MicrobesOnline Operon Predictions for Rickettsia felis URRWXCal2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 896423 896424 RF_0001 RF_0002   trxA TRUE 0.655 92.000 0.053 NA   NA
 896424 896425 RF_0002 RF_0003 trxA rfbE TRUE 0.991 6.000 0.778 1.000   NA
 896425 896426 RF_0003 RF_0004 rfbE rfbA TRUE 0.926 140.000 0.304 1.000 Y NA
 896426 896427 RF_0004 RF_0005 rfbA gltD TRUE 0.976 -3.000 0.088 1.000 N NA
 896428 896429 RF_0006 RF_0007 lpxA fabZ TRUE 0.979 9.000 0.264 1.000 N NA
 896429 896430 RF_0007 RF_0008 fabZ lpxD TRUE 0.683 231.000 0.212 1.000 N NA
 896431 896432 RF_0009 RF_0010     FALSE 0.018 506.000 0.000 NA   NA
 896433 896434 RF_0011 RF_RNA01     FALSE 0.482 140.000 0.000 NA   NA
 896435 896436 RF_0012 RF_0013 nifR3   FALSE 0.495 149.000 0.006 NA   NA
 896438 896439 RF_0015 RF_0016     TRUE 0.887 3.000 0.000 NA   NA
 896440 896441 RF_0017 RF_0018   znuA TRUE 0.888 -12.000 0.008 NA   NA
 896441 896442 RF_0018 RF_0019 znuA pcnB TRUE 0.961 -3.000 0.023 1.000 N NA
 896442 896443 RF_0019 RF_0020 pcnB   TRUE 0.853 -16.000 0.002 NA   NA
 896443 896444 RF_0020 RF_0021     TRUE 0.813 -97.000 0.000 NA   NA
 896445 896446 RF_0022 RF_RNA02 sca1   FALSE 0.211 238.000 0.000 NA   NA
 896446 896447 RF_RNA02 RF_0023     FALSE 0.516 181.000 0.000 NA   NA
 896447 896448 RF_0023 RF_0024     TRUE 0.541 168.000 0.000 NA   NA
 896448 896449 RF_0024 RF_0025     TRUE 0.538 100.000 0.000 1.000   NA
 896449 896450 RF_0025 RF_0026     TRUE 0.543 115.000 0.000 1.000   NA
 896451 896452 RF_0027 RF_0028 atpF atpX TRUE 0.985 106.000 0.863 0.009 Y NA
 896452 896453 RF_0028 RF_0029 atpX atpE TRUE 0.986 19.000 0.278 0.009   NA
 896453 896454 RF_0029 RF_0030 atpE atpB TRUE 0.915 237.000 0.628 0.006   NA
 896454 896455 RF_0030 RF_0031 atpB   TRUE 0.968 5.000 0.195 NA   NA
 896455 896456 RF_0031 RF_0032   dsbG TRUE 0.627 125.000 0.043 NA   NA
 896458 896459 RF_0034 RF_0035   recF TRUE 0.516 205.000 0.000 1.000   NA
 896459 896460 RF_0035 RF_0036 recF   TRUE 0.880 -130.000 0.003 1.000 N NA
 896460 896461 RF_0036 RF_0037     TRUE 0.900 10.000 0.000 1.000   NA
 896461 896462 RF_0037 RF_0038     TRUE 0.847 96.000 0.000 0.002   NA
 896462 896463 RF_0038 RF_0039   folKP TRUE 0.917 -10.000 0.005 1.000   NA
 896463 896464 RF_0039 RF_0040 folKP   FALSE 0.016 548.000 0.000 NA   NA
 896464 896465 RF_0040 RF_0041     FALSE 0.430 93.000 0.000 NA   NA
 896465 896466 RF_0041 RF_0042     TRUE 0.856 -24.000 0.000 NA   NA
 896469 896470 RF_0045 RF_0046 cvpA   FALSE 0.097 311.000 0.000 NA   NA
 896470 896471 RF_0046 RF_0047     FALSE 0.028 435.000 0.000 NA   NA
 896471 896472 RF_0047 RF_0048     TRUE 0.819 -64.000 0.000 NA   NA
 896472 896473 RF_0048 RF_0049     FALSE 0.411 203.000 0.000 NA   NA
 896474 896475 RF_0050 RF_0051     TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 896475 896476 RF_0051 RF_0052     TRUE 0.969 -25.000 0.000 0.018   NA
 896476 896477 RF_0052 RF_0053     FALSE 0.012 1060.000 0.000 1.000   NA
 896478 896479 RF_0054 RF_0055 dcd secB TRUE 0.611 209.000 0.015 1.000 N NA
 896479 896480 RF_0055 RF_0056 secB czcR FALSE 0.409 225.000 0.005 1.000 N NA
 896480 896481 RF_0056 RF_0057 czcR   TRUE 0.956 4.000 0.038 1.000   NA
 896482 896483 RF_0058 RF_0059   pntB TRUE 0.745 55.000 0.047 NA   NA
 896483 896484 RF_0059 RF_0060 pntB ompW TRUE 0.857 128.000 0.046 0.096 N NA
 896485 896486 RF_0061 RF_0062 sam proP1 TRUE 0.990 -13.000 0.556 1.000 N NA
 896486 896487 RF_0062 RF_RNA03 proP1   FALSE 0.434 88.000 0.000 NA   NA
 896487 896488 RF_RNA03 RF_0063     FALSE 0.133 281.000 0.000 NA   NA
 896488 896489 RF_0063 RF_0064     TRUE 0.830 -49.000 0.000 NA   NA
 896489 896490 RF_0064 RF_0065     FALSE 0.434 120.000 0.000 NA   NA
 896490 896491 RF_0065 RF_0066     TRUE 0.868 -16.000 0.000 NA   NA
 896493 896494 RF_0068 RF_0069 cysS rpsB FALSE 0.170 348.000 0.000 1.000 Y NA
 896494 896495 RF_0069 RF_0070 rpsB tsf TRUE 0.969 169.000 0.748 1.000 Y NA
 896495 896496 RF_0070 RF_0071 tsf   TRUE 0.522 203.000 0.000 1.000   NA
 896497 896498 RF_0072 RF_0073 kdtA   TRUE 0.972 -3.000 0.179 NA   NA
 896498 896499 RF_0073 RF_0074   aatA TRUE 0.667 108.000 0.062 NA   NA
 896500 896501 RF_0075 RF_0076   vacJ TRUE 0.959 5.000 0.049 1.000   NA
 896501 896502 RF_0076 RF_0077 vacJ   TRUE 0.912 20.000 0.070 NA N NA
 896502 896503 RF_0077 RF_0078   prs TRUE 0.821 179.000 0.133 NA N NA
 896503 896504 RF_0078 RF_0079 prs alr TRUE 0.983 -3.000 0.200 1.000 N NA
 896504 896505 RF_0079 RF_0080 alr   TRUE 0.556 134.000 0.012 NA N NA
 896505 896506 RF_0080 RF_0081   mkl TRUE 0.983 3.000 0.178 NA Y NA
 896506 896507 RF_0081 RF_0082 mkl   TRUE 0.951 2.000 0.050 NA   NA
 896507 896508 RF_0082 RF_0083   rpmB FALSE 0.438 74.000 0.003 NA   NA
 896508 896509 RF_0083 RF_0084 rpmB rpmE TRUE 0.987 -3.000 0.009 0.042 Y NA
 896509 896510 RF_0084 RF_RNA04 rpmE   FALSE 0.296 223.000 0.000 NA   NA
 896510 896511 RF_RNA04 RF_0085     FALSE 0.034 413.000 0.000 NA   NA
 896511 896512 RF_0085 RF_0086   argB TRUE 0.938 -52.000 0.046 1.000   NA
 896512 896513 RF_0086 RF_0087 argB virB3 TRUE 0.850 13.000 0.004 NA N NA
 896513 896514 RF_0087 RF_0088 virB3 virB4_1 TRUE 0.961 164.000 0.789 NA Y NA
 896514 896515 RF_0088 RF_0089 virB4_1 virB6_1 TRUE 0.949 175.000 0.421 1.000 Y NA
 896515 896516 RF_0089 RF_0090 virB6_1 virB6_2 TRUE 0.999 -13.000 1.000 0.005 Y NA
 896516 896517 RF_0090 RF_0091 virB6_2 virB6_3 TRUE 0.999 7.000 1.000 0.005 Y NA
 896517 896518 RF_0091 RF_0092 virB6_3 virB6_4 TRUE 0.965 229.000 0.750 0.005 Y NA
 896518 896519 RF_0092 RF_0093 virB6_4 virB6_5 TRUE 0.990 144.000 0.875 0.005 Y NA
 896519 896520 RF_0093 RF_0094 virB6_5 vapB2 FALSE 0.437 85.000 0.000 NA   NA
 896520 896521 RF_0094 RF_0095 vapB2 vapC2 TRUE 0.983 -3.000 0.378 NA   NA
 896521 896522 RF_0095 RF_0096 vapC2 pta FALSE 0.439 125.000 0.000 NA   NA
 896522 896523 RF_0096 RF_0097 pta ackA TRUE 0.977 -64.000 0.148 1.000 Y NA
 896523 896524 RF_0097 RF_0098 ackA   TRUE 0.543 199.000 0.000 1.000   NA
 896524 896525 RF_0098 RF_0099   trmD TRUE 0.518 88.000 0.002 1.000   NA
 896525 896526 RF_0099 RF_0100 trmD rplS TRUE 0.986 19.000 0.567 1.000 Y NA
 896526 896527 RF_0100 RF_0101 rplS   FALSE 0.168 309.000 0.000 1.000 N NA
 896527 896528 RF_0101 RF_0102     TRUE 0.781 75.000 0.000 0.051   NA
 896529 896530 RF_0103 RF_0104   secG FALSE 0.030 499.000 0.000 1.000   NA
 896530 896531 RF_0104 RF_0105 secG   FALSE 0.247 255.000 0.000 1.000   NA
 896531 896532 RF_0105 RF_0106     TRUE 0.781 75.000 0.000 0.051   NA
 896532 896533 RF_0106 RF_0107   parC TRUE 0.904 22.000 0.000 1.000 Y NA
 896533 896534 RF_0107 RF_0108 parC   FALSE 0.071 340.000 0.007 NA   NA
 896534 896535 RF_0108 RF_0109   argS FALSE 0.471 134.000 0.008 NA   NA
 896535 896536 RF_0109 RF_0110 argS dgt TRUE 0.966 6.000 0.062 1.000 N NA
 896538 896539 RF_0112 RF_0113   kdsA FALSE 0.017 675.000 0.000 1.000   NA
 896539 896540 RF_0113 RF_0114 kdsA   TRUE 0.705 36.000 0.011 NA   NA
 896540 896541 RF_0114 RF_0115   abcT1 TRUE 0.911 3.000 0.013 NA   NA
 896541 896542 RF_0115 RF_0116 abcT1   TRUE 0.563 192.000 0.006 1.000   NA
 896542 896543 RF_0116 RF_0117   soj TRUE 0.993 -13.000 0.827 1.000 N NA
 896543 896544 RF_0117 RF_0118 soj gidB TRUE 0.987 -3.000 0.339 1.000 N NA
 896544 896545 RF_0118 RF_0119 gidB gidA TRUE 0.986 -19.000 0.466 1.000 N NA
 896545 896546 RF_0119 RF_0120 gidA ndk TRUE 0.934 4.000 0.007 1.000 N NA
 896546 896547 RF_0120 RF_0121 ndk uhpC TRUE 0.809 30.000 0.007 1.000 N NA
 896547 896548 RF_0121 RF_0122 uhpC tlc1 TRUE 0.976 68.000 0.875 0.056 N NA
 896549 896550 RF_0123 RF_0124 dam def3 FALSE 0.034 504.000 0.000 1.000 N NA
 896551 896552 RF_0125 RF_0126     TRUE 0.863 -19.000 0.000 NA   NA
 896552 896553 RF_0126 RF_0127     FALSE 0.128 283.000 0.000 NA   NA
 896555 896556 RF_0129 RF_0130   pgsA TRUE 0.855 16.000 0.005 1.000   NA
 896556 896557 RF_0130 RF_0131 pgsA yidC TRUE 0.972 4.000 0.008 0.094 N NA
 896557 896558 RF_0131 RF_0132 yidC   TRUE 0.677 158.000 0.008 1.000 N NA
 896559 896560 RF_0133 RF_0134 lgt   TRUE 0.961 -21.000 0.170 NA   NA
 896561 896562 RF_0135 RF_0136   sdhB TRUE 0.674 34.000 0.006 NA   NA
 896562 896563 RF_0136 RF_0137 sdhB   FALSE 0.128 319.000 0.000 1.000   NA
 896563 896564 RF_0137 RF_0138     TRUE 0.848 95.000 0.000 0.002   NA
 896564 896565 RF_0138 RF_0139   ftsH TRUE 0.785 26.000 0.004 1.000   NA
 896565 896566 RF_0139 RF_0140 ftsH tilS TRUE 0.726 222.000 0.145 1.000 N NA
 896566 896567 RF_0140 RF_0141 tilS rplI FALSE 0.400 279.000 0.002 0.066 N NA
 896567 896568 RF_0141 RF_0142 rplI rpsR TRUE 0.995 12.000 0.499 0.042 Y NA
 896568 896569 RF_0142 RF_0143 rpsR rpsF TRUE 0.988 25.000 0.319 0.042 Y NA
 896570 896571 RF_0144 RF_0145   aco1 FALSE 0.021 479.000 0.000 NA   NA
 896571 896572 RF_0145 RF_0146 aco1 gcp TRUE 0.581 196.000 0.005 1.000 N NA
 896572 896573 RF_0146 RF_0147 gcp   FALSE 0.410 90.000 0.004 NA   NA
 896574 896575 RF_0148 RF_0149     FALSE 0.513 157.000 0.000 NA   NA
 896575 896576 RF_0149 RF_0150     FALSE 0.430 94.000 0.000 NA   NA
 896577 896578 RF_0151 RF_0152     FALSE 0.021 481.000 0.000 NA   NA
 896578 896579 RF_0152 RF_0153   phbB TRUE 0.939 0.000 0.027 NA   NA
 896579 896580 RF_0153 RF_0154 phbB   TRUE 0.789 27.000 0.018 NA   NA
 896580 896581 RF_0154 RF_0155     TRUE 0.980 -78.000 0.667 NA   NA
 896581 896582 RF_0155 RF_0156     TRUE 0.968 14.000 0.375 NA   NA
 896582 896583 RF_0156 RF_0157     FALSE 0.388 209.000 0.000 NA   NA
 896583 896584 RF_0157 RF_0158     TRUE 0.544 89.000 0.000 1.000   NA
 896584 896585 RF_0158 RF_0159     TRUE 0.782 75.000 0.000 0.050   NA
 896585 896586 RF_0159 RF_0160     FALSE 0.388 209.000 0.000 NA   NA
 896588 896589 RF_0162 RF_0163 phbC paaJ TRUE 0.980 -3.000 0.085 NA Y NA
 896593 896594 RF_0167 RF_0168     FALSE 0.128 283.000 0.000 NA   NA
 896594 896595 RF_0168 RF_0169     TRUE 0.821 -61.000 0.000 NA   NA
 896596 896597 RF_RNA05 RF_0170     FALSE 0.443 79.000 0.000 NA   NA
 896597 896598 RF_0170 RF_0171   fabD TRUE 0.542 173.000 0.000 NA   NA
 896599 896600 RF_0172 RF_0173     TRUE 0.539 175.000 0.000 NA   NA
 896601 896602 RF_0174 RF_0175   surf1 TRUE 0.617 140.000 0.023 NA   NA
 896602 896603 RF_0175 RF_0176 surf1 dnaQ FALSE 0.490 133.000 0.010 NA   NA
 896603 896604 RF_0176 RF_0177 dnaQ coaE TRUE 0.540 246.000 0.092 1.000 N NA
 896604 896605 RF_0177 RF_0178 coaE   TRUE 0.888 -6.000 0.006 NA   NA
 896606 896607 RF_RNA06 RF_0179     TRUE 0.844 -31.000 0.000 NA   NA
 896607 896608 RF_0179 RF_0180   rnhA TRUE 0.917 10.000 0.012 1.000   NA
 896608 896609 RF_0180 RF_0181 rnhA   TRUE 0.942 -12.000 0.012 1.000 N NA
 896609 896610 RF_0181 RF_0182     TRUE 0.917 26.000 0.199 NA   NA
 896610 896611 RF_0182 RF_0183     TRUE 0.529 162.000 0.000 NA   NA
 896611 896612 RF_0183 RF_0184     TRUE 0.977 9.000 0.400 NA   NA
 896615 896616 RF_0187 RF_0188     TRUE 0.628 43.000 0.000 NA   NA
 896616 896617 RF_0188 RF_0189     FALSE 0.439 125.000 0.000 NA   NA
 896618 896619 RF_0190 RF_0191   tgt TRUE 0.603 46.000 0.000 NA   NA
 896619 896620 RF_0191 RF_0192 tgt ligA TRUE 0.665 163.000 0.004 1.000 N NA
 896620 896621 RF_0192 RF_0193 ligA   FALSE 0.444 72.000 0.003 NA   NA
 896621 896622 RF_0193 RF_0194     FALSE 0.024 464.000 0.000 NA   NA
 896622 896623 RF_0194 RF_0195     TRUE 0.687 147.000 0.017 1.000   NA
 896623 896624 RF_0195 RF_0196   lpxK TRUE 0.781 162.000 0.006 1.000 Y NA
 896624 896625 RF_0196 RF_0197 lpxK htrB TRUE 0.968 -37.000 0.044 1.000 Y NA
 896627 896628 RF_0199 RF_0200     TRUE 0.579 51.000 0.000 NA   NA
 896628 896629 RF_0200 RF_0201   himA FALSE 0.496 140.000 0.008 NA   NA
 896629 896630 RF_0201 RF_0202 himA   TRUE 0.876 -10.000 0.005 NA   NA
 896630 896631 RF_0202 RF_0203     TRUE 0.920 4.000 0.006 1.000   NA
 896631 896632 RF_0203 RF_0204   spoT11 FALSE 0.075 377.000 0.000 1.000   NA
 896632 896633 RF_0204 RF_0205 spoT11 rompB FALSE 0.037 466.000 0.000 1.000   NA
 896633 896634 RF_0205 RF_0206 rompB   FALSE 0.018 657.000 0.000 1.000   NA
 896635 896636 RF_0207 RF_0208 ccmF   TRUE 0.946 -7.000 0.028 NA N NA
 896636 896637 RF_0208 RF_0209     FALSE 0.192 262.000 0.012 NA   NA
 896637 896638 RF_0209 RF_0210   lolD TRUE 0.645 65.000 0.009 1.000   NA
 896638 896639 RF_0210 RF_0211 lolD   TRUE 0.991 -7.000 0.620 1.000 N NA
 896639 896640 RF_0211 RF_0212   bcr2 TRUE 0.835 127.000 0.020 0.053 N NA
 896640 896641 RF_0212 RF_0213 bcr2   FALSE 0.015 585.000 0.000 NA   NA
 896641 896642 RF_0213 RF_0214   msbA2 FALSE 0.077 328.000 0.000 NA   NA
 896642 896643 RF_0214 RF_RNA07 msbA2   FALSE 0.499 185.000 0.000 NA   NA
 896644 896645 RF_0215 RF_0216     TRUE 0.935 -19.000 0.047 NA   NA
 896645 896646 RF_0216 RF_0217   exsB TRUE 0.900 -25.000 0.000 1.000   NA
 896646 896647 RF_0217 RF_0218 exsB rimJ TRUE 0.949 -3.000 0.017 1.000   NA
 896647 896648 RF_0218 RF_0219 rimJ clpX TRUE 0.645 151.000 0.006 1.000 N NA
 896649 896650 RF_0220 RF_0221     TRUE 0.892 0.000 0.000 NA   NA
 896651 896652 RF_0222 RF_0223     FALSE 0.439 84.000 0.000 NA   NA
 896652 896653 RF_0223 RF_0224     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 896656 896657 RF_0227 RF_0228     TRUE 0.952 146.000 0.750 NA Y NA
 896657 896658 RF_0228 RF_0229   valS TRUE 0.846 -43.000 0.002 NA N NA
 896658 896659 RF_0229 RF_0230 valS   FALSE 0.401 118.000 0.002 NA   NA
 896660 896661 RF_0231 RF_0232 ubiA   FALSE 0.498 66.000 0.000 NA   NA
 896663 896664 RF_0234 RF_0235 tmk metG TRUE 0.653 142.000 0.008 1.000 N NA
 896664 896665 RF_0235 RF_0236 metG tatD TRUE 0.833 142.000 0.221 NA N NA
 896665 896666 RF_0236 RF_0237 tatD   FALSE 0.224 235.000 0.000 NA   NA
 896666 896667 RF_0237 RF_0238     TRUE 0.535 164.000 0.000 NA   NA
 896668 896669 RF_0239 RF_0240     FALSE 0.020 489.000 0.000 NA   NA
 896669 896670 RF_0240 RF_0241   manC TRUE 0.941 2.000 0.032 NA   NA
 896670 896671 RF_0241 RF_0242 manC mutM TRUE 0.656 64.000 0.004 1.000 N NA
 896672 896673 RF_0243 RF_0244 ubiE ubiB TRUE 0.975 -3.000 0.115 1.000   NA
 896673 896674 RF_0244 RF_0245 ubiB   FALSE 0.048 381.000 0.000 NA   NA
 896674 896675 RF_0245 RF_0246     FALSE 0.431 112.000 0.000 NA   NA
 896675 896676 RF_0246 RF_0247     FALSE 0.435 121.000 0.000 NA   NA
 896677 896678 RF_0248 RF_0249     TRUE 0.882 3.000 0.005 NA   NA
 896678 896679 RF_0249 RF_0250   xth2 TRUE 0.965 4.000 0.138 NA   NA
 896679 896680 RF_0250 RF_0251 xth2   TRUE 0.956 -3.000 0.061 NA   NA
 896680 896681 RF_0251 RF_0252     TRUE 0.560 55.000 0.000 NA   NA
 896681 896682 RF_0252 RF_0253   xseA TRUE 0.523 122.000 0.002 1.000   NA
 896683 896684 RF_0254 RF_0255 ostA   TRUE 0.708 202.000 0.051 1.000   NA
 896684 896685 RF_0255 RF_0256   ksgA TRUE 0.600 145.000 0.006 1.000   NA
 896686 896687 RF_0257 RF_0258     FALSE 0.053 362.000 0.000 NA   NA
 896689 896690 RF_0260 RF_RNA08     FALSE 0.012 649.000 0.000 NA   NA
 896690 896691 RF_RNA08 RF_0261     FALSE 0.495 147.000 0.000 NA   NA
 896692 896693 RF_0262 RF_0263 cspA   FALSE 0.018 651.000 0.000 1.000   NA
 896693 896694 RF_0263 RF_0264     TRUE 0.969 -52.000 0.000 0.005   NA
 896694 896695 RF_0264 RF_0265   ampG2 FALSE 0.038 402.000 0.000 NA   NA
 896698 896699 RF_0268 RF_0269 ecoT   TRUE 0.878 18.000 0.034 NA   NA
 896699 896700 RF_0269 RF_0270   ftsZ TRUE 0.844 9.000 0.002 NA   NA
 896700 896701 RF_0270 RF_0271 ftsZ   FALSE 0.208 239.000 0.000 NA   NA
 896701 896702 RF_0271 RF_0272     TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 896702 896703 RF_0272 RF_0273   fumC FALSE 0.485 104.000 0.007 NA N NA
 896703 896704 RF_0273 RF_0274 fumC   TRUE 0.895 -3.000 0.007 NA   NA
 896704 896705 RF_0274 RF_0275     FALSE 0.397 111.000 0.002 NA   NA
 896706 896707 RF_RNA09 RF_RNA10     TRUE 0.544 170.000 0.000 NA   NA
 896707 896708 RF_RNA10 RF_0276   tuf FALSE 0.436 86.000 0.000 NA   NA
 896708 896709 RF_0276 RF_0277 tuf rpsJ TRUE 0.913 96.000 0.318 1.000 Y NA
 896709 896710 RF_0277 RF_0278 rpsJ rplC TRUE 0.996 1.000 0.307 0.053 Y NA
 896710 896711 RF_0278 RF_0279 rplC rplD TRUE 0.874 273.000 0.486 0.039 Y NA
 896711 896712 RF_0279 RF_0280 rplD rplW TRUE 0.997 -3.000 0.513 0.039 Y NA
 896712 896713 RF_0280 RF_0281 rplW rplB TRUE 0.998 1.000 0.849 0.031 Y NA
 896713 896714 RF_0281 RF_0282 rplB rpsS TRUE 0.994 25.000 0.820 0.053 Y NA
 896714 896715 RF_0282 RF_0283 rpsS rplV TRUE 0.991 9.000 0.119 0.053 Y NA
 896715 896716 RF_0283 RF_0284 rplV rpsC TRUE 0.993 2.000 0.109 0.053 Y NA
 896716 896717 RF_0284 RF_0285 rpsC rplP TRUE 0.996 15.000 0.828 0.053 Y NA
 896717 896718 RF_0285 RF_0286 rplP rpmC TRUE 0.998 -7.000 0.802 0.039 Y NA
 896718 896719 RF_0286 RF_0287 rpmC rpsQ TRUE 0.998 -13.000 0.828 0.039 Y NA
 896719 896720 RF_0287 RF_0288 rpsQ rplN TRUE 0.979 75.000 0.791 0.053 Y NA
 896720 896721 RF_0288 RF_0289 rplN rplX TRUE 0.992 1.000 0.071 0.053 Y NA
 896721 896722 RF_0289 RF_0290 rplX rplE TRUE 0.992 0.000 0.057 0.039 Y NA
 896722 896723 RF_0290 RF_0291 rplE rpsN TRUE 0.991 18.000 0.309 0.039 Y NA
 896723 896724 RF_0291 RF_0292 rpsN rpsH TRUE 0.990 20.000 0.295 0.039 Y NA
 896724 896725 RF_0292 RF_0293 rpsH rplF TRUE 0.997 10.000 0.808 0.039 Y NA
 896725 896726 RF_0293 RF_0294 rplF rplR TRUE 0.996 16.000 0.815 0.039 Y NA
 896726 896727 RF_0294 RF_0295 rplR rpsE TRUE 0.995 18.000 0.814 0.053 Y NA
 896727 896728 RF_0295 RF_0296 rpsE rpmD TRUE 0.998 -7.000 0.789 0.053 Y NA
 896728 896729 RF_0296 RF_0297 rpmD rplO TRUE 0.997 14.000 0.653 0.007 Y NA
 896729 896730 RF_0297 RF_0298 rplO secY TRUE 0.992 4.000 0.730 1.000 N NA
 896730 896731 RF_0298 RF_0299 secY adk TRUE 0.967 16.000 0.241 1.000 N NA
 896731 896732 RF_0299 RF_0300 adk rpsM TRUE 0.754 59.000 0.017 1.000 N NA
 896732 896733 RF_0300 RF_0301 rpsM rpsK TRUE 0.994 25.000 0.810 0.039 Y NA
 896733 896734 RF_0301 RF_0302 rpsK rpoA TRUE 0.967 19.000 0.308 1.000 N NA
 896734 896735 RF_0302 RF_0303 rpoA rplQ TRUE 0.991 13.000 0.873 1.000 N NA
 896735 896736 RF_0303 RF_0304 rplQ rpsT TRUE 0.925 49.000 0.008 0.039 Y NA
 896736 896737 RF_0304 RF_RNA11 rpsT   FALSE 0.431 112.000 0.000 NA   NA
 896737 896738 RF_RNA11 RF_0305   spoT5 FALSE 0.008 1204.000 0.000 NA   NA
 896739 896740 RF_0306 RF_0307     TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 896740 896741 RF_0307 RF_0308     TRUE 0.970 -25.000 0.000 0.016   NA
 896744 896745 RF_0311 RF_0312     TRUE 0.978 7.000 0.400 NA   NA
 896746 896747 RF_0313 RF_0314     FALSE 0.009 780.000 0.000 NA   NA
 896748 896749 RF_0315 RF_0316     FALSE 0.014 586.000 0.000 NA   NA
 896749 896750 RF_0316 RF_0317     FALSE 0.007 1251.000 0.000 NA   NA
 896750 896751 RF_0317 RF_0318     TRUE 0.826 -55.000 0.000 NA   NA
 896751 896752 RF_0318 RF_0319   sca11 FALSE 0.119 288.000 0.000 NA   NA
 896752 896753 RF_0319 RF_0320 sca11   TRUE 0.549 124.000 0.000 1.000   NA
 896753 896754 RF_0320 RF_0321     TRUE 0.786 75.000 0.000 0.046   NA
 896754 896755 RF_0321 RF_0322     FALSE 0.036 472.000 0.000 1.000   NA
 896755 896756 RF_0322 RF_0323     FALSE 0.104 300.000 0.000 NA   NA
 896756 896757 RF_0323 RF_0324   def1 FALSE 0.026 442.000 0.000 NA   NA
 896757 896758 RF_0324 RF_0325 def1 fmt TRUE 0.984 -3.000 0.008 0.061 Y NA
 896758 896759 RF_0325 RF_RNA12 fmt   FALSE 0.101 307.000 0.000 NA   NA
 896759 896760 RF_RNA12 RF_RNA13     FALSE 0.160 262.000 0.000 NA   NA
 896760 896761 RF_RNA13 RF_0326     FALSE 0.007 1528.000 0.000 NA   NA
 896761 896762 RF_0326 RF_0327     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 896763 896764 RF_0328 RF_0329 n2B   TRUE 0.929 -3.000 0.000 1.000   NA
 896764 896765 RF_0329 RF_0330   queA TRUE 0.929 -3.000 0.000 1.000   NA
 896765 896766 RF_0330 RF_0331 queA abcT3 FALSE 0.090 373.000 0.000 1.000 N NA
 896767 896768 RF_0332 RF_0333   cydA TRUE 0.836 210.000 0.500 NA   NA
 896769 896770 RF_0334 RF_0335   relB1 TRUE 0.882 4.000 0.000 NA   NA
 896771 896772 RF_0336 RF_0337 cydB lgtF FALSE 0.076 345.000 0.000 NA N NA
 896772 896773 RF_0337 RF_0338 lgtF mpp TRUE 0.588 79.000 0.025 NA   NA
 896773 896774 RF_0338 RF_0339 mpp purC TRUE 0.664 181.000 0.011 1.000   NA
 896774 896775 RF_0339 RF_0340 purC   FALSE 0.200 242.000 0.000 NA   NA
 896777 896778 RF_0342 RF_0343     TRUE 0.970 -25.000 0.000 0.016   NA
 896778 896779 RF_0343 RF_0344     TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 896779 896780 RF_0344 RF_0345     TRUE 0.611 45.000 0.000 NA   NA
 896780 896781 RF_0345 RF_0346     FALSE 0.491 186.000 0.000 NA   NA
 896782 896783 RF_0347 RF_0348 rnpA rpmH TRUE 0.994 20.000 0.787 0.002   NA
 896783 896784 RF_0348 RF_0349 rpmH rplT TRUE 0.833 153.000 0.007 0.038   NA
 896784 896785 RF_0349 RF_0350 rplT rpmI TRUE 0.996 21.000 0.928 0.038 Y NA
 896786 896787 RF_0351 RF_0352 nrdG rplY FALSE 0.057 413.000 0.002 1.000 N NA
 896787 896788 RF_0352 RF_0353 rplY pth TRUE 0.836 284.000 0.496 0.059 Y NA
 896788 896789 RF_0353 RF_0354 pth   TRUE 0.562 133.000 0.000 1.000   NA
 896789 896790 RF_0354 RF_0355   ychF TRUE 0.929 -3.000 0.000 1.000   NA
 896790 896791 RF_0355 RF_0356 ychF   TRUE 0.650 172.000 0.000 1.000   NA
 896791 896792 RF_0356 RF_0357     FALSE 0.516 181.000 0.000 NA   NA
 896792 896793 RF_0357 RF_0358   bcr1 FALSE 0.047 382.000 0.000 NA   NA
 896793 896794 RF_0358 RF_0359 bcr1   TRUE 0.654 184.000 0.000 1.000 N NA
 896796 896797 RF_0361 RF_0362     FALSE 0.045 385.000 0.000 NA   NA
 896798 896799 RF_0363 RF_0364   dnaA FALSE 0.435 87.000 0.000 NA   NA
 896799 896800 RF_0364 RF_0365 dnaA pspE TRUE 0.917 1.000 0.008 NA N NA
 896801 896802 RF_0366 RF_0367   mfd TRUE 0.941 12.000 0.078 NA   NA
 896802 896803 RF_0367 RF_0368 mfd murE TRUE 0.609 76.000 0.007 1.000 N NA
 896803 896804 RF_0368 RF_0369 murE murF TRUE 0.940 120.000 0.051 0.005 Y NA
 896804 896805 RF_0369 RF_0370 murF mraY1 TRUE 0.931 194.000 0.037 0.009 Y NA
 896805 896806 RF_0370 RF_0371 mraY1 rickA FALSE 0.309 217.000 0.003 NA   NA
 896807 896808 RF_0372 RF_0373   scoB TRUE 0.752 157.000 0.036 1.000   NA
 896808 896809 RF_0373 RF_0374 scoB scoA TRUE 0.996 4.000 0.125 0.002 Y NA
 896810 896811 RF_0375 RF_0376     TRUE 0.541 174.000 0.000 NA   NA
 896813 896814 RF_0378 RF_0379 recG   FALSE 0.010 1580.000 0.000 1.000   NA
 896814 896815 RF_0379 RF_0380   spoT6 FALSE 0.441 128.000 0.000 NA   NA
 896815 896816 RF_0380 RF_0381 spoT6 spoT13 FALSE 0.436 86.000 0.000 NA   NA
 896816 896817 RF_0381 RF_0382 spoT13   FALSE 0.013 600.000 0.000 NA   NA
 896817 896818 RF_0382 RF_0383     TRUE 0.928 41.000 0.444 NA   NA
 896818 896819 RF_0383 RF_0384   spoT15 TRUE 0.559 54.000 0.006 NA   NA
 896820 896821 RF_0385 RF_0386     FALSE 0.364 212.000 0.000 NA   NA
 896821 896822 RF_0386 RF_0387     FALSE 0.012 642.000 0.000 NA   NA
 896822 896823 RF_0387 RF_0388     TRUE 0.554 79.000 0.000 1.000   NA
 896823 896824 RF_0388 RF_0389     TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 896824 896825 RF_0389 RF_0390     TRUE 0.971 -25.000 0.000 0.015   NA
 896825 896826 RF_0390 RF_0391   proP FALSE 0.047 418.000 0.000 1.000   NA
 896827 896828 RF_0392 RF_0393     TRUE 0.789 75.000 0.000 0.044   NA
 896829 896830 RF_0394 RF_0395     FALSE 0.108 296.000 0.000 NA   NA
 896832 896833 RF_0397 RF_0398     TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 896833 896834 RF_0398 RF_0399     TRUE 0.572 52.000 0.000 NA   NA
 896834 896835 RF_0399 RF_0400     FALSE 0.498 66.000 0.000 NA   NA
 896835 896836 RF_0400 RF_0401   perM TRUE 0.653 234.000 0.362 NA   NA
 896836 896837 RF_0401 RF_0402 perM grpE TRUE 0.914 12.000 0.034 NA   NA
 896840 896841 RF_0405 RF_0406     FALSE 0.509 65.000 0.000 NA   NA
 896841 896842 RF_0406 RF_0407     TRUE 0.917 -15.000 0.020 NA   NA
 896842 896843 RF_0407 RF_0408   groES FALSE 0.496 129.000 0.000 NA N NA
 896843 896844 RF_0408 RF_0409 groES groEL TRUE 0.976 30.000 0.050 0.009 Y NA
 896844 896845 RF_0409 RF_0410 groEL spoT12 FALSE 0.011 1395.000 0.000 1.000   NA
 896845 896846 RF_0410 RF_0411 spoT12   TRUE 0.874 -70.000 0.000 1.000   NA
 896847 896848 RF_0412 RF_0413   gltX2 TRUE 0.908 -3.000 0.010 NA   NA
 896848 896849 RF_0413 RF_0414 gltX2 ubiG FALSE 0.128 340.000 0.008 1.000 N NA
 896850 896851 RF_0415 RF_0416 znuB   TRUE 0.981 -3.000 0.016 0.048 N NA
 896853 896854 RF_0418 RF_0419 pccB accC TRUE 0.884 131.000 0.157 1.000 Y NA
 896855 896856 RF_0420 RF_0421     FALSE 0.438 124.000 0.000 NA   NA
 896856 896857 RF_0421 RF_0422     FALSE 0.016 548.000 0.000 NA   NA
 896857 896858 RF_0422 RF_0423   ileS FALSE 0.439 84.000 0.000 NA   NA
 896861 896862 RF_0426 RF_0427 rpsU ntrY FALSE 0.163 293.000 0.000 1.000   NA
 896862 896863 RF_0427 RF_0428 ntrY   FALSE 0.484 123.000 0.011 NA   NA
 896863 896864 RF_0428 RF_RNA14     FALSE 0.063 345.000 0.000 NA   NA
 896864 896865 RF_RNA14 RF_0429     FALSE 0.133 281.000 0.000 NA   NA
 896865 896866 RF_0429 RF_0430     FALSE 0.095 312.000 0.000 NA   NA
 896866 896867 RF_0430 RF_0431     TRUE 0.588 49.000 0.000 NA   NA
 896867 896868 RF_0431 RF_0432     FALSE 0.138 279.000 0.000 NA   NA
 896868 896869 RF_0432 RF_0433   corA FALSE 0.015 573.000 0.000 NA   NA
 896869 896870 RF_0433 RF_0434 corA   FALSE 0.508 183.000 0.000 NA   NA
 896870 896871 RF_0434 RF_0435     TRUE 0.572 52.000 0.000 NA   NA
 896871 896872 RF_0435 RF_0436     TRUE 0.971 -25.000 0.000 0.015   NA
 896872 896873 RF_0436 RF_0437     TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 896873 896874 RF_0437 RF_0438   spoT7 FALSE 0.013 888.000 0.000 1.000   NA
 896877 896878 RF_0441 RF_0442     FALSE 0.017 685.000 0.000 1.000   NA
 896878 896879 RF_0442 RF_0443     FALSE 0.042 392.000 0.000 NA   NA
 896879 896880 RF_0443 RF_0444     FALSE 0.056 357.000 0.000 NA   NA
 896881 896882 RF_0445 RF_0446     FALSE 0.434 88.000 0.000 NA   NA
 896882 896883 RF_0446 RF_0447     FALSE 0.427 102.000 0.000 NA   NA
 896883 896884 RF_0447 RF_0448     FALSE 0.247 230.000 0.000 NA   NA
 896884 896885 RF_0448 RF_0449     FALSE 0.436 197.000 0.000 NA   NA
 896885 896886 RF_0449 RF_0450   spoT1 TRUE 0.530 177.000 0.000 NA   NA
 896887 896888 RF_0451 RF_0452     FALSE 0.501 153.000 0.000 NA   NA
 896888 896889 RF_0452 RF_0453   rodA TRUE 0.763 134.000 0.000 0.081   NA
 896889 896890 RF_0453 RF_0454 rodA ptrB TRUE 0.616 116.000 0.010 1.000 N NA
 896890 896891 RF_0454 RF_0455 ptrB nuoL3 TRUE 0.927 67.000 0.538 1.000 N NA
 896891 896892 RF_0455 RF_0456 nuoL3 vapC1 TRUE 0.987 2.000 0.556 NA   NA
 896892 896893 RF_0456 RF_0457 vapC1 vapB1 TRUE 0.982 -9.000 0.444 NA   NA
 896893 896894 RF_0457 RF_0458 vapB1 nuoL2 TRUE 0.817 45.000 0.070 NA   NA
 896894 896895 RF_0458 RF_0459 nuoL2   FALSE 0.427 100.000 0.000 NA   NA
 896895 896896 RF_0459 RF_0460   nuoN2 FALSE 0.509 65.000 0.000 NA   NA
 896896 896897 RF_0460 RF_0461 nuoN2 mnhC TRUE 0.975 140.000 0.426 0.017 Y NA
 896897 896898 RF_0461 RF_0462 mnhC virB9_1 TRUE 0.779 61.000 0.065 NA N NA
 896898 896899 RF_0462 RF_0463 virB9_1 virB8_1 TRUE 0.991 2.000 0.455 NA Y NA
 896900 896901 RF_0464 RF_0465   virB8_2 TRUE 0.894 50.000 0.316 NA   NA
 896901 896902 RF_0465 RF_0466 virB8_2 virB9_2 TRUE 0.980 -13.000 0.421 NA   NA
 896902 896903 RF_0466 RF_0467 virB9_2 virB10 TRUE 0.842 95.000 0.421 NA   NA
 896903 896904 RF_0467 RF_0468 virB10 virB11 TRUE 0.993 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 896904 896905 RF_0468 RF_0469 virB11 virD4 TRUE 0.588 321.000 0.405 1.000 Y NA
 896905 896906 RF_0469 RF_0470 virD4 gppA TRUE 0.959 10.000 0.054 1.000 N NA
 896906 896907 RF_0470 RF_0471 gppA   FALSE 0.059 399.000 0.000 1.000   NA
 896907 896908 RF_0471 RF_0472     TRUE 0.934 -3.000 0.022 NA   NA
 896908 896909 RF_0472 RF_0473     FALSE 0.457 192.000 0.000 NA   NA
 896909 896910 RF_0473 RF_0474     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 896910 896911 RF_0474 RF_0475     TRUE 0.844 -31.000 0.000 NA   NA
 896911 896912 RF_0475 RF_0476     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 896912 896913 RF_0476 RF_0477     FALSE 0.460 135.000 0.000 NA   NA
 896913 896914 RF_0477 RF_0478     FALSE 0.508 156.000 0.000 NA   NA
 896916 896917 RF_0480 RF_0481     TRUE 0.990 -16.000 0.875 NA   NA
 896917 896918 RF_0481 RF_0482   cysQ FALSE 0.443 229.000 0.048 NA   NA
 896919 896920 RF_0483 RF_0484 mutS   TRUE 0.533 60.000 0.000 NA   NA
 896920 896921 RF_0484 RF_0485     TRUE 0.831 -48.000 0.000 NA   NA
 896921 896922 RF_0485 RF_0486   lacA TRUE 0.601 67.000 0.000 1.000   NA
 896923 896924 RF_0487 RF_0488 nlpD1   TRUE 0.902 1.000 0.009 NA   NA
 896924 896925 RF_0488 RF_0489     TRUE 0.768 19.000 0.000 NA   NA
 896925 896926 RF_0489 RF_0490     TRUE 0.987 6.000 0.681 NA   NA
 896926 896927 RF_0490 RF_0491   thyX TRUE 0.769 18.000 0.005 NA   NA
 896927 896928 RF_0491 RF_0492 thyX tolB TRUE 0.652 195.000 0.014 1.000 N NA
 896932 896933 RF_0496 RF_0497 trmU atrC1 TRUE 0.736 169.000 0.014 1.000 N NA
 896933 896934 RF_0497 RF_0498 atrC1 hisS FALSE 0.214 288.000 0.008 1.000 N NA
 896934 896935 RF_0498 RF_0499 hisS   TRUE 0.629 64.000 0.000 1.000   NA
 896935 896936 RF_0499 RF_0500     TRUE 0.847 67.000 0.000 0.015   NA
 896937 896938 RF_0501 RF_0502     FALSE 0.493 144.000 0.000 NA   NA
 896938 896939 RF_0502 RF_0503     FALSE 0.010 740.000 0.000 NA   NA
 896940 896941 RF_0504 RF_0505 tolQ tolR TRUE 0.992 0.000 0.059 0.047 Y NA
 896941 896942 RF_0505 RF_0506 tolR   TRUE 0.972 -10.000 0.240 NA   NA
 896945 896946 RF_0509 RF_0510 proP2 aprE TRUE 0.929 140.000 0.273 0.079   NA
 896946 896947 RF_0510 RF_0511 aprE aprD TRUE 0.938 202.000 0.267 0.008   NA
 896947 896948 RF_0511 RF_0512 aprD asd TRUE 0.910 11.000 0.011 1.000   NA
 896948 896949 RF_0512 RF_0513 asd pkcI TRUE 0.950 -3.000 0.012 1.000 N NA
 896949 896950 RF_0513 RF_0514 pkcI   FALSE 0.501 135.000 0.010 NA   NA
 896951 896952 RF_0515 RF_0516 hslV hslU TRUE 0.996 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 896952 896953 RF_0516 RF_0517 hslU   TRUE 0.531 163.000 0.000 NA   NA
 896953 896954 RF_0517 RF_0518     FALSE 0.495 146.000 0.000 NA   NA
 896954 896955 RF_0518 RF_0519   lpxB TRUE 0.625 190.000 0.000 1.000 N NA
 896957 896958 RF_0521 RF_0522   cyaY TRUE 0.540 140.000 0.012 NA   NA
 896958 896959 RF_0522 RF_0523 cyaY   TRUE 0.904 -3.000 0.008 NA   NA
 896959 896960 RF_0523 RF_0524     FALSE 0.167 259.000 0.000 NA   NA
 896960 896961 RF_0524 RF_0525     TRUE 0.979 -13.000 0.375 NA   NA
 896961 896962 RF_0525 RF_0526   bioY1 FALSE 0.441 128.000 0.000 NA   NA
 896962 896963 RF_0526 RF_0527 bioY1 bioB TRUE 0.853 10.000 0.000 NA   NA
 896963 896964 RF_0527 RF_0528 bioB   FALSE 0.356 213.000 0.000 NA   NA
 896965 896966 RF_0529 RF_0530 gltX1 topA TRUE 0.636 188.000 0.007 1.000 N NA
 896966 896967 RF_0530 RF_0531 topA dprA TRUE 0.892 200.000 0.238 1.000 Y NA
 896967 896968 RF_0531 RF_0532 dprA tdpX1 TRUE 0.673 171.000 0.003 1.000 N NA
 896968 896969 RF_0532 RF_0533 tdpX1 hflC1 TRUE 0.765 76.000 0.014 1.000 Y NA
 896969 896970 RF_0533 RF_0534 hflC1   FALSE 0.078 371.000 0.000 1.000   NA
 896971 896972 RF_0535 RF_0536     FALSE 0.200 279.000 0.000 1.000   NA
 896972 896973 RF_0536 RF_0537     FALSE 0.434 88.000 0.000 NA   NA
 896973 896974 RF_0537 RF_0538     FALSE 0.428 97.000 0.000 NA   NA
 896974 896975 RF_0538 RF_0539   capD TRUE 0.948 199.000 0.271 0.003   NA
 896975 896976 RF_0539 RF_0540 capD rffE TRUE 0.976 -7.000 0.148 1.000   NA
 896976 896977 RF_0540 RF_0541 rffE   TRUE 0.837 -40.000 0.000 NA   NA
 896977 896978 RF_0541 RF_0542     FALSE 0.013 607.000 0.000 NA   NA
 896978 896979 RF_0542 RF_0543     FALSE 0.026 447.000 0.000 NA   NA
 896980 896981 RF_0544 RF_0545     FALSE 0.144 436.000 0.312 NA   NA
 896981 896982 RF_0545 RF_0546     TRUE 0.954 10.000 0.129 NA   NA
 896984 896985 RF_0548 RF_0549   rpsD FALSE 0.014 1209.000 0.000 1.000 N NA
 896992 896993 RF_0556 RF_0557   xseB TRUE 0.824 14.000 0.007 NA   NA
 896993 896994 RF_0557 RF_0558 xseB   FALSE 0.467 73.000 0.000 NA   NA
 896994 896995 RF_0558 RF_0559     TRUE 0.709 27.000 0.000 NA   NA
 896996 896997 RF_0560 RF_0561 mpg   TRUE 0.894 -7.000 0.008 NA   NA
 896997 896998 RF_0561 RF_0562     TRUE 0.869 4.000 0.002 NA   NA
 896998 896999 RF_0562 RF_0563   nuoE FALSE 0.439 109.000 0.007 NA   NA
 896999 897000 RF_0563 RF_0564 nuoE nuoD TRUE 0.980 176.000 0.355 0.008 Y NA
 897000 897001 RF_0564 RF_0565 nuoD nuoC TRUE 0.976 138.000 0.483 0.016 Y NA
 897001 897002 RF_0565 RF_0566 nuoC nuoB TRUE 0.996 -22.000 0.328 0.006 Y NA
 897002 897003 RF_0566 RF_0567 nuoB nuoA TRUE 0.998 5.000 0.507 0.006 Y NA
 897003 897004 RF_0567 RF_0568 nuoA   TRUE 0.698 152.000 0.031 NA N NA
 897004 897005 RF_0568 RF_0569     TRUE 0.958 1.000 0.066 NA   NA
 897006 897007 RF_0570 RF_RNA15     FALSE 0.099 308.000 0.000 NA   NA
 897007 897008 RF_RNA15 RF_0571   xerD TRUE 0.752 21.000 0.000 NA   NA
 897008 897009 RF_0571 RF_0572 xerD   FALSE 0.465 83.000 0.008 NA   NA
 897009 897010 RF_0572 RF_0573     TRUE 0.877 112.000 0.571 NA   NA
 897010 897011 RF_0573 RF_0574     TRUE 0.550 57.000 0.000 NA   NA
 897013 897014 RF_0576 RF_0577 cutE   TRUE 0.706 133.000 0.037 1.000   NA
 897014 897015 RF_0577 RF_0578     FALSE 0.007 1244.000 0.000 NA   NA
 897015 897016 RF_0578 RF_0579     TRUE 0.985 5.000 0.545 NA   NA
 897017 897018 RF_0580 RF_0581   dsbB TRUE 0.523 160.000 0.000 NA   NA
 897019 897020 RF_0582 RF_0583 lysS   FALSE 0.284 278.000 0.021 1.000   NA
 897020 897021 RF_0583 RF_0584   tme TRUE 0.816 178.000 0.071 1.000   NA
 897021 897022 RF_0584 RF_0585 tme   FALSE 0.422 221.000 0.000 1.000   NA
 897022 897023 RF_0585 RF_0586   proP3 FALSE 0.251 252.000 0.000 1.000   NA
 897024 897025 RF_0587 RF_0588     TRUE 0.792 75.000 0.000 0.041   NA
 897025 897026 RF_0588 RF_0589     FALSE 0.512 182.000 0.000 NA   NA
 897026 897027 RF_0589 RF_0590   mdh FALSE 0.451 133.000 0.000 NA   NA
 897029 897030 RF_0592 RF_0593 tlc2 pyrG FALSE 0.123 439.000 0.000 0.045 N NA
 897030 897031 RF_0593 RF_0594 pyrG kdsB TRUE 0.947 7.000 0.019 1.000 N NA
 897032 897033 RF_RNA16 RF_RNA17     TRUE 0.821 14.000 0.000 NA   NA
 897035 897036 RF_0596 RF_0597     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 897036 897037 RF_0597 RF_0598     FALSE 0.509 65.000 0.000 NA   NA
 897037 897038 RF_0598 RF_0599   folE TRUE 0.972 -7.000 0.092 1.000   NA
 897038 897039 RF_0599 RF_0600 folE proS TRUE 0.865 172.000 0.008 0.046 N NA
 897039 897040 RF_0600 RF_0601 proS   FALSE 0.491 64.000 0.002 NA   NA
 897040 897041 RF_0601 RF_0602     TRUE 0.889 143.000 0.500 NA   NA
 897041 897042 RF_0602 RF_0603     TRUE 0.726 25.000 0.000 NA   NA
 897042 897043 RF_0603 RF_0604   ruvA FALSE 0.515 157.000 0.007 NA   NA
 897043 897044 RF_0604 RF_0605 ruvA   TRUE 0.538 99.000 0.000 1.000   NA
 897044 897045 RF_0605 RF_0606   ruvB TRUE 0.617 63.000 0.004 1.000   NA
 897045 897046 RF_0606 RF_0607 ruvB msbA1 TRUE 0.937 -7.000 0.007 1.000 N NA
 897046 897047 RF_0607 RF_0608 msbA1 ampG4 TRUE 0.851 176.000 0.010 0.045   NA
 897047 897048 RF_0608 RF_0609 ampG4 dacF TRUE 0.918 191.000 0.625 1.000   NA
 897049 897050 RF_0610 RF_0611   rlpA TRUE 0.652 39.000 0.000 NA   NA
 897050 897051 RF_0611 RF_0612 rlpA   TRUE 0.921 -22.000 0.029 NA   NA
 897051 897052 RF_0612 RF_0613   ispZ FALSE 0.112 319.000 0.014 NA   NA
 897052 897053 RF_0613 RF_0614 ispZ   TRUE 0.873 30.000 0.027 1.000 N NA
 897053 897054 RF_0614 RF_0615     TRUE 0.983 10.000 0.629 NA   NA
 897054 897055 RF_0615 RF_0616     FALSE 0.373 211.000 0.000 NA   NA
 897056 897057 RF_0617 RF_0618   tlpA TRUE 0.669 206.000 0.026 1.000 N NA
 897057 897058 RF_0618 RF_0619 tlpA sppA1 TRUE 0.848 148.000 0.042 1.000 Y NA
 897058 897059 RF_0619 RF_0620 sppA1 dut TRUE 0.941 2.000 0.008 1.000 N NA
 897059 897060 RF_0620 RF_0621 dut mltE1 TRUE 0.658 157.000 0.006 1.000 N NA
 897060 897061 RF_0621 RF_0622 mltE1   TRUE 0.632 76.000 0.041 NA   NA
 897061 897062 RF_0622 RF_0623   mccF FALSE 0.157 502.000 0.571 NA   NA
 897065 897066 RF_0626 RF_0627   coxA TRUE 0.653 185.000 0.012 1.000   NA
 897066 897067 RF_0627 RF_0628 coxA   FALSE 0.179 250.000 0.000 NA   NA
 897067 897068 RF_0628 RF_0629   coxB FALSE 0.025 451.000 0.000 NA   NA
 897068 897069 RF_0629 RF_0630 coxB tagD TRUE 0.593 84.000 0.000 1.000 N NA
 897070 897071 RF_0631 RF_0632 nlpD2 lspA TRUE 0.971 29.000 0.031 0.028 Y NA
 897071 897072 RF_0632 RF_0633 lspA   TRUE 0.709 143.000 0.054 NA   NA
 897072 897073 RF_0633 RF_0634   murD FALSE 0.465 136.000 0.006 NA   NA
 897073 897074 RF_0634 RF_0635 murD ftsW TRUE 0.972 60.000 0.297 0.002 N NA
 897074 897075 RF_0635 RF_0636 ftsW murG TRUE 0.992 -3.000 0.647 1.000 N NA
 897075 897076 RF_0636 RF_0637 murG   FALSE 0.182 249.000 0.000 NA   NA
 897076 897077 RF_0637 RF_0638     FALSE 0.026 448.000 0.000 NA   NA
 897078 897079 RF_0639 RF_0640     TRUE 0.847 -30.000 0.000 NA   NA
 897079 897080 RF_0640 RF_0641     TRUE 0.782 18.000 0.000 NA   NA
 897080 897081 RF_0641 RF_0642   mfp FALSE 0.495 147.000 0.000 NA   NA
 897081 897082 RF_0642 RF_0643 mfp   TRUE 0.885 157.000 0.000 0.055 Y NA
 897082 897083 RF_0643 RF_0644     TRUE 0.659 211.000 0.000 1.000 Y NA
 897084 897085 RF_0645 RF_0646 dapF   TRUE 0.968 -25.000 0.109 1.000 N NA
 897085 897086 RF_0646 RF_0647   pheS TRUE 0.521 230.000 0.007 1.000 Y NA
 897086 897087 RF_0647 RF_0648 pheS pheT TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.002 Y NA
 897087 897088 RF_0648 RF_0649 pheT dnaN TRUE 0.945 5.000 0.015 1.000 N NA
 897088 897089 RF_0649 RF_0650 dnaN   FALSE 0.419 193.000 0.002 NA   NA
 897089 897090 RF_0650 RF_0651   leuS TRUE 0.677 191.000 0.051 NA   NA
 897091 897092 RF_0652 RF_0653   rnd2 TRUE 0.518 158.000 0.000 NA   NA
 897092 897093 RF_0653 RF_0654 rnd2   TRUE 0.576 207.000 0.015 1.000   NA
 897093 897094 RF_0654 RF_0655   cdsA TRUE 0.621 109.000 0.011 1.000 N NA
 897094 897095 RF_0655 RF_0656 cdsA uppS TRUE 0.988 -40.000 0.400 1.000 Y NA
 897095 897096 RF_0656 RF_0657 uppS envZ TRUE 0.585 114.000 0.006 1.000 N NA
 897096 897097 RF_0657 RF_0658 envZ ompR TRUE 0.992 -25.000 0.592 1.000 Y NA
 897098 897099 RF_0659 RF_0660 ilvE dapA TRUE 0.884 148.000 0.087 1.000 Y NA
 897099 897100 RF_0660 RF_0661 dapA smpB TRUE 0.943 -3.000 0.008 1.000 N NA
 897100 897101 RF_0661 RF_0662 smpB dsbA TRUE 0.772 155.000 0.007 1.000 Y NA
 897102 897103 RF_0663 RF_0664   sucD FALSE 0.011 688.000 0.000 NA   NA
 897103 897104 RF_0664 RF_0665 sucD sucC TRUE 0.956 214.000 0.256 0.002 Y NA
 897104 897105 RF_0665 RF_0666 sucC   FALSE 0.466 238.000 0.000 1.000 Y NA
 897105 897106 RF_0666 RF_0667     TRUE 0.699 103.000 0.028 1.000 N NA
 897106 897107 RF_0667 RF_0668     TRUE 0.646 131.000 0.018 1.000   NA
 897107 897108 RF_0668 RF_0669   rbfA FALSE 0.108 333.000 0.000 1.000   NA
 897108 897109 RF_0669 RF_0670 rbfA   TRUE 0.886 4.000 0.007 NA   NA
 897110 897111 RF_0671 RF_0672   recR TRUE 0.530 60.000 0.006 NA   NA
 897111 897112 RF_0672 RF_0673 recR   TRUE 0.528 84.000 0.003 1.000   NA
 897113 897114 RF_0674 RF_0675   ppnK FALSE 0.081 322.000 0.000 NA   NA
 897115 897116 RF_0676 RF_0677   gpsA TRUE 0.737 155.000 0.029 1.000   NA
 897118 897119 RF_0679 RF_0680     TRUE 0.841 59.000 0.096 1.000   NA
 897119 897120 RF_0680 RF_0681   trxB1 FALSE 0.434 220.000 0.007 1.000   NA
 897120 897121 RF_0681 RF_0682 trxB1   FALSE 0.437 123.000 0.000 NA   NA
 897121 897122 RF_0682 RF_0683     TRUE 0.833 58.000 0.182 NA   NA
 897122 897123 RF_0683 RF_0684   gabD TRUE 0.540 166.000 0.000 NA   NA
 897123 897124 RF_0684 RF_0685 gabD   FALSE 0.077 401.000 0.040 NA   NA
 897124 897125 RF_0685 RF_0686   lgtD TRUE 0.969 -10.000 0.182 NA   NA
 897125 897126 RF_0686 RF_0687 lgtD uvrD TRUE 0.626 180.000 0.012 NA N NA
 897126 897127 RF_0687 RF_0688 uvrD   FALSE 0.431 91.000 0.000 NA   NA
 897127 897128 RF_0688 RF_0689     TRUE 0.864 88.000 0.500 NA   NA
 897128 897129 RF_0689 RF_0690     FALSE 0.025 449.000 0.000 NA   NA
 897131 897132 RF_0692 RF_0693 lon sca3 FALSE 0.043 435.000 0.000 1.000   NA
 897132 897133 RF_0693 RF_0694 sca3   FALSE 0.059 350.000 0.000 NA   NA
 897134 897135 RF_0695 RF_RNA18     FALSE 0.008 947.000 0.000 NA   NA
 897136 897137 RF_0696 RF_0697   yhbH TRUE 0.553 119.000 0.020 NA   NA
 897137 897138 RF_0697 RF_0698 yhbH paaY TRUE 0.917 0.000 0.013 NA   NA
 897139 897140 RF_0699 RF_0700 folD trxB2 TRUE 0.704 127.000 0.026 1.000 N NA
 897140 897141 RF_0700 RF_0701 trxB2   TRUE 0.797 52.000 0.074 NA   NA
 897141 897142 RF_0701 RF_0702     TRUE 0.967 -13.000 0.182 NA   NA
 897143 897144 RF_0703 RF_0704     TRUE 0.988 5.000 0.750 NA   NA
 897144 897145 RF_0704 RF_0705     TRUE 0.863 112.000 0.500 NA   NA
 897145 897146 RF_0705 RF_0706     TRUE 0.611 45.000 0.000 NA   NA
 897146 897147 RF_0706 RF_0707     TRUE 0.883 -9.000 0.000 NA   NA
 897147 897148 RF_0707 RF_0708     FALSE 0.040 397.000 0.000 NA   NA
 897148 897149 RF_0708 RF_0709   nrdA FALSE 0.046 423.000 0.000 1.000   NA
 897149 897150 RF_0709 RF_0710 nrdA nrdB TRUE 0.975 166.000 0.161 0.002 Y NA
 897150 897151 RF_0710 RF_0711 nrdB   TRUE 0.715 188.000 0.065 NA   NA
 897151 897152 RF_0711 RF_0712     FALSE 0.296 223.000 0.000 NA   NA
 897152 897153 RF_0712 RF_0713     FALSE 0.443 79.000 0.000 NA   NA
 897154 897155 RF_0714 RF_0715 miaA   FALSE 0.356 213.000 0.000 NA   NA
 897155 897156 RF_0715 RF_0716   exoC FALSE 0.443 79.000 0.000 NA   NA
 897156 897157 RF_0716 RF_0717 exoC abcT2 TRUE 0.627 142.000 0.009 1.000   NA
 897157 897158 RF_0717 RF_0718 abcT2   TRUE 0.909 161.000 0.543 NA   NA
 897158 897159 RF_0718 RF_0719     TRUE 0.952 -34.000 0.144 NA   NA
 897159 897160 RF_0719 RF_0720   kpsF TRUE 0.959 6.000 0.115 NA   NA
 897160 897161 RF_0720 RF_0721 kpsF pnp TRUE 0.575 101.000 0.006 1.000 N NA
 897161 897162 RF_0721 RF_0722 pnp rpsO TRUE 0.932 142.000 0.335 1.000 Y NA
 897162 897163 RF_0722 RF_0723 rpsO truB TRUE 0.969 22.000 0.211 1.000 Y NA
 897164 897165 RF_0724 RF_0725 tlc4 sca4 FALSE 0.508 156.000 0.000 NA   NA
 897169 897170 RF_0729 RF_0730   def2 TRUE 0.521 172.000 0.004 NA   NA
 897170 897171 RF_0730 RF_0731 def2   FALSE 0.322 225.000 0.000 NA N NA
 897171 897172 RF_0731 RF_0732     TRUE 0.973 4.000 0.250 NA   NA
 897173 897174 RF_0733 RF_0734 addA   FALSE 0.015 551.000 0.000 NA   NA
 897174 897175 RF_0734 RF_0735   ppdK FALSE 0.427 200.000 0.000 NA   NA
 897176 897177 RF_RNA19 RF_0736     FALSE 0.076 329.000 0.000 NA   NA
 897178 897179 RF_0737 RF_0738     TRUE 0.698 172.000 0.029 NA   NA
 897180 897181 RF_0739 RF_0740 bioY2 folC FALSE 0.280 223.000 0.004 NA   NA
 897181 897182 RF_0740 RF_0741 folC sodB TRUE 0.636 91.000 0.013 1.000 N NA
 897182 897183 RF_0741 RF_0742 sodB   TRUE 0.918 5.000 0.007 1.000   NA
 897183 897184 RF_0742 RF_0743     TRUE 0.826 109.000 0.000 0.006   NA
 897184 897185 RF_0743 RF_0744   birA TRUE 0.545 88.000 0.000 1.000   NA
 897185 897186 RF_0744 RF_0745 birA   FALSE 0.440 83.000 0.000 NA   NA
 897186 897187 RF_0745 RF_0746     FALSE 0.319 221.000 0.000 NA   NA
 897187 897188 RF_0746 RF_0747     FALSE 0.435 121.000 0.000 NA   NA
 897188 897189 RF_0747 RF_0748     TRUE 0.861 -21.000 0.000 NA   NA
 897189 897190 RF_0748 RF_0749     FALSE 0.138 279.000 0.000 NA   NA
 897190 897191 RF_0749 RF_0750     TRUE 0.835 -42.000 0.000 NA   NA
 897191 897192 RF_0750 RF_0751     FALSE 0.438 124.000 0.000 NA   NA
 897192 897193 RF_0751 RF_0752     FALSE 0.443 129.000 0.000 NA   NA
 897193 897194 RF_0752 RF_0753     TRUE 0.985 2.000 0.500 NA   NA
 897194 897195 RF_0753 RF_0754     TRUE 0.874 -13.000 0.000 NA   NA
 897195 897196 RF_0754 RF_0755     TRUE 0.801 16.000 0.000 NA   NA
 897196 897197 RF_0755 RF_0756     TRUE 0.950 16.000 0.240 NA   NA
 897197 897198 RF_0756 RF_0757     TRUE 0.561 223.000 0.080 NA   NA
 897198 897199 RF_0757 RF_0758     TRUE 0.984 4.000 0.500 NA   NA
 897199 897200 RF_0758 RF_0759     TRUE 0.968 -13.000 0.194 NA   NA
 897200 897201 RF_0759 RF_0760   infC TRUE 0.530 178.000 0.007 NA   NA
 897201 897202 RF_0760 RF_0761 infC pdhC TRUE 0.623 188.000 0.005 1.000 N NA
 897202 897203 RF_0761 RF_0762 pdhC prfA TRUE 0.678 171.000 0.005 1.000 N NA
 897203 897204 RF_0762 RF_0763 prfA recJ FALSE 0.487 214.000 0.005 1.000 N NA
 897204 897205 RF_0763 RF_0764 recJ   FALSE 0.269 256.000 0.005 1.000 N NA
 897205 897206 RF_0764 RF_0765   rho FALSE 0.026 587.000 0.000 1.000 N NA
 897206 897207 RF_0765 RF_0766 rho sppA2 TRUE 0.588 131.000 0.005 1.000 N NA
 897207 897208 RF_0766 RF_0767 sppA2 himD TRUE 0.971 3.000 0.142 NA N NA
 897208 897209 RF_0767 RF_0768 himD   TRUE 0.864 8.000 0.006 NA   NA
 897209 897210 RF_0768 RF_0769     FALSE 0.150 272.000 0.000 NA   NA
 897212 897213 RF_0770 RF_0771 cmk rpsA TRUE 0.820 212.000 0.281 1.000 N NA
 897213 897214 RF_0771 RF_0772 rpsA clpP FALSE 0.334 243.000 0.009 1.000 N NA
 897214 897215 RF_0772 RF_RNA21 clpP   FALSE 0.032 417.000 0.000 NA   NA
 897215 897216 RF_RNA21 RF_0773     TRUE 0.535 164.000 0.000 NA   NA
 897218 897219 RF_0775 RF_0776     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 897219 897220 RF_0776 RF_0777     TRUE 0.521 180.000 0.000 NA   NA
 897220 897221 RF_0777 RF_0778     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 897221 897222 RF_0778 RF_0779     FALSE 0.472 190.000 0.000 NA   NA
 897222 897223 RF_0779 RF_0780     FALSE 0.030 426.000 0.000 NA   NA
 897223 897224 RF_0780 RF_0781     FALSE 0.070 340.000 0.000 NA   NA
 897225 897226 RF_0782 RF_0783     TRUE 0.860 9.000 0.000 NA   NA
 897226 897227 RF_0783 RF_0784     TRUE 0.791 17.000 0.000 NA   NA
 897229 897230 RF_0786 RF_0787 traC   FALSE 0.043 390.000 0.000 NA   NA
 897230 897231 RF_0787 RF_0788     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 897231 897232 RF_0788 RF_0789     FALSE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 897232 897233 RF_0789 RF_0790     TRUE 0.853 10.000 0.000 NA   NA
 897235 897236 RF_0792 RF_0793     TRUE 0.863 -19.000 0.000 NA   NA
 897236 897237 RF_0793 RF_0794     TRUE 0.538 165.000 0.000 NA   NA
 897237 897238 RF_0794 RF_0795     FALSE 0.016 529.000 0.000 NA   NA
 897238 897239 RF_0795 RF_0796     TRUE 0.978 8.000 0.000 0.003   NA
 897239 897240 RF_0796 RF_0797     FALSE 0.441 82.000 0.000 NA   NA
 897240 897241 RF_0797 RF_RNA22     TRUE 0.814 -81.000 0.000 NA   NA
 897241 897242 RF_RNA22 RF_0798   glmU FALSE 0.189 246.000 0.000 NA   NA
 897242 897243 RF_0798 RF_0799 glmU   TRUE 0.900 -3.000 0.008 NA   NA
 897243 897244 RF_0799 RF_0800   rpmJ TRUE 0.617 139.000 0.024 NA   NA
 897245 897246 RF_0801 RF_0802     FALSE 0.079 325.000 0.000 NA   NA
 897246 897247 RF_0802 RF_0803   mltE2 FALSE 0.429 109.000 0.000 NA   NA
 897247 897248 RF_0803 RF_0804 mltE2   TRUE 0.963 6.000 0.146 NA   NA
 897248 897249 RF_0804 RF_0805     TRUE 0.849 183.000 0.286 NA   NA
 897249 897250 RF_0805 RF_0806   bioC FALSE 0.490 71.000 0.008 NA   NA
 897250 897251 RF_0806 RF_0807 bioC lpdA2 FALSE 0.263 262.000 0.012 1.000   NA
 897251 897252 RF_0807 RF_0808 lpdA2   FALSE 0.401 225.000 0.004 1.000 N NA
 897253 897254 RF_0809 RF_0810 rnd   TRUE 0.891 10.000 0.015 NA   NA
 897255 897256 RF_0811 RF_0812 gcvT   FALSE 0.443 129.000 0.000 NA   NA
 897256 897257 RF_0812 RF_0813     TRUE 0.979 -100.000 0.667 NA   NA
 897257 897258 RF_0813 RF_0814     FALSE 0.064 344.000 0.000 NA   NA
 897258 897259 RF_0814 RF_0815     TRUE 0.897 41.000 0.000 0.051 N NA
 897259 897260 RF_0815 RF_0816   mccF2 TRUE 0.523 137.000 0.000 NA N NA
 897260 897261 RF_0816 RF_0817 mccF2 hemC TRUE 0.904 -3.000 0.003 NA N NA
 897261 897262 RF_0817 RF_0818 hemC   FALSE 0.476 65.000 0.002 NA   NA
 897262 897263 RF_0818 RF_0819     FALSE 0.429 110.000 0.000 NA   NA
 897264 897265 RF_0820 RF_0821     TRUE 0.837 -40.000 0.000 NA   NA
 897266 897267 RF_0822 RF_0823     FALSE 0.428 97.000 0.000 NA   NA
 897268 897269 RF_RNA23 RF_0824   trpS TRUE 0.533 60.000 0.000 NA   NA
 897270 897271 RF_0825 RF_0826 plsC   TRUE 0.829 53.000 0.092 NA N NA
 897274 897275 RF_0829 RF_0830     TRUE 0.941 -7.000 0.036 NA   NA
 897275 897276 RF_0830 RF_0831     TRUE 0.936 -16.000 0.045 NA   NA
 897276 897277 RF_0831 RF_0832   lysE TRUE 0.926 -52.000 0.026 1.000   NA
 897277 897278 RF_0832 RF_0833 lysE   TRUE 0.891 1.000 0.000 NA   NA
 897278 897279 RF_0833 RF_0834   ampG1 TRUE 0.535 176.000 0.000 NA   NA
 897279 897280 RF_0834 RF_0835 ampG1   TRUE 0.872 6.000 0.000 NA   NA
 897281 897282 RF_0836 RF_0837 rfaJ tlc3 TRUE 0.937 69.000 0.667 1.000 N NA
 897282 897283 RF_0837 RF_0838 tlc3   TRUE 0.902 99.000 0.778 NA   NA
 897283 897284 RF_0838 RF_0839   ispB FALSE 0.511 122.000 0.014 NA   NA
 897284 897285 RF_0839 RF_RNA24 ispB   TRUE 0.635 42.000 0.000 NA   NA
 897286 897287 RF_RNA25 RF_0840   pepP TRUE 0.599 47.000 0.000 NA   NA
 897287 897288 RF_0840 RF_0841 pepP potE TRUE 0.911 176.000 0.136 1.000 Y NA
 897288 897289 RF_0841 RF_0842 potE   FALSE 0.021 481.000 0.000 NA   NA
 897289 897290 RF_0842 RF_0843   iscA2 TRUE 0.537 73.000 0.013 NA   NA
 897290 897291 RF_0843 RF_0844 iscA2 iscU TRUE 0.950 4.000 0.056 NA   NA
 897291 897292 RF_0844 RF_0845 iscU iscS TRUE 0.906 137.000 0.448 1.000 N NA
 897292 897293 RF_0845 RF_0846 iscS spl1 TRUE 0.958 144.000 0.052 0.002 Y NA
 897293 897294 RF_0846 RF_0847 spl1 iscR TRUE 0.981 -3.000 0.168 1.000 N NA
 897294 897295 RF_0847 RF_0848 iscR   FALSE 0.043 391.000 0.000 NA   NA
 897295 897296 RF_0848 RF_0849     TRUE 0.921 25.000 0.200 NA   NA
 897296 897297 RF_0849 RF_0850     FALSE 0.008 837.000 0.000 NA   NA
 897297 897298 RF_0850 RF_0851     FALSE 0.492 270.000 0.000 0.022   NA
 897302 897303 RF_0855 RF_0856   hemB TRUE 0.579 188.000 0.017 NA   NA
 897306 897307 RF_0859 RF_0860 ubiX dnaB FALSE 0.303 246.000 0.000 1.000 N NA
 897308 897309 RF_0861 RF_0862     TRUE 0.699 29.000 0.000 NA   NA
 897310 897311 RF_0863 RF_0864 rluA2   TRUE 0.733 51.000 0.034 NA   NA
 897311 897312 RF_0864 RF_0865     TRUE 0.863 5.000 0.003 NA   NA
 897312 897313 RF_0865 RF_0866   radA TRUE 0.571 127.000 0.002 1.000 N NA
 897313 897314 RF_0866 RF_0867 radA   TRUE 0.894 -3.000 0.007 NA   NA
 897314 897315 RF_0867 RF_0868   recO FALSE 0.446 92.000 0.008 NA   NA
 897315 897316 RF_0868 RF_0869 recO   FALSE 0.030 528.000 0.000 1.000 N NA
 897317 897318 RF_0870 RF_0871   infB FALSE 0.017 521.000 0.000 NA   NA
 897318 897319 RF_0871 RF_0872 infB nusA TRUE 0.562 288.000 0.342 1.000 N NA
 897319 897320 RF_0872 RF_0873 nusA   TRUE 0.985 11.000 0.759 NA   NA
 897320 897321 RF_0873 RF_0874     FALSE 0.409 127.000 0.002 NA   NA
 897323 897324 RF_0876 RF_0877 tlyA tyrS TRUE 0.915 159.000 0.008 0.024 Y NA
 897325 897326 RF_0878 RF_0879     FALSE 0.009 812.000 0.000 NA   NA
 897327 897328 RF_0880 RF_0881     TRUE 0.804 75.000 0.000 0.037   NA
 897328 897329 RF_0881 RF_0882     FALSE 0.394 208.000 0.000 NA   NA
 897329 897330 RF_0882 RF_0883     TRUE 0.565 53.000 0.000 NA   NA
 897332 897333 RF_0885 RF_0886 proP8   FALSE 0.511 206.000 0.000 1.000   NA
 897335 897336 RF_0888 RF_0889     TRUE 0.972 3.000 0.200 NA   NA
 897336 897337 RF_0889 RF_0890   fadB FALSE 0.427 105.000 0.000 NA   NA
 897337 897338 RF_0890 RF_0891 fadB comF FALSE 0.018 505.000 0.000 NA   NA
 897338 897339 RF_0891 RF_0892 comF   FALSE 0.057 351.000 0.000 NA   NA
 897339 897340 RF_0892 RF_0893   ubiH FALSE 0.092 314.000 0.000 NA   NA
 897340 897341 RF_0893 RF_0894 ubiH   TRUE 0.958 -28.000 0.057 1.000 N NA
 897342 897343 RF_0895 RF_0896 ntrX   TRUE 0.909 -31.000 0.027 NA   NA
 897344 897345 RF_0897 RF_0898     FALSE 0.095 312.000 0.000 NA   NA
 897345 897346 RF_0898 RF_0899     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 897346 897347 RF_0899 RF_0900   pbpA1 TRUE 0.542 91.000 0.000 1.000   NA
 897347 897348 RF_0900 RF_0901 pbpA1   TRUE 0.959 -10.000 0.091 NA   NA
 897348 897349 RF_0901 RF_0902   pbpA2 FALSE 0.011 675.000 0.000 NA   NA
 897349 897350 RF_0902 RF_0903 pbpA2 ftsL TRUE 0.687 130.000 0.065 NA   NA
 897350 897351 RF_0903 RF_0904 ftsL mraW TRUE 0.787 59.000 0.089 NA   NA
 897351 897352 RF_0904 RF_0905 mraW mraZ TRUE 0.988 0.000 0.635 NA   NA
 897354 897355 RF_0907 RF_0908     TRUE 0.921 126.000 0.075 0.003   NA
 897355 897356 RF_0908 RF_0909     TRUE 0.858 -22.000 0.000 NA   NA
 897357 897358 RF_0910 RF_0911     TRUE 0.988 -9.000 0.681 NA   NA
 897359 897360 RF_0912 RF_0913 uvrC   FALSE 0.437 129.000 0.006 NA   NA
 897360 897361 RF_0913 RF_0914     TRUE 0.668 191.000 0.048 NA   NA
 897361 897362 RF_0914 RF_0915     FALSE 0.032 416.000 0.000 NA   NA
 897362 897363 RF_0915 RF_0916   dat TRUE 0.911 90.000 0.030 0.001 N NA
 897365 897366 RF_0918 RF_0919     TRUE 0.862 195.000 0.000 0.001   NA
 897367 897368 RF_0920 RF_0921     TRUE 0.804 75.000 0.000 0.037   NA
 897368 897369 RF_0921 RF_0922     TRUE 0.628 43.000 0.000 NA   NA
 897370 897371 RF_0923 RF_0924     FALSE 0.238 231.000 0.000 NA   NA
 897371 897372 RF_0924 RF_RNA26     FALSE 0.169 257.000 0.000 NA   NA
 897374 897375 RF_0926 RF_0927     TRUE 0.806 75.000 0.000 0.036   NA
 897376 897377 RF_0928 RF_0929     FALSE 0.039 398.000 0.000 NA   NA
 897377 897378 RF_0929 RF_0930     FALSE 0.011 658.000 0.000 NA   NA
 897378 897379 RF_0930 RF_0931     TRUE 0.806 75.000 0.000 0.036   NA
 897380 897381 RF_0932 RF_0933     FALSE 0.119 288.000 0.000 NA   NA
 897381 897382 RF_0933 RF_0934     TRUE 0.582 50.000 0.000 NA   NA
 897382 897383 RF_0934 RF_0935     FALSE 0.015 585.000 0.000 NA   NA
 897383 897384 RF_0935 RF_0936     FALSE 0.334 217.000 0.000 NA   NA
 897384 897385 RF_0936 RF_0937     TRUE 0.535 164.000 0.000 NA   NA
 897385 897386 RF_0937 RF_RNA27     FALSE 0.020 492.000 0.000 NA   NA
 897386 897387 RF_RNA27 RF_0938     TRUE 0.657 38.000 0.000 NA   NA
 897387 897388 RF_0938 RF_0939     FALSE 0.428 107.000 0.000 NA   NA
 897388 897389 RF_0939 RF_0940     FALSE 0.204 240.000 0.000 NA   NA
 897389 897390 RF_0940 RF_0941   secA FALSE 0.092 346.000 0.000 1.000   NA
 897392 897393 RF_0943 RF_0944 acpS rpoZ TRUE 0.945 1.000 0.009 1.000 N NA
 897393 897394 RF_0944 RF_0945 rpoZ murA TRUE 0.698 174.000 0.008 1.000 N NA
 897394 897395 RF_0945 RF_0946 murA   TRUE 0.582 99.000 0.000 1.000 N NA
 897395 897396 RF_0946 RF_0947   gyrB TRUE 0.708 104.000 0.000 1.000 Y NA
 897397 897398 RF_0948 RF_RNA28     FALSE 0.481 188.000 0.000 NA   NA
 897399 897400 RF_0949 RF_0950     FALSE 0.470 72.000 0.000 NA   NA
 897404 897405 RF_0954 RF_0955     TRUE 0.882 4.000 0.000 NA   NA
 897407 897408 RF_0956 RF_0957     TRUE 0.981 -16.000 0.490 NA   NA
 897409 897410 RF_0958 RF_0959 yajC secD TRUE 0.945 -16.000 0.009 NA Y NA
 897410 897411 RF_0959 RF_0960 secD   TRUE 0.869 146.000 0.263 1.000   NA
 897411 897412 RF_0960 RF_0961   ccmE TRUE 0.632 95.000 0.018 1.000   NA
 897412 897413 RF_0961 RF_0962 ccmE ppa TRUE 0.646 128.000 0.013 1.000 N NA
 897413 897414 RF_0962 RF_0963 ppa mviN TRUE 0.563 192.000 0.006 1.000   NA
 897414 897415 RF_0963 RF_0964 mviN traX TRUE 0.888 -19.000 0.012 NA   NA
 897415 897416 RF_0964 RF_0965 traX   TRUE 0.866 85.000 0.500 NA   NA
 897417 897418 RF_0966 RF_0967     FALSE 0.109 295.000 0.000 NA   NA
 897418 897419 RF_0967 RF_0968   spoT10 FALSE 0.434 120.000 0.000 NA   NA
 897420 897421 RF_0969 RF_0970     TRUE 0.544 118.000 0.000 1.000   NA
 897421 897422 RF_0970 RF_0971     TRUE 0.545 120.000 0.000 1.000   NA
 897422 897423 RF_0971 RF_0972     FALSE 0.045 428.000 0.000 1.000   NA
 897423 897424 RF_0972 RF_0973     FALSE 0.008 835.000 0.000 NA   NA
 897424 897425 RF_0973 RF_0974     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 897425 897426 RF_0974 RF_0975     FALSE 0.482 69.000 0.000 NA   NA
 897426 897427 RF_0975 RF_0976     TRUE 0.971 -25.000 0.000 0.012   NA
 897427 897428 RF_0976 RF_0977     TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 897433 897434 RF_0982 RF_0983     FALSE 0.443 129.000 0.000 NA   NA
 897434 897435 RF_0983 RF_0984     TRUE 0.892 0.000 0.000 NA   NA
 897436 897437 RF_0985 RF_0986 tolC   TRUE 0.969 2.000 0.146 NA   NA
 897437 897438 RF_0986 RF_0987     TRUE 0.741 145.000 0.073 NA   NA
 897438 897439 RF_0987 RF_0988   parE FALSE 0.073 370.000 0.016 NA   NA
 897439 897440 RF_0988 RF_0989 parE ctp TRUE 0.746 171.000 0.015 1.000 N NA
 897440 897441 RF_0989 RF_0990 ctp barA FALSE 0.262 262.000 0.000 1.000 N NA
 897441 897442 RF_0990 RF_0991 barA   FALSE 0.101 476.000 0.143 1.000   NA
 897442 897443 RF_0991 RF_0992     TRUE 0.979 13.000 0.583 NA   NA
 897443 897444 RF_0992 RF_0993     TRUE 0.923 5.000 0.022 NA   NA
 897444 897445 RF_0993 RF_0994   rplM TRUE 0.534 94.000 0.006 1.000   NA
 897445 897446 RF_0994 RF_0995 rplM rpsI TRUE 0.995 7.000 0.231 0.030 Y NA
 897446 897447 RF_0995 RF_RNA30 rpsI   FALSE 0.124 286.000 0.000 NA   NA
 897447 897448 RF_RNA30 RF_0996     FALSE 0.041 396.000 0.000 NA   NA
 897448 897449 RF_0996 RF_0997     TRUE 0.671 154.000 0.008 1.000 N NA
 897449 897450 RF_0997 RF_0998     TRUE 0.534 210.000 0.000 1.000 N NA
 897450 897451 RF_0998 RF_0999     TRUE 0.806 75.000 0.000 0.036   NA
 897452 897453 RF_RNA31 RF_1000   lepA FALSE 0.430 94.000 0.000 NA   NA
 897454 897455 RF_1001 RF_1002 prfB   TRUE 0.853 10.000 0.000 NA   NA
 897455 897456 RF_1002 RF_1003     FALSE 0.436 86.000 0.000 NA   NA
 897457 897458 RF_1004 RF_1005 hspC2 hspC1 TRUE 0.833 32.000 0.000 NA Y NA
 897458 897459 RF_1005 RF_1006 hspC1   TRUE 0.808 122.000 0.286 NA   NA
 897459 897460 RF_1006 RF_1007   fbcH FALSE 0.296 223.000 0.000 NA   NA
 897460 897461 RF_1007 RF_1008 fbcH   TRUE 0.608 135.000 0.006 1.000 N NA
 897461 897462 RF_1008 RF_1009   petB TRUE 0.726 48.000 0.005 1.000 N NA
 897462 897463 RF_1009 RF_1010 petB petA TRUE 0.991 7.000 0.021 0.002 Y NA
 897463 897464 RF_1010 RF_1011 petA   TRUE 0.978 22.000 0.875 NA   NA
 897464 897465 RF_1011 RF_1012   ccmB TRUE 0.902 77.000 0.700 NA   NA
 897465 897466 RF_1012 RF_1013 ccmB mnhB TRUE 0.983 -7.000 0.292 1.000   NA
 897466 897467 RF_1013 RF_1014 mnhB   TRUE 0.913 65.000 0.184 1.000 Y NA
 897467 897468 RF_1014 RF_1015   icd TRUE 0.829 64.000 0.069 1.000 N NA
 897468 897469 RF_1015 RF_1016 icd   TRUE 0.804 143.000 0.062 1.000 N NA
 897469 897470 RF_1016 RF_1017     TRUE 0.526 161.000 0.000 NA   NA
 897472 897473 RF_1019 RF_1020 pdhB pdhA TRUE 0.980 135.000 0.456 0.002 Y NA
 897473 897474 RF_1020 RF_1021 pdhA xth1 TRUE 0.754 176.000 0.018 1.000 N NA
 897474 897475 RF_1021 RF_1022 xth1 pbpE TRUE 0.951 14.000 0.063 1.000 N NA
 897475 897476 RF_1022 RF_1023 pbpE rluA1 TRUE 0.987 5.000 0.412 1.000 N NA
 897476 897477 RF_1023 RF_1024 rluA1 coxW FALSE 0.483 230.000 0.022 1.000 N NA
 897477 897478 RF_1024 RF_1025 coxW rne FALSE 0.313 243.000 0.000 1.000 N NA
 897479 897480 RF_1026 RF_1027     TRUE 0.860 9.000 0.000 NA   NA
 897480 897481 RF_1027 RF_1028   lpxC FALSE 0.496 183.000 0.005 NA   NA
 897483 897484 RF_1030 RF_1031 cycM   TRUE 0.915 -16.000 0.014 NA N NA
 897484 897485 RF_1031 RF_1032     FALSE 0.229 233.000 0.000 NA   NA
 897486 897487 RF_1033 RF_1034 ftsA ftsQ TRUE 0.769 128.000 0.137 NA N NA
 897487 897488 RF_1034 RF_1035 ftsQ ddlB TRUE 0.990 -3.000 0.372 NA Y NA
 897488 897489 RF_1035 RF_1036 ddlB murB TRUE 0.954 126.000 0.135 0.007 Y NA
 897489 897490 RF_1036 RF_1037 murB murC TRUE 0.635 343.000 0.108 0.007 Y NA
 897490 897491 RF_1037 RF_1038 murC   TRUE 0.596 170.000 0.006 NA N NA
 897492 897493 RF_1039 RF_1040 bolA1   TRUE 0.934 -3.000 0.022 NA   NA
 897494 897495 RF_1041 RF_1042     TRUE 0.844 -31.000 0.000 NA   NA
 897495 897496 RF_1042 RF_1043     TRUE 0.849 -27.000 0.000 NA   NA
 897496 897497 RF_1043 RF_1044   emrA FALSE 0.427 103.000 0.000 NA   NA
 897497 897498 RF_1044 RF_1045 emrA pssA TRUE 0.979 -6.000 0.013 0.047 N NA
 897498 897499 RF_1045 RF_1046 pssA psd TRUE 0.841 317.000 0.466 0.004 Y NA
 897499 897500 RF_1046 RF_1047 psd   TRUE 0.764 33.000 0.018 NA   NA
 897500 897501 RF_1047 RF_1048   suhB FALSE 0.193 240.000 0.005 NA   NA
 897501 897502 RF_1048 RF_1049 suhB efp TRUE 0.767 190.000 0.047 1.000 N NA
 897503 897504 RF_1050 RF_1051   nudH TRUE 0.873 25.000 0.017 1.000 N NA
 897505 897506 RF_1052 RF_1053     FALSE 0.114 290.000 0.000 NA   NA
 897506 897507 RF_1053 RF_1054     TRUE 0.808 75.000 0.000 0.035   NA
 897507 897508 RF_1054 RF_1055   gyrA FALSE 0.172 347.000 0.000 1.000 Y NA
 897508 897509 RF_1055 RF_1056 gyrA   FALSE 0.007 1563.000 0.000 NA   NA
 897509 897510 RF_1056 RF_1057   atm1 TRUE 0.620 44.000 0.000 NA   NA
 897510 897511 RF_1057 RF_1058 atm1   TRUE 0.812 29.000 0.000 1.000 N NA
 897511 897512 RF_1058 RF_1059   grxC1 TRUE 0.669 159.000 0.000 1.000 N NA
 897515 897516 RF_1062 RF_1063 hscB hscA TRUE 0.994 -9.000 0.634 1.000 Y NA
 897516 897517 RF_1063 RF_1064 hscA fdxB TRUE 0.838 65.000 0.091 1.000 N NA
 897517 897518 RF_1064 RF_1065 fdxB   TRUE 0.933 13.000 0.068 NA   NA
 897518 897519 RF_1065 RF_1066   imp TRUE 0.984 -43.000 0.778 NA   NA
 897519 897520 RF_1066 RF_1067 imp uspA TRUE 0.924 24.000 0.200 NA   NA
 897522 897523 RF_1069 RF_1070 pbpC   TRUE 0.870 15.000 0.000 1.000   NA
 897524 897525 RF_1071 RF_1072     TRUE 0.808 75.000 0.000 0.035   NA
 897525 897526 RF_1072 RF_1073   dapD FALSE 0.102 351.000 0.000 1.000 N NA
 897528 897529 RF_1075 RF_1076 trbC coxC TRUE 0.677 156.000 0.022 NA N NA
 897529 897530 RF_1076 RF_1077 coxC coq7 FALSE 0.019 723.000 0.000 1.000 N NA
 897530 897531 RF_1077 RF_1078 coq7 holA TRUE 0.817 29.000 0.007 1.000 N NA
 897531 897532 RF_1078 RF_1079 holA   TRUE 0.955 8.000 0.097 NA   NA
 897534 897535 RF_1081 RF_1082     TRUE 0.891 95.000 0.667 NA   NA
 897535 897536 RF_1082 RF_1083     FALSE 0.083 321.000 0.000 NA   NA
 897537 897538 RF_1084 RF_1085 dnaK dnaJ TRUE 0.973 153.000 0.236 0.004 Y NA
 897538 897539 RF_1085 RF_1086 dnaJ chaB FALSE 0.213 236.000 0.005 NA   NA
 897539 897540 RF_1086 RF_1087 chaB   FALSE 0.045 387.000 0.000 NA   NA
 897540 897541 RF_1087 RF_1088     FALSE 0.015 549.000 0.000 NA   NA
 897541 897542 RF_1088 RF_1089   recN TRUE 0.834 157.000 0.117 1.000   NA
 897542 897543 RF_1089 RF_1090 recN   TRUE 0.623 138.000 0.006 1.000 N NA
 897543 897544 RF_1090 RF_1091     TRUE 0.973 -61.000 0.000 0.001   NA
 897544 897545 RF_1091 RF_1092   sucA TRUE 0.629 159.000 0.000 1.000   NA
 897545 897546 RF_1092 RF_1093 sucA sucB TRUE 0.882 231.000 0.667 1.000 Y NA
 897546 897547 RF_1093 RF_1094 sucB   TRUE 0.729 174.000 0.013 1.000 N NA
 897547 897548 RF_1094 RF_1095   cutA TRUE 0.952 3.000 0.017 1.000 N NA
 897548 897549 RF_1095 RF_1096 cutA gltP TRUE 0.821 41.000 0.017 1.000 N NA
 897549 897550 RF_1096 RF_1097 gltP   FALSE 0.241 274.000 0.000 1.000 N NA
 897550 897551 RF_1097 RF_1098     FALSE 0.260 228.000 0.000 NA   NA
 897552 897553 RF_1099 RF_1100   hemN TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 897553 897554 RF_1100 RF_1101 hemN   TRUE 0.821 14.000 0.000 NA   NA
 897554 897555 RF_1101 RF_1102     TRUE 0.878 -12.000 0.000 NA   NA
 897555 897556 RF_1102 RF_1103     FALSE 0.476 139.000 0.000 NA   NA
 897557 897558 RF_1104 RF_1105     TRUE 0.904 52.000 0.000 0.003   NA
 897559 897560 RF_1106 RF_1107 ffh holB FALSE 0.254 264.000 0.000 1.000 N NA
 897560 897561 RF_1107 RF_1108 holB hupA FALSE 0.349 299.000 0.020 1.000 Y NA
 897562 897563 RF_1109 RF_1110 acrF   TRUE 0.759 87.000 0.179 NA   NA
 897565 897566 RF_1112 RF_1113     TRUE 0.901 0.000 0.008 NA   NA
 897567 897568 RF_1114 RF_1115     FALSE 0.428 108.000 0.000 NA   NA
 897568 897569 RF_1115 RF_1116     FALSE 0.433 89.000 0.000 NA   NA
 897571 897572 RF_1118 RF_1119 rrmJ nusB TRUE 0.923 -3.000 0.010 NA N NA
 897573 897574 RF_1120 RF_1121   omp1 FALSE 0.489 248.000 0.016 1.000 Y NA
 897574 897575 RF_1121 RF_RNA32 omp1   FALSE 0.263 227.000 0.000 NA   NA
 897575 897576 RF_RNA32 RF_1122     FALSE 0.130 282.000 0.000 NA   NA
 897578 897579 RF_1124 RF_1125 emrB mnhE TRUE 0.988 -16.000 0.171 0.065 N NA
 897579 897580 RF_1125 RF_1126 mnhE pyrH TRUE 0.923 9.000 0.008 1.000 N NA
 897580 897581 RF_1126 RF_1127 pyrH rrf TRUE 0.590 317.000 0.626 1.000 N NA
 897581 897582 RF_1127 RF_1128 rrf gatC TRUE 0.742 186.000 0.002 1.000 Y NA
 897582 897583 RF_1128 RF_1129 gatC gatA TRUE 0.998 3.000 0.643 0.002 Y NA
 897583 897584 RF_1129 RF_1130 gatA gatB TRUE 0.998 3.000 0.492 0.002 Y NA
 897584 897585 RF_1130 RF_1131 gatB yqiX TRUE 0.647 184.000 0.005 1.000 N NA
 897585 897586 RF_1131 RF_1132 yqiX   TRUE 0.978 -15.000 0.250 1.000   NA
 897586 897587 RF_1132 RF_1133   dapB TRUE 0.921 8.000 0.011 1.000   NA
 897587 897588 RF_1133 RF_1134 dapB   TRUE 0.703 46.000 0.006 1.000   NA
 897588 897589 RF_1134 RF_1135     FALSE 0.023 473.000 0.000 NA   NA
 897589 897590 RF_1135 RF_1136     FALSE 0.427 106.000 0.000 NA   NA
 897590 897591 RF_1136 RF_1137     FALSE 0.080 323.000 0.000 NA   NA
 897593 897594 RF_1139 RF_1140     TRUE 0.809 75.000 0.000 0.034   NA
 897595 897596 RF_1141 RF_1142     TRUE 0.702 86.000 0.082 NA   NA
 897596 897597 RF_1142 RF_1143   pepA TRUE 0.817 181.000 0.061 1.000 N NA
 897599 897600 RF_1145 RF_1146 rpoC rpoB TRUE 0.979 203.000 0.851 0.001   NA
 897600 897601 RF_1146 RF_1147 rpoB rplL FALSE 0.047 944.000 0.223 1.000   NA
 897601 897602 RF_1147 RF_1148 rplL rplJ TRUE 0.985 195.000 0.884 0.029 Y NA
 897602 897603 RF_1148 RF_1149 rplJ rplA TRUE 0.959 111.000 0.302 0.039 Y NA
 897603 897604 RF_1149 RF_1150 rplA rplK TRUE 0.998 6.000 0.838 0.039 Y NA
 897604 897605 RF_1150 RF_1151 rplK nusG TRUE 0.918 206.000 0.681 1.000 N NA
 897605 897606 RF_1151 RF_1152 nusG secE TRUE 0.988 16.000 0.843 1.000 N NA
 897606 897607 RF_1152 RF_RNA33 secE   FALSE 0.427 103.000 0.000 NA   NA
 897607 897608 RF_RNA33 RF_1153   fusA TRUE 0.526 161.000 0.000 NA   NA
 897608 897609 RF_1153 RF_1154 fusA rpsG TRUE 0.969 17.000 0.114 1.000 Y NA
 897609 897610 RF_1154 RF_1155 rpsG rpsL TRUE 0.976 27.000 0.029 0.006 Y NA
 897610 897611 RF_1155 RF_1156 rpsL yqiY TRUE 0.799 161.000 0.044 1.000 N NA
 897611 897612 RF_1156 RF_1157 yqiY   FALSE 0.268 226.000 0.000 NA   NA
 897612 897613 RF_1157 RF_1158     FALSE 0.429 110.000 0.000 NA   NA
 897613 897614 RF_1158 RF_1159   sdhA FALSE 0.028 435.000 0.000 NA   NA
 897614 897615 RF_1159 RF_1160 sdhA   FALSE 0.504 154.000 0.000 NA   NA
 897615 897616 RF_1160 RF_1161   sdhD TRUE 0.891 1.000 0.000 NA   NA
 897616 897617 RF_1161 RF_1162 sdhD   TRUE 0.920 -10.000 0.000 1.000   NA
 897617 897618 RF_1162 RF_1163   sdhC TRUE 0.848 18.000 0.000 1.000   NA
 897618 897619 RF_1163 RF_1164 sdhC   TRUE 0.674 177.000 0.026 NA   NA
 897619 897620 RF_1164 RF_1165     FALSE 0.498 66.000 0.000 NA   NA
 897620 897621 RF_1165 RF_1166   htrA FALSE 0.486 141.000 0.000 NA   NA
 897621 897622 RF_1166 RF_1167 htrA hflC2 TRUE 0.994 2.000 0.084 0.015 Y NA
 897622 897623 RF_1167 RF_1168 hflC2 hflK TRUE 0.989 186.000 0.947 0.015 Y NA
 897624 897625 RF_1169 RF_1170 mrp   TRUE 0.946 0.000 0.025 NA N NA
 897625 897626 RF_1170 RF_1171     TRUE 0.962 -12.000 0.118 NA   NA
 897627 897628 RF_1172 RF_1173   ruvC TRUE 0.938 1.000 0.006 1.000 N NA
 897628 897629 RF_1173 RF_1174 ruvC era TRUE 0.566 130.000 0.007 1.000   NA
 897629 897630 RF_1174 RF_1175 era   TRUE 0.798 26.000 0.000 1.000   NA
 897630 897631 RF_1175 RF_1176   rnc TRUE 0.742 40.000 0.000 1.000   NA
 897631 897632 RF_1176 RF_1177 rnc lepB TRUE 0.946 0.000 0.010 1.000 N NA
 897632 897633 RF_1177 RF_1178 lepB nuoF TRUE 0.703 135.000 0.021 1.000 N NA
 897633 897634 RF_1178 RF_1179 nuoF secF TRUE 0.688 139.000 0.015 1.000 N NA
 897636 897637 RF_1181 RF_1182     TRUE 0.809 75.000 0.000 0.034   NA
 897637 897638 RF_1182 RF_1183     TRUE 0.787 60.000 0.000 1.000 Y NA
 897640 897641 RF_1185 RF_1186 tlyC   TRUE 0.946 17.000 0.222 NA   NA
 897641 897642 RF_1186 RF_1187   lipA FALSE 0.080 319.000 0.004 NA   NA
 897642 897643 RF_1187 RF_1188 lipA glyA TRUE 0.945 -3.000 0.009 1.000 N NA
 897643 897644 RF_1188 RF_1189 glyA   TRUE 0.526 260.000 0.182 1.000   NA
 897644 897645 RF_1189 RF_1190   grxC2 TRUE 0.933 169.000 0.538 1.000   NA
 897647 897648 RF_1192 RF_1193     TRUE 0.959 48.000 1.000 NA   NA
 897648 897649 RF_1193 RF_1194     FALSE 0.024 468.000 0.000 NA   NA
 897652 897653 RF_1197 RF_1198 pgpA rplU TRUE 0.585 76.000 0.004 1.000 N NA
 897653 897654 RF_1198 RF_1199 rplU rpmA TRUE 0.994 25.000 0.667 0.028 Y NA
 897654 897655 RF_1199 RF_1200 rpmA lysC FALSE 0.032 515.000 0.000 1.000 N NA
 897655 897656 RF_1200 RF_1201 lysC   FALSE 0.047 418.000 0.000 1.000   NA
 897656 897657 RF_1201 RF_1202     TRUE 0.930 9.000 0.043 NA   NA
 897657 897658 RF_1202 RF_1203     TRUE 0.947 0.000 0.043 NA   NA
 897658 897659 RF_1203 RF_1204     FALSE 0.427 104.000 0.000 NA   NA
 897659 897660 RF_1204 RF_1205     TRUE 0.809 75.000 0.000 0.034   NA
 897661 897662 RF_1206 RF_1207     TRUE 0.991 -12.000 1.000 NA   NA
 897662 897663 RF_1207 RF_1208   proP5 TRUE 0.816 70.000 0.250 NA   NA
 897663 897664 RF_1208 RF_1209 proP5   FALSE 0.296 223.000 0.000 NA   NA
 897664 897665 RF_1209 RF_1210     TRUE 0.851 -22.000 0.005 NA   NA
 897665 897666 RF_1210 RF_1211     TRUE 0.896 3.000 0.008 NA   NA
 897666 897667 RF_1211 RF_1212     TRUE 0.745 145.000 0.077 NA   NA
 897667 897668 RF_1212 RF_1213     TRUE 0.963 4.000 0.115 NA   NA
 897669 897670 RF_1214 RF_1215 trmE   FALSE 0.278 225.000 0.000 NA   NA
 897670 897671 RF_1215 RF_1216     FALSE 0.008 909.000 0.000 NA   NA
 897672 897673 RF_1217 RF_1218     TRUE 0.840 -34.000 0.000 NA   NA
 897673 897674 RF_1218 RF_1219     FALSE 0.439 126.000 0.000 NA   NA
 897674 897675 RF_1219 RF_1220     FALSE 0.046 383.000 0.000 NA   NA
 897676 897677 RF_1221 RF_1222 recA fabG TRUE 0.940 -7.000 0.008 1.000 N NA
 897677 897678 RF_1222 RF_1223 fabG acpP TRUE 0.981 166.000 0.321 0.004 Y NA
 897678 897679 RF_1223 RF_1224 acpP fabF TRUE 0.942 36.000 0.106 1.000 Y NA
 897679 897680 RF_1224 RF_1225 fabF uup TRUE 0.607 149.000 0.000 1.000   NA
 897680 897681 RF_1225 RF_1226 uup   FALSE 0.449 81.000 0.007 NA   NA
 897682 897683 RF_1227 RF_1228     FALSE 0.182 249.000 0.000 NA   NA
 897683 897684 RF_1228 RF_1229   gmk TRUE 0.755 216.000 0.000 0.010   NA
 897684 897685 RF_1229 RF_1230 gmk   TRUE 0.591 137.000 0.008 1.000   NA
 897685 897686 RF_1230 RF_1231   mreC FALSE 0.027 515.000 0.000 1.000   NA
 897686 897687 RF_1231 RF_1232 mreC mreB TRUE 0.992 3.000 0.689 1.000 N NA
 897687 897688 RF_1232 RF_1233 mreB   FALSE 0.468 211.000 0.005 1.000   NA
 897688 897689 RF_1233 RF_RNA34     TRUE 0.635 42.000 0.000 NA   NA
 897689 897690 RF_RNA34 RF_1234   pal FALSE 0.022 474.000 0.000 NA   NA
 897690 897691 RF_1234 RF_1235 pal fabH FALSE 0.115 343.000 0.000 1.000 N NA
 897691 897692 RF_1235 RF_1236 fabH rpmF TRUE 0.916 14.000 0.014 1.000 N NA
 897693 897694 RF_1237 RF_1238   ftsY TRUE 0.643 185.000 0.005 1.000 N NA
 897694 897695 RF_1238 RF_1239 ftsY polA TRUE 0.639 146.000 0.005 1.000 N NA
 897695 897696 RF_1239 RF_1240 polA   FALSE 0.151 304.000 0.000 1.000   NA
 897696 897697 RF_1240 RF_1241     TRUE 0.737 41.000 0.000 1.000   NA
 897697 897698 RF_1241 RF_1242     TRUE 0.878 191.000 0.008 0.001   NA
 897698 897699 RF_1242 RF_1243     FALSE 0.434 120.000 0.000 NA   NA
 897700 897701 RF_1244 RF_1245 dnaE udg TRUE 0.648 144.000 0.007 1.000 N NA
 897702 897703 RF_1246 RF_1247   ampG3 TRUE 0.946 10.000 0.079 NA   NA
 897703 897704 RF_1247 RF_1248 ampG3 tatC TRUE 0.732 67.000 0.033 1.000   NA
 897704 897705 RF_1248 RF_1249 tatC serS TRUE 0.964 -22.000 0.065 1.000 N NA
 897705 897706 RF_1249 RF_1250 serS virB4_2 FALSE 0.508 245.000 0.000 0.095 N NA
 897706 897707 RF_1250 RF_1251 virB4_2   FALSE 0.234 389.000 0.375 NA   NA
 897707 897708 RF_1251 RF_1252   terC TRUE 0.683 136.000 0.051 NA   NA
 897708 897709 RF_1252 RF_1253 terC   TRUE 0.915 44.000 0.037 0.063   NA
 897709 897710 RF_1253 RF_1254     TRUE 0.957 168.000 0.857 1.000   NA
 897710 897711 RF_1254 RF_1255   nuoJ FALSE 0.258 264.000 0.012 1.000   NA
 897711 897712 RF_1255 RF_1256 nuoJ nuoK TRUE 0.998 -7.000 0.484 0.005 Y NA
 897712 897713 RF_1256 RF_1257 nuoK nuoL1 TRUE 0.997 2.000 0.451 0.013 Y NA
 897713 897714 RF_1257 RF_1258 nuoL1 nuoM TRUE 0.973 151.000 0.251 0.005 Y NA
 897714 897715 RF_1258 RF_1259 nuoM ccmA TRUE 0.844 22.000 0.000 1.000 N NA
 897716 897717 RF_1260 RF_1261 nuoI nuoH TRUE 0.980 186.000 0.500 0.013 Y NA
 897717 897718 RF_1261 RF_1262 nuoH nuoG TRUE 0.985 169.000 0.515 0.013 Y NA
 897718 897719 RF_1262 RF_1263 nuoG   TRUE 0.928 3.000 0.021 NA   NA
 897719 897720 RF_1263 RF_1264   acnA FALSE 0.458 115.000 0.008 NA   NA
 897720 897721 RF_1264 RF_1265 acnA atpC TRUE 0.588 222.000 0.005 1.000 Y NA
 897721 897722 RF_1265 RF_1266 atpC atpD TRUE 0.987 132.000 0.837 0.004 Y NA
 897722 897723 RF_1266 RF_1267 atpD atpG TRUE 0.995 29.000 0.724 0.004 Y NA
 897723 897724 RF_1267 RF_1268 atpG atpA TRUE 0.991 180.000 0.846 0.004 Y NA
 897724 897725 RF_1268 RF_1269 atpA atpH TRUE 0.989 188.000 0.864 0.006 Y NA
 897725 897726 RF_1269 RF_1270 atpH lpdA1 TRUE 0.965 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 897726 897727 RF_1270 RF_1271 lpdA1   TRUE 0.694 142.000 0.014 1.000 N NA
 897727 897728 RF_1271 RF_1272     TRUE 0.523 72.000 0.000 NA N NA
 897728 897729 RF_1272 RF_1273     TRUE 0.984 -9.000 0.500 NA   NA
 897731 897732 RF_1275 RF_1276 blaD mrcA TRUE 0.925 177.000 0.022 0.003 N NA
 897732 897733 RF_1276 RF_1277 mrcA   TRUE 0.801 16.000 0.000 NA   NA
 897733 897734 RF_1277 RF_1278   miaB FALSE 0.482 69.000 0.000 NA   NA
 897734 897735 RF_1278 RF_1279 miaB   FALSE 0.013 604.000 0.000 NA   NA
 897735 897736 RF_1279 RF_1280     TRUE 0.844 -31.000 0.000 NA   NA
 897736 897737 RF_1280 RF_1281     TRUE 0.821 14.000 0.000 NA   NA
 897737 897738 RF_1281 RF_1282     FALSE 0.232 232.000 0.000 NA   NA
 897738 897739 RF_1282 RF_1283   kefB TRUE 0.919 -31.000 0.039 NA   NA
 897739 897740 RF_1283 RF_1284 kefB   TRUE 0.898 -3.000 0.008 NA   NA
 897741 897742 RF_1285 RF_1286 bolA2   FALSE 0.088 332.000 0.000 NA N NA
 897742 897743 RF_1286 RF_1287     TRUE 0.959 9.000 0.095 NA N NA
 897746 897747 RF_1290 RF_1291 sca13 sca9 FALSE 0.049 377.000 0.000 NA   NA
 897748 897749 RF_RNA35 RF_1292   infA TRUE 0.782 18.000 0.000 NA   NA
 897749 897750 RF_1292 RF_1293 infA maf TRUE 0.964 12.000 0.207 NA N NA
 897751 897752 RF_1294 RF_1295 dksA xerC TRUE 0.721 108.000 0.040 1.000 N NA
 897754 897755 RF_1297 RF_1298   phaC TRUE 0.759 146.000 0.047 1.000   NA
 897755 897756 RF_1298 RF_1299 phaC ubiD FALSE 0.107 325.000 0.009 NA N NA
 897756 897757 RF_1299 RF_1300 ubiD surA TRUE 0.618 142.000 0.015 NA N NA
 897757 897758 RF_1300 RF_1301 surA   FALSE 0.054 411.000 0.000 1.000   NA
 897758 897759 RF_1301 RF_1302     TRUE 0.879 -58.000 0.000 1.000   NA
 897761 897762 RF_1304 RF_1305     TRUE 0.958 24.000 0.500 NA   NA
 897762 897763 RF_1305 RF_1306     FALSE 0.012 645.000 0.000 NA   NA
 897763 897764 RF_1306 RF_1307   ftsK FALSE 0.033 415.000 0.000 NA   NA
 897764 897765 RF_1307 RF_1308 ftsK fic TRUE 0.725 43.000 0.000 1.000   NA
 897766 897767 RF_1309 RF_1310 map radC FALSE 0.086 381.000 0.000 1.000 N NA
 897767 897768 RF_1310 RF_1311 radC mraY2 TRUE 0.674 104.000 0.020 1.000 N NA
 897768 897769 RF_1311 RF_1312 mraY2   TRUE 0.936 -3.000 0.023 NA   NA
 897770 897771 RF_1313 RF_1314     TRUE 0.588 298.000 0.000 0.004 Y NA
 897771 897772 RF_1314 RF_1315   fdxA TRUE 0.913 125.000 0.545 1.000 N NA
 897772 897773 RF_1315 RF_1316 fdxA   TRUE 0.803 31.000 0.000 1.000 N NA
 897773 897774 RF_1316 RF_1317     TRUE 0.933 13.000 0.069 NA   NA
 897774 897775 RF_1317 RF_1318   ccmC FALSE 0.437 123.000 0.000 NA   NA
 897775 897776 RF_1318 RF_1319 ccmC   TRUE 0.518 217.000 0.010 1.000 N NA
 897776 897777 RF_1319 RF_1320     TRUE 0.949 -19.000 0.023 1.000 N NA
 897778 897779 RF_1321 RF_1322 omp   TRUE 0.781 164.000 0.085 NA   NA
 897779 897780 RF_1322 RF_1323   znuC FALSE 0.288 236.000 0.016 NA   NA
 897782 897783 RF_1325 RF_1326 ssb   TRUE 0.841 12.000 0.000 NA   NA
 897783 897784 RF_1326 RF_1327     FALSE 0.430 111.000 0.000 NA   NA
 897784 897785 RF_1327 RF_1328     FALSE 0.438 124.000 0.000 NA   NA
 897786 897787 RF_1329 RF_1330     FALSE 0.451 193.000 0.000 NA   NA
 897787 897788 RF_1330 RF_1331     TRUE 0.595 48.000 0.000 NA   NA
 897788 897789 RF_1331 RF_RNA36     FALSE 0.014 591.000 0.000 NA   NA
 897790 897791 RF_1332 RF_1333   htpG FALSE 0.191 255.000 0.008 NA   NA
 897791 897792 RF_1333 RF_1334 htpG hemA TRUE 0.669 185.000 0.008 1.000 N NA
 897792 897793 RF_1334 RF_1335 hemA   FALSE 0.054 359.000 0.000 NA   NA
 897793 897794 RF_1335 RF_1336   tig FALSE 0.510 169.000 0.002 NA   NA
 897795 897796 RF_1337 RF_1338 obg gltA FALSE 0.444 212.000 0.002 1.000   NA
 897796 897797 RF_1338 RF_1339 gltA   FALSE 0.084 358.000 0.000 1.000   NA
 897797 897798 RF_1339 RF_1340     TRUE 0.552 80.000 0.000 1.000   NA
 897799 897800 RF_1341 RF_1342     TRUE 0.593 69.000 0.000 1.000   NA
 897800 897801 RF_1342 RF_1343     TRUE 0.961 -16.000 0.000 0.088   NA
 897801 897802 RF_1343 RF_1344   hemK TRUE 0.582 89.000 0.006 1.000 N NA
 897803 897804 RF_1345 RF_1346   glyS TRUE 0.867 29.000 0.013 NA Y NA
 897804 897805 RF_1346 RF_1347 glyS glyQ TRUE 0.998 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 897805 897806 RF_1347 RF_1348 glyQ   FALSE 0.050 360.000 0.005 NA   NA
 897806 897807 RF_1348 RF_1349   proP6 TRUE 0.913 3.000 0.014 NA   NA
 897807 897808 RF_1349 RF_1350 proP6   FALSE 0.326 220.000 0.000 NA   NA
 897808 897809 RF_1350 RF_1351     TRUE 0.989 10.000 1.000 NA   NA
 897809 897810 RF_1351 RF_1352     TRUE 0.901 150.000 0.556 NA   NA
 897812 897813 RF_1354 RF_1355     FALSE 0.014 591.000 0.000 NA   NA
 897813 897814 RF_1355 RF_1356   truA FALSE 0.470 137.000 0.000 NA   NA
 897814 897815 RF_1356 RF_1357 truA rpoD FALSE 0.067 405.000 0.006 1.000 N NA
 897815 897816 RF_1357 RF_1358 rpoD dnaG TRUE 0.931 45.000 0.299 1.000 N NA
 897816 897817 RF_1358 RF_1359 dnaG sec59 TRUE 0.933 5.000 0.008 1.000 N NA
 897819 897820 RF_1361 RF_1362 pntA2 pntA1 TRUE 0.998 -3.000 0.829 0.002   NA
 897821 897822 RF_1363 RF_RNA37     TRUE 0.726 25.000 0.000 NA   NA
 897822 897823 RF_RNA37 RF_1364   dnaX FALSE 0.439 125.000 0.000 NA   NA
 897823 897824 RF_1364 RF_1365 dnaX   TRUE 0.958 19.000 0.411 NA   NA
 897825 897826 RF_1366 RF_1367   ampC TRUE 0.914 15.000 0.022 1.000   NA
 897826 897827 RF_1367 RF_1368 ampC   TRUE 0.635 42.000 0.000 NA   NA
 897827 897828 RF_1368 RF_1369     FALSE 0.092 314.000 0.000 NA   NA
 897828 897829 RF_1369 RF_1370   glnQ TRUE 0.816 70.000 0.250 NA   NA
 897829 897830 RF_1370 RF_1371 glnQ phnP TRUE 0.945 4.000 0.019 1.000   NA
 897831 897832 RF_1372 RF_1373   dinJ TRUE 0.797 45.000 0.053 NA   NA
 897832 897833 RF_1373 RF_1374 dinJ   FALSE 0.145 274.000 0.000 NA   NA
 897834 897835 RF_1375 RF_RNA38     TRUE 0.663 36.000 0.000 NA   NA
 897835 897836 RF_RNA38 RF_1376   dapE TRUE 0.543 169.000 0.000 NA   NA
 897836 897837 RF_1376 RF_1377 dapE   TRUE 0.540 127.000 0.005 1.000   NA
 897837 897838 RF_1377 RF_1378     FALSE 0.022 475.000 0.000 NA   NA
 897838 897839 RF_1378 RF_1379     FALSE 0.498 66.000 0.000 NA   NA
 897840 897841 RF_1380 RF_1381   nhaA TRUE 0.854 107.000 0.000 0.001   NA
 897842 897843 RF_1382 RF_1383   lipB TRUE 0.897 -3.000 0.007 NA   NA
 897843 897844 RF_1383 RF_1384 lipB ampD FALSE 0.480 215.000 0.004 1.000 N NA
 897844 897845 RF_1384 RF_RNA39 ampD   FALSE 0.119 288.000 0.000 NA   NA
 897845 897846 RF_RNA39 RF_1385   rpsP TRUE 0.530 177.000 0.000 NA   NA
 897846 897847 RF_1385 RF_1386 rpsP rpmG TRUE 0.978 14.000 0.008 0.027 Y NA
 897847 897848 RF_1386 RF_1387 rpmG mutL FALSE 0.425 223.000 0.004 1.000 N NA
 897848 897849 RF_1387 RF_1388 mutL   TRUE 0.884 -3.000 0.004 NA   NA
 897850 897851 RF_1389 RF_1390     TRUE 0.856 91.000 0.000 0.001   NA
 897851 897852 RF_1390 RF_1391     TRUE 0.864 120.000 0.500 NA   NA
 897853 897854 RF_1392 RF_1393     TRUE 0.812 75.000 0.000 0.032   NA
 897854 897855 RF_1393 RF_1394     TRUE 0.826 21.000 0.000 1.000   NA
 897856 897857 RF_1395 RF_1396 proP7 hemF TRUE 0.941 -16.000 0.014 1.000 N NA
 897858 897859 RF_1397 RF_1398     FALSE 0.010 710.000 0.000 NA   NA
 897859 897860 RF_1398 RF_1399   hemH TRUE 0.920 12.000 0.043 NA   NA
 897860 897861 RF_1399 RF_1400 hemH hemE TRUE 0.978 -43.000 0.131 1.000 Y NA
 897863 897864 RF_p02 RF_p03   parA1 TRUE 0.576 136.000 0.000 1.000   NA
 897864 897865 RF_p03 RF_p04 parA1   TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 897865 897866 RF_p04 RF_p05     FALSE 0.019 504.000 0.000 NA   NA
 897866 897867 RF_p05 RF_p06     TRUE 0.878 -12.000 0.000 NA   NA
 897867 897868 RF_p06 RF_p07     TRUE 0.891 32.000 0.000 0.087   NA
 897871 897872 RF_p10 RF_p11   pat2 FALSE 0.013 622.000 0.000 NA   NA
 897872 897873 RF_p11 RF_p12 pat2   FALSE 0.420 202.000 0.000 NA   NA
 897873 897874 RF_p12 RF_p13   tmk FALSE 0.432 90.000 0.000 NA   NA
 897874 897875 RF_p13 RF_p14 tmk   TRUE 0.661 56.000 0.000 1.000   NA
 897875 897876 RF_p14 RF_p15     FALSE 0.437 85.000 0.000 NA   NA
 897876 897877 RF_p15 RF_p16     FALSE 0.268 226.000 0.000 NA   NA
 897877 897878 RF_p16 RF_p17     TRUE 0.918 34.000 0.000 0.019   NA
 897878 897879 RF_p17 RF_p18     TRUE 0.892 46.000 0.000 0.019   NA
 897879 897880 RF_p18 RF_p19     FALSE 0.041 393.000 0.000 NA   NA
 897880 897881 RF_p19 RF_p20     TRUE 0.821 -61.000 0.000 NA   NA
 897881 897882 RF_p20 RF_p21     FALSE 0.165 291.000 0.000 1.000   NA
 897882 897883 RF_p21 RF_p22     TRUE 0.860 9.000 0.000 NA   NA
 897883 897884 RF_p22 RF_p23   parA2 TRUE 0.967 3.000 0.143 NA   NA
 897885 897886 RF_p24 RF_p25   sca12 FALSE 0.010 707.000 0.000 NA   NA
 897886 897887 RF_p25 RF_p26 sca12 lon TRUE 0.592 140.000 0.000 1.000   NA
 897887 897888 RF_p26 RF_p27 lon   FALSE 0.427 106.000 0.000 NA   NA
 897888 897889 RF_p27 RF_p28     TRUE 0.810 15.000 0.000 NA   NA
 897891 897892 RF_p30 RF_p31     TRUE 0.812 75.000 0.000 0.032   NA
 897892 897893 RF_p31 RF_p32   tnpR FALSE 0.061 524.000 0.000 0.086   NA
 897894 897895 RF_p33 RF_p34     TRUE 0.538 165.000 0.000 NA   NA
 897895 897896 RF_p34 RF_p35   parB TRUE 0.825 26.000 0.000 1.000 N NA
 897899 897900 RF_p38 RF_p39     TRUE 0.969 -57.000 0.000 0.005   NA
 897900 897901 RF_p39 RF_p40     TRUE 0.744 22.000 0.000 NA   NA
 897901 897902 RF_p40 RF_p41     TRUE 0.768 19.000 0.000 NA   NA
 897903 897904 RF_p42 RF_p43     FALSE 0.509 65.000 0.000 NA   NA
 897904 897905 RF_p43 RF_p44     TRUE 0.976 7.000 0.333 NA   NA
 897905 897906 RF_p44 RF_p45     TRUE 0.841 12.000 0.000 NA   NA
 897906 897907 RF_p45 RF_p46     TRUE 0.663 36.000 0.000 NA   NA
 897907 897908 RF_p46 RF_p47     TRUE 0.652 39.000 0.000 NA   NA
 897908 897909 RF_p47 RF_p48     FALSE 0.067 341.000 0.000 NA   NA
 897909 897910 RF_p48 RF_p49     TRUE 0.737 23.000 0.000 NA   NA
 897910 897911 RF_p49 RF_p50     FALSE 0.475 70.000 0.000 NA   NA
 897911 897912 RF_p50 RF_p51   hspP2 FALSE 0.460 135.000 0.000 NA   NA
 897912 897913 RF_p51 RF_p52 hspP2 hspP1 TRUE 0.791 44.000 0.000 NA Y NA
 897913 897914 RF_p52 RF_p53 hspP1   TRUE 0.601 57.000 0.000 NA N NA
 897914 897915 RF_p53 RF_p54     TRUE 0.792 27.000 0.000 1.000   NA
 897915 897916 RF_p54 RF_p55     TRUE 0.828 69.000 0.000 0.032   NA
 897916 897917 RF_p55 RF_p56     FALSE 0.033 414.000 0.000 NA   NA
 897917 897918 RF_p56 RF_p57     FALSE 0.010 759.000 0.000 NA   NA
 897918 897919 RF_p57 RF_p58     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 897919 897920 RF_p58 RF_p59     FALSE 0.036 409.000 0.000 NA   NA
 897920 897921 RF_p59 RF_p60     TRUE 0.588 49.000 0.000 NA   NA
 897921 897922 RF_p60 RF_p61     TRUE 0.550 57.000 0.000 NA   NA
 897922 897923 RF_p61 RF_p62     TRUE 0.832 13.000 0.000 NA   NA
 897923 897924 RF_p62 RF_p63     TRUE 0.572 52.000 0.000 NA   NA
 897925 897926 RF_p64 RF_p65     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 897926 897927 RF_p65 RF_p66     FALSE 0.009 769.000 0.000 NA   NA
 897927 897928 RF_p66 RF_p67     FALSE 0.074 331.000 0.000 NA   NA
 897929 897862 RF_p68 RF_p01     FALSE 0.009 809.000 0.000 NA   NA
 897931 897932 RF_pd02 RF_pd03   parA1 TRUE 0.576 136.000 0.000 1.000   NA
 897932 897933 RF_pd03 RF_pd04 parA1   TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 897933 897934 RF_pd04 RF_pd05     FALSE 0.019 504.000 0.000 NA   NA
 897934 897935 RF_pd05 RF_pd06     TRUE 0.878 -12.000 0.000 NA   NA
 897935 897936 RF_pd06 RF_pd07     TRUE 0.892 32.000 0.000 0.085   NA
 897939 897940 RF_pd10 RF_pd11   pat2 FALSE 0.013 622.000 0.000 NA   NA
 897940 897941 RF_pd11 RF_pd12 pat2   FALSE 0.420 202.000 0.000 NA   NA
 897941 897942 RF_pd12 RF_pd13   tmk FALSE 0.432 90.000 0.000 NA   NA
 897942 897943 RF_pd13 RF_pd14 tmk   TRUE 0.661 56.000 0.000 1.000   NA
 897944 897945 RF_pd39 RF_pd40     TRUE 0.744 22.000 0.000 NA   NA
 897945 897946 RF_pd40 RF_pd41     TRUE 0.768 19.000 0.000 NA   NA
 897947 897948 RF_pd42 RF_pd43     FALSE 0.509 65.000 0.000 NA   NA
 897948 897949 RF_pd43 RF_pd44     TRUE 0.976 7.000 0.333 NA   NA
 897949 897950 RF_pd44 RF_pd45     TRUE 0.841 12.000 0.000 NA   NA
 897950 897951 RF_pd45 RF_pd46     TRUE 0.663 36.000 0.000 NA   NA
 897951 897952 RF_pd46 RF_pd47     TRUE 0.652 39.000 0.000 NA   NA
 897952 897953 RF_pd47 RF_pd48     FALSE 0.067 341.000 0.000 NA   NA
 897953 897954 RF_pd48 RF_pd49     TRUE 0.737 23.000 0.000 NA   NA
 897954 897955 RF_pd49 RF_pd50     FALSE 0.475 70.000 0.000 NA   NA
 897955 897956 RF_pd50 RF_pd51   hspP2 FALSE 0.460 135.000 0.000 NA   NA
 897956 897957 RF_pd51 RF_pd52 hspP2 hspP1 TRUE 0.791 44.000 0.000 NA Y NA
 897957 897958 RF_pd52 RF_pd53 hspP1   TRUE 0.601 57.000 0.000 NA N NA
 897958 897959 RF_pd53 RF_pd54     TRUE 0.792 27.000 0.000 1.000   NA
 897959 897960 RF_pd54 RF_pd55     TRUE 0.829 69.000 0.000 0.031   NA
 897960 897961 RF_pd55 RF_pd56     FALSE 0.033 414.000 0.000 NA   NA
 897961 897962 RF_pd56 RF_pd57     FALSE 0.010 759.000 0.000 NA   NA
 897962 897963 RF_pd57 RF_pd58     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA   NA
 897963 897964 RF_pd58 RF_pd59     FALSE 0.036 409.000 0.000 NA   NA
 897964 897965 RF_pd59 RF_pd60     TRUE 0.588 49.000 0.000 NA   NA
 897965 897966 RF_pd60 RF_pd61     TRUE 0.550 57.000 0.000 NA   NA
 897966 897967 RF_pd61 RF_pd62     TRUE 0.832 13.000 0.000 NA   NA
 897967 897968 RF_pd62 RF_pd63     TRUE 0.572 52.000 0.000 NA   NA
 897969 897970 RF_pd64 RF_pd65     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 897970 897971 RF_pd65 RF_pd66     FALSE 0.009 769.000 0.000 NA   NA
 897971 897972 RF_pd66 RF_pd67     FALSE 0.074 331.000 0.000 NA   NA
 897973 897930 RF_pd68 RF_pd01     FALSE 0.009 809.000 0.000 NA   NA