MicrobesOnline Operon Predictions for Agrobacterium radiobacter K84

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5481821 5481822 Arad_7000 Arad_7001 repAa1 repBf2 TRUE 0.986 -15.000 0.429 1.000 N NA
 5481822 5481823 Arad_7001 Arad_7003 repBf2 repCa1 FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5481823 5481824 Arad_7003 Arad_7004 repCa1   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5481824 5481825 Arad_7004 Arad_7005     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 5481825 5481826 Arad_7005 Arad_7006   nrtB TRUE 0.994 18.000 0.795 NA Y NA
 5481826 5481827 Arad_7006 Arad_7007 nrtB   TRUE 0.990 5.000 0.318 NA Y NA
 5481831 5481832 Arad_7011 Arad_7012     FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5481832 5481833 Arad_7012 Arad_7013     FALSE 0.016 223.000 0.000 NA   NA
 5481833 5481834 Arad_7013 Arad_7014   glf TRUE 0.757 7.000 0.008 1.000 N NA
 5481835 5481836 Arad_7015 Arad_7016     TRUE 0.991 10.000 0.812 NA   NA
 5481836 5481837 Arad_7016 Arad_7017     TRUE 0.997 -3.000 0.938 NA   NA
 5481837 5481838 Arad_7017 Arad_7019     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 5481839 5481840 Arad_7020 Arad_7021     TRUE 0.999 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 5481841 5481842 Arad_7022 Arad_7023     FALSE 0.321 120.000 0.172 1.000 N NA
 5481843 5481844 Arad_7024 Arad_7026     FALSE 0.051 158.000 0.000 NA   NA
 5481845 5481846 Arad_7028 Arad_7029 tauC   TRUE 0.998 -7.000 0.607 NA Y NA
 5481846 5481847 Arad_7029 Arad_7030     TRUE 0.961 49.000 0.435 NA Y NA
 5481847 5481848 Arad_7030 Arad_7031     FALSE 0.062 148.000 0.000 NA   NA
 5481848 5481849 Arad_7031 Arad_7033     FALSE 0.414 25.000 0.000 NA   NA
 5481849 5481850 Arad_7033 Arad_7034     FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5481850 5481851 Arad_7034 Arad_7035     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 5481854 5481855 Arad_7038 Arad_7039     FALSE 0.099 220.000 0.190 NA   NA
 5481855 5481856 Arad_7039 Arad_7040     FALSE 0.367 83.000 0.021 NA   NA
 5481858 5481859 Arad_7042 Arad_7043     FALSE 0.367 30.000 0.000 NA   NA
 5481862 5481863 Arad_7047 Arad_7048     FALSE 0.004 229.000 0.000 1.000 N NA
 5481863 5481864 Arad_7048 Arad_7049     TRUE 0.991 -3.000 0.125 NA Y NA
 5481864 5481865 Arad_7049 Arad_7050     TRUE 0.998 4.000 0.812 NA Y NA
 5481865 5481866 Arad_7050 Arad_7051     TRUE 0.958 26.000 0.250 NA Y NA
 5481866 5481867 Arad_7051 Arad_7052   ordL TRUE 0.918 65.000 0.286 NA Y NA
 5481867 5481868 Arad_7052 Arad_7054 ordL dehII TRUE 0.991 10.000 0.800 1.000   NA
 5481868 5481869 Arad_7054 Arad_7055 dehII   TRUE 0.894 42.000 0.429 1.000   NA
 5481870 5481871 Arad_7056 Arad_7058     FALSE 0.001 414.000 0.000 1.000 N NA
 5481871 5481872 Arad_7058 Arad_7060     TRUE 0.997 -3.000 0.462 1.000 Y NA
 5481872 5481873 Arad_7060 Arad_7061     TRUE 0.995 0.000 0.286 0.018 Y NA
 5481873 5481874 Arad_7061 Arad_7062     TRUE 0.979 25.000 0.429 1.000 Y NA
 5481874 5481875 Arad_7062 Arad_7064     FALSE 0.248 68.000 0.000 1.000   NA
 5481875 5481876 Arad_7064 Arad_7065     FALSE 0.411 30.000 0.000 1.000   NA
 5481879 5481880 Arad_7069 Arad_7070     TRUE 0.879 11.000 0.077 NA   NA
 5481880 5481881 Arad_7070 Arad_7071     TRUE 0.970 6.000 0.365 NA   NA
 5481881 5481882 Arad_7071 Arad_7072     TRUE 0.915 25.000 0.442 NA N NA
 5481882 5481883 Arad_7072 Arad_7073     TRUE 0.992 -3.000 0.621 NA N NA
 5481883 5481884 Arad_7073 Arad_7074   exsA FALSE 0.000 354.000 0.000 NA N NA
 5481886 5481887 Arad_7076 Arad_7078     TRUE 0.590 35.000 0.000 0.058   NA
 5481887 5481888 Arad_7078 Arad_7079     FALSE 0.029 118.000 0.000 1.000 N NA
 5481888 5481889 Arad_7079 Arad_7080     FALSE 0.501 123.000 0.000 NA Y NA
 5481890 5481891 Arad_7081 Arad_7082     FALSE 0.001 236.000 0.000 NA N NA
 5481891 5481892 Arad_7082 Arad_7083     TRUE 0.967 99.000 0.818 NA Y NA
 5481892 5481893 Arad_7083 Arad_7084     TRUE 0.998 0.000 0.818 NA Y NA
 5481893 5481894 Arad_7084 Arad_7085     TRUE 0.992 4.000 0.727 NA   NA
 5481894 5481895 Arad_7085 Arad_7087     TRUE 0.941 40.000 0.625 NA   NA
 5481895 5481896 Arad_7087 Arad_7088     TRUE 0.979 10.000 0.571 1.000 N NA
 5481896 5481897 Arad_7088 Arad_7089     FALSE 0.152 27.000 0.000 1.000 N NA
 5481898 5481899 Arad_7091 Arad_7092 dat   TRUE 0.853 58.000 0.043 1.000 Y NA
 5481899 5481900 Arad_7092 Arad_7094     FALSE 0.418 92.000 0.072 NA   NA
 5481900 5481901 Arad_7094 Arad_7095     FALSE 0.504 40.000 0.002 NA   NA
 5481901 5481902 Arad_7095 Arad_7096     FALSE 0.524 22.000 0.002 1.000 N NA
 5481902 5481903 Arad_7096 Arad_7097     TRUE 0.946 -3.000 0.125 1.000 N NA
 5481903 5481904 Arad_7097 Arad_7098   argE TRUE 0.986 4.000 0.600 1.000 N NA
 5481904 5481905 Arad_7098 Arad_7100 argE aapP TRUE 0.997 1.000 0.600 1.000 Y NA
 5481905 5481906 Arad_7100 Arad_7101 aapP   TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5481906 5481907 Arad_7101 Arad_7102     TRUE 0.991 49.000 1.000 1.000 Y NA
 5481909 5481910 Arad_7105 Arad_7107     TRUE 0.979 -10.000 0.000 NA Y NA
 5481910 5481911 Arad_7107 Arad_7109     TRUE 0.859 115.000 0.375 NA Y NA
 5481911 5481912 Arad_7109 Arad_7110     TRUE 0.755 53.000 0.250 NA   NA
 5481912 5481913 Arad_7110 Arad_7111   fadB1 FALSE 0.218 76.000 0.000 1.000   NA
 5481913 5481914 Arad_7111 Arad_7113 fadB1   TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5481914 5481915 Arad_7113 Arad_7114     TRUE 0.992 1.000 0.286 1.000 Y NA
 5481916 5481917 Arad_7115 Arad_7116     TRUE 0.581 49.000 0.125 1.000 N NA
 5481917 5481918 Arad_7116 Arad_7117   prsD FALSE 0.002 516.000 0.000 1.000   NA
 5481918 5481919 Arad_7117 Arad_7118 prsD prsE TRUE 0.982 -3.000 0.167 0.005   NA
 5481919 5481920 Arad_7118 Arad_7120 prsE   FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 5481920 5481921 Arad_7120 Arad_7121   exsH FALSE 0.204 71.000 0.000 NA   NA
 5481921 5481922 Arad_7121 Arad_7122 exsH   FALSE 0.050 304.000 0.000 NA Y NA
 5481923 5481924 Arad_7123 Arad_7124   dapAch1 TRUE 0.961 -3.000 0.200 1.000 N NA
 5481924 5481925 Arad_7124 Arad_7125 dapAch1 ooxB TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5481925 5481926 Arad_7125 Arad_7127 ooxB ooxA TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.058   NA
 5481927 5481928 Arad_7128 Arad_7129   occQe TRUE 0.991 37.000 0.857 1.000 Y NA
 5481928 5481929 Arad_7129 Arad_7130 occQe   TRUE 0.999 0.000 1.000 0.018 Y NA
 5481929 5481930 Arad_7130 Arad_7131     TRUE 0.999 -43.000 0.750 1.000 Y NA
 5481931 5481932 Arad_7133 Arad_7134     FALSE 0.312 99.000 0.097 NA N NA
 5481932 5481933 Arad_7134 Arad_7135   appD TRUE 0.869 52.000 0.065 NA Y NA
 5481933 5481934 Arad_7135 Arad_7137 appD   TRUE 0.999 -7.000 0.677 0.006 Y NA
 5481934 5481935 Arad_7137 Arad_7138   dppCch3 TRUE 0.995 15.000 0.742 NA Y NA
 5481935 5481936 Arad_7138 Arad_7140 dppCch3   TRUE 0.998 5.000 0.871 NA Y NA
 5481936 5481937 Arad_7140 Arad_7141     TRUE 0.891 84.000 0.296 NA Y NA
 5481942 5481943 Arad_7148 Arad_7149   bglSf TRUE 0.573 105.000 0.000 NA Y NA
 5481946 5481947 Arad_7153 Arad_7154   nah FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5481947 5481948 Arad_7154 Arad_7155 nah   FALSE 0.061 76.000 0.000 1.000 N NA
 5481948 5481949 Arad_7155 Arad_7156     FALSE 0.148 92.000 0.000 NA   NA
 5481951 5481952 Arad_7158 Arad_7159     FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5481952 5481953 Arad_7159 Arad_7160     TRUE 0.953 3.000 0.200 1.000   NA
 5481953 5481954 Arad_7160 Arad_7161     TRUE 0.763 51.000 0.238 1.000   NA
 5481954 5481955 Arad_7161 Arad_7162     TRUE 0.966 11.000 0.286 0.055   NA
 5481956 5481957 Arad_7163 Arad_7164     FALSE 0.138 203.000 0.250 1.000 N NA
 5481960 5481961 Arad_7168 Arad_7169     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5481961 5481962 Arad_7169 Arad_7170     FALSE 0.230 62.000 0.000 NA   NA
 5481962 5481963 Arad_7170 Arad_7171     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5481965 5481966 Arad_7177 Arad_7178 cheW5   TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5481968 5481969 Arad_7180 Arad_7181     TRUE 0.913 48.000 0.400 0.014   NA
 5481969 5481970 Arad_7181 Arad_7182     TRUE 0.973 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5481972 5481973 Arad_7185 Arad_7186     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 5481973 5481974 Arad_7186 Arad_7187     FALSE 0.237 188.000 0.000 1.000 Y NA
 5481974 5481975 Arad_7187 Arad_7188     FALSE 0.001 940.000 0.000 NA   NA
 5481975 5481976 Arad_7188 Arad_7191     FALSE 0.001 593.000 0.000 NA   NA
 5481976 5481977 Arad_7191 Arad_7192     FALSE 0.001 664.000 0.000 NA   NA
 5481977 5481978 Arad_7192 Arad_7193     FALSE 0.087 128.000 0.000 NA   NA
 5481979 5481980 Arad_7194 Arad_7196     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 5481981 5481982 Arad_7197 Arad_7198 iclR   TRUE 0.829 -7.000 0.000 NA   NA
 5481983 5481984 Arad_7199 Arad_7200 matB   TRUE 0.868 52.000 0.050 1.000 Y NA
 5481984 5481985 Arad_7200 Arad_7201   maiA TRUE 0.946 -3.000 0.125 1.000 N NA
 5481985 5481986 Arad_7201 Arad_7203 maiA   FALSE 0.077 61.000 0.000 1.000 N NA
 5481986 5481987 Arad_7203 Arad_7204     TRUE 0.955 -3.000 0.088 NA   NA
 5481988 5481989 Arad_7206 Arad_7207     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5481989 5481990 Arad_7207 Arad_7208     FALSE 0.498 18.000 0.000 NA   NA
 5481990 5481991 Arad_7208 Arad_7209     TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5481992 5481993 Arad_7210 Arad_7211     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5481993 5481994 Arad_7211 Arad_7212     FALSE 0.025 79.000 0.000 NA N NA
 5481994 5481995 Arad_7212 Arad_7213     TRUE 0.829 36.000 0.000 NA Y NA
 5481995 5481996 Arad_7213 Arad_7214   rbsAch2 TRUE 0.757 59.000 0.000 NA Y NA
 5481996 5481997 Arad_7214 Arad_7216 rbsAch2   FALSE 0.020 209.000 0.000 NA   NA
 5481997 5481998 Arad_7216 Arad_7217     FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5481999 5482000 Arad_7218 Arad_7219     FALSE 0.006 158.000 0.000 NA N NA
 5482000 5482001 Arad_7219 Arad_7221     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482001 5482002 Arad_7221 Arad_7222   tauC TRUE 0.945 11.000 0.000 NA Y NA
 5482002 5482003 Arad_7222 Arad_7223 tauC   TRUE 0.978 -21.000 0.000 NA Y NA
 5482003 5482004 Arad_7223 Arad_7224     TRUE 0.630 93.000 0.000 NA Y NA
 5482004 5482005 Arad_7224 Arad_7225   ilvG TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5482005 5482006 Arad_7225 Arad_7226 ilvG betB TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5482006 5482007 Arad_7226 Arad_7227 betB   TRUE 0.802 63.000 0.400 1.000 N NA
 5482008 5482009 Arad_7228 Arad_7229   ocdch1 FALSE 0.002 287.000 0.000 1.000 N NA
 5482009 5482010 Arad_7229 Arad_7230 ocdch1   FALSE 0.176 10.000 0.000 NA N NA
 5482011 5482012 Arad_7233 Arad_7232     TRUE 0.637 69.000 0.250 NA N NA
 5482013 5482014 Arad_7234 Arad_7235   amaB FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 5482018 5482019 Arad_7241 Arad_7242     TRUE 0.991 4.000 0.700 NA   NA
 5482019 5482020 Arad_7242 Arad_7243     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5482021 5482022 Arad_7244 Arad_7246     FALSE 0.230 62.000 0.000 NA   NA
 5482022 5482023 Arad_7246 Arad_7247     FALSE 0.329 45.000 0.000 1.000   NA
 5482024 5482025 Arad_7250 Arad_7251     TRUE 0.957 -10.000 0.100 NA   NA
 5482025 5482026 Arad_7251 Arad_7252     FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 5482027 5482028 Arad_7253 Arad_7254     FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 5482028 5482029 Arad_7254 Arad_7255     FALSE 0.020 142.000 0.000 1.000 N NA
 5482029 5482030 Arad_7255 Arad_7256     FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5482030 5482031 Arad_7256 Arad_7257     TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5482031 5482032 Arad_7257 Arad_7258   stcD TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5482032 5482033 Arad_7258 Arad_7260 stcD   FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482033 5482034 Arad_7260 Arad_7261     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 5482035 5482036 Arad_7262 Arad_7263   betB FALSE 0.162 86.000 0.000 NA   NA
 5482036 5482037 Arad_7263 Arad_7264 betB   TRUE 0.980 16.000 0.667 0.093 N NA
 5482037 5482038 Arad_7264 Arad_7266     TRUE 0.980 2.000 0.000 0.031 Y NA
 5482038 5482039 Arad_7266 Arad_7267     FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 5482039 5482040 Arad_7267 Arad_7268     FALSE 0.150 91.000 0.000 NA   NA
 5482040 5482041 Arad_7268 Arad_7270     TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 5482041 5482042 Arad_7270 Arad_7271     FALSE 0.090 21.000 0.000 NA N NA
 5482043 5482044 Arad_7273 Arad_7274     FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482044 5482045 Arad_7274 Arad_7275     FALSE 0.058 161.000 0.000 1.000   NA
 5482045 5482046 Arad_7275 Arad_7277     TRUE 0.964 2.000 0.250 NA   NA
 5482046 5482047 Arad_7277 Arad_7278     TRUE 0.938 -3.000 0.033 NA   NA
 5482047 5482048 Arad_7278 Arad_7279     TRUE 0.749 19.000 0.033 NA   NA
 5482050 5482051 Arad_7281 Arad_7284 phbB   FALSE 0.016 221.000 0.000 NA   NA
 5482051 5482052 Arad_7284 Arad_7285     FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482055 5482056 Arad_7288 Arad_7289     TRUE 0.915 106.000 0.900 1.000   NA
 5482056 5482057 Arad_7289 Arad_7290     TRUE 0.945 36.000 0.600 1.000   NA
 5482058 5482059 Arad_7291 Arad_7293     TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5482059 5482060 Arad_7293 Arad_7295     FALSE 0.014 111.000 0.000 NA N NA
 5482060 5482061 Arad_7295 Arad_7296   dadA TRUE 0.728 12.000 0.026 NA N NA
 5482062 5482063 Arad_7297 Arad_7298 braC1 braD TRUE 0.967 84.000 0.714 NA Y NA
 5482063 5482064 Arad_7298 Arad_7299 braD   TRUE 0.999 -7.000 0.714 NA Y NA
 5482064 5482065 Arad_7299 Arad_7301     TRUE 0.995 -7.000 0.312 NA Y NA
 5482065 5482066 Arad_7301 Arad_7302   braG TRUE 0.997 -3.000 0.312 0.055 Y NA
 5482066 5482067 Arad_7302 Arad_7303 braG   FALSE 0.045 45.000 0.000 NA N NA
 5482068 5482069 Arad_7304 Arad_7305     FALSE 0.012 121.000 0.000 NA N NA
 5482069 5482070 Arad_7305 Arad_7307     FALSE 0.010 131.000 0.000 NA N NA
 5482070 5482071 Arad_7307 Arad_7308     FALSE 0.100 46.000 0.000 1.000 N NA
 5482071 5482072 Arad_7308 Arad_7310     TRUE 0.998 -3.000 0.650 1.000 Y NA
 5482072 5482073 Arad_7310 Arad_7311     TRUE 0.992 0.000 0.154 0.017 Y NA
 5482073 5482074 Arad_7311 Arad_7312     TRUE 0.891 57.000 0.154 1.000 Y NA
 5482074 5482075 Arad_7312 Arad_7314     FALSE 0.019 94.000 0.000 NA N NA
 5482075 5482076 Arad_7314 Arad_7315     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482079 5482080 Arad_7319 Arad_7320 dppBf dppCch3 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482080 5482081 Arad_7320 Arad_7321 dppCch3   TRUE 0.963 5.000 0.300 NA   NA
 5482081 5482082 Arad_7321 Arad_7322     TRUE 0.942 18.000 0.375 1.000   NA
 5482082 5482083 Arad_7322 Arad_7324     TRUE 0.996 -7.000 0.800 NA   NA
 5482083 5482084 Arad_7324 Arad_7326   dppAch2 TRUE 0.904 48.000 0.500 NA   NA
 5482084 5482085 Arad_7326 Arad_7327 dppAch2   TRUE 0.781 69.000 0.333 NA   NA
 5482085 5482086 Arad_7327 Arad_7329     TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 5482086 5482087 Arad_7329 Arad_7330     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482087 5482088 Arad_7330 Arad_7331     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5482090 5482091 Arad_7333 Arad_7334 cheRf   FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 5482091 5482092 Arad_7334 Arad_7335     TRUE 0.933 52.000 0.667 NA   NA
 5482092 5482093 Arad_7335 Arad_7336   cheRf FALSE 0.016 222.000 0.000 NA   NA
 5482095 5482096 Arad_7341 Arad_7342     FALSE 0.023 136.000 0.000 1.000 N NA
 5482096 5482097 Arad_7342 Arad_7343     TRUE 0.936 93.000 0.500 1.000 Y NA
 5482097 5482098 Arad_7343 Arad_7345     TRUE 0.997 4.000 0.571 0.017 Y NA
 5482098 5482099 Arad_7345 Arad_7346     TRUE 0.998 2.000 0.714 1.000 Y NA
 5482099 5482100 Arad_7346 Arad_7347     TRUE 0.977 11.000 0.150 1.000 Y NA
 5482100 5482101 Arad_7347 Arad_7348     TRUE 0.949 -3.000 0.050 1.000   NA
 5482102 5482103 Arad_7349 Arad_7350     TRUE 0.998 -3.000 0.976 NA   NA
 5482103 5482104 Arad_7350 Arad_7351     TRUE 0.997 -10.000 0.864 NA   NA
 5482104 5482105 Arad_7351 Arad_7352     TRUE 0.974 -3.000 0.208 1.000   NA
 5482105 5482106 Arad_7352 Arad_7353     TRUE 0.908 13.000 0.188 1.000   NA
 5482106 5482107 Arad_7353 Arad_7354     FALSE 0.086 140.000 0.000 1.000   NA
 5482107 5482108 Arad_7354 Arad_7355     FALSE 0.001 340.000 0.000 1.000 N NA
 5482108 5482109 Arad_7355 Arad_7356   ggt FALSE 0.173 172.000 0.200 1.000 N NA
 5482109 5482110 Arad_7356 Arad_7357 ggt   FALSE 0.025 79.000 0.000 NA N NA
 5482110 5482111 Arad_7357 Arad_7358   potC FALSE 0.067 28.000 0.000 NA N NA
 5482111 5482112 Arad_7358 Arad_7359 potC potH TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 5482112 5482113 Arad_7359 Arad_7360 potH afuC1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482113 5482114 Arad_7360 Arad_7362 afuC1 potD TRUE 0.992 18.000 0.667 NA Y NA
 5482114 5482115 Arad_7362 Arad_7363 potD   FALSE 0.031 361.000 0.000 NA Y NA
 5482117 5482118 Arad_7365 Arad_7366   appF TRUE 0.873 11.000 0.067 NA   NA
 5482118 5482119 Arad_7366 Arad_7367 appF appD TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 5482119 5482120 Arad_7367 Arad_7368 appD   TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 5482120 5482121 Arad_7368 Arad_7369     TRUE 0.996 11.000 0.667 NA Y NA
 5482121 5482122 Arad_7369 Arad_7371     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 5482122 5482123 Arad_7371 Arad_7372     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5482123 5482124 Arad_7372 Arad_7373     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 5482124 5482125 Arad_7373 Arad_7374     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 5482125 5482126 Arad_7374 Arad_7375     FALSE 0.032 182.000 0.000 NA   NA
 5482126 5482127 Arad_7375 Arad_7376     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 5482130 5482131 Arad_7379 Arad_7380     TRUE 0.933 -3.000 0.000 0.054   NA
 5482131 5482132 Arad_7380 Arad_7381     FALSE 0.359 31.000 0.000 NA   NA
 5482132 5482133 Arad_7381 Arad_7382   acpD FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 5482133 5482134 Arad_7382 Arad_7383 acpD   FALSE 0.006 205.000 0.000 1.000 N NA
 5482136 5482137 Arad_7387 Arad_7388     TRUE 0.992 10.000 0.909 1.000 N NA
 5482137 5482138 Arad_7388 Arad_7389     FALSE 0.019 145.000 0.000 1.000 N NA
 5482138 5482139 Arad_7389 Arad_7390     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5482140 5482141 Arad_7391 Arad_7393 thiEb thiG TRUE 0.994 -3.000 0.118 0.005 Y NA
 5482141 5482142 Arad_7393 Arad_7394 thiG thiS TRUE 0.982 4.000 0.095 1.000 Y NA
 5482142 5482143 Arad_7394 Arad_7396 thiS thiO TRUE 0.959 -3.000 0.192 1.000 N NA
 5482143 5482144 Arad_7396 Arad_7398 thiO thiC TRUE 0.846 2.000 0.022 1.000 N NA
 5482144 5482145 Arad_7398 Arad_7399 thiC   FALSE 0.001 323.000 0.000 1.000 N NA
 5482145 5482146 Arad_7399 Arad_7400     TRUE 0.950 56.000 0.800 NA   NA
 5482147 5482148 Arad_7401 Arad_7403     TRUE 0.935 72.000 0.375 1.000 Y NA
 5482148 5482149 Arad_7403 Arad_7405     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.017 Y NA
 5482149 5482150 Arad_7405 Arad_7406     TRUE 0.999 -19.000 0.833 1.000 Y NA
 5482150 5482151 Arad_7406 Arad_7407     TRUE 0.928 27.000 0.500 1.000 N NA
 5482152 5482153 Arad_7409 Arad_7410     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5482154 5482155 Arad_7411 Arad_7412     TRUE 0.807 78.000 0.429 NA   NA
 5482155 5482156 Arad_7412 Arad_7414     TRUE 0.858 34.000 0.308 NA   NA
 5482156 5482157 Arad_7414 Arad_7415     TRUE 0.988 25.000 0.615 1.000 Y NA
 5482157 5482158 Arad_7415 Arad_7416     TRUE 0.611 148.000 0.125 1.000 Y NA
 5482162 5482163 Arad_7422 Arad_7425     FALSE 0.251 138.000 0.150 1.000 N NA
 5482166 5482167 Arad_7430 Arad_7431 pcaCd1   FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 5482167 5482168 Arad_7431 Arad_7432     TRUE 0.999 5.000 0.917 0.001 Y NA
 5482168 5482169 Arad_7432 Arad_7433     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.054 Y NA
 5482172 5482173 Arad_7437 Arad_7438     FALSE 0.001 618.000 0.000 NA   NA
 5482173 5482174 Arad_7438 Arad_7439     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 5482177 5482178 Arad_7447 Arad_7448   pepT TRUE 0.653 12.000 0.000 1.000   NA
 5482179 5482180 Arad_7449 Arad_7450     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482180 5482181 Arad_7450 Arad_7452   flgEf FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5482182 5482183 Arad_7453 Arad_7454 rpiB tpiA TRUE 0.997 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 5482183 5482184 Arad_7454 Arad_7455 tpiA glpRb TRUE 0.982 9.000 0.188 1.000 Y NA
 5482184 5482185 Arad_7455 Arad_7456 glpRb smoC TRUE 0.824 116.000 0.294 1.000 Y NA
 5482185 5482186 Arad_7456 Arad_7457 smoC   TRUE 0.797 63.000 0.333 NA   NA
 5482186 5482187 Arad_7457 Arad_7458   glpD TRUE 0.906 30.000 0.389 NA   NA
 5482187 5482188 Arad_7458 Arad_7460 glpD lyxX TRUE 0.842 67.000 0.350 0.002 N NA
 5482189 5482190 Arad_7462 Arad_7464     TRUE 0.996 -3.000 0.786 NA   NA
 5482190 5482191 Arad_7464 Arad_7465     TRUE 0.996 23.000 1.000 NA Y NA
 5482191 5482192 Arad_7465 Arad_7467     TRUE 0.945 115.000 0.727 NA Y NA
 5482192 5482193 Arad_7467 Arad_7468     TRUE 0.765 146.000 0.333 NA Y NA
 5482193 5482194 Arad_7468 Arad_7469   lyxX TRUE 0.959 44.000 0.375 1.000 Y NA
 5482194 5482195 Arad_7469 Arad_7470 lyxX   TRUE 0.976 24.000 0.833 1.000 N NA
 5482197 5482198 Arad_7473 Arad_7474     TRUE 0.995 0.000 0.275 0.002 Y NA
 5482198 5482199 Arad_7474 Arad_7476     TRUE 0.936 -3.000 0.028 NA   NA
 5482199 5482200 Arad_7476 Arad_7478     TRUE 0.975 -3.000 0.227 NA   NA
 5482200 5482201 Arad_7478 Arad_7479     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 5482201 5482202 Arad_7479 Arad_7480     TRUE 0.909 38.000 0.464 NA   NA
 5482202 5482203 Arad_7480 Arad_7482   aatAc TRUE 0.839 52.000 0.348 1.000   NA
 5482205 5482206 Arad_7485 Arad_7487     TRUE 0.989 5.000 0.640 1.000   NA
 5482206 5482207 Arad_7487 Arad_7488     TRUE 0.999 -3.000 0.810 0.017 Y NA
 5482207 5482208 Arad_7488 Arad_7489     TRUE 0.999 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 5482208 5482209 Arad_7489 Arad_7490     TRUE 0.986 30.000 0.632 1.000 Y NA
 5482209 5482210 Arad_7490 Arad_7492   menG TRUE 0.828 40.000 0.353 NA N NA
 5482212 5482213 Arad_7494 Arad_7496     TRUE 0.966 -7.000 0.145 1.000   NA
 5482213 5482214 Arad_7496 Arad_7497     TRUE 0.982 -3.000 0.290 1.000   NA
 5482214 5482215 Arad_7497 Arad_7499     TRUE 0.990 -3.000 0.514 1.000 N NA
 5482215 5482216 Arad_7499 Arad_7500     TRUE 0.999 -10.000 0.886 NA Y NA
 5482218 5482219 Arad_7503 Arad_7504     TRUE 0.990 55.000 1.000 NA Y NA
 5482219 5482220 Arad_7504 Arad_7506     TRUE 0.999 3.000 1.000 NA Y NA
 5482220 5482221 Arad_7506 Arad_7507     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA N NA
 5482221 5482222 Arad_7507 Arad_7509     TRUE 0.996 8.000 0.500 0.002 Y NA
 5482222 5482223 Arad_7509 Arad_7511     TRUE 0.877 107.000 0.857 NA N NA
 5482223 5482224 Arad_7511 Arad_7512     TRUE 0.966 86.000 0.714 NA Y NA
 5482224 5482225 Arad_7512 Arad_7513     TRUE 0.779 32.000 0.172 1.000   NA
 5482225 5482226 Arad_7513 Arad_7515     TRUE 0.927 36.000 0.517 NA   NA
 5482226 5482227 Arad_7515 Arad_7516     TRUE 0.986 14.000 0.788 NA   NA
 5482227 5482228 Arad_7516 Arad_7517     TRUE 0.923 17.000 0.303 NA   NA
 5482228 5482229 Arad_7517 Arad_7518     TRUE 0.789 14.000 0.087 NA N NA
 5482229 5482230 Arad_7518 Arad_7520     FALSE 0.022 139.000 0.000 1.000 N NA
 5482230 5482231 Arad_7520 Arad_7521     FALSE 0.028 120.000 0.000 1.000 N NA
 5482231 5482232 Arad_7521 Arad_7522     TRUE 0.994 -3.000 0.091 0.002 Y NA
 5482232 5482233 Arad_7522 Arad_7523   potG TRUE 0.985 0.000 0.061 1.000 Y NA
 5482233 5482234 Arad_7523 Arad_7524 potG   TRUE 0.974 65.000 0.667 NA Y NA
 5482234 5482235 Arad_7524 Arad_7525     TRUE 0.957 68.000 0.500 NA Y NA
 5482235 5482236 Arad_7525 Arad_7526     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 5482236 5482237 Arad_7526 Arad_7527     FALSE 0.001 321.000 0.000 NA N NA
 5482237 5482238 Arad_7527 Arad_7529     TRUE 0.900 57.000 0.200 NA Y NA
 5482238 5482239 Arad_7529 Arad_7530   mocBch2 TRUE 0.854 86.000 0.217 NA Y NA
 5482239 5482240 Arad_7530 Arad_7532 mocBch2 smoS TRUE 0.589 59.000 0.192 NA N NA
 5482240 5482241 Arad_7532 Arad_7533 smoS   TRUE 0.603 34.000 0.077 1.000 N NA
 5482241 5482242 Arad_7533 Arad_7535     TRUE 0.988 14.000 0.263 0.001 Y NA
 5482242 5482243 Arad_7535 Arad_7536     FALSE 0.428 158.000 0.263 0.001 N NA
 5482243 5482244 Arad_7536 Arad_7537     TRUE 0.974 60.000 1.000 0.001 N NA
 5482244 5482245 Arad_7537 Arad_7538     FALSE 0.208 79.000 0.000 1.000   NA
 5482246 5482247 Arad_7539 Arad_7540     TRUE 0.742 18.000 0.014 1.000   NA
 5482247 5482248 Arad_7540 Arad_7541     FALSE 0.015 237.000 0.000 1.000   NA
 5482249 5482250 Arad_7542 Arad_7543   gstch1 TRUE 0.874 30.000 0.364 1.000 N NA
 5482250 5482251 Arad_7543 Arad_7544 gstch1   TRUE 0.657 27.000 0.077 1.000 N NA
 5482251 5482252 Arad_7544 Arad_7545     TRUE 0.571 64.000 0.077 1.000   NA
 5482253 5482254 Arad_7546 Arad_7548     FALSE 0.103 168.000 0.069 NA N NA
 5482254 5482255 Arad_7548 Arad_7549     FALSE 0.000 354.000 0.000 NA N NA
 5482255 5482256 Arad_7549 Arad_7551     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5482256 5482257 Arad_7551 Arad_7552     TRUE 0.976 -28.000 0.250 NA   NA
 5482257 5482258 Arad_7552 Arad_7553     TRUE 0.753 127.000 0.500 0.003 N NA
 5482258 5482259 Arad_7553 Arad_7554     TRUE 0.986 12.000 0.800 NA N NA
 5482259 5482260 Arad_7554 Arad_7555     TRUE 0.996 -3.000 0.800 NA   NA
 5482260 5482261 Arad_7555 Arad_7557     TRUE 0.793 97.000 0.500 NA   NA
 5482262 5482263 Arad_7556 Arad_7558     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5482263 5482264 Arad_7558 Arad_7559     FALSE 0.003 371.000 0.000 NA   NA
 5482264 5482265 Arad_7559 Arad_7560     FALSE 0.049 161.000 0.000 NA   NA
 5482266 5482267 Arad_7561 Arad_7562 rcdA rcdB TRUE 0.994 -18.000 0.714 NA N NA
 5482271 5482272 Arad_7568 Arad_7571   ackA FALSE 0.452 71.000 0.089 1.000 N NA
 5482275 5482276 Arad_7576 Arad_7578 fixKf fixL TRUE 0.755 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5482277 5482278 Arad_7579 Arad_7580     TRUE 0.865 23.000 0.230 NA   NA
 5482278 5482279 Arad_7580 Arad_7581     TRUE 0.999 6.000 0.953 0.054 Y NA
 5482279 5482280 Arad_7581 Arad_7582     TRUE 0.803 82.000 0.059 1.000 Y NA
 5482280 5482281 Arad_7582 Arad_7583   cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.006 Y NA
 5482281 5482282 Arad_7583 Arad_7584 cydD   TRUE 0.901 -3.000 0.025 1.000 N NA
 5482282 5482283 Arad_7584 Arad_7586     FALSE 0.012 253.000 0.000 1.000   NA
 5482283 5482284 Arad_7586 Arad_7587     FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 5482284 5482285 Arad_7587 Arad_7588     FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5482285 5482286 Arad_7588 Arad_7589     FALSE 0.093 121.000 0.000 NA   NA
 5482286 5482287 Arad_7589 Arad_7590   actP FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 5482287 5482288 Arad_7590 Arad_7591 actP   FALSE 0.195 74.000 0.000 NA   NA
 5482291 5482292 Arad_7597 Arad_7598     TRUE 0.992 0.000 0.607 NA   NA
 5482292 5482293 Arad_7598 Arad_7600     FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 5482294 5482295 Arad_7601 Arad_7602 virB11d   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482296 5482297 Arad_7603 Arad_7604     FALSE 0.028 190.000 0.000 NA   NA
 5482298 5482299 Arad_7605 Arad_7607     FALSE 0.001 578.000 0.000 NA   NA
 5482299 5482300 Arad_7607 Arad_7608     TRUE 0.923 33.000 0.538 1.000 N NA
 5482300 5482301 Arad_7608 Arad_7609     TRUE 0.935 69.000 0.769 NA   NA
 5482301 5482302 Arad_7609 Arad_7610     TRUE 0.939 36.000 0.583 NA   NA
 5482303 5482304 Arad_7611 Arad_7612     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5482304 5482305 Arad_7612 Arad_7613     FALSE 0.000 566.000 0.000 1.000 N NA
 5482305 5482306 Arad_7613 Arad_7614   galE TRUE 0.996 0.000 0.333 0.010 Y NA
 5482306 5482307 Arad_7614 Arad_7615 galE   TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5482307 5482308 Arad_7615 Arad_7616   rkpK TRUE 0.946 34.000 0.238 1.000 Y NA
 5482308 5482309 Arad_7616 Arad_7617 rkpK   TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 5482309 5482310 Arad_7617 Arad_7618     TRUE 0.969 -3.000 0.190 NA   NA
 5482310 5482311 Arad_7618 Arad_7619     TRUE 0.871 34.000 0.333 NA   NA
 5482311 5482312 Arad_7619 Arad_7620     FALSE 0.001 966.000 0.000 NA   NA
 5482312 5482313 Arad_7620 Arad_7621     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482314 5482315 Arad_7622 Arad_7623 exoF2 exsH TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482315 5482316 Arad_7623 Arad_7624 exsH exoQ FALSE 0.000 1439.000 0.000 NA N NA
 5482316 5482317 Arad_7624 Arad_7625 exoQ   TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482317 5482318 Arad_7625 Arad_7626     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482318 5482319 Arad_7626 Arad_7627   exoY TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5482322 5482323 Arad_7631 Arad_7632 asnB   TRUE 0.899 15.000 0.211 NA   NA
 5482323 5482324 Arad_7632 Arad_7633   matB TRUE 0.925 22.000 0.367 NA   NA
 5482324 5482325 Arad_7633 Arad_7634 matB nadE TRUE 0.948 -3.000 0.133 1.000 N NA
 5482325 5482326 Arad_7634 Arad_7635 nadE   FALSE 0.185 22.000 0.000 1.000 N NA
 5482328 5482329 Arad_7637 Arad_7638     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5482329 5482330 Arad_7638 Arad_7639     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 5482331 5482332 Arad_7640 Arad_7641     TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5482332 5482333 Arad_7641 Arad_7643     FALSE 0.249 15.000 0.000 1.000 N NA
 5482333 5482334 Arad_7643 Arad_7644   ssuD FALSE 0.198 148.000 0.125 1.000 N NA
 5482334 5482335 Arad_7644 Arad_7645 ssuD   FALSE 0.228 63.000 0.000 NA   NA
 5482336 5482337 Arad_7646 Arad_7647     TRUE 0.998 -3.000 0.520 NA Y NA
 5482337 5482338 Arad_7647 Arad_7648   tauB TRUE 0.908 114.000 0.520 NA Y NA
 5482338 5482339 Arad_7648 Arad_7649 tauB   FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5482339 5482340 Arad_7649 Arad_7650   dctD TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482342 5482343 Arad_7652 Arad_7653   serA FALSE 0.113 16.000 0.000 NA N NA
 5482343 5482344 Arad_7653 Arad_7654 serA dapAch2 TRUE 0.973 5.000 0.000 0.091 Y NA
 5482347 5482348 Arad_7658 Arad_7659   ttuD FALSE 0.109 122.000 0.000 1.000   NA
 5482348 5482349 Arad_7659 Arad_7660 ttuD   TRUE 0.854 12.000 0.130 1.000 N NA
 5482349 5482350 Arad_7660 Arad_7661     TRUE 0.727 25.000 0.130 1.000 N NA
 5482351 5482352 Arad_7662 Arad_7664   rpoI FALSE 0.109 239.000 0.000 NA Y NA
 5482352 5482353 Arad_7664 Arad_7665 rpoI   TRUE 0.923 95.000 1.000 NA N NA
 5482353 5482354 Arad_7665 Arad_7666   fhuA TRUE 0.594 101.000 0.000 NA Y NA
 5482354 5482355 Arad_7666 Arad_7667 fhuA   TRUE 0.588 102.000 0.333 NA N NA
 5482355 5482356 Arad_7667 Arad_7668     FALSE 0.090 21.000 0.000 NA N NA
 5482358 5482359 Arad_7670 Arad_7672   dppAch1 FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 5482359 5482360 Arad_7672 Arad_7673 dppAch1   TRUE 0.982 61.000 0.792 NA Y NA
 5482360 5482361 Arad_7673 Arad_7674   dppCch1 TRUE 0.999 -3.000 0.864 NA Y NA
 5482361 5482362 Arad_7674 Arad_7675 dppCch1   TRUE 0.972 45.000 0.955 NA   NA
 5482362 5482363 Arad_7675 Arad_7676     TRUE 0.995 -10.000 0.667 NA   NA
 5482363 5482364 Arad_7676 Arad_7678     TRUE 0.897 31.000 0.375 NA   NA
 5482364 5482365 Arad_7678 Arad_7679     TRUE 0.942 23.000 0.455 NA   NA
 5482365 5482366 Arad_7679 Arad_7680     FALSE 0.023 201.000 0.000 NA   NA
 5482367 5482368 Arad_7681 Arad_7683     TRUE 0.629 80.000 0.222 NA   NA
 5482368 5482369 Arad_7683 Arad_7684     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482370 5482371 Arad_7685 Arad_7686     TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 5482371 5482372 Arad_7686 Arad_7687     TRUE 0.995 2.000 0.444 NA Y NA
 5482372 5482373 Arad_7687 Arad_7689   appF TRUE 1.000 -22.000 1.000 0.006 Y NA
 5482373 5482374 Arad_7689 Arad_7690 appF mocA TRUE 0.809 14.000 0.094 1.000 N NA
 5482374 5482375 Arad_7690 Arad_7691 mocA   FALSE 0.418 70.000 0.062 1.000 N NA
 5482375 5482376 Arad_7691 Arad_7694     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5482377 5482378 Arad_7696 Arad_7697     FALSE 0.001 798.000 0.000 NA   NA
 5482380 5482381 Arad_7700 Arad_7701   ntaA TRUE 0.928 14.000 0.000 NA Y NA
 5482381 5482382 Arad_7701 Arad_7702 ntaA   FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5482382 5482383 Arad_7702 Arad_7703     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5482383 5482384 Arad_7703 Arad_7704     TRUE 0.882 11.000 0.083 NA   NA
 5482384 5482385 Arad_7704 Arad_7705     FALSE 0.153 12.000 0.000 NA N NA
 5482386 5482387 Arad_7706 Arad_7708     TRUE 0.986 22.000 0.500 1.000 Y NA
 5482389 5482390 Arad_7710 Arad_7711   tauC TRUE 0.995 -21.000 0.294 NA Y NA
 5482390 5482391 Arad_7711 Arad_7712 tauC   FALSE 0.011 129.000 0.000 NA N NA
 5482391 5482392 Arad_7712 Arad_7713     FALSE 0.340 113.000 0.087 NA   NA
 5482392 5482393 Arad_7713 Arad_7715     TRUE 0.655 42.000 0.087 NA   NA
 5482393 5482394 Arad_7715 Arad_7716     TRUE 0.719 71.000 0.000 NA Y NA
 5482394 5482395 Arad_7716 Arad_7717     TRUE 0.956 57.000 0.444 NA Y NA
 5482395 5482396 Arad_7717 Arad_7718   dppCch3 TRUE 0.994 11.000 0.571 NA Y NA
 5482396 5482397 Arad_7718 Arad_7719 dppCch3   TRUE 0.993 -3.000 0.571 NA   NA
 5482397 5482398 Arad_7719 Arad_7721     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5482398 5482399 Arad_7721 Arad_7723     TRUE 0.800 46.000 0.000 NA Y NA
 5482400 5482401 Arad_7724 Arad_7725     TRUE 0.983 16.000 0.750 NA   NA
 5482401 5482402 Arad_7725 Arad_7726     TRUE 0.998 -28.000 0.600 NA Y NA
 5482402 5482403 Arad_7726 Arad_7727     TRUE 0.829 22.000 0.167 NA   NA
 5482405 5482406 Arad_7730 Arad_7732   thuG FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 5482406 5482407 Arad_7732 Arad_7734 thuG thuF TRUE 0.997 6.000 0.723 NA Y NA
 5482407 5482408 Arad_7734 Arad_7735 thuF   TRUE 0.987 -3.000 0.019 NA Y NA
 5482408 5482409 Arad_7735 Arad_7736   thuE TRUE 0.901 115.000 0.500 NA Y NA
 5482411 5482412 Arad_7739 Arad_7740 lysM   FALSE 0.262 181.000 0.000 1.000 Y NA
 5482412 5482413 Arad_7740 Arad_7741     TRUE 0.561 81.000 0.154 1.000   NA
 5482413 5482414 Arad_7741 Arad_7742     TRUE 0.988 8.000 0.667 NA   NA
 5482414 5482415 Arad_7742 Arad_7743     TRUE 0.961 10.000 0.333 NA   NA
 5482415 5482416 Arad_7743 Arad_7744     TRUE 0.883 130.000 0.500 NA Y NA
 5482417 5482418 Arad_7745 Arad_7746   dapAf2 FALSE 0.040 99.000 0.000 1.000 N NA
 5482418 5482419 Arad_7746 Arad_7748 dapAf2 dppAf TRUE 0.866 79.000 0.211 NA Y NA
 5482419 5482420 Arad_7748 Arad_7749 dppAf dppBf TRUE 0.983 7.000 0.200 NA Y NA
 5482420 5482421 Arad_7749 Arad_7750 dppBf dppCf TRUE 0.984 6.000 0.200 NA Y NA
 5482421 5482422 Arad_7750 Arad_7751 dppCf dppDf TRUE 0.993 -3.000 0.231 NA Y NA
 5482422 5482423 Arad_7751 Arad_7752 dppDf dppFf TRUE 0.999 -3.000 0.733 0.054 Y NA
 5482424 5482425 Arad_7753 Arad_7754   ugpQ TRUE 0.960 0.000 0.250 1.000 N NA
 5482427 5482428 Arad_7756 Arad_7757   casA FALSE 0.041 334.000 0.000 1.000 Y NA
 5482428 5482429 Arad_7757 Arad_7759 casA   FALSE 0.001 375.000 0.000 1.000 N NA
 5482431 5482432 Arad_7761 Arad_7762     FALSE 0.317 38.000 0.000 NA   NA
 5482432 5482433 Arad_7762 Arad_7763     FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 5482433 5482434 Arad_7763 Arad_7765     TRUE 0.916 56.000 0.600 NA   NA
 5482434 5482435 Arad_7765 Arad_7766   mcpZch2 FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482435 5482436 Arad_7766 Arad_7768 mcpZch2   FALSE 0.164 85.000 0.000 NA   NA
 5482436 5482437 Arad_7768 Arad_7769     TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 5482437 5482438 Arad_7769 Arad_7770     TRUE 0.999 -10.000 0.778 NA Y NA
 5482438 5482439 Arad_7770 Arad_7771   rbsBch3 TRUE 0.956 57.000 0.444 NA Y NA
 5482439 5482440 Arad_7771 Arad_7773 rbsBch3   FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5482441 5482442 Arad_7774 Arad_7775     FALSE 0.154 130.000 0.027 1.000 N NA
 5482442 5482443 Arad_7775 Arad_7777   aroEc FALSE 0.006 204.000 0.000 1.000 N NA
 5482443 5482444 Arad_7777 Arad_7778 aroEc   FALSE 0.086 140.000 0.000 1.000   NA
 5482446 5482447 Arad_7780 Arad_7781     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5482447 5482448 Arad_7781 Arad_7783     FALSE 0.002 439.000 0.000 1.000   NA
 5482451 5482452 Arad_7788 Arad_7790     FALSE 0.002 442.000 0.000 NA   NA
 5482452 5482453 Arad_7790 Arad_7791   mcpGd FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5482453 5482454 Arad_7791 Arad_7792 mcpGd   FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 5482456 5482457 Arad_7796 Arad_7797   intA FALSE 0.054 165.000 0.000 1.000   NA
 5482457 5482458 Arad_7797 Arad_7798 intA   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482458 5482459 Arad_7798 Arad_7801     FALSE 0.001 753.000 0.000 NA   NA
 5482459 5482460 Arad_7801 Arad_7802     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 5482460 5482461 Arad_7802 Arad_7803     TRUE 0.982 1.000 0.400 NA   NA
 5482461 5482462 Arad_7803 Arad_7804     FALSE 0.001 770.000 0.000 NA   NA
 5482462 5482463 Arad_7804 Arad_7805     FALSE 0.018 215.000 0.000 NA   NA
 5482463 5482464 Arad_7805 Arad_7806     TRUE 0.986 5.000 0.571 NA   NA
 5482464 5482465 Arad_7806 Arad_7807     FALSE 0.100 116.000 0.000 NA   NA
 5482465 5482466 Arad_7807 Arad_7808     TRUE 0.588 13.000 0.000 NA   NA
 5482466 5482467 Arad_7808 Arad_7809     TRUE 0.981 2.000 0.400 NA   NA
 5482467 5482468 Arad_7809 Arad_7810     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482469 5482470 Arad_7811 Arad_7812     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5482470 5482471 Arad_7812 Arad_7814     FALSE 0.527 119.000 0.286 NA   NA
 5482472 5482473 Arad_7816 Arad_7817     FALSE 0.338 34.000 0.000 NA   NA
 5482473 5482474 Arad_7817 Arad_7818     TRUE 0.891 11.000 0.105 NA   NA
 5482474 5482475 Arad_7818 Arad_7819     FALSE 0.073 140.000 0.000 NA   NA
 5482475 5482476 Arad_7819 Arad_7820     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482476 5482477 Arad_7820 Arad_7821     TRUE 0.936 -3.000 0.029 NA   NA
 5482477 5482478 Arad_7821 Arad_7822     TRUE 0.823 -13.000 0.000 NA   NA
 5482478 5482479 Arad_7822 Arad_7823     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482479 5482480 Arad_7823 Arad_7824     TRUE 0.994 -3.000 0.609 NA   NA
 5482480 5482481 Arad_7824 Arad_7826     TRUE 0.604 68.000 0.130 1.000   NA
 5482481 5482482 Arad_7826 Arad_7827     FALSE 0.111 191.000 0.087 NA   NA
 5482484 5482485 Arad_7831 Arad_7833 cpxP2   FALSE 0.350 9.000 0.000 1.000 N NA
 5482485 5482486 Arad_7833 Arad_7834     TRUE 0.619 53.000 0.105 NA   NA
 5482486 5482487 Arad_7834 Arad_7836     FALSE 0.001 849.000 0.000 NA   NA
 5482487 5482488 Arad_7836 Arad_7837     TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 5482488 5482489 Arad_7837 Arad_7838     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5482489 5482490 Arad_7838 Arad_7839     FALSE 0.040 170.000 0.000 NA   NA
 5482490 5482491 Arad_7839 Arad_7840     TRUE 0.998 6.000 0.667 0.045 Y NA
 5482491 5482492 Arad_7840 Arad_7842     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5482492 5482493 Arad_7842 Arad_7843     FALSE 0.208 70.000 0.000 NA   NA
 5482493 5482494 Arad_7843 Arad_7845     FALSE 0.089 126.000 0.000 NA   NA
 5482495 5482496 Arad_7846 Arad_7847     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5482496 5482497 Arad_7847 Arad_7848     TRUE 0.934 6.000 0.190 NA   NA
 5482497 5482498 Arad_7848 Arad_7849     TRUE 0.979 -25.000 0.286 NA   NA
 5482500 5482501 Arad_7852 Arad_7853   dnaEf FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5482503 5482504 Arad_7854 Arad_7855 phnC   TRUE 0.964 96.000 0.589 0.002 Y NA
 5482504 5482505 Arad_7855 Arad_7856   phnE TRUE 0.978 69.000 0.568 0.001 Y NA
 5482505 5482506 Arad_7856 Arad_7857 phnE phnE TRUE 0.996 9.000 0.491 0.001 Y NA
 5482506 5482507 Arad_7857 Arad_7858 phnE   FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 5482508 5482509 Arad_7859 Arad_7861     FALSE 0.252 54.000 0.000 NA   NA
 5482509 5482510 Arad_7861 Arad_7863     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5482510 5482511 Arad_7863 Arad_7864     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482511 5482512 Arad_7864 Arad_7865     FALSE 0.276 58.000 0.000 1.000   NA
 5482512 5482513 Arad_7865 Arad_7867   phnW TRUE 0.804 0.000 0.000 1.000   NA
 5482513 5482514 Arad_7867 Arad_7868 phnW   TRUE 0.854 -7.000 0.000 1.000   NA
 5482514 5482515 Arad_7868 Arad_7870     FALSE 0.010 262.000 0.000 1.000   NA
 5482515 5482516 Arad_7870 Arad_7871     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482516 5482517 Arad_7871 Arad_7872     FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 5482518 5482519 Arad_7874 Arad_7875     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482519 5482520 Arad_7875 Arad_7877     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5482520 5482521 Arad_7877 Arad_7878     TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5482521 5482522 Arad_7878 Arad_7879     FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5482522 5482523 Arad_7879 Arad_7880     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482523 5482524 Arad_7880 Arad_7881     FALSE 0.019 214.000 0.000 NA   NA
 5482525 5482526 Arad_7882 Arad_7883     FALSE 0.118 105.000 0.000 NA   NA
 5482526 5482527 Arad_7883 Arad_7884     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 5482527 5482528 Arad_7884 Arad_7886     FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 5482528 5482529 Arad_7886 Arad_7887     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482529 5482530 Arad_7887 Arad_7888     FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 5482530 5482531 Arad_7888 Arad_7889     FALSE 0.061 149.000 0.000 NA   NA
 5482532 5482533 Arad_7890 Arad_7891     FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 5482533 5482534 Arad_7891 Arad_7893     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482534 5482535 Arad_7893 Arad_7894     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5482535 5482536 Arad_7894 Arad_7895     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482536 5482537 Arad_7895 Arad_7896     FALSE 0.129 245.000 0.333 NA   NA
 5482537 5482538 Arad_7896 Arad_7897     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5482538 5482539 Arad_7897 Arad_7898     FALSE 0.003 420.000 0.000 1.000   NA
 5482540 5482541 Arad_7899 Arad_7900     TRUE 0.950 37.000 0.667 NA   NA
 5482541 5482542 Arad_7900 Arad_7902     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5482542 5482543 Arad_7902 Arad_7904   rzcA FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 5482546 5482547 Arad_7907 Arad_7908     TRUE 0.774 95.000 0.080 1.000 Y NA
 5482547 5482548 Arad_7908 Arad_7909   cydB TRUE 0.993 6.000 0.324 0.052 Y NA
 5482548 5482549 Arad_7909 Arad_7910 cydB   FALSE 0.023 136.000 0.000 1.000 N NA
 5482549 5482550 Arad_7910 Arad_7913     FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 5482550 5482551 Arad_7913 Arad_7914   grpE TRUE 0.759 1.000 0.000 NA   NA
 5482552 5482553 Arad_7915 Arad_7917   moeA FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5482554 5482555 Arad_7918 Arad_7920 dnaK dnaJ FALSE 0.373 182.000 0.000 0.002 Y NA
 5482555 5482556 Arad_7920 Arad_7921 dnaJ   TRUE 0.970 0.000 0.250 1.000   NA
 5482558 5482559 Arad_7923 Arad_7924     TRUE 0.996 -7.000 0.312 1.000 Y NA
 5482559 5482560 Arad_7924 Arad_7925   clpB FALSE 0.011 174.000 0.000 1.000 N NA
 5482560 5482561 Arad_7925 Arad_7926 clpB   FALSE 0.199 118.000 0.003 NA   NA
 5482561 5482562 Arad_7926 Arad_7927     FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5482562 5482563 Arad_7927 Arad_7929     FALSE 0.437 65.000 0.017 NA   NA
 5482563 5482564 Arad_7929 Arad_7930     TRUE 0.980 -7.000 0.267 NA   NA
 5482564 5482565 Arad_7930 Arad_7932   leuA1 FALSE 0.001 853.000 0.000 NA   NA
 5482565 5482566 Arad_7932 Arad_7933 leuA1 ilvG FALSE 0.502 128.000 0.000 1.000 Y NA
 5482566 5482567 Arad_7933 Arad_7934 ilvG   FALSE 0.471 62.000 0.026 NA   NA
 5482567 5482568 Arad_7934 Arad_7936     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 5482570 5482571 Arad_7939 Arad_7940     TRUE 0.949 84.000 0.542 NA Y NA
 5482571 5482572 Arad_7940 Arad_7941     TRUE 0.998 -3.000 0.625 NA Y NA
 5482572 5482573 Arad_7941 Arad_7942     TRUE 0.971 3.000 0.312 NA   NA
 5482573 5482574 Arad_7942 Arad_7943     TRUE 0.750 37.000 0.182 NA   NA
 5482576 5482577 Arad_7947 Arad_7948 selA   TRUE 0.692 37.000 0.083 1.000   NA
 5482578 5482579 Arad_7949 Arad_7951     TRUE 0.991 19.000 0.500 0.017 Y NA
 5482579 5482580 Arad_7951 Arad_7952     TRUE 0.907 51.000 0.182 1.000 Y NA
 5482580 5482581 Arad_7952 Arad_7953     TRUE 0.982 8.000 0.182 1.000 Y NA
 5482581 5482582 Arad_7953 Arad_7954     TRUE 0.941 -7.000 0.118 NA N NA
 5482582 5482583 Arad_7954 Arad_7955     TRUE 0.988 -3.000 0.471 NA N NA
 5482584 5482585 Arad_7957 Arad_7958     TRUE 0.993 -3.000 0.588 NA   NA
 5482586 5482587 Arad_7959 Arad_7960 speB   TRUE 0.905 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5482587 5482588 Arad_7960 Arad_7962     TRUE 0.969 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5482588 5482589 Arad_7962 Arad_7963     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 5482589 5482590 Arad_7963 Arad_7964     TRUE 0.995 21.000 0.833 1.000 Y NA
 5482593 5482594 Arad_7968 Arad_7969     TRUE 0.989 -3.000 0.071 NA Y NA
 5482594 5482595 Arad_7969 Arad_7971   matR TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA N NA
 5482595 5482596 Arad_7971 Arad_7972 matR serA TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5482596 5482597 Arad_7972 Arad_7973 serA   TRUE 0.991 -3.000 0.114 1.000 Y NA
 5482597 5482598 Arad_7973 Arad_7974     TRUE 0.939 -3.000 0.091 1.000 N NA
 5482598 5482599 Arad_7974 Arad_7975     TRUE 0.757 25.000 0.167 1.000 N NA
 5482601 5482602 Arad_7977 Arad_7978   occPch TRUE 0.975 0.000 0.300 NA   NA
 5482602 5482603 Arad_7978 Arad_7979 occPch   TRUE 0.995 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 5482603 5482604 Arad_7979 Arad_7980     TRUE 0.936 93.000 0.500 1.000 Y NA
 5482604 5482605 Arad_7980 Arad_7982     FALSE 0.001 411.000 0.000 1.000 N NA
 5482605 5482606 Arad_7982 Arad_7984     FALSE 0.405 75.000 0.022 NA   NA
 5482606 5482607 Arad_7984 Arad_7985     TRUE 0.751 48.000 0.222 NA   NA
 5482609 5482610 Arad_7990 Arad_7993     FALSE 0.001 659.000 0.000 NA   NA
 5482610 5482611 Arad_7993 Arad_7994     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482611 5482612 Arad_7994 Arad_7995     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5482612 5482613 Arad_7995 Arad_7996     FALSE 0.073 140.000 0.000 NA   NA
 5482613 5482614 Arad_7996 Arad_7997     FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482614 5482615 Arad_7997 Arad_7998   rosR FALSE 0.243 57.000 0.000 NA   NA
 5482615 5482616 Arad_7998 Arad_7999 rosR   FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 5482616 5482617 Arad_7999 Arad_8000     FALSE 0.188 76.000 0.000 NA   NA
 5482617 5482618 Arad_8000 Arad_8001     FALSE 0.240 58.000 0.000 NA   NA
 5482618 5482619 Arad_8001 Arad_8002     FALSE 0.286 46.000 0.000 NA   NA
 5482619 5482620 Arad_8002 Arad_8003     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 5482621 5482622 Arad_8005 Arad_8006 rinQ   FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 5482626 5482627 Arad_8012 Arad_8013     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 5482627 5482628 Arad_8013 Arad_8014   dppCf TRUE 0.995 -21.000 0.667 NA   NA
 5482628 5482629 Arad_8014 Arad_8015 dppCf   TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482629 5482630 Arad_8015 Arad_8016     TRUE 0.989 35.000 0.800 NA Y NA
 5482630 5482631 Arad_8016 Arad_8018     FALSE 0.002 216.000 0.000 NA N NA
 5482631 5482632 Arad_8018 Arad_8019     FALSE 0.023 201.000 0.000 NA   NA
 5482632 5482633 Arad_8019 Arad_8020     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482633 5482634 Arad_8020 Arad_8022     TRUE 0.851 -10.000 0.000 1.000   NA
 5482634 5482635 Arad_8022 Arad_8023   rbsAch3 TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482635 5482636 Arad_8023 Arad_8024 rbsAch3   TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5482636 5482637 Arad_8024 Arad_8026     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 5482638 5482639 Arad_8027 Arad_8028     FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 5482640 5482641 Arad_8030 Arad_8031   appD TRUE 0.998 -3.000 0.388 0.006 Y NA
 5482641 5482642 Arad_8031 Arad_8032 appD   TRUE 0.941 -3.000 0.100 1.000 N NA
 5482642 5482643 Arad_8032 Arad_8033   codAch2 TRUE 0.996 -3.000 0.231 0.006 Y NA
 5482643 5482644 Arad_8033 Arad_8034 codAch2 dppCch1 TRUE 0.858 10.000 0.115 NA N NA
 5482644 5482645 Arad_8034 Arad_8035 dppCch1   TRUE 0.956 17.000 0.097 NA Y NA
 5482645 5482646 Arad_8035 Arad_8036     TRUE 0.650 88.000 0.000 NA Y NA
 5482647 5482648 Arad_10055 Arad_8037     FALSE 0.529 67.000 0.054 1.000   NA
 5482649 5482650 Arad_8040 Arad_8042 rpsU   FALSE 0.009 275.000 0.000 1.000   NA
 5482650 5482651 Arad_8042 Arad_8043     FALSE 0.105 112.000 0.000 NA   NA
 5482651 5482652 Arad_8043 Arad_8044     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5482652 5482653 Arad_8044 Arad_8046   fhuA FALSE 0.103 244.000 0.000 NA Y NA
 5482653 5482654 Arad_8046 Arad_8048 fhuA   FALSE 0.219 164.000 0.214 1.000 N NA
 5482656 5482657 Arad_8050 Arad_8052     FALSE 0.001 327.000 0.000 1.000 N NA
 5482657 5482658 Arad_8052 Arad_8053     TRUE 0.978 -22.000 0.000 NA Y NA
 5482658 5482659 Arad_8053 Arad_8054     TRUE 0.790 98.000 0.160 NA Y NA
 5482659 5482660 Arad_8054 Arad_8056     TRUE 0.832 78.000 0.120 NA Y NA
 5482660 5482661 Arad_8056 Arad_8058     FALSE 0.062 894.000 0.444 NA Y NA
 5482662 5482663 Arad_8059 Arad_8060     FALSE 0.004 234.000 0.000 1.000 N NA
 5482664 5482665 Arad_8063 Arad_8064     FALSE 0.222 161.000 0.148 NA   NA
 5482666 5482667 Arad_8066 Arad_8067     TRUE 0.945 60.000 0.791 NA   NA
 5482667 5482668 Arad_8067 Arad_8069     TRUE 0.994 -28.000 0.660 1.000   NA
 5482668 5482669 Arad_8069 Arad_8071     TRUE 0.996 -3.000 0.623 0.089   NA
 5482669 5482670 Arad_8071 Arad_8072     TRUE 0.997 0.000 0.944 1.000   NA
 5482670 5482671 Arad_8072 Arad_8074     TRUE 0.965 -3.000 0.139 1.000   NA
 5482671 5482672 Arad_8074 Arad_8075     TRUE 0.939 2.000 0.128 NA   NA
 5482672 5482673 Arad_8075 Arad_8076     TRUE 0.976 12.000 0.520 NA   NA
 5482673 5482674 Arad_8076 Arad_8077     TRUE 0.976 -3.000 0.240 NA   NA
 5482674 5482675 Arad_8077 Arad_8079     FALSE 0.003 360.000 0.000 NA   NA
 5482675 5482676 Arad_8079 Arad_8080     TRUE 0.999 -3.000 0.706 NA Y NA
 5482676 5482677 Arad_8080 Arad_8081     TRUE 0.971 32.000 0.412 NA Y NA
 5482678 5482679 Arad_8082 Arad_8083     FALSE 0.007 193.000 0.000 1.000 N NA
 5482683 5482684 Arad_8090 Arad_8091     FALSE 0.201 72.000 0.000 NA   NA
 5482684 5482685 Arad_8091 Arad_8092     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 5482686 5482687 Arad_8093 Arad_8094     TRUE 0.987 22.000 0.556 NA Y NA
 5482687 5482688 Arad_8094 Arad_8096   braE TRUE 0.917 42.000 0.179 NA Y NA
 5482688 5482689 Arad_8096 Arad_8097 braE braF TRUE 0.992 -3.000 0.179 NA Y NA
 5482689 5482690 Arad_8097 Arad_8098 braF braG TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.052 Y NA
 5482690 5482691 Arad_8098 Arad_8100 braG aatAch TRUE 0.938 43.000 0.250 1.000 Y NA
 5482691 5482692 Arad_8100 Arad_8101 aatAch   FALSE 0.511 80.000 0.200 NA N NA
 5482692 5482693 Arad_8101 Arad_8102     FALSE 0.522 154.000 0.500 NA N NA
 5482693 5482694 Arad_8102 Arad_8103     TRUE 0.998 11.000 0.778 0.002 Y NA
 5482694 5482695 Arad_8103 Arad_8104     TRUE 0.902 10.000 0.096 1.000   NA
 5482695 5482696 Arad_8104 Arad_8106     TRUE 0.877 11.000 0.058 1.000   NA
 5482696 5482697 Arad_8106 Arad_8107     FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5482697 5482698 Arad_8107 Arad_8109     FALSE 0.003 356.000 0.000 NA   NA
 5482698 5482699 Arad_8109 Arad_8110     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482700 5482701 Arad_8111 Arad_8112   nolRch FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 5482702 5482703 Arad_8114 Arad_8115   ssuD TRUE 0.994 -3.000 0.667 1.000 N NA
 5482703 5482704 Arad_8115 Arad_8116 ssuD   FALSE 0.358 -7.000 0.000 NA N NA
 5482704 5482705 Arad_8116 Arad_8117     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482705 5482706 Arad_8117 Arad_8118     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482706 5482707 Arad_8118 Arad_8119     FALSE 0.250 55.000 0.000 NA   NA
 5482707 5482708 Arad_8119 Arad_8120     FALSE 0.002 418.000 0.000 NA   NA
 5482710 5482711 Arad_8124 Arad_8125     TRUE 0.902 6.000 0.158 1.000 N NA
 5482711 5482712 Arad_8125 Arad_8126     TRUE 0.920 2.000 0.048 1.000   NA
 5482712 5482713 Arad_8126 Arad_8127     FALSE 0.395 90.000 0.040 1.000   NA
 5482713 5482714 Arad_8127 Arad_8128     TRUE 0.896 109.000 0.450 NA Y NA
 5482714 5482715 Arad_8128 Arad_8130     TRUE 0.863 133.000 0.458 NA Y NA
 5482715 5482716 Arad_8130 Arad_8133     TRUE 0.996 16.000 0.917 NA Y NA
 5482716 5482717 Arad_8133 Arad_8134   mcpGc FALSE 0.000 572.000 0.000 NA N NA
 5482718 5482719 Arad_8136 Arad_8137     TRUE 0.745 63.000 0.333 NA N NA
 5482719 5482720 Arad_8137 Arad_8138     TRUE 0.820 -19.000 0.000 NA   NA
 5482721 5482722 Arad_8140 Arad_8142   dapAf3 TRUE 0.936 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5482722 5482723 Arad_8142 Arad_8144 dapAf3 dhaL TRUE 0.996 -7.000 0.690 0.089 N NA
 5482723 5482724 Arad_8144 Arad_8145 dhaL   TRUE 0.987 -3.000 0.345 0.055 N NA
 5482724 5482725 Arad_8145 Arad_8146     TRUE 0.977 54.000 0.636 1.000 Y NA
 5482725 5482726 Arad_8146 Arad_8147     TRUE 0.963 95.000 0.727 1.000 Y NA
 5482726 5482727 Arad_8147 Arad_8148     TRUE 0.973 29.000 0.400 NA Y NA
 5482727 5482728 Arad_8148 Arad_8150     TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 5482728 5482729 Arad_8150 Arad_8151     TRUE 0.952 19.000 0.100 NA Y NA
 5482729 5482730 Arad_8151 Arad_8152     FALSE 0.270 103.000 0.071 NA N NA
 5482731 5482732 Arad_8153 Arad_8154     FALSE 0.231 132.000 0.100 1.000 N NA
 5482735 5482736 Arad_8157 Arad_8158   braF TRUE 0.982 0.000 0.455 NA N NA
 5482736 5482737 Arad_8158 Arad_8159 braF braD TRUE 0.998 10.000 0.917 NA Y NA
 5482737 5482738 Arad_8159 Arad_8160 braD   TRUE 0.998 4.000 0.846 NA Y NA
 5482738 5482739 Arad_8160 Arad_8161     TRUE 0.872 96.000 0.308 NA Y NA
 5482739 5482740 Arad_8161 Arad_8162   braG TRUE 0.956 16.000 0.071 NA Y NA
 5482740 5482741 Arad_8162 Arad_8164 braG   FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5482745 5482746 Arad_8169 Arad_8170     FALSE 0.522 117.000 0.000 NA Y NA
 5482746 5482747 Arad_8170 Arad_8171     TRUE 0.990 2.000 0.600 NA   NA
 5482747 5482748 Arad_8171 Arad_8173     TRUE 0.646 104.000 0.333 NA   NA
 5482748 5482749 Arad_8173 Arad_8174     FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5482749 5482750 Arad_8174 Arad_8176     TRUE 0.924 75.000 0.750 NA   NA
 5482751 5482752 Arad_8177 Arad_8178   tpiA FALSE 0.343 54.000 0.000 0.088 N NA
 5482752 5482753 Arad_8178 Arad_8179 tpiA   TRUE 0.880 -3.000 0.000 0.088 N NA
 5482753 5482754 Arad_8179 Arad_8180   rbsAch3 TRUE 0.977 6.000 0.500 1.000 N NA
 5482754 5482755 Arad_8180 Arad_8181 rbsAch3 rbsBch3 TRUE 0.988 23.000 0.600 NA Y NA
 5482755 5482756 Arad_8181 Arad_8182 rbsBch3 rbsCch4 TRUE 0.795 118.000 0.261 NA Y NA
 5482757 5482758 Arad_8183 Arad_8184 tktB tktA TRUE 0.999 0.000 0.860 0.001 Y NA
 5482758 5482759 Arad_8184 Arad_8185 tktA glpK TRUE 0.882 66.000 0.596 1.000 N NA
 5482759 5482760 Arad_8185 Arad_8186 glpK   TRUE 0.811 22.000 0.200 1.000 N NA
 5482760 5482761 Arad_8186 Arad_8187     FALSE 0.006 205.000 0.000 1.000 N NA
 5482761 5482762 Arad_8187 Arad_8188   thuBf TRUE 0.922 23.000 0.353 1.000   NA
 5482762 5482763 Arad_8188 Arad_8189 thuBf   TRUE 0.935 -3.000 0.027 NA   NA
 5482763 5482764 Arad_8189 Arad_8190   iolC TRUE 0.948 -21.000 0.068 NA   NA
 5482764 5482765 Arad_8190 Arad_8191 iolC smoS FALSE 0.492 38.000 0.044 NA N NA
 5482765 5482766 Arad_8191 Arad_8193 smoS   TRUE 0.585 58.000 0.044 0.055 N NA
 5482767 5482768 Arad_8194 Arad_8195     FALSE 0.186 203.000 0.000 NA Y NA
 5482769 5482770 Arad_8196 Arad_8197     TRUE 0.994 11.000 0.571 NA Y NA
 5482770 5482771 Arad_8197 Arad_8198     TRUE 0.999 -3.000 0.714 NA Y NA
 5482771 5482772 Arad_8198 Arad_8200     TRUE 0.988 4.000 0.667 1.000 N NA
 5482772 5482773 Arad_8200 Arad_8201   aroQ FALSE 0.054 82.000 0.000 1.000 N NA
 5482775 5482776 Arad_8203 Arad_8204 mocBf mcpB TRUE 0.982 17.000 0.833 NA N NA
 5482776 5482777 Arad_8204 Arad_8205 mcpB   FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5482781 5482782 Arad_8211 Arad_8212 hppD hmgA FALSE 0.477 60.000 0.077 1.000 N NA
 5482782 5482783 Arad_8212 Arad_8213 hmgA   TRUE 0.902 38.000 0.060 1.000 Y NA
 5482783 5482784 Arad_8213 Arad_8214   maiA TRUE 0.978 -3.000 0.310 1.000 N NA
 5482785 5482786 Arad_8215 Arad_8216 vbsP   FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5482786 5482787 Arad_8216 Arad_8218     FALSE 0.046 164.000 0.000 NA   NA
 5482789 5482790 Arad_8221 Arad_8222 phbB fhuB FALSE 0.029 71.000 0.000 NA N NA
 5482790 5482791 Arad_8222 Arad_8223 fhuB fhuD TRUE 0.993 0.000 0.304 NA Y NA
 5482791 5482792 Arad_8223 Arad_8225 fhuD fhuC TRUE 0.989 -10.000 0.047 1.000 Y NA
 5482792 5482793 Arad_8225 Arad_8227 fhuC vbsC TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482793 5482794 Arad_8227 Arad_8228 vbsC   TRUE 0.944 3.000 0.158 1.000   NA
 5482794 5482795 Arad_8228 Arad_8229   vbsO FALSE 0.000 445.000 0.000 NA N NA
 5482795 5482796 Arad_8229 Arad_8230 vbsO vbsS TRUE 0.935 34.000 0.200 NA Y NA
 5482797 5482798 Arad_8231 Arad_8232 vbsA vbsD TRUE 0.922 18.000 0.364 1.000 N NA
 5482798 5482799 Arad_8232 Arad_8233 vbsD vbsL TRUE 0.992 -3.000 0.583 1.000 N NA
 5482799 5482800 Arad_8233 Arad_8234 vbsL lysA TRUE 0.613 118.000 0.002 1.000 Y NA
 5482800 5482801 Arad_8234 Arad_8235 lysA   FALSE 0.092 122.000 0.000 NA   NA
 5482802 5482803 Arad_8237 Arad_8238     FALSE 0.002 279.000 0.000 1.000 N NA
 5482803 5482804 Arad_8238 Arad_8240     FALSE 0.121 35.000 0.000 1.000 N NA
 5482804 5482805 Arad_8240 Arad_8241     TRUE 0.975 -10.000 0.286 1.000 N NA
 5482805 5482806 Arad_8241 Arad_8244   potD FALSE 0.462 71.000 0.100 1.000 N NA
 5482806 5482807 Arad_8244 Arad_8245 potD potI TRUE 0.900 42.000 0.100 NA Y NA
 5482807 5482808 Arad_8245 Arad_8246 potI potH TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482808 5482809 Arad_8246 Arad_8248 potH   FALSE 0.001 283.000 0.000 NA N NA
 5482809 5482810 Arad_8248 Arad_8249   nrdF FALSE 0.020 142.000 0.000 1.000 N NA
 5482810 5482811 Arad_8249 Arad_8250 nrdF   TRUE 0.971 17.000 0.048 0.000 Y NA
 5482811 5482812 Arad_8250 Arad_8252   nrdI TRUE 0.988 -18.000 0.054 NA Y NA
 5482812 5482813 Arad_8252 Arad_8253 nrdI nrdH TRUE 0.981 0.000 0.440 NA N NA
 5482815 5482816 Arad_8257 Arad_8258 nodW   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482816 5482817 Arad_8258 Arad_8259     FALSE 0.026 126.000 0.000 1.000 N NA
 5482817 5482818 Arad_8259 Arad_8260     TRUE 0.990 24.000 0.667 NA Y NA
 5482818 5482819 Arad_8260 Arad_8261     FALSE 0.000 651.000 0.000 NA N NA
 5482819 5482820 Arad_8261 Arad_8263     TRUE 0.985 7.000 0.083 0.023 Y NA
 5482820 5482821 Arad_8263 Arad_8264     TRUE 0.818 24.000 0.154 1.000   NA
 5482821 5482822 Arad_8264 Arad_8265   dppCch1 TRUE 0.926 2.000 0.077 NA   NA
 5482822 5482823 Arad_8265 Arad_8266 dppCch1   TRUE 0.998 -7.000 0.667 NA Y NA
 5482823 5482824 Arad_8266 Arad_8268     FALSE 0.073 271.000 0.000 NA Y NA
 5482824 5482825 Arad_8268 Arad_8269   argE TRUE 0.971 13.000 0.148 NA Y NA
 5482827 5482828 Arad_8271 Arad_8272   braF TRUE 0.999 0.000 0.750 0.052 Y NA
 5482828 5482829 Arad_8272 Arad_8273 braF   TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA Y NA
 5482829 5482830 Arad_8273 Arad_8274   braC1 TRUE 0.902 122.000 0.536 NA Y NA
 5482832 5482833 Arad_8277 Arad_8279 gcdH   FALSE 0.103 44.000 0.000 1.000 N NA
 5482833 5482834 Arad_8279 Arad_8280     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.002 Y NA
 5482834 5482835 Arad_8280 Arad_8281     FALSE 0.258 52.000 0.000 NA   NA
 5482835 5482836 Arad_8281 Arad_8282     TRUE 0.939 51.000 0.680 NA   NA
 5482836 5482837 Arad_8282 Arad_8283     TRUE 0.967 -7.000 0.171 NA   NA
 5482837 5482838 Arad_8283 Arad_8284     TRUE 0.871 20.000 0.214 NA   NA
 5482839 5482840 Arad_8286 Arad_8288   fpr FALSE 0.254 143.000 0.176 1.000 N NA
 5482841 5482842 Arad_8291 Arad_8292   xdhA TRUE 0.993 -3.000 0.074 0.009 Y NA
 5482842 5482843 Arad_8292 Arad_8294 xdhA   FALSE 0.001 304.000 0.000 1.000 N NA
 5482844 5482845 Arad_8295 Arad_8296 braC1   TRUE 0.927 69.000 0.333 NA Y NA
 5482845 5482846 Arad_8296 Arad_8298     TRUE 0.982 86.000 1.000 NA Y NA
 5482846 5482847 Arad_8298 Arad_8299     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA Y NA
 5482847 5482848 Arad_8299 Arad_8300     TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 5482848 5482849 Arad_8300 Arad_8301     TRUE 0.998 -3.000 0.556 0.052 Y NA
 5482849 5482850 Arad_8301 Arad_8302     TRUE 0.608 78.000 0.250 1.000 N NA
 5482850 5482851 Arad_8302 Arad_8303     TRUE 0.712 51.000 0.188 1.000   NA
 5482851 5482852 Arad_8303 Arad_8304     FALSE 0.178 90.000 0.000 1.000   NA
 5482852 5482853 Arad_8304 Arad_8305   dhaL FALSE 0.302 12.000 0.000 1.000 N NA
 5482854 5482855 Arad_8306 Arad_8307     FALSE 0.023 200.000 0.000 NA   NA
 5482855 5482856 Arad_8307 Arad_8308     TRUE 0.995 -3.000 0.739 NA N NA
 5482856 5482857 Arad_8308 Arad_8309     TRUE 0.999 -3.000 0.826 0.008 Y NA
 5482860 5482861 Arad_8312 Arad_8314     TRUE 0.801 170.000 0.560 NA Y NA
 5482861 5482862 Arad_8314 Arad_8316     TRUE 0.999 -3.000 0.762 NA Y NA
 5482862 5482863 Arad_8316 Arad_8317     TRUE 0.993 -3.000 0.211 NA Y NA
 5482863 5482864 Arad_8317 Arad_8319     TRUE 0.987 6.000 0.250 1.000 Y NA
 5482864 5482865 Arad_8319 Arad_8320   lacZ1 TRUE 0.991 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5482865 5482866 Arad_8320 Arad_8321 lacZ1   FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5482866 5482867 Arad_8321 Arad_8324     FALSE 0.001 921.000 0.000 NA   NA
 5482868 5482869 Arad_8325 Arad_8326     TRUE 0.695 31.000 0.148 1.000 N NA
 5482869 5482870 Arad_8326 Arad_8327     TRUE 0.958 5.000 0.000 NA Y NA
 5482870 5482871 Arad_8327 Arad_8328     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482871 5482872 Arad_8328 Arad_8329     TRUE 0.987 70.000 1.000 NA Y NA
 5482872 5482873 Arad_8329 Arad_8330     TRUE 0.920 59.000 0.267 NA Y NA
 5482877 5482878 Arad_8335 Arad_8336 dadA alr TRUE 0.658 29.000 0.089 1.000 N NA
 5482882 5482883 Arad_8343 Arad_8346 ropAe   FALSE 0.001 604.000 0.000 NA   NA
 5482883 5482884 Arad_8346 Arad_8347     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5482885 5482886 Arad_8348 Arad_8350     TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 5482886 5482887 Arad_8350 Arad_8351   znuB TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 5482887 5482888 Arad_8351 Arad_8352 znuB   TRUE 0.998 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 5482889 5482890 Arad_8353 Arad_8355 fur soxGe FALSE 0.008 148.000 0.000 NA N NA
 5482890 5482891 Arad_8355 Arad_8356 soxGe soxAe TRUE 0.992 -7.000 0.370 0.002   NA
 5482891 5482892 Arad_8356 Arad_8357 soxAe soxDe TRUE 0.998 -3.000 0.923 0.002   NA
 5482892 5482893 Arad_8357 Arad_8358 soxDe soxBe TRUE 0.998 13.000 0.846 0.002 Y NA
 5482894 5482895 Arad_8359 Arad_8360 glxA   TRUE 0.893 76.000 0.140 0.031 Y NA
 5482895 5482896 Arad_8360 Arad_8362   glxB FALSE 0.490 92.000 0.206 1.000 N NA
 5482896 5482897 Arad_8362 Arad_8364 glxB glxC TRUE 0.990 32.000 0.786 1.000 Y NA
 5482897 5482898 Arad_8364 Arad_8365 glxC glxD TRUE 0.997 16.000 0.901 1.000 Y NA
 5482898 5482899 Arad_8365 Arad_8367 glxD glnT TRUE 0.945 81.000 0.493 1.000 Y NA
 5482899 5482900 Arad_8367 Arad_8369 glnT purU FALSE 0.240 104.000 0.042 1.000 N NA
 5482900 5482901 Arad_8369 Arad_8371 purU folDch FALSE 0.411 4.000 0.000 1.000 N NA
 5482901 5482902 Arad_8371 Arad_8372 folDch   FALSE 0.031 114.000 0.000 1.000 N NA
 5482902 5482903 Arad_8372 Arad_8373     TRUE 0.965 13.000 0.438 NA   NA
 5482903 5482904 Arad_8373 Arad_8374     TRUE 0.993 -3.000 0.565 NA   NA
 5482904 5482905 Arad_8374 Arad_8376     TRUE 0.943 30.000 0.543 NA   NA
 5482905 5482906 Arad_8376 Arad_8377     TRUE 0.583 67.000 0.122 NA   NA
 5482906 5482907 Arad_8377 Arad_8378     FALSE 0.334 118.000 0.082 1.000   NA
 5482910 5482911 Arad_8382 Arad_8384     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482911 5482912 Arad_8384 Arad_8385     FALSE 0.179 79.000 0.000 NA   NA
 5482912 5482913 Arad_8385 Arad_8387     TRUE 0.966 19.000 0.217 NA Y NA
 5482913 5482914 Arad_8387 Arad_8388     TRUE 0.987 6.000 0.261 NA Y NA
 5482914 5482915 Arad_8388 Arad_8389     FALSE 0.045 44.000 0.000 NA N NA
 5482915 5482916 Arad_8389 Arad_8390   ocdch2 TRUE 0.901 7.000 0.182 NA N NA
 5482916 5482917 Arad_8390 Arad_8392 ocdch2   FALSE 0.275 112.000 0.091 1.000 N NA
 5482917 5482918 Arad_8392 Arad_8393   hutH TRUE 0.907 76.000 0.750 1.000 N NA
 5482918 5482919 Arad_8393 Arad_8394 hutH hutC TRUE 0.914 -3.000 0.040 1.000 N NA
 5482919 5482920 Arad_8394 Arad_8395 hutC   TRUE 0.914 -3.000 0.040 1.000 N NA
 5482920 5482921 Arad_8395 Arad_8396     TRUE 0.988 3.000 0.087 0.055 Y NA
 5482921 5482922 Arad_8396 Arad_8397     TRUE 0.993 -10.000 0.087 0.088 Y NA
 5482923 5482924 Arad_8398 Arad_8399     TRUE 0.998 -10.000 0.694 NA Y NA
 5482924 5482925 Arad_8399 Arad_8400   proW TRUE 0.998 5.000 0.918 NA Y NA
 5482925 5482926 Arad_8400 Arad_8402 proW opuAC TRUE 0.959 24.000 0.667 NA N NA
 5482926 5482927 Arad_8402 Arad_8403 opuAC hutH FALSE 0.204 116.000 0.043 1.000 N NA
 5482927 5482928 Arad_8403 Arad_8404 hutH   FALSE 0.098 47.000 0.000 1.000 N NA
 5482928 5482929 Arad_8404 Arad_8405   hbdA FALSE 0.431 3.000 0.000 1.000 N NA
 5482929 5482930 Arad_8405 Arad_8407 hbdA fadB1 TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482931 5482932 Arad_8408 Arad_8409 hipA   TRUE 0.961 -3.000 0.130 NA   NA
 5482932 5482933 Arad_8409 Arad_8411     FALSE 0.060 159.000 0.000 1.000   NA
 5482933 5482934 Arad_8411 Arad_8412     TRUE 0.838 5.000 0.040 1.000 N NA
 5482934 5482935 Arad_8412 Arad_8413     TRUE 0.747 95.000 0.040 1.000 Y NA
 5482935 5482936 Arad_8413 Arad_8414     TRUE 0.981 40.000 0.600 1.000 Y NA
 5482936 5482937 Arad_8414 Arad_8415     TRUE 0.998 -16.000 0.600 1.000 Y NA
 5482937 5482938 Arad_8415 Arad_8416     TRUE 0.999 12.000 1.000 0.017 Y NA
 5482938 5482939 Arad_8416 Arad_8417   uxuB TRUE 0.954 -3.000 0.167 1.000 N NA
 5482941 5482942 Arad_8419 Arad_8420     TRUE 0.906 44.000 0.143 NA Y NA
 5482942 5482943 Arad_8420 Arad_8422     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 5482943 5482944 Arad_8422 Arad_8423     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 5482944 5482945 Arad_8423 Arad_8425     TRUE 0.936 107.000 0.619 NA Y NA
 5482946 5482947 Arad_8426 Arad_8427     TRUE 0.998 -3.000 0.529 0.016 Y NA
 5482948 5482949 Arad_8428 Arad_8429   aceA TRUE 0.717 26.000 0.056 NA   NA
 5482950 5482951 Arad_8430 Arad_8431     FALSE 0.035 187.000 0.000 1.000   NA
 5482951 5482952 Arad_8431 Arad_8433     FALSE 0.005 385.000 0.000 0.052 N NA
 5482952 5482953 Arad_8433 Arad_8434   nuoE1 TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5482954 5482955 Arad_8435 Arad_8437     TRUE 0.929 20.000 0.357 NA   NA
 5482955 5482956 Arad_8437 Arad_8438     TRUE 0.967 -3.000 0.174 NA   NA
 5482956 5482957 Arad_8438 Arad_8440     TRUE 0.995 -3.000 0.316 NA Y NA
 5482957 5482958 Arad_8440 Arad_8441   pipb2 TRUE 0.841 52.000 0.368 NA   NA
 5482959 5482960 Arad_8442 Arad_8444   pipb1 TRUE 0.992 -3.000 0.520 1.000   NA
 5482960 5482961 Arad_8444 Arad_8446 pipb1   FALSE 0.006 318.000 0.000 1.000   NA
 5482962 5482963 Arad_8448 Arad_8449 oxyR   TRUE 0.725 14.000 0.041 NA N NA
 5482963 5482964 Arad_8449 Arad_8451     TRUE 0.907 125.000 0.551 1.000 Y NA
 5482965 5482966 Arad_8453 Arad_8454     TRUE 0.759 1.000 0.000 NA   NA
 5482969 5482970 Arad_8457 Arad_8459     FALSE 0.051 358.000 0.000 0.031 Y NA
 5482970 5482971 Arad_8459 Arad_8460     FALSE 0.017 829.000 0.000 0.031 Y NA
 5482977 5482978 Arad_8472 Arad_8473     FALSE 0.017 219.000 0.000 NA   NA
 5482978 5482979 Arad_8473 Arad_8474     FALSE 0.310 135.000 0.135 NA   NA
 5482979 5482980 Arad_8474 Arad_8476   degPch1 FALSE 0.009 277.000 0.000 1.000   NA
 5482980 5482981 Arad_8476 Arad_8477 degPch1   FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 5482981 5482982 Arad_8477 Arad_8478     FALSE 0.327 36.000 0.000 NA   NA
 5482983 5482984 Arad_8479 Arad_8481     TRUE 0.853 27.000 0.250 NA   NA
 5482985 5482986 Arad_8482 Arad_8483   manB1 FALSE 0.533 118.000 0.000 1.000 Y NA
 5482986 5482987 Arad_8483 Arad_8484 manB1   FALSE 0.134 31.000 0.000 1.000 N NA
 5482990 5482991 Arad_8490 Arad_8493     FALSE 0.002 523.000 0.000 1.000   NA
 5482992 5482993 Arad_8494 Arad_8495   kynU FALSE 0.143 29.000 0.000 1.000 N NA
 5482993 5482994 Arad_8495 Arad_8496 kynU   TRUE 0.798 14.000 0.028 NA   NA
 5482994 5482995 Arad_8496 Arad_8497     TRUE 0.948 5.000 0.222 NA   NA
 5482995 5482996 Arad_8497 Arad_8499     FALSE 0.434 77.000 0.041 NA   NA
 5482999 5483000 Arad_8503 Arad_8504     FALSE 0.367 30.000 0.000 NA   NA
 5483000 5483001 Arad_8504 Arad_8505     FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 5483002 5483003 Arad_8506 Arad_8507     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5483003 5483004 Arad_8507 Arad_8508     FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5483006 5483007 Arad_8511 Arad_8512     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5483008 5483009 Arad_8513 Arad_8515     FALSE 0.074 139.000 0.000 NA   NA
 5483009 5483010 Arad_8515 Arad_8517     FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 5483012 5483013 Arad_8520 Arad_8521     TRUE 0.941 53.000 0.714 NA   NA
 5483013 5483014 Arad_8521 Arad_8522     TRUE 0.997 11.000 0.833 1.000 Y NA
 5483014 5483015 Arad_8522 Arad_8523     TRUE 0.999 -13.000 0.833 NA Y NA
 5483015 5483016 Arad_8523 Arad_8526     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5483016 5483017 Arad_8526 Arad_8527     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 5483019 5483020 Arad_8530 Arad_8531     TRUE 0.852 126.000 0.400 NA Y NA
 5483020 5483021 Arad_8531 Arad_8532     TRUE 0.984 3.000 0.467 NA   NA
 5483021 5483022 Arad_8532 Arad_8533     TRUE 0.954 6.000 0.250 1.000   NA
 5483022 5483023 Arad_8533 Arad_8534   idhA TRUE 0.674 43.000 0.094 1.000   NA
 5483023 5483024 Arad_8534 Arad_8536 idhA   FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5483025 5483026 Arad_8537 Arad_8538     TRUE 0.778 18.000 0.000 0.004   NA
 5483028 5483029 Arad_8540 Arad_8541   dctA TRUE 0.601 36.000 0.083 1.000 N NA
 5483032 5483033 Arad_8544 Arad_8545     TRUE 0.610 14.000 0.000 1.000   NA
 5483033 5483034 Arad_8545 Arad_8547     FALSE 0.013 234.000 0.000 NA   NA
 5483034 5483035 Arad_8547 Arad_8548     FALSE 0.001 948.000 0.000 NA   NA
 5483035 5483036 Arad_8548 Arad_8549     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5483036 5483037 Arad_8549 Arad_8550     FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 5483037 5483038 Arad_8550 Arad_8551     FALSE 0.526 16.000 0.000 NA   NA
 5483039 5483040 Arad_8553 Arad_8554 ftsZ1 fabF2 FALSE 0.312 55.000 0.002 1.000 N NA
 5483040 5483041 Arad_8554 Arad_8555 fabF2   FALSE 0.244 124.000 0.093 1.000 N NA
 5483042 5483043 Arad_8556 Arad_8558     TRUE 0.995 0.000 0.857 NA N NA
 5483044 5483045 Arad_8559 Arad_8560   gatA1 FALSE 0.043 47.000 0.000 NA N NA
 5483045 5483046 Arad_8560 Arad_8561 gatA1   FALSE 0.061 31.000 0.000 NA N NA
 5483046 5483047 Arad_8561 Arad_8562     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5483047 5483048 Arad_8562 Arad_8563   oppD TRUE 0.992 -3.000 0.026 0.005 Y NA
 5483048 5483049 Arad_8563 Arad_8564 oppD dppCch2 TRUE 0.986 -3.000 0.018 NA Y NA
 5483049 5483050 Arad_8564 Arad_8565 dppCch2 dppBf TRUE 0.990 53.000 1.000 NA Y NA
 5483050 5483051 Arad_8565 Arad_8566 dppBf dppAch2 TRUE 0.630 93.000 0.000 NA Y NA
 5483053 5483054 Arad_8568 Arad_8570     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 5483054 5483055 Arad_8570 Arad_8572     FALSE 0.322 37.000 0.000 NA   NA
 5483057 5483058 Arad_8575 Arad_8577     FALSE 0.002 543.000 0.000 NA   NA
 5483058 5483059 Arad_8577 Arad_8579     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5483059 5483060 Arad_8579 Arad_8580     TRUE 0.997 -3.000 0.900 NA N NA
 5483061 5483062 Arad_8582 Arad_8583     TRUE 0.999 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 5483063 5483064 Arad_8585 Arad_8586 accCch   TRUE 0.699 42.000 0.203 1.000 N NA
 5483064 5483065 Arad_8586 Arad_8587     TRUE 0.897 8.000 0.082 NA   NA
 5483065 5483066 Arad_8587 Arad_8588     TRUE 0.772 25.000 0.108 NA   NA
 5483066 5483067 Arad_8588 Arad_8589     TRUE 0.911 12.000 0.189 NA   NA
 5483069 5483070 Arad_8591 Arad_8592     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5483070 5483071 Arad_8592 Arad_8594     FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 5483072 5483073 Arad_8595 Arad_8596     TRUE 0.630 42.000 0.065 NA   NA
 5483073 5483074 Arad_8596 Arad_8597     FALSE 0.180 89.000 0.000 1.000   NA
 5483074 5483075 Arad_8597 Arad_8598     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5483075 5483076 Arad_8598 Arad_8600     TRUE 0.886 75.000 0.239 NA Y NA
 5483076 5483077 Arad_8600 Arad_8601     TRUE 0.999 -10.000 0.727 NA Y NA
 5483077 5483078 Arad_8601 Arad_8603     TRUE 0.962 2.000 0.303 NA N NA
 5483078 5483079 Arad_8603 Arad_8604     TRUE 0.983 -3.000 0.364 1.000 N NA
 5483079 5483080 Arad_8604 Arad_8605     TRUE 0.988 13.000 0.385 1.000 Y NA
 5483080 5483081 Arad_8605 Arad_8606     TRUE 0.991 -27.000 0.588 1.000 N NA
 5483081 5483082 Arad_8606 Arad_8607   lyxX TRUE 0.928 34.000 0.154 1.000 Y NA
 5483082 5483083 Arad_8607 Arad_8608 lyxX   TRUE 0.936 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5483083 5483084 Arad_8608 Arad_8609     FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5483084 5483085 Arad_8609 Arad_8610     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 5483085 5483086 Arad_8610 Arad_8611     TRUE 0.991 49.000 1.000 NA Y NA
 5483086 5483087 Arad_8611 Arad_8613     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5483087 5483088 Arad_8613 Arad_8614     TRUE 0.982 18.000 0.385 NA Y NA
 5483090 5483091 Arad_8617 Arad_8618 dgoA idnO TRUE 0.905 10.000 0.076 0.087 N NA
 5483091 5483092 Arad_8618 Arad_8619 idnO idnD FALSE 0.404 65.000 0.045 1.000 N NA
 5483092 5483093 Arad_8619 Arad_8622 idnD   FALSE 0.001 316.000 0.000 1.000 N NA
 5483095 5483096 Arad_8624 Arad_8625     FALSE 0.101 129.000 0.000 1.000   NA
 5483096 5483097 Arad_8625 Arad_8627     TRUE 0.886 13.000 0.125 1.000   NA
 5483097 5483098 Arad_8627 Arad_8628     TRUE 0.927 31.000 0.476 NA   NA
 5483099 5483100 Arad_8629 Arad_8631 braC1   FALSE 0.009 276.000 0.000 1.000   NA
 5483100 5483101 Arad_8631 Arad_8633   gstA TRUE 0.634 127.000 0.415 NA   NA
 5483103 5483104 Arad_8635 Arad_8636   rhaU TRUE 0.963 -3.000 0.147 NA   NA
 5483104 5483105 Arad_8636 Arad_8637 rhaU   TRUE 0.966 -3.000 0.168 NA   NA
 5483105 5483106 Arad_8637 Arad_8638     TRUE 0.998 -3.000 0.515 NA Y NA
 5483106 5483107 Arad_8638 Arad_8639     TRUE 0.997 11.000 0.794 NA Y NA
 5483107 5483108 Arad_8639 Arad_8640   rhaS TRUE 0.943 74.000 0.446 NA Y NA
 5483108 5483109 Arad_8640 Arad_8642 rhaS   TRUE 0.946 54.000 0.357 NA Y NA
 5483110 5483111 Arad_8644 Arad_8646 rhaD rhaI TRUE 0.611 65.000 0.147 NA   NA
 5483111 5483112 Arad_8646 Arad_8648 rhaI ialA FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5483113 5483114 Arad_8650 Arad_8651   ggt FALSE 0.000 599.000 0.000 1.000 N NA
 5483114 5483115 Arad_8651 Arad_8652 ggt   FALSE 0.085 55.000 0.000 1.000 N NA
 5483117 5483118 Arad_8655 Arad_8656   btuE FALSE 0.041 178.000 0.000 1.000   NA
 5483118 5483119 Arad_8656 Arad_8658 btuE   FALSE 0.056 163.000 0.000 1.000   NA
 5483119 5483120 Arad_8658 Arad_8659     TRUE 0.832 49.000 0.333 NA   NA
 5483120 5483121 Arad_8659 Arad_8660   ggt TRUE 0.698 5.000 0.000 NA   NA
 5483121 5483122 Arad_8660 Arad_8661 ggt dppCf TRUE 0.942 23.000 0.095 NA Y NA
 5483122 5483123 Arad_8661 Arad_8662 dppCf   TRUE 0.999 -3.000 0.762 NA Y NA
 5483123 5483124 Arad_8662 Arad_8663     TRUE 0.884 63.000 0.176 NA Y NA
 5483124 5483125 Arad_8663 Arad_8665   ansR FALSE 0.414 90.000 0.160 NA N NA
 5483125 5483126 Arad_8665 Arad_8667 ansR   FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5483126 5483127 Arad_8667 Arad_8668     TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5483128 5483129 Arad_8669 Arad_8670     TRUE 0.966 -7.000 0.167 NA   NA
 5483129 5483130 Arad_8670 Arad_8671     FALSE 0.083 131.000 0.000 NA   NA
 5483130 5483131 Arad_8671 Arad_8674     FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000   NA
 5483133 5483134 Arad_8676 Arad_8677     FALSE 0.002 453.000 0.000 1.000   NA
 5483134 5483135 Arad_8677 Arad_8679     FALSE 0.017 150.000 0.000 1.000 N NA
 5483136 5483137 Arad_8681 Arad_8682     FALSE 0.234 85.000 0.000 0.087 N NA
 5483138 5483139 Arad_8684 Arad_8686     TRUE 0.998 -12.000 0.667 NA Y NA
 5483139 5483140 Arad_8686 Arad_8688     TRUE 0.991 -19.000 0.139 NA Y NA
 5483140 5483141 Arad_8688 Arad_8689     TRUE 0.706 21.000 0.083 NA N NA
 5483141 5483142 Arad_8689 Arad_8690     TRUE 0.993 16.000 0.500 0.005 Y NA
 5483142 5483143 Arad_8690 Arad_8691     TRUE 0.957 13.000 0.452 NA N NA
 5483144 5483145 Arad_8692 Arad_8693     FALSE 0.051 86.000 0.000 1.000 N NA
 5483146 5483147 Arad_8694 Arad_8696   ftsZ1 FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5483147 5483148 Arad_8696 Arad_8697 ftsZ1   FALSE 0.001 309.000 0.000 1.000 N NA
 5483148 5483149 Arad_8697 Arad_8698     FALSE 0.014 244.000 0.000 1.000   NA
 5483150 5483151 Arad_8700 Arad_8701     FALSE 0.143 94.000 0.000 NA   NA
 5483151 5483152 Arad_8701 Arad_8702   narB FALSE 0.083 131.000 0.000 NA   NA
 5483152 5483153 Arad_8702 Arad_8703 narB nirD TRUE 0.931 12.000 0.294 1.000 N NA
 5483153 5483154 Arad_8703 Arad_8704 nirD nirB TRUE 0.989 5.000 0.539 0.000 N NA
 5483154 5483155 Arad_8704 Arad_8705 nirB nrtCf TRUE 0.871 5.000 0.074 1.000 N NA
 5483155 5483156 Arad_8705 Arad_8706 nrtCf nrtB TRUE 0.993 11.000 0.323 0.000 Y NA
 5483156 5483157 Arad_8706 Arad_8707 nrtB nrtA TRUE 0.986 66.000 0.915 NA Y NA
 5483157 5483158 Arad_8707 Arad_8708 nrtA nrtCch FALSE 0.030 366.000 0.000 NA Y NA
 5483158 5483159 Arad_8708 Arad_8709 nrtCch nasT TRUE 0.860 50.000 0.466 NA N NA
 5483161 5483162 Arad_8713 Arad_8714     FALSE 0.003 354.000 0.000 NA   NA
 5483163 5483164 Arad_8715 Arad_8716   pqqB FALSE 0.002 650.000 0.000 1.000   NA
 5483164 5483165 Arad_8716 Arad_8717 pqqB pqqC TRUE 0.998 -19.000 0.825 0.001   NA
 5483165 5483166 Arad_8717 Arad_8718 pqqC   TRUE 0.993 -3.000 0.404 0.001   NA
 5483166 5483167 Arad_8718 Arad_8719   pqqE TRUE 0.887 63.000 0.361 0.001   NA
 5483167 5483168 Arad_8719 Arad_8720 pqqE   FALSE 0.048 162.000 0.000 NA   NA
 5483169 5483170 Arad_8721 Arad_8722 rpsU   TRUE 0.734 42.000 0.188 NA   NA
 5483170 5483171 Arad_8722 Arad_8723   modA FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 5483171 5483172 Arad_8723 Arad_8724 modA   TRUE 0.990 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5483172 5483173 Arad_8724 Arad_8725   hmuU TRUE 0.997 8.000 0.792 NA Y NA
 5483173 5483174 Arad_8725 Arad_8726 hmuU   TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA Y NA
 5483175 5483176 Arad_8727 Arad_8728 panB purU FALSE 0.079 59.000 0.000 1.000 N NA
 5483176 5483177 Arad_8728 Arad_8730 purU folDch FALSE 0.411 4.000 0.000 1.000 N NA
 5483177 5483178 Arad_8730 Arad_8731 folDch ropAe FALSE 0.002 604.000 0.000 1.000   NA
 5483179 5483180 Arad_8732 Arad_8733     FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000   NA
 5483184 5483185 Arad_8741 Arad_8742     TRUE 0.891 73.000 0.600 NA   NA
 5483185 5483186 Arad_8742 Arad_8744   groL TRUE 0.933 74.000 0.800 NA   NA
 5483186 5483187 Arad_8744 Arad_8745 groL groESch3 TRUE 0.983 49.000 0.714 1.000 Y NA
 5483188 5483189 Arad_8748 Arad_8750     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5483189 5483190 Arad_8750 Arad_8751     FALSE 0.169 83.000 0.000 NA   NA
 5483190 5483191 Arad_8751 Arad_8752   glpRb FALSE 0.002 232.000 0.000 NA N NA
 5483191 5483192 Arad_8752 Arad_8754 glpRb   FALSE 0.184 228.000 0.000 0.065 Y NA
 5483194 5483195 Arad_8758 Arad_8760   hrcJ TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA   NA
 5483195 5483196 Arad_8760 Arad_8761 hrcJ   TRUE 0.995 0.000 0.800 NA   NA
 5483196 5483197 Arad_8761 Arad_8762   hrpE TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483197 5483198 Arad_8762 Arad_8764 hrpE hrcN TRUE 0.854 -7.000 0.000 1.000   NA
 5483198 5483199 Arad_8764 Arad_8765 hrcN hrcQ TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483199 5483200 Arad_8765 Arad_8766 hrcQ hrcR TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483200 5483201 Arad_8766 Arad_8768 hrcR hrcS TRUE 0.995 4.000 0.333 0.009 Y NA
 5483201 5483202 Arad_8768 Arad_8770 hrcS hrcT TRUE 0.991 6.000 0.333 1.000 Y NA
 5483202 5483203 Arad_8770 Arad_8772 hrcT hrcU TRUE 0.999 -13.000 1.000 1.000 Y NA
 5483204 5483205 Arad_8773 Arad_8774   hrcV FALSE 0.222 65.000 0.000 NA   NA
 5483205 5483206 Arad_8774 Arad_8775 hrcV   TRUE 0.984 4.000 0.500 NA   NA
 5483206 5483207 Arad_8775 Arad_8777     TRUE 0.643 143.000 0.500 NA   NA
 5483209 5483210 Arad_8780 Arad_8781     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483210 5483211 Arad_8781 Arad_8782   hflK TRUE 0.994 -3.000 0.700 NA N NA
 5483211 5483212 Arad_8782 Arad_8783 hflK hflC TRUE 0.977 3.000 0.022 NA Y NA
 5483212 5483213 Arad_8783 Arad_8784 hflC   TRUE 0.987 -3.000 0.019 NA Y NA
 5483213 5483214 Arad_8784 Arad_8785     FALSE 0.003 187.000 0.000 NA N NA
 5483214 5483215 Arad_8785 Arad_8786     TRUE 0.887 19.000 0.235 NA   NA
 5483215 5483216 Arad_8786 Arad_8787     TRUE 0.959 -3.000 0.118 NA   NA
 5483216 5483217 Arad_8787 Arad_8788     TRUE 0.997 -3.000 0.273 0.005 Y NA
 5483217 5483218 Arad_8788 Arad_8789     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 5483218 5483219 Arad_8789 Arad_8790     TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 5483219 5483220 Arad_8790 Arad_8791     TRUE 0.949 47.000 0.333 NA Y NA
 5483221 5483222 Arad_8792 Arad_8793 dapAb   TRUE 0.831 12.000 0.108 NA N NA
 5483222 5483223 Arad_8793 Arad_8794     FALSE 0.196 114.000 0.046 NA N NA
 5483223 5483224 Arad_8794 Arad_8795   pdxA TRUE 0.805 19.000 0.167 1.000 N NA
 5483226 5483227 Arad_8797 Arad_8799     TRUE 0.880 11.000 0.080 NA   NA
 5483227 5483228 Arad_8799 Arad_8800     FALSE 0.012 119.000 0.000 NA N NA
 5483228 5483229 Arad_8800 Arad_8801   braC2 FALSE 0.278 133.000 0.182 NA N NA
 5483229 5483230 Arad_8801 Arad_8803 braC2   TRUE 0.883 61.000 0.167 NA Y NA
 5483230 5483231 Arad_8803 Arad_8804     TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA Y NA
 5483231 5483232 Arad_8804 Arad_8805     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 5483232 5483233 Arad_8805 Arad_8807   braG TRUE 0.998 4.000 0.667 0.051 Y NA
 5483233 5483234 Arad_8807 Arad_8808 braG aroEc TRUE 0.987 1.000 0.133 1.000 Y NA
 5483234 5483235 Arad_8808 Arad_8810 aroEc hppD TRUE 0.983 6.000 0.167 1.000 Y NA
 5483235 5483236 Arad_8810 Arad_8811 hppD   FALSE 0.000 747.000 0.000 1.000 N NA
 5483236 5483237 Arad_8811 Arad_8812     TRUE 0.999 -3.000 0.958 NA Y NA
 5483237 5483238 Arad_8812 Arad_8813     TRUE 0.996 -3.000 0.348 NA Y NA
 5483238 5483239 Arad_8813 Arad_8815     TRUE 0.990 3.000 0.250 1.000 Y NA
 5483241 5483242 Arad_8817 Arad_8818     TRUE 0.883 36.000 0.375 NA   NA
 5483242 5483243 Arad_8818 Arad_8820     TRUE 0.997 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 5483243 5483244 Arad_8820 Arad_8821     TRUE 0.996 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 5483244 5483245 Arad_8821 Arad_8823     TRUE 0.620 124.000 0.375 1.000   NA
 5483246 5483247 Arad_8824 Arad_8825   matR FALSE 0.152 27.000 0.000 1.000 N NA
 5483248 5483249 Arad_8826 Arad_8827 matA matB TRUE 0.805 24.000 0.130 1.000   NA
 5483249 5483250 Arad_8827 Arad_8828 matB matC FALSE 0.333 111.000 0.058 1.000   NA
 5483254 5483255 Arad_8836 Arad_8838     TRUE 0.951 104.000 0.697 NA Y NA
 5483255 5483256 Arad_8838 Arad_8839   dppCch1 TRUE 0.998 2.000 0.694 NA Y NA
 5483256 5483257 Arad_8839 Arad_8840 dppCch1   FALSE 0.128 174.000 0.056 NA   NA
 5483257 5483258 Arad_8840 Arad_8841   argE FALSE 0.186 87.000 0.000 1.000   NA
 5483258 5483259 Arad_8841 Arad_8842 argE   FALSE 0.098 47.000 0.000 1.000 N NA
 5483263 5483264 Arad_8846 Arad_8848     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5483266 5483267 Arad_8850 Arad_8852 ansP   TRUE 0.987 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 5483268 5483269 Arad_8854 Arad_8855     FALSE 0.016 103.000 0.000 NA N NA
 5483270 5483271 Arad_8856 Arad_8857 minC minD TRUE 0.976 33.000 0.466 1.000 Y NA
 5483271 5483272 Arad_8857 Arad_8858 minD minE TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 5483274 5483275 Arad_8861 Arad_8862 prsD prsE TRUE 0.982 -3.000 0.167 0.004   NA
 5483277 5483278 Arad_8864 Arad_8865     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5483278 5483279 Arad_8865 Arad_8867     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5483279 5483280 Arad_8867 Arad_8870     FALSE 0.131 99.000 0.000 NA   NA
 5483283 5483284 Arad_8874 Arad_8875   occT FALSE 0.051 168.000 0.000 1.000   NA
 5483284 5483285 Arad_8875 Arad_8876 occT occPch TRUE 0.929 37.000 0.182 1.000 Y NA
 5483285 5483286 Arad_8876 Arad_8877 occPch occMch TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5483286 5483287 Arad_8877 Arad_8878 occMch occQch TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.016 Y NA
 5483287 5483288 Arad_8878 Arad_8880 occQch hipO FALSE 0.482 85.000 0.083 1.000   NA
 5483290 5483291 Arad_8882 Arad_8883     FALSE 0.004 225.000 0.000 1.000 N NA
 5483292 5483293 Arad_8885 Arad_8887 uxuA uxuB TRUE 0.995 -3.000 0.263 1.000 Y NA
 5483293 5483294 Arad_8887 Arad_8888 uxuB   FALSE 0.023 136.000 0.000 1.000 N NA
 5483294 5483295 Arad_8888 Arad_8889     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483295 5483296 Arad_8889 Arad_8890     TRUE 0.760 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5483296 5483297 Arad_8890 Arad_8892     TRUE 0.970 9.000 0.000 0.016 Y NA
 5483297 5483298 Arad_8892 Arad_8893   aapP TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483298 5483299 Arad_8893 Arad_8894 aapP   FALSE 0.390 5.000 0.000 1.000 N NA
 5483299 5483300 Arad_8894 Arad_8896   recX FALSE 0.116 117.000 0.000 1.000   NA
 5483300 5483301 Arad_8896 Arad_8897 recX   FALSE 0.219 66.000 0.000 NA   NA
 5483303 5483304 Arad_8900 Arad_8901   dppAch1 FALSE 0.005 173.000 0.000 NA N NA
 5483304 5483305 Arad_8901 Arad_8902 dppAch1 appD TRUE 0.945 11.000 0.000 NA Y NA
 5483305 5483306 Arad_8902 Arad_8904 appD   TRUE 0.988 -7.000 0.000 0.011 Y NA
 5483306 5483307 Arad_8904 Arad_8905     TRUE 0.940 12.000 0.000 NA Y NA
 5483307 5483308 Arad_8905 Arad_8907   dppCch3 TRUE 0.986 25.000 0.571 NA Y NA
 5483308 5483309 Arad_8907 Arad_8908 dppCch3 ugpQ FALSE 0.048 41.000 0.000 NA N NA
 5483309 5483310 Arad_8908 Arad_8909 ugpQ   FALSE 0.010 177.000 0.000 1.000 N NA
 5483310 5483311 Arad_8909 Arad_8910     FALSE 0.044 46.000 0.000 NA N NA
 5483311 5483312 Arad_8910 Arad_8911   dppCch1 TRUE 0.994 -3.000 0.250 NA Y NA
 5483312 5483313 Arad_8911 Arad_8912 dppCch1   FALSE 0.200 6.000 0.000 NA N NA
 5483313 5483314 Arad_8912 Arad_8913     FALSE 0.216 18.000 0.000 1.000 N NA
 5483314 5483315 Arad_8913 Arad_8914   ggt TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5483315 5483316 Arad_8914 Arad_8915 ggt   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483316 5483317 Arad_8915 Arad_8916     TRUE 0.995 -3.000 0.180 0.005 Y NA
 5483317 5483318 Arad_8916 Arad_8917     TRUE 0.969 1.000 0.000 NA Y NA
 5483319 5483320 Arad_8918 Arad_8919   ilvD TRUE 0.766 19.000 0.133 NA N NA
 5483320 5483321 Arad_8919 Arad_8920 ilvD   FALSE 0.036 56.000 0.000 NA N NA
 5483321 5483322 Arad_8920 Arad_8921   tauB TRUE 0.995 4.000 0.500 NA Y NA
 5483322 5483323 Arad_8921 Arad_8923 tauB   TRUE 0.994 19.000 0.800 1.000 Y NA
 5483326 5483327 Arad_8927 Arad_8928   nadA FALSE 0.484 70.000 0.037 1.000   NA
 5483327 5483328 Arad_8928 Arad_8930 nadA nadB TRUE 0.996 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 5483328 5483329 Arad_8930 Arad_8931 nadB nadC TRUE 0.994 2.000 0.223 0.002 Y NA
 5483330 5483331 Arad_8932 Arad_8933 idnO   FALSE 0.032 111.000 0.000 1.000 N NA
 5483332 5483333 Arad_8934 Arad_8935 murA   TRUE 0.856 -3.000 0.007 NA N NA
 5483333 5483334 Arad_8935 Arad_8937     FALSE 0.024 274.000 0.035 NA   NA
 5483334 5483335 Arad_8937 Arad_8938     FALSE 0.168 170.000 0.111 NA   NA
 5483335 5483336 Arad_8938 Arad_8939     TRUE 0.934 28.000 0.134 NA Y NA
 5483336 5483337 Arad_8939 Arad_8940     TRUE 0.990 -3.000 0.104 NA Y NA
 5483337 5483338 Arad_8940 Arad_8941     TRUE 0.973 -3.000 0.211 NA   NA
 5483338 5483339 Arad_8941 Arad_8942     TRUE 0.928 6.000 0.150 1.000   NA
 5483339 5483340 Arad_8942 Arad_8943     TRUE 0.695 11.000 0.011 NA N NA
 5483340 5483341 Arad_8943 Arad_8945     FALSE 0.114 107.000 0.000 NA   NA
 5483341 5483342 Arad_8945 Arad_8947     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5483343 5483344 Arad_8948 Arad_8949 guaD   FALSE 0.150 91.000 0.000 NA   NA
 5483344 5483345 Arad_8949 Arad_8950     FALSE 0.255 53.000 0.000 NA   NA
 5483345 5483346 Arad_8950 Arad_8951     TRUE 0.951 10.000 0.286 NA   NA
 5483346 5483347 Arad_8951 Arad_8952     TRUE 0.984 15.000 0.750 NA   NA
 5483347 5483348 Arad_8952 Arad_8954     TRUE 0.986 2.000 0.500 NA   NA
 5483348 5483349 Arad_8954 Arad_8955     TRUE 0.769 79.000 0.353 1.000   NA
 5483350 5483351 Arad_8956 Arad_8959     FALSE 0.056 153.000 0.000 NA   NA
 5483351 5483352 Arad_8959 Arad_8960   gstc TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 5483352 5483353 Arad_8960 Arad_8961 gstc ade TRUE 0.646 19.000 0.038 NA N NA
 5483354 5483355 Arad_8962 Arad_8963     FALSE 0.040 100.000 0.000 1.000 N NA
 5483355 5483356 Arad_8963 Arad_8964     TRUE 0.984 2.000 0.444 1.000   NA
 5483356 5483357 Arad_8964 Arad_8965     TRUE 0.928 27.000 0.444 NA   NA
 5483357 5483358 Arad_8965 Arad_8966     TRUE 0.999 -3.000 0.900 NA Y NA
 5483358 5483359 Arad_8966 Arad_8967     TRUE 0.979 72.000 0.800 NA Y NA
 5483359 5483360 Arad_8967 Arad_8968     TRUE 0.930 68.000 0.818 NA N NA
 5483360 5483361 Arad_8968 Arad_8971     FALSE 0.010 179.000 0.000 1.000 N NA
 5483361 5483362 Arad_8971 Arad_8972   vbsS TRUE 0.763 15.000 0.061 1.000 N NA
 5483362 5483363 Arad_8972 Arad_8973 vbsS   FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 5483364 5483365 Arad_8974 Arad_8975 dctB dctD TRUE 0.995 -3.000 0.263 1.000 Y NA
 5483366 5483367 Arad_8977 Arad_8978     TRUE 0.988 6.000 0.286 NA Y NA
 5483367 5483368 Arad_8978 Arad_8979     TRUE 0.936 90.000 0.500 NA Y NA
 5483368 5483369 Arad_8979 Arad_8981     FALSE 0.019 455.000 0.000 NA Y NA
 5483369 5483370 Arad_8981 Arad_8982     TRUE 0.746 135.000 0.250 NA Y NA
 5483370 5483371 Arad_8982 Arad_8983     TRUE 0.993 4.000 0.400 NA Y NA
 5483372 5483373 Arad_8985 Arad_8986     TRUE 0.588 13.000 0.000 NA   NA
 5483373 5483374 Arad_8986 Arad_8987     FALSE 0.002 436.000 0.000 NA   NA
 5483374 5483375 Arad_8987 Arad_8988     FALSE 0.002 400.000 0.000 NA   NA
 5483375 5483376 Arad_8988 Arad_8991   rzcA FALSE 0.000 733.000 0.000 1.000 N NA
 5483376 5483377 Arad_8991 Arad_8992 rzcA   TRUE 0.990 8.000 0.750 NA   NA
 5483377 5483378 Arad_8992 Arad_8993     TRUE 0.967 15.000 0.500 NA   NA
 5483378 5483379 Arad_8993 Arad_8994     TRUE 0.959 30.000 0.667 NA   NA
 5483379 5483380 Arad_8994 Arad_8995   invp FALSE 0.351 146.000 0.222 NA   NA
 5483381 5483382 Arad_8996 Arad_8997     FALSE 0.001 374.000 0.000 1.000 N NA
 5483382 5483383 Arad_8997 Arad_8998     TRUE 0.997 -7.000 0.500 NA Y NA
 5483383 5483384 Arad_8998 Arad_8999     TRUE 0.934 100.000 0.556 NA Y NA
 5483384 5483385 Arad_8999 Arad_9000   proC TRUE 0.892 69.000 0.207 1.000 Y NA
 5483385 5483386 Arad_9000 Arad_9001 proC   TRUE 0.867 14.000 0.194 1.000 N NA
 5483387 5483388 Arad_9002 Arad_9004     TRUE 0.694 49.000 0.171 NA   NA
 5483390 5483391 Arad_9006 Arad_9007     FALSE 0.002 269.000 0.000 1.000 N NA
 5483391 5483392 Arad_9007 Arad_9008     FALSE 0.135 97.000 0.000 NA   NA
 5483392 5483393 Arad_9008 Arad_9010     FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5483393 5483394 Arad_9010 Arad_9011     TRUE 0.673 52.000 0.167 NA   NA
 5483394 5483395 Arad_9011 Arad_9013     TRUE 0.947 17.000 0.400 NA   NA
 5483395 5483396 Arad_9013 Arad_9015     FALSE 0.013 233.000 0.000 NA   NA
 5483398 5483399 Arad_9017 Arad_9019   nerA TRUE 0.677 134.000 0.378 0.054   NA
 5483399 5483400 Arad_9019 Arad_9021 nerA   FALSE 0.013 232.000 0.000 NA   NA
 5483400 5483401 Arad_9021 Arad_9023     FALSE 0.002 484.000 0.000 NA   NA
 5483401 5483402 Arad_9023 Arad_9024     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 5483402 5483403 Arad_9024 Arad_9026     FALSE 0.002 399.000 0.000 NA   NA
 5483403 5483404 Arad_9026 Arad_9027     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 5483404 5483405 Arad_9027 Arad_9029     FALSE 0.001 881.000 0.000 NA   NA
 5483406 5483407 Arad_9031 Arad_9032     TRUE 0.963 -6.000 0.200 1.000 N NA
 5483408 5483409 Arad_9033 Arad_9035     FALSE 0.001 766.000 0.000 NA   NA
 5483409 5483410 Arad_9035 Arad_9036     TRUE 0.968 9.000 0.250 0.010   NA
 5483411 5483412 Arad_9039 Arad_9040     FALSE 0.344 33.000 0.000 NA   NA
 5483412 5483413 Arad_9040 Arad_9041     FALSE 0.105 112.000 0.000 NA   NA
 5483415 5483416 Arad_9044 Arad_9045 lacZ1   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483416 5483417 Arad_9045 Arad_9047     TRUE 0.733 68.000 0.000 NA Y NA
 5483417 5483418 Arad_9047 Arad_9048     TRUE 0.995 0.000 0.375 NA Y NA
 5483418 5483419 Arad_9048 Arad_9049     TRUE 0.939 65.000 0.375 NA Y NA
 5483420 5483421 Arad_9050 Arad_9051     FALSE 0.039 51.000 0.000 NA N NA
 5483421 5483422 Arad_9051 Arad_9052     TRUE 0.989 -3.000 0.421 NA   NA
 5483422 5483423 Arad_9052 Arad_9054   gcd FALSE 0.001 594.000 0.000 NA   NA
 5483423 5483424 Arad_9054 Arad_9055 gcd   FALSE 0.033 210.000 0.000 0.050 N NA
 5483425 5483426 Arad_9057 Arad_9058     FALSE 0.329 85.000 0.065 NA N NA
 5483427 5483428 Arad_9059 Arad_9061     TRUE 0.999 -3.000 0.952 NA Y NA
 5483428 5483429 Arad_9061 Arad_9062     FALSE 0.539 38.000 0.066 NA N NA
 5483430 5483431 Arad_9063 Arad_9064     FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 5483431 5483432 Arad_9064 Arad_9065     TRUE 0.799 31.000 0.263 NA N NA
 5483432 5483433 Arad_9065 Arad_9067     TRUE 0.914 66.000 0.158 0.018 Y NA
 5483433 5483434 Arad_9067 Arad_9068     FALSE 0.059 77.000 0.000 1.000 N NA
 5483434 5483435 Arad_9068 Arad_9069     FALSE 0.349 40.000 0.000 1.000   NA
 5483435 5483436 Arad_9069 Arad_9070     TRUE 0.803 26.000 0.154 1.000   NA
 5483436 5483437 Arad_9070 Arad_9072     TRUE 0.945 19.000 0.421 NA   NA
 5483437 5483438 Arad_9072 Arad_9073     TRUE 0.983 27.000 0.526 NA Y NA
 5483439 5483440 Arad_9075 Arad_9077     FALSE 0.498 18.000 0.000 NA   NA
 5483441 5483442 Arad_9078 Arad_9079     TRUE 0.996 5.000 0.613 NA Y NA
 5483442 5483443 Arad_9079 Arad_9080     TRUE 0.997 2.000 0.571 NA Y NA
 5483443 5483444 Arad_9080 Arad_9081     TRUE 0.825 77.000 0.094 NA Y NA
 5483444 5483445 Arad_9081 Arad_9083     TRUE 0.989 31.000 0.737 NA Y NA
 5483446 5483447 Arad_9084 Arad_9085   codAb FALSE 0.082 57.000 0.000 1.000 N NA
 5483447 5483448 Arad_9085 Arad_9086 codAb codAb TRUE 0.907 56.000 0.050 0.006 Y NA
 5483450 5483451 Arad_9090 Arad_9091     FALSE 0.338 34.000 0.000 NA   NA
 5483451 5483452 Arad_9091 Arad_9092   mdeAe TRUE 0.989 -3.000 0.478 1.000 N NA
 5483452 5483453 Arad_9092 Arad_9093 mdeAe   TRUE 0.745 45.000 0.265 NA N NA
 5483453 5483454 Arad_9093 Arad_9095     TRUE 0.943 88.000 0.529 NA Y NA
 5483454 5483455 Arad_9095 Arad_9096     TRUE 0.997 4.000 0.647 NA Y NA
 5483455 5483456 Arad_9096 Arad_9098     TRUE 0.890 50.000 0.118 NA Y NA
 5483457 5483458 Arad_9099 Arad_9100 map1   FALSE 0.078 60.000 0.000 1.000 N NA
 5483461 5483462 Arad_9104 Arad_9105     TRUE 0.995 -3.000 0.182 0.016 Y NA
 5483462 5483463 Arad_9105 Arad_9106     FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5483466 5483467 Arad_9111 Arad_9112     TRUE 0.995 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 5483467 5483468 Arad_9112 Arad_9114     TRUE 0.999 -3.000 0.812 0.016 Y NA
 5483468 5483469 Arad_9114 Arad_9116     TRUE 0.979 81.000 0.846 1.000 Y NA
 5483470 5483471 Arad_9117 Arad_9118 hutC   TRUE 0.995 -3.000 0.214 0.099 Y NA
 5483471 5483472 Arad_9118 Arad_9119     FALSE 0.413 106.000 0.214 NA N NA
 5483473 5483474 Arad_9120 Arad_9121 aspB2 speB FALSE 0.509 149.000 0.016 1.000 Y NA
 5483475 5483476 Arad_9122 Arad_9124     FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 5483476 5483477 Arad_9124 Arad_9126     TRUE 0.651 112.000 0.439 1.000 N NA
 5483478 5483479 Arad_9127 Arad_9128     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483479 5483480 Arad_9128 Arad_9129     FALSE 0.046 165.000 0.000 NA   NA
 5483480 5483481 Arad_9129 Arad_9130     FALSE 0.485 19.000 0.000 NA   NA
 5483481 5483482 Arad_9130 Arad_9131     FALSE 0.461 21.000 0.000 NA   NA
 5483482 5483483 Arad_9131 Arad_9133   pssN FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5483483 5483484 Arad_9133 Arad_9134 pssN glxA FALSE 0.083 56.000 0.000 1.000 N NA
 5483484 5483485 Arad_9134 Arad_9136 glxA   FALSE 0.000 662.000 0.000 1.000 N NA
 5483485 5483486 Arad_9136 Arad_9137     TRUE 0.761 90.000 0.036 1.000 Y NA
 5483487 5483488 Arad_9138 Arad_9140     TRUE 0.984 22.000 0.315 0.001 Y NA
 5483488 5483489 Arad_9140 Arad_9141     TRUE 0.991 -3.000 0.135 1.000 Y NA
 5483489 5483490 Arad_9141 Arad_9142   nlpE1 TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483490 5483491 Arad_9142 Arad_9143 nlpE1   FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5483494 5483495 Arad_9148 Arad_9149     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483495 5483496 Arad_9149 Arad_9152     TRUE 0.819 -22.000 0.000 NA   NA
 5483496 5483497 Arad_9152 Arad_9153     FALSE 0.054 155.000 0.000 NA   NA
 5483497 5483498 Arad_9153 Arad_9154   ropB2 FALSE 0.312 39.000 0.000 NA   NA
 5483501 5483502 Arad_9158 Arad_9160     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 5483503 5483504 Arad_9161 Arad_9162 exsI   FALSE 0.062 148.000 0.000 NA   NA
 5483504 5483505 Arad_9162 Arad_9163     FALSE 0.121 104.000 0.000 NA   NA
 5483506 5483507 Arad_9164 Arad_9165   argE TRUE 0.973 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5483507 5483508 Arad_9165 Arad_9166 argE   TRUE 0.915 101.000 0.455 1.000 Y NA
 5483508 5483509 Arad_9166 Arad_9167     TRUE 0.946 23.000 0.476 NA   NA
 5483509 5483510 Arad_9167 Arad_9168     FALSE 0.312 158.000 0.235 NA   NA
 5483510 5483511 Arad_9168 Arad_9169     TRUE 0.994 10.000 0.412 0.085 Y NA
 5483511 5483512 Arad_9169 Arad_9170   gabDf1 TRUE 0.989 21.000 0.481 0.085 Y NA
 5483515 5483516 Arad_9174 Arad_9176   dehII TRUE 0.926 14.000 0.250 1.000   NA
 5483517 5483518 Arad_9178 Arad_9179   bioA TRUE 0.921 12.000 0.200 1.000   NA
 5483518 5483519 Arad_9179 Arad_9180 bioA   FALSE 0.164 221.000 0.300 1.000   NA
 5483519 5483520 Arad_9180 Arad_9181     TRUE 0.787 75.000 0.375 NA   NA
 5483520 5483521 Arad_9181 Arad_9182     TRUE 0.915 97.000 0.450 NA Y NA
 5483521 5483522 Arad_9182 Arad_9183     TRUE 0.999 3.000 0.900 NA Y NA
 5483522 5483523 Arad_9183 Arad_9184     TRUE 0.997 -3.000 0.900 NA   NA
 5483525 5483526 Arad_9188 Arad_9189     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA N NA
 5483526 5483527 Arad_9189 Arad_9190     TRUE 0.999 -6.000 0.833 NA Y NA
 5483528 5483529 Arad_9192 Arad_9193     FALSE 0.246 56.000 0.000 NA   NA
 5483529 5483530 Arad_9193 Arad_9194   fhuA TRUE 0.864 29.000 0.000 1.000 Y NA
 5483531 5483532 Arad_9196 Arad_9197     FALSE 0.151 100.000 0.000 1.000   NA
 5483533 5483534 Arad_9198 Arad_9199     FALSE 0.473 132.000 0.000 NA Y NA
 5483534 5483535 Arad_9199 Arad_9201     FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5483538 5483539 Arad_9204 Arad_9205     TRUE 0.993 2.000 0.810 1.000 N NA
 5483539 5483540 Arad_9205 Arad_9206     TRUE 0.991 6.000 0.839 NA N NA
 5483540 5483541 Arad_9206 Arad_9207     TRUE 0.998 5.000 0.820 NA Y NA
 5483542 5483543 Arad_9208 Arad_9210   dctA FALSE 0.020 220.000 0.000 1.000   NA
 5483544 5483545 Arad_9211 Arad_9212 dctB dctD FALSE 0.207 423.000 0.615 1.000 Y NA
 5483545 5483546 Arad_9212 Arad_9214 dctD   FALSE 0.023 135.000 0.000 1.000 N NA
 5483547 5483548 Arad_9215 Arad_9216     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 5483548 5483549 Arad_9216 Arad_9217     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 5483549 5483550 Arad_9217 Arad_9218     TRUE 0.819 -22.000 0.000 NA   NA
 5483551 5483552 Arad_9219 Arad_9220 thiM thiEe TRUE 0.995 -3.000 0.146 0.005 Y NA
 5483552 5483553 Arad_9220 Arad_9221 thiEe thiD TRUE 0.994 -3.000 0.109 0.005 Y NA
 5483553 5483554 Arad_9221 Arad_9222 thiD   TRUE 0.906 -3.000 0.030 1.000 N NA
 5483555 5483556 Arad_9223 Arad_9224 phnA   FALSE 0.055 81.000 0.000 1.000 N NA
 5483556 5483557 Arad_9224 Arad_9226     FALSE 0.131 99.000 0.000 NA   NA
 5483557 5483558 Arad_9226 Arad_9228     FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 5483559 5483560 Arad_9230 Arad_9231 rbcL   TRUE 0.984 6.000 0.541 NA   NA
 5483560 5483561 Arad_9231 Arad_9232     FALSE 0.475 97.000 0.162 NA   NA
 5483561 5483562 Arad_9232 Arad_9233     TRUE 0.737 78.000 0.320 NA   NA
 5483562 5483563 Arad_9233 Arad_9235     TRUE 0.873 70.000 0.520 NA   NA
 5483563 5483564 Arad_9235 Arad_9236     TRUE 0.993 -3.000 0.542 NA   NA
 5483564 5483565 Arad_9236 Arad_9237     TRUE 0.996 -3.000 0.793 NA   NA
 5483565 5483566 Arad_9237 Arad_9238     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 5483566 5483567 Arad_9238 Arad_9239     TRUE 0.985 0.000 0.433 NA   NA
 5483567 5483568 Arad_9239 Arad_9240     TRUE 0.797 41.000 0.250 NA   NA
 5483568 5483569 Arad_9240 Arad_9241     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 5483569 5483570 Arad_9241 Arad_9242     TRUE 0.917 83.000 0.375 NA Y NA
 5483570 5483571 Arad_9242 Arad_9244     TRUE 0.969 105.000 0.875 NA Y NA
 5483571 5483572 Arad_9244 Arad_9246     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 5483572 5483573 Arad_9246 Arad_9247     TRUE 0.886 35.000 0.375 NA   NA
 5483573 5483574 Arad_9247 Arad_9248     TRUE 0.977 25.000 0.800 1.000   NA
 5483575 5483576 Arad_9249 Arad_9250     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5483576 5483577 Arad_9250 Arad_9252     FALSE 0.001 695.000 0.000 NA   NA
 5483577 5483578 Arad_9252 Arad_9253     TRUE 0.903 62.000 0.211 1.000 Y NA
 5483578 5483579 Arad_9253 Arad_9254   glnH TRUE 0.942 93.000 0.538 1.000 Y NA
 5483584 5483585 Arad_9259 Arad_9260     TRUE 0.986 8.000 0.608 1.000   NA
 5483585 5483586 Arad_9260 Arad_9261     TRUE 0.968 13.000 0.081 1.000 Y NA
 5483586 5483587 Arad_9261 Arad_9262     FALSE 0.143 29.000 0.000 1.000 N NA
 5483587 5483588 Arad_9262 Arad_9264     TRUE 0.919 7.000 0.069 0.028 N NA
 5483588 5483589 Arad_9264 Arad_9265     FALSE 0.248 130.000 0.138 NA N NA
 5483589 5483590 Arad_9265 Arad_9267     TRUE 0.829 98.000 0.227 NA Y NA
 5483590 5483591 Arad_9267 Arad_9268     TRUE 0.995 -3.000 0.318 NA Y NA
 5483591 5483592 Arad_9268 Arad_9270     TRUE 0.823 -13.000 0.000 NA   NA
 5483594 5483595 Arad_9272 Arad_9273     TRUE 0.936 16.000 0.333 NA   NA
 5483596 5483597 Arad_9274 Arad_9276     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 5483597 5483598 Arad_9276 Arad_9277     TRUE 0.983 4.000 0.477 NA   NA
 5483600 5483601 Arad_9280 Arad_9281 nodTch   TRUE 0.754 57.000 0.312 1.000 N NA
 5483601 5483602 Arad_9281 Arad_9282     TRUE 0.993 10.000 1.000 1.000 N NA
 5483603 5483604 Arad_9283 Arad_9284     TRUE 0.982 6.000 0.143 1.000 Y NA
 5483608 5483609 Arad_9289 Arad_9290   hmuU TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 5483609 5483610 Arad_9290 Arad_9291 hmuU   TRUE 0.992 -3.000 0.182 NA Y NA
 5483610 5483611 Arad_9291 Arad_9292     TRUE 0.979 9.000 0.156 NA Y NA
 5483611 5483612 Arad_9292 Arad_9293     FALSE 0.531 93.000 0.242 1.000 N NA
 5483612 5483613 Arad_9293 Arad_9294     FALSE 0.246 56.000 0.000 NA   NA
 5483613 5483614 Arad_9294 Arad_9295     FALSE 0.055 154.000 0.000 NA   NA
 5483614 5483615 Arad_9295 Arad_9296     TRUE 0.953 31.000 0.250 1.000 Y NA
 5483615 5483616 Arad_9296 Arad_9297     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.016 Y NA
 5483616 5483617 Arad_9297 Arad_9298     TRUE 0.997 11.000 0.789 1.000 Y NA
 5483617 5483618 Arad_9298 Arad_9299     TRUE 0.943 12.000 0.273 1.000   NA
 5483618 5483619 Arad_9299 Arad_9300     TRUE 0.776 67.000 0.318 NA   NA
 5483621 5483622 Arad_9304 Arad_9305     TRUE 0.947 0.000 0.133 NA   NA
 5483622 5483623 Arad_9305 Arad_9306     TRUE 0.962 2.000 0.238 NA   NA
 5483623 5483624 Arad_9306 Arad_9308     TRUE 0.933 9.000 0.267 NA N NA
 5483627 5483628 Arad_9311 Arad_9313   dppCf TRUE 0.991 -3.000 0.467 NA   NA
 5483628 5483629 Arad_9313 Arad_9314 dppCf   TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA Y NA
 5483629 5483630 Arad_9314 Arad_9315     TRUE 0.997 2.000 0.556 NA Y NA
 5483630 5483631 Arad_9315 Arad_9316     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 5483631 5483632 Arad_9316 Arad_9318     FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5483632 5483633 Arad_9318 Arad_9319     FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5483633 5483634 Arad_9319 Arad_9321     FALSE 0.032 112.000 0.000 1.000 N NA
 5483635 5483636 Arad_9323 Arad_9324   ugpBc FALSE 0.070 275.000 0.000 NA Y NA
 5483636 5483637 Arad_9324 Arad_9326 ugpBc ugpAc TRUE 0.980 68.000 0.793 NA Y NA
 5483637 5483638 Arad_9326 Arad_9327 ugpAc ugpEc TRUE 0.994 10.000 0.559 NA Y NA
 5483638 5483639 Arad_9327 Arad_9328 ugpEc ugpCc TRUE 0.996 0.000 0.464 NA Y NA
 5483639 5483640 Arad_9328 Arad_9331 ugpCc   FALSE 0.009 142.000 0.000 NA N NA
 5483640 5483641 Arad_9331 Arad_9333   pit TRUE 0.996 -3.000 0.396 NA Y NA
 5483641 5483642 Arad_9333 Arad_9335 pit   FALSE 0.000 482.000 0.000 NA N NA
 5483642 5483643 Arad_9335 Arad_9336     TRUE 0.980 69.000 0.800 NA Y NA
 5483643 5483644 Arad_9336 Arad_9337   dppCch1 TRUE 0.999 -3.000 0.850 NA Y NA
 5483644 5483645 Arad_9337 Arad_9338 dppCch1   TRUE 0.979 7.000 0.471 NA   NA
 5483645 5483646 Arad_9338 Arad_9339   bioA TRUE 0.615 41.000 0.040 1.000   NA
 5483646 5483647 Arad_9339 Arad_9340 bioA gatA1 TRUE 0.701 17.000 0.040 1.000 N NA
 5483647 5483648 Arad_9340 Arad_9341 gatA1   FALSE 0.297 115.000 0.056 NA   NA
 5483648 5483649 Arad_9341 Arad_9343     TRUE 0.980 33.000 1.000 NA   NA
 5483649 5483650 Arad_9343 Arad_9344     FALSE 0.004 230.000 0.000 1.000 N NA
 5483651 5483652 Arad_9345 Arad_9346 dppCch1   TRUE 0.982 50.000 0.725 NA Y NA
 5483652 5483653 Arad_9346 Arad_9347     TRUE 0.804 75.000 0.042 NA Y NA
 5483655 5483656 Arad_9350 Arad_9351     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5483656 5483657 Arad_9351 Arad_9353     TRUE 0.621 31.000 0.000 0.053   NA
 5483657 5483658 Arad_9353 Arad_9355   braG TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5483658 5483659 Arad_9355 Arad_9356 braG braF TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.050 Y NA
 5483659 5483660 Arad_9356 Arad_9357 braF braE TRUE 0.980 -7.000 0.000 NA Y NA
 5483660 5483661 Arad_9357 Arad_9358 braE braD TRUE 0.977 4.000 0.033 NA Y NA
 5483661 5483662 Arad_9358 Arad_9359 braD   TRUE 0.987 -3.000 0.033 NA Y NA
 5483662 5483663 Arad_9359 Arad_9360     FALSE 0.012 118.000 0.000 NA N NA
 5483663 5483664 Arad_9360 Arad_9362     FALSE 0.057 33.000 0.000 NA N NA
 5483665 5483666 Arad_9363 Arad_9364   ampR FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5483667 5483668 Arad_9365 Arad_9366     TRUE 0.995 -3.000 0.296 NA Y NA
 5483668 5483669 Arad_9366 Arad_9368     TRUE 0.989 -3.000 0.417 NA   NA
 5483669 5483670 Arad_9368 Arad_9369   oxyR FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 5483674 5483675 Arad_9373 Arad_9375 exsH   FALSE 0.311 49.000 0.000 1.000   NA
 5483675 5483676 Arad_9375 Arad_9376     FALSE 0.164 176.000 0.200 1.000 N NA
 5483677 5483678 Arad_9378 Arad_9379     FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5483679 5483680 Arad_9380 Arad_9381 pssF pssP FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5483680 5483681 Arad_9381 Arad_9382 pssP   TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5483681 5483682 Arad_9382 Arad_9384     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483682 5483683 Arad_9384 Arad_9385     FALSE 0.099 117.000 0.000 NA   NA
 5483683 5483684 Arad_9385 Arad_9388   exoY FALSE 0.005 168.000 0.000 NA N NA
 5483685 5483686 Arad_9389 Arad_9390     FALSE 0.054 165.000 0.000 1.000   NA
 5483686 5483687 Arad_9390 Arad_9391   exoF1 TRUE 0.835 37.000 0.000 1.000 Y NA
 5483688 5483689 Arad_9393 Arad_9394     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 5483689 5483690 Arad_9394 Arad_9395     FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5483692 5483693 Arad_9398 Arad_9399 feuQ feuP TRUE 0.999 -3.000 0.963 1.000 Y NA
 5483693 5483694 Arad_9399 Arad_9400 feuP   TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5483698 5483699 Arad_9405 Arad_9406     TRUE 0.993 5.000 0.414 1.000 Y NA
 5483699 5483700 Arad_9406 Arad_9407     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5483701 5483702 Arad_9408 Arad_9410     TRUE 0.785 131.000 0.667 NA   NA
 5483702 5483703 Arad_9410 Arad_9411     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483703 5483704 Arad_9411 Arad_9414     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 5483706 5483707 Arad_9417 Arad_9418     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 5483707 5483708 Arad_9418 Arad_9420     FALSE 0.002 424.000 0.000 NA   NA
 5483710 5483711 Arad_9422 Arad_9423     FALSE 0.075 25.000 0.000 NA N NA
 5483711 5483712 Arad_9423 Arad_9424     TRUE 0.974 101.000 0.941 NA Y NA
 5483712 5483713 Arad_9424 Arad_9425   rbsCch4 TRUE 0.999 -7.000 0.941 NA Y NA
 5483713 5483714 Arad_9425 Arad_9426 rbsCch4   TRUE 0.999 -7.000 0.938 NA Y NA
 5483714 5483715 Arad_9426 Arad_9427     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5483715 5483716 Arad_9427 Arad_9428     TRUE 0.968 23.000 0.273 1.000 Y NA
 5483717 5483718 Arad_9431 Arad_9432     FALSE 0.220 154.000 0.200 NA N NA
 5483718 5483719 Arad_9432 Arad_9433     TRUE 0.745 63.000 0.333 NA N NA
 5483719 5483720 Arad_9433 Arad_9434     TRUE 0.968 14.000 0.125 1.000 Y NA
 5483720 5483721 Arad_9434 Arad_9435     TRUE 0.989 5.000 0.148 0.016 Y NA
 5483721 5483722 Arad_9435 Arad_9436     TRUE 0.978 63.000 0.706 1.000 Y NA
 5483722 5483723 Arad_9436 Arad_9437     FALSE 0.001 320.000 0.000 1.000 N NA
 5483724 5483725 Arad_9438 Arad_9439     TRUE 0.856 24.000 0.276 1.000 N NA
 5483725 5483726 Arad_9439 Arad_9440     TRUE 0.695 39.000 0.194 1.000 N NA
 5483726 5483727 Arad_9440 Arad_9441     TRUE 0.969 -3.000 0.194 NA   NA
 5483727 5483728 Arad_9441 Arad_9442     TRUE 0.793 21.000 0.088 NA   NA
 5483728 5483729 Arad_9442 Arad_9443     FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 5483730 5483731 Arad_9445 Arad_9446     TRUE 0.994 -3.000 0.083 0.013 Y NA
 5483731 5483732 Arad_9446 Arad_9447     TRUE 0.984 12.000 0.167 0.013 Y NA
 5483732 5483733 Arad_9447 Arad_9449   mctS TRUE 0.996 -3.000 0.261 0.015 Y NA
 5483735 5483736 Arad_9452 Arad_9453     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.011 Y NA
 5483736 5483737 Arad_9453 Arad_9454     TRUE 0.997 4.000 0.714 NA Y NA
 5483737 5483738 Arad_9454 Arad_9455     TRUE 0.998 4.000 0.833 NA Y NA
 5483738 5483739 Arad_9455 Arad_9456     TRUE 0.897 118.000 0.500 NA Y NA
 5483739 5483740 Arad_9456 Arad_9457     FALSE 0.114 211.000 0.250 NA N NA
 5483740 5483741 Arad_9457 Arad_9458   celI FALSE 0.061 227.000 0.167 1.000 N NA
 5483741 5483742 Arad_9458 Arad_9459 celI   FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5483743 5483744 Arad_9462 Arad_9463 kdpA kdpB FALSE 0.446 221.000 0.201 0.001 Y NA
 5483744 5483745 Arad_9463 Arad_9464 kdpB kdpC TRUE 0.998 13.000 0.877 0.001 Y NA
 5483745 5483746 Arad_9464 Arad_9466 kdpC kdpD FALSE 0.506 62.000 0.106 1.000 N NA
 5483746 5483747 Arad_9466 Arad_9467 kdpD kdpE TRUE 0.999 -3.000 0.695 1.000 Y NA
 5483747 5483748 Arad_9467 Arad_9468 kdpE ptsNe TRUE 0.984 5.000 0.169 1.000 Y NA
 5483748 5483749 Arad_9468 Arad_9469 ptsNe   FALSE 0.013 163.000 0.000 1.000 N NA
 5483749 5483750 Arad_9469 Arad_9470   cysT TRUE 0.912 7.000 0.026 0.001 N NA
 5483750 5483751 Arad_9470 Arad_9472 cysT cysW TRUE 0.998 -10.000 0.935 0.000 N NA
 5483751 5483752 Arad_9472 Arad_9473 cysW   TRUE 0.963 12.000 0.025 1.000 Y NA
 5483753 5483754 Arad_9474 Arad_9475     FALSE 0.062 157.000 0.000 1.000   NA
 5483754 5483755 Arad_9475 Arad_9477     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5483755 5483756 Arad_9477 Arad_9478   cls FALSE 0.335 123.000 0.121 NA   NA
 5483757 5483758 Arad_9480 Arad_9483     FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 5483758 5483759 Arad_9483 Arad_9486   gste FALSE 0.061 149.000 0.000 NA   NA
 5483759 5483760 Arad_9486 Arad_9487 gste   TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5483761 5483762 Arad_9488 Arad_9489     FALSE 0.055 81.000 0.000 1.000 N NA
 5483762 5483763 Arad_9489 Arad_9490   pcaF FALSE 0.380 154.000 0.000 1.000 Y NA
 5483763 5483764 Arad_9490 Arad_9491 pcaF pcaJ TRUE 0.994 11.000 0.517 1.000 Y NA
 5483764 5483765 Arad_9491 Arad_9494 pcaJ pcaI TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.001 Y NA
 5483770 5483771 Arad_9500 Arad_9502 pcaD pcaC TRUE 0.995 -7.000 0.636 1.000   NA
 5483771 5483772 Arad_9502 Arad_9503 pcaC pcaH TRUE 0.869 13.000 0.080 1.000   NA
 5483772 5483773 Arad_9503 Arad_9504 pcaH pcaG TRUE 0.999 -3.000 0.782 0.000 Y NA
 5483773 5483774 Arad_9504 Arad_9505 pcaG pcaB TRUE 0.960 4.000 0.314 1.000 N NA
 5483774 5483775 Arad_9505 Arad_9506 pcaB   FALSE 0.106 153.000 0.028 1.000 N NA
 5483775 5483776 Arad_9506 Arad_9507     TRUE 0.964 112.000 0.867 NA Y NA
 5483776 5483777 Arad_9507 Arad_9508     TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 5483777 5483778 Arad_9508 Arad_9509     TRUE 0.999 -3.000 0.824 NA Y NA
 5483778 5483779 Arad_9509 Arad_9510     TRUE 0.999 -19.000 0.824 0.050 Y NA
 5483781 5483782 Arad_9512 Arad_9513     FALSE 0.042 232.000 0.000 0.013   NA
 5483783 5483784 Arad_9514 Arad_9516     TRUE 0.961 -10.000 0.111 1.000   NA
 5483785 5483786 Arad_9517 Arad_9518 cyaCe   FALSE 0.367 30.000 0.000 NA   NA
 5483788 5483789 Arad_9522 Arad_9523   cyaA FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 5483789 5483790 Arad_9523 Arad_9524 cyaA   FALSE 0.367 162.000 0.292 1.000   NA
 5483790 5483791 Arad_9524 Arad_9525     TRUE 0.996 -6.000 0.741 NA   NA
 5483791 5483792 Arad_9525 Arad_9526     TRUE 0.999 -7.000 0.821 NA Y NA
 5483792 5483793 Arad_9526 Arad_9527     TRUE 0.946 81.000 0.929 NA   NA
 5483793 5483794 Arad_9527 Arad_9528   redA TRUE 0.576 75.000 0.158 NA   NA
 5483794 5483795 Arad_9528 Arad_9529 redA redB TRUE 0.973 18.000 0.614 1.000   NA
 5483795 5483796 Arad_9529 Arad_9530 redB   TRUE 0.984 -18.000 0.318 1.000   NA
 5483796 5483797 Arad_9530 Arad_9531     FALSE 0.052 238.000 0.068 1.000   NA
 5483797 5483798 Arad_9531 Arad_9532     TRUE 0.627 52.000 0.186 1.000 N NA
 5483798 5483799 Arad_9532 Arad_9534     FALSE 0.050 87.000 0.000 1.000 N NA
 5483799 5483800 Arad_9534 Arad_9535     FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 5483801 5483802 Arad_9536 Arad_9538   agaL2 FALSE 0.037 184.000 0.000 1.000   NA
 5483802 5483803 Arad_9538 Arad_9539 agaL2   TRUE 0.958 18.000 0.464 1.000   NA
 5483803 5483804 Arad_9539 Arad_9540     TRUE 0.989 14.000 0.857 NA   NA
 5483804 5483805 Arad_9540 Arad_9543     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5483805 5483806 Arad_9543 Arad_9544   agpA TRUE 0.933 152.000 0.867 NA Y NA
 5483806 5483807 Arad_9544 Arad_9545 agpA agaL1 FALSE 0.449 141.000 0.348 NA N NA
 5483808 5483809 Arad_9546 Arad_9548   lacZ2 FALSE 0.002 287.000 0.000 1.000 N NA
 5483809 5483810 Arad_9548 Arad_9549 lacZ2   FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 5483812 5483813 Arad_9551 Arad_9552     TRUE 0.588 89.000 0.273 1.000 N NA
 5483813 5483814 Arad_9552 Arad_9553     FALSE 0.004 181.000 0.000 NA N NA
 5483814 5483815 Arad_9553 Arad_9554     TRUE 0.812 93.000 0.171 NA Y NA
 5483815 5483816 Arad_9554 Arad_9556     TRUE 0.784 32.000 0.195 NA   NA
 5483817 5483818 Arad_9558 Arad_9559   exoZ FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 5483818 5483819 Arad_9559 Arad_9561 exoZ   TRUE 0.947 -3.000 0.150 NA N NA
 5483819 5483820 Arad_9561 Arad_9562   exoF2 TRUE 0.991 10.000 0.400 NA Y NA
 5483820 5483821 Arad_9562 Arad_9563 exoF2 exoY TRUE 0.957 84.000 0.611 NA Y NA
 5483822 5483823 Arad_9564 Arad_9565 exoX exoU FALSE 0.152 90.000 0.000 NA   NA
 5483824 5483825 Arad_9566 Arad_9567 exoV exoW FALSE 0.475 86.000 0.100 NA   NA
 5483826 5483827 Arad_9569 Arad_9570 exoT exoH FALSE 0.003 400.000 0.000 1.000   NA
 5483827 5483828 Arad_9570 Arad_9571 exoH exoK TRUE 0.960 4.000 0.250 1.000   NA
 5483828 5483829 Arad_9571 Arad_9573 exoK exoL TRUE 0.594 65.000 0.129 NA   NA
 5483829 5483830 Arad_9573 Arad_9574 exoL exoA TRUE 0.963 -3.000 0.143 NA   NA
 5483830 5483831 Arad_9574 Arad_9575 exoA exoM TRUE 0.963 -3.000 0.143 NA   NA
 5483831 5483832 Arad_9575 Arad_9576 exoM exoO TRUE 0.980 -3.000 0.280 NA   NA
 5483832 5483833 Arad_9576 Arad_9577 exoO exoN TRUE 0.992 5.000 0.357 NA Y NA
 5483833 5483834 Arad_9577 Arad_9578 exoN exoP TRUE 0.915 84.000 0.357 1.000 Y NA
 5483835 5483836 Arad_9579 Arad_9580     FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 5483836 5483837 Arad_9580 Arad_9582   mocFe FALSE 0.172 82.000 0.000 NA   NA
 5483837 5483838 Arad_9582 Arad_9583 mocFe mocEe TRUE 0.988 11.000 0.727 NA   NA
 5483838 5483839 Arad_9583 Arad_9584 mocEe mocD TRUE 0.975 32.000 1.000 NA N NA
 5483840 5483841 Arad_9585 Arad_9586     FALSE 0.538 160.000 0.119 NA Y NA
 5483842 5483843 Arad_9587 Arad_9589 nikR cobM FALSE 0.065 72.000 0.000 1.000 N NA
 5483843 5483844 Arad_9589 Arad_9591 cobM cobL TRUE 0.964 17.000 0.016 0.006 Y NA
 5483846 5483847 Arad_9593 Arad_9594 cobJ cobI TRUE 0.994 -18.000 0.138 0.006 Y NA
 5483847 5483848 Arad_9594 Arad_9595 cobI cobH TRUE 0.995 -3.000 0.191 0.006 Y NA
 5483848 5483849 Arad_9595 Arad_9596 cobH cobG TRUE 0.952 3.000 0.255 1.000 N NA
 5483849 5483850 Arad_9596 Arad_9597 cobG cobF FALSE 0.116 169.000 0.082 1.000 N NA
 5483850 5483851 Arad_9597 Arad_9599 cobF   FALSE 0.192 75.000 0.000 NA   NA
 5483851 5483852 Arad_9599 Arad_9600     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 5483852 5483853 Arad_9600 Arad_9601   putR FALSE 0.095 134.000 0.000 1.000   NA
 5483855 5483856 Arad_9604 Arad_9605   hydA TRUE 0.946 -3.000 0.053 NA   NA
 5483856 5483857 Arad_9605 Arad_9606 hydA   TRUE 0.945 -3.000 0.118 1.000 N NA
 5483857 5483858 Arad_9606 Arad_9607   ooxA TRUE 0.989 -3.000 0.429 1.000   NA
 5483858 5483859 Arad_9607 Arad_9608 ooxA dapA TRUE 0.932 11.000 0.211 1.000   NA
 5483859 5483860 Arad_9608 Arad_9609 dapA   TRUE 0.959 17.000 0.105 1.000 Y NA
 5483860 5483861 Arad_9609 Arad_9611     TRUE 0.954 73.000 0.500 1.000 Y NA
 5483861 5483862 Arad_9611 Arad_9612     FALSE 0.494 112.000 0.286 1.000 N NA
 5483864 5483865 Arad_9614 Arad_9616 xylG   TRUE 0.979 -7.000 0.263 NA   NA
 5483865 5483866 Arad_9616 Arad_9618     FALSE 0.420 108.000 0.158 NA   NA
 5483866 5483867 Arad_9618 Arad_9619     FALSE 0.119 232.000 0.000 NA Y NA
 5483867 5483868 Arad_9619 Arad_9621     TRUE 0.998 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 5483869 5483870 Arad_9622 Arad_9623     TRUE 0.572 16.000 0.000 1.000   NA
 5483871 5483872 Arad_9624 Arad_9625     TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA Y NA
 5483874 5483875 Arad_9627 Arad_9628     TRUE 0.857 21.000 0.190 1.000   NA
 5483876 5483877 Arad_9629 Arad_9630 thuE thuF TRUE 0.993 2.000 0.333 NA Y NA
 5483877 5483878 Arad_9630 Arad_9631 thuF thuG TRUE 0.987 -3.000 0.021 NA Y NA
 5483878 5483879 Arad_9631 Arad_9632 thuG   TRUE 0.958 5.000 0.000 NA Y NA
 5483879 5483880 Arad_9632 Arad_9633     TRUE 0.898 12.000 0.154 NA   NA
 5483880 5483881 Arad_9633 Arad_9634     TRUE 0.997 -3.000 0.889 NA   NA
 5483881 5483882 Arad_9634 Arad_9635     TRUE 0.993 -3.000 0.556 NA   NA
 5483882 5483883 Arad_9635 Arad_9636   rpe TRUE 0.982 -3.000 0.308 NA   NA
 5483883 5483884 Arad_9636 Arad_9637 rpe   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483884 5483885 Arad_9637 Arad_9638     TRUE 0.981 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5483885 5483886 Arad_9638 Arad_9639     FALSE 0.234 121.000 0.000 0.049   NA
 5483886 5483887 Arad_9639 Arad_9640     FALSE 0.009 271.000 0.000 1.000   NA
 5483887 5483888 Arad_9640 Arad_9641     TRUE 0.774 25.000 0.088 1.000   NA
 5483888 5483889 Arad_9641 Arad_9642     TRUE 0.956 3.000 0.088 0.052   NA
 5483889 5483890 Arad_9642 Arad_9643     TRUE 0.881 80.000 0.250 NA Y NA
 5483890 5483891 Arad_9643 Arad_9644   appB TRUE 0.971 82.000 0.750 NA Y NA
 5483891 5483892 Arad_9644 Arad_9645 appB appC TRUE 0.997 11.000 0.800 NA Y NA
 5483892 5483893 Arad_9645 Arad_9647 appC   TRUE 0.977 9.000 0.125 NA Y NA
 5483894 5483895 Arad_9648 Arad_9649 rtlK   TRUE 0.971 3.000 0.306 1.000   NA
 5483895 5483896 Arad_9649 Arad_9651     TRUE 0.881 37.000 0.375 NA   NA
 5483896 5483897 Arad_9651 Arad_9652     TRUE 0.993 -3.000 0.565 NA   NA
 5483897 5483898 Arad_9652 Arad_9653     TRUE 0.843 90.000 0.565 NA   NA
 5483898 5483899 Arad_9653 Arad_9654     FALSE 0.002 213.000 0.000 NA N NA
 5483899 5483900 Arad_9654 Arad_9656   mcpCf FALSE 0.004 231.000 0.000 1.000 N NA
 5483900 5483901 Arad_9656 Arad_9657 mcpCf   FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5483901 5483902 Arad_9657 Arad_9658     FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 5483903 5483904 Arad_9660 Arad_9661     TRUE 0.996 16.000 0.852 NA Y NA
 5483904 5483905 Arad_9661 Arad_9664     TRUE 0.985 44.000 0.741 NA Y NA
 5483906 5483907 Arad_9666 Arad_9668     FALSE 0.115 196.000 0.125 NA   NA
 5483907 5483908 Arad_9668 Arad_9669     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 5483908 5483909 Arad_9669 Arad_9671   idnO TRUE 0.674 140.000 0.167 1.000 Y NA
 5483910 5483911 Arad_9672 Arad_9673   idnD TRUE 0.938 11.000 0.300 1.000 N NA
 5483914 5483915 Arad_9677 Arad_9679     FALSE 0.331 44.000 0.000 1.000   NA
 5483915 5483916 Arad_9679 Arad_9680     TRUE 0.998 -7.000 1.000 NA   NA
 5483916 5483917 Arad_9680 Arad_9681     TRUE 0.991 -3.000 0.136 NA Y NA
 5483917 5483918 Arad_9681 Arad_9683     FALSE 0.403 188.000 0.136 NA Y NA
 5483918 5483919 Arad_9683 Arad_9685   hipO FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5483920 5483921 Arad_9686 Arad_9687     TRUE 0.661 164.000 0.750 NA N NA
 5483921 5483922 Arad_9687 Arad_9688   fhuA FALSE 0.510 120.000 0.000 NA Y NA
 5483922 5483923 Arad_9688 Arad_9689 fhuA   TRUE 0.973 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5483923 5483924 Arad_9689 Arad_9690     TRUE 0.711 73.000 0.000 NA Y NA
 5483925 5483926 Arad_9691 Arad_9692     FALSE 0.002 519.000 0.000 NA   NA
 5483926 5483927 Arad_9692 Arad_9693     TRUE 0.772 177.000 1.000 NA   NA
 5483927 5483928 Arad_9693 Arad_9694     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5483930 5483931 Arad_9696 Arad_9697 dppFch2 dppDch2 TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.049 Y NA
 5483931 5483932 Arad_9697 Arad_9699 dppDch2 dppCch2 TRUE 0.997 -13.000 0.500 NA Y NA
 5483932 5483933 Arad_9699 Arad_9700 dppCch2 dppBch2 TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 5483933 5483934 Arad_9700 Arad_9701 dppBch2 dppAch2 TRUE 0.993 21.000 0.750 NA Y NA
 5483935 5483936 Arad_9702 Arad_9703   uxuAch TRUE 0.883 35.000 0.429 1.000 N NA
 5483936 5483937 Arad_9703 Arad_9704 uxuAch   TRUE 0.576 39.000 0.078 1.000 N NA
 5483937 5483938 Arad_9704 Arad_9705     FALSE 0.029 71.000 0.000 NA N NA
 5483939 5483940 Arad_9706 Arad_9707   braG TRUE 0.693 30.000 0.138 1.000 N NA
 5483940 5483941 Arad_9707 Arad_9708 braG   TRUE 0.924 90.000 0.444 NA Y NA
 5483941 5483942 Arad_9708 Arad_9709   braE TRUE 0.931 103.000 0.556 NA Y NA
 5483942 5483943 Arad_9709 Arad_9710 braE braD TRUE 0.999 -3.000 0.818 NA Y NA
 5483945 5483946 Arad_9713 Arad_9714 ssuD   FALSE 0.021 439.000 0.000 1.000 Y NA
 5483946 5483947 Arad_9714 Arad_9717     FALSE 0.001 380.000 0.000 1.000 N NA
 5483947 5483948 Arad_9717 Arad_9718     TRUE 0.999 -3.000 0.815 NA Y NA
 5483948 5483949 Arad_9718 Arad_9719     TRUE 0.998 2.000 0.852 NA Y NA
 5483949 5483950 Arad_9719 Arad_9721     TRUE 0.822 117.000 0.304 NA Y NA
 5483950 5483951 Arad_9721 Arad_9723     TRUE 0.867 40.000 0.357 NA   NA
 5483951 5483952 Arad_9723 Arad_9724   dhaS TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 5483952 5483953 Arad_9724 Arad_9725 dhaS   TRUE 0.995 6.000 0.548 NA Y NA
 5483953 5483954 Arad_9725 Arad_9726     TRUE 0.990 -3.000 0.452 NA   NA
 5483954 5483955 Arad_9726 Arad_9727     TRUE 0.979 -3.000 0.273 NA   NA
 5483955 5483956 Arad_9727 Arad_9728     TRUE 0.969 18.000 0.582 NA   NA
 5483956 5483957 Arad_9728 Arad_9730     FALSE 0.003 368.000 0.000 NA   NA
 5483957 5483958 Arad_9730 Arad_9732   exsD FALSE 0.010 176.000 0.000 1.000 N NA
 5483958 5483959 Arad_9732 Arad_9733 exsD exsB FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 5483959 5483960 Arad_9733 Arad_9735 exsB   FALSE 0.041 169.000 0.000 NA   NA
 5483961 5483962 Arad_9736 Arad_9738     FALSE 0.004 222.000 0.000 1.000 N NA
 5483962 5483963 Arad_9738 Arad_9739     FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 5483963 5483964 Arad_9739 Arad_9740   ilvE FALSE 0.060 150.000 0.000 NA   NA
 5483965 5483966 Arad_9741 Arad_9743     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 5483966 5483967 Arad_9743 Arad_9745   bglSf FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5483967 5483968 Arad_9745 Arad_9746 bglSf floR FALSE 0.195 74.000 0.000 NA   NA
 5483971 5483972 Arad_9752 Arad_9753     TRUE 0.818 74.000 0.000 0.001 Y NA
 5483974 5483975 Arad_9755 Arad_9757     FALSE 0.003 254.000 0.000 1.000 N NA
 5483976 5483977 Arad_9758 Arad_9759     FALSE 0.447 26.000 0.000 1.000   NA
 5483977 5483978 Arad_9759 Arad_9760     TRUE 0.965 14.000 0.105 NA Y NA
 5483978 5483979 Arad_9760 Arad_9761     TRUE 0.999 -3.000 0.897 NA Y NA
 5483979 5483980 Arad_9761 Arad_9763     TRUE 0.975 64.000 0.674 NA Y NA
 5483980 5483981 Arad_9763 Arad_9764   aglR FALSE 0.416 55.000 0.047 NA N NA
 5483982 5483983 Arad_9765 Arad_9766   appA TRUE 0.990 -3.000 0.533 NA N NA
 5483983 5483984 Arad_9766 Arad_9767 appA appB TRUE 0.962 67.000 0.533 NA Y NA
 5483984 5483985 Arad_9767 Arad_9768 appB appC TRUE 0.998 4.000 0.778 NA Y NA
 5483985 5483986 Arad_9768 Arad_9769 appC dapAch1 TRUE 0.967 20.000 0.242 NA Y NA
 5483986 5483987 Arad_9769 Arad_9770 dapAch1 appD TRUE 0.991 -3.000 0.109 1.000 Y NA
 5483987 5483988 Arad_9770 Arad_9771 appD appF TRUE 0.997 1.000 0.436 0.005 Y NA
 5483988 5483989 Arad_9771 Arad_9772 appF   FALSE 0.075 64.000 0.000 1.000 N NA
 5483990 5483991 Arad_9773 Arad_9774     TRUE 0.910 3.000 0.054 NA   NA
 5483991 5483992 Arad_9774 Arad_9776     TRUE 0.551 75.000 0.130 NA   NA
 5483992 5483993 Arad_9776 Arad_9777     TRUE 0.967 -3.000 0.174 NA   NA
 5483993 5483994 Arad_9777 Arad_9778     TRUE 0.950 -7.000 0.062 NA   NA
 5483994 5483995 Arad_9778 Arad_9779     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483995 5483996 Arad_9779 Arad_9780   dapE1 FALSE 0.344 33.000 0.000 NA   NA
 5483997 5483998 Arad_9781 Arad_9782 dapAf1   TRUE 0.951 26.000 0.615 1.000 N NA
 5483998 5483999 Arad_9782 Arad_9783     TRUE 0.883 52.000 0.538 NA N NA
 5483999 5484000 Arad_9783 Arad_9784     TRUE 0.996 -3.000 0.385 NA Y NA
 5484000 5484001 Arad_9784 Arad_9785     TRUE 0.997 -24.000 0.455 NA Y NA
 5484001 5484002 Arad_9785 Arad_9786     TRUE 0.962 26.000 0.273 NA Y NA
 5484002 5484003 Arad_9786 Arad_9787     TRUE 0.990 0.000 0.200 NA Y NA
 5484004 5484005 Arad_9789 Arad_9790 amaB   TRUE 0.948 -3.000 0.047 1.000   NA
 5484005 5484006 Arad_9790 Arad_9791   rbsK TRUE 0.959 -3.000 0.094 1.000   NA
 5484006 5484007 Arad_9791 Arad_9792 rbsK   TRUE 0.970 7.000 0.375 NA   NA
 5484007 5484008 Arad_9792 Arad_9793     TRUE 0.962 34.000 0.733 NA   NA
 5484008 5484009 Arad_9793 Arad_9795     TRUE 0.985 4.000 0.526 NA   NA
 5484009 5484010 Arad_9795 Arad_9797     TRUE 0.880 84.000 0.632 NA   NA
 5484010 5484011 Arad_9797 Arad_9799   rbsBch3 TRUE 0.710 86.000 0.323 NA   NA
 5484011 5484012 Arad_9799 Arad_9800 rbsBch3   FALSE 0.114 161.000 0.065 NA N NA
 5484012 5484013 Arad_9800 Arad_9801     FALSE 0.008 266.000 0.000 NA   NA
 5484017 5484018 Arad_9807 Arad_9808     FALSE 0.498 18.000 0.000 NA   NA
 5484018 5484019 Arad_9808 Arad_9809     TRUE 0.952 0.000 0.227 NA N NA
 5484019 5484020 Arad_9809 Arad_9811     TRUE 0.986 30.000 0.647 NA Y NA
 5484020 5484021 Arad_9811 Arad_9812   amaB TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA N NA
 5484021 5484022 Arad_9812 Arad_9813 amaB glpRb TRUE 0.826 50.000 0.385 1.000 N NA
 5484022 5484023 Arad_9813 Arad_9814 glpRb   TRUE 0.869 61.000 0.455 1.000   NA
 5484023 5484024 Arad_9814 Arad_9816   dppCch1 TRUE 0.994 -3.000 0.636 NA   NA
 5484024 5484025 Arad_9816 Arad_9817 dppCch1   TRUE 0.992 -3.000 0.163 NA Y NA
 5484025 5484026 Arad_9817 Arad_9818   dppAch1 TRUE 0.875 65.000 0.163 NA Y NA
 5484026 5484027 Arad_9818 Arad_9821 dppAch1   FALSE 0.000 1109.000 0.000 NA N NA
 5484027 5484028 Arad_9821 Arad_9822     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5484028 5484029 Arad_9822 Arad_9823     FALSE 0.344 33.000 0.000 NA   NA
 5484030 5484031 Arad_9824 Arad_9825     TRUE 0.978 -25.000 0.000 NA Y NA
 5484031 5484032 Arad_9825 Arad_9826     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5484032 5484033 Arad_9826 Arad_9827     TRUE 0.958 5.000 0.000 NA Y NA
 5484034 5484035 Arad_9828 Arad_9829 argE bglSf FALSE 0.178 23.000 0.000 1.000 N NA
 5484035 5484036 Arad_9829 Arad_9830 bglSf   FALSE 0.002 288.000 0.000 1.000 N NA
 5484036 5484037 Arad_9830 Arad_9832   nifSch TRUE 0.644 50.000 0.116 NA   NA
 5484037 5484038 Arad_9832 Arad_9833 nifSch   TRUE 0.865 15.000 0.140 NA   NA
 5484038 5484039 Arad_9833 Arad_9834     FALSE 0.476 53.000 0.075 NA N NA
 5484040 5484041 Arad_9835 Arad_9836     FALSE 0.017 220.000 0.000 NA   NA
 5484042 5484043 Arad_9837 Arad_9838     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 5484043 5484044 Arad_9838 Arad_9839     FALSE 0.000 428.000 0.000 NA N NA
 5484044 5484045 Arad_9839 Arad_9840     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 5484047 5484048 Arad_9842 Arad_9844     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 5484048 5484049 Arad_9844 Arad_9845     FALSE 0.028 189.000 0.000 NA   NA
 5484051 5484052 Arad_9847 Arad_9849     FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5484052 5484053 Arad_9849 Arad_9850     FALSE 0.167 84.000 0.000 NA   NA
 5484053 5484054 Arad_9850 Arad_9851     FALSE 0.382 166.000 0.333 NA   NA
 5484054 5484055 Arad_9851 Arad_9852     FALSE 0.051 38.000 0.000 NA N NA
 5484055 5484056 Arad_9852 Arad_9854     FALSE 0.002 218.000 0.000 NA N NA
 5484058 5484059 Arad_9856 Arad_9857   qor FALSE 0.286 46.000 0.000 NA   NA
 5484059 5484060 Arad_9857 Arad_9859 qor   FALSE 0.005 374.000 0.000 0.052 N NA
 5484061 5484062 Arad_9860 Arad_9861     FALSE 0.000 341.000 0.000 NA N NA
 5484062 5484063 Arad_9861 Arad_9862     FALSE 0.103 18.000 0.000 NA N NA
 5484063 5484064 Arad_9862 Arad_9863   metS FALSE 0.002 285.000 0.000 1.000 N NA
 5484068 5484069 Arad_9869 Arad_9870     TRUE 0.979 -10.000 0.000 NA Y NA
 5484069 5484070 Arad_9870 Arad_9872     TRUE 0.848 31.000 0.000 NA Y NA
 5484070 5484071 Arad_9872 Arad_9873   udp FALSE 0.083 23.000 0.000 NA N NA
 5484071 5484072 Arad_9873 Arad_9875 udp iunH2 TRUE 0.956 6.000 0.000 NA Y NA
 5484072 5484073 Arad_9875 Arad_9876 iunH2   TRUE 0.923 15.000 0.000 NA Y NA
 5484073 5484074 Arad_9876 Arad_9877     FALSE 0.331 166.000 0.000 1.000 Y NA
 5484074 5484075 Arad_9877 Arad_9878   mcpY FALSE 0.001 597.000 0.000 NA   NA
 5484076 5484077 Arad_9879 Arad_9880 xylBch   TRUE 0.953 16.000 0.400 1.000   NA
 5484077 5484078 Arad_9880 Arad_9881   atzF FALSE 0.110 121.000 0.000 1.000   NA
 5484078 5484079 Arad_9881 Arad_9882 atzF   FALSE 0.322 11.000 0.000 1.000 N NA
 5484079 5484080 Arad_9882 Arad_9883     TRUE 0.988 -7.000 0.000 0.027 Y NA
 5484080 5484081 Arad_9883 Arad_9884     TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5484081 5484082 Arad_9884 Arad_9885     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA Y NA
 5484082 5484083 Arad_9885 Arad_9886     TRUE 0.956 6.000 0.000 NA Y NA
 5484083 5484084 Arad_9886 Arad_9887     TRUE 0.567 106.000 0.000 NA Y NA
 5484086 5484087 Arad_9889 Arad_9891     FALSE 0.250 55.000 0.000 NA   NA
 5484088 5484089 Arad_9892 Arad_9893 glpRb codAb FALSE 0.130 32.000 0.000 1.000 N NA
 5484089 5484090 Arad_9893 Arad_9894 codAb   FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 5484090 5484091 Arad_9894 Arad_9896     FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 5484091 5484092 Arad_9896 Arad_9897   pcm1 FALSE 0.218 76.000 0.000 1.000   NA
 5484093 5484094 Arad_9898 Arad_9899     TRUE 0.972 -3.000 0.253 1.000 N NA
 5484094 5484095 Arad_9899 Arad_9900     FALSE 0.006 304.000 0.000 1.000   NA
 5484095 5484096 Arad_9900 Arad_9902     FALSE 0.240 70.000 0.000 1.000   NA
 5484098 5484099 Arad_9904 Arad_9905     FALSE 0.020 210.000 0.000 NA   NA
 5484099 5484100 Arad_9905 Arad_9906     FALSE 0.232 61.000 0.000 NA   NA
 5484100 5484101 Arad_9906 Arad_9907     FALSE 0.006 313.000 0.000 1.000   NA
 5484102 5484103 Arad_9908 Arad_9910   coxM FALSE 0.001 720.000 0.000 NA   NA
 5484103 5484104 Arad_9910 Arad_9912 coxM ctaD TRUE 0.964 56.000 0.344 0.001 Y NA
 5484104 5484105 Arad_9912 Arad_9913 ctaD coxO TRUE 0.999 -3.000 0.786 0.001 Y NA
 5484105 5484106 Arad_9913 Arad_9914 coxO coxP TRUE 0.994 13.000 0.440 0.001 Y NA
 5484106 5484107 Arad_9914 Arad_9915 coxP   TRUE 0.975 11.000 0.488 NA   NA
 5484109 5484110 Arad_9917 Arad_9919     FALSE 0.002 510.000 0.000 NA   NA
 5484111 5484112 Arad_9920 Arad_9922     FALSE 0.344 33.000 0.000 NA   NA
 5484112 5484113 Arad_9922 Arad_9923     FALSE 0.082 132.000 0.000 NA   NA
 5484113 5484114 Arad_9923 Arad_9926     FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 5484114 5484115 Arad_9926 Arad_9928     FALSE 0.000 621.000 0.000 1.000 N NA
 5484117 5484118 Arad_9931 Arad_9934     FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 5484118 5484119 Arad_9934 Arad_9936     FALSE 0.078 145.000 0.000 1.000   NA
 5484119 5484120 Arad_9936 Arad_9938     FALSE 0.295 52.000 0.000 1.000   NA
 5484121 5484122 Arad_9940 Arad_9942   dppCf TRUE 0.998 -10.000 0.556 NA Y NA
 5484122 5484123 Arad_9942 Arad_9943 dppCf   TRUE 0.964 -3.000 0.222 NA N NA
 5484123 5484124 Arad_9943 Arad_9944     TRUE 0.798 37.000 0.286 1.000 N NA
 5484124 5484125 Arad_9944 Arad_9946     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.005 Y NA
 5484125 5484126 Arad_9946 Arad_9947   dppAch1 TRUE 0.862 50.000 0.039 NA Y NA
 5484128 5484129 Arad_9951 Arad_9952     FALSE 0.228 63.000 0.000 NA   NA
 5484129 5484130 Arad_9952 Arad_9953     FALSE 0.085 193.000 0.000 0.005   NA
 5484130 5484131 Arad_9953 Arad_9954     TRUE 0.824 -12.000 0.000 NA   NA
 5484131 5484132 Arad_9954 Arad_9956     FALSE 0.001 631.000 0.000 NA   NA
 5484135 5484136 Arad_9961 Arad_9962     FALSE 0.218 76.000 0.000 1.000   NA
 5484137 5484138 Arad_9963 Arad_9964 afuA1 afuB1 TRUE 0.969 92.000 0.800 NA Y NA
 5484138 5484139 Arad_9964 Arad_9965 afuB1 afuC1 TRUE 0.993 -3.000 0.632 NA N NA
 5484139 5484140 Arad_9965 Arad_9967 afuC1   TRUE 0.892 29.000 0.400 1.000 N NA
 5484140 5484141 Arad_9967 Arad_9971     FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 5484141 5484142 Arad_9971 Arad_9973     FALSE 0.002 492.000 0.000 NA   NA
 5484142 5484143 Arad_9973 Arad_9974   celA TRUE 0.902 62.000 0.571 NA   NA
 5484143 5484144 Arad_9974 Arad_9975 celA celB TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 5484144 5484145 Arad_9975 Arad_9976 celB celC TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484145 5484146 Arad_9976 Arad_9977 celC celG FALSE 0.300 51.000 0.000 1.000   NA
 5484146 5484147 Arad_9977 Arad_9978 celG   FALSE 0.070 151.000 0.000 1.000   NA
 5484149 5484150 Arad_9980 Arad_9982 rbsBch1 rbsAch1 FALSE 0.486 169.000 0.118 NA Y NA
 5484150 5484151 Arad_9982 Arad_9983 rbsAch1 rbsCch1 TRUE 0.999 -16.000 0.750 NA Y NA
 5484154 5484155 Arad_9986 Arad_9988     FALSE 0.002 504.000 0.000 NA   NA
 5484156 5484157 Arad_9990 Arad_9991   gspD FALSE 0.009 277.000 0.000 1.000   NA
 5484157 5484158 Arad_9991 Arad_9992 gspD   TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5484158 5484159 Arad_9992 Arad_9993     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5484160 5484161 Arad_9995 Arad_9997     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5484161 5484162 Arad_9997 Arad_9998     TRUE 0.948 -3.000 0.000 0.001   NA
 5484162 5484163 Arad_9998 Arad_9999   cpaF TRUE 0.920 57.000 0.250 1.000 Y NA
 5484163 5484164 Arad_9999 Arad_10001 cpaF   TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 5484164 5484165 Arad_10001 Arad_10002     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484165 5484166 Arad_10002 Arad_10003     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484166 5484167 Arad_10003 Arad_10004     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484169 5484170 Arad_10006 Arad_10008     TRUE 0.986 -3.000 0.357 NA   NA
 5484172 5484173 Arad_10010 Arad_10012     FALSE 0.039 51.000 0.000 NA N NA
 5484173 5484174 Arad_10012 Arad_10013   hipO FALSE 0.046 172.000 0.000 1.000   NA
 5484175 5484176 Arad_10014 Arad_10015 cyaG2   FALSE 0.007 277.000 0.000 NA   NA
 5484176 5484177 Arad_10015 Arad_10017   tetA FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 5484180 5484181 Arad_10020 Arad_10021     TRUE 0.999 2.000 0.859 0.000 Y NA
 5484181 5484182 Arad_10021 Arad_10022     FALSE 0.045 166.000 0.000 NA   NA
 5484182 5484183 Arad_10022 Arad_10024     FALSE 0.526 16.000 0.000 NA   NA
 5484184 5484185 Arad_10025 Arad_10026 ocdch2   TRUE 0.880 14.000 0.155 NA   NA
 5484187 5484188 Arad_10030 Arad_10031     FALSE 0.000 368.000 0.000 NA N NA
 5484188 5484189 Arad_10031 Arad_10032     TRUE 0.977 67.000 0.719 NA Y NA
 5484189 5484190 Arad_10032 Arad_10034     TRUE 0.999 -27.000 0.797 NA Y NA
 5484190 5484191 Arad_10034 Arad_10035     TRUE 0.983 -3.000 0.314 NA   NA
 5484191 5484192 Arad_10035 Arad_10036     TRUE 0.990 15.000 0.931 NA   NA
 5484192 5484193 Arad_10036 Arad_10038   uca TRUE 0.858 131.000 0.835 NA   NA
 5484193 5484194 Arad_10038 Arad_10039 uca atzF TRUE 0.982 0.000 0.437 1.000 N NA
 5484197 5484198 Arad_10044 Arad_10045     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5484199 5484200 Arad_10046 Arad_10048     FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 5484201 5484202 Arad_10051 Arad_10053     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 5484203 5484204 Arad_0001 Arad_4980   maf TRUE 0.705 39.000 0.135 NA   NA
 5484204 5484205 Arad_4980 Arad_0002 maf aroEch1 TRUE 0.952 -7.000 0.169 NA N NA
 5484205 5484206 Arad_0002 Arad_0003 aroEch1 coaE TRUE 0.934 -3.000 0.078 1.000 N NA
 5484206 5484207 Arad_0003 Arad_0004 coaE dnaQ TRUE 0.906 2.000 0.092 1.000 N NA
 5484208 5484209 Arad_0005 Arad_0006   secB FALSE 0.019 146.000 0.000 1.000 N NA
 5484209 5484210 Arad_0006 Arad_0007 secB fxsA FALSE 0.445 96.000 0.122 NA   NA
 5484211 5484212 Arad_0009 Arad_0011     TRUE 0.985 -3.000 0.324 1.000   NA
 5484212 5484213 Arad_0011 Arad_0012     TRUE 0.978 0.000 0.332 NA   NA
 5484213 5484214 Arad_0012 Arad_0013     TRUE 0.968 -3.000 0.183 NA   NA
 5484214 5484215 Arad_0013 Arad_0014   gyrB FALSE 0.088 149.000 0.008 1.000 N NA
 5484216 5484217 Arad_0015 Arad_0016     FALSE 0.381 82.000 0.025 NA   NA
 5484218 5484219 Arad_0017 Arad_0018     FALSE 0.025 130.000 0.000 1.000 N NA
 5484219 5484220 Arad_0018 Arad_0020     FALSE 0.001 288.000 0.000 NA N NA
 5484220 5484221 Arad_0020 Arad_0021     FALSE 0.209 159.000 0.118 NA   NA
 5484221 5484222 Arad_0021 Arad_0022     FALSE 0.360 91.000 0.034 NA   NA
 5484222 5484223 Arad_0022 Arad_0024   trpF FALSE 0.323 91.000 0.017 NA   NA
 5484223 5484224 Arad_0024 Arad_0026 trpF trpB TRUE 0.996 3.000 0.375 0.001 Y NA
 5484224 5484225 Arad_0026 Arad_0028 trpB trpf TRUE 0.993 11.000 0.344 0.000 Y NA
 5484225 5484226 Arad_0028 Arad_0030 trpf   FALSE 0.441 110.000 0.232 1.000 N NA
 5484226 5484227 Arad_0030 Arad_0031   folC TRUE 0.693 91.000 0.383 1.000 N NA
 5484228 5484229 Arad_0033 Arad_0034 trxA addA TRUE 0.603 76.000 0.173 1.000   NA
 5484229 5484230 Arad_0034 Arad_0035 addA addB TRUE 0.999 -7.000 0.863 0.041 Y NA
 5484230 5484231 Arad_0035 Arad_0036 addB   TRUE 0.921 5.000 0.196 1.000 N NA
 5484231 5484232 Arad_0036 Arad_0037     TRUE 0.894 77.000 0.642 NA   NA
 5484232 5484233 Arad_0037 Arad_0038     TRUE 0.954 -3.000 0.085 NA   NA
 5484233 5484234 Arad_0038 Arad_0039   ahcY FALSE 0.008 320.000 0.018 1.000 N NA
 5484234 5484235 Arad_0039 Arad_0041 ahcY   FALSE 0.045 188.000 0.012 1.000 N NA
 5484235 5484236 Arad_0041 Arad_0042     TRUE 0.989 20.000 0.420 0.001 Y NA
 5484236 5484237 Arad_0042 Arad_0044     FALSE 0.257 153.000 0.145 1.000   NA
 5484237 5484238 Arad_0044 Arad_0045   chvG TRUE 0.989 -3.000 0.304 0.009   NA
 5484238 5484239 Arad_0045 Arad_0046 chvG chvI TRUE 0.931 149.000 0.829 1.000 Y NA
 5484240 5484241 Arad_0047 Arad_0049 pckA   FALSE 0.246 123.000 0.025 1.000   NA
 5484241 5484242 Arad_0049 Arad_0050   alkB FALSE 0.009 353.000 0.016 NA   NA
 5484242 5484243 Arad_0050 Arad_0051 alkB   FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 5484244 5484245 Arad_0052 Arad_0053 coaA hisE TRUE 0.867 7.000 0.086 1.000 N NA
 5484245 5484246 Arad_0053 Arad_0055 hisE hisF TRUE 0.976 16.000 0.105 0.002 Y NA
 5484246 5484247 Arad_0055 Arad_0056 hisF hisA TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.002 Y NA
 5484247 5484248 Arad_0056 Arad_0057 hisA hisH TRUE 0.867 85.000 0.070 0.002 Y NA
 5484248 5484249 Arad_0057 Arad_0059 hisH   TRUE 0.980 3.000 0.417 NA   NA
 5484249 5484250 Arad_0059 Arad_0060   hisB TRUE 0.695 26.000 0.041 NA   NA
 5484251 5484252 Arad_0061 Arad_0063 hslV hslU TRUE 0.986 45.000 0.752 1.000 Y NA
 5484252 5484253 Arad_0063 Arad_0065 hslU   FALSE 0.106 170.000 0.021 NA   NA
 5484253 5484254 Arad_0065 Arad_0067     TRUE 0.802 48.000 0.286 NA   NA
 5484254 5484255 Arad_0067 Arad_0070     TRUE 0.818 88.000 0.136 1.000 Y NA
 5484255 5484256 Arad_0070 Arad_0071   glcB FALSE 0.162 120.000 0.022 1.000 N NA
 5484259 5484260 Arad_0074 Arad_0075 actR actS TRUE 0.959 76.000 0.560 1.000 Y NA
 5484260 5484261 Arad_0075 Arad_0076 actS hrpB TRUE 0.862 3.000 0.042 1.000 N NA
 5484261 5484262 Arad_0076 Arad_0078 hrpB ocdch1 TRUE 0.797 6.000 0.021 1.000 N NA
 5484263 5484264 Arad_5100 Arad_5000     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5484264 5484265 Arad_5000 Arad_5001     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5484265 5484266 Arad_5001 Arad_5101     FALSE 0.001 726.000 0.000 NA   NA
 5484266 5484267 Arad_5101 Arad_5102     FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5484267 5484268 Arad_5102 Arad_5002     FALSE 0.067 144.000 0.000 NA   NA
 5484270 5484271 Arad_0081 Arad_0082     TRUE 0.990 -7.000 0.444 NA   NA
 5484273 5484274 Arad_0087 Arad_0088     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5484274 5484275 Arad_0088 Arad_0089     TRUE 0.939 20.000 0.400 NA   NA
 5484275 5484276 Arad_0089 Arad_0092     FALSE 0.054 155.000 0.000 NA   NA
 5484276 5484277 Arad_0092 Arad_0094     FALSE 0.001 858.000 0.000 NA   NA
 5484277 5484278 Arad_0094 Arad_0095     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5484278 5484279 Arad_0095 Arad_0096     FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5484279 5484280 Arad_0096 Arad_4981     FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 5484280 5484281 Arad_4981 Arad_4982     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484281 5484282 Arad_4982 Arad_4986     FALSE 0.001 657.000 0.000 NA   NA
 5484282 5484283 Arad_4986 Arad_0097     FALSE 0.046 165.000 0.000 NA   NA
 5484284 5484285 Arad_0098 Arad_0099     FALSE 0.056 163.000 0.000 1.000   NA
 5484285 5484286 Arad_0099 Arad_0100   serA TRUE 0.854 -7.000 0.000 1.000   NA
 5484286 5484287 Arad_0100 Arad_0101 serA   TRUE 0.929 0.000 0.136 1.000 N NA
 5484287 5484288 Arad_0101 Arad_0102   gabDch TRUE 0.877 10.000 0.136 1.000 N NA
 5484288 5484289 Arad_0102 Arad_0103 gabDch idhA TRUE 0.751 4.000 0.000 1.000   NA
 5484290 5484291 Arad_0105 Arad_0106 iolD iolE FALSE 0.452 2.000 0.000 1.000 N NA
 5484291 5484292 Arad_0106 Arad_0107 iolE   TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5484292 5484293 Arad_0107 Arad_0108     FALSE 0.224 4.000 0.000 NA N NA
 5484293 5484294 Arad_0108 Arad_0109     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 5484296 5484297 Arad_0112 Arad_0113     TRUE 0.597 100.000 0.000 NA Y NA
 5484297 5484298 Arad_0113 Arad_0115     FALSE 0.010 794.000 0.000 NA Y NA
 5484298 5484299 Arad_0115 Arad_0116     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5484299 5484300 Arad_0116 Arad_0117     TRUE 0.817 18.000 0.089 NA   NA
 5484302 5484303 Arad_0120 Arad_0121   ada FALSE 0.007 193.000 0.000 1.000 N NA
 5484304 5484305 Arad_0123 Arad_0124     TRUE 0.736 56.000 0.292 1.000 N NA
 5484305 5484306 Arad_0124 Arad_0126     TRUE 0.961 17.000 0.148 NA Y NA
 5484306 5484307 Arad_0126 Arad_0127     TRUE 0.999 -3.000 0.926 NA Y NA
 5484307 5484308 Arad_0127 Arad_0129     TRUE 0.861 113.000 0.370 NA Y NA
 5484309 5484310 Arad_0130 Arad_0132     FALSE 0.068 70.000 0.000 1.000 N NA
 5484311 5484312 Arad_0133 Arad_0134 crp487   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484314 5484315 Arad_0136 Arad_0138 gabDch gabT TRUE 0.850 75.000 0.556 1.000 N NA
 5484316 5484317 Arad_0139 Arad_0140   rnd1 FALSE 0.392 87.000 0.030 1.000   NA
 5484317 5484318 Arad_0140 Arad_0141 rnd1   FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5484319 5484320 Arad_0142 Arad_0143 rpsA cmk FALSE 0.217 180.000 0.281 1.000 N NA
 5484320 5484321 Arad_0143 Arad_0144 cmk aroA TRUE 0.964 -3.000 0.209 1.000 N NA
 5484322 5484323 Arad_0145 Arad_5003     FALSE 0.055 154.000 0.000 NA   NA
 5484323 5484324 Arad_5003 Arad_0146     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5484324 5484325 Arad_0146 Arad_0147     FALSE 0.358 109.000 0.087 NA   NA
 5484327 5484328 Arad_0152 Arad_0155     FALSE 0.005 472.000 0.018 NA   NA
 5484330 5484331 Arad_0158 Arad_0159 fabA fabB TRUE 0.961 53.000 0.451 1.000 Y NA
 5484331 5484332 Arad_0159 Arad_0161 fabB fabI1 TRUE 0.989 5.000 0.265 1.000 Y NA
 5484332 5484333 Arad_0161 Arad_0162 fabI1   FALSE 0.346 54.000 0.000 0.082 N NA
 5484333 5484334 Arad_0162 Arad_0163     FALSE 0.004 226.000 0.000 1.000 N NA
 5484335 5484336 Arad_0164 Arad_0165   pnp TRUE 0.771 83.000 0.021 1.000 Y NA
 5484336 5484337 Arad_0165 Arad_0169 pnp rpsO FALSE 0.125 383.000 0.335 1.000 Y NA
 5484337 5484338 Arad_0169 Arad_0170 rpsO   FALSE 0.122 153.000 0.005 NA   NA
 5484338 5484339 Arad_0170 Arad_0171   truB FALSE 0.273 98.000 0.008 NA   NA
 5484339 5484340 Arad_0171 Arad_0172 truB rbfA TRUE 0.985 13.000 0.318 1.000 Y NA
 5484340 5484341 Arad_0172 Arad_0173 rbfA infB TRUE 0.956 76.000 0.530 1.000 Y NA
 5484341 5484342 Arad_0173 Arad_0174 infB   FALSE 0.374 102.000 0.171 NA N NA
 5484342 5484343 Arad_0174 Arad_0176   nusA TRUE 0.995 -3.000 0.323 NA Y NA
 5484343 5484344 Arad_0176 Arad_0177 nusA   TRUE 0.941 61.000 0.759 NA   NA
 5484344 5484345 Arad_0177 Arad_0178     FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 5484345 5484346 Arad_0178 Arad_0179   recR TRUE 0.558 23.000 0.014 1.000 N NA
 5484350 5484351 Arad_0185 Arad_0186   dnaX TRUE 0.697 107.000 0.411 NA   NA
 5484351 5484352 Arad_0186 Arad_5116 dnaX   FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5484353 5484354 Arad_0187 Arad_0188     TRUE 0.943 -3.000 0.108 1.000 N NA
 5484354 5484355 Arad_0188 Arad_0189     TRUE 0.695 14.000 0.028 NA N NA
 5484355 5484356 Arad_0189 Arad_0192     FALSE 0.012 429.000 0.167 NA   NA
 5484357 5484358 Arad_0193 Arad_0195 pheA kdsB1 TRUE 0.685 25.000 0.083 1.000 N NA
 5484360 5484361 Arad_0198 Arad_0199     FALSE 0.083 142.000 0.000 1.000   NA
 5484363 5484364 Arad_0202 Arad_0203     FALSE 0.174 81.000 0.000 NA   NA
 5484365 5484366 Arad_0205 Arad_0206     TRUE 0.751 86.000 0.000 0.081 Y NA
 5484367 5484368 Arad_0207 Arad_0208   moeB TRUE 0.972 -3.000 0.196 1.000   NA
 5484368 5484369 Arad_0208 Arad_0209 moeB recF FALSE 0.451 38.000 0.019 1.000 N NA
 5484369 5484370 Arad_0209 Arad_0210 recF dnaJ1 FALSE 0.002 297.000 0.000 1.000 N NA
 5484370 5484371 Arad_0210 Arad_0212 dnaJ1 dnaK TRUE 0.915 84.000 0.236 0.002 Y NA
 5484371 5484372 Arad_0212 Arad_0213 dnaK   FALSE 0.003 249.000 0.000 1.000 N NA
 5484373 5484374 Arad_0214 Arad_0216     FALSE 0.002 465.000 0.000 NA   NA
 5484375 5484376 Arad_0219 Arad_5114   suhB FALSE 0.001 630.000 0.000 NA   NA
 5484376 5484377 Arad_5114 Arad_0222 suhB nodTch TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 5484377 5484378 Arad_0222 Arad_0223 nodTch purC FALSE 0.001 352.000 0.000 1.000 N NA
 5484378 5484379 Arad_0223 Arad_0224 purC   TRUE 0.740 69.000 0.000 1.000 Y NA
 5484379 5484380 Arad_0224 Arad_0226     TRUE 0.979 -13.000 0.318 1.000 N NA
 5484381 5484382 Arad_0228 Arad_0229     TRUE 0.998 4.000 0.857 1.000 Y NA
 5484384 5484385 Arad_5103 Arad_5004     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5484385 5484386 Arad_5004 Arad_5005     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5484386 5484387 Arad_5005 Arad_5104     FALSE 0.001 726.000 0.000 NA   NA
 5484387 5484388 Arad_5104 Arad_5105     FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5484388 5484389 Arad_5105 Arad_5006     FALSE 0.067 144.000 0.000 NA   NA
 5484389 5484390 Arad_5006 Arad_0232   mcpCf FALSE 0.001 730.000 0.000 NA   NA
 5484391 5484392 Arad_0233 Arad_0234 potA potC TRUE 0.981 7.000 0.158 NA Y NA
 5484392 5484393 Arad_0234 Arad_0235 potC potB TRUE 0.989 3.000 0.250 NA Y NA
 5484393 5484394 Arad_0235 Arad_0237 potB potD TRUE 0.964 41.000 0.409 NA Y NA
 5484395 5484396 Arad_0238 Arad_0239 ade   FALSE 0.001 259.000 0.000 NA N NA
 5484396 5484397 Arad_0239 Arad_0240     FALSE 0.001 264.000 0.000 NA N NA
 5484397 5484398 Arad_0240 Arad_0241     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484398 5484399 Arad_0241 Arad_0242   rosR FALSE 0.305 50.000 0.000 1.000   NA
 5484402 5484403 Arad_0245 Arad_0246     TRUE 0.993 2.000 0.750 NA   NA
 5484403 5484404 Arad_0246 Arad_0247     TRUE 0.938 13.000 0.286 NA   NA
 5484406 5484407 Arad_0251 Arad_0252   cyoD TRUE 0.977 28.000 0.849 NA   NA
 5484407 5484408 Arad_0252 Arad_0254 cyoD cyoC TRUE 0.999 -3.000 0.906 0.048 Y NA
 5484408 5484409 Arad_0254 Arad_0255 cyoC cyoB TRUE 0.999 6.000 0.847 0.048 Y NA
 5484409 5484410 Arad_0255 Arad_0257 cyoB cyoA TRUE 0.993 48.000 0.915 0.006 Y NA
 5484411 5484412 Arad_0258 Arad_0259   sfuA FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 5484412 5484413 Arad_0259 Arad_0260 sfuA sfuB TRUE 0.950 126.000 0.824 NA Y NA
 5484413 5484414 Arad_0260 Arad_0261 sfuB sfuC TRUE 0.973 -3.000 0.275 NA N NA
 5484414 5484415 Arad_0261 Arad_0263 sfuC   FALSE 0.200 82.000 0.000 1.000   NA
 5484416 5484417 Arad_0264 Arad_0265 ade   TRUE 0.991 -3.000 0.118 NA Y NA
 5484417 5484418 Arad_0265 Arad_0266   dapE1 FALSE 0.021 87.000 0.000 NA N NA
 5484422 5484423 Arad_0272 Arad_0274 phnN phnM TRUE 0.896 57.000 0.173 1.000 Y NA
 5484423 5484424 Arad_0274 Arad_0276 phnM   TRUE 0.926 11.000 0.205 NA   NA
 5484424 5484425 Arad_0276 Arad_0277   phnE FALSE 0.105 191.000 0.075 NA   NA
 5484425 5484426 Arad_0277 Arad_0278 phnE phnE TRUE 0.996 9.000 0.491 0.001 Y NA
 5484426 5484427 Arad_0278 Arad_0279 phnE   TRUE 0.978 69.000 0.568 0.001 Y NA
 5484427 5484428 Arad_0279 Arad_0281   phnC TRUE 0.964 96.000 0.589 0.002 Y NA
 5484428 5484429 Arad_0281 Arad_0282 phnC   FALSE 0.017 227.000 0.000 1.000   NA
 5484429 5484430 Arad_0282 Arad_0283     FALSE 0.164 95.000 0.000 1.000   NA
 5484430 5484431 Arad_0283 Arad_0285   phnL TRUE 0.960 -3.000 0.104 1.000   NA
 5484431 5484432 Arad_0285 Arad_0287 phnL phnK TRUE 0.998 13.000 0.859 0.048 Y NA
 5484432 5484433 Arad_0287 Arad_0288 phnK phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 5484433 5484434 Arad_0288 Arad_0289 phnJ phnI TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 5484434 5484435 Arad_0289 Arad_0291 phnI phnH TRUE 0.999 4.000 0.960 0.002 Y NA
 5484435 5484436 Arad_0291 Arad_0292 phnH phnG TRUE 0.999 0.000 0.967 0.002 Y NA
 5484438 5484439 Arad_0294 Arad_0295 gpmA dapB1 TRUE 0.597 26.000 0.038 1.000 N NA
 5484439 5484440 Arad_0295 Arad_0296 dapB1   TRUE 0.655 16.000 0.017 1.000 N NA
 5484440 5484441 Arad_0296 Arad_0297   glk FALSE 0.132 141.000 0.027 1.000 N NA
 5484441 5484442 Arad_0297 Arad_0298 glk mgsA TRUE 0.903 33.000 0.035 1.000 Y NA
 5484442 5484443 Arad_0298 Arad_0300 mgsA mepA FALSE 0.227 104.000 0.035 1.000 N NA
 5484444 5484445 Arad_0301 Arad_0303     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5484445 5484446 Arad_0303 Arad_0305     FALSE 0.209 174.000 0.197 NA   NA
 5484446 5484447 Arad_0305 Arad_0306     TRUE 0.996 0.000 0.882 NA   NA
 5484447 5484448 Arad_0306 Arad_0307     TRUE 0.996 -3.000 0.744 NA   NA
 5484448 5484449 Arad_0307 Arad_0308     TRUE 0.913 12.000 0.179 1.000   NA
 5484449 5484450 Arad_0308 Arad_0309   pncB FALSE 0.221 193.000 0.000 1.000 Y NA
 5484450 5484451 Arad_0309 Arad_0311 pncB   FALSE 0.049 88.000 0.000 1.000 N NA
 5484456 5484457 Arad_0318 Arad_0319   nerA TRUE 0.934 -3.000 0.000 0.051   NA
 5484457 5484458 Arad_0319 Arad_0320 nerA   FALSE 0.003 205.000 0.000 NA N NA
 5484458 5484459 Arad_0320 Arad_0321     FALSE 0.018 96.000 0.000 NA N NA
 5484459 5484460 Arad_0321 Arad_0322     FALSE 0.038 102.000 0.000 1.000 N NA
 5484460 5484461 Arad_0322 Arad_0323     FALSE 0.078 145.000 0.000 1.000   NA
 5484461 5484462 Arad_0323 Arad_0324     FALSE 0.197 83.000 0.000 1.000   NA
 5484473 5484474 Arad_0334 Arad_0335     FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 5484474 5484475 Arad_0335 Arad_0338     TRUE 0.875 81.000 0.586 1.000   NA
 5484475 5484476 Arad_0338 Arad_0339     TRUE 0.928 8.000 0.184 NA   NA
 5484476 5484477 Arad_0339 Arad_0340     TRUE 0.989 10.000 0.720 NA   NA
 5484477 5484478 Arad_0340 Arad_0341   cdd TRUE 0.907 4.000 0.060 NA   NA
 5484478 5484479 Arad_0341 Arad_0344 cdd   TRUE 0.994 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 5484479 5484480 Arad_0344 Arad_0346   deoC TRUE 0.983 3.000 0.083 1.000 Y NA
 5484480 5484481 Arad_0346 Arad_0347 deoC deoA TRUE 0.990 5.000 0.286 1.000 Y NA
 5484482 5484483 Arad_0348 Arad_0349   upp FALSE 0.163 148.000 0.014 1.000   NA
 5484483 5484484 Arad_0349 Arad_0352 upp add TRUE 0.634 123.000 0.030 1.000 Y NA
 5484484 5484485 Arad_0352 Arad_0353 add deoB TRUE 0.937 -3.000 0.086 1.000 N NA
 5484485 5484486 Arad_0353 Arad_0354 deoB   FALSE 0.159 138.000 0.055 NA N NA
 5484486 5484487 Arad_0354 Arad_0356     TRUE 0.996 15.000 0.857 NA Y NA
 5484487 5484488 Arad_0356 Arad_0357     TRUE 0.825 63.000 0.381 NA   NA
 5484489 5484490 Arad_0358 Arad_0359 pilA pilA TRUE 0.887 87.000 0.300 NA Y NA
 5484490 5484491 Arad_0359 Arad_0360 pilA cpaA TRUE 0.925 94.000 0.467 NA Y NA
 5484491 5484492 Arad_0360 Arad_0362 cpaA cpaB TRUE 0.840 166.000 0.611 NA Y NA
 5484492 5484493 Arad_0362 Arad_0363 cpaB cpaC TRUE 0.992 -3.000 0.167 NA Y NA
 5484493 5484494 Arad_0363 Arad_0364 cpaC cpaD FALSE 0.508 54.000 0.100 NA N NA
 5484494 5484495 Arad_0364 Arad_0365 cpaD cpaE TRUE 0.887 38.000 0.467 NA N NA
 5484495 5484496 Arad_0365 Arad_0367 cpaE cpaF TRUE 0.655 248.000 0.765 1.000 Y NA
 5484496 5484497 Arad_0367 Arad_0368 cpaF   TRUE 0.998 11.000 0.882 NA Y NA
 5484497 5484498 Arad_0368 Arad_0369     TRUE 0.995 22.000 0.941 NA Y NA
 5484498 5484499 Arad_0369 Arad_0370     FALSE 0.182 144.000 0.103 NA N NA
 5484501 5484502 Arad_0372 Arad_0375     FALSE 0.031 310.000 0.130 0.061 N NA
 5484502 5484503 Arad_0375 Arad_0376     TRUE 0.855 12.000 0.150 NA N NA
 5484503 5484504 Arad_0376 Arad_0377     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 5484505 5484506 Arad_0379 Arad_0381 gatA1   TRUE 0.621 26.000 0.061 NA N NA
 5484506 5484507 Arad_0381 Arad_0382     TRUE 0.999 -3.000 0.829 NA Y NA
 5484507 5484508 Arad_0382 Arad_0383     TRUE 0.864 49.000 0.038 NA Y NA
 5484508 5484509 Arad_0383 Arad_0384     FALSE 0.204 167.000 0.222 NA N NA
 5484509 5484510 Arad_0384 Arad_0385     TRUE 0.607 16.000 0.013 NA N NA
 5484510 5484511 Arad_0385 Arad_0386     FALSE 0.093 180.000 0.027 NA   NA
 5484511 5484512 Arad_0386 Arad_0387     FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 5484512 5484513 Arad_0387 Arad_0388     FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 5484513 5484514 Arad_0388 Arad_0389   purU FALSE 0.095 119.000 0.000 NA   NA
 5484514 5484515 Arad_0389 Arad_0391 purU   FALSE 0.044 167.000 0.000 NA   NA
 5484515 5484516 Arad_0391 Arad_0393   egl TRUE 0.787 87.000 0.438 NA   NA
 5484517 5484518 Arad_0394 Arad_0395   lpsB2 FALSE 0.161 216.000 0.000 1.000 Y NA
 5484520 5484521 Arad_0398 Arad_0400     FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 5484521 5484522 Arad_0400 Arad_0402     TRUE 0.936 14.000 0.300 NA   NA
 5484522 5484523 Arad_0402 Arad_0403     TRUE 0.997 -3.000 0.433 NA Y NA
 5484523 5484524 Arad_0403 Arad_0404     TRUE 0.960 38.000 0.357 NA Y NA
 5484524 5484525 Arad_0404 Arad_0406     TRUE 0.919 86.000 0.400 NA Y NA
 5484526 5484527 Arad_0407 Arad_0408     TRUE 0.955 2.000 0.205 NA   NA
 5484527 5484528 Arad_0408 Arad_0409     TRUE 0.928 12.000 0.231 NA   NA
 5484529 5484530 Arad_0410 Arad_0412     TRUE 0.933 27.000 0.538 NA N NA
 5484530 5484531 Arad_0412 Arad_0414     TRUE 0.912 25.000 0.417 1.000 N NA
 5484531 5484532 Arad_0414 Arad_0415   hexA TRUE 0.807 29.000 0.250 1.000 N NA
 5484532 5484533 Arad_0415 Arad_0416 hexA   FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 5484536 5484537 Arad_5049 Arad_0419   noeK FALSE 0.146 93.000 0.000 NA   NA
 5484538 5484539 Arad_0420 Arad_0421     FALSE 0.104 113.000 0.000 NA   NA
 5484541 5484542 Arad_0423 Arad_0425     FALSE 0.110 121.000 0.000 1.000   NA
 5484544 5484545 Arad_0428 Arad_0429     TRUE 0.896 16.000 0.205 1.000   NA
 5484547 5484548 Arad_0431 Arad_0432 aphA   FALSE 0.024 199.000 0.000 NA   NA
 5484551 5484552 Arad_0435 Arad_0437     FALSE 0.018 282.000 0.014 NA   NA
 5484553 5484554 Arad_0438 Arad_0440 infC rpmI FALSE 0.365 322.000 0.652 1.000 Y NA
 5484554 5484555 Arad_0440 Arad_0441 rpmI rplT TRUE 0.995 38.000 0.928 0.008 Y NA
 5484555 5484556 Arad_0441 Arad_0443 rplT   FALSE 0.174 81.000 0.000 NA   NA
 5484556 5484557 Arad_0443 Arad_0444   pheS FALSE 0.312 39.000 0.000 NA   NA
 5484557 5484558 Arad_0444 Arad_0445 pheS pheT TRUE 0.995 16.000 0.574 0.000 Y NA
 5484559 5484560 Arad_0447 Arad_0448   pbpC FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5484560 5484561 Arad_0448 Arad_0449 pbpC   TRUE 0.978 10.000 0.473 1.000   NA
 5484561 5484562 Arad_0449 Arad_0451     FALSE 0.008 285.000 0.000 1.000   NA
 5484563 5484564 Arad_0452 Arad_0453     FALSE 0.129 100.000 0.000 NA   NA
 5484565 5484566 Arad_0454 Arad_0455     TRUE 0.838 15.000 0.065 1.000   NA
 5484566 5484567 Arad_0455 Arad_0456     FALSE 0.185 107.000 0.019 1.000 N NA
 5484567 5484568 Arad_0456 Arad_0458     TRUE 0.992 -3.000 0.596 1.000 N NA
 5484570 5484571 Arad_0461 Arad_0462     TRUE 0.959 -3.000 0.114 NA   NA
 5484572 5484573 Arad_0464 Arad_0466   xseA FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 5484573 5484574 Arad_0466 Arad_0467 xseA   TRUE 0.902 0.000 0.007 1.000   NA
 5484575 5484576 Arad_0468 Arad_0469     FALSE 0.281 95.000 0.006 NA   NA
 5484576 5484577 Arad_0469 Arad_0471     FALSE 0.359 31.000 0.000 NA   NA
 5484577 5484578 Arad_0471 Arad_0472     FALSE 0.002 474.000 0.000 1.000   NA
 5484579 5484580 Arad_0473 Arad_0474     FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5484581 5484582 Arad_0476 Arad_0477     FALSE 0.104 113.000 0.000 NA   NA
 5484582 5484583 Arad_0477 Arad_0479     FALSE 0.003 192.000 0.000 NA N NA
 5484584 5484585 Arad_0480 Arad_0481     FALSE 0.045 93.000 0.000 1.000 N NA
 5484587 5484588 Arad_0484 Arad_0485     FALSE 0.015 225.000 0.000 NA   NA
 5484592 5484593 Arad_0490 Arad_0492     TRUE 0.815 41.000 0.167 0.050   NA
 5484594 5484595 Arad_0493 Arad_0494     FALSE 0.367 30.000 0.000 NA   NA
 5484595 5484596 Arad_0494 Arad_0495     FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5484597 5484598 Arad_0496 Arad_0497     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5484600 5484601 Arad_0502 Arad_0503   idhA FALSE 0.415 90.000 0.050 1.000   NA
 5484602 5484603 Arad_0504 Arad_0506     TRUE 0.954 16.000 0.048 1.000 Y NA
 5484605 5484606 Arad_0510 Arad_0511 guaA1 pfs TRUE 0.682 104.000 0.012 1.000 Y NA
 5484606 5484607 Arad_0511 Arad_0512 pfs   TRUE 0.911 -3.000 0.048 NA N NA
 5484609 5484610 Arad_0518 Arad_0519     TRUE 0.987 6.000 0.620 NA   NA
 5484610 5484611 Arad_0519 Arad_0520     TRUE 0.994 0.000 0.713 NA   NA
 5484611 5484612 Arad_0520 Arad_0521     TRUE 0.855 46.000 0.436 NA N NA
 5484614 5484615 Arad_0523 Arad_0525 sun   FALSE 0.045 220.000 0.020 NA   NA
 5484615 5484616 Arad_0525 Arad_0526     FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 5484616 5484617 Arad_0526 Arad_0528     TRUE 0.920 -24.000 0.055 1.000 N NA
 5484617 5484618 Arad_0528 Arad_0530   gstch2 TRUE 0.884 13.000 0.213 NA N NA
 5484620 5484621 Arad_0534 Arad_0535     FALSE 0.265 112.000 0.028 NA   NA
 5484621 5484622 Arad_0535 Arad_0538   pyrF TRUE 0.720 24.000 0.044 NA   NA
 5484622 5484623 Arad_0538 Arad_0539 pyrF   TRUE 0.819 2.000 0.018 NA N NA
 5484623 5484624 Arad_0539 Arad_0541     TRUE 0.552 90.000 0.256 NA N NA
 5484624 5484625 Arad_0541 Arad_0542   dnaN FALSE 0.061 165.000 0.002 1.000 N NA
 5484626 5484627 Arad_0543 Arad_0545     TRUE 0.929 7.000 0.165 1.000   NA
 5484627 5484628 Arad_0545 Arad_0546     FALSE 0.118 105.000 0.000 NA   NA
 5484628 5484629 Arad_0546 Arad_0547     FALSE 0.179 79.000 0.000 NA   NA
 5484629 5484630 Arad_0547 Arad_0549   gshB FALSE 0.396 73.000 0.015 NA   NA
 5484630 5484631 Arad_0549 Arad_0550 gshB   FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 5484632 5484633 Arad_0552 Arad_0553 cysK1   TRUE 0.665 137.000 0.132 1.000 Y NA
 5484634 5484635 Arad_0554 Arad_0555     FALSE 0.171 24.000 0.000 1.000 N NA
 5484635 5484636 Arad_0555 Arad_0556     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5484637 5484638 Arad_0557 Arad_0558     TRUE 0.948 -3.000 0.059 NA   NA
 5484640 5484641 Arad_0560 Arad_0561   dut TRUE 0.903 0.000 0.008 1.000   NA
 5484643 5484644 Arad_0563 Arad_0564     FALSE 0.533 99.000 0.214 NA   NA
 5484644 5484645 Arad_0564 Arad_0565     FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 5484648 5484649 Arad_0568 Arad_0569     TRUE 0.821 -16.000 0.000 NA   NA
 5484650 5484651 Arad_0570 Arad_0571   betC FALSE 0.078 60.000 0.000 1.000 N NA
 5484653 5484654 Arad_0573 Arad_0574 otsA otsB TRUE 0.924 46.000 0.037 0.000 Y NA
 5484661 5484662 Arad_0581 Arad_0582     TRUE 0.576 23.000 0.028 NA N NA
 5484663 5484664 Arad_0583 Arad_0584     TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA   NA
 5484664 5484665 Arad_0584 Arad_0585     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5484665 5484666 Arad_0585 Arad_0586   hutU FALSE 0.255 65.000 0.000 1.000   NA
 5484666 5484667 Arad_0586 Arad_0588 hutU   FALSE 0.012 369.000 0.068 NA   NA
 5484667 5484668 Arad_0588 Arad_0590     TRUE 0.945 5.000 0.209 NA   NA
 5484668 5484669 Arad_0590 Arad_0591     TRUE 0.944 0.000 0.191 1.000 N NA
 5484669 5484670 Arad_0591 Arad_0592   hutHch TRUE 0.844 10.000 0.074 1.000 N NA
 5484672 5484673 Arad_0594 Arad_0595 ubiB ubiE TRUE 0.610 63.000 0.115 1.000   NA
 5484674 5484675 Arad_0597 Arad_0598 mutM fadB1 FALSE 0.416 34.000 0.004 1.000 N NA
 5484675 5484676 Arad_0598 Arad_0600 fadB1 rpsT FALSE 0.036 193.000 0.003 1.000 N NA
 5484676 5484677 Arad_0600 Arad_0601 rpsT dnaA FALSE 0.000 875.000 0.000 1.000 N NA
 5484677 5484678 Arad_0601 Arad_0603 dnaA   FALSE 0.082 143.000 0.005 NA N NA
 5484681 5484682 Arad_0608 Arad_0609 hemNch rdgB TRUE 0.745 35.000 0.218 1.000 N NA
 5484682 5484683 Arad_0609 Arad_0610 rdgB   TRUE 0.683 12.000 0.013 NA N NA
 5484683 5484684 Arad_0610 Arad_0611   rph TRUE 0.581 20.000 0.019 NA N NA
 5484688 5484689 Arad_0616 Arad_0618 ptsN   TRUE 0.665 89.000 0.353 NA N NA
 5484689 5484690 Arad_0618 Arad_0619   rpoN FALSE 0.001 253.000 0.000 NA N NA
 5484690 5484691 Arad_0619 Arad_0620 rpoN   FALSE 0.011 335.000 0.009 1.000   NA
 5484691 5484692 Arad_0620 Arad_0622   yhbN TRUE 0.974 14.000 0.543 NA   NA
 5484692 5484693 Arad_0622 Arad_0623 yhbN   TRUE 0.963 -3.000 0.144 NA   NA
 5484694 5484695 Arad_0624 Arad_0625 sppA ihfB TRUE 0.710 28.000 0.142 1.000 N NA
 5484695 5484696 Arad_0625 Arad_0626 ihfB   FALSE 0.192 158.000 0.085 NA   NA
 5484696 5484697 Arad_0626 Arad_0628   mcpY FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 5484698 5484699 Arad_0629 Arad_0630     TRUE 0.912 21.000 0.312 NA   NA
 5484700 5484701 Arad_0631 Arad_0632   spoU TRUE 0.973 -3.000 0.213 NA   NA
 5484701 5484702 Arad_0632 Arad_0633 spoU lspA TRUE 0.942 -3.000 0.104 1.000 N NA
 5484702 5484703 Arad_0633 Arad_0634 lspA   FALSE 0.083 56.000 0.000 1.000 N NA
 5484703 5484704 Arad_0634 Arad_0636     FALSE 0.044 224.000 0.026 NA   NA
 5484705 5484706 Arad_0637 Arad_0638 cyaH pta FALSE 0.056 80.000 0.000 1.000 N NA
 5484709 5484710 Arad_0642 Arad_0643 glnD mviN TRUE 0.957 -3.000 0.081 1.000   NA
 5484710 5484711 Arad_0643 Arad_0644 mviN   FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5484711 5484712 Arad_0644 Arad_0645     FALSE 0.056 153.000 0.000 NA   NA
 5484712 5484713 Arad_0645 Arad_0647   trpS FALSE 0.146 113.000 0.016 NA N NA
 5484713 5484714 Arad_0647 Arad_0648 trpS   FALSE 0.474 74.000 0.042 1.000   NA
 5484714 5484715 Arad_0648 Arad_0649   nifUch1 FALSE 0.385 120.000 0.151 1.000   NA
 5484715 5484716 Arad_0649 Arad_0651 nifUch1   TRUE 0.562 149.000 0.061 1.000 Y NA
 5484716 5484717 Arad_0651 Arad_0652   rimI TRUE 0.955 3.000 0.209 1.000   NA
 5484717 5484718 Arad_0652 Arad_0653 rimI fur TRUE 0.658 39.000 0.061 1.000   NA
 5484718 5484719 Arad_0653 Arad_0654 fur olsA TRUE 0.644 31.000 0.091 1.000 N NA
 5484719 5484720 Arad_0654 Arad_0656 olsA   FALSE 0.381 61.000 0.030 1.000 N NA
 5484720 5484721 Arad_0656 Arad_0657   phoH TRUE 0.775 30.000 0.220 1.000 N NA
 5484721 5484722 Arad_0657 Arad_0658 phoH   TRUE 0.990 -3.000 0.457 NA   NA
 5484722 5484723 Arad_0658 Arad_0659     TRUE 0.841 26.000 0.222 NA   NA
 5484723 5484724 Arad_0659 Arad_0660   lnt TRUE 0.617 80.000 0.213 NA   NA
 5484724 5484725 Arad_0660 Arad_0661 lnt   FALSE 0.270 154.000 0.231 1.000 N NA
 5484725 5484726 Arad_0661 Arad_0663   metK FALSE 0.093 189.000 0.113 1.000 N NA
 5484726 5484727 Arad_0663 Arad_0665 metK trmB TRUE 0.962 -3.000 0.112 1.000   NA
 5484728 5484729 Arad_0666 Arad_0667   hsp TRUE 0.972 46.000 0.955 NA   NA
 5484731 5484732 Arad_0669 Arad_0670 mcpX1 rbsK FALSE 0.004 228.000 0.000 1.000 N NA
 5484732 5484733 Arad_0670 Arad_0672 rbsK   FALSE 0.292 103.000 0.024 NA   NA
 5484734 5484735 Arad_0674 Arad_0677 def stdB FALSE 0.003 396.000 0.000 NA   NA
 5484735 5484736 Arad_0677 Arad_0679 stdB fmt TRUE 0.651 23.000 0.006 NA   NA
 5484736 5484737 Arad_0679 Arad_0680 fmt truA TRUE 0.990 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 5484737 5484738 Arad_0680 Arad_0682 truA   FALSE 0.105 126.000 0.000 1.000   NA
 5484739 5484740 Arad_0683 Arad_0684   dapE2 TRUE 0.944 -13.000 0.050 NA   NA
 5484740 5484741 Arad_0684 Arad_0685 dapE2 dapD TRUE 0.611 170.000 0.109 0.001 Y NA
 5484742 5484743 Arad_0687 Arad_0690     FALSE 0.105 112.000 0.000 NA   NA
 5484749 5484750 Arad_0696 Arad_0697 sigK   TRUE 0.985 -3.000 0.349 NA   NA
 5484750 5484751 Arad_0697 Arad_0698     TRUE 0.589 110.000 0.304 NA   NA
 5484753 5484754 Arad_0700 Arad_0701     FALSE 0.289 45.000 0.000 NA   NA
 5484755 5484756 Arad_0703 Arad_0704 yidC rnpA TRUE 0.921 0.000 0.105 1.000 N NA
 5484757 5484758 Arad_0705 Arad_0706 mcpT   FALSE 0.414 25.000 0.000 NA   NA
 5484758 5484759 Arad_0706 Arad_0708   regM TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5484759 5484760 Arad_0708 Arad_5007 regM   FALSE 0.090 125.000 0.000 NA   NA
 5484760 5484761 Arad_5007 Arad_0710     FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 5484763 5484764 Arad_0713 Arad_0714     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 5484764 5484765 Arad_0714 Arad_0715     TRUE 0.934 -3.000 0.026 NA   NA
 5484765 5484766 Arad_0715 Arad_0716     FALSE 0.439 70.000 0.026 NA   NA
 5484767 5484768 Arad_0717 Arad_0718     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5484771 5484772 Arad_0721 Arad_0722 pmtA   TRUE 0.916 12.000 0.250 1.000 N NA
 5484774 5484775 Arad_0724 Arad_0725     TRUE 0.636 41.000 0.026 0.050 N NA
 5484775 5484776 Arad_0725 Arad_0727     FALSE 0.002 521.000 0.000 NA   NA
 5484776 5484777 Arad_0727 Arad_0729     FALSE 0.116 252.000 0.333 NA   NA
 5484777 5484778 Arad_0729 Arad_0730     TRUE 0.784 11.000 0.034 1.000 N NA
 5484778 5484779 Arad_0730 Arad_0731     TRUE 0.691 15.000 0.034 NA N NA
 5484780 5484781 Arad_0732 Arad_0734 fucUch1 frcR TRUE 0.992 -13.000 0.188 1.000 Y NA
 5484782 5484783 Arad_0735 Arad_0736 frcB frcC TRUE 0.827 179.000 0.676 NA Y NA
 5484783 5484784 Arad_0736 Arad_0738 frcC frcA TRUE 0.996 -24.000 0.797 NA   NA
 5484784 5484785 Arad_0738 Arad_0739 frcA frcK TRUE 0.936 -3.000 0.020 1.000   NA
 5484785 5484786 Arad_0739 Arad_0740 frcK pyrC FALSE 0.191 97.000 0.009 1.000 N NA
 5484788 5484789 Arad_0742 Arad_0743 pyrE frk FALSE 0.334 77.000 0.039 1.000 N NA
 5484790 5484791 Arad_0744 Arad_0745 pgi fadD FALSE 0.076 175.000 0.035 1.000 N NA
 5484791 5484792 Arad_0745 Arad_0747 fadD   FALSE 0.041 169.000 0.000 NA   NA
 5484792 5484793 Arad_0747 Arad_0748   gloA FALSE 0.124 103.000 0.000 NA   NA
 5484795 5484796 Arad_0751 Arad_0752     TRUE 0.998 -3.000 0.542 NA Y NA
 5484796 5484797 Arad_0752 Arad_0753     TRUE 0.994 6.000 0.489 NA Y NA
 5484797 5484798 Arad_0753 Arad_0755     FALSE 0.488 166.000 0.521 NA N NA
 5484799 5484800 Arad_0756 Arad_0757     FALSE 0.450 22.000 0.000 NA   NA
 5484803 5484804 Arad_5048 Arad_0761     FALSE 0.074 139.000 0.000 NA   NA
 5484807 5484808 Arad_0764 Arad_0766 phoR pstS FALSE 0.064 188.000 0.056 NA N NA
 5484808 5484809 Arad_0766 Arad_0768 pstS pstC TRUE 0.968 13.000 0.107 NA Y NA
 5484809 5484810 Arad_0768 Arad_0769 pstC pstA TRUE 0.998 -3.000 0.485 0.002 Y NA
 5484810 5484811 Arad_0769 Arad_0770 pstA pstB TRUE 0.992 15.000 0.402 0.002 Y NA
 5484811 5484812 Arad_0770 Arad_0771 pstB phoU TRUE 0.909 52.000 0.203 NA Y NA
 5484812 5484813 Arad_0771 Arad_0772 phoU phoB FALSE 0.418 81.000 0.128 NA N NA
 5484815 5484816 Arad_0775 Arad_0776 argD1 argF FALSE 0.465 168.000 0.058 1.000 Y NA
 5484816 5484817 Arad_0776 Arad_0778 argF hsp33 FALSE 0.479 50.000 0.052 1.000 N NA
 5484818 5484819 Arad_0779 Arad_0780 apaG metZ FALSE 0.013 304.000 0.066 NA N NA
 5484820 5484821 Arad_0783 Arad_5008 dcd   FALSE 0.237 59.000 0.000 NA   NA
 5484821 5484822 Arad_5008 Arad_0784     FALSE 0.040 170.000 0.000 NA   NA
 5484822 5484823 Arad_0784 Arad_0785     FALSE 0.066 153.000 0.000 1.000   NA
 5484824 5484825 Arad_0786 Arad_0787     FALSE 0.525 83.000 0.143 NA   NA
 5484825 5484826 Arad_0787 Arad_0788     TRUE 0.877 16.000 0.185 NA   NA
 5484826 5484827 Arad_0788 Arad_0789     FALSE 0.074 139.000 0.000 NA   NA
 5484828 5484829 Arad_0790 Arad_0791   pyrD TRUE 0.958 -3.000 0.108 NA   NA
 5484830 5484831 Arad_0792 Arad_0793 dinF   TRUE 0.756 18.000 0.030 NA   NA
 5484831 5484832 Arad_0793 Arad_0795     TRUE 0.968 2.000 0.275 NA   NA
 5484833 5484834 Arad_0796 Arad_0797     TRUE 0.588 73.000 0.162 NA   NA
 5484837 5484838 Arad_0800 Arad_0802     TRUE 0.878 24.000 0.262 NA   NA
 5484839 5484840 Arad_0803 Arad_0804 lhr   TRUE 0.849 72.000 0.460 1.000   NA
 5484843 5484844 Arad_0807 Arad_0808     TRUE 0.980 -3.000 0.274 NA   NA
 5484847 5484848 Arad_0813 Arad_0815 acd1 fadA TRUE 0.945 36.000 0.247 1.000 Y NA
 5484848 5484849 Arad_0815 Arad_0816 fadA fadB2 TRUE 0.992 15.000 0.562 1.000 Y NA
 5484851 5484852 Arad_0818 Arad_0821   mscL FALSE 0.012 251.000 0.000 1.000   NA
 5484852 5484853 Arad_0821 Arad_0823 mscL aspB1 FALSE 0.095 148.000 0.012 1.000 N NA
 5484853 5484854 Arad_0823 Arad_0826 aspB1 galE FALSE 0.043 226.000 0.080 1.000 N NA
 5484856 5484857 Arad_0828 Arad_0830     TRUE 0.990 17.000 0.548 NA Y NA
 5484857 5484858 Arad_0830 Arad_0832     TRUE 0.999 3.000 1.000 0.047 Y NA
 5484858 5484859 Arad_0832 Arad_0833     TRUE 0.994 5.000 0.447 NA Y NA
 5484859 5484860 Arad_0833 Arad_0834     TRUE 0.999 -3.000 0.902 NA Y NA
 5484860 5484861 Arad_0834 Arad_0835     TRUE 0.989 12.000 0.390 NA Y NA
 5484861 5484862 Arad_0835 Arad_0836     FALSE 0.110 40.000 0.000 1.000 N NA
 5484862 5484863 Arad_0836 Arad_0837   mmsB TRUE 0.932 23.000 0.032 1.000 Y NA
 5484866 5484867 Arad_0841 Arad_0842 secD   TRUE 0.579 94.000 0.231 NA   NA
 5484867 5484868 Arad_0842 Arad_0843     TRUE 0.818 16.000 0.067 NA   NA
 5484868 5484869 Arad_0843 Arad_0844     FALSE 0.001 352.000 0.000 1.000 N NA
 5484870 5484871 Arad_0845 Arad_0847 mcpE   TRUE 0.693 63.000 0.217 NA   NA
 5484871 5484872 Arad_0847 Arad_0848   cheY1 TRUE 0.992 -3.000 0.525 NA   NA
 5484872 5484873 Arad_0848 Arad_0850 cheY1 cheA TRUE 0.972 77.000 0.711 1.000 Y NA
 5484873 5484874 Arad_0850 Arad_0851 cheA cheW1 TRUE 0.985 5.000 0.044 0.006 Y NA
 5484874 5484875 Arad_0851 Arad_0852 cheW1 cheRch1 TRUE 0.989 -3.000 0.047 1.000 Y NA
 5484875 5484876 Arad_0852 Arad_0853 cheRch1 cheBch1 TRUE 0.997 -3.000 0.439 1.000 Y NA
 5484876 5484877 Arad_0853 Arad_0854 cheBch1 cheY2 TRUE 0.995 0.000 0.258 0.012 Y NA
 5484877 5484878 Arad_0854 Arad_0855 cheY2 cheD TRUE 0.996 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 5484878 5484879 Arad_0855 Arad_0856 cheD   TRUE 0.873 18.000 0.200 NA   NA
 5484879 5484880 Arad_0856 Arad_0858   fliF FALSE 0.203 168.000 0.158 NA   NA
 5484880 5484881 Arad_0858 Arad_0859 fliF   FALSE 0.000 527.000 0.000 1.000 N NA
 5484881 5484882 Arad_0859 Arad_0860     TRUE 0.982 12.000 0.133 0.028 Y NA
 5484883 5484884 Arad_0861 Arad_0863   flhB TRUE 0.986 6.000 0.595 NA   NA
 5484884 5484885 Arad_0863 Arad_0864 flhB fliG TRUE 0.946 94.000 0.571 1.000 Y NA
 5484885 5484886 Arad_0864 Arad_0867 fliG fliN TRUE 0.941 169.000 0.875 0.003 Y NA
 5484886 5484887 Arad_0867 Arad_0870 fliN fliM TRUE 0.956 65.000 0.485 NA Y NA
 5484887 5484888 Arad_0870 Arad_0871 fliM motA TRUE 0.998 6.000 0.879 NA Y NA
 5484889 5484890 Arad_0873 Arad_0875 flgF fliI TRUE 0.993 13.000 0.529 1.000 Y NA
 5484890 5484891 Arad_0875 Arad_0876 fliI   TRUE 0.968 2.000 0.275 NA   NA
 5484891 5484892 Arad_0876 Arad_0877   flgB FALSE 0.260 119.000 0.040 NA   NA
 5484892 5484893 Arad_0877 Arad_0879 flgB flgC TRUE 0.997 17.000 0.804 0.001 Y NA
 5484893 5484894 Arad_0879 Arad_0880 flgC fliE TRUE 0.992 0.000 0.115 0.001 Y NA
 5484894 5484895 Arad_0880 Arad_0881 fliE flgG TRUE 0.976 99.000 0.771 0.003 Y NA
 5484895 5484896 Arad_0881 Arad_0882 flgG flgA TRUE 0.898 19.000 0.252 NA   NA
 5484896 5484897 Arad_0882 Arad_0884 flgA flgI TRUE 0.979 -3.000 0.261 NA   NA
 5484897 5484898 Arad_0884 Arad_0885 flgI   TRUE 0.992 -3.000 0.531 NA   NA
 5484898 5484899 Arad_0885 Arad_0886   flgH TRUE 0.993 -3.000 0.592 NA   NA
 5484899 5484900 Arad_0886 Arad_0887 flgH fliL TRUE 0.922 46.000 0.043 0.004 Y NA
 5484900 5484901 Arad_0887 Arad_0889 fliL fliP TRUE 0.989 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 5484903 5484904 Arad_0893 Arad_0895 flaCe flaCe FALSE 0.145 258.000 0.000 0.001 Y NA
 5484905 5484906 Arad_0897 Arad_0898     TRUE 0.855 -6.000 0.000 1.000   NA
 5484907 5484908 Arad_0899 Arad_0900   flaCch4 FALSE 0.140 262.000 0.000 0.001 Y NA
 5484908 5484909 Arad_0900 Arad_0901 flaCch4   FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5484909 5484910 Arad_0901 Arad_0902   motB TRUE 0.979 -3.000 0.263 NA   NA
 5484910 5484911 Arad_0902 Arad_0903 motB motC TRUE 0.992 4.000 0.737 NA   NA
 5484911 5484912 Arad_0903 Arad_0905 motC motD TRUE 0.971 7.000 0.379 NA   NA
 5484912 5484913 Arad_0905 Arad_0906 motD   TRUE 0.974 -19.000 0.229 NA   NA
 5484913 5484914 Arad_0906 Arad_0907     FALSE 0.001 280.000 0.000 NA N NA
 5484914 5484915 Arad_0907 Arad_0910   flgEf FALSE 0.002 282.000 0.000 1.000 N NA
 5484915 5484916 Arad_0910 Arad_0911 flgEf flgK TRUE 0.926 25.000 0.000 0.003 Y NA
 5484916 5484917 Arad_0911 Arad_0912 flgK flgLch TRUE 0.877 46.000 0.000 0.003 Y NA
 5484917 5484918 Arad_0912 Arad_0913 flgLch flaF TRUE 0.823 38.000 0.000 NA Y NA
 5484918 5484919 Arad_0913 Arad_0914 flaF flbT TRUE 0.985 57.000 0.829 NA Y NA
 5484919 5484920 Arad_0914 Arad_0916 flbT flgD TRUE 0.998 -9.000 0.528 NA Y NA
 5484920 5484921 Arad_0916 Arad_0918 flgD fliQ TRUE 0.965 56.000 0.509 NA Y NA
 5484921 5484922 Arad_0918 Arad_0919 fliQ flhA TRUE 0.841 151.000 0.349 0.001 Y NA
 5484922 5484923 Arad_0919 Arad_0920 flhA fliR TRUE 0.995 -3.000 0.186 0.001 Y NA
 5484923 5484924 Arad_0920 Arad_0922 fliR   TRUE 0.970 5.000 0.350 NA   NA
 5484924 5484925 Arad_0922 Arad_0923     TRUE 0.570 132.000 0.360 NA   NA
 5484925 5484926 Arad_0923 Arad_0925     TRUE 0.962 14.000 0.440 NA   NA
 5484926 5484927 Arad_0925 Arad_0927     TRUE 0.989 -3.000 0.438 NA   NA
 5484927 5484928 Arad_0927 Arad_0928   cpsF FALSE 0.031 256.000 0.043 NA   NA
 5484928 5484929 Arad_0928 Arad_0929 cpsF   TRUE 0.839 79.000 0.130 1.000 Y NA
 5484929 5484930 Arad_0929 Arad_0930   folDch FALSE 0.036 105.000 0.000 1.000 N NA
 5484932 5484933 Arad_0932 Arad_0933 aglE aglF TRUE 0.923 133.000 0.670 NA Y NA
 5484933 5484934 Arad_0933 Arad_0935 aglF aglG TRUE 0.998 2.000 0.693 NA Y NA
 5484934 5484935 Arad_0935 Arad_0936 aglG aglA TRUE 0.960 43.000 0.387 NA Y NA
 5484935 5484936 Arad_0936 Arad_0937 aglA aglK TRUE 0.992 22.000 0.697 1.000 Y NA
 5484936 5484937 Arad_0937 Arad_0939 aglK   FALSE 0.475 140.000 0.303 NA   NA
 5484940 5484941 Arad_0942 Arad_0943 edd pgl FALSE 0.502 181.000 0.202 1.000 Y NA
 5484941 5484942 Arad_0943 Arad_0944 pgl zwf TRUE 0.988 -13.000 0.028 1.000 Y NA
 5484942 5484943 Arad_0944 Arad_0945 zwf ordL FALSE 0.228 130.000 0.088 1.000 N NA
 5484943 5484944 Arad_0945 Arad_0947 ordL glnA1 TRUE 0.995 14.000 0.706 1.000 Y NA
 5484945 5484946 Arad_0948 Arad_0949     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5484946 5484947 Arad_0949 Arad_0951     FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 5484947 5484948 Arad_0951 Arad_0952     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484948 5484949 Arad_0952 Arad_0953   mcpZch1 FALSE 0.092 122.000 0.000 NA   NA
 5484949 5484950 Arad_0953 Arad_0954 mcpZch1   FALSE 0.001 319.000 0.000 1.000 N NA
 5484950 5484951 Arad_0954 Arad_0955   potF FALSE 0.013 167.000 0.000 1.000 N NA
 5484951 5484952 Arad_0955 Arad_0957 potF potG TRUE 0.910 120.000 0.541 1.000 Y NA
 5484952 5484953 Arad_0957 Arad_0959 potG potH TRUE 0.997 0.000 0.545 NA Y NA
 5484953 5484954 Arad_0959 Arad_0960 potH potI TRUE 0.998 4.000 0.758 NA Y NA
 5484956 5484957 Arad_0962 Arad_0963   deaD FALSE 0.001 352.000 0.000 1.000 N NA
 5484958 5484959 Arad_0965 Arad_0966     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5484960 5484961 Arad_0967 Arad_5009     FALSE 0.015 225.000 0.000 NA   NA
 5484965 5484966 Arad_0974 Arad_0976 mmsA   FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 5484966 5484967 Arad_0976 Arad_0978     FALSE 0.051 158.000 0.000 NA   NA
 5484967 5484968 Arad_0978 Arad_0979     TRUE 0.994 -22.000 0.637 NA   NA
 5484968 5484969 Arad_0979 Arad_0980   rirA FALSE 0.141 136.000 0.038 NA N NA
 5484969 5484970 Arad_0980 Arad_0982 rirA dppAch1 FALSE 0.000 341.000 0.000 NA N NA
 5484970 5484971 Arad_0982 Arad_0984 dppAch1 dppBch1 TRUE 0.866 60.000 0.097 NA Y NA
 5484971 5484972 Arad_0984 Arad_0985 dppBch1 dppCch1 TRUE 0.997 10.000 0.779 NA Y NA
 5484972 5484973 Arad_0985 Arad_0987 dppCch1 dppDch1 TRUE 0.997 0.000 0.560 NA Y NA
 5484973 5484974 Arad_0987 Arad_0988 dppDch1 dppFch1 TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.005 Y NA
 5484974 5484975 Arad_0988 Arad_0989 dppFch1 gntK FALSE 0.361 111.000 0.065 0.099 N NA
 5484976 5484977 Arad_0990 Arad_0991     FALSE 0.321 126.000 0.088 1.000   NA
 5484977 5484978 Arad_0991 Arad_0992     TRUE 0.939 0.000 0.074 1.000   NA
 5484979 5484980 Arad_0993 Arad_0995   rpoE1 FALSE 0.033 191.000 0.000 1.000   NA
 5484980 5484981 Arad_0995 Arad_0997 rpoE1   TRUE 0.988 17.000 0.500 NA Y NA
 5484983 5484984 Arad_1000 Arad_1001   ppx1 FALSE 0.021 89.000 0.000 NA N NA
 5484984 5484985 Arad_1001 Arad_1002 ppx1 ftsJ TRUE 0.978 -3.000 0.316 NA N NA
 5484985 5484986 Arad_1002 Arad_1003 ftsJ   FALSE 0.483 64.000 0.035 NA   NA
 5484988 5484989 Arad_1005 Arad_1006   guaB FALSE 0.044 216.000 0.002 1.000   NA
 5484989 5484990 Arad_1006 Arad_1008 guaB   TRUE 0.856 4.000 0.005 NA   NA
 5484990 5484991 Arad_1008 Arad_1009     FALSE 0.513 71.000 0.070 NA   NA
 5484991 5484992 Arad_1009 Arad_1012     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 5484994 5484995 Arad_1015 Arad_1017     FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 5484996 5484997 Arad_1018 Arad_1019     FALSE 0.093 121.000 0.000 NA   NA
 5484997 5484998 Arad_1019 Arad_1020     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5484998 5484999 Arad_1020 Arad_1021     TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5484999 5485000 Arad_1021 Arad_1023     FALSE 0.275 128.000 0.066 NA   NA
 5485001 5485002 Arad_1024 Arad_1025     FALSE 0.158 97.000 0.000 1.000   NA
 5485003 5485004 Arad_1026 Arad_1027     TRUE 0.827 11.000 0.019 NA   NA
 5485004 5485005 Arad_1027 Arad_1028     FALSE 0.379 104.000 0.069 1.000   NA
 5485006 5485007 Arad_1031 Arad_1033   ahcY FALSE 0.256 117.000 0.086 1.000 N NA
 5485009 5485010 Arad_1035 Arad_1036 glcD glcE TRUE 0.996 -3.000 0.266 0.013 Y NA
 5485010 5485011 Arad_1036 Arad_1037 glcE glcF TRUE 0.980 17.000 0.227 0.049 Y NA
 5485012 5485013 Arad_1038 Arad_1039   lpxQ FALSE 0.201 72.000 0.000 NA   NA
 5485013 5485014 Arad_1039 Arad_1040 lpxQ   FALSE 0.153 216.000 0.273 NA   NA
 5485014 5485015 Arad_1040 Arad_1041     FALSE 0.120 204.000 0.172 NA   NA
 5485016 5485017 Arad_1042 Arad_1044 tag   TRUE 0.925 -3.000 0.013 NA   NA
 5485024 5485025 Arad_1052 Arad_1054     TRUE 0.932 81.000 0.833 NA   NA
 5485026 5485027 Arad_1055 Arad_1056 hisS hisZ TRUE 0.957 1.000 0.097 0.001 N NA
 5485027 5485028 Arad_1056 Arad_1058 hisZ hisG TRUE 0.992 0.000 0.239 1.000 Y NA
 5485029 5485030 Arad_1059 Arad_1061     TRUE 0.970 -13.000 0.200 NA   NA
 5485030 5485031 Arad_1061 Arad_1062     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 5485033 5485034 Arad_1066 Arad_1067   groEL FALSE 0.002 432.000 0.000 NA   NA
 5485034 5485035 Arad_1067 Arad_1068 groEL groES TRUE 0.969 76.000 0.565 0.099 Y NA
 5485036 5485037 Arad_1070 Arad_1071 chrA   FALSE 0.209 105.000 0.027 1.000 N NA
 5485037 5485038 Arad_1071 Arad_1072   ribF TRUE 0.730 16.000 0.049 1.000 N NA
 5485038 5485039 Arad_1072 Arad_1073 ribF mctS FALSE 0.001 344.000 0.000 1.000 N NA
 5485039 5485040 Arad_1073 Arad_1074 mctS mctR TRUE 0.997 -3.000 0.312 0.014 Y NA
 5485040 5485041 Arad_1074 Arad_1075 mctR   FALSE 0.294 103.000 0.025 NA   NA
 5485041 5485042 Arad_1075 Arad_1076   mctP TRUE 0.998 -10.000 0.947 NA   NA
 5485042 5485043 Arad_1076 Arad_1078 mctP ileS FALSE 0.001 299.000 0.000 NA N NA
 5485043 5485044 Arad_1078 Arad_1079 ileS   FALSE 0.195 134.000 0.019 NA   NA
 5485046 5485047 Arad_1082 Arad_1083 rluB   TRUE 0.862 7.000 0.079 1.000 N NA
 5485047 5485048 Arad_1083 Arad_1085     TRUE 0.729 19.000 0.013 1.000   NA
 5485050 5485051 Arad_1087 Arad_1088 pmbA   TRUE 0.573 81.000 0.182 NA   NA
 5485051 5485052 Arad_1088 Arad_1090   kdtA FALSE 0.001 434.000 0.000 1.000 N NA
 5485052 5485053 Arad_1090 Arad_1091 kdtA   TRUE 0.836 15.000 0.062 1.000   NA
 5485053 5485054 Arad_1091 Arad_1092   lpxK FALSE 0.314 97.000 0.015 1.000   NA
 5485055 5485056 Arad_1093 Arad_1095   mutL FALSE 0.357 84.000 0.019 NA   NA
 5485057 5485058 Arad_1096 Arad_1097     TRUE 0.934 101.000 0.538 1.000 Y NA
 5485061 5485062 Arad_1100 Arad_1101     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 5485062 5485063 Arad_1101 Arad_1102   kdgA TRUE 0.988 5.000 0.253 NA Y NA
 5485063 5485064 Arad_1102 Arad_1103 kdgA dgoK TRUE 0.990 0.000 0.205 1.000 Y NA
 5485064 5485065 Arad_1103 Arad_1105 dgoK fabG1 TRUE 0.976 0.000 0.367 1.000 N NA
 5485066 5485067 Arad_1106 Arad_1107     FALSE 0.042 331.000 0.000 1.000 Y NA
 5485067 5485068 Arad_1107 Arad_1109   mrp FALSE 0.000 621.000 0.000 1.000 N NA
 5485068 5485069 Arad_1109 Arad_1111 mrp corA FALSE 0.000 504.000 0.000 1.000 N NA
 5485069 5485070 Arad_1111 Arad_1113 corA kupch1 TRUE 0.960 18.000 0.133 1.000 Y NA
 5485070 5485071 Arad_1113 Arad_1114 kupch1   FALSE 0.011 174.000 0.000 1.000 N NA
 5485071 5485072 Arad_1114 Arad_1115   atpI FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 5485072 5485073 Arad_1115 Arad_1117 atpI atpB TRUE 0.590 80.000 0.195 NA   NA
 5485073 5485074 Arad_1117 Arad_1119 atpB atpE TRUE 0.941 69.000 0.628 0.002   NA
 5485074 5485075 Arad_1119 Arad_1120 atpE atpF1 TRUE 0.791 83.000 0.278 0.002   NA
 5485075 5485076 Arad_1120 Arad_1121 atpF1 atpF TRUE 0.999 3.000 0.863 0.002 Y NA
 5485076 5485077 Arad_1121 Arad_1123 atpF   FALSE 0.073 140.000 0.000 NA   NA
 5485078 5485079 Arad_1124 Arad_1125 rnhB   TRUE 0.689 105.000 0.022 1.000 Y NA
 5485080 5485081 Arad_1126 Arad_1127     FALSE 0.197 183.000 0.214 NA   NA
 5485082 5485083 Arad_1128 Arad_1130 moaB ispE TRUE 0.855 0.000 0.018 1.000 N NA
 5485083 5485084 Arad_1130 Arad_1132 ispE   TRUE 0.909 9.000 0.107 1.000   NA
 5485084 5485085 Arad_1132 Arad_1133   ispB FALSE 0.535 53.000 0.028 1.000   NA
 5485087 5485088 Arad_1138 Arad_1139     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5485089 5485090 Arad_4987 Arad_1143   sohB FALSE 0.236 71.000 0.000 1.000   NA
 5485090 5485091 Arad_1143 Arad_1145 sohB   TRUE 0.746 17.000 0.019 NA   NA
 5485092 5485093 Arad_1146 Arad_1147     TRUE 0.659 9.000 0.000 NA   NA
 5485094 5485095 Arad_1148 Arad_1149 glyQ   FALSE 0.301 88.000 0.003 NA   NA
 5485095 5485096 Arad_1149 Arad_1151   aroA FALSE 0.310 88.000 0.007 NA   NA
 5485096 5485097 Arad_1151 Arad_1152 aroA   FALSE 0.320 85.000 0.006 NA   NA
 5485097 5485098 Arad_1152 Arad_1154     FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5485098 5485099 Arad_1154 Arad_1155   glyS TRUE 0.895 2.000 0.013 1.000   NA
 5485099 5485100 Arad_1155 Arad_1157 glyS   TRUE 0.742 15.000 0.006 NA   NA
 5485101 5485102 Arad_1158 Arad_1159 mcpV2   FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 5485102 5485103 Arad_1159 Arad_1161   purD FALSE 0.205 121.000 0.010 NA   NA
 5485104 5485105 Arad_1162 Arad_1163   cfa FALSE 0.019 146.000 0.000 1.000 N NA
 5485107 5485108 Arad_1165 Arad_1166   ubiA FALSE 0.032 65.000 0.000 NA N NA
 5485108 5485109 Arad_1166 Arad_1167 ubiA   FALSE 0.311 49.000 0.000 1.000   NA
 5485111 5485112 Arad_1171 Arad_1172   ftsK1 FALSE 0.048 162.000 0.000 NA   NA
 5485113 5485114 Arad_1173 Arad_1174     TRUE 0.659 35.000 0.158 NA N NA
 5485114 5485115 Arad_1174 Arad_1176     FALSE 0.535 59.000 0.053 NA   NA
 5485116 5485117 Arad_1178 Arad_1180     FALSE 0.001 586.000 0.000 NA   NA
 5485117 5485118 Arad_1180 Arad_1182     TRUE 0.984 4.000 0.455 0.046 N NA
 5485122 5485123 Arad_1187 Arad_1189     TRUE 0.987 11.000 0.303 1.000 Y NA
 5485124 5485125 Arad_1191 Arad_1193 rumA   TRUE 0.989 -3.000 0.062 NA Y NA
 5485126 5485127 Arad_1195 Arad_1197 mcpU   FALSE 0.051 309.000 0.000 1.000 Y NA
 5485128 5485129 Arad_1198 Arad_1200 dxs   FALSE 0.208 126.000 0.017 NA   NA
 5485129 5485130 Arad_1200 Arad_1202   xseB FALSE 0.356 75.000 0.003 NA   NA
 5485130 5485131 Arad_1202 Arad_1203 xseB   TRUE 0.807 3.000 0.019 NA N NA
 5485133 5485134 Arad_1206 Arad_1208 bioY bioN TRUE 0.818 29.000 0.211 NA   NA
 5485134 5485135 Arad_1208 Arad_1209 bioN bioM TRUE 0.998 0.000 0.729 1.000 Y NA
 5485137 5485138 Arad_1211 Arad_1213 ribA aroC TRUE 0.761 11.000 0.023 1.000 N NA
 5485140 5485141 Arad_1216 Arad_1217 gpmB fabI2 TRUE 0.943 21.000 0.397 0.078 N NA
 5485141 5485142 Arad_1217 Arad_1218 fabI2 dnaJ2 TRUE 0.654 122.000 0.404 1.000   NA
 5485142 5485143 Arad_1218 Arad_1219 dnaJ2   FALSE 0.026 293.000 0.087 NA   NA
 5485146 5485147 Arad_1222 Arad_1223 dacF1   FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5485148 5485149 Arad_1224 Arad_1226 tldD   FALSE 0.481 65.000 0.037 NA   NA
 5485150 5485151 Arad_1227 Arad_1228 coxB ctaD TRUE 0.997 16.000 0.741 0.001 Y NA
 5485151 5485152 Arad_1228 Arad_1229 ctaD cyoE TRUE 0.691 58.000 0.153 0.046 N NA
 5485152 5485153 Arad_1229 Arad_1230 cyoE   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5485153 5485154 Arad_1230 Arad_1231   ctaG TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5485154 5485155 Arad_1231 Arad_1232 ctaG ctaE TRUE 0.979 7.000 0.536 1.000 N NA
 5485155 5485156 Arad_1232 Arad_1234 ctaE   FALSE 0.041 169.000 0.000 NA   NA
 5485156 5485157 Arad_1234 Arad_1235     FALSE 0.013 233.000 0.000 NA   NA
 5485157 5485158 Arad_1235 Arad_1236     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 5485158 5485159 Arad_1236 Arad_1237     TRUE 0.649 49.000 0.116 NA   NA
 5485161 5485162 Arad_1241 Arad_1242     TRUE 0.985 -7.000 0.340 NA   NA
 5485162 5485163 Arad_1242 Arad_1244   ispH FALSE 0.196 161.000 0.105 NA   NA
 5485163 5485164 Arad_1244 Arad_1245 ispH thrB TRUE 0.831 35.000 0.251 1.000   NA
 5485164 5485165 Arad_1245 Arad_1246 thrB rnhA TRUE 0.960 -3.000 0.104 1.000   NA
 5485165 5485166 Arad_1246 Arad_1247 rnhA   FALSE 0.002 464.000 0.000 NA   NA
 5485166 5485167 Arad_1247 Arad_1248     FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5485168 5485169 Arad_1249 Arad_1250     TRUE 0.974 29.000 0.400 1.000 Y NA
 5485169 5485170 Arad_1250 Arad_1251     TRUE 0.998 -3.000 0.465 0.098 Y NA
 5485170 5485171 Arad_1251 Arad_1253     FALSE 0.001 325.000 0.000 1.000 N NA
 5485171 5485172 Arad_1253 Arad_1255     TRUE 0.914 82.000 0.357 NA Y NA
 5485173 5485174 Arad_1256 Arad_1258     FALSE 0.322 90.000 0.014 NA   NA
 5485174 5485175 Arad_1258 Arad_1259     TRUE 0.551 130.000 0.333 NA   NA
 5485176 5485177 Arad_1260 Arad_1261   rimJ TRUE 0.976 -3.000 0.293 1.000 N NA
 5485177 5485178 Arad_1261 Arad_1262 rimJ   TRUE 0.940 52.000 0.674 1.000   NA
 5485178 5485179 Arad_1262 Arad_1264   thrC TRUE 0.825 21.000 0.129 1.000   NA
 5485182 5485183 Arad_1268 Arad_1269     FALSE 0.205 160.000 0.115 NA   NA
 5485183 5485184 Arad_1269 Arad_1270     TRUE 0.691 33.000 0.079 NA   NA
 5485185 5485186 Arad_1271 Arad_1272     FALSE 0.023 137.000 0.000 1.000 N NA
 5485187 5485188 Arad_1273 Arad_1274     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 5485188 5485189 Arad_1274 Arad_1275   ccrM FALSE 0.292 120.000 0.050 1.000   NA
 5485190 5485191 Arad_1277 Arad_1279     TRUE 0.894 5.000 0.052 NA   NA
 5485191 5485192 Arad_1279 Arad_1280   mutY TRUE 0.747 18.000 0.016 1.000   NA
 5485193 5485194 Arad_1281 Arad_1282     FALSE 0.371 168.000 0.333 NA   NA
 5485194 5485195 Arad_1282 Arad_1283   smc FALSE 0.093 160.000 0.039 NA N NA
 5485195 5485196 Arad_1283 Arad_1285 smc   FALSE 0.070 142.000 0.000 NA   NA
 5485197 5485198 Arad_1286 Arad_1287     TRUE 0.976 10.000 0.467 NA   NA
 5485200 5485201 Arad_1291 Arad_1292     TRUE 0.626 88.000 0.250 NA   NA
 5485203 5485204 Arad_1295 Arad_1296     TRUE 0.928 -3.000 0.017 NA   NA
 5485206 5485207 Arad_1297 Arad_1299     FALSE 0.017 218.000 0.000 NA   NA
 5485209 5485210 Arad_1300 Arad_1301     TRUE 0.827 -9.000 0.000 NA   NA
 5485211 5485212 Arad_1304 Arad_1306     FALSE 0.001 1121.000 0.000 NA   NA
 5485212 5485213 Arad_1306 Arad_1307     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5485214 5485215 Arad_1309 Arad_1310     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5485217 5485218 Arad_1312 Arad_1314     FALSE 0.002 404.000 0.000 NA   NA
 5485220 5485221 Arad_1317 Arad_1318     FALSE 0.001 823.000 0.000 NA   NA
 5485222 5485223 Arad_1320 Arad_1321     FALSE 0.001 683.000 0.000 NA   NA
 5485224 5485225 Arad_1322 Arad_1323     TRUE 0.823 -13.000 0.000 NA   NA
 5485226 5485227 Arad_1324 Arad_1325     FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 5485227 5485228 Arad_1325 Arad_1327   msrB FALSE 0.003 189.000 0.000 NA N NA
 5485228 5485229 Arad_1327 Arad_1329 msrB msrAb TRUE 0.998 -3.000 0.404 0.001 Y NA
 5485232 5485233 Arad_1335 Arad_1337   ropAch3 FALSE 0.003 376.000 0.000 1.000   NA
 5485233 5485234 Arad_1337 Arad_1338 ropAch3   FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 5485234 5485235 Arad_1338 Arad_1339     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5485237 5485238 Arad_1342 Arad_1343 cysN cysD TRUE 0.957 2.000 0.100 0.000 N NA
 5485238 5485239 Arad_1343 Arad_1345 cysD cysH TRUE 0.583 134.000 0.017 1.000 Y NA
 5485242 5485243 Arad_1349 Arad_1350     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5485244 5485245 Arad_1351 Arad_1352 betA betB TRUE 0.572 168.000 0.634 1.000 N NA
 5485245 5485246 Arad_1352 Arad_1353 betB gstA TRUE 0.823 0.000 0.012 NA N NA
 5485246 5485247 Arad_1353 Arad_1354 gstA betI TRUE 0.814 2.000 0.016 NA N NA
 5485248 5485249 Arad_1355 Arad_1357     FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5485249 5485250 Arad_1357 Arad_1358     FALSE 0.112 199.000 0.107 1.000   NA
 5485250 5485251 Arad_1358 Arad_1359     TRUE 0.545 82.000 0.214 1.000 N NA
 5485253 5485254 Arad_1361 Arad_1362     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA N NA
 5485256 5485257 Arad_1363 Arad_1365   gstch6 FALSE 0.090 183.000 0.028 NA   NA
 5485261 5485262 Arad_1372 Arad_1373   ivdH TRUE 0.654 31.000 0.007 0.045 N NA
 5485262 5485263 Arad_1373 Arad_1374 ivdH mccA TRUE 0.957 37.000 0.316 1.000 Y NA
 5485263 5485264 Arad_1374 Arad_1375 mccA   TRUE 0.692 11.000 0.009 NA N NA
 5485264 5485265 Arad_1375 Arad_1376     TRUE 0.716 10.000 0.012 NA N NA
 5485265 5485266 Arad_1376 Arad_1377   pyc TRUE 0.979 -3.000 0.229 0.077 N NA
 5485266 5485267 Arad_1377 Arad_1378 pyc fadB1 TRUE 0.978 -3.000 0.218 0.077 N NA
 5485269 5485270 Arad_1380 Arad_1381     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5485270 5485271 Arad_1381 Arad_1382     TRUE 0.993 0.000 0.751 NA N NA
 5485271 5485272 Arad_1382 Arad_1383     FALSE 0.386 91.000 0.037 1.000   NA
 5485273 5485274 Arad_1385 Arad_1386 bhbA bhbA FALSE 0.336 254.000 0.220 0.000 Y NA
 5485275 5485276 Arad_1387 Arad_1389     TRUE 0.547 163.000 0.500 NA   NA
 5485278 5485279 Arad_1391 Arad_1392     FALSE 0.235 133.000 0.044 NA   NA
 5485279 5485280 Arad_1392 Arad_1393     TRUE 0.989 11.000 0.763 NA   NA
 5485282 5485283 Arad_1395 Arad_1397     FALSE 0.156 160.000 0.046 NA   NA
 5485285 5485286 Arad_1400 Arad_1402     FALSE 0.172 82.000 0.000 NA   NA
 5485287 5485288 Arad_1403 Arad_1405 zwf tam FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000   NA
 5485288 5485289 Arad_1405 Arad_1406 tam   FALSE 0.286 55.000 0.000 1.000   NA
 5485293 5485294 Arad_1416 Arad_1417     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5485294 5485295 Arad_1417 Arad_1418     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5485295 5485296 Arad_1418 Arad_1419     FALSE 0.121 104.000 0.000 NA   NA
 5485296 5485297 Arad_1419 Arad_1421     FALSE 0.272 49.000 0.000 NA   NA
 5485297 5485298 Arad_1421 Arad_1422     FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5485300 5485301 Arad_1424 Arad_1426   cspA1 FALSE 0.024 198.000 0.000 NA   NA
 5485302 5485303 Arad_1428 Arad_1430 sodB   FALSE 0.287 102.000 0.011 1.000   NA
 5485307 5485308 Arad_1437 Arad_1439   cycF FALSE 0.190 156.000 0.154 1.000 N NA
 5485308 5485309 Arad_1439 Arad_1441 cycF cycG TRUE 0.928 107.000 0.424 0.006 Y NA
 5485313 5485314 Arad_1445 Arad_1447     TRUE 0.730 38.000 0.163 NA   NA
 5485314 5485315 Arad_1447 Arad_1449   bla FALSE 0.339 86.000 0.058 1.000 N NA
 5485317 5485318 Arad_1452 Arad_1453     TRUE 0.588 13.000 0.000 NA   NA
 5485319 5485320 Arad_1454 Arad_1455   ptrB TRUE 0.761 22.000 0.061 NA   NA
 5485322 5485323 Arad_1457 Arad_1458     TRUE 0.992 4.000 0.750 NA   NA
 5485325 5485326 Arad_1460 Arad_1461     FALSE 0.323 101.000 0.037 NA   NA
 5485329 5485330 Arad_1466 Arad_1468   nuoL FALSE 0.018 149.000 0.000 1.000 N NA
 5485330 5485331 Arad_1468 Arad_1469 nuoL   TRUE 0.991 -3.000 0.493 NA   NA
 5485331 5485332 Arad_1469 Arad_1470     TRUE 0.988 0.000 0.500 NA   NA
 5485332 5485333 Arad_1470 Arad_1471     TRUE 0.999 5.000 0.896 0.003 Y NA
 5485333 5485334 Arad_1471 Arad_1472     TRUE 0.999 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 5485334 5485335 Arad_1472 Arad_1473     TRUE 0.999 -3.000 0.644 0.045 Y NA
 5485335 5485336 Arad_1473 Arad_1474     TRUE 0.998 0.000 0.614 1.000 Y NA
 5485336 5485337 Arad_1474 Arad_1475   rosR FALSE 0.000 536.000 0.000 1.000 N NA
 5485338 5485339 Arad_1476 Arad_1477     FALSE 0.240 123.000 0.032 NA   NA
 5485340 5485341 Arad_1478 Arad_1479     TRUE 0.842 -28.000 0.000 1.000   NA
 5485341 5485342 Arad_1479 Arad_1480     TRUE 0.607 49.000 0.071 NA   NA
 5485343 5485344 Arad_1482 Arad_1483     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 5485344 5485345 Arad_1483 Arad_1484     FALSE 0.001 778.000 0.000 NA   NA
 5485345 5485346 Arad_1484 Arad_1485     TRUE 0.998 -7.000 0.941 NA   NA
 5485346 5485347 Arad_1485 Arad_1486   pbp TRUE 0.702 142.000 0.582 NA   NA
 5485348 5485349 Arad_1487 Arad_1488     FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5485349 5485350 Arad_1488 Arad_1489     FALSE 0.001 568.000 0.000 NA   NA
 5485350 5485351 Arad_1489 Arad_1490   feuP FALSE 0.400 137.000 0.223 NA   NA
 5485351 5485352 Arad_1490 Arad_1491 feuP feuQ TRUE 0.999 -10.000 0.713 1.000 Y NA
 5485352 5485353 Arad_1491 Arad_1492 feuQ lppA FALSE 0.312 91.000 0.069 NA N NA
 5485353 5485354 Arad_1492 Arad_1493 lppA cycH FALSE 0.375 99.000 0.163 NA N NA
 5485354 5485355 Arad_1493 Arad_1494 cycH cycJ TRUE 0.991 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 5485355 5485356 Arad_1494 Arad_1495 cycJ ccmF TRUE 0.854 99.000 0.125 0.001 Y NA
 5485356 5485357 Arad_1495 Arad_1496 ccmF cycL TRUE 0.998 -3.000 0.644 NA Y NA
 5485357 5485358 Arad_1496 Arad_1497 cycL degPch2 FALSE 0.517 175.000 0.200 NA Y NA
 5485358 5485359 Arad_1497 Arad_1499 degPch2 ragA FALSE 0.447 105.000 0.222 1.000 N NA
 5485359 5485360 Arad_1499 Arad_1500 ragA ragB TRUE 0.999 -3.000 0.733 1.000 Y NA
 5485360 5485361 Arad_1500 Arad_1502 ragB glnE TRUE 0.629 139.000 0.081 1.000 Y NA
 5485362 5485363 Arad_1503 Arad_1504   pepN FALSE 0.026 230.000 0.025 1.000 N NA
 5485363 5485364 Arad_1504 Arad_1505 pepN mcpV2 FALSE 0.103 170.000 0.009 1.000   NA
 5485364 5485365 Arad_1505 Arad_1506 mcpV2   FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5485367 5485368 Arad_1508 Arad_1509     FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5485368 5485369 Arad_1509 Arad_1510     FALSE 0.229 125.000 0.027 NA   NA
 5485369 5485370 Arad_1510 Arad_1511     FALSE 0.069 179.000 0.034 1.000 N NA
 5485370 5485371 Arad_1511 Arad_1512     FALSE 0.003 244.000 0.000 1.000 N NA
 5485371 5485372 Arad_1512 Arad_1513     TRUE 0.969 -3.000 0.100 0.007 N NA
 5485372 5485373 Arad_1513 Arad_1515     FALSE 0.001 427.000 0.000 1.000 N NA
 5485374 5485375 Arad_1517 Arad_1518 etf   TRUE 0.722 6.000 0.000 1.000   NA
 5485378 5485379 Arad_1521 Arad_1523 mgtE   FALSE 0.001 354.000 0.000 1.000 N NA
 5485385 5485386 Arad_1531 Arad_1532     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5485386 5485387 Arad_1532 Arad_1533     TRUE 0.987 -7.000 0.019 NA Y NA
 5485389 5485390 Arad_1535 Arad_1536     TRUE 0.903 11.000 0.143 NA   NA
 5485390 5485391 Arad_1536 Arad_1537     TRUE 0.984 19.000 0.833 NA   NA
 5485391 5485392 Arad_1537 Arad_1539     TRUE 0.994 11.000 1.000 NA   NA
 5485392 5485393 Arad_1539 Arad_1540   amn FALSE 0.002 405.000 0.000 NA   NA
 5485393 5485394 Arad_1540 Arad_1541 amn   FALSE 0.229 124.000 0.026 NA   NA
 5485394 5485395 Arad_1541 Arad_1542     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5485395 5485396 Arad_1542 Arad_1543     FALSE 0.152 90.000 0.000 NA   NA
 5485397 5485398 Arad_1544 Arad_1545     FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 5485399 5485400 Arad_1547 Arad_1548 hisC   FALSE 0.374 102.000 0.073 NA   NA
 5485401 5485402 Arad_1550 Arad_1552     FALSE 0.016 222.000 0.000 NA   NA
 5485402 5485403 Arad_1552 Arad_1554     TRUE 0.771 67.000 0.312 NA   NA
 5485404 5485405 Arad_5115 Arad_1555 suhB iolB TRUE 0.818 -23.000 0.000 NA   NA
 5485405 5485406 Arad_1555 Arad_1557 iolB iolE TRUE 0.959 14.000 0.038 1.000 Y NA
 5485406 5485407 Arad_1557 Arad_1558 iolE iolD FALSE 0.096 48.000 0.000 1.000 N NA
 5485407 5485408 Arad_1558 Arad_1559 iolD iolC FALSE 0.157 26.000 0.000 1.000 N NA
 5485408 5485409 Arad_1559 Arad_1561 iolC   FALSE 0.055 184.000 0.021 1.000 N NA
 5485410 5485411 Arad_1562 Arad_1563     FALSE 0.392 146.000 0.143 0.048   NA
 5485411 5485412 Arad_1563 Arad_5012     FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 5485415 5485416 Arad_1567 Arad_1568   arsB TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5485416 5485417 Arad_1568 Arad_1569 arsB arsC TRUE 0.952 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5485417 5485418 Arad_1569 Arad_1571 arsC   FALSE 0.040 100.000 0.000 1.000 N NA
 5485419 5485420 Arad_1574 Arad_1575   ropAch1 FALSE 0.001 606.000 0.000 NA   NA
 5485420 5485421 Arad_1575 Arad_1578 ropAch1 ropAch3 FALSE 0.007 477.000 0.000 0.002   NA
 5485422 5485423 Arad_1580 Arad_1581     FALSE 0.464 84.000 0.082 NA   NA
 5485424 5485425 Arad_1582 Arad_1583 dapAch2 smpB FALSE 0.230 115.000 0.058 1.000 N NA
 5485427 5485428 Arad_1586 Arad_1588 rpoZ relA TRUE 0.923 65.000 0.291 1.000 Y NA
 5485428 5485429 Arad_1588 Arad_1589 relA   FALSE 0.007 562.000 0.086 NA   NA
 5485429 5485430 Arad_1589 Arad_1591   acpS TRUE 0.578 41.000 0.032 NA   NA
 5485430 5485431 Arad_1591 Arad_1592 acpS lepB FALSE 0.151 115.000 0.012 1.000 N NA
 5485431 5485432 Arad_1592 Arad_1593 lepB rnc TRUE 0.879 -3.000 0.010 1.000 N NA
 5485432 5485433 Arad_1593 Arad_1595 rnc era TRUE 0.973 -27.000 0.098 0.057   NA
 5485433 5485434 Arad_1595 Arad_1596 era exsF FALSE 0.002 536.000 0.000 1.000   NA
 5485434 5485435 Arad_1596 Arad_1597 exsF recO FALSE 0.303 59.000 0.004 1.000 N NA
 5485436 5485437 Arad_1599 Arad_1600     TRUE 0.944 10.000 0.123 0.025   NA
 5485437 5485438 Arad_1600 Arad_1601     FALSE 0.455 76.000 0.049 NA   NA
 5485439 5485440 Arad_1602 Arad_1604   sodC FALSE 0.208 146.000 0.058 NA   NA
 5485440 5485441 Arad_1604 Arad_1606 sodC casA FALSE 0.016 234.000 0.000 1.000   NA
 5485442 5485443 Arad_1607 Arad_1608     TRUE 0.978 -3.000 0.258 NA   NA
 5485443 5485444 Arad_1608 Arad_1609     TRUE 0.941 -3.000 0.039 NA   NA
 5485444 5485445 Arad_1609 Arad_1610     FALSE 0.406 74.000 0.021 NA   NA
 5485445 5485446 Arad_1610 Arad_1611     TRUE 0.960 17.000 0.484 NA   NA
 5485446 5485447 Arad_1611 Arad_1613     TRUE 0.697 118.000 0.462 NA   NA
 5485447 5485448 Arad_1613 Arad_1615     TRUE 0.675 79.000 0.259 NA   NA
 5485449 5485450 Arad_1616 Arad_1617     TRUE 0.661 44.000 0.103 NA   NA
 5485451 5485452 Arad_1618 Arad_1620   pssA FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 5485452 5485453 Arad_1620 Arad_1622 pssA psd TRUE 0.985 21.000 0.466 1.000 Y NA
 5485453 5485454 Arad_1622 Arad_1623 psd   FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000   NA
 5485454 5485455 Arad_1623 Arad_1624     FALSE 0.225 74.000 0.000 1.000   NA
 5485455 5485456 Arad_1624 Arad_1625     FALSE 0.208 199.000 0.290 NA   NA
 5485458 5485459 Arad_1629 Arad_1630   leuA1 FALSE 0.259 112.000 0.026 NA   NA
 5485459 5485460 Arad_1630 Arad_1632 leuA1 pip FALSE 0.355 96.000 0.032 1.000   NA
 5485460 5485461 Arad_1632 Arad_1633 pip   TRUE 0.960 -27.000 0.121 1.000   NA
 5485461 5485462 Arad_1633 Arad_1635     TRUE 0.965 35.000 0.600 0.002   NA
 5485462 5485463 Arad_1635 Arad_1636     TRUE 0.990 -24.000 0.316 0.002   NA
 5485463 5485464 Arad_1636 Arad_1637   cysS TRUE 0.923 -18.000 0.005 1.000   NA
 5485464 5485465 Arad_1637 Arad_1639 cysS   FALSE 0.005 213.000 0.000 1.000 N NA
 5485465 5485466 Arad_1639 Arad_1640   purF FALSE 0.461 71.000 0.100 1.000 N NA
 5485466 5485467 Arad_1640 Arad_1642 purF cvpA FALSE 0.191 166.000 0.101 1.000   NA
 5485467 5485468 Arad_1642 Arad_1643 cvpA radA FALSE 0.452 94.000 0.094 1.000   NA
 5485470 5485471 Arad_1645 Arad_1646 alr dnaB FALSE 0.274 114.000 0.096 1.000 N NA
 5485472 5485473 Arad_1649 Arad_1651     TRUE 0.966 9.000 0.357 NA   NA
 5485473 5485474 Arad_1651 Arad_1652     TRUE 0.923 18.000 0.311 NA   NA
 5485475 5485476 Arad_1655 Arad_1656 rplI   TRUE 0.746 21.000 0.043 NA   NA
 5485476 5485477 Arad_1656 Arad_1657   rpsR FALSE 0.363 90.000 0.033 NA   NA
 5485477 5485478 Arad_1657 Arad_1658 rpsR rpsF TRUE 0.989 14.000 0.319 0.007 Y NA
 5485480 5485481 Arad_1661 Arad_1663     FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 5485481 5485482 Arad_1663 Arad_1665     FALSE 0.046 164.000 0.000 NA   NA
 5485483 5485484 Arad_1666 Arad_1668 fabD fabG TRUE 0.986 27.000 0.432 0.002 Y NA
 5485486 5485487 Arad_1671 Arad_1672 fabF1   FALSE 0.079 221.000 0.134 NA   NA
 5485487 5485488 Arad_1672 Arad_1673     FALSE 0.314 112.000 0.060 NA   NA
 5485488 5485489 Arad_1673 Arad_1675   gmk2 TRUE 0.962 4.000 0.276 NA   NA
 5485490 5485491 Arad_1676 Arad_1677 ksgA pdxA TRUE 0.960 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5485491 5485492 Arad_1677 Arad_1679 pdxA   TRUE 0.979 9.000 0.561 1.000 N NA
 5485492 5485493 Arad_1679 Arad_1681     FALSE 0.066 210.000 0.112 1.000 N NA
 5485493 5485494 Arad_1681 Arad_1682     TRUE 0.760 33.000 0.153 1.000   NA
 5485494 5485495 Arad_1682 Arad_1683     TRUE 0.996 -3.000 0.631 0.045   NA
 5485495 5485496 Arad_1683 Arad_1684     FALSE 0.282 104.000 0.012 1.000   NA
 5485497 5485498 Arad_1686 Arad_1688 pepA   TRUE 0.767 33.000 0.230 1.000 N NA
 5485499 5485500 Arad_1689 Arad_1691   gal FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 5485501 5485502 Arad_1692 Arad_1693     TRUE 0.996 0.000 0.465 NA Y NA
 5485503 5485504 Arad_1694 Arad_1695     FALSE 0.008 145.000 0.000 NA N NA
 5485504 5485505 Arad_1695 Arad_1697     FALSE 0.081 248.000 0.286 1.000 N NA
 5485505 5485506 Arad_1697 Arad_1698     FALSE 0.298 104.000 0.019 1.000   NA
 5485506 5485507 Arad_1698 Arad_1700     TRUE 0.595 50.000 0.067 NA   NA
 5485507 5485508 Arad_1700 Arad_1701     FALSE 0.203 164.000 0.136 NA   NA
 5485510 5485511 Arad_1705 Arad_1706     TRUE 0.975 21.000 0.714 NA   NA
 5485513 5485514 Arad_1709 Arad_1710 moaE moaD TRUE 0.931 125.000 0.501 0.002 Y NA
 5485514 5485515 Arad_1710 Arad_1711 moaD pgsA TRUE 0.936 -3.000 0.082 1.000 N NA
 5485515 5485516 Arad_1711 Arad_1712 pgsA uvrC FALSE 0.105 214.000 0.227 1.000 N NA
 5485516 5485517 Arad_1712 Arad_1713 uvrC   TRUE 0.886 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5485519 5485520 Arad_1718 Arad_1720 gstch7   TRUE 0.621 31.000 0.024 NA   NA
 5485521 5485522 Arad_1721 Arad_1722     TRUE 0.943 -24.000 0.123 1.000 N NA
 5485522 5485523 Arad_1722 Arad_1723   phnM FALSE 0.171 151.000 0.096 1.000 N NA
 5485524 5485525 Arad_1724 Arad_1725 purN purM TRUE 0.996 -3.000 0.230 0.002 Y NA
 5485526 5485527 Arad_1726 Arad_1727     TRUE 0.976 3.000 0.362 NA   NA
 5485527 5485528 Arad_1727 Arad_1728   ppk FALSE 0.470 76.000 0.134 1.000 N NA
 5485528 5485529 Arad_1728 Arad_1729 ppk ppx2 TRUE 0.977 11.000 0.149 1.000 Y NA
 5485530 5485531 Arad_1730 Arad_1731   cyaB FALSE 0.345 140.000 0.195 NA   NA
 5485531 5485532 Arad_1731 Arad_1732 cyaB rnd FALSE 0.097 149.000 0.015 1.000 N NA
 5485532 5485533 Arad_1732 Arad_1733 rnd   FALSE 0.133 132.000 0.017 1.000 N NA
 5485539 5485540 Arad_1741 Arad_1742     TRUE 0.939 -3.000 0.035 NA   NA
 5485540 5485541 Arad_1742 Arad_1743     TRUE 0.687 62.000 0.208 NA   NA
 5485541 5485542 Arad_1743 Arad_1744   ate TRUE 0.903 1.000 0.024 NA   NA
 5485542 5485543 Arad_1744 Arad_1745 ate   FALSE 0.121 193.000 0.128 NA   NA
 5485543 5485544 Arad_1745 Arad_1746   hemB FALSE 0.454 78.000 0.055 NA   NA
 5485545 5485546 Arad_1747 Arad_1748   expG FALSE 0.385 128.000 0.192 NA   NA
 5485546 5485547 Arad_1748 Arad_1750 expG   FALSE 0.013 234.000 0.000 NA   NA
 5485547 5485548 Arad_1750 Arad_1751     FALSE 0.074 139.000 0.000 NA   NA
 5485548 5485549 Arad_1751 Arad_1752   glyA FALSE 0.163 178.000 0.123 1.000   NA
 5485549 5485550 Arad_1752 Arad_1753 glyA   TRUE 0.807 10.000 0.052 NA N NA
 5485550 5485551 Arad_1753 Arad_1754   ribD TRUE 0.973 -3.000 0.277 NA N NA
 5485551 5485552 Arad_1754 Arad_1755 ribD ribE TRUE 0.997 -3.000 0.456 1.000 Y NA
 5485553 5485554 Arad_1756 Arad_1757     TRUE 0.940 -9.000 0.000 0.012   NA
 5485554 5485555 Arad_1757 Arad_1758     TRUE 0.918 5.000 0.110 NA   NA
 5485556 5485557 Arad_1759 Arad_1760   ribH FALSE 0.162 86.000 0.000 NA   NA
 5485557 5485558 Arad_1760 Arad_1762 ribH nusB TRUE 0.963 5.000 0.347 1.000 N NA
 5485558 5485559 Arad_1762 Arad_1764 nusB   FALSE 0.014 250.000 0.004 1.000 N NA
 5485561 5485562 Arad_1767 Arad_1768     TRUE 0.884 10.000 0.071 NA   NA
 5485562 5485563 Arad_1768 Arad_1770   plsX FALSE 0.329 103.000 0.044 NA   NA
 5485563 5485564 Arad_1770 Arad_1772 plsX fabH TRUE 0.988 20.000 0.380 0.002 Y NA
 5485564 5485565 Arad_1772 Arad_1773 fabH ihfA FALSE 0.422 106.000 0.207 1.000 N NA
 5485565 5485566 Arad_1773 Arad_1774 ihfA   FALSE 0.244 228.000 0.535 1.000 N NA
 5485568 5485569 Arad_1777 Arad_1778 ropAe   FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5485571 5485572 Arad_1781 Arad_5013     FALSE 0.100 116.000 0.000 NA   NA
 5485574 5485575 Arad_1783 Arad_1784     FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 5485576 5485577 Arad_1786 Arad_1787   hisD TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5485577 5485578 Arad_1787 Arad_1789 hisD   FALSE 0.222 65.000 0.000 NA   NA
 5485580 5485581 Arad_1791 Arad_1792     TRUE 0.755 24.000 0.073 NA   NA
 5485581 5485582 Arad_1792 Arad_1793     TRUE 0.986 -3.000 0.357 NA   NA
 5485582 5485583 Arad_1793 Arad_1794     TRUE 0.949 77.000 0.500 NA Y NA
 5485583 5485584 Arad_1794 Arad_1796     TRUE 0.993 13.000 0.571 1.000 Y NA
 5485588 5485589 Arad_1802 Arad_1804   argC FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 5485589 5485590 Arad_1804 Arad_1805 argC speB TRUE 0.814 88.000 0.124 1.000 Y NA
 5485592 5485593 Arad_1809 Arad_1810 floR rpsI FALSE 0.005 221.000 0.000 1.000 N NA
 5485593 5485594 Arad_1810 Arad_1812 rpsI rplM TRUE 0.996 -3.000 0.231 0.007 Y NA
 5485594 5485595 Arad_1812 Arad_1813 rplM   FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5485595 5485596 Arad_1813 Arad_1815     FALSE 0.001 905.000 0.000 NA   NA
 5485597 5485598 Arad_1816 Arad_1818     FALSE 0.118 172.000 0.040 NA   NA
 5485598 5485599 Arad_1818 Arad_1819   ddlA FALSE 0.033 110.000 0.000 1.000 N NA
 5485599 5485600 Arad_1819 Arad_1820 ddlA   FALSE 0.143 94.000 0.000 NA   NA
 5485600 5485601 Arad_1820 Arad_1821     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5485601 5485602 Arad_1821 Arad_1823   pstC TRUE 0.876 76.000 0.046 0.002 Y NA
 5485602 5485603 Arad_1823 Arad_1825 pstC pstA TRUE 0.996 12.000 0.537 0.002 Y NA
 5485603 5485604 Arad_1825 Arad_1826 pstA pstB TRUE 0.989 27.000 0.526 0.002 Y NA
 5485605 5485606 Arad_1827 Arad_1828     TRUE 0.563 42.000 0.080 1.000 N NA
 5485607 5485608 Arad_1829 Arad_1831 clpP clpX TRUE 0.693 169.000 0.352 1.000 Y NA
 5485608 5485609 Arad_1831 Arad_1832 clpX lon FALSE 0.083 419.000 0.201 0.095 Y NA
 5485609 5485610 Arad_1832 Arad_1833 lon hrm FALSE 0.047 206.000 0.043 1.000 N NA
 5485611 5485612 Arad_1834 Arad_1835     FALSE 0.062 75.000 0.000 1.000 N NA
 5485613 5485614 Arad_1836 Arad_1837     TRUE 0.925 4.000 0.115 NA   NA
 5485614 5485615 Arad_1837 Arad_1838     FALSE 0.382 101.000 0.077 NA   NA
 5485619 5485620 Arad_5014 Arad_5015     FALSE 0.250 55.000 0.000 NA   NA
 5485620 5485621 Arad_5015 Arad_1842   nuoA1 FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 5485621 5485622 Arad_1842 Arad_1843 nuoA1 nuoB1 TRUE 0.998 -9.000 0.396 0.001 Y NA
 5485622 5485623 Arad_1843 Arad_1844 nuoB1 nuoC1 TRUE 0.983 19.000 0.262 0.001 Y NA
 5485623 5485624 Arad_1844 Arad_1846 nuoC1 nuoD1 TRUE 0.971 69.000 0.483 0.003 Y NA
 5485624 5485625 Arad_1846 Arad_1847 nuoD1   TRUE 0.917 0.000 0.035 NA   NA
 5485625 5485626 Arad_1847 Arad_1848   nuoE1 TRUE 0.761 16.000 0.022 NA   NA
 5485626 5485627 Arad_1848 Arad_1849 nuoE1 nuoF TRUE 0.993 11.000 0.343 0.003 Y NA
 5485627 5485628 Arad_1849 Arad_1851 nuoF   TRUE 0.888 3.000 0.024 NA   NA
 5485628 5485629 Arad_1851 Arad_1854     FALSE 0.027 242.000 0.006 NA   NA
 5485629 5485630 Arad_1854 Arad_1855   nuoH1 TRUE 0.995 13.000 0.515 0.003 Y NA
 5485630 5485631 Arad_1855 Arad_1857 nuoH1 nuoI TRUE 0.985 35.000 0.500 0.003 Y NA
 5485631 5485632 Arad_1857 Arad_1858 nuoI nuoJ TRUE 0.865 153.000 0.442 0.003 Y NA
 5485632 5485633 Arad_1858 Arad_1860 nuoJ nuoK1 TRUE 0.986 32.000 0.484 0.001 Y NA
 5485633 5485634 Arad_1860 Arad_1861 nuoK1 nuoL TRUE 0.996 8.000 0.451 0.003 Y NA
 5485634 5485635 Arad_1861 Arad_1862 nuoL nuoM1 TRUE 0.996 -27.000 0.251 0.001 Y NA
 5485635 5485636 Arad_1862 Arad_1863 nuoM1 nuoN1 TRUE 0.991 19.000 0.453 0.001 Y NA
 5485636 5485637 Arad_1863 Arad_1865 nuoN1 birA TRUE 0.983 -3.000 0.372 1.000 N NA
 5485637 5485638 Arad_1865 Arad_1867 birA   TRUE 0.942 14.000 0.307 1.000   NA
 5485638 5485639 Arad_1867 Arad_1868     TRUE 0.700 39.000 0.105 1.000   NA
 5485639 5485640 Arad_1868 Arad_1869     FALSE 0.449 105.000 0.172 NA   NA
 5485640 5485641 Arad_1869 Arad_1870   proS FALSE 0.004 537.000 0.006 NA   NA
 5485641 5485642 Arad_1870 Arad_1871 proS   TRUE 0.687 24.000 0.076 1.000 N NA
 5485642 5485643 Arad_1871 Arad_1872     TRUE 0.970 16.000 0.620 1.000 N NA
 5485644 5485645 Arad_1873 Arad_1874     FALSE 0.164 85.000 0.000 NA   NA
 5485651 5485652 Arad_1881 Arad_1882     TRUE 0.963 3.000 0.256 NA   NA
 5485653 5485654 Arad_1884 Arad_1885 celR1 celR2 TRUE 0.993 14.000 0.461 0.012 Y NA
 5485655 5485656 Arad_1886 Arad_1887 rpmG   FALSE 0.237 97.000 0.028 1.000 N NA
 5485656 5485657 Arad_1887 Arad_1889     FALSE 0.005 308.000 0.000 NA   NA
 5485657 5485658 Arad_1889 Arad_1890   rnr TRUE 0.671 31.000 0.050 NA   NA
 5485658 5485659 Arad_1890 Arad_1891 rnr topA TRUE 0.919 -3.000 0.045 1.000 N NA
 5485659 5485660 Arad_1891 Arad_1893 topA dprA FALSE 0.301 238.000 0.238 1.000 Y NA
 5485660 5485661 Arad_1893 Arad_1894 dprA   TRUE 0.938 0.000 0.070 1.000   NA
 5485661 5485662 Arad_1894 Arad_1896     TRUE 0.750 30.000 0.108 1.000   NA
 5485662 5485663 Arad_1896 Arad_1897   pyrB TRUE 0.997 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 5485664 5485665 Arad_1899 Arad_1900 aidB   FALSE 0.044 94.000 0.000 1.000 N NA
 5485665 5485666 Arad_1900 Arad_1901     TRUE 0.987 -10.000 0.385 NA   NA
 5485666 5485667 Arad_1901 Arad_1902     FALSE 0.222 65.000 0.000 NA   NA
 5485667 5485668 Arad_1902 Arad_1903     FALSE 0.142 104.000 0.000 1.000   NA
 5485668 5485669 Arad_1903 Arad_1905     FALSE 0.005 300.000 0.000 NA   NA
 5485671 5485672 Arad_1907 Arad_1908   gatC FALSE 0.470 68.000 0.024 1.000   NA
 5485672 5485673 Arad_1908 Arad_1909 gatC gatA2 TRUE 0.981 70.000 0.643 0.001 Y NA
 5485673 5485674 Arad_1909 Arad_1911 gatA2   FALSE 0.018 215.000 0.000 NA   NA
 5485676 5485677 Arad_1913 Arad_1914   gatB FALSE 0.049 169.000 0.000 1.000   NA
 5485677 5485678 Arad_1914 Arad_1916 gatB   TRUE 0.790 5.000 0.014 1.000 N NA
 5485678 5485679 Arad_1916 Arad_1918     TRUE 0.883 20.000 0.085 0.012   NA
 5485679 5485680 Arad_1918 Arad_1919     FALSE 0.344 105.000 0.050 1.000   NA
 5485680 5485681 Arad_1919 Arad_1920     TRUE 0.561 105.000 0.260 NA   NA
 5485682 5485683 Arad_1922 Arad_1923     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5485683 5485684 Arad_1923 Arad_1924   aat FALSE 0.075 185.000 0.013 NA   NA
 5485684 5485685 Arad_1924 Arad_1925 aat   TRUE 0.880 7.000 0.114 1.000 N NA
 5485685 5485686 Arad_1925 Arad_1927     TRUE 0.989 5.000 0.153 0.002 Y NA
 5485686 5485687 Arad_1927 Arad_1928   aroQ FALSE 0.534 25.000 0.014 1.000 N NA
 5485687 5485688 Arad_1928 Arad_1929 aroQ   FALSE 0.064 212.000 0.110 1.000 N NA
 5485691 5485692 Arad_1933 Arad_1936 amiC mrcA FALSE 0.340 263.000 0.396 1.000 Y NA
 5485692 5485693 Arad_1936 Arad_1938 mrcA prfB FALSE 0.036 221.000 0.041 1.000 N NA
 5485695 5485696 Arad_5016 Arad_1940     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5485696 5485697 Arad_1940 Arad_1941     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5485697 5485698 Arad_1941 Arad_1942     FALSE 0.103 114.000 0.000 NA   NA
 5485699 5485700 Arad_1943 Arad_1945     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5485700 5485701 Arad_1945 Arad_1946     TRUE 0.818 11.000 0.005 1.000   NA
 5485702 5485703 Arad_5017 Arad_5018     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5485705 5485706 Arad_1948 Arad_1949   tufB FALSE 0.002 424.000 0.000 NA   NA
 5485708 5485709 Arad_1951 Arad_1952     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 5485709 5485710 Arad_1952 Arad_1953   kdsB2 TRUE 0.840 19.000 0.150 NA   NA
 5485710 5485711 Arad_1953 Arad_5019 kdsB2   FALSE 0.018 215.000 0.000 NA   NA
 5485711 5485712 Arad_5019 Arad_1954   secE FALSE 0.024 199.000 0.000 NA   NA
 5485712 5485713 Arad_1954 Arad_1955 secE nusG TRUE 0.981 19.000 0.843 1.000 N NA
 5485713 5485714 Arad_1955 Arad_1957 nusG rplK FALSE 0.363 222.000 0.681 1.000 N NA
 5485714 5485715 Arad_1957 Arad_1958 rplK rplA TRUE 0.999 5.000 0.838 0.009 Y NA
 5485715 5485716 Arad_1958 Arad_1959 rplA rplJ FALSE 0.150 333.000 0.302 1.000 Y NA
 5485716 5485717 Arad_1959 Arad_1960 rplJ rplL TRUE 0.987 58.000 0.884 1.000 Y NA
 5485717 5485718 Arad_1960 Arad_1962 rplL rpoB FALSE 0.068 263.000 0.223 1.000   NA
 5485718 5485719 Arad_1962 Arad_1963 rpoB rpoC TRUE 0.770 190.000 0.851 0.000   NA
 5485721 5485722 Arad_1966 Arad_1967 rpsL rpsG TRUE 0.976 79.000 0.620 0.001 Y NA
 5485722 5485723 Arad_1967 Arad_1968 rpsG fusA TRUE 0.928 31.000 0.114 1.000 Y NA
 5485723 5485724 Arad_1968 Arad_1970 fusA tuf TRUE 0.910 68.000 0.102 0.001 Y NA
 5485724 5485725 Arad_1970 Arad_1971 tuf rplC FALSE 0.019 487.000 0.000 1.000 Y NA
 5485725 5485726 Arad_1971 Arad_1973 rplC rplD TRUE 0.994 14.000 0.486 0.007 Y NA
 5485726 5485727 Arad_1973 Arad_1974 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5485727 5485728 Arad_1974 Arad_1975 rplW rplB TRUE 0.997 12.000 0.849 1.000 Y NA
 5485728 5485729 Arad_1975 Arad_1977 rplB rpsS TRUE 0.997 16.000 0.820 0.009 Y NA
 5485729 5485730 Arad_1977 Arad_1978 rpsS rplV TRUE 0.990 3.000 0.119 0.009 Y NA
 5485730 5485731 Arad_1978 Arad_1979 rplV rpsC TRUE 0.992 0.000 0.109 0.009 Y NA
 5485731 5485732 Arad_1979 Arad_1980 rpsC rplP TRUE 0.993 37.000 0.828 0.009 Y NA
 5485732 5485733 Arad_1980 Arad_1982 rplP rpmC TRUE 0.998 12.000 0.802 0.007 Y NA
 5485733 5485734 Arad_1982 Arad_1983 rpmC rpsQ TRUE 0.998 13.000 0.828 0.007 Y NA
 5485734 5485735 Arad_1983 Arad_1985 rpsQ rplN TRUE 0.803 226.000 0.791 0.009 Y NA
 5485735 5485736 Arad_1985 Arad_1986 rplN rplX TRUE 0.998 13.000 0.810 0.009 Y NA
 5485736 5485737 Arad_1986 Arad_1988 rplX rplE TRUE 0.999 -7.000 0.758 0.007 Y NA
 5485737 5485738 Arad_1988 Arad_1990 rplE rpsN TRUE 0.972 34.000 0.309 0.007 Y NA
 5485738 5485739 Arad_1990 Arad_1991 rpsN rpsH TRUE 0.989 13.000 0.295 0.007 Y NA
 5485739 5485740 Arad_1991 Arad_1992 rpsH rplF TRUE 0.992 43.000 0.808 0.007 Y NA
 5485740 5485741 Arad_1992 Arad_1994 rplF rplR TRUE 0.998 13.000 0.815 0.007 Y NA
 5485743 5485744 Arad_1995 Arad_1998 rpsE rplO FALSE 0.286 249.000 0.148 0.009 Y NA
 5485744 5485745 Arad_1998 Arad_2000 rplO secY FALSE 0.375 226.000 0.730 1.000 N NA
 5485745 5485746 Arad_2000 Arad_2002 secY adk TRUE 0.880 -3.000 0.010 1.000 N NA
 5485746 5485747 Arad_2002 Arad_2003 adk rpsM FALSE 0.005 219.000 0.000 1.000 N NA
 5485747 5485748 Arad_2003 Arad_2004 rpsM rpsK TRUE 0.962 134.000 0.810 0.007 Y NA
 5485748 5485749 Arad_2004 Arad_2005 rpsK rpoA TRUE 0.563 104.000 0.308 1.000 N NA
 5485749 5485750 Arad_2005 Arad_2007 rpoA rplQ TRUE 0.959 48.000 0.873 1.000 N NA
 5485752 5485753 Arad_2012 Arad_2014     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5485753 5485754 Arad_2014 Arad_2015     TRUE 0.952 -3.000 0.074 NA   NA
 5485754 5485755 Arad_2015 Arad_2016     TRUE 0.698 5.000 0.000 NA   NA
 5485755 5485756 Arad_2016 Arad_2017   mexE1 TRUE 0.986 -3.000 0.353 NA   NA
 5485757 5485758 Arad_2020 Arad_2021     TRUE 0.997 -3.000 0.790 0.044   NA
 5485761 5485762 Arad_2024 Arad_2026 degPch3   TRUE 0.922 -3.000 0.051 1.000 N NA
 5485763 5485764 Arad_2027 Arad_2028     FALSE 0.327 110.000 0.062 NA   NA
 5485764 5485765 Arad_2028 Arad_2030   dapA FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 5485768 5485769 Arad_2033 Arad_2034     TRUE 0.998 -22.000 1.000 NA   NA
 5485769 5485770 Arad_2034 Arad_2035     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA   NA
 5485770 5485771 Arad_2035 Arad_2037     FALSE 0.167 84.000 0.000 NA   NA
 5485772 5485773 Arad_2038 Arad_2040   tlyC FALSE 0.074 139.000 0.000 NA   NA
 5485774 5485775 Arad_2041 Arad_2043     FALSE 0.002 443.000 0.000 NA   NA
 5485778 5485779 Arad_2046 Arad_2047     FALSE 0.060 150.000 0.000 NA   NA
 5485779 5485780 Arad_2047 Arad_2048     FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 5485780 5485781 Arad_2048 Arad_2050   gph1 FALSE 0.090 138.000 0.000 1.000   NA
 5485781 5485782 Arad_2050 Arad_2051 gph1   FALSE 0.014 244.000 0.000 1.000   NA
 5485782 5485783 Arad_2051 Arad_2052   gpt FALSE 0.011 772.000 0.000 1.000 Y NA
 5485783 5485784 Arad_2052 Arad_2055 gpt   FALSE 0.004 350.000 0.000 1.000   NA
 5485784 5485785 Arad_2055 Arad_2056   cinA1 FALSE 0.235 118.000 0.013 1.000   NA
 5485786 5485787 Arad_2057 Arad_2058 wrbA   FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 5485788 5485789 Arad_2059 Arad_5046 rpe   FALSE 0.344 33.000 0.000 NA   NA
 5485789 5485790 Arad_5046 Arad_2060     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 5485791 5485792 Arad_2061 Arad_2062 ilvA   TRUE 0.636 38.000 0.056 NA   NA
 5485793 5485794 Arad_2064 Arad_2065     FALSE 0.005 219.000 0.000 1.000 N NA
 5485798 5485799 Arad_2070 Arad_2071 cpdB   FALSE 0.323 136.000 0.154 NA   NA
 5485803 5485804 Arad_2075 Arad_2076     FALSE 0.482 72.000 0.053 NA   NA
 5485804 5485805 Arad_2076 Arad_2078   sseA TRUE 0.949 4.000 0.200 1.000   NA
 5485805 5485806 Arad_2078 Arad_2079 sseA alaS1 TRUE 0.692 65.000 0.222 NA   NA
 5485806 5485807 Arad_2079 Arad_2081 alaS1 cysK2 TRUE 0.909 5.000 0.082 NA   NA
 5485808 5485809 Arad_2082 Arad_2083   ugpCch2 FALSE 0.095 134.000 0.000 1.000   NA
 5485810 5485811 Arad_2086 Arad_2087     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5485811 5485812 Arad_2087 Arad_2088   ugpEch2 FALSE 0.185 77.000 0.000 NA   NA
 5485812 5485813 Arad_2088 Arad_2089 ugpEch2 ugpAch2 TRUE 0.998 8.000 0.900 NA Y NA
 5485813 5485814 Arad_2089 Arad_2092 ugpAch2 ugpBch2 TRUE 0.976 94.000 0.900 NA Y NA
 5485820 5485821 Arad_2100 Arad_2103   ropAch3 FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5485821 5485822 Arad_2103 Arad_2104 ropAch3   FALSE 0.001 874.000 0.000 NA   NA
 5485822 5485823 Arad_2104 Arad_5045     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 5485824 5485825 Arad_2106 Arad_2107   pcm FALSE 0.016 155.000 0.000 1.000 N NA
 5485825 5485826 Arad_2107 Arad_2109 pcm   FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5485826 5485827 Arad_2109 Arad_2111   valS FALSE 0.245 122.000 0.033 NA   NA
 5485827 5485828 Arad_2111 Arad_2113 valS   FALSE 0.001 404.000 0.000 1.000 N NA
 5485828 5485829 Arad_2113 Arad_2114   exoR2 FALSE 0.001 707.000 0.000 1.000   NA
 5485831 5485832 Arad_2117 Arad_2118   dgt TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5485832 5485833 Arad_2118 Arad_2119 dgt argS FALSE 0.479 54.000 0.062 1.000 N NA
 5485833 5485834 Arad_2119 Arad_2120 argS   FALSE 0.470 63.000 0.027 NA   NA
 5485834 5485835 Arad_2120 Arad_2121     FALSE 0.253 132.000 0.056 NA   NA
 5485835 5485836 Arad_2121 Arad_2122     TRUE 0.778 24.000 0.103 NA   NA
 5485836 5485837 Arad_2122 Arad_2124     TRUE 0.936 36.000 0.570 NA   NA
 5485837 5485838 Arad_2124 Arad_2126   tatA FALSE 0.037 251.000 0.060 NA   NA
 5485838 5485839 Arad_2126 Arad_2127 tatA tatB TRUE 0.889 56.000 0.353 0.004   NA
 5485839 5485840 Arad_2127 Arad_2129 tatB tatC TRUE 0.998 -3.000 0.535 NA Y NA
 5485840 5485841 Arad_2129 Arad_2130 tatC serS FALSE 0.269 101.000 0.065 NA N NA
 5485841 5485842 Arad_2130 Arad_2132 serS surE TRUE 0.813 17.000 0.058 1.000   NA
 5485842 5485843 Arad_2132 Arad_2133 surE pcm TRUE 0.966 -3.000 0.147 1.000   NA
 5485843 5485844 Arad_2133 Arad_2134 pcm lppB FALSE 0.116 171.000 0.089 1.000 N NA
 5485846 5485847 Arad_2136 Arad_2137 yajC secD2 FALSE 0.468 170.000 0.099 NA Y NA
 5485847 5485848 Arad_2137 Arad_2138 secD2   TRUE 0.900 5.000 0.060 NA   NA
 5485848 5485849 Arad_2138 Arad_2139   crtB TRUE 0.846 19.000 0.165 NA   NA
 5485849 5485850 Arad_2139 Arad_2141 crtB   FALSE 0.467 77.000 0.059 NA   NA
 5485851 5485852 Arad_2142 Arad_2143 gidA1   FALSE 0.249 114.000 0.023 NA   NA
 5485852 5485853 Arad_2143 Arad_2144     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 5485854 5485855 Arad_2145 Arad_2147     TRUE 0.993 -3.000 0.589 NA   NA
 5485855 5485856 Arad_2147 Arad_5021     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 5485856 5485857 Arad_5021 Arad_2148   tig FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 5485858 5485859 Arad_2150 Arad_2151     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5485859 5485860 Arad_2151 Arad_2152     FALSE 0.032 111.000 0.000 1.000 N NA
 5485860 5485861 Arad_2152 Arad_2154   radC FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 5485861 5485862 Arad_2154 Arad_2156 radC map TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5485862 5485863 Arad_2156 Arad_2157 map sfsA TRUE 0.922 3.000 0.080 NA   NA
 5485863 5485864 Arad_2157 Arad_2158 sfsA phbC TRUE 0.786 13.000 0.013 NA   NA
 5485865 5485866 Arad_2159 Arad_2161   aatCch FALSE 0.038 223.000 0.009 NA   NA
 5485866 5485867 Arad_2161 Arad_2162 aatCch thrA TRUE 0.827 96.000 0.202 1.000 Y NA
 5485867 5485868 Arad_2162 Arad_2163 thrA recJ FALSE 0.367 48.000 0.009 1.000 N NA
 5485871 5485872 Arad_2165 Arad_2167     FALSE 0.106 176.000 0.108 NA N NA
 5485872 5485873 Arad_2167 Arad_2168     TRUE 0.900 91.000 0.833 NA N NA
 5485873 5485874 Arad_2168 Arad_2169     TRUE 0.997 6.000 0.714 1.000 Y NA
 5485875 5485876 Arad_2171 Arad_2172     TRUE 0.979 28.000 0.467 NA Y NA
 5485876 5485877 Arad_2172 Arad_2173     TRUE 0.997 7.000 0.714 NA Y NA
 5485877 5485878 Arad_2173 Arad_2174   potC TRUE 0.999 -7.000 0.833 NA Y NA
 5485878 5485879 Arad_2174 Arad_2175 potC map1 TRUE 0.933 53.000 0.294 NA Y NA
 5485879 5485880 Arad_2175 Arad_2176 map1   TRUE 0.972 2.000 0.294 1.000   NA
 5485880 5485881 Arad_2176 Arad_2177     FALSE 0.001 671.000 0.000 NA   NA
 5485881 5485882 Arad_2177 Arad_4988     FALSE 0.121 104.000 0.000 NA   NA
 5485882 5485883 Arad_4988 Arad_2178     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5485883 5485884 Arad_2178 Arad_2179     FALSE 0.001 596.000 0.000 NA   NA
 5485884 5485885 Arad_2179 Arad_2181     FALSE 0.001 1217.000 0.000 NA   NA
 5485886 5485887 Arad_5043 Arad_5042     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5485887 5485888 Arad_5042 Arad_2182     FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 5485888 5485889 Arad_2182 Arad_2183   gloA FALSE 0.020 209.000 0.000 NA   NA
 5485890 5485891 Arad_2184 Arad_2186 cspA3   TRUE 0.960 2.000 0.226 NA   NA
 5485891 5485892 Arad_2186 Arad_5022     FALSE 0.089 126.000 0.000 NA   NA
 5485892 5485893 Arad_5022 Arad_2188     FALSE 0.033 180.000 0.000 NA   NA
 5485893 5485894 Arad_2188 Arad_5023     FALSE 0.137 96.000 0.000 NA   NA
 5485895 5485896 Arad_2189 Arad_2190     FALSE 0.286 46.000 0.000 NA   NA
 5485898 5485899 Arad_2192 Arad_2194   aapP FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5485899 5485900 Arad_2194 Arad_2196 aapP aapM TRUE 0.847 4.000 0.039 1.000 N NA
 5485900 5485901 Arad_2196 Arad_2198 aapM aapQ TRUE 0.935 2.000 0.043 0.014 N NA
 5485901 5485902 Arad_2198 Arad_2199 aapQ aapJ TRUE 0.946 91.000 0.548 1.000 Y NA
 5485904 5485905 Arad_2202 Arad_2204 nah   TRUE 0.715 162.000 0.745 NA   NA
 5485908 5485909 Arad_2206 Arad_2208 cysE1   TRUE 0.606 129.000 0.386 NA   NA
 5485909 5485910 Arad_2208 Arad_2209     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 5485910 5485911 Arad_2209 Arad_2210     FALSE 0.526 16.000 0.000 NA   NA
 5485911 5485912 Arad_2210 Arad_2211   clpS FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5485912 5485913 Arad_2211 Arad_2212 clpS clpA TRUE 0.987 5.000 0.596 NA   NA
 5485914 5485915 Arad_2213 Arad_2214     FALSE 0.452 96.000 0.131 NA   NA
 5485915 5485916 Arad_2214 Arad_2215     TRUE 0.980 -3.000 0.280 NA   NA
 5485916 5485917 Arad_2215 Arad_2216     TRUE 0.992 0.000 0.696 NA N NA
 5485918 5485919 Arad_2217 Arad_2219   rpsB FALSE 0.055 202.000 0.009 NA   NA
 5485919 5485920 Arad_2219 Arad_2220 rpsB tsf TRUE 0.562 274.000 0.748 1.000 Y NA
 5485920 5485921 Arad_2220 Arad_2222 tsf pyrH FALSE 0.454 155.000 0.416 1.000 N NA
 5485921 5485922 Arad_2222 Arad_2223 pyrH frr TRUE 0.908 55.000 0.626 1.000 N NA
 5485922 5485923 Arad_2223 Arad_2224 frr uppS TRUE 0.654 106.000 0.409 1.000 N NA
 5485923 5485924 Arad_2224 Arad_2225 uppS cdsAch TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5485924 5485925 Arad_2225 Arad_2226 cdsAch   TRUE 0.681 25.000 0.080 1.000 N NA
 5485925 5485926 Arad_2226 Arad_2227   omp1 FALSE 0.425 199.000 0.204 1.000 Y NA
 5485926 5485927 Arad_2227 Arad_2229 omp1 lpxD TRUE 0.877 51.000 0.063 1.000 Y NA
 5485927 5485928 Arad_2229 Arad_2231 lpxD fabZ TRUE 0.965 -7.000 0.212 1.000 N NA
 5485928 5485929 Arad_2231 Arad_2232 fabZ lpxA TRUE 0.973 -3.000 0.264 1.000 N NA
 5485929 5485930 Arad_2232 Arad_2233 lpxA   TRUE 0.989 2.000 0.552 NA   NA
 5485930 5485931 Arad_2233 Arad_2234   lpxB TRUE 0.967 -3.000 0.173 NA   NA
 5485935 5485936 Arad_2241 Arad_2242   kdsA TRUE 0.932 -3.000 0.023 NA   NA
 5485936 5485937 Arad_2242 Arad_2243 kdsA eno FALSE 0.124 151.000 0.041 1.000 N NA
 5485937 5485938 Arad_2243 Arad_2245 eno   FALSE 0.023 243.000 0.032 1.000 N NA
 5485938 5485939 Arad_2245 Arad_2246   pdhA1 FALSE 0.155 158.000 0.104 1.000 N NA
 5485939 5485940 Arad_2246 Arad_2247 pdhA1 pdhA2 TRUE 0.991 19.000 0.456 0.000 Y NA
 5485940 5485941 Arad_2247 Arad_2249 pdhA2   TRUE 0.976 16.000 0.254 1.000 Y NA
 5485941 5485942 Arad_2249 Arad_2250     TRUE 0.592 26.000 0.036 1.000 N NA
 5485942 5485943 Arad_2250 Arad_2251   lpdA FALSE 0.364 55.000 0.017 1.000 N NA
 5485943 5485944 Arad_2251 Arad_2253 lpdA   FALSE 0.506 56.000 0.021 1.000   NA
 5485944 5485945 Arad_2253 Arad_2254     TRUE 0.990 14.000 0.750 0.044   NA
 5485945 5485946 Arad_2254 Arad_2255   lipA TRUE 0.567 37.000 0.009 1.000   NA
 5485946 5485947 Arad_2255 Arad_2256 lipA   FALSE 0.009 142.000 0.000 NA N NA
 5485947 5485948 Arad_2256 Arad_2258     TRUE 0.777 52.000 0.000 NA Y NA
 5485948 5485949 Arad_2258 Arad_2259     FALSE 0.035 58.000 0.000 NA N NA
 5485950 5485951 Arad_2261 Arad_2262 cinA2 ispD TRUE 0.949 -3.000 0.061 NA   NA
 5485952 5485953 Arad_2263 Arad_2264 nifR ntrB TRUE 0.940 -3.000 0.094 1.000 N NA
 5485953 5485954 Arad_2264 Arad_2265 ntrB ntrC TRUE 0.996 -3.000 0.297 0.093 Y NA
 5485954 5485955 Arad_2265 Arad_2267 ntrC ntrY FALSE 0.215 284.000 0.205 0.093 Y NA
 5485955 5485956 Arad_2267 Arad_2268 ntrY ntrX TRUE 0.998 -10.000 0.533 0.093 Y NA
 5485956 5485957 Arad_2268 Arad_2269 ntrX dat FALSE 0.421 76.000 0.085 1.000 N NA
 5485957 5485958 Arad_2269 Arad_2271 dat hfq FALSE 0.538 108.000 0.243 1.000   NA
 5485958 5485959 Arad_2271 Arad_2272 hfq   FALSE 0.537 79.000 0.115 1.000   NA
 5485960 5485961 Arad_2273 Arad_2274 mazG   TRUE 0.665 26.000 0.015 1.000   NA
 5485962 5485963 Arad_2277 Arad_2278 cysG   TRUE 0.937 5.000 0.188 NA   NA
 5485963 5485964 Arad_2278 Arad_2279   cysI TRUE 0.986 20.000 0.919 NA   NA
 5485964 5485965 Arad_2279 Arad_2280 cysI   TRUE 0.954 11.000 0.309 NA   NA
 5485965 5485966 Arad_2280 Arad_2281   fpr FALSE 0.033 241.000 0.022 NA   NA
 5485967 5485968 Arad_2282 Arad_2286     FALSE 0.002 503.000 0.000 1.000   NA
 5485968 5485969 Arad_2286 Arad_2287     FALSE 0.022 204.000 0.000 NA   NA
 5485970 5485971 Arad_5024 Arad_2288     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 5485971 5485972 Arad_2288 Arad_2289     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5485972 5485973 Arad_2289 Arad_2290     TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5485973 5485974 Arad_2290 Arad_2291     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 5485974 5485975 Arad_2291 Arad_2292     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5485975 5485976 Arad_2292 Arad_4983     FALSE 0.001 1148.000 0.000 NA   NA
 5485976 5485977 Arad_4983 Arad_2293     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5485977 5485978 Arad_2293 Arad_2294     FALSE 0.304 41.000 0.000 NA   NA
 5485978 5485979 Arad_2294 Arad_2295     TRUE 0.936 0.000 0.080 NA   NA
 5485979 5485980 Arad_2295 Arad_2296     TRUE 0.944 -3.000 0.048 NA   NA
 5485980 5485981 Arad_2296 Arad_2297     TRUE 0.714 93.000 0.357 NA   NA
 5485981 5485982 Arad_2297 Arad_2298     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5485982 5485983 Arad_2298 Arad_2300     FALSE 0.001 715.000 0.000 NA   NA
 5485983 5485984 Arad_2300 Arad_2301     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 5485984 5485985 Arad_2301 Arad_2302     FALSE 0.044 167.000 0.000 NA   NA
 5485985 5485986 Arad_2302 Arad_2303     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5485986 5485987 Arad_2303 Arad_2304     TRUE 0.645 43.000 0.082 NA   NA
 5485987 5485988 Arad_2304 Arad_2305     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5485988 5485989 Arad_2305 Arad_2306     TRUE 0.711 33.000 0.100 NA   NA
 5485989 5485990 Arad_2306 Arad_2307     TRUE 0.560 58.000 0.067 NA   NA
 5485990 5485991 Arad_2307 Arad_2308     TRUE 0.979 3.000 0.400 NA   NA
 5485991 5485992 Arad_2308 Arad_2310     TRUE 0.765 92.000 0.429 NA   NA
 5485994 5485995 Arad_2312 Arad_2314     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 5485995 5485996 Arad_2314 Arad_2315     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 5485996 5485997 Arad_2315 Arad_2316   nlpE1 FALSE 0.049 161.000 0.000 NA   NA
 5485999 5486000 Arad_2318 Arad_2319     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486000 5486001 Arad_2319 Arad_2320     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5486001 5486002 Arad_2320 Arad_2321     FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5486004 5486005 Arad_2323 Arad_2324     FALSE 0.056 153.000 0.000 NA   NA
 5486006 5486007 Arad_2325 Arad_2326     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486007 5486008 Arad_2326 Arad_2328     FALSE 0.001 693.000 0.000 NA   NA
 5486008 5486009 Arad_2328 Arad_2329     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 5486014 5486015 Arad_2336 Arad_2337     FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 5486015 5486016 Arad_2337 Arad_2338     FALSE 0.188 76.000 0.000 NA   NA
 5486016 5486017 Arad_2338 Arad_2339   ccsA FALSE 0.232 61.000 0.000 NA   NA
 5486017 5486018 Arad_2339 Arad_2340 ccsA mdcF TRUE 0.559 66.000 0.075 1.000   NA
 5486020 5486021 Arad_2343 Arad_2345 pcs qor TRUE 0.832 13.000 0.108 1.000 N NA
 5486021 5486022 Arad_2345 Arad_2346 qor   TRUE 0.747 41.000 0.182 1.000   NA
 5486022 5486023 Arad_2346 Arad_2347     TRUE 0.989 -10.000 0.418 NA   NA
 5486023 5486024 Arad_2347 Arad_2348     TRUE 0.997 -3.000 0.923 NA   NA
 5486024 5486025 Arad_2348 Arad_2349     TRUE 0.820 50.000 0.318 NA   NA
 5486025 5486026 Arad_2349 Arad_2350     FALSE 0.224 146.000 0.076 NA   NA
 5486026 5486027 Arad_2350 Arad_2352     TRUE 0.979 73.000 0.804 NA Y NA
 5486027 5486028 Arad_2352 Arad_2353     TRUE 0.998 -3.000 0.506 NA Y NA
 5486028 5486029 Arad_2353 Arad_2354     TRUE 0.999 -3.000 0.865 NA Y NA
 5486029 5486030 Arad_2354 Arad_2355     TRUE 0.727 17.000 0.067 NA N NA
 5486030 5486031 Arad_2355 Arad_2356   glmU FALSE 0.031 205.000 0.006 1.000 N NA
 5486031 5486032 Arad_2356 Arad_2357 glmU glmS TRUE 0.695 118.000 0.083 1.000 Y NA
 5486032 5486033 Arad_2357 Arad_2358 glmS   FALSE 0.122 178.000 0.059 NA   NA
 5486037 5486038 Arad_2362 Arad_2364   mfd TRUE 0.953 -3.000 0.078 NA   NA
 5486039 5486040 Arad_2366 Arad_2368     FALSE 0.178 23.000 0.000 1.000 N NA
 5486040 5486041 Arad_2368 Arad_2369     FALSE 0.309 111.000 0.147 NA N NA
 5486043 5486044 Arad_2371 Arad_2372   glnA2 FALSE 0.043 218.000 0.012 NA   NA
 5486044 5486045 Arad_2372 Arad_2373 glnA2 glnB TRUE 0.880 63.000 0.145 1.000 Y NA
 5486047 5486048 Arad_2376 Arad_2377   uvrA TRUE 0.569 31.000 0.005 NA   NA
 5486052 5486053 Arad_2383 Arad_2384     TRUE 0.829 -7.000 0.000 NA   NA
 5486053 5486054 Arad_2384 Arad_2385     FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 5486054 5486055 Arad_2385 Arad_2386     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 5486056 5486057 Arad_2387 Arad_2388 coaD ppiA FALSE 0.461 39.000 0.024 1.000 N NA
 5486057 5486058 Arad_2388 Arad_2390 ppiA ppiB TRUE 0.954 83.000 0.420 0.002 Y NA
 5486058 5486059 Arad_2390 Arad_2393 ppiB queA FALSE 0.327 75.000 0.031 1.000 N NA
 5486059 5486060 Arad_2393 Arad_2394 queA tgt TRUE 0.995 7.000 0.360 0.000 Y NA
 5486062 5486063 Arad_2397 Arad_2398     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 5486064 5486065 Arad_2400 Arad_2401   fabF2 TRUE 0.592 60.000 0.104 NA   NA
 5486065 5486066 Arad_2401 Arad_2402 fabF2   TRUE 0.869 23.000 0.302 NA N NA
 5486066 5486067 Arad_2402 Arad_2403     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA N NA
 5486067 5486068 Arad_2403 Arad_2404     FALSE 0.103 44.000 0.000 1.000 N NA
 5486068 5486069 Arad_2404 Arad_2405     TRUE 0.997 3.000 0.500 0.005 Y NA
 5486069 5486070 Arad_2405 Arad_2406     FALSE 0.014 162.000 0.000 1.000 N NA
 5486071 5486072 Arad_2408 Arad_2410     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486073 5486074 Arad_2412 Arad_2413     TRUE 0.919 -3.000 0.005 NA   NA
 5486074 5486075 Arad_2413 Arad_2416     TRUE 0.635 56.000 0.139 NA   NA
 5486075 5486076 Arad_2416 Arad_2417   metS TRUE 0.915 9.000 0.221 NA N NA
 5486078 5486079 Arad_2420 Arad_2423 holB tmk TRUE 0.972 -3.000 0.254 1.000 N NA
 5486079 5486080 Arad_2423 Arad_2424 tmk dac FALSE 0.197 143.000 0.099 1.000 N NA
 5486080 5486081 Arad_2424 Arad_2425 dac rlpA TRUE 0.881 69.000 0.198 NA Y NA
 5486085 5486086 Arad_2429 Arad_2430     TRUE 0.996 -7.000 0.700 1.000   NA
 5486086 5486087 Arad_2430 Arad_2431     TRUE 0.987 -7.000 0.441 1.000 N NA
 5486087 5486088 Arad_2431 Arad_2434     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5486089 5486090 Arad_2435 Arad_2437 ppiD1 trpD TRUE 0.667 25.000 0.012 1.000   NA
 5486090 5486091 Arad_2437 Arad_2438 trpD trpC TRUE 0.984 13.000 0.293 1.000 Y NA
 5486091 5486092 Arad_2438 Arad_2440 trpC moaC TRUE 0.913 2.000 0.113 1.000 N NA
 5486092 5486093 Arad_2440 Arad_2441 moaC moeA TRUE 0.989 4.000 0.093 0.002 Y NA
 5486100 5486101 Arad_2450 Arad_2451     TRUE 0.972 38.000 0.875 NA   NA
 5486101 5486102 Arad_2451 Arad_2454     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5486102 5486103 Arad_2454 Arad_2455     FALSE 0.445 139.000 0.000 NA Y NA
 5486105 5486106 Arad_2457 Arad_2458 pyrG secG FALSE 0.449 70.000 0.083 1.000 N NA
 5486106 5486107 Arad_2458 Arad_2459 secG tpiA FALSE 0.333 120.000 0.184 1.000 N NA
 5486107 5486108 Arad_2459 Arad_2461 tpiA   FALSE 0.080 183.000 0.016 NA   NA
 5486109 5486110 Arad_2462 Arad_2463 parE   FALSE 0.113 159.000 0.006 NA   NA
 5486110 5486111 Arad_2463 Arad_2464     FALSE 0.231 143.000 0.069 NA   NA
 5486112 5486113 Arad_2465 Arad_2466     FALSE 0.322 37.000 0.000 NA   NA
 5486113 5486114 Arad_2466 Arad_2468     FALSE 0.366 130.000 0.179 NA   NA
 5486114 5486115 Arad_2468 Arad_2469     TRUE 0.955 0.000 0.033 0.043   NA
 5486117 5486118 Arad_2471 Arad_2472   thrS FALSE 0.267 109.000 0.014 1.000   NA
 5486118 5486119 Arad_2472 Arad_2473 thrS   FALSE 0.223 124.000 0.023 NA   NA
 5486119 5486120 Arad_2473 Arad_2474     TRUE 0.839 6.000 0.006 NA   NA
 5486120 5486121 Arad_2474 Arad_2475   nifUch2 TRUE 0.827 13.000 0.041 NA   NA
 5486122 5486123 Arad_2476 Arad_2477 folE hisI TRUE 0.596 26.000 0.038 1.000 N NA
 5486123 5486124 Arad_2477 Arad_2478 hisI   FALSE 0.345 91.000 0.017 1.000   NA
 5486125 5486126 Arad_2479 Arad_2480     FALSE 0.262 168.000 0.211 1.000   NA
 5486127 5486128 Arad_2483 Arad_2484     TRUE 0.571 119.000 0.320 NA   NA
 5486128 5486129 Arad_2484 Arad_2486   pip FALSE 0.201 72.000 0.000 NA   NA
 5486129 5486130 Arad_2486 Arad_2487 pip   FALSE 0.002 491.000 0.000 NA   NA
 5486130 5486131 Arad_2487 Arad_2489     FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 5486131 5486132 Arad_2489 Arad_2491     FALSE 0.370 118.000 0.146 NA   NA
 5486132 5486133 Arad_2491 Arad_2493     FALSE 0.288 130.000 0.083 NA   NA
 5486137 5486138 Arad_2498 Arad_2499     TRUE 0.572 69.000 0.118 NA   NA
 5486138 5486139 Arad_2499 Arad_2500     TRUE 0.846 13.000 0.059 NA   NA
 5486140 5486141 Arad_2501 Arad_2502   mgtE FALSE 0.380 93.000 0.118 1.000 N NA
 5486143 5486144 Arad_2504 Arad_5040     FALSE 0.024 199.000 0.000 NA   NA
 5486147 5486148 Arad_2507 Arad_2508     FALSE 0.217 67.000 0.000 NA   NA
 5486148 5486149 Arad_2508 Arad_2510     FALSE 0.194 101.000 0.014 1.000 N NA
 5486149 5486150 Arad_2510 Arad_2512     FALSE 0.204 71.000 0.000 NA   NA
 5486150 5486151 Arad_2512 Arad_2513   fghA TRUE 0.553 33.000 0.005 NA   NA
 5486151 5486152 Arad_2513 Arad_2514 fghA sugE FALSE 0.065 154.000 0.000 1.000   NA
 5486153 5486154 Arad_2515 Arad_2516   pccB FALSE 0.235 124.000 0.029 NA   NA
 5486154 5486155 Arad_2516 Arad_2517 pccB   FALSE 0.465 63.000 0.025 NA   NA
 5486155 5486156 Arad_2517 Arad_2518     FALSE 0.454 71.000 0.036 NA   NA
 5486156 5486157 Arad_2518 Arad_2519   gph1 TRUE 0.948 10.000 0.269 NA   NA
 5486157 5486158 Arad_2519 Arad_2520 gph1 rluC TRUE 0.988 -3.000 0.389 1.000   NA
 5486158 5486159 Arad_2520 Arad_2523 rluC   FALSE 0.017 219.000 0.000 NA   NA
 5486160 5486161 Arad_2525 Arad_2526 gcvT gcvH TRUE 0.967 28.000 0.202 0.002 Y NA
 5486161 5486162 Arad_2526 Arad_2527 gcvH gcvP TRUE 0.988 0.000 0.130 1.000 Y NA
 5486162 5486163 Arad_2527 Arad_2528 gcvP   FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5486163 5486164 Arad_2528 Arad_2529     TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5486165 5486166 Arad_2530 Arad_2531     FALSE 0.177 80.000 0.000 NA   NA
 5486166 5486167 Arad_2531 Arad_2532   sufA FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5486167 5486168 Arad_2532 Arad_2534 sufA   FALSE 0.496 77.000 0.083 NA   NA
 5486168 5486169 Arad_2534 Arad_2535     TRUE 0.949 12.000 0.309 NA   NA
 5486169 5486170 Arad_2535 Arad_2536   sufD TRUE 0.877 13.000 0.193 1.000 N NA
 5486170 5486171 Arad_2536 Arad_2537 sufD sufC TRUE 0.984 23.000 0.482 1.000 Y NA
 5486171 5486172 Arad_2537 Arad_2539 sufC sufB FALSE 0.139 433.000 0.466 1.000 Y NA
 5486172 5486173 Arad_2539 Arad_2541 sufB nifSch FALSE 0.188 148.000 0.109 1.000 N NA
 5486175 5486176 Arad_2544 Arad_2545     FALSE 0.030 195.000 0.000 1.000   NA
 5486177 5486178 Arad_2546 Arad_2548   tyrS FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 5486179 5486180 Arad_2549 Arad_2550     FALSE 0.338 34.000 0.000 NA   NA
 5486181 5486182 Arad_2551 Arad_2552 bcp   TRUE 0.932 0.000 0.052 1.000   NA
 5486182 5486183 Arad_2552 Arad_2553     FALSE 0.340 118.000 0.086 1.000   NA
 5486183 5486184 Arad_2553 Arad_2554   rhlE1 FALSE 0.060 184.000 0.029 1.000 N NA
 5486184 5486185 Arad_2554 Arad_2556 rhlE1   TRUE 0.790 15.000 0.087 1.000 N NA
 5486186 5486187 Arad_2557 Arad_2558   selA TRUE 0.832 4.000 0.039 NA N NA
 5486187 5486188 Arad_2558 Arad_2559 selA   TRUE 0.987 -3.000 0.447 NA N NA
 5486188 5486189 Arad_2559 Arad_2560     TRUE 0.989 0.000 0.533 NA   NA
 5486189 5486190 Arad_2560 Arad_2561     TRUE 0.967 8.000 0.355 NA   NA
 5486190 5486191 Arad_2561 Arad_2563     TRUE 0.989 5.000 0.645 NA   NA
 5486191 5486192 Arad_2563 Arad_2564     TRUE 0.820 21.000 0.117 1.000   NA
 5486193 5486194 Arad_2565 Arad_2566   rpe FALSE 0.181 94.000 0.010 NA N NA
 5486194 5486195 Arad_2566 Arad_2567 rpe   TRUE 0.823 -13.000 0.000 NA   NA
 5486195 5486196 Arad_2567 Arad_2568   purB FALSE 0.258 103.000 0.008 NA   NA
 5486197 5486198 Arad_2569 Arad_2570     TRUE 0.889 110.000 0.833 NA   NA
 5486199 5486200 Arad_2572 Arad_2573   purC FALSE 0.020 266.000 0.011 NA   NA
 5486200 5486201 Arad_2573 Arad_2574 purC purS TRUE 0.986 19.000 0.460 1.000 Y NA
 5486201 5486202 Arad_2574 Arad_2576 purS kptA TRUE 0.749 9.000 0.010 1.000 N NA
 5486202 5486203 Arad_2576 Arad_2577 kptA purQ TRUE 0.877 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5486203 5486204 Arad_2577 Arad_2579 purQ   FALSE 0.215 126.000 0.020 NA   NA
 5486206 5486207 Arad_2582 Arad_2583     FALSE 0.486 78.000 0.078 NA   NA
 5486207 5486208 Arad_2583 Arad_2585   purL FALSE 0.123 156.000 0.009 NA   NA
 5486208 5486209 Arad_2585 Arad_2586 purL   TRUE 0.688 24.000 0.093 NA N NA
 5486210 5486211 Arad_2587 Arad_2588     FALSE 0.067 144.000 0.000 NA   NA
 5486212 5486213 Arad_2589 Arad_2592 grlA   FALSE 0.236 141.000 0.147 1.000 N NA
 5486213 5486214 Arad_2592 Arad_2593     TRUE 0.955 14.000 0.000 0.043 Y NA
 5486215 5486216 Arad_2594 Arad_2595 cyaJ   FALSE 0.044 94.000 0.000 1.000 N NA
 5486216 5486217 Arad_2595 Arad_2597     TRUE 0.949 18.000 0.000 0.001 Y NA
 5486217 5486218 Arad_2597 Arad_2599     FALSE 0.186 94.000 0.012 NA N NA
 5486218 5486219 Arad_2599 Arad_2601   glsA FALSE 0.338 60.000 0.025 NA N NA
 5486219 5486220 Arad_2601 Arad_2602 glsA rpsD FALSE 0.282 72.000 0.011 1.000 N NA
 5486220 5486221 Arad_2602 Arad_2605 rpsD   FALSE 0.019 221.000 0.000 1.000   NA
 5486221 5486222 Arad_2605 Arad_2606   lldD1 FALSE 0.061 158.000 0.000 1.000   NA
 5486222 5486223 Arad_2606 Arad_2607 lldD1   FALSE 0.205 80.000 0.000 1.000   NA
 5486223 5486224 Arad_2607 Arad_2609   murI TRUE 0.735 5.000 0.000 1.000   NA
 5486224 5486225 Arad_2609 Arad_2610 murI   TRUE 0.897 -19.000 0.025 1.000 N NA
 5486225 5486226 Arad_2610 Arad_2611     FALSE 0.217 112.000 0.005 NA   NA
 5486226 5486227 Arad_2611 Arad_2612     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486228 5486229 Arad_2613 Arad_2615   gstch8 FALSE 0.134 120.000 0.008 1.000 N NA
 5486230 5486231 Arad_2616 Arad_2617   alaS2 FALSE 0.289 62.000 0.002 1.000 N NA
 5486231 5486232 Arad_2617 Arad_2618 alaS2 recA FALSE 0.154 172.000 0.054 0.091 N NA
 5486233 5486234 Arad_2619 Arad_2620     TRUE 0.575 47.000 0.131 NA N NA
 5486235 5486236 Arad_2622 Arad_2623 trpS   FALSE 0.007 317.000 0.000 0.091 N NA
 5486237 5486238 Arad_2624 Arad_2626     FALSE 0.320 47.000 0.000 1.000   NA
 5486240 5486241 Arad_2629 Arad_2631     FALSE 0.284 127.000 0.072 NA   NA
 5486241 5486242 Arad_2631 Arad_2632     TRUE 0.996 -3.000 0.791 NA   NA
 5486242 5486243 Arad_2632 Arad_2633     FALSE 0.308 113.000 0.059 NA   NA
 5486244 5486245 Arad_2634 Arad_2636 folK folB TRUE 0.992 -7.000 0.142 1.000 Y NA
 5486245 5486246 Arad_2636 Arad_2637 folB folP TRUE 0.979 6.000 0.094 1.000 Y NA
 5486248 5486249 Arad_2639 Arad_2642 fdx   TRUE 0.565 150.000 0.451 NA   NA
 5486251 5486252 Arad_2644 Arad_2645     FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 5486252 5486253 Arad_2645 Arad_2646   xynA FALSE 0.065 212.000 0.049 NA   NA
 5486253 5486254 Arad_2646 Arad_2647 xynA   FALSE 0.265 107.000 0.067 1.000 N NA
 5486254 5486255 Arad_2647 Arad_2648     TRUE 0.613 70.000 0.029 0.045   NA
 5486255 5486256 Arad_2648 Arad_2649     TRUE 0.996 -3.000 0.722 NA   NA
 5486256 5486257 Arad_2649 Arad_2651   manB2 TRUE 0.914 82.000 0.357 NA Y NA
 5486257 5486258 Arad_2651 Arad_2652 manB2   TRUE 0.922 56.000 0.250 1.000 Y NA
 5486258 5486259 Arad_2652 Arad_2653     TRUE 0.998 4.000 0.889 NA Y NA
 5486259 5486260 Arad_2653 Arad_2655     TRUE 0.997 -7.000 0.500 NA Y NA
 5486260 5486261 Arad_2655 Arad_2656     FALSE 0.479 212.000 0.333 NA Y NA
 5486265 5486266 Arad_2662 Arad_2663     FALSE 0.351 32.000 0.000 NA   NA
 5486266 5486267 Arad_2663 Arad_2664     TRUE 0.943 0.000 0.109 NA   NA
 5486267 5486268 Arad_2664 Arad_2666     TRUE 0.998 9.000 0.850 NA Y NA
 5486268 5486269 Arad_2666 Arad_2667     TRUE 0.997 13.000 0.889 NA Y NA
 5486269 5486270 Arad_2667 Arad_2668     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA N NA
 5486270 5486271 Arad_2668 Arad_2671     FALSE 0.001 977.000 0.000 1.000   NA
 5486272 5486273 Arad_2672 Arad_2673 dme   FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 5486274 5486275 Arad_2674 Arad_2675     FALSE 0.044 167.000 0.000 NA   NA
 5486275 5486276 Arad_2675 Arad_2676   nadE FALSE 0.392 32.000 0.005 NA N NA
 5486277 5486278 Arad_2677 Arad_2678 cgmA   FALSE 0.367 84.000 0.023 NA   NA
 5486278 5486279 Arad_2678 Arad_2679     FALSE 0.172 82.000 0.000 NA   NA
 5486280 5486281 Arad_2681 Arad_2682     FALSE 0.139 159.000 0.018 1.000   NA
 5486281 5486282 Arad_2682 Arad_2684   gor FALSE 0.160 150.000 0.079 1.000 N NA
 5486282 5486283 Arad_2684 Arad_2686 gor   FALSE 0.210 175.000 0.200 NA   NA
 5486283 5486284 Arad_2686 Arad_2687   rpiA TRUE 0.838 14.000 0.065 NA   NA
 5486287 5486288 Arad_2691 Arad_2694 fumC fumB FALSE 0.393 197.000 0.003 0.000 Y NA
 5486288 5486289 Arad_2694 Arad_2695 fumB   FALSE 0.007 195.000 0.000 1.000 N NA
 5486290 5486291 Arad_2696 Arad_2697     TRUE 0.606 58.000 0.111 NA   NA
 5486293 5486294 Arad_2699 Arad_2700     TRUE 0.641 32.000 0.038 NA   NA
 5486296 5486297 Arad_2702 Arad_2704   mcpZf2 FALSE 0.005 215.000 0.000 1.000 N NA
 5486298 5486299 Arad_2705 Arad_2706   mobA TRUE 0.683 11.000 0.007 NA N NA
 5486299 5486300 Arad_2706 Arad_2707 mobA mobB TRUE 0.993 -3.000 0.056 0.002 Y NA
 5486302 5486303 Arad_2710 Arad_2712     TRUE 0.758 115.000 0.185 1.000 Y NA
 5486303 5486304 Arad_2712 Arad_2713     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.014 Y NA
 5486304 5486305 Arad_2713 Arad_2714     FALSE 0.488 196.000 0.273 NA Y NA
 5486305 5486306 Arad_2714 Arad_2715     FALSE 0.517 68.000 0.061 NA   NA
 5486306 5486307 Arad_2715 Arad_2717   gstch9 FALSE 0.284 132.000 0.086 NA   NA
 5486307 5486308 Arad_2717 Arad_2718 gstch9   TRUE 0.940 -7.000 0.114 NA N NA
 5486308 5486309 Arad_2718 Arad_2719     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 5486310 5486311 Arad_2720 Arad_2721     TRUE 0.989 15.000 0.472 NA Y NA
 5486311 5486312 Arad_2721 Arad_2722   ssuD TRUE 0.803 25.000 0.226 NA N NA
 5486312 5486313 Arad_2722 Arad_2723 ssuD   FALSE 0.051 205.000 0.049 1.000 N NA
 5486315 5486316 Arad_2726 Arad_2728     FALSE 0.327 91.000 0.081 NA N NA
 5486316 5486317 Arad_2728 Arad_2730   exoI TRUE 0.980 3.000 0.050 NA Y NA
 5486319 5486320 Arad_2732 Arad_2733 dgkA cobU FALSE 0.066 186.000 0.042 1.000 N NA
 5486321 5486322 Arad_2734 Arad_2735 cobS   TRUE 0.732 20.000 0.028 NA   NA
 5486322 5486323 Arad_2735 Arad_2736     TRUE 0.982 -3.000 0.305 NA   NA
 5486323 5486324 Arad_2736 Arad_2737     FALSE 0.135 97.000 0.000 NA   NA
 5486325 5486326 Arad_2738 Arad_2739   folC TRUE 0.767 3.000 0.000 1.000   NA
 5486326 5486327 Arad_2739 Arad_2741 folC hndJ FALSE 0.012 266.000 0.000 0.091 N NA
 5486327 5486328 Arad_2741 Arad_2742 hndJ hndI TRUE 0.997 -3.000 0.303 0.091 Y NA
 5486328 5486329 Arad_2742 Arad_2743 hndI   FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 5486329 5486330 Arad_2743 Arad_2744     FALSE 0.164 85.000 0.000 NA   NA
 5486331 5486332 Arad_2745 Arad_2746     TRUE 0.927 8.000 0.182 NA   NA
 5486332 5486333 Arad_2746 Arad_2748     FALSE 0.083 131.000 0.000 NA   NA
 5486333 5486334 Arad_2748 Arad_2749     FALSE 0.352 95.000 0.000 0.009   NA
 5486334 5486335 Arad_2749 Arad_2750     FALSE 0.331 100.000 0.000 0.009   NA
 5486335 5486336 Arad_2750 Arad_2752     FALSE 0.018 216.000 0.000 NA   NA
 5486338 5486339 Arad_2754 Arad_2755 uvrB   FALSE 0.121 104.000 0.000 NA   NA
 5486339 5486340 Arad_2755 Arad_2756     FALSE 0.499 102.000 0.200 NA   NA
 5486340 5486341 Arad_2756 Arad_2757   cspA4 FALSE 0.001 441.000 0.000 1.000 N NA
 5486343 5486344 Arad_2760 Arad_2761     TRUE 0.787 17.000 0.035 1.000   NA
 5486345 5486346 Arad_2763 Arad_2764 zur znuB TRUE 0.990 -3.000 0.086 1.000 Y NA
 5486346 5486347 Arad_2764 Arad_4989 znuB   TRUE 0.999 -7.000 0.755 0.091 Y NA
 5486348 5486349 Arad_2765 Arad_2767 znuA   FALSE 0.374 93.000 0.045 NA   NA
 5486350 5486351 Arad_2770 Arad_2773   msbB FALSE 0.022 274.000 0.025 NA   NA
 5486351 5486352 Arad_2773 Arad_2774 msbB   TRUE 0.970 -3.000 0.248 1.000 N NA
 5486352 5486353 Arad_2774 Arad_2775     TRUE 0.847 55.000 0.453 1.000 N NA
 5486353 5486354 Arad_2775 Arad_2776     TRUE 0.997 13.000 0.784 0.013 Y NA
 5486354 5486355 Arad_2776 Arad_2778     TRUE 0.970 44.000 0.490 NA Y NA
 5486355 5486356 Arad_2778 Arad_2779   acpP TRUE 0.852 123.000 0.394 NA Y NA
 5486356 5486357 Arad_2779 Arad_2781 acpP   FALSE 0.485 19.000 0.000 NA   NA
 5486357 5486358 Arad_2781 Arad_2782     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5486358 5486359 Arad_2782 Arad_2783   cobD FALSE 0.212 123.000 0.016 NA   NA
 5486359 5486360 Arad_2783 Arad_2784 cobD cobC TRUE 0.989 -3.000 0.344 0.005 N NA
 5486360 5486361 Arad_2784 Arad_2785 cobC cobB TRUE 0.966 -3.000 0.067 0.005 N NA
 5486361 5486362 Arad_2785 Arad_2786 cobB cobA TRUE 0.991 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 5486362 5486363 Arad_2786 Arad_2787 cobA iunH2 FALSE 0.001 305.000 0.000 NA N NA
 5486363 5486364 Arad_2787 Arad_2789 iunH2 cobE FALSE 0.009 259.000 0.000 NA   NA
 5486365 5486366 Arad_2790 Arad_2792     FALSE 0.266 104.000 0.014 NA   NA
 5486366 5486367 Arad_2792 Arad_2794     TRUE 0.967 -3.000 0.174 NA   NA
 5486368 5486369 Arad_2795 Arad_2796 cobO   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486369 5486370 Arad_2796 Arad_2797   cobN TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486370 5486371 Arad_2797 Arad_2799 cobN cobW TRUE 0.952 10.000 0.274 1.000   NA
 5486371 5486372 Arad_2799 Arad_2800 cobW cobP TRUE 0.903 6.000 0.063 1.000   NA
 5486375 5486376 Arad_2803 Arad_2804     FALSE 0.001 848.000 0.000 NA   NA
 5486376 5486377 Arad_2804 Arad_2806     FALSE 0.339 247.000 0.333 NA Y NA
 5486377 5486378 Arad_2806 Arad_2808     TRUE 0.928 59.000 0.300 NA Y NA
 5486378 5486379 Arad_2808 Arad_2810   metH FALSE 0.392 152.000 0.000 1.000 Y NA
 5486380 5486381 Arad_2811 Arad_2813 nlpE1   FALSE 0.230 62.000 0.000 NA   NA
 5486381 5486382 Arad_2813 Arad_2814     FALSE 0.201 72.000 0.000 NA   NA
 5486382 5486383 Arad_2814 Arad_2816     FALSE 0.424 77.000 0.036 NA   NA
 5486383 5486384 Arad_2816 Arad_2818     FALSE 0.420 105.000 0.143 NA   NA
 5486385 5486386 Arad_2819 Arad_2823 metH   FALSE 0.540 152.000 0.436 NA   NA
 5486386 5486387 Arad_2823 Arad_2824     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5486387 5486388 Arad_2824 Arad_2827     TRUE 0.960 -7.000 0.118 NA   NA
 5486388 5486389 Arad_2827 Arad_2828     TRUE 0.995 4.000 0.875 NA   NA
 5486389 5486390 Arad_2828 Arad_2829     FALSE 0.378 96.000 0.045 1.000   NA
 5486390 5486391 Arad_2829 Arad_2831     TRUE 0.882 3.000 0.018 NA   NA
 5486391 5486392 Arad_2831 Arad_2832     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5486393 5486394 Arad_2834 Arad_2835     FALSE 0.118 105.000 0.000 NA   NA
 5486395 5486396 Arad_2837 Arad_2838     FALSE 0.006 287.000 0.000 NA   NA
 5486397 5486398 Arad_2839 Arad_2840   rrpX FALSE 0.022 283.000 0.000 0.011   NA
 5486398 5486399 Arad_2840 Arad_2841 rrpX   FALSE 0.014 230.000 0.000 NA   NA
 5486399 5486400 Arad_2841 Arad_2843     FALSE 0.119 177.000 0.053 NA   NA
 5486400 5486401 Arad_2843 Arad_2844     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 5486401 5486402 Arad_2844 Arad_2845     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 5486404 5486405 Arad_2848 Arad_2849     FALSE 0.022 204.000 0.000 NA   NA
 5486405 5486406 Arad_2849 Arad_5039     FALSE 0.001 702.000 0.000 NA   NA
 5486406 5486407 Arad_5039 Arad_2852     FALSE 0.089 126.000 0.000 NA   NA
 5486407 5486408 Arad_2852 Arad_2853     FALSE 0.326 203.000 0.444 1.000   NA
 5486408 5486409 Arad_2853 Arad_2854     TRUE 0.979 -3.000 0.250 1.000   NA
 5486409 5486410 Arad_2854 Arad_2855   afuC2 FALSE 0.267 145.000 0.107 1.000   NA
 5486410 5486411 Arad_2855 Arad_2856 afuC2 afuB2 TRUE 0.992 -12.000 0.590 1.000 N NA
 5486411 5486412 Arad_2856 Arad_2858 afuB2 afuA3 TRUE 0.991 18.000 0.607 NA Y NA
 5486415 5486416 Arad_2862 Arad_4990     TRUE 0.985 0.000 0.429 NA   NA
 5486416 5486417 Arad_4990 Arad_2863     TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5486418 5486419 Arad_2864 Arad_2866   ilvC FALSE 0.181 127.000 0.002 NA   NA
 5486419 5486420 Arad_2866 Arad_2867 ilvC   FALSE 0.385 51.000 0.019 1.000 N NA
 5486420 5486421 Arad_2867 Arad_2868     TRUE 0.924 23.000 0.000 0.083 Y NA
 5486423 5486424 Arad_2870 Arad_2872 ndhch   FALSE 0.045 166.000 0.000 NA   NA
 5486424 5486425 Arad_2872 Arad_2874     FALSE 0.146 93.000 0.000 NA   NA
 5486426 5486427 Arad_2875 Arad_2876     TRUE 0.786 75.000 0.011 1.000 Y NA
 5486427 5486428 Arad_2876 Arad_2878     FALSE 0.452 72.000 0.000 0.011   NA
 5486428 5486429 Arad_2878 Arad_2879     FALSE 0.126 111.000 0.000 1.000   NA
 5486429 5486430 Arad_2879 Arad_2880     TRUE 0.868 57.000 0.522 NA N NA
 5486431 5486432 Arad_2881 Arad_2882 gltD   TRUE 0.818 11.000 0.071 NA N NA
 5486434 5486435 Arad_2885 Arad_2887 pdxJ recD FALSE 0.086 181.000 0.011 1.000   NA
 5486435 5486436 Arad_2887 Arad_2888 recD   TRUE 0.574 50.000 0.041 1.000   NA
 5486436 5486437 Arad_2888 Arad_2889   nthB TRUE 0.992 14.000 0.761 0.000   NA
 5486437 5486438 Arad_2889 Arad_2890 nthB nthA TRUE 0.998 -3.000 0.761 0.000   NA
 5486439 5486440 Arad_2891 Arad_2892     TRUE 0.995 0.000 0.800 NA   NA
 5486443 5486444 Arad_2896 Arad_2897   ilvN FALSE 0.148 92.000 0.000 NA   NA
 5486444 5486445 Arad_2897 Arad_2898 ilvN ilvB TRUE 0.822 116.000 0.146 0.000 Y NA
 5486448 5486449 Arad_2903 Arad_2904 serB   FALSE 0.441 36.000 0.014 1.000 N NA
 5486450 5486451 Arad_2906 Arad_2908 degPch4 hflC FALSE 0.259 219.000 0.084 NA Y NA
 5486451 5486452 Arad_2908 Arad_2909 hflC hflK TRUE 0.999 0.000 0.947 NA Y NA
 5486452 5486453 Arad_2909 Arad_2910 hflK folA FALSE 0.080 176.000 0.044 1.000 N NA
 5486453 5486454 Arad_2910 Arad_2911 folA   FALSE 0.034 109.000 0.000 1.000 N NA
 5486454 5486455 Arad_2911 Arad_2913     FALSE 0.003 190.000 0.000 NA N NA
 5486455 5486456 Arad_2913 Arad_2914     FALSE 0.002 502.000 0.000 NA   NA
 5486456 5486457 Arad_2914 Arad_2915   ligK TRUE 0.983 -7.000 0.309 NA   NA
 5486457 5486458 Arad_2915 Arad_2917 ligK   TRUE 0.922 0.000 0.044 NA   NA
 5486458 5486459 Arad_2917 Arad_2918     TRUE 0.738 24.000 0.057 NA   NA
 5486460 5486461 Arad_2920 Arad_2921     TRUE 0.999 0.000 0.913 NA Y NA
 5486461 5486462 Arad_2921 Arad_2922     TRUE 0.999 -3.000 0.913 NA Y NA
 5486462 5486463 Arad_2922 Arad_2923     TRUE 0.999 -7.000 0.913 0.042 Y NA
 5486463 5486464 Arad_2923 Arad_2924     TRUE 0.686 79.000 0.000 NA Y NA
 5486464 5486465 Arad_2924 Arad_2925     FALSE 0.016 104.000 0.000 NA N NA
 5486465 5486466 Arad_2925 Arad_2926     TRUE 0.922 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5486468 5486469 Arad_2928 Arad_2930     TRUE 0.876 11.000 0.070 NA   NA
 5486470 5486471 Arad_2932 Arad_2934   thyA FALSE 0.036 105.000 0.000 1.000 N NA
 5486472 5486473 Arad_2935 Arad_5109     TRUE 0.816 -28.000 0.000 NA   NA
 5486473 5486474 Arad_5109 Arad_2936     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5486474 5486475 Arad_2936 Arad_2937     TRUE 0.628 54.000 0.118 NA   NA
 5486475 5486476 Arad_2937 Arad_2938     TRUE 0.762 92.000 0.425 NA   NA
 5486477 5486478 Arad_2939 Arad_2940   glcD FALSE 0.132 193.000 0.156 NA   NA
 5486479 5486480 Arad_2941 Arad_2943     TRUE 0.897 65.000 0.205 1.000 Y NA
 5486480 5486481 Arad_2943 Arad_2944     TRUE 0.997 -3.000 0.308 0.013 Y NA
 5486481 5486482 Arad_2944 Arad_2946     TRUE 0.998 -22.000 0.532 1.000 Y NA
 5486485 5486486 Arad_2950 Arad_2951 ompA flaCch5 FALSE 0.047 203.000 0.000 0.004 N NA
 5486486 5486487 Arad_2951 Arad_2952 flaCch5   FALSE 0.002 210.000 0.000 NA N NA
 5486487 5486488 Arad_2952 Arad_2954     TRUE 0.986 -3.000 0.442 NA N NA
 5486489 5486490 Arad_2955 Arad_2956 uvrD2   FALSE 0.047 375.000 0.000 0.006 Y NA
 5486490 5486491 Arad_2956 Arad_2957     FALSE 0.018 149.000 0.000 1.000 N NA
 5486491 5486492 Arad_2957 Arad_2959   pncA FALSE 0.031 113.000 0.000 1.000 N NA
 5486492 5486493 Arad_2959 Arad_2960 pncA   FALSE 0.056 80.000 0.000 1.000 N NA
 5486495 5486496 Arad_2962 Arad_2963 panC panB TRUE 0.997 2.000 0.395 0.000 Y NA
 5486498 5486499 Arad_2965 Arad_2966     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA   NA
 5486500 5486501 Arad_2967 Arad_2968   prmA FALSE 0.002 691.000 0.027 1.000 N NA
 5486501 5486502 Arad_2968 Arad_2969 prmA   FALSE 0.192 21.000 0.000 1.000 N NA
 5486502 5486503 Arad_2969 Arad_2971   senC TRUE 0.859 8.000 0.000 0.042   NA
 5486506 5486507 Arad_2976 Arad_2979     FALSE 0.167 84.000 0.000 NA   NA
 5486508 5486509 Arad_2980 Arad_2981 ligA recN TRUE 0.856 81.000 0.039 0.006 Y NA
 5486509 5486510 Arad_2981 Arad_2982 recN   TRUE 0.884 13.000 0.117 1.000   NA
 5486510 5486511 Arad_2982 Arad_2984   lpxC FALSE 0.026 289.000 0.064 1.000   NA
 5486511 5486512 Arad_2984 Arad_2986 lpxC ftsZ2 FALSE 0.015 332.000 0.134 1.000 N NA
 5486512 5486513 Arad_2986 Arad_2988 ftsZ2 ftsA TRUE 0.735 111.000 0.114 1.000 Y NA
 5486513 5486514 Arad_2988 Arad_2989 ftsA ftsQ TRUE 0.944 -3.000 0.137 NA N NA
 5486514 5486515 Arad_2989 Arad_2991 ftsQ ddlB TRUE 0.996 -12.000 0.372 NA Y NA
 5486515 5486516 Arad_2991 Arad_2992 ddlB   FALSE 0.002 300.000 0.000 1.000 N NA
 5486518 5486519 Arad_2994 Arad_2995 murB murC TRUE 0.994 -3.000 0.108 0.002 Y NA
 5486519 5486520 Arad_2995 Arad_2996 murC murG TRUE 0.995 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 5486520 5486521 Arad_2996 Arad_2997 murG ftsW FALSE 0.523 179.000 0.647 1.000 N NA
 5486521 5486522 Arad_2997 Arad_2998 ftsW murD TRUE 0.979 2.000 0.297 0.001 N NA
 5486522 5486523 Arad_2998 Arad_3000 murD mraY TRUE 0.997 8.000 0.647 0.002 Y NA
 5486523 5486524 Arad_3000 Arad_3001 mraY murF TRUE 0.991 12.000 0.309 0.002 Y NA
 5486524 5486525 Arad_3001 Arad_3002 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 5486525 5486526 Arad_3002 Arad_3003 murE ftsI TRUE 0.815 66.000 0.014 1.000 Y NA
 5486526 5486527 Arad_3003 Arad_3004 ftsI   TRUE 0.935 0.000 0.076 NA   NA
 5486527 5486528 Arad_3004 Arad_3006   mraW TRUE 0.931 2.000 0.089 NA   NA
 5486528 5486529 Arad_3006 Arad_3005 mraW mraZ TRUE 0.978 15.000 0.635 NA   NA
 5486529 5486530 Arad_3005 Arad_5110 mraZ   FALSE 0.002 433.000 0.000 NA   NA
 5486530 5486531 Arad_5110 Arad_3007     FALSE 0.215 68.000 0.000 NA   NA
 5486531 5486532 Arad_3007 Arad_3009     FALSE 0.436 83.000 0.057 NA   NA
 5486532 5486533 Arad_3009 Arad_3010     FALSE 0.024 266.000 0.026 NA   NA
 5486533 5486534 Arad_3010 Arad_3012   djlA TRUE 0.941 -3.000 0.098 1.000 N NA
 5486535 5486536 Arad_3013 Arad_3014 pfk   TRUE 0.565 60.000 0.158 1.000 N NA
 5486536 5486537 Arad_3014 Arad_3016     FALSE 0.362 115.000 0.123 NA   NA
 5486539 5486540 Arad_3020 Arad_3021 btaA btaB TRUE 0.981 -3.000 0.347 NA N NA
 5486540 5486541 Arad_3021 Arad_3022 btaB lyc FALSE 0.042 220.000 0.058 1.000 N NA
 5486541 5486542 Arad_3022 Arad_3024 lyc   TRUE 0.880 80.000 0.235 1.000 Y NA
 5486542 5486543 Arad_3024 Arad_3025     FALSE 0.191 168.000 0.137 NA   NA
 5486544 5486545 Arad_3026 Arad_3028 metF   TRUE 0.952 -16.000 0.160 1.000 N NA
 5486545 5486546 Arad_3028 Arad_3030     FALSE 0.067 195.000 0.009 1.000   NA
 5486546 5486547 Arad_3030 Arad_3031     FALSE 0.220 128.000 0.016 1.000   NA
 5486548 5486549 Arad_3032 Arad_3033     TRUE 0.884 19.000 0.227 NA   NA
 5486549 5486550 Arad_3033 Arad_3034     TRUE 0.822 18.000 0.098 NA   NA
 5486550 5486551 Arad_3034 Arad_3035   ilvG TRUE 0.956 -3.000 0.176 1.000 N NA
 5486552 5486553 Arad_3036 Arad_3037     FALSE 0.506 98.000 0.194 NA   NA
 5486553 5486554 Arad_3037 Arad_3039     FALSE 0.195 74.000 0.000 NA   NA
 5486556 5486557 Arad_3041 Arad_3042     TRUE 0.999 -3.000 0.706 0.044 Y NA
 5486557 5486558 Arad_3042 Arad_3043   glnA3 FALSE 0.379 161.000 0.361 1.000 N NA
 5486558 5486559 Arad_3043 Arad_3044 glnA3   TRUE 0.626 143.000 0.108 1.000 Y NA
 5486559 5486560 Arad_3044 Arad_3045     TRUE 0.833 127.000 0.346 1.000 Y NA
 5486561 5486562 Arad_3046 Arad_3047     FALSE 0.065 186.000 0.053 NA N NA
 5486562 5486563 Arad_3047 Arad_3049     FALSE 0.437 73.000 0.032 NA   NA
 5486563 5486564 Arad_3049 Arad_3051     TRUE 0.996 -12.000 0.774 NA   NA
 5486564 5486565 Arad_3051 Arad_3052     TRUE 0.991 12.000 0.461 NA Y NA
 5486565 5486566 Arad_3052 Arad_3053   ribH2 FALSE 0.001 325.000 0.000 1.000 N NA
 5486566 5486567 Arad_3053 Arad_3055 ribH2   FALSE 0.237 59.000 0.000 NA   NA
 5486568 5486569 Arad_3057 Arad_3058 phnF   TRUE 0.782 2.000 0.000 1.000   NA
 5486569 5486570 Arad_3058 Arad_3059   ubiA FALSE 0.036 186.000 0.000 1.000   NA
 5486570 5486571 Arad_3059 Arad_3060 ubiA   FALSE 0.011 175.000 0.000 1.000 N NA
 5486571 5486572 Arad_3060 Arad_3061     TRUE 0.970 13.000 0.463 1.000   NA
 5486572 5486573 Arad_3061 Arad_3062     TRUE 0.988 -3.000 0.415 NA   NA
 5486573 5486574 Arad_3062 Arad_3064     TRUE 0.995 13.000 0.708 NA Y NA
 5486574 5486575 Arad_3064 Arad_3066     TRUE 0.558 217.000 0.456 NA Y NA
 5486576 5486577 Arad_3067 Arad_3068     TRUE 0.994 -3.000 0.704 NA N NA
 5486580 5486581 Arad_3071 Arad_3072     FALSE 0.232 61.000 0.000 NA   NA
 5486584 5486585 Arad_3075 Arad_3076     FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5486585 5486586 Arad_3076 Arad_3077     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 5486587 5486588 Arad_3078 Arad_3079     FALSE 0.304 41.000 0.000 NA   NA
 5486588 5486589 Arad_3079 Arad_3080     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 5486589 5486590 Arad_3080 Arad_3082     FALSE 0.127 101.000 0.000 NA   NA
 5486590 5486591 Arad_3082 Arad_3083     FALSE 0.252 54.000 0.000 NA   NA
 5486591 5486592 Arad_3083 Arad_3085     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5486592 5486593 Arad_3085 Arad_3086     FALSE 0.268 50.000 0.000 NA   NA
 5486593 5486594 Arad_3086 Arad_3087     FALSE 0.127 101.000 0.000 NA   NA
 5486596 5486597 Arad_3089 Arad_3090     TRUE 0.817 -25.000 0.000 NA   NA
 5486597 5486598 Arad_3090 Arad_3091     FALSE 0.237 59.000 0.000 NA   NA
 5486599 5486600 Arad_3092 Arad_3094     FALSE 0.041 169.000 0.000 NA   NA
 5486600 5486601 Arad_3094 Arad_3096     FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 5486601 5486602 Arad_3096 Arad_3097     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486603 5486604 Arad_3098 Arad_5038     FALSE 0.095 119.000 0.000 NA   NA
 5486606 5486607 Arad_3100 Arad_3101     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5486607 5486608 Arad_3101 Arad_3103     FALSE 0.034 179.000 0.000 NA   NA
 5486608 5486609 Arad_3103 Arad_3104     FALSE 0.325 86.000 0.009 NA   NA
 5486611 5486612 Arad_3106 Arad_3108     FALSE 0.204 71.000 0.000 NA   NA
 5486612 5486613 Arad_3108 Arad_3109     FALSE 0.258 52.000 0.000 NA   NA
 5486613 5486614 Arad_3109 Arad_3110     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5486614 5486615 Arad_3110 Arad_3111     FALSE 0.478 84.000 0.094 NA   NA
 5486615 5486616 Arad_3111 Arad_3112     FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5486616 5486617 Arad_3112 Arad_3114     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486617 5486618 Arad_3114 Arad_3116     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5486618 5486619 Arad_3116 Arad_3117   rpoD FALSE 0.020 90.000 0.000 NA N NA
 5486619 5486620 Arad_3117 Arad_3118 rpoD tdh FALSE 0.001 446.000 0.000 1.000 N NA
 5486620 5486621 Arad_3118 Arad_3119 tdh kbl TRUE 0.950 22.000 0.547 1.000 N NA
 5486623 5486624 Arad_3122 Arad_3123 recQ dnaG TRUE 0.968 8.000 0.008 1.000 Y NA
 5486628 5486629 Arad_3128 Arad_3129     FALSE 0.131 99.000 0.000 NA   NA
 5486629 5486630 Arad_3129 Arad_3131     FALSE 0.125 149.000 0.039 1.000 N NA
 5486630 5486631 Arad_3131 Arad_3132     FALSE 0.003 371.000 0.000 NA   NA
 5486631 5486632 Arad_3132 Arad_3133     FALSE 0.426 94.000 0.087 NA   NA
 5486633 5486634 Arad_3134 Arad_3135   carB FALSE 0.046 171.000 0.003 NA N NA
 5486634 5486635 Arad_3135 Arad_3136 carB greA FALSE 0.072 242.000 0.241 1.000 N NA
 5486635 5486636 Arad_3136 Arad_3138 greA lpcC TRUE 0.817 7.000 0.036 1.000 N NA
 5486637 5486638 Arad_3139 Arad_3140     FALSE 0.485 19.000 0.000 NA   NA
 5486638 5486639 Arad_3140 Arad_3141   lrp TRUE 0.698 5.000 0.000 NA   NA
 5486640 5486641 Arad_3143 Arad_3145 trxB   TRUE 0.843 9.000 0.065 1.000 N NA
 5486641 5486642 Arad_3145 Arad_5113   suhB FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5486642 5486643 Arad_5113 Arad_3147 suhB   FALSE 0.005 320.000 0.000 NA   NA
 5486643 5486644 Arad_3147 Arad_3148   nerA TRUE 0.573 79.000 0.224 1.000 N NA
 5486644 5486645 Arad_3148 Arad_3150 nerA   FALSE 0.495 84.000 0.189 1.000 N NA
 5486651 5486652 Arad_3158 Arad_3159     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5486652 5486653 Arad_3159 Arad_3160   cspA5 FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 5486653 5486654 Arad_3160 Arad_3161 cspA5   TRUE 0.895 41.000 0.438 NA   NA
 5486656 5486657 Arad_3164 Arad_3166     FALSE 0.051 247.000 0.118 NA   NA
 5486657 5486658 Arad_3166 Arad_3167     FALSE 0.002 471.000 0.000 NA   NA
 5486658 5486659 Arad_3167 Arad_3169     TRUE 0.936 89.000 0.392 0.097 Y NA
 5486659 5486660 Arad_3169 Arad_3170     TRUE 0.987 26.000 0.592 1.000 Y NA
 5486660 5486661 Arad_3170 Arad_3171     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5486662 5486663 Arad_3172 Arad_3173 csaA proC TRUE 0.801 27.000 0.163 1.000   NA
 5486663 5486664 Arad_3173 Arad_3175 proC   TRUE 0.972 2.000 0.308 NA   NA
 5486664 5486665 Arad_3175 Arad_3176     FALSE 0.011 392.000 0.080 NA   NA
 5486666 5486667 Arad_3177 Arad_3178 lgt   TRUE 0.568 79.000 0.170 NA   NA
 5486667 5486668 Arad_3178 Arad_3179     TRUE 0.958 -3.000 0.107 NA   NA
 5486668 5486669 Arad_3179 Arad_3181     TRUE 0.896 2.000 0.023 NA   NA
 5486669 5486670 Arad_3181 Arad_3183     TRUE 0.883 56.000 0.485 NA   NA
 5486670 5486671 Arad_3183 Arad_3185   prsAch FALSE 0.486 107.000 0.209 NA   NA
 5486672 5486673 Arad_3186 Arad_3187     FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 5486673 5486674 Arad_3187 Arad_3188     FALSE 0.114 107.000 0.000 NA   NA
 5486675 5486676 Arad_3189 Arad_3190 rplY   FALSE 0.016 245.000 0.006 1.000 N NA
 5486676 5486677 Arad_3190 Arad_3191     TRUE 0.993 15.000 0.600 1.000 Y NA
 5486677 5486678 Arad_3191 Arad_3192   pth FALSE 0.254 76.000 0.007 1.000 N NA
 5486678 5486679 Arad_3192 Arad_3193 pth   TRUE 0.884 2.000 0.002 1.000   NA
 5486681 5486682 Arad_3195 Arad_3197     FALSE 0.032 202.000 0.005 1.000 N NA
 5486682 5486683 Arad_3197 Arad_3198     TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.044 Y NA
 5486684 5486685 Arad_3199 Arad_3200 apt fbcC FALSE 0.145 121.000 0.015 1.000 N NA
 5486685 5486686 Arad_3200 Arad_3201 fbcC fbcB TRUE 0.995 16.000 0.630 0.000 Y NA
 5486686 5486687 Arad_3201 Arad_3203 fbcB petA TRUE 0.973 15.000 0.029 0.000 Y NA
 5486689 5486690 Arad_3205 Arad_3206     TRUE 0.725 188.000 0.385 0.005 Y NA
 5486691 5486692 Arad_3207 Arad_3209     FALSE 0.169 83.000 0.000 NA   NA
 5486692 5486693 Arad_3209 Arad_3210     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 5486695 5486696 Arad_3212 Arad_3213 hemF   FALSE 0.322 90.000 0.014 NA   NA
 5486696 5486697 Arad_3213 Arad_3214     FALSE 0.448 135.000 0.259 NA   NA
 5486698 5486699 Arad_3216 Arad_3217 papS   TRUE 0.967 -3.000 0.163 1.000   NA
 5486699 5486700 Arad_3217 Arad_3218     TRUE 0.985 -3.000 0.346 NA   NA
 5486701 5486702 Arad_3220 Arad_3221     TRUE 0.964 29.000 0.697 NA   NA
 5486702 5486703 Arad_3221 Arad_3223     TRUE 0.997 -3.000 0.816 NA   NA
 5486703 5486704 Arad_3223 Arad_3224     TRUE 0.996 2.000 0.876 NA   NA
 5486704 5486705 Arad_3224 Arad_3226     TRUE 0.946 -3.000 0.052 NA   NA
 5486706 5486707 Arad_3227 Arad_3229     FALSE 0.068 143.000 0.000 NA   NA
 5486710 5486711 Arad_3233 Arad_3234     FALSE 0.326 96.000 0.018 1.000   NA
 5486711 5486712 Arad_3234 Arad_3235   rpoE3 FALSE 0.022 214.000 0.000 1.000   NA
 5486712 5486713 Arad_3235 Arad_3237 rpoE3   TRUE 0.995 21.000 0.909 NA Y NA
 5486713 5486714 Arad_3237 Arad_3238     FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5486717 5486718 Arad_3242 Arad_3243 leuA   FALSE 0.001 330.000 0.000 1.000 N NA
 5486718 5486719 Arad_3243 Arad_3244   greB FALSE 0.036 105.000 0.000 1.000 N NA
 5486719 5486720 Arad_3244 Arad_3245 greB   FALSE 0.051 158.000 0.000 NA   NA
 5486720 5486721 Arad_3245 Arad_3246   clpP FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5486723 5486724 Arad_3250 Arad_3251     TRUE 0.907 2.000 0.025 1.000   NA
 5486726 5486727 Arad_3254 Arad_3255   trpE FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 5486727 5486728 Arad_3255 Arad_3256 trpE   FALSE 0.011 255.000 0.000 1.000   NA
 5486728 5486729 Arad_3256 Arad_3257     FALSE 0.003 413.000 0.000 1.000   NA
 5486733 5486734 Arad_3261 Arad_3262     TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 5486736 5486737 Arad_3265 Arad_3266     FALSE 0.251 127.000 0.045 NA   NA
 5486737 5486738 Arad_3266 Arad_3267     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5486738 5486739 Arad_3267 Arad_3268     FALSE 0.021 88.000 0.000 NA N NA
 5486739 5486740 Arad_3268 Arad_3270   tdk FALSE 0.108 41.000 0.000 1.000 N NA
 5486741 5486742 Arad_3272 Arad_3274 proX proW TRUE 0.762 169.000 0.469 NA Y NA
 5486742 5486743 Arad_3274 Arad_3275 proW proV TRUE 0.999 -3.000 0.844 NA Y NA
 5486743 5486744 Arad_3275 Arad_3276 proV   TRUE 0.639 41.000 0.054 1.000   NA
 5486744 5486745 Arad_3276 Arad_3277   nolRch FALSE 0.022 300.000 0.054 1.000   NA
 5486745 5486746 Arad_3277 Arad_3278 nolRch bioA FALSE 0.001 435.000 0.000 1.000 N NA
 5486746 5486747 Arad_3278 Arad_3279 bioA ade FALSE 0.055 81.000 0.000 1.000 N NA
 5486749 5486750 Arad_3281 Arad_3282 oppA oppB TRUE 0.975 13.000 0.192 NA Y NA
 5486750 5486751 Arad_3282 Arad_3283 oppB oppC TRUE 0.999 -3.000 0.870 NA Y NA
 5486751 5486752 Arad_3283 Arad_3284 oppC oppD TRUE 0.981 2.000 0.043 NA Y NA
 5486752 5486753 Arad_3284 Arad_3285 oppD oppF TRUE 0.994 -7.000 0.079 0.004 Y NA
 5486753 5486754 Arad_3285 Arad_3287 oppF kdgK FALSE 0.026 128.000 0.000 1.000 N NA
 5486754 5486755 Arad_3287 Arad_3288 kdgK   FALSE 0.027 123.000 0.000 1.000 N NA
 5486758 5486759 Arad_3291 Arad_3292 engA   TRUE 0.785 16.000 0.026 1.000   NA
 5486759 5486760 Arad_3292 Arad_3295     FALSE 0.420 102.000 0.123 NA   NA
 5486764 5486765 Arad_3299 Arad_3301 map   FALSE 0.534 51.000 0.112 NA N NA
 5486765 5486766 Arad_3301 Arad_3302     FALSE 0.004 176.000 0.000 NA N NA
 5486766 5486767 Arad_3302 Arad_3303     FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 5486767 5486768 Arad_3303 Arad_3304     FALSE 0.458 99.000 0.152 NA   NA
 5486768 5486769 Arad_3304 Arad_3305     TRUE 0.997 -3.000 0.867 NA   NA
 5486769 5486770 Arad_3305 Arad_3306     FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5486770 5486771 Arad_3306 Arad_3308     FALSE 0.536 113.000 0.000 NA Y NA
 5486771 5486772 Arad_3308 Arad_3309     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5486772 5486773 Arad_3309 Arad_3310   glpK FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 5486774 5486775 Arad_3311 Arad_3312 bdhA xdhA FALSE 0.517 70.000 0.149 1.000 N NA
 5486775 5486776 Arad_3312 Arad_3313 xdhA xdhB TRUE 0.992 3.000 0.164 0.000 Y NA
 5486776 5486777 Arad_3313 Arad_3314 xdhB xdhC FALSE 0.015 302.000 0.090 NA N NA
 5486781 5486782 Arad_3319 Arad_3320   guaD TRUE 0.904 9.000 0.088 1.000   NA
 5486782 5486783 Arad_3320 Arad_3321 guaD lldD3 FALSE 0.252 97.000 0.036 1.000 N NA
 5486784 5486785 Arad_3322 Arad_3324     TRUE 0.934 4.000 0.133 1.000   NA
 5486785 5486786 Arad_3324 Arad_3326   allA TRUE 0.994 -3.000 0.571 1.000   NA
 5486786 5486787 Arad_3326 Arad_3327 allA   TRUE 0.980 -21.000 0.292 NA   NA
 5486787 5486788 Arad_3327 Arad_3328     TRUE 0.844 35.000 0.292 NA   NA
 5486788 5486789 Arad_3328 Arad_3330     TRUE 0.920 2.000 0.058 NA   NA
 5486789 5486790 Arad_3330 Arad_3331     FALSE 0.364 97.000 0.052 NA   NA
 5486790 5486791 Arad_3331 Arad_3332     FALSE 0.353 107.000 0.078 NA   NA
 5486794 5486795 Arad_3336 Arad_3337     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 5486795 5486796 Arad_3337 Arad_3338   rhlE2 FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 5486796 5486797 Arad_3338 Arad_3341 rhlE2   FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 5486799 5486800 Arad_3344 Arad_3346     TRUE 0.992 8.000 0.805 NA   NA
 5486800 5486801 Arad_3346 Arad_3347     TRUE 0.955 13.000 0.365 NA   NA
 5486801 5486802 Arad_3347 Arad_3350     FALSE 0.000 754.000 0.000 NA N NA
 5486803 5486804 Arad_3351 Arad_3352 ilvD   TRUE 0.761 66.000 0.261 0.070 N NA
 5486804 5486805 Arad_3352 Arad_3354   gguC TRUE 0.707 66.000 0.122 0.070   NA
 5486805 5486806 Arad_3354 Arad_3355 gguC gguB FALSE 0.539 116.000 0.286 NA   NA
 5486806 5486807 Arad_3355 Arad_3356 gguB gguA TRUE 0.998 0.000 0.680 NA Y NA
 5486807 5486808 Arad_3356 Arad_3358 gguA chvE TRUE 0.914 106.000 0.500 NA Y NA
 5486809 5486810 Arad_3359 Arad_3360 gbpR   TRUE 0.747 78.000 0.333 NA   NA
 5486814 5486815 Arad_3364 Arad_3365 xylF xylH FALSE 0.151 290.000 0.208 NA Y NA
 5486815 5486816 Arad_3365 Arad_3366 xylH xylG TRUE 0.936 16.000 0.333 NA   NA
 5486816 5486817 Arad_3366 Arad_5025 xylG   FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5486818 5486819 Arad_3367 Arad_3369     FALSE 0.033 180.000 0.000 NA   NA
 5486819 5486820 Arad_3369 Arad_3370     FALSE 0.023 202.000 0.000 NA   NA
 5486820 5486821 Arad_3370 Arad_3372   ampC FALSE 0.001 771.000 0.000 NA   NA
 5486823 5486824 Arad_3374 Arad_3376   nodD3 FALSE 0.000 684.000 0.000 1.000 N NA
 5486825 5486826 Arad_3377 Arad_3378     FALSE 0.022 204.000 0.000 NA   NA
 5486826 5486827 Arad_3378 Arad_3379     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 5486829 5486830 Arad_3381 Arad_3382     FALSE 0.020 210.000 0.000 NA   NA
 5486830 5486831 Arad_3382 Arad_3383     FALSE 0.043 47.000 0.000 NA N NA
 5486831 5486832 Arad_3383 Arad_3384   mntH FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 5486832 5486833 Arad_3384 Arad_3385 mntH   FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 5486837 5486838 Arad_3389 Arad_3390     FALSE 0.332 35.000 0.000 NA   NA
 5486839 5486840 Arad_3392 Arad_3393     FALSE 0.315 48.000 0.000 1.000   NA
 5486841 5486842 Arad_3394 Arad_3395   bkdA2 FALSE 0.001 268.000 0.000 NA N NA
 5486843 5486844 Arad_3396 Arad_3398     FALSE 0.001 328.000 0.000 1.000 N NA
 5486844 5486845 Arad_3398 Arad_3399     FALSE 0.010 262.000 0.000 1.000   NA
 5486845 5486846 Arad_3399 Arad_3400   thuBch FALSE 0.074 148.000 0.000 1.000   NA
 5486846 5486847 Arad_3400 Arad_3401 thuBch thuAch TRUE 0.659 9.000 0.000 NA   NA
 5486847 5486848 Arad_3401 Arad_3403 thuAch   FALSE 0.001 245.000 0.000 NA N NA
 5486848 5486849 Arad_3403 Arad_3404     TRUE 0.749 20.000 0.098 1.000 N NA
 5486849 5486850 Arad_3404 Arad_3405   aglK FALSE 0.130 32.000 0.000 1.000 N NA
 5486850 5486851 Arad_3405 Arad_3406 aglK   TRUE 0.724 70.000 0.000 NA Y NA
 5486851 5486852 Arad_3406 Arad_3407     TRUE 0.997 2.000 0.600 NA Y NA
 5486852 5486853 Arad_3407 Arad_3410     TRUE 0.986 74.000 1.000 NA Y NA
 5486853 5486854 Arad_3410 Arad_3411     FALSE 0.187 250.000 0.125 NA Y NA
 5486854 5486855 Arad_3411 Arad_3413     TRUE 0.959 20.000 0.520 NA   NA
 5486856 5486857 Arad_3414 Arad_3415     FALSE 0.189 86.000 0.000 1.000   NA
 5486857 5486858 Arad_3415 Arad_3417     TRUE 0.934 -3.000 0.026 NA   NA
 5486859 5486860 Arad_3418 Arad_3420     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 5486860 5486861 Arad_3420 Arad_3421     TRUE 0.587 126.000 0.357 NA   NA
 5486861 5486862 Arad_3421 Arad_3422     TRUE 0.946 5.000 0.214 NA   NA
 5486863 5486864 Arad_3425 Arad_3427 hmuS hmuT TRUE 0.990 11.000 0.384 1.000 Y NA
 5486864 5486865 Arad_3427 Arad_3428 hmuT hmuU TRUE 0.998 2.000 0.852 NA Y NA
 5486865 5486866 Arad_3428 Arad_3429 hmuU hmuV TRUE 0.980 8.000 0.158 NA Y NA
 5486866 5486867 Arad_3429 Arad_3430 hmuV   FALSE 0.232 175.000 0.222 NA   NA
 5486868 5486869 Arad_3433 Arad_3434 rpoE4   TRUE 0.930 12.000 0.237 NA   NA
 5486870 5486871 Arad_3436 Arad_3438 tcrX tcrY FALSE 0.473 73.000 0.143 NA N NA
 5486871 5486872 Arad_3438 Arad_3439 tcrY   FALSE 0.000 510.000 0.000 NA N NA
 5486872 5486873 Arad_3439 Arad_3441     TRUE 0.921 14.000 0.301 1.000 N NA
 5486875 5486876 Arad_3446 Arad_3447 amaB hydA TRUE 0.586 50.000 0.137 1.000 N NA
 5486878 5486879 Arad_3450 Arad_3451     TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5486879 5486880 Arad_3451 Arad_3452     TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5486880 5486881 Arad_3452 Arad_3453     TRUE 0.999 -3.000 0.855 NA Y NA
 5486881 5486882 Arad_3453 Arad_3455     TRUE 0.967 58.000 0.539 NA Y NA
 5486882 5486883 Arad_3455 Arad_3457     FALSE 0.000 397.000 0.000 NA N NA
 5486883 5486884 Arad_3457 Arad_3458     TRUE 0.804 15.000 0.130 NA N NA
 5486885 5486886 Arad_3459 Arad_3460 ureG ureF TRUE 0.893 107.000 0.283 0.001 Y NA
 5486886 5486887 Arad_3460 Arad_3462 ureF ureE TRUE 0.994 7.000 0.330 0.001 Y NA
 5486887 5486888 Arad_3462 Arad_3465 ureE   FALSE 0.318 80.000 0.037 1.000 N NA
 5486888 5486889 Arad_3465 Arad_3466     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 5486889 5486890 Arad_3466 Arad_3467   ureC TRUE 0.853 8.000 0.023 NA   NA
 5486890 5486891 Arad_3467 Arad_3469 ureC   TRUE 0.886 4.000 0.029 NA   NA
 5486891 5486892 Arad_3469 Arad_3470   ureB FALSE 0.292 44.000 0.000 NA   NA
 5486892 5486893 Arad_3470 Arad_3472 ureB ureA TRUE 0.993 23.000 0.595 0.000 Y NA
 5486893 5486894 Arad_3472 Arad_3474 ureA ureD TRUE 0.965 32.000 0.664 0.001 N NA
 5486894 5486895 Arad_3474 Arad_3475 ureD   FALSE 0.217 166.000 0.221 1.000 N NA
 5486895 5486896 Arad_3475 Arad_3476     TRUE 0.995 2.000 0.731 0.041   NA
 5486896 5486897 Arad_3476 Arad_3477     TRUE 0.993 5.000 0.823 1.000   NA
 5486897 5486898 Arad_3477 Arad_3478     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.100 Y NA
 5486898 5486899 Arad_3478 Arad_3480     TRUE 0.969 72.000 0.654 NA Y NA
 5486900 5486901 Arad_3481 Arad_3482     TRUE 0.904 -7.000 0.000 0.011 N NA
 5486902 5486903 Arad_3483 Arad_3484 braC2   FALSE 0.122 180.000 0.069 NA   NA
 5486903 5486904 Arad_3484 Arad_3485   braG TRUE 0.941 25.000 0.475 NA   NA
 5486904 5486905 Arad_3485 Arad_3486 braG braF TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.041 Y NA
 5486905 5486906 Arad_3486 Arad_3487 braF braE TRUE 0.996 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 5486906 5486907 Arad_3487 Arad_3489 braE braD TRUE 0.995 5.000 0.406 0.100 Y NA
 5486907 5486908 Arad_3489 Arad_3491 braD   FALSE 0.051 307.000 0.000 1.000 Y NA
 5486908 5486909 Arad_3491 Arad_3492     FALSE 0.017 218.000 0.000 NA   NA
 5486909 5486910 Arad_3492 Arad_3493   soxAe TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5486910 5486911 Arad_3493 Arad_3494 soxAe soxDe TRUE 0.948 -3.000 0.000 0.001   NA
 5486911 5486912 Arad_3494 Arad_3496 soxDe soxBe TRUE 0.977 14.000 0.062 0.001 Y NA
 5486913 5486914 Arad_3497 Arad_3499 pssB   FALSE 0.016 232.000 0.000 1.000   NA
 5486914 5486915 Arad_3499 Arad_3500     FALSE 0.011 344.000 0.021 1.000   NA
 5486918 5486919 Arad_3504 Arad_3506     FALSE 0.071 208.000 0.055 NA   NA
 5486920 5486921 Arad_3507 Arad_3509     FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 5486922 5486923 Arad_3510 Arad_3511     TRUE 0.872 11.000 0.064 NA   NA
 5486924 5486925 Arad_3512 Arad_3513 rluD rpoH FALSE 0.007 367.000 0.046 1.000 N NA
 5486926 5486927 Arad_3514 Arad_3515   purA FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5486927 5486928 Arad_3515 Arad_3517 purA   FALSE 0.018 224.000 0.000 1.000   NA
 5486928 5486929 Arad_3517 Arad_3518   codAb FALSE 0.147 102.000 0.000 1.000   NA
 5486930 5486931 Arad_3519 Arad_3521 rkpK lpsL TRUE 0.975 15.000 0.222 1.000 Y NA
 5486935 5486936 Arad_3525 Arad_3527     TRUE 0.908 146.000 0.702 NA Y NA
 5486936 5486937 Arad_3527 Arad_3528     TRUE 0.951 117.000 0.769 1.000 Y NA
 5486937 5486938 Arad_3528 Arad_3529   codAch2 TRUE 0.973 0.000 0.333 1.000 N NA
 5486938 5486939 Arad_3529 Arad_3530 codAch2   TRUE 0.953 -28.000 0.174 1.000 N NA
 5486939 5486940 Arad_3530 Arad_3531     TRUE 0.984 -3.000 0.217 0.044   NA
 5486943 5486944 Arad_3535 Arad_3537     FALSE 0.327 36.000 0.000 NA   NA
 5486944 5486945 Arad_3537 Arad_3538     FALSE 0.461 21.000 0.000 NA   NA
 5486945 5486946 Arad_3538 Arad_3539     TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5486948 5486949 Arad_3541 Arad_3542     FALSE 0.093 121.000 0.000 NA   NA
 5486949 5486950 Arad_3542 Arad_3543     TRUE 0.978 16.000 0.667 NA   NA
 5486950 5486951 Arad_3543 Arad_3544   ung FALSE 0.143 144.000 0.055 NA N NA
 5486951 5486952 Arad_3544 Arad_3547 ung   FALSE 0.040 99.000 0.000 1.000 N NA
 5486952 5486953 Arad_3547 Arad_3548     FALSE 0.003 254.000 0.000 1.000 N NA
 5486953 5486954 Arad_3548 Arad_3549     TRUE 0.988 10.000 0.786 NA N NA
 5486958 5486959 Arad_3554 Arad_3555   ilvD FALSE 0.021 261.000 0.047 1.000 N NA
 5486959 5486960 Arad_3555 Arad_3557 ilvD   TRUE 0.942 -19.000 0.116 1.000 N NA
 5486960 5486961 Arad_3557 Arad_3558     TRUE 0.976 -3.000 0.182 0.008 N NA
 5486961 5486962 Arad_3558 Arad_3559   mexF1 FALSE 0.003 254.000 0.000 1.000 N NA
 5486962 5486963 Arad_3559 Arad_3560 mexF1 mexE1 FALSE 0.025 131.000 0.000 1.000 N NA
 5486963 5486964 Arad_3560 Arad_3561 mexE1   FALSE 0.009 181.000 0.000 1.000 N NA
 5486971 5486972 Arad_3570 Arad_3571     FALSE 0.007 301.000 0.000 1.000   NA
 5486973 5486974 Arad_3572 Arad_3573 cyaG1   FALSE 0.015 157.000 0.000 1.000 N NA
 5486974 5486975 Arad_3573 Arad_3575     TRUE 0.884 81.000 0.250 1.000 Y NA
 5486976 5486977 Arad_3576 Arad_3578   ntaA FALSE 0.008 143.000 0.000 NA N NA
 5486977 5486978 Arad_3578 Arad_3579 ntaA   TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5486982 5486983 Arad_3585 Arad_3587 ggt   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5486983 5486984 Arad_3587 Arad_3588     FALSE 0.094 120.000 0.000 NA   NA
 5486985 5486986 Arad_3589 Arad_3590   cspA1 FALSE 0.002 409.000 0.000 NA   NA
 5486987 5486988 Arad_3591 Arad_3592     FALSE 0.073 140.000 0.000 NA   NA
 5486989 5486990 Arad_3593 Arad_3595     FALSE 0.044 94.000 0.000 1.000 N NA
 5486990 5486991 Arad_3595 Arad_3596     FALSE 0.413 41.000 0.000 0.069 N NA
 5486994 5486995 Arad_3599 Arad_3600     FALSE 0.002 214.000 0.000 NA N NA
 5486995 5486996 Arad_3600 Arad_3603     TRUE 0.910 120.000 0.560 NA Y NA
 5486996 5486997 Arad_3603 Arad_3604     TRUE 0.998 -10.000 0.565 1.000 Y NA
 5486999 5487000 Arad_3606 Arad_3607 tauA tauB TRUE 0.842 61.000 0.035 1.000 Y NA
 5487000 5487001 Arad_3607 Arad_3608 tauB tauC TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 5487002 5487003 Arad_3609 Arad_3610 hflK   FALSE 0.018 95.000 0.000 NA N NA
 5487003 5487004 Arad_3610 Arad_3611     FALSE 0.081 58.000 0.000 1.000 N NA
 5487004 5487005 Arad_3611 Arad_3613     FALSE 0.027 122.000 0.000 1.000 N NA
 5487006 5487007 Arad_3614 Arad_3615     FALSE 0.070 142.000 0.000 NA   NA
 5487009 5487010 Arad_3620 Arad_3621 ropAe   FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 5487011 5487012 Arad_3623 Arad_3624     TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 5487012 5487013 Arad_3624 Arad_3625     TRUE 0.895 3.000 0.000 0.035   NA
 5487014 5487015 Arad_3626 Arad_3627     FALSE 0.001 1033.000 0.000 NA   NA
 5487017 5487018 Arad_3630 Arad_3631   sohB TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487018 5487019 Arad_3631 Arad_3632 sohB   FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5487019 5487020 Arad_3632 Arad_3633     FALSE 0.089 126.000 0.000 NA   NA
 5487022 5487023 Arad_3636 Arad_3637     FALSE 0.032 182.000 0.000 NA   NA
 5487023 5487024 Arad_3637 Arad_3640     TRUE 0.969 1.000 0.273 NA   NA
 5487026 5487027 Arad_3642 Arad_3643     FALSE 0.327 36.000 0.000 NA   NA
 5487027 5487028 Arad_3643 Arad_3644     FALSE 0.088 127.000 0.000 NA   NA
 5487028 5487029 Arad_3644 Arad_3645     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 5487029 5487030 Arad_3645 Arad_3646     FALSE 0.277 48.000 0.000 NA   NA
 5487030 5487031 Arad_3646 Arad_3647     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 5487031 5487032 Arad_3647 Arad_3648     FALSE 0.252 54.000 0.000 NA   NA
 5487033 5487034 Arad_3649 Arad_3650     FALSE 0.001 1189.000 0.000 NA   NA
 5487036 5487037 Arad_3652 Arad_3653     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5487039 5487040 Arad_3655 Arad_3656     FALSE 0.080 134.000 0.000 NA   NA
 5487040 5487041 Arad_3656 Arad_5037     FALSE 0.020 209.000 0.000 NA   NA
 5487041 5487042 Arad_5037 Arad_3657   trmU FALSE 0.046 165.000 0.000 NA   NA
 5487042 5487043 Arad_3657 Arad_3660 trmU pgsAb FALSE 0.008 191.000 0.000 1.000 N NA
 5487043 5487044 Arad_3660 Arad_3661 pgsAb   TRUE 0.911 4.000 0.069 NA   NA
 5487044 5487045 Arad_3661 Arad_3662   cdsAb TRUE 0.933 -3.000 0.024 NA   NA
 5487045 5487046 Arad_3662 Arad_3663 cdsAb   TRUE 0.994 -3.000 0.595 1.000   NA
 5487046 5487047 Arad_3663 Arad_3664   serA FALSE 0.046 172.000 0.000 1.000   NA
 5487047 5487048 Arad_3664 Arad_3666 serA serC TRUE 0.623 147.000 0.140 1.000 Y NA
 5487050 5487051 Arad_3669 Arad_3670     FALSE 0.149 252.000 0.000 0.003 Y NA
 5487053 5487054 Arad_3672 Arad_3673     FALSE 0.185 77.000 0.000 NA   NA
 5487054 5487055 Arad_3673 Arad_3674   glmM FALSE 0.011 171.000 0.000 1.000 N NA
 5487055 5487056 Arad_3674 Arad_3675 glmM ftsH FALSE 0.018 241.000 0.012 1.000 N NA
 5487056 5487057 Arad_3675 Arad_3676 ftsH mesJ FALSE 0.390 126.000 0.145 0.087 N NA
 5487057 5487058 Arad_3676 Arad_3677 mesJ ygbF TRUE 0.684 39.000 0.085 1.000   NA
 5487058 5487059 Arad_3677 Arad_3678 ygbF pal FALSE 0.267 162.000 0.199 1.000   NA
 5487059 5487060 Arad_3678 Arad_3679 pal tolB TRUE 0.596 156.000 0.592 1.000 N NA
 5487060 5487061 Arad_3679 Arad_3680 tolB   TRUE 0.911 0.000 0.027 NA   NA
 5487061 5487062 Arad_3680 Arad_3681   tolA FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5487062 5487063 Arad_3681 Arad_3682 tolA tolR TRUE 0.878 10.000 0.061 NA   NA
 5487063 5487064 Arad_3682 Arad_3684 tolR tolQ TRUE 0.952 28.000 0.220 1.000 Y NA
 5487064 5487065 Arad_3684 Arad_3685 tolQ ybgC FALSE 0.071 418.000 0.593 1.000   NA
 5487066 5487067 Arad_3686 Arad_3687 sqdB sqdD TRUE 0.990 -3.000 0.086 1.000 Y NA
 5487067 5487068 Arad_3687 Arad_3688 sqdD sqdC TRUE 0.999 -3.000 0.696 1.000 Y NA
 5487068 5487069 Arad_3688 Arad_3689 sqdC   FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 5487069 5487070 Arad_3689 Arad_3690     TRUE 0.922 -3.000 0.009 NA   NA
 5487071 5487072 Arad_3692 Arad_3693   mutT TRUE 0.920 15.000 0.261 NA   NA
 5487072 5487073 Arad_3693 Arad_3694 mutT   TRUE 0.990 -13.000 0.333 0.010   NA
 5487073 5487074 Arad_3694 Arad_3695   ruvB TRUE 0.934 -3.000 0.016 1.000   NA
 5487074 5487075 Arad_3695 Arad_3697 ruvB ruvA TRUE 0.836 183.000 0.549 0.001 Y NA
 5487075 5487076 Arad_3697 Arad_3698 ruvA   TRUE 0.781 13.000 0.010 NA   NA
 5487076 5487077 Arad_3698 Arad_3699   ruvC FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 5487079 5487080 Arad_3703 Arad_3704     FALSE 0.242 120.000 0.028 NA   NA
 5487080 5487081 Arad_3704 Arad_3706     FALSE 0.197 128.000 0.013 NA   NA
 5487081 5487082 Arad_3706 Arad_3708     TRUE 0.914 4.000 0.077 NA   NA
 5487082 5487083 Arad_3708 Arad_3709     FALSE 0.142 104.000 0.000 1.000   NA
 5487083 5487084 Arad_3709 Arad_3713   acvB FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5487084 5487085 Arad_3713 Arad_3714 acvB lpiA TRUE 0.967 -3.000 0.176 NA   NA
 5487085 5487086 Arad_3714 Arad_3715 lpiA   FALSE 0.004 342.000 0.000 NA   NA
 5487087 5487088 Arad_3716 Arad_3717     FALSE 0.186 87.000 0.000 1.000   NA
 5487090 5487091 Arad_3719 Arad_3720 fabG2   TRUE 0.964 48.000 0.333 0.043 Y NA
 5487094 5487095 Arad_5111 Arad_3724     FALSE 0.201 72.000 0.000 NA   NA
 5487095 5487096 Arad_3724 Arad_3726     TRUE 0.585 52.000 0.068 NA   NA
 5487097 5487098 Arad_3727 Arad_3729 tkt gap TRUE 0.952 65.000 0.439 1.000 Y NA
 5487098 5487099 Arad_3729 Arad_3730 gap   TRUE 0.909 3.000 0.051 NA   NA
 5487099 5487100 Arad_3730 Arad_3731     FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   NA
 5487100 5487101 Arad_3731 Arad_3732   pgk FALSE 0.472 29.000 0.008 1.000 N NA
 5487101 5487102 Arad_3732 Arad_3734 pgk fbaB FALSE 0.357 212.000 0.032 0.002 Y NA
 5487102 5487103 Arad_3734 Arad_3737 fbaB phzF FALSE 0.005 481.000 0.016 1.000   NA
 5487104 5487105 Arad_4991 Arad_3738     FALSE 0.246 56.000 0.000 NA   NA
 5487106 5487107 Arad_3741 Arad_3742     TRUE 0.839 30.000 0.250 NA   NA
 5487107 5487108 Arad_3742 Arad_3745     FALSE 0.011 426.000 0.141 NA   NA
 5487108 5487109 Arad_3745 Arad_3747     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5487111 5487112 Arad_3750 Arad_3751     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 5487112 5487113 Arad_3751 Arad_3753     FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5487113 5487114 Arad_3753 Arad_3754     TRUE 0.958 8.000 0.300 NA   NA
 5487115 5487116 Arad_3755 Arad_3757     FALSE 0.208 70.000 0.000 NA   NA
 5487116 5487117 Arad_3757 Arad_3759   suhBch FALSE 0.186 134.000 0.014 NA   NA
 5487117 5487118 Arad_3759 Arad_3760 suhBch   FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 5487118 5487119 Arad_3760 Arad_3761     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487121 5487122 Arad_3763 Arad_3764 enhC thiEch TRUE 0.899 10.000 0.086 1.000   NA
 5487125 5487126 Arad_3768 Arad_3770   purE TRUE 0.757 20.000 0.044 NA   NA
 5487126 5487127 Arad_3770 Arad_3771 purE purK TRUE 0.996 -3.000 0.201 0.000 Y NA
 5487127 5487128 Arad_3771 Arad_3772 purK rpmJ FALSE 0.184 153.000 0.045 1.000   NA
 5487128 5487129 Arad_3772 Arad_3773 rpmJ   FALSE 0.106 125.000 0.000 1.000   NA
 5487129 5487130 Arad_3773 Arad_3774     FALSE 0.195 74.000 0.000 NA   NA
 5487132 5487133 Arad_3777 Arad_3778     TRUE 0.958 6.000 0.273 1.000   NA
 5487133 5487134 Arad_3778 Arad_3780     TRUE 0.929 4.000 0.133 NA   NA
 5487134 5487135 Arad_3780 Arad_3781     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487136 5487137 Arad_3782 Arad_3783   pyk FALSE 0.154 156.000 0.092 1.000 N NA
 5487137 5487138 Arad_3783 Arad_3784 pyk   TRUE 0.988 0.000 0.487 NA   NA
 5487139 5487140 Arad_3786 Arad_3787     TRUE 0.725 66.000 0.254 NA   NA
 5487140 5487141 Arad_3787 Arad_3789     FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 5487141 5487142 Arad_3789 Arad_3791     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 5487142 5487143 Arad_3791 Arad_3792     FALSE 0.338 34.000 0.000 NA   NA
 5487143 5487144 Arad_3792 Arad_3794   cysJ FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 5487144 5487145 Arad_3794 Arad_3795 cysJ   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487145 5487146 Arad_3795 Arad_3796   cyoA FALSE 0.162 86.000 0.000 NA   NA
 5487146 5487147 Arad_3796 Arad_3797 cyoA senC FALSE 0.435 72.000 0.000 0.040   NA
 5487147 5487148 Arad_3797 Arad_3798 senC   FALSE 0.105 126.000 0.000 1.000   NA
 5487149 5487150 Arad_3799 Arad_3800     TRUE 0.819 12.000 0.071 1.000 N NA
 5487150 5487151 Arad_3800 Arad_3801     FALSE 0.241 138.000 0.048 1.000   NA
 5487151 5487152 Arad_3801 Arad_3802   purN FALSE 0.167 94.000 0.000 1.000   NA
 5487152 5487153 Arad_3802 Arad_3804 purN   FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 5487153 5487154 Arad_3804 Arad_3805   tacA FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 5487155 5487156 Arad_3807 Arad_3808 pepF pabB TRUE 0.927 24.000 0.027 1.000 Y NA
 5487156 5487157 Arad_3808 Arad_3809 pabB   TRUE 0.980 12.000 0.219 1.000 Y NA
 5487157 5487158 Arad_3809 Arad_3811     TRUE 0.856 5.000 0.013 NA   NA
 5487158 5487159 Arad_3811 Arad_3813     FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5487159 5487160 Arad_3813 Arad_3814   hss FALSE 0.093 193.000 0.059 NA   NA
 5487160 5487161 Arad_3814 Arad_3816 hss omp3 FALSE 0.344 183.000 0.385 NA   NA
 5487161 5487162 Arad_3816 Arad_3817 omp3   TRUE 0.797 29.000 0.190 NA   NA
 5487162 5487163 Arad_3817 Arad_3820     FALSE 0.166 149.000 0.028 NA   NA
 5487163 5487164 Arad_3820 Arad_3821   hemH FALSE 0.294 98.000 0.061 1.000 N NA
 5487165 5487166 Arad_3822 Arad_3823     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487167 5487168 Arad_3825 Arad_3826     TRUE 0.991 4.000 0.313 NA Y NA
 5487172 5487173 Arad_3830 Arad_3831     TRUE 0.730 89.000 0.346 1.000   NA
 5487173 5487174 Arad_3831 Arad_3833     FALSE 0.134 107.000 0.000 1.000   NA
 5487175 5487176 Arad_3834 Arad_3836 gltD gltB TRUE 0.670 178.000 0.236 0.000 Y NA
 5487177 5487178 Arad_3837 Arad_3838     FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5487179 5487180 Arad_3839 Arad_3841     FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 5487182 5487183 Arad_3843 Arad_3845 ibpA   FALSE 0.003 358.000 0.000 NA   NA
 5487186 5487187 Arad_3849 Arad_3850     FALSE 0.004 345.000 0.000 1.000   NA
 5487187 5487188 Arad_3850 Arad_3851   pldB FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 5487192 5487193 Arad_3856 Arad_5026     FALSE 0.164 85.000 0.000 NA   NA
 5487194 5487195 Arad_3857 Arad_3859     FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5487195 5487196 Arad_3859 Arad_3861     FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 5487197 5487198 Arad_3862 Arad_3863     FALSE 0.010 263.000 0.000 1.000   NA
 5487198 5487199 Arad_3863 Arad_3864     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5487199 5487200 Arad_3864 Arad_3865     TRUE 0.981 14.000 0.667 NA   NA
 5487200 5487201 Arad_3865 Arad_3866     TRUE 0.993 2.000 0.734 NA   NA
 5487201 5487202 Arad_3866 Arad_3867     FALSE 0.237 106.000 0.058 NA N NA
 5487202 5487203 Arad_3867 Arad_3868   glgP FALSE 0.001 299.000 0.000 NA N NA
 5487203 5487204 Arad_3868 Arad_3869 glgP glgB TRUE 0.993 -3.000 0.189 1.000 Y NA
 5487204 5487205 Arad_3869 Arad_3871 glgB glgC TRUE 0.970 27.000 0.205 0.000 Y NA
 5487205 5487206 Arad_3871 Arad_3872 glgC glgA TRUE 0.984 4.000 0.134 1.000 Y NA
 5487206 5487207 Arad_3872 Arad_3873 glgA pgm TRUE 0.976 5.000 0.032 1.000 Y NA
 5487207 5487208 Arad_3873 Arad_3874 pgm glgX FALSE 0.218 223.000 0.034 1.000 Y NA
 5487208 5487209 Arad_3874 Arad_3875 glgX nodN FALSE 0.325 69.000 0.020 1.000 N NA
 5487210 5487211 Arad_3877 Arad_3878 soxGch soxAch TRUE 0.993 -7.000 0.407 0.002   NA
 5487211 5487212 Arad_3878 Arad_3879 soxAch soxDch TRUE 0.998 -3.000 0.867 0.001   NA
 5487212 5487213 Arad_3879 Arad_3881 soxDch   TRUE 0.845 17.000 0.133 NA   NA
 5487213 5487214 Arad_3881 Arad_3882   soxBch TRUE 0.973 3.000 0.333 NA   NA
 5487215 5487216 Arad_3885 Arad_3887 rpsU   FALSE 0.313 139.000 0.136 1.000   NA
 5487216 5487217 Arad_3887 Arad_3890     FALSE 0.083 142.000 0.000 1.000   NA
 5487217 5487218 Arad_3890 Arad_3891     FALSE 0.010 176.000 0.000 1.000 N NA
 5487219 5487220 Arad_3892 Arad_3893 pntB pntA1 TRUE 0.977 8.000 0.306 0.001   NA
 5487220 5487221 Arad_3893 Arad_3894 pntA1 pntA TRUE 0.964 1.000 0.058 0.001   NA
 5487221 5487222 Arad_3894 Arad_3895 pntA   FALSE 0.311 104.000 0.038 NA   NA
 5487222 5487223 Arad_3895 Arad_3896     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5487223 5487224 Arad_3896 Arad_3897     FALSE 0.002 230.000 0.000 NA N NA
 5487226 5487227 Arad_3899 Arad_3900     TRUE 0.834 32.000 0.308 1.000 N NA
 5487227 5487228 Arad_3900 Arad_3901     TRUE 0.889 121.000 0.368 0.051 Y NA
 5487229 5487230 Arad_3902 Arad_3903     TRUE 0.707 139.000 0.565 NA   NA
 5487230 5487231 Arad_3903 Arad_3905     TRUE 0.966 0.000 0.231 NA   NA
 5487231 5487232 Arad_3905 Arad_3906   cysE2 TRUE 0.753 17.000 0.024 NA   NA
 5487232 5487233 Arad_3906 Arad_3908 cysE2   FALSE 0.003 246.000 0.000 1.000 N NA
 5487233 5487234 Arad_3908 Arad_3909     TRUE 0.930 24.000 0.467 1.000 N NA
 5487235 5487236 Arad_3910 Arad_3911     TRUE 0.615 96.000 0.257 1.000   NA
 5487237 5487238 Arad_3912 Arad_3913     TRUE 0.926 67.000 0.706 NA   NA
 5487238 5487239 Arad_3913 Arad_3914     TRUE 0.975 -6.000 0.226 NA   NA
 5487240 5487241 Arad_3915 Arad_3916     FALSE 0.215 68.000 0.000 NA   NA
 5487241 5487242 Arad_3916 Arad_3917   eda FALSE 0.237 131.000 0.042 NA   NA
 5487243 5487244 Arad_3919 Arad_3920     TRUE 0.934 -22.000 0.032 NA   NA
 5487244 5487245 Arad_3920 Arad_3921     FALSE 0.170 141.000 0.015 NA   NA
 5487246 5487247 Arad_3923 Arad_3924     FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 5487247 5487248 Arad_3924 Arad_3925   bglSch FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 5487250 5487251 Arad_3928 Arad_3930     FALSE 0.105 305.000 0.481 NA   NA
 5487251 5487252 Arad_3930 Arad_3932     FALSE 0.134 261.000 0.043 NA Y NA
 5487252 5487253 Arad_3932 Arad_3934     TRUE 0.894 66.000 0.217 NA Y NA
 5487253 5487254 Arad_3934 Arad_3935     TRUE 0.981 51.000 0.700 1.000 Y NA
 5487255 5487256 Arad_3936 Arad_3937     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5487257 5487258 Arad_3938 Arad_3939 xylA xylB TRUE 0.902 43.000 0.094 1.000 Y NA
 5487258 5487259 Arad_3939 Arad_3940 xylB   TRUE 0.964 28.000 0.300 1.000 Y NA
 5487259 5487260 Arad_3940 Arad_3942     TRUE 0.569 145.000 0.048 1.000 Y NA
 5487260 5487261 Arad_3942 Arad_3944     TRUE 0.961 19.000 0.586 1.000 N NA
 5487262 5487263 Arad_3945 Arad_3946     TRUE 0.559 105.000 0.156 0.079   NA
 5487263 5487264 Arad_3946 Arad_3947     FALSE 0.291 134.000 0.083 1.000   NA
 5487265 5487266 Arad_3950 Arad_3952     FALSE 0.172 82.000 0.000 NA   NA
 5487267 5487268 Arad_3953 Arad_3954 gltX1 lysS TRUE 0.961 16.000 0.014 0.086 Y NA
 5487269 5487270 Arad_3957 Arad_3958     TRUE 0.950 18.000 0.412 1.000   NA
 5487270 5487271 Arad_3958 Arad_3959   iolE TRUE 0.885 49.000 0.088 NA Y NA
 5487272 5487273 Arad_3960 Arad_3962     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487275 5487276 Arad_3964 Arad_3966     FALSE 0.104 203.000 0.196 1.000 N NA
 5487276 5487277 Arad_3966 Arad_3969     TRUE 0.928 137.000 0.609 0.098 Y NA
 5487277 5487278 Arad_3969 Arad_3970   potH TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.098 Y NA
 5487278 5487279 Arad_3970 Arad_3972 potH   TRUE 0.999 -10.000 0.821 0.098 Y NA
 5487279 5487280 Arad_3972 Arad_3974     TRUE 0.953 13.000 0.405 1.000 N NA
 5487280 5487281 Arad_3974 Arad_3976     FALSE 0.042 236.000 0.042 NA   NA
 5487282 5487283 Arad_3978 Arad_3980     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5487283 5487284 Arad_3980 Arad_3981     FALSE 0.147 102.000 0.000 1.000   NA
 5487284 5487285 Arad_3981 Arad_3983     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5487285 5487286 Arad_3983 Arad_3984     TRUE 0.983 4.000 0.364 0.043   NA
 5487286 5487287 Arad_3984 Arad_3985     FALSE 0.146 175.000 0.088 NA   NA
 5487287 5487288 Arad_3985 Arad_3986     TRUE 0.865 15.000 0.140 NA   NA
 5487288 5487289 Arad_3986 Arad_3987     TRUE 0.861 17.000 0.219 1.000 N NA
 5487289 5487290 Arad_3987 Arad_3988     TRUE 0.993 5.000 0.318 0.098 Y NA
 5487290 5487291 Arad_3988 Arad_3990     TRUE 0.992 3.000 0.250 0.098 Y NA
 5487291 5487292 Arad_3990 Arad_3991     TRUE 0.713 161.000 0.250 0.098 Y NA
 5487293 5487294 Arad_3992 Arad_3993     TRUE 0.618 64.000 0.131 1.000   NA
 5487294 5487295 Arad_3993 Arad_3995     TRUE 0.608 32.000 0.000 0.068   NA
 5487295 5487296 Arad_3995 Arad_3997     TRUE 0.828 2.000 0.000 0.068 N NA
 5487301 5487302 Arad_4003 Arad_4004     FALSE 0.348 124.000 0.142 NA   NA
 5487306 5487307 Arad_4009 Arad_4010     TRUE 0.969 18.000 0.562 1.000   NA
 5487307 5487308 Arad_4010 Arad_4011   mtlK TRUE 0.727 101.000 0.308 0.068   NA
 5487308 5487309 Arad_4011 Arad_4012 mtlK smoK TRUE 0.828 123.000 0.326 1.000 Y NA
 5487309 5487310 Arad_4012 Arad_4014 smoK smoG TRUE 0.992 12.000 0.373 0.098 Y NA
 5487310 5487311 Arad_4014 Arad_4016 smoG smoF TRUE 0.999 2.000 0.918 0.098 Y NA
 5487311 5487312 Arad_4016 Arad_4017 smoF smoEch TRUE 0.811 144.000 0.306 0.098 Y NA
 5487312 5487313 Arad_4017 Arad_4019 smoEch smoC FALSE 0.305 147.000 0.236 1.000 N NA
 5487313 5487314 Arad_4019 Arad_4021 smoC fucUc FALSE 0.079 59.000 0.000 1.000 N NA
 5487315 5487316 Arad_4022 Arad_4023     TRUE 0.992 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 5487316 5487317 Arad_4023 Arad_4024     FALSE 0.020 92.000 0.000 NA N NA
 5487317 5487318 Arad_4024 Arad_4025   cutC TRUE 0.898 -10.000 0.033 NA N NA
 5487318 5487319 Arad_4025 Arad_4027 cutC pssV FALSE 0.074 139.000 0.000 NA   NA
 5487319 5487320 Arad_4027 Arad_4028 pssV   FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 5487321 5487322 Arad_4029 Arad_4030     TRUE 0.996 -3.000 0.761 NA   NA
 5487322 5487323 Arad_4030 Arad_4031     TRUE 0.976 19.000 0.683 NA   NA
 5487323 5487324 Arad_4031 Arad_5036     FALSE 0.001 859.000 0.000 NA   NA
 5487324 5487325 Arad_5036 Arad_4034     FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 5487325 5487326 Arad_4034 Arad_4035   maf TRUE 0.911 6.000 0.102 NA   NA
 5487326 5487327 Arad_4035 Arad_4037 maf infA TRUE 0.628 56.000 0.207 NA N NA
 5487327 5487328 Arad_4037 Arad_4038 infA   FALSE 0.373 143.000 0.293 NA N NA
 5487328 5487329 Arad_4038 Arad_4039     TRUE 0.996 -24.000 0.768 NA   NA
 5487329 5487330 Arad_4039 Arad_4040   hisD TRUE 0.935 4.000 0.157 NA   NA
 5487330 5487331 Arad_4040 Arad_4042 hisD   TRUE 0.582 61.000 0.096 NA   NA
 5487331 5487332 Arad_4042 Arad_4043   murA FALSE 0.319 133.000 0.138 NA   NA
 5487332 5487333 Arad_4043 Arad_4044 murA   FALSE 0.225 128.000 0.028 NA   NA
 5487334 5487335 Arad_5027 Arad_4046     FALSE 0.001 780.000 0.000 NA   NA
 5487338 5487339 Arad_4051 Arad_4052     TRUE 0.954 21.000 0.583 NA N NA
 5487339 5487340 Arad_4052 Arad_4053     TRUE 0.601 59.000 0.188 1.000 N NA
 5487340 5487341 Arad_4053 Arad_4055     FALSE 0.092 122.000 0.000 NA   NA
 5487344 5487345 Arad_4058 Arad_4061   dgoA FALSE 0.534 63.000 0.138 1.000 N NA
 5487346 5487347 Arad_4062 Arad_4063     TRUE 0.915 23.000 0.343 NA   NA
 5487347 5487348 Arad_4063 Arad_4064     TRUE 0.997 -13.000 0.475 NA Y NA
 5487348 5487349 Arad_4064 Arad_4066     TRUE 0.698 5.000 0.000 NA   NA
 5487349 5487350 Arad_4066 Arad_4067   msrAe FALSE 0.093 121.000 0.000 NA   NA
 5487350 5487351 Arad_4067 Arad_4068 msrAe   FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5487352 5487353 Arad_4069 Arad_4070     TRUE 0.988 -3.000 0.381 1.000   NA
 5487353 5487354 Arad_4070 Arad_4072     TRUE 0.997 -7.000 0.381 0.097 Y NA
 5487354 5487355 Arad_4072 Arad_4073     TRUE 0.995 -3.000 0.222 0.097 Y NA
 5487355 5487356 Arad_4073 Arad_4074   ugpBc TRUE 0.970 26.000 0.250 0.097 Y NA
 5487358 5487359 Arad_4077 Arad_4078     FALSE 0.068 143.000 0.000 NA   NA
 5487368 5487369 Arad_4090 Arad_4092     FALSE 0.001 642.000 0.000 NA   NA
 5487369 5487370 Arad_4092 Arad_4093     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5487370 5487371 Arad_4093 Arad_4095     FALSE 0.004 730.000 0.000 0.024   NA
 5487372 5487373 Arad_4984 Arad_4992     FALSE 0.002 428.000 0.000 NA   NA
 5487373 5487374 Arad_4992 Arad_4096     TRUE 0.824 -12.000 0.000 NA   NA
 5487375 5487376 Arad_4097 Arad_4098     TRUE 0.730 152.000 0.700 NA   NA
 5487376 5487377 Arad_4098 Arad_4099     TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA   NA
 5487377 5487378 Arad_4099 Arad_4100     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 5487378 5487379 Arad_4100 Arad_4102     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5487380 5487381 Arad_4103 Arad_4104     FALSE 0.090 124.000 0.000 NA   NA
 5487382 5487383 Arad_4105 Arad_4106     FALSE 0.061 149.000 0.000 NA   NA
 5487383 5487384 Arad_4106 Arad_4107     FALSE 0.002 412.000 0.000 NA   NA
 5487384 5487385 Arad_4107 Arad_4108     FALSE 0.154 89.000 0.000 NA   NA
 5487385 5487386 Arad_4108 Arad_4109   secA FALSE 0.001 851.000 0.000 NA   NA
 5487386 5487387 Arad_4109 Arad_4110 secA   FALSE 0.084 188.000 0.000 0.034   NA
 5487387 5487388 Arad_4110 Arad_4112   smc FALSE 0.452 57.000 0.012 NA   NA
 5487388 5487389 Arad_4112 Arad_4113 smc   FALSE 0.413 145.000 0.000 NA Y NA
 5487389 5487390 Arad_4113 Arad_4114     TRUE 0.964 7.000 0.330 NA   NA
 5487390 5487391 Arad_4114 Arad_4115     TRUE 0.831 81.000 0.491 NA   NA
 5487393 5487394 Arad_5035 Arad_5108     FALSE 0.067 144.000 0.000 NA   NA
 5487394 5487395 Arad_5108 Arad_5107     FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5487397 5487398 Arad_5034 Arad_5033     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5487398 5487399 Arad_5033 Arad_5106     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5487401 5487402 Arad_4123 Arad_4124   clpB FALSE 0.183 148.000 0.000 0.008   NA
 5487402 5487403 Arad_4124 Arad_4126 clpB   FALSE 0.025 248.000 0.006 NA   NA
 5487403 5487404 Arad_4126 Arad_4127   hemK FALSE 0.010 347.000 0.021 NA   NA
 5487404 5487405 Arad_4127 Arad_4128 hemK prfA TRUE 0.994 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 5487405 5487406 Arad_4128 Arad_4130 prfA ptsP TRUE 0.707 32.000 0.034 0.023 N NA
 5487406 5487407 Arad_4130 Arad_4131 ptsP lysC FALSE 0.288 103.000 0.069 1.000 N NA
 5487409 5487410 Arad_4134 Arad_4135     TRUE 0.668 27.000 0.031 NA   NA
 5487410 5487411 Arad_4135 Arad_4137     TRUE 0.957 -3.000 0.097 NA   NA
 5487411 5487412 Arad_4137 Arad_4139   grxC TRUE 0.793 25.000 0.121 1.000   NA
 5487412 5487413 Arad_4139 Arad_4141 grxC comF FALSE 0.359 31.000 0.000 NA   NA
 5487415 5487416 Arad_4148 Arad_4150 pilA   TRUE 0.687 79.000 0.273 NA   NA
 5487416 5487417 Arad_4150 Arad_4152   mutT FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5487417 5487418 Arad_4152 Arad_4153 mutT   TRUE 0.957 -3.000 0.082 1.000   NA
 5487418 5487419 Arad_4153 Arad_4154   argJ TRUE 0.932 -28.000 0.020 1.000   NA
 5487419 5487420 Arad_4154 Arad_4155 argJ ppiD2 FALSE 0.458 63.000 0.070 1.000 N NA
 5487425 5487426 Arad_4162 Arad_4163     TRUE 0.977 3.000 0.378 NA   NA
 5487427 5487428 Arad_4164 Arad_4166     FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 5487428 5487429 Arad_4166 Arad_4168     TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA   NA
 5487429 5487430 Arad_4168 Arad_4169   lepB FALSE 0.021 141.000 0.000 1.000 N NA
 5487431 5487432 Arad_4170 Arad_4171   ubiG FALSE 0.120 221.000 0.286 1.000 N NA
 5487434 5487435 Arad_4173 Arad_5028     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 5487437 5487438 Arad_4176 Arad_4178     FALSE 0.001 1543.000 0.000 NA   NA
 5487438 5487439 Arad_4178 Arad_4180     TRUE 0.948 16.000 0.385 NA   NA
 5487440 5487441 Arad_4182 Arad_4183   alkA FALSE 0.134 151.000 0.050 1.000 N NA
 5487444 5487445 Arad_4187 Arad_4188     TRUE 0.866 23.000 0.231 NA   NA
 5487445 5487446 Arad_4188 Arad_4189     TRUE 0.881 14.000 0.156 NA   NA
 5487446 5487447 Arad_4189 Arad_4191   etfBf FALSE 0.067 199.000 0.015 1.000   NA
 5487447 5487448 Arad_4191 Arad_4193 etfBf etfAch TRUE 0.973 25.000 0.226 0.007 Y NA
 5487448 5487449 Arad_4193 Arad_4195 etfAch hbdA FALSE 0.165 152.000 0.092 1.000 N NA
 5487451 5487452 Arad_4197 Arad_4198 argH   FALSE 0.268 100.000 0.008 NA   NA
 5487452 5487453 Arad_4198 Arad_4200   lysA TRUE 0.770 14.000 0.013 NA   NA
 5487453 5487454 Arad_4200 Arad_4202 lysA   FALSE 0.039 250.000 0.062 NA   NA
 5487455 5487456 Arad_4203 Arad_4205   hpt FALSE 0.065 181.000 0.031 1.000 N NA
 5487456 5487457 Arad_4205 Arad_4206 hpt   FALSE 0.342 89.000 0.021 NA   NA
 5487458 5487459 Arad_4207 Arad_4208 ftsE ftsX TRUE 0.801 92.000 0.139 NA Y NA
 5487459 5487460 Arad_4208 Arad_4209 ftsX   TRUE 0.827 70.000 0.417 NA   NA
 5487460 5487461 Arad_4209 Arad_4211   plsC TRUE 0.576 99.000 0.250 NA   NA
 5487463 5487464 Arad_4213 Arad_4214     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 5487464 5487465 Arad_4214 Arad_4215     TRUE 0.997 -10.000 0.407 NA Y NA
 5487466 5487467 Arad_4216 Arad_4217 tyrC hisC TRUE 0.993 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 5487467 5487468 Arad_4217 Arad_4218 hisC   FALSE 0.273 104.000 0.008 1.000   NA
 5487469 5487470 Arad_4219 Arad_4220 gloB   TRUE 0.951 -3.000 0.071 NA   NA
 5487470 5487471 Arad_4220 Arad_4221     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5487472 5487473 Arad_4222 Arad_4223     FALSE 0.430 90.000 0.076 NA   NA
 5487474 5487475 Arad_4224 Arad_4225 rpmB   FALSE 0.245 117.000 0.025 NA   NA
 5487476 5487477 Arad_4227 Arad_4228   cobT FALSE 0.156 88.000 0.000 NA   NA
 5487477 5487478 Arad_4228 Arad_4229 cobT cobS TRUE 0.972 18.000 0.433 0.000   NA
 5487478 5487479 Arad_4229 Arad_4231 cobS dnaJ3 FALSE 0.006 309.000 0.000 1.000   NA
 5487481 5487482 Arad_4233 Arad_4234   aroB FALSE 0.380 60.000 0.040 NA N NA
 5487482 5487483 Arad_4234 Arad_4236 aroB aroK TRUE 0.992 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 5487484 5487485 Arad_4237 Arad_4238   xerD TRUE 0.843 12.000 0.043 NA   NA
 5487485 5487486 Arad_4238 Arad_4239 xerD   FALSE 0.435 64.000 0.058 1.000 N NA
 5487486 5487487 Arad_4239 Arad_4240     FALSE 0.036 230.000 0.015 NA   NA
 5487487 5487488 Arad_4240 Arad_4242     TRUE 0.949 -7.000 0.060 NA   NA
 5487489 5487490 Arad_4243 Arad_4244   dacF2 TRUE 0.965 14.000 0.458 NA   NA
 5487491 5487492 Arad_4246 Arad_5029 hipO   FALSE 0.093 121.000 0.000 NA   NA
 5487492 5487493 Arad_5029 Arad_4248     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5487494 5487495 Arad_4249 Arad_4250     FALSE 0.008 268.000 0.000 NA   NA
 5487497 5487498 Arad_4252 Arad_4253     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 5487498 5487499 Arad_4253 Arad_4255     FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 5487499 5487500 Arad_4255 Arad_4256     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 5487500 5487501 Arad_4256 Arad_4257     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487502 5487503 Arad_4258 Arad_4259     FALSE 0.002 206.000 0.000 NA N NA
 5487508 5487509 Arad_4264 Arad_4265 pssO hemAch FALSE 0.003 391.000 0.000 1.000   NA
 5487509 5487510 Arad_4265 Arad_4266 hemAch xdhA FALSE 0.006 202.000 0.000 1.000 N NA
 5487510 5487511 Arad_4266 Arad_4267 xdhA   TRUE 0.992 19.000 0.525 0.039 Y NA
 5487511 5487512 Arad_4267 Arad_4268   xdhA TRUE 0.855 84.000 0.062 0.039 Y NA
 5487513 5487514 Arad_4269 Arad_4270     FALSE 0.011 326.000 0.010 NA   NA
 5487514 5487515 Arad_4270 Arad_4271     TRUE 0.685 64.000 0.212 NA   NA
 5487516 5487517 Arad_4272 Arad_4273 dehII   FALSE 0.010 262.000 0.000 1.000   NA
 5487517 5487518 Arad_4273 Arad_4274     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 5487519 5487520 Arad_4276 Arad_4277 rocF rocD TRUE 0.939 21.000 0.038 1.000 Y NA
 5487520 5487521 Arad_4277 Arad_4278 rocD cheW5 FALSE 0.132 131.000 0.015 1.000 N NA
 5487522 5487523 Arad_4281 Arad_4282   fdsD FALSE 0.285 119.000 0.057 NA   NA
 5487523 5487524 Arad_4282 Arad_4284 fdsD fdhD TRUE 0.994 -10.000 0.458 0.001   NA
 5487524 5487525 Arad_4284 Arad_4285 fdhD fdhA FALSE 0.180 218.000 0.180 0.001   NA
 5487525 5487526 Arad_4285 Arad_4286 fdhA fdsB TRUE 0.980 6.000 0.466 1.000   NA
 5487526 5487527 Arad_4286 Arad_4287 fdsB fdsG TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.006 Y NA
 5487527 5487528 Arad_4287 Arad_4288 fdsG   FALSE 0.412 119.000 0.243 1.000 N NA
 5487528 5487529 Arad_4288 Arad_4289     FALSE 0.093 121.000 0.000 NA   NA
 5487529 5487530 Arad_4289 Arad_4290     FALSE 0.195 74.000 0.000 NA   NA
 5487530 5487531 Arad_4290 Arad_4291     FALSE 0.016 154.000 0.000 1.000 N NA
 5487532 5487533 Arad_4293 Arad_4294 glpRb glpD FALSE 0.385 64.000 0.036 1.000 N NA
 5487535 5487536 Arad_4296 Arad_4298     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5487537 5487538 Arad_4299 Arad_4300   dhaL TRUE 0.569 22.000 0.000 0.067 N NA
 5487538 5487539 Arad_4300 Arad_4301 dhaL   TRUE 0.980 2.000 0.000 0.042 Y NA
 5487541 5487542 Arad_4304 Arad_4306 atpC atpD TRUE 0.987 76.000 0.837 0.002 Y NA
 5487542 5487543 Arad_4306 Arad_4307 atpD atpG TRUE 0.999 -3.000 0.724 0.002 Y NA
 5487543 5487544 Arad_4307 Arad_4308 atpG atpA TRUE 0.995 30.000 0.846 0.002 Y NA
 5487544 5487545 Arad_4308 Arad_4310 atpA atpH TRUE 0.999 -3.000 0.864 0.002 Y NA
 5487545 5487546 Arad_4310 Arad_4312 atpH   FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5487550 5487551 Arad_4317 Arad_4318 frcK   TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5487552 5487553 Arad_4319 Arad_4321 xerC   FALSE 0.212 134.000 0.030 NA   NA
 5487554 5487555 Arad_4322 Arad_4323     FALSE 0.124 103.000 0.000 NA   NA
 5487555 5487556 Arad_4323 Arad_4324   lpdA FALSE 0.222 75.000 0.000 1.000   NA
 5487556 5487557 Arad_4324 Arad_4326 lpdA   FALSE 0.177 110.000 0.018 1.000 N NA
 5487557 5487558 Arad_4326 Arad_4327     TRUE 0.752 19.000 0.091 1.000 N NA
 5487558 5487559 Arad_4327 Arad_4328     TRUE 0.989 -12.000 0.429 NA   NA
 5487559 5487560 Arad_4328 Arad_4329     TRUE 0.988 0.000 0.500 NA   NA
 5487560 5487561 Arad_4329 Arad_4330   sucB TRUE 0.590 30.000 0.009 NA   NA
 5487561 5487562 Arad_4330 Arad_4331 sucB   TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5487562 5487563 Arad_4331 Arad_4332   sucA FALSE 0.526 16.000 0.000 NA   NA
 5487563 5487564 Arad_4332 Arad_4333 sucA sucD FALSE 0.445 177.000 0.092 1.000 Y NA
 5487564 5487565 Arad_4333 Arad_4335 sucD   FALSE 0.208 70.000 0.000 NA   NA
 5487565 5487566 Arad_4335 Arad_4336   sucC FALSE 0.047 163.000 0.000 NA   NA
 5487566 5487567 Arad_4336 Arad_4338 sucC mdh TRUE 0.934 28.000 0.113 1.000 Y NA
 5487567 5487568 Arad_4338 Arad_4339 mdh   FALSE 0.097 180.000 0.032 NA   NA
 5487568 5487569 Arad_4339 Arad_4340   omp4 TRUE 0.881 61.000 0.500 NA   NA
 5487569 5487570 Arad_4340 Arad_4341 omp4   FALSE 0.078 136.000 0.000 NA   NA
 5487570 5487571 Arad_4341 Arad_4342   sdhB FALSE 0.475 49.000 0.006 NA   NA
 5487571 5487572 Arad_4342 Arad_4345 sdhB sdhA TRUE 0.995 18.000 0.604 0.001 Y NA
 5487572 5487573 Arad_4345 Arad_4346 sdhA sdhD TRUE 0.998 8.000 0.705 0.001 Y NA
 5487573 5487574 Arad_4346 Arad_4348 sdhD sdhC TRUE 0.945 72.000 0.291 0.000 Y NA
 5487576 5487577 Arad_4350 Arad_4351     TRUE 0.718 22.000 0.031 NA   NA
 5487577 5487578 Arad_4351 Arad_4352     TRUE 0.927 4.000 0.122 NA   NA
 5487578 5487579 Arad_4352 Arad_4354   gpsA TRUE 0.922 31.000 0.456 NA   NA
 5487579 5487580 Arad_4354 Arad_4355 gpsA gcp TRUE 0.932 -3.000 0.070 1.000 N NA
 5487581 5487582 Arad_4356 Arad_4357 hemC hemD TRUE 0.986 6.000 0.056 0.001 Y NA
 5487582 5487583 Arad_4357 Arad_4358 hemD   FALSE 0.177 80.000 0.000 NA   NA
 5487583 5487584 Arad_4358 Arad_4359     FALSE 0.526 16.000 0.000 NA   NA
 5487584 5487585 Arad_4359 Arad_4360     TRUE 0.558 70.000 0.108 NA   NA
 5487585 5487586 Arad_4360 Arad_4361   guaA2 TRUE 0.990 -7.000 0.452 NA   NA
 5487587 5487588 Arad_4362 Arad_4363     TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5487589 5487590 Arad_4364 Arad_4365     TRUE 0.944 -3.000 0.048 NA   NA
 5487591 5487592 Arad_4366 Arad_4368 ppa   FALSE 0.058 223.000 0.048 1.000   NA
 5487592 5487593 Arad_4368 Arad_4370   typA FALSE 0.051 207.000 0.002 1.000   NA
 5487593 5487594 Arad_4370 Arad_4371 typA dcp FALSE 0.046 183.000 0.008 1.000 N NA
 5487594 5487595 Arad_4371 Arad_4372 dcp   TRUE 0.725 98.000 0.029 1.000 Y NA
 5487598 5487599 Arad_4375 Arad_4376     FALSE 0.349 146.000 0.207 1.000   NA
 5487600 5487601 Arad_4377 Arad_4378     TRUE 0.833 6.000 0.002 NA   NA
 5487601 5487602 Arad_4378 Arad_4379     FALSE 0.019 265.000 0.006 NA   NA
 5487602 5487603 Arad_4379 Arad_4380     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5487603 5487604 Arad_4380 Arad_4381   pcbD FALSE 0.423 96.000 0.094 NA   NA
 5487606 5487607 Arad_4383 Arad_4384   tesA TRUE 0.690 24.000 0.077 1.000 N NA
 5487608 5487609 Arad_4385 Arad_4386     TRUE 0.998 -3.000 0.626 NA Y NA
 5487609 5487610 Arad_4386 Arad_4388     FALSE 0.107 196.000 0.101 NA   NA
 5487610 5487611 Arad_4388 Arad_4389     FALSE 0.370 119.000 0.149 NA   NA
 5487611 5487612 Arad_4389 Arad_4390   ropB2 FALSE 0.050 310.000 0.000 1.000 Y NA
 5487613 5487614 Arad_4391 Arad_4393     FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5487614 5487615 Arad_4393 Arad_4394   acnA FALSE 0.027 264.000 0.038 NA   NA
 5487616 5487617 Arad_4395 Arad_4396 ccmA ccmB TRUE 0.772 200.000 0.503 0.001 Y NA
 5487617 5487618 Arad_4396 Arad_4397 ccmB ccmC TRUE 0.978 59.000 0.501 0.000 Y NA
 5487618 5487619 Arad_4397 Arad_4398 ccmC cycX TRUE 0.988 2.000 0.501 1.000   NA
 5487619 5487620 Arad_4398 Arad_4399 cycX cycY TRUE 0.969 -3.000 0.172 1.000   NA
 5487621 5487622 Arad_4401 Arad_4402   ispZ TRUE 0.940 -3.000 0.037 NA   NA
 5487622 5487623 Arad_4402 Arad_4403 ispZ ftsY TRUE 0.921 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5487623 5487624 Arad_4403 Arad_4404 ftsY   TRUE 0.719 16.000 0.042 1.000 N NA
 5487624 5487625 Arad_4404 Arad_4405   dapF TRUE 0.943 -3.000 0.109 1.000 N NA
 5487627 5487628 Arad_4407 Arad_4409     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487629 5487630 Arad_4410 Arad_4411 ffh   TRUE 0.637 19.000 0.023 1.000 N NA
 5487630 5487631 Arad_4411 Arad_4412   rpsP FALSE 0.216 116.000 0.050 1.000 N NA
 5487631 5487632 Arad_4412 Arad_4414 rpsP rimM TRUE 0.886 124.000 0.342 0.006 Y NA
 5487632 5487633 Arad_4414 Arad_4416 rimM trmD TRUE 0.997 8.000 0.672 1.000 Y NA
 5487633 5487634 Arad_4416 Arad_4417 trmD   FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5487636 5487637 Arad_4421 Arad_4422     TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5487638 5487639 Arad_4423 Arad_4424     FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5487642 5487643 Arad_4428 Arad_4429   rplS FALSE 0.001 319.000 0.000 1.000 N NA
 5487643 5487644 Arad_4429 Arad_4431 rplS   FALSE 0.026 216.000 0.006 1.000 N NA
 5487644 5487645 Arad_4431 Arad_4432     TRUE 0.983 35.000 0.609 1.000 Y NA
 5487645 5487646 Arad_4432 Arad_4433     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487646 5487647 Arad_4433 Arad_4434   leuC FALSE 0.537 70.000 0.086 NA   NA
 5487651 5487652 Arad_4439 Arad_4441 npdG   FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5487653 5487654 Arad_4442 Arad_4443     FALSE 0.177 152.000 0.047 NA   NA
 5487655 5487656 Arad_4444 Arad_4446     TRUE 0.985 10.000 0.261 NA Y NA
 5487657 5487658 Arad_4447 Arad_4448 xth   FALSE 0.280 104.000 0.068 1.000 N NA
 5487658 5487659 Arad_4448 Arad_4449   ftsK2 FALSE 0.149 138.000 0.035 1.000 N NA
 5487659 5487660 Arad_4449 Arad_4451 ftsK2 amt FALSE 0.002 286.000 0.000 1.000 N NA
 5487660 5487661 Arad_4451 Arad_4452 amt glnK TRUE 0.754 29.000 0.197 1.000 N NA
 5487661 5487662 Arad_4452 Arad_4453 glnK tesB FALSE 0.005 215.000 0.000 1.000 N NA
 5487665 5487666 Arad_4456 Arad_4457     TRUE 0.752 41.000 0.200 NA   NA
 5487667 5487668 Arad_4458 Arad_4459   lonD TRUE 0.915 9.000 0.148 NA   NA
 5487668 5487669 Arad_4459 Arad_4460 lonD trxA FALSE 0.124 220.000 0.222 1.000   NA
 5487669 5487670 Arad_4460 Arad_4462 trxA   FALSE 0.319 158.000 0.245 NA   NA
 5487671 5487672 Arad_5030 Arad_4463     FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   NA
 5487673 5487674 Arad_4464 Arad_4465     TRUE 0.995 5.000 0.389 0.096 Y NA
 5487674 5487675 Arad_4465 Arad_4466     TRUE 0.997 -3.000 0.389 0.096 Y NA
 5487675 5487676 Arad_4466 Arad_4467     TRUE 0.986 60.000 0.778 0.096 Y NA
 5487676 5487677 Arad_4467 Arad_4468     FALSE 0.244 69.000 0.000 1.000   NA
 5487678 5487679 Arad_4469 Arad_4470     FALSE 0.020 209.000 0.000 NA   NA
 5487680 5487681 Arad_4471 Arad_4473     FALSE 0.032 182.000 0.000 NA   NA
 5487681 5487682 Arad_4473 Arad_4474     FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5487683 5487684 Arad_4475 Arad_4476     TRUE 0.986 3.000 0.162 1.000 Y NA
 5487684 5487685 Arad_4476 Arad_4477     FALSE 0.285 187.000 0.333 NA   NA
 5487685 5487686 Arad_4477 Arad_4478     TRUE 0.838 107.000 0.667 NA   NA
 5487686 5487687 Arad_4478 Arad_4479     FALSE 0.003 352.000 0.000 NA   NA
 5487687 5487688 Arad_4479 Arad_4480     TRUE 0.723 149.000 0.667 NA   NA
 5487688 5487689 Arad_4480 Arad_4481     TRUE 0.830 3.000 0.000 0.039 N NA
 5487696 5487697 Arad_4488 Arad_4490 cfa   FALSE 0.121 114.000 0.000 1.000   NA
 5487697 5487698 Arad_4490 Arad_4491     TRUE 0.945 0.000 0.118 NA   NA
 5487698 5487699 Arad_4491 Arad_4493     TRUE 0.962 -19.000 0.147 NA   NA
 5487699 5487700 Arad_4493 Arad_4494   mocD TRUE 0.954 -13.000 0.069 1.000   NA
 5487700 5487701 Arad_4494 Arad_4496 mocD   FALSE 0.474 71.000 0.034 1.000   NA
 5487701 5487702 Arad_4496 Arad_4497     TRUE 0.902 5.000 0.052 1.000   NA
 5487702 5487703 Arad_4497 Arad_4498     TRUE 0.992 -3.000 0.152 1.000 Y NA
 5487703 5487704 Arad_4498 Arad_4499     FALSE 0.214 103.000 0.025 1.000 N NA
 5487704 5487705 Arad_4499 Arad_4501   feuP TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5487705 5487706 Arad_4501 Arad_4502 feuP   FALSE 0.167 94.000 0.000 1.000   NA
 5487706 5487707 Arad_4502 Arad_4503     TRUE 0.774 87.000 0.400 1.000   NA
 5487707 5487708 Arad_4503 Arad_4505     FALSE 0.503 59.000 0.093 1.000 N NA
 5487708 5487709 Arad_4505 Arad_4506     FALSE 0.514 147.000 0.000 0.077 Y NA
 5487712 5487713 Arad_4509 Arad_4511     FALSE 0.177 80.000 0.000 NA   NA
 5487713 5487714 Arad_4511 Arad_4512     TRUE 0.952 9.000 0.278 NA   NA
 5487714 5487715 Arad_4512 Arad_4513     FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 5487719 5487720 Arad_4517 Arad_4518     FALSE 0.090 125.000 0.000 NA   NA
 5487720 5487721 Arad_4518 Arad_4519   aceC FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 5487723 5487724 Arad_4523 Arad_4525     FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5487724 5487725 Arad_4525 Arad_4526     TRUE 0.920 47.000 0.200 1.000 Y NA
 5487726 5487727 Arad_4527 Arad_4530     FALSE 0.009 270.000 0.000 1.000   NA
 5487727 5487728 Arad_4530 Arad_4531     TRUE 0.997 15.000 0.914 1.000 Y NA
 5487728 5487729 Arad_4531 Arad_4532     TRUE 0.893 91.000 0.333 NA Y NA
 5487730 5487731 Arad_4533 Arad_4535     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 5487731 5487732 Arad_4535 Arad_4537     FALSE 0.001 321.000 0.000 1.000 N NA
 5487732 5487733 Arad_4537 Arad_4540     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 5487733 5487734 Arad_4540 Arad_4541     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 5487734 5487735 Arad_4541 Arad_4542     FALSE 0.185 77.000 0.000 NA   NA
 5487737 5487738 Arad_4545 Arad_4546     TRUE 0.993 9.000 1.000 1.000 N NA
 5487739 5487740 Arad_4547 Arad_4548     TRUE 0.999 -3.000 0.963 NA Y NA
 5487740 5487741 Arad_4548 Arad_4549     TRUE 0.993 -3.000 0.630 NA N NA
 5487741 5487742 Arad_4549 Arad_4550     FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 5487743 5487744 Arad_4551 Arad_4552 actP cueR TRUE 0.973 12.000 0.545 1.000 N NA
 5487746 5487747 Arad_4555 Arad_4556     TRUE 0.995 0.000 0.800 NA   NA
 5487748 5487749 Arad_4557 Arad_4558     TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5487749 5487750 Arad_4558 Arad_4559     FALSE 0.053 166.000 0.000 1.000   NA
 5487750 5487751 Arad_4559 Arad_4561     FALSE 0.172 82.000 0.000 NA   NA
 5487751 5487752 Arad_4561 Arad_4562   hutU TRUE 0.902 6.000 0.077 NA   NA
 5487752 5487753 Arad_4562 Arad_4563 hutU hutH TRUE 0.996 2.000 0.315 0.000 Y NA
 5487753 5487754 Arad_4563 Arad_4564 hutH hutI TRUE 0.976 -3.000 0.192 0.022 N NA
 5487755 5487756 Arad_4565 Arad_4566 hutF hutC FALSE 0.329 83.000 0.047 1.000 N NA
 5487756 5487757 Arad_4566 Arad_4568 hutC hutH FALSE 0.001 321.000 0.000 1.000 N NA
 5487757 5487758 Arad_4568 Arad_4570 hutH   FALSE 0.029 188.000 0.000 NA   NA
 5487759 5487760 Arad_4571 Arad_4572     TRUE 0.830 -6.000 0.000 NA   NA
 5487760 5487761 Arad_4572 Arad_4573   mexF1 FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 5487761 5487762 Arad_4573 Arad_4574 mexF1 mexE1 TRUE 0.996 0.000 0.945 1.000 N NA
 5487765 5487766 Arad_4578 Arad_4580 mntH   FALSE 0.024 133.000 0.000 1.000 N NA
 5487766 5487767 Arad_4580 Arad_4581     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5487767 5487768 Arad_4581 Arad_4582     TRUE 0.993 -3.000 0.545 NA   NA
 5487769 5487770 Arad_4584 Arad_4585     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.001 Y NA
 5487770 5487771 Arad_4585 Arad_4586   xdhA TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.039 Y NA
 5487772 5487773 Arad_4588 Arad_4589     FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5487774 5487775 Arad_4590 Arad_4592     TRUE 0.970 21.000 0.190 0.095 Y NA
 5487775 5487776 Arad_4592 Arad_4593     TRUE 0.999 -7.000 0.833 0.095 Y NA
 5487776 5487777 Arad_4593 Arad_4594     TRUE 0.921 58.000 0.179 0.095 Y NA
 5487778 5487779 Arad_4596 Arad_4597     TRUE 0.791 41.000 0.229 1.000   NA
 5487779 5487780 Arad_4597 Arad_4598     TRUE 0.968 25.000 0.692 NA   NA
 5487780 5487781 Arad_4598 Arad_4600     FALSE 0.033 180.000 0.000 NA   NA
 5487781 5487782 Arad_4600 Arad_4601     FALSE 0.114 107.000 0.000 NA   NA
 5487782 5487783 Arad_4601 Arad_4602     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5487783 5487784 Arad_4602 Arad_4603     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5487784 5487785 Arad_4603 Arad_4604     FALSE 0.201 72.000 0.000 NA   NA
 5487785 5487786 Arad_4604 Arad_4605     TRUE 0.997 16.000 0.865 0.008 Y NA
 5487786 5487787 Arad_4605 Arad_4606     TRUE 0.999 -24.000 0.847 0.095 Y NA
 5487787 5487788 Arad_4606 Arad_4608     TRUE 0.967 138.000 0.922 0.095 Y NA
 5487788 5487789 Arad_4608 Arad_4609     TRUE 0.990 13.000 0.854 NA   NA
 5487789 5487790 Arad_4609 Arad_4610     FALSE 0.412 214.000 0.640 NA   NA
 5487790 5487791 Arad_4610 Arad_4611     FALSE 0.016 232.000 0.000 1.000   NA
 5487793 5487794 Arad_4613 Arad_4615     FALSE 0.299 42.000 0.000 NA   NA
 5487794 5487795 Arad_4615 Arad_4616     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487795 5487796 Arad_4616 Arad_4617     FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5487797 5487798 Arad_4618 Arad_4619     FALSE 0.295 52.000 0.000 1.000   NA
 5487798 5487799 Arad_4619 Arad_4620     FALSE 0.380 34.000 0.000 1.000   NA
 5487799 5487800 Arad_4620 Arad_4621     TRUE 0.779 137.000 0.667 1.000   NA
 5487801 5487802 Arad_4622 Arad_4624     TRUE 0.997 5.000 0.643 0.095 Y NA
 5487802 5487803 Arad_4624 Arad_4625     TRUE 0.999 -7.000 0.714 0.095 Y NA
 5487803 5487804 Arad_4625 Arad_4627     FALSE 0.355 140.000 0.190 1.000   NA
 5487804 5487805 Arad_4627 Arad_4629     TRUE 0.959 7.000 0.190 0.041   NA
 5487805 5487806 Arad_4629 Arad_4630     FALSE 0.339 42.000 0.000 1.000   NA
 5487807 5487808 Arad_4631 Arad_4632 manB3   TRUE 0.958 8.000 0.300 NA   NA
 5487808 5487809 Arad_4632 Arad_4633     TRUE 0.871 3.000 0.008 NA   NA
 5487809 5487810 Arad_4633 Arad_4635   acd2 TRUE 0.759 6.000 0.016 NA N NA
 5487810 5487811 Arad_4635 Arad_4636 acd2   TRUE 0.986 0.000 0.440 1.000   NA
 5487811 5487812 Arad_4636 Arad_4637   kamA FALSE 0.004 355.000 0.000 1.000   NA
 5487812 5487813 Arad_4637 Arad_4638 kamA genX TRUE 0.956 -3.000 0.174 1.000 N NA
 5487816 5487817 Arad_4641 Arad_4642 lon   TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5487817 5487818 Arad_4642 Arad_4643   metA FALSE 0.006 209.000 0.000 1.000 N NA
 5487818 5487819 Arad_4643 Arad_4644 metA   TRUE 0.856 4.000 0.005 NA   NA
 5487821 5487822 Arad_4647 Arad_4648   galM FALSE 0.003 249.000 0.000 1.000 N NA
 5487822 5487823 Arad_4648 Arad_4651 galM   FALSE 0.364 94.000 0.106 1.000 N NA
 5487823 5487824 Arad_4651 Arad_4652   glmS2 TRUE 0.975 -3.000 0.280 1.000 N NA
 5487824 5487825 Arad_4652 Arad_4653 glmS2 nagA TRUE 0.983 -3.000 0.369 1.000 N NA
 5487825 5487826 Arad_4653 Arad_4654 nagA   TRUE 0.809 23.000 0.123 1.000   NA
 5487827 5487828 Arad_4655 Arad_4656 mexF2 mexE2 TRUE 0.995 -3.000 0.720 1.000 N NA
 5487828 5487829 Arad_4656 Arad_4658 mexE2   FALSE 0.005 328.000 0.000 1.000   NA
 5487829 5487830 Arad_4658 Arad_4659     TRUE 0.941 3.000 0.030 0.084   NA
 5487830 5487831 Arad_4659 Arad_4660     FALSE 0.319 65.000 0.014 1.000 N NA
 5487832 5487833 Arad_4662 Arad_4663     FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 5487833 5487834 Arad_4663 Arad_4664   thiP TRUE 0.986 8.000 0.697 1.000 N NA
 5487834 5487835 Arad_4664 Arad_4665 thiP thiQ TRUE 0.994 -7.000 0.522 0.012 N NA
 5487835 5487836 Arad_4665 Arad_4667 thiQ   FALSE 0.149 152.000 0.013 1.000   NA
 5487837 5487838 Arad_4669 Arad_4671 rpoH   FALSE 0.050 407.000 0.012 0.077 Y NA
 5487838 5487839 Arad_4671 Arad_4672   fdxA FALSE 0.001 399.000 0.000 1.000 N NA
 5487839 5487840 Arad_4672 Arad_4674 fdxA   FALSE 0.056 200.000 0.050 1.000 N NA
 5487840 5487841 Arad_4674 Arad_4675   mgpS TRUE 0.983 4.000 0.116 1.000 Y NA
 5487842 5487843 Arad_4677 Arad_4678     TRUE 0.727 48.000 0.200 NA   NA
 5487844 5487845 Arad_4680 Arad_4682 phbB phbAch TRUE 0.824 124.000 0.319 1.000 Y NA
 5487847 5487848 Arad_4685 Arad_4687 rpmF gstch10 FALSE 0.050 180.000 0.009 1.000 N NA
 5487848 5487849 Arad_4687 Arad_4689 gstch10 mtgA FALSE 0.258 112.000 0.016 1.000   NA
 5487850 5487851 Arad_4690 Arad_4691 ispA   FALSE 0.147 127.000 0.020 1.000 N NA
 5487852 5487853 Arad_4692 Arad_4693 ispG   FALSE 0.113 127.000 0.011 NA N NA
 5487856 5487857 Arad_4697 Arad_4698     FALSE 0.008 190.000 0.000 1.000 N NA
 5487858 5487859 Arad_4699 Arad_4700     FALSE 0.026 127.000 0.000 1.000 N NA
 5487860 5487861 Arad_4702 Arad_4703     TRUE 0.996 -3.000 0.727 NA   NA
 5487861 5487862 Arad_4703 Arad_4704   clpP TRUE 0.684 25.000 0.028 NA   NA
 5487862 5487863 Arad_4704 Arad_4705 clpP   FALSE 0.003 241.000 0.000 1.000 N NA
 5487863 5487864 Arad_4705 Arad_4707     TRUE 0.964 89.000 0.594 0.095 Y NA
 5487864 5487865 Arad_4707 Arad_4709     TRUE 0.997 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 5487866 5487867 Arad_4711 Arad_4713   prsE FALSE 0.023 211.000 0.000 1.000   NA
 5487867 5487868 Arad_4713 Arad_4714 prsE prsD TRUE 0.982 -3.000 0.167 0.003   NA
 5487868 5487869 Arad_4714 Arad_4717 prsD   FALSE 0.002 645.000 0.000 1.000   NA
 5487869 5487870 Arad_4717 Arad_4718   pyc FALSE 0.194 84.000 0.000 1.000   NA
 5487870 5487871 Arad_4718 Arad_4719 pyc   FALSE 0.287 76.000 0.018 1.000 N NA
 5487873 5487874 Arad_4722 Arad_4725 ropAe opgC FALSE 0.004 344.000 0.000 NA   NA
 5487874 5487875 Arad_4725 Arad_4726 opgC ndvB FALSE 0.415 87.000 0.055 NA   NA
 5487875 5487876 Arad_4726 Arad_4728 ndvB   FALSE 0.001 421.000 0.000 1.000 N NA
 5487876 5487877 Arad_4728 Arad_4729     FALSE 0.006 289.000 0.000 NA   NA
 5487877 5487878 Arad_4729 Arad_4731     TRUE 0.812 166.000 1.000 NA   NA
 5487878 5487879 Arad_4731 Arad_4732   dppFch3 FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5487879 5487880 Arad_4732 Arad_4734 dppFch3 dppCch3 TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487880 5487881 Arad_4734 Arad_4735 dppCch3 dppBch3 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.095 Y NA
 5487881 5487882 Arad_4735 Arad_4736 dppBch3 dppAch3 TRUE 0.993 22.000 0.667 0.095 Y NA
 5487882 5487883 Arad_4736 Arad_4737 dppAch3   TRUE 0.990 37.000 0.833 1.000 Y NA
 5487887 5487888 Arad_4743 Arad_4744     FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 5487888 5487889 Arad_4744 Arad_4745     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 5487889 5487890 Arad_4745 Arad_4746     FALSE 0.001 642.000 0.000 NA   NA
 5487892 5487893 Arad_4748 Arad_4749     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5487893 5487894 Arad_4749 Arad_4750     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5487894 5487895 Arad_4750 Arad_4751     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 5487895 5487896 Arad_4751 Arad_4753     FALSE 0.001 744.000 0.000 NA   NA
 5487896 5487897 Arad_4753 Arad_4755     TRUE 0.858 26.000 0.250 NA   NA
 5487897 5487898 Arad_4755 Arad_4756     TRUE 0.939 20.000 0.400 NA   NA
 5487899 5487900 Arad_4757 Arad_4985     FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5487900 5487901 Arad_4985 Arad_4758     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5487901 5487902 Arad_4758 Arad_4760     TRUE 0.829 -7.000 0.000 NA   NA
 5487903 5487904 Arad_4761 Arad_4762     TRUE 0.910 34.000 0.061 1.000 Y NA
 5487904 5487905 Arad_4762 Arad_4763   mocBch2 TRUE 0.699 76.000 0.000 NA Y NA
 5487907 5487908 Arad_4766 Arad_4767   galE TRUE 0.556 -22.000 0.000 1.000 N NA
 5487908 5487909 Arad_4767 Arad_4769 galE traA FALSE 0.002 278.000 0.000 1.000 N NA
 5487910 5487911 Arad_4770 Arad_4771 traC traDd FALSE 0.268 50.000 0.000 NA   NA
 5487911 5487912 Arad_4771 Arad_4772 traDd   FALSE 0.156 88.000 0.000 NA   NA
 5487913 5487914 Arad_4773 Arad_4774     FALSE 0.204 71.000 0.000 NA   NA
 5487914 5487915 Arad_4774 Arad_4775     FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5487918 5487919 Arad_4778 Arad_4779 lpsB1   FALSE 0.286 46.000 0.000 NA   NA
 5487920 5487921 Arad_4780 Arad_4781 avhB11 avhB10 TRUE 0.994 9.000 0.500 1.000 Y NA
 5487921 5487922 Arad_4781 Arad_4784 avhB10 avhB9 TRUE 0.998 -10.000 0.667 NA Y NA
 5487922 5487923 Arad_4784 Arad_4783 avhB9 avhB8 TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5487923 5487924 Arad_4783 Arad_4785 avhB8 avhB7 TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5487924 5487925 Arad_4785 Arad_4786 avhB7 avhB6 FALSE 0.309 40.000 0.000 NA   NA
 5487925 5487926 Arad_4786 Arad_4787 avhB6   TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5487926 5487927 Arad_4787 Arad_4788   avhB5 TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487927 5487928 Arad_4788 Arad_4789 avhB5 avhB4 TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5487928 5487929 Arad_4789 Arad_4792 avhB4 avhB3 TRUE 0.978 -28.000 0.000 NA Y NA
 5487929 5487930 Arad_4792 Arad_4790 avhB3 avhB2 TRUE 0.996 6.000 0.667 NA Y NA
 5487930 5487931 Arad_4790 Arad_4793 avhB2 avhB1 TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA   NA
 5487931 5487932 Arad_4793 Arad_4794 avhB1   TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5487935 5487936 Arad_4799 Arad_4800 nocQ nocM TRUE 0.998 5.000 0.714 0.012 Y NA
 5487936 5487937 Arad_4800 Arad_4801 nocM nocT TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.094 Y NA
 5487937 5487938 Arad_4801 Arad_4802 nocT   FALSE 0.012 118.000 0.000 NA N NA
 5487940 5487941 Arad_4804 Arad_4805     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 5487941 5487942 Arad_4805 Arad_4807     TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5487943 5487944 Arad_4808 Arad_4810     TRUE 0.938 -3.000 0.033 NA   NA
 5487944 5487945 Arad_4810 Arad_4811     FALSE 0.210 144.000 0.053 NA   NA
 5487946 5487947 Arad_4812 Arad_4813     FALSE 0.001 641.000 0.000 NA   NA
 5487947 5487948 Arad_4813 Arad_4814   traG FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5487949 5487950 Arad_4816 Arad_4818     FALSE 0.014 229.000 0.000 NA   NA
 5487951 5487952 Arad_4819 Arad_4820     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 5487952 5487953 Arad_4820 Arad_4821     TRUE 0.941 69.000 0.400 NA Y NA
 5487954 5487955 Arad_4823 Arad_4824     FALSE 0.002 515.000 0.000 NA   NA
 5487955 5487956 Arad_4824 Arad_4825     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5487958 5487959 Arad_4828 Arad_4829     FALSE 0.047 163.000 0.000 NA   NA
 5487959 5487960 Arad_4829 Arad_4830     TRUE 0.979 -3.000 0.273 NA   NA
 5487960 5487961 Arad_4830 Arad_4831     FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5487962 5487963 Arad_4832 Arad_4833     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5487963 5487964 Arad_4833 Arad_4834     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5487964 5487965 Arad_4834 Arad_4835   rfbA FALSE 0.039 101.000 0.000 1.000 N NA
 5487967 5487968 Arad_4837 Arad_4838 rfbB rfbD TRUE 0.993 -3.000 0.034 0.002 Y NA
 5487968 5487969 Arad_4838 Arad_4839 rfbD   FALSE 0.522 117.000 0.000 NA Y NA
 5487969 5487970 Arad_4839 Arad_4840   wzt TRUE 0.962 4.000 0.000 NA Y NA
 5487970 5487971 Arad_4840 Arad_4841 wzt   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5487971 5487972 Arad_4841 Arad_4842     TRUE 0.996 0.000 0.333 0.012 Y NA
 5487972 5487973 Arad_4842 Arad_4843     TRUE 0.669 64.000 0.250 1.000 N NA
 5487973 5487974 Arad_4843 Arad_4846     TRUE 0.994 -3.000 0.625 1.000   NA
 5487974 5487975 Arad_4846 Arad_4847     TRUE 0.987 8.000 0.636 1.000   NA
 5487975 5487976 Arad_4847 Arad_4848     TRUE 0.978 30.000 0.467 1.000 Y NA
 5487977 5487978 Arad_4849 Arad_4850     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5487978 5487979 Arad_4850 Arad_5032     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 5487979 5487980 Arad_5032 Arad_4851     FALSE 0.049 161.000 0.000 NA   NA
 5487980 5487981 Arad_4851 Arad_4853     TRUE 0.996 -13.000 0.812 NA   NA
 5487982 5487983 Arad_4855 Arad_4856     FALSE 0.272 49.000 0.000 NA   NA
 5487983 5487984 Arad_4856 Arad_4857     FALSE 0.443 71.000 0.030 NA   NA
 5487984 5487985 Arad_4857 Arad_4858     TRUE 0.974 10.000 0.450 NA   NA
 5487985 5487986 Arad_4858 Arad_4859     TRUE 0.928 21.000 0.367 NA   NA
 5487988 5487989 Arad_4862 Arad_4864     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5487990 5487991 Arad_4866 Arad_4867     FALSE 0.001 796.000 0.000 NA   NA
 5487994 5487995 Arad_4870 Arad_4872 rplU rpmA TRUE 0.991 33.000 0.667 0.006 Y NA
 5487995 5487996 Arad_4872 Arad_4873 rpmA   TRUE 0.642 122.000 0.035 1.000 Y NA
 5487996 5487997 Arad_4873 Arad_4874     TRUE 0.996 -3.000 0.222 0.010 Y NA
 5487997 5487998 Arad_4874 Arad_4875     FALSE 0.012 319.000 0.008 1.000   NA
 5487998 5487999 Arad_4875 Arad_4877   proB TRUE 0.958 -3.000 0.087 1.000   NA
 5487999 5488000 Arad_4877 Arad_4878 proB proA TRUE 0.994 -7.000 0.065 0.001 Y NA
 5488000 5488001 Arad_4878 Arad_4880 proA nadD TRUE 0.675 38.000 0.170 1.000 N NA
 5488001 5488002 Arad_4880 Arad_4881 nadD   FALSE 0.277 48.000 0.000 NA   NA
 5488002 5488003 Arad_4881 Arad_4883   modA FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 5488003 5488004 Arad_4883 Arad_4884 modA modB TRUE 0.985 55.000 0.627 0.001 Y NA
 5488004 5488005 Arad_4884 Arad_4885 modB modC TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.001 Y NA
 5488007 5488008 Arad_4887 Arad_4889     TRUE 0.562 117.000 0.307 NA   NA
 5488008 5488009 Arad_4889 Arad_4891     FALSE 0.068 216.000 0.067 NA   NA
 5488009 5488010 Arad_4891 Arad_4892   ctpA TRUE 0.986 -10.000 0.408 1.000 N NA
 5488010 5488011 Arad_4892 Arad_4893 ctpA   FALSE 0.221 178.000 0.210 1.000   NA
 5488011 5488012 Arad_4893 Arad_4894   ialA FALSE 0.516 83.000 0.109 1.000   NA
 5488013 5488014 Arad_4895 Arad_4896 bfr   TRUE 0.850 8.000 0.020 NA   NA
 5488014 5488015 Arad_4896 Arad_4897   dnaEch2 FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5488015 5488016 Arad_4897 Arad_4898 dnaEch2   TRUE 0.996 -3.000 0.366 1.000 Y NA
 5488016 5488017 Arad_4898 Arad_4899     TRUE 0.919 41.000 0.514 NA   NA
 5488019 5488020 Arad_4901 Arad_4903   citEch TRUE 0.760 34.000 0.179 NA   NA
 5488021 5488022 Arad_4904 Arad_4906   leuD FALSE 0.103 179.000 0.038 NA   NA
 5488022 5488023 Arad_4906 Arad_4908 leuD   FALSE 0.008 192.000 0.000 1.000 N NA
 5488023 5488024 Arad_4908 Arad_4909   leuB FALSE 0.003 253.000 0.000 1.000 N NA
 5488024 5488025 Arad_4909 Arad_4910 leuB   FALSE 0.060 203.000 0.011 1.000   NA
 5488025 5488026 Arad_4910 Arad_4912     FALSE 0.017 228.000 0.000 1.000   NA
 5488026 5488027 Arad_4912 Arad_4914     FALSE 0.398 157.000 0.300 1.000   NA
 5488027 5488028 Arad_4914 Arad_4916     FALSE 0.002 288.000 0.000 1.000 N NA
 5488028 5488029 Arad_4916 Arad_4917     FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5488029 5488030 Arad_4917 Arad_4918   asd FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5488030 5488031 Arad_4918 Arad_4920 asd   FALSE 0.008 294.000 0.012 NA N NA
 5488032 5488033 Arad_4922 Arad_4923 cynT   FALSE 0.437 74.000 0.089 1.000 N NA
 5488034 5488035 Arad_4924 Arad_4925     FALSE 0.268 50.000 0.000 NA   NA
 5488036 5488037 Arad_4926 Arad_4927 purH   FALSE 0.392 96.000 0.068 NA   NA
 5488037 5488038 Arad_4927 Arad_4928   sun FALSE 0.200 152.000 0.071 NA   NA
 5488038 5488039 Arad_4928 Arad_4929 sun htpX2 TRUE 0.933 -3.000 0.075 1.000 N NA
 5488044 5488045 Arad_4935 Arad_4936 leuS   TRUE 0.955 -10.000 0.090 NA   NA
 5488045 5488046 Arad_4936 Arad_4937   holA TRUE 0.847 15.000 0.097 NA   NA
 5488047 5488048 Arad_4938 Arad_4939 parB parA2 TRUE 0.967 31.000 0.827 1.000 N NA
 5488048 5488049 Arad_4939 Arad_4940 parA2 gidB TRUE 0.968 3.000 0.339 1.000 N NA
 5488049 5488050 Arad_4940 Arad_4941 gidB gidA2 TRUE 0.900 34.000 0.466 1.000 N NA
 5488050 5488051 Arad_4941 Arad_4943 gidA2 trmE TRUE 0.557 111.000 0.266 1.000   NA
 5488051 5488052 Arad_4943 Arad_4944 trmE rho FALSE 0.023 292.000 0.050 1.000   NA
 5488052 5488053 Arad_4944 Arad_4946 rho   FALSE 0.068 198.000 0.024 NA   NA
 5488053 5488054 Arad_4946 Arad_4947   hemE TRUE 0.889 5.000 0.044 NA   NA
 5488055 5488056 Arad_12000 Arad_12001     FALSE 0.038 173.000 0.000 NA   NA
 5488056 5488057 Arad_12001 Arad_12002     TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5488057 5488058 Arad_12002 Arad_12003     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5488059 5488060 Arad_12005 Arad_12006     TRUE 0.975 0.000 0.300 NA   NA
 5488060 5488061 Arad_12006 Arad_12007     FALSE 0.047 163.000 0.000 NA   NA
 5488062 5488063 Arad_12008 Arad_12011     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 5488064 5488065 Arad_12012 Arad_12013     FALSE 0.010 132.000 0.000 NA N NA
 5488065 5488066 Arad_12013 Arad_12014     FALSE 0.248 68.000 0.000 1.000   NA
 5488067 5488068 Arad_12015 Arad_12016     FALSE 0.169 83.000 0.000 NA   NA
 5488068 5488069 Arad_12016 Arad_12017     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 5488071 5488072 Arad_12019 Arad_12020 repA repB TRUE 0.994 5.000 1.000 1.000 N NA
 5488072 5488073 Arad_12020 Arad_12022 repB repC FALSE 0.052 157.000 0.000 NA   NA
 5488074 5488075 Arad_12023 Arad_12024     FALSE 0.001 636.000 0.000 NA   NA
 5488077 5488078 Arad_12028 Arad_12029     FALSE 0.009 260.000 0.000 NA   NA
 5488084 5488085 Arad_12037 Arad_12038     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488085 5488086 Arad_12038 Arad_12039     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 5488087 5488088 Arad_12040 Arad_12044     FALSE 0.148 92.000 0.000 NA   NA
 5488089 5488090 Arad_12045 Arad_12046     FALSE 0.001 754.000 0.000 NA   NA
 5488090 5488091 Arad_12046 Arad_12049     FALSE 0.299 42.000 0.000 NA   NA
 5488091 5488092 Arad_12049 Arad_12050     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5488092 5488093 Arad_12050 Arad_12051     FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 5488093 5488094 Arad_12051 Arad_12052     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5488094 5488095 Arad_12052 Arad_12053     FALSE 0.511 17.000 0.000 NA   NA
 5488095 5488096 Arad_12053 Arad_12054     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 5488096 5488097 Arad_12054 Arad_12055     TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5488097 5488098 Arad_12055 Arad_12056   exoI FALSE 0.240 58.000 0.000 NA   NA
 5488098 5488099 Arad_12056 Arad_12057 exoI   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488099 5488100 Arad_12057 Arad_12058     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5488100 5488101 Arad_12058 Arad_12059     FALSE 0.485 19.000 0.000 NA   NA
 5488102 5488103 Arad_12060 Arad_12061     TRUE 0.976 18.000 0.667 NA   NA
 5488103 5488104 Arad_12061 Arad_12063     TRUE 0.994 0.000 0.333 NA Y NA
 5488104 5488105 Arad_12063 Arad_12064   avhB4a TRUE 0.979 26.000 0.444 NA Y NA
 5488105 5488106 Arad_12064 Arad_12065 avhB4a   FALSE 0.082 132.000 0.000 NA   NA
 5488106 5488107 Arad_12065 Arad_12066     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5488107 5488108 Arad_12066 Arad_12067     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488108 5488109 Arad_12067 Arad_12068   avhB6a FALSE 0.185 77.000 0.000 NA   NA
 5488109 5488110 Arad_12068 Arad_12070 avhB6a avhB8a TRUE 0.992 34.000 0.900 NA Y NA
 5488110 5488111 Arad_12070 Arad_12071 avhB8a avhB9a TRUE 0.936 42.000 0.250 NA Y NA
 5488111 5488112 Arad_12071 Arad_12072 avhB9a avhB10a TRUE 0.994 -10.000 0.250 NA Y NA
 5488112 5488113 Arad_12072 Arad_12073 avhB10a avhB11a TRUE 0.993 -25.000 0.214 1.000 Y NA
 5488113 5488114 Arad_12073 Arad_12074 avhB11a   TRUE 0.993 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 5488114 5488115 Arad_12074 Arad_12076     FALSE 0.087 128.000 0.000 NA   NA
 5488115 5488116 Arad_12076 Arad_12077   repC FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 5488116 5488117 Arad_12077 Arad_12079 repC   TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5488117 5488118 Arad_12079 Arad_12080     FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 5488118 5488119 Arad_12080 Arad_12081     TRUE 0.961 10.000 0.333 NA   NA
 5488119 5488120 Arad_12081 Arad_12083     FALSE 0.001 721.000 0.000 NA   NA
 5488120 5488121 Arad_12083 Arad_12084     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5488121 5488122 Arad_12084 Arad_12085     FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 5488124 5488125 Arad_12088 Arad_12091     FALSE 0.001 635.000 0.000 NA   NA
 5488125 5488126 Arad_12091 Arad_12092     FALSE 0.114 38.000 0.000 1.000 N NA
 5488126 5488127 Arad_12092 Arad_12094     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488127 5488128 Arad_12094 Arad_12096   asnB TRUE 0.824 -12.000 0.000 NA   NA
 5488128 5488129 Arad_12096 Arad_12097 asnB   TRUE 0.854 -7.000 0.000 1.000   NA
 5488129 5488130 Arad_12097 Arad_12098     FALSE 0.315 48.000 0.000 1.000   NA
 5488131 5488132 Arad_12099 Arad_12100     TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5488133 5488134 Arad_12103 Arad_12107     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 5488135 5488136 Arad_12108 Arad_12109     TRUE 0.993 -3.000 0.538 NA   NA
 5488136 5488137 Arad_12109 Arad_12110     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5488137 5488138 Arad_12110 Arad_12113     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 5488138 5488139 Arad_12113 Arad_12114     FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 5488139 5488140 Arad_12114 Arad_12115     TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5488140 5488141 Arad_12115 Arad_12116     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488141 5488142 Arad_12116 Arad_12118     FALSE 0.210 5.000 0.000 NA N NA
 5488142 5488143 Arad_12118 Arad_12119     FALSE 0.358 38.000 0.000 1.000   NA
 5488143 5488144 Arad_12119 Arad_12120     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5488144 5488145 Arad_12120 Arad_12121     FALSE 0.390 5.000 0.000 1.000 N NA
 5488145 5488146 Arad_12121 Arad_12123     TRUE 0.698 12.000 0.000 0.093 N NA
 5488146 5488147 Arad_12123 Arad_12124     TRUE 0.732 10.000 0.000 0.093 N NA
 5488149 5488150 Arad_12126 Arad_12128     FALSE 0.001 664.000 0.000 NA   NA
 5488152 5488153 Arad_12131 Arad_12132     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488153 5488154 Arad_12132 Arad_12133     FALSE 0.090 124.000 0.000 NA   NA
 5488154 5488155 Arad_12133 Arad_12135     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5488155 5488156 Arad_12135 Arad_12136     TRUE 0.644 57.000 0.080 0.040 N NA
 5488156 5488157 Arad_12136 Arad_12137     FALSE 0.265 14.000 0.000 1.000 N NA
 5488157 5488158 Arad_12137 Arad_12138     TRUE 0.996 10.000 1.000 0.093   NA
 5488158 5488159 Arad_12138 Arad_12139     TRUE 0.987 2.000 0.500 1.000   NA
 5488159 5488160 Arad_12139 Arad_12140     TRUE 0.873 118.000 0.429 NA Y NA
 5488161 5488162 Arad_12141 Arad_12143     FALSE 0.403 77.000 0.000 0.049   NA
 5488163 5488164 Arad_12144 Arad_12145 proC   FALSE 0.452 2.000 0.000 1.000 N NA
 5488164 5488165 Arad_12145 Arad_12146     TRUE 0.957 7.000 0.000 1.000 Y NA
 5488165 5488166 Arad_12146 Arad_12147     TRUE 0.903 32.000 0.000 0.007 Y NA
 5488166 5488167 Arad_12147 Arad_12148   betA TRUE 0.889 -25.000 0.000 0.038 N NA
 5488167 5488168 Arad_12148 Arad_12149 betA   FALSE 0.006 206.000 0.000 1.000 N NA
 5488168 5488169 Arad_12149 Arad_12151     FALSE 0.011 255.000 0.000 1.000   NA
 5488169 5488170 Arad_12151 Arad_12152     FALSE 0.295 52.000 0.000 1.000   NA
 5488170 5488171 Arad_12152 Arad_12153     TRUE 0.994 -3.000 0.244 1.000 Y NA
 5488171 5488172 Arad_12153 Arad_12155     TRUE 0.926 47.000 0.218 1.000 Y NA
 5488172 5488173 Arad_12155 Arad_12156     FALSE 0.002 264.000 0.000 1.000 N NA
 5488174 5488175 Arad_12157 Arad_12158     TRUE 0.844 55.000 0.000 0.040 Y NA
 5488176 5488177 Arad_12160 Arad_12162     FALSE 0.401 169.000 0.000 0.075 Y NA
 5488180 5488181 Arad_12169 Arad_12171     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 5488181 5488182 Arad_12171 Arad_12172     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 5488182 5488183 Arad_12172 Arad_12173     TRUE 0.845 131.000 0.306 0.093 Y NA
 5488183 5488184 Arad_12173 Arad_12175     TRUE 0.999 2.000 0.918 0.093 Y NA
 5488184 5488185 Arad_12175 Arad_12178     TRUE 0.992 12.000 0.373 0.093 Y NA
 5488185 5488186 Arad_12178 Arad_12179     TRUE 0.978 -3.000 0.309 1.000 N NA
 5488186 5488187 Arad_12179 Arad_12180     FALSE 0.081 58.000 0.000 1.000 N NA
 5488188 5488189 Arad_12181 Arad_12185     FALSE 0.002 530.000 0.000 NA   NA
 5488189 5488190 Arad_12185 Arad_12186     FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5488194 5488195 Arad_12193 Arad_12195     TRUE 0.992 4.000 0.571 0.038   NA
 5488195 5488196 Arad_12195 Arad_12196     TRUE 0.994 3.000 0.833 NA   NA
 5488198 5488199 Arad_12198 Arad_12199   pcaD FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5488199 5488200 Arad_12199 Arad_12201 pcaD   TRUE 0.782 2.000 0.000 1.000   NA
 5488200 5488201 Arad_12201 Arad_12202     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.038 Y NA
 5488201 5488202 Arad_12202 Arad_12203     TRUE 0.991 -3.000 0.115 1.000 Y NA
 5488202 5488203 Arad_12203 Arad_12204     TRUE 0.993 4.000 0.269 0.093 Y NA
 5488203 5488204 Arad_12204 Arad_12205     TRUE 0.936 51.000 0.286 1.000 Y NA
 5488204 5488205 Arad_12205 Arad_12206     FALSE 0.058 78.000 0.000 1.000 N NA
 5488205 5488206 Arad_12206 Arad_12207     TRUE 0.989 0.000 0.574 1.000 N NA
 5488206 5488207 Arad_12207 Arad_12208     TRUE 0.978 20.000 0.672 0.038 N NA
 5488207 5488208 Arad_12208 Arad_12209     TRUE 0.956 87.000 0.953 0.000 N NA
 5488208 5488209 Arad_12209 Arad_12211   catA TRUE 0.594 61.000 0.188 1.000 N NA
 5488209 5488210 Arad_12211 Arad_12212 catA   TRUE 0.752 97.000 0.057 1.000 Y NA
 5488210 5488211 Arad_12212 Arad_12213     FALSE 0.390 5.000 0.000 1.000 N NA
 5488212 5488213 Arad_12214 Arad_12216     FALSE 0.012 169.000 0.000 1.000 N NA
 5488213 5488214 Arad_12216 Arad_12217     TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5488215 5488216 Arad_12218 Arad_12220     FALSE 0.010 178.000 0.000 1.000 N NA
 5488216 5488217 Arad_12220 Arad_12221     TRUE 0.941 -3.000 0.100 1.000 N NA
 5488217 5488218 Arad_12221 Arad_12222     TRUE 0.888 5.000 0.105 1.000 N NA
 5488220 5488221 Arad_12224 Arad_12225     FALSE 0.467 73.000 0.000 0.003   NA
 5488223 5488224 Arad_12227 Arad_12228     FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5488225 5488226 Arad_12230 Arad_12231   cydB TRUE 0.994 21.000 0.700 0.038 Y NA
 5488226 5488227 Arad_12231 Arad_12232 cydB   TRUE 0.946 0.000 0.125 NA   NA
 5488227 5488228 Arad_12232 Arad_12234     FALSE 0.001 618.000 0.000 NA   NA
 5488228 5488229 Arad_12234 Arad_12235     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488229 5488230 Arad_12235 Arad_12237     FALSE 0.001 572.000 0.000 NA   NA
 5488230 5488231 Arad_12237 Arad_12238     FALSE 0.461 110.000 0.200 NA   NA
 5488231 5488232 Arad_12238 Arad_12239     TRUE 0.601 35.000 0.028 NA   NA
 5488232 5488233 Arad_12239 Arad_12240     TRUE 0.826 11.000 0.018 NA   NA
 5488233 5488234 Arad_12240 Arad_12241     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5488234 5488235 Arad_12241 Arad_12242     FALSE 0.511 17.000 0.000 NA   NA
 5488235 5488236 Arad_12242 Arad_12246     FALSE 0.001 623.000 0.000 NA   NA
 5488236 5488237 Arad_12246 Arad_12248     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5488237 5488238 Arad_12248 Arad_12249     FALSE 0.050 87.000 0.000 1.000 N NA
 5488240 5488241 Arad_12252 Arad_12253     TRUE 0.891 69.000 0.040 0.001 Y NA
 5488242 5488243 Arad_12254 Arad_12258     FALSE 0.108 123.000 0.000 1.000   NA
 5488243 5488244 Arad_12258 Arad_12259     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000   NA
 5488244 5488245 Arad_12259 Arad_12260     TRUE 0.999 2.000 0.909 0.092 Y NA
 5488245 5488246 Arad_12260 Arad_12261     FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5488246 5488247 Arad_12261 Arad_12262     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5488247 5488248 Arad_12262 Arad_12263     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 5488248 5488249 Arad_12263 Arad_12264     TRUE 0.986 -22.000 0.000 0.092 Y NA
 5488249 5488250 Arad_12264 Arad_12265     TRUE 0.989 17.000 0.500 1.000 Y NA
 5488250 5488251 Arad_12265 Arad_12266     TRUE 0.969 19.000 0.667 1.000 N NA
 5488254 5488255 Arad_12270 Arad_12272     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 5488255 5488256 Arad_12272 Arad_12273   groL TRUE 0.906 28.000 0.000 0.081 Y NA
 5488256 5488257 Arad_12273 Arad_12275 groL   TRUE 0.821 -16.000 0.000 NA   NA
 5488259 5488260 Arad_12277 Arad_12279     FALSE 0.090 125.000 0.000 NA   NA
 5488260 5488261 Arad_12279 Arad_12280     FALSE 0.359 31.000 0.000 NA   NA
 5488262 5488263 Arad_12281 Arad_12282     TRUE 0.973 25.000 0.226 0.007 Y NA
 5488263 5488264 Arad_12282 Arad_12284     TRUE 0.881 39.000 0.000 0.038 Y NA
 5488264 5488265 Arad_12284 Arad_12286   pntA TRUE 0.996 21.000 0.745 0.001 Y NA
 5488269 5488270 Arad_12290 Arad_12294     FALSE 0.002 445.000 0.000 NA   NA
 5488271 5488272 Arad_12297 Arad_12298     TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5488272 5488273 Arad_12298 Arad_12299     TRUE 0.966 -3.000 0.167 NA   NA
 5488274 5488275 Arad_12300 Arad_12302     TRUE 0.911 14.000 0.222 NA   NA
 5488275 5488276 Arad_12302 Arad_12303     FALSE 0.085 141.000 0.000 1.000   NA
 5488277 5488278 Arad_12304 Arad_12306     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5488278 5488279 Arad_12306 Arad_12307     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488279 5488280 Arad_12307 Arad_12308     FALSE 0.130 32.000 0.000 1.000 N NA
 5488280 5488281 Arad_12308 Arad_12310     FALSE 0.026 127.000 0.000 1.000 N NA
 5488281 5488282 Arad_12310 Arad_12311     TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5488282 5488283 Arad_12311 Arad_12313     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5488285 5488286 Arad_12315 Arad_12316     FALSE 0.059 77.000 0.000 1.000 N NA
 5488286 5488287 Arad_12316 Arad_12317     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.040 Y NA
 5488288 5488289 Arad_12318 Arad_12319     FALSE 0.108 41.000 0.000 1.000 N NA
 5488290 5488291 Arad_12321 Arad_12322     TRUE 0.557 17.000 0.000 1.000   NA
 5488293 5488294 Arad_12325 Arad_12331     FALSE 0.014 1340.000 0.000 0.038 Y NA
 5488294 5488295 Arad_12331 Arad_12332     FALSE 0.024 80.000 0.000 NA N NA
 5488295 5488296 Arad_12332 Arad_12333     TRUE 0.819 -22.000 0.000 NA   NA
 5488296 5488297 Arad_12333 Arad_12335     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5488297 5488298 Arad_12335 Arad_12337     FALSE 0.006 287.000 0.000 NA   NA
 5488298 5488299 Arad_12337 Arad_12339     FALSE 0.028 73.000 0.000 NA N NA
 5488299 5488300 Arad_12339 Arad_12340     TRUE 0.891 96.000 0.750 NA   NA
 5488301 5488302 Arad_12341 Arad_12342     TRUE 0.821 68.000 0.000 0.014 Y NA
 5488302 5488303 Arad_12342 Arad_12343     TRUE 0.936 39.000 0.222 1.000 Y NA
 5488303 5488304 Arad_12343 Arad_12344     TRUE 0.974 24.000 0.333 1.000 Y NA
 5488304 5488305 Arad_12344 Arad_12346     TRUE 0.994 4.000 0.333 0.092 Y NA
 5488305 5488306 Arad_12346 Arad_12347     FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5488309 5488310 Arad_12352 Arad_12353     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.092 Y NA
 5488310 5488311 Arad_12353 Arad_12354     TRUE 0.963 11.000 0.000 0.092 Y NA
 5488311 5488312 Arad_12354 Arad_12355     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5488312 5488313 Arad_12355 Arad_12356     FALSE 0.309 40.000 0.000 NA   NA
 5488313 5488314 Arad_12356 Arad_12357     FALSE 0.035 58.000 0.000 NA N NA
 5488314 5488315 Arad_12357 Arad_12358     FALSE 0.504 127.000 0.000 1.000 Y NA
 5488315 5488316 Arad_12358 Arad_12359     TRUE 0.813 65.000 0.000 0.092 Y NA
 5488316 5488317 Arad_12359 Arad_12361     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.092 Y NA
 5488317 5488318 Arad_12361 Arad_12362     TRUE 0.987 23.000 1.000 1.000   NA
 5488318 5488319 Arad_12362 Arad_12363     FALSE 0.438 23.000 0.000 NA   NA
 5488320 5488321 Arad_12364 Arad_12365     TRUE 0.980 12.000 0.118 0.092 Y NA
 5488321 5488322 Arad_12365 Arad_12366     TRUE 0.998 4.000 0.647 0.092 Y NA
 5488322 5488323 Arad_12366 Arad_12367     TRUE 0.728 206.000 0.529 0.092 Y NA
 5488324 5488325 Arad_12368 Arad_12370     FALSE 0.040 179.000 0.000 1.000   NA
 5488326 5488327 Arad_12371 Arad_12372     FALSE 0.051 86.000 0.000 1.000 N NA
 5488327 5488328 Arad_12372 Arad_12373     FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5488328 5488329 Arad_12373 Arad_12374     FALSE 0.498 18.000 0.000 NA   NA
 5488329 5488330 Arad_12374 Arad_12376     FALSE 0.015 328.000 0.000 0.004   NA
 5488330 5488331 Arad_12376 Arad_12378     FALSE 0.456 75.000 0.000 0.004   NA
 5488331 5488332 Arad_12378 Arad_12379     FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 5488332 5488333 Arad_12379 Arad_12380     TRUE 0.744 88.000 0.022 NA Y NA
 5488333 5488334 Arad_12380 Arad_12383     TRUE 0.987 -28.000 0.022 1.000 Y NA
 5488335 5488336 Arad_12384 Arad_12385     FALSE 0.286 46.000 0.000 NA   NA
 5488336 5488337 Arad_12385 Arad_12386     TRUE 0.988 66.000 1.000 NA Y NA
 5488337 5488338 Arad_12386 Arad_12387     TRUE 0.988 12.000 0.375 NA Y NA
 5488338 5488339 Arad_12387 Arad_12388     TRUE 0.999 -3.000 0.800 NA Y NA
 5488339 5488340 Arad_12388 Arad_12389     TRUE 0.859 34.000 0.300 1.000   NA
 5488340 5488341 Arad_12389 Arad_12390     FALSE 0.237 59.000 0.000 NA   NA
 5488341 5488342 Arad_12390 Arad_12392     FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 5488343 5488344 Arad_12394 Arad_12395     FALSE 0.152 90.000 0.000 NA   NA
 5488344 5488345 Arad_12395 Arad_12396     TRUE 0.978 -28.000 0.000 NA Y NA
 5488345 5488346 Arad_12396 Arad_12397     TRUE 0.895 55.000 0.174 NA Y NA
 5488346 5488347 Arad_12397 Arad_12398     TRUE 0.931 31.000 0.133 1.000 Y NA
 5488347 5488348 Arad_12398 Arad_12399     FALSE 0.002 513.000 0.000 1.000   NA
 5488349 5488350 Arad_12400 Arad_12402     FALSE 0.048 501.000 0.554 NA   NA
 5488351 5488352 Arad_12403 Arad_12405     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5488352 5488353 Arad_12405 Arad_12406     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 5488353 5488354 Arad_12406 Arad_12407     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.092 Y NA
 5488354 5488355 Arad_12407 Arad_12408     TRUE 0.997 15.000 0.833 0.092 Y NA
 5488355 5488356 Arad_12408 Arad_12410     FALSE 0.069 27.000 0.000 NA N NA
 5488356 5488357 Arad_12410 Arad_12411     FALSE 0.025 77.000 0.000 NA N NA
 5488357 5488358 Arad_12411 Arad_12412     FALSE 0.013 163.000 0.000 1.000 N NA
 5488359 5488360 Arad_12413 Arad_12414 pcaD   FALSE 0.156 88.000 0.000 NA   NA
 5488360 5488361 Arad_12414 Arad_12415     FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 5488361 5488362 Arad_12415 Arad_12416     TRUE 0.980 11.000 0.068 0.092 Y NA
 5488362 5488363 Arad_12416 Arad_12417     TRUE 0.983 0.000 0.000 0.012 Y NA
 5488364 5488365 Arad_12419 Arad_12422     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 5488365 5488366 Arad_12422 Arad_12423     TRUE 0.933 22.000 0.400 NA   NA
 5488366 5488367 Arad_12423 Arad_12424     TRUE 0.588 13.000 0.000 NA   NA
 5488367 5488368 Arad_12424 Arad_12425     FALSE 0.020 143.000 0.000 1.000 N NA
 5488368 5488369 Arad_12425 Arad_12426     TRUE 0.999 5.000 1.000 0.092 Y NA
 5488369 5488370 Arad_12426 Arad_12427     TRUE 0.998 -16.000 1.000 1.000   NA
 5488370 5488371 Arad_12427 Arad_12429     TRUE 0.610 14.000 0.000 1.000   NA
 5488372 5488373 Arad_12433 Arad_12434     TRUE 0.999 -15.000 1.000 0.092 Y NA
 5488373 5488374 Arad_12434 Arad_12435     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.092 Y NA
 5488374 5488375 Arad_12435 Arad_12436     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5488375 5488376 Arad_12436 Arad_12438     FALSE 0.003 412.000 0.000 1.000   NA
 5488376 5488377 Arad_12438 Arad_12440     FALSE 0.172 198.000 0.222 1.000   NA
 5488377 5488378 Arad_12440 Arad_12441     FALSE 0.424 78.000 0.000 0.010   NA
 5488378 5488379 Arad_12441 Arad_12443     FALSE 0.011 258.000 0.000 1.000   NA
 5488379 5488380 Arad_12443 Arad_12444     FALSE 0.272 59.000 0.000 1.000   NA
 5488381 5488382 Arad_12445 Arad_12446   ihfA FALSE 0.000 524.000 0.000 1.000 N NA
 5488382 5488383 Arad_12446 Arad_12448 ihfA   FALSE 0.001 624.000 0.000 NA   NA
 5488385 5488386 Arad_12452 Arad_12453 cysE   FALSE 0.139 30.000 0.000 1.000 N NA
 5488386 5488387 Arad_12453 Arad_12454     FALSE 0.054 83.000 0.000 1.000 N NA
 5488387 5488388 Arad_12454 Arad_12455     FALSE 0.191 85.000 0.000 1.000   NA
 5488388 5488389 Arad_12455 Arad_12456     FALSE 0.218 76.000 0.000 1.000   NA
 5488389 5488390 Arad_12456 Arad_12457     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5488390 5488391 Arad_12457 Arad_12458     TRUE 0.653 12.000 0.000 1.000   NA
 5488391 5488392 Arad_12458 Arad_12460     FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 5488392 5488393 Arad_12460 Arad_12461     TRUE 0.815 -839.000 0.000 NA   NA
 5488393 5488394 Arad_12461 Arad_12462     TRUE 0.966 13.000 0.059 1.000 Y NA
 5488394 5488395 Arad_12462 Arad_12463     TRUE 0.987 4.000 0.088 0.092 Y NA
 5488395 5488396 Arad_12463 Arad_12465     FALSE 0.004 224.000 0.000 1.000 N NA
 5488396 5488397 Arad_12465 Arad_12466   ehuA FALSE 0.001 340.000 0.000 1.000 N NA
 5488397 5488398 Arad_12466 Arad_12467 ehuA ehuD TRUE 0.981 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5488398 5488399 Arad_12467 Arad_12468 ehuD   TRUE 0.793 77.000 0.000 0.012 Y NA
 5488399 5488400 Arad_12468 Arad_12469   ehuB TRUE 0.975 72.000 0.611 0.092 Y NA
 5488400 5488401 Arad_12469 Arad_12471 ehuB   FALSE 0.004 182.000 0.000 NA N NA
 5488401 5488402 Arad_12471 Arad_12472     TRUE 0.953 8.000 0.000 NA Y NA
 5488402 5488403 Arad_12472 Arad_12473     FALSE 0.029 70.000 0.000 NA N NA
 5488405 5488406 Arad_12476 Arad_12477     TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5488406 5488407 Arad_12477 Arad_12478     TRUE 0.968 72.000 0.636 NA Y NA
 5488407 5488408 Arad_12478 Arad_12480     TRUE 0.993 -3.000 0.538 NA   NA
 5488408 5488409 Arad_12480 Arad_12481     FALSE 0.057 162.000 0.000 1.000   NA
 5488409 5488410 Arad_12481 Arad_12482     FALSE 0.402 31.000 0.000 1.000   NA
 5488412 5488413 Arad_12484 Arad_12485     FALSE 0.009 137.000 0.000 NA N NA
 5488413 5488414 Arad_12485 Arad_12488     FALSE 0.447 26.000 0.000 1.000   NA
 5488414 5488415 Arad_12488 Arad_12489     FALSE 0.473 59.000 0.000 0.064   NA
 5488415 5488416 Arad_12489 Arad_12490     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 5488416 5488417 Arad_12490 Arad_12491     TRUE 0.759 1.000 0.000 NA   NA
 5488417 5488418 Arad_12491 Arad_12492     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5488418 5488419 Arad_12492 Arad_12493     TRUE 0.938 -3.000 0.023 1.000   NA
 5488422 5488423 Arad_12496 Arad_12499     FALSE 0.002 634.000 0.000 1.000   NA
 5488423 5488424 Arad_12499 Arad_12500     FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 5488426 5488427 Arad_12503 Arad_12504     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 5488427 5488055 Arad_12504 Arad_12000     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5488428 5488429 Arad_14000 Arad_14001     TRUE 0.958 -10.000 0.200 NA N NA
 5488429 5488430 Arad_14001 Arad_14002     TRUE 0.970 13.000 0.019 0.092 Y NA
 5488430 5488431 Arad_14002 Arad_14003     TRUE 0.968 10.000 0.019 1.000 Y NA
 5488431 5488432 Arad_14003 Arad_14004     TRUE 0.957 -3.000 0.182 1.000 N NA
 5488432 5488433 Arad_14004 Arad_14005     TRUE 0.646 32.000 0.125 NA N NA
 5488433 5488434 Arad_14005 Arad_14006     FALSE 0.130 14.000 0.000 NA N NA
 5488435 5488436 Arad_14007 Arad_14009     FALSE 0.002 525.000 0.000 NA   NA
 5488436 5488437 Arad_14009 Arad_14011     FALSE 0.011 248.000 0.000 NA   NA
 5488437 5488438 Arad_14011 Arad_14013     FALSE 0.004 336.000 0.000 NA   NA
 5488439 5488440 Arad_14014 Arad_14016     FALSE 0.002 533.000 0.000 NA   NA
 5488440 5488441 Arad_14016 Arad_14017     FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 5488443 5488444 Arad_14019 Arad_14020     TRUE 0.704 75.000 0.000 NA Y NA
 5488449 5488450 Arad_14027 Arad_14028     TRUE 0.700 9.000 0.000 1.000   NA
 5488453 5488454 Arad_14034 Arad_14035     TRUE 0.981 14.000 0.667 NA   NA
 5488454 5488455 Arad_14035 Arad_14038   dnaE TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5488455 5488456 Arad_14038 Arad_14039 dnaE   FALSE 0.013 235.000 0.000 NA   NA
 5488459 5488460 Arad_14043 Arad_14044     TRUE 0.847 -15.000 0.000 1.000   NA
 5488460 5488461 Arad_14044 Arad_14047     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 5488462 5488463 Arad_14048 Arad_14050     FALSE 0.180 233.000 0.000 0.032 Y NA
 5488463 5488464 Arad_14050 Arad_14051     TRUE 0.584 97.000 0.250 NA   NA
 5488464 5488465 Arad_14051 Arad_14052     FALSE 0.042 315.000 0.250 NA   NA
 5488465 5488466 Arad_14052 Arad_14053     TRUE 0.986 -24.000 0.375 NA   NA
 5488466 5488467 Arad_14053 Arad_14054     TRUE 0.977 -3.000 0.250 NA   NA
 5488468 5488469 Arad_14056 Arad_14058     TRUE 0.823 -13.000 0.000 NA   NA
 5488470 5488471 Arad_14059 Arad_14062     FALSE 0.005 308.000 0.000 NA   NA
 5488471 5488472 Arad_14062 Arad_14063     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488472 5488473 Arad_14063 Arad_14065     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 5488474 5488475 Arad_14066 Arad_14068     FALSE 0.300 51.000 0.000 1.000   NA
 5488475 5488476 Arad_14068 Arad_14069     TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5488476 5488477 Arad_14069 Arad_14071     FALSE 0.099 117.000 0.000 NA   NA
 5488477 5488478 Arad_14071 Arad_14072   tniB TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488478 5488479 Arad_14072 Arad_14074 tniB   TRUE 0.684 6.000 0.000 NA   NA
 5488479 5488480 Arad_14074 Arad_14075     FALSE 0.028 200.000 0.000 1.000   NA
 5488481 5488482 Arad_14076 Arad_14079     FALSE 0.164 85.000 0.000 NA   NA
 5488482 5488483 Arad_14079 Arad_14080     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 5488484 5488485 Arad_14082 Arad_14085 hns   FALSE 0.076 138.000 0.000 NA   NA
 5488485 5488486 Arad_14085 Arad_14088     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5488486 5488487 Arad_14088 Arad_14089     TRUE 0.988 0.000 0.500 NA   NA
 5488487 5488488 Arad_14089 Arad_14091   traG TRUE 0.998 -27.000 1.000 NA   NA
 5488488 5488489 Arad_14091 Arad_14092 traG traD TRUE 0.998 -13.000 1.000 1.000   NA
 5488489 5488490 Arad_14092 Arad_14093 traD   TRUE 0.995 5.000 1.000 NA   NA
 5488491 5488492 Arad_14094 Arad_14095 traA traF TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA N NA
 5488492 5488493 Arad_14095 Arad_14096 traF traB TRUE 0.977 17.000 0.667 NA   NA
 5488493 5488494 Arad_14096 Arad_14097 traB traH TRUE 0.992 14.000 1.000 NA   NA
 5488496 5488497 Arad_14100 Arad_14101     TRUE 0.980 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 5488497 5488498 Arad_14101 Arad_14102     TRUE 0.909 19.000 0.000 1.000 Y NA
 5488498 5488499 Arad_14102 Arad_14103     FALSE 0.176 10.000 0.000 NA N NA
 5488499 5488500 Arad_14103 Arad_14104     TRUE 0.614 96.000 0.000 NA Y NA
 5488500 5488501 Arad_14104 Arad_14106   traM FALSE 0.001 919.000 0.000 NA   NA
 5488502 5488503 Arad_14109 Arad_14110   traR TRUE 0.674 50.000 0.154 NA   NA
 5488503 5488504 Arad_14110 Arad_14112 traR   FALSE 0.028 121.000 0.000 1.000 N NA
 5488504 5488505 Arad_14112 Arad_14113   galM FALSE 0.458 162.000 0.000 0.013 Y NA
 5488505 5488506 Arad_14113 Arad_14114 galM   FALSE 0.106 42.000 0.000 1.000 N NA
 5488506 5488507 Arad_14114 Arad_14118     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 5488507 5488508 Arad_14118 Arad_14120     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488508 5488509 Arad_14120 Arad_14121     TRUE 0.780 23.000 0.091 NA   NA
 5488509 5488510 Arad_14121 Arad_14122   accG FALSE 0.028 201.000 0.000 1.000   NA
 5488510 5488511 Arad_14122 Arad_14123 accG accF TRUE 0.952 -7.000 0.150 1.000 N NA
 5488511 5488512 Arad_14123 Arad_14125 accF accF TRUE 0.760 93.000 0.000 0.001 Y NA
 5488512 5488513 Arad_14125 Arad_14126 accF accE FALSE 0.041 97.000 0.000 1.000 N NA
 5488513 5488514 Arad_14126 Arad_14127 accE accD TRUE 0.994 -3.000 0.143 0.091 Y NA
 5488514 5488515 Arad_14127 Arad_14128 accD accC TRUE 0.998 -6.000 0.667 1.000 Y NA
 5488515 5488516 Arad_14128 Arad_14129 accC accB TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 5488516 5488517 Arad_14129 Arad_14130 accB accA TRUE 0.977 11.000 0.143 1.000 Y NA
 5488517 5488518 Arad_14130 Arad_14131 accA accR FALSE 0.102 190.000 0.143 1.000 N NA
 5488518 5488519 Arad_14131 Arad_14132 accR accA FALSE 0.007 487.000 0.143 1.000 N NA
 5488519 5488520 Arad_14132 Arad_14133 accA accR FALSE 0.096 193.000 0.143 1.000 N NA
 5488520 5488521 Arad_14133 Arad_14137 accR accE FALSE 0.001 481.000 0.000 1.000 N NA
 5488521 5488522 Arad_14137 Arad_14138 accE accD TRUE 0.992 0.000 0.143 0.091 Y NA
 5488522 5488523 Arad_14138 Arad_14139 accD gdpD FALSE 0.431 3.000 0.000 1.000 N NA
 5488523 5488524 Arad_14139 Arad_14140 gdpD   TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5488524 5488525 Arad_14140 Arad_14141     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 5488525 5488526 Arad_14141 Arad_14142   accA TRUE 0.973 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5488527 5488528 Arad_14143 Arad_14145 chsB   FALSE 0.390 5.000 0.000 1.000 N NA
 5488529 5488530 Arad_14146 Arad_14149 traR   FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 5488530 5488531 Arad_14149 Arad_14151     FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 5488531 5488532 Arad_14151 Arad_14152     TRUE 0.939 -3.000 0.024 1.000   NA
 5488532 5488533 Arad_14152 Arad_14153   rocF FALSE 0.389 77.000 0.011 1.000   NA
 5488533 5488534 Arad_14153 Arad_14154 rocF noxA TRUE 0.930 -3.000 0.011 1.000   NA
 5488534 5488535 Arad_14154 Arad_14155 noxA noxB FALSE 0.019 287.000 0.000 0.040   NA
 5488536 5488537 Arad_14157 Arad_14159     TRUE 0.999 4.000 1.000 0.001 Y NA
 5488538 5488539 Arad_14160 Arad_14161   nocM TRUE 0.607 115.000 0.400 1.000 N NA
 5488539 5488540 Arad_14161 Arad_14163 nocM nocQ TRUE 0.998 2.000 0.625 0.012 Y NA
 5488540 5488541 Arad_14163 Arad_14164 nocQ nocT TRUE 0.899 73.000 0.250 1.000 Y NA
 5488541 5488542 Arad_14164 Arad_14165 nocT nocP TRUE 0.974 66.000 0.667 1.000 Y NA
 5488544 5488545 Arad_14167 Arad_14168 trbI trbH TRUE 0.992 13.000 1.000 NA   NA
 5488545 5488546 Arad_14168 Arad_14169 trbH trbG TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5488546 5488547 Arad_14169 Arad_14170 trbG trbF TRUE 0.999 -18.000 1.000 NA Y NA
 5488547 5488548 Arad_14170 Arad_14172 trbF trbL TRUE 0.997 15.000 1.000 NA Y NA
 5488548 5488549 Arad_14172 Arad_14173 trbL trbK TRUE 0.998 -6.000 1.000 NA   NA
 5488549 5488550 Arad_14173 Arad_14175 trbK trbJ TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5488550 5488551 Arad_14175 Arad_14177 trbJ trbE TRUE 0.999 -28.000 1.000 NA Y NA
 5488551 5488552 Arad_14177 Arad_14178 trbE trbD TRUE 0.945 11.000 0.000 NA Y NA
 5488552 5488553 Arad_14178 Arad_14179 trbD trbC TRUE 0.980 -7.000 0.000 NA Y NA
 5488553 5488554 Arad_14179 Arad_14181 trbC trbB TRUE 0.999 -10.000 1.000 NA Y NA
 5488554 5488555 Arad_14181 Arad_14182 trbB traI TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 N NA
 5488556 5488557 Arad_14184 Arad_14185 repA repB FALSE 0.349 230.000 0.714 1.000 N NA
 5488557 5488558 Arad_14185 Arad_14186 repB repC FALSE 0.018 215.000 0.000 NA   NA
 5488561 5488562 Arad_14190 Arad_14191     FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 5488563 5488564 Arad_14192 Arad_14193     TRUE 0.987 9.000 0.667 NA   NA
 5488564 5488565 Arad_14193 Arad_14194     TRUE 0.967 3.000 0.286 NA   NA
 5488565 5488566 Arad_14194 Arad_14196     TRUE 0.618 98.000 0.286 NA   NA
 5488567 5488568 Arad_14197 Arad_14198     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5488568 5488569 Arad_14198 Arad_14199     FALSE 0.402 26.000 0.000 NA   NA
 5488572 5488573 Arad_14202 Arad_14203     TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5488573 5488574 Arad_14203 Arad_14204     TRUE 0.975 27.000 0.400 1.000 Y NA
 5488574 5488575 Arad_14204 Arad_14205     FALSE 0.130 14.000 0.000 NA N NA
 5488575 5488576 Arad_14205 Arad_14206     FALSE 0.011 123.000 0.000 NA N NA
 5488576 5488577 Arad_14206 Arad_14207     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5488577 5488578 Arad_14207 Arad_14208     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5488578 5488579 Arad_14208 Arad_14209     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488579 5488580 Arad_14209 Arad_14210     TRUE 0.830 -6.000 0.000 NA   NA
 5488580 5488581 Arad_14210 Arad_14211     TRUE 0.991 -3.000 0.133 NA Y NA
 5488581 5488582 Arad_14211 Arad_14213     FALSE 0.158 158.000 0.133 NA N NA
 5488582 5488583 Arad_14213 Arad_14214     FALSE 0.303 160.000 0.286 1.000 N NA
 5488584 5488585 Arad_14216 Arad_14218     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5488585 5488586 Arad_14218 Arad_14219     FALSE 0.208 140.000 0.040 NA   NA
 5488586 5488587 Arad_14219 Arad_14221     FALSE 0.483 54.000 0.019 NA   NA
 5488587 5488588 Arad_14221 Arad_14222     FALSE 0.258 109.000 0.019 NA   NA
 5488588 5488589 Arad_14222 Arad_14223     TRUE 0.999 -13.000 1.000 1.000 Y NA
 5488589 5488590 Arad_14223 Arad_14224     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5488590 5488591 Arad_14224 Arad_14225     FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5488591 5488592 Arad_14225 Arad_14226     FALSE 0.541 80.000 0.125 1.000   NA
 5488592 5488593 Arad_14226 Arad_14227     TRUE 0.860 88.000 0.667 1.000 N NA
 5488593 5488594 Arad_14227 Arad_14229     TRUE 0.930 58.000 0.667 1.000   NA
 5488594 5488595 Arad_14229 Arad_14230     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000   NA
 5488595 5488596 Arad_14230 Arad_14231     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.091 Y NA
 5488596 5488597 Arad_14231 Arad_14232     TRUE 0.994 -18.000 0.250 NA Y NA
 5488597 5488598 Arad_14232 Arad_14234     TRUE 0.918 11.000 0.250 NA N NA
 5488598 5488599 Arad_14234 Arad_14235     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5488600 5488601 Arad_14236 Arad_14238     TRUE 0.648 46.000 0.095 NA   NA
 5488601 5488602 Arad_14238 Arad_14239     TRUE 0.829 -7.000 0.000 NA   NA
 5488602 5488603 Arad_14239 Arad_14240     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488603 5488604 Arad_14240 Arad_14241     TRUE 0.987 4.000 0.565 1.000   NA
 5488604 5488428 Arad_14241 Arad_14000     FALSE 0.003 352.000 0.000 NA   NA
 5488605 5488606 Arad_15024 Arad_15025 agnG agnF FALSE 0.003 384.000 0.000 NA   NA
 5488607 5488608 Arad_15026 Arad_15027 agnE2 agnE1 FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5488609 5488610 Arad_15028 Arad_15029 agnD1 agnD2 TRUE 0.817 -25.000 0.000 NA   NA
 5488610 5488611 Arad_15029 Arad_15036 agnD2 agnD3 FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5488612 5488613 Arad_15030 Arad_15031 agnC7 agnC6 TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488613 5488614 Arad_15031 Arad_15032 agnC6 agnC5 FALSE 0.342 -22.000 0.000 NA N NA
 5488614 5488615 Arad_15032 Arad_15033 agnC5 agnC4 TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5488615 5488616 Arad_15033 Arad_15034 agnC4 agnC3 TRUE 0.767 3.000 0.000 1.000   NA
 5488616 5488617 Arad_15034 Arad_15035 agnC3 agnC2 TRUE 0.980 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 5488617 5488618 Arad_15035 Arad_15001 agnC2 agnC1 FALSE 0.511 17.000 0.000 NA   NA
 5488618 5488619 Arad_15001 Arad_15002 agnC1 agnB2 FALSE 0.002 411.000 0.000 NA   NA
 5488619 5488620 Arad_15002 Arad_15003 agnB2   TRUE 0.774 10.000 0.000 0.021 N NA
 5488620 5488621 Arad_15003 Arad_15004   agnA TRUE 0.659 17.000 0.000 0.021 N NA
 5488621 5488622 Arad_15004 Arad_15005 agnA   FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5488622 5488623 Arad_15005 Arad_15006     FALSE 0.017 219.000 0.000 NA   NA
 5488625 5488626 Arad_15008 Arad_15009     FALSE 0.034 109.000 0.000 1.000 N NA
 5488626 5488627 Arad_15009 Arad_15010     TRUE 0.933 22.000 0.000 0.009 Y NA
 5488627 5488628 Arad_15010 Arad_15011   tn7 TRUE 0.594 104.000 0.000 1.000 Y NA
 5488629 5488630 Arad_15012 Arad_15013     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488630 5488631 Arad_15013 Arad_15014     FALSE 0.243 57.000 0.000 NA   NA
 5488631 5488632 Arad_15014 Arad_15015   repA FALSE 0.001 745.000 0.000 NA   NA
 5488632 5488633 Arad_15015 Arad_15016 repA   FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 5488633 5488634 Arad_15016 Arad_15017   parA FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 5488635 5488636 Arad_15018 Arad_15019     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488636 5488637 Arad_15019 Arad_15020   traG TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 5488637 5488638 Arad_15020 Arad_15021 traG   TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA   NA
 5488638 5488639 Arad_15021 Arad_15022     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5488640 5488605 Arad_15023 Arad_15024 traA agnG FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA