MicrobesOnline Operon Predictions for Salmonella enterica Paratyphi A

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 902901 902902 SPA0001 SPA0002 thrL thrA FALSE 0.247 82.000 0.043 1.000   NA
 902902 902903 SPA0002 SPA0003 thrA thrB TRUE 0.990 2.000 0.133 1.000 Y NA
 902903 902904 SPA0003 SPA0004 thrB thrC TRUE 0.993 4.000 0.233 1.000 Y NA
 902905 10702252 SPA0005 SPA0006 yaaA   TRUE 0.848 -6.000 0.000 NA   NA
 902906 902907 SPA0007 SPA0008 talB mog FALSE 0.105 111.000 0.042 1.000 N NA
 902908 902909 SPA0009 SPA0010 yaaH htgA FALSE 0.122 150.000 0.000 NA   NA
 902909 902910 SPA0010 SPA0011 htgA yaaI FALSE 0.450 36.000 0.000 NA   NA
 902911 902912 SPA0012 SPA0013 dnaK dnaJ TRUE 0.933 86.000 0.236 0.004 Y NA
 902912 902913 SPA0013 SPA0014 dnaJ   FALSE 0.009 284.000 0.000 1.000 N NA
 902913 902914 SPA0014 SPA0015     TRUE 0.716 127.000 0.600 NA   NA
 902915 902916 SPA0016 SPA0017     TRUE 0.964 17.000 0.600 NA   NA
 10702253 902917 SPA0018 SPA0019     TRUE 0.487 32.000 0.000 NA   NA
 902917 902918 SPA0019 SPA0020     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 902918 902919 SPA0020 SPA0021   bcfA FALSE 0.003 430.000 0.000 NA N NA
 902919 902920 SPA0021 SPA0022 bcfA bcfB TRUE 0.907 101.000 0.500 1.000 Y NA
 902920 902921 SPA0022 SPA0023 bcfB radA TRUE 0.997 5.000 0.667 1.000 Y NA
 902921 902922 SPA0023 SPA0024 radA bcfD TRUE 0.997 1.000 0.500 NA Y NA
 902922 902923 SPA0024 SPA0025 bcfD bcfE TRUE 0.997 1.000 0.500 NA Y NA
 902923 10702254 SPA0025 SPA0026 bcfE   TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 10702254 902924 SPA0026 SPA0027   bcfG TRUE 0.831 -7.000 0.000 NA   NA
 902924 902925 SPA0027 SPA0028 bcfG bcfH TRUE 0.720 65.000 0.167 0.018 N NA
 902925 902926 SPA0028 SPA0029 bcfH   FALSE 0.427 39.000 0.000 NA   NA
 902931 902932 SPA0034 SPA0035     FALSE 0.221 99.000 0.000 NA   NA
 10702255 902933 SPA0036 SPA0037     FALSE 0.219 102.000 0.000 NA   NA
 902933 902934 SPA0037 SPA0038     TRUE 0.594 25.000 0.000 1.000   NA
 902934 902935 SPA0038 SPA0039     FALSE 0.173 127.000 0.000 NA   NA
 902935 902936 SPA0039 SPA0040   nhaA FALSE 0.093 163.000 0.000 NA   NA
 902936 902937 SPA0040 SPA0041 nhaA nhaR TRUE 0.660 62.000 0.292 1.000 N NA
 902938 902939 SPA0042 SPA0043     TRUE 0.928 40.000 0.231 1.000 Y NA
 902939 902940 SPA0043 SPA0044   rpsT FALSE 0.003 456.000 0.000 1.000 N NA
 902941 902942 SPA0045 SPA0046 yaaY ribF TRUE 0.793 8.000 0.019 NA   NA
 902942 902943 SPA0046 SPA0047 ribF ileS TRUE 0.707 45.000 0.254 1.000 N NA
 902943 902944 SPA0047 SPA0048 ileS lspA TRUE 0.813 0.000 0.045 1.000 N NA
 902944 902945 SPA0048 SPA0049 lspA fkpB FALSE 0.209 155.000 0.154 1.000 N NA
 902945 902946 SPA0049 SPA0050 fkpB lytB TRUE 0.989 3.000 0.626 1.000 N NA
 902946 902947 SPA0050 SPA0051 lytB   FALSE 0.047 200.000 0.000 NA   NA
 902947 902948 SPA0051 SPA0052   yaaF TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 902949 902950 SPA0053 SPA0054 citB   TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 902950 902951 SPA0054 SPA0055   oadB FALSE 0.136 135.000 0.068 1.000 N NA
 902951 902952 SPA0055 SPA0056 oadB oadA TRUE 0.998 13.000 0.886 0.002 Y NA
 902952 902953 SPA0056 SPA0057 oadA oadG TRUE 0.997 16.000 0.720 0.002 Y NA
 902953 902954 SPA0057 SPA0058 oadG   FALSE 0.446 159.000 0.060 1.000 Y NA
 902955 902956 SPA0059 SPA0060 citC citD TRUE 0.968 30.000 0.426 1.000 Y NA
 902956 902957 SPA0060 SPA0061 citD citE TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.002 N NA
 902957 902958 SPA0061 SPA0062 citE citF TRUE 0.989 11.000 0.373 0.001 N NA
 902958 902959 SPA0062 SPA0063 citF   TRUE 0.970 0.000 0.231 1.000 N NA
 902959 902960 SPA0063 SPA0064   citG TRUE 0.988 -22.000 0.400 1.000 Y NA
 902960 902961 SPA0064 SPA0065 citG dapB FALSE 0.011 180.000 0.002 1.000 N NA
 902961 10702256 SPA0065 SPA0066 dapB   FALSE 0.108 155.000 0.000 NA   NA
 10702256 902962 SPA0066 SPA0067   carA FALSE 0.006 454.000 0.000 NA   NA
 902962 902963 SPA0067 SPA0068 carA carB TRUE 0.992 19.000 0.345 0.001 Y NA
 902963 902964 SPA0068 SPA0069 carB caiF FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 902965 902966 SPA0070 SPA0071 caiE caiD FALSE 0.287 111.000 0.069 1.000   NA
 902966 902967 SPA0071 SPA0072 caiD caiC TRUE 0.883 54.000 0.000 0.029 Y NA
 902967 902968 SPA0072 SPA0073 caiC caiB TRUE 0.710 63.000 0.154 0.029 N NA
 902968 902969 SPA0073 SPA0074 caiB caiA TRUE 0.692 112.000 0.529 1.000 N NA
 902969 902970 SPA0074 SPA0075 caiA caiT FALSE 0.326 35.000 0.000 1.000 N NA
 902971 902972 SPA0076 SPA0077 fixA fixB TRUE 0.974 16.000 0.000 0.022 Y NA
 902972 902973 SPA0077 SPA0078 fixB fixC TRUE 0.881 50.000 0.000 0.062 Y NA
 902973 902974 SPA0078 SPA0079 fixC fixX TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.062 Y NA
 902974 902975 SPA0079 SPA0080 fixX yaaU FALSE 0.077 148.000 0.000 1.000 N NA
 902975 902976 SPA0080 SPA0081 yaaU   FALSE 0.232 89.000 0.000 NA   NA
 902976 902977 SPA0081 SPA0082     FALSE 0.018 272.000 0.000 NA   NA
 902979 902980 SPA0084 SPA0085     FALSE 0.005 494.000 0.000 NA   NA
 902980 10702257 SPA0085 SPA0086     FALSE 0.005 554.000 0.000 NA   NA
 10702257 902981 SPA0086 SPA0087   kefC TRUE 0.831 -7.000 0.000 NA   NA
 902981 902982 SPA0087 SPA0088 kefC folA FALSE 0.010 199.000 0.012 1.000 N NA
 902983 902984 SPA0089 SPA0090 apaH apaG TRUE 0.949 11.000 0.267 NA N NA
 902984 902985 SPA0090 SPA0091 apaG ksgA TRUE 0.878 3.000 0.078 NA N NA
 902985 902986 SPA0091 SPA0092 ksgA pdxA TRUE 0.957 -3.000 0.197 1.000 N NA
 902986 902987 SPA0092 SPA0093 pdxA surA TRUE 0.988 0.000 0.561 1.000 N NA
 902987 902988 SPA0093 SPA0094 surA imp TRUE 0.573 54.000 0.182 1.000 N NA
 902990 902991 SPA0096 SPA0097 rluA hepA TRUE 0.949 12.000 0.294 1.000 N NA
 902991 902992 SPA0097 SPA0098 hepA polB TRUE 0.608 174.000 0.098 0.062 Y NA
 902992 902993 SPA0098 SPA0099 polB   FALSE 0.117 340.000 0.000 0.062 Y NA
 902997 902998 SPA0103 SPA0104 araD araA TRUE 0.484 141.000 0.017 1.000 Y NA
 902998 902999 SPA0104 SPA0105 araA araB TRUE 0.905 11.000 0.138 1.000 N NA
 903000 903001 SPA0106 SPA0107 araC yabI FALSE 0.422 119.000 0.167 NA   NA
 903002 903003 SPA0108 SPA0109 yabJ yabK TRUE 0.983 -16.000 0.522 0.018 N NA
 903003 903004 SPA0109 SPA0110 yabK tbpA TRUE 0.984 -24.000 0.697 0.081 N NA
 903004 903005 SPA0110 SPA0111 tbpA yabN FALSE 0.199 178.000 0.000 0.081   NA
 903005 903006 SPA0111 SPA0112 yabN leuD FALSE 0.005 551.000 0.000 1.000   NA
 903006 903007 SPA0112 SPA0113 leuD leuC TRUE 0.997 11.000 0.309 0.001 Y NA
 903007 903008 SPA0113 SPA0114 leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 903008 903009 SPA0114 SPA0115 leuB leuA TRUE 0.996 0.000 0.126 0.002 Y NA
 903009 903010 SPA0115 SPA0116 leuA leuL TRUE 0.567 88.000 0.010 0.002   NA
 903011 903012 SPA0117 SPA0118 leuO ilvI FALSE 0.006 322.000 0.000 1.000 N NA
 903012 903013 SPA0118 SPA0119 ilvI ilvH TRUE 0.998 0.000 0.371 0.002 Y NA
 903013 903014 SPA0119 SPA0120 ilvH fruR FALSE 0.012 284.000 0.063 1.000 N NA
 903014 903015 SPA0120 SPA0121 fruR yabB FALSE 0.004 606.000 0.000 NA   NA
 903015 903016 SPA0121 SPA0122 yabB yabC TRUE 0.991 2.000 0.635 NA   NA
 903016 903017 SPA0122 SPA0123 yabC ftsL TRUE 0.964 -3.000 0.227 1.000 N NA
 903017 903018 SPA0123 SPA0124 ftsL ftsI TRUE 0.815 16.000 0.124 1.000 N NA
 903018 903019 SPA0124 SPA0125 ftsI murE TRUE 0.963 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 903019 903020 SPA0125 SPA0126 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 903020 903021 SPA0126 SPA0127 murF mraY TRUE 0.997 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 903021 903022 SPA0127 SPA0128 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 903022 903023 SPA0128 SPA0129 murD ftsW TRUE 0.992 0.000 0.297 0.003 N NA
 903023 903024 SPA0129 SPA0130 ftsW murG TRUE 0.988 -3.000 0.647 1.000 N NA
 903024 903025 SPA0130 SPA0131 murG murC TRUE 0.829 119.000 0.283 1.000 Y NA
 903025 903026 SPA0131 SPA0132 murC ddlB TRUE 0.994 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 903026 903027 SPA0132 SPA0133 ddlB ftsQ TRUE 0.995 2.000 0.372 NA Y NA
 903027 903028 SPA0133 SPA0134 ftsQ ftsA TRUE 0.978 -3.000 0.389 NA N NA
 903028 903029 SPA0134 SPA0135 ftsA ftsZ TRUE 0.933 61.000 0.460 1.000 Y NA
 903029 903030 SPA0135 SPA0136 ftsZ lpxC FALSE 0.350 101.000 0.134 1.000 N NA
 903030 903031 SPA0136 SPA0137 lpxC yacA FALSE 0.019 279.000 0.000 1.000   NA
 903031 903032 SPA0137 SPA0138 yacA secA FALSE 0.381 62.000 0.065 1.000   NA
 903032 903033 SPA0138 SPA0139 secA mutT FALSE 0.240 152.000 0.168 1.000 N NA
 903036 903037 SPA0142 SPA0143 yacG yacF TRUE 0.976 10.000 0.356 NA   NA
 903037 903038 SPA0143 SPA0144 yacF yacE TRUE 0.950 0.000 0.110 NA   NA
 903040 903041 SPA0146 SPA0147 hofC hofB TRUE 0.994 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 903041 903042 SPA0147 SPA0148 hofB ppdD TRUE 0.995 10.000 0.556 1.000 Y NA
 903042 903043 SPA0148 SPA0149 ppdD nadC FALSE 0.007 222.000 0.015 1.000 N NA
 903044 903045 SPA0150 SPA0151 ampD ampE TRUE 0.993 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 903046 903047 SPA0152 SPA0153     TRUE 0.984 0.000 0.333 1.000   NA
 903047 903048 SPA0153 SPA0154   aroP FALSE 0.269 164.000 0.238 1.000 N NA
 903049 903050 SPA0155 SPA0156 pdhR aceE FALSE 0.312 160.000 0.276 1.000 N NA
 903050 903051 SPA0156 SPA0157 aceE aceF TRUE 0.980 15.000 0.220 1.000 Y NA
 903051 903052 SPA0157 SPA0158 aceF lpdA TRUE 0.603 202.000 0.463 1.000 Y NA
 903052 903053 SPA0158 SPA0159 lpdA   FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 903054 903055 SPA0160 SPA0161   yacH TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 903056 903057 SPA0162 SPA0163 acnB yacL FALSE 0.079 188.000 0.068 NA   NA
 903057 903058 SPA0163 SPA0164 yacL kdgT FALSE 0.027 235.000 0.000 NA   NA
 903058 903059 SPA0164 SPA0165 kdgT ygbK TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903059 903060 SPA0165 SPA0166 ygbK   TRUE 0.967 -10.000 0.361 NA   NA
 903060 903061 SPA0166 SPA0167     TRUE 0.980 10.000 0.533 1.000 N NA
 903062 903063 SPA0168 SPA0169 speD speE TRUE 0.955 21.000 0.162 1.000 Y NA
 903063 903064 SPA0169 SPA0170 speE yacC TRUE 0.660 107.000 0.354 NA   NA
 903069 903070 SPA0175 SPA0176 yadG yadH TRUE 0.997 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 903070 903071 SPA0176 SPA0177 yadH yadI FALSE 0.095 105.000 0.037 1.000 N NA
 903071 903072 SPA0177 SPA0178 yadI yadE TRUE 0.869 68.000 0.222 1.000 Y NA
 903073 903074 SPA0179 SPA0180 stkG stkF TRUE 0.997 12.000 0.571 0.010 Y NA
 903074 903075 SPA0180 SPA0181 stkF stkE TRUE 0.981 19.000 0.571 0.010   NA
 903075 903076 SPA0181 SPA0182 stkE stkD TRUE 0.970 27.000 0.571 0.010   NA
 903076 903077 SPA0182 SPA0183 stkD stkC TRUE 0.971 35.000 0.571 1.000 Y NA
 903077 903078 SPA0183 SPA0184 stkC stkB TRUE 0.962 68.000 1.000 1.000 Y NA
 903078 903079 SPA0184 SPA0185 stkB stkA TRUE 0.942 87.000 0.750 1.000 Y NA
 903079 903080 SPA0185 SPA0186 stkA panD FALSE 0.010 277.000 0.000 1.000 N NA
 903080 903081 SPA0186 SPA0187 panD panC TRUE 0.877 95.000 0.342 1.000 Y NA
 903081 903082 SPA0187 SPA0188 panC panB TRUE 0.943 126.000 0.395 0.001 Y NA
 903082 903083 SPA0188 SPA0189 panB folK TRUE 0.707 121.000 0.117 1.000 Y NA
 903083 903084 SPA0189 SPA0190 folK pcnB TRUE 0.965 -3.000 0.234 1.000 N NA
 903084 903085 SPA0190 SPA0191 pcnB yadB TRUE 0.665 141.000 0.131 1.000 Y NA
 903085 903086 SPA0191 SPA0192 yadB dksA TRUE 0.574 69.000 0.231 1.000 N NA
 903086 903087 SPA0192 SPA0193 dksA sfsA FALSE 0.187 177.000 0.151 NA   NA
 903087 903088 SPA0193 SPA0194 sfsA ligT TRUE 0.664 17.000 0.045 NA   NA
 903089 903090 SPA0195 SPA0196 hrpB mrcB FALSE 0.276 141.000 0.158 1.000 N NA
 903090 10702258 SPA0196 SPA0197 mrcB   FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 10702258 903091 SPA0197 SPA0198   fhuC FALSE 0.361 49.000 0.000 NA   NA
 903091 903092 SPA0198 SPA0199 fhuC fhuD TRUE 0.983 0.000 0.047 1.000 Y NA
 903092 903093 SPA0199 SPA0200 fhuD fhuB TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 903093 903094 SPA0200 SPA0201 fhuB stfA FALSE 0.002 941.000 0.000 1.000 N NA
 903094 10702259 SPA0201 SPA0202 stfA   FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 10702259 903095 SPA0202 SPA0203   stfD TRUE 0.671 18.000 0.000 NA   NA
 903095 903096 SPA0203 SPA0204 stfD stfE TRUE 0.978 19.000 0.333 1.000 Y NA
 903096 10702260 SPA0204 SPA0205 stfE   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 10702260 903097 SPA0205 SPA0206   stfG TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 903097 903098 SPA0206 SPA0207 stfG   TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 903100 903101 SPA0209 SPA0210 yadQ yadR FALSE 0.361 37.000 0.031 NA   NA
 903102 903103 SPA0211 SPA0212 yadS btuF TRUE 0.763 37.000 0.213 NA   NA
 903103 903104 SPA0212 SPA0213 btuF mtn TRUE 0.822 -7.000 0.073 1.000 N NA
 903105 903106 SPA0214 SPA0215 dgt htrA FALSE 0.218 130.000 0.101 1.000 N NA
 903106 903107 SPA0215 SPA0216 htrA yaeG FALSE 0.104 153.000 0.080 NA N NA
 903110 903111 SPA0219 SPA0220 dapD glnD TRUE 0.577 30.000 0.097 1.000 N NA
 903111 903112 SPA0220 SPA0221 glnD map TRUE 0.486 113.000 0.243 1.000 N NA
 903113 903114 SPA0222 SPA0223   rpsB TRUE 0.512 29.000 0.000 NA   NA
 903114 903115 SPA0223 SPA0224 rpsB tsf TRUE 0.522 258.000 0.748 1.000 Y NA
 903115 903116 SPA0224 SPA0225 tsf pyrH TRUE 0.510 145.000 0.416 1.000 N NA
 903116 903117 SPA0225 SPA0226 pyrH frr TRUE 0.611 147.000 0.626 1.000 N NA
 903117 903118 SPA0226 SPA0227 frr dxr FALSE 0.053 142.000 0.032 1.000 N NA
 903118 903119 SPA0227 SPA0228 dxr uppS FALSE 0.065 313.000 0.025 1.000 Y NA
 903119 903120 SPA0228 SPA0229 uppS cdsA TRUE 0.990 13.000 0.400 1.000 Y NA
 903120 903121 SPA0229 SPA0230 cdsA yaeL TRUE 0.811 12.000 0.080 1.000 N NA
 903121 903122 SPA0230 SPA0231 yaeL yaeT TRUE 0.937 32.000 0.204 1.000 Y NA
 903122 903123 SPA0231 SPA0232 yaeT ompH TRUE 0.849 123.000 0.354 1.000 Y NA
 903123 903124 SPA0232 SPA0233 ompH lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 903124 903125 SPA0233 SPA0234 lpxD fabZ TRUE 0.791 106.000 0.796 1.000 N NA
 903125 903126 SPA0234 SPA0235 fabZ lpxA TRUE 0.991 4.000 0.850 1.000 N NA
 903126 903127 SPA0235 SPA0236 lpxA lpxB TRUE 0.995 0.000 0.289 1.000 Y NA
 903127 903128 SPA0236 SPA0237 lpxB rnhB TRUE 0.955 -3.000 0.186 1.000 N NA
 903128 903129 SPA0237 SPA0238 rnhB dnaE TRUE 0.931 24.000 0.104 1.000 Y NA
 903129 903130 SPA0238 SPA0239 dnaE accA TRUE 0.860 13.000 0.122 1.000 N NA
 903130 903131 SPA0239 SPA0240 accA   FALSE 0.045 179.000 0.003 1.000   NA
 903131 903132 SPA0240 SPA0241   ldcC FALSE 0.463 76.000 0.118 1.000   NA
 903132 903133 SPA0241 SPA0242 ldcC yaeR TRUE 0.739 56.000 0.039 NA Y NA
 903133 903134 SPA0242 SPA0243 yaeR mesJ FALSE 0.043 63.000 0.015 NA N NA
 903135 903136 SPA0244 SPA0245 rof yaeP TRUE 0.943 -7.000 0.179 NA   NA
 903137 903138 SPA0246 SPA0247 yaeQ yaeJ TRUE 0.870 -3.000 0.034 1.000   NA
 903138 903139 SPA0247 SPA0248 yaeJ cutF FALSE 0.390 32.000 0.027 NA   NA
 903140 903141 SPA0249 SPA0250 proS yaeB FALSE 0.201 111.000 0.048 NA   NA
 903141 903142 SPA0250 SPA0251 yaeB rcsF TRUE 0.973 -3.000 0.247 NA   NA
 903142 903143 SPA0251 SPA0252 rcsF yaeC TRUE 0.698 119.000 0.500 NA   NA
 903143 903144 SPA0252 SPA0253 yaeC yaeE TRUE 0.975 39.000 0.411 0.066 Y NA
 903144 903145 SPA0253 SPA0254 yaeE abc TRUE 0.996 8.000 0.584 1.000 Y NA
 903146 903147 SPA0255 SPA0256 yaeD rrsH FALSE 0.008 372.000 0.000 NA   NA
 903147 903148 SPA0256 SPA0257 rrsH ileV FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 903148 903149 SPA0257 SPA0258 ileV alaV FALSE 0.203 113.000 0.000 NA   NA
 903149 903150 SPA0258 SPA0259 alaV rrlH FALSE 0.061 187.000 0.000 NA   NA
 903150 903151 SPA0259 SPA0261 rrlH rrfH FALSE 0.224 95.000 0.000 NA   NA
 903151 903152 SPA0261 SPA0262 rrfH   FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 903152 903153 SPA0262 SPA0263   kgtP FALSE 0.218 104.000 0.051 NA   NA
 903154 903155 SPA0264 SPA0265 yfiM pssA TRUE 0.524 45.000 0.089 NA   NA
 903155 903156 SPA0265 SPA0266 pssA yfiQ TRUE 0.520 115.000 0.121 0.062 N NA
 903156 903157 SPA0266 SPA0267 yfiQ yfiP TRUE 0.688 54.000 0.222 NA   NA
 903157 903158 SPA0267 SPA0268 yfiP yfiG FALSE 0.371 73.000 0.084 NA   NA
 10702261 903159 SPA0269 SPA0270   yfiF TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   NA
 903167 903168 SPA0278 SPA0279 rpoE rseA TRUE 0.916 32.000 0.705 NA N NA
 903168 903169 SPA0279 SPA0280 rseA rseB TRUE 0.998 0.000 0.856 NA Y NA
 903169 903170 SPA0280 SPA0281 rseB rseC TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 903170 903171 SPA0281 SPA0282 rseC lepA FALSE 0.009 252.000 0.045 NA N NA
 903171 903172 SPA0282 SPA0283 lepA lepB TRUE 0.896 17.000 0.187 1.000   NA
 903172 903173 SPA0283 SPA0284 lepB rnc FALSE 0.042 274.000 0.117 1.000   NA
 903173 903174 SPA0284 SPA0285 rnc era TRUE 0.979 -3.000 0.127 0.060   NA
 903174 903175 SPA0285 SPA0286 era recO TRUE 0.906 12.000 0.109 1.000   NA
 903175 903176 SPA0286 SPA0287 recO pdxJ TRUE 0.906 12.000 0.166 1.000 N NA
 903176 903177 SPA0287 SPA0288 pdxJ acpS TRUE 0.979 0.000 0.326 1.000 N NA
 903178 903179 SPA0289 SPA0290 yfhL   FALSE 0.468 38.000 0.000 1.000   NA
 903180 903181 SPA0291 SPA0292     FALSE 0.463 22.000 0.000 1.000 N NA
 903183 903184 SPA0294 SPA0295     TRUE 0.929 11.000 0.125 1.000   NA
 903184 10702262 SPA0295 SPA0296     TRUE 0.885 4.000 0.000 NA   NA
 10702262 903185 SPA0296 SPA0297   yfhC TRUE 0.561 25.000 0.000 NA   NA
 903186 903187 SPA0298 SPA0299 yfhD   TRUE 0.829 1.000 0.013 NA   NA
 903188 903189 SPA0300 SPA0301 purL   FALSE 0.007 407.000 0.000 NA   NA
 903189 903190 SPA0301 SPA0302   yfhK FALSE 0.149 140.000 0.000 NA   NA
 903190 903191 SPA0302 SPA0303 yfhK yfhG TRUE 0.895 2.000 0.000 NA   NA
 903191 903192 SPA0303 SPA0304 yfhG yfhA TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903192 903193 SPA0304 SPA0305 yfhA glnB FALSE 0.414 77.000 0.146 1.000 N NA
 903194 903195 SPA0306 SPA0307 yjdL cadA TRUE 0.932 56.000 0.400 1.000 Y NA
 903195 903196 SPA0307 SPA0308 cadA cadB TRUE 0.689 83.000 0.000 1.000 Y NA
 903196 10702263 SPA0308 SPA0309 cadB   FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 10702263 903197 SPA0309 SPA0310   hmpA FALSE 0.067 182.000 0.000 NA   NA
 903198 903199 SPA0311 SPA0312 glyA hcaT FALSE 0.053 196.000 0.044 1.000   NA
 903201 903202 SPA0314 SPA0315     TRUE 0.925 -9.000 0.150 NA   NA
 903203 903204 SPA0316 SPA0317 asrC asrB TRUE 0.998 11.000 0.636 0.035 Y NA
 903204 903205 SPA0317 SPA0318 asrB asrA TRUE 0.991 4.000 0.318 0.035   NA
 903205 903206 SPA0318 SPA0319 asrA   FALSE 0.076 182.000 0.000 1.000   NA
 903206 903207 SPA0319 SPA0320   suhB FALSE 0.089 145.000 0.003 1.000   NA
 903208 903209 SPA0321 SPA0322   yfhP FALSE 0.124 178.000 0.126 1.000 N NA
 903209 903210 SPA0322 SPA0323 yfhP nifS FALSE 0.334 181.000 0.424 1.000 N NA
 903210 903211 SPA0323 SPA0324 nifS nifU TRUE 0.888 28.000 0.448 1.000 N NA
 903211 903212 SPA0324 SPA0325 nifU yfhF TRUE 0.958 29.000 0.359 0.002   NA
 903212 903213 SPA0325 SPA0326 yfhF yfhE FALSE 0.357 197.000 0.500 1.000   NA
 903213 903214 SPA0326 SPA0327 yfhE hscA TRUE 0.994 13.000 0.634 1.000 Y NA
 903214 903215 SPA0327 SPA0328 hscA fdx TRUE 0.991 2.000 0.794 1.000 N NA
 903215 903216 SPA0328 SPA0329 fdx yfhJ TRUE 0.982 12.000 0.625 1.000   NA
 903216 903217 SPA0329 SPA0330 yfhJ yfhI TRUE 0.642 54.000 0.171 1.000   NA
 903217 903218 SPA0330 SPA0331 yfhI sseB TRUE 0.581 101.000 0.253 NA   NA
 903219 903220 SPA0332 SPA0333     FALSE 0.018 271.000 0.000 NA   NA
 903220 903221 SPA0333 SPA0334   sseA FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 903222 903223 SPA0335 SPA0336   pbpC TRUE 0.993 1.000 0.711 1.000   NA
 903223 10702264 SPA0336 SPA0337 pbpC   FALSE 0.167 130.000 0.000 NA   NA
 10702264 903224 SPA0337 SPA0338     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903224 903225 SPA0338 SPA0339     TRUE 0.986 -7.000 0.667 1.000   NA
 903225 903226 SPA0339 SPA0340     TRUE 0.966 0.000 0.154 1.000   NA
 903226 903227 SPA0340 SPA0341   ndk FALSE 0.032 121.000 0.002 1.000 N NA
 903227 903228 SPA0341 SPA0342 ndk yfgB FALSE 0.123 207.000 0.156 1.000   NA
 903228 903229 SPA0342 SPA0343 yfgB yfgA FALSE 0.011 292.000 0.020 1.000   NA
 903229 903230 SPA0343 SPA0344 yfgA gcpE TRUE 0.849 27.000 0.233 1.000   NA
 903230 903231 SPA0344 SPA0345 gcpE hisS FALSE 0.446 111.000 0.207 1.000 N NA
 903231 903232 SPA0345 SPA0346 hisS yfgM TRUE 0.944 14.000 0.259 1.000   NA
 903232 903233 SPA0346 SPA0347 yfgM yfgL TRUE 0.980 11.000 0.492 1.000   NA
 903233 903234 SPA0347 SPA0348 yfgL engA TRUE 0.501 117.000 0.203 1.000   NA
 903234 903235 SPA0348 SPA0349 engA yfgJ FALSE 0.138 89.000 0.009 NA   NA
 903235 10702265 SPA0349 SPA0350 yfgJ   FALSE 0.009 346.000 0.000 NA   NA
 10702265 903236 SPA0350 SPA0351   sinI FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 903236 903237 SPA0351 SPA0352 sinI ratA TRUE 0.527 120.000 0.250 NA   NA
 903237 10702266 SPA0352 SPA0353 ratA   FALSE 0.271 70.000 0.000 NA   NA
 903239 903240 SPA0356 SPA0357 guaB guaA TRUE 0.942 70.000 0.190 0.001 Y NA
 903240 903241 SPA0357 SPA0358 guaA   FALSE 0.234 88.000 0.000 NA   NA
 10702267 903242 SPA0359 SPA0360     FALSE 0.030 229.000 0.000 NA   NA
 903242 903243 SPA0360 SPA0361     TRUE 0.929 16.000 0.273 NA   NA
 903244 903245 SPA0362 SPA0363     FALSE 0.267 71.000 0.000 NA   NA
 903245 903246 SPA0363 SPA0364     FALSE 0.222 97.000 0.000 NA   NA
 903247 903248 SPA0365 SPA0366 ppx ppk TRUE 0.996 5.000 0.486 NA Y NA
 903248 903249 SPA0366 SPA0367 ppk purN FALSE 0.013 189.000 0.017 1.000 N NA
 903249 903250 SPA0367 SPA0368 purN purM TRUE 0.998 0.000 0.230 0.002 Y NA
 903251 903252 SPA0369 SPA0370 upp uraA TRUE 0.751 88.000 0.101 1.000 Y NA
 903252 903253 SPA0370 SPA0371 uraA yfgE FALSE 0.158 71.000 0.048 1.000 N NA
 903254 903255 SPA0372 SPA0373 yfgD   TRUE 0.795 40.000 0.259 1.000   NA
 10702268 903256 SPA0374 SPA0375     FALSE 0.010 340.000 0.000 NA   NA
 903256 903257 SPA0375 SPA0376     TRUE 0.615 68.000 0.290 NA N NA
 903257 903258 SPA0376 SPA0377     TRUE 0.993 6.000 0.295 1.000 Y NA
 903259 903260 SPA0378 SPA0379 bcp gcvR TRUE 0.927 0.000 0.102 1.000 N NA
 903261 903262 SPA0380 SPA0381 dapA nlpB TRUE 0.978 17.000 0.267 1.000 Y NA
 903262 903263 SPA0381 SPA0382 nlpB purC FALSE 0.019 175.000 0.019 1.000 N NA
 903263 903264 SPA0382 SPA0383 purC   FALSE 0.111 131.000 0.006 1.000   NA
 903264 903265 SPA0383 SPA0384   ypfI TRUE 0.671 16.000 0.029 1.000   NA
 903266 903267 SPA0385 SPA0386   dapE FALSE 0.415 28.000 0.025 NA   NA
 903267 903268 SPA0386 SPA0387 dapE yffB TRUE 0.972 4.000 0.292 1.000 N NA
 903268 903269 SPA0387 SPA0388 yffB acrD FALSE 0.003 574.000 0.000 1.000 N NA
 903269 10702269 SPA0388 SPA0389 acrD   FALSE 0.065 185.000 0.000 NA   NA
 903272 903273 SPA0392 SPA0393 yffH ypfG TRUE 0.583 125.000 0.333 NA   NA
 903273 903274 SPA0393 SPA0394 ypfG   FALSE 0.171 128.000 0.000 NA   NA
 903275 903276 SPA0395 SPA0396 tktB talA TRUE 0.989 20.000 0.739 1.000 Y NA
 903277 903278 SPA0397 SPA0398 maeB eutS FALSE 0.006 418.000 0.070 1.000 N NA
 903278 903279 SPA0398 SPA0399 eutS eutP TRUE 0.950 13.000 0.009 1.000 Y NA
 903279 903280 SPA0399 SPA0400 eutP eutQ TRUE 0.935 -22.000 0.009 NA Y NA
 903280 903281 SPA0400 SPA0401 eutQ eutT TRUE 0.992 -3.000 0.214 NA Y NA
 903281 903282 SPA0401 SPA0402 eutT eutD TRUE 0.799 -3.000 0.048 1.000 N NA
 903282 903283 SPA0402 SPA0403 eutD eutN TRUE 0.905 41.000 0.182 NA Y NA
 903283 903284 SPA0403 SPA0404 eutN eutM TRUE 0.877 53.000 0.182 NA Y NA
 903284 903285 SPA0404 SPA0405 eutM eutE TRUE 0.964 12.000 0.000 NA Y NA
 903285 903286 SPA0405 SPA0406 eutE eutJ TRUE 0.736 11.000 0.000 1.000 N NA
 903286 903287 SPA0406 SPA0407 eutJ eutG TRUE 0.699 -10.000 0.000 1.000 N NA
 903287 903288 SPA0407 SPA0408 eutG eutH FALSE 0.436 120.000 0.222 1.000 N NA
 903288 903289 SPA0408 SPA0409 eutH eutA TRUE 0.980 -3.000 0.000 NA Y NA
 903289 903290 SPA0409 SPA0410 eutA eutB TRUE 0.964 12.000 0.000 NA Y NA
 903290 903291 SPA0410 SPA0411 eutB eutC TRUE 0.975 19.000 0.000 0.001 Y NA
 903291 903292 SPA0411 SPA0412 eutC eutL TRUE 0.973 10.000 0.043 1.000 Y NA
 903292 903293 SPA0412 SPA0413 eutL eutK TRUE 0.617 13.000 0.000 NA N NA
 903293 903294 SPA0413 SPA0414 eutK yfeG FALSE 0.208 48.000 0.000 NA N NA
 903295 903296 SPA0415 SPA0416 hemF amiA TRUE 0.691 3.000 0.025 1.000 N NA
 903297 903298 SPA0417 SPA0418   yfeZ TRUE 0.808 -13.000 0.059 NA   NA
 903298 903299 SPA0418 SPA0419 yfeZ   TRUE 0.624 62.000 0.204 NA   NA
 903299 903300 SPA0419 SPA0420     TRUE 0.653 95.000 0.333 NA   NA
 903300 903301 SPA0420 SPA0421   yfeF FALSE 0.012 238.000 0.000 NA N NA
 903301 903302 SPA0421 SPA0422 yfeF cysP FALSE 0.060 158.000 0.000 1.000 N NA
 903302 903303 SPA0422 SPA0423 cysP cysU TRUE 0.995 0.000 0.479 0.002 N NA
 903303 903304 SPA0423 SPA0424 cysU cysW TRUE 0.996 0.000 0.583 0.001 N NA
 903304 903305 SPA0424 SPA0425 cysW cysA TRUE 0.983 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 903305 903306 SPA0425 SPA0426 cysA cysM FALSE 0.107 121.000 0.049 1.000 N NA
 903307 903308 SPA0427 SPA0428 yfeK yfeJ FALSE 0.312 59.000 0.000 NA   NA
 903308 903309 SPA0428 SPA0429 yfeJ ptsJ TRUE 0.666 15.000 0.059 1.000 N NA
 903310 903311 SPA0430 SPA0431 pdxK   TRUE 0.959 -3.000 0.160 NA   NA
 903312 903313 SPA0432 SPA0433 crr ptsI TRUE 0.960 41.000 0.203 0.011 Y NA
 903313 903314 SPA0433 SPA0434 ptsI ptsH TRUE 0.949 49.000 0.187 0.011 Y NA
 903314 903315 SPA0434 SPA0435 ptsH cysK FALSE 0.002 384.000 0.019 1.000 N NA
 903315 903316 SPA0435 SPA0436 cysK cysZ FALSE 0.120 312.000 0.122 1.000 Y NA
 903317 903318 SPA0437 SPA0438 zipA ligA FALSE 0.345 72.000 0.106 1.000 N NA
 903318 903319 SPA0438 SPA0439 ligA ypeB TRUE 0.742 -7.000 0.017 NA   NA
 903322 903323 SPA0442 SPA0443 lysV valY TRUE 0.866 8.000 0.000 NA   NA
 903323 903324 SPA0443 SPA0444 valY valX FALSE 0.383 45.000 0.000 NA   NA
 903324 903325 SPA0444 SPA0445 valX valU FALSE 0.361 49.000 0.000 NA   NA
 903327 903328 SPA0447 SPA0448 yfeD yfeC TRUE 0.992 2.000 0.250 0.006   NA
 903329 903330 SPA0449 SPA0450 alaX yfeA FALSE 0.053 194.000 0.000 NA   NA
 903332 903333 SPA0453 SPA0454 ypeC   TRUE 0.509 114.000 0.214 NA   NA
 903336 903337 SPA0457 SPA0458 glk yfdZ FALSE 0.002 723.000 0.000 1.000 N NA
 903341 10702271 SPA0462 SPA0463 pgtC   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 10702271 903342 SPA0463 SPA0464   pgtA TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 903342 903343 SPA0464 SPA0465 pgtA pgtE FALSE 0.011 268.000 0.000 1.000 N NA
 903343 10702272 SPA0465 SPA0466 pgtE   FALSE 0.004 864.000 0.000 NA   NA
 903344 903345 SPA0467 SPA0468   gtrB2 TRUE 0.690 17.000 0.000 NA   NA
 903345 903346 SPA0468 SPA0469 gtrB2 gtrA TRUE 0.727 -31.000 0.000 NA   NA
 903346 903347 SPA0469 SPA0470 gtrA   FALSE 0.003 1096.000 0.000 NA   NA
 903347 903348 SPA0470 SPA0471   yfdC FALSE 0.257 76.000 0.000 NA   NA
 903351 903352 SPA0474 SPA0475 yfcZ yfcY FALSE 0.089 177.000 0.061 NA   NA
 903352 903353 SPA0475 SPA0476 yfcY yfcX TRUE 0.996 0.000 0.430 1.000 Y NA
 903353 903354 SPA0476 SPA0477 yfcX sixA FALSE 0.023 209.000 0.000 1.000 N NA
 903356 903357 SPA0479 SPA0480 yfcB aroC FALSE 0.465 36.000 0.081 1.000 N NA
 903357 903358 SPA0480 SPA0481 aroC mepA TRUE 0.677 4.000 0.025 1.000 N NA
 903358 903359 SPA0481 SPA0482 mepA yfcA TRUE 0.967 0.000 0.160 1.000   NA
 903359 903360 SPA0482 SPA0483 yfcA yfcM TRUE 0.963 0.000 0.153 NA   NA
 903360 903361 SPA0483 SPA0484 yfcM yfcL TRUE 0.884 33.000 0.425 NA   NA
 903363 903364 SPA0486 SPA0487 fabB   FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 903365 903366 SPA0488 SPA0489     TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 903366 903367 SPA0489 SPA0490     FALSE 0.083 169.000 0.000 NA   NA
 903368 903369 SPA0491 SPA0492     FALSE 0.079 180.000 0.000 1.000   NA
 903371 903372 SPA0494 SPA0495 pdxB usg TRUE 0.895 68.000 0.097 0.011 Y NA
 903372 903373 SPA0495 SPA0496 usg truA TRUE 0.789 0.000 0.040 1.000 N NA
 903373 903374 SPA0496 SPA0497 truA dedA FALSE 0.308 49.000 0.038 NA   NA
 903374 903375 SPA0497 SPA0498 dedA accD FALSE 0.079 150.000 0.020 NA   NA
 903375 903376 SPA0498 SPA0499 accD folC TRUE 0.705 68.000 0.383 1.000 N NA
 903376 903377 SPA0499 SPA0500 folC dedD TRUE 0.944 -10.000 0.216 NA   NA
 903377 903378 SPA0500 SPA0501 dedD cvpA FALSE 0.027 311.000 0.116 NA   NA
 903378 903379 SPA0501 SPA0502 cvpA purF TRUE 0.806 38.000 0.262 1.000   NA
 903381 903382 SPA0504 SPA0505     TRUE 0.739 91.000 0.095 1.000 Y NA
 903382 903383 SPA0505 SPA0506     TRUE 0.997 2.000 0.500 1.000 Y NA
 903383 903384 SPA0506 SPA0507     TRUE 0.935 64.000 0.500 1.000 Y NA
 903384 903385 SPA0507 SPA0508   ubiX FALSE 0.397 27.000 0.000 1.000 N NA
 903385 903386 SPA0508 SPA0509 ubiX argT FALSE 0.009 289.000 0.000 1.000 N NA
 903386 903387 SPA0509 SPA0510 argT hisJ FALSE 0.286 238.000 0.000 0.017 Y NA
 903387 903388 SPA0510 SPA0511 hisJ hisQ TRUE 0.880 183.000 0.833 0.064 Y NA
 903388 903389 SPA0511 SPA0512 hisQ hisM TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.018 Y NA
 903389 903390 SPA0512 SPA0513 hisM hisP TRUE 0.993 14.000 0.643 1.000 Y NA
 903391 903392 SPA0514 SPA0515 yfcH yfcG FALSE 0.175 126.000 0.000 NA   NA
 903393 903394 SPA0516 SPA0517 yfcF yfcE TRUE 0.472 56.000 0.092 NA   NA
 903394 903395 SPA0517 SPA0518 yfcE   TRUE 0.789 57.000 0.143 0.013   NA
 903397 903398 SPA0520 SPA0521     TRUE 0.888 81.000 0.117 0.011 Y NA
 903398 903399 SPA0521 SPA0522   ulaA TRUE 0.919 15.000 0.052 0.016   NA
 903399 903400 SPA0522 SPA0523 ulaA   TRUE 0.963 -3.000 0.167 1.000   NA
 903400 903401 SPA0523 SPA0524     TRUE 0.999 -7.000 0.742 0.001 Y NA
 903402 903403 SPA0525 SPA0526 yfcC pta FALSE 0.039 218.000 0.000 1.000   NA
 903403 903404 SPA0526 SPA0527 pta ackA TRUE 0.825 77.000 0.634 1.000   NA
 903405 903406 SPA0528 SPA0529   yfbU TRUE 0.581 83.000 0.221 NA   NA
 903406 10154377 SPA0529 SPA0530 yfbU yfbT TRUE 0.973 11.000 0.375 NA   NA
 10154377 903408 SPA0530 SPA0531 yfbT yfbS TRUE 0.688 76.000 0.308 1.000   NA
 903409 903410 SPA0532 SPA0533   yfbQ FALSE 0.391 94.000 0.104 1.000   NA
 903411 903412 SPA0534 SPA0535 lrhA   FALSE 0.249 80.000 0.000 NA   NA
 903412 903413 SPA0535 SPA0536   nuoA FALSE 0.007 395.000 0.000 NA   NA
 903413 903414 SPA0536 SPA0537 nuoA nuoB TRUE 0.994 16.000 0.377 0.003 Y NA
 903414 903415 SPA0537 SPA0538 nuoB nuoC TRUE 0.974 87.000 0.691 0.003 Y NA
 903415 903416 SPA0538 SPA0539 nuoC nuoE TRUE 0.998 3.000 0.407 0.006 Y NA
 903416 903417 SPA0539 SPA0540 nuoE nuoF TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.006 Y NA
 903417 903418 SPA0540 SPA0541 nuoF nuoG TRUE 0.978 25.000 0.180 0.006 Y NA
 903418 903419 SPA0541 SPA0542 nuoG nuoH TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.006 Y NA
 903419 903420 SPA0542 SPA0543 nuoH nuoI TRUE 0.995 15.000 0.423 0.006 Y NA
 903420 903421 SPA0543 SPA0544 nuoI nuoJ TRUE 0.997 11.000 0.428 0.006 Y NA
 903421 903422 SPA0544 SPA0545 nuoJ nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 903422 903423 SPA0545 SPA0546 nuoK nuoL TRUE 0.997 -3.000 0.211 0.006 Y NA
 903423 903424 SPA0546 SPA0547 nuoL nuoM TRUE 0.745 252.000 0.713 0.002 Y NA
 903424 903425 SPA0547 SPA0548 nuoM nuoN TRUE 0.998 7.000 0.437 0.002 Y NA
 903426 903427 SPA0549 SPA0550   elaC FALSE 0.444 66.000 0.091 1.000   NA
 903428 903429 SPA0551 SPA0552 elaA elaB FALSE 0.461 49.000 0.077 NA   NA
 903429 903430 SPA0552 SPA0553 elaB menF FALSE 0.196 101.000 0.043 NA   NA
 903430 903431 SPA0553 SPA0554 menF menD TRUE 0.867 86.000 0.281 1.000 Y NA
 903431 903432 SPA0554 SPA0555 menD yfbB TRUE 0.982 -3.000 0.355 NA   NA
 903432 903433 SPA0555 SPA0556 yfbB menB TRUE 0.938 15.000 0.280 NA   NA
 903433 903434 SPA0556 SPA0557 menB menC TRUE 0.997 0.000 0.171 0.002 Y NA
 903434 903435 SPA0557 SPA0558 menC menE TRUE 0.991 -3.000 0.283 0.002 N NA
 903435 903436 SPA0558 SPA0559 menE pmrD FALSE 0.127 98.000 0.005 NA   NA
 903437 903438 SPA0560 SPA0561     TRUE 0.991 0.000 0.613 NA   NA
 903438 903439 SPA0561 SPA0562   pqaB TRUE 0.939 -3.000 0.091 1.000   NA
 903439 903440 SPA0562 SPA0563 pqaB   TRUE 0.713 -3.000 0.031 1.000 N NA
 903440 903441 SPA0563 SPA0564   yfbG TRUE 0.996 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 903441 903442 SPA0564 SPA0565 yfbG pmrF TRUE 0.992 -3.000 0.220 NA Y NA
 903442 903443 SPA0565 SPA0566 pmrF yfbE TRUE 0.995 3.000 0.378 NA Y NA
 903446 903447 SPA0569 SPA0570 yfaZ   FALSE 0.136 115.000 0.005 1.000   NA
 903447 903448 SPA0570 SPA0571   yfaX FALSE 0.026 250.000 0.000 1.000   NA
 903448 903449 SPA0571 SPA0572 yfaX yfaW TRUE 0.913 2.000 0.090 1.000 N NA
 903449 903450 SPA0572 SPA0573 yfaW yfaV FALSE 0.262 56.000 0.060 1.000 N NA
 903450 903451 SPA0573 SPA0574 yfaV   TRUE 0.823 26.000 0.250 1.000 N NA
 903451 903452 SPA0574 SPA0575     TRUE 0.982 6.000 0.400 NA   NA
 903453 903454 SPA0576 SPA0577     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 903454 903455 SPA0577 SPA0578   glpC FALSE 0.013 302.000 0.000 NA   NA
 903455 903456 SPA0578 SPA0579 glpC glpB TRUE 0.993 -3.000 0.547 0.059 N NA
 903456 903457 SPA0579 SPA0580 glpB glpA TRUE 0.992 -10.000 0.650 0.001 N NA
 903458 903459 SPA0581 SPA0582 glpT glpQ TRUE 0.979 5.000 0.396 1.000 N NA
 903462 903463 SPA0585 SPA0586 yfaE nrdB TRUE 0.837 0.000 0.000 1.000 N NA
 903463 903464 SPA0586 SPA0587 nrdB nrdA TRUE 0.845 113.000 0.000 0.001 Y NA
 903464 903465 SPA0587 SPA0588 nrdA ubiG FALSE 0.005 356.000 0.000 1.000 N NA
 903465 903466 SPA0588 SPA0589 ubiG   FALSE 0.048 83.000 0.004 1.000 N NA
 903467 903468 SPA0590 SPA0591     TRUE 0.970 15.000 0.667 1.000 N NA
 903468 903469 SPA0591 SPA0592   gyrA FALSE 0.004 410.000 0.000 1.000 N NA
 903469 903470 SPA0592 SPA0593 gyrA rcsC FALSE 0.260 118.000 0.013 0.097 N NA
 903471 903472 SPA0594 SPA0595 rcsB yojN TRUE 0.989 17.000 0.558 1.000 Y NA
 903472 903473 SPA0595 SPA0596 yojN   FALSE 0.013 304.000 0.000 NA   NA
 903474 903475 SPA0597 SPA0598 ompC yojL FALSE 0.167 115.000 0.066 1.000 N NA
 903475 903476 SPA0598 SPA0599 yojL ada FALSE 0.158 81.000 0.000 1.000 N NA
 903476 903477 SPA0599 SPA0600 ada alkB TRUE 0.788 3.000 0.000 NA N NA
 903477 903478 SPA0600 SPA0601 alkB yojI FALSE 0.225 76.000 0.076 NA N NA
 903480 903481 SPA0603 SPA0604 napF yojF TRUE 0.942 -10.000 0.209 NA   NA
 903481 903482 SPA0604 SPA0605 yojF napA TRUE 0.991 -3.000 0.875 NA N NA
 903482 903483 SPA0605 SPA0606 napA napG TRUE 0.989 7.000 0.243 0.005   NA
 903483 903484 SPA0606 SPA0607 napG napH TRUE 0.992 -13.000 0.795 0.020   NA
 903484 903485 SPA0607 SPA0608 napH napB TRUE 0.926 116.000 0.316 0.009 Y NA
 903485 903486 SPA0608 SPA0609 napB napC TRUE 0.998 10.000 0.490 0.005 Y NA
 903486 903487 SPA0609 SPA0610 napC ccmA FALSE 0.416 21.000 0.043 1.000 N NA
 903487 903488 SPA0610 SPA0611 ccmA ccmB TRUE 0.999 0.000 0.503 0.005 Y NA
 903488 903489 SPA0611 SPA0612 ccmB ccmC TRUE 0.980 52.000 0.501 0.002 Y NA
 903489 903490 SPA0612 SPA0613 ccmC ccmD TRUE 0.985 -3.000 0.501 1.000 N NA
 903490 903491 SPA0613 SPA0614 ccmD ccmE TRUE 0.977 -3.000 0.344 1.000 N NA
 903491 903492 SPA0614 SPA0615 ccmE ccmF TRUE 0.997 -3.000 0.211 0.005 Y NA
 903492 903493 SPA0615 SPA0616 ccmF dsbE TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.005 Y NA
 903493 903494 SPA0616 SPA0617 dsbE ccmH TRUE 0.997 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 903497 903498 SPA0620 SPA0621     FALSE 0.383 45.000 0.000 NA   NA
 903498 903499 SPA0621 SPA0622   yejM FALSE 0.261 74.000 0.000 NA   NA
 903499 903500 SPA0622 SPA0623 yejM yejL FALSE 0.436 32.000 0.040 NA   NA
 903501 903502 SPA0624 SPA0625 yejK   TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 903503 903504 SPA0626 SPA0627 rplY yejH FALSE 0.327 125.000 0.024 0.015 N NA
 903505 903506 SPA0628 SPA0629 yejD bcr TRUE 0.743 28.000 0.182 1.000 N NA
 903506 903507 SPA0629 SPA0630 bcr   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903507 903508 SPA0630 SPA0631   yejG FALSE 0.014 296.000 0.000 NA   NA
 903509 903510 SPA0632 SPA0633 yejF yejE TRUE 0.993 2.000 0.758 1.000   NA
 903510 903511 SPA0633 SPA0634 yejE yejB TRUE 0.997 0.000 0.833 0.063   NA
 903511 903512 SPA0634 SPA0635 yejB yejA TRUE 0.995 10.000 0.848 0.063   NA
 903512 903513 SPA0635 SPA0636 yejA rtn TRUE 0.618 107.000 0.394 NA N NA
 903513 903514 SPA0636 SPA0637 rtn spr FALSE 0.033 326.000 0.219 NA N NA
 903514 903515 SPA0637 SPA0638 spr yeiU FALSE 0.007 414.000 0.000 NA   NA
 903515 903516 SPA0638 SPA0639 yeiU yeiR TRUE 0.812 36.000 0.275 NA   NA
 903516 903517 SPA0639 SPA0640 yeiR yeiP FALSE 0.062 212.000 0.085 NA   NA
 903517 903518 SPA0640 SPA0641 yeiP   FALSE 0.121 135.000 0.034 NA   NA
 903519 903520 SPA0642 SPA0643     TRUE 0.895 2.000 0.000 NA   NA
 903522 903523 SPA0645 SPA0646 fruB fruK TRUE 0.989 0.000 0.112 1.000 Y NA
 903523 903524 SPA0646 SPA0647 fruK fruA TRUE 0.989 17.000 0.562 1.000 Y NA
 903525 903526 SPA0648 SPA0649 nfo yeiH FALSE 0.215 79.000 0.040 NA   NA
 903527 903528 SPA0650 SPA0651 yeiE lysP FALSE 0.033 190.000 0.000 1.000 N NA
 903528 903529 SPA0651 SPA0652 lysP cirA FALSE 0.005 345.000 0.000 1.000 N NA
 903530 903531 SPA0653 SPA0654     FALSE 0.341 33.000 0.000 1.000 N NA
 10702273 903532 SPA0655 SPA0656     TRUE 0.879 5.000 0.000 NA   NA
 903534 903535 SPA0658 SPA0659 folE yeiB TRUE 0.977 15.000 0.719 NA   NA
 903535 903536 SPA0659 SPA0660 yeiB galS TRUE 0.578 150.000 0.500 NA   NA
 903536 903537 SPA0660 SPA0661 galS mglB FALSE 0.002 499.000 0.000 NA N NA
 903537 10702274 SPA0661 SPA0662 mglB   FALSE 0.159 134.000 0.000 NA   NA
 10702274 903538 SPA0662 SPA0663   mglC TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 903539 903540 SPA0664 SPA0665 yeiA   TRUE 0.945 -6.000 0.062 0.020 N NA
 903540 903541 SPA0665 SPA0666     FALSE 0.034 205.000 0.036 NA   NA
 903541 903542 SPA0666 SPA0667   sanA TRUE 0.823 -3.000 0.019 NA   NA
 903542 903543 SPA0667 SPA0668 sanA cdd FALSE 0.067 177.000 0.045 NA   NA
 903543 903544 SPA0668 SPA0669 cdd yohK FALSE 0.248 154.000 0.198 NA N NA
 903544 903545 SPA0669 SPA0670 yohK yohJ TRUE 0.981 -3.000 0.340 NA   NA
 903545 903546 SPA0670 SPA0671 yohJ   FALSE 0.141 132.000 0.031 1.000   NA
 903547 903548 SPA0672 SPA0673     TRUE 0.976 12.000 0.600 1.000 N NA
 903548 903549 SPA0673 SPA0674     TRUE 0.944 16.000 0.000 1.000 Y NA
 903549 903550 SPA0674 SPA0675     TRUE 0.779 9.000 0.000 1.000 N NA
 903550 903551 SPA0675 SPA0676     TRUE 0.828 15.000 0.120 1.000 N NA
 903551 903552 SPA0676 SPA0677   yohI FALSE 0.050 109.000 0.013 1.000 N NA
 903554 903555 SPA0679 SPA0680 yohG yohF FALSE 0.186 66.000 0.000 1.000 N NA
 903557 903558 SPA0682 SPA0683 yohC pbpG FALSE 0.206 166.000 0.145 NA   NA
 903560 903561 SPA0685 SPA0686 bglX yehZ FALSE 0.092 181.000 0.099 1.000 N NA
 903561 903562 SPA0686 SPA0687 yehZ yehY TRUE 0.935 4.000 0.028 0.063 N NA
 903562 903563 SPA0687 SPA0688 yehY yehX TRUE 0.968 -7.000 0.039 1.000 Y NA
 903563 903564 SPA0688 SPA0689 yehX yehW TRUE 0.992 -16.000 0.542 1.000 Y NA
 903565 903566 SPA0690 SPA0691   yehV TRUE 0.860 60.000 0.667 NA   NA
 903567 903568 SPA0692 SPA0693 yehU yehT TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.017 Y NA
 903568 903569 SPA0693 SPA0694 yehT yehS FALSE 0.370 47.000 0.051 NA   NA
 903570 903571 SPA0695 SPA0696   yehR FALSE 0.080 172.000 0.000 NA   NA
 903571 903572 SPA0696 SPA0697 yehR metG FALSE 0.025 241.000 0.000 NA   NA
 903573 903574 SPA0698 SPA0699 mrp yehE FALSE 0.017 278.000 0.000 NA   NA
 903574 903575 SPA0699 SPA0700 yehE stcA FALSE 0.016 279.000 0.000 NA   NA
 903575 903576 SPA0700 SPA0701 stcA stcB TRUE 0.881 62.000 0.222 1.000 Y NA
 903576 903577 SPA0701 SPA0702 stcB stcC TRUE 0.986 29.000 1.000 1.000 Y NA
 903577 903578 SPA0702 SPA0703 stcC stcD TRUE 0.963 16.000 0.500 1.000   NA
 903580 903581 SPA0705 SPA0706 thiM thiD TRUE 0.983 -13.000 0.037 0.005 Y NA
 903581 903582 SPA0706 SPA0707 thiD yegW FALSE 0.304 36.000 0.049 1.000 N NA
 903583 903584 SPA0708 SPA0709 yegV yegU TRUE 0.986 -3.000 0.600 NA N NA
 903584 903585 SPA0709 SPA0710 yegU yegT TRUE 0.982 -3.000 0.364 NA   NA
 903588 903589 SPA0713 SPA0714     FALSE 0.182 122.000 0.000 NA   NA
 903590 903591 SPA0715 SPA0716   yegQ FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 903592 903593 SPA0717 SPA0718     FALSE 0.011 318.000 0.000 NA   NA
 903593 903594 SPA0718 SPA0719     FALSE 0.025 240.000 0.000 NA   NA
 903594 903595 SPA0719 SPA0720     FALSE 0.006 437.000 0.000 NA   NA
 903595 903596 SPA0720 SPA0721     TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 903596 903597 SPA0721 SPA0722     FALSE 0.167 130.000 0.000 NA   NA
 903597 903598 SPA0722 SPA0723     FALSE 0.267 71.000 0.000 NA   NA
 903598 903599 SPA0723 SPA0724     FALSE 0.035 218.000 0.000 NA   NA
 903599 903600 SPA0724 SPA0725     FALSE 0.275 69.000 0.000 NA   NA
 903600 903601 SPA0725 SPA0726     FALSE 0.212 110.000 0.000 NA   NA
 903601 903602 SPA0726 SPA0727     FALSE 0.280 68.000 0.000 NA   NA
 903602 903603 SPA0727 SPA0728     FALSE 0.220 101.000 0.000 NA   NA
 903603 903604 SPA0728 SPA0729     FALSE 0.219 103.000 0.000 NA   NA
 903605 903606 SPA0730 SPA0731     FALSE 0.420 40.000 0.000 NA   NA
 903606 903607 SPA0731 SPA0732     TRUE 0.973 11.000 0.375 NA   NA
 903607 903608 SPA0732 SPA0733     TRUE 0.968 22.000 1.000 NA   NA
 903608 903609 SPA0733 SPA0734   baeR FALSE 0.004 587.000 0.000 NA   NA
 903609 903610 SPA0734 SPA0735 baeR baeS TRUE 0.998 -3.000 0.591 0.017 Y NA
 903610 903611 SPA0735 SPA0736 baeS yegB TRUE 0.946 0.000 0.139 1.000 N NA
 903611 903612 SPA0736 SPA0737 yegB yegO TRUE 0.982 -3.000 0.438 1.000 N NA
 903612 903613 SPA0737 SPA0738 yegO yegN TRUE 0.982 1.000 0.000 NA Y NA
 903613 10702275 SPA0738 SPA0739 yegN   TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 10702275 903614 SPA0739 SPA0740     FALSE 0.139 144.000 0.000 NA   NA
 903614 903615 SPA0740 SPA0741   yegD FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 903618 903619 SPA0744 SPA0745 udk dcd TRUE 0.742 91.000 0.098 1.000 Y NA
 903619 903620 SPA0745 SPA0746 dcd asmA FALSE 0.293 39.000 0.057 NA N NA
 903622 903623 SPA0748 SPA0749 wza wzb TRUE 0.968 6.000 0.286 1.000 N NA
 903623 903624 SPA0749 SPA0750 wzb wzc TRUE 0.989 -3.000 0.667 1.000 N NA
 903624 903625 SPA0750 SPA0751 wzc wcaA TRUE 0.839 87.000 0.231 NA Y NA
 903625 903626 SPA0751 SPA0752 wcaA wcaB TRUE 0.968 3.000 0.259 NA N NA
 903626 903627 SPA0752 SPA0753 wcaB wcaC TRUE 0.968 -3.000 0.259 1.000 N NA
 903627 903628 SPA0753 SPA0754 wcaC wcaD TRUE 0.956 -25.000 0.400 NA   NA
 903628 903629 SPA0754 SPA0755 wcaD wcaE TRUE 0.959 13.000 0.333 NA   NA
 903629 903630 SPA0755 SPA0756 wcaE wcaF TRUE 0.790 16.000 0.077 NA   NA
 903630 903631 SPA0756 SPA0757 wcaF gmd TRUE 0.608 24.000 0.000 1.000   NA
 903631 903632 SPA0757 SPA0758 gmd fcl TRUE 0.993 3.000 0.000 0.009 Y NA
 903632 903633 SPA0758 SPA0759 fcl wcaH TRUE 0.964 3.000 0.217 1.000 N NA
 903633 903634 SPA0759 SPA0760 wcaH wcaI TRUE 0.921 -3.000 0.108 1.000 N NA
 903634 903635 SPA0760 SPA0761 wcaI manC TRUE 0.989 -3.000 0.123 1.000 Y NA
 903635 903636 SPA0761 SPA0762 manC manB TRUE 0.814 111.000 1.000 1.000 N NA
 903636 10702276 SPA0762 SPA0763 manB   FALSE 0.338 54.000 0.000 NA   NA
 10702276 903637 SPA0763 SPA0764   wzxC FALSE 0.219 102.000 0.000 NA   NA
 903637 10702277 SPA0764 SPA0765 wzxC   TRUE 0.601 22.000 0.000 NA   NA
 10702277 903638 SPA0765 SPA0766   wcaL TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903638 903639 SPA0766 SPA0767 wcaL wcaM TRUE 0.967 11.000 0.292 1.000   NA
 903639 10702278 SPA0767 SPA0768 wcaM   FALSE 0.361 49.000 0.000 NA   NA
 10702278 903640 SPA0768 SPA0769   rfbB FALSE 0.008 377.000 0.000 NA   NA
 903640 903641 SPA0769 SPA0770 rfbB rfbD TRUE 0.996 0.000 0.084 0.002 Y NA
 903641 903642 SPA0770 SPA0771 rfbD rfbA TRUE 0.916 48.000 0.053 0.003 Y NA
 903642 903643 SPA0771 SPA0772 rfbA rfbC TRUE 0.989 10.000 0.211 1.000 Y NA
 903643 903644 SPA0772 SPA0773 rfbC rfbI TRUE 0.798 6.000 0.000 1.000 N NA
 903644 903645 SPA0773 SPA0774 rfbI rfbF TRUE 0.493 16.000 0.038 1.000 N NA
 903645 903646 SPA0774 SPA0775 rfbF rfbG TRUE 0.997 5.000 0.624 1.000 Y NA
 903646 903647 SPA0775 SPA0776 rfbG rfbH TRUE 0.955 27.000 0.247 1.000 Y NA
 903647 903648 SPA0776 SPA0777 rfbH rfbS TRUE 0.909 36.000 0.018 0.028 Y NA
 903648 903649 SPA0777 SPA0778 rfbS rfbE TRUE 0.987 -19.000 0.111 0.004 Y NA
 903649 903650 SPA0778 SPA0779 rfbE rfbX TRUE 0.532 71.000 0.167 NA   NA
 903650 903651 SPA0779 SPA0780 rfbX rfbV TRUE 0.951 2.000 0.118 NA   NA
 903651 903652 SPA0780 SPA0781 rfbV rfbU FALSE 0.010 575.000 0.118 NA   NA
 903652 903653 SPA0781 SPA0782 rfbU rfbV TRUE 0.951 2.000 0.118 NA   NA
 903653 903654 SPA0782 SPA0783 rfbV rfbU FALSE 0.010 575.000 0.118 NA   NA
 903654 903655 SPA0783 SPA0784 rfbU rfbV TRUE 0.951 2.000 0.118 NA   NA
 903655 903656 SPA0784 SPA0785 rfbV rfbU FALSE 0.028 575.000 0.000 NA Y NA
 903656 903657 SPA0785 SPA0786 rfbU rfbN TRUE 0.979 1.000 0.023 NA Y NA
 903657 903658 SPA0786 SPA0787 rfbN rfbM TRUE 0.979 1.000 0.023 NA Y NA
 903658 903659 SPA0787 SPA0788 rfbM rfbK TRUE 0.672 -13.000 0.000 1.000 N NA
 903659 903660 SPA0788 SPA0789 rfbK rfbP FALSE 0.171 72.000 0.000 1.000 N NA
 903660 903661 SPA0789 SPA0790 rfbP gnd FALSE 0.015 164.000 0.005 1.000 N NA
 903661 903662 SPA0790 SPA0791 gnd ugd FALSE 0.015 237.000 0.000 1.000 N NA
 903662 903663 SPA0791 SPA0792 ugd cld TRUE 0.730 149.000 0.250 1.000 Y NA
 903664 903665 SPA0793 SPA0794 hisI hisF TRUE 0.998 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 903665 903666 SPA0794 SPA0795 hisF hisA TRUE 0.996 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 903666 903667 SPA0795 SPA0796 hisA hisH TRUE 0.997 0.000 0.210 0.003 Y NA
 903667 903668 SPA0796 SPA0797 hisH hisB TRUE 0.996 0.000 0.128 0.003 Y NA
 903668 903669 SPA0797 SPA0798 hisB hisC TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 903669 903670 SPA0798 SPA0799 hisC hisD TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 903670 903671 SPA0799 SPA0800 hisD hisG TRUE 0.909 103.000 0.171 0.003 Y NA
 903672 903673 SPA0801 SPA0802 yeeZ yeeY FALSE 0.112 46.000 0.015 1.000 N NA
 903673 903674 SPA0802 SPA0803 yeeY yeeF FALSE 0.009 280.000 0.000 1.000 N NA
 903675 10702279 SPA0804 SPA0805 sbcB   FALSE 0.008 367.000 0.000 NA   NA
 903676 903677 SPA0807 SPA0808 phsB phsC TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.058 Y NA
 903677 10702280 SPA0808 SPA0809 phsC   FALSE 0.179 124.000 0.000 NA   NA
 10702280 903678 SPA0809 SPA0810   sbmC FALSE 0.119 151.000 0.000 NA   NA
 903678 903679 SPA0810 SPA0811 sbmC yeeA FALSE 0.306 119.000 0.096 NA   NA
 903679 903680 SPA0811 SPA0812 yeeA yeeX FALSE 0.078 245.000 0.180 NA   NA
 903681 903682 SPA0813 SPA0814 pduX pduW TRUE 0.730 58.000 0.080 0.001 N NA
 903682 903683 SPA0814 SPA0815 pduW pduV TRUE 0.938 -15.000 0.292 1.000 N NA
 903683 903684 SPA0815 SPA0816 pduV   TRUE 0.991 5.000 0.200 1.000 Y NA
 903684 903685 SPA0816 SPA0817   pduT TRUE 0.939 0.000 0.133 NA N NA
 903685 903686 SPA0817 SPA0818 pduT pduS TRUE 0.997 3.000 0.714 NA Y NA
 903686 903687 SPA0818 SPA0819 pduS pduQ TRUE 0.963 24.000 0.259 1.000 Y NA
 903687 903688 SPA0819 SPA0820 pduQ pduP TRUE 0.984 12.000 0.000 0.033 Y NA
 903688 903689 SPA0820 SPA0821 pduP pduO TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000   NA
 903689 903690 SPA0821 SPA0822 pduO pduN TRUE 0.967 10.000 0.268 NA   NA
 903690 903691 SPA0822 SPA0823 pduN pduM TRUE 0.978 4.000 0.296 NA   NA
 903691 903692 SPA0823 SPA0824 pduM pduL TRUE 0.973 -3.000 0.242 NA   NA
 903692 903693 SPA0824 SPA0825 pduL pduK TRUE 0.994 0.000 0.242 NA Y NA
 903693 903694 SPA0825 SPA0826 pduK pduJ TRUE 0.997 4.000 0.645 NA Y NA
 903694 903695 SPA0826 SPA0827 pduJ pduH TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   NA
 903695 903696 SPA0827 SPA0828 pduH pduG TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 903696 903697 SPA0828 SPA0829 pduG pduE FALSE 0.302 207.000 0.500 NA   NA
 903697 903698 SPA0829 SPA0830 pduE pduD TRUE 0.993 15.000 0.759 0.001   NA
 903698 903699 SPA0830 SPA0831 pduD pduC TRUE 0.967 11.000 0.000 0.001   NA
 903699 903700 SPA0831 SPA0832 pduC pduB TRUE 0.514 19.000 0.000 1.000 N NA
 903700 903701 SPA0832 SPA0833 pduB pduA FALSE 0.209 108.000 0.083 NA N NA
 10702281 903702 SPA0834 SPA0835   pocR FALSE 0.077 174.000 0.000 NA   NA
 903702 10702282 SPA0835 SPA0836 pocR   FALSE 0.005 489.000 0.000 NA   NA
 10702282 903703 SPA0836 SPA0837   cbiB TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903703 903704 SPA0837 SPA0838 cbiB cbiC TRUE 0.991 11.000 0.107 0.009 Y NA
 903704 903705 SPA0838 SPA0839 cbiC cbiD TRUE 0.996 0.000 0.168 0.009 Y NA
 903705 903706 SPA0839 SPA0840 cbiD cbiE TRUE 0.993 -6.000 0.126 0.009 Y NA
 903706 903707 SPA0840 SPA0841 cbiE cbiT TRUE 0.996 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 903707 903708 SPA0841 SPA0842 cbiT cbiF TRUE 0.982 -16.000 0.056 0.009 Y NA
 903708 903709 SPA0842 SPA0843 cbiF cbiG TRUE 0.995 -19.000 0.397 0.009 Y NA
 903709 903710 SPA0843 SPA0844 cbiG cbiH TRUE 0.998 0.000 0.352 0.009 Y NA
 903710 903711 SPA0844 SPA0845 cbiH cbiJ TRUE 0.998 -3.000 0.423 0.009 Y NA
 903711 903712 SPA0845 SPA0846 cbiJ cbiK TRUE 0.980 3.000 0.029 1.000 Y NA
 903712 903713 SPA0846 SPA0847 cbiK cbiL TRUE 0.981 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 903713 903714 SPA0847 SPA0848 cbiL cbiM TRUE 0.518 87.000 0.058 0.009 N NA
 903714 903715 SPA0848 SPA0849 cbiM cbiN TRUE 0.999 2.000 0.861 0.009 Y NA
 903715 903716 SPA0849 SPA0850 cbiN cbiQ TRUE 0.998 -13.000 0.804 0.001 Y NA
 903716 903717 SPA0850 SPA0851 cbiQ cbiO TRUE 0.995 9.000 0.152 0.002 Y NA
 903717 903718 SPA0851 SPA0852 cbiO cbiP TRUE 0.725 -3.000 0.033 1.000 N NA
 903718 903719 SPA0852 SPA0853 cbiP cobU TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 903719 903720 SPA0853 SPA0854 cobU cobS TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 903720 903721 SPA0854 SPA0855 cobS cobT TRUE 0.952 27.000 0.056 0.009 Y NA
 903721 903722 SPA0855 SPA0856 cobT erfK FALSE 0.161 78.000 0.015 NA   NA
 903722 903723 SPA0856 SPA0857 erfK   FALSE 0.352 51.000 0.000 NA   NA
 10702283 903725 SPA0859 SPA0860     FALSE 0.146 141.000 0.000 NA   NA
 903725 903726 SPA0860 SPA0861     FALSE 0.005 501.000 0.000 NA   NA
 903726 903727 SPA0861 SPA0862     TRUE 0.989 -6.000 0.800 NA   NA
 903731 903732 SPA0866 SPA0867     TRUE 0.891 3.000 0.000 NA   NA
 903733 903734 SPA0868 SPA0869 asnT yeeI FALSE 0.220 101.000 0.000 NA   NA
 903735 903736 SPA0870 SPA0871 serU   FALSE 0.013 306.000 0.000 NA   NA
 903736 903737 SPA0871 SPA0872   umuD FALSE 0.173 127.000 0.000 NA   NA
 903737 903738 SPA0872 SPA0873 umuD umuC TRUE 0.824 3.000 0.000 1.000 N NA
 903738 903739 SPA0873 SPA0874 umuC cspB FALSE 0.003 446.000 0.000 1.000 N NA
 10702284 903741 SPA0876 SPA0877   yedJ FALSE 0.249 80.000 0.000 NA   NA
 903741 903742 SPA0877 SPA0878 yedJ dcm FALSE 0.288 74.000 0.000 1.000   NA
 903742 903743 SPA0878 SPA0879 dcm vsr TRUE 0.976 -19.000 0.000 0.058 Y NA
 903745 903746 SPA0881 SPA0882 yedI   TRUE 0.594 17.000 0.025 NA   NA
 903746 903747 SPA0882 SPA0883     FALSE 0.277 165.000 0.208 NA   NA
 903748 903749 SPA0884 SPA0885 yedP   FALSE 0.036 215.000 0.000 NA   NA
 903749 903750 SPA0885 SPA0886   yodD TRUE 0.739 15.000 0.000 NA   NA
 903752 903753 SPA0888 SPA0889 rcsA fliR FALSE 0.009 282.000 0.000 1.000 N NA
 903753 903754 SPA0889 SPA0890 fliR fliQ TRUE 0.990 9.000 0.028 0.003 Y NA
 903754 903755 SPA0890 SPA0891 fliQ fliP TRUE 0.999 10.000 0.827 0.010 Y NA
 903755 903756 SPA0891 SPA0892 fliP fliO TRUE 0.993 0.000 0.203 1.000 Y NA
 903756 903757 SPA0892 SPA0893 fliO fliN TRUE 0.996 0.000 0.443 1.000 Y NA
 903757 903758 SPA0893 SPA0894 fliN fliM TRUE 0.996 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 903758 903759 SPA0894 SPA0895 fliM fliL TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 903759 903760 SPA0895 SPA0896 fliL fliK TRUE 0.752 105.000 0.119 1.000 Y NA
 903760 903761 SPA0896 SPA0897 fliK fliJ TRUE 0.998 -3.000 0.317 0.006 Y NA
 903761 903762 SPA0897 SPA0898 fliJ fliI TRUE 0.925 22.000 0.073 1.000 Y NA
 903762 903763 SPA0898 SPA0899 fliI fliH TRUE 0.984 0.000 0.000 1.000 Y NA
 903763 903764 SPA0899 SPA0900 fliH fliG TRUE 0.987 -7.000 0.005 0.003 Y NA
 903764 903765 SPA0900 SPA0901 fliG fliF TRUE 0.995 -7.000 0.220 0.006 Y NA
 903767 903768 SPA0903 SPA0904   yedF FALSE 0.014 299.000 0.000 NA   NA
 903768 903769 SPA0904 SPA0905 yedF yedE TRUE 0.993 -3.000 0.844 NA   NA
 903771 903772 SPA0907 SPA0908 amyA fliT FALSE 0.466 72.000 0.115 1.000   NA
 903772 903773 SPA0908 SPA0909 fliT fliS TRUE 0.984 0.000 0.324 1.000   NA
 903773 903774 SPA0909 SPA0910 fliS fliD TRUE 0.994 15.000 0.284 0.002 Y NA
 903775 10702285 SPA0911 SPA0912 fliC   FALSE 0.251 79.000 0.000 NA   NA
 10702285 903776 SPA0912 SPA0913   fliA FALSE 0.050 197.000 0.000 NA   NA
 903776 903777 SPA0913 SPA0914 fliA fliZ TRUE 0.511 59.000 0.108 1.000   NA
 903777 903778 SPA0914 SPA0915 fliZ fliY FALSE 0.463 147.000 0.280 1.000   NA
 903778 903779 SPA0915 SPA0916 fliY yedO TRUE 0.802 154.000 0.469 1.000 Y NA
 903779 903780 SPA0916 SPA0917 yedO yecS TRUE 0.915 21.000 0.050 1.000 Y NA
 903780 903781 SPA0917 SPA0918 yecS yecC TRUE 0.990 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 903781 903782 SPA0918 SPA0919 yecC sdiA FALSE 0.026 233.000 0.071 1.000 N NA
 903783 903784 SPA0920 SPA0921 yecF   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903785 903786 SPA0922 SPA0923 sirA uvrC TRUE 0.967 -3.000 0.086 0.025 N NA
 903786 903787 SPA0923 SPA0924 uvrC pgsA TRUE 0.624 57.000 0.227 1.000 N NA
 903787 903788 SPA0924 SPA0925 pgsA glyW FALSE 0.116 152.000 0.000 NA   NA
 903788 903789 SPA0925 SPA0926 glyW cysT FALSE 0.328 56.000 0.000 NA   NA
 903789 903790 SPA0926 SPA0927 cysT leuZ TRUE 0.739 15.000 0.000 NA   NA
 903790 903791 SPA0927 SPA0928 leuZ   FALSE 0.022 253.000 0.000 NA   NA
 903791 903792 SPA0928 SPA0929     FALSE 0.033 220.000 0.000 NA   NA
 903792 903793 SPA0929 SPA0930     FALSE 0.038 213.000 0.000 NA   NA
 903793 903794 SPA0930 SPA0931   yecA FALSE 0.026 239.000 0.000 NA   NA
 903797 903798 SPA0934 SPA0935 ftnA   FALSE 0.018 240.000 0.029 NA   NA
 903798 903799 SPA0935 SPA0936   yecI FALSE 0.010 331.000 0.000 NA   NA
 903800 903801 SPA0937 SPA0938 araH   FALSE 0.207 112.000 0.000 NA   NA
 903801 903802 SPA0938 SPA0939   otsB FALSE 0.025 223.000 0.037 NA   NA
 903802 903803 SPA0939 SPA0940 otsB otsA TRUE 0.985 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 903804 903805 SPA0941 SPA0942 yecG   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903806 903807 SPA0943 SPA0944 flhD flhC TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.001   NA
 903807 903808 SPA0944 SPA0945 flhC motA TRUE 0.646 126.000 0.408 1.000   NA
 903808 903809 SPA0945 SPA0946 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 903809 903810 SPA0946 SPA0947 motB cheA TRUE 0.998 5.000 0.913 1.000 Y NA
 903810 903811 SPA0947 SPA0948 cheA cheW TRUE 0.992 21.000 0.447 0.004 Y NA
 903811 10702286 SPA0948 SPA0949 cheW   FALSE 0.026 237.000 0.000 NA   NA
 10702286 903812 SPA0949 SPA0950   cheR FALSE 0.096 161.000 0.000 NA   NA
 903812 903813 SPA0950 SPA0951 cheR cheB TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 903813 903814 SPA0951 SPA0952 cheB ald TRUE 0.993 18.000 0.467 0.014 Y NA
 903814 903815 SPA0952 SPA0953 ald cheZ TRUE 0.971 11.000 0.000 1.000 Y NA
 903815 903816 SPA0953 SPA0954 cheZ flhB FALSE 0.277 194.000 0.000 1.000 Y NA
 903816 903817 SPA0954 SPA0955 flhB flhA TRUE 0.996 -7.000 0.287 0.010 Y NA
 903817 903818 SPA0955 SPA0956 flhA flhE TRUE 0.989 0.000 0.158 0.003   NA
 903821 903822 SPA0959 SPA0960   argS FALSE 0.009 189.000 0.002 1.000 N NA
 903823 903824 SPA0961 SPA0962 yecM cutC TRUE 0.681 20.000 0.057 1.000   NA
 903825 903826 SPA0963 SPA0964 yecP yecO TRUE 0.979 -3.000 0.315 NA   NA
 903826 903827 SPA0964 SPA0965 yecO yecN TRUE 0.551 41.000 0.089 NA   NA
 903827 903828 SPA0965 SPA0966 yecN yecE TRUE 0.562 53.000 0.126 NA   NA
 903828 903829 SPA0966 SPA0967 yecE yecD TRUE 0.932 -3.000 0.089 NA   NA
 903830 903831 SPA0968 SPA0969 aspS ntpA FALSE 0.136 103.000 0.050 1.000 N NA
 903831 903832 SPA0969 SPA0970 ntpA yebC FALSE 0.431 30.000 0.035 NA   NA
 903832 903833 SPA0970 SPA0971 yebC ruvC TRUE 0.809 37.000 0.277 NA   NA
 903835 903836 SPA0973 SPA0974   ruvA FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 903836 903837 SPA0974 SPA0975 ruvA ruvB TRUE 0.998 9.000 0.549 0.002 Y NA
 903838 903839 SPA0976 SPA0977 yebI znuC TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.093 Y NA
 903840 903841 SPA0978 SPA0979 znuA yebA TRUE 0.823 16.000 0.131 1.000 N NA
 903841 903842 SPA0979 SPA0980 yebA msbB TRUE 0.840 117.000 0.299 1.000 Y NA
 903843 903844 SPA0981 SPA0982 pykA hexR FALSE 0.163 124.000 0.071 1.000 N NA
 903845 903846 SPA0983 SPA0984 zwf edd FALSE 0.151 235.000 0.041 1.000 Y NA
 903846 903847 SPA0984 SPA0985 edd eda TRUE 0.965 38.000 0.523 1.000 Y NA
 10702287 903849 SPA0987 SPA0988   yebF FALSE 0.280 68.000 0.000 NA   NA
 903849 903850 SPA0988 SPA0989 yebF yebE FALSE 0.225 94.000 0.000 NA   NA
 903850 903851 SPA0989 SPA0990 yebE opdB FALSE 0.065 214.000 0.092 NA   NA
 903852 903853 SPA0991 SPA0992 exoX   TRUE 0.952 24.000 0.667 1.000   NA
 903853 903854 SPA0992 SPA0993   holE TRUE 0.561 108.000 0.222 1.000   NA
 903855 903856 SPA0994 SPA0995 yobA   TRUE 0.991 1.000 0.613 1.000   NA
 903856 903857 SPA0995 SPA0996     TRUE 0.970 17.000 0.704 NA   NA
 903857 903858 SPA0996 SPA0997     FALSE 0.304 61.000 0.000 NA   NA
 903860 903861 SPA1000 SPA1001     FALSE 0.004 648.000 0.000 NA   NA
 903861 903862 SPA1001 SPA1002     FALSE 0.003 985.000 0.000 NA   NA
 903864 903865 SPA1004 SPA1005     FALSE 0.098 159.000 0.000 NA   NA
 903867 903868 SPA1007 SPA1008     FALSE 0.047 200.000 0.000 NA   NA
 903868 903869 SPA1008 SPA1009     TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 903869 903870 SPA1009 SPA1010   pagO FALSE 0.162 133.000 0.000 NA   NA
 903870 903871 SPA1010 SPA1011 pagO   FALSE 0.003 1289.000 0.000 NA   NA
 903872 903873 SPA1013 SPA1014     FALSE 0.086 166.000 0.000 NA   NA
 903875 903876 SPA1016 SPA1017     FALSE 0.012 316.000 0.000 NA   NA
 903877 903878 SPA1018 SPA1019 sopE2   FALSE 0.015 285.000 0.000 NA   NA
 903878 903879 SPA1019 SPA1020   pphA FALSE 0.031 227.000 0.000 NA   NA
 903880 903881 SPA1021 SPA1022 yebW   TRUE 0.650 111.000 0.353 NA   NA
 903881 903882 SPA1022 SPA1023   yebU FALSE 0.372 114.000 0.121 NA   NA
 903882 903883 SPA1023 SPA1024 yebU   TRUE 0.737 78.000 0.420 NA   NA
 903883 903884 SPA1024 SPA1025   yebS TRUE 0.978 -37.000 0.840 NA   NA
 903885 10702290 SPA1026 SPA1027 yebR   FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 10702290 903886 SPA1027 SPA1028   prc TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 903886 903887 SPA1028 SPA1029 prc htpX FALSE 0.122 194.000 0.042 0.024 N NA
 903891 903892 SPA1033 SPA1034 yobG   TRUE 0.783 71.000 0.500 NA   NA
 903892 903893 SPA1034 SPA1035   yobF FALSE 0.004 649.000 0.000 NA   NA
 903893 903894 SPA1035 SPA1036 yobF cspC TRUE 0.936 13.000 0.214 NA   NA
 903894 903895 SPA1036 SPA1037 cspC ftsI FALSE 0.019 220.000 0.000 1.000 N NA
 903895 903896 SPA1037 SPA1038 ftsI rrmA FALSE 0.296 66.000 0.045 1.000   NA
 903897 903898 SPA1039 SPA1040 yebN   FALSE 0.009 356.000 0.000 NA   NA
 903898 903899 SPA1040 SPA1041   manZ TRUE 0.880 58.000 0.755 NA   NA
 903899 903900 SPA1041 SPA1042 manZ manY TRUE 0.999 4.000 0.939 0.011 Y NA
 903900 903901 SPA1042 SPA1043 manY manX TRUE 0.922 53.000 0.106 0.011 Y NA
 903902 903903 SPA1044 SPA1045   yoaE TRUE 0.738 -12.000 0.034 NA   NA
 903904 903905 SPA1046 SPA1047   sdaA TRUE 0.827 36.000 0.389 NA N NA
 903905 903906 SPA1047 SPA1048 sdaA yeaB FALSE 0.095 282.000 0.409 1.000 N NA
 903906 903907 SPA1048 SPA1049 yeaB pabB TRUE 0.926 4.000 0.116 1.000 N NA
 903910 903911 SPA1052 SPA1053 yoaA yeaZ FALSE 0.336 58.000 0.082 1.000 N NA
 903911 903912 SPA1053 SPA1054 yeaZ slp FALSE 0.088 72.000 0.024 1.000 N NA
 903912 903913 SPA1054 SPA1055 slp fadD FALSE 0.100 205.000 0.169 1.000 N NA
 903913 903914 SPA1055 SPA1056 fadD rnd FALSE 0.338 85.000 0.115 1.000 N NA
 903915 903916 SPA1057 SPA1058 minE minD TRUE 0.997 4.000 0.618 NA Y NA
 903916 903917 SPA1058 SPA1059 minD minC TRUE 0.978 24.000 0.466 1.000 Y NA
 903918 903919 SPA1060 SPA1061 ycgL ycgM FALSE 0.379 50.000 0.056 NA   NA
 903919 903920 SPA1061 SPA1062 ycgM ycgN FALSE 0.335 93.000 0.088 NA   NA
 903920 903921 SPA1062 SPA1063 ycgN   FALSE 0.009 352.000 0.000 NA   NA
 903921 903922 SPA1063 SPA1064     FALSE 0.054 193.000 0.000 NA   NA
 903923 903924 SPA1065 SPA1066   dsbB FALSE 0.068 109.000 0.036 NA N NA
 903924 903925 SPA1066 SPA1067 dsbB nhaB TRUE 0.676 142.000 0.723 1.000 N NA
 903928 903929 SPA1070 SPA1071 dadA dadX TRUE 0.885 14.000 0.168 1.000 N NA
 903930 903931 SPA1072 SPA1073 ycgO ycgQ FALSE 0.265 97.000 0.103 NA N NA
 903934 903935 SPA1077 SPA1078 treA   FALSE 0.021 214.000 0.000 1.000 N NA
 903935 903936 SPA1078 SPA1079     FALSE 0.010 344.000 0.000 NA   NA
 903936 903937 SPA1079 SPA1080   appB TRUE 0.878 13.000 0.105 NA   NA
 903937 903938 SPA1080 SPA1081 appB appC TRUE 0.990 12.000 0.158 0.056 Y NA
 903938 903939 SPA1081 SPA1082 appC hyaF FALSE 0.259 75.000 0.000 NA   NA
 903939 903940 SPA1082 SPA1083 hyaF hyaE TRUE 0.921 -3.000 0.077 NA   NA
 903940 903941 SPA1083 SPA1084 hyaE hyaD TRUE 0.885 -10.000 0.096 NA   NA
 903941 903942 SPA1084 SPA1085 hyaD hyaC TRUE 0.991 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 903942 903943 SPA1085 SPA1086 hyaC hyaB TRUE 0.989 19.000 0.355 0.056 Y NA
 903943 10702292 SPA1086 SPA1087 hyaB   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 903945 903946 SPA1089 SPA1090 ychF pth TRUE 0.780 117.000 0.184 1.000 Y NA
 903948 903949 SPA1092 SPA1093 ychM prsA FALSE 0.059 125.000 0.027 1.000 N NA
 903949 903950 SPA1093 SPA1094 prsA ipk FALSE 0.004 266.000 0.018 1.000 N NA
 903950 903951 SPA1094 SPA1095 ipk hemM TRUE 0.707 0.000 0.024 1.000 N NA
 903952 903953 SPA1096 SPA1097 hemA prfA TRUE 0.809 41.000 0.171 0.050 N NA
 903953 903954 SPA1097 SPA1098 prfA hemK TRUE 0.997 0.000 0.229 0.050 Y NA
 903954 903955 SPA1098 SPA1099 hemK sirC TRUE 0.942 -3.000 0.109 NA   NA
 903955 903956 SPA1099 SPA1100 sirC ychA TRUE 0.966 4.000 0.195 NA   NA
 903956 903957 SPA1100 SPA1101 ychA kdsA TRUE 0.600 38.000 0.089 1.000   NA
 903961 903962 SPA1106 SPA1107 narL narX TRUE 0.997 -7.000 0.521 0.016 Y NA
 903963 903964 SPA1108 SPA1109 narK narG FALSE 0.004 389.000 0.000 1.000 N NA
 903964 903965 SPA1109 SPA1110 narG narH TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 903965 903966 SPA1110 SPA1111 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.005 Y NA
 903966 903967 SPA1111 SPA1112 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.005 Y NA
 903967 903968 SPA1112 SPA1113 narI   FALSE 0.028 242.000 0.000 1.000   NA
 903969 903970 SPA1114 SPA1115     FALSE 0.333 55.000 0.000 NA   NA
 903970 903971 SPA1115 SPA1116     FALSE 0.333 55.000 0.000 NA   NA
 903971 903972 SPA1116 SPA1117     FALSE 0.333 55.000 0.000 NA   NA
 903972 903973 SPA1117 SPA1118     FALSE 0.333 55.000 0.000 NA   NA
 903973 903974 SPA1118 SPA1119   tyrT FALSE 0.307 60.000 0.000 NA   NA
 903974 903975 SPA1119 SPA1120 tyrT tyrT FALSE 0.434 38.000 0.000 NA   NA
 903977 903978 SPA1122 SPA1123 purU ychJ TRUE 0.672 51.000 0.200 NA   NA
 903979 903980 SPA1124 SPA1125 ychK hnr FALSE 0.243 91.000 0.048 1.000   NA
 903980 903981 SPA1125 SPA1126 hnr galU FALSE 0.144 203.000 0.235 1.000 N NA
 903985 903986 SPA1130 SPA1131 ychE oppA FALSE 0.002 660.000 0.000 NA N NA
 903986 903987 SPA1131 SPA1132 oppA oppB TRUE 0.840 122.000 0.151 0.060 Y NA
 903987 903988 SPA1132 SPA1133 oppB oppC TRUE 0.997 15.000 0.870 0.060 Y NA
 903988 903989 SPA1133 SPA1134 oppC oppD TRUE 0.994 12.000 0.554 1.000 Y NA
 903989 903990 SPA1134 SPA1135 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 903990 903991 SPA1135 SPA1136 oppF   TRUE 0.785 48.000 0.042 1.000 Y NA
 903992 903993 SPA1137 SPA1138 yciU cls TRUE 0.798 34.000 0.231 NA   NA
 903993 903994 SPA1138 SPA1139 cls yciI FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 903996 903997 SPA1141 SPA1142 yciA ispZ FALSE 0.185 161.000 0.167 NA N NA
 903997 903998 SPA1142 SPA1143 ispZ yciC FALSE 0.366 57.000 0.061 NA   NA
 903998 903999 SPA1143 SPA1144 yciC   TRUE 0.796 26.000 0.169 NA   NA
 904001 904002 SPA1146 SPA1147   yciE TRUE 0.936 20.000 0.115 0.002   NA
 904002 904003 SPA1147 SPA1148 yciE yciF TRUE 0.755 74.000 0.115 0.002   NA
 904003 904004 SPA1148 SPA1149 yciF yciG FALSE 0.231 90.000 0.000 NA   NA
 904004 904005 SPA1149 SPA1150 yciG trpA FALSE 0.005 480.000 0.000 NA   NA
 904005 904006 SPA1150 SPA1151 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 904006 904007 SPA1151 SPA1152 trpB trpC TRUE 0.996 10.000 0.221 0.001 Y NA
 904007 904008 SPA1152 SPA1153 trpC trpD TRUE 0.994 4.000 0.293 1.000 Y NA
 904008 904009 SPA1153 SPA1154 trpD trpE TRUE 0.994 0.000 0.010 0.001 Y NA
 904010 904011 SPA1155 SPA1156 trpH yciO TRUE 0.972 8.000 0.281 NA   NA
 904011 904012 SPA1156 SPA1157 yciO yciL TRUE 0.686 101.000 0.075 NA Y NA
 904013 904014 SPA1158 SPA1159 btuR yciK TRUE 0.810 -3.000 0.050 1.000 N NA
 904017 904018 SPA1162 SPA1163 topA cysB FALSE 0.001 411.000 0.008 1.000 N NA
 904018 904019 SPA1163 SPA1164 cysB acnA FALSE 0.002 977.000 0.000 1.000 N NA
 904021 904022 SPA1166 SPA1167 pgpB yciS FALSE 0.273 150.000 0.143 NA   NA
 904022 904023 SPA1167 SPA1168 yciS yciM TRUE 0.987 7.000 0.576 NA   NA
 904023 904024 SPA1168 SPA1169 yciM pyrF FALSE 0.096 191.000 0.125 1.000 N NA
 904024 904025 SPA1169 SPA1170 pyrF yciH TRUE 0.814 0.000 0.045 1.000 N NA
 904026 904027 SPA1171 SPA1172 osmB yciT FALSE 0.020 259.000 0.000 NA   NA
 904027 904028 SPA1172 SPA1173 yciT   FALSE 0.461 87.000 0.146 NA   NA
 904028 904029 SPA1173 SPA1174   yciR FALSE 0.294 113.000 0.083 NA   NA
 904029 904030 SPA1174 SPA1175 yciR rnb FALSE 0.011 262.000 0.000 1.000 N NA
 904030 904031 SPA1175 SPA1176 rnb yciW FALSE 0.381 89.000 0.105 NA   NA
 904031 904032 SPA1176 SPA1177 yciW fabI FALSE 0.052 200.000 0.057 NA   NA
 10702294 904033 SPA1178 SPA1179     FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 904034 904035 SPA1180 SPA1181 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.016 Y NA
 904035 904036 SPA1181 SPA1182 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 10702295 904038 SPA1184 SPA1186     FALSE 0.065 185.000 0.000 NA   NA
 904039 904040 SPA1187 SPA1188     FALSE 0.004 591.000 0.000 NA   NA
 904040 10702296 SPA1188 SPA1189     FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 10702296 904041 SPA1189 SPA1190     FALSE 0.390 44.000 0.000 NA   NA
 904042 904043 SPA1191 SPA1192 sapB sapA TRUE 0.985 -3.000 0.264 0.060 N NA
 904043 904044 SPA1192 SPA1193 sapA pspF TRUE 0.627 112.000 0.402 1.000 N NA
 904045 904046 SPA1194 SPA1195 pspA pspB TRUE 0.872 60.000 0.739 NA   NA
 904046 904047 SPA1195 SPA1196 pspB pspC TRUE 0.994 0.000 0.913 NA   NA
 904047 904048 SPA1196 SPA1197 pspC pspD TRUE 0.817 23.000 0.167 NA   NA
 904048 904049 SPA1197 SPA1198 pspD pspE TRUE 0.471 76.000 0.133 NA   NA
 904049 904050 SPA1198 SPA1199 pspE ycjX FALSE 0.074 149.000 0.013 NA   NA
 904050 904051 SPA1199 SPA1200 ycjX ycjF TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 904051 904052 SPA1200 SPA1201 ycjF tyrR FALSE 0.278 148.000 0.137 NA   NA
 904057 904058 SPA1207 SPA1208     FALSE 0.019 276.000 0.000 1.000   NA
 904060 904061 SPA1210 SPA1211     FALSE 0.169 129.000 0.000 NA   NA
 10702298 904062 SPA1212 SPA1213     FALSE 0.048 199.000 0.000 NA   NA
 904063 10702299 SPA1214 SPA1215     FALSE 0.259 75.000 0.000 NA   NA
 10702299 904064 SPA1215 SPA1216     TRUE 0.535 27.000 0.000 NA   NA
 904064 904065 SPA1216 SPA1217     FALSE 0.221 99.000 0.000 NA   NA
 904066 904067 SPA1218 SPA1219     TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 904071 904072 SPA1223 SPA1224 ydaA fnr TRUE 0.852 151.000 0.619 1.000 Y NA
 904072 904073 SPA1224 SPA1225 fnr ogt FALSE 0.030 196.000 0.000 1.000 N NA
 904074 10702300 SPA1226 SPA1227 ydaL   FALSE 0.007 411.000 0.000 NA   NA
 10702300 904075 SPA1227 SPA1228     FALSE 0.133 146.000 0.000 NA   NA
 904075 904076 SPA1228 SPA1229     FALSE 0.010 340.000 0.000 NA   NA
 904076 904077 SPA1229 SPA1230   dbpA FALSE 0.261 74.000 0.000 NA   NA
 904079 904080 SPA1232 SPA1233     FALSE 0.017 275.000 0.000 NA   NA
 904085 904086 SPA1238 SPA1239 hslJ ldhA FALSE 0.024 111.000 0.012 NA N NA
 904087 904088 SPA1240 SPA1241 ydbH ynbE TRUE 0.923 0.000 0.068 NA   NA
 904088 904089 SPA1241 SPA1242 ynbE ydbL TRUE 0.990 8.000 0.726 NA   NA
 904089 904090 SPA1242 SPA1243 ydbL   FALSE 0.149 140.000 0.000 NA   NA
 904092 904093 SPA1245 SPA1246 hrpA ydcF FALSE 0.294 64.000 0.000 NA   NA
 904093 904094 SPA1246 SPA1247 ydcF ydcG FALSE 0.033 220.000 0.000 NA   NA
 904094 904095 SPA1247 SPA1248 ydcG   FALSE 0.043 205.000 0.000 NA   NA
 904095 904096 SPA1248 SPA1249     TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 904097 904098 SPA1250 SPA1251 aac sgcR TRUE 0.912 0.000 0.000 1.000   NA
 904098 904099 SPA1251 SPA1252 sgcR   TRUE 0.944 16.000 0.000 1.000 Y NA
 904099 904100 SPA1252 SPA1253   sgcA TRUE 0.966 12.000 0.000 1.000 Y NA
 904100 904101 SPA1253 SPA1254 sgcA sgcQ TRUE 0.673 132.000 0.500 1.000   NA
 904101 904102 SPA1254 SPA1255 sgcQ sgcC TRUE 0.971 14.000 0.500 1.000   NA
 904102 904103 SPA1255 SPA1256 sgcC   TRUE 0.993 11.000 0.148 0.011 Y NA
 904103 904104 SPA1256 SPA1257   leuB TRUE 0.988 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 904107 904108 SPA1260 SPA1261 tehA tehB TRUE 0.928 -13.000 0.175 1.000   NA
 904108 904109 SPA1261 SPA1262 tehB   FALSE 0.171 156.000 0.088 NA   NA
 904111 10702302 SPA1265 SPA1266 yncJ   FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 904112 904113 SPA1267 SPA1268 ugtL   TRUE 0.475 33.000 0.000 NA   NA
 904113 904114 SPA1268 SPA1269   pcgL FALSE 0.020 262.000 0.000 NA   NA
 904114 904115 SPA1269 SPA1270 pcgL ydcR FALSE 0.095 136.000 0.000 1.000 N NA
 904115 904116 SPA1270 SPA1271 ydcR ydcW FALSE 0.095 136.000 0.000 1.000 N NA
 904116 904117 SPA1271 SPA1272 ydcW ydcX FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 904118 904119 SPA1273 SPA1274 srfC srfB TRUE 0.976 -3.000 0.278 NA   NA
 904119 904120 SPA1274 SPA1275 srfB srfA TRUE 0.958 5.000 0.167 NA   NA
 904122 904123 SPA1277 SPA1278 ydcZ yncA TRUE 0.926 0.000 0.070 NA   NA
 904124 904125 SPA1279 SPA1280 yncB yncC FALSE 0.012 334.000 0.000 1.000   NA
 904127 904128 SPA1282 SPA1283     FALSE 0.453 145.000 0.273 NA   NA
 904130 904131 SPA1285 SPA1286   nhoA FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 904132 904133 SPA1287 SPA1288 yddE narV FALSE 0.241 106.000 0.000 1.000   NA
 904133 10702303 SPA1288 SPA1289 narV   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 10702303 904134 SPA1289 SPA1290   narY TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 904134 904135 SPA1290 SPA1291 narY narZ TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 904135 904136 SPA1291 SPA1292 narZ narU TRUE 0.728 92.000 0.556 1.000 N NA
 904136 904137 SPA1292 SPA1293 narU   FALSE 0.042 214.000 0.000 1.000   NA
 904139 904140 SPA1295 SPA1296   nmpC FALSE 0.050 204.000 0.000 1.000   NA
 904140 904141 SPA1296 SPA1297 nmpC yddG FALSE 0.015 523.000 0.000 0.097   NA
 904142 904143 SPA1298 SPA1299 fdnG fdnH TRUE 0.996 14.000 0.429 0.002 Y NA
 904143 904144 SPA1299 SPA1300 fdnH fdnI TRUE 0.997 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 904145 904146 SPA1301 SPA1302 adhP sfcA FALSE 0.015 302.000 0.000 1.000   NA
 904146 904147 SPA1302 SPA1303 sfcA rpsV TRUE 0.571 177.000 0.750 1.000   NA
 904147 904148 SPA1303 SPA1304 rpsV yddX TRUE 0.768 95.000 0.571 NA   NA
 904150 10702304 SPA1306 SPA1307 hlyE   FALSE 0.169 129.000 0.000 NA   NA
 904151 904152 SPA1308 SPA1309     FALSE 0.141 143.000 0.000 NA   NA
 904152 904153 SPA1309 SPA1310     FALSE 0.169 129.000 0.000 NA   NA
 904153 904154 SPA1310 SPA1311     TRUE 0.997 -3.000 0.263 0.004 Y NA
 904154 904155 SPA1311 SPA1312     TRUE 0.877 57.000 0.015 0.004 Y NA
 904156 10702305 SPA1313 SPA1314     TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 10702305 904157 SPA1314 SPA1315     FALSE 0.003 1048.000 0.000 NA   NA
 904157 904158 SPA1315 SPA1316     FALSE 0.062 193.000 0.000 1.000   NA
 904159 904160 SPA1317 SPA1318 hyaA2 hyaB2 TRUE 0.999 3.000 0.611 0.002 Y NA
 904160 904161 SPA1318 SPA1319 hyaB2 hyaC2 TRUE 0.992 -49.000 0.355 0.054 Y NA
 904161 904162 SPA1319 SPA1320 hyaC2 hyaD2 TRUE 0.990 6.000 0.177 1.000 Y NA
 904162 10702306 SPA1320 SPA1321 hyaD2   TRUE 0.870 7.000 0.000 NA   NA
 10702306 904163 SPA1321 SPA1322   hyaE2 TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904163 904164 SPA1322 SPA1323 hyaE2 hyaF2 TRUE 0.970 18.000 0.769 NA   NA
 904164 904165 SPA1323 SPA1324 hyaF2   TRUE 0.791 -12.000 0.000 NA   NA
 904165 904166 SPA1324 SPA1325     TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 904169 904170 SPA1328 SPA1329   yneG FALSE 0.035 217.000 0.000 NA   NA
 904170 904171 SPA1329 SPA1330 yneG yneH TRUE 0.875 0.000 0.037 NA   NA
 904171 904172 SPA1330 SPA1331 yneH yneI FALSE 0.064 85.000 0.016 1.000 N NA
 904173 904174 SPA1332 SPA1333 yneJ ydeA FALSE 0.067 116.000 0.027 1.000 N NA
 904176 904177 SPA1335 SPA1336 marR marA TRUE 0.993 20.000 0.667 0.053 Y NA
 904177 904178 SPA1336 SPA1337 marA marB TRUE 0.512 29.000 0.000 NA   NA
 904178 904179 SPA1337 SPA1338 marB ydeE TRUE 0.848 -6.000 0.000 NA   NA
 904179 904180 SPA1338 SPA1339 ydeE   FALSE 0.048 221.000 0.077 NA   NA
 904183 904184 SPA1342 SPA1343   dcp FALSE 0.010 345.000 0.000 NA   NA
 904185 904186 SPA1344 SPA1345 ydfG ydfH FALSE 0.179 129.000 0.047 1.000   NA
 904186 904187 SPA1345 SPA1346 ydfH ydfZ FALSE 0.354 181.000 0.375 NA   NA
 904188 904189 SPA1347 SPA1348 ydfI ydfJ TRUE 0.752 144.000 0.250 1.000 Y NA
 904189 904190 SPA1348 SPA1349 ydfJ rspB TRUE 0.591 54.000 0.195 1.000 N NA
 904190 904191 SPA1349 SPA1350 rspB rspA TRUE 0.736 11.000 0.000 1.000 N NA
 904191 904192 SPA1350 SPA1351 rspA ynfA FALSE 0.203 122.000 0.000 1.000   NA
 904193 904194 SPA1352 SPA1353 ynfB speG FALSE 0.467 36.000 0.055 NA   NA
 904196 904197 SPA1355 SPA1356 ynfD   FALSE 0.405 157.000 0.304 NA   NA
 904197 904198 SPA1356 SPA1357   dmsB TRUE 0.992 11.000 0.154 0.054 Y NA
 904198 904199 SPA1357 SPA1358 dmsB   TRUE 0.908 2.000 0.000 1.000   NA
 904199 904200 SPA1358 SPA1359   ynfI FALSE 0.430 43.000 0.000 1.000   NA
 904200 904201 SPA1359 SPA1360 ynfI   FALSE 0.015 305.000 0.000 1.000   NA
 904201 904202 SPA1360 SPA1361     TRUE 0.931 29.000 0.403 0.058 N NA
 904202 904203 SPA1361 SPA1362     TRUE 0.983 10.000 0.313 0.058 N NA
 904203 904204 SPA1362 SPA1363     TRUE 0.999 0.000 0.903 0.097 Y NA
 904204 10702307 SPA1363 SPA1364     FALSE 0.155 136.000 0.000 NA   NA
 904205 904206 SPA1365 SPA1366 ynfK mlc TRUE 0.608 126.000 0.455 1.000 N NA
 904206 904207 SPA1366 SPA1367 mlc ynfL TRUE 0.856 128.000 0.408 1.000 Y NA
 904208 904209 SPA1368 SPA1369 ynfM asr FALSE 0.007 395.000 0.000 NA   NA
 904209 904210 SPA1369 SPA1370 asr   FALSE 0.018 269.000 0.000 NA   NA
 10702308 904211 SPA1371 SPA1372   ydgF TRUE 0.782 -13.000 0.000 NA   NA
 904211 904212 SPA1372 SPA1373 ydgF   FALSE 0.268 112.000 0.071 NA   NA
 904214 904215 SPA1375 SPA1376 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 904216 904217 SPA1377 SPA1378 ydgH ydgI FALSE 0.036 299.000 0.143 NA   NA
 904220 904221 SPA1382 SPA1383 ompN   FALSE 0.125 154.000 0.000 1.000   NA
 904221 904222 SPA1383 SPA1384   rstB FALSE 0.240 108.000 0.000 1.000   NA
 904222 904223 SPA1384 SPA1385 rstB tus TRUE 0.584 76.000 0.200 1.000   NA
 904224 904225 SPA1386 SPA1387 fumC fumA TRUE 0.662 168.000 0.000 0.001 Y NA
 904226 904227 SPA1388 SPA1389 manA ydgA TRUE 0.818 103.000 0.778 NA   NA
 904227 10702310 SPA1389 SPA1390 ydgA   FALSE 0.004 706.000 0.000 NA   NA
 904229 904230 SPA1392 SPA1393 ydgT ydgK FALSE 0.413 89.000 0.120 NA   NA
 904230 904231 SPA1393 SPA1394 ydgK   TRUE 0.489 77.000 0.148 NA   NA
 904231 904232 SPA1394 SPA1395   ydgM TRUE 0.998 0.000 0.564 0.054 Y NA
 904232 904233 SPA1395 SPA1396 ydgM   TRUE 0.997 -7.000 0.537 0.019 Y NA
 904233 904234 SPA1396 SPA1397   ydgO TRUE 0.999 1.000 0.814 0.054 Y NA
 904234 904235 SPA1397 SPA1398 ydgO ydgP TRUE 0.999 4.000 0.924 0.054 Y NA
 904235 904236 SPA1398 SPA1399 ydgP ydgQ TRUE 0.999 3.000 0.908 0.054 Y NA
 904236 904237 SPA1399 SPA1400 ydgQ nth TRUE 0.932 0.000 0.109 1.000 N NA
 904237 904238 SPA1400 SPA1401 nth ydgR FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 904238 904239 SPA1401 SPA1402 ydgR gst TRUE 0.603 105.000 0.344 1.000 N NA
 904240 904241 SPA1403 SPA1404 pdxY tyrS FALSE 0.160 60.000 0.041 1.000 N NA
 904241 904242 SPA1404 SPA1405 tyrS pdxH FALSE 0.113 127.000 0.054 1.000 N NA
 904242 904243 SPA1405 SPA1406 pdxH ydhA FALSE 0.250 59.000 0.034 NA   NA
 904243 904244 SPA1406 SPA1407 ydhA ydhH FALSE 0.185 88.000 0.034 NA   NA
 904247 904248 SPA1410 SPA1411 ydhI ydhJ TRUE 0.955 -33.000 0.412 NA   NA
 904248 904249 SPA1411 SPA1412 ydhJ   TRUE 0.945 0.000 0.088 1.000   NA
 904250 904251 SPA1413 SPA1414 sodC ydhF FALSE 0.221 80.000 0.033 1.000   NA
 904251 904252 SPA1414 SPA1415 ydhF ydhL FALSE 0.328 51.000 0.045 NA   NA
 904253 904254 SPA1416 SPA1417 ydhM nemA TRUE 0.724 59.000 0.362 1.000 N NA
 904254 904255 SPA1417 SPA1418 nemA gloA FALSE 0.201 69.000 0.057 1.000 N NA
 904255 904256 SPA1418 SPA1419 gloA rnt FALSE 0.352 101.000 0.136 1.000 N NA
 904258 904259 SPA1421 SPA1422 ydhO sodB FALSE 0.023 127.000 0.015 NA N NA
 904259 904260 SPA1422 SPA1423 sodB purR FALSE 0.003 468.000 0.000 1.000 N NA
 904262 904263 SPA1425 SPA1426 ydhC cfa FALSE 0.008 290.000 0.000 1.000 N NA
 904265 904266 SPA1428 SPA1429 ydhE   FALSE 0.116 152.000 0.000 NA   NA
 904266 904267 SPA1429 SPA1430     TRUE 0.761 14.000 0.000 NA   NA
 904268 904269 SPA1431 SPA1432 ssaU ssaT TRUE 0.997 -3.000 0.406 0.090 Y NA
 904269 904270 SPA1432 SPA1433 ssaT ssaS TRUE 0.998 1.000 0.516 0.090 Y NA
 904270 904271 SPA1433 SPA1434 ssaS yscR TRUE 0.994 -3.000 0.091 0.010 Y NA
 904271 904272 SPA1434 SPA1435 yscR ssaQ TRUE 0.832 68.000 0.154 1.000 Y NA
 904272 904273 SPA1435 SPA1436 ssaQ ssaP TRUE 0.897 -19.000 0.154 NA   NA
 904273 904274 SPA1436 SPA1437 ssaP ssaO TRUE 0.749 -19.000 0.000 NA   NA
 904274 904275 SPA1437 SPA1438 ssaO ssaN TRUE 0.891 3.000 0.000 NA   NA
 904275 904276 SPA1438 SPA1439 ssaN ssaV TRUE 0.998 -10.000 0.647 0.008 Y NA
 904276 904277 SPA1439 SPA1440 ssaV ssaM TRUE 0.978 -15.000 0.636 NA   NA
 904277 904278 SPA1440 SPA1441 ssaM ssaL TRUE 0.771 58.000 0.364 NA   NA
 904278 904279 SPA1441 SPA1442 ssaL ssaK TRUE 0.974 -10.000 0.462 NA   NA
 904279 904280 SPA1442 SPA1443 ssaK   TRUE 0.988 -3.000 0.538 NA   NA
 904280 904281 SPA1443 SPA1444   ssaJ TRUE 0.970 18.000 0.786 NA   NA
 904281 904282 SPA1444 SPA1445 ssaJ ssaI TRUE 0.994 -3.000 0.407 0.010   NA
 904282 904283 SPA1445 SPA1446 ssaI ssaH TRUE 0.971 12.000 0.407 NA   NA
 904283 904284 SPA1446 SPA1447 ssaH ssaG TRUE 0.903 41.000 0.650 NA   NA
 904284 904285 SPA1447 SPA1448 ssaG sseG FALSE 0.225 94.000 0.000 NA   NA
 904285 904286 SPA1448 SPA1449 sseG sseF TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904286 904287 SPA1449 SPA1450 sseF sscB TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 904287 904288 SPA1450 SPA1451 sscB sseE FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 904288 904289 SPA1451 SPA1452 sseE sseD TRUE 0.891 3.000 0.000 NA   NA
 904289 904290 SPA1452 SPA1453 sseD sseC TRUE 0.909 16.000 0.211 NA   NA
 904290 904291 SPA1453 SPA1454 sseC sscA TRUE 0.991 3.000 0.632 1.000   NA
 904291 904292 SPA1454 SPA1455 sscA   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904292 904293 SPA1455 SPA1456     TRUE 0.989 7.000 0.667 NA   NA
 904293 904294 SPA1456 SPA1457   ssaE FALSE 0.088 263.000 0.250 NA   NA
 904294 904295 SPA1457 SPA1458 ssaE ssaD TRUE 0.947 8.000 0.146 NA   NA
 904295 904296 SPA1458 SPA1459 ssaD spiA TRUE 0.940 -19.000 0.268 NA   NA
 904296 904297 SPA1459 SPA1460 spiA spiC TRUE 0.959 2.000 0.143 NA   NA
 904298 904299 SPA1461 SPA1462 ssrA ssrB TRUE 0.939 31.000 0.000 0.014 Y NA
 904299 904300 SPA1462 SPA1463 ssrB   TRUE 0.503 179.000 0.000 0.064 Y NA
 904300 904301 SPA1463 SPA1464     FALSE 0.080 172.000 0.000 NA   NA
 904302 904303 SPA1465 SPA1466 ydhZ ttrR FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 904303 904304 SPA1466 SPA1467 ttrR ttrS TRUE 0.991 -25.000 0.600 1.000 Y NA
 10702311 904305 SPA1468 SPA1469   ttrC TRUE 0.897 1.000 0.000 NA   NA
 904305 904306 SPA1469 SPA1470 ttrC ttrA TRUE 0.831 -7.000 0.000 NA   NA
 904306 10702312 SPA1470 SPA1471 ttrA   FALSE 0.011 323.000 0.000 NA   NA
 10702312 904307 SPA1471 SPA1472     TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 904307 904308 SPA1472 SPA1473     TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 904308 904309 SPA1473 SPA1474     TRUE 0.633 22.000 0.000 1.000   NA
 904309 904310 SPA1474 SPA1475   pykF FALSE 0.004 402.000 0.000 1.000 N NA
 904310 904311 SPA1475 SPA1476 pykF lppA FALSE 0.007 311.000 0.000 1.000 N NA
 904311 904312 SPA1476 SPA1477 lppA lppB TRUE 0.832 82.000 0.032 0.007 Y NA
 904312 904313 SPA1477 SPA1478 lppB lppB TRUE 0.836 78.000 0.032 0.007 Y NA
 904314 904315 SPA1479 SPA1480 ynhG ynhA FALSE 0.141 155.000 0.069 NA   NA
 904315 10702313 SPA1480 SPA1481 ynhA   TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 10702313 904316 SPA1481 SPA1483   sufC FALSE 0.003 1243.000 0.000 NA   NA
 904316 904317 SPA1483 SPA1484 sufC sufB TRUE 0.986 17.000 0.466 1.000 Y NA
 904317 904318 SPA1484 SPA1485 sufB sufA TRUE 0.837 9.000 0.041 NA   NA
 904320 904321 SPA1487 SPA1488   ydiH FALSE 0.080 172.000 0.000 NA   NA
 904321 904322 SPA1488 SPA1489 ydiH   FALSE 0.242 60.000 0.032 NA   NA
 904322 904323 SPA1489 SPA1490   ydiJ FALSE 0.460 54.000 0.129 NA N NA
 904328 904329 SPA1495 SPA1496 ydiA aroH FALSE 0.282 156.000 0.165 1.000   NA
 904329 904330 SPA1496 SPA1497 aroH ydiE FALSE 0.054 157.000 0.054 NA N NA
 904331 904332 SPA1498 SPA1499 ydiU ydiV FALSE 0.233 62.000 0.031 NA   NA
 904332 904333 SPA1499 SPA1500 ydiV nlpC FALSE 0.005 314.000 0.000 NA N NA
 904333 904334 SPA1500 SPA1501 nlpC btuD FALSE 0.424 77.000 0.167 NA N NA
 904334 904335 SPA1501 SPA1502 btuD btuE TRUE 0.670 0.000 0.018 1.000 N NA
 904335 904336 SPA1502 SPA1503 btuE btuC FALSE 0.248 92.000 0.084 1.000 N NA
 904336 904337 SPA1503 SPA1504 btuC himA FALSE 0.012 203.000 0.023 1.000 N NA
 904337 904338 SPA1504 SPA1505 himA pheT TRUE 0.957 5.000 0.208 1.000 N NA
 904338 904339 SPA1505 SPA1506 pheT pheS TRUE 0.996 16.000 0.574 0.001 Y NA
 904339 904340 SPA1506 SPA1507 pheS rplT FALSE 0.173 302.000 0.202 1.000 Y NA
 904340 904341 SPA1507 SPA1508 rplT rpmI TRUE 0.986 51.000 0.928 0.014 Y NA
 904343 904344 SPA1510 SPA1511 infC thrS TRUE 0.991 4.000 0.186 1.000 Y NA
 904346 904347 SPA1513 SPA1514     FALSE 0.079 173.000 0.000 NA   NA
 904347 904348 SPA1514 SPA1515     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904351 904352 SPA1518 SPA1519 pfkB ydiZ FALSE 0.156 97.000 0.025 NA   NA
 904352 904353 SPA1519 SPA1520 ydiZ   FALSE 0.138 107.000 0.016 NA   NA
 904355 904356 SPA1522 SPA1523 yniC ydjM FALSE 0.156 150.000 0.068 NA   NA
 904356 904357 SPA1523 SPA1524 ydjM ydjN FALSE 0.264 137.000 0.102 NA   NA
 904360 904361 SPA1527 SPA1528 celG celF TRUE 0.986 13.000 0.429 0.019   NA
 904361 904362 SPA1528 SPA1529 celF celD TRUE 0.691 125.000 0.625 1.000 N NA
 904362 904363 SPA1529 SPA1530 celD celC TRUE 0.978 13.000 0.727 1.000 N NA
 904363 904364 SPA1530 SPA1531 celC celB TRUE 0.985 51.000 0.833 0.010 Y NA
 904364 904365 SPA1531 SPA1532 celB celA TRUE 0.908 83.000 0.167 0.010 Y NA
 904365 904366 SPA1532 SPA1533 celA osmE FALSE 0.015 301.000 0.000 1.000   NA
 904367 904368 SPA1534 SPA1535 nadE   FALSE 0.039 121.000 0.010 1.000 N NA
 904369 904370 SPA1536 SPA1537 spy astE FALSE 0.005 336.000 0.000 NA N NA
 904370 904371 SPA1537 SPA1538 astE astB TRUE 0.982 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 904371 904372 SPA1538 SPA1539 astB astD TRUE 0.973 -3.000 0.306 1.000 N NA
 904372 904373 SPA1539 SPA1540 astD astA TRUE 0.953 -3.000 0.179 1.000 N NA
 904373 904374 SPA1540 SPA1541 astA astC TRUE 0.995 -9.000 0.625 1.000 Y NA
 904375 904376 SPA1542 SPA1543 xthA   FALSE 0.189 73.000 0.056 1.000 N NA
 904379 904380 SPA1546 SPA1547 topB selD TRUE 0.756 5.000 0.041 1.000 N NA
 904380 904381 SPA1547 SPA1548 selD ydjA FALSE 0.076 118.000 0.033 1.000 N NA
 904382 904383 SPA1549 SPA1550 sppA ansA FALSE 0.308 96.000 0.113 1.000 N NA
 904383 904384 SPA1550 SPA1551 ansA pncA FALSE 0.321 27.000 0.040 1.000 N NA
 904385 904386 SPA1552 SPA1553 yeaC yeaA TRUE 0.736 42.000 0.216 NA   NA
 904387 904388 SPA1554 SPA1555 gapA yeaD FALSE 0.121 329.000 0.154 1.000 Y NA
 904389 904390 SPA1556 SPA1557     FALSE 0.246 97.000 0.000 1.000   NA
 904390 904391 SPA1557 SPA1558   mipA FALSE 0.015 290.000 0.000 NA   NA
 10702314 904392 SPA1559 SPA1560   yeaH FALSE 0.181 123.000 0.000 NA   NA
 904392 904393 SPA1560 SPA1561 yeaH yeaJ FALSE 0.004 671.000 0.000 NA   NA
 904393 904394 SPA1561 SPA1562 yeaJ yeaK TRUE 0.533 41.000 0.083 NA   NA
 904398 904399 SPA1566 SPA1567 yeaN yeaO FALSE 0.108 119.000 0.007 NA   NA
 904400 904401 SPA1568 SPA1569   yaoF FALSE 0.298 69.000 0.057 NA   NA
 904401 904402 SPA1569 SPA1570 yaoF yeaQ FALSE 0.006 433.000 0.000 NA   NA
 904402 904403 SPA1570 SPA1571 yeaQ   TRUE 0.866 8.000 0.000 NA   NA
 904405 904406 SPA1573 SPA1574   yoaG FALSE 0.029 230.000 0.000 NA   NA
 904406 904407 SPA1574 SPA1575 yoaG yeaR TRUE 0.891 3.000 0.000 NA   NA
 904407 904408 SPA1575 SPA1576 yeaR yeaS FALSE 0.037 174.000 0.000 NA N NA
 904408 904409 SPA1576 SPA1577 yeaS aroQ FALSE 0.271 196.000 0.000 1.000 Y NA
 904410 904411 SPA1578 SPA1579     FALSE 0.251 79.000 0.000 NA   NA
 904412 904413 SPA1580 SPA1581     TRUE 0.558 69.000 0.000 0.063   NA
 904413 904414 SPA1581 SPA1582   aadA FALSE 0.152 145.000 0.000 1.000   NA
 904414 904415 SPA1582 SPA1583 aadA   FALSE 0.238 109.000 0.000 1.000   NA
 904415 904416 SPA1583 SPA1584     FALSE 0.207 112.000 0.000 NA   NA
 904416 904417 SPA1584 SPA1585     TRUE 0.861 9.000 0.000 NA   NA
 904419 904420 SPA1587 SPA1588     TRUE 0.957 -6.000 0.000 0.015   NA
 904420 904421 SPA1588 SPA1589     TRUE 0.865 -6.000 0.000 1.000   NA
 904421 904422 SPA1589 SPA1590     TRUE 0.982 -10.000 0.000 0.057 Y NA
 904422 904423 SPA1590 SPA1591     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.057 Y NA
 904424 904425 SPA1592 SPA1593     FALSE 0.125 149.000 0.000 NA   NA
 904427 904428 SPA1596 SPA1597     FALSE 0.021 255.000 0.000 NA   NA
 904429 904430 SPA1599 SPA1600 pagC   FALSE 0.008 378.000 0.000 NA   NA
 904430 904431 SPA1600 SPA1601     FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 904432 904433 SPA1602 SPA1603 pagD cspH FALSE 0.164 132.000 0.000 NA   NA
 904433 904434 SPA1603 SPA1604 cspH envE FALSE 0.007 402.000 0.000 NA   NA
 904434 904435 SPA1604 SPA1605 envE msgA FALSE 0.069 181.000 0.000 NA   NA
 904435 904436 SPA1605 SPA1606 msgA cdtB FALSE 0.004 874.000 0.000 NA   NA
 904436 904437 SPA1606 SPA1607 cdtB   FALSE 0.263 73.000 0.000 NA   NA
 904438 904439 SPA1608 SPA1609     FALSE 0.055 192.000 0.000 NA   NA
 904439 904440 SPA1609 SPA1610     TRUE 0.911 17.000 0.000 0.007   NA
 904440 904441 SPA1610 SPA1611     FALSE 0.003 947.000 0.000 NA   NA
 904441 904442 SPA1611 SPA1612   icdA FALSE 0.006 459.000 0.000 NA   NA
 904443 904444 SPA1613 SPA1614 rluB   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904444 904445 SPA1614 SPA1615   ymfB TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 904445 904446 SPA1615 SPA1616 ymfB trmU TRUE 0.535 54.000 0.158 1.000 N NA
 904446 904447 SPA1616 SPA1617 trmU ycfC TRUE 0.513 87.000 0.180 NA   NA
 904447 904448 SPA1617 SPA1618 ycfC purB TRUE 0.934 4.000 0.093 NA   NA
 904448 904449 SPA1618 SPA1619 purB phoP FALSE 0.039 124.000 0.011 1.000 N NA
 904449 904450 SPA1619 SPA1620 phoP phoQ TRUE 0.998 0.000 0.940 1.000 Y NA
 904450 904451 SPA1620 SPA1621 phoQ ycfD TRUE 0.727 81.000 0.408 NA   NA
 904452 904453 SPA1622 SPA1623   pepT TRUE 0.898 4.000 0.000 1.000   NA
 904454 904455 SPA1624 SPA1625 potA potB TRUE 0.994 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 904455 904456 SPA1625 SPA1626 potB sifA FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 904456 904457 SPA1626 SPA1627 sifA potC FALSE 0.012 316.000 0.000 NA   NA
 904457 904458 SPA1627 SPA1628 potC potD TRUE 0.933 25.000 0.007 0.057 Y NA
 904459 904460 SPA1629 SPA1630 cobB ycfX TRUE 0.960 17.000 0.119 1.000 Y NA
 904460 904461 SPA1630 SPA1631 ycfX ycfW TRUE 0.782 29.000 0.225 1.000 N NA
 904461 904462 SPA1631 SPA1632 ycfW ycfV TRUE 0.975 0.000 0.125 0.070 N NA
 904462 904463 SPA1632 SPA1633 ycfV ycfU TRUE 0.965 -7.000 0.175 0.070 N NA
 904464 904465 SPA1634 SPA1635 mfd ycfS FALSE 0.085 148.000 0.006 1.000   NA
 904466 904467 SPA1636 SPA1637 tnpA ycfR FALSE 0.039 211.000 0.000 NA   NA
 904469 904470 SPA1639 SPA1640 ycfJ ndh FALSE 0.085 191.000 0.071 1.000   NA
 904470 904471 SPA1640 SPA1641 ndh ycfP FALSE 0.019 278.000 0.057 NA   NA
 904471 904472 SPA1641 SPA1642 ycfP ycfO TRUE 0.697 25.000 0.091 NA   NA
 904472 904473 SPA1642 SPA1643 ycfO ycfN TRUE 0.554 23.000 0.069 1.000 N NA
 904473 904474 SPA1643 SPA1644 ycfN ycfM TRUE 0.947 -19.000 0.310 NA   NA
 904474 904475 SPA1644 SPA1645 ycfM ycfL TRUE 0.971 14.000 0.516 NA   NA
 904475 904476 SPA1645 SPA1646 ycfL ycfF TRUE 0.892 3.000 0.051 NA   NA
 904477 904478 SPA1648 SPA1649 ptsG ycfH FALSE 0.001 295.000 0.004 NA N NA
 904478 904479 SPA1649 SPA1650 ycfH holB TRUE 0.979 11.000 0.110 NA Y NA
 904479 904480 SPA1650 SPA1651 holB tmk TRUE 0.960 -3.000 0.211 1.000 N NA
 904480 904481 SPA1651 SPA1652 tmk yceG TRUE 0.941 -10.000 0.209 NA   NA
 904481 904482 SPA1652 SPA1653 yceG pabC TRUE 0.594 69.000 0.204 NA   NA
 904482 904483 SPA1653 SPA1654 pabC fabF FALSE 0.374 124.000 0.187 1.000 N NA
 904483 904484 SPA1654 SPA1655 fabF acpP TRUE 0.888 86.000 0.346 1.000 Y NA
 904484 904485 SPA1655 SPA1656 acpP fabG TRUE 0.868 156.000 0.321 0.004 Y NA
 904485 904486 SPA1656 SPA1657 fabG fabD TRUE 0.996 13.000 0.432 0.004 Y NA
 904486 904487 SPA1657 SPA1658 fabD fabH TRUE 0.989 16.000 0.182 0.004 Y NA
 904487 904488 SPA1658 SPA1659 fabH plsX TRUE 0.956 80.000 0.380 0.004 Y NA
 904488 904489 SPA1659 SPA1660 plsX rpmF TRUE 0.559 134.000 0.418 1.000 N NA
 904489 904490 SPA1660 SPA1661 rpmF yceD TRUE 0.864 52.000 0.599 NA   NA
 904490 904491 SPA1661 SPA1662 yceD   FALSE 0.442 37.000 0.000 NA   NA
 904493 904494 SPA1664 SPA1665 rluC   FALSE 0.030 190.000 0.005 NA   NA
 904496 904497 SPA1667 SPA1668 flgL flgK TRUE 0.990 15.000 0.142 0.001 Y NA
 904497 904498 SPA1668 SPA1669 flgK flgJ TRUE 0.981 65.000 0.705 0.002 Y NA
 904498 904499 SPA1669 SPA1670 flgJ flgI TRUE 0.993 0.000 0.036 0.007 Y NA
 904499 904500 SPA1670 SPA1671 flgI flgH TRUE 0.988 12.000 0.073 0.007 Y NA
 904500 904501 SPA1671 SPA1672 flgH flgG TRUE 0.959 55.000 0.268 0.005 Y NA
 904501 904502 SPA1672 SPA1673 flgG flgF TRUE 0.996 14.000 0.420 0.001 Y NA
 904502 904503 SPA1673 SPA1674 flgF flgE TRUE 0.992 21.000 0.476 0.004 Y NA
 904503 904504 SPA1674 SPA1675 flgE flgD TRUE 0.920 27.000 0.116 NA Y NA
 904504 904505 SPA1675 SPA1676 flgD flgC TRUE 0.983 12.000 0.186 NA Y NA
 904505 904506 SPA1676 SPA1677 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 904507 904508 SPA1678 SPA1679 flgA flgM TRUE 0.867 92.000 0.330 NA Y NA
 904508 904509 SPA1679 SPA1680 flgM flgN TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 904510 904511 SPA1681 SPA1682 mviN mviM FALSE 0.015 265.000 0.022 1.000   NA
 904511 904512 SPA1682 SPA1683 mviM yceH TRUE 0.945 2.000 0.103 NA   NA
 904512 904513 SPA1683 SPA1684 yceH rimJ TRUE 0.647 36.000 0.116 NA   NA
 904514 904515 SPA1685 SPA1686 yceL grxB FALSE 0.370 64.000 0.103 1.000 N NA
 904515 10702318 SPA1686 SPA1687 grxB   FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 10702318 904516 SPA1687 SPA1688   pyrC FALSE 0.219 104.000 0.000 NA   NA
 904516 904517 SPA1688 SPA1689 pyrC dinI FALSE 0.199 74.000 0.031 NA   NA
 904517 904518 SPA1689 SPA1690 dinI yceP FALSE 0.015 290.000 0.000 NA   NA
 904518 904519 SPA1690 SPA1691 yceP solA TRUE 0.681 113.000 0.423 NA   NA
 904519 904520 SPA1691 SPA1692 solA yceO TRUE 0.785 41.000 0.269 NA   NA
 904520 904521 SPA1692 SPA1693 yceO nanA FALSE 0.019 263.000 0.000 NA   NA
 904521 904522 SPA1693 SPA1694 nanA yceI TRUE 0.991 -3.000 0.676 NA   NA
 904524 904525 SPA1696 SPA1697 htrB yceE TRUE 0.761 155.000 0.857 0.087 N NA
 904525 904526 SPA1697 SPA1698 yceE msyB TRUE 0.681 82.000 0.333 NA   NA
 904527 904528 SPA1699 SPA1700 yceK mdoH TRUE 0.479 74.000 0.135 NA   NA
 904528 904529 SPA1700 SPA1701 mdoH mdoG TRUE 0.974 -7.000 0.469 1.000 N NA
 904531 904532 SPA1703 SPA1704 ymdC   TRUE 0.688 -64.000 0.046 NA   NA
 904532 904533 SPA1704 SPA1705   ymdA FALSE 0.170 89.000 0.028 NA   NA
 904533 904534 SPA1705 SPA1706 ymdA csgC TRUE 0.626 132.000 0.429 NA   NA
 904534 904535 SPA1706 SPA1707 csgC csgA TRUE 0.856 62.000 0.667 NA   NA
 904535 904536 SPA1707 SPA1708 csgA csgB TRUE 0.919 42.000 0.333 0.009   NA
 904537 904538 SPA1709 SPA1710 csgD csgE TRUE 0.961 5.000 0.176 NA   NA
 904538 10702319 SPA1710 SPA1711 csgE   TRUE 0.535 27.000 0.000 NA   NA
 10702319 904539 SPA1711 SPA1712   csgG TRUE 0.535 27.000 0.000 NA   NA
 904540 904541 SPA1713 SPA1714 ycdZ ycdY TRUE 0.589 53.000 0.145 NA   NA
 904541 904542 SPA1714 SPA1715 ycdY ycdX TRUE 0.922 24.000 0.417 1.000   NA
 904542 904543 SPA1715 SPA1716 ycdX ycdW TRUE 0.815 85.000 0.169 1.000 Y NA
 904545 904546 SPA1718 SPA1719 yjhC   TRUE 0.922 14.000 0.182 1.000   NA
 904546 904547 SPA1719 SPA1720     FALSE 0.051 283.000 0.000 0.056   NA
 904547 10702320 SPA1720 SPA1721     FALSE 0.378 46.000 0.000 NA   NA
 904548 904549 SPA1722 SPA1723     FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
 904549 904550 SPA1723 SPA1724     FALSE 0.009 286.000 0.000 1.000 N NA
 904551 904552 SPA1725 SPA1726 phoH putP FALSE 0.002 826.000 0.000 1.000 N NA
 904553 904554 SPA1727 SPA1728 putA   FALSE 0.456 59.000 0.094 NA   NA
 904555 904556 SPA1729 SPA1730 ycdC ymdF FALSE 0.111 136.000 0.028 NA   NA
 904557 904558 SPA1731 SPA1732 wrbA yccJ TRUE 0.899 21.000 0.290 NA   NA
 904559 904560 SPA1733 SPA1734 agp scsD FALSE 0.181 133.000 0.000 1.000   NA
 904560 904561 SPA1734 SPA1735 scsD scsC TRUE 0.996 -10.000 0.298 0.002 Y NA
 904561 10702321 SPA1735 SPA1736 scsC   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 10702321 904562 SPA1736 SPA1737   scsA FALSE 0.361 49.000 0.000 NA   NA
 904563 904564 SPA1738 SPA1739 cbpA yccD TRUE 0.989 0.000 0.512 NA   NA
 904564 904565 SPA1739 SPA1740 yccD   FALSE 0.004 654.000 0.000 NA   NA
 904566 904567 SPA1741 SPA1742   hpaA TRUE 0.823 14.000 0.067 1.000   NA
 904567 904568 SPA1742 SPA1743 hpaA hpaX TRUE 0.953 10.000 0.233 1.000 N NA
 904568 904569 SPA1743 SPA1744 hpaX hpcH TRUE 0.835 73.000 0.175 1.000 Y NA
 904569 904570 SPA1744 SPA1745 hpcH hpcG TRUE 0.972 11.000 0.439 1.000 N NA
 904570 904571 SPA1745 SPA1746 hpcG hpcD FALSE 0.414 143.000 0.282 1.000 N NA
 904571 904572 SPA1746 SPA1747 hpcD hpcB TRUE 0.975 10.000 0.330 1.000   NA
 904572 904573 SPA1747 SPA1748 hpcB hpaE TRUE 0.986 2.000 0.378 1.000   NA
 904573 10702322 SPA1748 SPA1749 hpaE   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904574 904575 SPA1750 SPA1751 hpcR hpaB FALSE 0.024 473.000 0.000 0.001 N NA
 904575 904576 SPA1751 SPA1752 hpaB hpaC TRUE 0.970 18.000 0.226 0.001   NA
 904578 904579 SPA1754 SPA1755 copR copS TRUE 0.999 -7.000 0.857 0.001 Y NA
 904579 10702323 SPA1755 SPA1756 copS   FALSE 0.079 173.000 0.000 NA   NA
 10702323 904580 SPA1756 SPA1757     FALSE 0.214 109.000 0.000 NA   NA
 904582 904583 SPA1759 SPA1760 sigD sigE TRUE 0.936 17.000 0.333 NA   NA
 904585 904586 SPA1762 SPA1763 pipB pipA FALSE 0.032 223.000 0.000 NA   NA
 904588 904589 SPA1765 SPA1766 yccA yccK FALSE 0.181 87.000 0.018 1.000   NA
 904590 904591 SPA1767 SPA1768 yccX   FALSE 0.086 49.000 0.007 1.000 N NA
 904591 10702324 SPA1768 SPA1769     TRUE 0.548 26.000 0.000 NA   NA
 904592 904593 SPA1770 SPA1771 yccW yccV FALSE 0.465 58.000 0.094 NA   NA
 904595 904596 SPA1773 SPA1774 yccT mgsA FALSE 0.235 95.000 0.055 NA   NA
 904598 904599 SPA1776 SPA1777 yccF yccS TRUE 0.768 19.000 0.090 NA   NA
 904601 904602 SPA1779 SPA1780 sulA ompA FALSE 0.005 357.000 0.000 1.000 N NA
 904604 904605 SPA1782 SPA1783 lonH fabA TRUE 0.627 69.000 0.290 1.000 N NA
 904606 904607 SPA1784 SPA1785 rmf ymbA FALSE 0.021 256.000 0.000 NA   NA
 904607 904608 SPA1785 SPA1786 ymbA pqiB TRUE 0.988 -3.000 0.531 NA   NA
 904608 904609 SPA1786 SPA1787 pqiB pqiA TRUE 0.992 5.000 0.819 NA   NA
 904609 904610 SPA1787 SPA1788 pqiA uup TRUE 0.750 15.000 0.054 NA   NA
 904610 904611 SPA1788 SPA1789 uup ycbY TRUE 0.829 13.000 0.061 1.000   NA
 904613 904614 SPA1791 SPA1792 ycbW pyrD FALSE 0.131 166.000 0.081 NA   NA
 904614 904615 SPA1792 SPA1793 pyrD pepN FALSE 0.009 208.000 0.014 1.000 N NA
 904617 904618 SPA1795 SPA1796     FALSE 0.142 246.000 0.000 1.000 Y NA
 904619 904620 SPA1797 SPA1798   asnS FALSE 0.007 201.000 0.005 1.000 N NA
 904620 904621 SPA1798 SPA1799 asnS ompF FALSE 0.002 607.000 0.000 1.000 N NA
 904621 904622 SPA1799 SPA1800 ompF aspC FALSE 0.048 185.000 0.060 1.000 N NA
 904623 904624 SPA1801 SPA1802 ycbL ycbK TRUE 0.660 28.000 0.089 NA   NA
 904624 904625 SPA1802 SPA1803 ycbK ycbB FALSE 0.130 260.000 0.372 NA   NA
 904625 904626 SPA1803 SPA1804 ycbB mukB FALSE 0.011 345.000 0.000 1.000   NA
 904626 904627 SPA1804 SPA1805 mukB mukE TRUE 0.995 0.000 0.000 0.001 Y NA
 904627 904628 SPA1805 SPA1806 mukE mukF TRUE 0.973 8.000 0.036 NA Y NA
 904628 904629 SPA1806 SPA1807 mukF smtA TRUE 0.959 -7.000 0.325 NA N NA
 904631 904632 SPA1809 SPA1810   kdsB FALSE 0.025 211.000 0.023 NA   NA
 904632 904633 SPA1810 SPA1811 kdsB ycaR TRUE 0.975 -3.000 0.265 NA   NA
 904633 904634 SPA1811 SPA1812 ycaR ycaQ FALSE 0.234 52.000 0.016 NA   NA
 904634 904635 SPA1812 SPA1813 ycaQ lpxK FALSE 0.270 44.000 0.017 NA   NA
 904635 904636 SPA1813 SPA1814 lpxK msbA TRUE 0.959 -3.000 0.205 1.000 N NA
 904636 10702325 SPA1814 SPA1815 msbA   FALSE 0.442 37.000 0.000 NA   NA
 10702325 904637 SPA1815 SPA1816   himD FALSE 0.029 230.000 0.000 NA   NA
 904637 904638 SPA1816 SPA1817 himD rpsA FALSE 0.347 156.000 0.292 1.000 N NA
 904638 904639 SPA1817 SPA1818 rpsA cmk TRUE 0.519 114.000 0.281 1.000 N NA
 904639 904640 SPA1818 SPA1819 cmk ycaL FALSE 0.013 173.000 0.004 1.000 N NA
 904640 904641 SPA1819 SPA1820 ycaL aroA FALSE 0.024 143.000 0.003 1.000 N NA
 904641 904642 SPA1820 SPA1821 aroA serC TRUE 0.684 71.000 0.033 1.000 Y NA
 904642 904643 SPA1821 SPA1822 serC ycaP FALSE 0.036 186.000 0.014 NA   NA
 904644 904645 SPA1823 SPA1824 ycaO focA FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 904645 904646 SPA1824 SPA1825 focA pflB TRUE 0.708 60.000 0.345 1.000 N NA
 904647 904648 SPA1827 SPA1828   pflA FALSE 0.190 119.000 0.000 NA   NA
 904649 904650 SPA1829 SPA1830 ycaM ycaD FALSE 0.020 218.000 0.000 1.000 N NA
 904650 904651 SPA1830 SPA1831 ycaD   FALSE 0.038 213.000 0.000 NA   NA
 904651 10702327 SPA1831 SPA1832     TRUE 0.504 30.000 0.000 NA   NA
 10702327 904652 SPA1832 SPA1833   dmsB TRUE 0.895 2.000 0.000 NA   NA
 904652 904653 SPA1833 SPA1834 dmsB dmsA TRUE 0.993 11.000 0.172 0.051 Y NA
 904653 904654 SPA1834 SPA1835 dmsA serS FALSE 0.016 236.000 0.000 1.000 N NA
 904654 904655 SPA1835 SPA1836 serS ycaJ FALSE 0.057 259.000 0.078 0.084 N NA
 904655 904656 SPA1836 SPA1837 ycaJ lolA TRUE 0.932 10.000 0.167 1.000 N NA
 904656 904657 SPA1837 SPA1838 lolA ftsK FALSE 0.382 152.000 0.305 1.000 N NA
 904657 904658 SPA1838 SPA1839 ftsK lrp TRUE 0.506 135.000 0.345 1.000 N NA
 904659 904660 SPA1840 SPA1841 trxB cydD FALSE 0.321 183.000 0.049 1.000 Y NA
 904660 904661 SPA1841 SPA1842 cydD cydC TRUE 0.999 1.000 0.631 0.006 Y NA
 904661 904662 SPA1842 SPA1843 cydC aat TRUE 0.806 45.000 0.049 1.000 Y NA
 904662 904663 SPA1843 SPA1844 aat   TRUE 0.897 1.000 0.000 NA   NA
 904663 904664 SPA1844 SPA1845   infA TRUE 0.706 -72.000 0.000 NA   NA
 904666 904667 SPA1847 SPA1848     TRUE 0.917 20.000 0.333 NA   NA
 904667 904668 SPA1848 SPA1849     FALSE 0.122 150.000 0.000 NA   NA
 904668 904669 SPA1849 SPA1850     FALSE 0.187 120.000 0.000 NA   NA
 904669 904670 SPA1850 SPA1851     FALSE 0.216 108.000 0.000 NA   NA
 904670 904671 SPA1851 SPA1852     FALSE 0.094 162.000 0.000 NA   NA
 904671 10702328 SPA1852 SPA1853     FALSE 0.053 195.000 0.000 NA   NA
 904672 904673 SPA1854 SPA1855 clpA yljA TRUE 0.922 31.000 0.596 NA   NA
 904675 904676 SPA1857 SPA1858 ybjZ ybjY TRUE 0.995 -3.000 0.789 0.092 N NA
 904679 904680 SPA1861 SPA1862 ybjE hcp FALSE 0.139 144.000 0.000 NA   NA
 904680 904681 SPA1862 SPA1863 hcp hcr TRUE 0.984 12.000 0.000 0.018 Y NA
 904681 904682 SPA1863 SPA1864 hcr poxB FALSE 0.030 158.000 0.025 1.000 N NA
 904682 904683 SPA1864 SPA1865 poxB ybjU TRUE 0.824 39.000 0.041 1.000 Y NA
 904683 904684 SPA1865 SPA1866 ybjU ybjT TRUE 0.822 11.000 0.074 1.000 N NA
 904684 904685 SPA1866 SPA1867 ybjT   TRUE 0.820 96.000 0.022 0.003 Y NA
 904686 904687 SPA1868 SPA1869 ybjR   TRUE 0.857 -3.000 0.037 NA   NA
 904688 904689 SPA1870 SPA1871 ybjP artP FALSE 0.046 229.000 0.081 NA   NA
 904689 904690 SPA1871 SPA1872 artP artI TRUE 0.979 18.000 0.323 1.000 Y NA
 904690 904691 SPA1872 SPA1873 artI artQ TRUE 0.996 7.000 0.260 0.055 Y NA
 904691 904692 SPA1873 SPA1874 artQ artM TRUE 0.999 0.000 0.714 0.015 Y NA
 904692 904693 SPA1874 SPA1875 artM artJ FALSE 0.386 237.000 0.143 0.055 Y NA
 904694 904695 SPA1876 SPA1877     TRUE 0.987 10.000 0.800 1.000 N NA
 904695 904696 SPA1877 SPA1878     TRUE 0.974 30.000 0.800 0.014   NA
 904696 904697 SPA1878 SPA1879     TRUE 0.861 9.000 0.000 NA   NA
 904697 904698 SPA1879 SPA1880   ybjF FALSE 0.255 77.000 0.000 NA   NA
 904698 904699 SPA1880 SPA1881 ybjF ybjO TRUE 0.744 43.000 0.226 NA   NA
 904699 904700 SPA1881 SPA1882 ybjO potI TRUE 0.644 74.000 0.264 NA   NA
 904700 904701 SPA1882 SPA1883 potI potH TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.055 Y NA
 904701 904702 SPA1883 SPA1884 potH potG TRUE 0.997 10.000 0.857 1.000 Y NA
 904702 904703 SPA1884 SPA1885 potG potF TRUE 0.937 88.000 0.679 1.000 Y NA
 904703 904704 SPA1885 SPA1886 potF ybjN FALSE 0.009 349.000 0.000 NA   NA
 904704 904705 SPA1886 SPA1887 ybjN rimK FALSE 0.464 97.000 0.161 NA   NA
 904705 904706 SPA1887 SPA1888 rimK nfsA FALSE 0.422 58.000 0.114 1.000 N NA
 904706 904707 SPA1888 SPA1889 nfsA ybjC TRUE 0.906 -16.000 0.159 NA   NA
 904712 904713 SPA1894 SPA1895     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000   NA
 904715 904716 SPA1897 SPA1898 ybjG deoR TRUE 0.641 72.000 0.235 1.000   NA
 904719 904720 SPA1901 SPA1902 yliI yliH FALSE 0.180 118.000 0.047 NA   NA
 904722 904723 SPA1904 SPA1905 yliD yliC TRUE 0.999 3.000 0.689 0.055 Y NA
 904723 904724 SPA1905 SPA1906 yliC yliB TRUE 0.978 61.000 0.803 0.055 Y NA
 904724 904725 SPA1906 SPA1907 yliB yliA TRUE 0.509 33.000 0.000 1.000   NA
 904725 904726 SPA1907 SPA1908 yliA ybiK TRUE 0.849 11.000 0.000 1.000   NA
 904727 904728 SPA1909 SPA1910 moeA moeB TRUE 0.987 24.000 0.323 0.003 Y NA
 904728 904729 SPA1910 SPA1911 moeB ybiY FALSE 0.010 278.000 0.000 1.000 N NA
 904729 904730 SPA1911 SPA1912 ybiY ybiW TRUE 0.990 6.000 0.316 0.002 N NA
 904735 904736 SPA1917 SPA1918 ybiR   TRUE 0.612 -3.000 0.014 1.000 N NA
 10702329 904739 SPA1921 SPA1922   dps FALSE 0.013 303.000 0.000 NA   NA
 904739 904740 SPA1922 SPA1923 dps glnH FALSE 0.003 477.000 0.000 1.000 N NA
 904740 904741 SPA1923 SPA1924 glnH glnP TRUE 0.667 146.000 0.000 0.068 Y NA
 904741 904742 SPA1924 SPA1925 glnP glnQ TRUE 0.978 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 904742 904743 SPA1925 SPA1926 glnQ ybiO FALSE 0.086 119.000 0.039 1.000 N NA
 904745 904746 SPA1928 SPA1929 ybiI   FALSE 0.100 158.000 0.000 NA   NA
 904746 904747 SPA1929 SPA1930   ybiJ TRUE 0.782 -13.000 0.000 NA   NA
 904748 904749 SPA1931 SPA1932 ybiB dinG FALSE 0.300 30.000 0.041 1.000 N NA
 904749 904750 SPA1932 SPA1933 dinG rhlE FALSE 0.375 207.000 0.029 0.013 Y NA
 904751 904752 SPA1934 SPA1935 ybiH   TRUE 0.970 0.000 0.236 1.000 N NA
 904752 904753 SPA1935 SPA1936   ybhF TRUE 0.983 -7.000 0.545 1.000   NA
 904753 904754 SPA1936 SPA1937 ybhF ybhS TRUE 0.990 -7.000 0.547 0.084   NA
 904754 904755 SPA1937 SPA1938 ybhS ybhR TRUE 0.959 116.000 0.609 0.006 Y NA
 904757 904758 SPA1940 SPA1941 ybhP ybhO TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904758 904759 SPA1941 SPA1942 ybhO ybhN TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 904760 904761 SPA1943 SPA1944   ybhM FALSE 0.057 190.000 0.000 NA   NA
 904761 904762 SPA1944 SPA1945 ybhM ybhL FALSE 0.104 147.000 0.037 NA   NA
 904762 904763 SPA1945 SPA1946 ybhL moaE FALSE 0.274 48.000 0.025 NA   NA
 904763 904764 SPA1946 SPA1947 moaE moaD TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 904764 904765 SPA1947 SPA1948 moaD moaC TRUE 0.994 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 904765 904766 SPA1948 SPA1949 moaC moaB TRUE 0.995 3.000 0.109 0.003 Y NA
 904766 904767 SPA1949 SPA1950 moaB moaA TRUE 0.976 22.000 0.108 0.003 Y NA
 10702330 904769 SPA1952 SPA1953     TRUE 0.866 8.000 0.000 NA   NA
 904769 904770 SPA1953 SPA1954   uvrB FALSE 0.012 308.000 0.000 NA   NA
 904770 904771 SPA1954 SPA1955 uvrB bioD FALSE 0.009 651.000 0.000 0.083 N NA
 904771 904772 SPA1955 SPA1956 bioD bioC TRUE 0.990 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 904772 904773 SPA1956 SPA1957 bioC bioF TRUE 0.990 -16.000 0.133 0.002 Y NA
 904773 904774 SPA1957 SPA1958 bioF bioB TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 904775 904776 SPA1959 SPA1960 bioA ybhB FALSE 0.190 58.000 0.003 NA   NA
 904777 10702331 SPA1961 SPA1962 hutH   TRUE 0.895 2.000 0.000 NA   NA
 10702331 904778 SPA1962 SPA1963   hutC FALSE 0.050 197.000 0.000 NA   NA
 904778 904779 SPA1963 SPA1964 hutC hutG FALSE 0.321 45.000 0.062 1.000 N NA
 904779 904780 SPA1964 SPA1965 hutG hutI TRUE 0.950 -3.000 0.171 1.000 N NA
 904784 904785 SPA1969 SPA1970 modC modB TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 904785 904786 SPA1970 SPA1971 modB modA TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 904786 904787 SPA1971 SPA1972 modA ybhT FALSE 0.117 167.000 0.072 NA   NA
 904788 904789 SPA1973 SPA1974 modE modF TRUE 0.549 68.000 0.000 0.083   NA
 904789 904790 SPA1974 SPA1975 modF   FALSE 0.081 171.000 0.000 NA   NA
 904790 904791 SPA1975 SPA1976   galE FALSE 0.032 223.000 0.000 NA   NA
 904791 904792 SPA1976 SPA1977 galE galT TRUE 0.957 11.000 0.053 0.001 N NA
 904792 904793 SPA1977 SPA1978 galT galK TRUE 0.994 3.000 0.370 0.001 N NA
 904793 904794 SPA1978 SPA1979 galK galM TRUE 0.993 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 904794 904795 SPA1979 SPA1980 galM gpmA FALSE 0.147 224.000 0.009 1.000 Y NA
 904796 904797 SPA1981 SPA1982     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 904797 904798 SPA1982 SPA1983   aroG FALSE 0.068 153.000 0.000 1.000 N NA
 904799 904800 SPA1984 SPA1985 ybgS ybgR FALSE 0.231 111.000 0.057 NA   NA
 904801 904802 SPA1986 SPA1987 pnuC nadA TRUE 0.878 25.000 0.023 1.000 Y NA
 904802 904803 SPA1987 SPA1988 nadA   FALSE 0.005 552.000 0.000 NA   NA
 904803 904804 SPA1988 SPA1989     FALSE 0.151 139.000 0.000 NA   NA
 904804 904805 SPA1989 SPA1990     FALSE 0.133 146.000 0.000 NA   NA
 904805 904806 SPA1990 SPA1991     TRUE 0.870 7.000 0.000 NA   NA
 904806 904807 SPA1991 SPA1992     FALSE 0.149 140.000 0.000 NA   NA
 904807 904808 SPA1992 SPA1993   ybgF FALSE 0.089 165.000 0.000 NA   NA
 904808 904809 SPA1993 SPA1994 ybgF pal TRUE 0.916 10.000 0.088 1.000   NA
 904809 904810 SPA1994 SPA1995 pal tolB TRUE 0.892 35.000 0.592 1.000 N NA
 904810 904811 SPA1995 SPA1996 tolB tolA FALSE 0.089 124.000 0.051 NA N NA
 904811 904812 SPA1996 SPA1997 tolA tolR FALSE 0.364 65.000 0.114 NA N NA
 904812 904813 SPA1997 SPA1998 tolR tolQ TRUE 0.998 4.000 0.556 0.067 Y NA
 904813 904814 SPA1998 SPA1999 tolQ ybgC TRUE 0.990 -3.000 0.593 1.000   NA
 904814 904815 SPA1999 SPA2000 ybgC ybgE FALSE 0.054 229.000 0.095 NA   NA
 904815 904816 SPA2000 SPA2001 ybgE ybgT FALSE 0.194 212.000 0.310 NA   NA
 904816 904817 SPA2001 SPA2002 ybgT cydB TRUE 0.888 15.000 0.149 NA   NA
 904817 904818 SPA2002 SPA2003 cydB cydA TRUE 0.972 16.000 0.000 0.051 Y NA
 904818 904819 SPA2003 SPA2004 cydA sucD FALSE 0.021 1586.000 0.000 1.000 Y NA
 904819 904820 SPA2004 SPA2005 sucD sucC TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 904820 904821 SPA2005 SPA2006 sucC sucB TRUE 0.665 142.000 0.136 1.000 Y NA
 904821 904822 SPA2006 SPA2007 sucB sucA TRUE 0.993 15.000 0.667 1.000 Y NA
 904822 904823 SPA2007 SPA2008 sucA sdhB FALSE 0.037 526.000 0.067 1.000 Y NA
 904823 904824 SPA2008 SPA2009 sdhB sdhA TRUE 0.997 14.000 0.604 0.003 Y NA
 904824 904825 SPA2009 SPA2010 sdhA sdhD TRUE 0.999 0.000 0.705 0.003 Y NA
 904825 904826 SPA2010 SPA2011 sdhD sdhC TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 904826 904827 SPA2011 SPA2012 sdhC   FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 904828 904829 SPA2013 SPA2014 gltA abrB FALSE 0.085 137.000 0.005 NA   NA
 904830 904831 SPA2015 SPA2016 nei   FALSE 0.361 49.000 0.000 NA   NA
 904831 904832 SPA2016 SPA2017     FALSE 0.280 68.000 0.000 NA   NA
 904832 904833 SPA2017 SPA2018     TRUE 0.885 4.000 0.000 NA   NA
 904833 904834 SPA2018 SPA2019     FALSE 0.054 193.000 0.000 NA   NA
 904834 904835 SPA2019 SPA2020     FALSE 0.225 94.000 0.000 NA   NA
 904835 904836 SPA2020 SPA2021     FALSE 0.024 903.000 0.000 1.000 Y NA
 904836 904837 SPA2021 SPA2022     FALSE 0.023 905.000 0.000 1.000 Y NA
 904837 904838 SPA2022 SPA2023     FALSE 0.020 259.000 0.000 NA   NA
 904838 10702332 SPA2023 SPA2024     TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 10702332 904839 SPA2024 SPA2025     FALSE 0.006 460.000 0.000 NA   NA
 904839 904840 SPA2025 SPA2026     FALSE 0.307 60.000 0.000 NA   NA
 904840 904841 SPA2026 SPA2027   ybgL FALSE 0.011 323.000 0.000 NA   NA
 904841 904842 SPA2027 SPA2028 ybgL ybgK TRUE 0.943 -10.000 0.211 NA   NA
 904842 904843 SPA2028 SPA2029 ybgK ybgJ TRUE 0.993 -6.000 0.379 NA Y NA
 904843 904844 SPA2029 SPA2030 ybgJ ybgI TRUE 0.710 16.000 0.050 NA   NA
 904846 904847 SPA2032 SPA2033 phrB ybfA FALSE 0.118 111.000 0.004 NA   NA
 904848 904849 SPA2034 SPA2035   kdpA TRUE 0.982 0.000 0.000 0.001   NA
 904849 904850 SPA2035 SPA2036 kdpA kdpB TRUE 0.986 21.000 0.201 0.001 Y NA
 904850 904851 SPA2036 SPA2037 kdpB kdpC TRUE 0.999 6.000 0.877 0.001 Y NA
 904851 904852 SPA2037 SPA2038 kdpC kdpD TRUE 0.964 -3.000 0.100 0.090 N NA
 904852 904853 SPA2038 SPA2039 kdpD kdpE TRUE 0.995 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 904853 904854 SPA2039 SPA2040 kdpE speF FALSE 0.002 763.000 0.000 1.000 N NA
 904854 904855 SPA2040 SPA2041 speF potE TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 904855 904856 SPA2041 SPA2042 potE   FALSE 0.315 65.000 0.050 1.000   NA
 904857 904858 SPA2043 SPA2044 pgm seqA TRUE 0.731 25.000 0.151 1.000 N NA
 904859 904860 SPA2045 SPA2046 ybfF ybfE TRUE 0.501 134.000 0.276 NA   NA
 904860 904861 SPA2046 SPA2047 ybfE fldA TRUE 0.571 151.000 0.473 1.000   NA
 904861 904862 SPA2047 SPA2048 fldA fur FALSE 0.034 282.000 0.156 1.000 N NA
 904862 904863 SPA2048 SPA2049 fur   FALSE 0.308 115.000 0.020 0.060 N NA
 904863 904864 SPA2049 SPA2050     FALSE 0.144 98.000 0.053 1.000 N NA
 904864 904865 SPA2050 SPA2051     TRUE 0.978 -13.000 0.618 NA   NA
 904865 904866 SPA2051 SPA2052   citA FALSE 0.423 51.000 0.069 NA   NA
 904867 904868 SPA2053 SPA2054 ybfN ybfM FALSE 0.357 50.000 0.000 NA   NA
 904868 904869 SPA2054 SPA2055 ybfM glnS FALSE 0.005 661.000 0.000 1.000   NA
 904869 904870 SPA2055 SPA2056 glnS nagE FALSE 0.007 211.000 0.006 1.000 N NA
 904871 904872 SPA2057 SPA2058 nagB nagA TRUE 0.979 60.000 0.557 0.001 Y NA
 904872 904873 SPA2058 SPA2059 nagA nagC TRUE 0.997 5.000 0.571 1.000 Y NA
 904873 904874 SPA2059 SPA2060 nagC nagD TRUE 0.825 47.000 0.070 1.000 Y NA
 904874 10702333 SPA2060 SPA2061 nagD   FALSE 0.015 290.000 0.000 NA   NA
 10702333 904875 SPA2061 SPA2062   metU FALSE 0.032 222.000 0.000 NA   NA
 904875 904876 SPA2062 SPA2063 metU leuW TRUE 0.761 14.000 0.000 NA   NA
 904876 904877 SPA2063 SPA2064 leuW glnW TRUE 0.535 27.000 0.000 NA   NA
 904877 904878 SPA2064 SPA2065 glnW glnW FALSE 0.427 39.000 0.000 NA   NA
 904878 904879 SPA2065 SPA2066 glnW metU TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   NA
 904879 904880 SPA2066 SPA2067 metU glnX FALSE 0.357 50.000 0.000 NA   NA
 904880 904881 SPA2067 SPA2068 glnX glnX FALSE 0.372 47.000 0.000 NA   NA
 904883 904884 SPA2070 SPA2071 miaB ybeZ FALSE 0.238 166.000 0.220 1.000 N NA
 904884 904885 SPA2071 SPA2072 ybeZ ybeY TRUE 0.986 -3.000 0.457 NA   NA
 904885 904886 SPA2072 SPA2073 ybeY ybeX FALSE 0.239 158.000 0.150 NA   NA
 904886 904887 SPA2073 SPA2074 ybeX lnt TRUE 0.939 20.000 0.557 1.000 N NA
 904887 904888 SPA2074 SPA2075 lnt ybeJ FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
 904888 904889 SPA2075 SPA2076 ybeJ gltJ TRUE 0.597 160.000 0.000 0.054 Y NA
 904889 904890 SPA2076 SPA2077 gltJ gltK TRUE 0.999 0.000 0.933 0.015 Y NA
 904890 904891 SPA2077 SPA2078 gltK gltL TRUE 0.996 0.000 0.379 1.000 Y NA
 904891 904892 SPA2078 SPA2079 gltL ybeK FALSE 0.386 117.000 0.195 NA N NA
 904892 904893 SPA2079 SPA2080 ybeK   TRUE 0.487 32.000 0.000 NA   NA
 904894 904895 SPA2081 SPA2082 ybeL   FALSE 0.250 93.000 0.000 1.000   NA
 904895 904896 SPA2082 SPA2083     FALSE 0.308 68.000 0.000 1.000   NA
 904896 904897 SPA2083 SPA2084     FALSE 0.389 50.000 0.000 1.000   NA
 904897 904898 SPA2084 SPA2085     TRUE 0.983 17.000 0.409 0.001   NA
 904899 904900 SPA2086 SPA2087 leuS rlpB TRUE 0.874 15.000 0.182 NA N NA
 904900 904901 SPA2087 SPA2088 rlpB holA TRUE 0.960 0.000 0.199 NA N NA
 904901 904902 SPA2088 SPA2089 holA ybeN TRUE 0.804 2.000 0.045 1.000 N NA
 904904 904905 SPA2091 SPA2092 cobC ybeB FALSE 0.011 328.000 0.000 NA   NA
 904905 904906 SPA2092 SPA2093 ybeB ybeA TRUE 0.979 4.000 0.307 NA   NA
 904906 904907 SPA2093 SPA2094 ybeA pbpA FALSE 0.412 31.000 0.031 NA   NA
 904907 904908 SPA2094 SPA2095 pbpA mrdB TRUE 0.804 3.000 0.046 1.000 N NA
 904908 904909 SPA2095 SPA2096 mrdB rlpA TRUE 0.554 11.000 0.035 NA N NA
 904909 904910 SPA2096 SPA2097 rlpA dacA TRUE 0.844 140.000 0.475 NA Y NA
 904910 904911 SPA2097 SPA2098 dacA ybeD FALSE 0.304 108.000 0.081 NA   NA
 904911 904912 SPA2098 SPA2099 ybeD lipB TRUE 0.545 100.000 0.219 NA   NA
 904912 904913 SPA2099 SPA2100 lipB ybeF FALSE 0.008 302.000 0.000 1.000 N NA
 904913 904914 SPA2100 SPA2101 ybeF lipA FALSE 0.007 206.000 0.005 1.000 N NA
 904915 904916 SPA2102 SPA2103 tatE ybeM FALSE 0.448 129.000 0.196 1.000   NA
 904918 904919 SPA2105 SPA2106 cspE pagP FALSE 0.308 188.000 0.333 1.000   NA
 904921 10702334 SPA2108 SPA2109 dpiA   TRUE 0.727 -31.000 0.000 NA   NA
 904922 904923 SPA2110 SPA2111 citC citD TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 904923 904924 SPA2111 SPA2112 citD citE TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.002 N NA
 904924 904925 SPA2112 SPA2113 citE citF TRUE 0.990 10.000 0.373 0.002 N NA
 904925 904926 SPA2113 SPA2114 citF citX FALSE 0.394 136.000 0.231 1.000 N NA
 904926 904927 SPA2114 SPA2115 citX citG TRUE 0.987 -28.000 0.400 1.000 Y NA
 904927 904928 SPA2115 SPA2116 citG citT FALSE 0.305 38.000 0.000 1.000 N NA
 904928 904929 SPA2116 SPA2117 citT rna FALSE 0.134 110.000 0.000 1.000 N NA
 904929 904930 SPA2117 SPA2118 rna rnk FALSE 0.006 235.000 0.018 1.000 N NA
 904932 904933 SPA2121 SPA2122     TRUE 0.995 0.000 1.000 1.000   NA
 904933 904934 SPA2122 SPA2123     TRUE 0.998 -3.000 0.444 0.050 Y NA
 904934 904935 SPA2123 SPA2124     TRUE 0.991 -7.000 0.556 0.050   NA
 904935 904936 SPA2124 SPA2125   ahpF FALSE 0.036 333.000 0.000 0.050   NA
 904936 904937 SPA2125 SPA2126 ahpF ahpC TRUE 0.490 242.000 0.551 1.000 Y NA
 904938 904939 SPA2127 SPA2128 dsbG ybdO FALSE 0.005 317.000 0.000 NA N NA
 904939 904940 SPA2128 SPA2129 ybdO ybdN FALSE 0.098 166.000 0.000 1.000   NA
 904940 904941 SPA2129 SPA2130 ybdN ybdM TRUE 0.951 -27.000 0.333 1.000   NA
 904944 904945 SPA2133 SPA2134 ybdD cstA TRUE 0.731 64.000 0.333 NA   NA
 904945 904946 SPA2134 SPA2135 cstA ybdB FALSE 0.183 182.000 0.222 NA N NA
 904946 904947 SPA2135 SPA2136 ybdB entA TRUE 0.983 3.000 0.065 NA Y NA
 904947 904948 SPA2136 SPA2137 entA entB TRUE 0.984 0.000 0.000 1.000 Y NA
 904948 904949 SPA2137 SPA2138 entB entE TRUE 0.956 14.000 0.000 1.000 Y NA
 904949 904950 SPA2138 SPA2139 entE entC TRUE 0.979 7.000 0.000 1.000 Y NA
 904953 904954 SPA2142 SPA2143 fepD fepG TRUE 0.997 0.000 0.300 0.054 Y NA
 904954 904955 SPA2143 SPA2144 fepG fepC TRUE 0.985 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 904956 904957 SPA2145 SPA2146 fepE entF FALSE 0.013 250.000 0.000 1.000 N NA
 904957 904958 SPA2146 SPA2147 entF ybdZ TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904958 904959 SPA2147 SPA2148 ybdZ fes TRUE 0.860 31.000 0.320 NA   NA
 904960 904961 SPA2149 SPA2150 fepA entD TRUE 0.878 47.000 0.700 1.000 N NA
 904961 904962 SPA2150 SPA2151 entD ybdK TRUE 0.826 12.000 0.000 1.000   NA
 904962 904963 SPA2151 SPA2152 ybdK ybdJ TRUE 0.888 67.000 1.000 NA   NA
 904965 904966 SPA2154 SPA2155   ybdF TRUE 0.973 0.000 0.208 NA   NA
 904966 904967 SPA2155 SPA2156 ybdF nfnB TRUE 0.798 97.000 0.667 NA   NA
 904972 904973 SPA2161 SPA2162 ykgB   TRUE 0.755 13.000 0.043 NA   NA
 904973 904974 SPA2162 SPA2163   ykgC TRUE 0.615 157.000 0.667 NA   NA
 904977 904978 SPA2166 SPA2167   gtrA FALSE 0.007 403.000 0.000 NA   NA
 904978 904979 SPA2167 SPA2168 gtrA gtrB TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 904979 10702336 SPA2168 SPA2169 gtrB   TRUE 0.749 -19.000 0.000 NA   NA
 10702336 904980 SPA2169 SPA2170     FALSE 0.007 386.000 0.000 NA   NA
 904980 10702337 SPA2170 SPA2171     FALSE 0.459 35.000 0.000 NA   NA
 904982 904983 SPA2173 SPA2174 fimW   FALSE 0.089 165.000 0.000 NA   NA
 904983 904984 SPA2174 SPA2175   fimY TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   NA
 904984 904985 SPA2175 SPA2176 fimY fimZ FALSE 0.004 604.000 0.000 NA   NA
 904986 904987 SPA2177 SPA2178 fimF fimH TRUE 0.997 10.000 0.875 NA Y NA
 904987 904988 SPA2178 SPA2179 fimH fimD TRUE 0.994 15.000 0.875 NA Y NA
 904988 904989 SPA2179 SPA2180 fimD fimC TRUE 0.984 31.000 0.875 1.000 Y NA
 904989 904990 SPA2180 SPA2181 fimC fimI TRUE 0.970 44.000 0.714 1.000 Y NA
 904990 904991 SPA2181 SPA2182 fimI fimA TRUE 0.976 75.000 0.750 0.008 Y NA
 904992 904993 SPA2183 SPA2184 folD ybcJ TRUE 0.913 2.000 0.055 1.000   NA
 904993 904994 SPA2184 SPA2185 ybcJ ybcI FALSE 0.100 128.000 0.011 NA   NA
 904996 904997 SPA2187 SPA2188 ppiB ybbF TRUE 0.976 3.000 0.237 1.000   NA
 904997 904998 SPA2188 SPA2189 ybbF purE FALSE 0.143 118.000 0.016 1.000   NA
 904998 904999 SPA2189 SPA2190 purE purK TRUE 0.996 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 905000 905001 SPA2191 SPA2192 arcC ylbF TRUE 0.983 4.000 0.375 NA   NA
 905001 905002 SPA2192 SPA2193 ylbF ylbE TRUE 0.955 12.000 0.265 NA   NA
 905002 10702338 SPA2193 SPA2194 ylbE   TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 905003 905004 SPA2195 SPA2196 allD allC TRUE 0.792 22.000 0.174 1.000 N NA
 905004 905005 SPA2196 SPA2197 allC ylbA TRUE 0.850 11.000 0.059 NA   NA
 905006 905007 SPA2198 SPA2199 glxK ybbY TRUE 0.731 23.000 0.133 1.000 N NA
 905007 905008 SPA2199 SPA2200 ybbY allB TRUE 0.856 59.000 0.161 1.000 Y NA
 905008 10702339 SPA2200 SPA2201 allB   FALSE 0.251 79.000 0.000 NA   NA
 10702339 905009 SPA2201 SPA2202     FALSE 0.223 96.000 0.000 NA   NA
 905009 905010 SPA2202 SPA2203     FALSE 0.187 66.000 0.051 1.000 N NA
 905010 905011 SPA2203 SPA2204   hyi FALSE 0.380 100.000 0.154 1.000 N NA
 905011 905012 SPA2204 SPA2205 hyi gcl TRUE 0.834 13.000 0.065 1.000   NA
 905012 905013 SPA2205 SPA2206 gcl allR FALSE 0.277 85.000 0.054 1.000   NA
 905013 905014 SPA2206 SPA2207 allR allA TRUE 0.777 79.000 0.625 1.000 N NA
 905015 905016 SPA2208 SPA2209 ybbS ybbB FALSE 0.169 70.000 0.012 NA   NA
 905017 905018 SPA2210 SPA2211 sfbC sfbB TRUE 0.997 -7.000 0.957 1.000 Y NA
 905018 905019 SPA2211 SPA2212 sfbB sfbA TRUE 0.936 37.000 0.261 NA Y NA
 905019 905020 SPA2212 SPA2213 sfbA   FALSE 0.010 257.000 0.000 NA N NA
 905020 905021 SPA2213 SPA2214   ybbP FALSE 0.106 186.000 0.034 0.089 N NA
 905021 905022 SPA2214 SPA2215 ybbP ybbA TRUE 0.997 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 905023 905024 SPA2216 SPA2217 tesA ybbO FALSE 0.162 155.000 0.072 1.000   NA
 905024 905025 SPA2217 SPA2218 ybbO ybbN TRUE 0.527 60.000 0.118 1.000   NA
 905026 905027 SPA2219 SPA2220 ybbM ybbL TRUE 0.899 -13.000 0.127 NA   NA
 10702340 905028 SPA2221 SPA2222   ybbJ TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905030 905031 SPA2224 SPA2225 ybaR   FALSE 0.111 154.000 0.000 NA   NA
 905031 905032 SPA2225 SPA2226   ybaP FALSE 0.159 134.000 0.000 NA   NA
 905032 905033 SPA2226 SPA2227 ybaP ybaK FALSE 0.029 202.000 0.022 NA   NA
 905035 905036 SPA2229 SPA2230 fsr ybaL FALSE 0.074 215.000 0.000 0.084 N NA
 905039 905040 SPA2233 SPA2234 hemH adk FALSE 0.006 230.000 0.013 1.000 N NA
 905040 905041 SPA2234 SPA2235 adk htpG FALSE 0.008 647.000 0.035 0.082 N NA
 905041 905042 SPA2235 SPA2236 htpG recR FALSE 0.086 87.000 0.028 1.000 N NA
 905042 905043 SPA2236 SPA2237 recR ybaB TRUE 0.991 0.000 0.604 NA   NA
 905043 905044 SPA2237 SPA2238 ybaB dnaX TRUE 0.832 46.000 0.411 NA   NA
 905044 905045 SPA2238 SPA2239 dnaX apt FALSE 0.229 114.000 0.088 1.000 N NA
 905045 905046 SPA2239 SPA2240 apt ybaN FALSE 0.099 153.000 0.043 NA   NA
 905047 905048 SPA2241 SPA2242 priC tRNA-Glu-5 TRUE 0.967 14.000 0.474 NA   NA
 905048 905049 SPA2242 SPA2243 tRNA-Glu-5 tRNA-Ala-4 FALSE 0.223 70.000 0.037 NA   NA
 905050 905051 SPA2244 SPA2245 tRNA-Asn-2 tRNA-Tyr-2 FALSE 0.118 119.000 0.000 1.000 N NA
 905052 905053 SPA2246 SPA2247 tRNA-Gln-2 tRNA-Ser-4 TRUE 0.913 23.000 0.458 1.000 N NA
 905053 905054 SPA2247 SPA2248 tRNA-Ser-4 tRNA-Thr-3 FALSE 0.005 496.000 0.000 NA   NA
 905054 905055 SPA2248 SPA2249 tRNA-Thr-3 tRNA-Arg-1 TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 905055 905056 SPA2249 SPA2250 tRNA-Arg-1 tRNA-Arg-2 FALSE 0.102 179.000 0.076 NA   NA
 905056 905057 SPA2250 SPA2251 tRNA-Arg-2 tRNA-Leu-1 FALSE 0.327 116.000 0.101 NA   NA
 905058 905059 SPA2252 SPA2253 tRNA-Lys-1 tRNA-Ser-1 TRUE 0.974 6.000 0.083 0.013   NA
 905065 905066 SPA2259 SPA2260 tRNA-Met-2 tRNA-Met-3 TRUE 0.679 32.000 0.156 1.000 N NA
 905066 905067 SPA2260 SPA2261 tRNA-Met-3 tRNA-Pro-1 FALSE 0.012 213.000 0.028 1.000 N NA
 905067 905068 SPA2261 SPA2262 tRNA-Pro-1 tRNA-Arg-3 TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 905068 905069 SPA2262 SPA2263 tRNA-Arg-3 tRNA-Leu-2 TRUE 0.644 41.000 0.179 1.000 N NA
 905072 905073 SPA2266 SPA2267 tRNA-Leu-3 tRNA-Lys-2 FALSE 0.229 65.000 0.019 1.000   NA
 905074 905075 SPA2268 SPA2269 tRNA-Asp-1 tRNA-Val-1 FALSE 0.183 104.000 0.027 1.000   NA
 905075 905076 SPA2269 SPA2270 tRNA-Val-1 tRNA-Ala-1 FALSE 0.045 150.000 0.033 1.000 N NA
 905076 905077 SPA2270 SPA2271 tRNA-Ala-1 tRNA-Glu-1 FALSE 0.008 291.000 0.000 1.000 N NA
 905077 905078 SPA2271 SPA2272 tRNA-Glu-1 tRNA-Cys-1 FALSE 0.023 209.000 0.000 1.000 N NA
 905078 905079 SPA2272 SPA2273 tRNA-Cys-1 tRNA-Pro-2 TRUE 0.651 186.000 0.201 0.081 Y NA
 905079 905080 SPA2273 SPA2274 tRNA-Pro-2 tRNA-Arg-4 FALSE 0.366 252.000 0.352 1.000 Y NA
 905080 905081 SPA2274 SPA2275 tRNA-Arg-4 tRNA-Leu-4 FALSE 0.377 247.000 0.351 1.000 Y NA
 905081 905082 SPA2275 SPA2276 tRNA-Leu-4 tRNA-Gly-3 FALSE 0.004 347.000 0.000 NA N NA
 905083 905084 SPA2277 SPA2278 tRNA-Thr-2 tRNA-Leu-5 TRUE 0.760 44.000 0.256 NA   NA
 905084 905085 SPA2278 SPA2279 tRNA-Leu-5 tRNA-Lys-3 FALSE 0.006 453.000 0.000 NA   NA
 905085 905086 SPA2279 SPA2280 tRNA-Lys-3 tRNA-Asp-2 TRUE 0.988 11.000 0.041 0.004 Y NA
 905086 905087 SPA2280 SPA2281 tRNA-Asp-2 tRNA-Val-2 TRUE 0.997 -10.000 0.697 0.050 Y NA
 905087 905088 SPA2281 SPA2282 tRNA-Val-2 tRNA-Ala-2 TRUE 0.998 0.000 0.485 0.050 Y NA
 905088 905089 SPA2282 SPA2283 tRNA-Ala-2 tRNA-Glu-2 TRUE 0.943 12.000 0.118 0.083 N NA
 905090 905091 SPA2284 SPA2285 tRNA-Leu-6 tRNA-Gln-1 FALSE 0.047 327.000 0.000 0.009   NA
 905092 905093 SPA2286 SPA2287 tRNA-His-1 tRNA-Trp-1 FALSE 0.030 228.000 0.000 NA   NA
 905095 905096 SPA2289 SPA2290 tRNA-Phe-2 tRNA-Met-4 TRUE 0.883 -37.000 0.155 NA   NA
 905097 905098 SPA2291 SPA2292 tRNA-Ser-3 tRNA-Ile-2 TRUE 0.987 10.000 0.315 0.051   NA
 905099 905100 SPA2293 SPA2294 tRNA-Gly-4 tRNA-Val-3 FALSE 0.099 198.000 0.152 1.000 N NA
 905100 905101 SPA2294 SPA2295 tRNA-Val-3 tRNA-Ala-3 TRUE 0.992 6.000 0.576 0.054 N NA
 905101 905102 SPA2295 SPA2296 tRNA-Ala-3 tRNA-Glu-3 TRUE 0.992 3.000 0.500 0.054 N NA
 905102 905103 SPA2296 SPA2297 tRNA-Glu-3 tRNA-Asn-1 TRUE 0.986 -6.000 0.375 0.054 N NA
 905105 905106 SPA2299 SPA2300 tRNA-Arg-5 ispA TRUE 0.757 1.000 0.035 1.000 N NA
 905106 905107 SPA2300 SPA2301 ispA dxs TRUE 0.909 24.000 0.060 1.000 Y NA
 905107 905108 SPA2301 SPA2302 dxs yajO FALSE 0.078 57.000 0.009 1.000 N NA
 905109 905110 SPA2303 SPA2304 pgpA thiL TRUE 0.896 -22.000 0.206 1.000 N NA
 905110 905111 SPA2304 SPA2305 thiL nusB TRUE 0.533 79.000 0.225 1.000 N NA
 905111 905112 SPA2305 SPA2306 nusB ribH TRUE 0.898 21.000 0.347 1.000 N NA
 905112 905113 SPA2306 SPA2307 ribH ribD TRUE 0.853 89.000 0.034 0.001 Y NA
 905113 905114 SPA2307 SPA2308 ribD ybaD TRUE 0.968 4.000 0.277 NA N NA
 905115 905116 SPA2309 SPA2310 yajI tsx FALSE 0.014 300.000 0.000 NA   NA
 905116 905117 SPA2310 SPA2311 tsx   FALSE 0.333 55.000 0.000 NA   NA
 905118 905119 SPA2312 SPA2313 yajD   FALSE 0.093 170.000 0.000 1.000   NA
 905119 905120 SPA2313 SPA2314     TRUE 0.915 26.000 0.452 NA   NA
 905120 905121 SPA2314 SPA2315   secF FALSE 0.082 145.000 0.015 NA   NA
 905121 905122 SPA2315 SPA2316 secF secD TRUE 0.996 11.000 0.206 0.001 Y NA
 905122 905123 SPA2316 SPA2317 secD yajC TRUE 0.869 28.000 0.045 NA Y NA
 905123 905124 SPA2317 SPA2318 yajC tgt TRUE 0.871 23.000 0.325 NA N NA
 905124 905125 SPA2318 SPA2319 tgt queA TRUE 0.795 197.000 0.360 0.001 Y NA
 905126 905127 SPA2320 SPA2321 yajB   FALSE 0.028 210.000 0.014 1.000   NA
 905128 905129 SPA2322 SPA2323 malZ proY FALSE 0.154 162.000 0.123 1.000 N NA
 905129 905130 SPA2323 SPA2324 proY brnQ TRUE 0.851 75.000 0.087 0.083 Y NA
 905130 905131 SPA2324 SPA2325 brnQ phoR FALSE 0.004 409.000 0.000 1.000 N NA
 905131 905132 SPA2325 SPA2326 phoR phoB TRUE 0.960 70.000 0.453 0.014 Y NA
 905133 905134 SPA2327 SPA2328 sbcD sbcC TRUE 0.993 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 905134 905135 SPA2328 SPA2329 sbcC araJ FALSE 0.026 173.000 0.030 1.000 N NA
 905138 905139 SPA2332 SPA2333 yaiE aroM FALSE 0.258 71.000 0.049 NA   NA
 905139 905140 SPA2333 SPA2334 aroM yaiA FALSE 0.023 251.000 0.000 NA   NA
 905140 905141 SPA2334 SPA2335 yaiA aroL TRUE 0.535 27.000 0.000 NA   NA
 905141 905142 SPA2335 SPA2336 aroL yaiI FALSE 0.035 185.000 0.007 NA   NA
 905144 905145 SPA2338 SPA2339 adrA psiF TRUE 0.588 92.000 0.250 NA   NA
 905145 905146 SPA2339 SPA2340 psiF yaiB FALSE 0.009 349.000 0.000 NA   NA
 905146 905147 SPA2340 SPA2341 yaiB   FALSE 0.039 297.000 0.154 NA   NA
 905147 905148 SPA2341 SPA2342     FALSE 0.139 169.000 0.090 NA   NA
 905151 905152 SPA2346 SPA2347 yaiW sbmA TRUE 0.748 15.000 0.045 1.000   NA
 905154 905155 SPA2349 SPA2350 yaiV yaiU TRUE 0.772 86.000 0.667 NA N NA
 905157 905158 SPA2352 SPA2353 prpE prpD TRUE 0.793 41.000 0.038 0.001   NA
 905158 905159 SPA2353 SPA2354 prpD prpC TRUE 0.765 40.000 0.216 1.000   NA
 905159 905160 SPA2354 SPA2355 prpC prpB TRUE 0.648 123.000 0.502 1.000 N NA
 905164 905165 SPA2359 SPA2360 foxA   FALSE 0.300 164.000 0.280 1.000 N NA
 905165 10702342 SPA2360 SPA2361     FALSE 0.459 35.000 0.000 NA   NA
 10702342 905166 SPA2361 SPA2362     TRUE 0.690 17.000 0.000 NA   NA
 905166 905167 SPA2362 SPA2363     TRUE 0.997 -3.000 0.333 0.049 Y NA
 905167 905168 SPA2363 SPA2364     FALSE 0.195 117.000 0.000 NA   NA
 905168 905169 SPA2364 SPA2365   res FALSE 0.017 277.000 0.000 NA   NA
 905169 905170 SPA2365 SPA2366 res mod TRUE 0.921 13.000 0.076 0.050 N NA
 905170 905171 SPA2366 SPA2367 mod   FALSE 0.034 189.000 0.000 1.000 N NA
 10702343 905172 SPA2368 SPA2369     TRUE 0.711 -54.000 0.000 NA   NA
 905173 905174 SPA2370 SPA2371     FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 905174 905175 SPA2371 SPA2372     TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 905175 905176 SPA2372 SPA2373     FALSE 0.012 258.000 0.000 1.000 N NA
 905176 10702344 SPA2373 SPA2374     FALSE 0.010 340.000 0.000 NA   NA
 10702344 905177 SPA2374 SPA2375     TRUE 0.475 33.000 0.000 NA   NA
 905177 905178 SPA2375 SPA2376     FALSE 0.428 100.000 0.182 1.000 N NA
 905178 905179 SPA2376 SPA2377     FALSE 0.011 326.000 0.000 NA   NA
 905179 905180 SPA2377 SPA2378     TRUE 0.982 -27.000 1.000 NA   NA
 905181 905182 SPA2379 SPA2380 stbA stbB TRUE 0.922 62.000 0.385 1.000 Y NA
 905182 905183 SPA2380 SPA2381 stbB stbC TRUE 0.995 -16.000 1.000 1.000 Y NA
 905183 905184 SPA2381 SPA2382 stbC stbD TRUE 0.893 5.000 0.000 1.000   NA
 905184 905185 SPA2382 SPA2383 stbD stbE TRUE 0.749 -34.000 0.000 1.000   NA
 905187 905188 SPA2385 SPA2386     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905188 905189 SPA2386 SPA2387     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 905192 905193 SPA2390 SPA2391 gp16 gp20 TRUE 0.966 0.000 0.167 NA   NA
 905193 905194 SPA2391 SPA2392 gp20 gp7 TRUE 0.811 43.000 0.333 NA   NA
 905194 905195 SPA2392 SPA2393 gp7 gp14 TRUE 0.990 3.000 0.600 NA   NA
 905195 905196 SPA2393 SPA2394 gp14 gp1 FALSE 0.003 5322.000 0.000 NA   NA
 905196 905197 SPA2394 SPA2395 gp1   FALSE 0.003 3116.000 0.000 NA   NA
 905197 905198 SPA2395 SPA2396     FALSE 0.038 213.000 0.000 NA   NA
 905198 905199 SPA2396 SPA2397   gp19 TRUE 0.700 18.000 0.000 1.000   NA
 905199 905200 SPA2397 SPA2398 gp19 gp13 TRUE 0.762 -16.000 0.000 NA   NA
 905200 905201 SPA2398 SPA2399 gp13   FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 905201 905202 SPA2399 SPA2400   ninH TRUE 0.794 -3.000 0.002 NA   NA
 905202 905203 SPA2400 SPA2401 ninH rus TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 905203 905204 SPA2401 SPA2402 rus   TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 905204 905205 SPA2402 SPA2403   ninF FALSE 0.049 198.000 0.000 NA   NA
 905205 905206 SPA2403 SPA2404 ninF ninX TRUE 0.986 -7.000 0.667 NA   NA
 905206 905207 SPA2404 SPA2405 ninX ninE TRUE 0.991 3.000 0.667 NA   NA
 905207 905208 SPA2405 SPA2406 ninE ninD TRUE 0.973 -33.000 0.667 NA   NA
 905208 905209 SPA2406 SPA2407 ninD ninB TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905209 905210 SPA2407 SPA2408 ninB   TRUE 0.716 -43.000 0.000 NA   NA
 905210 905211 SPA2408 SPA2409     FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 905211 905212 SPA2409 SPA2410   gp12 TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 905212 905213 SPA2410 SPA2411 gp12 gp18 TRUE 0.967 -10.000 0.364 NA   NA
 905213 905214 SPA2411 SPA2412 gp18   TRUE 0.970 -7.000 0.333 NA   NA
 905214 905215 SPA2412 SPA2413     FALSE 0.459 35.000 0.000 NA   NA
 905216 905217 SPA2414 SPA2415     FALSE 0.003 1215.000 0.000 NA   NA
 905219 905220 SPA2417 SPA2418   ral TRUE 0.985 -16.000 1.000 NA   NA
 905220 905221 SPA2418 SPA2419 ral   FALSE 0.442 37.000 0.000 NA   NA
 905221 905222 SPA2419 SPA2420     FALSE 0.012 315.000 0.000 NA   NA
 905222 905223 SPA2420 SPA2421   kil TRUE 0.749 -19.000 0.000 NA   NA
 905223 905224 SPA2421 SPA2422 kil   TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 905224 905225 SPA2422 SPA2423     TRUE 0.677 126.000 0.500 NA   NA
 905225 905226 SPA2423 SPA2424   abc1 TRUE 0.912 0.000 0.000 1.000   NA
 905226 905227 SPA2424 SPA2425 abc1 abc2 FALSE 0.372 47.000 0.000 NA   NA
 905227 905228 SPA2425 SPA2426 abc2   TRUE 0.985 11.000 0.667 NA   NA
 905228 905229 SPA2426 SPA2427     FALSE 0.004 653.000 0.000 NA   NA
 905229 905230 SPA2427 SPA2428   eaa1 FALSE 0.004 766.000 0.000 NA   NA
 905230 905231 SPA2428 SPA2429 eaa1   TRUE 0.705 -79.000 0.000 NA   NA
 905231 905232 SPA2429 SPA2430   xis FALSE 0.038 212.000 0.000 NA   NA
 905232 905233 SPA2430 SPA2431 xis int TRUE 0.702 -123.000 0.000 NA   NA
 905234 905235 SPA2432 SPA2433   proA FALSE 0.198 116.000 0.000 NA   NA
 905235 905236 SPA2433 SPA2434 proA proB TRUE 0.987 12.000 0.026 0.001 Y NA
 905238 905239 SPA2436 SPA2437 crl yafA FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 905239 905240 SPA2437 SPA2438 yafA gpt FALSE 0.121 89.000 0.000 NA N NA
 905242 905243 SPA2440 SPA2441 prfH   TRUE 0.978 -3.000 0.303 NA   NA
 905243 905244 SPA2441 SPA2442   dinP FALSE 0.034 219.000 0.000 NA   NA
 905246 905247 SPA2444 SPA2445 yafJ gmhA FALSE 0.326 164.000 0.229 1.000   NA
 905248 905249 SPA2446 SPA2447 yafH yafV FALSE 0.190 109.000 0.033 1.000   NA
 905249 905250 SPA2447 SPA2448 yafV   FALSE 0.008 371.000 0.000 NA   NA
 905250 905251 SPA2448 SPA2449     FALSE 0.005 331.000 0.000 NA N NA
 10702345 905252 SPA2450 SPA2451   tinR FALSE 0.149 140.000 0.000 NA   NA
 905252 905253 SPA2451 SPA2452 tinR tcfD FALSE 0.162 133.000 0.000 NA   NA
 905253 905254 SPA2452 SPA2453 tcfD tcfC TRUE 0.589 23.000 0.000 NA   NA
 905254 905255 SPA2453 SPA2454 tcfC tcfB TRUE 0.790 109.000 0.667 NA   NA
 905255 905256 SPA2454 SPA2455 tcfB tcfA TRUE 0.858 51.000 0.556 NA   NA
 905258 905259 SPA2457 SPA2458     FALSE 0.259 75.000 0.000 NA   NA
 905259 905260 SPA2458 SPA2459   sinR FALSE 0.187 120.000 0.000 NA   NA
 905260 905261 SPA2459 SPA2460 sinR   FALSE 0.002 820.000 0.000 1.000 N NA
 905261 10702346 SPA2460 SPA2461     FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 10702346 905262 SPA2461 SPA2462   safC TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 905262 905263 SPA2462 SPA2463 safC safB TRUE 0.982 24.000 0.600 1.000 Y NA
 905263 905264 SPA2463 SPA2464 safB safA FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 905264 905265 SPA2464 SPA2465 safA   FALSE 0.004 780.000 0.000 NA   NA
 905265 905266 SPA2465 SPA2466     FALSE 0.103 226.000 0.000 0.050   NA
 10702347 905268 SPA2468 SPA2469     FALSE 0.003 2424.000 0.000 NA   NA
 905268 905269 SPA2469 SPA2470     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 905269 905270 SPA2470 SPA2471     FALSE 0.003 2403.000 0.000 NA   NA
 905270 905271 SPA2471 SPA2472     TRUE 0.487 32.000 0.000 NA   NA
 905271 905272 SPA2472 SPA2473     TRUE 0.988 2.000 0.500 NA   NA
 905272 905273 SPA2473 SPA2474     FALSE 0.243 85.000 0.000 NA   NA
 905273 905274 SPA2474 SPA2475     TRUE 0.770 -15.000 0.000 NA   NA
 905274 905275 SPA2475 SPA2476     FALSE 0.219 104.000 0.000 NA   NA
 905275 10702348 SPA2476 SPA2477     TRUE 0.770 -15.000 0.000 NA   NA
 10702348 905276 SPA2477 SPA2478     FALSE 0.397 43.000 0.000 NA   NA
 905276 905277 SPA2478 SPA2479     TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 905277 905278 SPA2479 SPA2480     FALSE 0.467 34.000 0.000 NA   NA
 905278 905279 SPA2480 SPA2481     FALSE 0.045 202.000 0.000 NA   NA
 905279 905280 SPA2481 SPA2482     TRUE 0.879 5.000 0.000 NA   NA
 905280 905281 SPA2482 SPA2483     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905281 905282 SPA2483 SPA2484     TRUE 0.885 4.000 0.000 NA   NA
 905282 905283 SPA2484 SPA2485     TRUE 0.820 68.000 0.583 NA   NA
 905283 905284 SPA2485 SPA2486     FALSE 0.141 143.000 0.000 NA   NA
 905284 905285 SPA2486 SPA2487     TRUE 0.770 -15.000 0.000 NA   NA
 905285 905286 SPA2487 SPA2488     FALSE 0.210 111.000 0.000 NA   NA
 905286 905287 SPA2488 SPA2489     FALSE 0.284 67.000 0.000 NA   NA
 905287 905288 SPA2489 SPA2490     FALSE 0.022 252.000 0.000 NA   NA
 905288 905289 SPA2490 SPA2491     FALSE 0.173 127.000 0.000 NA   NA
 905289 905290 SPA2491 SPA2492     FALSE 0.011 328.000 0.000 NA   NA
 905290 905291 SPA2492 SPA2493     TRUE 0.575 24.000 0.000 NA   NA
 905291 905292 SPA2493 SPA2494     FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 905292 905293 SPA2494 SPA2495     TRUE 0.891 3.000 0.000 NA   NA
 905293 905294 SPA2495 SPA2496     TRUE 0.770 -15.000 0.000 NA   NA
 905295 10702349 SPA2497 SPA2498     TRUE 0.861 9.000 0.000 NA   NA
 10702349 905296 SPA2498 SPA2499     TRUE 0.782 -13.000 0.000 NA   NA
 905296 905297 SPA2499 SPA2500     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905297 905298 SPA2500 SPA2501     TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 905298 905299 SPA2501 SPA2502     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905299 905300 SPA2502 SPA2503     TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 905301 905302 SPA2504 SPA2505   dnaQ FALSE 0.159 134.000 0.000 NA   NA
 905305 905306 SPA2508 SPA2509 gloB mltD TRUE 0.639 72.000 0.233 1.000   NA
 905307 905308 SPA2510 SPA2511 yafE yafD FALSE 0.303 78.000 0.066 NA   NA
 905308 905309 SPA2511 SPA2512 yafD   FALSE 0.082 153.000 0.029 NA   NA
 905311 905312 SPA2514 SPA2515 yafB   FALSE 0.084 168.000 0.000 NA   NA
 905312 905313 SPA2515 SPA2516   rrfG FALSE 0.061 187.000 0.000 NA   NA
 905313 905314 SPA2516 SPA2517 rrfG rrlG FALSE 0.053 195.000 0.000 NA   NA
 905314 905315 SPA2517 SPA2518 rrlG   FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 905315 905316 SPA2518 SPA2519     TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   NA
 905316 905317 SPA2519 SPA2520   rrsG FALSE 0.245 83.000 0.000 NA   NA
 905317 905318 SPA2520 SPA2521 rrsG clpB FALSE 0.006 455.000 0.000 NA   NA
 905318 905319 SPA2521 SPA2522 clpB yfiH FALSE 0.295 130.000 0.108 NA   NA
 905319 905320 SPA2522 SPA2523 yfiH sfhB TRUE 0.961 -3.000 0.168 NA   NA
 905321 905322 SPA2524 SPA2525 yfiO yfiA FALSE 0.009 272.000 0.004 NA   NA
 905322 905323 SPA2525 SPA2526 yfiA pheA FALSE 0.003 251.000 0.015 NA N NA
 905324 905325 SPA2527 SPA2528   tyrA FALSE 0.175 58.000 0.000 NA N NA
 905325 905326 SPA2528 SPA2529 tyrA aroF TRUE 0.975 10.000 0.000 1.000 Y NA
 905327 905328 SPA2530 SPA2531 yfiR yfiN TRUE 0.979 -7.000 0.475 NA   NA
 905329 905330 SPA2532 SPA2533 rplS trmD TRUE 0.965 41.000 0.567 1.000 Y NA
 905330 905331 SPA2533 SPA2534 trmD yfjA TRUE 0.968 45.000 0.672 1.000 Y NA
 905331 905332 SPA2534 SPA2535 yfjA rpsP TRUE 0.990 19.000 0.342 0.012 Y NA
 905332 905333 SPA2535 SPA2536 rpsP ffh FALSE 0.116 252.000 0.361 1.000 N NA
 905334 905335 SPA2537 SPA2538 corE corB TRUE 0.651 110.000 0.349 NA   NA
 905335 905336 SPA2538 SPA2539 corB   FALSE 0.095 130.000 0.008 NA   NA
 905337 905338 SPA2540 SPA2541 grpE   TRUE 0.933 -3.000 0.091 NA   NA
 905339 905340 SPA2542 SPA2543 yfjB recN FALSE 0.437 86.000 0.170 1.000 N NA
 905340 905341 SPA2543 SPA2544 recN smpA FALSE 0.071 149.000 0.049 1.000 N NA
 905342 905343 SPA2545 SPA2546 yfjF yfjG TRUE 0.907 -10.000 0.124 NA   NA
 905344 905345 SPA2547 SPA2548 smpB   FALSE 0.005 619.000 0.000 1.000   NA
 905345 905346 SPA2548 SPA2549     TRUE 0.680 65.000 0.250 1.000   NA
 905346 905347 SPA2549 SPA2550     TRUE 0.984 -3.000 0.500 1.000 N NA
 905347 905348 SPA2550 SPA2551     TRUE 0.988 8.000 0.417 0.080 N NA
 905348 905349 SPA2551 SPA2552     TRUE 0.723 -34.000 0.000 NA   NA
 905349 905350 SPA2552 SPA2554     FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 905351 905352 SPA2555 SPA2556     TRUE 0.717 68.000 0.333 NA   NA
 905352 905353 SPA2556 SPA2557     TRUE 0.992 -3.000 0.750 NA   NA
 905353 905354 SPA2557 SPA2558     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 905354 905355 SPA2558 SPA2559     TRUE 0.986 -7.000 0.667 NA   NA
 905355 905356 SPA2559 SPA2560     TRUE 0.739 15.000 0.000 NA   NA
 905356 905357 SPA2560 SPA2561     FALSE 0.333 55.000 0.000 NA   NA
 905357 905358 SPA2561 SPA2562     TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 905358 905359 SPA2562 SPA2563   pin FALSE 0.219 103.000 0.000 NA   NA
 905361 905362 SPA2565 SPA2566     TRUE 0.870 7.000 0.000 NA   NA
 905362 905363 SPA2566 SPA2567     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905363 905364 SPA2567 SPA2568     TRUE 0.831 -7.000 0.000 NA   NA
 905364 905365 SPA2568 SPA2569     TRUE 0.782 -13.000 0.000 NA   NA
 905365 905366 SPA2569 SPA2570     TRUE 0.987 -3.000 0.500 NA   NA
 905366 905367 SPA2570 SPA2571     TRUE 0.840 69.000 0.667 NA   NA
 905367 905368 SPA2571 SPA2572     TRUE 0.986 -7.000 0.667 NA   NA
 905368 905369 SPA2572 SPA2573     TRUE 0.798 96.000 0.667 NA   NA
 905369 905370 SPA2573 SPA2574     TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 905370 905371 SPA2574 SPA2575   nucD TRUE 0.879 5.000 0.000 NA   NA
 905371 905372 SPA2575 SPA2576 nucD nucE TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 905372 905373 SPA2576 SPA2577 nucE   TRUE 0.987 4.000 0.500 NA   NA
 905373 905374 SPA2577 SPA2578     TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 905374 905375 SPA2578 SPA2579     TRUE 0.615 94.000 0.000 0.002   NA
 905375 905376 SPA2579 SPA2580     TRUE 0.898 4.000 0.000 1.000   NA
 905376 905377 SPA2580 SPA2581     TRUE 0.719 17.000 0.000 1.000   NA
 905378 905379 SPA2582 SPA2583     TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 905380 905381 SPA2584 SPA2585     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 905381 905382 SPA2585 SPA2586     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905382 905383 SPA2586 SPA2587     TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 905383 905384 SPA2587 SPA2588     FALSE 0.223 96.000 0.000 NA   NA
 905384 905385 SPA2588 SPA2589     TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 905385 905386 SPA2589 SPA2590     FALSE 0.084 168.000 0.000 NA   NA
 905386 905387 SPA2590 SPA2591     TRUE 0.814 -9.000 0.000 NA   NA
 905387 905388 SPA2591 SPA2592     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 905388 905389 SPA2592 SPA2593     TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000 N NA
 905389 905390 SPA2593 SPA2594     TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 905390 905391 SPA2594 SPA2595     FALSE 0.280 68.000 0.000 NA   NA
 905391 905392 SPA2595 SPA2596     TRUE 0.721 -36.000 0.000 NA   NA
 905392 905393 SPA2596 SPA2597   cII TRUE 0.985 8.000 0.500 NA   NA
 905393 905394 SPA2597 SPA2598 cII apl TRUE 0.855 33.000 0.333 NA   NA
 905395 905396 SPA2599 SPA2600 cI   TRUE 0.990 4.000 0.400 0.048 N NA
 905396 905397 SPA2600 SPA2601     FALSE 0.082 533.000 0.000 0.003 Y NA
 905398 905399 SPA2602 SPA2603     TRUE 0.905 3.000 0.059 NA   NA
 905399 905400 SPA2603 SPA2604     TRUE 0.772 26.000 0.147 NA   NA
 905400 905401 SPA2604 SPA2605     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 905401 10702350 SPA2605 SPA2606     TRUE 0.671 18.000 0.000 NA   NA
 10702350 905402 SPA2606 SPA2607     FALSE 0.003 1003.000 0.000 NA   NA
 905402 905403 SPA2607 SPA2608     TRUE 0.991 5.000 0.738 NA   NA
 905403 905404 SPA2608 SPA2609     TRUE 0.898 48.000 0.738 NA   NA
 905404 905405 SPA2609 SPA2610     TRUE 0.936 -3.000 0.097 NA   NA
 905405 905406 SPA2610 SPA2611     FALSE 0.106 188.000 0.094 NA   NA
 905406 905407 SPA2611 SPA2612     FALSE 0.004 817.000 0.000 NA   NA
 905407 905408 SPA2612 SPA2613     TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 905408 905409 SPA2613 SPA2614     TRUE 0.993 -3.000 0.939 NA   NA
 905409 905410 SPA2614 SPA2615     TRUE 0.993 -3.000 0.848 NA   NA
 905410 905411 SPA2615 SPA2616     TRUE 0.993 -3.000 0.848 NA   NA
 905411 905412 SPA2616 SPA2617     TRUE 0.990 -3.000 0.659 NA   NA
 905412 905413 SPA2617 SPA2618     TRUE 0.904 97.000 0.568 0.002   NA
 905413 905414 SPA2618 SPA2619     TRUE 0.719 46.000 0.207 1.000   NA
 905415 905416 SPA2620 SPA2621     TRUE 0.990 -3.000 0.636 NA   NA
 905416 905417 SPA2621 SPA2622     TRUE 0.688 51.000 0.212 NA   NA
 905418 905419 SPA2623 SPA2624     FALSE 0.005 530.000 0.000 NA   NA
 905419 905420 SPA2624 SPA2625     FALSE 0.003 1342.000 0.000 NA   NA
 905420 905421 SPA2625 SPA2626   fljA FALSE 0.003 3613.000 0.000 NA   NA
 905421 905422 SPA2626 SPA2627 fljA fljB FALSE 0.308 68.000 0.000 1.000   NA
 905423 905424 SPA2628 SPA2629 hin iroB FALSE 0.003 1040.000 0.000 NA   NA
 905424 905425 SPA2629 SPA2630 iroB iroC TRUE 0.726 81.000 0.500 1.000 N NA
 905425 905426 SPA2630 SPA2631 iroC iroD FALSE 0.109 110.000 0.000 NA N NA
 905426 905427 SPA2631 SPA2632 iroD iroE TRUE 0.544 32.000 0.065 NA   NA
 905429 905430 SPA2635 SPA2636     FALSE 0.076 175.000 0.000 NA   NA
 905431 905432 SPA2637 SPA2638 virK mig-14 FALSE 0.014 294.000 0.000 NA   NA
 905433 905434 SPA2639 SPA2640 nxiA tctE FALSE 0.099 133.000 0.000 1.000 N NA
 905434 905435 SPA2640 SPA2641 tctE tctD TRUE 0.997 -13.000 0.765 0.084 Y NA
 905436 905437 SPA2642 SPA2643     FALSE 0.053 195.000 0.000 NA   NA
 905437 905438 SPA2643 SPA2644     TRUE 0.960 15.000 0.426 NA   NA
 905438 905439 SPA2644 SPA2645     TRUE 0.915 11.000 0.115 NA   NA
 905439 905440 SPA2645 SPA2646     FALSE 0.013 303.000 0.000 NA   NA
 905440 905441 SPA2646 SPA2647   ygaF TRUE 0.548 26.000 0.000 NA   NA
 905441 905442 SPA2647 SPA2648 ygaF gabD TRUE 0.633 22.000 0.000 1.000   NA
 905442 905443 SPA2648 SPA2649 gabD gabT TRUE 0.930 15.000 0.303 1.000 N NA
 905443 905444 SPA2649 SPA2650 gabT gabP TRUE 0.688 130.000 0.121 1.000 Y NA
 905444 905445 SPA2650 SPA2651 gabP ygaE TRUE 0.875 42.000 0.625 1.000 N NA
 905446 905447 SPA2652 SPA2653 ygaU yqaE FALSE 0.228 70.000 0.027 1.000   NA
 905448 905449 SPA2654 SPA2655   ygaP TRUE 0.845 10.000 0.083 NA N NA
 905449 905450 SPA2655 SPA2656 ygaP   FALSE 0.116 133.000 0.028 NA   NA
 905453 905454 SPA2659 SPA2660 ygaC   FALSE 0.005 572.000 0.000 NA   NA
 905455 905456 SPA2661 SPA2662     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 905456 905457 SPA2662 SPA2663   nrdH FALSE 0.221 99.000 0.000 NA   NA
 905457 905458 SPA2663 SPA2664 nrdH nrdI TRUE 0.586 -3.000 0.026 NA N NA
 905458 905459 SPA2664 SPA2665 nrdI nrdE TRUE 0.972 -27.000 0.162 NA Y NA
 905459 10702352 SPA2665 SPA2666 nrdE   TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 10702352 905460 SPA2666 SPA2667   proV FALSE 0.009 355.000 0.000 NA   NA
 905460 905461 SPA2667 SPA2668 proV proW TRUE 0.997 -7.000 0.630 0.084 Y NA
 905461 905462 SPA2668 SPA2669 proW proX TRUE 0.972 70.000 0.695 0.051 Y NA
 905462 905463 SPA2669 SPA2670 proX   FALSE 0.372 165.000 0.174 0.051 N NA
 905463 905464 SPA2670 SPA2671   emrR FALSE 0.003 497.000 0.000 1.000 N NA
 905464 905465 SPA2671 SPA2672 emrR emrA FALSE 0.234 127.000 0.107 1.000 N NA
 905465 905466 SPA2672 SPA2673 emrA emrB TRUE 0.971 17.000 0.875 1.000 N NA
 10702353 905467 SPA2674 SPA2675   luxS FALSE 0.009 346.000 0.000 NA   NA
 905469 905470 SPA2677 SPA2678 gshA yqaA FALSE 0.321 77.000 0.071 NA   NA
 905470 905471 SPA2678 SPA2679 yqaA yqaB TRUE 0.910 -3.000 0.067 NA   NA
 905471 905472 SPA2679 SPA2680 yqaB   FALSE 0.025 240.000 0.000 NA   NA
 905472 905473 SPA2680 SPA2681     FALSE 0.286 66.000 0.000 NA   NA
 905473 905474 SPA2681 SPA2682     FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 905474 905475 SPA2682 SPA2683     TRUE 0.870 7.000 0.000 NA   NA
 905475 905476 SPA2683 SPA2684   csrA FALSE 0.013 303.000 0.000 NA   NA
 905476 905477 SPA2684 SPA2685 csrA alaS FALSE 0.007 235.000 0.020 1.000 N NA
 905477 905478 SPA2685 SPA2686 alaS oraA FALSE 0.049 236.000 0.085 1.000   NA
 905478 905479 SPA2686 SPA2687 oraA recA TRUE 0.597 117.000 0.296 1.000   NA
 905479 905480 SPA2687 SPA2688 recA ygaD FALSE 0.339 85.000 0.082 NA   NA
 905480 905481 SPA2688 SPA2689 ygaD mltB FALSE 0.004 479.000 0.026 NA   NA
 905482 905483 SPA2690 SPA2691 srlA srlE TRUE 0.998 -3.000 0.349 0.009 Y NA
 905483 905484 SPA2691 SPA2692 srlE srlB TRUE 0.997 12.000 0.533 0.009 Y NA
 905484 905485 SPA2692 SPA2693 srlB srlD TRUE 0.943 12.000 0.260 1.000 N NA
 905485 905486 SPA2693 SPA2694 srlD srlM TRUE 0.473 77.000 0.197 NA N NA
 905486 905487 SPA2694 SPA2695 srlM srlR FALSE 0.414 198.000 0.183 NA Y NA
 905487 905488 SPA2695 SPA2696 srlR gutQ TRUE 0.979 -7.000 0.562 1.000 N NA
 905490 905491 SPA2698 SPA2699   ygbD TRUE 0.979 -3.000 0.111 0.047   NA
 905492 905493 SPA2700 SPA2701 hypf hydN FALSE 0.033 146.000 0.018 1.000 N NA
 905493 905494 SPA2701 SPA2702 hydN   FALSE 0.046 201.000 0.000 NA   NA
 905494 905495 SPA2702 SPA2703   hycI FALSE 0.420 27.000 0.022 NA   NA
 905495 905496 SPA2703 SPA2704 hycI hycH TRUE 0.972 -7.000 0.360 NA   NA
 905496 905497 SPA2704 SPA2705 hycH hycG TRUE 0.935 -3.000 0.094 NA   NA
 905497 905498 SPA2705 SPA2706 hycG hycF TRUE 0.986 0.000 0.067 1.000 Y NA
 905498 905499 SPA2706 SPA2707 hycF hycE TRUE 0.975 10.000 0.000 1.000 Y NA
 905499 905500 SPA2707 SPA2708 hycE hycD TRUE 0.933 18.000 0.000 1.000 Y NA
 905500 905501 SPA2708 SPA2709 hycD hycC TRUE 0.996 3.000 0.382 1.000 Y NA
 905501 905502 SPA2709 SPA2710 hycC hycB TRUE 0.991 0.000 0.154 1.000 Y NA
 905502 905503 SPA2710 SPA2711 hycB hycA TRUE 0.679 146.000 0.667 NA   NA
 905504 905505 SPA2712 SPA2713 hypA hypB TRUE 0.873 70.000 0.306 0.002   NA
 905505 905506 SPA2713 SPA2714 hypB hypC TRUE 0.965 -9.000 0.000 NA Y NA
 905506 905507 SPA2714 SPA2715 hypC hypD TRUE 0.983 0.000 0.000 NA Y NA
 905507 905508 SPA2715 SPA2716 hypD hypE TRUE 0.950 39.000 0.353 1.000 Y NA
 905508 905509 SPA2716 SPA2717 hypE fhlA FALSE 0.008 219.000 0.019 1.000 N NA
 905511 905512 SPA2719 SPA2720 sitA sitB TRUE 0.998 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 905512 905513 SPA2720 SPA2721 sitB sitC TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.077 Y NA
 905513 905514 SPA2721 SPA2722 sitC sitD TRUE 0.997 -9.000 0.525 0.005 Y NA
 905514 905515 SPA2722 SPA2723 sitD   TRUE 0.731 -28.000 0.000 NA   NA
 905516 905517 SPA2724 SPA2725 sprB sprA FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 905517 905518 SPA2725 SPA2726 sprA   FALSE 0.009 346.000 0.000 NA   NA
 905518 905519 SPA2726 SPA2727   orgB TRUE 0.951 16.000 0.400 NA   NA
 905519 905520 SPA2727 SPA2728 orgB orgA TRUE 0.980 -43.000 1.000 NA   NA
 905520 905521 SPA2728 SPA2729 orgA prgK TRUE 0.961 -7.000 0.238 1.000   NA
 905521 905522 SPA2729 SPA2730 prgK prgJ TRUE 0.977 -3.000 0.286 NA   NA
 905522 905523 SPA2730 SPA2731 prgJ prgI TRUE 0.962 19.000 0.667 NA   NA
 905523 905524 SPA2731 SPA2732 prgI prgH TRUE 0.946 25.000 0.667 NA   NA
 905525 905526 SPA2733 SPA2734 hilD iagA FALSE 0.008 1091.000 0.000 0.048 N NA
 905526 905527 SPA2734 SPA2735 iagA iagB TRUE 0.700 18.000 0.000 1.000   NA
 905528 905529 SPA2736 SPA2737   sicP TRUE 0.804 -13.000 0.000 1.000   NA
 905529 905530 SPA2737 SPA2738 sicP   FALSE 0.275 69.000 0.000 NA   NA
 905530 905531 SPA2738 SPA2739   sipF FALSE 0.390 44.000 0.000 NA   NA
 905531 905532 SPA2739 SPA2740 sipF sipA TRUE 0.798 19.000 0.111 NA   NA
 905532 905533 SPA2740 SPA2741 sipA sipD TRUE 0.833 19.000 0.143 NA   NA
 905533 905534 SPA2741 SPA2742 sipD sipC TRUE 0.850 70.000 0.286 0.006   NA
 905534 905535 SPA2742 SPA2743 sipC sipB TRUE 0.898 28.000 0.125 0.006   NA
 905535 905536 SPA2743 SPA2744 sipB spaT TRUE 0.985 3.000 0.375 1.000   NA
 905536 905537 SPA2744 SPA2745 spaT spaS TRUE 0.608 138.000 0.409 1.000   NA
 905537 905538 SPA2745 SPA2746 spaS spaR TRUE 0.997 -13.000 0.682 0.079 Y NA
 905538 905539 SPA2746 SPA2747 spaR spaQ TRUE 0.999 4.000 1.000 0.079 Y NA
 905539 905540 SPA2747 SPA2748 spaQ spaP TRUE 0.994 26.000 0.833 0.009 Y NA
 905540 905541 SPA2748 SPA2749 spaP spaO TRUE 0.994 -10.000 0.625 1.000 Y NA
 905541 905542 SPA2749 SPA2750 spaO spaN TRUE 0.970 0.000 0.188 NA   NA
 905542 905543 SPA2750 SPA2751 spaN spaM TRUE 0.990 0.000 0.571 NA   NA
 905543 905544 SPA2751 SPA2752 spaM spaI TRUE 0.943 -22.000 0.300 NA   NA
 905544 905545 SPA2752 SPA2753 spaI spak TRUE 0.969 -3.000 0.200 1.000   NA
 905545 905546 SPA2753 SPA2754 spak invA TRUE 0.954 24.000 0.300 0.009   NA
 905546 905547 SPA2754 SPA2755 invA invE TRUE 0.895 25.000 0.320 1.000   NA
 905547 905548 SPA2755 SPA2756 invE invG TRUE 0.983 -3.000 0.360 1.000   NA
 905548 905549 SPA2756 SPA2757 invG invF TRUE 0.980 -3.000 0.385 1.000 N NA
 905550 905551 SPA2758 SPA2759 invH   FALSE 0.008 395.000 0.000 1.000   NA
 905551 905552 SPA2759 SPA2760     FALSE 0.021 270.000 0.000 1.000   NA
 905552 905553 SPA2760 SPA2761     TRUE 0.989 0.000 0.483 1.000   NA
 10702354 905554 SPA2762 SPA2764     FALSE 0.003 1053.000 0.000 NA   NA
 905554 905555 SPA2764 SPA2765     TRUE 0.861 9.000 0.000 NA   NA
 905557 905558 SPA2767 SPA2768     TRUE 0.863 63.000 0.714 NA   NA
 905560 905561 SPA2770 SPA2771     TRUE 0.991 -3.000 0.186 1.000 Y NA
 905561 905562 SPA2771 SPA2772     TRUE 0.854 40.000 0.071 1.000 Y NA
 905562 905563 SPA2772 SPA2773   ygbL TRUE 0.993 5.000 0.265 1.000 Y NA
 905563 905564 SPA2773 SPA2774 ygbL   TRUE 0.931 -3.000 0.088 NA   NA
 905564 905565 SPA2774 SPA2775   ygbJ TRUE 0.975 -6.000 0.355 NA   NA
 905568 905569 SPA2778 SPA2779     TRUE 0.977 11.000 0.444 NA   NA
 905570 905571 SPA2780 SPA2781 rpoS nlpD FALSE 0.457 63.000 0.142 1.000 N NA
 905571 905572 SPA2781 SPA2782 nlpD pcm FALSE 0.025 176.000 0.030 1.000 N NA
 905572 905573 SPA2782 SPA2783 pcm surE TRUE 0.977 -6.000 0.353 1.000   NA
 905573 905574 SPA2783 SPA2784 surE ygbO TRUE 0.937 -19.000 0.235 1.000   NA
 905574 905575 SPA2784 SPA2785 ygbO ygbB TRUE 0.965 -3.000 0.173 1.000   NA
 905575 905576 SPA2785 SPA2786 ygbB ygbP TRUE 0.996 0.000 0.419 1.000 Y NA
 905576 905577 SPA2786 SPA2787 ygbP ygbQ TRUE 0.833 19.000 0.185 1.000 N NA
 905577 905578 SPA2787 SPA2788 ygbQ ygbE FALSE 0.039 191.000 0.028 NA   NA
 905578 905579 SPA2788 SPA2789 ygbE cysC TRUE 0.669 51.000 0.198 NA   NA
 905579 905580 SPA2789 SPA2790 cysC cysN TRUE 0.989 -13.000 0.340 1.000 Y NA
 905580 905581 SPA2790 SPA2791 cysN cysD TRUE 0.994 10.000 0.574 0.001 N NA
 11501053 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8127.000 0.000 NA   NA
 11643416 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8127.000 0.000 NA   NA
 11785808 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8127.000 0.000 NA   NA
 11501054 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8156.000 0.000 NA   NA
 11643417 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8156.000 0.000 NA   NA
 11785809 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8156.000 0.000 NA   NA
 11501055 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8188.000 0.000 NA   NA
 11643418 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8188.000 0.000 NA   NA
 11785810 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8188.000 0.000 NA   NA
 11501056 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8217.000 0.000 NA   NA
 11643419 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8217.000 0.000 NA   NA
 11785811 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8217.000 0.000 NA   NA
 11501057 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8249.000 0.000 NA   NA
 11643420 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8249.000 0.000 NA   NA
 11785812 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8249.000 0.000 NA   NA
 11501058 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8278.000 0.000 NA   NA
 11643421 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8278.000 0.000 NA   NA
 11785813 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8278.000 0.000 NA   NA
 11501059 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8310.000 0.000 NA   NA
 11643422 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8310.000 0.000 NA   NA
 11785814 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8310.000 0.000 NA   NA
 11501060 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8339.000 0.000 NA   NA
 11643423 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8339.000 0.000 NA   NA
 11785815 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8339.000 0.000 NA   NA
 11501061 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8371.000 0.000 NA   NA
 11643424 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8371.000 0.000 NA   NA
 11785816 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8371.000 0.000 NA   NA
 11501062 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8400.000 0.000 NA   NA
 11643425 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8400.000 0.000 NA   NA
 11785817 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8400.000 0.000 NA   NA
 11501063 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8432.000 0.000 NA   NA
 11643426 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8432.000 0.000 NA   NA
 11785818 905572   SPA2782   pcm FALSE NA 8432.000 0.000 NA   NA
 905582 905583 SPA2793 SPA2794 ygbF   TRUE 0.913 30.000 0.509 NA   NA
 905583 905584 SPA2794 SPA2795     TRUE 0.991 0.000 0.589 NA   NA
 905584 905585 SPA2795 SPA2796     TRUE 0.980 0.000 0.282 NA   NA
 905585 905586 SPA2796 SPA2797     TRUE 0.989 10.000 0.780 NA   NA
 905586 905587 SPA2797 SPA2798     TRUE 0.884 23.000 0.276 NA   NA
 905587 10702356 SPA2798 SPA2799     TRUE 0.690 17.000 0.000 NA   NA
 905589 905590 SPA2802 SPA2803 cysH cysI FALSE 0.357 76.000 0.116 1.000 N NA
 905590 905591 SPA2803 SPA2804 cysI cysJ TRUE 0.999 0.000 0.791 0.001 Y NA
 10702357 905593 SPA2806 SPA2807   ygcF FALSE 0.004 606.000 0.000 NA   NA
 11501064 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5367.000 0.000 NA   NA
 11643427 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5367.000 0.000 NA   NA
 11785819 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5367.000 0.000 NA   NA
 11501065 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5396.000 0.000 NA   NA
 11643428 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5396.000 0.000 NA   NA
 11785820 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5396.000 0.000 NA   NA
 11501066 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5428.000 0.000 NA   NA
 11643429 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5428.000 0.000 NA   NA
 11785821 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5428.000 0.000 NA   NA
 11501067 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5457.000 0.000 NA   NA
 11643430 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5457.000 0.000 NA   NA
 11785822 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5457.000 0.000 NA   NA
 11501068 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5489.000 0.000 NA   NA
 11643431 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5489.000 0.000 NA   NA
 11785823 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5489.000 0.000 NA   NA
 11501069 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5518.000 0.000 NA   NA
 11643432 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5518.000 0.000 NA   NA
 11785824 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5518.000 0.000 NA   NA
 11501070 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5550.000 0.000 NA   NA
 11643433 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5550.000 0.000 NA   NA
 11785825 905589   SPA2802   cysH FALSE NA 5550.000 0.000 NA   NA
 905593 905594 SPA2807 SPA2808 ygcF   FALSE 0.245 83.000 0.000 NA   NA
 905594 905595 SPA2808 SPA2809   eno TRUE 0.714 -45.000 0.000 NA   NA
 905595 905596 SPA2809 SPA2810 eno pyrG FALSE 0.216 83.000 0.068 1.000 N NA
 905596 905597 SPA2810 SPA2811 pyrG mazG FALSE 0.024 228.000 0.025 1.000   NA
 905598 905599 SPA2812 SPA2813 steA steB TRUE 0.563 134.000 0.000 1.000 Y NA
 905599 905600 SPA2813 SPA2814 steB steC TRUE 0.960 13.000 0.000 1.000 Y NA
 905600 905601 SPA2814 SPA2815 steC steD TRUE 0.892 26.000 0.000 1.000 Y NA
 905601 905602 SPA2815 SPA2816 steD steE TRUE 0.980 15.000 0.000 0.008 Y NA
 905602 905603 SPA2816 SPA2817 steE steF TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 905603 905604 SPA2817 SPA2818 steF   FALSE 0.312 59.000 0.000 NA   NA
 905604 905605 SPA2818 SPA2819     FALSE 0.004 607.000 0.000 NA   NA
 905606 905607 SPA2820 SPA2821   relA FALSE 0.466 153.000 0.000 1.000 Y NA
 905607 905608 SPA2821 SPA2822 relA ygcA FALSE 0.364 52.000 0.082 1.000 N NA
 905610 905611 SPA2824 SPA2825   ygcX FALSE 0.114 78.000 0.037 1.000 N NA
 905611 10702358 SPA2825 SPA2826 ygcX   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 10702358 905612 SPA2826 SPA2827     FALSE 0.005 481.000 0.000 NA   NA
 905612 905613 SPA2827 SPA2828   yqcB TRUE 0.850 19.000 0.209 1.000 N NA
 905613 905614 SPA2828 SPA2829 yqcB yqcC TRUE 0.989 0.000 0.518 NA   NA
 905617 905618 SPA2832 SPA2833 yqcD ygdH FALSE 0.202 143.000 0.079 NA   NA
 905618 905619 SPA2833 SPA2834 ygdH sdaC FALSE 0.005 565.000 0.000 NA   NA
 905619 905620 SPA2834 SPA2835 sdaC sdaB TRUE 0.892 59.000 0.238 1.000 Y NA
 905620 905621 SPA2835 SPA2836 sdaB exo FALSE 0.040 171.000 0.044 1.000 N NA
 905622 905623 SPA2837 SPA2838 fucO fucA TRUE 0.642 17.000 0.066 1.000 N NA
 905624 905625 SPA2839 SPA2840 fucP fucI TRUE 0.905 32.000 0.104 1.000 Y NA
 905625 905626 SPA2840 SPA2841 fucI fucK TRUE 0.849 101.000 0.269 1.000 Y NA
 905626 905627 SPA2841 SPA2842 fucK fucU TRUE 0.993 2.000 0.211 1.000 Y NA
 905627 905628 SPA2842 SPA2843 fucU fucR TRUE 0.912 58.000 0.308 1.000 Y NA
 905629 905630 SPA2844 SPA2845 ygdE ygdD TRUE 0.931 -7.000 0.144 NA   NA
 905630 905631 SPA2845 SPA2846 ygdD gcvA TRUE 0.747 19.000 0.081 NA   NA
 905634 905635 SPA2849 SPA2850 csdA ygdK TRUE 0.989 0.000 0.122 0.001   NA
 905635 905636 SPA2850 SPA2851 ygdK   FALSE 0.020 273.000 0.000 1.000   NA
 905637 905638 SPA2852 SPA2853 ygdL mltA FALSE 0.134 110.000 0.000 1.000 N NA
 905639 905640 SPA2854 SPA2855 metZ metZ TRUE 0.475 33.000 0.000 NA   NA
 905643 905644 SPA2858 SPA2859 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 905644 905645 SPA2859 SPA2860 recB ptr TRUE 0.862 -7.000 0.092 1.000 N NA
 905645 905646 SPA2860 SPA2861 ptr recC FALSE 0.090 178.000 0.092 1.000 N NA
 905646 905647 SPA2861 SPA2862 recC ppdC TRUE 0.679 16.000 0.076 NA N NA
 905647 905648 SPA2862 SPA2863 ppdC ygdB TRUE 0.973 -15.000 0.538 NA   NA
 905648 905649 SPA2863 SPA2864 ygdB ppdB TRUE 0.983 -3.000 0.373 NA   NA
 905649 905650 SPA2864 SPA2865 ppdB ppdA TRUE 0.991 -9.000 0.368 NA Y NA
 905650 905651 SPA2865 SPA2866 ppdA thyA FALSE 0.008 185.000 0.016 NA N NA
 905651 905652 SPA2866 SPA2867 thyA lgt TRUE 0.939 7.000 0.164 1.000 N NA
 905652 905653 SPA2867 SPA2868 lgt ptsP FALSE 0.004 417.000 0.000 1.000 N NA
 905653 905654 SPA2868 SPA2869 ptsP ygdP TRUE 0.669 13.000 0.000 1.000 N NA
 905655 905656 SPA2870 SPA2871 mutH ygdQ FALSE 0.040 182.000 0.052 1.000 N NA
 905656 905657 SPA2871 SPA2872 ygdQ ygdR FALSE 0.433 170.000 0.429 NA   NA
 905657 905658 SPA2872 SPA2873 ygdR tas FALSE 0.048 191.000 0.043 NA   NA
 905659 905660 SPA2874 SPA2875 ygeD aas TRUE 0.922 -7.000 0.124 NA   NA
 905660 905661 SPA2875 SPA2876 aas   FALSE 0.229 91.000 0.000 NA   NA
 905661 905662 SPA2876 SPA2877     TRUE 0.704 -80.000 0.000 NA   NA
 905663 905664 SPA2878 SPA2879 galR   TRUE 0.990 14.000 0.200 0.045 Y NA
 905667 905668 SPA2882 SPA2883 ygeA araE FALSE 0.031 140.000 0.011 1.000 N NA
 905668 905669 SPA2883 SPA2884 araE kduD FALSE 0.005 354.000 0.000 1.000 N NA
 905669 905670 SPA2884 SPA2885 kduD kduI TRUE 0.665 57.000 0.269 1.000 N NA
 905670 905671 SPA2885 SPA2886 kduI yqeF FALSE 0.004 430.000 0.000 1.000 N NA
 905671 905672 SPA2886 SPA2887 yqeF   FALSE 0.109 123.000 0.050 1.000 N NA
 905673 905674 SPA2888 SPA2889     FALSE 0.279 142.000 0.119 NA   NA
 905677 905678 SPA2892 SPA2893     TRUE 0.973 -13.000 0.500 NA   NA
 905678 905679 SPA2893 SPA2894     TRUE 0.608 145.000 0.500 NA   NA
 905679 905680 SPA2894 SPA2895   stdC TRUE 0.988 -3.000 0.500 1.000   NA
 905680 905681 SPA2895 SPA2896 stdC stdB TRUE 0.826 41.000 0.000 1.000 Y NA
 905681 905682 SPA2896 SPA2897 stdB stdA TRUE 0.610 120.000 0.000 1.000 Y NA
 905682 905683 SPA2897 SPA2898 stdA   FALSE 0.004 718.000 0.000 NA   NA
 905683 10702359 SPA2898 SPA2899     FALSE 0.372 47.000 0.000 NA   NA
 10702359 905684 SPA2899 SPA2900   tnpA FALSE 0.004 678.000 0.000 NA   NA
 905684 905685 SPA2900 SPA2901 tnpA   FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 905685 905686 SPA2901 SPA2902     TRUE 0.993 0.000 0.727 NA   NA
 905687 905688 SPA2903 SPA2904     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 905689 905690 SPA2905 SPA2906 glyU   FALSE 0.249 80.000 0.000 NA   NA
 905692 905693 SPA2908 SPA2909 lysS prfB TRUE 0.993 10.000 0.162 0.041 Y NA
 905693 905694 SPA2909 SPA2910 prfB recJ FALSE 0.077 105.000 0.028 1.000 N NA
 905694 905695 SPA2910 SPA2911 recJ dsbC TRUE 0.882 6.000 0.082 1.000 N NA
 905695 905696 SPA2911 SPA2912 dsbC xerD TRUE 0.584 24.000 0.079 1.000 N NA
 905698 905699 SPA2914 SPA2915 ygfX ygfY TRUE 0.507 35.000 0.061 NA   NA
 905701 905702 SPA2917 SPA2918 yqfA yqfB FALSE 0.174 165.000 0.113 NA   NA
 905704 905705 SPA2920 SPA2921   gcvP FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 905705 905706 SPA2921 SPA2922 gcvP gcvH TRUE 0.657 163.000 0.249 1.000 Y NA
 905706 905707 SPA2922 SPA2923 gcvH gcvT TRUE 0.987 26.000 0.317 0.001 Y NA
 905707 905708 SPA2923 SPA2924 gcvT visC FALSE 0.001 455.000 0.004 1.000 N NA
 905708 905709 SPA2924 SPA2925 visC visB TRUE 0.951 125.000 0.474 0.001 Y NA
 905709 905710 SPA2925 SPA2926 visB pepP TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000 N NA
 905710 905711 SPA2926 SPA2927 pepP ygfB TRUE 0.548 26.000 0.000 NA   NA
 905712 905713 SPA2928 SPA2930 ygfE   FALSE 0.402 42.000 0.000 NA   NA
 905713 905714 SPA2930 SPA2931   ygfA FALSE 0.271 70.000 0.000 NA   NA
 905714 905715 SPA2931 SPA2932 ygfA   FALSE 0.347 52.000 0.000 NA   NA
 905716 905717 SPA2933 SPA2934 serA rpiA FALSE 0.006 267.000 0.029 1.000 N NA
 905719 905720 SPA2936 SPA2937 yggE yggA FALSE 0.299 94.000 0.075 NA   NA
 905720 905721 SPA2937 SPA2938 yggA yggB FALSE 0.051 201.000 0.049 1.000   NA
 905721 905722 SPA2938 SPA2939 yggB fba FALSE 0.013 223.000 0.038 1.000 N NA
 905722 905723 SPA2939 SPA2940 fba pgk TRUE 0.837 102.000 0.056 0.005 Y NA
 905723 905724 SPA2940 SPA2941 pgk epd TRUE 0.968 22.000 0.070 0.005 Y NA
 905725 905726 SPA2942 SPA2943     TRUE 0.708 26.000 0.103 NA   NA
 905726 905727 SPA2943 SPA2944     TRUE 0.915 34.000 0.605 NA   NA
 905727 905728 SPA2944 SPA2945     TRUE 0.967 -18.000 0.093 1.000 Y NA
 905728 905729 SPA2945 SPA2946     TRUE 0.995 -6.000 0.214 0.013 Y NA
 905732 905733 SPA2949 SPA2950 speB speA FALSE 0.180 228.000 0.055 1.000 Y NA
 905733 905734 SPA2950 SPA2951 speA yqgB TRUE 0.766 9.000 0.009 NA   NA
 905735 905736 SPA2952 SPA2953 yqgD metK FALSE 0.068 149.000 0.004 NA   NA
 905736 905737 SPA2953 SPA2954 metK galP FALSE 0.003 493.000 0.000 1.000 N NA
 905737 905738 SPA2954 SPA2955 galP sprT FALSE 0.248 79.000 0.042 1.000   NA
 905738 905739 SPA2955 SPA2956 sprT endA TRUE 0.552 95.000 0.210 1.000   NA
 905739 905740 SPA2956 SPA2957 endA yggJ TRUE 0.566 77.000 0.201 NA   NA
 905740 905741 SPA2957 SPA2958 yggJ gshB TRUE 0.848 20.000 0.173 NA   NA
 905741 905742 SPA2958 SPA2959 gshB yqgE FALSE 0.053 216.000 0.120 NA N NA
 905742 905743 SPA2959 SPA2960 yqgE yqgF TRUE 0.971 0.000 0.263 NA N NA
 905744 905745 SPA2961 SPA2962   pilT FALSE 0.101 132.000 0.000 1.000 N NA
 905746 905747 SPA2963 SPA2964 yggS yggT TRUE 0.870 19.000 0.189 NA   NA
 905747 905748 SPA2964 SPA2965 yggT yggU TRUE 0.925 -3.000 0.081 NA   NA
 905748 905749 SPA2965 SPA2966 yggU yggV TRUE 0.786 8.000 0.016 NA   NA
 905749 905750 SPA2966 SPA2967 yggV yggW TRUE 0.942 -7.000 0.218 1.000 N NA
 905751 905752 SPA2968 SPA2969 yggM ansB FALSE 0.102 133.000 0.018 NA   NA
 905752 905753 SPA2969 SPA2970 ansB yggN FALSE 0.040 189.000 0.027 NA   NA
 905753 905754 SPA2970 SPA2971 yggN yggL TRUE 0.604 53.000 0.155 NA   NA
 905754 905755 SPA2971 SPA2972 yggL yggH TRUE 0.943 0.000 0.092 NA   NA
 905756 905757 SPA2973 SPA2974 mutY yggX TRUE 0.678 28.000 0.150 NA N NA
 905757 905758 SPA2974 SPA2975 yggX mltC FALSE 0.296 113.000 0.128 NA N NA
 905758 905759 SPA2975 SPA2976 mltC nupG FALSE 0.038 217.000 0.056 NA   NA
 905761 905762 SPA2978 SPA2979 yqgA pheV FALSE 0.217 106.000 0.000 NA   NA
 905762 905763 SPA2979 SPA2980 pheV   FALSE 0.003 1226.000 0.000 NA   NA
 905763 905764 SPA2980 SPA2981     FALSE 0.040 209.000 0.000 NA   NA
 905764 905765 SPA2981 SPA2982     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 905765 905766 SPA2982 SPA2983     FALSE 0.008 384.000 0.000 NA   NA
 905766 905767 SPA2983 SPA2984     FALSE 0.131 243.000 0.000 0.001   NA
 905767 905768 SPA2984 SPA2985     FALSE 0.007 403.000 0.000 NA   NA
 905768 905769 SPA2985 SPA2986     FALSE 0.020 259.000 0.000 NA   NA
 905769 905770 SPA2986 SPA2987     FALSE 0.050 197.000 0.000 NA   NA
 905770 905771 SPA2987 SPA2988     TRUE 0.895 2.000 0.000 NA   NA
 905776 905777 SPA2993 SPA2994     TRUE 0.989 11.000 0.864 NA   NA
 905777 905778 SPA2994 SPA2995     FALSE 0.064 209.000 0.083 NA   NA
 905778 905779 SPA2995 SPA2996   ordL FALSE 0.349 123.000 0.125 NA   NA
 905781 905782 SPA2998 SPA2999     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 905782 905783 SPA2999 SPA3000     FALSE 0.004 725.000 0.000 NA   NA
 905783 905784 SPA3000 SPA3001     TRUE 0.785 39.000 0.000 0.004   NA
 905784 905785 SPA3001 SPA3002   exuT FALSE 0.005 555.000 0.000 1.000   NA
 905786 905787 SPA3003 SPA3004 uxuA uxuB TRUE 0.679 111.000 0.070 1.000 Y NA
 905787 905788 SPA3004 SPA3005 uxuB uxaC TRUE 0.995 12.000 0.647 1.000 Y NA
 905789 905790 SPA3006 SPA3007   gsp FALSE 0.005 670.000 0.000 1.000   NA
 905792 10702360 SPA3009 SPA3010     TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 10702360 905793 SPA3010 SPA3011   hybG FALSE 0.257 76.000 0.000 NA   NA
 905793 905794 SPA3011 SPA3012 hybG hybF TRUE 0.938 28.000 0.667 NA   NA
 905794 905795 SPA3012 SPA3013 hybF hybE TRUE 0.840 -7.000 0.055 NA   NA
 905795 905796 SPA3013 SPA3014 hybE hybD TRUE 0.965 -7.000 0.291 NA   NA
 905796 905797 SPA3014 SPA3015 hybD hybC TRUE 0.998 0.000 0.828 1.000 Y NA
 905797 905798 SPA3015 SPA3016 hybC hybB TRUE 0.980 -3.000 0.000 NA Y NA
 905798 905799 SPA3016 SPA3017 hybB hybA TRUE 0.963 -10.000 0.000 NA Y NA
 905799 905800 SPA3017 SPA3018 hybA hyb0 TRUE 0.999 3.000 0.615 0.015 Y NA
 905800 905801 SPA3018 SPA3019 hyb0 yghW FALSE 0.084 190.000 0.077 NA   NA
 905801 905802 SPA3019 SPA3020 yghW   TRUE 0.725 85.000 0.417 NA   NA
 905802 905803 SPA3020 SPA3021   yqhA FALSE 0.013 307.000 0.000 NA   NA
 905803 905804 SPA3021 SPA3022 yqhA   FALSE 0.035 218.000 0.052 NA   NA
 905805 905806 SPA3023 SPA3024     TRUE 0.978 17.000 1.000 NA   NA
 905806 905807 SPA3024 SPA3025   yghA FALSE 0.250 124.000 0.078 NA   NA
 905808 905809 SPA3026 SPA3027 exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.060 Y NA
 905809 905810 SPA3027 SPA3028 exbB   TRUE 0.821 -7.000 0.048 NA   NA
 905811 905812 SPA3029 SPA3030 metC yghB FALSE 0.414 140.000 0.212 NA   NA
 905814 905815 SPA3032 SPA3033 yqhD yqhE TRUE 0.530 106.000 0.200 1.000   NA
 905815 905816 SPA3033 SPA3034 yqhE   FALSE 0.068 188.000 0.000 1.000   NA
 905816 905817 SPA3034 SPA3035     FALSE 0.262 45.000 0.000 1.000 N NA
 905818 905819 SPA3036 SPA3037 ygiR   FALSE 0.159 134.000 0.000 NA   NA
 905819 905820 SPA3037 SPA3038     FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 905820 905821 SPA3038 SPA3039     TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 905821 10702361 SPA3039 SPA3040     FALSE 0.004 622.000 0.000 NA   NA
 10702361 905822 SPA3040 SPA3041   sufI FALSE 0.025 240.000 0.000 NA   NA
 905822 905823 SPA3041 SPA3042 sufI plsC FALSE 0.434 74.000 0.154 1.000 N NA
 905823 905824 SPA3042 SPA3043 plsC parC FALSE 0.010 257.000 0.043 1.000 N NA
 905824 905825 SPA3043 SPA3044 parC   TRUE 0.584 111.000 0.005 1.000 Y NA
 905825 905826 SPA3044 SPA3045   ygiW FALSE 0.272 72.000 0.053 NA   NA
 905827 905828 SPA3046 SPA3047 ygiX ygiY TRUE 0.996 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 905828 905829 SPA3047 SPA3048 ygiY mdaB FALSE 0.243 107.000 0.052 1.000   NA
 905829 905830 SPA3048 SPA3049 mdaB ygiN TRUE 0.819 32.000 0.074 0.026   NA
 905831 905832 SPA3050 SPA3051 parE yqiA TRUE 0.821 28.000 0.217 NA   NA
 905832 905833 SPA3051 SPA3052 yqiA icc TRUE 0.987 0.000 0.427 NA   NA
 905833 905834 SPA3052 SPA3053 icc yqiB TRUE 0.917 25.000 0.433 NA   NA
 905834 905835 SPA3053 SPA3054 yqiB yqiE TRUE 0.985 -3.000 0.443 NA   NA
 905836 905837 SPA3055 SPA3056 tolC ygiB FALSE 0.269 213.000 0.480 NA   NA
 905837 905838 SPA3056 SPA3057 ygiB ygiC TRUE 0.989 6.000 0.632 NA   NA
 905840 905841 SPA3059 SPA3060 ygiE assT FALSE 0.006 523.000 0.000 1.000   NA
 905841 905842 SPA3060 SPA3061 assT   TRUE 0.947 20.000 0.500 1.000   NA
 905842 905843 SPA3061 SPA3062     TRUE 0.983 15.000 0.375 0.005   NA
 905847 905848 SPA3066 SPA3067   yqiK TRUE 0.960 19.000 0.641 NA   NA
 905849 905850 SPA3068 SPA3069 rfaE glnE FALSE 0.386 48.000 0.083 1.000 N NA
 905850 905851 SPA3069 SPA3070 glnE ygiF FALSE 0.220 118.000 0.053 1.000   NA
 905852 905853 SPA3071 SPA3072 ygiM cca FALSE 0.353 63.000 0.106 NA N NA
 905854 905855 SPA3073 SPA3074 bacA folB FALSE 0.343 98.000 0.128 1.000 N NA
 905858 905859 SPA3077 SPA3078 rpsU dnaG FALSE 0.022 236.000 0.067 1.000 N NA
 905859 905860 SPA3078 SPA3079 dnaG rpoD TRUE 0.929 15.000 0.299 1.000 N NA
 905865 905866 SPA3084 SPA3085 cheM air FALSE 0.123 388.000 0.000 0.003 Y NA
 905867 905868 SPA3086 SPA3087 oat fadH FALSE 0.023 171.000 0.024 1.000 N NA
 905870 905871 SPA3089 SPA3090 ygjP ygjQ FALSE 0.073 152.000 0.019 NA   NA
 905871 905872 SPA3090 SPA3091 ygjQ ygjR FALSE 0.242 52.000 0.019 NA   NA
 905872 905873 SPA3091 SPA3092 ygjR   FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 905873 905874 SPA3092 SPA3093   ygjT TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   NA
 905874 905875 SPA3093 SPA3094 ygjT ygjU FALSE 0.012 255.000 0.000 1.000 N NA
 905875 905876 SPA3094 SPA3095 ygjU yqjA FALSE 0.006 450.000 0.000 NA   NA
 905876 905877 SPA3095 SPA3096 yqjA yqjB TRUE 0.988 4.000 0.529 NA   NA
 905877 905878 SPA3096 SPA3097 yqjB yqjC TRUE 0.694 145.000 0.684 NA   NA
 905878 905879 SPA3097 SPA3098 yqjC yqjD TRUE 0.893 42.000 0.609 NA   NA
 905879 905880 SPA3098 SPA3099 yqjD yqjE TRUE 0.967 3.000 0.185 NA   NA
 905880 905881 SPA3099 SPA3100 yqjE yqjK TRUE 0.965 -3.000 0.185 NA   NA
 905881 905882 SPA3100 SPA3101 yqjK yqjF FALSE 0.322 145.000 0.161 NA   NA
 905882 905883 SPA3101 SPA3102 yqjF yqjG FALSE 0.280 68.000 0.000 NA   NA
 905883 905884 SPA3102 SPA3103 yqjG yhaH FALSE 0.200 124.000 0.000 1.000   NA
 905886 10702362 SPA3105 SPA3106 yhaK   TRUE 0.575 24.000 0.000 NA   NA
 905887 10702363 SPA3107 SPA3108 yhaN   TRUE 0.548 26.000 0.000 NA   NA
 10702363 905888 SPA3108 SPA3109   tdcG FALSE 0.012 315.000 0.000 NA   NA
 905888 905889 SPA3109 SPA3110 tdcG tdcE FALSE 0.175 70.000 0.000 1.000 N NA
 905889 905890 SPA3110 SPA3111 tdcE tdcD TRUE 0.948 34.000 0.286 1.000 Y NA
 905890 905891 SPA3111 SPA3112 tdcD tdcC TRUE 0.654 67.000 0.308 1.000 N NA
 905891 905892 SPA3112 SPA3113 tdcC tdcB TRUE 0.903 21.000 0.029 1.000 Y NA
 905892 905893 SPA3113 SPA3114 tdcB tdcA FALSE 0.069 98.000 0.023 1.000 N NA
 905895 905896 SPA3116 SPA3117 garK garR FALSE 0.377 98.000 0.152 1.000 N NA
 905896 905897 SPA3117 SPA3118 garR garL TRUE 0.892 26.000 0.424 1.000 N NA
 905898 905899 SPA3120 SPA3121   agaR TRUE 0.983 11.000 0.150 NA Y NA
 905900 905901 SPA3122 SPA3123 gatY   TRUE 0.971 11.000 0.000 1.000 Y NA
 905901 905902 SPA3123 SPA3124     TRUE 0.951 27.000 0.217 1.000 Y NA
 905902 905903 SPA3124 SPA3125     TRUE 0.987 -13.000 0.087 0.008 Y NA
 905903 905904 SPA3125 SPA3126   gatZ FALSE 0.335 198.000 0.100 1.000 Y NA
 905904 905905 SPA3126 SPA3127 gatZ gatA TRUE 0.995 15.000 1.000 1.000 Y NA
 905905 905906 SPA3127 SPA3128 gatA gatB TRUE 0.992 31.000 0.800 0.008 Y NA
 905906 905907 SPA3128 SPA3129 gatB gatC TRUE 0.996 4.000 0.214 0.012 Y NA
 905907 905908 SPA3129 SPA3130 gatC gatD FALSE 0.268 44.000 0.000 1.000 N NA
 905908 905909 SPA3130 SPA3131 gatD gatR FALSE 0.132 111.000 0.000 1.000 N NA
 905911 905912 SPA3133 SPA3134 yraM yraN TRUE 0.900 -42.000 0.172 1.000   NA
 905912 905913 SPA3134 SPA3135 yraN yraO TRUE 0.806 22.000 0.187 1.000 N NA
 905913 905914 SPA3135 SPA3136 yraO yraP TRUE 0.986 10.000 0.613 NA   NA
 905919 905920 SPA3141 SPA3142 yhbS yhbT TRUE 0.971 -6.000 0.295 1.000   NA
 905921 905922 SPA3143 SPA3144 yhbU yhbV TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 905922 10702365 SPA3144 SPA3145 yhbV   FALSE 0.073 178.000 0.000 NA   NA
 905923 905924 SPA3146 SPA3147 mtr deaD FALSE 0.022 154.000 0.009 1.000 N NA
 905924 905925 SPA3147 SPA3148 deaD nlpI FALSE 0.082 179.000 0.053 1.000   NA
 905925 905926 SPA3148 SPA3149 nlpI pnp FALSE 0.296 110.000 0.071 1.000   NA
 905928 905929 SPA3151 SPA3152 rpsO truB TRUE 0.687 151.000 0.211 1.000 Y NA
 905929 905930 SPA3152 SPA3153 truB rbfA TRUE 0.995 0.000 0.318 1.000 Y NA
 905930 905931 SPA3153 SPA3154 rbfA infB TRUE 0.553 221.000 0.530 1.000 Y NA
 905931 905932 SPA3154 SPA3155 infB nusA TRUE 0.874 25.000 0.342 1.000 N NA
 905932 905933 SPA3155 SPA3156 nusA yhbC TRUE 0.945 28.000 0.759 NA   NA
 905933 905934 SPA3156 SPA3157 yhbC   FALSE 0.039 211.000 0.000 NA   NA
 905936 905937 SPA3159 SPA3160 leuU secG TRUE 0.761 14.000 0.000 NA   NA
 905937 905938 SPA3160 SPA3161 secG mrsA FALSE 0.007 223.000 0.016 1.000 N NA
 905938 905939 SPA3161 SPA3162 mrsA folP TRUE 0.951 -7.000 0.260 1.000 N NA
 905939 905940 SPA3162 SPA3163 folP ftsH TRUE 0.585 105.000 0.325 1.000 N NA
 905940 905941 SPA3163 SPA3164 ftsH ftsJ FALSE 0.374 104.000 0.152 1.000 N NA
 905945 905946 SPA3168 SPA3169 yhbZ yhbE TRUE 0.632 16.000 0.015 1.000   NA
 905946 905947 SPA3169 SPA3170 yhbE rpmA FALSE 0.127 130.000 0.019 1.000   NA
 905947 905948 SPA3170 SPA3171 rpmA rplU TRUE 0.994 20.000 0.667 0.012 Y NA
 905949 905950 SPA3172 SPA3173 ispB nlp FALSE 0.016 232.000 0.000 1.000 N NA
 905951 905952 SPA3174 SPA3175 murA yrbA TRUE 0.650 54.000 0.258 NA N NA
 905952 905953 SPA3175 SPA3176 yrbA yrbB TRUE 0.561 149.000 0.453 NA   NA
 905953 905954 SPA3176 SPA3177 yrbB yrbC TRUE 0.982 0.000 0.308 NA   NA
 905954 905955 SPA3177 SPA3178 yrbC yrbD TRUE 0.870 19.000 0.188 NA   NA
 905955 905956 SPA3178 SPA3179 yrbD yrbE TRUE 0.988 5.000 0.562 NA   NA
 905956 905957 SPA3179 SPA3180 yrbE yrbF TRUE 0.996 8.000 0.530 NA Y NA
 905958 905959 SPA3181 SPA3182 yrbG yrbH TRUE 0.917 14.000 0.226 1.000 N NA
 905959 905960 SPA3182 SPA3183 yrbH yrbI TRUE 0.953 21.000 0.598 1.000   NA
 905960 905961 SPA3183 SPA3184 yrbI yrbK TRUE 0.990 -3.000 0.617 NA   NA
 905961 905962 SPA3184 SPA3185 yrbK yhbN TRUE 0.985 5.000 0.459 NA   NA
 905962 905963 SPA3185 SPA3186 yhbN yhbG TRUE 0.986 7.000 0.543 NA   NA
 905963 905964 SPA3186 SPA3187 yhbG rpoN TRUE 0.657 48.000 0.163 1.000   NA
 905964 905965 SPA3187 SPA3188 rpoN yhbH TRUE 0.950 23.000 0.820 NA N NA
 905965 905966 SPA3188 SPA3189 yhbH ptsN TRUE 0.738 118.000 0.728 NA N NA
 905966 905967 SPA3189 SPA3190 ptsN yhbJ TRUE 0.683 46.000 0.186 NA   NA
 905967 905968 SPA3190 SPA3191 yhbJ ptsO TRUE 0.964 -3.000 0.182 NA   NA
 905968 905969 SPA3191 SPA3192 ptsO yrbL FALSE 0.024 245.000 0.000 NA   NA
 905970 905971 SPA3193 SPA3194 mtgA yhbL TRUE 0.908 -3.000 0.066 NA   NA
 905973 905974 SPA3196 SPA3197 arcB yhcC FALSE 0.408 94.000 0.113 1.000   NA
 905975 905976 SPA3198 SPA3199 gltB gltD TRUE 0.994 10.000 0.096 0.000 Y NA
 905976 905977 SPA3199 SPA3200 gltD yhcG FALSE 0.041 208.000 0.000 NA   NA
 905977 905978 SPA3200 SPA3201 yhcG codB FALSE 0.195 117.000 0.000 NA   NA
 905978 905979 SPA3201 SPA3202 codB codA TRUE 0.985 -13.000 0.250 1.000 Y NA
 905980 905981 SPA3203 SPA3204 yhcH nanK TRUE 0.992 -3.000 0.222 NA Y NA
 905981 905982 SPA3204 SPA3205 nanK nanE TRUE 0.993 -3.000 0.238 NA Y NA
 905982 905983 SPA3205 SPA3206 nanE nanT TRUE 0.878 47.000 0.143 1.000 Y NA
 905983 905984 SPA3206 SPA3207 nanT nanA TRUE 0.548 116.000 0.318 1.000 N NA
 905984 905985 SPA3207 SPA3208 nanA yhcK FALSE 0.188 135.000 0.091 1.000 N NA
 905985 905986 SPA3208 SPA3209 yhcK sspB FALSE 0.126 109.000 0.009 NA   NA
 905986 905987 SPA3209 SPA3210 sspB sspA TRUE 0.992 6.000 0.831 NA   NA
 905987 905988 SPA3210 SPA3211 sspA rpsI FALSE 0.002 313.000 0.014 1.000 N NA
 905988 905989 SPA3211 SPA3212 rpsI rplM TRUE 0.995 16.000 0.601 0.012 Y NA
 905989 905990 SPA3212 SPA3213 rplM yhcM FALSE 0.007 301.000 0.003 NA   NA
 905991 905992 SPA3214 SPA3215 yhcB degQ FALSE 0.251 157.000 0.154 NA   NA
 905992 905993 SPA3215 SPA3216 degQ degS TRUE 0.938 93.000 0.262 0.002 Y NA
 905994 905995 SPA3217 SPA3218   oadB FALSE 0.186 20.000 0.019 NA N NA
 905995 905996 SPA3218 SPA3219 oadB oadA TRUE 0.998 13.000 0.886 0.001 Y NA
 905996 905997 SPA3219 SPA3220 oadA oadG TRUE 0.997 16.000 0.720 0.001 Y NA
 905997 905998 SPA3220 SPA3221 oadG ttdB FALSE 0.403 156.000 0.025 1.000 Y NA
 905998 905999 SPA3221 SPA3222 ttdB ttdA TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 905999 10702366 SPA3222 SPA3223 ttdA   TRUE 0.475 33.000 0.000 NA   NA
 10702366 906000 SPA3223 SPA3224     FALSE 0.173 127.000 0.000 NA   NA
 906000 906001 SPA3224 SPA3225     TRUE 0.978 47.000 0.429 0.003 Y NA
 906001 906002 SPA3225 SPA3226   mdh FALSE 0.053 120.000 0.020 1.000 N NA
 906003 906004 SPA3227 SPA3228 argR yhcN FALSE 0.008 365.000 0.000 NA   NA
 906004 906005 SPA3228 SPA3229 yhcN   TRUE 0.780 104.000 0.625 NA   NA
 906006 906007 SPA3230 SPA3231 yhcO yhcP FALSE 0.056 172.000 0.027 NA   NA
 906007 906008 SPA3231 SPA3232 yhcP yhcQ TRUE 0.874 6.000 0.000 NA   NA
 906008 906009 SPA3232 SPA3233 yhcQ yhcR TRUE 0.866 8.000 0.000 NA   NA
 906011 906012 SPA3235 SPA3236 tldD yhdP FALSE 0.134 145.000 0.050 NA   NA
 906012 906013 SPA3236 SPA3237 yhdP rnG TRUE 0.599 112.000 0.296 NA   NA
 906013 906014 SPA3237 SPA3238 rnG yhdE TRUE 0.962 -10.000 0.417 NA N NA
 906014 906015 SPA3238 SPA3239 yhdE mreD TRUE 0.945 9.000 0.206 NA N NA
 906015 906016 SPA3239 SPA3240 mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 906016 906017 SPA3240 SPA3241 mreC mreB TRUE 0.831 65.000 0.689 1.000 N NA
 906017 906018 SPA3241 SPA3242 mreB yhdA FALSE 0.007 308.000 0.000 1.000 N NA
 906019 906020 SPA3243 SPA3244 yhdH   FALSE 0.251 113.000 0.059 1.000   NA
 906020 906021 SPA3244 SPA3245     TRUE 0.997 1.000 0.790 0.044   NA
 906021 906022 SPA3245 SPA3246   accB FALSE 0.008 393.000 0.000 1.000   NA
 906022 906023 SPA3246 SPA3247 accB accC TRUE 0.996 11.000 0.275 0.001 Y NA
 906023 906024 SPA3247 SPA3248 accC yhdT FALSE 0.353 109.000 0.103 NA   NA
 906024 906025 SPA3248 SPA3249 yhdT panF TRUE 0.983 -10.000 0.682 NA   NA
 906025 906026 SPA3249 SPA3250 panF prmA TRUE 0.640 12.000 0.041 1.000 N NA
 906026 906027 SPA3250 SPA3251 prmA yhdG FALSE 0.023 780.000 0.042 1.000 Y NA
 906027 906028 SPA3251 SPA3252 yhdG fis TRUE 0.734 26.000 0.161 1.000 N NA
 906028 10702367 SPA3252 SPA3253 fis   FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 10702367 906029 SPA3253 SPA3254   yhdU FALSE 0.328 56.000 0.000 NA   NA
 906029 906030 SPA3254 SPA3255 yhdU   FALSE 0.119 151.000 0.000 NA   NA
 906032 906033 SPA3257 SPA3258 acrE acrF TRUE 0.985 12.000 0.889 1.000 N NA
 906033 906034 SPA3258 SPA3259 acrF yhdV FALSE 0.026 237.000 0.000 NA   NA
 906035 906036 SPA3260 SPA3261 rrfF   FALSE 0.411 41.000 0.000 NA   NA
 906036 906037 SPA3261 SPA3262   rrfD TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 906037 906038 SPA3262 SPA3263 rrfD rrlD FALSE 0.227 92.000 0.000 NA   NA
 906038 906039 SPA3263 SPA3264 rrlD   FALSE 0.049 198.000 0.000 NA   NA
 906039 906040 SPA3264 SPA3265   rrsD FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 906042 906043 SPA3267 SPA3268 yrdB aroE TRUE 0.868 -3.000 0.043 NA   NA
 906043 906044 SPA3268 SPA3269 aroE yrdC TRUE 0.881 5.000 0.087 NA N NA
 906044 906045 SPA3269 SPA3270 yrdC yrdD TRUE 0.928 5.000 0.137 NA N NA
 906045 906046 SPA3270 SPA3271 yrdD smg TRUE 0.880 27.000 0.331 NA   NA
 906046 906047 SPA3271 SPA3272 smg smf TRUE 0.867 -28.000 0.124 NA   NA
 906048 906049 SPA3273 SPA3274 fms fmt TRUE 0.975 16.000 0.058 0.017 Y NA
 906049 906050 SPA3274 SPA3275 fmt sun TRUE 0.921 52.000 0.305 1.000 Y NA
 906050 906051 SPA3275 SPA3276 sun trkA TRUE 0.722 22.000 0.122 1.000 N NA
 906051 906052 SPA3276 SPA3277 trkA mscL FALSE 0.057 142.000 0.035 1.000 N NA
 906053 906054 SPA3278 SPA3279 zntR yhdN TRUE 0.902 11.000 0.095 NA   NA
 906054 906055 SPA3279 SPA3280 yhdN rplQ FALSE 0.131 108.000 0.012 NA   NA
 906055 906056 SPA3280 SPA3281 rplQ rpoA TRUE 0.913 41.000 0.873 1.000 N NA
 906056 906057 SPA3281 SPA3282 rpoA rpsD TRUE 0.916 26.000 0.549 1.000 N NA
 906057 906058 SPA3282 SPA3283 rpsD rpsK TRUE 0.985 34.000 0.509 0.015 Y NA
 906058 906059 SPA3283 SPA3284 rpsK rpsM TRUE 0.996 17.000 0.810 0.011 Y NA
 906059 906060 SPA3284 SPA3285 rpsM rpmJ TRUE 0.753 147.000 0.086 0.011 Y NA
 906060 906061 SPA3285 SPA3286 rpmJ prlA FALSE 0.259 32.000 0.036 1.000 N NA
 906061 906062 SPA3286 SPA3287 prlA rplO TRUE 0.988 8.000 0.730 1.000 N NA
 906062 906063 SPA3287 SPA3288 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 906063 906064 SPA3288 SPA3289 rpmD rpsE TRUE 0.999 4.000 0.789 0.015 Y NA
 906064 906065 SPA3289 SPA3290 rpsE rplR TRUE 0.972 15.000 0.007 0.015 Y NA
 906065 906066 SPA3290 SPA3291 rplR rplF TRUE 0.987 10.000 0.008 0.011 Y NA
 906066 906067 SPA3291 SPA3292 rplF rpsH TRUE 0.998 13.000 0.808 0.011 Y NA
 906067 906068 SPA3292 SPA3293 rpsH rpsN TRUE 0.984 34.000 0.473 0.011 Y NA
 906068 906069 SPA3293 SPA3294 rpsN rplE TRUE 0.995 15.000 0.496 0.011 Y NA
 906069 906070 SPA3294 SPA3295 rplE rplX TRUE 0.997 15.000 0.758 0.011 Y NA
 906070 906071 SPA3295 SPA3296 rplX rplN TRUE 0.998 11.000 0.810 0.015 Y NA
 906071 906072 SPA3296 SPA3297 rplN rpsQ TRUE 0.918 164.000 0.791 0.015 Y NA
 906072 906073 SPA3297 SPA3298 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.011 Y NA
 906073 906074 SPA3298 SPA3299 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.011 Y NA
 906074 906075 SPA3299 SPA3300 rplP rpsC TRUE 0.998 13.000 0.828 0.015 Y NA
 906075 906076 SPA3300 SPA3301 rpsC rplV TRUE 0.995 18.000 0.719 0.015 Y NA
 906076 906077 SPA3301 SPA3302 rplV rpsS TRUE 0.997 15.000 0.769 0.015 Y NA
 906077 906078 SPA3302 SPA3303 rpsS rplB TRUE 0.996 17.000 0.820 0.015 Y NA
 906078 906079 SPA3303 SPA3304 rplB rplW TRUE 0.996 18.000 0.849 0.013 Y NA
 906079 906080 SPA3304 SPA3305 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 906080 906081 SPA3305 SPA3306 rplD rplC TRUE 0.997 11.000 0.486 0.011 Y NA
 906081 906082 SPA3306 SPA3307 rplC rpsJ TRUE 0.977 33.000 0.307 0.015 Y NA
 906084 906085 SPA3309 SPA3310 bfr yheA TRUE 0.695 73.000 0.000 NA Y NA
 906085 906086 SPA3310 SPA3311 yheA tufA FALSE 0.005 185.000 0.007 NA N NA
 906086 906087 SPA3311 SPA3312 tufA fusA TRUE 0.966 72.000 0.400 0.001 Y NA
 906087 906088 SPA3312 SPA3313 fusA rpsG TRUE 0.920 97.000 0.579 1.000 Y NA
 906088 906089 SPA3313 SPA3314 rpsG rpsL TRUE 0.969 96.000 0.620 0.002 Y NA
 906089 906090 SPA3314 SPA3315 rpsL yheL FALSE 0.107 126.000 0.058 NA N NA
 906090 906091 SPA3315 SPA3316 yheL yheM TRUE 0.997 8.000 0.804 NA Y NA
 906091 906092 SPA3316 SPA3317 yheM yheN TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 906092 906093 SPA3317 SPA3318 yheN yheO TRUE 0.975 0.000 0.220 NA   NA
 906093 906094 SPA3318 SPA3319 yheO fkpA FALSE 0.094 277.000 0.310 NA   NA
 906096 906097 SPA3321 SPA3322 slyD yheV TRUE 0.692 95.000 0.370 1.000   NA
 906097 906098 SPA3322 SPA3323 yheV kefB TRUE 0.976 11.000 0.400 1.000   NA
 906098 906099 SPA3323 SPA3324 kefB yheR TRUE 0.995 0.000 0.927 1.000   NA
 10702368 906101 SPA3326 SPA3327     FALSE 0.245 83.000 0.000 NA   NA
 906102 906103 SPA3328 SPA3329 yheT yheU TRUE 0.971 -3.000 0.222 NA   NA
 906103 906104 SPA3329 SPA3330 yheU prkB TRUE 0.757 52.000 0.303 NA   NA
 906106 906107 SPA3332 SPA3333 crp yhfK TRUE 0.548 49.000 0.111 NA   NA
 906108 906109 SPA3334 SPA3335 argD pabA TRUE 0.741 86.000 0.088 1.000 Y NA
 906109 906110 SPA3335 SPA3336 pabA fic FALSE 0.139 32.000 0.008 1.000 N NA
 906110 906111 SPA3336 SPA3337 fic yhfG TRUE 0.957 -10.000 0.286 NA   NA
 906111 906112 SPA3337 SPA3338 yhfG ppiA TRUE 0.663 109.000 0.364 NA   NA
 906113 906114 SPA3339 SPA3340 yhfC nirB FALSE 0.011 262.000 0.000 1.000 N NA
 906114 906115 SPA3340 SPA3341 nirB nirD TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.000 N NA
 906115 906116 SPA3341 SPA3342 nirD nirC TRUE 0.530 196.000 0.283 1.000 Y NA
 906116 906117 SPA3342 SPA3343 nirC cysG TRUE 0.827 12.000 0.087 1.000 N NA
 906117 906118 SPA3343 SPA3344 cysG bigA FALSE 0.003 4074.000 0.000 NA   NA
 906118 10702369 SPA3344 SPA3345 bigA   FALSE 0.054 193.000 0.000 NA   NA
 906119 906120 SPA3346 SPA3347 trpS gph TRUE 0.925 -7.000 0.118 1.000   NA
 906120 906121 SPA3347 SPA3348 gph rpe TRUE 0.926 -7.000 0.120 1.000   NA
 906121 906122 SPA3348 SPA3349 rpe dam FALSE 0.456 18.000 0.040 1.000 N NA
 906122 906123 SPA3349 SPA3350 dam damX FALSE 0.253 181.000 0.234 NA   NA
 906123 906124 SPA3350 SPA3351 damX aroB FALSE 0.150 98.000 0.022 NA   NA
 906124 906125 SPA3351 SPA3352 aroB aroK TRUE 0.884 57.000 0.208 1.000 Y NA
 906125 906126 SPA3352 SPA3353 aroK hofQ FALSE 0.027 465.000 0.319 1.000 N NA
 906126 906127 SPA3353 SPA3354 hofQ yrfA TRUE 0.771 -85.000 0.072 NA   NA
 906127 906128 SPA3354 SPA3355 yrfA yrfB TRUE 0.973 -10.000 0.444 NA   NA
 906128 906129 SPA3355 SPA3356 yrfB yrfC TRUE 0.957 -16.000 0.348 NA   NA
 906129 10702370 SPA3356 SPA3357 yrfC   TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 906132 906133 SPA3360 SPA3361 yrfF yrfG TRUE 0.789 23.000 0.122 1.000   NA
 906133 906134 SPA3361 SPA3362 yrfG hslR TRUE 0.860 11.000 0.056 1.000   NA
 906134 906135 SPA3362 SPA3363 hslR yrfI TRUE 0.715 25.000 0.140 1.000 N NA
 906138 906139 SPA3366 SPA3367 envZ ompR TRUE 0.997 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 906140 906141 SPA3368 SPA3369 greB yhgF TRUE 0.759 99.000 0.123 1.000 Y NA
 906141 906142 SPA3369 SPA3370 yhgF feoA FALSE 0.003 437.000 0.000 1.000 N NA
 906142 906143 SPA3370 SPA3371 feoA feoB TRUE 0.963 19.000 0.177 1.000 Y NA
 906143 906144 SPA3371 SPA3372 feoB yhgG TRUE 0.970 13.000 0.455 NA   NA
 906144 906145 SPA3372 SPA3373 yhgG   FALSE 0.027 235.000 0.000 NA   NA
 906147 906148 SPA3375 SPA3376 yhgH yhgI FALSE 0.397 59.000 0.066 1.000   NA
 906148 906149 SPA3376 SPA3377 yhgI gntT FALSE 0.009 377.000 0.000 1.000   NA
 906150 906151 SPA3378 SPA3379 malQ malP TRUE 0.993 10.000 0.137 0.016 Y NA
 906153 906154 SPA3381 SPA3382 glpR glpG TRUE 0.534 93.000 0.190 1.000   NA
 906154 906155 SPA3382 SPA3383 glpG glpE TRUE 0.746 76.000 0.405 1.000   NA
 906157 906158 SPA3385 SPA3386 glgP glgA TRUE 0.968 20.000 0.228 1.000 Y NA
 906158 906159 SPA3386 SPA3387 glgA glgC TRUE 0.995 0.000 0.307 1.000 Y NA
 906159 906160 SPA3387 SPA3388 glgC glgX TRUE 0.980 15.000 0.228 1.000 Y NA
 906160 906161 SPA3388 SPA3389 glgX glgB TRUE 0.995 -3.000 0.098 0.003 Y NA
 906161 906162 SPA3389 SPA3390 glgB asd FALSE 0.005 378.000 0.000 1.000 N NA
 906162 906163 SPA3390 SPA3391 asd tnpA FALSE 0.003 440.000 0.000 1.000 N NA
 906163 906164 SPA3391 SPA3392 tnpA gntU FALSE 0.014 240.000 0.000 1.000 N NA
 906164 906165 SPA3392 SPA3393 gntU gntK TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 906165 906166 SPA3393 SPA3394 gntK gntR FALSE 0.092 139.000 0.000 1.000 N NA
 906166 906167 SPA3394 SPA3395 gntR yhhW FALSE 0.167 130.000 0.000 NA   NA
 906167 10702371 SPA3395 SPA3396 yhhW   FALSE 0.179 124.000 0.000 NA   NA
 10702371 906168 SPA3396 SPA3397     FALSE 0.022 254.000 0.000 NA   NA
 906169 906170 SPA3398 SPA3399 yhhY   FALSE 0.011 265.000 0.000 1.000 N NA
 906170 906171 SPA3399 SPA3400     TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 906171 906172 SPA3400 SPA3401     FALSE 0.338 54.000 0.000 NA   NA
 906172 906173 SPA3401 SPA3402     TRUE 0.910 -3.000 0.067 NA   NA
 906176 906177 SPA3405 SPA3406 ugpQ ugpC TRUE 0.890 -3.000 0.080 1.000 N NA
 906177 906178 SPA3406 SPA3407 ugpC ugpE TRUE 0.997 3.000 0.272 0.047 Y NA
 906178 906179 SPA3407 SPA3408 ugpE ugpA TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.047 Y NA
 906179 906180 SPA3408 SPA3409 ugpA ugpB TRUE 0.967 105.000 0.793 0.047 Y NA
 906180 906181 SPA3409 SPA3410 ugpB   FALSE 0.028 233.000 0.000 NA   NA
 906181 906182 SPA3410 SPA3411   livF FALSE 0.091 164.000 0.000 NA   NA
 906182 906183 SPA3411 SPA3412 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.013 Y NA
 906183 906184 SPA3412 SPA3413 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 906184 906185 SPA3413 SPA3414 livM livH TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.047 Y NA
 906185 906186 SPA3414 SPA3415 livH livK TRUE 0.881 60.000 0.217 1.000 Y NA
 906187 906188 SPA3416 SPA3417 yhhK   TRUE 0.770 -15.000 0.000 NA   NA
 906189 906190 SPA3418 SPA3419 livJ rpoH FALSE 0.006 322.000 0.000 1.000 N NA
 906190 906191 SPA3419 SPA3420 rpoH ftsX FALSE 0.014 246.000 0.051 1.000 N NA
 906191 906192 SPA3420 SPA3421 ftsX ftsE TRUE 0.982 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 906192 906193 SPA3421 SPA3422 ftsE ftsY TRUE 0.971 3.000 0.117 0.072 N NA
 906194 906195 SPA3423 SPA3424 yhhF yhhL TRUE 0.816 -13.000 0.063 NA   NA
 906197 906198 SPA3426 SPA3427 yhhN zntA TRUE 0.809 81.000 0.325 0.073   NA
 906198 906199 SPA3427 SPA3428 zntA tcp FALSE 0.029 197.000 0.000 1.000 N NA
 906201 906202 SPA3430 SPA3431 yhhQ   FALSE 0.315 73.000 0.066 NA   NA
 906204 906205 SPA3433 SPA3434 yhhT yhhU FALSE 0.347 52.000 0.000 NA   NA
 906205 906206 SPA3434 SPA3435 yhhU nikR FALSE 0.050 92.000 0.010 1.000 N NA
 906207 906208 SPA3436 SPA3437 yhhJ yhiH TRUE 0.996 0.000 0.500 0.005   NA
 906208 906209 SPA3437 SPA3438 yhiH yhiI TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.078   NA
 906210 906211 SPA3439 SPA3440     TRUE 0.587 16.000 0.000 1.000 N NA
 906211 906212 SPA3440 SPA3441     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA N NA
 906212 906213 SPA3441 SPA3442     FALSE 0.427 39.000 0.000 NA   NA
 906213 906214 SPA3442 SPA3443     FALSE 0.364 55.000 0.000 1.000   NA
 906215 906216 SPA3444 SPA3445   yhiN FALSE 0.220 100.000 0.000 NA   NA
 906219 906220 SPA3448 SPA3449 uspA yhiP FALSE 0.006 330.000 0.000 1.000 N NA
 906221 906222 SPA3450 SPA3451 yhiQ prlC TRUE 0.928 7.000 0.098 NA   NA
 906222 906223 SPA3451 SPA3452 prlC   FALSE 0.093 163.000 0.000 NA   NA
 906224 906225 SPA3453 SPA3454   yhiR FALSE 0.184 121.000 0.000 NA   NA
 906225 906226 SPA3454 SPA3455 yhiR gor FALSE 0.376 105.000 0.100 1.000   NA
 906227 906228 SPA3456 SPA3457     TRUE 0.736 -61.000 0.000 1.000   NA
 906228 906229 SPA3457 SPA3458     FALSE 0.251 179.000 0.286 1.000 N NA
 10702372 906234 SPA3463 SPA3464   yhjD FALSE 0.263 73.000 0.000 NA   NA
 906234 906235 SPA3464 SPA3465 yhjD yhjE FALSE 0.010 351.000 0.000 1.000   NA
 10702373 906236 SPA3466 SPA3467   yhjH FALSE 0.212 110.000 0.000 NA   NA
 906238 906239 SPA3469 SPA3470 yhjJ dctA FALSE 0.088 199.000 0.088 1.000   NA
 906239 906240 SPA3470 SPA3471 dctA yhjK FALSE 0.446 158.000 0.229 0.078 N NA
 906240 906241 SPA3471 SPA3472 yhjK yhjL FALSE 0.077 207.000 0.088 1.000   NA
 906241 906242 SPA3472 SPA3473 yhjL yhjM TRUE 0.944 -18.000 0.263 1.000   NA
 906242 906243 SPA3473 SPA3474 yhjM yhjN TRUE 0.898 4.000 0.000 1.000   NA
 906243 10702374 SPA3474 SPA3475 yhjN   TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 10702374 906244 SPA3475 SPA3476   yhjQ TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 906244 906245 SPA3476 SPA3477 yhjQ yhjR TRUE 0.988 1.000 0.464 NA   NA
 906246 906247 SPA3478 SPA3479 yhjS yhjT TRUE 0.935 -3.000 0.095 NA   NA
 906247 906248 SPA3479 SPA3480 yhjT yhjU TRUE 0.940 -3.000 0.105 NA   NA
 906251 906252 SPA3483 SPA3484 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 906252 906253 SPA3484 SPA3485 dppD dppC TRUE 0.995 11.000 0.560 1.000 Y NA
 906253 906254 SPA3485 SPA3486 dppC dppB TRUE 0.998 10.000 0.779 0.047 Y NA
 906254 906255 SPA3486 SPA3487 dppB dppA TRUE 0.679 157.000 0.087 0.047 Y NA
 906255 906256 SPA3487 SPA3488 dppA   FALSE 0.012 557.000 0.000 0.047 N NA
 906256 906257 SPA3488 SPA3489     FALSE 0.396 58.000 0.071 NA   NA
 906259 10702375 SPA3491 SPA3492 proK   FALSE 0.229 91.000 0.000 NA   NA
 10702375 906260 SPA3492 SPA3493   yhjY FALSE 0.029 231.000 0.000 NA   NA
 906261 906262 SPA3494 SPA3495 tag yiaC TRUE 0.701 -22.000 0.028 1.000   NA
 906264 906265 SPA3497 SPA3498 yiaD yiaE FALSE 0.020 219.000 0.000 1.000 N NA
 10702376 906267 SPA3500 SPA3501   cspA FALSE 0.038 213.000 0.000 NA   NA
 906267 906268 SPA3501 SPA3502 cspA   FALSE 0.073 178.000 0.000 NA   NA
 906269 906270 SPA3503 SPA3504     TRUE 0.984 -12.000 0.800 NA   NA
 906270 906271 SPA3504 SPA3505   yafP FALSE 0.083 178.000 0.000 1.000   NA
 906271 906272 SPA3505 SPA3506 yafP glyS FALSE 0.004 960.000 0.000 1.000   NA
 906272 906273 SPA3506 SPA3507 glyS glyQ TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 906273 906274 SPA3507 SPA3508 glyQ   FALSE 0.087 139.000 0.010 NA   NA
 906276 906277 SPA3510 SPA3511 yiaB xylB FALSE 0.183 175.000 0.143 NA   NA
 906277 906278 SPA3511 SPA3512 xylB xylA TRUE 0.628 100.000 0.034 1.000 Y NA
 906281 906282 SPA3515 SPA3516 malS avtA FALSE 0.087 174.000 0.085 1.000 N NA
 906283 906284 SPA3517 SPA3518 ysaA yiaJ FALSE 0.122 117.000 0.000 1.000 N NA
 906285 906286 SPA3519 SPA3520 yiaK yiaL TRUE 0.724 12.000 0.062 NA N NA
 906286 10702377 SPA3520 SPA3521 yiaL   TRUE 0.575 24.000 0.000 NA   NA
 10702377 906287 SPA3521 SPA3522   yiaM FALSE 0.151 139.000 0.000 NA   NA
 906287 906288 SPA3522 SPA3523 yiaM yiaN TRUE 0.998 3.000 0.864 NA Y NA
 906288 906289 SPA3523 SPA3524 yiaN yiaO TRUE 0.966 12.000 0.000 1.000 Y NA
 906289 906290 SPA3524 SPA3525 yiaO lyxK TRUE 0.981 4.000 0.000 1.000 Y NA
 906290 906291 SPA3525 SPA3526 lyxK yiaQ TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 906291 906292 SPA3526 SPA3527 yiaQ yiaR TRUE 0.992 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 906292 906293 SPA3527 SPA3528 yiaR yiaS TRUE 0.989 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 906298 906299 SPA3533 SPA3534 selB selA TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.001 N NA
 906299 906300 SPA3534 SPA3535 selA yibF FALSE 0.078 99.000 0.040 NA N NA
 906301 10702378 SPA3536 SPA3537 mtlA   TRUE 0.512 29.000 0.000 NA   NA
 10702378 906302 SPA3537 SPA3538   mtlD FALSE 0.232 89.000 0.000 NA   NA
 906302 10702379 SPA3538 SPA3539 mtlD   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 906304 906305 SPA3541 SPA3542 yibL   FALSE 0.005 487.000 0.000 NA   NA
 906305 10702380 SPA3542 SPA3543     FALSE 0.390 44.000 0.000 NA   NA
 10702380 906306 SPA3543 SPA3544   lldP FALSE 0.014 299.000 0.000 NA   NA
 906306 906307 SPA3544 SPA3545 lldP lctR TRUE 0.988 -3.000 0.652 1.000 N NA
 906307 906308 SPA3545 SPA3546 lctR lctD TRUE 0.974 -3.000 0.309 1.000 N NA
 906308 906309 SPA3546 SPA3547 lctD yibK FALSE 0.091 65.000 0.020 1.000 N NA
 906311 906312 SPA3549 SPA3550     TRUE 0.801 74.000 0.667 1.000 N NA
 906313 906314 SPA3551 SPA3552 cysE gpsA TRUE 0.700 78.000 0.429 1.000 N NA
 906314 906315 SPA3552 SPA3553 gpsA secB TRUE 0.965 0.000 0.206 1.000 N NA
 906315 906316 SPA3553 SPA3554 secB grxC FALSE 0.202 44.000 0.038 1.000 N NA
 906316 906317 SPA3554 SPA3555 grxC yibN FALSE 0.113 86.000 0.048 NA N NA
 906318 906319 SPA3556 SPA3557 pmgI yibP TRUE 0.933 10.000 0.170 1.000 N NA
 906319 906320 SPA3557 SPA3558 yibP yigQ TRUE 0.937 4.000 0.088 1.000   NA
 906321 906322 SPA3559 SPA3560 yibD tdh FALSE 0.002 495.000 0.000 NA N NA
 906322 906323 SPA3560 SPA3561 tdh kbl TRUE 0.981 10.000 0.547 1.000 N NA
 906324 906325 SPA3562 SPA3563 rfaD waaF TRUE 0.990 3.000 0.146 1.000 Y NA
 906325 906326 SPA3563 SPA3564 waaF waaC TRUE 0.998 0.000 0.205 0.001 Y NA
 906326 906327 SPA3564 SPA3565 waaC waaL TRUE 0.805 40.000 0.036 NA Y NA
 906328 906329 SPA3566 SPA3567 waaK waaZ TRUE 0.538 100.000 0.214 NA   NA
 906329 906330 SPA3567 SPA3568 waaZ waaY FALSE 0.364 150.000 0.214 NA   NA
 906330 906331 SPA3568 SPA3569 waaY waaJ TRUE 0.919 23.000 0.375 1.000   NA
 906331 906332 SPA3569 SPA3570 waaJ waaI TRUE 0.997 18.000 0.833 0.001 Y NA
 906332 906333 SPA3570 SPA3571 waaI waaB TRUE 0.989 6.000 0.167 1.000 Y NA
 906333 906334 SPA3571 SPA3572 waaB wabA TRUE 0.971 14.000 0.111 1.000 Y NA
 906334 906335 SPA3572 SPA3573 wabA waaP FALSE 0.359 56.000 0.000 1.000   NA
 906335 906336 SPA3573 SPA3574 waaP waaG TRUE 0.926 -7.000 0.121 1.000   NA
 906336 906337 SPA3574 SPA3575 waaG waaQ TRUE 0.985 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 906338 906339 SPA3576 SPA3577 kdtA coaD TRUE 0.602 9.000 0.020 1.000 N NA
 906340 906341 SPA3578 SPA3579 mutM rpmG FALSE 0.091 98.000 0.034 1.000 N NA
 906341 906342 SPA3579 SPA3580 rpmG rpmB TRUE 0.988 21.000 0.332 0.011 Y NA
 906342 906343 SPA3580 SPA3581 rpmB radC FALSE 0.005 218.000 0.002 1.000 N NA
 906344 906345 SPA3582 SPA3583 dfp dut TRUE 0.898 -19.000 0.201 1.000 N NA
 906345 906346 SPA3583 SPA3584 dut ttk FALSE 0.168 108.000 0.060 1.000 N NA
 906347 906348 SPA3585 SPA3586 pyrE rph FALSE 0.077 79.000 0.022 1.000 N NA
 906351 906352 SPA3589 SPA3590   yicG FALSE 0.023 248.000 0.000 NA   NA
 906354 906355 SPA3592 SPA3593 gmk rpoZ TRUE 0.790 55.000 0.471 1.000 N NA
 906355 906356 SPA3593 SPA3594 rpoZ spoT TRUE 0.975 19.000 0.291 1.000 Y NA
 906356 906357 SPA3594 SPA3595 spoT trmH TRUE 0.905 5.000 0.095 1.000 N NA
 906357 906358 SPA3595 SPA3596 trmH recG TRUE 0.872 6.000 0.076 1.000 N NA
 906360 906361 SPA3598 SPA3599 yicE yicH TRUE 0.528 121.000 0.257 NA   NA
 10702381 906362 SPA3600 SPA3601   yicJ TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 906365 10702382 SPA3604 SPA3605     FALSE 0.434 38.000 0.000 NA   NA
 10702382 906366 SPA3605 SPA3606   rhuM FALSE 0.459 35.000 0.000 NA   NA
 906366 906367 SPA3606 SPA3607 rhuM rmbA FALSE 0.003 1718.000 0.000 NA   NA
 906367 906368 SPA3607 SPA3608 rmbA misL FALSE 0.259 75.000 0.000 NA   NA
 906369 906370 SPA3609 SPA3610 fidL marT TRUE 0.975 11.000 0.400 NA   NA
 906372 906373 SPA3612 SPA3613 cigR mgtB FALSE 0.012 315.000 0.000 NA   NA
 906373 906374 SPA3613 SPA3614 mgtB mgtC FALSE 0.047 220.000 0.065 1.000   NA
 906376 906377 SPA3616 SPA3617     FALSE 0.027 236.000 0.000 NA   NA
 906377 906378 SPA3617 SPA3618     TRUE 0.972 -13.000 0.455 1.000   NA
 906378 906379 SPA3618 SPA3619     TRUE 0.978 4.000 0.364 1.000 N NA
 906379 906380 SPA3619 SPA3620     TRUE 0.998 0.000 0.500 0.012 Y NA
 906380 906381 SPA3620 SPA3621     TRUE 0.917 146.000 0.500 0.012 Y NA
 906381 906382 SPA3621 SPA3622     TRUE 0.998 11.000 0.667 0.008 Y NA
 906382 906383 SPA3622 SPA3623     FALSE 0.342 219.000 0.400 0.012 N NA
 906384 906385 SPA3624 SPA3625     FALSE 0.217 106.000 0.000 NA   NA
 10702383 906387 SPA3627 SPA3628     TRUE 0.762 -16.000 0.000 NA   NA
 906388 906389 SPA3629 SPA3630     TRUE 0.994 10.000 0.429 1.000 Y NA
 906389 906390 SPA3630 SPA3631     TRUE 0.798 63.000 0.091 1.000 Y NA
 906390 906391 SPA3631 SPA3632     TRUE 0.990 -7.000 0.273 1.000 Y NA
 906391 906392 SPA3632 SPA3633     TRUE 0.960 76.000 0.444 0.008 Y NA
 906392 906393 SPA3633 SPA3634     TRUE 0.997 -3.000 0.231 0.008 Y NA
 906393 906394 SPA3634 SPA3635     TRUE 0.811 18.000 0.150 1.000 N NA
 906394 906395 SPA3635 SPA3636   yicN FALSE 0.009 353.000 0.000 NA   NA
 906395 10702384 SPA3636 SPA3637 yicN   FALSE 0.054 193.000 0.000 NA   NA
 10702384 10702385 SPA3637 SPA3639     FALSE 0.003 1481.000 0.000 NA   NA
 10702385 906396 SPA3639 SPA3640   uhpA TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 906396 906397 SPA3640 SPA3641 uhpA   FALSE 0.168 154.000 0.074 1.000   NA
 906397 906398 SPA3641 SPA3642     TRUE 0.976 12.000 0.464 1.000   NA
 906398 906399 SPA3642 SPA3643     TRUE 0.941 31.000 0.209 1.000 Y NA
 906401 906402 SPA3645 SPA3646 ilvN ilvB TRUE 0.997 4.000 0.649 0.001   NA
 906402 906403 SPA3646 SPA3647 ilvB ivbL TRUE 0.536 107.000 0.216 NA   NA
 906404 906405 SPA3648 SPA3649   emrD FALSE 0.053 203.000 0.054 1.000   NA
 906406 906407 SPA3650 SPA3651   dsdC FALSE 0.413 64.000 0.077 1.000   NA
 906408 906409 SPA3652 SPA3653 dsdX dsdA TRUE 0.947 18.000 0.083 1.000 Y NA
 906410 906411 SPA3654 SPA3655 yidF yidG TRUE 0.985 -3.000 0.429 NA   NA
 906411 906412 SPA3655 SPA3656 yidG yidH TRUE 0.979 -10.000 0.571 NA   NA
 906412 906413 SPA3656 SPA3657 yidH yidE FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 906413 906414 SPA3657 SPA3658 yidE hslS FALSE 0.078 189.000 0.069 NA   NA
 906414 906415 SPA3658 SPA3659 hslS hslT TRUE 0.713 110.000 0.099 NA Y NA
 906417 10702386 SPA3661 SPA3662 yidR   FALSE 0.182 122.000 0.000 NA   NA
 10702386 906418 SPA3662 SPA3663   ccmG TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 906418 906419 SPA3663 SPA3664 ccmG ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.003 Y NA
 906419 906420 SPA3664 SPA3665 ccmF ccmE TRUE 0.997 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 906420 906421 SPA3665 SPA3666 ccmE ccmD TRUE 0.977 -3.000 0.344 1.000 N NA
 906421 906422 SPA3666 SPA3667 ccmD ccmC TRUE 0.985 -3.000 0.501 1.000 N NA
 906422 906423 SPA3667 SPA3668 ccmC ccmB TRUE 0.980 52.000 0.501 0.002 Y NA
 906423 906424 SPA3668 SPA3669 ccmB ccmA TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.003 Y NA
 906424 906425 SPA3669 SPA3670 ccmA yhjA TRUE 0.798 6.000 0.000 1.000 N NA
 906425 906426 SPA3670 SPA3671 yhjA torD FALSE 0.185 190.000 0.000 0.043   NA
 906426 906427 SPA3671 SPA3672 torD torA TRUE 0.959 -7.000 0.077 0.043   NA
 906427 906428 SPA3672 SPA3673 torA torC TRUE 0.994 -10.000 0.263 0.043 Y NA
 906432 10702387 SPA3677 SPA3678 dgoT   FALSE 0.243 85.000 0.000 NA   NA
 10702387 906433 SPA3678 SPA3679   gyrB FALSE 0.009 346.000 0.000 NA   NA
 906433 906434 SPA3679 SPA3680 gyrB recF TRUE 0.980 29.000 0.249 0.003 Y NA
 906434 906435 SPA3680 SPA3681 recF dnaN TRUE 0.771 148.000 0.318 1.000 Y NA
 906435 906436 SPA3681 SPA3682 dnaN dnaA TRUE 0.994 5.000 0.328 1.000 Y NA
 906437 906438 SPA3683 SPA3684 rpmH rnpA TRUE 0.974 17.000 0.787 1.000   NA
 906438 906439 SPA3684 SPA3685 rnpA   TRUE 0.966 -36.000 0.540 NA   NA
 906439 906440 SPA3685 SPA3686   yidC TRUE 0.987 3.000 0.461 NA   NA
 906440 906441 SPA3686 SPA3687 yidC thdF FALSE 0.436 142.000 0.221 1.000   NA
 906441 906442 SPA3687 SPA3688 thdF yidY FALSE 0.075 183.000 0.000 1.000   NA
 906442 906443 SPA3688 SPA3689 yidY yidZ TRUE 0.958 -31.000 0.526 1.000 N NA
 906443 906444 SPA3689 SPA3690 yidZ yieE FALSE 0.149 158.000 0.114 1.000 N NA
 906444 906445 SPA3690 SPA3691 yieE yieF TRUE 0.748 18.000 0.074 NA   NA
 906448 906449 SPA3694 SPA3695 phoU pstB TRUE 0.984 15.000 0.317 NA Y NA
 906449 906450 SPA3695 SPA3696 pstB pstA TRUE 0.969 87.000 0.526 0.001 Y NA
 906450 906451 SPA3696 SPA3697 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 906451 906452 SPA3697 SPA3698 pstC pstS TRUE 0.868 136.000 0.145 0.001 Y NA
 906454 906455 SPA3700 SPA3701 glmS glmU FALSE 0.306 189.000 0.055 1.000 Y NA
 906455 906456 SPA3701 SPA3702 glmU   FALSE 0.011 320.000 0.000 NA   NA
 906456 906457 SPA3702 SPA3703   atpC FALSE 0.029 230.000 0.000 NA   NA
 906457 906458 SPA3703 SPA3704 atpC atpD TRUE 0.996 21.000 0.837 0.003 Y NA
 906458 906459 SPA3704 SPA3705 atpD atpG TRUE 0.993 27.000 0.724 0.003 Y NA
 906459 906460 SPA3705 SPA3706 atpG atpA TRUE 0.987 51.000 0.846 0.003 Y NA
 906460 906461 SPA3706 SPA3707 atpA atpH TRUE 0.998 13.000 0.864 0.003 Y NA
 906461 906462 SPA3707 SPA3708 atpH atpF TRUE 0.992 15.000 0.242 0.003 Y NA
 906462 906463 SPA3708 SPA3709 atpF atpE TRUE 0.980 60.000 0.666 0.003 Y NA
 906463 906464 SPA3709 SPA3710 atpE atpB TRUE 0.982 47.000 0.557 0.003 Y NA
 906464 906465 SPA3710 SPA3711 atpB atpI TRUE 0.997 9.000 0.291 0.003 Y NA
 906465 906466 SPA3711 SPA3712 atpI gidB FALSE 0.001 616.000 0.005 1.000 N NA
 906466 906467 SPA3712 SPA3713 gidB gidA TRUE 0.677 103.000 0.466 1.000 N NA
 906467 906468 SPA3713 SPA3714 gidA mioC FALSE 0.004 379.000 0.000 1.000 N NA
 906468 906469 SPA3714 SPA3715 mioC asnC FALSE 0.409 90.000 0.165 1.000 N NA
 906471 906472 SPA3717 SPA3718 yieM yieN TRUE 0.980 -6.000 0.443 NA   NA
 906473 906474 SPA3719 SPA3720 kup rbsD FALSE 0.028 199.000 0.000 1.000 N NA
 906474 906475 SPA3720 SPA3721 rbsD rbsA TRUE 0.994 8.000 0.337 1.000 Y NA
 906475 10702388 SPA3721 SPA3722 rbsA   TRUE 0.874 6.000 0.000 NA   NA
 10702388 906476 SPA3722 SPA3723   rbsB TRUE 0.561 25.000 0.000 NA   NA
 906476 906477 SPA3723 SPA3724 rbsB rbsK TRUE 0.821 133.000 0.347 NA Y NA
 906477 10702389 SPA3724 SPA3725 rbsK   TRUE 0.885 4.000 0.000 NA   NA
 906478 906479 SPA3726 SPA3727 yieO yieP TRUE 0.899 12.000 0.100 1.000   NA
 906480 906481 SPA3728 SPA3729 rrsC   FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 906481 906482 SPA3729 SPA3730   rrlC FALSE 0.050 197.000 0.000 NA   NA
 906482 906483 SPA3730 SPA3732 rrlC rrfC FALSE 0.227 92.000 0.000 NA   NA
 906483 906484 SPA3732 SPA3733 rrfC aspT FALSE 0.333 55.000 0.000 NA   NA
 906484 906485 SPA3733 SPA3734 aspT trpT TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 906488 906489 SPA3737 SPA3738 tnpA yifB FALSE 0.055 254.000 0.000 0.044 N NA
 906490 906491 SPA3739 SPA3740 ilvL ilvG TRUE 0.571 140.000 0.091 0.002   NA
 906491 906492 SPA3740 SPA3741 ilvG ilvM TRUE 0.998 0.000 0.943 0.001   NA
 906492 906493 SPA3741 SPA3742 ilvM ilvE TRUE 0.895 18.000 0.205 1.000   NA
 906493 906494 SPA3742 SPA3743 ilvE ilvD TRUE 0.488 157.000 0.075 1.000 Y NA
 906494 906495 SPA3743 SPA3744 ilvD ilvA TRUE 0.988 3.000 0.106 1.000 Y NA
 906495 906496 SPA3744 SPA3745 ilvA   FALSE 0.026 238.000 0.000 NA   NA
 906496 906497 SPA3745 SPA3746     TRUE 0.983 -3.000 0.385 NA   NA
 906501 906502 SPA3750 SPA3751     TRUE 0.598 28.000 0.098 1.000 N NA
 906502 906503 SPA3751 SPA3752     TRUE 0.969 0.000 0.227 1.000 N NA
 906503 906504 SPA3752 SPA3753   rep FALSE 0.051 100.000 0.012 1.000 N NA
 906505 10702390 SPA3754 SPA3755 gppA   FALSE 0.190 119.000 0.000 NA   NA
 906506 906507 SPA3756 SPA3757 trxA rho FALSE 0.007 419.000 0.087 1.000 N NA
 906507 906508 SPA3757 SPA3758 rho rfe FALSE 0.017 230.000 0.000 1.000 N NA
 906508 906509 SPA3758 SPA3759 rfe wzzE TRUE 0.998 12.000 0.735 0.004 Y NA
 906509 906510 SPA3759 SPA3760 wzzE wecB TRUE 0.982 56.000 0.677 0.004 Y NA
 906510 906511 SPA3760 SPA3761 wecB rffD TRUE 0.995 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 906511 906512 SPA3761 SPA3762 rffD rffG TRUE 0.995 0.000 0.273 1.000 Y NA
 906512 906513 SPA3762 SPA3763 rffG rffH TRUE 0.992 33.000 0.739 0.002 Y NA
 906513 906514 SPA3763 SPA3764 rffH rffC FALSE 0.453 107.000 0.145 1.000   NA
 906514 906515 SPA3764 SPA3765 rffC rffA TRUE 0.974 5.000 0.248 1.000   NA
 906515 906516 SPA3765 SPA3766 rffA wzxE TRUE 0.975 2.000 0.218 1.000   NA
 906516 906517 SPA3766 SPA3767 wzxE   TRUE 0.990 -3.000 0.605 1.000   NA
 906517 906518 SPA3767 SPA3768   rffT TRUE 0.992 -3.000 0.684 1.000   NA
 906518 906519 SPA3768 SPA3769 rffT rffM TRUE 0.954 -3.000 0.126 1.000   NA
 906519 906520 SPA3769 SPA3770 rffM yifK FALSE 0.010 207.000 0.019 1.000 N NA
 906520 906521 SPA3770 SPA3771 yifK argX FALSE 0.219 103.000 0.000 NA   NA
 906521 906522 SPA3771 SPA3772 argX hisR FALSE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 906522 906523 SPA3772 SPA3773 hisR leuT TRUE 0.575 24.000 0.000 NA   NA
 906523 906524 SPA3773 SPA3774 leuT proM FALSE 0.378 46.000 0.000 NA   NA
 906524 906525 SPA3774 SPA3775 proM   FALSE 0.012 310.000 0.000 NA   NA
 906526 906527 SPA3776 SPA3777 hemY hemX TRUE 0.990 3.000 0.144 1.000 Y NA
 906527 906528 SPA3777 SPA3778 hemX hemD TRUE 0.984 22.000 0.600 1.000 Y NA
 906528 906529 SPA3778 SPA3779 hemD hemC TRUE 0.997 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 906530 906531 SPA3780 SPA3781 cyaA   FALSE 0.216 108.000 0.000 NA   NA
 906531 906532 SPA3781 SPA3782     FALSE 0.063 186.000 0.000 NA   NA
 906532 906533 SPA3782 SPA3783     TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 906534 906535 SPA3784 SPA3785 cyaY   FALSE 0.271 70.000 0.000 NA   NA
 906535 10702391 SPA3785 SPA3786     TRUE 0.575 24.000 0.000 NA   NA
 906536 906537 SPA3787 SPA3788 yifL dapF FALSE 0.105 37.000 0.021 NA N NA
 906537 906538 SPA3788 SPA3789 dapF yigA TRUE 0.963 -3.000 0.175 NA   NA
 906538 906539 SPA3789 SPA3790 yigA xerC TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   NA
 906539 906540 SPA3790 SPA3791 xerC yigB TRUE 0.986 0.000 0.367 1.000   NA
 906540 906541 SPA3791 SPA3792 yigB uvrD FALSE 0.334 136.000 0.128 1.000   NA
 906541 906542 SPA3792 SPA3793 uvrD corA FALSE 0.001 472.000 0.021 1.000 N NA
 906545 906546 SPA3796 SPA3797 rarD yigI TRUE 0.556 44.000 0.099 NA   NA
 906547 906548 SPA3798 SPA3799 pldA recQ FALSE 0.202 69.000 0.057 1.000 N NA
 906548 906549 SPA3799 SPA3800 recQ rhtC FALSE 0.160 64.000 0.043 1.000 N NA
 906551 906552 SPA3802 SPA3803 pldB yigL TRUE 0.965 16.000 0.524 1.000   NA
 906552 906553 SPA3803 SPA3804 yigL yigM FALSE 0.325 81.000 0.067 1.000   NA
 906555 906556 SPA3806 SPA3807 metE   FALSE 0.011 344.000 0.000 1.000   NA
 906558 906559 SPA3809 SPA3810 udp yigN FALSE 0.126 140.000 0.041 NA   NA
 906559 906560 SPA3810 SPA3811 yigN ubiE FALSE 0.210 96.000 0.047 NA   NA
 906560 906561 SPA3811 SPA3812 ubiE yigP TRUE 0.944 10.000 0.145 1.000   NA
 906561 906562 SPA3812 SPA3813 yigP aarF TRUE 0.986 -3.000 0.432 1.000   NA
 906562 906563 SPA3813 SPA3814 aarF tatA FALSE 0.044 206.000 0.044 1.000   NA
 906563 906564 SPA3814 SPA3815 tatA tatB TRUE 0.993 4.000 0.000 0.006 Y NA
 906564 906565 SPA3815 SPA3816 tatB tatC TRUE 0.981 3.000 0.000 NA Y NA
 906565 906566 SPA3816 SPA3817 tatC tatD TRUE 0.509 42.000 0.121 NA N NA
 906568 906569 SPA3819 SPA3820 yigC ubiB TRUE 0.733 86.000 0.090 NA Y NA
 906569 10702392 SPA3820 SPA3821 ubiB   FALSE 0.022 254.000 0.000 NA   NA
 906570 906571 SPA3822 SPA3823 fadA fadB TRUE 0.985 21.000 0.607 1.000 Y NA
 906572 906573 SPA3824 SPA3825 pepQ yigZ TRUE 0.961 0.000 0.127 1.000   NA
 906573 906574 SPA3825 SPA3826 yigZ trkH TRUE 0.755 39.000 0.202 1.000   NA
 906574 906575 SPA3826 SPA3827 trkH hemG TRUE 0.968 12.000 0.455 1.000 N NA
 906575 906576 SPA3827 SPA3828 hemG rrsA FALSE 0.008 379.000 0.000 NA   NA
 906576 906577 SPA3828 SPA3829 rrsA ileT FALSE 0.271 70.000 0.000 NA   NA
 906577 906578 SPA3829 SPA3830 ileT alaT FALSE 0.203 113.000 0.000 NA   NA
 906578 906579 SPA3830 SPA3831 alaT rrlA FALSE 0.063 186.000 0.000 NA   NA
 906579 906580 SPA3831 SPA3833 rrlA rrfA FALSE 0.227 92.000 0.000 NA   NA
 906581 906582 SPA3834 SPA3835 mobB mobA TRUE 0.994 -3.000 0.064 0.003 Y NA
 906583 906584 SPA3836 SPA3837 yihD yihE FALSE 0.411 77.000 0.106 NA   NA
 906584 906585 SPA3837 SPA3838 yihE dsbA TRUE 0.826 17.000 0.111 NA   NA
 906588 906589 SPA3841 SPA3842   yihA FALSE 0.255 77.000 0.000 NA   NA
 906590 906591 SPA3843 SPA3844   yihI FALSE 0.190 119.000 0.000 NA   NA
 906591 906592 SPA3844 SPA3845 yihI hemN FALSE 0.114 189.000 0.107 NA   NA
 906593 906594 SPA3846 SPA3847 glnG glnL TRUE 0.998 9.000 0.587 0.068 Y NA
 906594 906595 SPA3847 SPA3848 glnL glnA FALSE 0.010 275.000 0.053 1.000 N NA
 906595 906596 SPA3848 SPA3849 glnA   TRUE 0.594 -21.000 0.003 NA   NA
 906598 906599 SPA3851 SPA3852     TRUE 0.850 -15.000 0.087 NA   NA
 906599 906600 SPA3852 SPA3853     TRUE 0.990 -3.000 0.633 NA   NA
 906600 906601 SPA3853 SPA3854     TRUE 0.972 2.000 0.200 1.000   NA
 906601 906602 SPA3854 SPA3855     TRUE 0.977 -7.000 0.417 1.000   NA
 906602 906603 SPA3855 SPA3856     FALSE 0.031 430.000 0.263 NA   NA
 906603 906604 SPA3856 SPA3857   yshA FALSE 0.103 157.000 0.000 NA   NA
 906604 906605 SPA3857 SPA3858 yshA yihO TRUE 0.831 68.000 0.625 NA   NA
 906605 906606 SPA3858 SPA3859 yihO yihP TRUE 0.986 46.000 0.750 0.005 Y NA
 906606 906607 SPA3859 SPA3860 yihP yihQ TRUE 0.805 46.000 0.000 1.000 Y NA
 906607 906608 SPA3860 SPA3861 yihQ yihR TRUE 0.923 44.000 0.000 0.003 Y NA
 906608 906609 SPA3861 SPA3862 yihR yihS TRUE 0.977 4.000 0.017 1.000 Y NA
 906609 906610 SPA3862 SPA3863 yihS yihT TRUE 0.944 16.000 0.051 1.000 Y NA
 906610 906611 SPA3863 SPA3864 yihT yihU TRUE 0.846 23.000 0.250 1.000 N NA
 906612 906613 SPA3865 SPA3866 yihV yihW TRUE 0.856 34.000 0.000 1.000 Y NA
 906613 906614 SPA3866 SPA3867 yihW yihX FALSE 0.063 191.000 0.000 1.000   NA
 906614 10702393 SPA3867 SPA3868 yihX   TRUE 0.848 -6.000 0.000 NA   NA
 10702393 906615 SPA3868 SPA3869   yihZ TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 906615 906616 SPA3869 SPA3870 yihZ yiiD TRUE 0.917 -3.000 0.065 1.000   NA
 906617 906618 SPA3871 SPA3872 ygjM ygjN TRUE 0.949 -49.000 0.375 NA   NA
 906618 906619 SPA3872 SPA3873 ygjN   FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 906620 906621 SPA3874 SPA3875 yiiF   TRUE 0.954 0.000 0.120 NA   NA
 906622 906623 SPA3876 SPA3877 fdhE fdoI TRUE 0.949 -3.000 0.182 NA N NA
 906623 906624 SPA3877 SPA3878 fdoI fdoH TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 906624 10702394 SPA3878 SPA3879 fdoH   TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 906628 906629 SPA3883 SPA3884     TRUE 0.992 0.000 0.675 NA   NA
 906631 906632 SPA3886 SPA3887 yiiL   TRUE 0.905 -3.000 0.063 NA   NA
 906632 906633 SPA3887 SPA3888   rhaD FALSE 0.382 127.000 0.041 0.008 N NA
 906633 906634 SPA3888 SPA3889 rhaD rhaA TRUE 0.752 143.000 0.247 1.000 Y NA
 906634 906635 SPA3889 SPA3890 rhaA rhaB TRUE 0.995 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 906636 906637 SPA3891 SPA3892 rhaS rhaR TRUE 0.934 153.000 0.800 0.019 Y NA
 906640 906641 SPA3895 SPA3896     TRUE 0.969 -7.000 0.000 NA Y NA
 906641 906642 SPA3896 SPA3897     TRUE 0.986 19.000 0.600 NA Y NA
 906643 906644 SPA3898 SPA3899 sodA yiiM TRUE 0.504 70.000 0.129 1.000   NA
 906644 906645 SPA3899 SPA3900 yiiM   TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 906646 906647 SPA3901 SPA3902 cpxA cpxR TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 906648 906649 SPA3903 SPA3904 cpxP yiiP FALSE 0.442 149.000 0.031 NA Y NA
 906649 906650 SPA3904 SPA3905 yiiP pfkA FALSE 0.028 185.000 0.040 1.000 N NA
 906650 906651 SPA3905 SPA3906 pfkA sbp FALSE 0.024 204.000 0.049 1.000 N NA
 906651 906652 SPA3906 SPA3907 sbp cdh FALSE 0.310 101.000 0.115 1.000 N NA
 906652 10702395 SPA3907 SPA3908 cdh   FALSE 0.019 265.000 0.000 NA   NA
 10702395 906653 SPA3908 SPA3909     TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 906653 906654 SPA3909 SPA3910     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA N NA
 906654 906655 SPA3910 SPA3911     FALSE 0.188 54.000 0.000 NA N NA
 906655 906656 SPA3911 SPA3912     FALSE 0.221 98.000 0.000 NA   NA
 906656 906657 SPA3912 SPA3913     TRUE 0.714 16.000 0.000 NA   NA
 906658 906659 SPA3914 SPA3915   ydeV TRUE 0.953 14.000 0.000 NA Y NA
 906659 906660 SPA3915 SPA3916 ydeV ydeW FALSE 0.147 89.000 0.000 1.000 N NA
 906661 906662 SPA3917 SPA3918 ego ydeY TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 906662 906663 SPA3918 SPA3919 ydeY ydeZ TRUE 0.999 0.000 0.788 0.046 Y NA
 906663 906664 SPA3919 SPA3920 ydeZ yneA TRUE 0.983 29.000 0.844 NA Y NA
 906664 906665 SPA3920 SPA3921 yneA yneB TRUE 0.870 29.000 0.000 NA Y NA
 906665 906666 SPA3921 SPA3922 yneB yneC FALSE 0.423 44.000 0.000 1.000   NA
 906666 906667 SPA3922 SPA3923 yneC   TRUE 0.783 10.000 0.007 1.000   NA
 906668 906669 SPA3924 SPA3925 tpiA yiiQ FALSE 0.225 113.000 0.058 NA   NA
 906670 906671 SPA3927 SPA3928 fpr glpX FALSE 0.316 97.000 0.117 1.000 N NA
 906671 906672 SPA3928 SPA3929 glpX glpK FALSE 0.066 112.000 0.025 1.000 N NA
 906672 906673 SPA3929 SPA3930 glpK glpF TRUE 0.476 21.000 0.000 1.000 N NA
 906675 906676 SPA3932 SPA3933 menG menA TRUE 0.781 93.000 0.158 NA Y NA
 906676 906677 SPA3933 SPA3934 menA hslU FALSE 0.183 67.000 0.051 1.000 N NA
 906677 906678 SPA3934 SPA3935 hslU hslV TRUE 0.997 10.000 0.752 1.000 Y NA
 906678 906679 SPA3935 SPA3936 hslV ftsN FALSE 0.313 92.000 0.122 NA N NA
 906679 906680 SPA3936 SPA3937 ftsN cytR TRUE 0.499 94.000 0.245 NA N NA
 906680 906681 SPA3937 SPA3938 cytR priA FALSE 0.023 155.000 0.013 1.000 N NA
 906683 906684 SPA3940 SPA3941     FALSE 0.046 201.000 0.000 NA   NA
 906684 906685 SPA3941 SPA3942   metJ FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 906686 906687 SPA3943 SPA3944 metB metL TRUE 0.996 3.000 0.428 1.000 Y NA
 906688 906689 SPA3945 SPA3946     FALSE 0.003 1236.000 0.000 NA   NA
 906690 10702397 SPA3947 SPA3948     FALSE 0.024 244.000 0.000 NA   NA
 10702397 906691 SPA3948 SPA3949     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 906693 906694 SPA3951 SPA3952 metF katG FALSE 0.017 165.000 0.010 1.000 N NA
 906695 906696 SPA3953 SPA3954 gldA talC TRUE 0.976 12.000 0.600 1.000 N NA
 906696 906697 SPA3954 SPA3955 talC yijO FALSE 0.012 255.000 0.000 1.000 N NA
 906697 906698 SPA3955 SPA3956 yijO yijP FALSE 0.226 161.000 0.130 1.000   NA
 906698 906699 SPA3956 SPA3957 yijP ppc FALSE 0.045 211.000 0.000 1.000   NA
 906699 906700 SPA3957 SPA3958 ppc argE FALSE 0.005 369.000 0.053 1.000 N NA
 906701 906702 SPA3959 SPA3960 argC argB TRUE 0.992 11.000 0.097 0.002 Y NA
 906702 906703 SPA3960 SPA3961 argB argH TRUE 0.567 118.000 0.017 1.000 Y NA
 906707 906708 SPA3965 SPA3966 yijC yijD TRUE 0.962 16.000 0.508 NA   NA
 906710 906711 SPA3968 SPA3969 btuB murI FALSE 0.401 -55.000 0.025 1.000 N NA
 906711 906712 SPA3969 SPA3970 murI rrsB FALSE 0.008 380.000 0.000 NA   NA
 906712 906713 SPA3970 SPA3971 rrsB ileU FALSE 0.271 70.000 0.000 NA   NA
 906713 906714 SPA3971 SPA3972 ileU alaU FALSE 0.203 113.000 0.000 NA   NA
 906714 906715 SPA3972 SPA3973 alaU rrlB FALSE 0.063 186.000 0.000 NA   NA
 906715 906716 SPA3973 SPA3975 rrlB rrfB FALSE 0.226 93.000 0.000 NA   NA
 906716 906717 SPA3975 SPA3976 rrfB murB FALSE 0.023 247.000 0.000 NA   NA
 906717 906718 SPA3976 SPA3977 murB birA TRUE 0.960 -3.000 0.211 1.000 N NA
 906719 906720 SPA3978 SPA3979 coaA   FALSE 0.021 209.000 0.007 NA   NA
 906721 906722 SPA3980 SPA3981 thrU tyrU TRUE 0.806 12.000 0.000 NA   NA
 906722 906723 SPA3981 SPA3982 tyrU glyT FALSE 0.187 120.000 0.000 NA   NA
 906723 906724 SPA3982 SPA3983 glyT thrT TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   NA
 906724 906725 SPA3983 SPA3984 thrT tufB FALSE 0.190 119.000 0.000 NA   NA
 906725 906726 SPA3984 SPA3985 tufB secE FALSE 0.004 230.000 0.002 1.000 N NA
 906726 906727 SPA3985 SPA3986 secE nusG TRUE 0.766 2.000 0.037 1.000 N NA
 906727 906728 SPA3986 SPA3987 nusG rplK TRUE 0.569 158.000 0.681 1.000 N NA
 906728 906729 SPA3987 SPA3988 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.014 Y NA
 906729 906730 SPA3988 SPA3989 rplA rplJ FALSE 0.231 416.000 0.302 0.014 Y NA
 906730 906731 SPA3989 SPA3990 rplJ rplL TRUE 0.981 67.000 0.884 0.011 Y NA
 906731 906732 SPA3990 SPA3991 rplL rpoB FALSE 0.051 318.000 0.223 1.000   NA
 906732 906733 SPA3991 SPA3992 rpoB rpoC TRUE 0.951 77.000 0.851 0.000   NA
 906733 906734 SPA3992 SPA3993 rpoC   FALSE 0.236 87.000 0.000 NA   NA
 906737 906738 SPA3996 SPA3997 thiH thiG TRUE 0.997 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 906738 906739 SPA3997 SPA3998 thiG thiS TRUE 0.987 2.000 0.087 1.000 Y NA
 906739 906740 SPA3998 SPA3999 thiS thiF TRUE 0.991 -19.000 0.548 1.000 Y NA
 906740 906741 SPA3999 SPA4000 thiF thiE TRUE 0.989 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 906741 906742 SPA4000 SPA4001 thiE thiC TRUE 0.995 0.000 0.063 0.003 Y NA
 906742 906743 SPA4001 SPA4002 thiC rsD FALSE 0.005 364.000 0.000 1.000 N NA
 906744 906745 SPA4003 SPA4004 yjaD hemE FALSE 0.225 41.000 0.040 1.000 N NA
 906745 906746 SPA4004 SPA4005 hemE nfi TRUE 0.632 10.000 0.028 1.000 N NA
 906746 906747 SPA4005 SPA4006 nfi yjaG TRUE 0.530 42.000 0.086 NA   NA
 906747 906748 SPA4006 SPA4007 yjaG hupA FALSE 0.316 187.000 0.355 NA   NA
 906748 906749 SPA4007 SPA4008 hupA yjaH TRUE 0.969 12.000 0.375 NA   NA
 906751 906752 SPA4010 SPA4011 hydH hydG TRUE 0.989 6.000 0.000 0.069 Y NA
 906753 906754 SPA4012 SPA4013 purD purH TRUE 0.987 12.000 0.238 1.000 Y NA
 906755 906756 SPA4014 SPA4015 rrsE   FALSE 0.240 86.000 0.000 NA   NA
 906756 906757 SPA4015 SPA4016   rrlE FALSE 0.050 197.000 0.000 NA   NA
 906757 906758 SPA4016 SPA4018 rrlE rrfE FALSE 0.229 91.000 0.000 NA   NA
 906760 906761 SPA4020 SPA4021 metA aceB FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 906761 906762 SPA4021 SPA4022 aceB aceA TRUE 0.916 32.000 0.129 1.000 Y NA
 906762 10702398 SPA4022 SPA4023 aceA   FALSE 0.219 102.000 0.000 NA   NA
 906763 906764 SPA4024 SPA4025   iclR TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 906765 906766 SPA4026 SPA4027 metH yjbB FALSE 0.003 267.000 0.006 1.000 N NA
 906768 906769 SPA4029 SPA4030     FALSE 0.459 35.000 0.000 NA   NA
 906769 906770 SPA4030 SPA4031   yjbC FALSE 0.372 47.000 0.000 NA   NA
 906771 906772 SPA4032 SPA4033 yjbD   FALSE 0.298 63.000 0.000 NA   NA
 906772 906773 SPA4033 SPA4034     TRUE 0.804 -13.000 0.000 1.000   NA
 906773 906774 SPA4034 SPA4035     TRUE 0.893 17.000 0.000 0.043   NA
 906774 906775 SPA4035 SPA4036     TRUE 0.575 24.000 0.000 NA   NA
 906775 906776 SPA4036 SPA4037   lysC FALSE 0.002 510.000 0.000 NA N NA
 906777 906778 SPA4038 SPA4039 pgi yjbE FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 906778 906779 SPA4039 SPA4040 yjbE yjbF TRUE 0.870 64.000 0.778 NA   NA
 906779 906780 SPA4040 SPA4041 yjbF yjbG TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 906780 906781 SPA4041 SPA4042 yjbG yjbH TRUE 0.865 -69.000 0.140 NA   NA
 906781 906782 SPA4042 SPA4043 yjbH yjbA FALSE 0.141 143.000 0.000 NA   NA
 906783 906784 SPA4044 SPA4045 malG malF TRUE 0.997 15.000 0.814 0.045 Y NA
 906784 906785 SPA4045 SPA4046 malF malE TRUE 0.752 132.000 0.060 0.045 Y NA
 906786 906787 SPA4047 SPA4048 malK lamB TRUE 0.871 89.000 0.133 0.056 Y NA
 906787 906788 SPA4048 SPA4049 lamB malM FALSE 0.262 164.000 0.171 1.000   NA
 906788 906789 SPA4049 SPA4050 malM ubiC FALSE 0.046 181.000 0.025 NA   NA
 906789 906790 SPA4050 SPA4051 ubiC ubiA TRUE 0.982 14.000 0.248 NA Y NA
 906792 906793 SPA4053 SPA4054 dgkA lexA FALSE 0.350 109.000 0.141 1.000 N NA
 906793 906794 SPA4054 SPA4055 lexA dinF FALSE 0.026 179.000 0.033 1.000 N NA
 906794 906795 SPA4055 SPA4056 dinF   TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 906795 906796 SPA4056 SPA4057   yjbJ TRUE 0.649 19.000 0.000 NA   NA
 906798 906799 SPA4059 SPA4060   yjbN FALSE 0.168 96.000 0.017 1.000   NA
 906799 906800 SPA4060 SPA4061 yjbN yjbO FALSE 0.112 168.000 0.070 NA   NA
 906802 906803 SPA4063 SPA4064 dnaB alr TRUE 0.823 32.000 0.317 1.000 N NA
 906803 906804 SPA4064 SPA4065 alr tyrB FALSE 0.150 186.000 0.181 1.000 N NA
 906804 906805 SPA4065 SPA4066 tyrB aphA FALSE 0.049 187.000 0.026 1.000   NA
 906805 906806 SPA4066 SPA4067 aphA yjbQ FALSE 0.097 129.000 0.009 NA   NA
 906806 906807 SPA4067 SPA4068 yjbQ yjbR TRUE 0.830 3.000 0.018 NA   NA
 906808 906809 SPA4069 SPA4070     TRUE 0.986 -13.000 1.000 NA   NA
 906809 906810 SPA4070 SPA4071   uvrA FALSE 0.075 144.000 0.003 NA   NA
 906811 906812 SPA4072 SPA4073 ssb   FALSE 0.003 1189.000 0.000 NA   NA
 906812 906813 SPA4073 SPA4074     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 906813 906814 SPA4074 SPA4075     TRUE 0.880 -10.000 0.091 NA   NA
 906814 906815 SPA4075 SPA4076     TRUE 0.989 -3.000 0.667 1.000 N NA
 906815 906816 SPA4076 SPA4077     TRUE 0.877 17.000 0.000 0.075   NA
 906816 906817 SPA4077 SPA4078     TRUE 0.714 40.000 0.000 0.056   NA
 906823 906824 SPA4084 SPA4085   yjcD FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 906824 906825 SPA4085 SPA4086 yjcD yjcE FALSE 0.434 105.000 0.130 1.000   NA
 906827 906828 SPA4088 SPA4089     TRUE 0.989 -7.000 0.840 1.000   NA
 906829 10702399 SPA4090 SPA4091 yjcG   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 10702399 906830 SPA4091 SPA4092   acs FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 906831 906832 SPA4093 SPA4094   nrfA FALSE 0.221 99.000 0.000 NA   NA
 906832 906833 SPA4094 SPA4095 nrfA nrfB TRUE 0.612 112.000 0.000 0.001   NA
 906833 906834 SPA4095 SPA4096 nrfB nrfC TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.001   NA
 906834 906835 SPA4096 SPA4097 nrfC nrfD TRUE 0.997 -3.000 0.927 0.001 N NA
 906835 906836 SPA4097 SPA4098 nrfD nrfE TRUE 0.969 -7.000 0.400 1.000 N NA
 906836 906837 SPA4098 SPA4099 nrfE   TRUE 0.987 -7.000 0.214 NA Y NA
 906837 906838 SPA4099 SPA4100   nrfG TRUE 0.996 -3.000 0.464 NA Y NA
 906838 906839 SPA4100 SPA4101 nrfG gltP FALSE 0.005 345.000 0.000 1.000 N NA
 906840 906841 SPA4102 SPA4103 yjcO fdhF FALSE 0.085 177.000 0.000 1.000   NA
 906841 906842 SPA4103 SPA4104 fdhF lpxO FALSE 0.009 366.000 0.000 1.000   NA
 906842 906843 SPA4104 SPA4105 lpxO phnO FALSE 0.012 258.000 0.000 1.000 N NA
 906843 906844 SPA4105 SPA4106 phnO phnB FALSE 0.167 130.000 0.000 NA   NA
 906844 906845 SPA4106 SPA4107 phnB phnA FALSE 0.113 120.000 0.013 NA   NA
 906847 906848 SPA4109 SPA4110 pmrB pmrA TRUE 0.986 10.000 0.000 0.075 Y NA
 906848 906849 SPA4110 SPA4111 pmrA yjdB TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000   NA
 906849 906850 SPA4111 SPA4112 yjdB yjdE FALSE 0.178 134.000 0.000 1.000   NA
 906850 906851 SPA4112 SPA4113 yjdE adiY FALSE 0.292 140.000 0.167 1.000 N NA
 906851 906852 SPA4113 SPA4114 adiY adi FALSE 0.008 298.000 0.000 1.000 N NA
 906852 906853 SPA4114 SPA4115 adi melR FALSE 0.016 233.000 0.000 1.000 N NA
 906854 906855 SPA4116 SPA4117 melA melB TRUE 0.842 84.000 0.214 1.000 Y NA
 906856 906857 SPA4118 SPA4119 fumB dcuB FALSE 0.177 96.000 0.022 1.000   NA
 906857 906858 SPA4119 SPA4120 dcuB   FALSE 0.130 147.000 0.000 NA   NA
 906858 906859 SPA4120 SPA4121   dcuR FALSE 0.012 317.000 0.000 NA   NA
 906859 10702400 SPA4121 SPA4122 dcuR   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 906860 906861 SPA4124 SPA4125 dmsB dmsC TRUE 0.989 -7.000 0.800 1.000   NA
 906861 906862 SPA4125 SPA4126 dmsC   TRUE 0.967 -18.000 0.444 1.000   NA
 906865 906866 SPA4129 SPA4130     TRUE 0.614 21.000 0.000 NA   NA
 906866 906867 SPA4130 SPA4131     TRUE 0.589 23.000 0.000 NA   NA
 906867 906868 SPA4131 SPA4132     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.018   NA
 906868 906869 SPA4132 SPA4133     FALSE 0.019 266.000 0.000 NA   NA
 906870 906871 SPA4134 SPA4135     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000   NA
 906872 906873 SPA4136 SPA4137 phoN   FALSE 0.004 713.000 0.000 NA   NA
 906873 906874 SPA4137 SPA4138   yjdC FALSE 0.198 116.000 0.000 NA   NA
 906874 906875 SPA4138 SPA4139 yjdC dsbD TRUE 0.781 37.000 0.217 1.000   NA
 906875 906876 SPA4139 SPA4140 dsbD cutA TRUE 0.780 -24.000 0.092 1.000 N NA
 906876 906877 SPA4140 SPA4141 cutA dcuA FALSE 0.148 121.000 0.024 1.000   NA
 906877 906878 SPA4141 SPA4142 dcuA aspA TRUE 0.498 115.000 0.195 1.000   NA
 906878 906879 SPA4142 SPA4143 aspA   FALSE 0.340 33.000 0.015 NA   NA
 906882 906883 SPA4146 SPA4147 groES groEL TRUE 0.985 44.000 0.631 0.006 Y NA
 906883 906884 SPA4147 SPA4148 groEL yjeI FALSE 0.037 226.000 0.062 NA   NA
 906885 906886 SPA4149 SPA4150 yjeJ yjeK FALSE 0.016 282.000 0.000 NA   NA
 906887 906888 SPA4151 SPA4152 efp ecnA FALSE 0.216 62.000 0.007 1.000   NA
 906888 906889 SPA4152 SPA4153 ecnA ecnB TRUE 0.810 108.000 0.212 0.000   NA
 906892 906893 SPA4156 SPA4157 blc frdD FALSE 0.079 112.000 0.031 1.000 N NA
 906893 906894 SPA4157 SPA4158 frdD frdC TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 906894 906895 SPA4158 SPA4159 frdC frdB TRUE 0.998 11.000 0.454 0.002 Y NA
 906895 906896 SPA4159 SPA4160 frdB frdA TRUE 0.998 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 906897 906898 SPA4161 SPA4162 yjeA yjeM FALSE 0.005 226.000 0.009 1.000 N NA
 906898 906899 SPA4162 SPA4163 yjeM yjeN TRUE 0.981 8.000 0.400 NA   NA
 10702401 906900 SPA4164 SPA4165   psd FALSE 0.397 43.000 0.000 NA   NA
 906900 906901 SPA4165 SPA4166 psd yjeQ FALSE 0.377 92.000 0.095 1.000   NA
 906904 906905 SPA4169 SPA4170   glyW FALSE 0.097 160.000 0.000 NA   NA
 906905 906906 SPA4170 SPA4171 glyW glyW FALSE 0.097 160.000 0.000 NA   NA
 906908 906909 SPA4173 SPA4174 yjeF yjeE TRUE 0.862 -28.000 0.118 NA   NA
 906909 906910 SPA4174 SPA4175 yjeE amiB TRUE 0.825 17.000 0.109 NA   NA
 906910 906911 SPA4175 SPA4176 amiB mutL TRUE 0.877 10.000 0.092 1.000 N NA
 906911 906912 SPA4176 SPA4177 mutL miaA TRUE 0.968 -7.000 0.188 0.068 N NA
 906912 906913 SPA4177 SPA4178 miaA hfQ TRUE 0.786 83.000 0.531 1.000   NA
 906913 906914 SPA4178 SPA4179 hfQ hflX TRUE 0.510 72.000 0.141 1.000   NA
 906914 906915 SPA4179 SPA4180 hflX hflK FALSE 0.226 215.000 0.184 0.070   NA
 906915 906916 SPA4180 SPA4181 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.009 Y NA
 906916 906917 SPA4181 SPA4182 hflC yjeT TRUE 0.697 79.000 0.348 NA   NA
 906917 906918 SPA4182 SPA4183 yjeT purA FALSE 0.219 103.000 0.051 NA   NA
 906918 906919 SPA4183 SPA4184 purA yjeB FALSE 0.004 207.000 0.010 NA N NA
 906919 906920 SPA4184 SPA4185 yjeB rnr TRUE 0.816 38.000 0.038 NA Y NA
 906920 906921 SPA4185 SPA4186 rnr yjfH TRUE 0.642 91.000 0.147 0.013 N NA
 906921 906922 SPA4186 SPA4187 yjfH yjfI FALSE 0.089 132.000 0.002 NA   NA
 906922 906923 SPA4187 SPA4188 yjfI yjfJ TRUE 0.982 15.000 0.911 NA   NA
 906923 906924 SPA4188 SPA4189 yjfJ   TRUE 0.900 0.000 0.000 NA   NA
 906924 906925 SPA4189 SPA4190   yjfK FALSE 0.195 117.000 0.000 NA   NA
 906925 906926 SPA4190 SPA4191 yjfK yjfL TRUE 0.939 18.000 0.379 NA   NA
 906926 906927 SPA4191 SPA4192 yjfL yjfM TRUE 0.981 10.000 0.470 NA   NA
 906927 906928 SPA4192 SPA4193 yjfM yjfC TRUE 0.887 3.000 0.049 NA   NA
 906928 906929 SPA4193 SPA4194 yjfC aidB FALSE 0.405 67.000 0.133 NA N NA
 906930 906931 SPA4195 SPA4196 yjfN yjfO TRUE 0.647 86.000 0.300 NA   NA
 906933 906934 SPA4198 SPA4199 yjfQ yjfR FALSE 0.304 105.000 0.071 1.000   NA
 906935 906936 SPA4200 SPA4201 ulaA sgaB TRUE 0.920 16.000 0.059 0.011   NA
 906936 906937 SPA4201 SPA4202 sgaB sgaA TRUE 0.993 10.000 0.115 0.008 Y NA
 906937 906938 SPA4202 SPA4203 sgaA sgaH TRUE 0.987 14.000 0.328 1.000 Y NA
 906938 906939 SPA4203 SPA4204 sgaH sgaU TRUE 0.991 10.000 0.250 1.000 Y NA
 906939 906940 SPA4204 SPA4205 sgaU sgaE TRUE 0.993 0.000 0.200 1.000 Y NA
 906942 906943 SPA4207 SPA4208   rpsF FALSE 0.267 71.000 0.000 NA   NA
 906943 906944 SPA4208 SPA4209 rpsF priB TRUE 0.921 7.000 0.122 1.000 N NA
 906944 906945 SPA4209 SPA4210 priB rpsR TRUE 0.930 5.000 0.128 1.000 N NA
 906945 906946 SPA4210 SPA4211 rpsR rplI TRUE 0.980 42.000 0.499 0.011 Y NA
 906946 906947 SPA4211 SPA4212 rplI yifZ FALSE 0.023 148.000 0.006 1.000 N NA
 906949 906950 SPA4214 SPA4215 fklB cycA FALSE 0.008 296.000 0.000 1.000 N NA
 906950 906951 SPA4215 SPA4216 cycA   FALSE 0.010 338.000 0.000 NA   NA
 906951 10702402 SPA4216 SPA4217     TRUE 0.739 15.000 0.000 NA   NA
 906952 906953 SPA4218 SPA4219 ytfE ytfF FALSE 0.184 103.000 0.039 NA   NA
 906953 906954 SPA4219 SPA4220 ytfF ytfG FALSE 0.217 81.000 0.031 1.000   NA
 906960 906961 SPA4226 SPA4227 tnpA ytfL FALSE 0.049 198.000 0.000 NA   NA
 906961 906962 SPA4227 SPA4228 ytfL msrA FALSE 0.048 190.000 0.042 NA   NA
 906963 906964 SPA4229 SPA4230 ytfM ytfN TRUE 0.989 -3.000 0.575 NA   NA
 906964 906965 SPA4230 SPA4231 ytfN ytfP TRUE 0.962 3.000 0.167 NA   NA
 906966 906967 SPA4232 SPA4233     TRUE 0.899 -3.000 0.000 1.000   NA
 906967 906968 SPA4233 SPA4234   ppa FALSE 0.008 413.000 0.000 1.000   NA
 906968 906969 SPA4234 SPA4235 ppa fbp FALSE 0.014 227.000 0.043 1.000 N NA
 906971 906972 SPA4238 SPA4239 pmbA cybC FALSE 0.163 98.000 0.028 NA   NA
 906972 906973 SPA4239 SPA4240 cybC   FALSE 0.019 278.000 0.000 1.000   NA
 906973 906974 SPA4240 SPA4241     TRUE 0.988 11.000 0.821 NA   NA
 906974 906975 SPA4241 SPA4242     TRUE 0.994 3.000 0.893 NA   NA
 906975 906976 SPA4242 SPA4243     TRUE 0.964 23.000 0.897 NA   NA
 906976 906977 SPA4243 SPA4244     TRUE 0.988 12.000 0.966 NA   NA
 906977 906978 SPA4244 SPA4245     TRUE 0.809 59.000 0.475 NA   NA
 906978 906979 SPA4245 SPA4246     TRUE 0.981 -16.000 0.750 1.000   NA
 906979 906980 SPA4246 SPA4247     TRUE 0.991 -3.000 0.679 NA   NA
 906980 906981 SPA4247 SPA4248     TRUE 0.908 -43.000 0.208 NA   NA
 906981 906982 SPA4248 SPA4249   relB FALSE 0.436 78.000 0.172 NA N NA
 906982 906983 SPA4249 SPA4250 relB relE TRUE 0.983 -10.000 0.875 NA N NA
 906984 906985 SPA4251 SPA4252 nrdG nrdD FALSE 0.213 217.000 0.464 1.000 N NA
 906987 906988 SPA4254 SPA4255 treC treB TRUE 0.962 50.000 0.650 1.000 Y NA
 906988 906989 SPA4255 SPA4256 treB treR FALSE 0.303 138.000 0.168 1.000 N NA
 906990 906991 SPA4258 SPA4259   yjgF FALSE 0.282 75.000 0.057 NA   NA
 906991 906992 SPA4259 SPA4260 yjgF pyrI FALSE 0.251 77.000 0.084 NA N NA
 906992 906993 SPA4260 SPA4261 pyrI pyrB TRUE 0.994 13.000 0.197 0.000 Y NA
 906993 906994 SPA4261 SPA4262 pyrB pyrL FALSE 0.340 36.000 0.005 1.000   NA
 906994 906995 SPA4262 SPA4263 pyrL   TRUE 0.637 91.000 0.286 1.000   NA
 906995 906996 SPA4263 SPA4264     FALSE 0.070 187.000 0.000 1.000   NA
 906996 906997 SPA4264 SPA4265     TRUE 0.694 56.000 0.222 1.000   NA
 906997 906998 SPA4265 SPA4266     TRUE 0.890 112.000 0.444 1.000 Y NA
 906998 906999 SPA4266 SPA4267     TRUE 0.996 11.000 0.750 1.000 Y NA
 907002 907003 SPA4270 SPA4271 yjgD miaE TRUE 0.863 12.000 0.078 NA   NA
 907004 907005 SPA4272 SPA4273   ytgA FALSE 0.251 79.000 0.000 NA   NA
 907005 907006 SPA4273 SPA4274 ytgA yjgM FALSE 0.217 107.000 0.000 NA   NA
 907008 907009 SPA4276 SPA4277 valS holC TRUE 0.916 0.000 0.089 1.000 N NA
 907009 907010 SPA4277 SPA4278 holC pepA TRUE 0.689 98.000 0.494 1.000 N NA
 907011 907012 SPA4279 SPA4280 yjgP yjgQ TRUE 0.996 0.000 0.631 0.069   NA
 907013 907014 SPA4281 SPA4282 idnR idnT TRUE 0.548 64.000 0.200 1.000 N NA
 907014 907015 SPA4282 SPA4283 idnT idnO FALSE 0.398 62.000 0.111 1.000 N NA
 907015 907016 SPA4283 SPA4284 idnO idnD TRUE 0.952 25.000 0.444 0.024 N NA
 907019 907020 SPA4287 SPA4288 leuX int FALSE 0.085 167.000 0.000 NA   NA
 907022 907023 SPA4290 SPA4291 hsdS hsdR TRUE 0.967 -3.000 0.182 1.000   NA
 907024 907025 SPA4292 SPA4293     TRUE 0.690 17.000 0.000 NA   NA
 907025 10702405 SPA4293 SPA4294     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 907026 907027 SPA4296 SPA4297 cI   TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 907027 907028 SPA4297 SPA4298     TRUE 0.885 -3.000 0.000 NA   NA
 907028 907029 SPA4298 SPA4299     TRUE 0.739 15.000 0.000 NA   NA
 907029 907030 SPA4299 SPA4300     FALSE 0.018 268.000 0.000 NA   NA
 907030 907031 SPA4300 SPA4301     FALSE 0.155 136.000 0.000 NA   NA
 907032 907033 SPA4304 SPA4305 sefA sefB FALSE 0.182 122.000 0.000 NA   NA
 907033 907034 SPA4305 SPA4306 sefB sefC TRUE 0.980 5.000 0.000 1.000 Y NA
 10702407 907036 SPA4308 SPA4309     TRUE 0.770 -15.000 0.000 NA   NA
 907036 907037 SPA4309 SPA4310     FALSE 0.032 232.000 0.000 1.000   NA
 907037 907038 SPA4310 SPA4311     FALSE 0.061 187.000 0.000 NA   NA
 907038 907039 SPA4311 SPA4312     FALSE 0.019 263.000 0.000 NA   NA
 907039 907040 SPA4312 SPA4313     TRUE 0.554 81.000 0.000 0.042   NA
 907041 907042 SPA4314 SPA4315 yjiU   TRUE 0.962 13.000 0.360 NA   NA
 907043 907044 SPA4316 SPA4317     FALSE 0.253 78.000 0.000 NA   NA
 907044 10702408 SPA4317 SPA4318     FALSE 0.094 162.000 0.000 NA   NA
 907045 907046 SPA4319 SPA4320 yeeN yjhP FALSE 0.007 411.000 0.000 NA   NA
 907046 907047 SPA4320 SPA4321 yjhP   TRUE 0.830 11.000 0.000 NA   NA
 907048 907049 SPA4322 SPA4323     FALSE 0.008 376.000 0.000 NA   NA
 907049 907050 SPA4323 SPA4324     FALSE 0.043 205.000 0.000 NA   NA
 907054 907055 SPA4328 SPA4329     FALSE 0.018 269.000 0.000 NA   NA
 907055 907056 SPA4329 SPA4330     FALSE 0.026 239.000 0.000 NA   NA
 907057 907058 SPA4331 SPA4332 yjiE iadA FALSE 0.083 119.000 0.037 1.000 N NA
 907058 907059 SPA4332 SPA4333 iadA yjiG TRUE 0.743 13.000 0.028 1.000   NA
 907059 907060 SPA4333 SPA4334 yjiG yjiH TRUE 0.974 -3.000 0.019 0.001   NA
 907060 907061 SPA4334 SPA4335 yjiH   FALSE 0.139 144.000 0.000 NA   NA
 907061 907062 SPA4335 SPA4336   yjiJ FALSE 0.149 140.000 0.000 NA   NA
 907062 907063 SPA4336 SPA4337 yjiJ yjiN FALSE 0.033 220.000 0.000 NA   NA
 907063 10702409 SPA4337 SPA4338 yjiN   FALSE 0.397 43.000 0.000 NA   NA
 907064 907065 SPA4339 SPA4340     FALSE 0.069 181.000 0.000 NA   NA
 907068 907069 SPA4343 SPA4344   yjiW FALSE 0.261 74.000 0.000 NA   NA
 907069 907070 SPA4344 SPA4345 yjiW hsdS FALSE 0.101 165.000 0.059 NA   NA
 907070 907071 SPA4345 SPA4346 hsdS hsdM TRUE 0.997 -3.000 0.267 0.042 Y NA
 907071 907072 SPA4346 SPA4347 hsdM hsdR TRUE 0.895 158.000 0.567 0.042 Y NA
 907073 907074 SPA4348 SPA4349 mrr   FALSE 0.022 253.000 0.000 NA   NA
 907074 907075 SPA4349 SPA4350     TRUE 0.980 -13.000 0.654 NA   NA
 907076 907077 SPA4351 SPA4352 yjiA yjiX TRUE 0.952 11.000 0.212 NA   NA
 907077 907078 SPA4352 SPA4353 yjiX cstA TRUE 0.754 95.000 0.531 NA   NA
 907080 907081 SPA4355 SPA4356 mdoB yjjA FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 907081 907082 SPA4356 SPA4357 yjjA dnaC TRUE 0.773 58.000 0.368 NA   NA
 907082 907083 SPA4357 SPA4358 dnaC dnaT TRUE 0.992 3.000 0.778 NA   NA
 907083 907084 SPA4358 SPA4359 dnaT yjjB FALSE 0.211 93.000 0.046 NA   NA
 907084 907085 SPA4359 SPA4360 yjjB yjjP TRUE 0.985 -9.000 0.704 NA   NA
 907086 907087 SPA4361 SPA4362 yjjQ bglJ TRUE 0.998 12.000 0.889 0.018 Y NA
 907088 907089 SPA4363 SPA4364   fhuF FALSE 0.119 151.000 0.000 NA   NA
 907089 907090 SPA4364 SPA4365 fhuF   FALSE 0.320 121.000 0.108 NA   NA
 907092 907093 SPA4367 SPA4368 leuT leuT FALSE 0.459 35.000 0.000 NA   NA
 907093 907094 SPA4368 SPA4369 leuT leuT TRUE 0.498 31.000 0.000 NA   NA
 907094 907095 SPA4369 SPA4370 leuT rsmC FALSE 0.056 191.000 0.000 NA   NA
 907096 907097 SPA4371 SPA4372 holD rimI TRUE 0.862 -55.000 0.121 1.000   NA
 907097 907098 SPA4372 SPA4373 rimI yjjG TRUE 0.569 19.000 0.018 1.000   NA
 907098 907099 SPA4373 SPA4374 yjjG prfC FALSE 0.165 92.000 0.012 1.000   NA
 907099 907100 SPA4374 SPA4375 prfC osmY FALSE 0.007 402.000 0.000 NA   NA
 907100 907101 SPA4375 SPA4376 osmY   FALSE 0.166 111.000 0.035 NA   NA
 907101 907102 SPA4376 SPA4377   yjjU FALSE 0.465 124.000 0.211 NA   NA
 907102 907103 SPA4377 SPA4378 yjjU yjjV TRUE 0.896 -3.000 0.057 NA   NA
 907104 907105 SPA4379 SPA4380 yjjW yjjI TRUE 0.979 -28.000 0.810 NA   NA
 907106 907107 SPA4381 SPA4382 deoC deoA TRUE 0.813 127.000 0.286 1.000 Y NA
 907107 907108 SPA4382 SPA4383 deoA deoB TRUE 0.769 52.000 0.398 1.000 N NA
 907108 907109 SPA4383 SPA4384 deoB deoD FALSE 0.215 210.000 0.414 1.000 N NA
 907109 907110 SPA4384 SPA4385 deoD yafM FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000 N NA
 907111 907112 SPA4386 SPA4387 lplA smp TRUE 0.529 34.000 0.066 NA   NA
 907113 907114 SPA4388 SPA4389 serB radA FALSE 0.080 84.000 0.024 1.000 N NA
 907114 907115 SPA4389 SPA4390 radA nadR FALSE 0.032 151.000 0.021 1.000 N NA
 907117 907118 SPA4392 SPA4393 slt trpR TRUE 0.529 58.000 0.167 1.000 N NA
 907122 907123 SPA4397 SPA4398 creA creB TRUE 0.737 13.000 0.038 NA   NA
 907123 907124 SPA4398 SPA4399 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 907124 907125 SPA4399 SPA4400 creC creD TRUE 0.678 58.000 0.311 NA N NA
 907126 907127 SPA4401 SPA4402 sthE sthD TRUE 0.922 41.000 0.000 0.007 Y NA
 907127 907128 SPA4402 SPA4403 sthD sthC TRUE 0.991 18.000 0.750 1.000 Y NA
 907128 907129 SPA4403 SPA4404 sthC sthB TRUE 0.969 46.000 0.750 1.000 Y NA
 907129 907130 SPA4404 SPA4405 sthB sthA TRUE 0.960 71.000 1.000 1.000 Y NA
 907130 907131 SPA4405 SPA4406 sthA   FALSE 0.010 334.000 0.000 NA   NA
 907131 10702410 SPA4406 SPA4407     FALSE 0.047 200.000 0.000 NA   NA
 10702410 907132 SPA4407 SPA4408   arcA FALSE 0.019 267.000 0.000 NA   NA
 907133 907134 SPA4409 SPA4410 yjjY lasT FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 907134 902901 SPA4410 SPA0001 lasT thrL FALSE 0.042 214.000 0.000 1.000   NA