MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli HS

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3471954 3471955 EcHS_A0002 EcHS_A0003 thrL thrA FALSE 0.207 81.000 0.043 1.000   NA
 3471955 3471956 EcHS_A0003 EcHS_A0004 thrA thrB TRUE 0.993 2.000 0.133 1.000 Y NA
 3471956 3471957 EcHS_A0004 EcHS_A0005 thrB thrC TRUE 0.996 1.000 0.233 1.000 Y NA
 3471958 3471959 EcHS_A0006 EcHS_A0007     TRUE 0.799 -37.000 0.000 NA   NA
 3471959 3471960 EcHS_A0007 EcHS_A0008   agcS FALSE 0.142 70.000 0.028 NA   NA
 3471961 3471962 EcHS_A0009 EcHS_A0010 tal2 mog FALSE 0.163 115.000 0.042 1.000 N NA
 3471963 3471964 EcHS_A0011 EcHS_A0012     FALSE 0.070 149.000 0.043 NA   NA
 3471964 3471965 EcHS_A0012 EcHS_A0013     TRUE 0.907 26.000 0.500 NA   NA
 3471965 3471966 EcHS_A0013 EcHS_A0014     FALSE 0.068 135.000 0.000 NA   NA
 3471967 3471968 EcHS_A0015 EcHS_A0016 dnaK dnaJ TRUE 0.899 89.000 0.236 0.004 Y NA
 3471969 3471970 EcHS_A0017 EcHS_A0018     FALSE 0.127 78.000 0.000 NA   NA
 3471971 3471972 EcHS_A0019 EcHS_A0020 nhaA nhaR TRUE 0.640 66.000 0.292 1.000 N NA
 3471973 3471974 EcHS_A0021 EcHS_A0023     FALSE 0.026 192.000 0.000 NA   NA
 3471974 3471975 EcHS_A0023 EcHS_A4640     FALSE 0.003 433.000 0.000 NA   NA
 3471975 3471976 EcHS_A4640 EcHS_A0024     FALSE 0.230 42.000 0.000 NA   NA
 3471976 3471977 EcHS_A0024 EcHS_A0025   rpsT FALSE 0.002 484.000 0.000 NA   NA
 3471978 3471979 EcHS_A0026 EcHS_A0027   ribF TRUE 0.748 8.000 0.019 NA   NA
 3471979 3471980 EcHS_A0027 EcHS_A0028 ribF ileS TRUE 0.717 43.000 0.254 1.000 N NA
 3471980 3471981 EcHS_A0028 EcHS_A0029 ileS lspA TRUE 0.950 0.000 0.045 1.000 N NA
 3471981 3471982 EcHS_A0029 EcHS_A0030 lspA fkpB FALSE 0.385 88.000 0.154 1.000 N NA
 3471982 3471983 EcHS_A0030 EcHS_A0031 fkpB ispH TRUE 0.995 2.000 0.626 1.000 N NA
 3471983 3471984 EcHS_A0031 EcHS_A0032 ispH rihC FALSE 0.171 66.000 0.028 NA N NA
 3471984 3471985 EcHS_A0032 EcHS_A0033 rihC dapB FALSE 0.033 167.000 0.003 NA N NA
 3471987 3471988 EcHS_A0035 EcHS_A0036 carA carB TRUE 0.991 18.000 0.345 0.001 Y NA
 3471991 3471992 EcHS_A0039 EcHS_A0040 caiE caiD TRUE 0.861 6.000 0.000 1.000   NA
 3471992 3471993 EcHS_A0040 EcHS_A0041 caiD   TRUE 0.705 109.000 0.000 0.037 Y NA
 3471993 3471994 EcHS_A0041 EcHS_A0042   caiB TRUE 0.669 59.000 0.154 0.037 N NA
 3471994 3471995 EcHS_A0042 EcHS_A0043 caiB caiA TRUE 0.650 129.000 0.529 1.000 N NA
 3471995 3471996 EcHS_A0043 EcHS_A0044 caiA caiT TRUE 0.640 31.000 0.118 1.000 N NA
 3471997 3471998 EcHS_A0045 EcHS_A0046     FALSE 0.033 179.000 0.000 NA   NA
 3471998 3471999 EcHS_A0046 EcHS_A0047   fixA FALSE 0.380 69.000 0.154 NA   NA
 3471999 3472000 EcHS_A0047 EcHS_A0048 fixA fixB TRUE 0.987 15.000 0.231 0.022 Y NA
 3472000 3472001 EcHS_A0048 EcHS_A0049 fixB fixC TRUE 0.844 51.000 0.000 0.067 Y NA
 3472001 3472002 EcHS_A0049 EcHS_A0050 fixC fixX TRUE 0.997 -3.000 0.167 0.067 Y NA
 3472002 3472003 EcHS_A0050 EcHS_A0051 fixX   FALSE 0.253 59.000 0.000 1.000 N NA
 3472003 3472004 EcHS_A0051 EcHS_A0052   kefF FALSE 0.133 108.000 0.000 1.000   NA
 3472004 3472005 EcHS_A0052 EcHS_A0053 kefF kefC TRUE 0.994 -7.000 0.560 1.000   NA
 3472005 3472006 EcHS_A0053 EcHS_A0054 kefC folA FALSE 0.038 192.000 0.012 1.000 N NA
 3472007 3472008 EcHS_A0055 EcHS_A0056 apaH apaG TRUE 0.967 7.000 0.267 NA N NA
 3472008 3472009 EcHS_A0056 EcHS_A0057 apaG ksgA TRUE 0.925 3.000 0.078 NA N NA
 3472009 3472010 EcHS_A0057 EcHS_A0058 ksgA pdxA TRUE 0.983 -3.000 0.197 1.000 N NA
 3472010 3472011 EcHS_A0058 EcHS_A0059 pdxA surA TRUE 0.996 0.000 0.561 1.000 N NA
 3472011 3472012 EcHS_A0059 EcHS_A0060 surA imp TRUE 0.573 53.000 0.182 1.000 N NA
 3472014 3472015 EcHS_A0062 EcHS_A0063   rapA TRUE 0.952 12.000 0.294 1.000 N NA
 3472015 3472016 EcHS_A0063 EcHS_A0064 rapA polB TRUE 0.576 165.000 0.098 0.081 Y NA
 3472016 3472017 EcHS_A0064 EcHS_A0065 polB araD FALSE 0.192 75.000 0.018 1.000 N NA
 3472017 3472018 EcHS_A0065 EcHS_A0066 araD araA FALSE 0.332 169.000 0.017 1.000 Y NA
 3472018 3472019 EcHS_A0066 EcHS_A0067 araA araB TRUE 0.912 11.000 0.138 1.000 N NA
 3472020 3472021 EcHS_A0068 EcHS_A0069 araC   FALSE 0.341 86.000 0.167 NA   NA
 3472022 3472023 EcHS_A0070 EcHS_A0071 thiQ thiP TRUE 0.995 -16.000 0.522 0.018 N NA
 3472023 3472024 EcHS_A0071 EcHS_A0072 thiP thiB TRUE 0.996 -24.000 0.697 0.085 N NA
 3472024 3472025 EcHS_A0072 EcHS_A0073 thiB   FALSE 0.171 44.000 0.010 NA   NA
 3472025 3472026 EcHS_A0073 EcHS_A0074   sgrR TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 3472028 3472029 EcHS_A0076 EcHS_A0077 leuD leuC TRUE 0.996 11.000 0.309 0.001 Y NA
 3472029 3472030 EcHS_A0077 EcHS_A0078 leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 3472030 3472031 EcHS_A0078 EcHS_A0079 leuB leuA TRUE 0.998 0.000 0.126 0.002 Y NA
 3472031 3472032 EcHS_A0079 EcHS_A0080 leuA leuL FALSE 0.407 93.000 0.010 0.002   NA
 3472035 3472036 EcHS_A0083 EcHS_A0084 ilvI ilvH TRUE 0.999 3.000 0.371 0.002 Y NA
 3472036 3472037 EcHS_A0084 EcHS_A0085 ilvH   FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 3472037 3472038 EcHS_A0085 EcHS_A0086   fruR TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472038 3472039 EcHS_A0086 EcHS_A0087 fruR mraZ FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3472039 3472040 EcHS_A0087 EcHS_A0088 mraZ mraW TRUE 0.994 2.000 0.635 NA   NA
 3472040 3472041 EcHS_A0088 EcHS_A0089 mraW ftsL TRUE 0.986 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3472041 3472042 EcHS_A0089 EcHS_A0090 ftsL ftsI TRUE 0.824 16.000 0.124 1.000 N NA
 3472042 3472043 EcHS_A0090 EcHS_A0091 ftsI murE TRUE 0.988 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 3472043 3472044 EcHS_A0091 EcHS_A0092 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 3472044 3472045 EcHS_A0092 EcHS_A0093 murF mraY TRUE 0.999 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 3472045 3472046 EcHS_A0093 EcHS_A0094 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 3472046 3472047 EcHS_A0094 EcHS_A0095 murD ftsW TRUE 0.995 0.000 0.297 0.003 N NA
 3472047 3472048 EcHS_A0095 EcHS_A0096 ftsW murG TRUE 0.997 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3472048 3472049 EcHS_A0096 EcHS_A0097 murG murC TRUE 0.900 54.000 0.283 1.000 Y NA
 3472049 3472050 EcHS_A0097 EcHS_A0098 murC ddlB TRUE 0.997 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 3472050 3472051 EcHS_A0098 EcHS_A0099 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 3472051 3472052 EcHS_A0099 EcHS_A0100 ftsQ ftsA TRUE 0.992 -3.000 0.389 NA N NA
 3472052 3472053 EcHS_A0100 EcHS_A0101 ftsA ftsZ TRUE 0.930 61.000 0.460 1.000 Y NA
 3472053 3472054 EcHS_A0101 EcHS_A0102 ftsZ lpxC FALSE 0.314 101.000 0.134 1.000 N NA
 3472054 3472055 EcHS_A0102 EcHS_A0103 lpxC secM FALSE 0.072 156.000 0.000 1.000   NA
 3472055 3472056 EcHS_A0103 EcHS_A0104 secM secA FALSE 0.305 62.000 0.065 1.000   NA
 3472056 3472057 EcHS_A0104 EcHS_A0105 secA mutT TRUE 0.506 60.000 0.168 1.000 N NA
 3472058 3472059 EcHS_A0106 EcHS_A0107     TRUE 0.970 10.000 0.356 NA   NA
 3472059 3472060 EcHS_A0107 EcHS_A0108   coaE TRUE 0.961 0.000 0.110 NA   NA
 3472062 3472063 EcHS_A0110 EcHS_A0111 pilC hofB TRUE 0.998 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 3472063 3472064 EcHS_A0111 EcHS_A0112 hofB pilA TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3472064 3472065 EcHS_A0112 EcHS_A0113 pilA nadC FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 3472066 3472067 EcHS_A0114 EcHS_A0115 ampD ampE TRUE 0.997 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 3472069 3472070 EcHS_A0117 EcHS_A0118   aceE FALSE 0.309 161.000 0.276 1.000 N NA
 3472070 3472071 EcHS_A0118 EcHS_A0119 aceE aceF TRUE 0.976 15.000 0.220 1.000 Y NA
 3472071 3472072 EcHS_A0119 EcHS_A0120 aceF lpdA FALSE 0.262 325.000 0.463 1.000 Y NA
 3472074 3472075 EcHS_A0122 EcHS_A0123 acnB   FALSE 0.060 176.000 0.068 NA   NA
 3472076 3472077 EcHS_A0124 EcHS_A0125 speD speE TRUE 0.966 16.000 0.162 1.000 Y NA
 3472077 3472078 EcHS_A0125 EcHS_A0127 speE   TRUE 0.525 106.000 0.354 NA   NA
 3472083 3472084 EcHS_A0131 EcHS_A0132     TRUE 0.999 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 3472084 3472085 EcHS_A0132 EcHS_A0133     FALSE 0.164 105.000 0.037 1.000 N NA
 3472085 3472086 EcHS_A0133 EcHS_A0134     TRUE 0.853 64.000 0.222 1.000 Y NA
 3472089 3472090 EcHS_A0137 EcHS_A0138 panC panB TRUE 0.996 12.000 0.395 0.001 Y NA
 3472090 3472091 EcHS_A0138 EcHS_A0139 panB   FALSE 0.143 113.000 0.000 1.000 N NA
 3472091 3472092 EcHS_A0139 EcHS_A0140     TRUE 0.555 53.000 0.000 0.010   NA
 3472092 3472093 EcHS_A0140 EcHS_A0141     FALSE 0.129 112.000 0.000 1.000   NA
 3472093 3472094 EcHS_A0141 EcHS_A0142     TRUE 0.818 57.000 0.000 0.081 Y NA
 3472094 3472095 EcHS_A0142 EcHS_A0143     FALSE 0.134 123.000 0.000 1.000 N NA
 3472095 3472096 EcHS_A0143 EcHS_A0144     FALSE 0.092 105.000 0.000 NA   NA
 3472096 3472097 EcHS_A0144 EcHS_A0145   folK FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 3472097 3472098 EcHS_A0145 EcHS_A0146 folK pcnB TRUE 0.987 -3.000 0.234 1.000 N NA
 3472098 3472099 EcHS_A0146 EcHS_A0147 pcnB gluQ TRUE 0.717 93.000 0.131 1.000 Y NA
 3472099 3472100 EcHS_A0147 EcHS_A0148 gluQ dksA TRUE 0.731 37.000 0.231 1.000 N NA
 3472100 3472101 EcHS_A0148 EcHS_A0149 dksA sfsA FALSE 0.110 178.000 0.151 NA   NA
 3472101 3472102 EcHS_A0149 EcHS_A0150 sfsA ligT TRUE 0.627 15.000 0.045 NA   NA
 3472103 3472104 EcHS_A0151 EcHS_A0152 hrpB mrcB FALSE 0.114 196.000 0.158 1.000 N NA
 3472106 3472107 EcHS_A0154 EcHS_A0155 fhuA fhuC TRUE 0.854 51.000 0.156 1.000 Y NA
 3472107 3472108 EcHS_A0155 EcHS_A0156 fhuC fhuD TRUE 0.992 0.000 0.031 1.000 Y NA
 3472108 3472109 EcHS_A0156 EcHS_A0157 fhuD fhuB TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3472111 3472112 EcHS_A0159 EcHS_A0160 clcA yadR FALSE 0.127 82.000 0.031 NA   NA
 3472113 3472114 EcHS_A0161 EcHS_A0162   btuF TRUE 0.642 38.000 0.213 NA   NA
 3472114 3472115 EcHS_A0162 EcHS_A0163 btuF mtnN TRUE 0.952 -7.000 0.073 1.000 N NA
 3472116 3472117 EcHS_A0164 EcHS_A0165 dgt degP FALSE 0.223 130.000 0.101 1.000 N NA
 3472117 3472118 EcHS_A0165 EcHS_A0166 degP cdaR FALSE 0.105 155.000 0.080 NA N NA
 3472119 3472120 EcHS_A0167 EcHS_A0168   dapD FALSE 0.006 315.000 0.035 NA   NA
 3472120 3472121 EcHS_A0168 EcHS_A0169 dapD glnD TRUE 0.611 31.000 0.097 1.000 N NA
 3472121 3472122 EcHS_A0169 EcHS_A0170 glnD map TRUE 0.603 62.000 0.243 1.000 N NA
 3472123 3472124 EcHS_A4731 EcHS_A0171   rpsB FALSE 0.349 27.000 0.000 NA   NA
 3472124 3472125 EcHS_A0171 EcHS_A0172 rpsB tsf TRUE 0.576 258.000 0.748 1.000 Y NA
 3472125 3472126 EcHS_A0172 EcHS_A0173 tsf pyrH TRUE 0.500 147.000 0.416 1.000 N NA
 3472126 3472127 EcHS_A0173 EcHS_A0174 pyrH frr FALSE 0.164 292.000 0.626 1.000 N NA
 3472127 3472128 EcHS_A0174 EcHS_A0175 frr dxr FALSE 0.178 92.000 0.032 1.000 N NA
 3472128 3472129 EcHS_A0175 EcHS_A0176 dxr uppS FALSE 0.272 188.000 0.025 1.000 Y NA
 3472129 3472130 EcHS_A0176 EcHS_A0177 uppS cdsA1 TRUE 0.990 13.000 0.400 1.000 Y NA
 3472130 3472131 EcHS_A0177 EcHS_A0178 cdsA1 rseP TRUE 0.851 12.000 0.080 1.000 N NA
 3472131 3472132 EcHS_A0178 EcHS_A0179 rseP yaeT TRUE 0.933 30.000 0.204 1.000 Y NA
 3472132 3472133 EcHS_A0179 EcHS_A0180 yaeT skp TRUE 0.828 122.000 0.354 1.000 Y NA
 3472133 3472134 EcHS_A0180 EcHS_A0181 skp lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 3472134 3472135 EcHS_A0181 EcHS_A0182 lpxD fabZ TRUE 0.816 105.000 0.796 1.000 N NA
 3472135 3472136 EcHS_A0182 EcHS_A0183 fabZ lpxA TRUE 0.996 4.000 0.850 1.000 N NA
 3472136 3472137 EcHS_A0183 EcHS_A0184 lpxA lpxB TRUE 0.997 0.000 0.289 1.000 Y NA
 3472137 3472138 EcHS_A0184 EcHS_A0185 lpxB rnhB TRUE 0.983 -3.000 0.186 1.000 N NA
 3472138 3472139 EcHS_A0185 EcHS_A0186 rnhB dnaE TRUE 0.871 37.000 0.104 1.000 Y NA
 3472139 3472140 EcHS_A0186 EcHS_A0187 dnaE accA TRUE 0.869 13.000 0.122 1.000 N NA
 3472140 3472141 EcHS_A0187 EcHS_A0188 accA ldcC1 FALSE 0.131 99.000 0.010 1.000 N NA
 3472141 3472142 EcHS_A0188 EcHS_A0189 ldcC1   TRUE 0.713 57.000 0.039 NA Y NA
 3472142 3472143 EcHS_A0189 EcHS_A0190   tilS FALSE 0.143 65.000 0.015 NA N NA
 3472144 3472145 EcHS_A0191 EcHS_A0192 rof   TRUE 0.959 -13.000 0.179 NA   NA
 3472146 3472147 EcHS_A0193 EcHS_A0194     TRUE 0.940 -3.000 0.034 1.000   NA
 3472147 3472148 EcHS_A0194 EcHS_A0195   cutF TRUE 0.584 14.000 0.027 NA   NA
 3472148 3472149 EcHS_A0195 EcHS_A0196 cutF   FALSE 0.012 250.000 0.000 NA N NA
 3472150 3472151 EcHS_A0197 EcHS_A0198   proS FALSE 0.128 54.000 0.002 NA   NA
 3472151 3472152 EcHS_A0198 EcHS_A0199 proS   FALSE 0.117 112.000 0.048 NA   NA
 3472152 3472153 EcHS_A0199 EcHS_A0200   rcsF TRUE 0.984 -3.000 0.247 NA   NA
 3472153 3472154 EcHS_A0200 EcHS_A0201 rcsF metQ TRUE 0.616 118.000 0.500 NA   NA
 3472154 3472155 EcHS_A0201 EcHS_A0202 metQ metI TRUE 0.969 40.000 0.411 0.072 Y NA
 3472155 3472156 EcHS_A0202 EcHS_A0203 metI metN TRUE 0.999 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 3472157 3472158 EcHS_A0204 EcHS_A4732   rrs FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 3472158 3472159 EcHS_A4732 EcHS_A4641 rrs   FALSE 0.142 69.000 0.000 NA   NA
 3472159 3472160 EcHS_A4641 EcHS_A4642     FALSE 0.230 42.000 0.000 NA   NA
 3472160 3472161 EcHS_A4642 EcHS_A4733   rrl FALSE 0.035 174.000 0.000 NA   NA
 3472161 3472162 EcHS_A4733 EcHS_A4734 rrl rrf FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 3472162 3472163 EcHS_A4734 EcHS_A4643 rrf   FALSE 0.182 54.000 0.000 NA   NA
 3472163 3472164 EcHS_A4643 EcHS_A0211   dkgB FALSE 0.044 162.000 0.000 NA   NA
 3472166 3472167 EcHS_A0213 EcHS_A0214     FALSE 0.203 78.000 0.066 NA   NA
 3472168 3472169 EcHS_A0215 EcHS_A0216 mltD gloB TRUE 0.546 72.000 0.233 1.000   NA
 3472172 3472173 EcHS_A0218 EcHS_A4644 dnaQ   FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 3472176 3472177 EcHS_A0223 EcHS_A0224     TRUE 0.905 44.000 0.750 NA   NA
 3472177 3472178 EcHS_A0224 EcHS_A0225     TRUE 0.739 24.000 0.182 NA   NA
 3472178 3472179 EcHS_A0225 EcHS_A0226     TRUE 0.954 11.000 0.312 NA   NA
 3472179 3472180 EcHS_A0226 EcHS_A0227     TRUE 0.967 19.000 0.750 NA   NA
 3472180 3472181 EcHS_A0227 EcHS_A0228     TRUE 0.993 5.000 0.711 NA   NA
 3472181 3472182 EcHS_A0228 EcHS_A0229   clpV TRUE 0.919 -3.000 0.039 NA   NA
 3472182 3472183 EcHS_A0229 EcHS_A0230 clpV   TRUE 0.981 9.000 0.471 NA   NA
 3472183 3472184 EcHS_A0230 EcHS_A0231     TRUE 0.992 5.000 0.673 NA   NA
 3472184 3472185 EcHS_A0231 EcHS_A0232     TRUE 0.995 3.000 0.765 NA   NA
 3472185 3472186 EcHS_A0232 EcHS_A0233     TRUE 0.997 -3.000 0.862 NA   NA
 3472186 3472187 EcHS_A0233 EcHS_A0234     TRUE 0.916 25.000 0.510 NA   NA
 3472187 3472188 EcHS_A0234 EcHS_A0235     TRUE 0.994 -36.000 0.863 NA   NA
 3472188 3472189 EcHS_A0235 EcHS_A0236     TRUE 0.990 4.000 0.552 NA   NA
 3472189 3472190 EcHS_A0236 EcHS_A0237     TRUE 0.990 7.000 0.627 NA   NA
 3472190 3472191 EcHS_A0237 EcHS_A0238     FALSE 0.200 51.000 0.030 NA   NA
 3472191 3472192 EcHS_A0238 EcHS_A0239     FALSE 0.289 35.000 0.034 NA   NA
 3472193 3472194 EcHS_A0240 EcHS_A0241     FALSE 0.077 127.000 0.000 NA   NA
 3472194 3472195 EcHS_A0241 EcHS_A0242     FALSE 0.288 33.000 0.000 NA   NA
 3472195 3472196 EcHS_A0242 EcHS_A0243     FALSE 0.239 40.000 0.000 NA   NA
 3472196 3472197 EcHS_A0243 EcHS_A0244   rhsH TRUE 0.506 76.000 0.250 NA   NA
 3472197 3472198 EcHS_A0244 EcHS_A0245 rhsH   TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3472198 3472199 EcHS_A0245 EcHS_A0246     FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 3472203 3472204 EcHS_A0250 EcHS_A0251 gmhA   FALSE 0.134 206.000 0.229 1.000   NA
 3472205 3472206 EcHS_A0252 EcHS_A0253     FALSE 0.048 156.000 0.000 NA   NA
 3472206 3472207 EcHS_A0253 EcHS_A0254     TRUE 0.956 3.000 0.167 NA   NA
 3472209 3472210 EcHS_A0256 EcHS_A0257     TRUE 0.979 -7.000 0.250 NA   NA
 3472210 3472211 EcHS_A0257 EcHS_A0259     FALSE 0.092 105.000 0.000 NA   NA
 3472212 3472213 EcHS_A0258 EcHS_A0260   dinB FALSE 0.221 71.000 0.000 1.000 N NA
 3472213 3472214 EcHS_A0260 EcHS_A0261 dinB   TRUE 0.922 -3.000 0.011 1.000   NA
 3472214 3472215 EcHS_A0261 EcHS_A0262     FALSE 0.017 219.000 0.000 NA   NA
 3472215 3472216 EcHS_A0262 EcHS_A0263     TRUE 0.988 -3.000 0.303 NA   NA
 3472218 3472219 EcHS_A0265 EcHS_A0266 gpt frsA FALSE 0.127 92.000 0.040 NA   NA
 3472219 3472220 EcHS_A0266 EcHS_A0267 frsA crl FALSE 0.215 58.000 0.048 NA   NA
 3472222 3472223 EcHS_A0269 EcHS_A0270 proB proA TRUE 0.984 12.000 0.026 0.001 Y NA
 3472223 3472224 EcHS_A0270 EcHS_A4645 proA   FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 3472225 3472226 EcHS_A0272 EcHS_A0273     FALSE 0.006 310.000 0.000 NA   NA
 3472226 3472227 EcHS_A0273 EcHS_A0274     FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 3472227 3472228 EcHS_A0274 EcHS_A0275     TRUE 0.997 2.000 1.000 NA   NA
 3472228 3472229 EcHS_A0275 EcHS_A0276     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472229 3472230 EcHS_A0276 EcHS_A0277     TRUE 0.559 15.000 0.000 NA   NA
 3472230 3472231 EcHS_A0277 EcHS_A0278     TRUE 0.509 17.000 0.000 NA   NA
 3472231 3472232 EcHS_A0278 EcHS_A0279     TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3472233 3472234 EcHS_A0280 EcHS_A0281     TRUE 0.819 57.000 0.000 0.079 Y NA
 3472235 3472236 EcHS_A0282 EcHS_A0283     TRUE 0.961 -16.000 0.200 NA   NA
 3472236 3472237 EcHS_A0283 EcHS_A0284     FALSE 0.007 286.000 0.000 NA   NA
 3472237 3472238 EcHS_A0284 EcHS_A0285     FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 3472238 3472239 EcHS_A0285 EcHS_A0286     FALSE 0.030 183.000 0.000 NA   NA
 3472239 3472240 EcHS_A0286 EcHS_A0287     FALSE 0.069 134.000 0.000 NA   NA
 3472240 3472241 EcHS_A0287 EcHS_A0288     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472241 3472242 EcHS_A0288 EcHS_A0289   c2 FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 3472243 3472244 EcHS_A0290 EcHS_A0291 cro   FALSE 0.273 116.000 0.000 0.079   NA
 3472244 3472245 EcHS_A0291 EcHS_A0292     FALSE 0.036 172.000 0.000 NA   NA
 3472245 3472246 EcHS_A0292 EcHS_A0293     TRUE 0.985 -10.000 0.364 NA   NA
 3472246 3472247 EcHS_A0293 EcHS_A0294     FALSE 0.129 77.000 0.000 NA   NA
 3472247 3472248 EcHS_A0294 EcHS_A0295     FALSE 0.067 137.000 0.000 NA   NA
 3472248 3472249 EcHS_A0295 EcHS_A0296     TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 3472249 3472250 EcHS_A0296 EcHS_A0297     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3472250 3472251 EcHS_A0297 EcHS_A0298     TRUE 0.874 -7.000 0.000 NA   NA
 3472251 3472252 EcHS_A0298 EcHS_A0299     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3472252 3472253 EcHS_A0299 EcHS_A0300   rusA TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 3472253 3472254 EcHS_A0300 EcHS_A0301 rusA   TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3472254 3472255 EcHS_A0301 EcHS_A0302     TRUE 0.860 -3.000 0.002 NA   NA
 3472255 3472256 EcHS_A0302 EcHS_A0303     FALSE 0.002 823.000 0.000 NA   NA
 3472256 3472257 EcHS_A0303 EcHS_A0304     TRUE 0.961 -16.000 0.200 NA   NA
 3472257 3472258 EcHS_A0304 EcHS_A0305     TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000   NA
 3472258 3472259 EcHS_A0305 EcHS_A0306     FALSE 0.043 164.000 0.000 NA   NA
 3472259 3472260 EcHS_A0306 EcHS_A0307     FALSE 0.004 355.000 0.000 NA   NA
 3472260 3472261 EcHS_A0307 EcHS_A0308     TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 3472261 3472262 EcHS_A0308 EcHS_A0309     TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000   NA
 3472262 3472263 EcHS_A0309 EcHS_A0310     TRUE 0.850 17.000 0.214 NA   NA
 3472263 3472264 EcHS_A0310 EcHS_A0311     FALSE 0.398 91.000 0.214 NA   NA
 3472264 3472265 EcHS_A0311 EcHS_A0312     TRUE 0.600 19.000 0.065 NA   NA
 3472265 3472266 EcHS_A0312 EcHS_A0313     TRUE 0.872 6.000 0.065 NA   NA
 3472266 3472267 EcHS_A0313 EcHS_A0314     TRUE 0.824 -19.000 0.000 NA   NA
 3472267 3472268 EcHS_A0314 EcHS_A0315     TRUE 0.980 10.000 0.500 NA   NA
 3472268 3472269 EcHS_A0315 EcHS_A0316     TRUE 0.986 0.000 0.286 NA   NA
 3472269 3472270 EcHS_A0316 EcHS_A0317     TRUE 0.997 0.000 0.750 NA   NA
 3472270 3472271 EcHS_A0317 EcHS_A0318     TRUE 0.992 3.000 0.600 NA   NA
 3472271 3472272 EcHS_A0318 EcHS_A0319     TRUE 0.959 11.000 0.333 NA   NA
 3472272 3472273 EcHS_A0319 EcHS_A0320     TRUE 0.973 0.000 0.167 NA   NA
 3472274 3472275 EcHS_A0321 EcHS_A0322     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3472276 3472277 EcHS_A0323 EcHS_A0324     FALSE 0.219 89.000 0.087 NA   NA
 3472277 3472278 EcHS_A0324 EcHS_A0325     FALSE 0.157 61.000 0.000 NA   NA
 3472278 3472279 EcHS_A0325 EcHS_A0326     TRUE 0.820 57.000 0.000 0.078 Y NA
 3472279 3472280 EcHS_A0326 EcHS_A0327     FALSE 0.003 571.000 0.000 1.000   NA
 3472280 3472281 EcHS_A0327 EcHS_A0328     FALSE 0.002 707.000 0.000 NA   NA
 3472281 3472282 EcHS_A0328 EcHS_A0329     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 3472282 3472283 EcHS_A0329 EcHS_A0330     FALSE 0.046 242.000 0.000 0.078   NA
 3472283 3472284 EcHS_A0330 EcHS_A0331     TRUE 0.874 -7.000 0.000 NA   NA
 3472284 3472285 EcHS_A0331 EcHS_A0332     TRUE 0.794 -55.000 0.000 NA   NA
 3472286 3472287 EcHS_A0333 EcHS_A0335     FALSE 0.015 223.000 0.000 NA   NA
 3472288 3472289 EcHS_A0336 EcHS_A0337     TRUE 0.997 -3.000 0.740 NA   NA
 3472289 3472290 EcHS_A0337 EcHS_A0338     TRUE 0.985 12.000 0.779 NA   NA
 3472290 3472291 EcHS_A0338 EcHS_A0339     TRUE 0.813 46.000 0.477 NA   NA
 3472291 3472292 EcHS_A0339 EcHS_A0340     FALSE 0.237 177.000 0.310 NA   NA
 3472292 3472293 EcHS_A0340 EcHS_A0341     TRUE 0.980 11.000 0.564 NA   NA
 3472294 3472295 EcHS_A0342 EcHS_A0343     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472295 3472296 EcHS_A0343 EcHS_A0344     FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 3472296 3472297 EcHS_A0344 EcHS_A0345     TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 3472298 3472299 EcHS_A0346 EcHS_A0347     TRUE 0.820 57.000 0.000 0.078 Y NA
 3472300 3472301 EcHS_A0348 EcHS_A0349 matA rpmJ2 FALSE 0.002 1037.000 0.000 1.000   NA
 3472301 3472302 EcHS_A0349 EcHS_A0350 rpmJ2 rpmE2 TRUE 0.975 0.000 0.004 0.015   NA
 3472306 3472308 EcHS_A0355 EcHS_A0356     FALSE 0.004 357.000 0.000 NA   NA
 3472309 3472310 EcHS_A0357 EcHS_A0358     FALSE 0.182 54.000 0.000 NA   NA
 3472310 3472311 EcHS_A0358 EcHS_A0359     FALSE 0.002 527.000 0.000 NA N NA
 3472311 3472312 EcHS_A0359 EcHS_A0360     TRUE 0.988 11.000 0.286 NA Y NA
 3472312 3472313 EcHS_A0360 EcHS_A0361     TRUE 0.994 -7.000 0.286 0.001   NA
 3472314 3472315 EcHS_A0362 EcHS_A0363     FALSE 0.044 163.000 0.000 NA   NA
 3472315 3472316 EcHS_A0363 EcHS_A0364     FALSE 0.230 42.000 0.000 NA   NA
 3472316 3472317 EcHS_A0364 EcHS_A0365     FALSE 0.049 154.000 0.000 NA   NA
 3472317 3472318 EcHS_A0365 EcHS_A0366     FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000   NA
 3472318 3472319 EcHS_A0366 EcHS_A0367     FALSE 0.010 447.000 0.000 0.078   NA
 3472320 3472321 EcHS_A0368 EcHS_A0369     FALSE 0.038 169.000 0.000 NA   NA
 3472322 3472323 EcHS_A0370 EcHS_A0371 betA betB TRUE 0.978 14.000 0.634 1.000 N NA
 3472323 3472324 EcHS_A0371 EcHS_A0372 betB betI TRUE 0.964 14.000 0.459 1.000 N NA
 3472325 3472326 EcHS_A0373 EcHS_A0374 betT   FALSE 0.025 573.000 0.000 1.000 Y NA
 3472326 3472327 EcHS_A0374 EcHS_A0375     FALSE 0.102 142.000 0.000 1.000 N NA
 3472328 3472329 EcHS_A0376 EcHS_A0377     FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 3472330 3472331 EcHS_A0378 EcHS_A0379     TRUE 0.795 -52.000 0.000 NA   NA
 3472331 3472332 EcHS_A0379 EcHS_A0380     TRUE 0.899 40.000 0.667 NA   NA
 3472332 3472333 EcHS_A0380 EcHS_A0381     TRUE 0.988 -10.000 0.429 NA   NA
 3472333 3472334 EcHS_A0381 EcHS_A0382     TRUE 0.996 0.000 0.714 NA   NA
 3472334 3472335 EcHS_A0382 EcHS_A0383     FALSE 0.163 143.000 0.125 NA   NA
 3472335 3472336 EcHS_A0383 EcHS_A0384     FALSE 0.363 148.000 0.278 1.000 N NA
 3472336 3472337 EcHS_A0384 EcHS_A0385     FALSE 0.008 268.000 0.000 NA   NA
 3472337 3472338 EcHS_A0385 EcHS_A0386     FALSE 0.010 254.000 0.000 NA   NA
 3472338 3472339 EcHS_A0386 EcHS_A0387     TRUE 0.955 49.000 0.571 NA Y NA
 3472339 3472340 EcHS_A0387 EcHS_A0388     TRUE 0.999 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 3472340 3472341 EcHS_A0388 EcHS_A0389     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.069 Y NA
 3472341 3472342 EcHS_A0389 EcHS_A0390     FALSE 0.165 87.000 0.000 1.000   NA
 3472342 3472343 EcHS_A0390 EcHS_A0391     FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 3472343 3472344 EcHS_A0391 EcHS_A4646     FALSE 0.005 342.000 0.000 NA   NA
 3472344 3472346 EcHS_A4646 EcHS_A0393     FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 3472350 3472351 EcHS_A0397 EcHS_A0398 prpB prpC TRUE 0.860 45.000 0.502 1.000 N NA
 3472351 3472352 EcHS_A0398 EcHS_A0399 prpC prpD TRUE 0.721 34.000 0.216 1.000   NA
 3472352 3472353 EcHS_A0399 EcHS_A0400 prpD prpE TRUE 0.710 40.000 0.038 0.001   NA
 3472353 3472354 EcHS_A0400 EcHS_A0401 prpE codB FALSE 0.022 237.000 0.000 1.000 N NA
 3472354 3472355 EcHS_A0401 EcHS_A0402 codB codA TRUE 0.995 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 3472357 3472358 EcHS_A0404 EcHS_A0405 cynT cynS TRUE 0.884 31.000 0.075 1.000 Y NA
 3472358 3472359 EcHS_A0405 EcHS_A0406 cynS cynX TRUE 0.842 33.000 0.000 1.000 Y NA
 3472360 3472361 EcHS_A0407 EcHS_A0408 lacY lacZ TRUE 0.665 52.000 0.261 1.000   NA
 3472361 3472362 EcHS_A0408 EcHS_A0409 lacZ lacI FALSE 0.332 123.000 0.174 1.000 N NA
 3472362 3472363 EcHS_A0409 EcHS_A0410 lacI mhpR TRUE 0.800 68.000 0.000 0.052 Y NA
 3472364 3472365 EcHS_A0411 EcHS_A0412 mhpA mhpB TRUE 0.994 2.000 0.333 0.007   NA
 3472365 3472366 EcHS_A0412 EcHS_A0413 mhpB mhpC TRUE 0.992 3.000 0.300 0.007   NA
 3472366 3472367 EcHS_A0413 EcHS_A0414 mhpC mhpD TRUE 0.984 10.000 0.300 0.007   NA
 3472367 3472368 EcHS_A0414 EcHS_A0415 mhpD mhpF TRUE 0.998 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 3472368 3472369 EcHS_A0415 EcHS_A0416 mhpF mhpE TRUE 0.997 -3.000 0.750 1.000 N NA
 3472369 3472370 EcHS_A0416 EcHS_A0417 mhpE   TRUE 0.503 176.000 0.600 1.000 N NA
 3472370 3472371 EcHS_A0417 EcHS_A0418     FALSE 0.093 102.000 0.000 NA   NA
 3472371 3472372 EcHS_A0418 EcHS_A0419     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 3472373 3472374 EcHS_A0420 EcHS_A0421 fghA2 adhC TRUE 0.566 93.000 0.327 1.000   NA
 3472374 3472375 EcHS_A0421 EcHS_A0422 adhC   TRUE 0.876 35.000 0.531 NA   NA
 3472375 3472376 EcHS_A0422 EcHS_A0423     FALSE 0.029 186.000 0.000 NA   NA
 3472376 3472377 EcHS_A0423 EcHS_A0424     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3472377 3472378 EcHS_A0424 EcHS_A0425     FALSE 0.084 119.000 0.000 NA   NA
 3472378 3472379 EcHS_A0425 EcHS_A0426     TRUE 0.940 10.000 0.214 NA   NA
 3472382 3472383 EcHS_A0428 EcHS_A0430 tauA tauB TRUE 0.959 13.000 0.047 1.000 Y NA
 3472383 3472384 EcHS_A0430 EcHS_A0431 tauB tauC TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 3472384 3472385 EcHS_A0431 EcHS_A0432 tauC tauD TRUE 0.985 -3.000 0.214 1.000 N NA
 3472388 3472389 EcHS_A0435 EcHS_A0436     TRUE 0.820 57.000 0.000 0.077 Y NA
 3472390 3472391 EcHS_A0437 EcHS_A0438     TRUE 0.783 88.000 0.667 NA   NA
 3472392 3472393 EcHS_A0439 EcHS_A0441 ampH   FALSE 0.212 46.000 0.000 NA   NA
 3472394 3472395 EcHS_A0440 EcHS_A0442   smbA TRUE 0.448 20.000 0.000 NA   NA
 3472395 3472396 EcHS_A0442 EcHS_A0443 smbA   TRUE 0.715 13.000 0.000 1.000   NA
 3472400 3472401 EcHS_A0448 EcHS_A0449     FALSE 0.399 23.000 0.000 NA   NA
 3472401 3472402 EcHS_A0449 EcHS_A0450     FALSE 0.212 46.000 0.000 NA   NA
 3472402 3472403 EcHS_A0450 EcHS_A0451   phoA FALSE 0.100 101.000 0.032 NA   NA
 3472403 3472404 EcHS_A0451 EcHS_A0452 phoA psiF FALSE 0.089 119.000 0.032 NA   NA
 3472404 3472405 EcHS_A0452 EcHS_A0453 psiF   FALSE 0.410 102.000 0.250 NA   NA
 3472407 3472408 EcHS_A0455 EcHS_A0456   aroL FALSE 0.021 183.000 0.007 NA   NA
 3472408 3472409 EcHS_A0456 EcHS_A0457 aroL   FALSE 0.246 50.000 0.044 NA   NA
 3472409 3472410 EcHS_A0457 EcHS_A0458   aroM FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 3472410 3472411 EcHS_A0458 EcHS_A0459 aroM   FALSE 0.138 72.000 0.000 NA   NA
 3472411 3472412 EcHS_A0459 EcHS_A0460     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 3472415 3472416 EcHS_A0463 EcHS_A0464 araJ sbcC FALSE 0.348 42.000 0.030 1.000 N NA
 3472416 3472417 EcHS_A0464 EcHS_A0466 sbcC sbcD TRUE 0.997 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 3472418 3472419 EcHS_A0465 EcHS_A0467   phoB FALSE 0.137 73.000 0.000 NA   NA
 3472419 3472420 EcHS_A0467 EcHS_A0468 phoB phoR TRUE 0.961 58.000 0.453 0.016 Y NA
 3472421 3472422 EcHS_A0469 EcHS_A0470     FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 3472423 3472424 EcHS_A0471 EcHS_A0472 brnQ proY TRUE 0.924 76.000 0.348 0.098 Y NA
 3472424 3472425 EcHS_A0472 EcHS_A0473 proY malZ FALSE 0.172 156.000 0.123 1.000 N NA
 3472427 3472428 EcHS_A0475 EcHS_A0476 queA tgt TRUE 0.964 56.000 0.360 0.001 Y NA
 3472428 3472429 EcHS_A0476 EcHS_A0477 tgt yajC TRUE 0.869 23.000 0.325 NA N NA
 3472429 3472430 EcHS_A0477 EcHS_A0478 yajC secD TRUE 0.863 28.000 0.045 NA Y NA
 3472430 3472431 EcHS_A0478 EcHS_A0479 secD secF TRUE 0.994 11.000 0.206 0.001 Y NA
 3472431 3472432 EcHS_A0479 EcHS_A0480 secF   FALSE 0.096 129.000 0.015 1.000   NA
 3472432 3472433 EcHS_A0480 EcHS_A0481     TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3472434 3472435 EcHS_A0482 EcHS_A0483 tsx   FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 3472436 3472437 EcHS_A0484 EcHS_A0485 nrdR ribD TRUE 0.974 4.000 0.277 NA N NA
 3472437 3472438 EcHS_A0485 EcHS_A0486 ribD ribH TRUE 0.800 89.000 0.034 0.002 Y NA
 3472438 3472439 EcHS_A0486 EcHS_A0487 ribH nusB TRUE 0.915 20.000 0.347 1.000 N NA
 3472439 3472440 EcHS_A0487 EcHS_A0488 nusB thiL TRUE 0.523 78.000 0.225 1.000 N NA
 3472440 3472441 EcHS_A0488 EcHS_A0489 thiL pgpA TRUE 0.968 -22.000 0.206 1.000 N NA
 3472442 3472443 EcHS_A0490 EcHS_A0491   dxs FALSE 0.045 180.000 0.009 1.000 N NA
 3472443 3472444 EcHS_A0491 EcHS_A0492 dxs ispA TRUE 0.904 25.000 0.060 1.000 Y NA
 3472444 3472445 EcHS_A0492 EcHS_A0493 ispA xseB TRUE 0.944 0.000 0.035 1.000 N NA
 3472446 3472447 EcHS_A0494 EcHS_A0495   thiI FALSE 0.360 26.000 0.000 NA   NA
 3472448 3472449 EcHS_A0496 EcHS_A0497 thiJ panE TRUE 0.937 -37.000 0.155 NA   NA
 3472453 3472454 EcHS_A0501 EcHS_A0502     TRUE 0.884 -16.000 0.000 1.000   NA
 3472454 3472455 EcHS_A0502 EcHS_A0503   cyoE FALSE 0.100 137.000 0.000 1.000   NA
 3472455 3472456 EcHS_A0503 EcHS_A0504 cyoE cyoD TRUE 0.935 12.000 0.118 0.098 N NA
 3472456 3472457 EcHS_A0504 EcHS_A0505 cyoD cyoC TRUE 0.999 0.000 0.485 0.064 Y NA
 3472457 3472458 EcHS_A0505 EcHS_A0506 cyoC cyoB TRUE 0.999 -10.000 0.697 0.064 Y NA
 3472458 3472459 EcHS_A0506 EcHS_A0507 cyoB cyoA TRUE 0.956 22.000 0.041 0.004 Y NA
 3472459 3472460 EcHS_A0507 EcHS_A0508 cyoA   FALSE 0.009 461.000 0.000 0.098   NA
 3472460 3472461 EcHS_A0508 EcHS_A0509     TRUE 0.664 44.000 0.256 NA   NA
 3472461 3472462 EcHS_A0509 EcHS_A0510     FALSE 0.199 50.000 0.000 NA   NA
 3472463 3472464 EcHS_A0511 EcHS_A0512     TRUE 0.769 9.000 0.000 NA   NA
 3472464 3472465 EcHS_A0512 EcHS_A0513   tig FALSE 0.057 147.000 0.000 NA   NA
 3472465 3472466 EcHS_A0513 EcHS_A0514 tig clpP FALSE 0.376 246.000 0.351 1.000 Y NA
 3472466 3472467 EcHS_A0514 EcHS_A0515 clpP clpX TRUE 0.820 126.000 0.352 1.000 Y NA
 3472467 3472468 EcHS_A0515 EcHS_A0516 clpX lon TRUE 0.569 188.000 0.201 0.097 Y NA
 3472468 3472469 EcHS_A0516 EcHS_A0517 lon hupB FALSE 0.034 209.000 0.000 1.000 N NA
 3472469 3472470 EcHS_A0517 EcHS_A0518 hupB ppiD FALSE 0.045 192.000 0.000 1.000 N NA
 3472470 3472471 EcHS_A0518 EcHS_A0519 ppiD   FALSE 0.094 151.000 0.033 1.000 N NA
 3472471 3472472 EcHS_A0519 EcHS_A0520     FALSE 0.148 94.000 0.027 1.000   NA
 3472473 3472474 EcHS_A0521 EcHS_A0522 queC   FALSE 0.195 65.000 0.019 1.000   NA
 3472475 3472476 EcHS_A0523 EcHS_A0524 cof   FALSE 0.069 153.000 0.020 1.000   NA
 3472476 3472477 EcHS_A0524 EcHS_A0525   mdlA TRUE 0.731 30.000 0.179 1.000 N NA
 3472477 3472478 EcHS_A0525 EcHS_A0526 mdlA mdlB TRUE 1.000 -7.000 0.911 0.001 Y NA
 3472478 3472479 EcHS_A0526 EcHS_A0527 mdlB glnK FALSE 0.054 181.000 0.028 1.000 N NA
 3472479 3472480 EcHS_A0527 EcHS_A0528 glnK amt TRUE 0.704 30.000 0.156 1.000 N NA
 3472484 3472485 EcHS_A4735 EcHS_A0532 srpB   FALSE 0.065 139.000 0.000 NA   NA
 3472486 3472487 EcHS_A0533 EcHS_A0534     FALSE 0.047 158.000 0.000 NA   NA
 3472487 3472488 EcHS_A0534 EcHS_A0535   maa FALSE 0.331 77.000 0.101 1.000   NA
 3472488 3472489 EcHS_A0535 EcHS_A0536 maa   FALSE 0.069 172.000 0.076 NA   NA
 3472489 3472490 EcHS_A0536 EcHS_A0537     TRUE 0.537 26.000 0.080 NA   NA
 3472490 3472491 EcHS_A0537 EcHS_A0538     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 3472491 3472492 EcHS_A0538 EcHS_A0539   acrA TRUE 0.925 23.000 0.458 1.000 N NA
 3472493 3472494 EcHS_A0540 EcHS_A0541 acrR kefA FALSE 0.088 128.000 0.000 NA N NA
 3472494 3472495 EcHS_A0541 EcHS_A0542 kefA   FALSE 0.212 46.000 0.000 NA   NA
 3472496 3472497 EcHS_A0543 EcHS_A0544   priC TRUE 0.958 14.000 0.474 NA   NA
 3472498 3472499 EcHS_A0545 EcHS_A0546   apt FALSE 0.064 153.000 0.043 NA   NA
 3472499 3472500 EcHS_A0546 EcHS_A0547 apt dnaX FALSE 0.208 129.000 0.088 1.000 N NA
 3472500 3472501 EcHS_A0547 EcHS_A0548 dnaX   TRUE 0.753 53.000 0.411 NA   NA
 3472501 3472502 EcHS_A0548 EcHS_A0549   recR TRUE 0.995 0.000 0.604 NA   NA
 3472502 3472503 EcHS_A0549 EcHS_A0550 recR htpG FALSE 0.146 110.000 0.028 1.000 N NA
 3472503 3472504 EcHS_A0550 EcHS_A0551 htpG adk FALSE 0.126 181.000 0.035 0.096 N NA
 3472504 3472505 EcHS_A0551 EcHS_A0552 adk hemH FALSE 0.019 236.000 0.013 1.000 N NA
 3472508 3472509 EcHS_A0555 EcHS_A0556   fsr FALSE 0.051 238.000 0.000 0.098 N NA
 3472515 3472516 EcHS_A0561 EcHS_A0562     TRUE 0.771 -129.000 0.000 NA   NA
 3472516 3472517 EcHS_A0562 EcHS_A0563   copA TRUE 0.769 9.000 0.000 NA   NA
 3472518 3472519 EcHS_A0564 EcHS_A0565 glsA1   TRUE 0.986 3.000 0.028 1.000 Y NA
 3472519 3472520 EcHS_A0565 EcHS_A0566   cueR FALSE 0.132 125.000 0.000 1.000 N NA
 3472521 3472522 EcHS_A0567 EcHS_A0568     TRUE 0.997 -3.000 0.313 NA Y NA
 3472523 3472524 EcHS_A0569 EcHS_A0570     TRUE 0.942 -13.000 0.127 NA   NA
 3472525 3472526 EcHS_A0571 EcHS_A0572 ybbN   FALSE 0.409 61.000 0.118 1.000   NA
 3472526 3472527 EcHS_A0572 EcHS_A0574   tesA TRUE 0.938 -10.000 0.072 1.000   NA
 3472528 3472529 EcHS_A0573 EcHS_A0575     TRUE 0.999 -3.000 0.535 NA Y NA
 3472530 3472531 EcHS_A0577 EcHS_A0578 selU   FALSE 0.111 69.000 0.012 NA   NA
 3472532 3472533 EcHS_A0579 EcHS_A0580 allA allR TRUE 0.817 78.000 0.625 1.000 N NA
 3472533 3472534 EcHS_A0580 EcHS_A0581 allR gcl FALSE 0.206 90.000 0.054 1.000   NA
 3472534 3472535 EcHS_A0581 EcHS_A0582 gcl hyi TRUE 0.793 13.000 0.065 1.000   NA
 3472535 3472536 EcHS_A0582 EcHS_A0583 hyi   FALSE 0.342 100.000 0.154 1.000 N NA
 3472536 3472537 EcHS_A0583 EcHS_A0584     FALSE 0.065 169.000 0.000 1.000 N NA
 3472537 3472538 EcHS_A0584 EcHS_A0585   allB TRUE 0.825 60.000 0.161 1.000 Y NA
 3472538 3472539 EcHS_A0585 EcHS_A0586 allB   TRUE 0.837 57.000 0.161 1.000 Y NA
 3472539 3472540 EcHS_A0586 EcHS_A0587     TRUE 0.755 22.000 0.133 1.000 N NA
 3472540 3472541 EcHS_A0587 EcHS_A0588     FALSE 0.162 59.000 0.000 NA   NA
 3472542 3472543 EcHS_A0589 EcHS_A0590   allC TRUE 0.790 11.000 0.059 NA   NA
 3472543 3472544 EcHS_A0590 EcHS_A0591 allC allD TRUE 0.799 22.000 0.174 1.000 N NA
 3472545 3472546 EcHS_A0592 EcHS_A0593     TRUE 0.975 10.000 0.412 NA   NA
 3472546 3472547 EcHS_A0593 EcHS_A0594     TRUE 0.943 11.000 0.265 NA   NA
 3472547 3472548 EcHS_A0594 EcHS_A0595   arcC TRUE 0.991 -3.000 0.375 NA   NA
 3472548 3472549 EcHS_A0595 EcHS_A0596 arcC   TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3472550 3472551 EcHS_A0597 EcHS_A0598 purK purE TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 3472551 3472552 EcHS_A0598 EcHS_A0599 purE lpxH FALSE 0.110 118.000 0.016 1.000   NA
 3472552 3472553 EcHS_A0599 EcHS_A0600 lpxH ppiB TRUE 0.977 3.000 0.237 1.000   NA
 3472555 3472556 EcHS_A0602 EcHS_A0603   folD FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 3472557 3472558 EcHS_A0604 EcHS_A0605     FALSE 0.099 96.000 0.000 NA   NA
 3472558 3472559 EcHS_A0605 EcHS_A0606     TRUE 0.854 -10.000 0.000 NA   NA
 3472559 3472560 EcHS_A0606 EcHS_A0607   fimD2 TRUE 0.988 31.000 0.875 1.000 Y NA
 3472560 3472561 EcHS_A0607 EcHS_A0608 fimD2   TRUE 0.996 13.000 0.875 NA Y NA
 3472561 3472562 EcHS_A0608 EcHS_A0609     TRUE 0.997 11.000 0.875 NA Y NA
 3472565 3472566 EcHS_A0612 EcHS_A0614     FALSE 0.225 43.000 0.000 NA   NA
 3472566 3472567 EcHS_A0614 EcHS_A0615     FALSE 0.123 80.000 0.000 NA   NA
 3472567 3472568 EcHS_A0615 EcHS_A0616     TRUE 0.774 28.000 0.250 NA   NA
 3472568 3472569 EcHS_A0616 EcHS_A0617   cusS FALSE 0.002 737.000 0.000 NA   NA
 3472569 3472570 EcHS_A0617 EcHS_A0618 cusS cusR TRUE 0.999 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 3472571 3472572 EcHS_A0619 EcHS_A0620 cusC cusF TRUE 0.459 158.000 0.500 NA   NA
 3472572 3472573 EcHS_A0620 EcHS_A0621 cusF cusB TRUE 0.531 16.000 0.000 NA   NA
 3472573 3472574 EcHS_A0621 EcHS_A0622 cusB cusA TRUE 0.976 12.000 0.500 1.000 N NA
 3472574 3472575 EcHS_A0622 EcHS_A0623 cusA pheP FALSE 0.301 102.000 0.000 0.097 N NA
 3472576 3472577 EcHS_A0624 EcHS_A0625   nfnB FALSE 0.082 108.000 0.012 NA N NA
 3472577 3472578 EcHS_A0625 EcHS_A0626 nfnB   TRUE 0.664 94.000 0.500 NA   NA
 3472578 3472579 EcHS_A0626 EcHS_A0627     FALSE 0.150 65.000 0.000 NA   NA
 3472579 3472580 EcHS_A0627 EcHS_A0628     FALSE 0.148 66.000 0.000 NA   NA
 3472581 3472582 EcHS_A0629 EcHS_A0630     FALSE 0.129 77.000 0.000 NA   NA
 3472583 3472584 EcHS_A0631 EcHS_A0633 entD fepA TRUE 0.614 166.000 0.700 1.000 N NA
 3472585 3472586 EcHS_A0632 EcHS_A0634   fes FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 3472586 3472587 EcHS_A0634 EcHS_A0635 fes   TRUE 0.981 3.000 0.320 NA   NA
 3472587 3472588 EcHS_A0635 EcHS_A0636   entF TRUE 0.951 -3.000 0.080 NA   NA
 3472591 3472592 EcHS_A0639 EcHS_A0640 fepC fepG TRUE 0.992 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 3472592 3472593 EcHS_A0640 EcHS_A0641 fepG fepD TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.068 Y NA
 3472596 3472597 EcHS_A0644 EcHS_A0645 entC entE TRUE 0.997 10.000 0.667 1.000 Y NA
 3472597 3472598 EcHS_A0645 EcHS_A0646 entE entB TRUE 0.994 14.000 0.667 1.000 Y NA
 3472598 3472599 EcHS_A0646 EcHS_A0647 entB entA TRUE 0.991 0.000 0.024 1.000 Y NA
 3472599 3472600 EcHS_A0647 EcHS_A0648 entA   TRUE 0.987 3.000 0.065 NA Y NA
 3472600 3472601 EcHS_A0648 EcHS_A0649   cstA FALSE 0.168 181.000 0.222 NA N NA
 3472601 3472602 EcHS_A0649 EcHS_A0650 cstA   FALSE 0.239 183.000 0.333 NA   NA
 3472605 3472606 EcHS_A0653 EcHS_A0654     TRUE 0.887 -15.000 0.000 1.000   NA
 3472606 3472607 EcHS_A0654 EcHS_A0655     TRUE 0.416 147.000 0.333 1.000   NA
 3472607 3472608 EcHS_A0655 EcHS_A0656   dsbG FALSE 0.038 209.000 0.067 NA N NA
 3472609 3472610 EcHS_A0657 EcHS_A0658 ahpC ahpF TRUE 0.787 215.000 0.551 0.001 Y NA
 3472613 3472614 EcHS_A0661 EcHS_A0662 rnk rna FALSE 0.022 229.000 0.018 1.000 N NA
 3472614 3472615 EcHS_A0662 EcHS_A0663 rna   FALSE 0.136 114.000 0.024 1.000 N NA
 3472615 3472616 EcHS_A0663 EcHS_A0664   citG TRUE 0.602 51.000 0.194 1.000 N NA
 3472616 3472617 EcHS_A0664 EcHS_A0665 citG citX TRUE 0.996 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 3472617 3472618 EcHS_A0665 EcHS_A0666 citX citF TRUE 0.892 4.000 0.000 1.000 N NA
 3472618 3472619 EcHS_A0666 EcHS_A0667 citF citE TRUE 0.947 11.000 0.000 0.001 N NA
 3472619 3472620 EcHS_A0667 EcHS_A0668 citE citD TRUE 0.998 -3.000 0.537 0.001 N NA
 3472620 3472621 EcHS_A0668 EcHS_A0669 citD citC TRUE 0.944 15.000 0.000 1.000 Y NA
 3472622 3472623 EcHS_A0670 EcHS_A0671 dpiB dpiA TRUE 0.989 -31.000 0.000 0.082 Y NA
 3472624 3472625 EcHS_A0672 EcHS_A0673 dcuC   FALSE 0.065 139.000 0.000 NA   NA
 3472626 3472627 EcHS_A0674 EcHS_A0675 pagP cspE FALSE 0.299 175.000 0.333 1.000   NA
 3472629 3472630 EcHS_A0677 EcHS_A0678   tatA2 FALSE 0.324 129.000 0.196 1.000   NA
 3472631 3472632 EcHS_A0679 EcHS_A0680 lipA   FALSE 0.096 99.000 0.000 NA   NA
 3472632 3472633 EcHS_A0680 EcHS_A0681     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472633 3472634 EcHS_A0681 EcHS_A0682   lipB FALSE 0.016 259.000 0.000 1.000 N NA
 3472634 3472635 EcHS_A0682 EcHS_A0683 lipB   FALSE 0.370 101.000 0.219 NA   NA
 3472635 3472636 EcHS_A0683 EcHS_A0684   dacA FALSE 0.088 111.000 0.000 NA   NA
 3472636 3472637 EcHS_A0684 EcHS_A0685 dacA rlpA FALSE 0.064 140.000 0.000 NA   NA
 3472637 3472638 EcHS_A0685 EcHS_A0686 rlpA mrdB TRUE 0.752 11.000 0.035 NA N NA
 3472638 3472639 EcHS_A0686 EcHS_A0687 mrdB mrdA TRUE 0.923 3.000 0.046 1.000 N NA
 3472639 3472640 EcHS_A0687 EcHS_A0688 mrdA   FALSE 0.320 31.000 0.031 NA   NA
 3472640 3472641 EcHS_A0688 EcHS_A0689     TRUE 0.976 4.000 0.307 NA   NA
 3472641 3472642 EcHS_A0689 EcHS_A0690   cobC FALSE 0.009 260.000 0.000 NA   NA
 3472642 3472643 EcHS_A0690 EcHS_A0691 cobC nadD TRUE 0.604 24.000 0.057 1.000 N NA
 3472643 3472644 EcHS_A0691 EcHS_A0692 nadD holA TRUE 0.933 2.000 0.045 1.000 N NA
 3472644 3472645 EcHS_A0692 EcHS_A0693 holA   TRUE 0.979 0.000 0.199 NA N NA
 3472645 3472646 EcHS_A0693 EcHS_A0694   leuS TRUE 0.860 15.000 0.182 NA N NA
 3472648 3472649 EcHS_A0696 EcHS_A0697   gltL FALSE 0.324 118.000 0.195 NA N NA
 3472649 3472650 EcHS_A0697 EcHS_A0698 gltL gltK TRUE 0.998 0.000 0.379 1.000 Y NA
 3472650 3472651 EcHS_A0698 EcHS_A0699 gltK gltJ TRUE 1.000 0.000 0.933 0.017 Y NA
 3472651 3472652 EcHS_A0699 EcHS_A4737 gltJ sroC TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3472652 3472653 EcHS_A4737 EcHS_A0700 sroC gltI TRUE 0.885 -4.000 0.000 NA   NA
 3472654 3472655 EcHS_A0701 EcHS_A0702     FALSE 0.024 198.000 0.000 NA   NA
 3472656 3472657 EcHS_A0704 EcHS_A0705 lnt corC TRUE 0.938 25.000 0.557 1.000 N NA
 3472657 3472658 EcHS_A0705 EcHS_A0706 corC   FALSE 0.306 90.000 0.150 NA   NA
 3472658 3472659 EcHS_A0706 EcHS_A0707     TRUE 0.993 -3.000 0.457 NA   NA
 3472659 3472660 EcHS_A0707 EcHS_A0708   miaB FALSE 0.279 153.000 0.220 1.000 N NA
 3472662 3472663 EcHS_A4648 EcHS_A4649     FALSE 0.263 36.000 0.000 NA   NA
 3472663 3472664 EcHS_A4649 EcHS_A4650     FALSE 0.212 46.000 0.000 NA   NA
 3472664 3472665 EcHS_A4650 EcHS_A4651     TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3472665 3472666 EcHS_A4651 EcHS_A4652     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3472666 3472667 EcHS_A4652 EcHS_A4653     FALSE 0.399 23.000 0.000 NA   NA
 3472667 3472668 EcHS_A4653 EcHS_A4654     TRUE 0.791 7.000 0.000 NA   NA
 3472668 3472669 EcHS_A4654 EcHS_A0717   asnB FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 3472669 3472670 EcHS_A0717 EcHS_A0718 asnB   FALSE 0.005 426.000 0.000 1.000 N NA
 3472670 3472671 EcHS_A0718 EcHS_A0719   nagD FALSE 0.014 270.000 0.000 1.000 N NA
 3472671 3472672 EcHS_A0719 EcHS_A0720 nagD nagC TRUE 0.810 48.000 0.070 1.000 Y NA
 3472672 3472673 EcHS_A0720 EcHS_A0721 nagC nagA2 TRUE 0.997 9.000 0.571 1.000 Y NA
 3472673 3472674 EcHS_A0721 EcHS_A0722 nagA2 nagB TRUE 0.974 60.000 0.557 0.002 Y NA
 3472679 3472680 EcHS_A0728 EcHS_A0729     FALSE 0.199 50.000 0.000 NA   NA
 3472681 3472682 EcHS_A0730 EcHS_A0731 fur fldA FALSE 0.032 289.000 0.156 1.000 N NA
 3472682 3472683 EcHS_A0731 EcHS_A0732 fldA   TRUE 0.925 23.000 0.473 1.000   NA
 3472683 3472684 EcHS_A0732 EcHS_A0733   ybfF FALSE 0.338 140.000 0.276 NA   NA
 3472685 3472686 EcHS_A0734 EcHS_A0735 seqA pgm TRUE 0.732 26.000 0.151 1.000 N NA
 3472688 3472689 EcHS_A0737 EcHS_A0738     FALSE 0.328 29.000 0.000 NA   NA
 3472689 3472690 EcHS_A0738 EcHS_A0739     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.025 Y NA
 3472690 3472691 EcHS_A0739 EcHS_A0740     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3472692 3472693 EcHS_A0741 EcHS_A0742 kdpE kdpD TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 3472693 3472694 EcHS_A0742 EcHS_A0743 kdpD kdpC TRUE 0.961 -7.000 0.100 1.000 N NA
 3472694 3472695 EcHS_A0743 EcHS_A0744 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 3472695 3472696 EcHS_A0744 EcHS_A0745 kdpB kdpA TRUE 0.979 23.000 0.201 0.001 Y NA
 3472696 3472697 EcHS_A0745 EcHS_A0746 kdpA kdpF TRUE 0.984 0.000 0.022 0.001   NA
 3472698 3472699 EcHS_A0747 EcHS_A0748   rhsC FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 3472699 3472700 EcHS_A0748 EcHS_A0749 rhsC   FALSE 0.002 444.000 0.000 NA   NA
 3472700 3472701 EcHS_A0749 EcHS_A0750     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472701 3472702 EcHS_A0750 EcHS_A0751     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 3472702 3472703 EcHS_A0751 EcHS_A0752     FALSE 0.079 126.000 0.000 NA   NA
 3472703 3472704 EcHS_A0752 EcHS_A0753     FALSE 0.073 131.000 0.000 NA   NA
 3472704 3472705 EcHS_A0753 EcHS_A0754     FALSE 0.056 148.000 0.000 NA   NA
 3472705 3472706 EcHS_A0754 EcHS_A0755   phrB TRUE 0.888 -3.000 0.019 NA   NA
 3472706 3472707 EcHS_A0755 EcHS_A0756 phrB   FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3472709 3472710 EcHS_A0758 EcHS_A0759     TRUE 0.486 23.000 0.050 NA   NA
 3472710 3472711 EcHS_A0759 EcHS_A0760     TRUE 0.997 -6.000 0.379 NA Y NA
 3472711 3472712 EcHS_A0760 EcHS_A0761     TRUE 0.969 -10.000 0.211 NA   NA
 3472712 3472713 EcHS_A0761 EcHS_A0762   nei FALSE 0.382 36.000 0.037 1.000   NA
 3472714 3472715 EcHS_A0763 EcHS_A0764 abrB   FALSE 0.052 152.000 0.000 NA   NA
 3472715 3472716 EcHS_A0764 EcHS_A0765     TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000   NA
 3472716 3472717 EcHS_A0765 EcHS_A0766     TRUE 0.944 15.000 0.000 1.000 Y NA
 3472717 3472718 EcHS_A0766 EcHS_A0767     TRUE 0.978 9.000 0.000 1.000 Y NA
 3472718 3472719 EcHS_A0767 EcHS_A0768   gltA FALSE 0.006 389.000 0.000 1.000 N NA
 3472720 3472721 EcHS_A0769 EcHS_A0770 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 3472721 3472722 EcHS_A0770 EcHS_A0771 sdhD sdhA TRUE 1.000 0.000 0.705 0.002 Y NA
 3472722 3472723 EcHS_A0771 EcHS_A0772 sdhA sdhB TRUE 0.996 16.000 0.604 0.002 Y NA
 3472723 3472724 EcHS_A0772 EcHS_A0773 sdhB sucA FALSE 0.277 201.000 0.067 1.000 Y NA
 3472724 3472725 EcHS_A0773 EcHS_A0774 sucA sucB TRUE 0.994 15.000 0.667 1.000 Y NA
 3472725 3472726 EcHS_A0774 EcHS_A0775 sucB sucC FALSE 0.077 366.000 0.136 1.000 Y NA
 3472726 3472727 EcHS_A0775 EcHS_A0776 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 3472729 3472730 EcHS_A0778 EcHS_A0779     TRUE 0.489 18.000 0.000 NA   NA
 3472731 3472732 EcHS_A0780 EcHS_A0781     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.025 Y NA
 3472733 3472734 EcHS_A0782 EcHS_A0783     FALSE 0.373 25.000 0.000 NA   NA
 3472736 3472737 EcHS_A0785 EcHS_A0786 cydA cydB1 TRUE 0.963 16.000 0.000 0.062 Y NA
 3472737 3472738 EcHS_A0786 EcHS_A0787 cydB1   TRUE 0.819 15.000 0.149 NA   NA
 3472738 3472739 EcHS_A0787 EcHS_A0788     TRUE 0.988 0.000 0.310 NA   NA
 3472739 3472740 EcHS_A0788 EcHS_A0789   ybgC FALSE 0.121 150.000 0.095 NA   NA
 3472740 3472741 EcHS_A0789 EcHS_A0790 ybgC tolQ TRUE 0.996 -3.000 0.593 1.000   NA
 3472741 3472742 EcHS_A0790 EcHS_A0791 tolQ tolR TRUE 0.999 4.000 0.556 0.078 Y NA
 3472742 3472743 EcHS_A0791 EcHS_A0792 tolR tolA FALSE 0.349 65.000 0.114 NA N NA
 3472743 3472744 EcHS_A0792 EcHS_A0793 tolA tolB FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 3472744 3472745 EcHS_A0793 EcHS_A0795 tolB pal FALSE 0.269 35.000 0.000 NA   NA
 3472745 3472746 EcHS_A0795 EcHS_A0796 pal ygbF TRUE 0.897 10.000 0.088 1.000   NA
 3472746 3472747 EcHS_A0796 EcHS_A4655 ygbF   FALSE 0.043 164.000 0.000 NA   NA
 3472747 3472748 EcHS_A4655 EcHS_A4656     FALSE 0.069 134.000 0.000 NA   NA
 3472748 3472749 EcHS_A4656 EcHS_A4657     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3472749 3472750 EcHS_A4657 EcHS_A4658     FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 3472750 3472751 EcHS_A4658 EcHS_A4659     TRUE 0.825 4.000 0.000 NA   NA
 3472751 3472752 EcHS_A4659 EcHS_A4660     FALSE 0.058 146.000 0.000 NA   NA
 3472752 3472753 EcHS_A4660 EcHS_A4661     FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 3472753 3472754 EcHS_A4661 EcHS_A0804   nadA FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 3472754 3472755 EcHS_A0804 EcHS_A0805 nadA pnuC TRUE 0.746 53.000 0.023 1.000 Y NA
 3472756 3472757 EcHS_A0806 EcHS_A0807 zitB   FALSE 0.175 114.000 0.057 1.000   NA
 3472759 3472760 EcHS_A0809 EcHS_A0810 gpmA galM FALSE 0.213 203.000 0.009 1.000 Y NA
 3472760 3472761 EcHS_A0810 EcHS_A0811 galM galK TRUE 0.997 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 3472761 3472762 EcHS_A0811 EcHS_A0812 galK galT TRUE 0.994 4.000 0.370 0.001 N NA
 3472762 3472763 EcHS_A0812 EcHS_A0813 galT galE TRUE 0.963 10.000 0.053 0.001 N NA
 3472763 3472764 EcHS_A0813 EcHS_A0814 galE modF FALSE 0.013 262.000 0.023 1.000   NA
 3472764 3472765 EcHS_A0814 EcHS_A0815 modF modE FALSE 0.365 68.000 0.009 0.094   NA
 3472766 3472767 EcHS_A0816 EcHS_A0817   modA FALSE 0.073 167.000 0.072 NA   NA
 3472767 3472768 EcHS_A0817 EcHS_A0818 modA modB TRUE 1.000 0.000 0.627 0.001 Y NA
 3472768 3472769 EcHS_A0818 EcHS_A0819 modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 3472773 3472774 EcHS_A0823 EcHS_A0824     FALSE 0.132 76.000 0.000 NA   NA
 3472774 3472775 EcHS_A0824 EcHS_A0825     FALSE 0.338 159.000 0.300 1.000 N NA
 3472776 3472777 EcHS_A0826 EcHS_A0827     FALSE 0.052 152.000 0.000 NA   NA
 3472777 3472778 EcHS_A0827 EcHS_A0829   bioA FALSE 0.113 59.000 0.003 NA   NA
 3472779 3472780 EcHS_A0828 EcHS_A0830 bioB bioF TRUE 0.998 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 3472780 3472781 EcHS_A0830 EcHS_A0831 bioF bioC TRUE 0.996 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 3472781 3472782 EcHS_A0831 EcHS_A0832 bioC bioD1 TRUE 0.996 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 3472782 3472783 EcHS_A0832 EcHS_A0833 bioD1 uvrB FALSE 0.008 579.000 0.000 0.094 N NA
 3472785 3472786 EcHS_A0835 EcHS_A0836 moaA moaB TRUE 0.969 22.000 0.108 0.003 Y NA
 3472786 3472787 EcHS_A0836 EcHS_A0837 moaB moaC TRUE 0.996 3.000 0.109 0.003 Y NA
 3472787 3472788 EcHS_A0837 EcHS_A0838 moaC moaD TRUE 0.997 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 3472788 3472789 EcHS_A0838 EcHS_A0839 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 3472789 3472790 EcHS_A0839 EcHS_A0840 moaE   FALSE 0.063 137.000 0.025 NA   NA
 3472790 3472791 EcHS_A0840 EcHS_A0841     FALSE 0.024 206.000 0.037 NA   NA
 3472792 3472793 EcHS_A0842 EcHS_A0843     TRUE 0.944 0.000 0.071 NA   NA
 3472793 3472794 EcHS_A0843 EcHS_A0844     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 3472796 3472797 EcHS_A0846 EcHS_A0847     TRUE 0.998 11.000 0.609 0.005 Y NA
 3472797 3472798 EcHS_A0847 EcHS_A0848     TRUE 0.996 -7.000 0.547 0.094   NA
 3472798 3472799 EcHS_A0848 EcHS_A0849     TRUE 0.994 -7.000 0.545 1.000   NA
 3472799 3472800 EcHS_A0849 EcHS_A0850     TRUE 0.978 3.000 0.236 1.000 N NA
 3472802 3472803 EcHS_A0852 EcHS_A0854     FALSE 0.148 66.000 0.000 NA   NA
 3472804 3472805 EcHS_A0853 EcHS_A0855     TRUE 0.510 28.000 0.041 1.000 N NA
 3472805 3472806 EcHS_A0855 EcHS_A0856     FALSE 0.239 141.000 0.000 0.058 N NA
 3472807 3472808 EcHS_A0857 EcHS_A0858     FALSE 0.008 265.000 0.027 NA   NA
 3472808 3472809 EcHS_A0858 EcHS_A0859     FALSE 0.195 74.000 0.000 1.000   NA
 3472809 3472810 EcHS_A0859 EcHS_A0860   fiu TRUE 0.606 42.000 0.171 1.000   NA
 3472810 3472811 EcHS_A0860 EcHS_A0861 fiu   FALSE 0.009 265.000 0.000 NA   NA
 3472813 3472814 EcHS_A0863 EcHS_A0864     FALSE 0.155 62.000 0.000 NA   NA
 3472814 3472815 EcHS_A0864 EcHS_A0865   glnQ TRUE 0.509 17.000 0.000 NA   NA
 3472815 3472816 EcHS_A0865 EcHS_A0866 glnQ glnP TRUE 0.992 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 3472816 3472817 EcHS_A0866 EcHS_A0867 glnP glnH TRUE 0.630 139.000 0.051 0.078 Y NA
 3472817 3472818 EcHS_A0867 EcHS_A0868 glnH dps FALSE 0.005 404.000 0.000 1.000 N NA
 3472818 3472819 EcHS_A0868 EcHS_A0869 dps   FALSE 0.038 169.000 0.000 NA   NA
 3472819 3472820 EcHS_A0869 EcHS_A0870   rhtA FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3472822 3472823 EcHS_A0872 EcHS_A0873     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 3472824 3472825 EcHS_A0874 EcHS_A0875 mntR   TRUE 0.933 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3472827 3472828 EcHS_A0877 EcHS_A0878     FALSE 0.011 279.000 0.000 1.000   NA
 3472829 3472830 EcHS_A0879 EcHS_A0880   supH FALSE 0.052 152.000 0.000 NA   NA
 3472830 3472831 EcHS_A0880 EcHS_A0881 supH   FALSE 0.088 146.000 0.000 1.000   NA
 3472831 3472832 EcHS_A0881 EcHS_A0882     TRUE 0.990 6.000 0.316 0.003 N NA
 3472834 3472835 EcHS_A0884 EcHS_A0885 moeB moeA TRUE 0.999 0.000 0.323 0.003 Y NA
 3472836 3472837 EcHS_A0886 EcHS_A0887   gsiA TRUE 0.947 -13.000 0.104 1.000   NA
 3472837 3472838 EcHS_A0887 EcHS_A0888 gsiA gsiB TRUE 0.700 20.000 0.083 1.000   NA
 3472838 3472839 EcHS_A0888 EcHS_A0889 gsiB gsiC TRUE 0.996 18.000 0.803 0.066 Y NA
 3472839 3472840 EcHS_A0889 EcHS_A0890 gsiC gsiD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.066 Y NA
 3472840 3472841 EcHS_A0890 EcHS_A0891 gsiD   FALSE 0.039 178.000 0.000 NA N NA
 3472841 3472842 EcHS_A0891 EcHS_A0892     TRUE 0.976 8.000 0.000 NA Y NA
 3472843 3472844 EcHS_A0893 EcHS_A0894     TRUE 0.980 -10.000 0.300 NA   NA
 3472844 3472845 EcHS_A0894 EcHS_A0895     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 3472846 3472847 EcHS_A0896 EcHS_A0897 bssR   FALSE 0.088 111.000 0.000 NA   NA
 3472850 3472851 EcHS_A0901 EcHS_A0902 deoR   TRUE 0.603 58.000 0.235 1.000   NA
 3472852 3472853 EcHS_A0903 EcHS_A0904   mdfA TRUE 0.836 -15.000 0.000 NA   NA
 3472854 3472855 EcHS_A0905 EcHS_A0906   ybjI FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 3472855 3472856 EcHS_A0906 EcHS_A0907 ybjI   TRUE 0.932 0.000 0.000 1.000   NA
 3472861 3472862 EcHS_A0912 EcHS_A0913     TRUE 0.599 33.000 0.154 NA   NA
 3472862 3472863 EcHS_A0913 EcHS_A0914     FALSE 0.036 172.000 0.000 NA   NA
 3472863 3472864 EcHS_A0914 EcHS_A0915     TRUE 0.684 68.000 0.400 NA   NA
 3472864 3472865 EcHS_A0915 EcHS_A0916     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 3472865 3472866 EcHS_A0916 EcHS_A0917     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 N NA
 3472866 3472867 EcHS_A0917 EcHS_A0918     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3472867 3472868 EcHS_A0918 EcHS_A0919     TRUE 0.471 155.000 0.500 NA   NA
 3472868 3472869 EcHS_A0919 EcHS_A0920     TRUE 0.987 11.000 0.750 NA   NA
 3472869 3472870 EcHS_A0920 EcHS_A0921     TRUE 0.485 60.000 0.200 NA   NA
 3472870 3472871 EcHS_A0921 EcHS_A0922     FALSE 0.007 286.000 0.000 NA   NA
 3472872 3472873 EcHS_A0923 EcHS_A0924     TRUE 0.996 0.000 0.667 NA   NA
 3472874 3472875 EcHS_A0925 EcHS_A0926     TRUE 0.617 17.000 0.000 1.000   NA
 3472875 3472876 EcHS_A0926 EcHS_A0927     TRUE 0.880 4.000 0.000 1.000   NA
 3472876 3472877 EcHS_A0927 EcHS_A0928     TRUE 0.745 33.000 0.000 0.001   NA
 3472877 3472878 EcHS_A0928 EcHS_A0929     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3472878 3472879 EcHS_A0929 EcHS_A0930     TRUE 0.996 4.000 1.000 NA   NA
 3472879 3472880 EcHS_A0930 EcHS_A0931     TRUE 0.993 -19.000 0.667 NA   NA
 3472880 3472881 EcHS_A0931 EcHS_A0932     TRUE 0.995 2.000 0.667 NA   NA
 3472881 3472882 EcHS_A0932 EcHS_A0933     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3472882 3472883 EcHS_A0933 EcHS_A0934   gpR TRUE 0.845 96.000 1.000 NA   NA
 3472883 3472884 EcHS_A0934 EcHS_A0935 gpR   TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 3472884 3472885 EcHS_A0935 EcHS_A0936     TRUE 0.892 69.000 1.000 NA   NA
 3472885 3472886 EcHS_A0936 EcHS_A0937     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472886 3472887 EcHS_A0937 EcHS_A0938     TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 3472887 3472888 EcHS_A0938 EcHS_A0939     TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 3472888 3472889 EcHS_A0939 EcHS_A0940     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3472889 3472890 EcHS_A0940 EcHS_A0941     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3472890 3472891 EcHS_A0941 EcHS_A0942     FALSE 0.090 107.000 0.000 NA   NA
 3472891 3472892 EcHS_A0942 EcHS_A0943     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3472892 3472893 EcHS_A0943 EcHS_A0944     FALSE 0.179 55.000 0.000 NA   NA
 3472893 3472894 EcHS_A0944 EcHS_A0945     TRUE 0.559 15.000 0.000 NA   NA
 3472894 3472895 EcHS_A0945 EcHS_A0946     TRUE 0.874 -7.000 0.000 NA   NA
 3472895 3472896 EcHS_A0946 EcHS_A0947     TRUE 0.989 0.000 0.333 NA   NA
 3472896 3472897 EcHS_A0947 EcHS_A0948     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3472897 3472898 EcHS_A0948 EcHS_A0949     FALSE 0.108 91.000 0.000 NA   NA
 3472899 3472900 EcHS_A4738 EcHS_A0950 rybB   FALSE 0.123 80.000 0.000 NA   NA
 3472903 3472904 EcHS_A0953 EcHS_A0954   nfsA TRUE 0.950 -16.000 0.159 NA   NA
 3472904 3472905 EcHS_A0954 EcHS_A0955 nfsA rimK FALSE 0.246 61.000 0.000 1.000 N NA
 3472905 3472906 EcHS_A0955 EcHS_A0956 rimK   FALSE 0.351 40.000 0.065 NA   NA
 3472906 3472907 EcHS_A0956 EcHS_A0957   potF FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3472907 3472908 EcHS_A0957 EcHS_A0958 potF potG TRUE 0.935 95.000 0.679 1.000 Y NA
 3472908 3472909 EcHS_A0958 EcHS_A0959 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 3472909 3472910 EcHS_A0959 EcHS_A0960 potH potI TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.065 Y NA
 3472910 3472911 EcHS_A0960 EcHS_A0961 potI   TRUE 0.576 60.000 0.264 NA   NA
 3472911 3472912 EcHS_A0961 EcHS_A0962   rumB TRUE 0.649 41.000 0.226 NA   NA
 3472912 3472913 EcHS_A0962 EcHS_A0963 rumB   TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3472914 3472915 EcHS_A0964 EcHS_A0965 artJ artM FALSE 0.358 226.000 0.143 0.077 Y NA
 3472915 3472916 EcHS_A0965 EcHS_A0966 artM artQ TRUE 1.000 0.000 0.714 0.016 Y NA
 3472916 3472917 EcHS_A0966 EcHS_A0967 artQ artI TRUE 0.996 7.000 0.260 0.065 Y NA
 3472917 3472918 EcHS_A0967 EcHS_A0968 artI artP TRUE 0.978 18.000 0.323 1.000 Y NA
 3472918 3472919 EcHS_A0968 EcHS_A0969 artP   FALSE 0.046 218.000 0.081 1.000   NA
 3472920 3472921 EcHS_A0970 EcHS_A0971   amiD TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3472922 3472923 EcHS_A0972 EcHS_A0973     TRUE 0.839 63.000 0.022 0.003 Y NA
 3472923 3472924 EcHS_A0973 EcHS_A0974   ltaE TRUE 0.868 11.000 0.074 1.000 N NA
 3472924 3472925 EcHS_A0974 EcHS_A0975 ltaE poxB TRUE 0.830 37.000 0.041 1.000 Y NA
 3472925 3472926 EcHS_A0975 EcHS_A0976 poxB hcr FALSE 0.114 133.000 0.025 1.000 N NA
 3472926 3472927 EcHS_A0976 EcHS_A0977 hcr hcp TRUE 0.980 12.000 0.000 0.020 Y NA
 3472927 3472928 EcHS_A0977 EcHS_A0978 hcp   FALSE 0.090 144.000 0.000 1.000   NA
 3472928 3472929 EcHS_A0978 EcHS_A0979   aqpZ FALSE 0.003 495.000 0.025 1.000   NA
 3472932 3472933 EcHS_A0982 EcHS_A0983 macA macB TRUE 0.998 -3.000 0.789 1.000 N NA
 3472935 3472936 EcHS_A0985 EcHS_A0986 clpS clpA TRUE 0.911 31.000 0.596 NA   NA
 3472937 3472938 EcHS_A4662 EcHS_A0988   infA FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 3472938 3472939 EcHS_A0988 EcHS_A0989 infA aat FALSE 0.011 285.000 0.020 1.000 N NA
 3472939 3472940 EcHS_A0989 EcHS_A0990 aat cudC TRUE 0.816 42.000 0.049 1.000 Y NA
 3472940 3472941 EcHS_A0990 EcHS_A0991 cudC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 3472941 3472942 EcHS_A0991 EcHS_A0992 cydD trxB TRUE 0.566 123.000 0.049 1.000 Y NA
 3472943 3472944 EcHS_A0993 EcHS_A0994   lrp FALSE 0.004 363.000 0.000 NA   NA
 3472944 3472945 EcHS_A0994 EcHS_A0995 lrp ftsK TRUE 0.490 135.000 0.345 1.000 N NA
 3472945 3472946 EcHS_A0995 EcHS_A0996 ftsK lolA FALSE 0.356 155.000 0.305 1.000 N NA
 3472946 3472947 EcHS_A0996 EcHS_A0997 lolA   TRUE 0.926 11.000 0.167 1.000 N NA
 3472947 3472948 EcHS_A0997 EcHS_A0998   serS TRUE 0.422 91.000 0.078 0.091 N NA
 3472948 3472949 EcHS_A0998 EcHS_A0999 serS dmsA FALSE 0.021 239.000 0.000 1.000 N NA
 3472949 3472950 EcHS_A0999 EcHS_A1000 dmsA dmsB2 TRUE 0.990 11.000 0.172 0.060 Y NA
 3472950 3472951 EcHS_A1000 EcHS_A1001 dmsB2 dmsC1 TRUE 0.987 2.000 0.333 1.000   NA
 3472952 3472953 EcHS_A1002 EcHS_A1003     FALSE 0.037 170.000 0.000 NA   NA
 3472954 3472955 EcHS_A1004 EcHS_A1005     TRUE 0.626 18.000 0.000 1.000 N NA
 3472958 3472959 EcHS_A1008 EcHS_A1009 pflA pflB2 FALSE 0.084 192.000 0.092 1.000 N NA
 3472959 3472960 EcHS_A1009 EcHS_A1010 pflB2   TRUE 0.741 55.000 0.345 1.000 N NA
 3472960 3472961 EcHS_A1010 EcHS_A1011     FALSE 0.003 406.000 0.000 NA   NA
 3472962 3472963 EcHS_A1012 EcHS_A1013   serC FALSE 0.018 199.000 0.014 NA   NA
 3472963 3472964 EcHS_A1013 EcHS_A1014 serC aroA TRUE 0.686 71.000 0.033 1.000 Y NA
 3472964 3472965 EcHS_A1014 EcHS_A1015 aroA   FALSE 0.051 169.000 0.003 1.000 N NA
 3472965 3472966 EcHS_A1015 EcHS_A1016   cmk FALSE 0.048 173.000 0.004 1.000 N NA
 3472966 3472967 EcHS_A1016 EcHS_A1017 cmk rpsA TRUE 0.484 111.000 0.281 1.000 N NA
 3472967 3472968 EcHS_A1017 EcHS_A1018 rpsA ihfB FALSE 0.327 160.000 0.292 1.000 N NA
 3472968 3472969 EcHS_A1018 EcHS_A1019 ihfB   FALSE 0.074 130.000 0.000 NA   NA
 3472969 3472970 EcHS_A1019 EcHS_A1021   msbA FALSE 0.256 37.000 0.000 NA   NA
 3472970 3472971 EcHS_A1021 EcHS_A1022 msbA lpxK TRUE 0.984 -3.000 0.205 1.000 N NA
 3472971 3472972 EcHS_A1022 EcHS_A1023 lpxK   FALSE 0.217 37.000 0.017 NA   NA
 3472972 3472973 EcHS_A1023 EcHS_A1024     FALSE 0.159 52.000 0.016 NA   NA
 3472973 3472974 EcHS_A1024 EcHS_A1025   kdsB TRUE 0.986 -3.000 0.265 NA   NA
 3472974 3472975 EcHS_A1025 EcHS_A1026 kdsB   FALSE 0.045 154.000 0.023 NA   NA
 3472977 3472978 EcHS_A1028 EcHS_A1029 smtA mukF TRUE 0.990 -3.000 0.325 NA N NA
 3472978 3472979 EcHS_A1029 EcHS_A1030 mukF mukE TRUE 0.982 -19.000 0.036 NA Y NA
 3472979 3472980 EcHS_A1030 EcHS_A1031 mukE mukB TRUE 0.997 0.000 0.000 0.001 Y NA
 3472980 3472981 EcHS_A1031 EcHS_A1032 mukB   FALSE 0.014 261.000 0.000 1.000   NA
 3472981 3472982 EcHS_A1032 EcHS_A1033     FALSE 0.278 181.000 0.372 NA   NA
 3472982 3472983 EcHS_A1033 EcHS_A1034     TRUE 0.553 27.000 0.089 NA   NA
 3472984 3472985 EcHS_A1035 EcHS_A1036   aspC FALSE 0.013 279.000 0.000 1.000 N NA
 3472985 3472986 EcHS_A1036 EcHS_A1037 aspC ompF FALSE 0.055 185.000 0.036 1.000 N NA
 3472986 3472987 EcHS_A1037 EcHS_A1038 ompF asnS FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 3472987 3472988 EcHS_A1038 EcHS_A1039 asnS pncB FALSE 0.070 169.000 0.034 1.000 N NA
 3472989 3472990 EcHS_A1040 EcHS_A1041   pepN FALSE 0.263 36.000 0.000 NA   NA
 3472991 3472992 EcHS_A1042 EcHS_A1043     TRUE 0.999 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 3472992 3472993 EcHS_A1043 EcHS_A1044   ssuD TRUE 0.947 11.000 0.226 1.000 N NA
 3472993 3472994 EcHS_A1044 EcHS_A1045 ssuD   TRUE 0.992 -3.000 0.341 1.000 N NA
 3472994 3472995 EcHS_A1045 EcHS_A1046     TRUE 0.952 -49.000 0.169 1.000   NA
 3472996 3472997 EcHS_A1047 EcHS_A1048     FALSE 0.119 83.000 0.000 NA   NA
 3472997 3472998 EcHS_A1048 EcHS_A1049     TRUE 0.987 25.000 0.667 1.000 Y NA
 3472998 3472999 EcHS_A1049 EcHS_A1050     TRUE 0.988 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 3472999 3473000 EcHS_A1050 EcHS_A1051     TRUE 0.981 12.000 0.000 0.009 Y NA
 3473000 3473001 EcHS_A1051 EcHS_A1052     TRUE 0.999 8.000 0.667 0.009 Y NA
 3473001 3473002 EcHS_A1052 EcHS_A1053     TRUE 0.997 -34.000 0.500 1.000 Y NA
 3473002 3473003 EcHS_A1053 EcHS_A1054   pyrD FALSE 0.146 110.000 0.000 1.000 N NA
 3473003 3473004 EcHS_A1054 EcHS_A1055 pyrD   FALSE 0.129 138.000 0.081 NA   NA
 3473006 3473007 EcHS_A1057 EcHS_A1058   uup TRUE 0.814 12.000 0.061 1.000   NA
 3473007 3473008 EcHS_A1058 EcHS_A1059 uup pqiA FALSE 0.107 130.000 0.054 NA   NA
 3473008 3473009 EcHS_A1059 EcHS_A1060 pqiA pqiB TRUE 0.994 5.000 0.819 NA   NA
 3473009 3473010 EcHS_A1060 EcHS_A1061 pqiB   TRUE 0.994 -3.000 0.531 NA   NA
 3473010 3473011 EcHS_A1061 EcHS_A1062   rmf FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 3473012 3473013 EcHS_A1063 EcHS_A1064 fabA   TRUE 0.626 69.000 0.290 1.000 N NA
 3473015 3473016 EcHS_A1066 EcHS_A1067 ompA sulA FALSE 0.007 357.000 0.000 1.000 N NA
 3473018 3473019 EcHS_A1069 EcHS_A1070     TRUE 0.871 10.000 0.090 NA   NA
 3473021 3473022 EcHS_A1072 EcHS_A1073 mgsA   FALSE 0.143 96.000 0.055 NA   NA
 3473024 3473025 EcHS_A1075 EcHS_A1076     FALSE 0.325 58.000 0.094 NA   NA
 3473025 3473026 EcHS_A1076 EcHS_A1077   tusE FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 3473026 3473027 EcHS_A1077 EcHS_A1078 tusE   FALSE 0.287 91.000 0.140 NA   NA
 3473027 3473028 EcHS_A1078 EcHS_A4663     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 3473029 3473030 EcHS_A1080 EcHS_A1081 hyaA hyaB TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 3473030 3473031 EcHS_A1081 EcHS_A1082 hyaB hyaC TRUE 0.987 19.000 0.355 0.060 Y NA
 3473031 3473032 EcHS_A1082 EcHS_A1083 hyaC hyaD TRUE 0.996 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 3473032 3473033 EcHS_A1083 EcHS_A1084 hyaD hyaE TRUE 0.959 -3.000 0.096 NA   NA
 3473033 3473034 EcHS_A1084 EcHS_A1085 hyaE hyaF TRUE 0.997 -3.000 0.769 NA   NA
 3473034 3473035 EcHS_A1085 EcHS_A1086 hyaF appC FALSE 0.110 134.000 0.061 NA   NA
 3473035 3473036 EcHS_A1086 EcHS_A1087 appC appB TRUE 0.988 12.000 0.158 0.060 Y NA
 3473036 3473037 EcHS_A1087 EcHS_A1088 appB   TRUE 0.811 13.000 0.105 NA   NA
 3473037 3473038 EcHS_A1088 EcHS_A1089   appA FALSE 0.123 80.000 0.000 NA   NA
 3473039 3473040 EcHS_A1090 EcHS_A1091 etk1 etp TRUE 0.980 20.000 1.000 1.000 N NA
 3473040 3473041 EcHS_A1091 EcHS_A1092 etp yccZ TRUE 0.995 -12.000 0.750 1.000 N NA
 3473041 3473042 EcHS_A1092 EcHS_A1094 yccZ ymcA FALSE 0.373 25.000 0.000 NA   NA
 3473042 3473043 EcHS_A1094 EcHS_A1095 ymcA ymcB TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3473043 3473044 EcHS_A1095 EcHS_A1096 ymcB ymcC TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 3473044 3473045 EcHS_A1096 EcHS_A1097 ymcC   FALSE 0.090 107.000 0.000 NA   NA
 3473045 3473046 EcHS_A1097 EcHS_A1098     FALSE 0.003 424.000 0.000 NA   NA
 3473047 3473048 EcHS_A1099 EcHS_A1100     FALSE 0.035 174.000 0.000 NA   NA
 3473049 3473050 EcHS_A1101 EcHS_A1102     FALSE 0.288 33.000 0.000 NA   NA
 3473050 3473051 EcHS_A1102 EcHS_A1103     TRUE 0.772 -126.000 0.000 NA   NA
 3473051 3473052 EcHS_A1103 EcHS_A1104   torS FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3473055 3473056 EcHS_A1107 EcHS_A1108 torC torA TRUE 0.995 0.000 0.000 0.059 Y NA
 3473056 3473057 EcHS_A1108 EcHS_A1109 torA torD TRUE 0.983 -3.000 0.077 0.059   NA
 3473058 3473059 EcHS_A1110 EcHS_A1111   cbpM TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3473059 3473060 EcHS_A1111 EcHS_A1112 cbpM cbpA TRUE 0.994 0.000 0.512 NA   NA
 3473061 3473062 EcHS_A1113 EcHS_A1114     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 3473062 3473063 EcHS_A1114 EcHS_A1115   agp FALSE 0.062 141.000 0.000 NA   NA
 3473064 3473065 EcHS_A1116 EcHS_A1117   wrbA TRUE 0.859 21.000 0.290 NA   NA
 3473066 3473067 EcHS_A1118 EcHS_A1119     TRUE 0.618 13.000 0.000 NA   NA
 3473067 3473068 EcHS_A1119 EcHS_A1120     FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 3473069 3473070 EcHS_A1121 EcHS_A1122     TRUE 0.944 21.000 0.533 1.000   NA
 3473070 3473071 EcHS_A1122 EcHS_A1123     TRUE 0.992 11.000 0.625 0.048   NA
 3473071 3473072 EcHS_A1123 EcHS_A1124     TRUE 0.953 10.000 0.256 NA   NA
 3473072 3473073 EcHS_A1124 EcHS_A1125     TRUE 0.976 8.000 0.365 NA   NA
 3473073 3473074 EcHS_A1125 EcHS_A1126     TRUE 0.967 12.000 0.442 NA N NA
 3473074 3473075 EcHS_A1126 EcHS_A1127     TRUE 0.996 -3.000 0.621 NA N NA
 3473077 3473078 EcHS_A1129 EcHS_A1130 putA   FALSE 0.052 152.000 0.000 NA   NA
 3473079 3473080 EcHS_A1131 EcHS_A1132 putP   FALSE 0.002 542.000 0.000 NA N NA
 3473080 3473081 EcHS_A1132 EcHS_A1133     TRUE 0.904 58.000 0.356 NA Y NA
 3473081 3473082 EcHS_A1133 EcHS_A1134     TRUE 0.995 6.000 0.378 NA Y NA
 3473082 3473083 EcHS_A1134 EcHS_A1135   phoH FALSE 0.005 345.000 0.000 NA N NA
 3473084 3473085 EcHS_A1136 EcHS_A1137 pgaD pgaC TRUE 0.990 2.000 0.462 NA   NA
 3473085 3473086 EcHS_A1137 EcHS_A1138 pgaC pgaB TRUE 0.992 -7.000 0.435 1.000 N NA
 3473086 3473087 EcHS_A1138 EcHS_A1139 pgaB   TRUE 0.769 9.000 0.000 NA   NA
 3473087 3473088 EcHS_A1139 EcHS_A1140     FALSE 0.182 54.000 0.000 NA   NA
 3473088 3473089 EcHS_A1140 EcHS_A1141     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.024 Y NA
 3473089 3473090 EcHS_A1141 EcHS_A1142     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 3473092 3473093 EcHS_A1145 EcHS_A1146     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3473094 3473095 EcHS_A1147 EcHS_A1148     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3473096 3473097 EcHS_A4664 EcHS_A1150     FALSE 0.096 99.000 0.000 NA   NA
 3473098 3473099 EcHS_A1151 EcHS_A1152     TRUE 0.849 55.000 0.169 1.000 Y NA
 3473099 3473100 EcHS_A1152 EcHS_A1153     TRUE 0.908 24.000 0.417 1.000   NA
 3473100 3473101 EcHS_A1153 EcHS_A1154     FALSE 0.265 102.000 0.145 NA   NA
 3473102 3473103 EcHS_A1155 EcHS_A1156 csgG csgF FALSE 0.406 27.000 0.043 NA   NA
 3473103 3473104 EcHS_A1156 EcHS_A1157 csgF csgE TRUE 0.950 25.000 0.723 NA   NA
 3473104 3473105 EcHS_A1157 EcHS_A1158 csgE csgD TRUE 0.948 5.000 0.176 NA   NA
 3473105 3473106 EcHS_A1158 EcHS_A1159 csgD   FALSE 0.002 467.000 0.000 NA   NA
 3473107 3473108 EcHS_A1160 EcHS_A1161 csgB csgA TRUE 0.884 41.000 0.333 0.009   NA
 3473108 3473109 EcHS_A1161 EcHS_A1162 csgA csgC TRUE 0.846 59.000 0.667 NA   NA
 3473110 3473111 EcHS_A1163 EcHS_A1164     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.024 Y NA
 3473112 3473113 EcHS_A1165 EcHS_A1166     FALSE 0.147 95.000 0.028 1.000   NA
 3473113 3473114 EcHS_A1166 EcHS_A1167     TRUE 0.931 -7.000 0.046 1.000   NA
 3473115 3473116 EcHS_A1168 EcHS_A1169 mdoC   FALSE 0.218 45.000 0.000 NA   NA
 3473117 3473118 EcHS_A1170 EcHS_A1171 mdoG mdoH TRUE 0.993 -7.000 0.469 1.000 N NA
 3473118 3473119 EcHS_A1171 EcHS_A1172 mdoH   TRUE 0.769 9.000 0.000 NA   NA
 3473119 3473120 EcHS_A1172 EcHS_A1173     TRUE 0.863 -9.000 0.000 NA   NA
 3473121 3473122 EcHS_A1174 EcHS_A1175 msyB mdtG TRUE 0.574 83.000 0.333 NA   NA
 3473126 3473127 EcHS_A1179 EcHS_A1180 yceI   TRUE 0.994 4.000 0.676 1.000   NA
 3473127 3473128 EcHS_A1180 EcHS_A1181     FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 3473128 3473129 EcHS_A1181 EcHS_A1182   solA TRUE 0.655 48.000 0.269 NA   NA
 3473129 3473130 EcHS_A1182 EcHS_A1183 solA   TRUE 0.565 115.000 0.423 NA   NA
 3473130 3473131 EcHS_A1183 EcHS_A1184   dinI FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 3473131 3473132 EcHS_A1184 EcHS_A1185 dinI pyrC FALSE 0.141 74.000 0.031 NA   NA
 3473132 3473133 EcHS_A1185 EcHS_A1186 pyrC   FALSE 0.082 106.000 0.022 NA   NA
 3473133 3473134 EcHS_A1186 EcHS_A1187   grxB FALSE 0.131 134.000 0.078 NA   NA
 3473134 3473135 EcHS_A1187 EcHS_A1188 grxB mdtH FALSE 0.394 64.000 0.103 1.000 N NA
 3473136 3473137 EcHS_A1189 EcHS_A1190 rimJ   TRUE 0.868 11.000 0.116 NA   NA
 3473137 3473138 EcHS_A1190 EcHS_A1191     TRUE 0.944 2.000 0.103 NA   NA
 3473138 3473139 EcHS_A1191 EcHS_A1192   mviN FALSE 0.123 110.000 0.022 1.000   NA
 3473140 3473141 EcHS_A1193 EcHS_A1194 flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 3473141 3473142 EcHS_A1194 EcHS_A1195 flgM flgA TRUE 0.863 76.000 0.330 NA Y NA
 3473143 3473144 EcHS_A1196 EcHS_A1197 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 3473144 3473145 EcHS_A1197 EcHS_A1198 flgC flgD TRUE 0.979 12.000 0.186 NA Y NA
 3473145 3473146 EcHS_A1198 EcHS_A1199 flgD flgE TRUE 0.913 25.000 0.116 NA Y NA
 3473146 3473147 EcHS_A1199 EcHS_A1200 flgE flgF TRUE 0.992 20.000 0.476 0.003 Y NA
 3473147 3473148 EcHS_A1200 EcHS_A1201 flgF flgG TRUE 0.847 172.000 0.420 0.001 Y NA
 3473148 3473149 EcHS_A1201 EcHS_A1202 flgG flgH TRUE 0.947 53.000 0.268 0.005 Y NA
 3473149 3473150 EcHS_A1202 EcHS_A1203 flgH flgI TRUE 0.985 12.000 0.073 0.006 Y NA
 3473150 3473151 EcHS_A1203 EcHS_A1204 flgI flgJ TRUE 0.996 0.000 0.036 0.006 Y NA
 3473151 3473152 EcHS_A1204 EcHS_A1205 flgJ flgK TRUE 0.980 66.000 0.705 0.002 Y NA
 3473152 3473153 EcHS_A1205 EcHS_A1206 flgK flgL TRUE 0.990 12.000 0.142 0.001 Y NA
 3473157 3473158 EcHS_A4740 EcHS_A1210 sraB   FALSE 0.256 37.000 0.000 NA   NA
 3473158 3473159 EcHS_A1210 EcHS_A1211   rpmF TRUE 0.844 52.000 0.599 NA   NA
 3473159 3473160 EcHS_A1211 EcHS_A1212 rpmF plsX TRUE 0.697 81.000 0.418 1.000 N NA
 3473160 3473161 EcHS_A1212 EcHS_A1213 plsX fabH TRUE 0.952 68.000 0.380 0.004 Y NA
 3473161 3473162 EcHS_A1213 EcHS_A1214 fabH fabD TRUE 0.985 16.000 0.182 0.004 Y NA
 3473162 3473163 EcHS_A1214 EcHS_A1215 fabD fabG TRUE 0.995 13.000 0.432 0.004 Y NA
 3473163 3473164 EcHS_A1215 EcHS_A1216 fabG acpP TRUE 0.651 211.000 0.321 0.004 Y NA
 3473164 3473165 EcHS_A1216 EcHS_A1217 acpP fabF TRUE 0.868 88.000 0.346 1.000 Y NA
 3473165 3473166 EcHS_A1217 EcHS_A1218 fabF pabC TRUE 0.532 120.000 0.187 0.032 N NA
 3473166 3473167 EcHS_A1218 EcHS_A1219 pabC   TRUE 0.966 3.000 0.204 NA   NA
 3473167 3473168 EcHS_A1219 EcHS_A1220   tmk TRUE 0.968 -10.000 0.209 NA   NA
 3473168 3473169 EcHS_A1220 EcHS_A1221 tmk holB TRUE 0.985 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3473169 3473170 EcHS_A1221 EcHS_A1222 holB   TRUE 0.976 11.000 0.110 NA Y NA
 3473170 3473171 EcHS_A1222 EcHS_A1223   ptsG FALSE 0.005 295.000 0.004 NA N NA
 3473172 3473173 EcHS_A1224 EcHS_A1225 fhuE   FALSE 0.288 33.000 0.000 NA   NA
 3473174 3473175 EcHS_A1226 EcHS_A1227 hinT   TRUE 0.888 3.000 0.051 NA   NA
 3473175 3473176 EcHS_A1227 EcHS_A1228     TRUE 0.963 14.000 0.516 NA   NA
 3473176 3473177 EcHS_A1228 EcHS_A1229   thiK TRUE 0.976 -19.000 0.310 NA   NA
 3473177 3473178 EcHS_A1229 EcHS_A1230 thiK nagZ TRUE 0.863 11.000 0.069 1.000 N NA
 3473178 3473179 EcHS_A1230 EcHS_A1231 nagZ   TRUE 0.610 23.000 0.091 NA   NA
 3473179 3473180 EcHS_A1231 EcHS_A1232   ndh FALSE 0.004 408.000 0.057 NA   NA
 3473180 3473181 EcHS_A1232 EcHS_A1233 ndh   FALSE 0.036 227.000 0.071 1.000   NA
 3473184 3473185 EcHS_A1236 EcHS_A1237   mfd FALSE 0.071 144.000 0.006 1.000   NA
 3473185 3473186 EcHS_A1237 EcHS_A1238 mfd   FALSE 0.087 128.000 0.003 1.000   NA
 3473187 3473188 EcHS_A1239 EcHS_A1240 lolD lolE TRUE 0.986 0.000 0.125 0.074 N NA
 3473188 3473189 EcHS_A1240 EcHS_A1241 lolE nagK TRUE 0.787 29.000 0.225 1.000 N NA
 3473189 3473190 EcHS_A1241 EcHS_A1242 nagK npdA TRUE 0.959 16.000 0.119 1.000 Y NA
 3473191 3473192 EcHS_A1243 EcHS_A1244 potD potC TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.063 Y NA
 3473192 3473193 EcHS_A1244 EcHS_A1245 potC potB TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.063 Y NA
 3473193 3473194 EcHS_A1245 EcHS_A1246 potB potA TRUE 0.999 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 3473196 3473197 EcHS_A1248 EcHS_A1249   phoQ TRUE 0.666 76.000 0.408 NA   NA
 3473197 3473198 EcHS_A1249 EcHS_A1250 phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 3473198 3473199 EcHS_A1250 EcHS_A1251 phoP purB FALSE 0.054 169.000 0.011 1.000 N NA
 3473199 3473200 EcHS_A1251 EcHS_A1252 purB   TRUE 0.919 4.000 0.093 NA   NA
 3473200 3473201 EcHS_A1252 EcHS_A1253   trmU TRUE 0.611 36.000 0.180 NA   NA
 3473201 3473202 EcHS_A1253 EcHS_A1254 trmU   TRUE 0.533 54.000 0.158 1.000 N NA
 3473202 3473203 EcHS_A1254 EcHS_A1255   rluE TRUE 0.945 10.000 0.182 1.000 N NA
 3473205 3473206 EcHS_A1257 EcHS_A1258   mlrA FALSE 0.016 221.000 0.000 NA   NA
 3473206 3473207 EcHS_A1258 EcHS_A1259 mlrA   FALSE 0.212 205.000 0.333 1.000 N NA
 3473207 3473208 EcHS_A1259 EcHS_A1260     FALSE 0.003 640.000 0.000 1.000 N NA
 3473208 3473209 EcHS_A1260 EcHS_A1261     TRUE 0.822 57.000 0.000 0.071 Y NA
 3473210 3473211 EcHS_A1262 EcHS_A1263     FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 3473211 3473212 EcHS_A1263 EcHS_A1264     FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 3473212 3473213 EcHS_A1264 EcHS_A1265     FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 3473213 3473214 EcHS_A1265 EcHS_A1266     FALSE 0.104 93.000 0.000 NA   NA
 3473214 3473215 EcHS_A1266 EcHS_A1267     FALSE 0.043 164.000 0.000 NA   NA
 3473215 3473216 EcHS_A1267 EcHS_A1268     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 3473217 3473218 EcHS_A1269 EcHS_A1270     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3473218 3473219 EcHS_A1270 EcHS_A1271     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3473220 3473221 EcHS_A1272 EcHS_A1273     FALSE 0.041 166.000 0.000 NA   NA
 3473222 3473223 EcHS_A1274 EcHS_A1275 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 3473223 3473224 EcHS_A1275 EcHS_A1276 minD minC TRUE 0.978 24.000 0.466 1.000 Y NA
 3473227 3473228 EcHS_A1279 EcHS_A1280     FALSE 0.199 72.000 0.056 NA   NA
 3473228 3473229 EcHS_A1280 EcHS_A1281     FALSE 0.253 77.000 0.088 NA   NA
 3473230 3473231 EcHS_A1283 EcHS_A1285     TRUE 0.874 -7.000 0.000 NA   NA
 3473232 3473233 EcHS_A4741 EcHS_A1286   umuD FALSE 0.160 60.000 0.000 NA   NA
 3473233 3473234 EcHS_A1286 EcHS_A1287 umuD umuC TRUE 0.940 0.000 0.000 1.000 N NA
 3473235 3473236 EcHS_A1288 EcHS_A1289 dsbB nhaB TRUE 0.704 146.000 0.723 1.000 N NA
 3473239 3473240 EcHS_A1292 EcHS_A1293 dadA alr1 TRUE 0.940 10.000 0.168 1.000 N NA
 3473241 3473242 EcHS_A1294 EcHS_A1296 cvrA ldcA FALSE 0.242 95.000 0.103 NA N NA
 3473245 3473246 EcHS_A1298 EcHS_A1299     FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 3473249 3473250 EcHS_A1302 EcHS_A1303 dhaM   TRUE 0.895 11.000 0.118 1.000   NA
 3473250 3473251 EcHS_A1303 EcHS_A1304   dhaK TRUE 0.995 11.000 0.226 0.001 Y NA
 3473255 3473256 EcHS_A1308 EcHS_A1309 engD pth TRUE 0.720 117.000 0.184 1.000 Y NA
 3473258 3473259 EcHS_A1311 EcHS_A1312 ychM prs FALSE 0.086 152.000 0.027 1.000 N NA
 3473259 3473260 EcHS_A1312 EcHS_A1313 prs ispE FALSE 0.114 151.000 0.053 1.000 N NA
 3473260 3473261 EcHS_A1313 EcHS_A1314 ispE lolB TRUE 0.978 0.000 0.157 1.000 N NA
 3473262 3473263 EcHS_A1315 EcHS_A1316 hemA prfA TRUE 0.770 42.000 0.171 0.049 N NA
 3473263 3473264 EcHS_A1316 EcHS_A1317 prfA hemK TRUE 0.998 0.000 0.229 0.049 Y NA
 3473264 3473265 EcHS_A1317 EcHS_A1318 hemK   TRUE 0.963 -3.000 0.109 NA   NA
 3473265 3473266 EcHS_A1318 EcHS_A1319   sirB1 TRUE 0.958 4.000 0.195 NA   NA
 3473266 3473267 EcHS_A1319 EcHS_A1320 sirB1 kdsA TRUE 0.520 36.000 0.089 1.000   NA
 3473267 3473268 EcHS_A1320 EcHS_A1321 kdsA   FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 3473269 3473270 EcHS_A1322 EcHS_A1323     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 3473270 3473271 EcHS_A1323 EcHS_A1324     FALSE 0.003 378.000 0.000 NA   NA
 3473272 3473273 EcHS_A1325 EcHS_A1326     FALSE 0.192 137.000 0.140 NA   NA
 3473275 3473276 EcHS_A1328 EcHS_A1329     TRUE 0.792 -67.000 0.000 NA   NA
 3473277 3473278 EcHS_A1330 EcHS_A1331 narL narX TRUE 0.999 -7.000 0.521 0.015 Y NA
 3473279 3473280 EcHS_A1332 EcHS_A1333   narK FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 3473280 3473281 EcHS_A1333 EcHS_A1334 narK narG FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000 N NA
 3473281 3473282 EcHS_A1334 EcHS_A1335 narG narH TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 3473282 3473283 EcHS_A1335 EcHS_A1336 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 3473283 3473284 EcHS_A1336 EcHS_A1337 narJ narI2 TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 3473285 3473286 EcHS_A4665 EcHS_A4666     FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 3473286 3473287 EcHS_A4666 EcHS_A1340   purU FALSE 0.046 159.000 0.000 NA   NA
 3473287 3473288 EcHS_A1340 EcHS_A1341 purU   TRUE 0.552 50.000 0.200 NA   NA
 3473289 3473290 EcHS_A1342 EcHS_A1343     FALSE 0.190 92.000 0.048 1.000   NA
 3473290 3473291 EcHS_A1343 EcHS_A1344   galU FALSE 0.158 202.000 0.235 1.000 N NA
 3473292 3473293 EcHS_A1345 EcHS_A1346     FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 3473295 3473296 EcHS_A1348 EcHS_A1350   adhE FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 3473297 3473298 EcHS_A1351 EcHS_A1352   oppA FALSE 0.002 738.000 0.000 NA N NA
 3473298 3473299 EcHS_A1352 EcHS_A1353 oppA oppB TRUE 0.837 86.000 0.151 0.062 Y NA
 3473299 3473300 EcHS_A1353 EcHS_A1354 oppB oppC TRUE 0.997 15.000 0.870 0.062 Y NA
 3473300 3473301 EcHS_A1354 EcHS_A1355 oppC oppD TRUE 0.994 12.000 0.554 1.000 Y NA
 3473301 3473302 EcHS_A1355 EcHS_A1356 oppD oppF TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 3473303 3473304 EcHS_A1357 EcHS_A1358   cls TRUE 0.693 35.000 0.231 NA   NA
 3473304 3473305 EcHS_A1358 EcHS_A1359 cls kch FALSE 0.006 371.000 0.000 1.000 N NA
 3473305 3473306 EcHS_A1359 EcHS_A1360 kch   FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 3473308 3473309 EcHS_A1362 EcHS_A1363 yciA ispZ FALSE 0.303 105.000 0.167 NA N NA
 3473309 3473310 EcHS_A1363 EcHS_A1364 ispZ   TRUE 0.440 30.000 0.061 NA   NA
 3473312 3473313 EcHS_A1366 EcHS_A1367   yciF TRUE 0.746 46.000 0.115 0.002   NA
 3473313 3473314 EcHS_A1367 EcHS_A1368 yciF   TRUE 0.776 58.000 0.500 NA   NA
 3473314 3473315 EcHS_A1368 EcHS_A1369   trpA FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 3473315 3473316 EcHS_A1369 EcHS_A1370 trpA trpB TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 3473316 3473317 EcHS_A1370 EcHS_A1371 trpB trpC TRUE 0.993 12.000 0.221 0.001 Y NA
 3473317 3473318 EcHS_A1371 EcHS_A1372 trpC trpD TRUE 0.997 1.000 0.293 1.000 Y NA
 3473318 3473319 EcHS_A1372 EcHS_A1373 trpD trpE TRUE 0.996 0.000 0.010 0.001 Y NA
 3473319 3473320 EcHS_A1373 EcHS_A1374 trpE   FALSE 0.098 92.000 0.023 NA   NA
 3473321 3473322 EcHS_A1375 EcHS_A1376     TRUE 0.986 -3.000 0.281 NA   NA
 3473322 3473323 EcHS_A1376 EcHS_A1377     FALSE 0.337 28.000 0.000 NA   NA
 3473323 3473324 EcHS_A1377 EcHS_A1378   rluB FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 3473325 3473326 EcHS_A1379 EcHS_A1380 btuR   TRUE 0.955 -3.000 0.050 1.000 N NA
 3473329 3473330 EcHS_A1383 EcHS_A1384 topA cysB FALSE 0.027 210.000 0.008 1.000 N NA
 3473330 3473331 EcHS_A1384 EcHS_A1385 cysB   FALSE 0.011 289.000 0.000 1.000 N NA
 3473331 3473332 EcHS_A1385 EcHS_A1386     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.023 Y NA
 3473332 3473333 EcHS_A1386 EcHS_A1387   acnA FALSE 0.004 522.000 0.000 1.000 N NA
 3473335 3473336 EcHS_A1389 EcHS_A1390 pgpB   FALSE 0.166 149.000 0.143 NA   NA
 3473336 3473337 EcHS_A1390 EcHS_A1391     TRUE 0.988 7.000 0.576 NA   NA
 3473339 3473340 EcHS_A1393 EcHS_A1394 pyrF   TRUE 0.950 0.000 0.045 1.000 N NA
 3473341 3473342 EcHS_A1395 EcHS_A1396     FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 3473342 3473343 EcHS_A1396 EcHS_A1397     FALSE 0.302 90.000 0.146 NA   NA
 3473343 3473344 EcHS_A1397 EcHS_A1398     FALSE 0.132 138.000 0.083 NA   NA
 3473344 3473345 EcHS_A1398 EcHS_A1399   rnb FALSE 0.023 235.000 0.000 1.000 N NA
 3473345 3473346 EcHS_A1399 EcHS_A1400 rnb   FALSE 0.309 68.000 0.105 NA   NA
 3473346 3473347 EcHS_A1400 EcHS_A1401   fabI FALSE 0.214 66.000 0.057 NA   NA
 3473349 3473350 EcHS_A1403 EcHS_A1404   sapF FALSE 0.207 68.000 0.000 1.000   NA
 3473350 3473351 EcHS_A1404 EcHS_A1405 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.020 Y NA
 3473351 3473352 EcHS_A1405 EcHS_A1406 sapD sapC TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 3473352 3473353 EcHS_A1406 EcHS_A1407 sapC sapB TRUE 0.997 -13.000 0.284 0.062 Y NA
 3473353 3473354 EcHS_A1407 EcHS_A1408 sapB sapA TRUE 0.994 -3.000 0.264 0.062 N NA
 3473354 3473355 EcHS_A1408 EcHS_A1409 sapA   FALSE 0.006 312.000 0.000 NA   NA
 3473355 3473356 EcHS_A1409 EcHS_A1410     TRUE 0.531 16.000 0.000 NA   NA
 3473356 3473357 EcHS_A1410 EcHS_A1411     TRUE 0.781 8.000 0.000 NA   NA
 3473357 3473358 EcHS_A1411 EcHS_A1412   puuA FALSE 0.073 303.000 0.000 1.000 Y NA
 3473359 3473360 EcHS_A1413 EcHS_A1414 puuD puuR TRUE 0.510 27.000 0.046 1.000   NA
 3473360 3473361 EcHS_A1414 EcHS_A1415 puuR puuC FALSE 0.015 275.000 0.040 1.000 N NA
 3473361 3473362 EcHS_A1415 EcHS_A1416 puuC puuB TRUE 0.996 2.000 0.500 0.046 N NA
 3473362 3473363 EcHS_A1416 EcHS_A1417 puuB gabT1 TRUE 0.866 38.000 0.100 1.000 Y NA
 3473365 3473366 EcHS_A1419 EcHS_A1420 pspA pspB TRUE 0.880 54.000 0.739 NA   NA
 3473366 3473367 EcHS_A1420 EcHS_A1421 pspB pspC TRUE 0.998 0.000 0.913 NA   NA
 3473367 3473368 EcHS_A1421 EcHS_A1422 pspC pspD TRUE 0.930 9.000 0.167 NA   NA
 3473368 3473369 EcHS_A1422 EcHS_A1423 pspD pspE FALSE 0.331 75.000 0.133 NA   NA
 3473369 3473370 EcHS_A1423 EcHS_A1424 pspE   FALSE 0.032 212.000 0.000 1.000 N NA
 3473370 3473371 EcHS_A1424 EcHS_A1425     TRUE 0.987 14.000 0.360 1.000 Y NA
 3473371 3473372 EcHS_A1425 EcHS_A1426     TRUE 0.993 21.000 0.620 0.062 Y NA
 3473372 3473373 EcHS_A1426 EcHS_A1427     TRUE 0.999 -13.000 0.805 0.062 Y NA
 3473373 3473374 EcHS_A1427 EcHS_A1428     TRUE 0.749 31.000 0.205 1.000 N NA
 3473374 3473375 EcHS_A1428 EcHS_A1429     TRUE 0.868 19.000 0.261 NA N NA
 3473375 3473376 EcHS_A1429 EcHS_A1430     TRUE 0.969 10.000 0.347 NA   NA
 3473376 3473377 EcHS_A1430 EcHS_A1431     TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000   NA
 3473377 3473378 EcHS_A1431 EcHS_A1432   pgmB TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000   NA
 3473378 3473379 EcHS_A1432 EcHS_A1433 pgmB   TRUE 0.827 14.000 0.103 1.000   NA
 3473379 3473380 EcHS_A1433 EcHS_A1434   ompG TRUE 0.784 45.000 0.222 0.062   NA
 3473382 3473383 EcHS_A1436 EcHS_A1437     TRUE 0.997 -3.000 0.791 NA   NA
 3473383 3473384 EcHS_A1437 EcHS_A1438   tyrR FALSE 0.163 148.000 0.137 NA   NA
 3473387 3473388 EcHS_A1442 EcHS_A1443     FALSE 0.012 275.000 0.000 1.000   NA
 3473394 3473395 EcHS_A1449 EcHS_A1450 uspE fnr TRUE 0.856 152.000 0.619 1.000 Y NA
 3473395 3473396 EcHS_A1450 EcHS_A1451 fnr ogt FALSE 0.043 195.000 0.000 1.000 N NA
 3473396 3473397 EcHS_A1451 EcHS_A1452 ogt abgT TRUE 0.731 11.000 0.000 NA N NA
 3473397 3473398 EcHS_A1452 EcHS_A1453 abgT abgB TRUE 0.414 37.000 0.080 NA   NA
 3473398 3473399 EcHS_A1453 EcHS_A1454 abgB abgA TRUE 0.990 0.000 0.128 0.004   NA
 3473399 3473400 EcHS_A1454 EcHS_A1456 abgA   FALSE 0.132 76.000 0.000 NA   NA
 3473401 3473402 EcHS_A1455 EcHS_A4742     TRUE 0.824 -19.000 0.000 NA   NA
 3473402 3473403 EcHS_A4742 EcHS_A1457     FALSE 0.037 170.000 0.000 NA   NA
 3473405 3473406 EcHS_A1459 EcHS_A4743 zntB   FALSE 0.005 330.000 0.000 NA   NA
 3473406 3473407 EcHS_A4743 EcHS_A1460   dbpA FALSE 0.135 74.000 0.000 NA   NA
 3473408 3473409 EcHS_A1461 EcHS_A1462   uspF FALSE 0.039 177.000 0.000 NA N NA
 3473409 3473410 EcHS_A1462 EcHS_A1463 uspF ompN FALSE 0.104 141.000 0.000 1.000 N NA
 3473414 3473415 EcHS_A1466 EcHS_A1467 hslJ idhA FALSE 0.102 111.000 0.000 NA N NA
 3473416 3473417 EcHS_A1468 EcHS_A1469     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3473417 3473418 EcHS_A1469 EcHS_A1470     TRUE 0.991 8.000 0.726 NA   NA
 3473421 3473422 EcHS_A1473 EcHS_A1474 tynA paaN FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000 N NA
 3473423 3473424 EcHS_A1475 EcHS_A1476 paaG paaH TRUE 0.989 12.000 0.920 NA   NA
 3473424 3473425 EcHS_A1476 EcHS_A1477 paaH paaI TRUE 0.994 9.000 0.943 NA   NA
 3473425 3473426 EcHS_A1477 EcHS_A1478 paaI paaJ TRUE 0.983 15.000 0.919 NA   NA
 3473426 3473427 EcHS_A1478 EcHS_A1479 paaJ paaK TRUE 0.987 8.000 0.571 NA   NA
 3473427 3473428 EcHS_A1479 EcHS_A1480 paaK   TRUE 0.970 -3.000 0.093 1.000 N NA
 3473428 3473429 EcHS_A1480 EcHS_A1481   paaB TRUE 0.998 0.000 0.215 0.001 Y NA
 3473429 3473430 EcHS_A1481 EcHS_A1482 paaB paaC TRUE 0.990 2.000 0.051 1.000 Y NA
 3473430 3473431 EcHS_A1482 EcHS_A1483 paaC paaD TRUE 0.846 -10.000 0.013 NA N NA
 3473431 3473432 EcHS_A1483 EcHS_A1484 paaD pcaF TRUE 0.941 0.000 0.058 NA N NA
 3473432 3473433 EcHS_A1484 EcHS_A1485 pcaF paaF TRUE 0.846 27.000 0.293 1.000 N NA
 3473433 3473434 EcHS_A1485 EcHS_A1486 paaF paaX FALSE 0.264 101.000 0.132 NA N NA
 3473434 3473435 EcHS_A1486 EcHS_A1487 paaX paaY TRUE 0.932 -18.000 0.118 NA   NA
 3473435 3473436 EcHS_A1487 EcHS_A1488 paaY   FALSE 0.007 331.000 0.000 1.000   NA
 3473436 3473437 EcHS_A1488 EcHS_A1489     FALSE 0.031 208.000 0.000 1.000   NA
 3473437 3473438 EcHS_A1489 EcHS_A1490     FALSE 0.152 64.000 0.000 NA   NA
 3473438 3473439 EcHS_A1490 EcHS_A1491     FALSE 0.037 171.000 0.000 NA   NA
 3473439 3473440 EcHS_A1491 EcHS_A1492   cdsA2 TRUE 0.992 0.000 0.179 0.002   NA
 3473440 3473441 EcHS_A1492 EcHS_A1493 cdsA2   TRUE 0.531 16.000 0.000 NA   NA
 3473441 3473442 EcHS_A1493 EcHS_A1494     TRUE 0.981 14.000 0.285 NA Y NA
 3473444 3473445 EcHS_A1496 EcHS_A1497 hrpA   FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 3473445 3473446 EcHS_A1497 EcHS_A1498   aldA FALSE 0.029 197.000 0.040 NA   NA
 3473448 3473449 EcHS_A1500 EcHS_A1501     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 3473453 3473454 EcHS_A1505 EcHS_A1506     FALSE 0.015 225.000 0.000 NA   NA
 3473454 3473455 EcHS_A1506 EcHS_A1507     FALSE 0.061 140.000 0.026 NA   NA
 3473455 3473456 EcHS_A1507 EcHS_A1508   rimL FALSE 0.147 63.000 0.026 NA   NA
 3473458 3473459 EcHS_A1510 EcHS_A1511 tehA tehB TRUE 0.980 -3.000 0.175 1.000   NA
 3473459 3473460 EcHS_A1511 EcHS_A1512 tehB   FALSE 0.052 152.000 0.000 NA   NA
 3473460 3473461 EcHS_A1512 EcHS_A1513     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3473465 3473466 EcHS_A1517 EcHS_A1519     FALSE 0.410 31.000 0.000 1.000   NA
 3473467 3473468 EcHS_A1520 EcHS_A1521     FALSE 0.172 57.000 0.000 NA   NA
 3473469 3473470 EcHS_A1522 EcHS_A1523     FALSE 0.181 79.000 0.000 1.000   NA
 3473470 3473471 EcHS_A1523 EcHS_A1524   ydcS FALSE 0.132 245.000 0.000 1.000 Y NA
 3473471 3473472 EcHS_A1524 EcHS_A1525 ydcS ydcT TRUE 0.994 18.000 0.609 0.061 Y NA
 3473472 3473473 EcHS_A1525 EcHS_A1526 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.061 Y NA
 3473473 3473474 EcHS_A1526 EcHS_A1527 ydcU ydcV TRUE 0.999 -10.000 0.821 0.061 Y NA
 3473474 3473475 EcHS_A1527 EcHS_A1528 ydcV ydcW TRUE 0.835 22.000 0.216 1.000 N NA
 3473475 3473476 EcHS_A1528 EcHS_A1529 ydcW   FALSE 0.238 64.000 0.000 1.000 N NA
 3473476 3473477 EcHS_A1529 EcHS_A1530     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.023 Y NA
 3473477 3473478 EcHS_A1530 EcHS_A1531     FALSE 0.108 91.000 0.000 NA   NA
 3473478 3473479 EcHS_A1531 EcHS_A1532     FALSE 0.115 86.000 0.000 NA   NA
 3473480 3473481 EcHS_A1533 EcHS_A1534     TRUE 0.946 -3.000 0.070 NA   NA
 3473482 3473483 EcHS_A1535 EcHS_A1536     FALSE 0.036 198.000 0.000 1.000   NA
 3473485 3473486 EcHS_A1537 EcHS_A1539     FALSE 0.056 148.000 0.000 NA   NA
 3473490 3473491 EcHS_A1543 EcHS_A1544     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 3473491 3473492 EcHS_A1544 EcHS_A1545     FALSE 0.386 33.000 0.000 1.000   NA
 3473495 3473496 EcHS_A1548 EcHS_A1549   narI1 FALSE 0.181 79.000 0.000 1.000   NA
 3473496 3473497 EcHS_A1549 EcHS_A1550 narI1 narW TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.003 Y NA
 3473497 3473498 EcHS_A1550 EcHS_A1551 narW narY TRUE 1.000 0.000 0.714 0.003 Y NA
 3473498 3473499 EcHS_A1551 EcHS_A1552 narY narZ TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 3473499 3473500 EcHS_A1552 EcHS_A1553 narZ narU TRUE 0.774 82.000 0.556 1.000 N NA
 3473500 3473501 EcHS_A1553 EcHS_A1554 narU   FALSE 0.008 324.000 0.000 1.000   NA
 3473501 3473502 EcHS_A1554 EcHS_A1555     TRUE 0.494 24.000 0.000 1.000   NA
 3473502 3473503 EcHS_A1555 EcHS_A1556     FALSE 0.035 259.000 0.000 0.098   NA
 3473504 3473505 EcHS_A1557 EcHS_A1558 fdnG fdnH TRUE 0.996 13.000 0.429 0.002 Y NA
 3473505 3473506 EcHS_A1558 EcHS_A1559 fdnH fdnI TRUE 0.998 -25.000 0.333 0.002 Y NA
 3473506 3473507 EcHS_A1559 EcHS_A1560 fdnI   FALSE 0.116 85.000 0.000 NA   NA
 3473508 3473509 EcHS_A1562 EcHS_A1563     FALSE 0.088 146.000 0.000 1.000   NA
 3473509 3473510 EcHS_A1563 EcHS_A1564   sfcA FALSE 0.103 134.000 0.000 1.000   NA
 3473510 3473511 EcHS_A1564 EcHS_A1565 sfcA   TRUE 0.655 157.000 0.750 1.000   NA
 3473511 3473512 EcHS_A1565 EcHS_A1566     TRUE 0.692 102.000 0.571 NA   NA
 3473514 3473515 EcHS_A1568 EcHS_A1569     TRUE 0.998 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 3473515 3473516 EcHS_A1569 EcHS_A1570   yddQ TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 3473516 3473517 EcHS_A1570 EcHS_A1571 yddQ yddR TRUE 0.997 -3.000 0.143 0.061 Y NA
 3473517 3473518 EcHS_A1571 EcHS_A1572 yddR   TRUE 0.995 2.000 0.091 0.061 Y NA
 3473518 3473519 EcHS_A1572 EcHS_A1573   ddpX TRUE 0.827 14.000 0.091 1.000 N NA
 3473519 3473520 EcHS_A1573 EcHS_A1574 ddpX dos FALSE 0.016 258.000 0.000 1.000 N NA
 3473520 3473521 EcHS_A1574 EcHS_A1575 dos   TRUE 0.997 1.000 0.130 0.004 Y NA
 3473521 3473522 EcHS_A1575 EcHS_A1576     FALSE 0.005 377.000 0.000 1.000   NA
 3473522 3473523 EcHS_A1576 EcHS_A1577   gadC FALSE 0.108 131.000 0.000 1.000   NA
 3473523 3473524 EcHS_A1577 EcHS_A1578 gadC gadB TRUE 0.496 156.000 0.103 1.000 Y NA
 3473524 3473525 EcHS_A1578 EcHS_A1579 gadB pqqL FALSE 0.006 363.000 0.000 1.000   NA
 3473525 3473526 EcHS_A1579 EcHS_A1580 pqqL   TRUE 0.507 57.000 0.167 1.000   NA
 3473526 3473527 EcHS_A1580 EcHS_A1581     TRUE 0.576 38.000 0.000 0.072   NA
 3473527 3473528 EcHS_A1581 EcHS_A1582     FALSE 0.010 291.000 0.000 1.000   NA
 3473528 3473529 EcHS_A1582 EcHS_A1583     TRUE 0.864 52.000 0.600 1.000   NA
 3473529 3473530 EcHS_A1583 EcHS_A1584     FALSE 0.005 402.000 0.000 1.000 N NA
 3473530 3473531 EcHS_A1584 EcHS_A1585     FALSE 0.004 520.000 0.000 1.000 N NA
 3473531 3473532 EcHS_A1585 EcHS_A1586     FALSE 0.007 334.000 0.000 1.000   NA
 3473532 3473533 EcHS_A1586 EcHS_A1587     TRUE 0.520 59.000 0.000 0.008   NA
 3473533 3473534 EcHS_A1587 EcHS_A1588     TRUE 0.978 13.000 0.000 0.008 Y NA
 3473534 3473535 EcHS_A1588 EcHS_A1589     TRUE 0.688 14.000 0.000 1.000   NA
 3473535 3473536 EcHS_A1589 EcHS_A1590     FALSE 0.002 853.000 0.000 NA   NA
 3473536 3473537 EcHS_A1590 EcHS_A1591   hipB TRUE 0.996 0.000 0.675 NA   NA
 3473537 3473538 EcHS_A1591 EcHS_A1592 hipB   FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 3473538 3473539 EcHS_A1592 EcHS_A1593   lsrK FALSE 0.002 531.000 0.000 NA   NA
 3473539 3473540 EcHS_A1593 EcHS_A1594 lsrK lsrR FALSE 0.200 79.000 0.000 1.000 N NA
 3473541 3473542 EcHS_A1595 EcHS_A1596 lsrA lsrC TRUE 0.999 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 3473542 3473543 EcHS_A1596 EcHS_A1597 lsrC lsrD TRUE 1.000 0.000 0.788 0.061 Y NA
 3473543 3473544 EcHS_A1597 EcHS_A1598 lsrD lsrB TRUE 0.997 12.000 0.844 NA Y NA
 3473544 3473545 EcHS_A1598 EcHS_A1599 lsrB lsrF TRUE 0.857 27.000 0.000 NA Y NA
 3473545 3473546 EcHS_A1599 EcHS_A1600 lsrF lsrG TRUE 0.494 24.000 0.000 1.000   NA
 3473546 3473547 EcHS_A1600 EcHS_A1601 lsrG tam FALSE 0.243 57.000 0.000 1.000   NA
 3473548 3473549 EcHS_A1602 EcHS_A1603   uxaB FALSE 0.147 156.000 0.143 NA   NA
 3473549 3473550 EcHS_A1603 EcHS_A1604 uxaB   FALSE 0.025 227.000 0.000 1.000 N NA
 3473550 3473551 EcHS_A1604 EcHS_A1605     FALSE 0.040 220.000 0.098 NA   NA
 3473551 3473552 EcHS_A1605 EcHS_A1606   glsA2 TRUE 0.912 0.000 0.037 NA   NA
 3473552 3473553 EcHS_A1606 EcHS_A1607 glsA2   FALSE 0.238 64.000 0.000 1.000 N NA
 3473554 3473555 EcHS_A1608 EcHS_A1609     FALSE 0.127 78.000 0.000 NA   NA
 3473555 3473556 EcHS_A1609 EcHS_A1610   sotB FALSE 0.054 150.000 0.000 NA   NA
 3473558 3473559 EcHS_A1612 EcHS_A1613 marR marA TRUE 0.448 20.000 0.000 NA   NA
 3473559 3473560 EcHS_A1613 EcHS_A1614 marA marB FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3473561 3473562 EcHS_A1615 EcHS_A1617     FALSE 0.373 25.000 0.000 NA   NA
 3473562 3473563 EcHS_A1617 EcHS_A1618     FALSE 0.176 56.000 0.000 NA   NA
 3473563 3473564 EcHS_A1618 EcHS_A1619     TRUE 0.952 28.000 0.105 0.011 Y NA
 3473564 3473565 EcHS_A1619 EcHS_A1620     TRUE 0.961 124.000 0.789 0.011 Y NA
 3473568 3473569 EcHS_A1623 EcHS_A1624 ydeE   FALSE 0.143 127.000 0.077 NA   NA
 3473570 3473571 EcHS_A1625 EcHS_A1626     FALSE 0.010 255.000 0.000 NA   NA
 3473574 3473575 EcHS_A1629 EcHS_A1630     FALSE 0.162 89.000 0.000 1.000   NA
 3473576 3473577 EcHS_A1631 EcHS_A1632     TRUE 0.769 9.000 0.000 NA   NA
 3473577 3473578 EcHS_A1632 EcHS_A1633   ydfJ TRUE 0.622 89.000 0.000 1.000 Y NA
 3473579 3473580 EcHS_A1634 EcHS_A1635   pinR FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 3473581 3473582 EcHS_A1636 EcHS_A1637     FALSE 0.120 82.000 0.000 NA   NA
 3473582 3473583 EcHS_A1637 EcHS_A1638     TRUE 0.699 65.000 0.000 1.000 Y NA
 3473583 3473584 EcHS_A1638 EcHS_A1639     FALSE 0.144 68.000 0.000 NA   NA
 3473584 3473585 EcHS_A1639 EcHS_A1640     FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 3473585 3473586 EcHS_A1640 EcHS_A1641     FALSE 0.002 1050.000 0.000 NA   NA
 3473586 3473587 EcHS_A1641 EcHS_A1642     FALSE 0.002 672.000 0.000 NA   NA
 3473587 3473588 EcHS_A1642 EcHS_A1643     FALSE 0.004 361.000 0.000 NA   NA
 3473588 3473589 EcHS_A1643 EcHS_A1644     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3473589 3473590 EcHS_A1644 EcHS_A1645     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 3473590 3473591 EcHS_A1645 EcHS_A1646     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 3473591 3473592 EcHS_A1646 EcHS_A1647     FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 3473592 3473593 EcHS_A1647 EcHS_A1648     FALSE 0.003 407.000 0.000 NA   NA
 3473593 3473594 EcHS_A1648 EcHS_A1649     FALSE 0.002 873.000 0.000 NA   NA
 3473596 3473597 EcHS_A1651 EcHS_A1652     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.023 Y NA
 3473597 3473598 EcHS_A1652 EcHS_A1653     TRUE 0.461 29.000 0.000 1.000 N NA
 3473598 3473599 EcHS_A1653 EcHS_A1654   rspA TRUE 0.809 12.000 0.049 1.000 N NA
 3473599 3473600 EcHS_A1654 EcHS_A1655 rspA   FALSE 0.028 206.000 0.020 1.000   NA
 3473601 3473602 EcHS_A1656 EcHS_A1657   speG FALSE 0.359 35.000 0.055 NA   NA
 3473604 3473605 EcHS_A1659 EcHS_A1660   ynfE FALSE 0.170 199.000 0.304 NA   NA
 3473605 3473606 EcHS_A1660 EcHS_A1661 ynfE   TRUE 0.937 61.000 0.231 0.001 Y NA
 3473606 3473607 EcHS_A1661 EcHS_A1662   dmsB1 TRUE 0.998 11.000 0.667 0.056 Y NA
 3473607 3473608 EcHS_A1662 EcHS_A1663 dmsB1 dmsC2 TRUE 0.987 2.000 0.333 1.000   NA
 3473608 3473609 EcHS_A1663 EcHS_A1664 dmsC2 dmsD TRUE 0.528 43.000 0.125 1.000   NA
 3473609 3473610 EcHS_A1664 EcHS_A1665 dmsD   TRUE 0.431 21.000 0.000 NA   NA
 3473610 3473611 EcHS_A1665 EcHS_A1666     FALSE 0.146 67.000 0.000 NA   NA
 3473612 3473613 EcHS_A1667 EcHS_A1668 bioD2 mic TRUE 0.580 125.000 0.455 NA N NA
 3473613 3473614 EcHS_A1668 EcHS_A1669 mic   TRUE 0.799 135.000 0.408 NA Y NA
 3473615 3473616 EcHS_A1670 EcHS_A1671 ynfM   FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 3473616 3473617 EcHS_A1671 EcHS_A1672     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 3473618 3473619 EcHS_A1673 EcHS_A1674 mdtI mdtJ TRUE 0.999 -13.000 0.869 0.087 Y NA
 3473621 3473622 EcHS_A1676 EcHS_A1677   pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 3473623 3473624 EcHS_A1678 EcHS_A1679   ydgH TRUE 0.854 -10.000 0.000 NA   NA
 3473624 3473625 EcHS_A1679 EcHS_A1680 ydgH arcD FALSE 0.092 186.000 0.143 NA   NA
 3473625 3473626 EcHS_A1680 EcHS_A1681 arcD   TRUE 0.608 37.000 0.140 1.000 N NA
 3473628 3473629 EcHS_A1683 EcHS_A1684 rstA rstB TRUE 0.992 4.000 0.181 1.000 Y NA
 3473629 3473630 EcHS_A1684 EcHS_A1685 rstB tus TRUE 0.479 76.000 0.200 1.000   NA
 3473631 3473632 EcHS_A1686 EcHS_A1687 fumC fumA TRUE 0.682 143.000 0.000 0.001 Y NA
 3473633 3473634 EcHS_A1688 EcHS_A1689 manA   TRUE 0.784 101.000 0.778 NA   NA
 3473635 3473636 EcHS_A1690 EcHS_A1691 uidC uidB TRUE 0.819 39.000 0.375 1.000   NA
 3473636 3473637 EcHS_A1691 EcHS_A1692 uidB uidA TRUE 0.997 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 3473637 3473638 EcHS_A1692 EcHS_A1693 uidA uidR FALSE 0.005 391.000 0.000 1.000 N NA
 3473638 3473639 EcHS_A1693 EcHS_A1694 uidR   FALSE 0.027 221.000 0.000 1.000 N NA
 3473639 3473640 EcHS_A1694 EcHS_A1695   malI FALSE 0.144 112.000 0.000 1.000 N NA
 3473641 3473642 EcHS_A1696 EcHS_A1697 malX malY TRUE 0.985 10.000 0.531 1.000 N NA
 3473642 3473643 EcHS_A1697 EcHS_A1698 malY add FALSE 0.305 104.000 0.132 1.000 N NA
 3473645 3473646 EcHS_A1700 EcHS_A1701 blr   FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 3473646 3473647 EcHS_A1701 EcHS_A1702     FALSE 0.275 86.000 0.120 NA   NA
 3473647 3473648 EcHS_A1702 EcHS_A1703   rnfA FALSE 0.346 77.000 0.148 NA   NA
 3473648 3473649 EcHS_A1703 EcHS_A1704 rnfA rnfB TRUE 0.999 0.000 0.564 0.056 Y NA
 3473649 3473650 EcHS_A1704 EcHS_A1705 rnfB rnfC TRUE 0.999 -7.000 0.537 0.018 Y NA
 3473650 3473651 EcHS_A1705 EcHS_A1706 rnfC rnfD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.056 Y NA
 3473651 3473652 EcHS_A1706 EcHS_A1707 rnfD rnfG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.056 Y NA
 3473652 3473653 EcHS_A1707 EcHS_A1708 rnfG rnfE TRUE 0.999 4.000 0.908 0.056 Y NA
 3473653 3473654 EcHS_A1708 EcHS_A1709 rnfE nth TRUE 0.971 0.000 0.109 1.000 N NA
 3473654 3473655 EcHS_A1709 EcHS_A1710 nth tppB FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 3473655 3473656 EcHS_A1710 EcHS_A1711 tppB   TRUE 0.567 106.000 0.344 1.000 N NA
 3473657 3473658 EcHS_A1712 EcHS_A1713 pdxY tyrS FALSE 0.275 62.000 0.041 1.000 N NA
 3473658 3473659 EcHS_A1713 EcHS_A1714 tyrS pdxH FALSE 0.159 129.000 0.054 1.000 N NA
 3473659 3473660 EcHS_A1714 EcHS_A1715 pdxH   FALSE 0.176 59.000 0.034 NA   NA
 3473660 3473661 EcHS_A1715 EcHS_A1716     FALSE 0.102 104.000 0.034 NA   NA
 3473663 3473664 EcHS_A1718 EcHS_A1719     FALSE 0.373 25.000 0.000 NA   NA
 3473665 3473666 EcHS_A1720 EcHS_A1721     TRUE 0.987 3.000 0.412 NA   NA
 3473666 3473667 EcHS_A1721 EcHS_A1722     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3473668 3473669 EcHS_A1723 EcHS_A1724 sodC ydhF FALSE 0.187 81.000 0.033 1.000   NA
 3473670 3473671 EcHS_A1725 EcHS_A1726     FALSE 0.019 212.000 0.000 NA   NA
 3473671 3473672 EcHS_A1726 EcHS_A1727   nemA TRUE 0.838 35.000 0.362 1.000 N NA
 3473672 3473673 EcHS_A1727 EcHS_A1728 nemA gloA FALSE 0.251 81.000 0.057 1.000 N NA
 3473673 3473674 EcHS_A1728 EcHS_A1729 gloA rnt FALSE 0.311 103.000 0.136 1.000 N NA
 3473677 3473678 EcHS_A1732 EcHS_A1733     FALSE 0.120 82.000 0.000 NA   NA
 3473679 3473680 EcHS_A1734 EcHS_A1735   sodB FALSE 0.110 128.000 0.015 1.000 N NA
 3473681 3473682 EcHS_A1736 EcHS_A1737     FALSE 0.041 166.000 0.000 NA   NA
 3473685 3473686 EcHS_A1740 EcHS_A1741   cfa FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000 N NA
 3473689 3473690 EcHS_A1744 EcHS_A1745     FALSE 0.023 202.000 0.000 NA   NA
 3473691 3473692 EcHS_A4667 EcHS_A4668     TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 3473692 3473693 EcHS_A4668 EcHS_A1748   ydhR FALSE 0.090 107.000 0.000 NA   NA
 3473693 3473694 EcHS_A1748 EcHS_A1749 ydhR   FALSE 0.079 126.000 0.000 NA   NA
 3473694 3473695 EcHS_A1749 EcHS_A1750     FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 3473696 3473697 EcHS_A1751 EcHS_A1752     TRUE 0.999 -3.000 0.444 0.056 Y NA
 3473697 3473698 EcHS_A1752 EcHS_A1753     TRUE 0.911 13.000 0.235 NA   NA
 3473698 3473699 EcHS_A1753 EcHS_A1754     TRUE 0.986 4.000 0.458 NA   NA
 3473699 3473700 EcHS_A1754 EcHS_A1755     TRUE 0.993 21.000 0.600 0.018 Y NA
 3473700 3473701 EcHS_A1755 EcHS_A1756     FALSE 0.002 455.000 0.000 NA   NA
 3473702 3473703 EcHS_A1757 EcHS_A1758 pykF lpp FALSE 0.010 311.000 0.000 1.000 N NA
 3473704 3473705 EcHS_A1759 EcHS_A1760   sufE FALSE 0.096 149.000 0.069 NA   NA
 3473705 3473706 EcHS_A1760 EcHS_A1761 sufE sufS TRUE 0.880 13.000 0.183 NA   NA
 3473706 3473707 EcHS_A1761 EcHS_A1762 sufS sufD TRUE 0.983 -3.000 0.193 1.000 N NA
 3473707 3473708 EcHS_A1762 EcHS_A1763 sufD sufC TRUE 0.997 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 3473708 3473709 EcHS_A1763 EcHS_A1764 sufC sufB TRUE 0.995 10.000 0.466 1.000 Y NA
 3473709 3473710 EcHS_A1764 EcHS_A1765 sufB sufA TRUE 0.808 9.000 0.041 NA   NA
 3473712 3473713 EcHS_A1766 EcHS_A1767   ydiL TRUE 0.486 19.000 0.032 NA   NA
 3473713 3473714 EcHS_A1767 EcHS_A1768 ydiL   TRUE 0.970 -3.000 0.129 NA N NA
 3473715 3473716 EcHS_A1769 EcHS_A4746 ydiK rprA FALSE 0.029 186.000 0.000 NA   NA
 3473716 3473717 EcHS_A4746 EcHS_A1770 rprA   FALSE 0.089 109.000 0.000 NA   NA
 3473717 3473718 EcHS_A1770 EcHS_A1771   ydiM FALSE 0.195 133.000 0.095 1.000   NA
 3473718 3473719 EcHS_A1771 EcHS_A1772 ydiM   FALSE 0.272 221.000 0.000 0.060 Y NA
 3473719 3473720 EcHS_A1772 EcHS_A1773     TRUE 0.854 12.000 0.082 1.000 N NA
 3473720 3473721 EcHS_A1773 EcHS_A1774   aroD TRUE 0.901 31.000 0.113 1.000 Y NA
 3473721 3473722 EcHS_A1774 EcHS_A1775 aroD pct FALSE 0.059 145.000 0.000 NA   NA
 3473722 3473723 EcHS_A1775 EcHS_A1777 pct   TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3473724 3473725 EcHS_A1778 EcHS_A1779     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3473725 3473726 EcHS_A1779 EcHS_A1780     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.022 Y NA
 3473726 3473727 EcHS_A1780 EcHS_A1781   ppsA FALSE 0.087 152.000 0.000 1.000 N NA
 3473727 3473728 EcHS_A1781 EcHS_A1782 ppsA   FALSE 0.182 54.000 0.000 NA   NA
 3473729 3473730 EcHS_A1783 EcHS_A1784   aroH FALSE 0.194 157.000 0.165 1.000   NA
 3473730 3473731 EcHS_A1784 EcHS_A1785 aroH   FALSE 0.116 132.000 0.054 NA N NA
 3473732 3473733 EcHS_A1786 EcHS_A1787     FALSE 0.160 63.000 0.031 NA   NA
 3473733 3473734 EcHS_A1787 EcHS_A1788     FALSE 0.013 247.000 0.000 NA N NA
 3473734 3473735 EcHS_A1788 EcHS_A1789   btuD FALSE 0.146 78.000 0.000 NA N NA
 3473735 3473736 EcHS_A1789 EcHS_A1790 btuD btuE TRUE 0.940 0.000 0.000 1.000 N NA
 3473736 3473737 EcHS_A1790 EcHS_A1791 btuE btuC FALSE 0.365 63.000 0.084 1.000 N NA
 3473737 3473738 EcHS_A1791 EcHS_A1792 btuC ihfA FALSE 0.147 101.000 0.023 1.000 N NA
 3473738 3473739 EcHS_A1792 EcHS_A1793 ihfA pheT TRUE 0.966 5.000 0.208 1.000 N NA
 3473739 3473740 EcHS_A1793 EcHS_A1794 pheT pheS TRUE 0.996 15.000 0.574 0.001 Y NA
 3473740 3473741 EcHS_A1794 EcHS_A1795 pheS   FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 3473741 3473742 EcHS_A1795 EcHS_A1796     FALSE 0.134 75.000 0.000 NA   NA
 3473742 3473743 EcHS_A1796 EcHS_A1797   rplT FALSE 0.081 123.000 0.000 NA   NA
 3473743 3473744 EcHS_A1797 EcHS_A1798 rplT rpmI TRUE 0.988 53.000 0.928 0.013 Y NA
 3473744 3473745 EcHS_A1798 EcHS_A1799 rpmI infC TRUE 0.927 97.000 0.652 1.000 Y NA
 3473745 3473746 EcHS_A1799 EcHS_A1800 infC thrS TRUE 0.727 112.000 0.186 1.000 Y NA
 3473749 3473750 EcHS_A1804 EcHS_A1805 pfkB   FALSE 0.094 101.000 0.000 NA   NA
 3473750 3473751 EcHS_A1805 EcHS_A1806     FALSE 0.091 106.000 0.000 NA   NA
 3473753 3473754 EcHS_A1808 EcHS_A1809     FALSE 0.077 163.000 0.068 NA   NA
 3473754 3473755 EcHS_A1809 EcHS_A1810     FALSE 0.164 133.000 0.102 NA   NA
 3473756 3473757 EcHS_A1811 EcHS_A1812   cedA FALSE 0.007 289.000 0.000 NA   NA
 3473759 3473760 EcHS_A1814 EcHS_A1815     FALSE 0.008 322.000 0.000 1.000   NA
 3473760 3473761 EcHS_A1815 EcHS_A1816   chbF TRUE 0.980 13.000 0.429 0.019   NA
 3473761 3473762 EcHS_A1816 EcHS_A1817 chbF chbR TRUE 0.754 106.000 0.625 1.000 N NA
 3473762 3473763 EcHS_A1817 EcHS_A1818 chbR chbA TRUE 0.698 11.000 0.000 NA   NA
 3473763 3473764 EcHS_A1818 EcHS_A1819 chbA chbC FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 3473764 3473765 EcHS_A1819 EcHS_A1820 chbC chbB TRUE 0.951 85.000 0.500 0.010 Y NA
 3473765 3473766 EcHS_A1820 EcHS_A1821 chbB osmE FALSE 0.009 299.000 0.000 1.000   NA
 3473767 3473768 EcHS_A1822 EcHS_A1823 nadE cho FALSE 0.020 230.000 0.010 1.000 N NA
 3473769 3473770 EcHS_A1824 EcHS_A1825   spy FALSE 0.022 203.000 0.028 NA   NA
 3473772 3473773 EcHS_A1827 EcHS_A1828 astE astB TRUE 0.993 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 3473773 3473774 EcHS_A1828 EcHS_A1829 astB astD TRUE 0.990 -3.000 0.306 1.000 N NA
 3473774 3473775 EcHS_A1829 EcHS_A1830 astD astA TRUE 0.982 -3.000 0.179 1.000 N NA
 3473775 3473776 EcHS_A1830 EcHS_A1831 astA astC TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 3473777 3473778 EcHS_A1832 EcHS_A1833   xth TRUE 0.618 13.000 0.000 NA   NA
 3473778 3473779 EcHS_A1833 EcHS_A1834 xth   FALSE 0.032 167.000 0.016 NA   NA
 3473779 3473780 EcHS_A1834 EcHS_A1835     TRUE 0.902 5.000 0.083 NA   NA
 3473780 3473781 EcHS_A1835 EcHS_A1836     TRUE 0.844 15.000 0.174 NA   NA
 3473781 3473782 EcHS_A1836 EcHS_A1837     TRUE 0.952 0.000 0.087 NA   NA
 3473782 3473783 EcHS_A1837 EcHS_A1838     TRUE 0.755 10.000 0.032 NA   NA
 3473783 3473784 EcHS_A1838 EcHS_A1839   ynjC TRUE 0.995 -27.000 0.627 0.060   NA
 3473784 3473785 EcHS_A1839 EcHS_A1840 ynjC   TRUE 0.996 0.000 0.602 1.000   NA
 3473785 3473786 EcHS_A1840 EcHS_A1841     FALSE 0.378 67.000 0.111 1.000   NA
 3473791 3473792 EcHS_A1846 EcHS_A1847   topB FALSE 0.076 128.000 0.000 NA   NA
 3473792 3473793 EcHS_A1847 EcHS_A1848 topB selD TRUE 0.897 5.000 0.041 1.000 N NA
 3473793 3473794 EcHS_A1848 EcHS_A1849 selD   FALSE 0.149 117.000 0.033 1.000 N NA
 3473795 3473796 EcHS_A1850 EcHS_A1851 sppA ansA FALSE 0.138 167.000 0.113 1.000 N NA
 3473796 3473797 EcHS_A1851 EcHS_A1852 ansA pncA TRUE 0.823 11.000 0.040 1.000 N NA
 3473798 3473799 EcHS_A1853 EcHS_A1854 ydjE   TRUE 0.664 118.000 0.125 1.000 Y NA
 3473799 3473800 EcHS_A1854 EcHS_A1855     FALSE 0.400 137.000 0.269 1.000 N NA
 3473800 3473801 EcHS_A1855 EcHS_A1856     TRUE 0.964 10.000 0.269 1.000 N NA
 3473801 3473802 EcHS_A1856 EcHS_A1857     TRUE 0.996 5.000 0.368 1.000 Y NA
 3473802 3473803 EcHS_A1857 EcHS_A1859     TRUE 0.431 21.000 0.000 NA   NA
 3473803 3473804 EcHS_A1859 EcHS_A1860   ydjK TRUE 0.509 17.000 0.000 NA   NA
 3473804 3473805 EcHS_A1860 EcHS_A1861 ydjK   TRUE 0.821 27.000 0.250 1.000 N NA
 3473805 3473806 EcHS_A1861 EcHS_A1862     FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 3473806 3473807 EcHS_A1862 EcHS_A1863   msrB TRUE 0.622 42.000 0.216 NA   NA
 3473808 3473809 EcHS_A1864 EcHS_A1865 gapA   TRUE 0.814 63.000 0.154 1.000 Y NA
 3473810 3473811 EcHS_A1866 EcHS_A1867   mipA FALSE 0.180 90.000 0.067 NA   NA
 3473812 3473813 EcHS_A1868 EcHS_A1869     FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 3473813 3473814 EcHS_A1869 EcHS_A1870     TRUE 0.741 113.000 0.683 NA   NA
 3473814 3473815 EcHS_A1870 EcHS_A1871     FALSE 0.057 147.000 0.000 NA   NA
 3473815 3473816 EcHS_A1871 EcHS_A1872     TRUE 0.485 181.000 0.000 0.004 Y NA
 3473816 3473817 EcHS_A1872 EcHS_A1873     FALSE 0.386 43.000 0.083 NA   NA
 3473821 3473822 EcHS_A1877 EcHS_A1878 yeaN   FALSE 0.131 55.000 0.007 NA   NA
 3473824 3473825 EcHS_A1880 EcHS_A1881     TRUE 0.847 18.000 0.222 NA   NA
 3473826 3473827 EcHS_A1882 EcHS_A1883     TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3473827 3473828 EcHS_A1883 EcHS_A1884     TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3473828 3473829 EcHS_A1884 EcHS_A1885     TRUE 0.825 4.000 0.000 NA   NA
 3473829 3473830 EcHS_A1885 EcHS_A1886     FALSE 0.042 173.000 0.000 NA N NA
 3473830 3473831 EcHS_A1886 EcHS_A1887     FALSE 0.128 127.000 0.000 1.000 N NA
 3473832 3473833 EcHS_A1888 EcHS_A1889 ttuC   FALSE 0.115 251.000 0.333 1.000 N NA
 3473833 3473834 EcHS_A1889 EcHS_A1890     TRUE 0.426 32.000 0.000 1.000 N NA
 3473834 3473835 EcHS_A1890 EcHS_A1891     TRUE 0.536 56.000 0.043 0.055 N NA
 3473836 3473837 EcHS_A1892 EcHS_A4747 rnd   FALSE 0.360 26.000 0.000 NA   NA
 3473837 3473838 EcHS_A4747 EcHS_A1893   fadD TRUE 0.797 -41.000 0.000 NA   NA
 3473838 3473839 EcHS_A1893 EcHS_A1894 fadD slp FALSE 0.106 205.000 0.169 1.000 N NA
 3473839 3473840 EcHS_A1894 EcHS_A1895 slp   FALSE 0.343 40.000 0.024 1.000 N NA
 3473840 3473841 EcHS_A1895 EcHS_A1896     FALSE 0.381 58.000 0.082 1.000 N NA
 3473842 3473843 EcHS_A1897 EcHS_A1898     FALSE 0.004 362.000 0.000 NA   NA
 3473843 3473844 EcHS_A1898 EcHS_A1899     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 3473844 3473845 EcHS_A1899 EcHS_A1900     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.022 Y NA
 3473845 3473846 EcHS_A1900 EcHS_A1901     FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 3473846 3473847 EcHS_A1901 EcHS_A1902   pabB FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 3473847 3473848 EcHS_A1902 EcHS_A1903 pabB   TRUE 0.945 4.000 0.116 1.000   NA
 3473848 3473849 EcHS_A1903 EcHS_A1904   sdaA2 FALSE 0.322 184.000 0.409 1.000   NA
 3473849 3473850 EcHS_A1904 EcHS_A1905 sdaA2   TRUE 0.508 131.000 0.389 NA N NA
 3473852 3473853 EcHS_A1907 EcHS_A1908 manX manY TRUE 0.823 63.000 0.000 0.015 Y NA
 3473853 3473854 EcHS_A1908 EcHS_A1909 manY manZ TRUE 0.998 13.000 0.939 0.015 Y NA
 3473854 3473855 EcHS_A1909 EcHS_A1910 manZ   TRUE 0.881 55.000 0.755 NA   NA
 3473855 3473856 EcHS_A1910 EcHS_A1911     FALSE 0.003 429.000 0.000 NA   NA
 3473857 3473858 EcHS_A1912 EcHS_A1913 rrmA cspC FALSE 0.070 166.000 0.038 1.000   NA
 3473858 3473859 EcHS_A1913 EcHS_A1914 cspC   TRUE 0.898 13.000 0.214 NA   NA
 3473859 3473860 EcHS_A1914 EcHS_A1915     FALSE 0.002 669.000 0.000 NA   NA
 3473860 3473861 EcHS_A1915 EcHS_A1916     TRUE 0.728 75.000 0.500 NA   NA
 3473865 3473866 EcHS_A1920 EcHS_A1921   prc FALSE 0.134 192.000 0.042 0.022 N NA
 3473866 3473867 EcHS_A1921 EcHS_A1922 prc proQ TRUE 0.881 20.000 0.304 NA N NA
 3473867 3473868 EcHS_A1922 EcHS_A1923 proQ   TRUE 0.620 97.000 0.081 NA Y NA
 3473869 3473870 EcHS_A1924 EcHS_A1925     TRUE 0.994 -37.000 0.840 NA   NA
 3473870 3473871 EcHS_A1925 EcHS_A1926     TRUE 0.681 74.000 0.420 NA   NA
 3473871 3473872 EcHS_A1926 EcHS_A1927     FALSE 0.214 118.000 0.121 NA   NA
 3473872 3473873 EcHS_A1927 EcHS_A1928     TRUE 0.893 21.000 0.353 NA   NA
 3473876 3473877 EcHS_A4749 EcHS_A1930     FALSE 0.044 162.000 0.000 NA   NA
 3473877 3473878 EcHS_A1930 EcHS_A1931     TRUE 0.980 13.000 0.704 NA   NA
 3473878 3473879 EcHS_A1931 EcHS_A1932     TRUE 0.993 4.000 0.613 1.000   NA
 3473880 3473881 EcHS_A1933 EcHS_A1934 holE   TRUE 0.419 102.000 0.222 1.000   NA
 3473881 3473882 EcHS_A1934 EcHS_A1935   exoX TRUE 0.927 24.000 0.500 1.000   NA
 3473884 3473885 EcHS_A1937 EcHS_A1938     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 3473886 3473887 EcHS_A1939 EcHS_A1940     FALSE 0.142 67.000 0.027 NA   NA
 3473889 3473890 EcHS_A1942 EcHS_A1943 eda edd TRUE 0.967 37.000 0.523 1.000 Y NA
 3473890 3473891 EcHS_A1943 EcHS_A1944 edd zwf FALSE 0.161 235.000 0.041 1.000 Y NA
 3473891 3473892 EcHS_A1944 EcHS_A1945 zwf   FALSE 0.041 166.000 0.000 NA   NA
 3473893 3473894 EcHS_A1946 EcHS_A1947   pykA FALSE 0.186 128.000 0.071 1.000 N NA
 3473895 3473896 EcHS_A1948 EcHS_A1949 msbB   TRUE 0.795 120.000 0.299 1.000 Y NA
 3473896 3473897 EcHS_A1949 EcHS_A1951   znuA TRUE 0.830 16.000 0.131 1.000 N NA
 3473898 3473899 EcHS_A1950 EcHS_A1952 znuC znuB TRUE 1.000 -3.000 0.755 0.084 Y NA
 3473900 3473901 EcHS_A1953 EcHS_A1954 ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.549 0.001 Y NA
 3473903 3473904 EcHS_A1956 EcHS_A1957 ruvC   TRUE 0.736 35.000 0.277 NA   NA
 3473904 3473905 EcHS_A1957 EcHS_A1958   nudB FALSE 0.355 29.000 0.035 NA   NA
 3473905 3473906 EcHS_A1958 EcHS_A1959 nudB aspS FALSE 0.173 118.000 0.050 1.000 N NA
 3473906 3473907 EcHS_A1959 EcHS_A1960 aspS   FALSE 0.027 190.000 0.000 NA   NA
 3473908 3473909 EcHS_A1961 EcHS_A1962     TRUE 0.956 -3.000 0.089 NA   NA
 3473909 3473910 EcHS_A1962 EcHS_A1963     FALSE 0.412 53.000 0.126 NA   NA
 3473910 3473911 EcHS_A1963 EcHS_A1964     TRUE 0.415 41.000 0.089 NA   NA
 3473911 3473912 EcHS_A1964 EcHS_A1965     TRUE 0.988 -3.000 0.315 NA   NA
 3473912 3473913 EcHS_A1965 EcHS_A1966     FALSE 0.337 28.000 0.000 NA   NA
 3473914 3473915 EcHS_A1967 EcHS_A1968 torZ torY TRUE 0.998 7.000 0.481 0.001 Y NA
 3473915 3473916 EcHS_A1968 EcHS_A1969 torY cutC FALSE 0.006 388.000 0.000 1.000 N NA
 3473916 3473917 EcHS_A1969 EcHS_A1970 cutC   TRUE 0.691 14.000 0.057 NA   NA
 3473918 3473919 EcHS_A1971 EcHS_A1972 argS   FALSE 0.034 177.000 0.000 NA   NA
 3473920 3473921 EcHS_A1973 EcHS_A1974 flhE flhA TRUE 0.992 0.000 0.158 0.002   NA
 3473921 3473922 EcHS_A1974 EcHS_A1975 flhA flhB TRUE 0.998 -7.000 0.287 0.008 Y NA
 3473924 3473925 EcHS_A1977 EcHS_A1978 cheZ cheY TRUE 0.968 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3473925 3473926 EcHS_A1978 EcHS_A1979 cheY cheB TRUE 0.971 15.000 0.000 0.011 Y NA
 3473926 3473927 EcHS_A1979 EcHS_A1980 cheB cheR TRUE 0.986 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3473927 3473928 EcHS_A1980 EcHS_A1981 cheR tap TRUE 0.961 19.000 0.188 1.000 Y NA
 3473928 3473929 EcHS_A1981 EcHS_A1982 tap tar TRUE 0.956 46.000 0.235 0.001 Y NA
 3473931 3473932 EcHS_A1983 EcHS_A1984 cheW cheA TRUE 0.991 21.000 0.447 0.003 Y NA
 3473932 3473933 EcHS_A1984 EcHS_A1985 cheA motB TRUE 0.999 5.000 0.913 1.000 Y NA
 3473933 3473934 EcHS_A1985 EcHS_A1986 motB motA TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 3473934 3473935 EcHS_A1986 EcHS_A1987 motA flhC TRUE 0.563 127.000 0.408 1.000   NA
 3473935 3473936 EcHS_A1987 EcHS_A1988 flhC flhD TRUE 0.975 3.000 0.000 0.001   NA
 3473936 3473937 EcHS_A1988 EcHS_A1989 flhD   FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3473938 3473939 EcHS_A1990 EcHS_A1991     TRUE 0.824 57.000 0.000 0.066 Y NA
 3473939 3473940 EcHS_A1991 EcHS_A1992   uspC FALSE 0.138 119.000 0.000 1.000 N NA
 3473941 3473942 EcHS_A1993 EcHS_A1994 otsA otsB TRUE 0.994 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 3473942 3473943 EcHS_A1994 EcHS_A1995 otsB araH FALSE 0.365 167.000 0.037 1.000 Y NA
 3473943 3473944 EcHS_A1995 EcHS_A1996 araH araG TRUE 0.995 15.000 0.451 0.002 Y NA
 3473944 3473945 EcHS_A1996 EcHS_A1997 araG araF TRUE 0.985 70.000 0.917 0.002 Y NA
 3473946 3473948 EcHS_A1998 EcHS_A2000     FALSE 0.002 442.000 0.000 NA   NA
 3473948 3473949 EcHS_A2000 EcHS_A2001     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 3473954 3473955 EcHS_A2006 EcHS_A4669     FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 3473955 3473956 EcHS_A4669 EcHS_A4670     TRUE 0.618 13.000 0.000 NA   NA
 3473956 3473957 EcHS_A4670 EcHS_A4671     FALSE 0.179 55.000 0.000 NA   NA
 3473957 3473958 EcHS_A4671 EcHS_A2010   pgsA FALSE 0.052 152.000 0.000 NA   NA
 3473958 3473959 EcHS_A2010 EcHS_A2011 pgsA uvrC TRUE 0.615 57.000 0.227 1.000 N NA
 3473959 3473960 EcHS_A2011 EcHS_A2012 uvrC uvrY TRUE 0.987 -3.000 0.086 0.021 N NA
 3473960 3473961 EcHS_A2012 EcHS_A2013 uvrY   FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 3473963 3473964 EcHS_A2015 EcHS_A2016 sdiA yecC FALSE 0.038 230.000 0.071 1.000 N NA
 3473964 3473965 EcHS_A2016 EcHS_A2017 yecC   TRUE 0.996 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 3473965 3473966 EcHS_A2017 EcHS_A2018   dcyD TRUE 0.950 15.000 0.050 1.000 Y NA
 3473966 3473967 EcHS_A2018 EcHS_A2019 dcyD fliY TRUE 0.880 105.000 0.469 1.000 Y NA
 3473967 3473968 EcHS_A2019 EcHS_A2020 fliY   FALSE 0.108 91.000 0.000 NA   NA
 3473968 3473969 EcHS_A2020 EcHS_A2021   fliA FALSE 0.212 46.000 0.000 NA   NA
 3473969 3473970 EcHS_A2021 EcHS_A2022 fliA   FALSE 0.061 164.000 0.012 1.000 N NA
 3473971 3473972 EcHS_A2024 EcHS_A2025 fliD fliS TRUE 0.990 16.000 0.284 0.002 Y NA
 3473972 3473973 EcHS_A2025 EcHS_A2026 fliS fliT TRUE 0.990 0.000 0.324 1.000   NA
 3473973 3473974 EcHS_A2026 EcHS_A2027 fliT amyA FALSE 0.345 78.000 0.115 1.000   NA
 3473976 3473977 EcHS_A2029 EcHS_A2030     TRUE 0.997 -3.000 0.844 NA   NA
 3473977 3473978 EcHS_A2030 EcHS_A2031     FALSE 0.089 109.000 0.000 NA   NA
 3473981 3473982 EcHS_A2034 EcHS_A2035     TRUE 0.987 10.000 0.625 NA   NA
 3473982 3473983 EcHS_A2035 EcHS_A2036   emrE FALSE 0.038 169.000 0.000 NA   NA
 3473983 3473984 EcHS_A2036 EcHS_A2037 emrE fliE FALSE 0.008 344.000 0.000 1.000 N NA
 3473985 3473986 EcHS_A2038 EcHS_A2039 fliF fliG TRUE 0.998 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 3473986 3473987 EcHS_A2039 EcHS_A2040 fliG fliH TRUE 0.995 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 3473987 3473988 EcHS_A2040 EcHS_A2041 fliH fliI TRUE 0.996 0.000 0.000 0.003 Y NA
 3473988 3473989 EcHS_A2041 EcHS_A2042 fliI fliJ TRUE 0.957 19.000 0.006 0.006 Y NA
 3473989 3473990 EcHS_A2042 EcHS_A2043 fliJ fliK TRUE 0.999 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 3473990 3473991 EcHS_A2043 EcHS_A2044 fliK fliL TRUE 0.678 105.000 0.119 1.000 Y NA
 3473991 3473992 EcHS_A2044 EcHS_A2045 fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 3473992 3473993 EcHS_A2045 EcHS_A2046 fliM fliN TRUE 0.998 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 3473993 3473994 EcHS_A2046 EcHS_A2047 fliN fliO TRUE 0.997 3.000 0.443 1.000 Y NA
 3473994 3473995 EcHS_A2047 EcHS_A2048 fliO fliP TRUE 0.996 0.000 0.203 1.000 Y NA
 3473995 3473996 EcHS_A2048 EcHS_A2049 fliP fliQ TRUE 0.999 10.000 0.827 0.008 Y NA
 3473996 3473997 EcHS_A2049 EcHS_A2050 fliQ fliR TRUE 0.991 8.000 0.000 0.002 Y NA
 3473997 3473998 EcHS_A2050 EcHS_A2051 fliR rcsA FALSE 0.011 290.000 0.000 1.000 N NA
 3474002 3474003 EcHS_A2054 EcHS_A2055     FALSE 0.061 142.000 0.000 NA   NA
 3474004 3474005 EcHS_A2057 EcHS_A2059     FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 3474005 3474006 EcHS_A2059 EcHS_A2060     FALSE 0.119 79.000 0.025 NA   NA
 3474008 3474009 EcHS_A2062 EcHS_A2063 vsr dcm TRUE 0.991 -19.000 0.000 0.066 Y NA
 3474009 3474010 EcHS_A2063 EcHS_A2064 dcm   FALSE 0.210 67.000 0.000 1.000   NA
 3474011 3474012 EcHS_A2065 EcHS_A2066     TRUE 0.824 57.000 0.000 0.066 Y NA
 3474012 3474013 EcHS_A2066 EcHS_A2067     FALSE 0.145 96.000 0.000 1.000   NA
 3474013 3474014 EcHS_A2067 EcHS_A2068   hchA FALSE 0.002 591.000 0.000 NA   NA
 3474015 3474016 EcHS_A2069 EcHS_A2070     TRUE 1.000 0.000 0.857 0.001 Y NA
 3474017 3474018 EcHS_A2071 EcHS_A2072     FALSE 0.132 109.000 0.000 1.000   NA
 3474018 3474019 EcHS_A2072 EcHS_A2073     TRUE 0.998 1.000 0.790 0.054   NA
 3474019 3474020 EcHS_A2073 EcHS_A2074     FALSE 0.015 257.000 0.000 1.000   NA
 3474020 3474021 EcHS_A2074 EcHS_A2075     FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000   NA
 3474022 3474023 EcHS_A2076 EcHS_A2077     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3474025 3474026 EcHS_A2079 EcHS_A2080     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3474028 3474029 EcHS_A2082 EcHS_A2083     FALSE 0.349 27.000 0.000 NA   NA
 3474029 3474030 EcHS_A2083 EcHS_A2084     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 3474030 3474031 EcHS_A2084 EcHS_A2085     TRUE 0.997 -10.000 1.000 NA   NA
 3474031 3474032 EcHS_A2085 EcHS_A2086     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3474032 3474033 EcHS_A2086 EcHS_A2087     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3474033 3474034 EcHS_A2087 EcHS_A2088     TRUE 0.948 -3.000 0.074 NA   NA
 3474034 3474035 EcHS_A2088 EcHS_A2089     TRUE 0.791 -76.000 0.000 NA   NA
 3474035 3474036 EcHS_A2089 EcHS_A2090     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3474036 3474037 EcHS_A2090 EcHS_A2091     TRUE 0.994 2.000 0.600 NA   NA
 3474037 3474038 EcHS_A2091 EcHS_A2092     TRUE 0.977 -3.000 0.150 1.000   NA
 3474038 3474039 EcHS_A2092 EcHS_A2093     TRUE 0.709 60.000 0.350 1.000   NA
 3474039 3474040 EcHS_A2093 EcHS_A2094     TRUE 0.943 9.000 0.200 NA   NA
 3474040 3474041 EcHS_A2094 EcHS_A2095     TRUE 0.985 -58.000 0.500 NA   NA
 3474041 3474042 EcHS_A2095 EcHS_A2097     FALSE 0.011 248.000 0.000 NA   NA
 3474045 3474046 EcHS_A2099 EcHS_A4673     FALSE 0.095 100.000 0.000 NA   NA
 3474046 3474047 EcHS_A4673 EcHS_A2102     FALSE 0.013 238.000 0.000 NA   NA
 3474049 3474050 EcHS_A2104 EcHS_A2105 shiA amn FALSE 0.141 102.000 0.021 1.000 N NA
 3474050 3474051 EcHS_A2105 EcHS_A2106 amn   FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 3474052 3474053 EcHS_A4674 EcHS_A2108     FALSE 0.095 100.000 0.000 NA   NA
 3474055 3474056 EcHS_A2110 EcHS_A2111 cbl nac TRUE 0.851 102.000 0.222 0.053 Y NA
 3474058 3474059 EcHS_A2113 EcHS_A2114   cobT FALSE 0.122 65.000 0.015 NA   NA
 3474059 3474060 EcHS_A2114 EcHS_A2115 cobT cobS TRUE 0.985 12.000 0.056 0.003 Y NA
 3474060 3474061 EcHS_A2115 EcHS_A2116 cobS cobU TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3474061 3474062 EcHS_A2116 EcHS_A2117 cobU   FALSE 0.069 134.000 0.000 NA   NA
 3474062 3474063 EcHS_A2117 EcHS_A2118     FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 3474066 3474067 EcHS_A2121 EcHS_A2122     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 3474067 3474068 EcHS_A2122 EcHS_A2123     TRUE 0.834 31.000 0.000 NA Y NA
 3474069 3474070 EcHS_A2124 EcHS_A2127     FALSE 0.094 101.000 0.000 NA   NA
 3474070 3474071 EcHS_A2127 EcHS_A2128     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 3474073 3474074 EcHS_A2131 EcHS_A2132     FALSE 0.041 166.000 0.000 NA   NA
 3474077 3474078 EcHS_A2135 EcHS_A2136     FALSE 0.111 89.000 0.000 NA   NA
 3474078 3474079 EcHS_A2136 EcHS_A2137     FALSE 0.002 1186.000 0.000 NA   NA
 3474079 3474080 EcHS_A2137 EcHS_A2138     TRUE 0.695 85.000 0.500 NA   NA
 3474080 3474081 EcHS_A2138 EcHS_A2139     FALSE 0.004 372.000 0.000 NA   NA
 3474081 3474082 EcHS_A2139 EcHS_A2140     FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 3474082 3474083 EcHS_A2140 EcHS_A2141     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474083 3474084 EcHS_A2141 EcHS_A2142     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3474084 3474085 EcHS_A2142 EcHS_A2143     FALSE 0.002 716.000 0.000 NA   NA
 3474085 3474086 EcHS_A2143 EcHS_A2144     FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3474087 3474088 EcHS_A2145 EcHS_A2146     FALSE 0.143 172.000 0.180 NA   NA
 3474088 3474089 EcHS_A2146 EcHS_A2147   gyrI FALSE 0.056 198.000 0.096 NA   NA
 3474089 3474090 EcHS_A2147 EcHS_A2148 gyrI dacD FALSE 0.214 119.000 0.110 NA N NA
 3474092 3474093 EcHS_A2150 EcHS_A2151     TRUE 0.951 14.000 0.419 NA   NA
 3474093 3474094 EcHS_A2151 EcHS_A2152   yeeF FALSE 0.033 179.000 0.000 NA   NA
 3474094 3474095 EcHS_A2152 EcHS_A2153 yeeF   FALSE 0.015 267.000 0.000 1.000 N NA
 3474095 3474096 EcHS_A2153 EcHS_A2154     FALSE 0.288 46.000 0.015 1.000 N NA
 3474096 3474097 EcHS_A2154 EcHS_A2155   yoeB FALSE 0.119 83.000 0.000 NA   NA
 3474097 3474098 EcHS_A2155 EcHS_A2156 yoeB yefM TRUE 0.991 -3.000 0.366 NA   NA
 3474099 3474100 EcHS_A2157 EcHS_A2158 hisL hisG FALSE 0.252 146.000 0.003 0.003   NA
 3474100 3474101 EcHS_A2158 EcHS_A2159 hisG hisD TRUE 0.996 6.000 0.171 0.003 Y NA
 3474101 3474102 EcHS_A2159 EcHS_A2160 hisD hisC TRUE 0.999 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 3474102 3474103 EcHS_A2160 EcHS_A2161 hisC hisB TRUE 0.999 0.000 0.341 0.003 Y NA
 3474103 3474104 EcHS_A2161 EcHS_A2162 hisB hisH TRUE 0.998 0.000 0.128 0.003 Y NA
 3474104 3474105 EcHS_A2162 EcHS_A2163 hisH hisA TRUE 0.998 0.000 0.210 0.003 Y NA
 3474105 3474106 EcHS_A2163 EcHS_A2164 hisA hisF TRUE 0.998 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 3474106 3474107 EcHS_A2164 EcHS_A2165 hisF hisIE TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 3474108 3474109 EcHS_A2166 EcHS_A2167   mtfB TRUE 0.995 10.000 0.256 0.011 Y NA
 3474109 3474110 EcHS_A2167 EcHS_A2168 mtfB   TRUE 0.906 47.000 0.093 0.011 Y NA
 3474110 3474111 EcHS_A2168 EcHS_A2169     FALSE 0.221 86.000 0.057 1.000   NA
 3474111 3474112 EcHS_A2169 EcHS_A2170     TRUE 0.800 20.000 0.057 0.082   NA
 3474112 3474113 EcHS_A2170 EcHS_A2171     TRUE 0.998 3.000 0.450 0.082 Y NA
 3474113 3474114 EcHS_A2171 EcHS_A2172     TRUE 0.988 6.000 0.125 1.000 Y NA
 3474114 3474115 EcHS_A2172 EcHS_A2173   manC TRUE 0.733 24.000 0.133 1.000 N NA
 3474115 3474116 EcHS_A2173 EcHS_A2174 manC   TRUE 0.698 11.000 0.000 NA   NA
 3474116 3474117 EcHS_A2174 EcHS_A2175     FALSE 0.002 574.000 0.000 NA   NA
 3474117 3474118 EcHS_A2175 EcHS_A2176     FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 3474118 3474119 EcHS_A2176 EcHS_A2177     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.022 Y NA
 3474119 3474120 EcHS_A2177 EcHS_A2178   ugd FALSE 0.258 58.000 0.000 1.000 N NA
 3474120 3474121 EcHS_A2178 EcHS_A2179 ugd rfbC FALSE 0.394 181.000 0.105 1.000 Y NA
 3474121 3474122 EcHS_A2179 EcHS_A2180 rfbC rfbD TRUE 0.941 15.000 0.021 1.000 Y NA
 3474122 3474123 EcHS_A2180 EcHS_A2181 rfbD rfbA2 TRUE 0.927 32.000 0.021 0.002 Y NA
 3474123 3474124 EcHS_A2181 EcHS_A2182 rfbA2 rfbB1 TRUE 0.965 27.000 0.143 0.002 Y NA
 3474124 3474125 EcHS_A2182 EcHS_A2183 rfbB1 gnd FALSE 0.026 224.000 0.000 1.000 N NA
 3474125 3474126 EcHS_A2183 EcHS_A2184 gnd   FALSE 0.035 201.000 0.000 1.000   NA
 3474126 3474127 EcHS_A2184 EcHS_A2185     FALSE 0.119 83.000 0.000 NA   NA
 3474127 3474128 EcHS_A2185 EcHS_A2186     TRUE 0.874 -7.000 0.000 NA   NA
 3474128 3474129 EcHS_A2186 EcHS_A2187     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3474129 3474130 EcHS_A2187 EcHS_A2188     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3474130 3474131 EcHS_A2188 EcHS_A2189     FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 3474131 3474132 EcHS_A2189 EcHS_A2190     FALSE 0.273 38.000 0.035 NA   NA
 3474132 3474133 EcHS_A2190 EcHS_A2191   etk2 TRUE 0.788 103.000 0.250 1.000 Y NA
 3474133 3474134 EcHS_A2191 EcHS_A2192 etk2 wzb TRUE 0.987 15.000 1.000 1.000 N NA
 3474134 3474135 EcHS_A2192 EcHS_A2193 wzb   TRUE 0.996 2.000 0.667 1.000 N NA
 3474135 3474136 EcHS_A2193 EcHS_A2194     FALSE 0.203 144.000 0.167 NA   NA
 3474136 3474137 EcHS_A2194 EcHS_A2195     FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 3474137 3474138 EcHS_A2195 EcHS_A2196     TRUE 0.814 -25.000 0.000 NA   NA
 3474139 3474140 EcHS_A2197 EcHS_A2198     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 3474141 3474142 EcHS_A2199 EcHS_A2200     FALSE 0.087 112.000 0.000 NA   NA
 3474142 3474143 EcHS_A2200 EcHS_A2202   galF FALSE 0.003 393.000 0.000 NA   NA
 3474145 3474146 EcHS_A2204 EcHS_A2205 asmA dcd TRUE 0.559 22.000 0.057 NA N NA
 3474146 3474147 EcHS_A2205 EcHS_A2206 dcd udk TRUE 0.694 92.000 0.098 1.000 Y NA
 3474151 3474152 EcHS_A2211 EcHS_A2212     FALSE 0.212 46.000 0.000 NA   NA
 3474154 3474155 EcHS_A2214 EcHS_A2215     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474156 3474157 EcHS_A4752 EcHS_A4753     FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 3474157 3474158 EcHS_A4753 EcHS_A2216   mdtA FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 3474158 3474159 EcHS_A2216 EcHS_A2217 mdtA mdtB TRUE 0.913 0.000 0.000 NA N NA
 3474159 3474160 EcHS_A2217 EcHS_A2218 mdtB mdtC TRUE 0.990 1.000 0.062 NA Y NA
 3474160 3474161 EcHS_A2218 EcHS_A2219 mdtC   TRUE 0.992 1.000 0.438 1.000 N NA
 3474161 3474162 EcHS_A2219 EcHS_A2220   baeS TRUE 0.977 -3.000 0.139 1.000 N NA
 3474162 3474163 EcHS_A2220 EcHS_A2221 baeS baeR TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 3474163 3474164 EcHS_A2221 EcHS_A2222 baeR   FALSE 0.044 191.000 0.062 NA   NA
 3474164 3474165 EcHS_A2222 EcHS_A2223     FALSE 0.057 147.000 0.000 NA   NA
 3474165 3474166 EcHS_A2223 EcHS_A4754     FALSE 0.119 83.000 0.000 NA   NA
 3474169 3474170 EcHS_A2226 EcHS_A2227 gatR gatD FALSE 0.149 106.000 0.000 1.000 N NA
 3474170 3474171 EcHS_A2227 EcHS_A2228 gatD gatC FALSE 0.311 48.000 0.000 1.000 N NA
 3474171 3474172 EcHS_A2228 EcHS_A2229 gatC gatB TRUE 0.992 4.000 0.000 0.015 Y NA
 3474172 3474173 EcHS_A2229 EcHS_A2230 gatB gatA TRUE 0.924 31.000 0.000 0.010 Y NA
 3474173 3474174 EcHS_A2230 EcHS_A2231 gatA   TRUE 0.974 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3474174 3474175 EcHS_A2231 EcHS_A2232     TRUE 0.942 29.000 0.000 0.001 Y NA
 3474175 3474176 EcHS_A2232 EcHS_A2233   fbaB FALSE 0.162 308.000 0.000 0.001 Y NA
 3474177 3474178 EcHS_A2234 EcHS_A2235 yegT   TRUE 0.991 -3.000 0.364 NA   NA
 3474178 3474179 EcHS_A2235 EcHS_A2236     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA N NA
 3474180 3474181 EcHS_A2237 EcHS_A2238     FALSE 0.291 52.000 0.000 1.000 N NA
 3474181 3474182 EcHS_A2238 EcHS_A2239   thiD FALSE 0.235 65.000 0.000 1.000 N NA
 3474182 3474183 EcHS_A2239 EcHS_A2240 thiD thiM TRUE 0.996 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 3474183 3474184 EcHS_A2240 EcHS_A2241 thiM rcnR FALSE 0.015 223.000 0.000 NA   NA
 3474185 3474186 EcHS_A2242 EcHS_A2243 rcnA   FALSE 0.245 39.000 0.000 NA   NA
 3474187 3474188 EcHS_A2244 EcHS_A2245     TRUE 0.531 16.000 0.000 NA   NA
 3474188 3474189 EcHS_A2245 EcHS_A2246     TRUE 0.996 16.000 1.000 1.000 Y NA
 3474189 3474190 EcHS_A2246 EcHS_A2247     TRUE 0.820 80.000 0.222 1.000 Y NA
 3474190 3474191 EcHS_A2247 EcHS_A2248     FALSE 0.003 837.000 0.000 1.000 N NA
 3474192 3474193 EcHS_A2249 EcHS_A2250 metG molR FALSE 0.062 141.000 0.000 NA   NA
 3474193 3474194 EcHS_A2250 EcHS_A2251 molR   TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3474194 3474195 EcHS_A2251 EcHS_A2252     FALSE 0.157 61.000 0.000 NA   NA
 3474195 3474196 EcHS_A2252 EcHS_A2253     FALSE 0.006 307.000 0.000 NA   NA
 3474196 3474197 EcHS_A2253 EcHS_A2254     TRUE 0.698 11.000 0.000 NA   NA
 3474197 3474198 EcHS_A2254 EcHS_A2255     TRUE 0.874 -7.000 0.000 NA   NA
 3474198 3474199 EcHS_A2255 EcHS_A2256     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474199 3474200 EcHS_A2256 EcHS_A2257     FALSE 0.080 125.000 0.000 NA   NA
 3474201 3474202 EcHS_A2258 EcHS_A2259     FALSE 0.272 47.000 0.051 NA   NA
 3474202 3474203 EcHS_A2259 EcHS_A2260     TRUE 1.000 -3.000 0.877 0.014 Y NA
 3474204 3474205 EcHS_A2261 EcHS_A2262     FALSE 0.160 60.000 0.000 NA   NA
 3474206 3474207 EcHS_A2263 EcHS_A2264     TRUE 0.997 5.000 0.542 1.000 Y NA
 3474207 3474208 EcHS_A2264 EcHS_A2265     TRUE 0.998 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 3474208 3474209 EcHS_A2265 EcHS_A2266     TRUE 0.993 7.000 0.521 0.057 N NA
 3474209 3474210 EcHS_A2266 EcHS_A2267   bglX FALSE 0.036 252.000 0.099 1.000 N NA
 3474212 3474213 EcHS_A2269 EcHS_A2270 pbpG   FALSE 0.133 165.000 0.145 NA   NA
 3474215 3474216 EcHS_A2272 EcHS_A2273     TRUE 0.459 53.000 0.105 1.000 N NA
 3474216 3474217 EcHS_A2273 EcHS_A2274   dusC FALSE 0.003 680.000 0.000 1.000 N NA
 3474218 3474219 EcHS_A2275 EcHS_A2276     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474219 3474220 EcHS_A2276 EcHS_A2277   cdd FALSE 0.074 130.000 0.000 NA   NA
 3474220 3474221 EcHS_A2277 EcHS_A2278 cdd sanA FALSE 0.070 150.000 0.045 NA   NA
 3474221 3474222 EcHS_A2278 EcHS_A2279 sanA   TRUE 0.822 3.000 0.019 NA   NA
 3474222 3474223 EcHS_A2279 EcHS_A2280     FALSE 0.029 194.000 0.036 NA   NA
 3474223 3474224 EcHS_A2280 EcHS_A2281     TRUE 0.981 -6.000 0.062 0.017 N NA
 3474225 3474226 EcHS_A2282 EcHS_A2283 mglC mglA TRUE 0.995 16.000 0.905 1.000 Y NA
 3474226 3474227 EcHS_A2283 EcHS_A2284 mglA mglB TRUE 0.855 61.000 0.250 NA Y NA
 3474227 3474228 EcHS_A2284 EcHS_A2285 mglB galS FALSE 0.008 280.000 0.000 NA N NA
 3474228 3474229 EcHS_A2285 EcHS_A2286 galS   TRUE 0.530 142.000 0.500 NA   NA
 3474229 3474230 EcHS_A2286 EcHS_A2287   folE TRUE 0.971 17.000 0.719 NA   NA
 3474232 3474233 EcHS_A2289 EcHS_A2290 cirA   FALSE 0.104 93.000 0.000 NA   NA
 3474233 3474234 EcHS_A2290 EcHS_A2291   lysP FALSE 0.097 97.000 0.000 NA   NA
 3474234 3474235 EcHS_A2291 EcHS_A2292 lysP   FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 3474235 3474236 EcHS_A2292 EcHS_A2293     TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 3474237 3474238 EcHS_A2294 EcHS_A2295   nfo FALSE 0.162 74.000 0.040 NA   NA
 3474238 3474239 EcHS_A2295 EcHS_A2296 nfo   TRUE 0.821 3.000 0.004 NA N NA
 3474240 3474241 EcHS_A2297 EcHS_A2298     TRUE 0.580 100.000 0.056 NA Y NA
 3474243 3474244 EcHS_A2300 EcHS_A2302     FALSE 0.102 94.000 0.000 NA   NA
 3474244 3474245 EcHS_A2302 EcHS_A2303     TRUE 0.825 -12.000 0.008 NA N NA
 3474245 3474246 EcHS_A2303 EcHS_A2304   fruA FALSE 0.029 424.000 0.000 NA Y NA
 3474246 3474247 EcHS_A2304 EcHS_A2305 fruA fruK TRUE 0.990 17.000 0.562 1.000 Y NA
 3474247 3474248 EcHS_A2305 EcHS_A2306 fruK fruB TRUE 0.994 0.000 0.112 1.000 Y NA
 3474249 3474250 EcHS_A2307 EcHS_A2308   setB FALSE 0.139 71.000 0.000 NA   NA
 3474250 3474251 EcHS_A2308 EcHS_A2309 setB   FALSE 0.089 151.000 0.000 1.000 N NA
 3474251 3474252 EcHS_A2309 EcHS_A2310     FALSE 0.027 223.000 0.000 1.000 N NA
 3474252 3474253 EcHS_A2310 EcHS_A2311     FALSE 0.270 118.000 0.167 NA   NA
 3474253 3474254 EcHS_A2311 EcHS_A2312     TRUE 0.708 39.000 0.275 NA   NA
 3474254 3474255 EcHS_A2312 EcHS_A2313     FALSE 0.003 412.000 0.000 NA   NA
 3474255 3474256 EcHS_A2313 EcHS_A2314     FALSE 0.164 181.000 0.219 NA N NA
 3474256 3474257 EcHS_A2314 EcHS_A2315     TRUE 0.644 82.000 0.394 NA N NA
 3474257 3474258 EcHS_A2315 EcHS_A2316     TRUE 0.998 1.000 0.848 0.057   NA
 3474258 3474259 EcHS_A2316 EcHS_A2317     TRUE 0.999 0.000 0.833 0.057   NA
 3474259 3474260 EcHS_A2317 EcHS_A2318     TRUE 0.996 2.000 0.758 1.000   NA
 3474261 3474262 EcHS_A2319 EcHS_A2320   bcr FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 3474262 3474263 EcHS_A2320 EcHS_A2321 bcr rsuA TRUE 0.496 28.000 0.036 1.000 N NA
 3474264 3474265 EcHS_A2322 EcHS_A2323   rplY FALSE 0.322 125.000 0.024 0.012 N NA
 3474266 3474267 EcHS_A2324 EcHS_A2325 ndpA   FALSE 0.218 45.000 0.000 NA   NA
 3474268 3474269 EcHS_A2326 EcHS_A2327     TRUE 0.499 20.000 0.040 NA   NA
 3474269 3474270 EcHS_A2327 EcHS_A4677     FALSE 0.135 74.000 0.000 NA   NA
 3474272 3474273 EcHS_A2330 EcHS_A2331   narP FALSE 0.089 109.000 0.000 NA   NA
 3474274 3474275 EcHS_A2332 EcHS_A2333   dsbE TRUE 0.999 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 3474275 3474276 EcHS_A2333 EcHS_A2334 dsbE ccmF TRUE 1.000 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 3474276 3474277 EcHS_A2334 EcHS_A2335 ccmF ccmE TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 3474277 3474278 EcHS_A2335 EcHS_A2336 ccmE ccmD TRUE 0.992 -3.000 0.344 1.000 N NA
 3474278 3474279 EcHS_A2336 EcHS_A2337 ccmD ccmC TRUE 0.995 -3.000 0.501 1.000 N NA
 3474279 3474280 EcHS_A2337 EcHS_A2338 ccmC ccmB TRUE 0.982 42.000 0.501 0.001 Y NA
 3474280 3474281 EcHS_A2338 EcHS_A2339 ccmB ccmA TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 3474281 3474282 EcHS_A2339 EcHS_A2340 ccmA napC TRUE 0.645 19.000 0.043 1.000 N NA
 3474282 3474283 EcHS_A2340 EcHS_A2341 napC napB TRUE 0.998 10.000 0.490 0.004 Y NA
 3474283 3474284 EcHS_A2341 EcHS_A2342 napB napH TRUE 0.999 -3.000 0.316 0.008 Y NA
 3474284 3474285 EcHS_A2342 EcHS_A2343 napH   TRUE 0.998 -13.000 0.795 0.017   NA
 3474285 3474286 EcHS_A2343 EcHS_A2344   napA TRUE 0.983 7.000 0.243 0.053   NA
 3474286 3474287 EcHS_A2344 EcHS_A2345 napA napD TRUE 0.998 -3.000 0.875 NA N NA
 3474287 3474288 EcHS_A2345 EcHS_A2346 napD napF TRUE 0.969 -10.000 0.209 NA   NA
 3474290 3474291 EcHS_A2348 EcHS_A2349   mqo TRUE 0.854 -10.000 0.000 NA   NA
 3474291 3474292 EcHS_A2349 EcHS_A2350 mqo   FALSE 0.026 218.000 0.000 1.000   NA
 3474292 3474293 EcHS_A2350 EcHS_A2351   alkB FALSE 0.305 76.000 0.076 1.000 N NA
 3474293 3474294 EcHS_A2351 EcHS_A2352 alkB ada TRUE 0.978 0.000 0.015 0.014 N NA
 3474294 3474295 EcHS_A2352 EcHS_A2353 ada apbE FALSE 0.196 74.000 0.019 1.000 N NA
 3474295 3474296 EcHS_A2353 EcHS_A2354 apbE ompC FALSE 0.202 112.000 0.066 1.000 N NA
 3474299 3474300 EcHS_A2356 EcHS_A2357 yojN rcsB TRUE 0.998 -19.000 0.558 1.000 Y NA
 3474301 3474302 EcHS_A2358 EcHS_A2359   rcsC FALSE 0.093 102.000 0.000 NA   NA
 3474303 3474304 EcHS_A2360 EcHS_A2361 atoS atoC TRUE 0.999 -3.000 0.455 0.013 Y NA
 3474304 3474305 EcHS_A2361 EcHS_A2362 atoC pcaI FALSE 0.193 196.000 0.273 1.000 N NA
 3474305 3474306 EcHS_A2362 EcHS_A2363 pcaI   TRUE 1.000 0.000 0.800 0.001 Y NA
 3474306 3474307 EcHS_A2363 EcHS_A2364     TRUE 0.996 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 3474307 3474308 EcHS_A2364 EcHS_A2365   atoB TRUE 0.922 31.000 0.174 1.000 Y NA
 3474309 3474310 EcHS_A2366 EcHS_A2367     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 3474310 3474311 EcHS_A2367 EcHS_A2368     TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 3474311 3474312 EcHS_A2368 EcHS_A2369     FALSE 0.386 24.000 0.000 NA   NA
 3474312 3474313 EcHS_A2369 EcHS_A2370     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474313 3474314 EcHS_A2370 EcHS_A2371   gyrA FALSE 0.055 149.000 0.000 NA   NA
 3474317 3474318 EcHS_A2374 EcHS_A2375 nrdA nrdB FALSE 0.313 234.000 0.000 0.001 Y NA
 3474318 3474319 EcHS_A2375 EcHS_A2376 nrdB   TRUE 0.944 0.000 0.034 1.000 N NA
 3474322 3474323 EcHS_A2379 EcHS_A2380 glpQ glpT TRUE 0.985 5.000 0.396 1.000 N NA
 3474324 3474325 EcHS_A2381 EcHS_A2382   glpA FALSE 0.373 25.000 0.000 NA   NA
 3474325 3474326 EcHS_A2382 EcHS_A2383 glpA glpB TRUE 0.998 -10.000 0.650 0.001 N NA
 3474326 3474327 EcHS_A2383 EcHS_A2384 glpB glpC TRUE 0.998 -3.000 0.547 0.001 N NA
 3474327 3474328 EcHS_A2384 EcHS_A2385 glpC   FALSE 0.373 25.000 0.000 NA   NA
 3474328 3474329 EcHS_A2385 EcHS_A2386     FALSE 0.225 43.000 0.000 NA   NA
 3474330 3474331 EcHS_A2387 EcHS_A2388     TRUE 0.972 18.000 0.250 1.000 Y NA
 3474331 3474332 EcHS_A2388 EcHS_A2389     FALSE 0.343 57.000 0.060 1.000 N NA
 3474332 3474333 EcHS_A2389 EcHS_A2390     TRUE 0.948 3.000 0.090 1.000 N NA
 3474333 3474334 EcHS_A2390 EcHS_A2391     TRUE 0.559 15.000 0.000 NA   NA
 3474334 3474335 EcHS_A2391 EcHS_A2392     FALSE 0.089 110.000 0.000 NA   NA
 3474335 3474336 EcHS_A2392 EcHS_A2394   yfaZ FALSE 0.095 100.000 0.000 NA   NA
 3474336 3474337 EcHS_A2394 EcHS_A2395 yfaZ   FALSE 0.083 121.000 0.000 NA   NA
 3474340 3474341 EcHS_A2398 EcHS_A2399 arnB arnC TRUE 0.996 4.000 0.378 NA Y NA
 3474341 3474342 EcHS_A2399 EcHS_A2400 arnC arnA TRUE 0.996 0.000 0.220 NA Y NA
 3474342 3474343 EcHS_A2400 EcHS_A2401 arnA   TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 3474343 3474344 EcHS_A2401 EcHS_A2402   arnT TRUE 0.941 0.000 0.031 1.000 N NA
 3474344 3474345 EcHS_A2402 EcHS_A2403 arnT   TRUE 0.989 -3.000 0.158 0.091 N NA
 3474345 3474346 EcHS_A2403 EcHS_A2404     TRUE 0.981 0.000 0.226 NA   NA
 3474347 3474348 EcHS_A2405 EcHS_A2406 pmrD menE FALSE 0.062 110.000 0.005 NA   NA
 3474348 3474349 EcHS_A2406 EcHS_A2407 menE menC TRUE 0.996 -3.000 0.283 0.001 N NA
 3474349 3474350 EcHS_A2407 EcHS_A2408 menC menB TRUE 0.998 0.000 0.171 0.001 Y NA
 3474350 3474351 EcHS_A2408 EcHS_A2409 menB   TRUE 0.906 15.000 0.280 NA   NA
 3474351 3474352 EcHS_A2409 EcHS_A2410   menD TRUE 0.991 -3.000 0.355 NA   NA
 3474352 3474353 EcHS_A2410 EcHS_A2411 menD menF TRUE 0.834 89.000 0.281 1.000 Y NA
 3474353 3474354 EcHS_A2411 EcHS_A2412 menF   FALSE 0.156 79.000 0.043 NA   NA
 3474354 3474355 EcHS_A2412 EcHS_A2413     FALSE 0.303 55.000 0.077 NA   NA
 3474356 3474357 EcHS_A2414 EcHS_A2415 rnz   FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 3474358 3474359 EcHS_A2416 EcHS_A2417     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 3474362 3474363 EcHS_A2420 EcHS_A2421     FALSE 0.093 103.000 0.000 NA   NA
 3474365 3474366 EcHS_A2423 EcHS_A2424     FALSE 0.162 59.000 0.000 NA   NA
 3474367 3474368 EcHS_A2425 EcHS_A2426 nuoN nuoM TRUE 0.998 7.000 0.437 0.002 Y NA
 3474368 3474369 EcHS_A2426 EcHS_A2427 nuoM nuoL TRUE 0.928 164.000 0.713 0.002 Y NA
 3474369 3474370 EcHS_A2427 EcHS_A2428 nuoL nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.006 Y NA
 3474370 3474371 EcHS_A2428 EcHS_A2429 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 3474371 3474372 EcHS_A2429 EcHS_A2430 nuoJ nuoI TRUE 0.996 12.000 0.428 0.006 Y NA
 3474372 3474373 EcHS_A2430 EcHS_A2431 nuoI nuoH TRUE 0.994 15.000 0.423 0.006 Y NA
 3474373 3474374 EcHS_A2431 EcHS_A2432 nuoH nuoG TRUE 1.000 -3.000 0.664 0.006 Y NA
 3474374 3474375 EcHS_A2432 EcHS_A2433 nuoG nuoF TRUE 0.926 53.000 0.180 0.006 Y NA
 3474375 3474376 EcHS_A2433 EcHS_A2434 nuoF nuoE TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.006 Y NA
 3474376 3474377 EcHS_A2434 EcHS_A2435 nuoE nuoC TRUE 0.998 3.000 0.407 0.006 Y NA
 3474377 3474378 EcHS_A2435 EcHS_A2436 nuoC nuoB TRUE 0.968 94.000 0.691 0.003 Y NA
 3474378 3474379 EcHS_A2436 EcHS_A2437 nuoB nuoA TRUE 0.993 16.000 0.377 0.003 Y NA
 3474379 3474380 EcHS_A2437 EcHS_A2438 nuoA lrhA FALSE 0.003 631.000 0.000 1.000 N NA
 3474381 3474382 EcHS_A2439 EcHS_A2440   yfbR FALSE 0.311 84.000 0.104 1.000   NA
 3474383 3474384 EcHS_A2441 EcHS_A2442   yfbT TRUE 0.571 87.000 0.308 1.000   NA
 3474384 3474385 EcHS_A2442 EcHS_A2443 yfbT   TRUE 0.698 11.000 0.000 NA   NA
 3474385 3474386 EcHS_A2443 EcHS_A2444     FALSE 0.119 83.000 0.000 NA   NA
 3474386 3474387 EcHS_A2444 EcHS_A2445     FALSE 0.142 69.000 0.000 NA   NA
 3474388 3474389 EcHS_A2446 EcHS_A2447 ackA pta1 TRUE 0.825 75.000 0.634 1.000   NA
 3474389 3474390 EcHS_A2447 EcHS_A2448 pta1   FALSE 0.058 169.000 0.000 1.000   NA
 3474391 3474392 EcHS_A2449 EcHS_A2450     TRUE 0.674 58.000 0.143 0.011   NA
 3474392 3474393 EcHS_A2450 EcHS_A2451     FALSE 0.337 56.000 0.092 NA   NA
 3474394 3474395 EcHS_A2452 EcHS_A2453   folX FALSE 0.232 57.000 0.012 1.000 N NA
 3474395 3474396 EcHS_A2453 EcHS_A2454 folX   TRUE 0.742 21.000 0.122 1.000   NA
 3474397 3474398 EcHS_A2455 EcHS_A2456   hisP FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 3474398 3474399 EcHS_A2456 EcHS_A2457 hisP hisM TRUE 0.998 8.000 0.643 1.000 Y NA
 3474399 3474400 EcHS_A2457 EcHS_A2458 hisM hisQ TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.014 Y NA
 3474400 3474401 EcHS_A2458 EcHS_A2459 hisQ hisJ TRUE 0.972 90.000 0.833 0.056 Y NA
 3474401 3474402 EcHS_A2459 EcHS_A2460 hisJ argT FALSE 0.300 221.000 0.000 0.011 Y NA
 3474402 3474403 EcHS_A2460 EcHS_A2461 argT   FALSE 0.379 121.000 0.250 NA   NA
 3474403 3474404 EcHS_A2461 EcHS_A2462   ubiX TRUE 0.861 -22.000 0.047 NA   NA
 3474404 3474405 EcHS_A2462 EcHS_A2463 ubiX purF FALSE 0.212 95.000 0.056 1.000 N NA
 3474405 3474406 EcHS_A2463 EcHS_A2464 purF cvpA TRUE 0.745 37.000 0.262 1.000   NA
 3474406 3474407 EcHS_A2464 EcHS_A2465 cvpA   FALSE 0.026 259.000 0.116 NA   NA
 3474407 3474408 EcHS_A2465 EcHS_A2466   folC TRUE 0.970 -10.000 0.216 NA   NA
 3474408 3474409 EcHS_A2466 EcHS_A2467 folC accD TRUE 0.713 70.000 0.383 1.000 N NA
 3474409 3474410 EcHS_A2467 EcHS_A2468 accD   FALSE 0.042 156.000 0.020 NA   NA
 3474410 3474411 EcHS_A2468 EcHS_A2469   truA FALSE 0.138 83.000 0.038 NA   NA
 3474411 3474412 EcHS_A2469 EcHS_A2470 truA   TRUE 0.947 0.000 0.040 1.000 N NA
 3474412 3474413 EcHS_A2470 EcHS_A2471   pdxB TRUE 0.870 66.000 0.097 0.009 Y NA
 3474415 3474416 EcHS_A2473 EcHS_A2474   fabB FALSE 0.015 265.000 0.000 1.000 N NA
 3474418 3474419 EcHS_A2476 EcHS_A2477     TRUE 0.431 21.000 0.000 NA   NA
 3474419 3474420 EcHS_A2477 EcHS_A2478     TRUE 0.842 34.000 0.425 NA   NA
 3474420 3474421 EcHS_A2478 EcHS_A2479     TRUE 0.970 0.000 0.153 NA   NA
 3474421 3474422 EcHS_A2479 EcHS_A2480   mepA TRUE 0.977 0.000 0.160 1.000   NA
 3474422 3474423 EcHS_A2480 EcHS_A2481 mepA aroC TRUE 0.887 4.000 0.025 1.000 N NA
 3474423 3474424 EcHS_A2481 EcHS_A2482 aroC prmB TRUE 0.529 35.000 0.081 1.000 N NA
 3474426 3474427 EcHS_A2484 EcHS_A2485     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3474427 3474428 EcHS_A2485 EcHS_A2486     TRUE 0.999 -3.000 0.286 0.008 Y NA
 3474428 3474429 EcHS_A2486 EcHS_A2487     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.008 Y NA
 3474429 3474430 EcHS_A2487 EcHS_A2488     TRUE 0.982 16.000 0.333 1.000 Y NA
 3474430 3474431 EcHS_A2488 EcHS_A2489     TRUE 0.994 20.000 1.000 1.000 Y NA
 3474431 3474432 EcHS_A2489 EcHS_A2490     TRUE 0.966 82.000 1.000 1.000 Y NA
 3474432 3474433 EcHS_A2490 EcHS_A2491   sixA FALSE 0.003 684.000 0.000 1.000 N NA
 3474433 3474434 EcHS_A2491 EcHS_A2492 sixA fadJ FALSE 0.038 203.000 0.000 1.000 N NA
 3474434 3474435 EcHS_A2492 EcHS_A2493 fadJ fadI TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 3474435 3474436 EcHS_A2493 EcHS_A2494 fadI   FALSE 0.053 180.000 0.061 NA   NA
 3474437 3474438 EcHS_A2495 EcHS_A2496     FALSE 0.004 366.000 0.000 NA   NA
 3474439 3474440 EcHS_A2497 EcHS_A2498     FALSE 0.360 26.000 0.000 NA   NA
 3474441 3474442 EcHS_A2499 EcHS_A4678     FALSE 0.134 75.000 0.000 NA   NA
 3474444 3474445 EcHS_A2502 EcHS_A2503   dsdA TRUE 0.945 18.000 0.083 1.000 Y NA
 3474446 3474447 EcHS_A2504 EcHS_A2505 emrY emrK TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000   NA
 3474448 3474449 EcHS_A2506 EcHS_A2507 evgA evgS TRUE 0.991 5.000 0.000 0.011 Y NA
 3474450 3474451 EcHS_A2508 EcHS_A2509     FALSE 0.195 74.000 0.000 1.000   NA
 3474451 3474452 EcHS_A2509 EcHS_A2510     FALSE 0.202 70.000 0.000 1.000   NA
 3474452 3474453 EcHS_A2510 EcHS_A2511   frc TRUE 0.682 54.000 0.134 0.029 N NA
 3474453 3474454 EcHS_A2511 EcHS_A2512 frc   FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 3474454 3474455 EcHS_A2512 EcHS_A2513     FALSE 0.002 648.000 0.000 NA   NA
 3474456 3474457 EcHS_A2514 EcHS_A2515     FALSE 0.006 311.000 0.000 NA   NA
 3474459 3474460 EcHS_A2517 EcHS_A2518     TRUE 0.997 15.000 0.744 0.013 Y NA
 3474460 3474461 EcHS_A2518 EcHS_A2519     TRUE 0.976 13.000 0.051 0.068 Y NA
 3474462 3474463 EcHS_A2520 EcHS_A2521 fryA   TRUE 0.983 25.000 0.571 1.000 Y NA
 3474463 3474464 EcHS_A2521 EcHS_A2522   ypdF TRUE 0.976 0.000 0.009 0.021 N NA
 3474464 3474465 EcHS_A2522 EcHS_A2523 ypdF fryC TRUE 0.647 15.000 0.011 1.000 N NA
 3474465 3474466 EcHS_A2523 EcHS_A2524 fryC   TRUE 0.996 22.000 0.875 0.010 Y NA
 3474466 3474467 EcHS_A2524 EcHS_A2525   glk FALSE 0.239 219.000 0.091 1.000 Y NA
 3474473 3474474 EcHS_A2531 EcHS_A2532     FALSE 0.171 84.000 0.000 1.000   NA
 3474474 3474475 EcHS_A2532 EcHS_A4679     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 3474475 3474476 EcHS_A4679 EcHS_A4680     FALSE 0.245 39.000 0.000 NA   NA
 3474477 3474478 EcHS_A2535 EcHS_A2536     TRUE 0.974 2.000 0.000 0.005   NA
 3474480 3474481 EcHS_A4681 EcHS_A4682     FALSE 0.222 44.000 0.000 NA   NA
 3474481 3474482 EcHS_A4682 EcHS_A4683     FALSE 0.218 45.000 0.000 NA   NA
 3474482 3474483 EcHS_A4683 EcHS_A4684     TRUE 0.825 4.000 0.000 NA   NA
 3474483 3474484 EcHS_A4684 EcHS_A2542     FALSE 0.003 432.000 0.000 NA   NA
 3474487 3474488 EcHS_A2545 EcHS_A2546   ligA TRUE 0.842 2.000 0.017 NA   NA
 3474488 3474489 EcHS_A2546 EcHS_A2547 ligA zipA FALSE 0.178 71.000 0.002 1.000 N NA
 3474490 3474491 EcHS_A2548 EcHS_A2549 cysZ cysK FALSE 0.389 185.000 0.122 1.000 Y NA
 3474491 3474492 EcHS_A2549 EcHS_A2550 cysK ptsH FALSE 0.005 384.000 0.019 1.000 N NA
 3474492 3474493 EcHS_A2550 EcHS_A2551 ptsH ptsI TRUE 0.880 45.000 0.000 0.012 Y NA
 3474493 3474494 EcHS_A2551 EcHS_A2552 ptsI crr TRUE 0.890 41.000 0.000 0.012 Y NA
 3474496 3474497 EcHS_A2554 EcHS_A2555     FALSE 0.288 33.000 0.000 NA   NA
 3474499 3474500 EcHS_A2557 EcHS_A2558 cysM cysA FALSE 0.141 134.000 0.049 1.000 N NA
 3474500 3474501 EcHS_A2558 EcHS_A2559 cysA cysW TRUE 0.994 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 3474501 3474502 EcHS_A2559 EcHS_A2560 cysW cysT TRUE 0.998 0.000 0.583 0.001 N NA
 3474502 3474503 EcHS_A2560 EcHS_A2561 cysT cysP TRUE 0.998 0.000 0.479 0.002 N NA
 3474503 3474504 EcHS_A2561 EcHS_A2562 cysP ucpA FALSE 0.093 158.000 0.043 1.000 N NA
 3474504 3474505 EcHS_A2562 EcHS_A2563 ucpA   FALSE 0.124 129.000 0.000 1.000 N NA
 3474506 3474507 EcHS_A2564 EcHS_A2565 murQ murP TRUE 0.957 4.000 0.158 1.000   NA
 3474507 3474508 EcHS_A2565 EcHS_A2566 murP   TRUE 0.957 5.000 0.167 1.000 N NA
 3474508 3474509 EcHS_A2566 EcHS_A2567     FALSE 0.013 278.000 0.000 1.000 N NA
 3474510 3474511 EcHS_A2568 EcHS_A2569     TRUE 0.523 96.000 0.333 NA   NA
 3474511 3474512 EcHS_A2569 EcHS_A2570     TRUE 0.487 61.000 0.204 NA   NA
 3474512 3474513 EcHS_A2570 EcHS_A2571     TRUE 0.896 -13.000 0.059 NA   NA
 3474514 3474515 EcHS_A2572 EcHS_A2573 amiA hemF TRUE 0.887 4.000 0.025 1.000 N NA
 3474516 3474517 EcHS_A2574 EcHS_A2575     TRUE 0.658 46.000 0.250 NA N NA
 3474517 3474518 EcHS_A2575 EcHS_A2576     TRUE 0.825 13.000 0.106 NA N NA
 3474518 3474519 EcHS_A2576 EcHS_A2577   eutC TRUE 0.974 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3474519 3474520 EcHS_A2577 EcHS_A2578 eutC eutB TRUE 0.962 21.000 0.000 0.001 Y NA
 3474520 3474521 EcHS_A2578 EcHS_A2579 eutB eutA TRUE 0.955 12.000 0.000 NA Y NA
 3474521 3474522 EcHS_A2579 EcHS_A2580 eutA eutH TRUE 0.998 -3.000 0.400 NA Y NA
 3474522 3474523 EcHS_A2580 EcHS_A2581 eutH   TRUE 0.531 16.000 0.000 NA   NA
 3474523 3474524 EcHS_A2581 EcHS_A2582   eutG TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 3474524 3474525 EcHS_A2582 EcHS_A2583 eutG eutJ TRUE 0.993 -10.000 0.556 1.000 N NA
 3474525 3474526 EcHS_A2583 EcHS_A2584 eutJ eutE TRUE 0.971 11.000 0.375 1.000 N NA
 3474526 3474527 EcHS_A2584 EcHS_A2585 eutE eutN TRUE 0.995 12.000 0.667 NA Y NA
 3474527 3474528 EcHS_A2585 EcHS_A2586 eutN eutM TRUE 0.701 107.000 0.182 NA Y NA
 3474528 3474529 EcHS_A2586 EcHS_A2587 eutM pta2 TRUE 0.952 39.000 0.455 NA Y NA
 3474529 3474530 EcHS_A2587 EcHS_A2588 pta2 eutT TRUE 0.970 -3.000 0.095 1.000 N NA
 3474530 3474531 EcHS_A2588 EcHS_A2589 eutT   TRUE 0.996 -3.000 0.214 NA Y NA
 3474531 3474532 EcHS_A2589 EcHS_A2590   eutP TRUE 0.990 -25.000 0.167 NA Y NA
 3474532 3474533 EcHS_A2590 EcHS_A2591 eutP   TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3474533 3474534 EcHS_A2591 EcHS_A2592   maeB FALSE 0.042 221.000 0.070 1.000 N NA
 3474535 3474536 EcHS_A2593 EcHS_A2594 tal1 tktB TRUE 0.991 20.000 0.739 1.000 Y NA
 3474537 3474538 EcHS_A2595 EcHS_A2596     TRUE 0.461 126.000 0.333 NA   NA
 3474538 3474539 EcHS_A2596 EcHS_A2597   aegA1 TRUE 0.472 68.000 0.167 1.000 N NA
 3474540 3474541 EcHS_A2598 EcHS_A2599 narQ acrD FALSE 0.272 164.000 0.133 0.080 N NA
 3474543 3474544 EcHS_A2601 EcHS_A2602   dapE TRUE 0.980 4.000 0.292 1.000 N NA
 3474544 3474545 EcHS_A2602 EcHS_A2603 dapE   FALSE 0.323 28.000 0.025 NA   NA
 3474546 3474547 EcHS_A2604 EcHS_A2605     FALSE 0.135 74.000 0.000 NA   NA
 3474547 3474548 EcHS_A2605 EcHS_A2606     TRUE 0.666 15.000 0.029 1.000   NA
 3474548 3474549 EcHS_A2606 EcHS_A2607   purC FALSE 0.046 168.000 0.006 1.000   NA
 3474549 3474550 EcHS_A2607 EcHS_A2608 purC   TRUE 0.799 6.000 0.000 NA   NA
 3474550 3474551 EcHS_A2608 EcHS_A2609     FALSE 0.095 100.000 0.000 NA   NA
 3474551 3474552 EcHS_A2609 EcHS_A2610   dapA TRUE 0.976 17.000 0.267 1.000 Y NA
 3474553 3474554 EcHS_A2611 EcHS_A2612 gcvR bcp TRUE 0.970 0.000 0.102 1.000 N NA
 3474554 3474555 EcHS_A2612 EcHS_A2613 bcp hyfA FALSE 0.018 253.000 0.000 1.000 N NA
 3474555 3474556 EcHS_A2613 EcHS_A2615 hyfA hyfB TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3474556 3474557 EcHS_A2615 EcHS_A2616 hyfB hyfC TRUE 0.698 11.000 0.000 NA   NA
 3474557 3474558 EcHS_A2616 EcHS_A2618 hyfC   TRUE 0.509 17.000 0.000 NA   NA
 3474558 3474559 EcHS_A2618 EcHS_A2619   hyfE FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 3474559 3474560 EcHS_A2619 EcHS_A2620 hyfE   TRUE 0.999 5.000 0.864 0.006 Y NA
 3474560 3474561 EcHS_A2620 EcHS_A2621     TRUE 0.994 -10.000 0.016 0.006 Y NA
 3474561 3474562 EcHS_A2621 EcHS_A2622     TRUE 0.977 10.000 0.044 1.000 Y NA
 3474562 3474563 EcHS_A2622 EcHS_A2623     TRUE 0.997 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 3474563 3474564 EcHS_A2623 EcHS_A2624     TRUE 0.979 -7.000 0.250 NA   NA
 3474564 3474565 EcHS_A2624 EcHS_A2625     FALSE 0.099 96.000 0.000 NA   NA
 3474565 3474566 EcHS_A2625 EcHS_A2626   fnt TRUE 0.553 22.000 0.000 1.000 N NA
 3474568 3474569 EcHS_A2628 EcHS_A2629   arsC1 TRUE 0.864 21.000 0.259 1.000   NA
 3474570 3474571 EcHS_A2630 EcHS_A2631   hda TRUE 0.618 13.000 0.000 NA   NA
 3474571 3474572 EcHS_A2631 EcHS_A2632 hda uraA FALSE 0.352 50.000 0.048 1.000 N NA
 3474572 3474573 EcHS_A2632 EcHS_A2633 uraA upp TRUE 0.716 86.000 0.101 1.000 Y NA
 3474574 3474575 EcHS_A2634 EcHS_A2635 purM purN TRUE 0.999 0.000 0.230 0.001 Y NA
 3474575 3474576 EcHS_A2635 EcHS_A2636 purN ppk FALSE 0.056 170.000 0.017 1.000 N NA
 3474576 3474577 EcHS_A2636 EcHS_A2637 ppk ppx TRUE 0.997 5.000 0.486 1.000 Y NA
 3474578 3474579 EcHS_A2639 EcHS_A2640     FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 3474580 3474581 EcHS_A2641 EcHS_A2642     FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 3474581 3474582 EcHS_A2642 EcHS_A2643     TRUE 0.894 16.000 0.273 NA   NA
 3474583 3474584 EcHS_A2644 EcHS_A2645     FALSE 0.044 163.000 0.000 NA   NA
 3474584 3474585 EcHS_A2645 EcHS_A2646   trbL FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 3474585 3474586 EcHS_A2646 EcHS_A2647 trbL trbJ TRUE 0.476 188.000 0.250 NA Y NA
 3474586 3474587 EcHS_A2647 EcHS_A2648 trbJ   FALSE 0.120 82.000 0.000 NA   NA
 3474588 3474589 EcHS_A2649 EcHS_A2650     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 3474590 3474591 EcHS_A2651 EcHS_A2652     FALSE 0.140 70.000 0.000 NA   NA
 3474592 3474593 EcHS_A2653 EcHS_A2654     FALSE 0.104 93.000 0.000 NA   NA
 3474593 3474594 EcHS_A2654 EcHS_A2655     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 3474595 3474596 EcHS_A2656 EcHS_A2657     FALSE 0.153 63.000 0.000 NA   NA
 3474596 3474597 EcHS_A2657 EcHS_A2658   guaA FALSE 0.123 80.000 0.000 NA   NA
 3474597 3474598 EcHS_A2658 EcHS_A2659 guaA guaB TRUE 0.922 69.000 0.190 0.000 Y NA
 3474600 3474601 EcHS_A2661 EcHS_A2662   engA FALSE 0.106 69.000 0.009 NA   NA
 3474601 3474602 EcHS_A2662 EcHS_A2663 engA   FALSE 0.364 118.000 0.203 1.000   NA
 3474602 3474603 EcHS_A2663 EcHS_A2664     TRUE 0.978 11.000 0.492 1.000   NA
 3474603 3474604 EcHS_A2664 EcHS_A2665   hisS TRUE 0.889 18.000 0.259 1.000   NA
 3474604 3474605 EcHS_A2665 EcHS_A4757 hisS   TRUE 0.448 20.000 0.000 NA   NA
 3474605 3474606 EcHS_A4757 EcHS_A2666   ispG TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3474606 3474607 EcHS_A2666 EcHS_A2667 ispG   TRUE 0.800 27.000 0.233 1.000   NA
 3474607 3474608 EcHS_A2667 EcHS_A2668     FALSE 0.010 285.000 0.020 1.000   NA
 3474608 3474609 EcHS_A2668 EcHS_A2669   ndk FALSE 0.210 150.000 0.156 1.000   NA
 3474609 3474610 EcHS_A2669 EcHS_A2670 ndk pbpC FALSE 0.075 149.000 0.008 1.000 N NA
 3474610 3474611 EcHS_A2670 EcHS_A2671 pbpC   TRUE 0.996 1.000 0.711 1.000   NA
 3474612 3474613 EcHS_A2672 EcHS_A4758 sseA   FALSE 0.034 176.000 0.000 NA   NA
 3474613 3474614 EcHS_A4758 EcHS_A4759     FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 3474615 3474616 EcHS_A2673 EcHS_A2674 sseB pepB FALSE 0.310 142.000 0.253 NA   NA
 3474616 3474617 EcHS_A2674 EcHS_A2675 pepB iscX TRUE 0.506 58.000 0.171 1.000   NA
 3474617 3474618 EcHS_A2675 EcHS_A2676 iscX fdx TRUE 0.982 12.000 0.625 1.000   NA
 3474618 3474619 EcHS_A2676 EcHS_A2677 fdx hscA TRUE 0.996 2.000 0.794 1.000 N NA
 3474619 3474620 EcHS_A2677 EcHS_A2678 hscA hscB TRUE 0.992 17.000 0.634 1.000 Y NA
 3474620 3474621 EcHS_A2678 EcHS_A2679 hscB iscA TRUE 0.688 96.000 0.500 1.000   NA
 3474621 3474622 EcHS_A2679 EcHS_A2680 iscA iscU TRUE 0.986 11.000 0.359 0.002   NA
 3474622 3474623 EcHS_A2680 EcHS_A2681 iscU iscS TRUE 0.903 28.000 0.448 1.000 N NA
 3474623 3474624 EcHS_A2681 EcHS_A2682 iscS iscR FALSE 0.170 241.000 0.424 1.000 N NA
 3474624 3474625 EcHS_A2682 EcHS_A2683 iscR   FALSE 0.062 141.000 0.000 NA   NA
 3474625 3474626 EcHS_A2683 EcHS_A2684     TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3474627 3474628 EcHS_A2685 EcHS_A2686 suhB   FALSE 0.069 145.000 0.003 1.000   NA
 3474628 3474629 EcHS_A2686 EcHS_A2687   csiE FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 3474630 3474631 EcHS_A2688 EcHS_A2689 hcaT hcaR FALSE 0.069 160.000 0.000 1.000   NA
 3474632 3474633 EcHS_A2690 EcHS_A2691 hcaE hcaF TRUE 0.997 -3.000 0.333 0.001 N NA
 3474633 3474634 EcHS_A2691 EcHS_A2692 hcaF hcaC TRUE 0.990 0.000 0.083 0.001 N NA
 3474634 3474635 EcHS_A2692 EcHS_A2693 hcaC hcaB TRUE 0.986 -3.000 0.083 0.041 N NA
 3474635 3474636 EcHS_A2693 EcHS_A2694 hcaB hcaD TRUE 0.931 10.000 0.000 0.041   NA
 3474636 3474637 EcHS_A2694 EcHS_A2695 hcaD   FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 3474638 3474639 EcHS_A2696 EcHS_A2697     TRUE 0.769 12.000 0.000 1.000 N NA
 3474639 3474640 EcHS_A2697 EcHS_A2698     TRUE 0.414 33.000 0.000 1.000 N NA
 3474640 3474641 EcHS_A2698 EcHS_A2699     TRUE 0.933 25.000 0.148 1.000 Y NA
 3474641 3474642 EcHS_A2699 EcHS_A2700     TRUE 0.934 23.000 0.161 NA Y NA
 3474642 3474643 EcHS_A2700 EcHS_A2701     FALSE 0.295 36.000 0.000 NA N NA
 3474643 3474644 EcHS_A2701 EcHS_A4685     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 3474644 3474645 EcHS_A4685 EcHS_A2702     FALSE 0.049 180.000 0.000 1.000   NA
 3474649 3474650 EcHS_A2706 EcHS_A2707 glnB   TRUE 0.470 61.000 0.146 1.000 N NA
 3474650 3474651 EcHS_A2707 EcHS_A2708     TRUE 0.858 -10.000 0.029 NA   NA
 3474651 3474652 EcHS_A2708 EcHS_A2709     FALSE 0.047 159.000 0.029 NA   NA
 3474656 3474657 EcHS_A2712 EcHS_A2713 tadA yhfB TRUE 0.527 25.000 0.062 NA N NA
 3474658 3474659 EcHS_A2714 EcHS_A2715     FALSE 0.316 56.000 0.056 1.000   NA
 3474660 3474661 EcHS_A2716 EcHS_A2717     FALSE 0.199 50.000 0.000 NA   NA
 3474661 3474662 EcHS_A2717 EcHS_A2718   acpS FALSE 0.125 79.000 0.000 NA   NA
 3474662 3474663 EcHS_A2718 EcHS_A2719 acpS pdxJ TRUE 0.991 0.000 0.326 1.000 N NA
 3474663 3474664 EcHS_A2719 EcHS_A2720 pdxJ recO TRUE 0.909 12.000 0.166 1.000 N NA
 3474664 3474665 EcHS_A2720 EcHS_A2721 recO era TRUE 0.870 12.000 0.109 1.000   NA
 3474665 3474666 EcHS_A2721 EcHS_A2722 era rnc TRUE 0.988 -3.000 0.127 0.041   NA
 3474666 3474667 EcHS_A2722 EcHS_A2723 rnc lepB FALSE 0.028 272.000 0.117 1.000   NA
 3474667 3474668 EcHS_A2723 EcHS_A2724 lepB lepA TRUE 0.866 16.000 0.187 1.000   NA
 3474668 3474669 EcHS_A2724 EcHS_A2725 lepA rseC FALSE 0.036 198.000 0.045 NA N NA
 3474669 3474670 EcHS_A2725 EcHS_A2726 rseC rseB TRUE 0.999 -3.000 0.609 NA Y NA
 3474670 3474671 EcHS_A2726 EcHS_A2727 rseB rseA TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 3474671 3474672 EcHS_A2727 EcHS_A2728 rseA rpoE TRUE 0.930 33.000 0.705 NA N NA
 3474672 3474673 EcHS_A2728 EcHS_A2729 rpoE   FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 3474676 3474677 EcHS_A2732 EcHS_A2733 srmB   FALSE 0.096 271.000 0.000 1.000 Y NA
 3474683 3474684 EcHS_A2739 EcHS_A2740     FALSE 0.267 69.000 0.084 NA   NA
 3474684 3474685 EcHS_A2740 EcHS_A2741     TRUE 0.711 32.000 0.222 NA   NA
 3474685 3474686 EcHS_A2741 EcHS_A2742   pssA TRUE 0.454 114.000 0.121 0.048 N NA
 3474686 3474687 EcHS_A2742 EcHS_A2743 pssA   FALSE 0.384 46.000 0.089 NA   NA
 3474688 3474689 EcHS_A2744 EcHS_A4761 kgtP rrf FALSE 0.005 323.000 0.000 NA   NA
 3474689 3474690 EcHS_A4761 EcHS_A4762 rrf rrl FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 3474690 3474691 EcHS_A4762 EcHS_A4686 rrl   FALSE 0.030 184.000 0.000 NA   NA
 3474691 3474692 EcHS_A4686 EcHS_A4763   rrs FALSE 0.037 171.000 0.000 NA   NA
 3474694 3474695 EcHS_A2750 EcHS_A2751 clpB   FALSE 0.177 130.000 0.108 NA   NA
 3474695 3474696 EcHS_A2751 EcHS_A2752   rluD TRUE 0.975 -3.000 0.168 NA   NA
 3474697 3474698 EcHS_A2753 EcHS_A2754     FALSE 0.005 271.000 0.004 NA   NA
 3474698 3474699 EcHS_A2754 EcHS_A2756   pheA FALSE 0.010 249.000 0.015 NA N NA
 3474700 3474701 EcHS_A2757 EcHS_A2758 tyrA aroF TRUE 0.968 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3474702 3474703 EcHS_A2759 EcHS_A2760     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3474703 3474704 EcHS_A2760 EcHS_A2761     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 3474704 3474705 EcHS_A2761 EcHS_A2762     FALSE 0.020 210.000 0.000 NA   NA
 3474705 3474706 EcHS_A2762 EcHS_A2763     TRUE 0.991 -7.000 0.475 NA   NA
 3474706 3474707 EcHS_A2763 EcHS_A2764     TRUE 0.957 16.000 0.475 1.000 N NA
 3474708 3474709 EcHS_A2765 EcHS_A2766 rplS trmD TRUE 0.966 42.000 0.567 1.000 Y NA
 3474709 3474710 EcHS_A2766 EcHS_A2767 trmD rimM TRUE 0.983 31.000 0.672 1.000 Y NA
 3474710 3474711 EcHS_A2767 EcHS_A2768 rimM rpsP TRUE 0.988 19.000 0.342 0.012 Y NA
 3474711 3474712 EcHS_A2768 EcHS_A2769 rpsP ffh TRUE 0.502 137.000 0.361 1.000 N NA
 3474713 3474714 EcHS_A2770 EcHS_A2771     TRUE 0.752 45.000 0.349 NA   NA
 3474716 3474717 EcHS_A2773 EcHS_A2774 ppnK recN TRUE 0.415 86.000 0.170 1.000 N NA
 3474717 3474718 EcHS_A2774 EcHS_A2775 recN   FALSE 0.115 149.000 0.049 1.000 N NA
 3474719 3474720 EcHS_A2776 EcHS_A2777     TRUE 0.946 -10.000 0.124 NA   NA
 3474721 3474722 EcHS_A2778 EcHS_A4764 smpB ssrA FALSE 0.018 214.000 0.000 NA   NA
 3474722 3474723 EcHS_A4764 EcHS_A2780 ssrA   FALSE 0.002 647.000 0.000 NA   NA
 3474725 3474726 EcHS_A2781 EcHS_A2783     FALSE 0.013 238.000 0.000 NA   NA
 3474727 3474728 EcHS_A2784 EcHS_A2785     FALSE 0.058 146.000 0.000 NA   NA
 3474728 3474729 EcHS_A2785 EcHS_A2786     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.020 Y NA
 3474729 3474730 EcHS_A2786 EcHS_A2787     FALSE 0.014 230.000 0.000 NA   NA
 3474730 3474731 EcHS_A2787 EcHS_A2788     FALSE 0.155 62.000 0.000 NA   NA
 3474731 3474732 EcHS_A2788 EcHS_A2789     TRUE 0.826 57.000 0.000 0.062 Y NA
 3474734 3474735 EcHS_A2791 EcHS_A4687     FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 3474736 3474737 EcHS_A2793 EcHS_A2794     FALSE 0.005 336.000 0.000 NA   NA
 3474737 3474738 EcHS_A2794 EcHS_A2795     TRUE 0.466 19.000 0.000 NA   NA
 3474738 3474739 EcHS_A2795 EcHS_A2796   gabD TRUE 0.507 23.000 0.000 1.000   NA
 3474739 3474740 EcHS_A2796 EcHS_A2797 gabD gabT2 TRUE 0.939 14.000 0.303 1.000 N NA
 3474740 3474741 EcHS_A2797 EcHS_A2798 gabT2 gabP FALSE 0.212 238.000 0.121 1.000 Y NA
 3474741 3474742 EcHS_A2798 EcHS_A2799 gabP csiR TRUE 0.959 21.000 0.625 1.000 N NA
 3474743 3474744 EcHS_A2800 EcHS_A2801     FALSE 0.169 84.000 0.027 1.000   NA
 3474745 3474746 EcHS_A2802 EcHS_A2803     TRUE 0.873 10.000 0.083 NA N NA
 3474748 3474749 EcHS_A2805 EcHS_A2806     FALSE 0.079 126.000 0.000 NA   NA
 3474751 3474752 EcHS_A2808 EcHS_A2809   nrdH FALSE 0.011 248.000 0.000 NA   NA
 3474752 3474753 EcHS_A2809 EcHS_A2810 nrdH nrdI TRUE 0.914 -3.000 0.026 NA N NA
 3474753 3474754 EcHS_A2810 EcHS_A2811 nrdI nrdE TRUE 0.980 -27.000 0.000 NA Y NA
 3474754 3474755 EcHS_A2811 EcHS_A2812 nrdE nrdF TRUE 0.990 10.000 0.000 0.001 Y NA
 3474755 3474756 EcHS_A2812 EcHS_A2813 nrdF proV FALSE 0.007 354.000 0.000 1.000 N NA
 3474756 3474757 EcHS_A2813 EcHS_A2814 proV proW TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.088 Y NA
 3474757 3474758 EcHS_A2814 EcHS_A2815 proW proX TRUE 0.978 58.000 0.695 0.055 Y NA
 3474760 3474761 EcHS_A2817 EcHS_A2818     FALSE 0.139 124.000 0.060 NA N NA
 3474761 3474762 EcHS_A2818 EcHS_A2819     TRUE 0.996 -10.000 0.915 NA   NA
 3474762 3474763 EcHS_A2819 EcHS_A2820   mprA FALSE 0.174 91.000 0.065 NA   NA
 3474763 3474764 EcHS_A2820 EcHS_A2821 mprA emrA FALSE 0.239 127.000 0.107 1.000 N NA
 3474764 3474765 EcHS_A2821 EcHS_A2822 emrA emrB TRUE 0.982 17.000 0.875 1.000 N NA
 3474768 3474769 EcHS_A2824 EcHS_A2825 gshA   FALSE 0.229 73.000 0.071 NA   NA
 3474769 3474770 EcHS_A2825 EcHS_A2826     TRUE 0.943 -3.000 0.067 NA   NA
 3474770 3474771 EcHS_A2826 EcHS_A4688     FALSE 0.057 147.000 0.000 NA   NA
 3474771 3474772 EcHS_A4688 EcHS_A4689     FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 3474772 3474773 EcHS_A4689 EcHS_A4690     FALSE 0.157 61.000 0.000 NA   NA
 3474773 3474774 EcHS_A4690 EcHS_A4691     FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 3474774 3474775 EcHS_A4691 EcHS_A4692     TRUE 0.867 2.000 0.000 NA   NA
 3474775 3474776 EcHS_A4692 EcHS_A2832   csrA FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 3474776 3474777 EcHS_A2832 EcHS_A2833 csrA alaS FALSE 0.021 235.000 0.020 1.000 N NA
 3474777 3474778 EcHS_A2833 EcHS_A2834 alaS recX FALSE 0.194 128.000 0.085 1.000   NA
 3474778 3474779 EcHS_A2834 EcHS_A2835 recX recA TRUE 0.620 69.000 0.296 1.000   NA
 3474779 3474780 EcHS_A2835 EcHS_A2836 recA   FALSE 0.230 80.000 0.082 NA   NA
 3474780 3474781 EcHS_A2836 EcHS_A2837   mltB FALSE 0.057 145.000 0.026 NA   NA
 3474782 3474783 EcHS_A2838 EcHS_A2839 srlA srlE TRUE 0.999 -3.000 0.349 0.010 Y NA
 3474783 3474784 EcHS_A2839 EcHS_A2840 srlE srlB TRUE 0.984 11.000 0.000 0.010 Y NA
 3474784 3474785 EcHS_A2840 EcHS_A2841 srlB srlD TRUE 0.905 4.000 0.040 1.000 N NA
 3474785 3474786 EcHS_A2841 EcHS_A2842 srlD gutM FALSE 0.344 106.000 0.197 NA N NA
 3474786 3474787 EcHS_A2842 EcHS_A2843 gutM srlR TRUE 0.803 67.000 0.183 NA Y NA
 3474787 3474788 EcHS_A2843 EcHS_A2844 srlR gutQ TRUE 0.994 -7.000 0.562 1.000 N NA
 3474790 3474791 EcHS_A2846 EcHS_A2847 norV norW TRUE 0.984 -3.000 0.083 0.051   NA
 3474792 3474793 EcHS_A2848 EcHS_A2849 hypF   FALSE 0.075 153.000 0.018 1.000 N NA
 3474793 3474794 EcHS_A2849 EcHS_A2850   ascG FALSE 0.397 149.000 0.316 1.000 N NA
 3474795 3474796 EcHS_A2851 EcHS_A2852 ascF ascB TRUE 0.996 9.000 0.485 1.000 Y NA
 3474797 3474798 EcHS_A2853 EcHS_A2854 hycI   TRUE 0.987 -7.000 0.360 NA   NA
 3474798 3474799 EcHS_A2854 EcHS_A2855   hycG TRUE 0.972 -3.000 0.156 NA   NA
 3474799 3474800 EcHS_A2855 EcHS_A2856 hycG hycF TRUE 0.994 0.000 0.111 1.000 Y NA
 3474800 3474801 EcHS_A2856 EcHS_A2857 hycF hycE TRUE 0.988 10.000 0.200 1.000 Y NA
 3474801 3474802 EcHS_A2857 EcHS_A2858 hycE hycD TRUE 0.971 18.000 0.235 1.000 Y NA
 3474802 3474803 EcHS_A2858 EcHS_A2859 hycD hycC TRUE 0.997 3.000 0.382 1.000 Y NA
 3474803 3474804 EcHS_A2859 EcHS_A2860 hycC hycB TRUE 0.996 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 3474804 3474805 EcHS_A2860 EcHS_A2861 hycB hycA FALSE 0.080 125.000 0.000 NA   NA
 3474805 3474806 EcHS_A2861 EcHS_A2862 hycA   FALSE 0.113 88.000 0.000 NA   NA
 3474807 3474808 EcHS_A2863 EcHS_A2864 hypA2 hypB TRUE 0.992 4.000 0.306 0.002   NA
 3474808 3474809 EcHS_A2864 EcHS_A2865 hypB hypC2 TRUE 0.992 -9.000 0.139 NA Y NA
 3474809 3474810 EcHS_A2865 EcHS_A2866 hypC2 hypD TRUE 0.990 0.000 0.021 NA Y NA
 3474810 3474811 EcHS_A2866 EcHS_A2867 hypD hypE TRUE 0.998 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 3474811 3474812 EcHS_A2867 EcHS_A2868 hypE fhlA FALSE 0.195 74.000 0.019 1.000 N NA
 3474813 3474814 EcHS_A2869 EcHS_A2870     FALSE 0.129 77.000 0.000 NA   NA
 3474815 3474816 EcHS_A2871 EcHS_A2872 mutS pphB FALSE 0.134 106.000 0.000 1.000   NA
 3474818 3474819 EcHS_A2874 EcHS_A2875     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474819 3474820 EcHS_A2875 EcHS_A2876     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474820 3474821 EcHS_A2876 EcHS_A2877     TRUE 0.994 5.000 0.265 1.000 Y NA
 3474821 3474822 EcHS_A2877 EcHS_A2878     TRUE 0.741 89.000 0.143 1.000 Y NA
 3474823 3474824 EcHS_A2879 EcHS_A2880 rpoS nlpD TRUE 0.452 63.000 0.142 1.000 N NA
 3474824 3474825 EcHS_A2880 EcHS_A2881 nlpD pcm FALSE 0.108 140.000 0.030 1.000 N NA
 3474825 3474826 EcHS_A2881 EcHS_A2882 pcm surE TRUE 0.990 -6.000 0.353 1.000   NA
 3474826 3474827 EcHS_A2882 EcHS_A2883 surE truD TRUE 0.972 -19.000 0.235 1.000   NA
 3474827 3474828 EcHS_A2883 EcHS_A2884 truD ispF TRUE 0.980 -3.000 0.173 1.000   NA
 3474828 3474829 EcHS_A2884 EcHS_A2885 ispF ispD TRUE 0.998 0.000 0.419 1.000 Y NA
 3474829 3474830 EcHS_A2885 EcHS_A2886 ispD ftsB TRUE 0.840 19.000 0.185 1.000 N NA
 3474830 3474831 EcHS_A2886 EcHS_A2887 ftsB   FALSE 0.025 194.000 0.028 NA   NA
 3474831 3474832 EcHS_A2887 EcHS_A2888   cysC TRUE 0.548 50.000 0.198 NA   NA
 3474832 3474833 EcHS_A2888 EcHS_A2889 cysC cysN TRUE 0.998 0.000 0.340 1.000 Y NA
 3474833 3474834 EcHS_A2889 EcHS_A2890 cysN cysD TRUE 0.998 2.000 0.574 0.000 N NA
 11515726 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4363.000 0.000 NA   NA
 11658089 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4363.000 0.000 NA   NA
 11800481 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4363.000 0.000 NA   NA
 11515727 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4392.000 0.000 NA   NA
 11658090 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4392.000 0.000 NA   NA
 11800482 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4392.000 0.000 NA   NA
 11515728 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4424.000 0.000 NA   NA
 11658091 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4424.000 0.000 NA   NA
 11800483 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4424.000 0.000 NA   NA
 11515729 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4453.000 0.000 NA   NA
 11658092 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4453.000 0.000 NA   NA
 11800484 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4453.000 0.000 NA   NA
 11515730 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4485.000 0.000 NA   NA
 11658093 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4485.000 0.000 NA   NA
 11800485 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4485.000 0.000 NA   NA
 11515731 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4514.000 0.000 NA   NA
 11658094 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4514.000 0.000 NA   NA
 11800486 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4514.000 0.000 NA   NA
 11515732 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4546.000 0.000 NA   NA
 11658095 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4546.000 0.000 NA   NA
 11800487 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4546.000 0.000 NA   NA
 11515733 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4575.000 0.000 NA   NA
 11658096 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4575.000 0.000 NA   NA
 11800488 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4575.000 0.000 NA   NA
 11515734 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4607.000 0.000 NA   NA
 11658097 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4607.000 0.000 NA   NA
 11800489 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4607.000 0.000 NA   NA
 11515735 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4636.000 0.000 NA   NA
 11658098 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4636.000 0.000 NA   NA
 11800490 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4636.000 0.000 NA   NA
 11515736 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4668.000 0.000 NA   NA
 11658099 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4668.000 0.000 NA   NA
 11800491 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4668.000 0.000 NA   NA
 11515737 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4697.000 0.000 NA   NA
 11658100 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4697.000 0.000 NA   NA
 11800492 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4697.000 0.000 NA   NA
 11515738 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4729.000 0.000 NA   NA
 11658101 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4729.000 0.000 NA   NA
 11800493 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4729.000 0.000 NA   NA
 11515739 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4758.000 0.000 NA   NA
 11658102 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4758.000 0.000 NA   NA
 11800494 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4758.000 0.000 NA   NA
 11515740 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4790.000 0.000 NA   NA
 11658103 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4790.000 0.000 NA   NA
 11800495 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4790.000 0.000 NA   NA
 11515741 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4819.000 0.000 NA   NA
 11658104 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4819.000 0.000 NA   NA
 11800496 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4819.000 0.000 NA   NA
 11515742 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4851.000 0.000 NA   NA
 11658105 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4851.000 0.000 NA   NA
 11800497 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4851.000 0.000 NA   NA
 11515743 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4880.000 0.000 NA   NA
 11658106 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4880.000 0.000 NA   NA
 11800498 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4880.000 0.000 NA   NA
 11515744 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4912.000 0.000 NA   NA
 11658107 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4912.000 0.000 NA   NA
 11800499 3474831   EcHS_A2887     FALSE NA 4912.000 0.000 NA   NA
 3474838 3474839 EcHS_A2894 EcHS_A2895 cas1 cse3 TRUE 0.963 16.000 0.589 NA   NA
 3474839 3474840 EcHS_A2895 EcHS_A2896 cse3   TRUE 0.976 -13.000 0.282 NA   NA
 3474840 3474841 EcHS_A2896 EcHS_A2897   cse4 TRUE 0.975 -3.000 0.171 NA   NA
 3474841 3474842 EcHS_A2897 EcHS_A2898 cse4 cse2 TRUE 0.842 13.000 0.138 NA   NA
 3474842 3474843 EcHS_A2898 EcHS_A2899 cse2 cse1 TRUE 0.986 -7.000 0.336 NA   NA
 3474843 3474844 EcHS_A2899 EcHS_A2900 cse1   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474844 3474845 EcHS_A2900 EcHS_A2901   cas3 FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 3474845 3474846 EcHS_A2901 EcHS_A2902 cas3 cysH FALSE 0.005 359.000 0.003 1.000   NA
 3474846 3474847 EcHS_A2902 EcHS_A2903 cysH cysI FALSE 0.380 74.000 0.116 1.000 N NA
 3474847 3474848 EcHS_A2903 EcHS_A2904 cysI cysJ TRUE 1.000 0.000 0.791 0.000 Y NA
 3474849 3474850 EcHS_A2905 EcHS_A2906 queD   FALSE 0.177 78.000 0.014 1.000 N NA
 3474850 3474851 EcHS_A2906 EcHS_A2907     TRUE 0.986 -9.000 0.026 NA Y NA
 3474851 3474852 EcHS_A2907 EcHS_A2908     TRUE 0.549 17.000 0.000 NA N NA
 3474853 3474854 EcHS_A2909 EcHS_A2910     TRUE 0.997 -3.000 0.102 0.016 Y NA
 3474854 3474855 EcHS_A2910 EcHS_A2911     TRUE 0.964 -22.000 0.182 1.000 N NA
 3474855 3474856 EcHS_A2911 EcHS_A2912     TRUE 0.494 94.000 0.250 1.000 N NA
 3474856 3474857 EcHS_A2912 EcHS_A2913     TRUE 0.860 70.000 0.500 0.040 N NA
 3474858 3474859 EcHS_A2914 EcHS_A2915     TRUE 0.569 27.000 0.058 1.000 N NA
 3474859 3474860 EcHS_A2915 EcHS_A2916     FALSE 0.004 453.000 0.000 1.000   NA
 11515745 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 379.000 0.000 NA   NA
 11658108 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 379.000 0.000 NA   NA
 11800500 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 379.000 0.000 NA   NA
 11515746 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 347.000 0.000 NA   NA
 11658109 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 347.000 0.000 NA   NA
 11800501 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 347.000 0.000 NA   NA
 11515747 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 318.000 0.000 NA   NA
 11658110 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 318.000 0.000 NA   NA
 11800502 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 318.000 0.000 NA   NA
 11515748 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 286.000 0.000 NA   NA
 11658111 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 286.000 0.000 NA   NA
 11800503 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 286.000 0.000 NA   NA
 11515749 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 257.000 0.000 NA   NA
 11658112 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 257.000 0.000 NA   NA
 11800504 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 257.000 0.000 NA   NA
 11515750 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 225.000 0.000 NA   NA
 11658113 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 225.000 0.000 NA   NA
 11800505 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 225.000 0.000 NA   NA
 11515751 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 196.000 0.000 NA   NA
 11658114 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 196.000 0.000 NA   NA
 11800506 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 196.000 0.000 NA   NA
 11515752 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 164.000 0.000 NA   NA
 11658115 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 164.000 0.000 NA   NA
 11800507 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 164.000 0.000 NA   NA
 11515753 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 135.000 0.000 NA   NA
 11658116 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 135.000 0.000 NA   NA
 11800508 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 135.000 0.000 NA   NA
 11515754 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 103.000 0.000 NA   NA
 11658117 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 103.000 0.000 NA   NA
 11800509 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 103.000 0.000 NA   NA
 11515755 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 74.000 0.000 NA   NA
 11658118 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 74.000 0.000 NA   NA
 11800510 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 74.000 0.000 NA   NA
 11515756 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 42.000 0.000 NA   NA
 11658119 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 42.000 0.000 NA   NA
 11800511 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 42.000 0.000 NA   NA
 11515757 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 13.000 0.000 NA   NA
 11658120 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 13.000 0.000 NA   NA
 11800512 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 13.000 0.000 NA   NA
 11515758 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11658121 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11800513 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -19.000 0.000 NA   NA
 3474860 3474861 EcHS_A2916 EcHS_A2917     FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 11515759 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -48.000 0.000 NA   NA
 11658122 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -48.000 0.000 NA   NA
 11800514 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -48.000 0.000 NA   NA
 11515760 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -80.000 0.000 NA   NA
 11658123 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -80.000 0.000 NA   NA
 11800515 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -80.000 0.000 NA   NA
 11515761 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -109.000 0.000 NA   NA
 11658124 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -109.000 0.000 NA   NA
 11800516 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -109.000 0.000 NA   NA
 11515762 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -141.000 0.000 NA   NA
 11658125 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -141.000 0.000 NA   NA
 11800517 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -141.000 0.000 NA   NA
 11515763 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -170.000 0.000 NA   NA
 11658126 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -170.000 0.000 NA   NA
 11800518 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -170.000 0.000 NA   NA
 11515764 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -197.000 0.000 NA   NA
 11658127 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -197.000 0.000 NA   NA
 11800519 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -197.000 0.000 NA   NA
 11515765 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -165.000 0.000 NA   NA
 11658128 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -165.000 0.000 NA   NA
 11800520 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -165.000 0.000 NA   NA
 11515766 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -136.000 0.000 NA   NA
 11658129 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -136.000 0.000 NA   NA
 11800521 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -136.000 0.000 NA   NA
 11515767 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -104.000 0.000 NA   NA
 11658130 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -104.000 0.000 NA   NA
 11800522 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -104.000 0.000 NA   NA
 11515768 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -75.000 0.000 NA   NA
 11658131 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -75.000 0.000 NA   NA
 11800523 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -75.000 0.000 NA   NA
 11515769 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11658132 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11800524 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11515770 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -14.000 0.000 NA   NA
 11658133 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -14.000 0.000 NA   NA
 11800525 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA -14.000 0.000 NA   NA
 11515771 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 18.000 0.000 NA   NA
 11658134 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 18.000 0.000 NA   NA
 11800526 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 18.000 0.000 NA   NA
 11515772 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 47.000 0.000 NA   NA
 11658135 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 47.000 0.000 NA   NA
 11800527 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 47.000 0.000 NA   NA
 11515773 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 79.000 0.000 NA   NA
 11658136 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 79.000 0.000 NA   NA
 11800528 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 79.000 0.000 NA   NA
 11515774 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 108.000 0.000 NA   NA
 11658137 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 108.000 0.000 NA   NA
 11800529 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 108.000 0.000 NA   NA
 11515775 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 140.000 0.000 NA   NA
 11658138 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 140.000 0.000 NA   NA
 11800530 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 140.000 0.000 NA   NA
 11515776 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 169.000 0.000 NA   NA
 11658139 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 169.000 0.000 NA   NA
 11800531 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 169.000 0.000 NA   NA
 11515777 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 201.000 0.000 NA   NA
 11658140 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 201.000 0.000 NA   NA
 11800532 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 201.000 0.000 NA   NA
 11515778 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 230.000 0.000 NA   NA
 11658141 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 230.000 0.000 NA   NA
 11800533 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 230.000 0.000 NA   NA
 11515779 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11658142 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11800534 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11515780 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 291.000 0.000 NA   NA
 11658143 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 291.000 0.000 NA   NA
 11800535 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 291.000 0.000 NA   NA
 11515781 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 323.000 0.000 NA   NA
 11658144 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 323.000 0.000 NA   NA
 11800536 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 323.000 0.000 NA   NA
 11515782 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 352.000 0.000 NA   NA
 11658145 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 352.000 0.000 NA   NA
 11800537 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 352.000 0.000 NA   NA
 11515783 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 384.000 0.000 NA   NA
 11658146 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 384.000 0.000 NA   NA
 11800538 3474860   EcHS_A2916     FALSE NA 384.000 0.000 NA   NA
 3474863 3474864 EcHS_A2919 EcHS_A2920     TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3474864 3474865 EcHS_A2920 EcHS_A2921     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3474865 3474866 EcHS_A2921 EcHS_A2922     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 3474867 3474868 EcHS_A2923 EcHS_A2924 eno pyrG FALSE 0.255 88.000 0.068 1.000 N NA
 3474868 3474869 EcHS_A2924 EcHS_A2925 pyrG   FALSE 0.021 228.000 0.025 1.000   NA
 3474869 3474870 EcHS_A2925 EcHS_A2926   chpA FALSE 0.201 71.000 0.000 1.000   NA
 3474870 3474871 EcHS_A2926 EcHS_A2927 chpA chpR TRUE 0.999 0.000 0.531 NA Y NA
 3474871 3474872 EcHS_A2927 EcHS_A2928 chpR relA TRUE 0.620 78.000 0.000 NA Y NA
 3474872 3474873 EcHS_A2928 EcHS_A2929 relA rumA TRUE 0.443 48.000 0.082 1.000 N NA
 3474875 3474876 EcHS_A2931 EcHS_A2932     TRUE 0.964 21.000 0.000 0.000 Y NA
 3474876 3474877 EcHS_A2932 EcHS_A2933   gudP TRUE 0.919 2.000 0.000 1.000 N NA
 3474877 3474878 EcHS_A2933 EcHS_A2934 gudP   FALSE 0.004 435.000 0.000 1.000 N NA
 3474878 3474879 EcHS_A2934 EcHS_A2935   truC TRUE 0.866 18.000 0.209 1.000 N NA
 3474879 3474880 EcHS_A2935 EcHS_A2936 truC   TRUE 0.994 0.000 0.518 NA   NA
 3474880 3474881 EcHS_A2936 EcHS_A4767     FALSE 0.225 43.000 0.000 NA   NA
 3474881 3474882 EcHS_A4767 EcHS_A2937     FALSE 0.016 220.000 0.000 NA   NA
 3474883 3474884 EcHS_A2938 EcHS_A2939 queF   FALSE 0.163 112.000 0.079 NA   NA
 3474884 3474885 EcHS_A2939 EcHS_A2940     FALSE 0.002 557.000 0.000 NA   NA
 3474885 3474886 EcHS_A2940 EcHS_A2941   sdaB TRUE 0.724 58.000 0.000 1.000 Y NA
 3474886 3474887 EcHS_A2941 EcHS_A2942 sdaB xni TRUE 0.553 22.000 0.000 1.000 N NA
 3474888 3474889 EcHS_A2943 EcHS_A2944 fucO fucA TRUE 0.572 28.000 0.066 1.000 N NA
 3474890 3474891 EcHS_A2945 EcHS_A2946 fucP fucI TRUE 0.889 33.000 0.104 1.000 Y NA
 3474891 3474892 EcHS_A2946 EcHS_A2947 fucI fucK TRUE 0.791 109.000 0.269 1.000 Y NA
 3474892 3474893 EcHS_A2947 EcHS_A2948 fucK fucU TRUE 0.995 2.000 0.211 1.000 Y NA
 3474893 3474894 EcHS_A2948 EcHS_A2949 fucU fucR TRUE 0.899 58.000 0.308 1.000 Y NA
 3474895 3474896 EcHS_A2950 EcHS_A2951     TRUE 0.960 -7.000 0.144 NA   NA
 3474896 3474897 EcHS_A2951 EcHS_A2952   gcvA TRUE 0.649 19.000 0.081 NA   NA
 3474900 3474901 EcHS_A2954 EcHS_A2955 csdA csdE TRUE 0.991 0.000 0.122 0.001   NA
 3474902 3474903 EcHS_A2956 EcHS_A2957     FALSE 0.269 35.000 0.000 NA   NA
 3474903 3474904 EcHS_A2957 EcHS_A2959   mltA FALSE 0.102 94.000 0.000 NA   NA
 3474905 3474906 EcHS_A4693 EcHS_A4694     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3474906 3474907 EcHS_A4694 EcHS_A4695     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3474907 3474908 EcHS_A4695 EcHS_A4696     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3474911 3474912 EcHS_A2965 EcHS_A2966 recD recB TRUE 1.000 0.000 0.688 0.001 Y NA
 3474912 3474913 EcHS_A2966 EcHS_A2967 recB ptrA TRUE 0.959 -7.000 0.092 1.000 N NA
 3474913 3474914 EcHS_A2967 EcHS_A2968 ptrA recC FALSE 0.107 176.000 0.092 1.000 N NA
 3474914 3474915 EcHS_A2968 EcHS_A2969 recC ppdC TRUE 0.780 13.000 0.076 NA N NA
 3474915 3474916 EcHS_A2969 EcHS_A2970 ppdC   TRUE 0.990 -15.000 0.538 NA   NA
 3474916 3474917 EcHS_A2970 EcHS_A2971   ppdB TRUE 0.991 -3.000 0.373 NA   NA
 3474917 3474918 EcHS_A2971 EcHS_A2972 ppdB ppdA TRUE 0.997 -9.000 0.368 NA Y NA
 3474918 3474919 EcHS_A2972 EcHS_A2973 ppdA thyA FALSE 0.028 185.000 0.016 NA N NA
 3474919 3474920 EcHS_A2973 EcHS_A2974 thyA lgt TRUE 0.952 7.000 0.164 1.000 N NA
 3474920 3474921 EcHS_A2974 EcHS_A2975 lgt ptsP FALSE 0.089 151.000 0.000 1.000 N NA
 3474921 3474922 EcHS_A2975 EcHS_A2976 ptsP nudH TRUE 0.693 13.000 0.008 1.000 N NA
 3474922 3474923 EcHS_A2976 EcHS_A2977 nudH   FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 3474924 3474925 EcHS_A2978 EcHS_A2979 mutH   FALSE 0.275 69.000 0.052 1.000 N NA
 3474925 3474926 EcHS_A2979 EcHS_A2980     TRUE 0.498 138.000 0.429 NA   NA
 3474926 3474927 EcHS_A2980 EcHS_A2981   tas FALSE 0.112 108.000 0.043 NA   NA
 3474928 3474929 EcHS_A2982 EcHS_A2983 lplT aas TRUE 0.954 -7.000 0.124 NA   NA
 3474929 3474930 EcHS_A2983 EcHS_A4769 aas   FALSE 0.113 88.000 0.000 NA   NA
 3474930 3474931 EcHS_A4769 EcHS_A4770     FALSE 0.086 116.000 0.000 NA   NA
 3474935 3474936 EcHS_A2987 EcHS_A2988   araE FALSE 0.104 129.000 0.011 1.000 N NA
 3474936 3474937 EcHS_A2988 EcHS_A2989 araE kduD FALSE 0.009 315.000 0.000 1.000 N NA
 3474937 3474938 EcHS_A2989 EcHS_A2990 kduD kduI TRUE 0.815 30.000 0.269 1.000 N NA
 3474938 3474939 EcHS_A2990 EcHS_A2991 kduI   FALSE 0.012 287.000 0.000 1.000 N NA
 3474940 3474941 EcHS_A2992 EcHS_A2993     FALSE 0.005 400.000 0.000 1.000   NA
 3474941 3474942 EcHS_A2993 EcHS_A2994     FALSE 0.020 334.000 0.000 0.063   NA
 3474942 3474943 EcHS_A2994 EcHS_A2995     TRUE 0.637 82.000 0.400 NA   NA
 3474944 3474945 EcHS_A2996 EcHS_A2997     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 3474946 3474947 EcHS_A2998 EcHS_A2999     FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 3474947 3474948 EcHS_A2999 EcHS_A3000     FALSE 0.007 335.000 0.000 1.000   NA
 3474948 3474949 EcHS_A3000 EcHS_A3001     FALSE 0.002 510.000 0.000 NA   NA
 3474950 3474951 EcHS_A3002 EcHS_A3003     FALSE 0.017 219.000 0.000 NA   NA
 3474951 3474952 EcHS_A3003 EcHS_A3004     TRUE 0.986 3.000 0.400 NA   NA
 3474952 3474953 EcHS_A3004 EcHS_A3005     FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 3474954 3474955 EcHS_A3006 EcHS_A3007     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 3474956 3474957 EcHS_A3008 EcHS_A3009   eprJ TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3474957 3474958 EcHS_A3009 EcHS_A3010 eprJ eprI TRUE 0.833 20.000 0.231 NA   NA
 3474958 3474959 EcHS_A3010 EcHS_A3011 eprI eprH TRUE 0.904 38.000 0.667 NA   NA
 3474960 3474961 EcHS_A3012 EcHS_A3013     TRUE 0.910 2.000 0.000 1.000   NA
 3474962 3474963 EcHS_A3014 EcHS_A3015     FALSE 0.349 27.000 0.000 NA   NA
 3474963 3474964 EcHS_A3015 EcHS_A3016   epaR FALSE 0.090 107.000 0.000 NA   NA
 3474964 3474965 EcHS_A3016 EcHS_A3017 epaR epaQ TRUE 1.000 2.000 1.000 0.074 Y NA
 3474965 3474966 EcHS_A3017 EcHS_A3018 epaQ epaP TRUE 0.999 10.000 0.833 0.007 Y NA
 3474966 3474967 EcHS_A3018 EcHS_A3019 epaP epaO TRUE 0.998 -10.000 0.625 1.000 Y NA
 3474967 3474968 EcHS_A3019 EcHS_A3020 epaO   TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3474968 3474969 EcHS_A3020 EcHS_A3021     FALSE 0.044 162.000 0.000 NA   NA
 3474969 3474970 EcHS_A3021 EcHS_A3022     TRUE 0.829 57.000 0.000 0.058 Y NA
 3474970 3474971 EcHS_A3022 EcHS_A3023     TRUE 0.507 23.000 0.000 1.000   NA
 3474971 3474972 EcHS_A3023 EcHS_A4697     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 3474972 3474973 EcHS_A4697 EcHS_A3025     FALSE 0.127 78.000 0.000 NA   NA
 3474974 3474975 EcHS_A3026 EcHS_A3027 xdhA xdhB TRUE 0.998 11.000 0.500 0.000 Y NA
 3474975 3474976 EcHS_A3027 EcHS_A3028 xdhB xdhC TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.048 Y NA
 3474978 3474979 EcHS_A3030 EcHS_A3031     TRUE 0.884 58.000 0.265 1.000 Y NA
 3474979 3474980 EcHS_A3031 EcHS_A3032     TRUE 0.848 58.000 0.188 1.000 Y NA
 3474980 3474981 EcHS_A3032 EcHS_A3033   hyuA FALSE 0.339 53.000 0.050 1.000 N NA
 3474981 3474982 EcHS_A3033 EcHS_A3034 hyuA   FALSE 0.319 48.000 0.031 1.000 N NA
 3474983 3474984 EcHS_A3035 EcHS_A3036     TRUE 0.428 48.000 0.119 NA   NA
 3474985 3474986 EcHS_A3037 EcHS_A3038     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 3474986 3474987 EcHS_A3038 EcHS_A3039   ssnA TRUE 0.990 3.000 0.443 1.000 N NA
 3474987 3474988 EcHS_A3039 EcHS_A3040 ssnA   FALSE 0.388 51.000 0.066 1.000 N NA
 3474988 3474989 EcHS_A3040 EcHS_A3041     TRUE 1.000 -3.000 0.800 0.039 Y NA
 3474989 3474990 EcHS_A3041 EcHS_A3042     FALSE 0.071 165.000 0.000 1.000 N NA
 3474990 3474991 EcHS_A3042 EcHS_A3043   guaD TRUE 0.926 18.000 0.000 1.000 Y NA
 3474991 3474992 EcHS_A3043 EcHS_A3044 guaD   FALSE 0.356 36.000 0.000 1.000   NA
 3474993 3474994 EcHS_A3045 EcHS_A3046   aegA2 TRUE 0.995 0.000 0.333 0.016 N NA
 3474995 3474996 EcHS_A3047 EcHS_A3048   idi FALSE 0.018 250.000 0.000 1.000 N NA
 3474997 3474998 EcHS_A3049 EcHS_A3050 lysS2 prfB TRUE 0.992 10.000 0.162 0.040 Y NA
 3474998 3474999 EcHS_A3050 EcHS_A3051 prfB recJ FALSE 0.174 91.000 0.028 1.000 N NA
 3474999 3475000 EcHS_A3051 EcHS_A3052 recJ dsbC TRUE 0.925 6.000 0.082 1.000 N NA
 3475000 3475001 EcHS_A3052 EcHS_A3053 dsbC xerD TRUE 0.639 25.000 0.079 1.000 N NA
 3475004 3475005 EcHS_A3056 EcHS_A3057   ygfZ FALSE 0.090 77.000 0.004 NA   NA
 3475006 3475007 EcHS_A3058 EcHS_A3059     FALSE 0.111 164.000 0.113 NA   NA
 3475009 3475010 EcHS_A3061 EcHS_A3062   gcvP FALSE 0.012 266.000 0.006 1.000 N NA
 3475010 3475011 EcHS_A3062 EcHS_A3063 gcvP gcvH TRUE 0.766 119.000 0.249 1.000 Y NA
 3475011 3475012 EcHS_A3063 EcHS_A3064 gcvH gcvT TRUE 0.985 24.000 0.317 0.001 Y NA
 3475012 3475013 EcHS_A3064 EcHS_A3065 gcvT   FALSE 0.003 447.000 0.004 1.000 N NA
 3475013 3475014 EcHS_A3065 EcHS_A3066   ubiH TRUE 0.991 23.000 0.474 0.001 Y NA
 3475014 3475015 EcHS_A3066 EcHS_A3067 ubiH pepP TRUE 0.941 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3475015 3475016 EcHS_A3067 EcHS_A3068 pepP   FALSE 0.394 26.000 0.036 NA   NA
 3475017 3475018 EcHS_A3069 EcHS_A4771     FALSE 0.230 42.000 0.000 NA   NA
 3475018 3475019 EcHS_A4771 EcHS_A3070     FALSE 0.132 76.000 0.000 NA   NA
 3475019 3475020 EcHS_A3070 EcHS_A4772     FALSE 0.360 26.000 0.000 NA   NA
 3475021 3475022 EcHS_A3071 EcHS_A3072 serA rpiA FALSE 0.017 256.000 0.029 1.000 N NA
 3475022 3475023 EcHS_A3072 EcHS_A3073 rpiA   FALSE 0.176 56.000 0.000 NA   NA
 3475024 3475025 EcHS_A3074 EcHS_A3075 iciA msm FALSE 0.037 204.000 0.000 1.000 N NA
 3475025 3475026 EcHS_A3075 EcHS_A3076 msm   TRUE 0.990 -7.000 0.366 1.000 N NA
 3475026 3475027 EcHS_A3076 EcHS_A3077     TRUE 0.777 11.000 0.015 1.000 N NA
 3475027 3475028 EcHS_A3077 EcHS_A3078     TRUE 0.826 24.000 0.085 0.026 N NA
 3475029 3475030 EcHS_A3079 EcHS_A3080     FALSE 0.047 167.000 0.037 NA   NA
 3475030 3475031 EcHS_A3080 EcHS_A3081   argO FALSE 0.185 93.000 0.075 NA   NA
 3475031 3475032 EcHS_A3081 EcHS_A3082 argO mscS FALSE 0.122 139.000 0.049 1.000   NA
 3475032 3475033 EcHS_A3082 EcHS_A3083 mscS fbaA FALSE 0.008 358.000 0.038 1.000 N NA
 3475033 3475034 EcHS_A3083 EcHS_A3084 fbaA pgk FALSE 0.367 215.000 0.056 0.005 Y NA
 3475034 3475035 EcHS_A3084 EcHS_A3085 pgk epd TRUE 0.896 50.000 0.070 0.005 Y NA
 3475035 3475036 EcHS_A3085 EcHS_A3086 epd   FALSE 0.012 285.000 0.000 1.000 N NA
 3475036 3475037 EcHS_A3086 EcHS_A3087     TRUE 0.996 -3.000 0.588 NA N NA
 3475037 3475038 EcHS_A3087 EcHS_A3088   glpX2 TRUE 0.937 22.000 0.545 NA N NA
 3475038 3475039 EcHS_A3088 EcHS_A3089 glpX2 sorE TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3475039 3475040 EcHS_A3089 EcHS_A3090 sorE   TRUE 0.960 15.000 0.458 1.000 N NA
 3475040 3475041 EcHS_A3090 EcHS_A3091     FALSE 0.193 82.000 0.000 1.000 N NA
 3475041 3475042 EcHS_A3091 EcHS_A3092     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 3475042 3475043 EcHS_A3092 EcHS_A3093   tkt FALSE 0.012 287.000 0.000 1.000 N NA
 3475045 3475046 EcHS_A3095 EcHS_A3096 speB speA TRUE 0.464 138.000 0.015 1.000 Y NA
 3475046 3475047 EcHS_A3096 EcHS_A3097 speA   TRUE 0.769 9.000 0.000 NA   NA
 3475048 3475049 EcHS_A3098 EcHS_A3099   metK FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 3475049 3475050 EcHS_A3099 EcHS_A3100 metK   FALSE 0.153 63.000 0.000 NA   NA
 3475050 3475051 EcHS_A3100 EcHS_A3101   galP FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 3475051 3475052 EcHS_A3101 EcHS_A3102 galP sprT FALSE 0.216 77.000 0.042 1.000   NA
 3475052 3475053 EcHS_A3102 EcHS_A3103 sprT endA TRUE 0.417 95.000 0.210 1.000   NA
 3475053 3475054 EcHS_A3103 EcHS_A3104 endA   TRUE 0.415 80.000 0.201 NA   NA
 3475054 3475055 EcHS_A3104 EcHS_A3105   gshB TRUE 0.872 13.000 0.173 NA   NA
 3475055 3475056 EcHS_A3105 EcHS_A3106 gshB   FALSE 0.237 109.000 0.120 NA N NA
 3475056 3475057 EcHS_A3106 EcHS_A3107     TRUE 0.985 0.000 0.263 NA N NA
 3475058 3475059 EcHS_A3108 EcHS_A3109     FALSE 0.083 121.000 0.000 NA   NA
 3475059 3475060 EcHS_A3109 EcHS_A3110     FALSE 0.076 227.000 0.000 0.013 N NA
 3475061 3475062 EcHS_A3111 EcHS_A3112     TRUE 0.819 18.000 0.189 NA   NA
 3475062 3475063 EcHS_A3112 EcHS_A3113     TRUE 0.915 -15.000 0.081 NA   NA
 3475063 3475064 EcHS_A3113 EcHS_A3114   rdgB TRUE 0.739 8.000 0.016 NA   NA
 3475064 3475065 EcHS_A3114 EcHS_A3115 rdgB   TRUE 0.980 -7.000 0.218 1.000 N NA
 3475066 3475067 EcHS_A3116 EcHS_A3117   ansB FALSE 0.071 117.000 0.018 NA   NA
 3475067 3475068 EcHS_A3117 EcHS_A3118 ansB   FALSE 0.034 176.000 0.027 NA   NA
 3475068 3475069 EcHS_A3118 EcHS_A3119     FALSE 0.386 24.000 0.000 NA   NA
 3475069 3475070 EcHS_A3119 EcHS_A3120     FALSE 0.399 23.000 0.000 NA   NA
 3475070 3475071 EcHS_A3120 EcHS_A3121   trmB TRUE 0.955 0.000 0.092 NA   NA
 3475074 3475075 EcHS_A3124 EcHS_A3125 mltC nupG FALSE 0.034 202.000 0.056 NA   NA
 3475077 3475078 EcHS_A3127 EcHS_A4698     FALSE 0.092 105.000 0.000 NA   NA
 3475079 3475080 EcHS_A3129 EcHS_A3130 gspM gspL2 TRUE 0.999 2.000 0.811 1.000 Y NA
 3475080 3475081 EcHS_A3130 EcHS_A3131 gspL2 gspK TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.074 Y NA
 3475081 3475082 EcHS_A3131 EcHS_A3132 gspK gspJ2 TRUE 0.999 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 3475082 3475083 EcHS_A3132 EcHS_A3133 gspJ2 gspI2 TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.004   NA
 3475083 3475084 EcHS_A3133 EcHS_A3134 gspI2 gspH2 TRUE 0.998 -3.000 0.605 0.004   NA
 3475084 3475085 EcHS_A3134 EcHS_A3135 gspH2 gspG2 TRUE 0.994 4.000 0.425 0.004   NA
 3475085 3475086 EcHS_A3135 EcHS_A3136 gspG2 gspF2 TRUE 0.995 17.000 0.599 0.004 Y NA
 3475086 3475087 EcHS_A3136 EcHS_A3137 gspF2 gspE2 TRUE 1.000 0.000 0.653 0.004 Y NA
 3475087 3475088 EcHS_A3137 EcHS_A3138 gspE2 gspD2 TRUE 1.000 0.000 0.776 0.004 Y NA
 3475088 3475089 EcHS_A3138 EcHS_A3139 gspD2 gspC1 TRUE 0.989 30.000 0.575 0.004 Y NA
 3475089 3475090 EcHS_A3139 EcHS_A3140 gspC1   TRUE 0.489 18.000 0.000 NA   NA
 3475090 3475091 EcHS_A3140 EcHS_A3141     FALSE 0.148 66.000 0.000 NA   NA
 3475091 3475092 EcHS_A3141 EcHS_A3142     FALSE 0.095 140.000 0.000 1.000   NA
 3475093 3475094 EcHS_A3143 EcHS_A3144     FALSE 0.104 93.000 0.000 NA   NA
 3475094 3475095 EcHS_A3144 EcHS_A3145     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 3475096 3475097 EcHS_A3146 EcHS_A3147   glcA TRUE 0.559 15.000 0.000 NA   NA
 3475099 3475100 EcHS_A3148 EcHS_A3149 glcB   TRUE 0.506 22.000 0.052 NA   NA
 3475100 3475101 EcHS_A3149 EcHS_A3150   glcF TRUE 0.870 5.000 0.057 NA   NA
 3475101 3475102 EcHS_A3150 EcHS_A3151 glcF glcE TRUE 0.990 11.000 0.074 0.001 Y NA
 3475102 3475103 EcHS_A3151 EcHS_A3152 glcE glcD TRUE 0.997 0.000 0.070 0.001 Y NA
 3475106 3475107 EcHS_A3155 EcHS_A3156     TRUE 0.987 -3.000 0.096 0.026 N NA
 3475107 3475108 EcHS_A3156 EcHS_A3157     TRUE 0.499 32.000 0.064 1.000   NA
 3475108 3475109 EcHS_A3157 EcHS_A3158     TRUE 0.965 0.000 0.091 1.000   NA
 3475110 3475111 EcHS_A3159 EcHS_A3160     TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.073   NA
 3475111 3475112 EcHS_A3160 EcHS_A3161     FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3475112 3475113 EcHS_A3161 EcHS_A3162     TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3475113 3475114 EcHS_A3162 EcHS_A3163     TRUE 0.996 0.000 0.667 NA   NA
 3475114 3475115 EcHS_A3163 EcHS_A3164     TRUE 0.884 46.000 0.667 NA   NA
 3475115 3475116 EcHS_A3164 EcHS_A3165     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3475118 3475119 EcHS_A3167 EcHS_A3168 pitB gsp FALSE 0.011 292.000 0.000 1.000 N NA
 3475121 3475122 EcHS_A3170 EcHS_A3171 hybG hypA1 TRUE 0.618 13.000 0.000 NA   NA
 3475122 3475123 EcHS_A3171 EcHS_A3172 hypA1 hybE TRUE 0.913 -7.000 0.055 NA   NA
 3475123 3475124 EcHS_A3172 EcHS_A3173 hybE hybD2 TRUE 0.982 -7.000 0.291 NA   NA
 3475124 3475125 EcHS_A3173 EcHS_A3174 hybD2 hybC TRUE 0.999 0.000 0.828 1.000 Y NA
 3475125 3475126 EcHS_A3174 EcHS_A3175 hybC hybB TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 3475126 3475127 EcHS_A3175 EcHS_A3176 hybB hybA TRUE 0.985 -10.000 0.000 NA Y NA
 3475127 3475128 EcHS_A3176 EcHS_A3177 hybA hyb0 TRUE 0.999 3.000 0.615 0.015 Y NA
 3475128 3475129 EcHS_A3177 EcHS_A3178 hyb0   FALSE 0.053 189.000 0.077 NA   NA
 3475129 3475130 EcHS_A3178 EcHS_A3179     FALSE 0.084 119.000 0.000 NA   NA
 3475134 3475135 EcHS_A3183 EcHS_A3184   exbD TRUE 0.781 8.000 0.000 NA   NA
 3475135 3475136 EcHS_A3184 EcHS_A3185 exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.060 Y NA
 3475137 3475138 EcHS_A3186 EcHS_A3187 metC   FALSE 0.266 140.000 0.212 NA   NA
 3475140 3475141 EcHS_A3188 EcHS_A3190 yqhD dkgA TRUE 0.554 105.000 0.200 0.038   NA
 3475141 3475142 EcHS_A3190 EcHS_A3192 dkgA   FALSE 0.023 200.000 0.000 NA   NA
 3475142 3475143 EcHS_A3192 EcHS_A3193     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 3475144 3475145 EcHS_A3194 EcHS_A3195   sufI FALSE 0.139 111.000 0.025 1.000 N NA
 3475145 3475146 EcHS_A3195 EcHS_A3196 sufI plsC TRUE 0.432 75.000 0.154 1.000 N NA
 3475146 3475147 EcHS_A3196 EcHS_A3197 plsC parC FALSE 0.028 234.000 0.043 1.000 N NA
 3475147 3475148 EcHS_A3197 EcHS_A3198 parC   FALSE 0.109 138.000 0.000 1.000 N NA
 3475148 3475149 EcHS_A3198 EcHS_A3199     FALSE 0.105 133.000 0.000 1.000   NA
 3475149 3475150 EcHS_A3199 EcHS_A3200     TRUE 0.996 2.000 0.857 NA   NA
 3475150 3475151 EcHS_A3200 EcHS_A3201     FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 3475151 3475152 EcHS_A3201 EcHS_A3202     FALSE 0.254 53.000 0.053 NA   NA
 3475153 3475154 EcHS_A3203 EcHS_A3204 qseB qseC TRUE 0.999 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 3475156 3475157 EcHS_A3206 EcHS_A3207 mdaB ygiN TRUE 0.672 31.000 0.025 0.038   NA
 3475158 3475159 EcHS_A3208 EcHS_A3209 parE yqiA TRUE 0.732 29.000 0.217 NA   NA
 3475159 3475160 EcHS_A3209 EcHS_A3210 yqiA icc TRUE 0.992 0.000 0.427 NA   NA
 3475160 3475161 EcHS_A3210 EcHS_A3211 icc   TRUE 0.895 25.000 0.433 NA   NA
 3475161 3475162 EcHS_A3211 EcHS_A3212     TRUE 0.991 1.000 0.443 NA   NA
 3475163 3475164 EcHS_A3213 EcHS_A3214 tolC   TRUE 0.493 148.000 0.480 NA   NA
 3475164 3475165 EcHS_A3214 EcHS_A3215     TRUE 0.991 6.000 0.632 NA   NA
 3475168 3475169 EcHS_A3218 EcHS_A3219   ribB FALSE 0.013 238.000 0.000 NA   NA
 3475170 3475171 EcHS_A3220 EcHS_A3221     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 3475171 3475172 EcHS_A3221 EcHS_A3222     TRUE 0.959 60.000 0.667 1.000 Y NA
 3475172 3475173 EcHS_A3222 EcHS_A3223     TRUE 0.989 22.000 0.667 1.000 Y NA
 3475173 3475174 EcHS_A3223 EcHS_A3224     TRUE 0.990 2.000 0.400 1.000   NA
 3475176 3475177 EcHS_A3226 EcHS_A3227     FALSE 0.349 27.000 0.000 NA   NA
 3475178 3475179 EcHS_A4775 EcHS_A4776     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 3475179 3475180 EcHS_A4776 EcHS_A3229   hldE FALSE 0.218 45.000 0.000 NA   NA
 3475180 3475181 EcHS_A3229 EcHS_A3230 hldE glnE TRUE 0.444 48.000 0.083 1.000 N NA
 3475181 3475182 EcHS_A3230 EcHS_A3231 glnE   TRUE 0.582 23.000 0.053 1.000   NA
 3475183 3475184 EcHS_A3232 EcHS_A3233   cca FALSE 0.343 64.000 0.106 NA N NA
 3475185 3475186 EcHS_A3234 EcHS_A3235   uppP TRUE 0.489 18.000 0.000 NA   NA
 3475186 3475187 EcHS_A3235 EcHS_A3236 uppP folB FALSE 0.343 90.000 0.128 1.000 N NA
 3475190 3475191 EcHS_A3239 EcHS_A3240     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 3475191 3475192 EcHS_A3240 EcHS_A3241   ddtA TRUE 0.919 2.000 0.000 1.000 N NA
 3475192 3475193 EcHS_A3241 EcHS_A3242 ddtA ttdB TRUE 1.000 -3.000 0.667 0.000 Y NA
 3475193 3475194 EcHS_A3242 EcHS_A3243 ttdB   FALSE 0.330 49.000 0.037 1.000 N NA
 3475196 3475197 EcHS_A3245 EcHS_A3246 rpsU dnaG FALSE 0.205 111.000 0.067 1.000 N NA
 3475197 3475198 EcHS_A3246 EcHS_A3247 dnaG   TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3475198 3475199 EcHS_A3247 EcHS_A3248   rpoD FALSE 0.162 59.000 0.000 NA   NA
 3475204 3475205 EcHS_A3253 EcHS_A3254 aer   FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 3475208 3475209 EcHS_A3257 EcHS_A3258 ebgR ebgA FALSE 0.120 184.000 0.136 1.000 N NA
 3475209 3475210 EcHS_A3258 EcHS_A3259 ebgA ebgC TRUE 0.999 -3.000 0.682 NA Y NA
 3475210 3475211 EcHS_A3259 EcHS_A3260 ebgC   TRUE 0.718 63.000 0.412 NA N NA
 3475211 3475212 EcHS_A3260 EcHS_A3261     FALSE 0.069 134.000 0.000 NA   NA
 3475212 3475213 EcHS_A3261 EcHS_A3262     TRUE 0.509 17.000 0.000 NA   NA
 3475213 3475214 EcHS_A3262 EcHS_A3263   fadH FALSE 0.008 326.000 0.000 1.000   NA
 3475215 3475216 EcHS_A3264 EcHS_A3265     TRUE 0.991 -3.000 0.375 NA   NA
 3475216 3475217 EcHS_A3265 EcHS_A3266     FALSE 0.007 285.000 0.000 NA   NA
 3475218 3475219 EcHS_A3267 EcHS_A3268     FALSE 0.111 77.000 0.019 NA   NA
 3475219 3475220 EcHS_A3268 EcHS_A3269     FALSE 0.107 79.000 0.019 NA   NA
 3475220 3475221 EcHS_A3269 EcHS_A4777     FALSE 0.129 77.000 0.000 NA   NA
 3475221 3475222 EcHS_A4777 EcHS_A3270   alx TRUE 0.466 19.000 0.000 NA   NA
 3475222 3475223 EcHS_A3270 EcHS_A3271 alx   FALSE 0.089 109.000 0.000 NA   NA
 3475223 3475224 EcHS_A3271 EcHS_A3272   sstT FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 3475225 3475226 EcHS_A3273 EcHS_A3274   uxaA FALSE 0.293 83.000 0.126 NA   NA
 3475226 3475227 EcHS_A3274 EcHS_A3275 uxaA uxaC TRUE 0.960 15.000 0.092 1.000 Y NA
 3475229 3475230 EcHS_A3277 EcHS_A3278     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3475230 3475231 EcHS_A3278 EcHS_A3279     TRUE 0.818 73.000 0.667 NA   NA
 3475231 3475232 EcHS_A3279 EcHS_A3280     TRUE 0.907 30.000 0.556 NA   NA
 3475233 3475234 EcHS_A3281 EcHS_A3282 exuR   FALSE 0.004 345.000 0.000 NA   NA
 3475234 3475235 EcHS_A3282 EcHS_A3283     TRUE 0.989 4.000 0.529 NA   NA
 3475237 3475238 EcHS_A3285 EcHS_A3286     TRUE 0.890 38.000 0.609 NA   NA
 3475238 3475239 EcHS_A3286 EcHS_A3287     TRUE 0.962 3.000 0.185 NA   NA
 3475239 3475240 EcHS_A3287 EcHS_A3288     TRUE 0.964 -10.000 0.185 NA   NA
 3475240 3475241 EcHS_A3288 EcHS_A3289     FALSE 0.104 186.000 0.161 NA   NA
 3475241 3475242 EcHS_A3289 EcHS_A3290     FALSE 0.140 70.000 0.000 NA   NA
 3475242 3475243 EcHS_A3290 EcHS_A3291     FALSE 0.245 39.000 0.000 NA   NA
 3475243 3475244 EcHS_A3291 EcHS_A3292     FALSE 0.067 137.000 0.000 NA   NA
 3475244 3475245 EcHS_A3292 EcHS_A3293     FALSE 0.104 93.000 0.000 NA   NA
 3475245 3475246 EcHS_A3293 EcHS_A3294     FALSE 0.172 57.000 0.000 NA   NA
 3475248 3475249 EcHS_A3296 EcHS_A3297     FALSE 0.310 23.000 0.005 NA   NA
 3475250 3475251 EcHS_A3298 EcHS_A3299     TRUE 0.658 28.000 0.157 NA   NA
 3475251 3475252 EcHS_A3299 EcHS_A3300   sdaA1 FALSE 0.092 275.000 0.000 1.000 Y NA
 3475252 3475253 EcHS_A3300 EcHS_A3301 sdaA1   FALSE 0.383 72.000 0.150 NA N NA
 3475253 3475254 EcHS_A3301 EcHS_A3302   pflB1 TRUE 0.626 14.000 0.000 NA N NA
 3475254 3475255 EcHS_A3302 EcHS_A3303 pflB1 tdcD TRUE 0.940 34.000 0.286 1.000 Y NA
 3475255 3475256 EcHS_A3303 EcHS_A3304 tdcD tdcC TRUE 0.860 26.000 0.308 1.000 N NA
 3475256 3475257 EcHS_A3304 EcHS_A3305 tdcC tdcB TRUE 0.904 22.000 0.029 1.000 Y NA
 3475257 3475258 EcHS_A3305 EcHS_A3306 tdcB tdcA FALSE 0.149 99.000 0.023 1.000 N NA
 3475261 3475262 EcHS_A3309 EcHS_A3310     TRUE 0.414 22.000 0.000 NA   NA
 3475263 3475264 EcHS_A3311 EcHS_A3312     TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 3475264 3475265 EcHS_A3312 EcHS_A4778     TRUE 0.805 -31.000 0.000 NA   NA
 3475265 3475266 EcHS_A4778 EcHS_A3313   garK FALSE 0.104 93.000 0.000 NA   NA
 3475266 3475267 EcHS_A3313 EcHS_A3314 garK garR FALSE 0.345 97.000 0.152 1.000 N NA
 3475267 3475268 EcHS_A3314 EcHS_A3315 garR garL TRUE 0.858 36.000 0.424 1.000 N NA
 3475268 3475269 EcHS_A3315 EcHS_A3316 garL garP TRUE 0.963 16.000 0.143 1.000 Y NA
 3475270 3475271 EcHS_A3317 EcHS_A3318   garD FALSE 0.207 47.000 0.000 NA   NA
 3475271 3475272 EcHS_A3318 EcHS_A3319 garD sohA FALSE 0.064 149.000 0.000 NA N NA
 3475272 3475273 EcHS_A3319 EcHS_A3320 sohA   TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3475275 3475276 EcHS_A3322 EcHS_A3323   agaV TRUE 0.964 23.000 0.280 1.000 Y NA
 3475276 3475277 EcHS_A3323 EcHS_A3324 agaV agaW TRUE 0.999 11.000 0.905 0.013 Y NA
 3475277 3475278 EcHS_A3324 EcHS_A3325 agaW agaE TRUE 0.999 -10.000 0.619 0.013 Y NA
 3475278 3475279 EcHS_A3325 EcHS_A3326 agaE agaF TRUE 0.996 18.000 0.692 0.013 Y NA
 3475279 3475280 EcHS_A3326 EcHS_A3327 agaF nagA1 TRUE 0.995 -3.000 0.104 1.000 Y NA
 3475280 3475281 EcHS_A3327 EcHS_A3328 nagA1   FALSE 0.007 351.000 0.000 1.000 N NA
 3475281 3475282 EcHS_A3328 EcHS_A3329   agaY TRUE 0.961 13.000 0.391 1.000 N NA
 3475282 3475283 EcHS_A3329 EcHS_A3330 agaY agaB TRUE 0.430 167.000 0.087 1.000 Y NA
 3475283 3475284 EcHS_A3330 EcHS_A3331 agaB agaC TRUE 0.967 39.000 0.333 0.013 Y NA
 3475284 3475285 EcHS_A3331 EcHS_A3332 agaC agaD TRUE 0.999 -10.000 0.444 0.013 Y NA
 3475285 3475286 EcHS_A3332 EcHS_A3333 agaD agaI TRUE 0.992 1.000 0.080 1.000 Y NA
 3475286 3475287 EcHS_A3333 EcHS_A3334 agaI   FALSE 0.005 401.000 0.000 1.000 N NA
 3475287 3475288 EcHS_A3334 EcHS_A3335     TRUE 0.874 80.000 0.333 1.000 Y NA
 3475288 3475289 EcHS_A3335 EcHS_A3336     TRUE 0.862 30.000 0.000 1.000 Y NA
 3475289 3475290 EcHS_A3336 EcHS_A3337     TRUE 0.963 11.000 0.000 NA Y NA
 3475292 3475293 EcHS_A3339 EcHS_A3340     FALSE 0.409 84.000 0.172 1.000   NA
 3475293 3475294 EcHS_A3340 EcHS_A3341   diaA TRUE 0.832 20.000 0.187 1.000 N NA
 3475294 3475295 EcHS_A3341 EcHS_A3342 diaA   TRUE 0.986 10.000 0.613 NA   NA
 3475296 3475297 EcHS_A3343 EcHS_A3344     FALSE 0.176 73.000 0.045 NA   NA
 3475301 3475302 EcHS_A3348 EcHS_A3349     TRUE 0.987 -6.000 0.295 1.000   NA
 3475303 3475304 EcHS_A3350 EcHS_A3351     TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 3475304 3475305 EcHS_A3351 EcHS_A3352     FALSE 0.166 81.000 0.041 NA N NA
 3475306 3475307 EcHS_A3353 EcHS_A3354 mtr deaD FALSE 0.069 154.000 0.009 1.000 N NA
 3475307 3475308 EcHS_A3354 EcHS_A3355 deaD nlpI FALSE 0.165 114.000 0.053 1.000   NA
 3475308 3475309 EcHS_A3355 EcHS_A3356 nlpI pnp FALSE 0.200 109.000 0.071 1.000   NA
 3475311 3475312 EcHS_A3357 EcHS_A4780 rpsO   TRUE 0.793 -56.000 0.000 NA   NA
 3475312 3475313 EcHS_A4780 EcHS_A3358   truB FALSE 0.108 91.000 0.000 NA   NA
 3475313 3475314 EcHS_A3358 EcHS_A3359 truB rbfA TRUE 0.998 0.000 0.318 1.000 Y NA
 3475314 3475315 EcHS_A3359 EcHS_A3360 rbfA infB TRUE 0.794 164.000 0.530 1.000 Y NA
 3475315 3475316 EcHS_A3360 EcHS_A3361 infB nusA TRUE 0.885 25.000 0.342 1.000 N NA
 3475316 3475317 EcHS_A3361 EcHS_A3362 nusA   TRUE 0.946 28.000 0.759 NA   NA
 3475317 3475318 EcHS_A3362 EcHS_A4700     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 3475320 3475321 EcHS_A3365 EcHS_A4701 yhbX   FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 3475321 3475322 EcHS_A4701 EcHS_A3367   secG TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3475322 3475323 EcHS_A3367 EcHS_A3368 secG glmM FALSE 0.021 228.000 0.016 1.000 N NA
 3475323 3475324 EcHS_A3368 EcHS_A3369 glmM folP TRUE 0.984 -7.000 0.260 1.000 N NA
 3475324 3475325 EcHS_A3369 EcHS_A3370 folP hflB TRUE 0.593 90.000 0.325 1.000 N NA
 3475325 3475326 EcHS_A3370 EcHS_A3371 hflB rrmJ FALSE 0.371 91.000 0.152 1.000 N NA
 3475329 3475330 EcHS_A3374 EcHS_A3375 dacB   FALSE 0.202 49.000 0.000 NA   NA
 3475331 3475332 EcHS_A3376 EcHS_A3377     TRUE 0.596 16.000 0.015 1.000   NA
 3475332 3475333 EcHS_A3377 EcHS_A3378   rpmA FALSE 0.103 127.000 0.019 1.000   NA
 3475333 3475334 EcHS_A3378 EcHS_A3379 rpmA rplU TRUE 0.994 21.000 0.667 0.011 Y NA
 3475335 3475336 EcHS_A3380 EcHS_A3381 ispB sfsB FALSE 0.024 229.000 0.000 1.000 N NA
 3475341 3475342 EcHS_A3386 EcHS_A3387     TRUE 0.989 5.000 0.562 NA   NA
 3475342 3475343 EcHS_A3387 EcHS_A3388     TRUE 0.996 8.000 0.530 NA Y NA
 3475344 3475345 EcHS_A3389 EcHS_A3390   kdsD TRUE 0.916 14.000 0.226 1.000 N NA
 3475345 3475346 EcHS_A3390 EcHS_A3391 kdsD kdsC TRUE 0.953 21.000 0.598 1.000   NA
 3475346 3475347 EcHS_A3391 EcHS_A3392 kdsC   TRUE 0.996 -3.000 0.617 NA   NA
 3475347 3475348 EcHS_A3392 EcHS_A3393   lptA TRUE 0.985 -31.000 0.459 NA   NA
 3475348 3475349 EcHS_A3393 EcHS_A3394 lptA lptB TRUE 0.987 7.000 0.543 NA   NA
 3475349 3475350 EcHS_A3394 EcHS_A3395 lptB rpoN TRUE 0.556 48.000 0.163 1.000   NA
 3475350 3475351 EcHS_A3395 EcHS_A3396 rpoN yfiA TRUE 0.964 23.000 0.820 NA N NA
 3475351 3475352 EcHS_A3396 EcHS_A3397 yfiA ptsN TRUE 0.757 118.000 0.728 NA N NA
 3475352 3475353 EcHS_A3397 EcHS_A3398 ptsN   TRUE 0.555 46.000 0.186 NA   NA
 3475353 3475354 EcHS_A3398 EcHS_A3399   ptsO TRUE 0.977 -3.000 0.182 NA   NA
 3475354 3475355 EcHS_A3399 EcHS_A3400 ptsO   FALSE 0.012 214.000 0.007 NA   NA
 3475356 3475357 EcHS_A3401 EcHS_A3402 mtgA elbB TRUE 0.943 -3.000 0.066 NA   NA
 3475359 3475360 EcHS_A3403 EcHS_A3404 arcB   FALSE 0.282 96.000 0.113 1.000   NA
 3475361 3475362 EcHS_A3405 EcHS_A3406 gltB gltD TRUE 0.988 13.000 0.096 0.000 Y NA
 3475362 3475363 EcHS_A3406 EcHS_A3407 gltD   FALSE 0.030 184.000 0.000 NA   NA
 3475363 3475364 EcHS_A3407 EcHS_A3408     TRUE 0.824 -19.000 0.000 NA   NA
 3475365 3475366 EcHS_A3409 EcHS_A3410     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 3475366 3475367 EcHS_A3410 EcHS_A3411     TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3475367 3475368 EcHS_A3411 EcHS_A3412   nanT1 FALSE 0.311 48.000 0.000 1.000 N NA
 3475368 3475369 EcHS_A3412 EcHS_A3413 nanT1 nanA TRUE 0.530 109.000 0.318 1.000 N NA
 3475369 3475370 EcHS_A3413 EcHS_A3414 nanA nanR FALSE 0.135 122.000 0.000 1.000 N NA
 3475372 3475373 EcHS_A3417 EcHS_A3418 sspB sspA TRUE 0.994 6.000 0.831 NA   NA
 3475373 3475374 EcHS_A3418 EcHS_A3419 sspA rpsI FALSE 0.003 395.000 0.014 NA N NA
 3475374 3475375 EcHS_A3419 EcHS_A3420 rpsI rplM TRUE 0.995 16.000 0.601 0.011 Y NA
 3475375 3475376 EcHS_A3420 EcHS_A3421 rplM   FALSE 0.011 219.000 0.003 NA   NA
 3475377 3475378 EcHS_A3422 EcHS_A3423   degQ FALSE 0.161 154.000 0.154 NA   NA
 3475378 3475379 EcHS_A3423 EcHS_A3424 degQ degS TRUE 0.911 90.000 0.262 0.002 Y NA
 3475381 3475382 EcHS_A3426 EcHS_A3427 argR ycfR FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 3475383 3475384 EcHS_A3428 EcHS_A3429   aaeB FALSE 0.105 92.000 0.027 NA   NA
 3475384 3475385 EcHS_A3429 EcHS_A3430 aaeB aaeA TRUE 0.991 6.000 0.667 NA   NA
 3475385 3475386 EcHS_A3430 EcHS_A3431 aaeA aaeX TRUE 0.901 8.000 0.100 NA   NA
 3475390 3475391 EcHS_A3435 EcHS_A3436   cafA TRUE 0.584 68.000 0.296 NA   NA
 3475391 3475392 EcHS_A3436 EcHS_A3437 cafA maf1 TRUE 0.988 -10.000 0.417 NA N NA
 3475392 3475393 EcHS_A3437 EcHS_A3438 maf1 lytS TRUE 0.948 9.000 0.206 NA N NA
 3475393 3475394 EcHS_A3438 EcHS_A3439 lytS mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 3475394 3475395 EcHS_A3439 EcHS_A3440 mreC mreB TRUE 0.864 66.000 0.689 1.000 N NA
 3475398 3475399 EcHS_A3443 EcHS_A3444     FALSE 0.256 37.000 0.000 NA   NA
 3475399 3475400 EcHS_A3444 EcHS_A3445     TRUE 0.489 18.000 0.000 NA   NA
 3475400 3475401 EcHS_A3445 EcHS_A3446     FALSE 0.089 109.000 0.000 NA   NA
 3475401 3475402 EcHS_A3446 EcHS_A3447   accB FALSE 0.002 573.000 0.000 NA   NA
 3475402 3475403 EcHS_A3447 EcHS_A3448 accB accC TRUE 0.996 11.000 0.275 0.000 Y NA
 3475403 3475404 EcHS_A3448 EcHS_A3449 accC   FALSE 0.203 109.000 0.103 NA   NA
 3475404 3475405 EcHS_A3449 EcHS_A3450   panF TRUE 0.994 -10.000 0.682 NA   NA
 3475405 3475406 EcHS_A3450 EcHS_A3451 panF prmA TRUE 0.797 12.000 0.041 1.000 N NA
 3475406 3475407 EcHS_A3451 EcHS_A3452 prmA   FALSE 0.150 65.000 0.000 NA   NA
 3475407 3475408 EcHS_A3452 EcHS_A3453   dusB FALSE 0.036 172.000 0.000 NA   NA
 3475408 3475409 EcHS_A3453 EcHS_A3454 dusB fis TRUE 0.743 26.000 0.161 1.000 N NA
 3475409 3475410 EcHS_A3454 EcHS_A3455 fis   TRUE 0.616 86.000 0.016 1.000 Y NA
 3475410 3475411 EcHS_A3455 EcHS_A3456     TRUE 0.415 57.000 0.143 NA   NA
 3475413 3475414 EcHS_A3458 EcHS_A3459 acrE acrF TRUE 0.990 12.000 0.889 1.000 N NA
 3475414 3475415 EcHS_A3459 EcHS_A3460 acrF   FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 3475415 3475416 EcHS_A3460 EcHS_A3461     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 3475416 3475417 EcHS_A3461 EcHS_A3462     FALSE 0.301 29.000 0.022 NA   NA
 3475417 3475418 EcHS_A3462 EcHS_A3463     TRUE 0.962 68.000 0.548 0.050 Y NA
 3475418 3475419 EcHS_A3463 EcHS_A3464     TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3475419 3475420 EcHS_A3464 EcHS_A3466     TRUE 0.781 8.000 0.000 NA   NA
 3475421 3475422 EcHS_A4782 EcHS_A4702 rrf   FALSE 0.245 39.000 0.000 NA   NA
 3475422 3475423 EcHS_A4702 EcHS_A4783   rrf TRUE 0.588 14.000 0.000 NA   NA
 3475423 3475424 EcHS_A4783 EcHS_A4784 rrf rrl FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 3475424 3475425 EcHS_A4784 EcHS_A4703 rrl   FALSE 0.035 174.000 0.000 NA   NA
 3475425 3475426 EcHS_A4703 EcHS_A4704     FALSE 0.230 42.000 0.000 NA   NA
 3475426 3475427 EcHS_A4704 EcHS_A4785   rrs FALSE 0.142 69.000 0.000 NA   NA
 3475429 3475430 EcHS_A3474 EcHS_A3475   aroE TRUE 0.923 -3.000 0.043 NA   NA
 3475430 3475431 EcHS_A3475 EcHS_A3476 aroE   TRUE 0.913 5.000 0.087 NA N NA
 3475431 3475432 EcHS_A3476 EcHS_A3477     TRUE 0.934 -40.000 0.137 NA N NA
 3475432 3475433 EcHS_A3477 EcHS_A3478   smg TRUE 0.825 29.000 0.331 NA   NA
 3475433 3475434 EcHS_A3478 EcHS_A3479 smg dprA TRUE 0.927 -28.000 0.124 NA   NA
 3475435 3475436 EcHS_A3480 EcHS_A3481 def fmt TRUE 0.974 15.000 0.058 0.015 Y NA
 3475436 3475437 EcHS_A3481 EcHS_A3482 fmt rsmB TRUE 0.922 46.000 0.305 1.000 Y NA
 3475437 3475438 EcHS_A3482 EcHS_A3483 rsmB trkA TRUE 0.742 22.000 0.122 1.000 N NA
 3475438 3475439 EcHS_A3483 EcHS_A3484 trkA mscL FALSE 0.132 130.000 0.035 1.000 N NA
 3475440 3475441 EcHS_A3485 EcHS_A3486   zntR TRUE 0.547 56.000 0.219 NA   NA
 3475441 3475442 EcHS_A3486 EcHS_A3487 zntR   TRUE 0.850 11.000 0.095 NA   NA
 3475442 3475443 EcHS_A3487 EcHS_A3488   rplQ FALSE 0.070 107.000 0.012 NA   NA
 3475443 3475444 EcHS_A3488 EcHS_A3489 rplQ rpoA TRUE 0.941 41.000 0.873 1.000 N NA
 3475444 3475445 EcHS_A3489 EcHS_A3490 rpoA rpsD TRUE 0.932 26.000 0.549 1.000 N NA
 3475445 3475446 EcHS_A3490 EcHS_A3491 rpsD rpsK TRUE 0.983 34.000 0.509 0.014 Y NA
 3475446 3475447 EcHS_A3491 EcHS_A3492 rpsK rpsM TRUE 0.997 17.000 0.810 0.010 Y NA
 3475447 3475448 EcHS_A3492 EcHS_A3493 rpsM rpmJ1 TRUE 0.686 147.000 0.086 0.010 Y NA
 3475448 3475449 EcHS_A3493 EcHS_A3494 rpmJ1 secY TRUE 0.449 32.000 0.036 1.000 N NA
 3475449 3475450 EcHS_A3494 EcHS_A3495 secY rplO TRUE 0.993 8.000 0.730 1.000 N NA
 3475450 3475451 EcHS_A3495 EcHS_A3496 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 3475451 3475452 EcHS_A3496 EcHS_A3497 rpmD rpsE TRUE 0.999 4.000 0.789 0.014 Y NA
 3475452 3475453 EcHS_A3497 EcHS_A3498 rpsE rplR TRUE 0.997 15.000 0.814 0.014 Y NA
 3475453 3475454 EcHS_A3498 EcHS_A3499 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.010 Y NA
 3475454 3475455 EcHS_A3499 EcHS_A3500 rplF rpsH TRUE 0.998 13.000 0.808 0.010 Y NA
 3475455 3475456 EcHS_A3500 EcHS_A3501 rpsH rpsN TRUE 0.982 34.000 0.473 0.010 Y NA
 3475456 3475457 EcHS_A3501 EcHS_A3502 rpsN rplE TRUE 0.995 15.000 0.496 0.010 Y NA
 3475457 3475458 EcHS_A3502 EcHS_A3503 rplE rplX TRUE 0.997 15.000 0.758 0.010 Y NA
 3475458 3475459 EcHS_A3503 EcHS_A3504 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.014 Y NA
 3475459 3475460 EcHS_A3504 EcHS_A3505 rplN rpsQ TRUE 0.924 165.000 0.791 0.014 Y NA
 3475460 3475461 EcHS_A3505 EcHS_A3506 rpsQ rpmC TRUE 1.000 0.000 0.828 0.010 Y NA
 3475461 3475462 EcHS_A3506 EcHS_A3507 rpmC rplP TRUE 1.000 0.000 0.802 0.010 Y NA
 3475462 3475463 EcHS_A3507 EcHS_A3508 rplP rpsC TRUE 0.998 13.000 0.828 0.014 Y NA
 3475463 3475464 EcHS_A3508 EcHS_A3509 rpsC rplV TRUE 0.996 18.000 0.719 0.014 Y NA
 3475464 3475465 EcHS_A3509 EcHS_A3510 rplV rpsS TRUE 0.997 15.000 0.769 0.014 Y NA
 3475465 3475466 EcHS_A3510 EcHS_A3511 rpsS rplB TRUE 0.997 17.000 0.820 0.014 Y NA
 3475466 3475467 EcHS_A3511 EcHS_A3512 rplB rplW TRUE 0.997 18.000 0.849 0.012 Y NA
 3475467 3475468 EcHS_A3512 EcHS_A3513 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.010 Y NA
 3475468 3475469 EcHS_A3513 EcHS_A3514 rplD rplC TRUE 0.997 11.000 0.486 0.010 Y NA
 3475469 3475470 EcHS_A3514 EcHS_A3515 rplC rpsJ TRUE 0.971 33.000 0.307 0.014 Y NA
 3475470 3475471 EcHS_A3515 EcHS_A3516 rpsJ pioO FALSE 0.013 238.000 0.000 NA   NA
 3475471 3475472 EcHS_A3516 EcHS_A3517 pioO   TRUE 0.873 2.000 0.031 NA   NA
 3475473 3475474 EcHS_A3518 EcHS_A3519 gspC2 gspD1 TRUE 0.999 -28.000 0.575 0.004 Y NA
 3475474 3475475 EcHS_A3519 EcHS_A3520 gspD1 gspE1 TRUE 0.999 10.000 0.776 0.004 Y NA
 3475475 3475476 EcHS_A3520 EcHS_A3521 gspE1 gspF1 TRUE 1.000 -3.000 0.653 0.004 Y NA
 3475476 3475477 EcHS_A3521 EcHS_A3522 gspF1 gspG1 TRUE 0.998 10.000 0.599 0.004 Y NA
 3475477 3475478 EcHS_A3522 EcHS_A3523 gspG1 gspH1 TRUE 0.998 8.000 0.425 0.004 Y NA
 3475478 3475479 EcHS_A3523 EcHS_A3524 gspH1 gspI1 TRUE 0.998 -3.000 0.605 0.004   NA
 3475479 3475480 EcHS_A3524 EcHS_A3525 gspI1 gspJ1 TRUE 0.997 -7.000 0.569 0.004   NA
 3475480 3475481 EcHS_A3525 EcHS_A3526 gspJ1 gspK1 TRUE 0.998 -7.000 0.461 1.000 Y NA
 3475481 3475482 EcHS_A3526 EcHS_A3527 gspK1 gspL1 TRUE 0.994 15.000 0.537 0.071 Y NA
 3475482 3475483 EcHS_A3527 EcHS_A3528 gspL1   TRUE 0.995 -27.000 0.811 1.000   NA
 3475483 3475484 EcHS_A3528 EcHS_A3529   gspO TRUE 0.932 0.000 0.000 1.000   NA
 3475485 3475486 EcHS_A3530 EcHS_A3531 bfr bfd TRUE 0.650 72.000 0.033 NA Y NA
 3475486 3475487 EcHS_A3531 EcHS_A3532 bfd   FALSE 0.199 50.000 0.000 NA   NA
 3475487 3475488 EcHS_A3532 EcHS_A3533   chiA TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 3475488 3475489 EcHS_A3533 EcHS_A3534 chiA   FALSE 0.116 85.000 0.000 NA   NA
 3475489 3475490 EcHS_A3534 EcHS_A3535   tuf2 FALSE 0.202 49.000 0.000 NA   NA
 3475490 3475491 EcHS_A3535 EcHS_A3536 tuf2 fusA TRUE 0.958 71.000 0.400 0.001 Y NA
 3475491 3475492 EcHS_A3536 EcHS_A3537 fusA rpsG TRUE 0.915 97.000 0.579 1.000 Y NA
 3475492 3475493 EcHS_A3537 EcHS_A3538 rpsG rpsL TRUE 0.962 97.000 0.620 0.002 Y NA
 3475493 3475494 EcHS_A3538 EcHS_A3539 rpsL dsrH FALSE 0.134 126.000 0.058 NA N NA
 3475494 3475495 EcHS_A3539 EcHS_A3540 dsrH tusC TRUE 0.998 8.000 0.804 NA Y NA
 3475495 3475496 EcHS_A3540 EcHS_A3541 tusC tusD TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 3475496 3475497 EcHS_A3541 EcHS_A3542 tusD   TRUE 0.981 0.000 0.220 NA   NA
 3475497 3475498 EcHS_A3542 EcHS_A3543   fkpA FALSE 0.270 167.000 0.310 NA   NA
 3475500 3475501 EcHS_A3545 EcHS_A3546 slyD   TRUE 0.567 95.000 0.370 NA   NA
 3475501 3475502 EcHS_A3546 EcHS_A3547   kefB TRUE 0.974 10.000 0.400 NA   NA
 3475502 3475503 EcHS_A3547 EcHS_A3548 kefB kefG TRUE 0.998 0.000 0.927 1.000   NA
 3475504 3475505 EcHS_A3549 EcHS_A3550     TRUE 0.877 0.000 0.016 NA   NA
 3475505 3475506 EcHS_A3550 EcHS_A3551     TRUE 0.978 -6.000 0.222 NA   NA
 3475506 3475507 EcHS_A3551 EcHS_A3552     TRUE 0.656 54.000 0.303 NA   NA
 3475509 3475510 EcHS_A3554 EcHS_A3555 crp   FALSE 0.399 51.000 0.111 NA   NA
 3475511 3475512 EcHS_A3556 EcHS_A3557 argD pabA TRUE 0.703 86.000 0.088 1.000 Y NA
 3475512 3475513 EcHS_A3557 EcHS_A3558 pabA fic FALSE 0.373 32.000 0.008 1.000 N NA
 3475513 3475514 EcHS_A3558 EcHS_A3559 fic ppiA FALSE 0.016 262.000 0.000 1.000 N NA
 3475515 3475516 EcHS_A3560 EcHS_A3561 tsgA nirB FALSE 0.015 263.000 0.000 1.000 N NA
 3475516 3475517 EcHS_A3561 EcHS_A3562 nirB nirD TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.000 N NA
 3475517 3475518 EcHS_A3562 EcHS_A3563 nirD nirC TRUE 0.772 127.000 0.283 1.000 Y NA
 3475518 3475519 EcHS_A3563 EcHS_A3564 nirC cysG TRUE 0.605 19.000 0.000 1.000 N NA
 3475519 3475520 EcHS_A3564 EcHS_A3565 cysG   FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 3475520 3475521 EcHS_A3565 EcHS_A3566     FALSE 0.012 244.000 0.000 NA   NA
 3475521 3475522 EcHS_A3566 EcHS_A3567     TRUE 0.992 0.000 0.375 1.000 N NA
 3475522 3475523 EcHS_A3567 EcHS_A3568     TRUE 0.859 50.000 0.600 NA N NA
 3475523 3475524 EcHS_A3568 EcHS_A3569     TRUE 0.996 -3.000 0.200 NA Y NA
 3475524 3475525 EcHS_A3569 EcHS_A3570   frlR TRUE 0.448 100.000 0.267 NA N NA
 3475526 3475527 EcHS_A3571 EcHS_A3572     TRUE 0.897 12.000 0.185 NA   NA
 3475527 3475528 EcHS_A3572 EcHS_A3573     TRUE 0.987 12.000 0.828 NA   NA
 3475528 3475529 EcHS_A3573 EcHS_A3574     TRUE 0.961 11.000 0.312 1.000   NA
 3475529 3475530 EcHS_A3574 EcHS_A3575     TRUE 0.967 -3.000 0.094 1.000   NA
 3475530 3475531 EcHS_A3575 EcHS_A3576     TRUE 0.996 0.000 0.625 NA N NA
 3475531 3475532 EcHS_A3576 EcHS_A3577     TRUE 0.454 84.000 0.233 NA   NA
 3475532 3475533 EcHS_A3577 EcHS_A3578     TRUE 0.957 17.000 0.562 NA   NA
 3475533 3475534 EcHS_A3578 EcHS_A3579     FALSE 0.360 26.000 0.000 NA   NA
 3475534 3475535 EcHS_A3579 EcHS_A3580   trpS TRUE 0.466 19.000 0.000 NA   NA
 3475535 3475536 EcHS_A3580 EcHS_A3581 trpS gph TRUE 0.962 -7.000 0.118 1.000   NA
 3475536 3475537 EcHS_A3581 EcHS_A3582 gph rpe TRUE 0.963 -7.000 0.120 1.000   NA
 3475537 3475538 EcHS_A3582 EcHS_A3583 rpe dam TRUE 0.658 18.000 0.040 1.000 N NA
 3475538 3475539 EcHS_A3583 EcHS_A3584 dam damX FALSE 0.384 107.000 0.234 NA   NA
 3475539 3475540 EcHS_A3584 EcHS_A3585 damX aroB FALSE 0.095 92.000 0.022 NA   NA
 3475540 3475541 EcHS_A3585 EcHS_A3586 aroB aroK TRUE 0.862 57.000 0.208 1.000 Y NA
 3475541 3475542 EcHS_A3586 EcHS_A3587 aroK   FALSE 0.032 401.000 0.319 1.000 N NA
 3475542 3475543 EcHS_A3587 EcHS_A3588     FALSE 0.006 306.000 0.000 NA   NA
 3475543 3475544 EcHS_A3588 EcHS_A3589     TRUE 0.982 -16.000 0.348 NA   NA
 3475544 3475545 EcHS_A3589 EcHS_A3590   hofM TRUE 0.997 0.000 0.870 NA   NA
 3475548 3475549 EcHS_A3593 EcHS_A3594     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3475549 3475550 EcHS_A3594 EcHS_A3595     FALSE 0.402 65.000 0.122 1.000   NA
 3475550 3475551 EcHS_A3595 EcHS_A3596   hslR TRUE 0.835 11.000 0.056 1.000   NA
 3475551 3475552 EcHS_A3596 EcHS_A3597 hslR hslO TRUE 0.797 19.000 0.140 1.000 N NA
 3475553 3475554 EcHS_A3598 EcHS_A3599     FALSE 0.132 76.000 0.000 NA   NA
 3475556 3475557 EcHS_A3601 EcHS_A3602 envZ ompR TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 3475558 3475559 EcHS_A3603 EcHS_A3604 greB yhgF TRUE 0.696 97.000 0.123 1.000 Y NA
 3475559 3475560 EcHS_A3604 EcHS_A3605 yhgF   FALSE 0.004 438.000 0.000 1.000 N NA
 3475560 3475561 EcHS_A3605 EcHS_A3606   feoB TRUE 0.965 17.000 0.177 1.000 Y NA
 3475561 3475562 EcHS_A3606 EcHS_A3607 feoB   TRUE 0.993 0.000 0.455 NA   NA
 3475562 3475563 EcHS_A3607 EcHS_A3608     FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 3475565 3475566 EcHS_A3610 EcHS_A3611 gntX gntY FALSE 0.318 59.000 0.066 1.000   NA
 3475566 3475567 EcHS_A3611 EcHS_A3612 gntY   FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 3475567 3475568 EcHS_A3612 EcHS_A3613   gntT TRUE 0.531 16.000 0.000 NA   NA
 3475569 3475570 EcHS_A3614 EcHS_A3615 malQ malP TRUE 0.992 10.000 0.137 0.015 Y NA
 3475572 3475573 EcHS_A3617 EcHS_A3618 rtcA rtcB TRUE 0.908 4.000 0.081 NA   NA
 3475575 3475576 EcHS_A3620 EcHS_A3621 glpR   TRUE 0.858 17.000 0.190 1.000   NA
 3475576 3475577 EcHS_A3621 EcHS_A3622   glpE TRUE 0.809 45.000 0.405 1.000   NA
 3475579 3475580 EcHS_A3624 EcHS_A3625     TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 3475580 3475581 EcHS_A3625 EcHS_A3626     TRUE 0.863 26.000 0.000 NA Y NA
 3475581 3475582 EcHS_A3626 EcHS_A3627     TRUE 0.803 -34.000 0.000 NA   NA
 3475582 3475583 EcHS_A3627 EcHS_A3628   glgP FALSE 0.076 128.000 0.000 NA   NA
 3475583 3475584 EcHS_A3628 EcHS_A3629 glgP glgA TRUE 0.967 19.000 0.228 1.000 Y NA
 3475584 3475585 EcHS_A3629 EcHS_A3630 glgA glgC TRUE 0.997 0.000 0.307 1.000 Y NA
 3475585 3475586 EcHS_A3630 EcHS_A3631 glgC glgX TRUE 0.970 18.000 0.228 1.000 Y NA
 3475586 3475587 EcHS_A3631 EcHS_A3632 glgX glgB TRUE 0.996 -3.000 0.020 0.004 Y NA
 3475587 3475588 EcHS_A3632 EcHS_A3633 glgB asd FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000 N NA
 3475590 3475591 EcHS_A3635 EcHS_A3636 gntU gntK TRUE 0.984 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3475591 3475592 EcHS_A3636 EcHS_A3637 gntK gntR FALSE 0.108 139.000 0.000 1.000 N NA
 3475592 3475593 EcHS_A3637 EcHS_A3638 gntR   FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 3475593 3475594 EcHS_A3638 EcHS_A3639     TRUE 0.531 123.000 0.400 NA   NA
 3475594 3475595 EcHS_A3639 EcHS_A4787     FALSE 0.083 121.000 0.000 NA   NA
 3475596 3475597 EcHS_A3640 EcHS_A3641     FALSE 0.020 237.000 0.000 1.000   NA
 3475597 3475598 EcHS_A3641 EcHS_A3642     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3475598 3475599 EcHS_A3642 EcHS_A3643     FALSE 0.002 450.000 0.000 NA   NA
 3475602 3475603 EcHS_A3646 EcHS_A3647   ugpC TRUE 0.966 -3.000 0.080 1.000 N NA
 3475603 3475604 EcHS_A3647 EcHS_A3648 ugpC   TRUE 0.998 2.000 0.272 0.049 Y NA
 3475604 3475605 EcHS_A3648 EcHS_A3649   ugpA TRUE 0.999 -3.000 0.306 0.049 Y NA
 3475605 3475606 EcHS_A3649 EcHS_A3650 ugpA ugpB TRUE 0.965 98.000 0.793 0.049 Y NA
 3475606 3475607 EcHS_A3650 EcHS_A3651 ugpB   FALSE 0.018 214.000 0.000 NA   NA
 3475607 3475608 EcHS_A3651 EcHS_A3652   livF FALSE 0.146 67.000 0.000 NA   NA
 3475608 3475609 EcHS_A3652 EcHS_A3653 livF livG TRUE 0.998 14.000 0.967 0.016 Y NA
 3475609 3475610 EcHS_A3653 EcHS_A3654 livG livM TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 3475610 3475611 EcHS_A3654 EcHS_A3655 livM livH TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.049 Y NA
 3475611 3475612 EcHS_A3655 EcHS_A3656 livH livK TRUE 0.890 48.000 0.217 1.000 Y NA
 3475612 3475613 EcHS_A3656 EcHS_A3657 livK   FALSE 0.157 152.000 0.143 NA   NA
 3475615 3475616 EcHS_A3659 EcHS_A3660 livJ rpoH FALSE 0.014 271.000 0.000 1.000 N NA
 3475616 3475617 EcHS_A3660 EcHS_A3661 rpoH ftsX FALSE 0.025 245.000 0.051 1.000 N NA
 3475617 3475618 EcHS_A3661 EcHS_A3662 ftsX ftsE TRUE 0.993 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 3475618 3475619 EcHS_A3662 EcHS_A3663 ftsE ftsY TRUE 0.977 3.000 0.117 0.070 N NA
 3475620 3475621 EcHS_A3664 EcHS_A3665     TRUE 0.909 -10.000 0.063 NA   NA
 3475623 3475624 EcHS_A3667 EcHS_A3668   cadA TRUE 0.749 74.000 0.325 0.071   NA
 3475626 3475627 EcHS_A3670 EcHS_A3671     FALSE 0.218 73.000 0.066 NA   NA
 3475629 3475630 EcHS_A3673 EcHS_A3674   acpT TRUE 0.648 55.000 0.300 NA   NA
 3475630 3475631 EcHS_A3674 EcHS_A3675 acpT nikA FALSE 0.145 111.000 0.000 1.000 N NA
 3475631 3475632 EcHS_A3675 EcHS_A3676 nikA nikB TRUE 1.000 0.000 0.833 0.001 Y NA
 3475632 3475633 EcHS_A3676 EcHS_A3677 nikB nikC TRUE 1.000 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 3475633 3475634 EcHS_A3677 EcHS_A3678 nikC nikD TRUE 0.999 0.000 0.409 0.001 Y NA
 3475634 3475635 EcHS_A3678 EcHS_A3679 nikD nikE TRUE 0.999 -3.000 0.290 0.001 Y NA
 3475635 3475636 EcHS_A3679 EcHS_A3680 nikE nikR TRUE 0.878 6.000 0.031 1.000 N NA
 3475636 3475637 EcHS_A3680 EcHS_A3681 nikR rhsB FALSE 0.026 203.000 0.000 NA N NA
 3475637 3475638 EcHS_A3681 EcHS_A3683 rhsB   FALSE 0.002 950.000 0.000 NA   NA
 3475639 3475640 EcHS_A3684 EcHS_A3685     TRUE 0.997 0.000 0.500 0.004   NA
 3475640 3475641 EcHS_A3685 EcHS_A3686     TRUE 0.978 -3.000 0.049 0.079   NA
 3475642 3475643 EcHS_A3687 EcHS_A3688     TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.018 Y NA
 3475644 3475645 EcHS_A3689 EcHS_A3690     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3475645 3475646 EcHS_A3690 EcHS_A3691     FALSE 0.081 123.000 0.000 NA   NA
 3475647 3475648 EcHS_A3692 EcHS_A3693 pitA   FALSE 0.182 54.000 0.000 NA   NA
 3475650 3475651 EcHS_A3695 EcHS_A3696 uspA   FALSE 0.009 318.000 0.000 1.000 N NA
 3475652 3475653 EcHS_A3697 EcHS_A3698   prlC TRUE 0.899 8.000 0.098 NA   NA
 3475654 3475655 EcHS_A3699 EcHS_A3700 yhiR gor FALSE 0.346 72.000 0.100 1.000   NA
 3475656 3475657 EcHS_A3701 EcHS_A3702     FALSE 0.011 248.000 0.000 NA   NA
 3475658 3475659 EcHS_A3703 EcHS_A3704 arsR arsB FALSE 0.281 54.000 0.000 1.000 N NA
 3475659 3475660 EcHS_A3704 EcHS_A3705 arsB arsC2 TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3475660 3475661 EcHS_A3705 EcHS_A3706 arsC2   FALSE 0.179 55.000 0.000 NA   NA
 3475661 3475662 EcHS_A3706 EcHS_A3707     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 3475662 3475663 EcHS_A3707 EcHS_A3708     FALSE 0.004 355.000 0.000 NA   NA
 3475663 3475664 EcHS_A3708 EcHS_A3709   dctR FALSE 0.081 156.000 0.000 1.000 N NA
 3475665 3475666 EcHS_A3710 EcHS_A3711   hdeB FALSE 0.152 64.000 0.000 NA   NA
 3475666 3475667 EcHS_A3711 EcHS_A3712 hdeB   FALSE 0.092 104.000 0.000 NA   NA
 3475668 3475669 EcHS_A3713 EcHS_A3714   gadE FALSE 0.002 799.000 0.000 NA   NA
 3475669 3475670 EcHS_A3714 EcHS_A3715 gadE mdtE FALSE 0.007 339.000 0.000 1.000   NA
 3475670 3475671 EcHS_A3715 EcHS_A3716 mdtE mdtF TRUE 0.510 25.000 0.000 1.000 N NA
 3475672 3475673 EcHS_A3717 EcHS_A3718 gadW   FALSE 0.137 73.000 0.000 NA   NA
 3475675 3475676 EcHS_A3719 EcHS_A3720 gadX gadA FALSE 0.006 370.000 0.000 1.000 N NA
 3475676 3475677 EcHS_A3720 EcHS_A3721 gadA   FALSE 0.033 211.000 0.000 1.000 N NA
 3475680 3475681 EcHS_A3724 EcHS_A3725     TRUE 0.451 49.000 0.098 1.000   NA
 3475681 3475682 EcHS_A3725 EcHS_A3726     FALSE 0.004 411.000 0.000 1.000   NA
 3475683 3475684 EcHS_A3727 EcHS_A3728     FALSE 0.161 70.000 0.000 NA N NA
 3475686 3475687 EcHS_A3730 EcHS_A3731   dctA FALSE 0.046 221.000 0.088 1.000   NA
 3475687 3475688 EcHS_A3731 EcHS_A3732 dctA   FALSE 0.299 183.000 0.229 0.079 N NA
 3475688 3475689 EcHS_A3732 EcHS_A3734     FALSE 0.220 115.000 0.088 1.000   NA
 3475691 3475692 EcHS_A3735 EcHS_A3736     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 3475692 3475693 EcHS_A3736 EcHS_A3737     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3475695 3475696 EcHS_A3739 EcHS_A3740 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 3475696 3475697 EcHS_A3740 EcHS_A3741 dppD dppC TRUE 0.995 11.000 0.560 1.000 Y NA
 3475697 3475698 EcHS_A3741 EcHS_A3742 dppC dppB TRUE 0.999 10.000 0.779 0.049 Y NA
 3475698 3475700 EcHS_A3742 EcHS_A3744 dppB dppA FALSE 0.158 308.000 0.087 0.049 Y NA
 3475702 3475703 EcHS_A4705 EcHS_A3747     FALSE 0.108 91.000 0.000 NA   NA
 3475703 3475704 EcHS_A3747 EcHS_A3748     FALSE 0.020 324.000 0.000 0.070   NA
 3475704 3475705 EcHS_A3748 EcHS_A3750     FALSE 0.024 229.000 0.000 1.000 N NA
 3475706 3475707 EcHS_A3749 EcHS_A3751 tag   TRUE 0.936 -3.000 0.028 1.000   NA
 3475709 3475710 EcHS_A3753 EcHS_A3754   tkrA FALSE 0.151 104.000 0.000 1.000 N NA
 3475712 3475713 EcHS_A3756 EcHS_A3757     FALSE 0.087 281.000 0.000 1.000 Y NA
 3475715 3475716 EcHS_A3759 EcHS_A3760     TRUE 0.999 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 3475717 3475718 EcHS_A3761 EcHS_A3762 glyS glyQ TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 3475718 3475719 EcHS_A3762 EcHS_A3763 glyQ   FALSE 0.075 95.000 0.010 NA   NA
 3475721 3475722 EcHS_A3765 EcHS_A3766     FALSE 0.225 46.000 0.032 NA   NA
 3475722 3475723 EcHS_A3766 EcHS_A3767   xylB FALSE 0.120 169.000 0.143 NA   NA
 3475723 3475724 EcHS_A3767 EcHS_A3768 xylB xylA TRUE 0.686 72.000 0.034 1.000 Y NA
 3475725 3475726 EcHS_A3769 EcHS_A3770 xylF xylG TRUE 0.914 78.000 0.518 NA Y NA
 3475726 3475727 EcHS_A3770 EcHS_A3771 xylG xylH TRUE 0.997 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 3475727 3475728 EcHS_A3771 EcHS_A3772 xylH xylR FALSE 0.408 78.000 0.146 1.000 N NA
 3475730 3475731 EcHS_A3774 EcHS_A3775 malS   FALSE 0.098 178.000 0.085 1.000 N NA
 3475731 3475732 EcHS_A3775 EcHS_A3776     TRUE 0.825 4.000 0.000 NA   NA
 3475733 3475734 EcHS_A3777 EcHS_A3778     TRUE 0.619 102.000 0.400 1.000 N NA
 3475735 3475736 EcHS_A3779 EcHS_A3780 dlgD   FALSE 0.221 51.000 0.000 NA N NA
 3475736 3475737 EcHS_A3780 EcHS_A3781     TRUE 0.510 118.000 0.000 NA Y NA
 3475737 3475738 EcHS_A3781 EcHS_A3782     TRUE 0.999 3.000 0.864 NA Y NA
 3475738 3475739 EcHS_A3782 EcHS_A3783     TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3475739 3475740 EcHS_A3783 EcHS_A3784   lyx TRUE 0.984 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3475740 3475741 EcHS_A3784 EcHS_A3785 lyx sgbH TRUE 0.999 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 3475741 3475742 EcHS_A3785 EcHS_A3786 sgbH   TRUE 0.997 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 3475742 3475743 EcHS_A3786 EcHS_A3787   sgbE TRUE 0.996 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 3475746 3475747 EcHS_A3790 EcHS_A3791     TRUE 0.799 6.000 0.000 NA   NA
 3475749 3475750 EcHS_A3793 EcHS_A3794 aldB adhB TRUE 0.522 165.000 0.032 0.036 Y NA
 3475750 3475751 EcHS_A3794 EcHS_A3795 adhB selB FALSE 0.040 190.000 0.015 1.000 N NA
 3475751 3475752 EcHS_A3795 EcHS_A3796 selB selA TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.000 N NA
 3475752 3475753 EcHS_A3796 EcHS_A3798 selA   FALSE 0.176 98.000 0.040 1.000 N NA
 3475754 3475755 EcHS_A3797 EcHS_A3799     FALSE 0.113 87.000 0.000 NA   NA
 3475755 3475756 EcHS_A3799 EcHS_A3801     TRUE 0.431 21.000 0.000 NA   NA
 3475756 3475757 EcHS_A3801 EcHS_A3802     FALSE 0.230 42.000 0.000 NA   NA
 3475758 3475759 EcHS_A3803 EcHS_A3804     TRUE 0.991 3.000 0.556 NA   NA
 3475760 3475761 EcHS_A3805 EcHS_A3806   mtlA FALSE 0.003 419.000 0.000 NA   NA
 3475761 3475762 EcHS_A3806 EcHS_A3807 mtlA mtlD FALSE 0.370 230.000 0.292 1.000 Y NA
 3475762 3475763 EcHS_A3807 EcHS_A3808 mtlD mtlR TRUE 0.983 0.000 0.230 NA N NA
 3475766 3475767 EcHS_A3811 EcHS_A3812     FALSE 0.052 152.000 0.000 NA   NA
 3475768 3475769 EcHS_A3813 EcHS_A3814     TRUE 0.692 44.000 0.286 NA   NA
 3475769 3475770 EcHS_A3814 EcHS_A3815   lldP FALSE 0.006 368.000 0.000 1.000 N NA
 3475770 3475771 EcHS_A3815 EcHS_A3816 lldP   TRUE 0.997 0.000 0.652 1.000 N NA
 3475771 3475772 EcHS_A3816 EcHS_A3817   lldD TRUE 0.990 -3.000 0.309 1.000 N NA
 3475772 3475773 EcHS_A3817 EcHS_A3818 lldD   FALSE 0.076 154.000 0.020 1.000 N NA
 3475774 3475775 EcHS_A3819 EcHS_A3820 cysE   TRUE 0.709 80.000 0.429 1.000 N NA
 3475775 3475776 EcHS_A3820 EcHS_A3821   secB TRUE 0.984 0.000 0.206 1.000 N NA
 3475776 3475777 EcHS_A3821 EcHS_A3822 secB grxC FALSE 0.264 63.000 0.038 1.000 N NA
 3475777 3475778 EcHS_A3822 EcHS_A3823 grxC   FALSE 0.093 142.000 0.048 NA N NA
 3475779 3475780 EcHS_A3824 EcHS_A3825 gpmI   TRUE 0.941 10.000 0.170 1.000 N NA
 3475780 3475781 EcHS_A3825 EcHS_A3826     TRUE 0.934 4.000 0.088 1.000   NA
 3475782 3475783 EcHS_A3827 EcHS_A3828   tdh FALSE 0.014 239.000 0.000 NA N NA
 3475783 3475784 EcHS_A3828 EcHS_A3829 tdh kbl TRUE 0.986 10.000 0.547 1.000 N NA
 3475785 3475786 EcHS_A3830 EcHS_A3831 rfaD rfaF TRUE 0.985 10.000 0.146 1.000 Y NA
 3475786 3475787 EcHS_A3831 EcHS_A3832 rfaF rfaC TRUE 0.997 4.000 0.205 0.001 Y NA
 3475788 3475789 EcHS_A3833 EcHS_A3834     TRUE 0.463 46.000 0.133 NA   NA
 3475789 3475790 EcHS_A3834 EcHS_A3835   waaW TRUE 0.596 85.000 0.000 NA Y NA
 3475790 3475791 EcHS_A3835 EcHS_A3836 waaW rfaY TRUE 0.465 26.000 0.000 1.000   NA
 3475791 3475792 EcHS_A3836 EcHS_A3837 rfaY rfaJ2 TRUE 0.976 10.000 0.375 1.000   NA
 3475792 3475793 EcHS_A3837 EcHS_A3838 rfaJ2 rfaI TRUE 0.998 17.000 0.833 0.001 Y NA
 3475793 3475794 EcHS_A3838 EcHS_A3839 rfaI rfaP TRUE 0.637 16.000 0.000 1.000   NA
 3475794 3475795 EcHS_A3839 EcHS_A3840 rfaP rfaG TRUE 0.915 -7.000 0.000 1.000   NA
 3475795 3475796 EcHS_A3840 EcHS_A3841 rfaG rfaQ TRUE 0.994 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 3475797 3475798 EcHS_A3842 EcHS_A3843 waaA coaD TRUE 0.850 8.000 0.020 1.000 N NA
 3475799 3475800 EcHS_A3844 EcHS_A3845 mutM rpmG FALSE 0.168 98.000 0.034 1.000 N NA
 3475800 3475801 EcHS_A3845 EcHS_A3846 rpmG rpmB TRUE 0.986 21.000 0.332 0.010 Y NA
 3475801 3475802 EcHS_A3846 EcHS_A3847 rpmB radC FALSE 0.023 217.000 0.002 1.000 N NA
 3475803 3475804 EcHS_A3848 EcHS_A3849 coaBC dut TRUE 0.968 -19.000 0.201 1.000 N NA
 3475804 3475805 EcHS_A3849 EcHS_A3850 dut   FALSE 0.200 107.000 0.060 1.000 N NA
 3475806 3475807 EcHS_A3851 EcHS_A3852 pyrE rph FALSE 0.218 66.000 0.022 1.000 N NA
 3475810 3475811 EcHS_A3855 EcHS_A3857 dinD   FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 3475813 3475814 EcHS_A3859 EcHS_A3860 gmk rpoZ TRUE 0.809 55.000 0.471 1.000 N NA
 3475814 3475815 EcHS_A3860 EcHS_A3861 rpoZ spoT TRUE 0.973 19.000 0.291 1.000 Y NA
 3475815 3475816 EcHS_A3861 EcHS_A3862 spoT trmH TRUE 0.929 7.000 0.095 1.000 N NA
 3475816 3475817 EcHS_A3862 EcHS_A3863 trmH recG TRUE 0.920 6.000 0.076 1.000 N NA
 3475819 3475820 EcHS_A3865 EcHS_A3866 yicE   FALSE 0.386 121.000 0.257 NA   NA
 3475821 3475822 EcHS_A3867 EcHS_A3868 yicI   TRUE 0.974 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3475823 3475824 EcHS_A4706 EcHS_A3870     FALSE 0.091 106.000 0.000 NA   NA
 3475824 3475825 EcHS_A3870 EcHS_A3871   setC FALSE 0.003 382.000 0.000 NA   NA
 3475825 3475826 EcHS_A3871 EcHS_A3872 setC   TRUE 0.683 111.000 0.000 0.070 Y NA
 3475829 3475830 EcHS_A3875 EcHS_A3876 nepI   TRUE 0.644 46.000 0.250 NA   NA
 3475830 3475831 EcHS_A3876 EcHS_A3877     FALSE 0.186 53.000 0.000 NA   NA
 3475833 3475834 EcHS_A3879 EcHS_A3880 uhpT uhpC TRUE 0.626 138.000 0.000 0.049 Y NA
 3475834 3475835 EcHS_A3880 EcHS_A3881 uhpC uhpB TRUE 0.928 10.000 0.000 0.070 N NA
 3475835 3475836 EcHS_A3881 EcHS_A3882 uhpB uhpA TRUE 0.989 9.000 0.000 0.012 Y NA
 3475836 3475837 EcHS_A3882 EcHS_A3883 uhpA ilvN FALSE 0.362 75.000 0.118 1.000   NA
 3475837 3475838 EcHS_A3883 EcHS_A3884 ilvN ilvB TRUE 0.997 4.000 0.649 0.001   NA
 3475838 3475839 EcHS_A3884 EcHS_A3885 ilvB ivbL FALSE 0.357 106.000 0.216 NA   NA
 3475841 3475842 EcHS_A3887 EcHS_A3888     TRUE 0.993 -3.000 0.429 NA   NA
 3475842 3475843 EcHS_A3888 EcHS_A3889     TRUE 0.992 -10.000 0.571 NA   NA
 3475843 3475844 EcHS_A3889 EcHS_A3890     FALSE 0.037 170.000 0.000 NA   NA
 3475846 3475847 EcHS_A3893 EcHS_A3894 glvA   TRUE 0.997 0.000 0.309 1.000 Y NA
 3475851 3475852 EcHS_A3898 EcHS_A3899 ibpB ibpA TRUE 0.614 112.000 0.099 NA Y NA
 3475856 3475857 EcHS_A3903 EcHS_A3904     TRUE 0.491 75.000 0.192 1.000 N NA
 3475857 3475858 EcHS_A3904 EcHS_A3905     TRUE 0.996 -3.000 0.385 0.025 N NA
 3475858 3475859 EcHS_A3905 EcHS_A3906   dgoK TRUE 0.999 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 3475859 3475860 EcHS_A3906 EcHS_A3907 dgoK dgoR TRUE 0.997 -3.000 0.733 1.000 N NA
 3475862 3475863 EcHS_A3909 EcHS_A3910 yidA   FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 3475865 3475866 EcHS_A3912 EcHS_A3913 gyrB recF TRUE 0.974 29.000 0.249 0.003 Y NA
 3475866 3475867 EcHS_A3913 EcHS_A3914 recF dnaN TRUE 0.998 0.000 0.318 1.000 Y NA
 3475867 3475868 EcHS_A3914 EcHS_A3915 dnaN dnaA TRUE 0.995 5.000 0.328 1.000 Y NA
 3475869 3475870 EcHS_A3916 EcHS_A3917 rpmH rnpA TRUE 0.977 17.000 0.787 1.000   NA
 3475870 3475871 EcHS_A3917 EcHS_A3918 rnpA   TRUE 0.988 -36.000 0.540 NA   NA
 3475871 3475872 EcHS_A3918 EcHS_A3919     TRUE 0.988 3.000 0.461 NA   NA
 3475872 3475873 EcHS_A3919 EcHS_A3920   trmE FALSE 0.409 106.000 0.221 1.000   NA
 3475873 3475874 EcHS_A3920 EcHS_A3921 trmE tnaC FALSE 0.018 243.000 0.000 1.000   NA
 3475874 3475875 EcHS_A3921 EcHS_A3922 tnaC tnaA FALSE 0.041 221.000 0.077 1.000   NA
 3475875 3475876 EcHS_A3922 EcHS_A3923 tnaA tnaB TRUE 0.744 91.000 0.154 1.000 Y NA
 3475876 3475877 EcHS_A3923 EcHS_A3924 tnaB mdtL FALSE 0.117 133.000 0.000 1.000 N NA
 3475877 3475878 EcHS_A3924 EcHS_A3925 mdtL   TRUE 0.990 -25.000 0.526 1.000 N NA
 3475878 3475879 EcHS_A3925 EcHS_A3926     FALSE 0.161 157.000 0.114 1.000 N NA
 3475879 3475880 EcHS_A3926 EcHS_A3927     TRUE 0.579 22.000 0.074 NA   NA
 3475882 3475883 EcHS_A3929 EcHS_A3930 yieH   FALSE 0.146 67.000 0.000 NA   NA
 3475883 3475884 EcHS_A3930 EcHS_A3931     FALSE 0.202 49.000 0.000 NA   NA
 3475885 3475886 EcHS_A3932 EcHS_A3933     TRUE 0.559 15.000 0.000 NA   NA
 3475886 3475887 EcHS_A3933 EcHS_A3934   bglH FALSE 0.093 102.000 0.000 NA   NA
 3475887 3475888 EcHS_A3934 EcHS_A3935 bglH   TRUE 0.902 69.000 0.364 1.000 Y NA
 3475888 3475889 EcHS_A3935 EcHS_A3936   bglF TRUE 0.988 19.000 0.562 1.000 Y NA
 3475889 3475890 EcHS_A3936 EcHS_A3937 bglF   TRUE 0.442 134.000 0.312 1.000   NA
 3475892 3475893 EcHS_A3939 EcHS_A3940 phoU pstB TRUE 0.981 15.000 0.317 NA Y NA
 3475893 3475894 EcHS_A3940 EcHS_A3941 pstB pstA TRUE 0.859 183.000 0.526 0.001 Y NA
 3475894 3475895 EcHS_A3941 EcHS_A3942 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 3475895 3475896 EcHS_A3942 EcHS_A3943 pstC pstS TRUE 0.878 86.000 0.145 0.001 Y NA
 3475896 3475897 EcHS_A3943 EcHS_A3944 pstS glmS FALSE 0.010 314.000 0.000 1.000 N NA
 3475897 3475898 EcHS_A3944 EcHS_A3945 glmS glmU TRUE 0.416 162.000 0.055 1.000 Y NA
 3475898 3475899 EcHS_A3945 EcHS_A3946 glmU   FALSE 0.179 55.000 0.000 NA   NA
 3475899 3475900 EcHS_A3946 EcHS_A3947   atpC FALSE 0.019 212.000 0.000 NA   NA
 3475900 3475901 EcHS_A3947 EcHS_A3948 atpC atpD TRUE 0.996 21.000 0.837 0.002 Y NA
 3475901 3475902 EcHS_A3948 EcHS_A3949 atpD atpG TRUE 0.994 27.000 0.724 0.002 Y NA
 3475902 3475903 EcHS_A3949 EcHS_A3950 atpG atpA TRUE 0.989 51.000 0.846 0.002 Y NA
 3475903 3475904 EcHS_A3950 EcHS_A3951 atpA atpH TRUE 0.998 13.000 0.864 0.002 Y NA
 3475904 3475905 EcHS_A3951 EcHS_A3952 atpH atpF TRUE 0.990 15.000 0.242 0.002 Y NA
 3475905 3475906 EcHS_A3952 EcHS_A3953 atpF atpE TRUE 0.979 62.000 0.666 0.002 Y NA
 3475906 3475907 EcHS_A3953 EcHS_A3954 atpE atpB TRUE 0.981 47.000 0.557 0.002 Y NA
 3475907 3475908 EcHS_A3954 EcHS_A3955 atpB atpI TRUE 0.997 9.000 0.291 0.002 Y NA
 3475908 3475909 EcHS_A3955 EcHS_A3956 atpI gidB FALSE 0.002 617.000 0.005 1.000 N NA
 3475909 3475910 EcHS_A3956 EcHS_A3957 gidB gidA TRUE 0.774 64.000 0.466 1.000 N NA
 3475910 3475911 EcHS_A3957 EcHS_A3958 gidA mioC FALSE 0.006 379.000 0.000 1.000 N NA
 3475911 3475912 EcHS_A3958 EcHS_A3959 mioC asnC FALSE 0.392 90.000 0.165 1.000 N NA
 3475914 3475915 EcHS_A3961 EcHS_A3962     TRUE 0.991 -6.000 0.443 NA   NA
 3475916 3475917 EcHS_A3963 EcHS_A3964 kup rbsD FALSE 0.068 167.000 0.000 1.000 N NA
 3475917 3475918 EcHS_A3964 EcHS_A3965 rbsD rbsA TRUE 0.995 8.000 0.337 1.000 Y NA
 3475918 3475919 EcHS_A3965 EcHS_A3966 rbsA rbsC TRUE 0.997 5.000 0.504 1.000 Y NA
 3475919 3475920 EcHS_A3966 EcHS_A3967 rbsC rbsB TRUE 0.986 31.000 0.847 NA Y NA
 3475920 3475921 EcHS_A3967 EcHS_A3968 rbsB rbsK TRUE 0.796 126.000 0.347 NA Y NA
 3475921 3475922 EcHS_A3968 EcHS_A3969 rbsK   TRUE 0.825 4.000 0.000 NA   NA
 3475923 3475924 EcHS_A3970 EcHS_A3971     TRUE 0.831 57.000 0.000 0.054 Y NA
 3475926 3475927 EcHS_A3973 EcHS_A3974     TRUE 0.687 23.000 0.100 1.000   NA
 3475928 3475929 EcHS_A4789 EcHS_A4707 rrs   FALSE 0.116 85.000 0.000 NA   NA
 3475929 3475930 EcHS_A4707 EcHS_A4790   rrl FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 3475930 3475931 EcHS_A4790 EcHS_A4791 rrl rrf FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 3475931 3475932 EcHS_A4791 EcHS_A4708 rrf   FALSE 0.182 54.000 0.000 NA   NA
 3475932 3475933 EcHS_A4708 EcHS_A4709     TRUE 0.791 7.000 0.000 NA   NA
 3475937 3475938 EcHS_A3984 EcHS_A3985 ilvL ilvG FALSE 0.399 140.000 0.091 0.002   NA
 3475938 3475939 EcHS_A3985 EcHS_A3986 ilvG ilvM TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.001   NA
 3475939 3475940 EcHS_A3986 EcHS_A3987 ilvM ilvE TRUE 0.835 20.000 0.205 1.000   NA
 3475940 3475941 EcHS_A3987 EcHS_A3988 ilvE ilvD TRUE 0.750 65.000 0.075 1.000 Y NA
 3475941 3475942 EcHS_A3988 EcHS_A3989 ilvD ilvA TRUE 0.991 3.000 0.106 1.000 Y NA
 3475945 3475946 EcHS_A3992 EcHS_A3993 ppiC   FALSE 0.023 199.000 0.000 NA   NA
 3475948 3475949 EcHS_A3995 EcHS_A3996 gppA rhlB TRUE 0.539 136.000 0.406 1.000 N NA
 3475950 3475951 EcHS_A3997 EcHS_A3998 trx   FALSE 0.043 141.000 0.004 NA   NA
 3475951 3475952 EcHS_A3998 EcHS_A3999   rho FALSE 0.079 85.000 0.002 NA   NA
 3475952 3475953 EcHS_A3999 EcHS_A4000 rho   TRUE 0.743 10.000 0.000 NA   NA
 3475953 3475954 EcHS_A4000 EcHS_A4001   wecA TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3475954 3475955 EcHS_A4001 EcHS_A4002 wecA   TRUE 0.998 12.000 0.735 0.003 Y NA
 3475955 3475956 EcHS_A4002 EcHS_A4003     TRUE 0.982 56.000 0.677 0.003 Y NA
 3475956 3475957 EcHS_A4003 EcHS_A4004   wecC TRUE 0.998 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 3475957 3475958 EcHS_A4004 EcHS_A4005 wecC rfbB2 TRUE 0.997 0.000 0.273 1.000 Y NA
 3475958 3475959 EcHS_A4005 EcHS_A4006 rfbB2 rfbA1 TRUE 0.996 19.000 0.739 0.002 Y NA
 3475959 3475960 EcHS_A4006 EcHS_A4007 rfbA1 wecD FALSE 0.304 107.000 0.145 1.000   NA
 3475960 3475961 EcHS_A4007 EcHS_A4008 wecD wecE TRUE 0.971 5.000 0.248 1.000   NA
 3475961 3475962 EcHS_A4008 EcHS_A4009 wecE   TRUE 0.978 2.000 0.218 1.000   NA
 3475962 3475963 EcHS_A4009 EcHS_A4010   wecF TRUE 0.996 -3.000 0.605 1.000   NA
 3475963 3475964 EcHS_A4010 EcHS_A4011 wecF wzyE TRUE 0.997 -3.000 0.684 1.000   NA
 3475964 3475965 EcHS_A4011 EcHS_A4012 wzyE   TRUE 0.955 3.000 0.126 1.000   NA
 3475967 3475968 EcHS_A4014 EcHS_A4710     FALSE 0.093 103.000 0.000 NA   NA
 3475968 3475969 EcHS_A4710 EcHS_A4711     FALSE 0.166 58.000 0.000 NA   NA
 3475969 3475970 EcHS_A4711 EcHS_A4712     TRUE 0.466 19.000 0.000 NA   NA
 3475970 3475971 EcHS_A4712 EcHS_A4713     FALSE 0.235 41.000 0.000 NA   NA
 3475971 3475972 EcHS_A4713 EcHS_A4019   aslB FALSE 0.058 146.000 0.000 NA   NA
 3475973 3475974 EcHS_A4020 EcHS_A4021     FALSE 0.060 143.000 0.000 NA   NA
 3475976 3475977 EcHS_A4022 EcHS_A4023 hemY   TRUE 0.992 3.000 0.144 1.000 Y NA
 3475977 3475978 EcHS_A4023 EcHS_A4024   hemD TRUE 0.987 22.000 0.600 1.000 Y NA
 3475978 3475979 EcHS_A4024 EcHS_A4025 hemD hemC TRUE 0.999 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 3475981 3475982 EcHS_A4028 EcHS_A4029 cyaY   FALSE 0.205 48.000 0.000 NA   NA
 3475982 3475983 EcHS_A4029 EcHS_A4030     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3475983 3475984 EcHS_A4030 EcHS_A4031     FALSE 0.113 88.000 0.000 NA   NA
 3475984 3475985 EcHS_A4031 EcHS_A4032     FALSE 0.042 165.000 0.000 NA   NA
 3475986 3475987 EcHS_A4033 EcHS_A4034   dapF FALSE 0.264 37.000 0.021 NA N NA
 3475987 3475988 EcHS_A4034 EcHS_A4035 dapF   TRUE 0.976 -3.000 0.175 NA   NA
 3475988 3475989 EcHS_A4035 EcHS_A4036   xerC TRUE 0.997 -3.000 0.714 NA   NA
 3475989 3475990 EcHS_A4036 EcHS_A4037 xerC   TRUE 0.992 0.000 0.367 1.000   NA
 3475990 3475991 EcHS_A4037 EcHS_A4038   uvrD FALSE 0.345 84.000 0.128 1.000   NA
 3475993 3475994 EcHS_A4039 EcHS_A4041   corA FALSE 0.012 244.000 0.000 NA   NA
 3475995 3475996 EcHS_A4042 EcHS_A4043   rarD FALSE 0.002 489.000 0.000 NA   NA
 3475996 3475997 EcHS_A4043 EcHS_A4044 rarD   FALSE 0.372 52.000 0.099 NA   NA
 3475998 3475999 EcHS_A4045 EcHS_A4046 pldA recQ FALSE 0.156 133.000 0.057 1.000 N NA
 3475999 3476000 EcHS_A4046 EcHS_A4047 recQ rhtC FALSE 0.256 70.000 0.043 1.000 N NA
 3476002 3476003 EcHS_A4049 EcHS_A4050 pldB   TRUE 0.987 8.000 0.524 1.000   NA
 3476003 3476004 EcHS_A4050 EcHS_A4051     FALSE 0.269 76.000 0.067 1.000   NA
 3476008 3476009 EcHS_A4055 EcHS_A4056 udp rmuC FALSE 0.077 141.000 0.041 NA   NA
 3476009 3476010 EcHS_A4056 EcHS_A4057 rmuC ubiE FALSE 0.133 95.000 0.047 NA   NA
 3476010 3476011 EcHS_A4057 EcHS_A4058 ubiE   TRUE 0.862 14.000 0.145 1.000   NA
 3476011 3476012 EcHS_A4058 EcHS_A4059   ubiB TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 3476012 3476013 EcHS_A4059 EcHS_A4060 ubiB tatA FALSE 0.189 79.000 0.032 1.000   NA
 3476013 3476014 EcHS_A4060 EcHS_A4061 tatA tatB TRUE 0.996 4.000 0.188 0.004 Y NA
 3476014 3476015 EcHS_A4061 EcHS_A4062 tatB tatC TRUE 0.996 3.000 0.333 NA Y NA
 3476015 3476016 EcHS_A4062 EcHS_A4063 tatC tatD TRUE 0.489 42.000 0.121 NA N NA
 3476018 3476019 EcHS_A4065 EcHS_A4066 ubiD fre TRUE 0.811 46.000 0.090 NA Y NA
 3476019 3476020 EcHS_A4066 EcHS_A4067 fre   FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 3476021 3476022 EcHS_A4068 EcHS_A4069 fadA fadB TRUE 0.997 10.000 0.607 1.000 Y NA
 3476023 3476024 EcHS_A4070 EcHS_A4071 pepQ   TRUE 0.974 -3.000 0.127 1.000   NA
 3476024 3476025 EcHS_A4071 EcHS_A4072   trkH TRUE 0.667 39.000 0.202 1.000   NA
 3476025 3476026 EcHS_A4072 EcHS_A4073 trkH hemG TRUE 0.972 12.000 0.455 1.000 N NA
 3476026 3476027 EcHS_A4073 EcHS_A4793 hemG rrs FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 3476027 3476028 EcHS_A4793 EcHS_A4714 rrs   FALSE 0.142 69.000 0.000 NA   NA
 3476028 3476029 EcHS_A4714 EcHS_A4715     FALSE 0.230 42.000 0.000 NA   NA
 3476029 3476030 EcHS_A4715 EcHS_A4794   rrl FALSE 0.030 183.000 0.000 NA   NA
 3476030 3476031 EcHS_A4794 EcHS_A4795 rrl rrf FALSE 0.027 189.000 0.000 NA   NA
 3476032 3476033 EcHS_A4079 EcHS_A4080 mobB mobA TRUE 0.994 -18.000 0.064 0.002 Y NA
 3476034 3476035 EcHS_A4081 EcHS_A4082     FALSE 0.284 77.000 0.106 NA   NA
 3476035 3476036 EcHS_A4082 EcHS_A4083   dsbA TRUE 0.740 17.000 0.111 NA   NA
 3476036 3476037 EcHS_A4083 EcHS_A4084 dsbA   FALSE 0.373 25.000 0.000 NA   NA
 3476037 3476038 EcHS_A4084 EcHS_A4085     TRUE 0.854 -10.000 0.000 NA   NA
 3476039 3476040 EcHS_A4086 EcHS_A4087     FALSE 0.057 147.000 0.000 NA   NA
 3476041 3476042 EcHS_A4088 EcHS_A4796 polA spf FALSE 0.066 138.000 0.000 NA   NA
 3476044 3476045 EcHS_A4797 EcHS_A4091     FALSE 0.166 58.000 0.000 NA   NA
 3476045 3476046 EcHS_A4091 EcHS_A4092   hemN FALSE 0.071 189.000 0.107 NA   NA
 3476047 3476048 EcHS_A4093 EcHS_A4094     TRUE 0.831 -16.000 0.000 NA   NA
 3476048 3476049 EcHS_A4094 EcHS_A4095   ntrC FALSE 0.065 112.000 0.010 NA   NA
 3476049 3476050 EcHS_A4095 EcHS_A4096 ntrC glnL TRUE 0.997 12.000 0.587 0.058 Y NA
 3476050 3476051 EcHS_A4096 EcHS_A4097 glnL glnA FALSE 0.016 286.000 0.053 1.000 N NA
 3476052 3476053 EcHS_A4098 EcHS_A4099 typA   FALSE 0.081 217.000 0.000 0.036 N NA
 3476053 3476054 EcHS_A4099 EcHS_A4100     TRUE 0.992 8.000 0.800 NA   NA
 3476054 3476055 EcHS_A4100 EcHS_A4101     TRUE 0.805 102.000 0.833 NA   NA
 3476056 3476057 EcHS_A4102 EcHS_A4103     TRUE 0.985 40.000 1.000 1.000 Y NA
 3476058 3476059 EcHS_A4104 EcHS_A4105     TRUE 0.712 25.000 0.125 1.000 N NA
 3476059 3476060 EcHS_A4105 EcHS_A4106     TRUE 0.713 33.000 0.188 1.000 N NA
 3476060 3476061 EcHS_A4106 EcHS_A4107     FALSE 0.327 70.000 0.079 1.000 N NA
 3476061 3476062 EcHS_A4107 EcHS_A4108     FALSE 0.368 99.000 0.053 0.048   NA
 3476062 3476063 EcHS_A4108 EcHS_A4109     TRUE 0.986 -10.000 0.333 1.000   NA
 3476063 3476064 EcHS_A4109 EcHS_A4110   yihX FALSE 0.093 141.000 0.000 1.000   NA
 3476064 3476065 EcHS_A4110 EcHS_A4111 yihX rbn TRUE 0.922 -6.000 0.000 1.000   NA
 3476065 3476066 EcHS_A4111 EcHS_A4112 rbn dtd TRUE 0.959 -3.000 0.069 1.000   NA
 3476066 3476067 EcHS_A4112 EcHS_A4113 dtd   FALSE 0.398 45.000 0.065 1.000   NA
 3476069 3476070 EcHS_A4115 EcHS_A4117     FALSE 0.017 218.000 0.000 NA   NA
 3476071 3476072 EcHS_A4118 EcHS_A4119   fdhE FALSE 0.003 400.000 0.000 NA N NA
 3476072 3476073 EcHS_A4119 EcHS_A4120 fdhE fdoI TRUE 0.978 -3.000 0.182 NA N NA
 3476073 3476074 EcHS_A4120 EcHS_A4121 fdoI fdoH TRUE 1.000 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 3476074 3476075 EcHS_A4121 EcHS_A4122 fdoH fdoG TRUE 0.998 13.000 0.833 0.001 Y NA
 3476076 3476077 EcHS_A4123 EcHS_A4124 fdhD   FALSE 0.128 153.000 0.080 1.000   NA
 3476078 3476079 EcHS_A4125 EcHS_A4126     TRUE 0.993 0.000 0.400 1.000 N NA
 3476079 3476080 EcHS_A4126 EcHS_A4127     TRUE 0.999 -10.000 0.667 1.000 Y NA
 3476080 3476081 EcHS_A4127 EcHS_A4128     TRUE 0.985 11.000 0.000 0.008 Y NA
 3476081 3476082 EcHS_A4128 EcHS_A4129   rhaU FALSE 0.006 301.000 0.000 NA   NA
 3476082 3476083 EcHS_A4129 EcHS_A4130 rhaU rhaD TRUE 0.889 10.000 0.112 NA   NA
 3476083 3476084 EcHS_A4130 EcHS_A4132 rhaD rhaA FALSE 0.231 267.000 0.247 1.000 Y NA
 3476084 3476085 EcHS_A4132 EcHS_A4133 rhaA rhaB TRUE 0.998 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 3476086 3476087 EcHS_A4134 EcHS_A4135   rhaS FALSE 0.160 60.000 0.000 NA   NA
 3476087 3476088 EcHS_A4135 EcHS_A4136 rhaS rhaR TRUE 0.999 -16.000 0.800 0.017 Y NA
 3476092 3476093 EcHS_A4140 EcHS_A4141 kdgT   FALSE 0.083 149.000 0.000 1.000   NA
 3476094 3476095 EcHS_A4142 EcHS_A4143 cpxA cpxR TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 3476096 3476097 EcHS_A4144 EcHS_A4145 cpxP fieF FALSE 0.399 149.000 0.031 NA Y NA
 3476097 3476098 EcHS_A4145 EcHS_A4146 fieF pfkA FALSE 0.062 181.000 0.040 1.000 N NA
 3476098 3476099 EcHS_A4146 EcHS_A4147 pfkA   FALSE 0.239 40.000 0.000 NA   NA
 3476099 3476100 EcHS_A4147 EcHS_A4148   sbp FALSE 0.119 83.000 0.000 NA   NA
 3476100 3476101 EcHS_A4148 EcHS_A4149 sbp cdh FALSE 0.148 107.000 0.000 1.000 N NA
 3476102 3476103 EcHS_A4150 EcHS_A4151 tpiA   FALSE 0.137 108.000 0.058 NA   NA
 3476104 3476105 EcHS_A4152 EcHS_A4153     FALSE 0.019 212.000 0.000 NA   NA
 3476105 3476106 EcHS_A4153 EcHS_A4154   uspD FALSE 0.349 27.000 0.000 NA   NA
 3476107 3476108 EcHS_A4155 EcHS_A4156 fpr glpX1 FALSE 0.298 97.000 0.117 1.000 N NA
 3476108 3476109 EcHS_A4156 EcHS_A4157 glpX1 glpK FALSE 0.109 135.000 0.025 1.000 N NA
 3476109 3476110 EcHS_A4157 EcHS_A4158 glpK glpF TRUE 0.474 23.000 0.004 1.000 N NA
 3476111 3476112 EcHS_A4159 EcHS_A4160     FALSE 0.095 93.000 0.023 NA   NA
 3476113 3476114 EcHS_A4161 EcHS_A4162 rraA menA TRUE 0.710 93.000 0.158 NA Y NA
 3476114 3476115 EcHS_A4162 EcHS_A4163 menA hslU FALSE 0.279 67.000 0.051 1.000 N NA
 3476115 3476116 EcHS_A4163 EcHS_A4164 hslU hslV TRUE 0.998 10.000 0.752 1.000 Y NA
 3476116 3476117 EcHS_A4164 EcHS_A4165 hslV ftsN FALSE 0.320 93.000 0.122 1.000 N NA
 3476117 3476118 EcHS_A4165 EcHS_A4166 ftsN cytR TRUE 0.495 92.000 0.245 1.000 N NA
 3476118 3476119 EcHS_A4166 EcHS_A4167 cytR priA FALSE 0.077 150.000 0.013 1.000 N NA
 3476121 3476122 EcHS_A4169 EcHS_A4170     TRUE 0.791 7.000 0.000 NA   NA
 3476125 3476126 EcHS_A4172 EcHS_A4174 metB metL TRUE 0.997 3.000 0.428 1.000 Y NA
 3476126 3476127 EcHS_A4174 EcHS_A4175 metL metF FALSE 0.051 349.000 0.017 1.000 Y NA
 3476127 3476128 EcHS_A4175 EcHS_A4176 metF katG FALSE 0.007 329.000 0.010 1.000 N NA
 3476128 3476129 EcHS_A4176 EcHS_A4177 katG   FALSE 0.127 93.000 0.012 1.000   NA
 3476130 3476131 EcHS_A4178 EcHS_A4179     FALSE 0.006 310.000 0.000 NA   NA
 3476131 3476132 EcHS_A4179 EcHS_A4180   gldA FALSE 0.015 264.000 0.000 1.000 N NA
 3476132 3476133 EcHS_A4180 EcHS_A4181 gldA fsaB TRUE 0.985 11.000 0.600 1.000 N NA
 3476133 3476134 EcHS_A4181 EcHS_A4182 fsaB ptsA TRUE 0.962 12.000 0.000 1.000 Y NA
 3476135 3476136 EcHS_A4183 EcHS_A4184     TRUE 0.993 15.000 0.400 0.009 Y NA
 3476136 3476137 EcHS_A4184 EcHS_A4185     TRUE 0.699 51.000 0.280 1.000 N NA
 3476137 3476138 EcHS_A4185 EcHS_A4186     TRUE 0.991 -34.000 0.312 0.002 N NA
 3476138 3476139 EcHS_A4186 EcHS_A4187     TRUE 0.970 2.000 0.156 1.000 N NA
 3476140 3476141 EcHS_A4188 EcHS_A4189     FALSE 0.066 215.000 0.130 1.000   NA
 3476141 3476142 EcHS_A4189 EcHS_A4190   ppc FALSE 0.047 182.000 0.000 1.000   NA
 3476142 3476143 EcHS_A4190 EcHS_A4191 ppc argE FALSE 0.010 352.000 0.053 1.000 N NA
 3476144 3476145 EcHS_A4192 EcHS_A4193 argC argB TRUE 0.990 11.000 0.097 0.002 Y NA
 3476145 3476146 EcHS_A4193 EcHS_A4194 argB argH TRUE 0.698 61.000 0.017 1.000 Y NA
 3476150 3476151 EcHS_A4197 EcHS_A4198 fabR   TRUE 0.977 0.000 0.194 NA   NA
 3476153 3476154 EcHS_A4200 EcHS_A4201 btuB murI TRUE 0.866 -55.000 0.025 1.000 N NA
 3476154 3476155 EcHS_A4201 EcHS_A4800 murI rrs FALSE 0.003 374.000 0.000 NA   NA
 3476155 3476156 EcHS_A4800 EcHS_A4716 rrs   FALSE 0.116 85.000 0.000 NA   NA
 3476156 3476157 EcHS_A4716 EcHS_A4801   rrl FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 3476157 3476158 EcHS_A4801 EcHS_A4802 rrl rrf FALSE 0.099 96.000 0.000 NA   NA
 3476158 3476159 EcHS_A4802 EcHS_A4206 rrf murB FALSE 0.006 303.000 0.000 NA   NA
 3476159 3476160 EcHS_A4206 EcHS_A4207 murB birA TRUE 0.985 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3476162 3476163 EcHS_A4717 EcHS_A4718     TRUE 0.781 8.000 0.000 NA   NA
 3476163 3476164 EcHS_A4718 EcHS_A4719     FALSE 0.085 117.000 0.000 NA   NA
 3476164 3476165 EcHS_A4719 EcHS_A4720     TRUE 0.799 6.000 0.000 NA   NA
 3476165 3476166 EcHS_A4720 EcHS_A4213   tuf1 FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 3476166 3476167 EcHS_A4213 EcHS_A4214 tuf1 secE FALSE 0.019 230.000 0.009 1.000 N NA
 3476167 3476168 EcHS_A4214 EcHS_A4215 secE nusG TRUE 0.997 2.000 0.843 1.000 N NA
 3476168 3476169 EcHS_A4215 EcHS_A4216 nusG rplK TRUE 0.634 159.000 0.681 1.000 N NA
 3476169 3476170 EcHS_A4216 EcHS_A4217 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.013 Y NA
 3476170 3476171 EcHS_A4217 EcHS_A4218 rplA rplJ FALSE 0.179 413.000 0.302 0.013 Y NA
 3476171 3476172 EcHS_A4218 EcHS_A4219 rplJ rplL TRUE 0.984 67.000 0.884 0.010 Y NA
 3476172 3476173 EcHS_A4219 EcHS_A4220 rplL rpoB FALSE 0.036 320.000 0.223 1.000   NA
 3476173 3476174 EcHS_A4220 EcHS_A4221 rpoB rpoC TRUE 0.945 77.000 0.851 0.000   NA
 3476174 3476175 EcHS_A4221 EcHS_A4222 rpoC htrC FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 3476176 3476177 EcHS_A4803 EcHS_A4223   thiH FALSE 0.011 248.000 0.000 NA   NA
 3476177 3476178 EcHS_A4223 EcHS_A4224 thiH thiG TRUE 0.999 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 3476178 3476179 EcHS_A4224 EcHS_A4225 thiG thiS TRUE 0.992 2.000 0.087 1.000 Y NA
 3476179 3476180 EcHS_A4225 EcHS_A4226 thiS thiF TRUE 0.998 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 3476180 3476181 EcHS_A4226 EcHS_A4227 thiF thiE TRUE 0.996 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 3476181 3476182 EcHS_A4227 EcHS_A4228 thiE thiC TRUE 0.997 0.000 0.063 0.003 Y NA
 3476182 3476183 EcHS_A4228 EcHS_A4229 thiC rsd FALSE 0.024 233.000 0.000 1.000 N NA
 3476184 3476185 EcHS_A4230 EcHS_A4231 nudC hemE FALSE 0.389 40.000 0.040 1.000 N NA
 3476185 3476186 EcHS_A4231 EcHS_A4232 hemE nfi TRUE 0.835 10.000 0.028 1.000 N NA
 3476186 3476187 EcHS_A4232 EcHS_A4233 nfi   FALSE 0.392 43.000 0.086 NA   NA
 3476187 3476188 EcHS_A4233 EcHS_A4234   hupA FALSE 0.246 187.000 0.355 NA   NA
 3476188 3476189 EcHS_A4234 EcHS_A4235 hupA   TRUE 0.951 13.000 0.375 NA   NA
 3476191 3476192 EcHS_A4237 EcHS_A4238 zraS zraR TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.067 Y NA
 3476193 3476194 EcHS_A4239 EcHS_A4240 purD purH TRUE 0.985 12.000 0.238 1.000 Y NA
 3476195 3476196 EcHS_A4241 EcHS_A4805   rrs FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 3476196 3476197 EcHS_A4805 EcHS_A4721 rrs   FALSE 0.116 85.000 0.000 NA   NA
 3476197 3476198 EcHS_A4721 EcHS_A4806   rrl FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 3476198 3476199 EcHS_A4806 EcHS_A4807 rrl rrf FALSE 0.099 96.000 0.000 NA   NA
 3476201 3476202 EcHS_A4247 EcHS_A4248 metA aceB FALSE 0.014 269.000 0.000 1.000 N NA
 3476202 3476203 EcHS_A4248 EcHS_A4249 aceB aceA TRUE 0.944 30.000 0.043 0.001 Y NA
 3476203 3476204 EcHS_A4249 EcHS_A4250 aceA   FALSE 0.142 69.000 0.000 NA   NA
 3476204 3476205 EcHS_A4250 EcHS_A4251   aceK TRUE 0.817 -24.000 0.000 NA   NA
 3476206 3476207 EcHS_A4253 EcHS_A4254 arpA iclR FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 3476208 3476209 EcHS_A4255 EcHS_A4256 metH pNaS FALSE 0.022 220.000 0.006 1.000 N NA
 3476213 3476214 EcHS_A4260 EcHS_A4261     FALSE 0.278 33.000 0.026 NA   NA
 3476215 3476216 EcHS_A4262 EcHS_A4263   lysC FALSE 0.089 145.000 0.000 1.000   NA
 3476217 3476218 EcHS_A4264 EcHS_A4265 pgi   FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3476218 3476219 EcHS_A4265 EcHS_A4266     TRUE 0.823 84.000 0.778 NA   NA
 3476219 3476220 EcHS_A4266 EcHS_A4267     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3476220 3476221 EcHS_A4267 EcHS_A4268     TRUE 0.967 0.000 0.140 NA   NA
 3476224 3476225 EcHS_A4271 EcHS_A4272 xylE malG FALSE 0.005 372.000 0.000 1.000   NA
 3476225 3476226 EcHS_A4272 EcHS_A4273 malG malF TRUE 0.997 15.000 0.814 0.047 Y NA
 3476226 3476227 EcHS_A4273 EcHS_A4274 malF malE FALSE 0.407 154.000 0.000 1.000 Y NA
 3476228 3476229 EcHS_A4275 EcHS_A4276 malK malB TRUE 0.849 72.000 0.111 0.056 Y NA
 3476229 3476230 EcHS_A4276 EcHS_A4277 malB malM FALSE 0.048 243.000 0.143 1.000   NA
 3476230 3476231 EcHS_A4277 EcHS_A4278 malM   FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 3476231 3476232 EcHS_A4278 EcHS_A4279   ubiC FALSE 0.015 223.000 0.000 NA   NA
 3476232 3476233 EcHS_A4279 EcHS_A4280 ubiC ubiA TRUE 0.980 13.000 0.248 NA Y NA
 3476235 3476236 EcHS_A4282 EcHS_A4283 dgkA lexA FALSE 0.306 110.000 0.141 1.000 N NA
 3476236 3476237 EcHS_A4283 EcHS_A4284 lexA dinF TRUE 0.620 19.000 0.033 1.000 N NA
 3476237 3476238 EcHS_A4284 EcHS_A4285 dinF   FALSE 0.076 116.000 0.021 NA   NA
 3476240 3476241 EcHS_A4287 EcHS_A4288     FALSE 0.386 24.000 0.000 NA   NA
 3476241 3476242 EcHS_A4288 EcHS_A4289     FALSE 0.176 56.000 0.000 NA   NA
 3476242 3476243 EcHS_A4289 EcHS_A4290   dusA FALSE 0.034 176.000 0.000 NA   NA
 3476245 3476246 EcHS_A4292 EcHS_A4293 dnaB alr2 TRUE 0.723 53.000 0.317 1.000 N NA
 3476246 3476247 EcHS_A4293 EcHS_A4294 alr2 tyrB FALSE 0.056 253.000 0.181 1.000 N NA
 3476249 3476250 EcHS_A4296 EcHS_A4298     FALSE 0.088 111.000 0.000 NA   NA
 3476250 3476251 EcHS_A4298 EcHS_A4299     TRUE 0.797 4.000 0.018 NA   NA
 3476259 3476260 EcHS_A4307 EcHS_A4308     FALSE 0.178 152.000 0.130 1.000   NA
 3476261 3476262 EcHS_A4309 EcHS_A4310     FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3476262 3476263 EcHS_A4310 EcHS_A4311   actP FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 3476263 3476264 EcHS_A4311 EcHS_A4312 actP   TRUE 0.997 -3.000 0.733 NA   NA
 3476264 3476265 EcHS_A4312 EcHS_A4313     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3476265 3476266 EcHS_A4313 EcHS_A4314   acsA FALSE 0.132 76.000 0.000 NA   NA
 3476267 3476268 EcHS_A4315 EcHS_A4316 nrfA nrfB TRUE 0.740 45.000 0.083 0.001   NA
 3476268 3476269 EcHS_A4316 EcHS_A4317 nrfB nrfC TRUE 0.987 -3.000 0.049 0.001   NA
 3476269 3476270 EcHS_A4317 EcHS_A4318 nrfC nrfD TRUE 0.999 -3.000 0.927 0.001 N NA
 3476270 3476271 EcHS_A4318 EcHS_A4319 nrfD nrfE TRUE 0.689 80.000 0.400 1.000 N NA
 3476271 3476272 EcHS_A4319 EcHS_A4320 nrfE nrfF TRUE 0.995 -7.000 0.214 NA Y NA
 3476272 3476273 EcHS_A4320 EcHS_A4321 nrfF nrfG TRUE 0.998 -3.000 0.464 NA Y NA
 3476273 3476274 EcHS_A4321 EcHS_A4322 nrfG gltP FALSE 0.008 342.000 0.000 1.000 N NA
 3476275 3476276 EcHS_A4323 EcHS_A4324   fdhF FALSE 0.281 94.000 0.105 1.000   NA
 3476276 3476277 EcHS_A4324 EcHS_A4325 fdhF   FALSE 0.036 198.000 0.000 1.000   NA
 3476277 3476278 EcHS_A4325 EcHS_A4326   mdtO TRUE 0.996 -3.000 0.625 NA   NA
 3476278 3476279 EcHS_A4326 EcHS_A4327 mdtO mdtN TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 3476279 3476280 EcHS_A4327 EcHS_A4328 mdtN   TRUE 0.957 19.000 0.625 NA   NA
 3476280 3476281 EcHS_A4328 EcHS_A4329     FALSE 0.045 161.000 0.000 NA   NA
 3476282 3476283 EcHS_A4330 EcHS_A4331     TRUE 0.811 -27.000 0.000 NA   NA
 3476284 3476285 EcHS_A4332 EcHS_A4333   phnP FALSE 0.079 126.000 0.000 NA   NA
 3476285 3476286 EcHS_A4333 EcHS_A4334 phnP   TRUE 0.910 2.000 0.000 1.000   NA
 3476286 3476287 EcHS_A4334 EcHS_A4335   phnN TRUE 0.891 -13.000 0.000 1.000   NA
 3476287 3476288 EcHS_A4335 EcHS_A4336 phnN phnM TRUE 0.997 0.000 0.235 1.000 Y NA
 3476288 3476289 EcHS_A4336 EcHS_A4337 phnM phnL TRUE 0.998 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 3476289 3476290 EcHS_A4337 EcHS_A4338 phnL phnK TRUE 0.969 111.000 0.859 0.015 Y NA
 3476290 3476291 EcHS_A4338 EcHS_A4339 phnK phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 3476291 3476292 EcHS_A4339 EcHS_A4340 phnJ phnI TRUE 0.999 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 3476292 3476293 EcHS_A4340 EcHS_A4341 phnI phnH TRUE 1.000 0.000 0.960 0.001 Y NA
 3476293 3476294 EcHS_A4341 EcHS_A4342 phnH phnG TRUE 1.000 -3.000 0.967 0.001 Y NA
 3476294 3476295 EcHS_A4342 EcHS_A4343 phnG phnF TRUE 0.996 1.000 0.691 1.000 N NA
 3476295 3476296 EcHS_A4343 EcHS_A4344 phnF phnE TRUE 0.794 21.000 0.158 1.000 N NA
 3476296 3476297 EcHS_A4344 EcHS_A4345 phnE phnD TRUE 0.955 62.000 0.330 0.000 Y NA
 3476297 3476298 EcHS_A4345 EcHS_A4346 phnD phnC TRUE 0.986 25.000 0.337 0.001 Y NA
 3476298 3476299 EcHS_A4346 EcHS_A4347 phnC   FALSE 0.127 133.000 0.074 NA   NA
 3476299 3476300 EcHS_A4347 EcHS_A4348   phnA FALSE 0.035 160.000 0.013 NA   NA
 3476301 3476302 EcHS_A4349 EcHS_A4350     TRUE 0.952 30.000 0.857 NA   NA
 3476302 3476303 EcHS_A4350 EcHS_A4351   proP FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 3476304 3476305 EcHS_A4352 EcHS_A4353 basS basR TRUE 0.991 10.000 0.143 0.075 Y NA
 3476305 3476306 EcHS_A4353 EcHS_A4354 basR   TRUE 0.968 -3.000 0.095 1.000   NA
 3476306 3476307 EcHS_A4354 EcHS_A4355   adiC FALSE 0.195 74.000 0.000 1.000   NA
 3476307 3476308 EcHS_A4355 EcHS_A4356 adiC adiY FALSE 0.275 137.000 0.167 1.000 N NA
 3476308 3476309 EcHS_A4356 EcHS_A4357 adiY   FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 3476309 3476310 EcHS_A4357 EcHS_A4358   adiA FALSE 0.111 89.000 0.000 NA   NA
 3476310 3476311 EcHS_A4358 EcHS_A4359 adiA melR FALSE 0.043 196.000 0.000 1.000 N NA
 3476312 3476313 EcHS_A4360 EcHS_A4361 melA melB TRUE 0.761 103.000 0.214 1.000 Y NA
 3476314 3476315 EcHS_A4362 EcHS_A4363   fumB FALSE 0.081 123.000 0.000 NA   NA
 3476315 3476316 EcHS_A4363 EcHS_A4364 fumB dcuB FALSE 0.184 78.000 0.000 1.000   NA
 3476316 3476317 EcHS_A4364 EcHS_A4365 dcuB dcuR FALSE 0.003 571.000 0.000 1.000   NA
 3476317 3476318 EcHS_A4365 EcHS_A4366 dcuR dcuS TRUE 0.997 -3.000 0.086 0.057 Y NA
 3476319 3476320 EcHS_A4367 EcHS_A4368     TRUE 0.886 12.000 0.168 NA   NA
 3476320 3476321 EcHS_A4368 EcHS_A4369     FALSE 0.002 551.000 0.000 NA   NA
 3476322 3476323 EcHS_A4370 EcHS_A4371 lysS1   FALSE 0.022 237.000 0.000 1.000 N NA
 3476323 3476324 EcHS_A4371 EcHS_A4372   ldcC2 TRUE 0.718 59.000 0.000 1.000 Y NA
 3476324 3476325 EcHS_A4372 EcHS_A4373 ldcC2   TRUE 0.649 80.000 0.000 1.000 Y NA
 3476325 3476326 EcHS_A4373 EcHS_A4374   cadC FALSE 0.006 366.000 0.000 1.000 N NA
 3476326 3476327 EcHS_A4374 EcHS_A4722 cadC   FALSE 0.002 616.000 0.000 NA   NA
 3476327 3476328 EcHS_A4722 EcHS_A4376     FALSE 0.091 106.000 0.000 NA   NA
 3476328 3476329 EcHS_A4376 EcHS_A4377   dsbD TRUE 0.699 37.000 0.217 1.000   NA
 3476329 3476330 EcHS_A4377 EcHS_A4378 dsbD cutA TRUE 0.938 -24.000 0.092 1.000 N NA
 3476330 3476331 EcHS_A4378 EcHS_A4379 cutA dcuA FALSE 0.100 116.000 0.005 1.000   NA
 3476331 3476332 EcHS_A4379 EcHS_A4380 dcuA aspA FALSE 0.108 118.000 0.015 1.000   NA
 3476335 3476336 EcHS_A4383 EcHS_A4384 groS groL TRUE 0.985 44.000 0.631 0.005 Y NA
 3476336 3476337 EcHS_A4384 EcHS_A4385 groL   FALSE 0.105 138.000 0.062 NA   NA
 3476337 3476338 EcHS_A4385 EcHS_A4386     FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 3476339 3476340 EcHS_A4387 EcHS_A4388     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 3476341 3476342 EcHS_A4389 EcHS_A4390 efp ecnB2 FALSE 0.220 52.000 0.007 1.000   NA
 3476342 3476343 EcHS_A4390 EcHS_A4391 ecnB2 ecnB1 TRUE 0.652 111.000 0.212 0.000   NA
 3476343 3476344 EcHS_A4391 EcHS_A4392 ecnB1 sugE FALSE 0.086 175.000 0.074 1.000   NA
 3476345 3476346 EcHS_A4393 EcHS_A4394 blc ampC FALSE 0.170 89.000 0.022 1.000 N NA
 3476346 3476347 EcHS_A4394 EcHS_A4395 ampC frdD FALSE 0.228 63.000 0.022 1.000 N NA
 3476347 3476348 EcHS_A4395 EcHS_A4396 frdD frdC TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 3476348 3476349 EcHS_A4396 EcHS_A4397 frdC frdB TRUE 0.997 11.000 0.454 0.002 Y NA
 3476349 3476350 EcHS_A4397 EcHS_A4398 frdB frdA TRUE 0.999 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 3476351 3476352 EcHS_A4399 EcHS_A4400 genX   FALSE 0.023 219.000 0.009 1.000 N NA
 3476353 3476354 EcHS_A4401 EcHS_A4402   psd TRUE 0.771 22.000 0.148 1.000 N NA
 3476354 3476355 EcHS_A4402 EcHS_A4404 psd rsgA FALSE 0.255 97.000 0.095 1.000   NA
 3476356 3476357 EcHS_A4403 EcHS_A4723 orn   FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 3476357 3476358 EcHS_A4723 EcHS_A4724     FALSE 0.263 36.000 0.000 NA   NA
 3476358 3476359 EcHS_A4724 EcHS_A4725     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3476361 3476362 EcHS_A4408 EcHS_A4410     TRUE 0.924 -28.000 0.118 NA   NA
 3476362 3476363 EcHS_A4410 EcHS_A4411     TRUE 0.704 19.000 0.109 NA   NA
 3476363 3476364 EcHS_A4411 EcHS_A4412   mutL TRUE 0.907 10.000 0.092 1.000 N NA
 3476364 3476365 EcHS_A4412 EcHS_A4413 mutL miaA TRUE 0.988 -7.000 0.188 0.066 N NA
 3476365 3476366 EcHS_A4413 EcHS_A4414 miaA hfq TRUE 0.741 86.000 0.531 1.000   NA
 3476366 3476367 EcHS_A4414 EcHS_A4415 hfq hflX FALSE 0.389 76.000 0.141 1.000   NA
 3476367 3476368 EcHS_A4415 EcHS_A4416 hflX hflK TRUE 0.577 86.000 0.184 0.067   NA
 3476368 3476369 EcHS_A4416 EcHS_A4417 hflK hflC TRUE 1.000 3.000 0.947 0.009 Y NA
 3476369 3476370 EcHS_A4417 EcHS_A4418 hflC   TRUE 0.595 82.000 0.348 NA   NA
 3476372 3476373 EcHS_A4420 EcHS_A4421 purA nsrR FALSE 0.019 205.000 0.010 NA N NA
 3476373 3476374 EcHS_A4421 EcHS_A4422 nsrR rnr TRUE 0.794 39.000 0.038 NA Y NA
 3476374 3476375 EcHS_A4422 EcHS_A4423 rnr   FALSE 0.225 43.000 0.000 NA   NA
 3476375 3476376 EcHS_A4423 EcHS_A4424     TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3476376 3476377 EcHS_A4424 EcHS_A4425     FALSE 0.052 127.000 0.002 NA   NA
 3476377 3476378 EcHS_A4425 EcHS_A4426     TRUE 0.976 19.000 0.911 NA   NA
 3476378 3476379 EcHS_A4426 EcHS_A4427     FALSE 0.312 51.000 0.071 NA   NA
 3476379 3476380 EcHS_A4427 EcHS_A4428     TRUE 0.921 18.000 0.379 NA   NA
 3476380 3476381 EcHS_A4428 EcHS_A4429     TRUE 0.979 10.000 0.470 NA   NA
 3476381 3476382 EcHS_A4429 EcHS_A4430     TRUE 0.885 3.000 0.049 NA   NA
 3476382 3476383 EcHS_A4430 EcHS_A4431     FALSE 0.316 84.000 0.133 NA N NA
 3476384 3476385 EcHS_A4432 EcHS_A4433     TRUE 0.620 137.000 0.588 NA   NA
 3476387 3476388 EcHS_A4435 EcHS_A4436 ulaR   FALSE 0.133 108.000 0.000 1.000   NA
 3476389 3476390 EcHS_A4437 EcHS_A4438 ulaA ulaB TRUE 0.882 16.000 0.059 0.012   NA
 3476390 3476391 EcHS_A4438 EcHS_A4439 ulaB ulaC TRUE 0.992 10.000 0.115 0.008 Y NA
 3476391 3476392 EcHS_A4439 EcHS_A4440 ulaC   TRUE 0.985 14.000 0.328 1.000 Y NA
 3476392 3476393 EcHS_A4440 EcHS_A4441   ulaE TRUE 0.991 10.000 0.250 1.000 Y NA
 3476393 3476394 EcHS_A4441 EcHS_A4442 ulaE ulaF TRUE 0.996 0.000 0.200 1.000 Y NA
 3476396 3476397 EcHS_A4444 EcHS_A4445 rpsF priB TRUE 0.940 7.000 0.122 1.000 N NA
 3476397 3476398 EcHS_A4445 EcHS_A4446 priB rpsR TRUE 0.947 5.000 0.128 1.000 N NA
 3476398 3476399 EcHS_A4446 EcHS_A4447 rpsR rplI TRUE 0.977 42.000 0.499 0.010 Y NA
 3476400 3476401 EcHS_A4448 EcHS_A4449     TRUE 0.751 53.000 0.000 1.000 Y NA
 3476401 3476402 EcHS_A4449 EcHS_A4450     FALSE 0.004 540.000 0.000 1.000 N NA
 3476402 3476403 EcHS_A4450 EcHS_A4451     TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3476403 3476404 EcHS_A4451 EcHS_A4452     TRUE 0.993 10.000 0.200 0.041 Y NA
 3476404 3476405 EcHS_A4452 EcHS_A4453     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA N NA
 3476405 3476406 EcHS_A4453 EcHS_A4454     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA N NA
 3476409 3476410 EcHS_A4457 EcHS_A4458 fklB cycA FALSE 0.010 309.000 0.000 1.000 N NA
 3476412 3476413 EcHS_A4459 EcHS_A4461     FALSE 0.013 234.000 0.000 NA   NA
 3476413 3476414 EcHS_A4461 EcHS_A4462     TRUE 0.836 -15.000 0.000 NA   NA
 3476415 3476416 EcHS_A4463 EcHS_A4464     FALSE 0.277 108.000 0.150 NA N NA
 3476416 3476417 EcHS_A4464 EcHS_A4466     TRUE 0.555 108.000 0.021 1.000 Y NA
 3476426 3476427 EcHS_A4474 EcHS_A4475     TRUE 0.995 -3.000 0.575 NA   NA
 3476427 3476428 EcHS_A4475 EcHS_A4476     TRUE 0.956 3.000 0.167 NA   NA
 3476428 3476429 EcHS_A4476 EcHS_A4477   chpS FALSE 0.019 212.000 0.000 NA   NA
 3476429 3476430 EcHS_A4477 EcHS_A4478 chpS chpB TRUE 0.997 -6.000 0.375 NA Y NA
 3476431 3476432 EcHS_A4479 EcHS_A4480 ppa   TRUE 0.656 12.000 0.000 NA   NA
 3476433 3476434 EcHS_A4481 EcHS_A4482     TRUE 0.905 140.000 0.804 NA Y NA
 3476434 3476435 EcHS_A4482 EcHS_A4483     TRUE 0.995 11.000 0.506 1.000 Y NA
 3476435 3476436 EcHS_A4483 EcHS_A4484     TRUE 0.999 -13.000 0.865 0.047 Y NA
 3476440 3476441 EcHS_A4488 EcHS_A4489 pmbA cybC FALSE 0.031 183.000 0.028 NA   NA
 3476442 3476443 EcHS_A4490 EcHS_A4491 nrdG   TRUE 0.899 0.000 0.000 NA   NA
 3476443 3476444 EcHS_A4491 EcHS_A4492   nrdD FALSE 0.160 60.000 0.000 NA   NA
 3476444 3476445 EcHS_A4492 EcHS_A4493 nrdD treC FALSE 0.005 394.000 0.000 1.000 N NA
 3476445 3476446 EcHS_A4493 EcHS_A4494 treC treB TRUE 0.967 50.000 0.650 1.000 Y NA
 3476446 3476447 EcHS_A4494 EcHS_A4495 treB treR FALSE 0.326 122.000 0.168 1.000 N NA
 3476448 3476449 EcHS_A4496 EcHS_A4497   mgtA FALSE 0.113 141.000 0.074 NA   NA
 3476450 3476451 EcHS_A4498 EcHS_A4499     FALSE 0.009 277.000 0.000 NA N NA
 3476451 3476452 EcHS_A4499 EcHS_A4500   pyrI FALSE 0.278 73.000 0.084 NA N NA
 3476452 3476453 EcHS_A4500 EcHS_A4501 pyrI pyrB TRUE 0.990 13.000 0.197 0.002 Y NA
 3476453 3476454 EcHS_A4501 EcHS_A4502 pyrB pyrL TRUE 0.849 4.000 0.005 1.000   NA
 3476454 3476455 EcHS_A4502 EcHS_A4503 pyrL   FALSE 0.245 39.000 0.000 NA   NA
 3476455 3476456 EcHS_A4503 EcHS_A4504     FALSE 0.092 105.000 0.000 NA   NA
 3476456 3476457 EcHS_A4504 EcHS_A4505     FALSE 0.084 131.000 0.000 NA N NA
 3476458 3476459 EcHS_A4506 EcHS_A4507     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA N NA
 3476459 3476460 EcHS_A4507 EcHS_A4508     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 3476460 3476461 EcHS_A4508 EcHS_A4509     TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 3476466 3476467 EcHS_A4514 EcHS_A4515 valS holC TRUE 0.967 0.000 0.089 1.000 N NA
 3476467 3476468 EcHS_A4515 EcHS_A4516 holC pepA TRUE 0.602 134.000 0.494 1.000 N NA
 3476469 3476470 EcHS_A4517 EcHS_A4518     TRUE 0.998 0.000 0.631 0.067   NA
 3476471 3476472 EcHS_A4519 EcHS_A4520   idnR FALSE 0.149 78.000 0.007 1.000   NA
 3476472 3476473 EcHS_A4520 EcHS_A4521 idnR idnT TRUE 0.525 67.000 0.200 1.000 N NA
 3476473 3476474 EcHS_A4521 EcHS_A4522 idnT idnO FALSE 0.403 65.000 0.111 1.000 N NA
 3476474 3476475 EcHS_A4522 EcHS_A4523 idnO idnD TRUE 0.954 24.000 0.444 0.035 N NA
 3476478 3476479 EcHS_A4726 EcHS_A4527     FALSE 0.113 88.000 0.000 NA   NA
 3476480 3476481 EcHS_A4528 EcHS_A4529     FALSE 0.074 130.000 0.000 NA   NA
 3476481 3476482 EcHS_A4529 EcHS_A4530     TRUE 0.831 57.000 0.000 0.052 Y NA
 3476482 3476483 EcHS_A4530 EcHS_A4531     FALSE 0.247 45.000 0.000 NA N NA
 3476483 3476484 EcHS_A4531 EcHS_A4532     TRUE 0.999 -7.000 0.759 NA Y NA
 3476484 3476485 EcHS_A4532 EcHS_A4533     FALSE 0.303 170.000 0.000 NA Y NA
 3476485 3476486 EcHS_A4533 EcHS_A4534     FALSE 0.019 212.000 0.000 NA   NA
 3476486 3476487 EcHS_A4534 EcHS_A4535     FALSE 0.150 65.000 0.000 NA   NA
 3476487 3476488 EcHS_A4535 EcHS_A4536     TRUE 0.448 20.000 0.000 NA   NA
 3476488 3476489 EcHS_A4536 EcHS_A4537     FALSE 0.002 666.000 0.000 NA   NA
 3476490 3476491 EcHS_A4538 EcHS_A4539 fimB fimE FALSE 0.061 478.000 0.000 0.005 Y NA
 3476491 3476492 EcHS_A4539 EcHS_A4540 fimE   FALSE 0.004 481.000 0.000 1.000 N NA
 3476492 3476493 EcHS_A4540 EcHS_A4541     TRUE 0.973 65.000 0.600 0.006 Y NA
 3476493 3476494 EcHS_A4541 EcHS_A4542   fimC TRUE 0.982 37.000 0.800 1.000 Y NA
 3476494 3476495 EcHS_A4542 EcHS_A4543 fimC fimD1 TRUE 0.932 112.000 0.750 1.000 Y NA
 3476495 3476496 EcHS_A4543 EcHS_A4544 fimD1 fimF TRUE 0.974 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3476496 3476497 EcHS_A4544 EcHS_A4545 fimF fimG TRUE 0.978 13.000 0.000 0.006 Y NA
 3476497 3476498 EcHS_A4545 EcHS_A4546 fimG fimH TRUE 0.987 20.000 0.833 0.006   NA
 3476500 3476501 EcHS_A4548 EcHS_A4549 uxuA   TRUE 0.697 81.000 0.070 1.000 Y NA
 3476505 3476506 EcHS_A4553 EcHS_A4554     FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 3476507 3476508 EcHS_A4555 EcHS_A4556   iadA FALSE 0.256 65.000 0.037 1.000 N NA
 3476508 3476509 EcHS_A4556 EcHS_A4557 iadA   TRUE 0.716 13.000 0.028 1.000   NA
 3476509 3476510 EcHS_A4557 EcHS_A4558     TRUE 0.985 -3.000 0.019 0.001   NA
 3476512 3476513 EcHS_A4560 EcHS_A4561     FALSE 0.327 68.000 0.118 NA   NA
 3476513 3476514 EcHS_A4561 EcHS_A4562   hgdC FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 3476514 3476515 EcHS_A4562 EcHS_A4563 hgdC   TRUE 0.866 10.000 0.078 NA N NA
 3476515 3476516 EcHS_A4563 EcHS_A4564     FALSE 0.067 116.000 0.013 NA   NA
 3476516 3476517 EcHS_A4564 EcHS_A4565   mdtM FALSE 0.208 41.000 0.020 NA   NA
 3476519 3476520 EcHS_A4567 EcHS_A4568     FALSE 0.179 55.000 0.000 NA   NA
 3476521 3476522 EcHS_A4569 EcHS_A4570     FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 3476523 3476524 EcHS_A4572 EcHS_A4573     TRUE 0.926 11.000 0.212 NA   NA
 3476524 3476525 EcHS_A4573 EcHS_A4574     TRUE 0.829 49.000 0.531 NA   NA
 3476525 3476526 EcHS_A4574 EcHS_A4575   hpaC FALSE 0.005 378.000 0.000 1.000   NA
 3476526 3476527 EcHS_A4575 EcHS_A4576 hpaC hpaB TRUE 0.952 18.000 0.226 0.000   NA
 3476527 3476528 EcHS_A4576 EcHS_A4577 hpaB hpaA FALSE 0.036 251.000 0.100 1.000 N NA
 3476528 3476529 EcHS_A4577 EcHS_A4578 hpaA hpaX TRUE 0.958 10.000 0.233 1.000 N NA
 3476529 3476530 EcHS_A4578 EcHS_A4579 hpaX hpaI TRUE 0.701 123.000 0.175 1.000 Y NA
 3476530 3476531 EcHS_A4579 EcHS_A4580 hpaI hpaH TRUE 0.976 11.000 0.439 1.000 N NA
 3476531 3476532 EcHS_A4580 EcHS_A4581 hpaH hpcD TRUE 0.485 111.000 0.282 1.000 N NA
 3476532 3476533 EcHS_A4581 EcHS_A4582 hpcD hpaD TRUE 0.970 10.000 0.330 1.000   NA
 3476533 3476534 EcHS_A4582 EcHS_A4583 hpaD hpaE TRUE 0.994 2.000 0.378 0.035   NA
 3476534 3476535 EcHS_A4583 EcHS_A4584 hpaE hpaG TRUE 0.997 -3.000 0.510 0.041 N NA
 3476536 3476537 EcHS_A4585 EcHS_A4586 hpaR tsr FALSE 0.240 119.000 0.095 1.000 N NA
 3476538 3476539 EcHS_A4587 EcHS_A4588     FALSE 0.095 215.000 0.182 1.000 N NA
 3476540 3476541 EcHS_A4589 EcHS_A4590     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3476542 3476543 EcHS_A4591 EcHS_A4592 mdoB   FALSE 0.010 254.000 0.000 NA   NA
 3476543 3476544 EcHS_A4592 EcHS_A4593   dnaC TRUE 0.758 46.000 0.368 NA   NA
 3476544 3476545 EcHS_A4593 EcHS_A4594 dnaC dnaT TRUE 0.995 3.000 0.778 NA   NA
 3476545 3476546 EcHS_A4594 EcHS_A4595 dnaT   FALSE 0.118 108.000 0.046 NA   NA
 3476546 3476547 EcHS_A4595 EcHS_A4596     TRUE 0.995 -9.000 0.704 NA   NA
 3476547 3476548 EcHS_A4596 EcHS_A4597     FALSE 0.045 161.000 0.000 NA   NA
 3476549 3476550 EcHS_A4598 EcHS_A4599     TRUE 0.999 -42.000 0.889 0.017 Y NA
 3476553 3476554 EcHS_A4727 EcHS_A4728     FALSE 0.277 34.000 0.000 NA   NA
 3476554 3476555 EcHS_A4728 EcHS_A4729     FALSE 0.337 28.000 0.000 NA   NA
 3476555 3476556 EcHS_A4729 EcHS_A4605   rsmC FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 3476557 3476558 EcHS_A4606 EcHS_A4607 holD rimI TRUE 0.939 -31.000 0.121 1.000   NA
 3476558 3476559 EcHS_A4607 EcHS_A4608 rimI yjjG TRUE 0.632 15.000 0.018 1.000   NA
 3476559 3476560 EcHS_A4608 EcHS_A4609 yjjG prfC FALSE 0.133 91.000 0.012 1.000   NA
 3476560 3476561 EcHS_A4609 EcHS_A4610 prfC osmY FALSE 0.003 393.000 0.000 NA   NA
 3476561 3476562 EcHS_A4610 EcHS_A4611 osmY   FALSE 0.077 127.000 0.000 NA   NA
 3476562 3476563 EcHS_A4611 EcHS_A4612     FALSE 0.321 122.000 0.211 NA   NA
 3476563 3476564 EcHS_A4612 EcHS_A4613     TRUE 0.937 -3.000 0.057 NA   NA
 3476565 3476566 EcHS_A4614 EcHS_A4615     TRUE 0.994 -28.000 0.810 NA   NA
 3476567 3476568 EcHS_A4616 EcHS_A4617 deoC deoA TRUE 0.774 127.000 0.286 1.000 Y NA
 3476568 3476569 EcHS_A4617 EcHS_A4618 deoA deoB TRUE 0.784 52.000 0.398 1.000 N NA
 3476569 3476570 EcHS_A4618 EcHS_A4619 deoB deoD TRUE 0.698 80.000 0.414 1.000 N NA
 3476571 3476572 EcHS_A4620 EcHS_A4621   lplA FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3476572 3476573 EcHS_A4621 EcHS_A4622 lplA   TRUE 0.471 28.000 0.066 NA   NA
 3476574 3476575 EcHS_A4623 EcHS_A4624 serB radA FALSE 0.295 49.000 0.024 1.000 N NA
 3476575 3476576 EcHS_A4624 EcHS_A4625 radA nadR TRUE 0.547 21.000 0.021 1.000 N NA
 3476576 3476577 EcHS_A4625 EcHS_A4626 nadR   FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 3476579 3476580 EcHS_A4628 EcHS_A4629 slt trpR FALSE 0.399 90.000 0.167 1.000 N NA
 3476584 3476585 EcHS_A4633 EcHS_A4634   creB TRUE 0.658 13.000 0.038 NA   NA
 3476585 3476586 EcHS_A4634 EcHS_A4635 creB creC TRUE 0.999 0.000 0.776 1.000 Y NA
 3476586 3476587 EcHS_A4635 EcHS_A4636 creC   TRUE 0.653 58.000 0.311 NA N NA
 3476589 3476590 EcHS_A4638 EcHS_A4639     FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 3476590 3471954 EcHS_A4639 EcHS_A0002   thrL FALSE 0.027 214.000 0.000 1.000   NA