MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter lari RM2100

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
6887354	6887355	Cla_0001	Cla_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.744	133.000	0.328	1.000	Y	NA
6887355	6887356	Cla_0002	Cla_0003	dnaN	gyrB	TRUE	0.968	10.000	0.114	1.000	Y	NA
6887356	6887357	Cla_0003	Cla_0004	gyrB		TRUE	0.691	9.000	0.000	1.000	N	NA
6887357	6887358	Cla_0004	Cla_0005			TRUE	0.681	-3.000	0.000	NA		NA
6887358	6887359	Cla_0005	Cla_0006			FALSE	0.415	-24.000	0.000	NA		NA
6887359	6887360	Cla_0006	Cla_0007			FALSE	0.077	172.000	0.000	1.000		NA
6887360	6887361	Cla_0007	Cla_0008			TRUE	0.988	3.000	0.180	0.052		NA
6887361	6887362	Cla_0008	Cla_0009			FALSE	0.154	43.000	0.000	1.000		NA
6887362	6887363	Cla_0009	Cla_0010			TRUE	0.634	10.000	0.000	1.000		NA
6887365	6887366	Cla_0012	Cla_0013	pyrG	recJ	TRUE	0.878	-10.000	0.026	1.000	N	NA
6887366	6887367	Cla_0013	Cla_0014	recJ		FALSE	0.077	69.000	0.000	NA		NA
6887368	6887369	Cla_0015	Cla_0016	prfA	rpsT	TRUE	0.956	4.000	0.029	1.000	Y	NA
6887369	6887370	Cla_0016	Cla_0017	rpsT		FALSE	0.304	289.000	0.000	0.032	Y	NA
6887370	6887371	Cla_0017	Cla_0018			TRUE	0.957	10.000	0.118	1.000		NA
6887371	6887372	Cla_0018	Cla_0019		ksgA	TRUE	0.812	-34.000	0.028	1.000		NA
6887373	6887374	Cla_0020	Cla_0021			TRUE	0.944	9.000	0.011	0.034		NA
6887374	6887375	Cla_0021	Cla_0022			FALSE	0.065	97.000	0.000	NA		NA
6887377	6887378	Cla_0024	Cla_0025	purB1	nrdA	TRUE	0.759	14.000	0.012	1.000	Y	NA
6887378	6887379	Cla_0025	Cla_0026	nrdA		FALSE	0.291	16.000	0.000	NA		NA
6887379	6887380	Cla_0026	Cla_0027			TRUE	0.947	-3.000	0.043	NA		NA
6887380	6887381	Cla_0027	Cla_0028		thrS	FALSE	0.432	107.000	0.063	1.000	N	NA
6887381	6887382	Cla_0028	Cla_0029	thrS	infC	TRUE	0.970	-3.000	0.060	1.000	Y	NA
6887382	6887383	Cla_0029	Cla_0030	infC		FALSE	0.329	34.000	0.004	1.000	N	NA
6887384	6887385	Cla_0031	Cla_0032			FALSE	0.069	79.000	0.000	NA		NA
6887385	6887386	Cla_0032	Cla_0033			FALSE	0.156	32.000	0.000	NA		NA
6887387	6887388	Cla_0034	Cla_0035	rpmI	rplT	TRUE	0.947	98.000	0.928	0.036	Y	NA
6887388	6887389	Cla_0035	Cla_0036	rplT		FALSE	0.426	-52.000	0.000	1.000	N	NA
6887390	6887391	Cla_0037	Cla_0038			TRUE	0.991	-7.000	0.616	1.000	Y	NA
6887391	6887392	Cla_0038	Cla_0039			TRUE	0.993	-3.000	0.509	1.000	Y	NA
6887394	6887395	Cla_0041	Cla_0042	pyrC1		TRUE	0.866	9.000	0.009	1.000		NA
6887395	6887396	Cla_0042	Cla_0043		dgkA	TRUE	0.961	-15.000	0.273	1.000		NA
6887396	6887397	Cla_0043	Cla_0044	dgkA		TRUE	0.967	0.000	0.091	1.000		NA
6887398	6887399	Cla_0045	Cla_0046	xth		FALSE	0.075	70.000	0.000	NA		NA
6887399	6887400	Cla_0046	Cla_0047			FALSE	0.067	213.000	0.000	NA		NA
6887400	6887401	Cla_0047	Cla_0048		nrdD	FALSE	0.064	132.000	0.000	NA		NA
6887401	6887402	Cla_0048	Cla_0049	nrdD	nrdG	TRUE	0.929	-52.000	0.192	1.000	N	NA
6887402	6887403	Cla_0049	Cla_0050	nrdG	sodB	FALSE	0.093	68.000	0.000	1.000	N	NA
6887403	6887404	Cla_0050	Cla_0051	sodB		FALSE	0.109	60.000	0.000	1.000	N	NA
6887406	6887407	Cla_0053	Cla_0054	coaE	dapF	TRUE	0.834	11.000	0.016	1.000	N	NA
6887407	6887408	Cla_0054	Cla_0055	dapF		TRUE	0.720	-25.000	0.010	1.000		NA
6887409	6887410	Cla_0056	Cla_0057			FALSE	0.204	23.000	0.000	NA		NA
6887411	6887412	Cla_0058	Cla_0059	rpsJ	rplC	TRUE	0.994	10.000	0.467	0.048	Y	NA
6887412	6887413	Cla_0059	Cla_0060	rplC	rplD	TRUE	0.995	-3.000	0.361	0.036	Y	NA
6887413	6887414	Cla_0060	Cla_0061	rplD	rplW	TRUE	0.993	2.000	0.513	1.000	Y	NA
6887414	6887415	Cla_0061	Cla_0062	rplW	rplB	TRUE	0.996	2.000	0.849	1.000	Y	NA
6887415	6887416	Cla_0062	Cla_0063	rplB	rpsS	TRUE	0.998	2.000	0.820	0.048	Y	NA
6887416	6887417	Cla_0063	Cla_0064	rpsS	rplV	TRUE	0.993	12.000	0.769	0.048	Y	NA
6887417	6887418	Cla_0064	Cla_0065	rplV	rpsC	TRUE	0.997	2.000	0.719	0.048	Y	NA
6887418	6887419	Cla_0065	Cla_0066	rpsC	rplP	TRUE	0.998	3.000	0.828	0.048	Y	NA
6887419	6887420	Cla_0066	Cla_0067	rplP	rpmC	TRUE	0.995	-13.000	0.802	0.036	Y	NA
6887420	6887421	Cla_0067	Cla_0068	rpmC	rpsQ	TRUE	0.997	10.000	0.828	0.036	Y	NA
6887421	6887422	Cla_0068	Cla_0069	rpsQ	rplN	TRUE	0.998	0.000	0.791	0.048	Y	NA
6887422	6887423	Cla_0069	Cla_0070	rplN	rplX	TRUE	0.998	0.000	0.810	0.048	Y	NA
6887423	6887424	Cla_0070	Cla_0071	rplX	rplE	TRUE	0.998	2.000	0.758	0.036	Y	NA
6887424	6887425	Cla_0071	Cla_0072	rplE	rpsN	TRUE	0.996	2.000	0.496	0.036	Y	NA
6887425	6887426	Cla_0072	Cla_0073	rpsN	rpsH	TRUE	0.987	13.000	0.473	0.036	Y	NA
6887426	6887427	Cla_0073	Cla_0074	rpsH	rplF	TRUE	0.942	77.000	0.808	0.036	Y	NA
6887427	6887428	Cla_0074	Cla_0075	rplF	rplR	TRUE	0.996	11.000	0.815	0.036	Y	NA
6887428	6887429	Cla_0075	Cla_0076	rplR	rpsE	TRUE	0.994	-16.000	0.814	0.048	Y	NA
6887429	6887430	Cla_0076	Cla_0077	rpsE	rplO	TRUE	0.990	4.000	0.148	0.048	Y	NA
6887430	6887431	Cla_0077	Cla_0078	rplO	secY	TRUE	0.994	0.000	0.730	1.000	N	NA
6887431	6887432	Cla_0078	Cla_0079	secY	murI	FALSE	0.158	41.000	0.000	1.000	N	NA
6887432	6887433	Cla_0079	Cla_0080	murI	ansA	FALSE	0.077	101.000	0.000	1.000	N	NA
6887433	6887434	Cla_0080	Cla_0081	ansA	rbr	FALSE	0.080	84.000	0.000	1.000	N	NA
6887434	6887435	Cla_0081	Cla_0082	rbr		FALSE	0.103	55.000	0.000	NA	N	NA
6887435	6887436	Cla_0082	Cla_0083		rnhB	TRUE	0.901	0.000	0.004	NA	Y	NA
6887436	6887437	Cla_0083	Cla_0084	rnhB	sdaC	FALSE	0.070	380.000	0.000	NA	N	NA
6887437	6887438	Cla_0084	Cla_0085	sdaC	sdaA	TRUE	0.976	12.000	0.400	NA	Y	NA
6887438	6887439	Cla_0085	Cla_0086	sdaA	map	FALSE	0.078	90.000	0.000	1.000	N	NA
6887440	6887441	Cla_0087	Cla_0088			TRUE	0.985	-16.000	0.800	1.000	N	NA
6887441	6887442	Cla_0088	Cla_0089			FALSE	0.116	57.000	0.000	1.000		NA
6887443	6887444	Cla_0090	Cla_0091	infA	rpmJ	FALSE	0.501	176.000	0.104	1.000		NA
6887444	6887445	Cla_0091	Cla_0092	rpmJ	rpsM	TRUE	0.989	4.000	0.194	0.036		NA
6887445	6887446	Cla_0092	Cla_0093	rpsM	rpsK	TRUE	0.997	10.000	0.810	0.036	Y	NA
6887446	6887447	Cla_0093	Cla_0094	rpsK	rpsD	TRUE	0.958	31.000	0.509	0.048	Y	NA
6887447	6887448	Cla_0094	Cla_0095	rpsD	rpoA	TRUE	0.959	15.000	0.549	1.000	N	NA
6887448	6887449	Cla_0095	Cla_0096	rpoA	rplQ	TRUE	0.995	4.000	0.873	1.000	N	NA
6887449	6887450	Cla_0096	Cla_0097	rplQ	hisG	FALSE	0.159	111.000	0.004	1.000	N	NA
6887450	6887451	Cla_0097	Cla_0098	hisG	hisD	TRUE	0.988	10.000	0.171	0.010	Y	NA
6887451	6887452	Cla_0098	Cla_0099	hisD	hisB	TRUE	0.966	-3.000	0.010	0.010	Y	NA
6887452	6887453	Cla_0099	Cla_0100	hisB		FALSE	0.150	34.000	0.000	NA		NA
6887453	6887454	Cla_0100	Cla_0101		hisH1	FALSE	0.212	22.000	0.000	NA		NA
6887454	6887455	Cla_0101	Cla_0102	hisH1	hisA	TRUE	0.993	7.000	0.210	0.010	Y	NA
6887455	6887456	Cla_0102	Cla_0103	hisA	hisF1	TRUE	0.989	-18.000	0.433	0.010	Y	NA
6887456	6887457	Cla_0103	Cla_0104	hisF1	hisIE	TRUE	0.990	12.000	0.430	0.010	Y	NA
6887457	6887458	Cla_0104	Cla_0105	hisIE		FALSE	0.076	123.000	0.000	1.000	N	NA
6887458	6887459	Cla_0105	Cla_0106			FALSE	0.067	230.000	0.000	NA		NA
6887459	6887460	Cla_0106	Cla_0107		flgE1	FALSE	0.064	136.000	0.000	NA		NA
6887461	6887462	Cla_0108	Cla_0109			FALSE	0.076	129.000	0.000	1.000		NA
6887463	6887464	Cla_0110	Cla_0111			TRUE	0.929	-13.000	0.107	NA		NA
6887464	6887465	Cla_0111	Cla_0112		murE	TRUE	0.891	-16.000	0.057	NA		NA
6887465	6887466	Cla_0112	Cla_0113	murE		TRUE	0.857	1.000	0.006	NA		NA
6887466	6887467	Cla_0113	Cla_0114			TRUE	0.877	-3.000	0.010	NA		NA
6887467	6887468	Cla_0114	Cla_0115		ispA	TRUE	0.977	-3.000	0.167	1.000		NA
6887468	6887469	Cla_0115	Cla_0116	ispA	tkt	TRUE	0.987	4.000	0.375	1.000	N	NA
6887469	6887470	Cla_0116	Cla_0117	tkt	iamB	TRUE	0.947	-10.000	0.132	NA	N	NA
6887470	6887471	Cla_0117	Cla_0118	iamB	iamA	TRUE	0.996	-3.000	0.912	NA	Y	NA
6887471	6887472	Cla_0118	Cla_0119	iamA		TRUE	0.996	0.000	0.912	NA	Y	NA
6887472	6887473	Cla_0119	Cla_0120			TRUE	0.970	2.000	0.120	NA		NA
6887473	6887474	Cla_0120	Cla_0121			FALSE	0.460	44.000	0.027	NA		NA
6887476	6887477	Cla_0123	Cla_0124			TRUE	0.675	66.000	0.250	NA		NA
6887478	6887479	Cla_0125	Cla_0126		ung	FALSE	0.116	50.000	0.000	NA		NA
6887479	6887480	Cla_0126	Cla_0127	ung		TRUE	0.691	9.000	0.000	1.000	N	NA
6887480	6887481	Cla_0127	Cla_0128			TRUE	0.723	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
6887481	6887482	Cla_0128	Cla_0129			TRUE	0.987	2.000	0.400	NA		NA
6887482	6887483	Cla_0129	Cla_0130			FALSE	0.087	63.000	0.000	NA		NA
6887484	6887485	Cla_0131	Cla_0132	mutY		TRUE	0.582	-10.000	0.000	1.000		NA
6887490	6887491	Cla_0137	Cla_0138	ktrA	ktrB	TRUE	0.997	-3.000	0.647	0.007	Y	NA
6887491	6887492	Cla_0138	Cla_0139	ktrB		FALSE	0.188	89.000	0.000	0.072		NA
6887492	6887493	Cla_0139	Cla_0140		aspA	TRUE	0.865	20.000	0.195	1.000		NA
6887493	6887494	Cla_0140	Cla_0141	aspA		FALSE	0.084	392.000	0.000	1.000	N	NA
6887494	6887495	Cla_0141	Cla_0142			FALSE	0.065	175.000	0.000	NA		NA
6887495	6887496	Cla_0142	Cla_0143			FALSE	0.084	64.000	0.000	NA		NA
6887496	6887497	Cla_0143	Cla_0144			TRUE	0.848	13.000	0.047	NA		NA
6887497	6887498	Cla_0144	Cla_0145		moaC	TRUE	0.877	-22.000	0.057	NA		NA
6887499	6887500	Cla_0146	Cla_0147			TRUE	0.695	3.000	0.000	NA		NA
6887503	6887504	Cla_0150	Cla_0151			TRUE	0.988	-10.000	0.788	NA		NA
6887504	6887505	Cla_0151	Cla_0152		eno	TRUE	0.960	-3.000	0.080	NA		NA
6887505	6887506	Cla_0152	Cla_0153	eno	recA	TRUE	0.945	0.000	0.033	1.000	N	NA
6887507	6887508	Cla_0154	Cla_0155		fliQ	TRUE	0.697	27.000	0.068	NA		NA
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6887651	6887652	Cla_0299	Cla_0300			FALSE	0.066	201.000	0.000	NA		NA
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6887663	6887664	Cla_0311	Cla_0312			FALSE	0.103	55.000	0.000	NA		NA
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6887806	6887807	Cla_0454	Cla_0455			FALSE	0.537	-13.000	0.000	1.000		NA
6887807	6887808	Cla_0455	Cla_0456			FALSE	0.516	79.000	0.103	1.000		NA
6887808	6887809	Cla_0456	Cla_0457			TRUE	0.878	1.000	0.000	0.066	N	NA
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6887812	6887813	Cla_0460	Cla_0461			FALSE	0.067	253.000	0.000	NA		NA
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6887814	6887815	Cla_0462	Cla_0463			FALSE	0.071	430.000	0.000	NA		NA
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6888143	6888144	Cla_0791	Cla_0792	hypB	hypF	TRUE	0.592	64.000	0.064	1.000	Y	NA
6888144	6888145	Cla_0792	Cla_0793	hypF		TRUE	0.772	-19.000	0.018	NA		NA
6888145	6888146	Cla_0793	Cla_0794			TRUE	0.796	32.000	0.211	NA		NA
6888146	6888147	Cla_0794	Cla_0795			TRUE	0.892	-24.000	0.085	NA		NA
6888147	6888148	Cla_0795	Cla_0796			FALSE	0.072	647.000	0.000	NA		NA
6888148	6888149	Cla_0796	Cla_0797			TRUE	0.691	2.000	0.000	NA		NA
6888149	6888150	Cla_0797	Cla_0798		pstB	FALSE	0.098	57.000	0.000	NA		NA
6888150	6888151	Cla_0798	Cla_0799	pstB	pstA	TRUE	0.996	-3.000	0.402	0.003	Y	NA
6888151	6888152	Cla_0799	Cla_0800	pstA	pstC	TRUE	0.997	-3.000	0.485	0.003	Y	NA
6888152	6888153	Cla_0800	Cla_0801	pstC	pstS	TRUE	0.877	15.000	0.079	NA	Y	NA
6888154	6888155	Cla_0802	Cla_0803			TRUE	0.982	-6.000	0.231	1.000	Y	NA
6888155	6888156	Cla_0803	Cla_0804		cft	FALSE	0.082	79.000	0.000	1.000	N	NA
6888156	6888157	Cla_0804	Cla_0805	cft		FALSE	0.064	109.000	0.000	NA	N	NA
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6888162	6888163	Cla_0810	Cla_0811		lpxD	TRUE	0.893	-7.000	0.026	NA		NA
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6888184	6888185	Cla_0832	Cla_0833			TRUE	0.687	1.000	0.000	NA		NA
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6888244	6888245	Cla_0892	Cla_0893	dnaE		FALSE	0.067	86.000	0.000	NA		NA
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6888265	6888266	Cla_0913	Cla_0914	fba	peb4	TRUE	0.949	0.000	0.036	1.000	N	NA
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6888279	6888280	Cla_0927	Cla_0928			TRUE	0.903	-7.000	0.030	NA		NA
6888281	6888282	Cla_0929	Cla_0930	pitB	pdxA	FALSE	0.379	47.000	0.014	1.000	N	NA
6888282	6888283	Cla_0930	Cla_0931	pdxA	pdxJ	TRUE	0.988	-3.000	0.048	0.001	Y	NA
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6888285	6888286	Cla_0933	Cla_0934			TRUE	0.720	-3.000	0.000	1.000		NA
6888287	6888288	Cla_0935	Cla_0936	dnaK	grpE	TRUE	0.854	22.000	0.029	0.011	Y	NA
6888288	6888289	Cla_0936	Cla_0937	grpE	hrcA	TRUE	0.943	-3.000	0.038	NA	N	NA
6888289	6888290	Cla_0937	Cla_0938	hrcA		FALSE	0.070	363.000	0.000	NA		NA
6888290	6888291	Cla_0938	Cla_0939			TRUE	0.983	-3.000	0.294	NA		NA
6888291	6888292	Cla_0939	Cla_0940			TRUE	0.937	-16.000	0.154	NA		NA
6888292	6888293	Cla_0940	Cla_0941		flhA	TRUE	0.951	10.000	0.106	NA		NA
6888293	6888294	Cla_0941	Cla_0942	flhA		TRUE	0.932	-7.000	0.053	NA	N	NA
6888296	6888297	Cla_0944	Cla_0945			TRUE	0.748	-13.000	0.008	NA	N	NA
6888297	6888298	Cla_0945	Cla_0946		dprA	TRUE	0.951	-3.000	0.026	1.000	Y	NA
6888298	6888299	Cla_0946	Cla_0947	dprA		TRUE	0.843	-13.000	0.022	1.000		NA
6888299	6888300	Cla_0947	Cla_0948		ilvC	TRUE	0.905	2.000	0.013	1.000		NA
6888301	6888302	Cla_0949	Cla_0950	rnr		TRUE	0.812	-7.000	0.005	1.000	N	NA
6888302	6888303	Cla_0950	Cla_0951		rpsF	FALSE	0.267	92.000	0.020	1.000	N	NA
6888303	6888304	Cla_0951	Cla_0952	rpsF	ssb	TRUE	0.944	4.000	0.033	1.000	N	NA
6888304	6888305	Cla_0952	Cla_0953	ssb	rpsR	TRUE	0.896	11.000	0.034	1.000	N	NA
6888305	6888306	Cla_0953	Cla_0954	rpsR		FALSE	0.110	52.000	0.000	NA	N	NA
6888307	6888308	Cla_0955	Cla_0956			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
6888308	6888309	Cla_0956	Cla_0957			FALSE	0.456	-16.000	0.000	NA		NA
6888309	6888310	Cla_0957	Cla_0958		proC	TRUE	0.681	-3.000	0.000	NA		NA
6888310	6888311	Cla_0958	Cla_0959	proC		TRUE	0.668	33.000	0.075	NA		NA
6888312	6888313	Cla_0960	Cla_0961		lon	TRUE	0.958	0.000	0.062	NA		NA
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6888315	6888316	Cla_0963	Cla_0964			FALSE	0.068	83.000	0.000	NA		NA
6888316	6888317	Cla_0964	Cla_0965		ilvA	FALSE	0.149	44.000	0.000	1.000		NA
6888317	6888318	Cla_0965	Cla_0966	ilvA		TRUE	0.936	3.000	0.030	NA		NA
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6888319	6888320	Cla_0967	Cla_0968			FALSE	0.457	12.000	0.000	NA		NA
6888320	6888321	Cla_0968	Cla_0969		trmA	FALSE	0.069	79.000	0.000	NA		NA
6888321	6888322	Cla_0969	Cla_0970	trmA		TRUE	0.955	1.000	0.056	NA	N	NA
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6888323	6888324	Cla_0971	Cla_0972			TRUE	0.681	-3.000	0.000	NA		NA
6888325	6888326	Cla_0973	Cla_0974	ogt		TRUE	0.729	2.000	0.000	1.000		NA
6888327	6888328	Cla_0975	Cla_0976	truA		TRUE	0.959	1.000	0.059	1.000		NA
6888328	6888329	Cla_0976	Cla_0977			TRUE	0.949	-3.000	0.039	1.000		NA
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6888332	6888333	Cla_0980	Cla_0981	dfp	glmU	TRUE	0.908	-3.000	0.016	1.000	N	NA
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6888335	6888336	Cla_0983	Cla_0984		pabB	TRUE	0.690	9.000	0.000	1.000		NA
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6888337	6888338	Cla_0985	Cla_0986	pabA	cmeD	FALSE	0.170	36.000	0.000	1.000	N	NA
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6888342	6888343	Cla_0990	Cla_0991	aroG		FALSE	0.108	53.000	0.000	NA		NA
6888343	6888344	Cla_0991	Cla_0992		rplS	TRUE	0.844	3.000	0.003	NA		NA
6888344	6888345	Cla_0992	Cla_0993	rplS	trmD	TRUE	0.984	12.000	0.567	1.000	Y	NA
6888345	6888346	Cla_0993	Cla_0994	trmD	rimM	TRUE	0.995	-3.000	0.672	1.000	Y	NA
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6888347	6888348	Cla_0995	Cla_0996		rpsP	TRUE	0.988	3.000	0.385	1.000		NA
6888348	6888349	Cla_0996	Cla_0997	rpsP	ffh	TRUE	0.726	72.000	0.361	1.000	N	NA
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6888352	6888353	Cla_1000	Cla_1001			TRUE	0.962	12.000	0.342	NA		NA
6888353	6888354	Cla_1001	Cla_1002		glyQ	TRUE	0.904	-10.000	0.041	NA		NA
6888354	6888355	Cla_1002	Cla_1003	glyQ		TRUE	0.883	-3.000	0.011	NA		NA
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6888356	6888357	Cla_1004	Cla_1005	purE		TRUE	0.914	-3.000	0.018	1.000	N	NA
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6888362	6888363	Cla_1010	Cla_1011			FALSE	0.081	66.000	0.000	NA		NA
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6888364	6888365	Cla_1012	Cla_1013		napD	TRUE	0.695	3.000	0.000	NA		NA
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6888366	6888367	Cla_1014	Cla_1015	napL	napB	TRUE	0.970	5.000	0.132	NA		NA
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6888377	6888378	Cla_1025	Cla_1027	thiC	dnaQ	FALSE	0.190	187.000	0.007	1.000	N	NA
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6888384	6888385	Cla_1033	Cla_1034		groEL	FALSE	0.076	121.000	0.000	1.000		NA
6888385	6888386	Cla_1034	Cla_1035	groEL	groES	TRUE	0.959	14.000	0.356	1.000	Y	NA
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6888394	6888395	Cla_1043	Cla_1044			TRUE	0.989	2.000	0.455	NA		NA
6888395	6888396	Cla_1044	Cla_1045		leuS	TRUE	0.934	-3.000	0.031	NA		NA
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6888397	6888398	Cla_1046	Cla_1047		secF	TRUE	0.993	3.000	0.667	NA		NA
6888398	6888399	Cla_1047	Cla_1048	secF	secD	TRUE	0.997	0.000	0.436	0.001	Y	NA
6888399	6888400	Cla_1048	Cla_1049	secD		TRUE	0.956	-7.000	0.068	NA	Y	NA
6888403	6888404	Cla_1052	Cla_1053		pyrB	TRUE	0.809	10.000	0.005	1.000	N	NA
6888404	6888405	Cla_1053	Cla_1054	pyrB	pepF	TRUE	0.861	5.000	0.005	1.000	N	NA
6888405	6888406	Cla_1054	Cla_1055	pepF		TRUE	0.953	-7.000	0.115	NA		NA
6888406	6888407	Cla_1055	Cla_1056		uvrD	TRUE	0.925	-3.000	0.026	NA		NA
6888407	6888408	Cla_1056	Cla_1057	uvrD	truB	TRUE	0.953	-3.000	0.046	1.000	N	NA
6888408	6888409	Cla_1057	Cla_1058	truB	csrA	TRUE	0.971	-6.000	0.046	0.025	N	NA
6888409	6888410	Cla_1058	Cla_1059	csrA	ispE	TRUE	0.947	-3.000	0.036	1.000	N	NA
6888410	6888411	Cla_1059	Cla_1060	ispE	smpB	TRUE	0.934	-3.000	0.028	1.000	N	NA
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6888412	6888413	Cla_1061	Cla_1062	trxC	clpS	TRUE	0.818	-16.000	0.024	NA		NA
6888413	6888414	Cla_1062	Cla_1063	clpS	clpA	TRUE	0.991	-3.000	0.596	NA		NA
6888414	6888415	Cla_1063	Cla_1064	clpA	aat	TRUE	0.926	-25.000	0.087	1.000	Y	NA
6888415	6888416	Cla_1064	Cla_1065	aat	flgB	FALSE	0.180	92.000	0.006	1.000	N	NA
6888416	6888417	Cla_1065	Cla_1066	flgB	flgC	TRUE	0.992	11.000	0.804	1.000	Y	NA
6888417	6888418	Cla_1066	Cla_1067	flgC	fliE	TRUE	0.995	4.000	0.271	0.006	Y	NA
6888418	6888419	Cla_1067	Cla_1068	fliE	pbpB	TRUE	0.756	58.000	0.303	1.000	N	NA
6888420	6888421	Cla_1069	Cla_1070	hemH		TRUE	0.872	0.000	0.005	1.000		NA
6888421	6888422	Cla_1070	Cla_1071			TRUE	0.970	-3.000	0.117	1.000		NA
6888423	6888424	Cla_1072	Cla_1073	alaS	maf	TRUE	0.902	0.000	0.015	NA	N	NA
6888424	6888425	Cla_1073	Cla_1074	maf	pbpA	TRUE	0.923	-3.000	0.026	NA	N	NA
6888425	6888426	Cla_1074	Cla_1075	pbpA		FALSE	0.079	86.000	0.000	1.000		NA
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6888427	6888428	Cla_1076	Cla_1077			FALSE	0.223	90.000	0.000	0.020		NA
6888429	6888430	Cla_1078	Cla_1079			FALSE	0.266	196.000	0.000	0.056	Y	NA
6888430	6888431	Cla_1079	Cla_1080			TRUE	0.998	-3.000	0.869	0.056	Y	NA
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6888433	6888434	Cla_1082	Cla_1083	ppi		FALSE	0.119	48.000	0.000	NA		NA
6888434	6888435	Cla_1083	Cla_1084			FALSE	0.116	50.000	0.000	NA		NA
6888435	6888436	Cla_1084	Cla_1085			FALSE	0.363	150.000	0.043	NA		NA
6888436	6888437	Cla_1085	Cla_1086			TRUE	0.961	-3.000	0.083	NA		NA
6888438	6888439	Cla_1087	Cla_1088	argS		TRUE	0.847	10.000	0.011	1.000	N	NA
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6888440	6888441	Cla_1089	Cla_1090	gmk		TRUE	0.681	-3.000	0.000	NA		NA
6888441	6888442	Cla_1090	Cla_1091		fliR	FALSE	0.093	60.000	0.000	NA		NA
6888442	6888443	Cla_1091	Cla_1092	fliR		TRUE	0.877	-13.000	0.032	1.000	N	NA
6888443	6888444	Cla_1092	Cla_1093		tsf	TRUE	0.919	3.000	0.019	1.000	N	NA
6888444	6888445	Cla_1093	Cla_1094	tsf	rpsB	TRUE	0.995	0.000	0.748	1.000	Y	NA
6888445	6888446	Cla_1094	Cla_1095	rpsB	petC	FALSE	0.077	174.000	0.000	1.000	N	NA
6888446	6888447	Cla_1095	Cla_1096	petC	petB	TRUE	0.991	3.000	0.103	0.002	Y	NA
6888447	6888448	Cla_1096	Cla_1097	petB	petA	TRUE	0.991	2.000	0.093	0.002	Y	NA
6888448	6888449	Cla_1097	Cla_1098	petA	gidA	FALSE	0.158	167.000	0.003	1.000	N	NA
6888450	6888451	Cla_1099	Cla_1100	ribE		TRUE	0.690	-36.000	0.011	NA		NA
6888451	6888452	Cla_1100	Cla_1101			TRUE	0.793	-7.000	0.005	NA		NA
6888453	6888454	Cla_1102	Cla_1103			TRUE	0.995	-7.000	0.846	1.000	Y	NA
6888455	6888456	Cla_1104	Cla_1105			FALSE	0.079	68.000	0.000	NA		NA
6888456	6888457	Cla_1105	Cla_1106			FALSE	0.079	68.000	0.000	NA		NA
6888457	6888458	Cla_1106	Cla_1107			FALSE	0.567	11.000	0.000	1.000		NA
6888458	6888459	Cla_1107	Cla_1108		porA2	FALSE	0.070	376.000	0.000	NA		NA
6888459	6888460	Cla_1108	Cla_1109	porA2		FALSE	0.069	290.000	0.000	NA		NA
6888460	6888461	Cla_1109	Cla_1110		livJ	TRUE	0.904	18.000	0.312	NA	N	NA
6888461	6888462	Cla_1110	Cla_1111	livJ	livK	TRUE	0.993	11.000	1.000	NA	Y	NA
6888462	6888463	Cla_1111	Cla_1112	livK	livH	TRUE	0.823	21.000	0.085	NA	Y	NA
6888463	6888464	Cla_1112	Cla_1113	livH	livM	TRUE	0.998	2.000	0.771	0.024	Y	NA
6888464	6888465	Cla_1113	Cla_1114	livM	livG	TRUE	0.985	-3.000	0.200	1.000	Y	NA
6888465	6888466	Cla_1114	Cla_1115	livG	livF	TRUE	0.989	-13.000	0.381	0.018	Y	NA
6888466	6888467	Cla_1115	Cla_1116	livF		TRUE	0.984	4.000	0.280	1.000	N	NA
6888467	6888468	Cla_1116	Cla_1117			FALSE	0.457	12.000	0.000	NA		NA
6888468	6888469	Cla_1117	Cla_1118		lepA	TRUE	0.591	10.000	0.000	NA		NA
6888472	6888473	Cla_1121	Cla_1122	hemD	thiE	TRUE	0.960	0.000	0.032	1.000	Y	NA
6888473	6888474	Cla_1122	Cla_1123	thiE	thiM	TRUE	0.985	-13.000	0.190	0.005	Y	NA
6888474	6888475	Cla_1123	Cla_1124	thiM	thiD	TRUE	0.985	4.000	0.039	0.005	Y	NA
6888477	6888478	Cla_1126	Cla_1127		gidB	TRUE	0.794	-6.000	0.002	NA		NA
6888478	6888479	Cla_1127	Cla_1128	gidB	ribA	TRUE	0.909	-3.000	0.017	1.000	N	NA
6888480	6888481	Cla_1129	Cla_1130	hemB		TRUE	0.695	3.000	0.000	NA		NA
6888481	6888482	Cla_1130	Cla_1131		hemN	TRUE	0.973	-13.000	0.419	NA		NA
6888482	6888483	Cla_1131	Cla_1132	hemN		TRUE	0.995	2.000	0.419	0.018	N	NA
6888484	6888485	Cla_1133	Cla_1134		alr	FALSE	0.140	38.000	0.000	NA		NA
6888485	6888486	Cla_1134	Cla_1135	alr		TRUE	0.937	0.000	0.031	NA		NA
6888487	6888488	Cla_1136	Cla_1137			TRUE	0.960	0.000	0.069	NA		NA
6888488	6888489	Cla_1137	Cla_1138			TRUE	0.977	4.000	0.192	NA		NA
6888490	6888491	Cla_1139	Cla_1140			FALSE	0.087	63.000	0.000	NA		NA
6888491	6888492	Cla_1140	Cla_1141			TRUE	0.985	-24.000	0.900	NA		NA
6888492	6888493	Cla_1141	Cla_1142		gyrA	FALSE	0.233	61.000	0.008	NA		NA
6888493	6888494	Cla_1142	Cla_1143	gyrA		FALSE	0.348	37.000	0.007	1.000		NA
6888494	6888495	Cla_1143	Cla_1144		mapA	TRUE	0.974	-3.000	0.152	NA		NA
6888497	6888498	Cla_1146	Cla_1147		thiH	TRUE	0.984	-10.000	0.128	0.005	Y	NA
6888498	6888499	Cla_1147	Cla_1148	thiH	thiG	TRUE	0.995	2.000	0.277	0.005	Y	NA
6888499	6888500	Cla_1148	Cla_1149	thiG	thiF	TRUE	0.980	0.000	0.054	0.025		NA
6888500	6888501	Cla_1149	Cla_1150	thiF	thiS	TRUE	0.987	0.000	0.346	1.000		NA
6888501	6888502	Cla_1150	Cla_1151	thiS		FALSE	0.150	34.000	0.000	NA		NA
6888502	6888503	Cla_1151	Cla_1152		dapE	FALSE	0.064	135.000	0.000	NA		NA
6888503	6888504	Cla_1152	Cla_1153	dapE		TRUE	0.940	4.000	0.018	1.000	Y	NA
6888504	6888505	Cla_1153	Cla_1154			TRUE	0.985	-6.000	0.417	1.000	N	NA
6888505	6888506	Cla_1154	Cla_1155		mutS	TRUE	0.926	9.000	0.029	1.000	N	NA
6888506	6888507	Cla_1155	Cla_1156	mutS		TRUE	0.980	0.000	0.217	NA		NA
6888507	6888508	Cla_1156	Cla_1157		murC	TRUE	0.849	-7.000	0.014	NA		NA
6888508	6888509	Cla_1157	Cla_1158	murC		TRUE	0.840	9.000	0.004	1.000		NA
6888509	6888510	Cla_1158	Cla_1159		guaB	FALSE	0.395	166.000	0.045	1.000		NA
6888510	6888511	Cla_1159	Cla_1160	guaB	gatA	TRUE	0.888	11.000	0.032	1.000	N	NA
6888511	6888512	Cla_1160	Cla_1161	gatA	ileS	FALSE	0.268	100.000	0.008	1.000	Y	NA
6888514	6888515	Cla_1163	Cla_1164			TRUE	0.968	-39.000	0.147	0.002		NA
6888515	6888516	Cla_1164	Cla_1165			TRUE	0.934	-10.000	0.078	1.000		NA
6888516	6888517	Cla_1165	Cla_1166			TRUE	0.978	0.000	0.175	1.000	N	NA
6888517	6888518	Cla_1166	Cla_1167			TRUE	0.995	-10.000	0.878	0.073	N	NA
6888518	6888519	Cla_1167	Cla_1168			TRUE	0.984	-10.000	0.625	NA		NA
6888519	6888520	Cla_1168	Cla_1169		p19	TRUE	0.717	77.000	0.386	NA		NA
6888520	6888521	Cla_1169	Cla_1170	p19		TRUE	0.985	-3.000	0.238	NA	Y	NA
6888521	6888522	Cla_1170	Cla_1171			FALSE	0.086	671.000	0.000	1.000	N	NA
6888522	6888523	Cla_1171	Cla_1172			FALSE	0.457	12.000	0.000	NA		NA
6888525	6888526	Cla_1174	Cla_1175		mraW	TRUE	0.935	4.000	0.031	NA		NA
6888527	6888528	Cla_1176	Cla_1177			FALSE	0.336	80.000	0.029	1.000		NA
6888528	6888529	Cla_1177	Cla_1178		ftsA	TRUE	0.978	-3.000	0.184	1.000		NA
6888529	6888530	Cla_1178	Cla_1179	ftsA	ftsZ	TRUE	0.946	12.000	0.114	1.000	Y	NA
6888530	6888531	Cla_1179	Cla_1180	ftsZ	pncB	FALSE	0.255	21.000	0.000	1.000	N	NA
6888532	6888533	Cla_1181	Cla_1182	ispG	priA	FALSE	0.250	57.000	0.006	1.000	N	NA
6888533	6888534	Cla_1182	Cla_1183	priA		TRUE	0.898	-3.000	0.016	NA		NA
6888534	6888535	Cla_1183	Cla_1184			TRUE	0.984	1.000	0.316	NA		NA
6888535	6888536	Cla_1184	Cla_1185			TRUE	0.984	-13.000	0.714	NA		NA
6888538	6888539	Cla_1187	Cla_1188	efp	serA	FALSE	0.241	61.000	0.007	1.000	N	NA
6888539	6888540	Cla_1188	Cla_1189	serA		TRUE	0.922	-3.000	0.025	NA		NA
6888540	6888541	Cla_1189	Cla_1190		rpsA	TRUE	0.672	121.000	0.343	NA		NA
6888541	6888542	Cla_1190	Cla_1191	rpsA	ispH	TRUE	0.824	56.000	0.118	0.001	N	NA
6888542	6888543	Cla_1191	Cla_1192	ispH	aroA	TRUE	0.895	-10.000	0.032	1.000	N	NA
6888543	6888544	Cla_1192	Cla_1193	aroA	pheT	TRUE	0.934	-3.000	0.028	1.000	N	NA
6888544	6888545	Cla_1193	Cla_1194	pheT	pheS	TRUE	0.998	-3.000	0.574	0.001	Y	NA
6888547	6888548	Cla_1196	Cla_1197	pckA	pycB	TRUE	0.882	11.000	0.016	1.000	Y	NA
6888548	6888549	Cla_1197	Cla_1198	pycB		TRUE	0.591	59.000	0.100	1.000		NA
6888549	6888550	Cla_1198	Cla_1199			TRUE	0.993	10.000	0.444	0.003		NA
6888550	6888551	Cla_1199	Cla_1200			TRUE	0.881	10.000	0.000	0.003		NA
6888552	6888553	Cla_1201	Cla_1202	atpE		FALSE	0.161	31.000	0.000	NA		NA
6888553	6888554	Cla_1202	Cla_1203			FALSE	0.197	24.000	0.000	NA		NA
6888554	6888555	Cla_1203	Cla_1204			FALSE	0.091	61.000	0.000	NA		NA
6888556	6888557	Cla_1205	Cla_1206	pyrC2	gpsA	TRUE	0.871	-3.000	0.007	1.000	N	NA
6888557	6888558	Cla_1206	Cla_1207	gpsA	gatB	TRUE	0.896	3.000	0.011	1.000	N	NA
6888558	6888559	Cla_1207	Cla_1208	gatB	atpB	FALSE	0.156	125.000	0.003	1.000	N	NA
6888559	6888560	Cla_1208	Cla_1209	atpB		FALSE	0.103	63.000	0.000	1.000	N	NA
6888560	6888561	Cla_1209	Cla_1210		radA	TRUE	0.607	-9.000	0.000	1.000	N	NA
6888561	6888562	Cla_1210	Cla_1211	radA	ftsY	TRUE	0.960	0.000	0.015	0.020	N	NA
6888562	6888563	Cla_1211	Cla_1212	ftsY		TRUE	0.896	0.000	0.011	1.000		NA
6888564	6888565	Cla_1213	Cla_1214			TRUE	0.865	-76.000	0.059	1.000		NA
6888565	6888566	Cla_1214	Cla_1215			TRUE	0.860	9.000	0.010	NA		NA
6888566	6888567	Cla_1215	Cla_1216			TRUE	0.851	-3.000	0.005	NA		NA
6888568	6888569	Cla_1217	Cla_1218	rbn	glcD	TRUE	0.942	0.000	0.031	1.000		NA
6888569	6888570	Cla_1218	Cla_1219	glcD		TRUE	0.988	0.000	0.404	NA		NA
6888571	6888572	Cla_1220	Cla_1221			TRUE	0.953	2.000	0.042	1.000	N	NA
6888572	6888573	Cla_1221	Cla_1222		tpx2	FALSE	0.503	12.000	0.000	1.000	N	NA
6888574	6888575	Cla_1223	Cla_1224	dnaB	cysK	FALSE	0.432	13.000	0.000	1.000	N	NA
6888575	6888576	Cla_1224	Cla_1225	cysK	hup	FALSE	0.289	96.000	0.024	1.000	N	NA
6888576	6888577	Cla_1225	Cla_1226	hup	waaF	FALSE	0.077	93.000	0.000	1.000	N	NA
6888579	6888580	Cla_1228	Cla_1229	ptmA	ptmB	TRUE	0.974	0.000	0.131	1.000	N	NA
6888580	6888581	Cla_1229	Cla_1230	ptmB	ptmF	TRUE	0.960	-7.000	0.144	NA		NA
6888581	6888582	Cla_1230	Cla_1231	ptmF	ptmE	TRUE	0.963	-3.000	0.088	NA		NA
6888582	6888583	Cla_1231	Cla_1232	ptmE		TRUE	0.808	11.000	0.014	NA		NA
6888583	6888584	Cla_1232	Cla_1233			TRUE	0.974	10.000	0.286	NA		NA
6888584	6888585	Cla_1233	Cla_1234		ptmD	TRUE	0.949	-3.000	0.039	1.000	N	NA
6888585	6888586	Cla_1234	Cla_1235	ptmD	ptmC	TRUE	0.991	-7.000	0.549	1.000	Y	NA
6888586	6888587	Cla_1235	Cla_1236	ptmC		TRUE	0.735	16.000	0.029	1.000	N	NA
6888587	6888588	Cla_1236	Cla_1237			FALSE	0.466	37.000	0.020	1.000	N	NA
6888589	6888590	Cla_1238	Cla_1239			TRUE	0.681	-3.000	0.000	NA		NA
6888590	6888591	Cla_1239	Cla_1240			FALSE	0.064	148.000	0.000	NA		NA
6888591	6888592	Cla_1240	Cla_1241			TRUE	0.813	4.000	0.000	NA	Y	NA
6888595	6888596	Cla_1244	Cla_1245			TRUE	0.865	4.000	0.007	NA		NA
6888596	6888597	Cla_1245	Cla_1246		htrB	TRUE	0.963	9.000	0.050	1.000	Y	NA
6888597	6888598	Cla_1246	Cla_1247	htrB	waaC	TRUE	0.986	-3.000	0.231	1.000	Y	NA
6888599	6888600	Cla_1248	Cla_1249	wlaX	galE	TRUE	0.571	59.000	0.086	1.000	N	NA
6888600	6888601	Cla_1249	Cla_1250	galE	pglK	TRUE	0.955	-6.000	0.086	1.000	N	NA
6888601	6888602	Cla_1250	Cla_1251	pglK	pglH	TRUE	0.977	-3.000	0.179	1.000	N	NA
6888602	6888603	Cla_1251	Cla_1252	pglH	pglJ	TRUE	0.933	2.000	0.000	0.018	Y	NA
6888603	6888604	Cla_1252	Cla_1253	pglJ	pglB	TRUE	0.987	2.000	0.375	1.000		NA
6888604	6888605	Cla_1253	Cla_1254	pglB	pglA	TRUE	0.953	-3.000	0.045	1.000		NA
6888605	6888606	Cla_1254	Cla_1255	pglA	pglC	TRUE	0.969	-7.000	0.128	NA	Y	NA
6888606	6888607	Cla_1255	Cla_1256	pglC	pglD	TRUE	0.879	-34.000	0.074	NA		NA
6888607	6888608	Cla_1256	Cla_1257	pglD	pglE	TRUE	0.963	0.000	0.070	1.000		NA
6888608	6888609	Cla_1257	Cla_1258	pglE	pglF	TRUE	0.981	2.000	0.133	1.000	Y	NA
6888609	6888610	Cla_1258	Cla_1259	pglF	cheY	FALSE	0.076	113.000	0.000	1.000	N	NA
6888610	6888611	Cla_1259	Cla_1260	cheY	prmA	TRUE	0.920	13.000	0.146	1.000	N	NA
6888611	6888612	Cla_1260	Cla_1261	prmA	ftsH2	TRUE	0.981	0.000	0.217	1.000	N	NA
6888612	6888613	Cla_1261	Cla_1262	ftsH2		TRUE	0.953	0.000	0.043	1.000	N	NA
6888613	6888614	Cla_1262	Cla_1263		pssA	TRUE	0.992	-3.000	0.466	1.000	Y	NA
6888614	6888615	Cla_1263	Cla_1264	pssA		FALSE	0.081	66.000	0.000	NA		NA
6888615	6888616	Cla_1264	Cla_1265			FALSE	0.119	48.000	0.000	NA		NA
6888616	6888617	Cla_1265	Cla_1266			FALSE	0.256	18.000	0.000	NA		NA
6888617	6888618	Cla_1266	Cla_1267			TRUE	0.990	-7.000	0.740	NA		NA
6888620	6888621	Cla_1269	Cla_1270		prsA	FALSE	0.082	65.000	0.000	NA	N	NA
6888621	6888622	Cla_1270	Cla_1271	prsA		FALSE	0.064	120.000	0.000	NA		NA
6888623	6888624	Cla_1272	Cla_1273			FALSE	0.371	-135.000	0.000	NA		NA
6888624	6888625	Cla_1273	Cla_1274			FALSE	0.066	90.000	0.000	NA		NA
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6888788	6888789	Cla_1437	Cla_1438	nuoI	nuoH	TRUE	0.996	9.000	0.500	0.010	Y	NA
6888789	6888790	Cla_1438	Cla_1439	nuoH	nuoG	TRUE	0.987	-3.000	0.065	0.010	Y	NA
6888790	6888791	Cla_1439	Cla_1440	nuoG		TRUE	0.995	-3.000	0.444	0.010		NA
6888791	6888792	Cla_1440	Cla_1441			TRUE	0.995	-3.000	0.464	0.010		NA
6888792	6888793	Cla_1441	Cla_1442		nuoD	TRUE	0.996	-3.000	0.650	0.010		NA
6888793	6888794	Cla_1442	Cla_1443	nuoD	nuoC	TRUE	0.997	2.000	0.650	0.010	Y	NA
6888794	6888795	Cla_1443	Cla_1444	nuoC	nuoB	TRUE	0.998	-3.000	0.703	0.005	Y	NA
6888795	6888796	Cla_1444	Cla_1445	nuoB	nuoA	TRUE	0.992	-21.000	0.571	0.005	Y	NA
6888796	6888797	Cla_1445	Cla_1446	nuoA	dppF	FALSE	0.076	121.000	0.000	1.000	N	NA
6888797	6888798	Cla_1446	Cla_1447	dppF	dppD	TRUE	0.973	-16.000	0.111	0.017	Y	NA
6888798	6888799	Cla_1447	Cla_1448	dppD	dppC	TRUE	0.988	-3.000	0.278	1.000	Y	NA
6888799	6888800	Cla_1448	Cla_1449	dppC	dppB	TRUE	0.996	-7.000	0.647	0.023	Y	NA
6888800	6888801	Cla_1449	Cla_1450	dppB	dppA	TRUE	0.996	0.000	0.412	0.023	Y	NA
6888801	6888802	Cla_1450	Cla_1451	dppA		FALSE	0.376	43.000	0.000	0.023	N	NA
6888802	6888803	Cla_1451	Cla_1452			FALSE	0.079	199.000	0.000	1.000		NA
6888803	6888804	Cla_1452	Cla_1453			TRUE	0.988	-7.000	0.209	0.002		NA
6888804	6888805	Cla_1453	Cla_1454			TRUE	0.994	-3.000	0.657	NA	Y	NA
6888805	6888806	Cla_1454	Cla_1455		lctP	TRUE	0.957	10.000	0.075	NA	Y	NA
6888806	6888807	Cla_1455	Cla_1456	lctP		FALSE	0.068	277.000	0.000	NA		NA
6888807	6888808	Cla_1456	Cla_1457			TRUE	0.985	0.000	0.333	NA		NA
6888809	6888810	Cla_1458	Cla_1459	torC	torA	TRUE	0.991	2.000	0.148	0.036	Y	NA
6888811	6888812	Cla_1460	Cla_1461			FALSE	0.073	678.000	0.000	NA		NA
6888812	6888813	Cla_1461	Cla_1462			FALSE	0.068	280.000	0.000	NA		NA
6888813	6888814	Cla_1462	Cla_1463			FALSE	0.071	430.000	0.000	NA		NA
6888814	6888815	Cla_1463	Cla_1464			TRUE	0.591	10.000	0.000	NA		NA
6888815	6888816	Cla_1464	Cla_1465			FALSE	0.067	253.000	0.000	NA		NA
6888816	6888817	Cla_1465	Cla_1466			FALSE	0.074	1162.000	0.000	NA		NA
6888817	6888818	Cla_1466	Cla_1467			TRUE	0.650	9.000	0.000	NA		NA
6888818	6888819	Cla_1467	Cla_1468			FALSE	0.169	29.000	0.000	NA		NA
6888819	6888820	Cla_1468	Cla_1469			TRUE	0.671	7.000	0.000	NA		NA
6888820	6888821	Cla_1469	Cla_1470			FALSE	0.274	17.000	0.000	NA		NA
6888821	6888822	Cla_1470	Cla_1471			FALSE	0.067	86.000	0.000	NA		NA
6888822	6888823	Cla_1471	Cla_1472		purN	FALSE	0.350	42.000	0.009	1.000	N	NA
6888823	6888824	Cla_1472	Cla_1473	purN		TRUE	0.835	-9.000	0.014	NA	N	NA
6888824	6888825	Cla_1473	Cla_1474		rmuC	TRUE	0.665	-16.000	0.003	NA		NA
6888825	6888826	Cla_1474	Cla_1475	rmuC		TRUE	0.695	3.000	0.000	NA		NA
6888826	6888827	Cla_1475	Cla_1476			TRUE	0.844	9.000	0.007	NA		NA
6888827	6888828	Cla_1476	Cla_1477		def	TRUE	0.957	-3.000	0.054	1.000	N	NA
6888828	6888829	Cla_1477	Cla_1478	def		TRUE	0.963	-3.000	0.076	1.000	N	NA
6888829	6888830	Cla_1478	Cla_1479		clpP	TRUE	0.610	15.000	0.009	1.000	N	NA
6888830	6888831	Cla_1479	Cla_1480	clpP	tig	TRUE	0.990	0.000	0.351	1.000	Y	NA
6888832	6888833	Cla_1481	Cla_1482	folE	fliI	TRUE	0.993	0.000	0.378	0.046	N	NA
6888833	6888834	Cla_1482	Cla_1483	fliI		FALSE	0.106	54.000	0.000	NA		NA
6888834	6888835	Cla_1483	Cla_1484			FALSE	0.101	56.000	0.000	NA		NA
6888835	6888836	Cla_1484	Cla_1485			FALSE	0.069	79.000	0.000	NA		NA
6888836	6888837	Cla_1485	Cla_1486		iscS	FALSE	0.330	123.000	0.034	NA		NA
6888837	6888838	Cla_1486	Cla_1487	iscS	iscU	TRUE	0.804	11.000	0.011	1.000	N	NA
6888838	6888839	Cla_1487	Cla_1488	iscU	nhaA1	FALSE	0.081	81.000	0.000	1.000	N	NA
6888839	6888840	Cla_1488	Cla_1489	nhaA1	nhaA2	TRUE	0.997	-3.000	0.571	0.003	Y	NA
6888840	6888841	Cla_1489	Cla_1490	nhaA2		FALSE	0.098	57.000	0.000	NA		NA
6888842	6888843	Cla_1491	Cla_1492			FALSE	0.150	34.000	0.000	NA		NA
6888843	6888844	Cla_1492	Cla_1493		aroC	FALSE	0.103	55.000	0.000	NA		NA
6888844	6888845	Cla_1493	Cla_1494	aroC	rnc	TRUE	0.937	-3.000	0.030	1.000	N	NA
6888845	6888846	Cla_1494	Cla_1495	rnc	rnhA	TRUE	0.915	-7.000	0.032	1.000	N	NA
6888846	6888847	Cla_1495	Cla_1496	rnhA		TRUE	0.878	-3.000	0.008	1.000	N	NA
6888848	6888849	Cla_1497	Cla_1498	dnaG		FALSE	0.417	66.000	0.035	1.000	N	NA
6888850	6888851	Cla_1499	Cla_1500		pbpC2	FALSE	0.077	176.000	0.000	1.000	N	NA
6888851	6888852	Cla_1500	Cla_1501	pbpC2		TRUE	0.988	-3.000	0.417	1.000		NA
6888853	6888854	Cla_1502	Cla_1503			FALSE	0.156	32.000	0.000	NA		NA
6888855	6888856	Cla_1504	Cla_1505		cynT	TRUE	0.969	-3.000	0.105	1.000	N	NA
6888857	6888858	Cla_1506	Cla_1507		secG	FALSE	0.171	100.000	0.007	NA		NA
6888858	6888859	Cla_1507	Cla_1508	secG	frr	TRUE	0.840	11.000	0.017	1.000	N	NA
6888859	6888860	Cla_1508	Cla_1509	frr	pyrE	TRUE	0.934	3.000	0.026	1.000	N	NA
6888860	6888861	Cla_1509	Cla_1510	pyrE		TRUE	0.961	0.000	0.071	NA		NA
6888861	6888862	Cla_1510	Cla_1511		nrdB	TRUE	0.962	-3.000	0.086	NA		NA
6888862	6888863	Cla_1511	Cla_1512	nrdB		FALSE	0.082	302.000	0.000	1.000	N	NA
6888863	6888864	Cla_1512	Cla_1513		pimT	FALSE	0.139	88.000	0.000	1.000	Y	NA
6888864	6888865	Cla_1513	Cla_1514	pimT		FALSE	0.078	91.000	0.000	1.000	N	NA
6888866	6888867	Cla_1515	Cla_1516		typA	TRUE	0.859	0.000	0.006	NA		NA
6888868	6888869	Cla_1517	Cla_1518			TRUE	0.687	4.000	0.000	NA		NA
6888869	6888870	Cla_1518	Cla_1519		flgD	TRUE	0.708	51.000	0.184	NA		NA
6888870	6888871	Cla_1519	Cla_1520	flgD	flgE2	TRUE	0.989	5.000	0.341	NA	Y	NA
6888872	6888873	Cla_1521	Cla_1522			FALSE	0.183	153.000	0.010	NA		NA
6888873	6888874	Cla_1522	Cla_1523		fic	FALSE	0.065	166.000	0.000	NA		NA
6888874	6888875	Cla_1523	Cla_1524	fic		FALSE	0.103	63.000	0.000	1.000	N	NA
6888875	6888876	Cla_1524	Cla_1525			TRUE	0.996	3.000	0.529	0.022	N	NA
6888876	6888877	Cla_1525	Cla_1526			TRUE	0.982	18.000	0.618	0.022	Y	NA
6888880	6888881	Cla_1529	Cla_1530			FALSE	0.179	26.000	0.000	NA		NA
6888881	6888882	Cla_1530	Cla_1531			FALSE	0.077	69.000	0.000	NA		NA
6888883	6888884	Cla_1532	Cla_1533	ctsG	gcp	TRUE	0.862	-3.000	0.005	1.000		NA
6888884	6888885	Cla_1533	Cla_1534	gcp		TRUE	0.866	-3.000	0.008	NA		NA
6888885	6888886	Cla_1534	Cla_1535		dxr	TRUE	0.856	-3.000	0.006	NA		NA
6888886	6888887	Cla_1535	Cla_1536	dxr	cdsA	TRUE	0.990	-3.000	0.372	1.000	Y	NA
6888887	6888888	Cla_1536	Cla_1537	cdsA		TRUE	0.705	12.000	0.007	NA		NA
6888888	6888889	Cla_1537	Cla_1538			TRUE	0.931	3.000	0.028	NA		NA
6888893	6888894	Cla_1542	Cla_1543			FALSE	0.143	37.000	0.000	NA		NA
6888894	6888895	Cla_1543	Cla_1544			FALSE	0.231	20.000	0.000	NA		NA
6888895	6888896	Cla_1544	Cla_1545			FALSE	0.338	14.000	0.000	NA		NA
6888897	6888898	Cla_1546	Cla_1547			FALSE	0.309	131.000	0.000	0.010	Y	NA
6888899	6888900	Cla_1548	Cla_1549			FALSE	0.087	63.000	0.000	NA		NA
6888900	6888901	Cla_1549	Cla_1550			TRUE	0.950	9.000	0.065	NA		NA
6888901	6888902	Cla_1550	Cla_1551			TRUE	0.887	-3.000	0.012	NA		NA
6888902	6888903	Cla_1551	Cla_1552			TRUE	0.851	-10.000	0.021	NA		NA
6888903	6888904	Cla_1552	Cla_1553			TRUE	0.972	0.000	0.118	1.000	N	NA
6888904	6888905	Cla_1553	Cla_1554			TRUE	0.990	10.000	0.763	NA		NA
6888905	6888906	Cla_1554	Cla_1555			FALSE	0.073	73.000	0.000	NA		NA
6888906	6888907	Cla_1555	Cla_1556		rpsU	FALSE	0.145	45.000	0.000	1.000	N	NA
6888908	6888909	Cla_1557	Cla_1558		cmeR	TRUE	0.995	-3.000	0.818	1.000		NA
6888909	6888910	Cla_1558	Cla_1559	cmeR	cmeA	FALSE	0.570	83.000	0.145	1.000		NA
6888910	6888911	Cla_1559	Cla_1560	cmeA	cmeB	TRUE	0.996	0.000	0.945	1.000	N	NA
6888911	6888912	Cla_1560	Cla_1561	cmeB	cmeC	TRUE	0.987	-7.000	0.241	0.022	N	NA
6888914	6888915	Cla_1563	Cla_1564			FALSE	0.113	58.000	0.000	1.000		NA
6888916	6888917	Cla_1565	Cla_1566		lspA	TRUE	0.782	-19.000	0.020	NA		NA
6888917	6888918	Cla_1566	Cla_1567	lspA		TRUE	0.929	-7.000	0.042	1.000	N	NA
6888919	6888920	Cla_1568	Cla_1569			TRUE	0.847	-3.000	0.005	NA		NA
6888920	6888921	Cla_1569	Cla_1570			FALSE	0.119	48.000	0.000	NA		NA
6887314	6887315	Cla_a002	Cla_a003			FALSE	0.291	188.000	0.000	0.034	Y	NA
6887315	6887316	Cla_a003	Cla_a004			FALSE	0.076	122.000	0.000	1.000		NA
6887316	6887317	Cla_a004	Cla_a005			TRUE	0.718	5.000	0.000	1.000		NA
6887317	6887318	Cla_a005	Cla_a006			FALSE	0.068	268.000	0.000	NA		NA
6887318	6887319	Cla_a006	Cla_a007			FALSE	0.072	469.000	0.000	NA		NA
6887320	6887321	Cla_a008	Cla_a009			TRUE	0.671	7.000	0.000	NA		NA
6887321	6887322	Cla_a009	Cla_a010			TRUE	0.681	-3.000	0.000	NA		NA
6887322	6887323	Cla_a010	Cla_a011			TRUE	0.946	14.000	0.400	NA		NA
6887323	6887324	Cla_a011	Cla_a012			TRUE	0.727	499.000	0.400	NA		NA
6887324	6887325	Cla_a012	Cla_a013			TRUE	0.681	-3.000	0.000	NA		NA
6887325	6887326	Cla_a013	Cla_a014			FALSE	0.069	290.000	0.000	NA		NA
6887326	6887327	Cla_a014	Cla_a015			TRUE	0.976	-10.000	0.400	NA		NA
6887327	6887328	Cla_a015	Cla_a016			TRUE	0.600	291.000	0.200	NA		NA
6887328	6887329	Cla_a016	Cla_a017			TRUE	0.994	-3.000	0.600	NA	Y	NA
6887329	6887330	Cla_a017	Cla_a018			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA	Y	NA
6887330	6887331	Cla_a018	Cla_a019			TRUE	0.988	0.000	0.250	1.000	Y	NA
6887331	6887332	Cla_a019	Cla_a020			FALSE	0.536	-10.000	0.000	NA		NA
6887332	6887333	Cla_a020	Cla_a021			FALSE	0.536	-10.000	0.000	NA		NA
6887333	6887334	Cla_a021	Cla_a022			TRUE	0.942	-16.000	0.190	NA		NA
6887334	6887335	Cla_a022	Cla_a023			FALSE	0.064	121.000	0.000	NA		NA
6887335	6887336	Cla_a023	Cla_a024			TRUE	0.593	-7.000	0.000	NA		NA
6887336	6887337	Cla_a024	Cla_a025			TRUE	0.830	84.000	0.750	NA		NA
6887337	6887338	Cla_a025	Cla_a026			TRUE	0.635	54.000	0.120	NA		NA
6887338	6887339	Cla_a026	Cla_a027			TRUE	0.588	13.000	0.000	1.000	Y	NA
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