MicrobesOnline Operon Predictions for Synechococcus sp. JA-2-3B'a(2-13)

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
1221323	1221324	CYB_0001	CYB_0002	dnaA		FALSE	0.405	26.000	0.002	NA		NA
1221325	1221326	CYB_0003	CYB_0004			TRUE	0.758	108.000	0.069	1.000	N	NA
1221326	1221327	CYB_0004	CYB_0005			TRUE	0.749	137.000	0.069	1.000		NA
1221328	1221329	CYB_0006	CYB_0007			FALSE	0.214	108.000	0.000	NA		NA
1221332	1221333	CYB_0009	CYB_0011			FALSE	0.349	141.000	0.000	1.000		NA
1221333	1221334	CYB_0011	CYB_0012			FALSE	0.084	184.000	0.000	NA		NA
1221336	1221337	CYB_0013	CYB_0015			FALSE	0.003	772.000	0.000	NA		NA
1221339	1221340	CYB_0017	CYB_0018			FALSE	0.464	47.000	0.000	NA	N	NA
1221340	1221341	CYB_0018	CYB_0019			TRUE	0.802	-145.000	0.000	NA	Y	NA
1221341	1221342	CYB_0019	CYB_0020			TRUE	0.688	117.000	0.000	0.058		NA
1221342	1221343	CYB_0020	CYB_0021		psaB	FALSE	0.349	108.000	0.000	1.000		NA
1221343	1221344	CYB_0021	CYB_0022	psaB	psaA	TRUE	0.961	22.000	0.154	0.003		NA
1221345	1221346	CYB_0023	CYB_0024	ureC		TRUE	0.835	64.000	0.000	1.000	Y	NA
1221346	1221347	CYB_0024	CYB_0025			FALSE	0.465	68.000	0.000	1.000	N	NA
1221347	1221348	CYB_0025	CYB_0026			TRUE	0.978	-145.000	1.000	NA	Y	NA
1221348	1221349	CYB_0026	CYB_0027			FALSE	0.331	60.000	0.000	NA		NA
1221350	1221351	CYB_0028	CYB_0029			TRUE	0.892	19.000	0.087	1.000	N	NA
1221351	1221352	CYB_0029	CYB_0030			FALSE	0.036	226.000	0.000	NA		NA
1221355	1221356	CYB_0033	CYB_0034		nirA	FALSE	0.072	193.000	0.000	NA		NA
1221356	1221357	CYB_0034	CYB_0035	nirA	nrtA	TRUE	0.941	62.000	0.128	NA	Y	NA
1221357	1221358	CYB_0035	CYB_0036	nrtA	ntrB-1	TRUE	0.960	146.000	0.915	NA	Y	NA
1221358	1221359	CYB_0036	CYB_0037	ntrB-1	ntrC-1	TRUE	0.949	73.000	0.043	0.003	Y	NA
1221359	1221360	CYB_0037	CYB_0038	ntrC-1	ntrD	TRUE	0.992	39.000	0.667	0.003	Y	NA
1221360	1221361	CYB_0038	CYB_0039	ntrD		TRUE	0.558	18.000	0.000	1.000		NA
1221361	1221362	CYB_0039	CYB_0040		narB	FALSE	0.348	87.000	0.000	1.000		NA
1221362	1221363	CYB_0040	CYB_0042	narB		TRUE	0.790	25.000	0.048	NA		NA
1221364	1221365	CYB_0041	CYB_0043		purD	FALSE	0.006	461.000	0.000	NA	N	NA
1221365	1221366	CYB_0043	CYB_0044	purD		FALSE	0.260	103.000	0.002	NA	N	NA
1221366	1221367	CYB_0044	CYB_0045			FALSE	0.231	168.000	0.007	NA		NA
1221369	1221370	CYB_0047	CYB_0048		dapA	TRUE	0.548	220.000	0.605	1.000		NA
1221374	1221375	CYB_0052	CYB_0053			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1221375	1221376	CYB_0053	CYB_0054			FALSE	0.040	219.000	0.000	NA		NA
1221377	1221378	CYB_0055	CYB_0056			TRUE	0.779	83.000	0.143	NA		NA
1221378	1221379	CYB_0056	CYB_0057			FALSE	0.018	343.000	0.000	1.000	N	NA
1221379	1221380	CYB_0057	CYB_0058		speE	TRUE	0.927	120.000	0.125	1.000	Y	NA
1221380	1221381	CYB_0058	CYB_0060	speE		TRUE	0.556	93.000	0.014	1.000	N	NA
1221382	1221383	CYB_0059	CYB_0061			TRUE	0.835	58.000	0.087	NA		NA
1221383	1221384	CYB_0061	CYB_0062			FALSE	0.003	597.000	0.000	NA		NA
1221384	1221385	CYB_0062	CYB_0063			TRUE	0.892	43.000	0.149	NA		NA
1221385	1221386	CYB_0063	CYB_0064		lepA	TRUE	0.641	5.000	0.003	1.000	N	NA
1221386	1221387	CYB_0064	CYB_0065	lepA		FALSE	0.008	332.000	0.000	NA		NA
1221387	1221388	CYB_0065	CYB_0066		glyQ	FALSE	0.290	151.000	0.005	NA		NA
1221388	1221389	CYB_0066	CYB_0067	glyQ		TRUE	0.631	53.000	0.003	1.000	N	NA
1221389	1221390	CYB_0067	CYB_0068			TRUE	0.701	49.000	0.012	1.000		NA
1221391	1221392	CYB_0069	CYB_0070			FALSE	0.486	59.000	0.005	NA		NA
1221392	1221393	CYB_0070	CYB_0071			TRUE	0.525	50.000	0.005	NA		NA
1221393	1221394	CYB_0071	CYB_0072			FALSE	0.483	161.000	0.045	NA		NA
1221394	1221395	CYB_0072	CYB_0073		hisD	FALSE	0.024	248.000	0.000	NA		NA
1221395	1221396	CYB_0073	CYB_0074	hisD		FALSE	0.131	179.000	0.000	NA	N	NA
1221396	1221397	CYB_0074	CYB_0075			FALSE	0.049	206.000	0.000	NA		NA
1221397	1221398	CYB_0075	CYB_0076			FALSE	0.048	247.000	0.000	1.000		NA
1221401	1221402	CYB_0079	CYB_0080	purA		FALSE	0.083	212.000	0.000	1.000		NA
1221404	1221405	CYB_0082	CYB_0083	tig		FALSE	0.266	72.000	0.002	NA		NA
1221405	1221406	CYB_0083	CYB_0084			FALSE	0.393	85.000	0.010	NA		NA
1221409	1221410	CYB_0087	CYB_0088		xseA	TRUE	0.857	35.000	0.000	NA	Y	NA
1221410	1221411	CYB_0088	CYB_0089	xseA	xseB	TRUE	0.967	-19.000	0.412	0.001		NA
1221411	1221412	CYB_0089	CYB_0090	xseB	folD	FALSE	0.371	93.000	0.002	1.000		NA
1221413	1221414	CYB_0091	CYB_0092			FALSE	0.417	110.000	0.011	NA		NA
1221414	1221415	CYB_0092	CYB_0093			TRUE	0.669	57.000	0.011	1.000		NA
1221415	1221416	CYB_0093	CYB_0094			FALSE	0.009	327.000	0.000	NA		NA
1221417	1221418	CYB_0095	CYB_0096	murA		FALSE	0.129	194.000	0.000	1.000		NA
1221418	1221419	CYB_0096	CYB_0097		sixA	FALSE	0.338	144.000	0.000	1.000		NA
1221422	1221423	CYB_0099	CYB_0101			FALSE	0.502	71.000	0.015	NA		NA
1221423	1221424	CYB_0101	CYB_0102			TRUE	0.741	2.000	0.037	NA		NA
1221425	1221426	CYB_0103	CYB_0104	psaK	psbK	TRUE	0.849	131.000	0.050	0.027		NA
1221427	1221428	CYB_0105	CYB_0106			FALSE	0.239	76.000	0.000	NA		NA
1221430	1221431	CYB_0108	CYB_0109		nucH	FALSE	0.005	409.000	0.000	NA		NA
1221431	1221432	CYB_0109	CYB_0110	nucH		FALSE	0.053	203.000	0.000	NA		NA
1221433	1221434	CYB_0111	CYB_0112			FALSE	0.033	232.000	0.000	NA		NA
1221434	1221435	CYB_0112	CYB_0113			FALSE	0.260	145.000	0.000	NA	N	NA
1221436	1221437	CYB_0114	CYB_0115	scpB		FALSE	0.266	100.000	0.000	NA	N	NA
1221438	1221439	CYB_0116	CYB_0117			FALSE	0.236	119.000	0.000	NA		NA
1221441	1221442	CYB_0119	CYB_0120			FALSE	0.378	31.000	0.000	NA		NA
1221442	1221443	CYB_0120	CYB_0121		ispG	TRUE	0.541	50.000	0.000	1.000		NA
1221445	1221446	CYB_0123	CYB_0124			FALSE	0.049	206.000	0.000	NA		NA
1221447	1221448	CYB_0125	CYB_0126	grxC	polA	FALSE	0.392	93.000	0.002	1.000	N	NA
1221449	1221450	CYB_0127	CYB_0128			TRUE	0.842	65.000	0.133	NA	N	NA
1221450	1221451	CYB_0128	CYB_0129		psbP	FALSE	0.017	264.000	0.000	NA		NA
1221451	1221452	CYB_0129	CYB_0131	psbP	icc	FALSE	0.019	316.000	0.000	1.000		NA
1221453	1221454	CYB_0130	CYB_0132			TRUE	0.934	-3.000	0.084	0.037	N	NA
1221456	1221457	CYB_0134	CYB_0135			FALSE	0.232	78.000	0.000	NA		NA
1221457	1221458	CYB_0135	CYB_0136		psbU	FALSE	0.366	52.000	0.000	NA		NA
1221459	1221460	CYB_0137	CYB_0138	gcvP		FALSE	0.380	34.000	0.000	NA		NA
1221460	1221461	CYB_0138	CYB_0139			TRUE	0.859	3.000	0.095	NA		NA
1221461	1221462	CYB_0139	CYB_0140			TRUE	0.884	38.000	0.130	NA		NA
1221462	1221463	CYB_0140	CYB_0141			TRUE	0.730	46.000	0.030	NA		NA
1221463	1221464	CYB_0141	CYB_0142			FALSE	0.002	2893.000	0.000	NA		NA
11510482	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	2999.000	0.000	NA		NA
11652845	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	2999.000	0.000	NA		NA
11795237	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	2999.000	0.000	NA		NA
11510483	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3035.000	0.000	NA		NA
11652846	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3035.000	0.000	NA		NA
11795238	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3035.000	0.000	NA		NA
11510484	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3071.000	0.000	NA		NA
11652847	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3071.000	0.000	NA		NA
11795239	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3071.000	0.000	NA		NA
11510485	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3107.000	0.000	NA		NA
11652848	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3107.000	0.000	NA		NA
11795240	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3107.000	0.000	NA		NA
11510486	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3148.000	0.000	NA		NA
11652849	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3148.000	0.000	NA		NA
11795241	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3148.000	0.000	NA		NA
11510487	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3184.000	0.000	NA		NA
11652850	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3184.000	0.000	NA		NA
11795242	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3184.000	0.000	NA		NA
11510488	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3223.000	0.000	NA		NA
11652851	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3223.000	0.000	NA		NA
11795243	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3223.000	0.000	NA		NA
11510489	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3259.000	0.000	NA		NA
11652852	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3259.000	0.000	NA		NA
11795244	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3259.000	0.000	NA		NA
11510490	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3295.000	0.000	NA		NA
11652853	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3295.000	0.000	NA		NA
11795245	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3295.000	0.000	NA		NA
11510491	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3331.000	0.000	NA		NA
11652854	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3331.000	0.000	NA		NA
11795246	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3331.000	0.000	NA		NA
11510492	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3370.000	0.000	NA		NA
11652855	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3370.000	0.000	NA		NA
11795247	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3370.000	0.000	NA		NA
11510493	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3406.000	0.000	NA		NA
11652856	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3406.000	0.000	NA		NA
11795248	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3406.000	0.000	NA		NA
11510494	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3446.000	0.000	NA		NA
11652857	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3446.000	0.000	NA		NA
11795249	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3446.000	0.000	NA		NA
11510495	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3482.000	0.000	NA		NA
11652858	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3482.000	0.000	NA		NA
11795250	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3482.000	0.000	NA		NA
11510496	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3518.000	0.000	NA		NA
11652859	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3518.000	0.000	NA		NA
11795251	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3518.000	0.000	NA		NA
11510497	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3554.000	0.000	NA		NA
11652860	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3554.000	0.000	NA		NA
11795252	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3554.000	0.000	NA		NA
11510498	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3591.000	0.000	NA		NA
11652861	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3591.000	0.000	NA		NA
11795253	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3591.000	0.000	NA		NA
11510499	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3627.000	0.000	NA		NA
11652862	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3627.000	0.000	NA		NA
11795254	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3627.000	0.000	NA		NA
11510500	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3666.000	0.000	NA		NA
11652863	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3666.000	0.000	NA		NA
11795255	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3666.000	0.000	NA		NA
11510501	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3702.000	0.000	NA		NA
11652864	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3702.000	0.000	NA		NA
11795256	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3702.000	0.000	NA		NA
11510502	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3745.000	0.000	NA		NA
11652865	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3745.000	0.000	NA		NA
11795257	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3745.000	0.000	NA		NA
11510503	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3781.000	0.000	NA		NA
11652866	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3781.000	0.000	NA		NA
11795258	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3781.000	0.000	NA		NA
11510504	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3821.000	0.000	NA		NA
11652867	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3821.000	0.000	NA		NA
11795259	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3821.000	0.000	NA		NA
11510505	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3857.000	0.000	NA		NA
11652868	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3857.000	0.000	NA		NA
11795260	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3857.000	0.000	NA		NA
11510506	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3895.000	0.000	NA		NA
11652869	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3895.000	0.000	NA		NA
11795261	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3895.000	0.000	NA		NA
11510507	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3931.000	0.000	NA		NA
11652870	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3931.000	0.000	NA		NA
11795262	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3931.000	0.000	NA		NA
11510508	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3971.000	0.000	NA		NA
11652871	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3971.000	0.000	NA		NA
11795263	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	3971.000	0.000	NA		NA
11510509	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4007.000	0.000	NA		NA
11652872	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4007.000	0.000	NA		NA
11795264	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4007.000	0.000	NA		NA
11510510	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4042.000	0.000	NA		NA
11652873	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4042.000	0.000	NA		NA
11795265	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4042.000	0.000	NA		NA
11510511	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4078.000	0.000	NA		NA
11652874	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4078.000	0.000	NA		NA
11795266	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4078.000	0.000	NA		NA
11510512	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4116.000	0.000	NA		NA
11652875	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4116.000	0.000	NA		NA
11795267	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4116.000	0.000	NA		NA
11510513	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4152.000	0.000	NA		NA
11652876	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4152.000	0.000	NA		NA
11795268	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4152.000	0.000	NA		NA
11510514	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4189.000	0.000	NA		NA
11652877	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4189.000	0.000	NA		NA
11795269	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4189.000	0.000	NA		NA
11510515	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4225.000	0.000	NA		NA
11652878	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4225.000	0.000	NA		NA
11795270	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4225.000	0.000	NA		NA
11510516	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4270.000	0.000	NA		NA
11652879	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4270.000	0.000	NA		NA
11795271	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4270.000	0.000	NA		NA
11510517	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4306.000	0.000	NA		NA
11652880	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4306.000	0.000	NA		NA
11795272	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4306.000	0.000	NA		NA
11510518	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4342.000	0.000	NA		NA
11652881	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4342.000	0.000	NA		NA
11795273	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4342.000	0.000	NA		NA
11510519	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4378.000	0.000	NA		NA
11652882	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4378.000	0.000	NA		NA
11795274	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4378.000	0.000	NA		NA
11510520	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4417.000	0.000	NA		NA
11652883	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4417.000	0.000	NA		NA
11795275	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4417.000	0.000	NA		NA
11510521	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4453.000	0.000	NA		NA
11652884	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4453.000	0.000	NA		NA
11795276	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4453.000	0.000	NA		NA
11510522	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4494.000	0.000	NA		NA
11652885	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4494.000	0.000	NA		NA
11795277	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4494.000	0.000	NA		NA
11510523	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4530.000	0.000	NA		NA
11652886	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4530.000	0.000	NA		NA
11795278	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4530.000	0.000	NA		NA
11510524	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4577.000	0.000	NA		NA
11652887	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4577.000	0.000	NA		NA
11795279	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4577.000	0.000	NA		NA
11510525	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4613.000	0.000	NA		NA
11652888	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4613.000	0.000	NA		NA
11795280	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4613.000	0.000	NA		NA
11510526	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4650.000	0.000	NA		NA
11652889	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4650.000	0.000	NA		NA
11795281	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4650.000	0.000	NA		NA
11510527	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4686.000	0.000	NA		NA
11652890	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4686.000	0.000	NA		NA
11795282	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4686.000	0.000	NA		NA
11510528	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4728.000	0.000	NA		NA
11652891	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4728.000	0.000	NA		NA
11795283	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4728.000	0.000	NA		NA
11510529	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4764.000	0.000	NA		NA
11652892	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4764.000	0.000	NA		NA
11795284	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4764.000	0.000	NA		NA
11510530	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4804.000	0.000	NA		NA
11652893	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4804.000	0.000	NA		NA
11795285	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4804.000	0.000	NA		NA
11510531	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4840.000	0.000	NA		NA
11652894	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4840.000	0.000	NA		NA
11795286	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4840.000	0.000	NA		NA
11510532	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4879.000	0.000	NA		NA
11652895	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4879.000	0.000	NA		NA
11795287	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4879.000	0.000	NA		NA
11510533	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4915.000	0.000	NA		NA
11652896	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4915.000	0.000	NA		NA
11795288	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4915.000	0.000	NA		NA
11510534	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4958.000	0.000	NA		NA
11652897	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4958.000	0.000	NA		NA
11795289	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4958.000	0.000	NA		NA
11510535	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4994.000	0.000	NA		NA
11652898	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4994.000	0.000	NA		NA
11795290	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	4994.000	0.000	NA		NA
11510536	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5031.000	0.000	NA		NA
11652899	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5031.000	0.000	NA		NA
11795291	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5031.000	0.000	NA		NA
11510537	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5067.000	0.000	NA		NA
11652900	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5067.000	0.000	NA		NA
11795292	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5067.000	0.000	NA		NA
11510538	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5104.000	0.000	NA		NA
11652901	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5104.000	0.000	NA		NA
11795293	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5104.000	0.000	NA		NA
11510539	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5140.000	0.000	NA		NA
11652902	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5140.000	0.000	NA		NA
11795294	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5140.000	0.000	NA		NA
11510540	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5177.000	0.000	NA		NA
11652903	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5177.000	0.000	NA		NA
11795295	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5177.000	0.000	NA		NA
11510541	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5213.000	0.000	NA		NA
11652904	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5213.000	0.000	NA		NA
11795296	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5213.000	0.000	NA		NA
11510542	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5246.000	0.000	NA		NA
11652905	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5246.000	0.000	NA		NA
11795297	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5246.000	0.000	NA		NA
11510543	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5282.000	0.000	NA		NA
11652906	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5282.000	0.000	NA		NA
11795298	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5282.000	0.000	NA		NA
11510544	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5323.000	0.000	NA		NA
11652907	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5323.000	0.000	NA		NA
11795299	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5323.000	0.000	NA		NA
11510545	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5359.000	0.000	NA		NA
11652908	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5359.000	0.000	NA		NA
11795300	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5359.000	0.000	NA		NA
11510546	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5398.000	0.000	NA		NA
11652909	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5398.000	0.000	NA		NA
11795301	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5398.000	0.000	NA		NA
11510547	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5434.000	0.000	NA		NA
11652910	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5434.000	0.000	NA		NA
11795302	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5434.000	0.000	NA		NA
11510548	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5471.000	0.000	NA		NA
11652911	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5471.000	0.000	NA		NA
11795303	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5471.000	0.000	NA		NA
11510549	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5507.000	0.000	NA		NA
11652912	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5507.000	0.000	NA		NA
11795304	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5507.000	0.000	NA		NA
11510550	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5544.000	0.000	NA		NA
11652913	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5544.000	0.000	NA		NA
11795305	1221460		CYB_0138			FALSE	NA	5544.000	0.000	NA		NA
1221464	1221465	CYB_0142	CYB_0143			FALSE	0.462	98.000	0.018	NA		NA
1221465	1221466	CYB_0143	CYB_0144			TRUE	0.675	14.000	0.018	NA		NA
1221466	1221467	CYB_0144	CYB_0145			TRUE	0.969	-3.000	0.339	1.000	Y	NA
1221467	1221468	CYB_0145	CYB_0147			TRUE	0.956	11.000	0.080	1.000	Y	NA
1221470	1221471	CYB_0148	CYB_0149	rpmF		FALSE	0.375	112.000	0.002	1.000		NA
1221471	1221472	CYB_0149	CYB_0150			TRUE	0.901	128.000	0.744	NA		NA
1221472	1221473	CYB_0150	CYB_0151			FALSE	0.516	8.000	0.004	NA		NA
1221474	1221475	CYB_0152	CYB_0153			FALSE	0.396	43.000	0.000	NA		NA
1221475	1221476	CYB_0153	CYB_0154		crcB	FALSE	0.010	310.000	0.000	NA		NA
1221476	1221477	CYB_0154	CYB_0155	crcB		TRUE	0.578	53.000	0.000	1.000	N	NA
1221477	1221478	CYB_0155	CYB_0156			FALSE	0.009	328.000	0.000	NA		NA
1221478	1221479	CYB_0156	CYB_0157		hisIE	FALSE	0.430	8.000	0.002	NA		NA
1221479	1221480	CYB_0157	CYB_0158	hisIE		FALSE	0.208	94.000	0.000	NA		NA
1221481	1221482	CYB_0159	CYB_0160	phnC-1	phnD-1	TRUE	0.987	47.000	0.337	0.006	Y	NA
1221482	1221483	CYB_0160	CYB_0161	phnD-1	phnE-1	TRUE	0.982	-31.000	0.330	0.003	Y	NA
1221483	1221484	CYB_0161	CYB_0162	phnE-1		TRUE	0.909	10.000	0.024	0.006		NA
1221484	1221485	CYB_0162	CYB_0163		phnH	TRUE	0.984	9.000	0.967	0.006		NA
1221485	1221486	CYB_0163	CYB_0164	phnH	phnI	TRUE	0.991	-15.000	0.960	0.006	Y	NA
1221486	1221487	CYB_0164	CYB_0165	phnI	phnJ	TRUE	0.981	-16.000	0.880	1.000	Y	NA
1221487	1221488	CYB_0165	CYB_0166	phnJ	phnK	TRUE	0.898	-7.000	0.016	1.000	Y	NA
1221488	1221489	CYB_0166	CYB_0167	phnK	phnL	TRUE	0.942	11.000	0.000	0.025	Y	NA
1221489	1221490	CYB_0167	CYB_0168	phnL		TRUE	0.952	-19.000	0.136	1.000	Y	NA
1221491	1221492	CYB_0169	CYB_0170			FALSE	0.009	450.000	0.000	1.000		NA
1221502	1221503	CYB_0180	CYB_0181	sir		TRUE	0.563	154.000	0.036	1.000		NA
1221503	1221504	CYB_0181	CYB_0182			FALSE	0.217	84.000	0.000	NA		NA
1221504	1221505	CYB_0182	CYB_0183			FALSE	0.208	97.000	0.000	NA		NA
1221505	1221506	CYB_0183	CYB_0184		rpsO	TRUE	0.751	37.000	0.037	NA		NA
1221508	1221509	CYB_0186	CYB_0187	apcD	pilT-1	FALSE	0.471	192.000	0.077	1.000		NA
1221509	1221510	CYB_0187	CYB_0188	pilT-1	folE	FALSE	0.060	243.000	0.000	1.000	N	NA
1221510	1221511	CYB_0188	CYB_0189	folE		TRUE	0.870	113.000	0.391	1.000		NA
1221512	1221513	CYB_0190	CYB_0191			FALSE	0.010	484.000	0.000	1.000	N	NA
1221513	1221514	CYB_0191	CYB_0192		trx-1	FALSE	0.006	673.000	0.000	1.000		NA
1221514	1221515	CYB_0192	CYB_0193	trx-1		TRUE	0.584	115.000	0.036	NA		NA
1221515	1221516	CYB_0193	CYB_0194		trpF	FALSE	0.383	63.000	0.003	NA		NA
1221517	1221518	CYB_0195	CYB_0196			FALSE	0.511	69.000	0.005	1.000		NA
1221519	1221520	CYB_0197	CYB_0198			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1221521	1221522	CYB_0199	CYB_0200		rbfA	FALSE	0.011	297.000	0.000	NA		NA
1221523	1221524	CYB_0201	CYB_0202		phrB-1	FALSE	0.235	123.000	0.000	NA		NA
1221525	1221526	CYB_0203	CYB_0204			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1221529	1221530	CYB_0207	CYB_0208			TRUE	0.983	-7.000	0.306	0.009	Y	NA
1221530	1221531	CYB_0208	CYB_0209			TRUE	0.925	2.000	0.404	NA		NA
1221531	1221532	CYB_0209	CYB_0210			TRUE	0.953	-3.000	0.913	NA		NA
1221532	1221533	CYB_0210	CYB_0211			TRUE	0.942	20.000	0.605	NA		NA
1221533	1221534	CYB_0211	CYB_0212			TRUE	0.941	10.000	0.605	NA		NA
1221534	1221535	CYB_0212	CYB_0214			TRUE	0.970	-3.000	0.489	NA	Y	NA
1221537	1221538	CYB_0215	CYB_0216	carB	psbA-1	FALSE	0.013	357.000	0.000	1.000		NA
1221539	1221540	CYB_0217	CYB_0218			TRUE	0.616	45.000	0.003	1.000		NA
1221540	1221541	CYB_0218	CYB_0219			FALSE	0.380	28.000	0.000	NA		NA
1221541	1221542	CYB_0219	CYB_0220			FALSE	0.175	153.000	0.000	NA		NA
1221543	1221544	CYB_0221	CYB_0223			FALSE	0.129	167.000	0.000	NA		NA
1221545	1221546	CYB_0222	CYB_0224			FALSE	0.378	33.000	0.000	NA		NA
1221547	1221548	CYB_0225	CYB_0226	cobH-1		TRUE	0.945	7.000	0.667	NA		NA
1221548	1221549	CYB_0226	CYB_0227		cbiE/cbiT	TRUE	0.611	1.000	0.012	NA		NA
1221551	1221552	CYB_0229	CYB_0230	sfsA		FALSE	0.208	98.000	0.000	NA		NA
1221552	1221553	CYB_0230	CYB_0231		xth	TRUE	0.605	13.000	0.000	1.000	N	NA
1221553	1221554	CYB_0231	CYB_0233	xth		FALSE	0.144	265.000	0.000	NA	Y	NA
1221556	1221557	CYB_0234	CYB_0235		msrA	FALSE	0.409	82.000	0.000	1.000	N	NA
1221558	1221559	CYB_0236	CYB_0237	cysW	cysT	TRUE	0.957	-10.000	0.156	0.001	N	NA
1221559	1221560	CYB_0237	CYB_0238	cysT	cysA	TRUE	0.718	7.000	0.010	1.000	N	NA
1221560	1221561	CYB_0238	CYB_0239	cysA	sbp	TRUE	0.838	175.000	0.010	0.001	Y	NA
1221561	1221562	CYB_0239	CYB_0240	sbp		FALSE	0.045	259.000	0.000	1.000	N	NA
1221562	1221563	CYB_0240	CYB_0241			TRUE	0.954	11.000	0.071	1.000	Y	NA
1221563	1221564	CYB_0241	CYB_0242			TRUE	0.596	93.000	0.022	1.000	N	NA
1221564	1221565	CYB_0242	CYB_0243		pflA	TRUE	0.588	183.000	0.007	1.000	Y	NA
1221565	1221566	CYB_0243	CYB_0244	pflA		FALSE	0.036	226.000	0.000	NA		NA
1221566	1221567	CYB_0244	CYB_0245		pflB	TRUE	0.537	82.000	0.027	NA		NA
1221570	1221571	CYB_0248	CYB_0249			FALSE	0.097	204.000	0.000	1.000		NA
1221571	1221572	CYB_0249	CYB_0250			FALSE	0.351	85.000	0.000	1.000		NA
1221572	1221573	CYB_0250	CYB_0251			FALSE	0.325	-13.000	0.000	NA		NA
1221573	1221574	CYB_0251	CYB_0252			FALSE	0.325	-13.000	0.000	NA		NA
1221578	1221579	CYB_0256	CYB_0257			FALSE	0.375	3.000	0.000	NA		NA
1221579	1221580	CYB_0257	CYB_0258			FALSE	0.082	185.000	0.000	NA		NA
1221580	1221581	CYB_0258	CYB_0259			FALSE	0.163	182.000	0.000	1.000		NA
1221582	1221583	CYB_0260	CYB_0261	hisC		TRUE	0.594	49.000	0.000	1.000	N	NA
1221583	1221584	CYB_0261	CYB_0262		ffh	TRUE	0.596	10.000	0.002	1.000	N	NA
1221587	1221588	CYB_0265	CYB_0266			TRUE	0.865	83.000	0.500	NA		NA
1221588	1221589	CYB_0266	CYB_0267			TRUE	0.891	68.000	0.500	NA		NA
1221589	1221590	CYB_0267	CYB_0268			TRUE	0.970	23.000	0.250	1.000	Y	NA
1221590	1221591	CYB_0268	CYB_0269			FALSE	0.190	149.000	0.000	NA		NA
1221592	1221593	CYB_0270	CYB_0271	ndk		FALSE	0.277	88.000	0.002	NA	N	NA
1221593	1221594	CYB_0271	CYB_0272			TRUE	0.780	51.000	0.048	NA		NA
1221595	1221596	CYB_0273	CYB_0274			TRUE	0.537	108.000	0.011	1.000	N	NA
1221596	1221597	CYB_0274	CYB_0275			FALSE	0.006	358.000	0.000	NA		NA
1221597	1221598	CYB_0275	CYB_0276			TRUE	0.786	52.000	0.049	NA		NA
1221598	1221599	CYB_0276	CYB_0277			TRUE	0.662	77.000	0.049	NA		NA
1221599	1221600	CYB_0277	CYB_0278		thiC	FALSE	0.040	219.000	0.000	NA		NA
1221600	1221601	CYB_0278	CYB_0279	thiC		FALSE	0.102	211.000	0.000	1.000	N	NA
1221603	1221604	CYB_0281	CYB_0282	psbB	psbT	TRUE	0.936	107.000	0.651	0.090		NA
1221604	1221605	CYB_0282	CYB_0283	psbT		FALSE	0.010	400.000	0.000	1.000		NA
1221606	1221607	CYB_0284	CYB_0285	purQ	purS	TRUE	0.983	116.000	0.656	0.001	Y	NA
1221608	1221609	CYB_0286	CYB_0287		comB	FALSE	0.390	17.000	0.000	NA		NA
1221611	1221612	CYB_0289	CYB_0290	argC		FALSE	0.367	-66.000	0.003	NA		NA
1221614	1221615	CYB_0292	CYB_0293	murD		TRUE	0.609	-91.000	0.006	1.000	N	NA
1221615	1221616	CYB_0293	CYB_0294			FALSE	0.388	12.000	0.000	NA		NA
1221617	1221618	CYB_0295	CYB_0296			FALSE	0.209	91.000	0.000	NA		NA
1221620	1221621	CYB_0298	CYB_0299			FALSE	0.209	254.000	0.000	1.000	Y	NA
1221622	1221623	CYB_0300	CYB_0301	cdsA	valS	FALSE	0.005	824.000	0.000	1.000		NA
1221623	1221624	CYB_0301	CYB_0302	valS		FALSE	0.048	247.000	0.000	1.000		NA
1221625	1221626	CYB_0303	CYB_0304			FALSE	0.311	-30.000	0.000	NA		NA
1221626	1221627	CYB_0304	CYB_0305			FALSE	0.327	-12.000	0.000	NA		NA
1221627	1221628	CYB_0305	CYB_0306			FALSE	0.232	125.000	0.000	NA		NA
1221628	1221629	CYB_0306	CYB_0307			FALSE	0.143	161.000	0.000	NA		NA
1221629	1221630	CYB_0307	CYB_0308			FALSE	0.295	-153.000	0.000	NA		NA
1221630	1221631	CYB_0308	CYB_0309			FALSE	0.218	168.000	0.000	1.000		NA
1221631	1221632	CYB_0309	CYB_0310			TRUE	0.818	44.000	0.000	0.089		NA
1221632	1221633	CYB_0310	CYB_0311			FALSE	0.006	359.000	0.000	NA		NA
1221633	1221634	CYB_0311	CYB_0312		ftsY	FALSE	0.208	97.000	0.000	NA		NA
1221634	1221635	CYB_0312	CYB_0313	ftsY		FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
1221635	1221636	CYB_0313	CYB_0314			FALSE	0.259	69.000	0.000	NA		NA
1221636	1221637	CYB_0314	CYB_0315			FALSE	0.003	813.000	0.000	NA		NA
1221638	1221639	CYB_0316	CYB_0317	minC	minD	TRUE	0.970	-3.000	0.368	1.000	Y	NA
1221639	1221640	CYB_0317	CYB_0318	minD	minE	TRUE	0.928	92.000	0.347	NA	Y	NA
1221640	1221641	CYB_0318	CYB_0320	minE		FALSE	0.007	398.000	0.000	NA	N	NA
1221642	1221643	CYB_0319	CYB_0321			TRUE	0.711	43.000	0.024	NA		NA
1221643	1221644	CYB_0321	CYB_0322		gyrB	FALSE	0.083	212.000	0.000	1.000		NA
1221644	1221645	CYB_0322	CYB_0323	gyrB	rimM	FALSE	0.124	202.000	0.000	1.000	N	NA
1221645	1221646	CYB_0323	CYB_0324	rimM		TRUE	0.625	13.000	0.002	1.000	N	NA
1221647	1221648	CYB_0325	CYB_0326			TRUE	0.880	72.000	0.333	1.000	N	NA
1221648	1221649	CYB_0326	CYB_0327		leuC	FALSE	0.166	190.000	0.000	1.000	N	NA
1221650	1221651	CYB_0328	CYB_0329			FALSE	0.090	182.000	0.000	NA		NA
1221651	1221652	CYB_0329	CYB_0330			FALSE	0.318	71.000	0.000	NA	N	NA
1221652	1221653	CYB_0330	CYB_0331			FALSE	0.269	89.000	0.000	NA	N	NA
1221654	1221655	CYB_0332	CYB_0333			TRUE	0.741	114.000	0.051	1.000	N	NA
1221657	1221658	CYB_0335	CYB_0336			FALSE	0.230	128.000	0.000	NA		NA
1221658	1221659	CYB_0336	CYB_0337			FALSE	0.036	261.000	0.000	1.000		NA
1221662	1221663	CYB_0340	CYB_0341			TRUE	0.901	23.000	0.222	NA		NA
1221663	1221664	CYB_0341	CYB_0342			FALSE	0.007	348.000	0.000	NA		NA
1221664	1221665	CYB_0342	CYB_0343		pyrF	FALSE	0.519	48.000	0.005	NA		NA
1221665	1221666	CYB_0343	CYB_0344	pyrF		FALSE	0.440	-3.000	0.003	NA		NA
1221666	1221667	CYB_0344	CYB_0345			FALSE	0.003	597.000	0.000	NA		NA
1221667	1221668	CYB_0345	CYB_0346			FALSE	0.418	-3.000	0.003	NA		NA
1221670	1221671	CYB_0348	CYB_0349	gcvH		FALSE	0.477	82.000	0.006	1.000		NA
1221674	1221675	CYB_0352	CYB_0353			FALSE	0.273	141.000	0.000	NA	N	NA
1221677	1221678	CYB_0355	CYB_0356			FALSE	0.397	41.000	0.000	NA		NA
1221681	1221682	CYB_0359	CYB_0360	murI		TRUE	0.545	183.000	0.002	1.000	Y	NA
1221683	1221684	CYB_0361	CYB_0362		cbiT	FALSE	0.007	354.000	0.000	NA		NA
1221684	1221685	CYB_0362	CYB_0363	cbiT		FALSE	0.386	198.000	0.087	NA		NA
1221687	1221688	CYB_0365	CYB_0366			FALSE	0.020	258.000	0.000	NA		NA
1221688	1221689	CYB_0366	CYB_0367		cobU	FALSE	0.003	695.000	0.000	NA		NA
1221689	1221690	CYB_0367	CYB_0368	cobU		TRUE	0.565	38.000	0.006	NA		NA
1221690	1221691	CYB_0368	CYB_0370			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1221692	1221693	CYB_0369	CYB_0371		psbA-2	FALSE	0.006	371.000	0.000	NA		NA
1221693	1221694	CYB_0371	CYB_0372	psbA-2		FALSE	0.499	108.000	0.011	1.000		NA
1221694	1221695	CYB_0372	CYB_0373			TRUE	0.692	5.000	0.011	1.000		NA
1221695	1221696	CYB_0373	CYB_0374			TRUE	0.585	109.000	0.039	NA		NA
1221697	1221698	CYB_0375	CYB_0376			TRUE	0.745	78.000	0.000	NA	Y	NA
1221698	1221699	CYB_0376	CYB_0377			FALSE	0.003	606.000	0.000	NA		NA
1221699	1221700	CYB_0377	CYB_0378			FALSE	0.296	85.000	0.003	NA		NA
1221700	1221701	CYB_0378	CYB_0379		cobH-2	FALSE	0.456	85.000	0.003	1.000	N	NA
1221701	1221702	CYB_0379	CYB_0380	cobH-2		FALSE	0.004	501.000	0.000	NA		NA
1221703	1221704	CYB_0381	CYB_0382			FALSE	0.405	116.000	0.002	1.000		NA
1221706	1221707	CYB_0384	CYB_0385			TRUE	0.881	52.000	0.154	NA		NA
1221707	1221708	CYB_0385	CYB_0386			TRUE	0.880	-3.000	0.195	NA		NA
1221708	1221709	CYB_0386	CYB_0387			TRUE	0.775	-3.000	0.049	NA		NA
1221709	1221710	CYB_0387	CYB_0388			TRUE	0.705	67.000	0.049	NA		NA
1221710	1221711	CYB_0388	CYB_0389			TRUE	0.981	7.000	0.976	0.031		NA
1221711	1221712	CYB_0389	CYB_0390			TRUE	0.953	-10.000	0.864	1.000		NA
1221712	1221713	CYB_0390	CYB_0391			TRUE	0.930	-28.000	0.591	1.000		NA
1221715	1221716	CYB_0392	CYB_0394			FALSE	0.386	32.000	0.002	NA		NA
1221716	1221717	CYB_0394	CYB_0395			TRUE	0.564	45.000	0.002	1.000		NA
1221717	1221718	CYB_0395	CYB_0396			TRUE	0.594	60.000	0.015	NA		NA
1221720	1221721	CYB_0398	CYB_0399	modB	modA	TRUE	0.962	38.000	0.103	0.001	N	NA
1221721	1221722	CYB_0399	CYB_0400	modA		FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
1221724	1221725	CYB_0402	CYB_0403			FALSE	0.008	343.000	0.000	NA		NA
1221725	1221726	CYB_0403	CYB_0404			TRUE	0.803	100.000	0.250	NA		NA
1221726	1221727	CYB_0404	CYB_0405			TRUE	0.920	29.000	0.250	1.000		NA
1221727	1221728	CYB_0405	CYB_0406		nifW	TRUE	0.766	43.000	0.022	1.000		NA
1221728	1221729	CYB_0406	CYB_0407	nifW		TRUE	0.818	-3.000	0.067	NA		NA
1221729	1221730	CYB_0407	CYB_0408			TRUE	0.832	67.000	0.179	NA		NA
1221730	1221731	CYB_0408	CYB_0409		nifX	TRUE	0.894	3.000	0.210	NA		NA
1221731	1221732	CYB_0409	CYB_0410	nifX	nifN	TRUE	0.952	82.000	0.663	0.006		NA
1221732	1221733	CYB_0410	CYB_0411	nifN	nifE	TRUE	0.989	0.000	0.475	0.003	Y	NA
1221733	1221734	CYB_0411	CYB_0412	nifE		TRUE	0.574	-9.000	0.013	NA		NA
1221734	1221735	CYB_0412	CYB_0413			TRUE	0.827	4.000	0.061	NA		NA
1221735	1221736	CYB_0413	CYB_0414		dpsA	TRUE	0.866	43.000	0.091	NA		NA
1221736	1221737	CYB_0414	CYB_0415	dpsA		TRUE	0.891	55.000	0.231	NA		NA
1221737	1221738	CYB_0415	CYB_0416			FALSE	0.004	487.000	0.000	NA		NA
1221739	1221740	CYB_0417	CYB_0418	nifB		TRUE	0.761	26.000	0.024	1.000		NA
1221740	1221741	CYB_0418	CYB_0419		nifS	TRUE	0.767	44.000	0.023	1.000		NA
1221741	1221742	CYB_0419	CYB_0420	nifS	nifU	TRUE	0.953	57.000	0.716	1.000	N	NA
1221742	1221743	CYB_0420	CYB_0421	nifU	nifH	FALSE	0.035	278.000	0.000	1.000	N	NA
1221743	1221744	CYB_0421	CYB_0422	nifH	nifD	TRUE	0.895	96.000	0.065	0.001	N	NA
1221744	1221745	CYB_0422	CYB_0423	nifD	nifK	TRUE	0.990	66.000	0.902	0.001	Y	NA
1221745	1221746	CYB_0423	CYB_0424	nifK	nifV	FALSE	0.051	254.000	0.000	1.000	N	NA
1221746	1221747	CYB_0424	CYB_0425	nifV		FALSE	0.329	-10.000	0.000	NA		NA
1221747	1221748	CYB_0425	CYB_0426		nifZ	FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1221748	1221749	CYB_0426	CYB_0427	nifZ		TRUE	0.964	-3.000	0.354	0.006		NA
1221749	1221750	CYB_0427	CYB_0428			FALSE	0.478	153.000	0.011	1.000	N	NA
1221750	1221751	CYB_0428	CYB_0429			FALSE	0.210	142.000	0.000	NA		NA
1221754	1221755	CYB_0432	CYB_0433	ruvB	psbA-3	FALSE	0.359	141.000	0.002	1.000		NA
1221756	1221757	CYB_0434	CYB_0435		efp	TRUE	0.604	37.000	0.002	1.000	N	NA
1221757	1221758	CYB_0435	CYB_0436	efp	accB	TRUE	0.838	70.000	0.120	1.000	N	NA
1221758	1221759	CYB_0436	CYB_0437	accB		FALSE	0.011	395.000	0.000	1.000		NA
1221759	1221760	CYB_0437	CYB_0438		cysH	FALSE	0.378	77.000	0.000	1.000		NA
1221760	1221761	CYB_0438	CYB_0439	cysH		TRUE	0.607	4.000	0.003	1.000		NA
1221761	1221762	CYB_0439	CYB_0440			FALSE	0.233	116.000	0.000	NA		NA
1221764	1221765	CYB_0442	CYB_0443			FALSE	0.023	250.000	0.000	NA		NA
1221766	1221767	CYB_0444	CYB_0445	cysQ	hisF	TRUE	0.625	16.000	0.002	1.000	N	NA
1221767	1221768	CYB_0445	CYB_0446	hisF		TRUE	0.543	62.000	0.002	1.000	N	NA
1221768	1221769	CYB_0446	CYB_0447			FALSE	0.393	-3.000	0.002	NA		NA
1221769	1221770	CYB_0447	CYB_0448		rpsP	TRUE	0.528	53.000	0.006	NA		NA
1221777	1221778	CYB_0455	CYB_0456	pdxJ		FALSE	0.508	15.000	0.004	NA		NA
1221778	1221779	CYB_0456	CYB_0457			TRUE	0.552	13.000	0.005	NA		NA
1221779	1221780	CYB_0457	CYB_0458			TRUE	0.778	27.000	0.030	1.000		NA
1221780	1221781	CYB_0458	CYB_0459			FALSE	0.217	84.000	0.000	NA		NA
1221783	1221784	CYB_0461	CYB_0462			FALSE	0.345	106.000	0.006	NA		NA
1221785	1221786	CYB_0463	CYB_0464			FALSE	0.446	65.000	0.000	1.000		NA
1221786	1221787	CYB_0464	CYB_0465			TRUE	0.884	46.000	0.000	1.000	Y	NA
1221789	1221790	CYB_0467	CYB_0468			FALSE	0.023	252.000	0.000	NA		NA
1221790	1221791	CYB_0468	CYB_0469			FALSE	0.056	202.000	0.000	NA		NA
1221791	1221792	CYB_0469	CYB_0470			FALSE	0.379	30.000	0.000	NA		NA
1221793	1221794	CYB_0471	CYB_0472			FALSE	0.003	633.000	0.000	NA		NA
1221794	1221795	CYB_0472	CYB_0473			FALSE	0.382	27.000	0.000	NA		NA
1221795	1221796	CYB_0473	CYB_0474			TRUE	0.949	-27.000	1.000	NA		NA
1221798	1221799	CYB_0476	CYB_0477			FALSE	0.381	5.000	0.000	NA		NA
1221800	1221801	CYB_0478	CYB_0479		ilvE	TRUE	0.681	66.000	0.027	1.000		NA
1221802	1221803	CYB_0480	CYB_0481			FALSE	0.017	266.000	0.000	NA		NA
1221806	1221807	CYB_0484	CYB_0485			FALSE	0.214	263.000	0.240	NA		NA
1221807	1221808	CYB_0485	CYB_0486		pilN	TRUE	0.948	0.000	0.760	NA		NA
1221808	1221809	CYB_0486	CYB_0487	pilN	pilM	TRUE	0.934	61.000	0.087	NA	Y	NA
1221809	1221810	CYB_0487	CYB_0488	pilM	kaiC	FALSE	0.089	220.000	0.000	1.000	N	NA
1221810	1221811	CYB_0488	CYB_0489	kaiC	kaiB	TRUE	0.965	29.000	0.927	1.000		NA
1221811	1221812	CYB_0489	CYB_0490	kaiB	kaiA	TRUE	0.956	3.000	0.732	1.000		NA
1221813	1221814	CYB_0491	CYB_0492		pgsA	FALSE	0.419	79.000	0.000	1.000	N	NA
1221814	1221815	CYB_0492	CYB_0493	pgsA	ruvC	FALSE	0.022	320.000	0.000	1.000	N	NA
1221815	1221816	CYB_0493	CYB_0494	ruvC		FALSE	0.378	96.000	0.002	1.000		NA
1221818	1221819	CYB_0496	CYB_0497			TRUE	0.850	7.000	0.080	NA		NA
1221819	1221820	CYB_0497	CYB_0498			FALSE	0.034	230.000	0.000	NA		NA
1221820	1221821	CYB_0498	CYB_0499			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1221821	1221822	CYB_0499	CYB_0500		rumA	FALSE	0.397	42.000	0.000	NA		NA
1221822	1221823	CYB_0500	CYB_0501	rumA		FALSE	0.210	107.000	0.000	NA		NA
1221824	1221825	CYB_0502	CYB_0503			TRUE	0.801	4.000	0.050	NA		NA
11510551	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4298.000	0.000	NA		NA
11652914	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4298.000	0.000	NA		NA
11795306	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4298.000	0.000	NA		NA
11510552	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4334.000	0.000	NA		NA
11652915	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4334.000	0.000	NA		NA
11795307	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4334.000	0.000	NA		NA
11510553	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4373.000	0.000	NA		NA
11652916	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4373.000	0.000	NA		NA
11795308	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4373.000	0.000	NA		NA
11510554	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4409.000	0.000	NA		NA
11652917	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4409.000	0.000	NA		NA
11795309	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4409.000	0.000	NA		NA
11510555	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4448.000	0.000	NA		NA
11652918	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4448.000	0.000	NA		NA
11795310	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4448.000	0.000	NA		NA
11510556	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4484.000	0.000	NA		NA
11652919	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4484.000	0.000	NA		NA
11795311	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4484.000	0.000	NA		NA
11510557	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4524.000	0.000	NA		NA
11652920	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4524.000	0.000	NA		NA
11795312	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4524.000	0.000	NA		NA
11510558	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4560.000	0.000	NA		NA
11652921	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4560.000	0.000	NA		NA
11795313	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4560.000	0.000	NA		NA
11510559	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4596.000	0.000	NA		NA
11652922	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4596.000	0.000	NA		NA
11795314	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4596.000	0.000	NA		NA
11510560	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4632.000	0.000	NA		NA
11652923	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4632.000	0.000	NA		NA
11795315	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4632.000	0.000	NA		NA
11510561	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4669.000	0.000	NA		NA
11652924	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4669.000	0.000	NA		NA
11795316	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4669.000	0.000	NA		NA
11510562	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4705.000	0.000	NA		NA
11652925	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4705.000	0.000	NA		NA
11795317	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4705.000	0.000	NA		NA
11510563	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4743.000	0.000	NA		NA
11652926	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4743.000	0.000	NA		NA
11795318	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4743.000	0.000	NA		NA
11510564	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4779.000	0.000	NA		NA
11652927	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4779.000	0.000	NA		NA
11795319	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4779.000	0.000	NA		NA
11510565	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4823.000	0.000	NA		NA
11652928	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4823.000	0.000	NA		NA
11795320	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4823.000	0.000	NA		NA
11510566	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4859.000	0.000	NA		NA
11652929	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4859.000	0.000	NA		NA
11795321	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4859.000	0.000	NA		NA
11510567	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4903.000	0.000	NA		NA
11652930	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4903.000	0.000	NA		NA
11795322	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4903.000	0.000	NA		NA
11510568	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4939.000	0.000	NA		NA
11652931	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4939.000	0.000	NA		NA
11795323	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4939.000	0.000	NA		NA
11510569	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4975.000	0.000	NA		NA
11652932	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4975.000	0.000	NA		NA
11795324	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	4975.000	0.000	NA		NA
11510570	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5011.000	0.000	NA		NA
11652933	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5011.000	0.000	NA		NA
11795325	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5011.000	0.000	NA		NA
11510571	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5051.000	0.000	NA		NA
11652934	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5051.000	0.000	NA		NA
11795326	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5051.000	0.000	NA		NA
11510572	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5087.000	0.000	NA		NA
11652935	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5087.000	0.000	NA		NA
11795327	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5087.000	0.000	NA		NA
11510573	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5129.000	0.000	NA		NA
11652936	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5129.000	0.000	NA		NA
11795328	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5129.000	0.000	NA		NA
11510574	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5165.000	0.000	NA		NA
11652937	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5165.000	0.000	NA		NA
11795329	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5165.000	0.000	NA		NA
11510575	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5203.000	0.000	NA		NA
11652938	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5203.000	0.000	NA		NA
11795330	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5203.000	0.000	NA		NA
11510576	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5239.000	0.000	NA		NA
11652939	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5239.000	0.000	NA		NA
11795331	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5239.000	0.000	NA		NA
11510577	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5281.000	0.000	NA		NA
11652940	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5281.000	0.000	NA		NA
11795332	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5281.000	0.000	NA		NA
11510578	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5317.000	0.000	NA		NA
11652941	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5317.000	0.000	NA		NA
11795333	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5317.000	0.000	NA		NA
11510579	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5357.000	0.000	NA		NA
11652942	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5357.000	0.000	NA		NA
11795334	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5357.000	0.000	NA		NA
11510580	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5393.000	0.000	NA		NA
11652943	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5393.000	0.000	NA		NA
11795335	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5393.000	0.000	NA		NA
11510581	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5429.000	0.000	NA		NA
11652944	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5429.000	0.000	NA		NA
11795336	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5429.000	0.000	NA		NA
11510582	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5465.000	0.000	NA		NA
11652945	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5465.000	0.000	NA		NA
11795337	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5465.000	0.000	NA		NA
11510583	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5502.000	0.000	NA		NA
11652946	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5502.000	0.000	NA		NA
11795338	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5502.000	0.000	NA		NA
11510584	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5538.000	0.000	NA		NA
11652947	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5538.000	0.000	NA		NA
11795339	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5538.000	0.000	NA		NA
11510585	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5583.000	0.000	NA		NA
11652948	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5583.000	0.000	NA		NA
11795340	1221821		CYB_0499			FALSE	NA	5583.000	0.000	NA		NA
1221826	1221827	CYB_0504	CYB_0505			FALSE	0.208	99.000	0.000	NA		NA
1221827	1221828	CYB_0505	CYB_0506			TRUE	0.954	63.000	1.000	1.000		NA
1221832	1221833	CYB_0510	CYB_0511		tgt	FALSE	0.375	3.000	0.000	NA		NA
1221833	1221834	CYB_0511	CYB_0512	tgt		FALSE	0.295	120.000	0.003	NA		NA
1221834	1221835	CYB_0512	CYB_0513			TRUE	0.915	95.000	1.000	NA		NA
1221835	1221836	CYB_0513	CYB_0514			TRUE	0.967	7.000	1.000	1.000		NA
1221839	1221840	CYB_0517	CYB_0518			FALSE	0.007	447.000	0.000	NA	N	NA
1221844	1221845	CYB_0522	CYB_0523		bcp-1	FALSE	0.247	175.000	0.002	1.000	N	NA
1221845	1221846	CYB_0523	CYB_0524	bcp-1	infC	TRUE	0.608	16.000	0.002	1.000	N	NA
1221847	1221848	CYB_0525	CYB_0526			TRUE	0.847	42.000	0.069	NA		NA
1221848	1221849	CYB_0526	CYB_0527			TRUE	0.565	41.000	0.000	1.000		NA
1221849	1221850	CYB_0527	CYB_0528			FALSE	0.368	80.000	0.000	1.000		NA
1221852	1221853	CYB_0530	CYB_0531			FALSE	0.241	75.000	0.000	NA		NA
1221854	1221855	CYB_0532	CYB_0533		chlG	FALSE	0.112	174.000	0.000	NA		NA
1221855	1221856	CYB_0533	CYB_0534	chlG		FALSE	0.003	807.000	0.000	NA		NA
1221856	1221857	CYB_0534	CYB_0535		trpE	TRUE	0.559	16.000	0.006	NA		NA
1221858	1221859	CYB_0536	CYB_0537			FALSE	0.016	272.000	0.000	NA		NA
1221861	1221862	CYB_0539	CYB_0540			FALSE	0.385	47.000	0.000	NA		NA
1221863	1221864	CYB_0541	CYB_0542	lspA		FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1221866	1221867	CYB_0544	CYB_0545			FALSE	0.367	0.000	0.000	NA		NA
1221868	1221869	CYB_0546	CYB_0547	ruvA	nadD	TRUE	0.585	-3.000	0.002	1.000	N	NA
1221869	1221870	CYB_0547	CYB_0548	nadD		FALSE	0.371	147.000	0.000	1.000	N	NA
1221873	1221874	CYB_0551	CYB_0552			TRUE	0.740	4.000	0.036	NA		NA
1221874	1221875	CYB_0552	CYB_0553			FALSE	0.255	136.000	0.002	NA		NA
1221875	1221876	CYB_0553	CYB_0554			FALSE	0.484	138.000	0.019	NA		NA
1221876	1221877	CYB_0554	CYB_0555			TRUE	0.856	58.000	0.118	NA		NA
1221879	1221880	CYB_0557	CYB_0558			FALSE	0.226	81.000	0.000	NA		NA
1221883	1221884	CYB_0561	CYB_0562			TRUE	0.549	161.000	0.038	1.000	N	NA
1221884	1221885	CYB_0562	CYB_0563			FALSE	0.006	374.000	0.000	NA		NA
1221885	1221886	CYB_0563	CYB_0564			FALSE	0.214	108.000	0.000	NA		NA
1221887	1221888	CYB_0565	CYB_0566	menB	cobA/hemD	TRUE	0.817	118.000	0.005	1.000	Y	NA
1221888	1221889	CYB_0566	CYB_0567	cobA/hemD		FALSE	0.221	136.000	0.000	NA		NA
1221894	1221895	CYB_0572	CYB_0573			FALSE	0.331	60.000	0.000	NA		NA
1221895	1221896	CYB_0573	CYB_0574			FALSE	0.313	62.000	0.000	NA		NA
1221896	1221897	CYB_0574	CYB_0575			TRUE	0.852	25.000	0.000	0.008		NA
1221897	1221898	CYB_0575	CYB_0576			TRUE	0.735	189.000	0.667	1.000		NA
1221900	1221901	CYB_0578	CYB_0579			FALSE	0.017	353.000	0.000	1.000	N	NA
1221901	1221902	CYB_0579	CYB_0580			TRUE	0.926	27.000	0.250	1.000	N	NA
1221902	1221903	CYB_0580	CYB_0581			TRUE	0.981	-3.000	0.778	1.000	Y	NA
1221903	1221904	CYB_0581	CYB_0582			TRUE	0.815	126.000	0.111	1.000	N	NA
1221904	1221905	CYB_0582	CYB_0584			FALSE	0.003	938.000	0.000	NA		NA
1221906	1221907	CYB_0585	CYB_0586			TRUE	0.903	50.000	0.250	NA		NA
1221907	1221908	CYB_0586	CYB_0587			TRUE	0.907	11.000	0.250	NA		NA
1221908	1221909	CYB_0587	CYB_0588			TRUE	0.911	3.000	0.333	NA		NA
1221909	1221910	CYB_0588	CYB_0589			TRUE	0.942	-3.000	0.714	NA		NA
1221910	1221911	CYB_0589	CYB_0590			TRUE	0.839	167.000	0.130	NA	Y	NA
1221911	1221912	CYB_0590	CYB_0591			FALSE	0.388	20.000	0.000	NA		NA
1221912	1221913	CYB_0591	CYB_0592			FALSE	0.378	4.000	0.000	NA		NA
1221913	1221914	CYB_0592	CYB_0593		csx10	TRUE	0.931	-3.000	0.600	NA		NA
1221914	1221915	CYB_0593	CYB_0594	csx10		TRUE	0.935	0.000	0.600	NA		NA
1221915	1221916	CYB_0594	CYB_0595		crm2-1	TRUE	0.937	0.000	0.625	NA		NA
1221917	1221918	CYB_0596	CYB_0598	cas6		FALSE	0.002	1195.000	0.000	NA		NA
1221920	1221921	CYB_0599	CYB_0600	csx3		FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
1221922	1221923	CYB_0601	CYB_0602		ntrC-2	TRUE	0.972	72.000	0.200	0.003	Y	NA
1221923	1221924	CYB_0602	CYB_0603	ntrC-2	ntrB-2	TRUE	0.988	69.000	0.867	0.003	Y	NA
1221924	1221925	CYB_0603	CYB_0604	ntrB-2		FALSE	0.247	522.000	0.867	NA	Y	NA
1221926	1221927	CYB_0605	CYB_0606			FALSE	0.105	176.000	0.000	NA		NA
1221927	1221928	CYB_0606	CYB_0607		clpC	FALSE	0.236	119.000	0.000	NA		NA
1221928	1221929	CYB_0607	CYB_0608	clpC	clpP-1	TRUE	0.873	128.000	0.039	1.000	Y	NA
1221929	1221930	CYB_0608	CYB_0609	clpP-1		FALSE	0.390	18.000	0.000	NA		NA
1221930	1221931	CYB_0609	CYB_0610		clpP	FALSE	0.300	-52.000	0.000	NA		NA
1221931	1221932	CYB_0610	CYB_0611	clpP		TRUE	0.621	108.000	0.048	NA		NA
1221935	1221936	CYB_0614	CYB_0615			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1221937	1221938	CYB_0616	CYB_0618			FALSE	0.007	349.000	0.000	NA		NA
1221941	1221942	CYB_0619	CYB_0621			FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
1221945	1221946	CYB_0624	CYB_0625	tyrA		FALSE	0.457	69.000	0.000	1.000	N	NA
1221946	1221947	CYB_0625	CYB_0626			TRUE	0.936	112.000	0.371	NA	Y	NA
1221947	1221948	CYB_0626	CYB_0628			FALSE	0.008	342.000	0.000	NA		NA
1221950	1221951	CYB_0629	CYB_0630			FALSE	0.253	71.000	0.000	NA		NA
1221951	1221952	CYB_0630	CYB_0631		hflB	FALSE	0.268	142.000	0.000	NA	N	NA
1221953	1221954	CYB_0632	CYB_0633			FALSE	0.009	499.000	0.000	1.000	N	NA
1221954	1221955	CYB_0633	CYB_0634			FALSE	0.382	35.000	0.000	NA		NA
1221955	1221956	CYB_0634	CYB_0635			FALSE	0.229	129.000	0.000	NA		NA
1221957	1221958	CYB_0636	CYB_0637			FALSE	0.465	68.000	0.000	1.000	N	NA
1221958	1221959	CYB_0637	CYB_0638			FALSE	0.003	532.000	0.000	NA		NA
1221959	1221960	CYB_0638	CYB_0639			FALSE	0.003	676.000	0.000	NA		NA
1221960	1221961	CYB_0639	CYB_0640			FALSE	0.016	269.000	0.000	NA		NA
1221961	1221962	CYB_0640	CYB_0641			FALSE	0.306	-42.000	0.000	NA		NA
1221962	1221963	CYB_0641	CYB_0642			FALSE	0.034	263.000	0.000	1.000		NA
1221965	1221966	CYB_0644	CYB_0645			TRUE	0.668	81.000	0.051	NA		NA
1221966	1221967	CYB_0645	CYB_0646		glgA-1	FALSE	0.003	546.000	0.000	NA		NA
1221967	1221968	CYB_0646	CYB_0647	glgA-1		FALSE	0.478	160.000	0.025	1.000		NA
1221970	1221971	CYB_0649	CYB_0650			FALSE	0.486	110.000	0.007	1.000		NA
1221974	1221975	CYB_0653	CYB_0654			TRUE	0.566	14.000	0.006	NA		NA
1221975	1221976	CYB_0654	CYB_0655		alr	FALSE	0.084	184.000	0.000	NA		NA
1221976	1221977	CYB_0655	CYB_0656	alr	sppA-1	TRUE	0.739	45.000	0.012	1.000	N	NA
1221979	1221980	CYB_0658	CYB_0659			FALSE	0.388	20.000	0.000	NA		NA
1221980	1221981	CYB_0659	CYB_0660		cyoE	FALSE	0.005	451.000	0.000	NA		NA
1221981	1221982	CYB_0660	CYB_0661	cyoE		TRUE	0.952	54.000	0.090	1.000	Y	NA
1221982	1221983	CYB_0661	CYB_0662			FALSE	0.007	650.000	0.000	1.000	N	NA
1221984	1221985	CYB_0663	CYB_0664			FALSE	0.009	331.000	0.000	NA		NA
1221986	1221987	CYB_0665	CYB_0666			FALSE	0.397	42.000	0.000	NA		NA
1221987	1221988	CYB_0666	CYB_0667			TRUE	0.801	10.000	0.031	1.000	N	NA
1221988	1221989	CYB_0667	CYB_0668			FALSE	0.086	222.000	0.000	1.000	N	NA
1221989	1221990	CYB_0668	CYB_0669		recQ	TRUE	0.707	148.000	0.054	1.000	N	NA
1221991	1221992	CYB_0670	CYB_0671		hisB	FALSE	0.386	36.000	0.000	NA		NA
1221992	1221993	CYB_0671	CYB_0672	hisB		FALSE	0.375	3.000	0.000	NA		NA
1221993	1221994	CYB_0672	CYB_0673		psbY	FALSE	0.194	148.000	0.000	NA		NA
1221994	1221995	CYB_0673	CYB_0674	psbY		TRUE	0.737	35.000	0.017	1.000		NA
1221995	1221996	CYB_0674	CYB_0675			FALSE	0.181	178.000	0.000	1.000		NA
1221996	1221997	CYB_0675	CYB_0676			TRUE	0.752	11.000	0.037	NA		NA
1221997	1221998	CYB_0676	CYB_0677			FALSE	0.235	123.000	0.000	NA		NA
1221998	1221999	CYB_0677	CYB_0679			TRUE	0.588	48.000	0.009	NA		NA
1222001	1222002	CYB_0680	CYB_0681			TRUE	0.879	-7.000	0.222	NA		NA
1222003	1222004	CYB_0682	CYB_0683		clpS-1	TRUE	0.922	16.000	0.378	NA		NA
1222005	1222006	CYB_0684	CYB_0685	phoD		FALSE	0.027	241.000	0.000	NA		NA
1222007	1222008	CYB_0686	CYB_0687			FALSE	0.215	85.000	0.000	NA		NA
1222008	1222009	CYB_0687	CYB_0688			TRUE	0.866	149.000	0.667	NA		NA
1222010	1222011	CYB_0689	CYB_0690			TRUE	0.914	-3.000	0.400	NA		NA
1222011	1222012	CYB_0690	CYB_0691			TRUE	0.839	95.000	0.400	NA		NA
1222012	1222013	CYB_0691	CYB_0692			FALSE	0.207	102.000	0.000	NA		NA
1222014	1222015	CYB_0693	CYB_0694		hisS	TRUE	0.624	-6.000	0.018	NA		NA
1222015	1222016	CYB_0694	CYB_0695	hisS		FALSE	0.390	95.000	0.003	1.000		NA
1222016	1222017	CYB_0695	CYB_0696		prmA	FALSE	0.514	-63.000	0.003	1.000		NA
1222018	1222019	CYB_0697	CYB_0699			FALSE	0.213	141.000	0.000	NA		NA
1222020	1222021	CYB_0698	CYB_0700	pcyA		FALSE	0.133	166.000	0.000	NA		NA
1222021	1222022	CYB_0700	CYB_0700			FALSE	0.298	-86.000	0.000	NA		NA
1222026	1222027	CYB_0703	CYB_0705			TRUE	0.786	30.000	0.048	NA		NA
1222027	1222028	CYB_0705	CYB_0706			TRUE	0.654	76.000	0.048	NA		NA
1222028	1222029	CYB_0706	CYB_0707			FALSE	0.304	63.000	0.000	NA		NA
1222031	1222032	CYB_0708	CYB_0710	gatB		FALSE	0.383	148.000	0.002	1.000	N	NA
1222032	1222033	CYB_0710	CYB_0711			FALSE	0.005	425.000	0.000	NA		NA
1222033	1222034	CYB_0711	CYB_0712			FALSE	0.003	572.000	0.000	NA		NA
1222034	1222035	CYB_0712	CYB_0713			FALSE	0.003	567.000	0.000	NA		NA
1222035	1222036	CYB_0713	CYB_0714		chlD	FALSE	0.231	126.000	0.000	NA		NA
1222036	1222037	CYB_0714	CYB_0715	chlD		FALSE	0.033	280.000	0.000	1.000	N	NA
1222038	1222039	CYB_0716	CYB_0717			FALSE	0.008	341.000	0.000	NA		NA
1222039	1222040	CYB_0717	CYB_0718			TRUE	0.941	62.000	0.667	1.000	N	NA
1222041	1222042	CYB_0719	CYB_0720			FALSE	0.070	194.000	0.000	NA		NA
1222042	1222043	CYB_0720	CYB_0721			FALSE	0.229	129.000	0.000	NA		NA
1222043	1222044	CYB_0721	CYB_0722			TRUE	0.789	35.000	0.048	NA		NA
1222046	1222047	CYB_0724	CYB_0725		pth	FALSE	0.029	293.000	0.000	1.000	N	NA
1222048	1222049	CYB_0726	CYB_0727			FALSE	0.026	283.000	0.000	1.000		NA
1222052	1222053	CYB_0729	CYB_0731	menC		FALSE	0.012	365.000	0.000	1.000		NA
1222053	1222054	CYB_0731	CYB_0732			TRUE	0.953	61.000	0.259	0.009		NA
1222054	1222055	CYB_0732	CYB_0733			TRUE	0.611	195.000	0.050	0.009		NA
1222056	1222057	CYB_0734	CYB_0735	nrdJ	pheS	FALSE	0.411	134.000	0.000	1.000	N	NA
1222058	1222059	CYB_0736	CYB_0737			FALSE	0.324	192.000	0.048	NA		NA
1222059	1222060	CYB_0737	CYB_0738			FALSE	0.346	197.000	0.061	NA		NA
1222060	1222061	CYB_0738	CYB_0739			TRUE	0.856	55.000	0.061	1.000	N	NA
1222061	1222062	CYB_0739	CYB_0740			FALSE	0.047	257.000	0.000	1.000	N	NA
1222062	1222063	CYB_0740	CYB_0741		rpmA	FALSE	0.059	245.000	0.000	1.000	N	NA
1222063	1222064	CYB_0741	CYB_0742	rpmA	rplU	TRUE	0.981	77.000	0.667	0.017	Y	NA
1222064	1222065	CYB_0742	CYB_0743	rplU		FALSE	0.013	287.000	0.000	NA		NA
1222065	1222066	CYB_0743	CYB_0744			TRUE	0.946	37.000	0.667	NA		NA
1222066	1222067	CYB_0744	CYB_0745			TRUE	0.925	-3.000	0.500	NA		NA
1222067	1222068	CYB_0745	CYB_0746			TRUE	0.814	157.000	0.500	NA		NA
1222068	1222069	CYB_0746	CYB_0747			FALSE	0.019	259.000	0.000	NA		NA
1222069	1222070	CYB_0747	CYB_0748			TRUE	0.673	-3.000	0.012	1.000		NA
1222071	1222072	CYB_0749	CYB_0750	lpdA		TRUE	0.618	109.000	0.024	1.000	N	NA
1222072	1222073	CYB_0750	CYB_0751			FALSE	0.031	234.000	0.000	NA		NA
1222073	1222074	CYB_0751	CYB_0752		mutY	FALSE	0.208	95.000	0.000	NA		NA
1222074	1222075	CYB_0752	CYB_0753	mutY		FALSE	0.212	88.000	0.000	NA		NA
1222077	1222078	CYB_0755	CYB_0756	rnc		FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222079	1222080	CYB_0757	CYB_0758			TRUE	0.683	160.000	0.143	NA		NA
1222080	1222081	CYB_0758	CYB_0759			FALSE	0.379	120.000	0.000	1.000		NA
1222083	1222084	CYB_0760	CYB_0762			FALSE	0.008	346.000	0.000	NA		NA
1222084	1222085	CYB_0762	CYB_0763			TRUE	0.885	140.000	0.667	NA		NA
1222085	1222086	CYB_0763	CYB_0764			FALSE	0.378	31.000	0.000	NA		NA
1222086	1222087	CYB_0764	CYB_0765			FALSE	0.013	290.000	0.000	NA		NA
1222087	1222088	CYB_0765	CYB_0766			FALSE	0.056	350.000	0.000	0.041	N	NA
1222088	1222089	CYB_0766	CYB_0767			FALSE	0.370	51.000	0.000	NA		NA
1222091	1222092	CYB_0768	CYB_0770			TRUE	0.601	66.000	0.026	NA		NA
1222092	1222093	CYB_0770	CYB_0771			FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
1222093	1222094	CYB_0771	CYB_0772			FALSE	0.004	511.000	0.000	NA		NA
1222094	1222095	CYB_0772	CYB_0773			FALSE	0.229	114.000	0.000	NA		NA
1222096	1222097	CYB_0774	CYB_0775			TRUE	0.987	-3.000	0.582	0.021	Y	NA
1222098	1222099	CYB_0776	CYB_0777	recN		FALSE	0.121	196.000	0.000	1.000		NA
1222099	1222100	CYB_0777	CYB_0778			FALSE	0.468	235.000	0.552	1.000		NA
1222100	1222101	CYB_0778	CYB_0779			FALSE	0.249	72.000	0.000	NA		NA
1222104	1222105	CYB_0782	CYB_0783		ispF	FALSE	0.007	352.000	0.000	NA		NA
1222105	1222106	CYB_0783	CYB_0784	ispF		FALSE	0.279	183.000	0.009	1.000	N	NA
1222107	1222108	CYB_0785	CYB_0786			TRUE	0.841	132.000	0.200	1.000	N	NA
1222108	1222109	CYB_0786	CYB_0787			FALSE	0.208	101.000	0.000	NA		NA
1222109	1222110	CYB_0787	CYB_0788			FALSE	0.234	124.000	0.000	NA		NA
1222110	1222111	CYB_0788	CYB_0789			FALSE	0.378	31.000	0.000	NA		NA
1222111	1222112	CYB_0789	CYB_0790			TRUE	0.566	83.000	0.035	NA		NA
1222112	1222113	CYB_0790	CYB_0791			TRUE	0.761	0.000	0.044	NA		NA
1222113	1222114	CYB_0791	CYB_0792			TRUE	0.953	60.000	1.000	NA		NA
1222114	1222115	CYB_0792	CYB_0793			TRUE	0.925	115.000	1.000	NA		NA
1222115	1222116	CYB_0793	CYB_0794			FALSE	0.232	125.000	0.000	NA		NA
1222117	1222118	CYB_0795	CYB_0796			FALSE	0.389	19.000	0.000	NA		NA
1222118	1222119	CYB_0796	CYB_0797			TRUE	0.834	35.000	0.000	0.041	N	NA
1222119	1222120	CYB_0797	CYB_0798			TRUE	0.864	57.000	0.071	1.000	N	NA
1222120	1222121	CYB_0798	CYB_0800			FALSE	0.002	1132.000	0.000	NA		NA
1222122	1222123	CYB_0801	CYB_0802	mrr		FALSE	0.219	138.000	0.000	NA		NA
1222123	1222124	CYB_0802	CYB_0803		phrB-2	FALSE	0.208	100.000	0.000	NA		NA
1222124	1222125	CYB_0803	CYB_0804	phrB-2	hup-1	TRUE	0.922	13.000	0.020	1.000	Y	NA
1222128	1222129	CYB_0807	CYB_0808	uvrB		FALSE	0.352	86.000	0.002	1.000		NA
1222129	1222130	CYB_0808	CYB_0809			TRUE	0.659	34.000	0.017	NA		NA
1222131	1222132	CYB_0810	CYB_0811			TRUE	0.535	181.000	0.077	1.000		NA
1222132	1222133	CYB_0811	CYB_0812		psbX	FALSE	0.039	257.000	0.000	1.000		NA
1222133	1222134	CYB_0812	CYB_0813	psbX		TRUE	0.689	105.000	0.050	1.000		NA
1222134	1222135	CYB_0813	CYB_0814			FALSE	0.006	485.000	0.000	NA	N	NA
1222136	1222137	CYB_0815	CYB_0816			TRUE	0.523	96.000	0.010	1.000	N	NA
1222138	1222139	CYB_0817	CYB_0818			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222140	1222141	CYB_0819	CYB_0820		sll1405	TRUE	0.982	4.000	0.235	0.036	Y	NA
1222142	1222143	CYB_0821	CYB_0822	argF	prc-1	FALSE	0.270	178.000	0.004	1.000	N	NA
1222144	1222145	CYB_0823	CYB_0824	proA		FALSE	0.042	254.000	0.000	1.000		NA
1222145	1222146	CYB_0824	CYB_0825			TRUE	0.723	92.000	0.061	1.000		NA
1222147	1222148	CYB_0826	CYB_0827			FALSE	0.008	334.000	0.000	NA		NA
1222149	1222150	CYB_0828	CYB_0829	recJ-1		TRUE	0.531	-10.000	0.002	1.000		NA
1222150	1222151	CYB_0829	CYB_0830		rdgB	FALSE	0.497	59.000	0.002	1.000		NA
1222151	1222152	CYB_0830	CYB_0831	rdgB		FALSE	0.217	112.000	0.002	NA		NA
1222152	1222153	CYB_0831	CYB_0832		tmk	FALSE	0.428	23.000	0.002	NA		NA
1222153	1222154	CYB_0832	CYB_0833	tmk		FALSE	0.004	477.000	0.000	NA		NA
1222155	1222156	CYB_0834	CYB_0835	cas2	cas1	TRUE	0.963	0.000	0.280	NA	Y	NA
1222156	1222157	CYB_0835	CYB_0836	cas1		FALSE	0.367	0.000	0.000	NA		NA
1222157	1222158	CYB_0836	CYB_0837			TRUE	0.923	30.000	0.400	NA		NA
1222158	1222159	CYB_0837	CYB_0838			TRUE	0.923	31.000	0.400	NA		NA
1222159	1222160	CYB_0838	CYB_0839			TRUE	0.920	0.000	0.400	NA		NA
1222160	1222161	CYB_0839	CYB_0840		cmr4	TRUE	0.955	25.000	0.833	NA		NA
1222161	1222162	CYB_0840	CYB_0841	cmr4		TRUE	0.956	48.000	0.130	NA	Y	NA
1222162	1222163	CYB_0841	CYB_0842		crm2-2	TRUE	0.890	-3.000	0.233	NA		NA
1222163	1222164	CYB_0842	CYB_0843	crm2-2		FALSE	0.053	203.000	0.000	NA		NA
1222165	1222166	CYB_0844	CYB_0845			FALSE	0.314	-25.000	0.000	NA		NA
1222167	1222168	CYB_0846	CYB_0847			FALSE	0.004	490.000	0.000	NA		NA
1222168	1222169	CYB_0847	CYB_0848			FALSE	0.232	78.000	0.000	NA		NA
1222173	1222174	CYB_0852	CYB_0853	cobW	psbC	TRUE	0.533	137.000	0.013	1.000		NA
1222174	1222175	CYB_0853	CYB_0854	psbC	psbD-1	TRUE	0.873	149.000	0.073	0.003		NA
1222176	1222177	CYB_0855	CYB_0856	petM	panE-1	TRUE	0.645	114.000	0.034	1.000		NA
1222177	1222178	CYB_0856	CYB_0857	panE-1		FALSE	0.129	194.000	0.000	1.000		NA
1222178	1222179	CYB_0857	CYB_0858			TRUE	0.611	73.000	0.020	1.000		NA
1222179	1222180	CYB_0858	CYB_0859			TRUE	0.652	155.000	0.050	1.000	N	NA
1222180	1222181	CYB_0859	CYB_0860			FALSE	0.170	264.000	0.125	NA		NA
1222184	1222185	CYB_0863	CYB_0864			FALSE	0.387	22.000	0.000	NA		NA
1222186	1222187	CYB_0865	CYB_0866			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222190	1222191	CYB_0869	CYB_0870			TRUE	0.986	39.000	0.242	0.007	Y	NA
1222191	1222192	CYB_0870	CYB_0871			FALSE	0.458	117.000	0.013	NA		NA
1222192	1222193	CYB_0871	CYB_0872			TRUE	0.596	30.000	0.010	NA		NA
1222195	1222196	CYB_0874	CYB_0875			TRUE	0.877	144.000	0.667	NA		NA
1222196	1222197	CYB_0875	CYB_0876			FALSE	0.312	-28.000	0.000	NA		NA
1222198	1222199	CYB_0877	CYB_0878	ureG	ureD	TRUE	0.970	18.000	0.030	0.003	Y	NA
1222199	1222200	CYB_0878	CYB_0879	ureD		TRUE	0.601	52.000	0.012	NA		NA
1222200	1222201	CYB_0879	CYB_0880			FALSE	0.339	59.000	0.000	NA		NA
1222201	1222202	CYB_0880	CYB_0882			FALSE	0.051	205.000	0.000	NA		NA
1222203	1222204	CYB_0881	CYB_0883			TRUE	0.761	31.000	0.025	1.000		NA
1222206	1222207	CYB_0885	CYB_0886			TRUE	0.896	33.000	0.214	NA		NA
1222207	1222208	CYB_0886	CYB_0887			FALSE	0.389	13.000	0.000	NA		NA
1222208	1222209	CYB_0887	CYB_0888			FALSE	0.082	185.000	0.000	NA		NA
1222209	1222210	CYB_0888	CYB_0889		hisH	TRUE	0.526	7.000	0.005	NA		NA
1222213	1222214	CYB_0892	CYB_0894			TRUE	0.798	129.000	0.182	NA		NA
1222216	1222217	CYB_0895	CYB_0896		hup-2	FALSE	0.023	316.000	0.000	1.000	N	NA
1222217	1222218	CYB_0896	CYB_0897	hup-2	cobD-1	TRUE	0.860	36.000	0.052	1.000	N	NA
1222218	1222219	CYB_0897	CYB_0898	cobD-1		TRUE	0.708	26.000	0.026	NA		NA
1222219	1222220	CYB_0898	CYB_0899			FALSE	0.013	283.000	0.000	NA		NA
1222221	1222222	CYB_0900	CYB_0901		purN	FALSE	0.469	27.000	0.003	NA		NA
1222222	1222223	CYB_0901	CYB_0902	purN		FALSE	0.378	31.000	0.000	NA		NA
1222224	1222225	CYB_0903	CYB_0904			FALSE	0.378	49.000	0.000	NA		NA
1222225	1222226	CYB_0904	CYB_0905		aat	TRUE	0.644	18.000	0.004	1.000		NA
1222226	1222227	CYB_0905	CYB_0906	aat		FALSE	0.404	138.000	0.000	1.000	N	NA
1222230	1222231	CYB_0909	CYB_0910	gspO		TRUE	0.547	141.000	0.033	NA		NA
1222231	1222232	CYB_0910	CYB_0911		cphA	FALSE	0.006	361.000	0.000	NA		NA
1222235	1222236	CYB_0914	CYB_0915			TRUE	0.979	81.000	0.750	0.072	Y	NA
1222236	1222237	CYB_0915	CYB_0917			FALSE	0.153	194.000	0.000	1.000	N	NA
1222239	1222240	CYB_0918	CYB_0919	rpsL	rpsG	TRUE	0.980	84.000	0.620	0.003	Y	NA
1222240	1222241	CYB_0919	CYB_0920	rpsG	fusA	TRUE	0.941	153.000	0.579	1.000	Y	NA
1222241	1222242	CYB_0920	CYB_0921	fusA	tuf	TRUE	0.990	32.000	0.400	0.001	Y	NA
1222242	1222243	CYB_0921	CYB_0922	tuf	rpsJ	TRUE	0.943	125.000	0.318	1.000	Y	NA
1222243	1222244	CYB_0922	CYB_0924	rpsJ	dapB	FALSE	0.426	122.000	0.002	1.000	N	NA
1222245	1222246	CYB_0923	CYB_0925			TRUE	0.554	78.000	0.029	NA		NA
1222246	1222247	CYB_0925	CYB_0926			FALSE	0.036	225.000	0.000	NA		NA
1222247	1222248	CYB_0926	CYB_0927			FALSE	0.038	221.000	0.000	NA		NA
1222248	1222249	CYB_0927	CYB_0928			FALSE	0.208	95.000	0.000	NA		NA
1222249	1222250	CYB_0928	CYB_0929		tatC	FALSE	0.329	-10.000	0.000	NA		NA
1222250	1222251	CYB_0929	CYB_0930	tatC		FALSE	0.299	163.000	0.008	NA	N	NA
1222251	1222252	CYB_0930	CYB_0931			TRUE	0.969	4.000	0.356	0.008	N	NA
1222252	1222253	CYB_0931	CYB_0932			TRUE	0.918	99.000	0.034	0.026	Y	NA
1222256	1222257	CYB_0935	CYB_0936			FALSE	0.217	140.000	0.000	NA		NA
1222257	1222258	CYB_0936	CYB_0937		trpA	TRUE	0.845	62.000	0.000	1.000	Y	NA
1222260	1222261	CYB_0939	CYB_0940	cpcB-1	cpcA-1	TRUE	0.948	146.000	0.667	0.005		NA
1222261	1222262	CYB_0940	CYB_0941	cpcA-1	cpcD	FALSE	0.083	316.000	0.000	0.007		NA
1222262	1222263	CYB_0941	CYB_0942	cpcD	cpcE-1	FALSE	0.342	92.000	0.000	1.000		NA
1222263	1222264	CYB_0942	CYB_0943	cpcE-1	cpcF	TRUE	0.964	17.000	0.333	0.017		NA
1222264	1222265	CYB_0943	CYB_0944	cpcF	cpcG1	TRUE	0.933	59.000	0.500	1.000		NA
1222265	1222266	CYB_0944	CYB_0945	cpcG1		TRUE	0.767	142.000	0.143	NA		NA
1222266	1222267	CYB_0945	CYB_0946			TRUE	0.937	30.000	0.591	NA		NA
1222267	1222268	CYB_0946	CYB_0947			TRUE	0.938	0.000	0.483	1.000		NA
1222270	1222271	CYB_0949	CYB_0950			TRUE	0.875	4.000	0.069	1.000	N	NA
1222272	1222273	CYB_0951	CYB_0952			FALSE	0.322	-16.000	0.000	NA		NA
1222273	1222274	CYB_0952	CYB_0953			FALSE	0.394	44.000	0.000	NA		NA
1222274	1222275	CYB_0953	CYB_0954			FALSE	0.002	1213.000	0.000	NA		NA
1222276	1222277	CYB_0955	CYB_0956		pip	TRUE	0.745	28.000	0.020	1.000		NA
1222277	1222278	CYB_0956	CYB_0957	pip		FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222278	1222279	CYB_0957	CYB_0958			FALSE	0.297	-97.000	0.000	NA		NA
1222279	1222280	CYB_0958	CYB_0959			TRUE	0.961	32.000	1.000	NA		NA
1222280	1222281	CYB_0959	CYB_0961			TRUE	0.874	11.000	0.111	NA		NA
1222282	1222283	CYB_0960	CYB_0962	trx-2		TRUE	0.832	-49.000	0.124	NA		NA
1222284	1222285	CYB_0963	CYB_0964			FALSE	0.034	230.000	0.000	NA		NA
1222286	1222287	CYB_0965	CYB_0966			TRUE	0.663	121.000	0.037	1.000		NA
1222287	1222288	CYB_0966	CYB_0967			FALSE	0.482	157.000	0.037	NA		NA
1222289	1222290	CYB_0968	CYB_0969			FALSE	0.379	30.000	0.000	NA		NA
1222290	1222291	CYB_0969	CYB_0970			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222291	1222292	CYB_0970	CYB_0971		ilvN	FALSE	0.275	165.000	0.000	1.000	N	NA
1222292	1222293	CYB_0971	CYB_0972	ilvN		TRUE	0.556	18.000	0.006	NA		NA
1222295	1222296	CYB_0974	CYB_0975	glk		FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222296	1222297	CYB_0975	CYB_0976			FALSE	0.384	8.000	0.000	NA		NA
1222297	1222298	CYB_0976	CYB_0978			TRUE	0.949	14.000	0.056	1.000	Y	NA
1222301	1222302	CYB_0980	CYB_0981			FALSE	0.208	95.000	0.000	NA		NA
1222302	1222303	CYB_0981	CYB_0982			FALSE	0.231	127.000	0.000	NA		NA
1222305	1222306	CYB_0984	CYB_0985	sppA-2		TRUE	0.582	75.000	0.012	1.000	N	NA
1222306	1222307	CYB_0985	CYB_0986		ksgA	FALSE	0.382	106.000	0.002	1.000	N	NA
1222307	1222308	CYB_0986	CYB_0987	ksgA		TRUE	0.601	45.000	0.002	1.000	N	NA
1222308	1222309	CYB_0987	CYB_0988			TRUE	0.583	27.000	0.008	NA		NA
1222310	1222311	CYB_0989	CYB_0990			FALSE	0.447	133.000	0.002	1.000	N	NA
1222311	1222312	CYB_0990	CYB_0991		nth	TRUE	0.764	7.000	0.018	1.000	N	NA
1222312	1222313	CYB_0991	CYB_0992	nth		FALSE	0.248	111.000	0.002	NA		NA
1222313	1222314	CYB_0992	CYB_0993			TRUE	0.876	-7.000	0.214	NA		NA
1222315	1222316	CYB_0994	CYB_0995			FALSE	0.239	76.000	0.000	NA		NA
1222318	1222319	CYB_0997	CYB_0998			FALSE	0.277	175.000	0.006	1.000		NA
1222319	1222320	CYB_0998	CYB_0999			TRUE	0.542	67.000	0.006	1.000		NA
1222320	1222321	CYB_0999	CYB_1000			FALSE	0.068	236.000	0.000	1.000	N	NA
1222322	1222323	CYB_1001	CYB_1003		htpG	FALSE	0.329	108.000	0.003	NA	N	NA
1222325	1222326	CYB_1004	CYB_1005		glnA-1	FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222327	1222328	CYB_1006	CYB_1007	aroE		TRUE	0.607	63.000	0.021	NA		NA
1222328	1222329	CYB_1007	CYB_1008			TRUE	0.924	48.000	0.400	NA		NA
1222329	1222330	CYB_1008	CYB_1009			FALSE	0.023	250.000	0.000	NA		NA
1222331	1222332	CYB_1010	CYB_1011			FALSE	0.339	59.000	0.000	NA		NA
1222332	1222333	CYB_1011	CYB_1012		hemL	FALSE	0.223	82.000	0.000	NA		NA
1222333	1222334	CYB_1012	CYB_1014	hemL		TRUE	0.603	39.000	0.009	NA		NA
1222335	1222336	CYB_1013	CYB_1015	chlN		TRUE	0.923	42.000	0.019	0.002	N	NA
1222336	1222337	CYB_1015	CYB_1016		chlL	TRUE	0.893	159.000	0.198	0.002	N	NA
1222337	1222338	CYB_1016	CYB_1017	chlL		FALSE	0.007	357.000	0.000	NA		NA
1222338	1222339	CYB_1017	CYB_1018			FALSE	0.387	22.000	0.000	NA		NA
1222339	1222340	CYB_1018	CYB_1019			FALSE	0.315	-24.000	0.000	NA		NA
1222341	1222342	CYB_1020	CYB_1021			TRUE	0.592	3.000	0.000	1.000	N	NA
1222343	1222344	CYB_1022	CYB_1023	ileS		FALSE	0.006	464.000	0.000	NA	N	NA
1222344	1222345	CYB_1023	CYB_1024			FALSE	0.007	352.000	0.000	NA		NA
1222346	1222347	CYB_1025	CYB_1026			FALSE	0.495	158.000	0.035	NA	N	NA
1222349	1222350	CYB_1028	CYB_1029			FALSE	0.314	-25.000	0.000	NA		NA
1222350	1222351	CYB_1029	CYB_1030			FALSE	0.383	26.000	0.000	NA		NA
1222351	1222352	CYB_1030	CYB_1031		purE	FALSE	0.469	15.000	0.000	NA	N	NA
1222352	1222353	CYB_1031	CYB_1032	purE		FALSE	0.283	67.000	0.002	NA		NA
1222353	1222354	CYB_1032	CYB_1033			FALSE	0.009	325.000	0.000	NA		NA
1222357	1222358	CYB_1036	CYB_1037			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222358	1222359	CYB_1037	CYB_1038			FALSE	0.387	11.000	0.000	NA		NA
1222360	1222361	CYB_1039	CYB_1040		cobA	TRUE	0.737	65.000	0.041	1.000		NA
1222361	1222362	CYB_1040	CYB_1041	cobA		TRUE	0.664	-3.000	0.023	NA		NA
1222362	1222363	CYB_1041	CYB_1042			FALSE	0.208	95.000	0.000	NA		NA
1222363	1222364	CYB_1042	CYB_1044			FALSE	0.163	168.000	0.000	NA	N	NA
1222368	1222369	CYB_1047	CYB_1048			FALSE	0.004	465.000	0.000	NA		NA
1222372	1222373	CYB_1051	CYB_1052	rpmB		FALSE	0.400	25.000	0.002	NA		NA
1222376	1222377	CYB_1055	CYB_1056			FALSE	0.007	356.000	0.000	NA		NA
1222377	1222378	CYB_1056	CYB_1057			TRUE	0.599	71.000	0.016	1.000		NA
1222378	1222379	CYB_1057	CYB_1058			TRUE	0.763	49.000	0.019	1.000	N	NA
1222381	1222382	CYB_1060	CYB_1061	zds		FALSE	0.014	353.000	0.000	1.000		NA
1222382	1222383	CYB_1061	CYB_1062			TRUE	0.829	40.000	0.000	0.039		NA
1222384	1222385	CYB_1063	CYB_1064			TRUE	0.751	75.000	0.057	1.000		NA
1222385	1222386	CYB_1064	CYB_1065			FALSE	0.116	171.000	0.000	NA		NA
1222386	1222387	CYB_1065	CYB_1066			FALSE	0.378	49.000	0.000	NA		NA
1222387	1222388	CYB_1066	CYB_1067		glgC	TRUE	0.575	136.000	0.020	1.000		NA
1222389	1222390	CYB_1068	CYB_1069			FALSE	0.213	141.000	0.000	NA		NA
1222390	1222391	CYB_1069	CYB_1070		sat	FALSE	0.129	167.000	0.000	NA		NA
1222392	1222393	CYB_1071	CYB_1072			FALSE	0.009	319.000	0.000	NA		NA
1222393	1222394	CYB_1072	CYB_1073			TRUE	0.562	44.000	0.000	1.000		NA
1222394	1222395	CYB_1073	CYB_1074		pstB-1	FALSE	0.444	96.000	0.003	1.000	N	NA
1222395	1222396	CYB_1074	CYB_1075	pstB-1	pstA-1	TRUE	0.981	83.000	0.667	0.004	Y	NA
1222396	1222397	CYB_1075	CYB_1076	pstA-1	pstC-1	TRUE	0.985	7.000	0.222	0.004	Y	NA
1222397	1222398	CYB_1076	CYB_1077	pstC-1	pstS-1	TRUE	0.985	34.000	0.222	0.004	Y	NA
1222398	1222399	CYB_1077	CYB_1078	pstS-1		FALSE	0.013	290.000	0.000	NA		NA
1222400	1222401	CYB_1079	CYB_1080		rplI	FALSE	0.045	210.000	0.000	NA		NA
1222401	1222402	CYB_1080	CYB_1081	rplI	dnaB	FALSE	0.490	179.000	0.048	1.000	N	NA
1222402	1222403	CYB_1081	CYB_1082	dnaB		FALSE	0.413	132.000	0.000	1.000	N	NA
1222403	1222404	CYB_1082	CYB_1083			TRUE	0.553	47.000	0.000	1.000		NA
1222404	1222405	CYB_1083	CYB_1084			FALSE	0.036	261.000	0.000	1.000		NA
1222407	1222408	CYB_1086	CYB_1087	mkl		TRUE	0.980	0.000	0.667	1.000	Y	NA
1222408	1222409	CYB_1087	CYB_1089		glmS	FALSE	0.255	177.000	0.003	1.000	N	NA
1222410	1222411	CYB_1088	CYB_1090			FALSE	0.371	128.000	0.000	1.000		NA
1222411	1222412	CYB_1090	CYB_1091			FALSE	0.049	206.000	0.000	NA		NA
1222413	1222414	CYB_1092	CYB_1093			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1222415	1222416	CYB_1094	CYB_1095	rpsD	gmd	FALSE	0.214	177.000	0.002	1.000	N	NA
1222416	1222417	CYB_1095	CYB_1096	gmd		TRUE	0.630	133.000	0.025	1.000	N	NA
1222417	1222418	CYB_1096	CYB_1097			FALSE	0.239	76.000	0.000	NA		NA
1222419	1222420	CYB_1098	CYB_1100		hisZ	TRUE	0.615	50.000	0.004	1.000		NA
1222423	1222424	CYB_1101	CYB_1103			FALSE	0.015	277.000	0.000	NA		NA
1222424	1222425	CYB_1103	CYB_1104			FALSE	0.385	25.000	0.000	NA		NA
1222425	1222426	CYB_1104	CYB_1105			FALSE	0.003	992.000	0.000	NA		NA
1222427	1222428	CYB_1106	CYB_1107	recJ-2		FALSE	0.409	135.000	0.000	1.000	N	NA
1222429	1222430	CYB_1108	CYB_1109			FALSE	0.208	99.000	0.000	NA		NA
1222430	1222431	CYB_1109	CYB_1110			TRUE	0.915	0.000	0.379	NA		NA
1222431	1222432	CYB_1110	CYB_1111			TRUE	0.837	33.000	0.069	NA		NA
1222432	1222433	CYB_1111	CYB_1112		tal	TRUE	0.882	36.000	0.087	1.000		NA
1222433	1222434	CYB_1112	CYB_1113	tal		FALSE	0.030	291.000	0.000	1.000	N	NA
1222435	1222436	CYB_1114	CYB_1115		ppsA	FALSE	0.208	98.000	0.000	NA		NA
1222436	1222437	CYB_1115	CYB_1116	ppsA		TRUE	0.525	82.000	0.007	1.000	N	NA
1222439	1222440	CYB_1118	CYB_1119		tkt	FALSE	0.273	67.000	0.000	NA		NA
1222442	1222443	CYB_1121	CYB_1122			FALSE	0.355	55.000	0.000	NA		NA
1222443	1222444	CYB_1122	CYB_1123			FALSE	0.016	271.000	0.000	NA		NA
1222445	1222446	CYB_1124	CYB_1125			TRUE	0.944	28.000	0.667	NA		NA
1222446	1222447	CYB_1125	CYB_1126		proS	FALSE	0.445	22.000	0.002	NA		NA
1222447	1222448	CYB_1126	CYB_1127	proS	infB	FALSE	0.368	127.000	0.002	1.000		NA
1222450	1222451	CYB_1129	CYB_1130			TRUE	0.883	45.000	0.005	NA	Y	NA
1222451	1222452	CYB_1130	CYB_1131			FALSE	0.302	-43.000	0.000	NA		NA
1222454	1222455	CYB_1133	CYB_1134			FALSE	0.008	339.000	0.000	NA		NA
1222455	1222456	CYB_1134	CYB_1135			FALSE	0.224	134.000	0.000	NA		NA
1222458	1222459	CYB_1137	CYB_1138			TRUE	0.640	19.000	0.013	NA		NA
1222464	1222465	CYB_1143	CYB_1144			TRUE	0.817	105.000	0.333	NA		NA
1222465	1222466	CYB_1144	CYB_1145			TRUE	0.733	112.000	0.057	1.000		NA
1222466	1222467	CYB_1145	CYB_1146		mraY	FALSE	0.357	149.000	0.002	1.000	N	NA
1222467	1222468	CYB_1146	CYB_1147	mraY		FALSE	0.027	296.000	0.000	1.000	N	NA
1222472	1222473	CYB_1151	CYB_1152			FALSE	0.040	236.000	0.000	NA	N	NA
1222473	1222474	CYB_1152	CYB_1153			FALSE	0.235	118.000	0.000	NA		NA
1222478	1222479	CYB_1157	CYB_1158			TRUE	0.808	-12.000	0.071	NA		NA
1222480	1222481	CYB_1159	CYB_1160			TRUE	0.665	33.000	0.018	NA		NA
1222481	1222482	CYB_1160	CYB_1161		aspS	FALSE	0.089	220.000	0.000	1.000	N	NA
1222482	1222483	CYB_1161	CYB_1162	aspS		FALSE	0.439	73.000	0.002	1.000	N	NA
1222484	1222485	CYB_1163	CYB_1164			TRUE	0.987	25.000	0.500	0.093	Y	NA
1222486	1222487	CYB_1165	CYB_1166		gidB	FALSE	0.118	197.000	0.000	1.000		NA
1222487	1222488	CYB_1166	CYB_1167	gidB		FALSE	0.374	-3.000	0.002	NA		NA
1222490	1222491	CYB_1169	CYB_1170			TRUE	0.949	3.000	0.750	NA		NA
1222491	1222492	CYB_1170	CYB_1171			TRUE	0.865	110.000	0.500	NA		NA
1222492	1222493	CYB_1171	CYB_1172			FALSE	0.005	419.000	0.000	NA		NA
1222493	1222494	CYB_1172	CYB_1173			FALSE	0.319	-19.000	0.000	NA		NA
1222495	1222496	CYB_1174	CYB_1175			TRUE	0.857	31.000	0.091	NA		NA
1222496	1222497	CYB_1175	CYB_1176			TRUE	0.777	18.000	0.043	NA		NA
1222497	1222498	CYB_1176	CYB_1177			FALSE	0.021	255.000	0.000	NA		NA
1222498	1222499	CYB_1177	CYB_1178			FALSE	0.011	299.000	0.000	NA		NA
1222499	1222500	CYB_1178	CYB_1179			TRUE	0.957	-3.000	1.000	NA		NA
1222500	1222501	CYB_1179	CYB_1180			FALSE	0.224	134.000	0.000	NA		NA
1222501	1222502	CYB_1180	CYB_1181			TRUE	0.557	41.000	0.005	NA		NA
1222502	1222503	CYB_1181	CYB_1182			FALSE	0.386	10.000	0.000	NA		NA
1222505	1222506	CYB_1184	CYB_1185	selD		FALSE	0.205	144.000	0.000	NA		NA
1222506	1222507	CYB_1185	CYB_1186			FALSE	0.385	47.000	0.000	NA		NA
1222511	1222512	CYB_1190	CYB_1191		trmU	FALSE	0.457	103.000	0.004	1.000	N	NA
1222513	1222514	CYB_1192	CYB_1193			TRUE	0.702	108.000	0.071	NA		NA
1222514	1222515	CYB_1193	CYB_1194			FALSE	0.014	351.000	0.000	1.000		NA
1222518	1222519	CYB_1197	CYB_1198			FALSE	0.032	248.000	0.000	NA	N	NA
1222519	1222520	CYB_1198	CYB_1199			FALSE	0.385	9.000	0.000	NA		NA
1222520	1222521	CYB_1199	CYB_1200			FALSE	0.032	233.000	0.000	NA		NA
1222521	1222522	CYB_1200	CYB_1201			FALSE	0.280	83.000	0.000	NA	N	NA
1222523	1222524	CYB_1202	CYB_1203			FALSE	0.226	81.000	0.000	NA		NA
1222526	1222527	CYB_1205	CYB_1206			TRUE	0.934	0.000	0.571	NA		NA
1222527	1222528	CYB_1206	CYB_1207		mfd	TRUE	0.708	121.000	0.002	0.092	N	NA
1222529	1222530	CYB_1208	CYB_1209	cydA	cydB	TRUE	0.925	194.000	0.750	0.044	Y	NA
1222531	1222532	CYB_1210	CYB_1211			FALSE	0.321	-18.000	0.000	NA		NA
1222532	1222533	CYB_1211	CYB_1212		rimI	FALSE	0.006	395.000	0.000	NA		NA
1222533	1222534	CYB_1212	CYB_1213	rimI		FALSE	0.383	7.000	0.000	NA		NA
1222534	1222535	CYB_1213	CYB_1214		purK	TRUE	0.538	-3.000	0.007	NA		NA
1222536	1222537	CYB_1215	CYB_1216			FALSE	0.184	151.000	0.000	NA		NA
1222537	1222538	CYB_1216	CYB_1217		trmD	FALSE	0.387	6.000	0.002	NA		NA
1222538	1222539	CYB_1217	CYB_1218	trmD		FALSE	0.383	4.000	0.002	NA		NA
1222539	1222540	CYB_1218	CYB_1219		secE	FALSE	0.237	104.000	0.002	NA		NA
1222540	1222541	CYB_1219	CYB_1220	secE	nusG	TRUE	0.950	63.000	0.843	1.000	N	NA
1222541	1222542	CYB_1220	CYB_1221	nusG	rplK	TRUE	0.959	10.000	0.681	1.000	N	NA
1222542	1222543	CYB_1221	CYB_1222	rplK	rplA	TRUE	0.981	107.000	0.838	0.020	Y	NA
1222543	1222544	CYB_1222	CYB_1223	rplA	rplJ	TRUE	0.532	299.000	0.302	0.020	Y	NA
1222544	1222545	CYB_1223	CYB_1224	rplJ	rplL	TRUE	0.988	66.000	0.884	0.015	Y	NA
1222550	1222551	CYB_1229	CYB_1230	rpsU		FALSE	0.013	355.000	0.000	1.000		NA
1222552	1222553	CYB_1231	CYB_1232			FALSE	0.516	-3.000	0.000	1.000		NA
1222553	1222554	CYB_1232	CYB_1233		dxr	FALSE	0.044	252.000	0.000	1.000		NA
1222554	1222555	CYB_1233	CYB_1234	dxr		TRUE	0.575	60.000	0.002	1.000	N	NA
1222555	1222556	CYB_1234	CYB_1235		murE	TRUE	0.810	61.000	0.004	0.092	N	NA
1222557	1222558	CYB_1236	CYB_1237	carA		FALSE	0.365	62.000	0.002	NA		NA
1222558	1222559	CYB_1237	CYB_1238			TRUE	0.898	41.000	0.182	NA		NA
1222559	1222560	CYB_1238	CYB_1239			TRUE	0.887	51.000	0.182	NA		NA
1222560	1222561	CYB_1239	CYB_1240			TRUE	0.842	65.000	0.167	NA		NA
1222561	1222562	CYB_1240	CYB_1241			FALSE	0.386	10.000	0.000	NA		NA
1222562	1222563	CYB_1241	CYB_1242			FALSE	0.382	27.000	0.000	NA		NA
1222563	1222564	CYB_1242	CYB_1243			FALSE	0.208	105.000	0.000	NA		NA
1222564	1222565	CYB_1243	CYB_1244		mutM	FALSE	0.213	87.000	0.000	NA		NA
1222565	1222566	CYB_1244	CYB_1245	mutM	psaE	TRUE	0.808	47.000	0.040	1.000		NA
1222567	1222568	CYB_1246	CYB_1247			FALSE	0.377	117.000	0.000	1.000		NA
1222569	1222570	CYB_1248	CYB_1249	nadE		TRUE	0.820	50.000	0.000	0.092	N	NA
1222570	1222571	CYB_1249	CYB_1250			TRUE	0.585	209.000	0.000	0.008	Y	NA
1222571	1222572	CYB_1250	CYB_1251		uvrC	FALSE	0.102	211.000	0.000	1.000	N	NA
1222573	1222574	CYB_1252	CYB_1253		gltS	FALSE	0.005	408.000	0.000	NA		NA
1222574	1222575	CYB_1253	CYB_1254	gltS	acsF	FALSE	0.484	105.000	0.010	1.000		NA
1222575	1222576	CYB_1254	CYB_1255	acsF		TRUE	0.773	48.000	0.028	1.000		NA
1222576	1222577	CYB_1255	CYB_1256			TRUE	0.565	42.000	0.000	1.000		NA
1222577	1222578	CYB_1256	CYB_1257			FALSE	0.386	103.000	0.000	1.000	N	NA
1222584	1222585	CYB_1263	CYB_1264	engA	smpB	TRUE	0.651	24.000	0.005	1.000		NA
1222585	1222586	CYB_1264	CYB_1265	smpB		FALSE	0.353	140.000	0.000	1.000		NA
1222587	1222588	CYB_1266	CYB_1267			FALSE	0.388	99.000	0.000	1.000	N	NA
1222588	1222589	CYB_1267	CYB_1268		era	FALSE	0.169	181.000	0.000	1.000		NA
1222589	1222590	CYB_1268	CYB_1269	era		FALSE	0.026	283.000	0.000	1.000		NA
1222591	1222592	CYB_1270	CYB_1271			FALSE	0.344	90.000	0.000	1.000		NA
1222592	1222593	CYB_1271	CYB_1272			FALSE	0.011	463.000	0.000	1.000	N	NA
1222596	1222597	CYB_1275	CYB_1276			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1222599	1222600	CYB_1278	CYB_1279			TRUE	0.981	78.000	0.506	0.002	Y	NA
1222600	1222601	CYB_1279	CYB_1280			FALSE	0.236	120.000	0.000	NA		NA
1222601	1222602	CYB_1280	CYB_1281			FALSE	0.119	170.000	0.000	NA		NA
1222602	1222603	CYB_1281	CYB_1282			TRUE	0.837	18.000	0.063	NA		NA
1222605	1222606	CYB_1284	CYB_1285			FALSE	0.020	305.000	0.000	1.000		NA
1222607	1222608	CYB_1286	CYB_1287			FALSE	0.006	374.000	0.000	NA		NA
1222608	1222609	CYB_1287	CYB_1288			FALSE	0.273	67.000	0.000	NA		NA
1222609	1222610	CYB_1288	CYB_1289		lpxD	FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
1222612	1222613	CYB_1291	CYB_1292			FALSE	0.012	291.000	0.000	NA		NA
1222614	1222615	CYB_1293	CYB_1294			FALSE	0.223	82.000	0.000	NA		NA
1222615	1222616	CYB_1294	CYB_1295			TRUE	0.962	5.000	1.000	NA		NA
1222616	1222617	CYB_1295	CYB_1296			FALSE	0.390	16.000	0.000	NA		NA
1222617	1222618	CYB_1296	CYB_1297			FALSE	0.116	171.000	0.000	NA		NA
1222618	1222619	CYB_1297	CYB_1298		crtH	FALSE	0.015	301.000	0.000	NA	N	NA
1222621	1222622	CYB_1299	CYB_1301	potB	potA	TRUE	0.982	-6.000	0.364	0.024	Y	NA
1222622	1222623	CYB_1301	CYB_1302	potA		FALSE	0.069	225.000	0.000	1.000		NA
1222623	1222624	CYB_1302	CYB_1303			FALSE	0.035	227.000	0.000	NA		NA
1222624	1222625	CYB_1303	CYB_1304		dnaX	FALSE	0.392	45.000	0.000	NA		NA
1222625	1222626	CYB_1304	CYB_1305	dnaX		TRUE	0.750	123.000	0.000	0.004		NA
1222626	1222627	CYB_1305	CYB_1306		coaE	FALSE	0.515	57.000	0.000	1.000		NA
1222627	1222628	CYB_1306	CYB_1307	coaE		TRUE	0.601	18.000	0.002	1.000	N	NA
1222628	1222629	CYB_1307	CYB_1308			FALSE	0.503	-10.000	0.006	NA		NA
1222630	1222631	CYB_1309	CYB_1310			FALSE	0.143	161.000	0.000	NA		NA
1222631	1222632	CYB_1310	CYB_1311			FALSE	0.014	282.000	0.000	NA		NA
1222633	1222634	CYB_1312	CYB_1313			TRUE	0.961	32.000	1.000	NA		NA
1222634	1222635	CYB_1313	CYB_1314			TRUE	0.964	42.000	1.000	NA		NA
1222635	1222636	CYB_1314	CYB_1315			FALSE	0.210	90.000	0.000	NA		NA
1222636	1222637	CYB_1315	CYB_1316			FALSE	0.024	248.000	0.000	NA		NA
1222637	1222638	CYB_1316	CYB_1317			FALSE	0.119	170.000	0.000	NA		NA
1222638	1222639	CYB_1317	CYB_1318			FALSE	0.056	202.000	0.000	NA		NA
1222641	1222642	CYB_1320	CYB_1321			FALSE	0.498	107.000	0.011	1.000		NA
1222642	1222643	CYB_1321	CYB_1322			FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
1222643	1222644	CYB_1322	CYB_1323			FALSE	0.211	89.000	0.000	NA		NA
1222646	1222647	CYB_1324	CYB_1326		aroA	TRUE	0.553	36.000	0.002	1.000		NA
1222648	1222649	CYB_1327	CYB_1328	mraW		FALSE	0.163	177.000	0.004	NA		NA
1222649	1222650	CYB_1328	CYB_1329			FALSE	0.048	207.000	0.000	NA		NA
1222650	1222651	CYB_1329	CYB_1330			FALSE	0.040	219.000	0.000	NA		NA
1222651	1222652	CYB_1330	CYB_1331			TRUE	0.572	150.000	0.031	1.000		NA
1222652	1222653	CYB_1331	CYB_1332			TRUE	0.733	12.000	0.031	NA		NA
1222653	1222654	CYB_1332	CYB_1333			TRUE	0.905	5.000	0.250	NA		NA
1222654	1222655	CYB_1333	CYB_1334			FALSE	0.487	105.000	0.022	NA		NA
1222655	1222656	CYB_1334	CYB_1335		ligA	TRUE	0.595	33.000	0.000	1.000	N	NA
1222656	1222657	CYB_1335	CYB_1336	ligA	clpX	FALSE	0.009	813.000	0.004	1.000	N	NA
1222657	1222658	CYB_1336	CYB_1337	clpX		FALSE	0.453	71.000	0.002	1.000	N	NA
1222658	1222659	CYB_1337	CYB_1338			TRUE	0.985	12.000	0.179	0.002	Y	NA
1222659	1222660	CYB_1338	CYB_1339			TRUE	0.607	79.000	0.024	1.000		NA
1222660	1222661	CYB_1339	CYB_1340		rnhA	FALSE	0.008	497.000	0.000	1.000		NA
1222664	1222665	CYB_1343	CYB_1344			TRUE	0.911	69.000	0.055	1.000	Y	NA
1222665	1222666	CYB_1344	CYB_1345			TRUE	0.891	110.000	0.000	0.008	Y	NA
1222666	1222667	CYB_1345	CYB_1346			FALSE	0.203	145.000	0.000	NA		NA
1222667	1222668	CYB_1346	CYB_1347			FALSE	0.210	142.000	0.000	NA		NA
1222668	1222669	CYB_1347	CYB_1348			FALSE	0.366	52.000	0.000	NA		NA
1222670	1222671	CYB_1349	CYB_1350			FALSE	0.010	303.000	0.000	NA		NA
1222672	1222673	CYB_1351	CYB_1352			FALSE	0.015	277.000	0.000	NA		NA
1222674	1222675	CYB_1353	CYB_1354	rbsK		FALSE	0.049	255.000	0.000	1.000	N	NA
1222677	1222678	CYB_1356	CYB_1357			TRUE	0.733	109.000	0.091	NA		NA
1222678	1222679	CYB_1357	CYB_1358		ald	FALSE	0.005	1621.000	0.000	1.000		NA
1222680	1222681	CYB_1359	CYB_1360			TRUE	0.971	77.000	0.875	1.000	Y	NA
1222681	1222682	CYB_1360	CYB_1361			FALSE	0.044	251.000	0.000	1.000		NA
1222682	1222683	CYB_1361	CYB_1362		rpsN	FALSE	0.510	58.000	0.000	1.000		NA
1222685	1222686	CYB_1363	CYB_1365			TRUE	0.667	84.000	0.054	NA		NA
1222686	1222687	CYB_1365	CYB_1366			FALSE	0.078	189.000	0.000	NA		NA
1222690	1222691	CYB_1369	CYB_1370			FALSE	0.033	231.000	0.000	NA		NA
1222692	1222693	CYB_1371	CYB_1372	dapF	psbN	TRUE	0.587	39.000	0.002	1.000		NA
1222698	1222699	CYB_1377	CYB_1378	rrsA		FALSE	0.020	257.000	0.000	NA		NA
1222699	1222700	CYB_1378	CYB_1379			FALSE	0.210	90.000	0.000	NA		NA
1222700	1222701	CYB_1379	CYB_1380		rrlA	FALSE	0.031	234.000	0.000	NA		NA
1222701	1222702	CYB_1380	CYB_1381	rrlA	rrfA	FALSE	0.345	58.000	0.000	NA		NA
1222703	1222704	CYB_1382	CYB_1383	folC	serA	TRUE	0.811	77.000	0.004	1.000	Y	NA
1222705	1222706	CYB_1384	CYB_1385	ackA		TRUE	0.699	119.000	0.057	NA		NA
1222706	1222707	CYB_1385	CYB_1386			FALSE	0.003	530.000	0.000	NA		NA
1222709	1222710	CYB_1388	CYB_1389			FALSE	0.321	259.000	0.571	NA		NA
1222710	1222711	CYB_1389	CYB_1390		ispE	FALSE	0.236	122.000	0.000	NA		NA
1222711	1222712	CYB_1390	CYB_1391	ispE	accC	TRUE	0.827	155.000	0.000	0.087	Y	NA
1222712	1222713	CYB_1391	CYB_1392	accC		TRUE	0.565	95.000	0.016	1.000	N	NA
1222714	1222715	CYB_1393	CYB_1394			TRUE	0.932	-9.000	0.667	NA		NA
1222717	1222718	CYB_1396	CYB_1397			FALSE	0.373	2.000	0.000	NA		NA
1222718	1222719	CYB_1397	CYB_1398			FALSE	0.390	16.000	0.000	NA		NA
1222719	1222720	CYB_1398	CYB_1399			FALSE	0.373	2.000	0.000	NA		NA
1222722	1222723	CYB_1401	CYB_1402		sufD	FALSE	0.014	280.000	0.000	NA		NA
1222723	1222724	CYB_1402	CYB_1403	sufD	sufC	TRUE	0.974	-3.000	0.482	1.000	Y	NA
1222724	1222725	CYB_1403	CYB_1404	sufC	mscL	TRUE	0.687	98.000	0.000	0.030	N	NA
1222725	1222726	CYB_1404	CYB_1405	mscL	sufB	FALSE	0.417	129.000	0.000	1.000	N	NA
1222727	1222728	CYB_1406	CYB_1407	sufR		FALSE	0.030	290.000	0.000	1.000	N	NA
1222728	1222729	CYB_1407	CYB_1408		folB-1	FALSE	0.075	232.000	0.000	1.000	N	NA
1222729	1222730	CYB_1408	CYB_1409	folB-1	miaE	TRUE	0.594	31.000	0.000	1.000	N	NA
1222730	1222731	CYB_1409	CYB_1410	miaE		TRUE	0.836	35.000	0.047	1.000	N	NA
1222734	1222735	CYB_1413	CYB_1414		lnt	FALSE	0.273	67.000	0.000	NA		NA
1222737	1222738	CYB_1416	CYB_1417		cysC	FALSE	0.342	97.000	0.000	1.000		NA
1222744	1222745	CYB_1423	CYB_1424		hemG	TRUE	0.715	54.000	0.033	NA		NA
1222745	1222746	CYB_1424	CYB_1425	hemG	hom	TRUE	0.557	158.000	0.033	1.000	N	NA
1222746	1222747	CYB_1425	CYB_1426	hom	gvpW	FALSE	0.095	205.000	0.000	1.000		NA
1222751	1222752	CYB_1430	CYB_1431	ampG		FALSE	0.007	556.000	0.000	1.000		NA
1222752	1222753	CYB_1431	CYB_1432			TRUE	0.560	175.000	0.100	NA		NA
1222753	1222754	CYB_1432	CYB_1433			TRUE	0.880	-16.000	0.250	NA		NA
1222754	1222755	CYB_1433	CYB_1434			TRUE	0.894	124.000	0.667	NA		NA
1222757	1222758	CYB_1435	CYB_1437			FALSE	0.397	72.000	0.003	NA	N	NA
1222759	1222760	CYB_1438	CYB_1439	apcA	apcB-1	TRUE	0.918	64.000	0.062	0.004		NA
1222760	1222761	CYB_1439	CYB_1440	apcB-1	apcC	TRUE	0.903	167.000	0.531	0.006		NA
1222761	1222762	CYB_1440	CYB_1441	apcC		TRUE	0.590	134.000	0.022	1.000		NA
1222763	1222764	CYB_1442	CYB_1443	leuA		TRUE	0.604	60.000	0.003	1.000	N	NA
1222765	1222766	CYB_1444	CYB_1445	moaD	pnpA	TRUE	0.544	60.000	0.000	1.000	N	NA
1222766	1222767	CYB_1445	CYB_1446	pnpA		FALSE	0.237	176.000	0.002	1.000	N	NA
1222770	1222771	CYB_1449	CYB_1450			FALSE	0.210	107.000	0.000	NA		NA
1222772	1222773	CYB_1451	CYB_1452			FALSE	0.081	215.000	0.000	1.000		NA
1222773	1222774	CYB_1452	CYB_1453			FALSE	0.006	636.000	0.000	1.000		NA
1222775	1222776	CYB_1454	CYB_1455			FALSE	0.011	395.000	0.000	1.000		NA
1222776	1222777	CYB_1455	CYB_1456			FALSE	0.506	135.000	0.022	NA		NA
1222777	1222778	CYB_1456	CYB_1457			FALSE	0.388	20.000	0.000	NA		NA
1222779	1222780	CYB_1458	CYB_1459			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1222780	1222781	CYB_1459	CYB_1460			FALSE	0.386	36.000	0.000	NA		NA
1222781	1222782	CYB_1460	CYB_1461			TRUE	0.729	66.000	0.051	NA		NA
1222782	1222783	CYB_1461	CYB_1462			TRUE	0.812	25.000	0.051	NA		NA
1222783	1222784	CYB_1462	CYB_1463		ycf4	FALSE	0.010	304.000	0.000	NA		NA
1222784	1222785	CYB_1463	CYB_1464	ycf4		FALSE	0.083	212.000	0.000	1.000		NA
1222785	1222786	CYB_1464	CYB_1465		phnD-2	FALSE	0.325	210.000	0.000	0.008	N	NA
1222786	1222787	CYB_1465	CYB_1466	phnD-2	phnD	FALSE	0.193	350.000	0.000	0.002	Y	NA
1222787	1222788	CYB_1466	CYB_1467	phnD	phnC-2	TRUE	0.980	142.000	0.667	0.004	Y	NA
1222788	1222789	CYB_1467	CYB_1468	phnC-2	phnE-2	TRUE	0.989	59.000	0.667	0.004	Y	NA
1222789	1222790	CYB_1468	CYB_1469	phnE-2	phnE-3	TRUE	0.993	0.000	0.915	0.001	Y	NA
1222790	1222791	CYB_1469	CYB_1470	phnE-3		FALSE	0.322	61.000	0.000	NA		NA
1222792	1222793	CYB_1471	CYB_1472		gvpK	TRUE	0.553	125.000	0.013	1.000		NA
1222793	1222794	CYB_1472	CYB_1473	gvpK		TRUE	0.668	87.000	0.047	1.000		NA
1222794	1222795	CYB_1473	CYB_1474			FALSE	0.072	222.000	0.000	1.000		NA
1222795	1222796	CYB_1474	CYB_1475			FALSE	0.374	50.000	0.000	NA		NA
1222797	1222798	CYB_1476	CYB_1477			FALSE	0.392	45.000	0.000	NA		NA
1222799	1222800	CYB_1478	CYB_1479	pyrG		FALSE	0.312	61.000	0.002	NA		NA
1222801	1222802	CYB_1480	CYB_1481			FALSE	0.248	169.000	0.000	1.000	N	NA
1222802	1222803	CYB_1481	CYB_1482			FALSE	0.014	279.000	0.000	NA		NA
1222803	1222804	CYB_1482	CYB_1483			FALSE	0.005	398.000	0.000	NA		NA
1222804	1222805	CYB_1483	CYB_1484			TRUE	0.852	81.000	0.400	NA		NA
1222805	1222806	CYB_1484	CYB_1485			TRUE	0.916	55.000	0.400	NA		NA
1222806	1222807	CYB_1485	CYB_1486			FALSE	0.061	233.000	0.000	1.000		NA
1222807	1222808	CYB_1486	CYB_1487		pyrE	FALSE	0.110	200.000	0.000	1.000		NA
1222808	1222809	CYB_1487	CYB_1488	pyrE		TRUE	0.613	41.000	0.000	1.000	N	NA
1222809	1222810	CYB_1488	CYB_1490		malQ	TRUE	0.823	162.000	0.000	0.010	Y	NA
1222811	1222812	CYB_1489	CYB_1491			FALSE	0.015	277.000	0.000	NA		NA
1222812	1222813	CYB_1491	CYB_1492		thrS	FALSE	0.395	39.000	0.000	NA		NA
1222816	1222817	CYB_1495	CYB_1496	psbE	psbF	TRUE	0.967	77.000	0.837	0.002		NA
1222817	1222818	CYB_1496	CYB_1497	psbF	psbL	TRUE	0.983	6.000	0.872	0.003		NA
1222818	1222819	CYB_1497	CYB_1498	psbL	psbJ	TRUE	0.963	142.000	0.878	0.003		NA
1222819	1222820	CYB_1498	CYB_1499	psbJ	psaL-1	FALSE	0.028	529.000	0.000	0.017		NA
1222820	1222821	CYB_1499	CYB_1500	psaL-1	psaI	TRUE	0.967	39.000	0.371	0.017		NA
1222821	1222822	CYB_1500	CYB_1501	psaI		FALSE	0.011	302.000	0.000	NA		NA
1222823	1222824	CYB_1502	CYB_1503			FALSE	0.019	341.000	0.000	1.000	N	NA
1222824	1222825	CYB_1503	CYB_1504			TRUE	0.868	0.000	0.080	1.000		NA
1222825	1222826	CYB_1504	CYB_1505			TRUE	0.872	51.000	0.125	NA		NA
1222826	1222827	CYB_1505	CYB_1506			FALSE	0.345	58.000	0.000	NA		NA
1222827	1222828	CYB_1506	CYB_1507			FALSE	0.319	-19.000	0.000	NA		NA
1222829	1222830	CYB_1508	CYB_1509	trpB		TRUE	0.581	38.000	0.007	NA		NA
1222830	1222831	CYB_1509	CYB_1510			FALSE	0.405	-10.000	0.003	NA		NA
1222831	1222832	CYB_1510	CYB_1511		aroC	TRUE	0.572	54.000	0.002	1.000	N	NA
1222832	1222833	CYB_1511	CYB_1512	aroC	radA	TRUE	0.603	13.000	0.002	1.000	N	NA
1222833	1222834	CYB_1512	CYB_1513	radA		FALSE	0.036	261.000	0.000	1.000		NA
1222834	1222835	CYB_1513	CYB_1514		lysS	TRUE	0.537	51.000	0.000	1.000		NA
1222836	1222837	CYB_1515	CYB_1516			TRUE	0.569	159.000	0.038	1.000	N	NA
1222837	1222838	CYB_1516	CYB_1517			TRUE	0.877	18.000	0.115	NA		NA
1222838	1222839	CYB_1517	CYB_1518			TRUE	0.871	63.000	0.250	NA		NA
1222839	1222840	CYB_1518	CYB_1519		petJ	TRUE	0.936	48.000	0.400	1.000		NA
1222845	1222846	CYB_1524	CYB_1525			FALSE	0.148	160.000	0.000	NA		NA
1222846	1222847	CYB_1525	CYB_1526			FALSE	0.223	135.000	0.000	NA		NA
1222847	1222848	CYB_1526	CYB_1527			TRUE	0.919	-3.000	0.417	NA		NA
1222848	1222849	CYB_1527	CYB_1528			FALSE	0.207	102.000	0.000	NA		NA
1222852	1222853	CYB_1531	CYB_1532			FALSE	0.394	44.000	0.000	NA		NA
1222854	1222855	CYB_1533	CYB_1534		rpsB	FALSE	0.387	22.000	0.000	NA		NA
1222855	1222856	CYB_1534	CYB_1535	rpsB	tsf	TRUE	0.941	160.000	0.748	1.000	Y	NA
1222856	1222857	CYB_1535	CYB_1536	tsf		FALSE	0.085	223.000	0.000	1.000	N	NA
1222857	1222858	CYB_1536	CYB_1537			TRUE	0.732	57.000	0.017	1.000	N	NA
1222858	1222859	CYB_1537	CYB_1538			FALSE	0.099	203.000	0.000	1.000		NA
1222860	1222861	CYB_1539	CYB_1540	dnaN		FALSE	0.056	202.000	0.000	NA		NA
1222863	1222864	CYB_1542	CYB_1543			FALSE	0.239	76.000	0.000	NA		NA
1222864	1222865	CYB_1543	CYB_1544			FALSE	0.184	151.000	0.000	NA		NA
1222865	1222866	CYB_1544	CYB_1545		pyk	FALSE	0.218	139.000	0.000	NA		NA
1222868	1222869	CYB_1547	CYB_1548			FALSE	0.205	144.000	0.000	NA		NA
1222869	1222870	CYB_1548	CYB_1549			TRUE	0.721	-22.000	0.029	1.000		NA
1222871	1222872	CYB_1550	CYB_1551	hisG	psbO	FALSE	0.369	109.000	0.002	1.000		NA
1222877	1222878	CYB_1555	CYB_1557	devA	devC	FALSE	0.483	226.000	0.000	0.030	Y	NA
1222878	1222879	CYB_1557	CYB_1558	devC		TRUE	0.981	10.000	0.200	0.063	Y	NA
1222880	1222881	CYB_1559	CYB_1560	murC	murB	TRUE	0.977	62.000	0.136	0.004	Y	NA
1222881	1222882	CYB_1560	CYB_1561	murB		FALSE	0.388	21.000	0.000	NA		NA
1222885	1222886	CYB_1563	CYB_1565	est		TRUE	0.852	42.000	0.051	1.000		NA
1222886	1222887	CYB_1565	CYB_1566			FALSE	0.295	160.000	0.000	1.000	N	NA
1222887	1222888	CYB_1566	CYB_1567			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1222890	1222891	CYB_1568	CYB_1570	asd	aroB	TRUE	0.886	35.000	0.002	1.000	Y	NA
1222891	1222892	CYB_1570	CYB_1571	aroB		FALSE	0.341	101.000	0.000	1.000		NA
1222893	1222894	CYB_1572	CYB_1573			TRUE	0.929	0.000	0.500	NA		NA
1222894	1222895	CYB_1573	CYB_1574			TRUE	0.847	147.000	0.500	NA		NA
1222896	1222897	CYB_1575	CYB_1576			TRUE	0.948	89.000	0.500	0.001		NA
1222898	1222899	CYB_1577	CYB_1578	rpmJ	rpsM	TRUE	0.806	202.000	0.086	0.014	Y	NA
1222899	1222900	CYB_1578	CYB_1579	rpsM	rpsK	TRUE	0.981	85.000	0.810	0.014	Y	NA
1222900	1222901	CYB_1579	CYB_1580	rpsK	rpoA	TRUE	0.829	151.000	0.308	1.000	N	NA
1222901	1222902	CYB_1580	CYB_1581	rpoA	rplQ	TRUE	0.922	96.000	0.873	1.000	N	NA
1222902	1222903	CYB_1581	CYB_1582	rplQ	truA	TRUE	0.961	14.000	0.102	1.000	Y	NA
1222903	1222904	CYB_1582	CYB_1583	truA	rplM	TRUE	0.950	46.000	0.058	1.000	Y	NA
1222904	1222905	CYB_1583	CYB_1584	rplM	rpsI	TRUE	0.988	-3.000	0.601	0.014	Y	NA
1222905	1222906	CYB_1584	CYB_1585	rpsI	rpmE	TRUE	0.951	77.000	0.062	0.014	Y	NA
1222906	1222907	CYB_1585	CYB_1586	rpmE	prfA	TRUE	0.955	55.000	0.110	1.000	Y	NA
1222907	1222908	CYB_1586	CYB_1587	prfA	acnB	FALSE	0.384	103.000	0.002	1.000	N	NA
1222908	1222909	CYB_1587	CYB_1588	acnB		FALSE	0.429	68.000	0.007	NA		NA
1222909	1222910	CYB_1588	CYB_1589			TRUE	0.752	179.000	0.667	NA		NA
1222910	1222911	CYB_1589	CYB_1590			FALSE	0.019	280.000	0.000	NA	N	NA
1222911	1222912	CYB_1590	CYB_1591			FALSE	0.517	89.000	0.020	NA	N	NA
1222915	1222916	CYB_1594	CYB_1596			FALSE	0.002	1911.000	0.000	NA		NA
1222916	1222917	CYB_1596	CYB_1597			FALSE	0.158	158.000	0.000	NA		NA
1222918	1222919	CYB_1598	CYB_1599			FALSE	0.006	388.000	0.000	NA		NA
1222919	1222920	CYB_1599	CYB_1600			FALSE	0.208	98.000	0.000	NA		NA
1222920	1222921	CYB_1600	CYB_1601			FALSE	0.331	60.000	0.000	NA		NA
1222921	1222922	CYB_1601	CYB_1602			FALSE	0.332	-9.000	0.000	NA		NA
1222922	1222923	CYB_1602	CYB_1603			FALSE	0.372	1.000	0.000	NA		NA
1222923	1222924	CYB_1603	CYB_1604			FALSE	0.214	108.000	0.000	NA		NA
1222924	1222925	CYB_1604	CYB_1605		gatA	FALSE	0.143	167.000	0.002	NA		NA
1222926	1222927	CYB_1606	CYB_1607	psbW		TRUE	0.804	32.000	0.040	1.000		NA
1222927	1222928	CYB_1607	CYB_1608			TRUE	0.575	99.000	0.040	NA		NA
1222928	1222929	CYB_1608	CYB_1609		gyrA	FALSE	0.082	187.000	0.002	NA		NA
1222930	1222931	CYB_1610	CYB_1611			FALSE	0.343	91.000	0.000	1.000		NA
1222931	1222932	CYB_1611	CYB_1612			TRUE	0.695	70.000	0.050	NA		NA
1222933	1222934	CYB_1613	CYB_1614			FALSE	0.043	215.000	0.000	NA		NA
1222934	1222935	CYB_1614	CYB_1615			FALSE	0.296	-102.000	0.000	NA		NA
1222935	1222936	CYB_1615	CYB_1616			FALSE	0.397	42.000	0.000	NA		NA
1222936	1222937	CYB_1616	CYB_1617			FALSE	0.394	102.000	0.011	NA		NA
1222937	1222938	CYB_1617	CYB_1618		groL-1	FALSE	0.007	348.000	0.000	NA		NA
1222938	1222939	CYB_1618	CYB_1619	groL-1	groS	TRUE	0.937	91.000	0.048	0.008	Y	NA
1222941	1222942	CYB_1621	CYB_1622	petA	petC	TRUE	0.960	123.000	0.881	0.041		NA
1222944	1222945	CYB_1624	CYB_1625			FALSE	0.203	145.000	0.000	NA		NA
1222945	1222946	CYB_1625	CYB_1626			TRUE	0.842	17.000	0.000	0.015		NA
1222949	1222950	CYB_1629	CYB_1630	petB	petD	TRUE	0.926	99.000	0.471	0.063		NA
1222950	1222951	CYB_1630	CYB_1631	petD	leuB	FALSE	0.089	208.000	0.000	1.000		NA
1222952	1222953	CYB_1632	CYB_1633		rpsR	TRUE	0.885	17.000	0.002	1.000	Y	NA
1222953	1222954	CYB_1633	CYB_1634	rpsR	rpmG	TRUE	0.966	30.000	0.037	0.014	Y	NA
1222954	1222955	CYB_1634	CYB_1635	rpmG		FALSE	0.209	92.000	0.000	NA		NA
1222955	1222956	CYB_1635	CYB_1636		rnz	FALSE	0.226	132.000	0.000	NA		NA
1222957	1222958	CYB_1637	CYB_1638			FALSE	0.319	-19.000	0.000	NA		NA
1222959	1222960	CYB_1639	CYB_1640			TRUE	0.983	35.000	0.143	0.007	Y	NA
1222960	1222961	CYB_1640	CYB_1641			FALSE	0.176	242.000	0.000	0.063	N	NA
1222961	1222962	CYB_1641	CYB_1642			FALSE	0.223	135.000	0.000	NA		NA
1222962	1222963	CYB_1642	CYB_1643			FALSE	0.385	9.000	0.000	NA		NA
1222964	1222965	CYB_1644	CYB_1645	lysA		FALSE	0.179	219.000	0.040	NA		NA
1222965	1222966	CYB_1645	CYB_1646		uppS	TRUE	0.771	6.000	0.043	NA		NA
1222967	1222968	CYB_1647	CYB_1648			TRUE	0.659	69.000	0.028	1.000		NA
1222968	1222969	CYB_1648	CYB_1649			FALSE	0.416	130.000	0.000	1.000	N	NA
1222969	1222970	CYB_1649	CYB_1650			FALSE	0.285	91.000	0.003	NA		NA
1222970	1222971	CYB_1650	CYB_1651			FALSE	0.226	132.000	0.000	NA		NA
1222972	1222973	CYB_1652	CYB_1653	prs		FALSE	0.496	159.000	0.020	1.000	N	NA
1222973	1222974	CYB_1653	CYB_1654			TRUE	0.985	-3.000	0.400	0.013	Y	NA
1222976	1222977	CYB_1656	CYB_1657	purM		FALSE	0.095	216.000	0.000	1.000	N	NA
1222977	1222978	CYB_1657	CYB_1658			TRUE	0.941	-3.000	0.710	NA		NA
1222978	1222979	CYB_1658	CYB_1659			TRUE	0.920	48.000	0.379	NA		NA
1222979	1222980	CYB_1659	CYB_1660			FALSE	0.389	19.000	0.000	NA		NA
1222981	1222982	CYB_1661	CYB_1662			TRUE	0.719	96.000	0.059	1.000		NA
1222982	1222983	CYB_1662	CYB_1663			TRUE	0.534	166.000	0.047	1.000		NA
1222983	1222984	CYB_1663	CYB_1664		rpsF	FALSE	0.509	74.000	0.004	1.000	N	NA
1222985	1222986	CYB_1665	CYB_1666	acpP	fabF	TRUE	0.973	46.000	0.346	1.000	Y	NA
1222986	1222987	CYB_1666	CYB_1667	fabF		TRUE	0.528	13.000	0.005	NA		NA
1222987	1222988	CYB_1667	CYB_1669			FALSE	0.313	62.000	0.000	NA		NA
1222989	1222990	CYB_1668	CYB_1670	queA	dcd	FALSE	0.431	84.000	0.002	1.000	N	NA
1222990	1222991	CYB_1670	CYB_1671	dcd		TRUE	0.802	124.000	0.091	1.000	N	NA
1222991	1222992	CYB_1671	CYB_1672			FALSE	0.009	505.000	0.000	1.000	N	NA
1222992	1222993	CYB_1672	CYB_1673			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1222993	1222994	CYB_1673	CYB_1674			FALSE	0.004	521.000	0.000	NA		NA
1222994	1222995	CYB_1674	CYB_1675			FALSE	0.227	113.000	0.000	NA		NA
1222995	1222996	CYB_1675	CYB_1676			TRUE	0.865	44.000	0.091	NA		NA
1222998	1222999	CYB_1678	CYB_1679			FALSE	0.174	180.000	0.000	1.000		NA
1222999	1223000	CYB_1679	CYB_1680		gltX	FALSE	0.187	233.000	0.000	0.084		NA
1223000	1223001	CYB_1680	CYB_1681	gltX		FALSE	0.236	121.000	0.000	NA		NA
1223004	1223005	CYB_1684	CYB_1685			TRUE	0.937	-3.000	0.446	1.000	N	NA
1223005	1223006	CYB_1685	CYB_1687		argB	TRUE	0.544	60.000	0.000	1.000	N	NA
1223008	1223009	CYB_1688	CYB_1689			FALSE	0.326	69.000	0.000	NA	N	NA
1223009	1223010	CYB_1689	CYB_1690			FALSE	0.010	428.000	0.000	1.000		NA
1223010	1223011	CYB_1690	CYB_1691			TRUE	0.613	199.000	0.404	1.000		NA
1223011	1223012	CYB_1691	CYB_1692			TRUE	0.865	125.000	0.423	NA		NA
1223014	1223015	CYB_1694	CYB_1695	pds	crtB	TRUE	0.871	157.000	0.691	1.000		NA
1223015	1223016	CYB_1695	CYB_1697	crtB		TRUE	0.682	83.000	0.041	1.000	N	NA
1223017	1223018	CYB_1696	CYB_1698			FALSE	0.233	116.000	0.000	NA		NA
1223018	1223019	CYB_1698	CYB_1699			TRUE	0.930	3.000	0.487	NA		NA
1223019	1223020	CYB_1699	CYB_1700			TRUE	0.854	44.000	0.077	NA		NA
1223020	1223021	CYB_1700	CYB_1701			TRUE	0.963	36.000	0.360	0.035		NA
1223022	1223023	CYB_1702	CYB_1703			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223023	1223024	CYB_1703	CYB_1704		gap-2	FALSE	0.334	-7.000	0.000	NA		NA
1223027	1223028	CYB_1706	CYB_1708			FALSE	0.347	88.000	0.000	1.000		NA
1223029	1223030	CYB_1709	CYB_1710			TRUE	0.939	30.000	0.000	0.033	Y	NA
1223030	1223031	CYB_1710	CYB_1711			TRUE	0.656	117.000	0.036	1.000		NA
1223031	1223032	CYB_1711	CYB_1712		groL-2	FALSE	0.110	200.000	0.000	1.000		NA
1223036	1223037	CYB_1716	CYB_1717			FALSE	0.213	87.000	0.000	NA		NA
1223037	1223038	CYB_1717	CYB_1718			FALSE	0.253	71.000	0.000	NA		NA
1223038	1223039	CYB_1718	CYB_1719			FALSE	0.200	146.000	0.000	NA		NA
1223039	1223040	CYB_1719	CYB_1720			TRUE	0.918	63.000	0.636	NA		NA
1223040	1223041	CYB_1720	CYB_1721			FALSE	0.395	39.000	0.000	NA		NA
1223042	1223043	CYB_1722	CYB_1723			FALSE	0.235	77.000	0.000	NA		NA
1223047	1223048	CYB_1728	CYB_1729			FALSE	0.349	195.000	0.000	0.034		NA
1223049	1223050	CYB_1730	CYB_1731			TRUE	0.820	55.000	0.000	0.015		NA
1223050	1223051	CYB_1731	CYB_1733			FALSE	0.386	10.000	0.000	NA		NA
1223052	1223053	CYB_1732	CYB_1734		glgA-2	TRUE	0.822	46.000	0.045	1.000		NA
1223054	1223055	CYB_1735	CYB_1736		psbD-2	FALSE	0.223	135.000	0.000	NA		NA
1223056	1223057	CYB_1737	CYB_1738	aroK	ribE	TRUE	0.622	12.000	0.002	1.000	N	NA
1223057	1223058	CYB_1738	CYB_1739	ribE		TRUE	0.557	13.000	0.000	1.000		NA
1223058	1223059	CYB_1739	CYB_1740			FALSE	0.006	605.000	0.000	1.000		NA
1223059	1223060	CYB_1740	CYB_1741		rph	FALSE	0.058	247.000	0.000	1.000	N	NA
1223060	1223061	CYB_1741	CYB_1742	rph		FALSE	0.085	224.000	0.000	1.000	N	NA
1223061	1223062	CYB_1742	CYB_1743			FALSE	0.040	256.000	0.000	1.000		NA
1223063	1223064	CYB_1744	CYB_1745	speB		FALSE	0.440	73.000	0.000	1.000	N	NA
1223064	1223065	CYB_1745	CYB_1746			FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
1223065	1223066	CYB_1746	CYB_1747			FALSE	0.042	579.000	0.194	NA		NA
1223066	1223067	CYB_1747	CYB_1749		proC	TRUE	0.901	6.000	0.224	NA		NA
1223068	1223069	CYB_1748	CYB_1750			FALSE	0.396	141.000	0.000	1.000	N	NA
1223072	1223073	CYB_1753	CYB_1754			FALSE	0.207	103.000	0.000	NA		NA
1223074	1223075	CYB_1755	CYB_1756			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223075	1223076	CYB_1756	CYB_1757		secF	FALSE	0.439	53.000	0.000	NA	N	NA
1223076	1223077	CYB_1757	CYB_1758	secF	secD	TRUE	0.989	-3.000	0.516	0.001	Y	NA
1223077	1223078	CYB_1758	CYB_1759	secD		FALSE	0.292	79.000	0.000	NA	N	NA
1223080	1223081	CYB_1761	CYB_1762	chlP		FALSE	0.422	125.000	0.000	1.000	N	NA
1223081	1223082	CYB_1762	CYB_1763			FALSE	0.521	-28.000	0.003	1.000		NA
1223082	1223083	CYB_1763	CYB_1764			TRUE	0.760	-3.000	0.047	NA		NA
1223083	1223084	CYB_1764	CYB_1765			FALSE	0.209	106.000	0.000	NA		NA
1223085	1223086	CYB_1766	CYB_1767	pdxA		FALSE	0.343	91.000	0.000	1.000		NA
1223086	1223087	CYB_1767	CYB_1768			FALSE	0.212	88.000	0.000	NA		NA
1223089	1223090	CYB_1770	CYB_1772			FALSE	0.026	243.000	0.000	NA		NA
1223091	1223092	CYB_1771	CYB_1773			FALSE	0.416	68.000	0.000	1.000		NA
1223092	1223093	CYB_1773	CYB_1774			FALSE	0.087	183.000	0.000	NA		NA
1223093	1223094	CYB_1774	CYB_1775			TRUE	0.915	94.000	1.000	NA		NA
1223094	1223095	CYB_1775	CYB_1776			FALSE	0.379	121.000	0.000	1.000		NA
1223096	1223097	CYB_1777	CYB_1778			FALSE	0.380	28.000	0.000	NA		NA
1223097	1223098	CYB_1778	CYB_1779			FALSE	0.005	450.000	0.000	NA		NA
1223098	1223099	CYB_1779	CYB_1780			FALSE	0.065	196.000	0.000	NA		NA
1223099	1223100	CYB_1780	CYB_1781		thyX	FALSE	0.145	183.000	0.005	NA		NA
1223100	1223101	CYB_1781	CYB_1782	thyX		TRUE	0.615	54.000	0.005	1.000		NA
1223101	1223102	CYB_1782	CYB_1783			FALSE	0.007	354.000	0.000	NA		NA
1223102	1223103	CYB_1783	CYB_1784		purC	TRUE	0.565	11.000	0.004	NA	N	NA
1223103	1223104	CYB_1784	CYB_1785	purC		FALSE	0.015	273.000	0.000	NA		NA
1223106	1223107	CYB_1787	CYB_1788			FALSE	0.214	188.000	0.016	NA		NA
1223107	1223108	CYB_1788	CYB_1789		ilvC	FALSE	0.517	64.000	0.002	1.000	N	NA
1223108	1223109	CYB_1789	CYB_1790	ilvC	serS	TRUE	0.608	34.000	0.002	1.000	N	NA
1223110	1223111	CYB_1791	CYB_1792			FALSE	0.028	239.000	0.000	NA		NA
1223111	1223112	CYB_1792	CYB_1793			FALSE	0.378	33.000	0.000	NA		NA
1223112	1223113	CYB_1793	CYB_1794		ccmM	TRUE	0.845	91.000	0.037	0.002		NA
1223113	1223114	CYB_1794	CYB_1795	ccmM	ccmL	TRUE	0.850	72.000	0.333	NA		NA
1223114	1223115	CYB_1795	CYB_1796	ccmL	ccmK-1	TRUE	0.980	0.000	0.818	NA	Y	NA
1223115	1223116	CYB_1796	CYB_1797	ccmK-1	ccmK-2	TRUE	0.915	72.000	0.105	NA	Y	NA
1223116	1223117	CYB_1797	CYB_1798	ccmK-2		FALSE	0.004	806.000	0.000	NA	N	NA
1223117	1223118	CYB_1798	CYB_1799			FALSE	0.517	8.000	0.003	NA	N	NA
1223118	1223119	CYB_1799	CYB_1800			FALSE	0.409	58.000	0.003	NA		NA
1223119	1223120	CYB_1800	CYB_1801			TRUE	0.639	131.000	0.048	NA		NA
1223120	1223121	CYB_1801	CYB_1802			FALSE	0.214	108.000	0.000	NA		NA
1223122	1223123	CYB_1803	CYB_1804	petE		FALSE	0.084	184.000	0.000	NA		NA
1223126	1223127	CYB_1807	CYB_1808			FALSE	0.493	99.000	0.011	1.000		NA
1223127	1223128	CYB_1808	CYB_1809			FALSE	0.382	35.000	0.000	NA		NA
1223128	1223129	CYB_1809	CYB_1810			FALSE	0.220	83.000	0.000	NA		NA
1223129	1223130	CYB_1810	CYB_1811			TRUE	0.836	37.000	0.062	NA		NA
1223130	1223131	CYB_1811	CYB_1812			TRUE	0.993	13.000	0.875	0.003	Y	NA
1223131	1223132	CYB_1812	CYB_1813			FALSE	0.229	129.000	0.000	NA		NA
1223133	1223134	CYB_1814	CYB_1815		thiE	TRUE	0.532	110.000	0.027	NA		NA
1223134	1223135	CYB_1815	CYB_1816	thiE		FALSE	0.124	202.000	0.000	1.000	N	NA
1223136	1223137	CYB_1817	CYB_1818			FALSE	0.099	203.000	0.000	1.000		NA
1223137	1223138	CYB_1818	CYB_1819			FALSE	0.223	82.000	0.000	NA		NA
1223138	1223139	CYB_1819	CYB_1820			FALSE	0.467	93.000	0.019	NA		NA
1223140	1223141	CYB_1821	CYB_1822	cysS		FALSE	0.339	153.000	0.000	1.000	N	NA
1223141	1223142	CYB_1822	CYB_1823			FALSE	0.007	767.000	0.000	1.000	N	NA
1223142	1223143	CYB_1823	CYB_1824		rnhB	TRUE	0.916	36.000	0.033	0.014	N	NA
1223143	1223144	CYB_1824	CYB_1825	rnhB		FALSE	0.389	13.000	0.000	NA		NA
1223144	1223145	CYB_1825	CYB_1826			FALSE	0.223	82.000	0.000	NA		NA
1223146	1223147	CYB_1827	CYB_1828			FALSE	0.009	325.000	0.000	NA		NA
1223147	1223148	CYB_1828	CYB_1829		gvpJ	FALSE	0.241	75.000	0.000	NA		NA
1223148	1223149	CYB_1829	CYB_1830	gvpJ	gvpN	TRUE	0.858	42.000	0.054	1.000		NA
1223149	1223150	CYB_1830	CYB_1831	gvpN	gvpC	TRUE	0.891	80.000	0.054	0.001		NA
1223153	1223154	CYB_1834	CYB_1835			FALSE	0.009	324.000	0.000	NA		NA
1223154	1223155	CYB_1835	CYB_1836			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223155	1223156	CYB_1836	CYB_1837			FALSE	0.345	58.000	0.000	NA		NA
1223156	1223157	CYB_1837	CYB_1838			FALSE	0.386	270.000	0.800	1.000		NA
1223157	1223158	CYB_1838	CYB_1839		aroH	FALSE	0.503	104.000	0.012	1.000		NA
1223164	1223165	CYB_1845	CYB_1846			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223165	1223166	CYB_1846	CYB_1847		ribD	FALSE	0.382	27.000	0.000	NA		NA
1223166	1223167	CYB_1847	CYB_1848	ribD		FALSE	0.016	269.000	0.000	NA		NA
1223168	1223169	CYB_1849	CYB_1850			FALSE	0.265	68.000	0.000	NA		NA
1223172	1223173	CYB_1853	CYB_1854			FALSE	0.224	112.000	0.000	NA		NA
1223173	1223174	CYB_1854	CYB_1855			FALSE	0.058	201.000	0.000	NA		NA
1223175	1223176	CYB_1856	CYB_1857			TRUE	0.593	46.000	0.009	NA		NA
1223176	1223177	CYB_1857	CYB_1858			TRUE	0.621	14.000	0.012	NA		NA
1223177	1223178	CYB_1858	CYB_1859		crtE	TRUE	0.853	71.000	0.214	1.000		NA
1223178	1223179	CYB_1859	CYB_1860	crtE		FALSE	0.244	74.000	0.000	NA		NA
1223180	1223181	CYB_1861	CYB_1863	hemE		FALSE	0.006	391.000	0.000	NA		NA
1223184	1223185	CYB_1865	CYB_1866			TRUE	0.593	85.000	0.042	NA		NA
1223185	1223186	CYB_1866	CYB_1867		thiL	FALSE	0.056	202.000	0.000	NA		NA
1223186	1223187	CYB_1867	CYB_1868	thiL		FALSE	0.372	115.000	0.000	1.000		NA
1223189	1223190	CYB_1870	CYB_1871			TRUE	0.969	141.000	0.414	0.082	Y	NA
1223190	1223191	CYB_1871	CYB_1872			FALSE	0.299	121.000	0.000	NA	N	NA
1223193	1223194	CYB_1874	CYB_1875	cefD	prfC	FALSE	0.037	271.000	0.000	1.000	N	NA
1223194	1223195	CYB_1875	CYB_1876	prfC		FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
1223195	1223196	CYB_1876	CYB_1877			FALSE	0.208	101.000	0.000	NA		NA
1223196	1223197	CYB_1877	CYB_1878		aspC	FALSE	0.304	159.000	0.000	1.000	N	NA
1223197	1223198	CYB_1878	CYB_1879	aspC		TRUE	0.591	76.000	0.035	NA		NA
1223198	1223199	CYB_1879	CYB_1880			FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
1223199	1223200	CYB_1880	CYB_1881			TRUE	0.878	94.000	0.431	1.000	N	NA
1223200	1223201	CYB_1881	CYB_1882			TRUE	0.932	-13.000	0.003	0.017	Y	NA
1223201	1223202	CYB_1882	CYB_1883			TRUE	0.987	5.000	1.000	1.000	Y	NA
1223202	1223203	CYB_1883	CYB_1884			TRUE	0.985	-3.000	0.429	0.022	Y	NA
1223203	1223204	CYB_1884	CYB_1885			TRUE	0.990	-15.000	0.875	0.022	Y	NA
1223206	1223207	CYB_1887	CYB_1888	ftsE		FALSE	0.212	194.000	0.006	1.000	N	NA
1223208	1223209	CYB_1889	CYB_1890			FALSE	0.368	130.000	0.000	1.000		NA
1223209	1223210	CYB_1890	CYB_1891			FALSE	0.386	10.000	0.000	NA		NA
1223211	1223212	CYB_1892	CYB_1893			FALSE	0.489	-12.000	0.000	1.000		NA
1223212	1223213	CYB_1893	CYB_1894			FALSE	0.420	127.000	0.000	1.000	N	NA
1223213	1223214	CYB_1894	CYB_1895		sasA	FALSE	0.014	389.000	0.000	1.000	N	NA
1223214	1223215	CYB_1895	CYB_1896	sasA		FALSE	0.011	299.000	0.000	NA		NA
1223218	1223219	CYB_1899	CYB_1900	eda		FALSE	0.383	26.000	0.000	NA		NA
1223219	1223220	CYB_1900	CYB_1901		dgkA	TRUE	0.748	104.000	0.123	NA		NA
1223222	1223223	CYB_1903	CYB_1904			FALSE	0.351	85.000	0.000	1.000		NA
1223223	1223224	CYB_1904	CYB_1906			FALSE	0.381	5.000	0.000	NA		NA
1223225	1223226	CYB_1905	CYB_1907			FALSE	0.016	269.000	0.000	NA		NA
1223227	1223228	CYB_1908	CYB_1909			TRUE	0.592	80.000	0.038	NA		NA
1223228	1223229	CYB_1909	CYB_1910			FALSE	0.007	356.000	0.000	NA		NA
1223230	1223231	CYB_1911	CYB_1912		pstB-2	TRUE	0.648	113.000	0.029	1.000	N	NA
1223231	1223232	CYB_1912	CYB_1913	pstB-2	pstA-2	TRUE	0.981	71.000	0.429	0.003	Y	NA
1223232	1223233	CYB_1913	CYB_1914	pstA-2	pstC-2	TRUE	0.981	39.000	0.081	0.003	Y	NA
1223233	1223234	CYB_1914	CYB_1915	pstC-2	pstS-2	TRUE	0.941	149.000	0.054	0.003	Y	NA
1223236	1223237	CYB_1917	CYB_1918	pyrB	purB	TRUE	0.882	10.000	0.002	1.000	Y	NA
1223238	1223239	CYB_1919	CYB_1920			FALSE	0.008	472.000	0.000	1.000		NA
1223240	1223241	CYB_1921	CYB_1922	lipB	trx-3	TRUE	0.606	14.000	0.000	1.000	N	NA
1223243	1223244	CYB_1923	CYB_1925			TRUE	0.915	-3.000	0.042	NA	Y	NA
1223244	1223245	CYB_1925	CYB_1926			TRUE	0.721	20.000	0.028	NA		NA
1223245	1223246	CYB_1926	CYB_1927			FALSE	0.500	98.000	0.025	NA		NA
1223248	1223249	CYB_1929	CYB_1930			TRUE	0.940	25.000	0.047	1.000	Y	NA
1223253	1223254	CYB_1934	CYB_1935			TRUE	0.931	192.000	0.524	0.002	Y	NA
1223254	1223255	CYB_1935	CYB_1936			TRUE	0.728	292.000	0.762	0.002	Y	NA
1223255	1223256	CYB_1936	CYB_1937			TRUE	0.918	116.000	0.095	1.000	Y	NA
1223256	1223257	CYB_1937	CYB_1938			TRUE	0.989	-3.000	0.667	0.010	Y	NA
1223257	1223258	CYB_1938	CYB_1939			TRUE	0.708	189.000	0.000	0.010	Y	NA
1223260	1223261	CYB_1941	CYB_1942			TRUE	0.933	173.000	0.304	0.012	Y	NA
1223261	1223262	CYB_1942	CYB_1943			FALSE	0.012	422.000	0.000	1.000	N	NA
1223264	1223265	CYB_1945	CYB_1946			TRUE	0.874	38.000	0.105	NA		NA
1223268	1223269	CYB_1949	CYB_1950		nrdR	FALSE	0.298	76.000	0.003	NA		NA
1223269	1223270	CYB_1950	CYB_1951	nrdR		FALSE	0.006	393.000	0.000	NA		NA
1223271	1223272	CYB_1952	CYB_1953		rrfB	FALSE	0.235	117.000	0.000	NA		NA
1223272	1223273	CYB_1953	CYB_1954	rrfB	rrlB	FALSE	0.345	58.000	0.000	NA		NA
1223273	1223274	CYB_1954	CYB_1955	rrlB		FALSE	0.031	234.000	0.000	NA		NA
1223274	1223275	CYB_1955	CYB_1956			FALSE	0.210	90.000	0.000	NA		NA
1223275	1223276	CYB_1956	CYB_1957		rrsB	FALSE	0.020	257.000	0.000	NA		NA
1223278	1223279	CYB_1959	CYB_1960		lgt-2	TRUE	0.595	4.000	0.003	1.000		NA
1223281	1223282	CYB_1962	CYB_1963		sun	TRUE	0.896	81.000	0.003	0.013	Y	NA
1223283	1223284	CYB_1964	CYB_1965	hisA		FALSE	0.363	134.000	0.000	1.000		NA
1223285	1223286	CYB_1966	CYB_1967			TRUE	0.755	125.000	0.095	NA		NA
1223286	1223287	CYB_1967	CYB_1968			TRUE	0.924	0.000	0.417	NA		NA
1223287	1223288	CYB_1968	CYB_1969			TRUE	0.896	-3.000	0.273	NA		NA
1223288	1223289	CYB_1969	CYB_1970			TRUE	0.907	-10.000	0.400	NA		NA
1223289	1223290	CYB_1970	CYB_1971			TRUE	0.942	-18.000	0.083	0.002	N	NA
1223290	1223291	CYB_1971	CYB_1972			FALSE	0.093	181.000	0.000	NA		NA
1223293	1223294	CYB_1974	CYB_1975		tatA-1	FALSE	0.067	227.000	0.000	1.000		NA
1223294	1223295	CYB_1975	CYB_1976	tatA-1		FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223296	1223297	CYB_1977	CYB_1978		glgB	TRUE	0.534	61.000	0.000	1.000	N	NA
1223300	1223301	CYB_1981	CYB_1982		cysK	FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
1223303	1223304	CYB_1984	CYB_1985		zwf	TRUE	0.551	26.000	0.000	1.000		NA
1223304	1223305	CYB_1985	CYB_1986	zwf	fbp	TRUE	0.918	38.000	0.015	1.000	Y	NA
1223307	1223308	CYB_1988	CYB_1989			FALSE	0.011	302.000	0.000	NA		NA
1223308	1223309	CYB_1989	CYB_1990			FALSE	0.090	182.000	0.000	NA		NA
1223310	1223311	CYB_1991	CYB_1992			FALSE	0.133	166.000	0.000	NA		NA
1223311	1223312	CYB_1992	CYB_1993		fmt	FALSE	0.226	81.000	0.002	NA		NA
1223313	1223314	CYB_1994	CYB_1995	radC		TRUE	0.889	20.000	0.083	1.000	N	NA
1223314	1223315	CYB_1995	CYB_1996			TRUE	0.711	-7.000	0.038	NA		NA
1223315	1223316	CYB_1996	CYB_1997			FALSE	0.395	39.000	0.000	NA		NA
1223317	1223318	CYB_1998	CYB_1999			TRUE	0.970	81.000	1.000	0.002		NA
1223318	1223319	CYB_1999	CYB_2000			FALSE	0.223	82.000	0.000	NA		NA
1223321	1223322	CYB_2002	CYB_2003			TRUE	0.902	66.000	0.400	1.000		NA
1223324	1223325	CYB_2005	CYB_2006			FALSE	0.419	128.000	0.000	1.000	N	NA
1223328	1223329	CYB_2008	CYB_2010			FALSE	0.385	47.000	0.000	NA		NA
1223329	1223330	CYB_2010	CYB_2011			FALSE	0.395	39.000	0.000	NA		NA
1223330	1223331	CYB_2011	CYB_2012			TRUE	0.950	35.000	0.126	0.016		NA
1223331	1223332	CYB_2012	CYB_2013			FALSE	0.314	175.000	0.011	1.000		NA
1223332	1223333	CYB_2013	CYB_2014			TRUE	0.955	4.000	0.013	0.020	Y	NA
1223333	1223334	CYB_2014	CYB_2015			TRUE	0.905	105.000	0.092	1.000	Y	NA
1223335	1223336	CYB_2016	CYB_2017			FALSE	0.520	55.000	0.000	1.000		NA
1223337	1223338	CYB_2018	CYB_2019	ureE		FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223339	1223340	CYB_2020	CYB_2021		leuD	FALSE	0.214	108.000	0.000	NA		NA
1223340	1223341	CYB_2021	CYB_2023	leuD		FALSE	0.417	105.000	0.013	NA		NA
1223343	1223344	CYB_2024	CYB_2025			FALSE	0.310	91.000	0.004	NA		NA
1223347	1223348	CYB_2028	CYB_2029			TRUE	0.582	139.000	0.038	NA		NA
1223351	1223352	CYB_2032	CYB_2033			FALSE	0.035	227.000	0.000	NA		NA
1223352	1223353	CYB_2033	CYB_2034			FALSE	0.024	248.000	0.000	NA		NA
1223353	1223354	CYB_2034	CYB_2035			TRUE	0.888	9.000	0.150	NA		NA
1223354	1223355	CYB_2035	CYB_2036		cbiQ	TRUE	0.970	-13.000	0.069	0.010	Y	NA
1223355	1223356	CYB_2036	CYB_2037	cbiQ		TRUE	0.601	-16.000	0.004	1.000	N	NA
1223356	1223357	CYB_2037	CYB_2038		rpiA	TRUE	0.635	51.000	0.003	1.000	N	NA
1223357	1223358	CYB_2038	CYB_2039	rpiA	murF	FALSE	0.022	321.000	0.000	1.000	N	NA
1223358	1223359	CYB_2039	CYB_2040	murF		TRUE	0.611	103.000	0.048	NA		NA
1223359	1223360	CYB_2040	CYB_2041			FALSE	0.013	289.000	0.000	NA		NA
1223362	1223363	CYB_2043	CYB_2045	cphB	menD	TRUE	0.566	-3.000	0.000	1.000	N	NA
1223369	1223370	CYB_2050	CYB_2051			FALSE	0.483	57.000	0.003	NA	N	NA
1223371	1223372	CYB_2052	CYB_2053			FALSE	0.003	651.000	0.000	NA		NA
1223372	1223373	CYB_2053	CYB_2054			FALSE	0.012	293.000	0.000	NA		NA
1223373	1223374	CYB_2054	CYB_2055			FALSE	0.214	86.000	0.000	NA		NA
1223374	1223375	CYB_2055	CYB_2056			FALSE	0.033	232.000	0.000	NA		NA
1223375	1223376	CYB_2056	CYB_2057			FALSE	0.010	303.000	0.000	NA		NA
1223376	1223377	CYB_2057	CYB_2058			FALSE	0.212	88.000	0.000	NA		NA
1223377	1223378	CYB_2058	CYB_2059			FALSE	0.301	-49.000	0.000	NA		NA
1223378	1223379	CYB_2059	CYB_2060			TRUE	0.650	0.000	0.017	NA		NA
1223380	1223381	CYB_2061	CYB_2062			FALSE	0.458	161.000	0.039	NA		NA
1223381	1223382	CYB_2062	CYB_2063			TRUE	0.699	74.000	0.054	NA		NA
1223382	1223383	CYB_2063	CYB_2064			TRUE	0.620	151.000	0.054	NA		NA
1223383	1223384	CYB_2064	CYB_2065			FALSE	0.400	140.000	0.000	1.000	N	NA
1223384	1223385	CYB_2065	CYB_2066			FALSE	0.020	333.000	0.000	1.000	N	NA
1223385	1223386	CYB_2066	CYB_2067			FALSE	0.439	53.000	0.000	NA	N	NA
1223386	1223387	CYB_2067	CYB_2068			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223387	1223388	CYB_2068	CYB_2069			FALSE	0.004	490.000	0.000	NA		NA
1223388	1223389	CYB_2069	CYB_2070		argH	FALSE	0.442	131.000	0.013	NA		NA
1223391	1223392	CYB_2072	CYB_2073			FALSE	0.140	162.000	0.000	NA		NA
1223392	1223393	CYB_2073	CYB_2074			FALSE	0.142	247.000	0.049	NA		NA
1223393	1223394	CYB_2074	CYB_2075			TRUE	0.958	3.000	0.101	1.000	Y	NA
1223394	1223395	CYB_2075	CYB_2077		ribAB	TRUE	0.830	111.000	0.014	1.000	Y	NA
1223396	1223397	CYB_2076	CYB_2078			TRUE	0.644	115.000	0.048	NA		NA
1223397	1223398	CYB_2078	CYB_2079			FALSE	0.323	156.000	0.000	1.000	N	NA
1223399	1223400	CYB_2080	CYB_2081			FALSE	0.230	79.000	0.000	NA		NA
1223401	1223402	CYB_2082	CYB_2083	ppk		TRUE	0.620	59.000	0.004	1.000	N	NA
1223402	1223403	CYB_2083	CYB_2084			TRUE	0.990	0.000	0.775	0.020	Y	NA
1223404	1223405	CYB_2085	CYB_2086			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223405	1223406	CYB_2086	CYB_2087			FALSE	0.322	61.000	0.000	NA		NA
1223406	1223407	CYB_2087	CYB_2088			TRUE	0.572	108.000	0.038	NA		NA
1223410	1223411	CYB_2091	CYB_2092	ggt		TRUE	0.795	38.000	0.033	1.000		NA
1223411	1223412	CYB_2092	CYB_2093			TRUE	0.548	-67.000	0.014	NA		NA
1223412	1223413	CYB_2093	CYB_2094		secG	FALSE	0.417	13.000	0.002	NA		NA
1223416	1223417	CYB_2097	CYB_2098			FALSE	0.210	90.000	0.000	NA		NA
1223418	1223419	CYB_2099	CYB_2100	nusB		FALSE	0.471	120.000	0.003	1.000	N	NA
1223419	1223420	CYB_2100	CYB_2101			TRUE	0.895	12.000	0.031	0.075		NA
1223421	1223422	CYB_2102	CYB_2103			TRUE	0.752	83.000	0.105	NA		NA
1223422	1223423	CYB_2103	CYB_2104			TRUE	0.926	77.000	1.000	NA		NA
1223423	1223424	CYB_2104	CYB_2105			FALSE	0.367	0.000	0.000	NA		NA
1223424	1223425	CYB_2105	CYB_2106			FALSE	0.310	-36.000	0.000	NA		NA
1223428	1223429	CYB_2109	CYB_2110	ddlB	ftsZ	TRUE	0.766	70.000	0.003	0.026	N	NA
1223429	1223430	CYB_2110	CYB_2111	ftsZ		FALSE	0.005	795.000	0.000	1.000		NA
1223430	1223431	CYB_2111	CYB_2112			TRUE	0.550	35.000	0.000	1.000		NA
1223431	1223432	CYB_2112	CYB_2113			FALSE	0.158	158.000	0.000	NA		NA
1223433	1223434	CYB_2114	CYB_2115	mgtE		FALSE	0.184	151.000	0.000	NA		NA
1223434	1223435	CYB_2115	CYB_2116			FALSE	0.380	28.000	0.000	NA		NA
1223436	1223437	CYB_2117	CYB_2118			TRUE	0.916	89.000	1.000	NA		NA
1223438	1223439	CYB_2119	CYB_2121			FALSE	0.014	282.000	0.000	NA		NA
1223440	1223441	CYB_2120	CYB_2122			FALSE	0.409	135.000	0.010	NA		NA
1223441	1223442	CYB_2122	CYB_2123			TRUE	0.535	98.000	0.016	1.000		NA
1223443	1223444	CYB_2124	CYB_2125			TRUE	0.959	72.000	0.095	0.020	Y	NA
1223444	1223445	CYB_2125	CYB_2126			FALSE	0.005	538.000	0.000	NA	N	NA
1223445	1223446	CYB_2126	CYB_2127			FALSE	0.309	153.000	0.004	NA	N	NA
1223446	1223447	CYB_2127	CYB_2128			FALSE	0.474	140.000	0.004	1.000	N	NA
1223449	1223450	CYB_2130	CYB_2131		purF	FALSE	0.003	809.000	0.000	NA		NA
1223450	1223451	CYB_2131	CYB_2132	purF	def-1	TRUE	0.636	53.000	0.003	1.000	N	NA
1223451	1223452	CYB_2132	CYB_2133	def-1		TRUE	0.599	12.000	0.009	NA		NA
1223452	1223453	CYB_2133	CYB_2134			FALSE	0.299	-66.000	0.000	NA		NA
1223453	1223454	CYB_2134	CYB_2135			FALSE	0.003	789.000	0.000	NA		NA
1223454	1223455	CYB_2135	CYB_2136		gvpG	FALSE	0.078	189.000	0.000	NA		NA
1223455	1223456	CYB_2136	CYB_2138	gvpG		TRUE	0.621	108.000	0.048	NA		NA
1223459	1223460	CYB_2140	CYB_2141		pilC	FALSE	0.488	113.000	0.007	1.000		NA
1223460	1223461	CYB_2141	CYB_2142	pilC	pilT-2	TRUE	0.760	198.000	0.218	1.000	Y	NA
1223461	1223462	CYB_2142	CYB_2143	pilT-2	pilB	TRUE	0.960	144.000	0.178	0.012	Y	NA
1223462	1223463	CYB_2143	CYB_2144	pilB		FALSE	0.494	157.000	0.017	1.000	N	NA
1223464	1223465	CYB_2145	CYB_2146			TRUE	0.902	0.000	0.258	NA		NA
1223465	1223466	CYB_2146	CYB_2147			FALSE	0.228	80.000	0.000	NA		NA
1223466	1223467	CYB_2147	CYB_2148			FALSE	0.004	514.000	0.000	NA		NA
1223467	1223468	CYB_2148	CYB_2149		map-1	FALSE	0.132	196.000	0.007	NA		NA
1223468	1223469	CYB_2149	CYB_2150	map-1		TRUE	0.901	7.000	0.111	1.000	N	NA
1223470	1223471	CYB_2151	CYB_2152		murG	TRUE	0.525	121.000	0.006	1.000	N	NA
1223471	1223472	CYB_2152	CYB_2153	murG		TRUE	0.542	31.000	0.006	NA		NA
1223472	1223473	CYB_2153	CYB_2154			TRUE	0.927	-3.000	0.521	NA		NA
1223478	1223479	CYB_2159	CYB_2160			TRUE	0.743	35.000	0.036	NA		NA
1223479	1223480	CYB_2160	CYB_2162			FALSE	0.033	280.000	0.000	1.000	N	NA
1223481	1223482	CYB_2161	CYB_2163			TRUE	0.605	37.000	0.000	1.000	N	NA
1223483	1223484	CYB_2164	CYB_2165			FALSE	0.025	247.000	0.000	NA		NA
1223484	1223485	CYB_2165	CYB_2166		trmB	FALSE	0.522	93.000	0.014	1.000		NA
1223485	1223486	CYB_2166	CYB_2167	trmB		TRUE	0.563	99.000	0.038	NA		NA
1223487	1223488	CYB_2168	CYB_2169		glnH	FALSE	0.466	-42.000	0.000	1.000		NA
1223488	1223489	CYB_2169	CYB_2170	glnH		FALSE	0.209	188.000	0.003	1.000	N	NA
1223490	1223491	CYB_2171	CYB_2172			FALSE	0.246	73.000	0.000	NA		NA
1223491	1223492	CYB_2172	CYB_2173		cobQ	FALSE	0.067	195.000	0.000	NA		NA
1223493	1223494	CYB_2174	CYB_2175			FALSE	0.020	332.000	0.000	1.000	N	NA
1223494	1223495	CYB_2175	CYB_2176			FALSE	0.248	169.000	0.000	1.000	N	NA
1223495	1223496	CYB_2176	CYB_2177			FALSE	0.367	0.000	0.000	NA		NA
1223496	1223497	CYB_2177	CYB_2178			FALSE	0.029	236.000	0.000	NA		NA
1223497	1223498	CYB_2178	CYB_2179			FALSE	0.358	54.000	0.000	NA		NA
1223500	1223501	CYB_2181	CYB_2182			FALSE	0.209	91.000	0.000	NA		NA
1223505	1223506	CYB_2186	CYB_2187			FALSE	0.419	180.000	0.040	1.000		NA
1223506	1223507	CYB_2187	CYB_2188			FALSE	0.033	231.000	0.000	NA		NA
1223507	1223508	CYB_2188	CYB_2189		cobI	FALSE	0.003	826.000	0.000	NA		NA
1223508	1223509	CYB_2189	CYB_2190	cobI		TRUE	0.688	13.000	0.005	1.000	N	NA
1223512	1223513	CYB_2193	CYB_2194	chlB	galE	TRUE	0.565	57.000	0.000	1.000	N	NA
1223513	1223514	CYB_2194	CYB_2195	galE	cutA	TRUE	0.610	62.000	0.005	1.000	N	NA
1223514	1223515	CYB_2195	CYB_2196	cutA	coaD	TRUE	0.632	21.000	0.002	1.000	N	NA
1223518	1223519	CYB_2198	CYB_2200			FALSE	0.207	143.000	0.000	NA		NA
1223520	1223521	CYB_2201	CYB_2202		ribF	FALSE	0.489	34.000	0.003	NA		NA
1223522	1223523	CYB_2203	CYB_2204	moaE	cobS	FALSE	0.149	279.000	0.000	1.000	Y	NA
1223523	1223524	CYB_2204	CYB_2205	cobS		FALSE	0.315	-24.000	0.000	NA		NA
1223524	1223525	CYB_2205	CYB_2206		rpoD	FALSE	0.215	85.000	0.000	NA		NA
1223526	1223527	CYB_2207	CYB_2208		metH	FALSE	0.027	241.000	0.000	NA		NA
1223530	1223531	CYB_2211	CYB_2212	apcB-2	truB	FALSE	0.052	240.000	0.000	1.000		NA
1223534	1223535	CYB_2215	CYB_2216		ycf3	FALSE	0.407	173.000	0.043	NA		NA
1223535	1223536	CYB_2216	CYB_2217	ycf3	gatC	TRUE	0.555	98.000	0.020	1.000		NA
1223539	1223540	CYB_2220	CYB_2221			FALSE	0.334	-7.000	0.000	NA		NA
1223541	1223542	CYB_2222	CYB_2223	atpC		FALSE	0.194	148.000	0.000	NA		NA
1223542	1223543	CYB_2223	CYB_2224			FALSE	0.049	206.000	0.000	NA		NA
1223545	1223546	CYB_2226	CYB_2227		priA	FALSE	0.397	42.000	0.000	NA		NA
1223546	1223547	CYB_2227	CYB_2228	priA		FALSE	0.227	113.000	0.000	NA		NA
1223547	1223548	CYB_2228	CYB_2230			TRUE	0.885	-3.000	0.215	NA		NA
1223550	1223551	CYB_2231	CYB_2232			TRUE	0.799	66.000	0.095	NA		NA
1223551	1223552	CYB_2232	CYB_2233			FALSE	0.346	91.000	0.006	NA		NA
1223552	1223553	CYB_2233	CYB_2234			FALSE	0.007	544.000	0.000	1.000		NA
1223556	1223557	CYB_2237	CYB_2238			FALSE	0.448	9.000	0.002	NA		NA
1223557	1223558	CYB_2238	CYB_2239			FALSE	0.440	90.000	0.015	NA		NA
1223561	1223562	CYB_2242	CYB_2243		ppa	FALSE	0.014	281.000	0.000	NA		NA
1223563	1223564	CYB_2244	CYB_2245		nusA	FALSE	0.028	294.000	0.000	1.000	N	NA
1223564	1223565	CYB_2245	CYB_2246	nusA		TRUE	0.899	136.000	0.759	NA		NA
1223566	1223567	CYB_2247	CYB_2248			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223568	1223569	CYB_2249	CYB_2250			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223569	1223570	CYB_2250	CYB_2251			FALSE	0.362	53.000	0.000	NA		NA
1223570	1223571	CYB_2251	CYB_2252			FALSE	0.016	332.000	0.000	1.000		NA
1223576	1223577	CYB_2257	CYB_2258	glpX	hemA	FALSE	0.060	328.000	0.038	1.000	N	NA
1223577	1223578	CYB_2258	CYB_2259	hemA		FALSE	0.405	108.000	0.003	1.000		NA
1223578	1223579	CYB_2259	CYB_2260		typA	FALSE	0.209	175.000	0.002	1.000		NA
1223580	1223581	CYB_2261	CYB_2262		cinA	FALSE	0.476	70.000	0.004	1.000		NA
1223581	1223582	CYB_2262	CYB_2263	cinA		FALSE	0.003	861.000	0.000	NA		NA
1223582	1223583	CYB_2263	CYB_2264			FALSE	0.222	154.000	0.000	NA	N	NA
1223583	1223584	CYB_2264	CYB_2265			FALSE	0.042	216.000	0.000	NA		NA
1223584	1223585	CYB_2265	CYB_2266			FALSE	0.028	238.000	0.000	NA		NA
1223585	1223586	CYB_2266	CYB_2267			TRUE	0.936	48.000	0.400	1.000		NA
1223586	1223587	CYB_2267	CYB_2268			TRUE	0.869	74.000	0.333	1.000		NA
1223588	1223589	CYB_2269	CYB_2271			TRUE	0.887	46.000	0.121	NA	N	NA
1223592	1223593	CYB_2272	CYB_2274			FALSE	0.367	0.000	0.000	NA		NA
1223593	1223594	CYB_2274	CYB_2275			FALSE	0.026	243.000	0.000	NA		NA
1223595	1223596	CYB_2276	CYB_2278			FALSE	0.389	37.000	0.000	NA		NA
1223597	1223598	CYB_2277	CYB_2279		btpA	TRUE	0.657	67.000	0.024	1.000		NA
1223598	1223599	CYB_2279	CYB_2280	btpA	pyrD	TRUE	0.606	32.000	0.003	1.000		NA
1223599	1223600	CYB_2280	CYB_2281	pyrD		FALSE	0.292	128.000	0.000	NA	N	NA
1223600	1223601	CYB_2281	CYB_2282			TRUE	0.804	0.000	0.049	NA	N	NA
1223603	1223604	CYB_2284	CYB_2285			FALSE	0.118	203.000	0.000	1.000	N	NA
1223605	1223606	CYB_2286	CYB_2287			TRUE	0.742	40.000	0.016	1.000		NA
1223608	1223609	CYB_2289	CYB_2290			TRUE	0.848	58.000	0.013	0.055		NA
1223609	1223610	CYB_2290	CYB_2291			FALSE	0.233	116.000	0.000	NA		NA
1223610	1223611	CYB_2291	CYB_2292		pyrH	FALSE	0.208	99.000	0.000	NA		NA
1223611	1223612	CYB_2292	CYB_2293	pyrH		FALSE	0.020	257.000	0.000	NA		NA
1223612	1223613	CYB_2293	CYB_2294		yqeG	FALSE	0.388	12.000	0.000	NA		NA
1223613	1223614	CYB_2294	CYB_2295	yqeG		FALSE	0.009	451.000	0.000	1.000		NA
1223614	1223615	CYB_2295	CYB_2296			FALSE	0.008	622.000	0.000	1.000	N	NA
1223615	1223616	CYB_2296	CYB_2297			FALSE	0.029	275.000	0.000	1.000		NA
1223617	1223618	CYB_2298	CYB_2299	thrC-1		FALSE	0.316	171.000	0.005	1.000	N	NA
1223619	1223620	CYB_2300	CYB_2301	menA		FALSE	0.168	155.000	0.000	NA		NA
1223620	1223621	CYB_2301	CYB_2302			FALSE	0.124	168.000	0.000	NA		NA
1223621	1223622	CYB_2302	CYB_2303			TRUE	0.937	-3.000	0.667	NA		NA
1223623	1223624	CYB_2304	CYB_2305			FALSE	0.217	140.000	0.000	NA		NA
1223624	1223625	CYB_2305	CYB_2306		gap-3	TRUE	0.948	26.000	0.689	NA		NA
1223626	1223627	CYB_2307	CYB_2308			FALSE	0.034	230.000	0.000	NA		NA
1223628	1223629	CYB_2309	CYB_2310		cax	TRUE	0.789	39.000	0.024	1.000	N	NA
1223629	1223630	CYB_2310	CYB_2311	cax		FALSE	0.042	216.000	0.000	NA		NA
1223630	1223631	CYB_2311	CYB_2312			FALSE	0.235	77.000	0.000	NA		NA
1223631	1223632	CYB_2312	CYB_2313			FALSE	0.074	192.000	0.000	NA		NA
1223632	1223633	CYB_2313	CYB_2314			FALSE	0.006	359.000	0.000	NA		NA
1223633	1223634	CYB_2314	CYB_2315			FALSE	0.005	426.000	0.000	NA		NA
1223635	1223636	CYB_2316	CYB_2317	cobO-1		TRUE	0.866	0.000	0.065	1.000	N	NA
1223636	1223637	CYB_2317	CYB_2319			TRUE	0.934	39.000	0.360	1.000		NA
1223638	1223639	CYB_2318	CYB_2320			TRUE	0.554	-3.000	0.002	1.000		NA
1223640	1223641	CYB_2321	CYB_2322			FALSE	0.317	-22.000	0.000	NA		NA
1223641	1223642	CYB_2322	CYB_2323			FALSE	0.165	156.000	0.000	NA		NA
1223643	1223644	CYB_2324	CYB_2325			FALSE	0.087	183.000	0.000	NA		NA
1223644	1223645	CYB_2325	CYB_2326			FALSE	0.227	131.000	0.000	NA		NA
1223647	1223648	CYB_2327	CYB_2329			TRUE	0.822	120.000	0.118	1.000	N	NA
1223648	1223649	CYB_2329	CYB_2330			FALSE	0.068	236.000	0.000	1.000	N	NA
1223650	1223651	CYB_2331	CYB_2332			FALSE	0.208	101.000	0.000	NA		NA
1223651	1223652	CYB_2332	CYB_2333			TRUE	0.988	-3.000	0.428	0.002	Y	NA
1223652	1223653	CYB_2333	CYB_2334			TRUE	0.989	2.000	0.406	0.002	Y	NA
1223653	1223654	CYB_2334	CYB_2335			TRUE	0.775	48.000	0.045	NA		NA
1223654	1223655	CYB_2335	CYB_2336			TRUE	0.540	41.000	0.005	NA		NA
1223658	1223659	CYB_2339	CYB_2340	fabD	fabH	TRUE	0.957	5.000	0.005	0.003	Y	NA
1223659	1223660	CYB_2340	CYB_2341	fabH	plsX	TRUE	0.985	-13.000	0.380	0.003	Y	NA
1223660	1223661	CYB_2341	CYB_2342	plsX		FALSE	0.046	209.000	0.000	NA		NA
1223662	1223663	CYB_2343	CYB_2344	trpC		TRUE	0.638	52.000	0.015	NA		NA
1223663	1223664	CYB_2344	CYB_2345			TRUE	0.860	60.000	0.143	NA		NA
1223664	1223665	CYB_2345	CYB_2346			TRUE	0.946	113.000	0.039	0.001	Y	NA
1223665	1223666	CYB_2346	CYB_2347		cbiX	FALSE	0.100	295.000	0.000	0.006		NA
1223666	1223667	CYB_2347	CYB_2349	cbiX		FALSE	0.482	101.000	0.022	NA		NA
1223668	1223669	CYB_2348	CYB_2350			FALSE	0.485	56.000	0.004	NA		NA
1223669	1223670	CYB_2350	CYB_2351			TRUE	0.524	19.000	0.004	NA		NA
1223670	1223671	CYB_2351	CYB_2352			FALSE	0.211	94.000	0.002	NA		NA
1223673	1223674	CYB_2354	CYB_2355			FALSE	0.301	-46.000	0.000	NA		NA
1223674	1223675	CYB_2355	CYB_2356			FALSE	0.315	-24.000	0.000	NA		NA
1223675	1223676	CYB_2356	CYB_2357			FALSE	0.129	167.000	0.000	NA		NA
1223678	1223679	CYB_2359	CYB_2360			FALSE	0.392	38.000	0.000	NA		NA
1223679	1223680	CYB_2360	CYB_2361			TRUE	0.582	52.000	0.000	1.000	N	NA
1223680	1223681	CYB_2361	CYB_2362			FALSE	0.009	328.000	0.000	NA		NA
1223681	1223682	CYB_2362	CYB_2363			FALSE	0.392	45.000	0.000	NA		NA
1223682	1223683	CYB_2363	CYB_2364			TRUE	0.615	30.000	0.007	NA	N	NA
1223684	1223685	CYB_2365	CYB_2366		arsC	TRUE	0.588	1.000	0.000	1.000	N	NA
1223686	1223687	CYB_2367	CYB_2368		tilS	FALSE	0.327	-12.000	0.000	NA		NA
1223687	1223688	CYB_2368	CYB_2369	tilS	hrcA	TRUE	0.574	54.000	0.002	1.000	N	NA
1223689	1223690	CYB_2370	CYB_2371	ureA	ureB	FALSE	0.374	50.000	0.000	NA		NA
1223690	1223691	CYB_2371	CYB_2372	ureB		FALSE	0.236	122.000	0.000	NA		NA
1223693	1223694	CYB_2374	CYB_2375			TRUE	0.669	113.000	0.051	NA		NA
1223694	1223695	CYB_2375	CYB_2376			TRUE	0.959	29.000	0.925	NA		NA
1223695	1223696	CYB_2376	CYB_2377			FALSE	0.033	231.000	0.000	NA		NA
1223696	1223697	CYB_2377	CYB_2378			FALSE	0.036	274.000	0.000	1.000	N	NA
1223697	1223698	CYB_2378	CYB_2379			FALSE	0.209	91.000	0.000	NA		NA
1223699	1223700	CYB_2380	CYB_2381			FALSE	0.153	159.000	0.000	NA		NA
1223700	1223701	CYB_2381	CYB_2382			FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
1223704	1223705	CYB_2385	CYB_2386			FALSE	0.389	37.000	0.000	NA		NA
1223706	1223707	CYB_2387	CYB_2388			FALSE	0.383	164.000	0.013	1.000		NA
1223707	1223708	CYB_2388	CYB_2389		upp-2	FALSE	0.031	271.000	0.000	1.000		NA
1223708	1223709	CYB_2389	CYB_2390	upp-2		FALSE	0.153	159.000	0.000	NA		NA
1223712	1223713	CYB_2393	CYB_2394	thiO	thiS	TRUE	0.917	-12.000	0.342	1.000	N	NA
1223713	1223714	CYB_2394	CYB_2395	thiS	thiG	TRUE	0.897	84.000	0.064	1.000	Y	NA
1223716	1223717	CYB_2397	CYB_2398			TRUE	0.721	132.000	0.074	NA		NA
1223717	1223718	CYB_2398	CYB_2399			TRUE	0.545	140.000	0.031	NA		NA
1223719	1223720	CYB_2400	CYB_2401			FALSE	0.225	133.000	0.000	NA		NA
1223721	1223722	CYB_2402	CYB_2403			FALSE	0.372	127.000	0.000	1.000		NA
1223724	1223725	CYB_2405	CYB_2406			FALSE	0.388	21.000	0.000	NA		NA
1223725	1223726	CYB_2406	CYB_2407			FALSE	0.382	27.000	0.000	NA		NA
1223726	1223727	CYB_2407	CYB_2408			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223727	1223728	CYB_2408	CYB_2409			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223728	1223729	CYB_2409	CYB_2410			FALSE	0.381	5.000	0.000	NA		NA
1223729	1223730	CYB_2410	CYB_2411			FALSE	0.021	256.000	0.000	NA		NA
1223730	1223731	CYB_2411	CYB_2412			TRUE	0.547	16.000	0.005	NA		NA
1223731	1223732	CYB_2412	CYB_2413			TRUE	0.788	-3.000	0.051	NA		NA
1223732	1223733	CYB_2413	CYB_2414			FALSE	0.241	75.000	0.000	NA		NA
1223734	1223735	CYB_2415	CYB_2416			FALSE	0.397	41.000	0.000	NA		NA
1223736	1223737	CYB_2417	CYB_2418	trpG		TRUE	0.897	51.000	0.231	NA		NA
1223737	1223738	CYB_2418	CYB_2419			TRUE	0.639	5.000	0.014	NA		NA
1223740	1223741	CYB_2421	CYB_2422			FALSE	0.008	343.000	0.000	NA		NA
1223741	1223742	CYB_2422	CYB_2423			FALSE	0.390	16.000	0.000	NA		NA
1223743	1223744	CYB_2424	CYB_2425		panC/cmk	FALSE	0.011	302.000	0.000	NA		NA
1223744	1223745	CYB_2425	CYB_2426	panC/cmk	petG	FALSE	0.483	64.000	0.002	1.000		NA
1223748	1223749	CYB_2429	CYB_2430			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223750	1223751	CYB_2431	CYB_2432		panE-2	FALSE	0.511	101.000	0.027	NA		NA
1223751	1223752	CYB_2432	CYB_2433	panE-2	pyrR	TRUE	0.701	52.000	0.009	1.000	N	NA
1223755	1223756	CYB_2436	CYB_2437	rpoB	rpoC1	TRUE	0.987	116.000	0.851	0.001	Y	NA
1223756	1223757	CYB_2437	CYB_2438	rpoC1	rpoC2	TRUE	0.968	54.000	0.031	0.001	Y	NA
1223757	1223758	CYB_2438	CYB_2440	rpoC2		TRUE	0.577	-19.000	0.010	NA	N	NA
1223759	1223760	CYB_2439	CYB_2441			FALSE	0.018	321.000	0.000	1.000		NA
1223760	1223761	CYB_2441	CYB_2442			TRUE	0.945	111.000	0.659	0.020		NA
1223764	1223765	CYB_2445	CYB_2446	gvpV		FALSE	0.108	175.000	0.000	NA		NA
1223766	1223767	CYB_2447	CYB_2448	purU		FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
1223767	1223768	CYB_2448	CYB_2449		tatA-2	FALSE	0.378	4.000	0.000	NA		NA
1223768	1223769	CYB_2449	CYB_2450	tatA-2		FALSE	0.395	39.000	0.000	NA		NA
1223775	1223776	CYB_2456	CYB_2457	hemB		FALSE	0.462	26.000	0.000	NA	N	NA
1223778	1223779	CYB_2459	CYB_2460			FALSE	0.236	121.000	0.000	NA		NA
1223781	1223782	CYB_2461	CYB_2463			FALSE	0.025	247.000	0.000	NA		NA
1223783	1223784	CYB_2464	CYB_2465			FALSE	0.057	216.000	0.000	NA	N	NA
1223784	1223785	CYB_2465	CYB_2466			TRUE	0.619	5.000	0.012	NA		NA
1223787	1223788	CYB_2468	CYB_2469			FALSE	0.388	21.000	0.000	NA		NA
1223788	1223789	CYB_2469	CYB_2470			TRUE	0.745	155.000	0.222	NA		NA
1223791	1223792	CYB_2472	CYB_2473			FALSE	0.236	121.000	0.000	NA		NA
1223792	1223793	CYB_2473	CYB_2474			FALSE	0.249	72.000	0.000	NA		NA
1223793	1223794	CYB_2474	CYB_2475			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223796	1223797	CYB_2477	CYB_2478	ugpB	upgA	TRUE	0.644	262.000	0.250	0.019	Y	NA
1223797	1223798	CYB_2478	CYB_2479	upgA		FALSE	0.209	92.000	0.000	NA		NA
1223798	1223799	CYB_2479	CYB_2481		gnd	FALSE	0.208	94.000	0.000	NA		NA
1223800	1223801	CYB_2480	CYB_2482	nadB	nadA	TRUE	0.985	30.000	0.210	0.002	Y	NA
1223801	1223802	CYB_2482	CYB_2483	nadA	nadC	TRUE	0.875	199.000	0.198	0.002	Y	NA
1223803	1223804	CYB_2484	CYB_2485			FALSE	0.074	192.000	0.000	NA		NA
1223804	1223805	CYB_2485	CYB_2486			FALSE	0.304	63.000	0.000	NA		NA
1223805	1223806	CYB_2486	CYB_2487			TRUE	0.894	29.000	0.200	NA		NA
1223806	1223807	CYB_2487	CYB_2488			TRUE	0.944	28.000	0.667	NA		NA
1223807	1223808	CYB_2488	CYB_2489			FALSE	0.035	451.000	0.000	0.021		NA
1223808	1223809	CYB_2489	CYB_2491			FALSE	0.012	368.000	0.000	1.000		NA
1223811	1223812	CYB_2492	CYB_2493	mreB	mreC	TRUE	0.718	68.000	0.043	1.000		NA
1223812	1223813	CYB_2493	CYB_2494	mreC	mreD	TRUE	0.970	-22.000	0.550	0.002		NA
1223813	1223814	CYB_2494	CYB_2495	mreD		FALSE	0.208	100.000	0.000	NA		NA
1223814	1223815	CYB_2495	CYB_2496			FALSE	0.200	146.000	0.000	NA		NA
1223816	1223817	CYB_2497	CYB_2498		cobD-2	FALSE	0.003	849.000	0.000	NA		NA
1223817	1223818	CYB_2498	CYB_2499	cobD-2		TRUE	0.766	14.000	0.034	NA	N	NA
1223819	1223820	CYB_2500	CYB_2501			TRUE	0.560	29.000	0.002	1.000		NA
1223822	1223823	CYB_2503	CYB_2505			TRUE	0.766	20.000	0.040	NA		NA
1223826	1223827	CYB_2506	CYB_2508			FALSE	0.003	892.000	0.000	NA		NA
1223827	1223828	CYB_2508	CYB_2509			FALSE	0.010	315.000	0.000	NA		NA
1223831	1223832	CYB_2512	CYB_2513			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223832	1223833	CYB_2513	CYB_2514		sodB	FALSE	0.017	264.000	0.000	NA		NA
1223835	1223836	CYB_2516	CYB_2517	napA	glyS	FALSE	0.205	180.000	0.000	1.000	N	NA
1223837	1223838	CYB_2518	CYB_2519			FALSE	0.006	656.000	0.000	1.000		NA
1223839	1223840	CYB_2520	CYB_2521			FALSE	0.468	46.000	0.000	NA	N	NA
1223840	1223841	CYB_2521	CYB_2522		pyrC	FALSE	0.291	114.000	0.000	NA	N	NA
1223841	1223842	CYB_2522	CYB_2523	pyrC		FALSE	0.016	269.000	0.000	NA		NA
1223843	1223844	CYB_2524	CYB_2525	clpB	zam	FALSE	0.149	200.000	0.003	1.000	N	NA
1223844	1223845	CYB_2525	CYB_2526	zam	phoU	TRUE	0.800	53.000	0.049	NA	N	NA
1223846	1223847	CYB_2527	CYB_2528			FALSE	0.244	74.000	0.000	NA		NA
1223847	1223848	CYB_2528	CYB_2530			TRUE	0.771	20.000	0.042	NA		NA
1223851	1223852	CYB_2531	CYB_2533	eno	ntcA	FALSE	0.064	239.000	0.000	1.000	N	NA
1223853	1223854	CYB_2534	CYB_2535			TRUE	0.531	84.000	0.013	1.000		NA
1223856	1223857	CYB_2537	CYB_2539			TRUE	0.962	0.000	0.242	0.005		NA
1223858	1223859	CYB_2538	CYB_2540		ureF	FALSE	0.284	135.000	0.000	NA	N	NA
1223859	1223860	CYB_2540	CYB_2541	ureF	yfiA	FALSE	0.456	4.000	0.000	NA	N	NA
1223861	1223862	CYB_2542	CYB_2543			FALSE	0.381	98.000	0.009	NA		NA
1223862	1223863	CYB_2543	CYB_2544			FALSE	0.012	294.000	0.000	NA		NA
1223863	1223864	CYB_2544	CYB_2546			TRUE	0.855	28.000	0.087	NA		NA
1223865	1223866	CYB_2545	CYB_2547	hypA		FALSE	0.378	4.000	0.000	NA		NA
1223866	1223867	CYB_2547	CYB_2548		argJ	FALSE	0.390	16.000	0.000	NA		NA
1223868	1223869	CYB_2549	CYB_2550			FALSE	0.180	262.000	0.000	1.000	Y	NA
1223870	1223871	CYB_2551	CYB_2552			TRUE	0.539	104.000	0.026	NA	N	NA
1223872	1223873	CYB_2553	CYB_2554			FALSE	0.244	74.000	0.000	NA		NA
1223877	1223878	CYB_2558	CYB_2559	deoC	recO	TRUE	0.720	-3.000	0.014	1.000	N	NA
1223878	1223879	CYB_2559	CYB_2561	recO		FALSE	0.010	464.000	0.000	1.000	N	NA
1223880	1223881	CYB_2560	CYB_2562			FALSE	0.005	429.000	0.000	NA		NA
1223884	1223885	CYB_2565	CYB_2566			FALSE	0.010	303.000	0.000	NA		NA
1223885	1223886	CYB_2566	CYB_2568		clpS-2	FALSE	0.101	178.000	0.000	NA		NA
1223888	1223889	CYB_2569	CYB_2570			TRUE	0.762	29.000	0.041	NA		NA
1223889	1223890	CYB_2570	CYB_2571			TRUE	0.616	0.000	0.013	NA		NA
1223890	1223891	CYB_2571	CYB_2573			FALSE	0.012	292.000	0.000	NA		NA
1223892	1223893	CYB_2572	CYB_2574			FALSE	0.368	130.000	0.000	1.000		NA
1223894	1223895	CYB_2575	CYB_2576			FALSE	0.003	747.000	0.000	NA		NA
1223896	1223897	CYB_2577	CYB_2578	cbbS	rbcX	TRUE	0.965	9.000	0.913	1.000		NA
1223897	1223898	CYB_2578	CYB_2579	rbcX	cbbL	TRUE	0.935	67.000	0.792	1.000		NA
1223898	1223899	CYB_2579	CYB_2580	cbbL		FALSE	0.005	421.000	0.000	NA		NA
1223899	1223900	CYB_2580	CYB_2581		clpP-2	FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1223901	1223902	CYB_2582	CYB_2583			FALSE	0.350	57.000	0.000	NA		NA
1223903	1223904	CYB_2584	CYB_2585			FALSE	0.230	79.000	0.000	NA		NA
1223906	1223907	CYB_2586	CYB_2588	cobB	cobO-2	TRUE	0.955	17.000	0.005	0.009	Y	NA
1223908	1223909	CYB_2589	CYB_2590		metK	FALSE	0.004	493.000	0.000	NA		NA
1223910	1223911	CYB_2591	CYB_2592			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223911	1223912	CYB_2592	CYB_2593			FALSE	0.318	71.000	0.000	NA	N	NA
1223912	1223913	CYB_2593	CYB_2594			FALSE	0.389	37.000	0.000	NA		NA
1223913	1223914	CYB_2594	CYB_2595			FALSE	0.509	185.000	0.125	NA		NA
1223914	1223915	CYB_2595	CYB_2596			FALSE	0.004	511.000	0.000	NA		NA
1223916	1223917	CYB_2597	CYB_2598	rplC	rplD	TRUE	0.986	51.000	0.361	0.012	Y	NA
1223917	1223918	CYB_2598	CYB_2599	rplD	rplW	TRUE	0.986	-7.000	0.513	0.012	Y	NA
1223918	1223919	CYB_2599	CYB_2600	rplW	rplB	TRUE	0.992	50.000	0.849	0.012	Y	NA
1223919	1223920	CYB_2600	CYB_2601	rplB	rpsS	TRUE	0.986	67.000	0.820	0.015	Y	NA
1223920	1223921	CYB_2601	CYB_2602	rpsS	rplV	TRUE	0.991	46.000	0.769	0.015	Y	NA
1223921	1223922	CYB_2602	CYB_2603	rplV	rpsC	TRUE	0.991	43.000	0.719	0.015	Y	NA
1223922	1223923	CYB_2603	CYB_2604	rpsC	rplP	TRUE	0.991	56.000	0.828	0.015	Y	NA
1223923	1223924	CYB_2604	CYB_2605	rplP	rpmC	TRUE	0.992	14.000	0.802	0.012	Y	NA
1223924	1223925	CYB_2605	CYB_2606	rpmC	rpsQ	TRUE	0.991	0.000	0.828	0.012	Y	NA
1223925	1223926	CYB_2606	CYB_2607	rpsQ	rplN	TRUE	0.990	-3.000	0.791	0.015	Y	NA
1223926	1223927	CYB_2607	CYB_2608	rplN	rplX	TRUE	0.991	0.000	0.810	0.015	Y	NA
1223927	1223928	CYB_2608	CYB_2609	rplX	rplE	TRUE	0.985	69.000	0.758	0.012	Y	NA
1223928	1223929	CYB_2609	CYB_2610	rplE	rpsH	TRUE	0.976	47.000	0.059	0.012	Y	NA
1223929	1223930	CYB_2610	CYB_2611	rpsH	rplF	TRUE	0.992	34.000	0.808	0.012	Y	NA
1223930	1223931	CYB_2611	CYB_2612	rplF	rplR	TRUE	0.992	32.000	0.815	0.012	Y	NA
1223931	1223932	CYB_2612	CYB_2613	rplR	rpsE	TRUE	0.992	19.000	0.814	0.015	Y	NA
1223932	1223933	CYB_2613	CYB_2614	rpsE	rplO	TRUE	0.982	38.000	0.148	0.015	Y	NA
1223933	1223934	CYB_2614	CYB_2615	rplO	secY	TRUE	0.890	153.000	0.730	1.000	N	NA
1223934	1223935	CYB_2615	CYB_2616	secY	adk	TRUE	0.761	0.000	0.020	1.000	N	NA
1223935	1223936	CYB_2616	CYB_2617	adk	map-2	TRUE	0.828	39.000	0.039	1.000	N	NA
1223936	1223937	CYB_2617	CYB_2618	map-2	infA	TRUE	0.815	131.000	0.007	1.000	Y	NA
1223937	1223938	CYB_2618	CYB_2619	infA		FALSE	0.272	78.000	0.002	NA		NA
1223938	1223939	CYB_2619	CYB_2620			FALSE	0.010	307.000	0.000	NA		NA
1223940	1223941	CYB_2621	CYB_2622			TRUE	0.711	88.000	0.054	1.000		NA
1223941	1223942	CYB_2622	CYB_2623			TRUE	0.725	94.000	0.054	1.000	N	NA
1223942	1223943	CYB_2623	CYB_2624			FALSE	0.051	241.000	0.000	1.000		NA
1223943	1223944	CYB_2624	CYB_2625			FALSE	0.054	238.000	0.000	1.000		NA
1223944	1223945	CYB_2625	CYB_2626			TRUE	0.912	16.000	0.189	1.000		NA
1223945	1223946	CYB_2626	CYB_2627			TRUE	0.869	89.000	0.595	NA		NA
1223947	1223948	CYB_2628	CYB_2629	msrB		TRUE	0.702	50.000	0.008	1.000	N	NA
1223949	1223950	CYB_2630	CYB_2631			FALSE	0.020	258.000	0.000	NA		NA
1223950	1223951	CYB_2631	CYB_2632			TRUE	0.876	37.000	0.117	NA		NA
1223951	1223952	CYB_2632	CYB_2633			FALSE	0.180	152.000	0.000	NA		NA
1223952	1223953	CYB_2633	CYB_2634			FALSE	0.223	135.000	0.000	NA		NA
1223954	1223955	CYB_2635	CYB_2636	glmU		FALSE	0.209	91.000	0.000	NA		NA
1223955	1223956	CYB_2636	CYB_2637			FALSE	0.022	253.000	0.000	NA		NA
1223956	1223957	CYB_2637	CYB_2638			FALSE	0.378	32.000	0.000	NA		NA
1223957	1223958	CYB_2638	CYB_2639			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223958	1223959	CYB_2639	CYB_2641			FALSE	0.004	495.000	0.000	NA		NA
1223959	1223960	CYB_2641	CYB_2642			TRUE	0.840	52.000	0.080	NA		NA
1223960	1223961	CYB_2642	CYB_2643		ispH	FALSE	0.224	198.000	0.032	NA		NA
1223961	1223962	CYB_2643	CYB_2645	ispH		TRUE	0.784	27.000	0.032	1.000		NA
1223963	1223964	CYB_2644	CYB_2646			FALSE	0.116	171.000	0.000	NA		NA
1223966	1223967	CYB_2648	CYB_2649			FALSE	0.002	1232.000	0.000	NA		NA
1223967	1223968	CYB_2649	CYB_2650			FALSE	0.381	48.000	0.000	NA		NA
1223968	1223969	CYB_2650	CYB_2651			FALSE	0.051	205.000	0.000	NA		NA
1223969	1223970	CYB_2651	CYB_2652			FALSE	0.331	60.000	0.000	NA		NA
1223970	1223971	CYB_2652	CYB_2653			FALSE	0.235	117.000	0.000	NA		NA
1223971	1223972	CYB_2653	CYB_2654			FALSE	0.385	47.000	0.000	NA		NA
1223972	1223973	CYB_2654	CYB_2655			TRUE	0.613	1.000	0.012	NA		NA
1223973	1223974	CYB_2655	CYB_2656			TRUE	0.836	34.000	0.067	NA		NA
1223974	1223975	CYB_2656	CYB_2657			FALSE	0.040	268.000	0.000	1.000	N	NA
1223975	1223976	CYB_2657	CYB_2658			FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
1223976	1223977	CYB_2658	CYB_2659			FALSE	0.008	332.000	0.000	NA		NA
1223977	1223978	CYB_2659	CYB_2660			TRUE	0.683	-3.000	0.027	NA		NA
1223978	1223979	CYB_2660	CYB_2661			TRUE	0.902	72.000	0.667	NA		NA
1223980	1223981	CYB_2662	CYB_2663			TRUE	0.810	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1223983	1223984	CYB_2665	CYB_2666	accD		FALSE	0.044	261.000	0.000	1.000	N	NA
1223984	1223985	CYB_2666	CYB_2667			FALSE	0.387	102.000	0.000	1.000	N	NA
1223987	1223988	CYB_2669	CYB_2670			FALSE	0.332	-9.000	0.000	NA		NA
1223988	1223989	CYB_2670	CYB_2671			FALSE	0.208	94.000	0.000	NA		NA
1223990	1223991	CYB_2672	CYB_2673	atpG	atpA	TRUE	0.990	62.000	0.846	0.003	Y	NA
1223991	1223992	CYB_2673	CYB_2674	atpA	atpH	TRUE	0.993	45.000	0.864	0.003	Y	NA
1223992	1223993	CYB_2674	CYB_2675	atpH	atpF	TRUE	0.984	21.000	0.132	0.003	Y	NA
1223993	1223994	CYB_2675	CYB_2676	atpF		TRUE	0.990	36.000	0.569	0.003	Y	NA
1223994	1223995	CYB_2676	CYB_2677		atpE	TRUE	0.972	95.000	0.368	0.003	Y	NA
1223995	1223996	CYB_2677	CYB_2678	atpE		FALSE	0.388	21.000	0.000	NA		NA
1223996	1223997	CYB_2678	CYB_2679		atpB	FALSE	0.314	-25.000	0.000	NA		NA
1223997	1223998	CYB_2679	CYB_2680	atpB		TRUE	0.888	6.000	0.099	1.000		NA
1223998	1223999	CYB_2680	CYB_2681			FALSE	0.003	638.000	0.000	NA		NA
1224000	1224001	CYB_2682	CYB_2683			TRUE	0.848	-3.000	0.098	NA		NA
1224002	1224003	CYB_2684	CYB_2685	gpmI		FALSE	0.079	216.000	0.000	1.000		NA
1224003	1224004	CYB_2685	CYB_2686		dps	TRUE	0.787	40.000	0.029	1.000		NA
1224004	1224005	CYB_2686	CYB_2687	dps	trmE	FALSE	0.402	111.000	0.003	1.000		NA
1224006	1224007	CYB_2688	CYB_2690	glgP		FALSE	0.010	413.000	0.000	1.000		NA
1224010	1224011	CYB_2692	CYB_2693			FALSE	0.076	190.000	0.000	NA		NA
1224011	1224012	CYB_2693	CYB_2694			FALSE	0.217	84.000	0.000	NA		NA
1224012	1224013	CYB_2694	CYB_2695			FALSE	0.019	261.000	0.000	NA		NA
1224013	1224014	CYB_2695	CYB_2696			TRUE	0.562	44.000	0.000	1.000		NA
1224015	1224016	CYB_2697	CYB_2698	coxB	ctaD	TRUE	0.969	78.000	0.132	0.001	Y	NA
1224016	1224017	CYB_2698	CYB_2700	ctaD	ctaE	TRUE	0.963	119.000	0.079	0.001	Y	NA
1224018	1224019	CYB_2699	CYB_2701	holA		TRUE	0.749	146.000	0.000	1.000	Y	NA
1224020	1224021	CYB_2702	CYB_2703			FALSE	0.006	377.000	0.000	NA		NA
1224021	1224022	CYB_2703	CYB_2704		glnB	TRUE	0.651	152.000	0.059	NA	N	NA
1224022	1224023	CYB_2704	CYB_2705	glnB	amt	TRUE	0.734	152.000	0.083	1.000	N	NA
1224023	1224024	CYB_2705	CYB_2706	amt	ispD	FALSE	0.154	200.000	0.003	1.000	N	NA
1224024	1224025	CYB_2706	CYB_2707	ispD		FALSE	0.005	492.000	0.000	NA	N	NA
1224025	1224026	CYB_2707	CYB_2708		cobM	FALSE	0.006	462.000	0.000	NA	N	NA
1224026	1224027	CYB_2708	CYB_2709	cobM		FALSE	0.019	339.000	0.000	1.000	N	NA
1224027	1224028	CYB_2709	CYB_2710		rhdA	TRUE	0.611	39.000	0.000	1.000	N	NA
1224028	1224029	CYB_2710	CYB_2711	rhdA		FALSE	0.427	-3.000	0.000	NA	N	NA
1224029	1224030	CYB_2711	CYB_2712			TRUE	0.577	168.000	0.000	NA	Y	NA
1224030	1224031	CYB_2712	CYB_2714			FALSE	0.265	103.000	0.000	NA	N	NA
1224032	1224033	CYB_2713	CYB_2715			FALSE	0.266	101.000	0.000	NA	N	NA
1224033	1224034	CYB_2715	CYB_2716			TRUE	0.601	8.000	0.000	1.000	N	NA
1224034	1224035	CYB_2716	CYB_2717			FALSE	0.367	0.000	0.000	NA		NA
1224039	1224040	CYB_2721	CYB_2722			FALSE	0.351	-3.000	0.000	NA		NA
1224040	1224041	CYB_2722	CYB_2723			TRUE	0.737	149.000	0.000	1.000	Y	NA
1224043	1224044	CYB_2725	CYB_2726			TRUE	0.970	33.000	0.250	0.001	N	NA
1224044	1224045	CYB_2726	CYB_2727			TRUE	0.827	47.000	0.041	1.000	N	NA
1224045	1224046	CYB_2727	CYB_2728			TRUE	0.926	65.000	0.061	1.000	Y	NA
1224046	1224047	CYB_2728	CYB_2729			TRUE	0.970	-3.000	0.385	1.000	Y	NA
1224048	1224049	CYB_2730	CYB_2731		mutS	FALSE	0.394	44.000	0.000	NA		NA
1224052	1224053	CYB_2733	CYB_2735	mviN		FALSE	0.367	0.000	0.000	NA		NA
1224053	1224054	CYB_2735	CYB_2736		cpcE-2	FALSE	0.030	253.000	0.000	NA	N	NA
1224054	1224055	CYB_2736	CYB_2737	cpcE-2	cpcC	TRUE	0.952	34.000	0.667	1.000		NA
1224057	1224058	CYB_2738	CYB_2740	cpcA-2	cpcB-2	TRUE	0.890	194.000	1.000	0.003		NA
1224059	1224060	CYB_2741	CYB_2743	cpeT		FALSE	0.104	202.000	0.000	1.000		NA
1224062	1224063	CYB_2744	CYB_2745			FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
1224063	1224064	CYB_2745	CYB_2746			TRUE	0.764	130.000	0.111	NA		NA
1224064	1224065	CYB_2746	CYB_2747			TRUE	0.882	8.000	0.133	NA		NA
1224065	1224066	CYB_2747	CYB_2748			FALSE	0.014	389.000	0.000	1.000	N	NA
1224066	1224067	CYB_2748	CYB_2749			TRUE	0.984	48.000	0.200	0.009	Y	NA
1224067	1224068	CYB_2749	CYB_2750			TRUE	0.938	108.000	0.333	1.000	Y	NA
1224068	1224069	CYB_2750	CYB_2751			TRUE	0.989	49.000	0.385	0.001	Y	NA
1224069	1224070	CYB_2751	CYB_2752			TRUE	0.986	2.000	0.231	0.002	Y	NA
1224070	1224071	CYB_2752	CYB_2754			TRUE	0.932	4.000	0.500	NA		NA
1224075	1224076	CYB_2757	CYB_2758			TRUE	0.860	68.000	0.333	NA		NA
1224076	1224077	CYB_2758	CYB_2759			FALSE	0.028	239.000	0.000	NA		NA
1224077	1224078	CYB_2759	CYB_2761			FALSE	0.006	361.000	0.000	NA		NA
1224080	1224081	CYB_2762	CYB_2763			FALSE	0.006	392.000	0.000	NA		NA
1224081	1224082	CYB_2763	CYB_2764			FALSE	0.029	236.000	0.000	NA		NA
1224082	1224083	CYB_2764	CYB_2765			FALSE	0.114	172.000	0.000	NA		NA
1224083	1224084	CYB_2765	CYB_2766			FALSE	0.372	1.000	0.000	NA		NA
1224087	1224088	CYB_2769	CYB_2770	def-2		FALSE	0.207	143.000	0.000	NA		NA
1224088	1224089	CYB_2770	CYB_2771			TRUE	0.940	4.000	0.625	NA		NA
1224089	1224090	CYB_2771	CYB_2772			TRUE	0.769	0.000	0.047	NA		NA
1224091	1224092	CYB_2773	CYB_2774			FALSE	0.138	163.000	0.000	NA		NA
1224092	1224093	CYB_2774	CYB_2775		sbcD	FALSE	0.455	124.000	0.004	1.000		NA
1224093	1224094	CYB_2775	CYB_2776	sbcD		FALSE	0.007	520.000	0.000	1.000		NA
1224094	1224095	CYB_2776	CYB_2777			FALSE	0.220	83.000	0.000	NA		NA
1224095	1224096	CYB_2777	CYB_2778			FALSE	0.373	2.000	0.000	NA		NA
1224098	1224099	CYB_2780	CYB_2781	pstS-3	dnaK-1	FALSE	0.030	291.000	0.000	1.000	N	NA
1224099	1224100	CYB_2781	CYB_2782	dnaK-1		TRUE	0.865	209.000	0.390	0.004	Y	NA
1224102	1224103	CYB_2784	CYB_2785		lpxC	FALSE	0.501	15.000	0.003	NA		NA
1224103	1224104	CYB_2785	CYB_2786	lpxC	fabZ	FALSE	0.360	214.000	0.083	1.000	N	NA
1224104	1224105	CYB_2786	CYB_2787	fabZ	lpxA	FALSE	0.270	234.000	0.071	1.000	N	NA
1224105	1224106	CYB_2787	CYB_2789	lpxA	lpxB	TRUE	0.950	27.000	0.062	1.000	Y	NA
1224110	1224111	CYB_2792	CYB_2793			FALSE	0.031	234.000	0.000	NA		NA
1224118	1224119	CYB_2799	CYB_2801	moaA		FALSE	0.140	197.000	0.000	1.000	N	NA
1224121	1224122	CYB_2803	CYB_2804		glnA-2	FALSE	0.241	75.000	0.000	NA		NA
1224123	1224124	CYB_2805	CYB_2806		trxB	FALSE	0.353	56.000	0.000	NA		NA
1224125	1224126	CYB_2807	CYB_2808	purL	recG	TRUE	0.603	22.000	0.000	1.000	N	NA
1224126	1224127	CYB_2808	CYB_2809	recG	psaM	FALSE	0.090	207.000	0.000	1.000		NA
1224128	1224129	CYB_2810	CYB_2811	glyA		TRUE	0.908	34.000	0.137	1.000	N	NA
1224129	1224130	CYB_2811	CYB_2812			TRUE	0.599	-3.000	0.013	NA		NA
1224133	1224134	CYB_2815	CYB_2816			FALSE	0.009	323.000	0.000	NA		NA
1224134	1224135	CYB_2816	CYB_2817			FALSE	0.005	431.000	0.000	NA		NA
1224135	1224136	CYB_2817	CYB_2818			TRUE	0.685	27.000	0.005	1.000	N	NA
1224136	1224137	CYB_2818	CYB_2819			TRUE	0.810	37.000	0.033	1.000	N	NA
1224137	1224138	CYB_2819	CYB_2820		thrC-2	TRUE	0.551	105.000	0.014	1.000	N	NA
1224139	1224140	CYB_2821	CYB_2823		gidA	FALSE	0.048	207.000	0.000	NA		NA
1224142	1224143	CYB_2824	CYB_2825	psaF	psaJ	TRUE	0.965	45.000	0.318	0.013		NA
1224143	1224144	CYB_2825	CYB_2826	psaJ	psaL-2	TRUE	0.856	102.000	0.056	0.013		NA
1224144	1224145	CYB_2826	CYB_2827	psaL-2		FALSE	0.386	10.000	0.000	NA		NA
1224145	1224146	CYB_2827	CYB_2828			FALSE	0.133	166.000	0.000	NA		NA
1224146	1224147	CYB_2828	CYB_2829			TRUE	0.958	34.000	0.150	0.004		NA
1224147	1224148	CYB_2829	CYB_2830			TRUE	0.728	23.000	0.031	NA		NA
1224148	1224149	CYB_2830	CYB_2831			TRUE	0.812	0.000	0.056	NA		NA
1224149	1224150	CYB_2831	CYB_2832			FALSE	0.004	529.000	0.000	NA		NA
1224150	1224151	CYB_2832	CYB_2833		thiD	FALSE	0.112	174.000	0.000	NA		NA
1224151	1224152	CYB_2833	CYB_2834	thiD		FALSE	0.382	27.000	0.000	NA		NA
1224152	1224153	CYB_2834	CYB_2835			FALSE	0.010	304.000	0.000	NA		NA
1224154	1224155	CYB_2836	CYB_2837		hemF	FALSE	0.498	52.000	0.004	NA		NA
1224155	1224156	CYB_2837	CYB_2838	hemF		FALSE	0.296	147.000	0.004	NA		NA
1224159	1224160	CYB_2841	CYB_2842			FALSE	0.386	36.000	0.000	NA		NA
1224160	1224161	CYB_2842	CYB_2843			FALSE	0.389	37.000	0.000	NA		NA
1224161	1224162	CYB_2843	CYB_2844			FALSE	0.386	10.000	0.000	NA		NA
1224162	1224163	CYB_2844	CYB_2845			TRUE	0.785	124.000	0.000	1.000	Y	NA
1224165	1224166	CYB_2847	CYB_2848		rpmI	FALSE	0.425	129.000	0.002	1.000	N	NA
1224166	1224167	CYB_2848	CYB_2849	rpmI	rplT	TRUE	0.985	134.000	0.928	0.011	Y	NA
1224167	1224168	CYB_2849	CYB_2850	rplT		TRUE	0.624	-118.000	0.008	1.000	N	NA
1224169	1224170	CYB_2851	CYB_2852	purH	cysE	FALSE	0.339	153.000	0.000	1.000	N	NA
1224170	1224171	CYB_2852	CYB_2853	cysE		FALSE	0.358	137.000	0.000	1.000		NA
1224171	1224172	CYB_2853	CYB_2854		ubiA	FALSE	0.169	181.000	0.000	1.000		NA
1224174	1224175	CYB_2855	CYB_2857		hemH	FALSE	0.440	146.000	0.004	1.000	N	NA
1224175	1224176	CYB_2857	CYB_2858	hemH		FALSE	0.015	273.000	0.000	NA		NA
1224177	1224178	CYB_2859	CYB_2860		moaC	FALSE	0.209	93.000	0.000	NA		NA
1224178	1224179	CYB_2860	CYB_2861	moaC		FALSE	0.336	-6.000	0.000	NA		NA
1224179	1224180	CYB_2861	CYB_2862			FALSE	0.516	-6.000	0.007	NA		NA
1224180	1224181	CYB_2862	CYB_2863			FALSE	0.390	17.000	0.000	NA		NA
1224182	1224183	CYB_2864	CYB_2865			FALSE	0.197	177.000	0.007	NA		NA
1224183	1224184	CYB_2865	CYB_2866			FALSE	0.324	196.000	0.051	NA		NA
1224184	1224185	CYB_2866	CYB_2867			TRUE	0.644	99.000	0.051	NA		NA
1224187	1224188	CYB_2869	CYB_2870			TRUE	0.870	46.000	0.058	1.000	N	NA
1224189	1224190	CYB_2871	CYB_2872			TRUE	0.914	3.000	0.353	NA		NA
1224190	1224191	CYB_2872	CYB_2873			FALSE	0.503	79.000	0.008	1.000		NA
1224191	1224192	CYB_2873	CYB_2874			FALSE	0.396	141.000	0.000	1.000	N	NA
1224192	1224193	CYB_2874	CYB_2875			FALSE	0.013	406.000	0.000	1.000	N	NA
1224193	1224194	CYB_2875	CYB_2876			TRUE	0.992	51.000	0.714	0.002	Y	NA
1224194	1224195	CYB_2876	CYB_2877			TRUE	0.947	59.000	0.857	NA		NA
1224195	1224196	CYB_2877	CYB_2878			TRUE	0.861	82.000	0.455	NA		NA
1224196	1224197	CYB_2878	CYB_2879			FALSE	0.005	458.000	0.000	NA		NA
1224198	1224199	CYB_2880	CYB_2881		leuS	FALSE	0.225	133.000	0.000	NA		NA
1224199	1224200	CYB_2881	CYB_2882	leuS	petH	FALSE	0.346	141.000	0.002	1.000		NA
1224201	1224202	CYB_2883	CYB_2885	prk	pgl	TRUE	0.601	87.000	0.022	1.000	N	NA
1224203	1224204	CYB_2884	CYB_2886			FALSE	0.396	40.000	0.000	NA		NA
1224204	1224205	CYB_2886	CYB_2887			FALSE	0.224	112.000	0.000	NA		NA
1224205	1224206	CYB_2887	CYB_2888			FALSE	0.387	22.000	0.000	NA		NA
1224206	1224207	CYB_2888	CYB_2889		rplS	FALSE	0.265	68.000	0.000	NA		NA
1224208	1224209	CYB_2890	CYB_2892		macB	TRUE	0.972	-3.000	0.667	0.051	N	NA
1224210	1224211	CYB_2891	CYB_2893	ubiD		TRUE	0.608	19.000	0.006	NA	N	NA
1224212	1224213	CYB_2894	CYB_2895		recR	TRUE	0.940	36.000	0.604	NA		NA
1224215	1224216	CYB_2897	CYB_2898	frr		FALSE	0.260	237.000	0.000	1.000	Y	NA
1224217	1224218	CYB_2899	CYB_2900			TRUE	0.602	93.000	0.047	NA		NA
1224218	1224219	CYB_2900	CYB_2901			FALSE	0.005	427.000	0.000	NA		NA
1224220	1224221	CYB_2902	CYB_2903			FALSE	0.004	466.000	0.000	NA		NA
1224221	1224222	CYB_2903	CYB_2905		lipA-2	FALSE	0.038	222.000	0.000	NA		NA
1224225	1224226	CYB_2907	CYB_2908			FALSE	0.315	-24.000	0.000	NA		NA
1224227	1224228	CYB_2909	CYB_2910			FALSE	0.163	168.000	0.000	NA	N	NA
1224228	1224229	CYB_2910	CYB_2911			FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
1224229	1224230	CYB_2911	CYB_2912		aroQ	TRUE	0.918	41.000	0.333	NA		NA
1224231	1224232	CYB_2913	CYB_2914			TRUE	0.902	-3.000	0.156	1.000	N	NA
1224232	1224233	CYB_2914	CYB_2915			TRUE	0.700	106.000	0.000	0.019	N	NA
1224235	1224236	CYB_2917	CYB_2918		opcA	FALSE	0.004	476.000	0.000	NA		NA
1224236	1224237	CYB_2918	CYB_2919	opcA	pgi	TRUE	0.816	131.000	0.019	NA	Y	NA
1224237	1224238	CYB_2919	CYB_2920	pgi	folK	TRUE	0.602	47.000	0.000	1.000	N	NA
1224238	1224239	CYB_2920	CYB_2921	folK	folB-2	TRUE	0.924	-3.000	0.037	1.000	Y	NA
1224239	1224240	CYB_2921	CYB_2922	folB-2	folP	TRUE	0.900	-13.000	0.021	1.000	Y	NA
1224240	1224241	CYB_2922	CYB_2923	folP		FALSE	0.076	191.000	0.000	NA		NA
1224241	1224242	CYB_2923	CYB_2924			FALSE	0.040	219.000	0.000	NA		NA
1224242	1224243	CYB_2924	CYB_2925			FALSE	0.030	254.000	0.000	NA	N	NA
1224243	1224244	CYB_2925	CYB_2926			FALSE	0.124	181.000	0.000	NA	N	NA
1224245	1224246	CYB_2927	CYB_2928		tas	FALSE	0.368	94.000	0.008	NA		NA
1224246	1224247	CYB_2928	CYB_2929	tas		FALSE	0.108	175.000	0.000	NA		NA
1224247	1224248	CYB_2929	CYB_2930			TRUE	0.867	135.000	0.500	NA		NA
1224248	1224249	CYB_2930	CYB_2931			FALSE	0.441	88.000	0.015	NA		NA
1224249	1224250	CYB_2931	CYB_2932			TRUE	0.659	41.000	0.015	NA		NA
1224250	1224251	CYB_2932	CYB_2933		grpE	FALSE	0.259	181.000	0.005	1.000	N	NA
1224251	1224252	CYB_2933	CYB_2934	grpE	dnaK-2	TRUE	0.918	180.000	0.224	0.007	Y	NA
1224252	1224253	CYB_2934	CYB_2935	dnaK-2	dnaJ	TRUE	0.967	131.000	0.196	0.004	Y	NA
1224253	1224254	CYB_2935	CYB_2936	dnaJ		TRUE	0.945	-3.000	0.067	1.000	Y	NA
1224254	1224255	CYB_2936	CYB_2937			TRUE	0.838	-3.000	0.058	1.000		NA
1224256	1224257	CYB_2938	CYB_2939			FALSE	0.430	182.000	0.000	0.028		NA
1224257	1224258	CYB_2939	CYB_2940			FALSE	0.345	89.000	0.000	1.000		NA
1224258	1224259	CYB_2940	CYB_2941		rnpA	FALSE	0.419	84.000	0.002	1.000	N	NA
1224259	1224260	CYB_2941	CYB_2942	rnpA	rpmH	TRUE	0.909	94.000	0.787	1.000		NA