MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli W3110

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1238932 1238933     thrL thrA FALSE 0.174 82.000 0.043 1.000   NA
 1238933 1238934     thrA thrB TRUE 0.991 2.000 0.133 1.000 Y NA
 1238934 1238935     thrB thrC TRUE 0.994 1.000 0.233 1.000 Y NA
 1238935 1238936     thrC yaaX FALSE 0.017 214.000 0.003 NA   NA
 1238937 1238938     yaaA yaaJ FALSE 0.132 70.000 0.028 NA   NA
 1238939 1238940     talB mog FALSE 0.108 115.000 0.042 1.000 N NA
 1238941 1238942     yaaH yaaW FALSE 0.081 149.000 0.043 NA   NA
 1238945 1238946     dnaK dnaJ TRUE 0.900 89.000 0.236 0.004 Y NA
 1238946 1238947     dnaJ insL FALSE 0.101 147.000 0.000 1.000   NA
 1238949 1238948     hokC mokC TRUE 0.802 -152.000 0.000 NA   NA
 1238950 1238951     sokC nhaA FALSE 0.004 483.000 0.000 NA   NA
 1238951 1238952     nhaA nhaR TRUE 0.593 60.000 0.292 1.000 N NA
 1238953 1238954     insB insA TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.020 Y NA
 1238954 1238955     insA rpsT FALSE 0.011 307.000 0.000 1.000 N NA
 1238956 1238957     yaaY ribF TRUE 0.799 8.000 0.019 NA   NA
 1238957 1238958     ribF ileS TRUE 0.684 43.000 0.254 1.000 N NA
 1238958 1238959     ileS lspA TRUE 0.893 0.000 0.045 1.000 N NA
 1238959 1238960     lspA fkpB FALSE 0.260 125.000 0.154 1.000 N NA
 1238960 1238961     fkpB ispH TRUE 0.992 2.000 0.626 1.000 N NA
 1238961 1238962     ispH rihC FALSE 0.137 66.000 0.028 1.000 N NA
 1238962 1238963     rihC dapB FALSE 0.035 167.000 0.003 1.000 N NA
 1238963 1238964     dapB carA FALSE 0.043 456.000 0.034 1.000 Y NA
 1238964 1238965     carA carB TRUE 0.995 18.000 0.345 0.001 Y NA
 1238965 1238966     carB caiF FALSE 0.017 262.000 0.000 NA   NA
 1238967 1238968     caiE caiD TRUE 0.881 6.000 0.000 1.000   NA
 1238968 1238969     caiD caiC TRUE 0.994 1.000 0.000 0.027 Y NA
 1238969 1238970     caiC caiB TRUE 0.654 59.000 0.154 0.027 N NA
 1238970 1238971     caiB caiA TRUE 0.611 129.000 0.529 1.000 N NA
 1238971 1238972     caiA caiT TRUE 0.632 31.000 0.118 1.000 N NA
 1238973 1238974     fixA fixB TRUE 0.992 15.000 0.231 0.022 Y NA
 1238974 1238975     fixB fixC TRUE 0.855 51.000 0.000 0.068 Y NA
 1238975 1238976     fixC fixX TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.068 Y NA
 1238976 1238977     fixX yaaU FALSE 0.197 57.000 0.000 1.000 N NA
 1238977 1238978     yaaU kefF FALSE 0.140 108.000 0.000 1.000   NA
 1238978 1238979     kefF kefC TRUE 0.991 -7.000 0.560 1.000   NA
 1238979 1238980     kefC folA FALSE 0.026 192.000 0.012 1.000 N NA
 1238981 1238982     apaH apaG TRUE 0.968 7.000 0.267 NA N NA
 1238982 1238983     apaG ksgA TRUE 0.898 3.000 0.078 NA N NA
 1238983 1238984     ksgA pdxA TRUE 0.970 -3.000 0.197 1.000 N NA
 1238984 1238985     pdxA surA TRUE 0.992 0.000 0.561 1.000 N NA
 1238985 1238986     surA imp TRUE 0.513 53.000 0.182 1.000 N NA
 1238987 1238988     djlA yabP FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 1238988 1238989     yabP yabQ TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1238990 1238991     rluA hepA TRUE 0.961 12.000 0.294 1.000 N NA
 1238991 1238992     hepA polB TRUE 0.620 165.000 0.098 0.079 Y NA
 1238992 1238993     polB araD FALSE 0.107 75.000 0.018 1.000 N NA
 1238993 1238994     araD araA FALSE 0.106 285.000 0.017 1.000 Y NA
 1238994 1238995     araA araB TRUE 0.923 11.000 0.138 1.000 N NA
 1238996 1238997     araC yabI FALSE 0.342 86.000 0.167 NA   NA
 1238998 1238999     thiQ thiP TRUE 0.994 -16.000 0.522 0.018 N NA
 1238999 1239000     thiP tbpA TRUE 0.994 -24.000 0.697 0.085 N NA
 1239000 1239001     tbpA sgrR FALSE 0.173 164.000 0.010 0.085   NA
 1239002 1239003     sgrS setA TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1239004 1239005     leuD leuC TRUE 0.997 11.000 0.309 0.001 Y NA
 1239005 1239006     leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 1239006 1239007     leuB leuA TRUE 0.997 0.000 0.126 0.002 Y NA
 1239007 1239008     leuA leuL TRUE 0.458 93.000 0.010 0.002   NA
 1239009 1239010     leuO ilvI FALSE 0.010 318.000 0.000 1.000 N NA
 1239010 1239011     ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 1239011 1239012     ilvH fruR FALSE 0.066 180.000 0.063 1.000 N NA
 1239012 1239013     fruR mraZ FALSE 0.004 602.000 0.000 NA   NA
 1239013 1239014     mraZ mraW TRUE 0.993 2.000 0.635 NA   NA
 1239014 1239015     mraW ftsL TRUE 0.975 -3.000 0.227 1.000 N NA
 1239015 1239016     ftsL ftsI TRUE 0.855 16.000 0.124 1.000 N NA
 1239016 1239017     ftsI murE TRUE 0.983 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 1239017 1239018     murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 1239018 1239019     murF mraY TRUE 0.998 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 1239019 1239020     mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 1239020 1239021     murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 1239021 1239022     ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1239022 1239023     murG murC TRUE 0.887 54.000 0.283 1.000 Y NA
 1239023 1239024     murC ddlB TRUE 0.996 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 1239024 1239025     ddlB ftsQ TRUE 0.996 2.000 0.372 NA Y NA
 1239025 1239026     ftsQ ftsA TRUE 0.986 -3.000 0.389 NA N NA
 1239026 1239027     ftsA ftsZ TRUE 0.914 61.000 0.460 1.000 Y NA
 1239027 1239028     ftsZ lpxC FALSE 0.272 101.000 0.134 1.000 N NA
 1239028 1239029     lpxC secM FALSE 0.029 231.000 0.000 1.000   NA
 1239029 1239030     secM secA FALSE 0.268 62.000 0.065 1.000   NA
 1239030 1239031     secA mutT FALSE 0.429 60.000 0.168 1.000 N NA
 1239032 1239033     yacG yacF TRUE 0.978 10.000 0.356 NA   NA
 1239033 1239034     yacF coaE TRUE 0.948 0.000 0.110 NA   NA
 1239036 1239037     hofC hofB TRUE 0.997 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 1239037 1239038     hofB ppdD TRUE 0.997 10.000 0.556 NA Y NA
 1239038 1239039     ppdD nadC FALSE 0.015 203.000 0.015 NA N NA
 1239040 1239041     ampD ampE TRUE 0.995 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 1239043 1239044     pdhR aceE FALSE 0.296 161.000 0.276 1.000 N NA
 1239044 1239045     aceE aceF TRUE 0.984 15.000 0.220 1.000 Y NA
 1239045 1239046     aceF lpd FALSE 0.311 325.000 0.463 1.000 Y NA
 1239048 1239049     acnB yacL FALSE 0.074 176.000 0.068 NA   NA
 1239050 1239051     speD speE TRUE 0.977 16.000 0.162 1.000 Y NA
 1239051 1239052     speE yacC TRUE 0.536 106.000 0.354 NA   NA
 1239057 1239058     yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.099 Y NA
 1239058 1239059     yadH yadI FALSE 0.110 105.000 0.037 1.000 N NA
 1239059 1239060     yadI yadE TRUE 0.826 64.000 0.222 1.000 Y NA
 1239063 1239064     panC panB TRUE 0.998 12.000 0.395 0.001 Y NA
 1239064 1239065     panB yadC FALSE 0.107 114.000 0.000 1.000 N NA
 1239065 1239066     yadC yadK TRUE 0.884 50.000 0.000 0.010 Y NA
 1239066 1239067     yadK yadL TRUE 0.975 27.000 0.571 0.010   NA
 1239067 1239068     yadL yadM TRUE 0.993 12.000 0.571 0.010   NA
 1239068 1239069     yadM htrE TRUE 0.993 17.000 0.571 1.000 Y NA
 1239069 1239070     htrE ecpD TRUE 0.986 35.000 1.000 1.000 Y NA
 1239070 1239071     ecpD yadN TRUE 0.884 98.000 0.500 1.000 Y NA
 1239071 1239072     yadN folK FALSE 0.006 370.000 0.000 1.000 N NA
 1239072 1239073     folK pcnB TRUE 0.976 -3.000 0.234 1.000 N NA
 1239073 1239074     pcnB yadB TRUE 0.778 60.000 0.131 1.000 Y NA
 1239074 1239075     yadB dksA TRUE 0.723 37.000 0.231 1.000 N NA
 1239075 1239076     dksA sfsA FALSE 0.138 178.000 0.151 NA   NA
 1239076 1239077     sfsA ligT TRUE 0.738 15.000 0.045 NA   NA
 1239078 1239079     hrpB mrcB FALSE 0.111 196.000 0.158 1.000 N NA
 1239079 1239080     mrcB fhuA FALSE 0.025 220.000 0.000 1.000 N NA
 1239080 1239081     fhuA fhuC TRUE 0.843 51.000 0.156 1.000 Y NA
 1239081 1239082     fhuC fhuD TRUE 0.987 0.000 0.031 1.000 Y NA
 1239082 1239083     fhuD fhuB TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1239085 1239086     clcA yadR FALSE 0.123 82.000 0.031 NA   NA
 1239087 1239088     yadS btuF TRUE 0.684 38.000 0.213 NA   NA
 1239088 1239089     btuF pfs TRUE 0.907 -7.000 0.073 1.000 N NA
 1239090 1239091     dgt degP FALSE 0.186 130.000 0.101 1.000 N NA
 1239091 1239092     degP cdaR FALSE 0.093 155.000 0.080 NA N NA
 1239093 1239094     yaeH yaeI FALSE 0.065 162.000 0.000 NA   NA
 1239094 1239095     yaeI dapD FALSE 0.259 54.000 0.000 1.000   NA
 1239095 1239096     dapD glnD TRUE 0.595 31.000 0.097 1.000 N NA
 1239096 1239097     glnD map TRUE 0.527 62.000 0.243 1.000 N NA
 1239098 1239099     tff rpsB TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 1239099 1239100     rpsB tsf TRUE 0.611 258.000 0.748 1.000 Y NA
 1239100 1239101     tsf pyrH TRUE 0.481 147.000 0.416 1.000 N NA
 1239101 1239102     pyrH frr FALSE 0.188 292.000 0.626 1.000 N NA
 1239102 1239103     frr dxr FALSE 0.111 92.000 0.032 1.000 N NA
 1239103 1239104     dxr ispU FALSE 0.290 186.000 0.025 1.000 Y NA
 1239104 1239105     ispU cdsA TRUE 0.993 13.000 0.400 1.000 Y NA
 1239105 1239106     cdsA yaeL TRUE 0.860 12.000 0.080 1.000 N NA
 1239106 1239107     yaeL yaeT TRUE 0.942 30.000 0.204 1.000 Y NA
 1239107 1239108     yaeT hlpA TRUE 0.812 122.000 0.354 1.000 Y NA
 1239108 1239109     hlpA lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 1239109 1239110     lpxD fabZ TRUE 0.770 105.000 0.796 1.000 N NA
 1239110 1239111     fabZ lpxA TRUE 0.994 4.000 0.850 1.000 N NA
 1239111 1239112     lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 1239112 1239113     lpxB rnhB TRUE 0.968 -3.000 0.186 1.000 N NA
 1239113 1239114     rnhB dnaE TRUE 0.880 37.000 0.104 1.000 Y NA
 1239114 1239115     dnaE accA TRUE 0.889 13.000 0.122 1.000 N NA
 1239115 1239116     accA ldcC FALSE 0.080 99.000 0.010 1.000 N NA
 1239116 1239117     ldcC yaeR TRUE 0.688 57.000 0.039 NA Y NA
 1239117 1239118     yaeR tilS FALSE 0.080 65.000 0.015 NA N NA
 1239119 1239120     rof yaeP TRUE 0.959 -7.000 0.179 NA   NA
 1239121 1239122     yaeQ yaeJ TRUE 0.901 -3.000 0.034 1.000   NA
 1239122 1239123     yaeJ nlpE TRUE 0.703 14.000 0.027 NA   NA
 1239124 1239125     yaeF proS FALSE 0.142 54.000 0.002 NA   NA
 1239125 1239126     proS yaeB FALSE 0.122 112.000 0.048 NA   NA
 1239126 1239127     yaeB rcsF TRUE 0.977 -3.000 0.247 NA   NA
 1239127 1239128     rcsF metQ TRUE 0.612 118.000 0.500 NA   NA
 1239128 1239129     metQ metI TRUE 0.972 40.000 0.411 0.071 Y NA
 1239129 1239130     metI metN TRUE 0.998 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 1239131 1239132     gmhB rrsH FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 1239132 1239133     rrsH ileV FALSE 0.158 69.000 0.000 NA   NA
 1239133 1239134     ileV alaV FALSE 0.283 43.000 0.000 NA   NA
 1239134 1239135     alaV rrlH FALSE 0.045 184.000 0.000 NA   NA
 1239135 1239136     rrlH rrfH FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 1239136 1239137     rrfH aspU FALSE 0.223 53.000 0.000 NA   NA
 1239137 1239138     aspU dkgB FALSE 0.064 163.000 0.000 NA   NA
 1239140 1239141     yafD yafE TRUE 0.900 4.000 0.066 NA   NA
 1239142 1239143     mltD gloB TRUE 0.504 72.000 0.233 1.000   NA
 1239146 1239147     dnaQ aspV FALSE 0.097 133.000 0.000 NA   NA
 1239147 1239148     aspV yafT FALSE 0.009 328.000 0.000 NA   NA
 1239154 1239155     lpcA yafJ FALSE 0.155 206.000 0.229 1.000   NA
 1239156 1239157     yafK yafQ FALSE 0.069 156.000 0.000 NA   NA
 1239157 1239158     yafQ dinJ TRUE 0.957 3.000 0.167 NA   NA
 1239159 1239160     yafL yafM FALSE 0.039 176.000 0.000 NA N NA
 1239163 1239165     mbhA dinB FALSE 0.155 71.000 0.000 NA   NA
 1239165 1239166     dinB yafN FALSE 0.181 52.000 0.000 NA N NA
 1239166 1239167     yafN yafO TRUE 0.989 3.000 0.500 NA   NA
 1239167 1239168     yafO yafP TRUE 0.836 10.000 0.000 NA   NA
 1239168 1239169     yafP ykfJ FALSE 0.011 306.000 0.000 NA   NA
 1239169 1239170     ykfJ prfH TRUE 0.969 -31.000 0.303 NA   NA
 1239172 1239173     gpt frsA FALSE 0.127 92.000 0.040 NA   NA
 1239173 1239174     frsA crl FALSE 0.210 58.000 0.048 NA   NA
 1239176 1239177     proB proA TRUE 0.991 12.000 0.026 0.001 Y NA
 1239177 1239178     proA thrW FALSE 0.109 115.000 0.000 NA   NA
 1239179 1239180     ykfI yafW TRUE 0.968 21.000 0.667 NA   NA
 1239180 1239181     yafW ykfH TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 1239181 1239182     ykfH ykfG TRUE 0.846 9.000 0.000 NA   NA
 1239182 1239183     ykfG yafX TRUE 0.703 16.000 0.000 NA   NA
 1239183 1239184     yafX ykfF FALSE 0.126 98.000 0.000 NA   NA
 1239184 1239185     ykfF ykfB FALSE 0.147 77.000 0.000 NA   NA
 1239185 1239186     ykfB yafY TRUE 0.553 23.000 0.000 NA   NA
 1239186 1239187     yafY yafZ FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 1239187 1239188     yafZ ykfA FALSE 0.130 92.000 0.000 NA   NA
 1239188 1239189     ykfA perR FALSE 0.039 329.000 0.000 0.054   NA
 1239190 1239191     insN insI TRUE 0.990 -43.000 0.000 0.017 Y NA
 1239191 1239192     insI insO FALSE 0.180 76.000 0.000 1.000   NA
 1239192 1239193     insO ykfC FALSE 0.005 592.000 0.000 1.000   NA
 1239195 1239196     mmuP mmuM TRUE 0.989 -13.000 0.147 1.000 Y NA
 1239197 1239198     afuC afuB TRUE 0.966 12.000 0.143 0.071   NA
 1239198 1239199     afuB insB TRUE 0.899 2.000 0.000 1.000   NA
 1239199 1239200     insB insA TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 1239200 1239201     insA ykgN TRUE 0.647 149.000 0.000 0.019 Y NA
 1239201 1239202     ykgN yagB TRUE 0.553 23.000 0.000 NA   NA
 1239202 1239203     yagB yagA FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 1239204 1239205     yagE yagF TRUE 0.998 15.000 0.750 0.063 Y NA
 1239205 1239206     yagF yagG FALSE 0.194 227.000 0.000 1.000 Y NA
 1239206 1239207     yagG yagH TRUE 0.990 12.000 0.273 1.000 Y NA
 1239208 1239209     yagI argF TRUE 0.476 139.000 0.375 1.000 N NA
 1239209 1239210     argF insB FALSE 0.008 344.000 0.000 1.000 N NA
 1239210 1239211     insB insA TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 1239213 1239214     yagK yagL FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 1239214 1239215     yagL yagM TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 1239215 1239216     yagM yagN FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 1239216 1239217     yagN intF FALSE 0.108 117.000 0.000 NA   NA
 1239217 1239218     intF yagP FALSE 0.014 285.000 0.000 NA   NA
 1239218 1239219     yagP yagQ TRUE 0.830 -21.000 0.000 NA   NA
 1239219 1239220     yagQ yagR TRUE 0.908 10.000 0.111 NA N NA
 1239220 1239221     yagR yagS TRUE 1.000 -3.000 0.917 0.001 Y NA
 1239221 1239222     yagS yagT TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.067 Y NA
 1239224 1239225     ykgJ yagV FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 1239225 1239226     yagV yagW TRUE 0.967 -31.000 0.286 NA   NA
 1239226 1239227     yagW yagX TRUE 0.851 -10.000 0.000 NA   NA
 1239227 1239228     yagX yagY TRUE 0.875 26.000 0.308 NA   NA
 1239228 1239229     yagY yagZ TRUE 0.698 58.000 0.385 NA   NA
 1239229 1239230     yagZ ykgK TRUE 0.638 75.000 0.400 NA   NA
 1239232 1239233     ykgM ykgM TRUE 0.970 0.000 0.004 0.015   NA
 1239234 1239235     eaeH insE FALSE 0.382 38.000 0.000 1.000   NA
 1239235 1239236     insE insF TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.077   NA
 1239237 1239238     ykgA ykgB FALSE 0.004 590.000 0.000 NA   NA
 1239238 1239239     ykgB ykgI TRUE 0.798 12.000 0.043 NA   NA
 1239239 1239240     ykgI ykgC TRUE 0.721 109.000 0.667 NA   NA
 1239241 1239242     ykgD ykgE FALSE 0.003 527.000 0.000 NA N NA
 1239242 1239243     ykgE ykgF TRUE 0.992 11.000 0.286 NA Y NA
 1239243 1239244     ykgF ykgG TRUE 0.993 -7.000 0.286 0.001   NA
 1239245 1239246     ykgH betA FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 1239246 1239247     betA betB TRUE 0.982 14.000 0.634 1.000 N NA
 1239247 1239248     betB betI TRUE 0.972 14.000 0.459 1.000 N NA
 1239249 1239250     betT yahA FALSE 0.003 875.000 0.000 1.000 N NA
 1239251 1239252     yahB yahC FALSE 0.130 92.000 0.000 NA   NA
 1239253 1239254     yahD yahE TRUE 0.900 40.000 0.667 NA   NA
 1239254 1239255     yahE yahF TRUE 0.984 -10.000 0.429 NA   NA
 1239255 1239256     yahF yahG TRUE 0.994 0.000 0.714 NA   NA
 1239256 1239257     yahG yahH FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 1239257 1239258     yahH yahI FALSE 0.149 76.000 0.000 NA   NA
 1239258 1239259     yahI yahJ TRUE 0.969 10.000 0.278 1.000 N NA
 1239259 1239260     yahJ yahK FALSE 0.008 377.000 0.000 1.000   NA
 1239260 1239261     yahK yahL FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 1239261 1239262     yahL yahM FALSE 0.005 413.000 0.000 NA   NA
 1239266 1239267     prpB prpC FALSE 0.064 440.000 0.502 1.000 N NA
 1239267 1239268     prpC prpD TRUE 0.759 34.000 0.216 1.000   NA
 1239268 1239269     prpD prpE TRUE 0.765 40.000 0.038 0.001   NA
 1239269 1239270     prpE codB FALSE 0.009 330.000 0.000 1.000 N NA
 1239270 1239271     codB codA TRUE 0.993 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 1239273 1239274     cynT cynS TRUE 0.896 31.000 0.075 1.000 Y NA
 1239274 1239275     cynS cynX TRUE 0.865 33.000 0.000 1.000 Y NA
 1239276 1239277     lacA lacY TRUE 0.510 66.000 0.222 1.000   NA
 1239277 1239278     lacY lacZ TRUE 0.653 52.000 0.261 1.000   NA
 1239278 1239279     lacZ lacI FALSE 0.289 123.000 0.174 1.000 N NA
 1239279 1239280     lacI mhpR TRUE 0.779 77.000 0.000 0.054 Y NA
 1239281 1239282     mhpA mhpB TRUE 0.994 2.000 0.333 0.007   NA
 1239282 1239283     mhpB mhpC TRUE 0.992 3.000 0.300 0.007   NA
 1239283 1239284     mhpC mhpD TRUE 0.990 10.000 0.300 0.007   NA
 1239284 1239285     mhpD mhpF TRUE 0.997 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 1239285 1239286     mhpF mhpE TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 N NA
 1239286 1239287     mhpE mhpT FALSE 0.063 578.000 0.600 1.000 N NA
 1239287 1239288     mhpT yaiL FALSE 0.123 102.000 0.000 NA   NA
 1239289 1239290     frmB frmA TRUE 0.548 94.000 0.327 1.000   NA
 1239290 1239291     frmA frmR TRUE 0.894 35.000 0.531 NA   NA
 1239291 1239292     frmR yaiO FALSE 0.042 188.000 0.000 NA   NA
 1239292 1239293     yaiO yaiX TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1239295 1239296     insC insD TRUE 0.988 -42.000 0.000 0.077 Y NA
 1239297 1239298     yaiF yaiP TRUE 0.802 -151.000 0.000 NA   NA
 1239298 1239299     yaiP yaiS FALSE 0.341 124.000 0.214 NA   NA
 1239300 1239301     tauA tauB TRUE 0.970 13.000 0.047 1.000 Y NA
 1239301 1239302     tauB tauC TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 1239302 1239303     tauC tauD TRUE 0.972 -3.000 0.214 1.000 N NA
 1239304 1239305     hemB ykiB FALSE 0.057 170.000 0.000 NA   NA
 1239307 1239308     insF insE TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.077   NA
 1239309 1239310     yaiU yaiV TRUE 0.888 43.000 0.667 NA   NA
 1239312 1239313     sbmA yaiW TRUE 0.804 13.000 0.000 1.000   NA
 1239317 1239318     yaiB phoA FALSE 0.109 101.000 0.032 NA   NA
 1239318 1239319     phoA psiF FALSE 0.093 119.000 0.032 NA   NA
 1239319 1239320     psiF yaiC FALSE 0.431 102.000 0.250 NA   NA
 1239322 1239323     yaiI aroL FALSE 0.029 183.000 0.007 NA   NA
 1239323 1239324     aroL yaiA FALSE 0.253 50.000 0.044 NA   NA
 1239324 1239325     yaiA aroM FALSE 0.018 258.000 0.000 NA   NA
 1239325 1239326     aroM yaiE FALSE 0.169 72.000 0.049 NA   NA
 1239326 1239327     yaiE ykiA FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 1239330 1239331     araJ sbcC FALSE 0.086 126.000 0.030 1.000 N NA
 1239331 1239332     sbcC sbcD TRUE 0.995 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 1239333 1239334     phoB phoR TRUE 0.959 58.000 0.453 0.016 Y NA
 1239334 1239335     phoR brnQ FALSE 0.005 407.000 0.000 1.000 N NA
 1239335 1239336     brnQ proY TRUE 0.914 76.000 0.348 0.099 Y NA
 1239336 1239337     proY malZ FALSE 0.154 156.000 0.123 1.000 N NA
 1239339 1239340     queA tgt TRUE 0.964 56.000 0.360 0.001 Y NA
 1239340 1239341     tgt yajC TRUE 0.893 23.000 0.325 NA N NA
 1239341 1239342     yajC secD TRUE 0.889 28.000 0.045 NA Y NA
 1239342 1239343     secD secF TRUE 0.996 11.000 0.206 0.001 Y NA
 1239343 1239344     secF yajD FALSE 0.091 129.000 0.015 1.000   NA
 1239345 1239346     tsx yajI FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 1239347 1239348     ybaD ribD TRUE 0.972 4.000 0.277 NA N NA
 1239348 1239349     ribD ribE TRUE 0.803 89.000 0.034 0.002 Y NA
 1239349 1239350     ribE nusB TRUE 0.931 20.000 0.347 1.000 N NA
 1239350 1239351     nusB thiL FALSE 0.447 78.000 0.225 1.000 N NA
 1239351 1239352     thiL pgpA TRUE 0.953 -22.000 0.206 1.000 N NA
 1239353 1239354     yajO dxs FALSE 0.031 180.000 0.009 1.000 N NA
 1239354 1239355     dxs ispA TRUE 0.921 25.000 0.060 1.000 Y NA
 1239355 1239356     ispA xseB TRUE 0.875 0.000 0.035 1.000 N NA
 1239358 1239359     yajL panE TRUE 0.933 -37.000 0.155 NA   NA
 1239361 1239362     yajR cyoE FALSE 0.242 149.000 0.061 0.099 N NA
 1239362 1239363     cyoE cyoD TRUE 0.954 12.000 0.118 0.099 N NA
 1239363 1239364     cyoD cyoC TRUE 0.999 0.000 0.485 0.066 Y NA
 1239364 1239365     cyoC cyoB TRUE 0.999 -10.000 0.697 0.066 Y NA
 1239365 1239366     cyoB cyoA TRUE 0.972 22.000 0.041 0.004 Y NA
 1239366 1239367     cyoA ampG FALSE 0.017 460.000 0.000 0.099   NA
 1239367 1239368     ampG yajG TRUE 0.680 44.000 0.256 NA   NA
 1239369 1239370     bolA tig FALSE 0.006 344.000 0.000 NA N NA
 1239370 1239371     tig clpP FALSE 0.426 246.000 0.351 1.000 Y NA
 1239371 1239372     clpP clpX TRUE 0.807 126.000 0.352 1.000 Y NA
 1239372 1239373     clpX lon TRUE 0.616 188.000 0.201 0.096 Y NA
 1239373 1239374     lon hupB FALSE 0.030 209.000 0.000 1.000 N NA
 1239374 1239375     hupB ppiD FALSE 0.040 192.000 0.000 1.000 N NA
 1239375 1239376     ppiD ybaV FALSE 0.065 151.000 0.033 1.000 N NA
 1239376 1239377     ybaV ybaW FALSE 0.133 94.000 0.027 1.000   NA
 1239378 1239379     ybaX ybaE FALSE 0.161 65.000 0.019 1.000   NA
 1239380 1239381     cof ybaO FALSE 0.069 153.000 0.020 1.000   NA
 1239381 1239382     ybaO mdlA TRUE 0.737 30.000 0.179 1.000 N NA
 1239382 1239383     mdlA mdlB TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 1239383 1239384     mdlB glnK FALSE 0.038 181.000 0.028 1.000 N NA
 1239384 1239385     glnK amtB TRUE 0.708 30.000 0.156 1.000 N NA
 1239389 1239390     ffs ybaA FALSE 0.112 111.000 0.000 NA   NA
 1239391 1239392     ylaB ylaC FALSE 0.063 164.000 0.000 NA   NA
 1239392 1239393     ylaC maa FALSE 0.229 116.000 0.101 1.000   NA
 1239393 1239394     maa hha FALSE 0.086 172.000 0.076 NA   NA
 1239394 1239395     hha ybaJ TRUE 0.627 26.000 0.080 NA   NA
 1239395 1239396     ybaJ acrB FALSE 0.004 546.000 0.000 NA   NA
 1239396 1239397     acrB acrA TRUE 0.935 23.000 0.458 1.000 N NA
 1239398 1239399     acrR kefA FALSE 0.077 128.000 0.000 NA N NA
 1239400 1239401     ybaM priC TRUE 0.973 14.000 0.474 NA   NA
 1239402 1239403     ybaN apt FALSE 0.074 153.000 0.043 NA   NA
 1239403 1239404     apt dnaX FALSE 0.169 129.000 0.088 1.000 N NA
 1239404 1239405     dnaX ybaB TRUE 0.749 53.000 0.411 NA   NA
 1239405 1239406     ybaB recR TRUE 0.993 0.000 0.604 NA   NA
 1239406 1239407     recR htpG FALSE 0.092 110.000 0.028 1.000 N NA
 1239407 1239408     htpG adk FALSE 0.135 181.000 0.035 0.096 N NA
 1239408 1239409     adk hemH FALSE 0.014 236.000 0.013 1.000 N NA
 1239412 1239413     ybaL fsr FALSE 0.067 238.000 0.000 0.098 N NA
 1239415 1239416     ybaK ybaP FALSE 0.025 204.000 0.022 NA   NA
 1239419 1239420     ybaS ybaT TRUE 0.984 3.000 0.028 1.000 Y NA
 1239420 1239421     ybaT cueR FALSE 0.101 125.000 0.000 1.000 N NA
 1239422 1239423     ybbJ ybbK TRUE 0.996 0.000 0.313 NA Y NA
 1239424 1239425     ybbL ybbM TRUE 0.933 -13.000 0.127 NA   NA
 1239426 1239427     ybbN ybbO FALSE 0.379 61.000 0.118 1.000   NA
 1239427 1239428     ybbO tesA TRUE 0.913 -10.000 0.072 1.000   NA
 1239429 1239430     ybbA ybbP TRUE 0.998 -3.000 0.535 NA Y NA
 1239430 1239431     ybbP rhsD FALSE 0.004 431.000 0.000 NA N NA
 1239431 1239432     rhsD ybbC FALSE 0.310 40.000 0.000 NA   NA
 1239432 1239433     ybbC ylbH TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1239433 1239434     ylbH ybbD TRUE 0.832 -19.000 0.000 NA   NA
 1239435 1239436     ylbG ybbB FALSE 0.108 116.000 0.000 NA   NA
 1239436 1239437     ybbB ybbS FALSE 0.109 69.000 0.012 NA   NA
 1239438 1239439     allA allR TRUE 0.756 78.000 0.625 1.000 N NA
 1239439 1239440     allR gcl FALSE 0.182 90.000 0.054 1.000   NA
 1239440 1239441     gcl hyi TRUE 0.846 13.000 0.065 1.000   NA
 1239441 1239442     hyi glxR FALSE 0.301 100.000 0.154 1.000 N NA
 1239442 1239443     glxR ybbV FALSE 0.407 32.000 0.000 NA   NA
 1239443 1239444     ybbV ybbW TRUE 0.957 -141.000 0.250 NA   NA
 1239444 1239445     ybbW allB TRUE 0.799 60.000 0.161 1.000 Y NA
 1239445 1239446     allB ybbY TRUE 0.816 57.000 0.161 1.000 Y NA
 1239446 1239447     ybbY glxK TRUE 0.780 22.000 0.133 1.000 N NA
 1239448 1239449     ylbA allC TRUE 0.853 11.000 0.059 NA   NA
 1239449 1239450     allC allD TRUE 0.824 22.000 0.174 1.000 N NA
 1239451 1239452     fdrA ylbE TRUE 0.836 10.000 0.000 NA   NA
 1239452 1239456     ylbE ylbF TRUE 0.815 11.000 0.000 NA   NA
 1239456 1239457     ylbF ybcF TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 1239458 1239459     purK purE TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 1239459 1239460     purE lpxH FALSE 0.099 118.000 0.016 1.000   NA
 1239460 1239461     lpxH ppiB TRUE 0.975 3.000 0.237 1.000   NA
 1239463 1239464     ybcI ybcJ FALSE 0.077 108.000 0.011 NA   NA
 1239464 1239465     ybcJ folD TRUE 0.914 2.000 0.055 1.000   NA
 1239466 1239467     sfmA sfmC FALSE 0.206 220.000 0.000 1.000 Y NA
 1239467 1239468     sfmC sfmD TRUE 0.988 31.000 0.875 1.000 Y NA
 1239468 1239469     sfmD sfmH TRUE 0.978 42.000 0.875 1.000 Y NA
 1239469 1239470     sfmH sfmF TRUE 0.999 11.000 0.875 0.010 Y NA
 1239473 1239474     intD ybcC FALSE 0.315 120.000 0.000 0.076   NA
 1239475 1239477     ybcD insE FALSE 0.084 146.000 0.000 NA   NA
 1239477 1239478     insE insF TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.076   NA
 1239478 1239479     insF renD FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 1239479 1239480     renD emrE FALSE 0.161 68.000 0.000 NA   NA
 1239480 1239481     emrE ybcK FALSE 0.018 255.000 0.000 1.000 N NA
 1239481 1239482     ybcK ybcL FALSE 0.005 465.000 0.000 NA   NA
 1239482 1239483     ybcL ybcM TRUE 0.989 10.000 0.625 NA   NA
 1239483 1239484     ybcM ybcN FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 1239484 1239485     ybcN ninE TRUE 0.961 0.000 0.154 NA   NA
 1239485 1239486     ninE ybcO TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 1239486 1239487     ybcO rusA TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1239487 1239488     rusA ylcG TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1239488 1239489     ylcG ybcQ FALSE 0.135 86.000 0.000 NA   NA
 1239490 1239491     insH nmpC TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 1239493 1239494     essD ybcS TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1239494 1239495     ybcS rzpD TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000   NA
 1239495 1239496     rzpD rzoD TRUE 0.834 -241.000 0.000 1.000   NA
 1239497 1239498     borD ybcV FALSE 0.013 291.000 0.000 NA   NA
 1239499 1239500     ybcW nohB FALSE 0.003 748.000 0.000 NA   NA
 1239500 1239501     nohB tfaD FALSE 0.070 155.000 0.000 NA   NA
 1239504 1239505     ylcE appY FALSE 0.004 621.000 0.000 NA   NA
 1239506 1239507     ompT envY FALSE 0.004 514.000 0.000 1.000 N NA
 1239507 1239508     envY ybcH FALSE 0.047 183.000 0.000 NA   NA
 1239508 1239509     ybcH nfrA TRUE 0.990 1.000 0.500 NA   NA
 1239509 1239510     nfrA nfrB TRUE 0.951 -13.000 0.159 1.000   NA
 1239510 1239511     nfrB cusS FALSE 0.210 150.000 0.000 0.095 N NA
 1239511 1239512     cusS cusR TRUE 0.999 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 1239513 1239514     cusC cusF TRUE 0.487 158.000 0.500 NA   NA
 1239514 1239515     cusF cusB TRUE 0.703 16.000 0.000 NA   NA
 1239515 1239516     cusB cusA TRUE 0.980 12.000 0.500 1.000 N NA
 1239516 1239517     cusA pheP FALSE 0.310 102.000 0.000 0.097 N NA
 1239518 1239519     ybdG nfnB FALSE 0.051 108.000 0.012 NA N NA
 1239519 1239520     nfnB ybdF TRUE 0.658 94.000 0.500 NA   NA
 1239520 1239521     ybdF ybdJ FALSE 0.168 65.000 0.000 NA   NA
 1239521 1239522     ybdJ ybdK FALSE 0.165 66.000 0.000 NA   NA
 1239523 1239524     hokE insL FALSE 0.147 77.000 0.000 NA   NA
 1239525 1239526     entD fepA TRUE 0.581 166.000 0.700 1.000 N NA
 1239527 1239528     fes ybdZ TRUE 0.980 3.000 0.320 NA   NA
 1239528 1239529     ybdZ entF TRUE 0.931 -3.000 0.080 NA   NA
 1239529 1239530     entF fepE FALSE 0.027 216.000 0.000 1.000 N NA
 1239531 1239532     fepC fepG TRUE 0.987 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1239532 1239533     fepG fepD TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.069 Y NA
 1239536 1239537     entC entE TRUE 0.997 10.000 0.667 1.000 Y NA
 1239537 1239538     entE entB TRUE 0.996 14.000 0.667 1.000 Y NA
 1239538 1239539     entB entA TRUE 0.986 0.000 0.024 1.000 Y NA
 1239539 1239540     entA ybdB TRUE 0.986 3.000 0.065 NA Y NA
 1239540 1239541     ybdB cstA FALSE 0.175 181.000 0.222 NA N NA
 1239541 1239542     cstA ybdD FALSE 0.277 183.000 0.333 NA   NA
 1239545 1239546     ybdM ybdN TRUE 0.854 -27.000 0.000 1.000   NA
 1239546 1239547     ybdN ybdO FALSE 0.435 147.000 0.333 1.000   NA
 1239547 1239548     ybdO dsbG FALSE 0.043 209.000 0.067 1.000 N NA
 1239549 1239550     ahpC ahpF TRUE 0.555 245.000 0.551 1.000 Y NA
 1239553 1239554     rnk rna FALSE 0.016 230.000 0.018 1.000 N NA
 1239554 1239555     rna citT FALSE 0.083 114.000 0.024 1.000 N NA
 1239555 1239556     citT citG TRUE 0.548 51.000 0.194 1.000 N NA
 1239556 1239557     citG citX TRUE 0.995 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 1239557 1239558     citX citF TRUE 0.860 4.000 0.000 1.000 N NA
 1239558 1239559     citF citE TRUE 0.967 11.000 0.000 0.001 N NA
 1239559 1239560     citE citD TRUE 0.997 -3.000 0.537 0.001 N NA
 1239560 1239561     citD citC TRUE 0.963 15.000 0.000 1.000 Y NA
 1239562 1239563     citA citB TRUE 0.988 -31.000 0.000 0.087 Y NA
 1239567 1239568     crcA cspE FALSE 0.324 175.000 0.333 1.000   NA
 1239570 1239571     ybeH ybeM TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.002   NA
 1239571 1239572     ybeM tatE FALSE 0.333 129.000 0.196 1.000   NA
 1239573 1239574     lipA ybeF FALSE 0.018 209.000 0.005 1.000 N NA
 1239574 1239575     ybeF lipB FALSE 0.017 259.000 0.000 1.000 N NA
 1239575 1239576     lipB ybeD FALSE 0.394 101.000 0.219 NA   NA
 1239576 1239577     ybeD dacA FALSE 0.180 110.000 0.081 NA   NA
 1239577 1239578     dacA rlpA TRUE 0.821 139.000 0.475 NA Y NA
 1239578 1239579     rlpA mrdB TRUE 0.742 11.000 0.035 NA N NA
 1239579 1239580     mrdB mrdA TRUE 0.876 3.000 0.046 1.000 N NA
 1239580 1239581     mrdA ybeA FALSE 0.383 31.000 0.031 NA   NA
 1239581 1239582     ybeA ybeB TRUE 0.978 4.000 0.307 NA   NA
 1239582 1239583     ybeB cobC FALSE 0.017 260.000 0.000 NA   NA
 1239583 1239584     cobC nadD TRUE 0.590 24.000 0.057 1.000 N NA
 1239584 1239585     nadD holA TRUE 0.880 2.000 0.045 1.000 N NA
 1239585 1239586     holA rlpB TRUE 0.966 0.000 0.199 NA N NA
 1239586 1239587     rlpB leuS TRUE 0.897 15.000 0.182 NA N NA
 1239590 1239591     ybeR djlB TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1239593 1239594     ybeU djlC TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1239595 1239596     hscC rihA FALSE 0.105 84.000 0.000 NA N NA
 1239596 1239597     rihA gltL FALSE 0.296 118.000 0.195 NA N NA
 1239597 1239598     gltL gltK TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 1239598 1239599     gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.017 Y NA
 1239599 1239600     gltJ gltI TRUE 0.534 170.000 0.000 0.068 Y NA
 1239600 1239601     gltI insH FALSE 0.019 250.000 0.000 1.000 N NA
 1239601 1239602     insH lnt FALSE 0.009 330.000 0.000 1.000 N NA
 1239602 1239603     lnt ybeX TRUE 0.943 25.000 0.557 1.000 N NA
 1239603 1239604     ybeX ybeY FALSE 0.311 90.000 0.150 NA   NA
 1239604 1239605     ybeY ybeZ TRUE 0.989 -3.000 0.457 NA   NA
 1239605 1239606     ybeZ miaB FALSE 0.360 114.000 0.220 1.000 N NA
 1239608 1239609     glnX glnV FALSE 0.330 38.000 0.000 NA   NA
 1239609 1239610     glnV metU FALSE 0.254 48.000 0.000 NA   NA
 1239610 1239611     metU glnW TRUE 0.703 16.000 0.000 NA   NA
 1239611 1239612     glnW glnU FALSE 0.371 35.000 0.000 NA   NA
 1239612 1239613     glnU leuW TRUE 0.536 24.000 0.000 NA   NA
 1239613 1239614     leuW metT TRUE 0.836 10.000 0.000 NA   NA
 1239614 1239615     metT asnB FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 1239615 1239616     asnB nagD FALSE 0.006 397.000 0.000 1.000 N NA
 1239616 1239617     nagD nagC TRUE 0.796 48.000 0.070 1.000 Y NA
 1239617 1239618     nagC nagA TRUE 0.997 9.000 0.571 1.000 Y NA
 1239618 1239619     nagA nagB TRUE 0.974 60.000 0.557 0.001 Y NA
 1239620 1239621     nagE glnS FALSE 0.020 203.000 0.006 1.000 N NA
 1239621 1239622     glnS ybfM FALSE 0.005 577.000 0.000 1.000   NA
 1239622 1239623     ybfM ybfN FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 1239624 1239625     fur fldA FALSE 0.039 289.000 0.156 1.000 N NA
 1239625 1239626     fldA ybfE TRUE 0.565 140.000 0.473 1.000   NA
 1239626 1239627     ybfE ybfF FALSE 0.371 140.000 0.276 NA   NA
 1239628 1239629     seqA pgm TRUE 0.750 26.000 0.151 1.000 N NA
 1239629 1239630     pgm ybfP FALSE 0.029 214.000 0.000 NA   NA
 1239631 1239632     ybfG ybfH FALSE 0.422 31.000 0.000 NA   NA
 1239632 1239633     ybfH potE FALSE 0.008 349.000 0.000 NA   NA
 1239633 1239634     potE speF TRUE 0.990 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 1239634 1239635     speF kdpE FALSE 0.004 596.000 0.000 1.000 N NA
 1239635 1239636     kdpE kdpD TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 1239636 1239637     kdpD kdpC TRUE 0.929 -7.000 0.100 1.000 N NA
 1239637 1239638     kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 1239638 1239639     kdpB kdpA TRUE 0.987 23.000 0.201 0.001 Y NA
 1239639 1239640     kdpA kdpF TRUE 0.991 0.000 0.172 0.001   NA
 1239641 1239642     ybfA rhsC FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 1239642 1239643     rhsC ybfB TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1239643 1239644     ybfB ybfO FALSE 0.107 118.000 0.000 NA   NA
 1239644 1239645     ybfO ybfC TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1239645 1239646     ybfC ybfQ FALSE 0.024 226.000 0.000 NA   NA
 1239646 1239647     ybfQ ybfL FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 1239647 1239649     ybfL ybfD FALSE 0.099 131.000 0.000 NA   NA
 1239649 1239650     ybfD ybgA FALSE 0.080 148.000 0.000 NA   NA
 1239650 1239651     ybgA phr TRUE 0.851 -3.000 0.019 NA   NA
 1239653 1239654     ybgI ybgJ TRUE 0.586 23.000 0.050 NA   NA
 1239654 1239655     ybgJ ybgK TRUE 0.996 -6.000 0.379 NA Y NA
 1239655 1239656     ybgK ybgL TRUE 0.961 -10.000 0.211 NA   NA
 1239656 1239657     ybgL nei FALSE 0.399 36.000 0.037 1.000   NA
 1239658 1239659     abrB ybgO FALSE 0.074 152.000 0.000 NA   NA
 1239659 1239660     ybgO ybgP TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000   NA
 1239660 1239661     ybgP ybgQ TRUE 0.963 15.000 0.000 1.000 Y NA
 1239661 1239662     ybgQ ybgD TRUE 0.687 60.000 0.000 1.000 Y NA
 1239662 1239663     ybgD gltA FALSE 0.006 390.000 0.000 1.000 N NA
 1239664 1239665     sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 1239665 1239666     sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.003 Y NA
 1239666 1239667     sdhA sdhB TRUE 0.997 16.000 0.604 0.003 Y NA
 1239667 1239668     sdhB sucA FALSE 0.116 301.000 0.067 1.000 Y NA
 1239668 1239669     sucA sucB TRUE 0.995 15.000 0.667 1.000 Y NA
 1239669 1239670     sucB sucC FALSE 0.192 275.000 0.136 1.000 Y NA
 1239670 1239671     sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 1239673 1239674     mngA mngB TRUE 0.949 18.000 0.036 1.000 Y NA
 1239674 1239675     mngB cydA FALSE 0.003 847.000 0.000 1.000 N NA
 1239675 1239676     cydA cydB TRUE 0.979 16.000 0.000 0.065 Y NA
 1239676 1239677     cydB ybgT TRUE 0.888 15.000 0.149 NA   NA
 1239677 1239678     ybgT ybgE TRUE 0.983 0.000 0.310 NA   NA
 1239678 1239679     ybgE ybgC FALSE 0.141 150.000 0.095 NA   NA
 1239679 1239680     ybgC tolQ TRUE 0.993 -3.000 0.593 1.000   NA
 1239680 1239681     tolQ tolR TRUE 0.998 4.000 0.556 0.080 Y NA
 1239681 1239682     tolR tolA FALSE 0.284 65.000 0.114 NA N NA
 1239682 1239683     tolA tolB FALSE 0.086 133.000 0.051 NA N NA
 1239683 1239684     tolB pal TRUE 0.908 35.000 0.592 1.000 N NA
 1239684 1239685     pal ybgF TRUE 0.918 10.000 0.088 1.000   NA
 1239685 1239686     ybgF lysT FALSE 0.062 165.000 0.000 NA   NA
 1239686 1239687     lysT valT FALSE 0.094 136.000 0.000 NA   NA
 1239687 1239688     valT lysW TRUE 0.870 3.000 0.000 NA   NA
 1239688 1239689     lysW valZ FALSE 0.076 150.000 0.000 NA   NA
 1239689 1239690     valZ lysY TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 1239690 1239691     lysY lysZ FALSE 0.082 147.000 0.000 NA   NA
 1239691 1239692     lysZ lysQ FALSE 0.097 133.000 0.000 NA   NA
 1239692 1239693     lysQ nadA FALSE 0.005 433.000 0.000 NA   NA
 1239693 1239694     nadA pnuC TRUE 0.813 38.000 0.023 1.000 Y NA
 1239695 1239696     zitB ybgS FALSE 0.162 114.000 0.057 1.000   NA
 1239698 1239699     gpmA galM FALSE 0.234 202.000 0.009 1.000 Y NA
 1239699 1239700     galM galK TRUE 0.996 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 1239700 1239701     galK galT TRUE 0.994 4.000 0.370 0.001 N NA
 1239701 1239702     galT galE TRUE 0.973 10.000 0.053 0.001 N NA
 1239702 1239703     galE modF FALSE 0.017 261.000 0.023 1.000   NA
 1239703 1239704     modF modE FALSE 0.368 68.000 0.009 0.094   NA
 1239705 1239706     ybhT modA FALSE 0.089 167.000 0.072 NA   NA
 1239706 1239707     modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 1239707 1239708     modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 1239712 1239713     ybhH ybhI FALSE 0.149 76.000 0.000 NA   NA
 1239713 1239714     ybhI ybhJ FALSE 0.246 183.000 0.300 1.000 N NA
 1239715 1239716     ybhC ybhB FALSE 0.074 152.000 0.000 NA   NA
 1239716 1239717     ybhB bioA FALSE 0.121 59.000 0.003 NA   NA
 1239718 1239719     bioB bioF TRUE 0.997 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 1239719 1239720     bioF bioC TRUE 0.996 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 1239720 1239721     bioC bioD TRUE 0.995 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 1239721 1239722     bioD uvrB FALSE 0.012 579.000 0.000 0.094 N NA
 1239724 1239725     moaA moaB TRUE 0.980 22.000 0.108 0.003 Y NA
 1239725 1239726     moaB moaC TRUE 0.996 3.000 0.109 0.003 Y NA
 1239726 1239727     moaC moaD TRUE 0.997 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 1239727 1239728     moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 1239728 1239729     moaE ybhL FALSE 0.074 137.000 0.025 NA   NA
 1239729 1239730     ybhL ybhM FALSE 0.031 205.000 0.037 NA   NA
 1239731 1239732     ybhN ybhO TRUE 0.924 0.000 0.071 NA   NA
 1239732 1239733     ybhO ybhP TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 1239735 1239736     ybhR ybhS TRUE 0.999 11.000 0.609 0.005 Y NA
 1239736 1239737     ybhS ybhF TRUE 0.995 -7.000 0.547 0.093   NA
 1239737 1239738     ybhF ybhG TRUE 0.990 -7.000 0.545 1.000   NA
 1239738 1239739     ybhG ybiH TRUE 0.976 0.000 0.236 1.000 N NA
 1239742 1239743     dinG ybiB TRUE 0.461 28.000 0.041 1.000 N NA
 1239743 1239744     ybiB ybiC FALSE 0.268 141.000 0.000 0.060 N NA
 1239745 1239746     ybiJ ybiI FALSE 0.013 265.000 0.027 NA   NA
 1239746 1239747     ybiI ybiX FALSE 0.183 74.000 0.000 1.000   NA
 1239747 1239748     ybiX fiu TRUE 0.618 42.000 0.171 1.000   NA
 1239748 1239749     fiu ybiM FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   NA
 1239751 1239752     ybiO glnQ FALSE 0.013 261.000 0.000 NA N NA
 1239752 1239753     glnQ glnP TRUE 0.987 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1239753 1239754     glnP glnH TRUE 0.656 139.000 0.051 0.080 Y NA
 1239754 1239755     glnH dps FALSE 0.005 404.000 0.000 1.000 N NA
 1239755 1239756     dps rhtA FALSE 0.012 299.000 0.044 NA   NA
 1239761 1239762     mntR ybiR TRUE 0.838 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1239765 1239766     ybiU ybiV FALSE 0.074 152.000 0.000 NA   NA
 1239766 1239767     ybiV ybiW FALSE 0.103 146.000 0.000 1.000   NA
 1239767 1239768     ybiW ybiY TRUE 0.992 6.000 0.316 0.003 N NA
 1239770 1239771     moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 1239772 1239773     iaaA yliA TRUE 0.804 20.000 0.104 1.000   NA
 1239773 1239774     yliA yliB TRUE 0.774 20.000 0.083 1.000   NA
 1239774 1239775     yliB yliC TRUE 0.997 18.000 0.803 0.067 Y NA
 1239775 1239776     yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.067 Y NA
 1239776 1239777     yliD yliE FALSE 0.038 178.000 0.000 NA N NA
 1239777 1239778     yliE yliF TRUE 0.981 8.000 0.000 NA Y NA
 1239780 1239781     yliH yliI FALSE 0.121 111.000 0.047 NA   NA
 1239784 1239785     deoR ybjG TRUE 0.578 58.000 0.235 1.000   NA
 1239787 1239788     ybjH ybjI FALSE 0.135 86.000 0.000 NA   NA
 1239788 1239789     ybjI ybjJ TRUE 0.909 0.000 0.000 1.000   NA
 1239791 1239792     rybB ybjL FALSE 0.143 80.000 0.000 NA   NA
 1239795 1239796     ybjC nfsA TRUE 0.943 -16.000 0.159 NA   NA
 1239796 1239797     nfsA rimK FALSE 0.176 61.000 0.000 1.000 N NA
 1239797 1239798     rimK ybjN FALSE 0.176 88.000 0.065 NA   NA
 1239798 1239799     ybjN potF FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 1239799 1239800     potF potG TRUE 0.921 95.000 0.679 1.000 Y NA
 1239800 1239801     potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 1239801 1239802     potH potI TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.067 Y NA
 1239802 1239803     potI ybjO TRUE 0.565 60.000 0.264 NA   NA
 1239803 1239804     ybjO rumB TRUE 0.678 41.000 0.226 NA   NA
 1239805 1239806     artJ artM FALSE 0.274 291.000 0.143 0.079 Y NA
 1239806 1239807     artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.017 Y NA
 1239807 1239808     artQ artI TRUE 0.996 7.000 0.260 0.067 Y NA
 1239808 1239809     artI artP TRUE 0.985 18.000 0.323 1.000 Y NA
 1239809 1239810     artP ybjP FALSE 0.052 218.000 0.081 1.000   NA
 1239811 1239812     ybjQ ybjR TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1239813 1239814     ybjS ybjT TRUE 0.784 99.000 0.022 0.002 Y NA
 1239814 1239815     ybjT ltaE TRUE 0.872 11.000 0.074 1.000 N NA
 1239815 1239816     ltaE poxB TRUE 0.837 37.000 0.041 1.000 Y NA
 1239816 1239817     poxB hcr FALSE 0.075 133.000 0.025 1.000 N NA
 1239817 1239818     hcr hcp TRUE 0.988 12.000 0.000 0.020 Y NA
 1239818 1239819     hcp ybjE FALSE 0.105 144.000 0.000 1.000   NA
 1239819 1239820     ybjE aqpZ FALSE 0.004 495.000 0.025 1.000   NA
 1239823 1239824     macA macB TRUE 0.995 -3.000 0.789 1.000 N NA
 1239826 1239827     clpS clpA TRUE 0.925 31.000 0.596 NA   NA
 1239828 1239829     serW infA FALSE 0.019 254.000 0.000 NA   NA
 1239829 1239830     infA aat FALSE 0.010 285.000 0.020 1.000 N NA
 1239830 1239831     aat cydC TRUE 0.809 42.000 0.049 1.000 Y NA
 1239831 1239832     cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 1239832 1239833     cydD trxB TRUE 0.542 123.000 0.049 1.000 Y NA
 1239834 1239835     lrp ftsK TRUE 0.462 135.000 0.345 1.000 N NA
 1239835 1239836     ftsK lolA FALSE 0.336 156.000 0.305 1.000 N NA
 1239836 1239837     lolA ycaJ TRUE 0.936 11.000 0.167 1.000 N NA
 1239837 1239838     ycaJ serS FALSE 0.393 91.000 0.078 0.093 N NA
 1239838 1239839     serS dmsA FALSE 0.021 239.000 0.000 1.000 N NA
 1239839 1239840     dmsA dmsB TRUE 0.994 11.000 0.172 0.064 Y NA
 1239840 1239841     dmsB dmsC TRUE 0.984 2.000 0.333 1.000   NA
 1239843 1239844     ycaD ycaM FALSE 0.030 210.000 0.000 1.000 N NA
 1239847 1239848     pflA pflB FALSE 0.075 192.000 0.092 1.000 N NA
 1239848 1239849     pflB focA TRUE 0.688 55.000 0.345 1.000 N NA
 1239849 1239850     focA ycaO FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 1239851 1239852     ycaP serC FALSE 0.024 199.000 0.014 NA   NA
 1239852 1239853     serC aroA TRUE 0.631 71.000 0.033 1.000 Y NA
 1239853 1239854     aroA ycaL FALSE 0.034 169.000 0.003 1.000 N NA
 1239854 1239855     ycaL cmk FALSE 0.032 173.000 0.004 1.000 N NA
 1239855 1239856     cmk rpsA FALSE 0.436 111.000 0.281 1.000 N NA
 1239856 1239857     rpsA ihfB FALSE 0.313 160.000 0.292 1.000 N NA
 1239857 1239858     ihfB ycaI FALSE 0.026 208.000 0.003 1.000   NA
 1239858 1239859     ycaI msbA TRUE 0.715 37.000 0.075 0.095   NA
 1239859 1239860     msbA lpxK TRUE 0.971 -3.000 0.205 1.000 N NA
 1239860 1239861     lpxK ycaQ FALSE 0.266 37.000 0.017 NA   NA
 1239861 1239862     ycaQ ycaR FALSE 0.170 52.000 0.016 NA   NA
 1239862 1239863     ycaR kdsB TRUE 0.979 -3.000 0.265 NA   NA
 1239863 1239864     kdsB ycbJ FALSE 0.054 154.000 0.023 NA   NA
 1239866 1239867     smtA mukF TRUE 0.982 -3.000 0.325 NA N NA
 1239867 1239868     mukF mukE TRUE 0.980 8.000 0.036 NA Y NA
 1239868 1239869     mukE mukB TRUE 0.996 0.000 0.000 0.001 Y NA
 1239869 1239870     mukB ycbB FALSE 0.021 261.000 0.000 1.000   NA
 1239870 1239871     ycbB ycbK FALSE 0.315 181.000 0.372 NA   NA
 1239871 1239872     ycbK ycbL TRUE 0.643 27.000 0.089 NA   NA
 1239873 1239874     aspC ompF FALSE 0.040 185.000 0.036 1.000 N NA
 1239874 1239875     ompF asnS FALSE 0.004 603.000 0.000 1.000 N NA
 1239875 1239876     asnS pncB FALSE 0.050 169.000 0.034 1.000 N NA
 1239878 1239879     ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 1239879 1239880     ssuC ssuD TRUE 0.955 11.000 0.226 1.000 N NA
 1239880 1239881     ssuD ssuA TRUE 0.985 -3.000 0.341 1.000 N NA
 1239881 1239882     ssuA ssuE TRUE 0.961 -7.000 0.169 1.000   NA
 1239883 1239884     ycbQ ycbR TRUE 0.895 83.000 0.500 1.000 Y NA
 1239884 1239885     ycbR ycbS TRUE 0.988 25.000 0.667 1.000 Y NA
 1239885 1239886     ycbS ycbT TRUE 0.983 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 1239886 1239887     ycbT ycbU TRUE 0.989 12.000 0.000 0.010 Y NA
 1239887 1239888     ycbU ycbV TRUE 0.999 8.000 0.667 0.010 Y NA
 1239888 1239889     ycbV ycbF TRUE 0.997 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 1239889 1239890     ycbF pyrD FALSE 0.109 111.000 0.000 1.000 N NA
 1239890 1239891     pyrD ycbW FALSE 0.089 174.000 0.081 NA   NA
 1239893 1239894     ycbY uup TRUE 0.861 12.000 0.061 1.000   NA
 1239894 1239895     uup pqiA FALSE 0.118 130.000 0.054 NA   NA
 1239895 1239896     pqiA pqiB TRUE 0.994 5.000 0.819 NA   NA
 1239896 1239897     pqiB ymbA TRUE 0.982 12.000 0.531 NA   NA
 1239897 1239898     ymbA rmf FALSE 0.018 256.000 0.000 NA   NA
 1239899 1239900     fabA ycbZ TRUE 0.545 69.000 0.290 1.000 N NA
 1239902 1239903     ompA sulA FALSE 0.007 357.000 0.000 1.000 N NA
 1239905 1239906     yccS yccF TRUE 0.775 19.000 0.090 NA   NA
 1239908 1239909     mgsA yccT FALSE 0.151 96.000 0.055 NA   NA
 1239911 1239912     yccV yccW FALSE 0.323 58.000 0.094 NA   NA
 1239914 1239915     yccK yccA FALSE 0.322 91.000 0.140 1.000   NA
 1239915 1239916     yccA serT FALSE 0.032 207.000 0.000 NA   NA
 1239917 1239918     hyaA hyaB TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1239918 1239919     hyaB hyaC TRUE 0.992 19.000 0.355 0.063 Y NA
 1239919 1239920     hyaC hyaD TRUE 0.994 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 1239920 1239921     hyaD hyaE TRUE 0.942 -3.000 0.096 NA   NA
 1239921 1239922     hyaE hyaF TRUE 0.995 -3.000 0.769 NA   NA
 1239922 1239923     hyaF appC FALSE 0.146 134.000 0.061 1.000   NA
 1239923 1239924     appC appB TRUE 0.992 12.000 0.158 0.063 Y NA
 1239924 1239925     appB appA FALSE 0.055 185.000 0.000 1.000   NA
 1239926 1239927     yccC etp TRUE 0.981 20.000 1.000 1.000 N NA
 1239927 1239928     etp yccZ TRUE 0.992 -12.000 0.750 1.000 N NA
 1239928 1239929     yccZ ymcA FALSE 0.265 46.000 0.000 NA   NA
 1239929 1239930     ymcA ymcB TRUE 0.914 0.000 0.060 NA   NA
 1239930 1239931     ymcB ymcC TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 1239931 1239932     ymcC ymcD FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 1239933 1239934     insA insB TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.018 Y NA
 1239936 1239937     cspG ymcE FALSE 0.054 174.000 0.000 NA   NA
 1239937 1239938     ymcE gnsA TRUE 0.851 -10.000 0.000 NA   NA
 1239939 1239940     yccM torS FALSE 0.150 72.000 0.000 1.000 N NA
 1239943 1239944     torC torA TRUE 0.994 0.000 0.000 0.063 Y NA
 1239944 1239945     torA torD TRUE 0.978 -3.000 0.077 0.063   NA
 1239946 1239947     cbpM cbpA TRUE 0.991 0.000 0.512 NA   NA
 1239948 1239949     yccE agp FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 1239950 1239951     yccJ wrbA TRUE 0.906 21.000 0.290 NA   NA
 1239953 1239954     ycdG ycdH TRUE 0.959 21.000 0.533 1.000   NA
 1239954 1239955     ycdH ycdI TRUE 0.994 11.000 0.625 0.037   NA
 1239955 1239956     ycdI rarA TRUE 0.969 10.000 0.256 1.000   NA
 1239956 1239957     rarA ycdK TRUE 0.981 8.000 0.365 NA   NA
 1239957 1239958     ycdK ycdL TRUE 0.975 12.000 0.442 NA N NA
 1239958 1239959     ycdL ycdM TRUE 0.993 0.000 0.621 NA N NA
 1239962 1239963     putP ycdN FALSE 0.004 543.000 0.000 NA   NA
 1239963 1239967     ycdN ycdO FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 1239967 1239968     ycdO ycdB TRUE 0.995 6.000 0.378 NA Y NA
 1239968 1239969     ycdB phoH FALSE 0.006 345.000 0.000 NA N NA
 1239970 1239971     ycdP ycdQ TRUE 0.988 2.000 0.462 NA   NA
 1239971 1239972     ycdQ ycdR TRUE 0.986 -7.000 0.435 1.000 N NA
 1239972 1239973     ycdR ycdS TRUE 0.992 9.000 0.696 1.000   NA
 1239975 1239976     insF insE TRUE 0.970 -3.000 0.000 0.073   NA
 1239977 1239979     ymdE ycdU TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1239981 1239982     ycdW ycdX TRUE 0.832 55.000 0.169 1.000 Y NA
 1239982 1239983     ycdX ycdY TRUE 0.930 24.000 0.417 1.000   NA
 1239983 1239984     ycdY ycdZ FALSE 0.290 102.000 0.145 NA   NA
 1239985 1239986     csgG csgF TRUE 0.492 27.000 0.043 NA   NA
 1239986 1239987     csgF csgE TRUE 0.960 25.000 0.723 NA   NA
 1239987 1239988     csgE csgD TRUE 0.956 5.000 0.176 NA   NA
 1239989 1239990     csgB csgA TRUE 0.902 41.000 0.333 0.010   NA
 1239990 1239991     csgA csgC TRUE 0.823 59.000 0.667 NA   NA
 1239992 1239993     insD insC TRUE 0.988 -60.000 0.000 0.073 Y NA
 1239994 1239995     ymdA ymdB FALSE 0.106 95.000 0.028 NA   NA
 1239995 1239996     ymdB ymdC TRUE 0.884 2.000 0.046 NA   NA
 1239998 1239999     mdoG mdoH TRUE 0.987 -7.000 0.469 1.000 N NA
 1239999 1240000     mdoH yceK FALSE 0.134 173.000 0.135 NA   NA
 1240001 1240002     msyB mdtG TRUE 0.559 83.000 0.333 NA   NA
 1240002 1240003     mdtG lpxL TRUE 0.736 172.000 0.857 0.094 N NA
 1240005 1240006     yceI yceJ TRUE 0.993 4.000 0.676 1.000   NA
 1240006 1240007     yceJ yceO FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 1240007 1240008     yceO solA TRUE 0.898 21.000 0.269 NA   NA
 1240008 1240009     solA yceP TRUE 0.566 115.000 0.423 NA   NA
 1240009 1240010     yceP dinI FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 1240010 1240011     dinI pyrC FALSE 0.132 74.000 0.031 NA   NA
 1240011 1240012     pyrC yceB FALSE 0.090 106.000 0.022 NA   NA
 1240012 1240013     yceB grxB FALSE 0.147 134.000 0.078 NA   NA
 1240013 1240014     grxB mdtH FALSE 0.303 64.000 0.103 1.000 N NA
 1240015 1240016     rimJ yceH TRUE 0.912 11.000 0.116 NA   NA
 1240016 1240017     yceH mviM TRUE 0.938 2.000 0.103 NA   NA
 1240017 1240018     mviM mviN FALSE 0.111 110.000 0.022 1.000   NA
 1240019 1240020     flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 1240020 1240021     flgM flgA TRUE 0.843 76.000 0.330 NA Y NA
 1240022 1240023     flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 1240023 1240024     flgC flgD TRUE 0.986 12.000 0.186 NA Y NA
 1240024 1240025     flgD flgE TRUE 0.935 25.000 0.116 NA Y NA
 1240025 1240026     flgE flgF TRUE 0.995 20.000 0.476 0.004 Y NA
 1240026 1240027     flgF flgG TRUE 0.876 172.000 0.420 0.001 Y NA
 1240027 1240028     flgG flgH TRUE 0.948 53.000 0.268 0.005 Y NA
 1240028 1240029     flgH flgI TRUE 0.991 12.000 0.073 0.006 Y NA
 1240029 1240030     flgI flgJ TRUE 0.995 0.000 0.036 0.006 Y NA
 1240030 1240031     flgJ flgK TRUE 0.976 66.000 0.705 0.002 Y NA
 1240031 1240032     flgK flgL TRUE 0.994 12.000 0.142 0.001 Y NA
 1240034 1240035     yceQ rluC FALSE 0.067 118.000 0.005 NA   NA
 1240037 1240038     sraB yceD FALSE 0.346 37.000 0.000 NA   NA
 1240038 1240039     yceD rpmF TRUE 0.835 52.000 0.599 NA   NA
 1240039 1240040     rpmF plsX TRUE 0.632 81.000 0.418 1.000 N NA
 1240040 1240041     plsX fabH TRUE 0.947 68.000 0.380 0.004 Y NA
 1240041 1240042     fabH fabD TRUE 0.991 16.000 0.182 0.004 Y NA
 1240042 1240043     fabD fabG TRUE 0.997 13.000 0.432 0.004 Y NA
 1240043 1240044     fabG acpP TRUE 0.705 211.000 0.321 0.004 Y NA
 1240044 1240045     acpP fabF TRUE 0.846 88.000 0.346 1.000 Y NA
 1240045 1240046     fabF pabC FALSE 0.311 120.000 0.187 1.000 N NA
 1240046 1240047     pabC yceG TRUE 0.965 3.000 0.204 NA   NA
 1240047 1240048     yceG tmk TRUE 0.961 -10.000 0.209 NA   NA
 1240048 1240049     tmk holB TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 1240049 1240050     holB ycfH TRUE 0.983 11.000 0.110 NA Y NA
 1240050 1240051     ycfH ptsG FALSE 0.004 295.000 0.004 NA N NA
 1240053 1240054     hinT ycfL TRUE 0.886 3.000 0.051 NA   NA
 1240054 1240055     ycfL ycfM TRUE 0.976 14.000 0.516 NA   NA
 1240055 1240056     ycfM ycfN TRUE 0.972 -19.000 0.310 NA   NA
 1240056 1240057     ycfN nagZ TRUE 0.865 11.000 0.069 1.000 N NA
 1240057 1240058     nagZ ycfP TRUE 0.705 23.000 0.091 NA   NA
 1240058 1240059     ycfP ndh FALSE 0.007 400.000 0.057 NA   NA
 1240059 1240060     ndh ycfJ FALSE 0.054 210.000 0.071 1.000   NA
 1240063 1240064     ycfS mfd FALSE 0.072 144.000 0.006 1.000   NA
 1240064 1240065     mfd ycfT FALSE 0.085 128.000 0.003 1.000   NA
 1240066 1240067     lolC lolD TRUE 0.980 -7.000 0.175 0.078 N NA
 1240067 1240068     lolD lolE TRUE 0.979 0.000 0.125 0.078 N NA
 1240068 1240069     lolE ycfX TRUE 0.797 29.000 0.225 1.000 N NA
 1240069 1240070     ycfX cobB TRUE 0.972 16.000 0.119 1.000 Y NA
 1240071 1240072     ycfZ ymfA TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1240072 1240073     ymfA potD FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 1240073 1240074     potD potC TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.066 Y NA
 1240074 1240075     potC potB TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.066 Y NA
 1240075 1240076     potB potA TRUE 0.996 14.000 0.789 1.000 Y NA
 1240078 1240079     ycfD phoQ TRUE 0.642 76.000 0.408 NA   NA
 1240079 1240080     phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 1240080 1240081     phoP purB FALSE 0.036 169.000 0.011 1.000 N NA
 1240081 1240082     purB hflD TRUE 0.926 4.000 0.093 NA   NA
 1240082 1240083     hflD trmU TRUE 0.673 36.000 0.180 NA   NA
 1240083 1240084     trmU ymfB TRUE 0.467 54.000 0.158 1.000 N NA
 1240084 1240085     ymfB ymfC TRUE 0.950 10.000 0.182 1.000 N NA
 1240087 1240088     ymfD ymfE TRUE 0.996 1.000 1.000 NA   NA
 1240090 1240091     intE ymfG TRUE 0.992 -19.000 0.400 0.010   NA
 1240091 1240092     ymfG ymfH FALSE 0.346 37.000 0.000 NA   NA
 1240094 1240095     ymfJ ymfK FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 1240096 1240097     ymfT ymfL FALSE 0.407 32.000 0.000 NA   NA
 1240097 1240098     ymfL ymfM TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1240098 1240099     ymfM ymfN TRUE 0.836 10.000 0.000 NA   NA
 1240099 1240100     ymfN ymfR TRUE 0.902 12.000 0.120 NA   NA
 1240100 1240101     ymfR ymfO TRUE 0.993 0.000 0.600 NA   NA
 1240101 1240102     ymfO ymfP FALSE 0.206 56.000 0.000 NA   NA
 1240102 1240103     ymfP ymfQ TRUE 0.913 -9.000 0.083 NA   NA
 1240103 1240104     ymfQ ycfK TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 1240104 1240105     ycfK ymfS TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1240106 1240107     tfaE stfE TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1240109 1240110     pin mcrA FALSE 0.142 107.000 0.000 1.000   NA
 1240110 1240111     mcrA icdC FALSE 0.020 246.000 0.000 NA   NA
 1240113 1240114     elbA ycgX FALSE 0.003 700.000 0.000 NA   NA
 1240114 1240115     ycgX ycgE FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 1240115 1240116     ycgE ycgF FALSE 0.209 205.000 0.333 1.000 N NA
 1240117 1240118     ycgZ ymgA FALSE 0.283 43.000 0.000 NA   NA
 1240118 1240119     ymgA ymgB TRUE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 1240119 1240120     ymgB ymgC FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 1240120 1240121     ymgC ycgG FALSE 0.009 332.000 0.000 NA   NA
 1240121 1240122     ycgG ymgF FALSE 0.098 132.000 0.000 NA   NA
 1240122 1240123     ymgF ycgH FALSE 0.003 1600.000 0.000 NA   NA
 1240127 1240128     ymgD ymgG TRUE 0.836 10.000 0.000 NA   NA
 1240129 1240130     ymgH ycgI TRUE 0.846 9.000 0.000 NA   NA
 1240131 1240132     minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 1240132 1240133     minD minC TRUE 0.983 24.000 0.466 1.000 Y NA
 1240136 1240137     ycgL ycgM FALSE 0.187 72.000 0.056 NA   NA
 1240137 1240138     ycgM ycgN FALSE 0.217 92.000 0.088 NA   NA
 1240140 1240141     umuD umuC TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000 N NA
 1240142 1240143     dsbB nhaB TRUE 0.668 146.000 0.723 1.000 N NA
 1240146 1240147     dadA dadX TRUE 0.945 10.000 0.168 1.000 N NA
 1240148 1240149     cvrA ldcA FALSE 0.208 95.000 0.103 NA N NA
 1240152 1240153     ymgE ycgY FALSE 0.050 178.000 0.000 NA   NA
 1240154 1240155     treA dhaH FALSE 0.012 320.000 0.000 1.000   NA
 1240155 1240156     dhaH dhaL TRUE 0.924 11.000 0.118 1.000   NA
 1240156 1240157     dhaL dhaK TRUE 0.997 11.000 0.226 0.001 Y NA
 1240159 1240160     ycgV ychF FALSE 0.003 769.000 0.000 1.000 N NA
 1240160 1240161     ychF pth TRUE 0.703 117.000 0.184 1.000 Y NA
 1240163 1240164     ychM prsA FALSE 0.082 125.000 0.027 1.000 N NA
 1240164 1240165     prsA ispE FALSE 0.086 151.000 0.053 1.000 N NA
 1240165 1240166     ispE lolB TRUE 0.961 0.000 0.157 1.000 N NA
 1240167 1240168     hemA prfA TRUE 0.784 42.000 0.171 0.047 N NA
 1240168 1240169     prfA prmC TRUE 0.997 0.000 0.229 0.047 Y NA
 1240169 1240170     prmC ychQ TRUE 0.948 -3.000 0.109 NA   NA
 1240170 1240171     ychQ ychA TRUE 0.962 4.000 0.195 NA   NA
 1240171 1240172     ychA kdsA TRUE 0.556 36.000 0.089 1.000   NA
 1240180 1240181     chaB chaC FALSE 0.221 137.000 0.140 NA   NA
 1240184 1240185     narL narX TRUE 0.999 -7.000 0.521 0.015 Y NA
 1240186 1240187     narK narG FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000 N NA
 1240187 1240188     narG narH TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 1240188 1240189     narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.005 Y NA
 1240189 1240190     narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.005 Y NA
 1240190 1240191     narI ychS FALSE 0.047 183.000 0.000 NA   NA
 1240192 1240193     rttR tpr TRUE 0.803 -122.000 0.000 NA   NA
 1240193 1240194     tpr tyrV FALSE 0.206 56.000 0.000 NA   NA
 1240194 1240195     tyrV tyrT FALSE 0.031 210.000 0.000 NA   NA
 1240195 1240196     tyrT purU FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 1240196 1240197     purU ychJ TRUE 0.567 50.000 0.200 NA   NA
 1240198 1240199     rssA rssB FALSE 0.169 92.000 0.048 1.000   NA
 1240199 1240200     rssB galU FALSE 0.155 202.000 0.235 1.000 N NA
 1240203 1240207     ychG adhE FALSE 0.020 248.000 0.000 NA   NA
 1240208 1240209     ychE insC FALSE 0.008 308.000 0.000 NA N NA
 1240209 1240210     insC insD TRUE 0.988 -60.000 0.000 0.071 Y NA
 1240210 1240211     insD oppA FALSE 0.004 538.000 0.000 1.000 N NA
 1240211 1240212     oppA oppB TRUE 0.834 86.000 0.151 0.065 Y NA
 1240212 1240213     oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.065 Y NA
 1240213 1240214     oppC oppD TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 1240214 1240215     oppD oppF TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 1240216 1240217     yciU cls TRUE 0.746 35.000 0.231 NA   NA
 1240217 1240218     cls kch FALSE 0.006 371.000 0.000 1.000 N NA
 1240218 1240219     kch yciI FALSE 0.012 300.000 0.000 NA   NA
 1240221 1240222     yciA yciB FALSE 0.283 105.000 0.167 NA N NA
 1240222 1240223     yciB yciC TRUE 0.513 30.000 0.061 NA   NA
 1240225 1240226     yciE yciF TRUE 0.787 46.000 0.115 0.002   NA
 1240226 1240227     yciF yciG FALSE 0.135 86.000 0.000 NA   NA
 1240227 1240228     yciG trpA FALSE 0.006 381.000 0.000 NA   NA
 1240228 1240229     trpA trpB TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 1240229 1240230     trpB trpC TRUE 0.996 12.000 0.221 0.001 Y NA
 1240230 1240231     trpC trpD TRUE 0.995 4.000 0.293 1.000 Y NA
 1240231 1240232     trpD trpE TRUE 0.995 0.000 0.010 0.001 Y NA
 1240232 1240233     trpE trpL FALSE 0.101 92.000 0.023 NA   NA
 1240234 1240235     yciV yciO TRUE 0.980 -3.000 0.281 NA   NA
 1240235 1240236     yciO yciQ TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1240236 1240237     yciQ rluB FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 1240238 1240239     btuR yciK TRUE 0.900 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1240242 1240243     topA cysB FALSE 0.018 210.000 0.008 1.000 N NA
 1240243 1240244     cysB yciX FALSE 0.009 331.000 0.000 NA   NA
 1240244 1240248     yciX acnA FALSE 0.006 373.000 0.000 NA   NA
 1240250 1240251     pgpB yciS FALSE 0.195 149.000 0.143 NA   NA
 1240251 1240252     yciS yciM TRUE 0.990 7.000 0.576 NA   NA
 1240252 1240253     yciM pyrF FALSE 0.094 194.000 0.125 1.000 N NA
 1240253 1240254     pyrF yciH TRUE 0.893 0.000 0.045 1.000 N NA
 1240255 1240256     osmB yciT FALSE 0.016 269.000 0.000 NA   NA
 1240256 1240257     yciT gmr FALSE 0.018 411.000 0.000 0.081 N NA
 1240257 1240258     gmr rnb FALSE 0.022 236.000 0.000 1.000 N NA
 1240258 1240259     rnb yciW FALSE 0.295 68.000 0.105 NA   NA
 1240259 1240260     yciW fabI FALSE 0.107 144.000 0.057 NA   NA
 1240260 1240261     fabI ycjD FALSE 0.008 368.000 0.000 1.000   NA
 1240261 1240262     ycjD sapF FALSE 0.194 68.000 0.000 1.000   NA
 1240262 1240263     sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.016 Y NA
 1240263 1240264     sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 1240264 1240265     sapC sapB TRUE 0.996 -13.000 0.284 0.064 Y NA
 1240265 1240266     sapB sapA TRUE 0.990 -3.000 0.264 0.064 N NA
 1240266 1240267     sapA ymjA FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 1240267 1240268     ymjA puuP FALSE 0.095 134.000 0.000 NA   NA
 1240268 1240269     puuP puuA FALSE 0.100 303.000 0.000 1.000 Y NA
 1240270 1240271     puuD puuR TRUE 0.560 27.000 0.046 1.000   NA
 1240271 1240272     puuR puuC FALSE 0.014 275.000 0.040 1.000 N NA
 1240272 1240273     puuC puuB TRUE 0.995 2.000 0.500 0.035 N NA
 1240273 1240274     puuB puuE TRUE 0.870 38.000 0.100 1.000 Y NA
 1240276 1240277     pspA pspB TRUE 0.864 54.000 0.739 NA   NA
 1240277 1240278     pspB pspC TRUE 0.996 0.000 0.913 NA   NA
 1240278 1240279     pspC pspD TRUE 0.948 9.000 0.167 NA   NA
 1240279 1240280     pspD pspE FALSE 0.321 75.000 0.133 NA   NA
 1240280 1240281     pspE ycjM FALSE 0.028 213.000 0.000 1.000 N NA
 1240281 1240282     ycjM ycjN TRUE 0.991 14.000 0.360 1.000 Y NA
 1240282 1240283     ycjN ycjO TRUE 0.995 21.000 0.620 0.064 Y NA
 1240283 1240284     ycjO ycjP TRUE 0.999 -13.000 0.805 0.064 Y NA
 1240284 1240285     ycjP ycjQ TRUE 0.751 31.000 0.205 1.000 N NA
 1240285 1240286     ycjQ ycjR TRUE 0.901 19.000 0.261 NA N NA
 1240286 1240287     ycjR ycjS TRUE 0.977 10.000 0.347 NA   NA
 1240287 1240288     ycjS ycjT TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000   NA
 1240288 1240289     ycjT ycjU TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000   NA
 1240289 1240290     ycjU ycjV TRUE 0.879 14.000 0.103 1.000   NA
 1240290 1240291     ycjV ymjB TRUE 0.982 0.000 0.000 0.002   NA
 1240291 1240292     ymjB ompG FALSE 0.319 45.000 0.000 1.000   NA
 1240294 1240295     ycjX ycjF TRUE 0.995 -3.000 0.791 NA   NA
 1240295 1240296     ycjF tyrR FALSE 0.193 148.000 0.137 NA   NA
 1240299 1240300     mpaA ymjC TRUE 0.574 22.000 0.000 NA   NA
 1240300 1240301     ymjC ycjY FALSE 0.155 71.000 0.000 NA   NA
 1240302 1240303     ycjZ mppA FALSE 0.008 337.000 0.000 1.000 N NA
 1240305 1240306     insH ynaJ FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 1240307 1240308     uspE fnr TRUE 0.848 152.000 0.619 1.000 Y NA
 1240308 1240309     fnr ogt FALSE 0.038 195.000 0.000 1.000 N NA
 1240309 1240310     ogt abgT TRUE 0.765 11.000 0.000 NA N NA
 1240310 1240311     abgT abgB TRUE 0.469 37.000 0.080 NA   NA
 1240311 1240312     abgB abgA TRUE 0.988 0.000 0.128 0.004   NA
 1240317 1240318     ydaN dbpA FALSE 0.004 478.000 0.000 1.000 N NA
 1240319 1240320     ydaO intR FALSE 0.110 52.000 0.012 NA N NA
 1240320 1240321     intR ydaQ TRUE 0.986 2.000 0.400 NA   NA
 1240321 1240322     ydaQ ydaC FALSE 0.144 79.000 0.000 NA   NA
 1240322 1240323     ydaC lar TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 1240323 1240324     lar recT FALSE 0.201 57.000 0.000 NA   NA
 1240324 1240325     recT recE TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 1240325 1240326     recE racC FALSE 0.123 102.000 0.000 NA   NA
 1240326 1240327     racC ydaE TRUE 0.529 75.000 0.286 NA   NA
 1240327 1240328     ydaE kil TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1240330 1240331     ydaF ydaG TRUE 0.815 11.000 0.000 NA   NA
 1240331 1240332     ydaG racR FALSE 0.011 309.000 0.000 NA   NA
 1240333 1240334     ydaS ydaT TRUE 0.553 23.000 0.000 NA   NA
 1240334 1240335     ydaT ydaU TRUE 0.766 13.000 0.000 NA   NA
 1240335 1240336     ydaU ydaV TRUE 0.853 7.000 0.000 NA   NA
 1240336 1240337     ydaV ydaW TRUE 0.975 23.000 1.000 NA   NA
 1240337 1240338     ydaW rzpR FALSE 0.396 33.000 0.000 NA   NA
 1240338 1240339     rzpR rzoR TRUE 0.835 -240.000 0.000 1.000   NA
 1240339 1240340     rzoR trkG FALSE 0.047 197.000 0.000 1.000   NA
 1240340 1240341     trkG ynaK FALSE 0.113 138.000 0.000 1.000   NA
 1240341 1240342     ynaK ydaY TRUE 0.832 -19.000 0.000 NA   NA
 1240342 1240343     ydaY ynaA FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 1240343 1240344     ynaA lomR TRUE 0.828 -24.000 0.000 NA   NA
 1240349 1240350     stfR tfaR TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1240351 1240352     pinR ynaE FALSE 0.010 317.000 0.000 NA   NA
 1240352 1240353     ynaE uspF FALSE 0.003 928.000 0.000 NA   NA
 1240353 1240354     uspF ompN FALSE 0.085 141.000 0.000 1.000 N NA
 1240358 1240359     hslJ ldhA FALSE 0.085 111.000 0.000 NA N NA
 1240360 1240361     ydbH ynbE TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1240361 1240362     ynbE ydbL TRUE 0.992 8.000 0.726 NA   NA
 1240365 1240366     tynA maoC FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000 N NA
 1240367 1240368     paaA paaB TRUE 0.991 12.000 0.920 NA   NA
 1240368 1240369     paaB paaC TRUE 0.994 9.000 0.943 NA   NA
 1240369 1240370     paaC paaD TRUE 0.988 15.000 0.919 NA   NA
 1240370 1240371     paaD paaE TRUE 0.989 8.000 0.571 NA   NA
 1240371 1240372     paaE paaF TRUE 0.940 -3.000 0.093 1.000 N NA
 1240372 1240373     paaF paaG TRUE 0.998 0.000 0.215 0.001 Y NA
 1240373 1240374     paaG paaH TRUE 0.986 2.000 0.051 1.000 Y NA
 1240374 1240375     paaH paaI TRUE 0.707 -10.000 0.013 NA N NA
 1240375 1240376     paaI paaJ TRUE 0.890 0.000 0.058 NA N NA
 1240376 1240377     paaJ paaK TRUE 0.860 27.000 0.293 1.000 N NA
 1240377 1240378     paaK paaX FALSE 0.242 101.000 0.132 NA N NA
 1240378 1240379     paaX paaY TRUE 0.924 -18.000 0.118 NA   NA
 1240379 1240380     paaY ydbA FALSE 0.009 331.000 0.000 NA   NA
 1240383 1240384     insD insC TRUE 0.988 -42.000 0.000 0.070 Y NA
 1240385 1240387     insI ydbC FALSE 0.003 3712.000 0.000 1.000 N NA
 1240387 1240388     ydbC ydbD FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 1240388 1240389     ydbD ynbA FALSE 0.056 171.000 0.000 NA   NA
 1240389 1240390     ynbA ynbB TRUE 0.990 0.000 0.179 0.003   NA
 1240390 1240391     ynbB ynbC TRUE 0.703 16.000 0.000 NA   NA
 1240391 1240392     ynbC ynbD TRUE 0.987 14.000 0.285 NA Y NA
 1240394 1240395     hrpA ydcF FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 1240395 1240396     ydcF aldA FALSE 0.037 197.000 0.040 NA   NA
 1240401 1240402     cybB ydcA FALSE 0.020 245.000 0.000 NA   NA
 1240403 1240404     hokB mokB TRUE 0.804 -109.000 0.000 NA   NA
 1240405 1240406     sokB trg FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 1240408 1240409     ydcJ mdoD FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 1240409 1240410     mdoD ydcH FALSE 0.071 140.000 0.026 NA   NA
 1240410 1240411     ydcH rimL FALSE 0.142 63.000 0.026 NA   NA
 1240413 1240414     tehA tehB TRUE 0.970 -3.000 0.175 1.000   NA
 1240414 1240415     tehB ydcL FALSE 0.021 302.000 0.088 NA   NA
 1240422 1240423     ydcN ydcP FALSE 0.184 73.000 0.000 1.000   NA
 1240425 1240426     yncN ydcQ TRUE 0.754 25.000 0.143 NA   NA
 1240426 1240427     ydcQ ydcR FALSE 0.174 79.000 0.000 1.000   NA
 1240427 1240428     ydcR ydcS FALSE 0.168 245.000 0.000 1.000 Y NA
 1240428 1240429     ydcS ydcT TRUE 0.996 18.000 0.609 0.063 Y NA
 1240429 1240430     ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.063 Y NA
 1240430 1240431     ydcU ydcV TRUE 0.999 -10.000 0.821 0.063 Y NA
 1240431 1240432     ydcV ydcW TRUE 0.857 22.000 0.216 1.000 N NA
 1240432 1240433     ydcW ydcX FALSE 0.006 387.000 0.000 NA   NA
 1240433 1240434     ydcX ydcY FALSE 0.135 86.000 0.000 NA   NA
 1240435 1240436     ydcZ yncA TRUE 0.924 -3.000 0.070 NA   NA
 1240437 1240438     yncB yncC FALSE 0.046 198.000 0.000 1.000   NA
 1240442 1240443     yncG yncH FALSE 0.149 76.000 0.000 NA   NA
 1240443 1240444     yncH rhsE FALSE 0.003 738.000 0.000 NA   NA
 1240444 1240445     rhsE ydcD TRUE 0.837 -16.000 0.000 NA   NA
 1240445 1240446     ydcD yncI FALSE 0.047 182.000 0.000 NA   NA
 1240446 1240447     yncI yncM TRUE 0.655 44.000 0.000 0.015   NA
 1240447 1240448     yncM ydcC FALSE 0.097 240.000 0.000 0.015   NA
 1240448 1240449     ydcC ydcE FALSE 0.151 100.000 0.000 1.000   NA
 1240452 1240453     yddE narV FALSE 0.174 79.000 0.000 1.000   NA
 1240453 1240454     narV narW TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.004 Y NA
 1240454 1240455     narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.004 Y NA
 1240455 1240456     narY narZ TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 1240456 1240457     narZ narU TRUE 0.712 82.000 0.556 1.000 N NA
 1240457 1240458     narU yddJ FALSE 0.009 324.000 0.000 NA   NA
 1240458 1240459     yddJ yddK FALSE 0.319 39.000 0.000 NA   NA
 1240459 1240460     yddK yddL TRUE 0.592 24.000 0.000 1.000   NA
 1240460 1240461     yddL yddG FALSE 0.017 260.000 0.000 NA   NA
 1240462 1240463     fdnG fdnH TRUE 0.997 13.000 0.429 0.002 Y NA
 1240463 1240464     fdnH fdnI TRUE 0.998 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 1240465 1240466     yddM adhP FALSE 0.194 68.000 0.000 1.000   NA
 1240466 1240467     adhP sfcA FALSE 0.117 134.000 0.000 1.000   NA
 1240467 1240468     sfcA sra TRUE 0.645 157.000 0.750 1.000   NA
 1240468 1240469     sra bdm TRUE 0.692 102.000 0.571 NA   NA
 1240471 1240472     ddpF ddpD TRUE 0.997 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 1240472 1240473     ddpD ddpC TRUE 0.996 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 1240473 1240474     ddpC ddpB TRUE 0.996 -3.000 0.143 0.063 Y NA
 1240474 1240475     ddpB ddpA TRUE 0.995 2.000 0.091 0.063 Y NA
 1240475 1240476     ddpA ddpX TRUE 0.848 14.000 0.091 1.000 N NA
 1240476 1240477     ddpX dos FALSE 0.017 258.000 0.000 1.000 N NA
 1240477 1240478     dos yddV TRUE 0.976 25.000 0.130 0.005 Y NA
 1240478 1240479     yddV yddW FALSE 0.004 703.000 0.000 1.000   NA
 1240479 1240480     yddW gadC FALSE 0.121 131.000 0.000 1.000   NA
 1240480 1240481     gadC gadB TRUE 0.505 156.000 0.103 1.000 Y NA
 1240481 1240482     gadB pqqL FALSE 0.009 362.000 0.000 1.000   NA
 1240482 1240483     pqqL yddB TRUE 0.584 45.000 0.167 1.000   NA
 1240483 1240484     yddB yddA TRUE 0.658 38.000 0.000 0.075   NA
 1240484 1240485     yddA ydeM FALSE 0.016 291.000 0.000 1.000   NA
 1240485 1240486     ydeM ydeN TRUE 0.848 52.000 0.600 1.000   NA
 1240486 1240487     ydeN ydeO FALSE 0.006 402.000 0.000 1.000 N NA
 1240487 1240488     ydeO ydeP FALSE 0.004 520.000 0.000 1.000 N NA
 1240488 1240489     ydeP ydeQ FALSE 0.011 334.000 0.000 1.000   NA
 1240489 1240490     ydeQ ydeR TRUE 0.562 59.000 0.000 0.009   NA
 1240490 1240491     ydeR ydeS TRUE 0.987 13.000 0.000 0.009 Y NA
 1240491 1240492     ydeS ydeT TRUE 0.786 14.000 0.000 1.000   NA
 1240492 1240493     ydeT yneL FALSE 0.009 356.000 0.000 1.000   NA
 1240493 1240494     yneL hipA FALSE 0.010 318.000 0.000 NA   NA
 1240494 1240495     hipA hipB TRUE 0.994 0.000 0.675 NA   NA
 1240495 1240496     hipB ydeU FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 1240496 1240498     ydeU ydeK FALSE 0.277 44.000 0.000 NA   NA
 1240498 1240499     ydeK ydeV FALSE 0.004 531.000 0.000 NA   NA
 1240499 1240500     ydeV ydeW FALSE 0.141 79.000 0.000 1.000 N NA
 1240501 1240502     ego lsrC TRUE 0.999 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 1240502 1240503     lsrC lsrD TRUE 0.999 0.000 0.788 0.063 Y NA
 1240503 1240504     lsrD lsrB TRUE 0.997 12.000 0.844 NA Y NA
 1240504 1240505     lsrB lsrF TRUE 0.894 27.000 0.000 NA Y NA
 1240505 1240506     lsrF lsrG TRUE 0.592 24.000 0.000 1.000   NA
 1240506 1240507     lsrG tam FALSE 0.240 57.000 0.000 1.000   NA
 1240508 1240509     yneE uxaB FALSE 0.086 207.000 0.143 NA   NA
 1240509 1240510     uxaB yneF FALSE 0.024 227.000 0.000 1.000 N NA
 1240510 1240511     yneF yneG FALSE 0.204 112.000 0.098 NA   NA
 1240511 1240512     yneG yneH TRUE 0.882 0.000 0.037 NA   NA
 1240512 1240513     yneH yneI FALSE 0.168 64.000 0.000 1.000 N NA
 1240514 1240515     yneJ yneK FALSE 0.146 78.000 0.000 NA   NA
 1240515 1240516     yneK ydeA FALSE 0.076 150.000 0.000 NA   NA
 1240518 1240519     marR marA TRUE 0.996 20.000 0.667 0.048 Y NA
 1240519 1240520     marA marB FALSE 0.407 32.000 0.000 NA   NA
 1240523 1240524     ydeH ydeI FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 1240527 1240528     ydfG ydfH FALSE 0.160 89.000 0.000 1.000   NA
 1240528 1240529     ydfH ydfZ FALSE 0.051 177.000 0.000 NA   NA
 1240530 1240531     ydfI ydfJ TRUE 0.597 89.000 0.000 1.000 Y NA
 1240532 1240533     ydfK pinQ FALSE 0.010 317.000 0.000 NA   NA
 1240534 1240535     tfaQ stfQ TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1240535 1240536     stfQ nohA TRUE 0.845 -49.000 0.000 1.000   NA
 1240537 1240538     ynfO ydfO FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 1240539 1240540     gnsB ynfN FALSE 0.055 172.000 0.000 NA   NA
 1240540 1240541     ynfN cspI FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 1240541 1240542     cspI ydfP FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 1240542 1240543     ydfP ydfQ TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1240543 1240544     ydfQ ydfR TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1240544 1240545     ydfR essQ TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 1240545 1240546     essQ cspB FALSE 0.003 754.000 0.000 NA   NA
 1240548 1240549     ydfT ydfU TRUE 0.746 14.000 0.000 NA   NA
 1240549 1240550     ydfU rem FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 1240550 1240551     rem hokD FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 1240551 1240552     hokD relE FALSE 0.154 72.000 0.000 NA   NA
 1240552 1240553     relE relB TRUE 0.855 0.000 0.000 NA N NA
 1240554 1240555     ydfV flxA FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 1240556 1240557     ydfW ydfX TRUE 0.553 23.000 0.000 NA   NA
 1240557 1240558     ydfX dicC TRUE 0.837 -16.000 0.000 NA   NA
 1240559 1240560     dicA ydfA FALSE 0.060 167.000 0.000 NA   NA
 1240560 1240561     ydfA ydfB TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1240561 1240562     ydfB ydfC FALSE 0.438 30.000 0.000 NA   NA
 1240562 1240563     ydfC dicF FALSE 0.008 341.000 0.000 NA   NA
 1240563 1240564     dicF dicB FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 1240564 1240565     dicB ydfD TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1240565 1240566     ydfD ydfE FALSE 0.129 93.000 0.000 NA   NA
 1240566 1240567     ydfE insD TRUE 0.804 -117.000 0.000 NA   NA
 1240567 1240568     insD intQ TRUE 0.991 -25.000 0.000 0.009 Y NA
 1240569 1240571     ynfP rspB FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 1240571 1240572     rspB rspA TRUE 0.805 12.000 0.049 1.000 N NA
 1240572 1240573     rspA ynfA FALSE 0.023 206.000 0.020 NA   NA
 1240574 1240575     ynfB speG FALSE 0.421 35.000 0.055 NA   NA
 1240577 1240578     ynfD ynfE FALSE 0.205 199.000 0.304 NA   NA
 1240578 1240579     ynfE ynfF TRUE 0.937 61.000 0.231 0.001 Y NA
 1240579 1240580     ynfF ynfG TRUE 0.998 11.000 0.667 0.059 Y NA
 1240580 1240581     ynfG ynfH TRUE 0.984 2.000 0.333 1.000   NA
 1240581 1240582     ynfH dmsD TRUE 0.534 43.000 0.125 1.000   NA
 1240582 1240583     dmsD clcB FALSE 0.073 195.000 0.079 1.000   NA
 1240584 1240585     ynfK dgsA TRUE 0.571 125.000 0.455 1.000 N NA
 1240585 1240586     dgsA ynfL TRUE 0.816 135.000 0.408 1.000 Y NA
 1240587 1240588     ynfM asr FALSE 0.005 424.000 0.000 NA   NA
 1240588 1240589     asr ydgD FALSE 0.015 276.000 0.000 NA   NA
 1240590 1240591     mdtI mdtJ TRUE 0.999 -13.000 0.869 0.089 Y NA
 1240593 1240594     pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 1240595 1240596     ydgH ydgI FALSE 0.115 186.000 0.143 NA   NA
 1240596 1240597     ydgI folM TRUE 0.591 37.000 0.140 1.000 N NA
 1240599 1240600     rstA rstB TRUE 0.992 4.000 0.181 1.000 Y NA
 1240600 1240601     rstB tus FALSE 0.444 76.000 0.200 1.000   NA
 1240602 1240603     fumC fumA TRUE 0.738 143.000 0.000 0.001 Y NA
 1240604 1240605     manA ydgA TRUE 0.770 101.000 0.778 NA   NA
 1240606 1240607     uidC uidB TRUE 0.826 39.000 0.375 1.000   NA
 1240607 1240608     uidB uidA TRUE 0.995 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 1240608 1240609     uidA uidR FALSE 0.006 391.000 0.000 1.000 N NA
 1240609 1240610     uidR hdhA FALSE 0.025 221.000 0.000 1.000 N NA
 1240610 1240611     hdhA malI FALSE 0.108 112.000 0.000 1.000 N NA
 1240612 1240613     malX malY TRUE 0.986 10.000 0.531 1.000 N NA
 1240613 1240614     malY add FALSE 0.265 104.000 0.132 1.000 N NA
 1240616 1240617     blr ydgT FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 1240617 1240618     ydgT ydgK FALSE 0.276 86.000 0.120 NA   NA
 1240618 1240619     ydgK rsxA FALSE 0.340 77.000 0.148 NA   NA
 1240619 1240620     rsxA rsxB TRUE 0.999 0.000 0.564 0.059 Y NA
 1240620 1240621     rsxB rsxC TRUE 0.999 -7.000 0.537 0.019 Y NA
 1240621 1240622     rsxC rsxD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.059 Y NA
 1240622 1240623     rsxD rsxG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.059 Y NA
 1240623 1240624     rsxG rsxE TRUE 0.999 4.000 0.908 0.059 Y NA
 1240624 1240625     rsxE nth TRUE 0.946 0.000 0.109 1.000 N NA
 1240625 1240626     nth ydgR FALSE 0.004 611.000 0.000 1.000 N NA
 1240626 1240627     ydgR gst TRUE 0.524 106.000 0.344 1.000 N NA
 1240628 1240629     pdxY tyrS FALSE 0.185 59.000 0.041 1.000 N NA
 1240629 1240630     tyrS pdxH FALSE 0.116 129.000 0.054 1.000 N NA
 1240630 1240631     pdxH ydhA FALSE 0.170 59.000 0.034 NA   NA
 1240631 1240632     ydhA ydhH FALSE 0.114 98.000 0.034 NA   NA
 1240635 1240636     ydhI ydhJ TRUE 0.986 3.000 0.412 NA   NA
 1240636 1240637     ydhJ ydhK TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1240638 1240639     sodC ydhF FALSE 0.156 81.000 0.033 1.000   NA
 1240639 1240640     ydhF ydhL FALSE 0.262 49.000 0.045 NA   NA
 1240641 1240642     ydhM nemA TRUE 0.822 37.000 0.362 1.000 N NA
 1240642 1240643     nemA gloA FALSE 0.170 81.000 0.057 1.000 N NA
 1240643 1240644     gloA rnt FALSE 0.271 103.000 0.136 1.000 N NA
 1240644 1240645     rnt lhr FALSE 0.432 93.000 0.000 0.013   NA
 1240647 1240648     ydhO sodB FALSE 0.069 128.000 0.015 1.000 N NA
 1240652 1240653     ydhC cfa FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000 N NA
 1240657 1240658     valV valW TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 1240658 1240659     valW ydhR FALSE 0.115 108.000 0.000 NA   NA
 1240659 1240660     ydhR ydhS FALSE 0.103 126.000 0.000 NA   NA
 1240661 1240662     ydhT ydhU TRUE 0.967 4.000 0.222 NA   NA
 1240662 1240663     ydhU ydhX TRUE 0.999 -3.000 0.444 0.059 Y NA
 1240663 1240664     ydhX ydhW TRUE 0.515 64.000 0.235 NA   NA
 1240664 1240665     ydhW ydhV TRUE 0.987 4.000 0.458 NA   NA
 1240665 1240666     ydhV ydhY TRUE 0.995 21.000 0.600 0.019 Y NA
 1240666 1240667     ydhY ydhZ FALSE 0.005 455.000 0.000 NA   NA
 1240668 1240669     pykF lpp FALSE 0.010 311.000 0.000 1.000 N NA
 1240670 1240671     ynhG sufE FALSE 0.112 149.000 0.069 NA   NA
 1240671 1240672     sufE sufS TRUE 0.925 13.000 0.183 NA   NA
 1240672 1240673     sufS sufD TRUE 0.969 -3.000 0.193 1.000 N NA
 1240673 1240674     sufD sufC TRUE 0.996 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 1240674 1240675     sufC sufB TRUE 0.996 10.000 0.466 1.000 Y NA
 1240675 1240676     sufB sufA TRUE 0.847 9.000 0.041 NA   NA
 1240676 1240677     sufA rydB FALSE 0.009 327.000 0.000 NA   NA
 1240677 1240678     rydB ydiH FALSE 0.071 154.000 0.000 NA   NA
 1240678 1240679     ydiH ydiI TRUE 0.610 19.000 0.032 NA   NA
 1240679 1240680     ydiI ydiJ TRUE 0.947 -3.000 0.129 NA N NA
 1240681 1240682     ydiK rprA FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 1240682 1240683     rprA ydiL FALSE 0.090 139.000 0.000 NA   NA
 1240683 1240684     ydiL ydiM FALSE 0.249 100.000 0.095 1.000   NA
 1240684 1240685     ydiM ydiN FALSE 0.328 227.000 0.000 0.062 Y NA
 1240685 1240686     ydiN ydiB TRUE 0.865 12.000 0.082 1.000 N NA
 1240686 1240687     ydiB aroD TRUE 0.913 31.000 0.113 1.000 Y NA
 1240687 1240688     aroD ydiF FALSE 0.060 143.000 0.019 1.000 N NA
 1240688 1240689     ydiF ydiO TRUE 0.994 14.000 0.500 1.000 Y NA
 1240691 1240692     ydiQ ydiR TRUE 0.997 20.000 1.000 0.019 Y NA
 1240692 1240693     ydiR ydiS TRUE 0.983 56.000 1.000 0.059 Y NA
 1240693 1240694     ydiS ydiT TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.059 Y NA
 1240694 1240695     ydiT ydiD TRUE 0.916 3.000 0.080 1.000 N NA
 1240697 1240698     ydiA aroH FALSE 0.212 157.000 0.165 1.000   NA
 1240698 1240699     aroH ydiE FALSE 0.092 132.000 0.054 NA N NA
 1240700 1240701     ydiU ydiV FALSE 0.152 63.000 0.031 NA   NA
 1240701 1240702     ydiV nlpC FALSE 0.015 247.000 0.000 NA N NA
 1240702 1240703     nlpC btuD FALSE 0.112 78.000 0.000 NA N NA
 1240703 1240704     btuD btuE TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000 N NA
 1240704 1240705     btuE btuC FALSE 0.272 63.000 0.084 1.000 N NA
 1240705 1240706     btuC ihfA FALSE 0.094 101.000 0.023 1.000 N NA
 1240706 1240707     ihfA pheT TRUE 0.962 5.000 0.208 1.000 N NA
 1240707 1240708     pheT pheS TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 1240708 1240709     pheS pheM FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 1240709 1240710     pheM rplT FALSE 0.104 123.000 0.000 NA   NA
 1240710 1240711     rplT rpmI TRUE 0.986 53.000 0.928 0.013 Y NA
 1240711 1240712     rpmI infC TRUE 0.915 97.000 0.652 1.000 Y NA
 1240712 1240713     infC thrS TRUE 0.992 4.000 0.186 1.000 Y NA
 1240714 1240718     arpB yniD FALSE 0.068 157.000 0.000 NA   NA
 1240720 1240721     pfkB ydiZ FALSE 0.124 101.000 0.000 NA   NA
 1240721 1240722     ydiZ yniA FALSE 0.119 106.000 0.000 NA   NA
 1240724 1240725     yniC ydjM FALSE 0.091 163.000 0.068 NA   NA
 1240725 1240726     ydjM ydjN FALSE 0.185 133.000 0.102 NA   NA
 1240727 1240728     ydjO cedA FALSE 0.014 277.000 0.000 NA   NA
 1240730 1240731     chbG chbF TRUE 0.988 13.000 0.429 0.020   NA
 1240731 1240732     chbF chbR TRUE 0.713 105.000 0.625 1.000 N NA
 1240732 1240733     chbR chbA TRUE 0.992 8.000 0.727 1.000 N NA
 1240733 1240734     chbA chbC TRUE 0.985 51.000 0.833 0.013 Y NA
 1240734 1240735     chbC chbB TRUE 0.946 85.000 0.500 0.013 Y NA
 1240735 1240736     chbB osmE FALSE 0.015 299.000 0.000 1.000   NA
 1240737 1240738     nadE ydjQ FALSE 0.014 230.000 0.010 1.000 N NA
 1240739 1240740     ydjR spy FALSE 0.028 203.000 0.028 NA   NA
 1240740 1240741     spy astE FALSE 0.007 330.000 0.000 NA N NA
 1240741 1240742     astE astB TRUE 0.990 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 1240742 1240743     astB astD TRUE 0.982 -3.000 0.306 1.000 N NA
 1240743 1240744     astD astA TRUE 0.967 -3.000 0.179 1.000 N NA
 1240744 1240745     astA astC TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 1240746 1240747     xthA ydjX FALSE 0.041 167.000 0.016 NA   NA
 1240747 1240748     ydjX ydjY TRUE 0.915 5.000 0.083 NA   NA
 1240748 1240749     ydjY ydjZ TRUE 0.904 15.000 0.174 NA   NA
 1240749 1240750     ydjZ ynjA TRUE 0.936 0.000 0.087 NA   NA
 1240750 1240751     ynjA ynjB TRUE 0.815 10.000 0.032 NA   NA
 1240751 1240752     ynjB ynjC TRUE 0.987 18.000 0.627 0.062   NA
 1240752 1240753     ynjC ynjD TRUE 0.993 0.000 0.602 1.000   NA
 1240753 1240754     ynjD ynjE FALSE 0.339 67.000 0.111 1.000   NA
 1240759 1240760     ynjI topB FALSE 0.101 128.000 0.000 NA   NA
 1240760 1240761     topB selD TRUE 0.855 5.000 0.041 1.000 N NA
 1240761 1240762     selD ydjA FALSE 0.094 117.000 0.033 1.000 N NA
 1240763 1240764     sppA ansA FALSE 0.126 167.000 0.113 1.000 N NA
 1240764 1240765     ansA pncA TRUE 0.807 11.000 0.040 1.000 N NA
 1240766 1240767     ydjE ydjF TRUE 0.647 117.000 0.125 1.000 Y NA
 1240767 1240768     ydjF ydjG FALSE 0.377 137.000 0.269 1.000 N NA
 1240768 1240769     ydjG ydjH TRUE 0.968 10.000 0.269 1.000 N NA
 1240769 1240770     ydjH ydjI TRUE 0.996 5.000 0.368 1.000 Y NA
 1240770 1240771     ydjI ydjJ TRUE 0.938 21.000 0.194 0.018 N NA
 1240771 1240772     ydjJ ydjK TRUE 0.876 17.000 0.167 1.000 N NA
 1240772 1240773     ydjK ydjL TRUE 0.836 27.000 0.250 1.000 N NA
 1240773 1240774     ydjL yeaC FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 1240774 1240775     yeaC yeaA TRUE 0.650 42.000 0.216 NA   NA
 1240776 1240777     gapA yeaD TRUE 0.733 84.000 0.154 1.000 Y NA
 1240778 1240779     yeaE mipA FALSE 0.179 90.000 0.067 NA   NA
 1240780 1240781     yeaG yeaH TRUE 0.722 113.000 0.683 NA   NA
 1240781 1240782     yeaH yeaI FALSE 0.082 147.000 0.000 NA   NA
 1240782 1240783     yeaI yeaJ TRUE 0.558 181.000 0.000 0.005 Y NA
 1240783 1240784     yeaJ yeaK FALSE 0.411 43.000 0.083 NA   NA
 1240788 1240789     yeaN yeaO FALSE 0.142 55.000 0.007 NA   NA
 1240792 1240793     yeaQ yoaG FALSE 0.080 148.000 0.000 NA   NA
 1240793 1240794     yoaG yeaR TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 1240794 1240795     yeaR yeaS FALSE 0.041 173.000 0.000 NA N NA
 1240795 1240796     yeaS yeaT FALSE 0.100 127.000 0.000 1.000 N NA
 1240797 1240798     yeaU yeaV FALSE 0.250 191.000 0.333 1.000 N NA
 1240798 1240799     yeaV yeaW FALSE 0.401 32.000 0.000 1.000 N NA
 1240799 1240800     yeaW yeaX TRUE 0.505 56.000 0.043 0.059 N NA
 1240801 1240802     rnd fadD FALSE 0.300 70.000 0.115 1.000 N NA
 1240802 1240803     fadD yeaY FALSE 0.103 205.000 0.169 1.000 N NA
 1240803 1240804     yeaY yeaZ FALSE 0.248 40.000 0.024 1.000 N NA
 1240804 1240805     yeaZ yoaA FALSE 0.292 58.000 0.082 1.000 N NA
 1240806 1240807     yoaB yoaC FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 1240809 1240810     pabB yeaB TRUE 0.945 4.000 0.116 1.000   NA
 1240810 1240811     yeaB sdaA FALSE 0.349 184.000 0.409 1.000   NA
 1240811 1240812     sdaA yoaD TRUE 0.489 131.000 0.389 NA N NA
 1240814 1240815     manX manY TRUE 0.825 63.000 0.000 0.014 Y NA
 1240815 1240816     manY manZ TRUE 0.999 4.000 0.939 0.014 Y NA
 1240816 1240817     manZ yobD TRUE 0.863 55.000 0.755 NA   NA
 1240817 1240818     yobD yebN FALSE 0.005 429.000 0.000 NA   NA
 1240819 1240820     rrmA cspC FALSE 0.072 166.000 0.038 1.000   NA
 1240820 1240821     cspC yobF TRUE 0.936 13.000 0.214 NA   NA
 1240821 1240822     yobF yebO FALSE 0.003 670.000 0.000 NA   NA
 1240822 1240823     yebO yobG TRUE 0.700 75.000 0.500 NA   NA
 1240827 1240828     htpX prc FALSE 0.151 192.000 0.042 0.023 N NA
 1240828 1240829     prc proQ TRUE 0.910 20.000 0.304 NA N NA
 1240829 1240830     proQ yebR TRUE 0.618 97.000 0.081 NA Y NA
 1240831 1240832     yebS yebT TRUE 0.992 -31.000 0.840 NA   NA
 1240832 1240833     yebT yebU TRUE 0.638 80.000 0.420 NA   NA
 1240833 1240834     yebU yebV FALSE 0.227 118.000 0.121 NA   NA
 1240834 1240835     yebV yebW TRUE 0.539 105.000 0.353 NA   NA
 1240838 1240839     ryeB yebY FALSE 0.142 81.000 0.000 NA   NA
 1240839 1240840     yebY yebZ TRUE 0.986 13.000 0.704 NA   NA
 1240840 1240841     yebZ yobA TRUE 0.992 4.000 0.613 1.000   NA
 1240842 1240843     holE yobB FALSE 0.424 102.000 0.222 1.000   NA
 1240843 1240844     yobB exoX TRUE 0.943 24.000 0.500 1.000   NA
 1240845 1240846     ptrB yebE FALSE 0.059 209.000 0.092 NA   NA
 1240846 1240847     yebE yebF FALSE 0.007 327.000 0.028 NA   NA
 1240847 1240848     yebF yebG FALSE 0.176 55.000 0.027 NA   NA
 1240850 1240851     eda edd TRUE 0.967 37.000 0.523 1.000 Y NA
 1240851 1240852     edd zwf FALSE 0.184 235.000 0.041 1.000 Y NA
 1240853 1240854     yebK pykA FALSE 0.144 128.000 0.071 1.000 N NA
 1240855 1240856     lpxM yebA TRUE 0.779 120.000 0.299 1.000 Y NA
 1240856 1240857     yebA znuA TRUE 0.860 16.000 0.131 1.000 N NA
 1240858 1240859     znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.085 Y NA
 1240860 1240861     ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.549 0.001 Y NA
 1240863 1240864     ruvC yebC TRUE 0.783 35.000 0.277 NA   NA
 1240864 1240865     yebC nudB FALSE 0.427 29.000 0.035 NA   NA
 1240865 1240866     nudB aspS FALSE 0.118 118.000 0.050 1.000 N NA
 1240867 1240868     yecD yecE TRUE 0.939 -3.000 0.089 NA   NA
 1240868 1240869     yecE yecN FALSE 0.424 53.000 0.126 NA   NA
 1240869 1240870     yecN yecO FALSE 0.450 41.000 0.089 NA   NA
 1240870 1240871     yecO yecP TRUE 0.983 -3.000 0.315 NA   NA
 1240872 1240873     torZ torY TRUE 0.990 25.000 0.481 0.058 Y NA
 1240873 1240874     torY cutC FALSE 0.006 388.000 0.000 1.000 N NA
 1240874 1240875     cutC yecM TRUE 0.819 14.000 0.057 1.000   NA
 1240876 1240877     argS yecT FALSE 0.051 177.000 0.000 NA   NA
 1240878 1240879     flhE flhA TRUE 0.990 0.000 0.158 0.002   NA
 1240879 1240880     flhA flhB TRUE 0.998 -7.000 0.287 0.007 Y NA
 1240880 1240881     flhB cheZ FALSE 0.261 202.000 0.000 1.000 Y NA
 1240881 1240882     cheZ cheY TRUE 0.977 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1240882 1240883     cheY cheB TRUE 0.984 15.000 0.000 0.011 Y NA
 1240883 1240884     cheB cheR TRUE 0.983 3.000 0.025 1.000 Y NA
 1240884 1240885     cheR tap TRUE 0.973 19.000 0.188 1.000 Y NA
 1240885 1240886     tap tar TRUE 0.961 46.000 0.235 0.001 Y NA
 1240886 1240887     tar cheW TRUE 0.704 145.000 0.043 0.004 Y NA
 1240887 1240888     cheW cheA TRUE 0.994 21.000 0.447 0.003 Y NA
 1240888 1240889     cheA motB TRUE 0.999 5.000 0.913 1.000 Y NA
 1240889 1240890     motB motA TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 1240890 1240891     motA flhC TRUE 0.561 127.000 0.408 1.000   NA
 1240891 1240892     flhC flhD TRUE 0.980 3.000 0.000 0.001   NA
 1240892 1240893     flhD insH FALSE 0.020 435.000 0.000 0.067   NA
 1240895 1240896     otsA otsB TRUE 0.994 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 1240896 1240897     otsB araH FALSE 0.376 167.000 0.037 1.000 Y NA
 1240897 1240898     araH araG TRUE 0.998 12.000 0.451 0.002 Y NA
 1240898 1240899     araG araF TRUE 0.981 70.000 0.917 0.002 Y NA
 1240901 1240902     yecJ isrB FALSE 0.142 81.000 0.000 NA   NA
 1240903 1240904     yecR ftn FALSE 0.056 171.000 0.000 NA   NA
 1240907 1240908     yecA leuZ FALSE 0.038 196.000 0.000 NA   NA
 1240908 1240909     leuZ cysT TRUE 0.766 13.000 0.000 NA   NA
 1240909 1240910     cysT glyW FALSE 0.212 55.000 0.000 NA   NA
 1240910 1240911     glyW pgsA FALSE 0.074 152.000 0.000 NA   NA
 1240911 1240912     pgsA uvrC TRUE 0.548 57.000 0.227 1.000 N NA
 1240912 1240913     uvrC uvrY TRUE 0.979 -3.000 0.086 0.022 N NA
 1240915 1240916     sdiA yecC FALSE 0.034 230.000 0.071 1.000 N NA
 1240916 1240917     yecC yecS TRUE 0.993 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 1240917 1240918     yecS yedO TRUE 0.965 15.000 0.050 1.000 Y NA
 1240918 1240919     yedO fliY TRUE 0.870 105.000 0.469 1.000 Y NA
 1240919 1240920     fliY fliZ TRUE 0.510 88.000 0.280 1.000   NA
 1240920 1240921     fliZ fliA TRUE 0.482 46.000 0.108 1.000   NA
 1240921 1240922     fliA fliC FALSE 0.006 321.000 0.012 1.000 N NA
 1240923 1240924     fliD fliS TRUE 0.988 25.000 0.284 0.002 Y NA
 1240924 1240925     fliS fliT TRUE 0.985 0.000 0.324 1.000   NA
 1240925 1240926     fliT amyA FALSE 0.315 78.000 0.115 1.000   NA
 1240928 1240929     yedE yedF TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 1240929 1240930     yedF yedK FALSE 0.114 109.000 0.000 NA   NA
 1240930 1240931     yedK yedL FALSE 0.112 111.000 0.000 NA   NA
 1240932 1240936     yedN yedM FALSE 0.098 132.000 0.000 NA   NA
 1240940 1240941     fliF fliG TRUE 0.997 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 1240941 1240942     fliG fliH TRUE 0.994 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 1240942 1240943     fliH fliI TRUE 0.995 0.000 0.000 0.003 Y NA
 1240943 1240944     fliI fliJ TRUE 0.975 19.000 0.006 0.006 Y NA
 1240944 1240945     fliJ fliK TRUE 0.998 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 1240945 1240946     fliK fliL TRUE 0.669 105.000 0.119 1.000 Y NA
 1240946 1240947     fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 1240947 1240948     fliM fliN TRUE 0.997 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 1240948 1240949     fliN fliO TRUE 0.997 3.000 0.443 1.000 Y NA
 1240949 1240950     fliO fliP TRUE 0.994 0.000 0.203 1.000 Y NA
 1240950 1240951     fliP fliQ TRUE 0.999 10.000 0.827 0.007 Y NA
 1240951 1240952     fliQ fliR TRUE 0.994 8.000 0.000 0.002 Y NA
 1240952 1240953     fliR rcsA FALSE 0.013 290.000 0.000 1.000 N NA
 1240958 1240959     yedQ yodC FALSE 0.203 171.000 0.208 NA   NA
 1240959 1240960     yodC yedI FALSE 0.116 79.000 0.025 NA   NA
 1240962 1240963     vsr dcm TRUE 0.990 -19.000 0.048 0.067 Y NA
 1240963 1240964     dcm yedJ FALSE 0.267 67.000 0.074 1.000   NA
 1240964 1240965     yedJ yedR FALSE 0.379 40.000 0.062 NA   NA
 1240966 1240971     yedS hchA FALSE 0.004 592.000 0.000 NA   NA
 1240972 1240973     yedV yedW TRUE 1.000 0.000 0.857 0.001 Y NA
 1240974 1240975     yedX yedY FALSE 0.139 109.000 0.000 1.000   NA
 1240975 1240976     yedY yedZ TRUE 0.997 1.000 0.790 0.058   NA
 1240976 1240977     yedZ yodA FALSE 0.022 257.000 0.000 1.000   NA
 1240977 1240978     yodA yodB FALSE 0.010 343.000 0.000 1.000   NA
 1240980 1240981     yeeI asnT FALSE 0.124 101.000 0.000 NA   NA
 1240981 1240982     asnT yeeJ FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 1240987 1240988     shiA amn FALSE 0.090 102.000 0.021 1.000 N NA
 1240988 1240989     amn yeeN FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 1240990 1240991     asnW yeeO FALSE 0.124 101.000 0.000 NA   NA
 1240993 1240994     cbl nac TRUE 0.863 102.000 0.222 0.057 Y NA
 1240996 1240997     erfK cobT FALSE 0.120 65.000 0.015 NA   NA
 1240997 1240998     cobT cobS TRUE 0.991 12.000 0.056 0.003 Y NA
 1240998 1240999     cobS cobU TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1240999 1241000     cobU insH FALSE 0.004 541.000 0.000 1.000 N NA
 1241003 1241004     insD insC TRUE 0.988 -42.000 0.000 0.067 Y NA
 1241005 1241006     yoeE yeeP FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 1241006 1241008     yeeP isrC FALSE 0.121 104.000 0.000 NA   NA
 1241008 1241009     isrC flu TRUE 0.598 21.000 0.000 NA   NA
 1241009 1241010     flu yeeR FALSE 0.105 121.000 0.000 NA   NA
 1241010 1241011     yeeR yeeS TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241011 1241012     yeeS yeeT FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 1241012 1241013     yeeT yeeU FALSE 0.152 74.000 0.000 NA   NA
 1241013 1241014     yeeU yeeV FALSE 0.132 89.000 0.000 NA   NA
 1241014 1241015     yeeV yeeW TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241015 1241016     yeeW yoeF FALSE 0.005 441.000 0.000 NA   NA
 1241017 1241018     yeeX yeeA FALSE 0.331 106.000 0.180 NA   NA
 1241018 1241019     yeeA sbmC FALSE 0.072 198.000 0.096 NA   NA
 1241019 1241020     sbmC dacD FALSE 0.184 119.000 0.110 NA N NA
 1241022 1241023     yeeD yeeE TRUE 0.969 14.000 0.419 NA   NA
 1241023 1241024     yeeE yeeF FALSE 0.050 179.000 0.000 NA   NA
 1241024 1241025     yeeF yeeY FALSE 0.015 267.000 0.000 1.000 N NA
 1241025 1241026     yeeY yeeZ FALSE 0.190 46.000 0.015 1.000 N NA
 1241026 1241027     yeeZ yoeB FALSE 0.139 83.000 0.000 NA   NA
 1241027 1241028     yoeB yefM TRUE 0.986 -3.000 0.366 NA   NA
 1241029 1241030     hisL hisG FALSE 0.325 146.000 0.003 0.003   NA
 1241030 1241031     hisG hisD TRUE 0.996 6.000 0.171 0.003 Y NA
 1241031 1241032     hisD hisC TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 1241032 1241033     hisC hisB TRUE 0.999 0.000 0.341 0.003 Y NA
 1241033 1241034     hisB hisH TRUE 0.997 0.000 0.128 0.003 Y NA
 1241034 1241035     hisH hisA TRUE 0.998 0.000 0.210 0.003 Y NA
 1241035 1241036     hisA hisF TRUE 0.998 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 1241036 1241037     hisF hisI TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 1241038 1241039     cld ugd TRUE 0.471 146.000 0.000 1.000 Y NA
 1241039 1241040     ugd gnd FALSE 0.019 249.000 0.000 1.000 N NA
 1241040 1241041     gnd wbbL FALSE 0.101 128.000 0.000 NA   NA
 1241041 1241044     wbbL insH TRUE 0.800 -1494.000 0.000 NA   NA
 1241044 1241046     insH wbbK FALSE 0.004 480.000 0.000 1.000 N NA
 1241046 1241047     wbbK wbbJ TRUE 0.870 -15.000 0.043 1.000   NA
 1241047 1241048     wbbJ wbbI TRUE 0.832 -19.000 0.000 NA   NA
 1241048 1241049     wbbI wbbH TRUE 0.870 3.000 0.000 NA   NA
 1241049 1241050     wbbH glf TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1241050 1241051     glf rfbX TRUE 0.877 8.000 0.000 1.000   NA
 1241051 1241052     rfbX rfbC TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000   NA
 1241052 1241053     rfbC rfbA TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1241053 1241054     rfbA rfbD TRUE 0.876 58.000 0.053 0.002 Y NA
 1241054 1241055     rfbD rfbB TRUE 0.996 0.000 0.084 0.002 Y NA
 1241055 1241056     rfbB galF FALSE 0.059 373.000 0.000 1.000 Y NA
 1241056 1241057     galF wcaM FALSE 0.239 175.000 0.259 NA   NA
 1241057 1241058     wcaM wcaL TRUE 0.966 11.000 0.292 NA   NA
 1241058 1241059     wcaL wcaK TRUE 0.941 -3.000 0.095 NA   NA
 1241059 1241060     wcaK wzxC FALSE 0.029 276.000 0.095 NA   NA
 1241060 1241061     wzxC wcaJ TRUE 0.980 2.000 0.304 NA   NA
 1241061 1241062     wcaJ cpsG TRUE 0.783 55.000 0.538 NA N NA
 1241062 1241063     cpsG cpsB TRUE 0.812 105.000 1.000 1.000 N NA
 1241063 1241064     cpsB wcaI TRUE 0.990 3.000 0.123 1.000 Y NA
 1241064 1241065     wcaI nudD TRUE 0.947 -3.000 0.108 1.000 N NA
 1241065 1241066     nudD fcl TRUE 0.968 3.000 0.217 1.000 N NA
 1241066 1241067     fcl gmd TRUE 0.994 3.000 0.000 0.007 Y NA
 1241067 1241068     gmd wcaF TRUE 0.495 26.000 0.022 1.000   NA
 1241068 1241069     wcaF wcaE TRUE 0.793 16.000 0.077 NA   NA
 1241069 1241070     wcaE wcaD TRUE 0.972 11.000 0.333 NA   NA
 1241070 1241071     wcaD wcaC TRUE 0.979 -25.000 0.400 NA   NA
 1241071 1241072     wcaC wcaB TRUE 0.978 -3.000 0.259 1.000 N NA
 1241072 1241073     wcaB wcaA TRUE 0.971 3.000 0.259 NA N NA
 1241073 1241074     wcaA wzc TRUE 0.568 93.000 0.000 NA Y NA
 1241074 1241075     wzc wzb TRUE 0.867 3.000 0.000 1.000 N NA
 1241075 1241076     wzb wza TRUE 0.974 6.000 0.286 1.000 N NA
 1241078 1241079     asmA dcd TRUE 0.575 22.000 0.057 NA N NA
 1241079 1241080     dcd udk TRUE 0.667 92.000 0.098 1.000 Y NA
 1241086 1241087     yegK yegL TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241088 1241089     ryeC ryeD FALSE 0.043 187.000 0.000 NA   NA
 1241089 1241090     ryeD mdtA FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 1241090 1241091     mdtA mdtB TRUE 0.855 0.000 0.000 NA N NA
 1241091 1241092     mdtB mdtC TRUE 0.987 1.000 0.062 NA Y NA
 1241092 1241093     mdtC mdtD TRUE 0.988 1.000 0.438 1.000 N NA
 1241093 1241094     mdtD baeS TRUE 0.956 -3.000 0.139 1.000 N NA
 1241094 1241095     baeS baeR TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 1241095 1241096     baeR yegP FALSE 0.056 191.000 0.062 NA   NA
 1241096 1241097     yegP yegQ FALSE 0.052 147.000 0.008 NA   NA
 1241097 1241098     yegQ ryeE FALSE 0.139 83.000 0.000 NA   NA
 1241099 1241100     ogrK yegZ FALSE 0.140 82.000 0.000 NA   NA
 1241100 1241102     yegZ yegR FALSE 0.058 169.000 0.000 NA   NA
 1241107 1241108     insE insF TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.066   NA
 1241110 1241111     gatD gatC FALSE 0.249 48.000 0.000 1.000 N NA
 1241111 1241112     gatC gatB TRUE 0.993 4.000 0.000 0.013 Y NA
 1241112 1241113     gatB gatA TRUE 0.790 31.000 0.000 0.013   NA
 1241115 1241116     gatA gatZ TRUE 0.865 10.000 0.000 1.000   NA
 1241116 1241117     gatZ gatY TRUE 0.889 29.000 0.000 1.000 Y NA
 1241117 1241118     gatY fbaB FALSE 0.246 308.000 0.000 0.001 Y NA
 1241119 1241120     yegT yegU TRUE 0.986 -3.000 0.364 NA   NA
 1241120 1241121     yegU yegV TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA N NA
 1241122 1241123     yegW yegX FALSE 0.226 52.000 0.000 1.000 N NA
 1241123 1241124     yegX thiD FALSE 0.165 65.000 0.000 1.000 N NA
 1241124 1241125     thiD thiM TRUE 0.995 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 1241125 1241126     thiM yohL FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 1241127 1241128     yohM yohN FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 1241129 1241130     yehA yehB TRUE 0.748 16.000 0.000 1.000   NA
 1241130 1241131     yehB yehC TRUE 0.996 16.000 1.000 1.000 Y NA
 1241131 1241132     yehC yehD TRUE 0.931 35.000 0.222 1.000 Y NA
 1241132 1241133     yehD yehE FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 1241133 1241134     yehE mrp FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 1241135 1241136     metG molR FALSE 0.088 141.000 0.000 NA   NA
 1241136 1241141     molR yehI TRUE 0.836 10.000 0.000 NA   NA
 1241141 1241142     yehI yehK FALSE 0.180 61.000 0.000 NA   NA
 1241142 1241143     yehK yehL FALSE 0.011 307.000 0.000 NA   NA
 1241143 1241144     yehL yehM TRUE 0.815 11.000 0.000 NA   NA
 1241144 1241145     yehM yehP TRUE 0.864 -7.000 0.000 NA   NA
 1241145 1241146     yehP yehQ TRUE 0.963 -3.000 0.160 NA   NA
 1241146 1241147     yehQ yehR FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 1241148 1241149     yehS yehT FALSE 0.288 47.000 0.051 NA   NA
 1241149 1241150     yehT yehU TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.014 Y NA
 1241151 1241152     mlrA yohO FALSE 0.184 60.000 0.000 NA   NA
 1241153 1241154     yehW yehX TRUE 0.997 5.000 0.542 1.000 Y NA
 1241154 1241155     yehX yehY TRUE 0.997 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 1241155 1241156     yehY yehZ TRUE 0.994 7.000 0.521 0.060 N NA
 1241156 1241157     yehZ bglX FALSE 0.059 211.000 0.099 1.000 N NA
 1241159 1241160     pbpG yohC FALSE 0.141 174.000 0.145 NA   NA
 1241162 1241163     yohF yohG FALSE 0.382 53.000 0.105 1.000 N NA
 1241163 1241164     yohG yohH FALSE 0.092 138.000 0.000 NA   NA
 1241164 1241165     yohH dusC FALSE 0.003 752.000 0.000 NA   NA
 1241166 1241167     yohJ yohK TRUE 0.986 -3.000 0.340 1.000   NA
 1241167 1241168     yohK cdd FALSE 0.306 130.000 0.198 1.000 N NA
 1241168 1241169     cdd sanA FALSE 0.081 150.000 0.045 NA   NA
 1241169 1241170     sanA yeiS TRUE 0.825 3.000 0.019 NA   NA
 1241170 1241171     yeiS yeiT FALSE 0.037 194.000 0.036 NA   NA
 1241171 1241172     yeiT yeiA TRUE 0.972 -6.000 0.062 0.018 N NA
 1241173 1241174     mglC mglA TRUE 0.996 16.000 0.905 1.000 Y NA
 1241174 1241175     mglA mglB TRUE 0.838 61.000 0.250 NA Y NA
 1241175 1241176     mglB galS FALSE 0.011 280.000 0.000 NA N NA
 1241176 1241177     galS yeiB TRUE 0.555 142.000 0.500 NA   NA
 1241177 1241178     yeiB folE TRUE 0.979 17.000 0.719 NA   NA
 1241180 1241181     cirA lysP FALSE 0.012 294.000 0.000 1.000 N NA
 1241181 1241182     lysP yeiE FALSE 0.032 205.000 0.000 1.000 N NA
 1241183 1241184     yeiH nfo FALSE 0.150 74.000 0.040 NA   NA
 1241184 1241185     nfo yeiI TRUE 0.711 3.000 0.004 NA N NA
 1241186 1241187     yeiJ rihB TRUE 0.580 100.000 0.056 NA Y NA
 1241189 1241190     yeiM yeiN FALSE 0.098 94.000 0.000 NA N NA
 1241190 1241191     yeiN yeiC TRUE 0.678 -12.000 0.008 NA N NA
 1241191 1241192     yeiC fruA FALSE 0.045 423.000 0.000 NA Y NA
 1241192 1241193     fruA fruK TRUE 0.992 17.000 0.562 1.000 Y NA
 1241193 1241194     fruK fruB TRUE 0.991 0.000 0.112 1.000 Y NA
 1241197 1241198     yeiP yeiQ FALSE 0.024 223.000 0.000 1.000 N NA
 1241198 1241199     yeiQ yeiR FALSE 0.285 118.000 0.167 NA   NA
 1241199 1241200     yeiR yeiU TRUE 0.739 39.000 0.275 NA   NA
 1241200 1241201     yeiU spr FALSE 0.005 412.000 0.000 NA   NA
 1241201 1241202     spr rtn FALSE 0.171 181.000 0.219 NA N NA
 1241202 1241203     rtn yejA TRUE 0.590 82.000 0.394 NA N NA
 1241203 1241204     yejA yejB TRUE 0.998 1.000 0.848 0.060   NA
 1241204 1241205     yejB yejE TRUE 0.998 0.000 0.833 0.060   NA
 1241205 1241206     yejE yejF TRUE 0.994 2.000 0.758 1.000   NA
 1241207 1241208     yejG bcr FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 1241208 1241209     bcr rsuA FALSE 0.441 28.000 0.036 1.000 N NA
 1241210 1241211     yejH rplY FALSE 0.325 125.000 0.024 0.012 N NA
 1241213 1241214     yejL yejM TRUE 0.616 20.000 0.040 NA   NA
 1241214 1241215     yejM proL FALSE 0.150 75.000 0.000 NA   NA
 1241216 1241217     yejO insH FALSE 0.060 165.000 0.000 1.000 N NA
 1241219 1241220     ccmH ccmG TRUE 0.998 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 1241220 1241221     ccmG ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 1241221 1241222     ccmF ccmE TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 1241222 1241223     ccmE ccmD TRUE 0.985 -3.000 0.344 1.000 N NA
 1241223 1241224     ccmD ccmC TRUE 0.991 -3.000 0.501 1.000 N NA
 1241224 1241225     ccmC ccmB TRUE 0.984 42.000 0.501 0.001 Y NA
 1241225 1241226     ccmB ccmA TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 1241226 1241227     ccmA napC TRUE 0.765 13.000 0.043 1.000 N NA
 1241227 1241228     napC napB TRUE 0.998 10.000 0.490 0.003 Y NA
 1241228 1241229     napB napH TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.004 Y NA
 1241229 1241230     napH napG TRUE 0.997 -13.000 0.795 0.004   NA
 1241230 1241231     napG napA TRUE 0.990 7.000 0.243 0.004   NA
 1241231 1241232     napA napD TRUE 0.998 -3.000 0.875 0.004 N NA
 1241232 1241233     napD napF TRUE 0.965 -10.000 0.209 1.000   NA
 1241235 1241236     mqo yojI FALSE 0.033 218.000 0.000 1.000   NA
 1241236 1241237     yojI alkB FALSE 0.215 76.000 0.076 1.000 N NA
 1241237 1241238     alkB ada TRUE 0.970 0.000 0.015 0.011 N NA
 1241238 1241239     ada yojL FALSE 0.109 74.000 0.019 1.000 N NA
 1241239 1241240     yojL ompC FALSE 0.147 112.000 0.066 1.000 N NA
 1241241 1241242     micF rcsD FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 1241242 1241243     rcsD rcsB TRUE 0.992 17.000 0.558 1.000 Y NA
 1241244 1241245     rcsC insD FALSE 0.153 70.000 0.000 1.000 N NA
 1241245 1241246     insD insC TRUE 0.988 -60.000 0.000 0.065 Y NA
 1241246 1241247     insC rcsC FALSE 0.288 42.000 0.000 1.000 N NA
 1241248 1241249     atoS atoC TRUE 0.999 -3.000 0.455 0.014 Y NA
 1241249 1241250     atoC atoD FALSE 0.191 196.000 0.273 1.000 N NA
 1241250 1241251     atoD atoA TRUE 1.000 0.000 0.800 0.001 Y NA
 1241251 1241252     atoA atoE TRUE 0.993 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 1241252 1241253     atoE atoB TRUE 0.932 31.000 0.174 1.000 Y NA
 1241254 1241255     yfaP yfaQ TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 1241255 1241256     yfaQ yfaS TRUE 0.880 1.000 0.000 NA   NA
 1241256 1241260     yfaS yfaT TRUE 0.809 -66.000 0.000 NA   NA
 1241260 1241261     yfaT yfaA TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241261 1241262     yfaA gyrA FALSE 0.078 149.000 0.000 NA   NA
 1241265 1241266     nrdA nrdB FALSE 0.410 234.000 0.000 0.001 Y NA
 1241266 1241267     nrdB yfaE TRUE 0.875 0.000 0.034 1.000 N NA
 1241270 1241271     glpQ glpT TRUE 0.983 5.000 0.396 1.000 N NA
 1241272 1241273     glpA glpB TRUE 0.997 -10.000 0.650 0.001 N NA
 1241273 1241274     glpB glpC TRUE 0.996 -3.000 0.547 0.056 N NA
 1241274 1241275     glpC yfaD FALSE 0.040 193.000 0.000 NA   NA
 1241275 1241276     yfaD ypaA TRUE 0.766 13.000 0.000 NA   NA
 1241278 1241279     yfaU yfaV TRUE 0.980 18.000 0.250 1.000 Y NA
 1241279 1241280     yfaV yfaW FALSE 0.247 57.000 0.060 1.000 N NA
 1241280 1241281     yfaW yfaX TRUE 0.926 3.000 0.090 1.000 N NA
 1241281 1241282     yfaX yfaY FALSE 0.032 220.000 0.000 1.000   NA
 1241282 1241283     yfaY yfaZ FALSE 0.106 100.000 0.005 1.000   NA
 1241286 1241287     yfbE yfbF TRUE 0.996 4.000 0.378 NA Y NA
 1241287 1241288     yfbF yfbG TRUE 0.994 0.000 0.220 NA Y NA
 1241288 1241289     yfbG yfbH TRUE 0.997 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 1241289 1241290     yfbH arnT TRUE 0.868 0.000 0.031 1.000 N NA
 1241290 1241291     arnT yfbW TRUE 0.982 -3.000 0.158 0.096 N NA
 1241291 1241292     yfbW yfbJ TRUE 0.975 0.000 0.226 NA   NA
 1241293 1241294     pmrD menE FALSE 0.072 110.000 0.005 NA   NA
 1241294 1241295     menE menC TRUE 0.994 -3.000 0.283 0.001 N NA
 1241295 1241296     menC menB TRUE 0.998 0.000 0.171 0.001 Y NA
 1241296 1241297     menB yfbB TRUE 0.942 15.000 0.280 NA   NA
 1241297 1241298     yfbB menD TRUE 0.986 -3.000 0.355 NA   NA
 1241298 1241299     menD menF TRUE 0.811 89.000 0.281 1.000 Y NA
 1241299 1241300     menF elaB FALSE 0.149 79.000 0.043 NA   NA
 1241300 1241301     elaB elaA FALSE 0.304 55.000 0.077 NA   NA
 1241302 1241303     elaC elaD FALSE 0.053 188.000 0.000 1.000   NA
 1241305 1241306     yfbL yfbM FALSE 0.122 103.000 0.000 NA   NA
 1241308 1241309     yfbO yfbP FALSE 0.206 56.000 0.000 NA   NA
 1241310 1241311     nuoN nuoM TRUE 0.840 187.000 0.437 0.002 Y NA
 1241311 1241312     nuoM nuoL TRUE 0.934 164.000 0.713 0.002 Y NA
 1241312 1241313     nuoL nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.007 Y NA
 1241313 1241314     nuoK nuoJ TRUE 0.998 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 1241314 1241315     nuoJ nuoI TRUE 0.997 12.000 0.428 0.007 Y NA
 1241315 1241316     nuoI nuoH TRUE 0.996 15.000 0.423 0.007 Y NA
 1241316 1241317     nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.007 Y NA
 1241317 1241318     nuoG nuoF TRUE 0.940 47.000 0.180 0.007 Y NA
 1241318 1241319     nuoF nuoE TRUE 0.997 -3.000 0.186 0.007 Y NA
 1241319 1241320     nuoE nuoC TRUE 0.998 3.000 0.407 0.007 Y NA
 1241320 1241321     nuoC nuoB TRUE 0.966 94.000 0.691 0.003 Y NA
 1241321 1241322     nuoB nuoA TRUE 0.996 16.000 0.377 0.003 Y NA
 1241322 1241323     nuoA lrhA FALSE 0.003 631.000 0.000 1.000 N NA
 1241323 1241324     lrhA insB FALSE 0.063 162.000 0.000 1.000 N NA
 1241324 1241325     insB insA TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.016 Y NA
 1241326 1241327     yfbQ yfbR FALSE 0.285 84.000 0.104 1.000   NA
 1241328 1241329     yfbS yfbT TRUE 0.543 87.000 0.308 1.000   NA
 1241329 1241330     yfbT yfbU TRUE 0.976 11.000 0.375 NA   NA
 1241330 1241331     yfbU yfbV FALSE 0.429 83.000 0.221 NA   NA
 1241332 1241333     ackA pta TRUE 0.784 75.000 0.634 1.000   NA
 1241333 1241334     pta yfcC FALSE 0.052 190.000 0.000 1.000   NA
 1241335 1241336     yfcD yfcE TRUE 0.704 58.000 0.143 0.009   NA
 1241336 1241337     yfcE yfcF FALSE 0.360 53.000 0.092 NA   NA
 1241338 1241339     yfcG folX FALSE 0.136 57.000 0.012 1.000 N NA
 1241339 1241340     folX yfcH TRUE 0.809 21.000 0.122 1.000   NA
 1241341 1241342     yfcI hisP FALSE 0.038 197.000 0.000 NA   NA
 1241342 1241343     hisP hisM TRUE 0.998 8.000 0.643 1.000 Y NA
 1241343 1241344     hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.015 Y NA
 1241344 1241345     hisQ hisJ TRUE 0.966 90.000 0.833 0.059 Y NA
 1241345 1241346     hisJ argT FALSE 0.378 221.000 0.000 0.011 Y NA
 1241346 1241347     argT ubiX FALSE 0.016 266.000 0.000 1.000 N NA
 1241347 1241348     ubiX purF FALSE 0.151 95.000 0.056 1.000 N NA
 1241348 1241349     purF cvpA TRUE 0.770 37.000 0.262 1.000   NA
 1241349 1241350     cvpA dedD FALSE 0.040 259.000 0.116 NA   NA
 1241350 1241351     dedD folC TRUE 0.962 -10.000 0.216 NA   NA
 1241351 1241352     folC accD TRUE 0.637 70.000 0.383 1.000 N NA
 1241352 1241353     accD dedA FALSE 0.051 156.000 0.020 NA   NA
 1241353 1241354     dedA truA FALSE 0.133 83.000 0.038 NA   NA
 1241354 1241355     truA usg TRUE 0.884 0.000 0.040 1.000 N NA
 1241355 1241356     usg pdxB TRUE 0.864 66.000 0.097 0.008 Y NA
 1241358 1241359     yfcJ fabB FALSE 0.016 265.000 0.000 1.000 N NA
 1241361 1241362     yfcL yfcM TRUE 0.870 34.000 0.425 NA   NA
 1241362 1241363     yfcM yfcA TRUE 0.961 0.000 0.153 NA   NA
 1241363 1241364     yfcA mepA TRUE 0.967 0.000 0.160 1.000   NA
 1241364 1241365     mepA aroC TRUE 0.823 4.000 0.025 1.000 N NA
 1241365 1241366     aroC prmB TRUE 0.498 35.000 0.081 1.000 N NA
 1241368 1241369     yfcO yfcP TRUE 0.899 2.000 0.000 1.000   NA
 1241369 1241370     yfcP yfcQ TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.009 Y NA
 1241370 1241371     yfcQ yfcR TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.009 Y NA
 1241371 1241372     yfcR yfcS TRUE 0.996 0.000 0.333 1.000 Y NA
 1241372 1241373     yfcS yfcT TRUE 0.983 20.000 1.000 1.000   NA
 1241373 1241374     yfcT yfcU TRUE 0.935 13.000 0.000 0.059   NA
 1241374 1241375     yfcU yfcV TRUE 0.951 82.000 1.000 1.000 Y NA
 1241375 1241376     yfcV sixA FALSE 0.003 681.000 0.000 1.000 N NA
 1241376 1241377     sixA yfcX FALSE 0.033 203.000 0.000 1.000 N NA
 1241377 1241378     yfcX yfcY TRUE 0.997 0.000 0.430 1.000 Y NA
 1241378 1241379     yfcY yfcZ FALSE 0.064 181.000 0.061 NA   NA
 1241380 1241381     fadL yfdF FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 1241383 1241384     yfdC argW FALSE 0.149 76.000 0.000 NA   NA
 1241384 1241385     argW intS FALSE 0.065 162.000 0.000 NA   NA
 1241385 1241386     intS yfdG FALSE 0.089 153.000 0.000 1.000   NA
 1241386 1241387     yfdG yfdH TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241387 1241388     yfdH yfdI TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241388 1241389     yfdI tfaS FALSE 0.008 341.000 0.000 NA   NA
 1241391 1241392     yfdK yfdL TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 1241392 1241393     yfdL yfdM FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 1241393 1241394     yfdM yfdN TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1241394 1241395     yfdN yfdO TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241396 1241397     yfdP yfdQ TRUE 0.500 66.000 0.233 NA   NA
 1241397 1241398     yfdQ yfdR FALSE 0.098 128.000 0.039 NA   NA
 1241398 1241399     yfdR yfdS TRUE 0.856 -9.000 0.000 NA   NA
 1241399 1241400     yfdS yfdT TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1241400 1241401     yfdT ypdJ TRUE 0.805 -84.000 0.000 NA   NA
 1241401 1241402     ypdJ torI FALSE 0.149 76.000 0.000 NA   NA
 1241404 1241405     dsdX dsdA TRUE 0.961 18.000 0.083 1.000 Y NA
 1241406 1241407     emrY emrK TRUE 0.996 0.000 1.000 1.000   NA
 1241408 1241409     evgA evgS TRUE 0.993 5.000 0.000 0.011 Y NA
 1241410 1241411     yfdE yfdV FALSE 0.183 74.000 0.000 1.000   NA
 1241411 1241412     yfdV oxc FALSE 0.189 70.000 0.000 1.000   NA
 1241412 1241413     oxc frc FALSE 0.425 54.000 0.134 1.000 N NA
 1241413 1241414     frc yfdX FALSE 0.004 513.000 0.000 NA   NA
 1241419 1241420     ypdA ypdB TRUE 0.998 15.000 0.744 0.014 Y NA
 1241420 1241421     ypdB ypdC TRUE 0.985 13.000 0.051 0.074 Y NA
 1241422 1241423     ypdD ypdE TRUE 0.985 25.000 0.571 1.000 Y NA
 1241423 1241424     ypdE ypdF TRUE 0.965 0.000 0.009 0.022 N NA
 1241424 1241425     ypdF ypdG TRUE 0.622 15.000 0.011 1.000 N NA
 1241425 1241426     ypdG ypdH TRUE 0.997 22.000 0.875 0.012 Y NA
 1241426 1241427     ypdH glk FALSE 0.261 219.000 0.091 1.000 Y NA
 1241428 1241429     yfeO ypeC FALSE 0.109 115.000 0.000 NA   NA
 1241431 1241432     nupC insL FALSE 0.162 87.000 0.000 1.000   NA
 1241433 1241434     yfeA alaX FALSE 0.031 209.000 0.000 NA   NA
 1241434 1241435     alaX alaW FALSE 0.310 40.000 0.000 NA   NA
 1241436 1241437     yfeC yfeD TRUE 0.976 2.000 0.000 0.006   NA
 1241439 1241440     valU valX FALSE 0.272 45.000 0.000 NA   NA
 1241440 1241441     valX valY FALSE 0.259 47.000 0.000 NA   NA
 1241441 1241442     valY lysV TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 1241443 1241444     xapR xapB FALSE 0.055 252.000 0.130 1.000   NA
 1241444 1241445     xapB xapA FALSE 0.372 60.000 0.111 1.000   NA
 1241449 1241450     ypeB ligA TRUE 0.830 2.000 0.017 NA   NA
 1241450 1241451     ligA zipA FALSE 0.095 71.000 0.002 1.000 N NA
 1241452 1241453     cysZ cysK FALSE 0.410 185.000 0.122 1.000 Y NA
 1241453 1241454     cysK ptsH FALSE 0.004 384.000 0.019 1.000 N NA
 1241454 1241455     ptsH ptsI TRUE 0.895 45.000 0.000 0.012 Y NA
 1241455 1241456     ptsI crr TRUE 0.908 41.000 0.000 0.012 Y NA
 1241458 1241459     yfeK yfeS FALSE 0.396 33.000 0.000 NA   NA
 1241460 1241461     cysM cysA FALSE 0.103 134.000 0.049 1.000 N NA
 1241461 1241462     cysA cysW TRUE 0.991 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 1241462 1241463     cysW cysU TRUE 0.997 0.000 0.583 0.001 N NA
 1241463 1241464     cysU cysP TRUE 0.996 0.000 0.479 0.002 N NA
 1241464 1241465     cysP ucpA FALSE 0.011 304.000 0.043 1.000 N NA
 1241465 1241466     ucpA yfeT FALSE 0.098 129.000 0.000 1.000 N NA
 1241467 1241468     yfeU murP TRUE 0.958 4.000 0.158 1.000   NA
 1241468 1241469     murP yfeW TRUE 0.952 5.000 0.167 1.000 N NA
 1241470 1241471     yfeX yfeY TRUE 0.531 96.000 0.333 NA   NA
 1241471 1241472     yfeY yfeZ TRUE 0.478 61.000 0.204 NA   NA
 1241472 1241473     yfeZ ypeA TRUE 0.877 -13.000 0.059 NA   NA
 1241474 1241475     amiA hemF TRUE 0.824 4.000 0.025 1.000 N NA
 1241476 1241477     yfeG yffI TRUE 0.635 46.000 0.250 NA N NA
 1241477 1241478     yffI eutL TRUE 0.858 13.000 0.106 NA N NA
 1241478 1241479     eutL eutC TRUE 0.980 10.000 0.000 1.000 Y NA
 1241479 1241480     eutC eutB TRUE 0.978 21.000 0.000 0.001 Y NA
 1241480 1241481     eutB eutA TRUE 0.971 12.000 0.000 NA Y NA
 1241481 1241482     eutA eutH TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA Y NA
 1241482 1241483     eutH eutG FALSE 0.115 217.000 0.222 1.000 N NA
 1241483 1241484     eutG eutJ TRUE 0.989 -10.000 0.556 1.000 N NA
 1241484 1241485     eutJ eutE TRUE 0.976 11.000 0.375 1.000 N NA
 1241485 1241486     eutE cchB TRUE 0.996 12.000 0.667 NA Y NA
 1241486 1241487     cchB cchA TRUE 0.703 107.000 0.182 NA Y NA
 1241487 1241488     cchA eutI TRUE 0.954 39.000 0.455 NA Y NA
 1241488 1241489     eutI eutT TRUE 0.941 -3.000 0.095 1.000 N NA
 1241489 1241490     eutT eutQ TRUE 0.994 -3.000 0.214 NA Y NA
 1241490 1241491     eutQ eutP TRUE 0.987 -25.000 0.167 NA Y NA
 1241491 1241492     eutP ypfE TRUE 0.970 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1241492 1241493     ypfE maeB FALSE 0.018 293.000 0.070 1.000 N NA
 1241494 1241495     talA tktB TRUE 0.993 20.000 0.739 1.000 Y NA
 1241496 1241497     ypfG yffH TRUE 0.474 126.000 0.333 NA   NA
 1241497 1241498     yffH aegA FALSE 0.386 68.000 0.167 1.000 N NA
 1241499 1241500     narQ acrD FALSE 0.293 164.000 0.133 0.083 N NA
 1241500 1241501     acrD yffB FALSE 0.004 539.000 0.000 1.000 N NA
 1241501 1241502     yffB dapE TRUE 0.976 4.000 0.292 1.000 N NA
 1241502 1241503     dapE ypfN FALSE 0.405 28.000 0.025 NA   NA
 1241504 1241505     ypfH ypfI FALSE 0.183 74.000 0.000 1.000   NA
 1241505 1241506     ypfI ypfJ TRUE 0.739 15.000 0.029 1.000   NA
 1241506 1241507     ypfJ purC FALSE 0.049 168.000 0.006 1.000   NA
 1241507 1241508     purC nlpB FALSE 0.020 213.000 0.019 1.000 N NA
 1241508 1241509     nlpB dapA TRUE 0.983 17.000 0.267 1.000 Y NA
 1241510 1241511     gcvR bcp TRUE 0.943 0.000 0.102 1.000 N NA
 1241511 1241512     bcp hyfA FALSE 0.018 253.000 0.000 1.000 N NA
 1241512 1241513     hyfA hyfB TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1241513 1241514     hyfB hyfC TRUE 0.977 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1241514 1241515     hyfC hyfD TRUE 0.989 17.000 0.412 1.000 Y NA
 1241515 1241516     hyfD hyfE TRUE 0.992 12.000 0.093 0.006 Y NA
 1241516 1241517     hyfE hyfF TRUE 0.999 5.000 0.864 0.006 Y NA
 1241517 1241518     hyfF hyfG TRUE 0.992 -10.000 0.016 0.006 Y NA
 1241518 1241519     hyfG hyfH TRUE 0.981 10.000 0.044 1.000 Y NA
 1241519 1241520     hyfH hyfI TRUE 0.995 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 1241520 1241521     hyfI hyfJ TRUE 0.972 -7.000 0.250 NA   NA
 1241521 1241522     hyfJ hyfR FALSE 0.438 30.000 0.000 NA   NA
 1241522 1241523     hyfR focB TRUE 0.567 22.000 0.000 1.000 N NA
 1241525 1241526     yfgC yfgD TRUE 0.902 21.000 0.259 1.000   NA
 1241527 1241528     hda uraA FALSE 0.257 50.000 0.048 1.000 N NA
 1241528 1241529     uraA upp TRUE 0.681 86.000 0.101 1.000 Y NA
 1241530 1241531     purM purN TRUE 0.998 0.000 0.230 0.002 Y NA
 1241531 1241532     purN ppk FALSE 0.037 172.000 0.017 1.000 N NA
 1241532 1241533     ppk ppx TRUE 0.997 5.000 0.486 1.000 Y NA
 1241535 1241536     yfgG yfgH FALSE 0.011 311.000 0.000 NA   NA
 1241536 1241537     yfgH yfgI TRUE 0.934 16.000 0.273 NA   NA
 1241538 1241539     guaA guaB TRUE 0.916 69.000 0.190 0.001 Y NA
 1241541 1241542     yfgJ der FALSE 0.104 70.000 0.009 NA   NA
 1241542 1241543     der yfgL FALSE 0.357 118.000 0.203 1.000   NA
 1241543 1241544     yfgL yfgM TRUE 0.984 11.000 0.492 1.000   NA
 1241544 1241545     yfgM hisS TRUE 0.924 18.000 0.259 1.000   NA
 1241545 1241546     hisS ispG FALSE 0.346 111.000 0.207 1.000 N NA
 1241546 1241547     ispG yfgA TRUE 0.841 27.000 0.233 1.000   NA
 1241547 1241548     yfgA yfgB FALSE 0.013 285.000 0.020 1.000   NA
 1241548 1241549     yfgB ndk FALSE 0.226 150.000 0.156 1.000   NA
 1241549 1241550     ndk pbpC FALSE 0.048 149.000 0.008 1.000 N NA
 1241550 1241551     pbpC yfhM TRUE 0.994 1.000 0.711 1.000   NA
 1241552 1241553     sseA ryfA FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 1241554 1241555     sseB pepB FALSE 0.344 142.000 0.253 NA   NA
 1241555 1241556     pepB yfhJ FALSE 0.171 178.000 0.171 1.000   NA
 1241556 1241557     yfhJ fdx TRUE 0.987 12.000 0.625 1.000   NA
 1241557 1241558     fdx hscA TRUE 0.994 2.000 0.794 1.000 N NA
 1241558 1241559     hscA hscB TRUE 0.994 17.000 0.634 1.000 Y NA
 1241559 1241560     hscB iscA TRUE 0.675 96.000 0.500 1.000   NA
 1241560 1241561     iscA iscU TRUE 0.983 17.000 0.359 0.002   NA
 1241561 1241562     iscU iscS TRUE 0.909 28.000 0.448 1.000 N NA
 1241562 1241563     iscS iscR TRUE 0.568 112.000 0.424 1.000 N NA
 1241563 1241564     iscR yfhQ FALSE 0.012 452.000 0.126 1.000 N NA
 1241565 1241566     suhB yfhR FALSE 0.089 118.000 0.003 1.000   NA
 1241566 1241567     yfhR csiE FALSE 0.051 191.000 0.000 1.000   NA
 1241568 1241569     hcaT hcaR FALSE 0.082 160.000 0.000 1.000   NA
 1241570 1241571     hcaE hcaF TRUE 0.995 -3.000 0.333 0.001 N NA
 1241571 1241572     hcaF hcaC TRUE 0.977 0.000 0.083 0.055 N NA
 1241572 1241573     hcaC hcaB TRUE 0.978 -3.000 0.083 0.032 N NA
 1241573 1241574     hcaB hcaD TRUE 0.960 10.000 0.000 0.032   NA
 1241574 1241575     hcaD yphA TRUE 0.518 25.000 0.000 NA   NA
 1241576 1241577     yphB yphC TRUE 0.786 12.000 0.000 1.000 N NA
 1241577 1241578     yphC yphD FALSE 0.162 66.000 0.000 1.000 N NA
 1241578 1241579     yphD yphE TRUE 0.947 25.000 0.148 1.000 Y NA
 1241579 1241580     yphE yphF TRUE 0.953 23.000 0.161 NA Y NA
 1241580 1241581     yphF yphG FALSE 0.126 97.000 0.000 NA   NA
 1241585 1241586     glnB yfhA FALSE 0.389 61.000 0.146 1.000 N NA
 1241586 1241587     yfhA yfhG TRUE 0.826 -10.000 0.029 NA   NA
 1241587 1241588     yfhG yfhK FALSE 0.052 165.000 0.029 NA   NA
 1241588 1241589     yfhK sroF FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 1241589 1241590     sroF purL FALSE 0.010 316.000 0.000 NA   NA
 1241592 1241593     tadA yfhB TRUE 0.535 25.000 0.062 NA N NA
 1241594 1241595     yfhH yfhL FALSE 0.283 56.000 0.056 1.000   NA
 1241596 1241597     acpS pdxJ TRUE 0.984 0.000 0.326 1.000 N NA
 1241597 1241598     pdxJ recO TRUE 0.924 12.000 0.166 1.000 N NA
 1241598 1241599     recO era TRUE 0.907 12.000 0.109 1.000   NA
 1241599 1241600     era rnc TRUE 0.984 -3.000 0.127 0.045   NA
 1241600 1241601     rnc lepB FALSE 0.041 272.000 0.117 1.000   NA
 1241601 1241602     lepB lepA TRUE 0.911 16.000 0.187 1.000   NA
 1241602 1241603     lepA rseC FALSE 0.030 198.000 0.045 NA N NA
 1241603 1241604     rseC rseB TRUE 0.998 -3.000 0.609 NA Y NA
 1241604 1241605     rseB rseA TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 1241605 1241606     rseA rpoE TRUE 0.929 33.000 0.705 NA N NA
 1241615 1241616     trxC yfiP FALSE 0.252 69.000 0.084 NA   NA
 1241616 1241617     yfiP yfiQ TRUE 0.764 32.000 0.222 NA   NA
 1241617 1241618     yfiQ pssA TRUE 0.453 114.000 0.121 0.052 N NA
 1241618 1241619     pssA yfiM FALSE 0.216 97.000 0.089 NA   NA
 1241620 1241621     kgtP rrfG FALSE 0.009 323.000 0.000 NA   NA
 1241621 1241622     rrfG rrlG FALSE 0.129 93.000 0.000 NA   NA
 1241622 1241623     rrlG gltW FALSE 0.044 185.000 0.000 NA   NA
 1241623 1241624     gltW rrsG FALSE 0.055 172.000 0.000 NA   NA
 1241624 1241625     rrsG clpB FALSE 0.005 443.000 0.000 NA   NA
 1241625 1241626     clpB yfiH FALSE 0.197 130.000 0.108 NA   NA
 1241626 1241627     yfiH rluD TRUE 0.965 -3.000 0.168 NA   NA
 1241628 1241629     yfiO yfiA FALSE 0.009 271.000 0.004 NA   NA
 1241629 1241630     yfiA pheL FALSE 0.121 104.000 0.000 NA   NA
 1241630 1241631     pheL pheA FALSE 0.125 99.000 0.000 NA   NA
 1241632 1241633     tyrA aroF TRUE 0.977 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1241634 1241635     yfiL yfiR FALSE 0.197 150.000 0.148 NA   NA
 1241635 1241636     yfiR yfiN TRUE 0.986 -10.000 0.475 NA   NA
 1241636 1241637     yfiN yfiB TRUE 0.967 16.000 0.475 1.000 N NA
 1241638 1241639     rplS trmD TRUE 0.963 42.000 0.567 1.000 Y NA
 1241639 1241640     trmD rimM TRUE 0.983 31.000 0.672 1.000 Y NA
 1241640 1241641     rimM rpsP TRUE 0.993 19.000 0.342 0.012 Y NA
 1241641 1241642     rpsP ffh FALSE 0.146 249.000 0.361 1.000 N NA
 1241643 1241644     ypjD yfjD TRUE 0.517 111.000 0.349 NA   NA
 1241646 1241647     yfjB recN FALSE 0.347 86.000 0.170 1.000 N NA
 1241647 1241648     recN smpA FALSE 0.086 149.000 0.049 1.000 N NA
 1241649 1241650     yfjF yfjG TRUE 0.935 -10.000 0.124 NA   NA
 1241651 1241652     smpB ssrA FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 1241652 1241653     ssrA intA FALSE 0.034 204.000 0.000 NA   NA
 1241655 1241656     alpA yfjI FALSE 0.100 129.000 0.000 NA   NA
 1241656 1241657     yfjI yfjJ FALSE 0.072 153.000 0.000 NA   NA
 1241658 1241659     yfjK yfjL TRUE 0.988 -3.000 0.407 NA   NA
 1241659 1241660     yfjL yfjM FALSE 0.007 360.000 0.000 NA   NA
 1241661 1241662     yfjN yfjO TRUE 0.992 -7.000 0.667 NA   NA
 1241662 1241663     yfjO yfjP FALSE 0.007 355.000 0.000 NA   NA
 1241663 1241664     yfjP yfjQ FALSE 0.130 92.000 0.000 NA   NA
 1241664 1241665     yfjQ yfjR FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 1241665 1241666     yfjR ypjK FALSE 0.302 41.000 0.000 NA   NA
 1241666 1241667     ypjK yfjS TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1241667 1241668     yfjS yfjT TRUE 0.536 24.000 0.000 NA   NA
 1241669 1241670     yfjU ypjL TRUE 0.804 13.000 0.000 1.000   NA
 1241670 1241671     ypjL yfjV FALSE 0.373 151.000 0.000 0.001   NA
 1241671 1241672     yfjV ypjM TRUE 0.811 -60.000 0.000 NA   NA
 1241674 1241675     yfjW yfjX FALSE 0.003 898.000 0.000 NA   NA
 1241675 1241676     yfjX yfjY TRUE 0.846 9.000 0.000 NA   NA
 1241676 1241677     yfjY ypjJ TRUE 0.846 9.000 0.000 NA   NA
 1241677 1241678     ypjJ yfjZ FALSE 0.330 38.000 0.000 NA   NA
 1241678 1241679     yfjZ ypjF TRUE 0.598 21.000 0.000 NA   NA
 1241680 1241681     ypjA pinH FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 1241681 1241683     pinH ypjB FALSE 0.005 430.000 0.000 NA   NA
 1241683 1241684     ypjB ypjC FALSE 0.124 100.000 0.000 NA   NA
 1241684 1241685     ypjC ileY FALSE 0.003 751.000 0.000 NA   NA
 1241686 1241687     ygaQ ygaR TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 1241687 1241688     ygaR yqaC FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 1241688 1241690     yqaC yqaD FALSE 0.090 139.000 0.000 NA   NA
 1241690 1241691     yqaD ygaT FALSE 0.008 336.000 0.000 NA   NA
 1241691 1241692     ygaT ygaF TRUE 0.622 20.000 0.000 NA   NA
 1241692 1241693     ygaF gabD TRUE 0.608 23.000 0.000 1.000   NA
 1241693 1241694     gabD gabT TRUE 0.952 14.000 0.303 1.000 N NA
 1241694 1241695     gabT gabP FALSE 0.250 238.000 0.121 1.000 Y NA
 1241695 1241696     gabP csiR TRUE 0.964 21.000 0.625 1.000 N NA
 1241697 1241698     ygaU yqaE FALSE 0.142 84.000 0.027 1.000   NA
 1241699 1241700     ygaV ygaP TRUE 0.881 10.000 0.083 NA N NA
 1241704 1241705     ygaM nrdH FALSE 0.020 248.000 0.000 NA   NA
 1241705 1241706     nrdH nrdI TRUE 0.813 -3.000 0.026 NA N NA
 1241706 1241707     nrdI nrdE TRUE 0.977 -27.000 0.000 NA Y NA
 1241707 1241708     nrdE nrdF TRUE 0.993 10.000 0.000 0.001 Y NA
 1241708 1241709     nrdF proV FALSE 0.007 354.000 0.000 1.000 N NA
 1241709 1241710     proV proW TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.093 Y NA
 1241710 1241711     proW proX TRUE 0.974 58.000 0.695 0.057 Y NA
 1241711 1241712     proX ygaX FALSE 0.287 192.000 0.174 0.057   NA
 1241712 1241713     ygaX ygaY FALSE 0.438 30.000 0.000 NA   NA
 1241713 1241715     ygaY ygaZ FALSE 0.104 124.000 0.000 NA   NA
 1241715 1241716     ygaZ ygaH TRUE 0.994 -10.000 0.915 NA   NA
 1241716 1241717     ygaH mprA FALSE 0.175 91.000 0.065 NA   NA
 1241717 1241718     mprA emrA FALSE 0.198 127.000 0.107 1.000 N NA
 1241718 1241719     emrA emrB TRUE 0.984 17.000 0.875 1.000 N NA
 1241722 1241723     gshA yqaA FALSE 0.215 73.000 0.071 NA   NA
 1241723 1241724     yqaA yqaB TRUE 0.920 -3.000 0.067 NA   NA
 1241724 1241725     yqaB argQ FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 1241725 1241726     argQ argZ FALSE 0.036 199.000 0.000 NA   NA
 1241726 1241727     argZ argY FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 1241727 1241728     argY argV FALSE 0.036 199.000 0.000 NA   NA
 1241728 1241729     argV serV TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 1241729 1241730     serV csrA FALSE 0.010 316.000 0.000 NA   NA
 1241730 1241731     csrA alaS FALSE 0.016 235.000 0.020 1.000 N NA
 1241731 1241732     alaS recX FALSE 0.194 128.000 0.085 1.000   NA
 1241732 1241733     recX recA TRUE 0.579 69.000 0.296 1.000   NA
 1241733 1241734     recA ygaD FALSE 0.224 80.000 0.082 NA   NA
 1241734 1241735     ygaD mltB FALSE 0.068 145.000 0.026 NA   NA
 1241736 1241737     srlA srlE TRUE 0.998 -3.000 0.349 0.013 Y NA
 1241737 1241738     srlE srlB TRUE 0.990 11.000 0.000 0.013 Y NA
 1241738 1241739     srlB srlD TRUE 0.857 4.000 0.040 1.000 N NA
 1241739 1241740     srlD gutM FALSE 0.326 105.000 0.197 NA N NA
 1241740 1241741     gutM srlR TRUE 0.779 67.000 0.183 NA Y NA
 1241741 1241742     srlR gutQ TRUE 0.990 -7.000 0.562 1.000 N NA
 1241744 1241745     norV norW TRUE 0.980 -3.000 0.083 0.055   NA
 1241746 1241747     hypF hydN FALSE 0.050 153.000 0.018 1.000 N NA
 1241747 1241748     hydN ascG FALSE 0.379 149.000 0.316 1.000 N NA
 1241749 1241750     ascF ascB TRUE 0.996 9.000 0.485 1.000 Y NA
 1241751 1241752     hycI hycH TRUE 0.982 -7.000 0.360 NA   NA
 1241752 1241753     hycH hycG TRUE 0.962 -3.000 0.156 NA   NA
 1241753 1241754     hycG hycF TRUE 0.991 0.000 0.111 1.000 Y NA
 1241754 1241755     hycF hycE TRUE 0.991 10.000 0.200 1.000 Y NA
 1241755 1241756     hycE hycD TRUE 0.980 18.000 0.235 1.000 Y NA
 1241756 1241757     hycD hycC TRUE 0.996 3.000 0.382 1.000 Y NA
 1241757 1241758     hycC hycB TRUE 0.993 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 1241758 1241759     hycB hycA FALSE 0.104 125.000 0.000 NA   NA
 1241760 1241761     hypA hypB TRUE 0.993 4.000 0.306 0.002   NA
 1241761 1241762     hypB hypC TRUE 0.989 -9.000 0.139 NA Y NA
 1241762 1241763     hypC hypD TRUE 0.985 0.000 0.021 NA Y NA
 1241763 1241764     hypD hypE TRUE 0.945 39.000 0.353 1.000 Y NA
 1241764 1241765     hypE fhlA FALSE 0.108 74.000 0.019 1.000 N NA
 1241767 1241768     mutS pphB FALSE 0.144 106.000 0.000 1.000   NA
 1241770 1241771     ygbJ ygbK TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1241771 1241772     ygbK ygbL FALSE 0.130 92.000 0.000 NA   NA
 1241772 1241773     ygbL ygbM TRUE 0.994 5.000 0.265 1.000 Y NA
 1241773 1241774     ygbM ygbN TRUE 0.713 89.000 0.143 1.000 Y NA
 1241775 1241776     rpoS nlpD FALSE 0.126 180.000 0.142 1.000 N NA
 1241776 1241777     nlpD pcm FALSE 0.074 140.000 0.030 1.000 N NA
 1241777 1241778     pcm surE TRUE 0.985 -6.000 0.353 1.000   NA
 1241778 1241779     surE truD TRUE 0.966 -19.000 0.235 1.000   NA
 1241779 1241780     truD ispF TRUE 0.970 -3.000 0.173 1.000   NA
 1241780 1241781     ispF ispD TRUE 0.997 0.000 0.419 1.000 Y NA
 1241781 1241782     ispD ftsB TRUE 0.871 19.000 0.185 1.000 N NA
 1241782 1241783     ftsB ygbE FALSE 0.032 194.000 0.028 NA   NA
 1241783 1241784     ygbE cysC TRUE 0.564 50.000 0.198 NA   NA
 1241784 1241785     cysC cysN TRUE 0.996 0.000 0.340 1.000 Y NA
 1241785 1241786     cysN cysD TRUE 0.997 2.000 0.574 0.001 N NA
 11461730 1241781       ispD FALSE NA 5211.000 0.000 NA   NA
 11604093 1241781       ispD FALSE NA 5211.000 0.000 NA   NA
 11746485 1241781       ispD FALSE NA 5211.000 0.000 NA   NA
 11461731 1241781       ispD FALSE NA 5240.000 0.000 NA   NA
 11604094 1241781       ispD FALSE NA 5240.000 0.000 NA   NA
 11746486 1241781       ispD FALSE NA 5240.000 0.000 NA   NA
 11461732 1241781       ispD FALSE NA 5272.000 0.000 NA   NA
 11604095 1241781       ispD FALSE NA 5272.000 0.000 NA   NA
 11746487 1241781       ispD FALSE NA 5272.000 0.000 NA   NA
 11461733 1241781       ispD FALSE NA 5301.000 0.000 NA   NA
 11604096 1241781       ispD FALSE NA 5301.000 0.000 NA   NA
 11746488 1241781       ispD FALSE NA 5301.000 0.000 NA   NA
 11461734 1241781       ispD FALSE NA 5333.000 0.000 NA   NA
 11604097 1241781       ispD FALSE NA 5333.000 0.000 NA   NA
 11746489 1241781       ispD FALSE NA 5333.000 0.000 NA   NA
 11461735 1241781       ispD FALSE NA 5362.000 0.000 NA   NA
 11604098 1241781       ispD FALSE NA 5362.000 0.000 NA   NA
 11746490 1241781       ispD FALSE NA 5362.000 0.000 NA   NA
 11461736 1241781       ispD FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11604099 1241781       ispD FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11746491 1241781       ispD FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11461737 1241781       ispD FALSE NA 5423.000 0.000 NA   NA
 11604100 1241781       ispD FALSE NA 5423.000 0.000 NA   NA
 11746492 1241781       ispD FALSE NA 5423.000 0.000 NA   NA
 11461738 1241781       ispD FALSE NA 5455.000 0.000 NA   NA
 11604101 1241781       ispD FALSE NA 5455.000 0.000 NA   NA
 11746493 1241781       ispD FALSE NA 5455.000 0.000 NA   NA
 11461739 1241781       ispD FALSE NA 5484.000 0.000 NA   NA
 11604102 1241781       ispD FALSE NA 5484.000 0.000 NA   NA
 11746494 1241781       ispD FALSE NA 5484.000 0.000 NA   NA
 11461740 1241781       ispD FALSE NA 5516.000 0.000 NA   NA
 11604103 1241781       ispD FALSE NA 5516.000 0.000 NA   NA
 11746495 1241781       ispD FALSE NA 5516.000 0.000 NA   NA
 11461741 1241781       ispD FALSE NA 5545.000 0.000 NA   NA
 11604104 1241781       ispD FALSE NA 5545.000 0.000 NA   NA
 11746496 1241781       ispD FALSE NA 5545.000 0.000 NA   NA
 11461742 1241781       ispD FALSE NA 5577.000 0.000 NA   NA
 11604105 1241781       ispD FALSE NA 5577.000 0.000 NA   NA
 11746497 1241781       ispD FALSE NA 5577.000 0.000 NA   NA
 11461743 1241781       ispD FALSE NA 5606.000 0.000 NA   NA
 11604106 1241781       ispD FALSE NA 5606.000 0.000 NA   NA
 11746498 1241781       ispD FALSE NA 5606.000 0.000 NA   NA
 11461744 1241781       ispD FALSE NA 5638.000 0.000 NA   NA
 11604107 1241781       ispD FALSE NA 5638.000 0.000 NA   NA
 11746499 1241781       ispD FALSE NA 5638.000 0.000 NA   NA
 11461745 1241781       ispD FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11604108 1241781       ispD FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11746500 1241781       ispD FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11461746 1241781       ispD FALSE NA 5700.000 0.000 NA   NA
 11604109 1241781       ispD FALSE NA 5700.000 0.000 NA   NA
 11746501 1241781       ispD FALSE NA 5700.000 0.000 NA   NA
 11461747 1241781       ispD FALSE NA 5729.000 0.000 NA   NA
 11604110 1241781       ispD FALSE NA 5729.000 0.000 NA   NA
 11746502 1241781       ispD FALSE NA 5729.000 0.000 NA   NA
 11461748 1241781       ispD FALSE NA 5762.000 0.000 NA   NA
 11604111 1241781       ispD FALSE NA 5762.000 0.000 NA   NA
 11746503 1241781       ispD FALSE NA 5762.000 0.000 NA   NA
 11461749 1241781       ispD FALSE NA 5791.000 0.000 NA   NA
 11604112 1241781       ispD FALSE NA 5791.000 0.000 NA   NA
 11746504 1241781       ispD FALSE NA 5791.000 0.000 NA   NA
 11461750 1241781       ispD FALSE NA 5823.000 0.000 NA   NA
 11604113 1241781       ispD FALSE NA 5823.000 0.000 NA   NA
 11746505 1241781       ispD FALSE NA 5823.000 0.000 NA   NA
 11461751 1241781       ispD FALSE NA 5852.000 0.000 NA   NA
 11604114 1241781       ispD FALSE NA 5852.000 0.000 NA   NA
 11746506 1241781       ispD FALSE NA 5852.000 0.000 NA   NA
 11461752 1241781       ispD FALSE NA 5884.000 0.000 NA   NA
 11604115 1241781       ispD FALSE NA 5884.000 0.000 NA   NA
 11746507 1241781       ispD FALSE NA 5884.000 0.000 NA   NA
 11461753 1241781       ispD FALSE NA 5913.000 0.000 NA   NA
 11604116 1241781       ispD FALSE NA 5913.000 0.000 NA   NA
 11746508 1241781       ispD FALSE NA 5913.000 0.000 NA   NA
 11461754 1241781       ispD FALSE NA 5945.000 0.000 NA   NA
 11604117 1241781       ispD FALSE NA 5945.000 0.000 NA   NA
 11746509 1241781       ispD FALSE NA 5945.000 0.000 NA   NA
 1241788 1241789     ygbF ygbT TRUE 0.990 2.000 0.509 NA   NA
 1241789 1241790     ygbT ygcH TRUE 0.975 16.000 0.589 NA   NA
 1241790 1241791     ygcH ygcI TRUE 0.971 -13.000 0.282 NA   NA
 1241791 1241792     ygcI ygcJ TRUE 0.958 3.000 0.171 NA   NA
 1241792 1241793     ygcJ ygcK TRUE 0.900 13.000 0.138 NA   NA
 1241793 1241794     ygcK ygcL TRUE 0.981 -7.000 0.336 NA   NA
 1241794 1241795     ygcL ygcB FALSE 0.030 415.000 0.263 NA   NA
 1241795 1241796     ygcB cysH FALSE 0.006 359.000 0.003 1.000   NA
 1241796 1241797     cysH cysI FALSE 0.291 75.000 0.116 1.000 N NA
 1241797 1241798     cysI cysJ TRUE 1.000 0.000 0.791 0.000 Y NA
 1241799 1241800     ygcM ygcN FALSE 0.098 78.000 0.014 1.000 N NA
 1241800 1241801     ygcN ygcO TRUE 0.980 -9.000 0.026 NA Y NA
 1241801 1241802     ygcO ygcP TRUE 0.540 17.000 0.026 NA N NA
 1241803 1241804     ygcQ ygcR TRUE 0.996 -3.000 0.102 0.017 Y NA
 1241804 1241805     ygcR ygcS TRUE 0.947 -22.000 0.182 1.000 N NA
 1241805 1241806     ygcS ygcU FALSE 0.440 94.000 0.250 1.000 N NA
 1241806 1241807     ygcU ygcW TRUE 0.836 70.000 0.500 0.031 N NA
 1241808 1241809     yqcE ygcE TRUE 0.547 27.000 0.058 1.000 N NA
 11461755 1241809       ygcE FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11604118 1241809       ygcE FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11746510 1241809       ygcE FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11461756 1241809       ygcE FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11604119 1241809       ygcE FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11746511 1241809       ygcE FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11461757 1241809       ygcE FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11604120 1241809       ygcE FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11746512 1241809       ygcE FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11461758 1241809       ygcE FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11604121 1241809       ygcE FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11746513 1241809       ygcE FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11461759 1241809       ygcE FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11604122 1241809       ygcE FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11746514 1241809       ygcE FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11461760 1241809       ygcE FALSE NA 790.000 0.000 NA   NA
 11604123 1241809       ygcE FALSE NA 790.000 0.000 NA   NA
 11746515 1241809       ygcE FALSE NA 790.000 0.000 NA   NA
 11461761 1241809       ygcE FALSE NA 823.000 0.000 NA   NA
 11604124 1241809       ygcE FALSE NA 823.000 0.000 NA   NA
 11746516 1241809       ygcE FALSE NA 823.000 0.000 NA   NA
 11461762 1241809       ygcE FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11604125 1241809       ygcE FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11746517 1241809       ygcE FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11461763 1241809       ygcE FALSE NA 884.000 0.000 NA   NA
 11604126 1241809       ygcE FALSE NA 884.000 0.000 NA   NA
 11746518 1241809       ygcE FALSE NA 884.000 0.000 NA   NA
 11461764 1241809       ygcE FALSE NA 912.000 0.000 NA   NA
 11604127 1241809       ygcE FALSE NA 912.000 0.000 NA   NA
 11746519 1241809       ygcE FALSE NA 912.000 0.000 NA   NA
 11461765 1241809       ygcE FALSE NA 945.000 0.000 NA   NA
 11604128 1241809       ygcE FALSE NA 945.000 0.000 NA   NA
 11746520 1241809       ygcE FALSE NA 945.000 0.000 NA   NA
 11461766 1241809       ygcE FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11604129 1241809       ygcE FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11746521 1241809       ygcE FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11461767 1241809       ygcE FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11604130 1241809       ygcE FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11746522 1241809       ygcE FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 1241812 1241813     eno pyrG FALSE 0.180 88.000 0.068 1.000 N NA
 1241813 1241814     pyrG mazG FALSE 0.024 228.000 0.025 1.000   NA
 1241814 1241815     mazG chpA FALSE 0.187 71.000 0.000 1.000   NA
 1241815 1241816     chpA chpR TRUE 0.998 0.000 0.531 NA Y NA
 1241816 1241817     chpR relA TRUE 0.603 78.000 0.000 NA Y NA
 1241817 1241818     relA rumA FALSE 0.368 48.000 0.082 1.000 N NA
 1241820 1241821     gudD gudX TRUE 0.979 21.000 0.000 0.000 Y NA
 1241821 1241822     gudX gudP TRUE 0.873 2.000 0.000 1.000 N NA
 1241822 1241823     gudP yqcA FALSE 0.005 435.000 0.000 1.000 N NA
 1241823 1241824     yqcA yqcB TRUE 0.893 18.000 0.209 1.000 N NA
 1241824 1241825     yqcB yqcC TRUE 0.991 0.000 0.518 NA   NA
 1241825 1241826     yqcC csrB FALSE 0.283 43.000 0.000 NA   NA
 1241826 1241827     csrB syd FALSE 0.026 220.000 0.000 NA   NA
 1241828 1241829     yqcD ygdH FALSE 0.169 112.000 0.079 NA   NA
 1241829 1241830     ygdH sdaC FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 1241830 1241831     sdaC sdaB TRUE 0.701 58.000 0.000 1.000 Y NA
 1241831 1241832     sdaB exo TRUE 0.567 22.000 0.000 1.000 N NA
 1241833 1241834     fucO fucA TRUE 0.598 25.000 0.066 1.000 N NA
 1241835 1241836     fucP fucI TRUE 0.901 33.000 0.104 1.000 Y NA
 1241836 1241837     fucI fucK TRUE 0.821 79.000 0.269 1.000 Y NA
 1241837 1241838     fucK fucU TRUE 0.993 2.000 0.211 1.000 Y NA
 1241838 1241839     fucU fucR TRUE 0.882 58.000 0.308 1.000 Y NA
 1241840 1241841     ygdE ygdD TRUE 0.949 -7.000 0.144 NA   NA
 1241841 1241842     ygdD gcvA TRUE 0.756 19.000 0.081 NA   NA
 1241845 1241846     csdA ygdK TRUE 0.989 0.000 0.122 0.001   NA
 1241847 1241848     ygdL mltA FALSE 0.013 239.000 0.009 1.000 N NA
 1241849 1241850     metZ metW FALSE 0.384 34.000 0.000 NA   NA
 1241850 1241851     metW metV FALSE 0.384 34.000 0.000 NA   NA
 1241854 1241855     recD recB TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 1241855 1241856     recB ptr TRUE 0.924 -7.000 0.092 1.000 N NA
 1241856 1241857     ptr recC FALSE 0.095 176.000 0.092 1.000 N NA
 1241857 1241858     recC ppdC TRUE 0.810 13.000 0.076 NA N NA
 1241858 1241859     ppdC ygdB TRUE 0.987 -15.000 0.538 NA   NA
 1241859 1241860     ygdB ppdB TRUE 0.987 -3.000 0.373 NA   NA
 1241860 1241861     ppdB ppdA TRUE 0.995 -9.000 0.368 NA Y NA
 1241861 1241862     ppdA thyA FALSE 0.021 184.000 0.016 NA N NA
 1241862 1241863     thyA lgt TRUE 0.949 7.000 0.164 1.000 N NA
 1241863 1241864     lgt ptsP FALSE 0.073 151.000 0.000 1.000 N NA
 1241864 1241865     ptsP nudH TRUE 0.661 13.000 0.008 1.000 N NA
 1241866 1241867     mutH ygdQ FALSE 0.177 69.000 0.052 1.000 N NA
 1241867 1241868     ygdQ ygdR TRUE 0.525 138.000 0.429 NA   NA
 1241868 1241869     ygdR tas FALSE 0.118 108.000 0.043 NA   NA
 1241870 1241871     ygeD aas TRUE 0.941 -7.000 0.124 NA   NA
 1241871 1241872     aas rygA FALSE 0.133 88.000 0.000 NA   NA
 1241872 1241873     rygA rygB FALSE 0.105 121.000 0.000 NA   NA
 1241877 1241878     ygeA araE FALSE 0.064 129.000 0.011 1.000 N NA
 1241878 1241879     araE kduD FALSE 0.010 315.000 0.000 1.000 N NA
 1241879 1241880     kduD kduI TRUE 0.821 30.000 0.269 1.000 N NA
 1241880 1241881     kduI yqeF FALSE 0.013 287.000 0.000 1.000 N NA
 1241882 1241883     yqeG yqeH FALSE 0.006 460.000 0.000 1.000   NA
 1241883 1241884     yqeH yqeI FALSE 0.033 334.000 0.000 0.070   NA
 1241884 1241885     yqeI yqeJ TRUE 0.984 -7.000 0.400 NA   NA
 1241887 1241888     ygeF ygeG FALSE 0.016 268.000 0.000 NA   NA
 1241888 1241889     ygeG ygeH FALSE 0.011 335.000 0.000 1.000   NA
 1241889 1241890     ygeH ygeI FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 1241890 1241891     ygeI pbl FALSE 0.044 185.000 0.000 NA   NA
 1241893 1241894     ygeK ygeL FALSE 0.384 34.000 0.000 NA   NA
 1241894 1241895     ygeL ygeM FALSE 0.025 222.000 0.000 NA   NA
 1241895 1241896     ygeM ygeN TRUE 0.870 3.000 0.000 NA   NA
 1241896 1241898     ygeN ygeO TRUE 0.812 -58.000 0.000 NA   NA
 1241898 1241899     ygeO insD TRUE 0.868 -15.000 0.000 1.000   NA
 1241899 1241900     insD insC TRUE 0.989 -42.000 0.000 0.061 Y NA
 1241900 1241901     insC ygeP FALSE 0.277 44.000 0.000 NA   NA
 1241901 1241902     ygeP ygeQ FALSE 0.265 46.000 0.000 NA   NA
 1241902 1241903     ygeQ glyU FALSE 0.069 156.000 0.000 NA   NA
 1241903 1241904     glyU ygeR FALSE 0.144 79.000 0.000 NA   NA
 1241905 1241906     xdhA xdhB TRUE 0.998 11.000 0.500 0.001 Y NA
 1241906 1241907     xdhB xdhC TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.052 Y NA
 1241909 1241910     ygeW ygeX TRUE 0.866 58.000 0.265 1.000 Y NA
 1241910 1241911     ygeX ygeY TRUE 0.828 58.000 0.188 1.000 Y NA
 1241911 1241912     ygeY hyuA FALSE 0.242 53.000 0.050 1.000 N NA
 1241912 1241913     hyuA yqeA FALSE 0.221 48.000 0.031 1.000 N NA
 1241914 1241915     yqeB yqeC TRUE 0.452 48.000 0.119 NA   NA
 1241916 1241917     ygfJ ygfK FALSE 0.010 322.000 0.000 NA   NA
 1241917 1241918     ygfK ssnA TRUE 0.987 3.000 0.443 1.000 N NA
 1241918 1241919     ssnA ygfM FALSE 0.300 51.000 0.066 1.000 N NA
 1241919 1241920     ygfM xdhD TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.030 Y NA
 1241920 1241921     xdhD ygfO FALSE 0.060 165.000 0.000 1.000 N NA
 1241921 1241922     ygfO guaD TRUE 0.963 15.000 0.000 1.000 Y NA
 1241922 1241923     guaD ygfQ FALSE 0.414 36.000 0.000 1.000   NA
 1241924 1241925     ygfS ygfT TRUE 0.993 0.000 0.333 0.017 N NA
 1241926 1241927     ygfU idi FALSE 0.019 250.000 0.000 1.000 N NA
 1241928 1241929     lysS prfB TRUE 0.995 10.000 0.162 0.040 Y NA
 1241929 1241930     prfB recJ FALSE 0.106 91.000 0.028 1.000 N NA
 1241930 1241931     recJ dsbC TRUE 0.910 6.000 0.082 1.000 N NA
 1241931 1241932     dsbC xerD TRUE 0.635 25.000 0.079 1.000 N NA
 1241934 1241935     ygfX ygfY TRUE 0.871 -19.000 0.061 NA   NA
 1241937 1241938     yqfA yqfB FALSE 0.135 164.000 0.113 NA   NA
 1241940 1241941     ygfF gcvP FALSE 0.009 267.000 0.006 1.000 N NA
 1241941 1241942     gcvP gcvH TRUE 0.748 119.000 0.249 1.000 Y NA
 1241942 1241943     gcvH gcvT TRUE 0.990 24.000 0.317 0.001 Y NA
 1241943 1241944     gcvT visC FALSE 0.003 448.000 0.004 1.000 N NA
 1241944 1241945     visC ubiH TRUE 0.994 23.000 0.474 0.001 Y NA
 1241945 1241946     ubiH pepP TRUE 0.860 -3.000 0.026 1.000 N NA
 1241946 1241947     pepP ygfB TRUE 0.481 26.000 0.036 NA   NA
 1241948 1241949     zapA ssrS FALSE 0.293 42.000 0.000 NA   NA
 1241949 1241950     ssrS ygfA FALSE 0.149 76.000 0.000 NA   NA
 1241950 1241951     ygfA rygC TRUE 0.501 26.000 0.000 NA   NA
 1241952 1241953     serA rpiA FALSE 0.014 256.000 0.029 1.000 N NA
 1241953 1241954     rpiA yqfE FALSE 0.206 56.000 0.000 NA   NA
 1241955 1241956     argP yliK FALSE 0.033 204.000 0.000 1.000 N NA
 1241956 1241957     yliK argK TRUE 0.983 -7.000 0.366 1.000 N NA
 1241957 1241958     argK ygfG TRUE 0.742 11.000 0.015 1.000 N NA
 1241958 1241959     ygfG ygfH TRUE 0.870 24.000 0.085 0.020 N NA
 1241960 1241961     ygfI yggE FALSE 0.056 167.000 0.037 NA   NA
 1241961 1241962     yggE argO FALSE 0.191 93.000 0.075 NA   NA
 1241962 1241963     argO mscS FALSE 0.121 139.000 0.049 1.000   NA
 1241963 1241964     mscS fbaA FALSE 0.007 358.000 0.038 1.000 N NA
 1241964 1241965     fbaA pgk FALSE 0.437 215.000 0.056 0.005 Y NA
 1241965 1241966     pgk epd TRUE 0.903 50.000 0.070 0.005 Y NA
 1241966 1241967     epd yggC FALSE 0.013 285.000 0.000 1.000 N NA
 1241967 1241968     yggC yggD TRUE 0.992 -3.000 0.588 NA N NA
 1241968 1241969     yggD yggF TRUE 0.948 22.000 0.545 NA N NA
 1241969 1241970     yggF yggP TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1241970 1241971     yggP cmtA TRUE 0.969 15.000 0.458 1.000 N NA
 1241971 1241972     cmtA cmtB TRUE 0.980 28.000 0.250 0.012 Y NA
 1241972 1241973     cmtB tktA FALSE 0.092 314.000 0.000 1.000 Y NA
 1241975 1241976     speB speA TRUE 0.465 138.000 0.015 1.000 Y NA
 1241976 1241977     speA yqgB TRUE 0.846 9.000 0.000 NA   NA
 1241980 1241981     metK galP FALSE 0.005 424.000 0.000 1.000 N NA
 1241981 1241982     galP sprT FALSE 0.180 77.000 0.042 1.000   NA
 1241982 1241983     sprT endA FALSE 0.411 95.000 0.210 1.000   NA
 1241983 1241984     endA yggJ FALSE 0.408 80.000 0.201 NA   NA
 1241984 1241985     yggJ gshB TRUE 0.920 13.000 0.173 NA   NA
 1241985 1241986     gshB yqgE FALSE 0.209 109.000 0.120 NA N NA
 1241986 1241987     yqgE yqgF TRUE 0.976 0.000 0.263 NA N NA
 1241989 1241990     yggS yggT TRUE 0.885 18.000 0.189 NA   NA
 1241990 1241991     yggT yggU TRUE 0.933 -3.000 0.081 NA   NA
 1241991 1241992     yggU yggV TRUE 0.794 8.000 0.016 NA   NA
 1241992 1241993     yggV yggW TRUE 0.966 -7.000 0.218 1.000 N NA
 1241994 1241995     yggM ansB FALSE 0.077 117.000 0.018 NA   NA
 1241995 1241996     ansB yggN FALSE 0.042 176.000 0.027 NA   NA
 1241996 1241997     yggN yggL FALSE 0.129 184.000 0.155 NA   NA
 1241997 1241998     yggL yggH TRUE 0.940 0.000 0.092 NA   NA
 1241999 1242000     mutY yggX TRUE 0.696 28.000 0.150 NA N NA
 1242000 1242001     yggX mltC FALSE 0.308 65.000 0.128 NA N NA
 1242001 1242002     mltC nupG FALSE 0.043 202.000 0.056 NA   NA
 1242004 1242005     yqgA pheV FALSE 0.119 106.000 0.000 NA   NA
 1242006 1242007     yghD yghE TRUE 0.876 2.000 0.000 NA   NA
 1242007 1242009     yghE yghF FALSE 0.165 66.000 0.000 NA   NA
 1242009 1242010     yghF yghG FALSE 0.082 147.000 0.000 NA   NA
 1242010 1242011     yghG pppA FALSE 0.165 66.000 0.000 NA   NA
 1242011 1242012     pppA yghJ FALSE 0.046 198.000 0.000 1.000   NA
 1242012 1242013     yghJ yghK FALSE 0.006 485.000 0.000 1.000   NA
 1242013 1242014     yghK glcB FALSE 0.067 355.000 0.000 1.000 Y NA
 1242014 1242015     glcB glcG TRUE 0.612 22.000 0.052 NA   NA
 1242015 1242016     glcG glcF TRUE 0.886 5.000 0.057 NA   NA
 1242016 1242017     glcF glcE TRUE 0.991 11.000 0.074 0.030 Y NA
 1242017 1242018     glcE glcD TRUE 0.996 0.000 0.070 0.008 Y NA
 1242022 1242023     yghQ yghR TRUE 0.879 46.000 0.667 NA   NA
 1242023 1242024     yghR yghS FALSE 0.407 32.000 0.000 NA   NA
 1242026 1242027     pitB gss FALSE 0.012 292.000 0.000 1.000 N NA
 1242029 1242030     hybG hybF TRUE 0.766 13.000 0.000 NA   NA
 1242030 1242031     hybF hybE TRUE 0.886 -7.000 0.055 NA   NA
 1242031 1242032     hybE hybD TRUE 0.976 -7.000 0.291 NA   NA
 1242032 1242033     hybD hybC TRUE 0.999 0.000 0.828 1.000 Y NA
 1242033 1242034     hybC hybB TRUE 0.986 -3.000 0.000 NA Y NA
 1242034 1242035     hybB hybA TRUE 0.981 -10.000 0.000 NA Y NA
 1242035 1242036     hybA hybO TRUE 0.999 3.000 0.615 0.017 Y NA
 1242036 1242037     hybO yghW FALSE 0.066 189.000 0.077 NA   NA
 1242037 1242038     yghW yghX FALSE 0.106 119.000 0.000 NA   NA
 1242038 1242040     yghX yghY TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1242045 1242046     exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.064 Y NA
 1242047 1242048     metC yghB FALSE 0.299 140.000 0.212 NA   NA
 1242050 1242051     yqhD dkgA FALSE 0.384 105.000 0.200 1.000   NA
 1242051 1242052     dkgA yqhG FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 1242052 1242053     yqhG yqhH FALSE 0.236 51.000 0.000 NA   NA
 1242054 1242055     ygiQ sufI FALSE 0.086 111.000 0.025 1.000 N NA
 1242055 1242056     sufI plsC FALSE 0.349 75.000 0.154 1.000 N NA
 1242056 1242057     plsC parC FALSE 0.023 234.000 0.043 1.000 N NA
 1242057 1242058     parC ygiS FALSE 0.090 138.000 0.000 1.000 N NA
 1242058 1242059     ygiS ygiT FALSE 0.118 133.000 0.000 1.000   NA
 1242059 1242060     ygiT ygiU TRUE 0.995 2.000 0.857 NA   NA
 1242060 1242061     ygiU ygiV FALSE 0.033 205.000 0.000 NA   NA
 1242061 1242062     ygiV ygiW FALSE 0.257 53.000 0.053 NA   NA
 1242063 1242064     qseB qseC TRUE 0.998 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 1242066 1242067     mdaB ygiN TRUE 0.755 31.000 0.025 0.030   NA
 1242068 1242069     parE yqiA TRUE 0.790 29.000 0.217 NA   NA
 1242069 1242070     yqiA cpdA TRUE 0.989 0.000 0.427 NA   NA
 1242070 1242071     cpdA yqiB TRUE 0.923 25.000 0.433 NA   NA
 1242071 1242072     yqiB nudF TRUE 0.988 1.000 0.443 NA   NA
 1242073 1242074     tolC ygiA TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1242074 1242075     ygiA ygiB TRUE 0.896 -16.000 0.080 NA   NA
 1242075 1242076     ygiB ygiC TRUE 0.991 6.000 0.632 NA   NA
 1242080 1242081     yqiC ygiL FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 1242081 1242082     ygiL insC FALSE 0.050 177.000 0.000 1.000 N NA
 1242082 1242083     insC insD TRUE 0.989 -42.000 0.000 0.060 Y NA
 1242083 1242084     insD yqiG TRUE 0.836 -15.000 0.000 1.000 N NA
 1242084 1242085     yqiG yqiH TRUE 0.995 16.000 0.667 1.000 Y NA
 1242085 1242086     yqiH yqiI TRUE 0.987 2.000 0.400 1.000   NA
 1242088 1242089     yqiJ yqiK TRUE 0.948 27.000 0.641 NA   NA
 1242090 1242091     rygD rfaE FALSE 0.005 420.000 0.000 NA   NA
 1242091 1242092     rfaE glnE FALSE 0.369 48.000 0.083 1.000 N NA
 1242092 1242093     glnE ygiF TRUE 0.645 23.000 0.053 1.000   NA
 1242094 1242095     htrG cca FALSE 0.276 64.000 0.106 NA N NA
 1242096 1242097     bacA folB FALSE 0.279 90.000 0.128 1.000 N NA
 1242100 1242101     ttdA ttdB TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 1242101 1242102     ttdB ygjE FALSE 0.236 48.000 0.037 1.000 N NA
 1242104 1242105     rpsU dnaG FALSE 0.151 111.000 0.067 1.000 N NA
 1242105 1242106     dnaG rpoD FALSE 0.211 195.000 0.299 1.000 N NA
 1242114 1242115     ebgR ebgA FALSE 0.113 184.000 0.136 1.000 N NA
 1242115 1242116     ebgA ebgC TRUE 0.999 -3.000 0.682 0.001 Y NA
 1242116 1242117     ebgC ygjI TRUE 0.686 63.000 0.412 1.000 N NA
 1242117 1242118     ygjI ygjJ FALSE 0.095 134.000 0.000 NA   NA
 1242118 1242119     ygjJ ygjK TRUE 0.682 17.000 0.000 NA   NA
 1242119 1242120     ygjK fadH FALSE 0.007 426.000 0.000 1.000   NA
 1242121 1242122     ygjM ygjN TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 1242122 1242123     ygjN ygjO FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 1242124 1242125     ygjP ygjQ FALSE 0.109 77.000 0.019 NA   NA
 1242125 1242126     ygjQ ygjR FALSE 0.135 61.000 0.019 NA   NA
 1242126 1242127     ygjR sraF FALSE 0.147 77.000 0.000 NA   NA
 1242127 1242128     sraF alx TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 1242128 1242129     alx sstT FALSE 0.006 399.000 0.000 1.000 N NA
 1242130 1242131     ygjV uxaA FALSE 0.293 83.000 0.126 NA   NA
 1242131 1242132     uxaA uxaC TRUE 0.972 15.000 0.092 1.000 Y NA
 1242133 1242134     exuT exuR TRUE 0.549 130.000 0.433 1.000 N NA
 1242134 1242135     exuR yqjA FALSE 0.008 345.000 0.000 NA   NA
 1242135 1242136     yqjA yqjB TRUE 0.989 4.000 0.529 NA   NA
 1242136 1242137     yqjB yqjC TRUE 0.653 147.000 0.684 NA   NA
 1242137 1242138     yqjC yqjD TRUE 0.897 38.000 0.609 NA   NA
 1242138 1242139     yqjD yqjE TRUE 0.962 3.000 0.185 NA   NA
 1242139 1242140     yqjE yqjK TRUE 0.956 -10.000 0.185 NA   NA
 1242140 1242141     yqjK yqjF FALSE 0.129 186.000 0.161 NA   NA
 1242141 1242142     yqjF yqjG FALSE 0.157 70.000 0.000 NA   NA
 1242142 1242143     yqjG yhaH FALSE 0.015 294.000 0.000 1.000   NA
 1242143 1242144     yhaH yhaI FALSE 0.077 242.000 0.000 0.077   NA
 1242146 1242147     yhaK yhaL FALSE 0.427 23.000 0.005 NA   NA
 1242148 1242149     yhaM yhaO TRUE 0.736 28.000 0.157 NA   NA
 1242149 1242150     yhaO tdcG FALSE 0.076 338.000 0.000 1.000 Y NA
 1242150 1242151     tdcG tdcF FALSE 0.320 72.000 0.150 NA N NA
 1242151 1242152     tdcF tdcE TRUE 0.684 14.000 0.000 NA N NA
 1242154 1242155     tdcD tdcC TRUE 0.874 26.000 0.308 1.000 N NA
 1242155 1242156     tdcC tdcB TRUE 0.925 22.000 0.029 1.000 Y NA
 1242156 1242157     tdcB tdcA FALSE 0.095 99.000 0.023 1.000 N NA
 1242158 1242159     tdcR yhaB FALSE 0.018 256.000 0.000 NA   NA
 1242159 1242160     yhaB yhaC TRUE 0.574 22.000 0.000 NA   NA
 1242161 1242162     rnpB garK FALSE 0.396 33.000 0.000 NA   NA
 1242162 1242163     garK garR TRUE 0.876 16.000 0.152 1.000 N NA
 1242163 1242164     garR garL TRUE 0.892 30.000 0.424 1.000 N NA
 1242164 1242165     garL garP TRUE 0.975 16.000 0.143 1.000 Y NA
 1242166 1242167     garD sohA FALSE 0.059 149.000 0.000 NA N NA
 1242167 1242168     sohA yhaV TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1242170 1242171     kbaZ agaV TRUE 0.972 23.000 0.280 1.000 Y NA
 1242171 1242172     agaV agaW TRUE 0.815 11.000 0.000 NA   NA
 1242172 1242174     agaW agaA TRUE 0.622 20.000 0.000 NA   NA
 1242174 1242175     agaA agaS FALSE 0.009 351.000 0.000 1.000   NA
 1242175 1242176     agaS kbaY TRUE 0.969 13.000 0.391 1.000 N NA
 1242176 1242177     kbaY agaB FALSE 0.447 167.000 0.087 1.000 Y NA
 1242177 1242178     agaB agaC TRUE 0.972 39.000 0.333 0.012 Y NA
 1242178 1242179     agaC agaD TRUE 0.998 -10.000 0.444 0.012 Y NA
 1242179 1242180     agaD agaI TRUE 0.989 1.000 0.080 1.000 Y NA
 1242180 1242181     agaI yraH FALSE 0.006 401.000 0.000 1.000 N NA
 1242181 1242182     yraH yraI TRUE 0.850 80.000 0.333 1.000 Y NA
 1242182 1242183     yraI yraJ TRUE 0.889 29.000 0.000 1.000 Y NA
 1242183 1242184     yraJ yraK TRUE 0.975 11.000 0.000 NA Y NA
 1242186 1242187     yraM yraN TRUE 0.946 -42.000 0.172 1.000   NA
 1242187 1242188     yraN yraO TRUE 0.863 20.000 0.187 1.000 N NA
 1242188 1242189     yraO yraP TRUE 0.989 10.000 0.613 NA   NA
 1242190 1242191     yraQ yraR FALSE 0.163 73.000 0.045 NA   NA
 1242195 1242196     yhbS yhbT TRUE 0.980 -6.000 0.295 1.000   NA
 1242197 1242198     yhbU yhbV TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 1242198 1242199     yhbV yhbW FALSE 0.109 81.000 0.041 NA N NA
 1242200 1242201     mtr deaD FALSE 0.044 154.000 0.009 1.000 N NA
 1242201 1242202     deaD nlpI FALSE 0.070 180.000 0.053 1.000   NA
 1242202 1242203     nlpI pnp FALSE 0.189 109.000 0.071 1.000   NA
 1242205 1242206     rpsO truB TRUE 0.649 149.000 0.211 1.000 Y NA
 1242206 1242207     truB rbfA TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 1242207 1242208     rbfA infB TRUE 0.794 164.000 0.530 1.000 Y NA
 1242208 1242209     infB nusA TRUE 0.897 25.000 0.342 1.000 N NA
 1242209 1242210     nusA yhbC TRUE 0.954 28.000 0.759 NA   NA
 1242210 1242211     yhbC metY FALSE 0.032 207.000 0.000 NA   NA
 1242213 1242214     yhbX leuU FALSE 0.005 459.000 0.000 NA   NA
 1242214 1242215     leuU secG TRUE 0.726 15.000 0.000 NA   NA
 1242215 1242216     secG glmM FALSE 0.016 228.000 0.016 1.000 N NA
 1242216 1242217     glmM folP TRUE 0.973 -7.000 0.260 1.000 N NA
 1242217 1242218     folP ftsH TRUE 0.529 90.000 0.325 1.000 N NA
 1242218 1242219     ftsH rrmJ FALSE 0.299 100.000 0.152 1.000 N NA
 1242223 1242224     obgE yhbE TRUE 0.680 16.000 0.015 1.000   NA
 1242224 1242225     yhbE rpmA FALSE 0.097 127.000 0.019 1.000   NA
 1242225 1242226     rpmA rplU TRUE 0.996 21.000 0.667 0.011 Y NA
 1242227 1242228     ispB sfsB FALSE 0.023 228.000 0.000 1.000 N NA
 1242229 1242230     murA yrbA TRUE 0.572 55.000 0.258 NA N NA
 1242230 1242231     yrbA yrbB TRUE 0.450 160.000 0.453 NA   NA
 1242231 1242232     yrbB yrbC TRUE 0.983 0.000 0.308 NA   NA
 1242232 1242233     yrbC yrbD TRUE 0.875 19.000 0.188 NA   NA
 1242233 1242234     yrbD yrbE TRUE 0.990 5.000 0.562 NA   NA
 1242234 1242235     yrbE yrbF TRUE 0.997 8.000 0.530 NA Y NA
 1242236 1242237     yrbG kdsD TRUE 0.934 14.000 0.226 1.000 N NA
 1242237 1242238     kdsD kdsC TRUE 0.965 21.000 0.598 1.000   NA
 1242238 1242239     kdsC yrbK TRUE 0.993 -3.000 0.617 NA   NA
 1242239 1242240     yrbK yhbN TRUE 0.982 -31.000 0.459 NA   NA
 1242240 1242241     yhbN yhbG TRUE 0.989 7.000 0.543 NA   NA
 1242241 1242242     yhbG rpoN TRUE 0.556 48.000 0.163 1.000   NA
 1242242 1242243     rpoN yhbH TRUE 0.967 23.000 0.820 NA N NA
 1242243 1242244     yhbH ptsN TRUE 0.711 118.000 0.728 NA N NA
 1242244 1242245     ptsN yhbJ TRUE 0.581 46.000 0.186 NA   NA
 1242245 1242246     yhbJ npr TRUE 0.968 -3.000 0.182 NA   NA
 1242246 1242247     npr yrbL FALSE 0.018 214.000 0.007 NA   NA
 1242248 1242249     mtgA elbB TRUE 0.919 -3.000 0.066 NA   NA
 1242251 1242252     arcB yhcC FALSE 0.278 96.000 0.113 1.000   NA
 1242253 1242254     gltB gltD TRUE 0.993 13.000 0.096 0.000 Y NA
 1242254 1242255     gltD gltF FALSE 0.004 560.000 0.000 NA   NA
 1242255 1242256     gltF yhcA FALSE 0.055 172.000 0.000 NA   NA
 1242256 1242257     yhcA yhcD TRUE 0.930 21.000 0.000 NA Y NA
 1242257 1242258     yhcD yhcE TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1242263 1242264     yhcF yhcG FALSE 0.044 185.000 0.000 NA   NA
 1242265 1242266     yhcH nanK TRUE 0.986 -3.000 0.000 NA Y NA
 1242266 1242267     nanK nanE TRUE 0.986 -3.000 0.000 NA Y NA
 1242267 1242268     nanE nanT TRUE 0.768 48.000 0.000 1.000 Y NA
 1242268 1242269     nanT nanA TRUE 0.483 109.000 0.318 1.000 N NA
 1242269 1242270     nanA nanR FALSE 0.102 122.000 0.000 1.000 N NA
 1242272 1242273     sspB sspA TRUE 0.994 6.000 0.831 NA   NA
 1242273 1242274     sspA rpsI FALSE 0.004 395.000 0.014 1.000 N NA
 1242274 1242275     rpsI rplM TRUE 0.997 16.000 0.601 0.011 Y NA
 1242275 1242276     rplM yhcM FALSE 0.016 219.000 0.003 NA   NA
 1242277 1242278     yhcB degQ FALSE 0.191 154.000 0.154 NA   NA
 1242278 1242279     degQ degS TRUE 0.913 90.000 0.262 0.002 Y NA
 1242281 1242282     argR yhcN FALSE 0.007 365.000 0.000 NA   NA
 1242283 1242284     yhcO aaeB FALSE 0.107 92.000 0.027 NA   NA
 1242284 1242285     aaeB aaeA TRUE 0.992 6.000 0.667 NA   NA
 1242285 1242286     aaeA aaeX TRUE 0.922 8.000 0.100 NA   NA
 1242288 1242289     tldD yhdP FALSE 0.006 430.000 0.050 NA   NA
 1242289 1242290     yhdP rng TRUE 0.560 68.000 0.296 NA   NA
 1242290 1242291     rng yhdE TRUE 0.982 -10.000 0.417 NA N NA
 1242291 1242292     yhdE mreD TRUE 0.953 9.000 0.206 NA N NA
 1242292 1242293     mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 1242293 1242294     mreC mreB TRUE 0.807 66.000 0.689 1.000 N NA
 1242294 1242295     mreB yhdA FALSE 0.011 305.000 0.000 1.000 N NA
 1242296 1242297     yhdH accB FALSE 0.003 978.000 0.000 1.000 N NA
 1242297 1242298     accB accC TRUE 0.997 11.000 0.275 0.000 Y NA
 1242298 1242299     accC yhdT FALSE 0.216 109.000 0.103 NA   NA
 1242299 1242300     yhdT panF TRUE 0.992 -10.000 0.682 NA   NA
 1242300 1242301     panF prmA TRUE 0.787 12.000 0.041 1.000 N NA
 1242301 1242302     prmA dusB FALSE 0.082 329.000 0.042 1.000 Y NA
 1242302 1242303     dusB fis TRUE 0.761 26.000 0.161 1.000 N NA
 1242303 1242304     fis yhdJ TRUE 0.574 86.000 0.016 1.000 Y NA
 1242304 1242305     yhdJ yhdU FALSE 0.313 84.000 0.143 NA   NA
 1242307 1242308     acrE acrF TRUE 0.991 12.000 0.889 1.000 N NA
 1242308 1242309     acrF yhdV FALSE 0.019 253.000 0.000 NA   NA
 1242309 1242310     yhdV yhdW FALSE 0.004 538.000 0.000 NA   NA
 1242310 1242311     yhdW yhdX TRUE 0.956 68.000 0.548 0.053 Y NA
 1242311 1242312     yhdX yhdY TRUE 0.999 10.000 0.815 0.013 Y NA
 1242312 1242313     yhdY yhdZ TRUE 0.998 8.000 0.734 1.000 Y NA
 1242314 1242315     rrfF thrV FALSE 0.330 38.000 0.000 NA   NA
 1242315 1242316     thrV rrfD TRUE 0.766 13.000 0.000 NA   NA
 1242316 1242317     rrfD rrlD FALSE 0.129 93.000 0.000 NA   NA
 1242317 1242318     rrlD gltV FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 1242318 1242319     gltV rrsD FALSE 0.135 86.000 0.000 NA   NA
 1242320 1242321     purH purD TRUE 0.989 12.000 0.238 1.000 Y NA
 1242322 1242323     zraR zraS TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.074 Y NA
 1242325 1242326     yjaH hupA TRUE 0.968 13.000 0.375 NA   NA
 1242326 1242327     hupA yjaG FALSE 0.280 187.000 0.355 NA   NA
 1242327 1242328     yjaG nfi FALSE 0.419 43.000 0.086 NA   NA
 1242328 1242329     nfi hemE TRUE 0.802 10.000 0.028 1.000 N NA
 1242329 1242330     hemE nudC FALSE 0.301 40.000 0.040 1.000 N NA
 1242331 1242332     rsd thiC FALSE 0.022 233.000 0.000 1.000 N NA
 1242332 1242333     thiC thiE TRUE 0.996 0.000 0.063 0.004 Y NA
 1242333 1242334     thiE thiF TRUE 0.994 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 1242334 1242335     thiF thiS TRUE 0.997 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 1242335 1242336     thiS thiG TRUE 0.989 2.000 0.087 1.000 Y NA
 1242336 1242337     thiG thiH TRUE 0.998 -3.000 0.277 0.004 Y NA
 1242338 1242339     htrC rpoC FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 1242339 1242340     rpoC rpoB TRUE 0.938 77.000 0.851 0.000   NA
 1242340 1242341     rpoB rplL FALSE 0.049 320.000 0.223 1.000   NA
 1242341 1242342     rplL rplJ TRUE 0.979 67.000 0.884 0.011 Y NA
 1242342 1242343     rplJ rplA FALSE 0.259 413.000 0.302 0.014 Y NA
 1242343 1242344     rplA rplK TRUE 0.999 4.000 0.838 0.014 Y NA
 1242344 1242345     rplK nusG TRUE 0.597 159.000 0.681 1.000 N NA
 1242345 1242346     nusG secE TRUE 0.995 2.000 0.843 1.000 N NA
 1242346 1242347     secE tufB FALSE 0.014 230.000 0.009 1.000 N NA
 1242347 1242348     tufB thrT FALSE 0.109 115.000 0.000 NA   NA
 1242348 1242349     thrT glyT TRUE 0.853 7.000 0.000 NA   NA
 1242349 1242350     glyT tyrU FALSE 0.108 117.000 0.000 NA   NA
 1242350 1242351     tyrU thrU TRUE 0.846 9.000 0.000 NA   NA
 1242353 1242354     birA murB TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 1242354 1242355     murB rrfB FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 1242355 1242356     rrfB rrlB FALSE 0.129 93.000 0.000 NA   NA
 1242356 1242357     rrlB gltT FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 1242357 1242358     gltT rrsB FALSE 0.055 172.000 0.000 NA   NA
 1242358 1242359     rrsB murI FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1242359 1242360     murI btuB TRUE 0.763 -55.000 0.025 1.000 N NA
 1242362 1242363     yijD fabR TRUE 0.970 0.000 0.194 NA   NA
 1242367 1242368     argH argB TRUE 0.655 61.000 0.017 1.000 Y NA
 1242368 1242369     argB argC TRUE 0.994 11.000 0.097 0.002 Y NA
 1242370 1242371     argE ppc FALSE 0.004 598.000 0.053 1.000 N NA
 1242371 1242372     ppc yijP FALSE 0.059 182.000 0.000 1.000   NA
 1242372 1242373     yijP yijO FALSE 0.080 215.000 0.130 1.000   NA
 1242374 1242375     frwD pflC TRUE 0.956 2.000 0.156 1.000 N NA
 1242375 1242376     pflC pflD TRUE 0.990 -34.000 0.312 0.002 N NA
 1242376 1242377     pflD frwB TRUE 0.653 51.000 0.280 1.000 N NA
 1242377 1242378     frwB frwC TRUE 0.996 15.000 0.400 0.011 Y NA
 1242379 1242380     ptsA fsaB TRUE 0.974 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1242380 1242381     fsaB gldA TRUE 0.987 11.000 0.600 1.000 N NA
 1242381 1242382     gldA yijF FALSE 0.015 275.000 0.000 NA   NA
 1242383 1242384     yijE katG FALSE 0.114 93.000 0.012 1.000   NA
 1242384 1242385     katG metF FALSE 0.006 329.000 0.010 1.000 N NA
 1242385 1242386     metF metL FALSE 0.062 349.000 0.017 1.000 Y NA
 1242386 1242387     metL metB TRUE 0.997 3.000 0.428 1.000 Y NA
 1242388 1242389     metJ yiiX FALSE 0.045 184.000 0.000 NA   NA
 1242391 1242392     priA cytR FALSE 0.045 156.000 0.013 1.000 N NA
 1242392 1242393     cytR ftsN FALSE 0.436 92.000 0.245 1.000 N NA
 1242393 1242394     ftsN hslV FALSE 0.264 93.000 0.122 1.000 N NA
 1242394 1242395     hslV hslU TRUE 0.998 10.000 0.752 1.000 Y NA
 1242395 1242396     hslU menA FALSE 0.180 67.000 0.051 1.000 N NA
 1242396 1242397     menA rraA TRUE 0.703 93.000 0.158 NA Y NA
 1242399 1242400     glpF glpK FALSE 0.416 23.000 0.004 1.000 N NA
 1242400 1242401     glpK glpX FALSE 0.072 135.000 0.025 1.000 N NA
 1242401 1242402     glpX fpr FALSE 0.251 97.000 0.117 1.000 N NA
 1242403 1242404     yiiT yiiS TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 1242404 1242405     yiiS yiiR FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 1242406 1242407     yiiQ tpiA FALSE 0.145 108.000 0.058 NA   NA
 1242408 1242409     cdh sbp FALSE 0.114 107.000 0.000 1.000 N NA
 1242409 1242410     sbp pfkA FALSE 0.011 320.000 0.049 1.000 N NA
 1242410 1242411     pfkA fieF FALSE 0.046 181.000 0.040 1.000 N NA
 1242411 1242412     fieF cpxP FALSE 0.418 149.000 0.031 NA Y NA
 1242413 1242414     cpxR cpxA TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 1242415 1242416     yiiM kdgT FALSE 0.097 149.000 0.000 1.000   NA
 1242416 1242417     kdgT sodA FALSE 0.022 260.000 0.000 1.000   NA
 1242419 1242420     rhaR rhaS TRUE 0.999 -16.000 0.800 0.019 Y NA
 1242421 1242422     rhaB rhaA TRUE 0.997 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 1242422 1242423     rhaA rhaD FALSE 0.109 451.000 0.247 1.000 Y NA
 1242423 1242424     rhaD yiiL TRUE 0.921 10.000 0.112 NA   NA
 1242424 1242425     yiiL frvA FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 1242425 1242426     frvA frvB TRUE 0.990 11.000 0.000 0.011 Y NA
 1242426 1242427     frvB frvX TRUE 0.998 -10.000 0.667 1.000 Y NA
 1242427 1242428     frvX frvR TRUE 0.987 0.000 0.400 1.000 N NA
 1242429 1242430     yiiG fdhD FALSE 0.134 153.000 0.080 1.000   NA
 1242431 1242432     fdoG fdoH TRUE 0.999 13.000 0.833 0.001 Y NA
 1242432 1242433     fdoH fdoI TRUE 1.000 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 1242433 1242434     fdoI fdhE TRUE 0.963 -3.000 0.182 NA N NA
 1242435 1242436     yiiF yiiE FALSE 0.021 242.000 0.000 NA   NA
 1242436 1242437     yiiE yiiD FALSE 0.004 853.000 0.000 1.000   NA
 1242437 1242438     yiiD dtd TRUE 0.931 -3.000 0.065 1.000   NA
 1242438 1242439     dtd rbn TRUE 0.934 -3.000 0.069 1.000   NA
 1242439 1242440     rbn yihX TRUE 0.895 -6.000 0.000 1.000   NA
 1242440 1242441     yihX yihW FALSE 0.152 99.000 0.000 1.000   NA
 1242441 1242442     yihW yihV TRUE 0.859 34.000 0.000 1.000 Y NA
 1242443 1242444     yihU yihT TRUE 0.861 24.000 0.250 1.000 N NA
 1242444 1242445     yihT yihS TRUE 0.957 17.000 0.051 1.000 Y NA
 1242445 1242446     yihS yihR TRUE 0.525 114.000 0.026 1.000 Y NA
 1242446 1242447     yihR yihQ TRUE 0.489 199.000 0.000 0.004 Y NA
 1242447 1242448     yihQ yihP TRUE 0.973 25.000 0.333 1.000 Y NA
 1242448 1242449     yihP yihO TRUE 0.988 43.000 0.750 0.004 Y NA
 1242449 1242450     yihO ompL TRUE 0.792 68.000 0.625 1.000   NA
 1242451 1242452     yihN yihM TRUE 0.789 102.000 0.833 NA   NA
 1242452 1242453     yihM yihL TRUE 0.993 8.000 0.800 NA   NA
 1242453 1242454     yihL bipA FALSE 0.103 217.000 0.000 0.041 N NA
 1242455 1242456     glnA glnL FALSE 0.016 286.000 0.053 1.000 N NA
 1242456 1242457     glnL glnG TRUE 0.998 12.000 0.587 0.067 Y NA
 1242458 1242459     hemN yihI FALSE 0.088 189.000 0.107 NA   NA
 1242459 1242460     yihI csrC FALSE 0.163 67.000 0.000 NA   NA
 1242462 1242463     spf polA FALSE 0.082 147.000 0.000 NA   NA
 1242465 1242466     yihF dsbA FALSE 0.070 155.000 0.000 NA   NA
 1242466 1242467     dsbA yihE TRUE 0.829 17.000 0.111 NA   NA
 1242467 1242468     yihE yihD FALSE 0.274 77.000 0.106 NA   NA
 1242469 1242470     mobA mobB TRUE 0.996 -3.000 0.064 0.003 Y NA
 1242471 1242472     rrfA rrlA FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 1242472 1242473     rrlA alaT FALSE 0.045 184.000 0.000 NA   NA
 1242473 1242474     alaT ileT FALSE 0.283 43.000 0.000 NA   NA
 1242474 1242475     ileT rrsA FALSE 0.158 69.000 0.000 NA   NA
 1242475 1242476     rrsA hemG FALSE 0.006 378.000 0.000 NA   NA
 1242476 1242477     hemG trkH TRUE 0.978 12.000 0.455 1.000 N NA
 1242477 1242478     trkH yigZ TRUE 0.685 39.000 0.202 1.000   NA
 1242478 1242479     yigZ pepQ TRUE 0.959 0.000 0.127 1.000   NA
 1242480 1242481     fadB fadA TRUE 0.997 10.000 0.607 1.000 Y NA
 1242482 1242483     fre ubiD TRUE 0.811 46.000 0.090 NA Y NA
 1242485 1242486     tatD tatC TRUE 0.463 42.000 0.121 NA N NA
 1242486 1242487     tatC tatB TRUE 0.995 3.000 0.333 NA Y NA
 1242487 1242488     tatB tatA TRUE 0.997 4.000 0.188 0.004 Y NA
 1242488 1242489     tatA ubiB FALSE 0.158 79.000 0.032 1.000   NA
 1242489 1242490     ubiB yigP TRUE 0.990 -3.000 0.432 1.000   NA
 1242490 1242491     yigP ubiE TRUE 0.906 14.000 0.145 1.000   NA
 1242491 1242492     ubiE rmuC FALSE 0.138 95.000 0.047 NA   NA
 1242492 1242493     rmuC udp FALSE 0.088 141.000 0.041 NA   NA
 1242497 1242498     yigM yigL FALSE 0.231 76.000 0.067 1.000   NA
 1242498 1242499     yigL pldB TRUE 0.989 8.000 0.524 1.000   NA
 1242501 1242502     rhtC recQ FALSE 0.173 64.000 0.043 1.000 N NA
 1242502 1242503     recQ pldA FALSE 0.118 133.000 0.057 1.000 N NA
 1242504 1242505     yigI rarD FALSE 0.384 52.000 0.099 NA   NA
 1242505 1242506     rarD yigG FALSE 0.081 95.000 0.006 NA   NA
 1242506 1242507     yigG yigF TRUE 0.923 14.000 0.200 NA   NA
 1242510 1242511     uvrD yigB FALSE 0.322 84.000 0.128 1.000   NA
 1242511 1242512     yigB xerC TRUE 0.987 0.000 0.367 1.000   NA
 1242512 1242513     xerC yigA TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 1242513 1242514     yigA dapF TRUE 0.966 -3.000 0.175 NA   NA
 1242514 1242515     dapF yifL FALSE 0.206 37.000 0.021 NA N NA
 1242515 1242516     yifL yzcX FALSE 0.043 187.000 0.000 NA   NA
 1242519 1242520     hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 1242520 1242521     hemD hemX TRUE 0.989 22.000 0.600 1.000 Y NA
 1242521 1242522     hemX hemY TRUE 0.991 3.000 0.144 1.000 Y NA
 1242525 1242526     aslB proM FALSE 0.082 147.000 0.000 NA   NA
 1242526 1242527     proM leuT FALSE 0.283 43.000 0.000 NA   NA
 1242527 1242528     leuT hisR TRUE 0.598 21.000 0.000 NA   NA
 1242528 1242529     hisR argX FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 1242529 1242530     argX yifK FALSE 0.122 103.000 0.000 NA   NA
 1242530 1242531     yifK rffM FALSE 0.040 191.000 0.000 1.000 N NA
 1242531 1242532     rffM wzyE TRUE 0.951 3.000 0.126 1.000   NA
 1242532 1242533     wzyE rffT TRUE 0.995 -3.000 0.684 1.000   NA
 1242533 1242534     rffT wzxE TRUE 0.994 -3.000 0.605 1.000   NA
 1242534 1242535     wzxE rffA TRUE 0.973 2.000 0.218 1.000   NA
 1242535 1242536     rffA rffC TRUE 0.973 5.000 0.248 1.000   NA
 1242536 1242537     rffC rffH FALSE 0.305 107.000 0.145 1.000   NA
 1242537 1242538     rffH rffG TRUE 0.997 19.000 0.739 0.002 Y NA
 1242538 1242539     rffG rffD TRUE 0.995 0.000 0.273 1.000 Y NA
 1242539 1242540     rffD rffE TRUE 0.997 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 1242540 1242541     rffE wzzE TRUE 0.980 56.000 0.677 0.004 Y NA
 1242541 1242542     wzzE rfe TRUE 0.999 12.000 0.735 0.004 Y NA
 1242542 1242543     rfe rho FALSE 0.021 240.000 0.000 1.000 N NA
 1242543 1242544     rho rhoL FALSE 0.086 85.000 0.002 NA   NA
 1242544 1242545     rhoL trxA FALSE 0.054 141.000 0.004 NA   NA
 1242546 1242547     rhlB gpp TRUE 0.511 136.000 0.406 1.000 N NA
 1242549 1242551     yifN yifO TRUE 0.814 -45.000 0.000 NA   NA
 1242551 1242552     yifO ppiC FALSE 0.036 199.000 0.000 NA   NA
 1242555 1242556     ilvA ilvD TRUE 0.989 3.000 0.106 1.000 Y NA
 1242556 1242557     ilvD ilvE TRUE 0.705 65.000 0.075 1.000 Y NA
 1242557 1242558     ilvE ilvM TRUE 0.885 20.000 0.205 1.000   NA
 1242558 1242559     ilvM ilvG TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1242559 1242563     ilvG ilvL FALSE 0.089 140.000 0.000 NA   NA
 1242567 1242568     trpT aspT TRUE 0.846 9.000 0.000 NA   NA
 1242568 1242569     aspT rrfC FALSE 0.223 53.000 0.000 NA   NA
 1242569 1242570     rrfC rrlC FALSE 0.129 93.000 0.000 NA   NA
 1242570 1242571     rrlC gltU FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 1242571 1242572     gltU rrsC FALSE 0.135 86.000 0.000 NA   NA
 1242573 1242574     yieP hsrA TRUE 0.750 23.000 0.100 1.000   NA
 1242575 1242576     rbsR rbsK TRUE 0.988 4.000 0.500 1.000 N NA
 1242576 1242577     rbsK rbsB TRUE 0.793 126.000 0.347 NA Y NA
 1242577 1242578     rbsB rbsC TRUE 0.990 25.000 0.847 NA Y NA
 1242578 1242579     rbsC rbsA TRUE 0.997 5.000 0.504 1.000 Y NA
 1242579 1242580     rbsA rbsD TRUE 0.995 8.000 0.337 1.000 Y NA
 1242580 1242581     rbsD trkD FALSE 0.058 167.000 0.000 1.000 N NA
 1242582 1242583     yieN yieM TRUE 0.987 -6.000 0.443 NA   NA
 1242585 1242586     asnC mioC FALSE 0.328 90.000 0.165 1.000 N NA
 1242587 1242588     gidA gidB TRUE 0.711 64.000 0.466 1.000 N NA
 1242588 1242589     gidB atpI FALSE 0.002 617.000 0.005 1.000 N NA
 1242589 1242590     atpI atpB TRUE 0.997 9.000 0.291 0.003 Y NA
 1242590 1242591     atpB atpE TRUE 0.981 47.000 0.557 0.003 Y NA
 1242591 1242592     atpE atpF TRUE 0.976 62.000 0.666 0.002 Y NA
 1242592 1242593     atpF atpH TRUE 0.994 15.000 0.242 0.002 Y NA
 1242593 1242594     atpH atpA TRUE 0.999 13.000 0.864 0.002 Y NA
 1242594 1242595     atpA atpG TRUE 0.988 51.000 0.846 0.002 Y NA
 1242595 1242596     atpG atpD TRUE 0.995 27.000 0.724 0.002 Y NA
 1242596 1242597     atpD atpC TRUE 0.997 21.000 0.837 0.002 Y NA
 1242597 1242598     atpC glmU FALSE 0.011 353.000 0.067 1.000 N NA
 1242598 1242599     glmU glmS FALSE 0.423 162.000 0.055 1.000 Y NA
 1242599 1242600     glmS pstS FALSE 0.010 314.000 0.000 1.000 N NA
 1242600 1242601     pstS pstC TRUE 0.881 87.000 0.145 0.001 Y NA
 1242601 1242602     pstC pstA TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 1242602 1242603     pstA pstB TRUE 0.882 183.000 0.526 0.001 Y NA
 1242603 1242604     pstB phoU TRUE 0.987 15.000 0.317 NA Y NA
 1242604 1242605     phoU bglG FALSE 0.013 286.000 0.000 NA   NA
 1242605 1242606     bglG bglF TRUE 0.453 134.000 0.312 1.000   NA
 1242606 1242607     bglF bglB TRUE 0.991 19.000 0.562 1.000 Y NA
 1242607 1242608     bglB bglH TRUE 0.876 69.000 0.364 1.000 Y NA
 1242608 1242609     bglH yieL TRUE 0.979 0.000 0.267 1.000 N NA
 1242609 1242610     yieL yieK TRUE 0.814 15.000 0.080 1.000 N NA
 1242611 1242612     cbrC yieI FALSE 0.248 49.000 0.000 NA   NA
 1242612 1242613     yieI yieH FALSE 0.163 67.000 0.000 NA   NA
 1242615 1242616     yieF yieE TRUE 0.680 22.000 0.074 NA   NA
 1242616 1242617     yieE insD FALSE 0.095 132.000 0.000 1.000 N NA
 1242617 1242618     insD insC TRUE 0.989 -60.000 0.000 0.058 Y NA
 1242618 1242619     insC yidZ FALSE 0.103 121.000 0.000 1.000 N NA
 1242619 1242620     yidZ mdtL TRUE 0.985 -25.000 0.526 1.000 N NA
 1242620 1242621     mdtL tnaB FALSE 0.120 132.000 0.000 1.000   NA
 1242623 1242624     tnaB tnaA TRUE 0.720 91.000 0.154 1.000 Y NA
 1242626 1242627     tnaC trmE FALSE 0.026 243.000 0.000 1.000   NA
 1242627 1242628     trmE yidC FALSE 0.411 106.000 0.221 1.000   NA
 1242628 1242629     yidC yidD TRUE 0.988 3.000 0.461 NA   NA
 1242629 1242630     yidD rnpA TRUE 0.985 -36.000 0.540 NA   NA
 1242630 1242631     rnpA rpmH TRUE 0.982 17.000 0.787 1.000   NA
 1242632 1242633     dnaA dnaN TRUE 0.995 5.000 0.328 1.000 Y NA
 1242633 1242634     dnaN recF TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 1242634 1242635     recF gyrB TRUE 0.981 29.000 0.249 0.003 Y NA
 1242635 1242636     gyrB yidB FALSE 0.021 240.000 0.000 NA   NA
 1242636 1242637     yidB yidA FALSE 0.109 115.000 0.000 NA   NA
 1242639 1242640     dgoR dgoK TRUE 0.994 -3.000 0.733 1.000 N NA
 1242640 1242641     dgoK dgoA TRUE 0.998 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 1242641 1242642     dgoA dgoD TRUE 0.994 -3.000 0.385 0.019 N NA
 1242642 1242643     dgoD dgoT FALSE 0.316 120.000 0.192 1.000 N NA
 1242647 1242648     ibpA ibpB TRUE 0.608 112.000 0.099 NA Y NA
 1242648 1242649     ibpB yidE FALSE 0.038 196.000 0.000 NA   NA
 1242651 1242652     glvC glvB TRUE 0.964 25.000 0.055 0.011 Y NA
 1242652 1242653     glvB glvG TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1242653 1242655     glvG ysdC TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1242658 1242659     yidK yidJ TRUE 0.979 -3.000 0.235 1.000   NA
 1242661 1242662     yidH yidG TRUE 0.989 -10.000 0.571 NA   NA
 1242662 1242663     yidG yidF TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 1242665 1242666     ivbL ilvB FALSE 0.378 106.000 0.216 NA   NA
 1242666 1242667     ilvB ilvN TRUE 0.997 4.000 0.649 0.001   NA
 1242667 1242668     ilvN uhpA FALSE 0.324 76.000 0.118 1.000   NA
 1242668 1242669     uhpA uhpB TRUE 0.995 0.000 0.000 0.012 Y NA
 1242669 1242670     uhpB uhpC TRUE 0.946 10.000 0.000 0.074 N NA
 1242670 1242671     uhpC uhpT TRUE 0.676 138.000 0.000 0.052 Y NA
 1242673 1242674     yicO yicN FALSE 0.223 53.000 0.000 NA   NA
 1242674 1242675     yicN yicM TRUE 0.662 46.000 0.250 NA   NA
 1242678 1242679     yicL setC TRUE 0.700 111.000 0.000 0.074 Y NA
 1242679 1242680     setC selC FALSE 0.004 637.000 0.000 NA   NA
 1242681 1242682     yicJ yicI TRUE 0.980 10.000 0.000 1.000 Y NA
 1242683 1242684     yicH yicE FALSE 0.396 121.000 0.257 NA   NA
 1242686 1242687     recG trmH TRUE 0.903 6.000 0.076 1.000 N NA
 1242687 1242688     trmH spoT TRUE 0.920 7.000 0.095 1.000 N NA
 1242688 1242689     spoT rpoZ TRUE 0.981 19.000 0.291 1.000 Y NA
 1242689 1242690     rpoZ gmk TRUE 0.764 55.000 0.471 1.000 N NA
 1242692 1242693     yicG dinD FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 1242693 1242694     dinD yicC FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 1242695 1242697     rph pyrE FALSE 0.127 95.000 0.000 NA   NA
 1242698 1242699     ttk dut FALSE 0.148 107.000 0.060 1.000 N NA
 1242699 1242700     dut dfp TRUE 0.953 -19.000 0.201 1.000 N NA
 1242701 1242702     yicR rpmB FALSE 0.016 217.000 0.002 1.000 N NA
 1242702 1242703     rpmB rpmG TRUE 0.991 21.000 0.332 0.011 Y NA
 1242703 1242704     rpmG mutM FALSE 0.111 98.000 0.034 1.000 N NA
 1242705 1242706     coaD kdtA TRUE 0.800 8.000 0.020 1.000 N NA
 1242707 1242708     rfaQ rfaG TRUE 0.990 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 1242708 1242709     rfaG rfaP TRUE 0.889 -7.000 0.000 1.000   NA
 1242709 1242710     rfaP rfaS FALSE 0.346 37.000 0.000 NA   NA
 1242710 1242711     rfaS rfaB TRUE 0.870 14.000 0.111 NA   NA
 1242711 1242712     rfaB rfaI TRUE 0.993 0.000 0.167 1.000 Y NA
 1242712 1242713     rfaI rfaJ TRUE 0.992 40.000 0.833 0.001 Y NA
 1242713 1242714     rfaJ rfaY TRUE 0.952 18.000 0.375 1.000   NA
 1242714 1242715     rfaY rfaZ FALSE 0.450 71.000 0.214 NA   NA
 1242715 1242716     rfaZ rfaK FALSE 0.396 33.000 0.000 NA   NA
 1242717 1242718     rfaL rfaC TRUE 0.976 10.000 0.024 NA Y NA
 1242718 1242719     rfaC rfaF TRUE 0.997 4.000 0.205 0.001 Y NA
 1242719 1242720     rfaF rfaD TRUE 0.988 10.000 0.146 1.000 Y NA
 1242721 1242722     htrL kbl FALSE 0.015 275.000 0.000 NA   NA
 1242722 1242723     kbl tdh TRUE 0.987 10.000 0.547 1.000 N NA
 1242723 1242724     tdh yibD FALSE 0.016 239.000 0.000 NA N NA
 1242725 1242726     yibQ envC TRUE 0.933 4.000 0.088 1.000   NA
 1242726 1242727     envC gpmI TRUE 0.680 34.000 0.170 1.000 N NA
 1242728 1242729     yibN grxC FALSE 0.074 142.000 0.048 NA N NA
 1242729 1242730     grxC secB FALSE 0.164 63.000 0.038 1.000 N NA
 1242730 1242731     secB gpsA TRUE 0.971 0.000 0.206 1.000 N NA
 1242731 1242732     gpsA cysE TRUE 0.643 80.000 0.429 1.000 N NA
 1242733 1242734     yibK lldD FALSE 0.026 198.000 0.020 1.000 N NA
 1242734 1242735     lldD lldR TRUE 0.983 -3.000 0.309 1.000 N NA
 1242735 1242736     lldR lldP TRUE 0.994 0.000 0.652 1.000 N NA
 1242736 1242737     lldP yibL FALSE 0.006 372.000 0.000 NA   NA
 1242739 1242740     mtlR mtlD TRUE 0.972 0.000 0.230 NA N NA
 1242740 1242741     mtlD mtlA FALSE 0.411 230.000 0.292 1.000 Y NA
 1242742 1242743     yibI yibH TRUE 0.990 3.000 0.556 NA   NA
 1242744 1242745     yibG yibJ FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 1242745 1242746     yibJ yibA FALSE 0.293 42.000 0.000 NA   NA
 1242746 1242747     yibA rhsA TRUE 0.524 21.000 0.000 NA N NA
 1242748 1242749     yibF selA FALSE 0.119 98.000 0.040 1.000 N NA
 1242749 1242750     selA selB TRUE 0.997 -3.000 0.569 0.000 N NA
 1242750 1242751     selB yiaY FALSE 0.028 190.000 0.015 1.000 N NA
 1242751 1242752     yiaY aldB TRUE 0.569 165.000 0.032 0.046 Y NA
 1242752 1242753     aldB yiaW FALSE 0.004 545.000 0.000 NA   NA
 1242753 1242754     yiaW yiaV TRUE 0.855 6.000 0.000 NA   NA
 1242757 1242758     sgbE sgbU TRUE 0.993 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 1242758 1242759     sgbU sgbH TRUE 0.996 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 1242759 1242760     sgbH lyxK TRUE 0.999 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 1242760 1242761     lyxK yiaO TRUE 0.984 4.000 0.000 1.000 Y NA
 1242761 1242762     yiaO yiaN TRUE 0.970 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1242762 1242763     yiaN yiaM TRUE 0.998 3.000 0.864 NA Y NA
 1242763 1242764     yiaM yiaL TRUE 0.516 118.000 0.000 NA Y NA
 1242764 1242765     yiaL yiaK TRUE 0.736 12.000 0.000 NA N NA
 1242766 1242767     yiaJ yiaI TRUE 0.580 102.000 0.400 1.000 N NA
 1242768 1242769     avtA malS FALSE 0.086 178.000 0.085 1.000 N NA
 1242771 1242772     xylR xylH FALSE 0.330 78.000 0.146 1.000 N NA
 1242772 1242773     xylH xylG TRUE 0.996 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 1242773 1242774     xylG xylF TRUE 0.898 78.000 0.518 NA Y NA
 1242775 1242776     xylA xylB TRUE 0.629 72.000 0.034 1.000 Y NA
 1242776 1242777     xylB yiaB FALSE 0.148 169.000 0.143 NA   NA
 1242777 1242778     yiaB yiaA FALSE 0.239 46.000 0.032 NA   NA
 1242780 1242781     ysaB glyQ FALSE 0.084 95.000 0.010 NA   NA
 1242781 1242782     glyQ glyS TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 1242783 1242784     insK insJ TRUE 0.998 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 1242786 1242787     cspA yiaG FALSE 0.123 281.000 0.000 1.000 Y NA
 1242789 1242790     tiaE yiaD FALSE 0.119 104.000 0.000 1.000 N NA
 1242792 1242793     yiaC tag TRUE 0.895 -3.000 0.028 1.000   NA
 1242794 1242795     yhjY yhjX FALSE 0.023 229.000 0.000 1.000 N NA
 1242795 1242796     yhjX eptB FALSE 0.036 324.000 0.000 0.074   NA
 1242796 1242797     eptB proK FALSE 0.130 92.000 0.000 NA   NA
 1242797 1242798     proK dppA FALSE 0.003 911.000 0.000 NA   NA
 1242798 1242799     dppA dppB FALSE 0.223 308.000 0.087 0.052 Y NA
 1242799 1242800     dppB dppC TRUE 0.999 10.000 0.779 0.052 Y NA
 1242800 1242801     dppC dppD TRUE 0.996 11.000 0.560 1.000 Y NA
 1242801 1242802     dppD dppF TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 1242803 1242804     yhjV rdlD FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 1242806 1242807     bcsG bcsF TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1242807 1242808     bcsF bcsE TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1242809 1242810     yhjR yhjQ FALSE 0.360 36.000 0.000 NA   NA
 1242810 1242812     yhjQ bcsA TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1242812 1242813     bcsA bcsB TRUE 0.970 11.000 0.000 0.001   NA
 1242813 1242814     bcsB bcsZ TRUE 0.880 7.000 0.000 1.000   NA
 1242814 1242815     bcsZ bcsC TRUE 0.966 -18.000 0.263 1.000 N NA
 1242815 1242816     bcsC yhjK FALSE 0.177 121.000 0.088 1.000 N NA
 1242816 1242817     yhjK dctA FALSE 0.326 183.000 0.229 0.084 N NA
 1242817 1242818     dctA yhjJ FALSE 0.054 221.000 0.088 1.000   NA
 1242820 1242821     yhjH yhjG FALSE 0.166 55.000 0.000 NA N NA
 1242822 1242823     yhjE yhjD FALSE 0.007 411.000 0.000 1.000   NA
 1242823 1242824     yhjD yhjC FALSE 0.441 49.000 0.098 1.000   NA
 1242827 1242828     yhjA gadA FALSE 0.029 211.000 0.000 1.000 N NA
 1242828 1242829     gadA gadX FALSE 0.006 370.000 0.000 1.000 N NA
 1242832 1242833     mdtF mdtE TRUE 0.511 25.000 0.000 1.000 N NA
 1242833 1242834     mdtE gadE FALSE 0.010 339.000 0.000 1.000   NA
 1242834 1242835     gadE hdeD FALSE 0.003 799.000 0.000 NA   NA
 1242836 1242837     hdeA hdeB FALSE 0.108 116.000 0.000 NA   NA
 1242837 1242838     hdeB yhiD FALSE 0.172 64.000 0.000 NA   NA
 1242839 1242840     yhiF slp FALSE 0.067 156.000 0.000 1.000 N NA
 1242842 1242843     yhiS arsC FALSE 0.004 629.000 0.000 NA   NA
 1242843 1242844     arsC arsB TRUE 0.970 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1242844 1242845     arsB arsR FALSE 0.213 54.000 0.000 1.000 N NA
 1242845 1242846     arsR gor FALSE 0.003 877.000 0.000 1.000 N NA
 1242846 1242847     gor yhiR FALSE 0.307 72.000 0.100 1.000   NA
 1242848 1242849     prlC yhiQ TRUE 0.921 8.000 0.098 NA   NA
 1242850 1242851     yhiP uspA FALSE 0.010 317.000 0.000 1.000 N NA
 1242856 1242857     yhiL yhiK TRUE 0.828 -24.000 0.000 NA   NA
 1242857 1242859     yhiK yhiJ FALSE 0.017 262.000 0.000 NA   NA
 1242859 1242860     yhiJ yhiI FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 1242860 1242861     yhiI rbbA TRUE 0.970 -3.000 0.049 0.084   NA
 1242861 1242862     rbbA yhhJ TRUE 0.997 0.000 0.500 0.004   NA
 1242863 1242864     yhhI yrhC FALSE 0.020 246.000 0.000 NA   NA
 1242864 1242866     yrhC yhhH FALSE 0.120 105.000 0.000 NA   NA
 1242866 1242867     yhhH rhsB TRUE 0.823 -28.000 0.000 NA   NA
 1242867 1242868     rhsB nikR FALSE 0.026 203.000 0.000 NA N NA
 1242868 1242869     nikR nikE TRUE 0.830 6.000 0.031 1.000 N NA
 1242869 1242870     nikE nikD TRUE 0.998 -3.000 0.290 0.071 Y NA
 1242870 1242871     nikD nikC TRUE 0.997 0.000 0.409 1.000 Y NA
 1242871 1242872     nikC nikB TRUE 0.999 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 1242872 1242873     nikB nikA TRUE 0.999 0.000 0.833 0.061 Y NA
 1242873 1242874     nikA acpT FALSE 0.109 111.000 0.000 1.000 N NA
 1242874 1242875     acpT yhhT TRUE 0.644 55.000 0.300 NA   NA
 1242877 1242878     dcrB yhhQ FALSE 0.204 73.000 0.066 NA   NA
 1242880 1242881     zntA yhhN TRUE 0.742 74.000 0.325 0.073   NA
 1242883 1242884     yhhL yhhF TRUE 0.887 -10.000 0.063 NA   NA
 1242885 1242886     ftsY ftsE TRUE 0.975 3.000 0.117 0.071 N NA
 1242886 1242887     ftsE ftsX TRUE 0.990 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 1242887 1242888     ftsX rpoH FALSE 0.023 245.000 0.051 1.000 N NA
 1242888 1242889     rpoH livJ FALSE 0.015 271.000 0.000 1.000 N NA
 1242891 1242892     livK livH TRUE 0.883 48.000 0.217 1.000 Y NA
 1242892 1242893     livH livM TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.052 Y NA
 1242893 1242894     livM livG TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 1242894 1242895     livG livF TRUE 0.999 2.000 0.967 0.013 Y NA
 1242895 1242896     livF ugpB FALSE 0.006 399.000 0.000 1.000 N NA
 1242896 1242897     ugpB ugpA TRUE 0.962 98.000 0.793 0.052 Y NA
 1242897 1242898     ugpA ugpE TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.052 Y NA
 1242898 1242899     ugpE ugpC TRUE 0.997 2.000 0.272 0.052 Y NA
 1242899 1242900     ugpC ugpQ TRUE 0.930 -3.000 0.080 1.000 N NA
 1242903 1242904     yrhB insB FALSE 0.004 579.000 0.000 NA   NA
 1242904 1242905     insB insA TRUE 0.989 -81.000 0.000 0.014 Y NA
 1242905 1242906     insA yrhA TRUE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 1242906 1242907     yrhA yhhZ TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 1242907 1242908     yhhZ yhhY FALSE 0.028 237.000 0.000 1.000   NA
 1242909 1242910     ryhB yhhX FALSE 0.107 118.000 0.000 NA   NA
 1242910 1242911     yhhX yhhW TRUE 0.537 123.000 0.400 NA   NA
 1242911 1242912     yhhW gntR FALSE 0.024 224.000 0.000 NA   NA
 1242912 1242913     gntR gntK FALSE 0.088 139.000 0.000 1.000 N NA
 1242913 1242914     gntK gntU TRUE 0.984 4.000 0.000 1.000 Y NA
 1242916 1242917     asd glgB FALSE 0.015 273.000 0.000 1.000 N NA
 1242917 1242918     glgB glgX TRUE 0.995 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 1242918 1242919     glgX glgC TRUE 0.979 18.000 0.228 1.000 Y NA
 1242919 1242920     glgC glgA TRUE 0.996 0.000 0.307 1.000 Y NA
 1242920 1242921     glgA glgP TRUE 0.977 19.000 0.228 1.000 Y NA
 1242921 1242922     glgP yzgL FALSE 0.070 129.000 0.016 NA   NA
 1242924 1242925     glpE glpG TRUE 0.806 45.000 0.405 1.000   NA
 1242925 1242926     glpG glpR TRUE 0.904 17.000 0.190 1.000   NA
 1242928 1242929     rtcB rtcA TRUE 0.915 4.000 0.081 NA   NA
 1242931 1242932     malP malQ TRUE 0.994 10.000 0.137 0.017 Y NA
 1242933 1242934     gntT gntY FALSE 0.009 360.000 0.000 1.000   NA
 1242934 1242935     gntY gntX FALSE 0.284 59.000 0.066 1.000   NA
 1242937 1242938     yhgA yhgG FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 1242938 1242939     yhgG feoB TRUE 0.989 0.000 0.455 NA   NA
 1242939 1242940     feoB feoA TRUE 0.976 17.000 0.177 1.000 Y NA
 1242940 1242941     feoA yhgF FALSE 0.005 457.000 0.000 1.000 N NA
 1242941 1242942     yhgF greB TRUE 0.685 97.000 0.123 1.000 Y NA
 1242943 1242944     ompR envZ TRUE 0.998 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 1242947 1242948     hslO hslR TRUE 0.746 25.000 0.140 1.000 N NA
 1242948 1242949     hslR yrfG TRUE 0.872 11.000 0.056 1.000   NA
 1242949 1242950     yrfG yrfF FALSE 0.367 65.000 0.122 1.000   NA
 1242953 1242954     yrfD yrfC TRUE 0.996 0.000 0.870 NA   NA
 1242954 1242955     yrfC yrfB TRUE 0.977 -16.000 0.348 NA   NA
 1242955 1242956     yrfB yrfA TRUE 0.985 -10.000 0.444 NA   NA
 1242956 1242957     yrfA hofQ TRUE 0.864 -88.000 0.072 NA   NA
 1242957 1242958     hofQ aroK FALSE 0.040 401.000 0.319 1.000 N NA
 1242958 1242959     aroK aroB TRUE 0.843 57.000 0.208 1.000 Y NA
 1242959 1242960     aroB damX FALSE 0.099 92.000 0.022 NA   NA
 1242960 1242961     damX dam FALSE 0.401 107.000 0.234 NA   NA
 1242961 1242962     dam rpe TRUE 0.651 18.000 0.040 1.000 N NA
 1242962 1242963     rpe gph TRUE 0.947 -7.000 0.120 1.000   NA
 1242963 1242964     gph trpS TRUE 0.946 -7.000 0.118 1.000   NA
 1242964 1242965     trpS yhfZ FALSE 0.008 290.000 0.004 NA   NA
 1242965 1242966     yhfZ yhfY TRUE 0.971 17.000 0.562 NA   NA
 1242966 1242967     yhfY yhfX FALSE 0.446 84.000 0.233 NA   NA
 1242967 1242968     yhfX yhfW TRUE 0.993 0.000 0.625 NA N NA
 1242968 1242969     yhfW php TRUE 0.949 -3.000 0.094 1.000   NA
 1242969 1242970     php yhfU TRUE 0.972 11.000 0.312 1.000   NA
 1242970 1242971     yhfU yhfT TRUE 0.990 12.000 0.828 NA   NA
 1242971 1242972     yhfT yhfS TRUE 0.935 12.000 0.185 NA   NA
 1242973 1242974     frlR frlD FALSE 0.426 100.000 0.267 NA N NA
 1242974 1242975     frlD frlC TRUE 0.994 -3.000 0.200 NA Y NA
 1242975 1242976     frlC frlB TRUE 0.834 50.000 0.600 NA N NA
 1242976 1242977     frlB frlA TRUE 0.931 21.000 0.375 1.000 N NA
 1242977 1242978     frlA yhfL FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 1242978 1242979     yhfL cysG FALSE 0.020 247.000 0.000 NA   NA
 1242979 1242980     cysG nirC TRUE 0.636 19.000 0.000 1.000 N NA
 1242980 1242981     nirC nirD TRUE 0.765 126.000 0.283 1.000 Y NA
 1242981 1242982     nirD nirB TRUE 0.998 -3.000 0.829 0.000 N NA
 1242982 1242983     nirB tsgA FALSE 0.016 262.000 0.000 1.000 N NA
 1242984 1242985     ppiA yhfG TRUE 0.548 105.000 0.364 NA   NA
 1242985 1242986     yhfG fic TRUE 0.851 -10.000 0.000 NA   NA
 1242986 1242987     fic pabA FALSE 0.291 32.000 0.008 1.000 N NA
 1242987 1242988     pabA argD TRUE 0.667 86.000 0.088 1.000 Y NA
 1242989 1242990     yhfK crp TRUE 0.553 39.000 0.111 1.000   NA
 1242992 1242993     prkB yheU TRUE 0.655 54.000 0.303 NA   NA
 1242993 1242994     yheU yheT TRUE 0.970 -6.000 0.222 NA   NA
 1242994 1242995     yheT yheS TRUE 0.845 0.000 0.016 NA   NA
 1242996 1242997     kefG kefB TRUE 0.996 0.000 0.927 1.000   NA
 1242997 1242998     kefB yheV TRUE 0.981 10.000 0.400 NA   NA
 1242998 1242999     yheV slyD TRUE 0.568 95.000 0.370 NA   NA
 1243001 1243002     fkpA yheO FALSE 0.311 167.000 0.310 NA   NA
 1243002 1243003     yheO yheN TRUE 0.974 0.000 0.220 NA   NA
 1243003 1243004     yheN yheM TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 1243004 1243005     yheM yheL TRUE 0.998 8.000 0.804 NA Y NA
 1243005 1243006     yheL rpsL FALSE 0.105 126.000 0.058 NA N NA
 1243006 1243007     rpsL rpsG TRUE 0.962 97.000 0.620 0.002 Y NA
 1243007 1243008     rpsG fusA TRUE 0.983 28.000 0.579 1.000 Y NA
 1243008 1243009     fusA tufA TRUE 0.955 71.000 0.400 0.001 Y NA
 1243009 1243010     tufA chiA FALSE 0.016 292.000 0.000 1.000   NA
 1243010 1243011     chiA bfd FALSE 0.058 169.000 0.000 NA   NA
 1243011 1243012     bfd bfr TRUE 0.607 72.000 0.033 NA Y NA
 1243013 1243014     gspO gspM TRUE 0.909 0.000 0.000 1.000   NA
 1243014 1243015     gspM gspL TRUE 0.996 -3.000 0.811 1.000   NA
 1243015 1243016     gspL gspK TRUE 0.996 15.000 0.537 0.073 Y NA
 1243016 1243017     gspK gspJ TRUE 0.997 -7.000 0.461 1.000 Y NA
 1243017 1243018     gspJ gspI TRUE 0.996 -7.000 0.569 0.003   NA
 1243018 1243019     gspI gspH TRUE 0.997 -3.000 0.605 0.003   NA
 1243019 1243020     gspH gspG TRUE 0.998 8.000 0.425 0.003 Y NA
 1243020 1243021     gspG gspF TRUE 0.999 10.000 0.599 0.003 Y NA
 1243021 1243022     gspF gspE TRUE 0.999 -3.000 0.653 0.003 Y NA
 1243022 1243023     gspE gspD TRUE 0.999 10.000 0.776 0.003 Y NA
 1243023 1243024     gspD gspC TRUE 0.999 -16.000 0.575 0.003 Y NA
 1243025 1243026     gspA pioO TRUE 0.858 2.000 0.031 NA   NA
 1243026 1243027     pioO rpsJ FALSE 0.022 238.000 0.000 NA   NA
 1243027 1243028     rpsJ rplC TRUE 0.977 33.000 0.307 0.014 Y NA
 1243028 1243029     rplC rplD TRUE 0.998 11.000 0.486 0.011 Y NA
 1243029 1243030     rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 1243030 1243031     rplW rplB TRUE 0.998 18.000 0.849 0.013 Y NA
 1243031 1243032     rplB rpsS TRUE 0.998 17.000 0.820 0.014 Y NA
 1243032 1243033     rpsS rplV TRUE 0.998 15.000 0.769 0.014 Y NA
 1243033 1243034     rplV rpsC TRUE 0.997 18.000 0.719 0.014 Y NA
 1243034 1243035     rpsC rplP TRUE 0.999 13.000 0.828 0.014 Y NA
 1243035 1243036     rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.011 Y NA
 1243036 1243037     rpmC rpsQ TRUE 0.999 0.000 0.828 0.011 Y NA
 1243037 1243038     rpsQ rplN TRUE 0.927 165.000 0.791 0.014 Y NA
 1243038 1243039     rplN rplX TRUE 0.999 11.000 0.810 0.014 Y NA
 1243039 1243040     rplX rplE TRUE 0.998 15.000 0.758 0.011 Y NA
 1243040 1243041     rplE rpsN TRUE 0.997 15.000 0.496 0.011 Y NA
 1243041 1243042     rpsN rpsH TRUE 0.985 34.000 0.473 0.011 Y NA
 1243042 1243043     rpsH rplF TRUE 0.999 13.000 0.808 0.011 Y NA
 1243043 1243044     rplF rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.011 Y NA
 1243044 1243045     rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.014 Y NA
 1243045 1243046     rpsE rpmD TRUE 0.999 4.000 0.789 0.014 Y NA
 1243046 1243047     rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 1243047 1243048     rplO secY TRUE 0.992 8.000 0.730 1.000 N NA
 1243048 1243049     secY rpmJ FALSE 0.379 32.000 0.036 1.000 N NA
 1243049 1243050     rpmJ rpsM TRUE 0.725 147.000 0.086 0.011 Y NA
 1243050 1243051     rpsM rpsK TRUE 0.998 17.000 0.810 0.011 Y NA
 1243051 1243052     rpsK rpsD TRUE 0.986 34.000 0.509 0.014 Y NA
 1243052 1243053     rpsD rpoA TRUE 0.938 26.000 0.549 1.000 N NA
 1243053 1243054     rpoA rplQ TRUE 0.925 41.000 0.873 1.000 N NA
 1243054 1243055     rplQ yhdN FALSE 0.079 107.000 0.012 NA   NA
 1243055 1243056     yhdN zntR TRUE 0.899 11.000 0.095 NA   NA
 1243056 1243057     zntR yhdL TRUE 0.545 56.000 0.219 NA   NA
 1243058 1243059     mscL trkA FALSE 0.089 130.000 0.035 1.000 N NA
 1243059 1243060     trkA rsmB TRUE 0.765 22.000 0.122 1.000 N NA
 1243060 1243061     rsmB fmt TRUE 0.917 46.000 0.305 1.000 Y NA
 1243061 1243062     fmt def TRUE 0.985 15.000 0.058 0.016 Y NA
 1243063 1243064     smf smg TRUE 0.921 -28.000 0.124 NA   NA
 1243064 1243065     smg yrdD TRUE 0.862 29.000 0.331 NA   NA
 1243065 1243066     yrdD yrdC TRUE 0.934 5.000 0.137 NA N NA
 1243066 1243067     yrdC aroE TRUE 0.902 5.000 0.087 NA N NA
 1243067 1243068     aroE yrdB TRUE 0.891 -3.000 0.043 NA   NA
 1243070 1243071     rrsE ileU FALSE 0.158 69.000 0.000 NA   NA
 1243071 1243072     ileU alaU FALSE 0.283 43.000 0.000 NA   NA
 1243072 1243073     alaU rrlE FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 1243073 1243074     rrlE rrfE FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 1243074 1243075     rrfE yjaA FALSE 0.150 75.000 0.000 NA   NA
 1243077 1243078     metA aceB FALSE 0.015 269.000 0.000 1.000 N NA
 1243078 1243079     aceB aceA TRUE 0.959 30.000 0.043 0.001 Y NA
 1243079 1243080     aceA aceK FALSE 0.045 183.000 0.000 1.000 N NA
 1243081 1243082     arpA iclR FALSE 0.010 317.000 0.000 NA   NA
 1243083 1243084     metH yjbB FALSE 0.015 220.000 0.006 1.000 N NA
 1243087 1243088     yjbD lysC FALSE 0.019 253.000 0.000 NA   NA
 1243089 1243090     pgi yjbE FALSE 0.004 499.000 0.000 NA   NA
 1243090 1243091     yjbE yjbF TRUE 0.745 114.000 0.778 NA   NA
 1243091 1243092     yjbF yjbG TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 1243092 1243093     yjbG yjbH TRUE 0.957 0.000 0.140 NA   NA
 1243093 1243094     yjbH yjbA FALSE 0.004 595.000 0.000 NA   NA
 1243095 1243096     xylE malG FALSE 0.008 372.000 0.000 1.000   NA
 1243096 1243097     malG malF TRUE 0.998 15.000 0.814 0.051 Y NA
 1243097 1243098     malF malE FALSE 0.427 154.000 0.000 1.000 Y NA
 1243099 1243100     malK lamB TRUE 0.837 72.000 0.111 0.060 Y NA
 1243100 1243101     lamB malM FALSE 0.064 243.000 0.143 1.000   NA
 1243101 1243102     malM yjbI FALSE 0.005 481.000 0.000 NA   NA
 1243102 1243103     yjbI ubiC FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 1243103 1243104     ubiC ubiA TRUE 0.987 13.000 0.248 NA Y NA
 1243106 1243107     dgkA lexA FALSE 0.260 110.000 0.141 1.000 N NA
 1243107 1243108     lexA dinF TRUE 0.607 19.000 0.033 1.000 N NA
 1243108 1243109     dinF yjbJ FALSE 0.081 116.000 0.021 NA   NA
 1243111 1243112     yjbL yjbM TRUE 0.536 24.000 0.000 NA   NA
 1243112 1243113     yjbM yjbN FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 1243113 1243114     yjbN yjbO FALSE 0.137 134.000 0.070 NA   NA
 1243116 1243117     dnaB alr TRUE 0.674 53.000 0.317 1.000 N NA
 1243117 1243118     alr tyrB FALSE 0.065 253.000 0.181 1.000 N NA
 1243118 1243119     tyrB aphA FALSE 0.003 1107.000 0.026 1.000   NA
 1243119 1243120     aphA yjbQ FALSE 0.073 111.000 0.009 NA   NA
 1243120 1243121     yjbQ yjbR TRUE 0.815 4.000 0.018 NA   NA
 1243129 1243130     yjcD yjcE FALSE 0.192 152.000 0.130 1.000   NA
 1243131 1243132     yjcF actP FALSE 0.050 178.000 0.000 NA   NA
 1243132 1243133     actP yjcH TRUE 0.995 -3.000 0.733 NA   NA
 1243133 1243134     yjcH acs FALSE 0.099 200.000 0.147 NA   NA
 1243135 1243136     nrfA nrfB TRUE 0.782 45.000 0.083 0.001   NA
 1243136 1243137     nrfB nrfC TRUE 0.984 -3.000 0.049 0.001   NA
 1243137 1243138     nrfC nrfD TRUE 0.999 -3.000 0.927 0.001 N NA
 1243138 1243139     nrfD nrfE TRUE 0.622 80.000 0.400 1.000 N NA
 1243139 1243140     nrfE nrfF TRUE 0.992 -7.000 0.214 NA Y NA
 1243140 1243141     nrfF nrfG TRUE 0.997 -3.000 0.464 NA Y NA
 1243141 1243142     nrfG gltP FALSE 0.008 342.000 0.000 1.000 N NA
 1243143 1243144     yjcO fdhF FALSE 0.270 94.000 0.105 1.000   NA
 1243144 1243145     fdhF yjcP FALSE 0.046 198.000 0.000 1.000   NA
 1243145 1243146     yjcP yjcQ TRUE 0.993 -3.000 0.625 NA   NA
 1243146 1243147     yjcQ yjcR TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 1243147 1243148     yjcR yjcS FALSE 0.004 503.000 0.000 1.000 N NA
 1243150 1243151     alsK alsE TRUE 0.984 -16.000 0.081 1.000 Y NA
 1243151 1243152     alsE alsC TRUE 0.979 11.000 0.385 1.000   NA
 1243152 1243153     alsC alsA TRUE 0.945 -21.000 0.154 1.000   NA
 1243153 1243154     alsA alsB TRUE 0.503 127.000 0.000 NA Y NA
 1243154 1243155     alsB rpiR TRUE 0.527 59.000 0.250 NA N NA
 1243156 1243157     rpiB yjdP FALSE 0.323 69.000 0.125 NA   NA
 1243158 1243159     phnP phnO TRUE 0.899 2.000 0.000 1.000   NA
 1243159 1243160     phnO phnN TRUE 0.799 -13.000 0.000 NA N NA
 1243160 1243161     phnN phnM TRUE 0.994 0.000 0.235 NA Y NA
 1243161 1243162     phnM phnL TRUE 0.996 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 1243162 1243163     phnL phnK TRUE 0.966 111.000 0.859 0.012 Y NA
 1243163 1243164     phnK phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 1243164 1243165     phnJ phnI TRUE 0.999 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 1243165 1243166     phnI phnH TRUE 1.000 0.000 0.960 0.001 Y NA
 1243166 1243167     phnH phnG TRUE 1.000 -3.000 0.967 0.001 Y NA
 1243167 1243168     phnG phnF TRUE 0.994 1.000 0.691 1.000 N NA
 1243168 1243169     phnF phnE TRUE 0.598 21.000 0.000 NA   NA
 1243169 1243172     phnE phnD FALSE 0.212 55.000 0.000 NA   NA
 1243172 1243173     phnD phnC TRUE 0.990 25.000 0.337 0.001 Y NA
 1243173 1243174     phnC phnB FALSE 0.144 133.000 0.074 NA   NA
 1243174 1243175     phnB phnA FALSE 0.002 658.000 0.013 NA   NA
 1243176 1243177     yjdA yjcZ TRUE 0.996 -3.000 0.857 NA   NA
 1243177 1243178     yjcZ proP FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 1243179 1243180     basS basR TRUE 0.993 10.000 0.143 0.082 Y NA
 1243180 1243181     basR eptA TRUE 0.950 -3.000 0.095 1.000   NA
 1243181 1243182     eptA adiC FALSE 0.148 104.000 0.000 1.000   NA
 1243182 1243183     adiC adiY FALSE 0.252 137.000 0.167 1.000 N NA
 1243183 1243184     adiY adiA FALSE 0.009 325.000 0.000 1.000 N NA
 1243184 1243185     adiA melR FALSE 0.037 196.000 0.000 1.000 N NA
 1243186 1243187     melA melB TRUE 0.729 115.000 0.214 1.000 Y NA
 1243188 1243189     yjdF fumB FALSE 0.105 122.000 0.000 NA   NA
 1243189 1243190     fumB dcuB FALSE 0.176 78.000 0.000 1.000   NA
 1243190 1243191     dcuB dcuR FALSE 0.005 571.000 0.000 1.000   NA
 1243191 1243192     dcuR dcuS TRUE 0.995 -3.000 0.086 0.064 Y NA
 1243193 1243194     yjdI yjdJ TRUE 0.928 12.000 0.168 NA   NA
 1243194 1243195     yjdJ yjdK FALSE 0.024 227.000 0.000 NA   NA
 1243195 1243196     yjdK yjdO TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1243197 1243198     lysU yjdL FALSE 0.022 237.000 0.000 1.000 N NA
 1243198 1243199     yjdL cadA TRUE 0.692 59.000 0.000 1.000 Y NA
 1243199 1243200     cadA cadB TRUE 0.619 80.000 0.000 1.000 Y NA
 1243200 1243201     cadB cadC FALSE 0.007 365.000 0.000 1.000 N NA
 1243201 1243202     cadC pheU FALSE 0.004 617.000 0.000 NA   NA
 1243202 1243203     pheU yjdC FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 1243203 1243204     yjdC dipZ TRUE 0.728 37.000 0.217 1.000   NA
 1243204 1243205     dipZ cutA TRUE 0.902 -24.000 0.092 1.000 N NA
 1243205 1243206     cutA dcuA FALSE 0.092 116.000 0.005 1.000   NA
 1243206 1243207     dcuA aspA FALSE 0.010 306.000 0.015 1.000   NA
 1243210 1243211     groS groL TRUE 0.984 44.000 0.631 0.006 Y NA
 1243211 1243212     groL yjeI FALSE 0.121 138.000 0.062 NA   NA
 1243213 1243214     yjeJ yjeK FALSE 0.006 395.000 0.000 NA   NA
 1243215 1243216     efp ecnA FALSE 0.200 52.000 0.007 1.000   NA
 1243216 1243217     ecnA ecnB TRUE 0.694 111.000 0.212 0.000   NA
 1243217 1243218     ecnB sugE FALSE 0.093 176.000 0.074 1.000   NA
 1243219 1243220     blc ampC FALSE 0.099 89.000 0.022 1.000 N NA
 1243220 1243221     ampC frdD FALSE 0.133 63.000 0.022 1.000 N NA
 1243221 1243222     frdD frdC TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 1243222 1243223     frdC frdB TRUE 0.998 11.000 0.454 0.002 Y NA
 1243223 1243224     frdB frdA TRUE 0.999 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 1243225 1243226     poxA yjeM FALSE 0.016 219.000 0.009 1.000 N NA
 1243226 1243227     yjeM yjeN TRUE 0.749 52.000 0.400 NA   NA
 1243227 1243228     yjeN yjeO TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1243229 1243230     yjeP psd TRUE 0.797 22.000 0.148 1.000 N NA
 1243230 1243231     psd rsgA FALSE 0.251 97.000 0.095 1.000   NA
 1243232 1243233     orn glyV FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 1243233 1243234     glyV glyX FALSE 0.346 37.000 0.000 NA   NA
 1243234 1243235     glyX glyY FALSE 0.360 36.000 0.000 NA   NA
 1243237 1243238     yjeF yjeE TRUE 0.918 -28.000 0.118 NA   NA
 1243238 1243239     yjeE amiB TRUE 0.801 19.000 0.109 NA   NA
 1243239 1243240     amiB mutL TRUE 0.907 10.000 0.092 1.000 N NA
 1243240 1243241     mutL miaA TRUE 0.982 -7.000 0.188 0.070 N NA
 1243241 1243242     miaA hfq TRUE 0.709 86.000 0.531 1.000   NA
 1243242 1243243     hfq hflX FALSE 0.357 76.000 0.141 1.000   NA
 1243243 1243244     hflX hflK TRUE 0.589 86.000 0.184 0.072   NA
 1243244 1243245     hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.010 Y NA
 1243245 1243246     hflC yjeT TRUE 0.578 82.000 0.348 NA   NA
 1243246 1243247     yjeT purA FALSE 0.138 104.000 0.051 NA   NA
 1243247 1243248     purA yjeB FALSE 0.013 205.000 0.010 NA N NA
 1243248 1243249     yjeB rnr TRUE 0.804 39.000 0.038 NA Y NA
 1243249 1243250     rnr rlmB FALSE 0.308 180.000 0.147 0.013 N NA
 1243250 1243251     rlmB yjfI FALSE 0.063 127.000 0.002 NA   NA
 1243251 1243252     yjfI yjfJ TRUE 0.982 19.000 0.911 NA   NA
 1243252 1243253     yjfJ yjfK FALSE 0.321 51.000 0.071 NA   NA
 1243253 1243254     yjfK yjfL TRUE 0.949 18.000 0.379 NA   NA
 1243254 1243255     yjfL yjfM TRUE 0.984 10.000 0.470 NA   NA
 1243255 1243256     yjfM yjfC TRUE 0.882 3.000 0.049 NA   NA
 1243256 1243257     yjfC aidB FALSE 0.267 84.000 0.133 NA N NA
 1243258 1243259     yjfN yjfO TRUE 0.587 149.000 0.588 NA   NA
 1243261 1243262     ulaR ulaG FALSE 0.140 108.000 0.000 1.000   NA
 1243263 1243264     ulaA ulaB TRUE 0.933 16.000 0.059 0.013   NA
 1243264 1243265     ulaB ulaC TRUE 0.994 10.000 0.115 0.011 Y NA
 1243265 1243266     ulaC ulaD TRUE 0.990 14.000 0.328 1.000 Y NA
 1243266 1243267     ulaD ulaE TRUE 0.992 10.000 0.250 1.000 Y NA
 1243267 1243268     ulaE ulaF TRUE 0.994 0.000 0.200 1.000 Y NA
 1243270 1243271     rpsF priB TRUE 0.934 7.000 0.122 1.000 N NA
 1243271 1243272     priB rpsR TRUE 0.939 5.000 0.128 1.000 N NA
 1243272 1243273     rpsR rplI TRUE 0.979 42.000 0.499 0.010 Y NA
 1243277 1243278     fklB cycA FALSE 0.010 309.000 0.000 1.000 N NA
 1243279 1243280     ytfE ytfF FALSE 0.252 108.000 0.150 NA N NA
 1243280 1243281     ytfF ytfG TRUE 0.556 99.000 0.021 1.000 Y NA
 1243284 1243285     cysQ ytfI FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 1243288 1243289     ytfL msrA FALSE 0.010 323.000 0.042 NA   NA
 1243290 1243291     ytfM ytfN TRUE 0.992 -3.000 0.575 NA   NA
 1243291 1243292     ytfN ytfP TRUE 0.957 3.000 0.167 NA   NA
 1243294 1243295     chpS chpB TRUE 0.996 -6.000 0.375 NA Y NA
 1243297 1243298     ytfQ ytfR TRUE 0.896 140.000 0.804 NA Y NA
 1243298 1243299     ytfR ytfT TRUE 0.994 14.000 0.506 1.000 Y NA
 1243299 1243300     ytfT yjfF TRUE 0.999 -13.000 0.865 0.050 Y NA
 1243304 1243305     pmbA cybC FALSE 0.021 242.000 0.000 NA   NA
 1243307 1243308     nrdG nrdD TRUE 0.460 158.000 0.464 1.000 N NA
 1243308 1243309     nrdD treC FALSE 0.006 394.000 0.000 1.000 N NA
 1243309 1243310     treC treB TRUE 0.960 50.000 0.650 1.000 Y NA
 1243310 1243311     treB treR FALSE 0.285 119.000 0.168 1.000 N NA
 1243313 1243314     yjgF pyrI FALSE 0.211 73.000 0.084 NA N NA
 1243314 1243315     pyrI pyrB TRUE 0.995 13.000 0.197 0.001 Y NA
 1243315 1243316     pyrB pyrL TRUE 0.839 4.000 0.005 1.000   NA
 1243316 1243317     pyrL yjgH FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 1243317 1243318     yjgH yjgI FALSE 0.075 131.000 0.000 NA N NA
 1243319 1243320     yjgJ yjgK FALSE 0.064 145.000 0.000 NA N NA
 1243320 1243321     yjgK yjgL FALSE 0.104 123.000 0.000 NA   NA
 1243326 1243327     valS holC TRUE 0.937 0.000 0.089 1.000 N NA
 1243327 1243328     holC pepA TRUE 0.471 160.000 0.494 1.000 N NA
 1243329 1243330     yjgP yjgQ TRUE 0.997 0.000 0.631 0.071   NA
 1243331 1243332     yjgR idnR FALSE 0.125 78.000 0.007 1.000   NA
 1243332 1243333     idnR idnT FALSE 0.440 67.000 0.200 1.000 N NA
 1243333 1243334     idnT idnO FALSE 0.326 62.000 0.111 1.000 N NA
 1243334 1243335     idnO idnD TRUE 0.965 24.000 0.444 0.028 N NA
 1243338 1243339     leuX intB FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 1243339 1243340     intB insC FALSE 0.214 287.000 0.000 0.055 Y NA
 1243340 1243341     insC insD TRUE 0.989 -42.000 0.000 0.055 Y NA
 1243341 1243342     insD yjgW FALSE 0.125 99.000 0.000 NA   NA
 1243350 1243351     yjhB yjhC TRUE 0.941 12.000 0.182 1.000   NA
 1243354 1243356     yjhE insN FALSE 0.133 88.000 0.000 NA   NA
 1243357 1243358     insI insM TRUE 0.814 -43.000 0.000 NA   NA
 1243360 1243362     insO yjhW TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 1243362 1243364     yjhW yjhV TRUE 0.809 -73.000 0.000 NA   NA
 1243365 1243366     fecE fecD TRUE 0.997 1.000 0.380 1.000 Y NA
 1243366 1243367     fecD fecC TRUE 0.998 -3.000 0.340 0.050 Y NA
 1243367 1243368     fecC fecB TRUE 0.999 -3.000 0.864 1.000 Y NA
 1243368 1243369     fecB fecA TRUE 0.889 45.000 0.211 1.000 Y NA
 1243369 1243370     fecA fecR TRUE 0.793 87.000 0.267 NA Y NA
 1243370 1243371     fecR fecI TRUE 0.981 -3.000 0.308 NA N NA
 1243372 1243373     insA insB TRUE 0.807 -81.000 0.000 NA   NA
 1243377 1243378     yjhU yjhF FALSE 0.008 347.000 0.000 1.000 N NA
 1243378 1243379     yjhF yjhG TRUE 0.563 107.000 0.000 1.000 Y NA
 1243379 1243380     yjhG yjhH TRUE 0.989 11.000 0.000 0.045 Y NA
 1243380 1243381     yjhH yjhI TRUE 0.855 5.000 0.000 1.000 N NA
 1243381 1243382     yjhI sgcR FALSE 0.183 303.000 0.000 0.063 Y NA
 1243382 1243383     sgcR sgcE TRUE 0.954 17.000 0.000 1.000 Y NA
 1243383 1243384     sgcE sgcA TRUE 0.974 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1243384 1243385     sgcA sgcQ TRUE 0.610 131.000 0.500 1.000   NA
 1243385 1243386     sgcQ sgcC TRUE 0.979 13.000 0.500 1.000   NA
 1243386 1243387     sgcC sgcB TRUE 0.993 12.000 0.148 0.011 Y NA
 1243387 1243388     sgcB sgcX TRUE 0.991 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 1243388 1243389     sgcX yjhP FALSE 0.003 786.000 0.000 1.000 N NA
 1243389 1243390     yjhP yjhQ TRUE 0.546 56.000 0.000 0.045   NA
 1243390 1243391     yjhQ yjhX TRUE 0.791 12.000 0.000 NA   NA
 1243393 1243394     yjhS yjhT FALSE 0.168 65.000 0.000 NA   NA
 1243394 1243395     yjhT yjhA TRUE 0.622 20.000 0.000 NA   NA
 1243396 1243397     fimB fimE FALSE 0.100 478.000 0.000 0.008 Y NA
 1243397 1243398     fimE fimA FALSE 0.004 482.000 0.000 1.000 N NA
 1243398 1243399     fimA fimI TRUE 0.968 65.000 0.600 0.007 Y NA
 1243399 1243400     fimI fimC TRUE 0.980 37.000 0.800 1.000 Y NA
 1243400 1243401     fimC fimD TRUE 0.945 67.000 0.750 1.000 Y NA
 1243401 1243402     fimD fimF TRUE 0.980 10.000 0.000 1.000 Y NA
 1243402 1243403     fimF fimG TRUE 0.988 13.000 0.000 0.007 Y NA
 1243403 1243404     fimG fimH TRUE 0.991 20.000 0.833 0.007   NA
 1243406 1243407     uxuA uxuB TRUE 0.654 81.000 0.070 1.000 Y NA
 1243407 1243408     uxuB uxuR FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000 N NA
 1243411 1243412     yjiE iadA FALSE 0.156 65.000 0.037 1.000 N NA
 1243412 1243413     iadA yjiG TRUE 0.776 13.000 0.028 1.000   NA
 1243413 1243414     yjiG yjiH TRUE 0.981 -3.000 0.019 0.001   NA
 1243416 1243417     yjiJ yjiK FALSE 0.314 68.000 0.118 NA   NA
 1243417 1243418     yjiK yjiL FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 1243418 1243419     yjiL yjiM TRUE 0.871 10.000 0.078 NA N NA
 1243419 1243420     yjiM yjiN FALSE 0.074 116.000 0.013 NA   NA
 1243420 1243421     yjiN yjiO FALSE 0.237 41.000 0.020 NA   NA
 1243422 1243424     yjiP yjiQ FALSE 0.248 49.000 0.000 NA   NA
 1243426 1243427     yjiS yjiT FALSE 0.004 499.000 0.000 NA   NA
 1243427 1243428     yjiT yjiV FALSE 0.034 204.000 0.000 NA   NA
 1243430 1243431     mcrC mcrB TRUE 0.997 0.000 0.490 NA Y NA
 1243431 1243432     mcrB yjiW FALSE 0.065 162.000 0.000 NA   NA
 1243432 1243433     yjiW hsdS FALSE 0.073 171.000 0.059 NA   NA
 1243433 1243434     hsdS hsdM TRUE 0.998 -3.000 0.267 0.055 Y NA
 1243434 1243435     hsdM hsdR TRUE 0.813 201.000 0.567 0.055 Y NA
 1243437 1243438     yjiA yjiX TRUE 0.951 11.000 0.212 NA   NA
 1243438 1243439     yjiX yjiY TRUE 0.822 50.000 0.531 NA   NA
 1243441 1243442     yjiZ yjjM FALSE 0.096 215.000 0.182 1.000 N NA
 1243444 1243445     mdoB yjjA FALSE 0.019 254.000 0.000 NA   NA
 1243445 1243446     yjjA dnaC TRUE 0.748 49.000 0.368 NA   NA
 1243446 1243447     dnaC dnaT TRUE 0.994 3.000 0.778 NA   NA
 1243447 1243448     dnaT yjjB FALSE 0.126 107.000 0.046 NA   NA
 1243448 1243449     yjjB yjjP TRUE 0.686 138.000 0.704 NA   NA
 1243450 1243451     yjjQ bglJ TRUE 0.999 12.000 0.889 0.018 Y NA
 1243454 1243455     leuV leuP FALSE 0.371 35.000 0.000 NA   NA
 1243455 1243456     leuP leuQ TRUE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 1243456 1243457     leuQ rsmC FALSE 0.016 268.000 0.000 NA   NA
 1243458 1243459     holD rimI TRUE 0.928 -31.000 0.121 1.000   NA
 1243459 1243460     rimI yjjG TRUE 0.711 15.000 0.018 1.000   NA
 1243460 1243461     yjjG prfC FALSE 0.116 91.000 0.012 1.000   NA
 1243461 1243462     prfC osmY FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 1243462 1243463     osmY ytjA FALSE 0.114 109.000 0.000 NA   NA
 1243463 1243464     ytjA yjjU FALSE 0.336 122.000 0.211 NA   NA
 1243464 1243465     yjjU yjjV TRUE 0.912 -3.000 0.057 NA   NA
 1243466 1243467     yjjW yjjI TRUE 0.992 -28.000 0.810 NA   NA
 1243468 1243469     deoC deoA TRUE 0.766 127.000 0.286 1.000 Y NA
 1243469 1243470     deoA deoB TRUE 0.744 52.000 0.398 1.000 N NA
 1243470 1243471     deoB deoD TRUE 0.722 57.000 0.414 1.000 N NA
 1243471 1243472     deoD yjjJ FALSE 0.059 167.000 0.041 NA   NA
 1243473 1243474     lplA ytjB TRUE 0.556 28.000 0.066 NA   NA
 1243475 1243476     serB radA FALSE 0.196 49.000 0.024 1.000 N NA
 1243476 1243477     radA nadR TRUE 0.511 21.000 0.021 1.000 N NA
 1243479 1243480     slt trpR FALSE 0.335 90.000 0.167 1.000 N NA
 1243484 1243485     creA creB TRUE 0.756 13.000 0.038 NA   NA
 1243485 1243486     creB creC TRUE 0.999 0.000 0.776 1.000 Y NA
 1243486 1243487     creC creD TRUE 0.606 58.000 0.311 NA N NA
 1243489 1243490     yjjY yjtD FALSE 0.006 400.000 0.000 NA   NA
 1243490 1238932     yjtD thrL FALSE 0.036 214.000 0.000 1.000   NA