MicrobesOnline Operon Predictions for Shigella dysenteriae Sd197

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1153829 1153830 SDY_0001 SDY_0002 thrL thrA FALSE 0.445 81.000 0.043 1.000   NA
 1153830 1153831 SDY_0002 SDY_0003 thrA thrB TRUE 0.985 2.000 0.133 1.000 Y NA
 1153831 1153832 SDY_0003 SDY_0004 thrB thrC TRUE 0.991 1.000 0.233 1.000 Y NA
 1153832 1153833 SDY_0004 SDY_0005 thrC   FALSE 0.027 214.000 0.003 NA   NA
 1153834 1153835 SDY_0006 SDY_0007 yaaA yaaJ FALSE 0.017 291.000 0.028 NA   NA
 1153836 1153837 SDY_0008 SDY_0009 talB mog FALSE 0.362 115.000 0.042 1.000 N NA
 1153838 1153839 SDY_0010 SDY_0011 yaaH   FALSE 0.225 149.000 0.043 NA   NA
 1153839 1153840 SDY_0011 SDY_0012   yaaI TRUE 0.971 26.000 0.500 NA   NA
 1153841 1153842 SDY_0013 SDY_0014 dnaK dnaJ TRUE 0.950 89.000 0.236 0.004 Y NA
 1153843 1153844 SDY_0015 SDY_0016 gef   FALSE 0.020 262.000 0.000 NA   NA
 1153844 1153845 SDY_0016 SDY_0017     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1153846 1153847 SDY_0018 SDY_0019 nhaA nhaR TRUE 0.883 60.000 0.292 1.000 N NA
 1153848 1153849 SDY_0020 SDY_0021     FALSE 0.496 -9.000 0.000 NA   NA
 1153851 1153852 SDY_0023 SDY_0024 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153853 1153854 SDY_0025 SDY_0026 acnB yacL FALSE 0.206 175.000 0.068 NA   NA
 1153855 1153856 SDY_0027 SDY_0028 speD speE TRUE 0.976 16.000 0.162 1.000 Y NA
 1153856 1153857 SDY_0028 SDY_0029 speE yacC TRUE 0.775 106.000 0.354 NA   NA
 1153860 1153861 SDY_0031 SDY_0032 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153861 1153862 SDY_0032 SDY_0034 insB hpt FALSE 0.001 1728.000 0.000 NA N NA
 1153864 1153865 SDY_0036 SDY_0037 yadG yadH TRUE 0.996 -3.000 0.688 0.082 Y NA
 1153865 1153866 SDY_0037 SDY_0038 yadH yadI FALSE 0.310 105.000 0.037 1.000 N NA
 1153866 1153867 SDY_0038 SDY_0039 yadI   TRUE 0.812 64.000 0.222 NA   NA
 1153867 1153868 SDY_0039 SDY_0040   yadE FALSE 0.544 -22.000 0.056 NA   NA
 1153870 1153871 SDY_0042 SDY_0043 yadD insA TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1153871 1153872 SDY_0043 SDY_0044 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153874 1153875 SDY_0046 SDY_0047   ribF TRUE 0.655 8.000 0.019 NA   NA
 1153875 1153876 SDY_0047 SDY_0048 ribF ileS TRUE 0.941 43.000 0.254 1.000 N NA
 1153876 1153877 SDY_0048 SDY_0049 ileS lspA TRUE 0.832 0.000 0.045 1.000 N NA
 1153877 1153878 SDY_0049 SDY_0050 lspA slpA FALSE 0.620 88.000 0.154 1.000 N NA
 1153878 1153879 SDY_0050 SDY_0051 slpA lytB TRUE 0.986 2.000 0.626 1.000 N NA
 1153879 1153880 SDY_0051 SDY_0052 lytB yaaF FALSE 0.444 66.000 0.028 1.000 N NA
 1153880 1153881 SDY_0052 SDY_0053 yaaF dapB FALSE 0.118 167.000 0.003 1.000 N NA
 1153881 1153882 SDY_0053 SDY_0054 dapB carA FALSE 0.048 458.000 0.034 1.000 Y NA
 1153882 1153883 SDY_0054 SDY_0055 carA carB TRUE 0.993 18.000 0.345 0.001 Y NA
 1153883 1153884 SDY_0055 SDY_0056 carB caiF FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1153885 1153886 SDY_0057 SDY_0058 caiE caiD FALSE 0.569 -15.000 0.000 1.000   NA
 1153886 1153887 SDY_0058 SDY_0059 caiD caiC TRUE 0.981 1.000 0.000 0.018 Y NA
 1153887 1153888 SDY_0059 SDY_0060 caiC caiB TRUE 0.857 59.000 0.154 0.018 N NA
 1153888 1153889 SDY_0060 SDY_0061 caiB caiA TRUE 0.870 129.000 0.529 1.000 N NA
 1153889 1153890 SDY_0061 SDY_0062 caiA caiT TRUE 0.879 31.000 0.118 1.000 N NA
 1153891 1153892 SDY_0063 SDY_0064 fixA fixB TRUE 0.988 15.000 0.231 0.014 Y NA
 1153892 1153893 SDY_0064 SDY_0065 fixB fixC FALSE 0.165 287.000 0.000 1.000 Y NA
 1153893 1153894 SDY_0065 SDY_0066 fixC fixX TRUE 0.981 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 1153894 1153895 SDY_0066 SDY_0067 fixX yaaU FALSE 0.558 58.000 0.000 1.000   NA
 1153895 1153896 SDY_0067 SDY_0068 yaaU   TRUE 0.863 10.000 0.000 0.049   NA
 1153896 1153897 SDY_0068 SDY_0069   yabF FALSE 0.027 279.000 0.000 1.000   NA
 1153897 1153898 SDY_0069 SDY_0070 yabF kefC TRUE 0.964 -7.000 0.560 1.000   NA
 1153898 1153899 SDY_0070 SDY_0071 kefC folA FALSE 0.072 192.000 0.012 1.000 N NA
 1153899 1153900 SDY_0071 SDY_0072 folA   FALSE 0.357 86.000 0.000 1.000   NA
 1153900 1153901 SDY_0072 SDY_0073     TRUE 0.814 3.000 0.000 1.000   NA
 1153902 1153903 SDY_0074 SDY_0075 apaH apaG TRUE 0.946 7.000 0.267 NA N NA
 1153903 1153904 SDY_0075 SDY_0076 apaG ksgA TRUE 0.840 3.000 0.078 NA N NA
 1153904 1153905 SDY_0076 SDY_0077 ksgA pdxA TRUE 0.930 -3.000 0.197 1.000 N NA
 1153905 1153906 SDY_0077 SDY_0078 pdxA surA TRUE 0.983 0.000 0.561 1.000 N NA
 1153906 1153907 SDY_0078 SDY_0079 surA imp TRUE 0.854 53.000 0.182 1.000 N NA
 1153908 1153909 SDY_0080 SDY_0081 yabH yabP FALSE 0.014 295.000 0.000 NA   NA
 1153910 1153911 SDY_0082 SDY_0083 yabO hepA TRUE 0.946 12.000 0.294 1.000 N NA
 1153911 1153912 SDY_0083 SDY_0087 hepA polB FALSE 0.135 164.000 0.000 NA   NA
 1153912 1153913 SDY_0087 SDY_0084 polB   FALSE 0.206 -1872.000 0.000 NA   NA
 1153914 1153915 SDY_0085 SDY_0086 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153916 1153917 SDY_0088 SDY_0089 araD araA FALSE 0.630 168.000 0.017 1.000 Y NA
 1153917 1153918 SDY_0089 SDY_0090 araA araB TRUE 0.888 11.000 0.138 1.000 N NA
 1153919 1153920 SDY_0091 SDY_0092 araC yabI FALSE 0.252 86.000 0.000 NA   NA
 1153921 1153922 SDY_0093 SDY_0094 yabJ yabK TRUE 0.959 -16.000 0.522 0.015 N NA
 1153922 1153923 SDY_0094 SDY_0095 yabK tbpA TRUE 0.962 -24.000 0.697 0.063 N NA
 1153923 1153924 SDY_0095 SDY_0096 tbpA insA FALSE 0.003 700.000 0.000 1.000 N NA
 1153924 1153925 SDY_0096 SDY_0097 insA yabN FALSE 0.005 523.000 0.000 1.000   NA
 1153925 1153926 SDY_0097 SDY_0098 yabN leuD FALSE 0.018 328.000 0.000 1.000   NA
 1153926 1153927 SDY_0098 SDY_0099 leuD leuC TRUE 0.993 11.000 0.309 0.001 Y NA
 1153927 1153928 SDY_0099 SDY_0100 leuC leuB TRUE 0.995 3.000 0.275 0.001 Y NA
 1153928 1153929 SDY_0100 SDY_0101 leuB leuA TRUE 0.990 0.000 0.126 0.001 Y NA
 1153929 1153930 SDY_0101 SDY_0102 leuA leuL FALSE 0.542 93.000 0.010 0.001   NA
 1153931 1153932 SDY_0103 SDY_0104   leuO TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1153933 1153934 SDY_0105 SDY_0106 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153935 1153936 SDY_0107 SDY_0108 ilvI ilvH TRUE 0.996 3.000 0.371 0.002 Y NA
 1153936 1153937 SDY_0108 SDY_0109 ilvH fruL FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1153937 1153938 SDY_0109 SDY_0110 fruL fruR FALSE 0.263 82.000 0.000 NA   NA
 1153938 1153939 SDY_0110 SDY_0111 fruR yabB FALSE 0.002 603.000 0.000 NA   NA
 1153939 1153940 SDY_0111 SDY_0112 yabB yabC TRUE 0.985 2.000 0.635 NA   NA
 1153940 1153941 SDY_0112 SDY_0113 yabC ftsL TRUE 0.941 -3.000 0.227 1.000 N NA
 1153941 1153942 SDY_0113 SDY_0114 ftsL ftsI TRUE 0.865 16.000 0.124 1.000 N NA
 1153942 1153943 SDY_0114 SDY_0115 ftsI murE TRUE 0.931 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 1153943 1153944 SDY_0115 SDY_0116 murE murF TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 1153944 1153945 SDY_0116 SDY_0117 murF mraY TRUE 0.989 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 1153945 1153946 SDY_0117 SDY_0118 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.004 Y NA
 1153946 1153947 SDY_0118 SDY_0119 murD ftsW TRUE 0.979 0.000 0.297 0.003 N NA
 1153947 1153948 SDY_0119 SDY_0120 ftsW murG TRUE 0.981 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1153948 1153949 SDY_0120 SDY_0121 murG murC TRUE 0.976 54.000 0.283 1.000 Y NA
 1153949 1153950 SDY_0121 SDY_0122 murC ddlB TRUE 0.977 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 1153950 1153951 SDY_0122 SDY_0123 ddlB ftsQ TRUE 0.993 2.000 0.372 NA Y NA
 1153951 1153952 SDY_0123 SDY_0124 ftsQ ftsA TRUE 0.959 -3.000 0.389 NA N NA
 1153952 1153953 SDY_0124 SDY_0125 ftsA ftsZ TRUE 0.979 61.000 0.460 1.000 Y NA
 1153953 1153954 SDY_0125 SDY_0126 ftsZ lpxC FALSE 0.539 101.000 0.134 1.000 N NA
 1153954 1153955 SDY_0126 SDY_0127 lpxC yacA FALSE 0.052 230.000 0.000 1.000   NA
 1153955 1153956 SDY_0127 SDY_0128 yacA secA TRUE 0.644 62.000 0.065 1.000   NA
 1153956 1153957 SDY_0128 SDY_0129 secA mutT TRUE 0.794 60.000 0.168 1.000 N NA
 1153958 1153959 SDY_0130 SDY_0131   yacG FALSE 0.272 -49.000 0.000 NA   NA
 1153959 1153960 SDY_0131 SDY_0132 yacG yacF TRUE 0.960 10.000 0.356 NA   NA
 1153960 1153961 SDY_0132 SDY_0133 yacF yacE TRUE 0.894 0.000 0.110 NA   NA
 1153963 1153964 SDY_0135 SDY_0136   hofC TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1153964 1153965 SDY_0136 SDY_0137 hofC hofB FALSE 0.634 40.000 0.000 NA   NA
 1153965 1153966 SDY_0137 SDY_0138 hofB ppdD TRUE 0.993 10.000 0.556 NA Y NA
 1153966 1153967 SDY_0138 SDY_0139 ppdD nadC FALSE 0.031 203.000 0.015 NA N NA
 1153968 1153969 SDY_0140 SDY_0141 ampD ampE TRUE 0.987 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 1153971 1153972 SDY_0143 SDY_0144 pdhR aceE FALSE 0.621 161.000 0.276 1.000 N NA
 1153972 1153973 SDY_0144 SDY_0145 aceE aceF TRUE 0.982 15.000 0.220 1.000 Y NA
 1153973 1153974 SDY_0145 SDY_0146 aceF lpdA TRUE 0.775 208.000 0.463 1.000 Y NA
 1153975 1153976 SDY_0147 SDY_0148     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1153976 1153977 SDY_0148 SDY_0149   insB FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1153977 1153978 SDY_0149 SDY_0150 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153978 1153979 SDY_0150 SDY_0151 insA   FALSE 0.633 51.000 0.000 1.000   NA
 1153979 1153980 SDY_0151 SDY_0152     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1153981 1153982 SDY_0153 SDY_0154   panB FALSE 0.004 463.000 0.000 NA   NA
 1153982 1153983 SDY_0154 SDY_0155 panB panC TRUE 0.994 12.000 0.395 0.001 Y NA
 1153983 1153984 SDY_0155 SDY_0156 panC insB FALSE 0.002 613.000 0.000 NA N NA
 1153984 1153985 SDY_0156 SDY_0157 insB   FALSE 0.028 548.000 0.000 NA Y NA
 1153986 1153987 SDY_0158 SDY_0159 folK pcnB TRUE 0.943 -3.000 0.234 1.000 N NA
 1153987 1153988 SDY_0159 SDY_0160 pcnB yadB TRUE 0.976 39.000 0.131 1.000 Y NA
 1153988 1153989 SDY_0160 SDY_0161 yadB dksA TRUE 0.819 67.000 0.231 1.000 N NA
 1153989 1153990 SDY_0161 SDY_0162 dksA sfsA FALSE 0.329 178.000 0.151 NA   NA
 1153990 1153991 SDY_0162 SDY_0163 sfsA yadP TRUE 0.693 15.000 0.045 NA   NA
 1153992 1153993 SDY_0164 SDY_0165 hrpB mrcB FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 1153993 1153994 SDY_0165 SDY_0166 mrcB fhuA FALSE 0.049 220.000 0.000 1.000 N NA
 1153994 1153995 SDY_0166 SDY_0167 fhuA fhuC TRUE 0.965 51.000 0.156 1.000 Y NA
 1153995 1153996 SDY_0167 SDY_0168 fhuC fhuD TRUE 0.972 0.000 0.031 1.000 Y NA
 1153996 1153997 SDY_0168 SDY_0169 fhuD fhuB TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1153999 1154000 SDY_0171 SDY_0172 yadQ yadR FALSE 0.300 82.000 0.031 NA   NA
 1154001 1154002 SDY_0173 SDY_0174 yadS yadT TRUE 0.925 38.000 0.213 NA   NA
 1154002 1154003 SDY_0174 SDY_0175 yadT pfs TRUE 0.745 -7.000 0.073 1.000 N NA
 1154004 1154005 SDY_0176 SDY_0177 dgt   FALSE 0.220 -937.000 0.000 NA   NA
 1154005 1154006 SDY_0177 SDY_0178   htrA FALSE 0.001 672.000 0.000 NA N NA
 1154006 1154007 SDY_0178 SDY_0179 htrA yaeG FALSE 0.185 178.000 0.080 NA N NA
 1154007 1154008 SDY_0179 SDY_0180 yaeG   TRUE 0.741 4.000 0.030 NA   NA
 1154009 1154010 SDY_0181 SDY_0182 yaeH dapD FALSE 0.016 314.000 0.035 NA   NA
 1154010 1154011 SDY_0182 SDY_0183 dapD glnD TRUE 0.861 31.000 0.097 1.000 N NA
 1154011 1154012 SDY_0183 SDY_0184 glnD map TRUE 0.852 62.000 0.243 1.000 N NA
 1154013 1154014 SDY_0185 SDY_0186 rpsB tsf TRUE 0.723 258.000 0.748 1.000 Y NA
 1154014 1154015 SDY_0186 SDY_0187 tsf pyrH TRUE 0.767 147.000 0.416 1.000 N NA
 1154015 1154016 SDY_0187 SDY_0188 pyrH frr FALSE 0.278 292.000 0.626 1.000 N NA
 1154016 1154017 SDY_0188 SDY_0189 frr yaeM FALSE 0.312 92.000 0.032 1.000 N NA
 1154017 1154018 SDY_0189 SDY_0190 yaeM yaeS FALSE 0.524 186.000 0.025 1.000 Y NA
 1154018 1154019 SDY_0190 SDY_0191 yaeS cdsA TRUE 0.989 13.000 0.400 1.000 Y NA
 1154019 1154020 SDY_0191 SDY_0192 cdsA yaeL TRUE 0.818 12.000 0.080 1.000 N NA
 1154020 1154021 SDY_0192 SDY_0193 yaeL yaeT TRUE 0.984 30.000 0.204 1.000 Y NA
 1154021 1154022 SDY_0193 SDY_0194 yaeT hlpA TRUE 0.949 122.000 0.354 1.000 Y NA
 1154022 1154023 SDY_0194 SDY_0195 hlpA lpxD TRUE 0.997 4.000 0.814 1.000 Y NA
 1154023 1154024 SDY_0195 SDY_0196 lpxD fabZ TRUE 0.899 105.000 0.796 1.000 N NA
 1154024 1154025 SDY_0196 SDY_0197 fabZ lpxA TRUE 0.989 4.000 0.850 1.000 N NA
 1154025 1154026 SDY_0197 SDY_0198 lpxA lpxB TRUE 0.992 0.000 0.289 1.000 Y NA
 1154026 1154027 SDY_0198 SDY_0199 lpxB rnhB TRUE 0.928 -3.000 0.186 1.000 N NA
 1154027 1154028 SDY_0199 SDY_0200 rnhB dnaE TRUE 0.973 37.000 0.104 1.000 Y NA
 1154028 1154029 SDY_0200 SDY_0201 dnaE accA TRUE 0.860 13.000 0.122 1.000 N NA
 1154029 1154030 SDY_0201 SDY_0202 accA insA FALSE 0.016 312.000 0.000 1.000 N NA
 1154030 1154031 SDY_0202 SDY_0203 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154031 1154032 SDY_0203 SDY_0204 insB ldcC TRUE 0.650 28.000 0.000 NA   NA
 1154032 1154033 SDY_0204 SDY_0205 ldcC yaeR FALSE 0.208 100.000 0.000 NA   NA
 1154033 1154034 SDY_0205 SDY_0206 yaeR mesJ FALSE 0.364 68.000 0.015 1.000 N NA
 1154035 1154036 SDY_0207 SDY_0208 yaeO yaeP TRUE 0.816 -13.000 0.179 NA   NA
 1154037 1154038 SDY_0209 SDY_0210 yaeQ yaeJ TRUE 0.701 -3.000 0.034 NA   NA
 1154038 1154039 SDY_0210 SDY_0211 yaeJ cutF FALSE 0.621 14.000 0.027 NA   NA
 1154040 1154041 SDY_0212 SDY_0213 yaeF proS FALSE 0.379 53.000 0.002 NA   NA
 1154041 1154042 SDY_0213 SDY_0214 proS yaeB FALSE 0.326 111.000 0.048 NA   NA
 1154042 1154043 SDY_0214 SDY_0215 yaeB rcsF TRUE 0.940 -3.000 0.247 NA   NA
 1154043 1154044 SDY_0215 SDY_0216 rcsF yaeC TRUE 0.853 118.000 0.500 NA   NA
 1154044 1154045 SDY_0216 SDY_0217 yaeC yaeE TRUE 0.989 40.000 0.411 NA Y NA
 1154045 1154046 SDY_0217 SDY_0218 yaeE abc TRUE 0.990 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 1154047 1154048 SDY_0219 SDY_0220 yaeD rrsH FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 1154048 1154049 SDY_0220 SDY_0221 rrsH   FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1154049 1154050 SDY_0221 SDY_0222     FALSE 0.626 43.000 0.000 NA   NA
 1154050 1154051 SDY_0222 SDY_0223   rrlH FALSE 0.107 175.000 0.000 NA   NA
 1154051 1154052 SDY_0223 SDY_0224 rrlH rrfH FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1154052 1154053 SDY_0224 SDY_0225 rrfH   FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1154053 1154054 SDY_0225 SDY_0226   yafB FALSE 0.137 163.000 0.000 NA   NA
 1154056 1154057 SDY_0228 SDY_0229 yafD yafE FALSE 0.038 269.000 0.066 NA   NA
 1154058 1154059 SDY_0230 SDY_0231 dniR gloB TRUE 0.810 72.000 0.233 1.000   NA
 1154062 1154063 SDY_0234 SDY_0235 dnaQ   FALSE 0.232 133.000 0.000 NA   NA
 1154064 1154065 SDY_0236 SDY_0237 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154065 1154066 SDY_0237 SDY_0238 insA   FALSE 0.511 51.000 0.000 NA   NA
 1154066 1154067 SDY_0238 SDY_0239     FALSE 0.219 138.000 0.000 NA   NA
 1154067 1154068 SDY_0239 SDY_0240     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154068 1154069 SDY_0240 SDY_0241     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1154070 1154071 SDY_0242 SDY_0243     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1154071 1154072 SDY_0243 SDY_0244     FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1154076 1154077 SDY_0248 SDY_0249 gmhA yafJ FALSE 0.327 206.000 0.229 1.000   NA
 1154078 1154079 SDY_0250 SDY_0251 yafK yafQ FALSE 0.146 156.000 0.000 NA   NA
 1154079 1154080 SDY_0251 SDY_0252 yafQ dinJ TRUE 0.928 3.000 0.167 NA   NA
 1154081 1154082 SDY_0253 SDY_0254 yafL yafM FALSE 0.077 176.000 0.000 NA N NA
 1154082 1154083 SDY_0254 SDY_0255 yafM   FALSE 0.094 335.000 0.000 NA Y NA
 1154083 1154084 SDY_0255 SDY_0256   sfmC FALSE 0.031 231.000 0.000 NA   NA
 1154084 1154085 SDY_0256 SDY_0257 sfmC insA TRUE 0.750 34.000 0.000 1.000   NA
 1154085 1154086 SDY_0257 SDY_0258 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154086 1154087 SDY_0258 SDY_0259 insB   FALSE 0.125 167.000 0.000 NA   NA
 1154088 1154089 SDY_0260 SDY_0262   envY FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1154091 1154092 SDY_0263 SDY_0264   ybcH FALSE 0.527 49.000 0.000 NA   NA
 1154092 1154093 SDY_0264 SDY_0265 ybcH nfrA TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1154093 1154094 SDY_0265 SDY_0266 nfrA nfrB FALSE 0.237 113.000 0.000 NA   NA
 1154095 1154096 SDY_0267 SDY_0268 insB fdrA FALSE 0.007 336.000 0.000 NA N NA
 1154096 1154097 SDY_0268 SDY_0269 fdrA ylbE FALSE 0.217 268.000 0.412 NA   NA
 1154097 1154098 SDY_0269 SDY_0270 ylbE ylbF TRUE 0.939 11.000 0.265 NA   NA
 1154098 1154099 SDY_0270 SDY_0271 ylbF arcC TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154100 1154101 SDY_0272 SDY_0273 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154101 1154102 SDY_0273 SDY_0274 insA purK FALSE 0.002 840.000 0.000 1.000 N NA
 1154102 1154103 SDY_0274 SDY_0275 purK purE TRUE 0.987 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 1154103 1154104 SDY_0275 SDY_0276 purE ybbF FALSE 0.328 118.000 0.016 1.000   NA
 1154104 1154105 SDY_0276 SDY_0277 ybbF ppiB TRUE 0.963 3.000 0.237 1.000   NA
 1154107 1154108 SDY_0279 SDY_0280 ybcI ybcJ FALSE 0.223 -48.000 0.011 NA   NA
 1154108 1154109 SDY_0280 SDY_0281 ybcJ folD TRUE 0.647 -19.000 0.055 1.000   NA
 1154109 1154110 SDY_0281 SDY_0282 folD insA FALSE 0.003 609.000 0.000 1.000 N NA
 1154110 1154111 SDY_0282 SDY_0283 insA   TRUE 0.791 111.000 0.000 1.000 Y NA
 1154111 1154112 SDY_0283 SDY_0284     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154113 1154114 SDY_0285 SDY_0286 ybaE ybaX FALSE 0.014 341.000 0.019 1.000   NA
 1154115 1154116 SDY_0287 SDY_0288 ybaW   FALSE 0.638 38.000 0.000 NA   NA
 1154118 1154119 SDY_0290 SDY_0291 ybaV ybaU FALSE 0.226 151.000 0.033 1.000 N NA
 1154119 1154120 SDY_0291 SDY_0292 ybaU hupB FALSE 0.048 192.000 0.000 NA N NA
 1154120 1154121 SDY_0292 SDY_0293 hupB lon FALSE 0.175 134.000 0.000 NA N NA
 1154121 1154122 SDY_0293 SDY_0294 lon clpX TRUE 0.784 188.000 0.201 0.081 Y NA
 1154122 1154123 SDY_0294 SDY_0295 clpX clpP TRUE 0.949 126.000 0.352 1.000 Y NA
 1154123 1154124 SDY_0295 SDY_0296 clpP tig FALSE 0.604 245.000 0.351 1.000 Y NA
 1154124 1154125 SDY_0296 SDY_0297 tig   FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 1154125 1154126 SDY_0297 SDY_0298   bolA FALSE 0.260 -66.000 0.000 NA   NA
 1154127 1154128 SDY_0299 SDY_0300 yajG ampG TRUE 0.934 44.000 0.256 NA   NA
 1154130 1154131 SDY_0302 SDY_0303   yajR FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 1154133 1154134 SDY_0305 SDY_0306 apbA thiJ FALSE 0.637 -43.000 0.155 NA   NA
 1154136 1154137 SDY_0308 SDY_0309 xseB ispA TRUE 0.808 0.000 0.035 1.000 N NA
 1154137 1154138 SDY_0309 SDY_0310 ispA dxs TRUE 0.969 25.000 0.060 1.000 Y NA
 1154138 1154139 SDY_0310 SDY_0311 dxs yajO FALSE 0.475 55.000 0.009 1.000 N NA
 1154139 1154140 SDY_0311 SDY_0312 yajO   FALSE 0.005 377.000 0.000 NA N NA
 1154140 1154141 SDY_0312 SDY_0313     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1154144 1154145 SDY_0316 SDY_0317 pgpA thiL TRUE 0.830 -22.000 0.206 1.000 N NA
 1154145 1154146 SDY_0317 SDY_0318 thiL nusB TRUE 0.766 78.000 0.225 1.000 N NA
 1154146 1154147 SDY_0318 SDY_0319 nusB ribH TRUE 0.959 20.000 0.347 1.000 N NA
 1154147 1154148 SDY_0319 SDY_0320 ribH ribD TRUE 0.883 89.000 0.034 0.001 Y NA
 1154148 1154149 SDY_0320 SDY_0321 ribD ybaD TRUE 0.954 4.000 0.277 NA N NA
 1154150 1154151 SDY_0322 SDY_0323 yajI tsx FALSE 0.014 299.000 0.000 NA   NA
 1154152 1154153 SDY_0324 SDY_0325 yajD secF FALSE 0.320 129.000 0.015 1.000   NA
 1154153 1154154 SDY_0325 SDY_0326 secF secD TRUE 0.990 11.000 0.206 0.001 Y NA
 1154154 1154155 SDY_0326 SDY_0327 secD yajC TRUE 0.958 28.000 0.045 NA Y NA
 1154155 1154156 SDY_0327 SDY_0328 yajC tgt TRUE 0.950 23.000 0.325 NA N NA
 1154156 1154157 SDY_0328 SDY_0329 tgt queA TRUE 0.988 55.000 0.360 0.001 Y NA
 1154160 1154161 SDY_0332 SDY_0333     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154162 1154163 SDY_0334 SDY_0335 malZ proY FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 1154163 1154164 SDY_0335 SDY_0336 proY brnQ TRUE 0.968 76.000 0.348 0.074 Y NA
 1154164 1154165 SDY_0336 SDY_0337 brnQ phoR FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 1154165 1154166 SDY_0337 SDY_0338 phoR phoB FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1154169 1154170 SDY_0341 SDY_0342 sbcC araJ FALSE 0.629 42.000 0.000 NA   NA
 1154170 1154171 SDY_0342 SDY_0343 araJ   FALSE 0.219 -961.000 0.000 NA   NA
 1154174 1154175 SDY_0346 SDY_0347     FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1154175 1154176 SDY_0347 SDY_0348     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1154177 1154178 SDY_0349 SDY_0350     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154178 1154179 SDY_0350 SDY_0351     FALSE 0.002 732.000 0.000 NA   NA
 1154180 1154181 SDY_0352 SDY_0353 yaiE aroM FALSE 0.416 72.000 0.049 NA   NA
 1154181 1154182 SDY_0353 SDY_0354 aroM yaiA FALSE 0.022 258.000 0.000 NA   NA
 1154182 1154183 SDY_0354 SDY_0355 yaiA aroL FALSE 0.621 50.000 0.044 NA   NA
 1154183 1154184 SDY_0355 SDY_0357 aroL yaiI FALSE 0.065 183.000 0.007 NA   NA
 1154186 1154187 SDY_0358 SDY_0359 yaiC   FALSE 0.118 182.000 0.000 1.000 N NA
 1154187 1154188 SDY_0359 SDY_0360   psiF FALSE 0.003 537.000 0.000 NA   NA
 1154188 1154189 SDY_0360 SDY_0361 psiF phoA FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1154191 1154192 SDY_0363 SDY_0364 yaiB   FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1154196 1154197 SDY_0368 SDY_0369 yaiW sbmA TRUE 0.713 13.000 0.000 1.000   NA
 1154201 1154202 SDY_0373 SDY_0374 yaiV insB FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1154202 1154203 SDY_0374 SDY_0375 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154203 1154204 SDY_0375 SDY_0376 insA lacY TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1154206 1154207 SDY_0378 SDY_0379 lacZ lacI FALSE 0.083 289.000 0.174 1.000 N NA
 1154207 1154208 SDY_0379 SDY_0380 lacI   TRUE 0.871 37.000 0.032 0.037   NA
 1154209 1154210 SDY_0381 SDY_0382     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154210 1154211 SDY_0382 SDY_0383   cof TRUE 0.754 28.000 0.000 1.000   NA
 1154211 1154212 SDY_0383 SDY_0384 cof ybaO FALSE 0.461 66.000 0.020 1.000   NA
 1154212 1154213 SDY_0384 SDY_0385 ybaO mdlA TRUE 0.917 30.000 0.179 1.000 N NA
 1154213 1154214 SDY_0385 SDY_0386 mdlA mdlB TRUE 0.996 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 1154214 1154215 SDY_0386 SDY_0387 mdlB glnK FALSE 0.132 181.000 0.028 1.000 N NA
 1154215 1154216 SDY_0387 SDY_0388 glnK amtB TRUE 0.905 30.000 0.156 1.000 N NA
 1154223 1154224 SDY_0395 SDY_0396 gcl ybbU FALSE 0.438 90.000 0.054 1.000   NA
 1154224 1154225 SDY_0396 SDY_0397 ybbU ybbT TRUE 0.910 78.000 0.625 1.000 N NA
 1154226 1154227 SDY_0398 SDY_0399 ybbS ybbB FALSE 0.275 69.000 0.012 NA   NA
 1154227 1154228 SDY_0399 SDY_0400 ybbB   FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1154228 1154229 SDY_0400 SDY_0401   insA FALSE 0.002 705.000 0.000 NA   NA
 1154229 1154230 SDY_0401 SDY_0402 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154231 1154232 SDY_0403 SDY_0405 ybbP ybbA TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154233 1154234 SDY_0404 SDY_0406 tesA ybbO TRUE 0.738 -10.000 0.072 1.000   NA
 1154234 1154235 SDY_0406 SDY_0407 ybbO ybbN TRUE 0.895 25.000 0.118 1.000   NA
 1154236 1154237 SDY_0408 SDY_0409 ybbM ybbL TRUE 0.641 -40.000 0.127 NA   NA
 1154238 1154239 SDY_0410 SDY_0411 ybbK ybbJ TRUE 0.987 -3.000 0.313 NA Y NA
 1154240 1154241 SDY_0412 SDY_0413     FALSE 0.006 390.000 0.000 NA   NA
 1154243 1154244 SDY_0415 SDY_0416 ybbI   TRUE 0.712 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1154244 1154245 SDY_0416 SDY_0417     TRUE 0.838 -3.000 0.000 0.073 N NA
 1154245 1154246 SDY_0417 SDY_0418     TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1154246 1154247 SDY_0418 SDY_0419     FALSE 0.626 43.000 0.000 NA   NA
 1154247 1154248 SDY_0419 SDY_0420     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1154248 1154249 SDY_0420 SDY_0421     FALSE 0.367 64.000 0.000 NA   NA
 1154249 1154250 SDY_0421 SDY_0422     FALSE 0.211 104.000 0.000 NA   NA
 1154250 1154251 SDY_0422 SDY_0423     TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1154251 1154252 SDY_0423 SDY_0424     FALSE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 1154252 1154253 SDY_0424 SDY_0425     FALSE 0.248 -90.000 0.000 NA   NA
 1154253 1154254 SDY_0425 SDY_0426     FALSE 0.311 71.000 0.000 NA   NA
 1154256 1154257 SDY_0428 SDY_0429     TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1154258 1154259 SDY_0430 SDY_0431 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154260 1154261 SDY_0432 SDY_0433 ybaT ybaS TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1154264 1154265 SDY_0436 SDY_0437 ybaP ybaK FALSE 0.050 204.000 0.022 NA   NA
 1154272 1154273 SDY_0444 SDY_0445 hemH adk FALSE 0.254 132.000 0.013 1.000 N NA
 1154273 1154274 SDY_0445 SDY_0446 adk htpG FALSE 0.247 181.000 0.035 0.080 N NA
 1154274 1154275 SDY_0446 SDY_0447 htpG recR FALSE 0.301 110.000 0.028 1.000 N NA
 1154275 1154276 SDY_0447 SDY_0448 recR ybaB TRUE 0.983 0.000 0.604 NA   NA
 1154276 1154277 SDY_0448 SDY_0449 ybaB dnaX TRUE 0.933 53.000 0.411 NA   NA
 1154277 1154278 SDY_0449 SDY_0450 dnaX apt FALSE 0.497 129.000 0.088 1.000 N NA
 1154278 1154279 SDY_0450 SDY_0451 apt ybaN FALSE 0.210 153.000 0.043 NA   NA
 1154280 1154281 SDY_0452 SDY_0453 priC ybaM TRUE 0.961 14.000 0.474 NA   NA
 1154282 1154283 SDY_0454 SDY_0455 aefA acrR FALSE 0.300 128.000 0.000 1.000 N NA
 1154284 1154285 SDY_0456 SDY_0457 acrA acrB TRUE 0.971 23.000 0.458 1.000 N NA
 1154285 1154286 SDY_0457 SDY_0458 acrB ybaJ FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1154286 1154287 SDY_0458 SDY_0459 ybaJ hha TRUE 0.819 26.000 0.080 NA   NA
 1154287 1154288 SDY_0459 SDY_0460 hha ylaD FALSE 0.232 172.000 0.076 NA   NA
 1154288 1154289 SDY_0460 SDY_0461 ylaD ylaC FALSE 0.613 77.000 0.101 1.000   NA
 1154289 1154290 SDY_0461 SDY_0462 ylaC   FALSE 0.135 164.000 0.000 NA   NA
 1154290 1154291 SDY_0462 SDY_0463     FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1154291 1154292 SDY_0463 SDY_0464     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154293 1154294 SDY_0465 SDY_0466 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154295 1154296 SDY_0467 SDY_0468     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1154296 1154297 SDY_0468 SDY_0469     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154297 1154298 SDY_0469 SDY_0470     FALSE 0.035 478.000 0.000 NA Y NA
 1154299 1154300 SDY_0471 SDY_0472     FALSE 0.026 246.000 0.000 NA   NA
 1154300 1154301 SDY_0472 SDY_0473   proA FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 1154301 1154302 SDY_0473 SDY_0474 proA proB TRUE 0.973 12.000 0.026 0.001 Y NA
 1154303 1154304 SDY_0475 SDY_0476 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154305 1154306 SDY_0477 SDY_0478 crl yafA FALSE 0.549 58.000 0.048 NA   NA
 1154306 1154307 SDY_0478 SDY_0479 yafA gpt FALSE 0.291 92.000 0.040 NA   NA
 1154309 1154310 SDY_0481 SDY_0482 prfH   TRUE 0.844 -31.000 0.303 NA   NA
 1154310 1154311 SDY_0482 SDY_0483   dinP FALSE 0.002 756.000 0.000 NA   NA
 1154311 1154312 SDY_0483 SDY_0484 dinP mbhA FALSE 0.373 71.000 0.000 1.000 N NA
 1154312 1154313 SDY_0484 SDY_0485 mbhA   TRUE 0.965 147.000 0.846 1.000 Y NA
 1154314 1154315 SDY_0486 SDY_0487   insA FALSE 0.018 270.000 0.000 NA   NA
 1154315 1154316 SDY_0487 SDY_0488 insA   FALSE 0.003 496.000 0.000 NA   NA
 1154316 1154317 SDY_0488 SDY_0489   pheP FALSE 0.208 102.000 0.000 NA   NA
 1154318 1154319 SDY_0490 SDY_0491 ybdG nfnB FALSE 0.236 108.000 0.012 1.000 N NA
 1154319 1154320 SDY_0491 SDY_0492 nfnB ybdF TRUE 0.833 94.000 0.500 NA   NA
 1154320 1154321 SDY_0492 SDY_0493 ybdF ybdJ FALSE 0.360 65.000 0.000 NA   NA
 1154321 1154322 SDY_0493 SDY_0494 ybdJ ybdK FALSE 0.352 66.000 0.000 NA   NA
 1154322 1154323 SDY_0494 SDY_0495 ybdK   FALSE 0.003 924.000 0.000 1.000   NA
 1154323 1154324 SDY_0495 SDY_0496     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154325 1154326 SDY_0497 SDY_0498     FALSE 0.216 139.000 0.000 NA   NA
 1154326 1154327 SDY_0498 SDY_0499   insA FALSE 0.633 51.000 0.000 1.000   NA
 1154327 1154328 SDY_0499 SDY_0500 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154328 1154329 SDY_0500 SDY_0501 insB hemB FALSE 0.012 282.000 0.000 NA N NA
 1154330 1154331 SDY_0502 SDY_0503 tauD tauC TRUE 0.936 -3.000 0.214 1.000 N NA
 1154331 1154332 SDY_0503 SDY_0504 tauC tauB TRUE 0.995 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 1154332 1154333 SDY_0504 SDY_0505 tauB tauA TRUE 0.957 13.000 0.047 1.000 Y NA
 1154334 1154335 SDY_0506 SDY_0507     TRUE 0.998 0.000 0.900 0.011 Y NA
 1154336 1154337 SDY_0508 SDY_0509     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1154337 1154338 SDY_0509 SDY_0510     FALSE 0.300 -42.000 0.000 NA   NA
 1154338 1154339 SDY_0510 SDY_0511   entD FALSE 0.004 400.000 0.000 NA N NA
 1154339 1154340 SDY_0511 SDY_0512 entD fepA TRUE 0.813 166.000 0.700 1.000 N NA
 1154341 1154342 SDY_0513 SDY_0514 fes ybdZ TRUE 0.967 3.000 0.320 NA   NA
 1154342 1154343 SDY_0514 SDY_0515 ybdZ entF TRUE 0.819 -3.000 0.080 NA   NA
 1154344 1154345 SDY_0516 SDY_0517 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154347 1154348 SDY_0519 SDY_0520 fepC fepG TRUE 0.963 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1154348 1154349 SDY_0520 SDY_0521 fepG fepD TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.048 Y NA
 1154352 1154353 SDY_0524 SDY_0525 entC entE TRUE 0.995 10.000 0.667 1.000 Y NA
 1154353 1154354 SDY_0525 SDY_0526 entE entB TRUE 0.994 14.000 0.667 1.000 Y NA
 1154354 1154355 SDY_0526 SDY_0527 entB entA TRUE 0.971 0.000 0.024 1.000 Y NA
 1154355 1154356 SDY_0527 SDY_0528 entA ybdB TRUE 0.974 3.000 0.065 NA Y NA
 1154356 1154357 SDY_0528 SDY_0529 ybdB cstA FALSE 0.095 181.000 0.000 NA   NA
 1154357 1154358 SDY_0529 SDY_0530 cstA ybdD FALSE 0.092 182.000 0.000 NA   NA
 1154361 1154362 SDY_0533 SDY_0534 ybdM   FALSE 0.369 -27.000 0.000 NA   NA
 1154363 1154364 SDY_0535 SDY_0536     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154368 1154369 SDY_0540 SDY_0541 ahpC ahpF TRUE 0.958 99.000 0.551 1.000 Y NA
 1154371 1154372 SDY_0543 SDY_0544 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154372 1154373 SDY_0544 SDY_0545 insB   FALSE 0.043 212.000 0.000 NA   NA
 1154373 1154374 SDY_0545 SDY_0546   cspE FALSE 0.623 175.000 0.333 1.000   NA
 1154376 1154377 SDY_0548 SDY_0549 ybeM ybeC FALSE 0.112 285.000 0.196 1.000   NA
 1154378 1154379 SDY_0550 SDY_0551 lipA ybeF FALSE 0.044 209.000 0.005 1.000 N NA
 1154379 1154380 SDY_0551 SDY_0552 ybeF lipB FALSE 0.006 413.000 0.000 1.000 N NA
 1154380 1154381 SDY_0552 SDY_0553 lipB ybeD TRUE 0.656 100.000 0.219 NA   NA
 1154381 1154382 SDY_0553 SDY_0554 ybeD dacA FALSE 0.419 110.000 0.081 NA   NA
 1154382 1154383 SDY_0554 SDY_0555 dacA rlpA TRUE 0.944 140.000 0.475 NA Y NA
 1154383 1154384 SDY_0555 SDY_0556 rlpA mrdB FALSE 0.629 11.000 0.035 NA N NA
 1154384 1154385 SDY_0556 SDY_0557 mrdB mrdA TRUE 0.836 3.000 0.046 1.000 N NA
 1154385 1154386 SDY_0557 SDY_0558 mrdA ybeA TRUE 0.685 31.000 0.031 NA   NA
 1154386 1154387 SDY_0558 SDY_0559 ybeA ybeB TRUE 0.962 4.000 0.307 NA   NA
 1154387 1154388 SDY_0559 SDY_0560 ybeB phpB FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 1154388 1154389 SDY_0560 SDY_0561 phpB ybeN TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154389 1154390 SDY_0561 SDY_0562 ybeN holA TRUE 0.839 2.000 0.045 1.000 N NA
 1154390 1154391 SDY_0562 SDY_0563 holA rlpB TRUE 0.938 0.000 0.199 NA N NA
 1154391 1154392 SDY_0563 SDY_0564 rlpB leuS TRUE 0.889 15.000 0.182 NA N NA
 1154393 1154394 SDY_0565 SDY_0566     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1154394 1154395 SDY_0566 SDY_0567   ybeL FALSE 0.352 121.000 0.000 1.000   NA
 1154396 1154397 SDY_0568 SDY_0569 ybeQ insB FALSE 0.034 229.000 0.000 NA   NA
 1154397 1154398 SDY_0569 SDY_0570 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154398 1154399 SDY_0570 SDY_0571 insA   TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1154399 1154400 SDY_0571 SDY_0572     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154400 1154401 SDY_0572 SDY_0573     FALSE 0.003 551.000 0.000 NA   NA
 1154401 1154402 SDY_0573 SDY_0574     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1154402 1154403 SDY_0574 SDY_0575     TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1154403 1154404 SDY_0575 SDY_0576     TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1154404 1154405 SDY_0576 SDY_0577     FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 1154405 1154406 SDY_0577 SDY_0578     FALSE 0.018 273.000 0.000 NA   NA
 1154406 1154407 SDY_0578 SDY_0579     TRUE 0.986 -3.000 1.000 NA   NA
 1154407 1154408 SDY_0579 SDY_0580     FALSE 0.565 207.000 0.667 NA   NA
 1154408 1154409 SDY_0580 SDY_0581     FALSE 0.636 39.000 0.000 NA   NA
 1154409 1154410 SDY_0581 SDY_0582     FALSE 0.352 66.000 0.000 NA   NA
 1154410 1154411 SDY_0582 SDY_0583     FALSE 0.247 -94.000 0.000 NA   NA
 1154411 1154412 SDY_0583 SDY_0584     FALSE 0.552 81.000 0.000 0.041   NA
 1154412 1154413 SDY_0584 SDY_0585     TRUE 0.911 36.000 0.182 NA   NA
 1154414 1154415 SDY_0586 SDY_0587     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1154416 1154417 SDY_0588 SDY_0589 gltK gltJ TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154418 1154419 SDY_0590 SDY_0591     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154420 1154421 SDY_0592 SDY_0593 ybeJ lnt FALSE 0.007 397.000 0.000 1.000 N NA
 1154421 1154422 SDY_0593 SDY_0594 lnt ybeX TRUE 0.977 25.000 0.557 1.000 N NA
 1154422 1154423 SDY_0594 SDY_0595 ybeX ybeY FALSE 0.571 90.000 0.150 NA   NA
 1154423 1154424 SDY_0595 SDY_0596 ybeY ybeZ TRUE 0.968 -3.000 0.457 NA   NA
 1154424 1154425 SDY_0596 SDY_0597 ybeZ yleA TRUE 0.717 114.000 0.220 1.000 N NA
 1154428 1154429 SDY_0600 SDY_0602     FALSE 0.527 49.000 0.000 NA   NA
 1154429 1154431 SDY_0602 SDY_0603     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1154431 1154433 SDY_0603 SDY_0605     TRUE 0.644 35.000 0.000 NA   NA
 1154433 1154434 SDY_0605 SDY_0606     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154434 1154435 SDY_0606 SDY_0607     TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1154435 1154436 SDY_0607 SDY_0608   asnB FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 1154436 1154437 SDY_0608 SDY_0609 asnB nagD FALSE 0.029 257.000 0.000 1.000 N NA
 1154437 1154438 SDY_0609 SDY_0610 nagD nagC TRUE 0.951 48.000 0.070 1.000 Y NA
 1154438 1154439 SDY_0610 SDY_0611 nagC nagA TRUE 0.995 9.000 0.571 1.000 Y NA
 1154439 1154440 SDY_0611 SDY_0612 nagA nagB TRUE 0.990 60.000 0.557 0.001 Y NA
 1154441 1154442 SDY_0613 SDY_0614 nagE glnS FALSE 0.052 203.000 0.006 1.000 N NA
 1154443 1154444 SDY_0615 SDY_0616 insB insA FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1154445 1154446 SDY_0617 SDY_0618     FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1154446 1154447 SDY_0618 SDY_0619   insA FALSE 0.633 51.000 0.000 1.000   NA
 1154447 1154448 SDY_0619 SDY_0620 insA   FALSE 0.004 588.000 0.000 1.000   NA
 1154449 1154450 SDY_0621 SDY_0622     FALSE 0.623 44.000 0.000 NA   NA
 1154450 1154451 SDY_0622 SDY_0623   fur TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1154451 1154452 SDY_0623 SDY_0624 fur fldA FALSE 0.074 289.000 0.156 1.000 N NA
 1154452 1154453 SDY_0624 SDY_0625 fldA ybfE TRUE 0.842 140.000 0.473 1.000   NA
 1154453 1154454 SDY_0625 SDY_0626 ybfE ybfF TRUE 0.806 71.000 0.276 NA   NA
 1154455 1154456 SDY_0627 SDY_0628 seqA pgm TRUE 0.903 26.000 0.151 1.000 N NA
 1154457 1154458 SDY_0629 SDY_0630 kdpE kdpD FALSE 0.175 146.000 0.000 NA   NA
 1154458 1154459 SDY_0630 SDY_0631 kdpD kdpC FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1154459 1154460 SDY_0631 SDY_0632 kdpC kdpB TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1154460 1154461 SDY_0632 SDY_0633 kdpB kdpA TRUE 0.655 23.000 0.000 NA   NA
 1154461 1154462 SDY_0633 SDY_0634 kdpA kdpF TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154463 1154464 SDY_0635 SDY_0636 ybfA rhsC FALSE 0.027 243.000 0.000 NA   NA
 1154466 1154467 SDY_0638 SDY_0639     FALSE 0.299 74.000 0.000 NA   NA
 1154469 1154470 SDY_0641 SDY_0642   ybgA FALSE 0.004 425.000 0.000 NA   NA
 1154470 1154471 SDY_0642 SDY_0643 ybgA phrB FALSE 0.634 -3.000 0.019 NA   NA
 1154473 1154474 SDY_0645 SDY_0646 ybgI ybgJ TRUE 0.759 23.000 0.050 NA   NA
 1154474 1154475 SDY_0646 SDY_0647 ybgJ ybgK TRUE 0.985 -6.000 0.379 NA Y NA
 1154475 1154476 SDY_0647 SDY_0648 ybgK ybgL TRUE 0.864 -10.000 0.211 NA   NA
 1154476 1154477 SDY_0648 SDY_0649 ybgL nei TRUE 0.783 36.000 0.037 1.000   NA
 1154478 1154479 SDY_0650 SDY_0651 abrB ybgO FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1154479 1154480 SDY_0651 SDY_0652 ybgO ybgP TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1154482 1154483 SDY_0654 SDY_0655 ybgQ ybgD FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1154483 1154484 SDY_0655 SDY_0656 ybgD insB FALSE 0.574 26.000 0.000 NA N NA
 1154484 1154485 SDY_0656 SDY_0657 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154485 1154486 SDY_0657 SDY_0658 insA gltA FALSE 0.005 441.000 0.000 1.000 N NA
 1154487 1154488 SDY_0659 SDY_0660 sdhC sdhD TRUE 0.993 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 1154488 1154489 SDY_0660 SDY_0661 sdhD sdhA TRUE 0.998 0.000 0.705 0.003 Y NA
 1154489 1154490 SDY_0661 SDY_0662 sdhA sdhB TRUE 0.996 16.000 0.604 0.003 Y NA
 1154490 1154491 SDY_0662 SDY_0663 sdhB   FALSE 0.420 59.000 0.000 NA   NA
 1154491 1154492 SDY_0663 SDY_0664   sucA FALSE 0.427 -18.000 0.000 NA   NA
 1154492 1154493 SDY_0664 SDY_0665 sucA sucB TRUE 0.994 15.000 0.667 1.000 Y NA
 1154493 1154494 SDY_0665 SDY_0666 sucB sucC TRUE 0.870 94.000 0.136 1.000 Y NA
 1154494 1154495 SDY_0666 SDY_0667 sucC sucD TRUE 0.998 0.000 0.806 0.001 Y NA
 1154495 1154496 SDY_0667 SDY_0668 sucD insA FALSE 0.003 706.000 0.000 1.000 N NA
 1154496 1154497 SDY_0668 SDY_0669 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154497 1154498 SDY_0669 SDY_0670 insB insA TRUE 0.804 78.000 0.000 NA Y NA
 1154498 1154499 SDY_0670 SDY_0671 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154500 1154501 SDY_0672 SDY_0673     TRUE 0.966 4.000 0.333 NA   NA
 1154501 1154502 SDY_0673 SDY_0674     TRUE 0.996 0.000 0.651 1.000 Y NA
 1154502 1154503 SDY_0674 SDY_0675     TRUE 0.963 19.000 0.429 NA   NA
 1154503 1154504 SDY_0675 SDY_0676     TRUE 0.971 0.000 0.367 NA   NA
 1154505 1154506 SDY_0677 SDY_0678     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154508 1154509 SDY_0680 SDY_0681 cydA cydB TRUE 0.966 16.000 0.000 0.042 Y NA
 1154509 1154510 SDY_0681 SDY_0682 cydB ybgT TRUE 0.866 15.000 0.149 NA   NA
 1154510 1154511 SDY_0682 SDY_0683 ybgT ybgE TRUE 0.965 0.000 0.310 NA   NA
 1154511 1154512 SDY_0683 SDY_0684 ybgE ybgC FALSE 0.353 150.000 0.095 NA   NA
 1154512 1154513 SDY_0684 SDY_0685 ybgC tolQ TRUE 0.980 -3.000 0.593 1.000   NA
 1154513 1154514 SDY_0685 SDY_0686 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.060 Y NA
 1154514 1154515 SDY_0686 SDY_0687 tolR tolA FALSE 0.618 65.000 0.114 NA N NA
 1154515 1154516 SDY_0687 SDY_0688 tolA tolB FALSE 0.288 133.000 0.051 NA N NA
 1154516 1154517 SDY_0688 SDY_0689 tolB pal TRUE 0.978 35.000 0.592 1.000 N NA
 1154517 1154518 SDY_0689 SDY_0690 pal ybgF TRUE 0.872 10.000 0.088 1.000   NA
 1154518 1154519 SDY_0690 SDY_0691 ybgF   FALSE 0.131 165.000 0.000 NA   NA
 1154519 1154520 SDY_0691 SDY_0692     FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 1154520 1154521 SDY_0692 SDY_0693     TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1154521 1154522 SDY_0693 SDY_0694   nadA FALSE 0.017 278.000 0.000 NA   NA
 1154522 1154523 SDY_0694 SDY_0695 nadA pnuC TRUE 0.957 38.000 0.023 1.000 Y NA
 1154524 1154525 SDY_0696 SDY_0697 ybgR   FALSE 0.457 114.000 0.057 1.000   NA
 1154525 1154526 SDY_0697 SDY_0698     FALSE 0.252 86.000 0.000 NA   NA
 1154527 1154528 SDY_0699 SDY_0700     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154528 1154529 SDY_0700 SDY_0701   aroG FALSE 0.239 130.000 0.000 NA   NA
 1154530 1154531 SDY_0702 SDY_0703 gpmA galM FALSE 0.380 205.000 0.009 1.000 Y NA
 1154531 1154532 SDY_0703 SDY_0704 galM galK TRUE 0.975 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 1154532 1154533 SDY_0704 SDY_0705 galK galT TRUE 0.984 4.000 0.370 0.001 N NA
 1154533 1154534 SDY_0705 SDY_0706 galT galE TRUE 0.910 10.000 0.053 0.001 N NA
 1154534 1154535 SDY_0706 SDY_0707 galE modF FALSE 0.033 262.000 0.023 1.000   NA
 1154535 1154536 SDY_0707 SDY_0708 modF modE FALSE 0.580 68.000 0.009 0.078   NA
 1154537 1154538 SDY_0709 SDY_0710   modA FALSE 0.243 167.000 0.072 NA   NA
 1154538 1154539 SDY_0710 SDY_0711 modA modB TRUE 0.998 0.000 0.627 0.001 Y NA
 1154539 1154540 SDY_0711 SDY_0712 modB modC TRUE 0.997 3.000 0.537 0.001 Y NA
 1154541 1154542 SDY_0713 SDY_0714 ybhA   FALSE 0.002 736.000 0.000 NA   NA
 1154542 1154543 SDY_0714 SDY_0715     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154543 1154544 SDY_0715 SDY_0716     TRUE 0.825 71.000 0.000 NA Y NA
 1154546 1154547 SDY_0718 SDY_0719     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154547 1154548 SDY_0719 SDY_0720     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1154548 1154549 SDY_0720 SDY_0721     TRUE 0.935 57.000 0.500 NA   NA
 1154549 1154550 SDY_0721 SDY_0722     TRUE 0.962 45.000 0.500 NA   NA
 1154551 1154552 SDY_0723 SDY_0724     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154552 1154553 SDY_0724 SDY_0725     FALSE 0.001 1431.000 0.000 NA   NA
 1154553 1154554 SDY_0725 SDY_0726     TRUE 0.926 -76.000 1.000 NA   NA
 1154555 1154556 SDY_0727 SDY_0728     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154556 1154557 SDY_0728 SDY_0729     TRUE 0.735 97.000 0.000 NA Y NA
 1154557 1154558 SDY_0729 SDY_0730     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154559 1154560 SDY_0731 SDY_0732     FALSE 0.256 -72.000 0.000 NA   NA
 1154560 1154561 SDY_0732 SDY_0733     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154561 1154562 SDY_0733 SDY_0734   insA FALSE 0.511 51.000 0.000 NA   NA
 1154562 1154563 SDY_0734 SDY_0735 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154564 1154565 SDY_0736 SDY_0737 ybjF ybjO TRUE 0.929 41.000 0.226 NA   NA
 1154565 1154566 SDY_0737 SDY_0738 ybjO potI TRUE 0.855 61.000 0.264 NA   NA
 1154566 1154567 SDY_0738 SDY_0739 potI potH TRUE 0.995 -3.000 0.528 0.047 Y NA
 1154567 1154568 SDY_0739 SDY_0740 potH potG TRUE 0.996 10.000 0.857 1.000 Y NA
 1154568 1154569 SDY_0740 SDY_0741 potG potF TRUE 0.968 95.000 0.679 1.000 Y NA
 1154569 1154570 SDY_0741 SDY_0742 potF ybjN FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 1154570 1154571 SDY_0742 SDY_0743 ybjN rimK FALSE 0.397 88.000 0.065 NA   NA
 1154571 1154572 SDY_0743 SDY_0744 rimK mdaA FALSE 0.465 61.000 0.000 1.000 N NA
 1154572 1154573 SDY_0744 SDY_0745 mdaA ybjC TRUE 0.783 -16.000 0.159 NA   NA
 1154576 1154577 SDY_0748 SDY_0749     FALSE 0.017 333.000 0.000 1.000   NA
 1154579 1154580 SDY_0751 SDY_0752     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154581 1154582 SDY_0753 SDY_0754 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154582 1154583 SDY_0754 SDY_0755 insA   FALSE 0.276 93.000 0.000 1.000 N NA
 1154583 1154584 SDY_0755 SDY_0756     TRUE 0.998 3.000 0.689 0.047 Y NA
 1154584 1154585 SDY_0756 SDY_0757     TRUE 0.996 18.000 0.803 0.047 Y NA
 1154585 1154586 SDY_0757 SDY_0758     TRUE 0.857 20.000 0.083 1.000   NA
 1154586 1154587 SDY_0758 SDY_0759   ybiK TRUE 0.877 20.000 0.104 1.000   NA
 1154588 1154589 SDY_0760 SDY_0761 moeA moeB TRUE 0.995 0.000 0.323 0.003 Y NA
 1154591 1154592 SDY_0763 SDY_0764 ybiY ybiW TRUE 0.977 6.000 0.316 0.003 N NA
 1154592 1154593 SDY_0764 SDY_0765 ybiW   FALSE 0.258 146.000 0.000 1.000   NA
 1154594 1154595 SDY_0766 SDY_0767     FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 1154597 1154598 SDY_0769 SDY_0770     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154599 1154600 SDY_0771 SDY_0772     FALSE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 1154600 1154601 SDY_0772 SDY_0773     FALSE 0.013 301.000 0.000 NA   NA
 1154601 1154602 SDY_0773 SDY_0774     FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1154602 1154603 SDY_0774 SDY_0775   ybiU FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 1154606 1154607 SDY_0778 SDY_0779 ybiR   FALSE 0.176 151.000 0.014 1.000 N NA
 1154610 1154611 SDY_0782 SDY_0783 ybiF dps FALSE 0.014 299.000 0.000 NA   NA
 1154613 1154614 SDY_0785 SDY_0786 glnH glnP TRUE 0.855 139.000 0.051 0.059 Y NA
 1154614 1154615 SDY_0786 SDY_0787 glnP glnQ TRUE 0.963 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1154615 1154616 SDY_0787 SDY_0788 glnQ ybiO FALSE 0.244 117.000 0.000 NA   NA
 1154617 1154618 SDY_0789 SDY_0790   ybiN FALSE 0.002 1232.000 0.000 NA   NA
 1154619 1154620 SDY_0791 SDY_0792 ybiM   FALSE 0.020 265.000 0.000 NA   NA
 1154620 1154621 SDY_0792 SDY_0793     FALSE 0.636 39.000 0.000 NA   NA
 1154621 1154622 SDY_0793 SDY_0794     FALSE 0.082 174.000 0.000 NA N NA
 1154622 1154623 SDY_0794 SDY_0795   ybiX TRUE 0.915 42.000 0.171 1.000   NA
 1154623 1154624 SDY_0795 SDY_0796 ybiX ybiI FALSE 0.412 74.000 0.000 1.000   NA
 1154624 1154625 SDY_0796 SDY_0797 ybiI ybiJ FALSE 0.021 266.000 0.027 NA   NA
 1154626 1154627 SDY_0798 SDY_0799 ybiC ybiB FALSE 0.423 141.000 0.000 0.039 N NA
 1154627 1154628 SDY_0799 SDY_0800 ybiB dinG TRUE 0.766 28.000 0.041 1.000 N NA
 1154628 1154629 SDY_0800 SDY_0801 dinG   FALSE 0.050 397.000 0.000 NA Y NA
 1154630 1154631 SDY_0802 SDY_0803     FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1154635 1154636 SDY_0807 SDY_0808 ybiH   TRUE 0.959 0.000 0.236 1.000 N NA
 1154636 1154637 SDY_0808 SDY_0809   ybhF TRUE 0.939 -22.000 0.545 1.000   NA
 1154637 1154638 SDY_0809 SDY_0810 ybhF ybhS TRUE 0.972 -7.000 0.547 0.078   NA
 1154638 1154639 SDY_0810 SDY_0811 ybhS ybhR TRUE 0.996 11.000 0.609 0.005 Y NA
 1154641 1154642 SDY_0813 SDY_0814 ybhP ybhO TRUE 0.956 -3.000 0.333 NA   NA
 1154642 1154643 SDY_0814 SDY_0815 ybhO ybhN TRUE 0.853 0.000 0.071 NA   NA
 1154644 1154645 SDY_0816 SDY_0817   ybhL FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1154645 1154646 SDY_0817 SDY_0818 ybhL   FALSE 0.235 112.000 0.000 NA   NA
 1154647 1154648 SDY_0819 SDY_0820     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154649 1154650 SDY_0821 SDY_0822 moaE moaD TRUE 0.997 2.000 0.501 0.003 Y NA
 1154650 1154651 SDY_0822 SDY_0823 moaD moaC TRUE 0.980 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 1154651 1154652 SDY_0823 SDY_0824 moaC moaB TRUE 0.989 3.000 0.109 0.003 Y NA
 1154652 1154653 SDY_0824 SDY_0825 moaB moaA TRUE 0.984 22.000 0.108 0.003 Y NA
 1154655 1154656 SDY_0827 SDY_0828 uvrB bioD FALSE 0.007 579.000 0.000 0.077 N NA
 1154656 1154657 SDY_0828 SDY_0829 bioD bioC TRUE 0.966 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 1154657 1154658 SDY_0829 SDY_0830 bioC bioF TRUE 0.969 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 1154658 1154659 SDY_0830 SDY_0831 bioF bioB TRUE 0.988 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 1154660 1154661 SDY_0832 SDY_0833 bioA ybhB FALSE 0.317 59.000 0.003 NA   NA
 1154661 1154662 SDY_0833 SDY_0834 ybhB ipaH_1 FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 1154662 1154663 SDY_0834 SDY_0835 ipaH_1   FALSE 0.011 325.000 0.000 NA   NA
 1154663 1154664 SDY_0835 SDY_0836     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154664 1154665 SDY_0836 SDY_0837     TRUE 0.725 12.000 0.000 1.000   NA
 1154666 1154667 SDY_0838 SDY_0839 yliJ   FALSE 0.023 230.000 0.000 NA N NA
 1154668 1154669 SDY_0840 SDY_0841   dacC FALSE 0.244 -97.000 0.000 NA   NA
 1154670 1154671 SDY_0842 SDY_0843 deoR ybjG TRUE 0.882 58.000 0.235 1.000   NA
 1154672 1154673 SDY_0844 SDY_0845 cmr   FALSE 0.012 313.000 0.000 NA   NA
 1154673 1154674 SDY_0845 SDY_0846     TRUE 0.989 45.000 0.500 NA Y NA
 1154674 1154675 SDY_0846 SDY_0847     FALSE 0.094 387.000 0.000 0.040 Y NA
 1154675 1154676 SDY_0847 SDY_0848     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154678 1154679 SDY_0849 SDY_0850     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154679 1154680 SDY_0850 SDY_0852   yfaSR FALSE 0.002 1343.000 0.000 1.000   NA
 1154680 1154681 SDY_0852 SDY_0853 yfaSR   TRUE 0.941 1.000 0.182 NA   NA
 1154681 1154682 SDY_0853 SDY_0854     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1154682 1154683 SDY_0854 SDY_0855     FALSE 0.552 -6.000 0.000 NA   NA
 1154683 1154684 SDY_0855 SDY_0856   rcsC FALSE 0.017 275.000 0.000 NA   NA
 1154685 1154686 SDY_0857 SDY_0858 rcsB yojN TRUE 0.993 17.000 0.558 1.000 Y NA
 1154686 1154687 SDY_0858 SDY_0859 yojN   FALSE 0.003 437.000 0.000 NA N NA
 1154688 1154689 SDY_0860 SDY_0861   ompC FALSE 0.021 259.000 0.000 NA   NA
 1154689 1154690 SDY_0861 SDY_0862 ompC yojL FALSE 0.432 112.000 0.066 1.000 N NA
 1154690 1154691 SDY_0862 SDY_0863 yojL ada FALSE 0.342 74.000 0.019 1.000 N NA
 1154691 1154692 SDY_0863 SDY_0864 ada alkB TRUE 0.885 0.000 0.015 0.012 N NA
 1154692 1154693 SDY_0864 SDY_0865 alkB yojI FALSE 0.528 76.000 0.076 1.000 N NA
 1154693 1154694 SDY_0865 SDY_0866 yojI yojH FALSE 0.063 218.000 0.000 1.000   NA
 1154695 1154696 SDY_0869 SDY_0867 eco   FALSE 0.212 -1096.000 0.000 NA   NA
 1154696 1154697 SDY_0867 SDY_0868     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154698 1154699 SDY_0870 SDY_0871 napF napD TRUE 0.885 -10.000 0.209 1.000   NA
 1154699 1154700 SDY_0871 SDY_0872 napD napA TRUE 0.991 -3.000 0.875 0.004 N NA
 1154700 1154701 SDY_0872 SDY_0873 napA napG TRUE 0.972 7.000 0.243 0.004   NA
 1154701 1154702 SDY_0873 SDY_0874 napG napH TRUE 0.978 -13.000 0.795 0.004   NA
 1154702 1154703 SDY_0874 SDY_0875 napH napB TRUE 0.993 -3.000 0.316 0.004 Y NA
 1154703 1154704 SDY_0875 SDY_0876 napB napC TRUE 0.995 10.000 0.490 0.002 Y NA
 1154704 1154705 SDY_0876 SDY_0877 napC ccmA TRUE 0.754 19.000 0.043 1.000 N NA
 1154705 1154706 SDY_0877 SDY_0878 ccmA ccmB TRUE 0.996 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 1154706 1154707 SDY_0878 SDY_0879 ccmB ccmC TRUE 0.995 42.000 0.501 0.001 Y NA
 1154707 1154708 SDY_0879 SDY_0880 ccmC ccmD TRUE 0.974 -3.000 0.501 1.000 N NA
 1154708 1154709 SDY_0880 SDY_0881 ccmD ccmE TRUE 0.961 -3.000 0.344 1.000 N NA
 1154709 1154710 SDY_0881 SDY_0882 ccmE ccmF TRUE 0.991 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 1154710 1154711 SDY_0882 SDY_0883 ccmF dsbE TRUE 0.997 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 1154711 1154712 SDY_0883 SDY_0884 dsbE ccmH TRUE 0.994 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 1154713 1154714 SDY_0885 SDY_0886 narP   FALSE 0.002 629.000 0.000 NA N NA
 1154714 1154715 SDY_0886 SDY_0887   insB FALSE 0.002 657.000 0.000 NA   NA
 1154715 1154716 SDY_0887 SDY_0888 insB insA FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1154718 1154719 SDY_0890 SDY_0891   yejM FALSE 0.295 75.000 0.000 NA   NA
 1154719 1154720 SDY_0891 SDY_0892 yejM yejL TRUE 0.709 20.000 0.040 NA   NA
 1154722 1154723 SDY_0894 SDY_0895 rplY yejH FALSE 0.515 125.000 0.024 0.012 N NA
 1154724 1154725 SDY_0896 SDY_0897 rsuA bcr TRUE 0.754 28.000 0.036 1.000 N NA
 1154725 1154726 SDY_0897 SDY_0898 bcr yejG FALSE 0.010 333.000 0.000 NA   NA
 1154727 1154728 SDY_0899 SDY_0900 yejF yejE TRUE 0.989 2.000 0.758 1.000   NA
 1154728 1154729 SDY_0900 SDY_0901 yejE yejB TRUE 0.993 0.000 0.833 0.046   NA
 1154729 1154730 SDY_0901 SDY_0902 yejB yejA TRUE 0.993 1.000 0.848 0.046   NA
 1154730 1154731 SDY_0902 SDY_0903 yejA rtn TRUE 0.819 82.000 0.394 NA N NA
 1154731 1154732 SDY_0903 SDY_0904 rtn spr FALSE 0.408 181.000 0.219 NA N NA
 1154732 1154733 SDY_0904 SDY_0905 spr   FALSE 0.003 412.000 0.000 NA N NA
 1154733 1154734 SDY_0905 SDY_0906   yeiR TRUE 0.960 3.000 0.275 NA   NA
 1154734 1154735 SDY_0906 SDY_0907 yeiR yeiQ FALSE 0.368 175.000 0.167 NA   NA
 1154735 1154736 SDY_0907 SDY_0908 yeiQ yeiP FALSE 0.047 223.000 0.000 1.000 N NA
 1154736 1154737 SDY_0908 SDY_0909 yeiP yeiO FALSE 0.006 406.000 0.000 1.000 N NA
 1154737 1154738 SDY_0909 SDY_0910 yeiO   FALSE 0.213 140.000 0.000 NA   NA
 1154739 1154740 SDY_0911 SDY_0912     TRUE 0.647 49.000 0.000 1.000   NA
 1154740 1154741 SDY_0912 SDY_0913     FALSE 0.003 574.000 0.000 NA   NA
 1154741 1154742 SDY_0913 SDY_0914     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1154742 1154743 SDY_0914 SDY_0915     TRUE 0.971 44.000 0.000 0.003 Y NA
 1154743 1154744 SDY_0915 SDY_0916     TRUE 0.987 -40.000 0.667 0.003 Y NA
 1154744 1154745 SDY_0916 SDY_0917   ycbF TRUE 0.975 -34.000 0.500 1.000 Y NA
 1154745 1154746 SDY_0917 SDY_0918 ycbF pyrD FALSE 0.283 111.000 0.000 1.000 N NA
 1154746 1154747 SDY_0918 SDY_0919 pyrD ycbW FALSE 0.409 138.000 0.081 NA   NA
 1154749 1154750 SDY_0921 SDY_0922 ycbY uup TRUE 0.816 12.000 0.061 1.000   NA
 1154750 1154751 SDY_0922 SDY_0923 uup pqiA FALSE 0.360 130.000 0.054 NA   NA
 1154751 1154752 SDY_0923 SDY_0924 pqiA pqiB TRUE 0.986 5.000 0.819 NA   NA
 1154752 1154753 SDY_0924 SDY_0925 pqiB ymbA TRUE 0.969 12.000 0.531 NA   NA
 1154753 1154754 SDY_0925 SDY_0926 ymbA rmf FALSE 0.023 256.000 0.000 NA   NA
 1154755 1154756 SDY_0927 SDY_0928 fabA   FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1154758 1154759 SDY_0930 SDY_0933 ompA sulA FALSE 0.007 358.000 0.000 NA   NA
 1154760 1154761 SDY_0931 SDY_0932     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154761 1154762 SDY_0932 SDY_0934     FALSE 0.003 471.000 0.000 NA N NA
 1154763 1154764 SDY_0935 SDY_0936   yccF TRUE 0.839 10.000 0.090 NA   NA
 1154766 1154767 SDY_0938 SDY_0939 mgsA   FALSE 0.327 96.000 0.055 NA   NA
 1154769 1154770 SDY_0941 SDY_0942 yccV yccW TRUE 0.859 7.000 0.094 NA   NA
 1154772 1154773 SDY_0944 SDY_0945 yccK yccA FALSE 0.611 91.000 0.140 1.000   NA
 1154773 1154774 SDY_0945 SDY_0946 yccA   FALSE 0.043 212.000 0.000 NA   NA
 1154775 1154776 SDY_0947 SDY_0948 hyaA hyaB TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1154776 1154777 SDY_0948 SDY_0949 hyaB hyaC TRUE 0.959 92.000 0.355 0.042 Y NA
 1154777 1154778 SDY_0949 SDY_0950 hyaC hyaD TRUE 0.982 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 1154778 1154779 SDY_0950 SDY_0951 hyaD hyaE TRUE 0.844 -3.000 0.096 NA   NA
 1154779 1154780 SDY_0951 SDY_0952 hyaE hyaF TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154780 1154781 SDY_0952 SDY_0953 hyaF appC FALSE 0.139 161.000 0.000 NA   NA
 1154781 1154782 SDY_0953 SDY_0954 appC appB TRUE 0.983 12.000 0.158 0.042 Y NA
 1154782 1154783 SDY_0954 SDY_0955 appB yccB TRUE 0.823 13.000 0.105 NA   NA
 1154783 1154784 SDY_0955 SDY_0956 yccB appA FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1154785 1154786 SDY_0957 SDY_0958 yccC etp TRUE 0.986 20.000 1.000 1.000 N NA
 1154786 1154787 SDY_0958 SDY_0959 etp yccZ TRUE 0.964 -12.000 0.750 1.000 N NA
 1154787 1154788 SDY_0959 SDY_0960 yccZ ymcA FALSE 0.543 46.000 0.000 NA   NA
 1154788 1154789 SDY_0960 SDY_0961 ymcA ymcB TRUE 0.836 0.000 0.060 NA   NA
 1154789 1154790 SDY_0961 SDY_0962 ymcB ymcC TRUE 0.977 -3.000 0.600 NA   NA
 1154790 1154791 SDY_0962 SDY_0963 ymcC ymcD FALSE 0.219 107.000 0.000 NA   NA
 1154791 1154792 SDY_0963 SDY_0964 ymcD cspH FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 1154792 1154793 SDY_0964 SDY_0965 cspH   FALSE 0.012 277.000 0.000 NA N NA
 1154793 1154794 SDY_0965 SDY_0966   yccM FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1154794 1154795 SDY_0966 SDY_0967 yccM torS FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 1154798 1154799 SDY_0970 SDY_0971 torC torA TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154799 1154800 SDY_0971 SDY_0972 torA torD FALSE 0.334 68.000 0.000 NA   NA
 1154801 1154802 SDY_0973 SDY_0974 yccD cbpA TRUE 0.980 0.000 0.512 NA   NA
 1154805 1154806 SDY_0977 SDY_0978   agp FALSE 0.002 665.000 0.000 NA   NA
 1154807 1154808 SDY_0979 SDY_0980 yccJ wrbA TRUE 0.947 21.000 0.290 NA   NA
 1154808 1154809 SDY_0980 SDY_0981 wrbA ycdG FALSE 0.004 629.000 0.000 1.000   NA
 1154809 1154810 SDY_0981 SDY_0982 ycdG   TRUE 0.898 -45.000 0.533 1.000   NA
 1154810 1154811 SDY_0982 SDY_0983     TRUE 0.979 47.000 0.625 0.023   NA
 1154811 1154812 SDY_0983 SDY_0984     TRUE 0.952 10.000 0.256 1.000   NA
 1154812 1154813 SDY_0984 SDY_0985     TRUE 0.964 8.000 0.365 NA   NA
 1154813 1154814 SDY_0985 SDY_0986     FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1154814 1154815 SDY_0986 SDY_0987     FALSE 0.300 -42.000 0.000 NA   NA
 1154819 1154820 SDY_0991 SDY_0992     FALSE 0.002 736.000 0.000 NA   NA
 1154821 1154822 SDY_0993 SDY_0994 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154824 1154825 SDY_0996 SDY_0997 csgD csgE TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1154825 1154826 SDY_0997 SDY_0998 csgE csgF TRUE 0.982 25.000 0.723 NA   NA
 1154826 1154827 SDY_0998 SDY_0999 csgF csgG TRUE 0.732 27.000 0.043 NA   NA
 1154827 1154828 SDY_0999 SDY_1000 csgG   FALSE 0.004 391.000 0.000 NA N NA
 1154829 1154830 SDY_1001 SDY_1002 ycdZ ycdY TRUE 0.796 54.000 0.145 NA   NA
 1154830 1154831 SDY_1002 SDY_1003 ycdY ycdX TRUE 0.971 24.000 0.417 1.000   NA
 1154831 1154832 SDY_1003 SDY_1004 ycdX ycdW TRUE 0.961 55.000 0.169 1.000 Y NA
 1154834 1154835 SDY_1006 SDY_1007     FALSE 0.210 97.000 0.000 NA   NA
 1154835 1154836 SDY_1007 SDY_1008     FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1154836 1154837 SDY_1008 SDY_1009   yeeV TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154837 1154838 SDY_1009 SDY_1010 yeeV yeeU FALSE 0.538 47.000 0.000 NA   NA
 1154838 1154839 SDY_1010 SDY_1011 yeeU   FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1154839 1154840 SDY_1011 SDY_1012   yeeT TRUE 0.978 19.000 0.667 NA   NA
 1154840 1154841 SDY_1012 SDY_1013 yeeT   FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1154841 1154842 SDY_1013 SDY_1014     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1154842 1154843 SDY_1014 SDY_1015     FALSE 0.047 208.000 0.000 NA   NA
 1154843 1154844 SDY_1015 SDY_1016     FALSE 0.005 394.000 0.000 NA   NA
 1154844 1154845 SDY_1016 SDY_1017     FALSE 0.002 651.000 0.000 NA   NA
 1154847 1154848 SDY_1019 SDY_1020     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154848 1154849 SDY_1020 SDY_1021     FALSE 0.020 712.000 0.000 NA Y NA
 1154851 1154852 SDY_1023 SDY_1024 iroE iroD FALSE 0.411 85.000 0.065 NA   NA
 1154852 1154853 SDY_1024 SDY_1025 iroD iroC TRUE 0.865 104.000 0.667 NA N NA
 1154853 1154854 SDY_1025 SDY_1026 iroC iroB FALSE 0.263 140.000 0.000 1.000 N NA
 1154856 1154857 SDY_1028 SDY_1029     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154857 1154858 SDY_1029 SDY_1030     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1154858 1154859 SDY_1030 SDY_1031     FALSE 0.023 633.000 0.000 NA Y NA
 1154861 1154862 SDY_1033 SDY_1034     FALSE 0.036 257.000 0.000 1.000   NA
 1154862 1154863 SDY_1034 SDY_1035     TRUE 0.993 1.000 0.790 0.041   NA
 1154863 1154864 SDY_1035 SDY_1036     FALSE 0.035 226.000 0.000 NA   NA
 1154869 1154870 SDY_1041 SDY_1042     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154870 1154871 SDY_1042 SDY_1043     TRUE 0.775 40.000 0.062 NA   NA
 1154871 1154872 SDY_1043 SDY_1044   yedJ TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1154872 1154873 SDY_1044 SDY_1045 yedJ dcm FALSE 0.342 67.000 0.000 NA   NA
 1154873 1154874 SDY_1045 SDY_1046 dcm vsr TRUE 0.899 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 1154876 1154877 SDY_1048 SDY_1049 yedI   FALSE 0.289 79.000 0.025 NA   NA
 1154877 1154878 SDY_1049 SDY_1050     FALSE 0.349 189.000 0.208 NA   NA
 1154879 1154880 SDY_1051 SDY_1052     FALSE 0.014 298.000 0.000 NA   NA
 1154881 1154882 SDY_1053 SDY_1054 dsrB   FALSE 0.002 639.000 0.000 NA   NA
 1154883 1154884 SDY_1055 SDY_1056 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154884 1154885 SDY_1056 SDY_1057 insA   FALSE 0.097 334.000 0.000 NA Y NA
 1154886 1154887 SDY_1058 SDY_1059     FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1154887 1154888 SDY_1059 SDY_1060     FALSE 0.002 1057.000 0.000 NA   NA
 1154888 1154889 SDY_1060 SDY_1061     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 1154889 1154890 SDY_1061 SDY_1062   ipaH_3 FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 1154891 1154892 SDY_1063 SDY_1064     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154892 1154893 SDY_1064 SDY_1065     FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 1154893 1154894 SDY_1065 SDY_1066     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154894 1154895 SDY_1066 SDY_1067     FALSE 0.409 60.000 0.000 NA   NA
 1154896 1154897 SDY_1068 SDY_1069     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154898 1154899 SDY_1070 SDY_1071     FALSE 0.004 472.000 0.000 NA   NA
 1154900 1154901 SDY_1072 SDY_1073     FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1154901 1154902 SDY_1073 SDY_1074     FALSE 0.016 286.000 0.000 NA   NA
 1154902 1154903 SDY_1074 SDY_1075     FALSE 0.231 111.000 0.000 NA   NA
 1154903 1154904 SDY_1075 SDY_1076     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154904 1154905 SDY_1076 SDY_1077     FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 1154906 1154907 SDY_1078 SDY_1079     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154907 1154908 SDY_1079 SDY_1080     FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 1154908 1154909 SDY_1080 SDY_1081     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154911 1154912 SDY_1083 SDY_1084   yedK FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 1154912 1154913 SDY_1084 SDY_1085 yedK yedF FALSE 0.225 109.000 0.000 NA   NA
 1154913 1154914 SDY_1085 SDY_1086 yedF yedE TRUE 0.984 -3.000 0.844 NA   NA
 1154916 1154917 SDY_1088 SDY_1089 amyA fliT FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1154917 1154918 SDY_1089 SDY_1090 fliT fliS TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154918 1154919 SDY_1090 SDY_1091 fliS fliD TRUE 0.993 25.000 0.284 0.001 Y NA
 1154921 1154922 SDY_1093 SDY_1094 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154923 1154924 SDY_1095 SDY_1096 fliA fliZ TRUE 0.888 10.000 0.108 1.000   NA
 1154924 1154925 SDY_1096 SDY_1097 fliZ fliY TRUE 0.785 88.000 0.280 1.000   NA
 1154925 1154926 SDY_1097 SDY_1098 fliY yedO TRUE 0.951 105.000 0.469 1.000 Y NA
 1154926 1154927 SDY_1098 SDY_1099 yedO yecS TRUE 0.957 15.000 0.050 1.000 Y NA
 1154927 1154928 SDY_1099 SDY_1100 yecS yecC TRUE 0.979 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 1154928 1154929 SDY_1100 SDY_1101 yecC sdiA FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1154929 1154930 SDY_1101 SDY_1102 sdiA   FALSE 0.233 -584.000 0.000 NA   NA
 1154932 1154933 SDY_1104 SDY_1105 uvrY uvrC TRUE 0.851 -3.000 0.086 1.000 N NA
 1154933 1154934 SDY_1105 SDY_1106 uvrC pgsA FALSE 0.568 164.000 0.227 1.000 N NA
 1154934 1154935 SDY_1106 SDY_1107 pgsA   FALSE 0.155 152.000 0.000 NA   NA
 1154935 1154936 SDY_1107 SDY_1108     FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1154936 1154937 SDY_1108 SDY_1109     FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1154937 1154938 SDY_1109 SDY_1110   yecA FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 1154941 1154942 SDY_1113 SDY_1114 ftn   FALSE 0.117 171.000 0.000 NA   NA
 1154942 1154943 SDY_1114 SDY_1115     FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 1154945 1154946 SDY_1117 SDY_1119     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 1154947 1154948 SDY_1118 SDY_1120   araF FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1154948 1154949 SDY_1120 SDY_1121 araF araG TRUE 0.990 70.000 0.917 0.002 Y NA
 1154949 1154950 SDY_1121 SDY_1122 araG araH TRUE 0.994 12.000 0.451 0.002 Y NA
 1154950 1154951 SDY_1122 SDY_1123 araH   FALSE 0.002 544.000 0.000 NA N NA
 1154951 1154952 SDY_1123 SDY_1124     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154953 1154954 SDY_1125 SDY_1126     TRUE 0.976 13.000 0.704 NA   NA
 1154954 1154955 SDY_1126 SDY_1127     FALSE 0.568 209.000 0.613 1.000   NA
 1154956 1154957 SDY_1128 SDY_1129 holE   TRUE 0.706 102.000 0.222 1.000   NA
 1154957 1154958 SDY_1129 SDY_1130     TRUE 0.976 24.000 0.500 1.000   NA
 1154959 1154960 SDY_1131 SDY_1132 ptrB yebE FALSE 0.117 209.000 0.092 NA   NA
 1154960 1154961 SDY_1132 SDY_1133 yebE yebF FALSE 0.013 324.000 0.028 NA   NA
 1154961 1154962 SDY_1133 SDY_1134 yebF yebG FALSE 0.488 55.000 0.027 NA   NA
 1154964 1154965 SDY_1136 SDY_1137 eda edd TRUE 0.993 37.000 0.523 1.000 Y NA
 1154965 1154966 SDY_1137 SDY_1138 edd zwf FALSE 0.305 235.000 0.041 1.000 Y NA
 1154967 1154968 SDY_1139 SDY_1140     TRUE 0.755 30.000 0.024 1.000   NA
 1154968 1154969 SDY_1140 SDY_1141   pykA FALSE 0.498 128.000 0.071 1.000   NA
 1154970 1154971 SDY_1142 SDY_1143 msbB yebA TRUE 0.939 120.000 0.299 1.000 Y NA
 1154971 1154972 SDY_1143 SDY_1144 yebA znuA TRUE 0.870 16.000 0.131 1.000 N NA
 1154973 1154974 SDY_1145 SDY_1146 yebM yebI TRUE 0.997 -3.000 0.755 0.075 Y NA
 1154975 1154976 SDY_1147 SDY_1148 ruvB ruvA TRUE 0.996 9.000 0.549 0.001 Y NA
 1154978 1154979 SDY_1150 SDY_1151 ruvC yebC TRUE 0.944 35.000 0.277 NA   NA
 1154979 1154980 SDY_1151 SDY_1152 yebC ntpA TRUE 0.702 29.000 0.035 NA   NA
 1154980 1154981 SDY_1152 SDY_1153 ntpA aspS FALSE 0.398 118.000 0.050 1.000 N NA
 1154982 1154983 SDY_1154 SDY_1155     FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1154983 1154984 SDY_1155 SDY_1156   insA FALSE 0.003 503.000 0.000 NA   NA
 1154984 1154985 SDY_1156 SDY_1157 insA insB TRUE 0.951 22.000 0.000 NA Y NA
 1154985 1154986 SDY_1157 SDY_1158 insB   FALSE 0.016 1102.000 0.000 NA Y NA
 1154986 1154987 SDY_1158 SDY_1159     TRUE 0.971 27.000 0.500 NA   NA
 1154987 1154988 SDY_1159 SDY_1160     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154989 1154990 SDY_1161 SDY_1162 insB   TRUE 0.893 -15.000 0.000 NA Y NA
 1154990 1154991 SDY_1162 SDY_1163     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154991 1154992 SDY_1163 SDY_1164   insA TRUE 0.751 93.000 0.000 NA Y NA
 1154992 1154993 SDY_1164 SDY_1165 insA   FALSE 0.071 361.000 0.000 NA Y NA
 1154993 1154994 SDY_1165 SDY_1166     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1154995 1154996 SDY_1167 SDY_1168   yecN TRUE 0.781 53.000 0.126 NA   NA
 1154996 1154997 SDY_1168 SDY_1169 yecN yecO TRUE 0.822 41.000 0.089 NA   NA
 1154997 1154998 SDY_1169 SDY_1170 yecO yecP TRUE 0.952 -3.000 0.315 NA   NA
 1154999 1155000 SDY_1171 SDY_1175 bisZ yecK TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1155000 1155001 SDY_1175 SDY_1172 yecK   FALSE 0.225 -721.000 0.000 NA   NA
 1155001 1155002 SDY_1172 SDY_1173     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155002 1155003 SDY_1173 SDY_1174     FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 1155003 1155004 SDY_1174 SDY_1176     FALSE 0.017 906.000 0.000 NA Y NA
 1155006 1155007 SDY_1178 SDY_1179 cutC yecM TRUE 0.735 14.000 0.057 NA   NA
 1155008 1155009 SDY_1180 SDY_1181 argS insA FALSE 0.039 235.000 0.000 1.000 N NA
 1155009 1155010 SDY_1181 SDY_1182 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155011 1155012 SDY_1183 SDY_1184 flhE flhA TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155012 1155013 SDY_1184 SDY_1185 flhA   FALSE 0.420 59.000 0.000 NA   NA
 1155014 1155015 SDY_1186 SDY_1187     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155016 1155017 SDY_1188 SDY_1189 motB motA TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155017 1155018 SDY_1189 SDY_1190 motA flhC TRUE 0.849 126.000 0.408 1.000   NA
 1155018 1155019 SDY_1190 SDY_1191 flhC flhD TRUE 0.924 3.000 0.000 0.001   NA
 1155021 1155022 SDY_1193 SDY_1194 otsA otsB FALSE 0.377 -25.000 0.000 NA   NA
 1155022 1155023 SDY_1194 SDY_1195 otsB   FALSE 0.552 -6.000 0.000 NA   NA
 1155023 1155024 SDY_1195 SDY_1196     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1155024 1155025 SDY_1196 SDY_1197     TRUE 0.859 -27.000 0.000 NA Y NA
 1155025 1155026 SDY_1197 SDY_1198     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155027 1155028 SDY_1199 SDY_1200 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155028 1155029 SDY_1200 SDY_1201 insB   FALSE 0.017 847.000 0.000 NA Y NA
 1155029 1155030 SDY_1201 SDY_1202     FALSE 0.005 393.000 0.000 NA   NA
 1155033 1155034 SDY_1205 SDY_1206 minE minD TRUE 0.995 4.000 0.618 NA Y NA
 1155034 1155035 SDY_1206 SDY_1207 minD minC TRUE 0.993 24.000 0.466 1.000 Y NA
 1155035 1155036 SDY_1207 SDY_1208 minC   FALSE 0.002 640.000 0.000 NA N NA
 1155039 1155040 SDY_1211 SDY_1212 ycgL   FALSE 0.451 72.000 0.056 NA   NA
 1155040 1155041 SDY_1212 SDY_1213   ycgN FALSE 0.440 92.000 0.088 NA   NA
 1155041 1155042 SDY_1213 SDY_1214 ycgN insA FALSE 0.260 83.000 0.000 NA   NA
 1155042 1155043 SDY_1214 SDY_1215 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155043 1155044 SDY_1215 SDY_1216 insB   FALSE 0.030 530.000 0.000 NA Y NA
 1155048 1155049 SDY_1220 SDY_1221 umuD umuC TRUE 0.775 0.000 0.000 1.000 N NA
 1155050 1155051 SDY_1222 SDY_1223 dsbB nhaB TRUE 0.865 146.000 0.723 1.000 N NA
 1155054 1155055 SDY_1226 SDY_1227 dadA dadX TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1155058 1155059 SDY_1230 SDY_1232     FALSE 0.417 95.000 0.103 NA N NA
 1155063 1155064 SDY_1235 SDY_1236 prrA modD TRUE 0.750 26.000 0.034 1.000 N NA
 1155064 1155065 SDY_1236 SDY_1237 modD   TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155067 1155068 SDY_1239 SDY_1240     TRUE 0.899 10.000 0.123 1.000   NA
 1155068 1155069 SDY_1240 SDY_1241     TRUE 0.996 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 1155069 1155070 SDY_1241 SDY_1242     TRUE 0.979 0.000 0.422 1.000   NA
 1155070 1155071 SDY_1242 SDY_1243     TRUE 0.826 49.000 0.000 0.002   NA
 1155071 1155072 SDY_1243 SDY_1244     FALSE 0.025 250.000 0.000 NA   NA
 1155072 1155073 SDY_1244 SDY_1246   treA FALSE 0.002 642.000 0.000 NA   NA
 1155075 1155076 SDY_1247 SDY_1248 ycgC   TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1155078 1155079 SDY_1250 SDY_1251     FALSE 0.002 650.000 0.000 NA   NA
 1155079 1155080 SDY_1251 SDY_1252   ychF FALSE 0.002 573.000 0.000 NA N NA
 1155080 1155081 SDY_1252 SDY_1253 ychF pth TRUE 0.911 117.000 0.184 1.000 Y NA
 1155083 1155084 SDY_1255 SDY_1256 ychM prsA FALSE 0.207 152.000 0.027 1.000 N NA
 1155084 1155085 SDY_1256 SDY_1257 prsA ychB FALSE 0.282 151.000 0.053 1.000 N NA
 1155085 1155086 SDY_1257 SDY_1258 ychB hemM TRUE 0.931 0.000 0.157 1.000 N NA
 1155087 1155088 SDY_1259 SDY_1260 hemA prfA TRUE 0.939 42.000 0.171 0.039 N NA
 1155088 1155089 SDY_1260 SDY_1261 prfA hemK TRUE 0.993 0.000 0.229 0.039 Y NA
 1155089 1155090 SDY_1261 SDY_1262 hemK   TRUE 0.858 -3.000 0.109 NA   NA
 1155090 1155091 SDY_1262 SDY_1263   ychA TRUE 0.940 4.000 0.195 NA   NA
 1155091 1155092 SDY_1263 SDY_1264 ychA kdsA TRUE 0.866 36.000 0.089 1.000   NA
 1155093 1155094 SDY_1265 SDY_1266   chaA FALSE 0.006 378.000 0.000 NA   NA
 1155095 1155096 SDY_1267 SDY_1268 insA insB FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1155096 1155097 SDY_1268 SDY_1269 insB chaB FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 1155097 1155098 SDY_1269 SDY_1270 chaB chaC FALSE 0.535 137.000 0.140 NA   NA
 1155099 1155100 SDY_1271 SDY_1272 ychN   FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 1155101 1155102 SDY_1273 SDY_1274   ychP FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155103 1155104 SDY_1275 SDY_1276 narL narX TRUE 0.992 -7.000 0.521 0.010 Y NA
 1155105 1155106 SDY_1277 SDY_1278   narK FALSE 0.214 95.000 0.000 NA   NA
 1155106 1155107 SDY_1278 SDY_1279 narK narG FALSE 0.007 393.000 0.000 1.000 N NA
 1155107 1155108 SDY_1279 SDY_1280 narG narH TRUE 0.995 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 1155108 1155109 SDY_1280 SDY_1281 narH narJ TRUE 0.996 -3.000 0.588 0.004 Y NA
 1155109 1155110 SDY_1281 SDY_1282 narJ narI TRUE 0.997 0.000 0.500 0.004 Y NA
 1155111 1155112 SDY_1283 SDY_1284   purU FALSE 0.143 159.000 0.000 NA   NA
 1155112 1155113 SDY_1284 SDY_1285 purU ychJ TRUE 0.876 50.000 0.200 NA   NA
 1155114 1155115 SDY_1286 SDY_1287 ychK hnr FALSE 0.049 258.000 0.048 1.000   NA
 1155115 1155116 SDY_1287 SDY_1288 hnr galU FALSE 0.338 202.000 0.235 1.000 N NA
 1155120 1155121 SDY_1292 SDY_1293   insA TRUE 0.916 51.000 0.000 NA Y NA
 1155121 1155122 SDY_1293 SDY_1294 insA insB FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1155124 1155125 SDY_1296 SDY_1297   insA TRUE 0.770 129.000 0.000 NA Y NA
 1155125 1155126 SDY_1297 SDY_1298 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155128 1155129 SDY_1300 SDY_1301   oppA FALSE 0.002 641.000 0.000 NA   NA
 1155129 1155130 SDY_1301 SDY_1302 oppA oppB TRUE 0.923 86.000 0.151 0.045 Y NA
 1155130 1155131 SDY_1302 SDY_1303 oppB oppC TRUE 0.996 15.000 0.870 0.045 Y NA
 1155131 1155132 SDY_1303 SDY_1304 oppC oppD TRUE 0.993 12.000 0.554 1.000 Y NA
 1155132 1155133 SDY_1304 SDY_1305 oppD oppF TRUE 0.995 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 1155134 1155135 SDY_1306 SDY_1307   cls TRUE 0.934 35.000 0.231 NA   NA
 1155135 1155136 SDY_1307 SDY_1308 cls kch FALSE 0.009 370.000 0.000 1.000 N NA
 1155136 1155137 SDY_1308 SDY_1309 kch yciI FALSE 0.014 300.000 0.000 NA   NA
 1155138 1155139 SDY_1310 SDY_1311     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155139 1155140 SDY_1311 SDY_1312     FALSE 0.401 205.000 0.000 1.000 Y NA
 1155140 1155141 SDY_1312 SDY_1313     TRUE 0.792 81.000 0.000 NA Y NA
 1155141 1155142 SDY_1313 SDY_1314     TRUE 0.971 27.000 0.500 NA   NA
 1155142 1155143 SDY_1314 SDY_1315     FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1155143 1155144 SDY_1315 SDY_1316   tonB FALSE 0.030 255.000 0.000 1.000 N NA
 1155145 1155146 SDY_1317 SDY_1318 yciA yciB FALSE 0.538 105.000 0.167 NA N NA
 1155146 1155147 SDY_1318 SDY_1319 yciB yciC TRUE 0.784 30.000 0.061 NA   NA
 1155149 1155150 SDY_1321 SDY_1322 yciE   TRUE 0.754 28.000 0.000 1.000   NA
 1155151 1155152 SDY_1323 SDY_1324 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155152 1155153 SDY_1324 SDY_1325 insB   FALSE 0.034 484.000 0.000 NA Y NA
 1155153 1155154 SDY_1325 SDY_1326     TRUE 0.868 62.000 0.000 NA Y NA
 1155154 1155155 SDY_1326 SDY_1327     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155156 1155157 SDY_1328 SDY_1329 trpA trpB TRUE 0.998 0.000 0.947 0.001 Y NA
 1155157 1155158 SDY_1329 SDY_1330 trpB trpC TRUE 0.990 12.000 0.221 0.001 Y NA
 1155158 1155159 SDY_1330 SDY_1331 trpC trpD TRUE 0.992 1.000 0.293 1.000 Y NA
 1155159 1155160 SDY_1331 SDY_1332 trpD trpE TRUE 0.982 0.000 0.010 0.001 Y NA
 1155160 1155161 SDY_1332 SDY_1333 trpE trpL FALSE 0.232 92.000 0.023 NA   NA
 1155162 1155163 SDY_1334 SDY_1335 yciV yciO TRUE 0.820 -39.000 0.281 NA   NA
 1155163 1155164 SDY_1335 SDY_1336 yciO insA FALSE 0.287 65.000 0.000 NA N NA
 1155164 1155165 SDY_1336 SDY_1337 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155165 1155166 SDY_1337 SDY_1338 insB   TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1155166 1155167 SDY_1338 SDY_1339   yciL FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 1155168 1155169 SDY_1340 SDY_1341 btuR yciK TRUE 0.791 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1155172 1155173 SDY_1344 SDY_1345 topA cysB FALSE 0.045 210.000 0.008 1.000 N NA
 1155174 1155175 SDY_1346 SDY_1347 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155176 1155177 SDY_1348 SDY_1349   yciX TRUE 0.938 -18.000 0.556 NA   NA
 1155177 1155178 SDY_1349 SDY_1350 yciX acnA FALSE 0.006 373.000 0.000 NA   NA
 1155179 1155180 SDY_1351 SDY_1352     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155180 1155181 SDY_1352 SDY_1353   ribA FALSE 0.001 760.000 0.000 NA N NA
 1155182 1155183 SDY_1354 SDY_1355 pgpB yciS FALSE 0.450 149.000 0.143 NA   NA
 1155183 1155184 SDY_1355 SDY_1356 yciS yciM TRUE 0.979 7.000 0.576 NA   NA
 1155184 1155185 SDY_1356 SDY_1357 yciM pyrF FALSE 0.222 193.000 0.125 1.000 N NA
 1155185 1155186 SDY_1357 SDY_1358 pyrF yciH TRUE 0.781 -3.000 0.045 1.000 N NA
 1155187 1155188 SDY_1359 SDY_1360 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155188 1155189 SDY_1360 SDY_1361 insA   FALSE 0.162 166.000 0.000 1.000 N NA
 1155189 1155190 SDY_1361 SDY_1362     FALSE 0.566 90.000 0.146 NA   NA
 1155190 1155191 SDY_1362 SDY_1363   yciR FALSE 0.168 148.000 0.000 NA   NA
 1155192 1155193 SDY_1364 SDY_1365 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155194 1155195 SDY_1366 SDY_1367 rnb yciW FALSE 0.609 68.000 0.105 NA   NA
 1155195 1155196 SDY_1367 SDY_1368 yciW fabI FALSE 0.045 251.000 0.057 NA   NA
 1155196 1155197 SDY_1368 SDY_1369 fabI   FALSE 0.003 437.000 0.000 NA N NA
 1155200 1155201 SDY_1372 SDY_1373     TRUE 0.977 10.000 0.367 0.044   NA
 1155201 1155202 SDY_1373 SDY_1374     TRUE 0.789 49.000 0.000 0.044   NA
 1155202 1155203 SDY_1374 SDY_1375     TRUE 0.944 9.000 0.143 0.044   NA
 1155204 1155205 SDY_1376 SDY_1377   sapF FALSE 0.021 259.000 0.000 NA   NA
 1155205 1155206 SDY_1377 SDY_1378 sapF sapD TRUE 0.998 2.000 0.684 0.013 Y NA
 1155206 1155207 SDY_1378 SDY_1379 sapD sapC TRUE 0.996 0.000 0.667 1.000 Y NA
 1155208 1155209 SDY_1380 SDY_1381 int insA FALSE 0.349 214.000 0.000 1.000 Y NA
 1155210 1155211 SDY_1382 SDY_1383   bet TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1155211 1155212 SDY_1383 SDY_1384 bet gam TRUE 0.753 6.000 0.040 NA   NA
 1155212 1155213 SDY_1384 SDY_1385 gam   TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155214 1155215 SDY_1386 SDY_1387     TRUE 0.642 36.000 0.000 NA   NA
 1155215 1155216 SDY_1387 SDY_1388     TRUE 0.865 29.000 0.000 0.038   NA
 1155216 1155217 SDY_1388 SDY_1389   stxA FALSE 0.174 173.000 0.000 1.000   NA
 1155217 1155218 SDY_1389 SDY_1390 stxA stxB TRUE 0.758 10.000 0.000 1.000   NA
 1155218 1155219 SDY_1390 SDY_1391 stxB yjhS FALSE 0.003 510.000 0.000 NA   NA
 1155219 1155220 SDY_1391 SDY_1392 yjhS   FALSE 0.077 187.000 0.000 NA   NA
 1155220 1155221 SDY_1392 SDY_1393     FALSE 0.286 77.000 0.000 NA   NA
 1155221 1155222 SDY_1393 SDY_1394     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155224 1155225 SDY_1396 SDY_1397 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155227 1155228 SDY_1399 SDY_1400 ycjX ycjF TRUE 0.983 -3.000 0.791 NA   NA
 1155228 1155229 SDY_1400 SDY_1401 ycjF tyrR FALSE 0.324 175.000 0.137 NA   NA
 1155232 1155233 SDY_1404 SDY_1405 ycjI   FALSE 0.004 388.000 0.000 NA N NA
 1155234 1155235 SDY_1406 SDY_1407     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1155235 1155236 SDY_1407 SDY_1408   ycjZ FALSE 0.184 130.000 0.000 NA N NA
 1155236 1155237 SDY_1408 SDY_1409 ycjZ   FALSE 0.016 316.000 0.000 1.000 N NA
 1155238 1155239 SDY_1410 SDY_1411   insB FALSE 0.004 381.000 0.000 NA N NA
 1155239 1155240 SDY_1411 SDY_1412 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155240 1155241 SDY_1412 SDY_1413 insA ydaA FALSE 0.032 250.000 0.000 1.000 N NA
 1155241 1155242 SDY_1413 SDY_1414 ydaA   FALSE 0.167 94.000 0.000 NA N NA
 1155242 1155243 SDY_1414 SDY_1415   fnr FALSE 0.003 437.000 0.000 NA N NA
 1155243 1155244 SDY_1415 SDY_1416 fnr ogt FALSE 0.079 195.000 0.000 1.000 N NA
 1155244 1155245 SDY_1416 SDY_1417 ogt   FALSE 0.004 443.000 0.000 NA   NA
 1155246 1155247 SDY_1418 SDY_1419   ydaL FALSE 0.002 692.000 0.000 NA   NA
 1155249 1155250 SDY_1421 SDY_1422     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155252 1155253 SDY_1424 SDY_1425   dbpA FALSE 0.003 478.000 0.000 NA   NA
 1155254 1155255 SDY_1426 SDY_1427 ydaO   FALSE 0.445 52.000 0.012 NA   NA
 1155255 1155256 SDY_1427 SDY_1428     TRUE 0.865 28.000 0.000 0.038   NA
 1155256 1155257 SDY_1428 SDY_1429   insB TRUE 0.804 78.000 0.000 NA Y NA
 1155257 1155258 SDY_1429 SDY_1430 insB insA TRUE 0.951 22.000 0.000 NA Y NA
 1155259 1155260 SDY_1431 SDY_1432   relF FALSE 0.003 521.000 0.000 NA   NA
 1155260 1155261 SDY_1432 SDY_1433 relF rem FALSE 0.040 217.000 0.000 NA   NA
 1155261 1155262 SDY_1433 SDY_1434 rem   FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 1155262 1155263 SDY_1434 SDY_1435     FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1155263 1155264 SDY_1435 SDY_1436     TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1155264 1155265 SDY_1436 SDY_1437     FALSE 0.179 144.000 0.000 NA   NA
 1155265 1155266 SDY_1437 SDY_1438     FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 1155266 1155267 SDY_1438 SDY_1439   insA FALSE 0.229 92.000 0.000 NA   NA
 1155267 1155268 SDY_1439 SDY_1440 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155270 1155271 SDY_1442 SDY_1443     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155271 1155272 SDY_1443 SDY_1444     FALSE 0.120 170.000 0.000 NA   NA
 1155272 1155273 SDY_1444 SDY_1445     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155275 1155276 SDY_1447 SDY_1448     FALSE 0.377 -25.000 0.000 NA   NA
 1155276 1155277 SDY_1448 SDY_1449     FALSE 0.007 358.000 0.000 NA   NA
 1155277 1155278 SDY_1449 SDY_1450     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155279 1155280 SDY_1451 SDY_1452     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155282 1155283 SDY_1454 SDY_1455 sitD sitC TRUE 0.996 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 1155283 1155284 SDY_1455 SDY_1456 sitC sitB TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.074 Y NA
 1155284 1155285 SDY_1456 SDY_1457 sitB sitA TRUE 0.997 0.000 0.894 1.000 Y NA
 1155285 1155286 SDY_1457 SDY_1458 sitA ynaF FALSE 0.003 587.000 0.000 1.000 N NA
 1155286 1155287 SDY_1458 SDY_1459 ynaF ompN FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1155287 1155288 SDY_1459 SDY_1460 ompN   FALSE 0.028 241.000 0.000 NA   NA
 1155288 1155289 SDY_1460 SDY_1461   ydbK FALSE 0.003 668.000 0.000 1.000 N NA
 1155291 1155292 SDY_1463 SDY_1464 hslJ ldhA FALSE 0.231 111.000 0.000 NA   NA
 1155293 1155294 SDY_1465 SDY_1466 ydbH ynbE TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155294 1155295 SDY_1466 SDY_1467 ynbE ydbL TRUE 0.905 -73.000 0.726 NA   NA
 1155295 1155296 SDY_1467 SDY_1468 ydbL   FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1155296 1155297 SDY_1468 SDY_1469   insA FALSE 0.272 228.000 0.000 NA Y NA
 1155297 1155298 SDY_1469 SDY_1470 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155298 1155299 SDY_1470 SDY_1471 insB   FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1155299 1155300 SDY_1471 SDY_1472     FALSE 0.120 170.000 0.000 NA   NA
 1155301 1155302 SDY_1473 SDY_1474   aroD FALSE 0.001 667.000 0.000 NA N NA
 1155302 1155303 SDY_1474 SDY_1475 aroD ydiB TRUE 0.975 31.000 0.113 1.000 Y NA
 1155303 1155304 SDY_1475 SDY_1476 ydiB   FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155304 1155305 SDY_1476 SDY_1477     FALSE 0.003 565.000 0.000 NA   NA
 1155305 1155306 SDY_1477 SDY_1478   insB FALSE 0.210 97.000 0.000 NA   NA
 1155306 1155307 SDY_1478 SDY_1479 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155307 1155308 SDY_1479 SDY_1480 insA   TRUE 0.850 71.000 0.000 1.000 Y NA
 1155308 1155309 SDY_1480 SDY_1481     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1155311 1155312 SDY_1483 SDY_1484     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155313 1155314 SDY_1485 SDY_1486 yeaF   FALSE 0.395 90.000 0.067 NA   NA
 1155315 1155316 SDY_1487 SDY_1488 yeaD gapA TRUE 0.940 63.000 0.154 1.000 Y NA
 1155317 1155318 SDY_1489 SDY_1490 yeaA   TRUE 0.930 -3.000 0.216 NA   NA
 1155318 1155319 SDY_1490 SDY_1491     FALSE 0.007 369.000 0.000 NA   NA
 1155319 1155320 SDY_1491 SDY_1492     TRUE 0.946 27.000 0.250 1.000 N NA
 1155320 1155321 SDY_1492 SDY_1493   ydjJ TRUE 0.819 56.000 0.167 1.000 N NA
 1155323 1155324 SDY_1495 SDY_1496     TRUE 0.945 10.000 0.269 NA   NA
 1155324 1155325 SDY_1496 SDY_1497     FALSE 0.523 131.000 0.000 0.022   NA
 1155325 1155326 SDY_1497 SDY_1498     TRUE 0.740 137.000 0.269 1.000 N NA
 1155326 1155327 SDY_1498 SDY_1499   ydjE FALSE 0.244 117.000 0.000 NA   NA
 1155327 1155328 SDY_1499 SDY_1500 ydjE   FALSE 0.005 392.000 0.000 NA   NA
 1155328 1155329 SDY_1500 SDY_1501   insA TRUE 0.950 34.000 0.000 NA Y NA
 1155329 1155330 SDY_1501 SDY_1502 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155333 1155334 SDY_1505 SDY_1506 ydjB ansA TRUE 0.749 11.000 0.040 1.000 N NA
 1155334 1155335 SDY_1506 SDY_1507 ansA sppA FALSE 0.402 154.000 0.113 1.000 N NA
 1155336 1155337 SDY_1508 SDY_1509 ydjA selD FALSE 0.336 117.000 0.033 1.000 N NA
 1155337 1155338 SDY_1509 SDY_1510 selD topB TRUE 0.801 5.000 0.041 1.000 N NA
 1155339 1155340 SDY_1511 SDY_1512     FALSE 0.004 443.000 0.000 NA   NA
 1155346 1155347 SDY_1518 SDY_1519     FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1155347 1155348 SDY_1519 SDY_1520     TRUE 0.856 142.000 0.602 1.000   NA
 1155348 1155349 SDY_1520 SDY_1521     TRUE 0.898 -51.000 0.627 NA   NA
 1155349 1155350 SDY_1521 SDY_1522     FALSE 0.176 154.000 0.032 NA   NA
 1155350 1155351 SDY_1522 SDY_1523   ynjA TRUE 0.721 7.000 0.032 NA   NA
 1155351 1155352 SDY_1523 SDY_1524 ynjA ydjZ TRUE 0.872 0.000 0.087 NA   NA
 1155352 1155353 SDY_1524 SDY_1525 ydjZ ydjY TRUE 0.885 15.000 0.174 NA   NA
 1155353 1155354 SDY_1525 SDY_1526 ydjY ydjX TRUE 0.852 5.000 0.083 NA   NA
 1155354 1155355 SDY_1526 SDY_1527 ydjX xthA FALSE 0.111 167.000 0.016 NA   NA
 1155358 1155359 SDY_1530 SDY_1531     TRUE 0.918 -3.000 0.179 1.000 N NA
 1155359 1155360 SDY_1531 SDY_1532     FALSE 0.039 469.000 0.306 1.000 N NA
 1155360 1155361 SDY_1532 SDY_1533   ydjS TRUE 0.883 120.000 0.126 1.000 Y NA
 1155361 1155362 SDY_1533 SDY_1534 ydjS spy FALSE 0.008 330.000 0.000 NA N NA
 1155362 1155363 SDY_1534 SDY_1535 spy   FALSE 0.059 203.000 0.028 NA   NA
 1155364 1155365 SDY_1536 SDY_1537     FALSE 0.629 19.000 0.000 NA   NA
 1155367 1155368 SDY_1539 SDY_1540   nadE FALSE 0.034 230.000 0.010 1.000 N NA
 1155369 1155370 SDY_1541 SDY_1542 osmE   FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 1155372 1155373 SDY_1544 SDY_1545 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155373 1155374 SDY_1545 SDY_1546 insB ydgC FALSE 0.237 113.000 0.000 NA   NA
 1155375 1155376 SDY_1547 SDY_1548 ydgB   TRUE 0.891 37.000 0.140 1.000 N NA
 1155376 1155377 SDY_1548 SDY_1549     FALSE 0.262 186.000 0.143 NA   NA
 1155378 1155379 SDY_1550 SDY_1551 pntA pntB TRUE 0.997 11.000 0.745 0.001 Y NA
 1155381 1155382 SDY_1553 SDY_1554     TRUE 0.994 -13.000 0.869 0.067 Y NA
 1155383 1155384 SDY_1555 SDY_1556   asr FALSE 0.017 276.000 0.000 NA   NA
 1155384 1155385 SDY_1556 SDY_1557 asr   FALSE 0.026 246.000 0.000 NA   NA
 1155388 1155389 SDY_1560 SDY_1561 insB ynfL FALSE 0.237 73.000 0.000 NA N NA
 1155389 1155390 SDY_1561 SDY_1562 ynfL mlc TRUE 0.948 135.000 0.408 1.000 Y NA
 1155390 1155391 SDY_1562 SDY_1563 mlc   TRUE 0.851 125.000 0.455 1.000 N NA
 1155392 1155393 SDY_1564 SDY_1565     FALSE 0.239 114.000 0.000 NA   NA
 1155393 1155394 SDY_1565 SDY_1566     TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1155394 1155395 SDY_1566 SDY_1567     TRUE 0.974 2.000 0.333 1.000   NA
 1155395 1155396 SDY_1567 SDY_1568     FALSE 0.634 11.000 0.000 NA   NA
 1155396 1155397 SDY_1568 SDY_1569     FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1155397 1155398 SDY_1569 SDY_1570     FALSE 0.058 198.000 0.000 NA   NA
 1155399 1155400 SDY_1571 SDY_1572 ynfC   TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155403 1155404 SDY_1575 SDY_1576 speG   TRUE 0.644 35.000 0.000 NA   NA
 1155405 1155406 SDY_1577 SDY_1578   rspA FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1155406 1155407 SDY_1578 SDY_1579 rspA rspB FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1155409 1155410 SDY_1581 SDY_1582     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1155410 1155411 SDY_1582 SDY_1583   ydfI FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1155412 1155413 SDY_1584 SDY_1585   ydfH FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 1155413 1155414 SDY_1585 SDY_1586 ydfH ydfG FALSE 0.342 89.000 0.000 1.000   NA
 1155417 1155418 SDY_1589 SDY_1590 ydeI ydeH FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 1155418 1155419 SDY_1590 SDY_1591 ydeH insA FALSE 0.006 408.000 0.000 1.000 N NA
 1155419 1155420 SDY_1591 SDY_1592 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155423 1155424 SDY_1595 SDY_1596 marB marA TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 1155424 1155425 SDY_1596 SDY_1597 marA marR TRUE 0.996 20.000 0.667 0.033 Y NA
 1155427 1155428 SDY_1599 SDY_1600 ydeA   FALSE 0.538 47.000 0.000 NA   NA
 1155430 1155431 SDY_1602 SDY_1603   yddG FALSE 0.027 342.000 0.000 0.071   NA
 1155432 1155433 SDY_1604 SDY_1605 fdnG fdnH FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1155433 1155434 SDY_1605 SDY_1606 fdnH fdnI TRUE 0.990 -7.000 0.333 0.001 Y NA
 1155435 1155436 SDY_1607 SDY_1608 yddM adhP FALSE 0.551 -18.000 0.000 1.000   NA
 1155436 1155437 SDY_1608 SDY_1609 adhP sfcA FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1155439 1155440 SDY_1611 SDY_1612     FALSE 0.398 61.000 0.000 NA   NA
 1155440 1155441 SDY_1612 SDY_1613     FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 1155441 1155442 SDY_1613 SDY_1614   xasA FALSE 0.337 131.000 0.000 1.000   NA
 1155442 1155443 SDY_1614 SDY_1615 xasA gadB TRUE 0.776 156.000 0.103 1.000 Y NA
 1155444 1155445 SDY_1616 SDY_1617 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155445 1155446 SDY_1617 SDY_1618 insB   TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1155446 1155447 SDY_1618 SDY_1619     FALSE 0.003 515.000 0.000 NA   NA
 1155447 1155448 SDY_1619 SDY_1620   insA FALSE 0.008 355.000 0.000 NA   NA
 1155448 1155449 SDY_1620 SDY_1621 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155449 1155450 SDY_1621 SDY_1622 insB   FALSE 0.051 396.000 0.000 NA Y NA
 1155450 1155451 SDY_1622 SDY_1623   yneB FALSE 0.318 -22.000 0.000 NA N NA
 1155451 1155452 SDY_1623 SDY_1624 yneB   TRUE 0.759 24.000 0.000 1.000   NA
 1155452 1155453 SDY_1624 SDY_1625     FALSE 0.570 57.000 0.000 1.000   NA
 1155454 1155455 SDY_1626 SDY_1627     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155455 1155456 SDY_1627 SDY_1628   uxaB FALSE 0.175 146.000 0.000 NA   NA
 1155456 1155457 SDY_1628 SDY_1629 uxaB   FALSE 0.177 145.000 0.000 NA   NA
 1155457 1155458 SDY_1629 SDY_1630     FALSE 0.447 139.000 0.098 NA   NA
 1155458 1155459 SDY_1630 SDY_1631   yneH TRUE 0.776 0.000 0.037 NA   NA
 1155459 1155460 SDY_1631 SDY_1632 yneH   FALSE 0.433 64.000 0.000 1.000 N NA
 1155461 1155462 SDY_1633 SDY_1634 yneJ   FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1155464 1155465 SDY_1636 SDY_1637   ymjA FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1155465 1155466 SDY_1637 SDY_1638 ymjA sapA FALSE 0.012 313.000 0.000 NA   NA
 1155466 1155467 SDY_1638 SDY_1639 sapA sapB TRUE 0.965 -3.000 0.264 0.043 N NA
 1155468 1155469 SDY_1640 SDY_1641     FALSE 0.055 201.000 0.000 NA   NA
 1155469 1155470 SDY_1641 SDY_1642     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155470 1155471 SDY_1642 SDY_1643     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1155473 1155474 SDY_1645 SDY_1646     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155475 1155476 SDY_1647 SDY_1648 narU narZ FALSE 0.057 199.000 0.000 NA   NA
 1155478 1155479 SDY_1650 SDY_1651   narY FALSE 0.001 1636.000 0.000 NA   NA
 1155479 1155480 SDY_1651 SDY_1652 narY narW TRUE 0.998 0.000 0.714 0.004 Y NA
 1155480 1155481 SDY_1652 SDY_1653 narW narV TRUE 0.995 -3.000 0.429 0.004 Y NA
 1155481 1155482 SDY_1653 SDY_1654 narV yddE FALSE 0.381 80.000 0.000 1.000   NA
 1155484 1155485 SDY_1656 SDY_1657     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155485 1155486 SDY_1657 SDY_1658     FALSE 0.017 334.000 0.000 1.000   NA
 1155486 1155487 SDY_1658 SDY_1659     FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 1155487 1155488 SDY_1659 SDY_1660     FALSE 0.295 75.000 0.000 NA   NA
 1155488 1155489 SDY_1660 SDY_1661     FALSE 0.009 387.000 0.000 1.000   NA
 1155491 1155492 SDY_1663 SDY_1664     FALSE 0.012 359.000 0.000 1.000   NA
 1155492 1155493 SDY_1664 SDY_1665   insB FALSE 0.013 305.000 0.000 NA   NA
 1155495 1155496 SDY_1667 SDY_1668     FALSE 0.219 107.000 0.000 NA   NA
 1155497 1155498 SDY_1669 SDY_1670     FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1155498 1155499 SDY_1670 SDY_1671     FALSE 0.248 120.000 0.000 NA   NA
 1155499 1155500 SDY_1671 SDY_1672     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155500 1155501 SDY_1672 SDY_1673     FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 1155501 1155502 SDY_1673 SDY_1674     TRUE 0.673 19.000 0.032 NA   NA
 1155502 1155503 SDY_1674 SDY_1675   ydiJ TRUE 0.862 -3.000 0.129 NA N NA
 1155505 1155506 SDY_1677 SDY_1678     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155509 1155510 SDY_1681 SDY_1682     TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1155510 1155511 SDY_1682 SDY_1683     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 1155511 1155512 SDY_1683 SDY_1684     FALSE 0.219 78.000 0.000 NA N NA
 1155512 1155513 SDY_1684 SDY_1685   yeaK TRUE 0.808 43.000 0.083 NA   NA
 1155517 1155518 SDY_1689 SDY_1690 yeaN yeaO FALSE 0.560 34.000 0.007 NA   NA
 1155523 1155524 SDY_1695 SDY_1696 yeaQ yoaG FALSE 0.168 148.000 0.000 NA   NA
 1155524 1155525 SDY_1696 SDY_1697 yoaG yeaR TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155525 1155526 SDY_1697 SDY_1698 yeaR yeaS FALSE 0.084 173.000 0.000 NA N NA
 1155526 1155527 SDY_1698 SDY_1699 yeaS   FALSE 0.158 100.000 0.000 NA N NA
 1155527 1155528 SDY_1699 SDY_1700   yeaT FALSE 0.005 369.000 0.000 NA N NA
 1155529 1155530 SDY_1701 SDY_1702 yeaU   FALSE 0.222 251.000 0.333 NA   NA
 1155532 1155533 SDY_1704 SDY_1705   yeaV FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 1155533 1155534 SDY_1705 SDY_1706 yeaV yeaW TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 1155534 1155535 SDY_1706 SDY_1707 yeaW yeaX TRUE 0.753 56.000 0.043 0.039 N NA
 1155536 1155537 SDY_1708 SDY_1709 rnd fadD TRUE 0.640 70.000 0.115 1.000 N NA
 1155537 1155538 SDY_1709 SDY_1710 fadD   FALSE 0.230 205.000 0.169 1.000 N NA
 1155538 1155539 SDY_1710 SDY_1711   yeaZ TRUE 0.699 40.000 0.024 1.000 N NA
 1155539 1155540 SDY_1711 SDY_1712 yeaZ   TRUE 0.691 58.000 0.082 1.000 N NA
 1155541 1155542 SDY_1713 SDY_1714   insA FALSE 0.039 202.000 0.000 NA N NA
 1155542 1155543 SDY_1714 SDY_1715 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155543 1155544 SDY_1715 SDY_1716 insB   FALSE 0.028 240.000 0.000 NA   NA
 1155546 1155547 SDY_1718 SDY_1719 pabB yeaB TRUE 0.915 4.000 0.116 1.000   NA
 1155547 1155548 SDY_1719 SDY_1720 yeaB sdaA FALSE 0.618 184.000 0.409 1.000   NA
 1155548 1155549 SDY_1720 SDY_1721 sdaA insA FALSE 0.009 370.000 0.000 1.000 N NA
 1155549 1155550 SDY_1721 SDY_1722 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155551 1155552 SDY_1723 SDY_1724   yncB FALSE 0.092 198.000 0.000 1.000   NA
 1155553 1155554 SDY_1725 SDY_1726     TRUE 0.806 -3.000 0.070 NA   NA
 1155557 1155558 SDY_1729 SDY_1730     FALSE 0.013 312.000 0.000 NA   NA
 1155558 1155559 SDY_1730 SDY_1731     TRUE 0.651 22.000 0.000 NA   NA
 1155559 1155560 SDY_1731 SDY_1732     FALSE 0.478 -10.000 0.000 NA   NA
 1155560 1155561 SDY_1732 SDY_1733     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155561 1155562 SDY_1733 SDY_1734     TRUE 0.995 18.000 0.609 0.043 Y NA
 1155562 1155563 SDY_1734 SDY_1735     FALSE 0.256 245.000 0.000 1.000 Y NA
 1155563 1155564 SDY_1735 SDY_1736     FALSE 0.386 79.000 0.000 1.000   NA
 1155568 1155569 SDY_1740 SDY_1742 ydcP ydcN TRUE 0.752 31.000 0.000 1.000   NA
 1155570 1155571 SDY_1741 SDY_1743     FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1155572 1155573 SDY_1744 SDY_1745 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155573 1155574 SDY_1745 SDY_1746 insA   TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1155574 1155575 SDY_1746 SDY_1747   tehB FALSE 0.034 303.000 0.088 NA   NA
 1155575 1155576 SDY_1747 SDY_1748 tehB tehA TRUE 0.924 -3.000 0.175 1.000   NA
 1155577 1155578 SDY_1749 SDY_1750     FALSE 0.116 231.000 0.000 0.003   NA
 1155579 1155580 SDY_1751 SDY_1752 rimL ydcH FALSE 0.393 63.000 0.026 NA   NA
 1155581 1155582 SDY_1753 SDY_1754 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155582 1155583 SDY_1754 SDY_1755 insB   FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1155584 1155585 SDY_1756 SDY_1757 ydcG   FALSE 0.035 225.000 0.000 NA   NA
 1155586 1155587 SDY_1758 SDY_1759     FALSE 0.007 335.000 0.000 NA N NA
 1155588 1155589 SDY_1760 SDY_1761 trg   FALSE 0.428 51.000 0.000 NA N NA
 1155591 1155592 SDY_1763 SDY_1764 ydcA cybB FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 1155594 1155595 SDY_1766 SDY_1767 aldA   FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1155595 1155596 SDY_1767 SDY_1768     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155596 1155597 SDY_1768 SDY_1769     FALSE 0.002 748.000 0.000 NA   NA
 1155597 1155598 SDY_1769 SDY_1770     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 1155599 1155600 SDY_1771 SDY_1772 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155601 1155602 SDY_1773 SDY_1774   hrpA FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1155604 1155605 SDY_1776 SDY_1777 ynbD   TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155607 1155608 SDY_1779 SDY_1780     TRUE 0.687 6.000 0.000 NA   NA
 1155608 1155609 SDY_1780 SDY_1781     FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1155610 1155611 SDY_1782 SDY_1783     FALSE 0.052 204.000 0.000 NA   NA
 1155612 1155613 SDY_1784 SDY_1785     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155613 1155614 SDY_1785 SDY_1786     FALSE 0.387 62.000 0.000 NA   NA
 1155616 1155617 SDY_1788 SDY_1789     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155618 1155619 SDY_1790 SDY_1791 ydiR ydiS FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1155619 1155620 SDY_1791 SDY_1792 ydiS ydiT TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.039 Y NA
 1155620 1155621 SDY_1792 SDY_1793 ydiT ydiD FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1155623 1155624 SDY_1795 SDY_1796     TRUE 0.645 155.000 0.000 NA Y NA
 1155624 1155625 SDY_1796 SDY_1797   ydiA FALSE 0.069 212.000 0.000 1.000   NA
 1155625 1155626 SDY_1797 SDY_1798 ydiA aroH FALSE 0.502 157.000 0.165 1.000   NA
 1155626 1155627 SDY_1798 SDY_1799 aroH ydiE FALSE 0.305 132.000 0.054 NA N NA
 1155628 1155629 SDY_1800 SDY_1801     FALSE 0.458 -7.000 0.011 NA   NA
 1155629 1155630 SDY_1801 SDY_1802     FALSE 0.416 63.000 0.031 NA   NA
 1155630 1155631 SDY_1802 SDY_1803   nlpC FALSE 0.019 247.000 0.000 NA N NA
 1155631 1155632 SDY_1803 SDY_1804 nlpC btuD FALSE 0.219 78.000 0.000 NA N NA
 1155632 1155633 SDY_1804 SDY_1805 btuD btuE TRUE 0.775 0.000 0.000 1.000 N NA
 1155633 1155634 SDY_1805 SDY_1806 btuE btuC TRUE 0.644 63.000 0.084 1.000 N NA
 1155634 1155635 SDY_1806 SDY_1807 btuC himA FALSE 0.259 101.000 0.023 1.000 N NA
 1155635 1155636 SDY_1807 SDY_1808 himA pheT TRUE 0.945 5.000 0.208 1.000 N NA
 1155636 1155637 SDY_1808 SDY_1809 pheT pheS TRUE 0.995 15.000 0.574 0.001 Y NA
 1155637 1155638 SDY_1809 SDY_1810 pheS   FALSE 0.016 283.000 0.000 NA   NA
 1155638 1155639 SDY_1810 SDY_1811   rplT FALSE 0.248 123.000 0.000 NA   NA
 1155639 1155640 SDY_1811 SDY_1812 rplT rpmI TRUE 0.995 53.000 0.928 0.011 Y NA
 1155640 1155641 SDY_1812 SDY_1813 rpmI infC TRUE 0.967 94.000 0.652 1.000 Y NA
 1155641 1155642 SDY_1813 SDY_1814 infC thrS TRUE 0.908 112.000 0.186 1.000 Y NA
 1155643 1155644 SDY_1815 SDY_1816   pfkB FALSE 0.093 167.000 0.000 NA N NA
 1155644 1155645 SDY_1816 SDY_1817 pfkB   FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1155645 1155646 SDY_1817 SDY_1818     FALSE 0.216 106.000 0.000 NA   NA
 1155648 1155649 SDY_1820 SDY_1821 yniC   FALSE 0.250 164.000 0.068 NA   NA
 1155650 1155651 SDY_1822 SDY_1823 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155652 1155653 SDY_1824 SDY_1825 rstA rstB TRUE 0.986 4.000 0.181 1.000 Y NA
 1155653 1155654 SDY_1825 SDY_1826 rstB tus TRUE 0.767 76.000 0.200 1.000   NA
 1155655 1155656 SDY_1827 SDY_1828 fumC fumA TRUE 0.831 142.000 0.000 0.001 Y NA
 1155657 1155658 SDY_1829 SDY_1830 manA ydgA TRUE 0.885 101.000 0.778 NA   NA
 1155663 1155664 SDY_1835 SDY_1836 uidB uidA FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 1155664 1155665 SDY_1836 SDY_1837 uidA uidR FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 1155665 1155666 SDY_1837 SDY_1838 uidR hdhA FALSE 0.044 229.000 0.000 1.000 N NA
 1155666 1155667 SDY_1838 SDY_1839 hdhA   FALSE 0.046 193.000 0.000 NA N NA
 1155667 1155668 SDY_1839 SDY_1840     FALSE 0.264 -58.000 0.000 NA   NA
 1155668 1155669 SDY_1840 SDY_1841   malI FALSE 0.182 142.000 0.000 NA   NA
 1155672 1155673 SDY_1844 SDY_1845   malY FALSE 0.062 194.000 0.000 NA   NA
 1155673 1155674 SDY_1845 SDY_1846 malY add FALSE 0.540 104.000 0.132 1.000 N NA
 1155676 1155677 SDY_1848 SDY_1849     FALSE 0.327 168.000 0.120 NA   NA
 1155677 1155678 SDY_1849 SDY_1850     FALSE 0.633 77.000 0.148 NA   NA
 1155678 1155679 SDY_1850 SDY_1851     TRUE 0.997 0.000 0.564 0.039 Y NA
 1155679 1155680 SDY_1851 SDY_1852     TRUE 0.992 -7.000 0.537 0.012 Y NA
 1155680 1155681 SDY_1852 SDY_1853   ydgO TRUE 0.998 1.000 0.814 0.039 Y NA
 1155681 1155682 SDY_1853 SDY_1854 ydgO   TRUE 0.998 4.000 0.924 0.039 Y NA
 1155682 1155683 SDY_1854 SDY_1855   ydgQ TRUE 0.998 4.000 0.908 0.039 Y NA
 1155683 1155684 SDY_1855 SDY_1856 ydgQ nth TRUE 0.906 0.000 0.109 1.000 N NA
 1155684 1155685 SDY_1856 SDY_1857 nth ydgR FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 1155685 1155686 SDY_1857 SDY_1858 ydgR gst TRUE 0.784 106.000 0.344 1.000 N NA
 1155687 1155688 SDY_1859 SDY_1860 pdxY tyrS FALSE 0.562 59.000 0.041 1.000 N NA
 1155688 1155689 SDY_1860 SDY_1861 tyrS pdxH FALSE 0.408 129.000 0.054 1.000 N NA
 1155689 1155690 SDY_1861 SDY_1862 pdxH ydhA FALSE 0.582 59.000 0.034 1.000   NA
 1155690 1155691 SDY_1862 SDY_1863 ydhA   FALSE 0.121 179.000 0.034 NA   NA
 1155694 1155695 SDY_1866 SDY_1867     TRUE 0.876 -39.000 0.412 NA   NA
 1155695 1155696 SDY_1867 SDY_1868     FALSE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 1155696 1155697 SDY_1868 SDY_1869     FALSE 0.277 79.000 0.000 NA   NA
 1155698 1155699 SDY_1870 SDY_1871 sodC   FALSE 0.410 81.000 0.033 1.000   NA
 1155699 1155700 SDY_1871 SDY_1873     FALSE 0.631 49.000 0.045 NA   NA
 1155703 1155704 SDY_1875 SDY_1876   nemA FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1155704 1155705 SDY_1876 SDY_1877 nemA gloA FALSE 0.451 81.000 0.057 1.000 N NA
 1155705 1155706 SDY_1877 SDY_1878 gloA rnt FALSE 0.544 103.000 0.136 1.000 N NA
 1155706 1155707 SDY_1878 SDY_1879 rnt lhr FALSE 0.224 93.000 0.000 NA   NA
 1155709 1155710 SDY_1881 SDY_1882 ydhO sodB FALSE 0.159 128.000 0.015 NA N NA
 1155714 1155715 SDY_1886 SDY_1887 ydhC cfa FALSE 0.019 291.000 0.000 1.000 N NA
 1155717 1155718 SDY_1889 SDY_1890   ydhE FALSE 0.135 144.000 0.000 NA N NA
 1155720 1155721 SDY_1892 SDY_1893     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155722 1155723 SDY_1894 SDY_1895     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155725 1155726 SDY_1897 SDY_1898   ydhU TRUE 0.948 4.000 0.222 NA   NA
 1155726 1155727 SDY_1898 SDY_1899 ydhU   TRUE 0.994 -3.000 0.444 0.038 Y NA
 1155727 1155728 SDY_1899 SDY_1900     TRUE 0.924 13.000 0.235 NA   NA
 1155729 1155730 SDY_1901 SDY_1902     FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 1155730 1155731 SDY_1902 SDY_1903     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155733 1155734 SDY_1905 SDY_1906 pykF insA FALSE 0.096 188.000 0.000 1.000 N NA
 1155734 1155735 SDY_1906 SDY_1907 insA insB FALSE 0.043 212.000 0.000 NA   NA
 1155735 1155736 SDY_1907 SDY_1908 insB lpp FALSE 0.053 203.000 0.000 NA   NA
 1155737 1155738 SDY_1909 SDY_1910 ynhG ynhA FALSE 0.299 149.000 0.069 NA   NA
 1155738 1155739 SDY_1910 SDY_1911 ynhA   TRUE 0.901 13.000 0.183 NA   NA
 1155739 1155740 SDY_1911 SDY_1912   ynhC FALSE 0.202 228.000 0.193 1.000 N NA
 1155740 1155741 SDY_1912 SDY_1913 ynhC ynhD TRUE 0.978 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 1155741 1155742 SDY_1913 SDY_1914 ynhD ynhE TRUE 0.974 10.000 0.466 1.000   NA
 1155742 1155743 SDY_1914 SDY_1915 ynhE   FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 1155743 1155744 SDY_1915 SDY_1916     FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1155746 1155747 SDY_1918 SDY_1919     FALSE 0.014 1989.000 0.000 NA Y NA
 1155748 1155749 SDY_1920 SDY_1921     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155750 1155751 SDY_1922 SDY_1923     TRUE 0.809 -6.000 0.118 NA   NA
 1155751 1155752 SDY_1923 SDY_1924     FALSE 0.003 547.000 0.000 NA   NA
 1155753 1155754 SDY_1925 SDY_1926     FALSE 0.316 94.000 0.000 1.000   NA
 1155754 1155755 SDY_1926 SDY_1927     TRUE 0.975 -3.000 0.500 1.000   NA
 1155755 1155756 SDY_1927 SDY_1928     FALSE 0.002 894.000 0.000 NA   NA
 1155756 1155757 SDY_1928 SDY_1929     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155758 1155759 SDY_1930 SDY_1931     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1155759 1155760 SDY_1931 SDY_1932     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1155761 1155762 SDY_1933 SDY_1934   insA FALSE 0.453 56.000 0.000 NA   NA
 1155763 1155764 SDY_1935 SDY_1936 ycjM pspE FALSE 0.086 184.000 0.000 NA   NA
 1155764 1155765 SDY_1936 SDY_1937 pspE pspD FALSE 0.619 75.000 0.133 NA   NA
 1155765 1155766 SDY_1937 SDY_1938 pspD pspC TRUE 0.908 9.000 0.167 NA   NA
 1155766 1155767 SDY_1938 SDY_1939 pspC pspB TRUE 0.989 0.000 0.913 NA   NA
 1155767 1155768 SDY_1939 SDY_1940 pspB pspA TRUE 0.963 54.000 0.739 NA   NA
 1155770 1155771 SDY_1942 SDY_1943 goaG ordL FALSE 0.638 38.000 0.000 NA   NA
 1155771 1155772 SDY_1943 SDY_1944 ordL aldH TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1155772 1155773 SDY_1944 SDY_1945 aldH ycjC FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 1155773 1155774 SDY_1945 SDY_1946 ycjC ycjL TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1155775 1155776 SDY_1947 SDY_1948   ycjJ FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 1155777 1155778 SDY_1949 SDY_1950     FALSE 0.003 522.000 0.000 NA   NA
 1155778 1155779 SDY_1950 SDY_1951     FALSE 0.291 76.000 0.000 NA   NA
 1155786 1155787 SDY_1958 SDY_1959 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155787 1155788 SDY_1959 SDY_1960 insB   FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1155788 1155789 SDY_1960 SDY_1961     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1155791 1155792 SDY_1963 SDY_1964 manX manY FALSE 0.377 63.000 0.000 NA   NA
 1155792 1155793 SDY_1964 SDY_1965 manY manZ TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155793 1155794 SDY_1965 SDY_1966 manZ   TRUE 0.962 55.000 0.755 NA   NA
 1155794 1155795 SDY_1966 SDY_1967     FALSE 0.006 375.000 0.000 NA   NA
 1155796 1155797 SDY_1968 SDY_1969 yebH cspC FALSE 0.229 166.000 0.038 1.000   NA
 1155797 1155798 SDY_1969 SDY_1970 cspC   TRUE 0.915 13.000 0.214 NA   NA
 1155800 1155801 SDY_1972 SDY_1973     TRUE 0.881 75.000 0.500 NA   NA
 1155805 1155806 SDY_1977 SDY_1978 htpX prc FALSE 0.210 192.000 0.042 0.018 N NA
 1155806 1155807 SDY_1978 SDY_1979 prc proQ TRUE 0.942 20.000 0.304 NA N NA
 1155807 1155808 SDY_1979 SDY_1980 proQ   TRUE 0.801 97.000 0.081 NA Y NA
 1155809 1155810 SDY_1981 SDY_1982     TRUE 0.704 37.000 0.038 NA   NA
 1155810 1155811 SDY_1982 SDY_1983     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1155811 1155812 SDY_1983 SDY_1984     TRUE 0.648 30.000 0.000 NA   NA
 1155812 1155813 SDY_1984 SDY_1985     TRUE 0.942 -37.000 0.840 NA   NA
 1155813 1155814 SDY_1985 SDY_1986   yebU TRUE 0.862 74.000 0.420 NA   NA
 1155814 1155815 SDY_1986 SDY_1987 yebU   FALSE 0.482 103.000 0.121 NA   NA
 1155815 1155816 SDY_1987 SDY_1988     TRUE 0.958 21.000 0.353 NA   NA
 1155817 1155818 SDY_1989 SDY_1990 pphA   FALSE 0.331 -37.000 0.000 NA   NA
 1155819 1155820 SDY_1991 SDY_1992     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1155822 1155823 SDY_1994 SDY_1995     TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1155823 1155824 SDY_1995 SDY_1996     TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1155824 1155825 SDY_1996 SDY_1997     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155825 1155826 SDY_1997 SDY_1998   ybcR FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 1155826 1155827 SDY_1998 SDY_1999 ybcR   FALSE 0.083 185.000 0.000 NA   NA
 1155827 1155828 SDY_1999 SDY_2000     FALSE 0.584 141.000 0.182 NA   NA
 1155830 1155831 SDY_2002 SDY_2003   ipaH_5 FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 1155832 1155833 SDY_2004 SDY_2005     FALSE 0.288 192.000 0.182 NA   NA
 1155833 1155834 SDY_2005 SDY_2006     FALSE 0.387 62.000 0.000 NA   NA
 1155834 1155835 SDY_2006 SDY_2007     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155836 1155837 SDY_2008 SDY_2009     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155837 1155838 SDY_2009 SDY_2010     FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1155838 1155839 SDY_2010 SDY_2011   ybhE FALSE 0.222 108.000 0.000 NA   NA
 1155840 1155841 SDY_2012 SDY_2013     FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1155842 1155843 SDY_2014 SDY_2015   ycgW FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1155845 1155846 SDY_2017 SDY_2018 ymfC   TRUE 0.927 10.000 0.182 1.000 N NA
 1155846 1155847 SDY_2018 SDY_2019   trmU TRUE 0.829 54.000 0.158 1.000 N NA
 1155847 1155848 SDY_2019 SDY_2020 trmU ycfC TRUE 0.906 36.000 0.180 NA   NA
 1155848 1155849 SDY_2020 SDY_2021 ycfC purB TRUE 0.873 4.000 0.093 NA   NA
 1155849 1155850 SDY_2021 SDY_2022 purB phoP FALSE 0.129 169.000 0.011 1.000 N NA
 1155850 1155851 SDY_2022 SDY_2023 phoP phoQ TRUE 0.997 0.000 0.940 1.000 Y NA
 1155851 1155852 SDY_2023 SDY_2024 phoQ ycfD TRUE 0.882 67.000 0.408 NA   NA
 1155854 1155855 SDY_2026 SDY_2027 potA potB TRUE 0.994 14.000 0.789 1.000 Y NA
 1155855 1155856 SDY_2027 SDY_2028 potB potC TRUE 0.992 -3.000 0.286 0.042 Y NA
 1155856 1155857 SDY_2028 SDY_2029 potC potD TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.042 Y NA
 1155858 1155859 SDY_2030 SDY_2031 cobB ycfX TRUE 0.971 16.000 0.119 1.000 Y NA
 1155859 1155860 SDY_2031 SDY_2032 ycfX ycfW TRUE 0.939 29.000 0.225 1.000 N NA
 1155860 1155861 SDY_2032 SDY_2033 ycfW lolD TRUE 0.946 0.000 0.125 0.053 N NA
 1155861 1155862 SDY_2033 SDY_2034 lolD ycfU TRUE 0.907 -7.000 0.175 0.053 N NA
 1155863 1155864 SDY_2035 SDY_2036 ycfT mfd FALSE 0.287 128.000 0.003 1.000   NA
 1155864 1155865 SDY_2036 SDY_2037 mfd ycfS FALSE 0.222 142.000 0.006 1.000   NA
 1155868 1155869 SDY_2040 SDY_2041 ycfJ ndh FALSE 0.100 227.000 0.071 1.000   NA
 1155869 1155870 SDY_2041 SDY_2042 ndh ycfP FALSE 0.009 406.000 0.057 NA   NA
 1155870 1155871 SDY_2042 SDY_2043 ycfP ycfO TRUE 0.838 23.000 0.091 NA   NA
 1155871 1155872 SDY_2043 SDY_2044 ycfO ycfN TRUE 0.817 11.000 0.069 1.000 N NA
 1155872 1155873 SDY_2044 SDY_2045 ycfN ycfM TRUE 0.882 -19.000 0.310 NA   NA
 1155873 1155874 SDY_2045 SDY_2046 ycfM ycfL TRUE 0.965 14.000 0.516 NA   NA
 1155874 1155875 SDY_2046 SDY_2047 ycfL ycfF TRUE 0.819 3.000 0.051 NA   NA
 1155877 1155878 SDY_2049 SDY_2050 ptsG ycfH FALSE 0.006 295.000 0.004 NA N NA
 1155878 1155879 SDY_2050 SDY_2051 ycfH holB TRUE 0.969 11.000 0.110 NA Y NA
 1155879 1155880 SDY_2051 SDY_2052 holB tmk TRUE 0.935 -3.000 0.211 1.000 N NA
 1155880 1155881 SDY_2052 SDY_2053 tmk yceG TRUE 0.934 -10.000 0.209 0.001   NA
 1155881 1155882 SDY_2053 SDY_2054 yceG pabC TRUE 0.956 3.000 0.204 1.000   NA
 1155882 1155883 SDY_2054 SDY_2055 pabC fabF TRUE 0.694 120.000 0.187 1.000 N NA
 1155883 1155884 SDY_2055 SDY_2056 fabF acpP TRUE 0.949 86.000 0.346 1.000 Y NA
 1155884 1155885 SDY_2056 SDY_2057 acpP fabG TRUE 0.781 211.000 0.321 0.003 Y NA
 1155885 1155886 SDY_2057 SDY_2058 fabG fabD TRUE 0.994 13.000 0.432 0.003 Y NA
 1155886 1155887 SDY_2058 SDY_2059 fabD fabH TRUE 0.987 16.000 0.182 0.003 Y NA
 1155887 1155888 SDY_2059 SDY_2060 fabH plsX TRUE 0.979 68.000 0.380 0.003 Y NA
 1155888 1155889 SDY_2060 SDY_2061 plsX rpmF TRUE 0.853 81.000 0.418 1.000 N NA
 1155889 1155890 SDY_2061 SDY_2062 rpmF yceD TRUE 0.958 52.000 0.599 NA   NA
 1155890 1155891 SDY_2062 SDY_2063 yceD   FALSE 0.003 573.000 0.000 NA   NA
 1155893 1155894 SDY_2065 SDY_2066 yceC   FALSE 0.180 118.000 0.005 NA   NA
 1155896 1155897 SDY_2068 SDY_2069 flgL flgK FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1155897 1155898 SDY_2069 SDY_2070 flgK flgJ FALSE 0.352 66.000 0.000 NA   NA
 1155898 1155899 SDY_2070 SDY_2071 flgJ flgI TRUE 0.984 0.000 0.036 0.002 Y NA
 1155899 1155900 SDY_2071 SDY_2072 flgI flgH TRUE 0.979 12.000 0.073 0.002 Y NA
 1155900 1155901 SDY_2072 SDY_2073 flgH flgG FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1155901 1155902 SDY_2073 SDY_2074 flgG flgF FALSE 0.219 138.000 0.000 NA   NA
 1155902 1155903 SDY_2074 SDY_2075 flgF flgE FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1155903 1155904 SDY_2075 SDY_2076 flgE flgD TRUE 0.972 25.000 0.116 NA Y NA
 1155904 1155905 SDY_2076 SDY_2077 flgD flgC TRUE 0.978 12.000 0.186 NA Y NA
 1155905 1155906 SDY_2077 SDY_2078 flgC flgB TRUE 0.998 4.000 0.824 0.001 Y NA
 1155907 1155908 SDY_2079 SDY_2080   flgA FALSE 0.118 151.000 0.000 NA N NA
 1155908 1155909 SDY_2080 SDY_2081 flgA flgM TRUE 0.947 76.000 0.330 NA Y NA
 1155909 1155910 SDY_2081 SDY_2082 flgM flgN TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155911 1155912 SDY_2083 SDY_2084 mviN mviM FALSE 0.324 110.000 0.022 1.000   NA
 1155912 1155913 SDY_2084 SDY_2085 mviM yceH TRUE 0.893 2.000 0.103 NA   NA
 1155913 1155914 SDY_2085 SDY_2086 yceH rimJ TRUE 0.854 11.000 0.116 NA   NA
 1155914 1155915 SDY_2086 SDY_2087 rimJ   FALSE 0.089 170.000 0.000 NA N NA
 1155916 1155917 SDY_2088 SDY_2089 yceL grxB FALSE 0.636 64.000 0.103 NA   NA
 1155917 1155918 SDY_2089 SDY_2090 grxB yceB FALSE 0.412 134.000 0.078 NA   NA
 1155918 1155919 SDY_2090 SDY_2091 yceB pyrC FALSE 0.212 106.000 0.022 NA   NA
 1155919 1155920 SDY_2091 SDY_2092 pyrC dinI FALSE 0.334 74.000 0.031 NA   NA
 1155922 1155923 SDY_2094 SDY_2095   yceP FALSE 0.117 171.000 0.000 NA   NA
 1155923 1155924 SDY_2095 SDY_2096 yceP solA TRUE 0.824 115.000 0.423 NA   NA
 1155924 1155925 SDY_2096 SDY_2097 solA yceO TRUE 0.943 21.000 0.269 NA   NA
 1155926 1155927 SDY_2098 SDY_2099   yeiL FALSE 0.003 425.000 0.000 NA N NA
 1155927 1155928 SDY_2099 SDY_2100 yeiL   FALSE 0.577 24.000 0.000 NA N NA
 1155930 1155931 SDY_2102 SDY_2103 insB insA FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 1155932 1155933 SDY_2104 SDY_2105 yeiK yeiJ TRUE 0.805 100.000 0.056 1.000 Y NA
 1155934 1155935 SDY_2106 SDY_2107 yeiI nfo FALSE 0.516 3.000 0.004 NA N NA
 1155935 1155936 SDY_2107 SDY_2108 nfo yeiH FALSE 0.374 74.000 0.040 NA   NA
 1155937 1155938 SDY_2109 SDY_2110 yeiE lysP FALSE 0.065 205.000 0.000 1.000 N NA
 1155938 1155939 SDY_2110 SDY_2111 lysP cirA FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 1155940 1155941 SDY_2112 SDY_2113 yeiG   FALSE 0.256 -72.000 0.000 NA   NA
 1155943 1155944 SDY_2115 SDY_2116     FALSE 0.034 229.000 0.000 NA   NA
 1155944 1155945 SDY_2116 SDY_2117     TRUE 0.983 12.000 1.000 NA   NA
 1155945 1155946 SDY_2117 SDY_2118     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155946 1155947 SDY_2118 SDY_2119     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155947 1155948 SDY_2119 SDY_2120     FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1155948 1155949 SDY_2120 SDY_2121     FALSE 0.002 638.000 0.000 NA   NA
 1155949 1155950 SDY_2121 SDY_2122   insB FALSE 0.224 93.000 0.000 NA   NA
 1155951 1155952 SDY_2123 SDY_2124     FALSE 0.001 830.000 0.000 NA N NA
 1155954 1155955 SDY_2126 SDY_2127   folE FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1155955 1155956 SDY_2127 SDY_2128 folE yeiB TRUE 0.978 17.000 0.719 NA   NA
 1155956 1155957 SDY_2128 SDY_2129 yeiB galS FALSE 0.105 372.000 0.500 NA   NA
 1155957 1155958 SDY_2129 SDY_2130 galS mglB FALSE 0.012 280.000 0.000 NA N NA
 1155960 1155961 SDY_2132 SDY_2133   mglA FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155961 1155962 SDY_2133 SDY_2134 mglA insB FALSE 0.229 -655.000 0.000 NA   NA
 1155963 1155964 SDY_2135 SDY_2136 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155966 1155967 SDY_2139 SDY_2138 yeiA   FALSE 0.230 -592.000 0.000 NA   NA
 1155967 1155968 SDY_2138 SDY_2140     FALSE 0.001 1552.000 0.000 NA N NA
 1155970 1155971 SDY_2142 SDY_2143   sanA TRUE 0.709 3.000 0.019 NA   NA
 1155971 1155972 SDY_2143 SDY_2144 sanA cdd FALSE 0.226 150.000 0.045 NA   NA
 1155972 1155973 SDY_2144 SDY_2145 cdd yohK TRUE 0.693 130.000 0.198 1.000 N NA
 1155973 1155974 SDY_2145 SDY_2146 yohK yohJ TRUE 0.964 -3.000 0.340 1.000   NA
 1155977 1155978 SDY_2149 SDY_2150 yohH yohG TRUE 0.729 94.000 0.286 NA   NA
 1155978 1155979 SDY_2150 SDY_2151 yohG yohF FALSE 0.137 220.000 0.105 1.000   NA
 1155981 1155982 SDY_2153 SDY_2154 yohC pbpG FALSE 0.387 165.000 0.145 NA   NA
 1155984 1155985 SDY_2156 SDY_2157 bglX yehZ FALSE 0.077 252.000 0.099 1.000 N NA
 1155985 1155986 SDY_2157 SDY_2158 yehZ yehY TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1155986 1155987 SDY_2158 SDY_2159 yehY yehX FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1155987 1155988 SDY_2159 SDY_2160 yehX yehW TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155989 1155990 SDY_2161 SDY_2162   yehV FALSE 0.409 60.000 0.000 NA   NA
 1155991 1155992 SDY_2163 SDY_2164 yehU yehT TRUE 0.993 -18.000 0.877 0.009 Y NA
 1155992 1155993 SDY_2164 SDY_2165 yehT yehS TRUE 0.661 47.000 0.051 NA   NA
 1155994 1155995 SDY_2166 SDY_2167 yehR   FALSE 0.237 113.000 0.000 NA   NA
 1155995 1155996 SDY_2167 SDY_2168     TRUE 0.650 28.000 0.000 NA   NA
 1155996 1155997 SDY_2168 SDY_2169     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155997 1155998 SDY_2169 SDY_2170     FALSE 0.629 42.000 0.000 NA   NA
 1155998 1155999 SDY_2170 SDY_2171     TRUE 0.732 -27.000 0.160 NA   NA
 1155999 1156000 SDY_2171 SDY_2172   yehP FALSE 0.445 -15.000 0.000 NA   NA
 1156000 1156001 SDY_2172 SDY_2173 yehP   FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1156001 1156002 SDY_2173 SDY_2174     FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1156004 1156005 SDY_2176 SDY_2177   molR_D TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1156005 1156006 SDY_2177 SDY_2178 molR_D   FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1156006 1156007 SDY_2178 SDY_2179     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1156007 1156008 SDY_2179 SDY_2180     FALSE 0.323 -40.000 0.000 NA   NA
 1156008 1156009 SDY_2180 SDY_2181   metG FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 1156010 1156011 SDY_2182 SDY_2183 mrp yehE FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 1156011 1156012 SDY_2183 SDY_2184 yehE   FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1156012 1156013 SDY_2184 SDY_2185     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156014 1156015 SDY_2186 SDY_2187 baeR baeS TRUE 0.994 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 1156015 1156016 SDY_2187 SDY_2188 baeS yegB FALSE 0.564 -106.000 0.139 NA   NA
 1156016 1156017 SDY_2188 SDY_2189 yegB   FALSE 0.342 67.000 0.000 NA   NA
 1156018 1156019 SDY_2190 SDY_2191     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156019 1156020 SDY_2191 SDY_2192     TRUE 0.973 -3.000 0.455 1.000   NA
 1156024 1156025 SDY_2196 SDY_2197 udk dcd TRUE 0.855 92.000 0.098 1.000 Y NA
 1156025 1156026 SDY_2197 SDY_2198 dcd asmA TRUE 0.744 22.000 0.057 NA N NA
 1156027 1156028 SDY_2199 SDY_2200     TRUE 0.897 -10.000 0.286 NA   NA
 1156028 1156029 SDY_2200 SDY_2201   yegH FALSE 0.009 338.000 0.000 NA   NA
 1156030 1156031 SDY_2202 SDY_2203   galF FALSE 0.028 219.000 0.000 NA N NA
 1156031 1156032 SDY_2203 SDY_2204 galF rfbB FALSE 0.077 372.000 0.000 1.000 Y NA
 1156032 1156033 SDY_2204 SDY_2205 rfbB rfbD TRUE 0.988 0.000 0.084 0.001 Y NA
 1156033 1156034 SDY_2205 SDY_2206 rfbD rfbA TRUE 0.953 58.000 0.053 0.001 Y NA
 1156034 1156035 SDY_2206 SDY_2207 rfbA rfbC TRUE 0.989 3.000 0.211 1.000 Y NA
 1156035 1156036 SDY_2207 SDY_2208 rfbC rfbX TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1156036 1156037 SDY_2208 SDY_2209 rfbX rfc TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156037 1156038 SDY_2209 SDY_2210 rfc rfbR FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1156038 1156039 SDY_2210 SDY_2211 rfbR rfbQ TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1156039 1156040 SDY_2211 SDY_2212 rfbQ gnd FALSE 0.002 1186.000 0.000 NA   NA
 1156040 1156041 SDY_2212 SDY_2213 gnd ugd FALSE 0.032 250.000 0.000 1.000 N NA
 1156041 1156042 SDY_2213 SDY_2214 ugd wzzB TRUE 0.795 90.000 0.000 1.000 Y NA
 1156043 1156044 SDY_2215 SDY_2216 hisI hisF TRUE 0.992 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 1156044 1156045 SDY_2216 SDY_2217 hisF hisA TRUE 0.934 -18.000 0.003 0.002 Y NA
 1156045 1156046 SDY_2217 SDY_2218 hisA hisH TRUE 0.981 0.000 0.010 0.002 Y NA
 1156046 1156047 SDY_2218 SDY_2219 hisH hisB TRUE 0.990 0.000 0.128 0.002 Y NA
 1156047 1156048 SDY_2219 SDY_2220 hisB hisC TRUE 0.996 0.000 0.341 0.002 Y NA
 1156048 1156049 SDY_2220 SDY_2221 hisC hisD TRUE 0.993 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 1156049 1156050 SDY_2221 SDY_2222 hisD hisG TRUE 0.990 6.000 0.171 0.002 Y NA
 1156051 1156052 SDY_2223 SDY_2224   yeeY FALSE 0.637 46.000 0.015 1.000   NA
 1156052 1156053 SDY_2224 SDY_2225 yeeY   FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1156053 1156054 SDY_2225 SDY_2226   yeeF FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1156054 1156055 SDY_2226 SDY_2227 yeeF yeeE FALSE 0.099 179.000 0.000 NA   NA
 1156056 1156057 SDY_2228 SDY_2229     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1156059 1156060 SDY_2231 SDY_2232 sbcB   FALSE 0.206 251.000 0.000 NA Y NA
 1156061 1156062 SDY_2233 SDY_2234 dacD sbmC FALSE 0.247 119.000 0.000 NA   NA
 1156062 1156063 SDY_2234 SDY_2235 sbmC   FALSE 0.234 -550.000 0.000 NA   NA
 1156063 1156064 SDY_2235 SDY_2236   yeeA FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 1156064 1156065 SDY_2236 SDY_2237 yeeA yeeX FALSE 0.598 106.000 0.180 NA   NA
 1156067 1156068 SDY_2239 SDY_2240   cobU FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   NA
 1156068 1156069 SDY_2240 SDY_2241 cobU cobS TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1156069 1156070 SDY_2241 SDY_2242 cobS cobT TRUE 0.976 12.000 0.056 0.003 Y NA
 1156070 1156071 SDY_2242 SDY_2243 cobT erfK FALSE 0.324 65.000 0.015 NA   NA
 1156073 1156074 SDY_2245 SDY_2246 nac cbl TRUE 0.932 102.000 0.222 0.037 Y NA
 1156076 1156077 SDY_2248 SDY_2249     TRUE 0.900 -9.000 0.120 0.001   NA
 1156077 1156078 SDY_2249 SDY_2250     FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1156078 1156079 SDY_2250 SDY_2251   insA FALSE 0.246 128.000 0.000 NA   NA
 1156079 1156080 SDY_2251 SDY_2252 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156081 1156082 SDY_2253 SDY_2254 amn shiA FALSE 0.250 102.000 0.021 1.000 N NA
 1156082 1156083 SDY_2254 SDY_2255 shiA   FALSE 0.004 462.000 0.000 NA   NA
 1156083 1156084 SDY_2255 SDY_2256     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156085 1156086 SDY_2257 SDY_2258     FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1156086 1156087 SDY_2258 SDY_2259   yegQ FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1156090 1156091 SDY_2262 SDY_2263 gatR gatD FALSE 0.257 100.000 0.000 1.000 N NA
 1156091 1156092 SDY_2263 SDY_2264 gatD gatC FALSE 0.079 186.000 0.000 NA   NA
 1156092 1156093 SDY_2264 SDY_2265 gatC gatB TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1156093 1156094 SDY_2265 SDY_2266 gatB gatA TRUE 0.648 31.000 0.000 NA   NA
 1156094 1156095 SDY_2266 SDY_2267 gatA   FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1156095 1156096 SDY_2267 SDY_2268   gatZ FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1156096 1156097 SDY_2268 SDY_2269 gatZ gatY TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1156097 1156098 SDY_2269 SDY_2270 gatY   FALSE 0.426 230.000 0.000 0.001 Y NA
 1156099 1156100 SDY_2271 SDY_2272 yegT   TRUE 0.960 -3.000 0.364 NA   NA
 1156100 1156101 SDY_2272 SDY_2273     TRUE 0.975 -3.000 0.600 NA N NA
 1156102 1156103 SDY_2274 SDY_2275 yegW yegX FALSE 0.570 52.000 0.000 1.000 N NA
 1156103 1156104 SDY_2275 SDY_2276 yegX   TRUE 0.895 13.000 0.048 0.001   NA
 1156104 1156105 SDY_2276 SDY_2277   thiD FALSE 0.481 65.000 0.000 1.000   NA
 1156105 1156106 SDY_2277 SDY_2278 thiD thiM TRUE 0.977 -3.000 0.037 0.003 Y NA
 1156106 1156107 SDY_2278 SDY_2279 thiM yohL FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 1156108 1156109 SDY_2280 SDY_2281 yohM   FALSE 0.638 38.000 0.000 NA   NA
 1156111 1156112 SDY_2283 SDY_2284     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156115 1156116 SDY_2287 SDY_2288 yehB insB FALSE 0.191 121.000 0.000 NA N NA
 1156116 1156117 SDY_2288 SDY_2289 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156117 1156118 SDY_2289 SDY_2290 insA   TRUE 0.959 29.000 0.000 1.000 Y NA
 1156118 1156119 SDY_2290 SDY_2291     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1156119 1156120 SDY_2291 SDY_2292   yceA FALSE 0.177 145.000 0.000 NA   NA
 1156122 1156123 SDY_2294 SDY_2295     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1156123 1156124 SDY_2295 SDY_2296     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1156125 1156126 SDY_2297 SDY_2298 yceE   FALSE 0.277 -45.000 0.000 NA   NA
 1156126 1156127 SDY_2298 SDY_2299   msyB TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1156128 1156129 SDY_2300 SDY_2301 yceK mdoH FALSE 0.336 173.000 0.135 NA   NA
 1156129 1156130 SDY_2301 SDY_2302 mdoH mdoG TRUE 0.952 -7.000 0.469 1.000 N NA
 1156132 1156133 SDY_2304 SDY_2305 ymdC   FALSE 0.358 -58.000 0.046 NA   NA
 1156133 1156134 SDY_2305 SDY_2306     FALSE 0.234 95.000 0.028 NA   NA
 1156135 1156136 SDY_2307 SDY_2308 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156136 1156137 SDY_2308 SDY_2309 insB   TRUE 0.642 36.000 0.000 NA   NA
 1156137 1156138 SDY_2309 SDY_2310     FALSE 0.239 130.000 0.000 NA   NA
 1156139 1156140 SDY_2311 SDY_2312 yceI   TRUE 0.985 4.000 0.676 NA   NA
 1156140 1156141 SDY_2312 SDY_2313     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1156143 1156144 SDY_2315 SDY_2316 fruA fruK TRUE 0.993 17.000 0.562 1.000 Y NA
 1156144 1156145 SDY_2316 SDY_2317 fruK fruB TRUE 0.982 0.000 0.112 1.000 Y NA
 1156145 1156146 SDY_2317 SDY_2318 fruB   FALSE 0.013 272.000 0.000 NA N NA
 1156147 1156148 SDY_2319 SDY_2320 ycbP ycbO TRUE 0.873 -7.000 0.169 1.000   NA
 1156148 1156149 SDY_2320 SDY_2321 ycbO   TRUE 0.871 -40.000 0.341 1.000   NA
 1156149 1156150 SDY_2321 SDY_2322     TRUE 0.918 -3.000 0.049 0.000   NA
 1156150 1156151 SDY_2322 SDY_2323   ycbM TRUE 0.937 12.000 0.226 1.000   NA
 1156151 1156152 SDY_2323 SDY_2324 ycbM ycbE TRUE 0.706 230.000 0.472 1.000 Y NA
 1156154 1156155 SDY_2326 SDY_2327 pncB asnS FALSE 0.178 170.000 0.034 1.000 N NA
 1156155 1156156 SDY_2327 SDY_2328 asnS ompF FALSE 0.003 603.000 0.000 1.000 N NA
 1156156 1156157 SDY_2328 SDY_2329 ompF aspC FALSE 0.128 185.000 0.036 1.000 N NA
 1156158 1156159 SDY_2330 SDY_2331 ycbL ycbK TRUE 0.835 27.000 0.089 NA   NA
 1156159 1156160 SDY_2331 SDY_2332 ycbK ycbB FALSE 0.581 181.000 0.372 NA   NA
 1156160 1156161 SDY_2332 SDY_2333 ycbB   FALSE 0.079 186.000 0.000 NA   NA
 1156161 1156162 SDY_2333 SDY_2334   mukB FALSE 0.004 402.000 0.000 NA N NA
 1156162 1156163 SDY_2334 SDY_2335 mukB mukE TRUE 0.984 0.000 0.000 0.000 Y NA
 1156163 1156164 SDY_2335 SDY_2336 mukE mukF TRUE 0.960 8.000 0.036 NA Y NA
 1156164 1156165 SDY_2336 SDY_2337 mukF smtA TRUE 0.950 -3.000 0.325 NA N NA
 1156167 1156168 SDY_2339 SDY_2340   kdsB FALSE 0.150 154.000 0.023 NA   NA
 1156168 1156169 SDY_2340 SDY_2341 kdsB ycaR TRUE 0.944 -3.000 0.265 NA   NA
 1156169 1156170 SDY_2341 SDY_2342 ycaR ycaQ FALSE 0.468 52.000 0.016 NA   NA
 1156170 1156171 SDY_2342 SDY_2343 ycaQ ycaH FALSE 0.609 37.000 0.017 NA   NA
 1156171 1156172 SDY_2343 SDY_2344 ycaH msbA TRUE 0.933 -3.000 0.205 1.000 N NA
 1156172 1156173 SDY_2344 SDY_2345 msbA ycaI TRUE 0.903 37.000 0.075 0.062   NA
 1156173 1156174 SDY_2345 SDY_2346 ycaI himD FALSE 0.059 207.000 0.003 1.000   NA
 1156174 1156175 SDY_2346 SDY_2347 himD rpsA TRUE 0.640 160.000 0.292 1.000 N NA
 1156175 1156176 SDY_2347 SDY_2348 rpsA cmk TRUE 0.756 111.000 0.281 1.000 N NA
 1156176 1156177 SDY_2348 SDY_2349 cmk ycaL FALSE 0.108 173.000 0.004 1.000 N NA
 1156178 1156179 SDY_2350 SDY_2351     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1156179 1156180 SDY_2351 SDY_2352     FALSE 0.392 198.000 0.000 NA Y NA
 1156181 1156182 SDY_2353 SDY_2354 aroA serC TRUE 0.858 71.000 0.033 1.000 Y NA
 1156182 1156183 SDY_2354 SDY_2355 serC ycaP FALSE 0.047 199.000 0.014 NA   NA
 1156184 1156185 SDY_2356 SDY_2357 ycaO focA FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 1156185 1156186 SDY_2357 SDY_2358 focA pflB TRUE 0.920 55.000 0.345 1.000 N NA
 1156186 1156187 SDY_2358 SDY_2359 pflB pflA FALSE 0.187 192.000 0.092 1.000 N NA
 1156190 1156191 SDY_2361 SDY_2363   ycaD FALSE 0.002 490.000 0.000 NA N NA
 1156193 1156194 SDY_2365 SDY_2366 dmsC dmsB TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1156194 1156195 SDY_2366 SDY_2367 dmsB dmsA FALSE 0.634 11.000 0.000 NA   NA
 1156195 1156196 SDY_2367 SDY_2368 dmsA serS FALSE 0.015 326.000 0.000 1.000 N NA
 1156196 1156197 SDY_2368 SDY_2369 serS ycaJ FALSE 0.586 91.000 0.078 0.068 N NA
 1156197 1156198 SDY_2369 SDY_2370 ycaJ lolA TRUE 0.906 11.000 0.167 1.000 N NA
 1156198 1156199 SDY_2370 SDY_2371 lolA ftsK TRUE 0.674 152.000 0.305 1.000 N NA
 1156199 1156200 SDY_2371 SDY_2372 ftsK lrp TRUE 0.794 135.000 0.345 1.000 N NA
 1156201 1156202 SDY_2373 SDY_2374 trxB cydD TRUE 0.831 123.000 0.049 1.000 Y NA
 1156202 1156203 SDY_2374 SDY_2375 cydD cydC TRUE 0.998 1.000 0.631 0.004 Y NA
 1156203 1156204 SDY_2375 SDY_2376 cydC aat TRUE 0.962 42.000 0.049 1.000 Y NA
 1156204 1156205 SDY_2376 SDY_2377 aat infA FALSE 0.020 285.000 0.020 1.000 N NA
 1156205 1156206 SDY_2377 SDY_2378 infA   FALSE 0.023 254.000 0.000 NA   NA
 1156207 1156208 SDY_2379 SDY_2380 clpA yljA TRUE 0.976 30.000 0.596 NA   NA
 1156210 1156211 SDY_2382 SDY_2383 ybjZ   TRUE 0.988 -3.000 0.789 0.066 N NA
 1156213 1156214 SDY_2385 SDY_2386 ybjD insB FALSE 0.573 173.000 0.000 NA Y NA
 1156214 1156215 SDY_2386 SDY_2387 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156216 1156217 SDY_2388 SDY_2389 aqpZ ybjE FALSE 0.237 134.000 0.025 NA   NA
 1156217 1156218 SDY_2389 SDY_2390 ybjE ybjW FALSE 0.179 144.000 0.000 NA   NA
 1156218 1156219 SDY_2390 SDY_2391 ybjW   TRUE 0.968 12.000 0.000 0.012 Y NA
 1156219 1156220 SDY_2391 SDY_2392   poxB FALSE 0.295 133.000 0.025 1.000 N NA
 1156220 1156221 SDY_2392 SDY_2393 poxB ybjU TRUE 0.962 37.000 0.041 1.000 Y NA
 1156221 1156222 SDY_2393 SDY_2394 ybjU ybjT TRUE 0.824 11.000 0.074 1.000 N NA
 1156222 1156223 SDY_2394 SDY_2395 ybjT   TRUE 0.927 63.000 0.022 0.002 Y NA
 1156224 1156225 SDY_2396 SDY_2397     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156227 1156228 SDY_2399 SDY_2400     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1156228 1156229 SDY_2400 SDY_2401     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1156230 1156231 SDY_2402 SDY_2403   ybjP FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 1156231 1156232 SDY_2403 SDY_2404 ybjP artP FALSE 0.090 218.000 0.081 NA   NA
 1156232 1156233 SDY_2404 SDY_2405 artP artI TRUE 0.988 18.000 0.323 1.000 Y NA
 1156233 1156234 SDY_2405 SDY_2406 artI artQ TRUE 0.992 7.000 0.260 0.041 Y NA
 1156234 1156235 SDY_2406 SDY_2407 artQ artM TRUE 0.998 0.000 0.714 0.012 Y NA
 1156235 1156236 SDY_2407 SDY_2408 artM artJ FALSE 0.015 291.000 0.000 NA   NA
 1156237 1156238 SDY_2409 SDY_2410     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156238 1156239 SDY_2410 SDY_2411     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156239 1156240 SDY_2411 SDY_2412     FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1156242 1156243 SDY_2414 SDY_2415     FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1156245 1156246 SDY_2417 SDY_2418 ninB   FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1156246 1156247 SDY_2418 SDY_2419     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1156249 1156250 SDY_2421 SDY_2422     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156250 1156251 SDY_2422 SDY_2423   gyrA FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1156253 1156254 SDY_2425 SDY_2426 yfaL   FALSE 0.223 136.000 0.000 NA   NA
 1156254 1156255 SDY_2426 SDY_2427     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 1156256 1156257 SDY_2428 SDY_2429 nrdA nrdB TRUE 0.824 146.000 0.000 0.001 Y NA
 1156257 1156258 SDY_2429 SDY_2430 nrdB yfaE TRUE 0.808 0.000 0.034 1.000 N NA
 1156259 1156260 SDY_2431 SDY_2432 inaA   FALSE 0.310 171.000 0.000 0.041   NA
 1156262 1156263 SDY_2434 SDY_2435 glpQ glpT TRUE 0.972 5.000 0.396 1.000 N NA
 1156264 1156265 SDY_2436 SDY_2437 glpA glpB TRUE 0.976 -10.000 0.650 0.001 N NA
 1156265 1156266 SDY_2437 SDY_2438 glpB glpC TRUE 0.986 -3.000 0.547 0.001 N NA
 1156266 1156267 SDY_2438 SDY_2439 glpC yfaD FALSE 0.064 193.000 0.000 NA   NA
 1156268 1156269 SDY_2440 SDY_2441     FALSE 0.622 18.000 0.000 NA   NA
 1156271 1156272 SDY_2443 SDY_2444   insB FALSE 0.218 -962.000 0.000 NA   NA
 1156272 1156273 SDY_2444 SDY_2445 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156273 1156274 SDY_2445 SDY_2446 insA   FALSE 0.019 268.000 0.000 NA   NA
 1156274 1156275 SDY_2446 SDY_2447     FALSE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 1156276 1156277 SDY_2448 SDY_2449     FALSE 0.257 84.000 0.000 NA   NA
 1156277 1156278 SDY_2449 SDY_2450     TRUE 0.971 4.000 0.378 NA   NA
 1156278 1156279 SDY_2450 SDY_2451     FALSE 0.329 191.000 0.220 NA N NA
 1156279 1156280 SDY_2451 SDY_2452     FALSE 0.129 345.000 0.447 1.000 N NA
 1156280 1156281 SDY_2452 SDY_2453     TRUE 0.797 0.000 0.031 1.000 N NA
 1156281 1156282 SDY_2453 SDY_2454     FALSE 0.010 332.000 0.000 NA   NA
 1156283 1156284 SDY_2455 SDY_2456 pmrD menE FALSE 0.203 80.000 0.005 NA   NA
 1156284 1156285 SDY_2456 SDY_2457 menE menC TRUE 0.972 -3.000 0.283 0.001 N NA
 1156285 1156286 SDY_2457 SDY_2458 menC menB TRUE 0.992 0.000 0.171 0.001 Y NA
 1156286 1156287 SDY_2458 SDY_2459 menB yfbB TRUE 0.933 15.000 0.280 NA   NA
 1156287 1156288 SDY_2459 SDY_2460 yfbB menD TRUE 0.960 -3.000 0.355 NA   NA
 1156288 1156289 SDY_2460 SDY_2461 menD menF TRUE 0.934 89.000 0.281 1.000 Y NA
 1156289 1156290 SDY_2461 SDY_2462 menF elaB FALSE 0.362 79.000 0.043 NA   NA
 1156290 1156291 SDY_2462 SDY_2463 elaB elaA TRUE 0.672 55.000 0.077 NA   NA
 1156292 1156293 SDY_2464 SDY_2465 elaC elaD FALSE 0.074 188.000 0.000 NA   NA
 1156293 1156294 SDY_2465 SDY_2466 elaD insA FALSE 0.511 51.000 0.000 NA   NA
 1156294 1156295 SDY_2466 SDY_2467 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156297 1156298 SDY_2469 SDY_2470     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1156298 1156299 SDY_2470 SDY_2471   yfbM FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1156300 1156301 SDY_2472 SDY_2473 nuoN nuoM TRUE 0.996 7.000 0.437 0.001 Y NA
 1156301 1156302 SDY_2473 SDY_2474 nuoM nuoL TRUE 0.856 231.000 0.713 0.001 Y NA
 1156302 1156303 SDY_2474 SDY_2475 nuoL nuoK TRUE 0.990 -3.000 0.211 0.005 Y NA
 1156303 1156304 SDY_2475 SDY_2476 nuoK nuoJ TRUE 0.992 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 1156304 1156305 SDY_2476 SDY_2477 nuoJ nuoI TRUE 0.994 12.000 0.428 0.005 Y NA
 1156305 1156306 SDY_2477 SDY_2478 nuoI nuoH TRUE 0.993 15.000 0.423 0.005 Y NA
 1156306 1156307 SDY_2478 SDY_2479 nuoH nuoG TRUE 0.997 -3.000 0.664 0.005 Y NA
 1156307 1156308 SDY_2479 SDY_2480 nuoG nuoF TRUE 0.981 47.000 0.180 0.005 Y NA
 1156308 1156309 SDY_2480 SDY_2481 nuoF nuoE TRUE 0.989 -3.000 0.186 0.005 Y NA
 1156309 1156310 SDY_2481 SDY_2482 nuoE nuoC TRUE 0.996 3.000 0.407 0.005 Y NA
 1156310 1156311 SDY_2482 SDY_2483 nuoC nuoB TRUE 0.980 94.000 0.691 0.003 Y NA
 1156311 1156312 SDY_2483 SDY_2484 nuoB nuoA TRUE 0.993 16.000 0.377 0.003 Y NA
 1156312 1156313 SDY_2484 SDY_2485 nuoA lrhA FALSE 0.003 632.000 0.000 1.000 N NA
 1156314 1156315 SDY_2486 SDY_2487     FALSE 0.583 84.000 0.104 1.000   NA
 1156316 1156317 SDY_2488 SDY_2489 yfbS yfbT TRUE 0.805 87.000 0.308 1.000   NA
 1156317 1156318 SDY_2489 SDY_2490 yfbT   TRUE 0.959 11.000 0.375 NA   NA
 1156318 1156319 SDY_2490 SDY_2491     TRUE 0.722 83.000 0.221 NA   NA
 1156320 1156321 SDY_2492 SDY_2493 ackA pta TRUE 0.923 75.000 0.634 1.000   NA
 1156321 1156322 SDY_2493 SDY_2494 pta yfcC FALSE 0.112 190.000 0.000 1.000   NA
 1156323 1156324 SDY_2495 SDY_2496   yfcE TRUE 0.874 58.000 0.143 0.007   NA
 1156324 1156325 SDY_2496 SDY_2497 yfcE   FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1156325 1156326 SDY_2497 SDY_2498   yfcF TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1156327 1156328 SDY_2499 SDY_2500 yfcG folX FALSE 0.469 57.000 0.012 1.000 N NA
 1156328 1156329 SDY_2500 SDY_2501 folX   TRUE 0.893 21.000 0.122 1.000   NA
 1156331 1156332 SDY_2503 SDY_2504     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156333 1156334 SDY_2505 SDY_2506 hisP hisM TRUE 0.995 8.000 0.643 1.000 Y NA
 1156334 1156335 SDY_2506 SDY_2507 hisM hisQ TRUE 0.997 -3.000 0.900 0.012 Y NA
 1156335 1156336 SDY_2507 SDY_2508 hisQ hisJ TRUE 0.982 90.000 0.833 0.040 Y NA
 1156336 1156337 SDY_2508 SDY_2509 hisJ argT FALSE 0.428 221.000 0.000 0.009 Y NA
 1156337 1156338 SDY_2509 SDY_2510 argT ubiX FALSE 0.026 265.000 0.000 1.000 N NA
 1156338 1156339 SDY_2510 SDY_2511 ubiX purF FALSE 0.378 95.000 0.056 1.000 N NA
 1156339 1156340 SDY_2511 SDY_2512 purF cvpA TRUE 0.950 37.000 0.262 1.000   NA
 1156340 1156341 SDY_2512 SDY_2513 cvpA dedD FALSE 0.013 441.000 0.116 NA   NA
 1156341 1156342 SDY_2513 SDY_2514 dedD folC TRUE 0.867 -10.000 0.216 NA   NA
 1156342 1156343 SDY_2514 SDY_2515 folC accD TRUE 0.874 70.000 0.383 1.000 N NA
 1156343 1156344 SDY_2515 SDY_2516 accD dedA FALSE 0.139 156.000 0.020 NA   NA
 1156344 1156345 SDY_2516 SDY_2517 dedA truA FALSE 0.321 83.000 0.038 NA   NA
 1156345 1156346 SDY_2517 SDY_2518 truA usg TRUE 0.820 0.000 0.040 1.000 N NA
 1156346 1156347 SDY_2518 SDY_2519 usg pdxB TRUE 0.942 66.000 0.097 0.007 Y NA
 1156349 1156350 SDY_2521 SDY_2522   fabB FALSE 0.008 396.000 0.000 1.000   NA
 1156352 1156353 SDY_2524 SDY_2525     TRUE 0.965 34.000 0.425 NA   NA
 1156353 1156354 SDY_2525 SDY_2526   yfcA TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1156354 1156355 SDY_2526 SDY_2527 yfcA mepA TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1156355 1156356 SDY_2527 SDY_2528 mepA aroC TRUE 0.768 4.000 0.025 1.000 N NA
 1156356 1156357 SDY_2528 SDY_2530 aroC yfcB TRUE 0.838 35.000 0.081 1.000 N NA
 1156359 1156360 SDY_2531 SDY_2532     FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 1156360 1156361 SDY_2532 SDY_2533     TRUE 0.992 -3.000 0.286 0.003 Y NA
 1156361 1156362 SDY_2533 SDY_2534     TRUE 0.996 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 1156362 1156363 SDY_2534 SDY_2535   yfcS TRUE 0.988 16.000 0.333 1.000 Y NA
 1156363 1156364 SDY_2535 SDY_2536 yfcS   TRUE 0.988 23.000 1.000 1.000   NA
 1156364 1156365 SDY_2536 SDY_2537     TRUE 0.699 -21.000 0.000 0.040   NA
 1156365 1156366 SDY_2537 SDY_2538     FALSE 0.335 487.000 1.000 1.000 Y NA
 1156366 1156367 SDY_2538 SDY_2539   insB FALSE 0.004 386.000 0.000 NA N NA
 1156367 1156368 SDY_2539 SDY_2540 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156368 1156369 SDY_2540 SDY_2541 insA   FALSE 0.010 359.000 0.000 1.000 N NA
 1156369 1156370 SDY_2541 SDY_2542     FALSE 0.068 203.000 0.000 1.000 N NA
 1156370 1156371 SDY_2542 SDY_2543     TRUE 0.994 0.000 0.430 1.000 Y NA
 1156371 1156372 SDY_2543 SDY_2544     FALSE 0.172 181.000 0.061 NA   NA
 1156376 1156377 SDY_2548 SDY_2549 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156377 1156378 SDY_2549 SDY_2550 insA vacJ FALSE 0.002 1274.000 0.000 1.000 N NA
 1156379 1156380 SDY_2551 SDY_2552 yfdC   FALSE 0.291 76.000 0.000 NA   NA
 1156381 1156382 SDY_2553 SDY_2554 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156382 1156383 SDY_2554 SDY_2556 insA   FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1156388 1156389 SDY_2560 SDY_2561   dsdA TRUE 0.848 18.000 0.083 1.000   NA
 1156390 1156391 SDY_2562 SDY_2563 emrY emrK TRUE 0.991 0.000 1.000 1.000   NA
 1156392 1156393 SDY_2564 SDY_2565 evgA   FALSE 0.228 -718.000 0.000 NA   NA
 1156393 1156394 SDY_2565 SDY_2566   evgS FALSE 0.011 328.000 0.000 NA   NA
 1156395 1156396 SDY_2567 SDY_2568   insA FALSE 0.016 1124.000 0.000 NA Y NA
 1156396 1156397 SDY_2568 SDY_2569 insA yfdE FALSE 0.025 267.000 0.000 1.000 N NA
 1156397 1156398 SDY_2569 SDY_2570 yfdE   TRUE 0.748 35.000 0.000 1.000   NA
 1156398 1156399 SDY_2570 SDY_2571     FALSE 0.432 70.000 0.000 1.000   NA
 1156399 1156400 SDY_2571 SDY_2572     TRUE 0.805 54.000 0.134 1.000 N NA
 1156400 1156401 SDY_2572 SDY_2573     FALSE 0.003 512.000 0.000 NA   NA
 1156405 1156406 SDY_2577 SDY_2578     FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1156407 1156408 SDY_2579 SDY_2580     FALSE 0.599 15.000 0.000 NA   NA
 1156408 1156409 SDY_2580 SDY_2581     FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1156410 1156411 SDY_2582 SDY_2583     TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1156411 1156412 SDY_2583 SDY_2584     TRUE 0.656 0.000 0.009 NA   NA
 1156412 1156413 SDY_2584 SDY_2585     TRUE 0.674 15.000 0.011 1.000   NA
 1156413 1156414 SDY_2585 SDY_2586     TRUE 0.997 22.000 0.875 0.007 Y NA
 1156414 1156415 SDY_2586 SDY_2587   glk FALSE 0.433 219.000 0.091 1.000 Y NA
 1156415 1156416 SDY_2587 SDY_2588 glk   FALSE 0.008 379.000 0.000 1.000 N NA
 1156417 1156418 SDY_2589 SDY_2590     TRUE 0.952 24.000 0.000 NA Y NA
 1156420 1156421 SDY_2592 SDY_2593   nupC FALSE 0.246 128.000 0.000 NA   NA
 1156422 1156423 SDY_2594 SDY_2595 yfeA   FALSE 0.232 91.000 0.000 NA   NA
 1156424 1156425 SDY_2596 SDY_2597 yfeC yfeD TRUE 0.916 2.000 0.000 0.004   NA
 1156429 1156430 SDY_2601 SDY_2602     FALSE 0.623 44.000 0.000 NA   NA
 1156430 1156431 SDY_2602 SDY_2603     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1156431 1156432 SDY_2603 SDY_2604   flxA FALSE 0.017 275.000 0.000 NA   NA
 1156435 1156436 SDY_2607 SDY_2608   lig TRUE 0.710 2.000 0.017 NA   NA
 1156436 1156437 SDY_2608 SDY_2609 lig zipA FALSE 0.293 71.000 0.002 1.000 N NA
 1156438 1156439 SDY_2610 SDY_2611 cysZ cysK TRUE 0.667 185.000 0.122 1.000 Y NA
 1156439 1156440 SDY_2611 SDY_2612 cysK ptsH FALSE 0.007 384.000 0.019 1.000 N NA
 1156440 1156441 SDY_2612 SDY_2613 ptsH ptsI TRUE 0.965 45.000 0.000 0.007 Y NA
 1156441 1156442 SDY_2613 SDY_2614 ptsI crr TRUE 0.971 41.000 0.000 0.007 Y NA
 1156445 1156446 SDY_2617 SDY_2618 cysM cysA FALSE 0.369 134.000 0.049 1.000 N NA
 1156446 1156447 SDY_2618 SDY_2619 cysA cysW TRUE 0.964 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 1156447 1156448 SDY_2619 SDY_2620 cysW cysU TRUE 0.991 0.000 0.583 0.000 N NA
 1156448 1156449 SDY_2620 SDY_2621 cysU cysP TRUE 0.988 0.000 0.479 0.001 N NA
 1156449 1156450 SDY_2621 SDY_2622 cysP ucpA FALSE 0.024 304.000 0.043 1.000 N NA
 1156450 1156451 SDY_2622 SDY_2623 ucpA yfeT FALSE 0.297 129.000 0.000 1.000 N NA
 1156452 1156453 SDY_2624 SDY_2625 yfeU   TRUE 0.935 4.000 0.158 1.000   NA
 1156453 1156454 SDY_2625 SDY_2626     FALSE 0.252 -82.000 0.000 NA   NA
 1156455 1156456 SDY_2627 SDY_2628     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156456 1156457 SDY_2628 SDY_2629     FALSE 0.002 778.000 0.000 NA   NA
 1156457 1156458 SDY_2629 SDY_2630     TRUE 0.846 69.000 0.333 NA   NA
 1156458 1156459 SDY_2630 SDY_2631     TRUE 0.814 61.000 0.204 NA   NA
 1156459 1156460 SDY_2631 SDY_2632     FALSE 0.580 -19.000 0.059 NA   NA
 1156461 1156462 SDY_2633 SDY_2634 amiA hemF TRUE 0.769 4.000 0.025 1.000 N NA
 1156463 1156464 SDY_2635 SDY_2636 yfeG   TRUE 0.901 46.000 0.250 NA N NA
 1156464 1156465 SDY_2636 SDY_2637     TRUE 0.853 7.000 0.106 NA N NA
 1156465 1156466 SDY_2637 SDY_2638   eutC TRUE 0.960 10.000 0.000 1.000 Y NA
 1156466 1156467 SDY_2638 SDY_2639 eutC eutB TRUE 0.646 21.000 0.000 NA   NA
 1156468 1156469 SDY_2640 SDY_2641     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156470 1156471 SDY_2642 SDY_2643     FALSE 0.377 63.000 0.000 NA   NA
 1156474 1156475 SDY_2646 SDY_2647 talA tktB FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1156476 1156477 SDY_2648 SDY_2649     FALSE 0.001 1481.000 0.000 NA   NA
 1156477 1156478 SDY_2649 SDY_2650   yffH TRUE 0.791 126.000 0.333 NA   NA
 1156478 1156479 SDY_2650 SDY_2651 yffH yffG TRUE 0.733 68.000 0.167 1.000 N NA
 1156479 1156480 SDY_2651 SDY_2652 yffG   FALSE 0.567 32.000 0.000 NA N NA
 1156481 1156482 SDY_2653 SDY_2654 narQ acrD FALSE 0.520 164.000 0.133 0.061 N NA
 1156482 1156483 SDY_2654 SDY_2655 acrD yffB FALSE 0.004 539.000 0.000 1.000 N NA
 1156483 1156484 SDY_2655 SDY_2656 yffB dapE TRUE 0.964 4.000 0.292 1.000 N NA
 1156484 1156485 SDY_2656 SDY_2657 dapE   TRUE 0.662 28.000 0.025 NA   NA
 1156486 1156487 SDY_2658 SDY_2659 ypfH   FALSE 0.538 47.000 0.000 NA   NA
 1156487 1156488 SDY_2659 SDY_2660     FALSE 0.263 82.000 0.000 NA   NA
 1156488 1156489 SDY_2660 SDY_2661   ypfI FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 1156489 1156490 SDY_2661 SDY_2662 ypfI   FALSE 0.554 15.000 0.014 NA   NA
 1156490 1156491 SDY_2662 SDY_2663     TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1156491 1156492 SDY_2663 SDY_2664   purC FALSE 0.037 237.000 0.006 1.000   NA
 1156494 1156495 SDY_2666 SDY_2667 nlpB dapA TRUE 0.984 14.000 0.267 1.000 Y NA
 1156496 1156497 SDY_2668 SDY_2669 gcvR bcp TRUE 0.901 0.000 0.102 1.000 N NA
 1156497 1156498 SDY_2669 SDY_2670 bcp hyfA FALSE 0.053 214.000 0.000 1.000 N NA
 1156498 1156499 SDY_2670 SDY_2671 hyfA hyfB TRUE 0.970 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1156499 1156500 SDY_2671 SDY_2672 hyfB hyfC TRUE 0.920 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 1156500 1156501 SDY_2672 SDY_2673 hyfC hyfD FALSE 0.614 17.000 0.000 NA   NA
 1156501 1156502 SDY_2673 SDY_2674 hyfD hyfE FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1156502 1156503 SDY_2674 SDY_2675 hyfE hyfF TRUE 0.998 5.000 0.864 0.005 Y NA
 1156503 1156504 SDY_2675 SDY_2676 hyfF hyfG TRUE 0.946 -10.000 0.016 0.005 Y NA
 1156504 1156505 SDY_2676 SDY_2677 hyfG hyfH TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1156505 1156506 SDY_2677 SDY_2678 hyfH hyfI TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156506 1156507 SDY_2678 SDY_2679 hyfI   TRUE 0.747 -70.000 0.250 NA   NA
 1156507 1156508 SDY_2679 SDY_2680   hyfR FALSE 0.511 51.000 0.000 NA   NA
 1156508 1156509 SDY_2680 SDY_2681 hyfR focB TRUE 0.651 22.000 0.000 NA   NA
 1156511 1156512 SDY_2683 SDY_2684     TRUE 0.951 21.000 0.259 1.000   NA
 1156513 1156514 SDY_2685 SDY_2686   uraA TRUE 0.679 50.000 0.048 1.000 N NA
 1156514 1156515 SDY_2686 SDY_2687 uraA upp TRUE 0.872 86.000 0.101 1.000 Y NA
 1156516 1156517 SDY_2688 SDY_2689 purM purN TRUE 0.994 0.000 0.230 0.001 Y NA
 1156517 1156518 SDY_2689 SDY_2690 purN ppk FALSE 0.136 171.000 0.017 1.000 N NA
 1156518 1156519 SDY_2690 SDY_2691 ppk ppx TRUE 0.994 5.000 0.486 1.000 Y NA
 1156520 1156521 SDY_2692 SDY_2693     FALSE 0.267 81.000 0.000 NA   NA
 1156526 1156527 SDY_2698 SDY_2699     FALSE 0.557 20.000 0.000 NA N NA
 1156528 1156529 SDY_2700 SDY_2701     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1156531 1156532 SDY_2703 SDY_2704 guaA guaB TRUE 0.964 69.000 0.190 0.000 Y NA
 1156534 1156535 SDY_2706 SDY_2707   engA FALSE 0.455 48.000 0.009 NA   NA
 1156535 1156536 SDY_2707 SDY_2708 engA   TRUE 0.726 118.000 0.203 1.000   NA
 1156536 1156537 SDY_2708 SDY_2709     TRUE 0.972 11.000 0.492 1.000   NA
 1156537 1156538 SDY_2709 SDY_2710   hisS TRUE 0.946 18.000 0.259 1.000   NA
 1156538 1156539 SDY_2710 SDY_2711 hisS gcpE TRUE 0.694 111.000 0.207 1.000 N NA
 1156539 1156540 SDY_2711 SDY_2712 gcpE yfgA TRUE 0.947 27.000 0.233 1.000   NA
 1156540 1156541 SDY_2712 SDY_2713 yfgA yfgB FALSE 0.025 285.000 0.020 1.000   NA
 1156541 1156542 SDY_2713 SDY_2714 yfgB ndk FALSE 0.524 150.000 0.156 1.000   NA
 1156542 1156543 SDY_2714 SDY_2715 ndk pbpC FALSE 0.165 149.000 0.000 NA   NA
 1156543 1156544 SDY_2715 SDY_2716 pbpC   TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1156546 1156547 SDY_2718 SDY_2719 sseB pepB TRUE 0.654 143.000 0.253 NA   NA
 1156547 1156548 SDY_2719 SDY_2720 pepB yfhJ FALSE 0.416 178.000 0.171 1.000   NA
 1156548 1156549 SDY_2720 SDY_2721 yfhJ fdx TRUE 0.978 12.000 0.625 1.000   NA
 1156549 1156550 SDY_2721 SDY_2722 fdx hscA TRUE 0.989 2.000 0.794 1.000 N NA
 1156550 1156551 SDY_2722 SDY_2723 hscA yfhE TRUE 0.994 17.000 0.634 1.000 Y NA
 1156551 1156552 SDY_2723 SDY_2724 yfhE yfhF TRUE 0.850 96.000 0.500 1.000   NA
 1156552 1156553 SDY_2724 SDY_2725 yfhF   TRUE 0.976 17.000 0.359 0.002   NA
 1156553 1156554 SDY_2725 SDY_2726   yfhO TRUE 0.970 28.000 0.448 1.000 N NA
 1156554 1156555 SDY_2726 SDY_2727 yfhO   TRUE 0.840 88.000 0.424 1.000 N NA
 1156555 1156556 SDY_2727 SDY_2728     FALSE 0.055 300.000 0.126 1.000 N NA
 1156557 1156558 SDY_2729 SDY_2730 suhB   FALSE 0.287 118.000 0.003 1.000   NA
 1156558 1156559 SDY_2730 SDY_2731   csiE FALSE 0.109 191.000 0.000 1.000   NA
 1156560 1156561 SDY_2732 SDY_2734 hcaT   FALSE 0.141 160.000 0.000 NA   NA
 1156561 1156562 SDY_2734 SDY_2733   hcaR FALSE 0.241 -107.000 0.000 NA   NA
 1156564 1156565 SDY_2736 SDY_2737 yphF   FALSE 0.225 135.000 0.000 NA   NA
 1156565 1156566 SDY_2737 SDY_2738   yphG TRUE 0.853 13.000 0.000 0.006   NA
 1156566 1156567 SDY_2738 SDY_2739 yphG   FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1156571 1156572 SDY_2743 SDY_2744 glnB yfhA TRUE 0.761 61.000 0.146 1.000 N NA
 1156572 1156573 SDY_2744 SDY_2745 yfhA yfhG FALSE 0.513 -10.000 0.029 NA   NA
 1156573 1156574 SDY_2745 SDY_2746 yfhG yfhK FALSE 0.148 165.000 0.029 NA   NA
 1156574 1156575 SDY_2746 SDY_2747 yfhK purL FALSE 0.004 501.000 0.000 1.000 N NA
 1156577 1156578 SDY_2749 SDY_2750 yfhC yfhB TRUE 0.757 25.000 0.062 NA N NA
 1156582 1156583 SDY_2754 SDY_2755     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156585 1156586 SDY_2757 SDY_2758     FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 1156586 1156587 SDY_2758 SDY_2759     FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1156587 1156588 SDY_2759 SDY_2760     FALSE 0.135 164.000 0.000 NA   NA
 1156591 1156592 SDY_2763 SDY_2764 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156592 1156593 SDY_2764 SDY_2765 insB aroF FALSE 0.035 207.000 0.000 NA N NA
 1156593 1156594 SDY_2765 SDY_2766 aroF tyrA TRUE 0.956 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1156595 1156596 SDY_2767 SDY_2768 pheA yfiA FALSE 0.014 251.000 0.015 NA N NA
 1156596 1156597 SDY_2768 SDY_2769 yfiA   FALSE 0.004 391.000 0.000 NA N NA
 1156598 1156599 SDY_2770 SDY_2771     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156599 1156600 SDY_2771 SDY_2772     FALSE 0.299 74.000 0.000 NA   NA
 1156600 1156601 SDY_2772 SDY_2773     FALSE 0.064 193.000 0.000 NA   NA
 1156601 1156602 SDY_2773 SDY_2774     FALSE 0.623 44.000 0.000 NA   NA
 1156602 1156603 SDY_2774 SDY_2775     TRUE 0.952 24.000 0.000 NA Y NA
 1156605 1156606 SDY_2777 SDY_2778   yfiN FALSE 0.072 408.000 0.475 NA   NA
 1156606 1156607 SDY_2778 SDY_2779 yfiN yfiB TRUE 0.968 16.000 0.475 1.000   NA
 1156608 1156609 SDY_2780 SDY_2781 rplS trmD TRUE 0.993 42.000 0.567 1.000 Y NA
 1156609 1156610 SDY_2781 SDY_2782 trmD rimM TRUE 0.995 31.000 0.672 1.000 Y NA
 1156610 1156611 SDY_2782 SDY_2783 rimM rpsP TRUE 0.993 19.000 0.342 0.010 Y NA
 1156611 1156612 SDY_2783 SDY_2784 rpsP ffh TRUE 0.800 137.000 0.361 1.000 N NA
 1156613 1156614 SDY_2785 SDY_2786   yfjD TRUE 0.787 111.000 0.349 NA   NA
 1156616 1156617 SDY_2788 SDY_2789 yfjB recN TRUE 0.656 86.000 0.170 1.000 N NA
 1156617 1156618 SDY_2789 SDY_2790 recN smpA FALSE 0.282 149.000 0.049 1.000 N NA
 1156619 1156620 SDY_2791 SDY_2792     TRUE 0.768 -10.000 0.124 NA   NA
 1156625 1156626 SDY_2797 SDY_2798     FALSE 0.055 200.000 0.000 NA   NA
 1156627 1156628 SDY_2799 SDY_2800     FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 1156632 1156633 SDY_2804 SDY_2805 acpS pdxJ TRUE 0.970 0.000 0.326 1.000 N NA
 1156633 1156634 SDY_2805 SDY_2806 pdxJ recO TRUE 0.896 12.000 0.166 1.000 N NA
 1156634 1156635 SDY_2806 SDY_2807 recO era TRUE 0.870 12.000 0.109 1.000   NA
 1156635 1156636 SDY_2807 SDY_2808 era rnc TRUE 0.937 -3.000 0.127 0.030   NA
 1156636 1156637 SDY_2808 SDY_2809 rnc lepB FALSE 0.074 273.000 0.117 1.000   NA
 1156637 1156638 SDY_2809 SDY_2810 lepB lepA TRUE 0.922 16.000 0.187 1.000   NA
 1156638 1156639 SDY_2810 SDY_2811 lepA rseC FALSE 0.070 198.000 0.045 NA N NA
 1156639 1156640 SDY_2811 SDY_2812 rseC rseB TRUE 0.994 -3.000 0.609 NA Y NA
 1156640 1156641 SDY_2812 SDY_2813 rseB rseA TRUE 0.997 0.000 0.856 NA Y NA
 1156641 1156642 SDY_2813 SDY_2814 rseA rpoE TRUE 0.979 33.000 0.705 NA N NA
 1156647 1156648 SDY_2819 SDY_2820     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156648 1156649 SDY_2820 SDY_2821   yfiK TRUE 0.678 12.000 0.000 1.000 N NA
 1156653 1156654 SDY_2825 SDY_2826 trxC yfiP TRUE 0.784 45.000 0.084 NA   NA
 1156654 1156655 SDY_2826 SDY_2827 yfiP yfiQ TRUE 0.932 32.000 0.222 NA   NA
 1156655 1156656 SDY_2827 SDY_2828 yfiQ pssA TRUE 0.672 111.000 0.121 0.033 N NA
 1156656 1156657 SDY_2828 SDY_2829 pssA yfiM FALSE 0.541 73.000 0.089 NA   NA
 1156658 1156659 SDY_2830 SDY_2831 kgtP rrfG FALSE 0.011 322.000 0.000 NA   NA
 1156659 1156660 SDY_2831 SDY_2832 rrfG rrlG FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1156660 1156661 SDY_2832 SDY_2833 rrlG   FALSE 0.083 185.000 0.000 NA   NA
 1156661 1156662 SDY_2833 SDY_2834   rrsG FALSE 0.248 87.000 0.000 NA   NA
 1156662 1156663 SDY_2834 SDY_2835 rrsG clpB FALSE 0.004 444.000 0.000 NA   NA
 1156663 1156664 SDY_2835 SDY_2836 clpB yfiH FALSE 0.499 130.000 0.108 NA   NA
 1156664 1156665 SDY_2836 SDY_2837 yfiH sfhB TRUE 0.903 -3.000 0.168 NA   NA
 1156668 1156669 SDY_2840 SDY_2841     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1156670 1156671 SDY_2842 SDY_2843     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156671 1156672 SDY_2843 SDY_2844     FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 1156672 1156673 SDY_2844 SDY_2845     TRUE 0.971 27.000 0.500 NA   NA
 1156673 1156674 SDY_2845 SDY_2846     TRUE 0.829 70.000 0.000 NA Y NA
 1156674 1156675 SDY_2846 SDY_2847     TRUE 0.739 105.000 0.000 NA Y NA
 1156675 1156676 SDY_2847 SDY_2848     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1156676 1156677 SDY_2848 SDY_2849   insB TRUE 0.640 37.000 0.000 NA   NA
 1156677 1156678 SDY_2849 SDY_2850 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156679 1156680 SDY_2851 SDY_2852 gabD gabT FALSE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 1156680 1156681 SDY_2852 SDY_2853 gabT gabP FALSE 0.029 238.000 0.000 NA   NA
 1156681 1156682 SDY_2853 SDY_2854 gabP ygaE TRUE 0.979 21.000 0.625 1.000 N NA
 1156683 1156684 SDY_2855 SDY_2856 ygaU   FALSE 0.379 84.000 0.027 1.000   NA
 1156685 1156686 SDY_2857 SDY_2858   ygaP TRUE 0.803 10.000 0.083 NA N NA
 1156688 1156689 SDY_2860 SDY_2861     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 1156693 1156694 SDY_2865 SDY_2866   nrdH FALSE 0.033 210.000 0.009 NA   NA
 1156694 1156695 SDY_2866 SDY_2867 nrdH nrdI FALSE 0.595 -3.000 0.026 NA N NA
 1156695 1156696 SDY_2867 SDY_2868 nrdI nrdE TRUE 0.944 12.000 0.000 NA Y NA
 1156696 1156697 SDY_2868 SDY_2869 nrdE nrdF FALSE 0.307 265.000 0.000 0.001 Y NA
 1156698 1156699 SDY_2870 SDY_2871 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156700 1156701 SDY_2872 SDY_2873 proV proW TRUE 0.993 -7.000 0.630 0.064 Y NA
 1156703 1156704 SDY_2875 SDY_2876 proX   FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1156704 1156705 SDY_2876 SDY_2877     FALSE 0.346 124.000 0.060 NA N NA
 1156705 1156706 SDY_2877 SDY_2878   ygaH TRUE 0.970 -10.000 0.915 NA   NA
 1156706 1156707 SDY_2878 SDY_2879 ygaH emrR FALSE 0.384 91.000 0.065 NA   NA
 1156707 1156708 SDY_2879 SDY_2880 emrR emrA FALSE 0.543 127.000 0.107 1.000 N NA
 1156708 1156709 SDY_2880 SDY_2881 emrA emrB FALSE 0.614 17.000 0.000 NA   NA
 1156709 1156710 SDY_2881 SDY_2882 emrB   FALSE 0.022 258.000 0.000 NA   NA
 1156710 1156711 SDY_2882 SDY_2883     TRUE 0.867 66.000 0.344 NA   NA
 1156712 1156713 SDY_2884 SDY_2885 ygaG gshA FALSE 0.369 150.000 0.087 1.000 N NA
 1156713 1156714 SDY_2885 SDY_2886 gshA   FALSE 0.237 168.000 0.071 NA   NA
 1156714 1156715 SDY_2886 SDY_2887   yqaB TRUE 0.798 -3.000 0.067 NA   NA
 1156715 1156716 SDY_2887 SDY_2888 yqaB   FALSE 0.168 148.000 0.000 NA   NA
 1156716 1156717 SDY_2888 SDY_2889     FALSE 0.057 199.000 0.000 NA   NA
 1156717 1156718 SDY_2889 SDY_2890     FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 1156718 1156719 SDY_2890 SDY_2891     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1156719 1156720 SDY_2891 SDY_2892   csrA FALSE 0.012 316.000 0.000 NA   NA
 1156720 1156721 SDY_2892 SDY_2893 csrA alaS FALSE 0.037 235.000 0.020 1.000 N NA
 1156721 1156722 SDY_2893 SDY_2894 alaS oraA FALSE 0.529 128.000 0.085 1.000   NA
 1156722 1156723 SDY_2894 SDY_2895 oraA recA FALSE 0.254 243.000 0.296 1.000   NA
 1156723 1156724 SDY_2895 SDY_2896 recA ygaD FALSE 0.480 80.000 0.082 NA   NA
 1156724 1156725 SDY_2896 SDY_2897 ygaD mltB FALSE 0.187 146.000 0.026 NA   NA
 1156726 1156727 SDY_2898 SDY_2899 srlA srlE TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156729 1156730 SDY_2901 SDY_2902 srlB srlD TRUE 0.809 4.000 0.040 1.000 N NA
 1156730 1156731 SDY_2902 SDY_2903 srlD gutM FALSE 0.614 106.000 0.197 NA N NA
 1156731 1156732 SDY_2903 SDY_2904 gutM srlR TRUE 0.933 67.000 0.183 NA Y NA
 1156732 1156733 SDY_2904 SDY_2905 srlR gutQ TRUE 0.962 -7.000 0.562 1.000 N NA
 1156735 1156736 SDY_2907 SDY_2908   ygbD TRUE 0.918 -3.000 0.083 0.036   NA
 1156737 1156738 SDY_2909 SDY_2910 hypF hydN FALSE 0.153 153.000 0.000 NA   NA
 1156738 1156739 SDY_2910 SDY_2911 hydN ascG TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1156741 1156742 SDY_2913 SDY_2914   hycI FALSE 0.152 170.000 0.000 1.000 N NA
 1156742 1156743 SDY_2914 SDY_2915 hycI hycH TRUE 0.933 -7.000 0.360 NA   NA
 1156743 1156744 SDY_2915 SDY_2916 hycH hycG TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156744 1156745 SDY_2916 SDY_2917 hycG hycF TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1156745 1156746 SDY_2917 SDY_2918 hycF hycE TRUE 0.985 10.000 0.200 1.000 Y NA
 1156746 1156747 SDY_2918 SDY_2919 hycE hycD TRUE 0.985 18.000 0.235 1.000 Y NA
 1156747 1156748 SDY_2919 SDY_2920 hycD hycC FALSE 0.244 117.000 0.000 NA   NA
 1156748 1156749 SDY_2920 SDY_2921 hycC hycB TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156749 1156750 SDY_2921 SDY_2922 hycB hycA FALSE 0.248 125.000 0.000 NA   NA
 1156751 1156752 SDY_2923 SDY_2924 hypA hypB TRUE 0.981 4.000 0.306 0.002   NA
 1156752 1156753 SDY_2924 SDY_2925 hypB hypC TRUE 0.953 -9.000 0.139 NA Y NA
 1156753 1156754 SDY_2925 SDY_2926 hypC hypD TRUE 0.964 0.000 0.021 NA Y NA
 1156754 1156755 SDY_2926 SDY_2927 hypD hypE TRUE 0.990 39.000 0.353 1.000 Y NA
 1156755 1156756 SDY_2927 SDY_2928 hypE fhlA FALSE 0.638 38.000 0.000 NA   NA
 1156757 1156758 SDY_2929 SDY_2930     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1156762 1156763 SDY_2934 SDY_2935 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156763 1156764 SDY_2935 SDY_2936 insA   FALSE 0.304 97.000 0.000 1.000   NA
 1156764 1156765 SDY_2936 SDY_2937     FALSE 0.634 11.000 0.000 NA   NA
 1156765 1156766 SDY_2937 SDY_2938     FALSE 0.514 182.000 0.000 NA Y NA
 1156768 1156769 SDY_2940 SDY_2941 rpoS nlpD TRUE 0.738 63.000 0.142 1.000 N NA
 1156769 1156770 SDY_2941 SDY_2942 nlpD pcm FALSE 0.288 140.000 0.030 1.000 N NA
 1156770 1156771 SDY_2942 SDY_2943 pcm surE TRUE 0.949 -6.000 0.353 1.000   NA
 1156771 1156772 SDY_2943 SDY_2944 surE ygbO TRUE 0.873 -19.000 0.235 1.000   NA
 1156772 1156773 SDY_2944 SDY_2945 ygbO ygbB TRUE 0.924 -3.000 0.173 1.000   NA
 1156773 1156774 SDY_2945 SDY_2946 ygbB ygbP TRUE 0.994 0.000 0.419 1.000 Y NA
 1156774 1156775 SDY_2946 SDY_2947 ygbP   TRUE 0.920 19.000 0.185 1.000 N NA
 1156775 1156776 SDY_2947 SDY_2948   ygbE FALSE 0.070 194.000 0.028 NA   NA
 1156776 1156777 SDY_2948 SDY_2949 ygbE cysC TRUE 0.875 50.000 0.198 NA   NA
 1156777 1156778 SDY_2949 SDY_2950 cysC cysN TRUE 0.993 0.000 0.340 1.000 Y NA
 1156778 1156779 SDY_2950 SDY_2951 cysN cysD TRUE 0.991 2.000 0.574 0.000 N NA
 1156781 1156782 SDY_2953 SDY_2954 ygbF   TRUE 0.981 2.000 0.509 NA   NA
 1156782 1156783 SDY_2954 SDY_2955     FALSE 0.369 247.000 0.589 NA   NA
 1156784 1156785 SDY_2956 SDY_2957 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156786 1156787 SDY_2958 SDY_2959     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1156788 1156789 SDY_2960 SDY_2961     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156790 1156791 SDY_2962 SDY_2963 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156791 1156792 SDY_2963 SDY_2964 insA cysH FALSE 0.407 67.000 0.000 1.000 N NA
 1156792 1156793 SDY_2964 SDY_2965 cysH cysI FALSE 0.622 74.000 0.116 1.000 N NA
 1156793 1156794 SDY_2965 SDY_2966 cysI cysJ TRUE 0.998 0.000 0.791 0.000 Y NA
 1156795 1156796 SDY_2967 SDY_2968 ygcM ygcN FALSE 0.563 48.000 0.014 1.000 N NA
 1156796 1156797 SDY_2968 SDY_2969 ygcN ygcO TRUE 0.880 -45.000 0.026 0.036 Y NA
 1156797 1156798 SDY_2969 SDY_2970 ygcO ygcP TRUE 0.691 17.000 0.026 1.000 N NA
 1156799 1156800 SDY_2971 SDY_2972 ygcQ ygcR FALSE 0.334 -36.000 0.000 NA   NA
 1156800 1156801 SDY_2972 SDY_2973 ygcR ygcS FALSE 0.361 -28.000 0.000 NA   NA
 1156801 1156802 SDY_2973 SDY_2974 ygcS   TRUE 0.713 103.000 0.250 1.000 N NA
 1156802 1156803 SDY_2974 SDY_2975     FALSE 0.545 43.000 0.000 NA N NA
 1156803 1156804 SDY_2975 SDY_2976   ygcW FALSE 0.003 406.000 0.000 NA N NA
 1156805 1156806 SDY_2977 SDY_2978 yqcE ygcE TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1156807 1156808 SDY_2979 SDY_2980     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1156808 1156809 SDY_2980 SDY_2981   ygcF FALSE 0.006 348.000 0.000 NA N NA
 1156809 1156810 SDY_2981 SDY_2982 ygcF   FALSE 0.244 88.000 0.000 NA   NA
 1156811 1156812 SDY_2983 SDY_2984     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1156812 1156813 SDY_2984 SDY_2985     FALSE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 1156815 1156816 SDY_2987 SDY_2988     TRUE 0.642 36.000 0.000 NA   NA
 1156817 1156818 SDY_2989 SDY_2990     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156819 1156820 SDY_2991 SDY_2992     FALSE 0.599 15.000 0.000 NA   NA
 1156821 1156822 SDY_2993 SDY_2994 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156824 1156825 SDY_2996 SDY_2997 eno pyrG FALSE 0.451 88.000 0.068 1.000 N NA
 1156825 1156826 SDY_2997 SDY_2998 pyrG mazG FALSE 0.060 223.000 0.025 1.000   NA
 1156826 1156827 SDY_2998 SDY_2999 mazG chpA FALSE 0.311 71.000 0.000 NA   NA
 1156827 1156828 SDY_2999 SDY_3000 chpA chpR TRUE 0.995 0.000 0.531 NA Y NA
 1156828 1156829 SDY_3000 SDY_3001 chpR relA TRUE 0.804 78.000 0.000 NA Y NA
 1156829 1156830 SDY_3001 SDY_3002 relA ygcA TRUE 0.769 48.000 0.082 1.000 N NA
 1156832 1156833 SDY_3004 SDY_3005 ygcX ygcY TRUE 0.646 21.000 0.000 NA   NA
 1156833 1156834 SDY_3005 SDY_3006 ygcY   TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156834 1156835 SDY_3006 SDY_3007     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 1156835 1156836 SDY_3007 SDY_3008   yqcB TRUE 0.926 18.000 0.209 1.000 N NA
 1156836 1156837 SDY_3008 SDY_3009 yqcB   TRUE 0.980 0.000 0.518 NA   NA
 1156837 1156838 SDY_3009 SDY_3010   syd FALSE 0.002 622.000 0.000 NA   NA
 1156839 1156840 SDY_3011 SDY_3012 yqcD ygdH FALSE 0.421 112.000 0.079 NA   NA
 1156840 1156841 SDY_3012 SDY_3013 ygdH sdaC FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 1156841 1156842 SDY_3013 SDY_3014 sdaC sdaB TRUE 0.906 58.000 0.000 1.000 Y NA
 1156842 1156843 SDY_3014 SDY_3015 sdaB exo TRUE 0.711 22.000 0.000 1.000 N NA
 1156844 1156845 SDY_3016 SDY_3017 fucO fucA TRUE 0.824 25.000 0.066 1.000 N NA
 1156846 1156847 SDY_3018 SDY_3019 fucP   FALSE 0.210 -1173.000 0.000 NA   NA
 1156847 1156848 SDY_3019 SDY_3020   fucI FALSE 0.001 811.000 0.000 NA N NA
 1156848 1156849 SDY_3020 SDY_3021 fucI fucK TRUE 0.943 79.000 0.269 1.000 Y NA
 1156849 1156850 SDY_3021 SDY_3022 fucK fucU TRUE 0.990 2.000 0.211 1.000 Y NA
 1156850 1156851 SDY_3022 SDY_3023 fucU fucR TRUE 0.974 58.000 0.308 1.000 Y NA
 1156852 1156853 SDY_3024 SDY_3025 ygdE ygdD TRUE 0.821 -7.000 0.144 NA   NA
 1156853 1156854 SDY_3025 SDY_3026 ygdD gcvA TRUE 0.807 19.000 0.081 NA   NA
 1156854 1156855 SDY_3026 SDY_3027 gcvA   FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 1156856 1156857 SDY_3028 SDY_3029   ygdK TRUE 0.960 0.000 0.122 0.001   NA
 1156858 1156859 SDY_3030 SDY_3031 ygdL mltA FALSE 0.030 239.000 0.009 1.000 N NA
 1156860 1156861 SDY_3032 SDY_3033     TRUE 0.644 35.000 0.000 NA   NA
 1156864 1156865 SDY_3036 SDY_3037 recD recB TRUE 0.998 0.000 0.688 0.001 Y NA
 1156865 1156866 SDY_3037 SDY_3038 recB ptr TRUE 0.780 -7.000 0.092 1.000 N NA
 1156866 1156867 SDY_3038 SDY_3039 ptr recC FALSE 0.272 176.000 0.092 1.000 N NA
 1156867 1156868 SDY_3039 SDY_3040 recC ppdC TRUE 0.746 13.000 0.076 NA N NA
 1156868 1156869 SDY_3040 SDY_3041 ppdC ygdB TRUE 0.941 -15.000 0.538 NA   NA
 1156869 1156870 SDY_3041 SDY_3042 ygdB ppdB TRUE 0.961 -3.000 0.373 NA   NA
 1156870 1156871 SDY_3042 SDY_3043 ppdB ppdA TRUE 0.980 -9.000 0.368 NA Y NA
 1156871 1156872 SDY_3043 SDY_3044 ppdA thyA FALSE 0.050 185.000 0.016 NA N NA
 1156872 1156873 SDY_3044 SDY_3045 thyA lgt TRUE 0.920 7.000 0.164 1.000 N NA
 1156873 1156874 SDY_3045 SDY_3046 lgt ptsP FALSE 0.195 152.000 0.000 1.000 N NA
 1156874 1156875 SDY_3046 SDY_3047 ptsP ygdP FALSE 0.603 13.000 0.008 1.000 N NA
 1156876 1156877 SDY_3048 SDY_3049 mutH   FALSE 0.498 69.000 0.052 1.000 N NA
 1156877 1156878 SDY_3049 SDY_3050     TRUE 0.809 138.000 0.429 NA   NA
 1156878 1156879 SDY_3050 SDY_3051     FALSE 0.294 108.000 0.043 NA   NA
 1156880 1156881 SDY_3052 SDY_3053 ygeD aas TRUE 0.799 -7.000 0.124 NA   NA
 1156885 1156886 SDY_3057 SDY_3058 ygeA araE FALSE 0.254 129.000 0.011 1.000 N NA
 1156886 1156887 SDY_3058 SDY_3059 araE insB FALSE 0.018 248.000 0.000 NA N NA
 1156887 1156888 SDY_3059 SDY_3060 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156888 1156889 SDY_3060 SDY_3061 insA dkgA FALSE 0.090 199.000 0.000 1.000   NA
 1156889 1156890 SDY_3061 SDY_3063 dkgA yqhD TRUE 0.685 105.000 0.200 1.000   NA
 1156892 1156893 SDY_3064 SDY_3065 yghB metC FALSE 0.633 141.000 0.212 NA   NA
 1156894 1156895 SDY_3066 SDY_3067   exbB FALSE 0.636 -7.000 0.048 NA   NA
 1156895 1156896 SDY_3067 SDY_3068 exbB exbD TRUE 0.997 7.000 0.810 0.049 Y NA
 1156899 1156900 SDY_3071 SDY_3072 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156900 1156901 SDY_3072 SDY_3073 insA   FALSE 0.579 51.000 0.000 1.000 N NA
 1156902 1156903 SDY_3074 SDY_3075 yghYX   FALSE 0.247 119.000 0.000 NA   NA
 1156903 1156904 SDY_3075 SDY_3076     FALSE 0.156 189.000 0.077 NA   NA
 1156904 1156905 SDY_3076 SDY_3077   hybA TRUE 0.997 3.000 0.615 0.011 Y NA
 1156905 1156906 SDY_3077 SDY_3078 hybA hybB TRUE 0.905 -10.000 0.000 NA Y NA
 1156906 1156907 SDY_3078 SDY_3079 hybB hybC TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA Y NA
 1156907 1156908 SDY_3079 SDY_3080 hybC hybD TRUE 0.997 0.000 0.828 1.000 Y NA
 1156908 1156909 SDY_3080 SDY_3081 hybD hybE TRUE 0.915 -7.000 0.291 NA   NA
 1156909 1156910 SDY_3081 SDY_3082 hybE hybF TRUE 0.664 -7.000 0.055 NA   NA
 1156910 1156911 SDY_3082 SDY_3083 hybF hybG FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1156913 1156914 SDY_3085 SDY_3086 gsp pitB FALSE 0.019 292.000 0.000 1.000 N NA
 1156917 1156918 SDY_3089 SDY_3090     TRUE 0.862 -3.000 0.096 1.000 N NA
 1156918 1156919 SDY_3090 SDY_3091     FALSE 0.459 46.000 0.000 NA N NA
 1156920 1156921 SDY_3092 SDY_3093 gspC gspD TRUE 0.806 240.000 0.575 0.002 Y NA
 1156921 1156922 SDY_3093 SDY_3094 gspD gspE TRUE 0.998 0.000 0.776 0.002 Y NA
 1156922 1156923 SDY_3094 SDY_3095 gspE gspF TRUE 0.998 0.000 0.653 0.002 Y NA
 1156923 1156924 SDY_3095 SDY_3096 gspF gspG TRUE 0.996 41.000 0.599 0.002 Y NA
 1156924 1156925 SDY_3096 SDY_3097 gspG gspH TRUE 0.964 37.000 0.425 NA   NA
 1156925 1156926 SDY_3097 SDY_3098 gspH gspI TRUE 0.977 -3.000 0.605 NA   NA
 1156926 1156927 SDY_3098 SDY_3099 gspI gspJ TRUE 0.987 33.000 0.569 0.002   NA
 1156927 1156928 SDY_3099 SDY_3100 gspJ gspK TRUE 0.992 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 1156928 1156929 SDY_3100 SDY_3101 gspK gspL FALSE 0.581 315.000 0.537 0.059 Y NA
 1156929 1156930 SDY_3101 SDY_3102 gspL gspM TRUE 0.976 116.000 0.811 1.000 Y NA
 1156931 1156932 SDY_3103 SDY_3106   yqgA FALSE 0.216 106.000 0.000 NA   NA
 1156933 1156934 SDY_3104 SDY_3105 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156934 1156935 SDY_3105 SDY_3107 insB speC FALSE 0.001 707.000 0.000 NA N NA
 1156936 1156937 SDY_3108 SDY_3109 nupG mltC FALSE 0.245 154.000 0.056 NA   NA
 1156937 1156938 SDY_3109 SDY_3110 mltC yggX TRUE 0.674 62.000 0.128 NA N NA
 1156938 1156939 SDY_3110 SDY_3111 yggX mutY TRUE 0.877 28.000 0.150 NA N NA
 1156940 1156941 SDY_3112 SDY_3113 yggH yggL TRUE 0.879 0.000 0.092 NA   NA
 1156941 1156942 SDY_3113 SDY_3114 yggL yggN FALSE 0.298 184.000 0.155 NA   NA
 1156942 1156943 SDY_3114 SDY_3115 yggN ansB FALSE 0.113 176.000 0.027 NA   NA
 1156943 1156944 SDY_3115 SDY_3116 ansB yggM FALSE 0.223 117.000 0.018 NA   NA
 1156945 1156946 SDY_3117 SDY_3118 yggW yggV TRUE 0.898 -7.000 0.218 1.000 N NA
 1156946 1156947 SDY_3118 SDY_3119 yggV yggU TRUE 0.642 8.000 0.016 NA   NA
 1156947 1156948 SDY_3119 SDY_3120 yggU yggT TRUE 0.822 -3.000 0.081 NA   NA
 1156948 1156949 SDY_3120 SDY_3122 yggT yggS TRUE 0.911 18.000 0.189 NA   NA
 1156951 1156952 SDY_3123 SDY_3124 yqgF yqgE TRUE 0.955 0.000 0.263 NA N NA
 1156952 1156953 SDY_3124 SDY_3125 yqgE gshB FALSE 0.466 109.000 0.120 NA N NA
 1156953 1156954 SDY_3125 SDY_3126 gshB yggJ TRUE 0.886 13.000 0.173 NA   NA
 1156954 1156955 SDY_3126 SDY_3127 yggJ endA TRUE 0.711 80.000 0.201 NA   NA
 1156955 1156956 SDY_3127 SDY_3128 endA sprT TRUE 0.697 95.000 0.210 1.000   NA
 1156956 1156957 SDY_3128 SDY_3129 sprT galP FALSE 0.465 77.000 0.042 1.000   NA
 1156957 1156958 SDY_3129 SDY_3130 galP metK FALSE 0.005 437.000 0.000 1.000 N NA
 1156961 1156962 SDY_3133 SDY_3134 yqgB speA TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1156962 1156963 SDY_3134 SDY_3135 speA   FALSE 0.175 146.000 0.000 NA   NA
 1156965 1156966 SDY_3137 SDY_3138     FALSE 0.234 132.000 0.000 NA   NA
 1156966 1156967 SDY_3138 SDY_3139   speB FALSE 0.223 136.000 0.000 NA   NA
 1156971 1156972 SDY_3143 SDY_3144 cmtB cmtA TRUE 0.991 28.000 0.250 0.006 Y NA
 1156972 1156973 SDY_3144 SDY_3145 cmtA   FALSE 0.190 303.000 0.458 1.000 N NA
 1156973 1156974 SDY_3145 SDY_3146   yggF TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156974 1156975 SDY_3146 SDY_3147 yggF yggD TRUE 0.651 22.000 0.000 NA   NA
 1156975 1156976 SDY_3147 SDY_3148 yggD yggC TRUE 0.974 -3.000 0.588 NA N NA
 1156977 1156978 SDY_3149 SDY_3150     TRUE 0.944 -6.000 0.214 0.011   NA
 1156978 1156979 SDY_3150 SDY_3151     TRUE 0.758 10.000 0.000 1.000   NA
 1156979 1156980 SDY_3151 SDY_3152     FALSE 0.462 -12.000 0.000 NA   NA
 1156980 1156981 SDY_3152 SDY_3153     TRUE 0.984 1.000 0.605 NA   NA
 1156981 1156982 SDY_3153 SDY_3154     TRUE 0.852 23.000 0.103 NA   NA
 1156983 1156984 SDY_3155 SDY_3156 epd pgk TRUE 0.967 50.000 0.070 0.004 Y NA
 1156984 1156985 SDY_3156 SDY_3157 pgk fba FALSE 0.511 215.000 0.056 0.004 Y NA
 1156985 1156986 SDY_3157 SDY_3158 fba yggB FALSE 0.112 191.000 0.038 1.000 N NA
 1156986 1156987 SDY_3158 SDY_3159 yggB yggA FALSE 0.395 139.000 0.049 1.000   NA
 1156987 1156988 SDY_3159 SDY_3160 yggA yggE FALSE 0.400 93.000 0.075 NA   NA
 1156991 1156992 SDY_3163 SDY_3164 ygfD sbm FALSE 0.334 68.000 0.000 NA   NA
 1156992 1156993 SDY_3164 SDY_3165 sbm iciA FALSE 0.053 203.000 0.000 NA   NA
 1156993 1156994 SDY_3165 SDY_3166 iciA   FALSE 0.180 112.000 0.000 NA N NA
 1156995 1156996 SDY_3167 SDY_3168   rpiA FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1156996 1156997 SDY_3168 SDY_3169 rpiA serA FALSE 0.033 256.000 0.029 1.000 N NA
 1156998 1156999 SDY_3170 SDY_3171 ygfA ygfE FALSE 0.017 300.000 0.034 NA   NA
 1157000 1157001 SDY_3172 SDY_3173 ygfB pepP TRUE 0.712 26.000 0.036 NA   NA
 1157001 1157002 SDY_3173 SDY_3174 pepP ubiH TRUE 0.724 -3.000 0.026 1.000 N NA
 1157002 1157003 SDY_3174 SDY_3175 ubiH visC TRUE 0.996 23.000 0.474 0.001 Y NA
 1157003 1157004 SDY_3175 SDY_3176 visC gcvT FALSE 0.004 448.000 0.004 1.000 N NA
 1157004 1157005 SDY_3176 SDY_3177 gcvT gcvH TRUE 0.994 24.000 0.317 0.001 Y NA
 1157005 1157006 SDY_3177 SDY_3178 gcvH gcvP TRUE 0.930 118.000 0.249 1.000 Y NA
 1157006 1157007 SDY_3178 SDY_3179 gcvP ygfF FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 1157013 1157014 SDY_3185 SDY_3186 ygfY   FALSE 0.584 -19.000 0.061 NA   NA
 1157016 1157017 SDY_3188 SDY_3189 xerD dsbC TRUE 0.842 25.000 0.079 1.000 N NA
 1157017 1157018 SDY_3189 SDY_3190 dsbC recJ TRUE 0.865 6.000 0.082 1.000 N NA
 1157018 1157019 SDY_3190 SDY_3191 recJ prfB FALSE 0.018 308.000 0.028 1.000 N NA
 1157019 1157020 SDY_3191 SDY_3192 prfB lysS TRUE 0.986 10.000 0.162 0.034 Y NA
 1157022 1157023 SDY_3194 SDY_3195 insA   FALSE 0.189 258.000 0.000 NA Y NA
 1157023 1157024 SDY_3195 SDY_3196     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1157024 1157025 SDY_3196 SDY_3197   insB TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1157030 1157031 SDY_3202 SDY_3203 ygiC ygiB TRUE 0.982 6.000 0.632 NA   NA
 1157031 1157032 SDY_3203 SDY_3204 ygiB ygiA FALSE 0.432 -112.000 0.080 NA   NA
 1157032 1157033 SDY_3204 SDY_3205 ygiA tolC TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1157034 1157035 SDY_3206 SDY_3207 yqiE yqiB TRUE 0.977 1.000 0.443 NA   NA
 1157035 1157036 SDY_3207 SDY_3208 yqiB icc TRUE 0.967 25.000 0.433 NA   NA
 1157036 1157037 SDY_3208 SDY_3209 icc yqiA TRUE 0.975 0.000 0.427 NA   NA
 1157037 1157038 SDY_3209 SDY_3210 yqiA parE TRUE 0.930 29.000 0.217 NA   NA
 1157039 1157040 SDY_3211 SDY_3212 ygiN mdaB TRUE 0.869 31.000 0.025 0.019   NA
 1157040 1157041 SDY_3212 SDY_3213 mdaB qseC FALSE 0.367 110.000 0.035 1.000   NA
 1157041 1157042 SDY_3213 SDY_3214 qseC ygiX TRUE 0.993 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 1157043 1157044 SDY_3215 SDY_3216 ygiW   FALSE 0.629 53.000 0.053 NA   NA
 1157044 1157045 SDY_3216 SDY_3217     FALSE 0.172 109.000 0.000 NA N NA
 1157045 1157046 SDY_3217 SDY_3218   parC FALSE 0.270 138.000 0.000 1.000 N NA
 1157046 1157047 SDY_3218 SDY_3219 parC plsC FALSE 0.055 234.000 0.043 1.000 N NA
 1157047 1157048 SDY_3219 SDY_3220 plsC sufI TRUE 0.678 75.000 0.154 1.000 N NA
 1157048 1157049 SDY_3220 SDY_3221 sufI ygiRQ FALSE 0.231 111.000 0.000 NA   NA
 1157050 1157051 SDY_3222 SDY_3223 yqhH   FALSE 0.527 49.000 0.000 NA   NA
 1157051 1157052 SDY_3223 SDY_3224   insB FALSE 0.398 61.000 0.000 NA   NA
 1157052 1157053 SDY_3224 SDY_3225 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157053 1157054 SDY_3225 SDY_3226 insA ribB FALSE 0.015 318.000 0.000 1.000 N NA
 1157056 1157057 SDY_3228 SDY_3229 glgS   FALSE 0.614 17.000 0.000 NA   NA
 1157057 1157058 SDY_3229 SDY_3230   insB FALSE 0.032 520.000 0.000 NA Y NA
 1157058 1157059 SDY_3230 SDY_3231 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157059 1157060 SDY_3231 SDY_3232 insA   FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1157061 1157062 SDY_3233 SDY_3234     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1157063 1157064 SDY_3235 SDY_3236   glnE TRUE 0.770 48.000 0.083 1.000 N NA
 1157064 1157065 SDY_3236 SDY_3237 glnE ygiF TRUE 0.826 23.000 0.053 1.000   NA
 1157066 1157067 SDY_3238 SDY_3239 ygiM cca TRUE 0.676 64.000 0.106 1.000 N NA
 1157068 1157069 SDY_3240 SDY_3241 bacA ygiG FALSE 0.232 91.000 0.000 NA   NA
 1157072 1157073 SDY_3244 SDY_3245   ttdA TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1157073 1157074 SDY_3245 SDY_3246 ttdA ttdB TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157074 1157075 SDY_3246 SDY_3247 ttdB ygjE FALSE 0.527 49.000 0.000 NA   NA
 1157077 1157078 SDY_3249 SDY_3250 rpsU dnaG FALSE 0.435 112.000 0.067 1.000 N NA
 1157078 1157079 SDY_3250 SDY_3251 dnaG rpoD FALSE 0.420 195.000 0.299 1.000 N NA
 1157087 1157088 SDY_3259 SDY_3260 ebgR ebgA FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 1157090 1157091 SDY_3262 SDY_3263 ygjJ ygjK FALSE 0.614 17.000 0.000 NA   NA
 1157091 1157092 SDY_3263 SDY_3264 ygjK   FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 1157092 1157093 SDY_3264 SDY_3265   ygjL FALSE 0.013 304.000 0.000 NA   NA
 1157094 1157095 SDY_3266 SDY_3267 ygjM ygjO FALSE 0.024 270.000 0.000 1.000 N NA
 1157098 1157099 SDY_3270 SDY_3271   ygjQ TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1157099 1157100 SDY_3271 SDY_3272 ygjQ ygjR FALSE 0.398 61.000 0.000 NA   NA
 1157100 1157101 SDY_3272 SDY_3273 ygjR ygjT FALSE 0.026 283.000 0.000 1.000   NA
 1157101 1157102 SDY_3273 SDY_3274 ygjT ygjU FALSE 0.004 554.000 0.000 1.000 N NA
 1157103 1157104 SDY_3275 SDY_3276 ygjV uxaA FALSE 0.511 94.000 0.126 NA   NA
 1157104 1157105 SDY_3276 SDY_3277 uxaA uxaC FALSE 0.599 15.000 0.000 NA   NA
 1157107 1157108 SDY_3279 SDY_3280 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157109 1157110 SDY_3281 SDY_3282 exuR yqjA FALSE 0.009 345.000 0.000 NA   NA
 1157110 1157111 SDY_3282 SDY_3283 yqjA yqjB TRUE 0.979 4.000 0.529 NA   NA
 1157111 1157112 SDY_3283 SDY_3284 yqjB yqjC TRUE 0.891 132.000 0.684 NA   NA
 1157112 1157113 SDY_3284 SDY_3285 yqjC yqjD TRUE 0.976 38.000 0.609 NA   NA
 1157113 1157114 SDY_3285 SDY_3286 yqjD yqjE TRUE 0.942 3.000 0.185 NA   NA
 1157114 1157115 SDY_3286 SDY_3287 yqjE   TRUE 0.848 -10.000 0.185 NA   NA
 1157116 1157117 SDY_3288 SDY_3289     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1157118 1157119 SDY_3290 SDY_3291 yqjF yqjG FALSE 0.316 70.000 0.000 NA   NA
 1157119 1157120 SDY_3291 SDY_3292 yqjG yhaH FALSE 0.026 283.000 0.000 1.000   NA
 1157122 1157123 SDY_3294 SDY_3295 yhaI insA FALSE 0.236 -437.000 0.000 NA   NA
 1157123 1157124 SDY_3295 SDY_3296 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157126 1157127 SDY_3298 SDY_3299 yhaK yhaL FALSE 0.541 20.000 0.005 NA   NA
 1157128 1157129 SDY_3300 SDY_3301 yhaNM yhaO TRUE 0.895 28.000 0.157 NA   NA
 1157129 1157130 SDY_3301 SDY_3302 yhaO insB FALSE 0.052 190.000 0.000 NA N NA
 1157130 1157131 SDY_3302 SDY_3303 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157131 1157132 SDY_3303 SDY_3304 insA yhaP FALSE 0.097 165.000 0.000 NA N NA
 1157132 1157133 SDY_3304 SDY_3305 yhaP yhaR FALSE 0.002 609.000 0.000 NA   NA
 1157133 1157134 SDY_3305 SDY_3306 yhaR tdcE FALSE 0.272 -49.000 0.000 NA   NA
 1157134 1157135 SDY_3306 SDY_3307 tdcE tdcD TRUE 0.988 34.000 0.286 1.000 Y NA
 1157135 1157136 SDY_3307 SDY_3308 tdcD tdcC TRUE 0.944 14.000 0.308 1.000 N NA
 1157136 1157137 SDY_3308 SDY_3309 tdcC tdcB TRUE 0.961 22.000 0.029 1.000 Y NA
 1157137 1157138 SDY_3309 SDY_3310 tdcB tdcA FALSE 0.259 99.000 0.023 1.000 N NA
 1157139 1157140 SDY_3311 SDY_3312 tdcR   FALSE 0.002 642.000 0.000 NA   NA
 1157140 1157141 SDY_3312 SDY_3313     FALSE 0.629 19.000 0.000 NA   NA
 1157142 1157143 SDY_3314 SDY_3315 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157145 1157146 SDY_3317 SDY_3318   yhaD FALSE 0.001 1256.000 0.000 NA N NA
 1157146 1157147 SDY_3318 SDY_3319 yhaD garR FALSE 0.570 97.000 0.152 1.000 N NA
 1157147 1157148 SDY_3319 SDY_3320 garR yhaF TRUE 0.968 30.000 0.424 1.000 N NA
 1157148 1157149 SDY_3320 SDY_3321 yhaF yhaU FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1157150 1157151 SDY_3322 SDY_3323 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157151 1157152 SDY_3323 SDY_3324 insB yraK FALSE 0.567 33.000 0.000 NA N NA
 1157154 1157155 SDY_3326 SDY_3327 yraM yraN TRUE 0.733 -42.000 0.172 1.000   NA
 1157155 1157156 SDY_3327 SDY_3328 yraN yraO TRUE 0.924 20.000 0.187 1.000 N NA
 1157156 1157157 SDY_3328 SDY_3329 yraO yraP TRUE 0.978 10.000 0.613 NA   NA
 1157158 1157159 SDY_3330 SDY_3331 yraQ yraR FALSE 0.303 73.000 0.000 NA   NA
 1157163 1157164 SDY_3335 SDY_3336 yhbS yhbT TRUE 0.937 -6.000 0.295 1.000   NA
 1157165 1157166 SDY_3337 SDY_3338 yhbU yhbV TRUE 0.995 -9.000 0.948 0.003 Y NA
 1157166 1157167 SDY_3338 SDY_3339 yhbV yhbW FALSE 0.287 81.000 0.041 NA N NA
 1157168 1157169 SDY_3340 SDY_3341 mtr deaD FALSE 0.155 154.000 0.009 1.000 N NA
 1157169 1157170 SDY_3341 SDY_3342 deaD yhbM FALSE 0.211 180.000 0.053 1.000   NA
 1157170 1157171 SDY_3342 SDY_3343 yhbM pnp FALSE 0.470 109.000 0.071 1.000   NA
 1157171 1157172 SDY_3343 SDY_3344 pnp rpsO TRUE 0.857 178.000 0.335 1.000 Y NA
 1157172 1157173 SDY_3344 SDY_3345 rpsO truB TRUE 0.875 149.000 0.211 1.000 Y NA
 1157173 1157174 SDY_3345 SDY_3346 truB rbfA TRUE 0.992 0.000 0.318 1.000 Y NA
 1157174 1157175 SDY_3346 SDY_3347 rbfA infB TRUE 0.927 164.000 0.530 1.000 Y NA
 1157175 1157176 SDY_3347 SDY_3348 infB nusA TRUE 0.961 25.000 0.342 1.000 N NA
 1157176 1157177 SDY_3348 SDY_3349 nusA yhbC TRUE 0.982 28.000 0.759 NA   NA
 1157177 1157178 SDY_3349 SDY_3350 yhbC   FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 1157180 1157181 SDY_3352 SDY_3353 yhbX   FALSE 0.311 71.000 0.000 NA   NA
 1157181 1157182 SDY_3353 SDY_3354     FALSE 0.377 -25.000 0.000 NA   NA
 1157182 1157183 SDY_3354 SDY_3355     FALSE 0.002 704.000 0.000 NA   NA
 1157183 1157184 SDY_3355 SDY_3356   secG FALSE 0.599 15.000 0.000 NA   NA
 1157184 1157185 SDY_3356 SDY_3357 secG mrsA FALSE 0.040 228.000 0.016 1.000 N NA
 1157185 1157186 SDY_3357 SDY_3358 mrsA folP TRUE 0.914 -7.000 0.260 1.000 N NA
 1157186 1157187 SDY_3358 SDY_3359 folP hflB TRUE 0.790 90.000 0.325 1.000 N NA
 1157187 1157188 SDY_3359 SDY_3360 hflB ftsJ FALSE 0.567 100.000 0.152 1.000 N NA
 1157192 1157193 SDY_3364 SDY_3365 yhbZ yhbE TRUE 0.692 16.000 0.015 1.000   NA
 1157193 1157194 SDY_3365 SDY_3366 yhbE rpmA FALSE 0.337 127.000 0.019 1.000   NA
 1157194 1157195 SDY_3366 SDY_3367 rpmA rplU TRUE 0.997 21.000 0.667 0.010 Y NA
 1157196 1157197 SDY_3368 SDY_3369 ispB nlp FALSE 0.025 228.000 0.000 NA N NA
 1157198 1157199 SDY_3370 SDY_3371 murA yrbA TRUE 0.873 55.000 0.258 NA N NA
 1157199 1157200 SDY_3371 SDY_3372 yrbA yrbB TRUE 0.773 145.000 0.453 NA   NA
 1157200 1157201 SDY_3372 SDY_3373 yrbB yrbC TRUE 0.772 -96.000 0.308 NA   NA
 1157201 1157202 SDY_3373 SDY_3374 yrbC yrbD TRUE 0.914 19.000 0.188 NA   NA
 1157202 1157203 SDY_3374 SDY_3375 yrbD yrbE TRUE 0.979 5.000 0.562 NA   NA
 1157203 1157204 SDY_3375 SDY_3376 yrbE yrbF TRUE 0.993 8.000 0.530 NA Y NA
 1157205 1157206 SDY_3377 SDY_3378 yrbG yrbH TRUE 0.926 14.000 0.226 1.000 N NA
 1157206 1157207 SDY_3378 SDY_3379 yrbH yrbI TRUE 0.980 21.000 0.598 1.000   NA
 1157207 1157208 SDY_3379 SDY_3380 yrbI yrbK TRUE 0.978 -3.000 0.617 NA   NA
 1157208 1157209 SDY_3380 SDY_3381 yrbK yhbN TRUE 0.895 -31.000 0.459 NA   NA
 1157209 1157210 SDY_3381 SDY_3382 yhbN yhbG TRUE 0.977 7.000 0.543 NA   NA
 1157210 1157211 SDY_3382 SDY_3383 yhbG rpoN TRUE 0.872 48.000 0.163 1.000   NA
 1157211 1157212 SDY_3383 SDY_3384 rpoN yhbH TRUE 0.982 23.000 0.820 NA N NA
 1157212 1157213 SDY_3384 SDY_3385 yhbH ptsN TRUE 0.894 118.000 0.728 NA N NA
 1157213 1157214 SDY_3385 SDY_3386 ptsN yhbJ TRUE 0.879 46.000 0.186 NA   NA
 1157214 1157215 SDY_3386 SDY_3387 yhbJ ptsO TRUE 0.918 -3.000 0.182 NA   NA
 1157215 1157216 SDY_3387 SDY_3388 ptsO yrbL FALSE 0.029 214.000 0.007 NA   NA
 1157217 1157218 SDY_3389 SDY_3390 mtgA yhbL TRUE 0.796 -3.000 0.066 NA   NA
 1157218 1157219 SDY_3390 SDY_3391 yhbL arcB FALSE 0.027 221.000 0.000 NA N NA
 1157219 1157220 SDY_3391 SDY_3392 arcB yhcC FALSE 0.537 96.000 0.113 1.000   NA
 1157221 1157222 SDY_3393 SDY_3394 gltB gltD TRUE 0.981 13.000 0.096 0.000 Y NA
 1157222 1157223 SDY_3394 SDY_3395 gltD yhcG FALSE 0.086 184.000 0.000 NA   NA
 1157224 1157225 SDY_3396 SDY_3397 yhcH yhcI TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA Y NA
 1157225 1157226 SDY_3397 SDY_3398 yhcI yhcJ TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1157226 1157227 SDY_3398 SDY_3399 yhcJ nanT FALSE 0.601 48.000 0.000 1.000 N NA
 1157227 1157228 SDY_3399 SDY_3400 nanT nanA TRUE 0.775 109.000 0.318 1.000 N NA
 1157228 1157229 SDY_3400 SDY_3401 nanA yhcK FALSE 0.081 194.000 0.000 1.000 N NA
 1157229 1157230 SDY_3401 SDY_3402 yhcK   FALSE 0.008 327.000 0.000 NA N NA
 1157232 1157233 SDY_3404 SDY_3405 sspB sspA TRUE 0.986 6.000 0.831 NA   NA
 1157233 1157234 SDY_3405 SDY_3406 sspA rpsI FALSE 0.006 394.000 0.014 1.000 N NA
 1157234 1157235 SDY_3406 SDY_3407 rpsI rplM TRUE 0.995 16.000 0.601 0.010 Y NA
 1157235 1157236 SDY_3407 SDY_3408 rplM yhcM FALSE 0.025 219.000 0.003 NA   NA
 1157237 1157238 SDY_3409 SDY_3410 yhcB degQ FALSE 0.442 154.000 0.154 NA   NA
 1157238 1157239 SDY_3410 SDY_3411 degQ degS TRUE 0.956 90.000 0.262 0.001 Y NA
 1157241 1157242 SDY_3413 SDY_3414 argR yhcN FALSE 0.007 365.000 0.000 NA   NA
 1157243 1157244 SDY_3415 SDY_3416 yhcO yhcP FALSE 0.248 92.000 0.027 NA   NA
 1157244 1157245 SDY_3416 SDY_3417 yhcP yhcQ TRUE 0.983 6.000 0.667 NA   NA
 1157245 1157246 SDY_3417 SDY_3418 yhcQ yhcR TRUE 0.862 8.000 0.100 NA   NA
 1157248 1157249 SDY_3420 SDY_3421 tldD yhdRP FALSE 0.222 156.000 0.050 NA   NA
 1157249 1157250 SDY_3421 SDY_3422 yhdRP cafA TRUE 0.834 68.000 0.296 NA   NA
 1157250 1157251 SDY_3422 SDY_3423 cafA yhdE TRUE 0.924 -10.000 0.417 NA N NA
 1157251 1157252 SDY_3423 SDY_3424 yhdE mreD TRUE 0.925 9.000 0.206 NA N NA
 1157252 1157253 SDY_3424 SDY_3425 mreD mreC TRUE 0.997 0.000 0.550 0.002 Y NA
 1157253 1157254 SDY_3425 SDY_3426 mreC mreB TRUE 0.941 66.000 0.689 1.000 N NA
 1157254 1157255 SDY_3426 SDY_3427 mreB yhdA FALSE 0.017 305.000 0.000 1.000 N NA
 1157258 1157259 SDY_3429 SDY_3431     FALSE 0.111 174.000 0.000 NA   NA
 1157259 1157260 SDY_3431 SDY_3432   accB FALSE 0.003 573.000 0.000 NA   NA
 1157260 1157261 SDY_3432 SDY_3433 accB accC TRUE 0.992 11.000 0.275 0.000 Y NA
 1157261 1157262 SDY_3433 SDY_3434 accC yhdT FALSE 0.469 109.000 0.103 NA   NA
 1157262 1157263 SDY_3434 SDY_3435 yhdT panF TRUE 0.961 -10.000 0.682 NA   NA
 1157263 1157264 SDY_3435 SDY_3436 panF prmA TRUE 0.740 12.000 0.041 1.000 N NA
 1157264 1157265 SDY_3436 SDY_3437 prmA yhdG FALSE 0.134 329.000 0.042 1.000 Y NA
 1157265 1157266 SDY_3437 SDY_3438 yhdG fis TRUE 0.909 26.000 0.161 1.000 N NA
 1157266 1157267 SDY_3438 SDY_3439 fis yhdJ FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1157267 1157268 SDY_3439 SDY_3440 yhdJ insA TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1157268 1157269 SDY_3440 SDY_3441 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157269 1157270 SDY_3441 SDY_3442 insB acrE FALSE 0.213 140.000 0.000 NA   NA
 1157270 1157271 SDY_3442 SDY_3443 acrE acrF_1 FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1157273 1157274 SDY_3445 SDY_3446 yhdW yhdX FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1157274 1157275 SDY_3446 SDY_3447 yhdX yhdY TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1157275 1157276 SDY_3447 SDY_3448 yhdY yhdZ TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1157277 1157278 SDY_3449 SDY_3450 rrfF   FALSE 0.632 41.000 0.000 NA   NA
 1157278 1157279 SDY_3450 SDY_3451   rrfD FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1157279 1157280 SDY_3451 SDY_3452 rrfD rrlD FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1157280 1157281 SDY_3452 SDY_3453 rrlD   FALSE 0.107 175.000 0.000 NA   NA
 1157281 1157282 SDY_3453 SDY_3454     FALSE 0.626 43.000 0.000 NA   NA
 1157282 1157283 SDY_3454 SDY_3455   rrsD FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1157285 1157286 SDY_3457 SDY_3458 yrdB aroE TRUE 0.732 -3.000 0.043 NA   NA
 1157286 1157287 SDY_3458 SDY_3459 aroE yrdC TRUE 0.836 5.000 0.087 NA N NA
 1157287 1157288 SDY_3459 SDY_3460 yrdC yrdD TRUE 0.889 5.000 0.137 NA N NA
 1157288 1157289 SDY_3460 SDY_3461 yrdD smg TRUE 0.954 29.000 0.331 NA   NA
 1157289 1157290 SDY_3461 SDY_3462 smg smf TRUE 0.672 -28.000 0.124 NA   NA
 1157291 1157292 SDY_3463 SDY_3464 def fmt TRUE 0.972 15.000 0.058 0.015 Y NA
 1157292 1157293 SDY_3464 SDY_3465 fmt sun TRUE 0.983 46.000 0.305 1.000 Y NA
 1157293 1157294 SDY_3465 SDY_3466 sun trkA TRUE 0.883 22.000 0.122 1.000 N NA
 1157294 1157295 SDY_3466 SDY_3467 trkA mscL FALSE 0.239 130.000 0.000 NA   NA
 1157296 1157297 SDY_3468 SDY_3469 yhdM yhdN TRUE 0.832 11.000 0.095 NA   NA
 1157297 1157298 SDY_3469 SDY_3470 yhdN rplQ FALSE 0.183 107.000 0.012 NA   NA
 1157298 1157299 SDY_3470 SDY_3471 rplQ rpoA TRUE 0.985 41.000 0.873 1.000 N NA
 1157299 1157300 SDY_3471 SDY_3472 rpoA rpsD TRUE 0.976 26.000 0.549 1.000 N NA
 1157300 1157301 SDY_3472 SDY_3473 rpsD rpsK TRUE 0.995 34.000 0.509 0.013 Y NA
 1157301 1157302 SDY_3473 SDY_3474 rpsK rpsM TRUE 0.997 17.000 0.810 0.010 Y NA
 1157302 1157303 SDY_3474 SDY_3475 rpsM rpmJ TRUE 0.853 147.000 0.086 0.010 Y NA
 1157303 1157304 SDY_3475 SDY_3476 rpmJ prlA TRUE 0.750 32.000 0.036 1.000 N NA
 1157304 1157305 SDY_3476 SDY_3477 prlA rplO TRUE 0.985 8.000 0.730 1.000 N NA
 1157305 1157306 SDY_3477 SDY_3478 rplO rpmD TRUE 0.998 4.000 0.653 0.002 Y NA
 1157306 1157307 SDY_3478 SDY_3479 rpmD rpsE TRUE 0.998 4.000 0.789 0.013 Y NA
 1157307 1157308 SDY_3479 SDY_3480 rpsE rplR TRUE 0.996 15.000 0.814 0.013 Y NA
 1157308 1157309 SDY_3480 SDY_3481 rplR rplF TRUE 0.997 10.000 0.815 0.010 Y NA
 1157309 1157310 SDY_3481 SDY_3482 rplF rpsH TRUE 0.996 13.000 0.808 0.010 Y NA
 1157310 1157311 SDY_3482 SDY_3483 rpsH rpsN TRUE 0.995 34.000 0.473 0.010 Y NA
 1157311 1157312 SDY_3483 SDY_3484 rpsN rplE TRUE 0.994 15.000 0.496 0.010 Y NA
 1157312 1157313 SDY_3484 SDY_3485 rplE rplX TRUE 0.996 15.000 0.758 0.010 Y NA
 1157313 1157314 SDY_3485 SDY_3486 rplX rplN TRUE 0.997 11.000 0.810 0.013 Y NA
 1157314 1157315 SDY_3486 SDY_3487 rplN rpsQ TRUE 0.963 165.000 0.791 0.013 Y NA
 1157315 1157316 SDY_3487 SDY_3488 rpsQ rpmC TRUE 0.998 0.000 0.828 0.010 Y NA
 1157316 1157317 SDY_3488 SDY_3489 rpmC rplP TRUE 0.998 0.000 0.802 0.010 Y NA
 1157317 1157318 SDY_3489 SDY_3490 rplP rpsC TRUE 0.996 13.000 0.828 0.013 Y NA
 1157318 1157319 SDY_3490 SDY_3491 rpsC rplV TRUE 0.996 18.000 0.719 0.013 Y NA
 1157319 1157320 SDY_3491 SDY_3492 rplV rpsS TRUE 0.996 15.000 0.769 0.013 Y NA
 1157320 1157321 SDY_3492 SDY_3493 rpsS rplB TRUE 0.997 17.000 0.820 0.013 Y NA
 1157321 1157322 SDY_3493 SDY_3494 rplB rplW TRUE 0.997 18.000 0.849 0.013 Y NA
 1157322 1157323 SDY_3494 SDY_3495 rplW rplD TRUE 0.995 -3.000 0.513 0.010 Y NA
 1157323 1157324 SDY_3495 SDY_3496 rplD rplC TRUE 0.995 11.000 0.486 0.010 Y NA
 1157324 1157325 SDY_3496 SDY_3497 rplC rpsJ TRUE 0.992 33.000 0.307 0.013 Y NA
 1157325 1157326 SDY_3497 SDY_3498 rpsJ bfr FALSE 0.002 843.000 0.000 1.000 N NA
 1157326 1157327 SDY_3498 SDY_3499 bfr   TRUE 0.830 73.000 0.033 NA Y NA
 1157327 1157328 SDY_3499 SDY_3500   tufA FALSE 0.041 183.000 0.007 NA N NA
 1157328 1157329 SDY_3500 SDY_3501 tufA fusA TRUE 0.979 71.000 0.400 0.001 Y NA
 1157329 1157330 SDY_3501 SDY_3502 fusA rpsG TRUE 0.960 97.000 0.579 1.000 Y NA
 1157330 1157331 SDY_3502 SDY_3503 rpsG rpsL TRUE 0.976 97.000 0.620 0.002 Y NA
 1157331 1157332 SDY_3503 SDY_3504 rpsL yheL FALSE 0.341 126.000 0.058 NA N NA
 1157332 1157333 SDY_3504 SDY_3505 yheL yheM TRUE 0.996 8.000 0.804 NA Y NA
 1157333 1157334 SDY_3505 SDY_3506 yheM yheN TRUE 0.996 0.000 0.790 NA Y NA
 1157334 1157335 SDY_3506 SDY_3507 yheN yheO TRUE 0.950 0.000 0.220 NA   NA
 1157335 1157336 SDY_3507 SDY_3508 yheO fkpA TRUE 0.648 155.000 0.310 NA   NA
 1157338 1157339 SDY_3510 SDY_3511 slyD   TRUE 0.781 95.000 0.370 NA   NA
 1157339 1157340 SDY_3511 SDY_3512   kefB TRUE 0.964 10.000 0.400 NA   NA
 1157340 1157341 SDY_3512 SDY_3513 kefB yheR TRUE 0.991 0.000 0.927 1.000   NA
 1157342 1157343 SDY_3514 SDY_3515 yheS yheT TRUE 0.693 0.000 0.016 NA   NA
 1157343 1157344 SDY_3515 SDY_3516 yheT yheU TRUE 0.902 -6.000 0.222 NA   NA
 1157344 1157345 SDY_3516 SDY_3517 yheU prkB FALSE 0.480 54.000 0.000 NA   NA
 1157347 1157348 SDY_3519 SDY_3520 crp yhfK TRUE 0.817 51.000 0.111 1.000   NA
 1157349 1157350 SDY_3521 SDY_3522 argD pabA TRUE 0.864 86.000 0.088 1.000 Y NA
 1157350 1157351 SDY_3522 SDY_3523 pabA fic TRUE 0.650 32.000 0.008 1.000 N NA
 1157351 1157352 SDY_3523 SDY_3524 fic yhfG FALSE 0.478 -10.000 0.000 NA   NA
 1157352 1157353 SDY_3524 SDY_3525 yhfG ppiA TRUE 0.777 105.000 0.364 NA   NA
 1157354 1157355 SDY_3526 SDY_3527 yhfC nirB FALSE 0.027 262.000 0.000 1.000 N NA
 1157355 1157356 SDY_3527 SDY_3528 nirB nirD TRUE 0.991 -3.000 0.829 0.000 N NA
 1157356 1157357 SDY_3528 SDY_3529 nirD nirC TRUE 0.936 126.000 0.283 1.000 Y NA
 1157357 1157358 SDY_3529 SDY_3530 nirC cysG TRUE 0.691 19.000 0.000 1.000 N NA
 1157360 1157361 SDY_3532 SDY_3533 gadA yhiX FALSE 0.009 368.000 0.000 1.000 N NA
 1157361 1157362 SDY_3533 SDY_3534 yhiX yhiW FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 1157365 1157366 SDY_3537 SDY_3538 yhiV yhiU TRUE 0.715 25.000 0.000 1.000 N NA
 1157366 1157367 SDY_3538 SDY_3539 yhiU yhiE FALSE 0.015 339.000 0.000 1.000   NA
 1157368 1157369 SDY_3540 SDY_3541 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157371 1157372 SDY_3543 SDY_3544 hdeA hdeB FALSE 0.211 104.000 0.000 NA   NA
 1157372 1157373 SDY_3544 SDY_3545 hdeB yhiD FALSE 0.248 123.000 0.000 NA   NA
 1157374 1157375 SDY_3546 SDY_3547   shuV FALSE 0.001 805.000 0.000 NA N NA
 1157375 1157376 SDY_3547 SDY_3548 shuV shuU TRUE 0.986 -3.000 0.220 1.000 Y NA
 1157376 1157377 SDY_3548 SDY_3549 shuU shuY FALSE 0.255 87.000 0.010 1.000 N NA
 1157377 1157378 SDY_3549 SDY_3550 shuY shuX TRUE 0.790 0.000 0.054 NA N NA
 1157378 1157379 SDY_3550 SDY_3551 shuX shuW FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1157379 1157380 SDY_3551 SDY_3552 shuW shuT FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1157381 1157382 SDY_3553 SDY_3554   shuA FALSE 0.017 276.000 0.000 NA   NA
 1157382 1157383 SDY_3554 SDY_3555 shuA shuS TRUE 0.946 49.000 0.056 1.000 Y NA
 1157384 1157385 SDY_3556 SDY_3557 yhiF slp FALSE 0.184 156.000 0.000 1.000 N NA
 1157387 1157388 SDY_3559 SDY_3560 arsC arsB TRUE 0.950 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1157388 1157389 SDY_3560 SDY_3561 arsB arsR TRUE 0.705 34.000 0.000 1.000 N NA
 1157389 1157390 SDY_3561 SDY_3562 arsR gor FALSE 0.002 880.000 0.000 1.000 N NA
 1157390 1157391 SDY_3562 SDY_3563 gor yhiR FALSE 0.634 72.000 0.100 1.000   NA
 1157392 1157393 SDY_3564 SDY_3565 prlC yhiQ TRUE 0.865 6.000 0.098 NA   NA
 1157394 1157395 SDY_3566 SDY_3567 yhiP uspA FALSE 0.016 317.000 0.000 1.000 N NA
 1157398 1157399 SDY_3570 SDY_3571 yhiN   FALSE 0.005 404.000 0.000 NA   NA
 1157400 1157401 SDY_3572 SDY_3573     TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1157401 1157402 SDY_3573 SDY_3574   glgP FALSE 0.216 129.000 0.016 NA   NA
 1157402 1157403 SDY_3574 SDY_3575 glgP glgA TRUE 0.985 19.000 0.228 1.000 Y NA
 1157403 1157404 SDY_3575 SDY_3576 glgA glgC TRUE 0.992 0.000 0.307 1.000 Y NA
 1157404 1157405 SDY_3576 SDY_3577 glgC glgX TRUE 0.984 18.000 0.228 1.000 Y NA
 1157405 1157406 SDY_3577 SDY_3578 glgX glgB TRUE 0.975 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 1157406 1157407 SDY_3578 SDY_3579 glgB asd FALSE 0.023 273.000 0.000 1.000 N NA
 1157409 1157410 SDY_3581 SDY_3582     FALSE 0.006 378.000 0.000 NA   NA
 1157411 1157412 SDY_3583 SDY_3584   insA TRUE 0.679 148.000 0.000 NA Y NA
 1157412 1157413 SDY_3584 SDY_3585 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157414 1157415 SDY_3586 SDY_3587   gntU FALSE 0.263 140.000 0.000 1.000 N NA
 1157415 1157416 SDY_3587 SDY_3588 gntU gntK TRUE 0.969 4.000 0.000 1.000 Y NA
 1157416 1157417 SDY_3588 SDY_3589 gntK gntR FALSE 0.266 139.000 0.000 1.000 N NA
 1157417 1157418 SDY_3589 SDY_3590 gntR yhhW FALSE 0.090 183.000 0.000 NA   NA
 1157418 1157419 SDY_3590 SDY_3591 yhhW yhhX TRUE 0.822 123.000 0.400 NA   NA
 1157420 1157421 SDY_3592 SDY_3593 yhhY   FALSE 0.008 356.000 0.000 NA   NA
 1157421 1157422 SDY_3593 SDY_3594     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157425 1157426 SDY_3597 SDY_3598 ugpQ ugpC TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157426 1157427 SDY_3598 SDY_3599 ugpC ugpE FALSE 0.331 -37.000 0.000 NA   NA
 1157427 1157428 SDY_3599 SDY_3600 ugpE ugpA TRUE 0.992 -3.000 0.306 0.037 Y NA
 1157428 1157429 SDY_3600 SDY_3601 ugpA ugpB TRUE 0.978 98.000 0.793 0.037 Y NA
 1157429 1157430 SDY_3601 SDY_3602 ugpB   FALSE 0.012 360.000 0.000 1.000   NA
 1157430 1157431 SDY_3602 SDY_3603   livF FALSE 0.351 119.000 0.000 1.000   NA
 1157431 1157432 SDY_3603 SDY_3604 livF livG TRUE 0.998 2.000 0.967 0.011 Y NA
 1157432 1157433 SDY_3604 SDY_3605 livG livM TRUE 0.994 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 1157433 1157434 SDY_3605 SDY_3606 livM livH TRUE 0.996 -3.000 0.574 0.037 Y NA
 1157434 1157435 SDY_3606 SDY_3607 livH livK TRUE 0.935 48.000 0.000 1.000 Y NA
 1157435 1157436 SDY_3607 SDY_3608 livK insB FALSE 0.255 69.000 0.000 NA N NA
 1157436 1157437 SDY_3608 SDY_3609 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157439 1157440 SDY_3611 SDY_3612 livJ rpoH FALSE 0.053 214.000 0.000 1.000 N NA
 1157440 1157441 SDY_3612 SDY_3613 rpoH ftsX FALSE 0.053 245.000 0.051 1.000 N NA
 1157441 1157442 SDY_3613 SDY_3614 ftsX ftsE TRUE 0.960 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 1157442 1157443 SDY_3614 SDY_3615 ftsE ftsY TRUE 0.943 3.000 0.117 0.062 N NA
 1157444 1157445 SDY_3616 SDY_3617 yhhF yhhL TRUE 0.648 -10.000 0.063 NA   NA
 1157447 1157448 SDY_3619 SDY_3620 yhhN zntA FALSE 0.299 74.000 0.000 NA   NA
 1157450 1157451 SDY_3622 SDY_3623 yhhQ   FALSE 0.475 73.000 0.066 NA   NA
 1157453 1157454 SDY_3625 SDY_3626 yhhT   FALSE 0.226 -720.000 0.000 NA   NA
 1157455 1157456 SDY_3627 SDY_3628 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157457 1157458 SDY_3629 SDY_3630   yhhU TRUE 0.881 2.000 0.073 1.000 N NA
 1157458 1157459 SDY_3630 SDY_3631 yhhU nikA FALSE 0.283 111.000 0.000 1.000 N NA
 1157459 1157460 SDY_3631 SDY_3632 nikA nikB TRUE 0.998 0.000 0.833 0.047 Y NA
 1157460 1157461 SDY_3632 SDY_3633 nikB nikC TRUE 0.997 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 1157461 1157462 SDY_3633 SDY_3634 nikC nikD TRUE 0.994 0.000 0.409 1.000 Y NA
 1157462 1157463 SDY_3634 SDY_3635 nikD nikE TRUE 0.991 -3.000 0.290 0.062 Y NA
 1157463 1157464 SDY_3635 SDY_3636 nikE yhhG TRUE 0.769 6.000 0.031 1.000 N NA
 1157464 1157465 SDY_3636 SDY_3637 yhhG   FALSE 0.071 190.000 0.000 NA   NA
 1157465 1157466 SDY_3637 SDY_3638     FALSE 0.214 -994.000 0.000 NA   NA
 1157468 1157469 SDY_3640 SDY_3641     TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1157469 1157470 SDY_3641 SDY_3642     TRUE 0.991 -3.000 0.231 0.006 Y NA
 1157470 1157471 SDY_3642 SDY_3643     TRUE 0.919 77.000 0.444 0.008   NA
 1157471 1157472 SDY_3643 SDY_3644   insA FALSE 0.323 109.000 0.000 1.000   NA
 1157472 1157473 SDY_3644 SDY_3645 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157473 1157474 SDY_3645 SDY_3646 insB   FALSE 0.263 82.000 0.000 NA   NA
 1157474 1157475 SDY_3646 SDY_3647     TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1157475 1157476 SDY_3647 SDY_3648     FALSE 0.010 333.000 0.000 NA   NA
 1157478 1157479 SDY_3650 SDY_3651 glpE glpG TRUE 0.960 45.000 0.405 1.000   NA
 1157479 1157480 SDY_3651 SDY_3652 glpG glpR TRUE 0.925 17.000 0.190 1.000   NA
 1157482 1157483 SDY_3653 SDY_3655 rtcB yhgKJ TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1157484 1157485 SDY_3656 SDY_3657     FALSE 0.618 -9.000 0.000 1.000   NA
 1157485 1157486 SDY_3657 SDY_3658   malT FALSE 0.521 61.000 0.000 1.000   NA
 1157487 1157488 SDY_3659 SDY_3660 malP malQ TRUE 0.986 10.000 0.137 0.010 Y NA
 1157489 1157490 SDY_3661 SDY_3662 gntT yhgI FALSE 0.012 361.000 0.000 1.000   NA
 1157490 1157491 SDY_3662 SDY_3664 yhgI yhgH FALSE 0.420 59.000 0.000 NA   NA
 1157493 1157494 SDY_3665 SDY_3666 yhgA yhgG FALSE 0.053 203.000 0.000 NA   NA
 1157494 1157495 SDY_3666 SDY_3667 yhgG feoB TRUE 0.976 0.000 0.455 NA   NA
 1157495 1157496 SDY_3667 SDY_3668 feoB feoA TRUE 0.979 17.000 0.177 1.000 Y NA
 1157496 1157497 SDY_3668 SDY_3669 feoA yhgF FALSE 0.005 457.000 0.000 1.000 N NA
 1157497 1157498 SDY_3669 SDY_3670 yhgF greB FALSE 0.587 196.000 0.123 1.000 Y NA
 1157499 1157500 SDY_3671 SDY_3672 ompR envZ TRUE 0.994 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 1157503 1157504 SDY_3675 SDY_3676     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157504 1157505 SDY_3676 SDY_3677   hslO FALSE 0.007 372.000 0.000 NA   NA
 1157505 1157506 SDY_3677 SDY_3678 hslO yrfH TRUE 0.898 25.000 0.140 1.000 N NA
 1157506 1157507 SDY_3678 SDY_3679 yrfH yrfG TRUE 0.821 11.000 0.056 1.000   NA
 1157507 1157508 SDY_3679 SDY_3680 yrfG yrfF TRUE 0.891 20.000 0.122 1.000   NA
 1157511 1157512 SDY_3683 SDY_3684   yrfD TRUE 0.648 31.000 0.000 NA   NA
 1157512 1157513 SDY_3684 SDY_3685 yrfD yrfC TRUE 0.989 0.000 0.870 NA   NA
 1157513 1157514 SDY_3685 SDY_3686 yrfC yrfB TRUE 0.905 -16.000 0.348 NA   NA
 1157514 1157515 SDY_3686 SDY_3687 yrfB yrfA TRUE 0.967 10.000 0.444 NA   NA
 1157515 1157516 SDY_3687 SDY_3688 yrfA hofQ FALSE 0.249 -88.000 0.000 NA   NA
 1157516 1157517 SDY_3688 SDY_3689 hofQ aroK FALSE 0.005 401.000 0.000 NA   NA
 1157517 1157518 SDY_3689 SDY_3690 aroK aroB TRUE 0.965 57.000 0.208 1.000 Y NA
 1157518 1157519 SDY_3690 SDY_3691 aroB damX FALSE 0.224 92.000 0.022 NA   NA
 1157519 1157520 SDY_3691 SDY_3692 damX dam TRUE 0.691 107.000 0.234 NA   NA
 1157520 1157521 SDY_3692 SDY_3693 dam rpe TRUE 0.775 18.000 0.053 1.000 N NA
 1157521 1157522 SDY_3693 SDY_3694 rpe gph TRUE 0.725 -7.000 0.050 1.000   NA
 1157522 1157523 SDY_3694 SDY_3695 gph trpS TRUE 0.831 -7.000 0.118 1.000   NA
 1157523 1157524 SDY_3695 SDY_3696 trpS yhfZ FALSE 0.002 487.000 0.004 NA   NA
 1157524 1157525 SDY_3696 SDY_3697 yhfZ yhfY FALSE 0.377 -25.000 0.000 NA   NA
 1157525 1157526 SDY_3697 SDY_3698 yhfY   FALSE 0.235 -548.000 0.000 NA   NA
 1157526 1157527 SDY_3698 SDY_3699     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1157527 1157528 SDY_3699 SDY_3700   yhfX FALSE 0.004 413.000 0.000 NA   NA
 1157528 1157529 SDY_3700 SDY_3701 yhfX yhfW FALSE 0.219 138.000 0.000 NA   NA
 1157529 1157530 SDY_3701 SDY_3702 yhfW yhfV TRUE 0.876 -3.000 0.094 1.000   NA
 1157530 1157531 SDY_3702 SDY_3703 yhfV yhfU FALSE 0.361 -28.000 0.000 NA   NA
 1157533 1157534 SDY_3705 SDY_3706   yiaI FALSE 0.035 244.000 0.000 1.000 N NA
 1157535 1157536 SDY_3707 SDY_3708 avtA malS FALSE 0.101 178.000 0.000 NA   NA
 1157538 1157539 SDY_3710 SDY_3711 xylR   FALSE 0.199 84.000 0.000 NA N NA
 1157542 1157543 SDY_3714 SDY_3715     FALSE 0.264 -58.000 0.000 NA   NA
 1157544 1157545 SDY_3716 SDY_3717 rrfC rrlC FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1157545 1157546 SDY_3717 SDY_3718 rrlC   FALSE 0.083 185.000 0.000 NA   NA
 1157546 1157547 SDY_3718 SDY_3719   rrsC FALSE 0.248 87.000 0.000 NA   NA
 1157548 1157549 SDY_3720 SDY_3721 purH purD TRUE 0.985 12.000 0.238 1.000 Y NA
 1157550 1157551 SDY_3722 SDY_3723 hydG hydH TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.062 Y NA
 1157553 1157554 SDY_3725 SDY_3726 yjaH hupA TRUE 0.953 13.000 0.375 NA   NA
 1157554 1157555 SDY_3726 SDY_3727 hupA yjaG FALSE 0.511 187.000 0.355 NA   NA
 1157555 1157556 SDY_3727 SDY_3728 yjaG nfi TRUE 0.812 43.000 0.086 NA   NA
 1157556 1157557 SDY_3728 SDY_3729 nfi hemE TRUE 0.736 10.000 0.028 1.000 N NA
 1157557 1157558 SDY_3729 SDY_3730 hemE yjaD TRUE 0.751 40.000 0.040 1.000 N NA
 1157559 1157560 SDY_3731 SDY_3732 yjaE thiC FALSE 0.040 234.000 0.000 1.000 N NA
 1157560 1157561 SDY_3732 SDY_3733 thiC thiE TRUE 0.986 0.000 0.063 0.003 Y NA
 1157561 1157562 SDY_3733 SDY_3734 thiE thiF TRUE 0.978 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 1157562 1157563 SDY_3734 SDY_3735 thiF thiS TRUE 0.985 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 1157563 1157564 SDY_3735 SDY_3736 thiS thiG TRUE 0.981 2.000 0.087 1.000 Y NA
 1157564 1157565 SDY_3736 SDY_3737 thiG thiH TRUE 0.992 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 1157568 1157569 SDY_3740 SDY_3741 rpoC rpoB TRUE 0.964 77.000 0.851 0.000   NA
 1157569 1157570 SDY_3741 SDY_3742 rpoB rplL FALSE 0.105 309.000 0.223 1.000   NA
 1157570 1157571 SDY_3742 SDY_3743 rplL rplJ TRUE 0.991 67.000 0.884 0.010 Y NA
 1157571 1157572 SDY_3743 SDY_3744 rplJ rplA FALSE 0.233 413.000 0.302 0.013 Y NA
 1157572 1157573 SDY_3744 SDY_3745 rplA rplK TRUE 0.998 4.000 0.838 0.013 Y NA
 1157573 1157574 SDY_3745 SDY_3746 rplK nusG TRUE 0.828 159.000 0.681 1.000 N NA
 1157574 1157575 SDY_3746 SDY_3747 nusG secE TRUE 0.990 2.000 0.843 1.000 N NA
 1157575 1157576 SDY_3747 SDY_3748 secE tufB FALSE 0.033 230.000 0.009 1.000 N NA
 1157576 1157577 SDY_3748 SDY_3749 tufB   FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 1157577 1157578 SDY_3749 SDY_3750     TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1157578 1157579 SDY_3750 SDY_3751     FALSE 0.244 117.000 0.000 NA   NA
 1157579 1157580 SDY_3751 SDY_3752     TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1157581 1157582 SDY_3753 SDY_3754   coaA FALSE 0.054 187.000 0.007 NA   NA
 1157583 1157584 SDY_3755 SDY_3756 birA murB TRUE 0.935 -3.000 0.211 1.000 N NA
 1157584 1157585 SDY_3756 SDY_3757 murB rrfA FALSE 0.225 135.000 0.000 NA   NA
 1157585 1157586 SDY_3757 SDY_3758 rrfA rrlA FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1157586 1157587 SDY_3758 SDY_3759 rrlA   FALSE 0.083 185.000 0.000 NA   NA
 1157587 1157588 SDY_3759 SDY_3760   rrsA FALSE 0.248 87.000 0.000 NA   NA
 1157588 1157589 SDY_3760 SDY_3761 rrsA murI FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1157589 1157590 SDY_3761 SDY_3762 murI btuB FALSE 0.333 -55.000 0.025 1.000 N NA
 1157592 1157593 SDY_3764 SDY_3765 yijD yijC TRUE 0.943 0.000 0.194 NA   NA
 1157593 1157594 SDY_3765 SDY_3768 yijC   FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1157595 1157596 SDY_3766 SDY_3767 insA insB FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1157597 1157598 SDY_3769 SDY_3770     TRUE 0.864 15.000 0.000 0.002   NA
 1157598 1157599 SDY_3770 SDY_3771     FALSE 0.248 87.000 0.000 NA   NA
 1157599 1157600 SDY_3771 SDY_3772   yiiX FALSE 0.002 622.000 0.000 NA   NA
 1157600 1157601 SDY_3772 SDY_3773 yiiX metJ FALSE 0.409 60.000 0.000 NA   NA
 1157602 1157603 SDY_3774 SDY_3775 metB metL TRUE 0.994 3.000 0.428 1.000 Y NA
 1157603 1157604 SDY_3775 SDY_3776 metL metF FALSE 0.093 349.000 0.017 1.000 Y NA
 1157604 1157605 SDY_3776 SDY_3777 metF katG FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 1157605 1157606 SDY_3777 SDY_3778 katG yijE FALSE 0.398 61.000 0.000 NA   NA
 1157607 1157608 SDY_3779 SDY_3780 yijF gldA FALSE 0.018 274.000 0.000 NA   NA
 1157608 1157609 SDY_3780 SDY_3781 gldA talC TRUE 0.977 11.000 0.600 1.000 N NA
 1157609 1157610 SDY_3781 SDY_3782 talC ptsA TRUE 0.953 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1157611 1157612 SDY_3783 SDY_3784 yijI frwC FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 1157612 1157613 SDY_3784 SDY_3785 frwC frwB TRUE 0.993 15.000 0.400 0.006 Y NA
 1157613 1157614 SDY_3785 SDY_3786 frwB pflD TRUE 0.915 51.000 0.280 1.000 N NA
 1157614 1157615 SDY_3786 SDY_3787 pflD pflC TRUE 0.909 -34.000 0.312 0.002 N NA
 1157615 1157616 SDY_3787 SDY_3788 pflC frwD TRUE 0.934 2.000 0.156 1.000 N NA
 1157617 1157618 SDY_3789 SDY_3790 yijO yijP FALSE 0.492 149.000 0.130 1.000   NA
 1157618 1157619 SDY_3790 SDY_3791 yijP ppc FALSE 0.143 182.000 0.000 1.000   NA
 1157619 1157620 SDY_3791 SDY_3792 ppc argE FALSE 0.007 475.000 0.053 1.000 N NA
 1157621 1157622 SDY_3793 SDY_3794 argC argB TRUE 0.982 11.000 0.097 0.002 Y NA
 1157622 1157623 SDY_3794 SDY_3795 argB argH TRUE 0.889 61.000 0.017 1.000 Y NA
 1157623 1157624 SDY_3795 SDY_3796 argH oxyR FALSE 0.018 267.000 0.002 1.000 N NA
 1157625 1157626 SDY_3797 SDY_3798 udhA   FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 1157628 1157629 SDY_3800 SDY_3801 rhsB rpmE FALSE 0.105 160.000 0.000 NA N NA
 1157630 1157631 SDY_3802 SDY_3803 priA cytR FALSE 0.160 156.000 0.013 1.000 N NA
 1157631 1157632 SDY_3803 SDY_3804 cytR ftsN TRUE 0.730 92.000 0.245 1.000 N NA
 1157632 1157633 SDY_3804 SDY_3805 ftsN hslV FALSE 0.539 93.000 0.122 1.000 N NA
 1157633 1157634 SDY_3805 SDY_3806 hslV hslU TRUE 0.996 10.000 0.752 1.000 Y NA
 1157634 1157635 SDY_3806 SDY_3807 hslU menA FALSE 0.516 67.000 0.051 1.000 N NA
 1157635 1157636 SDY_3807 SDY_3808 menA menG TRUE 0.866 93.000 0.158 NA Y NA
 1157638 1157639 SDY_3810 SDY_3811   insA FALSE 0.223 136.000 0.000 NA   NA
 1157639 1157640 SDY_3811 SDY_3812 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157640 1157641 SDY_3812 SDY_3813 insB   FALSE 0.035 479.000 0.000 NA Y NA
 1157641 1157642 SDY_3813 SDY_3814     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1157642 1157643 SDY_3814 SDY_3815     TRUE 0.650 28.000 0.000 NA   NA
 1157645 1157646 SDY_3817 SDY_3818 glpF glpK TRUE 0.642 23.000 0.004 1.000 N NA
 1157646 1157647 SDY_3818 SDY_3819 glpK glpX FALSE 0.044 230.000 0.025 1.000 N NA
 1157647 1157648 SDY_3819 SDY_3820 glpX fpr FALSE 0.508 97.000 0.117 1.000 N NA
 1157649 1157650 SDY_3821 SDY_3822 yiiT yiiS TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1157650 1157651 SDY_3822 SDY_3823 yiiS   FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1157651 1157652 SDY_3823 SDY_3824   yiiR FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1157653 1157654 SDY_3825 SDY_3826 yiiQ tpiA FALSE 0.353 108.000 0.058 NA   NA
 1157655 1157656 SDY_3829 SDY_3827 cdh insB FALSE 0.223 -889.000 0.000 NA   NA
 1157656 1157657 SDY_3827 SDY_3828 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157657 1157658 SDY_3828 SDY_3830 insA sbp FALSE 0.005 430.000 0.000 1.000 N NA
 1157658 1157659 SDY_3830 SDY_3831 sbp pfkA FALSE 0.023 319.000 0.049 1.000 N NA
 1157659 1157660 SDY_3831 SDY_3832 pfkA yiiP FALSE 0.153 181.000 0.040 1.000 N NA
 1157660 1157661 SDY_3832 SDY_3833 yiiP cpxP TRUE 0.691 148.000 0.031 NA Y NA
 1157662 1157663 SDY_3834 SDY_3835 cpxR cpxA TRUE 0.996 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 1157664 1157665 SDY_3836 SDY_3837 yiiM kdgT FALSE 0.245 149.000 0.000 1.000   NA
 1157665 1157666 SDY_3837 SDY_3838 kdgT sodA FALSE 0.034 260.000 0.000 1.000   NA
 1157668 1157669 SDY_3840 SDY_3841 rhaR rhaS TRUE 0.993 -16.000 0.800 0.013 Y NA
 1157670 1157671 SDY_3842 SDY_3843 rhaB rhaA TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157671 1157672 SDY_3843 SDY_3844 rhaA rhaD FALSE 0.260 83.000 0.000 NA   NA
 1157672 1157673 SDY_3844 SDY_3845 rhaD yiiL TRUE 0.862 10.000 0.112 NA   NA
 1157674 1157675 SDY_3846 SDY_3847   yiiG FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 1157675 1157676 SDY_3847 SDY_3848 yiiG fdhD FALSE 0.153 153.000 0.000 NA   NA
 1157677 1157678 SDY_3849 SDY_3850 fdoG fdoH TRUE 0.997 13.000 0.833 0.001 Y NA
 1157678 1157679 SDY_3850 SDY_3851 fdoH fdoI TRUE 0.998 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 1157679 1157680 SDY_3851 SDY_3852 fdoI fdhE TRUE 0.905 -3.000 0.182 NA N NA
 1157681 1157682 SDY_3853 SDY_3854 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157682 1157683 SDY_3854 SDY_3855 insA yiiD FALSE 0.156 178.000 0.000 1.000   NA
 1157683 1157684 SDY_3855 SDY_3856 yiiD yihZ TRUE 0.843 -3.000 0.065 1.000   NA
 1157684 1157685 SDY_3856 SDY_3857 yihZ rbn TRUE 0.848 -3.000 0.069 1.000   NA
 1157685 1157686 SDY_3857 SDY_3858 rbn yihX TRUE 0.670 -6.000 0.000 1.000   NA
 1157686 1157687 SDY_3858 SDY_3859 yihX   FALSE 0.014 351.000 0.000 1.000   NA
 1157687 1157688 SDY_3859 SDY_3860     FALSE 0.075 420.000 0.000 0.032 Y NA
 1157688 1157689 SDY_3860 SDY_3861     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1157689 1157690 SDY_3861 SDY_3862     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1157690 1157691 SDY_3862 SDY_3863     FALSE 0.100 164.000 0.000 NA N NA
 1157691 1157692 SDY_3863 SDY_3864     FALSE 0.128 166.000 0.000 NA   NA
 1157693 1157694 SDY_3865 SDY_3866     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157696 1157697 SDY_3868 SDY_3869 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157698 1157699 SDY_3870 SDY_3871 yihL   FALSE 0.054 202.000 0.000 NA   NA
 1157699 1157700 SDY_3871 SDY_3872   yihK FALSE 0.162 105.000 0.000 NA N NA
 1157701 1157702 SDY_3873 SDY_3874 glnA glnL FALSE 0.209 174.000 0.053 1.000 N NA
 1157702 1157703 SDY_3874 SDY_3875 glnL glnG TRUE 0.995 12.000 0.587 0.044 Y NA
 1157704 1157705 SDY_3876 SDY_3877 hemN yihI FALSE 0.198 189.000 0.107 NA   NA
 1157709 1157710 SDY_3882 SDY_3881 yihF   FALSE 0.216 -975.000 0.000 NA   NA
 1157710 1157711 SDY_3881 SDY_3883   insB FALSE 0.001 1243.000 0.000 NA   NA
 1157711 1157712 SDY_3883 SDY_3884 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157712 1157713 SDY_3884 SDY_3885 insA dsbA FALSE 0.060 220.000 0.000 1.000   NA
 1157713 1157714 SDY_3885 SDY_3886 dsbA yihE TRUE 0.837 17.000 0.111 NA   NA
 1157714 1157715 SDY_3886 SDY_3887 yihE yihD FALSE 0.555 77.000 0.106 NA   NA
 1157716 1157717 SDY_3888 SDY_3889 mobA mobB TRUE 0.981 -3.000 0.064 0.002 Y NA
 1157718 1157719 SDY_3890 SDY_3891 rrfB rrlB FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1157719 1157720 SDY_3891 SDY_3892 rrlB   FALSE 0.107 175.000 0.000 NA   NA
 1157720 1157721 SDY_3892 SDY_3893     FALSE 0.626 43.000 0.000 NA   NA
 1157721 1157722 SDY_3893 SDY_3894   rrsB FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1157722 1157723 SDY_3894 SDY_3895 rrsB hemG FALSE 0.006 378.000 0.000 NA   NA
 1157723 1157724 SDY_3895 SDY_3896 hemG trkH TRUE 0.965 12.000 0.455 1.000 N NA
 1157724 1157725 SDY_3896 SDY_3897 trkH yigZ TRUE 0.934 39.000 0.202 1.000   NA
 1157725 1157726 SDY_3897 SDY_3898 yigZ pepQ TRUE 0.900 -3.000 0.127 1.000   NA
 1157727 1157728 SDY_3899 SDY_3900 fadB fadA TRUE 0.995 10.000 0.607 1.000 Y NA
 1157729 1157730 SDY_3901 SDY_3902 ubiB yigC TRUE 0.950 46.000 0.090 NA Y NA
 1157732 1157733 SDY_3904 SDY_3905 tatD yigU TRUE 0.648 30.000 0.000 NA   NA
 1157733 1157734 SDY_3905 SDY_3906 yigU   TRUE 0.992 3.000 0.333 NA Y NA
 1157734 1157735 SDY_3906 SDY_3907     TRUE 0.992 4.000 0.188 0.004 Y NA
 1157735 1157736 SDY_3907 SDY_3908   yigR TRUE 0.770 37.000 0.032 1.000   NA
 1157736 1157737 SDY_3908 SDY_3909 yigR yigP TRUE 0.972 -3.000 0.432 1.000   NA
 1157737 1157738 SDY_3909 SDY_3910 yigP ubiE TRUE 0.888 14.000 0.145 1.000   NA
 1157738 1157739 SDY_3910 SDY_3911 ubiE yigN FALSE 0.301 95.000 0.047 NA   NA
 1157739 1157740 SDY_3911 SDY_3912 yigN udp FALSE 0.259 141.000 0.041 NA   NA
 1157744 1157745 SDY_3916 SDY_3917 yigM   FALSE 0.544 76.000 0.067 1.000   NA
 1157745 1157746 SDY_3917 SDY_3918   pldB TRUE 0.979 8.000 0.524 1.000   NA
 1157748 1157749 SDY_3920 SDY_3921 yigJ recQ FALSE 0.026 316.000 0.043 1.000   NA
 1157749 1157750 SDY_3921 SDY_3922 recQ pldA FALSE 0.427 127.000 0.057 1.000 N NA
 1157751 1157752 SDY_3923 SDY_3924 yigI rarD TRUE 0.749 52.000 0.099 NA   NA
 1157752 1157753 SDY_3924 SDY_3925 rarD insA FALSE 0.351 120.000 0.000 1.000   NA
 1157753 1157754 SDY_3925 SDY_3926 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157755 1157756 SDY_3927 SDY_3928 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157756 1157757 SDY_3928 SDY_3929 insA corA FALSE 0.040 234.000 0.000 1.000 N NA
 1157758 1157759 SDY_3930 SDY_3931 yigE   FALSE 0.260 83.000 0.000 NA   NA
 1157760 1157761 SDY_3932 SDY_3933 uvrD yigB FALSE 0.627 84.000 0.128 1.000   NA
 1157761 1157762 SDY_3933 SDY_3934 yigB xerC TRUE 0.976 0.000 0.367 1.000   NA
 1157762 1157763 SDY_3934 SDY_3935 xerC yigA TRUE 0.981 -3.000 0.714 NA   NA
 1157763 1157764 SDY_3935 SDY_3936 yigA dapF TRUE 0.907 -3.000 0.175 NA   NA
 1157764 1157765 SDY_3936 SDY_3937 dapF yifL FALSE 0.546 37.000 0.021 NA N NA
 1157765 1157766 SDY_3937 SDY_3939 yifL   FALSE 0.077 187.000 0.000 NA   NA
 1157769 1157770 SDY_3941 SDY_3942 hemC hemD TRUE 0.991 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 1157770 1157771 SDY_3942 SDY_3943 hemD hemX TRUE 0.994 22.000 0.600 1.000 Y NA
 1157771 1157772 SDY_3943 SDY_3944 hemX hemY TRUE 0.985 3.000 0.144 1.000 Y NA
 1157772 1157773 SDY_3944 SDY_3945 hemY aslA FALSE 0.003 678.000 0.000 1.000 N NA
 1157776 1157777 SDY_3948 SDY_3949     FALSE 0.626 43.000 0.000 NA   NA
 1157777 1157778 SDY_3949 SDY_3950     TRUE 0.646 21.000 0.000 NA   NA
 1157778 1157779 SDY_3950 SDY_3951     FALSE 0.420 59.000 0.000 NA   NA
 1157779 1157780 SDY_3951 SDY_3952   yifK FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1157780 1157781 SDY_3952 SDY_3953 yifK wecG FALSE 0.089 191.000 0.000 1.000 N NA
 1157781 1157782 SDY_3953 SDY_3954 wecG wecF TRUE 0.927 3.000 0.126 1.000   NA
 1157782 1157783 SDY_3954 SDY_3955 wecF yifM TRUE 0.983 -3.000 0.684 1.000   NA
 1157783 1157784 SDY_3955 SDY_3956 yifM wzxE TRUE 0.981 -3.000 0.605 1.000   NA
 1157784 1157785 SDY_3956 SDY_3957 wzxE wecE TRUE 0.961 2.000 0.218 1.000   NA
 1157785 1157786 SDY_3957 SDY_3958 wecE wecD TRUE 0.958 5.000 0.248 1.000   NA
 1157786 1157787 SDY_3958 SDY_3959 wecD rffH FALSE 0.600 107.000 0.145 1.000   NA
 1157787 1157788 SDY_3959 SDY_3960 rffH rffG FALSE 0.629 19.000 0.000 NA   NA
 1157788 1157789 SDY_3960 SDY_3961 rffG wecC TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1157789 1157790 SDY_3961 SDY_3962 wecC wecB TRUE 0.991 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 1157790 1157791 SDY_3962 SDY_3963 wecB wzzE TRUE 0.996 14.000 0.677 0.003 Y NA
 1157791 1157792 SDY_3963 SDY_3964 wzzE rfe TRUE 0.997 9.000 0.735 0.003 Y NA
 1157792 1157793 SDY_3964 SDY_3965 rfe   FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1157793 1157794 SDY_3965 SDY_3966   rho TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1157794 1157795 SDY_3966 SDY_3967 rho rhoL FALSE 0.178 85.000 0.002 NA   NA
 1157795 1157796 SDY_3967 SDY_3968 rhoL trxA FALSE 0.140 141.000 0.004 NA   NA
 1157797 1157798 SDY_3969 SDY_3970 rhlB gppA TRUE 0.821 134.000 0.406 1.000 N NA
 1157800 1157801 SDY_3972 SDY_3973   ppiC FALSE 0.005 517.000 0.000 1.000   NA
 1157804 1157805 SDY_3976 SDY_3977 ilvA ilvD TRUE 0.982 3.000 0.106 1.000 Y NA
 1157805 1157806 SDY_3977 SDY_3978 ilvD ilvE TRUE 0.908 65.000 0.075 1.000 Y NA
 1157806 1157807 SDY_3978 SDY_3979 ilvE ilvM TRUE 0.935 20.000 0.205 1.000   NA
 1157807 1157808 SDY_3979 SDY_3980 ilvM ilvG TRUE 0.992 -3.000 0.943 0.001   NA
 1157808 1157809 SDY_3980 SDY_3981 ilvG ilvL TRUE 0.666 140.000 0.091 0.002   NA
 1157810 1157811 SDY_3982 SDY_3983 yifB   FALSE 0.208 -1577.000 0.000 NA   NA
 1157814 1157815 SDY_3986 SDY_3987     TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1157815 1157816 SDY_3987 SDY_3988   rrfE FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1157816 1157817 SDY_3988 SDY_3989 rrfE rrlE FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1157817 1157818 SDY_3989 SDY_3990 rrlE   FALSE 0.083 185.000 0.000 NA   NA
 1157818 1157819 SDY_3990 SDY_3991   rrsE FALSE 0.248 87.000 0.000 NA   NA
 1157820 1157821 SDY_3992 SDY_3993 yieP yieO TRUE 0.882 23.000 0.100 1.000   NA
 1157822 1157823 SDY_3994 SDY_3995 rbsR rbsK TRUE 0.979 4.000 0.500 1.000 N NA
 1157823 1157824 SDY_3995 SDY_3996 rbsK rbsB FALSE 0.248 126.000 0.000 NA   NA
 1157824 1157825 SDY_3996 SDY_3997 rbsB rbsC TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1157825 1157826 SDY_3997 SDY_3998 rbsC   FALSE 0.169 108.000 0.000 NA N NA
 1157826 1157827 SDY_3998 SDY_3999   rbsA FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1157827 1157828 SDY_3999 SDY_4000 rbsA rbsD TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1157828 1157829 SDY_4000 SDY_4001 rbsD kup FALSE 0.148 155.000 0.000 NA   NA
 1157830 1157831 SDY_4002 SDY_4003 yieN yieM TRUE 0.950 -6.000 0.443 NA   NA
 1157833 1157834 SDY_4005 SDY_4006 asnC mioC FALSE 0.623 90.000 0.165 1.000 N NA
 1157834 1157835 SDY_4006 SDY_4007 mioC gidA FALSE 0.008 379.000 0.000 1.000 N NA
 1157835 1157836 SDY_4007 SDY_4008 gidA gidB TRUE 0.912 64.000 0.466 1.000 N NA
 1157836 1157837 SDY_4008 SDY_4009 gidB atpI FALSE 0.002 617.000 0.005 1.000 N NA
 1157837 1157838 SDY_4009 SDY_4010 atpI atpB TRUE 0.993 9.000 0.291 0.002 Y NA
 1157838 1157839 SDY_4010 SDY_4011 atpB atpE TRUE 0.994 47.000 0.557 0.002 Y NA
 1157839 1157840 SDY_4011 SDY_4012 atpE atpF TRUE 0.990 62.000 0.666 0.002 Y NA
 1157840 1157841 SDY_4012 SDY_4013 atpF atpH TRUE 0.990 15.000 0.242 0.002 Y NA
 1157841 1157842 SDY_4013 SDY_4014 atpH atpA TRUE 0.997 13.000 0.864 0.002 Y NA
 1157842 1157843 SDY_4014 SDY_4015 atpA atpG TRUE 0.995 51.000 0.846 0.002 Y NA
 1157843 1157844 SDY_4015 SDY_4016 atpG atpD TRUE 0.997 27.000 0.724 0.002 Y NA
 1157844 1157845 SDY_4016 SDY_4017 atpD atpC TRUE 0.997 21.000 0.837 0.002 Y NA
 1157845 1157846 SDY_4017 SDY_4018 atpC glmU FALSE 0.020 352.000 0.067 1.000 N NA
 1157846 1157847 SDY_4018 SDY_4019 glmU glmS TRUE 0.715 162.000 0.055 1.000 Y NA
 1157848 1157849 SDY_4020 SDY_4021     FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 1157850 1157851 SDY_4022 SDY_4023 pstS pstC TRUE 0.933 86.000 0.145 0.001 Y NA
 1157851 1157852 SDY_4023 SDY_4024 pstC pstA TRUE 0.997 0.000 0.537 0.001 Y NA
 1157852 1157853 SDY_4024 SDY_4025 pstA pstB TRUE 0.928 183.000 0.526 0.001 Y NA
 1157853 1157854 SDY_4025 SDY_4026 pstB phoU TRUE 0.985 15.000 0.317 NA Y NA
 1157854 1157855 SDY_4026 SDY_4027 phoU   FALSE 0.004 423.000 0.000 NA   NA
 1157855 1157856 SDY_4027 SDY_4028     FALSE 0.012 315.000 0.000 NA   NA
 1157856 1157857 SDY_4028 SDY_4029   insA FALSE 0.027 243.000 0.000 NA   NA
 1157857 1157858 SDY_4029 SDY_4030 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157858 1157859 SDY_4030 SDY_4031 insB   FALSE 0.016 1112.000 0.000 NA Y NA
 1157859 1157860 SDY_4031 SDY_4032     FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1157860 1157861 SDY_4032 SDY_4033     FALSE 0.511 51.000 0.000 NA   NA
 1157861 1157862 SDY_4033 SDY_4034     FALSE 0.011 549.000 0.000 0.003   NA
 1157862 1157863 SDY_4034 SDY_4035     FALSE 0.563 89.000 0.000 0.003   NA
 1157863 1157864 SDY_4035 SDY_4036   lldP FALSE 0.007 427.000 0.000 1.000   NA
 1157864 1157865 SDY_4036 SDY_4037 lldP lldR TRUE 0.986 0.000 0.652 1.000 N NA
 1157865 1157866 SDY_4037 SDY_4038 lldR lldD TRUE 0.956 -3.000 0.309 1.000 N NA
 1157866 1157867 SDY_4038 SDY_4039 lldD yibK FALSE 0.097 186.000 0.020 1.000 N NA
 1157868 1157869 SDY_4040 SDY_4041 cysE gpsA TRUE 0.861 80.000 0.429 1.000 N NA
 1157869 1157870 SDY_4041 SDY_4042 gpsA secB TRUE 0.952 0.000 0.206 1.000 N NA
 1157870 1157871 SDY_4042 SDY_4043 secB grxC FALSE 0.506 63.000 0.038 1.000 N NA
 1157871 1157872 SDY_4043 SDY_4044 grxC yibN FALSE 0.221 142.000 0.048 NA N NA
 1157873 1157874 SDY_4045 SDY_4046 yibO yibP TRUE 0.915 10.000 0.170 1.000 N NA
 1157874 1157875 SDY_4046 SDY_4047 yibP yibQ FALSE 0.529 130.000 0.088 1.000   NA
 1157876 1157877 SDY_4048 SDY_4049 yibD tdh FALSE 0.021 239.000 0.000 NA N NA
 1157877 1157878 SDY_4049 SDY_4050 tdh kbl TRUE 0.977 10.000 0.547 1.000 N NA
 1157879 1157880 SDY_4051 SDY_4052 rfaD rfaF TRUE 0.979 10.000 0.146 1.000 Y NA
 1157880 1157881 SDY_4052 SDY_4053 rfaF rfaC TRUE 0.993 4.000 0.205 0.001 Y NA
 1157882 1157883 SDY_4054 SDY_4055 waaL waaX TRUE 0.644 35.000 0.000 NA   NA
 1157883 1157884 SDY_4055 SDY_4056 waaX waaW TRUE 0.958 32.000 0.000 1.000 Y NA
 1157884 1157885 SDY_4056 SDY_4057 waaW rfaY TRUE 0.756 26.000 0.000 1.000   NA
 1157885 1157886 SDY_4057 SDY_4058 rfaY rfaJ TRUE 0.968 10.000 0.375 1.000   NA
 1157886 1157887 SDY_4058 SDY_4059 rfaJ rfaI TRUE 0.997 17.000 0.833 0.001 Y NA
 1157887 1157888 SDY_4059 SDY_4060 rfaI waaP TRUE 0.717 16.000 0.000 1.000   NA
 1157888 1157889 SDY_4060 SDY_4061 waaP rfaG FALSE 0.560 -16.000 0.000 1.000   NA
 1157889 1157890 SDY_4061 SDY_4062 rfaG waaQ TRUE 0.971 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 1157891 1157892 SDY_4063 SDY_4064 kdtA kdtB TRUE 0.725 8.000 0.020 1.000 N NA
 1157893 1157894 SDY_4065 SDY_4066 mutM rpmG FALSE 0.297 98.000 0.034 1.000 N NA
 1157894 1157895 SDY_4066 SDY_4067 rpmG rpmB TRUE 0.993 21.000 0.332 0.010 Y NA
 1157895 1157896 SDY_4067 SDY_4068 rpmB radC FALSE 0.037 217.000 0.002 1.000 N NA
 1157897 1157898 SDY_4069 SDY_4070 dfp dut TRUE 0.839 -19.000 0.201 1.000 N NA
 1157898 1157899 SDY_4070 SDY_4071 dut slmA FALSE 0.397 107.000 0.060 1.000 N NA
 1157900 1157901 SDY_4072 SDY_4073   pyrE FALSE 0.006 454.000 0.000 1.000   NA
 1157901 1157902 SDY_4073 SDY_4074 pyrE rph FALSE 0.409 66.000 0.022 1.000 N NA
 1157903 1157904 SDY_4075 SDY_4076 yicC dinD FALSE 0.038 220.000 0.000 NA   NA
 1157904 1157905 SDY_4076 SDY_4077 dinD yicG FALSE 0.029 238.000 0.000 NA   NA
 1157906 1157907 SDY_4078 SDY_4079 yicF   TRUE 0.651 22.000 0.000 NA   NA
 1157908 1157909 SDY_4080 SDY_4081 gmk rpoZ TRUE 0.940 55.000 0.471 1.000 N NA
 1157909 1157910 SDY_4081 SDY_4082 rpoZ spoT TRUE 0.987 19.000 0.291 1.000 Y NA
 1157910 1157911 SDY_4082 SDY_4083 spoT spoU TRUE 0.877 7.000 0.095 1.000 N NA
 1157911 1157912 SDY_4083 SDY_4084 spoU recG TRUE 0.858 6.000 0.076 1.000 N NA
 1157914 1157915 SDY_4086 SDY_4087 yicE yicH TRUE 0.741 121.000 0.257 NA   NA
 1157917 1157918 SDY_4089 SDY_4090     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1157919 1157920 SDY_4091 SDY_4092 melB melA FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 1157921 1157922 SDY_4093 SDY_4094 melR adiA FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 1157922 1157923 SDY_4094 SDY_4095 adiA insA FALSE 0.302 120.000 0.000 1.000 N NA
 1157923 1157924 SDY_4095 SDY_4096 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157924 1157925 SDY_4096 SDY_4097 insB adiY FALSE 0.011 285.000 0.000 NA N NA
 1157925 1157926 SDY_4097 SDY_4098 adiY yjdE FALSE 0.608 137.000 0.167 1.000 N NA
 1157926 1157927 SDY_4098 SDY_4099 yjdE yjdB FALSE 0.543 59.000 0.000 1.000   NA
 1157927 1157928 SDY_4099 SDY_4100 yjdB basR TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157928 1157929 SDY_4100 SDY_4101 basR basS TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1157930 1157931 SDY_4102 SDY_4103 proP yjcZ FALSE 0.020 264.000 0.000 NA   NA
 1157931 1157932 SDY_4103 SDY_4106 yjcZ yjdA TRUE 0.648 30.000 0.000 NA   NA
 1157933 1157934 SDY_4104 SDY_4105 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157935 1157936 SDY_4107 SDY_4108 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157937 1157938 SDY_4109 SDY_4110 phnA phnB FALSE 0.141 160.000 0.000 NA   NA
 1157938 1157939 SDY_4110 SDY_4111 phnB phnC FALSE 0.232 133.000 0.000 NA   NA
 1157939 1157940 SDY_4111 SDY_4112 phnC phnD TRUE 0.994 25.000 0.337 0.001 Y NA
 1157940 1157941 SDY_4112 SDY_4113 phnD phnE TRUE 0.987 55.000 0.330 0.000 Y NA
 1157941 1157942 SDY_4113 SDY_4114 phnE phnF TRUE 0.905 21.000 0.158 1.000 N NA
 1157942 1157943 SDY_4114 SDY_4115 phnF phnG TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1157943 1157944 SDY_4115 SDY_4116 phnG phnH TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157944 1157945 SDY_4116 SDY_4117 phnH phnI TRUE 0.998 0.000 0.960 0.001 Y NA
 1157945 1157946 SDY_4117 SDY_4118 phnI phnJ TRUE 0.994 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 1157946 1157947 SDY_4118 SDY_4119 phnJ phnK TRUE 0.996 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 1157947 1157948 SDY_4119 SDY_4120 phnK phnL TRUE 0.983 111.000 0.859 0.011 Y NA
 1157948 1157949 SDY_4120 SDY_4121 phnL phnM TRUE 0.990 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 1157949 1157950 SDY_4121 SDY_4122 phnM phnN TRUE 0.989 0.000 0.235 NA Y NA
 1157950 1157951 SDY_4122 SDY_4123 phnN phnO FALSE 0.374 -13.000 0.000 NA N NA
 1157951 1157952 SDY_4123 SDY_4124 phnO phnP TRUE 0.820 2.000 0.000 1.000   NA
 1157953 1157954 SDY_4125 SDY_4126     TRUE 0.865 69.000 0.375 NA   NA
 1157954 1157955 SDY_4126 SDY_4127     FALSE 0.478 -10.000 0.000 NA   NA
 1157956 1157957 SDY_4128 SDY_4129     FALSE 0.062 276.000 0.095 1.000   NA
 1157957 1157958 SDY_4129 SDY_4130     TRUE 0.933 19.000 0.238 NA   NA
 1157958 1157959 SDY_4130 SDY_4131     TRUE 0.713 55.000 0.095 NA   NA
 1157959 1157960 SDY_4131 SDY_4132     TRUE 0.865 15.000 0.149 NA   NA
 1157960 1157961 SDY_4132 SDY_4133     TRUE 0.979 -3.000 0.180 NA Y NA
 1157962 1157963 SDY_4134 SDY_4135     FALSE 0.577 24.000 0.000 NA N NA
 1157963 1157964 SDY_4135 SDY_4136     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1157964 1157965 SDY_4136 SDY_4137     FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 1157965 1157966 SDY_4137 SDY_4138     FALSE 0.077 187.000 0.000 NA   NA
 1157967 1157968 SDY_4139 SDY_4140 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157970 1157971 SDY_4142 SDY_4143     TRUE 0.950 -16.000 0.636 NA   NA
 1157972 1157973 SDY_4144 SDY_4145 yicN yicO TRUE 0.654 26.000 0.000 NA   NA
 1157975 1157976 SDY_4147 SDY_4148 uhpT uhpC TRUE 0.839 138.000 0.000 0.036 Y NA
 1157976 1157977 SDY_4148 SDY_4149 uhpC uhpB TRUE 0.859 7.000 0.000 0.055 N NA
 1157977 1157978 SDY_4149 SDY_4150 uhpB uhpA TRUE 0.974 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 1157980 1157981 SDY_4152 SDY_4153     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1157981 1157982 SDY_4153 SDY_4154   ilvN FALSE 0.004 460.000 0.000 NA   NA
 1157982 1157983 SDY_4154 SDY_4155 ilvN ilvB TRUE 0.992 4.000 0.649 0.001   NA
 1157983 1157984 SDY_4155 SDY_4156 ilvB ivbL TRUE 0.664 106.000 0.216 NA   NA
 1157986 1157987 SDY_4158 SDY_4159 yidF yidG TRUE 0.966 -3.000 0.429 NA   NA
 1157987 1157988 SDY_4159 SDY_4160 yidG yidH TRUE 0.951 -10.000 0.571 NA   NA
 1157990 1157991 SDY_4162 SDY_4165 yidJ yidK TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1157991 1157992 SDY_4165 SDY_4163 yidK insB FALSE 0.209 -1344.000 0.000 NA   NA
 1157992 1157993 SDY_4163 SDY_4164 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1157994 1157995 SDY_4166 SDY_4167 yidL   FALSE 0.224 -796.000 0.000 NA   NA
 1157996 1157997 SDY_4168 SDY_4169   glvC TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1157999 1158000 SDY_4171 SDY_4172 yidE ibpB FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 1158000 1158001 SDY_4172 SDY_4173 ibpB ibpA TRUE 0.838 112.000 0.099 NA Y NA
 1158004 1158005 SDY_4176 SDY_4177 yidS yidX FALSE 0.013 303.000 0.000 NA   NA
 1158005 1158006 SDY_4177 SDY_4178 yidX   FALSE 0.003 533.000 0.000 NA   NA
 1158007 1158008 SDY_4179 SDY_4180 yidA yidB FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 1158008 1158009 SDY_4180 SDY_4181 yidB gyrB FALSE 0.028 240.000 0.000 NA   NA
 1158009 1158010 SDY_4181 SDY_4182 gyrB recF TRUE 0.991 29.000 0.249 0.003 Y NA
 1158010 1158011 SDY_4182 SDY_4183 recF dnaN TRUE 0.992 0.000 0.318 1.000 Y NA
 1158011 1158012 SDY_4183 SDY_4184 dnaN dnaA TRUE 0.991 5.000 0.328 1.000 Y NA
 1158013 1158014 SDY_4185 SDY_4186 rpmH rnpA TRUE 0.982 17.000 0.787 1.000   NA
 1158014 1158015 SDY_4186 SDY_4187 rnpA yidD TRUE 0.908 -36.000 0.540 NA   NA
 1158015 1158016 SDY_4187 SDY_4188 yidD yidC TRUE 0.977 3.000 0.461 NA   NA
 1158016 1158017 SDY_4188 SDY_4189 yidC thdF TRUE 0.713 106.000 0.221 1.000   NA
 1158018 1158019 SDY_4190 SDY_4191     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1158019 1158020 SDY_4191 SDY_4192   insB FALSE 0.052 204.000 0.000 NA   NA
 1158020 1158021 SDY_4192 SDY_4193 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158021 1158022 SDY_4193 SDY_4194 insA   TRUE 0.850 71.000 0.000 1.000 Y NA
 1158022 1158023 SDY_4194 SDY_4195     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1158024 1158025 SDY_4196 SDY_4197 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158028 1158029 SDY_4200 SDY_4201 yieF yieE TRUE 0.651 22.000 0.000 NA   NA
 1158029 1158030 SDY_4201 SDY_4202 yieE yidZ FALSE 0.451 145.000 0.114 1.000 N NA
 1158030 1158031 SDY_4202 SDY_4203 yidZ yidY TRUE 0.926 -25.000 0.526 1.000 N NA
 1158031 1158032 SDY_4203 SDY_4204 yidY tnaB FALSE 0.287 132.000 0.000 1.000 N NA
 1158032 1158033 SDY_4204 SDY_4205 tnaB   FALSE 0.443 -25.000 0.000 1.000 N NA
 1158033 1158034 SDY_4205 SDY_4207     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158039 1158040 SDY_4211 SDY_4212 yibF selA FALSE 0.312 98.000 0.040 1.000 N NA
 1158040 1158041 SDY_4212 SDY_4213 selA selB TRUE 0.987 -3.000 0.569 0.000 N NA
 1158041 1158042 SDY_4213 SDY_4214 selB   FALSE 0.003 581.000 0.000 NA   NA
 1158042 1158043 SDY_4214 SDY_4215   insA FALSE 0.002 898.000 0.000 NA   NA
 1158043 1158044 SDY_4215 SDY_4216 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158044 1158045 SDY_4216 SDY_4217 insB xylE FALSE 0.002 607.000 0.000 NA   NA
 1158046 1158047 SDY_4218 SDY_4219 yjbA yjbH FALSE 0.002 594.000 0.000 NA   NA
 1158047 1158048 SDY_4219 SDY_4220 yjbH yjbG TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1158048 1158049 SDY_4220 SDY_4221 yjbG yjbF TRUE 0.986 -3.000 1.000 NA   NA
 1158049 1158050 SDY_4221 SDY_4222 yjbF yjbE TRUE 0.910 84.000 0.778 NA   NA
 1158050 1158051 SDY_4222 SDY_4223 yjbE   FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 1158052 1158053 SDY_4224 SDY_4225     FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 1158056 1158057 SDY_4228 SDY_4229     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158057 1158058 SDY_4229 SDY_4230   yjdF FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 1158058 1158059 SDY_4230 SDY_4231 yjdF fumB FALSE 0.224 93.000 0.000 NA   NA
 1158059 1158060 SDY_4231 SDY_4232 fumB dcuB FALSE 0.392 78.000 0.000 1.000   NA
 1158060 1158061 SDY_4232 SDY_4233 dcuB insB FALSE 0.225 135.000 0.000 NA   NA
 1158061 1158062 SDY_4233 SDY_4234 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158062 1158063 SDY_4234 SDY_4235 insA   FALSE 0.024 622.000 0.000 NA Y NA
 1158065 1158066 SDY_4237 SDY_4238 yjdG yjdH TRUE 0.980 -3.000 0.086 0.043 Y NA
 1158067 1158068 SDY_4239 SDY_4240 yjdI yjdJ TRUE 0.888 12.000 0.168 NA   NA
 1158072 1158073 SDY_4244 SDY_4245   insA TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1158073 1158074 SDY_4245 SDY_4246 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158074 1158075 SDY_4246 SDY_4247 insB ytfR FALSE 0.004 393.000 0.000 NA N NA
 1158075 1158076 SDY_4247 SDY_4248 ytfR ytfT TRUE 0.993 11.000 0.506 1.000 Y NA
 1158076 1158077 SDY_4248 SDY_4249 ytfT yjfF TRUE 0.982 107.000 0.865 0.036 Y NA
 1158081 1158082 SDY_4253 SDY_4254 pmbA cybC FALSE 0.021 268.000 0.028 NA   NA
 1158082 1158083 SDY_4254 SDY_4255 cybC relB FALSE 0.050 191.000 0.000 NA N NA
 1158084 1158085 SDY_4256 SDY_4257 nrdG nrdD FALSE 0.576 190.000 0.464 1.000 N NA
 1158085 1158086 SDY_4257 SDY_4258 nrdD treC FALSE 0.007 394.000 0.000 1.000 N NA
 1158086 1158087 SDY_4258 SDY_4259 treC treB TRUE 0.991 50.000 0.650 1.000 Y NA
 1158087 1158088 SDY_4259 SDY_4260 treB treR TRUE 0.647 119.000 0.168 1.000 N NA
 1158090 1158091 SDY_4262 SDY_4263 yjgF pyrI TRUE 0.798 34.000 0.084 NA N NA
 1158091 1158092 SDY_4263 SDY_4264 pyrI pyrB TRUE 0.988 13.000 0.197 0.000 Y NA
 1158092 1158093 SDY_4264 SDY_4265 pyrB pyrL TRUE 0.757 4.000 0.005 1.000   NA
 1158093 1158094 SDY_4265 SDY_4266 pyrL yjgH FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 1158094 1158095 SDY_4266 SDY_4267 yjgH yjgI FALSE 0.181 131.000 0.000 NA N NA
 1158096 1158097 SDY_4268 SDY_4269   yjgJ FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 1158097 1158098 SDY_4269 SDY_4270 yjgJ yjgK FALSE 0.223 136.000 0.000 NA   NA
 1158098 1158099 SDY_4270 SDY_4271 yjgK   FALSE 0.003 461.000 0.000 NA N NA
 1158099 1158100 SDY_4271 SDY_4272   insA FALSE 0.339 208.000 0.000 NA Y NA
 1158100 1158101 SDY_4272 SDY_4273 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158101 1158102 SDY_4273 SDY_4274 insB   TRUE 0.732 100.000 0.000 NA Y NA
 1158102 1158103 SDY_4274 SDY_4275     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158106 1158107 SDY_4278 SDY_4279     FALSE 0.025 248.000 0.000 NA   NA
 1158108 1158109 SDY_4280 SDY_4281 yjgN   FALSE 0.213 -1033.000 0.000 NA   NA
 1158110 1158111 SDY_4282 SDY_4283 valS holC TRUE 0.892 0.000 0.089 1.000 N NA
 1158111 1158112 SDY_4283 SDY_4284 holC pepA FALSE 0.294 258.000 0.494 1.000 N NA
 1158113 1158114 SDY_4285 SDY_4286 yjgP yjgQ TRUE 0.987 -3.000 0.631 0.055   NA
 1158115 1158116 SDY_4287 SDY_4288 yjgR yjgB FALSE 0.290 130.000 0.007 1.000   NA
 1158117 1158118 SDY_4289 SDY_4290     FALSE 0.057 199.000 0.000 NA   NA
 1158119 1158120 SDY_4291 SDY_4292     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1158120 1158121 SDY_4292 SDY_4293   fecE FALSE 0.001 960.000 0.000 NA N NA
 1158121 1158122 SDY_4293 SDY_4294 fecE fecD TRUE 0.994 1.000 0.380 1.000 Y NA
 1158122 1158123 SDY_4294 SDY_4295 fecD fecC TRUE 0.993 -3.000 0.340 0.036 Y NA
 1158123 1158124 SDY_4295 SDY_4296 fecC fecB TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158124 1158125 SDY_4296 SDY_4297 fecB fecA FALSE 0.636 39.000 0.000 NA   NA
 1158125 1158126 SDY_4297 SDY_4298 fecA fecR FALSE 0.248 87.000 0.000 NA   NA
 1158126 1158127 SDY_4298 SDY_4299 fecR fecI TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158127 1158128 SDY_4299 SDY_4300 fecI   TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1158129 1158130 SDY_4301 SDY_4302   insA FALSE 0.298 218.000 0.000 NA Y NA
 1158130 1158131 SDY_4302 SDY_4303 insA insB FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 1158131 1158132 SDY_4303 SDY_4304 insB   FALSE 0.001 1754.000 0.000 NA   NA
 1158133 1158134 SDY_4305 SDY_4306     FALSE 0.002 849.000 0.000 NA   NA
 1158134 1158135 SDY_4306 SDY_4307     FALSE 0.003 484.000 0.000 NA   NA
 1158135 1158136 SDY_4307 SDY_4308     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158140 1158141 SDY_4312 SDY_4313     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158142 1158143 SDY_4314 SDY_4315     FALSE 0.352 66.000 0.000 NA   NA
 1158143 1158144 SDY_4315 SDY_4316     TRUE 0.993 11.000 0.333 0.007 Y NA
 1158144 1158145 SDY_4316 SDY_4317     FALSE 0.637 159.000 0.286 1.000 N NA
 1158145 1158146 SDY_4317 SDY_4318   pepE FALSE 0.006 381.000 0.000 NA   NA
 1158147 1158148 SDY_4319 SDY_4320 yjbB insB FALSE 0.008 331.000 0.000 NA N NA
 1158148 1158149 SDY_4320 SDY_4321 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158149 1158150 SDY_4321 SDY_4322 insA metH TRUE 0.709 29.000 0.000 1.000 N NA
 1158151 1158152 SDY_4323 SDY_4324 iclR arp FALSE 0.012 318.000 0.000 NA   NA
 1158155 1158156 SDY_4327 SDY_4328 aceK aceA FALSE 0.111 184.000 0.000 1.000 N NA
 1158156 1158157 SDY_4328 SDY_4329 aceA aceB TRUE 0.648 30.000 0.000 NA   NA
 1158157 1158158 SDY_4329 SDY_4330 aceB metA FALSE 0.024 251.000 0.000 NA   NA
 1158158 1158159 SDY_4330 SDY_4331 metA insB FALSE 0.175 134.000 0.000 NA N NA
 1158159 1158160 SDY_4331 SDY_4332 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158165 1158166 SDY_4337 SDY_4338   insA TRUE 0.950 34.000 0.000 NA Y NA
 1158166 1158167 SDY_4338 SDY_4339 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158169 1158170 SDY_4341 SDY_4342     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1158170 1158171 SDY_4342 SDY_4343     TRUE 0.646 33.000 0.000 NA   NA
 1158171 1158172 SDY_4343 SDY_4344   glyQ FALSE 0.169 95.000 0.010 NA   NA
 1158172 1158173 SDY_4344 SDY_4345 glyQ glyS TRUE 0.997 10.000 0.651 0.000 Y NA
 1158173 1158174 SDY_4345 SDY_4346 glyS yiaZ FALSE 0.019 323.000 0.000 1.000   NA
 1158175 1158176 SDY_4347 SDY_4348 cspA yiaG FALSE 0.174 281.000 0.000 1.000 Y NA
 1158178 1158179 SDY_4350 SDY_4351 yiaE yiaD FALSE 0.211 104.000 0.000 NA   NA
 1158182 1158183 SDY_4354 SDY_4355 yhjY yhjX FALSE 0.006 388.000 0.000 NA   NA
 1158183 1158184 SDY_4355 SDY_4356 yhjX   FALSE 0.005 372.000 0.000 NA N NA
 1158185 1158186 SDY_4357 SDY_4358 yjfN yjfO TRUE 0.879 122.000 0.588 NA   NA
 1158188 1158189 SDY_4360 SDY_4361 yjfQ yjfR FALSE 0.319 108.000 0.000 1.000   NA
 1158190 1158191 SDY_4362 SDY_4363 ulaA sgaB TRUE 0.892 16.000 0.059 0.007   NA
 1158191 1158192 SDY_4363 SDY_4364 sgaB ptxA TRUE 0.984 10.000 0.115 0.006 Y NA
 1158192 1158193 SDY_4364 SDY_4365 ptxA sgaH TRUE 0.987 14.000 0.328 1.000 Y NA
 1158193 1158194 SDY_4365 SDY_4366 sgaH sgaU TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1158194 1158195 SDY_4366 SDY_4367 sgaU sgaE TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1158197 1158198 SDY_4369 SDY_4370 rpsF priB TRUE 0.897 7.000 0.122 1.000 N NA
 1158198 1158199 SDY_4370 SDY_4371 priB rpsR TRUE 0.907 5.000 0.128 1.000 N NA
 1158199 1158200 SDY_4371 SDY_4372 rpsR rplI TRUE 0.995 42.000 0.499 0.009 Y NA
 1158202 1158203 SDY_4374 SDY_4375 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158205 1158206 SDY_4377 SDY_4378 fklB cycA FALSE 0.017 309.000 0.000 1.000 N NA
 1158207 1158208 SDY_4379 SDY_4380 ytfE ytfF FALSE 0.504 103.000 0.150 NA N NA
 1158208 1158209 SDY_4380 SDY_4382 ytfF ytfG TRUE 0.765 99.000 0.021 1.000 Y NA
 1158211 1158212 SDY_4383 SDY_4384 cpdB   TRUE 0.665 1.000 0.000 NA N NA
 1158214 1158215 SDY_4386 SDY_4387 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158215 1158216 SDY_4387 SDY_4388 insA   TRUE 0.825 71.000 0.000 NA Y NA
 1158216 1158217 SDY_4388 SDY_4389   yjeK FALSE 0.003 405.000 0.000 NA N NA
 1158218 1158219 SDY_4390 SDY_4391 efp   FALSE 0.566 52.000 0.007 1.000   NA
 1158219 1158220 SDY_4391 SDY_4392   sugE FALSE 0.026 283.000 0.000 1.000   NA
 1158221 1158222 SDY_4393 SDY_4394 blc ampC FALSE 0.293 89.000 0.022 1.000 N NA
 1158222 1158223 SDY_4394 SDY_4395 ampC frdD FALSE 0.441 63.000 0.022 1.000 N NA
 1158223 1158224 SDY_4395 SDY_4396 frdD frdC TRUE 0.997 11.000 0.787 0.002 Y NA
 1158224 1158225 SDY_4396 SDY_4397 frdC frdB TRUE 0.995 11.000 0.454 0.002 Y NA
 1158225 1158226 SDY_4397 SDY_4398 frdB frdA TRUE 0.992 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 1158229 1158230 SDY_4401 SDY_4402   yjfM TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 1158230 1158231 SDY_4402 SDY_4403 yjfM yjfC TRUE 0.812 3.000 0.049 NA   NA
 1158231 1158232 SDY_4403 SDY_4404 yjfC aidB FALSE 0.620 69.000 0.133 NA N NA
 1158234 1158235 SDY_4406 SDY_4407   insA TRUE 0.752 109.000 0.000 NA Y NA
 1158235 1158236 SDY_4407 SDY_4408 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158237 1158238 SDY_4409 SDY_4410 yjfH vacB FALSE 0.461 181.000 0.147 0.013 N NA
 1158238 1158239 SDY_4410 SDY_4411 vacB yjeB TRUE 0.953 39.000 0.038 NA Y NA
 1158239 1158240 SDY_4411 SDY_4412 yjeB purA FALSE 0.025 205.000 0.010 NA N NA
 1158240 1158241 SDY_4412 SDY_4413 purA yjeT FALSE 0.310 104.000 0.051 NA   NA
 1158241 1158242 SDY_4413 SDY_4414 yjeT hflC TRUE 0.813 82.000 0.348 NA   NA
 1158242 1158243 SDY_4414 SDY_4415 hflC hflK TRUE 0.998 3.000 0.947 0.010 Y NA
 1158243 1158244 SDY_4415 SDY_4416 hflK hflX TRUE 0.789 86.000 0.184 0.054   NA
 1158244 1158245 SDY_4416 SDY_4417 hflX hfq TRUE 0.681 76.000 0.141 1.000   NA
 1158245 1158246 SDY_4417 SDY_4418 hfq miaA TRUE 0.885 86.000 0.531 1.000   NA
 1158246 1158247 SDY_4418 SDY_4419 miaA mutL TRUE 0.919 -7.000 0.188 0.060 N NA
 1158247 1158248 SDY_4419 SDY_4420 mutL amiB TRUE 0.860 10.000 0.092 1.000 N NA
 1158248 1158249 SDY_4420 SDY_4421 amiB yjeE TRUE 0.845 19.000 0.109 NA   NA
 1158249 1158250 SDY_4421 SDY_4426 yjeE yjeF FALSE 0.361 -28.000 0.000 NA   NA
 1158250 1158251 SDY_4426 SDY_4422 yjeF   FALSE 0.207 -1600.000 0.000 NA   NA
 1158255 1158256 SDY_4427 SDY_4428     TRUE 0.642 36.000 0.000 NA   NA
 1158256 1158257 SDY_4428 SDY_4429     TRUE 0.640 37.000 0.000 NA   NA
 1158257 1158258 SDY_4429 SDY_4430   yjeR FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 1158259 1158260 SDY_4431 SDY_4432 yjeQ psd FALSE 0.500 97.000 0.095 1.000   NA
 1158260 1158261 SDY_4432 SDY_4433 psd yjeP TRUE 0.901 22.000 0.148 1.000 N NA
 1158262 1158263 SDY_4434 SDY_4435 yjeM   FALSE 0.566 21.000 0.000 NA N NA
 1158265 1158266 SDY_4437 SDY_4438 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158266 1158267 SDY_4438 SDY_4439 insA   FALSE 0.002 751.000 0.000 NA   NA
 1158267 1158268 SDY_4439 SDY_4440   yjdC FALSE 0.074 188.000 0.000 NA   NA
 1158268 1158269 SDY_4440 SDY_4441 yjdC dsbD TRUE 0.930 13.000 0.217 1.000   NA
 1158269 1158270 SDY_4441 SDY_4442 dsbD cutA TRUE 0.665 -24.000 0.092 1.000 N NA
 1158270 1158271 SDY_4442 SDY_4443 cutA dcuA FALSE 0.288 116.000 0.005 1.000   NA
 1158271 1158272 SDY_4443 SDY_4444 dcuA aspA FALSE 0.323 118.000 0.015 1.000   NA
 1158274 1158275 SDY_4446 SDY_4447   yjeH FALSE 0.007 335.000 0.000 NA N NA
 1158276 1158277 SDY_4448 SDY_4449 mopB mopA TRUE 0.996 44.000 0.631 0.005 Y NA
 1158277 1158278 SDY_4449 SDY_4450 mopA yjeI FALSE 0.350 105.000 0.062 NA   NA
 1158283 1158284 SDY_4455 SDY_4456 ytfL msrA FALSE 0.016 323.000 0.042 NA   NA
 1158285 1158286 SDY_4457 SDY_4458 ytfM ytfN TRUE 0.976 -3.000 0.575 NA   NA
 1158286 1158287 SDY_4458 SDY_4459 ytfN ytfP TRUE 0.928 3.000 0.167 NA   NA
 1158287 1158288 SDY_4459 SDY_4460 ytfP chpS FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1158288 1158289 SDY_4460 SDY_4461 chpS chpB TRUE 0.984 -6.000 0.375 NA Y NA
 1158293 1158294 SDY_4465 SDY_4466 cadB cadA FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1158294 1158295 SDY_4466 SDY_4467 cadA yjdL FALSE 0.420 59.000 0.000 NA   NA
 1158295 1158296 SDY_4467 SDY_4468 yjdL lysU FALSE 0.030 237.000 0.000 NA   NA
 1158298 1158299 SDY_4470 SDY_4471     FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 1158299 1158301 SDY_4471 SDY_4472     FALSE 0.002 907.000 0.000 NA   NA
 1158301 1158302 SDY_4472 SDY_4473     FALSE 0.002 773.000 0.000 NA   NA
 1158302 1158303 SDY_4473 SDY_4474     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1158305 1158306 SDY_4476 SDY_4477   evgA FALSE 0.002 652.000 0.000 NA N NA
 1158306 1158307 SDY_4477 SDY_4478 evgA evgS TRUE 0.978 5.000 0.000 0.007 Y NA
 1158308 1158309 SDY_4479 SDY_4480     TRUE 0.919 50.000 0.000 NA Y NA
 1158310 1158311 SDY_4481 SDY_4482     FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1158311 1158312 SDY_4482 SDY_4483   insA FALSE 0.234 132.000 0.000 NA   NA
 1158312 1158313 SDY_4483 SDY_4484 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158313 1158314 SDY_4484 SDY_4485 insB   FALSE 0.405 195.000 0.000 NA Y NA
 1158317 1158318 SDY_4488 SDY_4489     FALSE 0.026 247.000 0.000 NA   NA
 1158318 1158319 SDY_4489 SDY_4490     FALSE 0.019 748.000 0.000 NA Y NA
 1158319 1158320 SDY_4490 SDY_4491     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1158322 1158323 SDY_4493 SDY_4494     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1158323 1158324 SDY_4494 SDY_4495     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1158325 1158326 SDY_4496 SDY_4497   yicK FALSE 0.248 121.000 0.000 NA   NA
 1158326 1158327 SDY_4497 SDY_4498 yicK yicL FALSE 0.139 161.000 0.000 NA   NA
 1158328 1158329 SDY_4499 SDY_4500 nlpA insB FALSE 0.201 83.000 0.000 NA N NA
 1158329 1158330 SDY_4500 SDY_4501 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158330 1158331 SDY_4501 SDY_4502 insA yjcE FALSE 0.040 233.000 0.000 1.000 N NA
 1158331 1158332 SDY_4502 SDY_4503 yjcE yjcD FALSE 0.478 151.000 0.130 1.000   NA
 1158332 1158333 SDY_4503 SDY_4504 yjcD soxR FALSE 0.005 547.000 0.000 1.000   NA
 1158334 1158335 SDY_4505 SDY_4506 soxS   FALSE 0.002 568.000 0.000 NA N NA
 1158335 1158336 SDY_4506 SDY_4507   yjcB FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 1158339 1158340 SDY_4510 SDY_4511 yjbR yjbQ TRUE 0.688 4.000 0.018 NA   NA
 1158340 1158341 SDY_4511 SDY_4514 yjbQ aphA FALSE 0.231 111.000 0.000 NA   NA
 1158341 1158342 SDY_4514 SDY_4512 aphA insB FALSE 0.231 -590.000 0.000 NA   NA
 1158342 1158343 SDY_4512 SDY_4513 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158344 1158345 SDY_4515 SDY_4516     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158345 1158346 SDY_4516 SDY_4517     FALSE 0.018 269.000 0.000 NA   NA
 1158347 1158348 SDY_4518 SDY_4519 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158348 1158349 SDY_4519 SDY_4520 insA tyrB FALSE 0.073 199.000 0.000 1.000 N NA
 1158349 1158350 SDY_4520 SDY_4521 tyrB alr FALSE 0.146 243.000 0.181 1.000 N NA
 1158350 1158351 SDY_4521 SDY_4522 alr dnaB TRUE 0.919 53.000 0.317 1.000 N NA
 1158353 1158354 SDY_4524 SDY_4525 pspG yjbN FALSE 0.395 134.000 0.070 NA   NA
 1158354 1158355 SDY_4525 SDY_4526 yjbN   FALSE 0.012 319.000 0.000 NA   NA
 1158356 1158357 SDY_4527 SDY_4528   yjbK FALSE 0.003 571.000 0.000 NA   NA
 1158358 1158359 SDY_4529 SDY_4530 yjbJ dinF FALSE 0.234 116.000 0.021 NA   NA
 1158359 1158360 SDY_4530 SDY_4531 dinF lexA FALSE 0.406 73.000 0.033 1.000 N NA
 1158360 1158361 SDY_4531 SDY_4532 lexA dgkA FALSE 0.577 110.000 0.141 1.000 N NA
 1158363 1158364 SDY_4534 SDY_4535 ubiA ubiC TRUE 0.981 13.000 0.248 NA Y NA
 1158365 1158366 SDY_4536 SDY_4537 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158366 1158367 SDY_4537 SDY_4538 insB yiaV TRUE 0.650 28.000 0.000 NA   NA
 1158369 1158370 SDY_4540 SDY_4541   yhjC FALSE 0.010 300.000 0.000 NA N NA
 1158370 1158371 SDY_4541 SDY_4542 yhjC yhjD TRUE 0.812 49.000 0.098 1.000   NA
 1158371 1158372 SDY_4542 SDY_4543 yhjD yhjE FALSE 0.009 392.000 0.000 1.000   NA
 1158373 1158374 SDY_4544 SDY_4545 yhjG yhjH FALSE 0.385 55.000 0.000 NA N NA
 1158376 1158377 SDY_4547 SDY_4548 yhjJ dctA FALSE 0.120 221.000 0.088 1.000   NA
 1158377 1158378 SDY_4548 SDY_4549 dctA yhjK FALSE 0.552 183.000 0.229 0.057 N NA
 1158378 1158379 SDY_4549 SDY_4550 yhjK yhjL FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 1158379 1158380 SDY_4550 SDY_4551 yhjL yhjM FALSE 0.409 60.000 0.000 NA   NA
 1158380 1158381 SDY_4551 SDY_4552 yhjM yhjN TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1158381 1158382 SDY_4552 SDY_4553 yhjN bcsA TRUE 0.892 11.000 0.000 0.000   NA
 1158382 1158383 SDY_4553 SDY_4554 bcsA yhjQ TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158383 1158384 SDY_4554 SDY_4555 yhjQ yhjR FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1158386 1158387 SDY_4557 SDY_4558     TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158387 1158388 SDY_4558 SDY_4559     TRUE 0.752 109.000 0.000 NA Y NA
 1158389 1158390 SDY_4560 SDY_4561 yhjT yhjU TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158390 1158391 SDY_4561 SDY_4562 yhjU yhjV FALSE 0.002 670.000 0.000 NA   NA
 1158392 1158393 SDY_4563 SDY_4564 dppF dppD TRUE 0.996 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 1158393 1158394 SDY_4564 SDY_4565 dppD dppC TRUE 0.993 11.000 0.560 1.000 Y NA
 1158394 1158395 SDY_4565 SDY_4566 dppC dppB TRUE 0.997 10.000 0.779 0.035 Y NA
 1158395 1158396 SDY_4566 SDY_4567 dppB dppA TRUE 0.836 151.000 0.087 0.035 Y NA
 1158396 1158397 SDY_4567 SDY_4568 dppA   FALSE 0.002 744.000 0.000 NA   NA
 1158397 1158398 SDY_4568 SDY_4569   yhjW FALSE 0.229 92.000 0.000 NA   NA
 1158398 1158399 SDY_4569 SDY_4570 yhjW   FALSE 0.019 267.000 0.000 NA   NA
 1158399 1158400 SDY_4570 SDY_4571     TRUE 0.725 12.000 0.000 1.000   NA
 1158400 1158401 SDY_4571 SDY_4572     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158402 1158403 SDY_4573 SDY_4574     FALSE 0.584 141.000 0.182 NA   NA
 1158404 1158405 SDY_4575 SDY_4578   yicJ TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1158405 1158406 SDY_4578 SDY_4576 yicJ   FALSE 0.215 -991.000 0.000 NA   NA
 1158407 1158408 SDY_4577 SDY_4579     FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 1158408 1158409 SDY_4579 SDY_4580     FALSE 0.014 300.000 0.000 NA   NA
 1158409 1158410 SDY_4580 SDY_4581     FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1158410 1158411 SDY_4581 SDY_4582     TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158413 1158414 SDY_4584 SDY_4585     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158414 1158415 SDY_4585 SDY_4586     TRUE 0.831 100.000 0.000 0.030 Y NA
 1158415 1158416 SDY_4586 SDY_4587   flu FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1158416 1158417 SDY_4587 SDY_4588 flu   FALSE 0.002 890.000 0.000 NA   NA
 1158417 1158418 SDY_4588 SDY_4589     FALSE 0.009 341.000 0.000 NA   NA
 1158418 1158419 SDY_4589 SDY_4590     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1158419 1158420 SDY_4590 SDY_4591     FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1158420 1158421 SDY_4591 SDY_4592     FALSE 0.002 992.000 0.000 NA   NA
 1158421 1158422 SDY_4592 SDY_4593     FALSE 0.001 1423.000 0.000 NA   NA
 1158422 1158423 SDY_4593 SDY_4594     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158424 1158425 SDY_4595 SDY_4596   yjiL TRUE 0.816 -3.000 0.078 NA   NA
 1158425 1158426 SDY_4596 SDY_4597 yjiL   TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1158426 1158427 SDY_4597 SDY_4598   yjiN FALSE 0.242 116.000 0.000 NA   NA
 1158427 1158428 SDY_4598 SDY_4599 yjiN yjiO FALSE 0.632 41.000 0.000 NA   NA
 1158431 1158432 SDY_4602 SDY_4603 yjiS   FALSE 0.210 97.000 0.000 NA   NA
 1158433 1158434 SDY_4604 SDY_4605   yjiA FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 1158434 1158435 SDY_4605 SDY_4606 yjiA yjiX TRUE 0.686 113.000 0.212 NA   NA
 1158435 1158436 SDY_4606 SDY_4607 yjiX yjiY TRUE 0.857 131.000 0.531 NA   NA
 1158439 1158440 SDY_4609 SDY_4610     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1158440 1158441 SDY_4610 SDY_4612   yjjN FALSE 0.003 507.000 0.000 NA   NA
 1158442 1158443 SDY_4613 SDY_4614 mdoB yjjA FALSE 0.023 254.000 0.000 NA   NA
 1158443 1158444 SDY_4614 SDY_4615 yjjA dnaC TRUE 0.939 46.000 0.368 NA   NA
 1158444 1158445 SDY_4615 SDY_4616 dnaC dnaT TRUE 0.987 3.000 0.778 NA   NA
 1158445 1158446 SDY_4616 SDY_4617 dnaT yjjB FALSE 0.305 107.000 0.046 NA   NA
 1158446 1158447 SDY_4617 SDY_4620 yjjB yjjP FALSE 0.496 -9.000 0.000 NA   NA
 1158448 1158449 SDY_4618 SDY_4619     TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1158451 1158452 SDY_4622 SDY_4623 yjjQ   FALSE 0.221 -894.000 0.000 NA   NA
 1158452 1158453 SDY_4623 SDY_4624   bglJ FALSE 0.004 457.000 0.000 NA   NA
 1158456 1158457 SDY_4627 SDY_4628     TRUE 0.644 35.000 0.000 NA   NA
 1158457 1158458 SDY_4628 SDY_4629     TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1158458 1158459 SDY_4629 SDY_4630   yjjT FALSE 0.055 200.000 0.000 NA   NA
 1158460 1158461 SDY_4631 SDY_4632 holD rimI TRUE 0.707 -31.000 0.121 1.000   NA
 1158461 1158462 SDY_4632 SDY_4633 rimI yjjG TRUE 0.695 15.000 0.018 1.000   NA
 1158462 1158463 SDY_4633 SDY_4634 yjjG prfC FALSE 0.298 91.000 0.012 1.000   NA
 1158463 1158464 SDY_4634 SDY_4635 prfC   FALSE 0.003 418.000 0.000 NA N NA
 1158464 1158465 SDY_4635 SDY_4636   osmY FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 1158465 1158466 SDY_4636 SDY_4637 osmY yjjU FALSE 0.005 410.000 0.000 NA   NA
 1158466 1158467 SDY_4637 SDY_4638 yjjU yjjV TRUE 0.780 -3.000 0.057 NA   NA
 1158468 1158469 SDY_4639 SDY_4640 yjjW yjjI TRUE 0.946 -28.000 0.810 NA   NA
 1158470 1158471 SDY_4641 SDY_4642 deoC deoA TRUE 0.937 127.000 0.286 1.000 Y NA
 1158471 1158472 SDY_4642 SDY_4643 deoA deoB TRUE 0.939 52.000 0.398 1.000 N NA
 1158472 1158473 SDY_4643 SDY_4644 deoB deoD TRUE 0.856 80.000 0.414 1.000 N NA
 1158473 1158474 SDY_4644 SDY_4645 deoD   FALSE 0.002 502.000 0.000 NA N NA
 1158475 1158476 SDY_4646 SDY_4647   lplA TRUE 0.751 32.000 0.000 1.000   NA
 1158476 1158477 SDY_4647 SDY_4648 lplA smp TRUE 0.795 28.000 0.066 NA   NA
 1158478 1158479 SDY_4649 SDY_4650 serB sms FALSE 0.600 49.000 0.024 1.000 N NA
 1158479 1158480 SDY_4650 SDY_4651 sms nadR TRUE 0.697 21.000 0.021 1.000 N NA
 1158482 1158483 SDY_4653 SDY_4654 slt trpR FALSE 0.631 90.000 0.167 1.000 N NA
 1158487 1158488 SDY_4658 SDY_4659 creA creB TRUE 0.670 13.000 0.038 NA   NA
 1158488 1158489 SDY_4659 SDY_4660 creB creC TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1158489 1158490 SDY_4660 SDY_4661 creC creD FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1158492 1158493 SDY_4663 SDY_4664 yjjY lasT FALSE 0.005 400.000 0.000 NA   NA
 1158493 1153829 SDY_4664 SDY_0001 lasT thrL FALSE 0.066 214.000 0.000 1.000   NA
 1158495 1158496 SDY_P001 SDY_P003   ospB FALSE 0.005 410.000 0.000 NA   NA
 1158496 1158497 SDY_P003 SDY_P004 ospB phoN2/apy FALSE 0.011 328.000 0.000 NA   NA
 1158500 1158501 SDY_P007 SDY_P008     FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1158501 1158502 SDY_P008 SDY_P009     TRUE 0.642 36.000 0.000 NA   NA
 1158502 1158503 SDY_P009 SDY_P010   ospD2 FALSE 0.002 690.000 0.000 NA   NA
 1158503 1158504 SDY_P010 SDY_P011 ospD2   FALSE 0.008 356.000 0.000 NA   NA
 1158504 1158505 SDY_P011 SDY_P012     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158505 1158506 SDY_P012 SDY_P013   mkaD FALSE 0.107 175.000 0.000 NA   NA
 1158506 1158507 SDY_P013 SDY_P014 mkaD   FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1158507 1158508 SDY_P014 SDY_P015     FALSE 0.003 537.000 0.000 NA   NA
 1158508 1158509 SDY_P015 SDY_P016     FALSE 0.034 229.000 0.000 NA   NA
 1158509 1158510 SDY_P016 SDY_P018     FALSE 0.002 623.000 0.000 NA   NA
 1158511 1158512 SDY_P017 SDY_P019     FALSE 0.018 271.000 0.000 NA   NA
 1158512 1158513 SDY_P019 SDY_P020     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1158513 1158514 SDY_P020 SDY_P021     TRUE 0.773 128.000 0.000 NA Y NA
 1158514 1158515 SDY_P021 SDY_P022     FALSE 0.002 769.000 0.000 NA   NA
 1158515 1158516 SDY_P022 SDY_P023   ospD1 FALSE 0.002 588.000 0.000 NA   NA
 1158518 1158519 SDY_P025 SDY_P026 ipgB2   FALSE 0.003 572.000 0.000 NA   NA
 1158519 1158520 SDY_P026 SDY_P027     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1158520 1158521 SDY_P027 SDY_P028     FALSE 0.085 340.000 0.000 NA Y NA
 1158521 1158522 SDY_P028 SDY_P029     FALSE 0.228 243.000 0.000 NA Y NA
 1158522 1158523 SDY_P029 SDY_P030     TRUE 0.877 -28.000 0.000 1.000 Y NA
 1158523 1158524 SDY_P030 SDY_P031   parA FALSE 0.002 747.000 0.000 1.000 N NA
 1158524 1158525 SDY_P031 SDY_P032 parA parB TRUE 0.987 0.000 0.667 1.000 N NA
 1158525 1158526 SDY_P032 SDY_P033 parB   FALSE 0.023 256.000 0.000 NA   NA
 1158527 1158528 SDY_P034 SDY_P035     FALSE 0.022 780.000 0.000 1.000 Y NA
 1158530 1158531 SDY_P037 SDY_P038 ipaH4.5 ipaH7.8 FALSE 0.015 428.000 0.000 0.010   NA
 1158531 1158532 SDY_P038 SDY_P039 ipaH7.8   FALSE 0.003 820.000 0.000 1.000   NA
 1158532 1158533 SDY_P039 SDY_P040     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1158533 1158534 SDY_P040 SDY_P041   insB FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1158535 1158536 SDY_P042 SDY_P043     TRUE 0.991 6.000 0.375 NA Y NA
 1158536 1158537 SDY_P043 SDY_P044     FALSE 0.216 139.000 0.000 NA   NA
 1158538 1158539 SDY_P045 SDY_P046 ipaH1.4 ospE2 FALSE 0.007 367.000 0.000 NA   NA
 1158539 1158540 SDY_P046 SDY_P047 ospE2   FALSE 0.453 56.000 0.000 NA   NA
 1158542 1158543 SDY_P049 SDY_P050     TRUE 0.951 27.000 0.000 NA Y NA
 1158543 1158544 SDY_P050 SDY_P051     FALSE 0.405 195.000 0.000 NA Y NA
 1158546 1158547 SDY_P053 SDY_P054     FALSE 0.291 76.000 0.000 NA   NA
 1158548 1158549 SDY_P055 SDY_P056 ospC1 ospD3 FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 1158550 1158551 SDY_P057 SDY_P058     TRUE 0.951 27.000 0.000 NA Y NA
 1158552 1158553 SDY_P059 SDY_P060     FALSE 0.212 96.000 0.000 NA   NA
 1158553 1158554 SDY_P060 SDY_P061     FALSE 0.445 -15.000 0.000 NA   NA
 1158556 1158557 SDY_P062 SDY_P064   ushA FALSE 0.020 290.000 0.000 1.000 N NA
 1158557 1158558 SDY_P064 SDY_P065 ushA   FALSE 0.255 69.000 0.000 NA N NA
 1158558 1158559 SDY_P065 SDY_P066     TRUE 0.951 27.000 0.000 NA Y NA
 1158559 1158560 SDY_P066 SDY_P067   phoN1 FALSE 0.004 415.000 0.000 NA   NA
 1158561 1158562 SDY_P068 SDY_P069     TRUE 0.967 6.000 0.375 NA   NA
 1158564 1158565 SDY_P071 SDY_P072     TRUE 0.991 6.000 0.375 NA Y NA
 1158565 1158566 SDY_P072 SDY_P073     FALSE 0.543 46.000 0.000 NA   NA
 1158566 1158567 SDY_P073 SDY_P074   stbB FALSE 0.079 186.000 0.000 NA   NA
 1158567 1158568 SDY_P074 SDY_P075 stbB stbA TRUE 0.976 0.000 0.455 NA   NA
 1158570 1158571 SDY_P077 SDY_P078   insB TRUE 0.845 67.000 0.000 NA Y NA
 1158571 1158572 SDY_P078 SDY_P079 insB   FALSE 0.036 474.000 0.000 NA Y NA
 1158572 1158573 SDY_P079 SDY_P080     FALSE 0.022 257.000 0.000 NA   NA
 1158573 1158574 SDY_P080 SDY_P081     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 1158574 1158575 SDY_P081 SDY_P082     FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1158575 1158576 SDY_P082 SDY_P083     FALSE 0.008 356.000 0.000 NA   NA
 1158578 1158579 SDY_P085 SDY_P086     TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1158580 1158581 SDY_P087 SDY_P088     TRUE 0.877 0.000 0.091 NA   NA
 1158581 1158582 SDY_P088 SDY_P089     FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1158583 1158584 SDY_P090 SDY_P092     TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 1158585 1158586 SDY_P091 SDY_P093     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA Y NA
 1158587 1158588 SDY_P094 SDY_P095     FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1158589 1158590 SDY_P096 SDY_P097 ccdA ccdB TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1158590 1158591 SDY_P097 SDY_P098 ccdB   FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 1158591 1158592 SDY_P098 SDY_P099   ipaH9.8 FALSE 0.086 184.000 0.000 NA   NA
 1158592 1158593 SDY_P099 SDY_P100 ipaH9.8 yacA FALSE 0.075 208.000 0.000 1.000   NA
 1158593 1158594 SDY_P100 SDY_P101 yacA ospG FALSE 0.024 252.000 0.000 NA   NA
 1158594 1158595 SDY_P101 SDY_P102 ospG   FALSE 0.005 405.000 0.000 NA   NA
 1158595 1158596 SDY_P102 SDY_P103     FALSE 0.636 39.000 0.000 NA   NA
 1158600 1158601 SDY_P107 SDY_P108 shf rfbU FALSE 0.202 150.000 0.000 1.000 N NA
 1158601 1158602 SDY_P108 SDY_P109 rfbU virK TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1158602 1158603 SDY_P109 SDY_P110 virK msbB2 FALSE 0.360 65.000 0.000 NA   NA
 1158603 1158604 SDY_P110 SDY_P111 msbB2   FALSE 0.111 174.000 0.000 NA   NA
 1158605 1158606 SDY_P112 SDY_P113     FALSE 0.398 61.000 0.000 NA   NA
 1158608 1158609 SDY_P115 SDY_P116     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1158610 1158611 SDY_P117 SDY_P118 traD   FALSE 0.238 -118.000 0.000 NA   NA
 1158611 1158612 SDY_P118 SDY_P119   trbH TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1158614 1158615 SDY_P121 SDY_P122     TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1158615 1158616 SDY_P122 SDY_P123     FALSE 0.627 -51.000 0.000 0.001   NA
 1158616 1158617 SDY_P123 SDY_P124   traX TRUE 0.953 20.000 0.333 NA   NA
 1158617 1158618 SDY_P124 SDY_P125 traX finO TRUE 0.958 55.000 0.667 NA   NA
 1158618 1158619 SDY_P125 SDY_P126 finO yigA TRUE 0.780 131.000 0.333 NA   NA
 1158619 1158620 SDY_P126 SDY_P127 yigA   FALSE 0.086 184.000 0.000 NA   NA
 1158621 1158622 SDY_P128 SDY_P129 insB   FALSE 0.019 268.000 0.000 NA   NA
 1158623 1158624 SDY_P130 SDY_P131   hmo FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1158624 1158625 SDY_P131 SDY_P132 hmo   FALSE 0.636 39.000 0.000 NA   NA
 1158626 1158627 SDY_P133 SDY_P134     TRUE 0.951 27.000 0.000 NA Y NA
 1158628 1158629 SDY_P135 SDY_P136 yihA repB FALSE 0.028 240.000 0.000 NA   NA
 1158629 1158630 SDY_P136 SDY_P137 repB repA FALSE 0.015 291.000 0.000 NA   NA
 1158630 1158631 SDY_P137 SDY_P138 repA   FALSE 0.002 743.000 0.000 NA   NA
 1158632 1158633 SDY_P139 SDY_P141     FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 1158635 1158636 SDY_P142 SDY_P143     TRUE 0.911 36.000 0.182 NA   NA
 1158636 1158637 SDY_P143 SDY_P144     FALSE 0.334 68.000 0.000 NA   NA
 1158637 1158638 SDY_P144 SDY_P145     TRUE 0.954 -9.000 0.500 1.000   NA
 1158638 1158639 SDY_P145 SDY_P146     FALSE 0.007 426.000 0.000 1.000   NA
 1158639 1158640 SDY_P146 SDY_P147     FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1158640 1158641 SDY_P147 SDY_P148     FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 1158641 1158642 SDY_P148 SDY_P149     FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1158642 1158643 SDY_P149 SDY_P150     FALSE 0.222 137.000 0.000 NA   NA
 1158644 1158645 SDY_P151 SDY_P152 ospC3   FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1158645 1158646 SDY_P152 SDY_P153     FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1158646 1158647 SDY_P153 SDY_P154     FALSE 0.248 125.000 0.000 NA   NA
 1158647 1158648 SDY_P154 SDY_P155     FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1158648 1158649 SDY_P155 SDY_P156     FALSE 0.112 190.000 0.000 1.000   NA
 1158651 1158652 SDY_P158 SDY_P159     FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1158654 1158655 SDY_P161 SDY_P162 virB acp FALSE 0.076 207.000 0.000 1.000   NA
 1158655 1158656 SDY_P162 SDY_P163 acp ipaA TRUE 0.912 4.000 0.111 1.000   NA
 1158656 1158657 SDY_P163 SDY_P164 ipaA ipaD TRUE 0.915 9.000 0.143 1.000   NA
 1158657 1158658 SDY_P164 SDY_P165 ipaD ipaC TRUE 0.952 51.000 0.286 0.003   NA
 1158658 1158659 SDY_P165 SDY_P166 ipaC ipaB TRUE 0.939 20.000 0.125 0.003   NA
 1158659 1158660 SDY_P166 SDY_P167 ipaB ipgC TRUE 0.972 6.000 0.375 1.000   NA
 1158660 1158661 SDY_P167 SDY_P168 ipgC ipgB1 FALSE 0.558 58.000 0.000 1.000   NA
 1158661 1158662 SDY_P168 SDY_P169 ipgB1 ipgA FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1158662 1158663 SDY_P169 SDY_P170 ipgA icsB TRUE 0.932 13.000 0.273 NA   NA
 1158664 1158665 SDY_P171 SDY_P172 ipgD ipgE TRUE 0.956 10.000 0.333 NA   NA
 1158665 1158666 SDY_P172 SDY_P173 ipgE ipgF TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1158666 1158667 SDY_P173 SDY_P174 ipgF mxiG TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1158667 1158668 SDY_P174 SDY_P175 mxiG mxiH TRUE 0.982 8.000 0.667 NA   NA
 1158668 1158669 SDY_P175 SDY_P176 mxiH mxiI TRUE 0.986 13.000 0.667 0.003   NA
 1158669 1158670 SDY_P176 SDY_P177 mxiI mxiJ TRUE 0.976 6.000 0.286 0.006   NA
 1158670 1158671 SDY_P177 SDY_P178 mxiJ mxiK TRUE 0.956 6.000 0.238 1.000   NA
 1158671 1158672 SDY_P178 SDY_P179 mxiK mxiN TRUE 0.939 -58.000 1.000 1.000   NA
 1158672 1158673 SDY_P179 SDY_P180 mxiN mxiL FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1158673 1158674 SDY_P180 SDY_P181 mxiL mxiM FALSE 0.436 -16.000 0.000 NA   NA
 1158674 1158675 SDY_P181 SDY_P182 mxiM mxiE FALSE 0.239 130.000 0.000 NA   NA
 1158675 1158676 SDY_P182 SDY_P183 mxiE mxiD FALSE 0.523 -13.000 0.000 1.000 N NA
 1158676 1158677 SDY_P183 SDY_P184 mxiD mxiC TRUE 0.854 79.000 0.360 1.000   NA
 1158677 1158678 SDY_P184 SDY_P185 mxiC mxiA TRUE 0.966 7.000 0.320 1.000   NA
 1158678 1158679 SDY_P185 SDY_P186 mxiA spa15 TRUE 0.952 13.000 0.200 0.005   NA
 1158679 1158680 SDY_P186 SDY_P187 spa15 spa47 TRUE 0.952 4.000 0.200 1.000   NA
 1158680 1158681 SDY_P187 SDY_P188 spa47 spa13 FALSE 0.179 144.000 0.000 NA   NA
 1158681 1158682 SDY_P188 SDY_P189 spa13 spa32 FALSE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 1158682 1158683 SDY_P189 SDY_P190 spa32 spa33 FALSE 0.552 -6.000 0.000 NA   NA
 1158683 1158684 SDY_P190 SDY_P191 spa33 spa24 TRUE 0.990 5.000 0.625 0.005   NA
 1158684 3420651 SDY_P191 SDY_P191a spa24 spa9 TRUE 0.997 15.000 0.833 0.005 Y NA
 3420651 1158685 SDY_P191a SDY_P192 spa9 spa29 TRUE 0.998 0.000 1.000 0.053 Y NA
 1158685 1158686 SDY_P192 SDY_P193 spa29 spa40 TRUE 0.997 7.000 0.682 0.053 Y NA
 1158686 1158687 SDY_P193 SDY_P194 spa40 spa-orf10 TRUE 0.651 22.000 0.000 NA   NA
 1158688 1158689 SDY_P195 SDY_P196     FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 1158689 1158690 SDY_P196 SDY_P197     FALSE 0.361 -28.000 0.000 NA   NA
 1158690 1158691 SDY_P197 SDY_P198     FALSE 0.002 1018.000 0.000 NA   NA
 1158691 1158692 SDY_P198 SDY_P199     FALSE 0.003 524.000 0.000 NA   NA
 1158692 1158693 SDY_P199 SDY_P200     FALSE 0.261 -63.000 0.000 NA   NA
 1158693 1158694 SDY_P200 SDY_P201     FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1158694 1158695 SDY_P201 SDY_P202     FALSE 0.039 218.000 0.000 NA   NA
 1158697 1158698 SDY_P204 SDY_P205     FALSE 0.377 63.000 0.000 NA   NA
 1158698 1158699 SDY_P205 SDY_P206     FALSE 0.002 991.000 0.000 NA   NA
 1158699 1158700 SDY_P206 SDY_P207     FALSE 0.250 -85.000 0.000 NA   NA
 1158700 1158701 SDY_P207 SDY_P208     FALSE 0.369 -27.000 0.000 NA   NA
 1158701 1158702 SDY_P208 SDY_P210     FALSE 0.239 -117.000 0.000 NA   NA
 1158704 1158705 SDY_P211 SDY_P212 virA   FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1158705 1158706 SDY_P212 SDY_P213     TRUE 0.951 27.000 0.000 NA Y NA
 1158708 1158709 SDY_P215 SDY_P216     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1158710 1158711 SDY_P217 SDY_P218     FALSE 0.247 127.000 0.000 NA   NA
 1158711 1158712 SDY_P218 SDY_P219   repB FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1158712 1158713 SDY_P219 SDY_P220 repB repA FALSE 0.013 302.000 0.000 NA   NA
 3420652 3420653 SDY_PA01 SDY_PA02 repA insA FALSE 0.010 376.000 0.000 1.000   NA
 3420653 3420654 SDY_PA02 SDY_PA03 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 3420655 3420656 SDY_PA04 SDY_PA05 rfpB rfpA FALSE 0.039 218.000 0.000 NA   NA
 3420656 3420657 SDY_PA05 SDY_PA06 rfpA   FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 3420658 3420659 SDY_PA07 SDY_PA08     FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 3420659 3420652 SDY_PA08 SDY_PA01   repA FALSE 0.002 1008.000 0.000 NA   NA