MicrobesOnline Operon Predictions for Haloferax volcanii DS2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10158464 10158465 HVO_0003 HVO_0004 polD1   FALSE 0.130 143.000 0.000 1.000 N NA
 10158466 10158467 HVO_0005 HVO_0006 gufA1   FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10158471 10158472 HVO_0010 HVO_0011   purO FALSE 0.464 49.000 0.072 1.000   NA
 10158473 10158474 HVO_0013 HVO_0014 cgi hel308a TRUE 0.970 -3.000 0.089 NA   NA
 10158475 10158476 HVO_0015 HVO_0016     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 10158477 10158478 HVO_0017 HVO_0018     FALSE 0.356 94.000 0.231 NA   NA
 10158480 10158481 HVO_0020 HVO_0021 thiQ thiP FALSE 0.333 104.000 0.045 0.064 N NA
 10158481 10158482 HVO_0021 HVO_0022 thiP thiB TRUE 0.966 10.000 0.697 0.064 N NA
 10158489 10158490 HVO_0029 HVO_0030 uvrB mutT TRUE 0.647 7.000 0.000 1.000 N NA
 10158490 10158491 HVO_0030 HVO_0031 mutT   FALSE 0.025 224.000 0.000 NA   NA
 10158491 10158492 HVO_0031 HVO_0032     FALSE 0.400 15.000 0.000 NA   NA
 10158492 10158493 HVO_0032 HVO_0033   uspA1 FALSE 0.437 70.000 0.103 1.000   NA
 10158494 10158495 HVO_0034 HVO_0035 act1   FALSE 0.003 451.000 0.000 NA N NA
 10158496 10158497 HVO_0036 HVO_0037     FALSE 0.137 51.000 0.000 NA   NA
 10158498 10158499 HVO_0038 HVO_0039 cyc rad3b FALSE 0.384 82.000 0.136 1.000 N NA
 10158501 10158502 HVO_0041 HVO_0042 argF argE TRUE 0.644 84.000 0.015 1.000 Y NA
 10158502 10158503 HVO_0042 HVO_0043 argE argD TRUE 0.996 -3.000 0.243 1.000 Y NA
 10158503 10158504 HVO_0043 HVO_0044 argD argB TRUE 0.994 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 10158504 10158505 HVO_0044 HVO_0045 argB argC TRUE 0.853 55.000 0.058 0.002 Y NA
 10158505 10158506 HVO_0045 HVO_0046 argC rimK1 TRUE 0.983 -3.000 0.209 1.000 N NA
 10158506 10158507 HVO_0046 HVO_0047 rimK1 lysW TRUE 0.990 2.000 0.667 1.000   NA
 10158507 10158508 HVO_0047 HVO_0048 lysW argH FALSE 0.041 321.000 0.042 1.000   NA
 10158508 10158509 HVO_0048 HVO_0049 argH argG TRUE 0.986 2.000 0.012 1.000 Y NA
 10158509 10158510 HVO_0049 HVO_0050 argG   FALSE 0.015 275.000 0.000 NA   NA
 10158510 10158511 HVO_0050 HVO_0051   kefB FALSE 0.076 94.000 0.000 NA   NA
 10158511 10158512 HVO_0051 HVO_0052 kefB   TRUE 0.998 0.000 0.714 1.000 Y NA
 10158512 10158513 HVO_0052 HVO_0053     TRUE 0.491 44.000 0.154 NA   NA
 10158513 10158514 HVO_0053 HVO_0054   glyS TRUE 0.705 7.000 0.013 NA   NA
 10158514 10158515 HVO_0054 HVO_0055 glyS   TRUE 0.938 -7.000 0.011 1.000   NA
 10158515 10158516 HVO_0055 HVO_0056     FALSE 0.093 133.000 0.000 NA   NA
 10158516 10158517 HVO_0056 HVO_0057     FALSE 0.111 62.000 0.000 NA   NA
 10158517 10158518 HVO_0057 HVO_0058   dppF1 TRUE 0.750 3.000 0.000 NA   NA
 10158518 10158519 HVO_0058 HVO_0059 dppF1 dppD1 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.010 Y NA
 10158519 10158520 HVO_0059 HVO_0060 dppD1 dppC1 TRUE 0.971 -3.000 0.065 1.000 N NA
 10158520 10158521 HVO_0060 HVO_0061 dppC1 dppB1 TRUE 0.908 7.000 0.087 0.064 N NA
 10158521 10158522 HVO_0061 HVO_0062 dppB1 dppA1 TRUE 0.771 213.000 0.750 0.064 Y NA
 10158523 10158524 HVO_0063 HVO_0064     FALSE 0.136 106.000 0.017 NA   NA
 10158524 10158525 HVO_0064 HVO_0065   polD2 TRUE 0.926 3.000 0.101 NA   NA
 10158527 10158528 HVO_0067 HVO_0068   panE FALSE 0.300 71.000 0.011 1.000   NA
 10158529 10158530 HVO_0069 HVO_0070     TRUE 0.504 79.000 0.250 1.000 N NA
 10158530 10158531 HVO_0070 HVO_0071     TRUE 0.738 45.000 0.583 NA   NA
 10158531 10158532 HVO_0071 HVO_0072     FALSE 0.074 159.000 0.000 NA   NA
 10158534 10158535 HVO_0073 HVO_0075 recJ   FALSE 0.053 137.000 0.000 NA N NA
 10158535 10158536 HVO_0075 HVO_0076   hemD TRUE 0.702 2.000 0.000 NA N NA
 10158536 10158537 HVO_0076 HVO_0077 hemD hemX TRUE 0.998 -3.000 0.679 1.000 Y NA
 10158537 10158538 HVO_0077 HVO_0078 hemX hemC TRUE 0.937 2.000 0.018 1.000   NA
 10158539 10158540 HVO_0079 HVO_0080     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10158541 10158542 HVO_0081 HVO_0082 hemL   FALSE 0.088 143.000 0.000 NA   NA
 10158542 10158543 HVO_0082 HVO_0083     FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 10158543 10158544 HVO_0083 HVO_0084   amt1 TRUE 0.943 4.000 0.235 1.000 N NA
 10158544 10158545 HVO_0084 HVO_0085 amt1   FALSE 0.052 380.000 0.235 1.000 N NA
 10158545 10158546 HVO_0085 HVO_0086   amt2 TRUE 0.984 -3.000 0.235 1.000 N NA
 10158546 10158547 HVO_0086 HVO_0087 amt2 hemB FALSE 0.013 344.000 0.000 1.000 N NA
 10158548 10158549 HVO_0088 HVO_0089     FALSE 0.169 43.000 0.000 NA   NA
 10158550 10158551 HVO_0090 HVO_0091     TRUE 0.674 76.000 0.611 NA   NA
 10158555 10158556 HVO_0095 HVO_0096     FALSE 0.397 104.000 0.333 NA   NA
 10158556 10158557 HVO_0096 HVO_0097     FALSE 0.404 125.000 0.250 NA   NA
 10158558 10158559 HVO_0098 HVO_0099     FALSE 0.347 82.000 0.143 NA   NA
 10158559 10158560 HVO_0099 HVO_0099A     FALSE 0.006 405.000 0.000 NA   NA
 10158561 10158562 HVO_0100 HVO_0101     FALSE 0.198 78.000 0.012 NA   NA
 10158563 10158564 HVO_0102 HVO_0103 htpX   TRUE 0.827 7.000 0.093 NA   NA
 10158564 10158565 HVO_0103 HVO_0104   radA FALSE 0.017 259.000 0.000 NA   NA
 10158565 10158566 HVO_0104 HVO_0105 radA   FALSE 0.018 251.000 0.000 NA   NA
 10158566 10158567 HVO_0105 HVO_0106     TRUE 0.671 11.000 0.026 NA   NA
 10158568 10158569 HVO_0107 HVO_0108 sufA   FALSE 0.119 73.000 0.000 NA   NA
 10158569 10158570 HVO_0108 HVO_0109   sufS FALSE 0.118 74.000 0.000 NA   NA
 10158572 10158573 HVO_0111 HVO_0112     TRUE 0.953 1.000 0.085 NA   NA
 10158574 10158575 HVO_0113 HVO_0114     FALSE 0.374 27.000 0.000 1.000 N NA
 10158575 10158576 HVO_0114 HVO_0115   rpl39R FALSE 0.236 151.000 0.020 1.000   NA
 10158576 10158577 HVO_0115 HVO_0116 rpl39R rpl31R TRUE 0.981 4.000 0.434 0.020   NA
 10158577 10158578 HVO_0116 HVO_0117 rpl31R   TRUE 0.991 4.000 0.474 1.000 Y NA
 10158578 10158579 HVO_0117 HVO_0118   rplX TRUE 0.555 82.000 0.324 1.000   NA
 10158579 10158580 HVO_0118 HVO_0119 rplX pfdA TRUE 0.990 -3.000 0.348 1.000   NA
 10158580 10158581 HVO_0119 HVO_0120 pfdA ftsY TRUE 0.526 33.000 0.050 1.000 N NA
 10158582 10158583 HVO_0121 HVO_0122   serA1 TRUE 0.902 34.000 0.250 1.000 Y NA
 10158584 10158585 HVO_0123 HVO_0124 srp54   FALSE 0.153 110.000 0.004 1.000 N NA
 10158585 10158586 HVO_0124 HVO_0125     TRUE 0.997 1.000 0.204 0.003 Y NA
 10158586 10158587 HVO_0125 HVO_0126     FALSE 0.329 75.000 0.074 NA   NA
 10158588 10158589 HVO_0127 HVO_0128     TRUE 0.896 3.000 0.042 NA   NA
 10158590 10158591 HVO_0129 HVO_3016     FALSE 0.162 44.000 0.000 NA   NA
 10158591 10158592 HVO_3016 HVO_0131     FALSE 0.006 414.000 0.000 NA   NA
 10158592 10158593 HVO_0131 HVO_0131A     FALSE 0.118 74.000 0.000 NA   NA
 10158594 10158595 HVO_0132 HVO_0133   cct1 FALSE 0.011 306.000 0.000 NA   NA
 10158595 10158596 HVO_0133 HVO_0134 cct1   FALSE 0.078 223.000 0.012 1.000   NA
 10158596 10158597 HVO_0134 HVO_0135   rio1 FALSE 0.212 94.000 0.012 1.000   NA
 10158597 10158598 HVO_0135 HVO_0136 rio1 tif1A1 FALSE 0.099 102.000 0.000 1.000 N NA
 10158600 10158601 HVO_0137 HVO_0138   tyrS FALSE 0.116 93.000 0.000 1.000 N NA
 10158604 10158605 HVO_0141 HVO_0142     TRUE 0.853 9.000 0.200 NA   NA
 10158606 10158607 HVO_0143 HVO_0144 phzF rnz FALSE 0.293 55.000 0.004 1.000   NA
 10158608 10158609 HVO_0145 HVO_0146 rfcC   TRUE 0.943 0.000 0.010 1.000 N NA
 10158609 10158610 HVO_0146 HVO_0147   ureB FALSE 0.031 241.000 0.000 1.000 N NA
 10158610 10158611 HVO_0147 HVO_0148 ureB ureC TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.002 Y NA
 10158611 10158612 HVO_0148 HVO_0149 ureC ureA TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.001 Y NA
 10158612 10158613 HVO_0149 HVO_0150 ureA ureG TRUE 0.993 -3.000 0.273 0.003 N NA
 10158613 10158614 HVO_0150 HVO_0151 ureG ureD TRUE 0.997 0.000 0.118 0.003 Y NA
 10158614 10158615 HVO_0151 HVO_0152 ureD ureE TRUE 0.996 0.000 0.071 0.003 Y NA
 10158615 10158616 HVO_0152 HVO_0153 ureE   TRUE 0.997 -3.000 0.087 0.003 Y NA
 10158616 10158617 HVO_0153 HVO_0154     FALSE 0.082 90.000 0.000 NA   NA
 10158618 10158619 HVO_0155 HVO_0156   trmL FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10158620 10158621 HVO_0157 HVO_0158   tbp1 FALSE 0.429 59.000 0.182 NA   NA
 10158621 10158622 HVO_0158 HVO_0159 tbp1   TRUE 0.591 80.000 0.455 NA   NA
 10158622 10158623 HVO_0159 HVO_0160     FALSE 0.152 46.000 0.000 NA   NA
 10158626 10158627 HVO_0163 HVO_0164     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA   NA
 10158632 10158633 HVO_0169 HVO_0170   hjc FALSE 0.069 73.000 0.000 NA N NA
 10158640 10158641 HVO_0176 HVO_0178 cat1   TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158642 10158643 HVO_0179 HVO_0180 trh1 ftsJ FALSE 0.038 166.000 0.000 NA N NA
 10158643 10158644 HVO_0180 HVO_0181 ftsJ   FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 10158645 10158646 HVO_0182 HVO_0183     FALSE 0.120 57.000 0.000 NA   NA
 10158646 10158647 HVO_0183 HVO_0184     TRUE 0.938 -7.000 0.053 NA   NA
 10158647 10158648 HVO_0184 HVO_0185   tatCt FALSE 0.452 120.000 0.353 NA   NA
 10158649 10158650 HVO_0186 HVO_0187 tatCo   FALSE 0.075 113.000 0.000 NA   NA
 10158654 10158655 HVO_0191 HVO_0193 mutS5a   FALSE 0.126 55.000 0.000 NA   NA
 10158657 10158658 HVO_0194 HVO_0195 orc9 rpiA FALSE 0.235 61.000 0.008 1.000 N NA
 10158660 10158661 HVO_0197 HVO_0197A     FALSE 0.083 148.000 0.000 NA   NA
 10158661 10158662 HVO_0197A HVO_0198     FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10158662 10158663 HVO_0198 HVO_0199   pmm FALSE 0.325 63.000 0.051 1.000 N NA
 10158664 10158665 HVO_0200 HVO_0201     FALSE 0.094 84.000 0.000 NA   NA
 10158665 10158666 HVO_0201 HVO_0202     TRUE 0.853 9.000 0.200 NA   NA
 10158668 10158669 HVO_0204 HVO_0205 kinA1 tspO TRUE 0.617 148.000 0.018 1.000 Y NA
 10158670 10158671 HVO_0206 HVO_0207 alaS1   FALSE 0.142 105.000 0.021 NA   NA
 10158671 10158672 HVO_0207 HVO_0208     FALSE 0.355 115.000 0.231 NA   NA
 10158672 10158673 HVO_0208 HVO_0209   acd1 FALSE 0.083 176.000 0.000 1.000 N NA
 10158673 10158674 HVO_0209 HVO_0210 acd1   FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10158674 10158675 HVO_0210 HVO_0211   ferB1 FALSE 0.037 203.000 0.000 NA   NA
 10158675 10158676 HVO_0211 HVO_0212 ferB1   FALSE 0.278 45.000 0.000 1.000   NA
 10158676 10158677 HVO_0212 HVO_0213     FALSE 0.158 123.000 0.000 1.000   NA
 10158677 10158678 HVO_0213 HVO_0214     FALSE 0.084 192.000 0.000 1.000   NA
 10158679 10158680 HVO_0215 HVO_0216   cbiQ1 FALSE 0.369 82.000 0.114 1.000 N NA
 10158680 10158681 HVO_0216 HVO_0217 cbiQ1 cbiO1 TRUE 0.991 -6.000 0.043 1.000 Y NA
 10158681 10158682 HVO_0217 HVO_0218 cbiO1 bioY TRUE 0.940 1.000 0.046 NA   NA
 10158683 10158684 HVO_0219 HVO_0220 cmi4 mcm FALSE 0.454 54.000 0.176 NA   NA
 10158684 10158685 HVO_0220 HVO_0221 mcm   FALSE 0.435 101.000 0.400 NA   NA
 10158685 10158686 HVO_0221 HVO_0222     TRUE 0.568 151.000 0.571 NA   NA
 10158686 10158687 HVO_0222 HVO_0223     TRUE 0.995 -3.000 0.875 NA   NA
 10158687 10158688 HVO_0223 HVO_0224     TRUE 0.697 52.000 0.556 NA   NA
 10158688 10158689 HVO_0224 HVO_0225   minD1 TRUE 0.995 -3.000 0.889 NA   NA
 10158692 10158693 HVO_0228 HVO_0229     FALSE 0.116 69.000 0.000 NA   NA
 10158693 10158694 HVO_0229 HVO_0230   hit1 FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10158694 10158695 HVO_0230 HVO_0231 hit1 ugd1 FALSE 0.019 289.000 0.010 NA N NA
 10158695 10158696 HVO_0231 HVO_0232 ugd1   TRUE 0.909 1.000 0.010 NA   NA
 10158696 10158697 HVO_0232 HVO_0233     FALSE 0.289 55.000 0.041 NA   NA
 10158697 10158698 HVO_0233 HVO_0234     FALSE 0.361 61.000 0.122 NA   NA
 10158698 10158699 HVO_0234 HVO_0235     FALSE 0.185 97.000 0.045 NA   NA
 10158700 10158701 HVO_0236 HVO_0237     FALSE 0.281 78.000 0.010 1.000   NA
 10158701 10158702 HVO_0237 HVO_0238     TRUE 0.899 2.000 0.000 1.000   NA
 10158705 10158706 HVO_0241 HVO_0242   pepB1 FALSE 0.010 316.000 0.000 NA   NA
 10158711 10158712 HVO_0247 HVO_0248     FALSE 0.169 43.000 0.000 NA   NA
 10158712 10158713 HVO_0248 HVO_0249     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158715 10158716 HVO_0251 HVO_0252   bcp2 TRUE 0.998 0.000 0.857 1.000 Y NA
 10158716 10158717 HVO_0252 HVO_0253 bcp2   FALSE 0.131 94.000 0.023 NA N NA
 10158719 10158720 HVO_0255 HVO_0256     TRUE 0.676 4.000 0.000 NA   NA
 10158721 10158722 HVO_0257 HVO_0258     FALSE 0.035 207.000 0.000 NA   NA
 10158722 10158723 HVO_0258 HVO_0259     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158724 10158725 HVO_0260 HVO_0261 phrH1   FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 10158725 10158726 HVO_0261 HVO_0262     FALSE 0.076 117.000 0.000 NA   NA
 10158730 10158731 HVO_0265 HVO_0266     TRUE 0.987 2.000 0.667 NA   NA
 10158733 10158734 HVO_0268 HVO_0269     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158734 10158735 HVO_0269 HVO_0270     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158735 10158736 HVO_0270 HVO_0271     TRUE 0.540 7.000 0.000 NA   NA
 10158736 10158737 HVO_0271 HVO_0272     FALSE 0.216 34.000 0.000 NA   NA
 10158737 10158738 HVO_0272 HVO_0273     TRUE 0.842 -6.000 0.000 NA   NA
 10158738 10158739 HVO_0273 HVO_0274     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158739 10158740 HVO_0274 HVO_0275     FALSE 0.044 236.000 0.000 1.000   NA
 10158740 10158741 HVO_0275 HVO_0276     TRUE 0.635 103.000 0.000 0.015 Y NA
 10158741 10158742 HVO_0276 HVO_0277     FALSE 0.002 1060.000 0.000 NA   NA
 10158742 10158743 HVO_0277 HVO_0278     FALSE 0.010 327.000 0.000 NA   NA
 10158744 10158745 HVO_0279 HVO_0280     FALSE 0.084 124.000 0.000 NA   NA
 10158745 10158746 HVO_0280 HVO_0280A     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10158746 10158747 HVO_0280A HVO_3017     FALSE 0.111 65.000 0.000 NA   NA
 10158747 10158748 HVO_3017 HVO_0282   arsB1 FALSE 0.139 50.000 0.000 NA   NA
 10158748 10158749 HVO_0282 HVO_0283 arsB1 ashA FALSE 0.219 72.000 0.000 1.000   NA
 10158749 10158750 HVO_0283 HVO_0284 ashA   FALSE 0.154 151.000 0.000 1.000   NA
 10158752 10158753 HVO_0286 HVO_0287     FALSE 0.059 173.000 0.000 NA   NA
 10158753 10702416 HVO_0287 HVO_3070     FALSE 0.023 232.000 0.000 NA   NA
 10158755 10158756 HVO_0290 HVO_0291   rpap3 FALSE 0.314 165.000 0.207 NA   NA
 10158756 10158757 HVO_0291 HVO_0292 rpap3 rpa3 TRUE 0.991 1.000 0.724 NA   NA
 10158758 10158759 HVO_0293 HVO_0294   manC FALSE 0.332 55.000 0.065 NA   NA
 10158759 10158760 HVO_0294 HVO_0295 manC   FALSE 0.175 42.000 0.000 NA   NA
 10158761 10158762 HVO_0296 HVO_0297     FALSE 0.286 112.000 0.065 1.000   NA
 10158762 10158763 HVO_0297 HVO_0298     FALSE 0.184 77.000 0.007 NA   NA
 10158766 10158767 HVO_0301 HVO_0302     FALSE 0.092 131.000 0.000 NA   NA
 10158768 10158769 HVO_0303 HVO_0304 fps etfA1 FALSE 0.018 304.000 0.000 1.000 N NA
 10158769 10158770 HVO_0304 HVO_0305 etfA1 etfB1 TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.018 Y NA
 10158770 10158771 HVO_0305 HVO_0306 etfB1   FALSE 0.321 70.000 0.069 NA   NA
 10158772 10158773 HVO_0307 HVO_0308     TRUE 0.653 94.000 0.833 NA   NA
 10158775 10158776 HVO_0310 HVO_0311 atpH atpI TRUE 0.981 -13.000 0.132 0.004   NA
 10158776 10158777 HVO_0311 HVO_0312 atpI atpK TRUE 0.749 175.000 0.848 0.004   NA
 10158777 10158778 HVO_0312 HVO_0313 atpK atpE TRUE 0.940 22.000 0.489 0.004   NA
 10158778 10158779 HVO_0313 HVO_0314 atpE atpC TRUE 0.998 -3.000 0.236 0.004 Y NA
 10158779 10158780 HVO_0314 HVO_0315 atpC atpF TRUE 0.999 -3.000 0.462 0.004 Y NA
 10158780 10158781 HVO_0315 HVO_0316 atpF atpA TRUE 0.990 7.000 0.437 0.004 Y NA
 10158781 10158782 HVO_0316 HVO_0317 atpA atpB TRUE 0.994 5.000 0.632 0.004 Y NA
 10158782 10158783 HVO_0317 HVO_0318 atpB   FALSE 0.173 130.000 0.000 1.000   NA
 10158783 10158784 HVO_0318 HVO_0319   atpD1 FALSE 0.078 199.000 0.000 1.000   NA
 10158784 10158785 HVO_0319 HVO_0320 atpD1   FALSE 0.236 82.000 0.038 NA   NA
 10158787 10158788 HVO_0322 HVO_0323     FALSE 0.186 40.000 0.000 NA   NA
 10158790 10158791 HVO_0325 HVO_0326     FALSE 0.005 460.000 0.000 NA   NA
 10158791 10158792 HVO_0326 HVO_0327   ribB TRUE 0.999 -3.000 0.438 0.002 Y NA
 10158795 10158796 HVO_0330 HVO_0331     TRUE 0.711 80.000 0.750 NA   NA
 10158797 10158798 HVO_0332 HVO_0333   pyrE2 FALSE 0.193 67.000 0.024 NA N NA
 10158798 10158799 HVO_0333 HVO_0334 pyrE2   TRUE 0.808 75.000 0.016 0.005 Y NA
 10158799 10158800 HVO_0334 HVO_0335     FALSE 0.164 187.000 0.035 1.000   NA
 10158800 10158801 HVO_0335 HVO_0336     FALSE 0.062 253.000 0.071 NA   NA
 10158801 10158802 HVO_0336 HVO_0337   grx FALSE 0.066 103.000 0.000 NA   NA
 10158806 10158807 HVO_0341 HVO_0342   crcB1 TRUE 0.706 21.000 0.114 NA   NA
 10158807 10158808 HVO_0342 HVO_0343 crcB1 crcB2 TRUE 0.996 -3.000 0.360 NA Y NA
 10158809 10158810 HVO_3018 HVO_3019     FALSE 0.247 30.000 0.000 NA   NA
 10158811 10158812 HVO_0346 HVO_0347 rpoH rpoB2 TRUE 0.994 -3.000 0.292 0.005   NA
 10158812 10158813 HVO_0347 HVO_0348 rpoB2 rpoB1 TRUE 0.995 2.000 0.909 0.005   NA
 10158813 10158814 HVO_0348 HVO_0349 rpoB1 rpoA1 TRUE 0.964 7.000 0.333 0.005   NA
 10158814 10158815 HVO_0349 HVO_0350 rpoA1 rpoA2 TRUE 0.986 -7.000 0.172 0.005   NA
 10158815 10158816 HVO_0350 HVO_0351 rpoA2   TRUE 0.905 3.000 0.010 1.000   NA
 10158816 10158817 HVO_0351 HVO_0352     FALSE 0.126 55.000 0.000 NA   NA
 10158817 10158818 HVO_0352 HVO_0353   rps12 FALSE 0.024 228.000 0.000 NA   NA
 10158818 10158819 HVO_0353 HVO_0354 rps12 rps7 TRUE 0.996 3.000 0.410 0.003 Y NA
 10158821 10158822 HVO_0356 HVO_0357 tef2   FALSE 0.007 298.000 0.000 NA N NA
 10158822 10158823 HVO_0357 HVO_0358   hom1 TRUE 0.998 -3.000 0.615 NA Y NA
 10158823 10158824 HVO_0358 HVO_0359 hom1 tef1a1 FALSE 0.133 191.000 0.035 1.000 N NA
 10158824 10158825 HVO_0359 HVO_0360 tef1a1 rps10 TRUE 0.990 3.000 0.249 1.000 Y NA
 10158825 10158826 HVO_0360 HVO_3020 rps10   FALSE 0.017 255.000 0.000 NA   NA
 10158826 10158827 HVO_3020 HVO_0362     FALSE 0.015 275.000 0.000 NA   NA
 10158827 10158828 HVO_0362 HVO_0364     FALSE 0.041 194.000 0.000 NA   NA
 10158829 10158830 HVO_0363 HVO_0365     TRUE 0.797 -10.000 0.000 NA   NA
 10158830 10158831 HVO_0365 HVO_0366     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10158831 10158832 HVO_0366 HVO_0367     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10158832 10158833 HVO_0367 HVO_0368     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158833 10158834 HVO_0368 HVO_0369     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10158834 10158835 HVO_0369 HVO_0370     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10158835 10158836 HVO_0370 HVO_0371     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10158836 10158837 HVO_0371 HVO_0372     FALSE 0.454 11.000 0.000 NA   NA
 10158837 10158838 HVO_0372 HVO_0373     TRUE 0.676 4.000 0.000 NA   NA
 10158839 10158840 HVO_0374 HVO_0375     FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10158840 10158841 HVO_0375 HVO_0376     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10158841 10158842 HVO_0376 HVO_0377     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158842 10158843 HVO_0377 HVO_0378     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158843 10158844 HVO_0378 HVO_0379     FALSE 0.004 569.000 0.000 NA   NA
 10158846 10158847 HVO_0381 HVO_0382     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 10158847 10158848 HVO_0382 HVO_0383     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158848 10158849 HVO_0383 HVO_0384     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158849 10158850 HVO_0384 HVO_0385     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158850 10158851 HVO_0385 HVO_0386     FALSE 0.002 1065.000 0.000 NA   NA
 10158851 10158852 HVO_0386 HVO_0387     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10158853 10158854 HVO_0388 HVO_0389 vacB   FALSE 0.264 121.000 0.098 NA   NA
 10158857 10158858 HVO_0392 HVO_0393   uvrA FALSE 0.121 120.000 0.002 NA   NA
 10158858 10158859 HVO_0393 HVO_0394 uvrA   FALSE 0.016 270.000 0.000 NA   NA
 10158859 10158860 HVO_0394 HVO_0395     FALSE 0.061 171.000 0.000 NA   NA
 10158860 10158861 HVO_0395 HVO_0396   bchP FALSE 0.212 76.000 0.000 1.000   NA
 10158862 10158863 HVO_0397 HVO_0398 ygfZ   FALSE 0.268 166.000 0.155 NA   NA
 10158864 10158865 HVO_0399 HVO_0400     TRUE 0.552 71.000 0.333 NA   NA
 10158865 10158866 HVO_0400 HVO_0401   uspA2 FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 10158866 10158867 HVO_0401 HVO_0402 uspA2   FALSE 0.110 78.000 0.000 NA   NA
 10158867 10158868 HVO_0402 HVO_0403   glcK FALSE 0.091 85.000 0.000 NA   NA
 10158871 10158872 HVO_0406 HVO_0407     TRUE 0.973 -3.000 0.120 NA   NA
 10158874 10158875 HVO_0409 HVO_0410 ribE   FALSE 0.230 32.000 0.000 NA   NA
 10158875 10158876 HVO_0410 HVO_0411   arsB2b FALSE 0.037 201.000 0.000 NA   NA
 10158876 10158877 HVO_0411 HVO_0412 arsB2b arsB2a TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.005   NA
 10158879 10158880 HVO_0414 HVO_0415   uvrD TRUE 0.849 7.000 0.088 1.000 N NA
 10158880 10158881 HVO_0415 HVO_0416 uvrD   FALSE 0.225 159.000 0.022 1.000   NA
 10158881 10158882 HVO_0416 HVO_0417   cxp FALSE 0.152 92.000 0.000 1.000   NA
 10158882 10158883 HVO_0417 HVO_0418 cxp   FALSE 0.080 195.000 0.000 1.000   NA
 10158883 10158884 HVO_0418 HVO_0419     FALSE 0.135 107.000 0.000 1.000   NA
 10158885 10158886 HVO_0420 HVO_0421 mpcT   FALSE 0.228 118.000 0.021 1.000   NA
 10158888 10158889 HVO_0423 HVO_0424     TRUE 0.963 3.000 0.328 NA   NA
 10158889 10158890 HVO_0424 HVO_0425     FALSE 0.093 137.000 0.000 NA   NA
 10158890 10158891 HVO_0425 HVO_0426     FALSE 0.126 55.000 0.000 NA   NA
 10158892 10158893 HVO_0427 HVO_0428 rtcA uspA3 TRUE 0.932 1.000 0.012 1.000 N NA
 10158893 10158894 HVO_0428 HVO_0429 uspA3   FALSE 0.310 82.000 0.034 1.000   NA
 10158895 10158896 HVO_0430 HVO_0431     TRUE 0.526 32.000 0.075 NA   NA
 10158896 10158897 HVO_0431 HVO_0432     FALSE 0.139 50.000 0.000 NA   NA
 10158897 10158898 HVO_0432 HVO_0433   npdG FALSE 0.079 92.000 0.000 NA   NA
 10158899 10158900 HVO_0434 HVO_0435     FALSE 0.034 235.000 0.000 1.000 N NA
 10158900 10158901 HVO_0435 HVO_0436   pdxT FALSE 0.149 79.000 0.012 NA N NA
 10158901 10158902 HVO_0436 HVO_0437 pdxT sec61b FALSE 0.189 56.000 0.019 NA N NA
 10158903 10158904 HVO_0438 HVO_0439 trxA1 rpl40R FALSE 0.230 114.000 0.022 1.000   NA
 10158905 10158906 HVO_0440 HVO_0441     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10158907 10158908 HVO_0442 HVO_0443     TRUE 0.971 -3.000 0.106 NA   NA
 10158908 10158909 HVO_0443 HVO_0444   ugd3 TRUE 0.626 25.000 0.077 NA   NA
 10158910 10158911 HVO_0445 HVO_0446 phnE1 phnC1 TRUE 0.994 -10.000 0.107 0.002 Y NA
 10158911 10158912 HVO_0446 HVO_0447 phnC1 phnD1 TRUE 0.780 96.000 0.107 0.002 Y NA
 10158913 10158914 HVO_0448 HVO_0449 hisH pheA1 TRUE 0.707 55.000 0.010 1.000 Y NA
 10158914 10158915 HVO_0449 HVO_0450 pheA1 hsp20A FALSE 0.106 144.000 0.006 NA N NA
 10158915 10158916 HVO_0450 HVO_0451 hsp20A hsp20B FALSE 0.486 120.000 0.000 NA Y NA
 10158916 10158917 HVO_0451 HVO_0452 hsp20B leuS FALSE 0.016 215.000 0.000 NA N NA
 10158917 10158918 HVO_0452 HVO_0453 leuS   FALSE 0.084 124.000 0.000 NA   NA
 10158919 10158920 HVO_0454 HVO_0455 ocd1 cct2 FALSE 0.018 299.000 0.000 1.000 N NA
 10158920 10158921 HVO_0455 HVO_0456 cct2   FALSE 0.250 186.000 0.231 NA   NA
 10158921 10158922 HVO_0456 HVO_0457     FALSE 0.110 64.000 0.000 NA   NA
 10158922 10158923 HVO_0457 HVO_3021     FALSE 0.004 546.000 0.000 NA   NA
 10158923 10158924 HVO_3021 HVO_0459     FALSE 0.021 238.000 0.000 NA   NA
 10158924 10158925 HVO_0459 HVO_0460     FALSE 0.091 85.000 0.000 NA   NA
 10158925 10158926 HVO_0460 HVO_0461   cydB FALSE 0.186 40.000 0.000 NA   NA
 10158926 10158927 HVO_0461 HVO_0462 cydB cioA TRUE 0.997 -7.000 0.600 0.059 Y NA
 10158927 10158928 HVO_0462 HVO_0463 cioA   FALSE 0.110 63.000 0.000 NA   NA
 10158928 10158929 HVO_0463 HVO_0464   ilvA1 FALSE 0.024 225.000 0.000 NA   NA
 10158934 10158935 HVO_0469 HVO_0470   thrC1 FALSE 0.302 97.000 0.095 1.000   NA
 10158936 10158937 HVO_0471 HVO_0472     FALSE 0.087 126.000 0.000 NA   NA
 10158939 10158940 HVO_0474 HVO_0475 pimT1   TRUE 0.516 22.000 0.014 NA   NA
 10158940 10158941 HVO_0475 HVO_0476     FALSE 0.172 97.000 0.037 NA   NA
 10158941 10158942 HVO_0476 HVO_0477   ampS1 FALSE 0.290 139.000 0.093 NA   NA
 10158944 10158945 HVO_0479 HVO_0480   pgk FALSE 0.006 416.000 0.000 NA   NA
 10158945 10158946 HVO_0480 HVO_0481 pgk gap TRUE 0.822 76.000 0.035 0.003 Y NA
 10158948 10158949 HVO_0483 HVO_0484 rimK2 rpl10R TRUE 0.646 86.000 0.028 1.000 Y NA
 10158952 10158953 HVO_0487 HVO_0488     FALSE 0.090 129.000 0.000 NA   NA
 10158953 10158954 HVO_0488 HVO_0489     FALSE 0.118 71.000 0.000 NA   NA
 10158954 10158955 HVO_0489 HVO_0490     FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 10158955 10158956 HVO_0490 HVO_0491     FALSE 0.457 118.000 0.375 NA   NA
 10158956 10158957 HVO_0491 HVO_0492   boa1 TRUE 0.588 103.000 0.625 1.000   NA
 10158957 10158958 HVO_0492 HVO_0493 boa1   TRUE 0.627 115.000 0.400 0.073   NA
 10158958 10158959 HVO_0493 HVO_0494     FALSE 0.076 118.000 0.000 NA   NA
 10158960 10158961 HVO_3022 HVO_0496     FALSE 0.139 50.000 0.000 NA   NA
 10158961 10158962 HVO_0496 HVO_0497   cspD1 FALSE 0.062 170.000 0.000 NA   NA
 10158962 10158963 HVO_0497 HVO_0498 cspD1 cspD2 TRUE 0.622 160.000 0.000 0.062 Y NA
 10158963 10158964 HVO_0498 HVO_3023 cspD2   FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 10158964 10158965 HVO_3023 HVO_0500     FALSE 0.111 62.000 0.000 NA   NA
 10158965 10158966 HVO_0500 HVO_0501     FALSE 0.152 46.000 0.000 NA   NA
 10158969 10158970 HVO_0504 HVO_0505     FALSE 0.279 41.000 0.007 NA   NA
 10158970 10158971 HVO_0505 HVO_0506     FALSE 0.382 105.000 0.308 NA   NA
 10158971 10158972 HVO_0506 HVO_0507     TRUE 0.567 44.000 0.154 1.000   NA
 10158973 10158974 HVO_0508 HVO_0509     FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10158974 10158975 HVO_0509 HVO_0510     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158980 10158981 HVO_0515 HVO_0516     FALSE 0.068 165.000 0.000 NA   NA
 10158982 10158983 HVO_0518 HVO_0519   rpa2 FALSE 0.045 189.000 0.000 NA   NA
 10158983 10158984 HVO_0519 HVO_0520 rpa2 hstA FALSE 0.175 193.000 0.093 1.000 N NA
 10158984 10158985 HVO_0520 HVO_0522 hstA hdal TRUE 0.997 0.000 0.600 NA Y NA
 10158987 10158988 HVO_3025 HVO_3026     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10158988 10158989 HVO_3026 HVO_0525     FALSE 0.060 172.000 0.000 NA   NA
 10158989 10158990 HVO_0525 HVO_0526     FALSE 0.016 270.000 0.000 NA   NA
 10158991 10158992 HVO_0527 HVO_0528     FALSE 0.007 377.000 0.000 NA   NA
 10158993 10158994 HVO_0530 HVO_0531 tsgA1 tsgB1 TRUE 0.989 11.000 0.800 0.058 Y NA
 10158994 10158995 HVO_0531 HVO_0532 tsgB1 tsgC1 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.058 Y NA
 10158995 10158996 HVO_0532 HVO_0534 tsgC1 tsgD1 TRUE 0.909 121.000 0.833 0.058 Y NA
 10158999 10159000 HVO_0537 HVO_0538   idr FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10159000 10159001 HVO_0538 HVO_0539 idr   TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159001 10159002 HVO_0539 HVO_0540     FALSE 0.039 198.000 0.000 NA   NA
 10159002 10159003 HVO_0540 HVO_0541   acnA FALSE 0.074 159.000 0.000 NA   NA
 10159003 10159004 HVO_0541 HVO_0542 acnA   FALSE 0.092 131.000 0.000 NA   NA
 10159004 10159005 HVO_0542 HVO_0543     FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 10159006 10159007 HVO_0544 HVO_0545     FALSE 0.010 320.000 0.000 NA   NA
 10159007 10159008 HVO_0545 HVO_0546     FALSE 0.074 111.000 0.000 NA   NA
 10159009 10159010 HVO_0547 HVO_0548   nhaC1 FALSE 0.440 128.000 0.286 NA   NA
 10159010 10159011 HVO_0548 HVO_0549 nhaC1 kdgK FALSE 0.137 137.000 0.000 1.000 N NA
 10159011 10159012 HVO_0549 HVO_0550 kdgK   FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10159012 10159013 HVO_0550 HVO_0551   mutLb FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10159013 10159014 HVO_0551 HVO_0552 mutLb mutS1b TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.002 Y NA
 10159015 10159016 HVO_0553 HVO_0554 basB basT TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA N NA
 10159016 10159017 HVO_0554 HVO_0555 basT htr15a FALSE 0.482 207.000 0.000 0.006 Y NA
 10159017 10159018 HVO_0555 HVO_0556 htr15a   FALSE 0.012 297.000 0.000 NA   NA
 10159021 10159022 HVO_0560 HVO_0561   rpl15R FALSE 0.070 107.000 0.000 NA   NA
 10159022 10159023 HVO_0561 HVO_0562 rpl15R malG FALSE 0.036 229.000 0.000 1.000 N NA
 10159023 10159024 HVO_0562 HVO_0563 malG malF TRUE 0.998 -3.000 0.355 0.058 Y NA
 10159024 10159025 HVO_0563 HVO_0564 malF malE TRUE 0.994 6.000 0.885 0.058 Y NA
 10159028 10159029 HVO_0567 HVO_0568     TRUE 0.935 6.000 0.429 NA N NA
 10159030 10159031 HVO_0569 HVO_0570 rio2 kinA2 FALSE 0.055 536.000 0.000 1.000 Y NA
 10159031 10159032 HVO_0570 HVO_0571 kinA2   FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10159033 10159034 HVO_0572 HVO_0573 lpl apn1 FALSE 0.261 55.000 0.008 1.000 N NA
 10159034 10159035 HVO_0573 HVO_0574 apn1   FALSE 0.258 82.000 0.010 1.000   NA
 10159042 10159043 HVO_0581 HVO_0582 ftsZ2   TRUE 0.944 3.000 0.089 1.000   NA
 10159043 10159044 HVO_0582 HVO_0583     FALSE 0.132 213.000 0.000 0.061   NA
 10159045 10159046 HVO_3027 HVO_0585     FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 10159046 10159047 HVO_0585 HVO_0586     FALSE 0.209 66.000 0.000 1.000   NA
 10159047 10159048 HVO_0586 HVO_0587   cobD TRUE 0.956 -9.000 0.076 1.000   NA
 10159048 10159049 HVO_0587 HVO_0588 cobD cobS TRUE 0.993 -9.000 0.046 0.014 Y NA
 10159049 10159050 HVO_0588 HVO_0589 cobS cobY TRUE 0.990 0.000 0.025 NA Y NA
 10159050 10159051 HVO_0589 HVO_0590 cobY   TRUE 0.985 -9.000 0.046 NA Y NA
 10159051 10159052 HVO_0590 HVO_0591   cobD1 TRUE 0.965 -10.000 0.015 0.014 N NA
 10159052 10159053 HVO_0591 HVO_0592 cobD1   TRUE 0.950 -7.000 0.033 1.000   NA
 10159053 10159054 HVO_0592 HVO_0593   cobD2 FALSE 0.315 100.000 0.136 1.000   NA
 10159056 10159057 HVO_0595 HVO_0596 minD2   TRUE 0.995 -3.000 0.875 NA   NA
 10159057 10159058 HVO_0596 HVO_0597     FALSE 0.111 65.000 0.000 NA   NA
 10159058 10159059 HVO_0597 HVO_0598     FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 10159061 10159062 HVO_0600 HVO_0601   hom2 TRUE 0.998 -3.000 0.615 NA Y NA
 10159063 10159064 HVO_0602 HVO_0603   aroD FALSE 0.125 542.000 0.013 0.001 Y NA
 10159066 10159067 HVO_0605 HVO_0606 arcR1 menG FALSE 0.015 222.000 0.000 NA N NA
 10159067 10159068 HVO_0606 HVO_0607 menG   FALSE 0.035 205.000 0.000 NA   NA
 10159071 10159072 HVO_0610 HVO_0611     TRUE 0.987 0.000 0.444 NA   NA
 10159072 10159073 HVO_0611 HVO_0612   uspA4 FALSE 0.004 536.000 0.000 NA   NA
 10159073 10159074 HVO_0612 HVO_0613 uspA4   FALSE 0.176 135.000 0.000 1.000   NA
 10159075 10159076 HVO_0614 HVO_0615     TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 10159076 10159077 HVO_0615 HVO_0616     TRUE 0.991 -7.000 0.857 NA   NA
 10159077 10159078 HVO_0616 HVO_0617     TRUE 0.992 -7.000 1.000 NA   NA
 10159078 10159079 HVO_0617 HVO_0618     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10159079 10159080 HVO_0618 HVO_0619   pilC1 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159080 10159081 HVO_0619 HVO_0620 pilC1 pilB1 TRUE 0.994 -3.000 0.167 NA Y NA
 10159081 10159082 HVO_0620 HVO_0621 pilB1   FALSE 0.040 222.000 0.000 1.000 N NA
 10159082 10159083 HVO_0621 HVO_0622     FALSE 0.071 205.000 0.000 1.000   NA
 10159084 10159085 HVO_0623 HVO_0624     FALSE 0.068 98.000 0.000 NA   NA
 10159086 10159087 HVO_0625 HVO_0626     FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10159088 10159089 HVO_0627 HVO_0628 dppDF2 dppA2 TRUE 0.560 148.000 0.000 1.000 Y NA
 10159089 10159090 HVO_0628 HVO_0629 dppA2 dppB2 TRUE 0.973 26.000 0.636 0.058 Y NA
 10159090 10159091 HVO_0629 HVO_0630 dppB2 dppC2 TRUE 0.998 -3.000 0.583 0.058 Y NA
 10159091 10159092 HVO_0630 HVO_0631 dppC2   TRUE 0.941 7.000 0.500 NA   NA
 10159093 10159094 HVO_0632 HVO_0633 fixL cirC TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10159094 10159095 HVO_0633 HVO_0634 cirC orc2 FALSE 0.309 153.000 0.000 0.015 N NA
 10159096 10159097 HVO_0635 HVO_0636     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159097 10159098 HVO_0636 HVO_0637     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159098 10159099 HVO_0637 HVO_0638     TRUE 0.981 -12.000 0.500 NA   NA
 10159103 10159104 HVO_0642 HVO_0643     FALSE 0.092 138.000 0.000 NA   NA
 10159105 10159106 HVO_0644 HVO_0645 leuA1   FALSE 0.096 208.000 0.046 NA   NA
 10159107 10159108 HVO_0646 HVO_0647   guaAa FALSE 0.066 101.000 0.000 NA   NA
 10159108 10159109 HVO_0647 HVO_0648 guaAa   FALSE 0.091 177.000 0.006 NA   NA
 10159110 10159111 HVO_0649 HVO_0650     FALSE 0.051 181.000 0.000 NA   NA
 10159111 10159112 HVO_0650 HVO_0651     TRUE 0.928 1.000 0.026 NA   NA
 10159112 10159113 HVO_0651 HVO_0652   pcc FALSE 0.162 44.000 0.000 NA   NA
 10159113 10159114 HVO_0652 HVO_0653 pcc rpoP TRUE 0.944 2.000 0.088 NA   NA
 10159114 10159115 HVO_0653 HVO_0654 rpoP rpl37aR TRUE 0.677 35.000 0.234 1.000 N NA
 10159119 10159120 HVO_0658 HVO_0659     TRUE 0.972 0.000 0.078 1.000   NA
 10159121 10159122 HVO_0660 HVO_0661   dcd FALSE 0.153 130.000 0.007 NA   NA
 10159122 10159123 HVO_0661 HVO_0662 dcd   TRUE 0.967 -3.000 0.022 1.000   NA
 10159123 10159124 HVO_0662 HVO_0663     TRUE 0.603 13.000 0.000 1.000   NA
 10159124 10159125 HVO_0663 HVO_0664     FALSE 0.114 67.000 0.000 NA   NA
 10159128 10159129 HVO_0667 HVO_0668   oadhB3 TRUE 0.974 1.000 0.031 0.081   NA
 10159129 10159130 HVO_0668 HVO_0669 oadhB3 oadhA3 TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 10159131 10159132 HVO_0670 HVO_0671     FALSE 0.291 97.000 0.080 1.000   NA
 10159133 10159134 HVO_0672 HVO_0673     FALSE 0.111 62.000 0.000 NA   NA
 10159134 10159135 HVO_0673 HVO_0674     FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10159135 10159136 HVO_0674 HVO_0675     TRUE 0.548 56.000 0.320 NA   NA
 10159136 10159137 HVO_0675 HVO_0676     FALSE 0.126 55.000 0.000 NA   NA
 10159137 10159138 HVO_0676 HVO_0677   aspS FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 10159139 10159140 HVO_0678 HVO_0679     FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10159146 10159147 HVO_0685 HVO_0686     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10159147 10159148 HVO_0686 HVO_0687   amiB FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10159148 10159149 HVO_0687 HVO_0688 amiB   FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10159149 10159150 HVO_0688 HVO_0689   smc FALSE 0.184 84.000 0.018 NA   NA
 10159150 10159151 HVO_0689 HVO_0690 smc   TRUE 0.939 -7.000 0.056 NA   NA
 10159151 10159152 HVO_0690 HVO_0691     FALSE 0.319 33.000 0.003 NA   NA
 10159153 10159154 HVO_0692 HVO_0693 mtaP   FALSE 0.346 46.000 0.005 1.000   NA
 10159154 10159155 HVO_0693 HVO_0694   gptA FALSE 0.252 163.000 0.046 1.000   NA
 10159156 10159157 HVO_0695 HVO_0696     FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 10159158 10159159 HVO_0697 HVO_0698     TRUE 0.549 55.000 0.305 NA   NA
 10159159 10159160 HVO_0698 HVO_0699   tif2a TRUE 0.986 5.000 0.519 NA Y NA
 10159160 10159161 HVO_0699 HVO_0700 tif2a rps27R TRUE 0.976 19.000 0.386 0.025 Y NA
 10159161 10159162 HVO_0700 HVO_0701 rps27R rpl36aR TRUE 0.994 4.000 0.436 0.018 Y NA
 10159165 10159166 HVO_0704 HVO_0705 dgs   TRUE 0.975 -7.000 0.300 NA   NA
 10159166 10159167 HVO_0705 HVO_3029     FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 10159167 10159168 HVO_3029 HVO_0707     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 10159169 10159170 HVO_0708 HVO_0709 pabC pabA TRUE 0.994 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 10159170 10159171 HVO_0709 HVO_0710 pabA pabB TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 10159171 10159172 HVO_0710 HVO_0711 pabB   FALSE 0.146 115.000 0.000 1.000   NA
 10159172 10159173 HVO_0711 HVO_0712   aroE2 FALSE 0.286 44.000 0.000 1.000   NA
 10159173 10159174 HVO_0712 HVO_0713 aroE2 aroE1 TRUE 0.964 -27.000 0.000 0.001   NA
 10159175 10159176 HVO_0714 HVO_0715 nce1   TRUE 0.602 134.000 0.022 NA Y NA
 10159176 10159177 HVO_0715 HVO_0716     FALSE 0.301 58.000 0.053 NA   NA
 10159177 10159178 HVO_0716 HVO_0717   ftsZ1 FALSE 0.361 158.000 0.245 NA   NA
 10159178 10159179 HVO_0717 HVO_0718 ftsZ1 sec61c FALSE 0.321 181.000 0.272 1.000 N NA
 10159179 10159180 HVO_0718 HVO_0719 sec61c nusG TRUE 0.985 2.000 0.506 1.000 N NA
 10159183 10159184 HVO_0722 HVO_0723   cinA FALSE 0.470 71.000 0.229 NA   NA
 10159186 10159187 HVO_0725 HVO_0726   endV FALSE 0.263 88.000 0.026 1.000   NA
 10159187 10159188 HVO_0726 HVO_0727 endV   TRUE 0.949 2.000 0.045 1.000   NA
 10159188 10159189 HVO_0727 HVO_0728     FALSE 0.038 200.000 0.000 NA   NA
 10159189 10159190 HVO_0728 HVO_0729   ppa FALSE 0.037 202.000 0.000 NA   NA
 10159192 10159193 HVO_0731 HVO_0732     TRUE 0.964 -7.000 0.182 NA   NA
 10159194 10159195 HVO_0733 HVO_0734 tfb4   FALSE 0.226 85.000 0.043 NA   NA
 10159195 10159196 HVO_0734 HVO_0735     FALSE 0.205 36.000 0.000 NA   NA
 10159197 10159198 HVO_0736 HVO_0737     FALSE 0.478 80.000 0.278 NA   NA
 10159198 10159199 HVO_0737 HVO_0738     TRUE 0.959 3.000 0.278 NA   NA
 10159201 10159202 HVO_0740 HVO_0741   polX TRUE 0.958 -3.000 0.041 NA   NA
 10159202 10159203 HVO_0741 HVO_0742 polX   TRUE 0.959 -3.000 0.044 NA   NA
 10159205 10159206 HVO_0744 HVO_0745   ftsZ3 FALSE 0.070 206.000 0.000 1.000   NA
 10159207 10159208 HVO_0746 HVO_0747     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159208 10159209 HVO_0747 HVO_0748   pilB2 FALSE 0.222 33.000 0.000 NA   NA
 10159209 10159210 HVO_0748 HVO_0749 pilB2 pilC2 TRUE 0.992 -6.000 0.842 NA   NA
 10159210 10159211 HVO_0749 HVO_0750 pilC2   TRUE 0.602 55.000 0.389 NA   NA
 10159211 10159212 HVO_0750 HVO_0751     TRUE 0.970 -22.000 0.333 NA   NA
 10159212 10159213 HVO_0751 HVO_0752     TRUE 0.988 -3.000 0.375 NA   NA
 10159213 10159214 HVO_0752 HVO_0753     TRUE 0.994 -3.000 0.778 NA   NA
 10159214 10159215 HVO_0753 HVO_0754     TRUE 0.656 59.000 0.538 NA   NA
 10159215 10159216 HVO_0754 HVO_0755     TRUE 0.947 -3.000 0.020 NA   NA
 10159216 10159217 HVO_0755 HVO_0756     FALSE 0.193 102.000 0.015 1.000   NA
 10159217 10159218 HVO_0756 HVO_0757     FALSE 0.334 92.000 0.103 1.000   NA
 10159220 10159221 HVO_0759 HVO_0760   wcaA FALSE 0.218 83.000 0.032 NA   NA
 10159221 10159222 HVO_0760 HVO_0761 wcaA   TRUE 0.947 -3.000 0.019 NA   NA
 10159222 10159223 HVO_0761 HVO_0762     TRUE 0.505 30.000 0.049 NA   NA
 10159225 10159226 HVO_0764 HVO_0765   soxB1 FALSE 0.082 283.000 0.217 NA   NA
 10159227 10159228 HVO_0766 HVO_0767 hsp20D   TRUE 0.976 -3.000 0.154 NA   NA
 10159230 10159231 HVO_0769 HVO_0770     FALSE 0.424 65.000 0.190 NA   NA
 10159231 10159232 HVO_0770 HVO_0771     FALSE 0.308 97.000 0.190 NA   NA
 10159232 10159233 HVO_0771 HVO_0772     FALSE 0.472 115.000 0.400 NA   NA
 10159234 10159235 HVO_0773 HVO_0774 pnm   FALSE 0.341 71.000 0.127 NA N NA
 10159237 10159238 HVO_0776 HVO_0777     FALSE 0.126 55.000 0.000 NA   NA
 10159238 10159239 HVO_0777 HVO_0778   cct3 FALSE 0.070 163.000 0.000 NA   NA
 10159239 10159240 HVO_0778 HVO_0779 cct3   FALSE 0.069 188.000 0.000 1.000 N NA
 10159241 10159242 HVO_0780 HVO_0781     TRUE 0.920 0.000 0.007 NA   NA
 10159242 10159243 HVO_0781 HVO_0782     TRUE 0.944 2.000 0.088 NA   NA
 10159244 10159245 HVO_0783 HVO_0784     TRUE 0.850 7.000 0.147 NA   NA
 10159245 10159246 HVO_0784 HVO_0785     FALSE 0.066 103.000 0.000 NA   NA
 10159248 10159249 HVO_0787 HVO_0788 trpC trpB TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10159249 10159250 HVO_0788 HVO_0789 trpB trpA TRUE 0.996 0.000 0.026 0.001 Y NA
 10159250 10159251 HVO_0789 HVO_0790 trpA   TRUE 0.578 25.000 0.024 1.000 N NA
 10159251 10159252 HVO_0790 HVO_0791   ogt FALSE 0.116 93.000 0.000 1.000 N NA
 10159252 10159253 HVO_0791 HVO_0792 ogt   FALSE 0.004 751.000 0.000 1.000 N NA
 10159254 10159255 HVO_0793 HVO_0794   zim FALSE 0.076 116.000 0.000 NA   NA
 10159255 10159256 HVO_0794 HVO_0795 zim tfb6 FALSE 0.162 64.000 0.000 1.000 N NA
 10159257 10159258 HVO_0796 HVO_0797     TRUE 0.542 21.000 0.017 NA   NA
 10159261 10159262 HVO_0800 HVO_0801     TRUE 0.525 83.000 0.385 NA   NA
 10159262 10159263 HVO_0801 HVO_0802     TRUE 0.567 140.000 0.006 NA Y NA
 10159263 10159264 HVO_0802 HVO_0803     FALSE 0.167 80.000 0.004 NA   NA
 10159264 10159265 HVO_0803 HVO_0804     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159265 10159266 HVO_0804 HVO_0805     FALSE 0.016 266.000 0.000 NA   NA
 10159266 10159267 HVO_0805 HVO_0806   pyk FALSE 0.481 45.000 0.154 NA   NA
 10159267 10159268 HVO_0806 HVO_0807 pyk   FALSE 0.076 115.000 0.000 NA   NA
 10159268 10159269 HVO_0807 HVO_0808     FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 10159269 10159270 HVO_0808 HVO_0809   metS FALSE 0.092 131.000 0.000 NA   NA
 10159270 10159271 HVO_0809 HVO_0810 metS   FALSE 0.013 291.000 0.000 NA   NA
 10159271 10159272 HVO_0810 HVO_0811   mfnA FALSE 0.296 49.000 0.029 NA   NA
 10159272 10159273 HVO_0811 HVO_0812 mfnA ppsA FALSE 0.387 130.000 0.167 1.000 N NA
 10159273 10159274 HVO_0812 HVO_0813 ppsA   FALSE 0.076 118.000 0.000 NA   NA
 10159279 10159280 HVO_0818 HVO_0819 thrC2 sirR FALSE 0.205 87.000 0.014 1.000 N NA
 10159280 10159281 HVO_0819 HVO_0820 sirR   TRUE 0.990 -3.000 0.375 1.000   NA
 10159281 10159282 HVO_0820 HVO_0821     FALSE 0.443 87.000 0.061 0.093   NA
 10159282 10159283 HVO_0821 HVO_0822     FALSE 0.233 136.000 0.021 1.000 N NA
 10159283 10159284 HVO_0822 HVO_0823     FALSE 0.032 270.000 0.014 NA   NA
 10159284 10159285 HVO_0823 HVO_0824   rfbU FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10159286 10159287 HVO_0825 HVO_0826 hcpA   FALSE 0.100 166.000 0.000 1.000 N NA
 10159288 10159289 HVO_0827 HVO_0828     FALSE 0.408 14.000 0.000 NA   NA
 10159289 10159290 HVO_0828 HVO_0829     FALSE 0.186 40.000 0.000 NA   NA
 10159290 10159291 HVO_0829 HVO_0830     FALSE 0.173 58.000 0.000 1.000 N NA
 10159291 10159292 HVO_0830 HVO_0831   argK TRUE 0.958 -3.000 0.019 1.000 N NA
 10159292 10159293 HVO_0831 HVO_0832 argK   FALSE 0.242 88.000 0.062 NA   NA
 10159293 10159294 HVO_0832 HVO_0833     FALSE 0.230 32.000 0.000 NA   NA
 10159295 10159296 HVO_0834 HVO_0835   acaB1 TRUE 0.992 -3.000 0.583 NA   NA
 10159297 10159298 HVO_0836 HVO_0837     FALSE 0.339 144.000 0.079 1.000   NA
 10159299 10159300 HVO_0838 HVO_0839     FALSE 0.483 138.000 0.333 NA   NA
 10159300 10159301 HVO_0839 HVO_0840     TRUE 0.991 -7.000 0.889 NA   NA
 10159301 10159302 HVO_0840 HVO_0841   petD TRUE 0.511 40.000 0.127 NA   NA
 10159302 10159303 HVO_0841 HVO_0842 petD petB TRUE 0.905 11.000 0.145 0.043   NA
 10159303 10159304 HVO_0842 HVO_0843 petB   TRUE 0.962 4.000 0.444 NA   NA
 10159304 10159305 HVO_0843 HVO_0844   hcpB TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10159305 10159306 HVO_0844 HVO_0845 hcpB   FALSE 0.089 86.000 0.000 NA   NA
 10159307 10159308 HVO_0846 HVO_0847     FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 10159314 10159315 HVO_0853 HVO_0854 mre11 rad50 TRUE 0.997 -3.000 0.157 0.002 Y NA
 10159316 10159317 HVO_0855 HVO_0856     TRUE 0.721 28.000 0.250 NA   NA
 10159317 10159318 HVO_0856 HVO_0857     TRUE 0.644 49.000 0.400 NA   NA
 10159319 10159320 HVO_0858 HVO_0859 polB1 sufC FALSE 0.064 219.000 0.007 1.000 N NA
 10159320 10159321 HVO_0859 HVO_0860 sufC sufB TRUE 0.973 13.000 0.466 1.000 Y NA
 10159321 10159322 HVO_0860 HVO_0861 sufB sufD TRUE 0.986 4.000 0.018 0.002 Y NA
 10159322 10159323 HVO_0861 HVO_0862 sufD   FALSE 0.288 144.000 0.041 1.000   NA
 10159323 10159324 HVO_0862 HVO_0863   troR TRUE 0.975 5.000 0.733 1.000   NA
 10159326 10702418 HVO_0864A HVO_t3070     FALSE 0.199 37.000 0.000 NA   NA
 10702418 10159327 HVO_t3070 HVO_0865     FALSE 0.067 104.000 0.000 NA   NA
 10159330 10159331 HVO_0868 HVO_0869     FALSE 0.176 109.000 0.015 1.000 N NA
 10159331 10159332 HVO_0869 HVO_0870   proS FALSE 0.168 158.000 0.009 1.000 N NA
 10159333 10159334 HVO_0871 HVO_0872     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159336 10159337 HVO_0874 HVO_0875 epf1   FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 10159337 10159338 HVO_0875 HVO_0876   mgsA FALSE 0.110 64.000 0.000 NA   NA
 10159338 10159339 HVO_0876 HVO_0877 mgsA   FALSE 0.120 164.000 0.009 NA   NA
 10159340 10159341 HVO_0878 HVO_0879 nthB   FALSE 0.316 70.000 0.065 NA   NA
 10159342 10159343 HVO_0880 HVO_0881   sppA FALSE 0.204 91.000 0.004 1.000   NA
 10159343 10159344 HVO_0881 HVO_0882 sppA   FALSE 0.271 44.000 0.011 NA   NA
 10159345 10159346 HVO_0883 HVO_0884     FALSE 0.344 89.000 0.182 NA   NA
 10159347 10159348 HVO_0885 HVO_0886     FALSE 0.332 23.000 0.000 NA   NA
 10159349 10159350 HVO_0887 HVO_0888 korB korA TRUE 0.997 -3.000 0.138 0.002 Y NA
 10159352 10159353 HVO_0890 HVO_0891 nosY nosF TRUE 0.958 -3.000 0.041 NA   NA
 10159353 10159354 HVO_0891 HVO_0892 nosF nosD TRUE 0.925 -7.000 0.055 NA N NA
 10159355 10159356 HVO_0893 HVO_0894 mcmA1 acs1 TRUE 0.567 187.000 0.026 0.078 Y NA
 10159359 10159360 HVO_0897 HVO_0898     FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10159361 10159362 HVO_0899 HVO_0900 livJ1 livH1 TRUE 0.586 124.000 0.033 NA Y NA
 10159362 10159363 HVO_0900 HVO_0901 livH1 livM1 TRUE 0.996 -3.000 0.049 0.055 Y NA
 10159363 10159364 HVO_0901 HVO_0902 livM1 livG1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 10159364 10159365 HVO_0902 HVO_0903 livG1 livF1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.031 Y NA
 10159365 10159366 HVO_0903 HVO_0905 livF1   TRUE 0.985 3.000 0.667 1.000   NA
 10159367 10159368 HVO_0904 HVO_0906 uspA5   TRUE 0.625 55.000 0.429 NA   NA
 10159368 10159369 HVO_0906 HVO_0907   coxA1 FALSE 0.006 414.000 0.000 NA   NA
 10159369 10159370 HVO_0907 HVO_0908 coxA1   FALSE 0.431 63.000 0.200 NA   NA
 10159370 10159371 HVO_0908 HVO_0909     TRUE 0.489 103.000 0.500 NA   NA
 10159371 10159372 HVO_0909 HVO_0910     TRUE 0.507 46.000 0.182 NA   NA
 10159373 10159374 HVO_0911 HVO_0912 gbp1   TRUE 0.963 -3.000 0.058 NA   NA
 10159376 10159377 HVO_0914 HVO_0915   cyo FALSE 0.208 155.000 0.050 NA   NA
 10159379 10159380 HVO_0917 HVO_0918     FALSE 0.086 88.000 0.000 NA   NA
 10159380 10159381 HVO_0918 HVO_0919     FALSE 0.066 103.000 0.000 NA   NA
 10159381 10159382 HVO_0919 HVO_0920     FALSE 0.081 91.000 0.000 NA   NA
 10159384 10159385 HVO_0922 HVO_0924     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10159385 10159386 HVO_0924 HVO_0925     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 10159389 10159390 HVO_3030 HVO_0929   trmM FALSE 0.078 93.000 0.000 NA   NA
 10159390 10159391 HVO_0929 HVO_0930 trmM   FALSE 0.009 341.000 0.000 NA   NA
 10159396 10159397 HVO_0935 HVO_0936 fdhA   TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10159398 10159399 HVO_0937 HVO_0938   uspA8 FALSE 0.218 74.000 0.000 1.000   NA
 10159399 10159400 HVO_0938 HVO_0939 uspA8   FALSE 0.238 31.000 0.000 NA   NA
 10159400 10159401 HVO_0939 HVO_0940   cpx TRUE 0.508 67.000 0.286 NA   NA
 10159401 10159402 HVO_0940 HVO_0941 cpx   TRUE 0.964 -3.000 0.014 1.000   NA
 10159402 10159403 HVO_0941 HVO_0942   cbaE TRUE 0.884 2.000 0.007 NA   NA
 10159404 10159405 HVO_0943 HVO_0944 cbaD cbaB TRUE 0.990 1.000 0.667 NA   NA
 10159405 10159406 HVO_0944 HVO_0945 cbaB cbaA TRUE 0.994 0.000 0.000 0.003 Y NA
 10159406 10159407 HVO_0945 HVO_0946 cbaA cbaC TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10159407 10159408 HVO_0946 HVO_0947 cbaC   FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 10159408 10159409 HVO_0947 HVO_0948   uspA9 FALSE 0.093 135.000 0.000 NA   NA
 10159412 10159413 HVO_0951 HVO_0952     FALSE 0.045 189.000 0.000 NA   NA
 10159413 10159414 HVO_0952 HVO_0953     FALSE 0.332 23.000 0.000 NA   NA
 10159414 10159415 HVO_0953 HVO_0954     TRUE 0.992 -3.000 0.625 NA   NA
 10159415 10159416 HVO_0954 HVO_0955     TRUE 0.593 51.000 0.333 NA   NA
 10159416 10159417 HVO_0955 HVO_0956     TRUE 0.982 -9.000 0.500 NA   NA
 10159417 10159418 HVO_0956 HVO_0957     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 10159418 10159419 HVO_0957 HVO_0958     TRUE 0.575 107.000 0.667 NA   NA
 10159419 10159420 HVO_0958 HVO_0959     FALSE 0.304 114.000 0.167 NA   NA
 10159421 10159422 HVO_0960 HVO_0961   lppD TRUE 0.899 2.000 0.000 1.000   NA
 10159422 10159423 HVO_0961 HVO_0962 lppD   FALSE 0.445 27.000 0.000 1.000   NA
 10159423 10159424 HVO_0962 HVO_0963     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 10159424 10159425 HVO_0963 HVO_0964   trxC FALSE 0.029 215.000 0.000 NA   NA
 10159425 10159426 HVO_0964 HVO_0965 trxC   FALSE 0.305 61.000 0.037 1.000 N NA
 10159426 10159427 HVO_0965 HVO_0966     FALSE 0.422 50.000 0.074 1.000 N NA
 10159430 10159431 HVO_0969 HVO_0970 htr39 rbcL FALSE 0.022 283.000 0.000 1.000 N NA
 10159431 10159432 HVO_0970 HVO_0971 rbcL hel308b FALSE 0.171 129.000 0.000 1.000   NA
 10159432 10159433 HVO_0971 HVO_0972 hel308b   FALSE 0.048 229.000 0.000 1.000   NA
 10159433 10159434 HVO_0972 HVO_0973   aspC3 FALSE 0.058 216.000 0.000 1.000   NA
 10159434 10159435 HVO_0973 HVO_0974 aspC3 ribH TRUE 0.963 -3.000 0.029 1.000 N NA
 10159436 10159437 HVO_0975 HVO_0976   purK FALSE 0.083 172.000 0.011 NA N NA
 10159437 10159438 HVO_0976 HVO_0977 purK purE TRUE 0.983 7.000 0.141 0.001 Y NA
 10159438 10159439 HVO_0977 HVO_0978 purE nuoA FALSE 0.089 200.000 0.008 1.000 N NA
 10159439 10159440 HVO_0978 HVO_0979 nuoA nuoB TRUE 0.998 -3.000 0.168 0.003 Y NA
 10159440 10159441 HVO_0979 HVO_0980 nuoB nuoCD TRUE 0.998 -3.000 0.279 0.003 Y NA
 10159441 10159442 HVO_0980 HVO_0981 nuoCD nuoH TRUE 0.998 0.000 0.600 0.007 Y NA
 10159442 10159443 HVO_0981 HVO_0982 nuoH nuoI TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.007 Y NA
 10159443 10159444 HVO_0982 HVO_0983 nuoI nuoJ1 FALSE 0.415 106.000 0.035 0.007   NA
 10159444 10159445 HVO_0983 HVO_0984 nuoJ1 nuoJ2 TRUE 0.989 -3.000 0.061 0.007   NA
 10159445 10159446 HVO_0984 HVO_0985 nuoJ2 nuoK TRUE 0.985 0.000 0.039 0.007   NA
 10159446 10159447 HVO_0985 HVO_0986 nuoK nuoL TRUE 0.992 4.000 0.253 0.007 Y NA
 10159447 10159448 HVO_0986 HVO_0987 nuoL nuoM TRUE 0.997 -3.000 0.050 0.002 Y NA
 10159448 10159449 HVO_0987 HVO_0988 nuoM nuoN TRUE 0.998 1.000 0.462 0.002 Y NA
 10159451 10159452 HVO_0990 HVO_0991     TRUE 0.616 44.000 0.209 1.000   NA
 10159453 10159454 HVO_0992 HVO_0993     FALSE 0.238 31.000 0.000 NA   NA
 10159457 10159458 HVO_0996 HVO_0997     FALSE 0.073 96.000 0.000 NA   NA
 10159458 10159459 HVO_0997 HVO_0998     FALSE 0.118 58.000 0.000 NA   NA
 10159460 10159461 HVO_0999 HVO_1000     TRUE 0.743 27.000 0.177 1.000   NA
 10159462 10159463 HVO_1001 HVO_1002     FALSE 0.032 211.000 0.000 NA   NA
 10159463 10159464 HVO_1002 HVO_1003   gufA2 FALSE 0.069 164.000 0.000 NA   NA
 10159465 10159466 HVO_1004 HVO_1005     FALSE 0.093 134.000 0.000 NA   NA
 10159466 10159467 HVO_1005 HVO_1006     TRUE 0.998 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 10159471 10159472 HVO_1010 HVO_1011     TRUE 0.583 13.000 0.011 NA   NA
 10159472 10159473 HVO_1011 HVO_1012     FALSE 0.215 67.000 0.016 NA   NA
 10159473 10159474 HVO_1012 HVO_1013   ctaB TRUE 0.828 28.000 0.500 NA   NA
 10159476 10159477 HVO_1015 HVO_1016 taqD   TRUE 0.982 -3.000 0.246 NA   NA
 10159478 10159479 HVO_1017 HVO_1018     FALSE 0.183 107.000 0.071 NA N NA
 10159480 10159481 HVO_1019 HVO_1020     FALSE 0.320 127.000 0.062 1.000   NA
 10159482 10159483 HVO_1021 HVO_1022     FALSE 0.205 64.000 0.000 1.000   NA
 10159483 10159484 HVO_1022 HVO_1023     FALSE 0.274 102.000 0.167 NA   NA
 10159485 10159486 HVO_1024 HVO_1025   acaB2 TRUE 0.990 0.000 0.556 NA   NA
 10159488 10159489 HVO_1027 HVO_1028 tatAo   FALSE 0.095 169.000 0.000 1.000 N NA
 10159489 10159490 HVO_1028 HVO_3031     FALSE 0.076 114.000 0.000 NA   NA
 10159490 10159491 HVO_3031 HVO_1030     FALSE 0.053 178.000 0.000 NA   NA
 10159491 10159492 HVO_1030 HVO_1031   trxB1 FALSE 0.094 84.000 0.000 NA   NA
 10159492 10159493 HVO_1031 HVO_1032 trxB1   FALSE 0.224 120.000 0.015 1.000   NA
 10159493 10159494 HVO_1032 HVO_1033   pilC3 FALSE 0.218 85.000 0.039 NA   NA
 10159494 10159495 HVO_1033 HVO_1034 pilC3 pilB3 TRUE 0.996 2.000 0.643 NA Y NA
 10159495 10159496 HVO_1034 HVO_1035 pilB3   TRUE 0.553 133.000 0.444 NA   NA
 10159496 10159497 HVO_1035 HVO_1036     FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10159498 10159499 HVO_1037 HVO_1038   ugd4 FALSE 0.334 130.000 0.154 NA   NA
 10159500 10159501 HVO_1039 HVO_1040     FALSE 0.291 145.000 0.044 1.000   NA
 10159502 10159503 HVO_1041 HVO_1042   rpoL TRUE 0.600 27.000 0.030 1.000   NA
 10159504 10159505 HVO_1043 HVO_1044   hisF FALSE 0.140 140.000 0.002 NA   NA
 10159506 10159507 HVO_1045 HVO_1046     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 10159507 10159508 HVO_1046 HVO_1047   qor2 FALSE 0.073 96.000 0.000 NA   NA
 10159510 10159511 HVO_1049 HVO_1050   asnA TRUE 0.973 0.000 0.086 1.000   NA
 10159512 10159513 HVO_1051 HVO_1052 nudH tfb1 FALSE 0.277 102.000 0.125 1.000 N NA
 10159514 10159515 HVO_1053 HVO_1054 aatC aatA TRUE 0.998 1.000 0.643 0.001 Y NA
 10159515 10159516 HVO_1054 HVO_1055 aatA trkA1 FALSE 0.135 130.000 0.000 1.000 N NA
 10159516 10159517 HVO_1055 HVO_1056 trkA1 trkH1 TRUE 0.998 0.000 0.429 0.008 Y NA
 10159518 10159519 HVO_1057 HVO_1058 trkH2 trkA2 TRUE 0.678 118.000 0.000 0.008 Y NA
 10159519 10159520 HVO_1058 HVO_1059 trkA2   FALSE 0.089 86.000 0.000 NA   NA
 10159521 10159522 HVO_1060 HVO_1061   trxB2 FALSE 0.104 81.000 0.000 NA   NA
 10159522 10159523 HVO_1061 HVO_1062 trxB2 coaBC FALSE 0.143 95.000 0.000 1.000   NA
 10159524 10159525 HVO_1063 HVO_1064     TRUE 0.998 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 10159525 10159526 HVO_1064 HVO_1065   mrpE TRUE 0.998 -7.000 0.769 0.029 Y NA
 10159526 10159527 HVO_1065 HVO_1066 mrpE   TRUE 0.997 0.000 0.455 1.000 Y NA
 10159527 10159528 HVO_1066 HVO_1067     TRUE 0.998 -3.000 0.455 0.007 Y NA
 10159528 10159529 HVO_1067 HVO_1068   phaA2 TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.007   NA
 10159529 10159530 HVO_1068 HVO_1069 phaA2 mrpA TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.007   NA
 10159531 10159532 HVO_1070 HVO_1071     FALSE 0.017 255.000 0.000 NA   NA
 10159532 10159533 HVO_1071 HVO_1072     FALSE 0.299 159.000 0.167 NA   NA
 10159533 10159534 HVO_1072 HVO_1073     FALSE 0.275 101.000 0.167 NA   NA
 10159534 10159535 HVO_1073 HVO_1074     FALSE 0.100 82.000 0.000 NA   NA
 10159538 10159539 HVO_1077 HVO_1078   cysD2 FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 10159539 10159540 HVO_1078 HVO_1079 cysD2 cysD1 FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 10159540 10159541 HVO_1079 HVO_1080 cysD1   FALSE 0.306 138.000 0.111 NA   NA
 10159541 10159542 HVO_1080 HVO_1081     FALSE 0.171 168.000 0.045 NA   NA
 10159542 10159543 HVO_1081 HVO_1082   pyrE1 FALSE 0.251 84.000 0.030 1.000 N NA
 10159543 10159544 HVO_1082 HVO_1083 pyrE1   TRUE 0.991 -3.000 0.455 1.000 N NA
 10159544 10159545 HVO_1083 HVO_1084   purB FALSE 0.014 330.000 0.000 1.000 N NA
 10159546 10159547 HVO_1085 HVO_1086 purH   FALSE 0.076 114.000 0.000 NA   NA
 10159547 10159548 HVO_1086 HVO_1087   uspA10 FALSE 0.152 46.000 0.000 NA   NA
 10159548 10159549 HVO_1087 HVO_1088 uspA10 folCP FALSE 0.443 126.000 0.250 1.000 N NA
 10159549 10159550 HVO_1088 HVO_1089 folCP   FALSE 0.192 67.000 0.009 NA   NA
 10159550 10159551 HVO_1089 HVO_1090   cinR TRUE 0.526 26.000 0.035 NA   NA
 10159552 10159553 HVO_1091 HVO_1092 psmA1 rnp2 TRUE 0.837 7.000 0.069 1.000 N NA
 10159553 10159554 HVO_1092 HVO_1093 rnp2   TRUE 0.870 10.000 0.172 1.000   NA
 10159554 10159555 HVO_1093 HVO_1094   rnp3 TRUE 0.971 -16.000 0.250 1.000   NA
 10159555 10159556 HVO_1094 HVO_1095 rnp3   FALSE 0.092 139.000 0.000 NA   NA
 10159556 10159557 HVO_1095 HVO_1096     FALSE 0.137 51.000 0.000 NA   NA
 10159557 10159558 HVO_1096 HVO_1097   dapF TRUE 0.992 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 10159558 10159559 HVO_1097 HVO_1098 dapF lysA TRUE 0.963 21.000 0.104 0.001 Y NA
 10159559 10159560 HVO_1098 HVO_1099 lysA dapD TRUE 0.992 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 10159560 10159561 HVO_1099 HVO_1100 dapD dapB TRUE 0.992 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 10159561 10159562 HVO_1100 HVO_1101 dapB dapA TRUE 0.994 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 10159564 10159565 HVO_1103 HVO_1104     FALSE 0.086 88.000 0.000 NA   NA
 10159567 10159568 HVO_1106 HVO_1107     FALSE 0.007 644.000 0.000 1.000   NA
 10159568 10159569 HVO_1107 HVO_1108   gar1 TRUE 0.641 49.000 0.294 1.000   NA
 10159569 10159570 HVO_1108 HVO_1109 gar1   TRUE 0.970 0.000 0.098 1.000 N NA
 10159570 10159571 HVO_1109 HVO_1110     FALSE 0.245 97.000 0.066 1.000 N NA
 10159572 10159573 HVO_1111 HVO_1112     TRUE 0.966 -3.000 0.041 1.000 N NA
 10159573 10159574 HVO_1112 HVO_1113   ftsZ5 FALSE 0.135 85.000 0.000 1.000 N NA
 10159574 10159575 HVO_1113 HVO_1114 ftsZ5   FALSE 0.087 87.000 0.000 NA   NA
 10159576 10159577 HVO_1115 HVO_1116     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10159578 10159579 HVO_1117 HVO_1118 boa2   FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10159581 10159582 HVO_1120 HVO_1121   pqqE1 TRUE 0.975 -3.000 0.151 NA   NA
 10159582 10159583 HVO_1121 HVO_1122 pqqE1   FALSE 0.106 80.000 0.000 NA   NA
 10159586 10159587 HVO_1125 HVO_1126 cysS hemAT2 FALSE 0.113 117.000 0.000 1.000 N NA
 10159587 10159588 HVO_1126 HVO_1127 hemAT2   FALSE 0.114 67.000 0.000 NA   NA
 10159589 10159590 HVO_1128 HVO_1129     TRUE 0.983 0.000 0.320 NA   NA
 10159591 10159592 HVO_1130 HVO_1131     FALSE 0.218 56.000 0.013 NA   NA
 10159592 10159593 HVO_1131 HVO_1132   purA FALSE 0.130 109.000 0.011 NA   NA
 10159599 10159600 HVO_1138 HVO_1139 coxC fdfT FALSE 0.149 221.000 0.167 1.000 N NA
 10159606 10159607 HVO_1145 HVO_1146 rps3aR   TRUE 0.940 -7.000 0.059 NA   NA
 10159607 10159608 HVO_1146 HVO_1147     TRUE 0.994 -3.000 0.769 NA   NA
 10159608 10159609 HVO_1147 HVO_1148   rps15 TRUE 0.853 5.000 0.073 NA   NA
 10159610 10159611 HVO_3032 HVO_1150     FALSE 0.004 560.000 0.000 NA   NA
 10159611 10159612 HVO_1150 HVO_1151     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10159612 10159613 HVO_1151 HVO_1153     FALSE 0.036 204.000 0.000 NA   NA
 10159614 10159615 HVO_1154 HVO_1155     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159615 10159616 HVO_1155 HVO_1156     TRUE 0.577 54.000 0.333 NA   NA
 10159616 10159617 HVO_1156 HVO_1157     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 10159617 10159618 HVO_1157 HVO_1158     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 10159618 10159619 HVO_1158 HVO_1159   pilC4 TRUE 0.985 0.000 0.364 NA   NA
 10159619 10159620 HVO_1159 HVO_1160 pilC4 pilB4 TRUE 0.996 1.000 0.636 NA Y NA
 10159620 10159621 HVO_1160 HVO_3033 pilB4   FALSE 0.022 234.000 0.000 NA   NA
 10159621 10159622 HVO_3033 HVO_1162   tatAt FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10159623 10159624 HVO_1163 HVO_1164 bcp3   FALSE 0.330 82.000 0.045 1.000   NA
 10159625 10159626 HVO_1165 HVO_1166     TRUE 0.933 -3.000 0.021 NA N NA
 10159626 10159627 HVO_1166 HVO_1167   rnp4 TRUE 0.593 112.000 0.070 NA Y NA
 10159628 10159629 HVO_1168 HVO_1169   sqdX TRUE 0.717 100.000 0.056 0.014 Y NA
 10159630 10159631 HVO_1170 HVO_1171     FALSE 0.231 61.000 0.023 NA   NA
 10159631 10159632 HVO_1171 HVO_1172   galE2 FALSE 0.164 125.000 0.015 NA   NA
 10159633 10159634 HVO_1173 HVO_1174     FALSE 0.311 85.000 0.124 NA   NA
 10159634 10159635 HVO_1174 HVO_1175     TRUE 0.960 1.000 0.131 NA   NA
 10159635 10159636 HVO_1175 HVO_1176     TRUE 0.939 5.000 0.353 NA   NA
 10159636 10159637 HVO_1176 HVO_1177     FALSE 0.182 88.000 0.023 NA   NA
 10159641 10159642 HVO_1181 HVO_1182 phoU1   FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10159643 10159644 HVO_1183 HVO_1184     FALSE 0.359 174.000 0.333 NA   NA
 10159645 10159646 HVO_1185 HVO_1186     FALSE 0.485 68.000 0.250 NA   NA
 10159646 10159647 HVO_1186 HVO_1187     TRUE 0.764 44.000 0.647 NA   NA
 10159647 10159648 HVO_1187 HVO_1188     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 10159652 10159653 HVO_1192 HVO_1193 livJ2 livH2 TRUE 0.799 53.000 1.000 NA   NA
 10159653 10159654 HVO_1193 HVO_1194 livH2 livM2 TRUE 0.988 -3.000 0.100 0.052   NA
 10159654 10159655 HVO_1194 HVO_1195 livM2 livG2 TRUE 0.995 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 10159655 10159656 HVO_1195 HVO_1196 livG2 livF2 TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.030 Y NA
 10159657 10159658 HVO_1197 HVO_1198   uspA11 FALSE 0.417 40.000 0.050 NA   NA
 10159662 10159663 HVO_1202 HVO_1203   flaD1 TRUE 0.514 103.000 0.556 NA   NA
 10159663 10159664 HVO_1203 HVO_1204 flaD1   FALSE 0.421 13.000 0.000 NA   NA
 10159664 10159665 HVO_1204 HVO_1205   cheD FALSE 0.079 92.000 0.000 NA   NA
 10159665 10159666 HVO_1205 HVO_1206 cheD cheC TRUE 0.879 22.000 0.014 NA Y NA
 10159666 10159667 HVO_1206 HVO_1207 cheC cheY TRUE 0.996 -3.000 0.286 NA Y NA
 10159667 10159668 HVO_1207 HVO_1208 cheY   FALSE 0.339 149.000 0.182 NA   NA
 10159669 10159670 HVO_1209 HVO_1210   flgA1 FALSE 0.030 214.000 0.000 NA   NA
 10159670 10159671 HVO_1210 HVO_1211 flgA1 flgA2 TRUE 0.993 11.000 1.000 0.001 Y NA
 10159673 10159674 HVO_1213 HVO_1214 flaCE flaF TRUE 0.976 -16.000 0.000 NA Y NA
 10159674 10159675 HVO_1214 HVO_1215 flaF flaG TRUE 0.995 1.000 0.409 NA Y NA
 10159675 10159676 HVO_1215 HVO_1216 flaG flaH TRUE 0.996 -3.000 0.243 1.000 Y NA
 10159676 10159677 HVO_1216 HVO_1217 flaH flaI TRUE 0.997 1.000 0.547 1.000 Y NA
 10159677 10159678 HVO_1217 HVO_1218 flaI flaJ TRUE 0.987 5.000 0.578 NA Y NA
 10159678 10159679 HVO_1218 HVO_1219 flaJ cheF2 TRUE 0.962 -3.000 0.053 NA   NA
 10159679 10159680 HVO_1219 HVO_1220 cheF2   FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10159681 10159682 HVO_1221 HVO_1222 cheF1 cheR TRUE 0.982 4.000 1.000 NA   NA
 10159682 10159683 HVO_1222 HVO_1223 cheR cheA TRUE 0.995 0.000 0.222 1.000 Y NA
 10159683 10159684 HVO_1223 HVO_1224 cheA cheB TRUE 0.998 3.000 1.000 0.006 Y NA
 10159687 10159688 HVO_1227 HVO_1228   hcpE FALSE 0.328 73.000 0.043 1.000 N NA
 10159689 10159690 HVO_1229 HVO_1230     FALSE 0.278 81.000 0.059 NA   NA
 10159691 10159692 HVO_1231 HVO_1232     FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 10159692 10159693 HVO_1232 HVO_1233   cspD3 FALSE 0.089 86.000 0.000 NA   NA
 10159694 10159695 HVO_1234 HVO_1235 phr3   FALSE 0.252 50.000 0.000 1.000   NA
 10159695 10159696 HVO_1235 HVO_1236   acs3 TRUE 0.489 70.000 0.167 1.000   NA
 10159696 10159697 HVO_1236 HVO_1237 acs3   FALSE 0.110 64.000 0.000 NA   NA
 10159699 10159700 HVO_1239 HVO_1240     FALSE 0.120 57.000 0.000 NA   NA
 10159700 10159701 HVO_1240 HVO_1241   prrC TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159703 10159704 HVO_1243 HVO_1244     TRUE 0.989 0.000 0.429 1.000   NA
 10159704 10159705 HVO_1244 HVO_1245     FALSE 0.358 148.000 0.200 NA   NA
 10159708 10159709 HVO_1248 HVO_1249     TRUE 0.666 37.000 0.286 NA   NA
 10159710 10159711 HVO_1250 HVO_1251     FALSE 0.275 82.000 0.016 1.000   NA
 10159715 10159716 HVO_1255 HVO_1256     FALSE 0.096 83.000 0.000 NA   NA
 10159716 10159717 HVO_1256 HVO_1257   moxR2 TRUE 0.964 8.000 1.000 NA   NA
 10159717 10159718 HVO_1257 HVO_1258 moxR2   TRUE 0.991 -7.000 0.800 NA   NA
 10159718 10159719 HVO_1258 HVO_1259     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10159719 10159720 HVO_1259 HVO_1260     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159720 10159721 HVO_1260 HVO_1261     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 10159723 10159724 HVO_1263 HVO_1264     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159725 10159726 HVO_1265 HVO_1266 lrp aspC2 TRUE 0.995 -3.000 0.894 1.000 N NA
 10159726 10159727 HVO_1266 HVO_1267 aspC2 uspA12 FALSE 0.104 107.000 0.000 1.000 N NA
 10159727 10159728 HVO_1267 HVO_1268 uspA12   FALSE 0.075 158.000 0.000 NA   NA
 10159728 10159729 HVO_1268 HVO_1269     FALSE 0.003 922.000 0.000 NA   NA
 10159730 10159731 HVO_1270 HVO_1271     FALSE 0.026 222.000 0.000 NA   NA
 10159731 10159732 HVO_1271 HVO_1272     FALSE 0.485 154.000 0.000 NA Y NA
 10159732 10159733 HVO_1272 HVO_1273   guaB1 FALSE 0.051 142.000 0.000 NA N NA
 10159734 10159735 HVO_1273A HVO_1274     TRUE 0.887 7.000 0.231 NA   NA
 10159735 10159736 HVO_1274 HVO_1275     FALSE 0.169 43.000 0.000 NA   NA
 10159736 10159737 HVO_1275 HVO_1276     FALSE 0.073 96.000 0.000 NA   NA
 10159737 10702419 HVO_1276 HVO_t3075     FALSE 0.118 58.000 0.000 NA   NA
 10159739 10159740 HVO_1278 HVO_1279   hdrA FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10159740 10159741 HVO_1279 HVO_1280 hdrA   FALSE 0.114 94.000 0.000 1.000 N NA
 10159742 10159743 HVO_1281 HVO_1282     TRUE 0.987 2.000 0.591 1.000 N NA
 10159743 10159744 HVO_1282 HVO_1283     TRUE 0.944 7.000 0.489 1.000 N NA
 10159744 10159745 HVO_1283 HVO_1284   gch TRUE 0.894 4.000 0.034 1.000   NA
 10159745 10159746 HVO_1284 HVO_1285 gch   FALSE 0.269 71.000 0.037 NA   NA
 10159747 10159748 HVO_1286 HVO_1287 pho   FALSE 0.200 106.000 0.016 1.000   NA
 10159748 10159749 HVO_1287 HVO_1288     FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10159750 10159751 HVO_1289 HVO_1290     FALSE 0.183 99.000 0.009 1.000   NA
 10159752 10159753 HVO_1291 HVO_1292 hpcE   TRUE 0.547 49.000 0.250 NA   NA
 10159753 10159754 HVO_1292 HVO_1293     TRUE 0.698 42.000 0.400 NA   NA
 10159754 10159755 HVO_1293 HVO_1294     TRUE 0.983 -7.000 0.444 NA   NA
 10159755 10159756 HVO_1294 HVO_1295   hisC TRUE 0.528 95.000 0.000 1.000 Y NA
 10159756 10159757 HVO_1295 HVO_1296 hisC   TRUE 0.915 -3.000 0.009 NA N NA
 10159757 10159758 HVO_1296 HVO_1297   pgsA TRUE 0.929 -3.000 0.018 NA N NA
 10159758 10159759 HVO_1297 HVO_1298 pgsA   FALSE 0.007 523.000 0.000 1.000 N NA
 10159759 10159760 HVO_1298 HVO_1299     FALSE 0.173 71.000 0.000 1.000 N NA
 10159760 10159761 HVO_1299 HVO_1300   tpiA1 FALSE 0.289 151.000 0.079 1.000 N NA
 10159762 10159763 HVO_1301 HVO_1302   polY FALSE 0.451 64.000 0.150 1.000   NA
 10159763 10159764 HVO_1302 HVO_1303 polY   FALSE 0.244 123.000 0.042 1.000 N NA
 10159764 10159765 HVO_1303 HVO_1304   porB FALSE 0.343 118.000 0.167 1.000 N NA
 10159765 10159766 HVO_1304 HVO_1305 porB porA TRUE 0.997 4.000 0.923 0.001 Y NA
 10159766 10159767 HVO_1305 HVO_1306 porA aroC FALSE 0.058 200.000 0.000 1.000 N NA
 10159771 10159772 HVO_1310 HVO_1311     FALSE 0.065 167.000 0.000 NA   NA
 10159773 10159774 HVO_1312 HVO_1313     FALSE 0.147 88.000 0.008 NA   NA
 10159774 10159775 HVO_1313 HVO_1314   surE1 FALSE 0.152 105.000 0.027 NA   NA
 10159775 10159776 HVO_1314 HVO_1316 surE1   FALSE 0.011 311.000 0.000 NA   NA
 10159779 10159780 HVO_1319 HVO_1320 osmC   FALSE 0.136 97.000 0.000 1.000   NA
 10159782 10159783 HVO_1322 HVO_1323 pheA2   TRUE 0.998 -3.000 0.214 0.002 Y NA
 10159784 10159785 HVO_1324 HVO_1325     TRUE 0.989 0.000 0.538 NA   NA
 10159787 10159788 HVO_1327 HVO_1328 cdc48c   FALSE 0.066 101.000 0.000 NA   NA
 10159789 10159790 HVO_1329 HVO_1330     FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 10159791 10159792 HVO_1331 HVO_1332     FALSE 0.079 92.000 0.000 NA   NA
 10159794 10159795 HVO_1334 HVO_1335     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159796 10159797 HVO_1336 HVO_1337 rpe rpap1 TRUE 0.843 5.000 0.064 NA   NA
 10159797 10159798 HVO_1337 HVO_1338 rpap1 rpa1 TRUE 0.972 -3.000 0.111 NA   NA
 10159801 10159802 HVO_1341 HVO_1342   trxA2 FALSE 0.297 135.000 0.059 1.000 N NA
 10159807 10159808 HVO_1347 HVO_1348 moaC   TRUE 0.932 -3.000 0.021 NA N NA
 10159809 10159810 HVO_1349 HVO_1350     TRUE 0.777 44.000 0.667 NA   NA
 10159810 10159811 HVO_1350 HVO_1351   rad3a FALSE 0.164 88.000 0.000 1.000   NA
 10159814 10159815 HVO_1354 HVO_1355 mutS5b   FALSE 0.428 84.000 0.250 NA   NA
 10159816 10159817 HVO_1356 HVO_1357     TRUE 0.865 142.000 0.333 0.011 Y NA
 10159818 10159819 HVO_1358 HVO_1359     FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10159819 10159820 HVO_1359 HVO_1360     FALSE 0.237 110.000 0.087 NA   NA
 10159820 10159821 HVO_1360 HVO_1361     FALSE 0.360 132.000 0.087 1.000   NA
 10159821 10159822 HVO_1361 HVO_1362     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159822 10159823 HVO_1362 HVO_1363     FALSE 0.005 496.000 0.000 NA   NA
 10159823 10159824 HVO_1363 HVO_1364     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159824 10159825 HVO_1364 HVO_1365     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 10159826 10159827 HVO_1366 HVO_1367     TRUE 0.976 -3.000 0.159 NA   NA
 10159828 10159829 HVO_1368 HVO_1369     FALSE 0.072 160.000 0.000 NA   NA
 10159829 10159830 HVO_1369 HVO_1370   proA FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10159830 10159831 HVO_1370 HVO_1371 proA proB TRUE 0.997 -7.000 0.281 0.001 Y NA
 10159831 10159832 HVO_1371 HVO_1372 proB proC TRUE 0.994 -7.000 0.014 0.001 Y NA
 10159832 10159833 HVO_1372 HVO_1373 proC acd4 FALSE 0.237 106.000 0.000 0.051 N NA
 10159833 10159834 HVO_1373 HVO_1374 acd4 acs4 TRUE 0.717 91.000 0.182 1.000 Y NA
 10159834 10159835 HVO_1374 HVO_1375 acs4 menE TRUE 0.578 93.000 0.005 1.000 Y NA
 10159835 10159836 HVO_1375 HVO_1376 menE gloA FALSE 0.130 100.000 0.000 1.000   NA
 10159837 10159838 HVO_1377 HVO_1378     TRUE 0.690 8.000 0.019 NA   NA
 10159839 10159840 HVO_1379 HVO_1380   mcmA2 FALSE 0.011 308.000 0.000 NA   NA
 10159841 10159842 HVO_1381 HVO_1382 mdmC   FALSE 0.163 83.000 0.008 NA   NA
 10159842 10159843 HVO_1382 HVO_1383   pimT2 TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 10159844 10159845 HVO_1384 HVO_1385   rpoM1 TRUE 0.595 41.000 0.231 NA   NA
 10159845 10159846 HVO_1385 HVO_1386 rpoM1   FALSE 0.414 94.000 0.308 NA   NA
 10159846 10159847 HVO_1386 HVO_1387   fadA1 FALSE 0.077 119.000 0.000 NA   NA
 10159849 10159850 HVO_1389 HVO_1390     FALSE 0.291 26.000 0.000 NA   NA
 10159850 10159851 HVO_1390 HVO_1391   apa FALSE 0.436 173.000 0.462 NA   NA
 10159853 10159854 HVO_1393 HVO_1394   nhaC3 TRUE 0.974 -3.000 0.136 NA   NA
 10159855 10159856 HVO_1395 HVO_1397     FALSE 0.173 130.000 0.000 1.000   NA
 10159857 10159858 HVO_1396 HVO_1398   tsgC11 FALSE 0.172 140.000 0.000 1.000   NA
 10159858 10159859 HVO_1398 HVO_1399 tsgC11 tsgB11 TRUE 0.982 -3.000 0.020 0.051   NA
 10159859 10159860 HVO_1399 HVO_1400 tsgB11 tsgD11 TRUE 0.961 -3.000 0.009 1.000   NA
 10159860 10159861 HVO_1400 HVO_1401 tsgD11 tsgA11 FALSE 0.050 224.000 0.000 1.000   NA
 10159861 10159862 HVO_1401 HVO_1402 tsgA11 pmu1 FALSE 0.241 185.000 0.130 1.000   NA
 10159863 10159864 HVO_1403 HVO_1404     FALSE 0.174 80.000 0.007 NA   NA
 10159865 10159866 HVO_1405 HVO_1406     FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 10159866 10159867 HVO_1406 HVO_1407     FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 10159868 10159869 HVO_1408 HVO_1409     FALSE 0.085 146.000 0.000 NA   NA
 10159869 10159870 HVO_1409 HVO_1410     FALSE 0.074 111.000 0.000 NA   NA
 10159872 10159873 HVO_1412 HVO_1413 dmd   FALSE 0.268 76.000 0.017 1.000 N NA
 10159873 10159874 HVO_1413 HVO_1414   kinA3 FALSE 0.100 166.000 0.000 1.000 N NA
 10159874 10159875 HVO_1414 HVO_1415 kinA3   FALSE 0.164 88.000 0.000 1.000   NA
 10159875 10159876 HVO_1415 HVO_1416     FALSE 0.079 92.000 0.000 NA   NA
 10159876 10159877 HVO_1416 HVO_1418   mc1A FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 10159879 10159880 HVO_1419 HVO_1420     FALSE 0.160 124.000 0.000 1.000   NA
 10159880 10159881 HVO_1420 HVO_1421     FALSE 0.326 118.000 0.000 0.022   NA
 10159883 10159884 HVO_1423 HVO_1424 phrH2   FALSE 0.080 151.000 0.000 NA   NA
 10159885 10159886 HVO_1425 HVO_1426     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 10159886 10159887 HVO_1426 HVO_1427     FALSE 0.081 122.000 0.000 NA   NA
 10159887 10159888 HVO_1427 HVO_1428     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159888 10159889 HVO_1428 HVO_1429     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10159889 10159890 HVO_1429 HVO_1430     FALSE 0.210 35.000 0.000 NA   NA
 10159890 10159891 HVO_1430 HVO_1431     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10159891 10159892 HVO_1431 HVO_1432     FALSE 0.046 187.000 0.000 NA   NA
 10159892 10159893 HVO_1432 HVO_1433     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10159893 10159894 HVO_1433 HVO_1434     FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10159894 10159895 HVO_1434 HVO_3034     FALSE 0.003 638.000 0.000 NA   NA
 10159896 10159897 HVO_1436 HVO_1437 hhoA   FALSE 0.109 188.000 0.053 NA N NA
 10159897 10159898 HVO_1437 HVO_1438     FALSE 0.125 102.000 0.013 NA   NA
 10159899 10159900 HVO_1439 HVO_1440 cysK1   FALSE 0.116 187.000 0.036 NA   NA
 10159900 10159901 HVO_1440 HVO_1441     FALSE 0.249 96.000 0.105 NA   NA
 10159901 10159902 HVO_1441 HVO_1442     TRUE 0.992 -7.000 0.950 NA   NA
 10159902 10159903 HVO_1442 HVO_1443     TRUE 0.995 -3.000 0.864 NA   NA
 10159903 10159904 HVO_1443 HVO_1444   hbd3 FALSE 0.124 148.000 0.000 1.000 N NA
 10159905 10159906 HVO_1445 HVO_1446   fbp1 FALSE 0.026 295.000 0.000 1.000   NA
 10159906 10159907 HVO_1446 HVO_1447 fbp1   FALSE 0.344 160.000 0.182 1.000 N NA
 10159907 10159908 HVO_1447 HVO_1449     FALSE 0.318 189.000 0.364 NA   NA
 10159909 10159910 HVO_1448 HVO_1450   maoC FALSE 0.150 97.000 0.022 NA   NA
 10159911 10159912 HVO_1451 HVO_1452     FALSE 0.194 52.000 0.000 1.000 N NA
 10159912 10159913 HVO_1452 HVO_1453   gdhA FALSE 0.105 163.000 0.000 1.000 N NA
 10159913 10159914 HVO_1453 HVO_1454 gdhA pyrB FALSE 0.087 264.000 0.000 0.006 N NA
 10159914 10159915 HVO_1454 HVO_1455 pyrB pyrI TRUE 0.998 -3.000 0.197 0.001 Y NA
 10159918 10159919 HVO_1458 HVO_1459     FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 10159919 10159920 HVO_1459 HVO_1460   fadA2 FALSE 0.065 77.000 0.000 NA N NA
 10159920 10159921 HVO_1460 HVO_1461 fadA2   FALSE 0.333 66.000 0.000 0.071 N NA
 10159921 10159922 HVO_1461 HVO_1462   menA TRUE 0.967 3.000 0.037 0.002 N NA
 10159922 10159923 HVO_1462 HVO_1463 menA trxB4 FALSE 0.107 177.000 0.000 1.000   NA
 10159923 10159924 HVO_1463 HVO_1464 trxB4   TRUE 0.899 2.000 0.000 1.000   NA
 10159924 10159925 HVO_1464 HVO_1465   menB FALSE 0.127 145.000 0.000 1.000 N NA
 10159926 10159927 HVO_1466 HVO_1467     TRUE 0.990 -7.000 0.750 NA   NA
 10159928 10159929 HVO_1468 HVO_1469   menD FALSE 0.106 80.000 0.000 NA   NA
 10159929 10159930 HVO_1469 HVO_1470 menD menF TRUE 0.642 88.000 0.033 1.000 Y NA
 10159930 10159931 HVO_1470 HVO_1471 menF   FALSE 0.271 176.000 0.135 1.000   NA
 10159932 10159933 HVO_1472 HVO_1473     TRUE 0.564 59.000 0.360 NA   NA
 10159933 10159934 HVO_1473 HVO_1474     FALSE 0.339 141.000 0.160 NA   NA
 10159935 10159936 HVO_1475 HVO_1476     TRUE 0.955 0.000 0.055 NA   NA
 10159936 10159937 HVO_1476 HVO_1477   comA FALSE 0.022 236.000 0.000 NA   NA
 10159940 10159941 HVO_1480 HVO_1481   uspA13 TRUE 0.828 35.000 0.667 NA   NA
 10159941 10159942 HVO_1481 HVO_1482 uspA13   FALSE 0.106 108.000 0.000 1.000 N NA
 10159943 10159944 HVO_1483 HVO_1484   hemAT1 FALSE 0.163 65.000 0.000 1.000 N NA
 10159945 10159946 HVO_1485 HVO_1486     FALSE 0.200 101.000 0.019 1.000   NA
 10159946 10159947 HVO_1486 HVO_1487   galK TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000   NA
 10159948 10159949 HVO_1488 HVO_1489     FALSE 0.091 85.000 0.000 NA   NA
 10159953 10159954 HVO_1493 HVO_1494   fba FALSE 0.037 201.000 0.000 NA   NA
 10159954 10159955 HVO_1494 HVO_1495 fba fruA1 TRUE 0.499 166.000 0.000 1.000 Y NA
 10159955 10159956 HVO_1495 HVO_1496 fruA1 ptsI TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.003 Y NA
 10159956 10159957 HVO_1496 HVO_1497 ptsI ptsH1 TRUE 0.994 4.000 0.417 0.003 Y NA
 10159957 10159958 HVO_1497 HVO_1498 ptsH1 fruA2 TRUE 0.998 0.000 0.500 0.003 Y NA
 10159958 10159959 HVO_1498 HVO_1499 fruA2   TRUE 0.952 45.000 0.600 0.002 Y NA
 10159959 10159960 HVO_1499 HVO_1500   pfkA TRUE 0.506 106.000 0.000 1.000 Y NA
 10159960 10159961 HVO_1500 HVO_1501 pfkA glpR TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10159961 10159962 HVO_1501 HVO_1502 glpR leuB FALSE 0.055 204.000 0.000 1.000 N NA
 10159962 10159963 HVO_1502 HVO_1503 leuB leuD TRUE 0.990 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 10159963 10159964 HVO_1503 HVO_1504 leuD leuC TRUE 0.998 -3.000 0.268 0.001 Y NA
 10159964 10159965 HVO_1504 HVO_1505 leuC   TRUE 0.930 -7.000 0.040 NA   NA
 10159965 10159966 HVO_1505 HVO_1506   ilvC TRUE 0.586 12.000 0.008 NA   NA
 10159966 10159967 HVO_1506 HVO_1507 ilvC ilvN TRUE 0.996 -3.000 0.011 0.001 Y NA
 10159967 10159968 HVO_1507 HVO_1508 ilvN ilvB1 TRUE 0.997 -3.000 0.054 0.001 Y NA
 10159968 10159969 HVO_1508 HVO_1509 ilvB1   FALSE 0.088 143.000 0.000 NA   NA
 10159969 10159970 HVO_1509 HVO_1510   leuA2 FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10159970 10159971 HVO_1510 HVO_1511 leuA2   FALSE 0.343 22.000 0.000 NA   NA
 10159972 10159973 HVO_1512 HVO_1513     FALSE 0.291 116.000 0.154 NA   NA
 10159973 10159974 HVO_1513 HVO_1514     TRUE 0.982 0.000 0.308 NA   NA
 10159978 10159979 HVO_1518 HVO_1519     TRUE 0.774 -1490.000 0.000 NA   NA
 10159980 10159981 HVO_1522 HVO_1523 aglP aglQ FALSE 0.066 103.000 0.000 NA   NA
 10159981 10159982 HVO_1523 HVO_1523A aglQ aglE TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10159982 10159983 HVO_1523A HVO_1524 aglE aglR FALSE 0.131 53.000 0.000 NA   NA
 10159983 10159984 HVO_1524 HVO_1525 aglR   FALSE 0.028 218.000 0.000 NA   NA
 10159985 10159986 HVO_1526 HVO_1527   aglF FALSE 0.063 169.000 0.000 NA   NA
 10159986 10159987 HVO_1527 HVO_1528 aglF aglI FALSE 0.143 49.000 0.000 NA   NA
 10159992 10159993 HVO_1533 HVO_1534     FALSE 0.065 168.000 0.000 NA   NA
 10159995 10159996 HVO_1536 HVO_1537   orc15 FALSE 0.133 109.000 0.012 NA   NA
 10159997 10159998 HVO_1538 HVO_1539 gpdA1 gpdB1 TRUE 0.993 -13.000 0.650 0.002 N NA
 10159998 10159999 HVO_1539 HVO_1540 gpdB1 gpdC1 TRUE 0.996 -3.000 0.547 0.002 N NA
 10159999 10160000 HVO_1540 HVO_1541 gpdC1 glpK FALSE 0.096 364.000 0.000 1.000 Y NA
 10160000 10160001 HVO_1541 HVO_1542 glpK   TRUE 0.808 4.000 0.013 NA   NA
 10160001 10160002 HVO_1542 HVO_1543   ptsH2 FALSE 0.068 98.000 0.000 NA   NA
 10160003 10160004 HVO_1544 HVO_1545     TRUE 0.985 -3.000 0.221 1.000   NA
 10160004 10160005 HVO_1545 HVO_1546   dhaK TRUE 0.846 124.000 0.226 0.001 Y NA
 10160005 10160006 HVO_1546 HVO_1547 dhaK ileS FALSE 0.141 166.000 0.004 1.000 N NA
 10160006 10160007 HVO_1547 HVO_1548 ileS   FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 10160007 10160008 HVO_1548 HVO_1549     FALSE 0.451 58.000 0.200 NA   NA
 10160008 10160009 HVO_1549 HVO_1550   act2 FALSE 0.110 64.000 0.000 NA   NA
 10160009 10160010 HVO_1550 HVO_1551 act2   FALSE 0.180 61.000 0.005 NA   NA
 10160010 10160011 HVO_1551 HVO_1552     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10160011 10160012 HVO_1552 HVO_1553   ttuD FALSE 0.205 64.000 0.000 1.000   NA
 10160013 10160014 HVO_1554 HVO_1555 traB   TRUE 0.949 -3.000 0.022 NA   NA
 10160016 10160017 HVO_1557 HVO_1558 purM   FALSE 0.232 73.000 0.002 1.000 N NA
 10160018 10160019 HVO_1559 HVO_1560     FALSE 0.437 68.000 0.196 NA   NA
 10160020 10160021 HVO_1561 HVO_1562   psmB FALSE 0.368 149.000 0.222 NA   NA
 10160022 10160023 HVO_1563 HVO_1564     FALSE 0.075 112.000 0.000 NA   NA
 10160024 10160025 HVO_1565 HVO_1566 ligA   FALSE 0.085 146.000 0.000 NA   NA
 10160025 10160026 HVO_1566 HVO_1567     FALSE 0.090 129.000 0.000 NA   NA
 10160026 10160027 HVO_1567 HVO_1568     FALSE 0.235 102.000 0.111 NA   NA
 10160027 10160028 HVO_1568 HVO_1569     FALSE 0.082 90.000 0.000 NA   NA
 10160029 10160030 HVO_1570 HVO_1571 top6A top6B TRUE 0.994 0.000 0.328 0.001   NA
 10160031 10160032 HVO_1572 HVO_1573 gyrB gyrA TRUE 0.997 2.000 0.306 0.001 Y NA
 10160033 10160034 HVO_1574 HVO_1575   rocF TRUE 0.910 0.000 0.000 1.000 N NA
 10160034 10160035 HVO_1575 HVO_1576 rocF galE3 FALSE 0.101 105.000 0.000 1.000 N NA
 10160037 10160038 HVO_1578 HVO_1579   udp1 FALSE 0.184 115.000 0.015 1.000 N NA
 10160038 10160039 HVO_1579 HVO_1580 udp1   TRUE 0.612 5.000 0.000 NA   NA
 10160039 10160040 HVO_1580 HVO_1581   cdd TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10160041 10160042 HVO_1582 HVO_1583     FALSE 0.410 97.000 0.333 NA   NA
 10160045 10160046 HVO_1586 HVO_1587 gltP1   FALSE 0.087 144.000 0.000 NA   NA
 10160046 10160047 HVO_1587 HVO_1588     FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10160047 10160048 HVO_1588 HVO_1589   dnaJ FALSE 0.131 53.000 0.000 NA   NA
 10160048 10160049 HVO_1589 HVO_1590 dnaJ dnaK TRUE 0.832 145.000 0.196 0.003 Y NA
 10160049 10160050 HVO_1590 HVO_1591 dnaK   FALSE 0.042 222.000 0.002 NA   NA
 10160050 10160051 HVO_1591 HVO_1592   grpE FALSE 0.195 94.000 0.044 NA   NA
 10160051 10160052 HVO_1592 HVO_1593 grpE ppd FALSE 0.392 127.000 0.231 NA   NA
 10160053 10160054 HVO_1594 HVO_1595 cna   TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 10160059 10160060 HVO_1600 HVO_1601   ssuB FALSE 0.210 35.000 0.000 NA   NA
 10160060 10160061 HVO_1601 HVO_1602 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 10160061 10160062 HVO_1602 HVO_1603 ssuC ssuA TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA Y NA
 10160063 10160064 HVO_1604 HVO_1605 aspC1   FALSE 0.053 131.000 0.000 NA N NA
 10160067 10160068 HVO_1608 HVO_1609 gbp2   FALSE 0.183 83.000 0.015 NA   NA
 10160068 10160069 HVO_1609 HVO_1610     FALSE 0.159 123.000 0.015 NA   NA
 10160071 10160072 HVO_1612 HVO_1613   gst FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10160072 10160073 HVO_1613 HVO_1614 gst   FALSE 0.442 76.000 0.200 NA   NA
 10160073 10160074 HVO_1614 HVO_1615     FALSE 0.133 103.000 0.017 NA   NA
 10160075 10160076 HVO_1616 HVO_1617     TRUE 0.540 7.000 0.000 NA   NA
 10160076 10160077 HVO_1617 HVO_1618     FALSE 0.088 143.000 0.000 NA   NA
 10160077 10160078 HVO_1618 HVO_1619     FALSE 0.003 825.000 0.000 NA   NA
 10160078 10160079 HVO_1619 HVO_1620     TRUE 0.988 -10.000 0.769 NA   NA
 10160081 10160082 HVO_1622 HVO_1624     TRUE 0.761 43.000 0.600 NA   NA
 10160083 10160084 HVO_1623 HVO_1625     FALSE 0.119 73.000 0.000 NA   NA
 10160084 10160085 HVO_1625 HVO_1626     FALSE 0.078 154.000 0.000 NA   NA
 10160086 10160087 HVO_1627 HVO_1628     FALSE 0.078 154.000 0.000 NA   NA
 10160088 10160089 HVO_1629 HVO_1630     FALSE 0.106 80.000 0.000 NA   NA
 10160089 10160090 HVO_1630 HVO_1631   dph FALSE 0.069 164.000 0.000 NA   NA
 10160091 10160092 HVO_1632 HVO_1633     FALSE 0.188 82.000 0.000 1.000   NA
 10160092 10160093 HVO_1633 HVO_1634   minD3 TRUE 0.491 74.000 0.167 1.000   NA
 10160093 10160094 HVO_1634 HVO_1635 minD3   TRUE 0.731 27.000 0.286 NA N NA
 10160095 10160096 HVO_1636 HVO_1637   slyD FALSE 0.235 74.000 0.021 NA   NA
 10160097 10160098 HVO_1638 HVO_1639     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10160098 10160099 HVO_1639 HVO_1640     FALSE 0.081 122.000 0.000 NA   NA
 10160100 10160101 HVO_1641 HVO_1642     FALSE 0.042 192.000 0.000 NA   NA
 10160101 10160102 HVO_1642 HVO_1643     FALSE 0.028 217.000 0.000 NA   NA
 10160102 10160103 HVO_1643 HVO_1644     TRUE 0.985 -3.000 0.286 NA   NA
 10160103 10160104 HVO_1644 HVO_1645   coxAC2 TRUE 0.906 11.000 0.429 NA   NA
 10160104 10160105 HVO_1645 HVO_1646 coxAC2 coxB2 TRUE 0.998 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 10160105 10160106 HVO_1646 HVO_1647 coxB2   FALSE 0.032 211.000 0.000 NA   NA
 10160107 10160108 HVO_1648 HVO_1649     FALSE 0.323 128.000 0.093 1.000 N NA
 10160110 10160111 HVO_1651 HVO_1652 thiI   FALSE 0.066 197.000 0.005 NA   NA
 10160111 10160112 HVO_1652 HVO_1653     TRUE 0.522 43.000 0.167 NA   NA
 10160116 10160117 HVO_1657 HVO_1658 purD   FALSE 0.200 91.000 0.003 1.000   NA
 10160118 10160119 HVO_1659 HVO_1660     TRUE 0.920 2.000 0.036 NA   NA
 10160119 10160120 HVO_1660 HVO_1661   glbN FALSE 0.076 117.000 0.000 NA   NA
 10160124 10160125 HVO_1665 HVO_1666   coaD FALSE 0.247 30.000 0.000 NA   NA
 10160125 10160126 HVO_1666 HVO_1667 coaD   FALSE 0.076 118.000 0.000 NA   NA
 10160126 10160127 HVO_1667 HVO_1668     TRUE 0.654 68.000 0.538 NA   NA
 10160127 10160128 HVO_1668 HVO_1669   fib FALSE 0.140 202.000 0.040 1.000   NA
 10160128 10160129 HVO_1669 HVO_1670 fib nop56 TRUE 0.998 -3.000 0.720 NA Y NA
 10160130 10160131 HVO_1671 HVO_1672     TRUE 0.574 39.000 0.182 NA   NA
 10160131 10160132 HVO_1672 HVO_1673     FALSE 0.397 104.000 0.333 NA   NA
 10160132 10160133 HVO_1673 HVO_1674     TRUE 0.537 61.000 0.333 NA   NA
 10160133 10160134 HVO_1674 HVO_1675   corA TRUE 0.937 -3.000 0.010 NA   NA
 10160134 10160135 HVO_1675 HVO_1676 corA tfb2 FALSE 0.040 222.000 0.000 1.000 N NA
 10160135 10160136 HVO_1676 HVO_1677 tfb2   TRUE 0.494 99.000 0.500 NA   NA
 10160139 10160140 HVO_1680 HVO_1681   ogg FALSE 0.286 62.000 0.054 NA   NA
 10160140 10160141 HVO_1681 HVO_1682 ogg   FALSE 0.113 114.000 0.000 1.000 N NA
 10160141 10160142 HVO_1682 HVO_1683   malQ FALSE 0.167 67.000 0.000 1.000 N NA
 10160144 10160145 HVO_1685 HVO_1686     FALSE 0.084 124.000 0.000 NA   NA
 10160147 10160148 HVO_1688 HVO_3036     FALSE 0.076 117.000 0.000 NA   NA
 10160150 10160151 HVO_1691 HVO_1692     FALSE 0.117 183.000 0.031 NA   NA
 10160151 10160152 HVO_1692 HVO_1693     TRUE 0.983 -7.000 0.046 0.001   NA
 10160152 10160153 HVO_1693 HVO_1694     FALSE 0.238 79.000 0.031 NA   NA
 10160153 10160154 HVO_1694 HVO_1695     TRUE 0.547 123.000 0.500 NA   NA
 10160155 10160156 HVO_1696 HVO_1697     FALSE 0.263 224.000 0.000 1.000 Y NA
 10160156 10160157 HVO_1697 HVO_1698     FALSE 0.172 140.000 0.000 1.000   NA
 10160158 10160159 HVO_1699 HVO_1700     FALSE 0.218 71.000 0.000 1.000   NA
 10160159 10160160 HVO_1700 HVO_1701     FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 10160160 10160161 HVO_1701 HVO_1702     TRUE 0.549 23.000 0.026 NA   NA
 10160162 10160163 HVO_1703 HVO_1704 hel2   FALSE 0.169 128.000 0.000 1.000   NA
 10160163 10160164 HVO_1704 HVO_1705     TRUE 0.625 123.000 0.571 1.000   NA
 10160164 10160165 HVO_1705 HVO_1706     TRUE 0.978 13.000 0.357 0.048 Y NA
 10160165 10160166 HVO_1706 HVO_1707     TRUE 0.963 -10.000 0.028 0.048 N NA
 10160166 10160167 HVO_1707 HVO_1708     TRUE 0.907 3.000 0.055 NA   NA
 10160168 10160169 HVO_1709 HVO_1710     FALSE 0.002 637.000 0.000 NA N NA
 10160170 10160171 HVO_1711 HVO_1712     FALSE 0.360 130.000 0.176 NA   NA
 10160172 10160173 HVO_1713 HVO_1714     TRUE 0.525 139.000 0.154 0.081   NA
 10160173 10160174 HVO_1714 HVO_1715     FALSE 0.202 79.000 0.000 1.000   NA
 10160174 10160175 HVO_1715 HVO_1716     FALSE 0.090 129.000 0.000 NA   NA
 10160175 10160176 HVO_1716 HVO_1717     FALSE 0.352 103.000 0.270 NA   NA
 10160176 10160177 HVO_1717 HVO_1718     TRUE 0.973 0.000 0.139 1.000 N NA
 10160177 10160178 HVO_1718 HVO_1719     FALSE 0.200 116.000 0.008 1.000   NA
 10160178 10160179 HVO_1719 HVO_1720     FALSE 0.076 118.000 0.000 NA   NA
 10160181 10160182 HVO_3037 HVO_1723   rad25d FALSE 0.118 74.000 0.000 NA   NA
 10160182 10160183 HVO_1723 HVO_1724 rad25d   FALSE 0.023 230.000 0.000 NA   NA
 10160185 10160186 HVO_1726 HVO_1727   tbp2 TRUE 0.730 86.000 0.250 NA Y NA
 10160187 10160188 HVO_3038 HVO_3039     FALSE 0.068 98.000 0.000 NA   NA
 10160188 10160189 HVO_3039 HVO_3040     FALSE 0.030 214.000 0.000 NA   NA
 10160189 10160190 HVO_3040 HVO_3041     FALSE 0.076 114.000 0.000 NA   NA
 10160190 10160191 HVO_3041 HVO_3042     FALSE 0.046 187.000 0.000 NA   NA
 10160191 10160192 HVO_3042 HVO_1733     FALSE 0.053 178.000 0.000 NA   NA
 10160192 10160193 HVO_1733 HVO_1734     TRUE 0.988 -3.000 0.375 NA   NA
 10160195 10160196 HVO_1736 HVO_1737 rad25b   TRUE 0.788 -13.000 0.000 NA   NA
 10160197 10160198 HVO_1738 HVO_1739     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160198 10160199 HVO_1739 HVO_1740     TRUE 0.540 7.000 0.000 NA   NA
 10160199 10160200 HVO_1740 HVO_1741     FALSE 0.114 60.000 0.000 NA   NA
 10160200 10160201 HVO_1741 HVO_1742     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10160201 10160202 HVO_1742 HVO_1743     FALSE 0.100 82.000 0.000 NA   NA
 10160202 10160203 HVO_1743 HVO_1744   hel1 FALSE 0.373 33.000 0.000 1.000   NA
 10160204 10160205 HVO_1745 HVO_1746     FALSE 0.143 49.000 0.000 NA   NA
 10160205 10160206 HVO_1746 HVO_1747     FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 10160209 10160210 HVO_1750 HVO_1751   copA FALSE 0.093 133.000 0.000 NA   NA
 10160210 10160211 HVO_1751 HVO_1752 copA   FALSE 0.298 142.000 0.068 1.000 N NA
 10160212 10160213 HVO_1753 HVO_1754     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 10160213 10160214 HVO_1754 HVO_1755     FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10160216 10160217 HVO_1757 HVO_1758   trxB5 FALSE 0.024 227.000 0.000 NA   NA
 10160217 10160218 HVO_1758 HVO_1759 trxB5   TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000   NA
 10160218 10160219 HVO_1759 HVO_1760     TRUE 0.995 0.000 0.192 1.000 Y NA
 10160220 10160221 HVO_1761 HVO_1762   cbpA FALSE 0.162 64.000 0.000 1.000 N NA
 10160223 10160224 HVO_1764 HVO_1765     FALSE 0.011 310.000 0.000 NA   NA
 10160225 10160226 HVO_1766 HVO_1767   dppB3 FALSE 0.365 34.000 0.000 1.000   NA
 10160226 10160227 HVO_1767 HVO_1768 dppB3 dppD3 TRUE 0.977 3.000 0.000 1.000 Y NA
 10160227 10160228 HVO_1768 HVO_1769 dppD3 dppF3 TRUE 0.997 -3.000 0.167 0.008 Y NA
 10160228 10160229 HVO_1769 HVO_1770 dppF3   TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160229 10160230 HVO_1770 HVO_1771     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160230 10160231 HVO_1771 HVO_1772     FALSE 0.488 9.000 0.000 NA   NA
 10160231 10160232 HVO_1772 HVO_1773     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10160232 10160233 HVO_1773 HVO_1774   ampS2 TRUE 0.969 1.000 0.194 NA   NA
 10160233 10160234 HVO_1774 HVO_1775 ampS2   TRUE 0.925 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10160234 10160235 HVO_1775 HVO_1776     TRUE 0.781 0.000 0.000 NA N NA
 10160235 10160236 HVO_1776 HVO_1778   katG FALSE 0.006 311.000 0.000 NA N NA
 10160238 10160239 HVO_1780 HVO_1781     TRUE 0.612 5.000 0.000 NA   NA
 10160242 10160243 HVO_1783 HVO_1785     FALSE 0.368 97.000 0.273 NA   NA
 10160243 10160244 HVO_1785 HVO_1786     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160245 10160246 HVO_1787 HVO_1788   nirA1 TRUE 0.692 89.000 0.917 NA   NA
 10160246 10160247 HVO_1788 HVO_1789 nirA1   FALSE 0.482 67.000 0.250 NA   NA
 10160247 10160248 HVO_1789 HVO_1790     FALSE 0.010 319.000 0.000 NA   NA
 10160251 10160252 HVO_1793 HVO_1794 kinA4   FALSE 0.016 359.000 0.000 1.000   NA
 10160253 10160254 HVO_1795 HVO_1796     FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 10160257 10160258 HVO_1799 HVO_1800     FALSE 0.191 39.000 0.000 NA   NA
 10160258 10160259 HVO_1800 HVO_1801     FALSE 0.114 60.000 0.000 NA   NA
 10160259 10160260 HVO_1801 HVO_1802     FALSE 0.091 85.000 0.000 NA   NA
 10160262 10160263 HVO_1804 HVO_1805 pncB   FALSE 0.110 78.000 0.000 NA   NA
 10160263 10160264 HVO_1805 HVO_1806     FALSE 0.194 38.000 0.000 NA   NA
 10160264 10160265 HVO_1806 HVO_1807     TRUE 0.830 45.000 1.000 NA   NA
 10160265 10160266 HVO_1807 HVO_1808     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10160269 10160270 HVO_1811 HVO_1812 ark1   FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 10160271 10160272 HVO_1813 HVO_1814     FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 10160273 10160274 HVO_1815 HVO_1816   pyrC FALSE 0.266 65.000 0.019 1.000 N NA
 10160278 10160279 HVO_1820 HVO_1821 uspA14 pat2 TRUE 0.993 -3.000 0.583 1.000   NA
 10160281 10160282 HVO_1823 HVO_1824 uspA16   FALSE 0.460 104.000 0.438 NA   NA
 10160283 10160284 HVO_1825 HVO_1826     FALSE 0.419 55.000 0.154 NA   NA
 10160284 10160285 HVO_1826 HVO_1827   rps6R TRUE 0.578 25.000 0.048 NA   NA
 10160288 10160289 HVO_1830 HVO_1831 gndA   FALSE 0.171 181.000 0.048 1.000 N NA
 10160289 10160290 HVO_1831 HVO_1832     FALSE 0.277 190.000 0.250 1.000 N NA
 10160290 10160291 HVO_1832 HVO_3043     FALSE 0.110 63.000 0.000 NA   NA
 10160291 10160292 HVO_3043 HVO_1835     FALSE 0.002 1621.000 0.000 NA   NA
 10160293 10160294 HVO_1834 HVO_1837     FALSE 0.004 615.000 0.000 NA   NA
 10160297 10160298 HVO_1840 HVO_1841     FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10160302 10160303 HVO_1845 HVO_3044     FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 10160304 10160305 HVO_1847 HVO_1848A pepF   FALSE 0.096 83.000 0.000 NA   NA
 10160307 10160308 HVO_1850 HVO_1851     FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10160308 10160309 HVO_1851 HVO_1852     FALSE 0.238 88.000 0.014 1.000   NA
 10160309 10160310 HVO_1852 HVO_1853   uspA17 FALSE 0.173 72.000 0.000 1.000 N NA
 10160310 10160311 HVO_1853 HVO_1854 uspA17 hisS FALSE 0.123 123.000 0.000 1.000 N NA
 10160311 10160312 HVO_1854 HVO_1855 hisS   FALSE 0.231 55.000 0.000 1.000   NA
 10160312 10160313 HVO_1855 HVO_1856     FALSE 0.167 103.000 0.040 NA   NA
 10160313 10160314 HVO_1856 HVO_1857     TRUE 0.941 4.000 0.262 NA   NA
 10160314 10160315 HVO_1857 HVO_1858   rps19R TRUE 0.494 106.000 0.399 1.000   NA
 10160315 10160316 HVO_1858 HVO_1859 rps19R   FALSE 0.182 115.000 0.036 NA   NA
 10160316 10160317 HVO_1859 HVO_1860     FALSE 0.222 33.000 0.000 NA   NA
 10160319 10160320 HVO_1862 HVO_1863     FALSE 0.014 450.000 0.035 NA   NA
 10160320 10160321 HVO_1863 HVO_1864   moaE FALSE 0.011 307.000 0.000 NA   NA
 10160321 10160322 HVO_1864 HVO_1865 moaE   FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 10160323 10160324 HVO_1866 HVO_1867   lysS TRUE 0.918 2.000 0.012 1.000 N NA
 10160326 10160327 HVO_1869 HVO_1870     FALSE 0.082 149.000 0.000 NA   NA
 10160327 10160328 HVO_1870 HVO_1871   pitA FALSE 0.188 107.000 0.009 1.000   NA
 10160329 10160330 HVO_1872 HVO_1873     FALSE 0.037 203.000 0.000 NA   NA
 10160330 10160331 HVO_1873 HVO_1874     TRUE 0.952 0.000 0.048 NA   NA
 10160332 10160333 HVO_1875 HVO_1876     FALSE 0.075 112.000 0.000 NA   NA
 10160337 10160338 HVO_1880 HVO_3046     FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10160339 10160340 HVO_1882 HVO_1883     FALSE 0.020 242.000 0.000 NA   NA
 10160341 10160342 HVO_1884 HVO_1885   trkA3 TRUE 0.587 41.000 0.222 NA   NA
 10160343 10160344 HVO_1886 HVO_1887     TRUE 0.953 -3.000 0.010 1.000 N NA
 10160344 10160345 HVO_1887 HVO_1888     TRUE 0.954 25.000 0.524 NA Y NA
 10160347 10160348 HVO_1890 HVO_1891     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160348 10160349 HVO_1891 HVO_1892     FALSE 0.118 58.000 0.000 NA   NA
 10160349 10160350 HVO_1892 HVO_1893     FALSE 0.071 161.000 0.000 NA   NA
 10160350 10160351 HVO_1893 HVO_1894     FALSE 0.202 55.000 0.006 NA   NA
 10160351 10160352 HVO_1894 HVO_1895   hkb FALSE 0.111 65.000 0.000 NA   NA
 10160352 10160353 HVO_1895 HVO_1896 hkb rps24R FALSE 0.300 34.000 0.000 1.000 N NA
 10160353 10160354 HVO_1896 HVO_1897 rps24R   TRUE 0.566 69.000 0.362 NA   NA
 10160354 10160355 HVO_1897 HVO_1898   rpoE2 TRUE 0.931 14.000 0.695 NA   NA
 10160355 10160356 HVO_1898 HVO_1899 rpoE2 rpoE1 TRUE 0.998 0.000 0.429 0.005 Y NA
 10160356 10160357 HVO_1899 HVO_1900 rpoE1   TRUE 0.865 8.000 0.221 NA   NA
 10160357 10160358 HVO_1900 HVO_1901   tif2g TRUE 0.984 2.000 0.511 NA   NA
 10160358 10160359 HVO_1901 HVO_1902 tif2g   FALSE 0.020 239.000 0.000 NA   NA
 10160361 10160362 HVO_1904 HVO_1905   phnP TRUE 0.932 -3.000 0.005 NA   NA
 10160365 10160366 HVO_1908 HVO_1909 napA mobA3 FALSE 0.116 59.000 0.000 NA   NA
 10160366 10160367 HVO_1909 HVO_1911 mobA3 nirA2 FALSE 0.017 263.000 0.000 NA   NA
 10160367 10160368 HVO_1911 HVO_1913 nirA2   TRUE 0.750 3.000 0.000 NA   NA
 10160368 10160369 HVO_1913 HVO_1914   acaB3 FALSE 0.089 128.000 0.000 NA   NA
 10160369 10160370 HVO_1914 HVO_1915 acaB3   FALSE 0.089 128.000 0.000 NA   NA
 10160371 10160372 HVO_1916 HVO_1917   acs6 FALSE 0.215 130.000 0.015 1.000 N NA
 10160372 10160373 HVO_1917 HVO_1918 acs6   FALSE 0.209 98.000 0.021 1.000   NA
 10160374 10160375 HVO_1919 HVO_1920   trnS TRUE 0.887 32.000 1.000 NA   NA
 10160375 10160376 HVO_1920 HVO_1921 trnS serS FALSE 0.080 178.000 0.000 1.000 N NA
 10160381 10160382 HVO_1926 HVO_1927     FALSE 0.154 91.000 0.015 NA   NA
 10160382 10160383 HVO_1927 HVO_1928     FALSE 0.169 43.000 0.000 NA   NA
 10160383 10160384 HVO_1928 HVO_1929     FALSE 0.079 92.000 0.000 NA   NA
 10160385 10160386 HVO_1930A HVO_1931   engB FALSE 0.092 139.000 0.000 NA   NA
 10160387 10160388 HVO_1932 HVO_1933 ddh   FALSE 0.354 21.000 0.000 NA   NA
 10160388 10160389 HVO_1933 HVO_1934   tif2Ba FALSE 0.007 375.000 0.000 NA   NA
 10160390 10160391 HVO_1935 HVO_1936   cofE FALSE 0.076 118.000 0.000 NA   NA
 10160391 10160392 HVO_1936 HVO_1937 cofE mer FALSE 0.437 53.000 0.158 NA   NA
 10160392 10160393 HVO_1937 HVO_1938 mer   FALSE 0.008 344.000 0.000 NA   NA
 10160394 10160395 HVO_1939 HVO_1940 mutLa mutS1a TRUE 0.993 -3.000 0.220 0.002   NA
 10160396 10160397 HVO_1941 HVO_1942     TRUE 0.962 6.000 0.667 NA   NA
 10160397 10160398 HVO_1942 HVO_1943     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 10160398 10160399 HVO_1943 HVO_1944     FALSE 0.111 62.000 0.000 NA   NA
 10160399 10160400 HVO_1944 HVO_1945     FALSE 0.067 166.000 0.000 NA   NA
 10160400 10160401 HVO_1945 HVO_1946   tif1 FALSE 0.114 67.000 0.000 NA   NA
 10160402 10160403 HVO_1947 HVO_1948     TRUE 0.908 1.000 0.010 NA   NA
 10160403 10160404 HVO_1948 HVO_1949     TRUE 0.951 -3.000 0.025 NA   NA
 10160404 10160405 HVO_1949 HVO_1950     TRUE 0.910 25.000 0.833 NA   NA
 10160405 10160406 HVO_1950 HVO_1951     FALSE 0.016 267.000 0.000 NA   NA
 10160406 10160407 HVO_1951 HVO_1952     FALSE 0.056 175.000 0.000 NA   NA
 10160407 10160408 HVO_1952 HVO_1953     TRUE 0.676 4.000 0.000 NA   NA
 10160408 10160409 HVO_1953 HVO_1954   rimI FALSE 0.400 83.000 0.125 1.000   NA
 10160409 10160410 HVO_1954 HVO_1955 rimI   FALSE 0.245 154.000 0.027 1.000   NA
 10160411 10160412 HVO_1956 HVO_1957   panB FALSE 0.010 403.000 0.000 1.000 N NA
 10160412 10160413 HVO_1957 HVO_1958 panB   TRUE 0.575 112.000 0.500 1.000   NA
 10160413 10160414 HVO_1958 HVO_1959     FALSE 0.155 91.000 0.000 1.000   NA
 10160414 10160415 HVO_1959 HVO_1960     FALSE 0.093 132.000 0.000 NA   NA
 10160415 10160416 HVO_1960 HVO_1961     FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 10160417 10160418 HVO_1962 HVO_1963   tif5B FALSE 0.076 118.000 0.000 NA   NA
 10160419 10160420 HVO_1964 HVO_1965     TRUE 0.729 19.000 0.124 NA   NA
 10160421 10160422 HVO_1966 HVO_1967   pgi FALSE 0.079 187.000 0.007 NA   NA
 10160424 10160425 HVO_1969 HVO_1970     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160425 10160426 HVO_1970 HVO_1971     TRUE 0.962 -3.000 0.011 1.000   NA
 10160426 10160427 HVO_1971 HVO_1972     FALSE 0.236 128.000 0.011 1.000   NA
 10160430 10160431 HVO_1975 HVO_1976 secF secD TRUE 0.999 -3.000 0.860 0.001 Y NA
 10160431 10160432 HVO_1976 HVO_1977 secD   FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 10160433 10160434 HVO_1978 HVO_1979 rnhB   FALSE 0.260 89.000 0.048 1.000 N NA
 10160436 10160437 HVO_1981 HVO_1982     FALSE 0.066 101.000 0.000 NA   NA
 10160437 10160438 HVO_1982 HVO_1983   aceB1 FALSE 0.004 517.000 0.000 NA   NA
 10160438 10160439 HVO_1983 HVO_1984 aceB1 aceA TRUE 0.995 -7.000 0.429 1.000 Y NA
 10160440 10160441 HVO_1985 HVO_1986     TRUE 0.999 -3.000 0.636 0.088 Y NA
 10160441 10160442 HVO_1986 HVO_1987   edp FALSE 0.126 146.000 0.000 1.000 N NA
 10160442 10160443 HVO_1987 HVO_1988 edp   TRUE 0.974 -13.000 0.375 NA   NA
 10160443 10160444 HVO_1988 HVO_1989     FALSE 0.029 215.000 0.000 NA   NA
 10160444 10702420 HVO_1989 HVO_3067     FALSE 0.089 86.000 0.000 NA   NA
 10702420 10160445 HVO_3067 HVO_1991     FALSE 0.004 546.000 0.000 NA   NA
 10160449 10160450 HVO_1995 HVO_1996     FALSE 0.152 46.000 0.000 NA   NA
 10160450 10160451 HVO_1996 HVO_1997     FALSE 0.079 92.000 0.000 NA   NA
 10160451 10160452 HVO_1997 HVO_1998   arsB3 FALSE 0.143 49.000 0.000 NA   NA
 10160453 10160454 HVO_1999 HVO_2000 htr7   TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 10160455 10160456 HVO_2001 HVO_2002 tgtA1   FALSE 0.219 73.000 0.000 1.000   NA
 10160456 10160457 HVO_2002 HVO_2003     TRUE 0.662 92.000 0.833 NA   NA
 10160458 10160459 HVO_2004 HVO_2005     FALSE 0.169 43.000 0.000 NA   NA
 10160462 10160463 HVO_2008 HVO_2009 tgtA2   FALSE 0.021 238.000 0.000 NA   NA
 10160463 10160464 HVO_2009 HVO_2010     FALSE 0.066 103.000 0.000 NA   NA
 10160464 10160465 HVO_2010 HVO_2011     FALSE 0.048 185.000 0.000 NA   NA
 10160466 10160467 HVO_2012 HVO_2013   ftsZ7 FALSE 0.169 128.000 0.000 1.000   NA
 10160469 10160470 HVO_2015 HVO_2016     FALSE 0.092 139.000 0.000 NA   NA
 10160470 10160471 HVO_2016 HVO_2017     FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 10160471 10160472 HVO_2017 HVO_2018     FALSE 0.067 100.000 0.000 NA   NA
 10160472 10160473 HVO_2018 HVO_2019     FALSE 0.016 271.000 0.000 NA   NA
 10160473 10160474 HVO_2019 HVO_2020     FALSE 0.004 583.000 0.000 NA   NA
 10160474 10160475 HVO_2020 HVO_2021     FALSE 0.017 263.000 0.000 NA   NA
 10160475 10160476 HVO_2021 HVO_2022     FALSE 0.016 271.000 0.000 NA   NA
 10160476 10160477 HVO_2022 HVO_2023     FALSE 0.111 65.000 0.000 NA   NA
 10160477 10160478 HVO_2023 HVO_2024     FALSE 0.003 660.000 0.000 NA   NA
 10160479 10160480 HVO_2025 HVO_2026     FALSE 0.066 103.000 0.000 NA   NA
 10160482 10160483 HVO_2028 HVO_2030     FALSE 0.263 28.000 0.000 NA   NA
 10160485 10160486 HVO_2031 HVO_2032 tsgA12 tsgD12 TRUE 0.811 58.000 1.000 1.000   NA
 10160486 10160487 HVO_2032 HVO_2033 tsgD12 tsgB12 TRUE 0.959 -3.000 0.006 1.000   NA
 10160487 10160488 HVO_2033 HVO_2034 tsgB12 tsgC12 TRUE 0.980 -3.000 0.006 0.046   NA
 10160488 10160489 HVO_2034 HVO_2035 tsgC12   FALSE 0.076 116.000 0.000 NA   NA
 10160489 10160490 HVO_2035 HVO_2036     FALSE 0.115 68.000 0.000 NA   NA
 10160491 10160492 HVO_2037 HVO_2037A     FALSE 0.005 483.000 0.000 NA   NA
 10160492 10160493 HVO_2037A HVO_2038     FALSE 0.075 112.000 0.000 NA   NA
 10160493 10160494 HVO_2038 HVO_2039     FALSE 0.011 309.000 0.000 NA   NA
 10160495 10160496 HVO_2040 HVO_2041 galE4   FALSE 0.010 314.000 0.000 NA   NA
 10160496 10160497 HVO_2041 HVO_2042   orc4 FALSE 0.002 1347.000 0.000 NA   NA
 10160498 10160499 HVO_2043 HVO_2044     FALSE 0.212 60.000 0.000 1.000   NA
 10160502 10160503 HVO_2047 HVO_2048     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10160503 10160504 HVO_2048 HVO_2049   rfbF FALSE 0.162 44.000 0.000 NA   NA
 10160506 10160507 HVO_2051 HVO_2052     FALSE 0.110 78.000 0.000 NA   NA
 10160507 10160508 HVO_2052 HVO_2053     FALSE 0.088 143.000 0.000 NA   NA
 10160509 10160510 HVO_2054 HVO_2055     FALSE 0.137 51.000 0.000 NA   NA
 10160511 10160512 HVO_2056 HVO_2057 spsK graD2 TRUE 0.719 63.000 0.051 1.000 Y NA
 10160514 10160515 HVO_2059 HVO_2060 galE5   TRUE 0.956 1.000 0.036 1.000   NA
 10160516 10160517 HVO_2061 HVO_2062 dpm   FALSE 0.005 487.000 0.000 NA   NA
 10160517 10160518 HVO_2062 HVO_2063     FALSE 0.003 686.000 0.000 NA   NA
 10160518 10160519 HVO_2063 HVO_2064     FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 10160520 10160521 HVO_2065 HVO_2066     FALSE 0.071 161.000 0.000 NA   NA
 10160522 10160523 HVO_2067 HVO_2068 acrR ftsZ8 FALSE 0.079 179.000 0.000 1.000 N NA
 10160523 10160524 HVO_2068 HVO_2069 ftsZ8   FALSE 0.154 121.000 0.000 1.000   NA
 10160524 10160525 HVO_2069 HVO_2070     TRUE 0.978 4.000 0.750 NA   NA
 10160526 10160527 HVO_2071 HVO_2072   csg FALSE 0.005 451.000 0.000 NA   NA
 10160529 10160530 HVO_2074 HVO_2076     FALSE 0.004 579.000 0.000 NA   NA
 10160532 10160533 HVO_2077 HVO_2078     FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 10160534 10160535 HVO_2079 HVO_2080     TRUE 0.884 29.000 0.800 NA   NA
 10160536 10160537 HVO_2081 HVO_2082     FALSE 0.017 258.000 0.000 NA   NA
 10160537 10160538 HVO_2082 HVO_2083     TRUE 0.983 2.000 0.400 1.000   NA
 10160538 10160539 HVO_2083 HVO_2084     TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 10160542 10160543 HVO_2087 HVO_2088   xloA FALSE 0.153 411.000 0.000 0.001 Y NA
 10160547 10160548 HVO_2091 HVO_2092 gabT2 arcR2 FALSE 0.030 247.000 0.000 1.000 N NA
 10160550 10160551 HVO_2094 HVO_2095     FALSE 0.165 126.000 0.000 1.000   NA
 10160552 10160553 HVO_2096 HVO_2097     TRUE 0.535 84.000 0.000 NA Y NA
 10160553 10160554 HVO_2097 HVO_2098     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 10160554 10160555 HVO_2098 HVO_2099     FALSE 0.011 308.000 0.000 NA   NA
 10160556 10160557 HVO_2100 HVO_2101   ptsH3 FALSE 0.388 17.000 0.000 NA   NA
 10160557 10160558 HVO_2101 HVO_2102 ptsH3   FALSE 0.383 233.000 0.000 0.003 Y NA
 10160558 10160559 HVO_2102 HVO_2103     TRUE 0.689 116.000 0.000 0.003 Y NA
 10160559 10160560 HVO_2103 HVO_2104     TRUE 0.836 124.000 0.222 0.003 Y NA
 10160560 10160561 HVO_2104 HVO_2105   tpiA2 TRUE 0.511 107.000 0.000 1.000 Y NA
 10160561 10160562 HVO_2105 HVO_2106 tpiA2 fbaB TRUE 0.878 29.000 0.000 0.064 Y NA
 10160562 10160563 HVO_2106 HVO_2107 fbaB   TRUE 0.750 3.000 0.000 NA   NA
 10160564 10160565 HVO_2108 HVO_2109 arcR3   FALSE 0.013 348.000 0.000 1.000 N NA
 10160565 10160566 HVO_2109 HVO_2110   arcR4 FALSE 0.005 721.000 0.000 1.000 N NA
 10160567 10160568 HVO_2111 HVO_2112 pdxA   TRUE 0.957 -3.000 0.039 NA   NA
 10160569 10160570 HVO_2113 HVO_2114 tsgA2   FALSE 0.138 134.000 0.000 1.000 N NA
 10160572 10160573 HVO_2116 HVO_2117 tsgB2 tsgC2 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.045 Y NA
 10160573 10160574 HVO_2117 HVO_2118 tsgC2 tsgD2 TRUE 0.673 121.000 0.500 0.045 N NA
 10160574 10160575 HVO_2118 HVO_2119 tsgD2   FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 10160575 10160576 HVO_2119 HVO_2120     FALSE 0.110 64.000 0.000 NA   NA
 10160577 10160578 HVO_2121 HVO_2122   dppF4 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160578 10160579 HVO_2122 HVO_2123 dppF4 dppD4 TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 10160579 10160580 HVO_2123 HVO_2124 dppD4 dppC4 TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10160580 10160581 HVO_2124 HVO_2125 dppC4 dppB4 TRUE 0.989 2.000 0.000 0.045 Y NA
 10160581 10160582 HVO_2125 HVO_2126 dppB4 dppA4 TRUE 0.739 76.000 0.000 0.045 Y NA
 10160583 10160584 HVO_2127 HVO_2128   amaB1 FALSE 0.401 130.000 0.000 0.005   NA
 10160584 10160585 HVO_2128 HVO_2129 amaB1   TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160585 10160586 HVO_2129 HVO_2130   arcR5 FALSE 0.324 24.000 0.000 NA   NA
 10160587 10160588 HVO_2131 HVO_2132 fbp2   FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 10160588 10160589 HVO_2132 HVO_2133   orc16 FALSE 0.072 160.000 0.000 NA   NA
 10160590 10160591 HVO_2134 HVO_2135     FALSE 0.093 133.000 0.000 NA   NA
 10160594 10160595 HVO_2138 HVO_2139     FALSE 0.020 242.000 0.000 NA   NA
 10160597 10160598 HVO_2141 HVO_2142 nirK   FALSE 0.062 170.000 0.000 NA   NA
 10160598 10160599 HVO_2142 HVO_2143     FALSE 0.247 30.000 0.000 NA   NA
 10160600 10160601 HVO_2144 HVO_2145 pqqE2 hcpF FALSE 0.169 86.000 0.000 1.000   NA
 10160601 10160602 HVO_2145 HVO_2146 hcpF   FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10160610 10160611 HVO_2153 HVO_2154 mcoA thiC FALSE 0.113 114.000 0.000 1.000 N NA
 10160611 10160612 HVO_2154 HVO_2155 thiC nce2 FALSE 0.114 118.000 0.000 1.000 N NA
 10160613 10160614 HVO_2156 HVO_2157 uspA18   FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10160614 10160615 HVO_2157 HVO_2158   mdh FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10160615 10160616 HVO_2158 HVO_2159 mdh   FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 10160617 10160618 HVO_2160 HVO_2161     FALSE 0.076 118.000 0.000 NA   NA
 10160620 10160621 HVO_2163 HVO_2164 lolD lolC TRUE 0.998 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 10160621 10160622 HVO_2164 HVO_2165 lolC lolE TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.076 Y NA
 10160622 10160623 HVO_2165 HVO_2166 lolE   FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 10160623 10160624 HVO_2166 HVO_2167     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 10160624 10160625 HVO_2167 HVO_2168   moxR3 FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 10160626 10160627 HVO_2169 HVO_2170     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160627 10160628 HVO_2170 HVO_2171     FALSE 0.374 19.000 0.000 NA   NA
 10160629 10160630 HVO_2172 HVO_2173     FALSE 0.474 62.000 0.250 NA   NA
 10160630 10160631 HVO_2173 HVO_2174     FALSE 0.042 192.000 0.000 NA   NA
 10160631 10160632 HVO_2174 HVO_2175   sph3 FALSE 0.205 36.000 0.000 NA   NA
 10160632 10160633 HVO_2175 HVO_2176 sph3   FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 10160633 10160634 HVO_2176 HVO_2177     FALSE 0.030 214.000 0.000 NA   NA
 10160634 10160635 HVO_2177 HVO_2178     TRUE 0.977 2.000 0.364 NA   NA
 10160635 10160636 HVO_2178 HVO_2179     TRUE 0.994 -3.000 0.727 NA   NA
 10160636 10160637 HVO_2179 HVO_2180     FALSE 0.199 37.000 0.000 NA   NA
 10160637 10160638 HVO_2180 HVO_2181     TRUE 0.985 1.000 0.482 NA   NA
 10160638 10160639 HVO_2181 HVO_2182     FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 10160640 10160641 HVO_2183 HVO_2184 aor4   FALSE 0.088 127.000 0.000 NA   NA
 10160641 10160642 HVO_2184 HVO_2185     TRUE 0.581 6.000 0.000 NA   NA
 10160643 10160644 HVO_2186 HVO_2187     FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10160645 10160646 HVO_2188 HVO_2189 purQ purS TRUE 0.998 2.000 0.656 0.001 Y NA
 10160647 10160648 HVO_2190 HVO_2191 idnT purU FALSE 0.126 146.000 0.000 1.000 N NA
 10160648 10160649 HVO_2191 HVO_2192 purU   FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 10160651 10160652 HVO_2194 HVO_2195 sir2 ark2 TRUE 0.651 10.000 0.000 1.000   NA
 10160652 10160653 HVO_2195 HVO_2196 ark2   TRUE 0.931 0.000 0.000 1.000   NA
 10160655 10160656 HVO_2198 HVO_2199 fbiC   TRUE 0.883 5.000 0.143 NA   NA
 10160656 10160657 HVO_2199 HVO_2200     TRUE 0.525 157.000 0.500 NA   NA
 10160658 10160659 HVO_2201 HVO_2202     FALSE 0.038 316.000 0.077 NA   NA
 10160659 10160660 HVO_2202 HVO_2203     TRUE 0.800 7.000 0.064 NA   NA
 10160660 10160661 HVO_2203 HVO_2204   ftsZ4 TRUE 0.517 56.000 0.273 NA   NA
 10160661 10160662 HVO_2204 HVO_2205 ftsZ4 nolA FALSE 0.083 212.000 0.016 1.000 N NA
 10160662 10160663 HVO_2205 HVO_2206 nolA   FALSE 0.084 147.000 0.000 NA   NA
 10160668 10160669 HVO_2211 HVO_2212 trkA4   TRUE 0.980 -3.000 0.200 NA   NA
 10160670 10160671 HVO_2213 HVO_2214   htr36 FALSE 0.009 331.000 0.000 NA   NA
 10160671 10160672 HVO_2214 HVO_2215 htr36   FALSE 0.076 114.000 0.000 NA   NA
 10160672 10160673 HVO_2215 HVO_2216     FALSE 0.247 30.000 0.000 NA   NA
 10160673 10160674 HVO_2216 HVO_3047     FALSE 0.076 115.000 0.000 NA   NA
 10160674 10160675 HVO_3047 HVO_2218     FALSE 0.175 42.000 0.000 NA   NA
 10160675 10160676 HVO_2218 HVO_2219     FALSE 0.472 10.000 0.000 NA   NA
 10160677 10160678 HVO_2220 HVO_2221 htr38   FALSE 0.076 115.000 0.000 NA   NA
 10160680 10160681 HVO_2223 HVO_2224     FALSE 0.081 91.000 0.000 NA   NA
 10160681 10160682 HVO_2224 HVO_2225     FALSE 0.087 87.000 0.000 NA   NA
 10160685 10160686 HVO_2228 HVO_2229     TRUE 0.545 137.000 0.333 1.000   NA
 10160687 10160688 HVO_2230 HVO_2231     TRUE 0.989 -3.000 0.333 1.000   NA
 10160688 10160689 HVO_2231 HVO_2232   cirD FALSE 0.166 87.000 0.000 1.000   NA
 10160689 10160690 HVO_2232 HVO_2233 cirD   TRUE 0.931 11.000 0.615 NA   NA
 10160690 10160691 HVO_2233 HVO_2234   msrB FALSE 0.229 64.000 0.024 NA   NA
 10160692 10160693 HVO_2235 HVO_2236     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10160693 10160694 HVO_2236 HVO_2237     FALSE 0.035 207.000 0.000 NA   NA
 10160696 10160697 HVO_2239 HVO_2240 uspA19   FALSE 0.154 121.000 0.000 1.000   NA
 10160701 10160702 HVO_2244 HVO_2245 mhpD   FALSE 0.082 90.000 0.000 NA   NA
 10160702 10160703 HVO_2245 HVO_2246     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160703 10160704 HVO_2246 HVO_2247     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160704 10160705 HVO_2247 HVO_2248     FALSE 0.096 83.000 0.000 NA   NA
 10160705 10160706 HVO_2248 HVO_2249     FALSE 0.062 170.000 0.000 NA   NA
 10160706 10160707 HVO_2249 HVO_2250   hpt TRUE 0.736 175.000 0.429 1.000 Y NA
 10160707 10160708 HVO_2250 HVO_2251 hpt   FALSE 0.171 70.000 0.000 1.000 N NA
 10160708 10160709 HVO_2251 HVO_2252     FALSE 0.002 586.000 0.000 NA N NA
 10160709 10160710 HVO_2252 HVO_2253     FALSE 0.002 1240.000 0.000 NA   NA
 10160710 10160711 HVO_2253 HVO_2254     FALSE 0.116 69.000 0.000 NA   NA
 10160712 10160713 HVO_2255 HVO_2256     FALSE 0.110 63.000 0.000 NA   NA
 10160713 10160714 HVO_2256 HVO_2257     FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10160714 10160715 HVO_2257 HVO_2258     FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10160715 10160716 HVO_2258 HVO_2259     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10160716 10160717 HVO_2259 HVO_2260     FALSE 0.408 14.000 0.000 NA   NA
 10160717 10160718 HVO_2260 HVO_2261     FALSE 0.007 372.000 0.000 NA   NA
 10160718 10160719 HVO_2261 HVO_2262     TRUE 0.676 4.000 0.000 NA   NA
 10160719 10160720 HVO_2262 HVO_2263     FALSE 0.078 154.000 0.000 NA   NA
 10160722 10160723 HVO_2265 HVO_2266     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10160723 10160724 HVO_2266 HVO_2267     TRUE 0.782 -16.000 0.000 NA   NA
 10160726 10160727 HVO_2269 HVO_2270 rmeR rmeM TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.046 Y NA
 10160727 10160728 HVO_2270 HVO_2271 rmeM rmeS TRUE 0.993 0.000 0.000 0.046 Y NA
 10160728 10160729 HVO_2271 HVO_2272 rmeS   FALSE 0.023 230.000 0.000 NA   NA
 10160729 10160730 HVO_2272 HVO_2273     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 10160730 10160731 HVO_2273 HVO_2274     FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 10160731 10160732 HVO_2274 HVO_2275     FALSE 0.003 670.000 0.000 NA   NA
 10160732 10160733 HVO_2275 HVO_2276     FALSE 0.075 112.000 0.000 NA   NA
 10160734 10160735 HVO_2277 HVO_2278     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160735 10160736 HVO_2278 HVO_2279     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160736 10160737 HVO_2279 HVO_2280     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160737 10160738 HVO_2280 HVO_2281     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160738 10160739 HVO_2281 HVO_2282     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160739 10160740 HVO_2282 HVO_2283     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10160740 10160741 HVO_2283 HVO_2284     TRUE 0.955 7.000 0.667 NA   NA
 10160741 10160742 HVO_2284 HVO_2285     FALSE 0.002 1265.000 0.000 NA   NA
 10160742 10160743 HVO_2285 HVO_2286     FALSE 0.006 405.000 0.000 NA   NA
 10160744 10160745 HVO_2287 HVO_2288     FALSE 0.003 933.000 0.000 NA   NA
 10160745 10160746 HVO_2288 HVO_2289     FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 10160746 10160747 HVO_2289 HVO_2290     FALSE 0.004 543.000 0.000 NA   NA
 10160747 10160748 HVO_2290 HVO_2291     FALSE 0.011 448.000 0.000 1.000   NA
 10160748 10160749 HVO_2291 HVO_2291A     FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 10160752 10160753 HVO_2294 HVO_2295     FALSE 0.076 94.000 0.000 NA   NA
 10160753 10160754 HVO_2295 HVO_2296     FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10160754 10160755 HVO_2296 HVO_2297     FALSE 0.091 130.000 0.000 NA   NA
 10160755 10160756 HVO_2297 HVO_2298     FALSE 0.250 82.000 0.007 1.000   NA
 10160756 10160757 HVO_2298 HVO_2299     FALSE 0.234 142.000 0.010 1.000   NA
 10160757 10160758 HVO_2299 HVO_2300   tif5A TRUE 0.688 16.000 0.035 1.000 N NA
 10160758 10160759 HVO_2300 HVO_2301 tif5A   FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10160759 10160760 HVO_2301 HVO_2302     FALSE 0.402 58.000 0.154 NA   NA
 10160760 10160761 HVO_2302 HVO_2303   hsp20E TRUE 0.957 9.000 0.846 NA   NA
 10160762 10160763 HVO_2304 HVO_2305 moeA1 moeA2 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.003 Y NA
 10160763 10160764 HVO_2305 HVO_2306 moeA2   FALSE 0.174 101.000 0.021 1.000 N NA
 10160765 10160766 HVO_2307 HVO_2308 pgp   TRUE 0.583 47.000 0.286 NA   NA
 10160766 10160767 HVO_2308 HVO_2309     TRUE 0.948 -3.000 0.021 NA   NA
 10160767 10160768 HVO_2309 HVO_2310     FALSE 0.152 46.000 0.000 NA   NA
 10160768 10160769 HVO_2310 HVO_2311   hemA FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10160769 10160770 HVO_2311 HVO_2312 hemA   TRUE 0.994 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 10160770 10160771 HVO_2312 HVO_2313   nirGH TRUE 0.942 2.000 0.125 NA N NA
 10160771 10160772 HVO_2313 HVO_2314 nirGH   FALSE 0.239 181.000 0.188 NA   NA
 10160774 10160775 HVO_2316 HVO_2317     FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 10160775 10160776 HVO_2317 HVO_2318   uppS2 FALSE 0.090 141.000 0.000 NA   NA
 10160777 10160778 HVO_2319 HVO_2320     TRUE 0.951 -3.000 0.024 NA   NA
 10160779 10160780 HVO_2321 HVO_2322 dnaG   FALSE 0.014 224.000 0.000 NA N NA
 10160781 10160782 HVO_2323 HVO_2324   panF TRUE 0.989 0.000 0.522 NA   NA
 10160782 10160783 HVO_2324 HVO_2325 panF   FALSE 0.117 70.000 0.000 NA   NA
 10160783 10160784 HVO_2325 HVO_2326   pai1 FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10160784 10160785 HVO_2326 HVO_2327 pai1   FALSE 0.076 117.000 0.000 NA   NA
 10160785 10160786 HVO_2327 HVO_2328     TRUE 0.767 29.000 0.345 NA   NA
 10160786 10160787 HVO_2328 HVO_2329     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10160787 10160788 HVO_2329 HVO_2330     FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10160788 10160789 HVO_2330 HVO_2331     FALSE 0.040 108.000 0.000 NA N NA
 10160789 10160790 HVO_2331 HVO_2332     FALSE 0.003 630.000 0.000 NA   NA
 10160790 10160791 HVO_2332 HVO_2333     FALSE 0.093 133.000 0.000 NA   NA
 10160792 10160793 HVO_2334 HVO_2335     FALSE 0.450 44.000 0.105 NA   NA
 10160795 10160796 HVO_2337 HVO_2338 uspA20 thrB FALSE 0.190 134.000 0.003 1.000 N NA
 10160796 10160797 HVO_2338 HVO_2339 thrB afsQ FALSE 0.333 67.000 0.000 0.083 N NA
 10160798 10160799 HVO_2340 HVO_2341     FALSE 0.302 148.000 0.087 1.000 N NA
 10160799 10160800 HVO_2341 HVO_2342     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 N NA
 10160802 10160803 HVO_2344 HVO_2345   noxA FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 10160803 10160804 HVO_2345 HVO_2346 noxA   FALSE 0.038 200.000 0.000 NA   NA
 10160804 10160805 HVO_2346 HVO_2347     FALSE 0.339 127.000 0.167 NA   NA
 10160805 10160806 HVO_2347 HVO_2348     FALSE 0.174 82.000 0.010 NA   NA
 10160807 10160808 HVO_2349 HVO_2350     TRUE 0.730 75.000 0.818 NA N NA
 10160809 10160810 HVO_2351 HVO_3048 fxsA   FALSE 0.051 181.000 0.000 NA   NA
 10160810 10160811 HVO_3048 HVO_2353     FALSE 0.010 324.000 0.000 NA   NA
 10160811 10160812 HVO_2353 HVO_2354     FALSE 0.059 173.000 0.000 NA   NA
 10160813 10160814 HVO_2355 HVO_2356 nce3   FALSE 0.453 70.000 0.125 1.000   NA
 10160815 10160816 HVO_2357 HVO_2358     TRUE 0.521 165.000 0.556 NA   NA
 10160816 10160817 HVO_2358 HVO_2359     FALSE 0.370 158.000 0.250 NA   NA
 10160819 10160820 HVO_2361 HVO_2362 carB   FALSE 0.118 153.000 0.000 1.000 N NA
 10160823 10160824 HVO_2365 HVO_2366 noxC uspA21 FALSE 0.242 163.000 0.065 1.000 N NA
 10160824 10160825 HVO_2366 HVO_2367 uspA21   TRUE 0.576 59.000 0.286 1.000   NA
 10160829 10160830 HVO_2371 HVO_2372     FALSE 0.466 75.000 0.229 NA   NA
 10160833 10160834 HVO_2375 HVO_2376 pstS1 pstC1 TRUE 0.674 64.000 0.009 1.000 Y NA
 10160834 10160835 HVO_2376 HVO_2377 pstC1 pstA1 TRUE 0.992 2.000 0.000 0.002 Y NA
 10160835 10160836 HVO_2377 HVO_2378 pstA1 pstB1 TRUE 0.811 52.000 0.000 0.002 Y NA
 10160836 10160837 HVO_2378 HVO_2379 pstB1 phoU3 FALSE 0.337 190.000 0.000 NA Y NA
 10160843 10160844 HVO_2385 HVO_2386 pilB5 pilC5 TRUE 0.978 -10.000 0.000 NA Y NA
 10160844 10160845 HVO_2386 HVO_2387 pilC5   TRUE 0.612 5.000 0.000 NA   NA
 10160845 10160846 HVO_2387 HVO_2388     TRUE 0.676 4.000 0.000 NA   NA
 10160846 10160847 HVO_2388 HVO_2389   dehII FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10160847 10160848 HVO_2389 HVO_2390 dehII   FALSE 0.100 82.000 0.000 NA   NA
 10160851 10160852 HVO_3049 HVO_2394     FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 10160852 10160853 HVO_2394 HVO_2395     FALSE 0.030 260.000 0.008 NA   NA
 10160853 10160854 HVO_2395 HVO_2396     TRUE 0.962 -3.000 0.010 1.000   NA
 10160855 10160856 HVO_2397 HVO_2398 znuA1 znuC1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 10160856 10160857 HVO_2398 HVO_2399 znuC1 znuB1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.083 Y NA
 10160857 10160858 HVO_2399 HVO_2400 znuB1   FALSE 0.108 176.000 0.000 1.000   NA
 10160859 10160860 HVO_2401 HVO_2402   gcvP TRUE 0.998 0.000 0.316 0.001 Y NA
 10160860 10160861 HVO_2402 HVO_2403 gcvP gcvH TRUE 0.989 2.000 0.054 1.000 Y NA
 10160861 10160862 HVO_2403 HVO_2404 gcvH gcvT TRUE 0.991 3.000 0.017 0.001 Y NA
 10160862 10160863 HVO_2404 HVO_2405 gcvT cbiO2 FALSE 0.035 231.000 0.000 1.000 N NA
 10160863 10160864 HVO_2405 HVO_2406 cbiO2 cbiQ2 TRUE 0.996 -12.000 0.682 1.000 Y NA
 10160864 10160865 HVO_2406 HVO_2407 cbiQ2 cbiM2 TRUE 0.975 -3.000 0.145 NA   NA
 10160865 10160866 HVO_2407 HVO_2408 cbiM2 cbiM1 TRUE 0.963 -3.000 0.058 NA   NA
 10160868 10160869 HVO_2410 HVO_2411   phaA TRUE 0.964 -10.000 0.235 NA   NA
 10160869 10160870 HVO_2411 HVO_2412 phaA trh6 FALSE 0.014 378.000 0.000 1.000   NA
 10160873 10160874 HVO_2415 HVO_2416     FALSE 0.070 107.000 0.000 NA   NA
 10160874 10160875 HVO_2416 HVO_2417     FALSE 0.260 153.000 0.095 NA   NA
 10160875 10160876 HVO_2417 HVO_2418     FALSE 0.306 58.000 0.057 NA   NA
 10160876 10160877 HVO_2418 HVO_2419   mvaB FALSE 0.110 63.000 0.000 NA   NA
 10160878 10160879 HVO_2420 HVO_2421     FALSE 0.091 140.000 0.000 NA   NA
 10160880 10160881 HVO_2422 HVO_2423     TRUE 0.553 89.000 0.500 NA   NA
 10160882 10160883 HVO_2424 HVO_2425     FALSE 0.048 185.000 0.000 NA   NA
 10160884 10160885 HVO_2426 HVO_2427   rfcB FALSE 0.092 139.000 0.000 NA   NA
 10160885 10160886 HVO_2427 HVO_2428 rfcB adh1 FALSE 0.160 89.000 0.000 1.000   NA
 10160887 10160888 HVO_2429 HVO_2430   glnQ FALSE 0.118 71.000 0.000 NA   NA
 10160888 10160889 HVO_2430 HVO_2431 glnQ glnP TRUE 0.996 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 10160889 10160890 HVO_2431 HVO_2432 glnP glnH TRUE 0.891 44.000 0.176 0.043 Y NA
 10160890 10160891 HVO_2432 HVO_2433 glnH ccp FALSE 0.021 289.000 0.000 1.000 N NA
 10160892 10160893 HVO_2434 HVO_2435     FALSE 0.046 121.000 0.000 NA N NA
 10160893 10160894 HVO_2435 HVO_2436   tme FALSE 0.137 132.000 0.000 1.000 N NA
 10160895 10160896 HVO_2437 HVO_2438   rnhA FALSE 0.053 178.000 0.000 NA   NA
 10160897 10160898 HVO_2440 HVO_2441 dppA5 dppB5 FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 10160898 10160899 HVO_2441 HVO_2442 dppB5 dppC5 TRUE 0.540 7.000 0.000 NA   NA
 10160899 10160900 HVO_2442 HVO_2443 dppC5 dppD5 TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10160900 10160901 HVO_2443 HVO_2444 dppD5 dppF5 TRUE 0.996 -7.000 1.000 0.007   NA
 10160901 10160902 HVO_2444 HVO_2445 dppF5   TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10160902 10160903 HVO_2445 HVO_2446     FALSE 0.074 111.000 0.000 NA   NA
 10160905 10160906 HVO_2448 HVO_2449 aad2   FALSE 0.420 61.000 0.182 NA   NA
 10160906 10160907 HVO_2449 HVO_2449A     TRUE 0.533 54.000 0.273 NA   NA
 10160908 10160909 HVO_2450 HVO_2451     TRUE 0.973 1.000 0.000 0.003   NA
 10160909 10160910 HVO_2451 HVO_2452     FALSE 0.011 454.000 0.000 1.000   NA
 10160910 10160911 HVO_2452 HVO_2453   trpG FALSE 0.004 841.000 0.000 1.000 N NA
 10160911 10160912 HVO_2453 HVO_2454 trpG trpE TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 10160912 10160913 HVO_2454 HVO_2455 trpE trpF TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10160913 10160914 HVO_2455 HVO_2456 trpF trpD1 TRUE 0.986 2.000 0.002 1.000 Y NA
 10160915 10160916 HVO_3050 HVO_3051     FALSE 0.152 46.000 0.000 NA   NA
 10160916 10160917 HVO_3051 HVO_2459     FALSE 0.025 224.000 0.000 NA   NA
 10160918 10160919 HVO_2460 HVO_2461   gul FALSE 0.075 113.000 0.000 NA   NA
 10160919 10160920 HVO_2461 HVO_2462 gul htr37 TRUE 0.869 2.000 0.000 1.000 N NA
 10160922 10160923 HVO_2464 HVO_2465 sucD sucC TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.001 Y NA
 10160923 10160924 HVO_2465 HVO_2466 sucC   FALSE 0.003 492.000 0.000 NA N NA
 10160925 10160926 HVO_2467 HVO_2468     FALSE 0.457 88.000 0.070 0.034 N NA
 10160926 10160927 HVO_2468 HVO_2469     FALSE 0.034 263.000 0.000 1.000   NA
 10160927 10160928 HVO_2469 HVO_2470   nac TRUE 0.640 173.000 0.400 0.001   NA
 10160928 10160929 HVO_2470 HVO_2471 nac   FALSE 0.046 233.000 0.000 1.000   NA
 10160929 10160930 HVO_2471 HVO_2472     TRUE 0.995 -3.000 0.833 NA   NA
 10160930 10160931 HVO_2472 HVO_2473     FALSE 0.110 64.000 0.000 NA   NA
 10160932 10160933 HVO_2474 HVO_2475 ugpQ rps17R FALSE 0.051 209.000 0.000 1.000 N NA
 10160933 10160934 HVO_2475 HVO_2476 rps17R   TRUE 0.687 25.000 0.064 1.000   NA
 10160934 10160935 HVO_2476 HVO_2477   citG TRUE 0.988 -3.000 0.288 1.000   NA
 10160935 10160936 HVO_2477 HVO_2478 citG   TRUE 0.975 0.000 0.163 1.000 N NA
 10160936 10160937 HVO_2478 HVO_2479   cofD TRUE 0.963 0.000 0.089 NA   NA
 10160937 10160938 HVO_2479 HVO_2480 cofD   FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10160939 10160940 HVO_2481 HVO_2482     TRUE 0.570 84.000 0.154 0.030   NA
 10160940 10160941 HVO_2482 HVO_2483     TRUE 0.664 53.000 0.385 1.000   NA
 10160941 10160942 HVO_2483 HVO_2484   uspA22 TRUE 0.575 157.000 0.545 1.000 N NA
 10160943 10160944 HVO_2485 HVO_2486   bccA FALSE 0.244 69.000 0.008 1.000 N NA
 10160945 10160946 HVO_2487 HVO_2488 asd   FALSE 0.006 437.000 0.000 NA   NA
 10160946 10160947 HVO_2488 HVO_2489     FALSE 0.012 300.000 0.000 NA   NA
 10160947 10160948 HVO_2489 HVO_2490     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 10160950 10160951 HVO_2493 HVO_2494     TRUE 0.917 3.000 0.044 1.000 N NA
 10160951 10160952 HVO_2494 HVO_2495   htlB FALSE 0.056 219.000 0.000 1.000   NA
 10160952 10160953 HVO_2495 HVO_2496 htlB adk FALSE 0.209 151.000 0.007 1.000   NA
 10160954 10160955 HVO_2497 HVO_2498     FALSE 0.079 92.000 0.000 NA   NA
 10160955 10160956 HVO_2498 HVO_2499   uspA23 FALSE 0.042 192.000 0.000 NA   NA
 10160956 10160957 HVO_2499 HVO_2500 uspA23 cat2 TRUE 0.994 -3.000 0.333 0.013 N NA
 10160957 10160958 HVO_2500 HVO_2501 cat2   FALSE 0.243 182.000 0.118 1.000   NA
 10160958 10160959 HVO_2501 HVO_2502   hmf FALSE 0.048 339.000 0.000 0.030   NA
 10160959 10160960 HVO_2502 HVO_2503 hmf kynU FALSE 0.183 55.000 0.000 1.000 N NA
 10160961 10160962 HVO_2504 HVO_2505 atsC   FALSE 0.334 109.000 0.222 NA   NA
 10160962 10160963 HVO_2505 HVO_2506     TRUE 0.882 -13.000 0.013 NA   NA
 10160963 10160964 HVO_2506 HVO_2507   trh7 FALSE 0.263 73.000 0.013 1.000 N NA
 10160965 10160966 HVO_2508 HVO_2509 carA   FALSE 0.142 194.000 0.000 0.082 N NA
 10160967 10160968 HVO_2510 HVO_2511   gatD TRUE 0.767 5.000 0.000 1.000   NA
 10160969 10160970 HVO_2512 HVO_2513     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10160971 10160972 HVO_2514 HVO_2515 cmi2   FALSE 0.403 66.000 0.167 NA   NA
 10702422 10160977 HVO_t3080 HVO_2520     FALSE 0.003 850.000 0.000 NA   NA
 11531774 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2671.000 0.000 NA   NA
 11674137 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2671.000 0.000 NA   NA
 11816529 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2671.000 0.000 NA   NA
 11531775 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2701.000 0.000 NA   NA
 11674138 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2701.000 0.000 NA   NA
 11816530 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2701.000 0.000 NA   NA
 11531776 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2737.000 0.000 NA   NA
 11674139 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2737.000 0.000 NA   NA
 11816531 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2737.000 0.000 NA   NA
 11531777 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2767.000 0.000 NA   NA
 11674140 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2767.000 0.000 NA   NA
 11816532 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2767.000 0.000 NA   NA
 11531778 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2805.000 0.000 NA   NA
 11674141 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2805.000 0.000 NA   NA
 11816533 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2805.000 0.000 NA   NA
 11531779 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2835.000 0.000 NA   NA
 11674142 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2835.000 0.000 NA   NA
 11816534 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2835.000 0.000 NA   NA
 11531780 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11674143 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11816535 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11531781 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2899.000 0.000 NA   NA
 11674144 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2899.000 0.000 NA   NA
 11816536 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2899.000 0.000 NA   NA
 11531782 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11674145 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11816537 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11531783 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2965.000 0.000 NA   NA
 11674146 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2965.000 0.000 NA   NA
 11816538 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 2965.000 0.000 NA   NA
 11531784 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3002.000 0.000 NA   NA
 11674147 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3002.000 0.000 NA   NA
 11816539 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3002.000 0.000 NA   NA
 11531785 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3032.000 0.000 NA   NA
 11674148 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3032.000 0.000 NA   NA
 11816540 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3032.000 0.000 NA   NA
 11531786 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11674149 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11816541 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11531787 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3101.000 0.000 NA   NA
 11674150 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3101.000 0.000 NA   NA
 11816542 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3101.000 0.000 NA   NA
 11531788 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3137.000 0.000 NA   NA
 11674151 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3137.000 0.000 NA   NA
 11816543 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3137.000 0.000 NA   NA
 11531789 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3167.000 0.000 NA   NA
 11674152 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3167.000 0.000 NA   NA
 11816544 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3167.000 0.000 NA   NA
 11531790 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3204.000 0.000 NA   NA
 11674153 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3204.000 0.000 NA   NA
 11816545 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3204.000 0.000 NA   NA
 11531791 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3234.000 0.000 NA   NA
 11674154 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3234.000 0.000 NA   NA
 11816546 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3234.000 0.000 NA   NA
 11531792 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3271.000 0.000 NA   NA
 11674155 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3271.000 0.000 NA   NA
 11816547 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3271.000 0.000 NA   NA
 11531793 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3301.000 0.000 NA   NA
 11674156 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3301.000 0.000 NA   NA
 11816548 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3301.000 0.000 NA   NA
 11531794 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3338.000 0.000 NA   NA
 11674157 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3338.000 0.000 NA   NA
 11816549 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3338.000 0.000 NA   NA
 11531795 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3368.000 0.000 NA   NA
 11674158 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3368.000 0.000 NA   NA
 11816550 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3368.000 0.000 NA   NA
 11531796 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3405.000 0.000 NA   NA
 11674159 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3405.000 0.000 NA   NA
 11816551 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3405.000 0.000 NA   NA
 11531797 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3435.000 0.000 NA   NA
 11674160 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3435.000 0.000 NA   NA
 11816552 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3435.000 0.000 NA   NA
 11531798 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3469.000 0.000 NA   NA
 11674161 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3469.000 0.000 NA   NA
 11816553 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3469.000 0.000 NA   NA
 11531799 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3499.000 0.000 NA   NA
 11674162 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3499.000 0.000 NA   NA
 11816554 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3499.000 0.000 NA   NA
 11531800 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3535.000 0.000 NA   NA
 11674163 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3535.000 0.000 NA   NA
 11816555 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3535.000 0.000 NA   NA
 11531801 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3565.000 0.000 NA   NA
 11674164 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3565.000 0.000 NA   NA
 11816556 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3565.000 0.000 NA   NA
 11531802 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3602.000 0.000 NA   NA
 11674165 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3602.000 0.000 NA   NA
 11816557 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3602.000 0.000 NA   NA
 11531803 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11674166 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11816558 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11531804 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3668.000 0.000 NA   NA
 11674167 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3668.000 0.000 NA   NA
 11816559 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3668.000 0.000 NA   NA
 11531805 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3698.000 0.000 NA   NA
 11674168 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3698.000 0.000 NA   NA
 11816560 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3698.000 0.000 NA   NA
 11531806 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3733.000 0.000 NA   NA
 11674169 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3733.000 0.000 NA   NA
 11816561 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3733.000 0.000 NA   NA
 11531807 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3763.000 0.000 NA   NA
 11674170 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3763.000 0.000 NA   NA
 11816562 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3763.000 0.000 NA   NA
 11531808 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3800.000 0.000 NA   NA
 11674171 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3800.000 0.000 NA   NA
 11816563 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3800.000 0.000 NA   NA
 11531809 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3830.000 0.000 NA   NA
 11674172 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3830.000 0.000 NA   NA
 11816564 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3830.000 0.000 NA   NA
 11531810 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3864.000 0.000 NA   NA
 11674173 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3864.000 0.000 NA   NA
 11816565 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3864.000 0.000 NA   NA
 11531811 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3894.000 0.000 NA   NA
 11674174 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3894.000 0.000 NA   NA
 11816566 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3894.000 0.000 NA   NA
 11531812 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3929.000 0.000 NA   NA
 11674175 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3929.000 0.000 NA   NA
 11816567 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3929.000 0.000 NA   NA
 11531813 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3959.000 0.000 NA   NA
 11674176 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3959.000 0.000 NA   NA
 11816568 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3959.000 0.000 NA   NA
 11531814 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3994.000 0.000 NA   NA
 11674177 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3994.000 0.000 NA   NA
 11816569 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 3994.000 0.000 NA   NA
 11531815 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4024.000 0.000 NA   NA
 11674178 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4024.000 0.000 NA   NA
 11816570 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4024.000 0.000 NA   NA
 11531816 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4060.000 0.000 NA   NA
 11674179 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4060.000 0.000 NA   NA
 11816571 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4060.000 0.000 NA   NA
 11531817 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4090.000 0.000 NA   NA
 11674180 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4090.000 0.000 NA   NA
 11816572 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4090.000 0.000 NA   NA
 11531818 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4125.000 0.000 NA   NA
 11674181 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4125.000 0.000 NA   NA
 11816573 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4125.000 0.000 NA   NA
 11531819 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4155.000 0.000 NA   NA
 11674182 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4155.000 0.000 NA   NA
 11816574 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4155.000 0.000 NA   NA
 11531820 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4191.000 0.000 NA   NA
 11674183 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4191.000 0.000 NA   NA
 11816575 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4191.000 0.000 NA   NA
 11531821 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4221.000 0.000 NA   NA
 11674184 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4221.000 0.000 NA   NA
 11816576 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4221.000 0.000 NA   NA
 11531822 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11674185 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11816577 10160973   HVO_2516   gpmI FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 10160979 10160980 HVO_2522 HVO_2523 trh8   FALSE 0.003 625.000 0.000 NA   NA
 10160980 10160981 HVO_2523 HVO_2524   crtB FALSE 0.121 169.000 0.014 NA   NA
 10160981 10160982 HVO_2524 HVO_2525 crtB   FALSE 0.118 58.000 0.000 NA   NA
 10160983 10160984 HVO_2526 HVO_2527     TRUE 0.777 25.000 0.283 NA   NA
 10160984 10160985 HVO_2527 HVO_2528   crtI TRUE 0.971 -3.000 0.065 1.000 N NA
 10160986 10160987 HVO_2529 HVO_2531     FALSE 0.386 76.000 0.150 NA   NA
 10160988 10160989 HVO_2530 HVO_2532     FALSE 0.111 62.000 0.000 NA   NA
 10160989 10160990 HVO_2532 HVO_2533     TRUE 0.988 -3.000 0.385 NA   NA
 10160992 10160993 HVO_2535 HVO_2536     FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10160993 10160994 HVO_2536 HVO_2537     FALSE 0.074 111.000 0.000 NA   NA
 10160994 10160995 HVO_2537 HVO_2538     FALSE 0.186 40.000 0.000 NA   NA
 10160995 10160996 HVO_2538 HVO_2539     TRUE 0.978 -3.000 0.176 NA   NA
 10160996 10160997 HVO_2539 HVO_2540     FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10160997 10160998 HVO_2540 HVO_2541   sec61a1 FALSE 0.119 171.000 0.000 1.000   NA
 10160998 10160999 HVO_2541 HVO_2542 sec61a1 rpl15 TRUE 0.948 4.000 0.261 1.000 N NA
 10160999 10161000 HVO_2542 HVO_2543 rpl15 rpl30 TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.002 Y NA
 10161000 10161001 HVO_2543 HVO_2544 rpl30 rps5 TRUE 0.998 0.000 0.475 0.016 Y NA
 10161001 10161002 HVO_2544 HVO_2545 rps5 rpl18 TRUE 0.997 -3.000 0.072 0.016 Y NA
 10161002 10161003 HVO_2545 HVO_2546 rpl18 rpl19R TRUE 0.996 0.000 0.079 0.013 Y NA
 10161003 10161004 HVO_2546 HVO_2547 rpl19R rpl32R TRUE 0.995 0.000 0.033 0.013 Y NA
 10161004 10161005 HVO_2547 HVO_2548 rpl32R rpl6 TRUE 0.996 0.000 0.055 0.013 Y NA
 10161005 10161006 HVO_2548 HVO_2549 rpl6 rps8 TRUE 0.983 5.000 0.068 0.013 Y NA
 10161006 10161007 HVO_2549 HVO_2550 rps8 rps14 TRUE 0.994 4.000 0.473 0.013 Y NA
 10161007 10161008 HVO_2550 HVO_2551 rps14 rpl5 TRUE 0.998 -3.000 0.496 0.013 Y NA
 10161008 10161009 HVO_2551 HVO_2552 rpl5 rps4R TRUE 0.997 -3.000 0.073 0.013 Y NA
 10161009 10161010 HVO_2552 HVO_2553 rps4R rpl24 TRUE 0.998 -3.000 0.478 0.016 Y NA
 10161010 10161011 HVO_2553 HVO_2554 rpl24 rpl14 TRUE 0.997 2.000 0.472 0.016 Y NA
 10161011 10161012 HVO_2554 HVO_2555 rpl14 rps17 TRUE 0.998 0.000 0.506 0.013 Y NA
 10161012 10161013 HVO_2555 HVO_2556 rps17 rnp1 TRUE 0.995 -9.000 0.468 1.000 Y NA
 10161013 10161014 HVO_2556 HVO_2557 rnp1 rpl29 TRUE 0.992 0.000 0.046 1.000 Y NA
 10161014 10161015 HVO_2557 HVO_2558 rpl29 rps3 TRUE 0.995 1.000 0.074 0.016 Y NA
 10161015 10161016 HVO_2558 HVO_2559 rps3 rpl22 TRUE 0.996 0.000 0.074 0.016 Y NA
 10161016 10161017 HVO_2559 HVO_2560 rpl22 rps19 TRUE 0.993 4.000 0.355 0.016 Y NA
 10161017 10161018 HVO_2560 HVO_2561 rps19 rpl2 TRUE 0.990 3.000 0.051 0.016 Y NA
 10161018 10161019 HVO_2561 HVO_2562 rpl2 rpl23 TRUE 0.998 3.000 0.849 0.008 Y NA
 10161019 10161020 HVO_2562 HVO_2563 rpl23 rpl4R TRUE 0.997 -3.000 0.075 0.013 Y NA
 10161020 10161021 HVO_2563 HVO_2564 rpl4R rpl3 TRUE 0.997 4.000 0.885 0.013 Y NA
 10161021 10161022 HVO_2564 HVO_2565 rpl3   TRUE 0.940 5.000 0.359 NA   NA
 10161023 10161024 HVO_3052 HVO_3053     FALSE 0.421 13.000 0.000 NA   NA
 10161025 10161026 HVO_2568 HVO_2569     FALSE 0.051 181.000 0.000 NA   NA
 10161026 10161027 HVO_2569 HVO_2570     FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 10161027 10161028 HVO_2570 HVO_2571     FALSE 0.322 40.000 0.000 1.000   NA
 10161029 10161030 HVO_2572 HVO_2573     FALSE 0.168 133.000 0.012 NA   NA
 10161030 10161031 HVO_2573 HVO_2574     TRUE 0.966 -3.000 0.070 NA   NA
 10161032 10161033 HVO_2575 HVO_2576     FALSE 0.169 142.000 0.000 1.000   NA
 10161033 10161034 HVO_2576 HVO_2577   pyrF FALSE 0.144 112.000 0.000 1.000   NA
 10161034 10161035 HVO_2577 HVO_2578 pyrF   FALSE 0.038 100.000 0.000 NA N NA
 10161035 10161036 HVO_2578 HVO_2579   nadC FALSE 0.052 85.000 0.000 NA N NA
 10161036 10161037 HVO_2579 HVO_2580 nadC   TRUE 0.987 -13.000 0.057 1.000 Y NA
 10161037 10161038 HVO_2580 HVO_2581   nadA TRUE 0.993 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 10161038 10161039 HVO_2581 HVO_2582 nadA   FALSE 0.088 211.000 0.004 1.000   NA
 10161042 10161043 HVO_2585 HVO_2586     FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 10161043 10161044 HVO_2586 HVO_2587     FALSE 0.048 184.000 0.000 NA   NA
 10161046 10161047 HVO_2589 HVO_2590     FALSE 0.230 86.000 0.023 1.000 N NA
 10161047 10161048 HVO_2590 HVO_2591     FALSE 0.117 70.000 0.000 NA   NA
 10161049 10161050 HVO_2592 HVO_2593     FALSE 0.076 116.000 0.000 NA   NA
 10161051 10161052 HVO_2594 HVO_2595   oadhA2 FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 10161052 10161053 HVO_2595 HVO_2596 oadhA2 oadhB2 TRUE 0.999 0.000 0.698 0.002 Y NA
 10161053 10161054 HVO_2596 HVO_2597 oadhB2 oadhL FALSE 0.476 32.000 0.047 NA   NA
 10161055 10161056 HVO_2598 HVO_2599 ppk2 prpA FALSE 0.273 78.000 0.007 1.000   NA
 10161057 10161058 HVO_2600 HVO_2601 map hit2 FALSE 0.241 81.000 0.015 1.000 N NA
 10161058 10161059 HVO_2601 HVO_2602 hit2   FALSE 0.234 82.000 0.015 1.000 N NA
 10161063 10161064 HVO_2606 HVO_2607     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10161065 10161066 HVO_2608 HVO_2609     FALSE 0.306 97.000 0.000 0.022   NA
 10161066 10161067 HVO_2609 HVO_2610   deoC FALSE 0.103 106.000 0.000 1.000 N NA
 10161068 10161069 HVO_2611 HVO_2612   suk FALSE 0.403 121.000 0.278 NA   NA
 10161069 10161070 HVO_2612 HVO_2613 suk   FALSE 0.363 69.000 0.111 NA   NA
 10161070 10161071 HVO_2613 HVO_2614   udp2 FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10161071 10161072 HVO_2614 HVO_2615 udp2   TRUE 0.927 10.000 0.417 1.000   NA
 10161074 10161075 HVO_2617 HVO_2618     TRUE 0.994 0.000 0.375 0.006   NA
 10161075 10161076 HVO_2618 HVO_2619     TRUE 0.744 24.000 0.115 1.000   NA
 10161080 10161081 HVO_2623 HVO_2624   pyrG FALSE 0.102 180.000 0.000 1.000   NA
 10161081 10161082 HVO_2624 HVO_2625 pyrG guaAb TRUE 0.992 0.000 0.024 1.000 Y NA
 10161082 10161083 HVO_2625 HVO_2626 guaAb   TRUE 0.962 -3.000 0.010 1.000   NA
 10161083 10161084 HVO_2626 HVO_2627     FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 10161084 10161085 HVO_2627 HVO_2628     FALSE 0.077 119.000 0.000 NA   NA
 10161085 10161086 HVO_2628 HVO_2629   htlC FALSE 0.298 87.000 0.119 NA   NA
 10161086 10161087 HVO_2629 HVO_2630 htlC   TRUE 0.558 85.000 0.474 NA   NA
 10161087 10161088 HVO_2630 HVO_2631     TRUE 0.945 16.000 1.000 NA   NA
 10161088 10161089 HVO_2631 HVO_2632   rpoM2 TRUE 0.574 85.000 0.500 NA   NA
 10161089 10161090 HVO_2632 HVO_2633 rpoM2   FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 10161091 10161092 HVO_2634 HVO_2635     FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10161093 10161094 HVO_2636 HVO_2637     FALSE 0.188 104.000 0.055 NA   NA
 10161095 10161096 HVO_2638 HVO_2639 tcbD   TRUE 0.959 1.000 0.118 NA   NA
 10161096 10161097 HVO_2639 HVO_2640     FALSE 0.088 127.000 0.000 NA   NA
 10161097 10161098 HVO_2640 HVO_2641     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10161098 10161099 HVO_2641 HVO_2642     FALSE 0.253 169.000 0.154 NA   NA
 10161099 10161100 HVO_2642 HVO_2643   qor1 TRUE 0.983 -10.000 0.538 NA   NA
 10161101 10161102 HVO_2644 HVO_2645     FALSE 0.038 101.000 0.000 NA N NA
 10161102 10161103 HVO_2645 HVO_2646   ilvD FALSE 0.388 97.000 0.250 1.000 N NA
 10161104 10161105 HVO_2647 HVO_2648   serA2 FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 10161105 10161106 HVO_2648 HVO_2649 serA2   FALSE 0.122 56.000 0.000 NA   NA
 10161107 10161108 HVO_2650 HVO_2651     FALSE 0.169 43.000 0.000 NA   NA
 10161109 10161110 HVO_2652 HVO_2653 sgb   FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10161110 10161111 HVO_2653 HVO_2654     FALSE 0.194 38.000 0.000 NA   NA
 10161111 10161112 HVO_2654 HVO_2655   qcrA TRUE 0.950 2.000 0.000 0.040 N NA
 10161112 10161113 HVO_2655 HVO_2656 qcrA   FALSE 0.400 15.000 0.000 NA   NA
 10161117 10161118 HVO_2659 HVO_2661     FALSE 0.208 77.000 0.000 1.000   NA
 10161118 10161119 HVO_2661 HVO_2662     FALSE 0.456 163.000 0.000 NA Y NA
 10161120 10161121 HVO_2663 HVO_2664     FALSE 0.445 42.000 0.025 1.000   NA
 10161122 10161123 HVO_2665 HVO_2666 hpcH thiD FALSE 0.103 106.000 0.000 1.000 N NA
 10161123 10161124 HVO_2666 HVO_2667 thiD thiM TRUE 0.994 1.000 0.015 0.004 Y NA
 10161124 10161125 HVO_2667 HVO_2668 thiM thiE TRUE 0.997 -3.000 0.146 0.004 Y NA
 10161126 10161127 HVO_2669 HVO_2670 hemG   TRUE 0.557 90.000 0.000 1.000 Y NA
 10161127 10161128 HVO_2670 HVO_2671     FALSE 0.113 115.000 0.000 1.000 N NA
 10161128 10161129 HVO_2671 HVO_2672     FALSE 0.089 128.000 0.000 NA   NA
 10161129 10161130 HVO_2672 HVO_2673     FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10161130 10161131 HVO_2673 HVO_2674   mntA FALSE 0.024 227.000 0.000 NA   NA
 10161131 10161132 HVO_2674 HVO_2675 mntA hisD FALSE 0.130 127.000 0.000 1.000 N NA
 10161132 10161133 HVO_2675 HVO_2676 hisD   FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 10161133 10161134 HVO_2676 HVO_2677     TRUE 0.508 40.000 0.125 NA   NA
 10161134 10161135 HVO_2677 HVO_2678     TRUE 0.529 89.000 0.455 NA   NA
 10161135 10161136 HVO_2678 HVO_2679     FALSE 0.439 57.000 0.182 NA   NA
 10161136 10161137 HVO_2679 HVO_2680     TRUE 0.985 -3.000 0.286 NA   NA
 10161137 10161138 HVO_2680 HVO_2681     FALSE 0.066 101.000 0.000 NA   NA
 10161138 10161139 HVO_2681 HVO_2682     FALSE 0.076 94.000 0.000 NA   NA
 10161139 10161140 HVO_2682 HVO_2683     FALSE 0.307 118.000 0.167 NA   NA
 10161140 10161141 HVO_2683 HVO_2684     FALSE 0.419 85.000 0.167 1.000   NA
 10161143 10161144 HVO_2686 HVO_2687     FALSE 0.199 37.000 0.000 NA   NA
 10161144 10161145 HVO_2687 HVO_2688     FALSE 0.334 130.000 0.154 NA   NA
 10161146 10161147 HVO_2689 HVO_2690     TRUE 0.569 43.000 0.222 NA   NA
 10161147 10161148 HVO_2690 HVO_2691     TRUE 0.502 155.000 0.444 NA   NA
 10161148 10161149 HVO_2691 HVO_2692   tsgD3 FALSE 0.472 116.000 0.400 NA   NA
 10161149 10161150 HVO_2692 HVO_2693 tsgD3 tsgC3 TRUE 0.998 3.000 1.000 0.040 Y NA
 10161150 10161151 HVO_2693 HVO_2694 tsgC3 tsgB3 TRUE 0.998 2.000 1.000 0.040 Y NA
 10161151 10161152 HVO_2694 HVO_2695 tsgB3 tsgA3 TRUE 0.955 51.000 1.000 0.040 Y NA
 10161152 10161153 HVO_2695 HVO_2696 tsgA3   FALSE 0.115 155.000 0.000 1.000 N NA
 10161154 10161155 HVO_2697 HVO_2698 priS ginS TRUE 0.978 -3.000 0.173 NA   NA
 10161155 10161156 HVO_2698 HVO_2699 ginS bcp1 TRUE 0.503 37.000 0.094 NA   NA
 10161157 10161158 HVO_2700 HVO_2701 cdc48b   TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 10161161 10161162 HVO_2704 HVO_2705     FALSE 0.091 85.000 0.000 NA   NA
 10161162 10161163 HVO_2705 HVO_2706   tif2Bd FALSE 0.350 95.000 0.231 NA   NA
 10161164 10161165 HVO_2707 HVO_2708     TRUE 0.913 4.000 0.067 1.000   NA
 10161165 10161166 HVO_2708 HVO_2709     FALSE 0.142 110.000 0.000 1.000   NA
 10161167 10161168 HVO_2710 HVO_2711     FALSE 0.157 92.000 0.018 NA   NA
 10161168 10161169 HVO_2711 HVO_2712   rtcB FALSE 0.333 38.000 0.015 NA   NA
 10161170 10161171 HVO_2713 HVO_2714     FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10161171 10161172 HVO_2714 HVO_2715   gph FALSE 0.033 210.000 0.000 NA   NA
 10161172 10161173 HVO_2715 HVO_2716 gph acd5 FALSE 0.058 527.000 0.417 1.000   NA
 10161173 10161174 HVO_2716 HVO_2717 acd5 alaS2 FALSE 0.403 100.000 0.250 1.000   NA
 10161174 10161175 HVO_2717 HVO_2718 alaS2   TRUE 0.734 36.000 0.294 1.000   NA
 10161175 10161176 HVO_2718 HVO_3054     FALSE 0.022 236.000 0.000 NA   NA
 10161178 10161179 HVO_2721 HVO_2722 purF rpl37R FALSE 0.043 378.000 0.169 1.000 N NA
 10161179 10161180 HVO_2722 HVO_2723 rpl37R snp TRUE 0.991 -3.000 0.439 1.000 N NA
 10161181 10161182 HVO_2724 HVO_2725   idsA TRUE 0.984 0.000 0.258 1.000   NA
 10161182 10161183 HVO_2725 HVO_2726 idsA gltS FALSE 0.160 190.000 0.063 1.000 N NA
 10161183 10161184 HVO_2726 HVO_2727 gltS   FALSE 0.220 67.000 0.019 NA   NA
 10161186 10161187 HVO_2729 HVO_2730 ferB2 etfB2 TRUE 0.717 131.000 0.000 0.012 Y NA
 10161187 10161188 HVO_2730 HVO_2731 etfB2 etfA2 TRUE 0.983 3.000 0.082 NA Y NA
 10161188 10161189 HVO_2731 HVO_2732 etfA2   TRUE 0.993 -3.000 0.082 NA Y NA
 10161189 10161190 HVO_2732 HVO_2733     TRUE 0.942 14.000 0.857 NA   NA
 10161190 10161191 HVO_2733 HVO_2734     FALSE 0.368 99.000 0.286 NA   NA
 10161192 10161193 HVO_2735 HVO_2736     FALSE 0.255 52.000 0.019 NA   NA
 10161194 10161195 HVO_2737 HVO_2738 rpl7aR rps28R TRUE 0.991 7.000 0.602 0.012 Y NA
 10161195 10161196 HVO_2738 HVO_2739 rps28R rpl24R TRUE 0.997 3.000 0.761 0.012 Y NA
 10161196 10161197 HVO_2739 HVO_2740 rpl24R ndk TRUE 0.954 1.000 0.054 1.000 N NA
 10161197 10161198 HVO_2740 HVO_2741 ndk   FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10161199 10161200 HVO_2742 HVO_2743 metE   TRUE 0.997 -3.000 0.039 0.001 Y NA
 10161200 10161201 HVO_2743 HVO_2744     FALSE 0.256 60.000 0.013 1.000 N NA
 10161201 10161202 HVO_2744 HVO_2745     TRUE 0.964 -3.000 0.033 1.000 N NA
 10161202 10161203 HVO_2745 HVO_2746   ksgA TRUE 0.832 4.000 0.006 1.000 N NA
 10161203 10161204 HVO_2746 HVO_2747 ksgA   TRUE 0.773 43.000 0.049 NA Y NA
 10161204 10161205 HVO_2747 HVO_2748   rpoF TRUE 0.751 54.000 0.730 NA   NA
 10161205 10161206 HVO_2748 HVO_2749 rpoF rpl21R TRUE 0.971 4.000 0.479 1.000   NA
 10161207 10161208 HVO_2750 HVO_2751 metB   FALSE 0.092 131.000 0.000 NA   NA
 10161209 10161210 HVO_2752 HVO_2753 tef1b   TRUE 0.994 3.000 0.511 1.000 Y NA
 10161210 10161211 HVO_2753 HVO_2754     FALSE 0.242 84.000 0.048 NA   NA
 10161211 10161212 HVO_2754 HVO_2755   rpl12 FALSE 0.099 209.000 0.053 NA   NA
 10161212 10161213 HVO_2755 HVO_2756 rpl12 rpl10 TRUE 0.985 22.000 0.758 0.012 Y NA
 10161213 10161214 HVO_2756 HVO_2757 rpl10 rpl1 TRUE 0.997 -3.000 0.076 0.012 Y NA
 10161214 10161215 HVO_2757 HVO_2758 rpl1 rpl11 TRUE 0.606 306.000 0.838 0.012 Y NA
 10161215 10161216 HVO_2758 HVO_2759 rpl11   FALSE 0.156 117.000 0.003 1.000 N NA
 10161217 10161218 HVO_2760 HVO_2761   mvk FALSE 0.072 160.000 0.000 NA   NA
 10161218 10161219 HVO_2761 HVO_2762 mvk   TRUE 0.984 -3.000 0.185 1.000   NA
 10161221 10161222 HVO_2764 HVO_2765 dppB6 dppC6 TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.040 Y NA
 10161222 10161223 HVO_2765 HVO_2766 dppC6 lhr1 FALSE 0.155 91.000 0.000 1.000   NA
 10161225 10161226 HVO_2768 HVO_2769     FALSE 0.377 102.000 0.308 NA   NA
 10161229 10161230 HVO_2772 HVO_2773   rps2 FALSE 0.110 175.000 0.000 1.000   NA
 10161230 10161231 HVO_2773 HVO_2774 rps2 eno TRUE 0.957 -3.000 0.017 1.000 N NA
 10161231 10161232 HVO_2774 HVO_2775 eno rpoK TRUE 0.887 5.000 0.100 1.000 N NA
 10161232 10161233 HVO_2775 HVO_2776 rpoK rpoN TRUE 0.997 -3.000 0.064 0.003 Y NA
 10161233 10161234 HVO_2776 HVO_2777 rpoN rps9 TRUE 0.922 13.000 0.536 1.000 N NA
 10161234 10161235 HVO_2777 HVO_2778 rps9 rpl13 TRUE 0.998 -6.000 0.515 0.016 Y NA
 10161235 10161236 HVO_2778 HVO_2779 rpl13 rpl18R TRUE 0.997 -3.000 0.075 0.016 Y NA
 10161236 10161237 HVO_2779 HVO_3055 rpl18R   FALSE 0.278 27.000 0.000 NA   NA
 10161237 10161238 HVO_3055 HVO_2781   rpoD FALSE 0.086 145.000 0.000 NA   NA
 10161238 10161239 HVO_2781 HVO_2782 rpoD rps11 TRUE 0.828 7.000 0.058 1.000 N NA
 10161239 10161240 HVO_2782 HVO_2783 rps11 rps4 TRUE 0.997 -3.000 0.073 0.016 Y NA
 10161240 10161241 HVO_2783 HVO_2784 rps4 rps13 TRUE 0.999 -3.000 0.512 0.008 Y NA
 10161241 10161242 HVO_2784 HVO_3056 rps13   FALSE 0.324 24.000 0.000 NA   NA
 10161244 10161245 HVO_2787 HVO_2788     FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 10161245 10161246 HVO_2788 HVO_2789   moaA FALSE 0.239 53.000 0.000 1.000   NA
 10161247 10161248 HVO_2790 HVO_2791 mrp1   TRUE 0.953 -3.000 0.029 NA   NA
 10161248 10161249 HVO_2791 HVO_2792   ugd2 FALSE 0.077 273.000 0.167 NA   NA
 10161249 10161250 HVO_2792 HVO_2793 ugd2   FALSE 0.326 83.000 0.125 NA   NA
 10161250 10161251 HVO_2793 HVO_3057     FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10161255 10161256 HVO_2798 HVO_2799 livJ3   FALSE 0.439 120.000 0.333 NA   NA
 10161257 10161258 HVO_2800 HVO_2801 livF3 livG3 TRUE 0.997 -3.000 0.089 0.023 Y NA
 10161258 10161259 HVO_2801 HVO_2802 livG3 livM3 TRUE 0.997 -7.000 0.714 1.000 Y NA
 10161259 10161260 HVO_2802 HVO_2803 livM3 livH3 TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.040 Y NA
 10161261 10702423 HVO_2804 HVO_3069 pai2   FALSE 0.421 13.000 0.000 NA   NA
 10161264 10161265 HVO_2806 HVO_2808   sdhA FALSE 0.011 455.000 0.000 1.000   NA
 10161265 10161266 HVO_2808 HVO_2809 sdhA sdhB TRUE 0.854 56.000 0.062 0.001 Y NA
 10161266 10161267 HVO_2809 HVO_2810 sdhB sdhD TRUE 0.997 0.000 0.092 0.001 Y NA
 10161267 10161268 HVO_2810 HVO_2811 sdhD sdhC TRUE 0.997 0.000 0.125 0.001 Y NA
 10161268 10161269 HVO_2811 HVO_2812 sdhC   FALSE 0.302 110.000 0.083 1.000   NA
 10161270 10161271 HVO_2813 HVO_2814   alkA FALSE 0.163 114.000 0.006 1.000 N NA
 10161271 10161272 HVO_2814 HVO_2815 alkA hbd1 FALSE 0.206 142.000 0.013 1.000 N NA
 10161272 10161273 HVO_2815 HVO_3058 hbd1   FALSE 0.087 87.000 0.000 NA   NA
 10161273 10161274 HVO_3058 HVO_2815A     FALSE 0.075 158.000 0.000 NA   NA
 10161274 10161275 HVO_2815A HVO_2817     FALSE 0.004 531.000 0.000 NA   NA
 10161277 10161278 HVO_2819 HVO_2820     FALSE 0.346 188.000 0.000 NA Y NA
 10161280 10161281 HVO_2822 HVO_2823     FALSE 0.247 30.000 0.000 NA   NA
 10161281 10161282 HVO_2823 HVO_2824     TRUE 0.797 -10.000 0.000 NA   NA
 10161282 10161283 HVO_2824 HVO_2825     FALSE 0.112 66.000 0.000 NA   NA
 10161283 10161284 HVO_2825 HVO_2826     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 10161284 10161285 HVO_2826 HVO_2827     TRUE 0.797 -10.000 0.000 NA   NA
 10161285 10161286 HVO_2827 HVO_2828     FALSE 0.020 240.000 0.000 NA   NA
 10161287 10161288 HVO_2829 HVO_2830     FALSE 0.037 369.000 0.000 0.042   NA
 10161288 10161289 HVO_2830 HVO_2831     FALSE 0.002 1268.000 0.000 NA   NA
 10161289 10161290 HVO_2831 HVO_2832     TRUE 0.647 27.000 0.143 NA   NA
 10161290 10161291 HVO_2832 HVO_2833     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 10161291 10161292 HVO_2833 HVO_2834   mutY2 FALSE 0.150 120.000 0.000 1.000   NA
 10161293 10161294 HVO_2835 HVO_2836 ark3   FALSE 0.207 65.000 0.000 1.000   NA
 10161294 10161295 HVO_2836 HVO_2837     FALSE 0.070 107.000 0.000 NA   NA
 10161297 10161298 HVO_2839 HVO_2840     FALSE 0.020 323.000 0.000 1.000   NA
 10161300 10161301 HVO_2842 HVO_2844   dsbB FALSE 0.077 255.000 0.000 0.067   NA
 10161302 10161303 HVO_2843 HVO_2845 phr2   FALSE 0.067 105.000 0.000 NA   NA
 10161303 10161304 HVO_2845 HVO_2846   spoVR TRUE 0.630 9.000 0.007 NA   NA
 10161304 10161305 HVO_2846 HVO_2847 spoVR   TRUE 0.994 -3.000 0.761 NA   NA
 10161305 10161306 HVO_2847 HVO_2848   prkA1 TRUE 0.988 -9.000 0.683 NA   NA
 10161306 10161307 HVO_2848 HVO_2849 prkA1 prkA2 TRUE 0.980 3.000 0.044 NA Y NA
 10161308 10161309 HVO_2850 HVO_2851     TRUE 0.657 25.000 0.110 NA   NA
 10161310 10161311 HVO_2852 HVO_2853     FALSE 0.270 120.000 0.113 NA   NA
 10161312 10161313 HVO_3059 HVO_2855     FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 10161315 10161316 HVO_2857 HVO_2858 suhB1 asnC FALSE 0.442 116.000 0.300 1.000 N NA
 10161316 10161317 HVO_2858 HVO_2859 asnC   FALSE 0.427 135.000 0.250 NA   NA
 10161318 10161319 HVO_2860 HVO_2861     TRUE 0.606 51.000 0.353 NA   NA
 10161320 10161321 HVO_2862 HVO_2863 glyA1   FALSE 0.068 98.000 0.000 NA   NA
 10161321 10161322 HVO_2863 HVO_2864     TRUE 0.970 -3.000 0.091 NA   NA
 10161322 10161323 HVO_2864 HVO_2865     FALSE 0.067 100.000 0.000 NA   NA
 10161324 10161325 HVO_2866 HVO_2867     FALSE 0.129 54.000 0.000 NA   NA
 10161326 10161327 HVO_2868 HVO_2869     FALSE 0.003 638.000 0.000 NA   NA
 10161330 10161331 HVO_2872 HVO_2873   fen1 FALSE 0.114 67.000 0.000 NA   NA
 10161331 10161332 HVO_2873 HVO_2874 fen1   FALSE 0.263 28.000 0.000 NA   NA
 10161333 10161334 HVO_2875 HVO_2876     TRUE 0.510 22.000 0.012 NA   NA
 10161336 10161337 HVO_2878 HVO_2879   ocd2 TRUE 0.731 74.000 0.727 NA   NA
 10161338 10161339 HVO_2880 HVO_2881     FALSE 0.210 35.000 0.000 NA   NA
 10161339 10161340 HVO_2881 HVO_2882     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 10161340 10161341 HVO_2882 HVO_2883     FALSE 0.048 184.000 0.000 NA   NA
 10161342 10161343 HVO_2884 HVO_2885   gltP2 FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 10161343 10161344 HVO_2885 HVO_2886 gltP2   FALSE 0.164 88.000 0.000 1.000   NA
 10161345 10161346 HVO_2887 HVO_2888   elp3 FALSE 0.139 84.000 0.000 1.000 N NA
 10161346 10161347 HVO_2888 HVO_2889 elp3   FALSE 0.210 135.000 0.011 1.000 N NA
 10161347 10161348 HVO_2889 HVO_2890     TRUE 0.511 127.000 0.400 NA   NA
 10161348 10161349 HVO_2890 HVO_2891   tdk TRUE 0.635 9.000 0.008 NA   NA
 10161349 10161350 HVO_2891 HVO_2892A tdk msuE FALSE 0.195 119.000 0.004 1.000   NA
 10161352 10161353 HVO_2894 HVO_2895     TRUE 0.658 35.000 0.250 NA   NA
 10161353 10161354 HVO_2895 HVO_2896   mutY1 FALSE 0.072 109.000 0.000 NA   NA
 10161357 10161358 HVO_2899 HVO_2900     FALSE 0.105 148.000 0.007 NA N NA
 10161358 10161359 HVO_2900 HVO_2901     FALSE 0.044 236.000 0.000 1.000   NA
 10161359 10161360 HVO_2901 HVO_2902   gatE FALSE 0.262 48.000 0.000 1.000   NA
 10161361 10161362 HVO_2903 HVO_2904     TRUE 0.810 2.000 0.000 NA   NA
 10161364 10161365 HVO_2906 HVO_2907     TRUE 0.970 -3.000 0.095 NA   NA
 10161366 10161367 HVO_2908 HVO_2909 dchpS   FALSE 0.171 189.000 0.117 NA   NA
 10161369 10161370 HVO_2911 HVO_2912 phr1   FALSE 0.145 85.000 0.004 NA   NA
 10161370 10161371 HVO_2912 HVO_2913   sod2 FALSE 0.186 138.000 0.020 NA   NA
 10161373 10161374 HVO_2915 HVO_2916     FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10161376 10161377 HVO_2918 HVO_2919 hts hdrB TRUE 0.978 -3.000 0.134 1.000 N NA
 10161377 10161378 HVO_2919 HVO_2920 hdrB   TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10161378 10161379 HVO_2920 HVO_2921     FALSE 0.076 117.000 0.000 NA   NA
 10161379 10161380 HVO_2921 HVO_2922     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10161380 10161381 HVO_2922 HVO_2923   psmA2 FALSE 0.418 160.000 0.333 NA   NA
 10161381 10161382 HVO_2923 HVO_2924 psmA2   TRUE 0.969 1.000 0.107 1.000   NA
 10161382 10161383 HVO_2924 HVO_2925     FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 10161383 10161384 HVO_2925 HVO_2926     FALSE 0.028 217.000 0.000 NA   NA
 10161384 10161385 HVO_2926 HVO_3060     FALSE 0.091 85.000 0.000 NA   NA
 10161387 10161388 HVO_2929 HVO_2930 ssnA   FALSE 0.108 109.000 0.000 1.000 N NA
 10161389 10161390 HVO_2931 HVO_2932   gbp4 FALSE 0.419 55.000 0.154 NA   NA
 10161391 10161392 HVO_2933 HVO_2934     FALSE 0.374 19.000 0.000 NA   NA
 10161393 10161394 HVO_2935 HVO_3061     FALSE 0.007 378.000 0.000 NA   NA
 10161394 10161395 HVO_3061 HVO_3062     FALSE 0.076 114.000 0.000 NA   NA
 10161395 10161396 HVO_3062 HVO_3063     FALSE 0.030 214.000 0.000 NA   NA
 10161396 10161397 HVO_3063 HVO_3064     FALSE 0.068 98.000 0.000 NA   NA
 10161400 10161401 HVO_2942 HVO_2943   pyrD FALSE 0.196 61.000 0.011 NA   NA
 10161401 10161402 HVO_2943 HVO_2944 pyrD   FALSE 0.135 125.000 0.003 NA   NA
 10161403 10161404 HVO_2945 HVO_2946 valS cgs FALSE 0.162 92.000 0.002 1.000 N NA
 10161404 10161405 HVO_2946 HVO_2947 cgs pheT FALSE 0.029 248.000 0.000 1.000 N NA
 10161405 10161406 HVO_2947 HVO_2948 pheT pheS TRUE 0.996 0.000 0.046 0.001 Y NA
 10161406 10161407 HVO_2948 HVO_2949 pheS soxB2 FALSE 0.022 280.000 0.000 1.000 N NA
 10161409 10161410 HVO_2951 HVO_2952 trpS1 endA TRUE 0.980 -3.000 0.111 1.000   NA
 10161410 10161411 HVO_2952 HVO_2953 endA   TRUE 0.567 186.000 0.769 1.000   NA
 10161414 10161415 HVO_2956 HVO_2957   lipA FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 10161415 10161416 HVO_2957 HVO_2958 lipA oadhA1 FALSE 0.028 297.000 0.004 1.000 N NA
 10161416 10161417 HVO_2958 HVO_2959 oadhA1 oadhB1 TRUE 0.999 -3.000 0.909 0.002 Y NA
 10161417 10161418 HVO_2959 HVO_2960 oadhB1 dsa TRUE 0.994 4.000 0.545 0.055 Y NA
 10161418 10161419 HVO_2960 HVO_2961 dsa lpdA TRUE 0.996 0.000 0.286 1.000 Y NA
 10161420 10161421 HVO_2962 HVO_2963     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 10161421 10161422 HVO_2963 HVO_2964     FALSE 0.035 205.000 0.000 NA   NA
 10161422 10161423 HVO_2964 HVO_2965   serB FALSE 0.134 52.000 0.000 NA   NA
 10161427 10161428 HVO_2969 HVO_2970 thrC3   FALSE 0.187 95.000 0.018 1.000 N NA
 10161428 10161429 HVO_2970 HVO_2971     TRUE 0.610 83.000 0.545 NA   NA
 10161429 10161430 HVO_2971 HVO_2972     FALSE 0.378 97.000 0.286 NA   NA
 10161430 10161431 HVO_2972 HVO_2973     TRUE 0.594 73.000 0.400 NA   NA
 10161432 10161433 HVO_2974 HVO_2975     TRUE 0.976 -3.000 0.154 NA   NA
 10161434 10161435 HVO_2976 HVO_2977 cstA arsA2 FALSE 0.433 135.000 0.057 0.065 N NA
 10161435 10161436 HVO_2977 HVO_2978 arsA2   TRUE 0.947 2.000 0.102 NA   NA
 10161437 10161438 HVO_2979 HVO_2980     TRUE 0.981 -3.000 0.222 NA   NA
 10161438 10161439 HVO_2980 HVO_2981   upp FALSE 0.118 109.000 0.005 NA   NA
 10161439 10161440 HVO_2981 HVO_2982 upp   FALSE 0.129 152.000 0.005 NA   NA
 10161441 10161442 HVO_2983 HVO_2984   trpY FALSE 0.026 334.000 0.005 1.000   NA
 10161448 10161449 HVO_2990 HVO_2991     FALSE 0.020 243.000 0.000 NA   NA
 10161449 10161450 HVO_2991 HVO_2992     FALSE 0.081 91.000 0.000 NA   NA
 10161450 10161451 HVO_2992 HVO_2993   pibD FALSE 0.246 82.000 0.005 1.000   NA
 10161451 10161452 HVO_2993 HVO_2994 pibD   FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 10161452 10161453 HVO_2994 HVO_2995     FALSE 0.004 547.000 0.000 NA   NA
 10161453 10161454 HVO_2995 HVO_2996     FALSE 0.370 141.000 0.154 1.000 N NA
 10161454 10161455 HVO_2996 HVO_2997   metY2 FALSE 0.101 105.000 0.000 1.000 N NA
 10161455 10161456 HVO_2997 HVO_2998 metY2 metX TRUE 0.765 133.000 0.231 1.000 Y NA
 10161456 10161457 HVO_2998 HVO_2999 metX metY1 TRUE 0.998 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 10161459 10161460 HVO_3001 HVO_3002     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 10161460 10161461 HVO_3002 HVO_3003     FALSE 0.076 115.000 0.000 NA   NA
 10161466 10161467 HVO_3008 HVO_3009   uspA25 FALSE 0.224 81.000 0.027 NA   NA
 10161468 10161469 HVO_3010 HVO_3011 hef   FALSE 0.089 86.000 0.000 NA   NA
 10161469 10161470 HVO_3011 HVO_3012     FALSE 0.084 147.000 0.000 NA   NA
 10161470 10161471 HVO_3012 HVO_3013     TRUE 0.732 49.000 0.629 NA   NA
 10161471 10161472 HVO_3013 HVO_3014   era TRUE 0.835 7.000 0.111 NA   NA
 10161473 10158462 HVO_3015 HVO_0001   orc1 FALSE 0.002 1114.000 0.000 NA   NA
 10157441 10157442 HVO_B0001 HVO_B0002 orc6   FALSE 0.121 122.000 0.000 1.000 N NA
 10157443 10157444 HVO_B0003 HVO_B0004   glyA2 FALSE 0.022 235.000 0.000 NA   NA
 10157448 10157449 HVO_B0008 HVO_B0009     TRUE 0.984 -7.000 0.500 NA   NA
 10157450 10157451 HVO_B0010 HVO_B0011   soxA1 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157451 10157452 HVO_B0011 HVO_B0012 soxA1 betl2 FALSE 0.020 291.000 0.000 1.000 N NA
 10157452 10157453 HVO_B0012 HVO_B0013 betl2   FALSE 0.199 37.000 0.000 NA   NA
 10157453 10157454 HVO_B0013 HVO_B0014   gcvT1 FALSE 0.030 214.000 0.000 NA   NA
 10157455 10157456 HVO_B0015 HVO_B0016     FALSE 0.151 132.000 0.006 NA   NA
 10157456 10157457 HVO_B0016 HVO_B0017     FALSE 0.076 156.000 0.000 NA   NA
 10157457 10157458 HVO_B0017 HVO_B0018   soj TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157459 10157460 HVO_B0019 HVO_B0020     FALSE 0.392 159.000 0.200 1.000   NA
 10157460 10157461 HVO_B0020 HVO_B0021   dppA10 TRUE 0.581 118.000 0.500 1.000   NA
 10157461 10157462 HVO_B0021 HVO_B0022 dppA10 dppB10 TRUE 0.875 31.000 0.000 0.039 Y NA
 10157462 10157463 HVO_B0022 HVO_B0023 dppB10 dppC10 TRUE 0.999 -3.000 0.814 0.039 Y NA
 10157463 10157464 HVO_B0023 HVO_B0024 dppC10 dppDF10 TRUE 0.994 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 10157466 10157467 HVO_B0026 HVO_B0027     FALSE 0.014 786.000 0.000 0.055   NA
 10157467 10157468 HVO_B0027 HVO_B0028     TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000   NA
 10157468 10157469 HVO_B0028 HVO_B0029     FALSE 0.420 61.000 0.000 0.030   NA
 10157470 10157471 HVO_B0030 HVO_B0031     FALSE 0.169 142.000 0.000 1.000   NA
 10157474 10157475 HVO_B0034 HVO_B0035 tsgA7 tsgB7 TRUE 0.951 55.000 1.000 0.039 Y NA
 10157475 10157476 HVO_B0035 HVO_B0036 tsgB7 tsgC7 TRUE 0.997 3.000 0.667 0.039 Y NA
 10157476 10157477 HVO_B0036 HVO_B0037 tsgC7 tsgE7 TRUE 0.995 4.000 0.667 0.039 Y NA
 10157477 10157478 HVO_B0037 HVO_B0038 tsgE7 tsgD7 TRUE 0.997 3.000 0.667 0.004 Y NA
 10157481 10157482 HVO_B0040 HVO_B0041 arcR14 iucC FALSE 0.005 659.000 0.000 1.000 N NA
 10157482 10157483 HVO_B0041 HVO_B0042 iucC hxyA TRUE 0.943 9.000 0.062 NA Y NA
 10157483 10157484 HVO_B0042 HVO_B0043 hxyA iucB TRUE 0.983 -3.000 0.286 NA N NA
 10157484 10157485 HVO_B0043 HVO_B0044 iucB iucA TRUE 0.986 -3.000 0.279 1.000 N NA
 10157485 10157486 HVO_B0044 HVO_B0045 iucA bdb TRUE 0.986 -3.000 0.279 1.000 N NA
 10157486 10157487 HVO_B0045 HVO_B0046 bdb dat TRUE 0.998 -3.000 0.289 0.013 Y NA
 10157487 10157488 HVO_B0046 HVO_B0047 dat   FALSE 0.008 458.000 0.000 1.000 N NA
 10157488 10157489 HVO_B0047 HVO_B0048   cbiE FALSE 0.125 89.000 0.000 1.000 N NA
 10157489 10157490 HVO_B0048 HVO_B0049 cbiE cbiC TRUE 0.994 -7.000 0.069 0.009 Y NA
 10157490 10157491 HVO_B0049 HVO_B0050 cbiC cobN TRUE 0.990 -7.000 0.069 1.000 Y NA
 10157493 10157494 HVO_B0052 HVO_B0053     TRUE 0.612 5.000 0.000 NA   NA
 10157494 10157495 HVO_B0053 HVO_B0054   cbiK TRUE 0.983 3.000 0.700 NA   NA
 10157495 10157496 HVO_B0054 HVO_B0055 cbiK   TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 10157496 10157497 HVO_B0055 HVO_B0056     TRUE 0.995 -3.000 0.900 NA   NA
 10157497 10157498 HVO_B0056 HVO_B0057   cobJ TRUE 0.913 2.000 0.025 NA   NA
 10157498 10157499 HVO_B0057 HVO_B0058 cobJ cobH TRUE 0.987 4.000 0.025 0.001 Y NA
 10157499 10157500 HVO_B0058 HVO_B0059 cobH   TRUE 0.993 -3.000 0.023 1.000 Y NA
 10157500 10157501 HVO_B0059 HVO_B0060   cbiF TRUE 0.993 -7.000 0.020 0.009 Y NA
 10157501 10157502 HVO_B0060 HVO_B0061 cbiF cbiL TRUE 0.998 -3.000 0.291 0.009 Y NA
 10157502 10157503 HVO_B0061 HVO_B0062 cbiL cbiT TRUE 0.997 -3.000 0.090 0.009 Y NA
 10157504 10157505 HVO_B0063 HVO_B0064     TRUE 0.927 3.000 0.105 NA   NA
 10157505 10157506 HVO_B0064 HVO_B0065     TRUE 0.993 0.000 0.833 NA   NA
 10157506 10157507 HVO_B0065 HVO_B0066   trh10 FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 10157508 10157509 HVO_B0067 HVO_B0068     FALSE 0.089 128.000 0.000 NA   NA
 10157509 10157510 HVO_B0068 HVO_B0069   gabD TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157512 10157513 HVO_B0071 HVO_B0072 adh2   FALSE 0.150 154.000 0.000 1.000   NA
 10157513 10157514 HVO_B0072 HVO_B0073     FALSE 0.433 75.000 0.000 0.029   NA
 10157514 10157515 HVO_B0073 HVO_B0074     FALSE 0.031 213.000 0.000 NA   NA
 10157515 10157516 HVO_B0074 HVO_B0075     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157516 10157517 HVO_B0075 HVO_B0076   hyuA4 TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10157517 10157518 HVO_B0076 HVO_B0077 hyuA4   TRUE 0.978 -7.000 0.346 NA   NA
 10157518 10157519 HVO_B0077 HVO_B0078   dppF11 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157519 10157520 HVO_B0078 HVO_B0079 dppF11 dppD11 TRUE 0.995 2.000 0.167 0.006 Y NA
 10157520 10157521 HVO_B0079 HVO_B0080 dppD11 dppC11 TRUE 0.996 -3.000 0.233 1.000 Y NA
 10157521 10157522 HVO_B0080 HVO_B0081 dppC11 dppB11 TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.039 Y NA
 10157522 10157523 HVO_B0081 HVO_B0082 dppB11 dppA11 TRUE 0.997 -3.000 0.200 0.039 Y NA
 10157525 10157526 HVO_B0084 HVO_B0085     FALSE 0.055 176.000 0.000 NA   NA
 10157527 10157528 HVO_B0086 HVO_B0087     FALSE 0.246 109.000 0.000 0.054 N NA
 10157529 10157530 HVO_B0088 HVO_B0089   dppF12 FALSE 0.051 181.000 0.000 NA   NA
 10157530 10157531 HVO_B0089 HVO_B0090 dppF12 dppD12 TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.006 Y NA
 10157531 10157532 HVO_B0090 HVO_B0091 dppD12 dppC12 TRUE 0.944 46.000 1.000 1.000 Y NA
 10157532 10157533 HVO_B0091 HVO_B0092 dppC12 dppB12 TRUE 0.997 3.000 0.667 0.038 Y NA
 10157533 10157534 HVO_B0092 HVO_B0093 dppB12 dppA12 TRUE 0.931 74.000 0.667 0.038 Y NA
 10157534 10157535 HVO_B0093 HVO_B0094 dppA12   FALSE 0.076 115.000 0.000 NA   NA
 10157538 10157539 HVO_B0097 HVO_B0098     FALSE 0.007 644.000 0.000 1.000   NA
 10157539 10157540 HVO_B0098 HVO_B0099   mdcM FALSE 0.131 99.000 0.000 1.000   NA
 10157540 10157541 HVO_B0099 HVO_B0100 mdcM aldY3 FALSE 0.171 141.000 0.000 1.000   NA
 10157543 10157544 HVO_B0102 HVO_B0103     FALSE 0.129 101.000 0.000 1.000   NA
 10157546 10157547 HVO_B0105 HVO_B0106   tsgA8 FALSE 0.163 125.000 0.000 1.000   NA
 10157547 10157548 HVO_B0106 HVO_B0107 tsgA8 tsgB8 TRUE 0.857 59.000 0.200 0.038 Y NA
 10157548 10157549 HVO_B0107 HVO_B0108 tsgB8 tsgC8 TRUE 0.993 0.000 0.000 0.038 Y NA
 10157549 10157550 HVO_B0108 HVO_B0109 tsgC8 tsgD8 TRUE 0.640 96.000 0.000 0.038 Y NA
 10157550 10157551 HVO_B0109 HVO_B0110 tsgD8   FALSE 0.095 169.000 0.000 1.000 N NA
 10157551 10157552 HVO_B0110 HVO_B0111     FALSE 0.128 88.000 0.000 1.000 N NA
 10157552 10157553 HVO_B0111 HVO_B0113     TRUE 0.897 3.000 0.067 NA N NA
 10157553 10157554 HVO_B0113 HVO_B0114   arcR16 FALSE 0.016 216.000 0.000 NA N NA
 10157554 10157555 HVO_B0114 HVO_B0115 arcR16   FALSE 0.100 100.000 0.000 1.000 N NA
 10157555 10157556 HVO_B0115 HVO_B0116     TRUE 0.769 52.000 0.000 0.054 Y NA
 10157556 10157557 HVO_B0116 HVO_B0117     FALSE 0.003 792.000 0.000 NA   NA
 10157557 10157558 HVO_B0117 HVO_B0118   sph2 FALSE 0.390 91.000 0.250 NA   NA
 10157562 10157563 HVO_B0122 HVO_B0123 dppA13 dppB13 TRUE 0.851 112.000 0.429 0.038 Y NA
 10157563 10157564 HVO_B0123 HVO_B0124 dppB13 dppC13 TRUE 0.998 -7.000 0.714 0.038 Y NA
 10157564 10157565 HVO_B0124 HVO_B0125 dppC13 dppD13 TRUE 0.796 181.000 0.714 1.000 Y NA
 10157566 10157567 HVO_B0126 HVO_B0127     FALSE 0.067 100.000 0.000 NA   NA
 10157570 10157571 HVO_B0130 HVO_B0131     FALSE 0.004 561.000 0.000 NA   NA
 10157571 10157572 HVO_B0131 HVO_B0132     FALSE 0.074 111.000 0.000 NA   NA
 10157573 10157574 HVO_B0133 HVO_B0134     TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 10157574 10157575 HVO_B0134 HVO_B0135     FALSE 0.087 87.000 0.000 NA   NA
 10157575 10157576 HVO_B0135 HVO_B0136   pcbD2 FALSE 0.077 155.000 0.000 NA   NA
 10157578 10157579 HVO_B0138 HVO_B0139     TRUE 0.987 -3.000 0.067 0.038   NA
 10157580 10157581 HVO_B0140 HVO_B0141     TRUE 0.797 -10.000 0.000 NA   NA
 10157581 10157582 HVO_B0141 HVO_B0142     FALSE 0.076 94.000 0.000 NA   NA
 10157585 10157586 HVO_B0145 HVO_B0146     FALSE 0.065 211.000 0.000 1.000   NA
 10157587 10157588 HVO_B0148 HVO_B0149   orf3 FALSE 0.352 169.000 0.286 NA   NA
 10157591 10157592 HVO_B0152 HVO_B0152A     FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10157592 10157593 HVO_B0152A HVO_B0153   capB FALSE 0.106 80.000 0.000 NA   NA
 10157593 10157594 HVO_B0153 HVO_B0153A capB   TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA   NA
 10157598 10157599 HVO_B0157 HVO_B0158     FALSE 0.002 1249.000 0.000 NA   NA
 10157599 10157600 HVO_B0158 HVO_B0159   boa9 FALSE 0.075 113.000 0.000 NA   NA
 10157601 10157602 HVO_B0160 HVO_B0161   narB TRUE 0.980 0.000 0.261 NA   NA
 10157602 10157603 HVO_B0161 HVO_B0162 narB qcrB TRUE 0.995 0.000 0.261 NA Y NA
 10157603 10157604 HVO_B0162 HVO_B0163 qcrB   TRUE 0.992 -7.000 1.000 NA   NA
 10157604 10157605 HVO_B0163 HVO_B0164   narG TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 10157605 10157606 HVO_B0164 HVO_B0165 narG narH TRUE 0.998 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 10157606 10157607 HVO_B0165 HVO_B0166 narH   TRUE 0.671 58.000 0.583 NA   NA
 10157607 10157608 HVO_B0166 HVO_B0167   narJ TRUE 0.896 11.000 0.381 NA   NA
 10157608 10157609 HVO_B0167 HVO_B0168 narJ   TRUE 0.974 -3.000 0.143 NA   NA
 10157609 10157610 HVO_B0168 HVO_B0169   prp TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157610 10157611 HVO_B0169 HVO_B0170 prp mrp2 TRUE 0.862 3.000 0.000 1.000   NA
 10157611 10157612 HVO_B0170 HVO_B0171 mrp2   FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 10157613 10157614 HVO_B0172 HVO_B0173 phoT3 sph4 FALSE 0.002 1029.000 0.000 NA   NA
 10157614 10157615 HVO_B0173 HVO_B0174 sph4   FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 10157615 10157616 HVO_B0174 HVO_B0175   kinA6 FALSE 0.080 121.000 0.000 NA   NA
 10157616 10157617 HVO_B0175 HVO_B0176 kinA6 cbiQ3 FALSE 0.043 237.000 0.000 1.000   NA
 10157617 10157618 HVO_B0176 HVO_B0177 cbiQ3 cbiO3 TRUE 0.994 -3.000 0.625 1.000   NA
 10157618 10157619 HVO_B0177 HVO_B0178 cbiO3   TRUE 0.919 20.000 0.714 NA   NA
 10157619 10157620 HVO_B0178 HVO_B0179     FALSE 0.009 337.000 0.000 NA   NA
 10157620 10157621 HVO_B0179 HVO_B0180     TRUE 0.880 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10157622 10157623 HVO_B0181 HVO_B0182 fjo21   FALSE 0.068 98.000 0.000 NA   NA
 10157623 10157624 HVO_B0182 HVO_B0183   racD FALSE 0.162 62.000 0.000 1.000 N NA
 10157624 10157625 HVO_B0183 HVO_B0184 racD dppA14 FALSE 0.021 285.000 0.000 1.000 N NA
 10157625 10157626 HVO_B0184 HVO_B0185 dppA14 dppB14 TRUE 0.708 83.000 0.000 0.038 Y NA
 10157626 10157627 HVO_B0185 HVO_B0186 dppB14 dppC14 TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.038 Y NA
 10157627 10157628 HVO_B0186 HVO_B0187 dppC14   FALSE 0.141 374.000 0.000 0.038 Y NA
 10157628 10157629 HVO_B0187 HVO_B0188     TRUE 0.989 3.000 0.625 0.038 N NA
 10157629 10157630 HVO_B0188 HVO_B0189     TRUE 0.620 48.000 0.100 0.038 N NA
 10157630 10157631 HVO_B0189 HVO_B0190     TRUE 0.998 0.000 0.632 1.000 Y NA
 10157631 10157632 HVO_B0190 HVO_B0191     FALSE 0.008 349.000 0.000 NA   NA
 10157633 10157634 HVO_B0192 HVO_B0193     TRUE 0.987 2.000 0.667 NA   NA
 10157634 10157635 HVO_B0193 HVO_B0194     FALSE 0.008 353.000 0.000 NA   NA
 10157635 10157636 HVO_B0194 HVO_B0195     FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10157638 10157639 HVO_B0197 HVO_B0198     TRUE 0.991 7.000 1.000 1.000 Y NA
 10157640 10157641 HVO_B0199 HVO_B0200   aceB2 FALSE 0.004 864.000 0.000 1.000 N NA
 10157642 10157643 HVO_B0201 HVO_B0202 arcR18   FALSE 0.411 183.000 0.500 NA   NA
 10157644 10157645 HVO_B0203 HVO_B0204     FALSE 0.038 200.000 0.000 NA   NA
 10157646 10157647 HVO_B0205 HVO_B0206 lccA   FALSE 0.093 136.000 0.000 NA   NA
 10157649 10157650 HVO_B0208 HVO_B0209     FALSE 0.135 96.000 0.030 NA N NA
 10157650 10157651 HVO_B0209 HVO_B0210     FALSE 0.301 46.000 0.045 NA N NA
 10157651 10157652 HVO_B0210 HVO_B0211     TRUE 0.966 4.000 0.500 NA   NA
 10157653 10157654 HVO_B0212 HVO_B0213 hybF   FALSE 0.100 82.000 0.000 NA   NA
 10157654 10157655 HVO_B0213 HVO_B0214   idi TRUE 0.965 -3.000 0.019 1.000   NA
 10157657 10157658 HVO_B0216 HVO_B0217   livJ6 FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 10157658 10157659 HVO_B0217 HVO_B0218 livJ6 livH6 FALSE 0.136 283.000 0.000 NA Y NA
 10157659 10157660 HVO_B0218 HVO_B0219 livH6 livM6 TRUE 0.996 -3.000 0.033 0.038 Y NA
 10157660 10157661 HVO_B0219 HVO_B0220 livM6 livG6 TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10157661 10157662 HVO_B0220 HVO_B0221 livG6 livF6 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.022 Y NA
 10157662 10157663 HVO_B0221 HVO_B0222 livF6   TRUE 0.503 190.000 0.667 1.000   NA
 10157664 10157665 HVO_B0223 HVO_B0224   yoaN FALSE 0.273 121.000 0.042 1.000   NA
 10157667 10157668 HVO_B0226 HVO_B0227   tsgD9 FALSE 0.004 1496.000 0.000 1.000   NA
 10157669 10157670 HVO_B0228 HVO_B0229 tsgA9 tsgB9 TRUE 0.984 7.000 0.250 0.038 Y NA
 10157670 10157671 HVO_B0229 HVO_B0230 tsgB9 tsgC9 TRUE 0.998 -7.000 0.667 0.038 Y NA
 10157671 10157672 HVO_B0230 HVO_B0231 tsgC9   TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157673 10157674 HVO_B0232 HVO_B0233   xsa FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10157676 10157677 HVO_B0235 HVO_B0236 fdhG nuoF TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.038   NA
 10157680 10157681 HVO_B0239 HVO_B0240 fdh   FALSE 0.257 81.000 0.045 NA   NA
 10157682 10157683 HVO_B0241 HVO_B0242     TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 10157683 10157684 HVO_B0242 HVO_B0243   cobW2 FALSE 0.088 143.000 0.000 NA   NA
 10157685 10157686 HVO_B0244 HVO_B0246 aor1   FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 10157690 10157691 HVO_B0250 HVO_B0251 cbg1   FALSE 0.175 132.000 0.000 1.000   NA
 10157691 10157692 HVO_B0251 HVO_B0252     FALSE 0.003 822.000 0.000 NA   NA
 10157692 10157693 HVO_B0252 HVO_B0253   suhB3 FALSE 0.011 309.000 0.000 NA   NA
 10157693 10157694 HVO_B0253 HVO_B0255 suhB3 arcR19 FALSE 0.005 690.000 0.000 1.000 N NA
 10157696 10157697 HVO_B0257 HVO_B0258 gabT5   TRUE 0.907 19.000 0.667 NA N NA
 10157699 10157700 HVO_B0260 HVO_B0261 betL1 gabT4 TRUE 0.612 173.000 0.833 1.000 N NA
 10157701 10157702 HVO_B0262 HVO_B0263 ilvA3   TRUE 0.991 -3.000 0.400 1.000   NA
 10157703 10157704 HVO_B0264 HVO_B0265 serA4   TRUE 0.960 7.000 0.667 1.000 N NA
 10157705 10157706 HVO_B0266 HVO_B0267 gdhB   TRUE 0.890 27.000 0.056 1.000 Y NA
 10157707 10157708 HVO_B0268 HVO_B0269     FALSE 0.112 66.000 0.000 NA   NA
 10157712 10157713 HVO_B0273 HVO_B0274 kinA7 cdsA FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10157713 10157714 HVO_B0274 HVO_B0275 cdsA   TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 10157717 10157718 HVO_B0278 HVO_B0279     FALSE 0.116 59.000 0.000 NA   NA
 10157718 10157719 HVO_B0279 HVO_B0280     FALSE 0.008 345.000 0.000 NA   NA
 10157720 10157721 HVO_B0281 HVO_B0282     FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 10157721 10157722 HVO_B0282 HVO_B0283     FALSE 0.076 114.000 0.000 NA   NA
 10157722 10157723 HVO_B0283 HVO_B0284     FALSE 0.130 100.000 0.000 1.000   NA
 10157723 10157724 HVO_B0284 HVO_B0285   tfb3 FALSE 0.092 171.000 0.000 1.000 N NA
 10157725 10157726 HVO_B0286 HVO_B0287     FALSE 0.039 199.000 0.000 NA   NA
 10157727 10157728 HVO_B0288 HVO_B0289   bioB FALSE 0.089 142.000 0.000 NA   NA
 10157730 10157731 HVO_B0291 HVO_B0292   ugpB FALSE 0.129 144.000 0.000 1.000 N NA
 10157731 10157732 HVO_B0292 HVO_B0293 ugpB ugpA TRUE 0.966 23.000 0.312 0.038 Y NA
 10157732 10157733 HVO_B0293 HVO_B0294 ugpA ugpE TRUE 0.995 5.000 0.812 0.038 Y NA
 10157733 10157734 HVO_B0294 HVO_B0295 ugpE ugpC TRUE 0.979 11.000 0.312 0.038 Y NA
 10157735 10157736 HVO_B0296 HVO_B0297     FALSE 0.075 112.000 0.000 NA   NA
 10157738 10157739 HVO_B0299 HVO_B0300     TRUE 0.959 2.000 0.087 1.000   NA
 10157739 10157740 HVO_B0300 HVO_B0301     TRUE 0.503 158.000 0.055 0.001   NA
 10157740 10157741 HVO_B0301 HVO_B0302   hyuH FALSE 0.177 84.000 0.000 1.000   NA
 10157741 10157742 HVO_B0302 HVO_B0303 hyuH pbuX TRUE 0.591 84.000 0.000 1.000 Y NA
 10157742 10157743 HVO_B0303 HVO_B0304 pbuX   FALSE 0.069 164.000 0.000 NA   NA
 10157743 10157744 HVO_B0304 HVO_B0305     FALSE 0.111 65.000 0.000 NA   NA
 10157744 10157745 HVO_B0305 HVO_B0306   amaB4 TRUE 0.595 27.000 0.079 NA   NA
 10157746 10157747 HVO_B0307 HVO_B0308     FALSE 0.003 705.000 0.000 NA   NA
 10157747 10157748 HVO_B0308 HVO_B0309   xdhD2 TRUE 0.998 2.000 1.000 0.037 Y NA
 10157748 10157749 HVO_B0309 HVO_B0310 xdhD2 coxM TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.037 Y NA
 10157749 10157750 HVO_B0310 HVO_B0311 coxM   FALSE 0.043 116.000 0.000 NA N NA
 10157750 10157751 HVO_B0311 HVO_B0312     FALSE 0.247 30.000 0.000 NA   NA
 10157751 10157752 HVO_B0312 HVO_B0313   glmU TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157753 10157754 HVO_B0314 HVO_B0315 tsgC13 tsgB13 TRUE 0.991 -3.000 0.200 0.038   NA
 10157754 10157755 HVO_B0315 HVO_B0316 tsgB13 tsgD13 TRUE 0.981 -3.000 0.133 1.000   NA
 10157756 10157757 HVO_B0317 HVO_B0318 ade tsgA13 FALSE 0.121 170.000 0.000 1.000   NA
 10157757 10157758 HVO_B0318 HVO_B0319 tsgA13 arcR20 FALSE 0.018 334.000 0.000 1.000   NA
 10157759 10157760 HVO_B0320 HVO_B0321 arcR21   FALSE 0.130 104.000 0.000 1.000   NA
 10157760 10157761 HVO_B0321 HVO_B0322   pelZ FALSE 0.130 100.000 0.000 1.000   NA
 10157762 10157763 HVO_B0323 HVO_B0324     FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 10157764 10157765 HVO_B0325 HVO_B0326     TRUE 0.540 7.000 0.000 NA   NA
 10157765 10157766 HVO_B0326 HVO_B0327     FALSE 0.005 491.000 0.000 NA   NA
 10157767 10157768 HVO_B0328 HVO_B0329 dppA15 dppBC15 FALSE 0.443 208.000 0.000 0.038 Y NA
 10157770 10157771 HVO_B0331 HVO_B0332 dppD15 dppF15 TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 10157772 10157773 HVO_B0333 HVO_B0334     FALSE 0.410 79.000 0.000 0.030   NA
 10157773 10157774 HVO_B0334 HVO_B0335     FALSE 0.093 133.000 0.000 NA   NA
 10157774 10157775 HVO_B0335 HVO_B0336     FALSE 0.081 91.000 0.000 NA   NA
 10157775 10157776 HVO_B0336 HVO_B0337   garD FALSE 0.008 577.000 0.000 1.000   NA
 10157776 10157777 HVO_B0337 HVO_B0338 garD   TRUE 0.992 -3.000 0.136 0.001   NA
 10157778 10157779 HVO_B0339 HVO_B0340     FALSE 0.076 94.000 0.000 NA   NA
 10157779 10157780 HVO_B0340 HVO_B0341     FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 10157781 10157782 HVO_B0342 HVO_B0343 mer2 lplD FALSE 0.056 83.000 0.000 NA N NA
 10157782 10157783 HVO_B0343 HVO_B0344 lplD uspA33 FALSE 0.205 64.000 0.000 1.000   NA
 10157783 10157784 HVO_B0344 HVO_B0345 uspA33   FALSE 0.386 109.000 0.200 1.000   NA
 10157784 10157785 HVO_B0345 HVO_B0346     TRUE 0.633 99.000 0.000 0.026 Y NA
 10157785 10157786 HVO_B0346 HVO_B0347     FALSE 0.149 93.000 0.000 1.000   NA
 10157787 10157788 HVO_B0348 HVO_B0349     FALSE 0.029 215.000 0.000 NA   NA
 10157788 10157789 HVO_B0349 HVO_B0350   palA FALSE 0.005 493.000 0.000 NA   NA
 10157791 10157792 HVO_B0352 HVO_B0353     FALSE 0.169 43.000 0.000 NA   NA
 10157793 10157794 HVO_B0354 HVO_B0355     FALSE 0.184 220.000 0.286 NA   NA
 10157794 10157795 HVO_B0355 HVO_B0356     TRUE 0.718 17.000 0.091 NA   NA
 10157795 10157796 HVO_B0356 HVO_B0357   speE TRUE 0.796 7.000 0.058 NA   NA
 10157796 10157797 HVO_B0357 HVO_B0358 speE   FALSE 0.229 70.000 0.019 NA   NA
 10157797 10157798 HVO_B0358 HVO_B0359     FALSE 0.053 178.000 0.000 NA   NA
 10157798 10157799 HVO_B0359 HVO_B0360     FALSE 0.019 249.000 0.000 NA   NA
 10157800 10157801 HVO_B0361 HVO_B0362     FALSE 0.485 133.000 0.333 NA   NA
 10157801 10157802 HVO_B0362 HVO_B0363   dmsA TRUE 0.990 -7.000 0.750 NA   NA
 10157802 10157803 HVO_B0363 HVO_B0364 dmsA hmoA TRUE 0.996 3.000 1.000 1.000 Y NA
 10157803 10157804 HVO_B0364 HVO_B0365 hmoA moz TRUE 0.998 0.000 1.000 NA Y NA
 10157804 10157805 HVO_B0365 HVO_B0366 moz   TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10157805 10157806 HVO_B0366 HVO_B0367     FALSE 0.322 152.000 0.000 0.037   NA
 10157806 10157807 HVO_B0367 HVO_B0368   mobA2 TRUE 0.767 5.000 0.000 1.000   NA
 10157807 10157808 HVO_B0368 HVO_B0369 mobA2   TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 10157808 10157809 HVO_B0369 HVO_B0370     TRUE 0.948 -19.000 0.193 NA N NA
 10157811 10157812 HVO_B0372 HVO_B0374     FALSE 0.015 278.000 0.000 NA   NA
 10157812 10157813 HVO_B0374 HVO_B0375     FALSE 0.021 237.000 0.000 NA   NA
 10157813 10157814 HVO_B0375 HVO_B0376     FALSE 0.100 82.000 0.000 NA   NA
 10157817 10157818 HVO_B0379 HVO_B0380 putP2   TRUE 0.951 -6.000 0.043 1.000 N NA
 10157818 10157819 HVO_B0380 HVO_B0381     TRUE 0.997 -3.000 0.073 0.001 Y NA
 10157820 10157441 HVO_B0382 HVO_B0001 tbp3 orc6 FALSE 0.004 794.000 0.000 1.000 N NA
 10157822 10157823 HVO_D0002 HVO_D0003     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 10157823 10157824 HVO_D0003 HVO_D0004     FALSE 0.041 194.000 0.000 NA   NA
 10157824 10157825 HVO_D0004 HVO_D0005     FALSE 0.003 749.000 0.000 NA   NA
 10157825 10157826 HVO_D0005 HVO_D0006     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10157828 10157829 HVO_A0002 HVO_A0003   parA3 TRUE 0.990 -7.000 0.750 NA   NA
 10157829 10157830 HVO_A0003 HVO_A0004 parA3 msrA2 FALSE 0.003 722.000 0.000 NA   NA
 10157831 10157832 HVO_A0005 HVO_A0006     FALSE 0.049 183.000 0.000 NA   NA
 10157832 10157833 HVO_A0006 HVO_A0007     FALSE 0.115 68.000 0.000 NA   NA
 10157833 10157834 HVO_A0007 HVO_A0008     FALSE 0.178 247.000 0.000 NA Y NA
 10157834 10157835 HVO_A0008 HVO_A0009     FALSE 0.005 475.000 0.000 NA   NA
 10157836 10157837 HVO_A0010 HVO_A0011     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157837 10157838 HVO_A0011 HVO_A0012     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 10157839 10157840 HVO_A0013 HVO_A0014     FALSE 0.003 662.000 0.000 NA   NA
 10157841 10157842 HVO_A0015 HVO_A0016     FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 10157843 10157844 HVO_A0017 HVO_A0018     TRUE 0.725 85.000 1.000 NA   NA
 10157844 10157845 HVO_A0018 HVO_A0019     FALSE 0.028 871.000 0.000 NA Y NA
 10157845 10157846 HVO_A0019 HVO_A0020     FALSE 0.004 569.000 0.000 NA   NA
 10157847 10157848 HVO_A0021 HVO_A0022     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 10157848 10157849 HVO_A0022 HVO_A0023     FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 10157850 10157851 HVO_A0024 HVO_A0026   tfb9 FALSE 0.081 122.000 0.000 NA   NA
 10157852 10157853 HVO_A0025 HVO_A0027     TRUE 0.918 18.000 0.667 NA   NA
 10157854 10157855 HVO_A0028 HVO_A0029     TRUE 0.578 97.000 0.667 NA   NA
 10157855 10157856 HVO_A0029 HVO_A0030     TRUE 0.694 92.000 1.000 NA   NA
 10157856 10157857 HVO_A0030 HVO_A0031     TRUE 0.706 70.000 0.667 NA   NA
 10157857 10157858 HVO_A0031 HVO_A0032     TRUE 0.705 75.000 0.667 NA   NA
 10157858 10157859 HVO_A0032 HVO_A0033     TRUE 0.610 107.000 0.750 NA   NA
 10157859 10157860 HVO_A0033 HVO_A0034     TRUE 0.978 4.000 0.750 NA   NA
 10157862 10157863 HVO_A0036 HVO_A0037     TRUE 0.984 3.000 0.750 NA   NA
 10157866 10157867 HVO_A0040 HVO_A0041     FALSE 0.148 47.000 0.000 NA   NA
 10157867 10157868 HVO_A0041 HVO_A0042     FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 10157868 10157869 HVO_A0042 HVO_A0043     FALSE 0.005 458.000 0.000 NA   NA
 10157869 10157870 HVO_A0043 HVO_A0044     FALSE 0.013 291.000 0.000 NA   NA
 10157870 10157871 HVO_A0044 HVO_A0045     TRUE 0.971 1.000 0.222 NA   NA
 10157871 10157872 HVO_A0045 HVO_A0046     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 10157875 10157876 HVO_A0049 HVO_A0050     FALSE 0.115 68.000 0.000 NA   NA
 10157876 10157877 HVO_A0050 HVO_A0051     FALSE 0.106 80.000 0.000 NA   NA
 10157877 10157878 HVO_A0051 HVO_A0052     TRUE 0.899 20.000 0.600 NA   NA
 10157878 10157879 HVO_A0052 HVO_A0053     TRUE 0.638 50.000 0.400 NA   NA
 10157879 10157880 HVO_A0053 HVO_A0054     FALSE 0.068 165.000 0.000 NA   NA
 10157880 10157881 HVO_A0054 HVO_A0055     TRUE 0.993 0.000 0.750 NA   NA
 10157881 10157882 HVO_A0055 HVO_A0056     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 10157882 10157883 HVO_A0056 HVO_A0057     FALSE 0.083 148.000 0.000 NA   NA
 10157883 10157884 HVO_A0057 HVO_A0058     FALSE 0.002 1072.000 0.000 NA   NA
 10157884 10157885 HVO_A0058 HVO_A0059     TRUE 0.709 73.000 0.667 NA   NA
 10157885 10157886 HVO_A0059 HVO_A0060   ltrC1 FALSE 0.087 87.000 0.000 NA   NA
 10157886 10157887 HVO_A0060 HVO_A0061 ltrC1   TRUE 0.579 137.000 0.500 NA   NA
 11427154 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3134.000 0.000 NA   NA
 11569517 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3134.000 0.000 NA   NA
 11711909 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3134.000 0.000 NA   NA
 11427155 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3157.000 0.000 NA   NA
 11569518 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3157.000 0.000 NA   NA
 11711910 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3157.000 0.000 NA   NA
 11427156 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3219.000 0.000 NA   NA
 11569519 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3219.000 0.000 NA   NA
 11711911 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3219.000 0.000 NA   NA
 11427157 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3242.000 0.000 NA   NA
 11569520 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3242.000 0.000 NA   NA
 11711912 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3242.000 0.000 NA   NA
 11427158 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3304.000 0.000 NA   NA
 11569521 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3304.000 0.000 NA   NA
 11711913 10157885   HVO_A0059     FALSE NA 3304.000 0.000 NA   NA
 10157890 10157891 HVO_A0064 HVO_A0065 orc13 polB2 FALSE 0.035 892.000 0.000 1.000 Y NA
 10157891 10157892 HVO_A0065 HVO_A0066 polB2   TRUE 0.979 2.000 0.000 NA Y NA
 10157892 10157893 HVO_A0066 HVO_A0067     FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 10157893 10157894 HVO_A0067 HVO_A0068     TRUE 0.976 3.000 0.500 NA   NA
 10157894 10157895 HVO_A0068 HVO_A0069     FALSE 0.015 274.000 0.000 NA   NA
 10157895 10157896 HVO_A0069 HVO_A0070     FALSE 0.243 52.000 0.000 1.000   NA
 10157898 10157899 HVO_A0072 HVO_A0073 orc12   FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 10157901 10157902 HVO_A0076A HVO_A0077     FALSE 0.116 69.000 0.000 NA   NA
 10157902 10157903 HVO_A0077 HVO_A0078     TRUE 0.737 63.000 0.000 0.038 Y NA
 10157903 10157904 HVO_A0078 HVO_A0079     TRUE 0.891 -10.000 0.000 1.000   NA
 10157906 10157907 HVO_A0081 HVO_A0082   arcR6 FALSE 0.024 191.000 0.000 NA N NA
 10157907 10157908 HVO_A0082 HVO_A0083 arcR6   FALSE 0.012 368.000 0.000 1.000 N NA
 10157908 10157909 HVO_A0083 HVO_A0084     TRUE 0.710 7.000 0.000 1.000   NA
 10157911 10157912 HVO_A0086 HVO_A0087 uspA27 xlnF FALSE 0.035 259.000 0.000 1.000   NA
 10157912 10157913 HVO_A0087 HVO_A0088 xlnF   FALSE 0.117 120.000 0.000 1.000 N NA
 10157913 10157914 HVO_A0088 HVO_A0089     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10157914 10157915 HVO_A0089 HVO_A0090   phdI FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 10157918 10157919 HVO_A0093 HVO_A0094 arcR7   FALSE 0.012 441.000 0.000 1.000   NA
 10157919 10157920 HVO_A0094 HVO_A0095     FALSE 0.222 57.000 0.000 1.000   NA
 10157920 10157921 HVO_A0095 HVO_A0096   acd7 FALSE 0.176 134.000 0.000 1.000   NA
 10157921 10157922 HVO_A0096 HVO_A0097 acd7 hbd2 TRUE 0.573 127.000 0.000 1.000 Y NA
 10157923 10157924 HVO_A0098 HVO_A0099 tfb12   FALSE 0.176 134.000 0.000 1.000   NA
 10157924 10157925 HVO_A0099 HVO_A0100     TRUE 0.784 -15.000 0.000 NA   NA
 10157929 10157930 HVO_A0104 HVO_A0105 ltrC2   TRUE 0.708 74.000 0.667 NA   NA
 10157930 10157931 HVO_A0105 HVO_A0106     FALSE 0.087 87.000 0.000 NA   NA
 10157931 10157932 HVO_A0106 HVO_A0107     FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 10157932 10157933 HVO_A0107 HVO_A0108     FALSE 0.374 19.000 0.000 NA   NA
 10157935 10157936 HVO_A0110 HVO_A0111     FALSE 0.060 172.000 0.000 NA   NA
 10157936 10157937 HVO_A0111 HVO_A0112     FALSE 0.013 294.000 0.000 NA   NA
 10157937 10157938 HVO_A0112 HVO_A0113     FALSE 0.110 64.000 0.000 NA   NA
 10157938 10157939 HVO_A0113 HVO_A0114     FALSE 0.012 297.000 0.000 NA   NA
 10157939 10157940 HVO_A0114 HVO_A0115     TRUE 0.979 -19.000 0.500 NA   NA
 10157940 10157941 HVO_A0115 HVO_A0116     FALSE 0.089 142.000 0.000 NA   NA
 10157942 10157943 HVO_A0117 HVO_A0118     FALSE 0.006 320.000 0.000 NA N NA
 10157944 10157945 HVO_A0119 HVO_A0120     FALSE 0.100 82.000 0.000 NA   NA
 10157947 10157948 HVO_A0122 HVO_A0123     FALSE 0.093 137.000 0.000 NA   NA
 10157948 10157949 HVO_A0123 HVO_A0124     FALSE 0.012 302.000 0.000 NA   NA
 10157954 10157955 HVO_A0129 HVO_A0130     TRUE 0.676 4.000 0.000 NA   NA
 10157956 10157957 HVO_A0131 HVO_A0132     FALSE 0.002 1012.000 0.000 NA   NA
 10157957 10157958 HVO_A0132 HVO_A0132A     FALSE 0.072 160.000 0.000 NA   NA
 10157958 10157959 HVO_A0132A HVO_A0133     FALSE 0.118 71.000 0.000 NA   NA
 10157960 10157961 HVO_A0134 HVO_A0135     FALSE 0.002 975.000 0.000 NA   NA
 10157961 10157962 HVO_A0135 HVO_A0136     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10157965 10157966 HVO_A0139 HVO_A0140     FALSE 0.112 174.000 0.000 1.000   NA
 10157966 10157967 HVO_A0140 HVO_A0141   ltrC3 FALSE 0.026 222.000 0.000 NA   NA
 10157967 10157968 HVO_A0141 HVO_A0142 ltrC3   TRUE 0.708 74.000 0.667 NA   NA
 10157968 10157969 HVO_A0142 HVO_A0143     FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 10157971 10157972 HVO_A0145 HVO_A0146 tsgA4 tsgB4 TRUE 0.997 3.000 0.750 0.036 Y NA
 10157972 10157973 HVO_A0146 HVO_A0147 tsgB4 tsgC4 TRUE 0.999 0.000 1.000 0.036 Y NA
 10157973 10157974 HVO_A0147 HVO_A0148 tsgC4 tsgD4 TRUE 0.945 64.000 1.000 0.036 Y NA
 10157975 10157976 HVO_A0149 HVO_A0150 cga2 trmB1 FALSE 0.075 112.000 0.000 NA   NA
 10157976 10157977 HVO_A0150 HVO_A0151 trmB1   FALSE 0.017 213.000 0.000 NA N NA
 10157978 10157979 HVO_A0152 HVO_A0153   uspA28 FALSE 0.190 90.000 0.032 NA   NA
 10157979 10157980 HVO_A0153 HVO_A0154 uspA28 ssf TRUE 0.865 4.000 0.009 1.000   NA
 10157980 10157981 HVO_A0154 HVO_A0155 ssf   TRUE 0.995 -3.000 0.916 NA   NA
 10157981 10157982 HVO_A0155 HVO_A0156   acs7 FALSE 0.122 56.000 0.000 NA   NA
 10157982 10157983 HVO_A0156 HVO_A0157 acs7 boa4 FALSE 0.078 199.000 0.000 1.000   NA
 10157983 10157984 HVO_A0157 HVO_A0158 boa4 acs8 FALSE 0.447 144.000 0.222 1.000   NA
 10157987 10157988 HVO_A0161 HVO_A0162   matE1 TRUE 0.988 -3.000 0.333 1.000 N NA
 10157989 10157990 HVO_A0163 HVO_A0164 prr   TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10157990 10157991 HVO_A0164 HVO_A0165     TRUE 0.966 2.000 0.227 NA   NA
 10157992 10157993 HVO_A0166 HVO_A0167     FALSE 0.238 31.000 0.000 NA   NA
 10157995 10157996 HVO_A0169 HVO_A0170     FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10157997 10157998 HVO_A0171 HVO_A0172 clc   FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 10157999 10158000 HVO_A0173 HVO_A0174   sec61a2 FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 10158000 10158001 HVO_A0174 HVO_A0175 sec61a2 cat3 FALSE 0.186 178.000 0.000 0.061 N NA
 10158002 10158003 HVO_A0176 HVO_A0177     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.069 Y NA
 10158004 10158005 HVO_A0178 HVO_A0179 atpD2   FALSE 0.111 65.000 0.000 NA   NA
 10158005 10158006 HVO_A0179 HVO_A0180   sph1 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158007 10158008 HVO_A0181 HVO_A0182     FALSE 0.116 59.000 0.000 NA   NA
 10158011 10158012 HVO_A0185 HVO_A0186     FALSE 0.278 27.000 0.000 NA   NA
 10158013 10158014 HVO_A0187 HVO_A0188     FALSE 0.070 107.000 0.000 NA   NA
 10158014 10158015 HVO_A0188 HVO_A0189     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158015 10158016 HVO_A0189 HVO_A0190     FALSE 0.082 149.000 0.000 NA   NA
 10158017 10158018 HVO_A0191 HVO_A0192     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158020 10158021 HVO_A0194 HVO_A0195     FALSE 0.093 137.000 0.000 NA   NA
 10158022 10158023 HVO_A0196 HVO_A0197     FALSE 0.005 455.000 0.000 NA   NA
 10158023 10158024 HVO_A0197 HVO_A0198     FALSE 0.010 320.000 0.000 NA   NA
 10158024 10158025 HVO_A0198 HVO_A0199     FALSE 0.137 51.000 0.000 NA   NA
 10158027 10158028 HVO_A0201 HVO_A0202     FALSE 0.003 734.000 0.000 NA   NA
 10158028 10158029 HVO_A0202 HVO_A0203     FALSE 0.003 680.000 0.000 NA   NA
 10158029 10158030 HVO_A0203 HVO_A0204     FALSE 0.080 121.000 0.000 NA   NA
 10158031 10158032 HVO_A0205 HVO_A0206 cas6   TRUE 0.975 0.000 0.194 NA   NA
 10158032 10158033 HVO_A0206 HVO_A0207   csh2 TRUE 0.868 21.000 0.441 NA   NA
 10158033 10158034 HVO_A0207 HVO_A0208 csh2 cas5 TRUE 0.930 11.000 0.603 NA   NA
 10158034 10158035 HVO_A0208 HVO_A0209 cas5 cas3 TRUE 0.756 25.000 0.246 NA   NA
 10158035 10158036 HVO_A0209 HVO_A0210 cas3 cas4 FALSE 0.277 190.000 0.298 NA   NA
 10158036 10158037 HVO_A0210 HVO_A0211 cas4 cas1 TRUE 0.975 4.000 0.088 NA Y NA
 10158037 10158038 HVO_A0211 HVO_A0212 cas1 cas2 TRUE 0.988 2.000 0.103 NA Y NA
 11427238 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5845.000 0.000 NA   NA
 11569601 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5845.000 0.000 NA   NA
 11711993 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5845.000 0.000 NA   NA
 11427239 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5875.000 0.000 NA   NA
 11569602 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5875.000 0.000 NA   NA
 11711994 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5875.000 0.000 NA   NA
 11427240 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5913.000 0.000 NA   NA
 11569603 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5913.000 0.000 NA   NA
 11711995 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5913.000 0.000 NA   NA
 11427241 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5943.000 0.000 NA   NA
 11569604 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5943.000 0.000 NA   NA
 11711996 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5943.000 0.000 NA   NA
 11427242 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5979.000 0.000 NA   NA
 11569605 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5979.000 0.000 NA   NA
 11711997 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 5979.000 0.000 NA   NA
 11427243 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6009.000 0.000 NA   NA
 11569606 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6009.000 0.000 NA   NA
 11711998 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6009.000 0.000 NA   NA
 11427244 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6043.000 0.000 NA   NA
 11569607 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6043.000 0.000 NA   NA
 11711999 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6043.000 0.000 NA   NA
 11427245 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6073.000 0.000 NA   NA
 11569608 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6073.000 0.000 NA   NA
 11712000 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6073.000 0.000 NA   NA
 11427246 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6110.000 0.000 NA   NA
 11569609 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6110.000 0.000 NA   NA
 11712001 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6110.000 0.000 NA   NA
 11427247 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6140.000 0.000 NA   NA
 11569610 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6140.000 0.000 NA   NA
 11712002 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6140.000 0.000 NA   NA
 11427248 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6176.000 0.000 NA   NA
 11569611 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6176.000 0.000 NA   NA
 11712003 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6176.000 0.000 NA   NA
 11427249 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6206.000 0.000 NA   NA
 11569612 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6206.000 0.000 NA   NA
 11712004 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6206.000 0.000 NA   NA
 11427250 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6241.000 0.000 NA   NA
 11569613 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6241.000 0.000 NA   NA
 11712005 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6241.000 0.000 NA   NA
 11427251 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6271.000 0.000 NA   NA
 11569614 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6271.000 0.000 NA   NA
 11712006 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6271.000 0.000 NA   NA
 11427252 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11569615 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11712007 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11427253 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6338.000 0.000 NA   NA
 11569616 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6338.000 0.000 NA   NA
 11712008 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6338.000 0.000 NA   NA
 11427254 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6373.000 0.000 NA   NA
 11569617 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6373.000 0.000 NA   NA
 11712009 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6373.000 0.000 NA   NA
 11427255 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6403.000 0.000 NA   NA
 11569618 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6403.000 0.000 NA   NA
 11712010 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6403.000 0.000 NA   NA
 11427256 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6438.000 0.000 NA   NA
 11569619 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6438.000 0.000 NA   NA
 11712011 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6438.000 0.000 NA   NA
 11427257 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6468.000 0.000 NA   NA
 11569620 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6468.000 0.000 NA   NA
 11712012 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6468.000 0.000 NA   NA
 11427258 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6505.000 0.000 NA   NA
 11569621 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6505.000 0.000 NA   NA
 11712013 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6505.000 0.000 NA   NA
 11427259 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6535.000 0.000 NA   NA
 11569622 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6535.000 0.000 NA   NA
 11712014 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6535.000 0.000 NA   NA
 11427260 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6569.000 0.000 NA   NA
 11569623 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6569.000 0.000 NA   NA
 11712015 10158033   HVO_A0207   csh2 FALSE NA 6569.000 0.000 NA   NA
 10158039 10158040 HVO_A0213 HVO_A0214     FALSE 0.056 175.000 0.000 NA   NA
 10158041 10158042 HVO_A0215 HVO_A0216     FALSE 0.049 183.000 0.000 NA   NA
 10158042 10158043 HVO_A0216 HVO_A0217     TRUE 0.994 -3.000 0.070 1.000 Y NA
 10158043 10158044 HVO_A0217 HVO_A0218     TRUE 0.981 -3.000 0.131 1.000   NA
 10158044 10158045 HVO_A0218 HVO_A0219     TRUE 0.987 -3.000 0.052 0.033   NA
 10158045 10158046 HVO_A0219 HVO_A0220     TRUE 0.993 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 10158046 10158047 HVO_A0220 HVO_A0221     TRUE 0.950 -7.000 0.033 1.000   NA
 10158047 10158048 HVO_A0221 HVO_A0222     FALSE 0.110 63.000 0.000 NA   NA
 10158048 10158049 HVO_A0222 HVO_A0223     FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10158049 10158050 HVO_A0223 HVO_A0224     TRUE 0.776 -33.000 0.000 NA   NA
 10158050 10158051 HVO_A0224 HVO_A0225     FALSE 0.084 89.000 0.000 NA   NA
 10158053 10158054 HVO_A0227 HVO_A0228   surE2 FALSE 0.374 19.000 0.000 NA   NA
 10158057 10158058 HVO_A0231 HVO_A0232     FALSE 0.086 88.000 0.000 NA   NA
 10158058 10158059 HVO_A0232 HVO_A0233     FALSE 0.007 365.000 0.000 NA   NA
 10158059 10158060 HVO_A0233 HVO_A0234     FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 10158060 10158061 HVO_A0234 HVO_A0235     FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 10158061 10158062 HVO_A0235 HVO_A0236     FALSE 0.454 11.000 0.000 NA   NA
 10158062 10158063 HVO_A0236 HVO_A0237     FALSE 0.009 330.000 0.000 NA   NA
 10158063 10158064 HVO_A0237 HVO_A0238     FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 10158064 10158065 HVO_A0238 HVO_A0239A     FALSE 0.089 86.000 0.000 NA   NA
 10158065 10158066 HVO_A0239A HVO_A0240     FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 10158067 10158068 HVO_A0241 HVO_A0242     FALSE 0.116 69.000 0.000 NA   NA
 10158069 10158070 HVO_A0243 HVO_A0244   doc TRUE 0.525 19.000 0.009 NA   NA
 10158070 10158071 HVO_A0244 HVO_A0245 doc   FALSE 0.110 63.000 0.000 NA   NA
 10158071 10158072 HVO_A0245 HVO_A0246     FALSE 0.365 150.000 0.222 NA   NA
 10158072 10158073 HVO_A0246 HVO_A0247     FALSE 0.004 547.000 0.000 NA   NA
 10158073 10158074 HVO_A0247 HVO_A0248     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 10158074 10158075 HVO_A0248 HVO_A0249     FALSE 0.082 90.000 0.000 NA   NA
 10158075 10158076 HVO_A0249 HVO_A0249A     FALSE 0.013 295.000 0.000 NA   NA
 10158076 10158077 HVO_A0249A HVO_A0250     FALSE 0.012 301.000 0.000 NA   NA
 10158077 10158078 HVO_A0250 HVO_A0251     FALSE 0.026 222.000 0.000 NA   NA
 10158081 10158082 HVO_A0254 HVO_A0254A     FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 10158082 10158083 HVO_A0254A HVO_A0256     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 10158084 10158085 HVO_A0257 HVO_A0258 orc7   FALSE 0.002 1024.000 0.000 NA   NA
 10158085 10158086 HVO_A0258 HVO_A0259     FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10158086 10158087 HVO_A0259 HVO_A0260     FALSE 0.010 327.000 0.000 NA   NA
 10158090 10158091 HVO_A0262 HVO_A0263     FALSE 0.004 531.000 0.000 NA   NA
 10158092 10158093 HVO_A0265 HVO_A0266   arcR8 FALSE 0.003 781.000 0.000 NA   NA
 10158093 10158094 HVO_A0266 HVO_A0267 arcR8   TRUE 0.613 67.000 0.400 1.000 N NA
 10158095 10158096 HVO_A0268 HVO_A0269 fuca gpdA2 FALSE 0.061 195.000 0.000 1.000 N NA
 10158096 10158097 HVO_A0269 HVO_A0270 gpdA2 gpdB2 TRUE 0.993 -10.000 0.650 0.001 N NA
 10158097 10158098 HVO_A0270 HVO_A0271 gpdB2 gpdC2 TRUE 0.806 63.000 0.547 0.001 N NA
 10158098 10158099 HVO_A0271 HVO_A0272 gpdC2   FALSE 0.115 68.000 0.000 NA   NA
 10158099 10158100 HVO_A0272 HVO_A0273     FALSE 0.018 250.000 0.000 NA   NA
 10158100 10158101 HVO_A0273 HVO_A0274   suhB2 TRUE 0.587 138.000 0.000 1.000 Y NA
 10158102 10158103 HVO_A0275 HVO_A0276     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10158104 10158105 HVO_A0277 HVO_A0278 rnhD sfsA FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 10158106 10158107 HVO_A0279 HVO_A0279A     FALSE 0.065 282.000 0.000 0.035 N NA
 10158107 10158108 HVO_A0279A HVO_A0280   arcR9 FALSE 0.065 717.000 0.000 0.035 Y NA
 10158109 10158110 HVO_A0281 HVO_A0282 tsgD5   TRUE 0.973 2.000 0.214 1.000   NA
 10158110 10158111 HVO_A0282 HVO_A0283   tsgA5 FALSE 0.452 71.000 0.120 1.000   NA
 10158111 10158112 HVO_A0283 HVO_A0284 tsgA5 tsgB5 TRUE 0.973 10.000 0.133 0.033 Y NA
 10158112 10158113 HVO_A0284 HVO_A0285 tsgB5 tsgC5 TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.033 Y NA
 10158113 10158114 HVO_A0285 HVO_A0286 tsgC5   FALSE 0.402 45.000 0.071 NA   NA
 10158114 10158115 HVO_A0286 HVO_A0287     TRUE 0.661 42.000 0.333 NA   NA
 10158115 10158116 HVO_A0287 HVO_A0288     TRUE 0.783 52.000 0.500 0.047 N NA
 10158116 10158117 HVO_A0288 HVO_A0289     TRUE 0.589 12.000 0.024 NA N NA
 10158121 10158122 HVO_A0293 HVO_A0294 potA1 potA2 TRUE 0.991 2.000 0.000 0.004 Y NA
 10158122 10158123 HVO_A0294 HVO_A0295 potA2 amaB2 TRUE 0.516 162.000 0.000 1.000 Y NA
 10158123 10158124 HVO_A0295 HVO_A0295A amaB2   TRUE 0.624 3.000 0.000 NA N NA
 10158124 10158125 HVO_A0295A HVO_A0296     FALSE 0.039 98.000 0.000 NA N NA
 10158125 10158126 HVO_A0296 HVO_A0297   potC FALSE 0.164 61.000 0.000 1.000 N NA
 10158128 10158129 HVO_A0299 HVO_A0300 potD potB TRUE 0.599 58.000 0.000 NA Y NA
 10158129 10158130 HVO_A0300 HVO_A0301 potB   FALSE 0.125 89.000 0.000 1.000 N NA
 10158132 10158133 HVO_A0303 HVO_A0304 dht groL FALSE 0.194 52.000 0.000 1.000 N NA
 10158135 10158136 HVO_A0306 HVO_A0307 gabT6 trh9 TRUE 0.496 49.000 0.154 1.000 N NA
 10158139 10158140 HVO_A0310 HVO_A0311   halC8 FALSE 0.363 20.000 0.000 NA   NA
 10158142 10158143 HVO_A0313 HVO_A0314     TRUE 0.581 6.000 0.000 NA   NA
 10158143 10158144 HVO_A0314 HVO_A0315     TRUE 0.788 -13.000 0.000 NA   NA
 10158144 10158145 HVO_A0315 HVO_A0316     FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 10158146 10158147 HVO_A0317 HVO_A0318     TRUE 0.943 17.000 1.000 NA   NA
 10158148 10158149 HVO_A0319 HVO_A0320     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 10158149 10158150 HVO_A0320 HVO_A0321     FALSE 0.009 340.000 0.000 NA   NA
 10158151 10158152 HVO_A0322 HVO_A0323     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 10158152 10158153 HVO_A0323 HVO_A0324     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 10158154 10158155 HVO_A0325 HVO_A0326   bgaH FALSE 0.009 523.000 0.000 1.000   NA
 10158156 10158157 HVO_A0327 HVO_A0328   pfk1 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158158 10158159 HVO_A0329 HVO_A0330 kdgA3 gfo2 FALSE 0.188 82.000 0.000 1.000   NA
 10158160 10158161 HVO_A0331 HVO_A0332   arcR10 FALSE 0.178 56.000 0.000 1.000 N NA
 10158161 10158162 HVO_A0332 HVO_A0333 arcR10   FALSE 0.002 1148.000 0.000 NA   NA
 10158165 10158166 HVO_A0336 HVO_A0337 dppDF7 dppC7 TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10158166 10158167 HVO_A0337 HVO_A0338 dppC7 dppB7 TRUE 0.993 0.000 0.000 0.033 Y NA
 10158167 10158168 HVO_A0338 HVO_A0339 dppB7 dppA7 TRUE 0.938 16.000 0.000 0.033 Y NA
 10158168 10158169 HVO_A0339 HVO_A0340 dppA7   FALSE 0.076 156.000 0.000 NA   NA
 10158170 10158171 HVO_A0341 HVO_A0342 amaB3 arcR11 FALSE 0.009 425.000 0.000 1.000 N NA
 10158171 10158172 HVO_A0342 HVO_A0343 arcR11   FALSE 0.060 172.000 0.000 NA   NA
 10158173 10158174 HVO_A0344 HVO_A0345   cat4 TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 10158175 10158176 HVO_A0346 HVO_A0347     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158176 10158177 HVO_A0347 HVO_A0348     FALSE 0.068 98.000 0.000 NA   NA
 10158179 10158180 HVO_A0350 HVO_A0351     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158182 10158183 HVO_A0353 HVO_A0354     FALSE 0.145 48.000 0.000 NA   NA
 10158183 10158184 HVO_A0354 HVO_A0355     FALSE 0.110 78.000 0.000 NA   NA
 10158184 10158185 HVO_A0355 HVO_A0356     FALSE 0.400 15.000 0.000 NA   NA
 10158185 10158186 HVO_A0356 HVO_A0357     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158186 10158187 HVO_A0357 HVO_A0358     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 10158187 10158188 HVO_A0358 HVO_A0359     FALSE 0.004 547.000 0.000 NA   NA
 10158192 10158193 HVO_A0363 HVO_A0364     FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 10158193 10158194 HVO_A0364 HVO_A0365     FALSE 0.065 168.000 0.000 NA   NA
 10158194 10158195 HVO_A0365 HVO_A0366     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 10158196 10158197 HVO_A0367 HVO_A0368     FALSE 0.043 112.000 0.000 NA N NA
 10158197 10158198 HVO_A0368 HVO_A0369     TRUE 0.990 -7.000 0.750 NA   NA
 10158199 10158200 HVO_A0370 HVO_A0371     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158202 10158203 HVO_A0374 HVO_A0375   tfb11 FALSE 0.076 200.000 0.000 1.000   NA
 10158204 10158205 HVO_A0376 HVO_A0377     TRUE 0.995 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 10158205 10158206 HVO_A0377 HVO_A0378   hyuB2 TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10158206 10158207 HVO_A0378 HVO_A0379 hyuB2 hyuA2 TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.002 Y NA
 10158208 10158209 HVO_A0380 HVO_A0381 dppA8 dppB8 TRUE 0.951 11.000 0.000 0.033 Y NA
 10158209 10158210 HVO_A0381 HVO_A0382 dppB8 dppC8 TRUE 0.959 8.000 0.000 0.033 Y NA
 10158210 10158211 HVO_A0382 HVO_A0383 dppC8 dppD8 TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 10158211 10158212 HVO_A0383 HVO_A0384 dppD8 dppF8 TRUE 0.997 -3.000 0.167 0.005 Y NA
 10158212 10158213 HVO_A0384 HVO_A0385 dppF8 hyuA3 TRUE 0.498 103.000 0.000 1.000 Y NA
 10158213 10158214 HVO_A0385 HVO_A0386 hyuA3 hyuB3 TRUE 0.999 0.000 0.636 0.002 Y NA
 10158214 10158215 HVO_A0386 HVO_A0387 hyuB3   TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000   NA
 10158217 10158218 HVO_A0389 HVO_A0391     FALSE 0.003 644.000 0.000 NA   NA
 10158218 10158219 HVO_A0391 HVO_A0392     FALSE 0.112 66.000 0.000 NA   NA
 10158219 10158220 HVO_A0392 HVO_A0393     TRUE 0.847 3.000 0.009 NA   NA
 10158220 10158221 HVO_A0393 HVO_A0394     FALSE 0.011 309.000 0.000 NA   NA
 10158221 10158222 HVO_A0394 HVO_A0395     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158222 10158223 HVO_A0395 HVO_A0396     TRUE 0.979 3.000 0.600 NA   NA
 10158225 10158226 HVO_A0398 HVO_A0399     FALSE 0.091 140.000 0.000 NA   NA
 10158226 10158227 HVO_A0399 HVO_A0400     FALSE 0.066 102.000 0.000 NA   NA
 10158228 10158229 HVO_A0401 HVO_A0402     FALSE 0.076 157.000 0.000 NA   NA
 10158230 10158231 HVO_A0403 HVO_A0404     TRUE 0.883 -15.000 0.000 1.000   NA
 10158231 10158232 HVO_A0404 HVO_A0405     FALSE 0.104 81.000 0.000 NA   NA
 10158234 10158235 HVO_A0408 HVO_A0409     FALSE 0.002 1046.000 0.000 NA   NA
 10158235 10158236 HVO_A0409 HVO_A0410     FALSE 0.049 225.000 0.000 1.000   NA
 10158236 10158237 HVO_A0410 HVO_A0411     FALSE 0.012 302.000 0.000 NA   NA
 10158237 10158238 HVO_A0411 HVO_A0412     FALSE 0.093 136.000 0.000 NA   NA
 10158240 10158241 HVO_A0414 HVO_A0415     FALSE 0.100 82.000 0.000 NA   NA
 10158243 10158244 HVO_A0417 HVO_A0418     TRUE 0.979 -19.000 0.500 NA   NA
 10158244 10158245 HVO_A0418 HVO_A0419     FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 10158247 10158248 HVO_A0421 HVO_A0423     FALSE 0.062 170.000 0.000 NA   NA
 10158251 10158252 HVO_A0425 HVO_A0426 dppF9 dppD9 TRUE 0.991 2.000 0.000 0.005 Y NA
 10158252 10158253 HVO_A0426 HVO_A0426A dppD9 dppC9 TRUE 0.967 4.000 0.000 1.000 Y NA
 10158253 10158254 HVO_A0426A HVO_A0427 dppC9 dppB9 TRUE 0.993 2.000 0.065 0.033 Y NA
 10158254 10158255 HVO_A0427 HVO_A0428 dppB9 dppA9 TRUE 0.956 28.000 0.333 0.033 Y NA
 10158255 10158256 HVO_A0428 HVO_A0429 dppA9 ureX FALSE 0.117 120.000 0.000 1.000 N NA
 10158256 10158257 HVO_A0429 HVO_A0429A ureX   FALSE 0.110 110.000 0.000 1.000 N NA
 10158257 10158258 HVO_A0429A HVO_A0430     TRUE 0.960 -3.000 0.046 NA   NA
 10158259 10158260 HVO_A0430A HVO_A0431     FALSE 0.080 151.000 0.000 NA   NA
 10158260 10158261 HVO_A0431 HVO_A0432     FALSE 0.408 14.000 0.000 NA   NA
 10158261 10158262 HVO_A0432 HVO_A0433     FALSE 0.070 163.000 0.000 NA   NA
 10158262 10158263 HVO_A0433 HVO_A0434     FALSE 0.021 237.000 0.000 NA   NA
 10158264 10158265 HVO_A0435 HVO_A0436     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158266 10158267 HVO_A0437 HVO_A0438     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158267 10158268 HVO_A0438 HVO_A0439     FALSE 0.006 407.000 0.000 NA   NA
 10158269 10158270 HVO_A0440 HVO_A0441   rad25a TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 10158270 10158271 HVO_A0441 HVO_A0442 rad25a   FALSE 0.076 117.000 0.000 NA   NA
 10158271 10158272 HVO_A0442 HVO_A0443     FALSE 0.012 298.000 0.000 NA   NA
 10158272 10158273 HVO_A0443 HVO_A0444     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158274 10158275 HVO_A0445 HVO_A0446     FALSE 0.065 168.000 0.000 NA   NA
 10158275 10158276 HVO_A0446 HVO_A0447     FALSE 0.065 167.000 0.000 NA   NA
 10158276 10158277 HVO_A0447 HVO_A0448   tfb10 FALSE 0.030 277.000 0.000 1.000   NA
 10158278 10158279 HVO_A0450 HVO_A0449 uspA29   TRUE 0.775 -1459.000 0.000 NA   NA
 10158280 10158281 HVO_A0451 HVO_A0452 arsB4 uspA30 TRUE 0.597 9.000 0.000 1.000 N NA
 10158281 10158282 HVO_A0452 HVO_A0453 uspA30   FALSE 0.063 169.000 0.000 NA   NA
 10158282 10158283 HVO_A0453 HVO_A0454     FALSE 0.114 67.000 0.000 NA   NA
 10158283 10158284 HVO_A0454 HVO_A0455     FALSE 0.066 101.000 0.000 NA   NA
 10158284 10158285 HVO_A0455 HVO_A0456     FALSE 0.114 67.000 0.000 NA   NA
 10158287 10158288 HVO_A0458 HVO_A0459 sojE   TRUE 0.985 -3.000 0.300 NA   NA
 10158289 10158290 HVO_A0460 HVO_A0461 phnE3 phnE2 TRUE 0.999 0.000 0.915 0.001 Y NA
 10158295 10158296 HVO_A0466 HVO_A0467     TRUE 0.994 0.000 0.750 1.000   NA
 10158298 10158299 HVO_A0469 HVO_A0470 acc1   FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10158299 10158300 HVO_A0470 HVO_A0471   estA TRUE 0.935 0.000 0.019 NA   NA
 10158303 10158304 HVO_A0474 HVO_A0475   sod1 FALSE 0.026 222.000 0.000 NA   NA
 10158304 10158305 HVO_A0475 HVO_A0476 sod1   FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 10158306 10158307 HVO_A0477 HVO_A0478 pstS2 pstC2 TRUE 0.624 63.000 0.009 NA Y NA
 10158307 10158308 HVO_A0478 HVO_A0479 pstC2 pstA2 TRUE 0.997 0.000 0.198 0.002 Y NA
 10158308 10158309 HVO_A0479 HVO_A0480 pstA2 pstB2 TRUE 0.991 3.000 0.038 0.002 Y NA
 10158309 10158310 HVO_A0480 HVO_A0481 pstB2 phoU4 FALSE 0.208 230.000 0.000 NA Y NA
 10158314 10158315 HVO_A0486 HVO_A0487 hypE cobB FALSE 0.093 170.000 0.000 1.000 N NA
 10158315 10158316 HVO_A0487 HVO_A0488 cobB cobO TRUE 0.774 73.000 0.000 0.008 Y NA
 10158317 10158318 HVO_A0489 HVO_A0490 nifV   TRUE 0.891 1.000 0.000 1.000 N NA
 10158318 10158319 HVO_A0490 HVO_A0491   tsgD6 TRUE 0.925 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10158319 10158320 HVO_A0491 HVO_A0492 tsgD6 tsgC6 TRUE 0.995 0.000 0.667 0.032 N NA
 10158320 10158321 HVO_A0492 HVO_A0493 tsgC6 tsgB6 TRUE 0.990 2.000 0.000 0.032 Y NA
 10158321 10158322 HVO_A0493 HVO_A0494 tsgB6 tsgA6 TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.032 Y NA
 10158322 10158323 HVO_A0494 HVO_A0495 tsgA6 boa7 FALSE 0.127 167.000 0.000 1.000   NA
 10158323 10158324 HVO_A0495 HVO_A0496 boa7 uspA31 FALSE 0.169 142.000 0.000 1.000   NA
 10158325 10158326 HVO_A0497 HVO_A0498     FALSE 0.084 124.000 0.000 NA   NA
 10158326 10158327 HVO_A0498 HVO_A0499     FALSE 0.096 83.000 0.000 NA   NA
 10158329 10158330 HVO_A0501 HVO_A0503     FALSE 0.004 512.000 0.000 NA   NA
 10158330 10158331 HVO_A0503 HVO_A0504     FALSE 0.006 429.000 0.000 NA   NA
 10158332 10158333 HVO_A0505 HVO_A0506 fadA4 boa8 TRUE 0.563 82.000 0.429 NA   NA
 10158334 10158335 HVO_A0507 HVO_A0508 paaA pacF TRUE 0.972 6.000 0.920 NA   NA
 10158335 10158336 HVO_A0508 HVO_A0509 pacF paaI TRUE 0.987 3.000 0.943 NA   NA
 10158336 10158337 HVO_A0509 HVO_A0510 paaI   TRUE 0.926 -7.000 0.035 NA   NA
 10158337 10158338 HVO_A0510 HVO_A0511     TRUE 0.982 4.000 1.000 NA   NA
 10158339 10158340 HVO_A0512 HVO_A0513 aldY5   FALSE 0.192 69.000 0.022 NA N NA
 10158340 10158341 HVO_A0513 HVO_A0514   livF4 FALSE 0.061 80.000 0.000 NA N NA
 10158341 10158342 HVO_A0514 HVO_A0515 livF4 livG4 TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.019 Y NA
 10158342 10158343 HVO_A0515 HVO_A0516 livG4 livHM4 TRUE 0.997 -7.000 0.800 1.000 Y NA
 10158343 10158344 HVO_A0516 HVO_A0517 livHM4   FALSE 0.082 50.000 0.000 NA N NA
 10158349 10158350 HVO_A0522 HVO_A0523 acaB4   TRUE 0.992 -3.000 0.040 NA Y NA
 10158350 10158351 HVO_A0523 HVO_A0524   hbd4 TRUE 0.515 87.000 0.000 NA Y NA
 10158351 10158352 HVO_A0524 HVO_A0525 hbd4 fadA5 TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 10158353 10158354 HVO_A0526 HVO_A0527   arcR12 FALSE 0.020 244.000 0.000 NA   NA
 10158355 10158356 HVO_A0528 HVO_A0529   ilvB2 TRUE 0.941 5.000 0.375 NA   NA
 10158356 10158357 HVO_A0529 HVO_A0530 ilvB2 galE6 TRUE 0.621 90.000 0.625 1.000 N NA
 10158358 10158359 HVO_A0531 HVO_A0532     FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10158359 10158360 HVO_A0532 HVO_A0533     FALSE 0.112 66.000 0.000 NA   NA
 10158360 10158361 HVO_A0533 HVO_A0534     TRUE 0.950 4.000 0.333 NA   NA
 10158363 10158364 HVO_A0536 HVO_A0537 hyuB1 hyuA1 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.002 Y NA
 10158364 10158365 HVO_A0537 HVO_A0538 hyuA1 mntH TRUE 0.972 0.000 0.121 1.000 N NA
 10158365 10158366 HVO_A0538 HVO_A0539 mntH orf5 FALSE 0.208 191.000 0.103 1.000   NA
 10158366 10158367 HVO_A0539 HVO_A0540 orf5 htlD2 FALSE 0.271 104.000 0.000 0.040   NA
 10158367 10158368 HVO_A0540 HVO_A0541 htlD2   FALSE 0.036 169.000 0.000 NA N NA
 10158368 10158369 HVO_A0541 HVO_A0542     FALSE 0.089 86.000 0.000 NA   NA
 10158369 10158370 HVO_A0542 HVO_A0543     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158371 10158372 HVO_A0544 HVO_A0545   tetR1 FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 10158375 10158376 HVO_A0548 HVO_A0549 doxD1 nosL1 FALSE 0.068 106.000 0.000 NA   NA
 10158376 10158377 HVO_A0549 HVO_A0550 nosL1   FALSE 0.036 169.000 0.000 NA N NA
 10158377 10158378 HVO_A0550 HVO_A0551   acs9 FALSE 0.123 123.000 0.000 1.000 N NA
 10158381 10158382 HVO_A0555 HVO_A0556     FALSE 0.009 328.000 0.000 NA   NA
 10158385 10158386 HVO_A0559 HVO_A0560 hutH hutI TRUE 0.970 -7.000 0.015 0.017 N NA
 10158386 10158387 HVO_A0560 HVO_A0561 hutI hutG TRUE 0.968 -7.000 0.171 1.000 N NA
 10158387 10158388 HVO_A0561 HVO_A0562 hutG hutU TRUE 0.997 -3.000 0.114 0.001 Y NA
 10158392 10158393 HVO_A0566 HVO_A0567     TRUE 0.997 -3.000 0.057 0.001 Y NA
 10158393 10158394 HVO_A0567 HVO_A0568     TRUE 0.989 2.000 0.053 1.000 Y NA
 10158394 10158395 HVO_A0568 HVO_A0569   baiF1 TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.046 N NA
 10158395 10158396 HVO_A0569 HVO_A0570 baiF1   FALSE 0.160 196.000 0.077 1.000 N NA
 10158396 10158397 HVO_A0570 HVO_A0571     TRUE 0.973 -3.000 0.077 1.000 N NA
 10158397 10158398 HVO_A0571 HVO_A0572     TRUE 0.836 31.000 0.667 NA N NA
 10158398 10158399 HVO_A0572 HVO_A0574     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 10158400 10158401 HVO_A0575 HVO_A0576   livJ5 FALSE 0.039 165.000 0.000 NA N NA
 10158401 10158402 HVO_A0576 HVO_A0577 livJ5 livH5 TRUE 0.654 95.000 0.182 NA Y NA
 10158402 10158403 HVO_A0577 HVO_A0578 livH5 livM5 TRUE 0.997 -3.000 0.143 0.032 Y NA
 10158403 10158404 HVO_A0578 HVO_A0579 livM5 livG5 TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10158404 10158405 HVO_A0579 HVO_A0580 livG5 livF5 TRUE 0.991 -7.000 0.000 0.018 Y NA
 10158405 10158406 HVO_A0580 HVO_A0581 livF5   TRUE 0.899 2.000 0.000 1.000   NA
 10158406 10158407 HVO_A0581 HVO_A0582     TRUE 0.831 42.000 0.286 0.000   NA
 10158407 10158408 HVO_A0582 HVO_A0583   arcR13 TRUE 0.809 70.000 1.000 1.000   NA
 10158409 10158410 HVO_A0584 HVO_A0585 guaB2   FALSE 0.230 32.000 0.000 NA   NA
 10158411 10158412 HVO_A0586 HVO_A0587 graD3 htlD3 FALSE 0.099 101.000 0.000 1.000 N NA
 10158412 10158413 HVO_A0587 HVO_A0588 htlD3   FALSE 0.016 216.000 0.000 NA N NA
 10158414 10158415 HVO_A0589 HVO_A0590     FALSE 0.071 162.000 0.000 NA   NA
 10158415 10158416 HVO_A0590 HVO_A0591     FALSE 0.067 100.000 0.000 NA   NA
 10158418 10158419 HVO_A0593 HVO_A0594   glmS FALSE 0.068 208.000 0.000 1.000   NA
 10158419 10158420 HVO_A0594 HVO_A0595 glmS graD4 TRUE 0.990 0.000 0.003 1.000 Y NA
 10158420 10158421 HVO_A0595 HVO_A0596 graD4   FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 10158421 10158422 HVO_A0596 HVO_A0597     FALSE 0.005 454.000 0.000 NA   NA
 10158423 10158424 HVO_A0598 HVO_A0599     FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 10158424 10158425 HVO_A0599 HVO_A0600     FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 10158426 10158427 HVO_A0601 HVO_A0602 nosL2 manB1 FALSE 0.043 117.000 0.000 NA N NA
 10158427 10158428 HVO_A0602 HVO_A0604 manB1   FALSE 0.048 184.000 0.000 NA   NA
 10158428 10158429 HVO_A0604 HVO_A0605     FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 10158429 10158430 HVO_A0605 HVO_A0606     FALSE 0.082 149.000 0.000 NA   NA
 10158430 10158431 HVO_A0606 HVO_A0607   cheW2 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158433 10158434 HVO_A0609 HVO_A0610 znuB2 znuC2 TRUE 0.926 143.000 1.000 0.061 Y NA
 10158434 10158435 HVO_A0610 HVO_A0611 znuC2 znuA2 TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 10158435 10158436 HVO_A0611 HVO_A0613 znuA2   FALSE 0.059 173.000 0.000 NA   NA
 10158438 10158439 HVO_A0615 HVO_A0616 cspD5 tetR2 TRUE 0.649 155.000 0.000 0.040 Y NA
 10158439 10158440 HVO_A0616 HVO_A0617 tetR2   FALSE 0.142 83.000 0.000 1.000 N NA
 10158440 10158441 HVO_A0617 HVO_A0618     FALSE 0.243 52.000 0.000 1.000   NA
 10158441 10158442 HVO_A0618 HVO_A0619     FALSE 0.074 111.000 0.000 NA   NA
 10158442 10158443 HVO_A0619 HVO_A0620     TRUE 0.900 23.000 0.667 NA   NA
 10158444 10158445 HVO_A0621 HVO_A0622     FALSE 0.191 39.000 0.000 NA   NA
 10158446 10158447 HVO_A0623 HVO_A0624   zntA1 FALSE 0.057 217.000 0.000 1.000   NA
 10158447 10158448 HVO_A0624 HVO_A0625 zntA1   FALSE 0.073 96.000 0.000 NA   NA
 10158448 10158449 HVO_A0625 HVO_A0626     TRUE 0.988 -3.000 0.375 NA   NA
 10158449 10158450 HVO_A0626 HVO_A0627     TRUE 0.562 66.000 0.375 NA   NA
 10158451 10158452 HVO_A0628 HVO_A0629   htlD5 TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10158454 10158455 HVO_A0631 HVO_A0632     FALSE 0.006 423.000 0.000 NA   NA
 10158455 10158456 HVO_A0632 HVO_A0633     FALSE 0.132 239.000 0.000 0.002   NA
 10158456 10158457 HVO_A0633 HVO_A0634     FALSE 0.132 165.000 0.000 1.000   NA
 10158457 10158458 HVO_A0634 HVO_A0635     TRUE 0.943 7.000 0.000 1.000 Y NA
 10158458 10158459 HVO_A0635 HVO_A0636     FALSE 0.110 63.000 0.000 NA   NA
 10158460 10158461 HVO_A0637 HVO_A0638 tif1A2   FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 10161474 10161475 HVO_C0001 HVO_C0002 orc10   FALSE 0.013 294.000 0.000 NA   NA
 10161475 10161476 HVO_C0002 HVO_C0003     FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 10161479 10161480 HVO_C0006 HVO_C0007     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 10161480 10161481 HVO_C0007 HVO_C0008     FALSE 0.093 132.000 0.000 NA   NA
 10161482 10161483 HVO_C0009 HVO_C0010     FALSE 0.060 172.000 0.000 NA   NA
 10161483 10161484 HVO_C0010 HVO_C0011     FALSE 0.027 220.000 0.000 NA   NA
 10161484 10161485 HVO_C0011 HVO_C0012     FALSE 0.032 211.000 0.000 NA   NA
 10161485 10161486 HVO_C0012 HVO_C0014     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 10161487 10161488 HVO_C0013 HVO_C0015     FALSE 0.004 582.000 0.000 NA   NA
 10161488 10161489 HVO_C0015 HVO_C0016     FALSE 0.263 28.000 0.000 NA   NA
 10161490 10161491 HVO_C0017 HVO_C0018 parA1   TRUE 0.750 3.000 0.000 NA   NA
 10161493 10161494 HVO_C0020A HVO_C0021     FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 10161495 10161496 HVO_C0022 HVO_C0023     FALSE 0.088 143.000 0.000 NA   NA
 10161496 10161497 HVO_C0023 HVO_C0025     FALSE 0.036 204.000 0.000 NA   NA
 10161497 10161498 HVO_C0025 HVO_C0026     FALSE 0.143 49.000 0.000 NA   NA
 10161499 10161500 HVO_C0027 HVO_C0028     FALSE 0.122 56.000 0.000 NA   NA
 10161500 10161501 HVO_C0028 HVO_C0029     TRUE 0.612 5.000 0.000 NA   NA
 10161501 10161502 HVO_C0029 HVO_C0030     FALSE 0.291 26.000 0.000 NA   NA
 10161503 10161504 HVO_C0031 HVO_C0032     FALSE 0.162 44.000 0.000 NA   NA
 10161505 10161506 HVO_C0033 HVO_C0034     FALSE 0.111 62.000 0.000 NA   NA
 10161506 10161507 HVO_C0034 HVO_C0035     FALSE 0.199 37.000 0.000 NA   NA
 10161507 10161508 HVO_C0035 HVO_C0036     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 10161508 10161509 HVO_C0036 HVO_C0037     FALSE 0.005 445.000 0.000 NA   NA
 10161511 10161512 HVO_C0039 HVO_C0040     FALSE 0.070 381.000 0.000 NA Y NA
 10161512 10161513 HVO_C0040 HVO_C0041     FALSE 0.036 204.000 0.000 NA   NA
 10161513 10161514 HVO_C0041 HVO_C0042     FALSE 0.067 105.000 0.000 NA   NA
 10161514 10161515 HVO_C0042 HVO_C0043     FALSE 0.074 95.000 0.000 NA   NA
 10161515 10161516 HVO_C0043 HVO_C0044     FALSE 0.278 27.000 0.000 NA   NA
 10161516 10161517 HVO_C0044 HVO_C0045     FALSE 0.086 145.000 0.000 NA   NA
 10161518 10161519 HVO_C0046 HVO_C0047     FALSE 0.137 51.000 0.000 NA   NA
 10161520 10161521 HVO_C0048 HVO_C0049     FALSE 0.131 53.000 0.000 NA   NA
 10161524 10161525 HVO_C0052 HVO_C0053     TRUE 0.773 -1506.000 0.000 NA   NA
 10161525 10161526 HVO_C0053 HVO_C0054     FALSE 0.018 250.000 0.000 NA   NA
 10161528 10161529 HVO_C0055 HVO_C0056     FALSE 0.009 332.000 0.000 NA   NA
 10161530 10161531 HVO_C0057 HVO_C0058 orc8   FALSE 0.002 1601.000 0.000 NA   NA
 10161531 10161532 HVO_C0058 HVO_C0060     FALSE 0.076 115.000 0.000 NA   NA
 10161532 10161533 HVO_C0060 HVO_C0061     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 10161534 10161535 HVO_C0062 HVO_C0063     FALSE 0.024 229.000 0.000 NA   NA
 10161536 10161537 HVO_C0064 HVO_C0065     FALSE 0.047 186.000 0.000 NA   NA
 10161540 10161541 HVO_C0069 HVO_C0070 gfo1   FALSE 0.216 75.000 0.000 1.000   NA
 10161541 10161542 HVO_C0070 HVO_C0071     FALSE 0.158 263.000 0.000 NA Y NA
 10161542 10161543 HVO_C0071 HVO_C0072   dppC16 FALSE 0.042 159.000 0.000 NA N NA
 10161543 10161544 HVO_C0072 HVO_C0073 dppC16 dppB16 TRUE 0.999 0.000 0.667 0.032 Y NA
 10161546 10161547 HVO_C0075 HVO_C0076 dppA16 arcR22 FALSE 0.010 387.000 0.000 1.000 N NA
 10161549 10161550 HVO_C0078 HVO_C0079     TRUE 0.502 8.000 0.000 NA   NA
 10161550 10161551 HVO_C0079 HVO_C0080     FALSE 0.454 11.000 0.000 NA   NA
 10161551 10161552 HVO_C0080 HVO_C0080A     FALSE 0.162 44.000 0.000 NA   NA
 10161552 10161553 HVO_C0080A HVO_C0081     FALSE 0.019 249.000 0.000 NA   NA
 10161553 10161554 HVO_C0081 HVO_C0082     FALSE 0.137 51.000 0.000 NA   NA
 10161556 10161557 HVO_C0084 HVO_C0085     FALSE 0.131 53.000 0.000 NA   NA
 10161557 10161558 HVO_C0085 HVO_C0086     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10161558 10161559 HVO_C0086 HVO_C0087     TRUE 0.889 -3.000 0.000 NA   NA
 10161559 10161560 HVO_C0087 HVO_C0088     FALSE 0.488 9.000 0.000 NA   NA
 10161560 10161561 HVO_C0088 HVO_C0089     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA