MicrobesOnline Operon Predictions for Cand. Blochmannia pennsylvanicus BPEN

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1079593 1079594 BPEN_001 BPEN_002 gidA atpB FALSE 0.013 718.000 0.004 1.000 N NA
 1079594 1079595 BPEN_002 BPEN_003 atpB atpE TRUE 0.999 40.000 0.557 0.014 Y NA
 1079595 1079596 BPEN_003 BPEN_004 atpE atpF TRUE 0.999 60.000 0.666 0.014 Y NA
 1079596 1079597 BPEN_004 BPEN_005 atpF atpH TRUE 0.998 1.000 0.242 0.014 Y NA
 1079597 1079598 BPEN_005 BPEN_006 atpH atpA TRUE 1.000 38.000 0.864 0.014 Y NA
 1079598 1079599 BPEN_006 BPEN_007 atpA atpG TRUE 1.000 33.000 0.846 0.014 Y NA
 1079599 1079600 BPEN_007 BPEN_008 atpG atpD TRUE 0.999 31.000 0.724 0.014 Y NA
 1079600 1079601 BPEN_008 BPEN_009 atpD atpC TRUE 0.999 38.000 0.837 0.014 Y NA
 1079601 1079602 BPEN_009 BPEN_010 atpC glmU TRUE 0.667 132.000 0.067 1.000 N NA
 1079603 1079604 BPEN_011 BPEN_012 trmE yidCD TRUE 0.978 75.000 0.221 0.084   NA
 1079604 1079605 BPEN_012 BPEN_013 yidCD rnpA TRUE 0.987 -21.000 0.105 1.000 N NA
 1079605 1079606 BPEN_013 BPEN_014 rnpA rmpH TRUE 0.999 24.000 0.787 1.000   NA
 1079607 1079608 BPEN_015 BPEN_016 dnaN gyrB TRUE 0.198 311.000 0.114 1.000 Y NA
 1079608 1079609 BPEN_016 BPEN_017 gyrB ibpA FALSE 0.021 212.000 0.000 NA N NA
 1079611 1079612 BPEN_019 BPEN_020 glyQ glyS TRUE 0.999 24.000 0.651 0.004 Y NA
 1079614 1079615 BPEN_022 BPEN_023   prlC FALSE 0.009 188.000 0.000 NA   NA
 1079619 1079620 BPEN_027 BPEN_028 dnaB ssb FALSE 0.042 442.000 0.010 0.023 Y NA
 1079620 1079621 BPEN_028 BPEN_029 ssb yjcE FALSE 0.006 546.000 0.000 1.000 N NA
 1079621 1079622 BPEN_029 BPEN_030 yjcE gltP FALSE 0.007 694.000 0.000 1.000 N NA
 1079623 1079624 BPEN_031 BPEN_032 yjgF argI TRUE 0.932 85.000 0.143 NA N NA
 1079624 1079625 BPEN_032 BPEN_033 argI valS FALSE 0.012 269.000 0.000 1.000 N NA
 1079625 1079626 BPEN_033 BPEN_034 valS holC TRUE 0.987 -3.000 0.089 1.000 N NA
 1079626 1079627 BPEN_034 BPEN_035 holC pepA TRUE 0.984 115.000 0.494 1.000 N NA
 1079628 1079629 BPEN_036 BPEN_037 yjgP yjgQ TRUE 0.999 6.000 0.631 0.083   NA
 1079631 1079632 BPEN_039 BPEN_040     FALSE 0.001 331.000 0.000 NA   NA
 1079632 1079633 BPEN_040 BPEN_041   znuC TRUE 0.369 19.000 0.000 NA   NA
 1079633 1079634 BPEN_041 BPEN_042 znuC znuB TRUE 0.990 91.000 0.465 1.000 Y NA
 1079635 1079636 BPEN_043 BPEN_044 yhbG yhbN TRUE 0.997 46.000 0.543 NA   NA
 1079636 1079637 BPEN_044 BPEN_045 yhbN yrbK TRUE 0.999 -22.000 0.459 NA   NA
 1079638 1079639 BPEN_046 BPEN_047 yrbA murA TRUE 0.992 50.000 0.258 NA N NA
 1079640 1079641 BPEN_048 BPEN_049 degQ yhcB TRUE 0.372 227.000 0.154 NA   NA
 1079642 1079643 BPEN_050 BPEN_051 rplM rpsI TRUE 0.999 28.000 0.601 0.069 Y NA
 1079645 1079646 BPEN_053 BPEN_054 yraL rnpB TRUE 0.376 17.000 0.000 NA   NA
 1079646 1079647 BPEN_054 BPEN_055 rnpB yqjA FALSE 0.001 611.000 0.000 NA   NA
 1079648 1079649 BPEN_056 BPEN_057   rpoD FALSE 0.002 322.000 0.000 NA   NA
 1079649 1079650 BPEN_057 BPEN_058 rpoD dnaG TRUE 0.887 174.000 0.299 1.000 N NA
 1079650 1079651 BPEN_058 BPEN_059 dnaG rpsU TRUE 0.545 160.000 0.067 1.000 N NA
 1079654 1079655 BPEN_062 BPEN_063 folB bacA TRUE 0.893 96.000 0.128 1.000 N NA
 1079659 1079660 BPEN_067 BPEN_068 ribB plsC FALSE 0.007 336.000 0.000 1.000 N NA
 1079661 1079662 BPEN_069 BPEN_070 metC   FALSE 0.002 1571.000 0.000 NA   NA
 1079662 1079663 BPEN_070 BPEN_071   cutA FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 1079664 1079665 BPEN_072 BPEN_073 groES groEL TRUE 0.999 50.000 0.631 0.010 Y NA
 1079665 1079666 BPEN_073 BPEN_074 groEL efp FALSE 0.155 129.000 0.003 1.000 N NA
 1079667 1079668 BPEN_075 BPEN_076 yjeP psd TRUE 0.973 57.000 0.148 1.000 N NA
 1079669 1079670 BPEN_077 BPEN_078 orn   FALSE 0.026 131.000 0.000 NA   NA
 1079670 1079671 BPEN_078 BPEN_079   yjeE FALSE 0.001 585.000 0.000 NA   NA
 1079671 1079672 BPEN_079 BPEN_080 yjeE amiB TRUE 0.986 -3.000 0.109 NA   NA
 1079672 1079673 BPEN_080 BPEN_081 amiB miaA FALSE 0.012 262.000 0.000 1.000 N NA
 1079673 1079674 BPEN_081 BPEN_082 miaA hfq TRUE 0.990 91.000 0.531 1.000   NA
 1079674 1079675 BPEN_082 BPEN_083 hfq hflX TRUE 0.666 163.000 0.141 1.000   NA
 1079675 1079676 BPEN_083 BPEN_084 hflX hflK TRUE 0.981 56.000 0.184 0.081   NA
 1079676 1079677 BPEN_084 BPEN_085 hflK hflC TRUE 1.000 1.000 0.947 0.024 Y NA
 1079677 1079678 BPEN_085 BPEN_086 hflC purA TRUE 0.319 162.000 0.019 1.000 N NA
 1079678 1079679 BPEN_086 BPEN_087 purA rlmB FALSE 0.015 236.000 0.002 1.000 N NA
 1079679 1079680 BPEN_087 BPEN_088 rlmB rpsF TRUE 0.358 171.000 0.017 1.000 Y NA
 1079680 1079681 BPEN_088 BPEN_089 rpsF rpsR TRUE 0.791 225.000 0.319 0.068 Y NA
 1079681 1079682 BPEN_089 BPEN_090 rpsR rplI TRUE 0.998 55.000 0.499 0.068 Y NA
 1079682 1079683 BPEN_090 BPEN_091 rplI cysQ FALSE 0.012 295.000 0.003 1.000 N NA
 1079683 1079684 BPEN_091 BPEN_092 cysQ ytfM FALSE 0.006 415.000 0.000 1.000 N NA
 1079684 1079685 BPEN_092 BPEN_093 ytfM ytfN TRUE 0.999 -3.000 0.575 1.000   NA
 1079686 1079687 BPEN_094 BPEN_095 ppa ispB FALSE 0.050 197.000 0.004 1.000 N NA
 1079688 1079689 BPEN_096 BPEN_097 rplU rpmA TRUE 0.999 46.000 0.667 0.068 Y NA
 1079689 1079690 BPEN_097 BPEN_098 rpmA cgtA TRUE 0.481 360.000 0.335 1.000   NA
 1079690 1079691 BPEN_098 BPEN_099 cgtA greA FALSE 0.002 331.000 0.000 1.000   NA
 1079691 1079692 BPEN_099 BPEN_100 greA rrmJ FALSE 0.021 377.000 0.009 NA N NA
 1079692 1079693 BPEN_100 BPEN_101 rrmJ hflB TRUE 0.955 74.000 0.152 NA N NA
 1079693 1079694 BPEN_101 BPEN_102 hflB folP TRUE 0.953 131.000 0.325 1.000 N NA
 1079694 1079695 BPEN_102 BPEN_103 folP mrsA TRUE 0.997 14.000 0.260 1.000 N NA
 1079695 1079696 BPEN_103 BPEN_104 mrsA secG TRUE 0.373 147.000 0.016 1.000 N NA
 1079696 1079697 BPEN_104 BPEN_105 secG   FALSE 0.015 159.000 0.000 NA   NA
 1079697 1079698 BPEN_105 BPEN_106     FALSE 0.111 72.000 0.000 NA   NA
 1079698 1079699 BPEN_106 BPEN_107   nusA FALSE 0.001 512.000 0.000 NA   NA
 1079699 1079700 BPEN_107 BPEN_108 nusA infB TRUE 0.997 31.000 0.342 1.000 N NA
 1079700 1079701 BPEN_108 BPEN_109 infB rbfA TRUE 0.992 91.000 0.530 1.000 Y NA
 1079701 1079702 BPEN_109 BPEN_110 rbfA truB TRUE 0.997 37.000 0.318 1.000 Y NA
 1079702 1079703 BPEN_110 BPEN_111 truB rpsO TRUE 0.424 330.000 0.211 1.000 Y NA
 1079703 1079704 BPEN_111 BPEN_112 rpsO pnp TRUE 0.917 178.000 0.335 1.000 Y NA
 1079704 1079705 BPEN_112 BPEN_113 pnp deaD FALSE 0.014 626.000 0.000 1.000 Y NA
 1079705 1079706 BPEN_113 BPEN_114 deaD holD TRUE 0.178 162.000 0.004 1.000 Y NA
 1079706 1079707 BPEN_114 BPEN_115 holD thrA FALSE 0.008 966.000 0.000 1.000 N NA
 1079707 1079708 BPEN_115 BPEN_116 thrA thrB TRUE 0.990 24.000 0.133 1.000 Y NA
 1079708 1079709 BPEN_116 BPEN_117 thrB thrC TRUE 0.998 0.000 0.233 1.000 Y NA
 1079709 1079710 BPEN_117 BPEN_118 thrC dnaK FALSE 0.007 370.000 0.000 1.000 N NA
 1079710 1079711 BPEN_118 BPEN_119 dnaK dnaJ TRUE 0.959 124.000 0.236 0.007 Y NA
 1079713 1079714 BPEN_121 BPEN_122 ribF ileS TRUE 0.997 -3.000 0.254 1.000 N NA
 1079714 1079715 BPEN_122 BPEN_123 ileS lspA TRUE 0.977 0.000 0.045 1.000 N NA
 1079715 1079716 BPEN_123 BPEN_124 lspA ispH TRUE 0.516 155.000 0.033 1.000 Y NA
 1079716 1079717 BPEN_124 BPEN_125 ispH dapB FALSE 0.105 204.000 0.009 1.000 N NA
 1079717 1079718 BPEN_125 BPEN_126 dapB carA FALSE 0.141 248.000 0.034 1.000 Y NA
 1079718 1079719 BPEN_126 BPEN_127 carA carB TRUE 0.999 22.000 0.345 0.003 Y NA
 1079719 1079720 BPEN_127 BPEN_128 carB folA TRUE 0.477 110.000 0.010 1.000 N NA
 1079721 1079722 BPEN_129 BPEN_130 apaH ksgA FALSE 0.034 393.000 0.025 1.000   NA
 1079722 1079723 BPEN_130 BPEN_131 ksgA pdxA TRUE 0.995 -19.000 0.197 1.000 N NA
 1079723 1079724 BPEN_131 BPEN_132 pdxA surA TRUE 0.999 2.000 0.561 1.000   NA
 1079724 1079725 BPEN_132 BPEN_133 surA imp TRUE 0.979 51.000 0.182 1.000   NA
 1079725 1079726 BPEN_133 BPEN_134 imp leuD FALSE 0.006 590.000 0.000 1.000 N NA
 1079726 1079727 BPEN_134 BPEN_135 leuD leuC TRUE 0.998 25.000 0.309 0.003 Y NA
 1079727 1079728 BPEN_135 BPEN_136 leuC leuB TRUE 0.998 2.000 0.275 0.007 Y NA
 1079728 1079729 BPEN_136 BPEN_137 leuB leuA TRUE 0.992 24.000 0.126 0.007 Y NA
 1079730 1079731 BPEN_138 BPEN_139 mraW ftsL TRUE 0.997 3.000 0.227 1.000 N NA
 1079731 1079732 BPEN_139 BPEN_140 ftsL ftsI TRUE 0.916 85.000 0.124 1.000 N NA
 1079732 1079733 BPEN_140 BPEN_141 ftsI murE TRUE 0.970 36.000 0.059 1.000 Y NA
 1079733 1079734 BPEN_141 BPEN_142 murE murF TRUE 1.000 -3.000 0.569 0.012 Y NA
 1079734 1079735 BPEN_142 BPEN_143 murF mraY TRUE 0.999 -15.000 0.309 0.017 Y NA
 1079735 1079736 BPEN_143 BPEN_144 mraY murD TRUE 1.000 5.000 0.647 0.017 Y NA
 1079736 1079737 BPEN_144 BPEN_145 murD ftsW TRUE 0.998 0.000 0.297 0.012 N NA
 1079737 1079738 BPEN_145 BPEN_146 ftsW murG TRUE 0.999 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1079738 1079739 BPEN_146 BPEN_147 murG murC TRUE 0.993 59.000 0.283 1.000 Y NA
 1079739 1079740 BPEN_147 BPEN_148 murC ftsQ TRUE 0.823 136.000 0.134 NA Y NA
 1079740 1079741 BPEN_148 BPEN_149 ftsQ ftsA TRUE 0.997 35.000 0.389 NA N NA
 1079741 1079742 BPEN_149 BPEN_150 ftsA ftsZ TRUE 0.994 76.000 0.460 1.000 Y NA
 1079742 1079743 BPEN_150 BPEN_151 ftsZ lpxC TRUE 0.889 104.000 0.134 1.000 N NA
 1079743 1079744 BPEN_151 BPEN_152 lpxC secA FALSE 0.018 810.000 0.005 1.000 N NA
 1079746 1079747 BPEN_154 BPEN_155 dksA folK FALSE 0.015 247.000 0.003 1.000 N NA
 1079748 1079749 BPEN_156 BPEN_157 lpdA aceF TRUE 0.881 212.000 0.463 1.000 Y NA
 1079749 1079750 BPEN_157 BPEN_158 aceF aceE TRUE 0.998 12.000 0.220 0.038 Y NA
 1079751 1079752 BPEN_159 BPEN_160 mrcB yadR FALSE 0.001 341.000 0.000 NA   NA
 1079752 1079753 BPEN_160 BPEN_161 yadR pyrG FALSE 0.001 464.000 0.000 NA   NA
 1079753 1079754 BPEN_161 BPEN_162 pyrG eno TRUE 0.887 77.000 0.068 1.000 N NA
 1079754 1079755 BPEN_162 BPEN_163 eno cysJ FALSE 0.006 593.000 0.000 1.000 N NA
 1079755 1079756 BPEN_163 BPEN_164 cysJ cysI TRUE 1.000 0.000 0.791 0.003 Y NA
 1079756 1079757 BPEN_164 BPEN_165 cysI cysH TRUE 0.989 -7.000 0.116 1.000 N NA
 1079757 1079758 BPEN_165 BPEN_166 cysH cysG FALSE 0.063 281.000 0.011 1.000 Y NA
 1079758 1079759 BPEN_166 BPEN_167 cysG cysD TRUE 0.999 17.000 0.417 1.000 Y NA
 1079759 1079760 BPEN_167 BPEN_168 cysD cysN TRUE 0.999 10.000 0.574 0.003 N NA
 1079760 1079761 BPEN_168 BPEN_169 cysN cysC TRUE 0.998 14.000 0.340 1.000 Y NA
 1079761 1079762 BPEN_169 BPEN_170 cysC ygbQ FALSE 0.032 370.000 0.013 1.000 N NA
 1079762 1079763 BPEN_170 BPEN_171 ygbQ ispD TRUE 0.971 72.000 0.185 1.000 N NA
 1079763 1079764 BPEN_171 BPEN_172 ispD ispF TRUE 0.999 15.000 0.419 1.000 Y NA
 1079764 1079765 BPEN_172 BPEN_173 ispF nlpD FALSE 0.007 650.000 0.000 1.000 N NA
 1079765 1079766 BPEN_173 BPEN_174 nlpD alaS FALSE 0.008 898.000 0.000 1.000 N NA
 1079766 1079767 BPEN_174 BPEN_175 alaS csrA TRUE 0.232 188.000 0.020 1.000 N NA
 1079767 1079768 BPEN_175 BPEN_176 csrA   FALSE 0.018 152.000 0.000 NA   NA
 1079768 1079769 BPEN_176 BPEN_177     TRUE 0.385 15.000 0.000 NA   NA
 1079769 1079770 BPEN_177 BPEN_178   ffh FALSE 0.012 173.000 0.000 NA   NA
 1079770 1079771 BPEN_178 BPEN_179 ffh rpsP TRUE 0.980 97.000 0.361 1.000 N NA
 1079771 1079772 BPEN_179 BPEN_180 rpsP rimM TRUE 0.999 -3.000 0.342 0.067 Y NA
 1079772 1079773 BPEN_180 BPEN_181 rimM trmD TRUE 0.999 27.000 0.672 1.000 Y NA
 1079773 1079774 BPEN_181 BPEN_182 trmD rplS TRUE 0.999 8.000 0.567 1.000 Y NA
 1079774 1079775 BPEN_182 BPEN_183 rplS aroF FALSE 0.006 505.000 0.000 1.000 N NA
 1079775 1079776 BPEN_183 BPEN_184 aroF tyrA TRUE 0.962 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 1079777 1079778 BPEN_185 BPEN_186 pheA yfiO FALSE 0.015 222.000 0.004 1.000   NA
 1079779 1079780 BPEN_187 BPEN_188 rluD clpB FALSE 0.012 289.000 0.003 1.000 N NA
 1079780 1079781 BPEN_188 BPEN_189 clpB murB FALSE 0.008 329.000 0.000 1.000 N NA
 1079781 1079782 BPEN_189 BPEN_190 murB birA TRUE 0.870 157.000 0.211 1.000 N NA
 1079784 1079785 BPEN_192 BPEN_193     TRUE 0.392 14.000 0.000 NA   NA
 1079785 1079786 BPEN_193 BPEN_194     FALSE 0.105 73.000 0.000 NA   NA
 1079786 1079787 BPEN_194 BPEN_195     TRUE 0.352 22.000 0.000 NA   NA
 1079787 1079788 BPEN_195 BPEN_196   bfr FALSE 0.019 149.000 0.000 NA   NA
 1079788 1079789 BPEN_196 BPEN_197 bfr rpsJ FALSE 0.008 320.000 0.000 1.000 N NA
 1079789 1079790 BPEN_197 BPEN_198 rpsJ rplC TRUE 0.978 106.000 0.307 0.088 Y NA
 1079790 1079791 BPEN_198 BPEN_199 rplC rplD TRUE 0.999 1.000 0.486 0.066 Y NA
 1079791 1079792 BPEN_199 BPEN_200 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.066 Y NA
 1079792 1079793 BPEN_200 BPEN_201 rplW rplB TRUE 1.000 24.000 0.849 0.049 Y NA
 1079793 1079794 BPEN_201 BPEN_202 rplB rpsS TRUE 1.000 27.000 0.820 0.088 Y NA
 1079794 1079795 BPEN_202 BPEN_203 rpsS rplV TRUE 0.999 50.000 0.769 0.088 Y NA
 1079795 1079796 BPEN_203 BPEN_204 rplV rpsC TRUE 0.999 34.000 0.719 0.088 Y NA
 1079796 1079797 BPEN_204 BPEN_205 rpsC rplP TRUE 1.000 12.000 0.828 0.088 Y NA
 1079797 1079798 BPEN_205 BPEN_206 rplP rpmC TRUE 1.000 0.000 0.802 0.066   NA
 1079798 1079799 BPEN_206 BPEN_207 rpmC rpsQ TRUE 1.000 15.000 0.828 0.066   NA
 1079799 1079800 BPEN_207 BPEN_208 rpsQ rplN TRUE 0.994 123.000 0.791 0.088 Y NA
 1079800 1079801 BPEN_208 BPEN_209 rplN rplX TRUE 1.000 16.000 0.810 0.088 Y NA
 1079801 1079802 BPEN_209 BPEN_210 rplX rplE TRUE 1.000 13.000 0.758 0.066 Y NA
 1079802 1079803 BPEN_210 BPEN_211 rplE rpsN TRUE 0.999 33.000 0.496 0.066 Y NA
 1079803 1079804 BPEN_211 BPEN_212 rpsN rpsH TRUE 0.999 32.000 0.473 0.066 Y NA
 1079804 1079805 BPEN_212 BPEN_213 rpsH rplF TRUE 1.000 -10.000 0.808 0.066 Y NA
 1079805 1079806 BPEN_213 BPEN_214 rplF rplR TRUE 1.000 32.000 0.815 0.066 Y NA
 1079806 1079807 BPEN_214 BPEN_215 rplR rpsE TRUE 1.000 16.000 0.814 0.088 Y NA
 1079807 1079808 BPEN_215 BPEN_216 rpsE rpmD TRUE 0.414 -4.000 0.000 NA   NA
 1079808 1079809 BPEN_216 BPEN_217 rpmD rplO TRUE 0.411 7.000 0.000 NA   NA
 1079809 1079810 BPEN_217 BPEN_218 rplO secY TRUE 1.000 11.000 0.730 1.000 N NA
 1079810 1079811 BPEN_218 BPEN_219 secY rmpJ TRUE 0.965 39.000 0.089 1.000   NA
 1079811 1079812 BPEN_219 BPEN_220 rmpJ rpsM TRUE 0.987 49.000 0.194 0.066   NA
 1079812 1079813 BPEN_220 BPEN_221 rpsM rpsK TRUE 1.000 32.000 0.810 0.066 Y NA
 1079813 1079814 BPEN_221 BPEN_222 rpsK rpsD TRUE 0.999 38.000 0.509 0.088 Y NA
 1079814 1079815 BPEN_222 BPEN_223 rpsD rpoA TRUE 0.998 35.000 0.549 1.000 N NA
 1079815 1079816 BPEN_223 BPEN_224 rpoA rplQ TRUE 0.999 41.000 0.873 1.000 N NA
 1079817 1079818 BPEN_225 BPEN_226 fmt def TRUE 0.986 11.000 0.058 0.098 Y NA
 1079819 1079820 BPEN_227 BPEN_228 yrdC aroE TRUE 0.978 28.000 0.087 NA N NA
 1079820 1079821 BPEN_228 BPEN_229 aroE rrf FALSE 0.008 192.000 0.000 NA   NA
 1079822 1079823 BPEN_230 BPEN_231 gloB rnhA FALSE 0.023 301.000 0.009 1.000   NA
 1079824 1079825 BPEN_232 BPEN_233 dnaQ gmhA FALSE 0.049 218.000 0.005 1.000 N NA
 1079825 1079826 BPEN_233 BPEN_234 gmhA   FALSE 0.006 205.000 0.000 NA   NA
 1079828 1079829 BPEN_236 BPEN_237 tgt yajC TRUE 0.989 73.000 0.325 NA N NA
 1079829 1079830 BPEN_237 BPEN_238 yajC secD TRUE 0.963 35.000 0.045 NA Y NA
 1079830 1079831 BPEN_238 BPEN_239 secD secF TRUE 0.989 62.000 0.206 0.003 Y NA
 1079831 1079832 BPEN_239 BPEN_240 secF ribD FALSE 0.006 466.000 0.000 1.000 N NA
 1079832 1079833 BPEN_240 BPEN_241 ribD ribH TRUE 0.804 105.000 0.034 0.008 Y NA
 1079833 1079834 BPEN_241 BPEN_242 ribH nusB TRUE 0.998 28.000 0.347 1.000 N NA
 1079834 1079835 BPEN_242 BPEN_243 nusB pgpA TRUE 0.300 88.000 0.003 1.000 N NA
 1079836 1079837 BPEN_244 BPEN_245 dxs ispA TRUE 0.971 36.000 0.060 1.000 Y NA
 1079839 1079840 BPEN_247 BPEN_248 yajR cyoE TRUE 0.569 161.000 0.061 0.079 N NA
 1079840 1079841 BPEN_248 BPEN_249 cyoE cyoD TRUE 0.989 20.000 0.118 0.079 N NA
 1079841 1079842 BPEN_249 BPEN_250 cyoD cyoC TRUE 0.999 4.000 0.485 0.039 Y NA
 1079842 1079843 BPEN_250 BPEN_251 cyoC cyoB TRUE 1.000 -22.000 0.697 0.039 Y NA
 1079843 1079844 BPEN_251 BPEN_252 cyoB cyoA TRUE 0.992 76.000 0.327 0.005 Y NA
 1079845 1079846 BPEN_253 BPEN_254 clpP clpX TRUE 0.963 139.000 0.352 1.000 Y NA
 1079847 1079848 BPEN_255 BPEN_256 yggX mutY TRUE 0.959 72.000 0.150 NA N NA
 1079848 1079849 BPEN_256 BPEN_257 mutY yqgF FALSE 0.018 943.000 0.000 1.000 Y NA
 1079849 1079850 BPEN_257 BPEN_258 yqgF yqgE TRUE 0.997 -7.000 0.263 NA N NA
 1079850 1079851 BPEN_258 BPEN_259 yqgE metK FALSE 0.007 788.000 0.000 NA N NA
 1079852 1079853 BPEN_260 BPEN_261 speB pgk FALSE 0.006 496.000 0.000 1.000 N NA
 1079853 1079854 BPEN_261 BPEN_262 pgk fbaA TRUE 0.897 85.000 0.056 0.017 Y NA
 1079854 1079855 BPEN_262 BPEN_263 fbaA rpiA FALSE 0.016 339.000 0.000 1.000 Y NA
 1079856 1079857 BPEN_264 BPEN_265 ygfA ygfE TRUE 0.452 142.000 0.034 NA   NA
 1079858 1079859 BPEN_266 BPEN_267 ubiH visC TRUE 0.999 24.000 0.474 0.005 Y NA
 1079861 1079862 BPEN_269 BPEN_270 prfB lysS TRUE 0.995 -7.000 0.162 1.000 Y NA
 1079862 1079863 BPEN_270 BPEN_271 lysS lysA FALSE 0.134 180.000 0.007 1.000 N NA
 1079863 1079864 BPEN_271 BPEN_272 lysA ygdP FALSE 0.007 630.000 0.000 1.000 N NA
 1079864 1079865 BPEN_272 BPEN_273 ygdP lgt FALSE 0.063 183.000 0.003 1.000 N NA
 1079865 1079866 BPEN_273 BPEN_274 lgt recC FALSE 0.006 464.000 0.000 1.000 N NA
 1079867 1079868 BPEN_275 BPEN_276 recD recB TRUE 0.894 284.000 0.688 0.003 Y NA
 1079868 1079869 BPEN_276 BPEN_277 recB dapD FALSE 0.019 226.000 0.000 1.000 N NA
 1079869 1079870 BPEN_277 BPEN_278 dapD map FALSE 0.039 452.000 0.021 1.000 N NA
 1079871 1079872 BPEN_279 BPEN_280 rpsB tsf TRUE 0.997 86.000 0.748 1.000 Y NA
 1079872 1079873 BPEN_280 BPEN_281 tsf pyrH TRUE 0.856 206.000 0.416 1.000 N NA
 1079873 1079874 BPEN_281 BPEN_282 pyrH frr TRUE 0.994 86.000 0.626 1.000 N NA
 1079874 1079875 BPEN_282 BPEN_283 frr dxr TRUE 0.716 95.000 0.032 1.000 N NA
 1079875 1079876 BPEN_283 BPEN_284 dxr uppS TRUE 0.459 157.000 0.025 1.000 Y NA
 1079876 1079877 BPEN_284 BPEN_285 uppS cdsA TRUE 0.998 32.000 0.400 1.000 Y NA
 1079877 1079878 BPEN_285 BPEN_286 cdsA ecfE TRUE 0.968 36.000 0.080 1.000 N NA
 1079878 1079879 BPEN_286 BPEN_287 ecfE yaeT TRUE 0.991 45.000 0.204 1.000 Y NA
 1079879 1079880 BPEN_287 BPEN_288 yaeT hlpA TRUE 0.990 80.000 0.354 1.000 Y NA
 1079880 1079881 BPEN_288 BPEN_289 hlpA lpxD TRUE 1.000 4.000 0.814 1.000 Y NA
 1079881 1079882 BPEN_289 BPEN_290 lpxD fabZ TRUE 0.994 100.000 0.796 1.000 N NA
 1079882 1079883 BPEN_290 BPEN_291 fabZ lpxA TRUE 1.000 5.000 0.850 1.000 N NA
 1079883 1079884 BPEN_291 BPEN_292 lpxA lpxB TRUE 0.998 3.000 0.289 1.000 Y NA
 1079884 1079885 BPEN_292 BPEN_293 lpxB rnhB TRUE 0.995 -3.000 0.186 1.000 N NA
 1079885 1079886 BPEN_293 BPEN_294 rnhB dnaE TRUE 0.972 47.000 0.104 1.000 Y NA
 1079886 1079887 BPEN_294 BPEN_295 dnaE accA TRUE 0.987 19.000 0.122 1.000 N NA
 1079887 1079888 BPEN_295 BPEN_296 accA tilS TRUE 0.699 156.000 0.123 1.000 N NA
 1079891 1079892 BPEN_299 BPEN_300 accC accB TRUE 0.998 11.000 0.275 0.003 Y NA
 1079892 1079893 BPEN_300 BPEN_301 accB aroQ TRUE 0.996 22.000 0.254 1.000 N NA
 1079894 1079895 BPEN_302 BPEN_303 mreB mreC TRUE 0.990 121.000 0.689 1.000 N NA
 1079895 1079896 BPEN_303 BPEN_304 mreC mreD TRUE 0.991 111.000 0.550 0.012 Y NA
 1079896 1079897 BPEN_304 BPEN_305 mreD tldD FALSE 0.001 410.000 0.000 NA   NA
 1079897 1079898 BPEN_305 BPEN_306 tldD pmbA FALSE 0.146 444.000 0.146 NA   NA
 1079898 1079899 BPEN_306 BPEN_307 pmbA lon FALSE 0.002 1335.000 0.000 NA   NA
 1079899 1079900 BPEN_307 BPEN_308 lon apt FALSE 0.009 1660.000 0.000 1.000 N NA
 1079900 1079901 BPEN_308 BPEN_309 apt dnaX TRUE 0.930 71.000 0.088 1.000 N NA
 1079901 1079902 BPEN_309 BPEN_310 dnaX adk FALSE 0.013 634.000 0.000 0.018 N NA
 1079906 1079907 BPEN_314 BPEN_315   ytfF FALSE 0.011 177.000 0.000 NA   NA
 1079908 1079909 BPEN_316 BPEN_317 mrdB mrdA TRUE 0.900 65.000 0.046 1.000 N NA
 1079909 1079910 BPEN_317 BPEN_318 mrdA ybeB FALSE 0.039 122.000 0.002 NA   NA
 1079910 1079911 BPEN_318 BPEN_319 ybeB holA FALSE 0.024 610.000 0.013 NA   NA
 1079911 1079912 BPEN_319 BPEN_320 holA rlpB TRUE 0.978 66.000 0.199 NA N NA
 1079912 1079913 BPEN_320 BPEN_321 rlpB leuS TRUE 0.994 5.000 0.182 NA N NA
 1079913 1079914 BPEN_321 BPEN_322 leuS lnt FALSE 0.022 276.000 0.005 1.000 N NA
 1079914 1079915 BPEN_322 BPEN_323 lnt ybeX TRUE 0.999 3.000 0.557 NA N NA
 1079915 1079916 BPEN_323 BPEN_324 ybeX ybeY TRUE 0.984 33.000 0.150 NA   NA
 1079916 1079917 BPEN_324 BPEN_325 ybeY phoL TRUE 0.979 111.000 0.457 NA   NA
 1079919 1079920 BPEN_327 BPEN_328     FALSE 0.078 84.000 0.000 NA   NA
 1079920 1079921 BPEN_328 BPEN_329     TRUE 0.315 28.000 0.000 NA   NA
 1079921 1079922 BPEN_329 BPEN_330   nagA FALSE 0.001 444.000 0.000 NA   NA
 1079922 1079923 BPEN_330 BPEN_331 nagA nagB TRUE 0.999 11.000 0.557 0.003 Y NA
 1079925 1079926 BPEN_333 BPEN_334 fldA ybfF FALSE 0.004 220.000 0.000 NA   NA
 1079929 1079930 BPEN_337 BPEN_338 sdhC sdhD TRUE 0.999 -24.000 0.453 0.003 Y NA
 1079930 1079931 BPEN_338 BPEN_339 sdhD sdhA TRUE 1.000 1.000 0.705 0.007 Y NA
 1079931 1079932 BPEN_339 BPEN_340 sdhA sdhB TRUE 1.000 17.000 0.604 0.007 Y NA
 1079932 1079933 BPEN_340 BPEN_341 sdhB sucA TRUE 0.409 201.000 0.067 1.000 Y NA
 1079933 1079934 BPEN_341 BPEN_342 sucA sucB TRUE 0.999 21.000 0.667 1.000 Y NA
 1079934 1079935 BPEN_342 BPEN_343 sucB sucC TRUE 0.886 117.000 0.136 1.000 Y NA
 1079935 1079936 BPEN_343 BPEN_344 sucC sucD TRUE 1.000 -16.000 0.806 0.003 Y NA
 1079936 1079937 BPEN_344 BPEN_345 sucD tolQ FALSE 0.015 378.000 0.006 1.000 N NA
 1079937 1079938 BPEN_345 BPEN_346 tolQ tolR TRUE 0.999 -31.000 0.556 0.023 Y NA
 1079938 1079939 BPEN_346 BPEN_347 tolR tolA TRUE 0.969 46.000 0.114 NA N NA
 1079939 1079940 BPEN_347 BPEN_348 tolA tolB TRUE 0.851 78.000 0.051 NA N NA
 1079940 1079941 BPEN_348 BPEN_349 tolB pal TRUE 0.997 60.000 0.592 1.000 N NA
 1079941 1079942 BPEN_349 BPEN_350 pal ybgF TRUE 0.984 8.000 0.088 1.000   NA
 1079944 1079945 BPEN_352 BPEN_353 gpmA ybhL FALSE 0.061 189.000 0.006 NA   NA
 1079946 1079947 BPEN_354 BPEN_355 ychF pth TRUE 0.950 94.000 0.184 1.000 Y NA
 1079947 1079948 BPEN_355 BPEN_356 pth prsA FALSE 0.062 245.000 0.011 1.000 N NA
 1079948 1079949 BPEN_356 BPEN_357 prsA ispE TRUE 0.827 86.000 0.053 1.000 N NA
 1079949 1079950 BPEN_357 BPEN_358 ispE lolB TRUE 0.993 -3.000 0.157 1.000 N NA
 1079951 1079952 BPEN_359 BPEN_360 prfA hemK TRUE 0.998 0.000 0.229 1.000 Y NA
 1079952 1079953 BPEN_360 BPEN_361 hemK kdsA FALSE 0.022 327.000 0.007 1.000 N NA
 1079953 1079954 BPEN_361 BPEN_362 kdsA thrS FALSE 0.015 2187.000 0.000 0.100 N NA
 1079954 1079955 BPEN_362 BPEN_363 thrS infC TRUE 0.996 7.000 0.186 1.000 Y NA
 1079955 1079956 BPEN_363 BPEN_364 infC rpmI TRUE 0.998 63.000 0.652 1.000 Y NA
 1079956 1079957 BPEN_364 BPEN_365 rpmI rplT TRUE 0.999 74.000 0.928 0.064 Y NA
 1079957 1079958 BPEN_365 BPEN_366 rplT pheS TRUE 0.788 185.000 0.202 1.000 Y NA
 1079958 1079959 BPEN_366 BPEN_367 pheS pheT TRUE 1.000 14.000 0.574 0.003 Y NA
 1079959 1079960 BPEN_367 BPEN_368 pheT lplA FALSE 0.006 586.000 0.000 1.000 N NA
 1079960 1079961 BPEN_368 BPEN_369 lplA sufA FALSE 0.001 484.000 0.000 NA   NA
 1079961 1079962 BPEN_369 BPEN_370 sufA sufB TRUE 0.964 15.000 0.041 NA   NA
 1079962 1079963 BPEN_370 BPEN_371 sufB sufC TRUE 0.997 57.000 0.466 1.000 Y NA
 1079963 1079964 BPEN_371 BPEN_372 sufC sufD TRUE 0.999 -19.000 0.482 1.000 Y NA
 1079964 1079965 BPEN_372 BPEN_373 sufD sufS TRUE 0.995 -3.000 0.193 1.000 N NA
 1079965 1079966 BPEN_373 BPEN_374 sufS sufE TRUE 0.992 19.000 0.183 NA   NA
 1079967 1079968 BPEN_375 BPEN_376 lpp   FALSE 0.002 265.000 0.000 NA   NA
 1079969 1079970 BPEN_377 BPEN_378 ribE ydhD FALSE 0.087 165.000 0.003 1.000 N NA
 1079972 1079973 BPEN_380 BPEN_381 slyA pdxH FALSE 0.008 326.000 0.000 1.000 N NA
 1079973 1079974 BPEN_381 BPEN_382 pdxH tyrS TRUE 0.645 130.000 0.054 1.000 N NA
 1079975 1079976 BPEN_383 BPEN_384 nth fumC TRUE 0.220 97.000 0.002 1.000 N NA
 1079978 1079979 BPEN_386 BPEN_387 ubiX kdsB FALSE 0.008 330.000 0.000 1.000 N NA
 1079979 1079980 BPEN_387 BPEN_388 kdsB ycaR TRUE 0.997 12.000 0.265 NA   NA
 1079980 1079981 BPEN_388 BPEN_389 ycaR lpxK TRUE 0.686 211.000 0.263 NA   NA
 1079981 1079982 BPEN_389 BPEN_390 lpxK msbA TRUE 0.996 0.000 0.205 1.000 N NA
 1079982 1079983 BPEN_390 BPEN_391 msbA rpsA FALSE 0.007 705.000 0.000 1.000 N NA
 1079983 1079984 BPEN_391 BPEN_392 rpsA cmk TRUE 0.984 75.000 0.281 1.000 N NA
 1079984 1079985 BPEN_392 BPEN_393 cmk aroA TRUE 0.919 129.000 0.209 1.000 N NA
 1079985 1079986 BPEN_393 BPEN_394 aroA serC TRUE 0.596 132.000 0.033 1.000 Y NA
 1079986 1079987 BPEN_394 BPEN_395 serC serS FALSE 0.022 338.000 0.008 1.000 N NA
 1079987 1079988 BPEN_395 BPEN_396 serS lolA FALSE 0.018 785.000 0.005 1.000 N NA
 1079988 1079989 BPEN_396 BPEN_397 lolA ftsK TRUE 0.961 118.000 0.305 1.000 N NA
 1079990 1079991 BPEN_398 BPEN_399 trxB infA FALSE 0.046 491.000 0.028 1.000 N NA
 1079994 1079995 BPEN_402 BPEN_403 emtA mntR FALSE 0.001 461.000 0.000 NA   NA
 1079996 1079997 BPEN_404 BPEN_405 trmU purB FALSE 0.015 417.000 0.006 1.000 N NA
 1079998 1079999 BPEN_406 BPEN_407 lolE lolD TRUE 0.991 11.000 0.125 0.053 N NA
 1079999 1080000 BPEN_407 BPEN_408 lolD lolC TRUE 0.995 -7.000 0.175 0.023 N NA
 1080000 1080001 BPEN_408 BPEN_409 lolC ycfM FALSE 0.061 243.000 0.016 NA   NA
 1080001 1080002 BPEN_409 BPEN_410 ycfM ycfF FALSE 0.094 190.000 0.010 NA   NA
 1080002 1080003 BPEN_410 BPEN_411 ycfF ycfH FALSE 0.053 274.000 0.013 NA N NA
 1080003 1080004 BPEN_411 BPEN_412 ycfH holB TRUE 0.989 17.000 0.110 NA Y NA
 1080004 1080005 BPEN_412 BPEN_413 holB tmk TRUE 0.996 7.000 0.211 1.000 N NA
 1080005 1080006 BPEN_413 BPEN_414 tmk pabC FALSE 0.007 372.000 0.002 1.000 N NA
 1080006 1080007 BPEN_414 BPEN_415 pabC acpP FALSE 0.020 620.000 0.008 1.000 N NA
 1080007 1080008 BPEN_415 BPEN_416 acpP fabG TRUE 0.969 129.000 0.321 0.018 Y NA
 1080008 1080009 BPEN_416 BPEN_417 fabG fabD TRUE 0.999 30.000 0.432 0.018 Y NA
 1080009 1080010 BPEN_417 BPEN_418 fabD fabH TRUE 0.995 24.000 0.182 0.018 Y NA
 1080010 1080011 BPEN_418 BPEN_419 fabH plsX TRUE 0.999 6.000 0.380 0.018 Y NA
 1080011 1080012 BPEN_419 BPEN_420 plsX rpmF TRUE 0.998 31.000 0.418 1.000 N NA
 1080012 1080013 BPEN_420 BPEN_421 rpmF rluC FALSE 0.024 897.000 0.004 1.000 Y NA
 1080014 1080015 BPEN_422 BPEN_423 rne lpxL FALSE 0.006 406.000 0.000 1.000 N NA
 1080015 1080016 BPEN_423 BPEN_424 lpxL ybiS FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   NA
 1080017 1080018 BPEN_425 BPEN_426     TRUE 0.385 15.000 0.000 NA   NA
 1080018 1080019 BPEN_426 BPEN_427   pgsA FALSE 0.001 428.000 0.000 NA   NA
 1080022 1080023 BPEN_430 BPEN_431 yccK yccV FALSE 0.005 208.000 0.000 NA   NA
 1080023 1080024 BPEN_431 BPEN_432 yccV fabA FALSE 0.002 835.000 0.000 NA   NA
 1080024 1080025 BPEN_432 BPEN_433 fabA asnS FALSE 0.011 346.000 0.000 0.097 N NA
 1080025 1080026 BPEN_433 BPEN_434 asnS aspC FALSE 0.042 219.000 0.005 1.000 N NA
 1080027 1080028 BPEN_435 BPEN_436 ycbL fabI FALSE 0.004 256.000 0.000 1.000   NA
 1080029 1080030 BPEN_437 BPEN_438 ribA trpE FALSE 0.021 3040.000 0.000 1.000 Y NA
 1080030 1080031 BPEN_438 BPEN_439 trpE trpG TRUE 1.000 3.000 0.703 0.003 Y NA
 1080031 1080032 BPEN_439 BPEN_440 trpG trpD TRUE 0.989 2.000 0.083 1.000 Y NA
 1080032 1080033 BPEN_440 BPEN_441 trpD trpC TRUE 0.998 -22.000 0.293 1.000 Y NA
 1080033 1080034 BPEN_441 BPEN_442 trpC trpB TRUE 0.995 43.000 0.221 0.005 Y NA
 1080034 1080035 BPEN_442 BPEN_443 trpB trpA TRUE 1.000 3.000 0.947 0.003 Y NA
 1080035 1080036 BPEN_443 BPEN_444 trpA yciC FALSE 0.033 455.000 0.026 NA   NA
 1080040 1080041 BPEN_448 BPEN_449 hns xthA FALSE 0.010 1959.000 0.000 0.037   NA
 1080041 1080042 BPEN_449 BPEN_450 xthA sppA FALSE 0.078 205.000 0.006 1.000 N NA
 1080042 1080043 BPEN_450 BPEN_451 sppA gapA FALSE 0.011 378.000 0.004 1.000 N NA
 1080043 1080044 BPEN_451 BPEN_452 gapA dsbB FALSE 0.006 519.000 0.000 1.000 N NA
 1080044 1080045 BPEN_452 BPEN_453 dsbB minC FALSE 0.007 704.000 0.000 1.000 N NA
 1080045 1080046 BPEN_453 BPEN_454 minC minD TRUE 0.999 26.000 0.466 1.000 Y NA
 1080046 1080047 BPEN_454 BPEN_455 minD minE TRUE 0.999 8.000 0.618 NA Y NA
 1080051 1080052 BPEN_459 BPEN_460 manX manY TRUE 0.947 76.000 0.106 0.008 Y NA
 1080052 1080053 BPEN_460 BPEN_461 manY manZ TRUE 1.000 27.000 0.939 0.008 Y NA
 1080054 1080055 BPEN_462 BPEN_463 cspC htpX FALSE 0.006 609.000 0.000 1.000 N NA
 1080055 1080056 BPEN_463 BPEN_464 htpX zwf FALSE 0.088 232.000 0.014 1.000 N NA
 1080058 1080059 BPEN_466 BPEN_467 yebA aspS FALSE 0.003 291.000 0.000 1.000   NA
 1080062 1080063 BPEN_470 BPEN_471 yceL   FALSE 0.005 208.000 0.000 NA   NA
 1080063 1080064 BPEN_471 BPEN_472     FALSE 0.001 448.000 0.000 NA   NA
 1080064 1080065 BPEN_472 BPEN_473     FALSE 0.002 282.000 0.000 NA   NA
 1080066 1080067 BPEN_474 BPEN_475 gutQ yeeX FALSE 0.001 494.000 0.000 NA   NA
 1080068 1080069 BPEN_476 BPEN_477 sbcB hisG FALSE 0.006 520.000 0.000 1.000 N NA
 1080069 1080070 BPEN_477 BPEN_478 hisG hisD TRUE 0.996 5.000 0.171 0.014 Y NA
 1080070 1080071 BPEN_478 BPEN_479 hisD hisC TRUE 0.998 -22.000 0.294 0.014 Y NA
 1080071 1080072 BPEN_479 BPEN_480 hisC hisB TRUE 0.999 17.000 0.341 0.014 Y NA
 1080072 1080073 BPEN_480 BPEN_481 hisB hisH TRUE 0.994 -3.000 0.128 0.014 Y NA
 1080073 1080074 BPEN_481 BPEN_482 hisH hisA TRUE 0.998 4.000 0.210 0.014 Y NA
 1080074 1080075 BPEN_482 BPEN_483 hisA hisF TRUE 0.999 -18.000 0.433 0.014 Y NA
 1080075 1080076 BPEN_483 BPEN_484 hisF hisI TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.014 Y NA
 1080080 1080081 BPEN_488 BPEN_489 rplY   FALSE 0.002 322.000 0.000 NA   NA
 1080082 1080083 BPEN_490 BPEN_491 ddlA omp TRUE 0.534 89.000 0.004 1.000 Y NA
 1080083 1080084 BPEN_491 BPEN_492 omp gyrA FALSE 0.007 704.000 0.000 1.000 N NA
 1080085 1080086 BPEN_493 BPEN_494 ubiG nrdA FALSE 0.006 384.000 0.000 1.000 N NA
 1080086 1080087 BPEN_494 BPEN_495 nrdA nrdB TRUE 0.995 57.000 0.286 0.003 Y NA
 1080087 1080088 BPEN_495 BPEN_496 nrdB yfaE TRUE 0.975 -25.000 0.046 1.000 N NA
 1080089 1080090 BPEN_497 BPEN_498 nuoN nuoM TRUE 0.999 34.000 0.437 0.006 Y NA
 1080090 1080091 BPEN_498 BPEN_499 nuoM nuoL TRUE 0.997 84.000 0.713 0.006 Y NA
 1080091 1080092 BPEN_499 BPEN_500 nuoL nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.021 Y NA
 1080092 1080093 BPEN_500 BPEN_501 nuoK nuoJ TRUE 0.998 -3.000 0.269 0.009 Y NA
 1080093 1080094 BPEN_501 BPEN_502 nuoJ nuoI TRUE 0.998 34.000 0.428 0.021 Y NA
 1080094 1080095 BPEN_502 BPEN_503 nuoI nuoH TRUE 0.999 25.000 0.423 0.021 Y NA
 1080095 1080096 BPEN_503 BPEN_504 nuoH nuoG TRUE 1.000 0.000 0.664 0.021 Y NA
 1080096 1080097 BPEN_504 BPEN_505 nuoG nuoF TRUE 0.928 117.000 0.180 0.021 Y NA
 1080097 1080098 BPEN_505 BPEN_506 nuoF nuoE TRUE 0.997 -3.000 0.186 0.017 Y NA
 1080098 1080099 BPEN_506 BPEN_507 nuoE nuoCD TRUE 0.999 14.000 0.407 0.017 Y NA
 1080099 1080100 BPEN_507 BPEN_508 nuoCD nuoB TRUE 0.999 38.000 0.691 0.009 Y NA
 1080100 1080101 BPEN_508 BPEN_509 nuoB nuoA TRUE 0.999 6.000 0.377 0.009 Y NA
 1080101 1080102 BPEN_509 BPEN_510 nuoA folC FALSE 0.007 665.000 0.000 1.000 N NA
 1080102 1080103 BPEN_510 BPEN_511 folC accD TRUE 0.993 67.000 0.383 1.000 N NA
 1080103 1080104 BPEN_511 BPEN_512 accD truA FALSE 0.068 351.000 0.044 1.000 N NA
 1080104 1080105 BPEN_512 BPEN_513 truA pdxB FALSE 0.012 517.000 0.005 1.000 N NA
 1080105 1080106 BPEN_513 BPEN_514 pdxB fabB TRUE 0.246 223.000 0.069 1.000 N NA
 1080107 1080108 BPEN_515 BPEN_516 yfcB aroC TRUE 0.979 25.000 0.081 1.000 N NA
 1080108 1080109 BPEN_516 BPEN_517 aroC   FALSE 0.002 309.000 0.000 NA   NA
 1080112 1080113 BPEN_520 BPEN_521   gltX FALSE 0.010 181.000 0.000 NA   NA
 1080114 1080115 BPEN_522 BPEN_523     TRUE 0.333 25.000 0.000 NA   NA
 1080117 1080118 BPEN_525 BPEN_526 cysK ptsH FALSE 0.038 386.000 0.019 1.000 N NA
 1080118 1080119 BPEN_526 BPEN_527 ptsH ptsI TRUE 0.943 66.000 0.055 0.003 Y NA
 1080120 1080121 BPEN_528 BPEN_529 cysA cysW TRUE 0.995 22.000 0.180 0.022 Y NA
 1080121 1080122 BPEN_529 BPEN_530 cysW cysU TRUE 0.999 0.000 0.583 0.003 N NA
 1080122 1080123 BPEN_530 BPEN_531 cysU cysP TRUE 0.999 0.000 0.479 0.003 N NA
 1080124 1080125 BPEN_532 BPEN_533 talA tktA TRUE 0.769 113.000 0.087 1.000   NA
 1080125 1080126 BPEN_533 BPEN_534 tktA dapE TRUE 0.237 179.000 0.015 1.000 N NA
 1080127 1080128 BPEN_535 BPEN_536   dapA TRUE 0.996 21.000 0.267 NA   NA
 1080132 1080133 BPEN_540 BPEN_541 ureG ureF TRUE 0.996 81.000 0.550 0.009 Y NA
 1080133 1080134 BPEN_541 BPEN_542 ureF ureC FALSE 0.013 471.000 0.000 0.009 N NA
 1080134 1080135 BPEN_542 BPEN_543 ureC ureB TRUE 0.999 3.000 0.486 0.005 Y NA
 1080135 1080136 BPEN_543 BPEN_544 ureB ureA TRUE 0.999 28.000 0.595 0.005 Y NA
 1080136 1080137 BPEN_544 BPEN_545 ureA ureD TRUE 1.000 14.000 0.664 0.009 N NA
 1080137 1080138 BPEN_545 BPEN_546 ureD guaA FALSE 0.006 390.000 0.000 1.000 N NA
 1080138 1080139 BPEN_546 BPEN_547 guaA guaB TRUE 0.904 144.000 0.190 0.003 Y NA
 1080141 1080142 BPEN_549 BPEN_550 engA hisS FALSE 0.002 321.000 0.000 1.000   NA
 1080142 1080143 BPEN_550 BPEN_551 hisS ispG TRUE 0.996 14.000 0.207 1.000 N NA
 1080143 1080144 BPEN_551 BPEN_552 ispG yfgB FALSE 0.046 221.000 0.004 0.011   NA
 1080144 1080145 BPEN_552 BPEN_553 yfgB ndk TRUE 0.501 206.000 0.156 1.000   NA
 1080145 1080146 BPEN_553 BPEN_554 ndk nifS FALSE 0.015 539.000 0.006 1.000 N NA
 1080148 1080149 BPEN_556 BPEN_557 glyA tadA FALSE 0.009 300.000 0.000 1.000 N NA
 1080149 1080150 BPEN_557 BPEN_558 tadA acpS TRUE 0.298 143.000 0.010 1.000 N NA
 1080150 1080151 BPEN_558 BPEN_559 acpS pdxJ TRUE 0.998 3.000 0.326 1.000 N NA
 1080151 1080152 BPEN_559 BPEN_560 pdxJ rnc FALSE 0.012 645.000 0.004 1.000 N NA
 1080152 1080153 BPEN_560 BPEN_561 rnc lepB TRUE 0.802 127.000 0.117 1.000 N NA
 1080153 1080154 BPEN_561 BPEN_562 lepB lepA TRUE 0.994 19.000 0.187 1.000 N NA
 1080157 1080158 BPEN_565 BPEN_566 yfjB smpA TRUE 0.500 96.000 0.008 1.000 N NA
 1080160 1080161 BPEN_568 BPEN_569 smpB tmRNA FALSE 0.174 55.000 0.000 NA   NA
 1080161 1080162 BPEN_569 BPEN_570 tmRNA emrE FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   NA
 1080162 1080163 BPEN_570 BPEN_571 emrE pssA FALSE 0.006 511.000 0.000 1.000 N NA
 1080164 1080165 BPEN_574 BPEN_573 rrs   FALSE 0.002 315.000 0.000 NA   NA
 1080165 1080166 BPEN_573 BPEN_572   rrl FALSE 0.041 111.000 0.000 NA   NA
 1080168 1080169 BPEN_576 BPEN_577 rpoC rpoB TRUE 0.998 89.000 0.851 0.003 Y NA
 1080169 1080170 BPEN_577 BPEN_578 rpoB rplL TRUE 0.523 256.000 0.223 1.000 N NA
 1080170 1080171 BPEN_578 BPEN_579 rplL rplJ TRUE 0.997 94.000 0.884 1.000 Y NA
 1080171 1080172 BPEN_579 BPEN_580 rplJ rplA TRUE 0.520 349.000 0.302 1.000 Y NA
 1080172 1080173 BPEN_580 BPEN_581 rplA rplK TRUE 1.000 6.000 0.838 0.081 Y NA
 1080173 1080174 BPEN_581 BPEN_582 rplK nusG TRUE 0.989 128.000 0.681 1.000 N NA
 1080174 1080175 BPEN_582 BPEN_583 nusG secE TRUE 1.000 2.000 0.843 1.000 N NA
 1080175 1080176 BPEN_583 BPEN_584 secE tuf TRUE 0.632 70.000 0.006 1.000 N NA
 1080176 1080177 BPEN_584 BPEN_585 tuf fusA TRUE 0.882 62.000 0.011 0.003 Y NA
 1080177 1080178 BPEN_585 BPEN_586 fusA rpsG TRUE 0.988 124.000 0.579 1.000 Y NA
 1080178 1080179 BPEN_586 BPEN_587 rpsG rpsL TRUE 0.984 152.000 0.620 0.012 Y NA
 1080179 1080180 BPEN_587 BPEN_588 rpsL pabA FALSE 0.009 1779.000 0.000 1.000 N NA
 1080180 1080181 BPEN_588 BPEN_589 pabA trpS FALSE 0.030 383.000 0.013 1.000 N NA
 1080181 1080182 BPEN_589 BPEN_590 trpS rpe FALSE 0.099 237.000 0.022 1.000 N NA
 1080182 1080183 BPEN_590 BPEN_591 rpe aroB FALSE 0.009 399.000 0.003 1.000 N NA
 1080183 1080184 BPEN_591 BPEN_592 aroB aroK TRUE 0.990 55.000 0.208 1.000 Y NA
 1080188 1080189 BPEN_596 BPEN_597 yigL corA FALSE 0.002 366.000 0.000 1.000   NA
 1080189 1080190 BPEN_597 BPEN_598 corA uvrD FALSE 0.001 488.000 0.000 NA   NA
 1080190 1080191 BPEN_598 BPEN_599 uvrD yigB FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1080191 1080192 BPEN_599 BPEN_600 yigB dapF FALSE 0.064 174.000 0.004 1.000   NA
 1080193 1080194 BPEN_601 BPEN_602 hemC hemD TRUE 0.993 47.000 0.205 0.003 Y NA
 1080195 1080196 BPEN_603 BPEN_604     FALSE 0.039 113.000 0.000 NA   NA
 1080196 1080197 BPEN_604 BPEN_605     TRUE 0.360 21.000 0.000 NA   NA
 1080197 1080198 BPEN_605 BPEN_606     TRUE 0.216 45.000 0.000 NA   NA
 1080198 1080199 BPEN_606 BPEN_607   rho FALSE 0.001 584.000 0.000 NA   NA
 1080199 1080200 BPEN_607 BPEN_608 rho trxA FALSE 0.083 442.000 0.087 1.000   NA
 1080200 1080201 BPEN_608 BPEN_609 trxA ilvC FALSE 0.005 236.000 0.000 1.000   NA
 1080201 1080202 BPEN_609 BPEN_610 ilvC ilvA TRUE 0.697 61.000 0.003 1.000 Y NA
 1080202 1080203 BPEN_610 BPEN_611 ilvA ilvD TRUE 0.990 9.000 0.106 1.000 Y NA
 1080203 1080204 BPEN_611 BPEN_612 ilvD ilvE TRUE 0.928 73.000 0.075 1.000 Y NA
 1080204 1080205 BPEN_612 BPEN_613 ilvE ilvM TRUE 0.980 61.000 0.205 1.000   NA
 1080205 1080206 BPEN_613 BPEN_614 ilvM ilvG TRUE 1.000 2.000 0.943 0.003   NA
 1080206 1080207 BPEN_614 BPEN_615 ilvG   FALSE 0.002 1212.000 0.000 NA   NA
 1080207 1080208 BPEN_615 BPEN_616     TRUE 0.360 21.000 0.000 NA   NA
 1080208 1080209 BPEN_616 BPEN_617     FALSE 0.022 141.000 0.000 NA   NA
 1080209 1080210 BPEN_617 BPEN_618   murI FALSE 0.001 484.000 0.000 NA   NA
 1080210 1080211 BPEN_618 BPEN_619 murI metF FALSE 0.006 442.000 0.000 1.000 N NA
 1080211 1080212 BPEN_619 BPEN_620 metF metB FALSE 0.025 412.000 0.007 1.000 Y NA
 1080212 1080213 BPEN_620 BPEN_621 metB rpmE FALSE 0.010 284.000 0.000 1.000 N NA
 1080214 1080215 BPEN_622 BPEN_623 fpr tpiA FALSE 0.057 232.000 0.008 1.000 N NA
 1080216 1080217 BPEN_624 BPEN_625 pfkA cysE FALSE 0.007 720.000 0.000 1.000 N NA
 1080217 1080218 BPEN_625 BPEN_626 cysE gpsA TRUE 0.996 51.000 0.429 1.000 N NA
 1080218 1080219 BPEN_626 BPEN_627 gpsA secB TRUE 0.994 31.000 0.206 1.000 N NA
 1080219 1080220 BPEN_627 BPEN_628 secB grxC TRUE 0.608 41.000 0.000 1.000 N NA
 1080220 1080221 BPEN_628 BPEN_629 grxC yibN TRUE 0.755 13.000 0.000 NA N NA
 1080222 1080223 BPEN_630 BPEN_631 hldD rfaF TRUE 0.992 19.000 0.146 1.000 Y NA
 1080223 1080224 BPEN_631 BPEN_632 rfaF rfaC TRUE 0.997 22.000 0.205 0.005 Y NA
 1080224 1080225 BPEN_632 BPEN_633 rfaC kdtA FALSE 0.092 1892.000 0.028 1.000 Y NA
 1080225 1080226 BPEN_633 BPEN_634 kdtA coaD FALSE 0.049 730.000 0.020 1.000 N NA
 1080227 1080228 BPEN_635 BPEN_636 rpmG rpmB TRUE 0.998 25.000 0.332 0.060 Y NA
 1080229 1080230 BPEN_637 BPEN_638 dfp dut TRUE 0.996 -13.000 0.201 1.000 N NA
 1080230 1080231 BPEN_638 BPEN_639 dut yicC FALSE 0.001 728.000 0.000 NA   NA
 1080231 1080232 BPEN_639 BPEN_640 yicC   FALSE 0.002 1003.000 0.000 NA   NA
 1080232 1080233 BPEN_640 BPEN_641   gmk FALSE 0.009 305.000 0.000 1.000 N NA
 1080233 1080234 BPEN_641 BPEN_642 gmk rpoZ TRUE 0.987 97.000 0.471 1.000 N NA
 1080234 1080235 BPEN_642 BPEN_643 rpoZ glnA FALSE 0.008 760.000 0.000 1.000 N NA
 1080235 1080236 BPEN_643 BPEN_644 glnA yihA FALSE 0.012 193.000 0.000 1.000   NA
 1080237 1080238 BPEN_645 BPEN_646 polA dsbA FALSE 0.011 195.000 0.000 1.000   NA
 1080238 1080239 BPEN_646 BPEN_647 dsbA ubiD FALSE 0.001 627.000 0.000 NA   NA
 1080239 1080240 BPEN_647 BPEN_648 ubiD ubiB FALSE 0.034 208.000 0.005 NA   NA
 1080240 1080241 BPEN_648 BPEN_649 ubiB ubiE FALSE 0.111 590.000 0.115 1.000   NA
 1080241 1080242 BPEN_649 BPEN_650 ubiE yigN TRUE 0.696 107.000 0.047 NA   NA
 1080242 1080243 BPEN_650 BPEN_651 yigN udp FALSE 0.104 244.000 0.041 NA   NA
 1080243 1080244 BPEN_651 BPEN_652 udp metE FALSE 0.026 233.000 0.004 1.000 N NA
 1080244 1080245 BPEN_652 BPEN_653 metE rpoH FALSE 0.017 304.000 0.000 0.023 N NA
 1080245 1080246 BPEN_653 BPEN_654 rpoH ftsY FALSE 0.020 608.000 0.008 1.000 N NA
 1080248 1080249 BPEN_656 BPEN_657 pgi metA FALSE 0.006 481.000 0.000 1.000 N NA
 1080250 1079593 BPEN_658 BPEN_001   gidA FALSE 0.001 630.000 0.000 NA   NA