MicrobesOnline Operon Predictions for Mycoplasma capricolum ATCC 27343

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1113520 1113521 MCAP_0001 MCAP_0002 dnaA dnaN TRUE 0.755 165.000 0.005 1.000 Y NA
 1113521 1113522 MCAP_0002 MCAP_0003 dnaN   TRUE 0.964 37.000 0.013 1.000 Y NA
 1113522 1113523 MCAP_0003 MCAP_0004   ksgA TRUE 0.933 -10.000 0.093 1.000 N NA
 1113523 1113524 MCAP_0004 MCAP_0005 ksgA   TRUE 0.584 55.000 0.002 1.000   NA
 1113524 1113525 MCAP_0005 MCAP_0006   mcs1 TRUE 0.361 69.000 0.000 NA   NA
 1113525 1113526 MCAP_0006 MCAP_0007 mcs1   TRUE 0.854 20.000 0.000 NA   NA
 1113526 1113527 MCAP_0007 MCAP_0008   dnaX TRUE 0.615 80.000 0.022 1.000 N NA
 1113527 1113528 MCAP_0008 MCAP_0009 dnaX recM TRUE 0.984 2.000 0.009 0.018 Y NA
 1113528 1113529 MCAP_0009 MCAP_0010 recM tmk TRUE 0.935 3.000 0.015 1.000 N NA
 1113529 1113530 MCAP_0010 MCAP_0011 tmk   TRUE 0.917 -22.000 0.254 1.000   NA
 1113530 1113531 MCAP_0011 MCAP_0012     TRUE 0.594 60.000 0.006 1.000   NA
 1113531 1113532 MCAP_0012 MCAP_0013     TRUE 0.673 51.000 0.006 1.000   NA
 1113532 1113533 MCAP_0013 MCAP_0014     TRUE 0.919 5.000 0.002 1.000 N NA
 1113534 1113535 MCAP_0015 MCAP_0016   mcs2 TRUE 0.848 21.000 0.000 NA   NA
 1113538 1113539 MCAP_0019 MCAP_0020   hslO FALSE 0.328 176.000 0.003 NA   NA
 1113539 1113540 MCAP_0020 MCAP_0021 hslO   TRUE 0.747 48.000 0.005 1.000 N NA
 1113542 1113543 MCAP_0023 MCAP_0024   rpsF FALSE 0.184 203.000 0.000 1.000 N NA
 1113543 1113544 MCAP_0024 MCAP_0025 rpsF ssb TRUE 0.937 16.000 0.002 1.000 N NA
 1113544 1113545 MCAP_0025 MCAP_0026 ssb rpsR TRUE 0.938 19.000 0.003 1.000 N NA
 1113545 1113546 MCAP_0026 MCAP_0027 rpsR   FALSE 0.135 696.000 0.000 NA N NA
 1113546 1113547 MCAP_0027 MCAP_0028     FALSE 0.165 275.000 0.000 NA N NA
 1113547 1113548 MCAP_0028 MCAP_0029     TRUE 0.936 0.000 0.040 1.000 N NA
 1113548 1113549 MCAP_0029 MCAP_0030     TRUE 0.921 0.000 0.040 1.000   NA
 1113549 1113550 MCAP_0030 MCAP_0031     FALSE 0.135 214.000 0.000 1.000   NA
 1113550 1113551 MCAP_0031 MCAP_0032     TRUE 0.933 1.000 0.012 1.000 N NA
 1113552 1113553 MCAP_0033 MCAP_0034     TRUE 0.938 25.000 1.000 NA   NA
 1113554 1113555 MCAP_0035 MCAP_0036 metG   FALSE 0.178 184.000 0.000 NA   NA
 1113555 1113556 MCAP_0036 MCAP_0037     TRUE 0.869 18.000 0.000 NA   NA
 1113556 1113557 MCAP_0037 MCAP_0038     TRUE 0.907 -10.000 0.012 1.000   NA
 1113557 1113558 MCAP_0038 MCAP_0039     TRUE 0.906 3.000 0.007 0.041   NA
 1113559 1113560 MCAP_0040 MCAP_0041 gyrA gyrB TRUE 0.804 132.000 0.306 0.008 Y NA
 1113560 1113561 MCAP_0041 MCAP_0042 gyrB   FALSE 0.113 400.000 0.000 NA   NA
 1113561 1113562 MCAP_0042 MCAP_0043     FALSE 0.187 168.000 0.000 NA   NA
 1113562 1113563 MCAP_0043 MCAP_0044     TRUE 0.945 -16.000 1.000 NA   NA
 1113563 1113564 MCAP_0044 MCAP_0045   secA TRUE 0.522 110.000 0.017 NA   NA
 1113565 1113566 MCAP_0046 MCAP_0047     TRUE 0.544 96.000 0.007 NA   NA
 1113566 1113567 MCAP_0047 MCAP_0048     TRUE 0.560 195.000 0.000 0.061 Y NA
 1113567 1113568 MCAP_0048 MCAP_0049   dam TRUE 0.984 -70.000 0.667 0.012 Y NA
 1113568 1113569 MCAP_0049 MCAP_0050 dam   TRUE 0.927 -22.000 0.412 NA   NA
 1113569 1113570 MCAP_0050 MCAP_0051     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1113570 1113571 MCAP_0051 MCAP_0052     TRUE 0.842 2.000 0.000 NA   NA
 1113571 1113572 MCAP_0052 MCAP_0053     FALSE 0.105 725.000 0.000 NA   NA
 1113572 1113573 MCAP_0053 MCAP_0054     TRUE 0.905 -10.000 0.003 NA   NA
 1113574 1113575 MCAP_0055 MCAP_0056     TRUE 0.915 0.000 0.012 1.000   NA
 1113575 1113576 MCAP_0056 MCAP_0057   xseA TRUE 0.918 -7.000 0.412 0.004   NA
 1113576 1113577 MCAP_0057 MCAP_0058 xseA   TRUE 0.935 2.000 0.012 1.000 N NA
 1113577 1113578 MCAP_0058 MCAP_0059     TRUE 0.948 12.000 0.027 NA   NA
 1113578 1113579 MCAP_0059 MCAP_0060     TRUE 0.871 27.000 0.004 NA   NA
 1113579 1113580 MCAP_0060 MCAP_0061     TRUE 0.907 -7.000 0.006 1.000   NA
 1113580 1113581 MCAP_0061 MCAP_0062     FALSE 0.358 75.000 0.000 NA   NA
 1113582 1113583 MCAP_0063 MCAP_0064     TRUE 0.976 3.000 0.000 NA Y NA
 1113583 1113584 MCAP_0064 MCAP_0065   rplK FALSE 0.185 202.000 0.000 1.000 N NA
 1113584 1113585 MCAP_0065 MCAP_0066 rplK rplA TRUE 0.990 0.000 0.838 1.000 Y NA
 1113585 1113586 MCAP_0066 MCAP_0067 rplA rplJ TRUE 0.736 229.000 0.302 1.000 Y NA
 1113586 1113587 MCAP_0067 MCAP_0068 rplJ rplL TRUE 0.917 76.000 0.884 1.000 Y NA
 1113587 1113588 MCAP_0068 MCAP_0069 rplL   FALSE 0.295 171.000 0.002 NA   NA
 1113588 1113589 MCAP_0069 MCAP_0070   rpoB TRUE 0.906 -10.000 0.003 NA   NA
 1113589 1113590 MCAP_0070 MCAP_0071 rpoB rpoC TRUE 0.992 12.000 0.851 0.006 Y NA
 1113590 1113591 MCAP_0071 MCAP_0072 rpoC   TRUE 0.514 90.000 0.002 NA   NA
 1113593 1113594 MCAP_0074 MCAP_0075   glyA TRUE 0.925 -16.000 0.028 1.000 N NA
 1113594 1113595 MCAP_0075 MCAP_0076 glyA upp TRUE 0.575 102.000 0.021 1.000 N NA
 1113595 1113596 MCAP_0076 MCAP_0077 upp   TRUE 0.370 141.000 0.004 NA   NA
 1113596 1113597 MCAP_0077 MCAP_0078   atpB TRUE 0.921 0.000 0.007 NA   NA
 1113597 1113598 MCAP_0078 MCAP_0079 atpB atpE TRUE 0.786 39.000 0.085 0.019   NA
 1113598 1113599 MCAP_0079 MCAP_0080 atpE atpF TRUE 0.877 28.000 0.500 0.019   NA
 1113599 1113600 MCAP_0080 MCAP_0081 atpF atpH TRUE 0.985 2.000 0.022 0.019 Y NA
 1113600 1113601 MCAP_0081 MCAP_0082 atpH atpA1 TRUE 0.992 12.000 0.864 0.019 Y NA
 1113601 1113602 MCAP_0082 MCAP_0083 atpA1 atpG TRUE 0.989 2.000 0.846 0.019 Y NA
 1113602 1113603 MCAP_0083 MCAP_0084 atpG atpD1 TRUE 0.989 9.000 0.724 0.019 Y NA
 1113603 1113604 MCAP_0084 MCAP_0085 atpD1 atpC TRUE 0.989 0.000 0.837 0.019 Y NA
 1113608 1113609 MCAP_0089 MCAP_0090 arcA arcB TRUE 0.978 18.000 0.000 1.000 Y NA
 1113609 1113610 MCAP_0090 MCAP_0091 arcB   TRUE 0.637 63.000 0.286 1.000   NA
 1113611 1113612 MCAP_0092 MCAP_0093     FALSE 0.347 92.000 0.000 NA   NA
 1113612 1113613 MCAP_0093 MCAP_0094   ptsG FALSE 0.352 105.000 0.000 1.000 N NA
 1113613 1113614 MCAP_0094 MCAP_0095 ptsG   FALSE 0.113 420.000 0.000 NA   NA
 1113614 1113615 MCAP_0095 MCAP_0096   smpB TRUE 0.907 0.000 0.002 NA   NA
 1113615 1113616 MCAP_0096 MCAP_0097 smpB   TRUE 0.945 10.000 0.143 0.059 N NA
 1113616 1113617 MCAP_0097 MCAP_0098     TRUE 0.831 36.000 0.064 1.000   NA
 1113618 1113619 MCAP_0099 MCAP_0100 nrdF nrdI TRUE 0.992 10.000 0.643 NA Y NA
 1113619 1113620 MCAP_0100 MCAP_0101 nrdI nrdE TRUE 0.990 -13.000 1.000 NA Y NA
 1113620 1113621 MCAP_0101 MCAP_0103 nrdE mcs4b TRUE 0.800 -38.000 0.000 NA   NA
 1113621 1113622 MCAP_0103 MCAP_0104 mcs4b prs TRUE 0.699 34.000 0.000 NA   NA
 1113622 1113623 MCAP_0104 MCAP_0105 prs pth FALSE 0.230 305.000 0.002 1.000 N NA
 1113623 1113624 MCAP_0105 MCAP_0106 pth rplI TRUE 0.765 131.000 0.002 1.000 Y NA
 1113624 1113625 MCAP_0106 MCAP_0107 rplI dnaC TRUE 0.942 2.000 0.100 1.000 N NA
 1113625 1113626 MCAP_0107 MCAP_0108 dnaC   TRUE 0.570 89.000 0.012 NA   NA
 1113626 1113627 MCAP_0108 MCAP_0109     TRUE 0.471 127.000 0.133 NA   NA
 1113627 1113628 MCAP_0109 MCAP_0110   cysS TRUE 0.922 9.000 0.003 NA   NA
 1113628 1113629 MCAP_0110 MCAP_0111 cysS   TRUE 0.987 2.000 0.088 1.000 Y NA
 1113629 1113630 MCAP_0111 MCAP_0112   rpmG TRUE 0.897 61.000 0.004 1.000 Y NA
 1113630 1113631 MCAP_0112 MCAP_0113 rpmG secE TRUE 0.919 0.000 0.025 1.000   NA
 1113631 1113632 MCAP_0113 MCAP_0114 secE nusG TRUE 0.923 17.000 0.002 1.000   NA
 1113632 1113633 MCAP_0114 MCAP_0115 nusG   FALSE 0.098 448.000 0.000 1.000   NA
 1113633 1113634 MCAP_0115 MCAP_0116     TRUE 0.930 9.000 0.083 1.000   NA
 1113634 1113635 MCAP_0116 MCAP_0117     TRUE 0.986 0.000 0.167 0.040 Y NA
 1113635 1113636 MCAP_0117 MCAP_0118     TRUE 0.990 2.000 1.000 0.040 Y NA
 1113636 1113637 MCAP_0118 MCAP_0119     TRUE 0.914 79.000 0.692 1.000 Y NA
 1113637 1113638 MCAP_0119 MCAP_0120     TRUE 0.607 76.000 0.769 0.008   NA
 1113640 1113641 MCAP_0122 MCAP_0123     TRUE 0.662 54.000 0.019 1.000   NA
 1113643 1113644 MCAP_0125 MCAP_0126 ilvA   FALSE 0.150 216.000 0.000 NA   NA
 1113644 1113645 MCAP_0126 MCAP_0127     TRUE 0.924 5.000 0.006 NA   NA
 1113645 1113646 MCAP_0127 MCAP_0128   nagB FALSE 0.169 195.000 0.000 NA   NA
 1113646 1113647 MCAP_0128 MCAP_0129 nagB   TRUE 0.989 4.000 0.364 1.000 Y NA
 1113647 1113648 MCAP_0129 MCAP_0130   gltX TRUE 0.440 131.000 0.008 1.000 N NA
 1113648 1113649 MCAP_0130 MCAP_0131 gltX   TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 1113649 1113650 MCAP_0131 MCAP_0132     TRUE 0.772 26.000 0.000 NA   NA
 1113650 1113651 MCAP_0132 MCAP_0133   pyrG TRUE 0.544 93.000 0.029 1.000   NA
 1113651 1113652 MCAP_0133 MCAP_0134 pyrG   FALSE 0.110 502.000 0.000 NA   NA
 1113652 1113653 MCAP_0134 MCAP_0135     TRUE 0.965 15.000 1.000 NA   NA
 1113653 1113654 MCAP_0135 MCAP_0136   fba TRUE 0.392 152.000 0.024 NA   NA
 1113656 1113657 MCAP_0138 MCAP_0139     TRUE 0.362 85.000 0.000 NA   NA
 1113657 1113658 MCAP_0139 MCAP_0140   rpmE TRUE 0.402 137.000 0.004 1.000 N NA
 1113658 1113659 MCAP_0140 MCAP_0141 rpmE   TRUE 0.559 75.000 0.005 NA   NA
 1113659 1113660 MCAP_0141 MCAP_0142     TRUE 0.960 10.000 1.000 NA   NA
 1113660 1113661 MCAP_0142 MCAP_0143   tdk TRUE 0.916 3.000 0.006 1.000   NA
 1113661 1113662 MCAP_0143 MCAP_0144 tdk prfA TRUE 0.940 3.000 0.062 1.000 N NA
 1113662 1113663 MCAP_0144 MCAP_0145 prfA   TRUE 0.986 -7.000 0.081 1.000 Y NA
 1113663 1113664 MCAP_0145 MCAP_0146     TRUE 0.747 46.000 0.007 NA   NA
 1113664 1113665 MCAP_0146 MCAP_0147     TRUE 0.931 9.000 0.016 NA   NA
 1113665 1113666 MCAP_0147 MCAP_0148     TRUE 0.582 68.000 0.011 NA   NA
 1113666 1113667 MCAP_0148 MCAP_0149     FALSE 0.255 124.000 0.000 NA   NA
 1113667 1113668 MCAP_0149 MCAP_0150     TRUE 0.934 0.000 0.154 NA   NA
 1113668 1113669 MCAP_0150 MCAP_0151   rpsL TRUE 0.476 124.000 0.008 1.000 N NA
 1113669 1113670 MCAP_0151 MCAP_0152 rpsL rpsG TRUE 0.885 90.000 0.224 0.015 Y NA
 1113670 1113671 MCAP_0152 MCAP_0153 rpsG fusA TRUE 0.982 27.000 0.579 1.000 Y NA
 1113671 1113672 MCAP_0153 MCAP_0154 fusA tuf TRUE 0.807 132.000 0.400 0.004 Y NA
 1113672 1113673 MCAP_0154 MCAP_0155 tuf   TRUE 0.437 123.000 0.002 1.000 N NA
 1113673 1113674 MCAP_0155 MCAP_0156     TRUE 0.984 -16.000 0.048 1.000 Y NA
 1113674 1113675 MCAP_0156 MCAP_0157   pepA1 TRUE 0.402 187.000 0.167 1.000 N NA
 1113676 1113677 MCAP_0158 MCAP_0159   alaS FALSE 0.182 177.000 0.000 NA   NA
 1113677 1113678 MCAP_0159 MCAP_0160 alaS   TRUE 0.525 69.000 0.002 NA   NA
 1113679 1113680 MCAP_0161 MCAP_0162     TRUE 0.991 16.000 0.556 0.038 Y NA
 1113680 1113681 MCAP_0162 MCAP_0163     TRUE 0.992 14.000 0.650 1.000 Y NA
 1113681 1113682 MCAP_0163 MCAP_0164     TRUE 0.940 2.000 0.333 0.007 N NA
 1113682 1113683 MCAP_0164 MCAP_0165     TRUE 0.942 17.000 0.074 1.000   NA
 1113683 1113684 MCAP_0165 MCAP_0166     FALSE 0.333 99.000 0.000 NA   NA
 1113684 1113685 MCAP_0166 MCAP_0167     FALSE 0.122 312.000 0.000 NA   NA
 1113685 1113686 MCAP_0167 MCAP_0168     FALSE 0.103 930.000 0.000 NA   NA
 1113686 1113687 MCAP_0168 MCAP_0169     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 1113687 1113688 MCAP_0169 MCAP_0170     FALSE 0.326 102.000 0.000 NA   NA
 1113688 1113689 MCAP_0170 MCAP_0171     TRUE 0.515 50.000 0.000 NA   NA
 1113689 1113690 MCAP_0171 MCAP_0172     FALSE 0.266 121.000 0.000 NA   NA
 1113690 1113691 MCAP_0172 MCAP_0173     FALSE 0.156 210.000 0.000 NA   NA
 1113695 1113696 MCAP_0177 MCAP_0178     FALSE 0.210 143.000 0.000 NA   NA
 1113696 1113697 MCAP_0178 MCAP_0179     TRUE 0.362 85.000 0.000 NA   NA
 1113697 1113698 MCAP_0179 MCAP_0180     FALSE 0.105 321.000 0.000 1.000   NA
 1113698 1113699 MCAP_0180 MCAP_0181     TRUE 0.586 42.000 0.000 NA   NA
 1113699 1113700 MCAP_0181 MCAP_0182     TRUE 0.741 28.000 0.000 NA   NA
 1113700 1113701 MCAP_0182 MCAP_0183     TRUE 0.791 25.000 0.000 NA   NA
 1113701 1113702 MCAP_0183 MCAP_0184     TRUE 0.374 67.000 0.000 NA   NA
 1113702 1113703 MCAP_0184 MCAP_0185     TRUE 0.835 0.000 0.000 NA   NA
 1113703 1113704 MCAP_0185 MCAP_0186     FALSE 0.117 350.000 0.000 NA   NA
 1113704 1113705 MCAP_0186 MCAP_0187     FALSE 0.101 386.000 0.000 1.000   NA
 1113705 1113706 MCAP_0187 MCAP_0189     FALSE 0.115 1579.000 0.000 1.000 N NA
 1113706 1113707 MCAP_0189 MCAP_0190     TRUE 0.889 99.000 0.250 1.000 Y NA
 1113707 1113708 MCAP_0190 MCAP_0191     TRUE 0.986 2.000 0.041 0.025 Y NA
 1113708 1113709 MCAP_0191 MCAP_0192     TRUE 0.934 22.000 0.019 1.000 N NA
 1113710 1113711 MCAP_0193 MCAP_0194     TRUE 0.937 0.000 0.250 NA   NA
 1113711 1113712 MCAP_0194 MCAP_0195   pepA2 TRUE 0.959 16.000 0.667 NA   NA
 1113712 1113713 MCAP_0195 MCAP_0196 pepA2   FALSE 0.283 116.000 0.000 NA   NA
 1113714 1113715 MCAP_0197 MCAP_0198     TRUE 0.986 0.000 0.273 0.004 Y NA
 1113715 1113716 MCAP_0198 MCAP_0199     FALSE 0.104 763.000 0.000 NA   NA
 1113717 1113718 MCAP_0200 MCAP_0201     TRUE 0.964 -15.000 0.000 0.037 Y NA
 1113718 1113719 MCAP_0201 MCAP_0202     TRUE 0.989 0.000 0.928 0.037 Y NA
 1113719 1113720 MCAP_0202 MCAP_0203   rplT FALSE 0.132 362.000 0.000 1.000 N NA
 1113720 1113721 MCAP_0203 MCAP_0204 rplT rpmI TRUE 0.951 19.000 0.928 0.074   NA
 1113721 1113722 MCAP_0204 MCAP_0205 rpmI infC TRUE 0.910 26.000 0.652 1.000   NA
 1113722 1113723 MCAP_0205 MCAP_0206 infC def TRUE 0.702 189.000 0.002 1.000 Y NA
 1113724 1113725 MCAP_0207 MCAP_0208   gmk TRUE 0.934 3.000 0.009 1.000 N NA
 1113725 1113726 MCAP_0208 MCAP_0209 gmk   TRUE 0.908 -37.000 0.003 1.000 N NA
 1113728 1113729 MCAP_0211 MCAP_0212     TRUE 0.963 11.000 1.000 NA   NA
 1113729 1113730 MCAP_0212 MCAP_0213   eno FALSE 0.262 123.000 0.000 NA   NA
 1113730 1113731 MCAP_0213 MCAP_0214 eno   TRUE 0.542 66.000 0.003 1.000   NA
 1113731 1113732 MCAP_0214 MCAP_0215     TRUE 0.913 2.000 0.004 1.000   NA
 1113732 1113733 MCAP_0215 MCAP_0216   hpt1 TRUE 0.930 6.000 0.004 1.000 N NA
 1113734 1113735 MCAP_0217 MCAP_0218   glpK TRUE 0.866 36.000 0.125 1.000 N NA
 1113735 1113736 MCAP_0218 MCAP_0219 glpK   TRUE 0.953 17.000 0.643 1.000   NA
 1113737 1113738 MCAP_0220 MCAP_0221 pfkA pyk TRUE 0.876 69.000 0.027 0.014 Y NA
 1113738 1113739 MCAP_0221 MCAP_0222 pyk thrS FALSE 0.149 271.000 0.000 1.000 N NA
 1113739 1113740 MCAP_0222 MCAP_0223 thrS   FALSE 0.084 630.000 0.000 0.078   NA
 1113740 1113741 MCAP_0223 MCAP_0224     TRUE 0.945 12.000 0.070 1.000   NA
 1113741 1113742 MCAP_0224 MCAP_0225   pdhA TRUE 0.860 35.000 0.020 1.000 N NA
 1113742 1113743 MCAP_0225 MCAP_0226 pdhA pdhB TRUE 0.987 0.000 0.458 0.004 Y NA
 1113743 1113744 MCAP_0226 MCAP_0227 pdhB pdhC TRUE 0.973 29.000 0.028 0.055 Y NA
 1113744 1113745 MCAP_0227 MCAP_0228 pdhC pdhD TRUE 0.990 19.000 0.143 1.000 Y NA
 1113745 1113746 MCAP_0228 MCAP_0229 pdhD pta TRUE 0.972 22.000 0.000 1.000 Y NA
 1113746 1113747 MCAP_0229 MCAP_0230 pta ackA TRUE 0.980 14.000 0.000 1.000 Y NA
 1113747 1113748 MCAP_0230 MCAP_0231 ackA   TRUE 0.614 68.000 0.333 1.000   NA
 1113748 1113749 MCAP_0231 MCAP_0232   coaD TRUE 0.930 10.000 0.015 1.000   NA
 1113749 1113750 MCAP_0232 MCAP_0233 coaD ptsI TRUE 0.587 93.000 0.015 1.000 N NA
 1113750 1113751 MCAP_0233 MCAP_0234 ptsI crr TRUE 0.885 82.000 0.105 0.030 Y NA
 1113751 1113752 MCAP_0234 MCAP_0235 crr   TRUE 0.461 492.000 0.000 1.000 Y NA
 1113752 1113753 MCAP_0235 MCAP_0236     TRUE 0.931 8.000 0.118 1.000   NA
 1113755 1113756 MCAP_0238 MCAP_0239   thiI TRUE 0.928 9.000 0.007 NA   NA
 1113756 1113757 MCAP_0239 MCAP_0240 thiI   TRUE 0.365 132.000 0.005 1.000   NA
 1113757 1113758 MCAP_0240 MCAP_0241     TRUE 0.567 117.000 0.667 NA   NA
 1113758 1113759 MCAP_0241 MCAP_0242     TRUE 0.947 10.000 0.250 NA   NA
 1113759 1113760 MCAP_0242 MCAP_0243     FALSE 0.142 235.000 0.000 NA   NA
 1113761 1113762 MCAP_0244 MCAP_0245     TRUE 0.916 9.000 0.004 1.000   NA
 1113762 1113763 MCAP_0245 MCAP_0246     TRUE 0.908 -6.000 0.002 NA   NA
 1113763 1113764 MCAP_0246 MCAP_0247     TRUE 0.955 2.000 1.000 NA   NA
 1113764 1113765 MCAP_0247 MCAP_0248     TRUE 0.947 3.000 0.667 NA   NA
 1113767 1113768 MCAP_0250 MCAP_0251   greA TRUE 0.630 59.000 0.031 1.000   NA
 1113768 1113769 MCAP_0251 MCAP_0252 greA uvrC TRUE 0.532 92.000 0.003 0.054 N NA
 1113769 1113770 MCAP_0252 MCAP_0253 uvrC   TRUE 0.915 9.000 0.002 NA   NA
 1113770 1113771 MCAP_0253 MCAP_0254     TRUE 0.384 65.000 0.000 NA   NA
 1113771 1113772 MCAP_0254 MCAP_0255     FALSE 0.294 114.000 0.000 NA   NA
 1113772 1113773 MCAP_0255 MCAP_0256     TRUE 0.431 119.000 0.026 0.054   NA
 1113773 1113774 MCAP_0256 MCAP_0257     TRUE 0.937 12.000 0.038 0.054   NA
 1113774 1113775 MCAP_0257 MCAP_0258   valS TRUE 0.433 124.000 0.002 1.000 N NA
 1113775 1113776 MCAP_0258 MCAP_0259 valS   TRUE 0.558 85.000 0.002 1.000 N NA
 1113776 1113777 MCAP_0259 MCAP_0260   rpe TRUE 0.929 -10.000 0.028 1.000 N NA
 1113777 1113778 MCAP_0260 MCAP_0261 rpe rsgA TRUE 0.920 2.000 0.018 1.000   NA
 1113778 1113779 MCAP_0261 MCAP_0262 rsgA   TRUE 0.932 10.000 0.024 1.000   NA
 1113779 1113780 MCAP_0262 MCAP_0263     TRUE 0.921 0.000 0.037 1.000   NA
 1113780 1113781 MCAP_0263 MCAP_0264     TRUE 0.778 -31.000 0.000 1.000   NA
 1113781 1113782 MCAP_0264 MCAP_0265     TRUE 0.726 30.000 0.000 NA   NA
 1113783 1113784 MCAP_0266 MCAP_0267     TRUE 0.903 2.000 0.002 1.000   NA
 1113785 1113786 MCAP_0268 MCAP_0269     FALSE 0.133 269.000 0.000 NA   NA
 1113786 1113787 MCAP_0269 MCAP_0270     FALSE 0.159 207.000 0.000 NA   NA
 1113788 1113789 MCAP_0271 MCAP_0272     TRUE 0.808 24.000 0.000 NA   NA
 1113789 1113790 MCAP_0272 MCAP_0273     FALSE 0.359 86.000 0.000 NA   NA
 1113790 1113791 MCAP_0273 MCAP_0274     FALSE 0.114 393.000 0.000 NA   NA
 1113791 1113792 MCAP_0274 MCAP_0275     FALSE 0.102 994.000 0.000 NA   NA
 1113792 1113793 MCAP_0275 MCAP_0276     FALSE 0.122 310.000 0.000 NA   NA
 1113793 1113794 MCAP_0276 MCAP_0277     TRUE 0.726 30.000 0.000 NA   NA
 11505856 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4263.000 0.000 NA   NA
 11648219 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4263.000 0.000 NA   NA
 11790611 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4263.000 0.000 NA   NA
 11505857 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4301.000 0.000 NA   NA
 11648220 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4301.000 0.000 NA   NA
 11790612 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4301.000 0.000 NA   NA
 11505858 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4338.000 0.000 NA   NA
 11648221 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4338.000 0.000 NA   NA
 11790613 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4338.000 0.000 NA   NA
 11505859 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4376.000 0.000 NA   NA
 11648222 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4376.000 0.000 NA   NA
 11790614 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4376.000 0.000 NA   NA
 11505860 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4413.000 0.000 NA   NA
 11648223 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4413.000 0.000 NA   NA
 11790615 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4413.000 0.000 NA   NA
 11505861 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4451.000 0.000 NA   NA
 11648224 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4451.000 0.000 NA   NA
 11790616 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4451.000 0.000 NA   NA
 11505862 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4488.000 0.000 NA   NA
 11648225 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4488.000 0.000 NA   NA
 11790617 1113788   MCAP_0271     FALSE NA 4488.000 0.000 NA   NA
 1113794 1113795 MCAP_0277 MCAP_0278     FALSE 0.358 72.000 0.000 NA   NA
 1113795 1113796 MCAP_0278 MCAP_0279     TRUE 0.569 44.000 0.000 NA   NA
 1113796 1113797 MCAP_0279 MCAP_0280     FALSE 0.121 314.000 0.000 NA   NA
 1113797 1113798 MCAP_0280 MCAP_0281     FALSE 0.192 165.000 0.000 NA   NA
 1113798 1113799 MCAP_0281 MCAP_0282     TRUE 0.464 51.000 0.000 1.000   NA
 1113799 1113800 MCAP_0282 MCAP_0283     TRUE 0.842 2.000 0.000 NA   NA
 1113800 1113801 MCAP_0283 MCAP_0284     TRUE 0.361 78.000 0.000 NA   NA
 1113801 1113802 MCAP_0284 MCAP_0285     FALSE 0.336 98.000 0.000 NA   NA
 1113802 1113803 MCAP_0285 MCAP_0286     TRUE 0.487 52.000 0.000 NA   NA
 1113803 1113804 MCAP_0286 MCAP_0287     TRUE 0.361 78.000 0.000 NA   NA
 1113804 1113805 MCAP_0287 MCAP_0288     TRUE 0.549 47.000 0.000 NA   NA
 1113805 1113806 MCAP_0288 MCAP_0289     FALSE 0.138 258.000 0.000 NA   NA
 1113806 1113807 MCAP_0289 MCAP_0290     TRUE 0.390 64.000 0.000 NA   NA
 1113807 1113808 MCAP_0290 MCAP_0291     FALSE 0.358 75.000 0.000 NA   NA
 1113808 1113809 MCAP_0291 MCAP_0292     TRUE 0.771 56.000 1.000 NA   NA
 1113809 1113810 MCAP_0292 MCAP_0293     TRUE 0.451 57.000 0.000 NA   NA
 1113810 1113811 MCAP_0293 MCAP_0294     TRUE 0.525 49.000 0.000 NA   NA
 1113811 1113812 MCAP_0294 MCAP_0295     TRUE 0.500 51.000 0.000 NA   NA
 1113812 1113813 MCAP_0295 MCAP_0296     TRUE 0.363 79.000 0.000 NA   NA
 1113813 1113814 MCAP_0296 MCAP_0297     TRUE 0.975 1.000 0.000 NA Y NA
 1113814 1113815 MCAP_0297 MCAP_0298     TRUE 0.840 4.000 0.000 NA   NA
 1113815 1113816 MCAP_0298 MCAP_0299     FALSE 0.109 580.000 0.000 NA   NA
 1113817 1113818 MCAP_0300 MCAP_0301     FALSE 0.139 249.000 0.000 NA   NA
 1113818 1113819 MCAP_0301 MCAP_0302     TRUE 0.417 60.000 0.000 NA   NA
 1113819 1113820 MCAP_0302 MCAP_0303     FALSE 0.104 804.000 0.000 NA   NA
 1113820 1113821 MCAP_0303 MCAP_0304     TRUE 0.835 0.000 0.000 NA   NA
 1113821 1113822 MCAP_0304 MCAP_0305     FALSE 0.139 257.000 0.000 NA   NA
 1113822 1113823 MCAP_0305 MCAP_0306     FALSE 0.229 131.000 0.000 NA   NA
 1113823 1113824 MCAP_0306 MCAP_0307     FALSE 0.111 476.000 0.000 NA   NA
 1113824 1113825 MCAP_0307 MCAP_0308     TRUE 0.384 65.000 0.000 NA   NA
 1113825 1113826 MCAP_0308 MCAP_0309     TRUE 0.404 62.000 0.000 NA   NA
 1113826 1113827 MCAP_0309 MCAP_0310     TRUE 0.464 55.000 0.000 NA   NA
 1113827 1113828 MCAP_0310 MCAP_0311     TRUE 0.397 63.000 0.000 NA   NA
 1113828 1113829 MCAP_0311 MCAP_0312     TRUE 0.397 63.000 0.000 NA   NA
 1113829 1113830 MCAP_0312 MCAP_0313   hupB TRUE 0.451 57.000 0.000 NA   NA
 1113830 1113831 MCAP_0313 MCAP_0314 hupB   TRUE 0.361 69.000 0.000 NA   NA
 1113832 1113833 MCAP_0315 MCAP_0316     FALSE 0.109 569.000 0.000 NA   NA
 1113833 1113834 MCAP_0316 MCAP_0317     FALSE 0.243 127.000 0.000 NA   NA
 1113834 1113835 MCAP_0317 MCAP_0318   proS TRUE 0.907 -19.000 0.007 NA   NA
 1113835 1113836 MCAP_0318 MCAP_0319 proS   TRUE 0.938 13.000 0.007 1.000   NA
 1113836 1113837 MCAP_0319 MCAP_0320     TRUE 0.842 2.000 0.000 NA   NA
 1113837 1113838 MCAP_0320 MCAP_0321   lepA TRUE 0.877 14.000 0.000 NA   NA
 1113838 1113839 MCAP_0321 MCAP_0322 lepA   TRUE 0.829 34.000 0.003 NA   NA
 1113840 1113841 MCAP_0323 MCAP_0324 aspS hisS TRUE 0.988 9.000 0.161 0.069 Y NA
 1113842 1113843 MCAP_0325 MCAP_0326 rbfA   TRUE 0.942 50.000 0.111 1.000 Y NA
 1113843 1922621 MCAP_0326 MCAP_0327     TRUE 0.909 -13.000 0.026 1.000   NA
 1113845 1113846 MCAP_0328 MCAP_0329     TRUE 0.957 12.000 1.000 0.005   NA
 1113847 1113848 MCAP_0330 MCAP_0331 rpsO   TRUE 0.417 60.000 0.000 NA   NA
 1113848 1113849 MCAP_0331 MCAP_0332     FALSE 0.350 91.000 0.000 NA   NA
 1113850 1113851 MCAP_0333 MCAP_0334 infB   TRUE 0.944 20.000 0.223 NA   NA
 1113851 1113852 MCAP_0334 MCAP_0335     TRUE 0.932 -13.000 0.408 NA   NA
 1113852 1113853 MCAP_0335 MCAP_0336     TRUE 0.987 -25.000 0.323 NA Y NA
 1113853 1113854 MCAP_0336 MCAP_0337     TRUE 0.952 9.000 0.759 NA   NA
 1113854 1113855 MCAP_0337 MCAP_0338     TRUE 0.464 113.000 0.002 NA   NA
 1113855 1113856 MCAP_0338 MCAP_0339   polC TRUE 0.814 40.000 0.010 1.000 N NA
 1113856 1113857 MCAP_0339 MCAP_0340 polC cdsA TRUE 0.937 9.000 0.011 1.000 N NA
 1113857 1113858 MCAP_0340 MCAP_0341 cdsA   FALSE 0.318 198.000 0.003 1.000 N NA
 1113861 1113862 MCAP_0344 MCAP_0345     FALSE 0.108 620.000 0.000 NA   NA
 1113862 1113863 MCAP_0345 MCAP_0346     TRUE 0.957 21.000 1.000 NA   NA
 1113863 1113864 MCAP_0346 MCAP_0347     FALSE 0.156 210.000 0.000 NA   NA
 1113864 1113865 MCAP_0347 MCAP_0348     TRUE 0.963 18.000 1.000 NA   NA
 1113865 1113866 MCAP_0348 MCAP_0349     TRUE 0.459 185.000 1.000 NA   NA
 1113866 1113867 MCAP_0349 MCAP_0350     TRUE 0.959 20.000 1.000 NA   NA
 1113867 1113868 MCAP_0350 MCAP_0351     FALSE 0.137 260.000 0.000 NA   NA
 1113868 1113869 MCAP_0351 MCAP_0352     TRUE 0.944 24.000 1.000 NA   NA
 1113869 1113870 MCAP_0352 MCAP_0353     TRUE 0.866 35.000 0.250 NA   NA
 1113870 1113871 MCAP_0353 MCAP_0354     TRUE 0.928 -25.000 0.500 NA   NA
 1113871 1113872 MCAP_0354 MCAP_0355     TRUE 0.944 2.000 0.500 NA   NA
 1113872 1113873 MCAP_0355 MCAP_0356     TRUE 0.953 0.000 1.000 NA   NA
 1113873 1113874 MCAP_0356 MCAP_0357     TRUE 0.942 2.000 0.375 NA   NA
 1113874 1113875 MCAP_0357 MCAP_0358   atpA2 TRUE 0.942 5.000 0.429 NA   NA
 1113875 1113876 MCAP_0358 MCAP_0359 atpA2 atpD2 TRUE 0.989 0.000 1.000 0.015 Y NA
 1113877 1113878 MCAP_0360 MCAP_0361     FALSE 0.135 263.000 0.000 NA   NA
 1113878 1113879 MCAP_0361 MCAP_0362     FALSE 0.201 154.000 0.000 NA   NA
 1113880 1113881 MCAP_0363 MCAP_0364     TRUE 0.950 14.000 0.007 1.000 N NA
 1113881 1113882 MCAP_0364 MCAP_0365     TRUE 0.910 0.000 0.005 1.000   NA
 1113882 1113883 MCAP_0365 MCAP_0366     FALSE 0.358 165.000 0.051 1.000   NA
 1113883 1113884 MCAP_0366 MCAP_0367   hrcA TRUE 0.930 5.000 0.004 1.000 N NA
 1113884 1113885 MCAP_0367 MCAP_0368 hrcA grpE TRUE 0.921 -16.000 0.015 1.000 N NA
 1113885 1113886 MCAP_0368 MCAP_0369 grpE dnaK TRUE 0.890 60.000 0.005 0.011 Y NA
 1113886 1113887 MCAP_0369 MCAP_0370 dnaK dnaJ TRUE 0.895 65.000 0.196 0.008 Y NA
 1113887 1113888 MCAP_0370 MCAP_0371 dnaJ rpsB FALSE 0.183 204.000 0.000 1.000 N NA
 1113888 1113889 MCAP_0371 MCAP_0372 rpsB tsf TRUE 0.993 12.000 0.748 1.000 Y NA
 1113889 1113890 MCAP_0372 MCAP_0373 tsf   TRUE 0.919 3.000 0.003 NA   NA
 1113890 1113891 MCAP_0373 MCAP_0374   pyrH TRUE 0.365 132.000 0.002 NA   NA
 1113891 1113892 MCAP_0374 MCAP_0375 pyrH frr TRUE 0.960 11.000 0.626 1.000 N NA
 1113892 1113893 MCAP_0375 MCAP_0376 frr argS TRUE 0.985 2.000 0.003 1.000 Y NA
 1113893 1113894 MCAP_0376 MCAP_0378 argS rrs-1 FALSE 0.156 210.000 0.000 NA   NA
 1113894 1113895 MCAP_0378 MCAP_0379 rrs-1 rrl-1 FALSE 0.145 230.000 0.000 NA   NA
 1113895 1113896 MCAP_0379 MCAP_0380 rrl-1 rrf-1 FALSE 0.359 76.000 0.000 NA   NA
 1113896 1113897 MCAP_0380 MCAP_0381 rrf-1   FALSE 0.248 126.000 0.000 NA   NA
 1113897 1113898 MCAP_0381 MCAP_0382     TRUE 0.966 12.000 1.000 NA   NA
 1113898 1113899 MCAP_0382 MCAP_0383   pheS TRUE 0.840 31.000 0.003 NA   NA
 1113899 1113900 MCAP_0383 MCAP_0384 pheS pheT TRUE 0.988 9.000 0.574 0.003 Y NA
 1113900 1113901 MCAP_0384 MCAP_0385 pheT   TRUE 0.916 0.000 0.003 NA   NA
 1113901 1113902 MCAP_0385 MCAP_0386   rpmF TRUE 0.958 15.000 0.599 NA   NA
 1113902 1113903 MCAP_0386 MCAP_0387 rpmF   TRUE 0.511 105.000 0.004 NA   NA
 1113903 1113904 MCAP_0387 MCAP_0388   mraW TRUE 0.948 9.000 0.635 NA   NA
 1113904 1113905 MCAP_0388 MCAP_0389 mraW   TRUE 0.916 9.000 0.002 NA   NA
 1113905 1113906 MCAP_0389 MCAP_0390   ftsZ TRUE 0.446 115.000 0.002 NA   NA
 1113906 1113907 MCAP_0390 MCAP_0391 ftsZ   TRUE 0.941 13.000 0.003 NA   NA
 1113907 1113908 MCAP_0391 MCAP_0392     TRUE 0.905 33.000 1.000 NA   NA
 1113908 1113909 MCAP_0392 MCAP_0393   ileS FALSE 0.108 583.000 0.000 NA   NA
 1113909 1113910 MCAP_0393 MCAP_0394 ileS lspA TRUE 0.939 9.000 0.019 1.000 N NA
 1113910 1113911 MCAP_0394 MCAP_0395 lspA   TRUE 0.921 -19.000 0.018 1.000 N NA
 1113911 1113912 MCAP_0395 MCAP_0396     TRUE 0.900 -16.000 0.003 NA   NA
 1113912 1113913 MCAP_0396 MCAP_0397     TRUE 0.876 27.000 0.007 NA   NA
 1113913 1113914 MCAP_0397 MCAP_0398     TRUE 0.786 40.000 0.004 NA   NA
 1113914 1113915 MCAP_0398 MCAP_0399     TRUE 0.364 81.000 0.000 NA   NA
 1113915 1113916 MCAP_0399 MCAP_0400     TRUE 0.854 20.000 0.000 NA   NA
 1113916 1113917 MCAP_0400 MCAP_0401     TRUE 0.586 42.000 0.000 NA   NA
 1113917 1113918 MCAP_0401 MCAP_0402     FALSE 0.216 135.000 0.000 NA   NA
 1113918 1113919 MCAP_0402 MCAP_0403     TRUE 0.722 51.000 0.043 NA   NA
 1113919 1113920 MCAP_0403 MCAP_0404     FALSE 0.243 127.000 0.000 NA   NA
 1113920 1113921 MCAP_0404 MCAP_0405     TRUE 0.843 7.000 0.000 NA   NA
 1113921 1113922 MCAP_0405 MCAP_0406     TRUE 0.845 8.000 0.000 NA   NA
 1113922 1113923 MCAP_0406 MCAP_0407     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1113923 1113924 MCAP_0407 MCAP_0408     TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 1113926 1113927 MCAP_0410 MCAP_0411     TRUE 0.909 22.000 0.002 NA   NA
 1113927 1113928 MCAP_0411 MCAP_0412   rplU FALSE 0.361 145.000 0.003 NA   NA
 1113928 1113929 MCAP_0412 MCAP_0413 rplU   TRUE 0.989 3.000 0.208 NA Y NA
 1113929 1113930 MCAP_0413 MCAP_0414   rpmA TRUE 0.989 2.000 0.203 NA Y NA
 1113930 1113931 MCAP_0414 MCAP_0415 rpmA nanA FALSE 0.304 194.000 0.002 1.000 N NA
 1113931 1113932 MCAP_0415 MCAP_0416 nanA   TRUE 0.988 4.000 0.130 1.000 Y NA
 1113932 1113933 MCAP_0416 MCAP_0417     TRUE 0.947 9.000 0.037 NA N NA
 1113933 1113934 MCAP_0417 MCAP_0418     TRUE 0.987 -7.000 0.100 NA Y NA
 1113934 1113935 MCAP_0418 MCAP_0419     TRUE 0.899 80.000 0.029 NA Y NA
 1113935 1113936 MCAP_0419 MCAP_0420     TRUE 0.414 154.000 0.023 1.000 N NA
 1113936 1113937 MCAP_0420 MCAP_0421     TRUE 0.588 81.000 0.023 NA   NA
 1113937 1113938 MCAP_0421 MCAP_0422   udk TRUE 0.896 25.000 0.005 NA   NA
 1113938 1113939 MCAP_0422 MCAP_0423 udk   FALSE 0.264 128.000 0.000 1.000 N NA
 1113940 1113941 MCAP_0424 MCAP_0425     TRUE 0.933 9.000 0.023 NA   NA
 1113943 1113944 MCAP_0427 MCAP_0428   ruvB FALSE 0.315 107.000 0.000 NA   NA
 1113944 1113945 MCAP_0428 MCAP_0429 ruvB ruvA TRUE 0.772 26.000 0.000 NA   NA
 1113945 1113946 MCAP_0429 MCAP_0430 ruvA rpsU TRUE 0.441 111.000 0.002 1.000   NA
 1113947 1113948 MCAP_0431 MCAP_0432     FALSE 0.141 237.000 0.000 NA   NA
 1113948 1113949 MCAP_0432 MCAP_0433     FALSE 0.140 239.000 0.000 NA   NA
 1113951 1113952 MCAP_0435 MCAP_0436     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1113954 1113955 MCAP_0438 MCAP_0439 nagA ldh TRUE 0.724 53.000 0.028 1.000 N NA
 1113956 1113957 MCAP_0440 MCAP_0441     FALSE 0.116 357.000 0.000 NA   NA
 1113957 1113958 MCAP_0441 MCAP_0442     TRUE 0.961 12.000 0.667 NA   NA
 1113959 1113960 MCAP_0443 MCAP_0444     FALSE 0.288 115.000 0.000 NA   NA
 1113961 1113962 MCAP_0445 MCAP_0446     TRUE 0.956 14.000 1.000 0.004   NA
 1113963 1113964 MCAP_0447 MCAP_0448     TRUE 0.939 7.000 0.214 NA   NA
 1113964 1113965 MCAP_0448 MCAP_0449     TRUE 0.919 -22.000 0.107 NA   NA
 1113965 1113966 MCAP_0449 MCAP_0450     TRUE 0.939 0.000 0.100 1.000 N NA
 1113967 1113968 MCAP_0451 MCAP_0452   gtsC TRUE 0.624 114.000 1.000 NA   NA
 1113968 1113969 MCAP_0452 MCAP_0453 gtsC gtsB TRUE 0.990 -22.000 1.000 NA Y NA
 1113969 1113970 MCAP_0453 MCAP_0454 gtsB gtsA TRUE 0.936 -7.000 0.018 NA N NA
 1113970 1113971 MCAP_0454 MCAP_0455 gtsA   TRUE 0.861 6.000 0.000 1.000 N NA
 1113971 1113972 MCAP_0455 MCAP_0456   parC TRUE 0.858 111.000 0.017 1.000 Y NA
 1113972 1113973 MCAP_0456 MCAP_0457 parC parE TRUE 0.988 2.000 0.552 0.006 Y NA
 1113974 1113975 MCAP_0458 MCAP_0459     TRUE 0.970 3.000 0.000 0.021 Y NA
 1113975 1113976 MCAP_0459 MCAP_0460     TRUE 0.972 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1113977 1113978 MCAP_0461 MCAP_0462     TRUE 0.380 167.000 0.007 1.000 N NA
 1113978 1113979 MCAP_0462 MCAP_0463     TRUE 0.941 17.000 0.007 NA   NA
 1113979 1113980 MCAP_0463 MCAP_0464     TRUE 0.839 41.000 0.667 NA   NA
 1113980 1113981 MCAP_0464 MCAP_0465   pgi TRUE 0.884 26.000 0.005 NA   NA
 1113981 1113982 MCAP_0465 MCAP_0466 pgi pepO FALSE 0.168 221.000 0.000 1.000 N NA
 1113982 1113983 MCAP_0466 MCAP_0467 pepO   TRUE 0.940 14.000 0.002 1.000 N NA
 1113983 1113984 MCAP_0467 MCAP_0468     TRUE 0.920 -7.000 0.003 1.000 N NA
 1113984 1113985 MCAP_0468 MCAP_0469     TRUE 0.939 4.000 0.053 1.000 N NA
 1113986 1113987 MCAP_0470 MCAP_0471     TRUE 0.953 22.000 1.000 NA   NA
 1113987 1113988 MCAP_0471 MCAP_0472     TRUE 0.928 3.000 0.017 NA   NA
 1113989 1113990 MCAP_0473 MCAP_0474   ung TRUE 0.559 69.000 0.024 1.000   NA
 1113990 1113991 MCAP_0474 MCAP_0475 ung pmi TRUE 0.937 -7.000 0.125 1.000 N NA
 1113991 1113992 MCAP_0475 MCAP_0476 pmi gid TRUE 0.482 121.000 0.005 1.000 N NA
 1113992 1113993 MCAP_0476 MCAP_0477 gid   TRUE 0.924 -7.000 0.005 1.000 N NA
 1113993 1113994 MCAP_0477 MCAP_0478   metK TRUE 0.925 -9.000 0.009 1.000 N NA
 1113994 1113995 MCAP_0478 MCAP_0479 metK   FALSE 0.271 211.000 0.005 1.000   NA
 1113995 1113996 MCAP_0479 MCAP_0480   p13 TRUE 0.904 -12.000 0.008 1.000   NA
 1113996 1113997 MCAP_0480 MCAP_0481 p13 ftsY TRUE 0.911 -16.000 0.081 1.000   NA
 1113997 1113998 MCAP_0481 MCAP_0482 ftsY   TRUE 0.597 69.000 0.003 NA N NA
 1113998 1113999 MCAP_0482 MCAP_0483   pstB TRUE 0.988 9.000 0.016 NA Y NA
 1113999 1114000 MCAP_0483 MCAP_0484 pstB   TRUE 0.983 -7.000 0.021 0.004 Y NA
 1114000 1114001 MCAP_0484 MCAP_0485     TRUE 0.989 4.000 0.208 NA Y NA
 1114001 1114002 MCAP_0485 MCAP_0486     TRUE 0.600 91.000 0.133 NA   NA
 1114002 1114003 MCAP_0486 MCAP_0487     TRUE 0.363 83.000 0.000 NA   NA
 1114003 1114004 MCAP_0487 MCAP_0488   rpmB TRUE 0.404 62.000 0.000 NA   NA
 1114005 1114006 MCAP_0489 MCAP_0490     TRUE 0.862 30.000 0.010 NA   NA
 1114006 1114007 MCAP_0490 MCAP_0491   plsX TRUE 0.845 32.000 0.021 1.000   NA
 1114007 1114008 MCAP_0491 MCAP_0492 plsX   TRUE 0.927 -10.000 0.020 1.000 N NA
 1114008 1114009 MCAP_0492 MCAP_0493     FALSE 0.178 184.000 0.000 NA   NA
 1114009 1114010 MCAP_0493 MCAP_0494     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 1114010 1114011 MCAP_0494 MCAP_0495     FALSE 0.118 327.000 0.000 NA   NA
 1114012 1114013 MCAP_0496 MCAP_0497   apt TRUE 0.655 60.000 0.010 1.000 N NA
 1114013 1114014 MCAP_0497 MCAP_0498 apt   TRUE 0.947 12.000 0.004 1.000 N NA
 1114014 1114015 MCAP_0498 MCAP_0499     TRUE 0.621 102.000 0.667 NA   NA
 1114015 1114016 MCAP_0499 MCAP_0500     TRUE 0.812 39.000 0.018 NA   NA
 1114016 1114017 MCAP_0500 MCAP_0501     TRUE 0.934 9.000 0.032 NA   NA
 1114017 1114018 MCAP_0501 MCAP_0502     TRUE 0.929 -13.000 0.283 NA   NA
 1114018 1114019 MCAP_0502 MCAP_0503   rpoD TRUE 0.926 3.000 0.053 1.000   NA
 1114019 1114020 MCAP_0503 MCAP_0504 rpoD dnaG TRUE 0.945 3.000 0.205 1.000 N NA
 1114020 1114021 MCAP_0504 MCAP_0505 dnaG glyS TRUE 0.844 37.000 0.019 1.000 N NA
 1114021 1114022 MCAP_0505 MCAP_0506 glyS   TRUE 0.648 64.000 0.034 1.000 N NA
 1114022 1114023 MCAP_0506 MCAP_0507   era TRUE 0.925 0.000 0.108 1.000   NA
 1114023 1114024 MCAP_0507 MCAP_0508 era   TRUE 0.931 3.000 0.026 NA   NA
 1114024 1114025 MCAP_0508 MCAP_0509     TRUE 0.926 6.000 0.008 NA   NA
 1114025 1114026 MCAP_0509 MCAP_0510     TRUE 0.927 -7.000 0.077 NA   NA
 1114026 1114027 MCAP_0510 MCAP_0511     TRUE 0.777 48.000 0.333 NA   NA
 1114028 1114029 MCAP_0512 MCAP_0513     TRUE 0.639 39.000 0.000 NA   NA
 1114029 1114030 MCAP_0513 MCAP_0514     TRUE 0.756 58.000 1.000 NA   NA
 1114031 1114032 MCAP_0515 MCAP_0516   lon TRUE 0.532 113.000 0.097 0.028 N NA
 1114032 1114033 MCAP_0516 MCAP_0517 lon tig TRUE 0.836 119.000 0.014 1.000 Y NA
 1114033 1114034 MCAP_0517 MCAP_0518 tig   TRUE 0.936 17.000 0.003 NA   NA
 1114034 1114035 MCAP_0518 MCAP_0519   efp TRUE 0.933 18.000 0.003 NA   NA
 1114035 1114036 MCAP_0519 MCAP_0520 efp fmt TRUE 0.857 90.000 0.002 1.000 Y NA
 1114036 1114037 MCAP_0520 MCAP_0521 fmt   TRUE 0.896 -10.000 0.002 NA   NA
 1114037 1114038 MCAP_0521 MCAP_0522     TRUE 0.656 77.000 0.667 NA   NA
 1114038 1114039 MCAP_0522 MCAP_0523   trmU TRUE 0.761 42.000 0.005 NA   NA
 1114039 1114040 MCAP_0523 MCAP_0524 trmU   TRUE 0.524 96.000 0.003 NA   NA
 1114040 1114041 MCAP_0524 MCAP_0525     FALSE 0.106 652.000 0.000 NA   NA
 1114041 1114042 MCAP_0525 MCAP_0526     TRUE 0.836 22.000 0.000 NA   NA
 1114042 1114043 MCAP_0526 MCAP_0527     FALSE 0.153 214.000 0.000 NA   NA
 1114043 1114044 MCAP_0527 MCAP_0528     TRUE 0.980 25.000 0.006 1.000 Y NA
 1114044 1114045 MCAP_0528 MCAP_0529     TRUE 0.924 23.000 0.010 1.000 N NA
 1114045 1114046 MCAP_0529 MCAP_0530     TRUE 0.931 18.000 0.002 NA   NA
 1114046 1114047 MCAP_0530 MCAP_0531     TRUE 0.939 18.000 0.007 NA   NA
 1114047 1114048 MCAP_0531 MCAP_0532     TRUE 0.895 -22.000 0.007 1.000   NA
 1114048 1114049 MCAP_0532 MCAP_0533     TRUE 0.577 71.000 0.019 NA   NA
 1114049 1114050 MCAP_0533 MCAP_0534     TRUE 0.932 -10.000 0.300 NA   NA
 1114050 1114051 MCAP_0534 MCAP_0535     TRUE 0.451 57.000 0.000 NA   NA
 1114051 1114052 MCAP_0535 MCAP_0536     TRUE 0.464 55.000 0.000 NA   NA
 1114052 1114053 MCAP_0536 MCAP_0537     TRUE 0.847 40.000 0.667 NA   NA
 1114053 1114054 MCAP_0537 MCAP_0538     TRUE 0.992 18.000 1.000 0.003 Y NA
 1114054 1114055 MCAP_0538 MCAP_0539     FALSE 0.133 216.000 0.000 1.000   NA
 1114056 1114057 MCAP_0540 MCAP_0541     TRUE 0.955 3.000 1.000 NA   NA
 1114058 1114059 MCAP_0542 MCAP_0543     TRUE 0.924 -6.000 0.148 1.000   NA
 1114059 1114060 MCAP_0543 MCAP_0544   rplS TRUE 0.542 93.000 0.027 1.000   NA
 1114060 1114061 MCAP_0544 MCAP_0545 rplS trmD TRUE 0.989 2.000 0.567 1.000 Y NA
 1114061 1114062 MCAP_0545 MCAP_0546 trmD   TRUE 0.990 2.000 0.672 1.000 Y NA
 1114062 1114063 MCAP_0546 MCAP_0547   rpsP TRUE 0.990 18.000 0.342 0.057 Y NA
 1114063 1114064 MCAP_0547 MCAP_0548 rpsP   TRUE 0.513 89.000 0.002 NA   NA
 1114064 1114065 MCAP_0548 MCAP_0549   ffh TRUE 0.916 6.000 0.003 NA   NA
 1114065 1114066 MCAP_0549 MCAP_0550 ffh   TRUE 0.846 30.000 0.002 1.000 N NA
 1114066 1114067 MCAP_0550 MCAP_0551   recA TRUE 0.414 152.000 0.018 1.000 N NA
 1114067 1114068 MCAP_0551 MCAP_0552 recA   TRUE 0.586 92.000 0.083 NA   NA
 1114068 1114069 MCAP_0552 MCAP_0553   rnpB TRUE 0.799 -40.000 0.000 NA   NA
 1114070 1114071 MCAP_0554 MCAP_0555     FALSE 0.120 316.000 0.000 NA   NA
 1114071 1114072 MCAP_0555 MCAP_0556     TRUE 0.791 25.000 0.000 NA   NA
 1114072 1114073 MCAP_0556 MCAP_0557     FALSE 0.303 112.000 0.000 NA   NA
 1114073 1114074 MCAP_0557 MCAP_0558     FALSE 0.112 440.000 0.000 NA   NA
 1114074 1114075 MCAP_0558 MCAP_0559     FALSE 0.115 374.000 0.000 NA   NA
 1114075 1114076 MCAP_0559 MCAP_0560     TRUE 0.712 32.000 0.000 NA   NA
 1114076 1114077 MCAP_0560 MCAP_0561     FALSE 0.219 133.000 0.000 NA   NA
 1114077 1114078 MCAP_0561 MCAP_0562     TRUE 0.961 12.000 0.667 NA   NA
 1114078 1114079 MCAP_0562 MCAP_0563     FALSE 0.319 105.000 0.000 NA   NA
 1114079 1114080 MCAP_0563 MCAP_0564     TRUE 0.840 4.000 0.000 NA   NA
 1114080 1114081 MCAP_0564 MCAP_0565     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 1114081 1114082 MCAP_0565 MCAP_0566     TRUE 0.961 19.000 1.000 NA   NA
 1114082 1114083 MCAP_0566 MCAP_0567     TRUE 0.826 -7.000 0.000 NA   NA
 1114083 1114084 MCAP_0567 MCAP_0568     TRUE 0.487 52.000 0.000 NA   NA
 1114084 1114085 MCAP_0568 MCAP_0569     FALSE 0.178 184.000 0.000 NA   NA
 1114085 1114086 MCAP_0569 MCAP_0570     FALSE 0.152 215.000 0.000 NA   NA
 1114086 1114087 MCAP_0570 MCAP_0571     TRUE 0.587 110.000 0.500 NA   NA
 1114090 1114091 MCAP_0574 MCAP_0575   hupA TRUE 0.756 58.000 1.000 NA   NA
 1114091 1114092 MCAP_0575 MCAP_0576 hupA gpsA TRUE 0.868 32.000 0.011 1.000 N NA
 1114092 1114093 MCAP_0576 MCAP_0577 gpsA engA TRUE 0.926 2.000 0.068 1.000   NA
 1114093 1114094 MCAP_0577 MCAP_0578 engA cmk TRUE 0.922 0.000 0.060 1.000   NA
 1114094 1114095 MCAP_0578 MCAP_0579 cmk   TRUE 0.919 9.000 0.002 NA   NA
 1114095 1114096 MCAP_0579 MCAP_0580     TRUE 0.692 69.000 1.000 NA   NA
 1114098 1114099 MCAP_0582 MCAP_0583     TRUE 0.438 58.000 0.000 NA   NA
 1114099 1114100 MCAP_0583 MCAP_0584     TRUE 0.563 45.000 0.000 NA   NA
 1114100 1114101 MCAP_0584 MCAP_0585     FALSE 0.126 292.000 0.000 NA   NA
 1114101 1114102 MCAP_0585 MCAP_0586     TRUE 0.689 35.000 0.000 NA   NA
 1114102 1114103 MCAP_0586 MCAP_0587     TRUE 0.829 47.000 1.000 NA   NA
 1114103 1114104 MCAP_0587 MCAP_0588     FALSE 0.126 291.000 0.000 NA   NA
 1114104 1114105 MCAP_0588 MCAP_0589     FALSE 0.165 199.000 0.000 NA   NA
 1114105 1114106 MCAP_0589 MCAP_0590     TRUE 0.930 0.000 0.250 1.000   NA
 1114106 1114107 MCAP_0590 MCAP_0591     TRUE 0.943 12.000 0.250 0.020   NA
 1114107 1114108 MCAP_0591 MCAP_0592     FALSE 0.127 289.000 0.000 NA   NA
 1114108 1114109 MCAP_0592 MCAP_0593     FALSE 0.316 106.000 0.000 NA   NA
 1114109 1114110 MCAP_0593 MCAP_0594     FALSE 0.114 398.000 0.000 NA   NA
 1114110 1114111 MCAP_0594 MCAP_0595     FALSE 0.101 1066.000 0.000 NA   NA
 1114111 1114112 MCAP_0595 MCAP_0596     FALSE 0.101 1453.000 0.000 NA   NA
 1114112 1114113 MCAP_0596 MCAP_0597     FALSE 0.134 267.000 0.000 NA   NA
 1114113 1114114 MCAP_0597 MCAP_0598     TRUE 0.559 100.000 0.039 NA   NA
 1114114 1114115 MCAP_0598 MCAP_0599     TRUE 0.949 12.000 0.039 NA   NA
 1114115 1114116 MCAP_0599 MCAP_0600     TRUE 0.945 11.000 0.008 1.000 N NA
 1114116 1114117 MCAP_0600 MCAP_0601   scpB TRUE 0.668 74.000 0.224 NA N NA
 1114117 1114118 MCAP_0601 MCAP_0602 scpB scpA TRUE 0.933 -16.000 0.570 NA   NA
 1114118 1114119 MCAP_0602 MCAP_0603 scpA   TRUE 0.931 10.000 0.004 NA   NA
 1114119 1114120 MCAP_0603 MCAP_0604     TRUE 0.952 12.000 0.105 NA   NA
 1114120 1114121 MCAP_0604 MCAP_0605     FALSE 0.123 309.000 0.000 NA   NA
 1114121 1114122 MCAP_0605 MCAP_0606     TRUE 0.468 150.000 0.667 NA   NA
 1114122 1114123 MCAP_0606 MCAP_0607     TRUE 0.961 12.000 0.667 NA   NA
 1114123 1114124 MCAP_0607 MCAP_0608     FALSE 0.330 100.000 0.000 NA   NA
 1114124 1114125 MCAP_0608 MCAP_0609     TRUE 0.390 64.000 0.000 NA   NA
 1114125 1114126 MCAP_0609 MCAP_0610   tkt TRUE 0.947 16.000 0.034 NA   NA
 1114126 1114127 MCAP_0610 MCAP_0611 tkt   TRUE 0.809 41.000 0.118 NA   NA
 1114127 1114128 MCAP_0611 MCAP_0612     TRUE 0.522 135.000 1.000 NA   NA
 1114128 1114129 MCAP_0612 MCAP_0613     TRUE 0.531 99.000 0.005 NA   NA
 1114131 1114132 MCAP_0615 MCAP_0616     FALSE 0.171 193.000 0.000 NA   NA
 1114133 1114134 MCAP_0617 MCAP_0618     TRUE 0.987 9.000 0.016 1.000 Y NA
 1114134 1114135 MCAP_0618 MCAP_0619     TRUE 0.990 13.000 0.015 1.000 Y NA
 1114136 1114137 MCAP_0620 MCAP_0621     FALSE 0.110 555.000 0.000 NA   NA
 1114138 1114139 MCAP_0622 MCAP_0623     FALSE 0.103 335.000 0.000 1.000   NA
 1114139 1114140 MCAP_0623 MCAP_0624     TRUE 0.577 78.000 0.015 NA   NA
 1114140 1114141 MCAP_0624 MCAP_0625     FALSE 0.102 1043.000 0.000 NA   NA
 1114141 1114142 MCAP_0625 MCAP_0626     FALSE 0.134 266.000 0.000 NA   NA
 1114142 1114143 MCAP_0626 MCAP_0627     FALSE 0.119 321.000 0.000 NA   NA
 1114143 1114144 MCAP_0627 MCAP_0628     TRUE 0.953 13.000 0.121 NA   NA
 1114144 1114145 MCAP_0628 MCAP_0629     FALSE 0.181 182.000 0.000 NA   NA
 1114145 1114146 MCAP_0629 MCAP_0630     FALSE 0.103 827.000 0.000 NA   NA
 1114147 1114148 MCAP_0631 MCAP_0632 pgk gap TRUE 0.763 128.000 0.003 0.010 Y NA
 1114148 1114149 MCAP_0632 MCAP_0633 gap   TRUE 0.596 93.000 0.024 1.000 N NA
 1114149 1114150 MCAP_0633 MCAP_0634     TRUE 0.992 10.000 0.817 NA Y NA
 1114150 1114151 MCAP_0634 MCAP_0635   mutM TRUE 0.785 158.000 0.012 NA Y NA
 1114151 1114152 MCAP_0635 MCAP_0636 mutM polA TRUE 0.990 11.000 0.101 1.000 Y NA
 1114152 1114153 MCAP_0636 MCAP_0637 polA dnaE TRUE 0.985 9.000 0.006 0.011 Y NA
 1114155 1114156 MCAP_0639 MCAP_0640 tyrS   TRUE 0.934 8.000 0.006 1.000 N NA
 1114156 1114157 MCAP_0640 MCAP_0641     TRUE 0.902 -22.000 0.020 1.000   NA
 1114158 1114159 MCAP_0642 MCAP_0643     TRUE 0.963 11.000 1.000 NA   NA
 1114160 1114161 MCAP_0644 MCAP_0645     TRUE 0.652 38.000 0.000 NA   NA
 1114161 1114162 MCAP_0645 MCAP_0646     FALSE 0.358 74.000 0.000 NA   NA
 1114162 1114163 MCAP_0646 MCAP_0647     TRUE 0.944 2.000 0.750 1.000   NA
 1114163 1114164 MCAP_0647 MCAP_0648     TRUE 0.946 21.000 0.500 NA   NA
 1114164 1114165 MCAP_0648 MCAP_0649     TRUE 0.946 -13.000 1.000 NA   NA
 1114165 1114166 MCAP_0649 MCAP_0650     FALSE 0.326 102.000 0.000 NA   NA
 1114166 1114167 MCAP_0650 MCAP_0651   arcC FALSE 0.243 127.000 0.000 NA   NA
 1114167 1114168 MCAP_0651 MCAP_0652 arcC   TRUE 0.852 119.000 0.125 1.000 Y NA
 1114168 1114169 MCAP_0652 MCAP_0653     TRUE 0.987 7.000 0.059 1.000 Y NA
 1114169 1114170 MCAP_0653 MCAP_0654   argF TRUE 0.986 22.000 0.028 1.000 Y NA
 1114171 1114172 MCAP_0655 MCAP_0656     TRUE 0.942 2.000 0.400 NA   NA
 1114173 1114174 MCAP_0657 MCAP_0658     TRUE 0.658 84.000 0.667 NA   NA
 1114174 1114175 MCAP_0658 MCAP_0659   leuS TRUE 0.555 67.000 0.003 NA   NA
 1114175 1114176 MCAP_0659 MCAP_0660 leuS   FALSE 0.218 134.000 0.000 NA   NA
 1114176 1114177 MCAP_0660 MCAP_0661     TRUE 0.438 58.000 0.000 NA   NA
 1114177 1114178 MCAP_0661 MCAP_0662   rpsI FALSE 0.197 162.000 0.000 NA   NA
 1114178 1114179 MCAP_0662 MCAP_0663 rpsI rplM TRUE 0.988 0.000 0.601 0.052 Y NA
 1114179 1114180 MCAP_0663 MCAP_0664 rplM   TRUE 0.380 120.000 0.002 1.000   NA
 1114180 1114181 MCAP_0664 MCAP_0665     TRUE 0.412 125.000 0.009 1.000   NA
 1114181 1114182 MCAP_0665 MCAP_0666     TRUE 0.941 2.000 0.076 1.000 N NA
 1114182 1114183 MCAP_0666 MCAP_0667     TRUE 0.991 13.000 0.095 1.000 Y NA
 1114183 1114184 MCAP_0667 MCAP_0668     TRUE 0.973 27.000 0.007 0.021 Y NA
 1114184 1114185 MCAP_0668 MCAP_0669   rplQ TRUE 0.511 111.000 0.003 1.000 N NA
 1114185 1114186 MCAP_0669 MCAP_0670 rplQ rpoA TRUE 0.961 20.000 0.873 1.000 N NA
 1114186 1114187 MCAP_0670 MCAP_0671 rpoA rpsK TRUE 0.947 4.000 0.308 1.000 N NA
 1114187 1114188 MCAP_0671 MCAP_0672 rpsK rpsM TRUE 0.983 26.000 0.810 0.052 Y NA
 1114188 1114189 MCAP_0672 MCAP_0673 rpsM rpmJ TRUE 0.810 38.000 0.194 0.052   NA
 1114189 1114190 MCAP_0673 MCAP_0674 rpmJ infA TRUE 0.597 70.000 0.257 1.000   NA
 1114190 1114191 MCAP_0674 MCAP_0675 infA map TRUE 0.991 12.000 0.051 1.000 Y NA
 1114191 1114192 MCAP_0675 MCAP_0676 map adk TRUE 0.936 0.000 0.041 1.000 N NA
 1114192 1114193 MCAP_0676 MCAP_0677 adk secY TRUE 0.435 129.000 0.005 1.000 N NA
 1114193 1114194 MCAP_0677 MCAP_0678 secY rplO TRUE 0.922 0.000 0.003 1.000 N NA
 1114194 1114195 MCAP_0678 MCAP_0679 rplO rpsE TRUE 0.988 20.000 0.148 0.069 Y NA
 1114195 1114196 MCAP_0679 MCAP_0680 rpsE rplR TRUE 0.991 19.000 0.814 0.069 Y NA
 1114196 1114197 MCAP_0680 MCAP_0681 rplR rplF TRUE 0.983 26.000 0.815 0.052 Y NA
 1114197 1114198 MCAP_0681 MCAP_0682 rplF rpsH TRUE 0.992 14.000 0.808 0.052 Y NA
 1114198 1114199 MCAP_0682 MCAP_0683 rpsH rpsN TRUE 0.987 22.000 0.473 0.052 Y NA
 1114199 1114200 MCAP_0683 MCAP_0684 rpsN rplE TRUE 0.990 19.000 0.496 0.052 Y NA
 1114200 1114201 MCAP_0684 MCAP_0685 rplE rplX TRUE 0.991 19.000 0.758 0.052 Y NA
 1114201 1114202 MCAP_0685 MCAP_0686 rplX rplN TRUE 0.992 14.000 0.810 0.069 Y NA
 1114202 1114203 MCAP_0686 MCAP_0687 rplN rpsQ TRUE 0.992 16.000 0.791 0.069 Y NA
 1114203 1114204 MCAP_0687 MCAP_0688 rpsQ   TRUE 0.989 0.000 0.828 0.052 Y NA
 1114204 1114205 MCAP_0688 MCAP_0689   rplP TRUE 0.989 0.000 0.802 0.052 Y NA
 1114205 1114206 MCAP_0689 MCAP_0690 rplP rpsC TRUE 0.990 3.000 0.828 0.069 Y NA
 1114206 1114207 MCAP_0690 MCAP_0691 rpsC rplV TRUE 0.991 18.000 0.719 0.069 Y NA
 1114207 1114208 MCAP_0691 MCAP_0692 rplV rpsS TRUE 0.987 24.000 0.769 0.069 Y NA
 1114208 1114209 MCAP_0692 MCAP_0693 rpsS rplB TRUE 0.989 22.000 0.820 0.069 Y NA
 1114209 1114210 MCAP_0693 MCAP_0694 rplB rplW TRUE 0.942 53.000 0.849 0.039 Y NA
 1114210 1114211 MCAP_0694 MCAP_0695 rplW rplD TRUE 0.987 0.000 0.307 0.052 Y NA
 1114211 1114212 MCAP_0695 MCAP_0696 rplD rplC TRUE 0.991 13.000 0.544 0.052 Y NA
 1114212 1114213 MCAP_0696 MCAP_0697 rplC rpsJ TRUE 0.897 75.000 0.467 0.069 Y NA
 1114213 1114214 MCAP_0697 MCAP_0698 rpsJ   FALSE 0.142 296.000 0.000 1.000 N NA
 1114216 1114217 MCAP_0700 MCAP_0701     TRUE 0.880 13.000 0.000 NA   NA
 1114217 1114218 MCAP_0701 MCAP_0702     TRUE 0.845 8.000 0.000 NA   NA
 1114218 1114219 MCAP_0702 MCAP_0703     TRUE 0.845 8.000 0.000 NA   NA
 1114219 1114220 MCAP_0703 MCAP_0704     FALSE 0.323 103.000 0.000 NA   NA
 1114220 1114221 MCAP_0704 MCAP_0705     TRUE 0.630 113.000 1.000 NA   NA
 1114221 1114222 MCAP_0705 MCAP_0706   folD TRUE 0.925 5.000 0.007 NA   NA
 1114222 1114223 MCAP_0706 MCAP_0707 folD   TRUE 0.937 9.000 0.011 1.000 N NA
 1114225 1114226 MCAP_0709 MCAP_0710 gatB gatA TRUE 0.987 2.000 0.492 0.004 Y NA
 1114226 1114227 MCAP_0710 MCAP_0711 gatA gatC TRUE 0.987 0.000 0.643 0.004 Y NA
 1114227 1114228 MCAP_0711 MCAP_0712 gatC ligA TRUE 0.938 2.000 0.024 1.000 N NA
 1114228 1114229 MCAP_0712 MCAP_0713 ligA   TRUE 0.913 4.000 0.002 NA   NA
 1114229 1114230 MCAP_0713 MCAP_0714     TRUE 0.925 3.000 0.007 NA   NA
 1114230 1114231 MCAP_0714 MCAP_0715     TRUE 0.917 3.000 0.007 1.000   NA
 1114231 1114232 MCAP_0715 MCAP_0716   ptsH TRUE 0.625 59.000 0.023 1.000   NA
 1114232 1114233 MCAP_0716 MCAP_0717 ptsH pcrA TRUE 0.616 66.000 0.007 1.000 N NA
 1114233 1114234 MCAP_0717 MCAP_0718 pcrA   TRUE 0.947 12.000 0.022 NA   NA
 1114234 1114235 MCAP_0718 MCAP_0719     TRUE 0.938 0.000 0.300 NA   NA
 1114235 1114236 MCAP_0719 MCAP_0720     TRUE 0.546 114.000 0.222 NA   NA
 1114236 1114237 MCAP_0720 MCAP_0721     FALSE 0.236 128.000 0.000 NA   NA
 1114237 1114238 MCAP_0721 MCAP_0722     TRUE 0.575 104.000 0.200 NA   NA
 1114238 1114239 MCAP_0722 MCAP_0723     TRUE 0.530 116.000 0.200 NA   NA
 1114239 1114240 MCAP_0723 MCAP_0724     TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 1114240 1114241 MCAP_0724 MCAP_0725     TRUE 0.606 117.000 1.000 NA   NA
 1114241 1114242 MCAP_0725 MCAP_0726     FALSE 0.128 288.000 0.000 NA   NA
 1114242 1114243 MCAP_0726 MCAP_0727     FALSE 0.172 190.000 0.000 NA   NA
 1114243 1114244 MCAP_0727 MCAP_0728     TRUE 0.878 12.000 0.000 NA   NA
 1114244 1114245 MCAP_0728 MCAP_0729     FALSE 0.333 99.000 0.000 NA   NA
 1114245 1114246 MCAP_0729 MCAP_0730     TRUE 0.985 -36.000 0.385 1.000 Y NA
 1114246 1114247 MCAP_0730 MCAP_0731     TRUE 0.936 1.000 0.467 1.000   NA
 1114247 1114248 MCAP_0731 MCAP_0732     FALSE 0.107 233.000 0.000 0.032   NA
 1114249 1114250 MCAP_0733 MCAP_0734     TRUE 0.954 10.000 0.105 NA N NA
 1114251 1114252 MCAP_0735 MCAP_0736     FALSE 0.162 204.000 0.000 NA   NA
 1114252 1114253 MCAP_0736 MCAP_0737     FALSE 0.158 208.000 0.000 NA   NA
 1114253 1114254 MCAP_0737 MCAP_0738     FALSE 0.147 223.000 0.000 NA   NA
 1114255 1114256 MCAP_0739 MCAP_0740     FALSE 0.167 197.000 0.000 NA   NA
 1114256 1114257 MCAP_0740 MCAP_0741     TRUE 0.535 48.000 0.000 NA   NA
 1114257 1114258 MCAP_0741 MCAP_0742     TRUE 0.868 11.000 0.000 NA   NA
 1114258 1114259 MCAP_0742 MCAP_0743     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 1114259 1114260 MCAP_0743 MCAP_0744     TRUE 0.880 13.000 0.000 NA   NA
 1114260 1114261 MCAP_0744 MCAP_0745     TRUE 0.586 42.000 0.000 NA   NA
 1114261 1114262 MCAP_0745 MCAP_0746     TRUE 0.820 23.000 0.000 NA   NA
 1114262 1114263 MCAP_0746 MCAP_0747     TRUE 0.841 3.000 0.000 NA   NA
 1114263 1114264 MCAP_0747 MCAP_0748     TRUE 0.843 7.000 0.000 NA   NA
 1114264 1114265 MCAP_0748 MCAP_0749   nagB1 FALSE 0.336 98.000 0.000 NA   NA
 1114265 1114266 MCAP_0749 MCAP_0750 nagB1 tpiA TRUE 0.860 105.000 0.007 1.000 Y NA
 1114266 1114267 MCAP_0750 MCAP_0751 tpiA   TRUE 0.898 -7.000 0.011 0.037   NA
 1114267 1114268 MCAP_0751 MCAP_0752   gpmI TRUE 0.914 3.000 0.004 1.000   NA
 1114268 1114269 MCAP_0752 MCAP_0753 gpmI   TRUE 0.520 97.000 0.003 NA   NA
 1114269 1114270 MCAP_0753 MCAP_0754     TRUE 0.937 2.000 0.143 NA   NA
 1114271 1114272 MCAP_0755 MCAP_0756 deoC   TRUE 0.951 12.000 0.013 1.000 N NA
 1114274 1114275 MCAP_0758 MCAP_0759   ssrA TRUE 0.361 78.000 0.000 NA   NA
 1114276 1114277 MCAP_0760 MCAP_0761 mgtE trmB TRUE 0.919 2.000 0.011 1.000   NA
 1114278 1114279 MCAP_0762 MCAP_0763     FALSE 0.201 154.000 0.000 NA   NA
 1114279 1114280 MCAP_0763 MCAP_0764     FALSE 0.118 335.000 0.000 NA   NA
 1114280 1114281 MCAP_0764 MCAP_0765   hpt2 FALSE 0.124 304.000 0.000 NA   NA
 1114281 1114282 MCAP_0765 MCAP_0766 hpt2 purB TRUE 0.980 23.000 0.002 1.000 Y NA
 1114282 1114283 MCAP_0766 MCAP_0767 purB purA TRUE 0.986 -7.000 0.038 1.000 Y NA
 1114283 1114284 MCAP_0767 MCAP_0768 purA   FALSE 0.163 285.000 0.000 NA N NA
 1114284 1114285 MCAP_0768 MCAP_0769     FALSE 0.189 167.000 0.000 NA   NA
 1114287 1114288 MCAP_0771 MCAP_0772     TRUE 0.920 3.000 0.003 NA   NA
 1114289 1114290 MCAP_0773 MCAP_0774 uvrB uvrA TRUE 0.987 9.000 0.154 0.004 Y NA
 1114290 1114291 MCAP_0774 MCAP_0775 uvrA folC TRUE 0.919 -7.000 0.003 1.000 N NA
 1114291 1114292 MCAP_0775 MCAP_0776 folC   TRUE 0.901 28.000 0.500 NA   NA
 1114292 1114293 MCAP_0776 MCAP_0777     TRUE 0.575 81.000 0.011 NA   NA
 1114293 1114294 MCAP_0777 MCAP_0778   lgt1 TRUE 0.946 11.000 0.011 1.000 N NA
 1114294 1114295 MCAP_0778 MCAP_0779 lgt1 trxB TRUE 0.924 -16.000 0.025 1.000 N NA
 1114295 1114296 MCAP_0779 MCAP_0780 trxB lgt2 TRUE 0.945 9.000 0.101 1.000 N NA
 1114296 1114297 MCAP_0780 MCAP_0781 lgt2   TRUE 0.944 12.000 0.009 NA   NA
 1114298 1114299 MCAP_0782 MCAP_0783     TRUE 0.404 62.000 0.000 NA   NA
 1114299 1114300 MCAP_0783 MCAP_0784     TRUE 0.487 52.000 0.000 NA   NA
 1114300 1114301 MCAP_0784 MCAP_0785     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1114301 1114302 MCAP_0785 MCAP_0786     TRUE 0.933 0.000 0.111 NA   NA
 1114302 1114303 MCAP_0786 MCAP_0787     TRUE 0.925 0.000 0.111 1.000   NA
 1114304 1114305 MCAP_0788 MCAP_0789     FALSE 0.255 124.000 0.000 NA   NA
 1114305 1114306 MCAP_0789 MCAP_0790     FALSE 0.148 221.000 0.000 NA   NA
 1114308 1114309 MCAP_0792 MCAP_0793 topA mcs3 FALSE 0.106 695.000 0.000 NA   NA
 1114310 1114311 MCAP_0794 MCAP_0795     TRUE 0.938 -13.000 0.667 NA   NA
 1114311 1114312 MCAP_0795 MCAP_0796     TRUE 0.940 -10.000 0.667 NA   NA
 1114312 1114313 MCAP_0796 MCAP_0797     TRUE 0.924 -22.000 0.250 NA   NA
 1114313 1114314 MCAP_0797 MCAP_0798     TRUE 0.940 2.000 0.250 NA   NA
 1114314 1114315 MCAP_0798 MCAP_0799     TRUE 0.518 140.000 1.000 NA   NA
 1114315 1114316 MCAP_0799 MCAP_0800     TRUE 0.950 -7.000 1.000 NA   NA
 1114316 1114317 MCAP_0800 MCAP_0801     TRUE 0.816 -13.000 0.000 NA   NA
 1114317 1114318 MCAP_0801 MCAP_0802     TRUE 0.862 19.000 0.000 NA   NA
 1114318 1114319 MCAP_0802 MCAP_0803     TRUE 0.644 108.000 1.000 NA   NA
 1114319 1114320 MCAP_0803 MCAP_0804     TRUE 0.571 69.000 0.061 1.000   NA
 1114320 1114321 MCAP_0804 MCAP_0805   engD TRUE 0.910 7.000 0.003 1.000   NA
 1114321 1114322 MCAP_0805 MCAP_0806 engD   TRUE 0.846 36.000 0.064 NA   NA
 1114322 1114323 MCAP_0806 MCAP_0807   gidB TRUE 0.922 2.000 0.004 NA   NA
 1114323 1114324 MCAP_0807 MCAP_0808 gidB pgsA TRUE 0.925 0.000 0.003 1.000 N NA
 1114324 1114325 MCAP_0808 MCAP_0809 pgsA   FALSE 0.326 102.000 0.000 NA   NA
 1114325 1114326 MCAP_0809 MCAP_0810     FALSE 0.359 86.000 0.000 NA   NA
 1114326 1114327 MCAP_0810 MCAP_0811     TRUE 0.925 -34.000 0.667 1.000   NA
 1114327 1114328 MCAP_0811 MCAP_0812     TRUE 0.750 59.000 1.000 0.066 N NA
 1114328 1114329 MCAP_0812 MCAP_0813   hup TRUE 0.863 8.000 0.000 1.000 N NA
 1114329 1114330 MCAP_0813 MCAP_0814 hup   FALSE 0.103 889.000 0.000 NA   NA
 1114330 1114331 MCAP_0814 MCAP_0815     FALSE 0.136 261.000 0.000 NA   NA
 1114331 1114332 MCAP_0815 MCAP_0816     FALSE 0.192 165.000 0.000 NA   NA
 1114332 1114333 MCAP_0816 MCAP_0817   asnA TRUE 0.661 57.000 0.011 NA   NA
 1114336 1114337 MCAP_0820 MCAP_0821     TRUE 0.463 109.000 0.002 NA   NA
 1114337 1114338 MCAP_0821 MCAP_0822     TRUE 0.877 24.000 0.002 1.000   NA
 1114338 1114339 MCAP_0822 MCAP_0823     TRUE 0.948 11.000 0.400 1.000   NA
 1114339 1114340 MCAP_0823 MCAP_0824   asnS TRUE 0.920 9.000 0.007 1.000   NA
 1114340 1114341 MCAP_0824 MCAP_0825 asnS   FALSE 0.133 269.000 0.000 NA   NA
 1114341 1114342 MCAP_0825 MCAP_0826     TRUE 0.954 14.000 0.212 NA   NA
 1114342 1114343 MCAP_0826 MCAP_0827     TRUE 0.986 4.000 0.058 0.066 Y NA
 1114345 1114346 MCAP_0829 MCAP_0830     TRUE 0.842 2.000 0.000 NA   NA
 1114346 1114347 MCAP_0830 MCAP_0831   rrs-2 FALSE 0.129 280.000 0.000 NA   NA
 1114347 1114348 MCAP_0831 MCAP_0832 rrs-2 rrl-2 FALSE 0.144 232.000 0.000 NA   NA
 1114348 1114349 MCAP_0832 MCAP_0833 rrl-2 rrf-2 FALSE 0.360 77.000 0.000 NA   NA
 1114349 1114350 MCAP_0833 MCAP_0834 rrf-2   FALSE 0.288 115.000 0.000 NA   NA
 1114350 1114351 MCAP_0834 MCAP_0835   trxA TRUE 0.949 12.000 0.200 1.000   NA
 1114352 1114353 MCAP_0836 MCAP_0837 lysS dus TRUE 0.987 3.000 0.032 1.000 Y NA
 1114353 1114354 MCAP_0837 MCAP_0838 dus   TRUE 0.678 50.000 0.002 NA   NA
 1114354 1114355 MCAP_0838 MCAP_0839   serS TRUE 0.513 94.000 0.003 NA   NA
 1114355 1114356 MCAP_0839 MCAP_0840 serS   TRUE 0.539 81.000 0.003 NA   NA
 1114356 1114357 MCAP_0840 MCAP_0841     TRUE 0.369 68.000 0.000 NA   NA
 1114357 1114358 MCAP_0841 MCAP_0842     TRUE 0.955 19.000 0.667 NA   NA
 1114361 1114362 MCAP_0845 MCAP_0846 bcp   FALSE 0.360 164.000 0.040 1.000   NA
 1114362 1114363 MCAP_0846 MCAP_0847     FALSE 0.105 750.000 0.000 NA   NA
 1114363 1114364 MCAP_0847 MCAP_0848     TRUE 0.752 54.000 0.667 NA   NA
 1114365 1114366 MCAP_0849 MCAP_0850 deoD   FALSE 0.143 233.000 0.000 NA   NA
 1114367 1114368 MCAP_0851 MCAP_0852     TRUE 0.986 0.000 0.022 1.000 Y NA
 1114368 1114369 MCAP_0852 MCAP_0853   fruA TRUE 0.990 3.000 0.816 1.000 Y NA
 1114369 1114370 MCAP_0853 MCAP_0854 fruA   FALSE 0.107 636.000 0.000 NA   NA
 1114370 1114371 MCAP_0854 MCAP_0855     FALSE 0.185 169.000 0.000 NA   NA
 1114372 1114373 MCAP_0856 MCAP_0857 gidA   FALSE 0.319 144.000 0.002 1.000   NA
 1114373 1114374 MCAP_0857 MCAP_0858     TRUE 0.924 22.000 0.085 1.000   NA
 1114376 1114377 MCAP_0860 MCAP_0861     TRUE 0.991 10.000 0.333 NA Y NA
 1114377 1114378 MCAP_0861 MCAP_0862     TRUE 0.532 272.000 0.000 NA Y NA
 1114378 1114379 MCAP_0862 MCAP_0863     TRUE 0.808 24.000 0.000 NA   NA
 1114379 1114380 MCAP_0863 MCAP_0864     TRUE 0.845 8.000 0.000 NA   NA
 1114380 1114381 MCAP_0864 MCAP_0865     FALSE 0.160 205.000 0.000 NA   NA
 1114381 1114382 MCAP_0865 MCAP_0866     TRUE 0.688 58.000 0.182 NA   NA
 1114382 1114383 MCAP_0866 MCAP_0867     TRUE 0.935 0.000 0.182 NA   NA
 1114383 1114384 MCAP_0867 MCAP_0868     TRUE 0.578 80.000 0.091 1.000   NA
 1114384 1114385 MCAP_0868 MCAP_0869   rnpA TRUE 0.798 42.000 0.021 1.000 N NA
 1114385 1114386 MCAP_0869 MCAP_0870 rnpA rpmH TRUE 0.945 7.000 0.787 1.000   NA