MicrobesOnline Operon Predictions for Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1098958 1098959 LSA0001 LSA0002 dnaA dnaN TRUE 0.755 178.000 0.328 1.000 Y NA
 1098959 1098960 LSA0002 LSA0003 dnaN   FALSE 0.305 243.000 0.103 1.000   NA
 1098960 1098961 LSA0003 LSA0004   recF TRUE 0.974 7.000 0.209 1.000   NA
 1098961 1098962 LSA0004 LSA0005 recF gyrB TRUE 0.979 37.000 0.249 0.008 Y NA
 1098962 1098963 LSA0005 LSA0006 gyrB gyrA TRUE 0.978 48.000 0.306 0.003 Y NA
 1098963 1098964 LSA0006 LSA0007 gyrA rpsF FALSE 0.184 237.000 0.003 1.000 N NA
 1098964 1098965 LSA0007 LSA0008 rpsF ssb TRUE 0.713 39.000 0.002 1.000 N NA
 1098965 1098966 LSA0008 LSA0009 ssb rpsR TRUE 0.770 31.000 0.002 1.000 N NA
 1098966 1098967 LSA0009 LSA0010 rpsR   FALSE 0.225 218.000 0.016 1.000 N NA
 1098967 1098968 LSA0010 LSA0011   rplI TRUE 0.923 21.000 0.119 1.000 N NA
 1098968 1098969 LSA0011 LSA0012 rplI dnaC TRUE 0.509 134.000 0.100 1.000 N NA
 1098971 1098972 LSA0014 LSA0015 gidB parB1 TRUE 0.971 0.000 0.089 1.000 N NA
 1098972 1098973 LSA0015 LSA0016 parB1 parA TRUE 0.924 12.000 0.069 1.000 N NA
 1098973 1098974 LSA0016 LSA0017 parA parB2 TRUE 0.996 -10.000 0.827 1.000 N NA
 1098974 1098975 LSA0017 LSA0018 parB2   TRUE 0.828 19.000 0.039 NA   NA
 1098975 1098976 LSA0018 LSA0019     TRUE 0.841 24.000 0.064 NA   NA
 1098976 1098977 LSA0019 LSA0020     TRUE 0.799 18.000 0.022 NA   NA
 1098977 1098978 LSA0020 LSA0021     FALSE 0.303 37.000 0.000 NA   NA
 1098978 1098979 LSA0021 LSA0022     FALSE 0.041 381.000 0.000 1.000   NA
 1098980 1098982 LSA0023 LSA0025     FALSE 0.018 1019.000 0.000 NA   NA
 1098982 1098983 LSA0025 LSA0026     TRUE 0.893 13.000 0.083 NA   NA
 1098984 1098985 LSA0027 LSA0028     FALSE 0.080 110.000 0.000 NA   NA
 1098986 1098987 LSA0029 LSA0030     FALSE 0.062 232.000 0.000 1.000   NA
 1098987 1098988 LSA0030 LSA0031     FALSE 0.171 84.000 0.000 1.000   NA
 1098988 1098989 LSA0031 LSA0032     FALSE 0.136 74.000 0.000 NA   NA
 1098989 1098990 LSA0032 LSA0033     FALSE 0.085 94.000 0.000 NA   NA
 1098990 1098991 LSA0033 LSA0035     FALSE 0.334 64.000 0.000 1.000 N NA
 1098991 1098992 LSA0035 LSA0036     TRUE 0.615 25.000 0.000 1.000 N NA
 1098993 1098994 LSA0037 LSA0038   usp5 FALSE 0.170 106.000 0.000 1.000 N NA
 1098994 1098995 LSA0038 LSA0039 usp5 tag1 FALSE 0.219 83.000 0.000 1.000 N NA
 1098995 1098996 LSA0039 LSA0040 tag1   FALSE 0.343 83.000 0.008 NA   NA
 1098996 1098997 LSA0040 LSA0041   panE FALSE 0.051 170.000 0.000 NA   NA
 1098997 1098998 LSA0041 LSA0042 panE usp1 TRUE 0.673 14.000 0.000 1.000 N NA
 1098998 1098999 LSA0042 LSA0043 usp1   FALSE 0.113 81.000 0.000 NA   NA
 1098999 1099000 LSA0043 LSA0044     FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 1099006 1099007 LSA0050 LSA0051     FALSE 0.074 123.000 0.000 NA   NA
 1099007 1099008 LSA0051 LSA0052     TRUE 0.959 -7.000 0.074 NA   NA
 1099008 1099009 LSA0052 LSA0053   pepO FALSE 0.092 141.000 0.000 NA N NA
 1099009 1099010 LSA0053 LSA0054 pepO maa FALSE 0.056 253.000 0.000 1.000   NA
 1099011 1099012 LSA0055 LSA0057   thiE TRUE 0.954 -10.000 0.016 1.000 N NA
 1099012 1099013 LSA0057 LSA0058 thiE thiD TRUE 0.992 -7.000 0.063 0.005 Y NA
 1099013 1099014 LSA0058 LSA0059 thiD thiM TRUE 0.990 -7.000 0.020 0.005 Y NA
 1099016 1099017 LSA0061 LSA0062     FALSE 0.082 100.000 0.000 NA   NA
 1099018 1099019 LSA0063 LSA0064 purA   FALSE 0.086 171.000 0.000 1.000   NA
 1099019 1099020 LSA0064 LSA0065     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 1099020 1099021 LSA0065 LSA0066   srtA1 FALSE 0.130 75.000 0.000 NA   NA
 1099021 1099022 LSA0066 LSA0067 srtA1   FALSE 0.059 205.000 0.000 NA N NA
 1099022 1099023 LSA0067 LSA0068     TRUE 0.858 40.000 0.028 1.000 Y NA
 1099023 1099024 LSA0068 LSA0069     TRUE 0.946 -114.000 0.000 0.012   NA
 1099024 1099025 LSA0069 LSA0070     TRUE 0.577 17.000 0.000 1.000   NA
 1099025 1099026 LSA0070 LSA0071     TRUE 0.820 16.000 0.000 1.000 Y NA
 1099026 1099027 LSA0071 LSA0072     FALSE 0.396 85.000 0.000 1.000 Y NA
 1099027 1099028 LSA0072 LSA0073     TRUE 0.956 40.000 0.533 1.000 N NA
 1099032 1099033 LSA0077 LSA0078     TRUE 0.996 10.000 0.597 0.079 Y NA
 1099033 1099034 LSA0078 LSA0079     TRUE 0.992 -10.000 0.575 NA   NA
 1099034 1099035 LSA0079 LSA0080     TRUE 0.994 5.000 0.890 NA   NA
 1099035 1099036 LSA0080 LSA0081     TRUE 0.880 35.000 0.176 NA   NA
 1099036 1099037 LSA0081 LSA0082   htrA FALSE 0.350 134.000 0.030 1.000   NA
 1099037 1099038 LSA0082 LSA0083 htrA   FALSE 0.044 192.000 0.000 NA   NA
 1099038 1099039 LSA0083 LSA0084     FALSE 0.025 342.000 0.000 NA   NA
 1099039 1099040 LSA0084 LSA0085     FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 1099042 1099043 LSA0087 LSA0088   adeC1 TRUE 0.912 10.000 0.038 1.000   NA
 1099045 1099046 LSA0090 LSA0091     TRUE 0.960 0.000 0.000 0.002   NA
 1099046 1099047 LSA0091 LSA0092     FALSE 0.334 34.000 0.000 NA   NA
 1099047 1099048 LSA0092 LSA0093     FALSE 0.104 84.000 0.000 NA   NA
 1099051 1099052 LSA0096 LSA0097 sipA1   FALSE 0.101 85.000 0.000 NA   NA
 1099053 1099054 LSA0098 LSA0099   racD TRUE 0.973 -3.000 0.104 1.000   NA
 1099054 1099055 LSA0099 LSA0100 racD gpm1 TRUE 0.760 10.000 0.000 1.000 N NA
 1099055 1099056 LSA0100 LSA0101 gpm1   TRUE 0.968 -19.000 0.074 1.000 N NA
 1099057 1099058 LSA0102 LSA0103     FALSE 0.401 26.000 0.000 NA   NA
 1099058 1099059 LSA0103 LSA0104   tpx FALSE 0.109 172.000 0.000 1.000 N NA
 1099060 1099061 LSA0105 LSA0106     FALSE 0.079 112.000 0.000 NA   NA
 1099061 1099062 LSA0106 LSA0107   gmk1 FALSE 0.119 96.000 0.000 NA N NA
 1099064 1099065 LSA0109 LSA0110     TRUE 0.801 19.000 0.020 NA   NA
 1099065 1099066 LSA0110 LSA0111     TRUE 0.912 36.000 0.267 NA   NA
 1099066 1099067 LSA0111 LSA0112     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1099067 1099068 LSA0112 LSA0113     FALSE 0.246 49.000 0.000 NA   NA
 1099068 1099069 LSA0113 LSA0114     TRUE 0.741 -3.000 0.000 NA   NA
 1099069 1099070 LSA0114 LSA0115     TRUE 0.735 -13.000 0.000 NA   NA
 1099070 1099071 LSA0115 LSA0116     FALSE 0.065 220.000 0.000 1.000   NA
 1099071 1099072 LSA0116 LSA0118     TRUE 0.786 34.000 0.000 0.012   NA
 1099072 1099073 LSA0118 LSA0119     FALSE 0.052 166.000 0.000 NA   NA
 1099074 1825227 LSA0120 LSA0121     FALSE 0.062 145.000 0.000 NA   NA
 1825227 1099075 LSA0121 LSA0122   dhaT FALSE 0.071 129.000 0.000 NA   NA
 1099076 1099077 LSA0123 LSA0125     FALSE 0.375 59.000 0.000 1.000 N NA
 1099079 1099080 LSA0127 LSA0128     TRUE 0.979 15.000 0.583 1.000   NA
 1099080 1099081 LSA0128 LSA0129   uxaC FALSE 0.080 183.000 0.000 1.000   NA
 1099081 1099082 LSA0129 LSA0130 uxaC   FALSE 0.166 112.000 0.000 1.000 N NA
 1099085 1099086 LSA0133 LSA0134 pepR   TRUE 0.513 74.000 0.023 1.000   NA
 1099087 1099088 LSA0135 LSA0136     TRUE 0.994 -3.000 0.160 0.093 Y NA
 1099088 1099089 LSA0136 LSA0137     FALSE 0.142 94.000 0.000 1.000   NA
 1099089 1099090 LSA0137 LSA0138   panK FALSE 0.348 108.000 0.013 1.000   NA
 1099090 1099091 LSA0138 LSA0139 panK guaA FALSE 0.433 167.000 0.006 0.064 N NA
 1099091 1099092 LSA0139 LSA0140 guaA   FALSE 0.065 141.000 0.000 NA   NA
 1099093 1099094 LSA0141 LSA0142 tnpA1-ISLsa1   FALSE 0.036 228.000 0.000 NA   NA
 1099094 1099095 LSA0142 LSA0143     TRUE 0.921 19.000 0.161 NA   NA
 1099095 1099096 LSA0143 LSA0144   tnpB1-IS1520 FALSE 0.273 284.000 0.000 0.071 Y NA
 1099096 1099097 LSA0144 LSA0145 tnpB1-IS1520 tnpA1-IS1520 TRUE 0.816 21.000 0.000 0.071   NA
 1099098 1099099 LSA0146 LSA0147     FALSE 0.205 532.000 0.000 0.071 Y NA
 1099099 1099100 LSA0147 LSA0148     FALSE 0.103 147.000 0.000 1.000   NA
 1099100 1099101 LSA0148 LSA0149     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1099101 1099102 LSA0149 LSA0150     FALSE 0.033 251.000 0.000 NA   NA
 1099102 1099103 LSA0150 LSA0151     TRUE 0.983 -3.000 0.229 NA   NA
 1099104 1099105 LSA0152 LSA0153     FALSE 0.274 42.000 0.000 NA   NA
 1099105 1099106 LSA0153 LSA0154     TRUE 0.741 -3.000 0.000 NA   NA
 1099108 1099109 LSA0156 LSA0157     TRUE 0.911 24.000 0.157 NA   NA
 1099109 1099110 LSA0157 LSA0158     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 1099112 1099113 LSA0160 LSA0161     TRUE 0.693 13.000 0.000 1.000 N NA
 1099113 1099114 LSA0161 LSA0162     FALSE 0.145 135.000 0.000 1.000 N NA
 1099115 1099116 LSA0163 LSA0164     FALSE 0.236 53.000 0.000 NA   NA
 1099116 1099117 LSA0164 LSA0165     TRUE 0.653 20.000 0.000 1.000 N NA
 1099117 1099118 LSA0165 LSA0166     FALSE 0.108 143.000 0.000 1.000   NA
 1099118 1099119 LSA0166 LSA0167     TRUE 0.970 19.000 0.500 NA   NA
 1099119 1099120 LSA0167 LSA0168     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 1099120 1099121 LSA0168 LSA0169     TRUE 0.440 16.000 0.000 NA   NA
 1099121 1099122 LSA0169 LSA0170     TRUE 0.973 27.000 0.667 NA   NA
 1099124 1099125 LSA0172 LSA0173     TRUE 0.986 20.000 1.000 NA   NA
 1099125 1099126 LSA0173 LSA0174     TRUE 0.744 -6.000 0.000 NA   NA
 1099126 1099127 LSA0174 LSA0175     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 1099127 1099128 LSA0175 LSA0176     TRUE 0.717 -28.000 0.000 NA   NA
 1099128 1099129 LSA0176 LSA0177     FALSE 0.049 173.000 0.000 NA   NA
 1099129 1099130 LSA0177 LSA0178     FALSE 0.079 111.000 0.000 NA   NA
 1099132 1099133 LSA0180 LSA0181 mtsC mtsB TRUE 0.989 -3.000 0.152 1.000 Y NA
 1099133 1099134 LSA0181 LSA0182 mtsB mtsA TRUE 0.988 -3.000 0.135 1.000 Y NA
 1099134 1099135 LSA0182 LSA0183 mtsA   FALSE 0.198 87.000 0.000 1.000 N NA
 1099135 1099136 LSA0183 LSA0184     FALSE 0.039 209.000 0.000 NA   NA
 1099136 1099137 LSA0184 LSA0185   galP TRUE 0.960 29.000 0.500 NA   NA
 1099137 1099138 LSA0185 LSA0186 galP   FALSE 0.032 408.000 0.000 NA N NA
 1099141 1099142 LSA0189 LSA0190     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 1099142 1099143 LSA0190 LSA0191     TRUE 0.996 0.000 0.957 NA   NA
 1099143 1099144 LSA0191 LSA0192     FALSE 0.148 71.000 0.000 NA   NA
 1099144 1099145 LSA0192 LSA0193     FALSE 0.045 188.000 0.000 NA   NA
 1099146 1099147 LSA0194 LSA0195     FALSE 0.029 286.000 0.000 NA   NA
 1099148 1099149 LSA0196 LSA0197 pepD2   FALSE 0.065 286.000 0.000 1.000 N NA
 1099149 1099150 LSA0197 LSA0198   ack1 FALSE 0.312 145.000 0.000 0.058 N NA
 1099150 1099151 LSA0198 LSA0199 ack1   TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 1099151 1099152 LSA0199 LSA0200   rbsU FALSE 0.049 175.000 0.000 NA   NA
 1099152 1099153 LSA0200 LSA0201 rbsU rbsD TRUE 0.931 21.000 0.045 1.000 Y NA
 1099153 1099154 LSA0201 LSA0202 rbsD rbsK TRUE 0.925 20.000 0.030 1.000 Y NA
 1099154 1099155 LSA0202 LSA0203 rbsK rbsR FALSE 0.322 65.000 0.000 1.000 N NA
 1099155 1099156 LSA0203 LSA0204 rbsR   FALSE 0.230 144.000 0.000 NA Y NA
 1099156 1099157 LSA0204 LSA0205     TRUE 0.948 -3.000 0.027 NA N NA
 1099157 1099158 LSA0205 LSA0206   gpm3 FALSE 0.348 96.000 0.000 1.000 Y NA
 1099158 1099159 LSA0206 LSA0207 gpm3 clpL FALSE 0.051 396.000 0.000 1.000 N NA
 1099159 1099160 LSA0207 LSA0208 clpL   FALSE 0.279 41.000 0.000 NA   NA
 1099162 1099163 LSA0210 LSA0211     FALSE 0.031 263.000 0.000 NA   NA
 1099163 1099164 LSA0211 LSA0212     TRUE 0.706 -201.000 0.000 NA   NA
 1099164 1099165 LSA0212 LSA0213     FALSE 0.136 74.000 0.000 NA   NA
 1099165 1099166 LSA0213 LSA0214     TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1099166 1099167 LSA0214 LSA0215     FALSE 0.192 62.000 0.000 NA   NA
 1099167 1099168 LSA0215 LSA0216_a   tnpA2-ISLsa1 FALSE 0.028 294.000 0.000 NA   NA
 1099168 1099169 LSA0216_a LSA0216_b tnpA2-ISLsa1   TRUE 0.487 32.000 0.000 1.000   NA
 1099169 1099170 LSA0216_b LSA0217     FALSE 0.304 134.000 0.000 0.058   NA
 1099170 1099171 LSA0217 LSA0218   trxA1 FALSE 0.195 88.000 0.000 1.000 N NA
 1099171 1099172 LSA0218 LSA0219_a trxA1   FALSE 0.059 306.000 0.000 1.000 N NA
 1099172 1099173 LSA0219_a LSA0219_b     FALSE 0.043 278.000 0.000 NA N NA
 1099173 1099174 LSA0219_b LSA0220_a   tnpA2-IS1520 FALSE 0.019 717.000 0.000 NA   NA
 1099174 1099175 LSA0220_a LSA0220_b tnpA2-IS1520 tnpB2-IS1520 TRUE 0.819 21.000 0.000 0.069   NA
 1099176 1099177 LSA0220_c LSA0221 dapE   FALSE 0.076 116.000 0.000 NA   NA
 1099177 1099178 LSA0221 LSA0223     FALSE 0.082 100.000 0.000 NA   NA
 1099179 1099180 LSA0224 LSA0225     TRUE 0.984 2.000 0.240 1.000   NA
 1099180 1099181 LSA0225 LSA0226   pepN FALSE 0.047 304.000 0.000 1.000   NA
 1099181 1099182 LSA0226 LSA0227 pepN   FALSE 0.118 161.000 0.000 1.000 N NA
 1099182 1099183 LSA0227 LSA0228     TRUE 0.835 -3.000 0.000 1.000   NA
 1099183 1099184 LSA0228 LSA0229     TRUE 0.599 15.000 0.000 1.000   NA
 1099184 1099185 LSA0229 LSA0230     TRUE 0.933 6.000 0.000 0.012   NA
 1099185 1099186 LSA0230 LSA0231     FALSE 0.099 150.000 0.000 1.000   NA
 1099186 1099187 LSA0231 LSA0232   lmrA TRUE 0.962 13.000 0.222 1.000 N NA
 1099187 1099188 LSA0232 LSA0233 lmrA   FALSE 0.143 283.000 0.000 0.085   NA
 1099188 1099189 LSA0233 LSA0234     TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.004   NA
 1099190 1099191 LSA0235 LSA0236     TRUE 0.783 41.000 0.094 NA   NA
 1099192 1099193 LSA0237 LSA0238     FALSE 0.146 92.000 0.000 1.000   NA
 1099193 1099194 LSA0238 LSA0239     TRUE 0.909 22.000 0.111 1.000   NA
 1099195 1099196 LSA0240 LSA0241     TRUE 0.889 20.000 0.072 1.000   NA
 1099197 1099198 LSA0242 LSA0243     FALSE 0.077 189.000 0.000 1.000   NA
 1099198 1099199 LSA0243 LSA0244     FALSE 0.054 163.000 0.000 NA   NA
 1099199 1099200 LSA0244 LSA0245     FALSE 0.092 90.000 0.000 NA   NA
 1099200 1099201 LSA0245 LSA0246   mntH1 FALSE 0.098 155.000 0.000 1.000   NA
 1099201 1099202 LSA0246 LSA0247 mntH1 usp2 TRUE 0.983 18.000 0.667 1.000 N NA
 1099202 1099203 LSA0247 LSA0248 usp2   FALSE 0.133 111.000 0.000 1.000   NA
 1099205 1099206 LSA0250 LSA0251   efp1 FALSE 0.096 87.000 0.000 NA   NA
 1099206 1099207 LSA0251 LSA0252 efp1 iunH1 FALSE 0.095 194.000 0.000 1.000 N NA
 1099209 1099210 LSA0254 LSA0255     TRUE 0.650 19.000 0.000 1.000 N NA
 1099210 1099211 LSA0255 LSA0256_a     FALSE 0.246 49.000 0.000 NA   NA
 1099212 1099213 LSA0256_b LSA0256_c tnpB3-IS1520 tnpA3-IS1520 TRUE 0.819 21.000 0.000 0.069   NA
 1099214 1099215 LSA0257 LSA0258     TRUE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 1099215 1099216 LSA0258 LSA0259     TRUE 0.631 23.000 0.000 1.000 N NA
 1099216 1099217 LSA0259 LSA0260     FALSE 0.160 117.000 0.000 1.000 N NA
 1099218 1099219 LSA0261 LSA0262 tnpB1-ISLsa2 tnpA1-ISLsa2 FALSE 0.274 42.000 0.000 NA   NA
 1099219 1099220 LSA0262 LSA0263 tnpA1-ISLsa2   FALSE 0.024 363.000 0.000 NA   NA
 1099220 1099221 LSA0263 LSA0264     FALSE 0.267 43.000 0.000 NA   NA
 1099221 1099222 LSA0264 LSA0265     FALSE 0.051 237.000 0.000 NA N NA
 1099223 1099224 LSA0266 LSA0267 rpsN   FALSE 0.031 265.000 0.000 NA   NA
 1099224 1099225 LSA0267 LSA0268     FALSE 0.279 41.000 0.000 NA   NA
 1099227 1099228 LSA0270 LSA0271     TRUE 0.957 -3.000 0.040 1.000   NA
 1099228 1099229 LSA0271 LSA0272     TRUE 0.994 4.000 0.720 1.000   NA
 1099230 1099231 LSA0273 LSA0274     TRUE 0.907 11.000 0.000 0.006   NA
 1099231 1099232 LSA0274 LSA0275     FALSE 0.038 444.000 0.000 1.000   NA
 1099233 1099234 LSA0276 LSA0277 guaB   FALSE 0.121 159.000 0.000 1.000 N NA
 1099234 1099235 LSA0277 LSA0278     TRUE 0.998 0.000 0.932 1.000 Y NA
 1099235 1099236 LSA0278 LSA0279   dacA TRUE 0.837 39.000 0.089 1.000 N NA
 1099236 1099237 LSA0279 LSA0280 dacA murE FALSE 0.267 149.000 0.000 1.000 Y NA
 1099237 1099238 LSA0280 LSA0281 murE   FALSE 0.424 23.000 0.000 NA   NA
 1099238 1099239 LSA0281 LSA0282     FALSE 0.059 150.000 0.000 NA   NA
 1099239 1099240 LSA0282 LSA0283     TRUE 0.976 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 1099240 1099241 LSA0283 LSA0284     TRUE 0.971 35.000 0.379 1.000 Y NA
 1099243 1099244 LSA0286 LSA0287     FALSE 0.089 145.000 0.000 NA N NA
 1099244 1099245 LSA0287 LSAt02   tRNA-Gln FALSE 0.082 102.000 0.000 NA   NA
 1099245 1099246 LSAt02 LSA0288 tRNA-Gln   FALSE 0.070 132.000 0.000 NA   NA
 1099246 1099247 LSA0288 LSA0289   xpk FALSE 0.106 175.000 0.000 1.000 N NA
 1099247 1099248 LSA0289 LSA0290 xpk gltX FALSE 0.145 135.000 0.000 1.000 N NA
 1099248 1099249 LSA0290 LSA0291 gltX kdgK FALSE 0.145 135.000 0.000 1.000 N NA
 1099249 1099250 LSA0291 LSA0292 kdgK budC FALSE 0.283 72.000 0.000 1.000 N NA
 1099252 1099253 LSA0294 LSA0295     TRUE 0.741 -3.000 0.000 NA   NA
 1099255 1099256 LSA0297 LSA0298 gntZ gntK TRUE 0.968 35.000 0.333 1.000 Y NA
 1099256 1099257 LSA0298 LSA0299 gntK gntP TRUE 0.884 91.000 0.444 1.000 Y NA
 1099257 1099258 LSA0299 LSA0300 gntP   FALSE 0.049 292.000 0.000 1.000   NA
 1099258 1099259 LSA0300 LSA0301     TRUE 0.898 13.000 0.000 0.002   NA
 1099261 1099262 LSA0303 LSA0304     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 1099262 1099263 LSA0304 LSA0305     FALSE 0.053 164.000 0.000 NA   NA
 1099263 1099264 LSA0305 LSA0306   aspD FALSE 0.142 94.000 0.000 1.000   NA
 1099264 1099265 LSA0306 LSAr01 aspD rrsE FALSE 0.020 523.000 0.000 NA   NA
 1099265 1099266 LSAr01 LSAr02 rrsE rrlE FALSE 0.037 224.000 0.000 NA   NA
 1099266 1099267 LSAr02 LSAr03 rrlE rrfE FALSE 0.088 92.000 0.000 NA   NA
 1099267 1099268 LSAr03 LSA0307 rrfE trxA2 FALSE 0.148 71.000 0.000 NA   NA
 1099270 1099271 LSA0309 LSA0310     TRUE 0.952 18.000 0.300 NA   NA
 1099271 1099272 LSA0310 LSA0311     FALSE 0.023 391.000 0.000 NA   NA
 1099272 1099273 LSA0311 LSA0312     TRUE 0.891 22.000 0.085 1.000   NA
 1099273 1099274 LSA0312 LSA0313     FALSE 0.039 209.000 0.000 NA   NA
 1099274 1099275 LSA0313 LSA0314     FALSE 0.082 101.000 0.000 NA   NA
 1099277 1099278 LSA0316 LSA0317 sdhB sdhA TRUE 0.985 17.000 0.324 0.001   NA
 1099278 1099279 LSA0317 LSA0318 sdhA   FALSE 0.363 30.000 0.000 NA   NA
 1099279 1099280 LSA0318 LSA0319     TRUE 0.961 -19.000 0.094 NA   NA
 1099280 1099281 LSA0319 LSA0320   pepD3 TRUE 0.805 58.000 0.143 1.000   NA
 1099281 1099282 LSA0320 LSA0321 pepD3   FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 1099284 1099285 LSA0324 LSA0325     TRUE 0.734 35.000 0.000 0.062   NA
 1099285 1099286 LSA0325 LSAt03   tRNA-Thr FALSE 0.170 65.000 0.000 NA   NA
 1099288 1099289 LSA0327 LSA0328 trpS   FALSE 0.087 209.000 0.000 1.000 N NA
 1099289 1099290 LSA0328 LSA0329     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1099290 1099291 LSA0329 LSA0330     FALSE 0.255 46.000 0.000 NA   NA
 1099291 1099292 LSA0330 LSA0331     FALSE 0.084 97.000 0.000 NA   NA
 1099292 1099293 LSA0331 LSA0332     FALSE 0.096 87.000 0.000 NA   NA
 1099293 1099294 LSA0332 LSA0333     TRUE 0.868 10.000 0.014 NA   NA
 1099294 1099295 LSA0333 LSA0334     TRUE 0.444 73.000 0.014 NA   NA
 1099295 1099296 LSA0334 LSA0335     FALSE 0.346 81.000 0.005 NA   NA
 1099296 1099297 LSA0335 LSA0336   dnaX FALSE 0.142 425.000 0.018 1.000 N NA
 1099297 1099298 LSA0336 LSA0337 dnaX   TRUE 0.865 27.000 0.100 NA   NA
 1099298 1099299 LSA0337 LSA0338   recR TRUE 0.971 26.000 0.604 NA   NA
 1099299 1099300 LSA0338 LSA0339 recR   TRUE 0.857 17.000 0.071 NA   NA
 1099300 1099301 LSA0339 LSA0340   tmk FALSE 0.246 144.000 0.016 NA   NA
 1099301 1099302 LSA0340 LSA0341 tmk   TRUE 0.829 15.000 0.033 NA   NA
 1099302 1099303 LSA0341 LSA0342   holB TRUE 0.929 4.000 0.040 NA   NA
 1099303 1099304 LSA0342 LSA0343 holB   TRUE 0.654 52.000 0.038 NA   NA
 1099304 1099305 LSA0343 LSA0344     FALSE 0.364 99.000 0.043 NA   NA
 1099305 1099306 LSA0344 LSA0345     TRUE 0.890 11.000 0.021 1.000   NA
 1099306 1099307 LSA0345 LSA0346     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 1099309 1099310 LSA0348 LSA0349     FALSE 0.226 141.000 0.006 NA   NA
 1099310 1099311 LSA0349 LSA0350     TRUE 0.623 62.000 0.026 1.000   NA
 1099311 1099312 LSA0350 LSA0351     TRUE 0.888 11.000 0.018 1.000   NA
 1099314 1099315 LSA0353 LSA0354     FALSE 0.082 100.000 0.000 NA   NA
 1099319 1099320 LSA0358 LSA0359 groS groL TRUE 0.957 54.000 0.160 0.008 Y NA
 1099320 1099321 LSA0359 LSA0360 groL   FALSE 0.044 627.000 0.000 1.000 N NA
 1099321 1099322 LSA0360 LSA0361     FALSE 0.056 255.000 0.000 1.000   NA
 1099322 1099323 LSA0361 LSA0362   mutS TRUE 0.805 22.000 0.005 1.000   NA
 1099323 1099324 LSA0362 LSA0363 mutS mutL TRUE 0.988 21.000 0.220 0.003 Y NA
 1099324 1099325 LSA0363 LSA0364 mutL maf TRUE 0.930 0.000 0.006 NA N NA
 1099325 1099326 LSA0364 LSA0365 maf   TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1099326 1099327 LSA0365 LSA0366   ruvA FALSE 0.022 411.000 0.000 NA   NA
 1099327 1099328 LSA0366 LSA0367 ruvA ruvB TRUE 0.995 13.000 0.549 0.003 Y NA
 1099328 1099329 LSA0367 LSA0368 ruvB queA TRUE 0.902 15.000 0.069 1.000 N NA
 1099329 1099330 LSA0368 LSA0369 queA   TRUE 0.805 24.000 0.000 1.000 Y NA
 1099330 1099331 LSA0369 LSA0370   arcA FALSE 0.089 207.000 0.000 1.000 N NA
 1099331 1099332 LSA0370 LSA0371 arcA arcB TRUE 0.948 26.000 0.125 1.000 Y NA
 1099332 1099333 LSA0371 LSA0372 arcB arcC TRUE 0.734 99.000 0.146 1.000 Y NA
 1099333 1099334 LSA0372 LSA0373 arcC arcT TRUE 0.950 12.000 0.044 1.000 Y NA
 1099334 1099335 LSA0373 LSA0374 arcT arcD TRUE 0.894 34.000 0.044 1.000 Y NA
 1099335 1099336 LSA0374 LSA0375 arcD arcR FALSE 0.283 72.000 0.000 1.000 N NA
 1099336 1099337 LSA0375 LSA0376 arcR   FALSE 0.112 138.000 0.000 1.000   NA
 1099337 1099338 LSA0376 LSA0377   tgt FALSE 0.146 92.000 0.000 1.000   NA
 1099338 1099339 LSA0377 LSA0378 tgt   TRUE 0.831 74.000 0.325 NA N NA
 1099339 1099340 LSA0378 LSA0379   adhE FALSE 0.049 243.000 0.000 NA N NA
 1099340 1099341 LSA0379 LSA0380 adhE   FALSE 0.399 184.000 0.098 1.000 N NA
 1099341 1099342 LSA0380 LSA0381   zwf TRUE 0.889 20.000 0.053 1.000 N NA
 1099342 1099343 LSA0381 LSA0382 zwf dinP TRUE 0.584 74.000 0.040 1.000 N NA
 1099343 1099344 LSA0382 LSA0383 dinP   FALSE 0.158 120.000 0.000 1.000 N NA
 1099344 1099345 LSA0383 LSA0384     TRUE 0.969 4.000 0.132 1.000   NA
 1099345 1099346 LSA0384 LSA0385     TRUE 0.937 45.000 0.182 0.020   NA
 1099346 1099347 LSA0385 LSA0386     TRUE 0.699 38.000 0.027 NA   NA
 1099347 1099348 LSA0386 LSA0387   alaS FALSE 0.034 245.000 0.000 NA   NA
 1099348 1099349 LSA0387 LSA0388 alaS   FALSE 0.339 186.000 0.110 NA   NA
 1099349 1099350 LSA0388 LSA0389     TRUE 0.991 0.000 0.537 NA   NA
 1099350 1099351 LSA0389 LSA0390     TRUE 0.946 50.000 0.651 NA   NA
 1099353 1099354 LSA0392 LSA0393     TRUE 0.732 56.000 0.070 1.000   NA
 1099354 1099355 LSA0393 LSA0394   trxA3 FALSE 0.318 140.000 0.008 1.000 N NA
 1099355 1099356 LSA0394 LSA0395 trxA3 dltA FALSE 0.053 368.000 0.000 1.000 N NA
 1099356 1099357 LSA0395 LSA0396 dltA dltB TRUE 0.991 -7.000 0.435 NA N NA
 1099357 1099358 LSA0396 LSA0397 dltB dltC TRUE 0.949 30.000 0.387 NA   NA
 1099358 1099359 LSA0397 LSA0398 dltC dltD TRUE 0.988 2.000 0.409 NA   NA
 1099361 1099362 LSA0400 LSA0401     TRUE 0.997 -10.000 0.600 1.000 Y NA
 1099362 1099363 LSA0401 LSA0402     TRUE 0.992 -3.000 0.095 0.043 Y NA
 1099363 1099364 LSA0402 LSA0403     TRUE 0.791 8.000 0.000 1.000 N NA
 1099366 1099367 LSA0405 LSA0406 murI   TRUE 0.860 -19.000 0.000 1.000 N NA
 1099367 1099368 LSA0406 LSA0407     TRUE 0.665 12.000 0.000 1.000   NA
 1099368 1099369 LSA0407 LSA0408     FALSE 0.139 98.000 0.000 1.000   NA
 1099370 1099371 LSA0409 LSA0410     TRUE 0.818 25.000 0.047 NA   NA
 1099372 1099373 LSA0411 LSA0412     TRUE 0.941 6.000 0.079 NA   NA
 1099374 1099375 LSA0413 LSA0414   pepQ FALSE 0.255 46.000 0.000 NA   NA
 1099379 1099380 LSA0418 LSA0419     TRUE 0.978 -3.000 0.182 NA   NA
 1099380 1099381 LSA0419 LSA0420     TRUE 0.940 -31.000 0.000 0.043   NA
 1099382 1099383 LSA0421 LSA0422     FALSE 0.057 156.000 0.000 NA   NA
 1099383 1099384 LSA0422 LSA0423     FALSE 0.239 52.000 0.000 NA   NA
 1099385 1099386 LSA0424 LSA0425 pepV   FALSE 0.096 193.000 0.000 1.000 N NA
 1099386 1099387 LSA0425 LSA0426     TRUE 0.500 206.000 0.203 1.000 N NA
 1099387 1099388 LSA0426 LSA0427     TRUE 0.661 15.000 0.000 1.000 N NA
 1099389 1099390 LSA0428 LSA0429     TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1099390 1099391 LSA0429 LSA0430     TRUE 0.881 13.000 0.069 NA   NA
 1099391 1099392 LSA0430 LSA0431     TRUE 0.960 19.000 0.347 NA   NA
 1099392 1099393 LSA0431 LSA0432     TRUE 0.976 9.000 0.320 NA   NA
 1099393 1099394 LSA0432 LSA0433     TRUE 0.988 -12.000 0.330 NA   NA
 1099394 1099395 LSA0433 LSA0434     TRUE 0.491 87.000 0.091 NA   NA
 1099397 1099398 LSA0436 LSA0437     TRUE 0.482 148.000 0.110 1.000 N NA
 1099398 1099399 LSA0437 LSA0438     TRUE 0.939 1.000 0.041 NA   NA
 1099399 1099400 LSA0438 LSAr04   rrsF FALSE 0.019 620.000 0.000 NA   NA
 1099400 1099401 LSAr04 LSAr05 rrsF rrlF FALSE 0.037 224.000 0.000 NA   NA
 1099401 1099402 LSAr05 LSAr06 rrlF rrfF FALSE 0.088 92.000 0.000 NA   NA
 1099402 1099403 LSAr06 LSAt04 rrfF tRNA-Val TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 1099403 1099404 LSAt04 LSAt05 tRNA-Val tRNA-Lys TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1099404 1099405 LSAt05 LSAt06 tRNA-Lys tRNA-Leu FALSE 0.424 23.000 0.000 NA   NA
 1099405 1099406 LSAt06 LSAt07 tRNA-Leu tRNA-Thr FALSE 0.311 36.000 0.000 NA   NA
 1099406 1099407 LSAt07 LSAt08 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.620 8.000 0.000 NA   NA
 1099407 1099408 LSAt08 LSAt09 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 1099408 1099409 LSAt09 LSAt10 tRNA-Leu tRNA-Arg TRUE 0.528 12.000 0.000 NA   NA
 1099409 1099410 LSAt10 LSAt11 tRNA-Arg tRNA-Pro TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 1099410 1099411 LSAt11 LSAt12 tRNA-Pro tRNA-Met FALSE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 1099411 1099412 LSAt12 LSAt13 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.434 17.000 0.000 NA   NA
 1099412 1099413 LSAt13 LSAt14 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.255 46.000 0.000 NA   NA
 1099413 1099414 LSAt14 LSAt15 tRNA-Met tRNA-Asp TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1099414 1099415 LSAt15 LSAt16 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 1099415 1099416 LSAt16 LSAt17 tRNA-Phe tRNA-Gly TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1099416 1099417 LSAt17 LSAt18 tRNA-Gly tRNA-Ile TRUE 0.635 7.000 0.000 NA   NA
 1099417 1099418 LSAt18 LSAt19 tRNA-Ile tRNA-Ser TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 1099418 1099419 LSAt19 LSAt20 tRNA-Ser tRNA-Glu TRUE 0.602 9.000 0.000 NA   NA
 1099419 1099420 LSAt20 LSAt21 tRNA-Glu tRNA-Ser FALSE 0.334 34.000 0.000 NA   NA
 1099420 1099421 LSAt21 LSAt22 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.470 14.000 0.000 NA   NA
 1099421 1099422 LSAt22 LSAt23 tRNA-Met tRNA-Asp TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1099422 1099423 LSAt23 LSAt24 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 1099423 1099424 LSAt24 LSAt25 tRNA-Phe tRNA-Tyr TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 1099424 1099425 LSAt25 LSAt26 tRNA-Tyr tRNA-Trp TRUE 0.620 8.000 0.000 NA   NA
 1099425 1099426 LSAt26 LSAt27 tRNA-Trp tRNA-His FALSE 0.200 60.000 0.000 NA   NA
 1099426 1099427 LSAt27 LSAt28 tRNA-His tRNA-Gln TRUE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 1099427 1099428 LSAt28 LSAt29 tRNA-Gln tRNA-Cys FALSE 0.381 28.000 0.000 NA   NA
 1099428 1099429 LSAt29 LSAt30 tRNA-Cys   FALSE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 1099429 1099430 LSAt30 LSA0439     FALSE 0.069 134.000 0.000 NA   NA
 1099432 1099433 LSA0441 LSA0442 mleS mleP1 TRUE 0.936 35.000 0.302 1.000   NA
 1099433 1099434 LSA0442 LSA0443 mleP1   FALSE 0.061 147.000 0.000 NA   NA
 1099434 1099435 LSA0443 LSA0444     TRUE 0.519 23.000 0.000 NA N NA
 1099437 1099438 LSA0446 LSA0447     TRUE 0.772 6.000 0.000 1.000   NA
 1099438 1099439 LSA0447 LSA0448   gltP FALSE 0.326 57.000 0.000 1.000   NA
 1099439 1099440 LSA0448 LSA0449 gltP manL FALSE 0.051 405.000 0.000 1.000 N NA
 1099440 1099441 LSA0449 LSA0450 manL manM TRUE 0.994 35.000 0.943 0.010 Y NA
 1099441 1099442 LSA0450 LSA0451 manM manN TRUE 0.996 19.000 0.812 0.010 Y NA
 1099442 1099443 LSA0451 LSA0452 manN   TRUE 0.544 343.000 0.583 NA   NA
 1099443 1099444 LSA0452 LSA0453     FALSE 0.058 152.000 0.000 NA   NA
 1099444 1099445 LSA0453 LSA0454     TRUE 0.994 0.000 0.710 NA   NA
 1099445 1099446 LSA0454 LSA0455     TRUE 0.442 21.000 0.000 NA   NA
 1099446 1099447 LSA0455 LSA0456     TRUE 0.957 -7.000 0.069 NA   NA
 1099447 1099448 LSA0456 LSA0457     FALSE 0.303 37.000 0.000 NA   NA
 1099448 1099449 LSA0457 LSA0458     TRUE 0.995 0.000 0.903 NA   NA
 1099451 1099452 LSA0460 LSA0461     FALSE 0.047 184.000 0.000 NA   NA
 1099452 1099453 LSA0461 LSA0462     TRUE 0.480 78.000 0.048 NA   NA
 1099453 1099454 LSA0462 LSA0463     TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1099454 1099455 LSA0463 LSA0464     TRUE 0.465 72.000 0.022 NA   NA
 1099455 1099456 LSA0464 LSA0465     FALSE 0.286 221.000 0.103 NA   NA
 1099456 1099457 LSA0465 LSA0466     FALSE 0.314 150.000 0.016 1.000 N NA
 1099457 1099458 LSA0466 LSAr07   rrsG FALSE 0.023 368.000 0.000 NA   NA
 1099458 1099459 LSAr07 LSAr08 rrsG rrlG FALSE 0.037 224.000 0.000 NA   NA
 1099459 1099460 LSAr08 LSAr09 rrlG rrfG FALSE 0.087 93.000 0.000 NA   NA
 1099460 1099461 LSAr09 LSAt31 rrfG tRNA-Asn FALSE 0.274 42.000 0.000 NA   NA
 1099461 1099462 LSAt31 LSAt32 tRNA-Asn tRNA-Ser TRUE 0.528 12.000 0.000 NA   NA
 1099462 1099463 LSAt32 LSAt33 tRNA-Ser tRNA-Glu FALSE 0.437 18.000 0.000 NA   NA
 1099463 1099464 LSAt33 LSAt34 tRNA-Glu tRNA-Val TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 1099464 1099465 LSAt34 LSAt35 tRNA-Val tRNA-Asp TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1099467 1099468 LSA0468 LSA0469 metK   FALSE 0.416 95.000 0.023 1.000 N NA
 1099470 1099471 LSA0471 LSA0472     TRUE 0.956 16.000 0.324 NA   NA
 1099471 1099472 LSA0472 LSA0473   tnpA2-ISLsa2 FALSE 0.027 304.000 0.000 NA   NA
 1099472 1099473 LSA0473 LSA0474 tnpA2-ISLsa2 tnpB2-ISLsa2 FALSE 0.274 42.000 0.000 NA   NA
 1099474 1099475 LSA0475 LSA0476   guaC FALSE 0.247 164.000 0.000 0.058   NA
 1099475 1099476 LSA0476 LSA0477 guaC   FALSE 0.290 147.000 0.016 1.000   NA
 1099477 1099478 LSA0478 LSA0479     FALSE 0.191 253.000 0.012 1.000 N NA
 1099478 1099479 LSA0479 LSA0480     TRUE 0.871 12.000 0.012 1.000   NA
 1099479 1099480 LSA0480 LSA0481   ftsK FALSE 0.358 140.000 0.042 1.000   NA
 1099480 1099481 LSA0481 LSA0482 ftsK   FALSE 0.280 198.000 0.058 1.000   NA
 1099481 1099482 LSA0482 LSA0483     TRUE 0.998 -10.000 0.872 0.005   NA
 1099482 1099483 LSA0483 LSA0484     TRUE 0.990 0.000 0.397 1.000   NA
 1099483 1099484 LSA0484 LSA0485     TRUE 0.732 82.000 0.213 1.000   NA
 1099484 1099485 LSA0485 LSA0486   pgsA TRUE 0.873 26.000 0.077 1.000   NA
 1099485 1099486 LSA0486 LSA0487 pgsA recA FALSE 0.274 183.000 0.022 1.000 N NA
 1099486 1099487 LSA0487 LSA0489 recA   FALSE 0.131 387.000 0.018 1.000   NA
 1099487 1099488 LSA0489 LSA0490   tagO FALSE 0.286 147.000 0.014 1.000   NA
 1099490 1099491 LSA0492 LSA0493     TRUE 0.974 0.000 0.130 1.000   NA
 1099491 1099492 LSA0493 LSA0494     FALSE 0.393 127.000 0.080 NA   NA
 1099492 1099493 LSA0494 LSA0495   secA FALSE 0.200 249.000 0.041 NA N NA
 1099493 1099494 LSA0495 LSA0496 secA prfB FALSE 0.318 188.000 0.052 1.000 N NA
 1099494 1099495 LSA0496 LSA0497 prfB ftsE FALSE 0.429 131.000 0.053 1.000 N NA
 1099495 1099496 LSA0497 LSA0498 ftsE ftsX TRUE 0.995 -34.000 0.431 1.000 Y NA
 1099496 1099497 LSA0498 LSA0499 ftsX   FALSE 0.074 194.000 0.000 1.000   NA
 1099497 1099498 LSA0499 LSA0500     TRUE 0.941 20.000 0.188 1.000   NA
 1099498 1099499 LSA0500 LSA0501     TRUE 0.990 -13.000 0.164 1.000 Y NA
 1099499 1099500 LSA0501 LSA0502   pstS TRUE 0.705 93.000 0.217 1.000 N NA
 1099500 1099501 LSA0502 LSA0503 pstS pstC TRUE 0.982 10.000 0.206 1.000 Y NA
 1099501 1099502 LSA0503 LSA0504 pstC ptsA TRUE 0.999 0.000 0.907 0.003 Y NA
 1099502 1099503 LSA0504 LSA0505 ptsA pstB1 TRUE 0.996 10.000 0.490 0.003 Y NA
 1099503 1099504 LSA0505 LSA0506 pstB1 pstB2 TRUE 0.995 21.000 0.542 0.001 Y NA
 1099504 1099505 LSA0506 LSA0507 pstB2   TRUE 0.980 17.000 0.413 NA Y NA
 1099505 1099506 LSA0507 LSA0508     FALSE 0.055 214.000 0.000 NA N NA
 1099506 1099507 LSA0508 LSA0509   kbl FALSE 0.099 190.000 0.000 1.000 N NA
 1099507 1099508 LSA0509 LSA0510 kbl   TRUE 0.936 20.000 0.165 1.000   NA
 1099508 1099509 LSA0510 LSA0511     TRUE 0.944 19.000 0.019 0.001   NA
 1099509 1099510 LSA0511 LSA0512     FALSE 0.046 187.000 0.000 NA   NA
 1099510 1099511 LSA0512 LSA0513     FALSE 0.381 28.000 0.000 NA   NA
 1099511 1099512 LSA0513 LSA0514     TRUE 0.725 0.000 0.000 NA   NA
 1099512 1099513 LSA0514 LSA0515     TRUE 0.947 0.000 0.052 NA   NA
 1099513 1099514 LSA0515 LSA0516   hprK TRUE 0.569 138.000 0.215 NA   NA
 1099514 1099515 LSA0516 LSA0517 hprK lgt TRUE 0.808 119.000 0.494 1.000 N NA
 1099515 1099516 LSA0517 LSA0518 lgt gps TRUE 0.893 18.000 0.067 1.000 N NA
 1099516 1099517 LSA0518 LSA0519 gps   FALSE 0.126 119.000 0.000 1.000   NA
 1099517 1099518 LSA0519 LSA0520   trxB2 FALSE 0.395 117.000 0.042 1.000   NA
 1099518 1099519 LSA0520 LSA0521 trxB2 pgm FALSE 0.341 156.000 0.033 1.000 N NA
 1099519 1099520 LSA0521 LSA0522 pgm   FALSE 0.295 125.000 0.024 NA   NA
 1099520 1099521 LSA0522 LSA0523   uvrB FALSE 0.139 208.000 0.002 NA   NA
 1099521 1099522 LSA0523 LSA0524 uvrB uvrA1 TRUE 0.991 10.000 0.154 0.002 Y NA
 1099522 1099523 LSA0524 LSA0525 uvrA1   FALSE 0.253 122.000 0.007 NA   NA
 1099523 1099524 LSA0525 LSA0526     FALSE 0.395 126.000 0.081 NA   NA
 1099524 1099525 LSA0526 LSA0527     TRUE 0.981 -3.000 0.214 NA   NA
 1099525 1099526 LSA0527 LSA0528     TRUE 0.988 3.000 0.470 NA   NA
 1099526 1099527 LSA0528 LSA0529     FALSE 0.144 93.000 0.000 1.000   NA
 1099528 1099529 LSA0530 LSA0531   clpP FALSE 0.146 224.000 0.000 NA Y NA
 1099529 1099530 LSA0531 LSA0532 clpP   FALSE 0.106 543.000 0.000 1.000 Y NA
 1099531 1099532 LSA0533 LSA0534 iunH2   FALSE 0.076 192.000 0.000 1.000   NA
 1099532 1099533 LSA0534 LSA0536     FALSE 0.033 726.000 0.000 1.000   NA
 1099533 1099534 LSA0536 LSA0537     FALSE 0.082 100.000 0.000 NA   NA
 1099534 1099535 LSA0537 LSA0538     FALSE 0.053 164.000 0.000 NA   NA
 1099535 1099536 LSA0538 LSA0539     FALSE 0.337 128.000 0.000 0.029   NA
 1099536 1099537 LSA0539 LSA0540     TRUE 0.951 -3.000 0.000 0.024   NA
 1099538 1099539 LSA0541 LSA0542     FALSE 0.128 116.000 0.000 1.000   NA
 1099539 1099540 LSA0542 LSA0543     FALSE 0.167 111.000 0.000 1.000 N NA
 1099541 1099542 LSA0544 LSA0545     TRUE 0.926 4.000 0.034 NA   NA
 1099542 1099543 LSA0545 LSA0546     TRUE 0.725 0.000 0.000 NA   NA
 1099543 1099544 LSA0546 LSA0547     TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1099544 1099545 LSA0547 LSA0548     TRUE 0.708 -90.000 0.000 NA   NA
 1099545 1099546 LSA0548 LSA0549     TRUE 0.999 -7.000 0.857 0.009 Y NA
 1099546 1099547 LSA0549 LSA0550     FALSE 0.150 70.000 0.000 NA   NA
 1099547 1099548 LSA0550 LSA0551     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 1099548 1099549 LSA0551 LSA0552     FALSE 0.234 80.000 0.000 1.000 N NA
 1099551 1099552 LSA0555 LSA0556     FALSE 0.071 129.000 0.000 NA   NA
 1099552 1099553 LSA0556 LSA0557     TRUE 0.995 0.000 0.849 NA   NA
 1099553 1099554 LSA0557 LSA0558     TRUE 0.843 27.000 0.078 NA   NA
 1099554 1099555 LSA0558 LSA0559     TRUE 0.969 6.000 0.188 NA   NA
 1099557 1099558 LSA0560_b LSA0561   sppKN FALSE 0.019 648.000 0.000 NA   NA
 1099558 1099559 LSA0561 LSA0562 sppKN sppKC TRUE 0.709 -63.000 0.000 NA   NA
 1099559 1099560 LSA0562 LSA0563 sppKC sppR TRUE 0.986 2.000 0.333 NA   NA
 1099560 1099561 LSA0563 LSA0564_a sppR   FALSE 0.052 166.000 0.000 NA   NA
 1099561 1099562 LSA0564_a LSA0564_b     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1099562 1099563 LSA0564_b LSA0564_c     FALSE 0.401 26.000 0.000 NA   NA
 1099563 1099564 LSA0564_c LSA0565     FALSE 0.018 847.000 0.000 NA   NA
 1099564 1099565 LSA0565 LSA0566     FALSE 0.343 33.000 0.000 NA   NA
 1099565 1099566 LSA0566 LSA0567     FALSE 0.064 142.000 0.000 NA   NA
 1099566 1099567 LSA0567 LSA0568     TRUE 0.443 19.000 0.000 NA   NA
 1099567 1099568 LSA0568 LSA0569_a     FALSE 0.416 24.000 0.000 NA   NA
 1099568 1099569 LSA0569_a LSA0569_b     FALSE 0.371 29.000 0.000 NA   NA
 1099571 1099572 LSA0571 LSA0572   tdcB FALSE 0.051 170.000 0.000 NA   NA
 1099572 1099573 LSA0572 LSA0573 tdcB   FALSE 0.063 144.000 0.000 NA   NA
 1099575 1099576 LSA0575 LSA0576 npr   FALSE 0.056 159.000 0.000 NA   NA
 1099576 1099577 LSA0576 LSA0577     TRUE 0.602 9.000 0.000 NA   NA
 1099579 1099580 LSA0579 LSA0580   ubiD TRUE 0.609 108.000 0.182 NA N NA
 1099580 1099581 LSA0580 LSA0581 ubiD ubiX TRUE 0.971 22.000 0.273 NA Y NA
 1099581 1099582 LSA0581 LSA0582 ubiX   TRUE 0.991 -22.000 0.500 NA   NA
 1099583 1099584 LSA0583 LSA0584 glpQ pepD4 FALSE 0.187 91.000 0.000 1.000 N NA
 1099586 1099587 LSA0586 LSA0587     FALSE 0.195 61.000 0.000 NA   NA
 1099587 1099588 LSA0587 LSA0588     TRUE 0.713 -36.000 0.000 NA   NA
 1099588 1099589 LSA0588 LSA0589     FALSE 0.083 98.000 0.000 NA   NA
 1099590 1099591 LSA0590 LSA0591     TRUE 0.800 3.000 0.000 1.000   NA
 1099591 1099592 LSA0591 LSA0592     FALSE 0.090 91.000 0.000 NA   NA
 1099592 1099593 LSA0592 LSA0593     FALSE 0.054 162.000 0.000 NA   NA
 1099593 1099594 LSA0593 LSA0594     TRUE 0.726 -19.000 0.000 NA   NA
 1099594 1099595 LSA0594 LSA0595     TRUE 0.742 -9.000 0.000 NA   NA
 1099595 1099596 LSA0595 LSA0596     FALSE 0.030 280.000 0.000 NA   NA
 1099596 1099597 LSA0596 LSA0597     FALSE 0.063 144.000 0.000 NA   NA
 1099597 1099598 LSA0597 LSA0598     TRUE 0.620 8.000 0.000 NA   NA
 1099598 1099599 LSA0598 LSA0599     FALSE 0.082 102.000 0.000 NA   NA
 1099599 1099600 LSA0599 LSA0600     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 1099604 1099605 LSA0603 LSA0604 cggR gap TRUE 0.856 39.000 0.109 1.000 N NA
 1099605 1099606 LSA0604 LSA0605 gap pgk TRUE 0.742 101.000 0.013 0.007 Y NA
 1099606 1099607 LSA0605 LSA0606 pgk tpi TRUE 0.952 26.000 0.141 1.000 Y NA
 1099607 1099608 LSA0606 LSA0607 tpi eno TRUE 0.533 118.000 0.018 1.000 Y NA
 1099608 1099609 LSA0607 LSA0608 eno gloAN FALSE 0.057 251.000 0.000 1.000   NA
 1099609 1099610 LSA0608 LSA0609 gloAN gloAC TRUE 0.966 -7.000 0.000 0.001   NA
 1099611 1099612 LSA0610 LSA0611     FALSE 0.437 18.000 0.000 NA   NA
 1099612 1099613 LSA0611 LSA0612     TRUE 0.726 -19.000 0.000 NA   NA
 1099613 1099614 LSA0612 LSA0613     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1099614 1099615 LSA0613 LSA0614     TRUE 0.712 -46.000 0.000 NA   NA
 1099616 1099617 LSA0615 LSA0616     FALSE 0.068 272.000 0.000 1.000 N NA
 1099617 1099618 LSA0616 LSA0617     TRUE 0.991 15.000 0.450 0.080 Y NA
 1099618 1099619 LSA0617 LSA0618     TRUE 0.993 12.000 0.650 0.039 N NA
 1099619 1099620 LSA0618 LSA0619     TRUE 0.997 -3.000 0.619 0.039 N NA
 1099622 1099623 LSA0621 LSA0622 pbp2A   TRUE 0.915 24.000 0.168 NA   NA
 1099623 1099624 LSA0622 LSA0623     FALSE 0.402 135.000 0.093 NA   NA
 1099624 1099625 LSA0623 LSA0624     TRUE 0.985 3.000 0.330 NA   NA
 1099625 1099626 LSA0624 LSA0625     TRUE 0.986 -10.000 0.291 NA   NA
 1099627 1099628 LSA0626 LSA0627 prtM   FALSE 0.054 163.000 0.000 NA   NA
 1099628 1099629 LSA0627 LSA0628     TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1099630 1099631 LSA0629 LSA0630     TRUE 0.973 0.000 0.135 NA N NA
 1099631 1099632 LSA0630 LSA0631     FALSE 0.367 133.000 0.049 NA N NA
 1099632 1099633 LSA0631 LSA0632     FALSE 0.376 205.000 0.154 NA   NA
 1099635 1099636 LSA0634 LSA0635 trxA4   TRUE 0.953 19.000 0.239 1.000   NA
 1099636 1099637 LSA0635 LSA0636   asnB FALSE 0.079 185.000 0.000 1.000   NA
 1099637 1099638 LSA0636 LSA0637 asnB murC FALSE 0.117 162.000 0.000 1.000 N NA
 1099638 1099639 LSA0637 LSA0638 murC   FALSE 0.265 97.000 0.002 NA   NA
 1099639 1099640 LSA0638 LSA0639     FALSE 0.031 261.000 0.000 NA   NA
 1099640 1099641 LSA0639 LSA0640     TRUE 0.995 0.000 0.875 NA   NA
 1099641 1099642 LSA0640 LSA0641     TRUE 0.712 1.000 0.000 NA   NA
 1099643 1099644 LSA0642 LSAt37 usp3 tRNA-Arg FALSE 0.040 207.000 0.000 NA   NA
 1099645 1099646 LSA0643 LSA0644 pepX   TRUE 0.585 21.000 0.000 1.000   NA
 1099646 1099647 LSA0644 LSA0645     FALSE 0.027 305.000 0.000 NA   NA
 1099647 1099648 LSA0645 LSA0646     TRUE 0.946 -28.000 0.054 NA   NA
 1099648 1099649 LSA0646 LSA0647     FALSE 0.045 263.000 0.000 NA N NA
 1099649 1099650 LSA0647 LSA0648     FALSE 0.059 205.000 0.000 NA N NA
 1099650 1099651 LSA0648 LSA0649   glpK FALSE 0.106 175.000 0.000 1.000 N NA
 1099651 1099652 LSA0649 LSA0650 glpK glpD TRUE 0.976 12.000 0.010 0.001 Y NA
 1099652 1099653 LSA0650 LSA0651 glpD glpF TRUE 0.965 25.000 0.350 1.000 N NA
 1099653 1099654 LSA0651 LSA0652 glpF purE FALSE 0.083 221.000 0.000 1.000 N NA
 1099654 1099655 LSA0652 LSA0653 purE purK1 TRUE 0.989 -16.000 0.002 0.002 Y NA
 1099655 1099656 LSA0653 LSA0654 purK1 purB1 TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1099656 1099657 LSA0654 LSA0655 purB1 purC TRUE 0.629 113.000 0.072 1.000 Y NA
 1099657 1099658 LSA0655 LSA0656 purC purS TRUE 0.996 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 1099658 1099659 LSA0656 LSA0657 purS purQ TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 1099659 1099660 LSA0657 LSA0658 purQ purL TRUE 0.998 -10.000 0.346 0.002 Y NA
 1099660 1099661 LSA0658 LSA0659 purL purF TRUE 0.991 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 1099661 1099662 LSA0659 LSA0660 purF purM TRUE 0.989 6.000 0.248 1.000 Y NA
 1099662 1099663 LSA0660 LSA0661 purM purN TRUE 0.997 -3.000 0.238 0.004 Y NA
 1099663 1099664 LSA0661 LSA0662 purN purH TRUE 0.972 17.000 0.225 1.000 Y NA
 1099664 1099665 LSA0662 LSA0663 purH purD TRUE 0.975 15.000 0.238 1.000 Y NA
 1099665 1099666 LSA0663 LSA0664 purD loxL1N FALSE 0.181 82.000 0.000 1.000   NA
 1099666 1099667 LSA0664 LSA0665 loxL1N loxL1I TRUE 0.958 -18.000 0.000 0.003   NA
 1099667 1099668 LSA0665 LSA0666 loxL1I loxL1C TRUE 0.831 30.000 0.000 0.003   NA
 1099668 1099669 LSA0666 LSA0667 loxL1C   FALSE 0.061 147.000 0.000 NA   NA
 1099671 1099672 LSA0669 LSA0670   rplU FALSE 0.256 148.000 0.005 1.000   NA
 1099672 1099673 LSA0670 LSA0671 rplU   TRUE 0.966 15.000 0.208 NA Y NA
 1099673 1099674 LSA0671 LSA0672   rpmA TRUE 0.952 29.000 0.203 NA Y NA
 1099674 1099675 LSA0672 LSA0673 rpmA efp2 FALSE 0.140 302.000 0.000 1.000 Y NA
 1099675 1099676 LSA0673 LSA0674 efp2   TRUE 0.662 46.000 0.031 NA   NA
 1099676 1099677 LSA0674 LSA0675   nusB TRUE 0.984 0.000 0.265 NA   NA
 1099677 1099678 LSA0675 LSA0676 nusB folD FALSE 0.346 195.000 0.082 1.000 N NA
 1099678 1099679 LSA0676 LSA0677 folD xseA TRUE 0.964 -7.000 0.045 1.000 N NA
 1099679 1099680 LSA0677 LSA0678 xseA xseB TRUE 0.998 2.000 0.412 0.001 Y NA
 1099680 1099681 LSA0678 LSA0679 xseB ispA TRUE 0.973 0.000 0.100 1.000 N NA
 1099681 1099682 LSA0679 LSA0680 ispA   TRUE 0.939 9.000 0.058 1.000 N NA
 1099682 1099683 LSA0680 LSA0681     TRUE 0.557 80.000 0.048 1.000 N NA
 1099683 1099684 LSA0681 LSA0682   recN TRUE 0.736 50.000 0.037 1.000 N NA
 1099686 1099687 LSA0684 LSA0685   gmk2 FALSE 0.142 73.000 0.000 NA   NA
 1099687 1099688 LSA0685 LSA0686 gmk2 rpoZ TRUE 0.990 5.000 0.471 1.000 N NA
 1099688 1099689 LSA0686 LSA0687 rpoZ dfp TRUE 0.698 89.000 0.192 1.000 N NA
 1099689 1099690 LSA0687 LSA0688 dfp priA TRUE 0.971 2.000 0.099 1.000 N NA
 1099690 1099691 LSA0688 LSA0689 priA fmt TRUE 0.888 20.000 0.052 1.000 N NA
 1099691 1099692 LSA0689 LSA0690 fmt   TRUE 0.994 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 1099692 1099693 LSA0690 LSA0691     TRUE 0.897 22.000 0.074 1.000 N NA
 1099693 1099694 LSA0691 LSA0692     TRUE 0.997 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 1099694 1099695 LSA0692 LSA0693     TRUE 0.646 100.000 0.196 1.000   NA
 1099695 1099696 LSA0693 LSA0694   rpe TRUE 0.558 24.000 0.000 1.000   NA
 1099696 1099697 LSA0694 LSA0695 rpe   TRUE 0.866 -13.000 0.000 1.000 N NA
 1099699 1099700 LSA0697 LSA0698     TRUE 0.906 64.000 0.567 NA   NA
 1099700 1099701 LSA0698 LSA0699   recG FALSE 0.167 586.000 0.074 1.000   NA
 1099701 1099702 LSA0699 LSA0700 recG plsX TRUE 0.873 20.000 0.033 1.000 N NA
 1099702 1099703 LSA0700 LSA0701 plsX acp TRUE 0.699 147.000 0.029 0.007 Y NA
 1099703 1099704 LSA0701 LSA0702 acp oppA FALSE 0.048 473.000 0.000 1.000 N NA
 1099704 1099705 LSA0702 LSA0703 oppA oppB TRUE 0.708 70.000 0.000 0.039 Y NA
 1099705 1099706 LSA0703 LSA0704 oppB oppC TRUE 0.996 1.000 0.299 0.039 Y NA
 1099706 1099707 LSA0704 LSA0705 oppC oppD TRUE 0.753 287.000 0.595 1.000 Y NA
 1099707 1099708 LSA0705 LSA0706 oppD oppF TRUE 0.994 29.000 0.619 0.001 Y NA
 1099708 1099709 LSA0706 LSA0707 oppF rncS FALSE 0.109 172.000 0.000 1.000 N NA
 1099709 1099710 LSA0707 LSA0708 rncS smc TRUE 0.874 36.000 0.120 1.000 N NA
 1099710 1099711 LSA0708 LSA0709 smc ftsY TRUE 0.982 11.000 0.165 0.017 N NA
 1099711 1099712 LSA0709 LSA0710 ftsY   FALSE 0.196 73.000 0.000 NA N NA
 1099712 1099713 LSA0710 LSA0711     FALSE 0.115 105.000 0.000 NA N NA
 1099713 1099714 LSA0711 LSA0712     TRUE 0.984 11.000 0.255 1.000 Y NA
 1099714 1099715 LSA0712 LSA0713     FALSE 0.121 126.000 0.000 1.000   NA
 1099715 1099716 LSA0713 LSA0714   ffh TRUE 0.919 25.000 0.151 1.000   NA
 1099716 1099717 LSA0714 LSA0715 ffh rpsP TRUE 0.792 93.000 0.361 1.000 N NA
 1099717 1099718 LSA0715 LSA0716 rpsP   TRUE 0.981 10.000 0.385 1.000   NA
 1099718 1099719 LSA0716 LSA0717   rimM TRUE 0.868 66.000 0.324 1.000   NA
 1099719 1099720 LSA0717 LSA0718 rimM trmD TRUE 0.997 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 1099720 1099721 LSA0718 LSA0719 trmD Rpl19 TRUE 0.886 119.000 0.567 1.000 Y NA
 1099721 1099722 LSA0719 LSA0720 Rpl19   FALSE 0.123 78.000 0.000 NA   NA
 1099723 1099724 LSA0721 LSA0722     FALSE 0.062 146.000 0.000 NA   NA
 1099725 1099726 LSA0723 LSAt38   tRNA-Ser FALSE 0.082 101.000 0.000 NA   NA
 1099727 1099728 LSA0724 LSA0725     FALSE 0.021 461.000 0.000 NA   NA
 1099728 1099729 LSA0725 LSA0727     FALSE 0.026 310.000 0.000 NA   NA
 1099732 1099733 LSA0730 LSA0731     FALSE 0.082 101.000 0.000 NA   NA
 1099733 1099734 LSA0731 LSA0732     TRUE 0.979 33.000 1.000 NA   NA
 1099734 1099735 LSA0732 LSA0733     FALSE 0.063 144.000 0.000 NA   NA
 1099735 1099736 LSA0733 LSA0734   prmA TRUE 0.505 64.000 0.013 NA   NA
 1099736 1099737 LSA0734 LSA0735 prmA   TRUE 0.958 12.000 0.227 NA   NA
 1099737 1099738 LSA0735 LSA0736     TRUE 0.626 40.000 0.006 NA   NA
 1099738 1099739 LSA0736 LSA0737   relA FALSE 0.394 81.000 0.021 NA   NA
 1099739 1099740 LSA0737 LSA0738 relA dtd TRUE 0.953 13.000 0.177 1.000 N NA
 1099740 1099741 LSA0738 LSA0739 dtd   TRUE 0.938 0.000 0.009 1.000   NA
 1099743 1099744 LSA0741 LSA0742     FALSE 0.031 262.000 0.000 NA   NA
 1099744 1099745 LSA0742 LSA0743     TRUE 0.978 15.000 0.635 NA   NA
 1099745 1099746 LSA0743 LSA0744   ftsL TRUE 0.957 6.000 0.077 1.000 N NA
 1099746 1099747 LSA0744 LSA0745 ftsL pbp2B1 TRUE 0.917 63.000 0.456 1.000 N NA
 1099747 1099748 LSA0745 LSA0746 pbp2B1 mraY TRUE 0.894 33.000 0.038 1.000 Y NA
 1099748 1099749 LSA0746 LSA0747 mraY murD TRUE 0.995 16.000 0.647 0.008 Y NA
 1099749 1099750 LSA0747 LSA0748 murD murG TRUE 0.936 16.000 0.060 1.000 Y NA
 1099750 1099751 LSA0748 LSA0749 murG ftsQ TRUE 0.927 22.000 0.072 NA Y NA
 1099751 1099752 LSA0749 LSA0750 ftsQ ftsA TRUE 0.736 130.000 0.389 NA N NA
 1099752 1099753 LSA0750 LSA0751 ftsA ftsZ TRUE 0.980 28.000 0.460 1.000 Y NA
 1099753 1099754 LSA0751 LSA0752 ftsZ   TRUE 0.798 16.000 0.020 NA   NA
 1099754 1099755 LSA0752 LSA0753     TRUE 0.987 1.000 0.370 NA   NA
 1099755 1099756 LSA0753 LSA0754     TRUE 0.986 2.000 0.287 1.000   NA
 1099756 1099757 LSA0754 LSA0755   divIVA TRUE 0.959 34.000 0.579 NA   NA
 1099757 1099758 LSA0755 LSA0756 divIVA ileS FALSE 0.169 232.000 0.012 NA N NA
 1099758 1099759 LSA0756 LSA0757 ileS   FALSE 0.085 172.000 0.000 1.000   NA
 1099759 1099760 LSA0757 LSA0758     FALSE 0.025 321.000 0.000 NA   NA
 1099760 1099761 LSA0758 LSA0759     TRUE 0.440 16.000 0.000 NA   NA
 1099761 1099762 LSA0759 LSA0760     TRUE 0.955 -3.000 0.000 0.009   NA
 1099762 1099763 LSA0760 LSA0761   topB FALSE 0.082 177.000 0.000 1.000   NA
 1099764 1099765 LSA0762 LSA0763   galR FALSE 0.131 113.000 0.000 1.000   NA
 1099766 1099767 LSA0764 LSA0765 galK galE1 TRUE 0.868 26.000 0.000 0.003 N NA
 1099767 1099768 LSA0765 LSA0766 galE1 galT TRUE 0.974 11.000 0.071 0.003 N NA
 1099768 1099769 LSA0766 LSA0767 galT galM TRUE 0.833 46.000 0.024 1.000 Y NA
 1099769 1099770 LSA0767 LSA0768 galM csp1 FALSE 0.169 107.000 0.000 1.000 N NA
 1099770 1099771 LSA0768 LSA0769 csp1 tyrS FALSE 0.052 385.000 0.000 1.000 N NA
 1099771 1099772 LSA0769 LSA0770 tyrS   FALSE 0.080 231.000 0.000 1.000 N NA
 1099773 1099774 LSA0771 LSA0772     FALSE 0.152 69.000 0.000 NA   NA
 1099774 1099775 LSA0772 LSA0773     TRUE 0.988 0.000 0.373 NA   NA
 1099776 1099777 LSA0774 LSA0775     TRUE 0.830 12.000 0.008 NA   NA
 1099777 1099778 LSA0775 LSA0776   pfs TRUE 0.630 43.000 0.013 NA   NA
 1099778 1099779 LSA0776 LSA0777 pfs   FALSE 0.032 256.000 0.000 NA   NA
 1099779 1099780 LSA0777 LSA0778     FALSE 0.081 107.000 0.000 NA   NA
 1099780 1099781 LSA0778 LSA0779     TRUE 0.440 16.000 0.000 NA   NA
 1099782 1099783 LSA0780 LSA0781     TRUE 0.772 6.000 0.000 1.000   NA
 1099783 1099784 LSA0781 LSA0782     TRUE 0.955 -16.000 0.000 0.006   NA
 1099784 1099785 LSA0782 LSA0783     FALSE 0.381 99.000 0.010 1.000 N NA
 1099786 1099787 LSA0784 LSA0785     TRUE 0.886 12.000 0.026 1.000   NA
 1099787 1099788 LSA0785 LSA0786     TRUE 0.928 -3.000 0.011 NA   NA
 1099788 1099789 LSA0786 LSA0787     TRUE 0.923 -18.000 0.010 NA   NA
 1099789 1099790 LSA0787 LSA0788     TRUE 0.539 64.000 0.026 NA   NA
 1099790 1099791 LSA0788 LSA0789     TRUE 0.442 21.000 0.000 NA   NA
 1099791 1099792 LSA0789 LSA0790     FALSE 0.408 25.000 0.000 NA   NA
 1099792 1099793 LSA0790 LSA0791     FALSE 0.120 128.000 0.000 1.000   NA
 1099793 1099794 LSA0791 LSA0792     TRUE 0.790 60.000 0.166 NA   NA
 1099794 1099795 LSA0792 LSA0794   trmU FALSE 0.197 186.000 0.021 NA   NA
 1099795 1099796 LSA0794 LSA0795 trmU deoC FALSE 0.291 159.000 0.000 0.054 N NA
 1099796 1099797 LSA0795 LSA0796 deoC deoB TRUE 0.939 16.000 0.047 0.054 N NA
 1099797 1099798 LSA0796 LSA0797 deoB deoD TRUE 0.861 17.000 0.027 1.000 N NA
 1099798 1099799 LSA0797 LSA0798 deoD   TRUE 0.816 22.000 0.000 1.000 Y NA
 1099799 1099800 LSA0798 LSA0799     TRUE 0.812 24.000 0.000 0.052   NA
 1099800 1099801 LSA0799 LSA0800   deoR TRUE 0.522 28.000 0.000 1.000   NA
 1099801 1099802 LSA0800 LSA0801 deoR pdp TRUE 0.878 19.000 0.040 1.000 N NA
 1099802 1099803 LSA0801 LSA0802 pdp nox FALSE 0.061 237.000 0.000 1.000   NA
 1099803 1099804 LSA0802 LSA0803 nox gpm4 FALSE 0.098 153.000 0.000 1.000   NA
 1099804 1099805 LSA0803 LSA0804 gpm4   TRUE 0.956 12.000 0.183 1.000   NA
 1099805 1099806 LSA0804 LSA0805   recD TRUE 0.982 6.000 0.281 1.000   NA
 1099806 1099807 LSA0805 LSA0806 recD   TRUE 0.715 43.000 0.025 1.000   NA
 1099809 1099810 LSA0808 LSA0809     FALSE 0.149 91.000 0.000 1.000   NA
 1099810 1099811 LSA0809 LSA0810     FALSE 0.095 194.000 0.000 1.000 N NA
 1099811 1099812 LSA0810 LSA0811     TRUE 0.935 2.000 0.022 NA N NA
 1099812 1099813 LSA0811 LSA0812   fabZ1 FALSE 0.044 268.000 0.000 NA N NA
 1099813 1099814 LSA0812 LSA0813 fabZ1 fabH TRUE 0.927 11.000 0.007 NA Y NA
 1099814 1099815 LSA0813 LSA0814 fabH acpP TRUE 0.896 43.000 0.065 0.007   NA
 1099815 1099816 LSA0814 LSA0815 acpP fabD FALSE 0.288 141.000 0.010 1.000   NA
 1099816 1099817 LSA0815 LSA0816 fabD fabG TRUE 0.995 0.000 0.432 1.000 Y NA
 1099817 1099818 LSA0816 LSA0817 fabG fabF TRUE 0.884 38.000 0.056 1.000 Y NA
 1099818 1099819 LSA0817 LSA0818 fabF accB TRUE 0.977 5.000 0.074 1.000 Y NA
 1099819 1099820 LSA0818 LSA0819 accB fabZ2 TRUE 0.989 4.000 0.058 0.007 Y NA
 1099820 1099821 LSA0819 LSA0820 fabZ2 accC TRUE 0.950 14.000 0.085 1.000 Y NA
 1099821 1099822 LSA0820 LSA0821 accC accD TRUE 0.981 14.000 0.090 0.002 Y NA
 1099822 1099823 LSA0821 LSA0822 accD accA TRUE 0.997 -22.000 0.234 0.002 Y NA
 1099823 1099824 LSA0822 LSA0823 accA fabI TRUE 0.907 24.000 0.015 1.000 Y NA
 1099824 1099825 LSA0823 LSA0824 fabI birA1 TRUE 0.937 6.000 0.024 1.000 N NA
 1099825 1099826 LSA0824 LSA0825 birA1   TRUE 0.443 19.000 0.000 NA   NA
 1099826 1099827 LSA0825 LSA0826     TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1099827 1099828 LSA0826 LSA0827     FALSE 0.279 41.000 0.000 NA   NA
 1099828 1099829 LSA0827 LSA0828     FALSE 0.177 64.000 0.000 NA   NA
 1099830 1099831 LSA0829 LSA0830   iunH3 TRUE 0.956 13.000 0.262 NA   NA
 1099834 1099835 LSA0832 LSA0833     TRUE 0.917 27.000 0.200 NA   NA
 1099835 1099836 LSA0833 LSA0835     FALSE 0.111 140.000 0.000 1.000   NA
 1099837 1099838 LSA0836 LSA0837 usp6   FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 1099838 1099839 LSA0837 LSA0839     FALSE 0.026 315.000 0.000 NA   NA
 1099844 1099845 LSA0845 LSA0846     TRUE 0.577 160.000 0.201 1.000 N NA
 1099845 1099846 LSA0846 LSA0847   thiI TRUE 0.965 25.000 0.349 1.000 N NA
 1099846 1099847 LSA0847 LSA0848 thiI   FALSE 0.293 128.000 0.005 1.000   NA
 1099847 1099848 LSA0848 LSA0849   valS FALSE 0.136 319.000 0.000 0.053   NA
 1099848 1099849 LSA0849 LSA0850 valS folC1 FALSE 0.344 122.000 0.007 1.000 N NA
 1099849 1099850 LSA0850 LSA0851 folC1   TRUE 0.522 28.000 0.000 1.000   NA
 1099850 1099851 LSA0851 LSA0852   radC TRUE 0.640 74.000 0.093 1.000   NA
 1099851 1099852 LSA0852 LSA0853 radC mreB TRUE 0.473 164.000 0.130 1.000 N NA
 1099852 1099853 LSA0853 LSA0854 mreB mreC FALSE 0.320 158.000 0.024 1.000 N NA
 1099853 1099854 LSA0854 LSA0855 mreC mreD TRUE 0.998 -13.000 0.550 0.004 Y NA
 1099854 1099855 LSA0855 LSA0856 mreD minC TRUE 0.917 17.000 0.106 1.000 N NA
 1099855 1099856 LSA0856 LSA0857 minC minD TRUE 0.994 2.000 0.368 1.000 Y NA
 1099856 1099857 LSA0857 LSA0858 minD   FALSE 0.049 452.000 0.000 1.000 N NA
 1099857 1099858 LSA0858 LSA0859   ls859 TRUE 0.964 13.000 0.130 1.000 Y NA
 1099858 1099859 LSA0859 LSA0860 ls859   TRUE 0.989 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 1099859 1099860 LSA0860 LSA0861   cls1 TRUE 0.890 13.000 0.031 1.000 N NA
 1099862 1099863 LSA0863 LSA0864 hisS aspS TRUE 0.994 0.000 0.161 0.053 Y NA
 1099863 1099864 LSA0864 LSA0865 aspS   FALSE 0.343 113.000 0.003 1.000 N NA
 1099864 1099865 LSA0865 LSA0866   msrA TRUE 0.981 0.000 0.000 0.001 Y NA
 1099865 1099866 LSA0866 LSA0867 msrA   TRUE 0.507 78.000 0.062 NA   NA
 1099866 1099867 LSA0867 LSA0868   nfo FALSE 0.211 147.000 0.006 NA   NA
 1099867 1099868 LSA0868 LSA0869 nfo   TRUE 0.731 -16.000 0.000 NA   NA
 1099868 1099869 LSA0869 LSA0870     TRUE 0.741 -10.000 0.000 NA   NA
 1099869 1099870 LSA0870 LSA0871     FALSE 0.082 101.000 0.000 NA   NA
 1099872 1099873 LSA0873 LSA0874 rpsU   TRUE 0.958 25.000 0.150 0.041   NA
 1099873 1099874 LSA0874 LSA0875   phoH FALSE 0.167 295.000 0.027 1.000   NA
 1099874 1099875 LSA0875 LSA0876 phoH   TRUE 0.980 10.000 0.457 NA   NA
 1099875 1099876 LSA0876 LSA0877   dgkA TRUE 0.938 -22.000 0.035 NA   NA
 1099876 1099877 LSA0877 LSA0878 dgkA   TRUE 0.806 36.000 0.063 1.000   NA
 1099877 1099878 LSA0878 LSA0879   recO TRUE 0.946 10.000 0.108 1.000   NA
 1099878 1099879 LSA0879 LSA0880 recO glyQ FALSE 0.239 238.000 0.036 1.000 N NA
 1099879 1099880 LSA0880 LSA0881 glyQ glyS TRUE 0.999 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 1099880 1099881 LSA0881 LSA0882 glyS   TRUE 0.734 25.000 0.003 NA   NA
 1099881 1099882 LSA0882 LSA0883   dnaG FALSE 0.057 156.000 0.000 NA   NA
 1099882 1099883 LSA0883 LSA0884 dnaG sigA TRUE 0.945 24.000 0.209 1.000 N NA
 1099885 1099886 LSA0886 LSA0887     TRUE 0.985 -12.000 0.283 NA   NA
 1099886 1099887 LSA0887 LSA0888   pepT TRUE 0.702 45.000 0.051 NA   NA
 1099888 1099889 LSA0889 LSA0890 aroD   FALSE 0.437 18.000 0.000 NA   NA
 1099889 1099890 LSA0890 LSA0891     FALSE 0.061 147.000 0.000 NA   NA
 1099891 1099892 LSA0892 LSA0893 aroE aroH TRUE 0.987 -3.000 0.121 1.000 Y NA
 1099892 1099893 LSA0893 LSA0894 aroH aroB TRUE 0.987 3.000 0.007 0.002 Y NA
 1099893 1099894 LSA0894 LSA0895 aroB aroK TRUE 0.631 78.000 0.005 1.000 Y NA
 1099894 1099895 LSA0895 LSA0896 aroK sodA FALSE 0.195 88.000 0.000 1.000 N NA
 1099899 1099900 LSA0900 LSA0901     FALSE 0.119 79.000 0.000 NA   NA
 1099900 1099901 LSA0901 LSA0902     TRUE 0.957 23.000 0.364 NA   NA
 1099902 1099903 LSA0903_a LSA0903_b tnpB3-ISLsa2 tnpA3C-ISLsa2 FALSE 0.274 42.000 0.000 NA   NA
 1099903 1099904 LSA0903_b LSA0904 tnpA3C-ISLsa2 tnpA3N-ISLsa2 TRUE 0.635 7.000 0.000 NA   NA
 1099904 1099905 LSA0904 LSA0905 tnpA3N-ISLsa2 idi FALSE 0.053 271.000 0.000 1.000   NA
 1099905 1099906 LSA0905 LSA0906 idi mvaK2 TRUE 0.971 13.000 0.097 0.004 N NA
 1099906 1099907 LSA0906 LSA0907 mvaK2 mvaD TRUE 0.996 6.000 0.312 0.004 Y NA
 1099907 1099908 LSA0907 LSA0908 mvaD mvaK1 TRUE 0.989 23.000 0.281 0.004 Y NA
 1099909 1099910 LSA0909 LSA0910 rexB rexAN TRUE 0.997 -16.000 0.276 0.006 Y NA
 1099910 1099911 LSA0910 LSA0911 rexAN rexAC TRUE 0.818 17.000 0.000 0.058   NA
 1099911 1099912 LSA0911 LSA0912 rexAC   TRUE 0.538 66.000 0.000 0.058   NA
 1099912 1099913 LSA0912 LSA0913     TRUE 0.779 78.000 0.296 NA   NA
 1099913 1099914 LSA0913 LSA0914   asnS FALSE 0.366 111.000 0.051 NA   NA
 1099914 1099915 LSA0914 LSA0915 asnS dnaD TRUE 0.652 121.000 0.234 NA N NA
 1099915 1099916 LSA0915 LSA0916 dnaD   TRUE 0.924 24.000 0.075 NA Y NA
 1099917 1099918 LSA0917 LSA0918 pbp1A recU TRUE 0.982 7.000 0.319 1.000   NA
 1099919 1099920 LSA0919 LSA0920     TRUE 0.859 80.000 0.579 NA   NA
 1099920 1099921 LSA0920 LSA0921     FALSE 0.021 490.000 0.000 NA   NA
 1099921 1099922 LSA0921 LSA0922   serA FALSE 0.364 103.000 0.006 1.000 N NA
 1099924 1099925 LSA0924 LSA0925   adh FALSE 0.149 132.000 0.000 1.000 N NA
 1099925 1099926 LSA0925 LSA0926 adh   FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1099927 1099928 LSA0927 LSA0928     TRUE 0.741 -3.000 0.000 NA   NA
 1099929 1099930 LSA0929 LSA0930     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1099930 1099931 LSA0930 LSA0931     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1099931 1099932 LSA0931 LSA0932     FALSE 0.077 115.000 0.000 NA   NA
 1099932 1099933 LSA0932 LSA0933     FALSE 0.311 36.000 0.000 NA   NA
 1099934 1099935 LSA0934 LSA0935 lplA   FALSE 0.159 119.000 0.000 1.000 N NA
 1099935 1099936 LSA0935 LSA0936     TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1099936 1099937 LSA0936 LSA0937     FALSE 0.079 111.000 0.000 NA   NA
 1099937 1099938 LSA0937 LSA0938     TRUE 0.902 115.000 0.920 1.000 N NA
 1099940 1099941 LSA0940 LSA0941 nrdF nrdE TRUE 0.832 424.000 0.500 0.001 Y NA
 1099941 1099942 LSA0941 LSA0942 nrdE nrdH FALSE 0.386 125.000 0.026 1.000 N NA
 1099942 1099943 LSA0942 LSA0943 nrdH cls2 FALSE 0.057 320.000 0.000 1.000 N NA
 1099943 1099944 LSA0943 LSA0944 cls2   FALSE 0.204 86.000 0.000 1.000 N NA
 1099947 1099948 LSA0947 LSA0948 fhs lspA FALSE 0.422 106.000 0.030 1.000 N NA
 1099948 1099949 LSA0948 LSA0949 lspA rluA2 TRUE 0.972 -7.000 0.082 1.000 N NA
 1099949 1099950 LSA0949 LSA0950 rluA2 pyrR FALSE 0.319 183.000 0.048 1.000 N NA
 1099950 1099951 LSA0950 LSA0951 pyrR pyrP TRUE 0.601 175.000 0.140 1.000 Y NA
 1099951 1099952 LSA0951 LSA0952 pyrP pyrB TRUE 0.982 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 1099952 1099953 LSA0952 LSA0953 pyrB pyrC TRUE 0.989 12.000 0.452 1.000 Y NA
 1099953 1099954 LSA0953 LSA0954 pyrC pyrAA TRUE 0.986 4.000 0.155 1.000 Y NA
 1099954 1099955 LSA0954 LSA0955 pyrAA pyrAB TRUE 0.982 18.000 0.117 0.001 Y NA
 1099955 1099956 LSA0955 LSA0956 pyrAB pyrDA TRUE 0.614 105.000 0.147 1.000 N NA
 1099956 1099957 LSA0956 LSA0957 pyrDA pyrDB TRUE 0.998 0.000 0.592 0.002 N NA
 1099957 1099958 LSA0957 LSA0958 pyrDB pyrF TRUE 0.994 4.000 0.154 0.002 Y NA
 1099958 1099959 LSA0958 LSA0959 pyrF pyrE TRUE 0.988 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 1099963 1099964 LSA0963 LSA0964     TRUE 0.891 29.000 0.152 NA   NA
 1099964 1099965 LSA0964 LSA0965     FALSE 0.072 126.000 0.000 NA   NA
 1099965 1099966 LSA0965 LSA0966     TRUE 0.847 2.000 0.000 1.000 N NA
 1099966 1099967 LSA0966 LSA0967   xerC1 FALSE 0.042 820.000 0.000 1.000 N NA
 1099967 1099968 LSA0967 LSA0968 xerC1   FALSE 0.038 214.000 0.000 NA   NA
 1099969 1099970 LSA0969 LSA0970     FALSE 0.083 98.000 0.000 NA   NA
 1099970 1099971 LSA0970 LSA0971   ppa FALSE 0.214 57.000 0.000 NA   NA
 1099971 1099972 LSA0971 LSA0972 ppa   TRUE 0.716 53.000 0.028 1.000 N NA
 1099972 1099973 LSA0972 LSA0973   pflA FALSE 0.343 130.000 0.011 1.000 N NA
 1099973 1099974 LSA0973 LSA0974 pflA pflB TRUE 0.495 118.000 0.082 1.000 N NA
 1099974 1099975 LSA0974 LSA0975 pflB parC FALSE 0.066 283.000 0.000 1.000 N NA
 1099975 1099976 LSA0975 LSA0976 parC parE TRUE 0.992 30.000 0.552 0.002 Y NA
 1099978 1099979 LSA0978 LSA0979     TRUE 0.969 -16.000 0.127 NA   NA
 1099981 1099982 LSA0981 LSA0982 aldB als TRUE 0.835 34.000 0.056 1.000 N NA
 1099982 1099983 LSA0982 LSA0983 als   FALSE 0.154 125.000 0.000 1.000 N NA
 1099983 1099984 LSA0983 LSA0984   hslU TRUE 0.847 23.000 0.020 1.000 N NA
 1099984 1099985 LSA0984 LSA0985 hslU hslV TRUE 0.997 4.000 0.752 1.000 Y NA
 1099985 1099986 LSA0985 LSA0986 hslV xerC2 TRUE 0.570 102.000 0.113 1.000 N NA
 1099986 1099987 LSA0986 LSA0987 xerC2   TRUE 0.702 68.000 0.105 1.000   NA
 1099987 1099988 LSA0987 LSA0988     TRUE 0.978 -22.000 0.013 0.005   NA
 1099988 1099989 LSA0988 LSA0989   topA TRUE 0.919 22.000 0.137 1.000   NA
 1099989 1099990 LSA0989 LSA0990 topA   FALSE 0.048 251.000 0.000 NA N NA
 1099990 1099991 LSA0990 LSA0991     TRUE 0.465 29.000 0.000 NA N NA
 1099991 1099992 LSA0991 LSA0992     FALSE 0.172 101.000 0.000 1.000 N NA
 1099992 1099993 LSA0992 LSA0993   rnhB TRUE 0.824 55.000 0.037 1.000 Y NA
 1099993 1099994 LSA0993 LSA0994 rnhB   TRUE 0.975 2.000 0.148 1.000   NA
 1099994 1099995 LSA0994 LSA0995   sipA2 FALSE 0.289 135.000 0.000 0.071   NA
 1099995 1099996 LSA0995 LSA0996 sipA2   FALSE 0.408 25.000 0.000 NA   NA
 1099996 1099997 LSA0996 LSA0997     TRUE 0.938 11.000 0.136 NA   NA
 1099997 1099998 LSA0997 LSA0998     TRUE 0.986 13.000 0.828 NA   NA
 1099998 1099999 LSA0998 LSA0999     TRUE 0.613 80.000 0.136 NA   NA
 1099999 1100000 LSA0999 LSA1000   dfrA FALSE 0.188 181.000 0.012 NA   NA
 1100000 1100001 LSA1000 LSA1001 dfrA thyA TRUE 0.976 11.000 0.295 1.000 N NA
 1100001 1100002 LSA1001 LSA1002 thyA   FALSE 0.250 196.000 0.036 1.000   NA
 1100002 1100003 LSA1002 LSA1003     FALSE 0.278 113.000 0.011 NA   NA
 1100003 1100004 LSA1003 LSA1004   papS TRUE 0.463 69.000 0.014 NA   NA
 1100008 1100009 LSA1008 LSA1009     FALSE 0.090 164.000 0.000 1.000   NA
 1100009 1100010 LSA1009 LSA1010     TRUE 0.906 9.000 0.000 0.037   NA
 1100012 1100013 LSA1012 LSA1013     FALSE 0.125 121.000 0.000 1.000   NA
 1100013 1100014 LSA1013 LSA1014     FALSE 0.151 130.000 0.000 1.000 N NA
 1100014 1100015 LSA1014 LSA1015   hbsU FALSE 0.179 94.000 0.000 1.000 N NA
 1100015 1100016 LSA1015 LSA1016 hbsU   FALSE 0.193 207.000 0.008 1.000   NA
 1100016 1100017 LSA1016 LSA1017   rpsA FALSE 0.213 234.000 0.032 1.000   NA
 1100017 1100018 LSA1017 LSA1018 rpsA cmk TRUE 0.466 95.000 0.047 1.000 N NA
 1100018 1100019 LSA1018 LSA1019 cmk   TRUE 0.519 67.000 0.007 1.000   NA
 1100019 1100020 LSA1019 LSA1020   recQ1 TRUE 0.678 69.000 0.095 1.000   NA
 1100020 1100021 LSA1020 LSA1021 recQ1   TRUE 0.982 -3.000 0.222 NA   NA
 1100023 1100024 LSA1023 LSA1024   rsuA1 FALSE 0.026 315.000 0.000 NA   NA
 1100024 1100025 LSA1024 LSA1025 rsuA1   TRUE 0.981 3.000 0.224 NA N NA
 1100025 1100026 LSA1025 LSA1026     TRUE 0.992 -16.000 0.570 NA   NA
 1100026 1100027 LSA1026 LSA1027     TRUE 0.877 9.000 0.013 NA   NA
 1100027 1100028 LSA1027 LSA1028   XerD FALSE 0.423 74.000 0.013 NA   NA
 1100028 1100029 LSA1028 LSA1029 XerD   TRUE 0.903 12.000 0.029 1.000 N NA
 1100029 1100030 LSA1029 LSA1030     TRUE 0.619 55.000 0.006 1.000   NA
 1100030 1100031 LSA1030 LSA1031     TRUE 0.798 21.000 0.019 NA   NA
 1100031 1100032 LSA1031 LSA1032   pyk FALSE 0.249 157.000 0.027 NA   NA
 1100032 1100033 LSA1032 LSA1033 pyk pfk TRUE 0.929 83.000 0.261 0.007 Y NA
 1100033 1100034 LSA1033 LSA1034 pfk dnaE TRUE 0.508 133.000 0.098 1.000 N NA
 1100036 1100037 LSA1036 LSA1037     FALSE 0.059 150.000 0.000 NA   NA
 1100037 1100038 LSA1037 LSA1038     FALSE 0.072 198.000 0.000 1.000   NA
 1100038 1100039 LSA1038 LSA1039   rpmF FALSE 0.135 107.000 0.000 1.000   NA
 1100039 1100040 LSA1039 LSA1040 rpmF clpB FALSE 0.129 367.000 0.002 1.000 N NA
 1100040 1100041 LSA1040 LSA1041 clpB   FALSE 0.169 175.000 0.003 NA   NA
 1100041 1100042 LSA1041 LSA1042     TRUE 0.909 9.000 0.048 NA   NA
 1100042 1100043 LSA1042 LSA1043   rnz TRUE 0.951 6.000 0.074 1.000   NA
 1100043 1100044 LSA1043 LSA1044 rnz   TRUE 0.737 35.000 0.011 1.000   NA
 1100044 1100045 LSA1044 LSA1045     FALSE 0.291 139.000 0.010 1.000   NA
 1100045 1100046 LSA1045 LSA1047     FALSE 0.095 159.000 0.000 1.000   NA
 1100047 1100048 LSA1048 LSA1049 fruR fruK TRUE 0.997 0.000 0.721 1.000 Y NA
 1100048 1100049 LSA1049 LSA1050 fruK fruA TRUE 0.990 25.000 0.816 1.000 Y NA
 1100050 1100051 LSA1051 LSA1052 uvrA2   FALSE 0.227 55.000 0.000 NA   NA
 1100051 1100052 LSA1052 LSA1053     FALSE 0.070 131.000 0.000 NA   NA
 1100054 1100055 LSA1055 LSA1056 uvrC   TRUE 0.451 80.000 0.004 1.000 N NA
 1100055 1100056 LSA1056 LSA1057     TRUE 0.995 -7.000 0.410 1.000 Y NA
 1100058 1100059 LSA1059 LSA1060     TRUE 0.923 0.000 0.011 NA   NA
 1100059 1100060 LSA1060 LSA1061   clpX FALSE 0.336 148.000 0.043 1.000   NA
 1100060 1100061 LSA1061 LSA1062 clpX tig TRUE 0.631 210.000 0.033 0.002 Y NA
 1100061 1100062 LSA1062 LSA1063 tig tuf FALSE 0.217 211.000 0.011 1.000 N NA
 1100062 1100063 LSA1063 LSA1064 tuf   FALSE 0.176 223.000 0.006 1.000   NA
 1100063 1100064 LSA1064 LSA1065     TRUE 0.663 89.000 0.182 1.000   NA
 1100064 1100065 LSA1065 LSA1066   rpsO FALSE 0.176 229.000 0.008 1.000   NA
 1100067 1100068 LSA1068 LSA1069 holA   TRUE 0.981 -3.000 0.163 1.000   NA
 1100068 1100069 LSA1069 LSA1070     TRUE 0.961 -3.000 0.055 1.000   NA
 1100069 1100070 LSA1070 LSA1071     TRUE 0.877 58.000 0.095 0.047 N NA
 1100070 1100071 LSA1071 LSA1072     TRUE 0.564 75.000 0.035 1.000 N NA
 1100071 1100072 LSA1072 LSA1073   kdtB TRUE 0.959 2.000 0.052 1.000 N NA
 1100072 1100073 LSA1073 LSA1074 kdtB   TRUE 0.975 13.000 0.367 1.000 N NA
 1100073 1100074 LSA1074 LSA1075     TRUE 0.931 5.000 0.048 NA   NA
 1100074 1100075 LSA1075 LSA1076     TRUE 0.785 24.000 0.022 NA   NA
 1100075 1100076 LSA1076 LSA1077   ftsW TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 1100076 1100077 LSA1077 LSA1078 ftsW   TRUE 0.928 9.000 0.083 NA   NA
 1100077 1100078 LSA1078 LSA1079     FALSE 0.074 121.000 0.000 NA   NA
 1100078 1100079 LSA1079 LSA1080     FALSE 0.338 146.000 0.024 1.000 N NA
 1100079 1100080 LSA1080 LSA1081     TRUE 0.958 17.000 0.337 NA   NA
 1100080 1100081 LSA1081 LSA1082   pdhD FALSE 0.389 145.000 0.096 NA   NA
 1100081 1100082 LSA1082 LSA1083 pdhD pdhC TRUE 0.997 8.000 0.948 1.000 Y NA
 1100082 1100083 LSA1083 LSA1084 pdhC pdhB TRUE 0.994 30.000 0.883 0.052 Y NA
 1100083 1100084 LSA1084 LSA1085 pdhB pdhA TRUE 0.998 -19.000 0.484 0.001 Y NA
 1100084 1100085 LSA1085 LSA1086 pdhA   FALSE 0.025 323.000 0.000 NA   NA
 1100087 1100088 LSA1088 LSA1089     TRUE 0.999 2.000 0.846 0.007 Y NA
 1100088 1100089 LSA1089 LSA1090     FALSE 0.381 28.000 0.000 NA   NA
 1100090 1100091 LSA1091 LSA1092     TRUE 0.990 5.000 0.576 NA   NA
 1100091 1100092 LSA1092 LSA1093     FALSE 0.377 134.000 0.045 1.000   NA
 1100093 1100094 LSA1094 LSA1095     TRUE 0.952 -7.000 0.052 NA   NA
 1100094 1100095 LSA1095 LSA1096     FALSE 0.020 570.000 0.000 NA   NA
 1100095 1100096 LSA1096 LSA1097     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 1100096 1100097 LSA1097 LSA1098   folP TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1100097 1100098 LSA1098 LSA1099 folP folC2 TRUE 0.993 11.000 0.286 0.004 Y NA
 1100098 1100099 LSA1099 LSA1100 folC2 folE TRUE 0.981 12.000 0.231 1.000 Y NA
 1100099 1100100 LSA1100 LSA1101 folE folK TRUE 0.971 -28.000 0.012 1.000 Y NA
 1100100 1100101 LSA1101 LSA1102 folK folB TRUE 0.988 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 1100104 1100105 LSA1105 LSA1107     FALSE 0.028 297.000 0.000 NA   NA
 1100105 1100106 LSA1107 LSA1108     FALSE 0.080 109.000 0.000 NA   NA
 1100107 1100108 LSA1109 LSA1110     TRUE 0.992 0.000 0.152 0.002 N NA
 1100108 1100109 LSA1110 LSA1111     TRUE 0.989 -13.000 0.292 1.000 N NA
 1100109 1100110 LSA1111 LSA1112     TRUE 0.994 -22.000 0.606 1.000 N NA
 1100110 1100111 LSA1112 LSA1113     TRUE 0.966 13.000 0.139 1.000 Y NA
 1100111 1100112 LSA1113 LSA1114     FALSE 0.203 170.000 0.003 NA N NA
 1100112 1100113 LSA1114 LSA1115     TRUE 0.961 20.000 0.181 NA Y NA
 1100113 1100114 LSA1115 LSA1116     TRUE 0.997 -7.000 0.642 1.000 Y NA
 1100114 1100115 LSA1116 LSA1117     FALSE 0.054 352.000 0.000 1.000 N NA
 1100115 1100116 LSA1117 LSA1118     TRUE 0.979 19.000 0.556 1.000 N NA
 1100116 1100117 LSA1118 LSA1119     TRUE 0.671 94.000 0.243 NA   NA
 1100117 1100118 LSA1119 LSA1120     TRUE 0.738 30.000 0.018 NA   NA
 1100118 1100119 LSA1120 LSA1121     TRUE 0.760 22.000 0.006 NA   NA
 1100119 1100120 LSA1121 LSA1122   mbl TRUE 0.781 27.000 0.027 NA   NA
 1100120 1100121 LSA1122 LSA1123 mbl murA1 TRUE 0.498 149.000 0.126 1.000 N NA
 1100121 1100122 LSA1123 LSA1124 murA1   TRUE 0.936 28.000 0.279 NA   NA
 1100122 1100123 LSA1124 LSA1125   atpC FALSE 0.260 161.000 0.039 NA   NA
 1100123 1100124 LSA1125 LSA1126 atpC atpD TRUE 0.997 13.000 0.837 0.004 Y NA
 1100124 1100125 LSA1126 LSA1127 atpD atpG TRUE 0.998 3.000 0.724 0.004 Y NA
 1100125 1100126 LSA1127 LSA1128 atpG atpA TRUE 0.997 13.000 0.846 0.004 Y NA
 1100126 1100127 LSA1128 LSA1129 atpA atpH TRUE 0.996 28.000 0.864 0.004 Y NA
 1100127 1100128 LSA1129 LSA1130 atpH atpF TRUE 0.996 -13.000 0.222 0.004 Y NA
 1100128 1100129 LSA1130 LSA1131 atpF atpE TRUE 0.920 63.000 0.077 0.004 Y NA
 1100129 1100130 LSA1131 LSA1132 atpE atpB TRUE 0.994 19.000 0.557 0.005 Y NA
 1100130 1100131 LSA1132 LSA1133 atpB upp FALSE 0.150 309.000 0.007 1.000 N NA
 1100131 1100132 LSA1133 LSA1134 upp glyA FALSE 0.313 158.000 0.021 1.000 N NA
 1100132 1100133 LSA1134 LSA1135 glyA   TRUE 0.527 86.000 0.088 NA N NA
 1100133 1100134 LSA1135 LSA1136     TRUE 0.951 30.000 0.204 NA Y NA
 1100134 1100135 LSA1136 LSA1137   prfA TRUE 0.982 -22.000 0.084 1.000 Y NA
 1100135 1100136 LSA1137 LSA1138 prfA tdk TRUE 0.948 7.000 0.062 1.000 N NA
 1100137 1100138 LSA1139 LSA1140     TRUE 0.996 -3.000 0.796 1.000   NA
 1100140 1100141 LSA1142 LSA1143     TRUE 0.864 20.000 0.071 NA   NA
 1100141 1100142 LSA1143 LSA1144     FALSE 0.074 122.000 0.000 NA   NA
 1100143 1100144 LSA1145 LSA1146   manA FALSE 0.218 74.000 0.000 1.000   NA
 1100144 1100145 LSA1146 LSA1147 manA   TRUE 0.604 102.000 0.140 1.000 N NA
 1100145 1100146 LSA1147 LSA1148     FALSE 0.345 98.000 0.000 1.000 Y NA
 1100146 1100147 LSA1148 LSA1149     TRUE 0.998 0.000 0.467 0.007 Y NA
 1100147 1100148 LSA1149 LSA1150     TRUE 0.975 24.000 0.533 1.000 N NA
 1100150 1100151 LSA1152_a LSA1152_b tnpA3-ISLsa1 csp2 FALSE 0.167 293.000 0.000 0.056 N NA
 1100152 1100153 LSA1153 LSA1154     TRUE 0.442 21.000 0.000 NA   NA
 1100153 1100154 LSA1154 LSA1155     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1100155 1100156 LSA1156 LSA1157   mgsA FALSE 0.104 84.000 0.000 NA   NA
 1100156 1100157 LSA1157 LSA1158 mgsA   TRUE 0.665 12.000 0.000 1.000   NA
 1100157 1100158 LSA1158 LSA1159     FALSE 0.110 141.000 0.000 1.000   NA
 1100158 1100160 LSA1159 LSA1160     FALSE 0.020 530.000 0.000 NA   NA
 1100160 1100159 LSA1160 LSAt40   tRNA-Glu TRUE 0.707 -125.000 0.000 NA   NA
 1100162 1100163 LSA1161 LSA1162     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1100163 1100164 LSA1162 LSA1163     TRUE 0.725 0.000 0.000 NA   NA
 1100164 1100165 LSA1163 LSA1164     TRUE 0.447 20.000 0.000 NA   NA
 1100165 1100166 LSA1164 LSA1165     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 1100166 1100167 LSA1165 LSA1166     FALSE 0.059 243.000 0.000 1.000   NA
 1100168 1100169 LSA1167 LSA1168     FALSE 0.070 133.000 0.000 NA   NA
 1100170 1100171 LSA1169 LSA1170     FALSE 0.126 350.000 0.000 1.000 Y NA
 1100172 1100173 LSA1171 LSA1172     FALSE 0.074 122.000 0.000 NA   NA
 1100173 1100174 LSA1172 LSA1173   usp4 FALSE 0.036 227.000 0.000 NA   NA
 1100174 1100175 LSA1173 LSA1174 usp4   FALSE 0.032 257.000 0.000 NA   NA
 1100175 1100176 LSA1174 LSA1175     FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 1100176 1100177 LSA1175 LSA1176     FALSE 0.170 65.000 0.000 NA   NA
 1100177 1100178 LSA1176 LSA1177     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1100178 1100179 LSA1177 LSA1178     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 1100181 1100182 LSA1180 LSA1181 tnpA-ISLsa3 tnpB-ISLsa3 TRUE 0.987 -57.000 0.375 NA   NA
 1100184 1100185 LSA1183_a LSA1183_b tnpA4-IS1520 tnpB4-IS1520 TRUE 0.825 21.000 0.000 0.056   NA
 1100187 1100188 LSA1184 LSA1185     FALSE 0.027 300.000 0.000 NA   NA
 1100188 1100189 LSA1185 LSA1186     TRUE 0.741 -3.000 0.000 NA   NA
 1100189 1100190 LSA1186 LSA1187     TRUE 0.996 -3.000 0.895 1.000   NA
 1100190 1100191 LSA1187 LSA1188   pox1 FALSE 0.071 204.000 0.000 1.000   NA
 1100192 1100193 LSA1189 LSA1190     FALSE 0.046 305.000 0.000 1.000   NA
 1100193 1100194 LSA1190 LSA1191     TRUE 0.964 16.000 0.333 1.000   NA
 1100194 1100195 LSA1191 LSA1192     TRUE 0.949 19.000 0.095 0.061   NA
 1100195 1100196 LSA1192 LSA1193     TRUE 0.646 16.000 0.000 1.000 N NA
 1100197 1100198 LSA1194 LSA1195     TRUE 0.931 60.000 0.650 NA   NA
 1100199 1100200 LSA1196 LSA1197     TRUE 0.835 -3.000 0.000 1.000   NA
 1100200 1100201 LSA1197 LSA1198     TRUE 0.729 9.000 0.000 1.000   NA
 1100201 1100202 LSA1198 LSA1199   treC TRUE 0.774 29.000 0.000 1.000 Y NA
 1100202 1100203 LSA1199 LSA1200 treC   TRUE 0.937 14.000 0.042 1.000 Y NA
 1100205 1100206 LSA1202 LSA1203     FALSE 0.048 178.000 0.000 NA   NA
 1100206 1100207 LSA1203 LSA1204     FALSE 0.052 166.000 0.000 NA   NA
 1100207 1100208 LSA1204 LSA1205     FALSE 0.041 289.000 0.000 NA N NA
 1100209 1100210 LSA1206 LSA1207     FALSE 0.340 104.000 0.000 1.000 Y NA
 1100211 1100212 LSA1208 LSA1209     TRUE 0.744 -6.000 0.000 NA   NA
 1100212 1100213 LSA1209 LSA1210     FALSE 0.076 116.000 0.000 NA   NA
 1100213 1100214 LSA1210 LSA1211     TRUE 0.877 16.000 0.000 0.002   NA
 1100215 1100216 LSA1212 LSA1213     TRUE 0.959 12.000 0.017 0.001   NA
 1100217 1100218 LSA1214 LSA1215     TRUE 0.996 0.000 0.586 1.000 Y NA
 1100219 1100220 LSA1216 LSA1218     FALSE 0.068 135.000 0.000 NA   NA
 1100220 1100221 LSA1218 LSA1219     FALSE 0.113 137.000 0.000 1.000   NA
 1100222 1100223 LSA1220 LSA1221 citG citR TRUE 0.996 -7.000 0.700 1.000 N NA
 1100223 1100224 LSA1221 LSA1222 citR oadA TRUE 0.794 82.000 0.273 1.000 N NA
 1100224 1100225 LSA1222 LSA1223 oadA citX TRUE 0.978 -6.000 0.123 1.000 N NA
 1100225 1100226 LSA1223 LSA1224 citX citF TRUE 0.980 -7.000 0.138 1.000 N NA
 1100226 1100227 LSA1224 LSA1225 citF citE TRUE 0.991 0.000 0.119 0.002 N NA
 1100227 1100228 LSA1225 LSA1226 citE citD TRUE 0.992 9.000 0.284 0.002 N NA
 1100228 1100229 LSA1226 LSA1227 citD citC TRUE 0.989 6.000 0.231 1.000 Y NA
 1100229 1100230 LSA1227 LSA1228 citC   TRUE 0.953 3.000 0.058 1.000   NA
 1100230 1100231 LSA1228 LSA1229   oadB TRUE 0.984 14.000 0.273 0.002   NA
 1100231 1100232 LSA1229 LSA1230 oadB oadG TRUE 0.977 12.000 0.103 0.002 N NA
 1100232 1100233 LSA1230 LSA1231 oadG   TRUE 0.956 0.000 0.077 NA   NA
 1100233 1100234 LSA1231 LSA1232   citM TRUE 0.944 31.000 0.364 NA   NA
 1100234 1100235 LSA1232 LSA1233 citM birA2 FALSE 0.095 194.000 0.000 1.000 N NA
 1100235 1100236 LSA1233 LSA1234 birA2   TRUE 0.442 21.000 0.000 NA   NA
 1100236 1100237 LSA1234 LSA1235   dnaJ FALSE 0.053 164.000 0.000 NA   NA
 1100237 1100238 LSA1235 LSA1236 dnaJ dnaK TRUE 0.881 120.000 0.196 0.003 Y NA
 1100238 1100239 LSA1236 LSA1237 dnaK grpE TRUE 0.940 37.000 0.026 0.006 Y NA
 1100239 1100240 LSA1237 LSA1238 grpE hrcA TRUE 0.884 16.000 0.051 1.000 N NA
 1100240 1100241 LSA1238 LSA1239 hrcA   FALSE 0.081 181.000 0.000 1.000   NA
 1100241 1100242 LSA1239 LSA1240     FALSE 0.103 147.000 0.000 1.000   NA
 1100242 1100243 LSA1240 LSA1241     TRUE 0.970 0.000 0.005 1.000 Y NA
 1100243 1100244 LSA1241 LSA1242   truB TRUE 0.966 19.000 0.308 1.000 N NA
 1100244 1100245 LSA1242 LSA1243 truB   FALSE 0.113 136.000 0.000 1.000   NA
 1100245 1100246 LSA1243 LSA1244     TRUE 0.681 4.000 0.000 NA   NA
 1100246 1100247 LSA1244 LSA1245     TRUE 0.741 -10.000 0.000 NA   NA
 1100247 1100248 LSA1245 LSA1246     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1100248 1100249 LSA1246 LSA1247   rbfA FALSE 0.048 248.000 0.000 NA N NA
 1100249 1100250 LSA1247 LSA1248 rbfA infB TRUE 0.985 23.000 0.530 1.000 Y NA
 1100250 1100251 LSA1248 LSA1249 infB   TRUE 0.967 18.000 0.223 NA Y NA
 1100251 1100252 LSA1249 LSA1250     TRUE 0.991 -3.000 0.408 NA N NA
 1100252 1100253 LSA1250 LSA1251   nusA TRUE 0.983 12.000 0.323 NA Y NA
 1100253 1100254 LSA1251 LSA1252 nusA   TRUE 0.981 19.000 0.759 NA   NA
 1100254 1100255 LSA1252 LSA1253     FALSE 0.268 99.000 0.004 NA   NA
 1100255 1100256 LSA1253 LSA1254     FALSE 0.030 275.000 0.000 NA   NA
 1100256 1100257 LSA1254 LSA1255     TRUE 0.945 -13.000 0.040 NA   NA
 1100257 1100258 LSA1255 LSA1256   polC FALSE 0.136 105.000 0.000 1.000   NA
 1100258 1100259 LSA1256 LSA1257 polC proS TRUE 0.538 175.000 0.070 0.050 N NA
 1100259 1100260 LSA1257 LSA1258 proS   TRUE 0.898 26.000 0.095 1.000 N NA
 1100260 1100261 LSA1258 LSA1259   cdsA FALSE 0.273 207.000 0.040 1.000 N NA
 1100261 1100262 LSA1259 LSA1260 cdsA uppS TRUE 0.934 31.000 0.113 1.000 Y NA
 1100264 1100265 LSA1262 LSA1263 frr pyrH TRUE 0.993 3.000 0.626 1.000 N NA
 1100265 1100266 LSA1263 LSA1264 pyrH tsf TRUE 0.766 136.000 0.416 1.000 N NA
 1100266 1100267 LSA1264 LSA1265 tsf rpsB TRUE 0.921 107.000 0.748 1.000 Y NA
 1100267 1100268 LSA1265 LSA1266 rpsB   FALSE 0.256 168.000 0.005 1.000 N NA
 1100268 1100269 LSA1266 LSA1267     TRUE 0.985 -7.000 0.209 1.000   NA
 1100271 1100272 LSA1269 LSA1270     FALSE 0.126 77.000 0.000 NA   NA
 1100272 1100273 LSA1270 LSA1271     FALSE 0.285 40.000 0.000 NA   NA
 1100273 1100274 LSA1271 LSA1272     TRUE 0.999 2.000 0.911 0.007 Y NA
 1100274 1100275 LSA1272 LSA1273     TRUE 0.603 142.000 0.214 1.000   NA
 1100275 1100276 LSA1273 LSA1274     TRUE 0.624 81.000 0.145 NA   NA
 1100278 1100279 LSA1276 LSA1277 apt recJ TRUE 0.919 24.000 0.128 1.000 N NA
 1100280 1100281 LSA1280 LSA1281 galE2   FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 1100281 1100282 LSA1281 LSA1282     FALSE 0.434 17.000 0.000 NA   NA
 1100283 1100284 LSA1283 LSA1284     TRUE 0.741 -10.000 0.000 NA   NA
 1100284 1100285 LSA1284 LSA1285     TRUE 0.741 -10.000 0.000 NA   NA
 1100286 1100287 LSA1286_a LSA1286_b tnpA5-IS1520 tnpB5-IS1520 TRUE 0.825 21.000 0.000 0.055   NA
 1100288 1100289 LSA1286_c LSA1287     FALSE 0.074 121.000 0.000 NA   NA
 1100289 1100290 LSA1287 LSA1288     FALSE 0.061 147.000 0.000 NA   NA
 1100292 1100293 LSA1290 LSA1291 lepA   FALSE 0.068 135.000 0.000 NA   NA
 1100294 1100295 LSA1292 LSA1293     FALSE 0.081 105.000 0.000 NA   NA
 1100295 1100296 LSA1293 LSA1294     TRUE 0.705 2.000 0.000 NA   NA
 1100296 1100297 LSA1294 LSA1295     FALSE 0.067 136.000 0.000 NA   NA
 1100297 1100298 LSA1295 LSA1296     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 1100299 1100300 LSA1297 LSA1298   ack2 FALSE 0.227 55.000 0.000 NA   NA
 1100300 1100301 LSA1298 LSA1299 ack2   TRUE 0.639 22.000 0.000 1.000 N NA
 1100301 1100302 LSA1299 LSA1300     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 1100302 1100303 LSA1300 LSA1301     TRUE 0.712 -37.000 0.000 NA   NA
 1100303 1100304 LSA1301 LSA1302     FALSE 0.401 26.000 0.000 NA   NA
 1100304 1100305 LSA1302 LSA1303     TRUE 0.735 -13.000 0.000 NA   NA
 1100305 1100306 LSA1303 LSA1304     TRUE 0.820 20.000 0.030 NA   NA
 1100306 1100307 LSA1304 LSA1305     TRUE 0.998 -3.000 0.861 NA Y NA
 1100307 1100308 LSA1305 LSA1306     TRUE 0.997 -7.000 0.639 0.071   NA
 1100308 1100309 LSA1306 LSA1307     FALSE 0.282 116.000 0.014 NA   NA
 1100309 1100310 LSA1307 LSA1308     FALSE 0.316 91.000 0.013 NA   NA
 1100311 1100312 LSA1309 LSAt42   tRNA-Ala FALSE 0.239 52.000 0.000 NA   NA
 1100316 1100317 LSA1313 LSA1314     TRUE 0.693 13.000 0.000 1.000 N NA
 1100318 1100319 LSA1315 LSA1316   rluA3 FALSE 0.303 37.000 0.000 NA   NA
 1100320 1100321 LSA1317 LSA1318     FALSE 0.044 193.000 0.000 NA   NA
 1100322 1100323 LSA1319 LSA1320     TRUE 0.725 0.000 0.000 NA   NA
 1100323 1100324 LSA1320 LSA1321   glnA FALSE 0.307 60.000 0.000 1.000   NA
 1100324 1100325 LSA1321 LSA1322 glnA glnR TRUE 0.908 16.000 0.090 1.000 N NA
 1100325 1100326 LSA1322 LSA1323 glnR tag2 FALSE 0.156 123.000 0.000 1.000 N NA
 1100326 1100327 LSA1323 LSA1324 tag2   TRUE 0.871 -6.000 0.000 1.000 N NA
 1100327 1100328 LSA1324 LSA1325     FALSE 0.111 169.000 0.000 1.000 N NA
 1100328 1100329 LSA1325 LSA1326   miaA TRUE 0.896 20.000 0.065 1.000 N NA
 1100331 1100332 LSA1328 LSA1329   glk TRUE 0.854 25.000 0.064 NA N NA
 1100332 1100333 LSA1329 LSA1330 glk   TRUE 0.991 -3.000 0.496 NA   NA
 1100333 1100334 LSA1330 LSA1331     TRUE 0.940 33.000 0.347 NA   NA
 1100334 1100335 LSA1331 LSA1332   fthC TRUE 0.880 13.000 0.037 1.000   NA
 1100335 1100336 LSA1332 LSA1333 fthC rpmG1 TRUE 0.706 59.000 0.045 1.000 N NA
 1100336 1100337 LSA1333 LSA1334 rpmG1 pbp2B2 FALSE 0.394 109.000 0.019 1.000 N NA
 1100339 1100340 LSA1336 LSA1337   murB TRUE 0.641 60.000 0.014 1.000 N NA
 1100341 1100342 LSA1338 LSA1339 exoA dnaQ TRUE 0.924 36.000 0.011 0.045 Y NA
 1100343 1100344 LSA1340 LSA1341     TRUE 0.665 12.000 0.000 1.000   NA
 1100344 1100345 LSA1341 LSA1342     TRUE 0.943 -10.000 0.033 NA   NA
 1100345 1100346 LSA1342 LSA1343   pta FALSE 0.235 159.000 0.023 NA   NA
 1100346 1100347 LSA1343 LSA1344 pta ung TRUE 0.558 91.000 0.092 1.000 N NA
 1100348 1100349 LSA1345 LSA1346     TRUE 0.965 7.000 0.182 NA   NA
 1100349 1100350 LSA1346 LSA1347     FALSE 0.071 129.000 0.000 NA   NA
 1100351 1100352 LSA1348 LSA1349     FALSE 0.058 153.000 0.000 NA   NA
 1100352 1100353 LSA1349 LSA1350     TRUE 0.584 63.000 0.000 0.049   NA
 1100353 1100354 LSA1350 LSA1351     TRUE 0.792 4.000 0.000 1.000   NA
 1100355 1100356 LSA1352 LSA1353     TRUE 0.948 -10.000 0.043 NA   NA
 1100356 1100357 LSA1353 LSA1354     TRUE 0.937 12.000 0.149 NA   NA
 1100360 1100361 LSA1357 LSA1358 glmM   TRUE 0.866 35.000 0.150 NA   NA
 1100361 1100362 LSA1358 LSA1359     TRUE 0.964 27.000 0.502 NA   NA
 1100362 1100363 LSA1359 LSA1360   potD TRUE 0.542 61.000 0.016 NA   NA
 1100363 1100364 LSA1360 LSA1361 potD potC TRUE 0.996 -3.000 0.253 0.034 Y NA
 1100364 1100365 LSA1361 LSA1362 potC potB TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.034 Y NA
 1100365 1100366 LSA1362 LSA1363 potB potA TRUE 0.998 9.000 0.928 0.034 Y NA
 1100368 1100369 LSA1365 LSA1366     FALSE 0.130 75.000 0.000 NA   NA
 1100369 1100370 LSA1366 LSA1367     TRUE 0.847 2.000 0.000 1.000 N NA
 1100370 1100371 LSA1367 LSA1368     FALSE 0.069 134.000 0.000 NA   NA
 1100371 1100372 LSA1368 LSA1369     TRUE 0.811 26.000 0.045 NA   NA
 1100372 1100373 LSA1369 LSA1370     TRUE 0.994 35.000 0.853 0.007 Y NA
 1100373 1100374 LSA1370 LSA1371     TRUE 0.994 -3.000 0.679 NA   NA
 1100374 1100375 LSA1371 LSA1372   greA FALSE 0.081 1021.000 0.014 NA   NA
 1100375 1100376 LSA1372 LSA1373 greA udk TRUE 0.639 22.000 0.000 1.000 N NA
 1100376 1100377 LSA1373 LSA1374 udk   FALSE 0.119 79.000 0.000 NA   NA
 1100377 1100378 LSA1374 LSA1375   pheT FALSE 0.321 86.000 0.007 NA   NA
 1100378 1100379 LSA1375 LSA1376 pheT pheS TRUE 0.998 4.000 0.574 0.001 Y NA
 1100379 1100380 LSA1376 LSA1378 pheS   FALSE 0.043 276.000 0.000 NA N NA
 1100380 1100381 LSA1378 LSA1379     FALSE 0.418 79.000 0.024 NA   NA
 1100381 1100382 LSA1379 LSA1380     FALSE 0.322 114.000 0.007 1.000   NA
 1100383 1100384 LSA1381 LSA1382   oxaA1 TRUE 0.815 63.000 0.154 1.000 N NA
 1100385 1100386 LSA1383 LSA1384     TRUE 0.997 -3.000 0.438 0.070 Y NA
 1100386 1100387 LSA1384 LSA1385   gndA FALSE 0.208 259.000 0.025 1.000 N NA
 1100387 1100388 LSA1385 LSA1386 gndA   FALSE 0.179 166.000 0.002 NA   NA
 1100388 1100389 LSA1386 LSA1387     TRUE 0.957 -6.000 0.070 NA   NA
 1100389 1100390 LSA1387 LSA1388     TRUE 0.934 9.000 0.094 NA   NA
 1100390 1100391 LSA1388 LSA1389     TRUE 0.962 -3.000 0.085 NA   NA
 1100391 1100392 LSA1389 LSA1390     TRUE 0.928 13.000 0.149 NA   NA
 1100392 1100393 LSA1390 LSA1391   nadD TRUE 0.991 -7.000 0.199 1.000 Y NA
 1100393 1100394 LSA1391 LSA1392 nadD   TRUE 0.923 16.000 0.150 NA N NA
 1100394 1100395 LSA1392 LSA1393     TRUE 0.848 23.000 0.068 NA   NA
 1100395 1100396 LSA1393 LSA1394     TRUE 0.993 -7.000 0.555 1.000   NA
 1100398 1100399 LSA1396 LSA1397 rplT rpmI TRUE 0.975 85.000 0.928 0.024 Y NA
 1100399 1100400 LSA1397 LSA1398 rpmI infC TRUE 0.983 34.000 0.652 1.000 Y NA
 1100400 1100401 LSA1398 LSA1399 infC loxL2 FALSE 0.072 255.000 0.000 1.000 N NA
 1100401 1100402 LSA1399 LSA1400 loxL2 thrS FALSE 0.062 296.000 0.000 1.000 N NA
 1100402 1100403 LSA1400 LSA1401 thrS dnaI FALSE 0.058 312.000 0.000 1.000 N NA
 1100403 1100404 LSA1401 LSA1402 dnaI dnaB TRUE 0.997 0.000 0.817 NA Y NA
 1100404 1100405 LSA1402 LSA1403 dnaB   TRUE 0.903 18.000 0.109 NA N NA
 1100405 1100406 LSA1403 LSA1404   coaE FALSE 0.113 549.000 0.024 NA N NA
 1100406 1100407 LSA1404 LSA1405 coaE fpg TRUE 0.966 0.000 0.066 1.000 N NA
 1100407 1100408 LSA1405 LSA1406 fpg polA TRUE 0.965 12.000 0.101 1.000 Y NA
 1100408 1100409 LSA1406 LSA1407 polA   FALSE 0.155 124.000 0.000 1.000 N NA
 1100409 1100410 LSA1407 LSA1408     FALSE 0.021 476.000 0.000 NA   NA
 1100410 1100411 LSA1408 LSA1409     FALSE 0.027 305.000 0.000 NA   NA
 1100411 1100412 LSA1409 LSA1410   smpB FALSE 0.039 405.000 0.000 1.000   NA
 1100412 1100413 LSA1410 LSA1411 smpB rnr TRUE 0.983 9.000 0.143 0.028 N NA
 1100413 1100414 LSA1411 LSA1412 rnr   TRUE 0.831 16.000 0.015 1.000   NA
 1100414 1100415 LSA1412 LSA1413   secG FALSE 0.323 113.000 0.007 1.000   NA
 1100415 1100416 LSA1413 LSA1414 secG   FALSE 0.234 80.000 0.000 1.000 N NA
 1100418 1100419 LSA1416 LSA1417     TRUE 0.980 18.000 0.750 NA   NA
 1100419 1100420 LSA1417 LSA1418     TRUE 0.894 11.000 0.000 0.024   NA
 1100420 1100421 LSA1418 LSA1419     TRUE 0.832 -13.000 0.000 1.000   NA
 1100421 1100422 LSA1419 LSA1420     FALSE 0.122 125.000 0.000 1.000   NA
 1100422 1100423 LSA1420 LSA1421   argS FALSE 0.036 515.000 0.000 1.000   NA
 1100423 1100424 LSA1421 LSA1422 argS   FALSE 0.069 264.000 0.000 1.000 N NA
 1100424 1100425 LSA1422 LSAt43   tRNA-Gly FALSE 0.031 261.000 0.000 NA   NA
 1100426 1100427 LSA1423 LSA1424     FALSE 0.045 312.000 0.000 1.000   NA
 1100427 1100428 LSA1424 LSA1426     FALSE 0.158 120.000 0.000 1.000 N NA
 1100429 1100430 LSA1427 LSA1428     FALSE 0.320 128.000 0.000 0.049   NA
 1100430 1100431 LSA1428 LSA1429     TRUE 0.911 31.000 0.024 0.006   NA
 1100431 1100432 LSA1429 LSAt44   tRNA-Leu FALSE 0.044 193.000 0.000 NA   NA
 1100434 1100435 LSA1431 LSA1432 rsuA2   TRUE 0.976 -3.000 0.128 1.000   NA
 1100435 1100436 LSA1432 LSA1433     FALSE 0.035 549.000 0.000 1.000   NA
 1100438 1100439 LSA1435 LSA1436   leuS FALSE 0.044 600.000 0.000 1.000 N NA
 1100439 1100440 LSA1436 LSA1437 leuS   FALSE 0.056 334.000 0.000 1.000 N NA
 1100441 1100442 LSA1438 LSA1439     TRUE 0.586 19.000 0.000 1.000   NA
 1100443 1100444 LSA1440 LSA1441 cutC bacA FALSE 0.077 240.000 0.000 1.000 N NA
 1100444 1100445 LSA1441 LSA1442 bacA rluA4 FALSE 0.135 144.000 0.000 1.000 N NA
 1100445 1100446 LSA1442 LSA1443 rluA4   TRUE 0.960 -10.000 0.030 1.000 N NA
 1100446 1100447 LSA1443 LSA1444     TRUE 0.995 -3.000 0.725 1.000   NA
 1100448 1100449 LSA1445 LSA1446     TRUE 0.525 78.000 0.071 NA   NA
 1100450 1100451 LSA1447 LSA1448   mecA TRUE 0.657 64.000 0.089 NA   NA
 1100451 1100452 LSA1448 LSA1449 mecA spxA FALSE 0.430 173.000 0.143 NA N NA
 1100452 1100453 LSA1449 LSA1450 spxA   FALSE 0.044 327.000 0.000 1.000   NA
 1100453 1100454 LSA1450 LSA1451     FALSE 0.071 130.000 0.000 NA   NA
 1100454 1100455 LSA1451 LSA1452     FALSE 0.437 18.000 0.000 NA   NA
 1100455 1100456 LSA1452 LSA1453     TRUE 0.989 -22.000 0.333 1.000   NA
 1100457 1100458 LSA1454 LSA1455     TRUE 0.989 10.000 0.375 1.000 Y NA
 1100458 1100459 LSA1455 LSA1456     FALSE 0.056 159.000 0.000 NA   NA
 1100460 1100461 LSA1457 LSA1458   nrdG FALSE 0.075 247.000 0.000 1.000 N NA
 1100461 1100462 LSA1458 LSA1459 nrdG nrdD TRUE 0.946 28.000 0.240 1.000 N NA
 1100462 1100463 LSA1459 LSA1460 nrdD atkB FALSE 0.237 201.000 0.000 0.048 N NA
 1100463 1100464 LSA1460 LSA1461 atkB atkY TRUE 0.840 3.000 0.000 1.000 N NA
 1100464 1100465 LSA1461 LSA1462 atkY ptsI FALSE 0.127 149.000 0.000 1.000 N NA
 1100465 1100466 LSA1462 LSA1463 ptsI ptsH TRUE 0.996 0.000 0.240 0.007 Y NA
 1100466 1100467 LSA1463 LSA1464 ptsH   FALSE 0.306 143.000 0.047 NA   NA
 1100468 1100469 LSA1465 LSA1466 clpE   TRUE 0.524 108.000 0.141 NA   NA
 1100469 1100470 LSA1466 LSA1467     FALSE 0.073 125.000 0.000 NA   NA
 1100470 1100471 LSA1467 LSA1468     FALSE 0.040 207.000 0.000 NA   NA
 1100472 1100473 LSA1469 LSA1470 prfC   TRUE 0.727 31.000 0.015 NA   NA
 1100473 1100474 LSA1470 LSA1471     FALSE 0.408 139.000 0.098 NA   NA
 1100475 1100476 LSA1472 LSA1473     FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 1100476 1100477 LSA1473 LSA1474     FALSE 0.070 133.000 0.000 NA   NA
 1100478 1100479 LSA1475 LSA1476     FALSE 0.366 87.000 0.011 NA N NA
 1100479 1100480 LSA1476 LSA1477     TRUE 0.937 -13.000 0.005 1.000   NA
 1100480 1100481 LSA1477 LSA1478     TRUE 0.715 -31.000 0.000 NA   NA
 1100484 1100485 LSA1481 LSA1482     FALSE 0.096 87.000 0.000 NA   NA
 1100486 1100487 LSA1483 LSA1484   mvaS FALSE 0.031 268.000 0.000 NA   NA
 1100487 1100488 LSA1484 LSA1485 mvaS mvaA TRUE 0.969 15.000 0.183 1.000 Y NA
 1100488 1100489 LSA1485 LSA1486 mvaA   TRUE 0.986 -7.000 0.098 1.000 Y NA
 1100490 1100491 LSA1487 LSA1488     FALSE 0.343 33.000 0.000 NA   NA
 1100491 1100492 LSA1488 LSA1489     FALSE 0.044 193.000 0.000 NA   NA
 1100492 1100493 LSA1489 LSA1490     TRUE 0.741 -3.000 0.000 NA   NA
 1100493 1100494 LSA1490 LSA1491     TRUE 0.735 -13.000 0.000 NA   NA
 1100497 1100498 LSA1494 LSA1495   rfbB FALSE 0.083 98.000 0.000 NA   NA
 1100498 1100499 LSA1495 LSA1496 rfbB   FALSE 0.171 103.000 0.000 1.000 N NA
 1100499 1100500 LSA1496 LSA1497     TRUE 0.981 0.000 0.070 1.000 Y NA
 1100500 1100501 LSA1497 LSA1498     FALSE 0.040 207.000 0.000 NA   NA
 1100502 1100503 LSA1499 LSA1500 def2   FALSE 0.053 367.000 0.000 1.000 N NA
 1100503 1100504 LSA1500 LSA1501     TRUE 0.744 -7.000 0.000 NA   NA
 1100504 1100505 LSA1501 LSA1503     FALSE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 1100505 1100506 LSA1503 LSA1504     TRUE 0.718 -25.000 0.000 NA   NA
 1100507 1100508 LSA1506 LSA1507   galU FALSE 0.267 43.000 0.000 NA   NA
 1100509 1100510 LSA1508 LSA1509     FALSE 0.041 205.000 0.000 NA   NA
 1100511 1100512 LSA1510_a LSA1510_b     TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 1100512 1100513 LSA1510_b LSA1510_c     TRUE 0.728 -18.000 0.000 NA   NA
 1100513 1100514 LSA1510_c LSA1510_d     TRUE 0.731 -16.000 0.000 NA   NA
 1100514 1100515 LSA1510_d LSA1510_e     TRUE 0.635 7.000 0.000 NA   NA
 1100515 1100516 LSA1510_e LSA1510_f     TRUE 0.818 18.000 0.000 1.000 Y NA
 1100516 1100517 LSA1510_f LSA1510_g     TRUE 0.541 58.000 0.000 NA Y NA
 1100517 1100518 LSA1510_g LSA1511     TRUE 0.519 23.000 0.000 NA N NA
 1100518 1100519 LSA1511 LSA1512     TRUE 0.991 7.000 0.615 1.000 N NA
 1100519 1100520 LSA1512 LSA1513     FALSE 0.135 87.000 0.000 NA N NA
 1100520 1100521 LSA1513 LSA1514     FALSE 0.068 135.000 0.000 NA   NA
 1100521 1100522 LSA1514 LSA1515   pepM TRUE 0.572 241.000 0.373 1.000   NA
 1100523 1100524 LSA1516 LSA1517   gtcA1 FALSE 0.180 580.000 0.086 1.000   NA
 1100524 1100525 LSA1517 LSA1518 gtcA1 gtcA2 TRUE 0.962 -7.000 0.000 0.003   NA
 1100525 1100526 LSA1518 LSA1519 gtcA2   TRUE 0.955 2.000 0.086 NA   NA
 1100527 1100528 LSA1520 LSA1521 mnaA   FALSE 0.140 97.000 0.000 1.000   NA
 1100529 1100530 LSA1522 LSA1523 pepS   FALSE 0.437 18.000 0.000 NA   NA
 1100530 1100531 LSA1523 LSA1524     FALSE 0.039 210.000 0.000 NA   NA
 1100531 1100532 LSA1524 LSA1525     FALSE 0.064 142.000 0.000 NA   NA
 1100533 1100534 LSA1526 LSA1527   fba FALSE 0.082 102.000 0.000 NA   NA
 1100534 1100535 LSA1527 LSAt45 fba tRNA-Arg FALSE 0.024 345.000 0.000 NA   NA
 1100535 1100536 LSAt45 LSA1528 tRNA-Arg   FALSE 0.214 57.000 0.000 NA   NA
 1100536 1100537 LSA1528 LSA1529     TRUE 0.907 9.000 0.000 0.033   NA
 1100537 1100538 LSA1529 LSA1530     TRUE 0.507 73.000 0.014 1.000   NA
 1100538 1100539 LSA1530 LSA1531     FALSE 0.059 242.000 0.000 1.000   NA
 1100539 1100540 LSA1531 LSA1532     TRUE 0.440 16.000 0.000 NA   NA
 1100540 1100541 LSA1532 LSA1533     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 1100541 1100542 LSA1533 LSA1534     FALSE 0.061 303.000 0.000 1.000 N NA
 1100542 1100543 LSA1534 LSA1535     TRUE 0.952 13.000 0.200 1.000   NA
 1100545 1100546 LSA1537 LSA1538     TRUE 0.440 16.000 0.000 NA   NA
 1100547 1100548 LSA1539 LSA1540     TRUE 0.914 28.000 0.200 NA   NA
 1100549 1100550 LSA1541 LSA1542     TRUE 0.984 -7.000 0.231 NA   NA
 1100550 1100551 LSA1542 LSA1543     TRUE 0.672 5.000 0.000 NA   NA
 1100551 1100552 LSA1543 LSA1544     FALSE 0.046 187.000 0.000 NA   NA
 1100552 1100553 LSA1544 LSA1545     TRUE 0.803 83.000 0.299 1.000 N NA
 1100553 1100554 LSA1545 LSA1546   gatB TRUE 0.872 21.000 0.034 1.000 N NA
 1100554 1100555 LSA1546 LSA1547 gatB gatA TRUE 0.998 0.000 0.492 0.002 Y NA
 1100555 1100556 LSA1547 LSA1548 gatA gatC TRUE 0.998 3.000 0.643 0.002 Y NA
 1100558 1100559 LSA1550 LSA1551   ligA FALSE 0.405 83.000 0.030 NA   NA
 1100559 1100560 LSA1551 LSA1552 ligA pcrA TRUE 0.527 515.000 0.103 0.017 Y NA
 1100561 1100562 LSA1553 LSA1554     TRUE 0.977 5.000 0.200 1.000   NA
 1100563 1100564 LSA1555 LSA1556 purB2 purK2 TRUE 0.773 56.000 0.004 1.000 Y NA
 1100564 1100565 LSA1556 LSA1557 purK2 xpt TRUE 0.516 142.000 0.032 1.000 Y NA
 1100565 1100566 LSA1557 LSA1558 xpt   FALSE 0.375 126.000 0.023 1.000 N NA
 1100568 1100569 LSA1560 LSA1561   csp3 FALSE 0.218 74.000 0.000 1.000   NA
 1100571 1100572 LSA1563 LSAt46   tRNA-Leu FALSE 0.072 128.000 0.000 NA   NA
 1100574 1100575 LSA1565 LSA1566     TRUE 0.980 0.000 0.215 NA   NA
 1100575 1100576 LSA1566 LSA1567     TRUE 0.465 66.000 0.009 NA   NA
 1100576 1100577 LSA1567 LSA1568     FALSE 0.301 285.000 0.159 NA   NA
 1100577 1100578 LSA1568 LSA1569   nadE FALSE 0.122 710.000 0.013 1.000 N NA
 1100578 1100579 LSA1569 LSA1570 nadE nadC TRUE 0.980 32.000 0.194 0.003 Y NA
 1100581 1100582 LSA1572 LSA1573     TRUE 0.442 21.000 0.000 NA   NA
 1100582 1100583 LSA1573 LSA1574   tagD TRUE 0.810 23.000 0.000 1.000 Y NA
 1100583 1100584 LSA1574 LSA1575 tagD   TRUE 0.755 7.000 0.000 1.000   NA
 1100584 1100585 LSA1575 LSA1576   tagB TRUE 0.932 2.000 0.000 0.067   NA
 1100585 1100586 LSA1576 LSA1577 tagB   TRUE 0.722 -22.000 0.000 NA   NA
 1100586 1100587 LSA1577 LSA1578     TRUE 0.443 19.000 0.000 NA   NA
 1100587 1100588 LSA1578 LSA1579     FALSE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 1100588 1100589 LSA1579 LSA1580     FALSE 0.232 54.000 0.000 NA   NA
 1100589 1100590 LSA1580 LSA1581     FALSE 0.043 194.000 0.000 NA   NA
 1100590 1100591 LSA1581 LSA1582     FALSE 0.255 46.000 0.000 NA   NA
 1100591 1100592 LSA1582 LSA1583     TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1100592 1100593 LSA1583 LSA1584     FALSE 0.085 94.000 0.000 NA   NA
 1100593 1100594 LSA1584 LSA1585     FALSE 0.218 74.000 0.000 1.000   NA
 1100594 1100595 LSA1585 LSA1587     FALSE 0.052 384.000 0.000 1.000 N NA
 1100595 1100596 LSA1587 LSA1588   nagA TRUE 0.926 19.000 0.125 1.000 N NA
 1100598 1100599 LSA1590 LSA1591 proC srtA2 FALSE 0.106 121.000 0.000 NA N NA
 1100599 1100600 LSA1591 LSAt47 srtA2 tRNA-Gln FALSE 0.021 514.000 0.000 NA   NA
 1100600 1100601 LSAt47 LSAt48 tRNA-Gln tRNA-Tyr TRUE 0.635 7.000 0.000 NA   NA
 1100601 1100602 LSAt48 LSA1592 tRNA-Tyr dtpT FALSE 0.072 126.000 0.000 NA   NA
 1100604 1100605 LSAt49 LSAt50 tRNA-Thr tRNA-Glu TRUE 0.620 8.000 0.000 NA   NA
 1100605 1100606 LSAt50 LSAt51 tRNA-Glu tRNA-Asn FALSE 0.260 45.000 0.000 NA   NA
 1100606 1100607 LSAt51 LSAr10 tRNA-Asn rrfD TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 1100607 1100608 LSAr10 LSAr11 rrfD rrlD FALSE 0.090 91.000 0.000 NA   NA
 1100608 1100609 LSAr11 LSAr12 rrlD rrsD FALSE 0.037 224.000 0.000 NA   NA
 1100609 1100610 LSAr12 LSA1594 rrsD lysS FALSE 0.021 470.000 0.000 NA   NA
 1100610 1100611 LSA1594 LSA1595 lysS   TRUE 0.694 76.000 0.032 1.000 Y NA
 1100611 1100612 LSA1595 LSA1596   hslO TRUE 0.499 84.000 0.034 1.000 N NA
 1100612 1100613 LSA1596 LSA1597 hslO ftsH TRUE 0.604 95.000 0.041 1.000 Y NA
 1100613 1100614 LSA1597 LSA1598 ftsH hpt FALSE 0.417 89.000 0.012 1.000 N NA
 1100614 1100615 LSA1598 LSA1599 hpt   TRUE 0.851 40.000 0.004 0.046 N NA
 1100615 1100616 LSA1599 LSA1600     TRUE 0.494 84.000 0.031 1.000 N NA
 1100616 1100617 LSA1600 LSA1601     TRUE 0.602 121.000 0.179 1.000   NA
 1100617 1100618 LSA1601 LSA1602     FALSE 0.317 146.000 0.027 1.000   NA
 1100618 1100619 LSA1602 LSA1603     TRUE 0.910 10.000 0.034 1.000   NA
 1100619 1100620 LSA1603 LSA1604   mfd TRUE 0.763 37.000 0.033 1.000   NA
 1100620 1100621 LSA1604 LSA1605 mfd pth FALSE 0.378 239.000 0.137 1.000 N NA
 1100624 1100625 LSA1608 LSA1609     FALSE 0.262 182.000 0.059 NA   NA
 1100626 1100627 LSA1610 LSA1611     FALSE 0.232 147.000 0.013 NA   NA
 1100627 1100628 LSA1611 LSA1612     TRUE 0.846 24.000 0.039 1.000   NA
 1100628 1100629 LSA1612 LSA1613   alr TRUE 0.519 82.000 0.054 1.000   NA
 1100629 1100630 LSA1613 LSA1614 alr acpS TRUE 0.965 4.000 0.093 1.000 N NA
 1100630 1100631 LSA1614 LSA1615 acpS   FALSE 0.372 134.000 0.025 1.000 N NA
 1100631 1100632 LSA1615 LSA1616   murF FALSE 0.190 274.000 0.021 1.000 N NA
 1100632 1100633 LSA1616 LSA1617 murF   FALSE 0.053 164.000 0.000 NA   NA
 1100633 1100634 LSA1617 LSA1618   htpX FALSE 0.074 121.000 0.000 NA   NA
 1100634 1100635 LSA1618 LSA1619 htpX   TRUE 0.944 14.000 0.222 NA   NA
 1100636 1100637 LSA1620 LSA1621     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 1100637 1100638 LSA1621 LSA1622     FALSE 0.220 56.000 0.000 NA   NA
 1100639 1100640 LSA1623 LSA1624     TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1100641 1100642 LSA1625 LSA1626     TRUE 0.948 -7.000 0.043 NA   NA
 1100643 1100644 LSA1627 LSA1628 rpmE murA2 FALSE 0.323 155.000 0.024 1.000 N NA
 1100644 1100645 LSA1628 LSA1629 murA2 pyrG FALSE 0.140 346.000 0.007 1.000 N NA
 1100647 1100648 LSA1631 LSA1632 rpoE   TRUE 0.800 44.000 0.122 NA   NA
 1100649 1100650 LSA1633 LSA1634     TRUE 0.954 15.000 0.082 0.021   NA
 1100650 1100651 LSA1634 LSA1635     TRUE 0.822 16.000 0.011 1.000   NA
 1100651 1100652 LSA1635 LSA1636     FALSE 0.034 242.000 0.000 NA   NA
 1100655 1100656 LSA1639 LSA1640   nanA FALSE 0.093 196.000 0.000 1.000 N NA
 1100656 1100657 LSA1640 LSA1641 nanA nanE TRUE 0.653 20.000 0.000 1.000 N NA
 1100657 1100658 LSA1641 LSA1642 nanE   FALSE 0.096 193.000 0.000 1.000 N NA
 1100659 1100660 LSA1643 LSA1644     FALSE 0.070 131.000 0.000 NA   NA
 1100660 1100661 LSA1644 LSA1645     TRUE 0.705 2.000 0.000 NA   NA
 1100665 1100666 LSA1649 LSA1650     FALSE 0.334 34.000 0.000 NA   NA
 1100667 1100668 LSA1651 LSA1652   ispE FALSE 0.295 213.000 0.062 1.000 N NA
 1100668 1100669 LSA1652 LSA1653 ispE   FALSE 0.073 252.000 0.000 1.000 N NA
 1100669 1100670 LSA1653 LSA1654     FALSE 0.039 211.000 0.000 NA   NA
 1100670 1100671 LSA1654 LSA1655   ksgA FALSE 0.408 84.000 0.035 NA   NA
 1100671 1100672 LSA1655 LSA1656 ksgA   TRUE 0.968 2.000 0.093 1.000 N NA
 1100672 1100673 LSA1656 LSA1657     TRUE 0.978 -3.000 0.058 NA Y NA
 1100673 1100674 LSA1657 LSA1658   metS FALSE 0.343 354.000 0.221 NA N NA
 1100674 1100675 LSA1658 LSA1659 metS   FALSE 0.252 130.000 0.010 NA   NA
 1100675 1100676 LSA1659 LSA1660     TRUE 0.528 12.000 0.000 NA   NA
 1100676 1100677 LSA1660 LSA1661     TRUE 0.681 4.000 0.000 NA   NA
 1100677 1100678 LSA1661 LSA1662     FALSE 0.141 95.000 0.000 1.000   NA
 1100678 1100679 LSA1662 LSA1663     TRUE 0.582 16.000 0.000 1.000   NA
 1100680 1100681 LSA1664 LSA1665   phnX FALSE 0.041 365.000 0.000 1.000   NA
 1100682 1100683 LSA1666 LSA1667 rplL rplJ TRUE 0.987 64.000 0.884 0.022 Y NA
 1100684 1100685 LSA1668 LSA1669 ack3   FALSE 0.074 194.000 0.000 1.000   NA
 1100685 1100686 LSA1669 LSA1670   adeC2 TRUE 0.582 16.000 0.000 1.000   NA
 1100687 1100688 LSA1671 LSA1672 rplA rplK TRUE 0.964 99.000 0.838 0.030 Y NA
 1100688 1100689 LSA1672 LSA1673 rplK   FALSE 0.121 126.000 0.000 1.000   NA
 1100689 1100690 LSA1673 LSA1674   nusG FALSE 0.116 343.000 0.002 1.000   NA
 1100690 1100691 LSA1674 LSA1675 nusG secE TRUE 0.888 98.000 0.843 1.000   NA
 1100691 1100692 LSA1675 LSA1676 secE rpmG2 TRUE 0.934 10.000 0.080 1.000   NA
 1100692 1100693 LSA1676 LSA1677 rpmG2   FALSE 0.428 126.000 0.049 1.000 N NA
 1100693 1100694 LSA1677 LSA1678     FALSE 0.415 78.000 0.021 NA   NA
 1100694 1100695 LSA1678 LSA1679     TRUE 0.958 4.000 0.109 NA   NA
 1100695 1100696 LSA1679 LSA1680     TRUE 0.991 -13.000 0.150 0.005   NA
 1100696 1100697 LSA1680 LSA1681   cysS TRUE 0.975 -15.000 0.129 1.000   NA
 1100697 1100698 LSA1681 LSA1682 cysS   FALSE 0.019 791.000 0.000 NA   NA
 1100698 1100699 LSA1682 LSA1683     TRUE 0.794 31.000 0.056 NA   NA
 1100699 1100700 LSA1683 LSA1684   dut TRUE 0.576 73.000 0.028 1.000 N NA
 1100701 1100702 LSA1685 LSA1686 rpiA pepC1N FALSE 0.048 475.000 0.000 1.000 N NA
 1100702 1100703 LSA1686 LSA1687 pepC1N pepC1C TRUE 0.874 22.000 0.000 0.002   NA
 1100703 1100704 LSA1687 LSA1688 pepC1C pepC2 FALSE 0.283 204.000 0.000 0.002   NA
 1100705 1100706 LSA1689 LSA1690     TRUE 0.639 22.000 0.000 1.000 N NA
 1100706 1100707 LSA1690 LSA1691     TRUE 0.935 16.000 0.167 1.000   NA
 1100707 1100708 LSA1691 LSA1692     TRUE 0.633 13.000 0.000 1.000   NA
 1100708 1100709 LSA1692 LSA1693   asnA2 TRUE 0.641 17.000 0.000 1.000 N NA
 1100709 1100710 LSA1693 LSA1694 asnA2   FALSE 0.236 171.000 0.000 1.000 Y NA
 1100710 1100711 LSA1694 LSA1695     TRUE 0.983 12.000 0.107 0.032 Y NA
 1100711 1100712 LSA1695 LSA1696     TRUE 0.984 5.000 0.031 0.066 Y NA
 1100712 1100713 LSA1696 LSA1697     FALSE 0.287 332.000 0.000 0.009 Y NA
 1100713 1100714 LSA1697 LSA1698     FALSE 0.186 215.000 0.000 0.066   NA
 1100714 1100715 LSA1698 LSA1699   mntH2 FALSE 0.327 113.000 0.000 0.066   NA
 1100715 1100716 LSA1699 LSA1700 mntH2   FALSE 0.029 283.000 0.000 NA   NA
 1100716 1100717 LSA1700 LSA1701   pdcA FALSE 0.077 115.000 0.000 NA   NA
 1100717 1100718 LSA1701 LSA1702 pdcA   FALSE 0.108 143.000 0.000 1.000   NA
 1100718 1100719 LSA1702 LSA1703     FALSE 0.139 98.000 0.000 1.000   NA
 1100721 1100722 LSA1705 LSA1706     FALSE 0.022 424.000 0.000 NA   NA
 1100722 1100723 LSA1706 LSA1707     TRUE 0.440 16.000 0.000 NA   NA
 1100723 1100724 LSA1707 LSA1708     FALSE 0.136 74.000 0.000 NA   NA
 1100724 1100725 LSA1708 LSA1709     FALSE 0.246 49.000 0.000 NA   NA
 1100725 1100726 LSA1709 LSA1710   lacM FALSE 0.055 161.000 0.000 NA   NA
 1100726 1100727 LSA1710 LSA1711 lacM lacL TRUE 0.997 -16.000 0.435 0.001   NA
 1100727 1100728 LSA1711 LSA1712 lacL   FALSE 0.048 467.000 0.000 1.000 N NA
 1100728 1100729 LSA1712 LSA1713     FALSE 0.110 82.000 0.000 NA   NA
 1100729 1100730 LSA1713 LSA1714     FALSE 0.073 125.000 0.000 NA   NA
 1100730 1100731 LSA1714 LSA1715     FALSE 0.177 64.000 0.000 NA   NA
 1100731 1100732 LSA1715 LSA1716     FALSE 0.130 75.000 0.000 NA   NA
 1100732 1100733 LSA1716 LSA1717     FALSE 0.054 162.000 0.000 NA   NA
 1100735 1100736 LSA1719 LSA1720_a     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 1100736 1100737 LSA1720_a LSA1720_b     TRUE 0.725 0.000 0.000 NA   NA
 1100737 1100738 LSA1720_b LSA1721   rpsI FALSE 0.064 143.000 0.000 NA   NA
 1100738 1100739 LSA1721 LSA1722 rpsI rplM TRUE 0.995 14.000 0.601 0.022 Y NA
 1100739 1100740 LSA1722 LSA1723 rplM truA TRUE 0.564 135.000 0.052 1.000 Y NA
 1100740 1100741 LSA1723 LSA1724 truA   FALSE 0.126 151.000 0.000 1.000 N NA
 1100741 1100742 LSA1724 LSA1725     FALSE 0.048 177.000 0.000 NA   NA
 1100742 1100743 LSA1725 LSA1726     FALSE 0.069 134.000 0.000 NA   NA
 1100743 1100744 LSA1726 LSA1727     TRUE 0.726 -19.000 0.000 NA   NA
 1100744 1100745 LSA1727 LSA1728     TRUE 0.725 0.000 0.000 NA   NA
 1100745 1100746 LSA1728 LSA1729     TRUE 0.977 35.000 1.000 NA   NA
 1100746 1100747 LSA1729 LSA1730     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 1100747 1100748 LSA1730 LSA1731     TRUE 0.735 -13.000 0.000 NA   NA
 1100748 1100749 LSA1731 LSA1732     FALSE 0.019 632.000 0.000 NA   NA
 1100749 1100750 LSA1732 LSA1733     FALSE 0.214 57.000 0.000 NA   NA
 1100750 1100751 LSA1733 LSA1734     FALSE 0.434 17.000 0.000 NA   NA
 1100751 1100752 LSA1734 LSA1735     FALSE 0.022 407.000 0.000 NA   NA
 1100752 1100753 LSA1735 LSA1736     TRUE 0.988 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 1100753 1100754 LSA1736 LSA1737     TRUE 0.998 -24.000 0.713 0.022 Y NA
 1100754 1100755 LSA1737 LSA1738   rplQ FALSE 0.183 676.000 0.074 1.000 N NA
 1100755 1100756 LSA1738 LSA1739 rplQ rpoA TRUE 0.985 27.000 0.873 1.000 N NA
 1100756 1100757 LSA1739 LSA1740 rpoA rpsK TRUE 0.803 84.000 0.308 1.000 N NA
 1100757 1100758 LSA1740 LSA1741 rpsK rpsM TRUE 0.995 24.000 0.810 0.022 Y NA
 1100758 1100759 LSA1741 LSA1742 rpsM rpmJ TRUE 0.972 23.000 0.086 0.022 Y NA
 1100759 1100760 LSA1742 LSA1743 rpmJ infA TRUE 0.910 33.000 0.067 1.000 Y NA
 1100760 1100761 LSA1743 LSA1744 infA adk FALSE 0.325 192.000 0.059 1.000 N NA
 1100761 1100762 LSA1744 LSA1745 adk secY TRUE 0.898 54.000 0.241 1.000 N NA
 1100762 1100763 LSA1745 LSA1746 secY rplO TRUE 0.995 1.000 0.730 1.000 N NA
 1100763 1100764 LSA1746 LSA1747 rplO rpmD TRUE 0.992 35.000 0.653 0.004 Y NA
 1100764 1100765 LSA1747 LSA1748 rpmD rpsE TRUE 0.996 15.000 0.789 0.029 Y NA
 1100765 1100766 LSA1748 LSA1749 rpsE rplR TRUE 0.919 19.000 0.000 0.029 Y NA
 1100766 1100767 LSA1749 LSA1750 rplR rplF TRUE 0.853 41.000 0.000 0.022 Y NA
 1100767 1100768 LSA1750 LSA1751 rplF rpsH TRUE 0.994 31.000 0.808 0.022 Y NA
 1100768 1100769 LSA1751 LSA1752 rpsH rplE TRUE 0.596 235.000 0.059 0.022 Y NA
 1100769 1100770 LSA1752 LSA1753 rplE rplX TRUE 0.994 29.000 0.758 0.022 Y NA
 1100770 1100771 LSA1753 LSA1754 rplX rplN TRUE 0.993 31.000 0.810 0.029 Y NA
 1100771 1100772 LSA1754 LSA1755 rplN rpsQ TRUE 0.990 43.000 0.791 0.029 Y NA
 1100772 1100773 LSA1755 LSA1756 rpsQ rpmC TRUE 0.995 24.000 0.828 0.022 Y NA
 1100773 1100774 LSA1756 LSA1757 rpmC rplP TRUE 0.999 -10.000 0.802 0.022 Y NA
 1100774 1100775 LSA1757 LSA1758 rplP rpsC TRUE 0.998 3.000 0.828 0.029 Y NA
 1100775 1100776 LSA1758 LSA1759 rpsC rplV TRUE 0.995 14.000 0.719 0.029 Y NA
 1100776 1100777 LSA1759 LSA1760 rplV rpsS TRUE 0.995 19.000 0.769 0.029 Y NA
 1100777 1100778 LSA1760 LSA1761 rpsS rplB TRUE 0.970 85.000 0.820 0.029 Y NA
 1100778 1100779 LSA1761 LSA1762 rplB rplW TRUE 0.992 39.000 0.849 0.026 Y NA
 1100779 1100780 LSA1762 LSA1763 rplW rplD TRUE 0.997 0.000 0.307 0.022 Y NA
 1100780 1100781 LSA1763 LSA1764 rplD rplC TRUE 0.992 24.000 0.544 0.022 Y NA
 1100781 1100782 LSA1764 LSA1765 rplC rpsJ TRUE 0.982 44.000 0.467 0.029 Y NA
 1100784 1100785 LSA1768 LSA1769 fusA rpsG TRUE 0.902 96.000 0.579 1.000 Y NA
 1100785 1100786 LSA1769 LSA1770 rpsG rpsL TRUE 0.913 90.000 0.224 0.004 Y NA
 1100788 1100789 LSA1772 LSA1773     TRUE 0.946 -70.000 0.000 0.021   NA
 1100789 1100790 LSA1773 LSA1774   rpoC FALSE 0.084 174.000 0.000 1.000   NA
 1100790 1100791 LSA1774 LSA1775 rpoC rpoB TRUE 0.985 71.000 0.851 0.002 Y NA
 1100791 1100792 LSA1775 LSA1776 rpoB   FALSE 0.055 259.000 0.000 1.000   NA
 1100793 1100794 LSA1777 LSA1778   fbp FALSE 0.142 138.000 0.000 1.000 N NA
 1100795 1100796 LSA1779 LSA1780 clpC ctsR TRUE 0.935 18.000 0.188 NA N NA
 1100796 1100797 LSA1780 LSAt52 ctsR tRNA-Pro FALSE 0.056 159.000 0.000 NA   NA
 1100797 1100798 LSAt52 LSAt53 tRNA-Pro tRNA-Gly FALSE 0.334 34.000 0.000 NA   NA
 1100798 1100799 LSAt53 LSAt54 tRNA-Gly tRNA-Pro FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 1100799 1100800 LSAt54 LSAt55 tRNA-Pro tRNA-Arg TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 1100800 1100801 LSAt55 LSAt56 tRNA-Arg tRNA-Leu TRUE 0.528 12.000 0.000 NA   NA
 1100801 1100802 LSAt56 LSAt57 tRNA-Leu tRNA-Gly TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 1100802 1100803 LSAt57 LSAt58 tRNA-Gly tRNA-Thr TRUE 0.620 8.000 0.000 NA   NA
 1100803 1100804 LSAt58 LSAt59 tRNA-Thr tRNA-Leu FALSE 0.311 36.000 0.000 NA   NA
 1100804 1100805 LSAt59 LSAt60 tRNA-Leu tRNA-Lys FALSE 0.424 23.000 0.000 NA   NA
 1100805 1100806 LSAt60 LSAt61 tRNA-Lys tRNA-Val TRUE 0.693 3.000 0.000 NA   NA
 1100806 1100807 LSAt61 LSAr13 tRNA-Val rrfC TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 1100807 1100808 LSAr13 LSAr14 rrfC rrl FALSE 0.088 92.000 0.000 NA   NA
 1100808 1100809 LSAr14 LSAt62 rrl tRNA-Ala FALSE 0.049 173.000 0.000 NA   NA
 1100809 1100810 LSAt62 LSAt63 tRNA-Ala   FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 1100810 1100811 LSAt63 LSAr15   rrsC FALSE 0.093 89.000 0.000 NA   NA
 1100811 1100812 LSAr15 LSA1781 rrsC   FALSE 0.019 756.000 0.000 NA   NA
 1100812 1100813 LSA1781 LSA1782     TRUE 0.965 19.000 0.333 1.000   NA
 1100813 1100814 LSA1782 LSA1783     TRUE 0.981 12.000 0.478 1.000   NA
 1100814 1100815 LSA1783 LSA1784     TRUE 0.964 79.000 0.500 0.004 Y NA
 1100816 1100817 LSA1785 LSA1786     TRUE 0.813 -54.000 0.000 1.000   NA
 1100818 1100819 LSA1787 LSA1788     FALSE 0.031 261.000 0.000 NA   NA
 1100819 1100820 LSA1788 LSA1789     FALSE 0.061 303.000 0.000 1.000 N NA
 1100820 1100821 LSA1789 LSA1790   scrK FALSE 0.214 191.000 0.000 1.000 Y NA
 1100821 1100822 LSA1790 LSA1791 scrK dexB TRUE 0.942 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 1100822 1100823 LSA1791 LSA1792 dexB scrA TRUE 0.867 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1100824 1100825 LSA1793 LSA1794 scrB scrR TRUE 0.973 28.000 0.571 1.000 N NA
 1100829 1100830 LSA1798 LSA1799     FALSE 0.088 167.000 0.000 1.000   NA
 1100831 1100832 LSA1800 LSA1801     FALSE 0.042 197.000 0.000 NA   NA
 1100832 1100833 LSA1801 LSA1802     TRUE 0.932 13.000 0.154 NA   NA
 1100833 1100834 LSA1802 LSA1803   serS FALSE 0.076 242.000 0.000 1.000 N NA
 1100834 1100835 LSA1803 LSA1804 serS   FALSE 0.028 293.000 0.000 NA   NA
 1100837 1100838 LSA1806 LSA1807     FALSE 0.026 314.000 0.000 NA   NA
 1100838 1100839 LSA1807 LSA1808     FALSE 0.130 75.000 0.000 NA   NA
 1100839 1100840 LSA1808 LSA1809     FALSE 0.142 73.000 0.000 NA   NA
 1100840 1100841 LSA1809 LSA1810     FALSE 0.220 56.000 0.000 NA   NA
 1100841 1100842 LSA1810 LSA1811     TRUE 0.824 116.000 0.667 NA   NA
 1100844 1100845 LSA1813 LSA1814     FALSE 0.082 103.000 0.000 NA   NA
 1100846 1100847 LSA1815 LSA1816     FALSE 0.123 78.000 0.000 NA   NA
 1100848 1100849 LSA1817 LSA1818 lysP   FALSE 0.023 401.000 0.000 NA   NA
 1100849 1100850 LSA1818 LSA1819     FALSE 0.136 74.000 0.000 NA   NA
 1100850 1100851 LSA1819 LSA1820     TRUE 0.443 19.000 0.000 NA   NA
 1100851 1100852 LSA1820 LSA1821     FALSE 0.396 153.000 0.111 NA   NA
 1100852 1100853 LSA1821 LSA1822     FALSE 0.022 446.000 0.000 NA   NA
 1100853 1100854 LSA1822 LSA1823     TRUE 0.635 7.000 0.000 NA   NA
 1100854 1100855 LSA1823 LSA1824     FALSE 0.084 97.000 0.000 NA   NA
 1100859 1100860 LSA1828 LSA1830   pox2 FALSE 0.081 106.000 0.000 NA   NA
 1100861 1100862 LSA1831 LSA1832     FALSE 0.072 172.000 0.000 NA N NA
 1100864 1100865 LSA1834 LSA1835     FALSE 0.092 90.000 0.000 NA   NA
 1100866 1100867 LSA1836 LSA1837     TRUE 0.990 -3.000 0.412 NA   NA
 1100867 1100868 LSA1837 LSA1838     TRUE 0.994 -33.000 0.673 1.000   NA
 1100868 1100869 LSA1838 LSA1839     TRUE 0.957 -51.000 0.091 NA   NA
 1100869 1100870 LSA1839 LSA1840     TRUE 0.528 12.000 0.000 NA   NA
 1100871 1100872 LSA1841 LSA1842     TRUE 0.989 16.000 0.667 1.000 Y NA
 1100872 1100873 LSA1842 LSA1843   ogt FALSE 0.179 94.000 0.000 1.000 N NA
 1100876 1100877 LSA1846 LSA1847 recQ2   FALSE 0.078 113.000 0.000 NA   NA
 1100878 1100879 LSA1848 LSA1849     FALSE 0.081 105.000 0.000 NA   NA
 1100879 1100880 LSA1849 LSA1850     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 1100880 1100881 LSA1850 LSA1851     FALSE 0.018 893.000 0.000 NA   NA
 1100884 1100885 LSA1854 LSA1855   gpm5 TRUE 0.667 10.000 0.000 NA N NA
 1100885 1100886 LSA1855 LSA1856 gpm5 araA FALSE 0.334 111.000 0.000 1.000 Y NA
 1100886 1100887 LSA1856 LSA1857 araA araD FALSE 0.357 289.000 0.063 1.000 Y NA
 1100887 1100888 LSA1857 LSA1859 araD araB TRUE 0.977 11.000 0.160 1.000 Y NA
 1100888 1100889 LSA1859 LSA1860 araB araT TRUE 0.959 20.000 0.136 1.000 Y NA
 1100889 1100890 LSA1860 LSA1861 araT araR FALSE 0.062 300.000 0.000 1.000 N NA
 1100890 1100891 LSA1861 LSA1862 araR   FALSE 0.046 186.000 0.000 NA   NA
 1100891 1100892 LSA1862 LSA1863     TRUE 0.725 0.000 0.000 NA   NA
 1100892 1100893 LSA1863 LSA1864     TRUE 0.492 13.000 0.000 NA   NA
 1100893 1100894 LSA1864 LSA1865     FALSE 0.084 97.000 0.000 NA   NA
 1100894 1100895 LSA1865 LSA1866     FALSE 0.162 67.000 0.000 NA   NA
 1100897 1100898 LSA1868 LSA1869     FALSE 0.334 64.000 0.000 1.000 N NA
 1100898 1100899 LSA1869 LSA1870     TRUE 0.991 0.000 0.382 1.000 N NA
 1100901 1100902 LSA1872 LSA1873     FALSE 0.054 162.000 0.000 NA   NA
 1100902 1100903 LSA1873 LSA1874     FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 1100905 1100906 LSA1876 LSA1877     TRUE 0.741 -3.000 0.000 NA   NA
 1100906 1100907 LSA1877 LSAr16   rrfB FALSE 0.056 159.000 0.000 NA   NA
 1100907 1100908 LSAr16 LSAr17 rrfB rrlB FALSE 0.088 92.000 0.000 NA   NA
 1100908 1100909 LSAr17 LSAr18 rrlB rrsB FALSE 0.037 224.000 0.000 NA   NA
 1100909 1100910 LSAr18 LSAr19 rrsB rrfA FALSE 0.021 497.000 0.000 NA   NA
 1100910 1100911 LSAr19 LSAr20 rrfA rrlA FALSE 0.090 91.000 0.000 NA   NA
 1100911 1100912 LSAr20 LSAr21 rrlA rrsA FALSE 0.037 224.000 0.000 NA   NA
 1100912 1100913 LSAr21 LSA1878 rrsA   FALSE 0.019 711.000 0.000 NA   NA
 1100913 1100914 LSA1878 LSA1879   gidA FALSE 0.122 125.000 0.000 1.000   NA
 1100914 1100915 LSA1879 LSA1880 gidA trmE TRUE 0.938 31.000 0.266 1.000   NA
 1100915 1100916 LSA1880 LSA1881 trmE   TRUE 0.440 159.000 0.116 1.000   NA
 1100916 1100917 LSA1881 LSA1882   pepF2 FALSE 0.146 92.000 0.000 1.000   NA
 1100919 1100920 LSA1884 LSA1885 oxaA2 rnpA TRUE 0.892 15.000 0.052 1.000 N NA
 1100920 1100921 LSA1885 LSA1886 rnpA rpmH TRUE 0.939 66.000 0.787 1.000   NA