MicrobesOnline Operon Predictions for Xanthomonas campestris vesicatoria 85-10

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1180854 1180855 XCV0001 XCV0002 dnaA dnaN TRUE 0.604 277.000 0.328 1.000 Y NA
 1180855 1180856 XCV0002 XCV0003 dnaN recF FALSE 0.218 1044.000 0.318 1.000 Y NA
 1180856 1180857 XCV0003 XCV0004 recF gyrB TRUE 0.958 61.000 0.249 0.005 Y NA
 1180857 1180858 XCV0004 XCV0005 gyrB   FALSE 0.376 69.000 0.005 NA   NA
 1180858 1180859 XCV0005 XCV0006     FALSE 0.407 184.000 0.079 NA   NA
 1180859 1180860 XCV0006 XCV0007     FALSE 0.084 317.000 0.063 1.000 N NA
 1180860 1180861 XCV0007 XCV0008   tonB1 FALSE 0.430 154.000 0.095 1.000 N NA
 1180861 1180862 XCV0008 XCV0009 tonB1 exbB1 TRUE 0.930 86.000 0.600 0.018 N NA
 1180862 1180863 XCV0009 XCV0010 exbB1 exbD1 TRUE 0.973 47.000 0.600 0.068 Y NA
 1180863 1180864 XCV0010 XCV0011 exbD1 exbD2 TRUE 0.999 4.000 0.857 0.054 Y NA
 1180864 1180865 XCV0011 XCV0012 exbD2 exbD3 TRUE 0.551 247.000 0.000 0.054 Y NA
 1180866 1180867 XCV0013 XCV0014 pdxJ   TRUE 0.900 8.000 0.009 NA   NA
 1180867 1180868 XCV0014 XCV0015   cls TRUE 0.820 76.000 0.417 NA   NA
 1180869 1180870 XCV0016 XCV0017     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1180871 1180872 XCV0018 XCV0019     FALSE 0.182 208.000 0.009 NA   NA
 1180872 1180873 XCV0019 XCV0020   fadL FALSE 0.078 262.000 0.000 NA   NA
 1180874 1180875 XCV0021 XCV0022     TRUE 0.616 64.000 0.096 NA   NA
 1180875 1180876 XCV0022 XCV0023   serA TRUE 0.977 0.000 0.043 NA   NA
 1180877 1180878 XCV0024 XCV0025 ctp   TRUE 0.894 105.000 0.408 0.050 N NA
 1180879 1180880 XCV0026 XCV0027     FALSE 0.442 162.000 0.049 1.000   NA
 1180881 1180882 XCV0028 XCV0029   egl1 FALSE 0.062 295.000 0.000 1.000   NA
 1180882 1180883 XCV0029 XCV0030 egl1   FALSE 0.068 276.000 0.000 NA   NA
 1180883 1180884 XCV0030 XCV0031   egl2 FALSE 0.326 67.000 0.000 NA   NA
 1180884 1180885 XCV0031 XCV0032 egl2   FALSE 0.104 234.000 0.000 NA   NA
 1180885 1180886 XCV0032 XCV0033   egl3 FALSE 0.053 301.000 0.000 NA   NA
 1180888 1180889 XCV0035 XCV0036   gltD FALSE 0.379 37.000 0.000 NA   NA
 1180889 1180890 XCV0036 XCV0037 gltD gltB TRUE 0.932 129.000 0.032 0.001 Y NA
 1180890 1180891 XCV0037 XCV0038 gltB   FALSE 0.213 203.000 0.011 1.000   NA
 1180894 1180895 XCV0041 XCV0042     TRUE 0.843 -72.000 0.000 0.001   NA
 1180897 1180898 XCV0044 XCV0045     TRUE 0.464 204.000 0.000 1.000 Y NA
 1180898 1180899 XCV0045 XCV0046     TRUE 0.997 4.000 0.500 NA Y NA
 1180899 1180900 XCV0046 XCV0047     FALSE 0.015 681.000 0.000 NA   NA
 1180900 1180901 XCV0047 XCV0048     FALSE 0.350 88.000 0.000 NA   NA
 1180902 1180903 XCV0049 XCV0050     TRUE 0.982 11.000 0.600 1.000   NA
 1180904 1180905 XCV0051 XCV0052   avrBs2 TRUE 0.691 189.000 0.667 NA N NA
 1180905 1180906 XCV0052 XCV0053 avrBs2   FALSE 0.312 133.000 0.000 NA   NA
 1180907 1180908 XCV0054 XCV0055     TRUE 0.990 -3.000 0.010 0.019   NA
 1180909 1180910 XCV0056 XCV0057     FALSE 0.325 66.000 0.000 NA   NA
 1180910 1180911 XCV0057 XCV0058     TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1180912 1180913 XCV0059 XCV0060     TRUE 0.945 60.000 0.250 0.063 Y NA
 1180914 1180915 XCV0061 XCV0062     FALSE 0.016 709.000 0.000 1.000   NA
 1180916 1180917 XCV0063 XCV0064     FALSE 0.365 39.000 0.000 NA   NA
 10702478 1180918 IS_1477_1 XCV0065     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1180918 1180919 XCV0065 XCV0066     TRUE 0.703 33.000 0.000 0.098   NA
 1180920 1180921 XCV0067 XCV0068     FALSE 0.030 400.000 0.000 NA   NA
 1180921 1180922 XCV0068 XCV0069     TRUE 0.632 17.000 0.000 NA   NA
 1180922 1180923 XCV0069 XCV0070     FALSE 0.019 526.000 0.000 NA   NA
 1180923 1180924 XCV0070 XCV0071     FALSE 0.111 228.000 0.000 NA   NA
 1180924 1180925 XCV0071 XCV0072     FALSE 0.100 237.000 0.000 NA   NA
 1180927 1180928 XCV0074 XCV0075     TRUE 0.988 -3.000 0.194 NA   NA
 1180928 1180929 XCV0075 XCV0076     TRUE 0.507 110.000 0.022 1.000   NA
 1180930 1180931 XCV0077 XCV0078     FALSE 0.186 41.000 0.000 1.000 N NA
 1180931 1180932 XCV0078 XCV0079     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA N NA
 1180932 1180933 XCV0079 XCV0080     TRUE 0.843 21.000 0.143 NA   NA
 1180933 1180934 XCV0080 XCV0081   proP FALSE 0.020 533.000 0.000 1.000   NA
 1180936 1180937 XCV0083 XCV0084     FALSE 0.210 197.000 0.009 NA   NA
 1180938 1180939 XCV0085 XCV0086     TRUE 0.996 -3.000 0.724 NA   NA
 1180939 1180940 XCV0086 XCV0087     TRUE 0.987 -3.000 0.172 NA   NA
 1180940 1180941 XCV0087 XCV0088     TRUE 0.691 44.000 0.161 NA   NA
 1180941 1180942 XCV0088 XCV0089     TRUE 0.919 14.000 0.193 NA   NA
 1180942 1180943 XCV0089 XCV0090     TRUE 0.703 113.000 0.168 NA   NA
 1180943 1180944 XCV0090 XCV0091     TRUE 0.996 -3.000 0.720 NA   NA
 1180944 1180945 XCV0091 XCV0092     TRUE 0.912 15.000 0.200 NA   NA
 1180945 1180946 XCV0092 XCV0093     FALSE 0.015 719.000 0.000 NA   NA
 1180946 1180947 XCV0093 XCV0094     FALSE 0.034 372.000 0.000 NA   NA
 1180947 1180948 XCV0094 XCV0095     FALSE 0.325 66.000 0.000 NA   NA
 1180948 1180949 XCV0095 XCV0096     FALSE 0.263 148.000 0.000 NA   NA
 1180949 1180950 XCV0096 XCV0097     FALSE 0.334 81.000 0.000 NA   NA
 1180950 1180951 XCV0097 XCV0098   cbbFC FALSE 0.055 299.000 0.000 NA   NA
 1180951 1180952 XCV0098 XCV0099 cbbFC   FALSE 0.020 529.000 0.000 1.000   NA
 1180952 1180953 XCV0099 XCV0100     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 1180953 1180954 XCV0100 XCV0101     FALSE 0.335 119.000 0.000 NA   NA
 1180955 1180956 XCV0102 XCV0103     TRUE 0.947 -18.000 0.500 NA   NA
 1180956 1180957 XCV0103 XCV0104     FALSE 0.162 195.000 0.000 NA   NA
 1180957 1180958 XCV0104 XCV0105     FALSE 0.031 387.000 0.000 NA   NA
 1180958 1180959 XCV0105 XCV0106     FALSE 0.282 177.000 0.014 NA   NA
 1180961 1180962 XCV0108 XCV0109     TRUE 0.977 0.000 0.043 NA   NA
 1180963 1180964 XCV0110 XCV0111 lctD   FALSE 0.146 140.000 0.000 1.000 N NA
 1180964 1180965 XCV0111 XCV0112     TRUE 0.759 27.000 0.091 NA   NA
 1180965 1180966 XCV0112 XCV0113     TRUE 0.495 -40.000 0.000 NA   NA
 1180967 1180968 XCV0114 XCV0115     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.035 Y NA
 1180968 1180969 XCV0115 XCV0116     FALSE 0.017 600.000 0.000 NA   NA
 1180969 1180970 XCV0116 XCV0117     FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 1180971 1180972 XCV0118 XCV0119     TRUE 0.985 -3.000 0.133 NA   NA
 1180973 1180974 XCV0120 XCV0121     FALSE 0.314 167.000 0.015 NA   NA
 1180976 1180977 XCV0123 XCV0124     FALSE 0.035 365.000 0.000 NA   NA
 10702479 1180978 IS_1477_2 XCV0125     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1180978 1180979 XCV0125 XCV0126     TRUE 0.704 33.000 0.000 0.097   NA
 1180980 1180981 XCV0127 XCV0128     FALSE 0.017 563.000 0.000 NA   NA
 1180981 10702480 XCV0128 IS_1479_1     TRUE 0.543 -29.000 0.000 NA   NA
 1180983 1180984 XCV0130 XCV0131     FALSE 0.030 395.000 0.000 NA   NA
 1180984 1180985 XCV0131 XCV0132     FALSE 0.246 155.000 0.000 NA   NA
 1180985 1180986 XCV0132 XCV0133     FALSE 0.196 179.000 0.000 NA   NA
 1180986 1180987 XCV0133 XCV0134     FALSE 0.016 656.000 0.000 NA   NA
 1180987 1180988 XCV0134 XCV0135     FALSE 0.038 350.000 0.000 NA   NA
 1180989 1180990 XCV0136 XCV0137     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1180990 1180991 XCV0137 XCV0138     TRUE 0.919 8.000 0.059 1.000 N NA
 1180992 1180993 XCV0139 XCV0140     TRUE 0.998 -3.000 0.544 0.014   NA
 1180993 1180994 XCV0140 XCV0141   glgB1 TRUE 0.998 -3.000 0.027 0.004 Y NA
 1180994 1180995 XCV0141 XCV0142 glgB1   FALSE 0.178 193.000 0.000 1.000   NA
 1180995 1180996 XCV0142 XCV0143     FALSE 0.439 69.000 0.012 1.000   NA
 1180997 1180998 XCV0144 XCV0145     TRUE 0.862 141.000 0.200 1.000 Y NA
 1180999 1181000 XCV0146 XCV0147   dctP TRUE 0.575 38.000 0.097 1.000 N NA
 1181000 1181001 XCV0147 XCV0148 dctP dctQ TRUE 0.994 11.000 0.756 NA Y NA
 1181001 1181002 XCV0148 XCV0149 dctQ dctM TRUE 0.998 0.000 0.390 NA Y NA
 1181002 1181003 XCV0149 XCV0150 dctM xylB1 TRUE 0.708 194.000 0.125 1.000 Y NA
 1181003 1181004 XCV0150 XCV0151 xylB1   TRUE 0.528 142.000 0.143 1.000 N NA
 1181004 1181005 XCV0151 XCV0152   kduI FALSE 0.011 422.000 0.000 1.000 N NA
 1181005 1181006 XCV0152 XCV0153 kduI kduD TRUE 0.679 183.000 0.571 1.000 N NA
 1181006 1181007 XCV0153 XCV0154 kduD rpiB FALSE 0.154 234.000 0.047 1.000 N NA
 1181007 1181008 XCV0154 XCV0155 rpiB   FALSE 0.054 223.000 0.000 1.000 N NA
 1181009 1181010 XCV0156 XCV0157   phhA FALSE 0.377 138.000 0.010 NA   NA
 1181011 1181012 XCV0158 XCV0159     FALSE 0.025 294.000 0.000 1.000 N NA
 1181015 1181016 XCV0162 XCV0163     FALSE 0.156 198.000 0.000 NA   NA
 1181017 1181018 XCV0164 XCV0165     TRUE 0.957 -10.000 0.333 1.000   NA
 1181018 1181019 XCV0165 XCV0166     TRUE 0.491 49.000 0.026 1.000   NA
 1181019 1181020 XCV0166 XCV0167     TRUE 0.982 -3.000 0.171 1.000 N NA
 1181022 1181023 XCV0169 XCV0170     TRUE 0.840 -126.000 0.354 NA   NA
 1181023 1181024 XCV0170 XCV0171     TRUE 0.484 49.000 0.029 NA   NA
 1181026 1181027 XCV0173 XCV0174     FALSE 0.015 835.000 0.000 1.000   NA
 1181027 1181028 XCV0174 XCV0175     FALSE 0.049 324.000 0.000 1.000   NA
 1181028 1181029 XCV0175 XCV0176     TRUE 0.792 16.000 0.079 1.000 N NA
 1181029 1181030 XCV0176 XCV0177     TRUE 0.587 61.000 0.083 NA   NA
 1181030 1181031 XCV0177 XCV0178     TRUE 0.985 -3.000 0.128 NA   NA
 1181031 1181032 XCV0178 XCV0179     FALSE 0.125 290.000 0.107 NA N NA
 1181032 1181033 XCV0179 XCV0180     TRUE 0.551 22.000 0.023 NA N NA
 1181033 1181034 XCV0180 XCV0181     TRUE 0.457 60.000 0.023 NA   NA
 1181034 1181035 XCV0181 XCV0182     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181035 1181036 XCV0182 XCV0183     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   NA
 1181036 1181037 XCV0183 XCV0184     FALSE 0.390 191.000 0.083 NA   NA
 1181037 1181038 XCV0184 XCV0185     FALSE 0.302 137.000 0.000 NA   NA
 1181039 1181040 XCV0186 XCV0187   bacA FALSE 0.036 241.000 0.000 NA N NA
 1181041 1181042 XCV0188 XCV0189 glnA glnB FALSE 0.277 274.000 0.000 1.000 Y NA
 1181042 1181043 XCV0189 XCV0190 glnB amtB TRUE 0.646 23.000 0.048 1.000 N NA
 1181043 1181044 XCV0190 XCV0191 amtB ntrB FALSE 0.033 265.000 0.000 1.000 N NA
 1181044 1181045 XCV0191 XCV0192 ntrB ntrC TRUE 0.993 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 1181045 1181046 XCV0192 XCV0193 ntrC sodC1 FALSE 0.023 368.000 0.007 1.000 N NA
 1181046 1181047 XCV0193 XCV0194 sodC1 sodC2 TRUE 0.974 49.000 0.375 0.001 Y NA
 1181048 1181049 XCV0195 XCV0196     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 1181049 1181050 XCV0196 XCV0197     TRUE 0.967 -3.000 0.018 NA   NA
 1181052 1181053 XCV0199 XCV0200     TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 1181053 1181054 XCV0200 XCV0201   hemD TRUE 0.951 104.000 0.600 1.000 Y NA
 1181055 1181056 XCV0202 XCV0203     FALSE 0.127 253.000 0.014 NA   NA
 1181056 1181057 XCV0203 XCV0204     TRUE 0.660 29.000 0.035 NA   NA
 1181057 1181058 XCV0204 XCV0205     TRUE 0.461 76.000 0.019 NA   NA
 1181058 1181059 XCV0205 XCV0206   secB TRUE 0.600 110.000 0.158 NA N NA
 1181059 1181060 XCV0206 XCV0207 secB   TRUE 0.632 16.000 0.015 1.000 N NA
 1181063 1181064 XCV0210 XCV0211     FALSE 0.352 89.000 0.000 NA   NA
 1181064 1181065 XCV0211 XCV0212     FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1181065 1181066 XCV0212 XCV0213     TRUE 0.524 -33.000 0.000 NA   NA
 1181066 1181067 XCV0213 XCV0214     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1181068 1181069 XCV0215 XCV0216     FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 1181069 1181070 XCV0216 XCV0217     FALSE 0.139 207.000 0.000 NA   NA
 1181070 1181071 XCV0217 XCV0218     FALSE 0.032 382.000 0.000 NA   NA
 1181071 1181072 XCV0218 XCV0219     FALSE 0.310 60.000 0.000 NA   NA
 10702481 1181075 IS_1477_3 XCV0222     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1181075 1181076 XCV0222 XCV0223     TRUE 0.705 33.000 0.000 0.096   NA
 1181077 1181078 XCV0224 XCV0225     TRUE 0.979 -15.000 0.514 0.096   NA
 1181079 1181080 XCV0226 XCV0227     FALSE 0.348 106.000 0.000 NA   NA
 1181080 10702482 XCV0227 IS_Xac2_1     FALSE 0.014 869.000 0.000 NA   NA
 10702482 1181081 IS_Xac2_1 XCV0228     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1181081 1181082 XCV0228 XCV0229     TRUE 0.942 -6.000 0.000 0.096   NA
 1181083 1181084 XCV0230 XCV0231 poxB   FALSE 0.160 50.000 0.000 1.000 N NA
 1181084 1181085 XCV0231 XCV0232     TRUE 0.985 -15.000 0.556 1.000 Y NA
 1181085 1181086 XCV0232 XCV0233     FALSE 0.425 191.000 0.111 NA   NA
 1181086 1181087 XCV0233 XCV0234     FALSE 0.350 103.000 0.000 NA   NA
 1181087 1181088 XCV0234 XCV0235     TRUE 0.688 93.000 0.133 NA   NA
 1181089 1181090 XCV0236 XCV0237     TRUE 0.555 27.000 0.007 NA   NA
 1181091 1181092 XCV0238 XCV0239   fabH TRUE 0.621 102.000 0.078 NA   NA
 1181092 1181093 XCV0239 XCV0240 fabH   TRUE 0.517 84.000 0.026 1.000   NA
 1181093 1181094 XCV0240 XCV0241     TRUE 0.454 149.000 0.036 1.000   NA
 1181096 1181097 XCV0243 XCV0244   cdh1 TRUE 0.463 228.000 0.418 1.000 N NA
 1181097 1181098 XCV0244 XCV0245 cdh1   TRUE 0.582 65.000 0.070 NA   NA
 1181100 1181101 XCV0247 XCV0248   ubiB TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 1181101 1181102 XCV0248 XCV0249 ubiB   TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1181102 1181103 XCV0249 XCV0250   truC FALSE 0.058 293.000 0.000 NA   NA
 1181105 1181106 XCV0252 XCV0253     TRUE 0.953 3.000 0.014 1.000   NA
 1181106 1181107 XCV0253 XCV0254     FALSE 0.312 89.000 0.013 1.000 N NA
 1181107 1181108 XCV0254 XCV0255   dcp2 TRUE 0.479 199.000 0.000 1.000 Y NA
 1181109 1181110 XCV0256 XCV0257     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1181112 1181113 XCV0259 XCV0260     TRUE 0.627 69.000 0.100 NA   NA
 1181113 1181114 XCV0260 XCV0261     FALSE 0.136 145.000 0.000 1.000 N NA
 1181114 1181115 XCV0261 XCV0262     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1181115 1181116 XCV0262 XCV0263     FALSE 0.345 111.000 0.000 NA   NA
 1181117 1181118 XCV0264 XCV0265   aceA TRUE 0.674 160.000 0.016 1.000 Y NA
 1181118 1181119 XCV0265 XCV0266 aceA   FALSE 0.024 300.000 0.000 1.000 N NA
 1181119 1181120 XCV0266 XCV0267     TRUE 0.997 4.000 0.154 0.010 Y NA
 1181123 1181124 XCV0270 XCV0271   accC FALSE 0.276 100.000 0.008 1.000 N NA
 1181124 1181125 XCV0271 XCV0272 accC accD TRUE 0.826 241.000 0.158 0.002 Y NA
 1181125 1181126 XCV0272 XCV0273 accD acdA TRUE 0.988 11.000 0.316 1.000 Y NA
 1181127 1181128 XCV0274 XCV0275     TRUE 0.543 87.000 0.036 NA   NA
 1181128 1181129 XCV0275 XCV0276     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181130 1181131 XCV0277 XCV0278     TRUE 0.984 -3.000 0.111 NA   NA
 1181131 1181132 XCV0278 XCV0279     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 1181132 1181133 XCV0279 XCV0280     TRUE 0.601 182.000 0.286 NA   NA
 1181134 1181135 XCV0281 XCV0282     FALSE 0.237 277.000 0.158 NA   NA
 1181138 1181139 XCV0285 XCV0286     TRUE 0.537 97.000 0.032 NA   NA
 1181140 1181141 XCV0287 XCV0288     TRUE 0.496 82.000 0.026 NA   NA
 1181141 1181142 XCV0288 XCV0289   ohrR FALSE 0.030 400.000 0.000 NA   NA
 1181142 1181143 XCV0289 XCV0290 ohrR ohr TRUE 0.534 100.000 0.086 1.000 N NA
 1181143 1181144 XCV0290 XCV0291 ohr   TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181147 1181148 XCV0294 XCV0295     FALSE 0.196 179.000 0.000 NA   NA
 1181148 1181149 XCV0295 XCV0296     TRUE 0.746 135.000 0.028 0.037   NA
 1181150 1181151 XCV0297 XCV0298   rluE FALSE 0.429 93.000 0.008 NA   NA
 1181152 1181153 XCV0299 XCV0300   hrpB FALSE 0.036 467.000 0.012 1.000   NA
 1181155 1181156 XCV0302 XCV0303     FALSE 0.307 168.000 0.014 NA   NA
 1181156 1181157 XCV0303 XCV0304     TRUE 0.846 -30.000 0.167 1.000   NA
 1181157 1181158 XCV0304 XCV0305     TRUE 0.983 -3.000 0.103 NA   NA
 1181158 1181159 XCV0305 XCV0306     TRUE 0.979 -3.000 0.061 NA   NA
 1181159 1181160 XCV0306 XCV0307     TRUE 0.665 -24.000 0.013 NA   NA
 1181160 1181161 XCV0307 XCV0308     TRUE 0.959 -3.000 0.036 1.000 N NA
 1181161 1181162 XCV0308 XCV0309     TRUE 0.807 53.000 0.060 1.000 Y NA
 1181162 1181163 XCV0309 XCV0310     FALSE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 1181163 1181164 XCV0310 XCV0311     FALSE 0.198 178.000 0.000 NA   NA
 1181166 1181167 XCV0313 XCV0314   ggt1 FALSE 0.118 224.000 0.000 NA   NA
 1181167 1181168 XCV0314 XCV0315 ggt1 gatA TRUE 0.970 0.000 0.068 1.000 N NA
 1181168 1181169 XCV0315 XCV0316 gatA   FALSE 0.008 467.000 0.000 NA N NA
 1181169 1181170 XCV0316 XCV0317   add TRUE 0.579 98.000 0.048 NA   NA
 1181170 1181171 XCV0317 XCV0318 add   FALSE 0.035 509.000 0.017 1.000   NA
 1181171 1181172 XCV0318 XCV0319     FALSE 0.193 186.000 0.000 1.000   NA
 1181172 1181173 XCV0319 XCV0320     TRUE 0.944 18.000 0.091 0.001 N NA
 1181174 1181175 XCV0321 XCV0322     FALSE 0.100 157.000 0.000 NA N NA
 1181181 1181182 XCV0328 XCV0329     FALSE 0.071 279.000 0.000 1.000   NA
 1181182 1181183 XCV0329 XCV0330     FALSE 0.361 60.000 0.031 1.000 N NA
 1181183 1181184 XCV0330 XCV0331     TRUE 0.484 35.000 0.040 1.000 N NA
 1181184 1181185 XCV0331 XCV0332     FALSE 0.129 214.000 0.000 NA   NA
 1181185 1181186 XCV0332 XCV0333   purU FALSE 0.098 240.000 0.000 NA   NA
 1181187 1181188 XCV0334 XCV0335     TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 1181189 1181190 XCV0336 XCV0337     TRUE 0.960 10.000 0.300 1.000 N NA
 1181190 1181191 XCV0337 XCV0338   oprN1 TRUE 0.998 -3.000 0.900 0.052 N NA
 1181192 1181193 XCV0339 XCV0340     FALSE 0.027 417.000 0.000 NA   NA
 1181193 1181194 XCV0340 XCV0341     TRUE 0.571 30.000 0.014 NA   NA
 1181194 1181195 XCV0341 XCV0342   metR TRUE 0.965 0.000 0.014 NA   NA
 1181196 1181197 XCV0343 XCV0344     TRUE 0.620 82.000 0.088 NA   NA
 1181197 1181198 XCV0344 XCV0345   metE TRUE 0.937 29.000 0.775 NA   NA
 1181199 1181200 XCV0346 XCV0347 kdgT   FALSE 0.253 153.000 0.000 NA   NA
 1181200 1181201 XCV0347 XCV0348     FALSE 0.016 611.000 0.000 NA   NA
 1181201 1181202 XCV0348 XCV0349     FALSE 0.325 66.000 0.000 NA   NA
 1181204 1181205 XCV0351 XCV0352     FALSE 0.022 471.000 0.000 NA   NA
 1181205 1181206 XCV0352 XCV0353     FALSE 0.330 124.000 0.000 NA   NA
 1181206 10702483 XCV0353 IS_Xac3_1     FALSE 0.045 323.000 0.000 NA   NA
 10702483 1181207 IS_Xac3_1 XCV0354     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1181207 1181208 XCV0354 XCV0355     TRUE 0.996 9.000 0.409 0.094 Y NA
 1181211 1181212 XCV0358 XCV0359     FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1181213 1181214 XCV0360 XCV0361     TRUE 0.798 11.000 0.000 NA   NA
 1181215 1181216 XCV0362 XCV0363     FALSE 0.376 150.000 0.056 1.000 N NA
 1181216 1181217 XCV0363 XCV0364     FALSE 0.014 383.000 0.000 1.000 N NA
 1181217 1181218 XCV0364 XCV0365     TRUE 0.704 175.000 0.600 NA N NA
 1181218 1181219 XCV0365 XCV0366     TRUE 0.581 34.000 0.091 NA N NA
 1181219 1181220 XCV0366 XCV0367     TRUE 0.905 32.000 0.286 0.037 N NA
 1181225 1181226 XCV0372 XCV0373 glpK glpF FALSE 0.217 140.000 0.008 1.000 N NA
 1181226 1181227 XCV0373 XCV0374 glpF glpD FALSE 0.063 442.000 0.129 1.000 N NA
 1181227 1181228 XCV0374 XCV0375 glpD glpR FALSE 0.162 224.000 0.040 1.000 N NA
 1181228 1181229 XCV0375 XCV0376 glpR   FALSE 0.063 208.000 0.000 1.000 N NA
 1181229 1181230 XCV0376 XCV0377     TRUE 0.819 101.000 0.170 0.055 N NA
 1181231 1181232 XCV0378 XCV0379 gctA gctB TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.001 Y NA
 1181232 1181233 XCV0379 XCV0380 gctB pcaF TRUE 0.997 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 1181233 1181234 XCV0380 XCV0381 pcaF pcaH TRUE 0.823 79.000 0.066 0.001 N NA
 1181234 1181235 XCV0381 XCV0382 pcaH pcaG TRUE 0.999 5.000 0.782 0.001 Y NA
 1181235 1181236 XCV0382 XCV0383 pcaG pcaB FALSE 0.193 328.000 0.314 1.000 N NA
 1181236 1181237 XCV0383 XCV0384 pcaB   TRUE 0.871 11.000 0.014 1.000   NA
 1181237 1181238 XCV0384 XCV0385   pcaC TRUE 0.929 27.000 0.600 1.000   NA
 1181238 1181239 XCV0385 XCV0386 pcaC   FALSE 0.190 181.000 0.000 NA   NA
 1181241 1181242 XCV0388 XCV0389     FALSE 0.037 255.000 0.000 1.000 N NA
 1181243 1181244 XCV0390 XCV0391   gidA FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 1181244 1181245 XCV0391 XCV0392 gidA   FALSE 0.078 262.000 0.000 NA   NA
 1181245 1181246 XCV0392 XCV0393     TRUE 0.869 133.000 0.667 NA   NA
 1181247 1181248 XCV0394 XCV0395     TRUE 0.514 51.000 0.042 NA   NA
 1181248 1181249 XCV0395 XCV0396     TRUE 0.469 44.000 0.019 NA   NA
 1181250 1181251 XCV0397 XCV0398 aspH bioC FALSE 0.038 250.000 0.000 1.000 N NA
 1181251 1181252 XCV0398 XCV0399 bioC   TRUE 0.733 64.000 0.006 1.000 Y NA
 1181252 1181253 XCV0399 XCV0400   bioH TRUE 0.527 46.000 0.033 1.000   NA
 1181253 1181254 XCV0400 XCV0401 bioH   TRUE 0.687 -67.000 0.065 NA   NA
 1181254 1181255 XCV0401 XCV0402   bioF FALSE 0.216 192.000 0.008 NA   NA
 1181255 1181256 XCV0402 XCV0403 bioF bioB TRUE 0.962 92.000 0.168 0.002 Y NA
 1181258 1181259 XCV0405 XCV0406 ubiA   FALSE 0.348 107.000 0.000 NA   NA
 1181261 1181262 XCV0407 XCV0408   hpaG FALSE 0.328 46.000 0.000 NA   NA
 1181262 1181263 XCV0408 XCV0409 hpaG hpaF FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 1181263 1181264 XCV0409 XCV0410 hpaF   FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1181264 1181265 XCV0410 XCV0411   hrpF FALSE 0.339 116.000 0.000 NA   NA
 1181266 1181267 XCV0412 XCV0413     TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1181267 1181268 XCV0413 XCV0414   xopF1 TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181269 1181270 XCV0415 XCV0416 hpaE hpaB TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1181270 1181271 XCV0416 XCV0417 hpaB hrpE FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1181271 1181272 XCV0417 XCV0418 hrpE hrpD6 TRUE 0.912 82.000 1.000 NA   NA
 1181272 1181273 XCV0418 XCV0419 hrpD6 hrcD TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181273 1181274 XCV0419 XCV0420 hrcD hpaA TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181274 1181275 XCV0420 XCV0421 hpaA hrcS TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1181275 1181276 XCV0421 XCV0422 hrcS hrcR TRUE 0.998 5.000 0.400 0.013 Y NA
 1181276 1181277 XCV0422 XCV0423 hrcR hrcQ TRUE 0.971 -13.000 0.182 1.000 Y NA
 1181277 1181278 XCV0423 XCV0424 hrcQ hpaC TRUE 0.740 132.000 0.273 NA   NA
 1181278 1181279 XCV0424 XCV0425 hpaC hrcV TRUE 0.994 0.000 0.400 NA   NA
 1181279 1181280 XCV0425 XCV0426 hrcV hrcU TRUE 0.998 9.000 0.500 0.013 Y NA
 1181281 1181282 XCV0427 XCV0428 hrpB1 hrpB2 TRUE 0.898 34.000 0.600 NA   NA
 1181282 1181283 XCV0428 XCV0429 hrpB2 hrcJ TRUE 0.996 2.000 0.833 1.000   NA
 1181283 1181284 XCV0429 XCV0430 hrcJ hrpB4 TRUE 0.992 8.000 0.833 NA   NA
 1181284 1181285 XCV0430 XCV0431 hrpB4 hrcL TRUE 0.933 -15.000 0.312 NA   NA
 1181285 1181286 XCV0431 XCV0432 hrcL hrcN TRUE 0.983 -10.000 0.312 NA Y NA
 1181286 1181287 XCV0432 XCV0433 hrcN hrpB7 TRUE 0.986 -7.000 0.800 NA   NA
 1181287 1181288 XCV0433 XCV0434 hrpB7 hrcT TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181288 1181289 XCV0434 XCV0435 hrcT hrcC TRUE 0.966 82.000 1.000 1.000 Y NA
 10702484 1181290 IS_1595_2 XCV0436     FALSE 0.279 -863.000 0.000 NA   NA
 1181291 1181292 XCV0437 XCV0438 xopD   FALSE 0.308 140.000 0.000 1.000   NA
 1181292 1181293 XCV0438 XCV0439     TRUE 0.861 51.000 0.286 0.093   NA
 1181296 1181297 XCV0442 XCV0443     FALSE 0.064 281.000 0.000 NA   NA
 1181297 1181298 XCV0443 XCV0444     FALSE 0.015 692.000 0.000 NA   NA
 1181305 1181306 XCV0451 XCV0452 glgA glgB2 TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 1181306 1181307 XCV0452 XCV0453 glgB2   TRUE 0.999 3.000 0.600 0.004 Y NA
 1181307 1181308 XCV0453 XCV0454   malQ TRUE 0.998 -3.000 0.093 0.013 Y NA
 1181308 1181309 XCV0454 XCV0455 malQ glgY TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.013 Y NA
 1181309 1181310 XCV0455 XCV0456 glgY   TRUE 0.717 22.000 0.031 NA   NA
 1181310 1181311 XCV0456 XCV0457   glgX1 TRUE 0.793 118.000 0.333 NA   NA
 1181311 1181312 XCV0457 XCV0458 glgX1   TRUE 0.918 17.000 0.016 NA Y NA
 1181313 1181314 XCV0459 XCV0460     TRUE 0.513 -36.000 0.000 NA   NA
 1181315 1181316 XCV0461 XCV0462   virK FALSE 0.108 231.000 0.000 NA   NA
 1181318 1181319 XCV0464 XCV0465     TRUE 0.799 78.000 0.500 1.000 N NA
 1181319 1181320 XCV0465 XCV0466     TRUE 0.996 -3.000 0.857 NA N NA
 1181320 1181321 XCV0466 XCV0467     TRUE 0.711 133.000 0.218 NA   NA
 1181321 1181322 XCV0467 XCV0468     TRUE 0.977 2.000 0.074 NA   NA
 1181322 1181323 XCV0468 XCV0469     TRUE 0.981 -3.000 0.074 NA   NA
 1181326 1181327 XCV0472 XCV0473     FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 1181327 1181328 XCV0473 XCV0474     TRUE 0.979 -3.000 0.064 NA   NA
 1181328 1181329 XCV0474 XCV0475     TRUE 0.971 2.000 0.042 NA   NA
 1181329 1181330 XCV0475 XCV0476     TRUE 0.997 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 1181330 1181331 XCV0476 XCV0477     FALSE 0.289 178.000 0.013 1.000   NA
 1181332 1181333 XCV0478 XCV0479     FALSE 0.325 250.000 0.000 1.000 Y NA
 1181333 1181334 XCV0479 XCV0480     TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1181336 1181337 XCV0482 XCV0483     FALSE 0.223 172.000 0.000 1.000   NA
 1181337 1181338 XCV0483 XCV0484   hmgA TRUE 0.452 61.000 0.017 1.000   NA
 1181341 1181342 XCV0487 XCV0488 phag phaF TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 1181342 1181343 XCV0488 XCV0489 phaF phaE TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.064 Y NA
 1181343 1181344 XCV0489 XCV0490 phaE phaD TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 1181344 1181345 XCV0490 XCV0491 phaD phaC TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 1181345 1181346 XCV0491 XCV0492 phaC phaA TRUE 1.000 0.000 0.881 0.006 Y NA
 1181348 1181349 XCV0494 XCV0495     FALSE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 1181349 1181350 XCV0495 XCV0496     FALSE 0.028 426.000 0.000 1.000   NA
 1181350 1181351 XCV0496 XCV0497     FALSE 0.326 73.000 0.000 NA   NA
 1181351 1181352 XCV0497 XCV0498     FALSE 0.100 237.000 0.000 NA   NA
 1181352 1181353 XCV0498 XCV0499     FALSE 0.108 231.000 0.000 NA   NA
 1181353 1181354 XCV0499 XCV0500   purC FALSE 0.356 132.000 0.004 NA   NA
 1181355 1181356 XCV0501 XCV0502   rpe FALSE 0.364 154.000 0.015 1.000   NA
 1181356 1181357 XCV0502 XCV0503 rpe   TRUE 0.979 -3.000 0.050 1.000   NA
 1181357 1181358 XCV0503 XCV0504     FALSE 0.110 236.000 0.000 1.000   NA
 1181358 1181359 XCV0504 XCV0505   trpE FALSE 0.036 258.000 0.000 1.000 N NA
 1181359 1181360 XCV0505 XCV0506 trpE   TRUE 0.990 0.000 0.007 1.000 Y NA
 1181360 1181361 XCV0506 XCV0507     TRUE 0.658 19.000 0.007 NA   NA
 1181361 1181362 XCV0507 XCV0508     FALSE 0.273 145.000 0.000 NA   NA
 1181362 1181363 XCV0508 XCV0509   hsdR1 TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1181363 1181364 XCV0509 XCV0510 hsdR1 hsdS1 TRUE 0.999 3.000 0.500 0.001 Y NA
 1181364 1181365 XCV0510 XCV0511 hsdS1   TRUE 0.995 2.000 0.286 0.093   NA
 1181365 1181366 XCV0511 XCV0512     TRUE 0.983 -3.000 0.102 NA   NA
 1181366 1181367 XCV0512 XCV0513   hsdM1 TRUE 0.983 -3.000 0.093 NA   NA
 1181367 1181368 XCV0513 XCV0514 hsdM1 trpG FALSE 0.208 146.000 0.008 1.000 N NA
 1181368 1181369 XCV0514 XCV0515 trpG   TRUE 0.468 101.000 0.013 1.000   NA
 1181369 1181370 XCV0515 XCV0516   trpD FALSE 0.396 116.000 0.003 1.000   NA
 1181370 1181371 XCV0516 XCV0517 trpD trpC TRUE 0.888 141.000 0.293 1.000 Y NA
 1181371 1181372 XCV0517 XCV0518 trpC   TRUE 0.962 -7.000 0.010 1.000 Y NA
 1181374 1181375 XCV0520 XCV0521 speD sugE FALSE 0.227 165.000 0.019 1.000 N NA
 1181377 1181378 XCV0523 XCV0524 rplM rpsI TRUE 0.999 3.000 0.601 0.012 Y NA
 1181379 1181380 XCV_tRNA02 XCV_tRNA03 tRNA-Gln tRNA-Met FALSE 0.303 53.000 0.000 NA   NA
 1181381 1181382 XCV0525 XCV0526 nudH   FALSE 0.287 81.000 0.015 NA N NA
 1181382 1181383 XCV0526 XCV0527   bfr FALSE 0.332 315.000 0.070 NA Y NA
 1181384 1181385 XCV0528 XCV0529     TRUE 0.999 1.000 0.556 0.027 Y NA
 1181388 1181389 XCV0532 XCV0533     TRUE 0.969 4.000 0.086 NA   NA
 1181389 1181390 XCV0533 XCV0534     TRUE 0.612 84.000 0.079 NA   NA
 1181392 1181393 XCV0536 XCV0537     FALSE 0.078 272.000 0.000 1.000   NA
 1181393 1181394 XCV0537 XCV0538     FALSE 0.332 74.000 0.020 1.000 N NA
 1181395 1181396 XCV0539 XCV0540     TRUE 0.667 48.000 0.148 NA   NA
 1181396 1181397 XCV0540 XCV0541     FALSE 0.026 463.000 0.000 1.000   NA
 1181397 1181398 XCV0541 XCV0542     FALSE 0.277 69.000 0.011 1.000 N NA
 1181400 1181401 XCV0544 XCV0545   purD FALSE 0.135 209.000 0.000 NA   NA
 1181401 1181402 XCV0545 XCV0546 purD   TRUE 0.451 33.000 0.002 NA   NA
 1181402 1181403 XCV0546 XCV0547   purH TRUE 0.558 25.000 0.003 NA   NA
 1181404 1181405 XCV0548 XCV0549 pgsA   TRUE 0.898 92.000 0.215 NA Y NA
 1181405 1181406 XCV0549 XCV0550     TRUE 0.991 -3.000 0.285 NA   NA
 1181406 1181407 XCV0550 XCV0551     TRUE 0.982 -3.000 0.090 NA   NA
 1181407 1181408 XCV0551 XCV0552     TRUE 0.989 -3.000 0.200 NA   NA
 1181408 1181409 XCV0552 XCV0553     TRUE 0.981 0.000 0.069 NA   NA
 1181409 1181410 XCV0553 XCV0554     TRUE 0.997 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 1181410 1181411 XCV0554 XCV0555     TRUE 0.996 -3.000 0.595 1.000   NA
 1181412 1181413 XCV0556 XCV0557     FALSE 0.348 106.000 0.000 NA   NA
 1181413 1181414 XCV0557 XCV0558     FALSE 0.013 955.000 0.000 NA   NA
 1181417 1181418 XCV0561 XCV0562     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1181419 1181420 XCV0563 XCV0564 accC   TRUE 0.818 -10.000 0.014 NA   NA
 1181420 1181421 XCV0564 XCV0565   accB TRUE 0.614 21.000 0.004 NA   NA
 1181421 1181422 XCV0565 XCV0566 accB aroQ TRUE 0.703 97.000 0.254 1.000 N NA
 1181422 1181423 XCV0566 XCV0567 aroQ   FALSE 0.006 845.000 0.000 1.000 N NA
 1181423 1181424 XCV0567 XCV0568   cutA TRUE 0.871 6.000 0.014 1.000 N NA
 1181424 1181425 XCV0568 XCV0569 cutA   FALSE 0.010 467.000 0.000 1.000 N NA
 1181426 1181427 XCV0570 XCV0571 groES groEL TRUE 0.952 143.000 0.269 0.007 Y NA
 1181429 1181430 XCV0573 XCV0574   aroG FALSE 0.020 533.000 0.000 1.000   NA
 1181430 1181431 XCV0574 XCV0575 aroG   FALSE 0.014 785.000 0.000 NA   NA
 1181431 1181432 XCV0575 XCV0576     FALSE 0.357 94.000 0.000 NA   NA
 1181433 1181434 XCV0577 XCV0578 gnl   TRUE 0.971 0.000 0.025 NA   NA
 1181440 1181441 XCV0584 XCV0585     TRUE 0.982 -3.000 0.088 NA   NA
 1181441 1181442 XCV0585 XCV0586     TRUE 0.626 43.000 0.088 NA   NA
 1181443 1181444 XCV0587 XCV0588     FALSE 0.320 232.000 0.132 NA   NA
 1181444 1181445 XCV0588 XCV0589     FALSE 0.035 367.000 0.000 NA   NA
 1181445 1181446 XCV0589 XCV0590   appA TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1181447 1181448 XCV0591 XCV0592   mxcB TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1181448 1181449 XCV0592 XCV0593 mxcB   FALSE 0.166 311.000 0.223 NA N NA
 1181450 1181451 XCV0594 XCV0595 mdcA mdcC TRUE 0.974 10.000 0.342 NA   NA
 1181451 1181452 XCV0595 XCV0596 mdcC mdcD TRUE 0.837 107.000 0.438 NA   NA
 1181452 1181453 XCV0596 XCV0597 mdcD mdcE TRUE 0.981 -9.000 0.700 NA   NA
 1181453 1181454 XCV0597 XCV0598 mdcE mdcG TRUE 0.977 3.000 0.102 NA   NA
 1181454 1181455 XCV0598 XCV0599 mdcG mdcB TRUE 0.983 -3.000 0.085 1.000   NA
 1181455 1181456 XCV0599 XCV0600 mdcB mdcH FALSE 0.319 227.000 0.203 1.000 N NA
 1181456 1181457 XCV0600 XCV0601 mdcH matC TRUE 0.623 88.000 0.070 1.000   NA
 1181457 1181458 XCV0601 XCV0602 matC mdcY TRUE 0.778 46.000 0.300 1.000   NA
 1181459 1181460 XCV0603 XCV0604     FALSE 0.193 222.000 0.015 1.000   NA
 1181460 1181461 XCV0604 XCV0605     TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 1181461 1181462 XCV0605 XCV0606     TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 1181463 1181464 XCV0607 XCV0608     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181464 1181465 XCV0608 XCV0609     FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 1181465 1181466 XCV0609 XCV0610   ganA TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181466 1181467 XCV0610 XCV0611 ganA aceE TRUE 0.880 0.000 0.000 1.000 N NA
 1181467 1181468 XCV0611 XCV0612 aceE   FALSE 0.028 426.000 0.000 1.000   NA
 1181468 1181469 XCV0612 XCV0613     TRUE 0.981 11.000 0.565 1.000   NA
 1181469 1181470 XCV0613 XCV0614     TRUE 0.869 -99.000 0.037 0.005   NA
 1181472 1181473 XCV0616 XCV0617     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181473 10702485 XCV0617 IS_Xcv1_1     FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1181474 1181475 XCV0618 XCV0619     TRUE 0.812 153.000 0.250 0.091   NA
 10702486 1181476 IS_Xac2_2 XCV0620     FALSE 0.345 -335.000 0.000 NA   NA
 1181476 1181477 XCV0620 XCV0621     TRUE 0.943 -6.000 0.000 0.091   NA
 1181477 10702487 XCV0621 IS_1479_2     FALSE 0.013 1767.000 0.000 NA   NA
 1181481 1181482 XCV0625 XCV0626     TRUE 0.709 33.000 0.000 0.091   NA
 1181482 1181483 XCV0626 XCV0627     FALSE 0.342 48.000 0.000 1.000   NA
 1181484 1181485 XCV0628 XCV0629     FALSE 0.066 277.000 0.000 NA   NA
 1181485 1181486 XCV0629 XCV0630     FALSE 0.225 164.000 0.000 NA   NA
 1181486 1181487 XCV0630 XCV0631     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 1181489 1181490 XCV0633 XCV0634     FALSE 0.026 426.000 0.000 NA   NA
 1181492 1181493 XCV0636 XCV0637     FALSE 0.227 163.000 0.000 NA   NA
 1181493 1181494 XCV0637 XCV0638     FALSE 0.395 73.000 0.041 NA N NA
 1181495 1181496 XCV0639 XCV0640     FALSE 0.083 256.000 0.000 NA   NA
 1181496 1181497 XCV0640 XCV0641     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181497 1181498 XCV0641 XCV0642     FALSE 0.014 773.000 0.000 NA   NA
 1181501 1181502 XCV0645 XCV0646     FALSE 0.352 109.000 0.024 NA N NA
 1181502 1181503 XCV0646 XCV0647     TRUE 0.641 103.000 0.195 NA N NA
 1181503 1181504 XCV0647 XCV0648     FALSE 0.201 176.000 0.000 NA   NA
 1181505 1181506 XCV0649 XCV0650     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1181506 1181507 XCV0650 XCV0651     FALSE 0.353 99.000 0.000 NA   NA
 1181515 1181516 XCV0659 XCV0660   treA FALSE 0.026 426.000 0.000 NA   NA
 1181516 1181517 XCV0660 XCV0661 treA   FALSE 0.071 273.000 0.000 NA   NA
 1181521 1181522 XCV0665 XCV0666     FALSE 0.035 366.000 0.000 NA   NA
 1181524 1181525 XCV0668 XCV0669     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181525 1181526 XCV0669 XCV0670   engXCA FALSE 0.039 249.000 0.000 1.000 N NA
 1181527 1181528 XCV0671 XCV0672     FALSE 0.044 238.000 0.000 1.000 N NA
 1181528 1181529 XCV0672 XCV0673     FALSE 0.232 168.000 0.000 1.000   NA
 1181531 1181532 XCV0675 XCV0676 opgH   TRUE 0.461 151.000 0.046 NA   NA
 1181532 1181533 XCV0676 XCV0677     TRUE 0.953 5.000 0.037 1.000   NA
 1181533 1181534 XCV0677 XCV0678   algR TRUE 0.988 31.000 0.775 0.033 Y NA
 1181534 1181535 XCV0678 XCV0679 algR hemC TRUE 0.511 31.000 0.032 1.000 N NA
 1181538 1181539 XCV0682 XCV0683   blc1 FALSE 0.023 462.000 0.000 NA   NA
 1181540 1181541 XCV0684 XCV0685     TRUE 0.512 68.000 0.034 NA   NA
 1181543 1181544 XCV0687 XCV0688 ptrB   FALSE 0.113 368.000 0.105 NA   NA
 1181544 1181545 XCV0688 XCV0689   dapF FALSE 0.053 301.000 0.000 NA   NA
 1181545 1181546 XCV0689 XCV0690 dapF   TRUE 0.987 -3.000 0.175 NA   NA
 1181546 1181547 XCV0690 XCV0691   xerC TRUE 0.787 181.000 0.714 NA   NA
 1181547 1181548 XCV0691 XCV0692 xerC hslV FALSE 0.162 197.000 0.020 1.000 N NA
 1181548 1181549 XCV0692 XCV0693 hslV hslU TRUE 0.960 111.000 0.752 1.000 Y NA
 1181550 1181551 XCV0694 XCV0695     TRUE 0.967 -3.000 0.014 1.000   NA
 1181551 1181552 XCV0695 XCV0696     TRUE 0.561 123.000 0.044 1.000   NA
 1181552 1181553 XCV0696 XCV0697     TRUE 0.996 -3.000 0.578 1.000   NA
 1181554 1181555 XCV0698 XCV0699 ubiE   FALSE 0.425 20.000 0.002 1.000 N NA
 1181555 1181556 XCV0699 XCV0700   pepN FALSE 0.439 121.000 0.047 1.000 N NA
 1181556 1181557 XCV0700 XCV0701 pepN   TRUE 0.610 88.000 0.070 NA   NA
 1181557 1181558 XCV0701 XCV0702     FALSE 0.063 385.000 0.031 NA   NA
 1181558 1181559 XCV0702 XCV0703     FALSE 0.021 497.000 0.000 NA   NA
 1181559 1181560 XCV0703 XCV0704     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 10702489 1181561 IS_Xac3_3 XCV0705     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1181561 1181562 XCV0705 XCV0706     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.090 Y NA
 1181563 1181564 XCV0707 XCV0708   mxaF FALSE 0.023 463.000 0.000 NA   NA
 1181564 1181565 XCV0708 XCV0709 mxaF mxaF TRUE 0.898 -25.000 0.000 0.001   NA
 1181565 1181566 XCV0709 XCV0710 mxaF   TRUE 0.855 84.000 0.500 1.000   NA
 1181566 1181567 XCV0710 XCV0711     TRUE 0.841 63.000 0.500 1.000   NA
 1181567 1181568 XCV0711 XCV0712     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181568 1181569 XCV0712 XCV0713     TRUE 0.847 36.000 0.400 NA   NA
 1181569 1181570 XCV0713 XCV0714     TRUE 0.972 12.000 0.667 1.000 N NA
 1181571 1181572 XCV0715 XCV0716     FALSE 0.037 256.000 0.000 1.000 N NA
 1181573 1181574 XCV0717 XCV0718 mreB mreC TRUE 0.769 166.000 0.689 1.000 N NA
 1181574 1181575 XCV0718 XCV0719 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 1181575 1181576 XCV0719 XCV0720 mreD mrdA TRUE 0.985 4.000 0.013 1.000 Y NA
 1181576 1181577 XCV0720 XCV0721 mrdA mrdB TRUE 0.933 -3.000 0.013 1.000 N NA
 1181577 1181578 XCV0721 XCV0722 mrdB pgl FALSE 0.016 357.000 0.000 1.000 N NA
 1181578 1181579 XCV0722 XCV0723 pgl mltB FALSE 0.071 678.000 0.000 NA Y NA
 1181579 1181580 XCV0723 XCV0724 mltB rlpA TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 1181580 1181581 XCV0724 XCV0725 rlpA dacC FALSE 0.209 442.000 0.080 1.000 Y NA
 1181583 1181584 XCV0727 XCV0728   lipB TRUE 0.931 -12.000 0.219 NA   NA
 1181584 1181585 XCV0728 XCV0729 lipB lipA TRUE 0.993 16.000 0.319 0.001 Y NA
 1181585 1181586 XCV0729 XCV0730 lipA prc FALSE 0.013 395.000 0.000 1.000 N NA
 1181590 1181591 XCV0734 XCV0735     TRUE 0.837 123.000 0.078 1.000 Y NA
 1181591 1181592 XCV0735 XCV0736     TRUE 0.683 23.000 0.022 NA   NA
 1181592 1181593 XCV0736 XCV0737     TRUE 0.825 -7.000 0.003 NA   NA
 1181593 1181594 XCV0737 XCV0738     FALSE 0.403 39.000 0.003 NA   NA
 1181594 1181595 XCV0738 XCV0739     TRUE 0.561 125.000 0.053 NA   NA
 1181595 1181596 XCV0739 XCV0740     TRUE 0.544 101.000 0.035 NA   NA
 1181596 1181597 XCV0740 XCV0741   gndA TRUE 0.754 21.000 0.042 NA   NA
 1181599 1181600 XCV0743 XCV0744     FALSE 0.063 282.000 0.000 NA   NA
 1181600 1181601 XCV0744 XCV0745     TRUE 0.995 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 1181601 1181602 XCV0745 XCV0746     TRUE 0.997 4.000 0.116 0.026 Y NA
 1181602 1181603 XCV0746 XCV0747   folK FALSE 0.344 93.000 0.017 1.000 N NA
 1181605 1181606 XCV0749 XCV0750     TRUE 0.785 -12.000 0.012 NA   NA
 1181607 1181608 XCV0751 XCV0752     FALSE 0.047 333.000 0.000 1.000   NA
 1181609 1181610 XCV0753 XCV0754     TRUE 0.803 77.000 0.373 NA   NA
 1181610 1181611 XCV0754 XCV0755   xcsC FALSE 0.439 159.000 0.043 1.000   NA
 1181611 1181612 XCV0755 XCV0756 xcsC xcsD TRUE 0.996 -3.000 0.575 1.000   NA
 1181612 1181613 XCV0756 XCV0757 xcsD xcsE TRUE 0.999 5.000 0.776 0.005 Y NA
 1181613 1181614 XCV0757 XCV0758 xcsE xcsF TRUE 0.996 -13.000 0.653 0.005 Y NA
 1181614 1181615 XCV0758 XCV0759 xcsF xcsG TRUE 0.989 29.000 0.599 0.005 Y NA
 1181615 1181616 XCV0759 XCV0760 xcsG xcsH TRUE 0.928 52.000 0.425 0.005   NA
 1181616 1181617 XCV0760 XCV0761 xcsH xcsI TRUE 0.986 -16.000 0.605 0.005   NA
 1181617 1181618 XCV0761 XCV0762 xcsI xcsJ TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.005   NA
 1181618 1181619 XCV0762 XCV0763 xcsJ xcsK TRUE 0.998 0.000 0.461 1.000 Y NA
 1181619 1181620 XCV0763 XCV0764 xcsK xcsL TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.062 Y NA
 1181620 1181621 XCV0764 XCV0765 xcsL xcsM TRUE 0.999 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 1181621 1181622 XCV0765 XCV0766 xcsM xcsN TRUE 0.991 6.000 0.649 1.000   NA
 1181622 1181623 XCV0766 XCV0767 xcsN   FALSE 0.041 353.000 0.000 1.000   NA
 1181623 1181624 XCV0767 XCV0768   gluP TRUE 0.531 44.000 0.093 1.000 N NA
 1181624 1181625 XCV0768 XCV0769 gluP   TRUE 0.604 41.000 0.140 1.000 N NA
 1181625 1181626 XCV0769 XCV0770   glmS TRUE 0.896 7.000 0.030 1.000 N NA
 1181626 1181627 XCV0770 XCV0771 glmS nagA TRUE 0.937 3.000 0.030 1.000 N NA
 1181627 1181628 XCV0771 XCV0772 nagA   FALSE 0.006 804.000 0.000 1.000 N NA
 1181629 1181630 XCV0773 XCV0774 cca beta FALSE 0.116 158.000 0.000 1.000 N NA
 1181630 1181631 XCV0774 XCV0775 beta betB TRUE 0.832 127.000 0.634 1.000 N NA
 1181631 1181632 XCV0775 XCV0776 betB betT FALSE 0.301 41.000 0.012 1.000 N NA
 1181632 1181633 XCV0776 XCV0777 betT   FALSE 0.122 282.000 0.029 NA   NA
 1181633 1181634 XCV0777 XCV0778     TRUE 0.802 20.000 0.074 NA   NA
 1181634 1181635 XCV0778 XCV0779     TRUE 0.985 92.000 0.714 0.006 Y NA
 1181635 1181636 XCV0779 XCV0780     TRUE 0.723 94.000 0.286 1.000 N NA
 1181637 1181638 XCV0781 XCV0782   gsh1 FALSE 0.211 179.000 0.000 1.000   NA
 1181639 1181640 XCV0783 XCV0784     TRUE 0.996 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 1181641 1181642 XCV0785 XCV0786     FALSE 0.379 95.000 0.000 1.000   NA
 1181642 1181643 XCV0786 XCV0787     FALSE 0.132 211.000 0.000 NA   NA
 1181643 1181644 XCV0787 XCV0788     TRUE 0.851 67.000 0.531 NA   NA
 1181644 1181645 XCV0788 XCV0789     TRUE 0.586 69.000 0.061 1.000   NA
 1181645 1181646 XCV0789 XCV0790     TRUE 0.560 59.000 0.057 1.000   NA
 1181647 1181648 XCV0791 XCV0792     FALSE 0.196 179.000 0.000 NA   NA
 1181649 1181650 XCV0793 XCV0794   glyA FALSE 0.156 198.000 0.000 NA   NA
 1181650 1181651 XCV0794 XCV0795 glyA   TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181651 1181652 XCV0795 XCV0796     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1181652 1181653 XCV0796 XCV0797     TRUE 0.955 -3.000 0.005 NA   NA
 1181653 1181654 XCV0797 XCV0798   ribD TRUE 0.843 -7.000 0.005 1.000   NA
 1181656 1181657 XCV0800 XCV0801 ribE ribB TRUE 0.991 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 1181657 1181658 XCV0801 XCV0802 ribB ribH TRUE 0.850 290.000 0.417 0.001 Y NA
 1181658 1181659 XCV0802 XCV0803 ribH nusB TRUE 0.930 -3.000 0.011 1.000 N NA
 1181659 1181660 XCV0803 XCV0804 nusB thiL TRUE 0.676 111.000 0.225 1.000 N NA
 1181660 1181661 XCV0804 XCV0805 thiL   FALSE 0.036 382.000 0.000 1.000   NA
 1181661 1181662 XCV0805 XCV0806     FALSE 0.116 225.000 0.000 NA   NA
 1181662 1181663 XCV0806 XCV0807   kdpF FALSE 0.024 448.000 0.000 NA   NA
 1181663 1181664 XCV0807 XCV0808 kdpF kdpA TRUE 0.847 16.000 0.071 NA   NA
 1181664 1181665 XCV0808 XCV0809 kdpA kdpB TRUE 0.992 13.000 0.145 0.001 Y NA
 1181665 1181666 XCV0809 XCV0810 kdpB kdpC TRUE 0.999 11.000 0.877 0.001 Y NA
 1181666 1181667 XCV0810 XCV0811 kdpC kdpD FALSE 0.234 171.000 0.026 1.000 N NA
 1181667 1181668 XCV0811 XCV0812 kdpD kdpE TRUE 0.986 -10.000 0.379 1.000 Y NA
 1181669 1181670 XCV0813 XCV0814     TRUE 0.965 5.000 0.091 NA   NA
 1181670 1181671 XCV0814 XCV0815     TRUE 0.798 -39.000 0.130 NA   NA
 1181671 1181672 XCV0815 XCV0816     TRUE 0.504 30.000 0.004 NA   NA
 1181672 1181673 XCV0816 XCV0817     TRUE 0.979 4.000 0.172 NA   NA
 1181675 1181676 XCV0819 XCV0820     TRUE 0.987 -3.000 0.170 NA   NA
 1181676 1181677 XCV0820 XCV0821     FALSE 0.396 48.000 0.009 NA   NA
 1181678 1181679 XCV0822 XCV0823 mraZ mraW TRUE 0.873 45.000 0.635 NA   NA
 1181679 1181680 XCV0823 XCV0824 mraW ftsL TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 N NA
 1181680 1181681 XCV0824 XCV0825 ftsL ftsI FALSE 0.069 284.000 0.024 1.000 N NA
 1181681 1181682 XCV0825 XCV0826 ftsI murE TRUE 0.973 9.000 0.012 1.000 Y NA
 1181682 1181683 XCV0826 XCV0827 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 1181683 1181684 XCV0827 XCV0828 murF mraY TRUE 0.994 -10.000 0.309 0.004 Y NA
 1181684 1181685 XCV0828 XCV0829 mraY ftsW TRUE 0.990 0.000 0.018 0.004 N NA
 1181685 1181686 XCV0829 XCV0830 ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1181686 1181687 XCV0830 XCV0831 murG murC TRUE 0.997 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 1181687 1181688 XCV0831 XCV0832 murC ddlB TRUE 0.999 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 1181688 1181689 XCV0832 XCV0833 ddlB ftsQ TRUE 0.918 125.000 0.372 NA Y NA
 1181689 1181690 XCV0833 XCV0834 ftsQ ftsA TRUE 0.990 -3.000 0.389 NA N NA
 1181690 1181691 XCV0834 XCV0835 ftsA ftsZ TRUE 0.596 314.000 0.460 1.000 Y NA
 1181691 1181692 XCV0835 XCV0836 ftsZ lpxC FALSE 0.239 235.000 0.134 1.000 N NA
 1181694 1181695 XCV0838 XCV0839   secA FALSE 0.373 157.000 0.068 1.000 N NA
 1181695 1181696 XCV0839 XCV0840 secA   FALSE 0.029 323.000 0.006 1.000 N NA
 1181697 1181698 XCV0841 XCV0842   metF FALSE 0.432 46.000 0.014 NA   NA
 1181698 1181699 XCV0842 XCV0843 metF   FALSE 0.442 40.000 0.007 1.000   NA
 1181700 1181701 XCV0844 XCV0845     FALSE 0.106 240.000 0.000 1.000   NA
 1181703 1181704 XCV0847 XCV0848     FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 1181705 1181706 XCV0849 XCV0850     TRUE 0.826 -120.000 0.000 0.001   NA
 1181707 1181708 XCV0851 XCV0852     FALSE 0.301 220.000 0.080 NA   NA
 1181708 1181709 XCV0852 XCV0853     FALSE 0.257 151.000 0.000 NA   NA
 1181709 1181710 XCV0853 XCV0854     FALSE 0.021 493.000 0.000 NA   NA
 1181710 1181711 XCV0854 XCV0855     TRUE 0.805 32.000 0.200 1.000   NA
 1181713 1181714 XCV0857 XCV0858     FALSE 0.078 352.000 0.089 1.000 N NA
 1181714 1181715 XCV0858 XCV0859     TRUE 0.639 65.000 0.105 1.000   NA
 1181715 1181716 XCV0859 XCV0860     TRUE 0.975 -3.000 0.039 NA   NA
 1181716 1181717 XCV0860 XCV0861     TRUE 0.946 9.000 0.078 NA   NA
 1181717 1181718 XCV0861 XCV0862     TRUE 0.719 142.000 0.286 NA   NA
 1181718 1181719 XCV0862 XCV0863     FALSE 0.009 505.000 0.000 1.000 N NA
 1181719 1181720 XCV0863 XCV0864   appA TRUE 0.791 56.000 0.375 1.000   NA
 1181723 1181724 XCV0867 XCV0868     TRUE 0.524 29.000 0.002 1.000   NA
 1181724 1181725 XCV0868 XCV0869     FALSE 0.399 108.000 0.002 1.000   NA
 1181725 1181726 XCV0869 XCV0870   rbsK FALSE 0.020 527.000 0.000 1.000   NA
 1181726 1181727 XCV0870 XCV0871 rbsK   FALSE 0.392 91.000 0.027 1.000 N NA
 1181727 1181728 XCV0871 XCV0872     FALSE 0.016 631.000 0.000 NA   NA
 1181729 1181730 XCV0873 XCV0874     FALSE 0.374 157.000 0.023 NA   NA
 1181730 1181731 XCV0874 XCV0875     FALSE 0.197 247.000 0.046 NA   NA
 1181731 1181732 XCV0875 XCV0876     TRUE 0.971 6.000 0.160 NA   NA
 1181732 1181733 XCV0876 XCV0877     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181733 1181734 XCV0877 XCV0878     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1181735 1181736 XCV0879 XCV0880     FALSE 0.419 80.000 0.011 NA   NA
 1181736 1181737 XCV0880 XCV0881     TRUE 0.999 -3.000 0.795 1.000 Y NA
 1181737 1181738 XCV0881 XCV0882     TRUE 0.997 4.000 0.553 NA Y NA
 1181738 1181739 XCV0882 XCV0883   tauD TRUE 0.844 41.000 0.647 NA N NA
 1181739 1181740 XCV0883 XCV0884 tauD   FALSE 0.368 249.000 0.011 NA Y NA
 1181740 1181741 XCV0884 XCV0885     TRUE 0.993 -3.000 0.535 NA N NA
 1181742 1181743 XCV0886 XCV0887     FALSE 0.336 92.000 0.016 1.000 N NA
 1181743 1181744 XCV0887 XCV0888     TRUE 0.933 50.000 0.500 1.000 Y NA
 1181746 1181747 XCV0890 XCV0891 dgkA   FALSE 0.379 64.000 0.007 NA   NA
 1181747 1181748 XCV0891 XCV0892     FALSE 0.039 345.000 0.000 NA   NA
 1181748 1181749 XCV0892 XCV0893     TRUE 0.966 0.000 0.015 NA   NA
 1181749 1181750 XCV0893 XCV0894   lgt FALSE 0.348 55.000 0.005 NA   NA
 1181750 1181751 XCV0894 XCV0895 lgt thyA TRUE 0.981 -3.000 0.164 1.000 N NA
 1181751 1181752 XCV0895 XCV0896 thyA   FALSE 0.303 54.000 0.000 NA   NA
 1181752 1181753 XCV0896 XCV0897   folA TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181754 1181755 XCV0898 XCV0899 apaH   TRUE 0.787 29.000 0.267 NA N NA
 1181755 1181756 XCV0899 XCV0900   ksgA TRUE 0.533 37.000 0.078 NA N NA
 1181756 1181757 XCV0900 XCV0901 ksgA pdxA TRUE 0.641 118.000 0.197 1.000 N NA
 1181757 1181758 XCV0901 XCV0902 pdxA surA TRUE 0.926 20.000 0.561 1.000 N NA
 1181758 1181759 XCV0902 XCV0903 surA ostA TRUE 0.945 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1181759 1181760 XCV0903 XCV0904 ostA   TRUE 0.726 129.000 0.357 NA N NA
 1181760 1181761 XCV0904 XCV0905     TRUE 0.465 39.000 0.013 NA   NA
 1181761 1181762 XCV0905 XCV0906     TRUE 0.937 4.000 0.013 NA   NA
 1181763 1181764 XCV0907 XCV0908 ubiH ubif TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 1181764 1181765 XCV0908 XCV0909 ubif   TRUE 0.803 98.000 0.017 0.007   NA
 1181765 1181766 XCV0909 XCV0910     TRUE 0.778 103.000 0.273 1.000   NA
 1181766 1181767 XCV0910 XCV0911     TRUE 0.532 151.000 0.091 NA   NA
 1181769 1181770 XCV0913 XCV0914 ligB ligA TRUE 0.988 11.000 0.190 0.001   NA
 1181770 1181771 XCV0914 XCV0915 ligA   TRUE 0.634 67.000 0.095 1.000   NA
 1181772 1181773 XCV0916 XCV0917     FALSE 0.303 204.000 0.000 0.057 N NA
 1181773 1181774 XCV0917 XCV0918   paaF TRUE 0.871 84.000 0.333 0.057 N NA
 1181774 1181775 XCV0918 XCV0919 paaF   TRUE 0.798 46.000 0.500 1.000 N NA
 1181775 1181776 XCV0919 XCV0920     FALSE 0.319 138.000 0.000 1.000   NA
 1181776 1181777 XCV0920 XCV0921     TRUE 0.501 26.000 0.000 NA   NA
 1181777 1181778 XCV0921 XCV0922     TRUE 0.629 82.000 0.094 NA   NA
 1181780 1181781 XCV0924 XCV0925     TRUE 0.542 40.000 0.032 NA   NA
 1181781 1181782 XCV0925 XCV0926     TRUE 0.980 0.000 0.065 NA   NA
 1181782 1181783 XCV0926 XCV0927     FALSE 0.047 318.000 0.000 NA   NA
 1181783 1181784 XCV0927 XCV0928     FALSE 0.436 32.000 0.000 NA   NA
 1181784 1181785 XCV0928 XCV0929     TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1181785 1181786 XCV0929 XCV0930   glnS FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1181787 1181788 XCV0931 XCV0932 gst1   TRUE 0.771 -16.000 0.024 NA   NA
 1181789 1181790 XCV0933 XCV0934     TRUE 0.998 -3.000 0.167 0.026 Y NA
 1181790 1181791 XCV0934 XCV0935     TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.082 N NA
 1181792 1181793 XCV0936 XCV0937   pms TRUE 0.457 96.000 0.013 NA   NA
 1181794 1181795 XCV0938 XCV0939   talB FALSE 0.037 356.000 0.000 NA   NA
 1181795 1181796 XCV0939 XCV0940 talB rnk FALSE 0.340 52.000 0.027 1.000 N NA
 1181796 1181797 XCV0940 XCV0941 rnk oxyR FALSE 0.211 498.000 0.008 0.082 Y NA
 1181797 1181798 XCV0941 XCV0942 oxyR ahpF TRUE 0.448 92.000 0.041 1.000 N NA
 1181798 1181799 XCV0942 XCV0943 ahpF ahpC TRUE 0.880 187.000 0.551 1.000 Y NA
 1181800 1181801 XCV0944 XCV0945 hemK pip FALSE 0.155 235.000 0.012 1.000   NA
 1181802 1181803 XCV0946 XCV0947     TRUE 0.944 -7.000 0.135 1.000   NA
 1181803 1181804 XCV0947 XCV0948   exo TRUE 0.981 -3.000 0.068 1.000   NA
 1181804 1181805 XCV0948 XCV0949 exo   TRUE 0.936 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1181806 1181807 XCV0950 XCV0951     FALSE 0.361 147.000 0.014 NA   NA
 1181808 1181809 XCV0952 XCV0953     TRUE 0.989 6.000 0.556 NA   NA
 1181809 1181810 XCV0953 XCV0954   rpoE1 TRUE 0.979 -3.000 0.065 NA   NA
 1181813 1181814 XCV0957 XCV0958   ilvE TRUE 0.465 65.000 0.017 1.000   NA
 1181814 1181815 XCV0958 XCV0959 ilvE   FALSE 0.022 308.000 0.000 1.000 N NA
 1181815 1181816 XCV0959 XCV0960     TRUE 0.907 259.000 0.667 0.005 Y NA
 1181816 1181817 XCV0960 XCV0961     FALSE 0.407 343.000 0.000 0.005 Y NA
 1181818 1181819 XCV0962 XCV0963     TRUE 0.920 5.000 0.006 1.000   NA
 1181820 1181821 XCV0964 XCV0965     FALSE 0.326 71.000 0.000 NA   NA
 1181822 1181823 XCV0966 XCV0967   wrbA TRUE 0.978 12.000 0.657 NA   NA
 1181824 1181825 XCV0968 XCV0969     TRUE 0.970 -3.000 0.020 1.000   NA
 1181825 1181826 XCV0969 XCV0970     TRUE 0.930 0.000 0.011 1.000 N NA
 1181826 1181827 XCV0970 XCV0971     FALSE 0.346 86.000 0.000 NA   NA
 1181828 1181829 XCV0972 XCV0973   moaB TRUE 0.497 33.000 0.006 1.000   NA
 1181829 1181830 XCV0973 XCV0974 moaB   FALSE 0.012 403.000 0.000 1.000 N NA
 1181830 1181831 XCV0974 XCV0975   prfA TRUE 0.907 -3.000 0.004 1.000 N NA
 1181831 1181832 XCV0975 XCV0976 prfA hemA TRUE 0.924 -22.000 0.171 0.035 N NA
 1181833 1181834 XCV0977 XCV0978   lolB TRUE 0.972 -3.000 0.024 1.000   NA
 1181834 1181835 XCV0978 XCV0979 lolB ispE TRUE 0.830 -18.000 0.157 1.000 N NA
 1181835 1181836 XCV0979 XCV_tRNA04 ispE tRNA-Gln TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1181836 1181837 XCV_tRNA04 XCV0980 tRNA-Gln prsA FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 1181837 1181838 XCV0980 XCV0981 prsA rplY TRUE 0.578 109.000 0.122 1.000 N NA
 1181838 1181839 XCV0981 XCV0982 rplY pth TRUE 0.969 52.000 0.496 0.018 Y NA
 1181839 1181840 XCV0982 XCV0983 pth   TRUE 0.881 78.000 0.184 1.000 Y NA
 1181840 1181841 XCV0983 XCV_tRNA05   tRNA-Tyr FALSE 0.246 155.000 0.000 NA   NA
 1181841 1181842 XCV_tRNA05 XCV_tRNA06 tRNA-Tyr tRNA-Gly TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 1181842 1181843 XCV_tRNA06 XCV_tRNA07 tRNA-Gly tRNA-Thr FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 1181843 1181844 XCV_tRNA07 XCV0984 tRNA-Thr tufA FALSE 0.325 47.000 0.000 NA   NA
 1181844 1181845 XCV0984 XCV_tRNA08 tufA tRNA-Trp FALSE 0.348 107.000 0.000 NA   NA
 1181845 1181846 XCV_tRNA08 XCV0985 tRNA-Trp secE FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1181846 1181847 XCV0985 XCV0986 secE nusG TRUE 0.970 14.000 0.843 1.000 N NA
 1181847 1181848 XCV0986 XCV0987 nusG rplK TRUE 0.675 199.000 0.681 1.000 N NA
 1181848 1181849 XCV0987 XCV0988 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.016 Y NA
 1181849 1181850 XCV0988 XCV0989 rplA rplJ FALSE 0.271 543.000 0.302 1.000 Y NA
 1181850 1181851 XCV0989 XCV0990 rplJ rplL TRUE 0.957 55.000 0.884 1.000 Y NA
 1181851 1181852 XCV0990 XCV0991 rplL rpoB FALSE 0.266 292.000 0.223 1.000   NA
 1181852 1181853 XCV0991 XCV0992 rpoB rpoC TRUE 0.973 101.000 0.851 0.001   NA
 1181853 1181854 XCV0992 XCV0993 rpoC rpsL FALSE 0.267 219.000 0.122 1.000 N NA
 1181854 1181855 XCV0993 XCV0994 rpsL rpsG TRUE 0.997 13.000 0.620 0.002 Y NA
 1181855 1181856 XCV0994 XCV0995 rpsG fusA TRUE 0.938 138.000 0.579 1.000 Y NA
 1181856 1181857 XCV0995 XCV0996 fusA tufB TRUE 0.976 49.000 0.400 0.001 Y NA
 1181859 1181860 XCV0998 XCV0999 rpsJ rplC TRUE 0.994 12.000 0.307 0.016 Y NA
 1181860 1181861 XCV0999 XCV1000 rplC rplD TRUE 0.995 13.000 0.486 0.012 Y NA
 1181861 1181862 XCV1000 XCV1001 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 1181862 1181863 XCV1001 XCV1002 rplW rplB TRUE 0.995 11.000 0.849 1.000 Y NA
 1181863 1181864 XCV1002 XCV1003 rplB rpsS TRUE 0.999 7.000 0.820 0.016 Y NA
 1181864 1181865 XCV1003 XCV1004 rpsS rplV TRUE 0.997 13.000 0.769 0.016 Y NA
 1181865 1181866 XCV1004 XCV1005 rplV rpsC TRUE 0.994 18.000 0.719 0.016 Y NA
 1181866 1181867 XCV1005 XCV1006 rpsC rplP TRUE 0.999 6.000 0.828 0.016 Y NA
 1181867 1181868 XCV1006 XCV1007 rplP rpmC TRUE 1.000 0.000 0.802 0.012 Y NA
 1181868 1181869 XCV1007 XCV1008 rpmC rpsQ TRUE 0.997 12.000 0.828 0.012 Y NA
 1181869 1181870 XCV1008 XCV1009 rpsQ rplN TRUE 0.996 15.000 0.791 0.016 Y NA
 1181870 1181871 XCV1009 XCV1010 rplN rplX TRUE 0.995 16.000 0.810 0.016 Y NA
 1181871 1181872 XCV1010 XCV1011 rplX rplE TRUE 0.997 12.000 0.758 0.012 Y NA
 1181872 1181873 XCV1011 XCV1012 rplE rpsN TRUE 0.988 19.000 0.309 0.012 Y NA
 1181873 1181874 XCV1012 XCV1013 rpsN rpsH TRUE 0.896 206.000 0.295 0.012 Y NA
 1181874 1181875 XCV1013 XCV1014 rpsH rplF TRUE 0.996 16.000 0.808 0.012 Y NA
 1181875 1181876 XCV1014 XCV1015 rplF rplR TRUE 0.986 92.000 0.815 0.012 Y NA
 1181876 1181877 XCV1015 XCV1016 rplR rpsE TRUE 0.973 160.000 0.814 0.016 Y NA
 1181877 1181878 XCV1016 XCV1017 rpsE rpmD TRUE 0.998 -7.000 0.789 0.016 Y NA
 1181878 1181879 XCV1017 XCV1018 rpmD rplO TRUE 0.999 5.000 0.653 0.002 Y NA
 1181879 1181880 XCV1018 XCV1019 rplO secY TRUE 0.987 8.000 0.730 1.000 N NA
 1181880 1181881 XCV1019 XCV1020 secY rpsM FALSE 0.034 333.000 0.011 1.000 N NA
 1181881 1181882 XCV1020 XCV1021 rpsM rpsK TRUE 0.998 11.000 0.810 0.012 Y NA
 1181882 1181883 XCV1021 XCV1022 rpsK rpsD TRUE 0.993 16.000 0.509 0.016 Y NA
 1181883 1181884 XCV1022 XCV1023 rpsD rpoA TRUE 0.796 54.000 0.549 1.000 N NA
 1181884 1181885 XCV1023 XCV1024 rpoA rplQ TRUE 0.769 181.000 0.873 1.000 N NA
 1181885 1181886 XCV1024 XCV1025 rplQ   FALSE 0.330 124.000 0.000 NA   NA
 1181886 1181887 XCV1025 XCV1026   dsbB TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1181889 1181890 XCV1028 XCV1029     FALSE 0.298 86.000 0.015 NA N NA
 1181891 1181892 XCV1030 XCV1031     TRUE 0.571 90.000 0.045 NA   NA
 1181892 1181893 XCV1031 XCV1032   typA TRUE 0.684 17.000 0.006 NA   NA
 1181894 1181895 XCV1033 XCV1034   mdh FALSE 0.333 118.000 0.018 1.000 N NA
 1181896 1181897 XCV1035 XCV1036 gst2   FALSE 0.099 409.000 0.111 1.000   NA
 1181897 1181898 XCV1036 XCV1037     FALSE 0.027 414.000 0.000 NA   NA
 1181898 1181899 XCV1037 XCV1038     FALSE 0.253 153.000 0.000 NA   NA
 1181899 1181900 XCV1038 XCV1039   fadH FALSE 0.227 163.000 0.000 NA   NA
 1181900 1181901 XCV1039 XCV1040 fadH   FALSE 0.157 204.000 0.000 1.000   NA
 1181901 1181902 XCV1040 XCV1041     TRUE 0.871 19.000 0.000 0.023   NA
 1181903 1181904 XCV1042 XCV1043     TRUE 0.598 193.000 0.333 NA   NA
 1181904 1181905 XCV1043 XCV1044   rluB1 TRUE 0.885 20.000 0.227 NA   NA
 1181906 1181907 XCV1045 XCV1046   kbl TRUE 0.945 3.000 0.007 1.000   NA
 1181908 1181909 XCV1047 XCV1048 cysP cysU TRUE 0.985 4.000 0.020 0.001 N NA
 1181909 1181910 XCV1048 XCV1049 cysU cysW TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.001 N NA
 1181910 1181911 XCV1049 XCV1050 cysW cysA TRUE 0.983 8.000 0.050 1.000 Y NA
 1181911 1181912 XCV1050 XCV1051 cysA   FALSE 0.066 278.000 0.000 NA   NA
 1181913 1181914 XCV1052 XCV1053 tdh   FALSE 0.026 290.000 0.000 1.000 N NA
 1181915 1181916 XCV1054 XCV1055 phlN1 xopO FALSE 0.108 231.000 0.000 NA   NA
 1181916 1181917 XCV1055 XCV1056 xopO   FALSE 0.341 84.000 0.000 NA   NA
 1181917 1181918 XCV1056 XCV1057     TRUE 0.745 34.000 0.143 1.000   NA
 1181918 1181919 XCV1057 XCV1058   folC FALSE 0.029 330.000 0.006 1.000 N NA
 1181919 1181920 XCV1058 XCV1059 folC   FALSE 0.425 68.000 0.013 NA   NA
 1181920 1181921 XCV1059 XCV1060   cvpA FALSE 0.165 214.000 0.007 NA   NA
 1181921 1181922 XCV1060 XCV1061 cvpA purF TRUE 0.838 31.000 0.262 1.000   NA
 1181922 1181923 XCV1061 XCV1062 purF   FALSE 0.349 154.000 0.012 1.000   NA
 1181923 1181924 XCV1062 XCV1063     FALSE 0.318 63.000 0.000 NA   NA
 1181924 1181925 XCV1063 XCV1064     FALSE 0.327 68.000 0.000 NA   NA
 1181925 1181926 XCV1064 XCV1065     TRUE 0.647 135.000 0.143 NA   NA
 1181927 1181928 XCV1066 XCV1067     FALSE 0.060 336.000 0.008 1.000   NA
 1181928 1181929 XCV1067 XCV1068   gtrB TRUE 0.857 -19.000 0.125 1.000   NA
 1181929 1181930 XCV1068 XCV1069 gtrB ppx FALSE 0.115 224.000 0.018 1.000 N NA
 1181930 1181931 XCV1069 XCV1070 ppx ppk TRUE 0.727 173.000 0.076 1.000 Y NA
 1181931 1181932 XCV1070 XCV1071 ppk phoR TRUE 0.444 113.000 0.045 1.000 N NA
 1181932 1181933 XCV1071 XCV1072 phoR phoB TRUE 0.931 74.000 0.453 1.000 Y NA
 1181933 1181934 XCV1072 XCV1073 phoB   FALSE 0.285 183.000 0.016 1.000   NA
 1181935 1181936 XCV1074 XCV1075     TRUE 0.976 -3.000 0.045 NA   NA
 1181936 1181937 XCV1075 XCV1076     FALSE 0.196 227.000 0.025 NA   NA
 1181939 1181940 XCV_tRNA09 XCV_tRNA10 tRNA-Pro tRNA-Arg FALSE 0.341 43.000 0.000 NA   NA
 1181940 1181941 XCV_tRNA10 XCV_tRNA11 tRNA-Arg tRNA-His FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1181941 1181942 XCV_tRNA11 XCV_tRNA12 tRNA-His tRNA-Lys FALSE 0.357 94.000 0.000 NA   NA
 1181943 1181944 XCV1078 XCV1079     FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1181945 1181946 XCV_tRNA13 XCV1080 tRNA-Leu tig FALSE 0.149 202.000 0.000 NA   NA
 1181946 1181947 XCV1080 XCV1081 tig clpP TRUE 0.928 93.000 0.351 1.000 Y NA
 1181947 1181948 XCV1081 XCV1082 clpP clpX TRUE 0.918 126.000 0.352 1.000 Y NA
 1181948 1181949 XCV1082 XCV1083 clpX lon TRUE 0.920 145.000 0.201 0.094 Y NA
 1181949 1181950 XCV1083 XCV1084 lon hupB FALSE 0.092 214.000 0.008 1.000 N NA
 1181950 1181951 XCV1084 XCV_tRNA14 hupB tRNA-Val TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1181951 1181952 XCV_tRNA14 XCV_tRNA15 tRNA-Val tRNA-Asp TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1181952 1181953 XCV_tRNA15 XCV_tRNA16 tRNA-Asp tRNA-Asp FALSE 0.357 95.000 0.000 NA   NA
 1181953 1181954 XCV_tRNA16 XCV1085 tRNA-Asp ppiD FALSE 0.066 278.000 0.000 NA   NA
 1181955 1181956 XCV1086 XCV1087 mltD gloB TRUE 0.962 -3.000 0.008 1.000   NA
 1181957 1181958 XCV1088 XCV1089   rnhA TRUE 0.519 28.000 0.003 NA   NA
 1181958 1181959 XCV1089 XCV1090 rnhA dnaQ TRUE 0.990 9.000 0.248 1.000 Y NA
 1181961 1181962 XCV_tRNA17 XCV1092 tRNA-Ser   FALSE 0.352 89.000 0.000 NA   NA
 1181965 1181966 XCV1095 XCV1096     TRUE 0.629 56.000 0.129 NA   NA
 10702490 1181967 IS_1477_5 XCV1097     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1181967 1181968 XCV1097 XCV1098     TRUE 0.711 33.000 0.000 0.088   NA
 1181970 1181971 XCV1100 XCV1101     FALSE 0.031 385.000 0.000 NA   NA
 1181973 1181974 XCV1103 XCV1104 kdkA   TRUE 0.975 0.000 0.032 1.000   NA
 1181974 1181975 XCV1104 XCV1105   moaA TRUE 0.985 0.000 0.108 1.000   NA
 1181975 1181976 XCV1105 XCV1106 moaA   TRUE 0.974 -3.000 0.037 NA   NA
 1181976 1181977 XCV1106 XCV1107   moaC TRUE 0.565 25.000 0.004 NA   NA
 1181977 1181978 XCV1107 XCV1108 moaC moaD TRUE 0.999 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 1181978 1181979 XCV1108 XCV1109 moaD moaE TRUE 0.999 3.000 0.501 0.002 Y NA
 1181980 1181981 XCV1110 XCV1111     FALSE 0.131 213.000 0.000 NA   NA
 1181981 1181982 XCV1111 XCV1112     TRUE 0.909 69.000 1.000 NA   NA
 10702491 1181983 IS_Xcc1_1 XCV1113     FALSE 0.335 -340.000 0.000 NA   NA
 1181983 1181984 XCV1113 XCV1114     TRUE 0.925 99.000 0.500 0.087   NA
 1181984 1181985 XCV1114 XCV1115     FALSE 0.154 371.000 0.000 1.000 Y NA
 1181985 1181986 XCV1115 XCV1116     FALSE 0.153 199.000 0.000 NA   NA
 1181986 1181987 XCV1116 XCV1117     TRUE 0.801 -7.000 0.000 NA   NA
 1181987 10702492 XCV1117 IS_Xac3_4     TRUE 0.471 -52.000 0.000 NA   NA
 10702492 1181988 IS_Xac3_4 XCV1118     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1181988 1181989 XCV1118 XCV1119     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.087 Y NA
 1181989 1181990 XCV1119 XCV1120     FALSE 0.316 62.000 0.000 NA   NA
 1181990 1181991 XCV1120 XCV1121     FALSE 0.034 374.000 0.000 NA   NA
 1181994 1181995 XCV1124 XCV1125     TRUE 0.868 157.000 1.000 NA   NA
 1181995 1181996 XCV1125 XCV1126     FALSE 0.269 146.000 0.000 NA   NA
 1181996 1181997 XCV1126 XCV_tRNA18   tRNA-Ser FALSE 0.348 87.000 0.000 NA   NA
 1181998 1181999 XCV1127 XCV1128 dnaX   TRUE 0.985 7.000 0.411 NA   NA
 1181999 1182000 XCV1128 XCV1129   recR TRUE 0.880 98.000 0.604 NA   NA
 1182000 1182001 XCV1129 XCV1130 recR   FALSE 0.306 101.000 0.013 1.000 N NA
 1182002 1182003 XCV1131 XCV1132 slp   TRUE 0.962 -3.000 0.012 NA   NA
 1182003 1182004 XCV1132 XCV1133     TRUE 0.985 -7.000 0.727 NA   NA
 1182004 1182005 XCV1133 XCV1134     TRUE 0.993 5.000 0.739 NA   NA
 1182006 1182007 XCV1135 XCV1136     FALSE 0.343 113.000 0.000 NA   NA
 10702493 1182009 IS_Xcc1_2 XCV1138     FALSE 0.335 -340.000 0.000 NA   NA
 1182009 1182010 XCV1138 XCV1139     TRUE 0.925 99.000 0.500 0.087   NA
 1182012 1182013 XCV1141 XCV1142   rpmF TRUE 0.876 98.000 0.599 NA   NA
 1182013 1182014 XCV1142 XCV1143 rpmF fabH FALSE 0.327 91.000 0.014 1.000 N NA
 1182014 1182015 XCV1143 XCV1144 fabH   FALSE 0.096 248.000 0.000 1.000   NA
 1182015 1182016 XCV1144 XCV1145   fabD FALSE 0.066 289.000 0.000 1.000   NA
 1182016 1182017 XCV1145 XCV1146 fabD fabG TRUE 0.977 83.000 0.432 0.003 Y NA
 1182017 1182018 XCV1146 XCV1147 fabG acpP TRUE 0.914 205.000 0.321 0.003 Y NA
 1182018 1182019 XCV1147 XCV1148 acpP fabF TRUE 0.900 142.000 0.346 1.000 Y NA
 1182019 1182020 XCV1148 XCV1149 fabF trpE TRUE 0.608 168.000 0.030 0.011 N NA
 1182020 1182021 XCV1149 XCV1150 trpE   FALSE 0.409 73.000 0.010 NA   NA
 1182021 1182022 XCV1150 XCV1151   holB TRUE 0.955 -3.000 0.005 NA   NA
 1182022 1182023 XCV1151 XCV1152 holB   TRUE 0.990 -3.000 0.382 NA N NA
 1182023 1182024 XCV1152 XCV_tRNA19   tRNA-Val FALSE 0.224 165.000 0.000 NA   NA
 1182024 1182025 XCV_tRNA19 XCV1153 tRNA-Val   FALSE 0.036 361.000 0.000 NA   NA
 1182025 1182026 XCV1153 XCV1154     FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 1182028 1182029 XCV1156 XCV1157 prpB   TRUE 0.806 75.000 0.502 1.000 N NA
 1182029 1182030 XCV1157 XCV1158   acnA TRUE 0.870 153.000 0.289 1.000 Y NA
 1182030 1182031 XCV1158 XCV1159 acnA   TRUE 0.899 10.000 0.018 1.000   NA
 1182031 1182032 XCV1159 XCV1160     TRUE 0.464 114.000 0.017 NA   NA
 1182032 1182033 XCV1160 XCV1161     FALSE 0.019 516.000 0.000 NA   NA
 1182033 1182034 XCV1161 XCV1162     TRUE 0.654 111.000 0.214 NA N NA
 1182034 1182035 XCV1162 XCV1163     FALSE 0.216 168.000 0.000 NA   NA
 1182035 1182036 XCV1163 XCV1164     TRUE 0.488 27.000 0.000 NA   NA
 1182036 1182037 XCV1164 XCV1165     FALSE 0.049 326.000 0.000 1.000   NA
 1182037 1182038 XCV1165 XCV1166     FALSE 0.414 272.000 0.400 1.000   NA
 1182038 1182039 XCV1166 XCV1167     FALSE 0.305 136.000 0.000 NA   NA
 1182039 1182040 XCV1167 XCV1168   pbpC TRUE 0.479 28.000 0.000 NA   NA
 1182041 1182042 XCV1169 XCV1170     TRUE 0.692 40.000 0.016 0.034 N NA
 1182042 1182043 XCV1170 XCV1171     TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1182044 1182045 XCV1172 XCV1173   cbpA FALSE 0.257 414.000 0.133 NA Y NA
 1182045 1182046 XCV1173 XCV1174 cbpA   FALSE 0.048 498.000 0.111 1.000 N NA
 1182046 1182047 XCV1174 XCV1175   hflK FALSE 0.006 680.000 0.000 1.000 N NA
 1182047 1182048 XCV1175 XCV1176 hflK hflC TRUE 1.000 0.000 0.947 0.010 Y NA
 1182048 1182049 XCV1176 XCV1177 hflC   FALSE 0.039 249.000 0.000 1.000 N NA
 1182049 1182050 XCV1177 XCV1178   purA FALSE 0.008 535.000 0.000 1.000 N NA
 1182050 1182051 XCV1178 XCV1179 purA pepN2 FALSE 0.014 376.000 0.000 1.000 N NA
 1182052 1182053 XCV1180 XCV1181     FALSE 0.121 221.000 0.000 NA   NA
 1182054 1182055 XCV1182 XCV1183     FALSE 0.021 490.000 0.000 NA   NA
 1182055 1182056 XCV1183 XCV1184     FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 1182056 1182057 XCV1184 XCV1185     TRUE 0.950 21.000 0.667 NA   NA
 1182057 1182058 XCV1185 XCV1186     TRUE 0.579 127.000 0.069 NA   NA
 1182058 1182059 XCV1186 XCV1187     TRUE 0.971 -10.000 0.517 NA   NA
 1182059 1182060 XCV1187 XCV1188     FALSE 0.437 190.000 0.118 NA   NA
 1182060 1182061 XCV1188 XCV1189     TRUE 0.993 7.000 1.000 NA   NA
 1182061 1182062 XCV1189 XCV1190     TRUE 0.610 41.000 0.069 NA   NA
 1182062 1182063 XCV1190 XCV1191   hsdM2 TRUE 0.901 73.000 0.051 0.087 Y NA
 1182063 1182064 XCV1191 XCV1192 hsdM2   TRUE 0.975 -3.000 0.038 NA   NA
 1182064 1182065 XCV1192 XCV1193   hsdS2 TRUE 0.977 -3.000 0.048 NA   NA
 1182065 1182066 XCV1193 XCV1194 hsdS2 hsdR2 TRUE 0.993 10.000 0.034 0.001 Y NA
 1182066 1182067 XCV1194 XCV1195 hsdR2   FALSE 0.054 300.000 0.000 NA   NA
 1182069 1182070 XCV1197 XCV1198     TRUE 0.614 18.000 0.000 NA   NA
 1182072 1182073 XCV1200 XCV1201     TRUE 0.991 0.000 0.013 NA Y NA
 1182073 1182074 XCV1201 XCV1202     FALSE 0.015 333.000 0.000 NA N NA
 1182075 1182076 XCV1203 XCV1204     TRUE 0.986 -3.000 0.250 1.000 N NA
 1182076 1182077 XCV1204 XCV1205     FALSE 0.009 479.000 0.000 1.000 N NA
 1182077 1182078 XCV1205 XCV1206     FALSE 0.038 370.000 0.000 1.000   NA
 1182079 1182080 XCV1207 XCV1208     FALSE 0.014 350.000 0.000 NA N NA
 1182080 1182081 XCV1208 XCV1209     TRUE 0.986 -3.000 0.125 1.000   NA
 1182083 1182084 XCV1211 XCV1212     FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1182084 1182085 XCV1212 XCV1213     FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1182086 1182087 XCV1214 XCV1215     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 1182087 1182088 XCV1215 XCV1216     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.051 Y NA
 1182089 1182090 XCV1217 XCV1218     TRUE 0.968 -3.000 0.021 NA   NA
 1182090 1182091 XCV1218 XCV1219     TRUE 0.514 63.000 0.038 NA   NA
 1182091 1182092 XCV1219 XCV1220     FALSE 0.400 163.000 0.038 NA   NA
 1182093 1182094 XCV1221 XCV1222     TRUE 0.944 9.000 0.074 NA   NA
 1182095 1182096 XCV1223 XCV1224 lexA1   TRUE 0.992 2.000 0.381 NA   NA
 1182096 1182097 XCV1224 XCV1225     TRUE 0.986 10.000 0.667 NA   NA
 1182097 1182098 XCV1225 XCV1226   dnaE1 TRUE 0.742 175.000 0.500 1.000   NA
 1182098 1182099 XCV1226 XCV1227 dnaE1   FALSE 0.169 67.000 0.000 1.000 N NA
 1182099 1182100 XCV1227 XCV1228     FALSE 0.172 78.000 0.000 1.000 N NA
 1182100 1182101 XCV1228 XCV1229     TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1182101 1182102 XCV1229 XCV1230     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182102 1182103 XCV1230 XCV1231     FALSE 0.015 707.000 0.000 NA   NA
 1182103 1182104 XCV1231 XCV1232     FALSE 0.060 290.000 0.000 NA   NA
 1182106 1182107 XCV1234 XCV1235     TRUE 0.833 132.000 0.500 NA   NA
 1182107 1182108 XCV1235 XCV1236   xopP FALSE 0.015 676.000 0.000 NA   NA
 1182109 1182110 XCV1237 XCV1238     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182110 1182111 XCV1238 XCV1239     FALSE 0.159 197.000 0.000 NA   NA
 1182111 1182112 XCV1239 XCV1240   katE FALSE 0.042 338.000 0.000 NA   NA
 1182112 1182113 XCV1240 XCV1241 katE   FALSE 0.148 208.000 0.000 1.000   NA
 1182113 1182114 XCV1241 XCV1242     FALSE 0.325 58.000 0.000 1.000   NA
 1182114 1182115 XCV1242 XCV1243   gcvP FALSE 0.093 179.000 0.000 1.000 N NA
 1182116 1182117 XCV1244 XCV1245 raxST raxA FALSE 0.373 89.000 0.000 1.000   NA
 1182117 1182118 XCV1245 XCV1246 raxA raxB TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1182118 1182119 XCV1246 XCV1247 raxB   FALSE 0.151 279.000 0.000 0.059 N NA
 1182119 1182120 XCV1247 XCV1248     TRUE 0.820 17.000 0.054 NA   NA
 1182121 1182122 XCV1249 XCV1250     TRUE 0.579 115.000 0.049 1.000   NA
 1182122 1182123 XCV1250 XCV1251     TRUE 0.987 -3.000 0.152 1.000   NA
 1182123 1182124 XCV1251 XCV1252     TRUE 0.612 100.000 0.061 1.000   NA
 1182125 1182126 XCV1253 XCV1254     TRUE 0.995 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 1182127 1182128 XCV1255 XCV1256   minE FALSE 0.441 69.000 0.015 NA   NA
 1182128 1182129 XCV1256 XCV1257 minE minD TRUE 0.998 3.000 0.618 NA Y NA
 1182129 1182130 XCV1257 XCV1258 minD minC TRUE 0.948 36.000 0.466 1.000 Y NA
 1182130 1182131 XCV1258 XCV1259 minC   TRUE 0.942 4.000 0.013 1.000   NA
 1182132 1182133 XCV1260 XCV1261     TRUE 1.000 0.000 0.900 0.031 Y NA
 1182133 1182134 XCV1261 XCV1262     FALSE 0.038 351.000 0.000 NA   NA
 1182134 1182135 XCV1262 XCV1263     FALSE 0.437 82.000 0.013 NA   NA
 1182135 1182136 XCV1263 XCV1264   alkA TRUE 0.943 3.000 0.008 NA   NA
 1182137 1182138 XCV1265 XCV1266     FALSE 0.060 298.000 0.000 1.000   NA
 1182138 1182139 XCV1266 XCV1267     TRUE 0.968 -3.000 0.020 NA   NA
 1182139 1182140 XCV1267 XCV1268     FALSE 0.355 157.000 0.018 NA   NA
 1182142 1182143 XCV1270 XCV1271     TRUE 0.928 29.000 0.667 NA   NA
 1182143 1182144 XCV1271 XCV1272     FALSE 0.083 256.000 0.000 NA   NA
 1182144 1182145 XCV1272 XCV1273   ate TRUE 0.593 -46.000 0.014 NA   NA
 1182147 1182148 XCV1275 XCV1276   rfaY FALSE 0.079 260.000 0.000 NA   NA
 1182148 1182149 XCV1276 XCV1277 rfaY   FALSE 0.345 110.000 0.000 NA   NA
 1182149 1182150 XCV1277 XCV1278   tesB FALSE 0.184 234.000 0.026 NA   NA
 1182150 1182151 XCV1278 XCV1279 tesB tesB TRUE 0.976 10.000 0.010 0.001   NA
 1182151 1182152 XCV1279 XCV1280 tesB   TRUE 0.778 70.000 0.021 1.000 Y NA
 1182154 1182155 XCV1282 XCV1283     TRUE 0.959 0.000 0.005 1.000   NA
 1182156 1182157 XCV1284 XCV1285 rplU rpmA TRUE 0.997 13.000 0.667 0.011 Y NA
 1182157 1182158 XCV1285 XCV1286 rpmA   TRUE 0.446 247.000 0.335 1.000   NA
 1182160 1182161 XCV1288 XCV1289   ribF TRUE 0.509 187.000 0.169 1.000   NA
 1182161 1182162 XCV1289 XCV1290 ribF ileS TRUE 0.968 7.000 0.254 1.000 N NA
 1182162 1182163 XCV1290 XCV1291 ileS lspA TRUE 0.590 79.000 0.147 1.000 N NA
 1182163 1182164 XCV1291 XCV1292 lspA ispH TRUE 0.845 67.000 0.095 1.000 Y NA
 1182164 1182165 XCV1292 XCV_tRNA20 ispH tRNA-Thr FALSE 0.355 91.000 0.000 NA   NA
 1182165 1182166 XCV_tRNA20 XCV1293 tRNA-Thr   FALSE 0.015 718.000 0.000 NA   NA
 1182166 10702494 XCV1293 IS_1479_3     TRUE 0.543 -29.000 0.000 NA   NA
 1182168 10702495 XCV1295 IS_Xac2_3     FALSE 0.045 323.000 0.000 NA   NA
 1182169 1182170 XCV1296 XCV1297     TRUE 0.944 -6.000 0.000 0.086   NA
 1182171 1182172 XCV1298 XCV1299     FALSE 0.021 488.000 0.000 NA   NA
 10702496 1182173 IS_1477_18 XCV1300     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1182173 1182174 XCV1300 XCV1301     TRUE 0.714 33.000 0.000 0.086   NA
 1182174 1182175 XCV1301 XCV1302     FALSE 0.153 199.000 0.000 NA   NA
 1182175 1182176 XCV1302 XCV1303     TRUE 0.940 25.000 0.667 NA   NA
 1182176 1182177 XCV1303 XCV1304     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1182177 1182178 XCV1304 XCV1305     FALSE 0.042 336.000 0.000 NA   NA
 1182178 1182179 XCV1305 XCV1306     TRUE 0.798 11.000 0.000 NA   NA
 1182180 1182181 XCV1307 XCV1308 cyoA cyoB TRUE 0.999 0.000 0.385 0.010 Y NA
 1182181 1182182 XCV1308 XCV1309 cyoB cyoC TRUE 0.998 3.000 0.385 0.050 Y NA
 1182182 1182183 XCV1309 XCV1310 cyoC cyoD TRUE 0.999 0.000 0.917 0.050 Y NA
 1182183 1182184 XCV1310 XCV1311 cyoD   TRUE 0.562 169.000 0.167 1.000   NA
 1182184 1182185 XCV1311 XCV1312   radA FALSE 0.283 250.000 0.000 0.043   NA
 1182185 1182186 XCV1312 XCV1313 radA   FALSE 0.030 411.000 0.000 1.000   NA
 1182188 1182189 XCV1315 XCV1316 hrpXv   FALSE 0.182 110.000 0.000 1.000 N NA
 1182189 1182190 XCV1316 XCV1317     TRUE 0.944 26.000 0.727 1.000   NA
 1182190 1182191 XCV1317 XCV1318     FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 1182191 1182192 XCV1318 XCV1319   rsbR FALSE 0.080 259.000 0.000 NA   NA
 1182192 1182193 XCV1319 XCV1320 rsbR rsbS TRUE 0.997 2.000 0.361 NA Y NA
 1182193 1182194 XCV1320 XCV1321 rsbS rsbT TRUE 0.998 -3.000 0.454 NA Y NA
 1182194 1182195 XCV1321 XCV1322 rsbT   TRUE 0.987 -9.000 0.522 0.091   NA
 1182195 1182196 XCV1322 XCV1323     TRUE 0.996 -3.000 0.261 0.091   NA
 1182196 1182197 XCV1323 XCV1324     TRUE 0.989 -10.000 0.125 0.015 Y NA
 1182200 1182201 XCV1327 XCV1328     FALSE 0.410 174.000 0.059 NA   NA
 1182201 1182202 XCV1328 XCV1329     FALSE 0.107 232.000 0.000 NA   NA
 1182202 1182203 XCV1329 XCV1330   cheB TRUE 0.980 -3.000 0.059 1.000   NA
 1182203 1182204 XCV1330 XCV1331 cheB cheR1 TRUE 0.994 -3.000 0.416 1.000   NA
 1182204 1182205 XCV1331 XCV1332 cheR1   TRUE 0.996 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 1182206 1182207 XCV1333 XCV1334     TRUE 0.993 -7.000 0.200 0.031 Y NA
 1182211 1182212 XCV1338 XCV1339 ffh   FALSE 0.214 188.000 0.003 1.000   NA
 1182212 1182213 XCV1339 XCV1340     TRUE 0.933 -15.000 0.000 0.001   NA
 1182213 1182214 XCV1340 XCV1341     TRUE 0.536 -36.000 0.000 1.000   NA
 1182214 1182215 XCV1341 XCV1342   rpsP FALSE 0.241 98.000 0.004 1.000 N NA
 1182215 1182216 XCV1342 XCV1343 rpsP rimM TRUE 0.993 14.000 0.342 0.011 Y NA
 1182216 1182217 XCV1343 XCV1344 rimM trmD TRUE 0.953 66.000 0.672 1.000 Y NA
 1182217 1182218 XCV1344 XCV1345 trmD rplS TRUE 0.927 146.000 0.567 1.000 Y NA
 1182220 1182221 XCV1347 XCV1348   gst3 TRUE 0.513 59.000 0.116 NA N NA
 1182221 1182222 XCV1348 XCV1349 gst3 hslR FALSE 0.053 224.000 0.000 1.000 N NA
 1182223 1182224 XCV1350 XCV1351 katG   FALSE 0.027 431.000 0.000 1.000   NA
 1182224 1182225 XCV1351 XCV1352   mutS FALSE 0.066 288.000 0.000 1.000   NA
 1182226 1182227 XCV1353 XCV1354     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 10702497 1182228 IS_Xcc1_3 XCV1355     FALSE 0.307 -760.000 0.000 NA   NA
 1182228 1182229 XCV1355 XCV1356     TRUE 0.926 99.000 0.500 0.085   NA
 1182230 1182231 XCV1357 XCV1358     TRUE 0.988 -3.000 0.182 NA   NA
 1182232 1182233 XCV1359 XCV1360     TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.012   NA
 1182233 1182234 XCV1360 XCV1361     TRUE 0.560 185.000 0.222 1.000   NA
 1182234 1182235 XCV1361 XCV1362     FALSE 0.021 516.000 0.000 1.000   NA
 1182236 1182237 XCV1363 XCV1364     TRUE 0.534 -31.000 0.019 1.000 N NA
 1182237 1182238 XCV1364 XCV1365     TRUE 0.997 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 1182238 1182239 XCV1365 XCV1366     TRUE 1.000 0.000 0.627 0.002 Y NA
 1182239 1182240 XCV1366 XCV1367     TRUE 0.924 166.000 0.687 1.000 Y NA
 1182240 1182241 XCV1367 XCV1368   czcD FALSE 0.059 214.000 0.000 1.000 N NA
 1182243 1182244 XCV1370 XCV1371 rpoE2   TRUE 0.995 -3.000 0.705 NA N NA
 1182244 1182245 XCV1371 XCV1372   mucD FALSE 0.396 110.000 0.035 NA N NA
 1182245 1182246 XCV1372 XCV1373 mucD lepA FALSE 0.118 191.000 0.007 1.000 N NA
 1182246 1182247 XCV1373 XCV1374 lepA lepB TRUE 0.646 106.000 0.187 1.000 N NA
 1182247 1182248 XCV1374 XCV1375 lepB   TRUE 0.682 31.000 0.053 NA   NA
 1182248 1182249 XCV1375 XCV1376   rnc TRUE 0.812 -10.000 0.013 NA   NA
 1182249 1182250 XCV1376 XCV1377 rnc era TRUE 0.990 -3.000 0.017 0.043   NA
 1182250 1182251 XCV1377 XCV1378 era   FALSE 0.049 315.000 0.000 NA   NA
 1182251 1182252 XCV1378 XCV1379     FALSE 0.300 138.000 0.000 NA   NA
 1182254 1182255 XCV1381 XCV1382 rumA   FALSE 0.416 80.000 0.007 1.000   NA
 1182255 1182256 XCV1382 XCV1383     FALSE 0.314 181.000 0.021 1.000   NA
 1182256 1182257 XCV1383 XCV1384     TRUE 0.757 17.000 0.017 1.000   NA
 1182257 1182258 XCV1384 XCV1385     TRUE 0.454 118.000 0.013 1.000   NA
 1182258 1182259 XCV1385 XCV1386     FALSE 0.416 35.000 0.000 1.000   NA
 1182259 1182260 XCV1386 XCV1387   hpt TRUE 0.959 0.000 0.034 1.000 N NA
 1182260 1182261 XCV1387 XCV1388 hpt deoD TRUE 0.944 88.000 0.067 0.003 Y NA
 1182261 1182262 XCV1388 XCV1389 deoD scoF FALSE 0.309 88.000 0.013 1.000 N NA
 1182262 1182263 XCV1389 XCV1390 scoF   TRUE 0.571 95.000 0.107 1.000 N NA
 1182263 1182264 XCV1390 XCV1391     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182265 1182266 XCV1392 XCV1393     TRUE 0.967 -10.000 0.460 1.000   NA
 1182266 1182267 XCV1393 XCV1394     TRUE 0.995 -3.000 0.214 0.091   NA
 1182267 1182268 XCV1394 XCV1395     TRUE 0.605 227.000 0.751 NA N NA
 1182268 1182269 XCV1395 XCV1396     FALSE 0.033 380.000 0.000 NA   NA
 1182269 1182270 XCV1396 XCV1397     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 1182270 1182271 XCV1397 XCV1398     TRUE 0.473 234.000 0.500 NA N NA
 1182271 1182272 XCV1398 XCV1399     TRUE 0.886 108.000 0.667 NA   NA
 1182272 1182273 XCV1399 XCV1400     FALSE 0.109 229.000 0.000 NA   NA
 1182273 1182274 XCV1400 XCV1401   thlA TRUE 0.732 123.000 0.222 NA   NA
 1182276 1182277 XCV1403 XCV1404 ldh   FALSE 0.259 157.000 0.000 1.000   NA
 1182277 1182278 XCV1404 XCV1405     FALSE 0.159 197.000 0.000 NA   NA
 1182282 1182283 XCV1409 XCV1410     FALSE 0.024 453.000 0.000 NA   NA
 1182283 1182284 XCV1410 XCV1411     FALSE 0.226 190.000 0.009 NA   NA
 1182284 1182285 XCV1411 XCV1412     FALSE 0.271 153.000 0.000 1.000   NA
 1182285 1182286 XCV1412 XCV1413     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.003   NA
 1182286 1182287 XCV1413 XCV1414     FALSE 0.043 343.000 0.000 1.000   NA
 1182288 1182289 XCV1415 XCV1416     FALSE 0.068 276.000 0.000 NA   NA
 1182291 1182292 XCV1418 XCV1419     TRUE 0.654 16.000 0.000 NA   NA
 1182292 1182293 XCV1419 XCV1420     FALSE 0.123 220.000 0.000 NA   NA
 1182293 1182294 XCV1420 XCV1421     FALSE 0.078 272.000 0.000 1.000   NA
 1182294 1182295 XCV1421 XCV1422     FALSE 0.437 36.000 0.005 NA   NA
 1182295 1182296 XCV1422 XCV1423     TRUE 0.549 61.000 0.056 NA   NA
 1182296 1182297 XCV1423 XCV1424     TRUE 0.565 70.000 0.056 NA   NA
 1182299 1182300 XCV1426 XCV1427     TRUE 0.871 11.000 0.018 NA   NA
 1182301 1182302 XCV1428 XCV1429 cfa   TRUE 0.924 18.000 0.324 1.000   NA
 1182302 1182303 XCV1429 XCV1430     TRUE 0.984 -3.000 0.113 NA   NA
 1182303 1182304 XCV1430 XCV1431   cfa TRUE 0.982 -3.000 0.087 NA   NA
 1182304 1182305 XCV1431 XCV1432 cfa   TRUE 0.978 -3.000 0.053 NA   NA
 1182305 1182306 XCV1432 XCV1433     TRUE 0.996 -3.000 0.722 NA   NA
 1182306 1182307 XCV1433 XCV1434     TRUE 0.641 -120.000 0.047 1.000   NA
 1182307 1182308 XCV1434 XCV1435     FALSE 0.353 90.000 0.000 NA   NA
 1182308 1182309 XCV1435 XCV1436   rpoE3 TRUE 0.940 -15.000 0.349 NA   NA
 1182309 1182310 XCV1436 XCV1437 rpoE3   TRUE 0.526 59.000 0.048 NA   NA
 1182310 1182311 XCV1437 XCV1438     TRUE 0.775 86.000 0.286 NA   NA
 1182311 1182312 XCV1438 XCV1439     FALSE 0.016 614.000 0.000 NA   NA
 1182312 1182313 XCV1439 XCV1440     FALSE 0.293 -40.000 0.000 1.000 N NA
 1182313 1182314 XCV1440 XCV1441   metS FALSE 0.406 228.000 0.333 1.000 N NA
 1182314 1182315 XCV1441 XCV1442 metS   FALSE 0.148 247.000 0.019 NA   NA
 1182315 1182316 XCV1442 XCV1443     FALSE 0.353 90.000 0.000 NA   NA
 1182316 1182317 XCV1443 XCV1444     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1182317 1182318 XCV1444 XCV1445     FALSE 0.142 205.000 0.000 NA   NA
 1182319 1182320 XCV1446 XCV1447     TRUE 0.900 57.000 1.000 NA   NA
 1182320 1182321 XCV1447 XCV1448     FALSE 0.273 145.000 0.000 NA   NA
 1182321 1182322 XCV1448 XCV1449   mmuM TRUE 0.996 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 1182323 1182324 XCV1450 XCV1451     FALSE 0.132 276.000 0.032 NA   NA
 1182324 1182325 XCV1451 XCV1452     TRUE 0.937 5.000 0.020 NA   NA
 1182328 1182329 XCV1455 XCV1456     TRUE 0.994 -3.000 0.417 NA   NA
 1182330 1182331 XCV1457 XCV1458 phaZ   FALSE 0.140 274.000 0.034 NA   NA
 1182333 1182334 XCV1460 XCV1461     FALSE 0.353 90.000 0.000 NA   NA
 1182334 1182335 XCV1461 XCV1462   accA FALSE 0.359 58.000 0.003 1.000   NA
 1182335 1182336 XCV1462 XCV1463 accA dnaE2 FALSE 0.366 184.000 0.122 1.000 N NA
 1182336 1182337 XCV1463 XCV1464 dnaE2 rnhB FALSE 0.345 218.000 0.104 1.000   NA
 1182337 1182338 XCV1464 XCV1465 rnhB lpxB FALSE 0.166 352.000 0.186 1.000   NA
 1182338 1182339 XCV1465 XCV1466 lpxB lpxA TRUE 0.997 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 1182339 1182340 XCV1466 XCV1467 lpxA fabZ TRUE 0.517 26.000 0.022 1.000 N NA
 1182340 1182341 XCV1467 XCV1468 fabZ lpxD TRUE 0.945 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1182343 1182344 XCV1470 XCV1471 oma   TRUE 0.756 84.000 0.007 1.000 Y NA
 1182344 1182345 XCV1471 XCV1472   dxr TRUE 0.898 27.000 0.568 1.000 N NA
 1182345 1182346 XCV1472 XCV1473 dxr cdsA TRUE 0.997 3.000 0.372 1.000 Y NA
 1182346 1182347 XCV1473 XCV1474 cdsA uppS TRUE 0.998 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 1182347 1182348 XCV1474 XCV1475 uppS frr TRUE 0.916 18.000 0.409 1.000 N NA
 1182348 1182349 XCV1475 XCV1476 frr pyrH TRUE 0.688 188.000 0.626 1.000 N NA
 1182349 1182350 XCV1476 XCV1477 pyrH   FALSE 0.240 107.000 0.004 1.000 N NA
 1182350 1182351 XCV1477 XCV1478   tsf FALSE 0.037 277.000 0.002 1.000 N NA
 1182351 1182352 XCV1478 XCV1479 tsf rpsB TRUE 0.923 170.000 0.748 1.000 Y NA
 1182352 1182353 XCV1479 XCV1480 rpsB papD1 FALSE 0.011 392.000 0.000 NA N NA
 1182353 1182354 XCV1480 XCV1481 papD1   FALSE 0.032 384.000 0.000 NA   NA
 1182354 1182355 XCV1481 XCV1482   papC TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 1182355 1182356 XCV1482 XCV1483 papC papD2 TRUE 0.973 -46.000 0.667 NA Y NA
 1182356 1182357 XCV1483 XCV1484 papD2   TRUE 0.956 9.000 0.125 NA   NA
 1182358 1182359 XCV1485 XCV1486 map glnD TRUE 0.978 -3.000 0.128 1.000 N NA
 1182359 1182360 XCV1486 XCV1487 glnD dapD FALSE 0.029 361.000 0.012 1.000 N NA
 1182360 1182361 XCV1487 XCV1488 dapD   FALSE 0.260 193.000 0.061 1.000 N NA
 1182361 1182362 XCV1488 XCV1489   dapE FALSE 0.329 246.000 0.292 1.000 N NA
 1182362 1182363 XCV1489 XCV1490 dapE asnB FALSE 0.236 294.000 0.000 1.000 Y NA
 1182364 1182365 XCV1491 XCV1492     FALSE 0.031 388.000 0.000 NA   NA
 1182365 1182366 XCV1492 XCV1493     TRUE 0.979 4.000 0.000 0.020   NA
 1182366 1182367 XCV1493 XCV1494     FALSE 0.029 417.000 0.000 1.000   NA
 1182369 1182370 XCV1496 XCV1497 tpmT parC FALSE 0.016 778.000 0.000 1.000   NA
 1182370 1182371 XCV1497 XCV1498 parC   FALSE 0.220 62.000 0.005 1.000 N NA
 1182372 1182373 XCV1499 XCV1500   oprN3 TRUE 0.731 79.000 0.333 1.000 N NA
 1182373 1182374 XCV1500 XCV1501 oprN3   TRUE 0.947 11.000 0.278 1.000 N NA
 1182374 1182375 XCV1501 XCV1502     TRUE 0.993 7.000 0.900 1.000   NA
 1182375 1182376 XCV1502 XCV1503     FALSE 0.019 511.000 0.000 NA   NA
 1182376 1182377 XCV1503 XCV1504     FALSE 0.341 114.000 0.000 NA   NA
 1182378 1182379 XCV_tRNA21 XCV1505 tRNA-Leu bglS FALSE 0.285 141.000 0.000 NA   NA
 1182379 1182380 XCV1505 XCV1506 bglS   TRUE 0.530 107.000 0.027 1.000   NA
 1182381 1182382 XCV1507 XCV1508     TRUE 0.957 8.000 0.091 1.000   NA
 1182384 1182385 XCV1510 XCV1511     TRUE 0.827 52.000 0.500 NA   NA
 1182385 1182386 XCV1511 XCV1512     TRUE 0.821 67.000 0.429 NA   NA
 1182389 1182390 XCV1515 XCV1516     FALSE 0.177 199.000 0.028 1.000 N NA
 1182391 1182392 XCV1517 XCV1518   gst4 FALSE 0.062 242.000 0.006 1.000 N NA
 1182392 1182393 XCV1518 XCV1519 gst4 cynT1 TRUE 0.509 113.000 0.077 1.000 N NA
 1182394 1182395 XCV1520 XCV1521 pldA   FALSE 0.275 190.000 0.021 NA   NA
 1182397 1182398 XCV1523 XCV1524 pcp   TRUE 0.852 133.000 0.556 1.000   NA
 1182400 1182401 XCV1526 XCV1527     TRUE 0.964 0.000 0.013 NA   NA
 1182402 1182403 XCV1528 XCV1529     TRUE 0.791 144.000 0.429 1.000   NA
 1182403 1182404 XCV1529 XCV1530     TRUE 0.854 32.000 0.333 NA   NA
 1182404 1182405 XCV1530 XCV1531     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1182405 1182406 XCV1531 XCV1532   gst5 FALSE 0.323 127.000 0.000 NA   NA
 1182406 1182407 XCV1532 XCV1533 gst5 asnB2 FALSE 0.209 185.000 0.028 1.000 N NA
 1182407 1182408 XCV1533 XCV1534 asnB2   FALSE 0.399 171.000 0.048 NA   NA
 1182408 1182409 XCV1534 XCV1535   dnaB FALSE 0.206 222.000 0.024 NA   NA
 1182409 1182410 XCV1535 XCV1536 dnaB   TRUE 0.877 22.000 0.006 1.000 Y NA
 1182410 1182411 XCV1536 XCV1537     FALSE 0.042 273.000 0.004 1.000 N NA
 1182413 1182414 XCV1539 XCV1540   mexE TRUE 0.963 -3.000 0.009 1.000   NA
 1182414 1182415 XCV1540 XCV1541 mexE mexF TRUE 0.750 179.000 0.750 1.000 N NA
 1182415 1182416 XCV1541 XCV1542 mexF   TRUE 0.607 44.000 0.160 1.000 N NA
 1182416 1182417 XCV1542 XCV1543   oprN4 TRUE 0.937 -6.000 0.160 1.000 N NA
 1182421 1182422 XCV1547 XCV1548     FALSE 0.331 79.000 0.000 NA   NA
 10702498 1182424 IS_1477_6 XCV1550     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1182424 1182425 XCV1550 XCV1551     TRUE 0.715 33.000 0.000 0.084   NA
 1182426 1182427 XCV1552 XCV1553     TRUE 0.819 18.000 0.067 NA   NA
 1182428 1182429 XCV1554 XCV1555     TRUE 0.527 24.000 0.000 NA   NA
 1182431 1182432 XCV1557 XCV1558     TRUE 0.864 14.000 0.063 NA   NA
 1182436 1182437 XCV1562 XCV1563 hrcA grpE FALSE 0.382 99.000 0.025 1.000 N NA
 1182437 1182438 XCV1563 XCV1564 grpE dnaK TRUE 0.913 142.000 0.049 0.006 Y NA
 1182438 1182439 XCV1564 XCV1565 dnaK dnaJ TRUE 0.940 161.000 0.236 0.003 Y NA
 1182439 1182440 XCV1565 XCV1566 dnaJ pdxY FALSE 0.008 525.000 0.000 1.000 N NA
 1182440 1182441 XCV1566 XCV1567 pdxY   TRUE 0.917 -3.000 0.007 1.000 N NA
 1182442 1182443 XCV1568 XCV1569   oprN5 FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 1182443 1182444 XCV1569 XCV1570 oprN5   TRUE 0.995 -3.000 0.714 1.000 N NA
 1182444 1182445 XCV1570 XCV1571     TRUE 0.976 -16.000 0.351 1.000 Y NA
 1182445 1182446 XCV1571 XCV1572     FALSE 0.363 90.000 0.021 1.000 N NA
 1182446 1182447 XCV1572 XCV1573     FALSE 0.042 242.000 0.000 1.000 N NA
 1182447 1182448 XCV1573 XCV1574     TRUE 0.965 -3.000 0.012 1.000   NA
 1182448 1182449 XCV1574 XCV1575     FALSE 0.074 268.000 0.000 NA   NA
 1182449 1182450 XCV1575 XCV1576   lpd FALSE 0.308 154.000 0.008 NA   NA
 1182450 1182451 XCV1576 XCV1577 lpd sucB TRUE 0.904 112.000 0.253 1.000 Y NA
 1182451 1182452 XCV1577 XCV1578 sucB sucA TRUE 0.955 43.000 0.667 1.000 Y NA
 1182452 1182453 XCV1578 XCV1579 sucA   FALSE 0.401 37.000 0.000 1.000   NA
 1182453 1182454 XCV1579 XCV1580     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182454 1182455 XCV1580 XCV1581     FALSE 0.092 246.000 0.000 NA   NA
 1182455 1182456 XCV1581 XCV1582   purB FALSE 0.093 244.000 0.000 NA   NA
 1182460 1182461 XCV1586 XCV1587     FALSE 0.271 340.000 0.400 NA   NA
 1182461 1182462 XCV1587 XCV1588     TRUE 0.729 35.000 0.143 NA   NA
 1182462 1182463 XCV1588 XCV1589     TRUE 0.942 11.000 0.143 NA   NA
 1182463 1182464 XCV1589 XCV1590     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1182464 1182465 XCV1590 XCV1591     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1182466 1182467 XCV1592 XCV1593   fkpA TRUE 0.821 86.000 0.042 1.000 Y NA
 1182467 1182468 XCV1593 XCV1594 fkpA ugd1 TRUE 0.856 26.000 0.357 1.000 N NA
 1182468 1182469 XCV1594 XCV1595 ugd1   TRUE 0.878 -7.000 0.020 NA   NA
 1182469 1182470 XCV1595 XCV1596     TRUE 0.737 19.000 0.024 NA   NA
 1182470 1182471 XCV1596 XCV1597     FALSE 0.040 343.000 0.000 NA   NA
 1182471 1182472 XCV1597 XCV1598     TRUE 0.558 139.000 0.077 NA   NA
 1182472 1182473 XCV1598 XCV1599     TRUE 0.851 14.000 0.115 1.000 N NA
 1182473 1182474 XCV1599 XCV1600     TRUE 0.997 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 1182474 1182475 XCV1600 XCV1601     TRUE 0.993 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 1182476 1182477 XCV1602 XCV1603 meth meth TRUE 0.867 167.000 0.009 0.001 Y NA
 1182477 1182478 XCV1603 XCV1604 meth   TRUE 0.941 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1182479 1182480 XCV1605 XCV1606 acdA   FALSE 0.033 265.000 0.000 1.000 N NA
 1182482 1182483 XCV1607 XCV1608 vacB   FALSE 0.089 274.000 0.004 1.000   NA
 1182483 1182484 XCV1608 XCV1609     FALSE 0.062 309.000 0.002 1.000   NA
 1182484 1182485 XCV1609 XCV1610     FALSE 0.223 103.000 0.002 1.000 N NA
 1182486 1182487 XCV1611 XCV1612 rnt   FALSE 0.076 264.000 0.000 NA   NA
 1182487 1182488 XCV1612 XCV1613   phoU TRUE 0.627 111.000 0.087 NA   NA
 1182488 1182489 XCV1613 XCV1614 phoU pstB TRUE 0.787 129.000 0.034 NA Y NA
 1182489 1182490 XCV1614 XCV1615 pstB pstA TRUE 0.992 23.000 0.526 0.002 Y NA
 1182490 1182491 XCV1615 XCV1616 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.002 Y NA
 1182491 1182492 XCV1616 XCV1617 pstC pstS TRUE 0.934 113.000 0.033 0.002 Y NA
 1182492 1182493 XCV1617 XCV1618 pstS phoX TRUE 0.735 349.000 0.333 0.002 Y NA
 1182493 1182494 XCV1618 XCV1619 phoX oprP1 TRUE 0.899 191.000 0.750 NA Y NA
 1182495 1182496 XCV1620 XCV1621   cynT2 TRUE 0.914 115.000 1.000 NA   NA
 1182496 1182497 XCV1621 XCV1622 cynT2   TRUE 0.969 12.000 0.069 1.000 Y NA
 1182498 1182499 XCV1623 XCV1624     TRUE 0.955 -3.000 0.005 NA   NA
 1182499 1182500 XCV1624 XCV1625     TRUE 0.966 8.000 0.160 NA   NA
 1182501 1182502 XCV1626 XCV1627     TRUE 0.527 113.000 0.028 1.000   NA
 1182502 1182503 XCV1627 XCV1628   sseA TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 1182503 1182504 XCV1628 XCV1629 sseA   FALSE 0.352 89.000 0.000 NA   NA
 1182506 1182507 XCV1631 XCV1632     TRUE 0.963 -3.000 0.014 NA   NA
 1182507 1182508 XCV1632 XCV1633     FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1182508 1182509 XCV1633 XCV1634     FALSE 0.057 302.000 0.000 1.000   NA
 1182509 1182510 XCV1634 XCV1635     FALSE 0.269 167.000 0.004 1.000   NA
 1182510 1182511 XCV1635 XCV1636   ppnk FALSE 0.055 221.000 0.000 1.000 N NA
 1182511 1182512 XCV1636 XCV1637 ppnk   FALSE 0.396 168.000 0.036 1.000   NA
 1182513 1182514 XCV1638 XCV1639     TRUE 0.675 116.000 0.139 NA   NA
 1182514 1182515 XCV1639 XCV1640   sbcB TRUE 0.974 -3.000 0.034 NA   NA
 1182515 1182516 XCV1640 XCV1641 sbcB   FALSE 0.077 259.000 0.017 1.000 N NA
 1182516 1182517 XCV1641 XCV1642     FALSE 0.378 172.000 0.100 1.000 N NA
 1182517 1182518 XCV1642 XCV1643     TRUE 0.647 34.000 0.060 NA   NA
 1182518 1182519 XCV1643 XCV1644     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1182519 1182520 XCV1644 XCV1645     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1182520 1182521 XCV1645 XCV1646     TRUE 0.530 87.000 0.027 1.000   NA
 1182522 1182523 XCV1647 XCV1648     TRUE 0.796 43.000 0.333 NA   NA
 1182523 1182524 XCV1648 XCV1649     TRUE 0.827 52.000 0.500 NA   NA
 1182524 1182525 XCV1649 XCV1650     TRUE 0.887 47.000 0.750 NA   NA
 1182525 1182526 XCV1650 XCV1651     TRUE 0.990 1.000 0.286 NA   NA
 1182526 1182527 XCV1651 XCV1652     FALSE 0.123 220.000 0.000 NA   NA
 1182527 1182528 XCV1652 XCV1653     TRUE 0.740 40.000 0.200 NA   NA
 1182528 1182529 XCV1653 XCV1654     FALSE 0.033 376.000 0.000 NA   NA
 1182529 1182530 XCV1654 XCV1655     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1182531 1182532 XCV1656 XCV1657     TRUE 0.981 2.000 0.116 NA   NA
 1182532 1182533 XCV1657 XCV1658     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 1182533 1182534 XCV1658 XCV1659   asnS FALSE 0.379 136.000 0.009 NA   NA
 1182535 1182536 XCV1660 XCV1661   rpsF FALSE 0.028 407.000 0.000 NA   NA
 1182536 1182537 XCV1661 XCV1662 rpsF rpsR TRUE 0.994 12.000 0.319 0.011 Y NA
 1182537 1182538 XCV1662 XCV1663 rpsR rplI TRUE 0.943 188.000 0.499 0.011 Y NA
 1182538 1182539 XCV1663 XCV1664 rplI smc FALSE 0.061 210.000 0.000 1.000 N NA
 1182539 1182540 XCV1664 XCV1665 smc zipA TRUE 0.937 57.000 0.115 0.009 Y NA
 1182540 1182541 XCV1665 XCV1666 zipA   TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1182543 1182544 XCV1668 XCV1669 ligA lysS TRUE 0.909 -3.000 0.004 1.000 N NA
 1182544 1182545 XCV1669 XCV1670 lysS   TRUE 0.505 109.000 0.026 NA   NA
 1182545 1182546 XCV1670 XCV1671   gcn3 FALSE 0.202 199.000 0.009 NA   NA
 1182546 1182547 XCV1671 XCV1672 gcn3 gyrA FALSE 0.092 210.000 0.007 1.000 N NA
 1182547 1182548 XCV1672 XCV1673 gyrA gcd1 FALSE 0.065 225.000 0.002 1.000 N NA
 1182548 1182549 XCV1673 XCV1674 gcd1   FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 1182550 1182551 XCV1675 XCV1676   hutU FALSE 0.098 269.000 0.008 NA   NA
 1182551 1182552 XCV1676 XCV1677 hutU hutG TRUE 0.943 17.000 0.061 1.000 Y NA
 1182552 1182553 XCV1677 XCV1678 hutG hutH TRUE 0.662 182.000 0.039 1.000 Y NA
 1182553 1182554 XCV1678 XCV1679 hutH hutI TRUE 0.957 14.000 0.192 0.033 N NA
 1182555 1182556 XCV1680 XCV1681     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 1182556 1182557 XCV1681 XCV1682   hutC TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1182558 1182559 XCV1683 XCV1684     FALSE 0.055 540.000 0.087 NA   NA
 1182559 1182560 XCV1684 XCV1685     TRUE 0.499 163.000 0.095 NA   NA
 1182562 1182563 XCV1687 XCV1688     TRUE 0.950 126.000 0.790 0.049   NA
 1182564 1182565 XCV1689 XCV1690 serC pheA TRUE 0.866 85.000 0.121 1.000 Y NA
 1182565 1182566 XCV1690 XCV1691 pheA aroA TRUE 0.801 124.000 0.035 1.000 Y NA
 1182567 1182568 XCV1692 XCV1693 tonB2 tonB3 TRUE 0.722 248.000 0.333 0.002   NA
 1182571 1182572 XCV1696 XCV_tRNA23   tRNA-Ser FALSE 0.035 369.000 0.000 NA   NA
 1182572 1182573 XCV_tRNA23 XCV1697 tRNA-Ser   FALSE 0.350 88.000 0.000 NA   NA
 1182573 10702499 XCV1697 IS_Xac3_5     TRUE 0.471 -52.000 0.000 NA   NA
 10702499 1182574 IS_Xac3_5 XCV1698     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1182574 1182575 XCV1698 XCV1699     TRUE 0.991 9.000 0.409 0.083   NA
 1182578 1182579 XCV1702 XCV1703     FALSE 0.032 270.000 0.000 1.000 N NA
 1182579 1182580 XCV1703 XCV1704     FALSE 0.210 36.000 0.000 1.000 N NA
 1182583 1182584 XCV1707 XCV1708   cvgSY TRUE 0.994 -13.000 0.667 0.088 Y NA
 1182585 1182586 XCV1709 XCV1710   ccmH1 TRUE 0.993 -6.000 0.500 NA Y NA
 1182586 1182587 XCV1710 XCV1711 ccmH1 ccmG1 TRUE 0.962 63.000 1.000 NA Y NA
 1182587 1182588 XCV1711 XCV1712 ccmG1 ccmF1 TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.003 Y NA
 1182588 1182589 XCV1712 XCV1713 ccmF1 ccmE1 TRUE 0.905 64.000 0.008 0.003 Y NA
 1182589 1182590 XCV1713 XCV1714 ccmE1 ccmD1 TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 1182590 1182591 XCV1714 XCV1715 ccmD1 ccmC1 TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 1182591 1182592 XCV1715 XCV1716 ccmC1   TRUE 0.852 11.000 0.008 1.000   NA
 1182592 1182593 XCV1716 XCV1717     FALSE 0.270 504.000 0.833 NA   NA
 1182593 1182594 XCV1717 XCV1718   rpoE4 TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 1182594 1182595 XCV1718 XCV1719 rpoE4   TRUE 0.865 52.000 0.667 NA   NA
 1182595 1182596 XCV1719 XCV1720     FALSE 0.145 429.000 0.286 NA   NA
 1182596 1182597 XCV1720 XCV1721     TRUE 0.923 27.000 0.571 NA   NA
 1182597 1182598 XCV1721 XCV1722     TRUE 0.849 84.000 0.500 NA   NA
 1182599 1182600 XCV1723 XCV1724     TRUE 0.757 -25.000 0.047 NA   NA
 1182600 1182601 XCV1724 XCV1725   wzxE TRUE 0.964 -3.000 0.012 1.000   NA
 1182601 1182602 XCV1725 XCV1726 wzxE   TRUE 0.973 -3.000 0.034 NA   NA
 1182602 1182603 XCV1726 XCV1727     TRUE 0.810 -15.000 0.034 NA   NA
 1182603 1182604 XCV1727 XCV1728     TRUE 0.912 44.000 1.000 NA   NA
 1182604 1182605 XCV1728 XCV1729     FALSE 0.068 284.000 0.000 1.000   NA
 1182605 1182606 XCV1729 XCV1730     TRUE 0.800 13.000 0.043 1.000 N NA
 1182606 1182607 XCV1730 XCV1731     TRUE 0.972 -3.000 0.083 1.000 N NA
 1182607 1182608 XCV1731 XCV1732     FALSE 0.418 125.000 0.042 1.000 N NA
 1182608 1182609 XCV1732 XCV1733     TRUE 0.997 -3.000 0.011 0.010 Y NA
 1182610 1182611 XCV1734 XCV1735     TRUE 0.706 56.000 0.222 NA   NA
 1182612 1182613 XCV1736 XCV1737     FALSE 0.408 67.000 0.007 1.000   NA
 1182614 1182615 XCV1738 XCV1739     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182616 1182617 XCV1740 XCV1741     FALSE 0.419 61.000 0.011 1.000   NA
 1182618 1182619 XCV1742 XCV1743 exoD   TRUE 0.905 -16.000 0.200 1.000   NA
 1182620 1182621 XCV1744 XCV1745 pitX pitA TRUE 0.973 10.000 0.030 NA Y NA
 1182621 1182622 XCV1745 XCV1746 pitA   FALSE 0.345 110.000 0.000 NA   NA
 1182623 1182624 XCV1747 XCV1748   parE FALSE 0.015 364.000 0.000 1.000 N NA
 1182625 1182626 XCV1749 XCV1750 pyrG   FALSE 0.277 221.000 0.138 1.000 N NA
 1182626 1182627 XCV1750 XCV1751     FALSE 0.387 108.000 0.004 NA   NA
 1182627 1182628 XCV1751 XCV1752   eno FALSE 0.366 125.000 0.003 NA   NA
 1182628 1182629 XCV1752 XCV1753 eno ftsB TRUE 0.976 4.000 0.241 1.000 N NA
 1182629 1182630 XCV1753 XCV1754 ftsB ispD TRUE 0.983 -3.000 0.185 1.000 N NA
 1182630 1182631 XCV1754 XCV1755 ispD ispF TRUE 0.996 4.000 0.419 1.000 Y NA
 1182631 1182632 XCV1755 XCV1756 ispF truD TRUE 0.715 114.000 0.173 1.000   NA
 1182634 1182635 XCV1758 XCV1759 surE   TRUE 0.993 -3.000 0.353 1.000   NA
 1182635 1182636 XCV1759 XCV1760     TRUE 0.797 19.000 0.055 NA   NA
 1182636 1182637 XCV1760 XCV1761   nlpD TRUE 0.981 -3.000 0.074 NA   NA
 1182638 1182639 XCV1762 XCV1763     TRUE 0.752 16.000 0.014 NA   NA
 1182640 1182641 XCV1764 XCV1765 ftsJ ftsH FALSE 0.427 55.000 0.066 NA N NA
 1182641 1182642 XCV1765 XCV1766 ftsH folP TRUE 0.717 127.000 0.325 1.000 N NA
 1182642 1182643 XCV1766 XCV1767 folP miaA TRUE 0.928 0.000 0.009 1.000 N NA
 1182643 1182644 XCV1767 XCV1768 miaA hfq TRUE 0.859 78.000 0.531 1.000   NA
 1182644 1182645 XCV1768 XCV1769 hfq hflX TRUE 0.931 12.000 0.141 1.000   NA
 1182645 1182646 XCV1769 XCV1770 hflX   FALSE 0.031 422.000 0.002 NA   NA
 1182646 1182647 XCV1770 XCV1771     FALSE 0.033 466.000 0.011 NA   NA
 1182647 1182648 XCV1771 XCV1772   lexA2 TRUE 0.857 86.000 0.500 1.000   NA
 1182648 1182649 XCV1772 XCV1773 lexA2 recA FALSE 0.401 173.000 0.005 0.082 N NA
 1182649 1182650 XCV1773 XCV1774 recA recX FALSE 0.295 297.000 0.296 1.000   NA
 1182650 1182651 XCV1774 XCV1775 recX alaS TRUE 0.643 102.000 0.085 1.000   NA
 1182651 1182652 XCV1775 XCV1776 alaS csrA1 FALSE 0.292 140.000 0.020 1.000 N NA
 1182652 1182653 XCV1776 XCV_tRNA24 csrA1 tRNA-Ser FALSE 0.341 84.000 0.000 NA   NA
 1182653 1182654 XCV_tRNA24 XCV1777 tRNA-Ser   FALSE 0.015 680.000 0.000 NA   NA
 1182654 1182655 XCV1777 XCV1778     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1182655 1182656 XCV1778 XCV1779     FALSE 0.341 84.000 0.000 NA   NA
 1182658 1182659 XCV1781 XCV1782     TRUE 0.732 45.000 0.222 NA   NA
 1182660 1182661 XCV_tRNA25 XCV_tRNA26 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.351 102.000 0.000 NA   NA
 1182661 1182662 XCV_tRNA26 XCV1783 tRNA-Arg   FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1182662 1182663 XCV1783 XCV1784   thiD TRUE 0.986 -3.000 0.148 NA   NA
 1182663 1182664 XCV1784 XCV1785 thiD   TRUE 0.735 -40.000 0.065 NA   NA
 1182664 1182665 XCV1785 XCV1786     TRUE 0.952 7.000 0.065 NA   NA
 1182665 1182666 XCV1786 XCV1787     TRUE 0.972 0.000 0.027 NA   NA
 1182666 1182667 XCV1787 XCV1788     TRUE 0.451 83.000 0.050 1.000 N NA
 1182667 1182668 XCV1788 XCV1789     FALSE 0.414 37.000 0.002 NA   NA
 1182668 1182669 XCV1789 XCV1790   gcvR TRUE 0.848 12.000 0.020 NA   NA
 1182670 1182671 XCV1791 XCV1792 dapA   TRUE 0.773 17.000 0.028 NA   NA
 1182672 1182673 XCV1793 XCV1794     TRUE 0.919 84.000 0.500 0.013 N NA
 1182673 1182674 XCV1794 XCV1795     TRUE 0.993 -3.000 0.053 NA Y NA
 1182674 1182675 XCV1795 XCV1796   dgoD TRUE 0.884 -6.000 0.053 NA N NA
 1182675 1182676 XCV1796 XCV1797 dgoD dgoA TRUE 0.994 -3.000 0.192 0.034 N NA
 1182677 1182678 XCV1798 XCV1799     TRUE 0.676 159.000 0.286 1.000   NA
 1182678 1182679 XCV1799 XCV1800     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.020   NA
 1182679 1182680 XCV1800 XCV1801     FALSE 0.375 339.000 0.000 0.020 Y NA
 1182680 1182681 XCV1801 XCV1802     TRUE 0.838 112.000 0.429 1.000   NA
 1182681 1182682 XCV1802 XCV1803     TRUE 0.843 89.000 0.429 1.000   NA
 1182682 1182683 XCV1803 XCV1804     TRUE 0.958 12.000 0.300 1.000   NA
 1182683 1182684 XCV1804 XCV1805     TRUE 0.959 102.000 0.250 0.023 Y NA
 1182684 1182685 XCV1805 XCV1806     TRUE 0.717 -106.000 0.094 1.000   NA
 1182685 1182686 XCV1806 XCV1807     TRUE 0.974 -3.000 0.029 1.000   NA
 1182686 1182687 XCV1807 XCV1808     TRUE 0.842 47.000 0.091 1.000 Y NA
 1182687 1182688 XCV1808 XCV1809     TRUE 0.468 86.000 0.013 1.000   NA
 1182688 1182689 XCV1809 XCV1810     FALSE 0.082 257.000 0.000 NA   NA
 1182691 1182692 XCV1812 XCV1813 amiC   TRUE 0.559 37.000 0.026 1.000   NA
 1182694 1182695 XCV1814 XCV1815 pcnB folK TRUE 0.976 4.000 0.234 1.000 N NA
 1182695 1182696 XCV1815 XCV1816 folK panB TRUE 0.885 36.000 0.117 1.000 Y NA
 1182696 1182697 XCV1816 XCV1817 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 1182697 1182698 XCV1817 XCV1818 panC panD TRUE 0.850 177.000 0.342 1.000 Y NA
 1182698 1182699 XCV1818 XCV1819 panD pgi TRUE 0.929 -3.000 0.011 1.000 N NA
 1182699 1182700 XCV1819 XCV1820 pgi   FALSE 0.246 155.000 0.000 NA   NA
 1182700 1182701 XCV1820 XCV1821     TRUE 0.984 4.000 0.278 NA   NA
 1182703 1182704 XCV1823 XCV1824 celD   FALSE 0.216 257.000 0.071 1.000   NA
 1182707 1182708 XCV1827 XCV1828 regR regS TRUE 0.999 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 1182709 1182710 XCV1829 XCV1830 ispG   TRUE 0.896 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 1182711 1182712 XCV1831 XCV1832     FALSE 0.130 194.000 0.011 1.000 N NA
 1182712 1182713 XCV1832 XCV1833     FALSE 0.218 140.000 0.011 NA N NA
 1182713 1182714 XCV1833 XCV1834   murB TRUE 0.914 -3.000 0.008 NA N NA
 1182714 1182715 XCV1834 XCV1835 murB pyrD TRUE 0.925 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1182715 1182716 XCV1835 XCV1836 pyrD   TRUE 0.913 6.000 0.006 1.000   NA
 1182716 1182717 XCV1836 XCV1837     TRUE 0.986 -3.000 0.138 NA   NA
 1182717 1182718 XCV1837 XCV1838     FALSE 0.043 495.000 0.032 NA   NA
 10702500 1182720 IS_1477_7 XCV1840     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1182720 1182721 XCV1840 XCV1841     TRUE 0.717 33.000 0.000 0.082   NA
 1182721 1182722 XCV1841 XCV1842     FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 10702501 1182723 IS_xac3_2 XCV1843     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1182723 1182724 XCV1843 XCV1844     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.082 Y NA
 1182724 1182725 XCV1844 XCV1845     FALSE 0.323 65.000 0.000 NA   NA
 10702502 1182726 IS_Xcc1_5 XCV1846     FALSE 0.307 -760.000 0.000 NA   NA
 1182726 1182727 XCV1846 XCV1847     TRUE 0.927 99.000 0.500 0.082   NA
 1182727 1182728 XCV1847 XCV1848     FALSE 0.223 266.000 0.000 0.082   NA
 1182730 10702503 XCV1849 IS_Xcv2_1     FALSE 0.252 -895.000 0.000 NA   NA
 10702503 1182731 IS_Xcv2_1 XCV1850     FALSE 0.326 67.000 0.000 NA   NA
 1182731 1182732 XCV1850 XCV1851     TRUE 0.927 99.000 0.500 0.081   NA
 1182733 1182734 XCV1852 XCV1853     FALSE 0.116 225.000 0.000 NA   NA
 1182734 1182735 XCV1853 XCV1854     FALSE 0.128 215.000 0.000 NA   NA
 1182736 1182737 XCV1855 XCV1856     FALSE 0.085 251.000 0.000 NA   NA
 1182737 1182738 XCV1856 XCV1857     FALSE 0.028 408.000 0.000 NA   NA
 1182739 1182740 XCV1858 XCV1859   fhaC FALSE 0.005 782.000 0.000 NA N NA
 1182740 1182741 XCV1859 XCV1860 fhaC fhaB1 FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1182741 1182742 XCV1860 XCV1861 fhaB1 fhaB2 TRUE 0.682 52.000 0.000 0.014   NA
 1182742 10702504 XCV1861 IS_1477_8 fhaB2   TRUE 0.640 -16.000 0.000 NA   NA
 10702504 1182743 IS_1477_8 XCV1862     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1182743 1182744 XCV1862 XCV1863     TRUE 0.719 33.000 0.000 0.081   NA
 1182744 1182745 XCV1863 XCV1864     FALSE 0.307 135.000 0.000 NA   NA
 1182745 1182746 XCV1864 XCV1865     TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1182746 1182747 XCV1865 XCV1866   thrA FALSE 0.007 590.000 0.000 1.000 N NA
 1182747 1182748 XCV1866 XCV1867 thrA thrB TRUE 0.991 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 1182750 1182751 XCV1869 XCV1870 thrC   FALSE 0.388 102.000 0.003 NA   NA
 1182753 1182754 XCV1872 XCV1873 hisS   FALSE 0.140 214.000 0.000 1.000   NA
 1182754 1182755 XCV1873 XCV1874   hisG TRUE 0.889 10.000 0.013 1.000   NA
 1182755 1182756 XCV1874 XCV1875 hisG hisD TRUE 0.999 -3.000 0.171 0.002 Y NA
 1182756 1182757 XCV1875 XCV1876 hisD hisC2 TRUE 0.999 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 1182757 1182758 XCV1876 XCV1877 hisC2 hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 1182758 1182759 XCV1877 XCV1878 hisB hisH TRUE 0.999 -3.000 0.128 0.002 Y NA
 1182759 1182760 XCV1878 XCV1879 hisH hisA TRUE 0.999 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 1182760 1182761 XCV1879 XCV1880 hisA hisF TRUE 0.998 -6.000 0.433 0.002 Y NA
 1182761 1182762 XCV1880 XCV1881 hisF hisIE TRUE 0.996 -10.000 0.430 0.002 Y NA
 1182762 1182763 XCV1881 XCV1882 hisIE   FALSE 0.221 180.000 0.003 NA   NA
 1182764 1182765 XCV1883 XCV1884     TRUE 0.467 98.000 0.012 1.000   NA
 1182765 1182766 XCV1884 XCV1885     TRUE 0.986 3.000 0.231 1.000   NA
 1182766 1182767 XCV1885 XCV1886     TRUE 0.738 36.000 0.148 1.000   NA
 1182767 1182768 XCV1886 XCV1887     FALSE 0.442 90.000 0.041 1.000 N NA
 1182768 1182769 XCV1887 XCV1888     TRUE 0.986 77.000 0.833 0.003 Y NA
 1182772 1182773 XCV1891 XCV1892     TRUE 0.701 35.000 0.111 NA   NA
 1182773 1182774 XCV1892 XCV1893     TRUE 0.991 -3.000 0.294 NA   NA
 1182775 1182776 XCV1894 XCV1895   efP1 TRUE 0.978 0.000 0.051 NA   NA
 1182776 1182777 XCV1895 XCV1896 efP1   TRUE 0.531 101.000 0.085 1.000 N NA
 1182777 1182778 XCV1896 XCV1897   mvaB TRUE 0.755 138.000 0.125 0.052 N NA
 1182778 1182779 XCV1897 XCV1898 mvaB   TRUE 0.815 107.000 0.042 NA Y NA
 1182779 1182780 XCV1898 XCV1899     TRUE 0.948 -3.000 0.027 NA N NA
 1182781 1182782 XCV1900 XCV1901 feoA feoB TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 1182782 1182783 XCV1901 XCV1902 feoB   TRUE 0.966 2.000 0.028 NA   NA
 1182783 1182784 XCV1902 XCV1903     TRUE 0.800 61.000 0.400 NA   NA
 1182784 1182785 XCV1903 XCV1904     FALSE 0.442 52.000 0.021 NA   NA
 1182785 1182786 XCV1904 XCV1905     TRUE 0.990 3.000 0.031 0.012   NA
 1182786 1182787 XCV1905 XCV1906   dapB FALSE 0.017 672.000 0.000 1.000   NA
 1182787 1182788 XCV1906 XCV1907 dapB carA TRUE 0.465 241.000 0.034 1.000 Y NA
 1182788 1182789 XCV1907 XCV1908 carA   TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1182789 1182790 XCV1908 XCV1909   carB TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1182790 1182791 XCV1909 XCV1910 carB greA TRUE 0.986 -3.000 0.241 1.000 N NA
 1182791 1182792 XCV1910 XCV1911 greA rpfE TRUE 0.557 -55.000 0.011 NA   NA
 1182792 1182793 XCV1911 XCV1912 rpfE   TRUE 0.960 -3.000 0.010 NA   NA
 1182795 1182796 XCV1914 XCV1915 rpfD prfB FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 1182796 1182797 XCV1915 XCV1916 prfB lysU TRUE 0.850 204.000 0.162 0.032 Y NA
 1182797 1182798 XCV1916 XCV1917 lysU rpfG FALSE 0.198 141.000 0.005 1.000 N NA
 1182798 1182799 XCV1917 XCV1918 rpfG rpfH TRUE 0.983 2.000 0.133 NA   NA
 1182799 1182800 XCV1918 XCV1919 rpfH rpfC TRUE 0.957 8.000 0.100 NA   NA
 1182801 1182802 XCV1920 XCV1921 rpfF rpfB TRUE 0.868 177.000 0.108 0.052 Y NA
 1182803 1182804 XCV1922 XCV1923     TRUE 0.579 -21.000 0.000 NA   NA
 1182806 1182807 XCV1925 XCV1926     TRUE 0.988 -3.000 0.177 NA   NA
 1182807 1182808 XCV1926 XCV1927   acnB TRUE 0.456 51.000 0.023 NA   NA
 1182808 1182809 XCV1927 XCV1928 acnB   FALSE 0.229 189.000 0.007 1.000   NA
 1182810 1182811 XCV1929 XCV1930   cheB1 TRUE 0.915 67.000 0.045 0.029 Y NA
 1182811 1182812 XCV1930 XCV1931 cheB1 CheD TRUE 0.997 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 1182812 1182813 XCV1931 XCV1932 CheD cheR2 TRUE 0.991 3.000 0.056 1.000 Y NA
 1182813 1182814 XCV1932 XCV1933 cheR2   FALSE 0.346 243.000 0.000 1.000 Y NA
 1182814 1182815 XCV1933 XCV1934     TRUE 0.741 84.000 0.222 NA   NA
 1182815 1182816 XCV1934 XCV1935   cheW1 FALSE 0.156 453.000 0.333 NA   NA
 1182816 1182817 XCV1935 XCV1936 cheW1   TRUE 0.598 136.000 0.200 NA N NA
 1182817 1182818 XCV1936 XCV1937     FALSE 0.054 300.000 0.000 NA   NA
 1182818 1182819 XCV1937 XCV1938     TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1182819 1182820 XCV1938 XCV1939     FALSE 0.197 649.000 0.000 0.012 Y NA
 1182820 1182821 XCV1939 XCV1940     FALSE 0.414 327.000 0.000 0.012 Y NA
 1182821 1182822 XCV1940 XCV1941     FALSE 0.208 587.000 0.000 0.012 Y NA
 1182822 1182823 XCV1941 XCV1942     TRUE 0.889 108.000 0.000 0.012 Y NA
 1182823 1182824 XCV1942 XCV1943     FALSE 0.163 194.000 0.000 NA   NA
 1182824 1182825 XCV1943 XCV1944     TRUE 0.578 20.000 0.000 NA   NA
 1182825 1182826 XCV1944 XCV1945     TRUE 0.501 284.000 0.000 0.012 Y NA
 1182826 1182827 XCV1945 XCV1946     FALSE 0.082 257.000 0.000 NA   NA
 1182827 1182828 XCV1946 XCV1947     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 1182828 1182829 XCV1947 XCV1948     TRUE 0.674 222.000 0.000 0.012 Y NA
 1182829 1182830 XCV1948 XCV1949     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1182830 1182831 XCV1949 XCV1950     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1182831 1182832 XCV1950 XCV1951     FALSE 0.053 301.000 0.000 NA   NA
 1182832 1182833 XCV1951 XCV1952     TRUE 0.991 7.000 0.000 0.012 Y NA
 1182833 1182834 XCV1952 XCV1953     FALSE 0.018 540.000 0.000 NA   NA
 1182834 1182835 XCV1953 XCV1954     FALSE 0.124 219.000 0.000 NA   NA
 1182835 1182836 XCV1954 XCV1955     TRUE 0.450 307.000 0.000 0.012 Y NA
 1182836 1182837 XCV1955 XCV1956   cheA1 TRUE 0.869 52.000 0.000 0.012 Y NA
 1182837 1182838 XCV1956 XCV1957 cheA1 cheY TRUE 0.897 34.000 0.135 1.000 Y NA
 1182838 1182839 XCV1957 XCV1958 cheY   TRUE 0.995 -3.000 0.514 NA   NA
 1182839 1182840 XCV1958 XCV1959   cheW2 TRUE 0.725 103.000 0.190 NA   NA
 1182840 1182841 XCV1959 XCV1960 cheW2   TRUE 0.953 -3.000 0.028 1.000 N NA
 1182841 1182842 XCV1960 XCV1961   motB1 TRUE 0.980 2.000 0.199 1.000 N NA
 1182842 1182843 XCV1961 XCV1962 motB1 motA1 TRUE 0.992 7.000 0.248 1.000 Y NA
 1182844 1182845 XCV1963 XCV1964     TRUE 0.578 20.000 0.000 NA   NA
 1182845 1182846 XCV1964 XCV1965     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1182846 1182847 XCV1965 XCV1966     FALSE 0.049 314.000 0.000 NA   NA
 1182847 1182848 XCV1966 XCV1967     FALSE 0.346 42.000 0.000 NA   NA
 1182848 10702505 XCV1967 IS_1477_9     FALSE 0.020 505.000 0.000 NA   NA
 10702505 1182849 IS_1477_9 XCV1968     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1182849 1182850 XCV1968 XCV1969     TRUE 0.719 33.000 0.000 0.081   NA
 1182850 1182851 XCV1969 XCV1970     FALSE 0.037 372.000 0.000 1.000   NA
 1182851 1182852 XCV1970 XCV1971     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1182852 1182853 XCV1971 XCV1972     TRUE 0.917 87.000 1.000 NA   NA
 1182853 1182854 XCV1972 XCV1973     TRUE 0.654 16.000 0.000 NA   NA
 1182855 1182856 XCV1974 XCV1975 cheA2 cheZ TRUE 0.996 3.000 0.341 1.000 Y NA
 1182856 1182857 XCV1975 XCV1976 cheZ cheY TRUE 0.998 0.000 0.516 1.000 Y NA
 1182857 1182858 XCV1976 XCV1977 cheY fliA TRUE 0.869 36.000 0.283 0.075 N NA
 1182858 1182859 XCV1977 XCV1978 fliA fleN TRUE 0.992 -3.000 0.482 1.000 N NA
 1182859 1182860 XCV1978 XCV1979 fleN flhF TRUE 0.963 -13.000 0.241 0.016 N NA
 1182860 1182861 XCV1979 XCV1980 flhF flhA FALSE 0.086 674.000 0.008 1.000 Y NA
 1182861 1182862 XCV1980 XCV1981 flhA flhB TRUE 0.997 -3.000 0.029 0.011 Y NA
 1182862 1182863 XCV1981 XCV1982 flhB   FALSE 0.244 140.000 0.012 1.000 N NA
 1182863 1182864 XCV1982 XCV1983     TRUE 0.557 271.000 0.000 0.008 Y NA
 1182864 1182865 XCV1983 XCV1984     FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 1182865 1182866 XCV1984 XCV1985     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182866 1182867 XCV1985 XCV1986   fliR FALSE 0.299 202.000 0.111 1.000 N NA
 1182867 1182868 XCV1986 XCV1987 fliR fliQ TRUE 0.974 14.000 0.215 1.000 Y NA
 1182868 1182869 XCV1987 XCV1988 fliQ fliP FALSE 0.353 893.000 0.177 0.011 Y NA
 1182869 1182870 XCV1988 XCV1989 fliP fliO TRUE 0.991 2.000 0.029 1.000 Y NA
 1182870 1182871 XCV1989 XCV1990 fliO fliN TRUE 0.983 -3.000 0.090 1.000   NA
 1182871 1182872 XCV1990 XCV1991 fliN fliM TRUE 0.994 -3.000 0.026 0.001   NA
 1182872 1182873 XCV1991 XCV1992 fliM fliL TRUE 0.991 11.000 0.029 0.001 Y NA
 1182873 1182874 XCV1992 XCV1993 fliL fliK TRUE 0.682 166.000 0.025 1.000 Y NA
 1182874 1182875 XCV1993 XCV1994 fliK fliJ TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.005   NA
 1182875 1182876 XCV1994 XCV1995 fliJ fliI TRUE 0.962 4.000 0.044 1.000   NA
 1182876 1182877 XCV1995 XCV1996 fliI fliH TRUE 0.995 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 1182877 1182878 XCV1996 XCV1997 fliH fliG TRUE 0.999 -3.000 0.320 0.003 Y NA
 1182878 1182879 XCV1997 XCV1998 fliG fliF TRUE 0.992 -10.000 0.189 0.005 Y NA
 1182879 1182880 XCV1998 XCV1999 fliF fliE TRUE 0.997 14.000 0.910 0.005 Y NA
 1182880 1182881 XCV1999 XCV2000 fliE   FALSE 0.121 221.000 0.000 NA   NA
 1182881 1182882 XCV2000 XCV2001     FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1182882 1182883 XCV2001 XCV2002     FALSE 0.014 797.000 0.000 NA   NA
 1182883 1182884 XCV2002 XCV2003   kdsB1 TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1182884 1182885 XCV2003 XCV2004 kdsB1   TRUE 0.448 42.000 0.013 NA   NA
 1182885 1182886 XCV2004 XCV2005     FALSE 0.181 185.000 0.000 NA   NA
 1182886 1182887 XCV2005 XCV2006     FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1182887 1182888 XCV2006 XCV2007     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 1182888 1182889 XCV2007 XCV2008     TRUE 0.631 31.000 0.027 1.000   NA
 1182889 1182890 XCV2008 XCV2009     TRUE 0.979 -3.000 0.054 1.000   NA
 1182890 1182891 XCV2009 XCV2010     TRUE 0.992 15.000 0.400 0.032 Y NA
 1182891 1182892 XCV2010 XCV2011   fabH TRUE 0.900 57.000 0.308 1.000 Y NA
 1182892 1182893 XCV2011 XCV2012 fabH   TRUE 0.976 6.000 0.219 NA   NA
 1182893 1182894 XCV2012 XCV2013     TRUE 0.528 65.000 0.041 NA   NA
 1182894 1182895 XCV2013 XCV2014   fleQ FALSE 0.303 118.000 0.014 1.000 N NA
 1182895 1182896 XCV2014 XCV2015 fleQ   TRUE 0.987 -7.000 0.050 0.075 Y NA
 1182896 1182897 XCV2015 XCV2016   rpoN1 TRUE 0.964 9.000 0.050 0.075 N NA
 1182897 1182898 XCV2016 XCV2017 rpoN1   TRUE 0.700 217.000 0.000 0.006 Y NA
 1182898 1182899 XCV2017 XCV2018     TRUE 0.783 36.000 0.238 NA   NA
 1182899 1182900 XCV2018 XCV2019     TRUE 0.990 0.000 0.250 NA   NA
 1182900 1182901 XCV2019 XCV2020   fliS TRUE 0.991 -3.000 0.300 NA   NA
 1182901 1182902 XCV2020 XCV2021 fliS fliD TRUE 0.970 151.000 0.500 0.002 Y NA
 1182902 1182903 XCV2021 XCV2022 fliD fliC FALSE 0.283 272.000 0.000 1.000 Y NA
 1182903 1182904 XCV2022 XCV2023 fliC flgL TRUE 0.497 318.000 0.000 0.001 Y NA
 1182904 1182905 XCV2023 XCV2024 flgL flgK TRUE 0.999 0.000 0.108 0.001 Y NA
 1182905 1182906 XCV2024 XCV2025 flgK flgJ TRUE 0.989 12.000 0.034 0.002 Y NA
 1182906 1182907 XCV2025 XCV2026 flgJ flgI TRUE 0.998 2.000 0.064 0.006 Y NA
 1182907 1182908 XCV2026 XCV2027 flgI flgH TRUE 0.993 11.000 0.106 0.006 Y NA
 1182908 1182909 XCV2027 XCV2028 flgH flgG TRUE 0.954 39.000 0.120 0.005 Y NA
 1182909 1182910 XCV2028 XCV2029 flgG flgF FALSE 0.426 760.000 0.174 0.001 Y NA
 1182910 1182911 XCV2029 XCV2030 flgF flgE TRUE 0.975 145.000 0.594 0.003 Y NA
 1182911 1182912 XCV2030 XCV2031 flgE flgD TRUE 0.975 32.000 0.875 NA Y NA
 1182912 1182913 XCV2031 XCV2032 flgD flgC TRUE 0.892 38.000 0.174 NA Y NA
 1182913 1182914 XCV2032 XCV2033 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.611 0.003 Y NA
 1182914 1182915 XCV2033 XCV2034 flgB   TRUE 0.450 334.000 0.267 1.000 Y NA
 1182916 1182917 XCV2035 XCV2036 flgA   TRUE 0.800 67.000 0.371 NA   NA
 1182917 1182918 XCV2036 XCV2037     TRUE 0.956 16.000 0.052 0.002   NA
 1182918 1182919 XCV2037 XCV2038     TRUE 0.706 167.000 0.364 1.000   NA
 1182920 1182921 XCV2039 XCV2040     TRUE 0.997 4.000 0.200 0.029 Y NA
 1182923 1182924 XCV2042 XCV2043     FALSE 0.029 405.000 0.000 NA   NA
 1182924 1182925 XCV2043 XCV2044     TRUE 0.555 87.000 0.041 NA   NA
 1182925 1182926 XCV2044 XCV2045     FALSE 0.440 149.000 0.036 NA   NA
 1182926 1182927 XCV2045 XCV2046   trmU TRUE 0.988 0.000 0.180 NA   NA
 1182927 1182928 XCV2046 XCV2047 trmU   TRUE 0.981 -3.000 0.158 1.000 N NA
 1182929 1182930 XCV2048 XCV2049 clpS clpA TRUE 0.832 143.000 0.596 NA   NA
 1182930 1182931 XCV2049 XCV2050 clpA   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182932 1182933 XCV2051 XCV2052 infA aat FALSE 0.340 81.000 0.020 1.000 N NA
 1182933 1182934 XCV2052 XCV2053 aat   FALSE 0.163 131.000 0.000 1.000 N NA
 1182934 1182935 XCV2053 XCV2054     FALSE 0.074 269.000 0.000 NA   NA
 1182935 1182936 XCV2054 XCV2055   trxB1 FALSE 0.383 58.000 0.010 NA   NA
 1182937 1182938 XCV2056 XCV2057 ftsK   FALSE 0.426 151.000 0.033 NA   NA
 1182938 1182939 XCV2057 XCV2058   lolA FALSE 0.437 107.000 0.011 NA   NA
 1182941 1182942 XCV2060 XCV2061   crcB FALSE 0.100 180.000 0.002 NA N NA
 1182942 1182943 XCV2061 XCV2062 crcB   TRUE 0.501 26.000 0.000 NA   NA
 1182944 1182945 XCV2063 XCV2064 fadA fadB TRUE 0.921 155.000 0.588 1.000 Y NA
 1182945 1182946 XCV2064 XCV2065 fadB   TRUE 0.517 25.000 0.019 1.000 N NA
 1182947 1182948 XCV2066 XCV2067 ndk   TRUE 0.969 7.000 0.156 1.000   NA
 1182948 1182949 XCV2067 XCV2068     TRUE 0.930 11.000 0.086 1.000   NA
 1182949 1182950 XCV2068 XCV2069     TRUE 0.989 -3.000 0.204 1.000   NA
 1182950 1182951 XCV2069 XCV2070     TRUE 0.457 71.000 0.015 1.000   NA
 1182951 1182952 XCV2070 XCV2071     TRUE 0.995 0.000 0.492 1.000   NA
 1182952 1182953 XCV2071 XCV2072   engA TRUE 0.956 11.000 0.203 1.000   NA
 1182953 1182954 XCV2072 XCV2073 engA moeA1 FALSE 0.057 303.000 0.000 1.000   NA
 1182956 1182957 XCV2075 XCV2076     TRUE 0.857 98.000 0.500 NA   NA
 1182957 1182958 XCV2076 XCV2077     FALSE 0.021 496.000 0.000 NA   NA
 1182958 1182959 XCV2077 XCV2078     TRUE 0.993 4.000 0.667 NA   NA
 1182959 1182960 XCV2078 XCV2079     TRUE 0.883 14.000 0.091 NA   NA
 1182964 1182965 XCV2083 XCV2084 moeA2   TRUE 0.922 38.000 0.005 0.002 Y NA
 1182965 1182966 XCV2084 XCV2085     TRUE 0.686 -16.000 0.005 NA   NA
 1182966 1182967 XCV2085 XCV2086     FALSE 0.113 227.000 0.000 NA   NA
 1182968 1182969 XCV2087 XCV2088   pedG TRUE 0.929 -7.000 0.081 1.000   NA
 1182969 1182970 XCV2088 XCV2089 pedG   FALSE 0.134 146.000 0.000 1.000 N NA
 1182971 1182972 XCV2090 XCV2091 nasT nasS TRUE 0.968 5.000 0.218 NA N NA
 1182972 1182973 XCV2091 XCV2092 nasS nasA FALSE 0.062 888.000 0.000 NA Y NA
 1182973 1182974 XCV2092 XCV2093 nasA nasB TRUE 0.694 23.000 0.074 1.000 N NA
 1182974 1182975 XCV2093 XCV2094 nasB nasE TRUE 0.998 -3.000 0.539 0.001 N NA
 1182975 1182976 XCV2094 XCV2095 nasE   TRUE 0.845 60.000 0.294 0.047 N NA
 1182976 1182977 XCV2095 XCV2096     FALSE 0.409 52.000 0.048 1.000 N NA
 1182977 1182978 XCV2096 XCV2097     FALSE 0.014 789.000 0.000 NA   NA
 1182978 1182979 XCV2097 XCV2098     FALSE 0.198 178.000 0.000 NA   NA
 1182979 1182980 XCV2098 XCV2099     FALSE 0.101 236.000 0.000 NA   NA
 1182980 1182981 XCV2099 XCV2100     FALSE 0.372 102.000 0.000 1.000   NA
 1182981 1182982 XCV2100 XCV2101     FALSE 0.043 333.000 0.000 NA   NA
 1182985 1182986 XCV2104 XCV2105     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 1182986 1182987 XCV2105 XCV2106   oprN6 FALSE 0.167 65.000 0.000 1.000 N NA
 1182987 1182988 XCV2106 XCV2107 oprN6   TRUE 0.988 -3.000 0.296 1.000 N NA
 1182988 1182989 XCV2107 XCV2108     TRUE 0.972 -7.000 0.519 1.000 N NA
 1182989 1182990 XCV2108 XCV2109     FALSE 0.023 488.000 0.000 1.000   NA
 1182991 1182992 XCV2110 XCV2111   lytS FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 1182992 1182993 XCV2111 XCV2112 lytS lytT TRUE 0.949 -21.000 0.000 0.029 Y NA
 1182995 1182996 XCV2114 XCV2115   sndH1 TRUE 0.992 -3.000 0.317 NA   NA
 1182996 1182997 XCV2115 XCV2116 sndH1   FALSE 0.101 244.000 0.000 1.000   NA
 1182998 1182999 XCV2117 XCV2118     FALSE 0.032 384.000 0.000 NA   NA
 1182999 1183000 XCV2118 XCV2119     FALSE 0.323 127.000 0.000 NA   NA
 1183001 1183002 XCV2120 XCV2121     TRUE 0.761 -64.000 0.133 NA   NA
 1183002 1183003 XCV2121 XCV2122     FALSE 0.352 100.000 0.000 NA   NA
 1183003 1183004 XCV2122 XCV2123     TRUE 0.488 27.000 0.000 NA   NA
 1183004 1183005 XCV2123 XCV2124     TRUE 0.946 -12.000 0.311 NA   NA
 1183005 1183006 XCV2124 XCV2125     TRUE 0.967 3.000 0.044 NA   NA
 1183006 1183007 XCV2125 XCV2126     TRUE 0.513 -36.000 0.000 NA   NA
 1183007 1183008 XCV2126 XCV2127   clpB1 FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1183008 1183009 XCV2127 XCV2128 clpB1   FALSE 0.326 72.000 0.000 NA   NA
 1183009 1183010 XCV2128 XCV2129     FALSE 0.167 192.000 0.000 NA   NA
 1183010 1183011 XCV2129 XCV2130     FALSE 0.013 1025.000 0.000 NA   NA
 1183011 1183012 XCV2130 XCV2131     TRUE 0.664 -15.000 0.000 NA   NA
 1183012 1183013 XCV2131 XCV2132     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183013 1183014 XCV2132 XCV2133     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 1183014 1183015 XCV2133 XCV2134     TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1183015 1183016 XCV2134 XCV2135     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183016 1183017 XCV2135 XCV2136     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183017 1183018 XCV2136 XCV2137     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1183018 1183019 XCV2137 XCV2138     TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1183019 1183020 XCV2138 XCV2139     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183020 1183021 XCV2139 XCV2140     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183021 1183022 XCV2140 XCV2141     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 1183022 1183023 XCV2141 XCV2142     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183024 1183025 XCV2143 XCV2144     TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1183025 1183026 XCV2144 XCV2145   virA FALSE 0.179 114.000 0.000 1.000 N NA
 1183026 1183027 XCV2145 XCV2146 virA   TRUE 0.877 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1183027 1183028 XCV2146 XCV2147   virG TRUE 0.983 -3.000 0.182 1.000 N NA
 1183028 1183029 XCV2147 XCV2148 virG   FALSE 0.029 402.000 0.000 NA   NA
 1183029 1183030 XCV2148 XCV2149     TRUE 0.765 48.000 0.300 NA   NA
 1183031 1183032 XCV2150 XCV2151     FALSE 0.161 61.000 0.000 1.000 N NA
 1183032 1183033 XCV2151 XCV2152     TRUE 0.877 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1183033 1183034 XCV2152 XCV2153     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.029 Y NA
 1183034 1183035 XCV2153 XCV2154     FALSE 0.289 140.000 0.000 NA   NA
 1183035 1183036 XCV2154 XCV2155     FALSE 0.027 422.000 0.000 NA   NA
 1183037 10702506 XCV2156 IS_Xac3_8 xopJ   FALSE 0.069 275.000 0.000 NA   NA
 10702506 1183038 IS_Xac3_8 XCV2157     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1183038 1183039 XCV2157 XCV2158     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.079 Y NA
 1183040 1183041 XCV2159 XCV2160 trbJ trbK TRUE 0.959 18.000 0.667 NA   NA
 1183041 1183042 XCV2160 XCV2161 trbK trbL TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1183042 1183043 XCV2161 XCV2162 trbL   FALSE 0.326 67.000 0.000 NA   NA
 1183045 1183046 XCV2164 XCV2165     TRUE 0.506 59.000 0.039 NA   NA
 1183046 1183047 XCV2165 XCV2166     TRUE 0.994 -3.000 0.434 NA   NA
 1183047 1183048 XCV2166 XCV2167     TRUE 0.985 -7.000 0.727 NA   NA
 1183048 1183049 XCV2167 XCV2168     TRUE 0.550 39.000 0.033 NA   NA
 1183049 1183050 XCV2168 XCV2169   recG TRUE 0.935 -18.000 0.400 NA   NA
 1183051 1183052 XCV2170 XCV2171     FALSE 0.322 137.000 0.000 1.000   NA
 1183052 1183053 XCV2171 XCV2172     FALSE 0.233 109.000 0.004 1.000 N NA
 1183053 1183054 XCV2172 XCV2173     TRUE 0.986 -3.000 0.152 NA   NA
 1183056 1183057 XCV2175 XCV2176     FALSE 0.021 495.000 0.000 NA   NA
 1183057 1183058 XCV2176 XCV2177     TRUE 0.938 28.000 0.750 NA   NA
 1183060 1183061 XCV2179 XCV2180     TRUE 0.953 23.000 0.308 0.047   NA
 1183061 1183062 XCV2180 XCV2181     TRUE 0.928 10.000 0.000 0.047 N NA
 1183062 1183063 XCV2181 XCV2182     FALSE 0.160 133.000 0.000 1.000 N NA
 1183063 1183064 XCV2182 XCV2183     FALSE 0.185 183.000 0.000 NA   NA
 1183066 1183067 XCV2185 XCV2186     TRUE 0.879 45.000 0.667 NA   NA
 1183067 1183068 XCV2186 XCV2187     FALSE 0.091 255.000 0.000 1.000   NA
 1183068 1183069 XCV2187 XCV2188     TRUE 0.997 -7.000 0.600 0.029 Y NA
 1183070 1183071 XCV2189 XCV2190     TRUE 0.976 -3.000 0.107 1.000 N NA
 1183071 1183072 XCV2190 XCV2191     TRUE 0.980 -3.000 0.071 NA   NA
 1183072 1183073 XCV2191 XCV2192     TRUE 0.525 114.000 0.033 NA   NA
 1183073 1183074 XCV2192 XCV2193     TRUE 0.645 95.000 0.082 1.000   NA
 1183074 1183075 XCV2193 XCV2194     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 1183075 1183076 XCV2194 XCV2195     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183077 1183078 XCV2196 XCV2197   mntH FALSE 0.016 760.000 0.000 1.000   NA
 1183079 1183080 XCV2198 XCV2199 mntR   TRUE 0.919 3.000 0.016 1.000 N NA
 1183080 1183081 XCV2199 XCV2200   orn FALSE 0.270 72.000 0.011 1.000 N NA
 1183082 1183083 XCV2201 XCV2202 mscS ppsA TRUE 0.940 0.000 0.018 NA N NA
 1183084 1183085 XCV2203 XCV2204     FALSE 0.335 189.000 0.043 NA   NA
 1183085 1183086 XCV2204 XCV2205     TRUE 0.500 71.000 0.030 NA   NA
 1183088 1183089 XCV2207 XCV2208 pssA   FALSE 0.442 55.000 0.022 NA   NA
 1183089 1183090 XCV2208 XCV2209   phbC TRUE 0.989 -3.000 0.210 NA   NA
 1183090 1183091 XCV2209 XCV2210 phbC   FALSE 0.379 114.000 0.032 NA N NA
 1183091 1183092 XCV2210 XCV2211     TRUE 0.932 9.000 0.043 NA   NA
 1183094 1183095 XCV2213 XCV2214   tex FALSE 0.433 103.000 0.010 NA   NA
 1183096 1183097 XCV2215 XCV2216     TRUE 0.706 203.000 0.000 0.023 Y NA
 1183098 1183099 XCV_tRNA29 XCV2217 tRNA-Leu   FALSE 0.181 185.000 0.000 NA   NA
 1183099 1183100 XCV2217 XCV2218     TRUE 0.919 92.000 1.000 NA   NA
 1183100 1183101 XCV2218 XCV2219     FALSE 0.353 99.000 0.000 NA   NA
 1183101 1183102 XCV2219 XCV2220     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183102 1183103 XCV2220 XCV2221     TRUE 0.689 -13.000 0.000 NA   NA
 1183103 1183104 XCV2221 XCV2222     FALSE 0.327 68.000 0.000 NA   NA
 1183104 1183105 XCV2222 XCV2223     FALSE 0.060 289.000 0.000 NA   NA
 1183105 1183106 XCV2223 XCV2224     FALSE 0.233 160.000 0.000 NA   NA
 1183106 1183107 XCV2224 XCV2225     FALSE 0.326 67.000 0.000 NA   NA
 1183108 1183109 XCV_tRNA30 XCV_tRNA31 tRNA-glu tRNA-Ala FALSE 0.322 48.000 0.000 NA   NA
 1183110 1183111 XCV2226 XCV2227     TRUE 0.527 24.000 0.000 NA   NA
 1183112 1183113 XCV_tRNA32 XCV_tRNA33 tRNA-glu tRNA-Ala FALSE 0.322 48.000 0.000 NA   NA
 1183113 1183114 XCV_tRNA33 XCV2228 tRNA-Ala   FALSE 0.356 92.000 0.000 NA   NA
 1183114 1183115 XCV2228 XCV2229     TRUE 0.998 9.000 0.688 0.009 Y NA
 1183116 1183117 XCV2230 XCV2231     TRUE 0.995 -3.000 0.778 NA N NA
 1183117 1183118 XCV2231 XCV2232     TRUE 0.998 -3.000 0.481 NA Y NA
 1183119 1183120 XCV2233 XCV2234 alkH edd TRUE 0.935 53.000 0.523 1.000 Y NA
 1183120 1183121 XCV2234 XCV2235 edd pgl TRUE 0.880 132.000 0.202 1.000 Y NA
 1183121 1183122 XCV2235 XCV2236 pgl glk1 TRUE 0.992 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 1183122 1183123 XCV2236 XCV2237 glk1 zwf1 TRUE 0.994 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 1183126 1183127 XCV2240 XCV2241     TRUE 0.520 57.000 0.047 NA   NA
 1183127 1183128 XCV2241 XCV2242     TRUE 0.999 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 1183128 1183129 XCV2242 XCV2243   sdhA TRUE 0.990 34.000 0.705 0.001 Y NA
 1183129 1183130 XCV2243 XCV2244 sdhA   TRUE 0.923 4.000 0.004 NA   NA
 1183130 1183131 XCV2244 XCV2245     TRUE 0.677 17.000 0.004 NA   NA
 1183131 1183132 XCV2245 XCV2246     TRUE 0.690 112.000 0.151 NA   NA
 1183132 1183133 XCV2246 XCV2247     TRUE 0.601 -49.000 0.016 NA   NA
 1183133 1183134 XCV2247 XCV2248   lolC TRUE 0.664 24.000 0.020 NA   NA
 1183134 1183135 XCV2248 XCV2249 lolC lolD TRUE 0.989 -7.000 0.620 0.054 N NA
 1183137 1183138 XCV2251 XCV2252   exbB2 TRUE 0.973 2.000 0.045 1.000   NA
 1183138 1183139 XCV2252 XCV2253 exbB2 exbD4 TRUE 0.999 4.000 0.746 0.054 Y NA
 1183139 1183140 XCV2253 XCV2254 exbD4 msbA TRUE 0.977 -3.000 0.120 1.000 N NA
 1183140 1183141 XCV2254 XCV2255 msbA lpxK TRUE 0.984 -3.000 0.205 1.000 N NA
 1183141 1183142 XCV2255 XCV2256 lpxK kdsB2 FALSE 0.339 305.000 0.054 1.000 Y NA
 1183142 1183143 XCV2256 XCV2257 kdsB2   TRUE 0.965 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1183143 1183144 XCV2257 XCV2258     TRUE 0.521 -57.000 0.006 NA   NA
 1183144 1183145 XCV2258 XCV2259   uvrC TRUE 0.953 -3.000 0.004 NA   NA
 1183145 1183146 XCV2259 XCV2260 uvrC pgsA TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 N NA
 1183146 1183147 XCV2260 XCV_tRNA34 pgsA tRNA-Gly FALSE 0.379 37.000 0.000 NA   NA
 1183147 1183148 XCV_tRNA34 XCV2261 tRNA-Gly   FALSE 0.115 226.000 0.000 NA   NA
 10702507 1183149 IS_Xac3_7 XCV2262     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1183149 1183150 XCV2262 XCV2263     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.078 Y NA
 1183150 1183151 XCV2263 XCV2264     FALSE 0.396 -126.000 0.000 NA   NA
 1183151 1183152 XCV2264 XCV2265     FALSE 0.276 144.000 0.000 NA   NA
 1183152 1183153 XCV2265 XCV2266     TRUE 0.855 89.000 0.500 NA   NA
 1183153 1183154 XCV2266 XCV2267     TRUE 0.872 49.000 0.667 NA   NA
 1183154 1183155 XCV2267 XCV2268     TRUE 0.722 64.000 0.222 NA   NA
 1183155 1183156 XCV2268 XCV2269     TRUE 0.723 128.000 0.222 NA   NA
 1183156 1183157 XCV2269 XCV2270     TRUE 0.725 92.000 0.182 NA   NA
 1183157 1183158 XCV2270 XCV2271     TRUE 0.687 62.000 0.182 NA   NA
 1183160 1183161 XCV2273 XCV2274     TRUE 0.954 9.000 0.000 0.078   NA
 1183163 1183164 XCV2276 XCV2277     FALSE 0.355 91.000 0.000 NA   NA
 1183164 1183165 XCV2277 XCV2278     FALSE 0.028 411.000 0.000 NA   NA
 1183166 1183167 XCV2279 XCV2280     FALSE 0.309 134.000 0.000 NA   NA
 1183168 1183169 XCV2281 XCV2282     FALSE 0.312 133.000 0.000 NA   NA
 1183169 1183170 XCV2282 XCV2283     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1183170 1183171 XCV2283 XCV2284     FALSE 0.096 241.000 0.000 NA   NA
 1183171 1183172 XCV2284 XCV2285     TRUE 0.551 22.000 0.000 NA   NA
 1183172 1183173 XCV2285 XCV2286     FALSE 0.022 473.000 0.000 NA   NA
 1183173 1183174 XCV2286 XCV2287   topB FALSE 0.087 535.000 0.000 1.000 Y NA
 1183174 1183175 XCV2287 XCV2288 topB   FALSE 0.261 280.000 0.000 1.000 Y NA
 1183175 1183176 XCV2288 XCV2289     TRUE 0.909 74.000 1.000 NA   NA
 1183176 1183177 XCV2289 XCV2290     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 1183177 1183178 XCV2290 XCV2291     FALSE 0.046 322.000 0.000 NA   NA
 1183178 1183179 XCV2291 XCV2292     TRUE 0.985 4.000 0.286 NA   NA
 1183179 1183180 XCV2292 XCV2293     TRUE 0.925 16.000 0.286 NA   NA
 1183180 1183181 XCV2293 XCV2294     TRUE 0.988 -7.000 1.000 NA   NA
 10702508 1183182 IS_Xac3_6 XCV2295     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1183182 1183183 XCV2295 XCV2296     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.078 Y NA
 1183183 10702509 XCV2296 IS_Xac2_5     FALSE 0.346 86.000 0.000 NA   NA
 10702509 1183184 IS_Xac2_5 XCV2297     FALSE 0.315 -434.000 0.000 NA   NA
 1183184 1183185 XCV2297 XCV_tRNA35   tRNA-Cys FALSE 0.056 296.000 0.000 NA   NA
 1183185 1183186 XCV_tRNA35 XCV_tRNA36 tRNA-Cys tRNA-Gly FALSE 0.336 82.000 0.000 NA   NA
 1183186 1183187 XCV_tRNA36 XCV2298 tRNA-Gly   FALSE 0.113 227.000 0.000 NA   NA
 1183190 1183191 XCV2301 XCV2302     TRUE 0.682 37.000 0.105 NA   NA
 1183191 1183192 XCV2302 XCV2303     TRUE 0.532 38.000 0.026 NA   NA
 1183192 1183193 XCV2303 XCV2304     TRUE 0.580 41.000 0.043 1.000   NA
 1183193 1183194 XCV2304 XCV2305     TRUE 0.807 19.000 0.067 NA   NA
 1183194 1183195 XCV2305 XCV2306   dsbG TRUE 0.725 96.000 0.182 NA   NA
 1183195 1183196 XCV2306 XCV2307 dsbG   TRUE 0.998 3.000 0.667 NA Y NA
 1183196 1183197 XCV2307 XCV2308     TRUE 0.999 0.000 0.333 0.003 Y NA
 1183198 1183199 XCV2309 XCV2310 qseB qseC TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 1183200 1183201 XCV2311 XCV2312 trxB2   FALSE 0.382 42.000 0.003 NA   NA
 1183201 1183202 XCV2312 XCV2313     FALSE 0.395 150.000 0.022 NA   NA
 1183204 1183205 XCV2315 XCV2316     TRUE 0.479 64.000 0.026 NA   NA
 1183205 1183206 XCV2316 XCV2317     TRUE 0.473 139.000 0.033 NA   NA
 1183206 1183207 XCV2317 XCV2318     TRUE 0.574 110.000 0.050 NA   NA
 1183207 1183208 XCV2318 XCV2319     TRUE 0.831 88.000 0.050 1.000 Y NA
 10702510 1183209 IS_6100_1 XCV2320     FALSE 0.299 -825.000 0.000 NA   NA
 1183211 1183212 XCV2322 XCV2323     FALSE 0.378 96.000 0.000 1.000   NA
 1183213 1183214 XCV2324 XCV2325   strB FALSE 0.229 162.000 0.000 NA   NA
 1183214 1183215 XCV2325 XCV2326 strB strA TRUE 0.985 -9.000 0.318 0.001 N NA
 1183215 1183216 XCV2326 XCV2327 strA   FALSE 0.249 66.000 0.008 1.000 N NA
 1183216 1183217 XCV2327 XCV2328     FALSE 0.349 104.000 0.000 NA   NA
 1183217 10702511 XCV2328 IS_6100_2     TRUE 0.711 -12.000 0.000 NA   NA
 10702511 1183218 IS_6100_2 XCV2329     FALSE 0.299 -825.000 0.000 NA   NA
 1183219 1183220 XCV2330 XCV2331     TRUE 0.950 3.000 0.053 NA N NA
 1183220 1183221 XCV2331 XCV2332     TRUE 0.916 19.000 0.024 1.000 Y NA
 1183221 1183222 XCV2332 XCV2333     TRUE 0.551 37.000 0.024 1.000   NA
 1183222 1183223 XCV2333 XCV2334     TRUE 0.569 53.000 0.068 1.000   NA
 1183224 1183225 XCV2335 XCV2336   copA TRUE 0.970 16.000 0.304 0.004 N NA
 1183226 1183227 XCV2337 XCV2338   zitB FALSE 0.253 189.000 0.049 1.000 N NA
 1183227 1183228 XCV2338 XCV2339 zitB   FALSE 0.050 322.000 0.000 1.000   NA
 10702512 1183229 IS_6100_3 XCV2340     FALSE 0.299 -825.000 0.000 NA   NA
 1183229 1183230 XCV2340 XCV2341     TRUE 0.444 -64.000 0.000 NA   NA
 1183230 1183231 XCV2341 XCV2342   tniB TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1183231 1183232 XCV2342 XCV2343 tniB   TRUE 0.995 3.000 0.750 1.000   NA
 1183233 1183234 XCV2344 XCV2345     TRUE 0.971 -7.000 0.375 NA   NA
 1183236 1183237 XCV2347 XCV2348     FALSE 0.167 192.000 0.000 NA   NA
 1183238 1183239 XCV2349 XCV2350     FALSE 0.162 201.000 0.000 1.000   NA
 10702513 1183242 IS_6100_4 XCV2353     FALSE 0.299 -825.000 0.000 NA   NA
 1183242 1183243 XCV2353 XCV2354   gcvA FALSE 0.131 148.000 0.000 1.000 N NA
 1183243 1183244 XCV2354 XCV2355 gcvA   FALSE 0.082 257.000 0.000 NA   NA
 1183246 1183247 XCV2357 XCV2358     TRUE 0.978 13.000 0.769 NA   NA
 1183247 1183248 XCV2358 XCV2359     TRUE 0.754 100.000 0.231 NA   NA
 1183249 1183250 XCV2360 XCV2361     TRUE 0.939 15.000 0.333 NA   NA
 1183250 1183251 XCV2361 XCV2362     TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 1183251 1183252 XCV2362 XCV2363     TRUE 0.969 10.000 0.286 NA   NA
 1183252 1183253 XCV2363 XCV2364     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183253 1183254 XCV2364 XCV2365     TRUE 0.689 163.000 0.333 NA   NA
 1183254 1183255 XCV2365 XCV2366     TRUE 0.547 182.000 0.333 NA N NA
 1183255 1183256 XCV2366 XCV2367     TRUE 0.977 14.000 0.857 NA   NA
 1183256 1183257 XCV2367 XCV2368     TRUE 0.991 0.000 0.286 NA   NA
 1183257 1183258 XCV2368 XCV2369     TRUE 0.830 -19.000 0.091 NA   NA
 1183258 1183259 XCV2369 XCV2370     TRUE 0.983 -10.000 1.000 NA   NA
 1183259 1183260 XCV2370 XCV2371     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 1183260 1183261 XCV2371 XCV2372     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 1183261 1183262 XCV2372 XCV2373     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1183262 1183263 XCV2373 XCV2374     TRUE 0.614 18.000 0.000 NA   NA
 1183263 1183264 XCV2374 XCV2375     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183264 1183265 XCV2375 XCV2376     TRUE 0.856 99.000 0.500 NA   NA
 1183265 1183266 XCV2376 XCV2377     TRUE 0.982 -3.000 0.091 NA   NA
 1183266 1183267 XCV2377 XCV2378     TRUE 0.994 5.000 1.000 NA   NA
 1183267 1183268 XCV2378 XCV2379     TRUE 0.994 -3.000 0.409 NA   NA
 1183268 1183269 XCV2379 XCV2380     TRUE 0.900 -18.000 0.222 NA   NA
 1183269 1183270 XCV2380 XCV2381     TRUE 0.953 13.000 0.333 NA   NA
 1183270 1183271 XCV2381 XCV2382     TRUE 0.825 54.000 0.500 NA   NA
 1183271 1183272 XCV2382 XCV2383     FALSE 0.411 189.000 0.091 NA   NA
 1183272 1183273 XCV2383 XCV2384     TRUE 0.850 17.000 0.083 1.000   NA
 1183273 1183274 XCV2384 XCV2385     FALSE 0.044 328.000 0.000 NA   NA
 1183274 1183275 XCV2385 XCV2386     TRUE 0.915 112.000 1.000 NA   NA
 1183275 1183276 XCV2386 XCV2387     TRUE 0.865 136.000 0.667 NA   NA
 1183276 1183277 XCV2387 XCV2388     FALSE 0.355 91.000 0.000 NA   NA
 1183277 1183278 XCV2388 XCV2389     TRUE 0.900 52.000 1.000 NA   NA
 1183278 1183279 XCV2389 XCV2390     TRUE 0.838 65.000 0.500 NA   NA
 1183279 1183280 XCV2390 XCV2391     TRUE 0.842 77.000 0.500 NA   NA
 1183280 1183281 XCV2391 XCV2392     TRUE 0.973 17.000 1.000 NA   NA
 1183281 1183282 XCV2392 XCV2393     TRUE 0.877 101.000 0.600 NA   NA
 1183282 1183283 XCV2393 XCV2394     TRUE 0.823 95.000 0.375 NA   NA
 1183283 1183284 XCV2394 XCV2395     TRUE 0.786 58.000 0.375 NA   NA
 1183284 1183285 XCV2395 XCV2396     FALSE 0.309 51.000 0.000 NA   NA
 1183285 1183286 XCV2396 XCV2397     TRUE 0.764 80.000 0.286 NA   NA
 1183286 1183287 XCV2397 XCV2398     TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 1183287 1183288 XCV2398 XCV2399     FALSE 0.063 283.000 0.000 NA   NA
 1183288 1183289 XCV2399 XCV2400     TRUE 0.764 98.000 0.250 NA   NA
 1183289 1183290 XCV2400 XCV2401     TRUE 0.844 80.000 0.500 NA   NA
 1183290 1183291 XCV2401 XCV2402     TRUE 0.858 146.000 0.750 NA   NA
 1183291 1183292 XCV2402 XCV2403     TRUE 0.962 22.000 1.000 NA   NA
 1183292 1183293 XCV2403 XCV2404     TRUE 0.772 158.000 0.500 NA   NA
 1183293 1183294 XCV2404 XCV2405     TRUE 0.834 49.000 0.500 NA   NA
 1183294 1183295 XCV2405 XCV2406   topB2 FALSE 0.020 534.000 0.000 1.000   NA
 1183295 1183296 XCV2406 XCV2407 topB2   FALSE 0.277 274.000 0.000 1.000 Y NA
 1183296 1183297 XCV2407 XCV2408     FALSE 0.327 74.000 0.000 NA   NA
 1183297 1183298 XCV2408 XCV2409     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183298 1183299 XCV2409 XCV2410     FALSE 0.048 317.000 0.000 NA   NA
 1183299 1183300 XCV2410 XCV2411     TRUE 0.991 3.000 0.429 NA   NA
 1183300 1183301 XCV2411 XCV2412     TRUE 0.975 16.000 1.000 NA   NA
 1183301 1183302 XCV2412 XCV2413     TRUE 0.983 -7.000 0.667 NA   NA
 1183302 1183303 XCV2413 XCV2414     TRUE 0.931 -16.000 0.333 NA   NA
 1183303 1183304 XCV2414 XCV2415     TRUE 0.467 43.000 0.064 NA N NA
 1183304 1183305 XCV2415 XCV2416     TRUE 0.641 119.000 0.106 NA   NA
 1183305 1183306 XCV2416 XCV_tRNA37   tRNA-Leu FALSE 0.013 1085.000 0.000 NA   NA
 1183308 1183309 XCV2418 XCV2419   fkpA TRUE 0.895 11.000 0.028 1.000   NA
 1183310 1183311 XCV2420 XCV2421     TRUE 0.469 100.000 0.015 NA   NA
 1183311 1183312 XCV2421 XCV2422     FALSE 0.098 240.000 0.000 NA   NA
 1183315 1183316 XCV2425 XCV2426     FALSE 0.055 298.000 0.000 NA   NA
 1183316 1183317 XCV2426 XCV2427     FALSE 0.338 265.000 0.050 0.099   NA
 1183317 1183318 XCV2427 XCV2428   phhb TRUE 0.972 -3.000 0.025 1.000   NA
 1183319 1183320 XCV2429 XCV2430     TRUE 0.825 14.000 0.030 NA   NA
 1183322 1183323 XCV2432 XCV2433     TRUE 0.838 52.000 0.706 1.000 N NA
 1183323 10702514 XCV2433 IS_1478_3     FALSE 0.039 344.000 0.000 NA   NA
 10702514 1183324 IS_1478_3 XCV2434     FALSE 0.313 -435.000 0.000 NA   NA
 10702515 1183326 IS_1595_1 XCV2436     FALSE 0.250 -980.000 0.000 NA   NA
 1183328 1183329 XCV2438 XCV2439     TRUE 0.959 8.000 0.000 0.076   NA
 1183329 1183330 XCV2439 XCV2440   hpaJ FALSE 0.160 133.000 0.000 1.000 N NA
 1183331 1183332 XCV2441 XCV2442     TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1183332 1183333 XCV2442 XCV2443     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183333 1183334 XCV2443 XCV2444     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183334 1183335 XCV2444 XCV2445     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183336 1183337 XCV2446 XCV2447     FALSE 0.058 293.000 0.000 NA   NA
 1183340 1183341 XCV2450 XCV2451     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183341 1183342 XCV2451 XCV2452     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 1183342 1183343 XCV2452 XCV2453     TRUE 0.992 2.000 0.400 NA   NA
 1183343 1183344 XCV2453 XCV2454     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 1183344 1183345 XCV2454 XCV2455     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 1183345 1183346 XCV2455 XCV2456     FALSE 0.167 192.000 0.000 NA   NA
 1183346 1183347 XCV2456 XCV2457     TRUE 0.972 12.000 0.500 NA   NA
 1183347 1183348 XCV2457 XCV2458     TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1183348 1183349 XCV2458 XCV2459     FALSE 0.044 330.000 0.000 NA   NA
 1183349 1183350 XCV2459 XCV2460     FALSE 0.323 127.000 0.000 NA   NA
 1183352 1183353 XCV2462 XCV2463     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 1183353 1183354 XCV2463 XCV2464     TRUE 0.997 2.000 1.000 NA   NA
 1183354 1183355 XCV2464 XCV2465     TRUE 0.536 23.000 0.000 NA   NA
 1183355 1183356 XCV2465 XCV2466     TRUE 0.798 11.000 0.000 NA   NA
 1183356 1183357 XCV2466 XCV2467     FALSE 0.317 130.000 0.000 NA   NA
 1183357 1183358 XCV2467 XCV2468     TRUE 0.479 28.000 0.000 NA   NA
 1183358 1183359 XCV2468 XCV2469     TRUE 0.964 -24.000 1.000 NA   NA
 1183359 1183360 XCV2469 XCV2470     TRUE 0.941 32.000 1.000 NA   NA
 1183360 1183361 XCV2470 XCV2471     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 1183361 1183362 XCV2471 XCV2472     TRUE 0.801 -7.000 0.000 NA   NA
 1183363 1183364 XCV2473 XCV2474     FALSE 0.341 43.000 0.000 NA   NA
 1183364 1183365 XCV2474 XCV2475     TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 10702516 1183367 IS_Xac3_9 XCV2477     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1183367 1183368 XCV2477 XCV2478     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.076 Y NA
 1183369 1183370 XCV2479 XCV2480     FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 1183370 1183371 XCV2480 XCV2481     TRUE 0.489 -43.000 0.000 NA   NA
 1183372 1183373 XCV2482 XCV2483     TRUE 0.604 104.000 0.067 NA   NA
 1183374 1183375 XCV2484 XCV2485   guaA FALSE 0.027 309.000 0.002 1.000 N NA
 1183375 1183376 XCV2485 XCV2486 guaA guaB TRUE 0.909 122.000 0.190 0.001   NA
 1183376 1183377 XCV2486 XCV2487 guaB folD FALSE 0.234 182.000 0.004 1.000   NA
 1183379 1183380 XCV2489 XCV2490 kefB galU FALSE 0.322 174.000 0.067 1.000 N NA
 1183380 1183381 XCV2490 XCV2491 galU   TRUE 0.999 0.000 0.350 0.010 Y NA
 1183381 1183382 XCV2491 XCV2492     TRUE 0.954 14.000 0.048 1.000 Y NA
 1183382 1183383 XCV2492 XCV2493     TRUE 0.961 0.000 0.038 1.000 N NA
 1183383 1183384 XCV2493 XCV2494     TRUE 0.989 7.000 0.576 NA   NA
 1183384 1183385 XCV2494 XCV2495   ihfB TRUE 0.718 67.000 0.208 NA   NA
 1183385 1183386 XCV2495 XCV2496 ihfB rpsA TRUE 0.682 59.000 0.292 1.000 N NA
 1183386 1183387 XCV2496 XCV2497 rpsA cmk TRUE 0.508 183.000 0.281 1.000 N NA
 1183388 1183389 XCV2498 XCV2499 rpmJ   FALSE 0.141 242.000 0.014 NA   NA
 1183389 1183390 XCV2499 XCV2500     FALSE 0.306 234.000 0.123 NA   NA
 1183390 1183391 XCV2500 XCV2501     TRUE 0.798 126.000 0.364 NA   NA
 1183391 1183392 XCV2501 XCV2502     TRUE 0.946 4.000 0.016 1.000   NA
 1183392 1183393 XCV2502 XCV2503     TRUE 0.885 -7.000 0.024 NA   NA
 1183394 1183395 XCV2504 XCV2505     TRUE 0.493 60.000 0.034 NA   NA
 1183395 1183396 XCV2505 XCV2506     TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 1183396 1183397 XCV2506 XCV2507     TRUE 0.998 -3.000 0.160 0.041 Y NA
 1183397 1183398 XCV2507 XCV2508     TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.041 Y NA
 1183398 1183399 XCV2508 XCV2509     TRUE 0.977 4.000 0.156 NA   NA
 1183399 1183400 XCV2509 XCV2510     TRUE 0.759 104.000 0.250 NA   NA
 1183400 1183401 XCV2510 XCV2511     TRUE 0.847 134.000 0.750 1.000 N NA
 1183401 1183402 XCV2511 XCV2512     FALSE 0.353 99.000 0.000 NA   NA
 1183402 1183403 XCV2512 XCV2513     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1183403 1183404 XCV2513 XCV2514     TRUE 0.983 -3.000 0.103 NA   NA
 1183405 1183406 XCV2515 XCV2516     TRUE 0.716 -61.000 0.083 NA   NA
 1183406 1183407 XCV2516 XCV2517   rluB2 TRUE 0.935 -7.000 0.210 NA N NA
 1183410 1183411 XCV2520 XCV2521     TRUE 0.562 149.000 0.099 1.000   NA
 1183412 1183413 XCV2522 XCV2523 ccmA ccmB TRUE 0.998 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 1183413 1183414 XCV2523 XCV2524 ccmB ccmC2 TRUE 0.949 95.000 0.051 0.001 Y NA
 1183414 1183415 XCV2524 XCV2525 ccmC2 ccmD2 TRUE 0.967 -3.000 0.015 1.000   NA
 1183415 1183416 XCV2525 XCV2526 ccmD2 ccmE2 TRUE 0.968 -3.000 0.016 1.000   NA
 1183416 1183417 XCV2526 XCV2527 ccmE2 ccmF2 TRUE 0.853 172.000 0.016 0.003 Y NA
 1183417 1183418 XCV2527 XCV2528 ccmF2 ccmG2 TRUE 0.998 -7.000 1.000 0.003 Y NA
 1183418 1183419 XCV2528 XCV2529 ccmG2 ccmH2 TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 1183419 1183420 XCV2529 XCV2530 ccmH2   TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000 Y NA
 1183420 1183421 XCV2530 XCV2531   metX FALSE 0.075 301.000 0.039 1.000 N NA
 1183421 1183422 XCV2531 XCV2532 metX   FALSE 0.350 152.000 0.011 1.000   NA
 1183423 1183424 XCV2533 XCV2534 cydC cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 1183425 1183426 XCV2535 XCV2536 cydA cydB TRUE 0.995 17.000 0.953 0.044 Y NA
 1183426 1183427 XCV2536 XCV2537 cydB   TRUE 0.873 -31.000 0.256 NA   NA
 1183427 1183428 XCV2537 XCV_tRNA38   tRNA-Pro FALSE 0.310 60.000 0.000 NA   NA
 1183428 1183429 XCV_tRNA38 XCV2538 tRNA-Pro   FALSE 0.019 511.000 0.000 NA   NA
 1183432 1183433 XCV2541 XCV2542 proA proB TRUE 0.871 161.000 0.007 0.001 Y NA
 1183433 1183434 XCV2542 XCV2543 proB   TRUE 0.883 14.000 0.091 NA   NA
 1183434 1183435 XCV2543 XCV2544   argH TRUE 0.954 -3.000 0.004 NA   NA
 1183435 1183436 XCV2544 XCV2545 argH argC TRUE 0.777 125.000 0.020 1.000 Y NA
 1183436 1183437 XCV2545 XCV2546 argC argA TRUE 0.922 -3.000 0.008 1.000 N NA
 1183437 1183438 XCV2546 XCV2547 argA argB TRUE 0.831 6.000 0.006 1.000 N NA
 1183438 1183439 XCV2547 XCV2548 argB argE TRUE 0.765 108.000 0.009 1.000 Y NA
 1183439 1183440 XCV2548 XCV2549 argE   TRUE 0.945 6.000 0.032 1.000   NA
 1183440 1183441 XCV2549 XCV2550   argG FALSE 0.117 241.000 0.002 1.000   NA
 1183441 1183442 XCV2550 XCV2551 argG argF TRUE 0.720 55.000 0.007 1.000 Y NA
 1183442 1183443 XCV2551 XCV2552 argF   FALSE 0.050 313.000 0.000 NA   NA
 1183444 1183445 XCV2553 XCV2554 cysS   FALSE 0.093 266.000 0.006 NA   NA
 1183445 1183446 XCV2554 XCV2555     TRUE 0.974 -3.000 0.034 NA   NA
 1183448 1183449 XCV2557 XCV2558     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1183449 1183450 XCV2558 XCV2559   pyrC TRUE 0.960 -3.000 0.010 NA   NA
 1183450 1183451 XCV2559 XCV2560 pyrC   TRUE 0.950 0.000 0.023 1.000 N NA
 1183451 1183452 XCV2560 XCV2561     FALSE 0.098 158.000 0.000 NA N NA
 1183452 1183453 XCV2561 XCV2562   eutP FALSE 0.114 427.000 0.000 NA Y NA
 1183453 1183454 XCV2562 XCV2563 eutP eutA TRUE 0.998 -3.000 0.407 1.000 Y NA
 1183454 1183455 XCV2563 XCV2564 eutA eutC TRUE 0.994 -37.000 0.859 0.001 Y NA
 1183456 1183457 XCV2565 XCV2566     TRUE 0.563 94.000 0.040 NA   NA
 1183457 1183458 XCV2566 XCV2567     FALSE 0.410 36.000 0.000 1.000   NA
 1183459 1183460 XCV2568 XCV2569     FALSE 0.067 286.000 0.000 1.000   NA
 1183460 1183461 XCV2569 XCV2570     FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1183461 1183462 XCV2570 XCV2571     FALSE 0.181 185.000 0.000 NA   NA
 1183463 1183464 XCV2572 XCV2573   cbbZ TRUE 0.699 -25.000 0.022 NA   NA
 1183464 1183465 XCV2573 XCV2574 cbbZ ubiG TRUE 0.769 86.000 0.259 1.000   NA
 1183465 1183466 XCV2574 XCV2575 ubiG   TRUE 0.658 31.000 0.104 1.000 N NA
 1183466 1183467 XCV2575 XCV2576     TRUE 0.929 6.000 0.018 NA   NA
 1183467 1183468 XCV2576 XCV2577   efP2 TRUE 0.896 6.000 0.002 NA   NA
 1183470 1183471 XCV2579 XCV2580     TRUE 0.983 -3.000 0.200 NA N NA
 1183471 1183472 XCV2580 XCV2581     FALSE 0.206 52.000 0.007 NA N NA
 1183475 1183476 XCV2584 XCV2585     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1183479 1183480 XCV2588 XCV2589 apt   FALSE 0.398 95.000 0.004 NA   NA
 1183482 1183483 XCV2591 XCV2592 gst6 cspA FALSE 0.293 171.000 0.046 1.000 N NA
 1183484 1183485 XCV2593 XCV2594     TRUE 0.950 3.000 0.011 1.000   NA
 1183485 1183486 XCV2594 XCV2595     FALSE 0.169 216.000 0.007 1.000   NA
 1183488 1183489 XCV2597 XCV2598 yadB phbB TRUE 0.668 83.000 0.014 0.030 N NA
 1183489 1183490 XCV2598 XCV2599 phbB   FALSE 0.388 160.000 0.031 NA   NA
 1183491 1183492 XCV2600 XCV2601     TRUE 0.902 34.000 0.625 NA   NA
 1183492 1183493 XCV2601 XCV2602   mutL TRUE 0.959 0.000 0.007 NA   NA
 1183493 1183494 XCV2602 XCV2603 mutL amiC FALSE 0.279 139.000 0.016 1.000 N NA
 1183494 1183495 XCV2603 XCV2604 amiC   FALSE 0.421 49.000 0.014 NA   NA
 1183495 1183496 XCV2604 XCV2605     TRUE 0.984 -3.000 0.118 NA   NA
 1183497 1183498 XCV2606 XCV2607   xseA FALSE 0.219 124.000 0.004 1.000 N NA
 1183499 1183500 XCV2608 XCV2609     FALSE 0.330 124.000 0.000 NA   NA
 1183500 1183501 XCV2609 XCV2610     FALSE 0.188 182.000 0.000 NA   NA
 1183503 1183504 XCV2612 XCV2613 lig3   TRUE 0.947 15.000 0.400 NA   NA
 1183505 1183506 XCV2614 XCV_tRNA39 hns1 tRNA-Ala FALSE 0.357 93.000 0.000 NA   NA
 1183506 1183507 XCV_tRNA39 XCV2615 tRNA-Ala   FALSE 0.201 176.000 0.000 NA   NA
 10702517 1183509 IS_1477_10 XCV2617     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1183509 1183510 XCV2617 XCV2618     TRUE 0.725 33.000 0.000 0.075   NA
 1183510 1183511 XCV2618 XCV2619     FALSE 0.021 515.000 0.000 1.000   NA
 1183511 1183512 XCV2619 XCV2620     TRUE 0.539 25.000 0.000 1.000   NA
 1183512 1183513 XCV2620 XCV2621     FALSE 0.023 494.000 0.000 1.000   NA
 1183513 1183514 XCV2621 XCV2622     FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1183514 1183515 XCV2622 XCV2623     FALSE 0.052 304.000 0.000 NA   NA
 1183516 1183517 XCV2624 XCV2625 cheW2   TRUE 0.996 12.000 0.500 0.012 Y NA
 1183521 1183522 XCV2629 XCV2630   sspB FALSE 0.302 158.000 0.009 NA   NA
 1183522 1183523 XCV2630 XCV2631 sspB sspA TRUE 0.898 79.000 0.831 NA   NA
 1183523 1183524 XCV2631 XCV2632 sspA petC FALSE 0.142 410.000 0.370 NA N NA
 1183524 1183525 XCV2632 XCV2633 petC petB TRUE 0.998 -7.000 0.630 0.001 Y NA
 1183525 1183526 XCV2633 XCV2634 petB petA TRUE 0.999 0.000 0.233 0.001 Y NA
 1183526 1183527 XCV2634 XCV2635 petA   FALSE 0.044 507.000 0.033 1.000   NA
 1183527 1183528 XCV2635 XCV2636     TRUE 0.694 192.000 0.500 1.000   NA
 1183529 1183530 XCV2637 XCV2638 gst miaB FALSE 0.243 39.000 0.003 1.000 N NA
 1183530 1183531 XCV2638 XCV2639 miaB   FALSE 0.326 73.000 0.000 NA   NA
 1183531 1183532 XCV2639 XCV2640     FALSE 0.165 193.000 0.000 NA   NA
 1183532 1183533 XCV2640 XCV2641     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 1183533 1183534 XCV2641 XCV2642     FALSE 0.352 100.000 0.000 NA   NA
 1183534 1183535 XCV2642 XCV2643     TRUE 0.956 0.000 0.005 NA   NA
 1183535 1183536 XCV2643 XCV2644   corC TRUE 0.512 96.000 0.024 NA   NA
 1183536 1183537 XCV2644 XCV2645 corC   TRUE 0.806 15.000 0.029 NA   NA
 1183537 1183538 XCV2645 XCV2646   corA TRUE 0.865 16.000 0.095 NA   NA
 1183539 1183540 XCV2647 XCV2648   potI FALSE 0.175 213.000 0.038 1.000 N NA
 1183540 1183541 XCV2648 XCV2649 potI potH TRUE 0.998 -3.000 0.094 0.041 Y NA
 1183541 1183542 XCV2649 XCV2650 potH potG TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 1183542 1183543 XCV2650 XCV2651 potG oprN7 FALSE 0.285 211.000 0.125 1.000 N NA
 1183543 1183544 XCV2651 XCV2652 oprN7   TRUE 0.996 5.000 0.520 0.041   NA
 1183544 1183545 XCV2652 XCV2653     TRUE 0.997 -3.000 0.880 1.000   NA
 1183545 1183546 XCV2653 XCV2654   potF FALSE 0.038 250.000 0.000 1.000 N NA
 1183546 1183547 XCV2654 XCV2655 potF   FALSE 0.056 220.000 0.000 1.000 N NA
 1183547 1183548 XCV2655 XCV2656   glnA2 FALSE 0.058 215.000 0.000 1.000 N NA
 1183548 1183549 XCV2656 XCV2657 glnA2   TRUE 0.964 7.000 0.111 1.000   NA
 1183550 1183551 XCV2658 XCV2659 glnA3   TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 1183551 1183552 XCV2659 XCV2660     TRUE 0.763 85.000 0.375 1.000 N NA
 1183552 1183553 XCV2660 XCV2661   hemT TRUE 0.671 130.000 0.267 1.000 N NA
 1183554 1183555 XCV2662 XCV2663     FALSE 0.052 305.000 0.000 NA   NA
 1183555 1183556 XCV2663 XCV2664     TRUE 0.894 14.000 0.114 NA   NA
 1183556 1183557 XCV2664 XCV2665     TRUE 0.998 -3.000 0.086 0.001 Y NA
 1183557 1183558 XCV2665 XCV2666     TRUE 0.917 7.000 0.011 1.000   NA
 1183559 1183560 XCV2667 XCV2668     FALSE 0.123 220.000 0.000 NA   NA
 1183560 1183561 XCV2668 XCV2669     TRUE 0.613 105.000 0.064 1.000   NA
 1183561 1183562 XCV2669 XCV2670     FALSE 0.165 232.000 0.013 1.000   NA
 1183562 1183563 XCV2670 XCV2671     FALSE 0.388 144.000 0.013 1.000   NA
 1183563 1183564 XCV2671 XCV2672     TRUE 0.963 31.000 0.133 0.022 Y NA
 1183564 1183565 XCV2672 XCV2673     FALSE 0.024 479.000 0.000 1.000   NA
 1183567 1183568 XCV2675 XCV2676     TRUE 0.950 15.000 0.571 1.000 N NA
 1183568 1183569 XCV2676 XCV2677     TRUE 0.977 13.000 1.000 1.000 N NA
 1183571 1183572 XCV2679 XCV2680 fruB fruK TRUE 0.996 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 1183572 1183573 XCV2680 XCV2681 fruK fruA TRUE 0.920 154.000 0.562 1.000 Y NA
 1183573 1183574 XCV2681 XCV2682 fruA oprB TRUE 0.517 172.000 0.025 0.052 N NA
 1183575 1183576 XCV2683 XCV2684     FALSE 0.245 156.000 0.000 NA   NA
 1183576 1183577 XCV2684 XCV2685     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 1183577 1183578 XCV2685 XCV2686     TRUE 0.551 22.000 0.000 NA   NA
 1183578 1183579 XCV2686 XCV2687     FALSE 0.379 37.000 0.000 NA   NA
 1183579 1183580 XCV2687 XCV2688     FALSE 0.089 248.000 0.000 NA   NA
 1183580 10702518 XCV2688 IS_Xac3_10     FALSE 0.269 146.000 0.000 NA   NA
 10702518 1183581 IS_Xac3_10 XCV2689     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1183581 1183582 XCV2689 XCV2690     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.075 Y NA
 1183584 1183585 XCV2692 XCV2693 secF secD TRUE 0.956 90.000 0.084 0.000 Y NA
 1183585 1183586 XCV2693 XCV2694 secD yajC TRUE 0.675 191.000 0.083 NA Y NA
 1183586 1183587 XCV2694 XCV2695 yajC tgt TRUE 0.695 133.000 0.325 NA N NA
 1183587 1183588 XCV2695 XCV2696 tgt queA TRUE 0.977 82.000 0.360 0.000 Y NA
 1183588 1183589 XCV2696 XCV2697 queA   FALSE 0.159 154.000 0.004 1.000 N NA
 1183591 1183592 XCV2699 XCV2700     FALSE 0.046 321.000 0.000 NA   NA
 1183592 1183593 XCV2700 XCV2701     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183593 1183594 XCV2701 XCV2702     TRUE 0.984 -3.000 0.220 NA N NA
 1183596 1183597 XCV2704 XCV2705 egl4   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183597 1183598 XCV2705 XCV2706   ggt2 FALSE 0.196 179.000 0.000 NA   NA
 1183598 1183599 XCV2706 XCV2707 ggt2   TRUE 0.982 -3.000 0.076 1.000   NA
 1183599 1183600 XCV2707 XCV2708     FALSE 0.440 52.000 0.020 NA   NA
 1183600 1183601 XCV2708 XCV2709   coaD FALSE 0.388 47.000 0.007 NA   NA
 1183601 1183602 XCV2709 XCV2710 coaD   TRUE 0.990 -3.000 0.367 1.000 N NA
 1183603 1183604 XCV2711 XCV2712 htpG   FALSE 0.170 191.000 0.000 NA   NA
 1183604 1183605 XCV2712 XCV2713     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 1183605 1183606 XCV2713 XCV2714     TRUE 0.538 -30.000 0.000 NA   NA
 1183606 1183607 XCV2714 XCV2715     FALSE 0.017 593.000 0.000 NA   NA
 1183608 1183609 XCV2716 XCV2717     FALSE 0.308 59.000 0.000 NA   NA
 1183609 1183610 XCV2717 XCV2718     FALSE 0.017 575.000 0.000 NA   NA
 1183610 1183611 XCV2718 XCV2719     FALSE 0.103 235.000 0.000 NA   NA
 1183611 1183612 XCV2719 XCV2720     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183612 1183613 XCV2720 XCV2721     TRUE 0.801 -7.000 0.000 NA   NA
 1183613 10702520 XCV2721 IS_1477_11     TRUE 0.640 -16.000 0.000 NA   NA
 10702520 1183614 IS_1477_11 XCV2722     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1183614 1183615 XCV2722 XCV2723     TRUE 0.727 33.000 0.000 0.074   NA
 1183616 1183617 XCV2724 XCV2725     TRUE 0.666 145.000 0.200 1.000   NA
 1183617 1183618 XCV2725 XCV2726     FALSE 0.074 459.000 0.000 0.097   NA
 1183618 1183619 XCV2726 XCV2727     FALSE 0.310 -529.000 0.000 NA   NA
 1183619 1183620 XCV2727 XCV2728     FALSE 0.124 308.000 0.053 NA   NA
 1183620 1183621 XCV2728 XCV2729     TRUE 0.998 -3.000 0.462 0.002   NA
 1183621 1183622 XCV2729 XCV2730     FALSE 0.033 400.000 0.000 1.000   NA
 1183622 1183623 XCV2730 XCV2731     FALSE 0.323 127.000 0.000 NA   NA
 1183623 1183624 XCV2731 XCV2732     FALSE 0.350 103.000 0.000 NA   NA
 1183624 1183625 XCV2732 XCV2733     FALSE 0.357 94.000 0.000 NA   NA
 1183627 1183628 XCV2735 XCV2736     TRUE 0.862 91.000 0.500 1.000   NA
 1183628 1183629 XCV2736 XCV2737     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1183629 1183630 XCV2737 XCV2738     TRUE 0.832 -109.000 0.000 0.001   NA
 1183630 1183631 XCV2738 XCV2739     TRUE 0.904 -10.000 0.000 0.097   NA
 1183631 1183632 XCV2739 XCV2740     TRUE 0.577 63.000 0.071 NA   NA
 1183632 1183633 XCV2740 XCV2741     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 1183633 1183634 XCV2741 XCV2742     TRUE 0.584 116.000 0.051 1.000   NA
 1183634 1183635 XCV2742 XCV2743     TRUE 0.971 -3.000 0.077 1.000 N NA
 1183635 1183636 XCV2743 XCV2744   dapA2 FALSE 0.431 211.000 0.044 0.048 N NA
 1183636 1183637 XCV2744 XCV2745 dapA2   TRUE 0.986 -3.000 0.133 1.000   NA
 1183637 1183638 XCV2745 XCV2746     TRUE 0.992 -7.000 0.600 0.044   NA
 1183638 1183639 XCV2746 XCV2747     TRUE 0.987 -3.000 0.143 1.000   NA
 1183639 1183640 XCV2747 XCV2748     TRUE 0.994 0.000 0.062 1.000 Y NA
 1183641 1183642 XCV2749 XCV2750   ftsY FALSE 0.125 170.000 0.002 1.000 N NA
 1183642 1183643 XCV2750 XCV2751 ftsY   TRUE 0.938 1.000 0.000 NA   NA
 1183643 1183644 XCV2751 XCV2752   mutY FALSE 0.139 207.000 0.000 NA   NA
 1183644 1183645 XCV2752 XCV2753 mutY   TRUE 0.755 24.000 0.150 NA N NA
 1183646 1183647 XCV2754 XCV2755     FALSE 0.316 131.000 0.000 NA   NA
 1183648 1183649 XCV2756 XCV2757     FALSE 0.096 241.000 0.000 NA   NA
 1183649 1183650 XCV2757 XCV2758     FALSE 0.303 56.000 0.000 NA   NA
 1183651 1183652 XCV2759 XCV_tRNA40   tRNA-Phe FALSE 0.159 197.000 0.000 NA   NA
 1183653 1183654 XCV2760 XCV2761 blc2   TRUE 0.854 115.000 0.500 1.000   NA
 1183654 1183655 XCV2761 XCV2762     TRUE 0.774 54.000 0.333 1.000   NA
 1183655 1183656 XCV2762 XCV2763     FALSE 0.027 288.000 0.000 1.000 N NA
 1183656 1183657 XCV2763 XCV2764   dxs FALSE 0.017 434.000 0.007 1.000 N NA
 1183658 1183659 XCV2765 XCV2766     TRUE 0.955 -10.000 0.333 NA   NA
 1183659 1183660 XCV2766 XCV2767     TRUE 0.859 59.000 0.625 NA   NA
 1183660 1183661 XCV2767 XCV2768   cdh2 TRUE 0.972 -9.000 0.077 1.000 Y NA
 1183661 1183662 XCV2768 XCV2769 cdh2 gumP TRUE 0.990 -3.000 0.233 1.000   NA
 1183662 1183663 XCV2769 XCV2770 gumP fabH TRUE 0.979 0.000 0.050 1.000   NA
 1183663 1183664 XCV2770 XCV2771 fabH gumN TRUE 0.526 132.000 0.044 NA   NA
 1183664 10702521 XCV2771 IS_1477_12 gumN   TRUE 0.689 -13.000 0.000 NA   NA
 10702521 1183665 IS_1477_12 XCV2772     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1183665 1183666 XCV2772 XCV2773     TRUE 0.727 33.000 0.000 0.074   NA
 1183666 1183667 XCV2773 XCV2774   gumN FALSE 0.316 62.000 0.000 NA   NA
 1183667 1183668 XCV2774 XCV2775 gumN   TRUE 0.578 119.000 0.059 NA   NA
 1183668 1183669 XCV2775 XCV2776   gumM TRUE 0.610 35.000 0.043 NA   NA
 1183669 1183670 XCV2776 XCV2777 gumM gumL TRUE 0.953 5.000 0.043 NA   NA
 1183670 1183671 XCV2777 XCV2778 gumL gumK FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 1183671 1183672 XCV2778 XCV2779 gumK gumJ TRUE 0.692 64.000 0.182 NA   NA
 1183672 1183673 XCV2779 XCV2780 gumJ gumI TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 1183673 1183674 XCV2780 XCV2781 gumI gumH TRUE 0.995 -3.000 0.111 NA Y NA
 1183674 1183675 XCV2781 XCV2782 gumH gumG TRUE 0.538 65.000 0.111 1.000 N NA
 1183675 1183676 XCV2782 XCV2783 gumG gumF TRUE 0.992 -132.000 1.000 0.001 Y NA
 1183676 1183677 XCV2783 XCV2784 gumF gumE TRUE 0.985 -3.000 0.125 NA   NA
 1183677 1183678 XCV2784 XCV2785 gumE gumD TRUE 0.713 83.000 0.188 NA   NA
 1183678 1183679 XCV2785 XCV2786 gumD gumC FALSE 0.334 244.000 0.000 NA Y NA
 1183679 1183680 XCV2786 XCV2787 gumC gumB TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.096 Y NA
 1183680 1183681 XCV2787 XCV_tRNA41 gumB tRNA-Pro FALSE 0.022 471.000 0.000 NA   NA
 1183681 1183682 XCV_tRNA41 XCV2788 tRNA-Pro   FALSE 0.316 62.000 0.000 NA   NA
 1183682 1183683 XCV2788 XCV2789   gumA TRUE 0.929 -19.000 0.535 1.000 N NA
 1183683 1183684 XCV2789 XCV2790 gumA pheT TRUE 0.820 22.000 0.208 1.000 N NA
 1183684 1183685 XCV2790 XCV2791 pheT pheS TRUE 0.983 127.000 0.574 0.000 Y NA
 1183685 1183686 XCV2791 XCV2792 pheS rplT TRUE 0.594 254.000 0.202 1.000 Y NA
 1183686 1183687 XCV2792 XCV2793 rplT rpmI TRUE 0.998 11.000 0.928 0.010 Y NA
 1183687 1183688 XCV2793 XCV2794 rpmI infC TRUE 0.794 247.000 0.652 1.000 Y NA
 1183688 1183689 XCV2794 XCV2795 infC thrS TRUE 0.888 112.000 0.186 1.000 Y NA
 1183691 1183692 XCV2797 XCV2798 cgt   TRUE 0.992 0.000 0.333 NA   NA
 1183692 1183693 XCV2798 XCV2799     TRUE 0.989 -3.000 0.200 NA   NA
 1183694 1183695 XCV2800 XCV2801     FALSE 0.052 318.000 0.000 1.000   NA
 1183695 1183696 XCV2801 XCV2802     FALSE 0.285 141.000 0.000 NA   NA
 1183697 1183698 XCV2803 XCV2804 aglA   FALSE 0.052 318.000 0.000 1.000   NA
 10702522 1183699 IS_1477_13 XCV2805     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1183699 1183700 XCV2805 XCV2806     TRUE 0.727 33.000 0.000 0.074   NA
 1183701 1183702 XCV2807 XCV2808 virB9 virB8 TRUE 0.998 -3.000 0.400 NA Y NA
 1183702 1183703 XCV2808 XCV2809 virB8   TRUE 0.809 126.000 0.400 NA   NA
 1183703 1183704 XCV2809 XCV2810   virD4 FALSE 0.043 333.000 0.000 NA   NA
 1183704 1183705 XCV2810 XCV2811 virD4   TRUE 0.899 37.000 0.667 NA   NA
 1183705 1183706 XCV2811 XCV_tRNA42   tRNA-Val FALSE 0.016 616.000 0.000 NA   NA
 1183706 1183707 XCV_tRNA42 XCV2812 tRNA-Val uvrB FALSE 0.353 99.000 0.000 NA   NA
 1183709 1183710 XCV_tRNA43 XCV2814 tRNA-Asn pilE FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1183710 1183711 XCV2814 XCV2815 pilE   TRUE 0.941 33.000 0.346 NA Y NA
 1183711 10702523 XCV2815 IS_1477_14     FALSE 0.355 98.000 0.000 NA   NA
 10702523 1183712 IS_1477_14 XCV2816     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1183712 1183713 XCV2816 XCV2817     TRUE 0.727 33.000 0.000 0.074   NA
 1183713 1183714 XCV2817 XCV2818     FALSE 0.322 48.000 0.000 NA   NA
 1183714 1183715 XCV2818 XCV2819     TRUE 0.982 3.000 0.171 NA   NA
 1183715 1183716 XCV2819 XCV2820     TRUE 0.990 6.000 0.143 NA Y NA
 1183716 1183717 XCV2820 XCV2821     TRUE 0.995 -3.000 0.119 NA Y NA
 1183717 1183718 XCV2821 XCV2822     FALSE 0.432 125.000 0.014 NA   NA
 1183718 1183719 XCV2822 XCV2823     TRUE 0.454 107.000 0.014 NA   NA
 1183719 1183720 XCV2823 XCV2824     FALSE 0.016 629.000 0.000 NA   NA
 1183720 1183721 XCV2824 XCV2825     TRUE 0.926 -3.000 0.013 NA N NA
 1183721 1183722 XCV2825 XCV2826     TRUE 0.940 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1183724 1183725 XCV2828 XCV2829 purK purE TRUE 0.999 -3.000 0.136 0.000 Y NA
 1183726 1183727 XCV2830 XCV2831   nadC TRUE 0.956 -3.000 0.006 NA   NA
 1183727 1183728 XCV2831 XCV2832 nadC   FALSE 0.366 63.000 0.005 NA   NA
 1183729 1183730 XCV2833 XCV2834 pnp rpsO TRUE 0.861 169.000 0.335 1.000 Y NA
 1183730 1183731 XCV2834 XCV2835 rpsO truB TRUE 0.838 157.000 0.211 1.000 Y NA
 1183731 1183732 XCV2835 XCV2836 truB rbfA TRUE 0.914 80.000 0.318 1.000 Y NA
 1183732 1183733 XCV2836 XCV2837 rbfA infB TRUE 0.926 145.000 0.530 1.000 Y NA
 1183733 1183734 XCV2837 XCV2838 infB nusA TRUE 0.761 96.000 0.342 1.000 N NA
 1183734 1183735 XCV2838 XCV2839 nusA   TRUE 0.993 5.000 0.759 NA   NA
 1183735 1183736 XCV2839 XCV_tRNA44   tRNA-Met FALSE 0.156 198.000 0.000 NA   NA
 1183736 1183737 XCV_tRNA44 XCV2840 tRNA-Met nuoN FALSE 0.150 201.000 0.000 NA   NA
 1183737 1183738 XCV2840 XCV2841 nuoN nuoM TRUE 0.979 34.000 0.340 0.002 Y NA
 1183738 1183739 XCV2841 XCV2842 nuoM nuoL TRUE 0.984 21.000 0.175 0.002 Y NA
 1183739 1183740 XCV2842 XCV2843 nuoL nuoK TRUE 0.998 8.000 0.451 0.004 Y NA
 1183740 1183741 XCV2843 XCV2844 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 1183741 1183742 XCV2844 XCV2845 nuoJ nuoI TRUE 0.998 8.000 0.442 0.004 Y NA
 1183742 1183743 XCV2845 XCV2846 nuoI nuoH TRUE 0.999 4.000 0.500 0.004 Y NA
 1183743 1183744 XCV2846 XCV2847 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.515 0.004 Y NA
 1183744 1183745 XCV2847 XCV2848 nuoG nuoF TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.004 Y NA
 1183745 1183746 XCV2848 XCV2849 nuoF nuoE TRUE 0.998 4.000 0.343 0.004 Y NA
 1183746 1183747 XCV2849 XCV2850 nuoE nuoD TRUE 0.999 -3.000 0.355 0.004 Y NA
 1183747 1183748 XCV2850 XCV2851 nuoD nuoC TRUE 0.999 -3.000 0.483 0.004 Y NA
 1183748 1183749 XCV2851 XCV2852 nuoC nuoB TRUE 0.976 37.000 0.328 0.002 Y NA
 1183749 1183750 XCV2852 XCV2853 nuoB nuoA TRUE 0.997 -9.000 0.507 0.002 Y NA
 1183750 1183751 XCV2853 XCV_tRNA45 nuoA tRNA-Leu FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1183751 1183752 XCV_tRNA45 XCV2854 tRNA-Leu secG FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1183752 1183753 XCV2854 XCV2855 secG tpiA TRUE 0.694 34.000 0.184 1.000 N NA
 1183754 1183755 XCV2856 XCV2857     TRUE 0.691 92.000 0.125 1.000   NA
 1183756 1183757 XCV2858 XCV2859     TRUE 0.996 0.000 0.619 NA   NA
 1183757 1183758 XCV2859 XCV2860     TRUE 0.980 -3.000 0.070 NA   NA
 1183758 1183759 XCV2860 XCV2861     TRUE 0.987 -3.000 0.143 1.000   NA
 1183759 1183760 XCV2861 XCV2862     FALSE 0.291 191.000 0.023 1.000   NA
 1183760 1183761 XCV2862 XCV2863   mrsA FALSE 0.401 123.000 0.005 1.000   NA
 1183761 1183762 XCV2863 XCV2864 mrsA   TRUE 0.921 -3.000 0.008 1.000 N NA
 1183762 1183763 XCV2864 XCV2865   trpA FALSE 0.207 288.000 0.232 1.000 N NA
 1183763 10702524 XCV2865 IS_Xac3_11 trpA   FALSE 0.165 193.000 0.000 NA   NA
 10702524 1183764 IS_Xac3_11 XCV2866     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1183764 1183765 XCV2866 XCV2867     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.073 Y NA
 1183765 1183766 XCV2867 XCV2868     TRUE 0.478 -49.000 0.000 NA   NA
 1183766 1183767 XCV2868 XCV2869   trpB FALSE 0.341 43.000 0.000 NA   NA
 1183769 1183770 XCV2871 XCV2872 trpF truA TRUE 0.979 -3.000 0.139 1.000 N NA
 1183770 1183771 XCV2872 XCV2873 truA   TRUE 0.788 12.000 0.003 NA   NA
 1183771 1183772 XCV2873 XCV2874     TRUE 0.986 -3.000 0.143 NA   NA
 1183772 1183773 XCV2874 XCV2875   asd FALSE 0.011 556.000 0.008 NA N NA
 1183773 1183774 XCV2875 XCV2876 asd   TRUE 0.702 84.000 0.008 0.005 N NA
 1183774 1183775 XCV2876 XCV2877   aroC FALSE 0.359 -46.000 0.005 1.000 N NA
 1183775 1183776 XCV2877 XCV2878 aroC   TRUE 0.889 11.000 0.081 1.000 N NA
 1183777 1183778 XCV2879 XCV2880   psd TRUE 0.979 -3.000 0.051 1.000   NA
 1183786 1183787 XCV2888 XCV2889     TRUE 0.943 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1183787 1183788 XCV2889 XCV2890     TRUE 0.610 28.000 0.017 NA   NA
 1183788 1183789 XCV2890 XCV2891     FALSE 0.028 411.000 0.000 NA   NA
 1183790 1183791 XCV2892 XCV2893     TRUE 0.578 92.000 0.112 1.000 N NA
 1183792 1183793 XCV2894 XCV2895     FALSE 0.117 411.000 0.000 0.018   NA
 1183793 1183794 XCV2895 XCV2896     TRUE 0.719 99.000 0.000 0.018   NA
 1183796 1183797 XCV2898 XCV2899     TRUE 0.904 128.000 0.000 0.001 Y NA
 1183797 1183798 XCV2899 XCV2900     TRUE 0.949 185.000 0.400 0.001 Y NA
 1183799 1183800 XCV2901 XCV2902     TRUE 0.588 41.000 0.046 1.000   NA
 1183800 1183801 XCV2902 XCV2903     FALSE 0.012 409.000 0.000 1.000 N NA
 1183801 1183802 XCV2903 XCV2904   dadA TRUE 0.984 -3.000 0.013 0.043 N NA
 1183802 1183803 XCV2904 XCV2905 dadA   TRUE 0.973 8.000 0.231 NA   NA
 1183803 1183804 XCV2905 XCV2906   slyD FALSE 0.296 229.000 0.098 NA   NA
 1183805 1183806 XCV2907 XCV2908 nlpC1 nlpC2 TRUE 0.966 110.000 1.000 NA Y NA
 1183807 1183808 XCV2909 XCV2910     FALSE 0.357 96.000 0.000 NA   NA
 1183808 1183809 XCV2910 XCV2911     TRUE 0.938 1.000 0.000 NA   NA
 1183809 1183810 XCV2911 XCV2912     TRUE 0.886 10.000 0.012 1.000   NA
 1183811 1183812 XCV2913 XCV2914 phoA mesJ FALSE 0.025 322.000 0.002 1.000 N NA
 1183812 1183813 XCV2914 XCV2915 mesJ xseB FALSE 0.327 32.000 0.006 1.000 N NA
 1183813 1183814 XCV2915 XCV2916 xseB ispA TRUE 0.979 2.000 0.177 1.000 N NA
 1183817 1183818 XCV2919 XCV2920   pmbA FALSE 0.040 399.000 0.008 NA   NA
 1183820 1183821 XCV2922 XCV2923   tldD FALSE 0.327 70.000 0.000 NA   NA
 1183823 1183824 XCV2925 XCV2926     TRUE 0.604 -120.000 0.037 NA   NA
 1183824 1183825 XCV2926 XCV2927   rng TRUE 0.730 141.000 0.296 NA   NA
 1183825 1183826 XCV2927 XCV2928 rng   TRUE 0.991 0.000 0.417 NA N NA
 1183827 1183828 XCV2929 XCV2930   tonB4 FALSE 0.058 301.000 0.000 1.000   NA
 1183831 1183832 XCV2933 XCV2934   nadD TRUE 0.513 57.000 0.044 NA   NA
 1183832 1183833 XCV2934 XCV2935 nadD holA TRUE 0.915 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1183833 1183834 XCV2935 XCV2936 holA rlpB TRUE 0.820 20.000 0.199 NA N NA
 1183834 1183835 XCV2936 XCV2937 rlpB   FALSE 0.207 172.000 0.000 NA   NA
 1183835 1183836 XCV2937 XCV2938   leuS FALSE 0.219 167.000 0.000 NA   NA
 1183836 1183837 XCV2938 XCV2939 leuS   TRUE 0.477 -88.000 0.005 NA   NA
 1183838 1183839 XCV2940 XCV2941     FALSE 0.105 267.000 0.011 NA   NA
 1183840 1183841 XCV2942 XCV2943 xopF2   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183842 1183843 XCV2944 XCV2945 xopN   FALSE 0.024 444.000 0.000 NA   NA
 1183843 1183844 XCV2945 XCV2946     FALSE 0.327 70.000 0.000 NA   NA
 1183846 1183847 XCV2948 XCV2949     FALSE 0.401 314.000 0.000 0.043 Y NA
 1183847 1183848 XCV2949 XCV2950     TRUE 0.614 34.000 0.042 NA   NA
 1183848 1183849 XCV2950 XCV2951     TRUE 0.842 77.000 0.500 NA   NA
 1183850 1183851 XCV2952 XCV2953     TRUE 0.973 -3.000 0.031 NA   NA
 1183852 1183853 XCV2954 XCV2955     TRUE 0.614 18.000 0.000 NA   NA
 1183854 1183855 XCV2956 XCV2957     TRUE 0.479 28.000 0.000 NA   NA
 1183855 1183856 XCV2957 XCV2958     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183856 1183857 XCV2958 XCV2959     TRUE 0.565 21.000 0.000 NA   NA
 1183857 1183858 XCV2959 XCV2960     TRUE 0.801 -7.000 0.000 NA   NA
 1183858 1183859 XCV2960 XCV2961     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA N NA
 1183859 1183860 XCV2961 XCV2962   ompV TRUE 0.940 23.000 0.167 NA Y NA
 1183860 1183861 XCV2962 XCV2963 ompV oprN8 TRUE 0.954 20.000 0.200 NA Y NA
 1183862 1183863 XCV2964 XCV2965     TRUE 0.962 44.000 0.833 1.000 Y NA
 1183864 1183865 XCV2966 XCV2967   ampC2 FALSE 0.134 146.000 0.000 1.000 N NA
 1183865 1183866 XCV2967 XCV2968 ampC2 rrrA TRUE 0.774 23.000 0.167 NA N NA
 1183867 1183868 XCV2969 XCV2970     FALSE 0.033 377.000 0.000 NA   NA
 1183869 1183870 XCV2971 XCV2972   rluF FALSE 0.265 198.000 0.074 1.000 N NA
 1183870 1183871 XCV2972 XCV2973 rluF   TRUE 0.485 101.000 0.057 1.000 N NA
 1183871 1183872 XCV2973 XCV2974   deaD FALSE 0.046 263.000 0.004 1.000 N NA
 1183873 1183874 XCV2975 XCV2976 rpoE5   TRUE 0.826 30.000 0.231 NA   NA
 1183874 1183875 XCV2976 XCV2977     FALSE 0.432 37.000 0.005 NA   NA
 1183875 1183876 XCV2977 XCV2978     TRUE 0.955 -3.000 0.005 NA   NA
 1183877 1183878 XCV2979 XCV2980     TRUE 0.803 26.000 0.138 NA   NA
 1183878 1183879 XCV2980 XCV2981     FALSE 0.030 401.000 0.000 NA   NA
 1183879 1183880 XCV2981 XCV2982     TRUE 0.678 77.000 0.154 NA   NA
 1183881 1183882 XCV2983 XCV2984 ada ogt TRUE 0.999 -3.000 0.275 0.000 Y NA
 1183882 1183883 XCV2984 XCV2985 ogt   TRUE 0.503 37.000 0.013 1.000   NA
 1183883 1183884 XCV2985 XCV2986   clcA TRUE 0.447 125.000 0.013 1.000   NA
 1183885 1183886 XCV2987 XCV2988     FALSE 0.339 444.000 1.000 NA   NA
 1183887 1183888 XCV2989 XCV2990     FALSE 0.323 65.000 0.000 NA   NA
 1183888 1183889 XCV2990 XCV2991     FALSE 0.279 143.000 0.000 NA   NA
 1183889 1183890 XCV2991 XCV2992     FALSE 0.118 224.000 0.000 NA   NA
 1183890 1183891 XCV2992 XCV2993     FALSE 0.038 352.000 0.000 NA   NA
 1183891 1183892 XCV2993 XCV2994     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1183893 1183894 XCV2995 XCV2996   araJ TRUE 0.490 157.000 0.158 1.000 N NA
 1183895 1183896 XCV2997 XCV2998     FALSE 0.162 749.000 0.000 0.042 Y NA
 1183899 1183900 XCV3001 XCV3002   oprN9 TRUE 0.871 -7.000 0.053 1.000 N NA
 1183900 1183901 XCV3002 XCV3003 oprN9   TRUE 0.994 2.000 0.263 0.040 N NA
 1183901 1183902 XCV3003 XCV3004     TRUE 0.886 17.000 0.278 1.000 N NA
 1183904 1183905 XCV3006 XCV3007 zur gluS TRUE 0.646 14.000 0.012 1.000 N NA
 1183905 1183906 XCV3007 XCV3008 gluS   FALSE 0.369 68.000 0.004 NA   NA
 1183906 1183907 XCV3008 XCV3009     TRUE 0.737 22.000 0.038 NA   NA
 1183907 1183908 XCV3009 XCV3010     FALSE 0.348 125.000 0.000 1.000   NA
 1183908 1183909 XCV3010 XCV3011     TRUE 0.597 -19.000 0.000 NA   NA
 1183909 1183910 XCV3011 XCV3012   creD TRUE 0.919 8.000 0.019 NA   NA
 1183912 1183913 XCV3014 XCV3015 creC creB TRUE 0.956 49.000 0.776 1.000 Y NA
 1183914 1183915 XCV3016 XCV3017     FALSE 0.048 371.000 0.007 1.000   NA
 1183915 1183916 XCV3017 XCV3018   mfd FALSE 0.015 414.000 0.002 1.000 N NA
 1183916 1183917 XCV3018 XCV3019 mfd   FALSE 0.008 471.000 0.000 NA N NA
 1183917 1183918 XCV3019 XCV3020   cheA3 TRUE 0.975 19.000 0.455 NA Y NA
 1183918 1183919 XCV3020 XCV3021 cheA3   TRUE 0.937 66.000 0.091 0.011 Y NA
 1183919 1183920 XCV3021 XCV3022   cheW3 TRUE 0.998 11.000 1.000 0.011 Y NA
 1183920 1183921 XCV3022 XCV3023 cheW3   TRUE 0.967 27.000 0.500 1.000 Y NA
 1183921 1183922 XCV3023 XCV3024   cheR3 TRUE 0.959 -16.000 0.136 1.000 Y NA
 1183922 1183923 XCV3024 XCV3025 cheR3 cheB2 TRUE 0.964 15.000 0.136 1.000 Y NA
 1183924 1183925 XCV3026 XCV3027 cls   FALSE 0.026 289.000 0.000 1.000 N NA
 1183925 1183926 XCV3027 XCV3028     TRUE 0.496 283.000 0.667 NA   NA
 1183926 1183927 XCV3028 XCV3029   gpmA TRUE 0.470 147.000 0.045 NA   NA
 1183930 1183931 XCV3032 XCV3033     FALSE 0.089 248.000 0.000 NA   NA
 1183932 1183933 XCV3034 XCV3035     TRUE 0.548 32.000 0.014 NA   NA
 1183936 1183937 XCV3038 XCV3039     TRUE 0.782 37.000 0.250 NA   NA
 1183938 1183939 XCV3040 XCV3041     TRUE 0.802 168.000 0.667 NA   NA
 1183939 1183940 XCV3041 XCV3042     FALSE 0.016 625.000 0.000 NA   NA
 1183940 1183941 XCV3042 XCV3043     FALSE 0.029 406.000 0.000 NA   NA
 1183941 1183942 XCV3043 XCV3044     TRUE 0.924 6.000 0.056 NA N NA
 1183942 1183943 XCV3044 XCV3045     TRUE 1.000 2.000 0.917 0.001 Y NA
 1183943 1183944 XCV3045 XCV3046     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.043 Y NA
 1183944 1183945 XCV3046 XCV3047     FALSE 0.098 430.000 0.000 0.043   NA
 1183949 1183950 XCV3051 XCV3052     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1183950 1183951 XCV3052 XCV3053   murD FALSE 0.394 35.000 0.000 NA   NA
 1183951 1183952 XCV3053 XCV3054 murD   TRUE 0.722 -19.000 0.019 NA   NA
 1183952 1183953 XCV3054 XCV3055     TRUE 0.982 -3.000 0.091 NA   NA
 1183953 1183954 XCV3055 XCV3056   lysA TRUE 0.741 -16.000 0.014 NA   NA
 1183955 1183956 XCV3057 XCV3058     TRUE 0.975 32.000 0.800 0.009   NA
 1183957 1183958 XCV3059 XCV3060     FALSE 0.419 63.000 0.011 1.000   NA
 1183958 1183959 XCV3060 XCV3061   pyrB FALSE 0.021 314.000 0.000 1.000 N NA
 1183959 1183960 XCV3061 XCV3062 pyrB ruvX TRUE 0.711 14.000 0.022 1.000 N NA
 1183960 1183961 XCV3062 XCV3063 ruvX   TRUE 0.944 -7.000 0.263 NA N NA
 1183962 1183963 XCV3064 XCV3065 tag   TRUE 0.749 26.000 0.074 NA   NA
 1183964 1183965 XCV3066 XCV3067   pilU FALSE 0.024 450.000 0.000 NA   NA
 1183965 1183966 XCV3067 XCV3068 pilU   TRUE 0.973 113.000 0.436 0.014 Y NA
 1183967 1183968 XCV3069 XCV3070   proC TRUE 0.803 44.000 0.357 NA   NA
 1183968 1183969 XCV3070 XCV3071 proC   FALSE 0.139 215.000 0.000 1.000   NA
 1183969 1183970 XCV3071 XCV3072     TRUE 0.784 107.000 0.286 1.000   NA
 1183970 1183971 XCV3072 XCV3073     TRUE 0.741 58.000 0.286 NA   NA
 1183971 1183972 XCV3073 XCV3074     TRUE 0.865 57.000 0.667 NA   NA
 1183972 1183973 XCV3074 XCV3075     TRUE 0.719 56.000 0.250 NA   NA
 1183974 1183975 XCV3076 XCV3077     TRUE 0.860 102.000 0.500 1.000   NA
 1183976 1183977 XCV3078 XCV3079   sufB TRUE 0.791 16.000 0.078 1.000 N NA
 1183977 1183978 XCV3079 XCV3080 sufB sufC TRUE 0.903 156.000 0.466 1.000 Y NA
 1183978 1183979 XCV3080 XCV3081 sufC sufD TRUE 0.998 0.000 0.482 1.000 Y NA
 1183979 1183980 XCV3081 XCV3082 sufD   TRUE 0.961 -3.000 0.041 1.000 N NA
 1183980 1183981 XCV3082 XCV3083     TRUE 0.736 170.000 0.066 0.010   NA
 1183981 1183982 XCV3083 XCV3084     TRUE 0.990 -3.000 0.217 1.000   NA
 1183982 1183983 XCV3084 XCV3085     FALSE 0.177 341.000 0.000 1.000 Y NA
 1183983 1183984 XCV3085 XCV3086     TRUE 0.775 49.000 0.312 1.000   NA
 1183984 1183985 XCV3086 XCV3087     TRUE 0.961 -7.000 0.250 1.000   NA
 1183985 1183986 XCV3087 XCV3088     TRUE 0.936 8.000 0.038 NA   NA
 1183986 1183987 XCV3088 XCV3089     TRUE 0.958 22.000 0.848 NA   NA
 1183987 1183988 XCV3089 XCV3090     TRUE 0.802 182.000 0.808 NA   NA
 1183988 1183989 XCV3090 XCV3091   apbE TRUE 0.778 122.000 0.462 NA N NA
 1183989 1183990 XCV3091 XCV3092 apbE   TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1183991 1183992 XCV3093 XCV3094     FALSE 0.246 155.000 0.000 NA   NA
 1183992 1183993 XCV3094 XCV3095     FALSE 0.153 199.000 0.000 NA   NA
 1183993 1183994 XCV3095 XCV3096     FALSE 0.359 63.000 0.004 NA   NA
 1183995 1183996 XCV3097 XCV3098     FALSE 0.022 509.000 0.000 1.000   NA
 1183996 1183997 XCV3098 XCV3099     FALSE 0.358 58.000 0.006 NA   NA
 1183997 1183998 XCV3099 XCV3100     TRUE 0.996 -3.000 0.642 NA   NA
 1183999 1184000 XCV3101 XCV3102     TRUE 0.989 -3.000 0.217 NA   NA
 1184000 1184001 XCV3102 XCV3103     TRUE 0.982 -3.000 0.087 NA   NA
 1184002 1184003 XCV3104 XCV3105 purM   TRUE 0.768 13.000 0.005 NA   NA
 1184003 1184004 XCV3105 XCV3106   purN TRUE 0.634 24.000 0.014 NA   NA
 1184004 1184005 XCV3106 XCV3107 purN   TRUE 0.964 1.000 0.020 NA   NA
 1184005 1184006 XCV3107 XCV3108     TRUE 0.995 4.000 1.000 NA   NA
 1184007 1184008 XCV3109 XCV3110   murA TRUE 0.963 -3.000 0.013 NA   NA
 1184008 1184009 XCV3110 XCV3111 murA   TRUE 0.664 -15.000 0.000 NA   NA
 1184009 1184010 XCV3111 XCV3112     FALSE 0.436 32.000 0.000 NA   NA
 1184011 1184012 XCV3113 XCV3114     TRUE 0.861 49.000 0.598 1.000   NA
 1184012 1184013 XCV3114 XCV3115     TRUE 0.996 -3.000 0.617 NA   NA
 1184013 1184014 XCV3115 XCV3116     TRUE 0.930 -22.000 0.459 NA   NA
 1184014 1184015 XCV3116 XCV3117     TRUE 0.995 0.000 0.543 NA   NA
 1184015 1184016 XCV3117 XCV3118   rpoN2 TRUE 0.704 83.000 0.163 1.000   NA
 1184016 1184017 XCV3118 XCV3119 rpoN2   TRUE 0.448 88.000 0.050 NA N NA
 1184017 1184018 XCV3119 XCV3120     FALSE 0.324 70.000 0.022 NA N NA
 1184018 1184019 XCV3120 XCV3121   ptsK TRUE 0.994 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 1184019 1184020 XCV3121 XCV3122 ptsK   TRUE 0.988 -3.000 0.194 NA   NA
 1184020 1184021 XCV3122 XCV3123     FALSE 0.081 524.000 0.171 NA   NA
 1184021 1184022 XCV3123 XCV3124   ptsH TRUE 0.996 -7.000 0.261 0.002 Y NA
 1184022 1184023 XCV3124 XCV3125 ptsH ptsI TRUE 0.958 59.000 0.205 0.002 Y NA
 1184023 1184024 XCV3125 XCV3126 ptsI mgtE FALSE 0.041 408.000 0.042 1.000 N NA
 1184024 1184025 XCV3126 XCV3127 mgtE   FALSE 0.387 142.000 0.012 1.000   NA
 1184026 1184027 XCV3128 XCV3129     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.042 Y NA
 1184027 1184028 XCV3129 XCV3130     FALSE 0.016 356.000 0.000 1.000 N NA
 1184028 1184029 XCV3130 XCV3131   gabP FALSE 0.080 597.000 0.000 1.000 Y NA
 1184029 1184030 XCV3131 XCV3132 gabP pel1 FALSE 0.008 518.000 0.000 1.000 N NA
 1184032 1184033 XCV3134 XCV3135 pip   TRUE 0.573 238.000 0.520 1.000   NA
 1184034 1184035 XCV3136 XCV3137     FALSE 0.436 32.000 0.000 NA   NA
 1184037 1184038 XCV3139 XCV3140     FALSE 0.396 -126.000 0.000 NA   NA
 1184038 1184039 XCV3140 XCV3141     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1184039 1184040 XCV3141 XCV3142     FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1184040 1184041 XCV3142 XCV3143     FALSE 0.302 137.000 0.000 NA   NA
 1184042 1184043 XCV3144 XCV3145     TRUE 0.941 23.000 0.647 NA   NA
 1184043 1184044 XCV3145 XCV3146     TRUE 0.991 5.000 0.647 NA   NA
 1184044 1184045 XCV3146 XCV3147     FALSE 0.277 327.000 0.364 NA   NA
 1184045 1184046 XCV3147 XCV3148     FALSE 0.014 1030.000 0.000 1.000   NA
 1184046 1184047 XCV3148 XCV3149   soxR FALSE 0.136 217.000 0.000 1.000   NA
 1184049 1184050 XCV3151 XCV3152     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1184050 1184051 XCV3152 XCV3153     TRUE 0.988 2.000 0.244 NA   NA
 1184051 1184052 XCV3153 XCV3154     TRUE 0.964 13.000 0.470 NA   NA
 1184052 1184053 XCV3154 XCV3155     TRUE 0.832 38.000 0.379 NA   NA
 1184053 1184054 XCV3155 XCV3156     TRUE 0.892 -57.000 0.455 NA   NA
 1184054 1184055 XCV3156 XCV3157     TRUE 0.806 26.000 0.143 NA   NA
 1184055 1184056 XCV3157 XCV3158     TRUE 0.981 13.000 0.911 NA   NA
 1184056 1184057 XCV3158 XCV3159   pdxH FALSE 0.376 45.000 0.004 NA   NA
 1184058 1184059 XCV3160 XCV3161 aroK aroB TRUE 0.996 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 1184059 1184060 XCV3161 XCV3162 aroB   FALSE 0.068 291.000 0.002 NA   NA
 1184060 1184061 XCV3162 XCV3163   heme TRUE 0.724 15.000 0.006 NA   NA
 1184061 1184062 XCV3163 XCV3164 heme   FALSE 0.018 336.000 0.000 1.000 N NA
 1184063 1184064 XCV3165 XCV3166     FALSE 0.364 353.000 0.000 0.013 Y NA
 1184064 1184065 XCV3166 XCV3167     TRUE 0.794 172.000 0.000 0.013 Y NA
 1184065 1184066 XCV3167 XCV3168     TRUE 0.468 296.000 0.000 0.013 Y NA
 1184067 1184068 XCV3169 XCV3170     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1184068 1184069 XCV3170 XCV3171     TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1184071 1184072 XCV3173 XCV3174 tdcG   FALSE 0.174 196.000 0.000 1.000   NA
 1184073 1184074 XCV3175 XCV3176 metL metB TRUE 0.993 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 1184074 1184075 XCV3176 XCV3177 metB   TRUE 0.995 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 1184076 1184077 XCV3178 XCV3179   prfC FALSE 0.210 139.000 0.006 1.000 N NA
 1184077 1184078 XCV3179 XCV3180 prfC   FALSE 0.414 76.000 0.008 1.000   NA
 1184078 1184079 XCV3180 XCV3181   asmA TRUE 0.483 68.000 0.025 NA   NA
 1184080 1184081 XCV3182 XCV3183   gtrB TRUE 0.793 -40.000 0.128 NA   NA
 1184081 1184082 XCV3183 XCV3184 gtrB mtgA TRUE 0.962 -3.000 0.013 NA   NA
 1184083 1184084 XCV3185 XCV3186     FALSE 0.434 121.000 0.010 1.000   NA
 1184084 1184085 XCV3186 XCV3187     FALSE 0.101 244.000 0.000 1.000   NA
 1184087 1184088 XCV3189 XCV3190   fadE TRUE 0.978 -3.000 0.045 1.000   NA
 1184089 1184090 XCV3191 XCV3192     FALSE 0.290 180.000 0.017 NA   NA
 1184092 1184093 XCV3194 XCV3195   gcvH FALSE 0.013 1011.000 0.000 NA   NA
 1184093 1184094 XCV3195 XCV3196 gcvH gcvT TRUE 0.962 149.000 0.317 0.001 Y NA
 1184094 1184095 XCV3196 XCV3197 gcvT   FALSE 0.138 171.000 0.008 NA N NA
 1184095 1184096 XCV3197 XCV3198     FALSE 0.170 191.000 0.000 NA   NA
 1184096 1184097 XCV3198 XCV3199     TRUE 0.959 -3.000 0.006 1.000   NA
 1184097 1184098 XCV3199 XCV3200   cysQ FALSE 0.226 191.000 0.007 1.000   NA
 1184098 1184099 XCV3200 XCV3201 cysQ nudE TRUE 0.990 -3.000 0.373 1.000 N NA
 1184100 1184101 XCV3202 XCV3203     TRUE 0.885 -9.000 0.041 NA   NA
 1184102 1184103 XCV3204 XCV3205 glk2   FALSE 0.289 140.000 0.000 NA   NA
 1184104 1184105 XCV3206 XCV3207   fucA1 TRUE 0.613 207.000 0.600 1.000 N NA
 1184105 1184106 XCV3207 XCV3208 fucA1   TRUE 0.972 15.000 0.214 0.010   NA
 1184106 1184107 XCV3208 XCV3209   nahA TRUE 0.900 135.000 0.286 0.010   NA
 1184107 1184108 XCV3209 XCV3210 nahA manB TRUE 0.989 22.000 0.417 0.010 Y NA
 1184108 1184109 XCV3210 XCV3211 manB   TRUE 0.920 209.000 0.500 0.020 Y NA
 1184109 1184110 XCV3211 XCV3212     FALSE 0.245 384.000 0.429 1.000   NA
 1184110 1184111 XCV3212 XCV3213     TRUE 0.938 62.000 0.600 0.030   NA
 1184111 1184112 XCV3213 XCV3214   bga1 TRUE 0.801 193.000 0.300 1.000 Y NA
 1184115 1184116 XCV3217 XCV3218     FALSE 0.328 76.000 0.000 NA   NA
 1184117 1184118 XCV3219 XCV3220     FALSE 0.346 86.000 0.000 NA   NA
 1184119 1184120 XCV3221 XCV3222 cutC   TRUE 0.960 -3.000 0.038 1.000 N NA
 1184121 1184122 XCV3223 XCV3224   rpoE6 TRUE 0.698 72.000 0.168 1.000   NA
 1184122 1184123 XCV3224 XCV3225 rpoE6   TRUE 0.966 -3.000 0.017 NA   NA
 1184124 1184125 XCV3226 XCV3227 rimJ   FALSE 0.049 231.000 0.000 1.000 N NA
 1184125 1184126 XCV3227 XCV3228     TRUE 0.963 34.000 0.167 0.011 Y NA
 1184126 1184127 XCV3228 XCV3229   pilL TRUE 0.983 -13.000 0.054 0.011 Y NA
 1184127 1184128 XCV3229 XCV3230 pilL pilJ TRUE 0.979 114.000 0.554 0.011 Y NA
 1184128 1184129 XCV3230 XCV3231 pilJ pili TRUE 0.986 40.000 0.795 0.011 Y NA
 1184129 1184130 XCV3231 XCV3232 pili pilH TRUE 0.994 0.000 0.076 1.000 Y NA
 1184130 1184131 XCV3232 XCV3233 pilH pilG TRUE 0.977 18.000 0.085 0.021 Y NA
 1184132 1184133 XCV3234 XCV3235 gshB tonB5 TRUE 0.973 -3.000 0.089 1.000 N NA
 1184134 1184135 XCV3236 XCV3237     FALSE 0.044 331.000 0.000 NA   NA
 1184135 1184136 XCV3237 XCV3238     TRUE 0.951 -3.000 0.002 NA   NA
 1184136 1184137 XCV3238 XCV3239   yoaA FALSE 0.370 166.000 0.082 1.000 N NA
 1184137 1184138 XCV3239 XCV3240 yoaA   FALSE 0.079 271.000 0.000 1.000   NA
 1184138 1184139 XCV3240 XCV3241   mcrB TRUE 0.796 14.000 0.014 1.000   NA
 1184141 1184142 XCV3243 XCV3244   relA FALSE 0.341 203.000 0.065 1.000   NA
 1184143 1184144 XCV3245 XCV3246 pqqB pqqC TRUE 0.999 -3.000 0.825 0.001   NA
 1184144 1184145 XCV3246 XCV3247 pqqC pqqD TRUE 0.998 -3.000 0.404 0.001   NA
 1184145 1184146 XCV3247 XCV3248 pqqD pqqE TRUE 0.998 -3.000 0.361 0.001   NA
 1184146 1184147 XCV3248 XCV3249 pqqE   FALSE 0.413 54.000 0.015 NA   NA
 1184147 1184148 XCV3249 XCV3250     FALSE 0.025 429.000 0.000 NA   NA
 1184148 1184149 XCV3250 XCV3251   glk3 FALSE 0.058 293.000 0.000 NA   NA
 1184149 1184150 XCV3251 XCV3252 glk3   TRUE 0.776 103.000 0.400 1.000 N NA
 1184152 1184153 XCV3254 XCV3255 dpsA recQ FALSE 0.020 382.000 0.005 1.000 N NA
 1184153 1184154 XCV3255 XCV3256 recQ   FALSE 0.378 139.000 0.011 NA   NA
 1184154 1184155 XCV3256 XCV3257     TRUE 0.768 52.000 0.333 NA   NA
 1184155 1184156 XCV3257 XCV3258     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 1184158 1184159 XCV3260 XCV3261     FALSE 0.019 515.000 0.000 NA   NA
 1184160 1184161 XCV3262 XCV3263     TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1184163 1184164 XCV3265 XCV3266   exsF TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1184164 1184165 XCV3266 XCV3267 exsF exsG TRUE 0.998 -3.000 0.083 0.026 Y NA
 1184166 1184167 XCV3268 XCV_tRNA46   tRNA-Lys FALSE 0.317 49.000 0.000 NA   NA
 1184168 1184169 XCV3269 XCV3270     TRUE 0.604 42.000 0.059 1.000   NA
 1184169 1184170 XCV3270 XCV3271   pal TRUE 0.979 7.000 0.278 1.000   NA
 1184170 1184171 XCV3271 XCV3272 pal tolB TRUE 0.807 58.000 0.592 1.000 N NA
 1184171 1184172 XCV3272 XCV3273 tolB tolA TRUE 0.532 189.000 0.215 NA   NA
 1184172 1184173 XCV3273 XCV3274 tolA tolR TRUE 0.966 -10.000 0.460 NA   NA
 1184173 1184174 XCV3274 XCV3275 tolR tolQ TRUE 0.959 158.000 0.556 0.049 Y NA
 1184174 1184175 XCV3275 XCV3276 tolQ   TRUE 0.977 12.000 0.593 1.000   NA
 1184175 1184176 XCV3276 XCV3277   ruvB TRUE 0.588 53.000 0.082 1.000   NA
 1184176 1184177 XCV3277 XCV3278 ruvB   FALSE 0.392 40.000 0.002 NA   NA
 1184177 1184178 XCV3278 XCV3279   kup TRUE 0.978 3.000 0.111 NA   NA
 1184178 1184179 XCV3279 XCV3280 kup ruvA FALSE 0.109 197.000 0.007 1.000 N NA
 1184179 1184180 XCV3280 XCV3281 ruvA ruvC TRUE 0.958 158.000 0.451 0.011 Y NA
 1184180 1184181 XCV3281 XCV3282 ruvC   TRUE 0.743 131.000 0.277 NA   NA
 1184181 1184182 XCV3282 XCV3283     FALSE 0.353 90.000 0.000 NA   NA
 1184182 1184183 XCV3283 XCV3284     FALSE 0.357 96.000 0.000 NA   NA
 1184188 1184189 XCV3289 XCV3290     FALSE 0.078 404.000 0.000 0.039 N NA
 1184189 1184190 XCV3290 XCV3291   phlN2 TRUE 0.707 75.000 0.300 1.000 N NA
 1184191 1184192 XCV3292 XCV3293   penP FALSE 0.180 113.000 0.000 1.000 N NA
 1184194 1184195 XCV3295 XCV3296     TRUE 0.698 61.000 0.200 NA   NA
 1184196 1184197 XCV3297 XCV3298     FALSE 0.026 424.000 0.000 NA   NA
 1184197 1184198 XCV3298 XCV3299     FALSE 0.096 241.000 0.000 NA   NA
 1184198 1184199 XCV3299 XCV3300     FALSE 0.349 104.000 0.000 NA   NA
 1184199 1184200 XCV3300 XCV3301     TRUE 0.883 6.000 0.000 NA   NA
 1184202 1184203 XCV3303 XCV3304     TRUE 0.862 -286.000 0.034 0.002   NA
 1184203 1184204 XCV3304 XCV3305     FALSE 0.018 338.000 0.000 1.000 N NA
 1184204 1184205 XCV3305 XCV3306     TRUE 0.981 1.000 0.194 1.000 N NA
 1184205 1184206 XCV3306 XCV3307     FALSE 0.280 237.000 0.194 1.000 N NA
 1184206 1184207 XCV3307 XCV3308     TRUE 0.910 -33.000 0.561 1.000 N NA
 1184207 1184208 XCV3308 XCV3309     TRUE 0.994 -3.000 0.463 1.000   NA
 1184208 1184209 XCV3309 XCV3310     TRUE 0.931 -22.000 0.433 1.000   NA
 1184209 1184210 XCV3310 XCV3311     TRUE 0.985 -3.000 0.222 1.000 N NA
 1184211 1184212 XCV3312 XCV3313   cobS FALSE 0.047 233.000 0.000 1.000 N NA
 1184212 1184213 XCV3313 XCV3314 cobS   TRUE 0.942 -3.000 0.021 NA N NA
 1184213 1184214 XCV3314 XCV3315   cobT TRUE 0.972 -3.000 0.090 NA N NA
 1184214 1184215 XCV3315 XCV3316 cobT cobU TRUE 0.981 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 1184215 1184216 XCV3316 XCV3317 cobU cobQ TRUE 0.913 26.000 0.079 1.000 Y NA
 1184216 1184217 XCV3317 XCV3318 cobQ cobC TRUE 0.991 -3.000 0.033 0.005 N NA
 1184217 1184218 XCV3318 XCV3319 cobC cobD TRUE 0.927 94.000 0.463 0.005 N NA
 1184218 1184219 XCV3319 XCV3320 cobD cobA TRUE 0.889 71.000 0.000 0.005 Y NA
 1184219 1184220 XCV3320 XCV3321 cobA   TRUE 0.970 -3.000 0.024 NA   NA
 1184220 1184221 XCV3321 XCV3322     TRUE 0.989 -3.000 0.200 NA   NA
 1184221 1184222 XCV3322 XCV3323     FALSE 0.042 337.000 0.000 NA   NA
 1184222 1184223 XCV3323 XCV3324   clpB2 FALSE 0.009 484.000 0.000 1.000 N NA
 1184223 1184224 XCV3324 XCV3325 clpB2   FALSE 0.327 70.000 0.000 NA   NA
 1184225 1184226 XCV3326 XCV3327     FALSE 0.433 45.000 0.010 1.000   NA
 1184227 1184228 XCV3328 XCV3329     FALSE 0.057 295.000 0.000 NA   NA
 1184228 1184229 XCV3329 XCV3330     TRUE 0.964 9.000 0.182 NA   NA
 1184229 1184230 XCV3330 XCV3331     TRUE 0.725 93.000 0.182 NA   NA
 1184230 1184231 XCV3331 XCV3332     TRUE 0.748 -33.000 0.057 NA   NA
 1184232 1184233 XCV3333 XCV3334   ostB FALSE 0.179 114.000 0.000 1.000 N NA
 1184233 1184234 XCV3334 XCV3335 ostB   TRUE 0.871 49.000 0.174 1.000 Y NA
 1184234 1184235 XCV3335 XCV3336   ostA2 TRUE 0.994 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 1184235 1184236 XCV3336 XCV3337 ostA2 gcd2 FALSE 0.081 591.000 0.000 1.000 Y NA
 1184236 1184237 XCV3337 XCV3338 gcd2   FALSE 0.042 674.000 0.000 0.042 N NA
 1184238 1184239 XCV3339 XCV3340     TRUE 0.766 -25.000 0.052 NA   NA
 1184239 1184240 XCV3340 XCV3341     TRUE 0.703 -15.000 0.004 NA   NA
 1184240 1184241 XCV3341 XCV3342   rluD TRUE 0.985 2.000 0.168 NA   NA
 1184242 1184243 XCV3343 XCV3344     FALSE 0.070 281.000 0.000 1.000   NA
 1184244 1184245 XCV3345 XCV3346 nadE   TRUE 0.834 12.000 0.014 NA   NA
 1184245 1184246 XCV3346 XCV3347     TRUE 0.972 16.000 0.833 NA   NA
 1184246 1184247 XCV3347 XCV3348   sucD FALSE 0.301 171.000 0.012 1.000   NA
 1184247 1184248 XCV3348 XCV3349 sucD succ TRUE 0.994 25.000 0.806 0.000 Y NA
 1184249 1184250 XCV3350 XCV3351 pilS pilR TRUE 0.846 267.000 0.556 0.076 Y NA
 1184251 1184252 XCV3352 XCV3353 pilB pilA TRUE 0.869 134.000 0.000 0.013 Y NA
 1184253 1184254 XCV3354 XCV3355 pilC pilD TRUE 0.995 7.000 0.454 1.000 Y NA
 1184254 1184255 XCV3355 XCV3356 pilD coaE TRUE 0.856 14.000 0.122 1.000 N NA
 1184255 1184256 XCV3356 XCV3357 coaE   FALSE 0.188 182.000 0.000 NA   NA
 1184256 1184257 XCV3357 XCV3358     FALSE 0.328 76.000 0.000 NA   NA
 1184257 10702525 XCV3358 IS_1477_15     FALSE 0.069 275.000 0.000 NA   NA
 10702525 1184258 IS_1477_15 XCV3359     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1184258 1184259 XCV3359 XCV3360     TRUE 0.730 33.000 0.000 0.071   NA
 1184259 1184260 XCV3360 XCV3361     FALSE 0.031 393.000 0.000 NA   NA
 1184260 10702526 XCV3361 IS_Xcc1_6     TRUE 0.529 -32.000 0.000 NA   NA
 10702526 1184261 IS_Xcc1_6 XCV3362     FALSE 0.335 -340.000 0.000 NA   NA
 1184261 1184262 XCV3362 XCV3363     TRUE 0.930 99.000 0.500 0.071   NA
 1184263 1184264 XCV3364 XCV3365 colS colR TRUE 0.990 -7.000 0.400 1.000 Y NA
 1184264 1184265 XCV3365 XCV3366 colR   TRUE 0.905 26.000 0.429 NA   NA
 1184265 1184266 XCV3366 XCV3367   rimK FALSE 0.135 209.000 0.000 NA   NA
 1184268 1184269 XCV3369 XCV3370   hns2 FALSE 0.183 184.000 0.000 NA   NA
 1184269 1184270 XCV3370 XCV3371 hns2   TRUE 0.919 91.000 1.000 NA   NA
 1184270 1184271 XCV3371 XCV3372     FALSE 0.345 111.000 0.000 NA   NA
 1184271 1184272 XCV3372 XCV3373     TRUE 0.767 -9.000 0.000 NA   NA
 1184273 1184274 XCV3374 XCV3375     FALSE 0.021 497.000 0.000 NA   NA
 1184274 1184275 XCV3375 XCV3376     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 1184275 1184276 XCV3376 XCV3377     TRUE 0.865 65.000 0.615 NA   NA
 1184279 1184280 XCV3380 XCV3381     FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 1184280 1184281 XCV3381 XCV3382     TRUE 0.937 33.000 1.000 NA   NA
 1184281 10702527 XCV3382 IS_Xac3_12     TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 10702527 1184282 IS_Xac3_12 XCV3383     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1184282 1184283 XCV3383 XCV3384     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.070 Y NA
 1184284 10702528 XCV3385 IS_1477_16     TRUE 0.950 -2.000 0.000 NA   NA
 10702528 1184285 IS_1477_16 XCV3386     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1184285 1184286 XCV3386 XCV3387     TRUE 0.731 33.000 0.000 0.070   NA
 1184287 1184288 XCV3388 XCV3389     FALSE 0.325 66.000 0.000 NA   NA
 1184288 1184289 XCV3389 XCV3390   virB6 FALSE 0.013 927.000 0.000 NA   NA
 1184289 1184290 XCV3390 XCV3391 virB6   TRUE 0.919 32.000 0.667 NA   NA
 1184290 1184291 XCV3391 XCV3392     FALSE 0.013 896.000 0.000 NA   NA
 1184292 1184293 XCV3393 XCV3394     FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1184293 10702529 XCV3394 IS_1479_4     FALSE 0.086 250.000 0.000 NA   NA
 1184295 10702530 XCV3396 IS_Xac3_13     FALSE 0.412 -111.000 0.000 NA   NA
 10702530 1184296 IS_Xac3_13 XCV3397     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1184296 1184297 XCV3397 XCV3398     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.070 Y NA
 1184297 1184298 XCV3398 XCV3399     FALSE 0.013 1142.000 0.000 NA   NA
 1184298 1184299 XCV3399 XCV3400     TRUE 0.546 55.000 0.062 NA   NA
 1184299 1184300 XCV3400 XCV3401     TRUE 0.557 50.000 0.062 NA   NA
 1184300 1184301 XCV3401 XCV3402     FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1184301 1184302 XCV3402 XCV3403     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.001   NA
 1184303 1184304 XCV3404 XCV3405     FALSE 0.137 208.000 0.000 NA   NA
 1184305 1184306 XCV3406 XCV3407     FALSE 0.016 615.000 0.000 NA   NA
 1184307 10702531 XCV3408 IS_Xac3_14 hns3   FALSE 0.295 139.000 0.000 NA   NA
 10702531 1184308 IS_Xac3_14 XCV3409     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1184308 1184309 XCV3409 XCV3410     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.070 Y NA
 10702532 1184310 IS_Xac2_4 XCV3411     FALSE 0.345 -335.000 0.000 NA   NA
 1184310 1184311 XCV3411 XCV3412     TRUE 0.948 -6.000 0.000 0.070   NA
 1184312 1184313 XCV3413 XCV_tRNA47   tRNA-Gly FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 1184313 1184314 XCV_tRNA47 XCV3414 tRNA-Gly   FALSE 0.335 119.000 0.000 NA   NA
 1184314 1184315 XCV3414 XCV3415     FALSE 0.255 31.000 0.000 1.000 N NA
 1184316 1184317 XCV3416 XCV3417 thiS thiG TRUE 0.852 50.000 0.130 1.000 Y NA
 1184317 1184318 XCV3417 XCV3418 thiG trmB FALSE 0.203 258.000 0.060 1.000   NA
 1184318 1184319 XCV3418 XCV3419 trmB   TRUE 0.912 8.000 0.012 1.000   NA
 1184321 1184322 XCV3421 XCV3422     FALSE 0.334 120.000 0.000 NA   NA
 1184322 1184323 XCV3422 XCV3423     FALSE 0.214 169.000 0.000 NA   NA
 1184323 1184324 XCV3423 XCV3424   mscL FALSE 0.245 61.000 0.008 1.000 N NA
 1184324 1184325 XCV3424 XCV3425 mscL   FALSE 0.409 124.000 0.007 1.000   NA
 1184325 1184326 XCV3425 XCV3426     FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1184326 1184327 XCV3426 XCV3427     FALSE 0.307 135.000 0.000 NA   NA
 1184328 1184329 XCV3428 XCV3429     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.017   NA
 1184329 1184330 XCV3429 XCV3430     TRUE 0.550 24.000 0.000 1.000   NA
 1184331 1184332 XCV3431 XCV3432     FALSE 0.053 301.000 0.000 NA   NA
 1184333 1184334 XCV3433 XCV3434     TRUE 0.960 0.000 0.036 1.000 N NA
 1184334 1184335 XCV3434 XCV3435     TRUE 0.764 36.000 0.000 1.000 Y NA
 1184338 1184339 XCV3438 XCV3439     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 1184339 1184340 XCV3439 XCV3440     FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1184340 1184341 XCV3440 XCV3441     FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1184341 1184342 XCV3441 XCV3442     FALSE 0.118 224.000 0.000 NA   NA
 1184343 1184344 XCV3443 XCV3444     TRUE 0.994 -3.000 0.260 0.091 N NA
 1184344 1184345 XCV3444 XCV3445   cysN FALSE 0.013 402.000 0.000 1.000 N NA
 1184345 1184346 XCV3445 XCV3446 cysN cysD TRUE 0.996 0.000 0.203 0.000 N NA
 1184347 1184348 XCV3447 XCV3448 cysJ cysI TRUE 0.988 102.000 0.791 0.001 Y NA
 1184348 1184349 XCV3448 XCV3449 cysI cysH TRUE 0.977 -3.000 0.116 1.000 N NA
 1184350 1184351 XCV3450 XCV3451     TRUE 0.992 0.000 0.312 1.000   NA
 1184351 1184352 XCV3451 XCV3452     TRUE 0.716 138.000 0.250 NA   NA
 1184353 1184354 XCV3453 XCV3454     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1184355 1184356 XCV3455 XCV3456     FALSE 0.257 151.000 0.000 NA   NA
 1184356 1184357 XCV3456 XCV3457   cysB TRUE 0.977 9.000 0.333 NA   NA
 1184358 1184359 XCV3458 XCV3459 cysG cysK TRUE 0.732 17.000 0.048 1.000 N NA
 1184359 1184360 XCV3459 XCV3460 cysK   FALSE 0.024 297.000 0.000 1.000 N NA
 1184360 1184361 XCV3460 XCV3461     FALSE 0.159 197.000 0.000 NA   NA
 1184362 1184363 XCV3462 XCV3463 fbaB pykA FALSE 0.264 563.000 0.010 0.004 Y NA
 1184363 1184364 XCV3463 XCV3464 pykA   FALSE 0.116 259.000 0.009 1.000   NA
 1184364 1184365 XCV3464 XCV3465   pgk TRUE 0.956 -3.000 0.004 1.000   NA
 1184365 1184366 XCV3465 XCV3466 pgk   FALSE 0.048 317.000 0.000 NA   NA
 1184366 1184367 XCV3466 XCV3467     TRUE 0.991 -3.000 0.283 NA   NA
 1184367 1184368 XCV3467 XCV3468     FALSE 0.142 252.000 0.020 NA   NA
 1184368 1184369 XCV3468 XCV3469   gapA FALSE 0.133 210.000 0.000 NA   NA
 1184370 1184371 XCV3470 XCV3471   ompW1 FALSE 0.061 287.000 0.000 NA   NA
 1184371 1184372 XCV3471 XCV3472 ompW1 ompW2 TRUE 0.927 118.000 0.034 0.005 Y NA
 1184372 1184373 XCV3472 XCV3473 ompW2   TRUE 0.469 76.000 0.017 1.000   NA
 1184373 1184374 XCV3473 XCV3474     TRUE 0.913 14.000 0.158 1.000   NA
 1184374 1184375 XCV3474 XCV3475   modA TRUE 0.456 76.000 0.014 1.000   NA
 1184375 1184376 XCV3475 XCV3476 modA modB TRUE 0.995 17.000 0.627 0.001 Y NA
 1184376 1184377 XCV3476 XCV3477 modB modC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001   NA
 1184378 1184379 XCV3478 XCV3479   blaR1 TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1184379 1184380 XCV3479 XCV3480 blaR1 blaR1 TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1184380 1184381 XCV3480 XCV3481 blaR1 blaI TRUE 0.981 -10.000 0.833 NA   NA
 1184382 1184383 XCV3482 XCV3483     TRUE 0.534 136.000 0.053 NA   NA
 1184383 1184384 XCV3483 XCV3484     TRUE 0.690 123.000 0.167 NA   NA
 1184384 1184385 XCV3484 XCV3485     TRUE 0.799 -57.000 0.000 0.017   NA
 1184385 1184386 XCV3485 XCV3486     FALSE 0.057 302.000 0.000 1.000   NA
 1184386 1184387 XCV3486 XCV3487     TRUE 0.982 3.000 0.146 1.000   NA
 1184388 1184389 XCV3488 XCV3489     FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 1184389 1184390 XCV3489 XCV3490   tktA FALSE 0.006 720.000 0.000 1.000 N NA
 1184390 1184391 XCV3490 XCV3491 tktA   FALSE 0.325 206.000 0.150 1.000 N NA
 1184391 1184392 XCV3491 XCV3492     FALSE 0.048 778.000 0.100 NA   NA
 1184392 1184393 XCV3492 XCV3493     TRUE 0.983 -3.000 0.095 NA   NA
 1184393 1184394 XCV3493 XCV3494     TRUE 0.830 -12.000 0.027 NA   NA
 1184394 1184395 XCV3494 XCV3495     FALSE 0.332 122.000 0.000 NA   NA
 1184395 1184396 XCV3495 XCV3496     TRUE 0.780 21.000 0.060 NA   NA
 1184396 1184397 XCV3496 XCV3497   pilQ FALSE 0.044 438.000 0.017 1.000   NA
 1184397 1184398 XCV3497 XCV3498 pilQ pilP TRUE 0.982 20.000 0.668 NA Y NA
 1184398 1184399 XCV3498 XCV3499 pilP pilO TRUE 0.999 -3.000 0.680 NA Y NA
 1184399 1184400 XCV3499 XCV3500 pilO pilN TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 1184400 1184401 XCV3500 XCV3501 pilN pilM TRUE 0.998 0.000 0.616 NA Y NA
 1184402 1184403 XCV3502 XCV3503 mrcA   FALSE 0.120 309.000 0.050 NA   NA
 1184404 1184405 XCV3504 XCV3505 gltA   FALSE 0.402 87.000 0.005 NA   NA
 1184405 1184406 XCV3505 XCV3506   rpmE TRUE 0.936 3.000 0.004 NA   NA
 1184406 1184407 XCV3506 XCV3507 rpmE iunH FALSE 0.252 72.000 0.008 1.000 N NA
 1184407 1184408 XCV3507 XCV3508 iunH recG FALSE 0.245 123.000 0.007 1.000 N NA
 1184408 1184409 XCV3508 XCV3509 recG yjgF TRUE 0.706 21.000 0.076 NA N NA
 1184409 1184410 XCV3509 XCV3510 yjgF spoT TRUE 0.644 80.000 0.215 NA N NA
 1184410 1184411 XCV3510 XCV3511 spoT rpoZ TRUE 0.904 128.000 0.291 1.000 Y NA
 1184411 1184412 XCV3511 XCV3512 rpoZ gmk FALSE 0.387 261.000 0.471 1.000 N NA
 1184412 1184413 XCV3512 XCV3513 gmk   TRUE 0.682 152.000 0.276 NA   NA
 1184414 1184415 XCV3514 XCV3515 rph   FALSE 0.390 84.000 0.005 NA   NA
 1184415 1184416 XCV3515 XCV3516     TRUE 0.952 -3.000 0.003 NA   NA
 1184416 1184417 XCV3516 XCV3517     TRUE 0.880 16.000 0.218 1.000 N NA
 1184417 1184418 XCV3517 XCV3518     FALSE 0.072 293.000 0.006 NA   NA
 1184418 1184419 XCV3518 XCV3519     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1184419 1184420 XCV3519 XCV3520   pepQ FALSE 0.318 208.000 0.072 NA   NA
 1184420 1184421 XCV3520 XCV3521 pepQ   TRUE 0.513 114.000 0.029 NA   NA
 1184422 1184423 XCV3522 XCV3523 pepP   TRUE 0.977 9.000 0.329 NA   NA
 1184424 1184425 XCV3524 XCV3525     TRUE 0.960 -3.000 0.010 NA   NA
 1184425 1184426 XCV3525 XCV3526     FALSE 0.036 577.000 0.034 NA   NA
 1184426 1184427 XCV3526 XCV3527     TRUE 0.528 -72.000 0.011 NA   NA
 1184427 1184428 XCV3527 XCV3528   rpiA FALSE 0.441 98.000 0.011 NA   NA
 1184428 1184429 XCV3528 XCV3529 rpiA   TRUE 0.610 22.000 0.006 NA   NA
 1184429 1184430 XCV3529 XCV3530     FALSE 0.438 58.000 0.020 NA   NA
 1184433 1184434 XCV3533 XCV3534     FALSE 0.022 484.000 0.000 NA   NA
 1184435 1184436 XCV3535 XCV3536 hemL   FALSE 0.006 873.000 0.000 1.000 N NA
 1184437 1184438 XCV3537 XCV3538   hisC3 FALSE 0.037 253.000 0.000 1.000 N NA
 1184438 1184439 XCV3538 XCV3539 hisC3   TRUE 0.551 31.000 0.050 NA N NA
 1184439 1184440 XCV3539 XCV3540     TRUE 0.616 25.000 0.050 NA N NA
 1184440 1184441 XCV3540 XCV3541     TRUE 0.990 -3.000 0.065 0.041 N NA
 1184441 1184442 XCV3541 XCV3542     TRUE 0.525 70.000 0.095 1.000 N NA
 1184446 1184447 XCV3546 XCV3547     TRUE 0.511 125.000 0.033 NA   NA
 1184449 1184450 XCV3549 XCV3550     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1184450 1184451 XCV3550 XCV3551     FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1184451 1184452 XCV3551 XCV3552   mpl TRUE 0.968 0.000 0.015 1.000   NA
 1184452 1184453 XCV3552 XCV3553 mpl adk FALSE 0.081 362.000 0.000 0.074 N NA
 1184454 1184455 XCV3554 XCV3555 pfkA   FALSE 0.026 426.000 0.000 NA   NA
 1184455 1184456 XCV3555 XCV3556     TRUE 0.565 21.000 0.000 NA   NA
 1184456 1184457 XCV3556 XCV3557     TRUE 0.990 8.000 0.667 NA   NA
 1184457 1184458 XCV3557 XCV3558   virB6 TRUE 0.874 48.000 0.667 NA   NA
 1184458 1184459 XCV3558 XCV3559 virB6   FALSE 0.013 1089.000 0.000 NA   NA
 1184459 1184460 XCV3559 XCV3560     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1184460 1184461 XCV3560 XCV3561   virB6 TRUE 0.930 3.000 0.000 1.000   NA
 1184461 1184462 XCV3561 XCV3562 virB6   FALSE 0.013 940.000 0.000 NA   NA
 1184462 1184463 XCV3562 XCV3563     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1184463 1184464 XCV3563 XCV3564   virB6 TRUE 0.902 5.000 0.000 1.000   NA
 1184464 1184465 XCV3564 XCV3565 virB6   FALSE 0.013 962.000 0.000 NA   NA
 1184465 1184466 XCV3565 XCV3566     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1184470 1184471 XCV3570 XCV3571 ppa   FALSE 0.206 147.000 0.009 1.000 N NA
 1184472 1184473 XCV3572 XCV3573     TRUE 0.840 49.000 0.500 1.000   NA
 1184473 1184474 XCV3573 XCV3574     TRUE 0.670 111.000 0.000 0.064   NA
 1184474 1184475 XCV3574 XCV3575   thiC FALSE 0.059 300.000 0.000 1.000   NA
 1184477 1184478 XCV3577 XCV3578     TRUE 0.595 79.000 0.154 1.000 N NA
 1184479 1184480 XCV3579 XCV3580 ilvC ilvG TRUE 0.924 44.000 0.012 0.001 Y NA
 1184480 1184481 XCV3580 XCV3581 ilvG   TRUE 0.992 -16.000 0.943 0.000   NA
 1184481 1184482 XCV3581 XCV3582     TRUE 0.471 76.000 0.017 1.000   NA
 1184482 1184483 XCV3582 XCV3583   leuA TRUE 0.991 -3.000 0.013 1.000 Y NA
 1184484 1184485 XCV3584 XCV3585 leuB leuD TRUE 0.964 91.000 0.159 0.001 Y NA
 1184485 1184486 XCV3585 XCV3586 leuD leuC TRUE 0.980 68.000 0.463 0.000 Y NA
 1184489 1184490 XCV3589 XCV3590   pcm FALSE 0.342 129.000 0.023 1.000 N NA
 1184490 1184491 XCV3590 XCV3591 pcm raxC TRUE 0.607 21.000 0.028 1.000 N NA
 1184494 1184495 XCV3594 XCV3595 waaL waaG TRUE 0.928 -19.000 0.050 NA Y NA
 1184495 1184496 XCV3595 XCV3596 waaG   TRUE 0.914 11.000 0.058 NA   NA
 1184498 1184499 XCV3598 XCV3599 maeB   TRUE 0.644 197.000 0.058 1.000 Y NA
 1184500 1184501 XCV3600 XCV3601 oprO   FALSE 0.085 365.000 0.130 NA N NA
 1184501 1184502 XCV3601 XCV3602   cit FALSE 0.032 270.000 0.000 1.000 N NA
 1184502 1184503 XCV3602 XCV3603 cit   TRUE 0.999 -3.000 0.357 0.038 Y NA
 1184505 1184506 XCV3605 XCV3606     TRUE 0.837 17.000 0.075 NA   NA
 1184506 1184507 XCV3606 XCV3607     TRUE 0.981 -3.000 0.075 NA   NA
 1184508 1184509 XCV3608 XCV3609     FALSE 0.317 210.000 0.158 1.000 N NA
 1184509 1184510 XCV3609 XCV3610   tctE TRUE 0.983 -3.000 0.190 1.000 N NA
 1184510 1184511 XCV3610 XCV3611 tctE tctD TRUE 0.984 -7.000 0.190 1.000 Y NA
 1184512 1184513 XCV3612 XCV3613 oprP2 citH FALSE 0.157 227.000 0.048 NA N NA
 1184513 1184514 XCV3613 XCV3614 citH phbB TRUE 0.532 119.000 0.094 1.000 N NA
 1184514 1184515 XCV3614 XCV3615 phbB   FALSE 0.124 246.000 0.038 1.000 N NA
 1184517 1184518 XCV3617 XCV3618   suh TRUE 0.565 -67.000 0.052 1.000 N NA
 1184519 1184520 XCV3619 XCV3620     FALSE 0.094 292.000 0.016 NA   NA
 1184520 1184521 XCV3620 XCV3621     TRUE 0.980 0.000 0.052 1.000   NA
 1184522 1184523 XCV3622 XCV3623     TRUE 0.991 0.000 0.013 1.000 Y NA
 1184523 1184524 XCV3623 XCV3624     FALSE 0.011 425.000 0.000 1.000 N NA
 1184526 1184527 XCV3626 XCV3627 grx   FALSE 0.228 199.000 0.016 NA   NA
 1184529 1184530 XCV3629 XCV3630     TRUE 1.000 -3.000 0.874 0.003 Y NA
 1184530 1184531 XCV3630 XCV3631     FALSE 0.069 275.000 0.000 NA   NA
 1184531 1184532 XCV3631 XCV3632     FALSE 0.041 339.000 0.000 NA   NA
 1184533 1184534 XCV3633 XCV3634   celS FALSE 0.295 139.000 0.000 NA   NA
 1184536 1184537 XCV3636 XCV3637 def1 arsC FALSE 0.029 278.000 0.000 1.000 N NA
 1184538 1184539 XCV3638 XCV3639     TRUE 0.978 -7.000 0.500 NA   NA
 1184540 1184541 XCV3640 XCV3641 bcsC bcsZ FALSE 0.407 -18.000 0.000 1.000 N NA
 1184541 1184542 XCV3641 XCV3642 bcsZ bcsB TRUE 0.997 -3.000 0.750 1.000   NA
 1184542 1184543 XCV3642 XCV3643 bcsB bcsA TRUE 0.995 6.000 0.273 0.001   NA
 1184543 1184544 XCV3643 XCV3644 bcsA bcsA TRUE 0.902 22.000 0.000 0.000   NA
 1184544 1184545 XCV3644 XCV3645 bcsA   FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 1184545 1184546 XCV3645 XCV3646     TRUE 0.798 29.000 0.167 NA   NA
 1184546 1184547 XCV3646 XCV3647   pncB FALSE 0.137 208.000 0.000 NA   NA
 1184547 1184548 XCV3647 XCV3648 pncB   FALSE 0.033 394.000 0.000 1.000   NA
 1184548 1184549 XCV3648 XCV3649     TRUE 0.819 -18.000 0.053 1.000   NA
 1184549 1184550 XCV3649 XCV3650     TRUE 0.663 -52.000 0.030 1.000   NA
 1184550 1184551 XCV3650 XCV3651     TRUE 0.902 11.000 0.040 NA   NA
 1184551 1184552 XCV3651 XCV3652     TRUE 0.476 129.000 0.026 NA   NA
 1184553 1184554 XCV3653 XCV3654     TRUE 0.552 32.000 0.014 NA   NA
 1184554 1184555 XCV3654 XCV3655   pnuC TRUE 0.644 181.000 0.186 0.090 N NA
 1184555 1184556 XCV3655 XCV3656 pnuC   TRUE 0.455 106.000 0.047 1.000 N NA
 1184557 1184558 XCV3657 XCV3658   xpsD FALSE 0.058 502.000 0.074 NA   NA
 1184558 1184559 XCV3658 XCV3659 xpsD xpsN TRUE 0.977 9.000 0.333 NA   NA
 1184559 1184560 XCV3659 XCV3660 xpsN xpsM TRUE 0.978 -10.000 0.700 NA   NA
 1184560 1184561 XCV3660 XCV3661 xpsM xpsL TRUE 0.938 -16.000 0.364 1.000   NA
 1184561 1184562 XCV3661 XCV3662 xpsL xpsK TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 1184562 1184563 XCV3662 XCV3663 xpsK xpsJ TRUE 0.855 -57.000 0.308 NA   NA
 1184563 1184564 XCV3663 XCV3664 xpsJ xpsI TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 1184564 1184565 XCV3664 XCV3665 xpsI xpsH TRUE 0.995 -3.000 0.130 NA Y NA
 1184565 1184566 XCV3665 XCV3666 xpsH xpsG TRUE 0.997 10.000 0.348 0.004 Y NA
 1184566 1184567 XCV3666 XCV3667 xpsG xpsF TRUE 0.853 210.000 0.125 0.004 Y NA
 1184567 1184568 XCV3667 XCV3668 xpsF xpsE TRUE 0.931 176.000 0.255 0.004 Y NA
 1184568 1184569 XCV3668 XCV3669 xpsE   FALSE 0.410 130.000 0.043 1.000 N NA
 1184569 1184570 XCV3669 XCV3670   xadA1 FALSE 0.128 224.000 0.000 1.000   NA
 1184570 1184571 XCV3670 XCV3671 xadA1   FALSE 0.020 539.000 0.000 1.000   NA
 1184571 1184572 XCV3671 XCV3672   xadA2 FALSE 0.371 103.000 0.000 1.000   NA
 1184572 1184573 XCV3672 XCV3673 xadA2   FALSE 0.050 310.000 0.000 NA   NA
 1184573 1184574 XCV3673 XCV3674   purL FALSE 0.303 56.000 0.000 NA   NA
 1184574 1184575 XCV3674 XCV3675 purL dsbC FALSE 0.036 318.000 0.011 1.000 N NA
 1184575 1184576 XCV3675 XCV3676 dsbC xerD FALSE 0.013 481.000 0.004 1.000 N NA
 1184578 1184579 XCV3678 XCV3679     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 1184579 1184580 XCV3679 XCV3680     TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.048   NA
 1184581 1184582 XCV3681 XCV3682 pepA   TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1184582 1184583 XCV3682 XCV3683   holC TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1184583 1184584 XCV3683 XCV3684 holC valS FALSE 0.280 199.000 0.089 1.000 N NA
 1184587 1184588 XCV3687 XCV3688 pel2   FALSE 0.015 806.000 0.000 1.000   NA
 1184588 1184589 XCV3688 XCV3689     TRUE 0.958 -3.000 0.005 1.000   NA
 1184589 1184590 XCV3689 XCV3690   pssA TRUE 0.612 23.000 0.005 1.000   NA
 1184591 1184592 XCV3691 XCV3692   proS FALSE 0.045 345.000 0.002 NA   NA
 1184592 1184593 XCV3692 XCV3693 proS   FALSE 0.331 144.000 0.004 1.000   NA
 1184595 1184596 XCV3695 XCV3696     TRUE 0.936 86.000 0.472 NA Y NA
 1184596 1184597 XCV3696 XCV3697     TRUE 0.995 3.000 0.275 NA Y NA
 1184597 1184598 XCV3697 XCV3698     TRUE 0.989 -3.000 0.201 NA   NA
 1184601 1184602 XCV3701 XCV3702 wxcJ wxcI TRUE 0.998 0.000 0.070 0.000 Y NA
 1184603 1184604 XCV3703 XCV3704 xanA xanB TRUE 0.795 47.000 0.500 1.000 N NA
 1184605 1184606 XCV3705 XCV3706 ugd2 rmlD FALSE 0.177 341.000 0.000 1.000 Y NA
 1184606 1184607 XCV3706 XCV3707 rmlD rmlC TRUE 0.828 78.000 0.063 1.000 Y NA
 1184607 1184608 XCV3707 XCV3708 rmlC rmlA TRUE 0.996 -3.000 0.163 1.000 Y NA
 1184608 1184609 XCV3708 XCV3709 rmlA rmlB TRUE 0.949 56.000 0.143 0.002 Y NA
 1184610 1184611 XCV3710 XCV3711 etfB etfA TRUE 0.999 0.000 0.316 0.011 Y NA
 1184611 1184612 XCV3711 XCV3712 etfA wxcK FALSE 0.008 525.000 0.000 1.000 N NA
 1184612 1184613 XCV3712 XCV3713 wxcK wxcL TRUE 0.940 -15.000 0.035 NA Y NA
 1184613 1184614 XCV3713 XCV3714 wxcL wxcM TRUE 0.994 -3.000 0.067 NA Y NA
 1184614 1184615 XCV3714 XCV3715 wxcM wxcN TRUE 0.666 -97.000 0.051 1.000   NA
 1184615 1184616 XCV3715 XCV3716 wxcN wxcO TRUE 0.546 95.000 0.034 NA   NA
 1184617 1184618 XCV3717 XCV3718 rmd gmd TRUE 0.989 -16.000 0.222 0.005 Y NA
 1184618 1184619 XCV3718 XCV3719 gmd wbdA1 TRUE 0.922 107.000 0.333 1.000 Y NA
 1184619 1184620 XCV3719 XCV3720 wbdA1 wxcB TRUE 0.950 0.000 0.000 1.000   NA
 1184620 1184621 XCV3720 XCV3721 wxcB wzt TRUE 0.619 53.000 0.000 0.073   NA
 1184621 1184622 XCV3721 XCV3722 wzt wzm TRUE 0.996 -3.000 0.450 0.073 N NA
 1184622 1184623 XCV3722 XCV3723 wzm wbdA2 TRUE 0.723 83.000 0.000 1.000 Y NA
 1184623 1184624 XCV3723 XCV3724 wbdA2   TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1184624 1184625 XCV3724 XCV3725     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1184625 1184626 XCV3725 XCV3726     TRUE 0.951 100.000 0.133 0.010 Y NA
 1184626 1184627 XCV3726 XCV3727     FALSE 0.258 236.000 0.081 NA   NA
 1184627 1184628 XCV3727 XCV3728   uptE FALSE 0.038 352.000 0.000 NA   NA
 1184628 1184629 XCV3728 XCV3729 uptE uptD TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 1184631 1184632 XCV3731 XCV3732   uptA TRUE 0.855 32.000 0.495 1.000 N NA
 1184633 1184634 XCV3733 XCV3734 rhlE ptpS FALSE 0.371 136.000 0.035 1.000 N NA
 1184634 1184635 XCV3734 XCV3735 ptpS   TRUE 0.492 75.000 0.028 NA   NA
 1184637 1184638 XCV3737 XCV3738     TRUE 0.815 12.000 0.009 NA   NA
 1184639 1184640 XCV3739 XCV3740   dinP FALSE 0.402 143.000 0.015 1.000   NA
 1184641 1184642 XCV3741 XCV3742 fabA fabB TRUE 0.998 0.000 0.451 1.000 Y NA
 1184643 1184644 XCV3743 XCV3744   opdA FALSE 0.295 139.000 0.000 NA   NA
 1184644 1184645 XCV3744 XCV3745 opdA   TRUE 0.582 199.000 0.028 1.000 Y NA
 1184646 1184647 XCV3746 XCV3747   copA TRUE 0.874 108.000 0.600 NA   NA
 1184647 1184648 XCV3747 XCV3748 copA copB TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.003 N NA
 1184648 1184649 XCV3748 XCV3749 copB gloA FALSE 0.111 162.000 0.000 1.000 N NA
 1184649 1184650 XCV3749 XCV3750 gloA   FALSE 0.193 180.000 0.000 NA   NA
 1184650 1184651 XCV3750 XCV3751     TRUE 0.844 80.000 0.500 NA   NA
 1184652 1184653 XCV3752 XCV3753     FALSE 0.104 234.000 0.000 NA   NA
 1184653 1184654 XCV3753 XCV3754   glmS FALSE 0.038 351.000 0.000 NA   NA
 1184655 1184656 XCV3755 XCV3756     TRUE 0.789 49.000 0.500 1.000 N NA
 1184656 1184657 XCV3756 XCV3757     TRUE 0.983 12.000 0.250 1.000 Y NA
 1184657 1184658 XCV3757 XCV3758     TRUE 0.979 56.000 1.000 0.089 Y NA
 1184658 1184659 XCV3758 XCV3759     FALSE 0.377 97.000 0.000 1.000   NA
 1184659 1184660 XCV3759 XCV3760     FALSE 0.248 161.000 0.000 1.000   NA
 1184660 1184661 XCV3760 XCV3761     TRUE 0.999 -3.000 0.957 0.073 Y NA
 1184664 1184665 XCV3764 XCV3765     FALSE 0.323 65.000 0.000 NA   NA
 1184665 1184666 XCV3765 XCV3766   atpC FALSE 0.044 240.000 0.000 1.000 N NA
 1184666 1184667 XCV3766 XCV3767 atpC atpD TRUE 0.983 144.000 0.837 0.002 Y NA
 1184667 1184668 XCV3767 XCV3768 atpD atpG TRUE 0.981 143.000 0.724 0.002 Y NA
 1184668 1184669 XCV3768 XCV3769 atpG atpA TRUE 0.966 198.000 0.846 0.002 Y NA
 1184669 1184670 XCV3769 XCV3770 atpA atpH TRUE 0.987 48.000 0.864 0.002 Y NA
 1184670 1184671 XCV3770 XCV3771 atpH atpF TRUE 0.998 4.000 0.242 0.002 Y NA
 1184671 1184672 XCV3771 XCV3772 atpF atpE TRUE 0.984 115.000 0.666 0.002 Y NA
 1184672 1184673 XCV3772 XCV3773 atpE atpB TRUE 0.981 73.000 0.557 0.002 Y NA
 1184673 1184674 XCV3773 XCV3774 atpB   TRUE 0.613 26.000 0.014 NA   NA
 1184676 1184677 XCV3776 XCV3777   lpdA FALSE 0.346 42.000 0.000 NA   NA
 1184677 1184678 XCV3777 XCV3778 lpdA   TRUE 0.705 17.000 0.009 NA   NA
 1184678 1184679 XCV3778 XCV3779     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1184679 1184680 XCV3779 XCV3780     FALSE 0.317 130.000 0.000 NA   NA
 1184680 1184681 XCV3780 XCV3781     FALSE 0.146 224.000 0.006 NA   NA
 1184682 1184683 XCV3782 XCV3783 ompW3   TRUE 0.539 163.000 0.133 NA   NA
 1184684 1184685 XCV3784 XCV3785     FALSE 0.040 343.000 0.000 NA   NA
 1184687 1184688 XCV3787 XCV3788   metI TRUE 0.874 147.000 0.294 NA Y NA
 1184688 1184689 XCV3788 XCV3789 metI metN TRUE 0.997 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 1184689 1184690 XCV3789 XCV3790 metN   FALSE 0.295 233.000 0.094 1.000   NA
 1184691 1184692 XCV3791 XCV3792     FALSE 0.295 139.000 0.000 NA   NA
 1184692 1184693 XCV3792 XCV3793     TRUE 0.597 -19.000 0.000 NA   NA
 1184693 1184694 XCV3793 XCV3794     FALSE 0.268 -55.000 0.000 1.000 N NA
 1184694 1184695 XCV3794 XCV3795     FALSE 0.241 157.000 0.000 NA   NA
 1184695 1184696 XCV3795 XCV3796     TRUE 0.938 1.000 0.000 NA   NA
 1184696 1184697 XCV3796 XCV3797     FALSE 0.340 115.000 0.000 NA   NA
 1184698 1184699 XCV3798 XCV3799   rsuA2 TRUE 0.979 -3.000 0.053 1.000   NA
 1184699 1184700 XCV3799 XCV3800 rsuA2 rsmC TRUE 0.995 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 1184702 1184703 XCV3802 XCV3803 sndH2   TRUE 0.562 89.000 0.042 NA   NA
 1184703 1184704 XCV3803 XCV3804     FALSE 0.332 332.000 0.500 NA   NA
 1184704 1184705 XCV3804 XCV3805     TRUE 0.801 106.000 0.333 NA   NA
 1184705 1184706 XCV3805 XCV3806     TRUE 0.979 -13.000 1.000 NA   NA
 1184708 1184709 XCV3808 XCV3809 alr dadA2 TRUE 0.976 0.000 0.099 1.000 N NA
 1184712 1184713 XCV3812 XCV3813 msrB   FALSE 0.053 343.000 0.008 NA   NA
 1184713 1184714 XCV3813 XCV3814   motA2 TRUE 0.581 98.000 0.049 NA   NA
 1184714 1184715 XCV3814 XCV3815 motA2 motB2 TRUE 0.993 11.000 0.571 1.000 Y NA
 1184715 1184716 XCV3815 XCV3816 motB2   TRUE 0.859 69.000 0.571 NA   NA
 1184716 1184717 XCV3816 XCV3817     TRUE 0.955 9.000 0.118 NA   NA
 1184718 1184719 XCV3818 XCV3819     FALSE 0.333 121.000 0.000 NA   NA
 1184721 1184722 XCV3821 XCV3822     TRUE 0.999 -3.000 0.303 0.073 Y NA
 1184722 1184723 XCV3822 XCV3823     FALSE 0.029 277.000 0.000 1.000 N NA
 1184725 1184726 XCV3825 XCV3826     TRUE 0.561 273.000 0.748 1.000   NA
 1184726 1184727 XCV3826 XCV3827     FALSE 0.148 208.000 0.000 1.000   NA
 1184728 1184729 XCV3828 XCV3829     FALSE 0.219 232.000 0.036 1.000   NA
 1184729 1184730 XCV3829 XCV3830     TRUE 0.752 139.000 0.034 0.027   NA
 1184730 1184731 XCV3830 XCV3831     TRUE 0.757 -112.000 0.000 0.027   NA
 1184731 1184732 XCV3831 XCV3832     TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1184732 1184733 XCV3832 XCV3833     FALSE 0.335 119.000 0.000 NA   NA
 1184733 1184734 XCV3833 XCV3834     TRUE 0.642 114.000 0.100 NA   NA
 1184737 1184738 XCV3837 XCV3838     FALSE 0.097 322.000 0.036 NA   NA
 1184738 1184739 XCV3838 XCV3839     TRUE 0.492 167.000 0.100 NA   NA
 1184739 1184740 XCV3839 XCV3840     TRUE 0.997 -3.000 0.268 0.025   NA
 1184742 1184743 XCV3842 XCV3843     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1184744 1184745 XCV3844 XCV3845     TRUE 0.882 137.000 0.167 0.002   NA
 1184745 1184746 XCV3845 XCV3846     TRUE 0.769 83.000 0.286 NA   NA
 1184751 1184752 XCV3851 XCV3852     TRUE 0.986 -3.000 0.143 NA   NA
 1184753 1184754 XCV3853 XCV3854   cioA FALSE 0.059 292.000 0.000 NA   NA
 1184754 1184755 XCV3854 XCV3855 cioA cioB TRUE 0.997 -9.000 0.667 0.040 Y NA
 1184756 1184757 XCV3856 XCV3857     TRUE 0.463 172.000 0.091 NA   NA
 1184758 1184759 XCV3858 XCV3859   galE FALSE 0.033 266.000 0.000 1.000 N NA
 1184759 1184760 XCV3859 XCV3860 galE   TRUE 0.644 38.000 0.080 NA   NA
 1184760 1184761 XCV3860 XCV3861   glf TRUE 0.979 -3.000 0.065 NA   NA
 1184761 1184762 XCV3861 XCV3862 glf   FALSE 0.428 90.000 0.036 1.000 N NA
 1184762 1184763 XCV3862 XCV3863     TRUE 0.990 -3.000 0.348 1.000 N NA
 1184764 1184765 XCV3864 XCV3865     TRUE 0.682 103.000 0.133 NA   NA
 1184768 1184769 XCV3868 XCV3869     TRUE 0.930 10.000 0.062 NA   NA
 1184771 1184772 XCV3871 XCV3872     TRUE 0.931 11.000 0.098 NA   NA
 1184772 1184773 XCV3872 XCV3873     TRUE 0.996 -3.000 0.679 NA   NA
 1184773 1184774 XCV3873 XCV3874     TRUE 0.996 -3.000 0.717 NA   NA
 1184775 1184776 XCV3875 XCV3876     TRUE 0.606 84.000 0.074 NA   NA
 1184776 1184777 XCV3876 XCV3877     TRUE 0.988 0.000 0.185 NA   NA
 1184777 1184778 XCV3877 XCV3878     TRUE 0.978 11.000 0.500 1.000   NA
 1184781 1184782 XCV3881 XCV3882     FALSE 0.011 388.000 0.000 NA N NA
 1184782 1184783 XCV3882 XCV3883     FALSE 0.063 293.000 0.000 1.000   NA
 1184785 1184786 XCV3885 XCV3886 acpD   TRUE 0.982 4.000 0.222 NA   NA
 1184787 1184788 XCV3887 XCV3888     FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1184788 1184789 XCV3888 XCV3889     FALSE 0.063 283.000 0.000 NA   NA
 1184791 1184792 XCV3891 XCV3892   clcB FALSE 0.299 263.000 0.000 1.000 Y NA
 1184794 1184795 XCV3894 XCV3895 map   TRUE 0.907 27.000 0.492 NA   NA
 1184795 1184796 XCV3895 XCV3896     TRUE 0.488 27.000 0.000 NA   NA
 1184797 1184798 XCV3897 XCV3898     FALSE 0.285 141.000 0.000 NA   NA
 1184798 1184799 XCV3898 XCV3899     FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 1184799 1184800 XCV3899 XCV3900     TRUE 0.795 -132.000 0.000 0.003   NA
 1184801 1184802 XCV3901 XCV3902     FALSE 0.340 115.000 0.000 NA   NA
 1184802 1184803 XCV3902 XCV3903     FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1184804 1184805 XCV3904 XCV3905 umuD   TRUE 0.984 0.000 0.111 NA   NA
 1184805 1184806 XCV3905 XCV3906     TRUE 0.919 -13.000 0.000 0.012   NA
 1184806 1184807 XCV3906 XCV3907     FALSE 0.317 49.000 0.000 NA   NA
 1184807 1184808 XCV3907 XCV3908     FALSE 0.207 172.000 0.000 NA   NA
 1184808 1184809 XCV3908 XCV3909     FALSE 0.016 664.000 0.000 NA   NA
 1184809 1184810 XCV3909 XCV3910     TRUE 0.551 22.000 0.000 NA   NA
 1184811 1184812 XCV_tRNA48 XCV3911 tRNA-Met   FALSE 0.071 273.000 0.000 NA   NA
 1184812 1184813 XCV3911 XCV3912   rpoD FALSE 0.163 194.000 0.000 NA   NA
 1184813 1184814 XCV3912 XCV3913 rpoD dtd FALSE 0.255 109.000 0.006 1.000 N NA
 1184817 1184818 XCV3916 XCV3917     TRUE 0.467 139.000 0.032 NA   NA
 1184818 1184819 XCV3917 XCV3918     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 1184820 10702533 XCV3919 IS_1478_2     FALSE 0.381 -302.000 0.000 NA   NA
 10702533 1184821 IS_1478_2 XCV3920     FALSE 0.266 147.000 0.000 NA   NA
 1184823 1184824 XCV3922 XCV3923     TRUE 0.719 166.000 0.053 NA Y NA
 1184824 1184825 XCV3923 XCV3924   rsmB FALSE 0.247 49.000 0.008 1.000 N NA
 1184825 1184826 XCV3924 XCV3925 rsmB fmt TRUE 0.997 0.000 0.305 1.000 Y NA
 1184826 1184827 XCV3925 XCV3926 fmt def2 TRUE 0.507 381.000 0.105 0.014 Y NA
 1184828 1184829 XCV3927 XCV3928     TRUE 0.523 72.000 0.033 1.000   NA
 1184829 1184830 XCV3928 XCV3929     TRUE 0.663 43.000 0.124 NA   NA
 1184830 1184831 XCV3929 XCV3930     TRUE 0.529 41.000 0.030 NA   NA
 1184831 1184832 XCV3930 XCV3931     FALSE 0.346 42.000 0.000 NA   NA
 1184832 1184833 XCV3931 XCV3932   topA FALSE 0.185 183.000 0.000 NA   NA
 1184833 1184834 XCV3932 XCV3933 topA yrdC TRUE 0.733 11.000 0.011 NA N NA
 1184834 1184835 XCV3933 XCV3934 yrdC   TRUE 0.473 74.000 0.022 NA   NA
 1184835 1184836 XCV3934 XCV3935     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1184839 1184840 XCV3938 XCV3939 sppA   FALSE 0.303 85.000 0.013 1.000 N NA
 1184842 1184843 XCV3941 XCV3942     TRUE 0.864 53.000 0.667 NA   NA
 1184845 1184846 XCV3944 XCV3945     TRUE 0.477 95.000 0.016 NA   NA
 1184846 1184847 XCV3945 XCV3946     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1184848 1184849 XCV3947 XCV3948     TRUE 0.509 51.000 0.040 NA   NA
 1184850 1184851 XCV3949 XCV3950 rpoH ung FALSE 0.116 189.000 0.005 1.000 N NA
 1184851 1184852 XCV3950 XCV3951 ung   TRUE 0.911 -3.000 0.005 1.000 N NA
 1184852 1184853 XCV3951 XCV3952   ftsX TRUE 0.774 9.000 0.005 1.000 N NA
 1184853 1184854 XCV3952 XCV3953 ftsX ftsE TRUE 0.991 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 1184854 1184855 XCV3953 XCV3954 ftsE rhlB TRUE 0.585 76.000 0.007 0.072 N NA
 1184856 1184857 XCV3955 XCV3956 trxA rho FALSE 0.029 828.000 0.087 1.000 N NA
 1184858 1184859 XCV3957 XCV3958   aceK TRUE 0.799 61.000 0.375 1.000   NA
 1184859 1184860 XCV3958 XCV3959 aceK   TRUE 0.990 -3.000 0.375 1.000 N NA
 1184860 1184861 XCV3959 XCV3960   icd FALSE 0.011 434.000 0.000 1.000 N NA
 1184861 1184862 XCV3960 XCV3961 icd   FALSE 0.036 358.000 0.000 NA   NA
 1184862 1184863 XCV3961 XCV3962     FALSE 0.348 106.000 0.000 NA   NA
 1184863 1184864 XCV3962 XCV3963     TRUE 0.840 10.000 0.000 1.000   NA
 1184864 1184865 XCV3963 XCV3964     FALSE 0.334 157.000 0.011 1.000   NA
 1184866 1184867 XCV3965 XCV3966     TRUE 0.792 94.000 0.148 0.087 N NA
 1184867 1184868 XCV3966 XCV3967     TRUE 0.958 134.000 0.963 NA Y NA
 1184869 1184870 XCV3968 XCV3969     TRUE 0.561 164.000 0.160 NA   NA
 1184870 1184871 XCV3969 XCV3970     FALSE 0.418 238.000 0.286 NA   NA
 1184871 1184872 XCV3970 XCV3971     FALSE 0.380 144.000 0.015 NA   NA
 1184872 1184873 XCV3971 XCV3972     FALSE 0.401 37.000 0.000 1.000   NA
 1184873 1184874 XCV3972 XCV3973     FALSE 0.395 245.000 0.000 0.002   NA
 1184874 1184875 XCV3973 XCV3974     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1184875 1184876 XCV3974 XCV3975     FALSE 0.336 44.000 0.000 NA   NA
 1184876 1184877 XCV3975 XCV3976     FALSE 0.115 226.000 0.000 NA   NA
 1184877 1184878 XCV3976 XCV3977     FALSE 0.062 286.000 0.000 NA   NA
 1184878 1184879 XCV3977 XCV3978   ampD FALSE 0.189 92.000 0.000 1.000 N NA
 1184880 1184881 XCV3979 XCV3980   tcbD TRUE 0.978 -3.000 0.055 NA   NA
 1184881 1184882 XCV3980 XCV3981 tcbD   FALSE 0.079 260.000 0.000 NA   NA
 1184882 1184883 XCV3981 XCV3982     TRUE 0.970 -3.000 0.024 NA   NA
 1184883 1184884 XCV3982 XCV3983     TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1184884 1184885 XCV3983 XCV3984     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1184885 1184886 XCV3984 XCV3985     TRUE 0.734 175.000 0.500 NA   NA
 1184889 1184890 XCV3988 XCV3989 bglX folB FALSE 0.049 229.000 0.000 1.000 N NA
 1184890 1184891 XCV3989 XCV3990 folB gcp FALSE 0.309 85.000 0.014 1.000 N NA
 1184892 1184893 XCV3991 XCV3992 rpsU   TRUE 0.537 264.000 0.173 0.014   NA
 1184893 1184894 XCV3992 XCV3993     FALSE 0.024 485.000 0.000 1.000   NA
 1184894 1184895 XCV3993 XCV3994   dnaG FALSE 0.408 82.000 0.006 1.000   NA
 1184895 1184896 XCV3994 XCV3995 dnaG   TRUE 0.902 5.000 0.000 1.000   NA
 1184896 1184897 XCV3995 XCV3996     FALSE 0.430 171.000 0.056 1.000   NA
 1184898 1184899 XCV3997 XCV3998 ctaB   TRUE 0.996 3.000 0.321 1.000 Y NA
 1184899 1184900 XCV3998 XCV3999     TRUE 0.961 11.000 0.255 1.000   NA
 1184900 1184901 XCV3999 XCV4000     TRUE 0.936 28.000 0.722 NA   NA
 1184903 1184904 XCV4002 XCV4003   ctaG TRUE 0.836 39.000 0.536 1.000 N NA
 1184904 1184905 XCV4003 XCV4004 ctaG   TRUE 0.960 -3.000 0.010 NA   NA
 1184905 1184906 XCV4004 XCV4005   ctaD TRUE 0.689 -19.000 0.012 NA   NA
 1184906 1184907 XCV4005 XCV4006 ctaD ctaC TRUE 0.988 39.000 0.741 0.001 Y NA
 1184907 1184908 XCV4006 XCV4007 ctaC   TRUE 0.803 17.000 0.042 NA   NA
 1184910 10702534 XCV4009 XCV_r5     FALSE 0.025 430.000 0.000 NA   NA
 10702534 1184911 XCV_r5 XCVr1     FALSE 0.320 129.000 0.000 NA   NA
 1184911 1184912 XCVr1 XCV_tRNA49   tRNA-Ile FALSE 0.139 207.000 0.000 NA   NA
 1184912 1184913 XCV_tRNA49 XCV_tRNA50 tRNA-Ile tRNA-Ala TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1184913 1184914 XCV_tRNA50 XCVr2 tRNA-Ala   FALSE 0.357 96.000 0.000 NA   NA
 1184914 1184915 XCVr2 XCV4010   tyrS FALSE 0.015 721.000 0.000 NA   NA
 1184916 1184917 XCV4011 XCV4012     FALSE 0.098 380.000 0.184 NA N NA
 1184918 1184919 XCV4013 XCV4014     TRUE 0.853 59.000 0.600 NA   NA
 1184919 1184920 XCV4014 XCV4015   exoA FALSE 0.051 320.000 0.000 1.000   NA
 1184921 1184922 XCV4016 XCV4017 pyrE   TRUE 0.668 23.000 0.018 NA   NA
 1184922 1184923 XCV4017 XCV4018   parA FALSE 0.374 115.000 0.003 NA   NA
 1184923 1184924 XCV4018 XCV4019 parA parB TRUE 0.996 0.000 0.827 1.000 N NA
 1184924 1184925 XCV4019 XCV4020 parB   FALSE 0.438 34.000 0.002 NA   NA
 1184925 1184926 XCV4020 XCV4021   wbnF FALSE 0.142 205.000 0.000 NA   NA
 1184926 1184927 XCV4021 XCV4022 wbnF   TRUE 0.553 276.000 0.227 1.000 Y NA
 1184927 1184928 XCV4022 XCV4023     TRUE 0.991 0.000 0.273 1.000   NA
 1184928 1184929 XCV4023 XCV4024     FALSE 0.037 355.000 0.000 NA   NA
 1184930 1184931 XCV4025 XCV4026 manB dut TRUE 0.766 14.000 0.039 1.000 N NA
 1184931 1184932 XCV4026 XCV4027 dut dfp TRUE 0.984 -3.000 0.201 1.000 N NA
 1184933 1184934 XCV4028 XCV4029 radC argS FALSE 0.226 67.000 0.005 1.000 N NA
 1184934 1184935 XCV4029 XCV4030 argS   FALSE 0.285 180.000 0.062 NA N NA
 1184935 1184936 XCV4030 XCV4031     TRUE 0.927 7.000 0.021 NA   NA
 1184936 1184937 XCV4031 XCV4032     TRUE 0.461 39.000 0.012 NA   NA
 1184938 1184939 XCV4033 XCV4034     FALSE 0.046 235.000 0.000 1.000 N NA
 1184939 1184940 XCV4034 XCV4035     TRUE 0.899 -7.000 0.091 1.000 N NA
 1184940 1184941 XCV4035 XCV4036     TRUE 0.989 6.000 0.121 1.000 Y NA
 1184941 1184942 XCV4036 XCV4037     FALSE 0.017 565.000 0.000 NA   NA
 1184942 1184943 XCV4037 XCV4038   speA FALSE 0.341 84.000 0.000 NA   NA
 1184945 1184946 XCV4040 XCV4041     FALSE 0.181 185.000 0.000 NA   NA
 1184948 1184949 XCV4043 XCV4044     FALSE 0.340 115.000 0.000 NA   NA
 1184949 1184950 XCV4044 XCV4045   glnB2 FALSE 0.295 139.000 0.000 NA   NA
 1184951 1184952 XCV4046 XCV4047     TRUE 0.848 16.000 0.074 NA   NA
 1184952 1184953 XCV4047 XCV4048   blc3 FALSE 0.026 292.000 0.000 1.000 N NA
 1184955 1184956 XCV4050 XCV4051     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1184957 1184958 XCV4052 XCV4053     TRUE 0.980 10.000 0.615 1.000 N NA
 1184961 1184962 XCV4056 XCV_tRNA51   tRNA-Thr TRUE 0.504 -38.000 0.000 NA   NA
 1184962 1184963 XCV_tRNA51 XCV4057 tRNA-Thr   FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 1184963 1184964 XCV4057 XCV4058     TRUE 0.678 46.000 0.155 NA   NA
 1184964 1184965 XCV4058 XCV4059     FALSE 0.141 206.000 0.000 NA   NA
 1184966 1184967 XCV4060 XCV4061     TRUE 0.990 0.000 0.221 NA   NA
 1184967 1184968 XCV4061 XCV4062     TRUE 0.635 89.000 0.087 NA   NA
 1184968 1184969 XCV4062 XCV4063     FALSE 0.309 51.000 0.000 NA   NA
 1184970 1184971 XCV4064 XCV4065     TRUE 0.881 44.000 0.667 NA   NA
 1184971 1184972 XCV4065 XCV4066     TRUE 0.877 74.000 0.667 NA   NA
 1184972 1184973 XCV4066 XCV4067     FALSE 0.139 207.000 0.000 NA   NA
 1184973 1184974 XCV4067 XCV4068     FALSE 0.284 147.000 0.000 1.000   NA
 1184974 1184975 XCV4068 XCV4069     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 1184975 1184976 XCV4069 XCV4070     FALSE 0.034 374.000 0.000 NA   NA
 1184976 1184977 XCV4070 XCV4071     TRUE 0.908 65.000 1.000 NA   NA
 1184977 1184978 XCV4071 XCV4072     TRUE 0.488 27.000 0.000 NA   NA
 1184980 1184981 XCV4074 XCV4075 htrA   TRUE 0.715 117.000 0.192 NA   NA
 1184981 1184982 XCV4075 XCV4076     TRUE 0.995 4.000 0.857 NA   NA
 1184982 1184983 XCV4076 XCV4077     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1184983 1184984 XCV4077 XCV4078     FALSE 0.143 598.000 0.455 NA   NA
 1184984 1184985 XCV4078 XCV4079     TRUE 0.482 101.000 0.018 NA   NA
 1184985 1184986 XCV4079 XCV4080   pepA2 TRUE 0.772 42.000 0.022 0.033   NA
 1184987 1184988 XCV4081 XCV4082 ptrR rpoE7 TRUE 0.998 -3.000 0.525 NA Y NA
 1184989 1184990 XCV4083 XCV4084 srpA   TRUE 0.998 -3.000 0.719 0.039   NA
 1184991 1184992 XCV4085 XCV4086     FALSE 0.249 228.000 0.054 NA   NA
 1184992 1184993 XCV4086 XCV4087     TRUE 0.956 70.000 0.270 0.024 Y NA
 1184994 1184995 XCV4088 XCV4089     FALSE 0.315 375.000 0.810 1.000 N NA
 1184995 1184996 XCV4089 XCV4090     TRUE 0.974 13.000 0.839 1.000 N NA
 1184996 1184997 XCV4090 XCV4091     TRUE 0.984 14.000 0.820 0.086 N NA
 1184997 1184998 XCV4091 XCV4092     TRUE 0.540 84.000 0.033 1.000   NA
 1184999 1185000 XCV4093 XCV4094 rarD   TRUE 0.985 -3.000 0.006 0.086   NA
 1185002 1185003 XCV4096 XCV4097     FALSE 0.049 401.000 0.014 1.000   NA
 1185003 1185004 XCV4097 XCV4098   trpS TRUE 0.445 51.000 0.017 1.000   NA
 1185004 1185005 XCV4098 XCV4099 trpS   FALSE 0.319 167.000 0.017 NA   NA
 1185005 1185006 XCV4099 XCV4100     FALSE 0.111 228.000 0.000 NA   NA
 1185006 1185007 XCV4100 XCV4101     TRUE 0.954 75.000 0.500 0.000   NA
 1185007 1185008 XCV4101 XCV4102   argi TRUE 0.490 107.000 0.017 1.000   NA
 1185009 1185010 XCV4103 XCV4104     TRUE 0.805 64.000 0.400 NA   NA
 1185010 1185011 XCV4104 XCV4105     FALSE 0.124 219.000 0.000 NA   NA
 1185011 1185012 XCV4105 XCV4106     FALSE 0.079 260.000 0.000 NA   NA
 1185012 1185013 XCV4106 XCV4107   tmk FALSE 0.436 32.000 0.000 NA   NA
 1185014 1185015 XCV_tRNA52 XCV4108 tRNA-Thr   FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1185015 1185016 XCV4108 XCV4109     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 1185016 1185017 XCV4109 XCV4110   birA TRUE 0.980 -3.000 0.147 1.000 N NA
 1185018 1185019 XCV4111 XCV4112     TRUE 0.850 12.000 0.020 NA   NA
 1185020 1185021 XCV4113 XCV4114     TRUE 0.539 120.000 0.041 NA   NA
 1185021 1185022 XCV4114 XCV4115   phoQ TRUE 0.792 119.000 0.333 NA   NA
 1185022 1185023 XCV4115 XCV4116 phoQ phoP TRUE 0.933 30.000 0.214 1.000 Y NA
 1185023 1185024 XCV4116 XCV4117 phoP   TRUE 0.667 72.000 0.143 NA   NA
 1185024 1185025 XCV4117 XCV4118   dusA FALSE 0.041 339.000 0.000 NA   NA
 1185025 1185026 XCV4118 XCV4119 dusA   FALSE 0.024 461.000 0.000 NA   NA
 1185028 1185029 XCV4121 XCV4122   catB TRUE 0.636 59.000 0.130 NA   NA
 1185029 1185030 XCV4122 XCV4123 catB dinG FALSE 0.008 540.000 0.000 1.000 N NA
 1185030 1185031 XCV4123 XCV4124 dinG   FALSE 0.074 268.000 0.000 NA   NA
 1185031 1185032 XCV4124 XCV4125     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1185032 1185033 XCV4125 XCV4126   aroE TRUE 0.948 2.000 0.007 NA   NA
 1185035 1185036 XCV4128 XCV4129     TRUE 0.723 25.000 0.045 NA   NA
 1185038 1185039 XCV4131 XCV4132 hemB   FALSE 0.147 225.000 0.007 NA   NA
 1185041 1185042 XCV4134 XCV4135     FALSE 0.116 225.000 0.000 NA   NA
 1185042 1185043 XCV4135 XCV4136     FALSE 0.274 198.000 0.029 NA   NA
 1185043 1185044 XCV4136 XCV4137   gst7 FALSE 0.044 333.000 0.020 1.000 N NA
 1185045 1185046 XCV4138 XCV4139     TRUE 0.656 153.000 0.231 NA   NA
 1185046 1185047 XCV4139 XCV4140     TRUE 0.955 -10.000 0.333 NA   NA
 1185047 1185048 XCV4140 XCV4141     TRUE 0.963 11.000 0.286 NA   NA
 1185048 1185049 XCV4141 XCV4142     TRUE 0.726 140.000 0.286 NA   NA
 1185050 1185051 XCV4143 XCV4144 natB natA TRUE 0.997 -3.000 0.271 NA Y NA
 1185051 1185052 XCV4144 XCV4145 natA   TRUE 0.844 32.000 0.292 1.000   NA
 1185052 1185053 XCV4145 XCV4146     TRUE 0.564 55.000 0.065 1.000   NA
 1185053 1185054 XCV4146 XCV4147     TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 1185059 1185060 XCV4152 XCV4153     TRUE 0.975 18.000 0.688 0.070 N NA
 1185060 1185061 XCV4153 XCV4154     TRUE 0.938 0.000 0.014 1.000 N NA
 1185061 1185062 XCV4154 XCV4155     FALSE 0.071 273.000 0.000 NA   NA
 1185063 1185064 XCV4156 XCV4157     FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 1185064 1185065 XCV4157 XCV4158     FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 1185065 1185066 XCV4158 XCV4159     TRUE 0.897 -58.000 0.484 1.000   NA
 1185066 1185067 XCV4159 XCV4160   nrdB FALSE 0.069 572.000 0.250 1.000 N NA
 1185067 1185068 XCV4160 XCV4161 nrdB nrdA TRUE 0.903 180.000 0.079 0.000 Y NA
 1185068 1185069 XCV4161 XCV4162 nrdA   FALSE 0.018 602.000 0.000 1.000   NA
 1185069 1185070 XCV4162 XCV4163     TRUE 0.570 106.000 0.041 1.000   NA
 1185070 1185071 XCV4163 XCV4164   mgtE TRUE 0.695 116.000 0.028 0.042 N NA
 1185072 1185073 XCV4165 XCV4166 ecaA kefC FALSE 0.424 217.000 0.000 1.000 Y NA
 1185074 1185075 XCV4167 XCV4168   zwf2 FALSE 0.005 763.000 0.000 NA N NA
 1185075 1185076 XCV4168 XCV4169 zwf2   TRUE 0.996 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 1185076 1185077 XCV4169 XCV4170     FALSE 0.031 389.000 0.000 NA   NA
 1185077 1185078 XCV4170 XCV4171     TRUE 0.903 -7.000 0.040 NA   NA
 1185079 1185080 XCV4172 XCV4173 fabF   TRUE 0.992 0.000 0.303 NA   NA
 1185080 1185081 XCV4173 XCV4174     TRUE 0.975 -3.000 0.037 NA   NA
 1185081 1185082 XCV4174 XCV4175     TRUE 0.968 -3.000 0.070 NA N NA
 1185082 10702535 XCV4175 IS_1479_5     FALSE 0.318 63.000 0.000 NA   NA
 10702535 1185083 IS_1479_5 XCV4176     FALSE 0.247 -1043.000 0.000 NA   NA
 1185083 1185084 XCV4176 XCV4177     FALSE 0.041 340.000 0.000 NA   NA
 1185087 1185088 XCV4180 XCV4181     TRUE 0.911 -13.000 0.171 NA   NA
 1185088 1185089 XCV4181 XCV4182     TRUE 0.886 -10.000 0.061 NA   NA
 1185089 1185090 XCV4182 XCV4183     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1185090 1185091 XCV4183 XCV4184     TRUE 0.537 139.000 0.062 NA   NA
 1185091 1185092 XCV4184 XCV4185     TRUE 0.790 -76.000 0.196 NA   NA
 1185092 1185093 XCV4185 XCV4186     TRUE 0.991 -3.000 0.297 NA   NA
 1185093 1185094 XCV4186 XCV4187     TRUE 0.964 12.000 0.045 NA Y NA
 1185094 1185095 XCV4187 XCV4188     TRUE 0.877 54.000 0.750 NA   NA
 1185095 1185096 XCV4188 XCV4189     TRUE 0.797 -25.000 0.083 NA   NA
 1185097 1185098 XCV4190 XCV4191     TRUE 0.834 -27.000 0.143 NA   NA
 1185100 1185101 XCV4193 XCV4194     FALSE 0.113 227.000 0.000 NA   NA
 1185101 1185102 XCV4194 XCV4195     FALSE 0.308 59.000 0.000 NA   NA
 1185102 1185103 XCV4195 XCV4196     FALSE 0.336 82.000 0.000 NA   NA
 1185103 1185104 XCV4196 XCV4197     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 1185104 1185105 XCV4197 XCV4198   hemF FALSE 0.037 403.000 0.006 NA   NA
 1185106 1185107 XCV4199 XCV4200   polA FALSE 0.025 437.000 0.000 NA   NA
 1185109 1185110 XCV4202 XCV4203   yapH FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1185110 1185111 XCV4203 XCV4204 yapH   TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1185111 1185112 XCV4204 XCV4205     TRUE 0.767 -9.000 0.000 NA   NA
 1185112 1185113 XCV4205 XCV4206     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1185113 1185114 XCV4206 XCV4207     TRUE 0.994 5.000 1.000 1.000   NA
 1185114 1185115 XCV4207 XCV4208     TRUE 0.978 -3.000 0.051 NA   NA
 1185115 1185116 XCV4208 XCV4209     TRUE 0.864 -12.000 0.051 NA   NA
 1185116 1185117 XCV4209 XCV4210     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA   NA
 1185117 1185118 XCV4210 XCV4211     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA   NA
 1185118 1185119 XCV4211 XCV4212     FALSE 0.020 503.000 0.000 NA   NA
 1185121 1185122 XCV4214 XCV4215     FALSE 0.328 76.000 0.000 NA   NA
 1185122 1185123 XCV4215 XCV4216     TRUE 0.798 11.000 0.000 NA   NA
 1185123 1185124 XCV4216 XCV4217     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1185124 1185125 XCV4217 XCV4218     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   NA
 1185125 1185126 XCV4218 XCV4219     FALSE 0.101 236.000 0.000 NA   NA
 1185126 1185127 XCV4219 XCV4220     FALSE 0.336 44.000 0.000 NA   NA
 1185127 1185128 XCV4220 XCV4221   rpoE8 TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1185129 1185130 XCV4222 XCV4223 rpoE9   TRUE 0.948 -9.000 0.333 1.000 N NA
 1185130 1185131 XCV4223 XCV4224     FALSE 0.026 459.000 0.000 1.000   NA
 1185131 1185132 XCV4224 XCV4225     FALSE 0.370 104.000 0.000 1.000   NA
 1185132 1185133 XCV4225 XCV4226     FALSE 0.326 73.000 0.000 NA   NA
 1185134 1185135 XCV4227 XCV4228     FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1185135 1185136 XCV4228 XCV4229     FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1185136 1185137 XCV4229 XCV4230     FALSE 0.338 117.000 0.000 NA   NA
 1185137 1185138 XCV4230 XCV4231     FALSE 0.142 205.000 0.000 NA   NA
 1185138 1185139 XCV4231 XCV4232     FALSE 0.336 82.000 0.000 NA   NA
 1185139 1185140 XCV4232 XCV4233     FALSE 0.013 1065.000 0.000 NA   NA
 10702536 1185141 IS_1477_17 XCV4234     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1185141 1185142 XCV4234 XCV4235     TRUE 0.734 33.000 0.000 0.065   NA
 1185143 1185144 XCV4236 XCV4237 clpB   TRUE 0.597 57.000 0.095 NA   NA
 1185144 1185145 XCV4237 XCV4238     TRUE 0.513 -36.000 0.000 NA   NA
 1185145 1185146 XCV4238 XCV4239     TRUE 0.572 -22.000 0.000 NA   NA
 1185146 1185147 XCV4239 XCV4240     TRUE 0.982 6.000 0.311 NA   NA
 1185147 1185148 XCV4240 XCV4241     FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 1185148 1185149 XCV4241 XCV4242     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 1185149 1185150 XCV4242 XCV4243     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 1185152 1185153 XCV4245 XCV4246     FALSE 0.093 251.000 0.000 1.000   NA
 1185155 1185156 XCV4248 XCV4249 uvrD   FALSE 0.069 347.000 0.022 NA   NA
 1185158 1185159 XCV4251 XCV4252 cls   TRUE 0.835 -88.000 0.286 1.000   NA
 1185160 1185161 XCV4253 XCV4254     TRUE 0.942 14.000 0.309 NA   NA
 1185161 1185162 XCV4254 XCV4255     FALSE 0.239 229.000 0.050 NA   NA
 1185163 1185164 XCV4256 XCV4257 rpmG rpmB TRUE 0.993 14.000 0.332 0.009 Y NA
 1185164 1185165 XCV4257 XCV4258 rpmB czcD1 FALSE 0.035 259.000 0.000 1.000 N NA
 1185165 1185166 XCV4258 XCV4259 czcD1 czcA TRUE 0.999 -3.000 0.286 0.002 Y NA
 1185166 1185167 XCV4259 XCV4260 czcA czcB FALSE 0.040 550.000 0.100 1.000 N NA
 1185167 1185168 XCV4260 XCV4261 czcB czcC TRUE 0.781 183.000 0.200 1.000 Y NA
 1185168 1185169 XCV4261 XCV4262 czcC   TRUE 0.792 56.000 0.400 NA   NA
 1185169 1185170 XCV4262 XCV4263     FALSE 0.024 457.000 0.000 NA   NA
 1185170 1185171 XCV4263 XCV4264   gidB FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 1185172 1185173 XCV4265 XCV4266 phoD1 phoD2 TRUE 0.846 172.000 0.000 0.000 Y NA
 1185176 1185177 XCV4269 XCV4270   xthA2 TRUE 0.963 -3.000 0.010 1.000   NA
 1185179 1185180 XCV4272 XCV4273     TRUE 0.996 -3.000 0.684 NA   NA
 1185180 1185181 XCV4273 XCV4274     TRUE 0.580 87.000 0.051 NA   NA
 1185182 1185183 XCV4275 XCV4276 acsA   TRUE 0.600 175.000 0.357 1.000 N NA
 1185185 1185186 XCV4278 XCV4279     FALSE 0.336 44.000 0.000 NA   NA
 1185186 1185187 XCV4279 XCV4280     TRUE 0.991 4.000 0.500 NA   NA
 1185189 1185190 XCV4282 XCV4283     TRUE 0.996 -3.000 0.600 1.000   NA
 1185190 1185191 XCV4283 XCV4284     TRUE 0.996 -3.000 0.214 0.042   NA
 1185191 1185192 XCV4284 XCV4285     TRUE 0.910 170.000 0.214 0.042 Y NA
 1185195 1185196 XCV4288 XCV4289   fucP TRUE 0.988 3.000 0.300 NA   NA
 1185197 1185198 XCV4290 XCV4291     FALSE 0.034 373.000 0.000 NA   NA
 1185200 1185201 XCV4293 XCV4294     FALSE 0.095 242.000 0.000 NA   NA
 1185202 1185203 XCV4295 XCV4296 ndvB   TRUE 0.996 3.000 0.344 1.000 Y NA
 1185204 1185205 XCV4297 XCV4298 idnK   FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1185205 1185206 XCV4298 XCV4299     FALSE 0.352 100.000 0.000 NA   NA
 1185206 1185207 XCV4299 XCV4300     FALSE 0.326 73.000 0.000 NA   NA
 1185208 1185209 XCV4301 XCV4302     TRUE 0.951 -19.000 0.600 NA   NA
 1185209 1185210 XCV4302 XCV4303     TRUE 0.981 11.000 0.600 NA   NA
 1185210 1185211 XCV4303 XCV4304     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 1185211 1185212 XCV4304 XCV4305     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1185212 1185213 XCV4305 XCV4306     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 1185214 1185215 XCV4307 XCV4308     TRUE 0.748 -300.000 0.000 0.016   NA
 1185216 1185217 XCV4309 XCV4310   glyS TRUE 0.950 0.000 0.000 1.000   NA
 1185217 1185218 XCV4310 XCV4311 glyS glyQ TRUE 0.871 318.000 0.651 0.000 Y NA
 1185220 1185221 XCV4313 XCV4314     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1185221 1185222 XCV4314 XCV4315     FALSE 0.328 46.000 0.000 NA   NA
 1185222 1185223 XCV4315 XCV4316     FALSE 0.303 56.000 0.000 NA   NA
 1185224 1185225 XCV4317 XCV4318 guaA   TRUE 0.735 27.000 0.070 NA   NA
 1185226 1185227 XCV4319 XCV4320 tatC tatB TRUE 0.991 -3.000 0.015 NA Y NA
 1185227 1185228 XCV4320 XCV4321 tatB tatA TRUE 0.979 16.000 0.037 0.006 Y NA
 1185228 1185229 XCV4321 XCV4322 tatA   TRUE 0.588 73.000 0.073 NA   NA
 1185230 1185231 XCV4323 XCV4324 hemH   TRUE 0.976 -3.000 0.037 1.000   NA
 1185231 1185232 XCV4324 XCV4325     TRUE 0.705 -19.000 0.015 NA   NA
 1185233 1185234 XCV4326 XCV4327   rdgC FALSE 0.066 563.000 0.121 1.000   NA
 1185234 1185235 XCV4327 XCV4328 rdgC   FALSE 0.254 64.000 0.012 NA N NA
 1185236 1185237 XCV4329 XCV4330   xylA FALSE 0.341 43.000 0.000 NA   NA
 1185237 1185238 XCV4330 XCV4331 xylA   FALSE 0.346 42.000 0.000 NA   NA
 1185240 1185241 XCV4333 XCV4334 aguA   TRUE 0.981 -3.000 0.082 NA   NA
 1185241 1185242 XCV4334 XCV4335   rspA TRUE 0.985 12.000 1.000 NA   NA
 1185242 1185243 XCV4335 XCV4336 rspA xylB3 TRUE 0.996 0.000 0.800 1.000 N NA
 1185243 1185244 XCV4336 XCV4337 xylB3   TRUE 0.999 3.000 0.800 0.018 Y NA
 1185244 1185245 XCV4337 XCV4338   mtlD TRUE 0.930 95.000 0.364 1.000 Y NA
 1185246 1185247 XCV4339 XCV4340     TRUE 0.757 109.000 0.250 NA   NA
 1185251 1185252 XCV4344 XCV4345     FALSE 0.186 41.000 0.000 1.000 N NA
 1185252 1185253 XCV4345 XCV4346     FALSE 0.158 103.000 0.000 NA N NA
 1185253 1185254 XCV4346 XCV4347     TRUE 0.987 10.000 0.750 NA   NA
 1185254 1185255 XCV4347 XCV4348   hemL TRUE 0.914 -19.000 0.300 1.000   NA
 1185255 1185256 XCV4348 XCV4349 hemL   TRUE 0.977 -3.000 0.115 1.000 N NA
 1185256 1185257 XCV4349 XCV4350   xylB4 TRUE 0.958 -13.000 0.077 1.000 Y NA
 1185257 1185258 XCV4350 XCV4351 xylB4   TRUE 0.989 0.000 0.214 NA   NA
 1185258 1185259 XCV4351 XCV4352     TRUE 0.732 83.000 0.214 NA   NA
 1185259 1185260 XCV4352 XCV4353   gnl1 FALSE 0.020 510.000 0.000 NA   NA
 1185260 1185261 XCV4353 XCV4354 gnl1   FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 1185261 1185262 XCV4354 XCV4355   xynA FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1185262 1185263 XCV4355 XCV4356 xynA bga2 TRUE 0.999 0.000 0.250 0.009 Y NA
 1185263 1185264 XCV4356 XCV4357 bga2 uxaC TRUE 0.826 85.000 0.049 1.000 Y NA
 1185264 1185265 XCV4357 XCV4358 uxaC xynB2 TRUE 0.814 41.000 0.033 1.000 Y NA
 1185265 1185266 XCV4358 XCV4359 xynB2   TRUE 0.779 101.000 0.286 NA   NA
 1185266 1185267 XCV4359 XCV4360   xynB3 TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 1185267 1185268 XCV4360 XCV4361 xynB3   TRUE 0.955 10.000 0.286 NA N NA
 1185269 1185270 XCV4362 XCV4363   xylP TRUE 0.833 42.000 0.136 0.084   NA
 1185270 1185271 XCV4363 XCV4364 xylP   TRUE 0.881 33.000 0.455 1.000   NA
 1185271 1185272 XCV4364 XCV4365   blc4 FALSE 0.045 339.000 0.000 1.000   NA
 1185273 1185274 XCV4366 XCV4367     FALSE 0.129 214.000 0.000 NA   NA
 1185274 1185275 XCV4367 XCV4368     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1185277 1185278 XCV4370 XCV4371   plsB FALSE 0.039 340.000 0.017 1.000 N NA
 1185278 1185279 XCV4371 XCV4372 plsB   TRUE 0.977 0.000 0.043 NA   NA
 1185280 1185281 XCV4373 XCV4374     TRUE 0.808 168.000 0.667 1.000   NA
 1185281 1185282 XCV4374 XCV4375     FALSE 0.229 317.000 0.000 0.004   NA
 1185282 1185283 XCV4375 XCV4376     TRUE 0.699 73.000 0.000 0.016   NA
 1185283 1185284 XCV4376 XCV4377     TRUE 0.875 106.000 0.600 NA   NA
 1185285 1185286 XCV4378 XCV4379 pyrF   TRUE 0.961 -3.000 0.008 1.000   NA
 1185288 1185289 XCV4381 XCV4382     TRUE 0.461 52.000 0.026 NA   NA
 1185289 1185290 XCV4382 XCV4383   rep FALSE 0.190 94.000 0.000 1.000 N NA
 1185291 1185292 XCV4384 XCV4385 tdk   FALSE 0.329 77.000 0.000 NA   NA
 1185292 1185293 XCV4385 XCV4386     FALSE 0.436 32.000 0.000 NA   NA
 1185294 1185295 XCV4387 XCV4388 opgD   TRUE 0.802 18.000 0.050 NA   NA
 1185295 1185296 XCV4388 XCV4389     FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1185296 1185297 XCV4389 XCV4390   mutM FALSE 0.018 551.000 0.000 NA   NA
 1185297 10702537 XCV4390 XCV_r6 mutM   FALSE 0.015 760.000 0.000 NA   NA
 10702537 1185298 XCV_r6 XCVr3     FALSE 0.320 129.000 0.000 NA   NA
 1185298 1185299 XCVr3 XCV_tRNA53   tRNA-Ile FALSE 0.139 207.000 0.000 NA   NA
 1185299 1185300 XCV_tRNA53 XCV_tRNA54 tRNA-Ile tRNA-Ala TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1185300 1185301 XCV_tRNA54 XCVr4 tRNA-Ala   FALSE 0.357 96.000 0.000 NA   NA
 1185303 1185304 XCV4392 XCV4393 aphB   TRUE 0.974 -3.000 0.103 NA N NA
 1185304 1185305 XCV4393 XCV4394     TRUE 0.455 100.000 0.051 NA N NA
 1185305 1185306 XCV4394 XCV4395     FALSE 0.071 199.000 0.000 1.000 N NA
 1185306 1185307 XCV4395 XCV4396     FALSE 0.381 176.000 0.045 NA   NA
 1185307 1185308 XCV4396 XCV4397     FALSE 0.303 56.000 0.000 NA   NA
 1185310 1185311 XCV4399 XCV4400     FALSE 0.070 274.000 0.000 NA   NA
 1185311 1185312 XCV4400 XCV4401     TRUE 0.884 -13.000 0.098 NA   NA
 1185312 1185313 XCV4401 XCV4402   folE TRUE 0.795 20.000 0.066 NA   NA
 1185314 1185315 XCV4403 XCV4404     TRUE 0.640 98.000 0.088 NA   NA
 1185315 1185316 XCV4404 XCV4405     TRUE 0.995 -3.000 0.529 NA   NA
 1185316 1185317 XCV4405 XCV4406   oprN12 TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.084 N NA
 1185317 1185318 XCV4406 XCV4407 oprN12   TRUE 0.981 -3.000 0.080 NA   NA
 1185319 1185320 XCV4408 XCV4409     TRUE 0.673 114.000 0.133 NA   NA
 1185321 1185322 XCV4410 XCV4411     TRUE 0.860 35.000 0.429 NA   NA
 1185322 1185323 XCV4411 XCV4412   cls TRUE 0.553 197.000 0.087 0.041 N NA
 1185325 1185326 XCV4414 XCV4415     TRUE 0.944 -13.000 0.333 NA   NA
 1185328 1185329 XCV4417 XCV4418     FALSE 0.015 695.000 0.000 NA   NA
 1185332 1185333 XCV4421 XCV4422     FALSE 0.031 388.000 0.000 NA   NA
 1185334 1185335 XCV4423 XCV4424     FALSE 0.030 398.000 0.000 NA   NA
 1185335 1185336 XCV4424 XCV4425     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.027   NA
 1185336 1185337 XCV4425 XCV4426     FALSE 0.023 467.000 0.000 NA   NA
 1185337 1185338 XCV4426 XCV4427     FALSE 0.331 79.000 0.000 NA   NA
 1185338 1185339 XCV4427 XCV4428   avrRxo1 FALSE 0.333 61.000 0.000 1.000   NA
 1185339 1185340 XCV4428 XCV4429 avrRxo1   TRUE 0.959 18.000 0.667 NA   NA
 1185341 1185342 XCV4430 XCV4431     FALSE 0.022 484.000 0.000 NA   NA
 1185342 1185343 XCV4431 XCV4432     TRUE 0.696 64.000 0.188 NA   NA
 1185343 1185344 XCV4432 XCV4433     TRUE 0.750 117.000 0.000 0.004   NA
 1185347 1185348 XCV4436 XCV4437     FALSE 0.042 336.000 0.000 NA   NA
 1185349 1185350 XCV4438 XCV4439 xopQ   FALSE 0.049 314.000 0.000 NA   NA
 1185350 1185351 XCV4439 XCV4440     TRUE 0.881 18.000 0.174 NA   NA
 1185351 1185352 XCV4440 XCV4441   recD FALSE 0.335 119.000 0.000 NA   NA
 1185352 1185353 XCV4441 XCV4442 recD recB TRUE 0.961 203.000 0.688 0.001 Y NA
 1185353 1185354 XCV4442 XCV4443 recB recC TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 1185354 1185355 XCV4443 XCV4444 recC   FALSE 0.060 213.000 0.000 1.000 N NA
 1185356 1185357 XCV4445 XCV4446     TRUE 0.871 68.000 0.649 NA   NA
 1185357 1185358 XCV4446 XCV4447     TRUE 0.850 61.000 0.571 NA   NA
 1185358 1185359 XCV4447 XCV4448     TRUE 0.982 5.000 0.286 NA   NA
 1185361 1185362 XCV4450 XCV4451     TRUE 0.998 0.000 0.530 NA Y NA
 1185362 1185363 XCV4451 XCV4452     TRUE 0.975 12.000 0.562 NA   NA
 1185363 1185364 XCV4452 XCV4453     TRUE 0.970 -3.000 0.024 NA   NA
 1185364 1185365 XCV4453 XCV4454     TRUE 0.951 5.000 0.041 NA   NA
 1185365 1185366 XCV4454 XCV4455     TRUE 0.896 11.000 0.035 NA   NA
 1185367 1185368 XCV4456 XCV4457   btuE FALSE 0.308 59.000 0.000 NA   NA
 1185368 1185369 XCV4457 XCV4458 btuE   FALSE 0.364 154.000 0.018 NA   NA
 1185369 1185370 XCV4458 XCV4459     FALSE 0.150 216.000 0.004 NA   NA
 1185370 1185371 XCV4459 XCV4460     FALSE 0.069 275.000 0.000 NA   NA
 1185372 1185373 XCV4461 XCV4462     FALSE 0.316 62.000 0.000 NA   NA
 1185373 1185374 XCV4462 XCV4463     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 1185374 1185375 XCV4463 XCV4464   gst8 FALSE 0.231 161.000 0.000 NA   NA
 1185375 1185376 XCV4464 XCV4465 gst8   FALSE 0.334 120.000 0.000 NA   NA
 1185376 1185377 XCV4465 XCV4466     FALSE 0.127 216.000 0.000 NA   NA
 1185378 1185379 XCV4467 XCV4468     FALSE 0.117 231.000 0.000 1.000   NA
 1185379 1185380 XCV4468 XCV4469     FALSE 0.016 667.000 0.000 NA   NA
 1185380 1185381 XCV4469 XCV4470     FALSE 0.344 112.000 0.000 NA   NA
 1185381 1185382 XCV4470 XCV4471     TRUE 0.854 65.000 0.000 0.059 Y NA
 1185382 1185383 XCV4471 XCV4472   glxK FALSE 0.128 233.000 0.030 1.000 N NA
 1185383 1185384 XCV4472 XCV4473 glxK   TRUE 0.938 26.000 0.188 1.000 Y NA
 1185384 1185385 XCV4473 XCV4474     FALSE 0.010 470.000 0.000 1.000 N NA
 1185385 1185386 XCV4474 XCV4475     FALSE 0.064 281.000 0.000 NA   NA
 1185386 1185387 XCV4475 XCV4476     TRUE 0.659 119.000 0.125 NA   NA
 1185388 1185389 XCV4477 XCV4478 terC   FALSE 0.098 428.000 0.000 0.044   NA
 1185390 1185391 XCV4479 XCV4480     FALSE 0.070 280.000 0.000 1.000   NA
 1185391 1185392 XCV4480 XCV4481     TRUE 0.959 10.000 0.000 0.015   NA
 1185394 1185395 XCV4483 XCV4484     FALSE 0.287 157.000 0.003 1.000   NA
 1185395 1185396 XCV4484 XCV4485   yidC FALSE 0.401 86.000 0.003 1.000   NA
 1185396 1185397 XCV4485 XCV4486 yidC rnpA TRUE 0.704 26.000 0.105 1.000 N NA
 1185397 1185398 XCV4486 XCV4487 rnpA rpmH TRUE 0.911 39.000 0.787 1.000   NA
 1180617 1180618 XCVb0003 XCVb0004     FALSE 0.318 63.000 0.000 NA   NA
 1180618 1180619 XCVb0004 XCVb_tRNA01   tRNA-Ile TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1180619 1180620 XCVb_tRNA01 XCVb0005 tRNA-Ile   FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 1180620 1180621 XCVb0005 XCVb0006     TRUE 0.801 -7.000 0.000 NA   NA
 1180621 1180622 XCVb0006 XCVb0007     TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1180622 1180623 XCVb0007 XCVb0008     FALSE 0.328 46.000 0.000 NA   NA
 1180625 10702469 XCVb0010 IS_Xac3_pXCV19_1     FALSE 0.333 121.000 0.000 NA   NA
 10702469 1180626 IS_Xac3_pXCV19_1 XCVb0011     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1180626 1180627 XCVb0011 XCVb0012     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.064 Y NA
 1180627 1180628 XCVb0012 XCVb0013     FALSE 0.181 185.000 0.000 NA   NA
 10702470 1180629 IS_1477_pXCV19_1 XCVb0014     FALSE 0.239 -1081.000 0.000 NA   NA
 1180630 1180631 XCVb0015 XCVb0016 tnpA   TRUE 0.969 5.000 0.115 NA   NA
 1180631 1180632 XCVb0016 XCVb0017     TRUE 0.996 0.000 0.615 NA   NA
 1180633 1180634 XCVb0018 XCVb0019 tnpR rep FALSE 0.014 1270.000 0.000 1.000   NA
 1180634 1180635 XCVb0019 XCVb0020 rep   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180635 1180636 XCVb0020 XCVb0021   parA FALSE 0.355 98.000 0.000 NA   NA
 1180636 1180637 XCVb0021 XCVb0022 parA   TRUE 0.984 3.000 0.182 1.000   NA
 1180639 1180640 XCVc0002 XCVc0003     TRUE 0.994 0.000 0.429 NA   NA
 1180640 1180641 XCVc0003 XCVc0004     FALSE 0.092 246.000 0.000 NA   NA
 1180641 1180642 XCVc0004 XCVc0005     TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 1180642 1180643 XCVc0005 XCVc0006     FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 1180644 1180645 XCVc0007 XCVc0008 kfrA tnpR FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 1180645 1180646 XCVc0008 XCVc0009 tnpR   FALSE 0.264 405.000 0.000 0.063 Y NA
 10702471 1180648 IS_Xac2_pXCV38_1 XCVc0011     FALSE 0.345 -335.000 0.000 NA   NA
 1180648 1180649 XCVc0011 XCVc0012     TRUE 0.950 -6.000 0.000 0.063   NA
 1180650 1180651 XCVc0013 XCVc0014     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180652 1180653 XCVc0015 XCVc0016     FALSE 0.327 74.000 0.000 NA   NA
 1180653 1180654 XCVc0016 XCVc0017     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1180654 1180655 XCVc0017 XCVc0018     FALSE 0.343 113.000 0.000 NA   NA
 1180655 1180656 XCVc0018 XCVc0019     TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1180656 1180657 XCVc0019 XCVc0020     FALSE 0.326 72.000 0.000 NA   NA
 1180657 1180658 XCVc0020 XCVc0021     TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1180658 1180659 XCVc0021 XCVc0022     TRUE 0.897 14.000 0.214 1.000 N NA
 1180660 1180661 XCVc0023 XCVc0024     TRUE 0.993 -3.000 0.351 NA   NA
 1180661 1180662 XCVc0024 XCVc0025     TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1180662 1180663 XCVc0025 XCVc0026     FALSE 0.055 298.000 0.000 NA   NA
 1180663 1180664 XCVc0026 XCVc0027     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1180664 1180665 XCVc0027 XCVc0028   virB1 FALSE 0.328 46.000 0.000 NA   NA
 1180665 1180666 XCVc0028 XCVc0029 virB1 virB11 TRUE 0.689 -13.000 0.000 NA   NA
 1180666 1180667 XCVc0029 XCVc0030 virB11 virB10 TRUE 0.953 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1180667 1180668 XCVc0030 XCVc0031 virB10 virB9 TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 1180668 1180669 XCVc0031 XCVc0032 virB9 virB8 TRUE 0.977 25.000 0.667 NA Y NA
 1180669 1180670 XCVc0032 XCVc0033 virB8 virB6 TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 1180670 1180671 XCVc0033 XCVc0034 virB6   TRUE 0.711 -12.000 0.000 NA   NA
 1180671 1180672 XCVc0034 XCVc0035   virB5 FALSE 0.080 259.000 0.000 NA   NA
 1180672 1180673 XCVc0035 XCVc0036 virB5   FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1180673 1180674 XCVc0036 XCVc0037     TRUE 0.951 19.000 0.600 NA   NA
 1180674 1180675 XCVc0037 XCVc0038     TRUE 0.969 5.000 0.115 NA   NA
 1180675 1180676 XCVc0038 XCVc0039     TRUE 0.996 0.000 0.615 NA   NA
 1180678 1180679 XCVc0041 XCVc0042 virB4 virB2 FALSE 0.047 319.000 0.000 NA   NA
 1180679 1180680 XCVc0042 XCVc0043 virB2   TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1180681 1180682 XCVd0001 XCVd0002 repA repB TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.063 N NA
 1180683 1180684 XCVd0003 XCVd0004 parB   FALSE 0.023 466.000 0.000 NA   NA
 1180685 1180686 XCVd0005 XCVd0006 dotD dotC TRUE 0.970 -13.000 0.667 NA   NA
 1180686 1180687 XCVd0006 XCVd0007 dotC dotB TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 1180687 1180688 XCVd0007 XCVd0008 dotB icmT TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180688 1180689 XCVd0008 XCVd0009 icmT   FALSE 0.317 49.000 0.000 NA   NA
 1180689 1180690 XCVd0009 XCVd0010     FALSE 0.023 467.000 0.000 NA   NA
 1180690 1180691 XCVd0010 XCVd0011   pilL FALSE 0.021 497.000 0.000 NA   NA
 1180691 1180692 XCVd0011 XCVd0012 pilL pilN TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180692 1180693 XCVd0012 XCVd0013 pilN pilO FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 1180693 1180694 XCVd0013 XCVd0014 pilO pilQ FALSE 0.021 486.000 0.000 NA   NA
 1180694 1180695 XCVd0014 XCVd0015 pilQ pilR TRUE 0.986 2.000 0.000 1.000 Y NA
 1180695 1180696 XCVd0015 XCVd0016 pilR pilT FALSE 0.307 259.000 0.000 1.000 Y NA
 1180696 1180697 XCVd0016 XCVd0017 pilT pilV TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180697 1180698 XCVd0017 XCVd0018 pilV   FALSE 0.016 611.000 0.000 NA   NA
 1180698 1180699 XCVd0018 XCVd0019     FALSE 0.340 115.000 0.000 NA   NA
 10702472 1180701 IS_1646_pXCV183_1 XCVd0021     FALSE 0.243 -1049.000 0.000 NA   NA
 10702473 1180702 IS_1404_pXCV183_1 XCVd0022     FALSE 0.241 -1057.000 0.000 NA   NA
 10702474 1180704 IS_Xac3_pXCV183_1 XCVd0024     FALSE 0.254 -878.000 0.000 NA   NA
 1180704 1180705 XCVd0024 XCVd0025     TRUE 0.854 66.000 0.000 0.063 Y NA
 1180705 10702475 XCVd0025 IS_1479_pXCV183_1     FALSE 0.016 653.000 0.000 NA   NA
 10702475 1180706 IS_1479_pXCV183_1 XCVd0026     FALSE 0.247 -1043.000 0.000 NA   NA
 1180706 1180707 XCVd0026 XCVd_tRNA01   tRNA-Ile FALSE 0.013 1152.000 0.000 NA   NA
 1180707 1180708 XCVd_tRNA01 XCVd0027 tRNA-Ile dotA FALSE 0.014 874.000 0.000 NA   NA
 1180709 1180710 XCVd0028 XCVd0029     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1180710 1180711 XCVd0029 XCVd0030     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1180711 1180712 XCVd0030 XCVd0031     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1180712 1180713 XCVd0031 XCVd0032     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180713 1180714 XCVd0032 XCVd0033     FALSE 0.334 81.000 0.000 NA   NA
 1180714 1180715 XCVd0033 XCVd0034     FALSE 0.327 70.000 0.000 NA   NA
 1180715 1180716 XCVd0034 XCVd0035     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180716 1180717 XCVd0035 XCVd0036     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1180717 1180718 XCVd0036 XCVd0037     FALSE 0.029 406.000 0.000 NA   NA
 1180718 1180719 XCVd0037 XCVd0038     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1180719 1180720 XCVd0038 XCVd0039     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180720 1180721 XCVd0039 XCVd0040     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180721 1180722 XCVd0040 XCVd0041   icmP TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180722 1180723 XCVd0041 XCVd0042 icmP   TRUE 0.597 -19.000 0.000 NA   NA
 1180723 1180724 XCVd0042 XCVd0043   icmO TRUE 0.798 11.000 0.000 NA   NA
 1180724 1180725 XCVd0043 XCVd0044 icmO   TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1180725 1180726 XCVd0044 XCVd0045     TRUE 0.711 -12.000 0.000 NA   NA
 1180726 1180727 XCVd0045 XCVd0046     FALSE 0.336 44.000 0.000 NA   NA
 1180727 1180728 XCVd0046 XCVd0047     FALSE 0.137 208.000 0.000 NA   NA
 1180728 1180729 XCVd0047 XCVd0048     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 1180729 1180730 XCVd0048 XCVd0049     FALSE 0.062 286.000 0.000 NA   NA
 1180730 1180731 XCVd0049 XCVd0050     FALSE 0.020 509.000 0.000 NA   NA
 1180731 1180732 XCVd0050 XCVd0051     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1180732 1180733 XCVd0051 XCVd0052     FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1180733 1180734 XCVd0052 XCVd0053     TRUE 0.519 -34.000 0.000 NA   NA
 1180735 1180736 XCVd0054 XCVd0055     FALSE 0.013 1733.000 0.000 NA   NA
 1180736 1180737 XCVd0055 XCVd0056     TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1180737 1180738 XCVd0056 XCVd0057     FALSE 0.022 476.000 0.000 NA   NA
 1180738 1180739 XCVd0057 XCVd0058     FALSE 0.300 138.000 0.000 NA   NA
 1180739 1180740 XCVd0058 XCVd0059     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1180740 1180741 XCVd0059 XCVd0060     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1180741 1180742 XCVd0060 XCVd0061     TRUE 0.565 21.000 0.000 NA   NA
 1180742 1180743 XCVd0061 XCVd0062     TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1180743 1180744 XCVd0062 XCVd0063     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180744 1180745 XCVd0063 XCVd0064     FALSE 0.027 421.000 0.000 NA   NA
 1180745 1180746 XCVd0064 XCVd0065     FALSE 0.333 80.000 0.000 NA   NA
 1180746 1180747 XCVd0065 XCVd0066     TRUE 0.689 -13.000 0.000 NA   NA
 1180747 1180748 XCVd0066 XCVd0067     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180748 1180749 XCVd0067 XCVd0068     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180749 1180750 XCVd0068 XCVd0069     FALSE 0.016 614.000 0.000 NA   NA
 1180750 1180751 XCVd0069 XCVd0070     FALSE 0.263 148.000 0.000 NA   NA
 1180752 1180753 XCVd0071 XCVd0072     FALSE 0.118 224.000 0.000 NA   NA
 1180753 1180754 XCVd0072 XCVd0073     FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1180754 1180755 XCVd0073 XCVd0074     FALSE 0.039 347.000 0.000 NA   NA
 1180755 1180756 XCVd0074 XCVd0075     TRUE 0.964 11.000 0.286 1.000   NA
 1180756 1180757 XCVd0075 XCVd0076     FALSE 0.327 68.000 0.000 NA   NA
 1180757 1180758 XCVd0076 XCVd0077     FALSE 0.295 139.000 0.000 NA   NA
 1180758 1180759 XCVd0077 XCVd0078     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180759 1180760 XCVd0078 XCVd0079     TRUE 0.965 -3.000 0.015 NA   NA
 1180760 1180761 XCVd0079 XCVd0080     TRUE 0.523 104.000 0.029 NA   NA
 1180761 1180762 XCVd0080 XCVd0081     TRUE 0.997 0.000 0.800 NA   NA
 1180762 1180763 XCVd0081 XCVd0082     TRUE 0.902 -19.000 0.273 NA   NA
 1180763 1180764 XCVd0082 XCVd0083     TRUE 0.993 -3.000 0.364 NA   NA
 1180764 1180765 XCVd0083 XCVd0084     TRUE 0.866 8.000 0.000 NA   NA
 1180767 1180768 XCVd0086 XCVd0087     FALSE 0.054 300.000 0.000 NA   NA
 1180768 1180769 XCVd0087 XCVd0088     FALSE 0.126 217.000 0.000 NA   NA
 10702476 1180771 IS_1477_pXCV183_1 XCVd0090     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1180771 1180772 XCVd0090 XCVd0091     TRUE 0.739 33.000 0.000 0.062   NA
 1180776 1180777 XCVd0095 XCVd0096     FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1180777 1180778 XCVd0096 XCVd0097   tnpA TRUE 0.996 9.000 1.000 0.062   NA
 1180779 1180780 XCVd0098 XCVd0099     FALSE 0.065 280.000 0.000 NA   NA
 1180780 1180781 XCVd0099 XCVd0100     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1180781 1180782 XCVd0100 XCVd0101     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1180782 1180783 XCVd0101 XCVd0102     TRUE 0.994 -3.000 0.487 NA   NA
 1180785 1180786 XCVd0104 XCVd0105 avrBs1   TRUE 0.671 91.000 0.105 1.000   NA
 1180786 1180787 XCVd0105 XCVd0106     FALSE 0.068 276.000 0.000 NA   NA
 10702477 1180788 IS_Xac2_pXCV183_1 XCVd0107     FALSE 0.340 -336.000 0.000 NA   NA
 1180788 1180789 XCVd0107 XCVd0108     TRUE 0.950 -6.000 0.000 0.062   NA
 1180791 1180792 XCVd0110 XCVd0111     TRUE 0.996 0.000 0.615 NA   NA
 1180792 1180793 XCVd0111 XCVd0112   tnpA TRUE 0.969 5.000 0.115 NA   NA
 1180793 1180794 XCVd0112 XCVd0113 tnpA   TRUE 0.951 19.000 0.600 NA   NA
 1180794 1180795 XCVd0113 XCVd0114     FALSE 0.276 144.000 0.000 NA   NA
 1180795 1180796 XCVd0114 XCVd0115     TRUE 0.957 9.000 0.000 0.062   NA
 1180796 1180797 XCVd0115 XCVd0116     FALSE 0.056 306.000 0.000 1.000   NA
 1180797 1180798 XCVd0116 XCVd0117     FALSE 0.113 227.000 0.000 NA   NA
 1180798 1180799 XCVd0117 XCVd0118     FALSE 0.032 383.000 0.000 NA   NA
 1180799 1180800 XCVd0118 XCVd0119     TRUE 0.578 20.000 0.000 NA   NA
 1180800 1180801 XCVd0119 XCVd0120     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180801 1180802 XCVd0120 XCVd0121     FALSE 0.345 110.000 0.000 NA   NA
 1180802 1180803 XCVd0121 XCVd0122     TRUE 0.551 22.000 0.000 NA   NA
 1180803 1180804 XCVd0122 XCVd0123     FALSE 0.327 68.000 0.000 NA   NA
 1180804 1180805 XCVd0123 XCVd0124     FALSE 0.325 47.000 0.000 NA   NA
 1180805 1180806 XCVd0124 XCVd0125     FALSE 0.020 498.000 0.000 NA   NA
 1180807 1180808 XCVd0126 XCVd0127   csrA2 FALSE 0.024 299.000 0.000 1.000 N NA
 1180808 1180809 XCVd0127 XCVd0128 csrA2   FALSE 0.014 375.000 0.000 1.000 N NA
 1180810 1180811 XCVd0129 XCVd0130 ssb   FALSE 0.357 96.000 0.000 NA   NA
 1180811 1180812 XCVd0130 XCVd0131     FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 1180812 1180813 XCVd0131 XCVd0132     TRUE 0.654 16.000 0.000 NA   NA
 1180813 1180814 XCVd0132 XCVd0133     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1180814 1180815 XCVd0133 XCVd0134   rdgC TRUE 0.906 16.000 0.000 1.000 Y NA
 1180815 1180816 XCVd0134 XCVd0135 rdgC   TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1180816 1180817 XCVd0135 XCVd0136     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1180817 1180818 XCVd0136 XCVd0137   dsbC TRUE 0.866 8.000 0.000 NA   NA
 1180821 1180822 XCVd0140 XCVd0141     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1180822 1180823 XCVd0141 XCVd0142     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1180823 1180824 XCVd0142 XCVd0143     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180824 1180825 XCVd0143 XCVd0144     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180825 1180826 XCVd0144 XCVd0145     TRUE 0.547 -28.000 0.000 NA   NA
 1180826 1180827 XCVd0145 XCVd0146     TRUE 0.829 -6.000 0.000 NA   NA
 1180827 1180828 XCVd0146 XCVd0147     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180828 1180829 XCVd0147 XCVd0148     TRUE 0.866 8.000 0.000 NA   NA
 1180829 1180830 XCVd0148 XCVd0149     FALSE 0.027 415.000 0.000 NA   NA
 1180830 1180831 XCVd0149 XCVd0150     FALSE 0.073 271.000 0.000 NA   NA
 1180835 1180836 XCVd0154 XCVd0155     TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1180836 1180837 XCVd0155 XCVd0156     FALSE 0.326 67.000 0.000 NA   NA
 1180837 1180838 XCVd0156 XCVd0157     FALSE 0.150 201.000 0.000 NA   NA
 1180838 1180839 XCVd0157 XCVd0158     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180839 1180840 XCVd0158 XCVd0159     FALSE 0.310 60.000 0.000 NA   NA
 1180840 1180841 XCVd0159 XCVd0160     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180841 1180842 XCVd0160 XCVd0161     TRUE 0.767 -9.000 0.000 NA   NA
 1180842 1180843 XCVd0161 XCVd0162   icmB TRUE 0.632 17.000 0.000 NA   NA
 1180843 1180844 XCVd0162 XCVd0163 icmB   FALSE 0.078 262.000 0.000 NA   NA
 1180844 1180845 XCVd0163 XCVd0164   icmJ TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1180845 1180846 XCVd0164 XCVd0165 icmJ   TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1180846 1180847 XCVd0165 XCVd0166   icmC FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 1180847 1180848 XCVd0166 XCVd0167 icmC icmG TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1180848 1180849 XCVd0167 XCVd0168 icmG icmE FALSE 0.317 130.000 0.000 NA   NA
 1180849 1180850 XCVd0168 XCVd0169 icmE icmK TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 1180850 1180851 XCVd0169 XCVd0170 icmK icmL TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1180851 1180852 XCVd0170 XCVd0171 icmL   FALSE 0.037 356.000 0.000 NA   NA
 1180852 1180853 XCVd0171 XCVd0172     FALSE 0.048 317.000 0.000 NA   NA