MicrobesOnline Operon Predictions for Synechococcus sp. JA-3-3Ab

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1304270 1304271 CYA_0001 CYA_0003 dnaA   FALSE 0.139 171.000 0.002 NA   NA
 1304272 1304273 CYA_0002 CYA_0004     TRUE 0.732 104.000 0.069 1.000 N NA
 1304273 1304274 CYA_0004 CYA_0005     TRUE 0.667 126.000 0.069 1.000   NA
 1304275 1304276 CYA_0006 CYA_0007     FALSE 0.254 107.000 0.000 NA   NA
 1304279 1304280 CYA_0010 CYA_0011   thiC FALSE 0.192 150.000 0.000 1.000   NA
 1304280 1304281 CYA_0011 CYA_0012 thiC   FALSE 0.008 309.000 0.000 NA   NA
 1304281 1304282 CYA_0012 CYA_0013     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304282 1304283 CYA_0013 CYA_0014     TRUE 0.854 41.000 0.049 NA   NA
 1304283 1304284 CYA_0014 CYA_0015     TRUE 0.827 51.000 0.049 NA   NA
 1304284 1304285 CYA_0015 CYA_0016   gvpW FALSE 0.082 161.000 0.000 NA   NA
 1304289 1304290 CYA_0019 CYA_0021 folK folB TRUE 0.963 7.000 0.037 1.000 Y NA
 1304290 1304291 CYA_0021 CYA_0022 folB folP TRUE 0.947 -13.000 0.021 1.000 Y NA
 1304291 1304292 CYA_0022 CYA_0023 folP   FALSE 0.006 342.000 0.000 NA   NA
 1304292 1304293 CYA_0023 CYA_0024     FALSE 0.038 189.000 0.000 NA   NA
 1304293 1304294 CYA_0024 CYA_0025   rumA FALSE 0.439 154.000 0.000 1.000 Y NA
 1304294 1304295 CYA_0025 CYA_0026 rumA   FALSE 0.030 188.000 0.000 NA N NA
 1304295 1304296 CYA_0026 CYA_0027     FALSE 0.515 128.000 0.049 NA N NA
 1304298 1304299 CYA_0029 CYA_0030     FALSE 0.069 181.000 0.000 1.000 N NA
 1304300 1304301 CYA_0031 CYA_0032     TRUE 0.798 47.000 0.016 1.000   NA
 1304303 1304304 CYA_0034 CYA_0035   psaL-1 FALSE 0.005 370.000 0.000 NA   NA
 1304304 1304305 CYA_0035 CYA_0036 psaL-1 psaI TRUE 0.968 50.000 0.371 0.030   NA
 1304305 1304306 CYA_0036 CYA_0037 psaI   FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 1304306 1304307 CYA_0037 CYA_0038     TRUE 0.967 -18.000 0.500 NA   NA
 1304311 1304312 CYA_0042 CYA_0043     FALSE 0.630 50.000 0.000 1.000   NA
 1304312 1304313 CYA_0043 CYA_0044     TRUE 0.758 88.000 0.071 NA   NA
 1304313 1304314 CYA_0044 CYA_0045     FALSE 0.194 126.000 0.000 NA   NA
 1304315 1304316 CYA_0046 CYA_0047 trmU   FALSE 0.542 99.000 0.004 1.000 N NA
 1304322 1304323 CYA_0052 CYA_0053     FALSE 0.582 30.000 0.000 NA   NA
 1304323 1304324 CYA_0053 CYA_0055   selD FALSE 0.139 155.000 0.000 1.000 N NA
 1304326 1304327 CYA_0056 CYA_0058     TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1304327 1304328 CYA_0058 CYA_0059     TRUE 0.758 37.000 0.005 NA   NA
 1304328 1304329 CYA_0059 CYA_0060     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 1304329 1304330 CYA_0060 CYA_0061     TRUE 0.986 -3.000 1.000 NA   NA
 1304330 1304331 CYA_0061 CYA_0062     FALSE 0.019 230.000 0.000 NA   NA
 1304331 1304332 CYA_0062 CYA_0063     FALSE 0.142 143.000 0.000 NA   NA
 1304332 1304333 CYA_0063 CYA_0064     FALSE 0.515 46.000 0.000 NA   NA
 1304333 1304334 CYA_0064 CYA_0065     TRUE 0.879 18.000 0.043 NA   NA
 1304334 1304335 CYA_0065 CYA_0066     TRUE 0.886 49.000 0.091 NA   NA
 1304335 1304336 CYA_0066 CYA_0067     FALSE 0.024 213.000 0.000 NA   NA
 1304337 1304338 CYA_0068 CYA_0069     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 1304338 1304339 CYA_0069 CYA_0070     FALSE 0.540 40.000 0.000 NA   NA
 1304343 1304344 CYA_0074 CYA_0075 secD secF TRUE 0.994 -3.000 0.516 0.001 Y NA
 1304346 1304347 CYA_0077 CYA_0078 murF   TRUE 0.647 98.000 0.048 NA   NA
 1304347 1304348 CYA_0078 CYA_0079     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 1304353 1304354 CYA_0084 CYA_0085 rpe   FALSE 0.086 160.000 0.000 NA   NA
 1304355 1304356 CYA_0086 CYA_0088     TRUE 0.796 -3.000 0.003 NA N NA
 1304357 1304358 CYA_0087 CYA_0089     FALSE 0.028 204.000 0.000 NA   NA
 1304358 1304359 CYA_0089 CYA_0090     FALSE 0.059 173.000 0.000 NA   NA
 1304359 1304360 CYA_0090 CYA_0091     FALSE 0.221 119.000 0.000 NA   NA
 1304360 1304361 CYA_0091 CYA_0092     FALSE 0.040 188.000 0.000 NA   NA
 1304361 1304362 CYA_0092 CYA_0093     TRUE 0.846 0.000 0.017 NA   NA
 1304363 1304364 CYA_0094 CYA_0095     FALSE 0.541 117.000 0.039 NA   NA
 1304364 1304365 CYA_0095 CYA_0096     FALSE 0.637 114.000 0.054 NA   NA
 1304365 1304366 CYA_0096 CYA_0097     FALSE 0.169 194.000 0.054 NA   NA
 1304366 1304367 CYA_0097 CYA_0098     FALSE 0.492 50.000 0.000 NA   NA
 1304367 1304368 CYA_0098 CYA_0099     FALSE 0.573 32.000 0.000 NA   NA
 1304368 1304369 CYA_0099 CYA_0100     FALSE 0.009 345.000 0.000 1.000 N NA
 1304369 1304370 CYA_0100 CYA_0102     TRUE 0.806 94.000 0.146 NA   NA
 1304372 1304373 CYA_0103 CYA_0104 argH   FALSE 0.299 92.000 0.000 NA   NA
 1304373 1304374 CYA_0104 CYA_0105     FALSE 0.004 416.000 0.000 NA   NA
 1304374 1304375 CYA_0105 CYA_0107     FALSE 0.023 217.000 0.000 NA   NA
 1304376 1304377 CYA_0106 CYA_0108     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 1304378 1304379 CYA_0109 CYA_0110 ftsZ ddlB TRUE 0.810 70.000 0.003 0.047 N NA
 1304382 1304383 CYA_0113 CYA_0114     FALSE 0.177 148.000 0.000 1.000 N NA
 1304383 1304384 CYA_0114 CYA_0115     TRUE 0.958 73.000 1.000 NA   NA
 1304384 1304385 CYA_0115 CYA_0116     TRUE 0.862 62.000 0.105 NA   NA
 1304389 1304390 CYA_0120 CYA_0121 def-1   FALSE 0.003 460.000 0.000 NA   NA
 1304390 1304391 CYA_0121 CYA_0122     TRUE 0.978 4.000 0.625 NA   NA
 1304391 1304392 CYA_0122 CYA_0123     TRUE 0.898 0.000 0.047 NA   NA
 1304392 1304393 CYA_0123 CYA_0124     FALSE 0.277 98.000 0.000 NA   NA
 1304394 1304395 CYA_0125 CYA_0126     FALSE 0.499 119.000 0.004 1.000   NA
 1304395 1304396 CYA_0126 CYA_0127     FALSE 0.010 342.000 0.000 1.000   NA
 1304398 1304399 CYA_0129 CYA_0130 pstS-1 dnaK-1 FALSE 0.022 250.000 0.000 1.000 N NA
 1304399 1304400 CYA_0130 CYA_0132 dnaK-1   TRUE 0.696 199.000 0.390 0.009 Y NA
 1304403 1304404 CYA_0133 CYA_0135   cas2-1 FALSE 0.007 394.000 0.000 1.000 N NA
 1304404 1304405 CYA_0135 CYA_0136 cas2-1   FALSE 0.572 -48.000 0.000 NA   NA
 1304405 1304406 CYA_0136 CYA_0137     FALSE 0.099 155.000 0.000 NA   NA
 1304406 1304407 CYA_0137 CYA_0138     FALSE 0.004 921.000 0.000 1.000   NA
 1304407 1304408 CYA_0138 CYA_0139     FALSE 0.032 313.000 0.000 0.059   NA
 1304408 1304409 CYA_0139 CYA_0140     TRUE 0.882 19.000 0.000 0.059   NA
 1304409 1304410 CYA_0140 CYA_0141     FALSE 0.006 342.000 0.000 NA   NA
 1304410 1304411 CYA_0141 CYA_0142     FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 1304411 1304412 CYA_0142 CYA_0143   ilvA FALSE 0.389 102.000 0.000 1.000   NA
 1304415 1304416 CYA_0146 CYA_0147   ftsE FALSE 0.009 526.000 0.006 1.000 N NA
 1304418 1304419 CYA_0149 CYA_0150     TRUE 0.995 -15.000 0.875 0.033 Y NA
 1304419 1304420 CYA_0150 CYA_0151     TRUE 0.992 -3.000 0.429 0.033 Y NA
 1304420 1304421 CYA_0151 CYA_0152     TRUE 0.994 5.000 1.000 1.000 Y NA
 1304421 1304422 CYA_0152 CYA_0153     TRUE 0.966 -13.000 0.003 0.025 Y NA
 1304422 1304423 CYA_0153 CYA_0154     TRUE 0.895 93.000 0.431 1.000 N NA
 1304423 1304424 CYA_0154 CYA_0155     FALSE 0.418 94.000 0.000 1.000   NA
 1304427 1304428 CYA_0157 CYA_0159   cax TRUE 0.832 40.000 0.024 1.000   NA
 1304428 1304429 CYA_0159 CYA_0160 cax   FALSE 0.040 188.000 0.000 NA   NA
 1304429 1304430 CYA_0160 CYA_0161   coaBC FALSE 0.462 55.000 0.000 NA   NA
 1304431 1304432 CYA_0162 CYA_0163     FALSE 0.013 260.000 0.000 NA   NA
 1304432 1304433 CYA_0163 CYA_0165     FALSE 0.575 -43.000 0.000 NA   NA
 1304434 1304435 CYA_0164 CYA_0166 ubiH   TRUE 0.931 3.000 0.056 1.000 N NA
 1304435 1304436 CYA_0166 CYA_0167   metE-2 FALSE 0.034 215.000 0.000 1.000 N NA
 1304436 1304437 CYA_0167 CYA_0168 metE-2   FALSE 0.002 623.000 0.000 NA   NA
 1304437 1304438 CYA_0168 CYA_0169   moaE FALSE 0.566 34.000 0.000 NA   NA
 1304438 1304439 CYA_0169 CYA_0170 moaE   TRUE 0.990 1.000 0.501 1.000 Y NA
 1304439 1304440 CYA_0170 CYA_0171   moaC TRUE 0.945 -25.000 0.027 1.000 Y NA
 1304440 1304441 CYA_0171 CYA_0172 moaC moaA TRUE 0.978 5.000 0.016 0.003 Y NA
 1304441 1304442 CYA_0172 CYA_0173 moaA moeA TRUE 0.985 2.000 0.053 0.003 Y NA
 1304442 1304443 CYA_0173 CYA_0174 moeA   FALSE 0.588 -22.000 0.000 NA   NA
 1304443 1304444 CYA_0174 CYA_0175     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304445 1304446 CYA_0177 CYA_0178   pyrC FALSE 0.023 246.000 0.000 1.000 N NA
 1304446 1304447 CYA_0178 CYA_0179 pyrC   FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 1304448 1304449 CYA_0180 CYA_0181 clpB zam FALSE 0.101 193.000 0.003 1.000 N NA
 1304449 1304450 CYA_0181 CYA_0182 zam phoU TRUE 0.786 58.000 0.049 NA N NA
 1304451 1304452 CYA_0183 CYA_0185     TRUE 0.879 17.000 0.042 NA   NA
 1304453 1304454 CYA_0184 CYA_0186 treZ   FALSE 0.013 263.000 0.000 NA   NA
 1304456 1304457 CYA_0188 CYA_0189 rpsU   FALSE 0.449 87.000 0.000 1.000   NA
 1304458 1304459 CYA_0191 CYA_0192     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304459 1304460 CYA_0192 CYA_0193   dxr FALSE 0.239 139.000 0.000 1.000   NA
 1304460 1304461 CYA_0193 CYA_0194 dxr   TRUE 0.701 60.000 0.002 1.000 N NA
 1304461 1304462 CYA_0194 CYA_0196   murE FALSE 0.579 91.000 0.004 1.000 N NA
 1304463 1304464 CYA_0195 CYA_0197 carA   FALSE 0.454 97.000 0.002 NA N NA
 1304464 1304465 CYA_0197 CYA_0198     TRUE 0.951 15.000 0.182 NA   NA
 1304465 1304466 CYA_0198 CYA_0199     TRUE 0.900 57.000 0.182 NA   NA
 1304466 1304467 CYA_0199 CYA_0200     TRUE 0.895 58.000 0.167 NA   NA
 1304467 1304468 CYA_0200 CYA_0201     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 1304468 1304469 CYA_0201 CYA_0202     FALSE 0.277 98.000 0.000 NA   NA
 1304469 1304470 CYA_0202 CYA_0203   mutM FALSE 0.241 112.000 0.000 NA   NA
 1304470 1304471 CYA_0203 CYA_0204 mutM psaE TRUE 0.849 46.000 0.040 1.000   NA
 1304473 1304474 CYA_0206 CYA_0207 nadE uvrC FALSE 0.427 81.000 0.000 1.000 N NA
 1304474 1304475 CYA_0207 CYA_0208 uvrC   FALSE 0.009 333.000 0.000 1.000 N NA
 1304475 1304476 CYA_0208 CYA_0209     TRUE 0.938 4.000 0.069 1.000 N NA
 1304476 1304477 CYA_0209 CYA_0210     FALSE 0.566 -57.000 0.000 NA   NA
 1304479 1304480 CYA_0212 CYA_0213     TRUE 0.977 0.000 0.483 1.000   NA
 1304480 1304481 CYA_0213 CYA_0214     TRUE 0.975 -3.000 0.591 NA   NA
 1304481 1304482 CYA_0214 CYA_0215   cpcG1 FALSE 0.636 140.000 0.143 NA   NA
 1304482 1304483 CYA_0215 CYA_0216 cpcG1 cpcF TRUE 0.963 43.000 0.500 1.000   NA
 1304483 1304484 CYA_0216 CYA_0217 cpcF cpcE-1 TRUE 0.982 13.000 0.333 0.024   NA
 1304484 1304485 CYA_0217 CYA_0218 cpcE-1 cpcD FALSE 0.434 91.000 0.000 1.000   NA
 1304485 1304486 CYA_0218 CYA_0219 cpcD   FALSE 0.154 138.000 0.000 NA   NA
 1304486 1304487 CYA_0219 CYA_0220   cpcA-1 FALSE 0.439 59.000 0.000 NA   NA
 1304487 1304488 CYA_0220 CYA_0221 cpcA-1 cpcB-1 TRUE 0.885 148.000 0.667 0.008   NA
 1304490 1304491 CYA_0223 CYA_0224 trpA-1   TRUE 0.861 54.000 0.000 1.000 Y NA
 1304491 1304492 CYA_0224 CYA_0225     FALSE 0.229 116.000 0.000 NA   NA
 1304492 1304493 CYA_0225 CYA_0226     FALSE 0.562 35.000 0.000 NA   NA
 1304496 1304497 CYA_0229 CYA_0230   gvpG FALSE 0.351 77.000 0.000 NA   NA
 1304497 1304498 CYA_0230 CYA_0231 gvpG   TRUE 0.741 73.000 0.048 NA   NA
 1304498 1304499 CYA_0231 CYA_0233     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 1304501 1304502 CYA_0234 CYA_0235     FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 1304502 1304503 CYA_0235 CYA_0236     FALSE 0.042 186.000 0.000 NA   NA
 1304503 1304504 CYA_0236 CYA_0237   thyX FALSE 0.589 75.000 0.005 NA   NA
 1304504 1304505 CYA_0237 CYA_0238 thyX   TRUE 0.818 -84.000 0.005 1.000   NA
 1304505 1304506 CYA_0238 CYA_0239     FALSE 0.123 149.000 0.000 NA   NA
 1304506 1304507 CYA_0239 CYA_0240   purC TRUE 0.805 11.000 0.004 NA N NA
 1304507 1304508 CYA_0240 CYA_0241 purC   TRUE 0.658 8.000 0.000 NA   NA
 1304508 1304509 CYA_0241 CYA_0242     FALSE 0.033 197.000 0.000 NA   NA
 1304511 1304512 CYA_0244 CYA_0245     FALSE 0.099 189.000 0.016 NA   NA
 1304512 1304513 CYA_0245 CYA_0246   ilvC FALSE 0.636 74.000 0.002 1.000 N NA
 1304513 1304514 CYA_0246 CYA_0247 ilvC serS TRUE 0.821 24.000 0.002 1.000 N NA
 1304514 1304515 CYA_0247 CYA_0248 serS   FALSE 0.387 92.000 0.000 1.000 N NA
 1304515 1304516 CYA_0248 CYA_0249     TRUE 0.974 -3.000 0.446 1.000 N NA
 1304516 1304517 CYA_0249 CYA_0250     FALSE 0.119 150.000 0.000 NA   NA
 1304517 1304518 CYA_0250 CYA_0251   ppa FALSE 0.005 382.000 0.000 NA   NA
 1304518 1304519 CYA_0251 CYA_0252 ppa   FALSE 0.357 99.000 0.000 1.000 N NA
 1304519 1304520 CYA_0252 CYA_0254     TRUE 0.948 77.000 0.371 NA Y NA
 1304525 1304526 CYA_0258 CYA_0259   psbY TRUE 0.836 34.000 0.017 1.000   NA
 1304526 1304527 CYA_0259 CYA_0260 psbY   TRUE 0.662 5.000 0.000 NA   NA
 1304527 1304528 CYA_0260 CYA_0261     FALSE 0.007 315.000 0.000 NA   NA
 1304528 1304529 CYA_0261 CYA_0262     FALSE 0.177 294.000 0.552 1.000   NA
 1304529 1304530 CYA_0262 CYA_0263     FALSE 0.595 56.000 0.000 1.000   NA
 1304530 1304531 CYA_0263 CYA_0264     FALSE 0.351 77.000 0.000 NA   NA
 1304531 1304532 CYA_0264 CYA_0265     FALSE 0.101 154.000 0.000 NA   NA
 1304533 1304534 CYA_0266 CYA_0267   ispF FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 1304534 1304535 CYA_0267 CYA_0268 ispF   FALSE 0.129 183.000 0.009 1.000 N NA
 1304536 1304537 CYA_0269 CYA_0270     TRUE 0.857 87.000 0.200 1.000 N NA
 1304537 1304538 CYA_0270 CYA_0271     FALSE 0.217 120.000 0.000 NA   NA
 1304539 1304540 CYA_0272 CYA_0273     TRUE 0.650 12.000 0.000 NA   NA
 1304540 1304541 CYA_0273 CYA_0274     FALSE 0.543 39.000 0.000 NA   NA
 1304541 1304542 CYA_0274 CYA_0276     FALSE 0.011 270.000 0.000 NA   NA
 1304542 1304543 CYA_0276 CYA_0277   purF FALSE 0.004 442.000 0.000 NA   NA
 1304543 1304544 CYA_0277 CYA_0278 purF def-2 TRUE 0.816 29.000 0.003 1.000 N NA
 1304544 1304545 CYA_0278 CYA_0279 def-2   TRUE 0.828 11.000 0.009 NA   NA
 1304545 1304546 CYA_0279 CYA_0280     FALSE 0.004 429.000 0.000 NA   NA
 1304546 1304547 CYA_0280 CYA_0281     FALSE 0.014 259.000 0.000 NA   NA
 1304547 1304548 CYA_0281 CYA_0283     FALSE 0.013 264.000 0.000 NA   NA
 1304550 1304551 CYA_0284 CYA_0285   ispE FALSE 0.299 92.000 0.000 NA   NA
 1304551 1304552 CYA_0285 CYA_0286 ispE leuC FALSE 0.162 151.000 0.000 1.000 N NA
 1304553 1304554 CYA_0287 CYA_0288 thiD   FALSE 0.019 233.000 0.000 NA   NA
 1304554 1304555 CYA_0288 CYA_0289     FALSE 0.387 70.000 0.000 NA   NA
 1304555 1304556 CYA_0289 CYA_0290     TRUE 0.919 9.000 0.056 NA   NA
 1304556 1304557 CYA_0290 CYA_0291     TRUE 0.782 47.000 0.031 NA   NA
 1304557 1304558 CYA_0291 CYA_0292     TRUE 0.970 33.000 0.150 0.007   NA
 1304558 1304559 CYA_0292 CYA_0293   psaL-2 FALSE 0.008 385.000 0.000 1.000   NA
 1304559 1304560 CYA_0293 CYA_0294 psaL-2 psaJ TRUE 0.767 126.000 0.056 0.028   NA
 1304560 1304561 CYA_0294 CYA_0295 psaJ psaF TRUE 0.956 60.000 0.318 0.028   NA
 1304564 1304565 CYA_0298 CYA_0299 thrC-1   FALSE 0.577 94.000 0.014 1.000 N NA
 1304565 1304566 CYA_0299 CYA_0300     TRUE 0.844 37.000 0.033 1.000 N NA
 1304566 1304567 CYA_0300 CYA_0301     TRUE 0.841 18.000 0.005 1.000 N NA
 1304567 1304568 CYA_0301 CYA_0302     FALSE 0.631 17.000 0.000 NA   NA
 1304568 1304569 CYA_0302 CYA_0304     FALSE 0.005 360.000 0.000 NA   NA
 1304570 1304571 CYA_0303 CYA_0305 phrB-1 hup-1 TRUE 0.957 2.000 0.020 1.000 Y NA
 1304571 1304572 CYA_0305 CYA_0306 hup-1   FALSE 0.223 118.000 0.000 NA   NA
 1304575 1304576 CYA_0309 CYA_0310 pheT argB FALSE 0.041 204.000 0.000 1.000 N NA
 1304576 1304577 CYA_0310 CYA_0311 argB   FALSE 0.037 210.000 0.000 1.000 N NA
 1304577 1304578 CYA_0311 CYA_0312     FALSE 0.008 380.000 0.000 1.000   NA
 1304578 1304579 CYA_0312 CYA_0313     FALSE 0.443 191.000 0.404 1.000   NA
 1304579 1304580 CYA_0313 CYA_0314     TRUE 0.792 132.000 0.423 NA   NA
 1304582 1304583 CYA_0316 CYA_0317 pds crtB TRUE 0.944 77.000 0.691 1.000   NA
 1304583 1304584 CYA_0317 CYA_0319 crtB   TRUE 0.884 24.000 0.041 1.000 N NA
 1304585 1304586 CYA_0318 CYA_0320     FALSE 0.423 93.000 0.000 1.000   NA
 1304586 1304587 CYA_0320 CYA_0321     TRUE 0.926 29.000 0.077 1.000   NA
 1304587 1304588 CYA_0321 CYA_0322     TRUE 0.982 -3.000 0.360 0.057   NA
 1304589 1304590 CYA_0323 CYA_0325   gap-2 FALSE 0.033 185.000 0.000 NA N NA
 1304596 1304597 CYA_0330 CYA_0331     FALSE 0.625 108.000 0.036 1.000   NA
 1304597 1304598 CYA_0331 CYA_0332   groL-1 FALSE 0.048 204.000 0.000 1.000   NA
 1304599 1304600 CYA_0333 CYA_0334 lysS   TRUE 0.645 47.000 0.000 1.000   NA
 1304600 1304601 CYA_0334 CYA_0335   radA FALSE 0.009 363.000 0.000 1.000   NA
 1304601 1304602 CYA_0335 CYA_0336 radA aroC TRUE 0.728 53.000 0.002 1.000 N NA
 1304602 1304603 CYA_0336 CYA_0337 aroC   TRUE 0.717 55.000 0.002 1.000 N NA
 1304603 1304604 CYA_0337 CYA_0338     TRUE 0.798 -10.000 0.003 NA   NA
 1304604 1304605 CYA_0338 CYA_0339   trpB TRUE 0.833 3.000 0.007 NA   NA
 1304606 1304607 CYA_0340 CYA_0341     FALSE 0.138 144.000 0.000 NA   NA
 1304607 1304608 CYA_0341 CYA_0342     TRUE 0.944 13.000 0.125 NA   NA
 1304608 1304609 CYA_0342 CYA_0343     TRUE 0.945 0.000 0.080 1.000   NA
 1304609 1304610 CYA_0343 CYA_0344     FALSE 0.299 92.000 0.000 NA   NA
 1304611 1304612 CYA_0345 CYA_0346     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1304612 1304613 CYA_0346 CYA_0347     FALSE 0.396 68.000 0.000 NA   NA
 1304614 1304615 CYA_0348 CYA_0349     TRUE 0.814 51.000 0.031 1.000   NA
 1304615 1304616 CYA_0349 CYA_0350   nusB FALSE 0.462 120.000 0.003 1.000 N NA
 1304621 1304622 CYA_0354 CYA_0356     TRUE 0.904 3.000 0.048 NA   NA
 1304622 1304623 CYA_0356 CYA_0357     TRUE 0.680 90.000 0.048 NA   NA
 1304623 1304624 CYA_0357 CYA_0358     FALSE 0.327 83.000 0.000 NA   NA
 1304626 1304627 CYA_0359 CYA_0361 gatB   TRUE 0.697 66.000 0.002 1.000   NA
 1304627 1304628 CYA_0361 CYA_0362     FALSE 0.065 277.000 0.000 0.001   NA
 1304628 1304629 CYA_0362 CYA_0363     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304630 1304631 CYA_0364 CYA_0365   chlD FALSE 0.261 126.000 0.000 1.000 N NA
 1304631 1304632 CYA_0365 CYA_0366 chlD   FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 1304634 1304635 CYA_0368 CYA_0369 mreB mreC TRUE 0.807 61.000 0.043 1.000   NA
 1304635 1304636 CYA_0369 CYA_0370 mreC mreD TRUE 0.986 -13.000 0.550 0.004   NA
 1304636 1304637 CYA_0370 CYA_0371 mreD   FALSE 0.013 288.000 0.000 1.000 N NA
 1304638 1304639 CYA_0372 CYA_0373     FALSE 0.004 432.000 0.000 NA   NA
 1304641 1304642 CYA_0374 CYA_0376   hemE FALSE 0.421 62.000 0.000 NA   NA
 1304643 1304644 CYA_0377 CYA_0378 crtE   TRUE 0.963 -3.000 0.214 1.000   NA
 1304644 1304645 CYA_0378 CYA_0379     TRUE 0.745 43.000 0.012 NA   NA
 1304645 1304646 CYA_0379 CYA_0380     TRUE 0.774 32.000 0.009 NA   NA
 1304651 1304652 CYA_0385 CYA_0386   ribD FALSE 0.003 522.000 0.000 NA   NA
 1304653 1304654 CYA_0387 CYA_0388 pgi opcA TRUE 0.718 120.000 0.019 NA Y NA
 1304655 1304656 CYA_0389 CYA_0390     TRUE 0.924 111.000 1.000 NA   NA
 1304657 1304658 CYA_0391 CYA_0392     TRUE 0.774 1.000 0.000 1.000   NA
 1304660 1304661 CYA_0394 CYA_0396     TRUE 0.658 8.000 0.000 NA   NA
 1304662 1304663 CYA_0395 CYA_0397     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1304666 1304667 CYA_0400 CYA_0401     FALSE 0.107 199.000 0.036 NA   NA
 1304667 1304668 CYA_0401 CYA_0402     TRUE 0.689 25.000 0.000 1.000 N NA
 1304669 1304670 CYA_0403 CYA_0404     FALSE 0.259 105.000 0.000 NA   NA
 1304670 1304671 CYA_0404 CYA_0405   panE-1 TRUE 0.704 63.000 0.027 NA   NA
 1304671 1304672 CYA_0405 CYA_0406 panE-1 pyrR TRUE 0.718 58.000 0.009 1.000 N NA
 1304675 1304676 CYA_0409 CYA_0410 rpoB rpoC1 TRUE 0.982 100.000 0.851 0.002 Y NA
 1304676 1304677 CYA_0410 CYA_0411 rpoC1 rpoC2 TRUE 0.921 90.000 0.031 0.002 Y NA
 1304677 1304678 CYA_0411 CYA_0412 rpoC2   TRUE 0.766 -19.000 0.010 NA N NA
 1304679 1304680 CYA_0413 CYA_0414     FALSE 0.045 208.000 0.000 1.000   NA
 1304680 1304681 CYA_0414 CYA_0415     TRUE 0.902 134.000 0.659 0.031   NA
 1304681 1304682 CYA_0415 CYA_0416     FALSE 0.094 157.000 0.000 NA   NA
 1304685 1304686 CYA_0419 CYA_0420 gvpV atpD FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 1304687 1304688 CYA_0421 CYA_0422     TRUE 0.869 4.000 0.002 1.000   NA
 1304689 1304690 CYA_0423 CYA_0424   cobD-1 TRUE 0.836 23.000 0.034 NA N NA
 1304691 1304692 CYA_0425 CYA_0426     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304692 1304693 CYA_0426 CYA_0427   rca FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 1304696 1304697 CYA_0430 CYA_0431     TRUE 0.867 31.000 0.048 NA   NA
 1304697 1304698 CYA_0431 CYA_0432     FALSE 0.208 122.000 0.000 NA   NA
 1304698 1304699 CYA_0432 CYA_0433     FALSE 0.073 165.000 0.000 NA   NA
 1304700 1304701 CYA_0434 CYA_0435     TRUE 0.948 68.000 0.667 1.000 N NA
 1304701 1304702 CYA_0435 CYA_0436     FALSE 0.049 171.000 0.000 NA N NA
 1304703 1304704 CYA_0437 CYA_0438     FALSE 0.101 154.000 0.000 NA   NA
 1304705 1304706 CYA_0439 CYA_0440     FALSE 0.577 31.000 0.000 NA   NA
 1304706 1304707 CYA_0440 CYA_0441     TRUE 0.879 5.000 0.035 NA   NA
 1304707 1304708 CYA_0441 CYA_0442     TRUE 0.894 0.000 0.044 NA   NA
 1304708 1304709 CYA_0442 CYA_0443     TRUE 0.963 65.000 1.000 NA   NA
 1304709 1304710 CYA_0443 CYA_0444     TRUE 0.973 51.000 1.000 NA   NA
 1304710 1304711 CYA_0444 CYA_0445     FALSE 0.003 493.000 0.000 NA   NA
 1304711 1304712 CYA_0445 CYA_0446     FALSE 0.082 161.000 0.000 NA   NA
 1304713 1304714 CYA_0447 CYA_0448     TRUE 0.891 47.000 0.071 1.000 N NA
 1304714 1304715 CYA_0448 CYA_0449     TRUE 0.979 -7.000 0.750 NA   NA
 1304720 1304721 CYA_0454 CYA_0455     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304722 1304723 CYA_0456 CYA_0457   nusA TRUE 0.727 160.000 0.759 NA   NA
 1304723 1304724 CYA_0457 CYA_0458 nusA   FALSE 0.553 56.000 0.000 1.000 N NA
 1304726 1304727 CYA_0460 CYA_0461   cobH-1 FALSE 0.615 -10.000 0.000 NA   NA
 1304727 1304728 CYA_0461 CYA_0462 cobH-1   TRUE 0.980 7.000 0.667 NA   NA
 1304728 1304729 CYA_0462 CYA_0463   cbiE/cbiT TRUE 0.837 1.000 0.012 NA   NA
 1304731 1304732 CYA_0465 CYA_0466 sfsA xth FALSE 0.600 25.000 0.000 NA   NA
 1304732 1304733 CYA_0466 CYA_0467 xth msrA FALSE 0.422 82.000 0.000 1.000 N NA
 1304734 1304735 CYA_0468 CYA_0469 cysW cysT TRUE 0.976 -10.000 0.156 0.001 N NA
 1304735 1304736 CYA_0469 CYA_0470 cysT cysA TRUE 0.861 7.000 0.010 1.000 N NA
 1304736 1304737 CYA_0470 CYA_0471 cysA sbp FALSE 0.575 175.000 0.010 0.001 Y NA
 1304737 1304738 CYA_0471 CYA_0472 sbp   FALSE 0.328 109.000 0.000 1.000 N NA
 1304738 1304739 CYA_0472 CYA_0473   adhE TRUE 0.967 26.000 0.071 1.000 Y NA
 1304739 1304740 CYA_0473 CYA_0474 adhE   FALSE 0.621 91.000 0.022 1.000 N NA
 1304740 1304741 CYA_0474 CYA_0475   pflA FALSE 0.335 182.000 0.007 1.000 Y NA
 1304741 1304742 CYA_0475 CYA_0476 pflA   FALSE 0.080 162.000 0.000 NA   NA
 1304742 1304743 CYA_0476 CYA_0477   pflB FALSE 0.605 88.000 0.027 NA   NA
 1304745 1304746 CYA_0479 CYA_0480     FALSE 0.011 312.000 0.000 1.000 N NA
 1304747 1304748 CYA_0481 CYA_0482   gcvH TRUE 0.648 79.000 0.006 1.000   NA
 1304749 1304750 CYA_0483 CYA_0484     FALSE 0.024 245.000 0.000 1.000 N NA
 1304750 1304751 CYA_0484 CYA_0485     TRUE 0.965 -3.000 0.047 1.000 Y NA
 1304752 1304753 CYA_0486 CYA_0487     FALSE 0.006 347.000 0.000 NA   NA
 1304753 1304754 CYA_0487 CYA_0488     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 1304756 1304757 CYA_0490 CYA_0491 ruvA nadD TRUE 0.846 -3.000 0.002 1.000 N NA
 1304760 1304761 CYA_0494 CYA_0495     TRUE 0.881 3.000 0.036 NA   NA
 1304761 1304762 CYA_0495 CYA_0496     FALSE 0.335 133.000 0.002 NA   NA
 1304762 1304763 CYA_0496 CYA_0497     FALSE 0.456 118.000 0.019 NA   NA
 1304763 1304764 CYA_0497 CYA_0498     TRUE 0.878 58.000 0.118 NA   NA
 1304764 1304765 CYA_0498 CYA_0499     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304766 1304767 CYA_0500 CYA_0501     FALSE 0.002 848.000 0.000 NA   NA
 1304768 1304769 CYA_0502 CYA_0503     FALSE 0.008 296.000 0.000 NA   NA
 1304769 1304770 CYA_0503 CYA_0504   hisIE TRUE 0.737 41.000 0.002 NA   NA
 1304770 1304771 CYA_0504 CYA_0505 hisIE   FALSE 0.019 261.000 0.000 1.000 N NA
 1304771 1304772 CYA_0505 CYA_0506     FALSE 0.007 405.000 0.000 1.000   NA
 1304773 1304774 CYA_0507 CYA_0509     FALSE 0.070 167.000 0.000 NA   NA
 1304774 1304775 CYA_0509 CYA_0510     FALSE 0.002 930.000 0.000 NA   NA
 1304776 1304777 CYA_0511 CYA_0512   valS FALSE 0.024 255.000 0.000 1.000   NA
 1304778 1304779 CYA_0513 CYA_0514     FALSE 0.562 35.000 0.000 NA   NA
 1304779 1304780 CYA_0514 CYA_0515     FALSE 0.535 -148.000 0.000 NA   NA
 1304781 1304782 CYA_0516 CYA_0517 cdsA   FALSE 0.592 -19.000 0.000 NA   NA
 1304783 1304784 CYA_0518 CYA_0519     FALSE 0.523 44.000 0.000 NA   NA
 1304784 1304785 CYA_0519 CYA_0520     FALSE 0.131 221.000 0.000 1.000 Y NA
 1304786 1304787 CYA_0521 CYA_0522     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 1304787 1304788 CYA_0522 CYA_0523     TRUE 0.980 17.000 0.667 1.000   NA
 1304788 1304789 CYA_0523 CYA_0524     TRUE 0.898 23.000 0.000 0.007   NA
 1304789 1304790 CYA_0524 CYA_0525   bchJ FALSE 0.602 55.000 0.000 1.000   NA
 1304790 1304791 CYA_0525 CYA_0526 bchJ   FALSE 0.099 173.000 0.000 1.000   NA
 1304794 1304795 CYA_0529 CYA_0530 cobA/hemD menB TRUE 0.928 37.000 0.005 1.000 Y NA
 1304795 1304796 CYA_0530 CYA_0531 menB polA FALSE 0.614 45.000 0.000 1.000 N NA
 1304796 1304797 CYA_0531 CYA_0532 polA grxC TRUE 0.669 66.000 0.002 1.000 N NA
 1304798 1304799 CYA_0533 CYA_0534     FALSE 0.123 149.000 0.000 NA   NA
 1304799 1304800 CYA_0534 CYA_0535     TRUE 0.770 10.000 0.000 1.000   NA
 1304803 1304804 CYA_0538 CYA_0539     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304806 1304807 CYA_0541 CYA_0542   glpX FALSE 0.409 65.000 0.000 NA   NA
 1304807 1304808 CYA_0542 CYA_0543 glpX hemA FALSE 0.032 319.000 0.038 1.000 N NA
 1304808 1304809 CYA_0543 CYA_0544 hemA   FALSE 0.521 113.000 0.003 1.000   NA
 1304809 1304810 CYA_0544 CYA_0545   typA FALSE 0.134 184.000 0.002 1.000   NA
 1304811 1304812 CYA_0546 CYA_0547   cinA TRUE 0.809 38.000 0.004 1.000   NA
 1304812 1304813 CYA_0547 CYA_0548 cinA   FALSE 0.316 122.000 0.000 1.000   NA
 1304813 1304814 CYA_0548 CYA_0549     FALSE 0.446 88.000 0.000 1.000   NA
 1304818 1304819 CYA_0552 CYA_0554     TRUE 0.690 65.000 0.026 NA   NA
 1304819 1304820 CYA_0554 CYA_0555     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 1304823 1304824 CYA_0558 CYA_0559   bolA TRUE 0.810 9.000 0.007 NA N NA
 1304824 1304825 CYA_0559 CYA_0560 bolA   FALSE 0.005 364.000 0.000 NA   NA
 1304828 1304829 CYA_0563 CYA_0564 dnaX   FALSE 0.310 89.000 0.000 NA   NA
 1304829 1304830 CYA_0564 CYA_0565   coaE FALSE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 1304830 1304831 CYA_0565 CYA_0566 coaE   FALSE 0.520 100.000 0.002 1.000 N NA
 1304831 1304832 CYA_0566 CYA_0567     TRUE 0.803 -10.000 0.006 NA   NA
 1304833 1304834 CYA_0568 CYA_0569     TRUE 0.721 48.000 0.008 NA   NA
 1304834 1304835 CYA_0569 CYA_0570     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 1304836 1304837 CYA_0571 CYA_0572     TRUE 0.981 32.000 1.000 NA   NA
 1304837 1304838 CYA_0572 CYA_0573     TRUE 0.946 87.000 1.000 NA   NA
 1304839 1304840 CYA_0574 CYA_0575   speE TRUE 0.973 29.000 0.125 1.000 Y NA
 1304840 1304841 CYA_0575 CYA_0577 speE   FALSE 0.554 100.000 0.014 1.000 N NA
 1304842 1304843 CYA_0576 CYA_0578     TRUE 0.880 50.000 0.087 NA   NA
 1304843 1304844 CYA_0578 CYA_0579     FALSE 0.063 171.000 0.000 NA   NA
 1304844 1304845 CYA_0579 CYA_0580     FALSE 0.017 240.000 0.000 NA   NA
 1304845 1304846 CYA_0580 CYA_0581     TRUE 0.915 46.000 0.149 NA   NA
 1304846 1304847 CYA_0581 CYA_0582   lepA TRUE 0.838 -7.000 0.003 1.000 N NA
 1304847 1304848 CYA_0582 CYA_0583 lepA   FALSE 0.012 267.000 0.000 NA   NA
 1304848 1304849 CYA_0583 CYA_0584   glyQ FALSE 0.270 148.000 0.005 NA   NA
 1304849 1304850 CYA_0584 CYA_0585 glyQ   TRUE 0.768 46.000 0.003 1.000 N NA
 1304850 1304851 CYA_0585 CYA_0586     TRUE 0.736 60.000 0.012 1.000   NA
 1304852 1304853 CYA_0587 CYA_0588     TRUE 0.692 54.000 0.005 NA   NA
 1304853 1304854 CYA_0588 CYA_0589     TRUE 0.765 35.000 0.005 NA   NA
 1304854 1304855 CYA_0589 CYA_0590     FALSE 0.285 161.000 0.045 NA   NA
 1304855 1304856 CYA_0590 CYA_0591   hisD FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 1304856 1304857 CYA_0591 CYA_0592 hisD   FALSE 0.075 164.000 0.000 NA   NA
 1304857 1304858 CYA_0592 CYA_0593     TRUE 0.817 97.000 0.200 NA   NA
 1304858 1304859 CYA_0593 CYA_0594     TRUE 0.974 25.000 0.667 NA   NA
 1304859 1304860 CYA_0594 CYA_0595     FALSE 0.009 360.000 0.000 1.000   NA
 1304860 1304861 CYA_0595 CYA_0596     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1304861 1304862 CYA_0596 CYA_0597     FALSE 0.170 121.000 0.000 NA N NA
 1304863 1304864 CYA_0598 CYA_0599     FALSE 0.068 168.000 0.000 NA   NA
 1304865 1304866 CYA_0600 CYA_0601     TRUE 0.657 9.000 0.000 NA   NA
 1304866 1304867 CYA_0601 CYA_0603   ureC TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1304867 1304868 CYA_0603 CYA_0604 ureC ureE TRUE 0.953 8.000 0.029 0.002 N NA
 1304868 1304869 CYA_0604 CYA_0605 ureE ureF TRUE 0.994 7.000 0.460 0.004 Y NA
 1304869 1304870 CYA_0605 CYA_0606 ureF ureG TRUE 0.976 12.000 0.016 0.004 Y NA
 1304870 1304871 CYA_0606 CYA_0607 ureG   TRUE 0.974 17.000 0.018 0.004 Y NA
 1304873 1304874 CYA_0609 CYA_0610     FALSE 0.004 440.000 0.000 NA   NA
 1304876 1304877 CYA_0612 CYA_0613 nirA nrtA TRUE 0.941 62.000 0.128 NA Y NA
 1304877 1304878 CYA_0613 CYA_0614 nrtA ntrB-1 TRUE 0.936 134.000 0.915 NA Y NA
 1304878 1304879 CYA_0614 CYA_0615 ntrB-1 ntrC-1 TRUE 0.945 73.000 0.043 0.003 Y NA
 1304879 1304880 CYA_0615 CYA_0616 ntrC-1 ntrD-1 TRUE 0.992 39.000 0.667 0.003 Y NA
 1304880 1304881 CYA_0616 CYA_0618 ntrD-1   TRUE 0.696 34.000 0.000 1.000   NA
 1304883 1304884 CYA_0619 CYA_0621 narB   TRUE 0.878 25.000 0.048 NA   NA
 1304885 1304886 CYA_0620 CYA_0622   purD FALSE 0.003 461.000 0.000 NA N NA
 1304886 1304887 CYA_0622 CYA_0623 purD   FALSE 0.327 126.000 0.002 NA N NA
 1304887 1304888 CYA_0623 CYA_0624     FALSE 0.374 127.000 0.007 NA   NA
 1304890 1304891 CYA_0626 CYA_0627   dapA FALSE 0.275 254.000 0.605 1.000   NA
 1304892 1304893 CYA_0628 CYA_0629     FALSE 0.036 192.000 0.000 NA   NA
 1304894 1304895 CYA_0630 CYA_0631 trpD   FALSE 0.582 30.000 0.000 NA   NA
 1304895 1304896 CYA_0631 CYA_0632   purN TRUE 0.783 27.000 0.003 NA   NA
 1304897 1304898 CYA_0633 CYA_0634   aat TRUE 0.858 17.000 0.004 1.000   NA
 1304898 1304899 CYA_0634 CYA_0635 aat   FALSE 0.299 92.000 0.000 NA   NA
 1304899 1304900 CYA_0635 CYA_0637   sasA FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 1304901 1304902 CYA_0636 CYA_0638     TRUE 0.785 135.000 0.455 NA   NA
 1304902 1304903 CYA_0638 CYA_0639     TRUE 0.972 46.000 0.857 NA   NA
 1304903 1304904 CYA_0639 CYA_0640     TRUE 0.993 41.000 0.714 0.005 Y NA
 1304904 1304905 CYA_0640 CYA_0641     FALSE 0.175 132.000 0.000 NA   NA
 1304905 1304906 CYA_0641 CYA_0642   psbM FALSE 0.434 60.000 0.000 NA   NA
 1304906 1304907 CYA_0642 CYA_0643 psbM   TRUE 0.858 81.000 0.139 1.000   NA
 1304908 1304909 CYA_0644 CYA_0645 psbB psbT TRUE 0.929 114.000 0.651 0.090   NA
 1304909 1304910 CYA_0645 CYA_0647 psbT   FALSE 0.008 398.000 0.000 1.000   NA
 1304911 1304912 CYA_0646 CYA_0648 purQ purS TRUE 0.990 53.000 0.656 0.002 Y NA
 1304913 1304914 CYA_0649 CYA_0651   comB FALSE 0.509 47.000 0.000 NA   NA
 1304916 1304917 CYA_0652 CYA_0653 argC   TRUE 0.761 -66.000 0.003 NA   NA
 1304917 1304918 CYA_0653 CYA_0654     FALSE 0.019 231.000 0.000 NA   NA
 1304918 1304919 CYA_0654 CYA_0655     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 1304919 1304920 CYA_0655 CYA_0656   clpC FALSE 0.217 120.000 0.000 NA   NA
 1304920 1304921 CYA_0656 CYA_0657 clpC   TRUE 0.659 149.000 0.039 1.000 Y NA
 1304921 1304922 CYA_0657 CYA_0658     TRUE 0.746 18.000 0.000 1.000   NA
 1304922 1304923 CYA_0658 CYA_0659     TRUE 0.717 28.000 0.000 1.000   NA
 1304923 1304924 CYA_0659 CYA_0660     FALSE 0.570 120.000 0.048 NA   NA
 1304926 1304927 CYA_0662 CYA_0664     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 1304928 1304929 CYA_0663 CYA_0665     FALSE 0.002 649.000 0.000 NA   NA
 1304929 1304930 CYA_0665 CYA_0666     FALSE 0.180 131.000 0.000 NA   NA
 1304930 1304931 CYA_0666 CYA_0667     TRUE 0.787 50.000 0.016 1.000   NA
 1304931 1304932 CYA_0667 CYA_0668   zds FALSE 0.272 132.000 0.000 1.000   NA
 1304932 1304933 CYA_0668 CYA_0669 zds   TRUE 0.653 11.000 0.000 NA   NA
 1304935 1304936 CYA_0671 CYA_0672     TRUE 0.808 40.000 0.019 1.000 N NA
 1304936 1304937 CYA_0672 CYA_0673     TRUE 0.704 71.000 0.016 1.000   NA
 1304938 1304939 CYA_0675 CYA_0676 mgtE-1   TRUE 0.947 30.000 0.250 NA   NA
 1304939 1304940 CYA_0676 CYA_0677     TRUE 0.777 35.000 0.014 NA   NA
 1304942 1304943 CYA_0679 CYA_0680     FALSE 0.608 23.000 0.000 NA   NA
 1304943 1304944 CYA_0680 CYA_0682     FALSE 0.010 282.000 0.000 NA   NA
 1304945 1304946 CYA_0681 CYA_0683     FALSE 0.337 135.000 0.010 NA   NA
 1304946 1304947 CYA_0683 CYA_0684     TRUE 0.787 50.000 0.016 1.000   NA
 1304948 1304949 CYA_0685 CYA_0686     TRUE 0.920 114.000 0.095 0.029 Y NA
 1304949 1304950 CYA_0686 CYA_0687     FALSE 0.002 536.000 0.000 NA N NA
 1304950 1304951 CYA_0687 CYA_0688     FALSE 0.204 153.000 0.004 NA N NA
 1304951 1304952 CYA_0688 CYA_0689     FALSE 0.355 140.000 0.004 1.000 N NA
 1304953 1304954 CYA_0690 CYA_0691     FALSE 0.009 286.000 0.000 NA   NA
 1304956 1304957 CYA_0692 CYA_0694 lipA-1   FALSE 0.021 222.000 0.000 NA   NA
 1304957 1304958 CYA_0694 CYA_0695     FALSE 0.003 466.000 0.000 NA   NA
 1304959 1304960 CYA_0696 CYA_0697     FALSE 0.592 -19.000 0.000 NA   NA
 1304960 1304961 CYA_0697 CYA_0698     FALSE 0.013 262.000 0.000 NA   NA
 1304961 1304962 CYA_0698 CYA_0699     FALSE 0.252 108.000 0.000 NA   NA
 1304962 1304963 CYA_0699 CYA_0700     FALSE 0.208 122.000 0.000 NA   NA
 1304963 1304964 CYA_0700 CYA_0701     TRUE 0.656 93.000 0.047 NA   NA
 1304965 1304966 CYA_0702 CYA_0703   frr-1 FALSE 0.115 236.000 0.000 1.000 Y NA
 1304968 1304969 CYA_0704 CYA_0706     TRUE 0.953 77.000 1.000 NA   NA
 1304973 1304974 CYA_0710 CYA_0711 argG   FALSE 0.011 272.000 0.000 NA   NA
 1304975 1304976 CYA_0712 CYA_0714   lipA-2 FALSE 0.342 79.000 0.000 NA   NA
 1304978 1304979 CYA_0715 CYA_0716     FALSE 0.600 25.000 0.000 NA   NA
 1304979 1304980 CYA_0716 CYA_0717     FALSE 0.270 100.000 0.000 NA   NA
 1304980 1304981 CYA_0717 CYA_0718   aroQ TRUE 0.954 -22.000 0.333 NA   NA
 1304984 1304985 CYA_0720 CYA_0722     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA   NA
 1304985 1304986 CYA_0722 CYA_0723     TRUE 0.966 -3.000 0.379 NA   NA
 1304986 1304987 CYA_0723 CYA_0724     TRUE 0.866 50.000 0.069 NA   NA
 1304987 1304988 CYA_0724 CYA_0725   tal TRUE 0.940 18.000 0.087 1.000   NA
 1304988 1304989 CYA_0725 CYA_0726 tal   FALSE 0.186 115.000 0.000 NA N NA
 1304989 1304990 CYA_0726 CYA_0727     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1304990 1304991 CYA_0727 CYA_0728   cas2-2 FALSE 0.002 622.000 0.000 NA   NA
 11460156 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1909.000 0.000 NA   NA
 11602519 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1909.000 0.000 NA   NA
 11744911 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1909.000 0.000 NA   NA
 11460157 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1938.000 0.000 NA   NA
 11602520 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1938.000 0.000 NA   NA
 11744912 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1938.000 0.000 NA   NA
 11460158 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1973.000 0.000 NA   NA
 11602521 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1973.000 0.000 NA   NA
 11744913 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 1973.000 0.000 NA   NA
 11460159 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2001.000 0.000 NA   NA
 11602522 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2001.000 0.000 NA   NA
 11744914 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2001.000 0.000 NA   NA
 11460160 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11602523 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11744915 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11460161 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2064.000 0.000 NA   NA
 11602524 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2064.000 0.000 NA   NA
 11744916 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2064.000 0.000 NA   NA
 11460162 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2099.000 0.000 NA   NA
 11602525 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2099.000 0.000 NA   NA
 11744917 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2099.000 0.000 NA   NA
 11460163 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2127.000 0.000 NA   NA
 11602526 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2127.000 0.000 NA   NA
 11744918 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2127.000 0.000 NA   NA
 11460164 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2163.000 0.000 NA   NA
 11602527 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2163.000 0.000 NA   NA
 11744919 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2163.000 0.000 NA   NA
 11460165 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11602528 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11744920 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11460166 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2227.000 0.000 NA   NA
 11602529 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2227.000 0.000 NA   NA
 11744921 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2227.000 0.000 NA   NA
 11460167 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2255.000 0.000 NA   NA
 11602530 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2255.000 0.000 NA   NA
 11744922 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2255.000 0.000 NA   NA
 11460168 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2290.000 0.000 NA   NA
 11602531 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2290.000 0.000 NA   NA
 11744923 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2290.000 0.000 NA   NA
 11460169 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2318.000 0.000 NA   NA
 11602532 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2318.000 0.000 NA   NA
 11744924 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2318.000 0.000 NA   NA
 11460170 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2354.000 0.000 NA   NA
 11602533 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2354.000 0.000 NA   NA
 11744925 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2354.000 0.000 NA   NA
 11460171 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2382.000 0.000 NA   NA
 11602534 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2382.000 0.000 NA   NA
 11744926 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2382.000 0.000 NA   NA
 11460172 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2418.000 0.000 NA   NA
 11602535 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2418.000 0.000 NA   NA
 11744927 1304988   CYA_0725   tal FALSE NA 2418.000 0.000 NA   NA
 1304991 1304992 CYA_0728 CYA_0729 cas2-2 cas1-1 TRUE 0.941 0.000 0.100 NA   NA
 1304992 1304993 CYA_0729 CYA_0730 cas1-1 cse3 TRUE 0.969 27.000 0.589 NA   NA
 1304993 1304994 CYA_0730 CYA_0731 cse3 cas5e TRUE 0.965 -18.000 0.444 NA   NA
 1304994 1304995 CYA_0731 CYA_0732 cas5e cse4 TRUE 0.960 4.000 0.224 NA   NA
 1304995 1304996 CYA_0732 CYA_0733 cse4 cse2 TRUE 0.744 67.000 0.043 NA   NA
 1304996 1304997 CYA_0733 CYA_0734 cse2 cse1 TRUE 0.954 12.000 0.190 NA   NA
 1304997 1304998 CYA_0734 CYA_0735 cse1 cas3 TRUE 0.949 17.000 0.179 NA   NA
 1304998 1304999 CYA_0735 CYA_0736 cas3   TRUE 0.874 3.000 0.032 NA   NA
 1305000 1305001 CYA_0737 CYA_0739     FALSE 0.002 751.000 0.000 NA   NA
 1305002 1305003 CYA_0738 CYA_0740     FALSE 0.073 165.000 0.000 NA   NA
 1305004 1305005 CYA_0741 CYA_0742 ppsA   TRUE 0.668 70.000 0.007 1.000 N NA
 1305005 1305006 CYA_0742 CYA_0743     FALSE 0.003 531.000 0.000 NA   NA
 1305007 1305008 CYA_0744 CYA_0745     TRUE 0.987 36.000 0.242 0.009 Y NA
 1305008 1305009 CYA_0745 CYA_0746     TRUE 0.659 62.000 0.013 NA   NA
 1305009 1305010 CYA_0746 CYA_0747     TRUE 0.778 31.000 0.010 NA   NA
 1305012 1305013 CYA_0749 CYA_0750     TRUE 0.935 74.000 0.667 NA   NA
 1305014 1305015 CYA_0751 CYA_0753   ureD TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305015 1305016 CYA_0753 CYA_0754 ureD   TRUE 0.760 38.000 0.012 NA   NA
 1305016 1305017 CYA_0754 CYA_0755     FALSE 0.492 50.000 0.000 NA   NA
 1305018 1305019 CYA_0756 CYA_0757     FALSE 0.033 197.000 0.000 NA   NA
 1305019 1305020 CYA_0757 CYA_0758     FALSE 0.628 -6.000 0.000 NA   NA
 1305020 1305021 CYA_0758 CYA_0759   ftsY FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 1305021 1305022 CYA_0759 CYA_0760 ftsY purU FALSE 0.372 95.000 0.000 1.000 N NA
 1305022 1305023 CYA_0760 CYA_0761 purU tatA-1 FALSE 0.012 302.000 0.000 1.000 N NA
 1305025 1305026 CYA_0763 CYA_0764     TRUE 0.920 35.000 0.133 NA N NA
 1305026 1305027 CYA_0764 CYA_0765     TRUE 0.737 10.000 0.000 1.000 N NA
 1305027 1305028 CYA_0765 CYA_0766     FALSE 0.094 157.000 0.000 NA   NA
 1305028 1305029 CYA_0766 CYA_0767     FALSE 0.573 32.000 0.000 NA   NA
 1305029 1305030 CYA_0767 CYA_0768   sixA FALSE 0.015 231.000 0.000 NA N NA
 1305031 1305032 CYA_0769 CYA_0770 trx-1   FALSE 0.452 131.000 0.036 NA   NA
 1305032 1305033 CYA_0770 CYA_0771   trpF TRUE 0.793 23.000 0.003 NA   NA
 1305034 1305035 CYA_0772 CYA_0773     FALSE 0.534 110.000 0.005 1.000   NA
 1305035 1305036 CYA_0773 CYA_0774     TRUE 0.732 45.000 0.005 NA   NA
 1305038 1305039 CYA_0776 CYA_0777 rbfA   FALSE 0.050 194.000 0.000 1.000 N NA
 1305040 1305041 CYA_0778 CYA_0779     FALSE 0.565 -61.000 0.000 NA   NA
 1305041 1305042 CYA_0779 CYA_0780   phrB-2 TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305043 1305044 CYA_0781 CYA_0782     FALSE 0.011 248.000 0.000 NA N NA
 1305044 1305045 CYA_0782 CYA_0783     FALSE 0.175 132.000 0.000 NA   NA
 1305047 1305048 CYA_0785 CYA_0786     FALSE 0.445 58.000 0.000 NA   NA
 1305049 1305050 CYA_0787 CYA_0788 dnaK-2 dnaJ TRUE 0.940 117.000 0.196 0.008 Y NA
 1305050 1305051 CYA_0788 CYA_0789 dnaJ   TRUE 0.972 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 1305051 1305052 CYA_0789 CYA_0790   rsgA TRUE 0.933 -3.000 0.058 1.000   NA
 1305052 1305053 CYA_0790 CYA_0791 rsgA   FALSE 0.165 135.000 0.000 NA   NA
 1305053 1305054 CYA_0791 CYA_0792     FALSE 0.607 -13.000 0.000 NA   NA
 1305054 1305055 CYA_0792 CYA_0793     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 1305055 1305056 CYA_0793 CYA_0794     FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 1305056 1305057 CYA_0794 CYA_0795     TRUE 0.909 96.000 0.036 0.008 Y NA
 1305057 1305058 CYA_0795 CYA_0796     TRUE 0.925 65.000 0.055 1.000 Y NA
 1305059 1305060 CYA_0797 CYA_0798   rnhA FALSE 0.414 64.000 0.000 NA   NA
 1305060 1305061 CYA_0798 CYA_0799 rnhA   FALSE 0.007 417.000 0.000 1.000   NA
 1305061 1305062 CYA_0799 CYA_0800     FALSE 0.120 199.000 0.024 1.000   NA
 1305062 1305063 CYA_0800 CYA_0801     TRUE 0.990 12.000 0.179 0.004 Y NA
 1305063 1305064 CYA_0801 CYA_0802   clpX FALSE 0.616 77.000 0.002 1.000 N NA
 1305064 1305065 CYA_0802 CYA_0803 clpX ligA FALSE 0.008 543.000 0.004 1.000 N NA
 1305065 1305066 CYA_0803 CYA_0804 ligA rnc FALSE 0.074 238.000 0.000 0.030 N NA
 1305068 1305069 CYA_0806 CYA_0807     TRUE 0.663 3.000 0.000 NA   NA
 1305069 1305070 CYA_0807 CYA_0808     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1305070 1305071 CYA_0808 CYA_0809   mutY FALSE 0.463 152.000 0.000 1.000 Y NA
 1305071 1305072 CYA_0809 CYA_0810 mutY   FALSE 0.003 586.000 0.000 NA   NA
 1305073 1305074 CYA_0811 CYA_0812     FALSE 0.386 103.000 0.000 1.000   NA
 1305074 1305075 CYA_0812 CYA_0813     FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 1305075 1305076 CYA_0813 CYA_0814     FALSE 0.327 83.000 0.000 NA   NA
 1305076 1305077 CYA_0814 CYA_0815   aspC TRUE 0.803 44.000 0.035 NA   NA
 1305077 1305078 CYA_0815 CYA_0816 aspC   FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 1305078 1305079 CYA_0816 CYA_0817   prfC FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 1305079 1305080 CYA_0817 CYA_0818 prfC cefD FALSE 0.022 219.000 0.000 NA   NA
 1305080 1305081 CYA_0818 CYA_0819 cefD   TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305081 1305082 CYA_0819 CYA_0820     FALSE 0.533 42.000 0.000 NA   NA
 1305082 1305083 CYA_0820 CYA_0821     FALSE 0.003 1026.000 0.000 1.000 N NA
 1305083 1305084 CYA_0821 CYA_0822   rnhB TRUE 0.877 59.000 0.033 0.021 N NA
 1305084 1305085 CYA_0822 CYA_0823 rnhB   FALSE 0.626 18.000 0.000 NA   NA
 1305086 1305087 CYA_0824 CYA_0825   gvpJ FALSE 0.356 76.000 0.000 NA   NA
 1305087 1305088 CYA_0825 CYA_0826 gvpJ gvpN TRUE 0.895 40.000 0.054 1.000   NA
 1305088 1305089 CYA_0826 CYA_0827 gvpN gvpC TRUE 0.880 89.000 0.054 0.002   NA
 1305089 1305090 CYA_0827 CYA_0828 gvpC   FALSE 0.004 409.000 0.000 NA   NA
 1305090 1305091 CYA_0828 CYA_0829   gvpA FALSE 0.427 61.000 0.000 NA   NA
 1305092 1305093 CYA_0830 CYA_0831     FALSE 0.110 152.000 0.000 NA   NA
 1305093 1305094 CYA_0831 CYA_0832     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305094 1305095 CYA_0832 CYA_0833     TRUE 0.969 46.000 0.786 NA   NA
 1305095 1305096 CYA_0833 CYA_0834     TRUE 0.967 57.000 0.800 1.000   NA
 1305096 1305097 CYA_0834 CYA_0836   aroH FALSE 0.609 92.000 0.012 1.000   NA
 1305100 1305101 CYA_0838 CYA_0839 ppc   FALSE 0.204 123.000 0.000 NA   NA
 1305104 1305105 CYA_0842 CYA_0843     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 1305105 1305106 CYA_0843 CYA_0844   map-1 FALSE 0.091 189.000 0.007 NA   NA
 1305106 1305107 CYA_0844 CYA_0845 map-1   TRUE 0.951 7.000 0.111 1.000 N NA
 1305108 1305109 CYA_0846 CYA_0847   murG FALSE 0.357 140.000 0.006 1.000 N NA
 1305109 1305110 CYA_0847 CYA_0848 murG   TRUE 0.830 8.000 0.006 NA   NA
 1305110 1305111 CYA_0848 CYA_0849     TRUE 0.966 30.000 0.521 NA   NA
 1305112 1305113 CYA_0850 CYA_0851     FALSE 0.004 429.000 0.000 NA   NA
 1305113 1305114 CYA_0851 CYA_0852   accC FALSE 0.004 396.000 0.000 NA   NA
 1305114 1305115 CYA_0852 CYA_0853 accC   FALSE 0.235 161.000 0.016 1.000 N NA
 1305116 1305117 CYA_0854 CYA_0855     TRUE 0.641 15.000 0.000 NA   NA
 1305117 1305118 CYA_0855 CYA_0856     TRUE 0.976 -9.000 0.667 NA   NA
 1305118 1305119 CYA_0856 CYA_0857     FALSE 0.007 326.000 0.000 NA   NA
 1305119 1305120 CYA_0857 CYA_0858     FALSE 0.509 47.000 0.000 NA   NA
 1305121 1305122 CYA_0859 CYA_0860 speB   FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 1305122 1305123 CYA_0860 CYA_0861     FALSE 0.028 574.000 0.194 NA   NA
 1305123 1305124 CYA_0861 CYA_0863   proC TRUE 0.960 6.000 0.224 NA   NA
 1305125 1305126 CYA_0862 CYA_0864     FALSE 0.589 50.000 0.000 1.000 N NA
 1305126 1305127 CYA_0864 CYA_0865     FALSE 0.573 32.000 0.000 NA   NA
 1305127 1305128 CYA_0865 CYA_0866     TRUE 0.662 1.000 0.000 NA   NA
 1305128 1305129 CYA_0866 CYA_0867     FALSE 0.026 208.000 0.000 NA   NA
 1305130 1305131 CYA_0868 CYA_0869   hemF FALSE 0.399 122.000 0.004 NA   NA
 1305131 1305132 CYA_0869 CYA_0870 hemF   TRUE 0.772 32.000 0.004 NA   NA
 1305132 1305133 CYA_0870 CYA_0872     FALSE 0.368 74.000 0.000 NA   NA
 1305134 1305135 CYA_0871 CYA_0873     TRUE 0.920 54.000 0.250 NA   NA
 1305135 1305136 CYA_0873 CYA_0874     TRUE 0.961 11.000 0.250 NA   NA
 1305136 1305137 CYA_0874 CYA_0875     TRUE 0.963 -3.000 0.333 NA   NA
 1305137 1305138 CYA_0875 CYA_0876     TRUE 0.980 -3.000 0.714 NA   NA
 1305138 1305139 CYA_0876 CYA_0877     TRUE 0.950 55.000 0.130 NA Y NA
 1305139 1305140 CYA_0877 CYA_0878     TRUE 0.658 8.000 0.000 NA   NA
 1305140 1305141 CYA_0878 CYA_0879     TRUE 0.663 4.000 0.000 NA   NA
 1305141 1305142 CYA_0879 CYA_0880   csx10 TRUE 0.976 -3.000 0.600 NA   NA
 1305142 1305143 CYA_0880 CYA_0881 csx10   TRUE 0.977 0.000 0.600 NA   NA
 1305143 1305144 CYA_0881 CYA_0882   crm2-1 TRUE 0.978 0.000 0.625 NA   NA
 1305146 1305147 CYA_0884 CYA_0885   cas2-3 FALSE 0.002 3530.000 0.000 NA   NA
 11460173 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8561.000 0.000 NA   NA
 11602536 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8561.000 0.000 NA   NA
 11744928 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8561.000 0.000 NA   NA
 11460174 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8593.000 0.000 NA   NA
 11602537 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8593.000 0.000 NA   NA
 11744929 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8593.000 0.000 NA   NA
 11460175 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8628.000 0.000 NA   NA
 11602538 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8628.000 0.000 NA   NA
 11744930 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8628.000 0.000 NA   NA
 11460176 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8665.000 0.000 NA   NA
 11602539 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8665.000 0.000 NA   NA
 11744931 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8665.000 0.000 NA   NA
 11460177 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8703.000 0.000 NA   NA
 11602540 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8703.000 0.000 NA   NA
 11744932 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8703.000 0.000 NA   NA
 11460178 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8740.000 0.000 NA   NA
 11602541 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8740.000 0.000 NA   NA
 11744933 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8740.000 0.000 NA   NA
 11460179 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8778.000 0.000 NA   NA
 11602542 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8778.000 0.000 NA   NA
 11744934 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8778.000 0.000 NA   NA
 11460180 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8815.000 0.000 NA   NA
 11602543 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8815.000 0.000 NA   NA
 11744935 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8815.000 0.000 NA   NA
 11460181 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8854.000 0.000 NA   NA
 11602544 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8854.000 0.000 NA   NA
 11744936 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8854.000 0.000 NA   NA
 11460182 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8891.000 0.000 NA   NA
 11602545 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8891.000 0.000 NA   NA
 11744937 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8891.000 0.000 NA   NA
 11460183 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8933.000 0.000 NA   NA
 11602546 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8933.000 0.000 NA   NA
 11744938 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8933.000 0.000 NA   NA
 11460184 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8970.000 0.000 NA   NA
 11602547 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8970.000 0.000 NA   NA
 11744939 1305137   CYA_0875     FALSE NA 8970.000 0.000 NA   NA
 11460185 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9006.000 0.000 NA   NA
 11602548 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9006.000 0.000 NA   NA
 11744940 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9006.000 0.000 NA   NA
 11460186 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9043.000 0.000 NA   NA
 11602549 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9043.000 0.000 NA   NA
 11744941 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9043.000 0.000 NA   NA
 11460187 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9080.000 0.000 NA   NA
 11602550 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9080.000 0.000 NA   NA
 11744942 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9080.000 0.000 NA   NA
 11460188 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9117.000 0.000 NA   NA
 11602551 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9117.000 0.000 NA   NA
 11744943 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9117.000 0.000 NA   NA
 11460189 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9155.000 0.000 NA   NA
 11602552 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9155.000 0.000 NA   NA
 11744944 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9155.000 0.000 NA   NA
 11460190 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9192.000 0.000 NA   NA
 11602553 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9192.000 0.000 NA   NA
 11744945 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9192.000 0.000 NA   NA
 11460191 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9230.000 0.000 NA   NA
 11602554 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9230.000 0.000 NA   NA
 11744946 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9230.000 0.000 NA   NA
 11460192 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9267.000 0.000 NA   NA
 11602555 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9267.000 0.000 NA   NA
 11744947 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9267.000 0.000 NA   NA
 11460193 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9306.000 0.000 NA   NA
 11602556 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9306.000 0.000 NA   NA
 11744948 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9306.000 0.000 NA   NA
 11460194 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9343.000 0.000 NA   NA
 11602557 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9343.000 0.000 NA   NA
 11744949 1305137   CYA_0875     FALSE NA 9343.000 0.000 NA   NA
 11460195 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2819.000 0.000 NA   NA
 11602558 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2819.000 0.000 NA   NA
 11744950 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2819.000 0.000 NA   NA
 11460196 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2776.000 0.000 NA   NA
 11602559 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2776.000 0.000 NA   NA
 11744951 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2776.000 0.000 NA   NA
 11460197 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2739.000 0.000 NA   NA
 11602560 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2739.000 0.000 NA   NA
 11744952 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2739.000 0.000 NA   NA
 11460198 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2705.000 0.000 NA   NA
 11602561 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2705.000 0.000 NA   NA
 11744953 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2705.000 0.000 NA   NA
 11460199 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2668.000 0.000 NA   NA
 11602562 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2668.000 0.000 NA   NA
 11744954 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2668.000 0.000 NA   NA
 11460200 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2632.000 0.000 NA   NA
 11602563 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2632.000 0.000 NA   NA
 11744955 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2632.000 0.000 NA   NA
 11460201 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2595.000 0.000 NA   NA
 11602564 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2595.000 0.000 NA   NA
 11744956 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2595.000 0.000 NA   NA
 11460202 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2555.000 0.000 NA   NA
 11602565 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2555.000 0.000 NA   NA
 11744957 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2555.000 0.000 NA   NA
 11460203 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2518.000 0.000 NA   NA
 11602566 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2518.000 0.000 NA   NA
 11744958 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2518.000 0.000 NA   NA
 11460204 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2479.000 0.000 NA   NA
 11602567 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2479.000 0.000 NA   NA
 11744959 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2479.000 0.000 NA   NA
 11460205 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2442.000 0.000 NA   NA
 11602568 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2442.000 0.000 NA   NA
 11744960 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2442.000 0.000 NA   NA
 11460206 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2404.000 0.000 NA   NA
 11602569 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2404.000 0.000 NA   NA
 11744961 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2404.000 0.000 NA   NA
 11460207 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2367.000 0.000 NA   NA
 11602570 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2367.000 0.000 NA   NA
 11744962 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2367.000 0.000 NA   NA
 11460208 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2327.000 0.000 NA   NA
 11602571 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2327.000 0.000 NA   NA
 11744963 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2327.000 0.000 NA   NA
 11460209 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2290.000 0.000 NA   NA
 11602572 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2290.000 0.000 NA   NA
 11744964 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2290.000 0.000 NA   NA
 11460210 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2253.000 0.000 NA   NA
 11602573 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2253.000 0.000 NA   NA
 11744965 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2253.000 0.000 NA   NA
 11460211 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2216.000 0.000 NA   NA
 11602574 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2216.000 0.000 NA   NA
 11744966 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2216.000 0.000 NA   NA
 11460212 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2175.000 0.000 NA   NA
 11602575 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2175.000 0.000 NA   NA
 11744967 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2175.000 0.000 NA   NA
 11460213 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2138.000 0.000 NA   NA
 11602576 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2138.000 0.000 NA   NA
 11744968 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2138.000 0.000 NA   NA
 11460214 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2102.000 0.000 NA   NA
 11602577 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2102.000 0.000 NA   NA
 11744969 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2102.000 0.000 NA   NA
 11460215 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2065.000 0.000 NA   NA
 11602578 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2065.000 0.000 NA   NA
 11744970 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2065.000 0.000 NA   NA
 11460216 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2028.000 0.000 NA   NA
 11602579 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2028.000 0.000 NA   NA
 11744971 1305148   CYA_0886     FALSE NA 2028.000 0.000 NA   NA
 11460217 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1991.000 0.000 NA   NA
 11602580 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1991.000 0.000 NA   NA
 11744972 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1991.000 0.000 NA   NA
 11460218 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1955.000 0.000 NA   NA
 11602581 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1955.000 0.000 NA   NA
 11744973 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1955.000 0.000 NA   NA
 11460219 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1918.000 0.000 NA   NA
 11602582 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1918.000 0.000 NA   NA
 11744974 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1918.000 0.000 NA   NA
 11460220 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1876.000 0.000 NA   NA
 11602583 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1876.000 0.000 NA   NA
 11744975 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1876.000 0.000 NA   NA
 11460221 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1839.000 0.000 NA   NA
 11602584 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1839.000 0.000 NA   NA
 11744976 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1839.000 0.000 NA   NA
 11460222 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1798.000 0.000 NA   NA
 11602585 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1798.000 0.000 NA   NA
 11744977 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1798.000 0.000 NA   NA
 11460223 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11602586 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11744978 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11460224 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1722.000 0.000 NA   NA
 11602587 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1722.000 0.000 NA   NA
 11744979 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1722.000 0.000 NA   NA
 11460225 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1685.000 0.000 NA   NA
 11602588 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1685.000 0.000 NA   NA
 11744980 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1685.000 0.000 NA   NA
 11460226 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1648.000 0.000 NA   NA
 11602589 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1648.000 0.000 NA   NA
 11744981 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1648.000 0.000 NA   NA
 11460227 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1611.000 0.000 NA   NA
 11602590 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1611.000 0.000 NA   NA
 11744982 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1611.000 0.000 NA   NA
 11460228 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1573.000 0.000 NA   NA
 11602591 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1573.000 0.000 NA   NA
 11744983 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1573.000 0.000 NA   NA
 11460229 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1536.000 0.000 NA   NA
 11602592 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1536.000 0.000 NA   NA
 11744984 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1536.000 0.000 NA   NA
 11460230 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11602593 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11744985 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1497.000 0.000 NA   NA
 11460231 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1460.000 0.000 NA   NA
 11602594 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1460.000 0.000 NA   NA
 11744986 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1460.000 0.000 NA   NA
 11460232 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1422.000 0.000 NA   NA
 11602595 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1422.000 0.000 NA   NA
 11744987 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1422.000 0.000 NA   NA
 11460233 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1385.000 0.000 NA   NA
 11602596 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1385.000 0.000 NA   NA
 11744988 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1385.000 0.000 NA   NA
 11460234 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1344.000 0.000 NA   NA
 11602597 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1344.000 0.000 NA   NA
 11744989 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1344.000 0.000 NA   NA
 11460235 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1307.000 0.000 NA   NA
 11602598 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1307.000 0.000 NA   NA
 11744990 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1307.000 0.000 NA   NA
 11460236 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1269.000 0.000 NA   NA
 11602599 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1269.000 0.000 NA   NA
 11744991 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1269.000 0.000 NA   NA
 11460237 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1232.000 0.000 NA   NA
 11602600 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1232.000 0.000 NA   NA
 11744992 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1232.000 0.000 NA   NA
 11460238 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1188.000 0.000 NA   NA
 11602601 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1188.000 0.000 NA   NA
 11744993 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1188.000 0.000 NA   NA
 11460239 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1151.000 0.000 NA   NA
 11602602 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1151.000 0.000 NA   NA
 11744994 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1151.000 0.000 NA   NA
 11460240 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1115.000 0.000 NA   NA
 11602603 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1115.000 0.000 NA   NA
 11744995 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1115.000 0.000 NA   NA
 11460241 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1078.000 0.000 NA   NA
 11602604 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1078.000 0.000 NA   NA
 11744996 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1078.000 0.000 NA   NA
 11460242 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11602605 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11744997 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11460243 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11602606 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11744998 1305148   CYA_0886     FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11460244 1305148   CYA_0886     FALSE NA 961.000 0.000 NA   NA
 11602607 1305148   CYA_0886     FALSE NA 961.000 0.000 NA   NA
 11744999 1305148   CYA_0886     FALSE NA 961.000 0.000 NA   NA
 11460245 1305148   CYA_0886     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11602608 1305148   CYA_0886     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11745000 1305148   CYA_0886     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11460246 1305148   CYA_0886     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11602609 1305148   CYA_0886     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11745001 1305148   CYA_0886     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11460247 1305148   CYA_0886     FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11602610 1305148   CYA_0886     FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11745002 1305148   CYA_0886     FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11460248 1305148   CYA_0886     FALSE NA 811.000 0.000 NA   NA
 11602611 1305148   CYA_0886     FALSE NA 811.000 0.000 NA   NA
 11745003 1305148   CYA_0886     FALSE NA 811.000 0.000 NA   NA
 11460249 1305148   CYA_0886     FALSE NA 774.000 0.000 NA   NA
 11602612 1305148   CYA_0886     FALSE NA 774.000 0.000 NA   NA
 11745004 1305148   CYA_0886     FALSE NA 774.000 0.000 NA   NA
 11460250 1305148   CYA_0886     FALSE NA 738.000 0.000 NA   NA
 11602613 1305148   CYA_0886     FALSE NA 738.000 0.000 NA   NA
 11745005 1305148   CYA_0886     FALSE NA 738.000 0.000 NA   NA
 11460251 1305148   CYA_0886     FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11602614 1305148   CYA_0886     FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11745006 1305148   CYA_0886     FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11460252 1305148   CYA_0886     FALSE NA 665.000 0.000 NA   NA
 11602615 1305148   CYA_0886     FALSE NA 665.000 0.000 NA   NA
 11745007 1305148   CYA_0886     FALSE NA 665.000 0.000 NA   NA
 11460253 1305148   CYA_0886     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11602616 1305148   CYA_0886     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11745008 1305148   CYA_0886     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11460254 1305148   CYA_0886     FALSE NA 590.000 0.000 NA   NA
 11602617 1305148   CYA_0886     FALSE NA 590.000 0.000 NA   NA
 11745009 1305148   CYA_0886     FALSE NA 590.000 0.000 NA   NA
 11460255 1305148   CYA_0886     FALSE NA 553.000 0.000 NA   NA
 11602618 1305148   CYA_0886     FALSE NA 553.000 0.000 NA   NA
 11745010 1305148   CYA_0886     FALSE NA 553.000 0.000 NA   NA
 1305147 1305148 CYA_0885 CYA_0886 cas2-3   TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1305150 1305151 CYA_0888 CYA_0889     TRUE 0.650 12.000 0.000 NA   NA
 1305153 1305154 CYA_0891 CYA_0892 ntrD-2 ntrC-2 TRUE 0.976 63.000 0.200 0.003 Y NA
 1305154 1305155 CYA_0892 CYA_0893 ntrC-2 ntrB-2 TRUE 0.931 160.000 0.867 0.003 Y NA
 1305155 1305156 CYA_0893 CYA_0894 ntrB-2   FALSE 0.156 540.000 0.867 NA Y NA
 1305159 1305160 CYA_0897 CYA_0898     FALSE 0.327 83.000 0.000 NA   NA
 1305161 1305162 CYA_0899 CYA_0900     TRUE 0.971 -10.000 0.522 NA   NA
 1305162 1305163 CYA_0900 CYA_0901     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 1305164 1305165 CYA_0902 CYA_0903   cobI TRUE 0.780 21.000 0.005 NA N NA
 1305165 1305166 CYA_0903 CYA_0904 cobI   FALSE 0.002 809.000 0.000 NA   NA
 1305166 1305167 CYA_0904 CYA_0905     FALSE 0.041 187.000 0.000 NA   NA
 1305167 1305168 CYA_0905 CYA_0907     TRUE 0.739 78.000 0.040 1.000   NA
 1305171 1305172 CYA_0908 CYA_0910 pcm   FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 1305172 1305173 CYA_0910 CYA_0911     TRUE 0.951 -7.000 0.214 NA   NA
 1305173 1305174 CYA_0911 CYA_0912   nth TRUE 0.700 50.000 0.002 NA   NA
 1305174 1305175 CYA_0912 CYA_0913 nth   TRUE 0.873 7.000 0.018 1.000 N NA
 1305175 1305176 CYA_0913 CYA_0914     FALSE 0.490 113.000 0.002 1.000 N NA
 1305177 1305178 CYA_0915 CYA_0916     TRUE 0.693 54.000 0.008 NA   NA
 1305178 1305179 CYA_0916 CYA_0917   ksgA TRUE 0.849 8.000 0.002 1.000 N NA
 1305179 1305180 CYA_0917 CYA_0918 ksgA   TRUE 0.744 49.000 0.002 1.000 N NA
 1305180 1305181 CYA_0918 CYA_0919   sppA-1 TRUE 0.802 75.000 0.012 0.029 N NA
 1305182 1305183 CYA_0920 CYA_0921     FALSE 0.002 679.000 0.000 NA   NA
 1305183 1305184 CYA_0921 CYA_0922     TRUE 0.662 2.000 0.000 NA   NA
 1305187 1305188 CYA_0925 CYA_0926 rpsT   FALSE 0.003 1077.000 0.000 1.000   NA
 1305189 1305190 CYA_0927 CYA_0928     FALSE 0.043 184.000 0.000 NA   NA
 1305190 1305191 CYA_0928 CYA_0929   cobA TRUE 0.849 -3.000 0.023 NA   NA
 1305191 1305192 CYA_0929 CYA_0930 cobA   TRUE 0.782 68.000 0.041 1.000   NA
 1305193 1305194 CYA_0931 CYA_0932     FALSE 0.026 208.000 0.000 NA   NA
 1305194 1305195 CYA_0932 CYA_0933     FALSE 0.002 1103.000 0.000 NA   NA
 1305196 1305197 CYA_0934 CYA_0935     FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 1305198 1305199 CYA_0936 CYA_0938     TRUE 0.774 113.000 0.182 NA   NA
 1305201 1305202 CYA_0939 CYA_0940   hup-2 FALSE 0.009 333.000 0.000 1.000 N NA
 1305202 1305203 CYA_0940 CYA_0941 hup-2 cobD-2 TRUE 0.802 71.000 0.052 1.000 N NA
 1305203 1305204 CYA_0941 CYA_0942 cobD-2   TRUE 0.864 27.000 0.026 1.000   NA
 1305204 1305205 CYA_0942 CYA_0943     FALSE 0.138 144.000 0.000 NA   NA
 1305207 1305208 CYA_0945 CYA_0946 nadC nadA TRUE 0.858 157.000 0.198 0.002 Y NA
 1305208 1305209 CYA_0946 CYA_0948 nadA nadB TRUE 0.974 38.000 0.210 1.000 Y NA
 1305210 1305211 CYA_0947 CYA_0949 gnd   FALSE 0.295 93.000 0.000 NA   NA
 1305212 1305213 CYA_0950 CYA_0951     FALSE 0.024 212.000 0.000 NA   NA
 1305213 1305214 CYA_0951 CYA_0952   sir FALSE 0.594 117.000 0.036 1.000   NA
 1305214 1305215 CYA_0952 CYA_0953 sir   FALSE 0.342 116.000 0.000 1.000   NA
 1305218 1305219 CYA_0956 CYA_0957     FALSE 0.368 74.000 0.000 NA   NA
 1305219 1305220 CYA_0957 CYA_0958     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 1305221 1305222 CYA_0959 CYA_0960   murD FALSE 0.444 77.000 0.000 1.000 N NA
 1305222 1305223 CYA_0960 CYA_0961 murD   TRUE 0.800 -91.000 0.006 1.000 N NA
 1305224 1305225 CYA_0962 CYA_0963     FALSE 0.576 -42.000 0.000 NA   NA
 1305227 1305228 CYA_0964 CYA_0966     TRUE 0.828 43.000 0.025 1.000   NA
 1305230 1305231 CYA_0968 CYA_0969   hisH TRUE 0.831 7.000 0.005 NA   NA
 1305233 1305234 CYA_0971 CYA_0972 grpE   FALSE 0.149 177.000 0.005 1.000 N NA
 1305234 1305235 CYA_0972 CYA_0973     TRUE 0.658 64.000 0.015 NA   NA
 1305235 1305236 CYA_0973 CYA_0974     TRUE 0.658 64.000 0.015 NA   NA
 1305236 1305237 CYA_0974 CYA_0975     TRUE 0.763 143.000 0.500 NA   NA
 1305237 1305238 CYA_0975 CYA_0976   tas FALSE 0.023 217.000 0.000 NA   NA
 1305238 1305239 CYA_0976 CYA_0977 tas   FALSE 0.557 82.000 0.008 NA   NA
 1305241 1305242 CYA_0979 CYA_0980     FALSE 0.368 74.000 0.000 NA   NA
 1305242 1305243 CYA_0980 CYA_0981     FALSE 0.046 182.000 0.000 NA   NA
 1305243 1305244 CYA_0981 CYA_0982     FALSE 0.383 71.000 0.000 NA   NA
 1305244 1305245 CYA_0982 CYA_0983     FALSE 0.003 476.000 0.000 NA   NA
 1305246 1305247 CYA_0984 CYA_0985     TRUE 0.661 114.000 0.051 1.000 N NA
 1305248 1305249 CYA_0986 CYA_0987     FALSE 0.476 53.000 0.000 NA   NA
 1305252 1305253 CYA_0990 CYA_0991     FALSE 0.018 280.000 0.000 1.000   NA
 1305255 1305256 CYA_0993 CYA_0994 pilM pilN TRUE 0.927 64.000 0.087 NA Y NA
 1305256 1305257 CYA_0994 CYA_0995 pilN   TRUE 0.982 0.000 0.760 NA   NA
 1305257 1305258 CYA_0995 CYA_0996     FALSE 0.102 288.000 0.240 NA   NA
 1305258 1305259 CYA_0996 CYA_0997     FALSE 0.509 47.000 0.000 NA   NA
 1305260 1305261 CYA_0998 CYA_0999     TRUE 0.891 -18.000 0.000 NA Y NA
 1305265 1305266 CYA_1003 CYA_1004     FALSE 0.029 203.000 0.000 NA   NA
 1305267 1305268 CYA_1005 CYA_1006 ilvE   TRUE 0.703 78.000 0.027 1.000   NA
 1305269 1305270 CYA_1007 CYA_1008     FALSE 0.002 779.000 0.000 NA   NA
 1305270 1305271 CYA_1008 CYA_1009     TRUE 0.985 16.000 1.000 NA   NA
 1305271 1305272 CYA_1009 CYA_1010     FALSE 0.002 654.000 0.000 NA   NA
 1305273 1305274 CYA_1011 CYA_1012     TRUE 0.979 37.000 1.000 NA   NA
 1305275 1305276 CYA_1013 CYA_1014     FALSE 0.608 23.000 0.000 NA   NA
 1305276 1305277 CYA_1014 CYA_1015   lpxD FALSE 0.161 136.000 0.000 NA   NA
 1305277 1305278 CYA_1015 CYA_1016 lpxD   FALSE 0.637 16.000 0.000 NA   NA
 1305278 1305279 CYA_1016 CYA_1017     FALSE 0.075 164.000 0.000 NA   NA
 1305280 1305281 CYA_1018 CYA_1019     FALSE 0.387 70.000 0.000 NA   NA
 1305281 1305282 CYA_1019 CYA_1020     FALSE 0.608 23.000 0.000 NA   NA
 1305282 1305283 CYA_1020 CYA_1021     FALSE 0.032 198.000 0.000 NA   NA
 1305283 1305284 CYA_1021 CYA_1022     FALSE 0.085 179.000 0.000 1.000   NA
 1305284 1305285 CYA_1022 CYA_1023     FALSE 0.295 93.000 0.000 NA   NA
 1305285 1305286 CYA_1023 CYA_1024     TRUE 0.921 34.000 0.117 NA   NA
 1305286 1305287 CYA_1024 CYA_1025     FALSE 0.051 178.000 0.000 NA   NA
 1305288 1305289 CYA_1026 CYA_1027   msrB TRUE 0.755 50.000 0.008 1.000 N NA
 1305290 1305291 CYA_1028 CYA_1029     TRUE 0.908 89.000 0.595 NA   NA
 1305291 1305292 CYA_1029 CYA_1030     TRUE 0.959 16.000 0.189 1.000   NA
 1305295 1305296 CYA_1032 CYA_1034   hemH FALSE 0.179 170.000 0.004 1.000 N NA
 1305299 1305300 CYA_1037 CYA_1038     FALSE 0.509 47.000 0.000 NA   NA
 1305300 1305301 CYA_1038 CYA_1039     TRUE 0.811 -6.000 0.007 NA   NA
 1305301 1305302 CYA_1039 CYA_1040     FALSE 0.012 266.000 0.000 NA   NA
 1305303 1305304 CYA_1041 CYA_1042     FALSE 0.164 166.000 0.007 NA   NA
 1305304 1305305 CYA_1042 CYA_1043     TRUE 0.662 103.000 0.051 NA   NA
 1305305 1305306 CYA_1043 CYA_1044     TRUE 0.652 106.000 0.051 NA   NA
 1305306 1305307 CYA_1044 CYA_1045     FALSE 0.024 212.000 0.000 NA   NA
 1305308 1305309 CYA_1046 CYA_1047     TRUE 0.967 3.000 0.353 NA   NA
 1305309 1305310 CYA_1047 CYA_1048     TRUE 0.700 68.000 0.008 1.000   NA
 1305310 1305311 CYA_1048 CYA_1049     FALSE 0.014 281.000 0.000 1.000 N NA
 1305311 1305312 CYA_1049 CYA_1050     FALSE 0.344 104.000 0.000 1.000 N NA
 1305313 1305314 CYA_1051 CYA_1052     FALSE 0.560 102.000 0.031 NA   NA
 1305314 1305315 CYA_1052 CYA_1053     FALSE 0.633 125.000 0.074 NA   NA
 1305315 1305316 CYA_1053 CYA_1054     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305318 1305319 CYA_1056 CYA_1057 thiG thiS TRUE 0.794 100.000 0.006 1.000 Y NA
 1305319 1305320 CYA_1057 CYA_1058 thiS thiO TRUE 0.848 -12.000 0.018 1.000 N NA
 1305320 1305321 CYA_1058 CYA_1059 thiO   FALSE 0.040 206.000 0.000 1.000 N NA
 1305321 1305322 CYA_1059 CYA_1060     FALSE 0.614 82.000 0.011 1.000 N NA
 1305323 1305324 CYA_1061 CYA_1062     FALSE 0.557 122.000 0.048 NA   NA
 1305324 1305325 CYA_1062 CYA_1063   ndk FALSE 0.538 75.000 0.002 NA N NA
 1305326 1305327 CYA_1064 CYA_1065     TRUE 0.982 19.000 0.250 1.000 Y NA
 1305327 1305328 CYA_1065 CYA_1066     TRUE 0.901 87.000 0.500 NA   NA
 1305328 1305329 CYA_1066 CYA_1067     TRUE 0.903 84.000 0.500 NA   NA
 1305329 1305330 CYA_1067 CYA_1068     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 1305331 1305332 CYA_1069 CYA_1071 ffh   TRUE 0.848 10.000 0.002 1.000 N NA
 1305335 1305336 CYA_1073 CYA_1074     FALSE 0.151 181.000 0.006 1.000   NA
 1305336 1305337 CYA_1074 CYA_1075     TRUE 0.695 69.000 0.006 1.000   NA
 1305337 1305338 CYA_1075 CYA_1076     FALSE 0.618 44.000 0.000 1.000 N NA
 1305339 1305340 CYA_1077 CYA_1079   htpG FALSE 0.430 105.000 0.003 NA N NA
 1305344 1305345 CYA_1082 CYA_1083   nrdR FALSE 0.613 69.000 0.003 NA   NA
 1305345 1305346 CYA_1083 CYA_1084 nrdR   FALSE 0.024 213.000 0.000 NA   NA
 1305347 1305348 CYA_1085 CYA_1086 rrfA rrlA FALSE 0.439 59.000 0.000 NA   NA
 1305348 1305349 CYA_1086 CYA_1087 rrlA   FALSE 0.198 125.000 0.000 NA   NA
 1305349 1305350 CYA_1087 CYA_1088     FALSE 0.553 37.000 0.000 NA   NA
 1305350 1305351 CYA_1088 CYA_1089   rrsA FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 1305351 1305352 CYA_1089 CYA_1090 rrsA   FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 1305352 1305353 CYA_1090 CYA_1091   lgt-1 TRUE 0.872 4.000 0.003 1.000   NA
 1305355 1305356 CYA_1093 CYA_1094   sun TRUE 0.961 34.000 0.003 0.018 Y NA
 1305358 1305359 CYA_1095 CYA_1097     TRUE 0.763 36.000 0.009 NA   NA
 1305359 1305360 CYA_1097 CYA_1098     FALSE 0.015 248.000 0.000 NA   NA
 1305360 1305361 CYA_1098 CYA_1099     TRUE 0.854 -16.000 0.037 NA   NA
 1305362 1305363 CYA_1100 CYA_1101 hom hemG TRUE 0.803 52.000 0.033 1.000 N NA
 1305363 1305364 CYA_1101 CYA_1103 hemG   TRUE 0.824 -70.000 0.033 NA   NA
 1305365 1305366 CYA_1102 CYA_1104     FALSE 0.379 72.000 0.000 NA   NA
 1305366 1305367 CYA_1104 CYA_1105     TRUE 0.808 31.000 0.022 NA   NA
 1305367 1305368 CYA_1105 CYA_1106     TRUE 0.962 4.000 0.250 NA   NA
 1305368 1305369 CYA_1106 CYA_1107     TRUE 0.870 10.000 0.031 NA   NA
 1305369 1305370 CYA_1107 CYA_1108     FALSE 0.574 98.000 0.031 NA   NA
 1305370 1305371 CYA_1108 CYA_1109     FALSE 0.019 273.000 0.000 1.000   NA
 1305372 1305373 CYA_1110 CYA_1111     FALSE 0.234 189.000 0.091 NA   NA
 1305373 1305374 CYA_1111 CYA_1112   ald FALSE 0.003 1034.000 0.000 1.000   NA
 1305375 1305376 CYA_1113 CYA_1114   rpsN FALSE 0.030 240.000 0.000 1.000   NA
 1305377 1305378 CYA_1115 CYA_1117     FALSE 0.598 -18.000 0.000 NA   NA
 1305379 1305380 CYA_1116 CYA_1118     TRUE 0.744 81.000 0.054 NA   NA
 1305382 1305383 CYA_1120 CYA_1121 recJ-1   FALSE 0.553 37.000 0.000 NA   NA
 1305384 1305385 CYA_1122 CYA_1123   cysH FALSE 0.493 76.000 0.000 1.000   NA
 1305385 1305386 CYA_1123 CYA_1124 cysH   TRUE 0.832 29.000 0.003 1.000   NA
 1305386 1305387 CYA_1124 CYA_1125     FALSE 0.272 132.000 0.000 1.000   NA
 1305387 1305388 CYA_1125 CYA_1126     FALSE 0.002 621.000 0.000 NA N NA
 1305388 1305389 CYA_1126 CYA_1127     TRUE 0.891 -18.000 0.000 NA Y NA
 1305391 1305392 CYA_1129 CYA_1131     FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 1305393 1305394 CYA_1130 CYA_1132     FALSE 0.063 171.000 0.000 NA   NA
 1305394 1305395 CYA_1132 CYA_1133     TRUE 0.830 7.000 0.004 NA   NA
 1305395 1305396 CYA_1133 CYA_1134     TRUE 0.848 134.000 0.744 NA   NA
 1305396 1305397 CYA_1134 CYA_1135   rpmF FALSE 0.574 95.000 0.002 1.000   NA
 1305397 1305398 CYA_1135 CYA_1136 rpmF   FALSE 0.008 298.000 0.000 NA   NA
 1305399 1305400 CYA_1137 CYA_1138     FALSE 0.258 88.000 0.000 NA N NA
 1305400 1305401 CYA_1138 CYA_1139     FALSE 0.083 245.000 0.000 NA Y NA
 1305401 1305402 CYA_1139 CYA_1140     FALSE 0.345 115.000 0.000 1.000   NA
 1305402 1305403 CYA_1140 CYA_1141     TRUE 0.660 7.000 0.000 NA   NA
 1305403 1305404 CYA_1141 CYA_1142     FALSE 0.567 -54.000 0.000 NA   NA
 1305404 1305405 CYA_1142 CYA_1143     FALSE 0.002 743.000 0.000 NA   NA
 1305407 1305408 CYA_1145 CYA_1147     FALSE 0.180 131.000 0.000 NA   NA
 1305409 1305410 CYA_1146 CYA_1148   ispH TRUE 0.902 6.000 0.032 1.000   NA
 1305410 1305411 CYA_1148 CYA_1149 ispH   FALSE 0.342 148.000 0.032 NA   NA
 1305411 1305412 CYA_1149 CYA_1150     TRUE 0.918 23.000 0.080 NA   NA
 1305412 1305413 CYA_1150 CYA_1151   glmU FALSE 0.223 118.000 0.000 NA   NA
 1305414 1305415 CYA_1152 CYA_1153     FALSE 0.007 315.000 0.000 NA   NA
 1305415 1305416 CYA_1153 CYA_1154     TRUE 0.833 61.000 0.054 1.000 N NA
 1305416 1305417 CYA_1154 CYA_1155     TRUE 0.688 98.000 0.054 NA   NA
 1305418 1305419 CYA_1156 CYA_1157   infA TRUE 0.747 30.000 0.002 NA N NA
 1305419 1305420 CYA_1157 CYA_1158 infA map-2 TRUE 0.696 131.000 0.007 1.000 Y NA
 1305420 1305421 CYA_1158 CYA_1159 map-2 adk TRUE 0.851 39.000 0.039 1.000 N NA
 1305421 1305422 CYA_1159 CYA_1160 adk secY TRUE 0.877 0.000 0.020 1.000 N NA
 1305422 1305423 CYA_1160 CYA_1161 secY rplO TRUE 0.909 109.000 0.730 1.000 N NA
 1305423 1305424 CYA_1161 CYA_1162 rplO rpsE TRUE 0.986 24.000 0.148 0.021 Y NA
 1305424 1305425 CYA_1162 CYA_1163 rpsE rplR TRUE 0.995 19.000 0.814 0.021 Y NA
 1305425 1305426 CYA_1163 CYA_1164 rplR rplF TRUE 0.996 3.000 0.815 0.016 Y NA
 1305426 1305427 CYA_1164 CYA_1165 rplF rpsH TRUE 0.994 27.000 0.808 0.016 Y NA
 1305427 1305428 CYA_1165 CYA_1166 rpsH rplE TRUE 0.961 61.000 0.059 0.016 Y NA
 1305428 1305429 CYA_1166 CYA_1167 rplE rplX TRUE 0.989 57.000 0.758 0.016 Y NA
 1305429 1305430 CYA_1167 CYA_1168 rplX rplN TRUE 0.996 0.000 0.810 0.021 Y NA
 1305430 1305431 CYA_1168 CYA_1169 rplN rpsQ TRUE 0.995 -3.000 0.791 0.021 Y NA
 1305431 1305432 CYA_1169 CYA_1170 rpsQ rpmC TRUE 0.996 0.000 0.828 0.016 Y NA
 1305432 1305433 CYA_1170 CYA_1171 rpmC rplP TRUE 0.995 18.000 0.802 0.016 Y NA
 1305433 1305434 CYA_1171 CYA_1172 rplP rpsC TRUE 0.990 56.000 0.828 0.021 Y NA
 1305434 1305435 CYA_1172 CYA_1173 rpsC rplV TRUE 0.992 42.000 0.719 0.021 Y NA
 1305435 1305436 CYA_1173 CYA_1174 rplV rpsS TRUE 0.992 43.000 0.769 0.021 Y NA
 1305436 1305437 CYA_1174 CYA_1175 rpsS rplB TRUE 0.984 79.000 0.820 0.021 Y NA
 1305437 1305438 CYA_1175 CYA_1176 rplB rplW TRUE 0.990 61.000 0.849 0.017 Y NA
 1305438 1305439 CYA_1176 CYA_1177 rplW rplD TRUE 0.993 -7.000 0.513 0.016 Y NA
 1305439 1305440 CYA_1177 CYA_1178 rplD rplC TRUE 0.984 52.000 0.361 0.016 Y NA
 1305441 1305442 CYA_1179 CYA_1180     FALSE 0.056 175.000 0.000 NA   NA
 1305442 1305443 CYA_1180 CYA_1181     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 1305443 1305444 CYA_1181 CYA_1182     FALSE 0.529 43.000 0.000 NA   NA
 1305444 1305445 CYA_1182 CYA_1183     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305445 1305446 CYA_1183 CYA_1184     FALSE 0.405 168.000 0.125 NA   NA
 1305446 1305447 CYA_1184 CYA_1185     FALSE 0.570 -49.000 0.000 NA   NA
 1305448 1305449 CYA_1186 CYA_1187 metK   FALSE 0.003 497.000 0.000 NA   NA
 1305450 1305451 CYA_1188 CYA_1189 cobO-1 cobB TRUE 0.971 18.000 0.005 0.012 Y NA
 1305451 1305452 CYA_1189 CYA_1190 cobB   FALSE 0.002 746.000 0.000 NA   NA
 1305453 1305454 CYA_1191 CYA_1192     FALSE 0.375 73.000 0.000 NA   NA
 1305455 1305456 CYA_1193 CYA_1194 clpP cbbL FALSE 0.004 509.000 0.000 1.000 N NA
 1305456 1305457 CYA_1194 CYA_1195 cbbL rbcX TRUE 0.949 71.000 0.792 NA   NA
 1305457 1305458 CYA_1195 CYA_1196 rbcX cbbS TRUE 0.985 9.000 0.913 NA   NA
 1305459 1305460 CYA_1197 CYA_1198     TRUE 0.662 1.000 0.000 NA   NA
 1305463 1305464 CYA_1201 CYA_1203     TRUE 0.862 -3.000 0.002 1.000   NA
 1305465 1305466 CYA_1202 CYA_1204     TRUE 0.966 -12.000 0.360 1.000   NA
 1305466 1305467 CYA_1204 CYA_1205   cobO-2 TRUE 0.933 12.000 0.065 1.000 N NA
 1305468 1305469 CYA_1206 CYA_1207     FALSE 0.362 75.000 0.000 NA   NA
 1305474 1305475 CYA_1212 CYA_1213     FALSE 0.549 93.000 0.026 NA N NA
 1305476 1305477 CYA_1214 CYA_1215     FALSE 0.044 200.000 0.000 1.000 N NA
 1305479 1305480 CYA_1217 CYA_1218 engA smpB TRUE 0.817 36.000 0.005 1.000   NA
 1305481 1305482 CYA_1219 CYA_1220   era FALSE 0.517 72.000 0.000 1.000   NA
 1305482 1305483 CYA_1220 CYA_1221 era   TRUE 0.771 9.000 0.000 1.000   NA
 1305483 1305484 CYA_1221 CYA_1223     FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 1305484 1305485 CYA_1223 CYA_1224     FALSE 0.470 54.000 0.000 NA   NA
 1305488 1305489 CYA_1227 CYA_1228     FALSE 0.003 501.000 0.000 NA   NA
 1305490 1305491 CYA_1229 CYA_1230     FALSE 0.003 564.000 0.000 NA   NA
 1305491 1305492 CYA_1230 CYA_1231     TRUE 0.861 -34.000 0.029 1.000   NA
 1305493 1305494 CYA_1232 CYA_1233 hisG psbO FALSE 0.094 200.000 0.002 1.000   NA
 1305494 1305495 CYA_1233 CYA_1234 psbO   FALSE 0.621 19.000 0.000 NA   NA
 1305495 1305496 CYA_1234 CYA_1235     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 1305496 1305497 CYA_1235 CYA_1236     TRUE 0.847 39.000 0.047 NA   NA
 1305497 1305498 CYA_1236 CYA_1237     TRUE 0.775 -28.000 0.003 NA   NA
 1305499 1305500 CYA_1238 CYA_1239 tig   FALSE 0.518 89.000 0.002 NA   NA
 1305500 1305501 CYA_1239 CYA_1240     FALSE 0.546 85.000 0.010 NA   NA
 1305502 1305503 CYA_1241 CYA_1243     FALSE 0.002 670.000 0.000 NA   NA
 1305507 1305508 CYA_1246 CYA_1247     TRUE 0.816 18.000 0.013 NA   NA
 1305508 1305509 CYA_1247 CYA_1249   menC FALSE 0.002 879.000 0.000 NA   NA
 11460273 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1532.000 0.000 NA   NA
 11602636 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1532.000 0.000 NA   NA
 11745028 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1532.000 0.000 NA   NA
 11460274 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1496.000 0.000 NA   NA
 11602637 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1496.000 0.000 NA   NA
 11745029 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1496.000 0.000 NA   NA
 11460275 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1460.000 0.000 NA   NA
 11602638 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1460.000 0.000 NA   NA
 11745030 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1460.000 0.000 NA   NA
 11460276 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1419.000 0.000 NA   NA
 11602639 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1419.000 0.000 NA   NA
 11745031 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1419.000 0.000 NA   NA
 11460277 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1383.000 0.000 NA   NA
 11602640 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1383.000 0.000 NA   NA
 11745032 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1383.000 0.000 NA   NA
 11460278 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1340.000 0.000 NA   NA
 11602641 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1340.000 0.000 NA   NA
 11745033 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1340.000 0.000 NA   NA
 11460279 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1304.000 0.000 NA   NA
 11602642 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1304.000 0.000 NA   NA
 11745034 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1304.000 0.000 NA   NA
 11460280 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11602643 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11745035 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11460281 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1230.000 0.000 NA   NA
 11602644 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1230.000 0.000 NA   NA
 11745036 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1230.000 0.000 NA   NA
 11460282 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1189.000 0.000 NA   NA
 11602645 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1189.000 0.000 NA   NA
 11745037 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1189.000 0.000 NA   NA
 11460283 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1153.000 0.000 NA   NA
 11602646 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1153.000 0.000 NA   NA
 11745038 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1153.000 0.000 NA   NA
 11460284 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1103.000 0.000 NA   NA
 11602647 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1103.000 0.000 NA   NA
 11745039 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1103.000 0.000 NA   NA
 11460285 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1072.000 0.000 NA   NA
 11602648 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1072.000 0.000 NA   NA
 11745040 1305510   CYA_1248   prfB FALSE NA 1072.000 0.000 NA   NA
 1305512 1305513 CYA_1250 CYA_1252     FALSE 0.021 266.000 0.000 1.000   NA
 1305515 1305516 CYA_1254 CYA_1255     FALSE 0.311 184.000 0.143 NA   NA
 1305516 1305517 CYA_1255 CYA_1256   leuS FALSE 0.004 602.000 0.000 1.000   NA
 1305517 1305518 CYA_1256 CYA_1257 leuS petH FALSE 0.430 129.000 0.002 1.000   NA
 1305519 1305520 CYA_1258 CYA_1259 prk pgl TRUE 0.680 75.000 0.022 1.000 N NA
 1305520 1305521 CYA_1259 CYA_1260 pgl   FALSE 0.229 116.000 0.000 NA   NA
 1305521 1305522 CYA_1260 CYA_1261     FALSE 0.002 656.000 0.000 NA   NA
 1305522 1305523 CYA_1261 CYA_1262     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 1305523 1305524 CYA_1262 CYA_1263     FALSE 0.259 105.000 0.000 NA   NA
 1305524 1305525 CYA_1263 CYA_1264   minC FALSE 0.119 150.000 0.000 NA   NA
 1305525 1305526 CYA_1264 CYA_1265 minC minD TRUE 0.986 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 1305526 1305527 CYA_1265 CYA_1266 minD minE TRUE 0.934 91.000 0.347 NA Y NA
 1305527 1305528 CYA_1266 CYA_1268 minE   FALSE 0.014 234.000 0.000 NA N NA
 1305529 1305530 CYA_1267 CYA_1269     TRUE 0.773 45.000 0.024 NA   NA
 1305530 1305531 CYA_1269 CYA_1270   holB TRUE 0.725 25.000 0.000 1.000   NA
 1305531 1305532 CYA_1270 CYA_1271 holB accB FALSE 0.267 125.000 0.000 1.000 N NA
 1305532 1305533 CYA_1271 CYA_1272 accB efp TRUE 0.872 68.000 0.120 1.000 N NA
 1305533 1305534 CYA_1272 CYA_1273 efp   TRUE 0.785 37.000 0.002 1.000 N NA
 1305538 1305539 CYA_1277 CYA_1279     FALSE 0.582 -28.000 0.000 NA   NA
 1305541 1305542 CYA_1280 CYA_1282     FALSE 0.175 163.000 0.008 NA   NA
 1305542 1305543 CYA_1282 CYA_1283     TRUE 0.984 4.000 0.356 0.009 N NA
 1305543 1305544 CYA_1283 CYA_1284     TRUE 0.882 109.000 0.034 0.022 Y NA
 1305547 1305548 CYA_1287 CYA_1288     FALSE 0.183 130.000 0.000 NA   NA
 1305548 1305549 CYA_1288 CYA_1290   trpA-2 FALSE 0.421 62.000 0.000 NA   NA
 1305550 1305551 CYA_1289 CYA_1291     TRUE 0.891 -18.000 0.000 NA Y NA
 1305552 1305553 CYA_1292 CYA_1293     FALSE 0.592 -19.000 0.000 NA   NA
 1305553 1305554 CYA_1293 CYA_1294     FALSE 0.010 350.000 0.000 1.000   NA
 1305556 1305557 CYA_1296 CYA_1297     TRUE 0.992 41.000 0.750 0.067 Y NA
 1305559 1305560 CYA_1299 CYA_1300 rpsL rpsG TRUE 0.991 44.000 0.620 0.003 Y NA
 1305560 1305561 CYA_1300 CYA_1301 rpsG fusA TRUE 0.847 157.000 0.579 1.000 Y NA
 1305561 1305562 CYA_1301 CYA_1302 fusA tuf TRUE 0.993 23.000 0.400 0.001 Y NA
 1305562 1305563 CYA_1302 CYA_1303 tuf rpsJ TRUE 0.937 94.000 0.318 1.000 Y NA
 1305563 1305564 CYA_1303 CYA_1305 rpsJ dapB TRUE 0.754 47.000 0.002 1.000 N NA
 1305565 1305566 CYA_1304 CYA_1306     FALSE 0.613 86.000 0.029 NA   NA
 1305566 1305567 CYA_1306 CYA_1307     FALSE 0.066 169.000 0.000 NA   NA
 1305567 1305568 CYA_1307 CYA_1308     FALSE 0.011 273.000 0.000 NA   NA
 1305568 1305569 CYA_1308 CYA_1309     FALSE 0.362 75.000 0.000 NA   NA
 1305569 1305570 CYA_1309 CYA_1310   tatC FALSE 0.013 261.000 0.000 NA   NA
 1305572 1305573 CYA_1312 CYA_1313     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305573 1305574 CYA_1313 CYA_1314     FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 1305574 1305575 CYA_1314 CYA_1316     FALSE 0.005 386.000 0.000 NA   NA
 1305576 1305577 CYA_1317 CYA_1318   gspO TRUE 0.661 77.000 0.033 NA   NA
 1305581 1305582 CYA_1322 CYA_1323     FALSE 0.231 115.000 0.000 NA   NA
 1305583 1305584 CYA_1324 CYA_1325 dapF psbN TRUE 0.802 39.000 0.002 1.000   NA
 1305587 1305588 CYA_1328 CYA_1329     FALSE 0.053 304.000 0.000 1.000 Y NA
 1305589 1305590 CYA_1330 CYA_1331     FALSE 0.427 61.000 0.000 NA   NA
 1305590 1305591 CYA_1331 CYA_1332     FALSE 0.057 197.000 0.000 1.000   NA
 1305591 1305592 CYA_1332 CYA_1333     TRUE 0.688 56.000 0.012 NA   NA
 1305592 1305593 CYA_1333 CYA_1334     TRUE 0.892 36.000 0.067 NA   NA
 1305594 1305595 CYA_1335 CYA_1336     TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1305596 1305597 CYA_1337 CYA_1338 apcB-1 truB FALSE 0.035 226.000 0.000 1.000   NA
 1305600 1305601 CYA_1341 CYA_1342   ycf3 TRUE 0.694 78.000 0.043 NA   NA
 1305601 1305602 CYA_1342 CYA_1343 ycf3 gatC TRUE 0.725 68.000 0.020 1.000   NA
 1305605 1305606 CYA_1346 CYA_1347     FALSE 0.003 534.000 0.000 NA   NA
 1305612 1305613 CYA_1353 CYA_1354 folC serA TRUE 0.872 68.000 0.004 1.000 Y NA
 1305613 1305614 CYA_1354 CYA_1355 serA   FALSE 0.028 204.000 0.000 NA   NA
 1305614 1305615 CYA_1355 CYA_1356     FALSE 0.002 687.000 0.000 NA   NA
 1305616 1305617 CYA_1357 CYA_1358     FALSE 0.566 34.000 0.000 NA   NA
 1305617 1305618 CYA_1358 CYA_1360     TRUE 0.891 -18.000 0.000 NA Y NA
 1305622 1305623 CYA_1363 CYA_1364 glnA   FALSE 0.012 266.000 0.000 NA   NA
 1305623 1305624 CYA_1364 CYA_1365     FALSE 0.342 79.000 0.000 NA   NA
 1305624 1305625 CYA_1365 CYA_1366   napA FALSE 0.083 180.000 0.000 1.000   NA
 1305626 1305627 CYA_1367 CYA_1368   recR FALSE 0.127 148.000 0.000 NA   NA
 1305627 1305628 CYA_1368 CYA_1369 recR   TRUE 0.972 22.000 0.604 NA   NA
 1305629 1305630 CYA_1370 CYA_1371   ubiD TRUE 0.733 37.000 0.006 NA N NA
 1305630 1305631 CYA_1371 CYA_1372 ubiD   FALSE 0.545 22.000 0.000 NA N NA
 1305633 1305634 CYA_1374 CYA_1375     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1305634 1305635 CYA_1375 CYA_1376     FALSE 0.036 191.000 0.000 NA   NA
 1305640 1305641 CYA_1380 CYA_1382     FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 1305641 1305642 CYA_1382 CYA_1383     TRUE 0.837 0.000 0.013 NA   NA
 1305642 1305643 CYA_1383 CYA_1384     TRUE 0.843 35.000 0.041 NA   NA
 1305645 1305646 CYA_1385 CYA_1387 clpS-1   FALSE 0.028 204.000 0.000 NA   NA
 1305646 1305647 CYA_1387 CYA_1388     FALSE 0.418 63.000 0.000 NA   NA
 1305650 1305651 CYA_1391 CYA_1393     FALSE 0.065 170.000 0.000 NA   NA
 1305652 1305653 CYA_1392 CYA_1394   recO FALSE 0.005 454.000 0.000 1.000 N NA
 1305653 1305654 CYA_1394 CYA_1395 recO deoC TRUE 0.859 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1305655 1305656 CYA_1396 CYA_1397     TRUE 0.955 -3.000 0.215 NA   NA
 1305658 1305659 CYA_1399 CYA_1400     TRUE 0.918 30.000 0.095 NA   NA
 1305659 1305660 CYA_1400 CYA_1401     FALSE 0.637 65.000 0.006 NA   NA
 1305662 1305663 CYA_1403 CYA_1404 petC petA FALSE 0.167 478.000 0.881 0.042   NA
 1305665 1305666 CYA_1406 CYA_1407 groS groL-2 TRUE 0.951 67.000 0.048 0.009 Y NA
 1305666 1305667 CYA_1407 CYA_1408 groL-2   FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 1305667 1305668 CYA_1408 CYA_1409     FALSE 0.218 156.000 0.011 NA   NA
 1305668 1305669 CYA_1409 CYA_1410     FALSE 0.536 41.000 0.000 NA   NA
 1305669 1305670 CYA_1410 CYA_1411     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 1305670 1305671 CYA_1411 CYA_1412     FALSE 0.017 445.000 0.000 0.021   NA
 1305672 1305673 CYA_1413 CYA_1414     TRUE 0.775 68.000 0.050 NA   NA
 1305674 1305675 CYA_1415 CYA_1416 gyrA   FALSE 0.082 191.000 0.002 NA   NA
 1305675 1305676 CYA_1416 CYA_1417     FALSE 0.429 138.000 0.040 NA   NA
 1305676 1305677 CYA_1417 CYA_1418   psbW FALSE 0.259 172.000 0.040 1.000   NA
 1305678 1305679 CYA_1419 CYA_1420 gatA   FALSE 0.107 181.000 0.002 NA   NA
 1305679 1305680 CYA_1420 CYA_1421     FALSE 0.252 108.000 0.000 NA   NA
 1305680 1305681 CYA_1421 CYA_1422     FALSE 0.351 77.000 0.000 NA   NA
 1305681 1305682 CYA_1422 CYA_1423     FALSE 0.620 -9.000 0.000 NA   NA
 1305682 1305683 CYA_1423 CYA_1424     FALSE 0.402 67.000 0.000 NA   NA
 1305683 1305684 CYA_1424 CYA_1425     FALSE 0.356 76.000 0.000 NA   NA
 1305684 1305685 CYA_1425 CYA_1426     FALSE 0.414 64.000 0.000 NA   NA
 1305686 1305687 CYA_1427 CYA_1428     FALSE 0.070 167.000 0.000 NA   NA
 1305687 1305688 CYA_1428 CYA_1430     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 1305690 1305691 CYA_1431 CYA_1432     FALSE 0.387 70.000 0.000 NA   NA
 1305691 1305692 CYA_1432 CYA_1433     FALSE 0.152 139.000 0.000 NA   NA
 1305692 1305693 CYA_1433 CYA_1434     TRUE 0.662 2.000 0.000 NA   NA
 1305693 1305694 CYA_1434 CYA_1435     FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 1305697 1305698 CYA_1438 CYA_1439     TRUE 0.989 -145.000 1.000 NA Y NA
 1305698 1305699 CYA_1439 CYA_1440     FALSE 0.396 68.000 0.000 NA   NA
 1305699 1305700 CYA_1440 CYA_1441     FALSE 0.574 89.000 0.020 NA   NA
 1305700 1305701 CYA_1441 CYA_1442     FALSE 0.015 230.000 0.000 NA N NA
 1305701 1305702 CYA_1442 CYA_1443     FALSE 0.568 179.000 0.667 NA   NA
 1305702 1305703 CYA_1443 CYA_1444   acnB FALSE 0.584 76.000 0.007 NA   NA
 1305703 1305704 CYA_1444 CYA_1445 acnB prfA FALSE 0.626 75.000 0.002 1.000 N NA
 1305704 1305705 CYA_1445 CYA_1446 prfA rpmE TRUE 0.938 71.000 0.110 1.000 Y NA
 1305705 1305706 CYA_1446 CYA_1447 rpmE rpsI TRUE 0.947 78.000 0.062 0.015 Y NA
 1305706 1305707 CYA_1447 CYA_1448 rpsI rplM TRUE 0.994 -3.000 0.601 0.015 Y NA
 1305707 1305708 CYA_1448 CYA_1449 rplM truA TRUE 0.947 50.000 0.058 1.000 Y NA
 1305708 1305709 CYA_1449 CYA_1450 truA rplQ TRUE 0.979 6.000 0.102 1.000 Y NA
 1305709 1305710 CYA_1450 CYA_1451 rplQ rpoA TRUE 0.957 73.000 0.873 1.000 N NA
 1305710 1305711 CYA_1451 CYA_1452 rpoA rpsK TRUE 0.802 123.000 0.308 1.000 N NA
 1305711 1305712 CYA_1452 CYA_1453 rpsK rpsM TRUE 0.982 89.000 0.810 0.015 Y NA
 1305712 1305713 CYA_1453 CYA_1454 rpsM rpmJ FALSE 0.474 214.000 0.086 0.015 Y NA
 1305714 1305715 CYA_1455 CYA_1456     TRUE 0.973 59.000 0.500 0.001   NA
 1305715 1305716 CYA_1456 CYA_1457     FALSE 0.018 280.000 0.000 1.000   NA
 1305716 1305717 CYA_1457 CYA_1458     FALSE 0.540 109.000 0.007 1.000   NA
 1305717 1305718 CYA_1458 CYA_1459     FALSE 0.615 53.000 0.000 1.000   NA
 1305719 1305720 CYA_1460 CYA_1461     TRUE 0.833 4.000 0.006 NA   NA
 1305720 1305721 CYA_1461 CYA_1462   alr FALSE 0.003 470.000 0.000 NA   NA
 1305721 1305722 CYA_1462 CYA_1463 alr sppA-2 TRUE 0.790 41.000 0.012 1.000 N NA
 1305723 1305724 CYA_1464 CYA_1465     FALSE 0.002 654.000 0.000 NA   NA
 1305724 1305725 CYA_1465 CYA_1466   priA FALSE 0.533 42.000 0.000 NA   NA
 1305725 1305726 CYA_1466 CYA_1467 priA   FALSE 0.122 160.000 0.000 1.000 N NA
 1305728 1305729 CYA_1469 CYA_1470     TRUE 0.886 49.000 0.091 NA   NA
 1305730 1305731 CYA_1471 CYA_1472     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1305732 1305733 CYA_1473 CYA_1474   dcd TRUE 0.808 85.000 0.091 1.000 N NA
 1305733 1305734 CYA_1474 CYA_1476 dcd queA FALSE 0.567 92.000 0.002 1.000 N NA
 1305735 1305736 CYA_1475 CYA_1477     TRUE 0.714 29.000 0.000 1.000   NA
 1305737 1305738 CYA_1478 CYA_1479   pyrG TRUE 0.684 52.000 0.002 NA   NA
 1305740 1305741 CYA_1481 CYA_1482     FALSE 0.037 221.000 0.000 1.000   NA
 1305741 1305742 CYA_1482 CYA_1483   gvpK TRUE 0.732 87.000 0.047 1.000   NA
 1305742 1305743 CYA_1483 CYA_1484 gvpK   FALSE 0.499 121.000 0.013 1.000   NA
 1305744 1305745 CYA_1485 CYA_1486 ycf4   FALSE 0.021 221.000 0.000 NA   NA
 1305745 1305746 CYA_1486 CYA_1487     TRUE 0.896 -12.000 0.051 NA   NA
 1305746 1305747 CYA_1487 CYA_1488     TRUE 0.836 52.000 0.051 NA   NA
 1305747 1305748 CYA_1488 CYA_1489     FALSE 0.553 37.000 0.000 NA   NA
 1305748 1305749 CYA_1489 CYA_1490     FALSE 0.434 60.000 0.000 NA   NA
 1305750 1305751 CYA_1491 CYA_1492     FALSE 0.582 30.000 0.000 NA   NA
 1305751 1305752 CYA_1492 CYA_1493     FALSE 0.472 117.000 0.022 NA   NA
 1305752 1305753 CYA_1493 CYA_1495     FALSE 0.554 64.000 0.000 1.000   NA
 1305754 1305755 CYA_1494 CYA_1496     FALSE 0.154 157.000 0.000 1.000   NA
 1305755 1305756 CYA_1496 CYA_1497     FALSE 0.286 129.000 0.000 1.000   NA
 1305756 1305757 CYA_1497 CYA_1498     FALSE 0.217 120.000 0.000 NA   NA
 1305757 1305758 CYA_1498 CYA_1499     FALSE 0.375 73.000 0.000 NA   NA
 1305760 1305761 CYA_1501 CYA_1502     FALSE 0.536 41.000 0.000 NA   NA
 1305761 1305762 CYA_1502 CYA_1503     FALSE 0.035 193.000 0.000 NA   NA
 1305762 1305763 CYA_1503 CYA_1504   cobM FALSE 0.008 366.000 0.000 1.000 N NA
 1305765 1305766 CYA_1505 CYA_1507 ispD amt FALSE 0.296 150.000 0.003 1.000 N NA
 1305766 1305767 CYA_1507 CYA_1508 amt glnB FALSE 0.511 152.000 0.083 1.000 N NA
 1305767 1305768 CYA_1508 CYA_1509 glnB   FALSE 0.411 152.000 0.059 NA N NA
 1305768 1305769 CYA_1509 CYA_1510     FALSE 0.082 161.000 0.000 NA   NA
 1305771 1305772 CYA_1512 CYA_1513 ctaE ctaD TRUE 0.925 117.000 0.079 0.001 Y NA
 1305772 1305773 CYA_1513 CYA_1514 ctaD ctaC TRUE 0.990 -3.000 0.132 0.001 Y NA
 1305774 1305775 CYA_1515 CYA_1517   cyoE TRUE 0.952 53.000 0.090 1.000 Y NA
 1305778 1305779 CYA_1519 CYA_1520 rpsD gmd FALSE 0.189 165.000 0.002 1.000 N NA
 1305779 1305780 CYA_1520 CYA_1521 gmd   FALSE 0.370 147.000 0.025 1.000 N NA
 1305781 1305782 CYA_1522 CYA_1524   hisZ TRUE 0.639 81.000 0.004 1.000   NA
 1305783 1305784 CYA_1523 CYA_1525 gyrB rimM FALSE 0.066 182.000 0.000 1.000 N NA
 1305784 1305785 CYA_1525 CYA_1526 rimM   TRUE 0.849 12.000 0.002 1.000 N NA
 1305786 1305787 CYA_1527 CYA_1528     FALSE 0.336 81.000 0.000 NA   NA
 1305787 1305788 CYA_1528 CYA_1529     TRUE 0.893 80.000 0.333 1.000 N NA
 1305788 1305789 CYA_1529 CYA_1530     FALSE 0.375 73.000 0.000 NA   NA
 1305792 1305793 CYA_1533 CYA_1534 lspA   FALSE 0.018 238.000 0.000 NA   NA
 1305793 1305794 CYA_1534 CYA_1535   cysC FALSE 0.346 78.000 0.000 NA   NA
 1305797 1305798 CYA_1538 CYA_1539     FALSE 0.292 127.000 0.000 1.000   NA
 1305798 1305799 CYA_1539 CYA_1540     TRUE 0.877 24.000 0.000 0.038   NA
 1305801 1305802 CYA_1542 CYA_1544 atpC   FALSE 0.279 122.000 0.000 1.000 N NA
 1305803 1305804 CYA_1543 CYA_1545 glmS   TRUE 0.645 74.000 0.003 1.000 N NA
 1305804 1305805 CYA_1545 CYA_1546     TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1305805 1305806 CYA_1546 CYA_1547     FALSE 0.007 311.000 0.000 NA   NA
 1305806 1305807 CYA_1547 CYA_1548     FALSE 0.020 268.000 0.000 1.000   NA
 1305807 1305808 CYA_1548 CYA_1549     TRUE 0.738 21.000 0.000 1.000   NA
 1305808 1305809 CYA_1549 CYA_1550   dnaB FALSE 0.289 128.000 0.000 1.000   NA
 1305809 1305810 CYA_1550 CYA_1551 dnaB rplI TRUE 0.650 111.000 0.048 1.000 N NA
 1305811 1305812 CYA_1552 CYA_1553 pstS-2 pstC-1 TRUE 0.989 25.000 0.222 0.003 Y NA
 1305812 1305813 CYA_1553 CYA_1554 pstC-1 pstA-1 TRUE 0.991 7.000 0.222 0.003 Y NA
 1305813 1305814 CYA_1554 CYA_1555 pstA-1 pstB-1 TRUE 0.993 37.000 0.667 0.003 Y NA
 1305814 1305815 CYA_1555 CYA_1556 pstB-1   TRUE 0.680 66.000 0.003 1.000 N NA
 1305815 1305816 CYA_1556 CYA_1557     TRUE 0.658 44.000 0.000 1.000   NA
 1305816 1305817 CYA_1557 CYA_1558     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 1305818 1305819 CYA_1559 CYA_1560 sat   FALSE 0.234 114.000 0.000 NA   NA
 1305819 1305820 CYA_1560 CYA_1561     FALSE 0.186 129.000 0.000 NA   NA
 1305821 1305822 CYA_1562 CYA_1563 glgC   FALSE 0.321 153.000 0.020 1.000   NA
 1305822 1305823 CYA_1563 CYA_1564     FALSE 0.529 43.000 0.000 NA   NA
 1305823 1305824 CYA_1564 CYA_1565     FALSE 0.334 163.000 0.057 NA   NA
 1305824 1305825 CYA_1565 CYA_1567     TRUE 0.807 76.000 0.057 1.000   NA
 1305827 1305828 CYA_1568 CYA_1569   thiE TRUE 0.682 69.000 0.027 NA   NA
 1305828 1305829 CYA_1569 CYA_1570 thiE   FALSE 0.217 137.000 0.000 1.000 N NA
 1305829 1305830 CYA_1570 CYA_1571     FALSE 0.248 130.000 0.000 1.000 N NA
 1305830 1305831 CYA_1571 CYA_1572     FALSE 0.004 395.000 0.000 NA   NA
 1305831 1305832 CYA_1572 CYA_1573     TRUE 0.713 49.000 0.003 NA   NA
 1305832 1305833 CYA_1573 CYA_1574   cobH-2 FALSE 0.607 82.000 0.003 1.000 N NA
 1305833 1305834 CYA_1574 CYA_1575 cobH-2   FALSE 0.582 30.000 0.000 NA   NA
 1305835 1305836 CYA_1576 CYA_1577     FALSE 0.507 115.000 0.002 1.000   NA
 1305836 1305837 CYA_1577 CYA_1578     FALSE 0.509 47.000 0.000 NA   NA
 1305837 1305838 CYA_1578 CYA_1579     TRUE 0.906 52.000 0.154 NA   NA
 1305838 1305839 CYA_1579 CYA_1580     FALSE 0.563 152.000 0.154 NA   NA
 1305839 1305840 CYA_1580 CYA_1581     TRUE 0.772 67.000 0.049 NA   NA
 1305840 1305841 CYA_1581 CYA_1582     TRUE 0.993 7.000 0.976 0.021   NA
 1305841 1305842 CYA_1582 CYA_1583     TRUE 0.984 -10.000 0.864 1.000   NA
 1305842 1305843 CYA_1583 CYA_1584     TRUE 0.973 -28.000 0.591 1.000   NA
 1305844 1305845 CYA_1585 CYA_1587   codA FALSE 0.378 58.000 0.000 NA N NA
 1305846 1305847 CYA_1586 CYA_1588     TRUE 0.777 26.000 0.002 NA   NA
 1305847 1305848 CYA_1588 CYA_1589     TRUE 0.783 45.000 0.002 1.000   NA
 1305848 1305849 CYA_1589 CYA_1590     TRUE 0.642 68.000 0.015 NA   NA
 1305852 1305853 CYA_1593 CYA_1594     TRUE 0.996 14.000 0.875 0.003 Y NA
 1305853 1305854 CYA_1594 CYA_1595     TRUE 0.850 54.000 0.062 NA   NA
 1305854 1305855 CYA_1595 CYA_1596     FALSE 0.011 273.000 0.000 NA   NA
 1305855 1305856 CYA_1596 CYA_1597     FALSE 0.577 31.000 0.000 NA   NA
 1305856 1305857 CYA_1597 CYA_1598     FALSE 0.372 143.000 0.011 1.000   NA
 1305860 1305861 CYA_1601 CYA_1602   petE FALSE 0.110 152.000 0.000 NA   NA
 1305861 1305862 CYA_1602 CYA_1603 petE   FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 1305865 1305866 CYA_1606 CYA_1607     TRUE 0.805 55.000 0.048 NA   NA
 1305866 1305867 CYA_1607 CYA_1608     TRUE 0.734 43.000 0.003 NA   NA
 1305867 1305868 CYA_1608 CYA_1609     TRUE 0.772 22.000 0.003 NA N NA
 1305868 1305869 CYA_1609 CYA_1610     FALSE 0.356 76.000 0.000 NA   NA
 1305869 1305870 CYA_1610 CYA_1611   ccmK-1 FALSE 0.008 295.000 0.000 NA   NA
 1305870 1305871 CYA_1611 CYA_1612 ccmK-1 ccmK-2 TRUE 0.896 92.000 0.105 NA Y NA
 1305871 1305872 CYA_1612 CYA_1613 ccmK-2 ccmL TRUE 0.992 1.000 0.818 NA Y NA
 1305872 1305873 CYA_1613 CYA_1614 ccmL ccmM TRUE 0.935 49.000 0.333 NA   NA
 1305873 1305874 CYA_1614 CYA_1615 ccmM   TRUE 0.860 81.000 0.040 0.004   NA
 1305874 1305875 CYA_1615 CYA_1616     TRUE 0.800 32.000 0.020 NA   NA
 1305875 1305876 CYA_1616 CYA_1617     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 1305877 1305878 CYA_1618 CYA_1619   rplS FALSE 0.418 63.000 0.000 NA   NA
 1305879 1305880 CYA_1620 CYA_1621   macB TRUE 0.988 -3.000 0.667 0.063 N NA
 1305880 1305881 CYA_1621 CYA_1622 macB thrB FALSE 0.469 73.000 0.000 1.000 N NA
 1305882 1305883 CYA_1623 CYA_1624 dgkA   TRUE 0.925 32.000 0.123 NA   NA
 1305883 1305884 CYA_1624 CYA_1625   eda FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 1305886 1305887 CYA_1626 CYA_1628     FALSE 0.439 59.000 0.000 NA   NA
 1305889 1305890 CYA_1630 CYA_1631     TRUE 0.981 77.000 0.506 0.002 Y NA
 1305890 1305891 CYA_1631 CYA_1632     FALSE 0.217 120.000 0.000 NA   NA
 1305891 1305892 CYA_1632 CYA_1633     FALSE 0.021 224.000 0.000 NA   NA
 1305892 1305893 CYA_1633 CYA_1634     TRUE 0.925 0.000 0.063 NA   NA
 1305894 1305895 CYA_1635 CYA_1636   mtnN FALSE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 1305897 1305898 CYA_1638 CYA_1639 rpsB tsf TRUE 0.794 176.000 0.748 1.000 Y NA
 1305898 1305899 CYA_1639 CYA_1640 tsf   FALSE 0.039 207.000 0.000 1.000 N NA
 1305899 1305900 CYA_1640 CYA_1641     TRUE 0.842 24.000 0.017 1.000 N NA
 1305902 1305903 CYA_1643 CYA_1644     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1305903 1305904 CYA_1644 CYA_1645     FALSE 0.604 -15.000 0.000 NA   NA
 1305904 1305905 CYA_1645 CYA_1646     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1305905 1305906 CYA_1646 CYA_1648     FALSE 0.588 -22.000 0.000 NA   NA
 1305909 1305910 CYA_1650 CYA_1651   rpsR TRUE 0.877 64.000 0.002 1.000 Y NA
 1305910 1305911 CYA_1651 CYA_1652 rpsR rpmG TRUE 0.971 30.000 0.037 0.015 Y NA
 1305911 1305912 CYA_1652 CYA_1653 rpmG   TRUE 0.848 90.000 0.243 NA   NA
 1305912 1305913 CYA_1653 CYA_1654   rnz FALSE 0.175 132.000 0.000 NA   NA
 1305915 1305916 CYA_1656 CYA_1657     TRUE 0.987 -13.000 0.143 0.007 Y NA
 1305916 1305917 CYA_1657 CYA_1658     FALSE 0.067 242.000 0.000 0.062 N NA
 1305918 1305919 CYA_1659 CYA_1660     FALSE 0.562 35.000 0.000 NA   NA
 1305919 1305920 CYA_1660 CYA_1661     FALSE 0.543 39.000 0.000 NA   NA
 1305920 1305921 CYA_1661 CYA_1662     TRUE 0.891 -18.000 0.000 NA Y NA
 1305921 1305922 CYA_1662 CYA_1663     FALSE 0.008 362.000 0.000 1.000 N NA
 1305922 1305923 CYA_1663 CYA_1664     TRUE 0.867 12.000 0.017 1.000 N NA
 1305923 1305924 CYA_1664 CYA_1665     FALSE 0.263 134.000 0.000 1.000   NA
 1305924 1305925 CYA_1665 CYA_1666     FALSE 0.579 -31.000 0.000 NA   NA
 1305925 1305926 CYA_1666 CYA_1667   purE TRUE 0.752 -30.000 0.004 NA N NA
 1305926 1305927 CYA_1667 CYA_1668 purE   FALSE 0.148 168.000 0.002 NA   NA
 1305927 1305928 CYA_1668 CYA_1669     FALSE 0.161 136.000 0.000 NA   NA
 1305928 1305929 CYA_1669 CYA_1670     TRUE 0.880 99.000 0.500 NA   NA
 1305929 1305930 CYA_1670 CYA_1672     TRUE 0.982 3.000 0.750 NA   NA
 1305931 1305932 CYA_1671 CYA_1673   guaA TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1305933 1305934 CYA_1674 CYA_1675   gidB TRUE 0.813 -3.000 0.002 NA   NA
 1305937 1305938 CYA_1678 CYA_1679     TRUE 0.992 16.000 0.500 0.085 Y NA
 1305939 1305940 CYA_1680 CYA_1681   aspS FALSE 0.639 73.000 0.002 1.000 N NA
 1305940 1305941 CYA_1681 CYA_1682 aspS   FALSE 0.530 60.000 0.000 1.000 N NA
 1305941 1305942 CYA_1682 CYA_1683     TRUE 0.820 22.000 0.018 NA   NA
 1305943 1305944 CYA_1684 CYA_1685     TRUE 0.925 -3.000 0.071 NA   NA
 1305944 1305945 CYA_1685 CYA_1686     FALSE 0.383 71.000 0.000 NA   NA
 1305945 1305946 CYA_1686 CYA_1687     TRUE 0.982 0.000 0.242 0.005   NA
 1305947 1305948 CYA_1688 CYA_1689     TRUE 0.867 -7.000 0.038 NA   NA
 1305948 1305949 CYA_1689 CYA_1690   radC TRUE 0.942 8.000 0.083 1.000 N NA
 1305950 1305951 CYA_1691 CYA_1692 fmt   TRUE 0.779 25.000 0.002 NA   NA
 1305951 1305952 CYA_1692 CYA_1693   mgtE-2 FALSE 0.059 173.000 0.000 NA   NA
 1305952 1305953 CYA_1693 CYA_1694 mgtE-2   FALSE 0.013 289.000 0.000 1.000 N NA
 1305954 1305955 CYA_1695 CYA_1696     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 1305957 1305958 CYA_1698 CYA_1699 fbp zwf TRUE 0.926 42.000 0.015 1.000 Y NA
 1305958 1305959 CYA_1699 CYA_1700 zwf   FALSE 0.147 153.000 0.000 1.000 N NA
 1305962 1305963 CYA_1703 CYA_1704 ileS   FALSE 0.003 520.000 0.000 NA   NA
 1305964 1305965 CYA_1705 CYA_1706     FALSE 0.157 177.000 0.035 NA N NA
 1305965 1305966 CYA_1706 CYA_1707     FALSE 0.310 89.000 0.000 NA   NA
 1305966 1305967 CYA_1707 CYA_1708     FALSE 0.006 331.000 0.000 NA   NA
 1305968 1305969 CYA_1709 CYA_1710     TRUE 0.932 -267.000 0.222 NA   NA
 1305969 1305970 CYA_1710 CYA_1711     FALSE 0.138 144.000 0.000 NA   NA
 1305970 1305971 CYA_1711 CYA_1712   pyrF TRUE 0.824 12.000 0.005 NA   NA
 1305971 1305972 CYA_1712 CYA_1713 pyrF   TRUE 0.800 21.000 0.003 NA   NA
 1305972 1305973 CYA_1713 CYA_1714     FALSE 0.585 -25.000 0.000 NA   NA
 1305973 1305974 CYA_1714 CYA_1715     FALSE 0.409 65.000 0.000 NA   NA
 1305974 1305975 CYA_1715 CYA_1716     TRUE 0.817 -3.000 0.003 NA   NA
 1305976 1305977 CYA_1717 CYA_1719     FALSE 0.631 17.000 0.000 NA   NA
 1305979 1305980 CYA_1720 CYA_1721     FALSE 0.549 98.000 0.025 NA   NA
 1305980 1305981 CYA_1721 CYA_1722     TRUE 0.845 20.000 0.028 NA   NA
 1305981 1305982 CYA_1722 CYA_1724   sulP TRUE 0.955 -3.000 0.042 NA Y NA
 1305984 1305985 CYA_1725 CYA_1727 trx-2 lipB TRUE 0.726 14.000 0.000 1.000 N NA
 1305986 1305987 CYA_1726 CYA_1728     FALSE 0.407 97.000 0.000 1.000   NA
 1305988 1305989 CYA_1729 CYA_1730 purB pyrB TRUE 0.950 10.000 0.002 1.000 Y NA
 1305991 1305992 CYA_1732 CYA_1733 pstS-3 pstC-2 TRUE 0.828 149.000 0.054 0.003 Y NA
 1305992 1305993 CYA_1733 CYA_1734 pstC-2 pstA-2 TRUE 0.980 39.000 0.081 0.003 Y NA
 1305993 1305994 CYA_1734 CYA_1735 pstA-2 pstB-2 TRUE 0.981 71.000 0.429 0.003 Y NA
 1305994 1305995 CYA_1735 CYA_1736 pstB-2   FALSE 0.564 113.000 0.029 1.000 N NA
 1305996 1305997 CYA_1737 CYA_1738     FALSE 0.005 356.000 0.000 NA   NA
 1305997 1305998 CYA_1738 CYA_1739     TRUE 0.671 79.000 0.038 NA   NA
 1305998 1305999 CYA_1739 CYA_1740     FALSE 0.034 194.000 0.000 NA   NA
 1306001 1306002 CYA_1742 CYA_1743     FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 1306003 1306004 CYA_1744 CYA_1745     TRUE 0.650 12.000 0.000 NA   NA
 1306004 1306005 CYA_1745 CYA_1746     FALSE 0.456 84.000 0.000 1.000   NA
 1306005 1306006 CYA_1746 CYA_1747     TRUE 0.790 45.000 0.003 1.000   NA
 1306007 1306008 CYA_1748 CYA_1749 psbA-2 carB FALSE 0.012 324.000 0.000 1.000   NA
 1306008 1306009 CYA_1749 CYA_1750 carB   FALSE 0.003 410.000 0.000 NA N NA
 1306009 1306010 CYA_1750 CYA_1751     TRUE 0.987 -3.000 0.489 NA Y NA
 1306010 1306011 CYA_1751 CYA_1752     TRUE 0.977 10.000 0.605 NA   NA
 1306011 1306012 CYA_1752 CYA_1753     TRUE 0.977 12.000 0.605 NA   NA
 1306012 1306013 CYA_1753 CYA_1754     TRUE 0.984 -3.000 0.913 NA   NA
 1306013 1306014 CYA_1754 CYA_1755     TRUE 0.972 2.000 0.404 NA   NA
 1306014 1306015 CYA_1755 CYA_1756     TRUE 0.991 -7.000 0.306 0.007 Y NA
 1306016 1306017 CYA_1757 CYA_1758     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 1306020 1306021 CYA_1761 CYA_1762     TRUE 0.975 -3.000 0.571 NA   NA
 1306021 1306022 CYA_1762 CYA_1763   mfd TRUE 0.691 104.000 0.002 0.084 N NA
 1306023 1306024 CYA_1764 CYA_1766 cydA cydB TRUE 0.981 82.000 0.750 0.039 Y NA
 1306025 1306026 CYA_1765 CYA_1767     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1306026 1306027 CYA_1767 CYA_1768   rimI FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 1306027 1306028 CYA_1768 CYA_1769 rimI   TRUE 0.660 7.000 0.000 NA   NA
 1306028 1306029 CYA_1769 CYA_1770   purK TRUE 0.822 -3.000 0.007 NA   NA
 1306030 1306031 CYA_1771 CYA_1772     FALSE 0.462 55.000 0.000 NA   NA
 1306031 1306032 CYA_1772 CYA_1773     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306032 1306033 CYA_1773 CYA_1774     FALSE 0.588 -22.000 0.000 NA   NA
 1306033 1306034 CYA_1774 CYA_1775   trmD TRUE 0.821 6.000 0.002 NA   NA
 1306034 1306035 CYA_1775 CYA_1776 trmD   TRUE 0.794 -9.000 0.002 NA   NA
 1306035 1306036 CYA_1776 CYA_1777   secE FALSE 0.467 102.000 0.002 NA   NA
 1306036 1306037 CYA_1777 CYA_1778 secE nusG TRUE 0.944 84.000 0.843 1.000 N NA
 1306037 1306038 CYA_1778 CYA_1779 nusG rplK TRUE 0.982 10.000 0.681 1.000 N NA
 1306038 1306039 CYA_1779 CYA_1780 rplK rplA TRUE 0.979 100.000 0.838 0.019 Y NA
 1306039 1306040 CYA_1780 CYA_1781 rplA   FALSE 0.625 -7.000 0.000 NA   NA
 1306040 1306041 CYA_1781 CYA_1782   rplJ FALSE 0.023 216.000 0.000 NA   NA
 1306041 1306042 CYA_1782 CYA_1784 rplJ rplL TRUE 0.988 74.000 0.884 0.015 Y NA
 1306044 1306045 CYA_1785 CYA_1786 oxaA   TRUE 0.946 44.000 0.254 1.000   NA
 1306045 1306046 CYA_1786 CYA_1787     FALSE 0.560 86.000 0.015 NA   NA
 1306046 1306047 CYA_1787 CYA_1788     TRUE 0.690 53.000 0.002 NA   NA
 1306050 1306051 CYA_1791 CYA_1792     FALSE 0.548 38.000 0.000 NA   NA
 1306051 1306052 CYA_1792 CYA_1793     FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 1306052 1306053 CYA_1793 CYA_1794     TRUE 0.888 25.000 0.000 0.015   NA
 1306053 1306054 CYA_1794 CYA_1795   prc-1 FALSE 0.441 89.000 0.000 1.000   NA
 1306055 1306056 CYA_1796 CYA_1797 petB petD TRUE 0.933 96.000 0.471 0.061   NA
 1306056 1306057 CYA_1797 CYA_1798 petD leuB FALSE 0.225 143.000 0.000 1.000   NA
 1306059 1306060 CYA_1800 CYA_1801     TRUE 0.646 82.000 0.013 1.000   NA
 1306062 1306063 CYA_1803 CYA_1804 upp   FALSE 0.014 307.000 0.000 1.000   NA
 1306063 1306064 CYA_1804 CYA_1805     FALSE 0.474 125.000 0.013 1.000   NA
 1306064 1306065 CYA_1805 CYA_1806     FALSE 0.059 194.000 0.000 1.000   NA
 1306067 1306068 CYA_1808 CYA_1809     TRUE 0.819 43.000 0.039 NA   NA
 1306068 1306069 CYA_1809 CYA_1810     TRUE 0.875 5.000 0.011 1.000   NA
 1306069 1306070 CYA_1810 CYA_1811   psbA-3 FALSE 0.556 105.000 0.011 1.000   NA
 1306070 1306071 CYA_1811 CYA_1812 psbA-3 ruvB-1 FALSE 0.370 140.000 0.002 1.000   NA
 1306071 1306072 CYA_1812 CYA_1813 ruvB-1   FALSE 0.048 181.000 0.000 NA   NA
 1306075 1306076 CYA_1815 CYA_1817     FALSE 0.094 157.000 0.000 NA   NA
 1306076 1306077 CYA_1817 CYA_1818     FALSE 0.274 153.000 0.011 1.000 N NA
 1306077 1306078 CYA_1818 CYA_1819   nifZ TRUE 0.984 -3.000 0.354 0.004   NA
 1306078 1306079 CYA_1819 CYA_1820 nifZ nifV TRUE 0.714 136.000 0.171 1.000   NA
 1306081 1306082 CYA_1821 CYA_1823 nifK nifD TRUE 0.991 66.000 0.902 0.001 Y NA
 1306082 1306083 CYA_1823 CYA_1824 nifD nifH TRUE 0.872 97.000 0.065 0.001 N NA
 1306083 1306084 CYA_1824 CYA_1825 nifH nifU FALSE 0.015 278.000 0.000 1.000 N NA
 1306084 1306085 CYA_1825 CYA_1826 nifU nifS TRUE 0.961 57.000 0.716 1.000 N NA
 1306085 1306086 CYA_1826 CYA_1827 nifS   TRUE 0.807 49.000 0.023 1.000   NA
 1306086 1306087 CYA_1827 CYA_1828   nifB TRUE 0.862 26.000 0.024 1.000   NA
 1306087 1306088 CYA_1828 CYA_1829 nifB   FALSE 0.105 153.000 0.000 NA   NA
 1306089 1306090 CYA_1830 CYA_1831   dpsA TRUE 0.913 55.000 0.231 NA   NA
 1306090 1306091 CYA_1831 CYA_1832 dpsA   TRUE 0.897 43.000 0.091 NA   NA
 1306091 1306092 CYA_1832 CYA_1833     TRUE 0.925 4.000 0.061 NA   NA
 1306092 1306093 CYA_1833 CYA_1834   nifE TRUE 0.811 -9.000 0.013 NA   NA
 1306093 1306094 CYA_1834 CYA_1835 nifE nifN TRUE 0.993 -12.000 0.475 0.002 Y NA
 1306094 1306095 CYA_1835 CYA_1836 nifN nifX TRUE 0.967 75.000 0.663 0.004   NA
 1306095 1306096 CYA_1836 CYA_1837 nifX   TRUE 0.958 3.000 0.210 NA   NA
 1306096 1306097 CYA_1837 CYA_1838     TRUE 0.879 67.000 0.179 NA   NA
 1306097 1306098 CYA_1838 CYA_1839   nifW TRUE 0.923 -3.000 0.067 NA   NA
 1306098 1306099 CYA_1839 CYA_1840 nifW   TRUE 0.824 43.000 0.022 1.000   NA
 1306099 1306100 CYA_1840 CYA_1841     TRUE 0.957 29.000 0.250 1.000   NA
 1306100 1306101 CYA_1841 CYA_1842     TRUE 0.839 95.000 0.250 NA   NA
 1306101 1306102 CYA_1842 CYA_1843     FALSE 0.006 343.000 0.000 NA   NA
 1306104 1306105 CYA_1845 CYA_1846 modA modB TRUE 0.970 24.000 0.103 0.001 N NA
 1306107 1306108 CYA_1848 CYA_1849   psbA-4 FALSE 0.556 105.000 0.011 1.000   NA
 1306108 1306109 CYA_1849 CYA_1850 psbA-4 ruvB-2 FALSE 0.169 174.000 0.002 1.000   NA
 1306112 1306113 CYA_1853 CYA_1854     FALSE 0.523 44.000 0.000 NA   NA
 1306115 1306116 CYA_1855 CYA_1857   crtH FALSE 0.122 160.000 0.000 1.000 N NA
 1306116 1306117 CYA_1857 CYA_1858 crtH potB FALSE 0.403 88.000 0.000 1.000 N NA
 1306117 1306118 CYA_1858 CYA_1859 potB potA TRUE 0.991 -6.000 0.364 0.020 Y NA
 1306118 1306119 CYA_1859 CYA_1860 potA   FALSE 0.535 68.000 0.000 1.000   NA
 1306120 1306121 CYA_1861 CYA_1862   frr-2 FALSE 0.226 117.000 0.000 NA   NA
 1306121 1306122 CYA_1862 CYA_1863 frr-2   TRUE 0.734 96.000 0.000 1.000 Y NA
 1306122 1306123 CYA_1863 CYA_1864     FALSE 0.438 90.000 0.000 1.000   NA
 1306123 1306124 CYA_1864 CYA_1865     FALSE 0.003 472.000 0.000 NA   NA
 1306124 1306125 CYA_1865 CYA_1866   aroB FALSE 0.342 79.000 0.000 NA   NA
 1306125 1306126 CYA_1866 CYA_1867 aroB asd TRUE 0.936 -21.000 0.002 1.000 Y NA
 1306126 1306127 CYA_1867 CYA_1868 asd   FALSE 0.562 35.000 0.000 NA   NA
 1306127 1306128 CYA_1868 CYA_1869     FALSE 0.002 604.000 0.000 NA   NA
 1306128 1306129 CYA_1869 CYA_1871   est TRUE 0.906 30.000 0.051 1.000   NA
 1306131 1306132 CYA_1872 CYA_1873     TRUE 0.662 5.000 0.000 NA   NA
 1306132 1306133 CYA_1873 CYA_1874     TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 1306134 1306135 CYA_1875 CYA_1876 murB murC TRUE 0.989 -3.000 0.136 0.003 Y NA
 1306136 1306137 CYA_1877 CYA_1878   devC TRUE 0.989 10.000 0.200 0.061 Y NA
 1306137 1306138 CYA_1878 CYA_1880 devC devA FALSE 0.270 179.000 0.000 1.000 Y NA
 1306139 1306140 CYA_1879 CYA_1881   alaS FALSE 0.501 66.000 0.000 1.000 N NA
 1306143 1306144 CYA_1884 CYA_1885   hisC FALSE 0.323 84.000 0.000 NA   NA
 1306145 1306146 CYA_1886 CYA_1887     FALSE 0.008 296.000 0.000 NA   NA
 1306148 1306149 CYA_1889 CYA_1890     FALSE 0.476 53.000 0.000 NA   NA
 1306149 1306150 CYA_1890 CYA_1891     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306150 1306151 CYA_1891 CYA_1892     FALSE 0.636 94.000 0.000 0.036 N NA
 1306151 1306152 CYA_1892 CYA_1893     FALSE 0.204 148.000 0.000 1.000   NA
 1306152 1306153 CYA_1893 CYA_1894     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 1306153 1306154 CYA_1894 CYA_1895     FALSE 0.544 94.000 0.019 NA   NA
 1306156 1306157 CYA_1897 CYA_1898     TRUE 0.666 85.000 0.042 NA   NA
 1306157 1306158 CYA_1898 CYA_1899   thiL FALSE 0.033 197.000 0.000 NA   NA
 1306158 1306159 CYA_1899 CYA_1900 thiL kaiC FALSE 0.413 84.000 0.000 1.000 N NA
 1306159 1306160 CYA_1900 CYA_1901 kaiC kaiB TRUE 0.984 26.000 0.927 1.000   NA
 1306160 1306161 CYA_1901 CYA_1902 kaiB kaiA TRUE 0.985 4.000 0.732 1.000   NA
 1306162 1306163 CYA_1903 CYA_1904   pgsA FALSE 0.011 312.000 0.000 1.000 N NA
 1306163 1306164 CYA_1904 CYA_1905 pgsA ruvC TRUE 0.664 -46.000 0.000 1.000 N NA
 1306164 1306165 CYA_1905 CYA_1906 ruvC   TRUE 0.698 67.000 0.002 1.000   NA
 1306165 1306166 CYA_1906 CYA_1907     FALSE 0.183 130.000 0.000 NA   NA
 1306166 1306167 CYA_1907 CYA_1908     TRUE 0.884 46.000 0.080 NA   NA
 1306167 1306168 CYA_1908 CYA_1909     FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 1306170 1306171 CYA_1911 CYA_1912     TRUE 0.950 51.000 0.400 1.000   NA
 1306177 1306178 CYA_1918 CYA_1919     TRUE 0.810 145.000 0.632 1.000   NA
 1306179 1306180 CYA_1920 CYA_1921     TRUE 0.965 35.000 0.126 0.015   NA
 1306180 1306181 CYA_1921 CYA_1922     FALSE 0.196 171.000 0.011 1.000   NA
 1306181 1306182 CYA_1922 CYA_1923     TRUE 0.975 4.000 0.013 0.020 Y NA
 1306182 1306183 CYA_1923 CYA_1924     TRUE 0.887 105.000 0.092 1.000 Y NA
 1306184 1306185 CYA_1925 CYA_1926     FALSE 0.492 68.000 0.000 1.000 N NA
 1306188 1306189 CYA_1928 CYA_1930     FALSE 0.629 71.000 0.015 NA   NA
 1306189 1306190 CYA_1930 CYA_1931     TRUE 0.751 59.000 0.037 NA   NA
 1306191 1306192 CYA_1932 CYA_1933 psaK psbK TRUE 0.758 126.000 0.050 0.018   NA
 1306193 1306194 CYA_1934 CYA_1935     FALSE 0.241 112.000 0.000 NA   NA
 1306195 1306196 CYA_1936 CYA_1937 chlI   FALSE 0.606 106.000 0.000 0.022 N NA
 1306196 1306197 CYA_1937 CYA_1938     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306198 1306199 CYA_1939 CYA_1940     FALSE 0.445 58.000 0.000 NA   NA
 1306199 1306200 CYA_1940 CYA_1941     FALSE 0.138 144.000 0.000 NA   NA
 1306200 1306201 CYA_1941 CYA_1942   icc FALSE 0.165 135.000 0.000 NA   NA
 1306201 1306202 CYA_1942 CYA_1943 icc psbP FALSE 0.068 188.000 0.000 1.000   NA
 1306202 1306203 CYA_1943 CYA_1944 psbP   FALSE 0.197 149.000 0.000 1.000   NA
 1306203 1306204 CYA_1944 CYA_1945     FALSE 0.053 199.000 0.000 1.000   NA
 1306205 1306206 CYA_1946 CYA_1947     TRUE 0.861 7.000 0.010 1.000 N NA
 1306207 1306208 CYA_1948 CYA_1949     TRUE 0.807 38.000 0.030 NA   NA
 1306208 1306209 CYA_1949 CYA_1950     TRUE 0.920 38.000 0.130 NA   NA
 1306209 1306210 CYA_1950 CYA_1951     TRUE 0.940 4.000 0.095 NA   NA
 1306213 1306214 CYA_1954 CYA_1955   lpxC TRUE 0.829 7.000 0.003 NA   NA
 1306214 1306215 CYA_1955 CYA_1956 lpxC   FALSE 0.017 268.000 0.000 1.000 N NA
 1306215 1306216 CYA_1956 CYA_1957   fabZ FALSE 0.431 80.000 0.000 1.000 N NA
 1306218 1306219 CYA_1959 CYA_1960   lpxA FALSE 0.020 208.000 0.000 NA N NA
 1306219 1306220 CYA_1960 CYA_1961 lpxA lpxB TRUE 0.972 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 1306221 1306222 CYA_1962 CYA_1963     TRUE 0.963 5.000 0.258 NA   NA
 1306223 1306224 CYA_1964 CYA_1965     FALSE 0.265 157.000 0.017 1.000 N NA
 1306224 1306225 CYA_1965 CYA_1966   pilT-1 TRUE 0.761 173.000 0.178 0.013 Y NA
 1306225 1306226 CYA_1966 CYA_1967 pilT-1 pilC TRUE 0.737 161.000 0.218 1.000 Y NA
 1306226 1306227 CYA_1967 CYA_1968 pilC   TRUE 0.767 52.000 0.007 1.000   NA
 1306227 1306228 CYA_1968 CYA_1969     FALSE 0.481 78.000 0.000 1.000   NA
 1306228 1306229 CYA_1969 CYA_1971     FALSE 0.217 137.000 0.000 1.000 N NA
 1306232 1306233 CYA_1973 CYA_1974   folD FALSE 0.011 331.000 0.000 1.000   NA
 1306233 1306234 CYA_1974 CYA_1975 folD xseB FALSE 0.553 102.000 0.002 1.000   NA
 1306234 1306235 CYA_1975 CYA_1976 xseB xseA TRUE 0.984 -19.000 0.412 0.001   NA
 1306236 1306237 CYA_1977 CYA_1978     FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 1306237 1306238 CYA_1978 CYA_1979     FALSE 0.217 120.000 0.000 NA   NA
 1306238 1306239 CYA_1979 CYA_1980     TRUE 0.957 23.000 0.333 NA   NA
 1306239 1306240 CYA_1980 CYA_1981     TRUE 0.736 100.000 0.057 1.000   NA
 1306240 1306241 CYA_1981 CYA_1982   mraY FALSE 0.161 172.000 0.002 1.000 N NA
 1306241 1306242 CYA_1982 CYA_1983 mraY   FALSE 0.023 217.000 0.000 NA   NA
 1306243 1306244 CYA_1984 CYA_1985     TRUE 0.647 64.000 0.011 NA   NA
 1306244 1306245 CYA_1985 CYA_1986     TRUE 0.839 28.000 0.011 1.000   NA
 1306245 1306246 CYA_1986 CYA_1987     FALSE 0.217 120.000 0.000 NA   NA
 1306247 1306248 CYA_1988 CYA_1990 murA   FALSE 0.279 122.000 0.000 1.000 N NA
 1306249 1306250 CYA_1989 CYA_1991     TRUE 0.740 120.000 0.118 1.000 N NA
 1306250 1306251 CYA_1991 CYA_1992     FALSE 0.196 143.000 0.000 1.000 N NA
 1306252 1306253 CYA_1993 CYA_1994     FALSE 0.290 94.000 0.000 NA   NA
 1306253 1306254 CYA_1994 CYA_1995     TRUE 0.994 -3.000 0.428 0.002 Y NA
 1306254 1306255 CYA_1995 CYA_1996     TRUE 0.994 2.000 0.406 0.002 Y NA
 1306255 1306256 CYA_1996 CYA_1997     TRUE 0.819 48.000 0.045 NA   NA
 1306256 1306257 CYA_1997 CYA_1998     TRUE 0.825 12.000 0.005 NA   NA
 1306257 1306258 CYA_1998 CYA_1999     FALSE 0.533 -252.000 0.000 NA   NA
 1306259 1306260 CYA_2000 CYA_2001     FALSE 0.577 31.000 0.000 NA   NA
 1306260 1306261 CYA_2001 CYA_2002     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306261 1306262 CYA_2002 CYA_2003     FALSE 0.071 186.000 0.000 1.000   NA
 1306263 1306264 CYA_2004 CYA_2005     FALSE 0.013 311.000 0.000 1.000   NA
 1306264 1306265 CYA_2005 CYA_2006     FALSE 0.524 61.000 0.000 1.000 N NA
 1306265 1306266 CYA_2006 CYA_2007     FALSE 0.050 179.000 0.000 NA   NA
 1306266 1306267 CYA_2007 CYA_2008     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 1306269 1306270 CYA_2010 CYA_2012     FALSE 0.003 587.000 0.000 NA   NA
 1306271 1306272 CYA_2013 CYA_2014 recG psaM FALSE 0.023 262.000 0.000 1.000   NA
 1306273 1306274 CYA_2015 CYA_2016 glyA   TRUE 0.936 34.000 0.137 1.000 N NA
 1306274 1306275 CYA_2016 CYA_2017     TRUE 0.836 8.000 0.013 NA   NA
 1306280 1306281 CYA_2022 CYA_2023 recF   FALSE 0.262 104.000 0.000 NA   NA
 1306281 1306282 CYA_2023 CYA_2024     FALSE 0.304 91.000 0.000 NA   NA
 1306282 1306283 CYA_2024 CYA_2025     TRUE 0.662 1.000 0.000 NA   NA
 1306283 1306284 CYA_2025 CYA_2026     FALSE 0.267 101.000 0.000 NA   NA
 1306284 1306285 CYA_2026 CYA_2027     FALSE 0.613 22.000 0.000 NA   NA
 1306287 1306288 CYA_2029 CYA_2030     TRUE 0.977 30.000 0.250 0.001 N NA
 1306288 1306289 CYA_2030 CYA_2031     TRUE 0.852 41.000 0.041 1.000 N NA
 1306289 1306290 CYA_2031 CYA_2032     TRUE 0.958 38.000 0.061 1.000 Y NA
 1306290 1306291 CYA_2032 CYA_2033     TRUE 0.987 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 1306291 1306292 CYA_2033 CYA_2034     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA N NA
 1306296 1306297 CYA_2038 CYA_2039 mviN   FALSE 0.072 166.000 0.000 NA   NA
 1306297 1306298 CYA_2039 CYA_2040   cpcE-2 FALSE 0.023 214.000 0.000 NA   NA
 1306298 1306299 CYA_2040 CYA_2041 cpcE-2 cpcC TRUE 0.975 33.000 0.667 1.000   NA
 1306299 1306300 CYA_2041 CYA_2042 cpcC cpcA-2 FALSE 0.057 275.000 0.000 0.007   NA
 1306300 1306301 CYA_2042 CYA_2043 cpcA-2 cpcB-2 TRUE 0.766 188.000 1.000 0.005   NA
 1306302 1306303 CYA_2044 CYA_2045 cpeT pheS FALSE 0.178 152.000 0.000 1.000   NA
 1306304 1306305 CYA_2046 CYA_2047     FALSE 0.137 198.000 0.048 NA   NA
 1306305 1306306 CYA_2047 CYA_2048     TRUE 0.741 88.000 0.061 NA   NA
 1306306 1306307 CYA_2048 CYA_2049     TRUE 0.847 60.000 0.061 1.000 N NA
 1306307 1306308 CYA_2049 CYA_2050     FALSE 0.020 259.000 0.000 1.000 N NA
 1306308 1306309 CYA_2050 CYA_2051   rpmA FALSE 0.257 127.000 0.000 1.000 N NA
 1306309 1306310 CYA_2051 CYA_2052 rpmA rplU TRUE 0.988 61.000 0.667 0.014 Y NA
 1306310 1306311 CYA_2052 CYA_2053 rplU   FALSE 0.091 158.000 0.000 NA   NA
 1306311 1306312 CYA_2053 CYA_2054     TRUE 0.958 53.000 0.667 NA   NA
 1306312 1306313 CYA_2054 CYA_2055     TRUE 0.973 -3.000 0.500 NA   NA
 1306313 1306314 CYA_2055 CYA_2056     TRUE 0.837 122.000 0.500 NA   NA
 1306314 1306315 CYA_2056 CYA_2057     FALSE 0.010 277.000 0.000 NA   NA
 1306315 1306316 CYA_2057 CYA_2058     TRUE 0.868 -3.000 0.012 1.000   NA
 1306317 1306318 CYA_2059 CYA_2060 lpdA   FALSE 0.426 136.000 0.024 1.000 N NA
 1306319 1306320 CYA_2061 CYA_2062   glgB FALSE 0.600 25.000 0.000 NA   NA
 1306320 1306321 CYA_2062 CYA_2063 glgB   FALSE 0.277 81.000 0.000 NA N NA
 1306322 1306323 CYA_2064 CYA_2065   tatA-2 FALSE 0.030 224.000 0.000 1.000 N NA
 1306323 1306324 CYA_2065 CYA_2066 tatA-2   FALSE 0.031 239.000 0.000 1.000   NA
 1306324 1306325 CYA_2066 CYA_2067     FALSE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 1306325 1306326 CYA_2067 CYA_2068     FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 1306326 1306327 CYA_2068 CYA_2069     FALSE 0.529 43.000 0.000 NA   NA
 1306327 1306328 CYA_2069 CYA_2070     TRUE 0.756 75.000 0.051 NA   NA
 1306328 1306329 CYA_2070 CYA_2071   glgA-1 FALSE 0.032 198.000 0.000 NA   NA
 1306329 1306330 CYA_2071 CYA_2072 glgA-1   FALSE 0.335 153.000 0.025 1.000   NA
 1306332 1306333 CYA_2074 CYA_2075     FALSE 0.270 100.000 0.000 NA   NA
 1306334 1306335 CYA_2076 CYA_2077     TRUE 0.968 -13.000 0.500 NA   NA
 1306335 1306336 CYA_2077 CYA_2078     TRUE 0.975 1.000 0.500 NA   NA
 1306338 1306339 CYA_2080 CYA_2081     FALSE 0.327 83.000 0.000 NA   NA
 1306339 1306340 CYA_2081 CYA_2082     TRUE 0.967 -18.000 0.500 NA   NA
 1306340 1306341 CYA_2082 CYA_2083     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 1306342 1306343 CYA_2084 CYA_2085     FALSE 0.387 70.000 0.000 NA   NA
 1306343 1306344 CYA_2085 CYA_2086     TRUE 0.747 110.000 0.120 NA   NA
 1306344 1306345 CYA_2086 CYA_2087     TRUE 0.888 7.000 0.040 NA   NA
 1306346 1306347 CYA_2088 CYA_2089     FALSE 0.183 130.000 0.000 NA   NA
 1306349 1306350 CYA_2091 CYA_2092     FALSE 0.531 -399.000 0.000 NA   NA
 1306350 1306351 CYA_2092 CYA_2093     FALSE 0.089 159.000 0.000 NA   NA
 1306352 1306353 CYA_2094 CYA_2095     FALSE 0.637 16.000 0.000 NA   NA
 1306354 1306355 CYA_2096 CYA_2097 tyrS psbU FALSE 0.007 410.000 0.000 1.000   NA
 1306357 1306358 CYA_2099 CYA_2100     FALSE 0.010 285.000 0.000 NA   NA
 1306358 1306359 CYA_2100 CYA_2101     TRUE 0.857 -3.000 0.027 NA   NA
 1306359 1306360 CYA_2101 CYA_2102     TRUE 0.910 94.000 0.667 NA   NA
 1306360 1306361 CYA_2102 CYA_2103     FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 1306362 1306363 CYA_2104 CYA_2105 accD   FALSE 0.015 280.000 0.000 1.000 N NA
 1306363 1306364 CYA_2105 CYA_2107     FALSE 0.417 83.000 0.000 1.000 N NA
 1306365 1306366 CYA_2106 CYA_2108     FALSE 0.391 69.000 0.000 NA   NA
 1306367 1306368 CYA_2109 CYA_2110     FALSE 0.620 -9.000 0.000 NA   NA
 1306368 1306369 CYA_2110 CYA_2111     FALSE 0.068 168.000 0.000 NA   NA
 1306370 1306371 CYA_2112 CYA_2113 atpG atpA TRUE 0.993 46.000 0.846 0.003 Y NA
 1306371 1306372 CYA_2113 CYA_2114 atpA atpH TRUE 0.991 60.000 0.864 0.003 Y NA
 1306372 1306373 CYA_2114 CYA_2115 atpH atpF TRUE 0.988 17.000 0.132 0.003 Y NA
 1306373 1306374 CYA_2115 CYA_2116 atpF   TRUE 0.988 54.000 0.569 0.003 Y NA
 1306374 1306375 CYA_2116 CYA_2117   atpE TRUE 0.967 95.000 0.368 0.003 Y NA
 1306375 1306376 CYA_2117 CYA_2118 atpE   FALSE 0.135 145.000 0.000 NA   NA
 1306376 1306377 CYA_2118 CYA_2119   atpB FALSE 0.573 -46.000 0.000 NA   NA
 1306377 1306378 CYA_2119 CYA_2120 atpB   TRUE 0.952 6.000 0.099 1.000   NA
 1306379 1306380 CYA_2121 CYA_2122     TRUE 0.937 -3.000 0.098 NA   NA
 1306381 1306382 CYA_2123 CYA_2124 gpmI   FALSE 0.045 208.000 0.000 1.000   NA
 1306382 1306383 CYA_2124 CYA_2125   dps TRUE 0.837 43.000 0.029 1.000   NA
 1306383 1306384 CYA_2125 CYA_2126 dps trmE FALSE 0.494 119.000 0.003 1.000   NA
 1306385 1306386 CYA_2127 CYA_2128 glgP   FALSE 0.132 162.000 0.000 1.000   NA
 1306386 1306387 CYA_2128 CYA_2129     FALSE 0.625 -7.000 0.000 NA   NA
 1306387 1306388 CYA_2129 CYA_2130   ilvN TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1306388 1306389 CYA_2130 CYA_2131 ilvN   TRUE 0.729 46.000 0.006 NA   NA
 1306392 1306393 CYA_2133 CYA_2135     TRUE 0.663 3.000 0.000 NA   NA
 1306394 1306395 CYA_2136 CYA_2137 trpE   TRUE 0.806 19.000 0.006 NA   NA
 1306395 1306396 CYA_2137 CYA_2138   chlG FALSE 0.020 228.000 0.000 NA   NA
 1306396 1306397 CYA_2138 CYA_2139 chlG   FALSE 0.631 17.000 0.000 NA   NA
 1306397 1306398 CYA_2139 CYA_2140     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1306399 1306400 CYA_2141 CYA_2142     FALSE 0.413 84.000 0.000 1.000 N NA
 1306400 1306401 CYA_2142 CYA_2143     TRUE 0.892 37.000 0.069 NA   NA
 1306402 1306403 CYA_2144 CYA_2145 infC bcp TRUE 0.839 16.000 0.002 1.000 N NA
 1306403 1306404 CYA_2145 CYA_2146 bcp   FALSE 0.417 127.000 0.002 1.000 N NA
 1306405 1306406 CYA_2147 CYA_2148     FALSE 0.022 218.000 0.000 NA   NA
 1306406 1306407 CYA_2148 CYA_2149     FALSE 0.557 -130.000 0.000 NA   NA
 1306407 1306408 CYA_2149 CYA_2150     TRUE 0.920 58.000 0.333 NA   NA
 1306412 1306413 CYA_2153 CYA_2155     TRUE 0.975 4.000 0.500 NA   NA
 1306413 1306414 CYA_2155 CYA_2156     TRUE 0.988 -55.000 0.231 0.002 Y NA
 1306416 1306417 CYA_2157 CYA_2159     TRUE 0.653 11.000 0.000 NA   NA
 1306417 1306418 CYA_2159 CYA_2160     FALSE 0.462 55.000 0.000 NA   NA
 1306418 1306419 CYA_2160 CYA_2161     TRUE 0.926 108.000 0.333 1.000 Y NA
 1306419 1306420 CYA_2161 CYA_2162     TRUE 0.982 48.000 0.200 0.012 Y NA
 1306420 1306421 CYA_2162 CYA_2163     FALSE 0.007 386.000 0.000 1.000 N NA
 1306421 1306422 CYA_2163 CYA_2164     TRUE 0.949 7.000 0.133 NA   NA
 1306422 1306423 CYA_2164 CYA_2165     TRUE 0.883 55.000 0.111 NA   NA
 1306423 1306424 CYA_2165 CYA_2166     FALSE 0.470 54.000 0.000 NA   NA
 1306424 1306425 CYA_2166 CYA_2167     FALSE 0.383 71.000 0.000 NA   NA
 1306425 1306426 CYA_2167 CYA_2168     FALSE 0.504 48.000 0.000 NA   NA
 1306426 1306427 CYA_2168 CYA_2169   nrdJ FALSE 0.128 163.000 0.000 1.000   NA
 1306428 1306429 CYA_2170 CYA_2171     TRUE 0.809 115.000 0.050 0.007   NA
 1306429 1306430 CYA_2171 CYA_2172     TRUE 0.983 0.000 0.259 0.007   NA
 1306432 1306433 CYA_2174 CYA_2175     TRUE 0.912 4.000 0.050 NA   NA
 1306436 1306437 CYA_2178 CYA_2179   gap-3 TRUE 0.970 38.000 0.689 NA   NA
 1306437 1306438 CYA_2179 CYA_2180 gap-3 murI FALSE 0.023 246.000 0.000 1.000 N NA
 1306438 1306439 CYA_2180 CYA_2181 murI   FALSE 0.571 151.000 0.002 1.000 Y NA
 1306441 1306442 CYA_2183 CYA_2184     FALSE 0.014 302.000 0.000 1.000   NA
 1306442 1306443 CYA_2184 CYA_2185   miaE TRUE 0.888 26.000 0.047 1.000 N NA
 1306443 1306444 CYA_2185 CYA_2186 miaE   FALSE 0.043 202.000 0.000 1.000 N NA
 1306444 1306445 CYA_2186 CYA_2187     FALSE 0.004 540.000 0.000 1.000 N NA
 1306445 1306446 CYA_2187 CYA_2189   sufR FALSE 0.018 264.000 0.000 1.000 N NA
 1306447 1306448 CYA_2190 CYA_2192 sufB mscL FALSE 0.024 245.000 0.000 1.000 N NA
 1306450 1306451 CYA_2193 CYA_2194 sufC sufD TRUE 0.988 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 1306451 1306452 CYA_2194 CYA_2195 sufD   FALSE 0.002 674.000 0.000 NA   NA
 1306452 1306453 CYA_2195 CYA_2196     TRUE 0.823 137.000 0.667 NA   NA
 1306454 1306455 CYA_2197 CYA_2198     FALSE 0.546 84.000 0.004 NA   NA
 1306457 1306458 CYA_2199 CYA_2201 rrmJ leuD TRUE 0.827 -3.000 0.013 NA   NA
 1306461 1306462 CYA_2204 CYA_2205     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1306462 1306463 CYA_2205 CYA_2206   pyk FALSE 0.007 404.000 0.000 1.000   NA
 1306463 1306464 CYA_2206 CYA_2207 pyk   FALSE 0.259 105.000 0.000 NA   NA
 1306464 1306465 CYA_2207 CYA_2208     FALSE 0.421 62.000 0.000 NA   NA
 1306465 1306466 CYA_2208 CYA_2209     FALSE 0.183 130.000 0.000 NA   NA
 1306466 1306467 CYA_2209 CYA_2210     FALSE 0.105 153.000 0.000 NA   NA
 1306468 1306469 CYA_2211 CYA_2212     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 1306470 1306471 CYA_2213 CYA_2214   rpmB TRUE 0.781 25.000 0.002 NA   NA
 1306474 1306475 CYA_2217 CYA_2218   pnpA FALSE 0.511 106.000 0.002 1.000 N NA
 1306478 1306479 CYA_2221 CYA_2222     FALSE 0.413 95.000 0.000 1.000   NA
 1306479 1306480 CYA_2222 CYA_2223   leuA TRUE 0.793 44.000 0.003 1.000   NA
 1306481 1306482 CYA_2224 CYA_2225   apcC FALSE 0.463 133.000 0.022 1.000   NA
 1306482 1306483 CYA_2225 CYA_2226 apcC apcB-2 TRUE 0.886 141.000 0.531 0.007   NA
 1306483 1306484 CYA_2226 CYA_2227 apcB-2 apcA TRUE 0.925 61.000 0.062 0.005   NA
 1306484 1306485 CYA_2227 CYA_2228 apcA   FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 1306486 1306487 CYA_2229 CYA_2230     FALSE 0.154 152.000 0.000 1.000 N NA
 1306487 1306488 CYA_2230 CYA_2231     TRUE 0.959 22.000 0.250 1.000 N NA
 1306488 1306489 CYA_2231 CYA_2232     TRUE 0.992 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 1306489 1306490 CYA_2232 CYA_2233     FALSE 0.248 198.000 0.111 1.000 N NA
 1306490 1306491 CYA_2233 CYA_2234     FALSE 0.616 21.000 0.000 NA   NA
 1306491 1306492 CYA_2234 CYA_2235     FALSE 0.519 45.000 0.000 NA   NA
 1306493 1306494 CYA_2236 CYA_2237 ubiE   FALSE 0.482 52.000 0.000 NA   NA
 1306494 1306495 CYA_2237 CYA_2238     FALSE 0.135 145.000 0.000 NA   NA
 1306495 1306496 CYA_2238 CYA_2239     FALSE 0.504 48.000 0.000 NA   NA
 1306497 1306498 CYA_2240 CYA_2241     FALSE 0.616 70.000 0.006 NA   NA
 1306498 1306499 CYA_2241 CYA_2242     TRUE 0.661 6.000 0.000 NA   NA
 1306500 1306501 CYA_2243 CYA_2244     FALSE 0.570 -49.000 0.000 NA   NA
 1306501 1306502 CYA_2244 CYA_2245     FALSE 0.339 80.000 0.000 NA   NA
 1306502 1306503 CYA_2245 CYA_2246     TRUE 0.908 -3.000 0.051 NA   NA
 1306503 1306504 CYA_2246 CYA_2247     TRUE 0.832 5.000 0.005 NA   NA
 1306504 1306505 CYA_2247 CYA_2248     TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 1306505 1306506 CYA_2248 CYA_2249     TRUE 0.662 1.000 0.000 NA   NA
 1306506 1306507 CYA_2249 CYA_2250     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306507 1306508 CYA_2250 CYA_2251     FALSE 0.462 55.000 0.000 NA   NA
 1306508 1306509 CYA_2251 CYA_2252     FALSE 0.637 16.000 0.000 NA   NA
 1306511 1306512 CYA_2254 CYA_2255     FALSE 0.596 26.000 0.000 NA   NA
 1306522 1306523 CYA_2265 CYA_2266     FALSE 0.501 96.000 0.006 NA   NA
 1306525 1306526 CYA_2268 CYA_2269     FALSE 0.362 75.000 0.000 NA   NA
 1306526 1306527 CYA_2269 CYA_2270     TRUE 0.775 4.000 0.000 1.000   NA
 1306527 1306528 CYA_2270 CYA_2271     TRUE 0.806 19.000 0.005 NA   NA
 1306528 1306529 CYA_2271 CYA_2272   pdxJ TRUE 0.820 -3.000 0.004 NA   NA
 1306536 1306537 CYA_2279 CYA_2280 rpsP   TRUE 0.715 64.000 0.006 1.000   NA
 1306537 1306538 CYA_2280 CYA_2281     TRUE 0.861 -3.000 0.002 1.000   NA
 1306538 1306539 CYA_2281 CYA_2282   hisF TRUE 0.814 28.000 0.002 1.000 N NA
 1306539 1306540 CYA_2282 CYA_2283 hisF cysQ TRUE 0.835 18.000 0.002 1.000 N NA
 1306541 1306542 CYA_2284 CYA_2285     FALSE 0.066 169.000 0.000 NA   NA
 1306548 1306549 CYA_2291 CYA_2292     FALSE 0.480 123.000 0.011 1.000   NA
 1306549 1306550 CYA_2292 CYA_2293     FALSE 0.570 -49.000 0.000 NA   NA
 1306552 1306553 CYA_2294 CYA_2296   aroA TRUE 0.833 25.000 0.002 1.000   NA
 1306554 1306555 CYA_2297 CYA_2299 mraW   FALSE 0.468 105.000 0.004 NA   NA
 1306556 1306557 CYA_2298 CYA_2300   tyrA FALSE 0.244 131.000 0.000 1.000 N NA
 1306564 1306565 CYA_2307 CYA_2308 rrsB   FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 1306565 1306566 CYA_2308 CYA_2309     FALSE 0.553 37.000 0.000 NA   NA
 1306566 1306567 CYA_2309 CYA_2310   rrlB FALSE 0.198 125.000 0.000 NA   NA
 1306567 1306568 CYA_2310 CYA_2311 rrlB rrfB FALSE 0.439 59.000 0.000 NA   NA
 1306569 1306570 CYA_2312 CYA_2313     TRUE 0.728 -15.000 0.000 1.000   NA
 1306570 1306571 CYA_2313 CYA_2314     FALSE 0.417 139.000 0.038 NA   NA
 1306574 1306575 CYA_2317 CYA_2318     FALSE 0.068 168.000 0.000 NA   NA
 1306575 1306576 CYA_2318 CYA_2319     FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 1306576 1306577 CYA_2319 CYA_2320     TRUE 0.894 58.000 0.161 NA   NA
 1306577 1306578 CYA_2320 CYA_2321     TRUE 0.953 3.000 0.150 NA   NA
 1306578 1306579 CYA_2321 CYA_2322   cbiQ TRUE 0.982 -13.000 0.069 0.010 Y NA
 1306579 1306580 CYA_2322 CYA_2323 cbiQ yliG FALSE 0.091 199.000 0.004 1.000 N NA
 1306580 1306581 CYA_2323 CYA_2325 yliG rpiA TRUE 0.809 31.000 0.003 1.000 N NA
 11460301 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6353.000 0.000 NA   NA
 11602664 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6353.000 0.000 NA   NA
 11745056 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6353.000 0.000 NA   NA
 11460302 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6389.000 0.000 NA   NA
 11602665 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6389.000 0.000 NA   NA
 11745057 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6389.000 0.000 NA   NA
 11460303 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6427.000 0.000 NA   NA
 11602666 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6427.000 0.000 NA   NA
 11745058 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6427.000 0.000 NA   NA
 11460304 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6463.000 0.000 NA   NA
 11602667 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6463.000 0.000 NA   NA
 11745059 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6463.000 0.000 NA   NA
 11460305 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6506.000 0.000 NA   NA
 11602668 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6506.000 0.000 NA   NA
 11745060 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6506.000 0.000 NA   NA
 11460306 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6542.000 0.000 NA   NA
 11602669 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6542.000 0.000 NA   NA
 11745061 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6542.000 0.000 NA   NA
 11460307 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6583.000 0.000 NA   NA
 11602670 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6583.000 0.000 NA   NA
 11745062 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6583.000 0.000 NA   NA
 11460308 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11602671 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11745063 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11460309 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6656.000 0.000 NA   NA
 11602672 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6656.000 0.000 NA   NA
 11745064 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6656.000 0.000 NA   NA
 11460310 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6692.000 0.000 NA   NA
 11602673 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6692.000 0.000 NA   NA
 11745065 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6692.000 0.000 NA   NA
 11460311 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6729.000 0.000 NA   NA
 11602674 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6729.000 0.000 NA   NA
 11745066 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6729.000 0.000 NA   NA
 11460312 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6765.000 0.000 NA   NA
 11602675 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6765.000 0.000 NA   NA
 11745067 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6765.000 0.000 NA   NA
 11460313 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6802.000 0.000 NA   NA
 11602676 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6802.000 0.000 NA   NA
 11745068 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6802.000 0.000 NA   NA
 11460314 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6838.000 0.000 NA   NA
 11602677 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6838.000 0.000 NA   NA
 11745069 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6838.000 0.000 NA   NA
 11460315 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6878.000 0.000 NA   NA
 11602678 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6878.000 0.000 NA   NA
 11745070 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6878.000 0.000 NA   NA
 11460316 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6914.000 0.000 NA   NA
 11602679 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6914.000 0.000 NA   NA
 11745071 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6914.000 0.000 NA   NA
 11460317 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6952.000 0.000 NA   NA
 11602680 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6952.000 0.000 NA   NA
 11745072 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6952.000 0.000 NA   NA
 11460318 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6988.000 0.000 NA   NA
 11602681 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6988.000 0.000 NA   NA
 11745073 1306575   CYA_2318     FALSE NA 6988.000 0.000 NA   NA
 11460319 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7025.000 0.000 NA   NA
 11602682 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7025.000 0.000 NA   NA
 11745074 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7025.000 0.000 NA   NA
 11460320 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7061.000 0.000 NA   NA
 11602683 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7061.000 0.000 NA   NA
 11745075 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7061.000 0.000 NA   NA
 11460321 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7099.000 0.000 NA   NA
 11602684 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7099.000 0.000 NA   NA
 11745076 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7099.000 0.000 NA   NA
 11460322 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7135.000 0.000 NA   NA
 11602685 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7135.000 0.000 NA   NA
 11745077 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7135.000 0.000 NA   NA
 11460323 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7170.000 0.000 NA   NA
 11602686 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7170.000 0.000 NA   NA
 11745078 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7170.000 0.000 NA   NA
 11460324 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11602687 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11745079 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11460325 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7246.000 0.000 NA   NA
 11602688 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7246.000 0.000 NA   NA
 11745080 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7246.000 0.000 NA   NA
 11460326 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7282.000 0.000 NA   NA
 11602689 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7282.000 0.000 NA   NA
 11745081 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7282.000 0.000 NA   NA
 11460327 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7325.000 0.000 NA   NA
 11602690 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7325.000 0.000 NA   NA
 11745082 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7325.000 0.000 NA   NA
 11460328 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7361.000 0.000 NA   NA
 11602691 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7361.000 0.000 NA   NA
 11745083 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7361.000 0.000 NA   NA
 11460329 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7396.000 0.000 NA   NA
 11602692 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7396.000 0.000 NA   NA
 11745084 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7396.000 0.000 NA   NA
 11460330 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7432.000 0.000 NA   NA
 11602693 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7432.000 0.000 NA   NA
 11745085 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7432.000 0.000 NA   NA
 11460331 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7472.000 0.000 NA   NA
 11602694 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7472.000 0.000 NA   NA
 11745086 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7472.000 0.000 NA   NA
 11460332 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7508.000 0.000 NA   NA
 11602695 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7508.000 0.000 NA   NA
 11745087 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7508.000 0.000 NA   NA
 11460333 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7547.000 0.000 NA   NA
 11602696 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7547.000 0.000 NA   NA
 11745088 1306575   CYA_2318     FALSE NA 7547.000 0.000 NA   NA
 1306587 1306588 CYA_2330 CYA_2331 petJ   TRUE 0.975 0.000 0.400 1.000   NA
 1306588 1306589 CYA_2331 CYA_2332     TRUE 0.933 45.000 0.250 NA   NA
 1306589 1306590 CYA_2332 CYA_2334   copCD TRUE 0.937 18.000 0.115 NA   NA
 1306591 1306592 CYA_2333 CYA_2335     FALSE 0.320 85.000 0.000 NA   NA
 1306593 1306594 CYA_2336 CYA_2337     TRUE 0.910 39.000 0.005 NA Y NA
 1306594 1306595 CYA_2337 CYA_2338   infB FALSE 0.043 389.000 0.171 NA N NA
 1306595 1306596 CYA_2338 CYA_2339 infB proS FALSE 0.542 103.000 0.002 1.000   NA
 1306596 1306597 CYA_2339 CYA_2340 proS   TRUE 0.795 22.000 0.002 NA   NA
 1306597 1306598 CYA_2340 CYA_2341     TRUE 0.978 -3.000 0.667 NA   NA
 1306599 1306600 CYA_2342 CYA_2343     FALSE 0.027 206.000 0.000 NA   NA
 1306600 1306601 CYA_2343 CYA_2344     FALSE 0.414 64.000 0.000 NA   NA
 1306607 1306608 CYA_2350 CYA_2351     FALSE 0.475 159.000 0.125 NA   NA
 1306608 1306609 CYA_2351 CYA_2352     FALSE 0.446 151.000 0.050 1.000 N NA
 1306609 1306610 CYA_2352 CYA_2353     TRUE 0.673 81.000 0.020 1.000   NA
 1306610 1306611 CYA_2353 CYA_2354     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 1306613 1306614 CYA_2356 CYA_2357 panE-2 petM TRUE 0.883 23.000 0.034 1.000   NA
 1306615 1306616 CYA_2358 CYA_2359 psbD-1 psbC TRUE 0.757 143.000 0.073 0.002   NA
 1306616 1306617 CYA_2359 CYA_2360 psbC cobW FALSE 0.439 132.000 0.013 1.000   NA
 1306619 1306620 CYA_2362 CYA_2363     TRUE 0.680 38.000 0.000 1.000   NA
 1306621 1306622 CYA_2364 CYA_2365   fabD FALSE 0.302 125.000 0.000 1.000   NA
 1306622 1306623 CYA_2365 CYA_2366 fabD fabH TRUE 0.972 20.000 0.005 0.003 Y NA
 1306623 1306624 CYA_2366 CYA_2367 fabH plsX TRUE 0.993 6.000 0.380 0.003 Y NA
 1306624 1306625 CYA_2367 CYA_2368 plsX   FALSE 0.003 483.000 0.000 NA   NA
 1306626 1306627 CYA_2369 CYA_2370 trpC   TRUE 0.762 41.000 0.015 NA   NA
 1306627 1306628 CYA_2370 CYA_2371     TRUE 0.873 65.000 0.143 NA   NA
 1306628 1306629 CYA_2371 CYA_2372     TRUE 0.808 111.000 0.039 0.001   NA
 1306629 1306630 CYA_2372 CYA_2373   cbiX FALSE 0.130 209.000 0.000 0.006   NA
 1306630 1306631 CYA_2373 CYA_2375 cbiX   FALSE 0.121 184.000 0.022 NA   NA
 1306632 1306633 CYA_2374 CYA_2376     TRUE 0.679 56.000 0.004 NA   NA
 1306633 1306634 CYA_2376 CYA_2377     TRUE 0.800 22.000 0.004 NA   NA
 1306634 1306635 CYA_2377 CYA_2378     TRUE 0.768 -25.000 0.002 NA   NA
 1306636 1306637 CYA_2379 CYA_2380 rpsA   TRUE 0.658 8.000 0.000 NA   NA
 1306637 1306638 CYA_2380 CYA_2381     TRUE 0.641 15.000 0.000 NA   NA
 1306638 1306639 CYA_2381 CYA_2382   chlL FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 1306639 1306640 CYA_2382 CYA_2383 chlL   TRUE 0.726 159.000 0.198 0.001 N NA
 1306640 1306641 CYA_2383 CYA_2385   chlN TRUE 0.933 30.000 0.019 0.001 N NA
 1306642 1306643 CYA_2384 CYA_2386   hemL FALSE 0.586 76.000 0.009 NA   NA
 1306643 1306644 CYA_2386 CYA_2387 hemL ispG FALSE 0.434 79.000 0.000 1.000 N NA
 1306644 1306645 CYA_2387 CYA_2388 ispG   FALSE 0.002 726.000 0.000 NA   NA
 1306648 1306649 CYA_2391 CYA_2392     FALSE 0.427 81.000 0.000 1.000 N NA
 1306649 1306650 CYA_2392 CYA_2393     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306653 1306654 CYA_2396 CYA_2397     FALSE 0.154 138.000 0.000 NA   NA
 1306654 1306655 CYA_2397 CYA_2398     FALSE 0.620 -9.000 0.000 NA   NA
 1306655 1306656 CYA_2398 CYA_2399     FALSE 0.582 -28.000 0.000 NA   NA
 1306657 1306658 CYA_2400 CYA_2401     FALSE 0.556 -133.000 0.000 NA   NA
 1306658 1306659 CYA_2401 CYA_2402     TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1306663 1306664 CYA_2406 CYA_2407   ribF TRUE 0.717 48.000 0.003 NA   NA
 1306665 1306666 CYA_2408 CYA_2409 cobS   FALSE 0.570 33.000 0.000 NA   NA
 1306666 1306667 CYA_2409 CYA_2410   rpoD FALSE 0.427 61.000 0.000 NA   NA
 1306669 1306670 CYA_2412 CYA_2413 potC   FALSE 0.014 299.000 0.000 1.000   NA
 1306670 1306671 CYA_2413 CYA_2414     FALSE 0.277 98.000 0.000 NA   NA
 1306671 1306672 CYA_2414 CYA_2415     TRUE 0.646 13.000 0.000 NA   NA
 1306674 1306675 CYA_2417 CYA_2418     FALSE 0.020 270.000 0.000 1.000   NA
 1306675 1306676 CYA_2418 CYA_2419   yqeG FALSE 0.023 262.000 0.000 1.000   NA
 1306676 1306677 CYA_2419 CYA_2420 yqeG   TRUE 0.907 44.000 0.113 NA   NA
 1306677 1306678 CYA_2420 CYA_2421   pyrH FALSE 0.212 121.000 0.000 NA   NA
 1306678 1306679 CYA_2421 CYA_2422 pyrH   FALSE 0.273 99.000 0.000 NA   NA
 1306679 1306680 CYA_2422 CYA_2423     FALSE 0.252 108.000 0.000 NA   NA
 1306680 1306681 CYA_2423 CYA_2424     FALSE 0.611 -12.000 0.000 NA   NA
 1306681 1306682 CYA_2424 CYA_2425     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306682 1306683 CYA_2425 CYA_2426     FALSE 0.006 351.000 0.000 NA   NA
 1306683 1306684 CYA_2426 CYA_2427   psbJ FALSE 0.003 460.000 0.000 NA   NA
 1306684 1306685 CYA_2427 CYA_2428 psbJ psbL TRUE 0.929 141.000 0.878 0.002   NA
 1306685 1306686 CYA_2428 CYA_2429 psbL psbF TRUE 0.993 6.000 0.872 0.002   NA
 1306686 1306687 CYA_2429 CYA_2430 psbF psbE TRUE 0.971 84.000 0.837 0.002   NA
 1306690 1306691 CYA_2433 CYA_2434 thrS   TRUE 0.842 39.000 0.000 0.075   NA
 1306691 1306692 CYA_2434 CYA_2435     TRUE 0.738 21.000 0.000 1.000   NA
 1306692 1306693 CYA_2435 CYA_2437     FALSE 0.004 631.000 0.000 1.000   NA
 1306694 1306695 CYA_2436 CYA_2438 malQ pyrE FALSE 0.137 156.000 0.000 1.000 N NA
 1306696 1306697 CYA_2439 CYA_2440     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306698 1306699 CYA_2441 CYA_2442     FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 1306701 1306702 CYA_2443 CYA_2445   yfiA FALSE 0.014 258.000 0.000 NA   NA
 1306703 1306704 CYA_2446 CYA_2447     TRUE 0.803 -10.000 0.009 NA   NA
 1306704 1306705 CYA_2447 CYA_2448     FALSE 0.006 337.000 0.000 NA   NA
 1306705 1306706 CYA_2448 CYA_2449     TRUE 0.894 43.000 0.087 NA   NA
 1306707 1306708 CYA_2450 CYA_2451     FALSE 0.499 49.000 0.000 NA   NA
 1306710 1306711 CYA_2452 CYA_2454   thrC-2 FALSE 0.238 113.000 0.000 NA   NA
 1306711 1306712 CYA_2454 CYA_2455 thrC-2   FALSE 0.262 154.000 0.005 1.000 N NA
 1306713 1306714 CYA_2456 CYA_2457 menA   FALSE 0.145 142.000 0.000 NA   NA
 1306714 1306715 CYA_2457 CYA_2458     FALSE 0.346 78.000 0.000 NA   NA
 1306715 1306716 CYA_2458 CYA_2459     TRUE 0.978 -3.000 0.667 NA   NA
 1306716 1306717 CYA_2459 CYA_2460     FALSE 0.277 98.000 0.000 NA   NA
 1306717 1306718 CYA_2460 CYA_2461     FALSE 0.321 121.000 0.000 1.000   NA
 1306719 1306720 CYA_2462 CYA_2463     TRUE 0.956 -7.000 0.250 NA   NA
 1306720 1306721 CYA_2463 CYA_2464     TRUE 0.831 135.000 0.667 NA   NA
 1306723 1306724 CYA_2466 CYA_2467     TRUE 0.679 50.000 0.003 NA N NA
 1306725 1306726 CYA_2468 CYA_2469     FALSE 0.010 282.000 0.000 NA   NA
 1306726 1306727 CYA_2469 CYA_2470     FALSE 0.116 211.000 0.049 NA   NA
 1306727 1306728 CYA_2470 CYA_2471     TRUE 0.979 3.000 0.101 1.000 Y NA
 1306728 1306729 CYA_2471 CYA_2473   ribAB TRUE 0.731 124.000 0.014 1.000 Y NA
 1306730 1306731 CYA_2472 CYA_2474     FALSE 0.473 137.000 0.048 NA   NA
 1306731 1306732 CYA_2474 CYA_2475     TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1306734 1306735 CYA_2477 CYA_2478 ppk   FALSE 0.131 182.000 0.004 1.000 N NA
 1306735 1306736 CYA_2478 CYA_2479     TRUE 0.996 0.000 0.775 0.018 Y NA
 1306737 1306738 CYA_2480 CYA_2481     TRUE 0.656 83.000 0.038 NA   NA
 1306741 1306742 CYA_2484 CYA_2485 ggt   TRUE 0.854 38.000 0.033 1.000   NA
 1306742 1306743 CYA_2485 CYA_2486     FALSE 0.498 100.000 0.014 NA   NA
 1306743 1306744 CYA_2486 CYA_2487   secG TRUE 0.811 15.000 0.002 NA   NA
 1306747 1306748 CYA_2490 CYA_2490     FALSE 0.559 -86.000 0.000 NA   NA
 1306748 1306749 CYA_2490 CYA_2492   pcyA FALSE 0.020 228.000 0.000 NA   NA
 1306751 1306752 CYA_2493 CYA_2494 prmA   TRUE 0.774 -30.000 0.003 NA   NA
 1306752 1306753 CYA_2494 CYA_2495   hisS FALSE 0.555 81.000 0.003 NA   NA
 1306753 1306754 CYA_2495 CYA_2496 hisS   TRUE 0.848 8.000 0.018 NA   NA
 1306755 1306756 CYA_2497 CYA_2498     FALSE 0.266 102.000 0.000 NA   NA
 1306756 1306757 CYA_2498 CYA_2499     TRUE 0.960 29.000 0.400 NA   NA
 1306757 1306758 CYA_2499 CYA_2500     TRUE 0.968 -3.000 0.400 NA   NA
 1306759 1306760 CYA_2501 CYA_2502     TRUE 0.674 163.000 0.667 NA   NA
 1306760 1306761 CYA_2502 CYA_2503     FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1306765 1306766 CYA_2507 CYA_2509 clpS-2   TRUE 0.965 16.000 0.378 NA   NA
 1306767 1306768 CYA_2508 CYA_2510     TRUE 0.662 1.000 0.000 NA   NA
 1306768 1306769 CYA_2510 CYA_2511     TRUE 0.952 -7.000 0.222 NA   NA
 1306770 1306771 CYA_2512 CYA_2513 dprA hisA FALSE 0.003 1025.000 0.000 1.000 N NA
 1306771 1306772 CYA_2513 CYA_2514 hisA   FALSE 0.007 415.000 0.000 1.000   NA
 1306773 1306774 CYA_2515 CYA_2516     FALSE 0.199 200.000 0.095 NA   NA
 1306774 1306775 CYA_2516 CYA_2517     TRUE 0.972 0.000 0.417 NA   NA
 1306775 1306776 CYA_2517 CYA_2518     TRUE 0.961 -3.000 0.273 NA   NA
 1306776 1306777 CYA_2518 CYA_2519     TRUE 0.964 -10.000 0.400 NA   NA
 1306777 1306778 CYA_2519 CYA_2520     TRUE 0.973 3.000 0.083 0.002 N NA
 1306779 1306780 CYA_2521 CYA_2522 psaA psaB TRUE 0.976 22.000 0.154 0.002   NA
 1306782 1306783 CYA_2524 CYA_2525     FALSE 0.427 61.000 0.000 NA   NA
 1306783 1306784 CYA_2525 CYA_2526     FALSE 0.008 308.000 0.000 NA   NA
 1306786 1306787 CYA_2528 CYA_2530     FALSE 0.577 31.000 0.000 NA   NA
 1306788 1306789 CYA_2529 CYA_2531     TRUE 0.985 10.000 0.080 0.074 Y NA
 1306789 1306790 CYA_2531 CYA_2532     TRUE 0.986 -3.000 0.339 1.000 Y NA
 1306790 1306791 CYA_2532 CYA_2533     TRUE 0.838 14.000 0.018 NA   NA
 1306791 1306792 CYA_2533 CYA_2534     FALSE 0.480 111.000 0.018 NA   NA
 1306793 1306794 CYA_2535 CYA_2536     FALSE 0.593 27.000 0.000 NA   NA
 1306794 1306795 CYA_2536 CYA_2537     TRUE 0.961 13.000 0.279 NA   NA
 11460334 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6660.000 0.000 NA   NA
 11602697 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6660.000 0.000 NA   NA
 11745089 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6660.000 0.000 NA   NA
 11460335 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11602698 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11745090 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11460336 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6744.000 0.000 NA   NA
 11602699 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6744.000 0.000 NA   NA
 11745091 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6744.000 0.000 NA   NA
 11460337 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6780.000 0.000 NA   NA
 11602700 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6780.000 0.000 NA   NA
 11745092 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6780.000 0.000 NA   NA
 11460338 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6819.000 0.000 NA   NA
 11602701 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6819.000 0.000 NA   NA
 11745093 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6819.000 0.000 NA   NA
 11460339 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6855.000 0.000 NA   NA
 11602702 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6855.000 0.000 NA   NA
 11745094 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6855.000 0.000 NA   NA
 11460340 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6897.000 0.000 NA   NA
 11602703 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6897.000 0.000 NA   NA
 11745095 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6897.000 0.000 NA   NA
 11460341 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6933.000 0.000 NA   NA
 11602704 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6933.000 0.000 NA   NA
 11745096 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6933.000 0.000 NA   NA
 11460342 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6971.000 0.000 NA   NA
 11602705 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6971.000 0.000 NA   NA
 11745097 1306789   CYA_2531     FALSE NA 6971.000 0.000 NA   NA
 11460343 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7007.000 0.000 NA   NA
 11602706 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7007.000 0.000 NA   NA
 11745098 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7007.000 0.000 NA   NA
 11460344 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7050.000 0.000 NA   NA
 11602707 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7050.000 0.000 NA   NA
 11745099 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7050.000 0.000 NA   NA
 11460345 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11602708 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11745100 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11460346 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7124.000 0.000 NA   NA
 11602709 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7124.000 0.000 NA   NA
 11745101 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7124.000 0.000 NA   NA
 11460347 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7160.000 0.000 NA   NA
 11602710 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7160.000 0.000 NA   NA
 11745102 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7160.000 0.000 NA   NA
 11460348 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7196.000 0.000 NA   NA
 11602711 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7196.000 0.000 NA   NA
 11745103 1306789   CYA_2531     FALSE NA 7196.000 0.000 NA   NA
 1306796 1306797 CYA_2538 CYA_2539   cas2-4 FALSE 0.005 491.000 0.000 1.000   NA
 11460349 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8377.000 0.000 NA   NA
 11602712 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8377.000 0.000 NA   NA
 11745104 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8377.000 0.000 NA   NA
 11460350 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8417.000 0.000 NA   NA
 11602713 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8417.000 0.000 NA   NA
 11745105 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8417.000 0.000 NA   NA
 11460351 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8451.000 0.000 NA   NA
 11602714 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8451.000 0.000 NA   NA
 11745106 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8451.000 0.000 NA   NA
 11460352 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8491.000 0.000 NA   NA
 11602715 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8491.000 0.000 NA   NA
 11745107 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8491.000 0.000 NA   NA
 11460353 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8526.000 0.000 NA   NA
 11602716 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8526.000 0.000 NA   NA
 11745108 1306789   CYA_2531     FALSE NA 8526.000 0.000 NA   NA
 1306797 1306798 CYA_2539 CYA_2540 cas2-4 cas1-2 TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1306798 1306799 CYA_2540 CYA_2541 cas1-2   TRUE 0.659 0.000 0.000 NA   NA
 1306799 1306800 CYA_2541 CYA_2542   cmr6 TRUE 0.957 33.000 0.400 NA   NA
 1306800 1306801 CYA_2542 CYA_2543 cmr6   TRUE 0.959 30.000 0.400 NA   NA
 1306801 1306802 CYA_2543 CYA_2544     TRUE 0.970 0.000 0.400 NA   NA
 1306802 1306803 CYA_2544 CYA_2545   cmr4 TRUE 0.983 14.000 0.833 NA   NA
 1306803 1306804 CYA_2545 CYA_2546 cmr4   TRUE 0.909 46.000 0.130 NA   NA
 1306804 1306805 CYA_2546 CYA_2547   crm2-2 TRUE 0.957 -3.000 0.233 NA   NA
 1306805 1306806 CYA_2547 CYA_2548 crm2-2   FALSE 0.004 415.000 0.000 NA   NA
 1306807 1306808 CYA_2549 CYA_2550     FALSE 0.529 43.000 0.000 NA   NA
 1306808 1306809 CYA_2550 CYA_2551     TRUE 0.873 28.000 0.000 0.031   NA
 1306809 1306810 CYA_2551 CYA_2552     TRUE 0.981 -43.000 1.000 NA   NA
 1306810 1306811 CYA_2552 CYA_2553     FALSE 0.004 415.000 0.000 NA   NA
 1306811 1306812 CYA_2553 CYA_2555     FALSE 0.010 321.000 0.000 1.000 N NA
 1306814 1306815 CYA_2556 CYA_2557     FALSE 0.133 157.000 0.000 1.000 N NA
 1306815 1306816 CYA_2557 CYA_2558   psbX-1 TRUE 0.657 118.000 0.050 1.000   NA
 1306816 1306817 CYA_2558 CYA_2559 psbX-1   FALSE 0.460 83.000 0.000 1.000   NA
 1306817 1306818 CYA_2559 CYA_2560     FALSE 0.575 146.000 0.077 1.000   NA
 1306818 1306819 CYA_2560 CYA_2561     TRUE 0.662 5.000 0.000 NA   NA
 1306820 1306821 CYA_2562 CYA_2563     TRUE 0.844 9.000 0.017 NA   NA
 1306821 1306822 CYA_2563 CYA_2564   uvrB FALSE 0.618 83.000 0.002 1.000   NA
 1306822 1306823 CYA_2564 CYA_2565 uvrB   FALSE 0.126 202.000 0.000 0.031   NA
 1306823 1306824 CYA_2565 CYA_2566     TRUE 0.714 29.000 0.000 1.000   NA
 1306828 1306829 CYA_2569 CYA_2571     TRUE 0.967 8.000 0.087 0.053 N NA
 1306830 1306831 CYA_2572 CYA_2573     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306831 1306832 CYA_2573 CYA_2574     FALSE 0.014 258.000 0.000 NA   NA
 1306832 1306833 CYA_2574 CYA_2575     TRUE 0.731 23.000 0.000 1.000   NA
 1306834 1306835 CYA_2576 CYA_2577     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 1306835 1306836 CYA_2577 CYA_2578     TRUE 0.981 28.000 0.925 NA   NA
 1306836 1306837 CYA_2578 CYA_2579     TRUE 0.643 109.000 0.051 NA   NA
 1306837 1306838 CYA_2579 CYA_2580     FALSE 0.126 159.000 0.000 1.000 N NA
 1306839 1306840 CYA_2581 CYA_2582     FALSE 0.037 320.000 0.000 NA Y NA
 1306841 1306842 CYA_2583 CYA_2584     FALSE 0.557 -106.000 0.000 NA   NA
 1306842 1306843 CYA_2584 CYA_2585     FALSE 0.409 65.000 0.000 NA   NA
 1306843 1306844 CYA_2585 CYA_2586     FALSE 0.255 106.000 0.000 NA   NA
 1306846 1306847 CYA_2588 CYA_2589     FALSE 0.346 78.000 0.000 NA   NA
 1306848 1306849 CYA_2590 CYA_2591 hrcA tilS TRUE 0.774 41.000 0.002 1.000 N NA
 1306850 1306851 CYA_2592 CYA_2593     TRUE 0.712 79.000 0.038 1.000 N NA
 1306854 1306855 CYA_2596 CYA_2597     FALSE 0.620 -9.000 0.000 NA   NA
 1306856 1306857 CYA_2598 CYA_2599     FALSE 0.002 790.000 0.000 NA   NA
 1306857 1306858 CYA_2599 CYA_2600   psbX-2 FALSE 0.626 18.000 0.000 NA   NA
 1306858 1306859 CYA_2600 CYA_2601 psbX-2   TRUE 0.723 97.000 0.050 1.000   NA
 1306859 1306860 CYA_2601 CYA_2602     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 1306860 1306861 CYA_2602 CYA_2603     FALSE 0.046 182.000 0.000 NA   NA
 1306861 1306862 CYA_2603 CYA_2604     FALSE 0.061 172.000 0.000 NA   NA
 1306862 1306863 CYA_2604 CYA_2605     TRUE 0.952 49.000 0.400 1.000   NA
 1306863 1306864 CYA_2605 CYA_2606     TRUE 0.934 57.000 0.333 1.000   NA
 1306864 1306865 CYA_2606 CYA_2607     FALSE 0.042 186.000 0.000 NA   NA
 1306866 1306867 CYA_2608 CYA_2610     FALSE 0.515 46.000 0.000 NA   NA
 1306872 1306873 CYA_2614 CYA_2615     FALSE 0.017 243.000 0.000 NA   NA
 1306874 1306875 CYA_2616 CYA_2617     FALSE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 1306876 1306877 CYA_2618 CYA_2619   btpA FALSE 0.261 163.000 0.024 1.000   NA
 1306877 1306878 CYA_2619 CYA_2620 btpA pyrD TRUE 0.864 13.000 0.003 1.000   NA
 1306878 1306879 CYA_2620 CYA_2621 pyrD   FALSE 0.177 148.000 0.000 1.000 N NA
 1306880 1306881 CYA_2622 CYA_2623     TRUE 0.994 -3.000 0.582 0.013 Y NA
 1306882 1306883 CYA_2624 CYA_2625 recN   FALSE 0.375 73.000 0.000 NA   NA
 1306886 1306887 CYA_2628 CYA_2629     FALSE 0.535 141.000 0.054 1.000 N NA
 1306887 1306888 CYA_2629 CYA_2630     FALSE 0.018 265.000 0.000 1.000 N NA
 1306888 1306889 CYA_2630 CYA_2631     TRUE 0.889 10.000 0.031 1.000 N NA
 1306890 1306891 CYA_2632 CYA_2633     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 1306891 1306892 CYA_2633 CYA_2634     FALSE 0.248 109.000 0.000 NA   NA
 1306896 1306897 CYA_2637 CYA_2639     TRUE 0.891 -18.000 0.000 NA Y NA
 1306898 1306899 CYA_2640 CYA_2641     FALSE 0.015 248.000 0.000 NA   NA
 1306901 1306902 CYA_2643 CYA_2644 rph   FALSE 0.004 503.000 0.000 1.000 N NA
 1306902 1306903 CYA_2644 CYA_2645   ribE TRUE 0.685 26.000 0.000 1.000 N NA
 1306903 1306904 CYA_2645 CYA_2646 ribE aroK TRUE 0.815 27.000 0.002 1.000 N NA
 1306906 1306907 CYA_2648 CYA_2650 glgA-2   FALSE 0.574 127.000 0.045 1.000   NA
 1306908 1306909 CYA_2649 CYA_2651     TRUE 0.661 6.000 0.000 NA   NA
 1306909 1306910 CYA_2651 CYA_2652     TRUE 0.801 61.000 0.000 0.013   NA
 1306910 1306911 CYA_2652 CYA_2653     FALSE 0.006 438.000 0.000 1.000   NA
 1306912 1306913 CYA_2654 CYA_2655 trpG   TRUE 0.952 -9.000 0.231 NA   NA
 1306913 1306914 CYA_2655 CYA_2656     TRUE 0.841 5.000 0.014 NA   NA
 1306916 1306917 CYA_2658 CYA_2659 bioB   FALSE 0.036 211.000 0.000 1.000 N NA
 1306917 1306918 CYA_2659 CYA_2660     FALSE 0.570 33.000 0.000 NA   NA
 1306918 1306919 CYA_2660 CYA_2661     FALSE 0.534 -186.000 0.000 NA   NA
 1306920 1306921 CYA_2662 CYA_2663   panC/cmk FALSE 0.057 197.000 0.000 1.000   NA
 1306921 1306922 CYA_2663 CYA_2664 panC/cmk petG TRUE 0.675 72.000 0.002 1.000   NA
 1306925 1306926 CYA_2667 CYA_2668     FALSE 0.002 732.000 0.000 NA   NA
 1306928 1306929 CYA_2670 CYA_2671   trmB TRUE 0.656 80.000 0.014 1.000   NA
 1306929 1306930 CYA_2671 CYA_2672 trmB   TRUE 0.721 68.000 0.038 NA   NA
 1306931 1306932 CYA_2673 CYA_2674     TRUE 0.705 -42.000 0.000 1.000   NA
 1306932 1306933 CYA_2674 CYA_2675     FALSE 0.399 132.000 0.003 1.000 N NA
 1306934 1306935 CYA_2676 CYA_2677     FALSE 0.616 21.000 0.000 NA   NA
 1306935 1306936 CYA_2677 CYA_2678   cobQ FALSE 0.024 212.000 0.000 NA   NA
 1306936 1306937 CYA_2678 CYA_2679 cobQ galE FALSE 0.486 69.000 0.000 1.000 N NA
 1306937 1306938 CYA_2679 CYA_2680 galE cutA TRUE 0.658 72.000 0.005 1.000 N NA
 1306938 1306939 CYA_2680 CYA_2681 cutA coaD TRUE 0.826 23.000 0.002 1.000 N NA
 1306941 1306942 CYA_2683 CYA_2684     FALSE 0.017 268.000 0.000 1.000 N NA
 1306942 1306943 CYA_2684 CYA_2685     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306943 1306944 CYA_2685 CYA_2686   gid FALSE 0.307 74.000 0.000 NA N NA
 1306946 1306947 CYA_2688 CYA_2689 ackA   FALSE 0.261 175.000 0.057 NA   NA
 1306947 1306948 CYA_2689 CYA_2690     FALSE 0.003 541.000 0.000 NA   NA
 1306950 1306951 CYA_2692 CYA_2693     FALSE 0.248 247.000 0.571 NA   NA
 1306951 1306952 CYA_2693 CYA_2694     FALSE 0.248 109.000 0.000 NA   NA
 1306952 1306953 CYA_2694 CYA_2695     TRUE 0.868 -145.000 0.000 NA Y NA
 1306953 1306954 CYA_2695 CYA_2696     FALSE 0.003 462.000 0.000 NA   NA
 1306954 1306955 CYA_2696 CYA_2697     TRUE 0.802 95.000 0.143 NA   NA
 1306955 1306956 CYA_2697 CYA_2698     FALSE 0.002 933.000 0.000 NA   NA
 1306956 1306957 CYA_2698 CYA_2699     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 1306957 1306958 CYA_2699 CYA_2700   lgt-2 FALSE 0.209 173.000 0.000 0.052 N NA
 1306959 1306960 CYA_2701 CYA_2702     TRUE 0.663 3.000 0.000 NA   NA
 1306960 1306961 CYA_2702 CYA_2703   acsF TRUE 0.823 47.000 0.028 1.000   NA
 1306961 1306962 CYA_2703 CYA_2704 acsF gltS FALSE 0.569 100.000 0.010 1.000   NA
 1306962 1306963 CYA_2704 CYA_2705 gltS   FALSE 0.336 81.000 0.000 NA   NA
 1306963 1306964 CYA_2705 CYA_2706     FALSE 0.368 74.000 0.000 NA   NA
 1306965 1306966 CYA_2707 CYA_2708     FALSE 0.362 75.000 0.000 NA   NA
 1306966 1306967 CYA_2708 CYA_2709     FALSE 0.154 126.000 0.000 NA N NA
 1306967 1306968 CYA_2709 CYA_2710     TRUE 0.891 -18.000 0.000 NA Y NA
 1306968 1306969 CYA_2710 CYA_2711     FALSE 0.324 110.000 0.000 1.000 N NA
 1306972 1306973 CYA_2714 CYA_2715   gltX TRUE 0.840 -67.000 0.000 0.071 N NA
 1306974 1306975 CYA_2716 CYA_2717     FALSE 0.277 98.000 0.000 NA   NA
 1306976 1306977 CYA_2718 CYA_2719     FALSE 0.577 31.000 0.000 NA   NA
 1306977 1306978 CYA_2719 CYA_2720     FALSE 0.375 73.000 0.000 NA   NA
 1306979 1306980 CYA_2721 CYA_2722     FALSE 0.566 34.000 0.000 NA   NA
 1306980 1306981 CYA_2722 CYA_2724     FALSE 0.014 568.000 0.000 NA Y NA
 1306981 1306982 CYA_2724 CYA_2725     FALSE 0.135 145.000 0.000 NA   NA
 1306982 1306983 CYA_2725 CYA_2726     FALSE 0.462 55.000 0.000 NA   NA
 1306983 1306984 CYA_2726 CYA_2727     FALSE 0.025 210.000 0.000 NA   NA
 1306984 1306985 CYA_2727 CYA_2728     TRUE 0.917 68.000 0.400 NA   NA
 1306985 1306986 CYA_2728 CYA_2729   aroE TRUE 0.793 36.000 0.021 NA   NA
 1306986 1306987 CYA_2729 CYA_2730 aroE   FALSE 0.010 277.000 0.000 NA   NA
 1306987 1306988 CYA_2730 CYA_2731     TRUE 0.938 16.000 0.105 NA   NA
 1306990 1306991 CYA_2733 CYA_2734     FALSE 0.582 30.000 0.000 NA   NA
 1306991 1306992 CYA_2734 CYA_2735     TRUE 0.920 138.000 0.304 0.011 Y NA
 1306994 1306995 CYA_2737 CYA_2738     FALSE 0.226 228.000 0.000 0.010 Y NA
 1306995 1306996 CYA_2738 CYA_2739     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.010 Y NA
 1306996 1306997 CYA_2739 CYA_2740   cheW FALSE 0.638 166.000 0.095 1.000 Y NA
 1306997 1306998 CYA_2740 CYA_2741 cheW   FALSE 0.505 309.000 0.762 0.001 Y NA
 1306998 1306999 CYA_2741 CYA_2742     TRUE 0.801 188.000 0.524 0.002 Y NA
 1306999 1307000 CYA_2742 CYA_2743     FALSE 0.165 135.000 0.000 NA   NA
 1307000 1307001 CYA_2743 CYA_2744   lnt FALSE 0.238 113.000 0.000 NA   NA
 1307001 1307002 CYA_2744 CYA_2745 lnt   FALSE 0.327 83.000 0.000 NA   NA
 1307002 1307003 CYA_2745 CYA_2746   cbiT FALSE 0.089 159.000 0.000 NA   NA
 1307003 1307004 CYA_2746 CYA_2747 cbiT   FALSE 0.524 148.000 0.087 NA   NA
 1307009 1307010 CYA_2752 CYA_2753     FALSE 0.005 456.000 0.000 1.000 N NA
 1307010 1307011 CYA_2753 CYA_2754     FALSE 0.007 394.000 0.000 1.000 N NA
 1307012 1307013 CYA_2755 CYA_2756     FALSE 0.010 319.000 0.000 1.000 N NA
 1307014 1307015 CYA_2757 CYA_2758     FALSE 0.002 1017.000 0.000 NA   NA
 1307019 1307020 CYA_2762 CYA_2763 hemB   FALSE 0.456 56.000 0.000 NA   NA
 1307021 1307022 CYA_2764 CYA_2765   psbI FALSE 0.221 119.000 0.000 NA   NA
 1307027 1307028 CYA_2770 CYA_2771     FALSE 0.286 95.000 0.000 NA   NA
 1307030 1307031 CYA_2772 CYA_2774     TRUE 0.663 4.000 0.000 NA   NA
 1307031 1307032 CYA_2774 CYA_2775     TRUE 0.824 97.000 0.222 NA   NA
 1307033 1307034 CYA_2776 CYA_2777 petN   TRUE 0.932 16.000 0.091 NA   NA
 1307035 1307036 CYA_2778 CYA_2779     TRUE 0.805 -12.000 0.012 NA   NA
 1307036 1307037 CYA_2779 CYA_2780     FALSE 0.158 125.000 0.000 NA N NA
 1307038 1307039 CYA_2781 CYA_2782     FALSE 0.004 518.000 0.000 1.000 N NA
 1307039 1307040 CYA_2782 CYA_2783     TRUE 0.995 1.000 0.607 0.017 Y NA
 1307040 1307041 CYA_2783 CYA_2784     FALSE 0.568 -52.000 0.000 NA   NA
 1307041 1307042 CYA_2784 CYA_2785   ugpB FALSE 0.456 56.000 0.000 NA   NA
 1307042 1307043 CYA_2785 CYA_2786 ugpB upgA FALSE 0.455 252.000 0.250 0.017 Y NA
 1307044 1307045 CYA_2787 CYA_2788   rpsO TRUE 0.828 36.000 0.037 NA   NA
 1307047 1307048 CYA_2790 CYA_2791 apcD pilT-2 FALSE 0.267 188.000 0.077 1.000   NA
 1307048 1307049 CYA_2791 CYA_2792 pilT-2 folE FALSE 0.025 242.000 0.000 1.000 N NA
 1307049 1307050 CYA_2792 CYA_2793 folE   TRUE 0.830 124.000 0.391 1.000   NA
 1307051 1307052 CYA_2794 CYA_2795     FALSE 0.003 456.000 0.000 NA   NA
 1307052 1307053 CYA_2795 CYA_2796     TRUE 0.815 42.000 0.037 NA   NA
 1307053 1307054 CYA_2796 CYA_2797     FALSE 0.462 142.000 0.037 1.000   NA
 1307056 1307057 CYA_2799 CYA_2801   trx-3 TRUE 0.922 35.000 0.124 NA   NA
 1307058 1307059 CYA_2800 CYA_2802     TRUE 0.941 -3.000 0.111 NA   NA
 1307059 1307060 CYA_2802 CYA_2803     TRUE 0.981 32.000 1.000 NA   NA
 1307060 1307061 CYA_2803 CYA_2804   pip TRUE 0.685 37.000 0.000 1.000   NA
 1307061 1307062 CYA_2804 CYA_2805 pip   TRUE 0.841 34.000 0.020 1.000   NA
 1307063 1307064 CYA_2806 CYA_2807     TRUE 0.640 48.000 0.000 1.000   NA
 1307064 1307065 CYA_2807 CYA_2809     FALSE 0.307 124.000 0.000 1.000   NA
 1307067 1307068 CYA_2810 CYA_2811   rpmI FALSE 0.434 123.000 0.002 1.000 N NA
 1307068 1307069 CYA_2811 CYA_2812 rpmI rplT TRUE 0.974 123.000 0.928 0.012 Y NA
 1307069 1307070 CYA_2812 CYA_2814 rplT   TRUE 0.862 5.000 0.008 1.000 N NA
 1307072 1307073 CYA_2815 CYA_2816     TRUE 0.991 4.000 0.235 0.023 Y NA
 1307074 1307075 CYA_2817 CYA_2818 argF prc-2 FALSE 0.520 106.000 0.004 1.000 N NA
 1307075 1307076 CYA_2818 CYA_2819 prc-2   FALSE 0.608 23.000 0.000 NA   NA
 1307077 1307078 CYA_2820 CYA_2821 proA   FALSE 0.022 264.000 0.000 1.000   NA
 1307078 1307079 CYA_2821 CYA_2822     TRUE 0.770 92.000 0.061 1.000   NA
 1307079 1307080 CYA_2822 CYA_2823     TRUE 0.728 24.000 0.000 1.000   NA
 1307081 1307082 CYA_2824 CYA_2825     FALSE 0.245 110.000 0.000 NA   NA
 1307083 1307084 CYA_2826 CYA_2827 recJ-2   TRUE 0.842 23.000 0.002 1.000   NA
 1307084 1307085 CYA_2827 CYA_2828   rdgB TRUE 0.757 51.000 0.002 1.000   NA
 1307085 1307086 CYA_2828 CYA_2829 rdgB   FALSE 0.078 193.000 0.002 NA   NA
 1307086 1307087 CYA_2829 CYA_2830   tmk TRUE 0.809 16.000 0.002 NA   NA
 1307087 1307088 CYA_2830 CYA_2831 tmk   FALSE 0.201 124.000 0.000 NA   NA
 1307088 1307089 CYA_2831 CYA_2832     FALSE 0.277 98.000 0.000 NA   NA
 1307089 1307090 CYA_2832 CYA_2834     TRUE 0.963 74.000 1.000 1.000   NA
 1307091 1307092 CYA_2833 CYA_2835     TRUE 0.663 4.000 0.000 NA   NA
 1307092 1307093 CYA_2835 CYA_2836     FALSE 0.450 57.000 0.000 NA   NA
 1307094 1307095 CYA_2837 CYA_2838     FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 1307095 1307096 CYA_2838 CYA_2839     FALSE 0.169 134.000 0.000 NA   NA
 1307098 1307099 CYA_2841 CYA_2842 tgt   FALSE 0.471 102.000 0.003 NA   NA
 1307099 1307100 CYA_2842 CYA_2843     TRUE 0.964 64.000 1.000 NA   NA
 1307100 1307101 CYA_2843 CYA_2844     TRUE 0.987 7.000 1.000 NA   NA
 1307101 1307102 CYA_2844 CYA_2845     FALSE 0.158 137.000 0.000 NA   NA
 1307102 1307103 CYA_2845 CYA_2846     TRUE 0.867 39.000 0.000 NA Y NA
 1307108 1307109 CYA_2851 CYA_2852     FALSE 0.099 155.000 0.000 NA   NA
 1307109 1307110 CYA_2852 CYA_2853     FALSE 0.204 123.000 0.000 NA   NA
 1307110 1307111 CYA_2853 CYA_2854     FALSE 0.110 152.000 0.000 NA   NA
 1307111 1307112 CYA_2854 CYA_2855     FALSE 0.004 426.000 0.000 NA   NA
 1307113 1307114 CYA_2856 CYA_2857     TRUE 0.645 -3.000 0.000 NA   NA
 1307114 1307115 CYA_2857 CYA_2858   sodB FALSE 0.037 190.000 0.000 NA   NA
 1307117 1307118 CYA_2860 CYA_2861     FALSE 0.427 61.000 0.000 NA   NA
 1307118 1307119 CYA_2861 CYA_2862   glyS FALSE 0.005 459.000 0.000 1.000 N NA
 1307120 1307121 CYA_2863 CYA_2864     TRUE 0.658 8.000 0.000 NA   NA
 1307121 1307122 CYA_2864 CYA_2865     FALSE 0.238 113.000 0.000 NA   NA
 1307122 1307123 CYA_2865 CYA_2866     FALSE 0.590 57.000 0.000 1.000   NA
 1307123 1307124 CYA_2866 CYA_2867     TRUE 0.937 54.000 0.400 NA   NA
 1307124 1307125 CYA_2867 CYA_2868     TRUE 0.806 125.000 0.400 NA   NA
 1307125 1307126 CYA_2868 CYA_2869     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 1307126 1307127 CYA_2869 CYA_2870     FALSE 0.080 162.000 0.000 NA   NA
 1307127 1307128 CYA_2870 CYA_2871     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 1307128 1307129 CYA_2871 CYA_2872     FALSE 0.295 93.000 0.000 NA   NA
 1307129 1307130 CYA_2872 CYA_2873   fabF TRUE 0.822 13.000 0.005 NA   NA
 1307130 1307131 CYA_2873 CYA_2874 fabF acpP TRUE 0.936 98.000 0.346 1.000 Y NA
 1307132 1307133 CYA_2875 CYA_2876 rpsF   FALSE 0.590 88.000 0.004 1.000 N NA
 1307133 1307134 CYA_2876 CYA_2877     TRUE 0.896 27.000 0.047 1.000   NA
 1307134 1307135 CYA_2877 CYA_2878     TRUE 0.911 33.000 0.059 1.000   NA
 1307136 1307137 CYA_2879 CYA_2880     FALSE 0.626 18.000 0.000 NA   NA
 1307137 1307138 CYA_2880 CYA_2881     TRUE 0.959 25.000 0.379 NA   NA
 1307138 1307139 CYA_2881 CYA_2882     TRUE 0.980 -3.000 0.710 NA   NA
 1307139 1307140 CYA_2882 CYA_2883   purM FALSE 0.042 203.000 0.000 1.000 N NA
 1307142 1307143 CYA_2885 CYA_2886     TRUE 0.993 12.000 0.400 0.012 Y NA
 1307143 1307144 CYA_2886 CYA_2887   prs FALSE 0.256 160.000 0.020 1.000 N NA
 1307145 1307146 CYA_2888 CYA_2889     FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   NA
 1307146 1307147 CYA_2889 CYA_2890     FALSE 0.521 91.000 0.003 NA   NA
 1307147 1307148 CYA_2890 CYA_2891     FALSE 0.008 350.000 0.000 1.000 N NA
 1307148 1307149 CYA_2891 CYA_2892     TRUE 0.871 25.000 0.028 1.000   NA
 1307150 1307151 CYA_2893 CYA_2894 uppS   TRUE 0.894 6.000 0.043 NA   NA
 1307151 1307152 CYA_2894 CYA_2895   lysA FALSE 0.072 236.000 0.040 NA   NA
 1307153 1307154 CYA_2896 CYA_2898     TRUE 0.662 5.000 0.000 NA   NA
 1307155 1307156 CYA_2897 CYA_2899 miaB purA FALSE 0.064 183.000 0.000 1.000 N NA
 1307156 1307157 CYA_2899 CYA_2900 purA   FALSE 0.150 158.000 0.000 1.000   NA
 1307157 1307158 CYA_2900 CYA_2901     FALSE 0.286 129.000 0.000 1.000   NA
 1307158 1307159 CYA_2901 CYA_2902     FALSE 0.561 -82.000 0.000 NA   NA
 1307159 1307160 CYA_2902 CYA_2903   smc FALSE 0.254 107.000 0.000 NA   NA
 1307160 1307161 CYA_2903 CYA_2904 smc rnpA FALSE 0.626 76.000 0.002 1.000 N NA
 1307161 1307162 CYA_2904 CYA_2905 rnpA rpmH TRUE 0.938 91.000 0.787 1.000   NA