258 0.003 Y NA
 3501107 3501108 Patl_1292 Patl_1293     TRUE 0.999 0.000 0.273 0.054 Y NA
 3501108 3501109 Patl_1293 Patl_1294     TRUE 0.925 14.000 0.064 0.059 N NA
 3501110 3501111 Patl_1295 Patl_1296     FALSE 0.066 175.000 0.000 0.093   NA
 3501112 3501113 Patl_1297 Patl_1298     TRUE 0.531 24.000 0.000 1.000   NA
 3501113 3501114 Patl_1298 Patl_1299     FALSE 0.011 270.000 0.000 1.000   NA
 3501114 3501115 Patl_1299 Patl_1300     FALSE 0.005 379.000 0.000 NA   NA
 3501116 3501117 Patl_1301 Patl_1302     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501117 3501118 Patl_1302 Patl_1303     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3501118 3501119 Patl_1303 Patl_1304     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3501119 3501120 Patl_1304 Patl_1305     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501120 3501121 Patl_1305 Patl_1306     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3501121 3501122 Patl_1306 Patl_1307     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3501122 3501123 Patl_1307 Patl_1308     FALSE 0.002 933.000 0.000 NA   NA
 3501123 3501124 Patl_1308 Patl_1309     TRUE 0.813 10.000 0.000 NA   NA
 3501125 3501126 Patl_1310 Patl_1311     TRUE 0.883 59.000 0.277 NA N NA
 3501126 3501127 Patl_1311 Patl_1312     TRUE 0.900 144.000 0.456 1.000 Y NA
 3501127 3501128 Patl_1312 Patl_1313     TRUE 0.822 96.000 0.065 1.000 Y NA
 3501128 3501129 Patl_1313 Patl_1314     FALSE 0.213 250.000 0.049 0.001 Y NA
 3501129 3501130 Patl_1314 Patl_1315     TRUE 0.996 1.000 0.347 1.000 N NA
 3501130 3501131 Patl_1315 Patl_1316     TRUE 0.840 73.000 0.225 1.000 N NA
 3501131 3501132 Patl_1316 Patl_1317     TRUE 0.993 0.000 0.206 1.000 N NA
 3501132 3501133 Patl_1317 Patl_1318     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3501134 3501135 Patl_1319 Patl_1320     TRUE 0.965 46.000 0.246 1.000 Y NA
 3501135 3501136 Patl_1320 Patl_1321     TRUE 0.992 0.000 0.177 1.000 N NA
 3501137 3501138 Patl_1322 Patl_1323   motB TRUE 0.999 4.000 0.566 1.000 Y NA
 3501139 3501140 Patl_1324 Patl_1325     TRUE 0.993 9.000 0.395 NA   NA
 3501140 3501141 Patl_1325 Patl_1326     TRUE 0.958 4.000 0.032 NA   NA
 3501141 3501142 Patl_1326 Patl_1327     TRUE 0.995 2.000 0.311 NA   NA
 3501142 3501143 Patl_1327 Patl_1328     TRUE 0.999 0.000 0.722 NA   NA
 3501143 3501144 Patl_1328 Patl_1329     TRUE 0.969 17.000 0.217 0.051   NA
 3501144 3501145 Patl_1329 Patl_1330     TRUE 0.998 -3.000 0.533 NA   NA
 3501146 3501147 Patl_1331 Patl_1332     TRUE 0.704 56.000 0.077 1.000   NA
 3501147 3501148 Patl_1332 Patl_1333     TRUE 0.999 -7.000 0.898 NA N NA
 3501150 3501151 Patl_1335 Patl_1336     TRUE 0.984 7.000 0.168 NA   NA
 3501151 3501152 Patl_1336 Patl_1337     TRUE 0.513 121.000 0.108 NA   NA
 3501153 3501154 Patl_1338 Patl_1339     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 3501155 3501156 Patl_1340 Patl_R0023     FALSE 0.002 871.000 0.000 NA   NA
 3501156 3501157 Patl_R0023 Patl_R0024     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3501157 3501158 Patl_R0024 Patl_R0025     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3501158 3501159 Patl_R0025 Patl_R0026     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3501159 3501160 Patl_R0026 Patl_R0027     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3501162 3501163 Patl_1342 Patl_1343     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501163 3501164 Patl_1343 Patl_R0028     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3501164 3501165 Patl_R0028 Patl_1344     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3501165 3501166 Patl_1344 Patl_1345     TRUE 0.955 16.000 0.171 NA   NA
 3501166 3501167 Patl_1345 Patl_1346     TRUE 0.993 0.000 0.186 NA   NA
 3501167 3501168 Patl_1346 Patl_1347     TRUE 0.987 -22.000 0.118 NA N NA
 3501168 3501169 Patl_1347 Patl_R0029     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501169 3501170 Patl_R0029 Patl_1348     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 3501170 3501171 Patl_1348 Patl_1349     TRUE 0.990 -7.000 0.121 1.000   NA
 3501172 3501173 Patl_1350 Patl_1351     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 3501173 3501174 Patl_1351 Patl_1352     FALSE 0.254 81.000 0.000 NA   NA
 3501174 3501175 Patl_1352 Patl_1353     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501177 3501178 Patl_1355 Patl_1356     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 3501179 3501180 Patl_1357 Patl_1358   prfC FALSE 0.004 353.000 0.000 1.000 N NA
 3501180 3501181 Patl_1358 Patl_1359 prfC   TRUE 0.810 76.000 0.006 0.035 Y NA
 3501181 3501182 Patl_1359 Patl_1360     FALSE 0.127 240.000 0.000 0.035 Y NA
 3501182 3501183 Patl_1360 Patl_1361   lysS TRUE 0.957 44.000 0.162 0.035 Y NA
 3501184 3501185 Patl_1362 Patl_1363     TRUE 0.713 18.000 0.011 1.000 N NA
 3501185 3501186 Patl_1363 Patl_1364     TRUE 0.978 -7.000 0.042 NA   NA
 3501187 3501188 Patl_1365 Patl_1366     TRUE 0.703 92.000 0.127 1.000   NA
 3501188 3501189 Patl_1366 Patl_1367     FALSE 0.012 2741.000 0.103 NA   NA
 3501189 3501190 Patl_1367 Patl_1368     FALSE 0.002 680.000 0.000 NA   NA
 3501192 3501193 Patl_1370 Patl_1371     TRUE 0.688 32.000 0.024 0.071 N NA
 3501195 3501196 Patl_1373 Patl_1374     FALSE 0.376 88.000 0.012 1.000   NA
 3501196 3501197 Patl_1374 Patl_1375     FALSE 0.284 70.000 0.000 1.000   NA
 3501199 3501200 Patl_1377 Patl_1378     FALSE 0.073 149.000 0.000 1.000   NA
 3501201 3501202 Patl_1379 Patl_1380     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 3501203 3501204 Patl_1381 Patl_1382     FALSE 0.258 79.000 0.000 NA   NA
 3501204 3501205 Patl_1382 Patl_1383     FALSE 0.003 491.000 0.000 NA   NA
 3501206 3501207 Patl_1384 Patl_1385     FALSE 0.004 1104.000 0.000 0.007   NA
 3501211 3501212 Patl_1389 Patl_1390     TRUE 0.549 22.000 0.000 NA   NA
 3501212 3501213 Patl_1390 Patl_1391     TRUE 0.743 20.000 0.013 NA   NA
 3501213 3501214 Patl_1391 Patl_1392     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 3501214 3501215 Patl_1392 Patl_1393     TRUE 0.998 4.000 0.761 NA   NA
 3501215 3501216 Patl_1393 Patl_1394     TRUE 0.969 54.000 0.683 NA   NA
 3501216 3501217 Patl_1394 Patl_1395     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA N NA
 3501223 3501224 Patl_1401 Patl_1402 glpQ   TRUE 0.483 37.000 0.009 1.000 N NA
 3501224 3501225 Patl_1402 Patl_1403     FALSE 0.128 103.000 0.000 1.000 N NA
 3501225 3501226 Patl_1403 Patl_1404     FALSE 0.003 423.000 0.000 1.000 N NA
 3501226 3501227 Patl_1404 Patl_1405     FALSE 0.002 842.000 0.000 1.000   NA
 3501227 3501228 Patl_1405 Patl_1406     FALSE 0.007 404.000 0.000 0.050   NA
 3501228 3501229 Patl_1406 Patl_1407     FALSE 0.049 165.000 0.000 NA   NA
 3501231 3501232 Patl_1409 Patl_1410     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3501232 3501233 Patl_1410 Patl_1411     FALSE 0.006 344.000 0.000 NA   NA
 3501233 3501234 Patl_1411 Patl_1412     FALSE 0.220 89.000 0.000 NA   NA
 3501234 3501235 Patl_1412 Patl_1413     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 3501235 3501236 Patl_1413 Patl_1414     TRUE 0.840 8.000 0.000 NA   NA
 3501236 3501237 Patl_1414 Patl_1415     FALSE 0.002 1423.000 0.000 NA   NA
 3501237 3501238 Patl_1415 Patl_1416     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3501238 3501239 Patl_1416 Patl_1417     FALSE 0.009 284.000 0.000 NA   NA
 3501240 3501241 Patl_1418 Patl_1419   prpB TRUE 0.609 105.000 0.130 1.000 N NA
 3501241 3501242 Patl_1419 Patl_1420 prpB   TRUE 0.864 116.000 0.502 1.000 N NA
 3501242 3501243 Patl_1420 Patl_1421     TRUE 0.877 133.000 0.289 1.000 Y NA
 3501243 3501244 Patl_1421 Patl_1422     TRUE 0.997 10.000 0.733 NA   NA
 3501244 3501245 Patl_1422 Patl_1423     FALSE 0.019 218.000 0.000 NA   NA
 3501245 3501246 Patl_1423 Patl_1424     FALSE 0.020 193.000 0.000 1.000 N NA
 3501246 3501247 Patl_1424 Patl_1425     FALSE 0.002 495.000 0.000 1.000 N NA
 3501247 3501248 Patl_1425 Patl_1426     FALSE 0.041 178.000 0.000 1.000   NA
 3501248 3501249 Patl_1426 Patl_1427     FALSE 0.002 684.000 0.000 1.000   NA
 3501249 3501250 Patl_1427 Patl_1428     TRUE 1.000 0.000 0.859 0.001 Y NA
 3501251 3501252 Patl_1429 Patl_1430     FALSE 0.009 281.000 0.000 NA   NA
 3501252 3501253 Patl_1430 Patl_1431     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3501253 3501254 Patl_1431 Patl_1432     FALSE 0.046 173.000 0.000 1.000   NA
 3501256 3501257 Patl_1434 Patl_1435     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3501257 3501258 Patl_1435 Patl_1436     FALSE 0.030 192.000 0.000 NA   NA
 3501259 3501260 Patl_1437 Patl_1438     FALSE 0.328 145.000 0.100 1.000 N NA
 3501260 3501261 Patl_1438 Patl_1439     FALSE 0.125 124.000 0.000 1.000   NA
 3501265 3501266 Patl_1443 Patl_1444     FALSE 0.056 161.000 0.000 1.000   NA
 3501269 3501270 Patl_1447 Patl_1448     FALSE 0.022 188.000 0.000 1.000 N NA
 3501271 3501272 Patl_1449 Patl_1450     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3501274 3501275 Patl_1452 Patl_1453     TRUE 1.000 -3.000 0.714 0.053 Y NA
 3501275 3501276 Patl_1453 Patl_1454     TRUE 0.707 42.000 0.057 NA   NA
 3501276 3501277 Patl_1454 Patl_1455     TRUE 0.809 26.000 0.057 NA   NA
 3501277 3501278 Patl_1455 Patl_1456     TRUE 0.997 -7.000 0.075 0.003 Y NA
 3501278 3501279 Patl_1456 Patl_1457     FALSE 0.056 306.000 0.000 1.000 Y NA
 3501279 3501280 Patl_1457 Patl_1458     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3501280 3501281 Patl_1458 Patl_1459     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 3501281 3501282 Patl_1459 Patl_1460     FALSE 0.002 821.000 0.000 NA   NA
 3501283 3501284 Patl_1461 Patl_1462     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA   NA
 3501284 3501285 Patl_1462 Patl_1463     FALSE 0.288 40.000 0.000 1.000 N NA
 3501286 3501287 Patl_1464 Patl_1465     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 3501289 3501290 Patl_1467 Patl_1468     TRUE 0.655 59.000 0.059 NA   NA
 3501290 3501291 Patl_1468 Patl_1469     FALSE 0.026 199.000 0.000 NA   NA
 3501291 3501292 Patl_1469 Patl_1470     FALSE 0.003 476.000 0.000 NA   NA
 3501292 3501293 Patl_1470 Patl_1471     TRUE 0.997 2.000 0.492 NA   NA
 3501294 3501295 Patl_1472 Patl_1473     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 3501295 3501296 Patl_1473 Patl_1474     TRUE 0.729 60.000 0.094 NA   NA
 3501296 3501297 Patl_1474 Patl_1475     FALSE 0.004 404.000 0.000 NA   NA
 3501297 3501298 Patl_1475 Patl_1476     FALSE 0.002 692.000 0.000 NA   NA
 3501298 3501299 Patl_1476 Patl_1477     FALSE 0.002 836.000 0.000 NA   NA
 3501299 3501300 Patl_1477 Patl_1478     FALSE 0.202 64.000 0.000 NA N NA
 3501300 3501301 Patl_1478 Patl_1479     FALSE 0.028 428.000 0.000 1.000 Y NA
 3501303 3501304 Patl_1481 Patl_1482     FALSE 0.008 306.000 0.000 1.000   NA
 3501304 3501305 Patl_1482 Patl_1483     FALSE 0.305 61.000 0.000 1.000   NA
 3501305 3501306 Patl_1483 Patl_1484     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3501306 3501307 Patl_1484 Patl_1485     TRUE 0.564 21.000 0.000 NA   NA
 3501308 3501309 Patl_1486 Patl_1487     TRUE 0.951 29.000 0.314 NA   NA
 3501309 3501310 Patl_1487 Patl_1488     FALSE 0.098 160.000 0.010 NA   NA
 3501310 3501311 Patl_1488 Patl_1489     TRUE 1.000 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 3501311 3501312 Patl_1489 Patl_1490     TRUE 0.997 6.000 0.292 1.000 Y NA
 3501312 3501313 Patl_1490 Patl_1491     TRUE 0.908 34.000 0.034 1.000 Y NA
 3501315 3501316 Patl_1493 Patl_1494     FALSE 0.008 298.000 0.000 NA   NA
 3501317 3501318 Patl_1495 Patl_1496     FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 3501323 3501324 Patl_1501 Patl_1502     FALSE 0.139 118.000 0.000 1.000   NA
 3501326 3501327 Patl_1504 Patl_1505     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3501327 3501328 Patl_1505 Patl_1506     TRUE 0.997 -7.000 0.368 1.000   NA
 3501329 3501330 Patl_1507 Patl_1508     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3501330 3501331 Patl_1508 Patl_1509     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3501332 3501333 Patl_1510 Patl_1511     TRUE 0.979 4.000 0.059 0.001   NA
 3501333 3501334 Patl_1511 Patl_1512     TRUE 0.566 122.000 0.133 1.000   NA
 3501334 3501335 Patl_1512 Patl_1513     TRUE 0.964 0.000 0.027 1.000 N NA
 3501336 3501337 Patl_1514 Patl_1515     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501339 3501340 Patl_1517 Patl_1518     FALSE 0.044 175.000 0.000 1.000   NA
 3501340 3501341 Patl_1518 Patl_1519     FALSE 0.432 59.000 0.000 0.034   NA
 3501341 3501342 Patl_1519 Patl_1520     TRUE 0.649 47.000 0.043 1.000   NA
 3501342 3501343 Patl_1520 Patl_1521     TRUE 0.697 87.000 0.000 NA Y NA
 3501343 3501344 Patl_1521 Patl_1522     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA N NA
 3501345 3501346 Patl_1523 Patl_1524     FALSE 0.019 223.000 0.000 1.000   NA
 3501347 3501348 Patl_1525 Patl_1526     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501348 3501349 Patl_1526 Patl_1527     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA   NA
 3501349 3501350 Patl_1527 Patl_1528     TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 3501351 3501352 Patl_1529 Patl_1530     FALSE 0.134 117.000 0.000 NA   NA
 3501354 3501355 Patl_1532 Patl_1533     TRUE 0.968 -7.000 0.019 1.000   NA
 3501356 3501357 Patl_1534 Patl_1535     TRUE 0.968 38.000 0.222 1.000 Y NA
 3501357 3501358 Patl_1535 Patl_1536     TRUE 0.808 39.000 0.118 1.000 N NA
 3501358 3501359 Patl_1536 Patl_1537     TRUE 0.582 75.000 0.059 1.000 N NA
 3501362 3501363 Patl_1540 Patl_1541     TRUE 0.645 71.000 0.081 1.000 N NA
 3501363 3501364 Patl_1541 Patl_1542     TRUE 0.669 51.000 0.055 1.000   NA
 3501364 3501365 Patl_1542 Patl_1543     FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000   NA
 3501366 3501367 Patl_1544 Patl_1545 ansA   FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501367 3501368 Patl_1545 Patl_1546     TRUE 0.848 7.000 0.000 NA   NA
 3501369 3501370 Patl_1547 Patl_1548     FALSE 0.364 41.000 0.000 NA   NA
 3501370 3501371 Patl_1548 Patl_1549     FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 3501372 3501373 Patl_1550 Patl_1551     FALSE 0.031 188.000 0.000 NA   NA
 3501373 3501374 Patl_1551 Patl_1552     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA   NA
 3501374 3501375 Patl_1552 Patl_1553     FALSE 0.002 563.000 0.000 1.000 N NA
 3501375 3501376 Patl_1553 Patl_1554     TRUE 0.999 -7.000 0.319 0.001 Y NA
 3501376 3501377 Patl_1554 Patl_1555     TRUE 0.862 62.000 0.219 NA   NA
 3501377 3501378 Patl_1555 Patl_1556     TRUE 0.767 21.000 0.024 NA   NA
 3501378 3501379 Patl_1556 Patl_1557     FALSE 0.457 177.000 0.080 NA Y NA
 3501379 3501380 Patl_1557 Patl_1558     TRUE 0.999 -10.000 0.298 NA Y NA
 3501380 3501381 Patl_1558 Patl_1559     TRUE 0.726 51.000 0.096 NA N NA
 3501381 3501382 Patl_1559 Patl_1560     TRUE 0.756 16.000 0.013 1.000 N NA
 3501382 3501383 Patl_1560 Patl_1561     TRUE 0.944 3.000 0.012 NA   NA
 3501383 3501384 Patl_1561 Patl_1562     TRUE 0.919 47.000 0.307 NA   NA
 3501384 3501385 Patl_1562 Patl_1563     TRUE 0.649 39.000 0.032 NA   NA
 3501385 3501386 Patl_1563 Patl_1564     TRUE 0.976 -3.000 0.045 1.000 N NA
 3501386 3501387 Patl_1564 Patl_1565     TRUE 0.993 0.000 0.199 NA N NA
 3501387 3501388 Patl_1565 Patl_1566   leuS TRUE 0.953 16.000 0.182 NA N NA
 3501389 3501390 Patl_1567 Patl_1568     TRUE 0.710 85.000 0.000 1.000 Y NA
 3501392 3501393 Patl_1570 Patl_1571     TRUE 0.801 53.000 0.152 NA N NA
 3501393 3501394 Patl_1571 Patl_1572     TRUE 0.871 86.000 0.325 1.000 N NA
 3501394 3501395 Patl_1572 Patl_1573     TRUE 0.993 3.000 0.260 1.000 N NA
 3501395 3501396 Patl_1573 Patl_1574     TRUE 0.716 130.000 0.082 1.000 Y NA
 3501396 3501397 Patl_1574 Patl_1575   secG TRUE 0.980 10.000 0.184 1.000 N NA
 3501397 3501398 Patl_1575 Patl_R0030 secG   TRUE 0.733 13.000 0.000 NA   NA
 3501398 3501399 Patl_R0030 Patl_1576     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3501399 3501400 Patl_1576 Patl_1577   rpsP FALSE 0.002 494.000 0.000 1.000 N NA
 3501400 3501401 Patl_1577 Patl_1578 rpsP   TRUE 0.987 31.000 0.342 0.012 Y NA
 3501401 3501402 Patl_1578 Patl_1579     TRUE 1.000 0.000 0.672 1.000 Y NA
 3501402 3501403 Patl_1579 Patl_1580   rplS TRUE 0.999 -10.000 0.567 1.000 Y NA
 3501405 3501406 Patl_1582 Patl_1583     FALSE 0.411 36.000 0.000 1.000   NA
 3501406 3501407 Patl_1583 Patl_1584     FALSE 0.047 171.000 0.000 1.000   NA
 3501407 3501408 Patl_1584 Patl_1585     FALSE 0.359 44.000 0.000 1.000   NA
 3501410 3501411 Patl_1587 Patl_1588   tyrA TRUE 0.980 12.000 0.045 1.000 Y NA
 3501411 3501412 Patl_1588 Patl_1589 tyrA   FALSE 0.450 30.000 0.000 NA   NA
 3501413 3501414 Patl_1590 Patl_1591     FALSE 0.015 209.000 0.000 1.000 N NA
 3501414 3501415 Patl_1591 Patl_1592     TRUE 0.476 33.000 0.006 1.000 N NA
 3501416 3501417 Patl_1593 Patl_1594     TRUE 0.989 34.000 0.524 NA Y NA
 3501417 3501418 Patl_1594 Patl_1595     TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000   NA
 3501418 3501419 Patl_1595 Patl_1596     FALSE 0.369 42.000 0.000 1.000   NA
 3501419 3501420 Patl_1596 Patl_1597     TRUE 0.865 100.000 0.096 0.055 Y NA
 3501420 3501421 Patl_1597 Patl_1598     TRUE 0.995 -7.000 0.197 0.055 N NA
 3501421 3501422 Patl_1598 Patl_1599     FALSE 0.201 96.000 0.000 NA   NA
 3501422 3501423 Patl_1599 Patl_1600     FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 3501423 3501424 Patl_1600 Patl_1601     FALSE 0.147 115.000 0.000 1.000   NA
 3501424 3501425 Patl_1601 Patl_1602     TRUE 0.972 0.000 0.029 NA   NA
 3501425 3501426 Patl_1602 Patl_1603     TRUE 0.974 -3.000 0.029 NA   NA
 3501426 3501427 Patl_1603 Patl_1604     FALSE 0.020 194.000 0.000 1.000 N NA
 3501427 3501428 Patl_1604 Patl_1605     FALSE 0.225 138.000 0.044 1.000 N NA
 3501428 3501429 Patl_1605 Patl_1606     TRUE 0.981 16.000 0.383 1.000 N NA
 3501429 3501430 Patl_1606 Patl_1607     TRUE 0.995 -3.000 0.216 NA   NA
 3501430 3501431 Patl_1607 Patl_1608     FALSE 0.418 138.000 0.116 NA   NA
 3501431 3501432 Patl_1608 Patl_1609     TRUE 0.946 27.000 0.262 1.000   NA
 3501434 3501435 Patl_1611 Patl_1612     TRUE 0.997 0.000 0.375 1.000   NA
 3501435 3501436 Patl_1612 Patl_1613     TRUE 0.992 4.000 0.182 0.003   NA
 3501436 3501437 Patl_1613 Patl_1614     FALSE 0.025 182.000 0.000 1.000 N NA
 3501439 3501440 Patl_1616 Patl_1617     FALSE 0.367 116.000 0.044 NA   NA
 3501441 3501442 Patl_1618 Patl_1619     FALSE 0.152 94.000 0.000 1.000 N NA
 3501442 3501443 Patl_1619 Patl_1620     TRUE 0.998 10.000 0.352 0.001 Y NA
 3501445 3501446 Patl_1622 Patl_1623     TRUE 0.900 51.000 0.269 NA   NA
 3501448 3501449 Patl_1625 Patl_1626     FALSE 0.066 238.000 0.061 1.000   NA
 3501449 3501450 Patl_1626 Patl_1627     TRUE 0.987 5.000 0.169 1.000   NA
 3501451 3501452 Patl_1628 Patl_1629     FALSE 0.032 214.000 0.006 NA   NA
 3501452 3501453 Patl_1629 Patl_1630     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501453 3501454 Patl_1630 Patl_1631     FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 3501454 3501455 Patl_1631 Patl_1632     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 3501456 3501457 Patl_1633 Patl_1634     TRUE 0.924 77.000 0.154 1.000 Y NA
 3501458 3501459 Patl_1635 Patl_1636 malQ   TRUE 0.968 51.000 0.235 0.008 Y NA
 3501459 3501460 Patl_1636 Patl_1637     TRUE 0.995 4.000 0.098 0.008 Y NA
 3501460 3501461 Patl_1637 Patl_1638     FALSE 0.260 129.000 0.039 1.000 N NA
 3501463 3501464 Patl_1640 Patl_1641     FALSE 0.019 293.000 0.028 1.000 N NA
 3501464 3501465 Patl_1641 Patl_1642     TRUE 0.837 88.000 0.060 1.000 Y NA
 3501465 3501466 Patl_1642 Patl_1643     TRUE 0.806 95.000 0.231 NA   NA
 3501466 3501467 Patl_1643 Patl_1644     TRUE 0.979 0.000 0.049 NA   NA
 3501467 3501468 Patl_1644 Patl_1645     TRUE 0.979 -10.000 0.049 NA   NA
 3501468 3501469 Patl_1645 Patl_1646     FALSE 0.258 79.000 0.000 NA   NA
 3501470 3501471 Patl_1647 Patl_1648     TRUE 0.986 19.000 0.214 1.000 Y NA
 3501471 3501472 Patl_1648 Patl_1649     TRUE 0.993 3.000 0.056 1.000 Y NA
 3501472 3501473 Patl_1649 Patl_1650     TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3501473 3501474 Patl_1650 Patl_1651     TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 3501474 3501475 Patl_1651 Patl_1652     FALSE 0.069 132.000 0.000 NA N NA
 3501475 3501476 Patl_1652 Patl_1653     FALSE 0.453 21.000 0.000 NA N NA
 3501478 3501479 Patl_1655 Patl_1656     TRUE 0.999 -7.000 0.946 NA   NA
 3501479 3501480 Patl_1656 Patl_1657     TRUE 0.529 187.000 0.432 NA   NA
 3501480 3501481 Patl_1657 Patl_1658     TRUE 0.985 5.000 0.152 NA   NA
 3501481 3501482 Patl_1658 Patl_1659     TRUE 0.986 -7.000 0.082 NA   NA
 3501482 3501483 Patl_1659 Patl_1660     TRUE 0.995 -7.000 0.233 NA   NA
 3501483 3501484 Patl_1660 Patl_1661     TRUE 0.992 -3.000 0.143 NA   NA
 3501484 3501485 Patl_1661 Patl_1662     TRUE 0.993 12.000 0.500 NA   NA
 3501486 3501487 Patl_1663 Patl_1664 fadI fadJ TRUE 0.997 11.000 0.430 1.000 Y NA
 3501488 3501489 Patl_1665 Patl_1666     FALSE 0.021 190.000 0.000 1.000 N NA
 3501491 3501492 Patl_1668 Patl_1669     TRUE 0.852 104.000 0.349 1.000   NA
 3501493 3501494 Patl_1670 Patl_1671     FALSE 0.090 117.000 0.000 NA N NA
 3501494 3501495 Patl_1671 Patl_1672     FALSE 0.063 154.000 0.000 NA   NA
 3501498 3501499 Patl_1675 Patl_1676     FALSE 0.402 103.000 0.033 NA   NA
 3501499 3501500 Patl_1676 Patl_1677     TRUE 0.518 24.000 0.000 NA   NA
 3501505 3501506 Patl_1682 Patl_1683     FALSE 0.294 61.000 0.000 NA   NA
 3501508 3501509 Patl_1685 Patl_1686     TRUE 0.975 49.000 0.800 1.000 N NA
 3501509 3501510 Patl_1686 Patl_1687     FALSE 0.010 303.000 0.000 0.069 N NA
 3501511 3501512 Patl_1688 Patl_1689     FALSE 0.006 281.000 0.000 1.000 N NA
 3501513 3501514 Patl_1690 Patl_1691     FALSE 0.010 282.000 0.000 1.000   NA
 3501514 3501515 Patl_1691 Patl_1692     FALSE 0.115 151.000 0.008 1.000   NA
 3501515 3501516 Patl_1692 Patl_R0031     FALSE 0.027 196.000 0.000 NA   NA
 3501516 3501517 Patl_R0031 Patl_1693     FALSE 0.053 161.000 0.000 NA   NA
 3501517 3501518 Patl_1693 Patl_1694     TRUE 0.975 49.000 0.759 NA   NA
 3501518 3501519 Patl_1694 Patl_1695     TRUE 0.963 24.000 0.342 1.000 N NA
 3501519 3501520 Patl_1695 Patl_1696     TRUE 0.961 108.000 0.530 1.000 Y NA
 3501520 3501521 Patl_1696 Patl_1697     TRUE 0.998 4.000 0.318 1.000 Y NA
 3501521 3501522 Patl_1697 Patl_R0032     FALSE 0.321 51.000 0.000 NA   NA
 3501522 3501523 Patl_R0032 Patl_1698     TRUE 0.918 -56.000 0.000 NA   NA
 3501524 3501525 Patl_1699 Patl_1700     TRUE 0.958 0.000 0.011 NA   NA
 3501525 3501526 Patl_1700 Patl_1701     TRUE 0.961 -7.000 0.011 NA   NA
 3501526 3501527 Patl_1701 Patl_1702     FALSE 0.425 24.000 0.000 1.000 N NA
 3501527 3501528 Patl_1702 Patl_1703     TRUE 0.953 23.000 0.250 NA   NA
 3501528 3501529 Patl_1703 Patl_1704     TRUE 0.984 2.000 0.099 NA   NA
 3501529 3501530 Patl_1704 Patl_1705     TRUE 0.999 3.000 0.819 NA   NA
 3501531 3501532 Patl_1706 Patl_1707     FALSE 0.005 301.000 0.000 1.000 N NA
 3501532 3501533 Patl_1707 Patl_1708     FALSE 0.211 66.000 0.000 1.000 N NA
 3501533 3501534 Patl_1708 Patl_1709     TRUE 0.806 76.000 0.019 1.000 Y NA
 3501537 3501538 Patl_1712 Patl_1713     FALSE 0.003 467.000 0.000 1.000   NA
 3501538 3501539 Patl_1713 Patl_1714     FALSE 0.358 114.000 0.049 1.000 N NA
 3501539 3501540 Patl_1714 Patl_1715     TRUE 0.728 93.000 0.170 1.000 N NA
 3501541 3501542 Patl_1716 Patl_1717     FALSE 0.164 117.000 0.006 1.000 N NA
 3501542 3501543 Patl_1717 Patl_1718     FALSE 0.011 268.000 0.000 NA   NA
 3501545 3501546 Patl_1720 Patl_1721     TRUE 0.939 -10.000 0.000 0.052 N NA
 3501546 3501547 Patl_1721 Patl_1722     TRUE 0.484 19.000 0.000 NA N NA
 3501547 3501548 Patl_1722 Patl_1723     FALSE 0.118 104.000 0.000 NA N NA
 3501549 3501550 Patl_1724 Patl_1725     TRUE 0.983 0.000 0.071 NA   NA
 3501550 3501551 Patl_1725 Patl_1726     TRUE 0.953 6.000 0.039 NA   NA
 3501552 3501553 Patl_1727 Patl_1728     FALSE 0.119 156.000 0.012 1.000   NA
 3501555 3501556 Patl_1730 Patl_1731     FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 3501556 3501557 Patl_1731 Patl_1732     FALSE 0.006 351.000 0.000 NA   NA
 3501558 3501559 Patl_1733 Patl_1734     TRUE 0.999 -18.000 0.833 NA   NA
 3501559 3501560 Patl_1734 Patl_1735     FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 3501561 3501562 Patl_1736 Patl_1737     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 3501566 3501567 Patl_1740 Patl_1741     TRUE 0.991 -3.000 0.124 NA   NA
 3501568 3501569 Patl_1742 Patl_1743     FALSE 0.027 198.000 0.000 NA   NA
 3501574 3501575 Patl_1748 Patl_1749     TRUE 0.993 3.000 0.278 NA N NA
 3501579 3501580 Patl_1753 Patl_1754     FALSE 0.017 231.000 0.000 NA   NA
 3501580 3501581 Patl_1754 Patl_1755     FALSE 0.013 251.000 0.000 NA   NA
 3501581 3501582 Patl_1755 Patl_1756     FALSE 0.011 232.000 0.000 1.000 N NA
 3501582 3501583 Patl_1756 Patl_1757     TRUE 1.000 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 3501583 3501584 Patl_1757 Patl_1758     TRUE 1.000 -6.000 0.688 0.001 Y NA
 3501586 3501587 Patl_1760 Patl_1761     FALSE 0.128 120.000 0.000 NA   NA
 3501587 3501588 Patl_1761 Patl_1762     FALSE 0.133 118.000 0.000 NA   NA
 3501592 3501593 Patl_1766 Patl_1767     TRUE 0.997 0.000 0.412 NA   NA
 3501594 3501595 Patl_1768 Patl_1769     FALSE 0.207 94.000 0.000 NA   NA
 3501595 3501596 Patl_1769 Patl_1770     FALSE 0.032 165.000 0.000 NA N NA
 3501596 3501597 Patl_1770 Patl_1771     TRUE 0.807 5.000 0.000 NA N NA
 3501600 3501601 Patl_1774 Patl_1775     TRUE 0.971 25.000 0.115 0.009 Y NA
 3501601 3501602 Patl_1775 Patl_1776     TRUE 0.749 51.000 0.106 1.000 N NA
 3501602 3501603 Patl_1776 Patl_1777     TRUE 0.913 4.000 0.003 NA   NA
 3501605 3501606 Patl_1779 Patl_1780     TRUE 0.628 96.000 0.075 0.056   NA
 3501606 3501607 Patl_1780 Patl_1781     TRUE 0.836 63.000 0.205 1.000 N NA
 3501607 3501608 Patl_1781 Patl_1782     TRUE 0.989 9.000 0.263 NA   NA
 3501608 3501609 Patl_1782 Patl_1783     TRUE 0.981 13.000 0.265 NA   NA
 3501609 3501610 Patl_1783 Patl_1784     FALSE 0.232 57.000 0.000 1.000 N NA
 3501610 3501611 Patl_1784 Patl_1785     FALSE 0.040 159.000 0.000 1.000 N NA
 3501611 3501612 Patl_1785 Patl_1786     TRUE 0.873 5.000 0.000 1.000   NA
 3501612 3501613 Patl_1786 Patl_1787     TRUE 0.580 20.000 0.000 NA   NA
 3501614 3501615 Patl_1788 Patl_1789     TRUE 0.518 24.000 0.000 NA   NA
 3501618 3501619 Patl_1792 Patl_1793     TRUE 0.827 29.000 0.095 1.000 N NA
 3501621 3501622 Patl_1795 Patl_1796     TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 3501622 3501623 Patl_1796 Patl_1797   sdhA TRUE 1.000 1.000 0.705 0.001 Y NA
 3501623 3501624 Patl_1797 Patl_1798 sdhA   TRUE 0.998 15.000 0.604 0.001 Y NA
 3501624 3501625 Patl_1798 Patl_1799   kgd FALSE 0.428 178.000 0.067 1.000 Y NA
 3501625 3501626 Patl_1799 Patl_1800 kgd   TRUE 0.999 10.000 0.667 1.000 Y NA
 3501626 3501627 Patl_1800 Patl_1801   sucC TRUE 0.807 124.000 0.136 1.000 Y NA
 3501627 3501628 Patl_1801 Patl_1802 sucC   TRUE 1.000 -3.000 0.806 0.001 Y NA
 3501629 3501630 Patl_1803 Patl_1804     FALSE 0.208 68.000 0.000 1.000 N NA
 3501632 3501633 Patl_1806 Patl_1807     FALSE 0.005 307.000 0.000 1.000 N NA
 3501633 3501634 Patl_1807 Patl_1808     FALSE 0.065 134.000 0.000 NA N NA
 3501634 3501635 Patl_1808 Patl_1809     FALSE 0.114 105.000 0.000 NA N NA
 3501635 3501636 Patl_1809 Patl_1810     FALSE 0.055 143.000 0.000 1.000 N NA
 3501637 3501638 Patl_1811 Patl_1812     TRUE 0.971 16.000 0.278 NA N NA
 3501638 3501639 Patl_1812 Patl_1813     TRUE 0.962 15.000 0.176 1.000   NA
 3501639 3501640 Patl_1813 Patl_1814     TRUE 0.595 58.000 0.037 1.000   NA
 3501641 3501642 Patl_1815 Patl_1816     FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 3501649 3501650 Patl_1823 Patl_1824     TRUE 0.723 102.000 0.190 1.000 N NA
 3501650 3501651 Patl_1824 Patl_1825     TRUE 0.995 5.000 0.143 1.000 Y NA
 3501654 3501655 Patl_1828 Patl_1829     TRUE 0.998 0.000 0.600 1.000   NA
 3501655 3501656 Patl_1829 Patl_1830     FALSE 0.173 104.000 0.000 NA   NA
 3501656 3501657 Patl_1830 Patl_1831     FALSE 0.137 116.000 0.000 NA   NA
 3501657 3501658 Patl_1831 Patl_1832     TRUE 0.929 58.000 0.333 0.068   NA
 3501658 3501659 Patl_1832 Patl_1833     FALSE 0.264 76.000 0.000 NA   NA
 3501659 3501660 Patl_1833 Patl_1834     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3501660 3501661 Patl_1834 Patl_1835     FALSE 0.006 339.000 0.000 1.000   NA
 3501661 3501662 Patl_1835 Patl_1836     FALSE 0.004 421.000 0.000 1.000   NA
 3501662 3501663 Patl_1836 Patl_1837     FALSE 0.003 419.000 0.000 1.000 N NA
 3501664 3501665 Patl_1838 Patl_1839     FALSE 0.012 262.000 0.000 NA   NA
 3501665 3501666 Patl_1839 Patl_1840     FALSE 0.003 593.000 0.000 1.000   NA
 3501666 3501667 Patl_1840 Patl_1841     FALSE 0.318 56.000 0.000 1.000   NA
 3501667 3501668 Patl_1841 Patl_1842     TRUE 0.782 79.000 0.000 0.005 Y NA
 3501671 3501672 Patl_1845 Patl_1846     FALSE 0.012 329.000 0.000 0.007   NA
 3501674 3501675 Patl_1848 Patl_1849     FALSE 0.359 44.000 0.000 1.000   NA
 3501676 3501677 Patl_1850 Patl_1851     FALSE 0.002 720.000 0.000 NA   NA
 3501678 3501679 Patl_1852 Patl_1853     FALSE 0.095 135.000 0.000 NA   NA
 3501679 3501680 Patl_1853 Patl_1854     FALSE 0.272 71.000 0.000 NA   NA
 3501680 3501681 Patl_1854 Patl_1855     FALSE 0.007 312.000 0.000 NA   NA
 3501681 3501682 Patl_1855 Patl_1856     FALSE 0.201 198.000 0.119 0.009 N NA
 3501682 3501683 Patl_1856 Patl_1857     TRUE 0.999 -13.000 0.786 1.000 N NA
 3501684 3501685 Patl_1858 Patl_1859     TRUE 0.981 27.000 0.615 NA   NA
 3501685 3501686 Patl_1859 Patl_1860     TRUE 0.994 -3.000 0.189 1.000   NA
 3501686 3501687 Patl_1860 Patl_1861     TRUE 0.999 -3.000 0.635 0.088   NA
 3501687 3501688 Patl_1861 Patl_1862     FALSE 0.045 196.000 0.000 0.063   NA
 3501688 3501689 Patl_1862 Patl_1863     TRUE 0.999 0.000 0.222 0.023 Y NA
 3501689 3501690 Patl_1863 Patl_1864     TRUE 0.668 94.000 0.000 NA Y NA
 3501690 3501691 Patl_1864 Patl_1865     TRUE 0.987 53.000 0.628 NA Y NA
 3501691 3501692 Patl_1865 Patl_1866     TRUE 1.000 -7.000 0.756 1.000 Y NA
 3501692 3501693 Patl_1866 Patl_1867     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 3501693 3501694 Patl_1867 Patl_1868     FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 3501694 3501695 Patl_1868 Patl_1869     FALSE 0.390 37.000 0.000 NA   NA
 3501695 3501696 Patl_1869 Patl_1870     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA   NA
 3501697 3501698 Patl_1871 Patl_1872     TRUE 0.998 -3.000 0.562 NA   NA
 3501698 3501699 Patl_1872 Patl_1873     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 3501699 3501700 Patl_1873 Patl_1874     TRUE 0.947 67.000 0.571 1.000 N NA
 3501700 3501701 Patl_1874 Patl_1875     FALSE 0.006 296.000 0.000 1.000 N NA
 3501702 3501703 Patl_1876 Patl_1877     FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 3501704 3501705 Patl_1878 Patl_1879   asnC FALSE 0.010 238.000 0.000 1.000 N NA
 3501706 3501707 Patl_1880 Patl_1881     FALSE 0.030 190.000 0.000 NA   NA
 3501709 3501710 Patl_1883 Patl_1884     FALSE 0.034 166.000 0.000 1.000 N NA
 3501710 3501711 Patl_1884 Patl_1885     TRUE 0.536 105.000 0.097 1.000 N NA
 3501712 3501713 Patl_1886 Patl_1887     TRUE 0.886 54.000 0.237 1.000   NA
 3501714 3501715 Patl_1888 Patl_1889 cysS   FALSE 0.003 533.000 0.000 1.000   NA
 3501716 3501717 Patl_1890 Patl_1891     TRUE 0.936 79.000 0.500 NA   NA
 3501717 3501718 Patl_1891 Patl_1892     TRUE 0.882 110.000 0.500 NA   NA
 3501720 3501721 Patl_1894 Patl_1895     TRUE 0.933 29.000 0.233 1.000   NA
 3501724 3501725 Patl_1898 Patl_1899     FALSE 0.293 106.000 0.025 1.000 N NA
 3501727 3501728 Patl_1901 Patl_R0034     FALSE 0.003 556.000 0.000 NA   NA
 3501729 3501730 Patl_1902 Patl_1903     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3501733 3501734 Patl_1906 Patl_1907     FALSE 0.001 1026.000 0.000 1.000 N NA
 3501734 3501735 Patl_1907 Patl_1908     FALSE 0.292 65.000 0.000 1.000   NA
 3501737 3501738 Patl_1910 Patl_1911     FALSE 0.006 278.000 0.000 NA N NA
 3501739 3501740 Patl_1912 Patl_1913     FALSE 0.011 237.000 0.000 1.000 N NA
 3501740 3501741 Patl_1913 Patl_1914     TRUE 0.771 78.000 0.000 0.067 Y NA
 3501741 3501742 Patl_1914 Patl_1915     TRUE 0.691 15.000 0.000 1.000   NA
 3501743 3501744 Patl_1916 Patl_1917     TRUE 0.990 32.000 0.500 1.000 Y NA
 3501744 3501745 Patl_1917 Patl_1918     TRUE 0.965 48.000 0.250 1.000 Y NA
 3501745 3501746 Patl_1918 Patl_1919     FALSE 0.260 82.000 0.000 1.000   NA
 3501747 3501748 Patl_1920 Patl_1921     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 3501748 3501749 Patl_1921 Patl_1922     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 3501750 3501751 Patl_1923 Patl_1924     FALSE 0.010 242.000 0.000 1.000 N NA
 3501751 3501752 Patl_1924 Patl_1925     FALSE 0.220 89.000 0.000 NA   NA
 3501752 3501753 Patl_1925 Patl_1926     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 3501754 3501755 Patl_1927 Patl_1928     FALSE 0.084 125.000 0.000 1.000 N NA
 3501755 3501756 Patl_1928 Patl_1929     FALSE 0.157 92.000 0.000 1.000 N NA
 3501756 3501757 Patl_1929 Patl_1930     FALSE 0.002 907.000 0.000 1.000   NA
 3501758 3501759 Patl_R0035 Patl_1931     FALSE 0.307 56.000 0.000 NA   NA
 3501759 3501760 Patl_1931 Patl_1932     TRUE 0.953 5.000 0.044 1.000 N NA
 3501760 3501761 Patl_1932 Patl_1933     TRUE 0.997 -6.000 0.342 1.000 N NA
 3501761 3501762 Patl_1933 Patl_1934   thiG TRUE 0.994 2.000 0.064 1.000 Y NA
 3501762 3501763 Patl_1934 Patl_1935 thiG   TRUE 0.992 3.000 0.012 0.003 Y NA
 3501763 3501764 Patl_1935 Patl_1936     TRUE 0.998 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 3501764 3501765 Patl_1936 Patl_1937     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 3501765 3501766 Patl_1937 Patl_1938     FALSE 0.002 811.000 0.000 NA   NA
 3501766 3501767 Patl_1938 Patl_1939     FALSE 0.086 138.000 0.000 NA   NA
 3501767 3501768 Patl_1939 Patl_1940     FALSE 0.003 489.000 0.000 NA   NA
 3501768 3501769 Patl_1940 Patl_1941     TRUE 0.624 96.000 0.113 1.000 N NA
 3501769 3501770 Patl_1941 Patl_1942     FALSE 0.002 919.000 0.000 NA   NA
 3501774 3501775 Patl_1946 Patl_1947     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3501776 3501777 Patl_1948 Patl_1949     TRUE 0.508 43.000 0.000 0.007   NA
 3501777 3501778 Patl_1949 Patl_1950     FALSE 0.004 654.000 0.000 0.007   NA
 3501779 3501780 Patl_1951 Patl_1952     FALSE 0.247 83.000 0.000 NA   NA
 3501780 3501781 Patl_1952 Patl_1953     FALSE 0.002 837.000 0.000 NA   NA
 3501783 3501784 Patl_1955 Patl_1956     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3501787 3501788 Patl_1959 Patl_1960     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3501789 3501790 Patl_1961 Patl_1962     TRUE 0.999 1.000 1.000 NA   NA
 3501791 3501792 Patl_1963 Patl_1964     FALSE 0.316 53.000 0.000 NA   NA
 3501792 3501793 Patl_1964 Patl_1965     FALSE 0.071 148.000 0.000 NA   NA
 3501793 3501794 Patl_1965 Patl_1966     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501794 3501795 Patl_1966 Patl_1967     FALSE 0.002 878.000 0.000 1.000   NA
 3501795 3501796 Patl_1967 Patl_1968     FALSE 0.147 115.000 0.000 1.000   NA
 3501796 3501797 Patl_1968 Patl_1969     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 3501797 3501798 Patl_1969 Patl_1970     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3501799 3501800 Patl_1971 Patl_1972     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 3501800 3501801 Patl_1972 Patl_1973     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 3501804 3501805 Patl_1976 Patl_1977     TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000   NA
 3501805 3501806 Patl_1977 Patl_1978     TRUE 0.493 27.000 0.000 1.000   NA
 3501806 3501807 Patl_1978 Patl_1979     TRUE 0.942 32.000 0.083 1.000 Y NA
 3501808 3501809 Patl_1980 Patl_1981     FALSE 0.102 310.000 0.241 1.000 N NA
 3501812 3501813 Patl_1984 Patl_1985     FALSE 0.005 373.000 0.000 1.000   NA
 3501814 3501815 Patl_1986 Patl_1987     TRUE 0.565 134.000 0.005 0.007 Y NA
 3501815 3501816 Patl_1987 Patl_1988     TRUE 0.632 200.000 0.236 0.003 Y NA
 3501816 3501817 Patl_1988 Patl_1989     FALSE 0.004 357.000 0.000 1.000 N NA
 3501817 3501818 Patl_1989 Patl_1990     FALSE 0.006 279.000 0.000 NA N NA
 3501818 3501819 Patl_1990 Patl_1991     TRUE 0.965 -3.000 0.014 NA   NA
 3501819 3501820 Patl_1991 Patl_1992     TRUE 0.825 23.000 0.053 NA   NA
 3501820 3501821 Patl_1992 Patl_1993     TRUE 0.992 5.000 0.304 NA N NA
 3501821 3501822 Patl_1993 Patl_1994     FALSE 0.045 202.000 0.008 1.000   NA
 3501822 3501823 Patl_1994 Patl_1995     TRUE 0.971 0.000 0.028 1.000   NA
 3501823 3501824 Patl_1995 Patl_1996     FALSE 0.370 100.000 0.031 1.000 N NA
 3501824 3501825 Patl_1996 Patl_1997     TRUE 0.987 0.000 0.099 NA   NA
 3501825 3501826 Patl_1997 Patl_1998     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 3501826 3501827 Patl_1998 Patl_1999     TRUE 0.996 11.000 0.710 NA   NA
 3501827 3501828 Patl_1999 Patl_2000     TRUE 0.947 59.000 0.500 NA   NA
 3501828 3501829 Patl_2000 Patl_2001     TRUE 0.995 7.000 0.455 NA   NA
 3501829 3501830 Patl_2001 Patl_2002     FALSE 0.009 285.000 0.000 1.000   NA
 3501830 3501831 Patl_2002 Patl_2003     TRUE 0.543 71.000 0.045 1.000 N NA
 3501831 3501832 Patl_2003 Patl_2004     TRUE 0.470 116.000 0.081 NA   NA
 3501832 3501833 Patl_2004 Patl_2005     FALSE 0.161 136.000 0.010 NA   NA
 3501833 3501834 Patl_2005 Patl_2006     FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000   NA
 3501834 3501835 Patl_2006 Patl_2007     TRUE 0.836 31.000 0.094 NA   NA
 3501835 3501836 Patl_2007 Patl_2008     FALSE 0.184 265.000 0.278 NA   NA
 3501839 3501840 Patl_2011 Patl_2012     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 3501840 3501841 Patl_2012 Patl_2013     FALSE 0.277 68.000 0.000 NA   NA
 3501841 3501842 Patl_2013 Patl_2014     TRUE 0.999 0.000 0.790 0.050   NA
 3501842 3501843 Patl_2014 Patl_2015     FALSE 0.234 88.000 0.000 1.000   NA
 3501843 3501844 Patl_2015 Patl_2016     TRUE 0.564 21.000 0.000 NA   NA
 3501844 3501845 Patl_2016 Patl_2017     FALSE 0.107 130.000 0.000 NA   NA
 3501845 3501846 Patl_2017 Patl_2018     FALSE 0.017 232.000 0.000 1.000   NA
 3501846 3501847 Patl_2018 Patl_2019     FALSE 0.002 880.000 0.000 1.000   NA
 3501847 3501848 Patl_2019 Patl_2020     FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000   NA
 3501848 3501849 Patl_2020 Patl_2021     TRUE 0.899 3.000 0.000 1.000   NA
 3501849 3501850 Patl_2021 Patl_2022     TRUE 0.930 -7.000 0.000 1.000   NA
 3501850 3501851 Patl_2022 Patl_2023     TRUE 0.997 0.000 0.333 NA   NA
 3501851 3501852 Patl_2023 Patl_2024     FALSE 0.002 865.000 0.000 NA   NA
 3501853 3501854 Patl_2025 Patl_2026     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501854 3501855 Patl_2026 Patl_2027     TRUE 0.998 -7.000 0.500 NA   NA
 3501855 3501856 Patl_2027 Patl_2028     TRUE 0.958 88.000 0.750 NA   NA
 3501856 3501857 Patl_2028 Patl_2029     TRUE 0.845 126.000 0.500 NA   NA
 3501857 3501858 Patl_2029 Patl_2030     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA N NA
 3501858 3501859 Patl_2030 Patl_2031     TRUE 0.957 54.000 0.600 NA N NA
 3501860 3501861 Patl_2032 Patl_2033     TRUE 0.940 3.000 0.010 NA   NA
 3501861 3501862 Patl_2033 Patl_2034     TRUE 0.989 -3.000 0.104 NA   NA
 3501863 3501864 Patl_2035 Patl_2036     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 3501864 3501865 Patl_2036 Patl_2037     TRUE 1.000 -7.000 0.558 0.001 Y NA
 3501865 3501866 Patl_2037 Patl_2038     TRUE 0.981 24.000 0.188 0.066 Y NA
 3501866 3501867 Patl_2038 Patl_2039     FALSE 0.076 168.000 0.007 NA   NA
 3501867 3501868 Patl_2039 Patl_2040     TRUE 0.636 25.000 0.007 NA   NA
 3501868 3501869 Patl_2040 Patl_2041     FALSE 0.453 43.000 0.010 1.000 N NA
 3501869 3501870 Patl_2041 Patl_2042     TRUE 0.794 15.000 0.008 1.000   NA
 3501870 3501871 Patl_2042 Patl_2043     FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000   NA
 3501873 3501874 Patl_2045 Patl_2046     FALSE 0.280 73.000 0.000 1.000   NA
 3501874 3501875 Patl_2046 Patl_2047     FALSE 0.039 179.000 0.000 1.000   NA
 3501875 3501876 Patl_2047 Patl_2048     FALSE 0.055 162.000 0.000 1.000   NA
 3501876 3501877 Patl_2048 Patl_2049     FALSE 0.174 105.000 0.000 1.000   NA
 3501877 3501878 Patl_2049 Patl_2050     FALSE 0.402 37.000 0.000 1.000   NA
 3501879 3501880 Patl_2051 Patl_2052     TRUE 0.997 0.000 0.108 1.000 Y NA
 3501880 3501881 Patl_2052 Patl_2053     TRUE 0.629 64.000 0.054 1.000   NA
 3501881 3501882 Patl_2053 Patl_2054     TRUE 0.833 59.000 0.172 1.000   NA
 3501882 3501883 Patl_2054 Patl_2055     TRUE 0.973 3.000 0.069 1.000 N NA
 3501883 3501884 Patl_2055 Patl_2056   fumC FALSE 0.004 351.000 0.000 1.000 N NA
 3501884 3501885 Patl_2056 Patl_2057 fumC   FALSE 0.054 144.000 0.000 1.000 N NA
 3501886 3501887 Patl_2058 Patl_2059     TRUE 0.956 -9.000 0.015 1.000 N NA
 3501887 3501888 Patl_2059 Patl_2060     TRUE 0.562 104.000 0.091 NA   NA
 3501888 3501889 Patl_2060 Patl_2061     TRUE 0.997 -7.000 0.313 NA   NA
 3501889 3501890 Patl_2061 Patl_2062     TRUE 0.998 -3.000 0.448 NA   NA
 3501891 3501892 Patl_2063 Patl_2064     TRUE 0.863 11.000 0.007 NA   NA
 3501892 3501893 Patl_2064 Patl_2065     FALSE 0.028 354.000 0.091 NA N NA
 3501893 3501894 Patl_2065 Patl_2066     FALSE 0.094 163.000 0.011 NA   NA
 3501894 3501895 Patl_2066 Patl_2067     TRUE 0.995 -13.000 0.266 NA   NA
 3501895 3501896 Patl_2067 Patl_2068     TRUE 0.997 18.000 0.713 NA Y NA
 3501896 3501897 Patl_2068 Patl_2069     TRUE 0.994 0.000 0.197 NA   NA
 3501897 3501898 Patl_2069 Patl_2070     TRUE 0.921 72.000 0.404 NA   NA
 3501898 3501899 Patl_2070 Patl_2071     TRUE 0.999 -7.000 0.636 0.002   NA
 3501899 3501900 Patl_2071 Patl_2072     TRUE 0.999 2.000 0.667 0.002   NA
 3501900 3501901 Patl_2072 Patl_2073     TRUE 0.996 12.000 0.700 0.002 N NA
 3501903 3501904 Patl_2075 Patl_2076     TRUE 0.999 0.000 0.396 0.001 Y NA
 3501905 3501906 Patl_2077 Patl_2078     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501906 3501907 Patl_2078 Patl_2079     TRUE 0.518 24.000 0.000 NA   NA
 3501907 3501908 Patl_2079 Patl_2080     FALSE 0.002 592.000 0.000 1.000 N NA
 3501908 3501909 Patl_2080 Patl_2081     FALSE 0.067 284.000 0.000 1.000 Y NA
 3501910 3501911 Patl_2082 Patl_2083     FALSE 0.125 122.000 0.000 NA   NA
 3501912 3501913 Patl_2084 Patl_2085     FALSE 0.015 208.000 0.000 1.000 N NA
 3501913 3501914 Patl_2085 Patl_2086     FALSE 0.210 61.000 0.000 NA N NA
 3501915 3501916 Patl_2087 Patl_2088     TRUE 0.886 -22.000 0.000 1.000 N NA
 3501917 3501918 Patl_2089 Patl_2090     FALSE 0.022 223.000 0.000 0.081 N NA
 3501918 3501919 Patl_2090 Patl_2091     TRUE 0.999 -10.000 0.667 1.000 N NA
 3501919 3501920 Patl_2091 Patl_2092     TRUE 0.953 36.000 0.400 NA   NA
 3501920 3501921 Patl_2092 Patl_2093     FALSE 0.002 592.000 0.000 NA   NA
 3501921 3501922 Patl_2093 Patl_2094     FALSE 0.371 40.000 0.000 NA   NA
 3501923 3501924 Patl_2095 Patl_2096     FALSE 0.146 138.000 0.000 0.023   NA
 3501924 3501925 Patl_2096 Patl_2097     TRUE 0.992 -10.000 0.000 0.025 Y NA
 3501927 3501928 Patl_2099 Patl_2100     TRUE 0.993 5.000 0.286 NA   NA
 3501928 3501929 Patl_2100 Patl_2101     FALSE 0.062 157.000 0.000 1.000   NA
 3501933 3501934 Patl_2105 Patl_2106     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 3501934 3501935 Patl_2106 Patl_2107     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501937 3501938 Patl_2109 Patl_2110     FALSE 0.002 608.000 0.000 1.000 N NA
 3501940 3501941 Patl_2112 Patl_2113     FALSE 0.079 293.000 0.000 0.008 Y NA
 3501943 3501944 Patl_2115 Patl_2116     TRUE 0.910 63.000 0.110 NA Y NA
 3501944 3501945 Patl_2116 Patl_2117     TRUE 0.993 2.000 0.211 0.086 N NA
 3501945 3501946 Patl_2117 Patl_2118     TRUE 0.847 68.000 0.209 NA   NA
 3501946 3501947 Patl_2118 Patl_2119     TRUE 0.814 85.000 0.204 NA   NA
 3501947 3501948 Patl_2119 Patl_2120     TRUE 0.614 133.000 0.187 0.037 N NA
 3501948 3501949 Patl_2120 Patl_2121     TRUE 0.966 79.000 0.346 1.000 Y NA
 3501949 3501950 Patl_2121 Patl_2122     TRUE 0.764 184.000 0.321 0.004 Y NA
 3501950 3501951 Patl_2122 Patl_2123     TRUE 0.996 15.000 0.432 0.004 Y NA
 3501951 3501952 Patl_2123 Patl_2124     TRUE 0.953 62.000 0.182 0.004 Y NA
 3501952 3501953 Patl_2124 Patl_2125     TRUE 0.999 4.000 0.380 0.004 Y NA
 3501953 3501954 Patl_2125 Patl_2126     TRUE 0.988 13.000 0.418 1.000 N NA
 3501954 3501955 Patl_2126 Patl_2127     TRUE 0.995 11.000 0.599 NA   NA
 3501957 3501958 Patl_2129 Patl_2130     TRUE 0.923 47.000 0.098 1.000 Y NA
 3501958 3501959 Patl_2130 Patl_2131     TRUE 0.955 28.000 0.100 1.000 Y NA
 3501959 3501960 Patl_2131 Patl_2132     TRUE 0.998 3.000 0.200 0.002 Y NA
 3501960 3501961 Patl_2132 Patl_2133     FALSE 0.243 52.000 0.000 1.000 N NA
 3501962 3501963 Patl_2134 Patl_2135     FALSE 0.222 183.000 0.000 1.000 Y NA
 3501963 3501964 Patl_2135 Patl_2136     FALSE 0.109 132.000 0.000 1.000   NA
 3501964 3501965 Patl_2136 Patl_2137     TRUE 0.964 3.000 0.034 NA   NA
 3501965 3501966 Patl_2137 Patl_2138     TRUE 0.813 10.000 0.000 NA   NA
 3501967 3501968 Patl_2139 Patl_2140     TRUE 0.949 28.000 0.062 0.047 Y NA
 3501968 3501969 Patl_2140 Patl_2141     TRUE 0.522 158.000 0.062 1.000 Y NA
 3501970 3501971 Patl_2142 Patl_2143     FALSE 0.003 581.000 0.000 1.000   NA
 3501972 3501973 Patl_2144 Patl_2145     FALSE 0.004 349.000 0.000 1.000 N NA
 3501973 3501974 Patl_2145 Patl_2146     TRUE 1.000 0.000 0.875 0.017 Y NA
 3501975 3501976 Patl_2147 Patl_2148     FALSE 0.068 182.000 0.010 1.000   NA
 3501976 3501977 Patl_2148 Patl_2149     FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000   NA
 3501977 3501978 Patl_2149 Patl_2150     TRUE 0.578 62.000 0.038 NA   NA
 3501978 3501979 Patl_2150 Patl_2151     TRUE 0.848 55.000 0.183 NA   NA
 3501979 3501980 Patl_2151 Patl_2152   fur FALSE 0.147 223.000 0.156 1.000 N NA
 3501981 3501982 Patl_2153 Patl_2154     TRUE 1.000 -10.000 0.660 0.001 Y NA
 3501982 3501983 Patl_2154 Patl_2155     TRUE 0.966 -7.000 0.026 1.000 N NA
 3501983 3501984 Patl_2155 Patl_2156     TRUE 0.999 4.000 0.501 1.000 Y NA
 3501984 3501985 Patl_2156 Patl_2157     TRUE 0.998 -3.000 0.175 1.000 Y NA
 3501985 3501986 Patl_2157 Patl_2158     TRUE 0.996 4.000 0.109 0.001 Y NA
 3501986 3501987 Patl_2158 Patl_2159     FALSE 0.141 115.000 0.000 NA   NA
 3501987 3501988 Patl_2159 Patl_2160   moaA TRUE 0.628 17.000 0.000 NA   NA
 3501989 3501990 Patl_2161 Patl_2162     TRUE 0.985 -7.000 0.069 1.000   NA
 3501990 3501991 Patl_2162 Patl_2163     TRUE 0.900 62.000 0.302 NA   NA
 3501991 3501992 Patl_2163 Patl_2164     TRUE 0.958 26.000 0.318 NA   NA
 3501992 3501993 Patl_2164 Patl_2165     FALSE 0.004 436.000 0.000 1.000   NA
 3501993 3501994 Patl_2165 Patl_2166     FALSE 0.249 112.000 0.000 0.007   NA
 3501997 3501998 Patl_2169 Patl_2170     FALSE 0.223 116.000 0.009 NA   NA
 3501998 3501999 Patl_2170 Patl_2171     FALSE 0.069 174.000 0.006 1.000   NA
 3502000 3502001 Patl_2172 Patl_2173     FALSE 0.430 151.000 0.011 1.000 Y NA
 3502002 3502003 Patl_2174 Patl_2175     FALSE 0.063 154.000 0.000 NA   NA
 3502005 3502006 Patl_2177 Patl_2178     TRUE 0.584 38.000 0.017 NA   NA
 3502006 3502007 Patl_2178 Patl_2179     FALSE 0.133 161.000 0.027 NA   NA
 3502007 3502008 Patl_2179 Patl_2180     FALSE 0.012 225.000 0.000 1.000 N NA
 3502008 3502009 Patl_2180 Patl_2181     FALSE 0.003 367.000 0.000 1.000 N NA
 3502009 3502010 Patl_2181 Patl_2182     TRUE 0.647 97.000 0.114 NA   NA
 3502014 3502015 Patl_2186 Patl_2187     TRUE 0.898 23.000 0.000 NA Y NA
 3502015 3502016 Patl_2187 Patl_2188     FALSE 0.003 361.000 0.000 NA N NA
 3502016 3502017 Patl_2188 Patl_2189     FALSE 0.022 213.000 0.000 1.000   NA
 3502017 3502018 Patl_2189 Patl_2190     FALSE 0.026 203.000 0.000 1.000   NA
 3502019 3502020 Patl_2191 Patl_2192     TRUE 0.996 -3.000 0.292 1.000 N NA
 3502020 3502021 Patl_2192 Patl_2193     TRUE 0.994 -3.000 0.163 0.032 N NA
 3502022 3502023 Patl_2194 Patl_2195     FALSE 0.134 117.000 0.000 NA   NA
 3502023 3502024 Patl_2195 Patl_2196     FALSE 0.121 105.000 0.000 1.000 N NA
 3502024 3502025 Patl_2196 Patl_2197     FALSE 0.037 162.000 0.000 1.000 N NA
 3502025 3502026 Patl_2197 Patl_2198     FALSE 0.127 253.000 0.005 0.023 Y NA
 3502026 3502027 Patl_2198 Patl_2199     TRUE 0.955 14.000 0.151 1.000 N NA
 3502027 3502028 Patl_2199 Patl_2200     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 3502028 3502029 Patl_2200 Patl_2201     TRUE 0.986 4.000 0.144 NA   NA
 3502029 3502030 Patl_2201 Patl_2202     FALSE 0.428 102.000 0.039 NA   NA
 3502030 3502031 Patl_2202 Patl_2203     TRUE 0.992 -16.000 0.157 NA   NA
 3502034 3502035 Patl_2206 Patl_2207     TRUE 0.920 29.000 0.220 1.000 N NA
 3502035 3502036 Patl_2207 Patl_2208     TRUE 0.998 -3.000 0.457 NA   NA
 3502036 3502037 Patl_2208 Patl_2209     TRUE 0.874 34.000 0.150 NA   NA
 3502037 3502038 Patl_2209 Patl_2210     TRUE 0.989 15.000 0.557 1.000 N NA
 3502041 3502042 Patl_2213 Patl_2214   carB TRUE 0.780 100.000 0.241 1.000 N NA
 3502042 3502043 Patl_2214 Patl_2215 carB   TRUE 0.984 39.000 0.345 0.001 Y NA
 3502043 3502044 Patl_2215 Patl_2216     FALSE 0.107 291.000 0.034 1.000 Y NA
 3502044 3502045 Patl_2216 Patl_2217     FALSE 0.161 90.000 0.000 1.000 N NA
 3502045 3502046 Patl_2217 Patl_2218     FALSE 0.123 177.000 0.050 1.000 N NA
 3502048 3502049 Patl_2220 Patl_2221     FALSE 0.077 144.000 0.000 NA   NA
 3502050 3502051 Patl_2222 Patl_2223     TRUE 0.795 48.000 0.000 1.000 Y NA
 3502051 3502052 Patl_2223 Patl_2224     FALSE 0.364 150.000 0.000 1.000 Y NA
 3502052 3502053 Patl_2224 Patl_2225     FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 3502053 3502054 Patl_2225 Patl_2226     FALSE 0.170 84.000 0.000 NA N NA
 3502054 3502055 Patl_2226 Patl_2227     FALSE 0.008 296.000 0.000 NA   NA
 3502057 3502058 Patl_2229 Patl_2230     TRUE 0.994 16.000 0.778 NA   NA
 3502058 3502059 Patl_2230 Patl_2231     TRUE 0.985 -7.000 0.074 NA   NA
 3502059 3502060 Patl_2231 Patl_2232     FALSE 0.148 92.000 0.000 NA N NA
 3502060 3502061 Patl_2232 Patl_2233     TRUE 0.520 18.000 0.000 1.000 N NA
 3502061 3502062 Patl_2233 Patl_2234     FALSE 0.008 255.000 0.000 1.000 N NA
 3502062 3502063 Patl_2234 Patl_2235     TRUE 0.996 13.000 0.833 NA N NA
 3502064 3502065 Patl_2236 Patl_2237     FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 3502066 3502067 Patl_2238 Patl_2239     TRUE 0.978 73.000 0.500 1.000 Y NA
 3502067 3502068 Patl_2239 Patl_2240     TRUE 1.000 -7.000 0.667 NA Y NA
 3502068 3502069 Patl_2240 Patl_2241     TRUE 0.985 14.000 0.118 NA Y NA
 3502070 3502071 Patl_2242 Patl_2243     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 3502071 3502072 Patl_2243 Patl_2244     TRUE 0.999 -3.000 0.933 NA   NA
 3502072 3502073 Patl_2244 Patl_2245     TRUE 0.999 -3.000 0.630 NA   NA
 3502073 3502074 Patl_2245 Patl_R0036     FALSE 0.002 728.000 0.000 NA   NA
 3502074 3502075 Patl_R0036 Patl_R0037     FALSE 0.002 835.000 0.000 NA   NA
 3502077 3502078 Patl_2247 Patl_2248     FALSE 0.075 291.000 0.000 0.080 Y NA
 3502078 3502079 Patl_2248 Patl_2249     TRUE 0.995 37.000 0.833 0.023 Y NA
 3502080 3502081 Patl_2250 Patl_2251     FALSE 0.082 140.000 0.000 NA   NA
 3502081 3502082 Patl_2251 Patl_2252     TRUE 0.974 75.000 0.444 1.000 Y NA
 3502082 3502083 Patl_2252 Patl_2253     TRUE 0.676 93.000 0.000 1.000 Y NA
 3502083 3502084 Patl_2253 Patl_2254     FALSE 0.099 116.000 0.000 1.000 N NA
 3502086 3502087 Patl_2256 Patl_2257     FALSE 0.358 28.000 0.000 NA N NA
 3502087 3502088 Patl_2257 Patl_2258     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA N NA
 3502089 3502090 Patl_2259 Patl_2260     FALSE 0.036 182.000 0.000 NA   NA
 3502090 3502091 Patl_2260 Patl_2261     FALSE 0.107 130.000 0.000 NA   NA
 3502091 3502092 Patl_2261 Patl_2262     TRUE 0.848 7.000 0.000 NA   NA
 3502092 3502093 Patl_2262 Patl_2263     FALSE 0.021 189.000 0.000 1.000 N NA
 3502094 3502095 Patl_2264 Patl_2265     FALSE 0.052 162.000 0.000 NA   NA
 3502096 3502097 Patl_2266 Patl_2267     FALSE 0.086 138.000 0.000 NA   NA
 3502097 3502098 Patl_2267 Patl_2268     FALSE 0.010 234.000 0.000 NA N NA
 3502098 3502099 Patl_2268 Patl_2269     FALSE 0.027 196.000 0.000 NA   NA
 3502099 3502100 Patl_2269 Patl_2270     FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 3502101 3502102 Patl_2271 Patl_2272     FALSE 0.264 76.000 0.000 NA   NA
 3502103 3502104 Patl_2273 Patl_2274     FALSE 0.436 119.000 0.071 1.000   NA
 3502104 3502105 Patl_2274 Patl_2275     TRUE 0.561 101.000 0.095 1.000 N NA
 3502105 3502106 Patl_2275 Patl_2276     TRUE 0.966 7.000 0.087 1.000 N NA
 3502106 3502107 Patl_2276 Patl_2277     TRUE 0.995 0.000 0.269 1.000 N NA
 3502107 3502108 Patl_2277 Patl_2278     TRUE 1.000 -3.000 0.577 0.052 Y NA
 3502108 3502109 Patl_2278 Patl_2279     TRUE 0.997 6.000 0.258 0.061 Y NA
 3502109 3502110 Patl_2279 Patl_2280     FALSE 0.003 488.000 0.000 NA   NA
 3502110 3502111 Patl_2280 Patl_2281     TRUE 0.466 28.000 0.000 NA   NA
 3502112 3502113 Patl_2282 Patl_2283     FALSE 0.013 248.000 0.000 NA   NA
 3502113 3502114 Patl_2283 Patl_2284     FALSE 0.005 377.000 0.000 NA   NA
 3502114 3502115 Patl_2284 Patl_2285     TRUE 0.985 2.000 0.118 1.000 N NA
 3502115 3502116 Patl_2285 Patl_2286     FALSE 0.007 274.000 0.000 1.000 N NA
 3502118 3502119 Patl_2288 Patl_2289     FALSE 0.006 354.000 0.000 1.000   NA
 3502120 3502121 Patl_2290 Patl_2291     TRUE 0.999 -3.000 0.263 0.024 Y NA
 3502122 3502123 Patl_2292 Patl_2293     TRUE 0.551 142.000 0.038 NA Y NA
 3502123 3502124 Patl_2293 Patl_2294     TRUE 1.000 0.000 0.827 NA Y NA
 3502124 3502125 Patl_2294 Patl_2295     TRUE 0.607 19.000 0.000 1.000   NA
 3502125 3502126 Patl_2295 Patl_2296     FALSE 0.173 104.000 0.000 NA   NA
 3502128 3502129 Patl_2298 Patl_2299     FALSE 0.061 156.000 0.000 NA   NA
 3502131 3502132 Patl_2301 Patl_2302     TRUE 0.993 3.000 0.047 1.000 Y NA
 3502133 3502134 Patl_2303 Patl_2304     TRUE 0.664 89.000 0.078 0.049   NA
 3502134 3502135 Patl_2304 Patl_2305     TRUE 0.642 97.000 0.098 0.049 N NA
 3502135 3502136 Patl_2305 Patl_2306     FALSE 0.016 207.000 0.000 1.000 N NA
 3502137 3502138 Patl_2307 Patl_2308     TRUE 0.979 14.000 0.273 NA   NA
 3502140 3502141 Patl_2310 Patl_2311     FALSE 0.040 158.000 0.000 1.000 N NA
 3502141 3502142 Patl_2311 Patl_2312     FALSE 0.015 208.000 0.000 1.000 N NA
 3502144 3502145 Patl_2314 Patl_2315     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3502145 3502146 Patl_2315 Patl_2316     TRUE 0.983 20.000 0.500 NA   NA
 3502146 3502147 Patl_2316 Patl_2317     TRUE 0.937 16.000 0.119 NA   NA
 3502148 3502149 Patl_2318 Patl_2319     FALSE 0.008 296.000 0.000 NA   NA
 3502150 3502151 Patl_2320 Patl_2321     TRUE 0.480 126.000 0.105 NA   NA
 3502151 3502152 Patl_2321 Patl_2322     TRUE 0.885 4.000 0.000 1.000   NA
 3502152 3502153 Patl_2322 Patl_2323     FALSE 0.213 92.000 0.000 NA   NA
 3502153 3502154 Patl_2323 Patl_2324     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3502154 3502155 Patl_2324 Patl_2325     FALSE 0.193 79.000 0.000 1.000 N NA
 3502156 3502157 Patl_2326 Patl_2327     FALSE 0.098 134.000 0.000 NA   NA
 3502158 3502159 Patl_2328 Patl_2329     FALSE 0.111 109.000 0.000 1.000 N NA
 3502160 3502161 Patl_2330 Patl_2331     FALSE 0.020 567.000 0.000 1.000 Y NA
 3502163 3502164 Patl_2333 Patl_2334     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 3502164 3502165 Patl_2334 Patl_2335     FALSE 0.082 140.000 0.000 NA   NA
 3502165 3502166 Patl_2335 Patl_2336     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 3502166 3502167 Patl_2336 Patl_2337     FALSE 0.115 126.000 0.000 NA   NA
 3502167 3502168 Patl_2337 Patl_2338     FALSE 0.010 241.000 0.000 1.000 N NA
 3502168 3502169 Patl_2338 Patl_2339     TRUE 0.619 50.000 0.039 NA   NA
 3502169 3502170 Patl_2339 Patl_2340     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3502171 3502172 Patl_2341 Patl_2342     FALSE 0.447 32.000 0.000 1.000   NA
 3502172 3502173 Patl_2342 Patl_2343     FALSE 0.010 278.000 0.000 NA   NA
 3502174 3502175 Patl_2344 Patl_2345     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3502176 3502177 Patl_2346 Patl_2347     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 3502178 3502179 Patl_2348 Patl_2349     FALSE 0.336 47.000 0.000 NA   NA
 3502181 3502182 Patl_2351 Patl_2352     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 3502183 3502184 Patl_2353 Patl_2354     FALSE 0.125 122.000 0.000 NA   NA
 3502185 3502186 Patl_2355 Patl_2356     FALSE 0.306 86.000 0.003 NA   NA
 3502190 3502191 Patl_2360 Patl_2361     TRUE 0.993 14.000 0.620 0.061 N NA
 3502191 3502192 Patl_2361 Patl_2362     FALSE 0.376 41.000 0.000 1.000   NA
 3502192 3502193 Patl_2362 Patl_R0038     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 3502193 3502194 Patl_R0038 Patl_R0039     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3502194 3502195 Patl_R0039 Patl_R0040     FALSE 0.424 33.000 0.000 NA   NA
 3502195 3502196 Patl_R0040 Patl_2363     FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 3502196 3502197 Patl_2363 Patl_2364     TRUE 0.844 30.000 0.098 NA   NA
 3502200 3502201 Patl_2367 Patl_2368     FALSE 0.323 108.000 0.006 0.032   NA
 3502203 3502204 Patl_2370 Patl_2371   aat TRUE 0.879 52.000 0.046 1.000 Y NA
 3502204 3502205 Patl_2371 Patl_2372 aat   TRUE 0.999 0.000 0.285 1.000 Y NA
 3502205 3502206 Patl_2372 Patl_2373     TRUE 0.617 81.000 0.078 1.000 N NA
 3502207 3502208 Patl_2374 Patl_2375     TRUE 0.986 21.000 0.596 NA   NA
 3502211 3502212 Patl_2378 Patl_2379     TRUE 0.829 53.000 0.011 1.000 Y NA
 3502212 3502213 Patl_2379 Patl_2380     TRUE 0.993 0.000 0.180 NA   NA
 3502213 3502214 Patl_2380 Patl_2381     TRUE 0.938 14.000 0.093 NA   NA
 3502214 3502215 Patl_2381 Patl_2382     FALSE 0.069 134.000 0.000 1.000 N NA
 3502215 3502216 Patl_2382 Patl_2383     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 3502217 3502218 Patl_2384 Patl_2385     FALSE 0.162 106.000 0.000 NA   NA
 3502218 3502219 Patl_2385 Patl_2386     TRUE 0.997 -10.000 0.273 0.024   NA
 3502219 3502220 Patl_2386 Patl_2387     FALSE 0.180 137.000 0.017 NA   NA
 3502220 3502221 Patl_2387 Patl_2388     FALSE 0.374 93.000 0.017 NA   NA
 3502222 3502223 Patl_2389 Patl_2390     FALSE 0.011 269.000 0.000 1.000   NA
 3502223 3502224 Patl_2390 Patl_2391     FALSE 0.017 234.000 0.000 1.000   NA
 3502225 3502226 Patl_2392 Patl_2393     TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 N NA
 3502226 3502227 Patl_2393 Patl_2394     TRUE 1.000 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 3502227 3502228 Patl_2394 Patl_2395     FALSE 0.020 215.000 0.000 NA   NA
 3502228 3502229 Patl_2395 Patl_2396     FALSE 0.007 326.000 0.000 NA   NA
 3502230 3502231 Patl_2397 Patl_2398     FALSE 0.003 543.000 0.000 NA   NA
 3502235 3502236 Patl_2402 Patl_2403     TRUE 0.631 90.000 0.091 NA   NA
 3502236 3502237 Patl_2403 Patl_2404     FALSE 0.012 262.000 0.000 NA   NA
 3502237 3502238 Patl_2404 Patl_2405     FALSE 0.005 380.000 0.000 1.000   NA
 3502238 3502239 Patl_2405 Patl_2406     TRUE 0.522 195.000 0.500 1.000 N NA
 3502239 3502240 Patl_2406 Patl_2407     TRUE 0.996 10.000 0.667 NA   NA
 3502240 3502241 Patl_2407 Patl_2408     TRUE 0.976 8.000 0.118 NA   NA
 3502241 3502242 Patl_2408 Patl_R0041     FALSE 0.303 58.000 0.000 NA   NA
 3502242 3502243 Patl_R0041 Patl_2409     FALSE 0.290 62.000 0.000 NA   NA
 3502243 3502244 Patl_2409 Patl_2410     FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 3502244 3502245 Patl_2410 Patl_2411     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA   NA
 3502246 3502247 Patl_2412 Patl_2413     TRUE 0.848 7.000 0.000 NA   NA
 3502247 3502248 Patl_2413 Patl_2414     FALSE 0.012 253.000 0.000 NA   NA
 3502248 3502249 Patl_2414 Patl_2415     FALSE 0.093 194.000 0.042 NA   NA
 3502249 3502250 Patl_2415 Patl_2416     TRUE 0.940 83.000 0.219 1.000 Y NA
 3502250 3502251 Patl_2416 Patl_2417     TRUE 0.991 53.000 0.767 NA Y NA
 3502251 3502252 Patl_2417 Patl_2418     FALSE 0.002 487.000 0.000 NA N NA
 3502252 3502253 Patl_2418 Patl_2419     TRUE 0.968 41.000 0.583 1.000   NA
 3502253 3502254 Patl_2419 Patl_2420     FALSE 0.003 553.000 0.000 1.000   NA
 3502256 3502257 Patl_2422 Patl_2423     TRUE 0.799 14.000 0.013 1.000 N NA
 3502258 3502259 Patl_2424 Patl_2425     TRUE 0.828 99.000 0.045 0.001 Y NA
 3502259 3502260 Patl_2425 Patl_2426     TRUE 0.997 2.000 0.463 NA N NA
 3502260 3502261 Patl_2426 Patl_2427     TRUE 0.476 87.000 0.031 NA   NA
 3502261 3502262 Patl_2427 Patl_2428     TRUE 0.977 -7.000 0.040 NA   NA
 3502262 3502263 Patl_2428 Patl_2429     TRUE 0.856 17.000 0.040 1.000   NA
 3502263 3502264 Patl_2429 Patl_2430     TRUE 0.756 41.000 0.077 1.000   NA
 3502265 3502266 Patl_2431 Patl_2432     FALSE 0.004 325.000 0.000 NA N NA
 3502266 3502267 Patl_2432 Patl_2433     FALSE 0.019 221.000 0.000 NA   NA
 3502267 3502268 Patl_2433 Patl_2434     TRUE 0.996 2.000 0.354 NA   NA
 3502268 3502269 Patl_2434 Patl_2435     FALSE 0.194 98.000 0.000 NA   NA
 3502269 3502270 Patl_2435 Patl_2436     FALSE 0.034 184.000 0.000 NA   NA
 3502270 3502271 Patl_2436 Patl_2437     FALSE 0.006 351.000 0.000 NA   NA
 3502271 3502272 Patl_2437 Patl_2438     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3502272 3502273 Patl_2438 Patl_2439     FALSE 0.043 176.000 0.000 1.000   NA
 3502274 3502275 Patl_2440 Patl_2441     FALSE 0.300 59.000 0.000 NA   NA
 3502275 3502276 Patl_2441 Patl_2442     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502276 3502277 Patl_2442 Patl_2443     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3502277 3502278 Patl_2443 Patl_2444     FALSE 0.002 755.000 0.000 NA   NA
 3502279 3502280 Patl_2445 Patl_2446     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 3502280 3502281 Patl_2446 Patl_2447     FALSE 0.002 598.000 0.000 NA   NA
 3502281 3502282 Patl_2447 Patl_R0042     FALSE 0.003 515.000 0.000 NA   NA
 3502282 3502283 Patl_R0042 Patl_R0043     FALSE 0.318 52.000 0.000 NA   NA
 3502283 3502284 Patl_R0043 Patl_R0044     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3502284 3502285 Patl_R0044 Patl_2448     FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 3502285 3502286 Patl_2448 Patl_2449   uvrC TRUE 0.844 70.000 0.227 1.000 N NA
 3502286 3502287 Patl_2449 Patl_2450 uvrC   TRUE 0.980 4.000 0.086 0.017 N NA
 3502287 3502288 Patl_2450 Patl_R0045     FALSE 0.002 1562.000 0.000 NA   NA
 3502288 3502289 Patl_R0045 Patl_R0046     FALSE 0.297 60.000 0.000 NA   NA
 3502290 3502291 Patl_2451 Patl_2452     TRUE 0.798 76.000 0.167 NA   NA
 3502291 3502292 Patl_2452 Patl_2453     TRUE 1.000 3.000 0.790 NA Y NA
 3502292 3502293 Patl_2453 Patl_2454     TRUE 1.000 1.000 0.804 NA Y NA
 3502293 3502294 Patl_2454 Patl_2455     TRUE 0.961 78.000 0.317 NA Y NA
 3502295 3502296 Patl_2456 Patl_2457     TRUE 0.904 11.000 0.033 NA N NA
 3502296 3502297 Patl_2457 Patl_2458     TRUE 0.963 1.000 0.033 NA N NA
 3502297 3502298 Patl_2458 Patl_2459     TRUE 0.991 0.000 0.167 1.000 N NA
 3502298 3502299 Patl_2459 Patl_2460     TRUE 0.954 25.000 0.305 1.000 N NA
 3502299 3502300 Patl_2460 Patl_2461     TRUE 0.764 125.000 0.345 1.000 N NA
 3502302 3502303 Patl_2463 Patl_2464     TRUE 0.977 7.000 0.125 1.000 N NA
 3502303 3502304 Patl_2464 Patl_2465     FALSE 0.002 472.000 0.000 1.000 N NA
 3502304 3502305 Patl_2465 Patl_2466   rpsA TRUE 0.877 71.000 0.292 1.000 N NA
 3502305 3502306 Patl_2466 Patl_2467 rpsA   TRUE 0.713 124.000 0.281 1.000 N NA
 3502306 3502307 Patl_2467 Patl_2468     TRUE 0.631 126.000 0.209 1.000 N NA
 3502307 3502308 Patl_2468 Patl_2469     TRUE 0.989 2.000 0.005 1.000 Y NA
 3502308 3502309 Patl_2469 Patl_2470     FALSE 0.283 100.000 0.014 1.000 N NA
 3502310 3502311 Patl_2471 Patl_2472     TRUE 0.994 2.000 0.259 1.000   NA
 3502311 3502312 Patl_2472 Patl_2473     FALSE 0.005 383.000 0.000 1.000   NA
 3502312 3502313 Patl_2473 Patl_2474   nrdB TRUE 0.971 66.000 0.300 0.001 Y NA
 3502313 3502314 Patl_2474 Patl_2475 nrdB   TRUE 0.989 0.000 0.126 1.000 N NA
 3502315 3502316 Patl_2476 Patl_2477     TRUE 0.463 79.000 0.031 NA N NA
 3502316 3502317 Patl_2477 Patl_2478     TRUE 0.996 10.000 0.267 NA Y NA
 3502318 3502319 Patl_2479 Patl_2480   bcp TRUE 0.726 57.000 0.102 1.000 N NA
 3502323 3502324 Patl_2484 Patl_2485     TRUE 0.997 -3.000 0.253 0.048   NA
 3502324 3502325 Patl_2485 Patl_2486     TRUE 0.987 22.000 0.657 NA   NA
 3502326 3502327 Patl_2487 Patl_2488     TRUE 0.993 0.000 0.174 NA   NA
 3502328 3502329 Patl_2489 Patl_2490     TRUE 0.999 0.000 0.230 0.002 Y NA
 3502329 3502330 Patl_2490 Patl_2491     TRUE 0.867 14.000 0.027 NA   NA
 3502330 3502331 Patl_2491 Patl_2492   fadE FALSE 0.072 204.000 0.034 NA   NA
 3502332 3502333 Patl_2493 Patl_2494   pheT TRUE 0.987 6.000 0.208 1.000 N NA
 3502333 3502334 Patl_2494 Patl_2495 pheT pheS TRUE 0.998 13.000 0.574 0.001 Y NA
 3502334 3502335 Patl_2495 Patl_2496 pheS rplT FALSE 0.265 298.000 0.202 1.000 Y NA
 3502335 3502336 Patl_2496 Patl_2497 rplT   TRUE 0.999 16.000 0.928 0.011 Y NA
 3502336 3502337 Patl_2497 Patl_2498     TRUE 0.965 118.000 0.652 1.000 Y NA
 3502337 3502338 Patl_2498 Patl_2499     TRUE 0.907 99.000 0.186 1.000 Y NA
 3502339 3502340 Patl_2500 Patl_2501     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 3502340 3502341 Patl_2501 Patl_2502     TRUE 0.926 10.000 0.029 NA   NA
 3502342 3502343 Patl_2503 Patl_2504     TRUE 0.946 17.000 0.174 1.000 N NA
 3502343 3502344 Patl_2504 Patl_2505     TRUE 0.536 131.000 0.167 1.000 N NA
 3502344 3502345 Patl_2505 Patl_2506     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 3502345 3502346 Patl_2506 Patl_R0047     FALSE 0.002 941.000 0.000 NA   NA
 3502347 3502348 Patl_2507 Patl_2508     FALSE 0.003 492.000 0.000 NA   NA
 3502348 3502349 Patl_2508 Patl_2509     TRUE 0.962 5.000 0.048 NA   NA
 3502350 3502351 Patl_2510 Patl_2511     TRUE 0.999 -3.000 0.400 0.048 Y NA
 3502351 3502352 Patl_2511 Patl_2512     FALSE 0.443 31.000 0.000 NA   NA
 3502352 3502353 Patl_2512 Patl_2513     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502353 3502354 Patl_2513 Patl_2514     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3502354 3502355 Patl_2514 Patl_2515     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3502355 3502356 Patl_2515 Patl_2516     TRUE 0.997 0.000 0.431 NA   NA
 3502357 3502358 Patl_2517 Patl_2518     FALSE 0.280 127.000 0.032 NA   NA
 3502358 3502359 Patl_2518 Patl_2519     FALSE 0.183 101.000 0.000 NA   NA
 3502359 3502360 Patl_2519 Patl_2520     FALSE 0.390 37.000 0.000 NA   NA
 3502362 3502363 Patl_2522 Patl_2523     FALSE 0.292 65.000 0.000 1.000   NA
 3502364 3502365 Patl_2524 Patl_2525     FALSE 0.015 211.000 0.000 1.000 N NA
 3502367 3502368 Patl_2527 Patl_2528     FALSE 0.123 102.000 0.000 NA N NA
 3502368 3502369 Patl_2528 Patl_2529     TRUE 0.998 -7.000 0.466 NA N NA
 3502369 3502370 Patl_2529 Patl_2530     FALSE 0.002 435.000 0.000 1.000 N NA
 3502370 3502371 Patl_2530 Patl_2531     FALSE 0.073 164.000 0.010 1.000 N NA
 3502371 3502372 Patl_2531 Patl_2532     TRUE 0.956 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3502372 3502373 Patl_2532 Patl_2533     TRUE 0.579 50.000 0.022 0.048 N NA
 3502373 3502374 Patl_2533 Patl_2534     TRUE 0.996 11.000 0.656 0.001 N NA
 3502375 3502376 Patl_2535 Patl_2536     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 3502376 3502377 Patl_2536 Patl_2537     TRUE 0.867 140.000 0.323 1.000 Y NA
 3502377 3502378 Patl_2537 Patl_2538     TRUE 0.936 1.000 0.009 1.000 N NA
 3502378 3502379 Patl_2538 Patl_2539     FALSE 0.378 147.000 0.000 1.000 Y NA
 3502380 3502381 Patl_2540 Patl_2541     FALSE 0.016 281.000 0.000 0.051   NA
 3502385 3502386 Patl_2545 Patl_2546     TRUE 0.879 62.000 0.250 NA   NA
 3502386 3502387 Patl_2546 Patl_2547     FALSE 0.022 184.000 0.000 NA N NA
 3502390 3502391 Patl_2550 Patl_2551     TRUE 0.961 10.000 0.094 1.000 N NA
 3502391 3502392 Patl_2551 Patl_2552     TRUE 0.956 27.000 0.294 0.045 N NA
 3502392 3502393 Patl_2552 Patl_2553     TRUE 0.975 6.000 0.088 0.045 N NA
 3502394 3502395 Patl_2554 Patl_2555     TRUE 0.566 68.000 0.050 1.000 N NA
 3502395 3502396 Patl_2555 Patl_2556     TRUE 0.837 14.000 0.025 1.000 N NA
 3502396 3502397 Patl_2556 Patl_2557     TRUE 0.998 0.000 0.168 1.000 Y NA
 3502399 3502400 Patl_2559 Patl_2560     FALSE 0.097 299.000 0.195 NA   NA
 3502400 3502401 Patl_2560 Patl_2561     FALSE 0.234 86.000 0.000 NA   NA
 3502401 3502402 Patl_2561 Patl_2562     FALSE 0.215 106.000 0.009 1.000 N NA
 3502402 3502403 Patl_2562 Patl_2563     TRUE 0.997 6.000 0.229 1.000 Y NA
 3502403 3502404 Patl_2563 Patl_2564     TRUE 0.735 102.000 0.171 0.032 N NA
 3502405 3502406 Patl_2565 Patl_2566     TRUE 0.991 -15.000 0.157 1.000 N NA
 3502406 3502407 Patl_2566 Patl_R0048     FALSE 0.307 56.000 0.000 NA   NA
 3502407 3502408 Patl_R0048 Patl_2567     FALSE 0.443 31.000 0.000 NA   NA
 3502408 3502409 Patl_2567 Patl_2568     FALSE 0.044 151.000 0.000 NA N NA
 3502409 3502410 Patl_2568 Patl_2569     FALSE 0.008 247.000 0.000 NA N NA
 3502410 3502411 Patl_2569 Patl_2570     TRUE 0.999 6.000 0.496 0.017 Y NA
 3502411 3502412 Patl_2570 Patl_2571     TRUE 0.955 45.000 0.184 1.000 Y NA
 3502412 3502413 Patl_2571 Patl_2572     FALSE 0.007 278.000 0.000 1.000 N NA
 3502413 3502414 Patl_2572 Patl_2573     FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 3502416 3502417 Patl_R0049 Patl_R0050     FALSE 0.336 47.000 0.000 NA   NA
 3502417 3502418 Patl_R0050 Patl_R0051     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3502418 3502419 Patl_R0051 Patl_R0052     FALSE 0.390 37.000 0.000 NA   NA
 3502419 3502420 Patl_R0052 Patl_2575     FALSE 0.021 213.000 0.000 NA   NA
 3502421 3502422 Patl_2576 Patl_2577     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 3502422 3502423 Patl_2577 Patl_2578     FALSE 0.309 55.000 0.000 NA   NA
 3502424 3502425 Patl_2579 Patl_2580     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502426 3502427 Patl_2581 Patl_2582     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502427 3502428 Patl_2582 Patl_2583     TRUE 0.993 -3.000 0.154 NA   NA
 3502428 3502429 Patl_2583 Patl_2584     FALSE 0.003 562.000 0.000 1.000   NA
 3502429 3502430 Patl_2584 Patl_2585     FALSE 0.013 250.000 0.000 1.000   NA
 3502430 3502431 Patl_2585 Patl_2586     FALSE 0.258 92.000 0.000 0.050 N NA
 3502431 3502432 Patl_2586 Patl_2587     FALSE 0.298 105.000 0.024 1.000 N NA
 3502432 3502433 Patl_2587 Patl_2588     TRUE 0.998 0.000 0.634 1.000 N NA
 3502433 3502434 Patl_2588 Patl_2589     TRUE 0.998 -10.000 0.459 1.000 N NA
 3502435 3502436 Patl_2590 Patl_2591     TRUE 0.821 10.000 0.000 1.000   NA
 3502437 3502438 Patl_2592 Patl_2593     TRUE 0.859 40.000 0.000 0.005 Y NA
 3502439 3502440 Patl_2594 Patl_2595     FALSE 0.003 392.000 0.000 1.000 N NA
 3502443 3502444 Patl_2598 Patl_2599     FALSE 0.023 247.000 0.000 0.040   NA
 3502444 3502445 Patl_2599 Patl_2600     FALSE 0.010 278.000 0.000 NA   NA
 3502446 3502447 Patl_2601 Patl_2602     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 3502447 3502448 Patl_2602 Patl_2603     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3502449 3502450 Patl_2604 Patl_2605     FALSE 0.264 76.000 0.000 NA   NA
 3502450 3502451 Patl_2605 Patl_2606     FALSE 0.004 405.000 0.000 NA   NA
 3502451 3502452 Patl_2606 Patl_2607     FALSE 0.086 138.000 0.000 NA   NA
 3502452 3502453 Patl_2607 Patl_2608     FALSE 0.062 184.000 0.009 NA   NA
 3502453 3502454 Patl_2608 Patl_2609     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502454 3502455 Patl_2609 Patl_2610     FALSE 0.324 54.000 0.000 1.000   NA
 3502456 3502457 Patl_2611 Patl_2612     FALSE 0.286 63.000 0.000 NA   NA
 3502457 3502458 Patl_2612 Patl_2613     FALSE 0.003 600.000 0.000 1.000   NA
 3502459 3502460 Patl_2614 Patl_2615     FALSE 0.003 525.000 0.000 NA   NA
 3502460 3502461 Patl_2615 Patl_2616     FALSE 0.016 233.000 0.000 NA   NA
 3502467 3502468 Patl_2622 Patl_2623     TRUE 0.947 71.000 0.556 NA   NA
 3502469 3502470 Patl_2624 Patl_2625     FALSE 0.202 98.000 0.000 1.000   NA
 3502471 3502472 Patl_2626 Patl_2627     FALSE 0.002 792.000 0.000 NA   NA
 3502472 3502473 Patl_2627 Patl_2628     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 3502474 3502475 Patl_2629 Patl_2630     TRUE 0.996 -7.000 0.278 NA   NA
 3502476 3502477 Patl_2631 Patl_2632     FALSE 0.003 524.000 0.000 NA   NA
 3502477 3502478 Patl_2632 Patl_2633     FALSE 0.152 110.000 0.000 NA   NA
 3502480 3502481 Patl_2635 Patl_2636     FALSE 0.180 104.000 0.000 1.000   NA
 3502482 3502483 Patl_2637 Patl_2638     FALSE 0.008 268.000 0.000 1.000 N NA
 3502483 3502484 Patl_2638 Patl_2639     TRUE 0.932 58.000 0.444 1.000 N NA
 3502485 3502486 Patl_2640 Patl_2641     FALSE 0.282 71.000 0.000 1.000   NA
 3502486 3502487 Patl_2641 Patl_2642     FALSE 0.418 35.000 0.000 1.000   NA
 3502487 3502488 Patl_2642 Patl_2643     TRUE 0.958 -3.000 0.000 0.036   NA
 3502488 3502489 Patl_2643 Patl_2644     TRUE 0.638 101.000 0.000 1.000 Y NA
 3502489 3502490 Patl_2644 Patl_2645     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3502490 3502491 Patl_2645 Patl_2646     TRUE 0.917 14.000 0.077 1.000 N NA
 3502491 3502492 Patl_2646 Patl_2647     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3502493 3502494 Patl_2648 Patl_2649     TRUE 0.900 15.000 0.056 NA   NA
 3502499 3502500 Patl_2654 Patl_2655     FALSE 0.002 840.000 0.000 NA   NA
 3502501 3502502 Patl_2656 Patl_2657     FALSE 0.155 93.000 0.000 1.000 N NA
 3502504 3502505 Patl_2659 Patl_2660     FALSE 0.059 227.000 0.053 1.000 N NA
 3502505 3502506 Patl_2660 Patl_2661     TRUE 0.996 -3.000 0.223 0.052 N NA
 3502507 3502508 Patl_2662 Patl_2663     TRUE 0.937 32.000 0.273 NA   NA
 3502508 3502509 Patl_2663 Patl_2664     FALSE 0.074 146.000 0.000 NA   NA
 3502509 3502510 Patl_2664 Patl_2665     FALSE 0.041 356.000 0.000 1.000 Y NA
 3502510 3502511 Patl_2665 Patl_2666     FALSE 0.005 312.000 0.000 1.000 N NA
 3502512 3502513 Patl_2667 Patl_2668     FALSE 0.019 196.000 0.000 1.000 N NA
 3502513 3502514 Patl_2668 Patl_2669     TRUE 0.999 -10.000 0.443 0.004 Y NA
 3502514 3502515 Patl_2669 Patl_2670     TRUE 0.998 5.000 0.671 NA   NA
 3502515 3502516 Patl_2670 Patl_2671     FALSE 0.405 35.000 0.000 NA   NA
 3502516 3502517 Patl_2671 Patl_2672     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3502517 3502518 Patl_2672 Patl_2673     TRUE 1.000 0.000 0.900 0.004 Y NA
 3502518 3502519 Patl_2673 Patl_2674     TRUE 1.000 4.000 0.767 0.004 Y NA
 3502519 3502520 Patl_2674 Patl_2675     TRUE 0.992 69.000 0.808 0.004 Y NA
 3502520 3502521 Patl_2675 Patl_2676     TRUE 1.000 -16.000 0.742 0.004 Y NA
 3502521 3502522 Patl_2676 Patl_2677     FALSE 0.015 239.000 0.000 NA   NA
 3502522 3502523 Patl_2677 Patl_2678     FALSE 0.003 442.000 0.000 NA   NA
 3502524 3502525 Patl_2679 Patl_2680     TRUE 0.988 15.000 0.500 NA N NA
 3502525 3502526 Patl_2680 Patl_2681     TRUE 0.986 16.000 0.500 NA N NA
 3502526 3502527 Patl_2681 Patl_2682     TRUE 0.793 7.000 0.000 1.000 N NA
 3502527 3502528 Patl_2682 Patl_2683     FALSE 0.018 226.000 0.000 1.000   NA
 3502528 3502529 Patl_2683 Patl_2684     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 3502529 3502530 Patl_2684 Patl_2685     TRUE 0.636 70.000 0.064 NA   NA
 3502530 3502531 Patl_2685 Patl_2686     TRUE 0.998 3.000 0.600 NA   NA
 3502531 3502532 Patl_2686 Patl_2687     TRUE 0.929 68.000 0.471 NA N NA
 3502532 3502533 Patl_2687 Patl_2688     TRUE 0.996 -7.000 0.250 NA   NA
 3502533 3502534 Patl_2688 Patl_2689     FALSE 0.401 123.000 0.067 NA   NA
 3502534 3502535 Patl_2689 Patl_2690     TRUE 0.642 155.000 0.347 NA   NA
 3502536 3502537 Patl_2691 Patl_2692     TRUE 0.966 49.000 0.667 NA N NA
 3502539 3502540 Patl_2694 Patl_2695     TRUE 0.742 74.000 0.000 1.000 Y NA
 3502542 3502543 Patl_2697 Patl_2698     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3502543 3502544 Patl_2698 Patl_2699     TRUE 0.494 26.000 0.000 NA   NA
 3502544 3502545 Patl_2699 Patl_2700     FALSE 0.057 138.000 0.000 NA N NA
 3502545 3502546 Patl_2700 Patl_2701     FALSE 0.008 252.000 0.000 NA N NA
 3502549 3502550 Patl_2704 Patl_2705     FALSE 0.104 132.000 0.000 NA   NA
 3502550 3502551 Patl_2705 Patl_2706     FALSE 0.192 99.000 0.000 NA   NA
 3502553 3502554 Patl_2708 Patl_2709     FALSE 0.017 228.000 0.000 NA   NA
 3502554 3502555 Patl_2709 Patl_2710     FALSE 0.303 58.000 0.000 NA   NA
 3502555 3502556 Patl_2710 Patl_2711     FALSE 0.079 128.000 0.000 1.000 N NA
 3502556 3502557 Patl_2711 Patl_2712     FALSE 0.008 304.000 0.000 NA   NA
 3502557 3502558 Patl_2712 Patl_2713     TRUE 0.652 16.000 0.000 NA   NA
 3502558 3502559 Patl_2713 Patl_2714     TRUE 0.982 51.000 0.429 0.035 Y NA
 3502559 3502560 Patl_2714 Patl_2715     TRUE 0.900 99.000 0.500 1.000 N NA
 3502560 3502561 Patl_2715 Patl_2716     TRUE 0.996 17.000 0.600 1.000 Y NA
 3502561 3502562 Patl_2716 Patl_2717     TRUE 0.986 20.000 0.600 1.000 N NA
 3502562 3502563 Patl_2717 Patl_2718     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3502563 3502564 Patl_2718 Patl_2719     TRUE 0.908 78.000 0.400 1.000 N NA
 3502564 3502565 Patl_2719 Patl_2720     TRUE 0.996 9.000 0.600 NA   NA
 3502565 3502566 Patl_2720 Patl_2721     FALSE 0.007 327.000 0.000 NA   NA
 3502566 3502567 Patl_2721 Patl_2722     FALSE 0.005 373.000 0.000 NA   NA
 3502568 3502569 Patl_2723 Patl_2724     FALSE 0.282 65.000 0.000 NA   NA
 3502572 3502573 Patl_2727 Patl_2728     FALSE 0.049 165.000 0.000 NA   NA
 3502573 3502574 Patl_2728 Patl_2729     FALSE 0.003 517.000 0.000 NA   NA
 3502574 3502575 Patl_2729 Patl_2730     TRUE 0.948 -3.000 0.002 NA   NA
 3502575 3502576 Patl_2730 Patl_2731     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3502577 3502578 Patl_2732 Patl_2733     TRUE 0.489 203.000 0.500 1.000 N NA
 3502578 3502579 Patl_2733 Patl_2734     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.004   NA
 3502581 3502582 Patl_2736 Patl_2737     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502583 3502584 Patl_2738 Patl_2739     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 3502586 3502587 Patl_2741 Patl_2742     FALSE 0.113 127.000 0.000 NA   NA
 3502587 3502588 Patl_2742 Patl_2743     TRUE 0.942 42.000 0.375 NA   NA
 3502590 3502591 Patl_2745 Patl_2746     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 3502591 3502592 Patl_2746 Patl_2747     FALSE 0.156 108.000 0.000 NA   NA
 3502592 3502593 Patl_2747 Patl_2748     FALSE 0.130 119.000 0.000 NA   NA
 3502595 3502596 Patl_2750 Patl_2751     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502596 3502597 Patl_2751 Patl_2752     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA N NA
 3502599 3502600 Patl_2754 Patl_2755     FALSE 0.043 174.000 0.000 NA   NA
 3502600 3502601 Patl_2755 Patl_2756     FALSE 0.218 90.000 0.000 NA   NA
 3502602 3502603 Patl_2757 Patl_2758     FALSE 0.335 50.000 0.000 1.000   NA
 3502604 3502605 Patl_2759 Patl_2760     FALSE 0.364 41.000 0.000 NA   NA
 3502605 3502606 Patl_2760 Patl_2761     FALSE 0.207 94.000 0.000 NA   NA
 3502606 3502607 Patl_2761 Patl_2762     FALSE 0.271 72.000 0.000 NA   NA
 3502609 3502610 Patl_2764 Patl_2765     TRUE 0.994 0.000 0.015 0.001 Y NA
 3502610 3502611 Patl_2765 Patl_2766     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3502611 3502612 Patl_2766 Patl_2767     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3502614 3502615 Patl_2769 Patl_2770     FALSE 0.002 677.000 0.000 NA   NA
 3502615 3502616 Patl_2770 Patl_2771     TRUE 0.997 4.000 0.500 NA   NA
 3502616 3502617 Patl_2771 Patl_2772     TRUE 0.821 45.000 0.130 NA   NA
 3502617 3502618 Patl_2772 Patl_2773     TRUE 0.653 97.000 0.130 NA N NA
 3502618 3502619 Patl_2773 Patl_2774     FALSE 0.012 255.000 0.000 NA   NA
 3502619 3502620 Patl_2774 Patl_2775     FALSE 0.002 876.000 0.000 NA   NA
 3502620 3502621 Patl_2775 Patl_2776     TRUE 0.998 -3.000 0.163 NA Y NA
 3502621 3502622 Patl_2776 Patl_2777     TRUE 0.986 0.000 0.104 1.000 N NA
 3502622 3502623 Patl_2777 Patl_2778     FALSE 0.016 235.000 0.000 1.000   NA
 3502623 3502624 Patl_2778 Patl_2779     TRUE 0.971 3.000 0.047 1.000   NA
 3502633 3502634 Patl_2788 Patl_2789     FALSE 0.341 188.000 0.227 NA   NA
 3502634 3502635 Patl_2789 Patl_2790     TRUE 0.585 88.000 0.068 NA   NA
 3502636 3502637 Patl_2791 Patl_2792     FALSE 0.013 247.000 0.000 NA   NA
 3502637 3502638 Patl_2792 Patl_2793   mdoG TRUE 0.948 44.000 0.469 NA N NA
 3502638 3502639 Patl_2793 Patl_2794 mdoG   FALSE 0.001 1006.000 0.000 1.000 N NA
 3502640 3502641 Patl_2795 Patl_2796 nhaB   TRUE 0.957 82.000 0.723 1.000 N NA
 3502641 3502642 Patl_2796 Patl_2797     FALSE 0.008 309.000 0.000 1.000   NA
 3502643 3502644 Patl_2798 Patl_2799     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3502644 3502645 Patl_2799 Patl_2800     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 3502645 3502646 Patl_2800 Patl_2801     TRUE 0.970 1.000 0.046 NA N NA
 3502646 3502647 Patl_2801 Patl_2802     TRUE 0.918 64.000 0.363 NA   NA
 3502647 3502648 Patl_2802 Patl_2803     TRUE 0.985 -7.000 0.073 NA   NA
 3502648 3502649 Patl_2803 Patl_2804     FALSE 0.463 49.000 0.015 1.000 N NA
 3502649 3502650 Patl_2804 Patl_2805     TRUE 0.514 152.000 0.044 1.000 Y NA
 3502650 3502651 Patl_2805 Patl_2806     FALSE 0.397 116.000 0.066 1.000 N NA
 3502651 3502652 Patl_2806 Patl_2807     FALSE 0.027 198.000 0.000 NA   NA
 3502652 3502653 Patl_2807 Patl_2808     FALSE 0.016 232.000 0.000 NA   NA
 3502653 3502654 Patl_2808 Patl_2809     TRUE 0.985 -3.000 0.082 1.000 N NA
 3502654 3502655 Patl_2809 Patl_2810     FALSE 0.069 134.000 0.000 1.000 N NA
 3502655 3502656 Patl_2810 Patl_2811     FALSE 0.128 120.000 0.000 NA   NA
 3502657 3502658 Patl_2812 Patl_2813     TRUE 0.971 1.000 0.035 NA   NA
 3502662 3502663 Patl_2817 Patl_2818     FALSE 0.012 252.000 0.000 NA   NA
 3502666 3502667 Patl_2821 Patl_2822     FALSE 0.002 610.000 0.000 NA   NA
 3502667 3502668 Patl_2822 Patl_2823     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3502668 3502669 Patl_2823 Patl_2824     FALSE 0.002 873.000 0.000 NA   NA
 3502669 3502670 Patl_2824 Patl_2825     TRUE 0.993 0.000 0.210 NA N NA
 3502670 3502671 Patl_2825 Patl_2826     TRUE 0.983 1.000 0.083 NA   NA
 3502671 3502672 Patl_2826 Patl_2827     TRUE 0.844 18.000 0.040 NA   NA
 3502672 3502673 Patl_2827 Patl_2828     TRUE 0.937 33.000 0.281 NA   NA
 3502674 3502675 Patl_2829 Patl_2830     TRUE 1.000 0.000 0.703 0.001 Y NA
 3502675 3502676 Patl_2830 Patl_2831     TRUE 0.989 10.000 0.083 1.000 Y NA
 3502676 3502677 Patl_2831 Patl_2832     TRUE 0.996 11.000 0.293 1.000 Y NA
 3502677 3502678 Patl_2832 Patl_2833     TRUE 0.965 55.000 0.221 0.001 Y NA
 3502678 3502679 Patl_2833 Patl_2834     TRUE 1.000 -7.000 0.947 0.001 Y NA
 3502679 3502680 Patl_2834 Patl_2835     TRUE 0.904 10.000 0.014 NA   NA
 3502680 3502681 Patl_2835 Patl_2836     FALSE 0.175 123.000 0.005 NA   NA
 3502681 3502682 Patl_2836 Patl_2837     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3502682 3502683 Patl_2837 Patl_2838     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3502683 3502684 Patl_2838 Patl_2839     FALSE 0.039 179.000 0.000 1.000   NA
 3502684 3502685 Patl_2839 Patl_2840     TRUE 0.998 0.000 0.500 1.000   NA
 3502685 3502686 Patl_2840 Patl_2841     TRUE 0.999 4.000 0.476 1.000 Y NA
 3502687 3502688 Patl_2842 Patl_2843     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 3502688 3502689 Patl_2843 Patl_2844     FALSE 0.017 234.000 0.000 1.000   NA
 3502689 3502690 Patl_2844 Patl_2845     TRUE 0.903 75.000 0.074 0.001 Y NA
 3502690 3502691 Patl_2845 Patl_2846     FALSE 0.007 333.000 0.000 1.000   NA
 3502695 3502696 Patl_2850 Patl_2851     FALSE 0.003 551.000 0.000 NA   NA
 3502696 3502697 Patl_2851 Patl_2853     FALSE 0.002 764.000 0.000 NA   NA
 3502698 3502699 Patl_2854 Patl_2855     TRUE 0.997 -13.000 0.333 1.000   NA
 3502701 3502702 Patl_2857 Patl_2858     FALSE 0.068 150.000 0.000 NA   NA
 3502702 3502703 Patl_2858 Patl_2859     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3502705 3502706 Patl_2861 Patl_2862     TRUE 0.870 28.000 0.000 NA Y NA
 3502706 3502707 Patl_2862 Patl_2863     TRUE 1.000 2.000 0.867 NA Y NA
 3502707 3502708 Patl_2863 Patl_2864     TRUE 1.000 2.000 0.733 1.000 Y NA
 3502708 3502709 Patl_2864 Patl_2865     FALSE 0.006 386.000 0.000 0.058 N NA
 3502709 3502710 Patl_2865 Patl_2866     FALSE 0.007 307.000 0.000 NA   NA
 3502713 3502714 Patl_2869 Patl_2870     TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA N NA
 3502714 3502715 Patl_2870 Patl_2871     TRUE 1.000 0.000 1.000 0.009 Y NA
 3502717 3502718 Patl_2873 Patl_2874     TRUE 0.992 3.000 0.180 0.046   NA
 3502718 3502719 Patl_2874 Patl_2875     TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 3502719 3502720 Patl_2875 Patl_2876     TRUE 0.808 67.000 0.167 NA   NA
 3502720 3502721 Patl_2876 Patl_2877     TRUE 0.993 10.000 0.333 0.044   NA
 3502721 3502722 Patl_2877 Patl_2878     FALSE 0.009 286.000 0.000 NA   NA
 3502722 3502723 Patl_2878 Patl_2879     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3502724 3502725 Patl_2880 Patl_2881 hisG   TRUE 0.941 81.000 0.171 0.002 Y NA
 3502725 3502726 Patl_2881 Patl_2882     TRUE 0.999 -7.000 0.294 0.002 Y NA
 3502726 3502727 Patl_2882 Patl_2883     TRUE 0.999 2.000 0.341 0.002 Y NA
 3502727 3502728 Patl_2883 Patl_2884     TRUE 0.998 0.000 0.128 0.002 Y NA
 3502728 3502729 Patl_2884 Patl_2885     TRUE 0.997 9.000 0.210 0.002 Y NA
 3502729 3502730 Patl_2885 Patl_2886     FALSE 0.203 188.000 0.000 1.000 Y NA
 3502730 3502731 Patl_2886 Patl_2887     TRUE 0.737 77.000 0.000 1.000 Y NA
 3502731 3502732 Patl_2887 Patl_2888     TRUE 0.981 62.000 0.430 0.002 Y NA
 3502732 3502733 Patl_2888 Patl_2889     FALSE 0.004 330.000 0.000 1.000 N NA
 3502733 3502734 Patl_2889 Patl_2890     TRUE 0.977 3.000 0.074 NA   NA
 3502734 3502735 Patl_2890 Patl_2891     FALSE 0.007 320.000 0.000 NA   NA
 3502736 3502737 Patl_2892 Patl_2893     FALSE 0.212 131.000 0.017 NA   NA
 3502737 3502738 Patl_2893 Patl_2894     FALSE 0.102 189.000 0.035 0.080 N NA
 3502738 3502739 Patl_2894 Patl_2895     FALSE 0.128 157.000 0.028 1.000 N NA
 3502739 3502740 Patl_2895 Patl_2896     TRUE 0.971 39.000 0.604 NA   NA
 3502740 3502741 Patl_2896 Patl_2897     TRUE 0.932 58.000 0.411 NA   NA
 3502741 3502742 Patl_2897 Patl_2898     TRUE 0.958 10.000 0.088 1.000 N NA
 3502742 3502743 Patl_2898 Patl_2899     FALSE 0.014 241.000 0.000 NA   NA
 3502743 3502744 Patl_2899 Patl_2900     TRUE 0.999 1.000 0.914 NA   NA
 3502744 3502745 Patl_2900 Patl_2901     TRUE 0.834 116.000 0.406 NA   NA
 3502745 3502746 Patl_2901 Patl_2902     FALSE 0.003 537.000 0.000 NA   NA
 3502746 3502747 Patl_2902 Patl_2903   anmK FALSE 0.002 461.000 0.000 NA N NA
 3502748 3502749 Patl_2904 Patl_2905     FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 3502750 3502751 Patl_2906 Patl_2907     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3502754 3502755 Patl_2910 Patl_2911 folX   TRUE 0.930 18.000 0.122 1.000   NA
 3502756 3502757 Patl_2912 Patl_2913     TRUE 0.997 4.000 0.535 NA N NA
 3502760 3502761 Patl_2916 Patl_2917     TRUE 0.997 5.000 0.637 NA   NA
 3502762 3502763 Patl_2918 Patl_R0053     FALSE 0.066 151.000 0.000 NA   NA
 3502763 3502764 Patl_R0053 Patl_R0054     FALSE 0.006 331.000 0.000 NA   NA
 3502764 3502765 Patl_R0054 Patl_R0055     FALSE 0.037 180.000 0.000 NA   NA
 3502765 3502766 Patl_R0055 Patl_R0056     FALSE 0.071 148.000 0.000 NA   NA
 3502766 3502767 Patl_R0056 Patl_2919   gltX FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 3502768 3502769 Patl_R0057 Patl_R0058     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 3502769 3502770 Patl_R0058 Patl_R0059     FALSE 0.280 66.000 0.000 NA   NA
 3502770 3502771 Patl_R0059 Patl_2920     FALSE 0.002 644.000 0.000 NA   NA
 3502772 3502773 Patl_2921 Patl_2922     TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 3502773 3502774 Patl_2922 Patl_2923     FALSE 0.246 177.000 0.000 1.000 Y NA
 3502775 3502776 Patl_2924 Patl_2925     TRUE 0.992 -3.000 0.166 1.000 N NA
 3502776 3502777 Patl_2925 Patl_2926     TRUE 0.951 91.000 0.316 1.000 Y NA
 3502777 3502778 Patl_2926 Patl_2927     TRUE 0.991 13.000 0.189 1.000 Y NA
 3502778 3502779 Patl_2927 Patl_2928     TRUE 0.999 -3.000 0.205 0.061 Y NA
 3502779 3502780 Patl_2928 Patl_2929     TRUE 0.996 -3.000 0.229 0.061 N NA
 3502781 3502782 Patl_2930 Patl_2931     FALSE 0.074 146.000 0.000 NA   NA
 3502784 3502785 Patl_2933 Patl_2934     TRUE 0.466 28.000 0.000 NA   NA
 3502787 3502788 Patl_2936 Patl_R0060     FALSE 0.004 402.000 0.000 NA   NA
 3502788 3502789 Patl_R0060 Patl_R0061     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 3502789 3502790 Patl_R0061 Patl_2937     FALSE 0.014 241.000 0.000 NA   NA
 3502790 3502791 Patl_2937 Patl_2938     TRUE 0.985 12.000 0.278 1.000   NA
 3502791 3502792 Patl_2938 Patl_2939     TRUE 0.960 47.000 0.592 1.000 N NA
 3502792 3502793 Patl_2939 Patl_2940     TRUE 0.984 0.000 0.089 NA N NA
 3502793 3502794 Patl_2940 Patl_2941     TRUE 0.963 14.000 0.183 NA N NA
 3502794 3502795 Patl_2941 Patl_2942     TRUE 0.998 13.000 0.556 0.057 Y NA
 3502795 3502796 Patl_2942 Patl_2943     TRUE 0.998 -10.000 0.593 1.000   NA
 3502796 3502797 Patl_2943 Patl_2944   ruvB FALSE 0.014 604.000 0.082 1.000   NA
 3502797 3502798 Patl_2944 Patl_2945 ruvB   TRUE 0.954 131.000 0.549 0.001 Y NA
 3502798 3502799 Patl_2945 Patl_2946     TRUE 0.995 17.000 0.451 0.007 Y NA
 3502799 3502800 Patl_2946 Patl_2947   ntpA TRUE 0.854 37.000 0.004 1.000 Y NA
 3502800 3502801 Patl_2947 Patl_2948 ntpA aspS TRUE 0.507 87.000 0.050 1.000 N NA
 3502803 3502804 Patl_2950 Patl_2951     TRUE 0.995 15.000 0.448 NA Y NA
 3502807 3502808 Patl_2954 Patl_2955   asnB FALSE 0.007 316.000 0.000 1.000   NA
 3502811 3502812 Patl_2958 Patl_2959     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3502812 3502813 Patl_2959 Patl_2960     TRUE 0.680 15.000 0.000 NA   NA
 3502815 3502816 Patl_2962 Patl_2963     FALSE 0.015 209.000 0.000 1.000 N NA
 3502816 3502817 Patl_2963 Patl_2964     TRUE 0.496 36.000 0.010 1.000 N NA
 3502818 3502819 Patl_R0062 Patl_R0063     FALSE 0.204 95.000 0.000 NA   NA
 3502819 3502820 Patl_R0063 Patl_2965     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 3502820 3502821 Patl_2965 Patl_2966     TRUE 0.999 0.000 0.564 0.046 Y NA
 3502821 3502822 Patl_2966 Patl_2967     TRUE 0.999 0.000 0.537 0.016 Y NA
 3502822 3502823 Patl_2967 Patl_2968     TRUE 0.999 9.000 0.814 0.046 Y NA
 3502823 3502824 Patl_2968 Patl_2969     TRUE 1.000 -3.000 0.924 0.046 Y NA
 3502824 3502825 Patl_2969 Patl_2970     TRUE 0.999 7.000 0.908 0.046 Y NA
 3502825 3502826 Patl_2970 Patl_2971     TRUE 0.816 35.000 0.109 1.000 N NA
 3502828 3502829 Patl_2973 Patl_2974     FALSE 0.174 105.000 0.000 1.000   NA
 3502830 3502831 Patl_2975 Patl_2976     TRUE 0.979 -15.000 0.050 NA   NA
 3502831 3502832 Patl_2976 Patl_2977     TRUE 0.719 61.000 0.091 NA   NA
 3502833 3502834 Patl_2978 Patl_2979     FALSE 0.020 217.000 0.000 1.000   NA
 3502834 3502835 Patl_2979 Patl_2980     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3502835 3502836 Patl_2980 Patl_2981     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3502837 3502838 Patl_2982 Patl_2983     FALSE 0.290 62.000 0.000 NA   NA
 3502838 3502839 Patl_2983 Patl_2984     FALSE 0.010 274.000 0.000 NA   NA
 3502839 3502840 Patl_2984 Patl_2985     FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 3502840 3502841 Patl_2985 Patl_2986     TRUE 0.987 0.000 0.091 1.000   NA
 3502841 3502842 Patl_2986 Patl_2987     TRUE 0.999 2.000 0.955 1.000 N NA
 3502842 3502843 Patl_2987 Patl_2988     TRUE 0.997 13.000 0.917 0.057   NA
 3502843 3502844 Patl_2988 Patl_2989     TRUE 0.999 2.000 0.821 0.014   NA
 3502844 3502845 Patl_2989 Patl_2990     TRUE 0.998 6.000 0.750 NA   NA
 3502847 3502848 Patl_2992 Patl_2993     FALSE 0.161 90.000 0.000 1.000 N NA
 3502852 3502853 Patl_2997 Patl_2998     FALSE 0.162 204.000 0.000 1.000 Y NA
 3502853 3502854 Patl_2998 Patl_2999   phhA TRUE 0.468 133.000 0.000 1.000 Y NA
 3502854 3502855 Patl_2999 Patl_3000 phhA   FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 3502855 3502856 Patl_3000 Patl_3001     TRUE 0.999 -3.000 0.791 NA   NA
 3502856 3502857 Patl_3001 Patl_3002     FALSE 0.413 163.000 0.190 NA   NA
 3502857 3502858 Patl_3002 Patl_3003   pspB TRUE 0.999 -3.000 0.913 NA   NA
 3502858 3502859 Patl_3003 Patl_3004 pspB   TRUE 0.989 23.000 0.739 NA   NA
 3502860 3502861 Patl_3005 Patl_3006     TRUE 0.994 6.000 0.402 1.000 N NA
 3502861 3502862 Patl_3006 Patl_3007     TRUE 0.997 0.000 0.118 0.048 Y NA
 3502862 3502863 Patl_3007 Patl_3008     TRUE 0.990 -13.000 0.118 0.048 N NA
 3502863 3502864 Patl_3008 Patl_3009     TRUE 0.999 0.000 0.272 1.000 Y NA
 3502864 3502865 Patl_3009 Patl_3010     TRUE 0.999 -3.000 0.239 0.012 Y NA
 3502866 3502867 Patl_3011 Patl_3012     TRUE 0.999 10.000 0.976 0.001 Y NA
 3502867 3502868 Patl_3012 Patl_3013     TRUE 0.996 31.000 0.810 0.001 Y NA
 3502868 3502869 Patl_3013 Patl_R0064     FALSE 0.013 249.000 0.000 NA   NA
 3502869 3502870 Patl_R0064 Patl_R0065     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3502870 3502871 Patl_R0065 Patl_R0066     FALSE 0.159 107.000 0.000 NA   NA
 3502871 3502872 Patl_R0066 Patl_3014     FALSE 0.006 352.000 0.000 NA   NA
 3502872 3502873 Patl_3014 Patl_3015     FALSE 0.165 136.000 0.020 1.000 N NA
 3502873 3502874 Patl_3015 Patl_3016     FALSE 0.435 126.000 0.085 1.000   NA
 3502876 3502877 Patl_3018 Patl_3019     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3502877 3502878 Patl_3019 Patl_3021     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 3502878 3502879 Patl_3021 Patl_3022     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 3502879 3502880 Patl_3022 Patl_3023     TRUE 0.980 37.000 0.743 NA   NA
 3502880 3502881 Patl_3023 Patl_3024     TRUE 0.993 24.000 0.886 0.006   NA
 3502881 3502882 Patl_3024 Patl_3025     TRUE 0.998 -3.000 0.454 1.000   NA
 3502882 3502883 Patl_3025 Patl_3026     TRUE 0.793 69.000 0.170 1.000 N NA
 3502883 3502884 Patl_3026 Patl_3027     TRUE 0.989 25.000 0.327 0.006 Y NA
 3502884 3502885 Patl_3027 Patl_3028     TRUE 0.995 13.000 0.341 1.000 Y NA
 3502885 3502886 Patl_3028 Patl_3029     TRUE 0.990 32.000 0.516 1.000 Y NA
 3502886 3502887 Patl_3029 Patl_3030   fliA TRUE 0.915 48.000 0.283 0.074 N NA
 3502887 3502888 Patl_3030 Patl_3031 fliA   TRUE 0.998 -3.000 0.482 1.000 N NA
 3502888 3502889 Patl_3031 Patl_3032     TRUE 0.996 -3.000 0.241 0.013 N NA
 3502889 3502890 Patl_3032 Patl_3033   flhA TRUE 0.963 35.000 0.178 1.000 Y NA
 3502890 3502891 Patl_3033 Patl_3034 flhA   TRUE 0.887 122.000 0.205 0.009 Y NA
 3502891 3502892 Patl_3034 Patl_3035   fliR TRUE 0.993 13.000 0.240 1.000 Y NA
 3502892 3502893 Patl_3035 Patl_3036 fliR   TRUE 1.000 2.000 0.719 0.002 Y NA
 3502893 3502894 Patl_3036 Patl_3037   fliP TRUE 1.000 3.000 0.702 0.009 Y NA
 3502894 3502895 Patl_3037 Patl_3038 fliP   TRUE 0.997 -7.000 0.122 1.000 Y NA
 3502895 3502896 Patl_3038 Patl_3039   fliN TRUE 0.999 -40.000 0.443 1.000 Y NA
 3502896 3502897 Patl_3039 Patl_3040 fliN fliM TRUE 0.997 21.000 0.741 0.001 Y NA
 3502897 3502898 Patl_3040 Patl_3041 fliM fliL TRUE 0.990 19.000 0.241 0.001 Y NA
 3502898 3502899 Patl_3041 Patl_3042 fliL   TRUE 0.933 79.000 0.182 1.000 Y NA
 3502899 3502900 Patl_3042 Patl_3043     FALSE 0.320 358.000 0.317 0.006 Y NA
 3502900 3502901 Patl_3043 Patl_3044   fliI TRUE 0.919 85.000 0.127 0.007 Y NA
 3502901 3502902 Patl_3044 Patl_3045 fliI fliH TRUE 0.997 7.000 0.248 0.003 Y NA
 3502902 3502903 Patl_3045 Patl_3046 fliH fliG TRUE 0.988 28.000 0.320 0.003 Y NA
 3502903 3502904 Patl_3046 Patl_3047 fliG fliF TRUE 0.965 44.000 0.189 0.006 Y NA
 3502904 3502905 Patl_3047 Patl_3048 fliF   TRUE 0.999 11.000 0.910 0.006 Y NA
 3502905 3502906 Patl_3048 Patl_3049     FALSE 0.174 327.000 0.446 1.000 N NA
 3502906 3502907 Patl_3049 Patl_3050     TRUE 0.999 5.000 0.679 0.079 Y NA
 3502907 3502908 Patl_3050 Patl_3051     TRUE 0.872 155.000 0.377 0.079 Y NA
 3502908 3502909 Patl_3051 Patl_3052     FALSE 0.013 253.000 0.000 1.000   NA
 3502910 3502911 Patl_3053 Patl_3054     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3502912 3502913 Patl_3055 Patl_3056     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3502913 3502914 Patl_3056 Patl_3057     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3502914 3502915 Patl_3057 Patl_3058     TRUE 0.899 3.000 0.000 1.000   NA
 3502915 3502916 Patl_3058 Patl_3059     FALSE 0.032 189.000 0.000 1.000   NA
 3502916 3502917 Patl_3059 Patl_3060     TRUE 0.986 -3.000 0.081 NA   NA
 3502917 3502918 Patl_3060 Patl_3061     TRUE 0.998 -3.000 0.457 NA   NA
 3502918 3502919 Patl_3061 Patl_3062     TRUE 0.998 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 3502919 3502920 Patl_3062 Patl_3063     TRUE 0.999 0.000 0.624 1.000 Y NA
 3502920 3502921 Patl_3063 Patl_3064     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502921 3502922 Patl_3064 Patl_3065     FALSE 0.309 55.000 0.000 NA   NA
 3502922 3502923 Patl_3065 Patl_3066     FALSE 0.408 140.000 0.000 NA Y NA
 3502923 3502924 Patl_3066 Patl_3067     TRUE 0.858 2.000 0.000 NA N NA
 3502924 3502925 Patl_3067 Patl_3068     TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000   NA
 3502925 3502926 Patl_3068 Patl_3069     TRUE 0.909 2.000 0.000 1.000   NA
 3502926 3502927 Patl_3069 Patl_3070     TRUE 0.988 1.000 0.000 NA Y NA
 3502927 3502928 Patl_3070 Patl_3071     FALSE 0.164 86.000 0.000 NA N NA
 3502928 3502929 Patl_3071 Patl_3072     TRUE 1.000 -7.000 0.769 0.061 Y NA
 3502929 3502930 Patl_3072 Patl_3073     TRUE 0.994 0.000 0.200 1.000   NA
 3502930 3502931 Patl_3073 Patl_3074     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3502931 3502932 Patl_3074 Patl_3075     TRUE 0.988 -3.000 0.097 NA   NA
 3502932 3502933 Patl_3075 Patl_3076     TRUE 0.998 -10.000 0.236 NA Y NA
 3502933 3502934 Patl_3076 Patl_3077     TRUE 0.823 39.000 0.000 NA Y NA
 3502934 3502935 Patl_3077 Patl_3078     TRUE 0.986 2.000 0.000 NA Y NA
 3502935 3502936 Patl_3078 Patl_3079     TRUE 0.996 11.000 0.296 1.000 Y NA
 3502936 3502937 Patl_3079 Patl_3080     TRUE 0.997 9.000 0.678 1.000   NA
 3502937 3502938 Patl_3080 Patl_3081     FALSE 0.104 132.000 0.000 NA   NA
 3502938 3502939 Patl_3081 Patl_3082     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3502939 3502940 Patl_3082 Patl_3083     TRUE 0.990 20.000 0.250 0.002 Y NA
 3502940 3502941 Patl_3083 Patl_3084     TRUE 0.964 25.000 0.117 NA Y NA
 3502941 3502942 Patl_3084 Patl_3085     TRUE 0.646 124.000 0.032 NA Y NA
 3502944 3502945 Patl_3087 Patl_3088     FALSE 0.044 396.000 0.000 0.001 Y NA
 3502947 3502948 Patl_3090 Patl_3091 flgL   TRUE 0.963 23.000 0.057 0.001 Y NA
 3502948 3502949 Patl_3091 Patl_3092     TRUE 0.996 28.000 0.705 0.002 Y NA
 3502949 3502950 Patl_3092 Patl_3093   flgI TRUE 0.780 191.000 0.405 0.007 Y NA
 3502950 3502951 Patl_3093 Patl_3094 flgI flgH TRUE 0.997 14.000 0.457 0.007 Y NA
 3502951 3502952 Patl_3094 Patl_3095 flgH flgG TRUE 1.000 0.000 0.909 0.006 Y NA
 3502952 3502953 Patl_3095 Patl_3096 flgG   TRUE 0.982 62.000 0.446 0.001 Y NA
 3502953 3502954 Patl_3096 Patl_3097   flgE TRUE 0.885 178.000 0.594 0.004 Y NA
 3502954 3502955 Patl_3097 Patl_3098 flgE flgD TRUE 0.998 15.000 0.875 NA Y NA
 3502955 3502956 Patl_3098 Patl_3099 flgD   TRUE 0.987 35.000 0.478 NA Y NA
 3502956 3502957 Patl_3099 Patl_3100     TRUE 1.000 0.000 0.889 0.003 Y NA
 3502957 3502958 Patl_3100 Patl_3101     TRUE 0.948 93.000 0.309 1.000 Y NA
 3502958 3502959 Patl_3101 Patl_3102     TRUE 0.998 17.000 0.838 1.000 Y NA
 3502960 3502961 Patl_3103 Patl_3104 flgA   TRUE 0.779 129.000 0.371 NA   NA
 3502961 3502962 Patl_3104 Patl_3105     TRUE 0.777 44.000 0.062 0.002   NA
 3502964 3502965 Patl_3107 Patl_R0067     FALSE 0.324 50.000 0.000 NA   NA
 3502967 3502968 Patl_3109 Patl_3110     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 3502975 3502976 Patl_3117 Patl_3118     FALSE 0.091 138.000 0.000 1.000   NA
 3502976 3502977 Patl_3118 Patl_3119   guaA FALSE 0.277 75.000 0.000 1.000   NA
 3502977 3502978 Patl_3119 Patl_3120 guaA   TRUE 0.863 78.000 0.190 0.001   NA
 3502980 3502981 Patl_3122 Patl_3123 engA   TRUE 0.804 88.000 0.203 1.000   NA
 3502981 3502982 Patl_3123 Patl_3124     TRUE 0.998 -7.000 0.492 1.000   NA
 3502982 3502983 Patl_3124 Patl_3125     TRUE 0.878 68.000 0.259 1.000   NA
 3502983 3502984 Patl_3125 Patl_3126     TRUE 0.683 114.000 0.207 1.000 N NA
 3502984 3502985 Patl_3126 Patl_3127     TRUE 0.852 79.000 0.233 1.000   NA
 3502985 3502986 Patl_3127 Patl_3128     TRUE 0.867 37.000 0.153 1.000   NA
 3502986 3502987 Patl_3128 Patl_3129     TRUE 0.940 12.000 0.067 1.000   NA
 3502987 3502988 Patl_3129 Patl_3130     TRUE 0.542 133.000 0.156 1.000   NA
 3502990 3502991 Patl_3132 Patl_3133     FALSE 0.166 170.000 0.051 1.000   NA
 3502991 3502992 Patl_3133 Patl_3134     FALSE 0.036 239.000 0.030 1.000 N NA
 3502992 3502993 Patl_3134 Patl_3135   clpX FALSE 0.409 246.000 0.201 0.079 Y NA
 3502993 3502994 Patl_3135 Patl_3136 clpX   TRUE 0.958 91.000 0.352 1.000 Y NA
 3502994 3502995 Patl_3136 Patl_3137   tig TRUE 0.959 88.000 0.351 1.000 Y NA
 3502995 3502996 Patl_3137 Patl_R0068 tig   FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 3502996 3502997 Patl_R0068 Patl_R0069     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3502997 3502998 Patl_R0069 Patl_R0070     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 3502998 3502999 Patl_R0070 Patl_R0071     FALSE 0.443 31.000 0.000 NA   NA
 3502999 3503000 Patl_R0071 Patl_3138     FALSE 0.013 245.000 0.000 NA   NA
 3503001 3503002 Patl_3139 Patl_3140     TRUE 0.799 17.000 0.019 NA   NA
 3503003 3503004 Patl_3141 Patl_3142     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3503004 3503005 Patl_3142 Patl_3143     TRUE 0.997 3.000 0.435 NA   NA
 3503005 3503006 Patl_3143 Patl_3144     TRUE 0.996 3.000 0.426 1.000   NA
 3503008 3503009 Patl_3146 Patl_3147     TRUE 0.813 13.000 0.013 NA N NA
 3503009 3503010 Patl_3147 Patl_3148     FALSE 0.376 78.000 0.006 1.000   NA
 3503010 3503011 Patl_3148 Patl_3149     TRUE 0.993 -7.000 0.127 0.037   NA
 3503011 3503012 Patl_3149 Patl_3150     TRUE 0.988 1.000 0.117 1.000   NA
 3503012 3503013 Patl_3150 Patl_3151     TRUE 0.993 1.000 0.187 1.000   NA
 3503013 3503014 Patl_3151 Patl_3152     FALSE 0.100 184.000 0.045 NA N NA
 3503014 3503015 Patl_3152 Patl_3153     TRUE 0.999 2.000 0.609 NA Y NA
 3503015 3503016 Patl_3153 Patl_3154     TRUE 0.994 41.000 0.856 NA Y NA
 3503016 3503017 Patl_3154 Patl_3155     TRUE 0.861 137.000 0.705 NA N NA
 3503019 3503020 Patl_3157 Patl_3158     TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 3503020 3503021 Patl_3158 Patl_3159     TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 3503022 3503023 Patl_3160 Patl_3161     FALSE 0.448 69.000 0.013 1.000   NA
 3503024 3503025 Patl_3162 Patl_3163   nadE TRUE 0.633 25.000 0.013 1.000 N NA
 3503025 3503026 Patl_3163 Patl_3164 nadE   FALSE 0.192 99.000 0.000 NA   NA
 3503026 3503027 Patl_3164 Patl_3165     TRUE 0.999 1.000 0.833 NA   NA
 3503027 3503028 Patl_3165 Patl_3166     TRUE 0.980 -10.000 0.051 NA   NA
 3503028 3503029 Patl_3166 Patl_3167     TRUE 0.928 -6.000 0.000 NA   NA
 3503030 3503031 Patl_3168 Patl_3169     TRUE 0.659 96.000 0.000 NA Y NA
 3503032 3503033 Patl_3170 Patl_3171     TRUE 0.961 8.000 0.064 NA   NA
 3503033 3503034 Patl_3171 Patl_3172     TRUE 0.994 -3.000 0.176 NA   NA
 3503034 3503035 Patl_3172 Patl_3173     TRUE 0.999 -3.000 0.600 NA   NA
 3503035 3503036 Patl_3173 Patl_3174     TRUE 0.989 12.000 0.375 NA   NA
 3503036 3503037 Patl_3174 Patl_3175     FALSE 0.008 299.000 0.000 NA   NA
 3503037 3503038 Patl_3175 Patl_3176     TRUE 0.964 46.000 0.626 1.000 N NA
 3503038 3503039 Patl_3176 Patl_3177     TRUE 0.997 -7.000 0.417 1.000 N NA
 3503039 3503040 Patl_3177 Patl_3178     TRUE 0.991 -7.000 0.147 1.000 N NA
 3503040 3503041 Patl_3178 Patl_3179     TRUE 0.901 42.000 0.254 1.000 N NA
 3503041 3503042 Patl_3179 Patl_3180     FALSE 0.243 196.000 0.169 1.000   NA
 3503043 3503044 Patl_3181 Patl_3182     FALSE 0.003 515.000 0.000 1.000   NA
 3503045 3503046 Patl_3183 Patl_3184     TRUE 0.902 34.000 0.209 1.000 N NA
 3503046 3503047 Patl_3184 Patl_3185     TRUE 0.998 0.000 0.518 NA   NA
 3503048 3503049 Patl_3186 Patl_3187     TRUE 0.998 -3.000 0.402 NA   NA
 3503055 3503056 Patl_3193 Patl_3194 queF   TRUE 0.668 73.000 0.079 NA   NA
 3503056 3503057 Patl_3194 Patl_3195     FALSE 0.380 88.000 0.014 NA   NA
 3503057 3503058 Patl_3195 Patl_3196     TRUE 0.680 15.000 0.000 NA   NA
 3503058 3503059 Patl_3196 Patl_3197     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 3503059 3503060 Patl_3197 Patl_3198     FALSE 0.059 159.000 0.000 1.000   NA
 3503061 3503062 Patl_3199 Patl_3200     TRUE 0.997 2.000 0.157 1.000 Y NA
 3503063 3503064 Patl_3201 Patl_3202     TRUE 0.899 88.000 0.400 NA   NA
 3503064 3503065 Patl_3202 Patl_3203     TRUE 0.912 19.000 0.105 NA   NA
 3503065 3503066 Patl_3203 Patl_3204     TRUE 0.997 -3.000 0.380 NA   NA
 3503067 3503068 Patl_3205 Patl_3206     TRUE 0.993 -3.000 0.154 NA   NA
 3503068 3503069 Patl_3206 Patl_3207     FALSE 0.006 337.000 0.000 NA   NA
 3503069 3503070 Patl_3207 Patl_3208     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3503070 3503071 Patl_3208 Patl_3209     FALSE 0.030 192.000 0.000 NA   NA
 3503071 3503072 Patl_3209 Patl_3210     FALSE 0.204 95.000 0.000 NA   NA
 3503072 3503073 Patl_3210 Patl_3211     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3503073 3503074 Patl_3211 Patl_3212     TRUE 0.664 16.000 0.000 1.000   NA
 3503074 3503075 Patl_3212 Patl_3213     TRUE 0.466 28.000 0.000 NA   NA
 3503075 3503076 Patl_3213 Patl_3214     FALSE 0.074 146.000 0.000 NA   NA
 3503076 3503077 Patl_3214 Patl_3215     FALSE 0.018 225.000 0.000 NA   NA
 3503077 3503078 Patl_3215 Patl_3216     FALSE 0.340 46.000 0.000 NA   NA
 3503078 3503079 Patl_3216 Patl_3217     TRUE 0.995 -3.000 0.231 NA   NA
 3503080 3503081 Patl_3218 Patl_3219     FALSE 0.434 32.000 0.000 NA   NA
 3503082 3503083 Patl_3220 Patl_3221     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3503083 3503084 Patl_3221 Patl_3222     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3503086 3503087 Patl_3224 Patl_3225     FALSE 0.247 83.000 0.000 NA   NA
 3503087 3503088 Patl_3225 Patl_3226     FALSE 0.004 400.000 0.000 NA   NA
 3503088 3503089 Patl_3226 Patl_3227     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3503089 3503090 Patl_3227 Patl_3228     TRUE 0.848 7.000 0.000 NA   NA
 3503090 3503091 Patl_3228 Patl_3229     TRUE 0.921 -13.000 0.000 NA   NA
 3503091 3503092 Patl_3229 Patl_3230     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3503092 3503093 Patl_3230 Patl_3231     TRUE 0.934 124.000 0.364 0.005 Y NA
 3503093 3503094 Patl_3231 Patl_3232     TRUE 0.999 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3503095 3503096 Patl_3233 Patl_3234     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3503096 3503097 Patl_3234 Patl_3235     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3503097 3503098 Patl_3235 Patl_3236     FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3503099 3503100 Patl_3237 Patl_3238     FALSE 0.003 483.000 0.000 NA   NA
 3503100 3503101 Patl_3238 Patl_3239     TRUE 0.993 3.000 0.057 1.000 Y NA
 3503101 3503102 Patl_3239 Patl_3240     TRUE 0.995 -3.000 0.056 NA Y NA
 3503102 3503103 Patl_3240 Patl_3241     FALSE 0.149 208.000 0.000 NA Y NA
 3503103 3503104 Patl_3241 Patl_3242     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3503104 3503105 Patl_3242 Patl_3243     FALSE 0.180 102.000 0.000 NA   NA
 3503106 3503107 Patl_3244 Patl_3245     FALSE 0.258 137.000 0.042 NA   NA
 3503107 3503108 Patl_3245 Patl_3246     TRUE 0.955 5.000 0.037 NA   NA
 3503109 3503110 Patl_3247 Patl_3248     TRUE 0.995 -3.000 0.239 NA N NA
 3503110 3503111 Patl_3248 Patl_3249     TRUE 1.000 -3.000 0.727 NA Y NA
 3503111 3503112 Patl_3249 Patl_3250     TRUE 0.999 -3.000 0.578 NA   NA
 3503112 3503113 Patl_3250 Patl_3251     TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002   NA
 3503113 3503114 Patl_3251 Patl_3252     TRUE 0.998 2.000 0.211 0.002 Y NA
 3503114 3503115 Patl_3252 Patl_3253     TRUE 0.997 -3.000 0.344 1.000 N NA
 3503115 3503116 Patl_3253 Patl_3254     TRUE 0.997 4.000 0.501 1.000 N NA
 3503116 3503117 Patl_3254 Patl_3255     TRUE 0.994 0.000 0.015 0.001 Y NA
 3503117 3503118 Patl_3255 Patl_3256     TRUE 0.995 -3.000 0.021 0.002 Y NA
 3503119 3503120 Patl_3257 Patl_3258     TRUE 0.733 32.000 0.041 1.000   NA
 3503121 3503122 Patl_3259 Patl_3260     FALSE 0.006 338.000 0.000 1.000   NA
 3503122 3503123 Patl_3260 Patl_3261     FALSE 0.327 49.000 0.000 NA   NA
 3503123 3503124 Patl_3261 Patl_3262     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3503127 3503128 Patl_3265 Patl_3266     FALSE 0.389 119.000 0.068 1.000 N NA
 3503128 3503129 Patl_3266 Patl_3267     FALSE 0.382 79.000 0.008 NA   NA
 3503129 3503130 Patl_3267 Patl_3268     FALSE 0.006 329.000 0.000 NA   NA
 3503130 3503131 Patl_3268 Patl_3269     TRUE 0.995 8.000 0.126 0.002 Y NA
 3503131 3503132 Patl_3269 Patl_3270     TRUE 0.995 13.000 0.275 0.002 Y NA
 3503132 3503133 Patl_3270 Patl_3271     TRUE 0.994 16.000 0.309 0.001 Y NA
 3503133 3503134 Patl_3271 Patl_3272     FALSE 0.011 231.000 0.000 1.000 N NA
 3503134 3503135 Patl_3272 Patl_3273     FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 3503136 3503137 Patl_3274 Patl_3275     TRUE 0.901 46.000 0.060 1.000 Y NA
 3503137 3503138 Patl_3275 Patl_3276     FALSE 0.003 380.000 0.000 NA N NA
 3503138 3503139 Patl_3276 Patl_3277     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 3503139 3503140 Patl_3277 Patl_3278     FALSE 0.077 144.000 0.000 NA   NA
 3503140 3503141 Patl_3278 Patl_3279     FALSE 0.002 1088.000 0.000 0.047 N NA
 3503141 3503142 Patl_3279 Patl_3280     FALSE 0.098 134.000 0.000 NA   NA
 3503142 3503143 Patl_3280 Patl_3281     TRUE 0.987 -7.000 0.089 NA   NA
 3503144 3503145 Patl_3282 Patl_3283     FALSE 0.309 55.000 0.000 NA   NA
 3503145 3503146 Patl_3283 Patl_3284     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3503147 3503148 Patl_3285 Patl_3286     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3503149 3503150 Patl_3287 Patl_3288     TRUE 0.989 5.000 0.218 1.000 N NA
 3503151 3503152 Patl_3289 Patl_3290     FALSE 0.277 68.000 0.000 NA   NA
 3503152 3503153 Patl_3290 Patl_3291     TRUE 0.874 91.000 0.333 NA   NA
 3503153 3503154 Patl_3291 Patl_3292     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3503154 3503155 Patl_3292 Patl_3293     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3503155 3503156 Patl_3293 Patl_3294     TRUE 0.890 43.000 0.214 NA   NA
 3503156 3503157 Patl_3294 Patl_3295     FALSE 0.292 65.000 0.000 1.000   NA
 3503157 3503158 Patl_3295 Patl_3296     TRUE 0.996 26.000 0.693 0.077 Y NA
 3503158 3503159 Patl_3296 Patl_3297     FALSE 0.461 61.000 0.023 1.000 N NA
 3503159 3503160 Patl_3297 Patl_3298   glpT FALSE 0.003 424.000 0.000 1.000 N NA
 3503160 3503161 Patl_3298 Patl_3299 glpT   FALSE 0.424 148.000 0.000 0.049 Y NA
 3503163 3503164 Patl_3301 Patl_3302     FALSE 0.015 236.000 0.000 NA   NA
 3503164 3503165 Patl_3302 Patl_3303     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3503167 3503168 Patl_3305 Patl_3306     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 3503168 3503169 Patl_3306 Patl_3307     FALSE 0.003 455.000 0.000 NA   NA
 3503169 3503170 Patl_3307 Patl_3308     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3503170 3503171 Patl_3308 Patl_3309     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 3503171 3503172 Patl_3309 Patl_3310     TRUE 0.997 11.000 0.750 NA   NA
 3503172 3503173 Patl_3310 Patl_3311     TRUE 0.992 -13.000 0.167 NA   NA
 3503173 3503174 Patl_3311 Patl_3312     TRUE 0.779 75.000 0.000 0.048 Y NA
 3503174 3503175 Patl_3312 Patl_3313     FALSE 0.010 236.000 0.000 NA N NA
 3503175 3503176 Patl_3313 Patl_3314     FALSE 0.032 394.000 0.000 NA Y NA
 3503176 3503177 Patl_3314 Patl_3315     TRUE 0.971 16.000 0.063 NA Y NA
 3503177 3503178 Patl_3315 Patl_3316     TRUE 0.997 13.000 0.402 0.001 Y NA
 3503178 3503179 Patl_3316 Patl_3317     TRUE 0.999 3.000 0.485 0.001 Y NA
 3503179 3503180 Patl_3317 Patl_3318     TRUE 0.972 17.000 0.079 NA Y NA
 3503180 3503181 Patl_3318 Patl_3319     FALSE 0.137 214.000 0.000 NA Y NA
 3503181 3503182 Patl_3319 Patl_3320     TRUE 0.999 13.000 0.937 NA Y NA
 3503183 3503184 Patl_3321 Patl_3322     FALSE 0.212 145.000 0.048 1.000 N NA
 3503184 3503185 Patl_3322 Patl_3323     TRUE 0.999 -10.000 0.486 1.000 Y NA
 3503185 3503186 Patl_3323 Patl_3324     FALSE 0.047 167.000 0.000 NA   NA
 3503186 3503187 Patl_3324 Patl_3325     FALSE 0.286 63.000 0.000 NA   NA
 3503188 3503189 Patl_3326 Patl_3327     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 3503189 3503190 Patl_3327 Patl_3328   pgk TRUE 0.518 158.000 0.032 0.005 Y NA
 3503190 3503191 Patl_3328 Patl_3329 pgk   TRUE 0.771 123.000 0.070 0.005 Y NA
 3503191 3503192 Patl_3329 Patl_3330     TRUE 0.839 144.000 0.285 1.000 Y NA
 3503193 3503194 Patl_3331 Patl_3332     FALSE 0.032 189.000 0.000 1.000   NA
 3503196 3503197 Patl_3334 Patl_3335     FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 3503198 3503199 Patl_3336 Patl_3337     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 3503199 3503200 Patl_3337 Patl_3338     FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 3503200 3503201 Patl_3338 Patl_3339     FALSE 0.071 150.000 0.000 1.000   NA
 3503201 3503202 Patl_3339 Patl_3340     TRUE 0.946 37.000 0.356 NA   NA
 3503202 3503203 Patl_3340 Patl_3341     TRUE 0.779 50.000 0.110 NA   NA
 3503203 3503204 Patl_3341 Patl_3342     TRUE 0.834 35.000 0.122 1.000 N NA
 3503204 3503205 Patl_3342 Patl_3343     TRUE 0.953 107.000 0.454 1.000 Y NA
 3503205 3503206 Patl_3343 Patl_3344     TRUE 0.833 65.000 0.007 0.005 Y NA
 3503206 3503207 Patl_3344 Patl_3345     FALSE 0.016 205.000 0.000 1.000 N NA
 3503207 3503208 Patl_3345 Patl_3346     TRUE 0.500 48.000 0.011 1.000   NA
 3503209 3503210 Patl_3347 Patl_3348     TRUE 0.958 60.000 0.249 1.000 Y NA
 3503210 3503211 Patl_3348 Patl_3349     FALSE 0.044 218.000 0.029 1.000 N NA
 3503211 3503212 Patl_3349 Patl_3350   aceE TRUE 0.540 107.000 0.105 1.000 N NA
 3503212 3503213 Patl_3350 Patl_3351 aceE   TRUE 0.956 21.000 0.053 1.000 Y NA
 3503213 3503214 Patl_3351 Patl_3352     TRUE 0.950 113.000 0.463 1.000 Y NA
 3503214 3503215 Patl_3352 Patl_3353     FALSE 0.008 343.000 0.009 1.000 N NA
 3503215 3503216 Patl_3353 Patl_3354     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3503218 3503219 Patl_3356 Patl_3357     FALSE 0.118 104.000 0.000 NA N NA
 3503219 3503220 Patl_3357 Patl_3358     TRUE 0.787 50.000 0.000 NA Y NA
 3503221 3503222 Patl_3359 Patl_3360     TRUE 0.999 -3.000 0.700 NA   NA
 3503222 3503223 Patl_3360 Patl_3361     TRUE 0.996 -7.000 0.286 1.000   NA
 3503223 3503224 Patl_3361 Patl_3362     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3503224 3503225 Patl_3362 Patl_3363     FALSE 0.006 408.000 0.006 NA   NA
 3503225 3503226 Patl_3363 Patl_3364     TRUE 0.944 41.000 0.097 0.006 Y NA
 3503226 3503227 Patl_3364 Patl_3365     FALSE 0.017 231.000 0.000 NA   NA
 3503227 3503228 Patl_3365 Patl_3366     TRUE 0.979 0.000 0.050 NA   NA
 3503229 3503230 Patl_3367 Patl_3368     FALSE 0.065 136.000 0.000 1.000 N NA
 3503230 3503231 Patl_3368 Patl_3369     TRUE 0.580 36.000 0.023 1.000 N NA
 3503231 3503232 Patl_3369 Patl_3370     TRUE 1.000 -7.000 0.682 1.000 Y NA
 3503232 3503233 Patl_3370 Patl_3371     FALSE 0.005 374.000 0.000 NA   NA
 3503233 3503234 Patl_3371 Patl_3372     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 3503234 3503235 Patl_3372 Patl_3373     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 3503235 3503236 Patl_3373 Patl_3374     FALSE 0.004 391.000 0.000 NA   NA
 3503237 3503238 Patl_3375 Patl_3376     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 3503238 3503239 Patl_3376 Patl_3377     TRUE 0.986 -7.000 0.094 NA N NA
 3503239 3503240 Patl_3377 Patl_3378     FALSE 0.159 149.000 0.023 NA   NA
 3503241 3503242 Patl_3379 Patl_3380     TRUE 0.989 9.000 0.267 NA   NA
 3503243 3503244 Patl_3381 Patl_3382     FALSE 0.277 75.000 0.000 1.000   NA
 3503244 3503245 Patl_3382 Patl_3383     FALSE 0.004 358.000 0.000 1.000 N NA
 3503247 3503248 Patl_3385 Patl_3386     TRUE 0.917 34.000 0.224 NA   NA
 3503248 3503249 Patl_3386 Patl_3387     TRUE 0.986 0.000 0.092 NA   NA
 3503250 3503251 Patl_3388 Patl_3389     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3503251 3503252 Patl_3389 Patl_3390     TRUE 0.953 7.000 0.044 NA   NA
 3503252 3503253 Patl_3390 Patl_3391     TRUE 0.920 14.000 0.067 NA   NA
 3503255 3503256 Patl_3393 Patl_3394     FALSE 0.101 133.000 0.000 NA   NA
 3503257 3503258 Patl_3395 Patl_3396     TRUE 0.936 15.000 0.103 NA   NA
 3503258 3503259 Patl_3396 Patl_3397     TRUE 0.984 0.000 0.077 NA   NA
 3503259 3503260 Patl_3397 Patl_3398     TRUE 0.686 89.000 0.128 1.000 N NA
 3503264 3503265 Patl_3402 Patl_3403     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 3503265 3503266 Patl_3403 Patl_3404     FALSE 0.003 452.000 0.000 NA   NA
 3503266 3503267 Patl_3404 Patl_3405     FALSE 0.027 197.000 0.000 NA   NA
 3503268 3503269 Patl_3406 Patl_3407     FALSE 0.061 156.000 0.000 NA   NA
 3503270 3503271 Patl_3408 Patl_3409     TRUE 0.990 -19.000 0.135 NA   NA
 3503271 3503272 Patl_3409 Patl_3410     FALSE 0.048 170.000 0.000 1.000   NA
 3503273 3503274 Patl_3411 Patl_3412     TRUE 0.999 -3.000 0.556 1.000 Y NA
 3503275 3503276 Patl_3413 Patl_3414     TRUE 0.564 21.000 0.000 NA   NA
 3503276 3503277 Patl_3414 Patl_3415   djlA FALSE 0.009 247.000 0.000 1.000 N NA
 3503277 3503278 Patl_3415 Patl_3416 djlA   TRUE 0.750 42.000 0.091 1.000 N NA
 3503278 3503279 Patl_3416 Patl_3417     TRUE 0.958 71.000 0.642 NA   NA
 3503280 3503281 Patl_3418 Patl_3419     TRUE 0.806 68.000 0.182 1.000 N NA
 3503281 3503282 Patl_3419 Patl_3420     TRUE 0.997 4.000 0.561 1.000 N NA
 3503282 3503283 Patl_3420 Patl_3421     TRUE 0.994 -3.000 0.197 1.000 N NA
 3503283 3503284 Patl_3421 Patl_3422   apaG TRUE 0.979 1.000 0.078 NA N NA
 3503284 3503285 Patl_3422 Patl_3423 apaG apaH TRUE 0.976 15.000 0.267 NA   NA
 3503285 3503286 Patl_3423 Patl_3424 apaH   FALSE 0.017 397.000 0.050 1.000   NA
 3503289 3503290 Patl_3427 Patl_3428     FALSE 0.016 277.000 0.007 NA   NA
 3503291 3503292 Patl_3429 Patl_3430     FALSE 0.006 348.000 0.000 1.000   NA
 3503293 3503294 Patl_3431 Patl_3432     FALSE 0.014 216.000 0.000 1.000 N NA
 3503294 3503295 Patl_3432 Patl_3433     FALSE 0.018 201.000 0.000 1.000 N NA
 3503295 3503296 Patl_3433 Patl_3434     FALSE 0.389 27.000 0.000 1.000 N NA
 3503297 3503298 Patl_3435 Patl_3436     FALSE 0.012 260.000 0.000 1.000   NA
 3503299 3503300 Patl_3437 Patl_3438     FALSE 0.003 496.000 0.000 1.000   NA
 3503300 3503301 Patl_3438 Patl_3439     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 3503304 3503305 Patl_3442 Patl_3443     TRUE 1.000 0.000 0.669 0.001 Y NA
 3503305 3503306 Patl_3443 Patl_3444     FALSE 0.003 588.000 0.000 NA   NA
 3503306 3503307 Patl_3444 Patl_3445     FALSE 0.005 357.000 0.000 NA   NA
 3503307 3503308 Patl_3445 Patl_3446     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3503308 3503309 Patl_3446 Patl_3447     FALSE 0.264 76.000 0.000 NA   NA
 3503309 3503310 Patl_3447 Patl_3448     FALSE 0.003 576.000 0.000 NA   NA
 3503310 3503311 Patl_3448 Patl_3449     FALSE 0.095 135.000 0.000 NA   NA
 3503314 3503315 Patl_3452 Patl_3453     FALSE 0.125 122.000 0.000 NA   NA
 3503315 3503316 Patl_3453 Patl_3454     FALSE 0.010 271.000 0.000 NA   NA
 3503318 3503319 Patl_3456 Patl_3457     FALSE 0.397 78.000 0.000 0.011   NA
 3503319 3503320 Patl_3457 Patl_3458     FALSE 0.047 171.000 0.000 1.000   NA
 3503322 3503323 Patl_3460 Patl_3461     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3503323 3503324 Patl_3461 Patl_3462     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3503324 3503325 Patl_3462 Patl_3463     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 3503325 3503326 Patl_3463 Patl_3464     FALSE 0.004 392.000 0.000 NA   NA
 3503326 3503327 Patl_3464 Patl_3465     FALSE 0.014 214.000 0.000 1.000 N NA
 3503328 3503329 Patl_3466 Patl_3467     FALSE 0.265 87.000 0.000 0.100 N NA
 3503329 3503330 Patl_3467 Patl_3468     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 3503331 3503332 Patl_3469 Patl_3470     FALSE 0.219 93.000 0.000 1.000   NA
 3503332 3503333 Patl_3470 Patl_3471     TRUE 0.872 98.000 0.357 1.000   NA
 3503333 3503334 Patl_3471 Patl_3472     FALSE 0.002 652.000 0.000 1.000 N NA
 3503334 3503335 Patl_3472 Patl_3473     TRUE 0.495 96.000 0.063 NA N NA
 3503335 3503336 Patl_3473 Patl_3474     TRUE 0.998 1.000 0.500 NA   NA
 3503340 3503341 Patl_3478 Patl_3479     TRUE 0.586 59.000 0.048 1.000 N NA
 3503341 3503342 Patl_3479 Patl_3480     TRUE 0.995 -13.000 0.275 1.000 N NA
 3503342 3503343 Patl_3480 Patl_R0072     FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 3503343 3503344 Patl_R0072 Patl_R0073     FALSE 0.321 51.000 0.000 NA   NA
 3503344 3503345 Patl_R0073 Patl_3481     FALSE 0.043 174.000 0.000 NA   NA
 3503346 3503347 Patl_3482 Patl_3483     FALSE 0.270 161.000 0.095 1.000   NA
 3503347 3503348 Patl_3483 Patl_3484     TRUE 0.973 3.000 0.068 1.000 N NA
 3503348 3503349 Patl_3484 Patl_3485     TRUE 0.969 10.000 0.119 1.000 N NA
 3503350 3503351 Patl_3486 Patl_3487     FALSE 0.053 161.000 0.000 NA   NA
 3503352 3503353 Patl_3488 Patl_3489     TRUE 0.652 16.000 0.000 NA   NA
 3503353 3503354 Patl_3489 Patl_3490     FALSE 0.019 218.000 0.000 NA   NA
 3503354 3503355 Patl_3490 Patl_3491     TRUE 0.980 27.000 0.600 NA   NA
 3503355 3503356 Patl_3491 Patl_3492     TRUE 0.952 91.000 0.720 NA   NA
 3503356 3503357 Patl_3492 Patl_3493     TRUE 0.842 50.000 0.168 NA   NA
 3503357 3503358 Patl_3493 Patl_3494     TRUE 0.991 3.000 0.193 NA   NA
 3503358 3503359 Patl_3494 Patl_3495     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3503359 3503360 Patl_3495 Patl_3496     TRUE 0.988 0.000 0.103 NA   NA
 3503360 3503361 Patl_3496 Patl_3497     TRUE 0.999 -3.000 0.724 NA   NA
 3503362 3503363 Patl_3498 Patl_3499     FALSE 0.008 300.000 0.000 NA   NA
 3503363 3503364 Patl_3499 Patl_3500     FALSE 0.273 77.000 0.000 1.000   NA
 3503364 3503365 Patl_3500 Patl_3501     FALSE 0.437 33.000 0.000 1.000   NA
 3503365 3503366 Patl_3501 Patl_3502     FALSE 0.288 40.000 0.000 1.000 N NA
 3503366 3503367 Patl_3502 Patl_3503     TRUE 0.917 13.000 0.051 NA   NA
 3503368 3503369 Patl_3504 Patl_3505     FALSE 0.204 95.000 0.000 NA   NA
 3503369 3503370 Patl_3505 Patl_3506     TRUE 0.840 22.000 0.072 NA N NA
 3503370 3503371 Patl_3506 Patl_3507     FALSE 0.061 156.000 0.002 NA N NA
 3503371 3503372 Patl_3507 Patl_3508     FALSE 0.165 141.000 0.027 1.000 N NA
 3503372 3503373 Patl_3508 Patl_3509     FALSE 0.024 203.000 0.000 NA   NA
 3503374 3503375 Patl_3510 Patl_3511     TRUE 0.721 94.000 0.168 1.000 N NA
 3503375 3503376 Patl_3511 Patl_3512     FALSE 0.221 175.000 0.111 1.000 N NA
 3503376 3503377 Patl_3512 Patl_3513   lpxC FALSE 0.456 139.000 0.003 1.000 Y NA
 3503377 3503378 Patl_3513 Patl_3514 lpxC   FALSE 0.251 177.000 0.134 1.000 N NA
 3503378 3503379 Patl_3514 Patl_3515     TRUE 0.972 84.000 0.460 1.000 Y NA
 3503379 3503380 Patl_3515 Patl_3516     FALSE 0.437 22.000 0.000 NA N NA
 3503380 3503381 Patl_3516 Patl_3517     TRUE 0.979 6.000 0.000 NA Y NA
 3503381 3503382 Patl_3517 Patl_3518     TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 3503382 3503383 Patl_3518 Patl_3519     TRUE 0.999 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 3503383 3503384 Patl_3519 Patl_3520     TRUE 0.999 -7.000 0.647 1.000 N NA
 3503384 3503385 Patl_3520 Patl_3521     TRUE 0.997 -3.000 0.297 0.002 N NA
 3503385 3503386 Patl_3521 Patl_3522     TRUE 0.998 16.000 0.647 0.003 Y NA
 3503386 3503387 Patl_3522 Patl_3523     TRUE 0.999 0.000 0.309 0.003 Y NA
 3503387 3503388 Patl_3523 Patl_3524     TRUE 1.000 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 3503388 3503389 Patl_3524 Patl_3525     TRUE 0.996 -10.000 0.083 1.000 Y NA
 3503389 3503390 Patl_3525 Patl_3526     TRUE 0.993 -3.000 0.173 1.000 N NA
 3503390 3503391 Patl_3526 Patl_3527   mraW TRUE 0.995 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3503391 3503392 Patl_3527 Patl_3528 mraW   TRUE 0.999 0.000 0.635 NA   NA
 3503393 3503394 Patl_3529 Patl_3530     TRUE 0.997 0.000 0.400 1.000 N NA
 3503394 3503395 Patl_3530 Patl_3531     TRUE 0.992 2.000 0.026 NA Y NA
 3503395 3503396 Patl_3531 Patl_3532     FALSE 0.197 68.000 0.000 NA N NA
 3503396 3503397 Patl_3532 Patl_3533     FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000 N NA
 3503397 3503398 Patl_3533 Patl_3534     TRUE 0.947 -3.000 0.000 0.020 N NA
 3503399 3503400 Patl_3535 Patl_3536     FALSE 0.013 246.000 0.000 NA   NA
 3503400 3503401 Patl_3536 Patl_3537     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3503401 3503402 Patl_3537 Patl_3538     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3503402 3503403 Patl_3538 Patl_3539     FALSE 0.121 126.000 0.000 1.000   NA
 3503403 3503404 Patl_3539 Patl_3540     FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 3503404 3503405 Patl_3540 Patl_3541     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA   NA
 3503405 3503406 Patl_3541 Patl_3542     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 3503406 3503407 Patl_3542 Patl_3543     TRUE 0.992 -10.000 0.000 0.020 Y NA
 3503407 3503408 Patl_3543 Patl_3544     FALSE 0.008 261.000 0.000 1.000 N NA
 3503408 3503409 Patl_3544 Patl_3545     FALSE 0.002 499.000 0.000 1.000 N NA
 3503409 3503410 Patl_3545 Patl_3546     TRUE 0.784 53.000 0.000 1.000 Y NA
 3503410 3503411 Patl_3546 Patl_3547     TRUE 0.865 30.000 0.000 1.000 Y NA
 3503411 3503412 Patl_3547 Patl_3548     TRUE 0.985 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3503414 3503415 Patl_3550 Patl_3551     FALSE 0.450 83.000 0.023 NA   NA
 3503415 3503416 Patl_3551 Patl_3552     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 3503418 3503419 Patl_3554 Patl_3555     TRUE 0.983 20.000 0.500 NA   NA
 3503419 3503420 Patl_3555 Patl_3556     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3503421 3503422 Patl_3557 Patl_3558     TRUE 0.466 28.000 0.000 NA   NA
 3503425 3503426 Patl_3560 Patl_3561     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.047   NA
 3503427 3503428 Patl_3562 Patl_3563     TRUE 0.971 27.000 0.494 1.000 N NA
 3503428 3503429 Patl_3563 Patl_3564   valS TRUE 0.829 27.000 0.089 1.000 N NA
 3503429 3503430 Patl_3564 Patl_3565 valS   FALSE 0.004 366.000 0.000 1.000 N NA
 3503430 3503431 Patl_3565 Patl_3566     TRUE 0.998 -7.000 0.500 1.000 N NA
 3503432 3503433 Patl_3567 Patl_3568     FALSE 0.004 403.000 0.000 NA   NA
 3503434 3503435 Patl_3569 Patl_3570     FALSE 0.371 40.000 0.000 NA   NA
 3503435 3503436 Patl_3570 Patl_3571     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3503436 3503437 Patl_3571 Patl_3572     TRUE 0.986 10.000 0.048 1.000 Y NA
 3503437 3503438 Patl_3572 Patl_3573     FALSE 0.039 160.000 0.000 1.000 N NA
 3503438 3503439 Patl_3573 Patl_3574     TRUE 0.990 0.000 0.125 NA   NA
 3503439 3503440 Patl_3574 Patl_3575     FALSE 0.098 134.000 0.000 NA   NA
 3503440 3503441 Patl_3575 Patl_3576     FALSE 0.007 331.000 0.000 1.000   NA
 3503442 3503443 Patl_3577 Patl_3578     TRUE 0.522 31.000 0.008 1.000 N NA
 3503443 3503444 Patl_3578 Patl_3579     TRUE 0.961 49.000 0.233 1.000 Y NA
 3503444 3503445 Patl_3579 Patl_3580   thrA TRUE 0.997 0.000 0.133 1.000 Y NA
 3503445 3503446 Patl_3580 Patl_3581 thrA   FALSE 0.002 694.000 0.000 1.000 N NA
 3503446 3503447 Patl_3581 Patl_3582     FALSE 0.156 88.000 0.000 NA N NA
 3503448 3503449 Patl_3583 Patl_3584     FALSE 0.002 943.000 0.000 1.000   NA
 3503449 3503450 Patl_3584 Patl_3585     TRUE 0.993 17.000 0.748 1.000   NA
 3503451 3503452 Patl_3586 Patl_3587     FALSE 0.004 425.000 0.000 NA   NA
 3503453 3503454 Patl_3588 Patl_3589     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 3503455 3503456 Patl_3590 Patl_3591     TRUE 0.569 205.000 0.249 1.000 Y NA
 3503456 3503457 Patl_3591 Patl_3592   gcvT TRUE 0.971 73.000 0.317 0.001 Y NA
 3503459 3503460 Patl_3594 Patl_3595     FALSE 0.018 226.000 0.000 1.000   NA
 3503460 3503461 Patl_3595 Patl_3596     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3503461 3503462 Patl_3596 Patl_3597     FALSE 0.074 146.000 0.000 NA   NA
 3503462 3503463 Patl_3597 Patl_3598     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA N NA
 3503463 3503464 Patl_3598 Patl_3599     TRUE 1.000 -3.000 0.714 0.054 Y NA
 3503465 3503466 Patl_3600 Patl_3601     FALSE 0.227 59.000 0.000 1.000 N NA
 3503467 3503468 Patl_3602 Patl_3603     TRUE 0.946 91.000 0.667 NA   NA
 3503470 3503471 Patl_3605 Patl_3606     FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 3503471 3503472 Patl_3606 Patl_3607     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3503472 3503473 Patl_3607 Patl_3608     FALSE 0.023 207.000 0.000 NA   NA
 3503473 3503474 Patl_3608 Patl_3609     FALSE 0.316 53.000 0.000 NA   NA
 3503474 3503475 Patl_3609 Patl_3610     TRUE 0.911 17.000 0.088 1.000   NA
 3503475 3503476 Patl_3610 Patl_3611     TRUE 0.802 63.000 0.170 1.000 N NA
 3503477 3503478 Patl_3612 Patl_3613     TRUE 0.642 19.000 0.006 NA N NA
 3503478 3503479 Patl_3613 Patl_3614     TRUE 0.578 23.000 0.005 1.000 N NA
 3503479 3503480 Patl_3614 Patl_3615     TRUE 0.976 12.000 0.206 1.000 N NA
 3503481 3503482 Patl_3616 Patl_3617     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 3503482 3503483 Patl_3617 Patl_3618     TRUE 0.994 0.000 0.206 NA   NA
 3503485 3503486 Patl_3620 Patl_3621     FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 3503487 3503488 Patl_3622 Patl_3623   pgi TRUE 0.867 82.000 0.073 1.000 Y NA
 3503489 3503490 Patl_3624 Patl_3625     TRUE 0.997 10.000 0.818 NA   NA
 3503490 3503491 Patl_3625 Patl_3626     TRUE 0.998 3.000 0.621 1.000 N NA
 3503493 3503494 Patl_3628 Patl_3629     TRUE 0.811 20.000 0.044 1.000 N NA
 3503494 3503495 Patl_3629 Patl_3630     FALSE 0.238 54.000 0.000 1.000 N NA
 3503495 3503496 Patl_3630 Patl_3631     TRUE 0.538 17.000 0.000 1.000 N NA
 3503496 3503497 Patl_3631 Patl_3632     FALSE 0.003 458.000 0.000 NA   NA
 3503500 3503501 Patl_3635 Patl_3636     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 3503501 3503502 Patl_3636 Patl_3637     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3503502 3503503 Patl_3637 Patl_3638     FALSE 0.002 700.000 0.000 NA   NA
 3503503 3503504 Patl_3638 Patl_3639     FALSE 0.035 185.000 0.000 1.000   NA
 3503504 3503505 Patl_3639 Patl_3640     FALSE 0.401 84.000 0.000 0.001   NA
 3503505 3503506 Patl_3640 Patl_3641     FALSE 0.102 134.000 0.000 1.000   NA
 3503506 3503507 Patl_3641 Patl_3642     TRUE 0.554 34.000 0.015 1.000 N NA
 3503507 3503508 Patl_3642 Patl_3643     FALSE 0.131 102.000 0.000 1.000 N NA
 3503508 3503509 Patl_3643 Patl_3644     FALSE 0.440 23.000 0.000 1.000 N NA
 3503509 3503510 Patl_3644 Patl_3645     FALSE 0.271 72.000 0.000 NA   NA
 3503511 3503512 Patl_3646 Patl_3647     FALSE 0.113 108.000 0.000 1.000 N NA
 3503512 3503513 Patl_3647 Patl_3648     FALSE 0.091 121.000 0.000 1.000 N NA
 3503513 3503514 Patl_3648 Patl_3649     TRUE 0.810 43.000 0.000 1.000 Y NA
 3503515 3503516 Patl_3650 Patl_3651     FALSE 0.010 277.000 0.000 1.000   NA
 3503519 3503520 Patl_3654 Patl_3655     TRUE 0.960 13.000 0.090 0.001   NA
 3503520 3503521 Patl_3655 Patl_3656     TRUE 0.999 0.000 0.829 0.001   NA
 3503521 3503522 Patl_3656 Patl_3657     FALSE 0.043 156.000 0.000 1.000 N NA
 3503522 3503523 Patl_3657 Patl_3658     TRUE 0.939 65.000 0.182 1.000 Y NA
 3503523 3503524 Patl_3658 Patl_3659     FALSE 0.314 58.000 0.000 1.000   NA
 3503526 3503527 Patl_3661 Patl_3662     FALSE 0.003 372.000 0.000 1.000 N NA
 3503527 3503528 Patl_3662 Patl_3663     FALSE 0.029 196.000 0.000 1.000   NA
 3503528 3503529 Patl_3663 Patl_3664     TRUE 0.886 18.000 0.069 NA   NA
 3503529 3503530 Patl_3664 Patl_3665     FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 3503531 3503532 Patl_3666 Patl_3667     FALSE 0.204 72.000 0.000 1.000 N NA
 3503532 3503533 Patl_3667 Patl_3668     FALSE 0.011 263.000 0.000 NA   NA
 3503535 3503536 Patl_3670 Patl_3671     FALSE 0.005 302.000 0.000 1.000 N NA
 3503539 3503540 Patl_3674 Patl_3675     TRUE 0.842 25.000 0.074 NA   NA
 3503540 3503541 Patl_3675 Patl_3676     TRUE 0.996 4.000 0.444 NA   NA
 3503541 3503542 Patl_3676 Patl_3677     FALSE 0.029 170.000 0.000 NA N NA
 3503542 3503543 Patl_3677 Patl_3678     FALSE 0.010 242.000 0.000 1.000 N NA
 3503543 3503544 Patl_3678 Patl_3679     TRUE 1.000 2.000 0.920 0.043 Y NA
 3503544 3503545 Patl_3679 Patl_3680     FALSE 0.005 314.000 0.000 1.000 N NA
 3503545 3503546 Patl_3680 Patl_3681     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3503546 3503547 Patl_3681 Patl_3682     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 3503547 3503548 Patl_3682 Patl_3683     FALSE 0.437 33.000 0.000 1.000   NA
 3503548 3503549 Patl_3683 Patl_3684     TRUE 0.655 112.000 0.167 NA   NA
 3503549 3503550 Patl_3684 Patl_3685     TRUE 0.999 3.000 1.000 NA   NA
 3503550 3503551 Patl_3685 Patl_3686     TRUE 0.730 199.000 1.000 NA N NA
 3503552 3503553 Patl_3687 Patl_3688     FALSE 0.005 311.000 0.000 1.000 N NA
 3503554 3503555 Patl_3689 Patl_3690     FALSE 0.155 112.000 0.000 1.000   NA
 3503555 3503556 Patl_3690 Patl_3691     FALSE 0.275 76.000 0.000 1.000   NA
 3503556 3503557 Patl_3691 Patl_3692     FALSE 0.286 69.000 0.000 1.000   NA
 3503558 3503559 Patl_3693 Patl_3694     TRUE 0.951 17.000 0.172 NA   NA
 3503559 3503560 Patl_3694 Patl_3695     TRUE 0.926 24.000 0.187 1.000 N NA
 3503560 3503561 Patl_3695 Patl_3696     TRUE 0.997 5.000 0.613 NA   NA
 3503562 3503563 Patl_3697 Patl_3698   sspA TRUE 0.995 15.000 0.831 NA   NA
 3503563 3503564 Patl_3698 Patl_3699 sspA   FALSE 0.427 194.000 0.370 NA N NA
 3503564 3503565 Patl_3699 Patl_3700     TRUE 1.000 -3.000 0.630 0.001 Y NA
 3503565 3503566 Patl_3700 Patl_3701     TRUE 0.998 2.000 0.233 0.001 Y NA
 3503566 3503567 Patl_3701 Patl_3702     FALSE 0.015 258.000 0.006 1.000 N NA
 3503567 3503568 Patl_3702 Patl_3703   rplM TRUE 0.998 13.000 0.601 0.010 Y NA
 3503568 3503569 Patl_3703 Patl_3704 rplM   FALSE 0.007 319.000 0.000 1.000   NA
 3503569 3503570 Patl_3704 Patl_3705     FALSE 0.156 108.000 0.000 NA   NA
 3503570 3503571 Patl_3705 Patl_3706     FALSE 0.043 174.000 0.000 NA   NA
 3503571 3503572 Patl_3706 Patl_3707     TRUE 0.976 0.000 0.040 1.000   NA
 3503572 3503573 Patl_3707 Patl_3708     FALSE 0.007 276.000 0.000 1.000 N NA
 3503573 3503574 Patl_3708 Patl_3709     TRUE 0.979 15.000 0.326 1.000 N NA
 3503574 3503575 Patl_3709 Patl_3710     TRUE 0.992 -3.000 0.166 1.000 N NA
 3503575 3503576 Patl_3710 Patl_3711     FALSE 0.418 48.000 0.003 NA   NA
 3503576 3503577 Patl_3711 Patl_3712     FALSE 0.265 97.000 0.004 NA   NA
 3503577 3503578 Patl_3712 Patl_3713     TRUE 0.626 81.000 0.082 1.000 N NA
 3503578 3503579 Patl_3713 Patl_3714     TRUE 0.576 89.000 0.079 1.000 N NA
 3503579 3503580 Patl_3714 Patl_3715     TRUE 0.927 -10.000 0.000 1.000   NA
 3503580 3503581 Patl_3715 Patl_3716     TRUE 0.547 84.000 0.026 0.035   NA
 3503581 3503582 Patl_3716 Patl_3717     TRUE 0.989 33.000 0.436 0.013 Y NA
 3503583 3503584 Patl_3718 Patl_3719     FALSE 0.379 137.000 0.092 NA   NA
 3503584 3503585 Patl_3719 Patl_3720     TRUE 0.884 26.000 0.117 1.000   NA
 3503585 3503586 Patl_3720 Patl_3721     TRUE 0.738 26.000 0.029 NA   NA
 3503586 3503587 Patl_3721 Patl_3722     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3503587 3503588 Patl_3722 Patl_3723     TRUE 0.867 21.000 0.087 NA N NA
 3503590 3503591 Patl_3725 Patl_3726     TRUE 0.485 154.000 0.034 1.000 Y NA
 3503592 3503593 Patl_3727 Patl_3728     FALSE 0.117 128.000 0.000 1.000   NA
 3503593 3503594 Patl_3728 Patl_3729     FALSE 0.100 135.000 0.000 1.000   NA
 3503596 3503597 Patl_3731 Patl_3732     TRUE 0.956 6.000 0.044 NA   NA
 3503599 3503600 Patl_3734 Patl_3735     FALSE 0.004 336.000 0.000 1.000 N NA
 3503600 3503601 Patl_3735 Patl_3736   obgE FALSE 0.209 119.000 0.007 1.000   NA
 3503601 3503602 Patl_3736 Patl_3737 obgE rpmA TRUE 0.539 174.000 0.335 1.000   NA
 3503602 3503603 Patl_3737 Patl_3738 rpmA   TRUE 0.998 16.000 0.667 0.010 Y NA
 3503605 3503606 Patl_3740 Patl_3741     TRUE 0.887 22.000 0.095 NA   NA
 3503606 3503607 Patl_3741 Patl_3742     TRUE 0.987 -7.000 0.087 NA   NA
 3503609 3503610 Patl_3744 Patl_3745 rplI   TRUE 0.993 27.000 0.499 0.010 Y NA
 3503610 3503611 Patl_3745 Patl_3746     TRUE 0.996 12.000 0.319 0.010 Y NA
 3503611 3503612 Patl_3746 Patl_3747     FALSE 0.014 214.000 0.000 1.000 N NA
 3503613 3503614 Patl_3748 Patl_3749 gltB gltD TRUE 0.980 20.000 0.118 0.000 Y NA
 3503614 3503615 Patl_3749 Patl_3750 gltD   FALSE 0.011 235.000 0.000 1.000 N NA
 3503617 3503618 Patl_3752 Patl_3753   groEL TRUE 0.931 35.000 0.046 0.006 Y NA
 3503618 3503619 Patl_3753 Patl_3754 groEL   FALSE 0.115 126.000 0.000 NA   NA
 3503619 3503620 Patl_3754 Patl_3755     FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 3503622 3503623 Patl_3757 Patl_3758     FALSE 0.300 59.000 0.000 NA   NA
 3503623 3503624 Patl_3758 Patl_3759     FALSE 0.004 387.000 0.000 NA   NA
 3503624 3503625 Patl_3759 Patl_3760     TRUE 0.693 100.000 0.000 0.041 Y NA
 3503625 3503626 Patl_3760 Patl_3761     FALSE 0.450 52.000 0.000 0.041   NA
 3503626 3503627 Patl_3761 Patl_3762     FALSE 0.348 47.000 0.000 1.000   NA
 3503627 3503628 Patl_3762 Patl_3763     FALSE 0.208 68.000 0.000 1.000 N NA
 3503628 3503629 Patl_3763 Patl_3764     FALSE 0.004 426.000 0.000 NA   NA
 3503629 3503630 Patl_3764 Patl_3765     TRUE 0.997 0.000 0.357 NA   NA
 3503631 3503632 Patl_3766 Patl_3767     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3503632 3503633 Patl_3767 Patl_3768     FALSE 0.183 101.000 0.000 NA   NA
 3503633 3503634 Patl_3768 Patl_3769     FALSE 0.003 475.000 0.000 NA   NA
 3503636 3503637 Patl_3771 Patl_3772     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA N NA
 3503638 3503639 Patl_3773 Patl_3774     TRUE 0.975 18.000 0.333 NA   NA
 3503639 3503640 Patl_3774 Patl_3775     TRUE 0.998 -3.000 0.444 NA   NA
 3503640 3503641 Patl_3775 Patl_3776     TRUE 0.819 28.000 0.074 NA   NA
 3503642 3503643 Patl_3777 Patl_3778     FALSE 0.009 244.000 0.000 1.000 N NA
 3503644 3503645 Patl_3779 Patl_3780     FALSE 0.013 222.000 0.000 1.000 N NA
 3503645 3503646 Patl_3780 Patl_3781     FALSE 0.002 702.000 0.000 NA   NA
 3503647 3503648 Patl_3782 Patl_3783     FALSE 0.357 42.000 0.000 NA   NA
 3503649 3503650 Patl_3784 Patl_3785     FALSE 0.076 273.000 0.000 1.000 Y NA
 3503651 3503652 Patl_3786 Patl_3787     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3503652 3503653 Patl_3787 Patl_3788     FALSE 0.340 46.000 0.000 NA   NA
 3503654 3503655 Patl_3789 Patl_3790     FALSE 0.137 119.000 0.000 1.000   NA
 3503655 3503656 Patl_3790 Patl_3791     FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000   NA
 3503656 3503657 Patl_3791 Patl_3792     FALSE 0.210 93.000 0.000 NA   NA
 3503658 3503659 Patl_3793 Patl_3794 dgt   FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 3503661 3503662 Patl_3796 Patl_3797     FALSE 0.003 400.000 0.000 1.000 N NA
 3503662 3503663 Patl_3797 Patl_3798     FALSE 0.008 256.000 0.000 1.000 N NA
 3503663 3503664 Patl_3798 Patl_3799     TRUE 0.919 74.000 0.367 0.045 N NA
 3503664 3503665 Patl_3799 Patl_3800     TRUE 0.968 4.000 0.067 1.000 N NA
 3503665 3503666 Patl_3800 Patl_3801     FALSE 0.003 482.000 0.000 1.000   NA
 3503666 3503667 Patl_3801 Patl_3802     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3503667 3503668 Patl_3802 Patl_3803     TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 3503668 3503669 Patl_3803 Patl_3804     FALSE 0.083 142.000 0.000 1.000   NA
 3503669 3503670 Patl_3804 Patl_3805     FALSE 0.234 86.000 0.000 NA   NA
 3503670 3503671 Patl_3805 Patl_3806     TRUE 0.971 33.000 0.519 NA   NA
 3503671 3503672 Patl_3806 Patl_3807     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 3503672 3503673 Patl_3807 Patl_3808     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3503673 3503674 Patl_3808 Patl_3809     FALSE 0.004 406.000 0.000 NA   NA
 3503674 3503675 Patl_3809 Patl_3810     FALSE 0.002 454.000 0.000 1.000 N NA
 3503675 3503676 Patl_3810 Patl_3811     TRUE 0.635 111.000 0.000 0.032 Y NA
 3503676 3503677 Patl_3811 Patl_3812     TRUE 0.774 79.000 0.000 0.032 Y NA
 3503677 3503678 Patl_3812 Patl_3813     FALSE 0.008 259.000 0.000 NA N NA
 3503678 3503679 Patl_3813 Patl_3814     TRUE 0.972 3.000 0.069 NA N NA
 3503681 3503682 Patl_3816 Patl_3817     FALSE 0.316 53.000 0.000 NA   NA
 3503682 3503683 Patl_3817 Patl_3818     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 3503683 3503684 Patl_3818 Patl_3819     FALSE 0.030 206.000 0.000 0.045 N NA
 3503687 3503688 Patl_3822 Patl_3823     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3503688 3503689 Patl_3823 Patl_3824     FALSE 0.018 194.000 0.000 NA N NA
 3503689 3503690 Patl_3824 Patl_3825     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3503690 3503691 Patl_3825 Patl_3826     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3503691 3503692 Patl_3826 Patl_3827     FALSE 0.247 83.000 0.000 NA   NA
 3503692 3503693 Patl_3827 Patl_3828     FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 3503695 3503696 Patl_3830 Patl_3831     TRUE 0.902 15.000 0.070 1.000 N NA
 3503696 3503697 Patl_3831 Patl_3832     TRUE 0.799 70.000 0.160 NA   NA
 3503697 3503698 Patl_3832 Patl_3833     FALSE 0.062 155.000 0.000 NA   NA
 3503699 3503700 Patl_3834 Patl_3835     FALSE 0.336 47.000 0.000 NA   NA
 3503700 3503701 Patl_3835 Patl_3836     TRUE 0.999 12.000 0.902 1.000 Y NA
 3503702 3503703 Patl_3837 Patl_3838 thyA   FALSE 0.117 128.000 0.000 1.000   NA
 3503704 3503705 Patl_3839 Patl_3840     FALSE 0.010 276.000 0.000 NA   NA
 3503707 3503708 Patl_3842 Patl_3843     FALSE 0.037 161.000 0.000 1.000 N NA
 3503708 3503709 Patl_3843 Patl_3844     TRUE 0.874 10.000 0.005 1.000   NA
 3503709 3503710 Patl_3844 Patl_3845     TRUE 0.982 15.000 0.333 1.000   NA
 3503710 3503711 Patl_3845 Patl_3846     TRUE 0.894 10.000 0.019 1.000 N NA
 3503712 3503713 Patl_3847 Patl_3848     TRUE 0.930 -7.000 0.000 1.000   NA
 3503714 3503715 Patl_3849 Patl_3850     TRUE 0.980 11.000 0.218 1.000 N NA
 3503715 3503716 Patl_3850 Patl_3851     FALSE 0.056 161.000 0.000 1.000   NA
 3503717 3503718 Patl_3852 Patl_3853     FALSE 0.176 82.000 0.000 NA N NA
 3503718 3503719 Patl_3853 Patl_3854     FALSE 0.364 41.000 0.000 NA   NA
 3503719 3503720 Patl_3854 Patl_3855     TRUE 0.999 2.000 0.724 NA   NA
 3503720 3503721 Patl_3855 Patl_3856     FALSE 0.101 149.000 0.004 NA   NA
 3503721 3503722 Patl_3856 Patl_3857     TRUE 0.984 7.000 0.185 1.000 N NA
 3503722 3503723 Patl_3857 Patl_3858     TRUE 0.999 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 3503723 3503724 Patl_3858 Patl_3859     TRUE 0.987 5.000 0.173 1.000   NA
 3503724 3503725 Patl_3859 Patl_3860     TRUE 0.995 -3.000 0.235 1.000   NA
 3503725 3503726 Patl_3860 Patl_3861     TRUE 0.887 89.000 0.353 1.000   NA
 3503726 3503727 Patl_3861 Patl_3862     FALSE 0.156 167.000 0.046 NA   NA
 3503727 3503728 Patl_3862 Patl_3863     FALSE 0.364 41.000 0.000 NA   NA
 3503728 3503729 Patl_3863 Patl_3864     TRUE 0.795 66.000 0.169 1.000 N NA
 3503731 3503732 Patl_3866 Patl_3867     FALSE 0.047 167.000 0.000 NA   NA
 3503734 3503735 Patl_3869 Patl_3870     FALSE 0.143 114.000 0.000 NA   NA
 3503735 3503736 Patl_3870 Patl_3871     TRUE 0.987 2.000 0.120 NA   NA
 3503740 3503741 Patl_3875 Patl_3876     TRUE 0.996 0.000 0.058 0.011 Y NA
 3503741 3503742 Patl_3876 Patl_3877     TRUE 0.607 19.000 0.000 1.000   NA
 3503744 3503745 Patl_3879 Patl_3880     FALSE 0.358 73.000 0.010 1.000 N NA
 3503745 3503746 Patl_3880 Patl_3881     TRUE 0.995 4.000 0.412 1.000 N NA
 3503747 3503748 Patl_3882 Patl_3883     TRUE 0.469 20.000 0.000 NA N NA
 3503748 3503749 Patl_3883 Patl_3884     TRUE 0.951 29.000 0.265 0.040   NA
 3503749 3503750 Patl_3884 Patl_3885     TRUE 0.996 10.000 0.588 0.040   NA
 3503750 3503751 Patl_3885 Patl_3886     TRUE 0.999 0.000 0.750 0.000   NA
 3503751 3503752 Patl_3886 Patl_3887     TRUE 0.990 10.000 0.294 1.000   NA
 3503752 3503753 Patl_3887 Patl_3888     TRUE 0.990 -3.000 0.088 0.032   NA
 3503753 3503754 Patl_3888 Patl_3889     TRUE 0.603 68.000 0.050 NA   NA
 3503754 3503755 Patl_3889 Patl_3890     TRUE 0.995 3.000 0.309 NA   NA
 3503759 3503760 Patl_3894 Patl_3895     FALSE 0.390 37.000 0.000 NA   NA
 3503761 3503762 Patl_3896 Patl_3897     FALSE 0.162 106.000 0.000 NA   NA
 3503764 3503765 Patl_3899 Patl_3900     FALSE 0.159 107.000 0.000 NA   NA
 3503765 3503766 Patl_3900 Patl_3901     FALSE 0.002 605.000 0.000 NA   NA
 3503766 3503767 Patl_3901 Patl_3902     TRUE 0.664 16.000 0.000 1.000   NA
 3503768 3503769 Patl_3903 Patl_3904     TRUE 0.706 86.000 0.000 1.000 Y NA
 3503770 3503771 Patl_3905 Patl_3906     FALSE 0.003 451.000 0.000 1.000   NA
 3503771 3503772 Patl_3906 Patl_3907     FALSE 0.002 837.000 0.000 1.000   NA
 3503772 3503773 Patl_3907 Patl_3908     TRUE 0.829 38.000 0.000 1.000 Y NA
 3503773 3503774 Patl_3908 Patl_3909     FALSE 0.290 62.000 0.000 NA   NA
 3503775 3503776 Patl_3910 Patl_3911     FALSE 0.013 250.000 0.000 NA   NA
 3503777 3503778 Patl_3912 Patl_3913     FALSE 0.011 270.000 0.000 NA   NA
 3503781 3503782 Patl_3916 Patl_3917     FALSE 0.117 128.000 0.000 1.000   NA
 3503784 3503785 Patl_3919 Patl_3920     TRUE 0.999 6.000 0.778 1.000 Y NA
 3503786 3503787 Patl_3921 Patl_3922     FALSE 0.113 309.000 0.241 1.000   NA
 3503787 3503788 Patl_3922 Patl_3923     TRUE 0.999 -3.000 0.741 NA   NA
 3503788 3503789 Patl_3923 Patl_3924     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 3503789 3503790 Patl_3924 Patl_3925     FALSE 0.104 132.000 0.000 NA   NA
 3503792 3503793 Patl_3927 Patl_3928     TRUE 1.000 -7.000 0.688 0.073 Y NA
 3503793 3503794 Patl_3928 Patl_3929     TRUE 0.854 15.000 0.028 NA   NA
 3503797 3503798 Patl_3932 Patl_3933     TRUE 0.998 8.000 0.395 0.000 Y NA
 3503798 3503799 Patl_3933 Patl_3934     TRUE 0.888 87.000 0.117 1.000 Y NA
 3503799 3503800 Patl_3934 Patl_3935     TRUE 0.995 -3.000 0.234 1.000 N NA
 3503800 3503801 Patl_3935 Patl_3936     FALSE 0.170 208.000 0.131 1.000   NA
 3503801 3503802 Patl_3936 Patl_3937     TRUE 0.866 65.000 0.231 1.000   NA
 3503802 3503803 Patl_3937 Patl_3938     FALSE 0.328 167.000 0.151 NA   NA
 3503806 3503807 Patl_3941 Patl_3942     TRUE 0.749 23.000 0.025 NA   NA
 3503809 3503810 Patl_3944 Patl_3945     TRUE 0.756 72.000 0.117 0.073 N NA
 3503810 3503811 Patl_3945 Patl_3946     TRUE 0.912 71.000 0.121 1.000 Y NA
 3503814 3503815 Patl_3949 Patl_3950     TRUE 0.548 96.000 0.065 1.000   NA
 3503815 3503816 Patl_3950 Patl_3951     TRUE 0.974 -3.000 0.010 0.028   NA
 3503817 3503818 Patl_3952 Patl_3953     TRUE 0.963 21.000 0.281 NA   NA
 3503819 3503820 Patl_3954 Patl_3955 rbn   TRUE 0.513 37.000 0.006 1.000   NA
 3503822 3503823 Patl_3957 Patl_3958     FALSE 0.043 156.000 0.000 1.000 N NA
 3503824 3503825 Patl_3959 Patl_3960     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 3503825 3503826 Patl_3960 Patl_3961     FALSE 0.296 89.000 0.010 1.000 N NA
 3503826 3503827 Patl_3961 Patl_3962     FALSE 0.095 169.000 0.015 NA   NA
 3503829 3503830 Patl_3964 Patl_3965     TRUE 0.997 -3.000 0.364 NA   NA
 3503834 3503835 Patl_3969 Patl_3970     TRUE 0.562 44.000 0.021 NA   NA
 3503835 3503836 Patl_3970 Patl_3971     FALSE 0.263 114.000 0.014 NA   NA
 3503838 3503839 Patl_3973 Patl_3974     TRUE 0.990 -3.000 0.118 NA   NA
 3503839 3503840 Patl_3974 Patl_3975     TRUE 0.802 42.000 0.109 NA   NA
 3503840 3503841 Patl_3975 Patl_3976     TRUE 0.724 50.000 0.092 1.000 N NA
 3503841 3503842 Patl_3976 Patl_3977     TRUE 0.994 -16.000 0.188 0.073 N NA
 3503842 3503843 Patl_3977 Patl_3978     TRUE 0.941 80.000 0.531 1.000   NA
 3503843 3503844 Patl_3978 Patl_3979     TRUE 0.902 26.000 0.141 1.000   NA
 3503844 3503845 Patl_3979 Patl_3980     TRUE 0.834 64.000 0.184 1.000   NA
 3503845 3503846 Patl_3980 Patl_3981     TRUE 1.000 4.000 0.947 0.008 Y NA
 3503847 3503848 Patl_3982 Patl_3983     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3503848 3503849 Patl_3983 Patl_3984     TRUE 0.984 14.000 0.114 NA Y NA
 3503849 3503850 Patl_3984 Patl_3985     FALSE 0.237 49.000 0.000 NA N NA
 3503850 3503851 Patl_3985 Patl_3986     FALSE 0.028 194.000 0.000 NA   NA
 3503851 3503852 Patl_3986 Patl_3987     TRUE 0.945 0.000 0.004 NA   NA
 3503852 3503853 Patl_3987 Patl_3988     TRUE 0.627 103.000 0.000 1.000 Y NA
 3503854 3503855 Patl_3989 Patl_3990     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 3503855 3503856 Patl_3990 Patl_3991     TRUE 0.895 18.000 0.077 1.000   NA
 3503856 3503857 Patl_3991 Patl_3992     TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000   NA
 3503858 3503859 Patl_3993 Patl_3994     FALSE 0.212 65.000 0.000 1.000 N NA
 3503859 3503860 Patl_3994 Patl_3995     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3503860 3503861 Patl_3995 Patl_3996     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 3503861 3503862 Patl_3996 Patl_R0075     FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 3503862 3503863 Patl_R0075 Patl_R0076     TRUE 0.848 7.000 0.000 NA   NA
 3503863 3503864 Patl_R0076 Patl_R0077     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 3503864 3503865 Patl_R0077 Patl_R0078     TRUE 0.840 8.000 0.000 NA   NA
 3503865 3503866 Patl_R0078 Patl_3997     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3503866 3503867 Patl_3997 Patl_3998     TRUE 0.990 -16.000 0.147 1.000 N NA
 3503867 3503868 Patl_3998 Patl_3999     TRUE 0.994 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3503868 3503869 Patl_3999 Patl_4000     TRUE 0.795 48.000 0.000 1.000 Y NA
 3503869 3503870 Patl_4000 Patl_4001     TRUE 0.998 3.000 0.222 0.096 Y NA
 3503870 3503871 Patl_4001 Patl_4002     TRUE 0.972 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3503871 3503872 Patl_4002 Patl_4003     TRUE 0.990 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3503872 3503873 Patl_4003 Patl_4004     TRUE 0.885 28.000 0.129 1.000   NA
 3503873 3503874 Patl_4004 Patl_4005     TRUE 0.984 -10.000 0.074 NA   NA
 3503874 3503875 Patl_4005 Patl_4006     TRUE 0.990 -7.000 0.000 NA Y NA
 3503875 3503876 Patl_4006 Patl_4007     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 3503876 3503877 Patl_4007 Patl_4008     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 3503877 3503878 Patl_4008 Patl_4009     TRUE 0.996 -16.000 0.286 NA   NA
 3503878 3503879 Patl_4009 Patl_4010     TRUE 0.930 -7.000 0.000 1.000   NA
 3503879 3503880 Patl_4010 Patl_4011     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3503880 3503881 Patl_4011 Patl_4012     FALSE 0.015 240.000 0.000 NA   NA
 3503881 3503882 Patl_4012 Patl_4013     TRUE 0.518 24.000 0.000 NA   NA
 3503884 3503885 Patl_R0079 Patl_R0080     FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 3503885 3503886 Patl_R0080 Patl_R0081     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3503886 3503887 Patl_R0081 Patl_R0082     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3503887 3503888 Patl_R0082 Patl_R0083     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3503890 3503891 Patl_4016 Patl_4017     FALSE 0.400 84.000 0.013 NA   NA
 3503891 3503892 Patl_4017 Patl_4018     TRUE 0.494 26.000 0.000 NA   NA
 3503892 3503893 Patl_4018 Patl_4019     TRUE 0.994 -9.000 0.200 NA   NA
 3503894 3503895 Patl_4020 Patl_4021     TRUE 0.956 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3503896 3503897 Patl_4022 Patl_4023     TRUE 0.547 36.000 0.009 NA   NA
 3503898 3503899 Patl_4024 Patl_4025     TRUE 0.905 10.000 0.026 1.000 N NA
 3503900 3503901 Patl_4026 Patl_4027     TRUE 0.939 36.000 0.315 NA   NA
 3503911 3503912 Patl_4037 Patl_4038     TRUE 0.988 -7.000 0.116 1.000 N NA
 3503912 3503913 Patl_4038 Patl_4039     TRUE 1.000 0.000 0.791 0.000 Y NA
 3503913 3503914 Patl_4039 Patl_4040     FALSE 0.204 132.000 0.015 NA   NA
 3503914 3503915 Patl_4040 Patl_4041     TRUE 0.992 4.000 0.236 NA   NA
 3503915 3503916 Patl_4041 Patl_4042     TRUE 0.985 10.000 0.213 NA   NA
 3503916 3503917 Patl_4042 Patl_4043     FALSE 0.137 116.000 0.000 NA   NA
 3503917 3503918 Patl_4043 Patl_4044     FALSE 0.080 141.000 0.000 NA   NA
 3503919 3503920 Patl_4045 Patl_4046     TRUE 0.999 5.000 0.895 NA   NA
 3503920 3503921 Patl_4046 Patl_4047     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.056 Y NA
 3503921 3503922 Patl_4047 Patl_4048     FALSE 0.254 48.000 0.000 1.000 N NA
 3503922 3503923 Patl_4048 Patl_4049     TRUE 0.624 18.000 0.000 1.000   NA
 3503924 3503925 Patl_4050 Patl_4051     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 3503925 3503926 Patl_4051 Patl_4052     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 3503927 3503928 Patl_4053 Patl_4054     FALSE 0.037 183.000 0.000 1.000   NA
 3503928 3503929 Patl_4054 Patl_4055     FALSE 0.105 113.000 0.000 1.000 N NA
 3503929 3503930 Patl_4055 Patl_4056     TRUE 0.999 4.000 0.333 0.004 Y NA
 3503930 3503931 Patl_4056 Patl_4057     TRUE 0.961 1.000 0.029 1.000 N NA
 3503931 3503932 Patl_4057 Patl_4058     FALSE 0.003 541.000 0.000 NA   NA
 3503932 3503933 Patl_4058 Patl_4059     FALSE 0.311 87.000 0.004 NA   NA
 3503934 3503935 Patl_4060 Patl_4061     FALSE 0.084 141.000 0.000 1.000   NA
 3503935 3503936 Patl_4061 Patl_4062     TRUE 0.986 -3.000 0.077 NA   NA
 3503938 3503939 Patl_4064 Patl_4065     FALSE 0.095 135.000 0.000 NA   NA
 3503940 3503941 Patl_4066 Patl_4067     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 3503941 3503942 Patl_4067 Patl_4068     TRUE 0.976 -3.000 0.030 1.000   NA
 3503942 3503943 Patl_4068 Patl_4069     FALSE 0.004 397.000 0.000 1.000   NA
 3503945 3503946 Patl_4071 Patl_4072     TRUE 0.892 84.000 0.336 NA   NA
 3503946 3503947 Patl_4072 Patl_4073     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA N NA
 3503947 3503948 Patl_4073 Patl_4074     TRUE 0.518 187.000 0.104 0.001 Y NA
 3503948 3503949 Patl_4074 Patl_4075     TRUE 0.993 -3.000 0.175 NA   NA
 3503949 3503950 Patl_4075 Patl_4076     TRUE 0.993 16.000 0.714 NA   NA
 3503950 3503951 Patl_4076 Patl_4077     TRUE 0.935 48.000 0.367 1.000   NA
 3503953 3503954 Patl_4079 Patl_4080     FALSE 0.423 90.000 0.033 1.000 N NA
 3503956 3503957 Patl_4082 Patl_4083     FALSE 0.005 376.000 0.000 NA   NA
 3503957 3503958 Patl_4083 Patl_4084     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3503960 3503961 Patl_4086 Patl_4087     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 3503961 3503962 Patl_4087 Patl_4088     FALSE 0.009 244.000 0.000 1.000 N NA
 3503962 3503963 Patl_4088 Patl_4089     FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 3503963 3503964 Patl_4089 Patl_4090     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA   NA
 3503964 3503965 Patl_4090 Patl_4091     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3503966 3503967 Patl_4092 Patl_4093     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3503971 3503972 Patl_4097 Patl_4098     TRUE 0.549 22.000 0.000 NA   NA
 3503972 3503973 Patl_4098 Patl_4099     FALSE 0.064 153.000 0.000 NA   NA
 3503973 3503974 Patl_4099 Patl_4100     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3503974 3503975 Patl_4100 Patl_4101     TRUE 0.596 48.000 0.030 NA   NA
 3503975 3503976 Patl_4101 Patl_4102     TRUE 0.902 7.000 0.000 0.072   NA
 3503976 3503977 Patl_4102 Patl_4103     FALSE 0.004 422.000 0.000 1.000   NA
 3503980 3503981 Patl_4106 Patl_4107     TRUE 0.992 0.000 0.154 NA   NA
 3503981 3503982 Patl_4107 Patl_4108     FALSE 0.192 207.000 0.154 NA   NA
 3503982 3503983 Patl_4108 Patl_4109     TRUE 0.992 0.000 0.154 NA   NA
 3503983 3503984 Patl_4109 Patl_4110     FALSE 0.102 266.000 0.154 NA   NA
 3503984 3503985 Patl_4110 Patl_4111     TRUE 0.993 -3.000 0.154 NA   NA
 3503985 3503986 Patl_4111 Patl_4112     TRUE 0.710 98.000 0.154 NA   NA
 3503986 3503987 Patl_4112 Patl_4113     TRUE 0.992 0.000 0.154 NA   NA
 3503989 3503990 Patl_4115 Patl_4116     FALSE 0.422 110.000 0.051 NA   NA
 3503990 3503991 Patl_4116 Patl_4117     TRUE 0.968 69.000 0.306 0.044 Y NA
 3503991 3503992 Patl_4117 Patl_4118     TRUE 1.000 3.000 0.918 0.044 Y NA
 3503992 3503993 Patl_4118 Patl_4119     TRUE 0.997 11.000 0.373 0.044 Y NA
 3503993 3503994 Patl_4119 Patl_4120     FALSE 0.010 281.000 0.000 1.000   NA
 3503994 3503995 Patl_4120 Patl_4121     TRUE 0.988 3.000 0.145 1.000   NA
 3503996 3503997 Patl_4122 Patl_4123     FALSE 0.002 571.000 0.000 1.000 N NA
 3503998 3503999 Patl_4124 Patl_4125     TRUE 0.997 12.000 0.923 1.000 N NA
 3503999 3504000 Patl_4125 Patl_4126     TRUE 0.999 -7.000 0.600 0.044 N NA
 3504002 3504003 Patl_4128 Patl_4129     TRUE 0.628 45.000 0.035 NA   NA
 3504004 3504005 Patl_4130 Patl_4131     FALSE 0.004 405.000 0.000 NA   NA
 3504007 3504008 Patl_4133 Patl_4134     FALSE 0.004 390.000 0.000 NA   NA
 3504008 3504009 Patl_4134 Patl_4135     FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 3504009 3504010 Patl_4135 Patl_4136     FALSE 0.003 463.000 0.000 NA   NA
 3504010 3504011 Patl_4136 Patl_4137     TRUE 0.968 47.000 0.636 NA   NA
 3504011 3504012 Patl_4137 Patl_4138     FALSE 0.019 218.000 0.000 NA   NA
 3504012 3504013 Patl_4138 Patl_4139     FALSE 0.290 62.000 0.000 NA   NA
 3504013 3504014 Patl_4139 Patl_4140     FALSE 0.125 122.000 0.000 NA   NA
 3504014 3504015 Patl_4140 Patl_4141     FALSE 0.131 122.000 0.000 1.000   NA
 3504017 3504018 Patl_4143 Patl_4144     FALSE 0.130 119.000 0.000 NA   NA
 3504018 3504019 Patl_4144 Patl_4145     FALSE 0.008 268.000 0.000 1.000 N NA
 3504019 3504020 Patl_4145 Patl_4146     TRUE 0.992 3.000 0.015 0.001 Y NA
 3504020 3504021 Patl_4146 Patl_4147     TRUE 0.997 12.000 0.500 1.000 Y NA
 3504024 3504025 Patl_4150 Patl_4151     TRUE 0.949 8.000 0.041 1.000   NA
 3504026 3504027 Patl_4152 Patl_4153     TRUE 0.989 16.000 0.179 0.019 Y NA
 3504027 3504028 Patl_4153 Patl_4154     TRUE 0.998 2.000 0.214 1.000 Y NA
 3504028 3504029 Patl_4154 Patl_4155     FALSE 0.462 53.000 0.000 0.012   NA
 3504029 3504030 Patl_4155 Patl_4156     TRUE 0.994 4.000 0.286 1.000   NA
 3504030 3504031 Patl_4156 Patl_4157     FALSE 0.003 403.000 0.000 1.000 N NA
 3504031 3504032 Patl_4157 Patl_4158     TRUE 0.994 2.000 0.285 1.000 N NA
 3504032 3504033 Patl_4158 Patl_4159     FALSE 0.008 264.000 0.000 1.000 N NA
 3504033 3504034 Patl_4159 Patl_4160     TRUE 0.703 101.000 0.000 0.002 Y NA
 3504035 3504036 Patl_4161 Patl_4162     FALSE 0.078 146.000 0.000 1.000   NA
 3504036 3504037 Patl_4162 Patl_4163     FALSE 0.125 124.000 0.000 1.000   NA
 3504037 3504038 Patl_4163 Patl_4164     FALSE 0.014 245.000 0.000 1.000   NA
 3504038 3504039 Patl_4164 Patl_4165     FALSE 0.006 359.000 0.000 1.000   NA
 3504040 3504041 Patl_4166 Patl_4167     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3504041 3504042 Patl_4167 Patl_4168   murQ TRUE 0.978 -3.000 0.040 NA   NA
 3504042 3504043 Patl_4168 Patl_4169 murQ   TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3504043 3504044 Patl_4169 Patl_4170     TRUE 0.994 -3.000 0.222 NA N NA
 3504044 3504045 Patl_4170 Patl_4171     TRUE 0.848 7.000 0.000 NA   NA
 3504045 3504046 Patl_4171 Patl_4172     TRUE 0.876 13.000 0.024 NA   NA
 3504047 3504048 Patl_4173 Patl_4174     TRUE 0.981 2.000 0.092 1.000 N NA
 3504048 3504049 Patl_4174 Patl_4175     TRUE 0.968 17.000 0.062 1.000 Y NA
 3504052 3504053 Patl_4178 Patl_4179     FALSE 0.330 52.000 0.000 1.000   NA
 3504053 3504054 Patl_4179 Patl_4180     FALSE 0.004 397.000 0.000 1.000   NA
 3504054 3504055 Patl_4180 Patl_4181     FALSE 0.021 214.000 0.000 1.000   NA
 3504055 3504056 Patl_4181 Patl_4182     TRUE 0.556 227.000 0.714 NA   NA
 3504056 3504057 Patl_4182 Patl_4183     TRUE 0.964 73.000 0.714 NA   NA
 3504057 3504058 Patl_4183 Patl_4184     FALSE 0.031 189.000 0.000 NA   NA
 3504058 3504059 Patl_4184 Patl_4185     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3504061 3504062 Patl_4187 Patl_4188     FALSE 0.003 608.000 0.009 1.000 N NA
 3504063 3504064 Patl_4189 Patl_4190     FALSE 0.210 132.000 0.018 NA   NA
 3504064 3504065 Patl_4190 Patl_4191     FALSE 0.160 207.000 0.122 NA   NA
 3504065 3504066 Patl_4191 Patl_4192   hslU TRUE 0.988 79.000 0.752 1.000 Y NA
 3504067 3504068 Patl_4193 Patl_4194     FALSE 0.002 628.000 0.000 1.000   NA
 3504068 3504069 Patl_4194 Patl_4195     TRUE 0.967 28.000 0.429 NA   NA
 3504069 3504070 Patl_4195 Patl_4196     FALSE 0.021 210.000 0.000 NA   NA
 3504070 3504071 Patl_4196 Patl_4197     FALSE 0.143 114.000 0.000 NA   NA
 3504072 3504073 Patl_4198 Patl_4199     FALSE 0.010 271.000 0.000 NA   NA
 3504073 3504074 Patl_4199 Patl_4200     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3504074 3504075 Patl_4200 Patl_4201     FALSE 0.003 464.000 0.000 NA   NA
 3504075 3504076 Patl_4201 Patl_4202     FALSE 0.194 98.000 0.000 NA   NA
 3504076 3504077 Patl_4202 Patl_4203   secD FALSE 0.171 169.000 0.056 NA   NA
 3504077 3504078 Patl_4203 Patl_4204 secD secF TRUE 0.997 -3.000 0.070 0.001 Y NA
 3504079 3504080 Patl_4205 Patl_4206     FALSE 0.007 328.000 0.000 1.000   NA
 3504081 3504082 Patl_4207 Patl_4208     TRUE 0.627 31.000 0.024 1.000 N NA
 3504082 3504083 Patl_4208 Patl_4209     FALSE 0.078 146.000 0.002 1.000 N NA
 3504083 3504084 Patl_4209 Patl_4210     TRUE 0.990 1.000 0.145 1.000   NA
 3504084 3504085 Patl_4210 Patl_4211     TRUE 0.996 4.000 0.432 1.000   NA
 3504087 3504088 Patl_4213 Patl_4214     TRUE 0.973 15.000 0.029 0.005 Y NA
 3504088 3504089 Patl_4214 Patl_4215     TRUE 0.998 7.000 0.333 NA Y NA
 3504089 3504090 Patl_4215 Patl_4216     TRUE 0.985 -3.000 0.071 NA   NA
 3504090 3504091 Patl_4216 Patl_4217     TRUE 0.984 2.000 0.098 NA   NA
 3504091 3504092 Patl_4217 Patl_4218     TRUE 0.983 4.000 0.134 NA N NA
 3504092 3504093 Patl_4218 Patl_4219     TRUE 0.575 50.000 0.038 1.000 N NA
 3504094 3504095 Patl_4220 Patl_4221     TRUE 0.997 -3.000 0.406 1.000 N NA
 3504096 3504097 Patl_4222 Patl_4223   rho FALSE 0.078 232.000 0.087 1.000 N NA
 3504097 3504098 Patl_4223 Patl_4224 rho   FALSE 0.007 276.000 0.000 1.000 N NA
 3504098 3504099 Patl_4224 Patl_4225     TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.000 Y NA
 3504099 3504100 Patl_4225 Patl_R0084     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 3504100 3504101 Patl_R0084 Patl_4226     FALSE 0.003 583.000 0.000 NA   NA
 3504101 3504102 Patl_4226 Patl_4227     FALSE 0.023 207.000 0.000 NA   NA
 3504103 3504104 Patl_4228 Patl_4229     TRUE 0.654 35.000 0.028 NA   NA
 3504104 3504105 Patl_4229 Patl_4230     FALSE 0.275 69.000 0.000 NA   NA
 3504111 3504112 Patl_4236 Patl_4237     TRUE 0.962 3.000 0.029 1.000   NA
 3504112 3504113 Patl_4237 Patl_4238     TRUE 0.989 -3.000 0.099 1.000   NA
 3504113 3504114 Patl_4238 Patl_4239     TRUE 0.997 10.000 0.321 1.000 Y NA
 3504114 3504115 Patl_4239 Patl_4240     TRUE 0.985 11.000 0.255 NA   NA
 3504115 3504116 Patl_4240 Patl_4241     TRUE 0.999 -16.000 0.722 NA   NA
 3504118 3504119 Patl_4243 Patl_4244     TRUE 0.993 12.000 0.536 1.000 N NA
 3504119 3504120 Patl_4244 Patl_4245     FALSE 0.197 243.000 0.268 1.000 N NA
 3504120 3504121 Patl_4245 Patl_4246     TRUE 0.999 11.000 0.741 0.002 Y NA
 3504121 3504122 Patl_4246 Patl_4247     FALSE 0.003 379.000 0.000 1.000 N NA
 3504124 3504125 Patl_4249 Patl_4250     TRUE 0.997 0.000 0.106 1.000 Y NA
 3504126 3504127 Patl_4251 Patl_4252     FALSE 0.391 62.000 0.005 NA   NA
 3504127 3504128 Patl_4252 Patl_4253     FALSE 0.117 128.000 0.000 1.000   NA
 3504130 3504131 Patl_4255 Patl_4256     FALSE 0.003 556.000 0.000 NA   NA
 3504132 3504133 Patl_4257 Patl_4258     FALSE 0.034 199.000 0.000 0.045 N NA
 3504133 3504134 Patl_4258 Patl_4259     FALSE 0.044 172.000 0.000 NA   NA
 3504134 3504135 Patl_4259 Patl_4260     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3504135 3504136 Patl_4260 Patl_4261     TRUE 0.963 -3.000 0.011 1.000   NA
 3504138 3504139 Patl_4263 Patl_4264     FALSE 0.014 242.000 0.000 NA   NA
 3504139 3504140 Patl_4264 Patl_4265     FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 3504140 3504141 Patl_4265 Patl_4266     FALSE 0.015 243.000 0.000 1.000   NA
 3504141 3504142 Patl_4266 Patl_4267     FALSE 0.347 44.000 0.000 NA   NA
 3504142 3504143 Patl_4267 Patl_4268     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3504143 3504144 Patl_4268 Patl_4269     TRUE 0.856 49.000 0.002 0.001 Y NA
 3504145 3504146 Patl_4270 Patl_4271     TRUE 0.998 3.000 0.571 NA   NA
 3504146 3504147 Patl_4271 Patl_4272     FALSE 0.120 124.000 0.000 NA   NA
 3504148 3504149 Patl_4273 Patl_4274     FALSE 0.305 57.000 0.000 NA   NA
 3504150 3504151 Patl_4275 Patl_4276     TRUE 0.864 13.000 0.019 NA   NA
 3504151 3504152 Patl_4276 Patl_4277     FALSE 0.097 171.000 0.019 NA   NA
 3504152 3504153 Patl_4277 Patl_4278     FALSE 0.133 118.000 0.000 NA   NA
 3504153 3504154 Patl_4278 Patl_4279     FALSE 0.037 179.000 0.000 NA   NA
 3504155 3504156 Patl_4280 Patl_4281   pyrE TRUE 0.932 2.000 0.009 1.000 N NA
 3504156 3504157 Patl_4281 Patl_4282 pyrE   TRUE 0.796 39.000 0.108 1.000 N NA
 3504158 3504159 Patl_4283 Patl_4284     FALSE 0.343 45.000 0.000 NA   NA
 3504161 3504162 Patl_4286 Patl_4287     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 3504162 3504163 Patl_4287 Patl_4288     TRUE 0.994 16.000 0.833 NA   NA
 3504163 3504164 Patl_4288 Patl_4289     TRUE 0.990 28.000 1.000 NA   NA
 3504164 3504165 Patl_4289 Patl_4290     TRUE 0.652 16.000 0.000 NA   NA
 3504167 3504168 Patl_4292 Patl_4293     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 3504169 3504170 Patl_4294 Patl_4295     TRUE 0.994 44.000 0.837 0.004 Y NA
 3504170 3504171 Patl_4295 Patl_4296     TRUE 0.995 32.000 0.724 0.004 Y NA
 3504171 3504172 Patl_4296 Patl_4297     TRUE 0.993 56.000 0.846 0.004 Y NA
 3504172 3504173 Patl_4297 Patl_4298     TRUE 0.999 14.000 0.864 0.004 Y NA
 3504173 3504174 Patl_4298 Patl_4299     TRUE 0.993 15.000 0.242 0.004 Y NA
 3504174 3504175 Patl_4299 Patl_4300     TRUE 0.993 40.000 0.666 0.004 Y NA
 3504175 3504176 Patl_4300 Patl_4301     TRUE 0.988 54.000 0.557 0.004 Y NA
 3504176 3504177 Patl_4301 Patl_4302     TRUE 0.969 49.000 0.291 1.000 Y NA
 3504177 3504178 Patl_4302 Patl_4303     FALSE 0.446 102.000 0.056 1.000 N NA
 3504178 3504179 Patl_4303 Patl_4304     TRUE 0.983 34.000 0.827 1.000 N NA
 3504179 3504180 Patl_4304 Patl_4305     TRUE 0.903 64.000 0.339 1.000 N NA
 3504180 3504181 Patl_4305 Patl_4306     TRUE 0.998 0.000 0.466 1.000 N NA
 3504181 3504182 Patl_4306 Patl_4307     FALSE 0.001 1057.000 0.000 1.000 N NA
 3504182 3504183 Patl_4307 Patl_4308     TRUE 0.580 20.000 0.000 NA   NA
 3504183 3504184 Patl_4308 Patl_4309     TRUE 0.961 4.000 0.038 NA   NA
 3504184 3504185 Patl_4309 Patl_4310   trmE FALSE 0.024 280.000 0.023 1.000   NA
 3504185 3504186 Patl_4310 Patl_4311 trmE   TRUE 0.880 9.000 0.004 NA   NA
 3504186 3504187 Patl_4311 Patl_4312     FALSE 0.217 111.000 0.005 NA   NA
 3504187 3504188 Patl_4312 Patl_4313     TRUE 0.866 112.000 0.461 NA   NA
 3504188 3504189 Patl_4313 Patl_4314     TRUE 0.998 -39.000 0.540 NA   NA
 3504189 3504190 Patl_4314 Patl_4315     TRUE 0.997 10.000 0.787 1.000   NA