MicrobesOnline Operon Predictions for Shigella sonnei Ss046

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
1158718	1158719	SSO_0001	SSO_0002	thrL	thrA	FALSE	0.203	82.000	0.043	1.000		NA
1158719	1158720	SSO_0002	SSO_0003	thrA	thrB	TRUE	0.994	2.000	0.133	1.000	Y	NA
1158720	1158721	SSO_0003	SSO_0004	thrB	thrC	TRUE	0.996	1.000	0.233	1.000	Y	NA
1158721	1158722	SSO_0004	SSO_0005	thrC		FALSE	0.035	214.000	0.003	NA		NA
1158723	1158724	SSO_0006	SSON_0008	yaaA	yaaJ	FALSE	0.171	70.000	0.000	NA		NA
1158725	1158726	SSO_0007	SSO_0009		talB	FALSE	0.003	1065.000	0.000	NA	N	NA
1158726	1158727	SSO_0009	SSO_0010	talB	mog	FALSE	0.227	115.000	0.042	1.000	N	NA
1158728	1158729	SSO_0011	SSO_0012	yaaH		FALSE	0.225	149.000	0.043	NA		NA
1158729	1158730	SSO_0012	SSO_0013		yaaI	TRUE	0.929	26.000	0.500	NA		NA
1158731	1158732	SSO_0014	SSO_0015	dnaK	dnaJ	TRUE	0.898	89.000	0.236	0.004	Y	NA
1158733	1158734	SSO_0016	SSO_0017	gef		FALSE	0.006	641.000	0.000	NA		NA
1158735	1158736	SSO_0018	SSO_0019			TRUE	0.990	0.000	0.000	1.000	Y	NA
1158738	1158739	SSO_0021	SSO_0022	nhaA	nhaR	TRUE	0.591	60.000	0.292	1.000	N	NA
1158740	1158741	SSO_0023	SSO_0024			FALSE	0.032	290.000	0.000	1.000		NA
1158743	1158744	SSO_0026	SSO_0027			FALSE	0.010	441.000	0.000	NA		NA
1158744	1158745	SSO_0027	SSO_0028		rpsT	FALSE	0.005	784.000	0.000	NA		NA
1158746	1158747	SSO_0029	SSO_0030		ribF	TRUE	0.842	8.000	0.019	NA		NA
1158747	1158748	SSO_0030	SSO_0031	ribF	ileS	TRUE	0.694	43.000	0.254	1.000	N	NA
1158748	1158749	SSO_0031	SSO_0032	ileS	lspA	TRUE	0.927	0.000	0.045	1.000	N	NA
1158749	1158750	SSO_0032	SSO_0033	lspA	slpA	TRUE	0.528	125.000	0.154	1.000	N	NA
1158750	1158751	SSO_0033	SSO_0034	slpA	lytB	TRUE	0.996	2.000	0.626	1.000	N	NA
1158751	1158752	SSO_0034	SSO_0035	lytB	yaaF	FALSE	0.093	66.000	0.028	1.000	N	NA
1158752	1158753	SSO_0035	SSO_0036	yaaF	dapB	FALSE	0.045	167.000	0.003	1.000	N	NA
1158753	1158754	SSO_0036	SSO_0037	dapB	carA	FALSE	0.048	456.000	0.034	1.000	Y	NA
1158754	1158755	SSO_0037	SSO_0038	carA	carB	TRUE	0.992	18.000	0.345	0.001	Y	NA
1158758	1158759	SSO_0041	SSO_0042	caiE	caiD	TRUE	0.751	-15.000	0.000	1.000		NA
1158759	1158760	SSO_0042	SSO_0043	caiD	caiC	TRUE	0.994	1.000	0.000	0.023	Y	NA
1158761	1158762	SSO_0044	SSO_0045			TRUE	0.665	141.000	0.000	NA	Y	NA
1158763	1158764	SSON_0046	SSO_0047	caiB	caiA	FALSE	0.304	129.000	0.000	NA		NA
1158764	1158765	SSO_0047	SSO_0048	caiA	caiT	TRUE	0.604	31.000	0.118	1.000	N	NA
11420046	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	149.000	0.000	NA		NA
11562409	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	149.000	0.000	NA		NA
11704801	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	149.000	0.000	NA		NA
11420047	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	107.000	0.000	NA		NA
11562410	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	107.000	0.000	NA		NA
11704802	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	107.000	0.000	NA		NA
11420048	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	90.000	0.000	NA		NA
11562411	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	90.000	0.000	NA		NA
11704803	1158766		SSON_0049		fixA	FALSE	NA	90.000	0.000	NA		NA
1158766	1158767	SSON_0049	SSO_0050	fixA	fixB	TRUE	0.989	15.000	0.231	0.018	Y	NA
1158767	1158768	SSO_0050	SSO_0051	fixB	fixC	TRUE	0.764	51.000	0.000	0.056	Y	NA
1158768	1158769	SSO_0051	SSO_0052	fixC	fixX	TRUE	0.995	-3.000	0.167	0.056	Y	NA
1158769	1158770	SSO_0052	SSON_0053	fixX	yaaU	FALSE	0.199	59.000	0.000	NA		NA
1158770	1158771	SSON_0053	SSO_0054	yaaU	yabF	FALSE	0.274	108.000	0.000	NA		NA
1158771	1158772	SSO_0054	SSO_0055	yabF	kefC	TRUE	0.987	-7.000	0.560	1.000		NA
1158772	1158773	SSO_0055	SSO_0056	kefC	folA	FALSE	0.036	192.000	0.012	1.000	N	NA
1158774	1158775	SSO_0057	SSO_0058	apaH	apaG	TRUE	0.980	7.000	0.267	NA	N	NA
1158775	1158776	SSO_0058	SSO_0059	apaG	ksgA	TRUE	0.942	3.000	0.078	NA	N	NA
1158776	1158777	SSO_0059	SSO_0060	ksgA	pdxA	TRUE	0.976	-3.000	0.197	1.000	N	NA
1158777	1158778	SSO_0060	SSO_0061	pdxA	surA	TRUE	0.996	0.000	0.561	1.000	N	NA
1158778	1158779	SSO_0061	SSO_0062	surA	imp	TRUE	0.466	53.000	0.182	1.000	N	NA
1158781	1158782	SSO_0064	SSO_0065	yabO	hepA	TRUE	0.968	12.000	0.294	1.000	N	NA
1158782	1158783	SSO_0065	SSO_0066	hepA	polB	TRUE	0.657	164.000	0.098	1.000	Y	NA
1158783	1158784	SSO_0066	SSO_0067	polB	araD	FALSE	0.066	75.000	0.018	1.000	N	NA
1158784	1158785	SSO_0067	SSO_0068	araD	araA	TRUE	0.489	169.000	0.017	1.000	Y	NA
1158785	1158786	SSO_0068	SSO_0069	araA	araB	TRUE	0.931	11.000	0.138	1.000	N	NA
1158787	1158788	SSO_0070	SSO_0071	araC	yabI	FALSE	0.438	86.000	0.167	NA		NA
1158789	1158790	SSO_0072	SSO_0073	yabJ	yabK	TRUE	0.981	-16.000	0.522	0.016	N	NA
1158790	1158791	SSO_0073	SSO_0074	yabK	tbpA	TRUE	0.983	-24.000	0.697	0.071	N	NA
1158791	1158792	SSO_0074	SSO_0075	tbpA	yabN	FALSE	0.310	164.000	0.010	0.071		NA
1158793	1158794	SSO_0076	SSO_0077	yabM		FALSE	0.026	249.000	0.000	NA	N	NA
1158795	1158796	SSO_0078	SSO_0079	leuD	leuC	TRUE	0.996	11.000	0.309	0.001	Y	NA
1158796	1158797	SSO_0079	SSON_0080	leuC	leuB	TRUE	0.998	3.000	0.275	0.001	Y	NA
1158797	1158798	SSON_0080	SSO_0081	leuB	leuA	TRUE	0.997	0.000	0.126	0.001	Y	NA
1158798	1158799	SSO_0081	SSO_0082	leuA	leuL	TRUE	0.480	93.000	0.010	0.001		NA
1158800	1158801	SSON_0083	SSO_0084	leuO	ilvI	FALSE	0.016	318.000	0.000	1.000	N	NA
1158801	1158802	SSO_0084	SSO_0085	ilvI	ilvH	TRUE	0.999	3.000	0.371	0.002	Y	NA
1158802	1158803	SSO_0085	SSO_0086	ilvH	fruL	TRUE	0.834	12.000	0.000	NA		NA
1158803	1158804	SSO_0086	SSO_0087	fruL	fruR	FALSE	0.183	82.000	0.000	NA		NA
1158804	1158805	SSO_0087	SSO_0088	fruR		FALSE	0.015	296.000	0.000	NA	N	NA
1158805	1158806	SSO_0088	SSO_0089		yabB	FALSE	0.007	580.000	0.000	NA		NA
1158806	1158807	SSO_0089	SSO_0090	yabB	yabC	TRUE	0.996	2.000	0.635	NA		NA
1158807	1158808	SSO_0090	SSO_0091	yabC	ftsL	TRUE	0.981	-3.000	0.227	1.000	N	NA
1158808	1158809	SSO_0091	SSO_0092	ftsL	ftsI	TRUE	0.848	16.000	0.124	1.000	N	NA
1158809	1158810	SSO_0092	SSO_0093	ftsI	murE	TRUE	0.949	-13.000	0.059	1.000	Y	NA
1158810	1158811	SSO_0093	SSO_0094	murE	murF	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.002	Y	NA
1158811	1158812	SSO_0094	SSO_0095	murF	mraY	TRUE	0.996	-6.000	0.309	0.004	Y	NA
1158812	1158813	SSO_0095	SSO_0096	mraY	murD	TRUE	0.999	3.000	0.647	0.004	Y	NA
1158813	1158814	SSO_0096	SSO_0097	murD	ftsW	TRUE	0.995	0.000	0.297	0.003	N	NA
1158814	1158815	SSO_0097	SSO_0098	ftsW	murG	TRUE	0.995	-3.000	0.647	1.000	N	NA
1158815	1158816	SSO_0098	SSO_0099	murG	murC	TRUE	0.852	54.000	0.283	1.000	Y	NA
1158816	1158817	SSO_0099	SSO_0100	murC	ddlB	TRUE	0.990	-7.000	0.153	0.004	Y	NA
1158817	1158818	SSO_0100	SSO_0101	ddlB	ftsQ	TRUE	0.998	2.000	0.372	NA	Y	NA
1158818	1158819	SSO_0101	SSO_0102	ftsQ	ftsA	TRUE	0.989	-3.000	0.389	NA	N	NA
1158819	1158820	SSO_0102	SSO_0103	ftsA	ftsZ	TRUE	0.891	61.000	0.460	1.000	Y	NA
1158820	1158821	SSO_0103	SSO_0104	ftsZ	lpxC	FALSE	0.411	101.000	0.134	1.000	N	NA
1158821	1158822	SSO_0104	SSON_0105	lpxC	yacA	FALSE	0.063	231.000	0.000	1.000		NA
1158822	1158823	SSON_0105	SSO_0106	yacA	secA	FALSE	0.271	62.000	0.065	1.000		NA
1158823	1158824	SSO_0106	SSO_0107	secA	mutT	FALSE	0.398	60.000	0.168	1.000	N	NA
1158825	1158826	SSO_0108	SSO_0109		yacG	TRUE	0.515	-49.000	0.000	NA		NA
1158826	1158827	SSO_0109	SSO_0110	yacG	yacF	TRUE	0.985	10.000	0.356	NA		NA
1158827	1158828	SSO_0110	SSO_0111	yacF	yacE	TRUE	0.974	0.000	0.110	NA		NA
1158830	1158831	SSO_0113	SSO_0114		hofC	TRUE	0.900	8.000	0.000	NA		NA
1158831	1158832	SSO_0114	SSON_0115	hofC	hofB	TRUE	0.771	-10.000	0.000	NA		NA
1158832	1158833	SSON_0115	SSO_0116	hofB	ppdD	TRUE	0.881	10.000	0.000	NA		NA
1158833	1158834	SSO_0116	SSO_0117	ppdD	nadC	FALSE	0.019	203.000	0.015	NA	N	NA
1158835	1158836	SSO_0118	SSO_0119	ampD	ampE	TRUE	0.995	-3.000	0.249	1.000	Y	NA
1158838	1158839	SSO_0121	SSO_0122	pdhR	aceE	TRUE	0.569	161.000	0.276	1.000	N	NA
1158839	1158840	SSO_0122	SSO_0123	aceE	aceF	TRUE	0.981	15.000	0.220	1.000	Y	NA
1158840	1158841	SSO_0123	SSO_0124	aceF	lpdA	FALSE	0.410	325.000	0.463	1.000	Y	NA
1158843	1158844	SSO_0126	SSO_0127	acnB	yacL	FALSE	0.210	175.000	0.068	NA		NA
1158845	1158846	SSO_0128	SSO_0129	speD	speE	TRUE	0.970	16.000	0.162	1.000	Y	NA
1158846	1158847	SSO_0129	SSO_0130	speE	yacC	TRUE	0.757	106.000	0.354	NA		NA
1158852	1158853	SSO_0135	SSO_0136	yadG	yadH	TRUE	0.999	-3.000	0.688	0.098	Y	NA
1158853	1158854	SSO_0136	SSO_0137	yadH	yadI	FALSE	0.169	105.000	0.037	1.000	N	NA
1158854	1158855	SSO_0137	SSO_0138	yadI	yadE	TRUE	0.787	64.000	0.222	1.000	Y	NA
1158858	1158859	SSO_0141	SSO_0142	panC	panB	TRUE	0.997	12.000	0.395	0.001	Y	NA
1158860	1158861	SSO_0143	SSON_0144			FALSE	0.042	527.000	0.000	NA	Y	NA
1158862	1158863	SSO_0145	SSO_0146	yadK	yadL	TRUE	0.966	27.000	0.571	0.008		NA
1158863	1158864	SSO_0146	SSON_0147	yadL		FALSE	0.010	495.000	0.000	1.000		NA
1158864	1158865	SSON_0147	SSON_0148			TRUE	0.874	-42.000	0.000	NA	Y	NA
1158865	1158866	SSON_0148	SSO_0149			TRUE	0.647	50.000	0.000	NA	Y	NA
1158866	1158867	SSO_0149	SSON_0151		htrE	FALSE	0.028	288.000	0.000	NA		NA
1158867	1158868	SSON_0151	SSO_0150	htrE		FALSE	0.370	-1524.000	0.000	NA		NA
1158868	1158869	SSO_0150	SSO_0152		ecpD	FALSE	0.002	1471.000	0.000	NA	N	NA
1158869	1158870	SSO_0152	SSO_0153	ecpD	yadN	TRUE	0.928	105.000	0.500	1.000	Y	NA
1158870	1158871	SSO_0153	SSO_0154	yadN	folK	FALSE	0.011	370.000	0.000	1.000	N	NA
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1159913	1159914	SSO_1196	SSO_1197		fliY	FALSE	0.013	339.000	0.000	1.000	N	NA
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1159923	1159924	SSO_1206	SSON_1207	pgsA		FALSE	0.220	152.000	0.000	NA		NA
1159924	1159925	SSON_1207	SSON_1208			FALSE	0.216	55.000	0.000	NA		NA
1159925	1159926	SSON_1208	SSON_1209			TRUE	0.805	13.000	0.000	NA		NA
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1159930	1159931	SSO_1213	SSO_1214	ftn		FALSE	0.162	171.000	0.000	NA		NA
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1160302	1160303	SSO_1585	SSO_1586		ydfI	FALSE	0.139	64.000	0.000	1.000	N	NA
1160304	1160305	SSO_1587	SSO_1588		ydfH	FALSE	0.150	177.000	0.000	NA		NA
1160305	1160306	SSO_1588	SSO_1589	ydfH	ydfG	FALSE	0.239	89.000	0.000	1.000		NA
1160309	1160310	SSO_1592	SSO_1593	ydeI	ydeH	FALSE	0.041	255.000	0.000	NA		NA
1160310	1160311	SSO_1593	SSO_1594	ydeH		FALSE	0.006	468.000	0.000	1.000	N	NA
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1160314	1160315	SSON_1597	SSON_1598	marA	marR	TRUE	0.994	20.000	0.667	0.040	Y	NA
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1160318	1160319	SSO_1601	SSO_1602		yneJ	FALSE	0.170	77.000	0.000	NA		NA
1160320	1160321	SSO_1603	SSO_1604		yneH	FALSE	0.139	64.000	0.000	1.000	N	NA
1160323	1160324	SSO_1606	SSO_1607		uxaB	FALSE	0.044	227.000	0.000	1.000	N	NA
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1160357	1160358	SSO_1640	SSO_1641			TRUE	0.842	179.000	0.219	0.002	Y	NA
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1160363	1160364	SSON_1646	SSO_1647	adhP	yddM	FALSE	0.175	68.000	0.000	NA		NA
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1160377	1160378	SSO_1660	SSO_1661	narV	yddE	FALSE	0.197	79.000	0.000	1.000		NA
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1160484	1160485	SSO_1767	SSO_1768			TRUE	0.994	0.000	0.400	NA		NA
1160486	1160487	SSO_1769	SSO_1770			TRUE	0.628	177.000	0.000	0.094	Y	NA
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1160491	1160492	SSON_1774	SSON_1775			TRUE	0.936	3.000	0.000	NA		NA
1160492	1160493	SSON_1775	SSON_1776			TRUE	0.940	2.000	0.000	NA		NA
1160493	1160494	SSON_1776	SSO_1777			FALSE	0.005	741.000	0.000	NA		NA
1160494	1160495	SSO_1777	SSO_1778			TRUE	0.945	0.000	0.000	NA		NA
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1161212	1161213	SSON_2495	SSO_2496		flxA	FALSE	0.032	276.000	0.000	NA		NA
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1161341	1161342	SSO_2624	SSO_2625	hcaD		FALSE	0.017	371.000	0.000	1.000		NA
1161342	1161343	SSO_2625	SSON_2626		yphA	FALSE	0.172	78.000	0.000	NA		NA
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1161347	1161348	SSO_2630	SSO_2631	yphE	yphF	TRUE	0.935	23.000	0.161	NA	Y	NA
1161348	1161349	SSO_2631	SSON_2632	yphF	yphG	FALSE	0.238	97.000	0.000	NA		NA
1161353	1161354	SSO_2636	SSO_2637	glnB	yfhA	FALSE	0.359	61.000	0.146	1.000	N	NA
1161354	1161355	SSO_2637	SSO_2638	yfhA	yfhG	TRUE	0.714	-10.000	0.029	NA		NA
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1161554	1161555	SSON_2837	SSON_2838			FALSE	0.183	64.000	0.000	NA		NA
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1163294	1163295	SSO_P024	SSO_P025	ipgB2		FALSE	0.008	572.000	0.000	1.000		NA
1163295	1163296	SSO_P025	SSO_P026			TRUE	0.930	-3.000	0.000	1.000		NA
1163296	1163297	SSO_P026	SSO_P027			FALSE	0.053	788.000	0.000	0.041	Y	NA
1163297	1163298	SSO_P027	SSO_P028			FALSE	0.126	192.000	0.000	1.000		NA
1163298	1163299	SSO_P028	SSO_P029			FALSE	0.085	274.000	0.000	0.078		NA
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1163301	1163302	SSO_P031	SSO_P032	parA	parB	TRUE	0.996	0.000	0.667	1.000	N	NA
1163302	1163303	SSO_P032	SSO_P033	parB		FALSE	0.047	256.000	0.000	1.000		NA
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1163313	1163314	SSO_P043	SSO_P044		ospE2	FALSE	0.134	182.000	0.000	NA		NA
1163315	1163316	SSO_P045	SSO_P046			FALSE	0.315	179.000	0.000	0.078		NA
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1163318	1163319	SSO_P048	SSO_P049		ospC1	FALSE	0.005	905.000	0.000	NA		NA
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1163333	1163334	SSO_P063	SSO_P064			TRUE	0.996	6.000	0.375	NA	Y	NA
1163336	1163337	SSO_P066	SSO_P067		insB	FALSE	0.269	223.000	0.000	NA	Y	NA
1163337	1163338	SSO_P067	SSO_P068	insB		FALSE	0.393	84.000	0.000	0.077		NA
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1163340	1163341	SSO_P070	SSO_P071			TRUE	0.640	20.000	0.000	NA		NA
1163342	1163343	SSO_P072	SSO_P073	ospC3		FALSE	0.018	338.000	0.000	NA		NA
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1163344	1163345	SSO_P074	SSO_P075			FALSE	0.313	125.000	0.000	NA		NA
1163345	1163346	SSO_P075	SSO_P076			FALSE	0.216	55.000	0.000	NA		NA
1163346	1163347	SSO_P076	SSO_P077			FALSE	0.313	121.000	0.000	NA		NA
1163347	1163348	SSO_P077	SSO_P078			TRUE	0.628	-30.000	0.000	NA		NA
1163349	1163350	SSON_P079	SSO_P080			TRUE	0.882	-42.000	0.000	1.000	Y	NA
1163350	1163351	SSO_P080	SSO_P081			FALSE	0.114	249.000	0.000	0.077		NA
1163351	1163352	SSO_P081	SSO_P082			FALSE	0.126	192.000	0.000	1.000		NA
1163353	1163354	SSO_P083	SSO_P084		ipaJ	FALSE	0.005	914.000	0.000	NA		NA
1163355	1163356	SSO_P085	SSO_P086	virB	acp	FALSE	0.081	217.000	0.000	1.000		NA
1163356	1163357	SSO_P086	SSO_P087	acp	ipaA	TRUE	0.969	4.000	0.111	1.000		NA
1163357	1163358	SSO_P087	SSO_P088	ipaA	ipaD	TRUE	0.962	9.000	0.143	1.000		NA
1163358	1163359	SSO_P088	SSO_P089	ipaD	ipaC	TRUE	0.819	51.000	0.286	0.003		NA
1163359	1163360	SSO_P089	SSO_P090	ipaC	ipaB	TRUE	0.919	20.000	0.125	0.003		NA
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1163361	1163362	SSO_P091	SSO_P092	ipgC	ipgB1	FALSE	0.229	58.000	0.000	1.000		NA
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1163368	1163369	SSO_P098	SSO_P099	mxiG	mxiH	TRUE	0.994	8.000	0.667	NA		NA
1163369	1163370	SSO_P099	SSO_P100	mxiH	mxiI	TRUE	0.980	13.000	0.231	0.003		NA
1163370	1163371	SSO_P100	SSO_P101	mxiI	mxiJ	TRUE	0.997	6.000	0.571	0.006		NA
1163371	1163372	SSO_P101	SSO_P102	mxiJ	mxiK	TRUE	0.985	-3.000	0.238	1.000		NA
1163372	1163373	SSO_P102	SSO_P103	mxiK	mxiN	TRUE	0.967	-58.000	1.000	1.000		NA
1163373	1163374	SSO_P103	SSO_P104	mxiN	mxiL	TRUE	0.826	-7.000	0.000	NA		NA
1163374	1163375	SSO_P104	SSO_P105	mxiL	mxiM	TRUE	0.712	-16.000	0.000	NA		NA
1163375	1163376	SSO_P105	SSO_P106	mxiM	mxiE	FALSE	0.302	130.000	0.000	NA		NA
1163376	1163377	SSO_P106	SSO_P107	mxiE	mxiD	TRUE	0.666	-13.000	0.000	1.000	N	NA
1163377	1163378	SSO_P107	SSO_P108	mxiD	mxiC	TRUE	0.950	19.000	0.360	1.000		NA
1163378	1163379	SSO_P108	SSO_P109	mxiC	mxiA	TRUE	0.987	7.000	0.320	1.000		NA
1163379	1163380	SSO_P109	SSO_P110	mxiA	spa15	TRUE	0.975	13.000	0.200	0.007		NA
1163380	1163381	SSO_P110	SSO_P111	spa15	spa47	TRUE	0.984	4.000	0.200	1.000		NA
1163381	1163382	SSO_P111	SSO_P112	spa47	spa13	FALSE	0.229	93.000	0.000	NA		NA
1163382	1163383	SSO_P112	SSO_P113	spa13	spa32	TRUE	0.734	-13.000	0.000	NA		NA
1163383	1163384	SSO_P113	SSO_P114	spa32	spa33	TRUE	0.853	-6.000	0.000	NA		NA
1163384	1163385	SSO_P114	SSO_P115	spa33	spa24	TRUE	0.999	5.000	0.625	0.007	Y	NA
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1163387	1163388	SSO_P117	SSO_P118	spa40		TRUE	0.592	22.000	0.000	NA		NA
1163389	1163390	SSO_P119	SSO_P120			TRUE	0.681	141.000	0.000	1.000	Y	NA
1163391	1163392	SSO_P121	SSO_P122			TRUE	0.937	17.000	0.000	1.000	Y	NA
1163392	1163393	SSO_P122	SSO_P123			FALSE	0.324	135.000	0.000	1.000		NA
1163394	1163395	SSO_P124	SSO_P125			TRUE	0.920	-3.000	0.000	NA		NA
1163395	1163396	SSO_P125	SSO_P126			FALSE	0.005	1019.000	0.000	NA		NA
1163396	1163397	SSO_P126	SSO_P127			FALSE	0.007	585.000	0.000	NA		NA
1163397	1163398	SSO_P127	SSO_P128			FALSE	0.054	231.000	0.000	NA		NA
1163399	1163400	SSO_P129	SSO_P130			TRUE	0.952	0.000	0.000	1.000		NA
1163400	1163401	SSO_P130	SSO_P131			FALSE	0.268	98.000	0.000	1.000		NA
1163401	1163402	SSO_P131	SSO_P132			TRUE	0.990	0.000	0.000	1.000	Y	NA
1163402	1163403	SSO_P132	SSO_P133			FALSE	0.268	98.000	0.000	1.000		NA
1163404	1163405	SSO_P134	SSO_P135			FALSE	0.116	248.000	0.000	0.077		NA
1163405	1163406	SSO_P135	SSO_P136			TRUE	0.952	0.000	0.000	1.000		NA
1163406	1163407	SSO_P136	SSO_P137			FALSE	0.007	663.000	0.000	1.000		NA
1163407	1163408	SSO_P137	SSO_P138			TRUE	0.762	32.000	0.000	0.001		NA
1163408	1163409	SSO_P138	SSO_P139			TRUE	0.474	-85.000	0.000	NA		NA
1163409	1163410	SSO_P139	SSO_P140			TRUE	0.646	-27.000	0.000	NA		NA
1163410	1163411	SSO_P140	SSO_P141			FALSE	0.268	107.000	0.000	NA		NA
1163411	1163412	SSO_P141	SSO_P142		virA	FALSE	0.144	179.000	0.000	NA		NA
1163413	1163414	SSO_P143	SSO_P144	icsA/virG		FALSE	0.138	186.000	0.000	1.000		NA
1163414	1163415	SSO_P144	SSO_P145			FALSE	0.126	192.000	0.000	1.000		NA
1163415	1163416	SSO_P145	SSO_P146			FALSE	0.039	272.000	0.000	1.000		NA
1163416	1163417	SSO_P146	SSO_P147		ushA	FALSE	0.013	341.000	0.000	1.000	N	NA
1163417	1163418	SSO_P147	SSO_P148	ushA		TRUE	0.620	-31.000	0.000	NA		NA
1163419	1163420	SSO_P149	SSO_P150			FALSE	0.190	84.000	0.000	NA		NA
1163420	1163421	SSO_P150	SSO_P151			TRUE	0.628	-30.000	0.000	NA		NA
1163421	1163422	SSO_P151	SSO_P152			TRUE	0.828	13.000	0.000	1.000		NA
1163422	1163423	SSO_P152	SSON_P153			TRUE	0.502	142.000	0.000	0.041		NA
1163423	1163424	SSON_P153	SSO_P154			TRUE	0.882	-42.000	0.000	1.000	Y	NA
1163424	1163425	SSO_P154	SSO_P155			FALSE	0.220	199.000	0.000	0.077		NA
1163425	1163426	SSO_P155	SSO_P156			FALSE	0.216	55.000	0.000	NA		NA
1163428	1163429	SSO_P158	SSO_P159			TRUE	0.620	-31.000	0.000	NA		NA
1163430	1163431	SSO_P160	SSO_P161	insB		FALSE	0.310	118.000	0.000	NA		NA
1163432	1163433	SSO_P162	SSO_P163			TRUE	0.990	0.000	0.000	1.000	Y	NA
1163434	1163435	SSO_P164	SSO_P165			TRUE	0.825	141.000	0.182	1.000	Y	NA
1163435	1163436	SSO_P165	SSO_P166			FALSE	0.042	254.000	0.000	NA		NA
1163436	1163437	SSO_P166	SSO_P167		ipaH9.8	FALSE	0.005	869.000	0.000	NA		NA
1163437	1163438	SSO_P167	SSO_P168	ipaH9.8		FALSE	0.092	208.000	0.000	1.000		NA
1163438	1163439	SSO_P168	SSO_P169		yacB	FALSE	0.168	74.000	0.000	NA		NA
1163439	1163440	SSO_P169	SSO_P170	yacB	ospG	TRUE	0.466	29.000	0.000	NA		NA
1163442	1163443	SSO_P172	SSO_P173			FALSE	0.208	57.000	0.000	NA		NA
1163447	1163448	SSO_P177	SSO_P178			TRUE	0.681	141.000	0.000	1.000	Y	NA
1163448	1163449	SSO_P178	SSO_P179			FALSE	0.015	322.000	0.000	1.000	N	NA
1163449	1163450	SSO_P179	SSO_P180			TRUE	0.914	3.000	0.000	1.000	N	NA
1163450	1163451	SSO_P180	SSO_P181		virK	TRUE	0.919	5.000	0.000	NA		NA
1163451	1163452	SSO_P181	SSO_P182	virK	msbB2	FALSE	0.180	65.000	0.000	NA		NA
1163454	1163455	SSO_P184	SSO_P185			FALSE	0.015	364.000	0.000	NA		NA
1163455	1163456	SSO_P185	SSO_P186			TRUE	0.784	14.000	0.000	NA		NA
1163456	1163457	SSO_P186	SSO_P187			FALSE	0.007	578.000	0.000	NA		NA
1163457	1163458	SSO_P187	SSO_P188			FALSE	0.208	57.000	0.000	NA		NA
1163458	1163459	SSO_P188	SSO_P189			TRUE	0.825	141.000	0.182	1.000	Y	NA
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