MicrobesOnline Operon Predictions for Chlamydia trachomatis A/HAR-13

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1082961 1082962 CTA_0003 CTA_0004 gatC gatA TRUE 0.995 12.000 0.643 0.005 Y NA
 1082962 1082963 CTA_0004 CTA_0005 gatA gatB TRUE 0.995 2.000 0.492 0.005 Y NA
 1082964 1082965 CTA_0006 CTA_0007     FALSE 0.366 128.000 0.667 NA   NA
 1082969 1082970 CTA_0011 CTA_0012 htrB   FALSE 0.306 131.000 0.222 NA   NA
 1082970 1082971 CTA_0012 CTA_0013   ybbP FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 1082972 1082973 CTA_0014 CTA_0015 cydA cydB TRUE 0.994 12.000 0.622 0.026 Y NA
 1082975 1082976 CTA_0017 CTA_0018     FALSE 0.299 186.000 0.750 NA   NA
 1082977 1082978 CTA_0019 CTA_0020     FALSE 0.033 277.000 0.000 NA   NA
 1082980 1082981 CTA_0022 CTA_0023 lepB   FALSE 0.262 186.000 0.333 NA   NA
 1082982 1082983 CTA_0024 CTA_0025 rpmE prfA TRUE 0.558 188.000 0.005 1.000 Y NA
 1082983 1082984 CTA_0025 CTA_0026 prfA   TRUE 0.953 -16.000 0.009 1.000 Y NA
 1082984 1082985 CTA_0026 CTA_0027   ffh TRUE 0.857 -3.000 0.005 1.000 N NA
 1082985 1082986 CTA_0027 CTA_0028 ffh rpsP TRUE 0.916 -9.000 0.361 1.000 N NA
 1082986 1082987 CTA_0028 CTA_0029 rpsP trmD TRUE 0.982 16.000 0.033 1.000 Y NA
 1082987 1082988 CTA_0029 CTA_0030 trmD rplS TRUE 0.979 26.000 0.567 1.000 Y NA
 1082988 1082989 CTA_0030 CTA_0031 rplS rnhB TRUE 0.685 63.000 0.066 1.000 N NA
 1082989 1082990 CTA_0031 CTA_0032 rnhB gmk TRUE 0.797 -9.000 0.003 1.000 N NA
 1082990 1082991 CTA_0032 CTA_0033 gmk   TRUE 0.600 -7.000 0.003 NA   NA
 1082991 1082992 CTA_0033 CTA_0034   metG TRUE 0.812 0.000 0.008 NA   NA
 1082993 1082994 CTA_0035 CTA_0036 recD_1 ytfF FALSE 0.139 248.000 0.000 1.000 N NA
 1082996 1082997 CTA_0038 CTA_0039     TRUE 0.525 7.000 0.000 NA   NA
 1082997 1082998 CTA_0039 CTA_0040     FALSE 0.111 64.000 0.000 NA   NA
 1082998 1082999 CTA_0040 CTA_0041     FALSE 0.111 64.000 0.000 NA   NA
 1082999 1083000 CTA_0041 CTA_0042   dcd TRUE 0.858 16.000 0.021 NA   NA
 1083001 1083002 CTA_0043 CTA_0044   ruvB FALSE 0.208 42.000 0.000 NA   NA
 1083002 1083003 CTA_0044 CTA_0045 ruvB   TRUE 0.536 -46.000 0.007 NA   NA
 1083004 1083005 CTA_0046 CTA_0047 glgX   FALSE 0.426 118.000 0.261 1.000   NA
 1083006 1083007 CTA_0048 CTA_0049 ssb pepA FALSE 0.305 341.000 0.013 1.000 N NA
 1083007 1083008 CTA_0049 CTA_0050 pepA hctB FALSE 0.288 137.000 0.017 1.000   NA
 1083008 1083009 CTA_0050 CTA_0051 hctB   FALSE 0.346 155.000 0.006 0.061   NA
 1083009 1083010 CTA_0051 CTA_0052   yraL FALSE 0.328 95.000 0.007 1.000   NA
 1083010 1083011 CTA_0052 CTA_0053 yraL   FALSE 0.312 91.000 0.014 NA   NA
 1083012 1083013 CTA_0054 CTA_0055     FALSE 0.401 104.000 0.400 NA   NA
 1083013 1083014 CTA_0055 CTA_0056   hemN_1 FALSE 0.305 54.000 0.002 NA   NA
 1083014 1083015 CTA_0056 CTA_0057 hemN_1   TRUE 0.709 -10.000 0.008 NA   NA
 1083016 1083017 CTA_0058 CTA_0059 sucA sucB_1 TRUE 0.989 4.000 0.667 1.000 Y NA
 1083018 1083019 CTA_0060 CTA_0061   gcpE TRUE 0.664 -18.000 0.009 NA   NA
 1083019 1083020 CTA_0061 CTA_0062 gcpE   FALSE 0.085 151.000 0.002 NA   NA
 1083020 1083021 CTA_0062 CTA_0063   fer FALSE 0.425 80.000 0.065 NA   NA
 1083021 1083022 CTA_0063 CTA_0064 fer   FALSE 0.237 38.000 0.000 NA   NA
 1083023 1083024 CTA_0065 CTA_0066 flhA fliA FALSE 0.461 108.000 0.025 1.000 N NA
 1083024 1083025 CTA_0066 CTA_0067 fliA tyrS FALSE 0.293 159.000 0.008 1.000 N NA
 1083025 1083026 CTA_0067 CTA_0068 tyrS gnd TRUE 0.930 10.000 0.014 1.000 N NA
 1083027 1083028 CTA_0069 CTA_0070 lepA   FALSE 0.189 186.000 0.002 1.000 N NA
 1083028 1083029 CTA_0070 CTA_0071     FALSE 0.034 351.000 0.000 NA   NA
 1083030 1083031 CTA_0072 CTA_0073 ytgA ytgB TRUE 0.958 -82.000 0.898 1.000 Y NA
 1083031 1083032 CTA_0073 CTA_0074 ytgB ytgC TRUE 0.980 1.000 0.012 1.000 Y NA
 1083032 1083033 CTA_0074 CTA_0075 ytgC ytgD TRUE 0.984 -10.000 0.012 0.006 Y NA
 1083033 1083034 CTA_0075 CTA_0076 ytgD dxr TRUE 0.850 27.000 0.008 1.000 N NA
 1083034 1083035 CTA_0076 CTA_0077 dxr yaeL FALSE 0.350 196.000 0.568 1.000   NA
 1083036 1083037 CTA_0078 CTA_0079   recF FALSE 0.123 158.000 0.006 NA   NA
 1083037 1083038 CTA_0079 CTA_0080 recF dnaN TRUE 0.986 0.000 0.318 1.000 Y NA
 1083040 1083041 CTA_0082 CTA_0083 apbE folD TRUE 0.951 -30.000 0.025 1.000 Y NA
 1083041 1083042 CTA_0083 CTA_0084 folD   FALSE 0.052 118.000 0.000 NA   NA
 1083043 1083044 CTA_0085 CTA_0086 ltuB   TRUE 0.629 57.000 0.333 NA   NA
 1083044 1083045 CTA_0086 CTA_0087     TRUE 0.914 10.000 0.333 NA   NA
 1083045 1083046 CTA_0087 CTA_0088     TRUE 0.912 -3.000 1.000 NA   NA
 1083047 1083048 CTA_0089 CTA_0090     FALSE 0.292 170.000 0.038 NA N NA
 1083048 1083049 CTA_0090 CTA_0091   rpmB FALSE 0.199 126.000 0.005 NA N NA
 1083049 1083050 CTA_0091 CTA_0092 rpmB malQ FALSE 0.235 149.000 0.005 1.000 N NA
 1083050 1083051 CTA_0092 CTA_0093 malQ sycE TRUE 0.946 4.000 0.600 1.000   NA
 1083051 1083052 CTA_0093 CTA_0094 sycE lcrE TRUE 0.912 38.000 0.240 0.012   NA
 1083052 1083053 CTA_0094 CTA_0095 lcrE lcrD TRUE 0.915 18.000 0.188 1.000   NA
 1083053 1083054 CTA_0095 CTA_0096 lcrD sctU TRUE 0.993 0.000 0.219 0.016 Y NA
 1083056 1083057 CTA_0098 CTA_0099 ribF truB_1 TRUE 0.804 -43.000 0.308 1.000   NA
 1083057 1083058 CTA_0099 CTA_0100 truB_1 truB_2 TRUE 0.816 53.000 0.010 0.009   NA
 1083058 1083059 CTA_0100 CTA_0101 truB_2 rbfA TRUE 0.793 38.000 0.111 1.000   NA
 1083059 1083060 CTA_0101 CTA_0102 rbfA infA_1 TRUE 0.989 7.000 0.530 1.000 Y NA
 1083060 1083061 CTA_0102 CTA_0103 infA_1 nusA TRUE 0.852 -43.000 0.342 1.000 N NA
 1083061 1083062 CTA_0103 CTA_0104 nusA rpsA TRUE 0.489 118.000 0.006 0.055 N NA
 1083063 1083064 CTA_0105 CTA_0106 trxB acpS TRUE 0.838 -12.000 0.008 1.000 N NA
 1083066 1083067 CTA_0108 CTA_0109     TRUE 0.736 35.000 0.009 1.000   NA
 1083069 1083070 CTA_0111 CTA_0112     FALSE 0.179 46.000 0.000 NA   NA
 1083072 1083073 CTA_0114 CTA_0115 mutY ybgI FALSE 0.299 54.000 0.002 NA   NA
 1083074 1083075 CTA_0116 CTA_0117   groEL_1 FALSE 0.339 128.000 0.400 NA   NA
 1083075 1083076 CTA_0117 CTA_0118 groEL_1 groES TRUE 0.980 38.000 0.412 0.016 Y NA
 1083076 1083077 CTA_0118 CTA_0119 groES pepF FALSE 0.394 172.000 0.188 1.000 N NA
 1083078 1083079 CTA_0120 CTA_0121 clpB   TRUE 0.810 26.000 0.009 1.000   NA
 1083079 1083080 CTA_0121 CTA_0122   incD FALSE 0.034 186.000 0.000 NA   NA
 1083080 1083081 CTA_0122 CTA_0123 incD incE TRUE 0.531 83.000 1.000 NA   NA
 1083081 1083082 CTA_0123 CTA_0124 incE incF TRUE 0.937 5.000 1.000 NA   NA
 1083082 1083083 CTA_0124 CTA_0125 incF incG TRUE 0.517 87.000 1.000 NA   NA
 1083084 1083085 CTA_0126 CTA_0127 incA   FALSE 0.050 121.000 0.000 NA   NA
 1083086 1083087 CTA_0128 CTA_0129 araD efp_1 TRUE 0.813 -13.000 0.007 1.000 N NA
 1083087 1083088 CTA_0129 CTA_0130 efp_1 accB TRUE 0.945 13.000 0.120 1.000 N NA
 1083088 1083089 CTA_0130 CTA_0131 accB accC TRUE 0.993 4.000 0.011 0.003 Y NA
 1083089 1083090 CTA_0131 CTA_0132 accC rplM FALSE 0.139 223.000 0.000 1.000 N NA
 1083090 1083091 CTA_0132 CTA_0133 rplM rpsI TRUE 0.988 26.000 0.601 0.061 Y NA
 1083092 1083093 CTA_0134 CTA_0135 ydhO adk FALSE 0.478 96.000 0.014 1.000 N NA
 1083094 1083095 CTA_0136 CTA_0137 glnP glnQ TRUE 0.986 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 1083096 1083097 CTA_0138 CTA_0139     TRUE 0.879 -3.000 0.017 1.000   NA
 1083097 1083098 CTA_0139 CTA_0140     FALSE 0.461 78.000 0.017 1.000   NA
 1083099 1083100 CTA_0141 CTA_0142     TRUE 0.600 59.000 0.333 NA   NA
 1083100 1083101 CTA_0142 CTA_0143     FALSE 0.115 270.000 0.007 NA   NA
 1083101 1083102 CTA_0143 CTA_0144   ywlC TRUE 0.678 19.000 0.004 NA   NA
 1083102 1083103 CTA_0144 CTA_0145 ywlC   TRUE 0.757 -22.000 0.012 NA N NA
 1083105 1083106 CTA_0147 CTA_0148 ypdP secA_1 FALSE 0.135 184.000 0.008 NA   NA
 1083106 1083107 CTA_0148 CTA_0149 secA_1   FALSE 0.097 69.000 0.000 NA   NA
 1083107 1083108 CTA_0149 CTA_0150     TRUE 0.518 9.000 0.000 NA   NA
 1083108 1083109 CTA_0150 CTA_0151     FALSE 0.036 167.000 0.000 NA   NA
 1083109 1083110 CTA_0151 CTA_0152     TRUE 0.931 2.000 1.000 NA   NA
 1083110 1083111 CTA_0152 CTA_0153     TRUE 0.926 0.000 1.000 NA   NA
 1083111 1083112 CTA_0153 CTA_0154     FALSE 0.216 186.000 0.044 NA   NA
 1083112 1083113 CTA_0154 CTA_0155   dnlJ TRUE 0.865 11.000 0.006 1.000   NA
 1083113 1083114 CTA_0155 CTA_0156 dnlJ   FALSE 0.208 98.000 0.006 NA   NA
 1083115 1083116 CTA_0157 CTA_0158 mhpA   FALSE 0.305 200.000 0.857 NA   NA
 1083117 1083118 CTA_0159 CTA_0160 rpmG   TRUE 0.645 36.000 0.006 1.000   NA
 1083118 1083119 CTA_0160 CTA_0161     TRUE 0.989 5.000 0.545 1.000 Y NA
 1083120 1083121 CTA_0162 CTA_0163     FALSE 0.085 186.000 0.000 1.000   NA
 1083121 1083122 CTA_0163 CTA_0164     TRUE 0.679 563.000 0.000 0.027 Y NA
 1083122 1083123 CTA_0164 CTA_0165     FALSE 0.194 -120.000 0.000 NA   NA
 1083123 1083124 CTA_0165 CTA_0166     FALSE 0.034 293.000 0.000 NA   NA
 1083124 1083125 CTA_0166 CTA_0167     TRUE 0.748 124.000 0.000 0.027 Y NA
 1083125 1083126 CTA_0167 CTA_0168     FALSE 0.213 -57.000 0.000 NA   NA
 1083126 1083127 CTA_0168 CTA_0169     FALSE 0.033 227.000 0.000 NA   NA
 1083127 1083128 CTA_0169 CTA_0170     FALSE 0.376 -7.000 0.000 NA   NA
 1083128 1083129 CTA_0170 CTA_0171     FALSE 0.039 148.000 0.000 NA   NA
 1083130 1083131 CTA_0172 CTA_0173     FALSE 0.144 57.000 0.000 NA   NA
 1083131 1083132 CTA_0173 CTA_0174     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 1083132 1083133 CTA_0174 CTA_0175     FALSE 0.036 470.000 0.000 NA   NA
 1083133 1083134 CTA_0175 CTA_0176     FALSE 0.033 237.000 0.000 NA   NA
 1083134 1083135 CTA_0176 CTA_0177     TRUE 0.526 4.000 0.000 NA   NA
 1083135 1083136 CTA_0177 CTA_0178     FALSE 0.319 29.000 0.000 NA   NA
 1083136 1083137 CTA_0178 CTA_0179     FALSE 0.289 32.000 0.000 NA   NA
 1083137 1083138 CTA_0179 CTA_0180     TRUE 0.518 9.000 0.000 NA   NA
 1083138 1083139 CTA_0180 CTA_0181     TRUE 0.518 9.000 0.000 NA   NA
 1083139 1083140 CTA_0181 CTA_0182   trpR FALSE 0.150 56.000 0.000 NA   NA
 1083140 1083141 CTA_0182 CTA_0183 trpR   FALSE 0.219 41.000 0.000 NA   NA
 1083141 1083142 CTA_0183 CTA_0184   trpB_2 FALSE 0.046 129.000 0.000 NA   NA
 1083142 1083143 CTA_0184 CTA_0185 trpB_2 trpB_1 TRUE 0.769 43.000 0.000 0.004   NA
 1083143 1083144 CTA_0185 CTA_0186 trpB_1 trpA TRUE 0.990 -7.000 0.146 0.004 Y NA
 1083145 1083146 CTA_0187 CTA_0188     TRUE 0.528 6.000 0.000 NA   NA
 1083146 1083147 CTA_0188 CTA_0189     FALSE 0.101 68.000 0.000 NA   NA
 1083147 1083148 CTA_0189 CTA_0190     FALSE 0.075 87.000 0.000 NA   NA
 1083150 1083151 CTA_0192 CTA_0193 dsbB dsbG TRUE 0.978 -3.000 0.308 NA Y NA
 1083153 1083154 CTA_0195 CTA_0196   tauB FALSE 0.265 144.000 0.111 NA   NA
 1083154 1083155 CTA_0196 CTA_0197 tauB   FALSE 0.237 38.000 0.000 NA   NA
 1083155 1083156 CTA_0197 CTA_0198     TRUE 0.528 6.000 0.000 NA   NA
 1083156 1083157 CTA_0198 CTA_0199     FALSE 0.051 119.000 0.000 NA   NA
 1083158 1083159 CTA_0200 CTA_0201 kdsB pyrG TRUE 0.825 -24.000 0.018 1.000 N NA
 1083159 1083160 CTA_0201 CTA_0202 pyrG yqgF TRUE 0.803 -13.000 0.006 1.000 N NA
 1083160 1083161 CTA_0202 CTA_0203 yqgF zwf FALSE 0.289 117.000 0.004 1.000 N NA
 1083161 1083162 CTA_0203 CTA_0204 zwf devB TRUE 0.973 25.000 0.021 1.000 Y NA
 1083163 1083164 CTA_0205 CTA_0206 dnaX_1 tdk TRUE 0.948 14.000 0.254 1.000 N NA
 1083164 1083165 CTA_0206 CTA_0207 tdk gyrA_1 TRUE 0.906 2.000 0.007 1.000 N NA
 1083165 1083166 CTA_0207 CTA_0208 gyrA_1 gyrB_1 TRUE 0.994 15.000 0.306 0.006 Y NA
 1083166 1083167 CTA_0208 CTA_0209 gyrB_1   TRUE 0.883 3.000 0.028 NA   NA
 1083167 1083168 CTA_0209 CTA_0210     FALSE 0.136 146.000 0.006 NA   NA
 1083168 1083169 CTA_0210 CTA_0211   tgt FALSE 0.033 226.000 0.000 NA   NA
 1083169 1083170 CTA_0211 CTA_0212 tgt mgtE FALSE 0.259 127.000 0.003 1.000 N NA
 1083170 1083171 CTA_0212 CTA_0213 mgtE   FALSE 0.035 439.000 0.000 NA   NA
 1083172 1083173 CTA_0214 CTA_0215   gcp FALSE 0.180 76.000 0.002 NA   NA
 1083173 1083174 CTA_0215 CTA_0216 gcp oppA_3 TRUE 0.709 -36.000 0.006 1.000 N NA
 1083174 1083175 CTA_0216 CTA_0217 oppA_3 oppB_1 TRUE 0.841 159.000 0.091 0.025 Y NA
 1083175 1083176 CTA_0217 CTA_0218 oppB_1 oppC_1 TRUE 0.984 32.000 0.273 0.025 Y NA
 1083176 1083177 CTA_0218 CTA_0219 oppC_1 oppD TRUE 0.974 -7.000 0.044 1.000 Y NA
 1083177 1083178 CTA_0219 CTA_0220 oppD oppF TRUE 0.993 15.000 0.044 0.006 Y NA
 1083178 1083179 CTA_0220 CTA_0221 oppF   FALSE 0.034 307.000 0.000 NA   NA
 1083179 1083180 CTA_0221 CTA_0222   ybhI TRUE 0.804 30.000 0.217 NA   NA
 1083180 1083181 CTA_0222 CTA_0223 ybhI pfkA_1 TRUE 0.928 20.000 0.088 1.000 N NA
 1083181 1083182 CTA_0223 CTA_0224 pfkA_1   TRUE 0.771 -51.000 0.088 1.000   NA
 1083182 1083183 CTA_0224 CTA_0225   pfkA_2 TRUE 0.875 -18.000 0.857 1.000   NA
 1083184 1083185 CTA_0226 CTA_0227     FALSE 0.447 19.000 0.000 NA   NA
 1083185 1083186 CTA_0227 CTA_0228   gseA FALSE 0.345 27.000 0.000 NA   NA
 1083186 1083187 CTA_0228 CTA_0229 gseA leuS TRUE 0.862 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1083189 1083190 CTA_0231 CTA_0232     TRUE 0.820 19.000 0.012 NA   NA
 1083190 1083191 CTA_0232 CTA_0233   rpiA TRUE 0.728 -10.000 0.011 NA   NA
 1083191 1083192 CTA_0233 CTA_0234 rpiA   FALSE 0.150 95.000 0.003 NA   NA
 1083193 1083194 CTA_0235 CTA_0236 dhnA xasA TRUE 0.960 14.000 1.000 1.000 N NA
 1083194 1083195 CTA_0236 CTA_0237 xasA ydaO TRUE 0.498 94.000 0.250 NA N NA
 1083195 1083196 CTA_0237 CTA_0238 ydaO surE FALSE 0.225 131.000 0.015 NA   NA
 1083196 1083197 CTA_0238 CTA_0239 surE ubiA FALSE 0.238 112.000 0.006 1.000   NA
 1083197 1083198 CTA_0239 CTA_0240 ubiA ubiX TRUE 0.979 -3.000 0.029 1.000 Y NA
 1083199 1083200 CTA_0241 CTA_0242 yqfU   FALSE 0.395 24.000 0.000 NA   NA
 1083200 1083201 CTA_0242 CTA_0243     TRUE 0.521 8.000 0.000 NA   NA
 1083201 1083202 CTA_0243 CTA_0244     FALSE 0.033 279.000 0.000 NA   NA
 1083202 1083203 CTA_0244 CTA_0245     FALSE 0.041 142.000 0.000 NA   NA
 1083203 1083204 CTA_0245 CTA_0246     FALSE 0.035 391.000 0.000 NA   NA
 1083204 1083205 CTA_0246 CTA_0247     FALSE 0.071 91.000 0.000 NA   NA
 1083205 1083206 CTA_0247 CTA_0248     FALSE 0.065 99.000 0.000 NA   NA
 1083206 1083207 CTA_0248 CTA_0249     FALSE 0.314 283.000 1.000 NA   NA
 1083207 1083208 CTA_0249 CTA_0250     FALSE 0.033 271.000 0.000 NA   NA
 1083208 1083209 CTA_0250 CTA_0251     FALSE 0.349 150.000 1.000 NA   NA
 1083210 1083211 CTA_0252 CTA_0253     FALSE 0.326 183.000 0.273 1.000   NA
 1083211 1083212 CTA_0253 CTA_0254   incB FALSE 0.378 105.000 0.273 NA   NA
 1083212 1083213 CTA_0254 CTA_0255 incB incC TRUE 0.559 77.000 1.000 NA   NA
 1083213 1083214 CTA_0255 CTA_0256 incC   TRUE 0.646 58.000 0.667 NA   NA
 1083214 1083215 CTA_0256 CTA_0257     TRUE 0.807 29.000 0.182 NA   NA
 1083216 1083217 CTA_0258 CTA_0259 acpP fabG TRUE 0.767 369.000 0.007 0.013 Y NA
 1083217 1083218 CTA_0259 CTA_0260 fabG fabD TRUE 0.990 -3.000 0.019 0.013 Y NA
 1083218 1083219 CTA_0260 CTA_0261 fabD fabH TRUE 0.989 17.000 0.009 0.013 Y NA
 1083220 1083221 CTA_0262 CTA_0263 recR yaeT FALSE 0.202 375.000 0.003 1.000 N NA
 1083221 1083222 CTA_0263 CTA_0264 yaeT   TRUE 0.881 69.000 0.175 1.000 Y NA
 1083222 1083223 CTA_0264 CTA_0265   lpxD TRUE 0.965 28.000 0.018 1.000 Y NA
 1083225 1083226 CTA_0267 CTA_0268 pdhA_1 pdhB TRUE 0.992 -7.000 0.456 0.003 Y NA
 1083226 1083227 CTA_0268 CTA_0269 pdhB pdhC TRUE 0.988 5.000 0.254 1.000 Y NA
 1083230 1083231 CTA_0272 CTA_0273 dnaA_1   TRUE 0.681 77.000 0.714 1.000 N NA
 1083231 1083232 CTA_0273 CTA_0274   lgt FALSE 0.239 310.000 0.006 1.000 N NA
 1083233 1083234 CTA_0275 CTA_0276     TRUE 0.924 4.000 0.500 NA   NA
 1083236 1083237 CTA_0278 CTA_0279     TRUE 0.851 -10.000 0.545 NA   NA
 1083238 1083239 CTA_0280 CTA_0281 yfhO_1   TRUE 0.946 6.000 0.041 1.000 N NA
 1083240 1083241 CTA_0282 CTA_0283   dnaQ_1 TRUE 0.895 9.000 0.050 NA   NA
 1083241 1083242 CTA_0283 CTA_0284 dnaQ_1   TRUE 0.851 -3.000 0.031 NA   NA
 1083242 1083243 CTA_0284 CTA_0285     TRUE 0.795 -7.000 0.019 NA   NA
 1083244 1083245 CTA_0286 CTA_0287 msbA accA TRUE 0.775 -34.000 0.010 1.000 N NA
 1083245 1083246 CTA_0287 CTA_0288 accA   FALSE 0.180 133.000 0.008 NA   NA
 1083246 1083247 CTA_0288 CTA_0289   ihfA FALSE 0.329 118.000 0.182 NA   NA
 1083247 1083248 CTA_0289 CTA_0290 ihfA amiA FALSE 0.139 220.000 0.000 1.000 N NA
 1083248 1083249 CTA_0290 CTA_0291 amiA murE TRUE 0.929 -85.000 0.014 1.000 Y NA
 1083249 1083250 CTA_0291 CTA_0292 murE pbp3 TRUE 0.670 323.000 0.022 1.000 Y NA
 1083250 1083251 CTA_0292 CTA_0293 pbp3   TRUE 0.803 -13.000 0.135 NA   NA
 1083251 1083252 CTA_0293 CTA_0294   mraW TRUE 0.794 0.000 0.007 NA   NA
 1083253 1083254 CTA_0295 CTA_0296     TRUE 0.915 7.000 0.286 NA   NA
 1083254 1083255 CTA_0296 CTA_0297   dnaA_2 FALSE 0.083 243.000 0.000 1.000   NA
 1083255 1083256 CTA_0297 CTA_0298 dnaA_2   TRUE 0.624 39.000 0.006 NA N NA
 1083258 1083259 CTA_0300 CTA_0301 nqrB nqrC TRUE 0.995 4.000 0.093 0.003 Y NA
 1083259 1083260 CTA_0301 CTA_0302 nqrC nqrD TRUE 0.986 -10.000 0.034 0.008 Y NA
 1083260 1083261 CTA_0302 CTA_0303 nqrD nqrE TRUE 0.994 6.000 0.034 0.008 Y NA
 1083262 1083263 CTA_0304 CTA_0305 gcsH   TRUE 0.931 20.000 0.857 1.000   NA
 1083263 1083264 CTA_0305 CTA_0306     FALSE 0.284 171.000 0.032 1.000   NA
 1083264 1083265 CTA_0306 CTA_0307   lplA_1 TRUE 0.974 6.000 0.032 0.025 N NA
 1083269 1083270 CTA_0311 CTA_0312   ptsN_1 TRUE 0.593 58.000 0.231 NA   NA
 1083270 1083271 CTA_0312 CTA_0313 ptsN_1 ptsN_2 TRUE 0.995 3.000 0.231 0.003 Y NA
 1083271 1083272 CTA_0313 CTA_0314 ptsN_2 dut TRUE 0.916 2.000 0.008 1.000 N NA
 1083272 1083273 CTA_0314 CTA_0315 dut accD TRUE 0.783 37.000 0.008 1.000 N NA
 1083273 1083274 CTA_0315 CTA_0316 accD sodM TRUE 0.523 72.000 0.009 1.000 N NA
 1083274 1083275 CTA_0316 CTA_0317 sodM mrsA_1 FALSE 0.436 132.000 0.067 1.000 N NA
 1083275 1083276 CTA_0317 CTA_0318 mrsA_1 dcrA FALSE 0.214 152.000 0.022 NA   NA
 1083277 1083278 CTA_0319 CTA_0320 rnc radA TRUE 0.808 -16.000 0.007 1.000 N NA
 1083278 1083279 CTA_0320 CTA_0321 radA hemC TRUE 0.783 -22.000 0.007 1.000 N NA
 1083279 1083280 CTA_0321 CTA_0322 hemC   FALSE 0.035 393.000 0.000 NA   NA
 1083281 1083282 CTA_0323 CTA_0324 pknD valS TRUE 0.893 15.000 0.006 1.000 N NA
 1083282 1083283 CTA_0324 CTA_0325 valS   FALSE 0.151 127.000 0.006 NA   NA
 1083283 1083284 CTA_0325 CTA_0326   atpK TRUE 0.648 -79.000 0.030 NA   NA
 1083284 1083285 CTA_0326 CTA_0327 atpK atpI TRUE 0.867 63.000 0.848 0.004   NA
 1083285 1083286 CTA_0327 CTA_0328 atpI atpD TRUE 0.994 6.000 0.270 0.010 Y NA
 1083286 1083287 CTA_0328 CTA_0329 atpD atpB TRUE 0.989 -15.000 0.903 0.010 Y NA
 1083287 1083288 CTA_0329 CTA_0330 atpB atpA TRUE 0.995 3.000 0.806 0.010 Y NA
 1083288 1083289 CTA_0330 CTA_0331 atpA   TRUE 0.882 -6.000 0.633 NA   NA
 1083289 1083290 CTA_0331 CTA_0332   atpE FALSE 0.306 167.000 0.667 NA   NA
 1083292 1083293 CTA_0334 CTA_0335   tal TRUE 0.786 45.000 0.667 1.000   NA
 1083293 1083294 CTA_0335 CTA_0336 tal rpoC FALSE 0.328 112.000 0.006 1.000 N NA
 1083294 1083295 CTA_0336 CTA_0337 rpoC rpoB TRUE 0.993 25.000 0.851 0.003 Y NA
 1083295 1083296 CTA_0337 CTA_0338 rpoB rplL FALSE 0.391 361.000 0.223 1.000 N NA
 1083296 1083297 CTA_0338 CTA_0339 rplL rplJ TRUE 0.985 32.000 0.884 0.055 Y NA
 1083297 1083298 CTA_0339 CTA_0340 rplJ rplA TRUE 0.989 22.000 0.302 0.073 Y NA
 1083298 1083299 CTA_0340 CTA_0341 rplA rplK TRUE 0.990 23.000 0.838 0.073 Y NA
 1083299 1083300 CTA_0341 CTA_0342 rplK nusG TRUE 0.579 106.000 0.681 1.000 N NA
 1083300 1083301 CTA_0342 CTA_0343 nusG secE TRUE 0.963 4.000 0.843 1.000 N NA
 1083301 1083302 CTA_0343 CTA_0344 secE   FALSE 0.308 30.000 0.000 NA   NA
 1083302 1083303 CTA_0344 CTA_0345   tufA FALSE 0.219 41.000 0.000 NA   NA
 1083303 1083304 CTA_0345 CTA_0346 tufA   FALSE 0.179 46.000 0.000 NA   NA
 1083304 1083305 CTA_0346 CTA_0347   infA_2 FALSE 0.033 231.000 0.000 NA   NA
 1083306 1083307 CTA_0348 CTA_0349     TRUE 0.863 -3.000 0.054 NA   NA
 1083308 1083309 CTA_0350 CTA_0351     FALSE 0.034 363.000 0.000 NA   NA
 1083309 1083310 CTA_0351 CTA_0352     FALSE 0.034 181.000 0.000 NA   NA
 1083313 1083314 CTA_0355 CTA_0356 tpiS xseA TRUE 0.907 14.000 0.007 1.000 N NA
 1083314 1083315 CTA_0356 CTA_0357 xseA xseB TRUE 0.949 -16.000 0.412 0.003   NA
 1083315 1083316 CTA_0357 CTA_0358 xseB   TRUE 0.817 7.000 0.007 NA   NA
 1083316 1083317 CTA_0358 CTA_0359   dxs TRUE 0.808 -3.000 0.011 NA   NA
 1083317 1083318 CTA_0359 CTA_0360 dxs pykF FALSE 0.338 97.000 0.004 1.000 N NA
 1083318 1083319 CTA_0360 CTA_0361 pykF uvrA TRUE 0.822 23.000 0.002 1.000 N NA
 1083319 1083320 CTA_0361 CTA_0362 uvrA dnaX_2 TRUE 0.482 218.000 0.000 1.000 Y NA
 1083320 1083321 CTA_0362 CTA_0363 dnaX_2   TRUE 0.863 -7.000 0.411 NA   NA
 1083322 1083323 CTA_0364 CTA_0365 ptsI ptsH TRUE 0.993 0.000 0.026 0.005 Y NA
 1083323 1083324 CTA_0365 CTA_0366 ptsH   FALSE 0.203 137.000 0.013 NA   NA
 1083324 1083325 CTA_0366 CTA_0368     FALSE 0.144 57.000 0.000 NA   NA
 1083327 1083328 CTA_0369 CTA_0370 pdhA_2 dnaJ TRUE 0.876 35.000 0.300 1.000 N NA
 1083328 1083329 CTA_0370 CTA_0371 dnaJ rpsU TRUE 0.873 29.000 0.412 1.000   NA
 1083329 1083330 CTA_0371 CTA_0372 rpsU   FALSE 0.168 197.000 0.006 1.000   NA
 1083331 1083332 CTA_0373 CTA_0374 lon   FALSE 0.268 102.000 0.012 NA   NA
 1083332 1083333 CTA_0374 CTA_0375   elaC FALSE 0.034 350.000 0.000 NA   NA
 1083333 1083334 CTA_0375 CTA_0376 elaC xerC FALSE 0.389 62.000 0.004 1.000   NA
 1083334 1083335 CTA_0376 CTA_0377 xerC yjjK TRUE 0.593 54.000 0.010 1.000   NA
 1083335 1083336 CTA_0377 CTA_0378 yjjK maf TRUE 0.691 36.000 0.017 NA   NA
 1083336 1083337 CTA_0378 CTA_0379 maf   TRUE 0.788 -18.000 0.017 NA N NA
 1083337 1083338 CTA_0379 CTA_0380     TRUE 0.923 7.000 0.500 NA   NA
 1083338 1083339 CTA_0380 CTA_0381     FALSE 0.037 164.000 0.000 NA   NA
 1083340 1083341 CTA_0382 CTA_0383 def ksgA TRUE 0.484 275.000 0.000 1.000 Y NA
 1083341 1083342 CTA_0383 CTA_0384 ksgA   TRUE 0.817 16.000 0.005 1.000   NA
 1083342 1083343 CTA_0384 CTA_0385   yyaL FALSE 0.362 305.000 0.667 1.000   NA
 1083346 1083347 CTA_0387 CTA_0389     TRUE 0.884 26.000 1.000 NA   NA
 1083348 1083349 CTA_0390 CTA_0391 bioY   FALSE 0.154 55.000 0.000 NA   NA
 1083349 1083350 CTA_0391 CTA_0392     FALSE 0.213 -57.000 0.000 NA   NA
 1083350 1083351 CTA_0392 CTA_0393   dapA FALSE 0.185 162.000 0.014 NA   NA
 1083351 1083352 CTA_0393 CTA_0394 dapA lysC TRUE 0.984 10.000 0.021 1.000 Y NA
 1083352 1083353 CTA_0394 CTA_0395 lysC asd TRUE 0.972 -7.000 0.022 1.000 Y NA
 1083353 1083354 CTA_0395 CTA_0396 asd dapB TRUE 0.986 10.000 0.005 0.065 Y NA
 1083354 1083355 CTA_0396 CTA_0397 dapB   FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 1083356 1083357 CTA_0398 CTA_0399 aroA aroL TRUE 0.910 -58.000 0.006 1.000 Y NA
 1083357 1083358 CTA_0399 CTA_0400 aroL aroC TRUE 0.958 -7.000 0.006 1.000 Y NA
 1083358 1083359 CTA_0400 CTA_0401 aroC aroB TRUE 0.992 -3.000 0.110 0.005 Y NA
 1083359 1083360 CTA_0401 CTA_0402 aroB aroE TRUE 0.976 -19.000 0.007 0.005 Y NA
 1083360 1083361 CTA_0402 CTA_0403 aroE   TRUE 0.707 42.000 0.214 NA   NA
 1083361 1083362 CTA_0403 CTA_0404     FALSE 0.294 141.000 0.300 NA   NA
 1083362 1083363 CTA_0404 CTA_0405     TRUE 0.616 69.000 0.429 1.000   NA
 1083363 1083364 CTA_0405 CTA_0406   arcD_3 TRUE 0.706 16.000 0.000 1.000   NA
 1083364 1083365 CTA_0406 CTA_0407 arcD_3 arcD_2 TRUE 0.936 9.000 0.000 0.004   NA
 1083365 1083366 CTA_0407 CTA_0408 arcD_2 arcD_1 FALSE 0.033 218.000 0.000 NA   NA
 1083366 1083367 CTA_0408 CTA_0409 arcD_1   FALSE 0.164 172.000 0.011 NA   NA
 1083368 1083369 CTA_0410 CTA_0411 mdhC ltuA FALSE 0.144 191.000 0.009 NA   NA
 1083369 1083370 CTA_0411 CTA_0412 ltuA pgi FALSE 0.329 115.000 0.133 NA   NA
 1083370 1083371 CTA_0412 CTA_0413 pgi hlfX FALSE 0.198 113.000 0.002 1.000   NA
 1083371 1083372 CTA_0413 CTA_0414 hlfX phnP TRUE 0.878 13.000 0.008 1.000   NA
 1083372 1083373 CTA_0414 CTA_0415 phnP artJ TRUE 0.701 29.000 0.005 1.000   NA
 1083373 1083374 CTA_0415 CTA_0416 artJ aroG TRUE 0.887 68.000 0.200 1.000 Y NA
 1083374 1083375 CTA_0416 CTA_0417 aroG   FALSE 0.042 137.000 0.000 NA   NA
 1083377 1083378 CTA_0419 CTA_0420   ycfF TRUE 0.716 15.000 0.000 1.000   NA
 1083378 1083379 CTA_0420 CTA_0421 ycfF   TRUE 0.809 -3.000 0.011 NA   NA
 1083382 1083383 CTA_0424 CTA_0425   aspC FALSE 0.251 108.000 0.012 NA   NA
 1083383 1083384 CTA_0425 CTA_0426 aspC   TRUE 0.892 8.000 0.037 NA   NA
 1083386 1083387 CTA_0428 CTA_0429 proS hrcA TRUE 0.516 69.000 0.007 1.000 N NA
 1083387 1083388 CTA_0429 CTA_0430 hrcA grpE TRUE 0.936 -3.000 0.286 1.000 N NA
 1083388 1083389 CTA_0430 CTA_0431 grpE dnaK TRUE 0.988 26.000 0.224 0.014 Y NA
 1083389 1083390 CTA_0431 CTA_0432 dnaK vacB FALSE 0.195 293.000 0.003 1.000 N NA
 1083390 1083391 CTA_0432 CTA_0433 vacB   FALSE 0.033 256.000 0.000 NA   NA
 1083392 1083393 CTA_0434 CTA_0435 yrbH sucB_2 TRUE 0.906 32.000 0.857 1.000 N NA
 1083393 1083394 CTA_0435 CTA_0436 sucB_2 gltT TRUE 0.743 246.000 0.714 1.000 Y NA
 1083394 1083395 CTA_0436 CTA_0437 gltT lpxK FALSE 0.301 301.000 0.013 1.000 N NA
 1083395 1083396 CTA_0437 CTA_0438 lpxK yjfH TRUE 0.876 16.000 0.006 1.000 N NA
 1083396 1083397 CTA_0438 CTA_0439 yjfH   TRUE 0.815 -12.000 0.213 NA   NA
 1083397 1083398 CTA_0439 CTA_0440   ribC TRUE 0.745 -3.000 0.006 NA   NA
 1083399 1083400 CTA_0441 CTA_0442   dksA TRUE 0.882 14.000 0.009 NA N NA
 1083400 1083401 CTA_0442 CTA_0443 dksA lspA TRUE 0.945 6.000 0.038 1.000 N NA
 1083401 1083402 CTA_0443 CTA_0444 lspA   TRUE 0.664 102.000 0.038 0.063 N NA
 1083402 1083403 CTA_0444 CTA_0445   pcnB_1 FALSE 0.139 216.000 0.000 1.000 N NA
 1083403 1083404 CTA_0445 CTA_0446 pcnB_1 lpxB TRUE 0.621 61.000 0.010 1.000 N NA
 1083404 1083405 CTA_0446 CTA_0447 lpxB pmpA FALSE 0.219 107.000 0.003 1.000   NA
 1083405 1083406 CTA_0447 CTA_0448 pmpA pmpB TRUE 0.599 139.000 0.400 0.015   NA
 1083406 1083407 CTA_0448 CTA_0449 pmpB pmpC TRUE 0.606 176.000 1.000 0.015   NA
 1083409 1083410 CTA_0451 CTA_0452 yebL   TRUE 0.984 -3.000 0.509 1.000 Y NA
 1083410 1083411 CTA_0452 CTA_0453     TRUE 0.978 -9.000 0.616 1.000 Y NA
 1083412 1083413 CTA_0454 CTA_0455 yhbZ rpmA TRUE 0.528 90.000 0.335 1.000   NA
 1083413 1083414 CTA_0455 CTA_0456 rpmA rplU TRUE 0.985 31.000 0.667 0.052 Y NA
 1083414 1083415 CTA_0456 CTA_0457 rplU   FALSE 0.034 317.000 0.000 NA   NA
 1083416 1083417 CTA_0458 CTA_0459     FALSE 0.205 170.000 0.024 NA   NA
 1083417 1083418 CTA_0459 CTA_0460     TRUE 0.910 17.000 0.667 NA   NA
 1083418 1083419 CTA_0460 CTA_0461     TRUE 0.774 13.000 0.006 NA   NA
 1083419 1083420 CTA_0461 CTA_0462   corC FALSE 0.301 133.000 0.222 NA   NA
 1083420 1083421 CTA_0462 CTA_0463 corC rsbV FALSE 0.093 189.000 0.006 NA   NA
 1083421 1083422 CTA_0463 CTA_0464 rsbV   FALSE 0.261 178.000 0.286 NA   NA
 1083422 1083423 CTA_0464 CTA_0465     TRUE 0.923 13.000 0.714 NA   NA
 1083423 1083424 CTA_0465 CTA_0466     TRUE 0.692 -31.000 0.027 NA   NA
 1083424 1083425 CTA_0466 CTA_0467     TRUE 0.757 -27.000 0.205 NA   NA
 1083425 1083426 CTA_0467 CTA_0468   ubiE TRUE 0.539 -64.000 0.008 NA   NA
 1083427 1083428 CTA_0469 CTA_0470   dapF FALSE 0.390 61.000 0.008 NA   NA
 1083428 1083429 CTA_0470 CTA_0471 dapF clpP_1 TRUE 0.715 -31.000 0.006 1.000 N NA
 1083429 1083430 CTA_0471 CTA_0472 clpP_1 glyA TRUE 0.943 12.000 0.051 1.000 N NA
 1083431 1083432 CTA_0473 CTA_0474   ispF FALSE 0.317 103.000 0.003 1.000 N NA
 1083433 1083434 CTA_0475 CTA_0476 cysJ rpsJ TRUE 0.875 17.000 0.006 1.000 N NA
 1083434 1083435 CTA_0476 CTA_0477 rpsJ fusA TRUE 0.979 8.000 0.007 1.000 Y NA
 1083435 1083436 CTA_0477 CTA_0478 fusA rpsG TRUE 0.924 42.000 0.008 1.000 Y NA
 1083436 1083437 CTA_0478 CTA_0479 rpsG rpsL TRUE 0.965 50.000 0.029 0.010 Y NA
 1083438 1083439 CTA_0480 CTA_0481   tsp FALSE 0.286 158.000 0.025 1.000   NA
 1083440 1083441 CTA_0482 CTA_0483 crpA omcB FALSE 0.318 178.000 0.200 1.000   NA
 1083441 1083442 CTA_0483 CTA_0484 omcB omcA TRUE 0.664 147.000 0.600 0.002   NA
 1083444 1083445 CTA_0486 CTA_0487 gltX euo FALSE 0.083 272.000 0.000 1.000   NA
 1083445 1083446 CTA_0487 CTA_0488 euo recJ FALSE 0.088 405.000 0.000 1.000   NA
 1083446 1083447 CTA_0488 CTA_0489 recJ secF FALSE 0.206 118.000 0.000 1.000 N NA
 1083447 1083448 CTA_0489 CTA_0490 secF secD TRUE 0.858 -15.000 0.000 0.004   NA
 1083448 1083449 CTA_0490 CTA_0491 secD   FALSE 0.035 420.000 0.000 NA   NA
 1083450 1083451 CTA_0492 CTA_0493 uppS cdsA TRUE 0.989 6.000 0.400 1.000 Y NA
 1083451 1083452 CTA_0493 CTA_0494 cdsA cmk TRUE 0.892 -3.000 0.008 1.000 N NA
 1083452 1083453 CTA_0494 CTA_0495 cmk plsC TRUE 0.892 -3.000 0.008 1.000 N NA
 1083453 1083454 CTA_0495 CTA_0496 plsC argS TRUE 0.886 15.000 0.006 1.000 N NA
 1083457 1083458 CTA_0499 CTA_0500   yhhY FALSE 0.075 185.000 0.002 NA   NA
 1083458 1083459 CTA_0500 CTA_0501 yhhY prfB TRUE 0.970 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 1083460 1083461 CTA_0503 CTA_0504   yaeI TRUE 0.686 58.000 0.316 1.000   NA
 1083461 1083462 CTA_0504 CTA_0505 yaeI ispD TRUE 0.802 -10.000 0.010 1.000   NA
 1083462 1083463 CTA_0505 CTA_0506 ispD truA TRUE 0.913 9.000 0.007 1.000 N NA
 1083465 1083466 CTA_0508 CTA_0509     FALSE 0.046 130.000 0.000 NA   NA
 1083466 1083467 CTA_0509 CTA_0510     FALSE 0.080 82.000 0.000 NA   NA
 1083467 1083468 CTA_0510 CTA_0511   atoS TRUE 0.747 -22.000 0.057 NA   NA
 1083468 1083469 CTA_0511 CTA_0512 atoS atoC TRUE 0.966 43.000 0.019 0.021 Y NA
 1083469 1083470 CTA_0512 CTA_0513 atoC   FALSE 0.104 67.000 0.000 NA   NA
 1083470 1083471 CTA_0513 CTA_0514     FALSE 0.075 87.000 0.000 NA   NA
 1083471 1083472 CTA_0514 CTA_0515     TRUE 0.557 -30.000 0.007 NA   NA
 1083473 1083474 CTA_0516 CTA_0517     FALSE 0.046 131.000 0.000 NA   NA
 1083475 1083476 CTA_0518 CTA_0519     TRUE 0.824 6.000 0.007 NA   NA
 1083478 1083479 CTA_0521 CTA_0522 pheT   TRUE 0.736 -3.000 0.006 NA   NA
 1083479 1083480 CTA_0522 CTA_0523   ada TRUE 0.861 19.000 0.038 NA   NA
 1083481 1083482 CTA_0524 CTA_0525 oppC_2 oppB_2 TRUE 0.972 2.000 0.400 0.022   NA
 1083482 1083483 CTA_0525 CTA_0526 oppB_2 oppA_4 TRUE 0.929 -18.000 0.318 0.022   NA
 1083483 1083484 CTA_0526 CTA_0527 oppA_4   FALSE 0.033 251.000 0.000 NA   NA
 1083484 1083485 CTA_0527 CTA_0528     FALSE 0.033 193.000 0.000 NA   NA
 1083485 1083486 CTA_0528 CTA_0529     FALSE 0.314 162.000 0.714 NA   NA
 1083488 1083489 CTA_0531 CTA_0532   hemZ FALSE 0.095 157.000 0.000 1.000   NA
 1083489 1083490 CTA_0532 CTA_0533 hemZ fliY TRUE 0.895 22.000 0.011 1.000 N NA
 1083490 1083491 CTA_0533 CTA_0534 fliY yhhF TRUE 0.623 46.000 0.005 1.000 N NA
 1083491 1083492 CTA_0534 CTA_0535 yhhF   TRUE 0.845 -3.000 0.008 1.000   NA
 1083492 1083493 CTA_0535 CTA_0536   glgC TRUE 0.486 89.000 0.070 1.000   NA
 1083495 1083496 CTA_0538 CTA_0539 rho yacE TRUE 0.906 -3.000 0.013 1.000 N NA
 1083496 1083497 CTA_0539 CTA_0540 yacE polA TRUE 0.914 -6.000 0.068 1.000 N NA
 1083497 1083498 CTA_0540 CTA_0541 polA sohB TRUE 0.878 17.000 0.006 1.000 N NA
 1083498 1083499 CTA_0541 CTA_0542 sohB   FALSE 0.333 139.000 0.011 1.000 N NA
 1083499 1083500 CTA_0542 CTA_0543   pgsA_1 FALSE 0.301 212.000 0.000 0.050 N NA
 1083500 1083501 CTA_0543 CTA_0544 pgsA_1   FALSE 0.034 182.000 0.000 NA   NA
 1083502 1083503 CTA_0545 CTA_0546 dnaB_1 gidA FALSE 0.141 295.000 0.000 1.000 N NA
 1083503 1083504 CTA_0546 CTA_0547 gidA lplA_2 TRUE 0.838 -10.000 0.008 1.000 N NA
 1083505 1083506 CTA_0548 CTA_0549 ndk ruvA FALSE 0.246 160.000 0.006 1.000 N NA
 1083506 1083507 CTA_0549 CTA_0550 ruvA ruvC TRUE 0.992 20.000 0.451 0.016 Y NA
 1083507 1083508 CTA_0550 CTA_0551 ruvC   FALSE 0.170 108.000 0.006 NA   NA
 1083508 1083509 CTA_0551 CTA_0552     FALSE 0.077 85.000 0.000 NA   NA
 1083509 1083510 CTA_0552 CTA_0553     FALSE 0.050 120.000 0.000 NA   NA
 1083510 1083511 CTA_0553 CTA_0554   gapA TRUE 0.901 11.000 0.128 NA   NA
 1083511 1083512 CTA_0554 CTA_0555 gapA rplQ TRUE 0.652 44.000 0.006 1.000 N NA
 1083512 1083513 CTA_0555 CTA_0556 rplQ rpoA TRUE 0.962 9.000 0.873 1.000 N NA
 1083513 1083514 CTA_0556 CTA_0557 rpoA rpsK TRUE 0.935 21.000 0.308 1.000 N NA
 1083514 1083515 CTA_0557 CTA_0558 rpsK rpsM TRUE 0.992 22.000 0.810 0.050 Y NA
 1083515 1083516 CTA_0558 CTA_0559 rpsM prlA TRUE 0.678 56.000 0.011 1.000 N NA
 1083516 1083517 CTA_0559 CTA_0560 prlA rplO TRUE 0.939 23.000 0.730 1.000 N NA
 1083517 1083518 CTA_0560 CTA_0561 rplO rpsE TRUE 0.986 -7.000 0.148 0.067 Y NA
 1083518 1083519 CTA_0561 CTA_0562 rpsE rplR TRUE 0.993 15.000 0.814 0.067 Y NA
 1083519 1083520 CTA_0562 CTA_0563 rplR rplF TRUE 0.992 22.000 0.815 0.050 Y NA
 1083520 1083521 CTA_0563 CTA_0564 rplF rpsH TRUE 0.988 28.000 0.808 0.050 Y NA
 1083521 1083522 CTA_0564 CTA_0565 rpsH rplE TRUE 0.990 18.000 0.059 0.050 Y NA
 1083522 1083523 CTA_0565 CTA_0566 rplE rplX TRUE 0.994 2.000 0.758 0.050 Y NA
 1083523 1083524 CTA_0566 CTA_0567 rplX rplN TRUE 0.993 13.000 0.810 0.067 Y NA
 1083524 1083525 CTA_0567 CTA_0568 rplN rpsQ TRUE 0.992 17.000 0.791 0.067 Y NA
 1083525 1083526 CTA_0568 CTA_0569 rpsQ rpmC TRUE 0.990 -7.000 0.828 0.050 Y NA
 1083526 1083527 CTA_0569 CTA_0570 rpmC rplP TRUE 0.994 2.000 0.802 0.050 Y NA
 1083527 1083528 CTA_0570 CTA_0571 rplP rpsC TRUE 0.983 33.000 0.828 0.067 Y NA
 1083528 1083529 CTA_0571 CTA_0572 rpsC rplV TRUE 0.993 10.000 0.719 0.067 Y NA
 1083529 1083530 CTA_0572 CTA_0573 rplV rpsS TRUE 0.992 19.000 0.769 0.067 Y NA
 1083530 1083531 CTA_0573 CTA_0574 rpsS rplB TRUE 0.994 6.000 0.820 0.067 Y NA
 1083531 1083532 CTA_0574 CTA_0575 rplB rplW TRUE 0.991 24.000 0.849 0.044 Y NA
 1083532 1083533 CTA_0575 CTA_0576 rplW rplD TRUE 0.989 16.000 0.013 0.050 Y NA
 1083533 1083534 CTA_0576 CTA_0577 rplD rplC TRUE 0.991 9.000 0.020 0.050 Y NA
 1083534 1083535 CTA_0577 CTA_0578 rplC   FALSE 0.035 435.000 0.000 NA   NA
 1083535 1083536 CTA_0578 CTA_0579   fmt FALSE 0.104 166.000 0.006 NA   NA
 1083536 1083537 CTA_0579 CTA_0580 fmt lpxA TRUE 0.828 -10.000 0.007 1.000 N NA
 1083537 1083538 CTA_0580 CTA_0581 lpxA fabZ TRUE 0.942 12.000 0.048 1.000 N NA
 1083538 1083539 CTA_0581 CTA_0582 fabZ lpxC TRUE 0.903 -3.000 0.012 1.000 N NA
 1083539 1083540 CTA_0582 CTA_0583 lpxC cutE TRUE 0.775 101.000 0.012 1.000 Y NA
 1083540 1083541 CTA_0583 CTA_0584 cutE yciA TRUE 0.675 64.000 0.072 1.000 N NA
 1083541 1083542 CTA_0584 CTA_0585 yciA dnaQ_2 FALSE 0.426 136.000 0.072 1.000 N NA
 1083542 1083543 CTA_0585 CTA_0586 dnaQ_2 yjeE TRUE 0.814 4.000 0.007 NA   NA
 1083543 1083544 CTA_0586 CTA_0587 yjeE   TRUE 0.656 -21.000 0.010 NA   NA
 1083545 1083546 CTA_0588 CTA_0589   trxA FALSE 0.035 174.000 0.000 NA   NA
 1083547 1083548 CTA_0590 CTA_0591 yibK mip TRUE 0.811 16.000 0.000 1.000 N NA
 1083548 1083549 CTA_0591 CTA_0592 mip aspS FALSE 0.260 137.000 0.006 1.000 N NA
 1083549 1083550 CTA_0592 CTA_0593 aspS hisS TRUE 0.971 -19.000 0.009 0.061 Y NA
 1083551 1083552 CTA_0594 CTA_0595 uhpC dnaE TRUE 0.903 14.000 0.007 1.000 N NA
 1083554 1083555 CTA_0597 CTA_0598     TRUE 0.882 25.000 0.750 NA   NA
 1083555 1083556 CTA_0598 CTA_0599   rsbW TRUE 0.858 -13.000 0.875 NA   NA
 1083558 1083559 CTA_0601 CTA_0602 dacC   FALSE 0.328 134.000 0.455 NA   NA
 1083559 1083560 CTA_0602 CTA_0603   fmu TRUE 0.838 -3.000 0.020 NA   NA
 1083560 1083561 CTA_0603 CTA_0604 fmu brnQ FALSE 0.224 150.000 0.008 NA N NA
 1083561 1083562 CTA_0604 CTA_0605 brnQ   FALSE 0.434 175.000 0.545 1.000 N NA
 1083562 1083563 CTA_0605 CTA_0606     FALSE 0.290 178.000 0.600 NA   NA
 1083563 1083564 CTA_0606 CTA_0607   lpdA FALSE 0.033 209.000 0.000 NA   NA
 1083564 1083565 CTA_0607 CTA_0608 lpdA lipA TRUE 0.895 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1083565 1083566 CTA_0608 CTA_0609 lipA sctJ FALSE 0.318 104.000 0.004 1.000 N NA
 1083566 1083567 CTA_0609 CTA_0610 sctJ   TRUE 0.927 1.000 0.875 NA   NA
 1083567 1083568 CTA_0610 CTA_0611   sctL FALSE 0.277 276.000 0.556 NA   NA
 1083568 1083569 CTA_0611 CTA_0612 sctL sctR TRUE 0.988 13.000 0.700 1.000 Y NA
 1083569 1083570 CTA_0612 CTA_0613 sctR sctS TRUE 0.995 12.000 0.700 0.013 Y NA
 1083570 1083571 CTA_0613 CTA_0614 sctS sctT TRUE 0.990 7.000 0.875 1.000 Y NA
 1083572 1083573 CTA_0615 CTA_0616     TRUE 0.503 91.000 1.000 NA   NA
 1083573 1083574 CTA_0616 CTA_0617     TRUE 0.929 6.000 0.667 NA   NA
 1083574 1083575 CTA_0617 CTA_0618     TRUE 0.839 -15.000 0.667 NA   NA
 1083575 1083576 CTA_0618 CTA_0619   gspG TRUE 0.831 -16.000 0.667 NA   NA
 1083576 1083577 CTA_0619 CTA_0620 gspG gspF TRUE 0.865 62.000 0.030 NA Y NA
 1083577 1083578 CTA_0620 CTA_0621 gspF gspE TRUE 0.984 12.000 0.035 1.000 Y NA
 1083578 1083579 CTA_0621 CTA_0622 gspE gspD_1 TRUE 0.971 -16.000 0.467 1.000 Y NA
 1083579 1083580 CTA_0622 CTA_0623 gspD_1   TRUE 0.913 1.000 0.467 NA   NA
 1083580 1083581 CTA_0623 CTA_0624   pepP FALSE 0.224 128.000 0.014 NA   NA
 1083581 1083582 CTA_0624 CTA_0625 pepP mutL TRUE 0.912 11.000 0.007 1.000 N NA
 1083583 1083584 CTA_0626 CTA_0627 lcrH_1   TRUE 0.898 17.000 0.333 NA   NA
 1083584 1083585 CTA_0627 CTA_0628     TRUE 0.813 37.000 0.857 NA   NA
 1083585 1083586 CTA_0628 CTA_0629     TRUE 0.948 31.000 0.750 0.009   NA
 1083588 1083589 CTA_0631 CTA_0632 thrS minD FALSE 0.357 451.000 0.035 1.000 N NA
 1083589 1083590 CTA_0632 CTA_0633 minD gp6D TRUE 0.935 5.000 0.875 NA   NA
 1083590 1083591 CTA_0633 CTA_0634 gp6D   TRUE 0.788 -34.000 0.750 NA   NA
 1083591 1083592 CTA_0634 CTA_0635   trpS FALSE 0.209 199.000 0.039 NA   NA
 1083592 1083593 CTA_0635 CTA_0636 trpS uvrB TRUE 0.917 25.000 0.006 0.059 N NA
 1083593 1083594 CTA_0636 CTA_0637 uvrB eno FALSE 0.240 162.000 0.006 1.000 N NA
 1083594 1083595 CTA_0637 CTA_0638 eno rbsU FALSE 0.293 127.000 0.006 1.000 N NA
 1083595 1083596 CTA_0638 CTA_0639 rbsU   FALSE 0.464 125.000 0.750 1.000   NA
 1083597 1083598 CTA_0640 CTA_0641   sdhB FALSE 0.311 97.000 0.019 NA   NA
 1083598 1083599 CTA_0641 CTA_0642 sdhB sdhA TRUE 0.939 79.000 0.231 0.005 Y NA
 1083599 1083600 CTA_0642 CTA_0643 sdhA sdhC TRUE 0.992 -3.000 0.179 0.005 Y NA
 1083600 1083601 CTA_0643 CTA_0644 sdhC   TRUE 0.879 26.000 0.000 0.005   NA
 1083601 1083602 CTA_0644 CTA_0645   ycfH FALSE 0.033 222.000 0.000 NA   NA
 1083602 1083603 CTA_0645 CTA_0646 ycfH dsdD FALSE 0.370 85.000 0.008 NA N NA
 1083604 1083605 CTA_0647 CTA_0648 exbB exbD TRUE 0.992 -3.000 0.583 0.035 Y NA
 1083605 1083606 CTA_0648 CTA_0649 exbD   TRUE 0.921 3.000 0.500 NA   NA
 1083606 1083607 CTA_0649 CTA_0650   tolB TRUE 0.919 0.000 0.750 NA   NA
 1083607 1083608 CTA_0650 CTA_0651 tolB pal TRUE 0.947 -3.000 0.750 1.000 N NA
 1083608 1083609 CTA_0651 CTA_0652 pal papQ TRUE 0.577 -10.000 0.000 1.000   NA
 1083609 1083610 CTA_0652 CTA_0653 papQ   FALSE 0.093 71.000 0.000 NA   NA
 1083611 1083612 CTA_0654 CTA_0655 ahpC   TRUE 0.495 1.000 0.000 NA   NA
 1083612 1083613 CTA_0655 CTA_0656   groEL_2 FALSE 0.033 207.000 0.000 NA   NA
 1083613 1083614 CTA_0656 CTA_0657 groEL_2 ybbC FALSE 0.453 77.000 0.128 NA   NA
 1083616 1083617 CTA_0659 CTA_0660   ung TRUE 0.796 -15.000 0.140 NA   NA
 1083618 1083619 CTA_0661 CTA_0662 uvrD rpoN TRUE 0.934 4.000 0.015 1.000 N NA
 1083620 1083621 CTA_0663 CTA_0664 pqqC   TRUE 0.863 -3.000 0.055 NA   NA
 1083621 1083622 CTA_0664 CTA_0665   folA TRUE 0.678 -28.000 0.017 NA   NA
 1083622 1083623 CTA_0665 CTA_0666 folA folP TRUE 0.977 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 1083623 1083624 CTA_0666 CTA_0667 folP folX TRUE 0.979 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 1083624 1083625 CTA_0667 CTA_0668 folX rpoD TRUE 0.923 19.000 0.030 1.000 N NA
 1083625 1083626 CTA_0668 CTA_0669 rpoD   TRUE 0.657 149.000 0.857 0.005   NA
 1083627 1083628 CTA_0670 CTA_0671 rpsT   FALSE 0.082 232.000 0.004 NA   NA
 1083631 1083632 CTA_0674 CTA_0675     FALSE 0.083 228.000 0.000 1.000   NA
 1083632 1083633 CTA_0675 CTA_0676     FALSE 0.430 108.000 0.833 NA   NA
 1083633 1083634 CTA_0676 CTA_0677   mviN FALSE 0.134 201.000 0.008 NA   NA
 1083638 1083639 CTA_0681 CTA_0682 ispA glmU TRUE 0.672 56.000 0.054 1.000   NA
 1083639 1083640 CTA_0682 CTA_0683 glmU cpxR TRUE 0.725 53.000 0.250 1.000   NA
 1083641 1083642 CTA_0684 CTA_0685     FALSE 0.064 100.000 0.000 NA   NA
 1083645 1083646 CTA_0688 CTA_0689     TRUE 0.860 22.000 0.086 NA   NA
 1083649 1083650 CTA_0692 CTA_0693 tyrB   TRUE 0.724 -25.000 0.005 1.000 N NA
 1083651 1083652 CTA_0694 CTA_0695 recB recC TRUE 0.995 2.000 0.542 0.005 Y NA
 1083656 1083657 CTA_0699 CTA_0700 yohI   TRUE 0.652 -21.000 0.005 1.000   NA
 1083658 1083659 CTA_0701 CTA_0702     TRUE 0.926 0.000 1.000 NA   NA
 1083659 1083660 CTA_0702 CTA_0703     TRUE 0.854 -9.000 0.429 NA   NA
 1083660 1083661 CTA_0703 CTA_0704   ygfA TRUE 0.777 3.000 0.006 NA   NA
 1083661 1083662 CTA_0704 CTA_0705 ygfA recA FALSE 0.139 261.000 0.000 1.000 N NA
 1083662 1083663 CTA_0705 CTA_0706 recA   FALSE 0.084 286.000 0.000 1.000   NA
 1083663 1083664 CTA_0706 CTA_0707   recD_2 TRUE 0.887 -3.000 0.023 1.000   NA
 1083664 1083665 CTA_0707 CTA_0708 recD_2   FALSE 0.336 66.000 0.008 NA   NA
 1083666 1083667 CTA_0709 CTA_0710 yhbG   TRUE 0.840 9.000 0.009 NA   NA
 1083667 1083668 CTA_0710 CTA_0711   kdsA TRUE 0.804 -3.000 0.011 NA   NA
 1083669 1083670 CTA_0712 CTA_0713     FALSE 0.058 107.000 0.000 NA   NA
 1083670 1083671 CTA_0713 CTA_0714     TRUE 0.926 0.000 1.000 NA   NA
 1083671 1083672 CTA_0714 CTA_0715   sfhB FALSE 0.161 82.000 0.002 NA   NA
 1083672 1083673 CTA_0715 CTA_0716 sfhB   FALSE 0.478 100.000 0.004 0.042   NA
 1083674 1083675 CTA_0717 CTA_0718 gyrA_2 gyrB_2 TRUE 0.993 15.000 0.110 0.005 Y NA
 1083676 1083677 CTA_0719 CTA_0720 hemA   FALSE 0.090 719.000 0.000 1.000   NA
 1083677 1083678 CTA_0720 CTA_0721     TRUE 0.907 4.000 0.146 NA   NA
 1083678 1083679 CTA_0721 CTA_0722     TRUE 0.674 44.000 0.171 NA   NA
 1083679 1083680 CTA_0722 CTA_0723     TRUE 0.870 27.000 0.857 NA   NA
 1083680 1083681 CTA_0723 CTA_0724     FALSE 0.447 19.000 0.000 NA   NA
 1083681 1083682 CTA_0724 CTA_0725     FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 1083682 1083683 CTA_0725 CTA_0726   sctN TRUE 0.929 2.000 0.857 NA   NA
 1083683 1083684 CTA_0726 CTA_0727 sctN   TRUE 0.899 23.000 0.875 NA   NA
 1083684 1083685 CTA_0727 CTA_0728     TRUE 0.931 4.000 0.750 NA   NA
 1083685 1083686 CTA_0728 CTA_0729   sctQ TRUE 0.923 10.000 0.600 NA   NA
 1083686 1083687 CTA_0729 CTA_0730 sctQ pkn5 TRUE 0.489 135.000 0.583 1.000 N NA
 1083687 1083688 CTA_0730 CTA_0731 pkn5 gspD_2 TRUE 0.933 -3.000 0.208 1.000 N NA
 1083688 1083689 CTA_0731 CTA_0732 gspD_2   FALSE 0.044 134.000 0.000 NA   NA
 1083690 1083691 CTA_0733 CTA_0734 karG   TRUE 0.900 -10.000 0.848 1.000   NA
 1083691 1083692 CTA_0734 CTA_0735     FALSE 0.067 96.000 0.000 NA   NA
 1083692 1083693 CTA_0735 CTA_0736     FALSE 0.464 17.000 0.000 NA   NA
 1083693 1083694 CTA_0736 CTA_0737   rrf FALSE 0.062 103.000 0.000 NA   NA
 1083694 1083695 CTA_0737 CTA_0738 rrf pyrH TRUE 0.944 -3.000 0.626 1.000 N NA
 1083695 1083696 CTA_0738 CTA_0739 pyrH tsf TRUE 0.953 13.000 0.416 1.000 N NA
 1083696 1083697 CTA_0739 CTA_0740 tsf rpsB TRUE 0.985 -3.000 0.748 1.000 Y NA
 1083697 1083698 CTA_0740 CTA_0741 rpsB   FALSE 0.080 82.000 0.000 NA   NA
 1083698 1083699 CTA_0741 CTA_0742   ompA FALSE 0.033 226.000 0.000 NA   NA
 1083700 1083701 CTA_0743 CTA_0744 pbpB   TRUE 0.647 64.000 0.400 1.000   NA
 1083701 1083702 CTA_0744 CTA_0745     FALSE 0.086 343.000 0.000 1.000   NA
 1083702 1083703 CTA_0745 CTA_0746     TRUE 0.988 3.000 0.466 1.000 Y NA
 1083703 1083704 CTA_0746 CTA_0747     TRUE 0.989 4.000 0.482 1.000 Y NA
 1083704 1083705 CTA_0747 CTA_0748   yfhO_2 TRUE 0.914 -7.000 0.193 1.000 N NA
 1083705 1083706 CTA_0748 CTA_0749 yfhO_2 parB FALSE 0.236 136.000 0.002 1.000 N NA
 1083707 1083708 CTA_0750 CTA_0751 dppF dppD TRUE 0.959 -7.000 0.250 0.004   NA
 1083709 1083710 CTA_0752 CTA_0753     TRUE 0.933 3.000 0.937 NA   NA
 1083710 1083711 CTA_0753 CTA_0754   pgk FALSE 0.196 128.000 0.005 1.000   NA
 1083711 1083712 CTA_0754 CTA_0755 pgk   FALSE 0.033 259.000 0.000 NA   NA
 1083712 1083713 CTA_0755 CTA_0756     TRUE 0.673 51.000 0.333 NA   NA
 1083713 1083714 CTA_0756 CTA_0757     TRUE 0.521 86.000 1.000 NA   NA
 1083715 1083716 CTA_0758 CTA_0759 nth trmE TRUE 0.883 7.000 0.007 1.000   NA
 1083717 1083718 CTA_0760 CTA_0761 psdD   TRUE 0.579 65.000 0.052 1.000   NA
 1083718 1083719 CTA_0761 CTA_0762   secA_2 FALSE 0.237 259.000 0.015 1.000   NA
 1083720 1083721 CTA_0763 CTA_0764   yphC FALSE 0.206 77.000 0.005 NA   NA
 1083721 1083722 CTA_0764 CTA_0765 yphC pcnB_2 FALSE 0.240 116.000 0.006 1.000   NA
 1083722 1083723 CTA_0765 CTA_0766 pcnB_2 clpX TRUE 0.888 15.000 0.006 1.000 N NA
 1083723 1083724 CTA_0766 CTA_0767 clpX clpP_2 TRUE 0.988 10.000 0.352 1.000 Y NA
 1083724 1083725 CTA_0767 CTA_0768 clpP_2 tig TRUE 0.741 167.000 0.351 1.000 Y NA
 1083725 1083726 CTA_0768 CTA_0769 tig   FALSE 0.272 35.000 0.000 NA   NA
 1083727 1083728 CTA_0770 CTA_0771   mreB TRUE 0.926 5.000 0.009 1.000 N NA
 1083728 1083729 CTA_0771 CTA_0772 mreB pckA TRUE 0.902 -3.000 0.011 1.000 N NA
 1083729 1083730 CTA_0772 CTA_0773 pckA   FALSE 0.288 112.000 0.026 NA   NA
 1083730 1083731 CTA_0773 CTA_0774     TRUE 0.875 27.000 1.000 NA   NA
 1083732 1083733 CTA_0775 CTA_0776 ompB gpdA FALSE 0.403 133.000 0.375 1.000   NA
 1083733 1083734 CTA_0776 CTA_0777 gpdA   TRUE 0.925 -3.000 0.044 1.000 N NA
 1083734 1083735 CTA_0777 CTA_0778     TRUE 0.890 12.000 0.044 NA   NA
 1083735 1083736 CTA_0778 CTA_0779   fliI TRUE 0.868 -7.000 0.500 NA   NA
 1083736 1083737 CTA_0779 CTA_0780 fliI   TRUE 0.539 74.000 0.667 NA   NA
 1083737 1083738 CTA_0780 CTA_0781   fliF TRUE 0.925 5.000 0.500 NA   NA
 1083738 1083739 CTA_0781 CTA_0782 fliF   FALSE 0.299 273.000 0.136 NA N NA
 1083739 1083740 CTA_0782 CTA_0783   yfhO_3 TRUE 0.931 -3.000 0.138 1.000 N NA
 1083740 1083741 CTA_0783 CTA_0784 yfhO_3 pgmA TRUE 0.797 -45.000 0.021 1.000 N NA
 1083742 1083743 CTA_0785 CTA_0786 yjbC   FALSE 0.311 119.000 0.080 NA   NA
 1083743 1083744 CTA_0786 CTA_0787   birA TRUE 0.812 27.000 0.061 NA   NA
 1083745 1083746 CTA_0788 CTA_0789 rodA zntA TRUE 0.723 92.000 0.078 0.046 N NA
 1083746 1083747 CTA_0789 CTA_0790 zntA   TRUE 0.821 24.000 0.026 NA   NA
 1083747 1083748 CTA_0790 CTA_0791   serS TRUE 0.735 37.000 0.057 NA   NA
 1083749 1083750 CTA_0792 CTA_0793 ribD ribA TRUE 0.867 110.000 0.007 0.004 Y NA
 1083750 1083751 CTA_0793 CTA_0794 ribA ribE TRUE 0.970 -31.000 0.006 0.004 Y NA
 1083753 1083754 CTA_0796 CTA_0797   dagA FALSE 0.385 105.000 0.316 NA   NA
 1083754 1083755 CTA_0797 CTA_0798 dagA ybcL TRUE 0.608 58.000 0.316 NA   NA
 1083756 1083757 CTA_0799 CTA_0800   yycJ TRUE 0.878 -3.000 0.016 1.000   NA
 1083757 1083758 CTA_0800 CTA_0801 yycJ ftsK TRUE 0.911 4.000 0.016 1.000   NA
 1083758 1083759 CTA_0801 CTA_0802 ftsK   FALSE 0.035 180.000 0.000 NA   NA
 1083759 1083760 CTA_0802 CTA_0803     FALSE 0.073 89.000 0.000 NA   NA
 1083761 1083762 CTA_0804 CTA_0805     FALSE 0.033 244.000 0.000 NA   NA
 1083762 3420678 CTA_0805 CTA_r01     FALSE 0.051 119.000 0.000 NA   NA
 1083763 1083764 CTA_0806 CTA_0807 dmpP yajC FALSE 0.213 143.000 0.007 NA N NA
 1083764 1083765 CTA_0807 CTA_0808 yajC ygcA FALSE 0.289 105.000 0.007 NA N NA
 1083765 1083766 CTA_0808 CTA_0809 ygcA hctA FALSE 0.284 188.000 0.048 1.000   NA
 1083768 1083769 CTA_0811 CTA_0812 hemG hemN_2 TRUE 0.992 -3.000 0.057 0.004 Y NA
 1083769 1083770 CTA_0812 CTA_0813 hemN_2 hemE TRUE 0.978 -27.000 0.012 0.004 Y NA
 1083770 1083771 CTA_0813 CTA_0814 hemE mfd TRUE 0.900 13.000 0.006 1.000 N NA
 1083771 1083772 CTA_0814 CTA_0815 mfd alaS TRUE 0.754 -24.000 0.006 1.000 N NA
 1083772 1083773 CTA_0815 CTA_0816 alaS   FALSE 0.039 150.000 0.000 NA   NA
 1083774 1083775 CTA_0817 CTA_0818     FALSE 0.033 244.000 0.000 NA   NA
 1083775 3420679 CTA_0818 CTA_r02     FALSE 0.050 120.000 0.000 NA   NA
 3420679 1083776 CTA_r02 CTA_0819   tktB FALSE 0.033 278.000 0.000 NA   NA
 1083779 1083780 CTA_0822 CTA_0823   icc TRUE 0.628 47.000 0.054 NA   NA
 1083780 1083781 CTA_0823 CTA_0824 icc groEL_3 FALSE 0.479 81.000 0.027 1.000   NA
 1083781 1083782 CTA_0824 CTA_0825 groEL_3   FALSE 0.084 78.000 0.000 NA   NA
 1083783 1083784 CTA_0826 CTA_0827 murF mraY TRUE 0.841 146.000 0.018 0.008 Y NA
 1083784 1083785 CTA_0827 CTA_0828 mraY murD TRUE 0.995 12.000 0.647 0.008 Y NA
 1083785 1083786 CTA_0828 CTA_0829 murD nlpD TRUE 0.970 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 1083786 1083787 CTA_0829 CTA_0830 nlpD ftsW TRUE 0.938 16.000 0.088 1.000 N NA
 1083787 1083788 CTA_0830 CTA_0831 ftsW murG TRUE 0.789 -91.000 0.037 1.000 N NA
 1083788 1083789 CTA_0831 CTA_0832 murG murC-ddlA TRUE 0.988 5.000 0.270 1.000 Y NA
 1083790 1083791 CTA_0833 CTA_0834     FALSE 0.094 158.000 0.005 NA   NA
 1083792 1083793 CTA_0835 CTA_0836 rbsV miaA TRUE 0.945 4.000 0.040 1.000 N NA
 1083795 1083796 CTA_0838 CTA_0839   ybeB FALSE 0.035 454.000 0.000 NA   NA
 1083796 1083797 CTA_0839 CTA_0840 ybeB fabF TRUE 0.820 11.000 0.008 NA   NA
 1083797 1083798 CTA_0840 CTA_0841 fabF   TRUE 0.938 -3.000 0.333 1.000 N NA
 1083802 1083803 CTA_0845 CTA_0846   aas TRUE 0.992 8.000 0.032 0.040 Y NA
 1083803 1083804 CTA_0846 CTA_0847 aas bioF TRUE 0.785 43.000 0.032 1.000 N NA
 1083805 1083806 CTA_0848 CTA_0849     TRUE 0.529 -45.000 0.007 NA   NA
 1083807 1083808 CTA_0850 CTA_0851   lysS FALSE 0.083 232.000 0.000 1.000   NA
 1083811 1083812 CTA_0854 CTA_0855 rnpA rpmH TRUE 0.945 13.000 0.787 1.000   NA
 1083813 1083814 CTA_0856 CTA_0857 rpmJ rpsN TRUE 0.931 24.000 0.013 0.045   NA
 1083815 1083816 CTA_0858 CTA_0859     FALSE 0.050 122.000 0.000 NA   NA
 1083818 1083819 CTA_0861 CTA_0862 uvrC mutS TRUE 0.978 25.000 0.006 0.055 Y NA
 1083820 1083821 CTA_0863 CTA_0864   dnaG TRUE 0.505 2.000 0.000 NA   NA
 1083821 1083822 CTA_0864 CTA_0865 dnaG   TRUE 0.488 85.000 0.625 NA   NA
 1083822 1083823 CTA_0865 CTA_0866     FALSE 0.338 127.000 0.333 NA   NA
 1083827 1083828 CTA_0870 CTA_0871   rplY FALSE 0.033 277.000 0.000 NA   NA
 1083828 1083829 CTA_0871 CTA_0872 rplY pth TRUE 0.993 8.000 0.496 0.068 Y NA
 1083829 1083830 CTA_0872 CTA_0873 pth rpsF TRUE 0.813 138.000 0.029 0.068 Y NA
 1083830 1083831 CTA_0873 CTA_0874 rpsF rpsR TRUE 0.992 17.000 0.319 0.045 Y NA
 1083831 1083832 CTA_0874 CTA_0875 rpsR rplI TRUE 0.991 21.000 0.499 0.045 Y NA
 1083832 1083833 CTA_0875 CTA_0876 rplI ispE TRUE 0.551 64.000 0.007 1.000 N NA
 1083834 1083835 CTA_0877 CTA_0878   ptr FALSE 0.253 179.000 0.250 NA   NA
 1083835 1083836 CTA_0878 CTA_0879 ptr plsB FALSE 0.308 57.000 0.000 1.000   NA
 1083836 1083837 CTA_0879 CTA_0880 plsB cafE TRUE 0.906 13.000 0.019 1.000   NA
 1083838 1083839 CTA_0881 CTA_0882   rpmF FALSE 0.086 260.000 0.005 NA   NA
 1083839 1083840 CTA_0882 CTA_0883 rpmF plsX TRUE 0.933 23.000 0.418 1.000 N NA
 1083840 1083841 CTA_0883 CTA_0884 plsX pmpD FALSE 0.144 221.000 0.005 1.000   NA
 1083841 1083842 CTA_0884 CTA_0885 pmpD   FALSE 0.033 244.000 0.000 NA   NA
 1083843 1083844 CTA_0886 CTA_0887     TRUE 0.805 -33.000 1.000 NA   NA
 1083845 1083846 CTA_0888 CTA_0889 mrsA_2 glmS TRUE 0.939 11.000 0.030 1.000 N NA
 1083846 1083847 CTA_0889 CTA_0890 glmS tyrP_1 FALSE 0.316 103.000 0.003 1.000 N NA
 1083847 1083848 CTA_0890 CTA_0891 tyrP_1 tyrP_2.1 TRUE 0.624 182.000 1.000 0.006   NA
 1083848 1083849 CTA_0891 CTA_0892 tyrP_2.1 typP_2.2 TRUE 0.844 -15.000 0.000 0.006   NA
 1083849 1083850 CTA_0892 CTA_0893 typP_2.2 yccA TRUE 0.714 42.000 0.250 NA   NA
 1083852 1083853 CTA_0895 CTA_0896 sucC sucD TRUE 0.995 15.000 0.467 0.002 Y NA
 1083853 1083854 CTA_0896 CTA_0897 sucD htrA FALSE 0.415 139.000 0.069 1.000 N NA
 1083854 1083855 CTA_0897 CTA_0898 htrA   FALSE 0.253 198.000 0.000 0.027   NA
 1083856 1083857 CTA_0899 CTA_0900   pssA TRUE 0.855 4.000 0.011 NA   NA
 1083858 1083859 CTA_0901 CTA_0902 nrdA nrdB TRUE 0.985 38.000 0.564 0.002 Y NA
 1083859 1083860 CTA_0902 CTA_0903 nrdB trmB FALSE 0.194 260.000 0.008 1.000   NA
 1083863 1083864 CTA_0906 CTA_0907 murB nusB FALSE 0.330 133.000 0.008 1.000 N NA
 1083865 1083866 CTA_0908 CTA_0909 infC rpmI TRUE 0.989 11.000 0.652 1.000 Y NA
 1083866 1083867 CTA_0909 CTA_0910 rpmI rplT TRUE 0.993 19.000 0.928 0.045 Y NA
 1083867 1083868 CTA_0910 CTA_0911 rplT pheS TRUE 0.987 7.000 0.202 1.000 Y NA
 1083868 1083869 CTA_0911 CTA_0912 pheS   TRUE 0.495 1.000 0.000 NA   NA
 1083869 1083870 CTA_0912 CTA_0913     FALSE 0.033 226.000 0.000 NA   NA
 1083871 1083872 CTA_0914 CTA_0915     TRUE 0.973 3.000 0.631 0.045   NA
 1083873 1083874 CTA_0916 CTA_0917 tilS ftsH FALSE 0.400 161.000 0.145 1.000 N NA
 1083875 1083876 CTA_0918 CTA_0919 pnp rpsO TRUE 0.973 29.000 0.335 1.000 Y NA
 1083877 1083878 CTA_0920 CTA_0921 yfhC   TRUE 0.699 32.000 0.013 NA   NA
 1083879 1083880 CTA_0922 CTA_0923     FALSE 0.375 135.000 1.000 NA   NA
 1083880 1083881 CTA_0923 CTA_0924     TRUE 0.923 16.000 1.000 NA   NA
 1083881 1083882 CTA_0924 CTA_0925     TRUE 0.868 28.000 1.000 NA   NA
 1083883 1083884 CTA_0926 CTA_0927     TRUE 0.901 19.000 0.571 NA   NA
 1083885 1083886 CTA_0928 CTA_0929 map yghN TRUE 0.698 58.000 0.429 NA N NA
 1083886 1083887 CTA_0929 CTA_0930 yghN   TRUE 0.976 18.000 0.042 NA Y NA
 1083887 1083888 CTA_0930 CTA_0931     FALSE 0.251 195.000 0.020 NA N NA
 1083890 1083891 CTA_0933 CTA_0934 ychM   FALSE 0.034 188.000 0.000 NA   NA
 1083892 1083893 CTA_0935 CTA_0936   cpa FALSE 0.453 114.000 0.400 1.000   NA
 1083893 1083894 CTA_0936 CTA_0937 cpa ispH TRUE 0.517 95.000 0.400 1.000   NA
 1083895 1083896 CTA_0938 CTA_0939     TRUE 0.932 12.000 1.000 NA   NA
 1083896 1083897 CTA_0939 CTA_0940   lcrH_2 TRUE 0.869 27.000 0.833 NA   NA
 1083897 1083898 CTA_0940 CTA_0941 lcrH_2   TRUE 0.764 -78.000 0.833 NA   NA
 1083899 1083900 CTA_0942 CTA_0943     FALSE 0.056 109.000 0.000 NA   NA
 1083902 1083903 CTA_0945 CTA_0946   glgB TRUE 0.916 15.000 0.636 NA   NA
 1083904 1083905 CTA_0947 CTA_0948     FALSE 0.335 211.000 0.000 0.002   NA
 1083905 1083906 CTA_0948 CTA_0949   pmpE FALSE 0.370 178.000 0.667 1.000   NA
 1083906 1083907 CTA_0949 CTA_0950 pmpE pmpF TRUE 0.921 3.000 0.000 0.013   NA
 1083908 1083909 CTA_0951 CTA_0952 pmpG pmpH TRUE 0.949 31.000 1.000 0.013   NA
 1083909 1083910 CTA_0952 CTA_0953 pmpH   FALSE 0.035 415.000 0.000 NA   NA
 1083912 1083913 pCTA_0001 pCTA_0002     FALSE 0.033 242.000 0.000 NA   NA
 1083913 1083914 pCTA_0002 pCTA_0003     TRUE 0.905 -3.000 0.750 NA   NA
 1083914 1083915 pCTA_0003 pCTA_0004     FALSE 0.482 91.000 0.750 NA   NA
 1083915 1083916 pCTA_0004 pCTA_0005     TRUE 0.562 70.000 0.800 NA   NA
 1083916 1083917 pCTA_0005 pCTA_0006     TRUE 0.610 62.000 0.600 NA   NA
 1083917 1083918 pCTA_0006 pCTA_0007   dnaB_2 TRUE 0.876 -6.000 0.500 NA   NA