MicrobesOnline Operon Predictions for Photorhabdus asymbiotica

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6849795 6849796 PAU_00001 PAU_00002 dnaA dnaN TRUE 0.997 5.000 0.328 1.000 Y NA
 6849796 6849797 PAU_00002 PAU_00003 dnaN recF TRUE 0.995 22.000 0.318 1.000 Y NA
 6849797 6849798 PAU_00003 PAU_00004 recF gyrB TRUE 0.996 17.000 0.249 0.005 Y NA
 6849799 6849800 PAU_00005 PAU_00006 asd ogrK FALSE 0.136 203.000 0.000 1.000   NA
 6849800 6849801 PAU_00006 PAU_00007 ogrK   TRUE 0.918 76.000 0.500 NA   NA
 6849801 6849802 PAU_00007 PAU_00008     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6849802 6849803 PAU_00008 PAU_00009     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6849803 6849804 PAU_00009 PAU_00010     FALSE 0.333 115.000 0.000 NA   NA
 6849804 6849805 PAU_00010 PAU_00011     TRUE 0.985 27.000 0.400 NA   NA
 6849805 6849806 PAU_00011 PAU_00012     TRUE 0.997 11.000 0.667 NA   NA
 6849808 6849809 PAU_00014 PAU_00015 tfaE stfE TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6849809 6849810 PAU_00015 PAU_00016 stfE   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6849810 6849811 PAU_00016 PAU_00017     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6849811 6849812 PAU_00017 PAU_00018     TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 6849812 6849813 PAU_00018 PAU_00019     TRUE 0.997 5.000 0.667 NA   NA
 6849813 6849814 PAU_00019 PAU_00020     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6849814 6849815 PAU_00020 PAU_00021     FALSE 0.055 291.000 0.000 NA   NA
 6849815 6849816 PAU_00021 PAU_00022     FALSE 0.222 154.000 0.000 NA   NA
 6849816 6849817 PAU_00022 PAU_00023   rlsC FALSE 0.060 281.000 0.000 NA   NA
 6849820 6849821 PAU_00026 PAU_00027     TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6849822 6849823 PAU_00028 PAU_00029   Sc/SvP TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6849823 6849824 PAU_00029 PAU_00030 Sc/SvP rpmJ FALSE 0.033 377.000 0.000 NA   NA
 6849824 6849825 PAU_00030 PAU_00031 rpmJ rpmE2 TRUE 0.956 18.000 0.000 0.015   NA
 6849827 6849828 PAU_00033 PAU_00034 glmS glmU TRUE 0.699 110.000 0.055 1.000 Y NA
 6849828 6849829 PAU_00034 PAU_00035 glmU atpC FALSE 0.241 131.000 0.067 1.000 N NA
 6849829 6849830 PAU_00035 PAU_00036 atpC atpD TRUE 0.999 22.000 0.837 0.004 Y NA
 6849830 6849831 PAU_00036 PAU_00037 atpD atpG TRUE 0.998 35.000 0.724 0.004 Y NA
 6849831 6849832 PAU_00037 PAU_00038 atpG atpA TRUE 0.994 59.000 0.846 0.004 Y NA
 6849832 6849833 PAU_00038 PAU_00039 atpA atpH TRUE 0.999 15.000 0.864 0.004 Y NA
 6849833 6849834 PAU_00039 PAU_00040 atpH atpF TRUE 0.997 13.000 0.242 0.004 Y NA
 6849834 6849835 PAU_00040 PAU_00041 atpF atpE TRUE 0.992 57.000 0.666 0.004 Y NA
 6849835 6849836 PAU_00041 PAU_00042 atpE atpB TRUE 0.992 49.000 0.557 0.004 Y NA
 6849836 6849837 PAU_00042 PAU_00043 atpB atpI TRUE 0.990 31.000 0.291 1.000 Y NA
 6849837 6849838 PAU_00043 PAU_00044 atpI gidB FALSE 0.003 610.000 0.005 1.000 N NA
 6849838 6849839 PAU_00044 PAU_00045 gidB gidA TRUE 0.985 -7.000 0.466 1.000 N NA
 6849839 6849840 PAU_00045 PAU_00046 gidA mioC FALSE 0.016 379.000 0.000 1.000 N NA
 6849840 6849841 PAU_00046 PAU_00047 mioC asnC TRUE 0.655 71.000 0.165 1.000 N NA
 6849843 6849844 PAU_00049 PAU_00050 viaA ravA TRUE 0.995 5.000 0.443 NA   NA
 6849845 6849846 PAU_00051 PAU_00052 rbsD rbsA TRUE 0.997 8.000 0.337 1.000 Y NA
 6849846 6849847 PAU_00052 PAU_00053 rbsA rbsC TRUE 0.999 7.000 0.504 0.001 Y NA
 6849847 6849848 PAU_00053 PAU_00054 rbsC rbsB TRUE 0.998 25.000 0.847 NA Y NA
 6849848 6849849 PAU_00054 PAU_00055 rbsB rbsK TRUE 0.827 172.000 0.347 NA Y NA
 6849849 6849850 PAU_00055 PAU_00056 rbsK rbsR TRUE 0.994 3.000 0.500 1.000 N NA
 6849851 6849852 PAU_00057 PAU_00058 yieO   FALSE 0.181 171.000 0.000 NA   NA
 6849853 6849854 PAU_00407n PAU_t001 16S_rRNA   FALSE 0.288 131.000 0.000 NA   NA
 6849854 6849855 PAU_t001 PAU_00407g   23S_rRNA FALSE 0.008 833.000 0.000 NA   NA
 6849855 6849856 PAU_00407g PAU_r001 23S_rRNA   FALSE 0.271 136.000 0.000 NA   NA
 6849857 6849858 PAU_00059 PAU_00060 yhbX actP FALSE 0.252 149.000 0.000 1.000   NA
 6849858 10702227 PAU_00060 PAU_00060a actP   TRUE 0.768 -53.000 0.000 NA   NA
 10702227 6849859 PAU_00060a PAU_00061   yjcH TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6849859 6849860 PAU_00061 PAU_00062 yjcH acs TRUE 0.756 66.000 0.147 NA   NA
 6849861 6849862 PAU_00063 PAU_00064 sodA yiiM TRUE 0.567 118.000 0.129 1.000   NA
 6849863 6849864 PAU_00065 PAU_00066 orf2 trpS FALSE 0.253 142.000 0.000 NA   NA
 6849864 6849865 PAU_00066 PAU_00067 trpS gph TRUE 0.977 5.000 0.118 1.000   NA
 6849865 6849866 PAU_00067 PAU_00068 gph rpe TRUE 0.936 -10.000 0.120 1.000   NA
 6849866 6849867 PAU_00068 PAU_00069 rpe dam TRUE 0.473 51.000 0.040 1.000 N NA
 6849867 6849868 PAU_00069 PAU_00070 dam damX TRUE 0.790 85.000 0.234 NA   NA
 6849868 6849869 PAU_00070 PAU_00071 damX aroB FALSE 0.267 122.000 0.022 NA   NA
 6849869 6849870 PAU_00071 PAU_00072 aroB aroK TRUE 0.966 47.000 0.208 1.000 Y NA
 6849870 6849871 PAU_00072 PAU_00073 aroK hofQ FALSE 0.219 370.000 0.319 1.000   NA
 6849871 6849872 PAU_00073 PAU_00074 hofQ   TRUE 0.836 -7.000 0.009 NA   NA
 6849872 6849873 PAU_00074 PAU_00075   yrfC TRUE 0.947 -13.000 0.174 NA   NA
 6849873 6849874 PAU_00075 PAU_00076 yrfC yrfD TRUE 0.998 -3.000 0.870 NA   NA
 6849877 6849878 PAU_00079 PAU_00080 yrfF yrfF TRUE 0.979 0.000 0.080 0.020   NA
 6849878 6849879 PAU_00080 PAU_00081 yrfF hslR TRUE 0.525 57.000 0.010 1.000   NA
 6849879 6849880 PAU_00081 PAU_00082 hslR hslO TRUE 0.920 27.000 0.140 1.000 N NA
 6849880 6849881 PAU_00082 PAU_00083 hslO pckA FALSE 0.064 216.000 0.048 1.000 N NA
 6849882 6849883 PAU_00084 PAU_00085 yhhW yhhW TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6849883 6849884 PAU_00085 PAU_s001 yhhW   FALSE 0.316 122.000 0.000 NA   NA
 6849885 6849886 PAU_00086 PAU_00087     TRUE 0.996 0.000 0.206 1.000 Y NA
 6849886 6849887 PAU_00087 PAU_00088     TRUE 0.755 101.000 0.235 NA   NA
 6849887 6849888 PAU_00088 PAU_00089     FALSE 0.009 773.000 0.000 NA   NA
 6849888 6849889 PAU_00089 PAU_00090     TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6849889 6849890 PAU_00090 PAU_00091   pulA FALSE 0.343 111.000 0.000 NA   NA
 6849890 6849891 PAU_00091 PAU_00092 pulA cynS FALSE 0.020 334.000 0.000 1.000 N NA
 6849892 6849893 PAU_00093 PAU_00094     TRUE 0.971 27.000 0.312 1.000 N NA
 6849894 6849895 PAU_00095 PAU_00096     TRUE 0.812 -18.000 0.000 NA   NA
 6849895 6849896 PAU_00096 PAU_00097     FALSE 0.049 309.000 0.000 NA   NA
 6849901 6849902 PAU_00102 PAU_00103     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6849903 6849904 PAU_00104 PAU_00105   uspA FALSE 0.008 813.000 0.000 NA   NA
 6849904 6849905 PAU_00105 PAU_00106 uspA gdhA FALSE 0.035 258.000 0.000 1.000 N NA
 6849906 6849907 PAU_00107 PAU_00108 yhiQ opdA TRUE 0.972 6.000 0.098 NA   NA
 6849908 6849909 PAU_t002 PAU_00109     FALSE 0.017 539.000 0.000 NA   NA
 6849909 6849910 PAU_00109 PAU_00110   cipB FALSE 0.007 928.000 0.000 NA   NA
 6849910 6849911 PAU_00110 PAU_00111 cipB   FALSE 0.012 642.000 0.000 NA   NA
 6849911 6849912 PAU_00111 PAU_00112     TRUE 0.895 9.000 0.000 1.000 N NA
 6849912 6849913 PAU_00112 PAU_00113     TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6849913 6849914 PAU_00113 PAU_00114     FALSE 0.049 309.000 0.000 NA   NA
 6849914 6849915 PAU_00114 PAU_00115     FALSE 0.114 216.000 0.000 1.000   NA
 6849915 6849916 PAU_00115 PAU_00116     TRUE 0.401 221.000 0.000 0.003 Y NA
 6849916 6849917 PAU_00116 PAU_00117     FALSE 0.266 290.000 0.000 0.003 Y NA
 6849917 6849918 PAU_00117 PAU_00118     TRUE 0.678 140.000 0.000 0.003 Y NA
 6849918 6849919 PAU_00118 PAU_00119     FALSE 0.008 519.000 0.000 1.000 N NA
 6849920 6849921 PAU_00120 PAU_00121 uxuA uxuR FALSE 0.276 90.000 0.047 1.000 N NA
 6849921 6849922 PAU_00121 PAU_00122 uxuR   TRUE 0.677 81.000 0.200 1.000 N NA
 6849923 6849924 PAU_00123 PAU_00124   ygiK TRUE 0.996 28.000 0.588 NA Y NA
 6849924 6849925 PAU_00124 PAU_00125 ygiK uxuB TRUE 0.992 39.000 0.471 1.000 Y NA
 6849925 6849926 PAU_00125 PAU_00126 uxuB uxaC TRUE 0.998 22.000 0.647 1.000 Y NA
 6849926 6849927 PAU_00126 PAU_00127 uxaC kdgK TRUE 0.993 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 6849927 6849928 PAU_00127 PAU_00128 kdgK eda TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 6849928 6849929 PAU_00128 PAU_00129 eda   FALSE 0.320 121.000 0.000 NA   NA
 6849932 6849933 PAU_00132 PAU_00133   glpD FALSE 0.042 332.000 0.000 NA   NA
 6849933 6849934 PAU_00133 PAU_00134 glpD glpR FALSE 0.045 356.000 0.104 1.000 N NA
 6849934 6849935 PAU_00134 PAU_00135 glpR glpG TRUE 0.982 17.000 0.190 1.000   NA
 6849935 6849936 PAU_00135 PAU_00136 glpG glpE TRUE 0.875 95.000 0.405 1.000   NA
 6849936 6849937 PAU_00136 PAU_00137 glpE gntY FALSE 0.364 96.000 0.025 1.000   NA
 6849937 6849938 PAU_00137 PAU_00138 gntY gntX TRUE 0.670 60.000 0.066 1.000   NA
 6849938 6849939 PAU_00138 PAU_00139 gntX OSJNAa0079B05.15 TRUE 0.789 -25.000 0.000 NA   NA
 6849941 6849942 PAU_00141 PAU_00142 spnH   TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6849942 6849943 PAU_00142 PAU_00143     TRUE 0.879 11.000 0.000 NA N NA
 6849943 6849944 PAU_00143 PAU_00144     TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6849944 6849945 PAU_00144 PAU_00145     FALSE 0.375 99.000 0.000 NA   NA
 6849948 6849949 PAU_00148 PAU_00149 bioH   FALSE 0.015 598.000 0.000 1.000   NA
 6849950 6849951 PAU_00150 PAU_00151 yhgG feoB TRUE 0.995 10.000 0.455 NA   NA
 6849951 6849952 PAU_00151 PAU_00152 feoB feoA TRUE 0.926 63.000 0.177 1.000 Y NA
 6849952 6849953 PAU_00152 PAU_00153 feoA yhgF FALSE 0.041 244.000 0.000 1.000 N NA
 6849953 6849954 PAU_00153 PAU_00154 yhgF   FALSE 0.063 276.000 0.000 NA   NA
 6849954 6849955 PAU_00154 PAU_00155   greB TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6849955 6849956 PAU_00155 PAU_00156 greB   TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6849957 6849958 PAU_00157 PAU_00158   iscS TRUE 0.647 46.000 0.019 NA   NA
 6849958 6849959 PAU_00158 PAU_00159 iscS   TRUE 0.873 23.000 0.019 NA   NA
 6849959 6849960 PAU_00159 PAU_00160   ompR FALSE 0.006 1356.000 0.000 NA   NA
 6849960 6849961 PAU_00160 PAU_00161 ompR envZ TRUE 0.998 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 6849961 6849962 PAU_00161 PAU_00162 envZ pstS TRUE 0.836 13.000 0.022 1.000 N NA
 6849962 6849963 PAU_00162 PAU_00163 pstS pstC TRUE 0.628 209.000 0.145 0.002 Y NA
 6849963 6849964 PAU_00163 PAU_00164 pstC pstA TRUE 0.999 2.000 0.537 0.002 Y NA
 6849964 6849965 PAU_00164 PAU_00165 pstA pstB TRUE 0.997 27.000 0.526 0.002 Y NA
 6849965 6849966 PAU_00165 PAU_00166 pstB phoU TRUE 0.996 -3.000 0.317 NA Y NA
 6849966 6849967 PAU_00166 PAU_00167 phoU fliY FALSE 0.018 253.000 0.014 NA N NA
 6849967 6849968 PAU_00167 PAU_00168 fliY   TRUE 0.954 69.000 0.263 0.051 Y NA
 6849968 6849969 PAU_00168 PAU_00169     TRUE 0.998 2.000 0.282 0.020 Y NA
 6849969 6849970 PAU_00169 PAU_00170   yieG FALSE 0.325 119.000 0.000 NA   NA
 6849970 6849971 PAU_00170 PAU_00171 yieG   TRUE 0.438 78.000 0.000 NA   NA
 6849971 6849972 PAU_00171 PAU_00172   insK TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6849974 6849975 PAU_00174 PAU_00175 yihI hemN FALSE 0.248 194.000 0.107 NA   NA
 6849976 6849977 PAU_00176 PAU_00177   glnG FALSE 0.010 729.000 0.000 NA   NA
 6849977 6849978 PAU_00177 PAU_00178 glnG glnL TRUE 0.999 4.000 0.587 0.071 Y NA
 6849978 6849979 PAU_00178 PAU_00179 glnL glnA FALSE 0.144 158.000 0.053 1.000 N NA
 6849981 6849982 PAU_00181 PAU_00182     FALSE 0.006 889.000 0.000 0.092 N NA
 6849983 6849984 PAU_00183 PAU_00184 yihX dtd TRUE 0.456 65.000 0.010 1.000   NA
 6849984 6849985 PAU_00184 PAU_00185 dtd yiiD TRUE 0.566 72.000 0.065 1.000   NA
 6849985 6849986 PAU_00185 PAU_00186 yiiD dinJ2 FALSE 0.076 260.000 0.000 1.000   NA
 6849986 6849987 PAU_00186 PAU_00187 dinJ2 ef0033 TRUE 0.996 4.000 0.500 NA   NA
 6849991 6849992 PAU_00191 PAU_00192 gltS   FALSE 0.056 302.000 0.000 1.000   NA
 6849992 6849993 PAU_00192 PAU_00193   relB FALSE 0.181 171.000 0.000 NA   NA
 6849993 6849994 PAU_00193 PAU_00194 relB relE TRUE 0.979 -10.000 0.444 NA N NA
 6849995 6849996 PAU_00195 PAU_00196   recG FALSE 0.007 962.000 0.000 NA   NA
 6849997 6849998 PAU_00197 PAU_00198 fimB   FALSE 0.027 430.000 0.000 1.000   NA
 6849998 6849999 PAU_00198 PAU_00199   aufB TRUE 0.821 127.000 0.400 1.000   NA
 6849999 6850000 PAU_00199 PAU_00200 aufB   TRUE 0.811 38.000 0.000 1.000   NA
 6850000 6850001 PAU_00200 PAU_00201   papA TRUE 0.709 62.000 0.000 0.006   NA
 6850001 6850002 PAU_00201 PAU_00202 papA   TRUE 0.686 136.000 0.000 0.006 Y NA
 6850002 6850003 PAU_00202 PAU_00203   afaB TRUE 0.752 77.000 0.000 1.000 Y NA
 6850003 6850004 PAU_00203 PAU_00204 afaB agg3D TRUE 0.974 29.000 0.000 0.003 Y NA
 6850004 6850005 PAU_00204 PAU_00205 agg3D lpfC TRUE 0.653 117.000 0.000 1.000 Y NA
 6850005 6850006 PAU_00205 PAU_00206 lpfC   FALSE 0.239 148.000 0.000 NA   NA
 6850006 6850007 PAU_00206 PAU_00207   yheC FALSE 0.293 130.000 0.000 NA   NA
 6850007 6850008 PAU_00207 PAU_00208 yheC   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850009 6850010 PAU_00209 PAU_00210 spoT rpoZ TRUE 0.995 18.000 0.291 1.000 Y NA
 6850010 6850011 PAU_00210 PAU_00211 rpoZ gmk TRUE 0.934 55.000 0.471 1.000 N NA
 6850013 6850014 PAU_00213 PAU_00214     FALSE 0.007 907.000 0.000 NA   NA
 6850014 6850015 PAU_00214 PAU_00215     FALSE 0.008 871.000 0.000 NA   NA
 6850015 6850016 PAU_00215 PAU_00216     FALSE 0.033 380.000 0.000 NA   NA
 6850016 6850017 PAU_00216 PAU_00217     FALSE 0.012 644.000 0.000 NA   NA
 6850017 6850018 PAU_00217 PAU_00218   s045 FALSE 0.144 191.000 0.000 NA   NA
 6850018 6850019 PAU_00218 PAU_00219 s045   FALSE 0.022 454.000 0.000 NA   NA
 6850019 6850020 PAU_00219 PAU_00220     TRUE 0.950 0.000 0.043 NA   NA
 6850024 6850025 PAU_00224 PAU_00225 yidQ avtA FALSE 0.010 696.000 0.000 NA   NA
 6850025 6850026 PAU_00225 PAU_00226 avtA tag FALSE 0.004 810.000 0.000 1.000 N NA
 6850027 6850028 PAU_00227 PAU_00228 glyQ glyS TRUE 0.999 10.000 0.651 0.001 Y NA
 6850028 6850029 PAU_00228 PAU_t003 glyS   FALSE 0.152 187.000 0.000 NA   NA
 6850031 6850032 PAU_00230 PAU_00231 FNV1263 dppA FALSE 0.365 102.000 0.000 NA   NA
 6850032 6850033 PAU_00231 PAU_00232 dppA dppB TRUE 0.475 217.000 0.087 0.034 Y NA
 6850033 6850034 PAU_00232 PAU_00233 dppB dppC TRUE 0.999 12.000 0.779 0.034 Y NA
 6850034 6850035 PAU_00233 PAU_00234 dppC dppD TRUE 0.999 13.000 0.560 1.000 Y NA
 6850035 6850036 PAU_00234 PAU_00235 dppD dppF TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 6850036 6850037 PAU_00235 PAU_00236 dppF yhjK FALSE 0.101 229.000 0.000 1.000   NA
 6850037 6850038 PAU_00236 PAU_00237 yhjK yhjJ FALSE 0.372 143.000 0.083 1.000   NA
 6850038 6850039 PAU_00237 PAU_00238 yhjJ   FALSE 0.229 151.000 0.000 NA   NA
 6850040 6850041 PAU_00239 PAU_00240 ybjE   TRUE 0.934 0.000 0.021 NA   NA
 6850041 6850042 PAU_00240 PAU_00241     FALSE 0.027 413.000 0.000 NA   NA
 6850042 6850043 PAU_00241 PAU_00242     TRUE 0.640 56.000 0.043 1.000   NA
 6850044 6850045 PAU_00243 PAU_00244     TRUE 0.586 58.000 0.000 NA   NA
 6850046 10702228 PAU_00245 PAU_00245b hylA   TRUE 0.756 -89.000 0.000 NA   NA
 10702228 6850047 PAU_00245b PAU_00246   phlB TRUE 0.556 62.000 0.000 NA   NA
 6850047 6850048 PAU_00246 PAU_00247 phlB   FALSE 0.010 699.000 0.000 NA   NA
 6850048 6850049 PAU_00247 PAU_00248     FALSE 0.009 755.000 0.000 NA   NA
 6850049 6850050 PAU_00248 PAU_00249     TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6850050 6850051 PAU_00249 PAU_00250     FALSE 0.011 668.000 0.000 NA   NA
 6850051 6850052 PAU_00250 PAU_00251     TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6850053 6850054 PAU_00252 PAU_00253 sdiA1   TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6850057 6850058 PAU_00256 PAU_00257     TRUE 0.904 112.000 0.600 NA   NA
 6850058 6850059 PAU_00257 PAU_00258     FALSE 0.368 101.000 0.000 NA   NA
 6850059 6850060 PAU_00258 PAU_00259     FALSE 0.075 251.000 0.000 NA   NA
 6850060 6850061 PAU_00259 PAU_00260     TRUE 0.996 14.000 0.600 NA   NA
 6850061 6850062 PAU_00260 PAU_00261     TRUE 0.900 23.000 0.000 NA   NA
 6850062 6850063 PAU_00261 PAU_00262     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6850063 6850064 PAU_00262 PAU_00263     FALSE 0.175 173.000 0.000 NA   NA
 6850064 6850065 PAU_00263 PAU_00264     FALSE 0.053 296.000 0.000 NA   NA
 6850067 6850068 PAU_00266 PAU_00267     FALSE 0.050 308.000 0.000 NA   NA
 6850068 6850069 PAU_00267 PAU_00268     FALSE 0.035 362.000 0.000 NA   NA
 6850069 6850070 PAU_00268 PAU_00269     FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 6850070 6850071 PAU_00269 PAU_00270     FALSE 0.080 245.000 0.000 NA   NA
 6850071 6850072 PAU_00270 PAU_00271     TRUE 0.996 2.000 0.500 NA   NA
 6850072 6850073 PAU_00271 PAU_00272     TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6850073 6850074 PAU_00272 PAU_00273     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6850074 6850075 PAU_00273 PAU_00274     TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6850075 6850076 PAU_00274 PAU_00275     TRUE 0.927 53.000 0.312 NA   NA
 6850076 6850077 PAU_00275 PAU_00276     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 6850077 6850078 PAU_00276 PAU_00277     TRUE 0.918 123.000 0.711 NA   NA
 6850078 6850079 PAU_00277 PAU_00278     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850079 6850080 PAU_00278 PAU_00279     TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6850080 6850081 PAU_00279 PAU_00280     TRUE 0.995 11.000 0.471 NA   NA
 6850081 6850082 PAU_00280 PAU_00281     TRUE 0.998 0.000 0.673 NA   NA
 6850082 6850083 PAU_00281 PAU_00282     TRUE 0.998 3.000 0.765 NA   NA
 6850083 6850084 PAU_00282 PAU_00283     TRUE 0.998 0.000 0.862 NA   NA
 6850084 6850085 PAU_00283 PAU_00284     TRUE 0.996 7.000 0.510 NA   NA
 6850085 6850086 PAU_00284 PAU_00285     TRUE 0.993 36.000 0.863 NA   NA
 6850086 6850087 PAU_00285 PAU_00286     TRUE 0.997 3.000 0.552 NA   NA
 6850087 6850088 PAU_00286 PAU_00287     TRUE 0.997 7.000 0.627 NA   NA
 6850088 6850089 PAU_00287 PAU_00288     TRUE 0.996 24.000 0.821 NA   NA
 6850090 6850091 PAU_00289 PAU_00290     FALSE 0.012 663.000 0.000 NA   NA
 6850091 6850092 PAU_00290 PAU_00291   gor TRUE 0.573 96.000 0.100 1.000   NA
 6850092 6850093 PAU_00291 PAU_00292 gor   FALSE 0.194 166.000 0.000 NA   NA
 6850093 6850094 PAU_00292 PAU_00293     FALSE 0.325 119.000 0.000 NA   NA
 6850094 6850095 PAU_00293 PAU_00294     FALSE 0.027 416.000 0.000 NA   NA
 6850096 6850097 PAU_00295 PAU_00296 mobB mobA TRUE 0.991 -3.000 0.064 0.003 Y NA
 6850098 6850099 PAU_00297 PAU_00298 rdoA dsbA TRUE 0.974 9.000 0.111 NA   NA
 6850099 6850100 PAU_00298 PAU_00299 dsbA polA FALSE 0.036 378.000 0.000 1.000   NA
 6850106 6850107 PAU_00304 PAU_00305 pabA argD TRUE 0.725 122.000 0.088 1.000 Y NA
 6850110 6850111 PAU_00308 PAU_00309 prkB yheU TRUE 0.986 21.000 0.303 NA   NA
 6850111 6850112 PAU_00309 PAU_00310 yheU yheT TRUE 0.986 -3.000 0.222 NA   NA
 6850113 6850114 PAU_00311 PAU_00312     FALSE 0.046 320.000 0.000 NA   NA
 6850114 6850115 PAU_00312 PAU_00313   tauD TRUE 0.394 94.000 0.000 NA   NA
 6850116 6850117 PAU_00314 PAU_00315   yfeU TRUE 0.910 31.000 0.087 1.000   NA
 6850117 6850118 PAU_00315 PAU_00316 yfeU   TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6850121 6850122 PAU_00319 PAU_00320     TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6850122 6850123 PAU_00320 PAU_00321     TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6850123 6850124 PAU_00321 PAU_00322     TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6850124 6850125 PAU_00322 PAU_00323     TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6850125 6850126 PAU_00323 PAU_00324     TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6850126 6850127 PAU_00324 PAU_00325     FALSE 0.017 539.000 0.000 NA   NA
 6850129 6850130 PAU_00327 PAU_00328 kefG kefB TRUE 0.998 4.000 0.927 1.000   NA
 6850130 6850131 PAU_00328 PAU_00329 kefB yheV TRUE 0.994 12.000 0.400 NA   NA
 6850131 6850132 PAU_00329 PAU_00330 yheV slyD TRUE 0.910 65.000 0.370 NA   NA
 6850132 6850133 PAU_00330 PAU_00331 slyD   FALSE 0.107 215.000 0.000 NA   NA
 6850133 6850134 PAU_00331 PAU_00332     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 6850134 6850135 PAU_00332 PAU_00333   fkpA FALSE 0.007 936.000 0.000 NA   NA
 6850137 6850138 PAU_00335 PAU_00336 yheO tusD TRUE 0.989 0.000 0.220 NA   NA
 6850138 6850139 PAU_00336 PAU_00337 tusD tusC TRUE 0.999 10.000 0.790 NA Y NA
 6850139 6850140 PAU_00337 PAU_00338 tusC tusB TRUE 0.999 21.000 0.804 NA Y NA
 6850140 6850141 PAU_00338 PAU_00339 tusB rpsL TRUE 0.848 23.000 0.058 NA N NA
 6850141 6850142 PAU_00339 PAU_00340 rpsL rpsG TRUE 0.979 97.000 0.620 0.003 Y NA
 6850142 6850143 PAU_00340 PAU_00341 rpsG fusA TRUE 0.971 81.000 0.579 1.000 Y NA
 6850143 6850144 PAU_00341 PAU_00342 fusA tufA TRUE 0.821 71.000 0.003 0.001 Y NA
 6850144 6850145 PAU_00342 PAU_00343 tufA   TRUE 0.965 83.000 1.000 NA   NA
 6850145 6850146 PAU_00343 PAU_00344   secE TRUE 0.856 22.000 0.002 NA   NA
 6850146 6850147 PAU_00344 PAU_00345 secE nusG TRUE 0.998 1.000 0.843 1.000 N NA
 6850147 6850148 PAU_00345 PAU_00346 nusG rplK TRUE 0.825 155.000 0.681 1.000 N NA
 6850148 6850149 PAU_00346 PAU_00347 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.019 Y NA
 6850149 6850150 PAU_00347 PAU_00348 rplA rplJ TRUE 0.491 310.000 0.302 1.000 Y NA
 6850150 6850151 PAU_00348 PAU_00349 rplJ rplL TRUE 0.990 64.000 0.884 1.000 Y NA
 6850151 6850152 PAU_00349 PAU_00350 rplL rpoB FALSE 0.181 339.000 0.223 1.000   NA
 6850152 6850153 PAU_00350 PAU_00351 rpoB rpoC TRUE 0.988 56.000 0.851 0.001   NA
 6850153 6850154 PAU_00351 PAU_00352 rpoC   FALSE 0.012 682.000 0.000 1.000   NA
 6850154 6850155 PAU_00352 PAU_00353     TRUE 0.394 135.000 0.000 0.038   NA
 6850155 6850156 PAU_00353 PAU_00354   chpR FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 6850156 6850157 PAU_00354 PAU_00355 chpR   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6850157 6850158 PAU_00355 PAU_00356     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850158 6850159 PAU_00356 PAU_00357     FALSE 0.036 359.000 0.000 NA   NA
 6850159 6850160 PAU_00357 PAU_00358   CWF19L1 TRUE 0.943 12.000 0.000 NA   NA
 6850160 6850161 PAU_00358 PAU_00359 CWF19L1 CsdB2 TRUE 0.824 -18.000 0.000 1.000   NA
 6850161 6850162 PAU_00359 PAU_00360 CsdB2   FALSE 0.065 282.000 0.000 1.000   NA
 6850162 6850163 PAU_00360 PAU_00361     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850163 6850164 PAU_00361 PAU_00362     TRUE 0.401 91.000 0.000 NA   NA
 6850164 6850165 PAU_00362 PAU_00363   rfaB TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6850166 6850167 PAU_00364 PAU_00365 malM lamB TRUE 0.393 121.000 0.057 1.000   NA
 6850167 6850168 PAU_00365 PAU_00366 lamB malK TRUE 0.958 37.000 0.044 0.049 Y NA
 6850169 6850170 PAU_00367 PAU_00368 malE malF TRUE 0.624 127.000 0.040 1.000 Y NA
 6850170 6850171 PAU_00368 PAU_00369 malF malG TRUE 0.999 13.000 0.814 0.033 Y NA
 6850174 6850175 PAU_00372 PAU_00373     FALSE 0.173 174.000 0.000 NA   NA
 6850175 6850176 PAU_00373 PAU_00374     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850176 6850177 PAU_00374 PAU_00375     FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6850177 6850178 PAU_00375 PAU_00376   malQ FALSE 0.007 956.000 0.000 NA   NA
 6850178 6850179 PAU_00376 PAU_00377 malQ malP TRUE 0.990 10.000 0.039 0.015 Y NA
 6850179 6850180 PAU_00377 PAU_00378 malP   FALSE 0.335 114.000 0.000 NA   NA
 6850183 6850184 PAU_00381 PAU_00382 gabT   TRUE 0.996 0.000 0.227 1.000 Y NA
 6850184 6850185 PAU_00382 PAU_00383   gph TRUE 0.983 14.000 0.182 1.000   NA
 6850185 6850186 PAU_00383 PAU_00384 gph   TRUE 0.929 61.000 0.400 NA   NA
 6850186 6850187 PAU_00384 PAU_00385     TRUE 0.927 15.000 0.033 NA   NA
 6850188 6850189 PAU_00386 PAU_00387 hmu   FALSE 0.050 308.000 0.000 NA   NA
 6850189 6850190 PAU_00387 PAU_00388     FALSE 0.032 384.000 0.000 NA   NA
 6850190 6850191 PAU_00388 PAU_00389   thiH FALSE 0.011 695.000 0.000 NA   NA
 6850191 6850192 PAU_00389 PAU_00390 thiH thiG TRUE 0.997 15.000 0.277 0.004 Y NA
 6850192 6850193 PAU_00390 PAU_00391 thiG thiS TRUE 0.991 2.000 0.087 1.000 Y NA
 6850193 6850194 PAU_00391 PAU_00392 thiS thiF TRUE 0.998 -3.000 0.548 1.000 Y NA
 6850194 6850195 PAU_00392 PAU_00393 thiF thiE TRUE 0.989 -10.000 0.242 1.000 Y NA
 6850195 6850196 PAU_00393 PAU_00394 thiE thiC TRUE 0.971 -16.000 0.063 0.004 Y NA
 6850196 6850197 PAU_00394 PAU_s003 thiC   FALSE 0.347 109.000 0.000 NA   NA
 6850198 6850199 PAU_00395 PAU_00396     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850199 6850200 PAU_00396 PAU_00397   PFI0330c TRUE 0.793 -24.000 0.000 NA   NA
 6850202 6850203 PAU_00399 PAU_00400 nudC hemE FALSE 0.229 98.000 0.040 1.000 N NA
 6850203 6850204 PAU_00400 PAU_00401 hemE nfi TRUE 0.870 6.000 0.028 1.000 N NA
 6850204 6850205 PAU_00401 PAU_00402 nfi yjaG TRUE 0.572 77.000 0.086 NA   NA
 6850205 6850206 PAU_00402 PAU_00403 yjaG dbhA TRUE 0.614 187.000 0.355 NA   NA
 6850206 6850207 PAU_00403 PAU_00404 dbhA yjaH TRUE 0.994 6.000 0.375 NA   NA
 6850208 6850209 PAU_00405 PAU_00406 purD purH TRUE 0.993 22.000 0.238 1.000 Y NA
 6850210 6850211 PAU_00407 PAU_00407a pdxY 16S_rRNA FALSE 0.025 431.000 0.000 NA   NA
 6850211 6850212 PAU_00407a PAU_t004 16S_rRNA   FALSE 0.288 131.000 0.000 NA   NA
 6850212 6850213 PAU_t004 PAU_00407h   23S_rRNA FALSE 0.008 833.000 0.000 NA   NA
 6850213 6850214 PAU_00407h PAU_r002 23S_rRNA   FALSE 0.271 136.000 0.000 NA   NA
 6850217 6850218 PAU_00410 PAU_00411     FALSE 0.168 178.000 0.000 NA   NA
 6850218 6850219 PAU_00411 PAU_00412     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850219 6850220 PAU_00412 PAU_00413     TRUE 0.774 -40.000 0.000 NA   NA
 6850220 6850221 PAU_00413 PAU_00414     FALSE 0.033 377.000 0.000 NA   NA
 6850221 6850222 PAU_00414 PAU_00415     FALSE 0.100 220.000 0.000 NA   NA
 6850223 6850224 PAU_00416 PAU_00417 aceB aceA TRUE 0.890 64.000 0.118 1.000 Y NA
 6850224 6850225 PAU_00417 PAU_00418 aceA aceK TRUE 0.903 65.000 0.455 1.000 N NA
 6850225 6850226 PAU_00418 PAU_00419 aceK   FALSE 0.045 324.000 0.000 NA   NA
 6850228 6850229 PAU_00421 PAU_00422     FALSE 0.008 878.000 0.000 NA   NA
 6850229 6850230 PAU_00422 PAU_00423     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850230 6850231 PAU_00423 PAU_00424     TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6850231 6850232 PAU_00424 PAU_00425     TRUE 0.938 15.000 0.000 1.000   NA
 6850232 6850233 PAU_00425 PAU_00426     FALSE 0.245 90.000 0.040 1.000 N NA
 6850233 6850234 PAU_00426 PAU_00427     TRUE 0.902 -16.000 0.105 NA   NA
 6850234 6850235 PAU_00427 PAU_00428   orf24 FALSE 0.017 526.000 0.000 NA   NA
 6850235 6850236 PAU_00428 PAU_00429 orf24 orf23 TRUE 0.997 -3.000 0.740 NA   NA
 6850236 6850237 PAU_00429 PAU_00430 orf23 orf22 TRUE 0.998 9.000 0.779 NA   NA
 6850237 6850238 PAU_00430 PAU_00431 orf22   TRUE 0.975 42.000 0.477 NA   NA
 6850238 6850239 PAU_00431 PAU_00432   orf19 TRUE 0.992 0.000 0.310 NA   NA
 6850241 6850242 PAU_00434 PAU_00435   hipB FALSE 0.102 228.000 0.000 1.000   NA
 6850242 6850243 PAU_00435 PAU_00436 hipB hipA TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6850244 6850245 PAU_00437 PAU_00438     TRUE 0.982 5.000 0.154 NA   NA
 6850245 6850246 PAU_00438 PAU_00439     FALSE 0.012 659.000 0.000 NA   NA
 6850246 6850247 PAU_00439 PAU_00440     FALSE 0.050 306.000 0.000 NA   NA
 6850247 6850248 PAU_00440 PAU_00441     TRUE 0.788 -7.000 0.000 1.000 N NA
 6850248 6850249 PAU_00441 PAU_00442     TRUE 0.988 6.000 0.206 1.000   NA
 6850249 6850250 PAU_00442 PAU_00443     TRUE 0.986 12.000 0.189 1.000   NA
 6850251 6850252 PAU_00444 PAU_00445     TRUE 0.912 21.000 0.000 NA   NA
 6850252 6850253 PAU_00445 PAU_00446     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850253 6850254 PAU_00446 PAU_00447   hecA1 TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6850254 6850255 PAU_00447 PAU_00448 hecA1   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850255 6850256 PAU_00448 PAU_00449     FALSE 0.249 144.000 0.000 NA   NA
 6850256 6850257 PAU_00449 PAU_00450     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6850257 6850258 PAU_00450 PAU_00451   hecA2 FALSE 0.219 155.000 0.000 NA   NA
 6850258 6850259 PAU_00451 PAU_00452 hecA2   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850259 6850260 PAU_00452 PAU_00453   bacA FALSE 0.006 1372.000 0.000 NA   NA
 6850260 6850261 PAU_00453 PAU_00454 bacA   TRUE 0.872 183.000 0.500 1.000 Y NA
 6850261 6850262 PAU_00454 PAU_00455   tycC TRUE 0.736 84.000 0.000 1.000 Y NA
 6850262 6850263 PAU_00455 PAU_00456 tycC def1 FALSE 0.333 98.000 0.071 1.000 N NA
 6850263 6850264 PAU_00456 PAU_00457 def1 yjhP FALSE 0.051 220.000 0.000 1.000 N NA
 6850264 6850265 PAU_00457 PAU_00458 yjhP   FALSE 0.033 269.000 0.000 1.000 N NA
 6850267 6850268 PAU_00460 PAU_00461   pks2A FALSE 0.089 243.000 0.000 1.000   NA
 6850268 6850269 PAU_00461 PAU_00462 pks2A   FALSE 0.256 140.000 0.000 NA   NA
 6850269 6850270 PAU_00462 PAU_00463     TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6850274 6850275 PAU_00467 PAU_00468   ordL FALSE 0.231 97.000 0.000 1.000 N NA
 6850275 6850276 PAU_00468 PAU_00469 ordL   TRUE 0.579 190.000 0.333 NA   NA
 6850276 6850277 PAU_00469 PAU_00470   feaB TRUE 0.952 29.000 0.167 NA   NA
 6850277 6850278 PAU_00470 PAU_00471 feaB   FALSE 0.018 507.000 0.000 NA   NA
 6850278 6850279 PAU_00471 PAU_00472   api89 TRUE 0.396 93.000 0.000 NA   NA
 6850279 6850280 PAU_00472 PAU_00473 api89   TRUE 0.719 45.000 0.000 NA   NA
 6850280 6850281 PAU_00473 PAU_00474     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850283 6850284 PAU_00476 PAU_00477     TRUE 0.998 17.000 0.864 NA   NA
 6850284 6850285 PAU_00477 PAU_00478     FALSE 0.015 563.000 0.000 NA   NA
 6850285 6850286 PAU_00478 PAU_00479   fes FALSE 0.027 280.000 0.000 NA N NA
 6850286 6850287 PAU_00479 PAU_00480 fes phoA TRUE 0.618 106.000 0.013 NA Y NA
 6850287 6850288 PAU_00480 PAU_00481 phoA attM/aiiB FALSE 0.064 284.000 0.000 1.000   NA
 6850288 6850289 PAU_00481 PAU_00482 attM/aiiB   FALSE 0.010 737.000 0.000 1.000   NA
 6850289 6850290 PAU_00482 PAU_00483     FALSE 0.372 97.000 0.029 1.000   NA
 6850290 6850291 PAU_00483 PAU_00484     FALSE 0.323 120.000 0.000 NA   NA
 6850291 6850292 PAU_00484 PAU_00485     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6850293 6850294 PAU_t005 PAU_t006     TRUE 0.644 52.000 0.000 NA   NA
 6850294 6850295 PAU_t006 PAU_00487   rsmC FALSE 0.046 318.000 0.000 NA   NA
 6850296 6850297 PAU_00488 PAU_00489 holD rimI TRUE 0.899 -31.000 0.121 1.000   NA
 6850297 6850298 PAU_00489 PAU_00490 rimI prfC FALSE 0.256 135.000 0.026 1.000   NA
 6850298 6850299 PAU_00490 PAU_00491 prfC osmY FALSE 0.047 316.000 0.000 NA   NA
 6850299 6850300 PAU_00491 PAU_00492 osmY yjjU FALSE 0.213 182.000 0.067 NA   NA
 6850300 6850301 PAU_00492 PAU_00493 yjjU yjjV TRUE 0.957 5.000 0.057 NA   NA
 6850301 6850302 PAU_00493 PAU_00494 yjjV yeiM FALSE 0.018 290.000 0.027 NA N NA
 6850303 6850304 PAU_00495 PAU_00496     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6850304 6850305 PAU_00496 PAU_00497     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850305 6850306 PAU_00497 PAU_00498     FALSE 0.138 194.000 0.000 NA   NA
 6850306 6850307 PAU_00498 PAU_00499     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850307 6850308 PAU_00499 PAU_00500     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850308 6850309 PAU_00500 PAU_00501     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850309 6850310 PAU_00501 PAU_00502     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6850310 6850311 PAU_00502 PAU_00503     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850311 6850312 PAU_00503 PAU_00504     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850312 6850313 PAU_00504 PAU_00505     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6850313 6850314 PAU_00505 PAU_00506     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850314 6850315 PAU_00506 PAU_00507     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850315 6850316 PAU_00507 PAU_00508     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850316 6850317 PAU_00508 PAU_00509     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850317 6850318 PAU_00509 PAU_00510     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850318 6850319 PAU_00510 PAU_00511     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850319 6850320 PAU_00511 PAU_00512     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850321 6850322 PAU_00513 PAU_00514 deoC deoA TRUE 0.936 74.000 0.286 1.000 Y NA
 6850322 6850323 PAU_00514 PAU_00515 deoA deoB TRUE 0.874 68.000 0.398 1.000 N NA
 6850323 6850324 PAU_00515 PAU_00516 deoB deoD TRUE 0.855 77.000 0.414 1.000 N NA
 6850325 6850326 PAU_00517 PAU_00518   mtcB TRUE 0.991 22.000 0.133 0.022 Y NA
 6850326 6850327 PAU_00518 PAU_00519 mtcB smp FALSE 0.006 1585.000 0.000 NA   NA
 6850328 6850329 PAU_00520 PAU_00521 serB radA TRUE 0.728 25.000 0.024 1.000 N NA
 6850329 6850330 PAU_00521 PAU_00522 radA nadR TRUE 0.833 13.000 0.021 1.000 N NA
 6850330 6850331 PAU_00522 PAU_00523 nadR   FALSE 0.005 669.000 0.000 1.000 N NA
 6850333 6850334 PAU_00525 PAU_00526   slt TRUE 0.486 70.000 0.000 NA   NA
 6850334 6850335 PAU_00526 PAU_00527 slt trpR TRUE 0.757 58.000 0.167 1.000 N NA
 6850341 6850342 PAU_s004 PAU_00533   thrA TRUE 0.824 -15.000 0.000 NA   NA
 6850342 6850343 PAU_00533 PAU_00534 thrA thrB TRUE 0.993 3.000 0.133 1.000 Y NA
 6850343 6850344 PAU_00534 PAU_00535 thrB thrC TRUE 0.996 4.000 0.233 1.000 Y NA
 6850346 6850347 PAU_00537 PAU_00538   tal FALSE 0.127 201.000 0.000 NA   NA
 6850347 6850348 PAU_00538 PAU_00539 tal mog FALSE 0.260 88.000 0.042 1.000 N NA
 6850348 6850349 PAU_00539 PAU_00540 mog galT FALSE 0.142 140.000 0.000 1.000 N NA
 6850349 6850350 PAU_00540 PAU_00541 galT galK TRUE 0.927 63.000 0.370 0.001 N NA
 6850352 6850353 PAU_00543 PAU_00544 dnaK dnaJ TRUE 0.922 109.000 0.236 0.003 Y NA
 6850354 6850355 PAU_00545 PAU_00546   bglB TRUE 0.876 14.000 0.000 1.000 N NA
 6850355 6850356 PAU_00546 PAU_00547 bglB bglF TRUE 0.822 63.000 0.000 1.000 Y NA
 6850357 6850358 PAU_00548 PAU_00549 bglG bglP TRUE 0.747 115.000 0.250 1.000   NA
 6850358 6850359 PAU_00549 PAU_00550 bglP   TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6850359 6850360 PAU_00550 PAU_00551   nhaA FALSE 0.054 294.000 0.000 NA   NA
 6850360 6850361 PAU_00551 PAU_00552 nhaA nhaR TRUE 0.488 175.000 0.292 1.000 N NA
 6850363 6850364 PAU_00554 PAU_00555 ribF ileS TRUE 0.968 25.000 0.254 1.000 N NA
 6850364 6850365 PAU_00555 PAU_00556 ileS lspA TRUE 0.908 0.000 0.045 1.000 N NA
 6850365 6850366 PAU_00556 PAU_00557 lspA   TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6850366 6850367 PAU_00557 PAU_00558   fkpB TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850367 6850368 PAU_00558 PAU_00559 fkpB ispH TRUE 0.983 -19.000 0.626 1.000 N NA
 6850368 6850369 PAU_00559 PAU_00560 ispH dapB FALSE 0.105 115.000 0.009 1.000 N NA
 6850369 6850370 PAU_00560 PAU_00561 dapB carA FALSE 0.084 436.000 0.034 1.000 Y NA
 6850370 6850371 PAU_00561 PAU_00562 carA carB TRUE 0.998 16.000 0.345 0.001 Y NA
 6850374 6850375 PAU_00565 PAU_00566 apaH apaG TRUE 0.986 3.000 0.267 NA N NA
 6850375 6850376 PAU_00566 PAU_00567 apaG ksgA TRUE 0.926 13.000 0.078 NA N NA
 6850376 6850377 PAU_00567 PAU_00568 ksgA pdxA TRUE 0.955 -7.000 0.197 1.000 N NA
 6850377 6850378 PAU_00568 PAU_00569 pdxA surA TRUE 0.979 -22.000 0.561 1.000 N NA
 6850378 6850379 PAU_00569 PAU_00570 surA imp TRUE 0.698 70.000 0.182 1.000 N NA
 6850381 6850382 PAU_00572 PAU_00573 rluA rapA TRUE 0.542 162.000 0.294 1.000 N NA
 6850382 6850383 PAU_00573 PAU_00574 rapA dinA FALSE 0.243 196.000 0.098 1.000   NA
 6850383 6850384 PAU_00574 PAU_00575 dinA rsib_orf.195 FALSE 0.011 708.000 0.000 1.000   NA
 6850384 6850385 PAU_00575 PAU_00576 rsib_orf.195 thiQ FALSE 0.007 1208.000 0.000 1.000   NA
 6850385 6850386 PAU_00576 PAU_00577c thiQ yabK TRUE 0.991 -7.000 0.522 0.019 N NA
 6850386 10702229 PAU_00577c PAU_00577 yabK   TRUE 0.750 -95.000 0.000 NA   NA
 10702229 6850387 PAU_00577 PAU_00578   tbpA TRUE 0.793 -24.000 0.000 NA   NA
 6850387 6850388 PAU_00578 PAU_s005 tbpA   TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6850389 6850390 PAU_00579 PAU_00580 rppH ptsP TRUE 0.823 10.000 0.012 1.000 N NA
 6850390 6850391 PAU_00580 PAU_00581 ptsP lgt FALSE 0.160 75.000 0.008 1.000 N NA
 6850391 6850392 PAU_00581 PAU_00582 lgt thyA TRUE 0.967 -3.000 0.164 1.000 N NA
 6850393 6850394 PAU_00583 PAU_00584 ygjM   TRUE 0.990 -3.000 0.308 NA   NA
 6850395 6850396 PAU_00585 PAU_00586 ppdA ppdB TRUE 0.842 168.000 0.368 NA Y NA
 6850396 6850397 PAU_00586 PAU_00587 ppdB   TRUE 0.994 6.000 0.373 NA   NA
 6850397 6850398 PAU_00587 PAU_00588   ppdC TRUE 0.995 -3.000 0.538 NA   NA
 6850398 6850399 PAU_00588 PAU_00589 ppdC recC TRUE 0.754 -22.000 0.076 NA N NA
 6850399 6850400 PAU_00589 PAU_00590 recC ptrA TRUE 0.934 16.000 0.092 1.000 N NA
 6850400 6850401 PAU_00590 PAU_00591 ptrA recB TRUE 0.938 -3.000 0.092 1.000 N NA
 6850401 6850402 PAU_00591 PAU_00592 recB recD TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 6850403 6850404 PAU_00593 PAU_00594 argA GE16597 TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6850408 6850409 PAU_t008 PAU_t009     TRUE 0.424 83.000 0.000 NA   NA
 6850410 6850411 PAU_00597 PAU_00598   mltA TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850411 6850412 PAU_00598 PAU_00599 mltA   TRUE 0.432 46.000 0.021 1.000 N NA
 6850413 6850414 PAU_00600 PAU_00601 ygdK csdA TRUE 0.987 4.000 0.122 0.002   NA
 6850414 6850415 PAU_00601 PAU_s006 csdA   FALSE 0.097 223.000 0.000 NA   NA
 6850416 6850417 PAU_00602 PAU_00603 gcvA   FALSE 0.074 315.000 0.081 NA   NA
 6850417 6850418 PAU_00603 PAU_00604   ygdE TRUE 0.956 -7.000 0.144 NA   NA
 6850418 6850419 PAU_00604 PAU_00605 ygdE   FALSE 0.006 1292.000 0.000 NA   NA
 6850419 6850420 PAU_00605 PAU_00606     TRUE 0.770 54.000 0.095 1.000   NA
 6850420 6850421 PAU_00606 PAU_00607   hasD TRUE 0.559 76.000 0.071 1.000   NA
 6850421 6850422 PAU_00607 PAU_00608 hasD   TRUE 0.970 61.000 0.562 0.010   NA
 6850422 6850423 PAU_00608 PAU_00609     TRUE 0.996 3.000 0.375 0.010   NA
 6850424 6850425 PAU_00610 PAU_00611 xni   TRUE 0.954 30.000 0.178 NA   NA
 6850425 6850426 PAU_00611 PAU_00612   queF FALSE 0.304 155.000 0.079 NA   NA
 6850426 6850427 PAU_00612 PAU_00613 queF   FALSE 0.036 380.000 0.000 1.000   NA
 6850427 6850428 PAU_00613 PAU_00614     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6850429 6850430 PAU_00615 PAU_00616 nikM hisC FALSE 0.053 217.000 0.000 1.000 N NA
 6850430 6850431 PAU_00616 PAU_00617 hisC   TRUE 0.654 -22.000 0.000 1.000 N NA
 6850432 6850433 PAU_00618 PAU_00619     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850433 6850434 PAU_00619 PAU_00620     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6850434 6850435 PAU_00620 PAU_00621   sanC TRUE 0.836 33.000 0.000 NA   NA
 6850435 6850436 PAU_00621 PAU_00622 sanC   TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6850436 6850437 PAU_00622 PAU_00623   yqkA TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6850437 6850438 PAU_00623 PAU_00624 yqkA   TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6850440 6850441 PAU_00626 PAU_00627   bmyC FALSE 0.212 158.000 0.000 NA   NA
 6850441 6850442 PAU_00627 PAU_00628 bmyC   TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6850442 6850443 PAU_00628 PAU_00629     TRUE 0.508 70.000 0.000 1.000   NA
 6850443 6850444 PAU_00629 PAU_00630   speC TRUE 0.747 44.000 0.000 1.000   NA
 6850444 6850445 PAU_00630 PAU_00631 speC   TRUE 0.965 3.000 0.067 1.000   NA
 6850445 6850446 PAU_00631 PAU_00632     FALSE 0.175 173.000 0.000 NA   NA
 6850446 6850447 PAU_00632 PAU_00633   murA TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6850447 6850448 PAU_00633 PAU_00634 murA   FALSE 0.166 130.000 0.000 1.000 N NA
 6850449 6850450 PAU_00635 PAU_00636     FALSE 0.017 538.000 0.000 NA   NA
 6850450 6850451 PAU_00636 PAU_00637   truC TRUE 0.996 2.000 0.518 NA   NA
 6850454 6850455 PAU_00640 PAU_00641 yaeH dapD FALSE 0.105 213.000 0.035 NA   NA
 6850455 6850456 PAU_00641 PAU_00642 dapD glnD TRUE 0.868 30.000 0.097 1.000 N NA
 6850456 6850457 PAU_00642 PAU_00643 glnD map TRUE 0.566 138.000 0.243 1.000 N NA
 6850458 6850459 PAU_s007 PAU_00644   rpsB TRUE 0.858 29.000 0.000 NA   NA
 6850459 6850460 PAU_00644 PAU_00645 rpsB tsf TRUE 0.950 153.000 0.748 1.000 Y NA
 6850460 6850461 PAU_00645 PAU_00646 tsf pyrH TRUE 0.704 147.000 0.416 1.000 N NA
 6850461 6850462 PAU_00646 PAU_00647 pyrH frr TRUE 0.869 121.000 0.626 1.000 N NA
 6850462 6850463 PAU_00647 PAU_00648 frr dxr FALSE 0.114 148.000 0.032 1.000 N NA
 6850463 6850464 PAU_00648 PAU_00649 dxr uppS FALSE 0.121 344.000 0.025 1.000 Y NA
 6850464 6850465 PAU_00649 PAU_00650 uppS cdsA TRUE 0.998 10.000 0.400 1.000 Y NA
 6850465 6850466 PAU_00650 PAU_00651 cdsA rseP TRUE 0.829 31.000 0.080 1.000 N NA
 6850466 6850467 PAU_00651 PAU_00652 rseP yaeT TRUE 0.983 35.000 0.204 1.000 Y NA
 6850467 6850468 PAU_00652 PAU_00653d yaeT hlpA TRUE 0.997 -3.000 0.354 1.000 Y NA
 6850468 10702230 PAU_00653d PAU_00653 hlpA   TRUE 0.737 -179.000 0.000 NA   NA
 10702230 6850469 PAU_00653 PAU_00654   lpxD FALSE 0.024 436.000 0.000 NA   NA
 6850469 6850470 PAU_00654 PAU_00655 lpxD fabZ TRUE 0.906 121.000 0.796 1.000 N NA
 6850470 6850471 PAU_00655 PAU_00656 fabZ lpxA TRUE 0.998 4.000 0.850 1.000 N NA
 6850471 6850472 PAU_00656 PAU_00657 lpxA lpxB TRUE 0.997 5.000 0.289 1.000 Y NA
 6850472 6850473 PAU_00657 PAU_00658 lpxB rnhB TRUE 0.973 -3.000 0.186 1.000 N NA
 6850473 6850474 PAU_00658 PAU_00659 rnhB dnaE TRUE 0.451 209.000 0.104 1.000 Y NA
 6850474 6850475 PAU_00659 PAU_00660 dnaE accA TRUE 0.958 13.000 0.122 1.000 N NA
 6850475 6850476 PAU_00660 PAU_00661 accA tilS FALSE 0.153 213.000 0.123 1.000 N NA
 6850479 6850480 PAU_00664 PAU_00665 proS   FALSE 0.332 127.000 0.048 NA   NA
 6850480 6850481 PAU_00665 PAU_00666   rcsF TRUE 0.987 -3.000 0.247 NA   NA
 6850481 6850482 PAU_00666 PAU_00667 rcsF metQ TRUE 0.818 145.000 0.500 NA   NA
 6850482 6850483 PAU_00667 PAU_00668 metQ metI TRUE 0.966 66.000 0.411 NA Y NA
 6850483 6850484 PAU_00668 PAU_00669 metI metN TRUE 0.997 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 6850485 6850486 PAU_00670 PAU_00407b gmhB 16S_rRNA FALSE 0.032 384.000 0.000 NA   NA
 6850486 6850487 PAU_00407b PAU_t010 16S_rRNA   FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6850487 6850488 PAU_t010 PAU_t011     FALSE 0.281 133.000 0.000 NA   NA
 6850488 6850489 PAU_t011 PAU_00407j   23S_rRNA FALSE 0.009 805.000 0.000 NA   NA
 6850489 6850490 PAU_00407j PAU_r003 23S_rRNA   FALSE 0.316 122.000 0.000 NA   NA
 6850490 6850491 PAU_r003 PAU_t012     TRUE 0.625 54.000 0.000 NA   NA
 6850491 6850492 PAU_t012 PAU_00671   ISPlu6L FALSE 0.166 179.000 0.000 NA   NA
 6850492 6850493 PAU_00671 PAU_00672 ISPlu6L ISPlu6L TRUE 0.580 59.000 0.000 NA   NA
 6850493 6850494 PAU_00672 PAU_00673 ISPlu6L yafD TRUE 0.406 89.000 0.000 NA   NA
 6850498 6850499 PAU_00677 PAU_00678 cysJ cysI TRUE 1.000 0.000 0.791 0.001 Y NA
 6850499 6850500 PAU_00678 PAU_00679 cysI cysH TRUE 0.950 -3.000 0.116 1.000 N NA
 6850502 6850503 PAU_00681 PAU_00682 cysG cysD TRUE 0.998 11.000 0.417 1.000 Y NA
 6850503 6850504 PAU_00682 PAU_00683 cysD cysN FALSE 0.371 396.000 0.574 0.001 N NA
 6850504 6850505 PAU_00683 PAU_00684 cysN cysC TRUE 0.998 2.000 0.340 0.001 Y NA
 6850505 6850506 PAU_00684 PAU_00685 cysC ftsB FALSE 0.081 145.000 0.013 1.000 N NA
 6850506 6850507 PAU_00685 PAU_00686 ftsB ispD TRUE 0.978 6.000 0.185 1.000 N NA
 6850507 6850508 PAU_00686 PAU_00687 ispD ispF TRUE 0.998 13.000 0.419 1.000 Y NA
 6850508 6850509 PAU_00687 PAU_00688 ispF truD TRUE 0.986 1.000 0.173 1.000   NA
 6850509 6850510 PAU_00688 PAU_00689 truD surE TRUE 0.956 -22.000 0.235 1.000   NA
 6850510 6850511 PAU_00689 PAU_00690 surE pcm TRUE 0.988 -6.000 0.353 1.000   NA
 6850511 6850512 PAU_00690 PAU_00691 pcm nlpD FALSE 0.173 109.000 0.030 1.000 N NA
 6850512 6850513 PAU_00691 PAU_00692 nlpD rpoS TRUE 0.759 52.000 0.142 1.000 N NA
 6850513 6850514 PAU_00692 PAU_00693 rpoS   FALSE 0.007 1016.000 0.000 NA   NA
 6850514 6850515 PAU_00693 PAU_00694     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6850516 6850517 PAU_00695 PAU_00696 miaE mutS TRUE 0.787 5.000 0.004 1.000 N NA
 6850517 6850518 PAU_00696 PAU_00697 mutS   FALSE 0.021 471.000 0.000 NA   NA
 6850518 6850519 PAU_00697 PAU_00698     FALSE 0.018 506.000 0.000 NA   NA
 6850519 6850520 PAU_00698 PAU_00699     FALSE 0.013 635.000 0.000 NA   NA
 6850520 6850521 PAU_00699 PAU_00700   fucR FALSE 0.008 822.000 0.000 NA   NA
 6850521 6850522 PAU_00700 PAU_00701 fucR fucK TRUE 0.984 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6850522 6850523 PAU_00701 PAU_00702 fucK fucI TRUE 0.997 1.000 0.269 1.000 Y NA
 6850523 6850524 PAU_00702 PAU_00703 fucI fucP TRUE 0.990 14.000 0.104 1.000 Y NA
 6850525 6850526 PAU_00704 PAU_00705 fucA   FALSE 0.355 114.000 0.000 1.000   NA
 6850526 6850527 PAU_00705 PAU_00706   ygcB FALSE 0.014 623.000 0.000 1.000   NA
 6850527 6850528 PAU_00706 PAU_00707 ygcB   TRUE 0.988 15.000 0.263 NA   NA
 6850528 6850529 PAU_00707 PAU_00708     TRUE 0.993 9.000 0.336 NA   NA
 6850529 6850530 PAU_00708 PAU_00709     TRUE 0.985 21.000 0.276 NA   NA
 6850530 6850531 PAU_00709 PAU_00710     TRUE 0.998 0.000 0.780 NA   NA
 6850531 6850532 PAU_00710 PAU_00711     TRUE 0.970 -13.000 0.282 NA   NA
 6850532 6850533 PAU_00711 PAU_00712   torD3 FALSE 0.016 549.000 0.000 NA   NA
 6850534 6850535 PAU_00713 PAU_00714     FALSE 0.149 188.000 0.000 NA   NA
 6850535 6850536 PAU_00714 PAU_00715     FALSE 0.141 192.000 0.000 NA   NA
 6850536 6850537 PAU_00715 PAU_00716     TRUE 0.784 -31.000 0.000 NA   NA
 6850537 6850538 PAU_00716 PAU_00717     FALSE 0.077 248.000 0.000 NA   NA
 6850538 6850539 PAU_00717 PAU_00718     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850539 6850540 PAU_00718 PAU_00719     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850540 6850541 PAU_00719 PAU_00720     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6850541 6850542 PAU_00720 PAU_00721     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850542 6850543 PAU_00721 PAU_00722     FALSE 0.009 754.000 0.000 NA   NA
 6850543 6850544 PAU_00722 PAU_00723     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6850544 6850545 PAU_00723 PAU_00724     FALSE 0.006 1139.000 0.000 NA   NA
 6850546 10702232 PAU_00725e PAU_00726 smfA   TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 10702231 6850546 PAU_00725 PAU_00725e   smfA TRUE 0.738 -164.000 0.000 NA   NA
 6850547 6850548 PAU_00726f PAU_00727 mrfB mrfC TRUE 0.976 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10702232 6850547 PAU_00726 PAU_00726f   mrfB TRUE 0.752 -92.000 0.000 NA   NA
 6850548 10702233 PAU_00727 PAU_00728 mrfC   TRUE 0.798 38.000 0.000 NA   NA
 6850549 6850550 PAU_00728g PAU_00729 mrfD mrfX TRUE 0.955 31.000 0.000 1.000 Y NA
 10702233 6850549 PAU_00728 PAU_00728g   mrfD TRUE 0.762 -74.000 0.000 NA   NA
 6850550 6850551 PAU_00729 PAU_00730h mrfX mrfF TRUE 0.978 -7.000 0.000 0.006 Y NA
 6850551 10702234 PAU_00730h PAU_00730 mrfF   TRUE 0.750 -95.000 0.000 NA   NA
 10702234 10702235 PAU_00730 PAU_00731     FALSE 0.019 485.000 0.000 NA   NA
 6850552 10702235 PAU_00731j PAU_00731 mrfG   TRUE 0.763 -71.000 0.000 NA   NA
 10702235 6850553 PAU_00731 PAU_00732   mrfG FALSE 0.025 432.000 0.000 NA   NA
 6850553 6850554 PAU_00732 PAU_00733 mrfG   TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6850554 6850555 PAU_00733 PAU_00734   mrfJ TRUE 0.858 29.000 0.000 NA   NA
 6850556 6850557 PAU_00735 PAU_00736   purA1 TRUE 0.948 12.000 0.000 1.000   NA
 6850557 6850558 PAU_00736 PAU_00737 purA1   FALSE 0.212 207.000 0.100 NA   NA
 6850558 6850559 PAU_00737 PAU_00738     TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6850559 6850560 PAU_00738 PAU_00739   hisA2 TRUE 0.952 3.000 0.000 1.000   NA
 6850560 6850561 PAU_00739 PAU_00740 hisA2 gene0004 FALSE 0.030 389.000 0.000 NA   NA
 6850561 6850562 PAU_00740 PAU_00741 gene0004 yhaO FALSE 0.092 231.000 0.000 NA   NA
 6850562 6850563 PAU_00741 PAU_00742 yhaO gene0005 FALSE 0.005 650.000 0.000 NA N NA
 6850563 6850564 PAU_00742 PAU_00743 gene0005 fdoH2 TRUE 1.000 0.000 0.944 0.002 Y NA
 6850564 6850565 PAU_00743 PAU_00744 fdoH2 fdnG TRUE 0.986 19.000 0.000 0.002 Y NA
 6850566 6850567 PAU_00745 PAU_00746     FALSE 0.016 572.000 0.000 1.000   NA
 6850567 6850568 PAU_00746 PAU_00747     TRUE 0.901 22.000 0.028 1.000   NA
 6850568 6850569 PAU_00747 PAU_00748     TRUE 0.923 -3.000 0.027 NA   NA
 6850571 6850572 PAU_00750 PAU_00751 paaA paaB TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6850572 6850573 PAU_00751 PAU_00752 paaB paaC TRUE 0.980 -7.000 0.286 NA   NA
 6850573 6850574 PAU_00752 PAU_00753 paaC   TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6850575 6850576 PAU_00754 PAU_00755     FALSE 0.032 381.000 0.000 NA   NA
 6850576 6850577 PAU_00755 PAU_00756     FALSE 0.356 106.000 0.000 NA   NA
 6850578 6850579 PAU_00757 PAU_00758     TRUE 0.388 101.000 0.000 1.000   NA
 6850579 6850580 PAU_00758 PAU_00759     FALSE 0.009 849.000 0.000 1.000   NA
 6850580 6850581 PAU_00759 PAU_00760     FALSE 0.195 114.000 0.000 1.000 N NA
 6850581 6850582 PAU_00760 PAU_00761     TRUE 0.881 6.000 0.000 NA N NA
 6850583 6850584 PAU_00762 PAU_00763 fbpC afuB TRUE 0.992 16.000 0.381 0.031 N NA
 6850584 6850585 PAU_00763 PAU_00764 afuB afuA TRUE 0.971 125.000 0.667 0.031 Y NA
 6850585 6850586 PAU_00764 PAU_00765 afuA uhpC TRUE 0.923 53.000 0.407 NA N NA
 6850586 6850587 PAU_00765 PAU_00766 uhpC uhpB TRUE 0.597 218.000 0.611 NA N NA
 6850587 6850588 PAU_00766 PAU_00767 uhpB uhpA TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.012 Y NA
 6850588 6850589 PAU_00767 PAU_00768 uhpA   FALSE 0.066 270.000 0.000 NA   NA
 6850589 6850590 PAU_00768 PAU_00769     FALSE 0.021 464.000 0.000 NA   NA
 6850593 6850594 PAU_00772 PAU_00773 agaR agaZ TRUE 0.989 24.000 0.182 1.000 Y NA
 6850594 6850595 PAU_00773 PAU_00774 agaZ agaS TRUE 0.982 -3.000 0.250 1.000 N NA
 6850595 6850596 PAU_00774 PAU_00775 agaS agaV TRUE 0.941 -34.000 0.286 1.000 N NA
 6850596 6850597 PAU_00775 PAU_00776 agaV agaC TRUE 1.000 11.000 0.905 0.009 Y NA
 6850597 6850598 PAU_00776 PAU_00777 agaC agaD TRUE 0.975 41.000 0.143 0.009 Y NA
 6850598 6850599 PAU_00777 PAU_00778 agaD yadI TRUE 0.981 23.000 0.000 0.009 Y NA
 6850599 6850600 PAU_00778 PAU_00779 yadI gatY TRUE 0.985 10.000 0.000 1.000 Y NA
 6850600 6850601 PAU_00779 PAU_00780 gatY ast TRUE 0.875 45.000 0.130 1.000   NA
 6850601 6850602 PAU_00780 PAU_00781 ast   FALSE 0.356 106.000 0.000 NA   NA
 6850602 6850603 PAU_00781 PAU_00782     FALSE 0.253 142.000 0.000 NA   NA
 6850603 6850604 PAU_00782 PAU_00783     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850604 6850605 PAU_00783 PAU_00784     FALSE 0.060 281.000 0.000 NA   NA
 6850605 6850606 PAU_00784 PAU_00785     TRUE 0.840 32.000 0.000 NA   NA
 6850606 6850607 PAU_00785 PAU_00786     FALSE 0.051 302.000 0.000 NA   NA
 6850607 6850608 PAU_00786 PAU_00787     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850610 6850611 PAU_00789 PAU_00790     FALSE 0.012 645.000 0.000 NA   NA
 6850611 6850612 PAU_00790 PAU_00791     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850615 6850616 PAU_00794 PAU_00795 speD speE TRUE 0.980 32.000 0.162 1.000 Y NA
 6850616 6850617 PAU_00795 PAU_00796 speE   TRUE 0.822 111.000 0.354 NA   NA
 6850618 6850619 PAU_00797 PAU_00798 cueO hpt FALSE 0.010 349.000 0.010 1.000 N NA
 6850620 6850621 PAU_00799 PAU_00800 chpB   TRUE 0.989 0.000 0.083 NA Y NA
 6850621 6850622 PAU_00800 PAU_00801   yadF FALSE 0.007 534.000 0.000 NA N NA
 6850623 6850624 PAU_00802 PAU_00803 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.097 Y NA
 6850625 6850626 PAU_00804 PAU_00805 panD panC TRUE 0.944 81.000 0.342 1.000 Y NA
 6850626 6850627 PAU_00805 PAU_00806 panC panB TRUE 0.986 54.000 0.395 0.001 Y NA
 6850627 6850628 PAU_00806 PAU_00807 panB folK TRUE 0.877 67.000 0.117 1.000 Y NA
 6850628 6850629 PAU_00807 PAU_00808 folK pcnB TRUE 0.985 3.000 0.234 1.000 N NA
 6850629 6850630 PAU_00808 PAU_00809 pcnB yadB TRUE 0.856 80.000 0.131 1.000 Y NA
 6850630 6850631 PAU_00809 PAU_00810 yadB dksA TRUE 0.825 60.000 0.231 1.000 N NA
 6850631 6850632 PAU_00810 PAU_00811 dksA dksA TRUE 0.780 -36.000 0.000 NA   NA
 6850632 6850633 PAU_00811 PAU_00812 dksA sfsA FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 6850634 6850635 PAU_00813 PAU_00814 hrpB mrcB TRUE 0.846 44.000 0.158 1.000 N NA
 6850635 6850636 PAU_00814 PAU_00815 mrcB   FALSE 0.018 545.000 0.000 1.000   NA
 6850636 6850637 PAU_00815 PAU_00816     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6850637 6850638 PAU_00816 PAU_00817     TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6850638 6850639 PAU_00817 PAU_00818     FALSE 0.103 218.000 0.000 NA   NA
 6850640 6850641 PAU_00819 PAU_00820     FALSE 0.062 278.000 0.000 NA   NA
 6850643 6850644 PAU_00822 PAU_00823 hemL   TRUE 0.660 50.000 0.000 NA   NA
 6850645 6850646 PAU_00824 PAU_00825   yadR FALSE 0.305 126.000 0.000 NA   NA
 6850647 6850648 PAU_00826 PAU_00827 btuF mtnA FALSE 0.202 150.000 0.073 1.000 N NA
 6850651 6850652 PAU_00830 PAU_00831 rumA relA FALSE 0.078 242.000 0.082 1.000 N NA
 6850652 6850653 PAU_00831 PAU_00832 relA mazG TRUE 0.387 102.000 0.040 1.000   NA
 6850653 6850654 PAU_00832 PAU_00833 mazG nad2 FALSE 0.015 568.000 0.000 NA   NA
 6850654 6850655 PAU_00833 PAU_00834 nad2   TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850655 6850656 PAU_00834 PAU_00835   vgaB TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850657 6850658 PAU_00836 PAU_00837     FALSE 0.323 120.000 0.000 NA   NA
 6850658 6850659 PAU_00837 PAU_00838     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6850659 6850660 PAU_00838 PAU_00839     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850661 6850662 PAU_00840 PAU_00841 pyrG eno TRUE 0.405 73.000 0.068 1.000 N NA
 6850662 6850663 PAU_00841 PAU_00842 eno pln FALSE 0.017 372.000 0.000 1.000 N NA
 6850664 6850665 PAU_00843 PAU_00844 orf80 orf78 FALSE 0.055 684.000 0.000 0.035 Y NA
 6850666 6850667 PAU_00845 PAU_00846     FALSE 0.012 647.000 0.000 NA   NA
 6850667 6850668 PAU_00846 PAU_00847     TRUE 0.998 10.000 1.000 NA   NA
 6850668 6850669 PAU_00847 PAU_00848     TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6850669 6850670 PAU_00848 PAU_00849     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850670 6850671 PAU_00849 PAU_00850     TRUE 0.951 5.000 0.000 1.000   NA
 6850671 6850672 PAU_00850 PAU_00851   tmk TRUE 0.894 -7.000 0.000 1.000   NA
 6850672 6850673 PAU_00851 PAU_00852 tmk   TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850674 6850675 PAU_00853 PAU_00854   orf74 FALSE 0.007 1023.000 0.000 NA   NA
 6850676 6850677 PAU_00855 PAU_00856     FALSE 0.022 454.000 0.000 NA   NA
 6850678 10702236 PAU_00857l PAU_00857 mltD   TRUE 0.764 -68.000 0.000 NA   NA
 10702236 6850679 PAU_00857 PAU_00858   gloB TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6850682 6850683 PAU_00861 PAU_t013 dnaQ   FALSE 0.293 130.000 0.000 NA   NA
 6850684 6850685 PAU_00862 PAU_00863     FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6850687 6850688 PAU_00865 PAU_00866 orf67 orf66 TRUE 0.954 18.000 0.000 0.035   NA
 6850688 6850689 PAU_00866 PAU_00867 orf66 orf66 TRUE 0.557 84.000 0.000 0.035   NA
 6850690 6850691 PAU_00868 PAU_00869 tktA   FALSE 0.009 836.000 0.000 1.000   NA
 6850691 6850692 PAU_00869 PAU_00870     TRUE 0.998 4.000 0.778 NA   NA
 6850692 6850693 PAU_00870 PAU_00871     TRUE 0.934 -12.000 0.130 NA   NA
 6850693 6850694 PAU_00871 PAU_00872     TRUE 0.998 11.000 0.914 NA   NA
 6850694 6850695 PAU_00872 PAU_00873     TRUE 0.991 5.000 0.271 NA   NA
 6850695 6850696 PAU_00873 PAU_00874   cydA1 FALSE 0.379 98.000 0.000 NA   NA
 6850696 6850697 PAU_00874 PAU_00875 cydA1 cydB1 TRUE 0.968 30.000 0.000 0.039 Y NA
 6850697 6850698 PAU_00875 PAU_00876 cydB1   FALSE 0.035 382.000 0.000 1.000   NA
 6850698 6850699 PAU_00876 PAU_00877   epd FALSE 0.016 570.000 0.000 1.000   NA
 6850699 6850700 PAU_00877 PAU_00878 epd pgk TRUE 0.848 83.000 0.070 0.005 Y NA
 6850700 6850701 PAU_00878 PAU_00879 pgk fba TRUE 0.920 54.000 0.056 0.005 Y NA
 6850703 6850704 PAU_00881 PAU_00882 basA/D phbF TRUE 0.577 84.000 0.095 NA   NA
 6850706 6850707 PAU_00884 PAU_00885     FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6850707 10702237 PAU_00885 PAU_00886     FALSE 0.200 164.000 0.000 NA   NA
 6850708 10702238 PAU_00886m PAU_00887 phuB   TRUE 0.894 24.000 0.000 NA   NA
 10702237 6850708 PAU_00886 PAU_00886m   phuB TRUE 0.744 -125.000 0.000 NA   NA
 6850709 10702239 PAU_00887m PAU_00888 phuG   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 10702238 6850709 PAU_00887 PAU_00887m   phuG TRUE 0.743 -131.000 0.000 NA   NA
 6850710 6850711 PAU_00888p PAU_00889 phuD phuA FALSE 0.059 667.000 0.000 0.031 Y NA
 10702239 6850710 PAU_00888 PAU_00888p   phuD TRUE 0.741 -146.000 0.000 NA   NA
 6850711 6850712 PAU_00889 PAU_00890 phuA phbH TRUE 0.412 137.000 0.091 1.000   NA
 6850712 6850713 PAU_00890 PAU_00891 phbH phuC FALSE 0.229 156.000 0.038 1.000   NA
 6850713 6850714 PAU_00891 PAU_00892 phuC phbC FALSE 0.202 278.000 0.000 1.000 Y NA
 6850714 6850715 PAU_00892 PAU_00893 phbC phbE TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6850715 6850716 PAU_00893 PAU_00894 phbE phbB TRUE 0.997 -13.000 0.667 1.000 Y NA
 6850716 6850717 PAU_00894 PAU_00895 phbB phbA TRUE 0.986 2.000 0.040 1.000 Y NA
 6850718 6850719 PAU_00896 PAU_00897 tccC3 tchA FALSE 0.305 126.000 0.000 NA   NA
 6850719 6850720 PAU_00897 PAU_00898 tchA tcaC TRUE 0.635 53.000 0.000 NA   NA
 6850720 6850721 PAU_00898 PAU_00899 tcaC tcdA2 TRUE 0.586 58.000 0.000 NA   NA
 6850721 6850722 PAU_00899 PAU_00900 tcdA2   FALSE 0.031 387.000 0.000 NA   NA
 6850722 6850723 PAU_00900 PAU_00901   tcdA FALSE 0.316 122.000 0.000 NA   NA
 6850727 6850728 PAU_00905 PAU_00906     TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6850730 6850731 PAU_00908 PAU_00909 yhiP hpaC FALSE 0.044 338.000 0.000 1.000   NA
 6850731 6850732 PAU_00909 PAU_00910 hpaC hpaB TRUE 0.958 21.000 0.000 0.001   NA
 6850732 6850733 PAU_00910 PAU_00911 hpaB   FALSE 0.014 600.000 0.000 NA   NA
 6850734 6850735 PAU_00912 PAU_00913   yfaA FALSE 0.049 309.000 0.000 NA   NA
 6850735 6850736 PAU_00913 PAU_00914 yfaA   TRUE 0.788 90.000 0.000 0.024 Y NA
 6850736 6850737 PAU_00914 PAU_00915   pfaC TRUE 0.883 59.000 0.000 0.024 Y NA
 6850737 6850738 PAU_00915 PAU_00916 pfaC   TRUE 0.910 5.000 0.048 1.000 N NA
 6850739 6850740 PAU_00917 PAU_00918 orf28 orf25 FALSE 0.029 401.000 0.000 NA   NA
 6850740 6850741 PAU_00918 PAU_00919 orf25 orf24 TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6850741 6850742 PAU_00919 PAU_00920 orf24   TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850742 6850743 PAU_00920 PAU_00921     FALSE 0.011 680.000 0.000 NA   NA
 6850745 6850746 PAU_00923 PAU_00924 hpaA hpaX TRUE 0.962 26.000 0.233 1.000 N NA
 6850746 6850747 PAU_00924 PAU_00925 hpaX hpaI TRUE 0.863 98.000 0.175 1.000 Y NA
 6850747 6850748 PAU_00925 PAU_00926 hpaI hpaH TRUE 0.993 12.000 0.439 1.000 N NA
 6850748 6850749 PAU_00926 PAU_00927 hpaH gabD TRUE 0.960 5.000 0.075 0.059 N NA
 6850749 6850750 PAU_00927 PAU_00928 gabD bcr TRUE 0.959 -3.000 0.136 1.000 N NA
 6850750 6850751 PAU_00928 PAU_00929 bcr hpaF TRUE 0.896 3.000 0.039 1.000 N NA
 6850751 6850752 PAU_00929 PAU_00930 hpaF hpaD TRUE 0.992 14.000 0.330 1.000   NA
 6850752 6850753 PAU_00930 PAU_00931 hpaD hpaE TRUE 0.917 65.000 0.378 1.000   NA
 6850753 6850754 PAU_00931 PAU_00932 hpaE hpaG2 TRUE 0.995 -3.000 0.510 0.059 N NA
 6850754 6850755 PAU_00932 PAU_00933 hpaG2 hpaG1 TRUE 0.999 -3.000 0.618 0.001 Y NA
 6850759 6850760 PAU_00937 PAU_00938     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6850760 6850761 PAU_00938 PAU_00939   gene0006 FALSE 0.009 787.000 0.000 NA   NA
 6850761 6850762 PAU_00939 PAU_00940 gene0006 gene0007 TRUE 0.768 45.000 0.059 NA   NA
 6850762 6850763 PAU_00940 PAU_00941 gene0007 gene0008 TRUE 0.557 219.000 0.147 0.067 Y NA
 6850764 6850765 PAU_00942 PAU_00943 gene0009 gene0010 TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6850765 6850766 PAU_00943 PAU_00944 gene0010 gene0011 TRUE 0.936 14.000 0.000 NA   NA
 6850767 6850768 PAU_00945 PAU_00946     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6850770 6850771 PAU_00948 PAU_00949 gene0012 gene0013 FALSE 0.198 461.000 0.147 0.067 Y NA
 6850772 6850773 PAU_00950 PAU_00951 gene0014 gene0015 TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6850774 6850775 PAU_00952 PAU_00953 gene0016   TRUE 0.992 14.000 0.333 NA   NA
 6850775 6850776 PAU_00953 PAU_00954   gene0017 FALSE 0.006 1136.000 0.000 NA   NA
 6850776 6850777 PAU_00954 PAU_00955 gene0017 gene0018 FALSE 0.198 461.000 0.147 0.067 Y NA
 6850778 6850779 PAU_00956 PAU_00957 gene0019 gene0020 TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6850780 6850781 PAU_00958 PAU_00959 gene0021 gene0022 TRUE 0.992 14.000 0.333 NA   NA
 6850781 6850782 PAU_00959 PAU_00960 gene0022 gene0023 FALSE 0.052 300.000 0.000 NA   NA
 6850782 6850783 PAU_00960 PAU_00961 gene0023 gene0024 TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 6850783 6850784 PAU_00961 PAU_00962 gene0024 gene0025 TRUE 0.768 45.000 0.059 NA   NA
 6850784 6850785 PAU_00962 PAU_00963 gene0025 gene0026 TRUE 0.557 219.000 0.147 0.067 Y NA
 6850786 6850787 PAU_00964 PAU_00965 gene0027 gene0028 TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6850788 6850789 PAU_00966 PAU_00967 gene0029 rhs-core TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6850789 6850790 PAU_00967 PAU_00968 rhs-core   TRUE 0.994 18.000 0.500 NA   NA
 6850790 6850791 PAU_00968 PAU_00969   vgrG TRUE 0.901 55.000 0.250 NA   NA
 6850791 6850792 PAU_00969 PAU_00970 vgrG ngrA FALSE 0.009 745.000 0.000 NA   NA
 6850792 6850793 PAU_00970 PAU_00971 ngrA phfB TRUE 0.522 47.000 0.000 1.000 N NA
 6850793 6850794 PAU_00971 PAU_00972 phfB yraJ TRUE 0.959 29.000 0.000 1.000 Y NA
 6850794 6850795 PAU_00972 PAU_00973q yraJ yraI TRUE 0.970 24.000 0.000 1.000 Y NA
 6850795 10702240 PAU_00973q PAU_00973 yraI   TRUE 0.765 -56.000 0.000 NA   NA
 10702240 6850796 PAU_00973 PAU_00974   phfS TRUE 0.788 39.000 0.000 NA   NA
 6850797 6850798 PAU_00975 PAU_00976 pltP   TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6850799 6850800 PAU_00977 PAU_00978 ybaL fsr FALSE 0.037 242.000 0.000 NA N NA
 6850802 6850803 PAU_00980 PAU_00981 ybbP ybbA TRUE 0.998 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 6850804 6850805 PAU_00982 PAU_00983 tesA ybbO TRUE 0.749 51.000 0.072 1.000   NA
 6850805 6850806 PAU_00983 PAU_00984 ybbO ybbN TRUE 0.714 67.000 0.118 1.000   NA
 6850806 6850807 PAU_00984 PAU_00985 ybbN ybbK TRUE 0.979 23.000 0.075 1.000 Y NA
 6850807 6850808 PAU_00985 PAU_00986 ybbK ybbJ TRUE 0.997 3.000 0.313 NA Y NA
 6850813 6850814 PAU_00991 PAU_00992     TRUE 0.727 83.000 0.250 NA N NA
 6850814 6850815 PAU_00992 PAU_00993     TRUE 0.861 57.000 0.286 NA N NA
 6850817 6850818 PAU_00995 PAU_00996   purK FALSE 0.064 272.000 0.000 NA   NA
 6850818 6850819 PAU_00996 PAU_00997 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 6850819 6850820 PAU_00997 PAU_00998 purE lpxH FALSE 0.235 135.000 0.016 1.000   NA
 6850820 6850821 PAU_00998 PAU_00999 lpxH ppiB TRUE 0.990 11.000 0.237 1.000   NA
 6850823 6850824 PAU_01001 PAU_01002   folD TRUE 0.960 0.000 0.055 1.000   NA
 6850825 6850826 PAU_t014 PAU_01003     FALSE 0.185 169.000 0.000 NA   NA
 6850827 6850828 PAU_01004 PAU_01005   yabA FALSE 0.021 462.000 0.000 NA   NA
 6850828 6850829 PAU_01005 PAU_01006 yabA   TRUE 0.902 92.000 0.500 NA   NA
 6850829 6850830 PAU_01006 PAU_01007   alpA1 TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 6850830 6850831 PAU_01007 PAU_01008 alpA1   TRUE 0.997 4.000 0.667 NA   NA
 6850834 6850835 PAU_01011 PAU_01012     TRUE 0.992 -3.000 0.370 NA   NA
 6850835 6850836 PAU_01012 PAU_01013     TRUE 0.998 2.000 0.630 0.011   NA
 6850836 6850837 PAU_01013 PAU_01014     TRUE 0.995 -3.000 0.485 1.000   NA
 6850837 6850838 PAU_01014 PAU_01015     TRUE 0.976 23.000 0.211 NA   NA
 6850838 6850839 PAU_01015 PAU_01016   Sc/SvQ FALSE 0.007 944.000 0.000 NA   NA
 6850839 6850840 PAU_01016 PAU_01017 Sc/SvQ Sc/SvP FALSE 0.030 392.000 0.000 NA   NA
 6850841 6850842 PAU_01018 PAU_01019   atoA FALSE 0.006 1292.000 0.000 NA   NA
 6850842 6850843 PAU_01019 PAU_01020 atoA atoD TRUE 0.991 7.000 0.000 0.001 Y NA
 6850843 6850844 PAU_01020 PAU_01021 atoD atoC FALSE 0.026 301.000 0.000 1.000 N NA
 6850844 6850845 PAU_01021 PAU_01022 atoC   FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 6850847 6850848 PAU_01024 PAU_01025     TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6850849 6850850 PAU_01026 PAU_01027 msc_3   FALSE 0.021 468.000 0.000 NA   NA
 6850850 6850851 PAU_01027 PAU_01028   cspI FALSE 0.025 431.000 0.000 NA   NA
 6850852 6850853 PAU_01029 PAU_01030 sctL sctK TRUE 0.991 -21.000 0.727 1.000   NA
 6850853 6850854 PAU_01030 PAU_01031 sctK sctJ TRUE 0.998 0.000 0.800 1.000   NA
 6850854 6850855 PAU_01031 PAU_01032 sctJ sctI TRUE 0.995 7.000 0.333 0.012   NA
 6850855 6850856 PAU_01032 PAU_01033 sctI sctH TRUE 0.996 0.000 0.333 0.009   NA
 6850856 6850857 PAU_01033 PAU_01034 sctH sctG TRUE 0.997 -7.000 0.900 0.009   NA
 6850857 6850858 PAU_01034 PAU_01035 sctG sctF TRUE 0.998 3.000 0.556 0.009   NA
 6850858 6850859 PAU_01035 PAU_01036 sctF sctD FALSE 0.255 151.000 0.049 NA   NA
 6850859 6850860 PAU_01036 PAU_01037r sctD sctC TRUE 0.985 -3.000 0.220 NA   NA
 6850860 10702241 PAU_01037r PAU_01037 sctC   TRUE 0.756 -89.000 0.000 NA   NA
 10702241 6850861 PAU_01037 PAU_01038   sctB TRUE 0.846 -12.000 0.000 NA   NA
 6850861 6850862 PAU_01038 PAU_01039 sctB   TRUE 0.996 16.000 0.583 NA   NA
 6850862 6850863 PAU_01039 PAU_01040   rhaS TRUE 0.906 115.000 0.615 NA   NA
 6850863 6850864 PAU_01040 PAU_01041 rhaS   FALSE 0.010 729.000 0.000 NA   NA
 6850864 6850865 PAU_01041 PAU_01042   spcU TRUE 0.743 43.000 0.000 NA   NA
 6850865 6850866 PAU_01042 PAU_01043 spcU exoU TRUE 0.996 10.000 0.500 NA   NA
 6850866 6850867 PAU_01043 PAU_01044 exoU   TRUE 0.389 96.000 0.000 NA   NA
 6850867 6850868 PAU_01044 PAU_01045   sctU FALSE 0.251 143.000 0.000 NA   NA
 6850868 6850869 PAU_01045 PAU_01046 sctU sctT TRUE 0.999 -3.000 0.548 0.064 Y NA
 6850869 6850870 PAU_01046 PAU_01047 sctT sctS TRUE 0.991 -3.000 0.097 0.064 Y NA
 6850870 6850871 PAU_01047 PAU_01048 sctS sctR TRUE 0.998 3.000 0.300 0.012 Y NA
 6850871 6850872 PAU_01048 PAU_01049 sctR sctQ TRUE 0.998 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 6850872 6850873 PAU_01049 PAU_01050 sctQ sctP TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.006   NA
 6850873 6850874 PAU_01050 PAU_01051 sctP sctO TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6850874 6850875 PAU_01051 PAU_01052 sctO sctN TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850876 6850877 PAU_01053 PAU_01054 sctW lssN TRUE 0.985 -3.000 0.208 1.000   NA
 6850877 6850878 PAU_01054 PAU_01055 lssN sctX TRUE 0.985 -3.000 0.214 NA   NA
 6850878 6850879 PAU_01055 PAU_01056 sctX sctY TRUE 0.969 3.000 0.087 NA   NA
 6850879 6850880 PAU_01056 PAU_01057 sctY lssD TRUE 0.953 -3.000 0.062 1.000   NA
 6850880 6850881 PAU_01057 PAU_01058 lssD pcrR TRUE 0.989 -3.000 0.281 NA   NA
 6850881 6850882 PAU_01058 PAU_01059 pcrR lssG TRUE 0.988 47.000 1.000 NA   NA
 6850882 6850883 PAU_01059 PAU_01060 lssG lssV TRUE 0.996 11.000 0.556 NA   NA
 6850883 6850884 PAU_01060 PAU_01061 lssV sycD TRUE 0.950 10.000 0.000 1.000   NA
 6850884 6850885 PAU_01061 PAU_01062 sycD   TRUE 0.818 -19.000 0.000 1.000   NA
 6850885 6850886 PAU_01062 PAU_01063     TRUE 0.996 13.000 0.526 NA   NA
 6850888 6850889 PAU_01065 PAU_01066 exsC exsE TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850889 6850890 PAU_01066 PAU_01067 exsE lscW TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850890 6850891 PAU_01067 PAU_01068 lscW hod FALSE 0.007 918.000 0.000 NA   NA
 6850891 6850892 PAU_01068 PAU_01069 hod orf35 FALSE 0.018 514.000 0.000 NA   NA
 6850892 6850893 PAU_01069 PAU_01070 orf35 orf36 TRUE 0.987 10.000 0.200 NA   NA
 6850893 6850894 PAU_01070 PAU_01071 orf36 Rz TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6850896 6850897 PAU_01073 PAU_01074 wza wzb TRUE 0.897 0.000 0.000 1.000 N NA
 6850897 6850898 PAU_01074 PAU_01075 wzb wzc TRUE 0.965 67.000 1.000 1.000 N NA
 6850898 6850899 PAU_01075 PAU_01076 wzc tehB FALSE 0.044 237.000 0.000 1.000 N NA
 6850901 6850902 PAU_01078 PAU_01079     TRUE 0.537 66.000 0.000 1.000   NA
 6850902 6850903 PAU_01079 PAU_01080     TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6850904 6850905 PAU_01081 PAU_01082 aldB   FALSE 0.023 318.000 0.000 1.000 N NA
 6850906 6850907 PAU_01083 PAU_01084 hcr   FALSE 0.081 244.000 0.000 NA   NA
 6850907 6850908 PAU_01084 PAU_s008     FALSE 0.219 155.000 0.000 NA   NA
 6850908 6850909 PAU_s008 PAU_01085     TRUE 0.450 75.000 0.000 NA   NA
 6850910 6850911 PAU_01086 PAU_01087 sprT metK FALSE 0.200 155.000 0.030 NA   NA
 6850912 6850913 PAU_01088 PAU_01089 speA speB TRUE 0.488 172.000 0.055 1.000 Y NA
 6850914 6850915 PAU_01090 PAU_01091 api10   FALSE 0.092 231.000 0.000 NA   NA
 6850915 6850916 PAU_01091 PAU_01092   mutH FALSE 0.238 94.000 0.000 1.000 N NA
 6850916 6850917 PAU_01092 PAU_01093 mutH sgrR FALSE 0.016 584.000 0.000 1.000   NA
 6850917 6850918 PAU_01093 PAU_01094 sgrR leuD FALSE 0.018 539.000 0.000 1.000   NA
 6850918 6850919 PAU_01094 PAU_01095 leuD leuC TRUE 0.998 13.000 0.309 0.001 Y NA
 6850919 6850920 PAU_01095 PAU_01096 leuC leuB TRUE 0.998 2.000 0.275 0.001 Y NA
 6850920 6850921 PAU_01096 PAU_01097 leuB leuA TRUE 0.996 3.000 0.126 0.001 Y NA
 6850922 6850923 PAU_01098 PAU_01099 leuO fadD FALSE 0.055 235.000 0.050 1.000 N NA
 6850923 6850924 PAU_01099 PAU_01100 fadD   FALSE 0.013 627.000 0.000 NA   NA
 6850924 6850925 PAU_01100 PAU_01101   ilvI FALSE 0.037 355.000 0.000 NA   NA
 6850925 6850926 PAU_01101 PAU_01102 ilvI ilvH TRUE 0.999 3.000 0.371 0.001 Y NA
 6850926 6850927 PAU_01102 PAU_01103 ilvH fruR FALSE 0.342 87.000 0.063 1.000 N NA
 6850927 6850928 PAU_01103 PAU_01104 fruR mraZ FALSE 0.014 585.000 0.000 NA   NA
 6850928 6850929 PAU_01104 PAU_01105 mraZ mraW TRUE 0.997 3.000 0.635 NA   NA
 6850929 6850930 PAU_01105 PAU_01106 mraW ftsL TRUE 0.984 0.000 0.227 1.000 N NA
 6850930 6850931 PAU_01106 PAU_01107 ftsL ftsI TRUE 0.896 30.000 0.124 1.000 N NA
 6850931 6850932 PAU_01107 PAU_01108 ftsI murE TRUE 0.959 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 6850932 6850933 PAU_01108 PAU_01109 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 6850933 6850934 PAU_01109 PAU_01110 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 6850934 6850935 PAU_01110 PAU_01111 mraY murD TRUE 0.996 42.000 0.647 0.004 Y NA
 6850935 6850936 PAU_01111 PAU_01112 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 6850936 6850937 PAU_01112 PAU_01113 ftsW murG TRUE 0.995 -3.000 0.647 1.000 N NA
 6850937 6850938 PAU_01113 PAU_01114 murG murC TRUE 0.968 53.000 0.283 1.000 Y NA
 6850938 6850939 PAU_01114 PAU_01115 murC ddlB TRUE 0.990 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 6850939 6850940 PAU_01115 PAU_01116 ddlB ftsQ TRUE 0.998 2.000 0.372 NA Y NA
 6850940 6850941 PAU_01116 PAU_01117 ftsQ ftsA TRUE 0.949 43.000 0.389 NA N NA
 6850941 6850942 PAU_01117 PAU_01118 ftsA ftsZ TRUE 0.974 64.000 0.460 1.000 Y NA
 6850942 6850943 PAU_01118 PAU_01119 ftsZ lpxC TRUE 0.499 99.000 0.134 1.000 N NA
 6850945 6850946 PAU_01121 PAU_01122 secM secA TRUE 0.530 81.000 0.065 1.000   NA
 6850946 6850947 PAU_01122 PAU_01123 secA mutT TRUE 0.520 117.000 0.168 1.000 N NA
 6850948 6850949 PAU_01124 PAU_01125 yacG yacF TRUE 0.980 31.000 0.356 NA   NA
 6850949 6850950 PAU_01125 PAU_01126 yacF coaE TRUE 0.969 14.000 0.110 NA   NA
 6850950 6850951 PAU_01126 PAU_01127 coaE hofC FALSE 0.120 92.000 0.004 1.000 N NA
 6850951 6850952 PAU_01127 PAU_01128 hofC hofB TRUE 0.998 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 6850952 6850953 PAU_01128 PAU_01129 hofB ppdD TRUE 0.904 167.000 0.556 NA Y NA
 6850953 6850954 PAU_01129 PAU_01130 ppdD nadC FALSE 0.033 199.000 0.015 NA N NA
 6850955 6850956 PAU_01131 PAU_01132 ampE   FALSE 0.080 245.000 0.000 NA   NA
 6850956 6850957 PAU_01132 PAU_01133     TRUE 0.963 9.000 0.073 NA   NA
 6850959 6850960 PAU_01135 PAU_01136     TRUE 0.788 39.000 0.000 NA   NA
 6850960 6850961 PAU_01136 PAU_01137   pdhR FALSE 0.010 709.000 0.000 NA   NA
 6850961 6850962 PAU_01137 PAU_01138 pdhR aceE TRUE 0.423 189.000 0.276 1.000 N NA
 6850962 6850963 PAU_01138 PAU_01139 aceE aceF TRUE 0.995 15.000 0.220 1.000 Y NA
 6850963 6850964 PAU_01139 PAU_01140 aceF lpdA TRUE 0.840 192.000 0.463 1.000 Y NA
 6850964 6850965 PAU_01140 PAU_01141 lpdA acnB FALSE 0.076 468.000 0.000 1.000 Y NA
 6850967 6850968 PAU_01143 PAU_01144 yacL yggB FALSE 0.332 138.000 0.066 NA   NA
 6850969 6850970 PAU_01145 PAU_01146     TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6850970 6850971 PAU_01146 PAU_01147     FALSE 0.024 439.000 0.000 NA   NA
 6850972 6850973 PAU_01148 PAU_01149 argO yggE TRUE 0.437 113.000 0.075 NA   NA
 6850975 6850976 PAU_01151 PAU_01152 rpiA serA FALSE 0.026 273.000 0.029 1.000 N NA
 6850977 6850978 PAU_01153 PAU_s009 ygfA   TRUE 0.763 41.000 0.000 NA   NA
 6850978 6850979 PAU_s009 PAU_01154   ygfE FALSE 0.338 113.000 0.000 NA   NA
 6850980 6850981 PAU_01155 PAU_01156 ygfB pepP TRUE 0.751 49.000 0.073 NA   NA
 6850981 6850982 PAU_01156 PAU_01157 pepP ubiH TRUE 0.909 8.000 0.047 1.000 N NA
 6850982 6850983 PAU_01157 PAU_01158 ubiH visC TRUE 0.995 39.000 0.474 0.001 Y NA
 6850983 6850984 PAU_01158 PAU_01159 visC gcvT FALSE 0.008 359.000 0.004 1.000 N NA
 6850984 6850985 PAU_01159 PAU_01160 gcvT gcvH TRUE 0.759 234.000 0.317 0.001 Y NA
 6850985 6850986 PAU_01160 PAU_01161 gcvH gcvP TRUE 0.913 88.000 0.249 1.000 Y NA
 6850986 6850987 PAU_01161 PAU_01162 gcvP cdiB FALSE 0.010 435.000 0.000 NA N NA
 6850987 6850988 PAU_01162 PAU_01163 cdiB   TRUE 0.556 62.000 0.000 NA   NA
 6850988 6850989 PAU_01163 PAU_01164     TRUE 0.915 20.000 0.000 NA   NA
 6850989 6850990 PAU_01164 PAU_01165     FALSE 0.188 168.000 0.000 NA   NA
 6850990 6850991 PAU_01165 PAU_01166   fhaB FALSE 0.042 331.000 0.000 NA   NA
 6850991 6850992 PAU_01166 PAU_01167 fhaB   TRUE 0.870 27.000 0.000 NA   NA
 6850992 6850993 PAU_01167 PAU_01168     FALSE 0.302 127.000 0.000 NA   NA
 6850993 6850994 PAU_01168 PAU_01169     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6850994 6850995 PAU_01169 PAU_01170     FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6850995 6850996 PAU_01170 PAU_01171     TRUE 0.904 89.000 0.500 NA   NA
 6850996 6850997 PAU_01171 PAU_01172     TRUE 0.846 -12.000 0.000 NA   NA
 6850997 6850998 PAU_01172 PAU_01173   ydcW FALSE 0.006 1543.000 0.000 NA   NA
 6850998 6850999 PAU_01173 PAU_01174 ydcW   TRUE 0.985 16.000 0.222 NA   NA
 6850999 6851000 PAU_01174 PAU_01175     TRUE 0.821 56.000 0.150 NA   NA
 6851000 6851001 PAU_01175 PAU_01176     TRUE 0.962 36.000 0.250 NA   NA
 6851001 6851002 PAU_01176 PAU_01177   goaG TRUE 0.971 37.000 0.333 NA   NA
 6851002 6851003 PAU_01177 PAU_01178 goaG yhaH TRUE 0.797 122.000 0.333 1.000   NA
 6851003 6851004 PAU_01178 PAU_01179 yhaH   TRUE 0.947 40.000 0.222 1.000   NA
 6851004 6851005 PAU_01179 PAU_01180   forZ FALSE 0.030 851.000 0.000 1.000 Y NA
 6851005 6851006 PAU_01180 PAU_01181 forZ   TRUE 0.817 -3.000 0.021 1.000 N NA
 6851006 6851007 PAU_01181 PAU_01182     TRUE 0.712 25.000 0.021 1.000 N NA
 6851007 6851008 PAU_01182 PAU_01183   papB TRUE 0.640 44.000 0.056 1.000 N NA
 6851008 6851009 PAU_01183 PAU_01184 papB   TRUE 0.948 -19.000 0.056 1.000 Y NA
 6851009 6851010 PAU_01184 PAU_01185   papC TRUE 0.959 -7.000 0.009 1.000 Y NA
 6851010 6851011 PAU_01185 PAU_01186 papC   TRUE 0.676 20.000 0.009 NA N NA
 6851011 6851012 PAU_01186 PAU_01187   alkB TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6851014 6851015 PAU_01189 PAU_01190   PE_PGRS51 FALSE 0.164 795.000 0.667 NA   NA
 6851015 6851016 PAU_01190 PAU_01191 PE_PGRS51   TRUE 0.931 98.000 0.667 NA   NA
 6851016 6851017 PAU_01191 PAU_01192     TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6851017 6851018 PAU_01192 PAU_01193     FALSE 0.018 517.000 0.000 NA   NA
 6851018 6851019 PAU_01193 PAU_01194   PE_PGRS23 FALSE 0.166 788.000 0.667 NA   NA
 6851019 6851020 PAU_01194 PAU_01195 PE_PGRS23 wdpA FALSE 0.007 1024.000 0.000 NA   NA
 6851020 6851021 PAU_01195 PAU_01196 wdpA   TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6851021 6851022 PAU_01196 PAU_01197   LOC496414 TRUE 0.929 16.000 0.000 NA   NA
 6851022 6851023 PAU_01197 PAU_01198 LOC496414   TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6851023 6851024 PAU_01198 PAU_01199     TRUE 0.960 53.000 0.500 NA   NA
 6851024 6851025 PAU_01199 PAU_01200     TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6851025 6851026 PAU_01200 PAU_01201   ISPlu10B TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851026 6851027 PAU_01201 PAU_01202 ISPlu10B FNV1726 FALSE 0.007 923.000 0.000 NA   NA
 6851027 6851028 PAU_01202 PAU_01203 FNV1726   TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6851028 6851029 PAU_01203 PAU_01204   cysX TRUE 0.900 23.000 0.000 NA   NA
 6851029 6851030 PAU_01204 PAU_01205 cysX   TRUE 0.902 24.000 0.000 1.000   NA
 6851031 6851032 PAU_01206 PAU_01207   ygfZ TRUE 0.921 11.000 0.009 NA   NA
 6851033 6851034 PAU_01208 PAU_01209 ygfY ygfX TRUE 0.846 -19.000 0.061 NA   NA
 6851036 6851037 PAU_01211 PAU_01212 xerD dsbC TRUE 0.873 25.000 0.079 1.000 N NA
 6851037 6851038 PAU_01212 PAU_01213 dsbC recJ TRUE 0.942 6.000 0.082 1.000 N NA
 6851038 6851039 PAU_01213 PAU_01214 recJ usp FALSE 0.017 546.000 0.000 1.000   NA
 6851039 6851040 PAU_01214 PAU_01215 usp   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851040 6851041 PAU_01215 PAU_01216     FALSE 0.006 1550.000 0.000 NA   NA
 6851041 6851042 PAU_01216 PAU_01217   col TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851042 6851043 PAU_01217 PAU_01218 col imm TRUE 0.831 -16.000 0.000 1.000   NA
 6851043 6851044 PAU_01218 PAU_01219 imm col FALSE 0.185 175.000 0.000 1.000   NA
 6851044 6851045 PAU_01219 PAU_01220 col   TRUE 0.831 -16.000 0.000 1.000   NA
 6851045 6851046 PAU_01220 PAU_01221     FALSE 0.080 245.000 0.000 NA   NA
 6851046 6851047 PAU_01221 PAU_01222     FALSE 0.076 250.000 0.000 NA   NA
 6851049 6851050 PAU_01224 PAU_01225   prfB FALSE 0.071 258.000 0.000 NA   NA
 6851050 6851051 PAU_01225 PAU_01226 prfB lysS TRUE 0.995 10.000 0.162 0.045 Y NA
 6851051 6851052 PAU_01226 PAU_t015 lysS   FALSE 0.239 148.000 0.000 NA   NA
 6851052 6851053 PAU_t015 PAU_01227     FALSE 0.027 416.000 0.000 NA   NA
 6851053 6851054 PAU_01227 PAU_01228   pqqE-4 FALSE 0.014 641.000 0.000 1.000   NA
 6851054 6851055 PAU_01228 PAU_01229 pqqE-4 DAK TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6851055 6851056 PAU_01229 PAU_01230 DAK yfaO FALSE 0.265 81.000 0.000 1.000 N NA
 6851060 6851061 PAU_01234 PAU_01235 prpB prpC TRUE 0.928 62.000 0.502 1.000 N NA
 6851061 6851062 PAU_01235 PAU_01236 prpC prpD TRUE 0.873 59.000 0.216 1.000   NA
 6851062 6851063 PAU_01236 PAU_01237 prpD prpE TRUE 0.666 71.000 0.038 0.001   NA
 6851064 6851065 PAU_01238 PAU_01239     FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6851066 6851067 PAU_01240 PAU_01241   oprC FALSE 0.105 216.000 0.000 NA   NA
 6851069 10702242 PAU_01243s PAU_01243 norM   TRUE 0.743 -131.000 0.000 NA   NA
 10702242 6851070 PAU_01243 PAU_01244     FALSE 0.006 2082.000 0.000 NA   NA
 6851070 6851071 PAU_01244 PAU_01245     TRUE 0.912 95.000 0.556 NA   NA
 6851071 6851072 PAU_01245 PAU_01246     TRUE 0.901 53.000 0.222 1.000   NA
 6851072 6851073 PAU_01246 PAU_01247   tonB FALSE 0.380 84.000 0.000 0.078 N NA
 6851075 6851076 PAU_01249 PAU_01250 lip-1   TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6851078 6851079 PAU_01252 PAU_01253   prpA FALSE 0.350 108.000 0.000 NA   NA
 6851079 6851080 PAU_01253 PAU_01254 prpA ybcA FALSE 0.023 445.000 0.000 NA   NA
 6851080 6851081 PAU_01254 PAU_01255 ybcA   FALSE 0.005 484.000 0.014 NA N NA
 6851081 6851082 PAU_01255 PAU_01256     TRUE 0.426 82.000 0.000 NA   NA
 6851082 6851083 PAU_01256 PAU_01257   fic TRUE 0.948 55.000 0.429 NA   NA
 6851083 6851084 PAU_01257 PAU_01258 fic scrK FALSE 0.003 1151.000 0.000 1.000 N NA
 6851084 6851085 PAU_01258 PAU_01259 scrK   FALSE 0.144 191.000 0.000 NA   NA
 6851085 6851086 PAU_01259 PAU_01260   scrA TRUE 0.524 70.000 0.050 NA   NA
 6851086 6851087 PAU_01260 PAU_01261 scrA scrB TRUE 0.998 0.000 0.475 1.000 Y NA
 6851087 6851088 PAU_01261 PAU_01262 scrB   FALSE 0.296 129.000 0.000 NA   NA
 6851088 6851089 PAU_01262 PAU_01263   ISPlu16B FALSE 0.330 117.000 0.000 NA   NA
 6851089 6851090 PAU_01263 PAU_01264 ISPlu16B psu TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6851090 6851091 PAU_01264 PAU_01265 psu psu TRUE 0.758 -85.000 0.000 NA   NA
 6851092 6851093 PAU_01266 PAU_01267     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851093 6851094 PAU_01267 PAU_s010     FALSE 0.037 357.000 0.000 NA   NA
 6851094 6851095 PAU_s010 PAU_01268     TRUE 0.746 -122.000 0.000 NA   NA
 6851095 6851096 PAU_01268 PAU_01269   smpB TRUE 0.571 48.000 0.003 NA   NA
 6851097 6851098 PAU_01270 PAU_01271 yfjG yfjF TRUE 0.949 -7.000 0.124 NA   NA
 6851099 6851100 PAU_01272 PAU_01273 smpA recN FALSE 0.232 113.000 0.049 1.000 N NA
 6851100 6851101 PAU_01273 PAU_01274 recN ppnK TRUE 0.608 88.000 0.170 1.000 N NA
 6851101 6851102 PAU_01274 PAU_01275 ppnK   TRUE 0.933 15.000 0.000 NA   NA
 6851102 6851103 PAU_01275 PAU_01276   ung FALSE 0.123 205.000 0.000 NA   NA
 6851104 6851105 PAU_01277 PAU_01278 yplA   TRUE 0.992 16.000 0.375 NA   NA
 6851107 6851108 PAU_01280 PAU_01281     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851108 6851109 PAU_01281 PAU_01282   pcrB TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6851109 6851110 PAU_01282 PAU_01283 pcrB idi TRUE 0.935 16.000 0.000 1.000   NA
 6851110 6851111 PAU_01283 PAU_01284 idi   FALSE 0.238 94.000 0.000 1.000 N NA
 6851111 6851112 PAU_01284 PAU_01285     FALSE 0.015 572.000 0.000 NA   NA
 6851112 6851113 PAU_01285 PAU_01286     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851113 6851114 PAU_01286 PAU_01287     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851114 6851115 PAU_01287 PAU_01288     FALSE 0.072 269.000 0.000 1.000   NA
 6851115 6851116 PAU_01288 PAU_01289     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6851116 6851117 PAU_01289 PAU_01290     TRUE 0.798 38.000 0.000 NA   NA
 6851117 6851118 PAU_01290 PAU_01291     TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6851118 6851119 PAU_01291 PAU_01292     TRUE 0.413 86.000 0.000 NA   NA
 6851119 6851120 PAU_01292 PAU_01293     FALSE 0.314 129.000 0.000 1.000   NA
 6851120 6851121 PAU_01293 PAU_01294   hlyD TRUE 0.894 -7.000 0.000 1.000   NA
 6851121 6851122 PAU_01294 PAU_01295 hlyD   FALSE 0.009 811.000 0.000 NA   NA
 6851126 6851127 PAU_01299 PAU_01300 rpoE rseA TRUE 0.983 40.000 0.705 NA N NA
 6851127 6851128 PAU_01300 PAU_01301 rseA rseB TRUE 0.999 3.000 0.856 NA Y NA
 6851128 6851129 PAU_01301 PAU_01302 rseB rseC TRUE 0.999 0.000 0.609 NA Y NA
 6851129 6851130 PAU_01302 PAU_01303 rseC lepA FALSE 0.069 196.000 0.045 NA N NA
 6851130 6851131 PAU_01303 PAU_01304 lepA lepB TRUE 0.977 21.000 0.187 1.000   NA
 6851131 6851132 PAU_01304 PAU_01305 lepB rnc FALSE 0.350 170.000 0.117 1.000   NA
 6851132 6851133 PAU_01305 PAU_01306 rnc era TRUE 0.981 -3.000 0.127 0.039   NA
 6851133 6851134 PAU_01306 PAU_01307 era recO TRUE 0.975 11.000 0.109 1.000   NA
 6851134 6851135 PAU_01307 PAU_01308 recO pdxJ TRUE 0.388 150.000 0.166 1.000 N NA
 6851135 6851136 PAU_01308 PAU_01309 pdxJ acpS TRUE 0.990 0.000 0.326 1.000 N NA
 6851137 6851138 PAU_01310 PAU_01311 yfhL   FALSE 0.024 443.000 0.000 NA   NA
 6851138 6851139 PAU_01311 PAU_01312     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851139 6851140 PAU_01312 PAU_01313     FALSE 0.065 271.000 0.000 NA   NA
 6851140 6851141 PAU_01313 PAU_01314     TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6851141 6851142 PAU_01314 PAU_01315     FALSE 0.029 403.000 0.000 NA   NA
 6851142 6851143 PAU_01315 PAU_01316     TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 6851143 6851144 PAU_01316 PAU_01317     FALSE 0.015 575.000 0.000 NA   NA
 6851144 6851145 PAU_01317 PAU_01318     FALSE 0.022 456.000 0.000 NA   NA
 6851146 6851147 PAU_01319 PAU_01320     FALSE 0.089 235.000 0.000 NA   NA
 6851148 6851149 PAU_01321 PAU_01322 adiA yfhD FALSE 0.172 127.000 0.000 1.000 N NA
 6851150 6851151 PAU_01323 PAU_01324   purL FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6851152 6851153 PAU_01325 PAU_s011     FALSE 0.025 430.000 0.000 NA   NA
 6851154 6851155 PAU_01326 PAU_01327 yfhK   TRUE 0.979 0.000 0.132 NA   NA
 6851155 6851156 PAU_01327 PAU_01328   yfhA TRUE 0.973 -3.000 0.130 NA   NA
 6851156 6851157 PAU_01328 PAU_01329 yfhA nadE TRUE 0.544 68.000 0.065 0.090 N NA
 6851157 6851158 PAU_01329 PAU_01330 nadE glnB TRUE 0.962 16.000 0.151 1.000 N NA
 6851158 6851159 PAU_01330 PAU_01331 glnB ehpF FALSE 0.014 641.000 0.000 1.000   NA
 6851159 6851160 PAU_01331 PAU_01332 ehpF ehpG TRUE 0.917 137.000 0.667 0.056   NA
 6851160 6851161 PAU_01332 PAU_01333 ehpG ehpG TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851161 6851162 PAU_01333 PAU_01334 ehpG   FALSE 0.073 254.000 0.000 NA   NA
 6851162 6851163 PAU_01334 PAU_01335     FALSE 0.212 158.000 0.000 NA   NA
 6851163 6851164 PAU_01335 PAU_01336     TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6851165 6851166 PAU_01337 PAU_01338   mxcG TRUE 0.872 64.000 0.000 0.006 Y NA
 6851166 6851167 PAU_01338 PAU_01339 mxcG mchD TRUE 0.669 37.000 0.000 1.000 N NA
 6851167 6851168 PAU_01339 PAU_01340 mchD mchC TRUE 0.992 19.000 0.429 NA   NA
 6851168 6851169 PAU_01340 PAU_01341 mchC   TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6851169 6851170 PAU_01341 PAU_01342   mchB FALSE 0.024 442.000 0.000 NA   NA
 6851171 6851172 PAU_01343 PAU_01344 mclA mchF TRUE 0.430 88.000 0.000 1.000   NA
 6851172 6851173 PAU_01344 PAU_01345 mchF mchF TRUE 0.851 40.000 0.000 0.061   NA
 6851173 6851174 PAU_01345 PAU_01346 mchF   FALSE 0.010 729.000 0.000 NA   NA
 6851174 6851175 PAU_01346 PAU_01347     TRUE 0.798 38.000 0.000 NA   NA
 6851175 6851176 PAU_01347 PAU_01348     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851176 6851177 PAU_01348 PAU_01349     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851177 6851178 PAU_01349 PAU_01350     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6851178 6851179 PAU_01350 PAU_01351     TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851181 6851182 PAU_01353 PAU_01354 N glyA FALSE 0.175 173.000 0.000 NA   NA
 6851182 6851183 PAU_01354 PAU_01355 glyA hcaT FALSE 0.179 184.000 0.044 1.000   NA
 6851183 6851184 PAU_01355 PAU_01356 hcaT treR TRUE 0.471 75.000 0.000 1.000   NA
 6851184 6851185 PAU_01356 PAU_01357 treR treB TRUE 0.419 145.000 0.168 1.000 N NA
 6851185 6851186 PAU_01357 PAU_01358 treB treC TRUE 0.977 76.000 0.650 1.000 Y NA
 6851188 6851189 PAU_01360 PAU_01361 trmJ iscR TRUE 0.515 88.000 0.126 1.000 N NA
 6851189 6851190 PAU_01361 PAU_01362 iscR iscS TRUE 0.935 51.000 0.424 1.000 N NA
 6851190 6851191 PAU_01362 PAU_01363 iscS nifU TRUE 0.983 26.000 0.448 1.000 N NA
 6851191 6851192 PAU_01363 PAU_01364 nifU iscA TRUE 0.891 104.000 0.359 0.003   NA
 6851192 6851193 PAU_01364 PAU_01365 iscA hscB TRUE 0.980 40.000 0.500 1.000   NA
 6851193 6851194 PAU_01365 PAU_01366 hscB hscA TRUE 0.999 12.000 0.634 1.000 Y NA
 6851194 6851195 PAU_01366 PAU_01367 hscA fdx TRUE 0.997 3.000 0.794 1.000 N NA
 6851195 6851196 PAU_01367 PAU_01368 fdx   TRUE 0.996 19.000 0.625 1.000   NA
 6851196 6851197 PAU_01368 PAU_01369   pepB TRUE 0.405 184.000 0.171 1.000   NA
 6851197 6851198 PAU_01369 PAU_01370 pepB   TRUE 0.964 35.000 0.253 NA   NA
 6851198 6851199 PAU_01370 PAU_01371     TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6851199 6851200 PAU_01371 PAU_01372   cysK FALSE 0.014 587.000 0.000 NA   NA
 6851200 6851201 PAU_01372 PAU_01373 cysK   TRUE 0.907 18.000 0.025 NA   NA
 6851201 6851202 PAU_01373 PAU_01374     FALSE 0.091 232.000 0.000 NA   NA
 6851202 6851203 PAU_01374 PAU_01375     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851203 6851204 PAU_01375 PAU_01376     FALSE 0.030 392.000 0.000 NA   NA
 6851204 6851205 PAU_01376 PAU_01377     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6851205 6851206 PAU_01377 PAU_01378     FALSE 0.215 157.000 0.000 NA   NA
 6851208 6851209 PAU_01380 PAU_01381   pbpC TRUE 0.977 55.000 0.711 1.000   NA
 6851209 6851210 PAU_01381 PAU_01382 pbpC ndk FALSE 0.072 144.000 0.008 1.000 N NA
 6851210 6851211 PAU_01382 PAU_01383 ndk yfgB FALSE 0.378 184.000 0.156 1.000   NA
 6851211 6851212 PAU_01383 PAU_01384 yfgB pilF TRUE 0.525 84.000 0.067 1.000   NA
 6851212 6851213 PAU_01384 PAU_01385 pilF yfgA TRUE 0.596 122.000 0.153 1.000   NA
 6851213 6851214 PAU_01385 PAU_01386 yfgA ispG TRUE 0.834 71.000 0.233 1.000   NA
 6851214 6851215 PAU_01386 PAU_01387 ispG hisS TRUE 0.583 121.000 0.207 1.000 N NA
 6851215 6851216 PAU_01387 PAU_01388 hisS   TRUE 0.990 12.000 0.259 1.000   NA
 6851216 6851217 PAU_01388 PAU_01389     TRUE 0.995 14.000 0.492 1.000   NA
 6851217 6851218 PAU_01389 PAU_01390   engA FALSE 0.243 269.000 0.203 1.000   NA
 6851219 6851220 PAU_01391 PAU_01392     FALSE 0.207 160.000 0.000 NA   NA
 6851220 6851221 PAU_01392 PAU_01393   hemF FALSE 0.098 232.000 0.000 1.000   NA
 6851224 6851225 PAU_01396 PAU_01397   cysP FALSE 0.053 296.000 0.000 NA   NA
 6851225 6851226 PAU_01397 PAU_01398 cysP cysU TRUE 0.996 0.000 0.479 0.002 N NA
 6851226 6851227 PAU_01398 PAU_01399 cysU cysW TRUE 0.997 0.000 0.583 0.001 N NA
 6851227 6851228 PAU_01399 PAU_01400 cysW cysA TRUE 0.988 -7.000 0.180 1.000 Y NA
 6851228 6851229 PAU_01400 PAU_01401 cysA cysM FALSE 0.169 140.000 0.049 1.000 N NA
 6851230 6851231 PAU_01402 PAU_01403 crr ptsI TRUE 0.952 50.000 0.114 0.006 Y NA
 6851231 6851232 PAU_01403 PAU_01404 ptsI ptsH TRUE 0.611 185.000 0.088 0.006 Y NA
 6851232 6851233 PAU_01404 PAU_01405 ptsH cysK FALSE 0.014 329.000 0.019 1.000 N NA
 6851233 6851234 PAU_01405 PAU_01406 cysK cysZ TRUE 0.769 122.000 0.122 1.000 Y NA
 6851235 6851236 PAU_01407 PAU_01408 zipA ligA FALSE 0.253 62.000 0.013 1.000 N NA
 6851236 6851237 PAU_01408 PAU_01409 ligA nupC FALSE 0.097 170.000 0.000 1.000 N NA
 6851237 6851238 PAU_01409 PAU_01410 nupC   FALSE 0.361 85.000 0.022 NA   NA
 6851239 6851240 PAU_t016 PAU_t017     TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6851240 6851241 PAU_t017 PAU_01411   gltX FALSE 0.069 263.000 0.000 NA   NA
 6851242 6851243 PAU_t018 PAU_t019     TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6851243 6851244 PAU_t019 PAU_t020     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6851244 6851245 PAU_t020 PAU_t021     TRUE 0.719 45.000 0.000 NA   NA
 6851245 6851246 PAU_t021 PAU_t022     TRUE 0.755 42.000 0.000 NA   NA
 6851246 6851247 PAU_t022 PAU_t023     TRUE 0.731 44.000 0.000 NA   NA
 6851247 6851248 PAU_t023 PAU_t024     FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6851248 6851249 PAU_t024 PAU_t025     FALSE 0.350 108.000 0.000 NA   NA
 6851249 6851250 PAU_t025 PAU_t026     FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6851250 6851251 PAU_t026 PAU_t027     FALSE 0.350 108.000 0.000 NA   NA
 6851251 6851252 PAU_t027 PAU_01412   glk FALSE 0.050 307.000 0.000 NA   NA
 6851256 6851257 PAU_01415 PAU_01416   fadI FALSE 0.072 292.000 0.061 NA   NA
 6851257 6851258 PAU_01416 PAU_01417 fadI fadJ TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 6851258 6851259 PAU_01417 PAU_01418 fadJ sixA FALSE 0.020 334.000 0.000 1.000 N NA
 6851261 6851262 PAU_01420 PAU_01421 hutI hutG TRUE 0.964 18.000 0.171 1.000 N NA
 6851262 6851263 PAU_01421 PAU_01422 hutG hutC FALSE 0.282 108.000 0.062 1.000 N NA
 6851263 6851264 PAU_01422 PAU_01423 hutC hutU FALSE 0.011 444.000 0.037 1.000 N NA
 6851264 6851265 PAU_01423 PAU_01424 hutU hutH TRUE 0.998 9.000 0.315 0.001 Y NA
 6851265 6851266 PAU_01424 PAU_01425 hutH   TRUE 0.677 86.000 0.008 1.000 Y NA
 6851266 6851267 PAU_01425 PAU_01426     FALSE 0.044 236.000 0.000 1.000 N NA
 6851267 6851268 PAU_01426 PAU_01427   aroC TRUE 0.407 81.000 0.081 1.000 N NA
 6851268 6851269 PAU_01427 PAU_01428 aroC   FALSE 0.326 88.000 0.005 1.000   NA
 6851269 6851270 PAU_01428 PAU_01429     TRUE 0.962 24.000 0.153 NA   NA
 6851270 6851271 PAU_01429 PAU_01430     TRUE 0.991 22.000 0.425 NA   NA
 6851272 6851273 PAU_01431 PAU_01432   dinJ TRUE 0.905 -4.000 0.000 NA   NA
 6851273 6851274 PAU_01432 PAU_01433 dinJ yfcK FALSE 0.361 104.000 0.000 NA   NA
 6851274 6851275 PAU_01433 PAU_01434 yfcK   TRUE 0.462 170.000 0.000 1.000 Y NA
 6851277 6851278 PAU_01436 PAU_01437   env FALSE 0.016 543.000 0.000 NA   NA
 6851279 6851280 PAU_01438 PAU_01439 fabB   FALSE 0.077 248.000 0.000 NA   NA
 6851281 6851282 PAU_01440 PAU_01441 tctA tctB TRUE 0.986 11.000 0.192 NA   NA
 6851282 6851283 PAU_01441 PAU_01442 tctB tctC TRUE 0.993 15.000 0.426 NA   NA
 6851284 6851285 PAU_01443 PAU_01444     FALSE 0.026 424.000 0.000 NA   NA
 6851285 6851286 PAU_01444 PAU_01445   tctD FALSE 0.013 620.000 0.000 NA   NA
 6851286 6851287 PAU_01445 PAU_01446 tctD tctE TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 6851289 6851290 PAU_01448 PAU_01449   pdxB TRUE 0.424 90.000 0.000 1.000   NA
 6851290 6851291 PAU_01449 PAU_01450 pdxB usg TRUE 0.929 57.000 0.097 0.009 Y NA
 6851291 6851292 PAU_01450 PAU_01451 usg truA TRUE 0.598 42.000 0.040 1.000 N NA
 6851292 6851293 PAU_01451 PAU_01452 truA dedA TRUE 0.689 47.000 0.038 NA   NA
 6851293 6851294 PAU_01452 PAU_01453 dedA accD FALSE 0.307 102.000 0.020 NA   NA
 6851294 6851295 PAU_01453 PAU_01454 accD folC TRUE 0.981 -7.000 0.383 1.000 N NA
 6851295 6851296 PAU_01454 PAU_01455 folC dedD TRUE 0.966 -10.000 0.216 NA   NA
 6851296 6851297 PAU_01455 PAU_01456 dedD cvpA FALSE 0.246 200.000 0.116 NA   NA
 6851297 6851298 PAU_01456 PAU_01457 cvpA purF TRUE 0.989 15.000 0.262 1.000   NA
 6851298 6851299 PAU_01457 PAU_01458 purF ubiX TRUE 0.643 44.000 0.056 1.000 N NA
 6851300 6851301 PAU_01459 PAU_01460   yfcG FALSE 0.289 128.000 0.035 NA   NA
 6851302 6851303 PAU_01461 PAU_01462 pdl yfcD FALSE 0.026 442.000 0.000 1.000   NA
 6851303 6851304 PAU_01462 PAU_01463 yfcD   FALSE 0.021 472.000 0.000 NA   NA
 6851304 6851305 PAU_01463 PAU_01464     FALSE 0.059 284.000 0.000 NA   NA
 6851305 6851306 PAU_01464 PAU_01465     TRUE 0.805 -19.000 0.000 NA   NA
 6851307 6851308 PAU_01466 PAU_01467     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851308 6851309 PAU_01467 PAU_01468   lsrG FALSE 0.023 448.000 0.000 NA   NA
 6851309 6851310 PAU_01468 PAU_01469 lsrG yneB TRUE 0.940 12.000 0.028 1.000   NA
 6851311 6851312 PAU_01470 PAU_01471 lsrR   TRUE 0.661 87.000 0.200 1.000 N NA
 6851312 6851313 PAU_01471 PAU_01472   sypC FALSE 0.003 1648.000 0.000 1.000 N NA
 6851314 6851315 PAU_01473 PAU_01474 cdiA   FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 6851315 6851316 PAU_01474 PAU_01475     TRUE 0.936 14.000 0.000 NA   NA
 6851316 6851317 PAU_01475 PAU_01476     FALSE 0.046 320.000 0.000 NA   NA
 6851317 6851318 PAU_01476 PAU_01477     TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6851318 6851319 PAU_01477 PAU_01478   cdiA TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851319 6851320 PAU_01478 PAU_01479 cdiA   TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6851320 6851321 PAU_01479 PAU_01480     TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6851321 6851322 PAU_01480 PAU_01481     FALSE 0.057 287.000 0.000 NA   NA
 6851322 6851323 PAU_01481 PAU_01482     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851323 6851324 PAU_01482 PAU_01483   fhaB2 FALSE 0.047 316.000 0.000 NA   NA
 6851324 6851325 PAU_01483 PAU_01484 fhaB2   FALSE 0.149 188.000 0.000 NA   NA
 6851325 6851326 PAU_01484 PAU_01485     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851326 6851327 PAU_01485 PAU_01486     TRUE 0.842 57.000 0.000 NA Y NA
 6851328 6851329 PAU_01487 PAU_01488   yadA TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6851330 6851331 PAU_01489 PAU_01490     FALSE 0.023 445.000 0.000 NA   NA
 6851332 6851333 PAU_01491 PAU_01492 sypB   FALSE 0.030 389.000 0.000 NA   NA
 6851334 6851335 PAU_01493 PAU_01494     TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6851335 6851336 PAU_01494 PAU_01495   tnp FALSE 0.076 249.000 0.000 NA   NA
 6851336 6851337 PAU_01495 PAU_01496 tnp   FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6851338 6851339 PAU_01497 PAU_01498 argM astA TRUE 0.998 22.000 0.750 1.000 Y NA
 6851339 6851340 PAU_01498 PAU_01499 astA astD TRUE 0.940 4.000 0.077 1.000 N NA
 6851340 6851341 PAU_01499 PAU_01500 astD astB TRUE 0.969 28.000 0.306 1.000 N NA
 6851341 6851342 PAU_01500 PAU_01501 astB astE TRUE 0.992 13.000 0.126 1.000 Y NA
 6851342 6851343 PAU_01501 PAU_01502 astE cycA TRUE 0.827 102.000 0.143 1.000 Y NA
 6851343 6851344 PAU_01502 PAU_01503 cycA   FALSE 0.013 626.000 0.000 NA   NA
 6851344 6851345 PAU_01503 PAU_01504     FALSE 0.015 572.000 0.000 NA   NA
 6851345 6851346 PAU_01504 PAU_01505     FALSE 0.026 418.000 0.000 NA   NA
 6851347 6851348 PAU_01506 PAU_01507     TRUE 0.950 35.000 0.190 NA   NA
 6851351 6851352 PAU_01510 PAU_01511   yfcA FALSE 0.067 267.000 0.000 NA   NA
 6851353 6851354 PAU_01512 PAU_01513 pta ackA TRUE 0.939 85.000 0.634 1.000   NA
 6851355 6851356 PAU_01514 PAU_01515 yfbV yfbS FALSE 0.128 200.000 0.000 NA   NA
 6851357 6851358 PAU_01516 PAU_01517 yfbR yfbQ FALSE 0.023 692.000 0.104 1.000   NA
 6851361 6851362 PAU_01520 PAU_01521 nuoA nuoB TRUE 0.998 17.000 0.377 0.002 Y NA
 6851362 6851363 PAU_01521 PAU_01522 nuoB nuoC TRUE 0.978 122.000 0.691 0.002 Y NA
 6851363 6851364 PAU_01522 PAU_01523 nuoC nuoE TRUE 0.999 3.000 0.407 0.004 Y NA
 6851364 6851365 PAU_01523 PAU_01524 nuoE nuoF TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 6851365 6851366 PAU_01524 PAU_01525 nuoF nuoG TRUE 0.942 67.000 0.180 0.004 Y NA
 6851366 6851367 PAU_01525 PAU_01526 nuoG nuoH TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 6851367 6851368 PAU_01526 PAU_01527 nuoH nuoI TRUE 0.998 14.000 0.423 0.004 Y NA
 6851368 6851369 PAU_01527 PAU_01528 nuoI nuoJ TRUE 0.999 13.000 0.428 0.004 Y NA
 6851369 6851370 PAU_01528 PAU_01529 nuoJ nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 6851370 6851371 PAU_01529 PAU_01530 nuoK nuoL TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 6851371 6851372 PAU_01530 PAU_01531 nuoL nuoM TRUE 0.999 21.000 0.713 0.001 Y NA
 6851372 6851373 PAU_01531 PAU_01532 nuoM nuoN TRUE 0.999 7.000 0.437 0.001 Y NA
 6851374 6851375 PAU_01533 PAU_01534   xaxA TRUE 0.719 45.000 0.000 NA   NA
 6851376 6851377 PAU_01535 PAU_01536   menF TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6851377 6851378 PAU_01536 PAU_01537 menF menF TRUE 0.788 39.000 0.000 NA   NA
 6851378 6851379 PAU_01537 PAU_01538 menF menD TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6851379 6851380 PAU_01538 PAU_01539 menD   TRUE 0.992 -3.000 0.355 NA   NA
 6851380 6851381 PAU_01539 PAU_01540   menB TRUE 0.991 3.000 0.280 NA   NA
 6851381 6851382 PAU_01540 PAU_01541 menB menC TRUE 0.996 0.000 0.171 0.002 Y NA
 6851382 6851383 PAU_01541 PAU_01542 menC menE TRUE 0.975 -12.000 0.283 0.002 N NA
 6851383 6851384 PAU_01542 PAU_01543 menE   TRUE 0.785 -30.000 0.000 NA   NA
 6851384 6851385 PAU_01543 PAU_01544     TRUE 0.987 11.000 0.211 NA   NA
 6851389 6851390 PAU_01548 PAU_01549     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851390 6851391 PAU_01549 PAU_01550     FALSE 0.209 159.000 0.000 NA   NA
 6851392 6851393 PAU_01551 PAU_01552     TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6851393 6851394 PAU_01552 PAU_01553     TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 6851394 6851395 PAU_01553 PAU_01554   yfaE TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6851395 6851396 PAU_01554 PAU_01555 yfaE nrdB TRUE 0.889 0.000 0.034 1.000 N NA
 6851396 6851397 PAU_01555 PAU_01556 nrdB nrdA TRUE 0.998 13.000 0.333 0.001 Y NA
 6851397 6851398 PAU_01556 PAU_01557 nrdA ubiG FALSE 0.017 366.000 0.000 1.000 N NA
 6851399 6851400 PAU_01558 PAU_01559 gyrA rcsC FALSE 0.037 277.000 0.013 0.087 N NA
 6851401 6851402 PAU_01560 PAU_01561 rcsB yojN TRUE 0.999 4.000 0.558 1.000 Y NA
 6851403 6851404 PAU_01562 PAU_t029     TRUE 0.409 88.000 0.000 NA   NA
 6851406 6851407 PAU_t030 PAU_01564     FALSE 0.011 670.000 0.000 NA   NA
 6851407 6851408 PAU_01564 PAU_01565   Q FALSE 0.064 272.000 0.000 NA   NA
 6851408 6851409 PAU_01565 PAU_01566 Q   FALSE 0.031 387.000 0.000 NA   NA
 6851409 6851410 PAU_01566 PAU_01567     TRUE 0.973 4.000 0.100 NA   NA
 6851410 6851411 PAU_01567 PAU_01568     TRUE 0.972 10.000 0.100 NA   NA
 6851411 6851412 PAU_01568 PAU_01569     FALSE 0.338 113.000 0.000 NA   NA
 6851412 6851413 PAU_01569 PAU_01570     FALSE 0.139 193.000 0.000 NA   NA
 6851413 6851414 PAU_01570 PAU_01571     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851414 6851415 PAU_01571 PAU_01572     TRUE 0.824 -15.000 0.000 NA   NA
 6851415 6851416 PAU_01572 PAU_01573     TRUE 0.546 63.000 0.000 NA   NA
 6851416 6851417 PAU_01573 PAU_01574     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851417 6851418 PAU_01574 PAU_01575     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851418 6851419 PAU_01575 PAU_01576     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6851419 6851420 PAU_01576 PAU_01577     TRUE 0.998 9.000 0.792 NA   NA
 6851420 6851421 PAU_01577 PAU_01578     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851422 6851423 PAU_01579 PAU_01580 wabK waaX TRUE 0.948 35.000 0.000 1.000 Y NA
 6851425 6851426 PAU_01582 PAU_01583     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851426 6851427 PAU_01583 PAU_01584     TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6851427 6851428 PAU_01584 PAU_01585     FALSE 0.284 132.000 0.000 NA   NA
 6851429 6851430 PAU_01586 PAU_01587     FALSE 0.007 920.000 0.000 NA   NA
 6851430 6851431 PAU_01587 PAU_01588     FALSE 0.034 376.000 0.000 NA   NA
 6851431 6851432 PAU_01588 PAU_01589     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6851433 6851434 PAU_01590 PAU_01591     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851435 6851436 PAU_01592 PAU_01593   ycfB TRUE 0.688 49.000 0.000 1.000   NA
 6851436 6851437 PAU_01593 PAU_01594 ycfB   FALSE 0.010 741.000 0.000 NA   NA
 6851437 6851438 PAU_01594 PAU_01595     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6851438 6851439 PAU_01595 PAU_01596   DKFZp469A1918 TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851440 6851441 PAU_01597 PAU_01598     FALSE 0.029 399.000 0.000 NA   NA
 6851441 6851442 PAU_01598 PAU_01599   dmsD FALSE 0.017 561.000 0.000 1.000   NA
 6851442 6851443 PAU_01599 PAU_01600 dmsD   FALSE 0.024 437.000 0.000 NA   NA
 6851444 6851445 PAU_01601 PAU_01602 cbiA cobD TRUE 0.993 -3.000 0.124 0.008 Y NA
 6851445 6851446 PAU_01602 PAU_01603 cobD cbiC TRUE 0.993 15.000 0.107 0.008 Y NA
 6851446 6851447 PAU_01603 PAU_01604 cbiC cbiD TRUE 0.995 -3.000 0.168 0.008 Y NA
 6851447 6851448 PAU_01604 PAU_01605 cbiD cbiE TRUE 0.994 -3.000 0.126 0.008 Y NA
 6851448 6851449 PAU_01605 PAU_01606 cbiE cbiT TRUE 0.994 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 6851449 6851450 PAU_01606 PAU_01607 cbiT cbiF TRUE 0.976 -10.000 0.056 0.008 Y NA
 6851450 6851451 PAU_01607 PAU_01608 cbiF cbiG TRUE 0.994 -19.000 0.397 0.008 Y NA
 6851451 6851452 PAU_01608 PAU_01609 cbiG cbiH TRUE 0.997 -6.000 0.352 0.008 Y NA
 6851452 6851453 PAU_01609 PAU_01610 cbiH cbiJ TRUE 0.998 -3.000 0.423 0.008 Y NA
 6851453 6851454 PAU_01610 PAU_01611 cbiJ cbiK TRUE 0.985 2.000 0.029 1.000 Y NA
 6851454 6851455 PAU_01611 PAU_01612 cbiK cbiL TRUE 0.987 0.000 0.048 1.000 Y NA
 6851455 6851456 PAU_01612 PAU_01613 cbiL cobQ TRUE 0.980 19.000 0.003 0.008 Y NA
 6851456 6851457 PAU_01613 PAU_01614 cobQ cobU TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 6851457 6851458 PAU_01614 PAU_01615 cobU cobS TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 6851460 6851461 PAU_01617 PAU_01618 cobC cobT TRUE 0.856 5.000 0.023 1.000 N NA
 6851463 6851464 PAU_01620 PAU_01621     FALSE 0.028 411.000 0.000 NA   NA
 6851464 6851465 PAU_01621 PAU_01622     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6851466 6851467 PAU_01623 PAU_01624     TRUE 0.574 60.000 0.000 NA   NA
 6851467 6851468 PAU_01624 PAU_01625     TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6851468 6851469 PAU_01625 PAU_01626   mcoln1 TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6851469 6851470 PAU_01626 PAU_01627 mcoln1   TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 6851471 6851472 PAU_01628 PAU_01629 LytE   FALSE 0.045 321.000 0.000 NA   NA
 6851473 6851474 PAU_01630 PAU_01631   eutC FALSE 0.078 256.000 0.000 1.000   NA
 6851474 6851475 PAU_01631 PAU_01632 eutC eutB TRUE 0.983 23.000 0.000 0.001 Y NA
 6851475 6851476 PAU_01632 PAU_01633 eutB eutA TRUE 0.993 12.000 0.167 NA Y NA
 6851477 6851478 PAU_01634 PAU_01635 cysG cobD TRUE 0.737 34.000 0.047 1.000 N NA
 6851478 6851479 PAU_01635 PAU_01636 cobD pduX TRUE 0.941 -52.000 0.300 1.000 N NA
 6851479 6851480 PAU_01636 PAU_01637 pduX cysG TRUE 0.851 18.000 0.000 1.000 N NA
 6851480 6851481 PAU_01637 PAU_01638 cysG btuR TRUE 0.986 1.000 0.000 1.000 Y NA
 6851482 6851483 PAU_01639 PAU_01640     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6851484 6851485 PAU_01641 PAU_01642     FALSE 0.196 165.000 0.000 NA   NA
 6851485 6851486 PAU_01642 PAU_01643     FALSE 0.262 138.000 0.000 NA   NA
 6851486 6851487 PAU_01643 PAU_01644     TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6851487 6851488 PAU_01644 PAU_01645     FALSE 0.028 405.000 0.000 NA   NA
 6851488 6851489 PAU_01645 PAU_01646   tfa TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6851489 6851490 PAU_01646 PAU_01647 tfa   FALSE 0.038 353.000 0.000 NA   NA
 6851490 6851491 PAU_01647 PAU_01648     FALSE 0.044 326.000 0.000 NA   NA
 6851491 6851492 PAU_01648 PAU_01649     FALSE 0.039 349.000 0.000 NA   NA
 6851492 6851493 PAU_01649 PAU_01650     FALSE 0.034 369.000 0.000 NA   NA
 6851493 6851494 PAU_01650 PAU_01651     FALSE 0.017 523.000 0.000 NA   NA
 6851494 6851495 PAU_01651 PAU_01652     FALSE 0.075 251.000 0.000 NA   NA
 6851495 6851496 PAU_01652 PAU_01653   stfE FALSE 0.013 610.000 0.000 NA   NA
 6851496 6851497 PAU_01653 PAU_01654 stfE   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851497 6851498 PAU_01654 PAU_01655     FALSE 0.040 339.000 0.000 NA   NA
 6851498 6851499 PAU_01655 PAU_01656     FALSE 0.066 269.000 0.000 NA   NA
 6851499 6851500 PAU_01656 PAU_01657     FALSE 0.021 468.000 0.000 NA   NA
 6851500 6851501 PAU_01657 PAU_01658     FALSE 0.009 767.000 0.000 NA   NA
 6851502 6851503 PAU_01659 PAU_01660 insI ISPlu1B TRUE 0.516 66.000 0.000 NA   NA
 6851503 6851504 PAU_01660 PAU_01661 ISPlu1B waaX FALSE 0.205 161.000 0.000 NA   NA
 6851504 6851505 PAU_01661 PAU_t031 waaX   FALSE 0.017 539.000 0.000 NA   NA
 6851505 6851506 PAU_t031 PAU_01662   yejM TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6851506 6851507 PAU_01662 PAU_01663 yejM yejL TRUE 0.811 33.000 0.027 NA   NA
 6851509 6851510 PAU_01665 PAU_01666 rplY yejH FALSE 0.177 157.000 0.024 0.019 N NA
 6851511 6851512 PAU_01667 PAU_01668   rsuA TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851512 6851513 PAU_01668 PAU_01669 rsuA bcr TRUE 0.830 44.000 0.145 1.000 N NA
 6851513 6851514 PAU_01669 PAU_01670 bcr   FALSE 0.375 99.000 0.000 NA   NA
 6851514 6851515 PAU_01670 PAU_01671   yejG FALSE 0.011 690.000 0.000 NA   NA
 6851516 6851517 PAU_01672 PAU_01673 spr   FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6851519 6851520 PAU_01675 PAU_01676 yeiP mtr TRUE 0.402 139.000 0.153 1.000 N NA
 6851520 6851521 PAU_01676 PAU_01677 mtr   FALSE 0.256 118.000 0.060 1.000 N NA
 6851523 6851524 PAU_01679 PAU_01680 nfo yeiH FALSE 0.346 111.000 0.040 NA   NA
 6851525 6851526 PAU_01681 PAU_01682 yeiE lysP TRUE 0.398 160.000 0.185 1.000 N NA
 6851526 6851527 PAU_01682 PAU_01683 lysP   FALSE 0.020 335.000 0.000 1.000 N NA
 6851527 6851528 PAU_01683 PAU_01684     TRUE 0.824 123.000 0.175 1.000 Y NA
 6851528 6851529 PAU_01684 PAU_01685   fepC TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 6851531 6851532 PAU_01687 PAU_01688   yeeF FALSE 0.009 681.000 0.000 0.073 N NA
 6851532 6851533 PAU_01688 PAU_01689 yeeF   TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6851533 6851534 PAU_01689 PAU_01690   dld TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6851536 6851537 PAU_01692 PAU_01693     TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 6851537 6851538 PAU_01693 PAU_01694   yeeX FALSE 0.026 419.000 0.000 NA   NA
 6851539 6851540 PAU_01695 PAU_01696   rne FALSE 0.052 163.000 0.005 1.000 N NA
 6851540 6851541 PAU_01696 PAU_s012 rne   TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6851544 6851545 PAU_01699 PAU_01700 yceD rpmF TRUE 0.996 13.000 0.599 NA   NA
 6851545 6851546 PAU_01700 PAU_01701 rpmF plsX TRUE 0.976 31.000 0.418 1.000 N NA
 6851546 6851547 PAU_01701 PAU_01702 plsX fabH TRUE 0.998 7.000 0.380 0.004 Y NA
 6851547 6851548 PAU_01702 PAU_01703 fabH fabD TRUE 0.995 19.000 0.182 0.004 Y NA
 6851548 6851549 PAU_01703 PAU_01704 fabD fabG TRUE 0.999 9.000 0.432 0.004 Y NA
 6851549 6851550 PAU_01704 PAU_01705 fabG acpP TRUE 0.894 155.000 0.321 0.004 Y NA
 6851550 6851551 PAU_01705 PAU_01706 acpP fabF TRUE 0.950 75.000 0.346 1.000 Y NA
 6851551 6851552 PAU_01706 PAU_01707 fabF pabC FALSE 0.176 249.000 0.187 1.000 N NA
 6851552 6851553 PAU_01707 PAU_01708 pabC yceG TRUE 0.957 33.000 0.204 NA   NA
 6851553 6851554 PAU_01708 PAU_01709 yceG tmk TRUE 0.984 -3.000 0.209 NA   NA
 6851554 6851555 PAU_01709 PAU_01710 tmk holB TRUE 0.982 0.000 0.211 1.000 N NA
 6851555 6851556 PAU_01710 PAU_01711 holB ycfH TRUE 0.952 31.000 0.000 NA Y NA
 6851556 6851557 PAU_01711 PAU_01712 ycfH hinT FALSE 0.060 197.000 0.000 NA N NA
 6851557 6851558 PAU_01712 PAU_01713 hinT ycfM FALSE 0.036 299.000 0.010 NA   NA
 6851558 6851559 PAU_01713 PAU_01714 ycfM thiK TRUE 0.973 -13.000 0.310 NA   NA
 6851561 6851562 PAU_01716 PAU_01717 nagZ ndh FALSE 0.009 487.000 0.000 1.000 N NA
 6851563 6851564 PAU_01718 PAU_01719   yiaC FALSE 0.065 282.000 0.000 1.000   NA
 6851564 6851565 PAU_01719 PAU_01720 yiaC pvcB FALSE 0.146 195.000 0.000 1.000   NA
 6851565 6851566 PAU_01720 PAU_01721 pvcB pvcA TRUE 0.999 13.000 0.630 NA Y NA
 6851566 6851567 PAU_01721 PAU_01722 pvcA   FALSE 0.363 103.000 0.000 NA   NA
 6851567 6851568 PAU_01722 PAU_01723   mfd FALSE 0.015 563.000 0.000 NA   NA
 6851568 6851569 PAU_01723 PAU_01724 mfd   FALSE 0.030 389.000 0.000 NA   NA
 6851570 6851571 PAU_01725 PAU_01726   lolC FALSE 0.086 238.000 0.000 NA   NA
 6851571 6851572 PAU_01726 PAU_01727 lolC lolD TRUE 0.963 -7.000 0.175 0.041 N NA
 6851572 6851573 PAU_01727 PAU_01728 lolD lolE TRUE 0.976 0.000 0.125 0.041 N NA
 6851573 6851574 PAU_01728 PAU_01729 lolE cobB FALSE 0.236 78.000 0.030 1.000 N NA
 6851574 6851575 PAU_01729 PAU_01730 cobB pepT FALSE 0.323 56.000 0.019 1.000 N NA
 6851576 6851577 PAU_01731 PAU_01732   ycfD FALSE 0.054 293.000 0.000 NA   NA
 6851577 6851578 PAU_01732 PAU_01733 ycfD phoQ TRUE 0.884 84.000 0.408 NA   NA
 6851578 6851579 PAU_01733 PAU_01734 phoQ phoP TRUE 0.999 20.000 0.940 1.000 Y NA
 6851579 6851580 PAU_01734 PAU_01735 phoP purB FALSE 0.022 244.000 0.011 1.000 N NA
 6851580 6851581 PAU_01735 PAU_01736 purB   TRUE 0.939 24.000 0.093 NA   NA
 6851581 6851582 PAU_01736 PAU_01737   trmU TRUE 0.985 3.000 0.180 NA   NA
 6851582 6851583 PAU_01737 PAU_01738 trmU ymfB TRUE 0.592 85.000 0.158 1.000 N NA
 6851583 6851584 PAU_01738 PAU_01739 ymfB rluE TRUE 0.937 -10.000 0.182 1.000 N NA
 6851585 6851586 PAU_01740 PAU_01741 icdA   FALSE 0.311 130.000 0.000 1.000   NA
 6851586 6851587 PAU_01741 PAU_01742     FALSE 0.006 1656.000 0.000 NA   NA
 6851587 6851588 PAU_01742 PAU_01743     TRUE 0.864 28.000 0.000 NA   NA
 6851588 6851589 PAU_01743 PAU_01744   yaaJ FALSE 0.025 447.000 0.000 1.000   NA
 6851589 6851590 PAU_01744 PAU_01745 yaaJ ybjR FALSE 0.080 254.000 0.095 1.000 N NA
 6851592 6851593 PAU_01747 PAU_01748   yddG TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6851594 6851595 PAU_01749 PAU_01750 yidA   TRUE 0.787 86.000 0.222 1.000   NA
 6851596 6851597 PAU_01751 PAU_01752 yobG   FALSE 0.166 179.000 0.000 NA   NA
 6851597 6851598 PAU_01752 PAU_01753   aroP TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851599 6851600 PAU_01754 PAU_01755 crcA ERF2 TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6851601 6851602 PAU_01756 PAU_s013 cspC   FALSE 0.331 116.000 0.000 NA   NA
 6851602 6851603 PAU_s013 PAU_01757   thiD TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851606 6851607 PAU_01760 PAU_01761   cII TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851607 6851608 PAU_01761 PAU_01762 cII yegQ FALSE 0.006 1553.000 0.000 NA   NA
 6851608 6851609 PAU_01762 PAU_01763 yegQ   FALSE 0.090 197.000 0.008 NA   NA
 6851609 6851610 PAU_01763 PAU_01764   baeR TRUE 0.485 87.000 0.062 NA   NA
 6851610 6851611 PAU_01764 PAU_01765 baeR baeS TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 6851611 6851612 PAU_01765 PAU_01766 baeS mdtC TRUE 0.910 -3.000 0.070 NA N NA
 6851612 6851613 PAU_01766 PAU_01767 mdtC mdtB TRUE 0.992 -3.000 0.156 NA Y NA
 6851613 6851614 PAU_01767 PAU_01768 mdtB mdtA TRUE 0.994 0.000 0.500 NA N NA
 6851615 6851616 PAU_01769 PAU_01770   rihB FALSE 0.024 313.000 0.000 1.000 N NA
 6851616 6851617 PAU_01770 PAU_01771 rihB   TRUE 0.486 150.000 0.013 1.000 Y NA
 6851617 6851618 PAU_01771 PAU_01772     TRUE 0.969 9.000 0.013 0.001   NA
 6851618 6851619 PAU_01772 PAU_01773     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6851619 6851620 PAU_01773 PAU_01774     FALSE 0.154 186.000 0.000 NA   NA
 6851621 6851622 PAU_01775 PAU_01776 yfgG ppx TRUE 0.946 13.000 0.047 NA   NA
 6851622 6851623 PAU_01776 PAU_01777 ppx ppk TRUE 0.998 4.000 0.486 1.000 Y NA
 6851623 6851624 PAU_01777 PAU_01778 ppk speG FALSE 0.276 79.000 0.041 1.000 N NA
 6851624 6851625 PAU_01778 PAU_01779 speG purN FALSE 0.116 125.000 0.017 1.000 N NA
 6851625 6851626 PAU_01779 PAU_01780 purN purM TRUE 0.997 -3.000 0.230 0.002 Y NA
 6851627 6851628 PAU_01781 PAU_01782 upp uraA TRUE 0.861 69.000 0.101 1.000 Y NA
 6851628 6851629 PAU_01782 PAU_01783 uraA   FALSE 0.325 119.000 0.000 NA   NA
 6851630 6851631 PAU_01784 PAU_01785   celF FALSE 0.068 266.000 0.000 NA   NA
 6851631 6851632 PAU_01785 PAU_01786 celF celC TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 6851632 6851633 PAU_01786 PAU_01787 celC celB TRUE 0.991 16.000 0.091 0.005 Y NA
 6851633 6851634 PAU_01787 PAU_01788 celB celA TRUE 0.980 31.000 0.091 0.005 Y NA
 6851636 6851637 PAU_01790 PAU_01791   yfgC TRUE 0.991 10.000 0.259 1.000   NA
 6851639 6851640 PAU_01793 PAU_01794 bcp gcvR TRUE 0.910 24.000 0.102 1.000 N NA
 6851640 6851641 PAU_01794 PAU_01795 gcvR   FALSE 0.335 114.000 0.000 NA   NA
 6851642 6851643 PAU_01796 PAU_01797 dapA nlpB TRUE 0.977 17.000 0.032 NA Y NA
 6851643 6851644 PAU_01797 PAU_01798 nlpB purC FALSE 0.104 93.000 0.008 NA N NA
 6851644 6851645 PAU_01798 PAU_01799 purC   FALSE 0.008 761.000 0.000 0.084 N NA
 6851645 6851646 PAU_01799 PAU_01800     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 6851646 6851647 PAU_01800 PAU_01801     FALSE 0.064 274.000 0.000 NA   NA
 6851647 6851648 PAU_01801 PAU_01802     FALSE 0.033 380.000 0.000 NA   NA
 6851649 6851650 PAU_01803 PAU_01804 entB   TRUE 0.711 33.000 0.000 1.000 N NA
 6851650 6851651 PAU_01804 PAU_01805     TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 6851651 6851652 PAU_01805 PAU_01806     TRUE 0.685 -16.000 0.000 1.000 N NA
 6851652 6851653 PAU_01806 PAU_01807   pvdD/pvdJ TRUE 0.494 49.000 0.000 1.000 N NA
 6851653 6851654 PAU_01807 PAU_01808 pvdD/pvdJ   TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851654 6851655 PAU_01808 PAU_01809     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851655 6851656 PAU_01809 PAU_01810     FALSE 0.012 654.000 0.000 NA   NA
 6851656 6851657 PAU_01810 PAU_01811     TRUE 0.986 11.000 0.200 NA   NA
 6851658 6851659 PAU_01812 PAU_01813   yeaL TRUE 0.660 50.000 0.000 NA   NA
 6851659 6851660 PAU_01813 PAU_01814 yeaL ypfI TRUE 0.972 6.000 0.100 NA   NA
 6851661 6851662 PAU_01815 PAU_01816 ypfN vanY TRUE 0.934 -12.000 0.130 NA   NA
 6851662 6851663 PAU_01816 PAU_01817 vanY dapE TRUE 0.978 -3.000 0.163 0.017 N NA
 6851663 6851664 PAU_01817 PAU_01818 dapE   TRUE 0.988 2.000 0.292 1.000 N NA
 6851664 6851665 PAU_01818 PAU_01819   narP FALSE 0.060 208.000 0.000 1.000 N NA
 6851666 6851667 PAU_01820 PAU_01821 maeB cjrA FALSE 0.382 89.000 0.032 NA   NA
 6851667 6851668 PAU_01821 PAU_01822 cjrA   FALSE 0.247 153.000 0.048 NA   NA
 6851668 6851669 PAU_01822 PAU_01823   ptrB TRUE 0.530 131.000 0.200 1.000 N NA
 6851669 6851670 PAU_01823 PAU_01824 ptrB cjrC TRUE 0.459 132.000 0.167 1.000 N NA
 6851672 6851673 PAU_01826 PAU_01827 guaB guaA TRUE 0.935 78.000 0.190 0.001 Y NA
 6851673 6851674 PAU_01827 PAU_01828 guaA   FALSE 0.229 151.000 0.000 NA   NA
 6851674 6851675 PAU_01828 PAU_01829     FALSE 0.055 292.000 0.000 NA   NA
 6851676 6851677 PAU_01830 PAU_01831     TRUE 0.774 -40.000 0.000 NA   NA
 6851679 6851680 PAU_01833 PAU_s014 yebN   TRUE 0.566 61.000 0.000 NA   NA
 6851680 6851681 PAU_s014 PAU_01834   yobD FALSE 0.207 160.000 0.000 NA   NA
 6851681 6851682 PAU_01834 PAU_01835 yobD manZ TRUE 0.794 204.000 0.755 NA   NA
 6851682 6851683 PAU_01835 PAU_01836 manZ manY TRUE 1.000 13.000 0.939 0.007 Y NA
 6851683 6851684 PAU_01836 PAU_01837 manY manX TRUE 0.949 75.000 0.255 0.007 Y NA
 6851684 6851685 PAU_01837 PAU_01838 manX   FALSE 0.043 328.000 0.000 NA   NA
 6851685 6851686 PAU_01838 PAU_01839   sdaA TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6851686 6851687 PAU_01839 PAU_01840 sdaA nudL TRUE 0.386 171.000 0.136 1.000   NA
 6851687 6851688 PAU_01840 PAU_01841 nudL pabB TRUE 0.971 -3.000 0.116 1.000   NA
 6851689 6851690 PAU_01842 PAU_01843 yoaH yebF TRUE 0.506 114.000 0.104 NA   NA
 6851690 6851691 PAU_01843 PAU_01844 yebF pip TRUE 0.446 73.000 0.034 NA   NA
 6851692 6851693 PAU_01845 PAU_01846 holE   TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851694 6851695 PAU_01847 PAU_01848 ftnA   FALSE 0.131 195.000 0.029 1.000   NA
 6851695 6851696 PAU_01848 PAU_01849     TRUE 0.997 3.000 0.613 1.000   NA
 6851696 6851697 PAU_01849 PAU_01850     TRUE 0.978 52.000 0.704 NA   NA
 6851699 6851700 PAU_01852 PAU_01853   proQ TRUE 0.762 96.000 0.081 NA Y NA
 6851700 6851701 PAU_01853 PAU_01854 proQ prc TRUE 0.980 20.000 0.304 NA N NA
 6851701 6851702 PAU_01854 PAU_01855 prc htpX FALSE 0.040 335.000 0.000 0.017 N NA
 6851703 6851704 PAU_01856 PAU_01857 ydjN   FALSE 0.264 187.000 0.102 NA   NA
 6851705 6851706 PAU_01858 PAU_01859   yniB FALSE 0.038 351.000 0.000 NA   NA
 6851707 6851708 PAU_01860 PAU_01861 yniA yfeD FALSE 0.139 124.000 0.033 NA N NA
 6851708 6851709 PAU_01861 PAU_01862 yfeD yfeC TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.007 Y NA
 6851709 6851710 PAU_01862 PAU_01863 yfeC   TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.083 Y NA
 6851710 6851711 PAU_01863 PAU_01864     TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 6851712 6851713 PAU_01865 PAU_01866 emtA thrS FALSE 0.027 415.000 0.000 NA   NA
 6851713 6851714 PAU_01866 PAU_01867 thrS infC TRUE 0.776 148.000 0.186 1.000 Y NA
 6851714 6851715 PAU_01867 PAU_01868 infC rpmI TRUE 0.970 99.000 0.652 1.000 Y NA
 6851715 6851716 PAU_01868 PAU_01869 rpmI rplT TRUE 0.997 43.000 0.928 0.011 Y NA
 6851716 6851717 PAU_01869 PAU_01870 rplT pheS FALSE 0.349 330.000 0.202 1.000 Y NA
 6851717 6851718 PAU_01870 PAU_01871 pheS pheT TRUE 0.999 15.000 0.574 0.001 Y NA
 6851718 6851719 PAU_01871 PAU_01872 pheT ihfA TRUE 0.982 5.000 0.208 1.000 N NA
 6851719 6851720 PAU_01872 PAU_01873 ihfA btuC FALSE 0.243 70.000 0.023 1.000 N NA
 6851720 6851721 PAU_01873 PAU_01874 btuC btuD TRUE 0.988 20.000 0.133 1.000 Y NA
 6851721 6851722 PAU_01874 PAU_01875 btuD arnB FALSE 0.362 138.000 0.129 1.000 N NA
 6851722 6851723 PAU_01875 PAU_01876 arnB arnC TRUE 0.993 -10.000 0.378 NA Y NA
 6851723 6851724 PAU_01876 PAU_01877 arnC arnA TRUE 0.996 0.000 0.220 NA Y NA
 6851724 6851725 PAU_01877 PAU_01878 arnA   TRUE 0.998 0.000 0.447 1.000 Y NA
 6851725 6851726 PAU_01878 PAU_01879   arnT TRUE 0.915 8.000 0.051 1.000 N NA
 6851726 6851727 PAU_01879 PAU_01880 arnT   TRUE 0.987 15.000 0.182 0.071   NA
 6851727 6851728 PAU_01880 PAU_01881   yfbJ TRUE 0.998 0.000 0.613 0.071   NA
 6851728 6851729 PAU_01881 PAU_01882 yfbJ   TRUE 0.617 55.000 0.000 NA   NA
 6851729 6851730 PAU_01882 PAU_01883   nlpC TRUE 0.763 41.000 0.000 NA   NA
 6851734 6851735 PAU_01887 PAU_01888     TRUE 0.985 9.000 0.000 1.000 Y NA
 6851735 6851736 PAU_01888 PAU_01889     TRUE 0.963 -7.000 0.222 1.000 N NA
 6851736 6851737 PAU_01889 PAU_01890     TRUE 0.991 -7.000 0.222 1.000 Y NA
 6851737 6851738 PAU_01890 PAU_01891     FALSE 0.013 614.000 0.000 NA   NA
 6851738 6851739 PAU_01891 PAU_01892     FALSE 0.020 477.000 0.000 NA   NA
 6851742 6851743 PAU_01895 PAU_01896 hmuV   TRUE 0.996 0.000 0.220 1.000 Y NA
 6851743 6851744 PAU_01896 PAU_01897   chuT TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 6851744 6851745 PAU_01897 PAU_01898 chuT chuS TRUE 0.997 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 6851745 6851746 PAU_01898 PAU_01899 chuS   TRUE 0.951 33.000 0.000 1.000 Y NA
 6851746 6851747 PAU_01899 PAU_01900   aroH FALSE 0.022 326.000 0.000 1.000 N NA
 6851747 6851748 PAU_01900 PAU_01901 aroH ydiA FALSE 0.196 267.000 0.165 1.000   NA
 6851751 6851752 PAU_01904 PAU_01905     TRUE 0.954 -3.000 0.129 NA N NA
 6851754 6851755 PAU_01907 PAU_01908 ydiC sufB TRUE 0.942 13.000 0.041 NA   NA
 6851755 6851756 PAU_01908 PAU_01909 sufB ynhD TRUE 0.979 57.000 0.466 1.000 Y NA
 6851756 6851757 PAU_01909 PAU_01910 ynhD ynhC TRUE 0.992 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 6851757 6851758 PAU_01910 PAU_01911 ynhC sufS TRUE 0.974 -3.000 0.193 1.000 N NA
 6851758 6851759 PAU_01911 PAU_01912 sufS sufE TRUE 0.937 38.000 0.183 NA   NA
 6851759 6851760 PAU_01912 PAU_01913 sufE ycfS TRUE 0.481 122.000 0.103 NA   NA
 6851763 6851764 PAU_01916 PAU_01917     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851764 6851765 PAU_01917 PAU_01918     FALSE 0.347 109.000 0.000 NA   NA
 6851765 6851766 PAU_01918 PAU_01919     FALSE 0.157 184.000 0.000 NA   NA
 6851766 6851767 PAU_01919 PAU_01920   pykF FALSE 0.060 291.000 0.000 1.000   NA
 6851767 6851768 PAU_01920 PAU_t032 pykF   FALSE 0.022 461.000 0.000 NA   NA
 6851768 6851769 PAU_t032 PAU_t033     TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6851769 6851770 PAU_t033 PAU_01921   mdtK FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6851771 6851772 PAU_01922 PAU_01923 ribE   FALSE 0.020 476.000 0.000 NA   NA
 6851773 6851774 PAU_01924 PAU_01925 cfa ydhC FALSE 0.028 288.000 0.000 1.000 N NA
 6851776 6851777 PAU_01927 PAU_01928 purR sodB FALSE 0.009 484.000 0.000 1.000 N NA
 6851778 6851779 PAU_01929 PAU_01930   grxD FALSE 0.204 162.000 0.000 NA   NA
 6851780 6851781 PAU_01931 PAU_01932 rnt gloA TRUE 0.968 0.000 0.136 1.000 N NA
 6851782 6851783 PAU_01933 PAU_01934   slyA FALSE 0.016 559.000 0.000 NA   NA
 6851785 6851786 PAU_01936 PAU_01937 anmK pdxH FALSE 0.318 48.000 0.013 NA N NA
 6851786 6851787 PAU_01937 PAU_01938 pdxH tyrS FALSE 0.056 239.000 0.054 1.000 N NA
 6851787 6851788 PAU_01938 PAU_01939 tyrS pdxY FALSE 0.244 95.000 0.041 1.000 N NA
 6851789 6851790 PAU_01940 PAU_01941 gst   FALSE 0.039 342.000 0.000 NA   NA
 6851790 6851791 PAU_01941 PAU_01942   fabI FALSE 0.027 414.000 0.000 NA   NA
 6851791 6851792 PAU_01942 PAU_01943 fabI sapF FALSE 0.136 187.000 0.078 1.000 N NA
 6851792 6851793 PAU_01943 PAU_01944 sapF sapD TRUE 0.999 3.000 0.684 0.013 Y NA
 6851793 6851794 PAU_01944 PAU_01945 sapD sapC TRUE 0.999 1.000 0.667 1.000 Y NA
 6851794 6851795 PAU_01945 PAU_01946 sapC sapB TRUE 0.992 -13.000 0.284 0.027 Y NA
 6851795 6851796 PAU_01946 PAU_01947 sapB sapA TRUE 0.988 -3.000 0.264 0.027 N NA
 6851796 6851797 PAU_01947 PAU_01948 sapA pspF FALSE 0.356 258.000 0.402 1.000 N NA
 6851798 6851799 PAU_01949 PAU_01950 pspA pspB TRUE 0.991 36.000 0.739 NA   NA
 6851799 6851800 PAU_01950 PAU_01951 pspB pspC TRUE 0.994 -13.000 0.913 NA   NA
 6851800 6851801 PAU_01951 PAU_01952 pspC   TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6851801 6851802 PAU_01952 PAU_01953   ycjX FALSE 0.368 101.000 0.000 NA   NA
 6851802 6851803 PAU_01953 PAU_01954 ycjX ycjF TRUE 0.997 -3.000 0.791 NA   NA
 6851807 6851808 PAU_01958 PAU_01959 mppA   FALSE 0.090 234.000 0.000 NA   NA
 6851808 6851809 PAU_01959 PAU_01960     FALSE 0.015 575.000 0.000 NA   NA
 6851809 6851810 PAU_01960 PAU_01961     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6851810 6851811 PAU_01961 PAU_01962     FALSE 0.161 182.000 0.000 NA   NA
 6851811 6851812 PAU_01962 PAU_01963   zntB TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6851812 6851813 PAU_01963 PAU_01964 zntB ydaO FALSE 0.007 558.000 0.000 NA N NA
 6851813 6851814 PAU_01964 PAU_01965 ydaO   FALSE 0.003 861.000 0.000 NA N NA
 6851814 6851815 PAU_01965 PAU_01966   ydbJ TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6851816 6851817 PAU_01967 PAU_01968 dsbB nhaB TRUE 0.824 160.000 0.723 1.000 N NA
 6851818 6851819 PAU_01969 PAU_01970 fadR dadA FALSE 0.008 522.000 0.000 1.000 N NA
 6851819 6851820 PAU_01970 PAU_01971 dadA dadX TRUE 0.969 15.000 0.168 1.000 N NA
 6851820 6851821 PAU_01971 PAU_01972 dadX yeaF FALSE 0.145 392.000 0.091 NA Y NA
 6851822 6851823 PAU_01973 PAU_01974 yeaD gapA TRUE 0.802 124.000 0.154 1.000 Y NA
 6851824 6851825 PAU_01975 PAU_01976 msrB yeaC TRUE 0.768 86.000 0.216 NA   NA
 6851826 6851827 PAU_01977 PAU_01978 ydjB ansA TRUE 0.882 13.000 0.040 1.000 N NA
 6851827 6851828 PAU_01978 PAU_01979 ansA sppA FALSE 0.277 153.000 0.113 1.000 N NA
 6851829 6851830 PAU_01980 PAU_01981 ydjA selD TRUE 0.870 13.000 0.033 1.000 N NA
 6851830 6851831 PAU_01981 PAU_01982 selD topB TRUE 0.897 6.000 0.041 1.000 N NA
 6851835 6851836 PAU_01986 PAU_01987     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851836 6851837 PAU_01987 PAU_01988   orf47 FALSE 0.010 719.000 0.000 NA   NA
 6851837 6851838 PAU_01988 PAU_01989 orf47   TRUE 0.900 23.000 0.000 NA   NA
 6851838 6851839 PAU_01989 PAU_01990     TRUE 0.644 52.000 0.000 NA   NA
 6851839 6851840 PAU_01990 PAU_01991     FALSE 0.200 164.000 0.000 NA   NA
 6851842 6851843 PAU_01993 PAU_01994     TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6851843 6851844 PAU_01994 PAU_01995     FALSE 0.163 181.000 0.000 NA   NA
 6851844 6851845 PAU_01995 PAU_01996     TRUE 0.625 54.000 0.000 NA   NA
 6851845 6851846 PAU_01996 PAU_01997   afp5 TRUE 0.993 14.000 0.400 NA   NA
 6851846 6851847 PAU_01997 PAU_01998 afp5   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851847 6851848 PAU_01998 PAU_01999     TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6851848 6851849 PAU_01999 PAU_02000     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851849 6851850 PAU_02000 PAU_02001     TRUE 0.993 28.000 0.667 NA   NA
 6851850 6851851 PAU_02001 PAU_02002     TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 6851851 6851852 PAU_02002 PAU_02003     FALSE 0.114 209.000 0.000 NA   NA
 6851852 6851853 PAU_02003 PAU_02004     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6851853 6851854 PAU_02004 PAU_02005     FALSE 0.302 127.000 0.000 NA   NA
 6851854 6851855 PAU_02005 PAU_02006     TRUE 0.546 63.000 0.000 NA   NA
 6851855 6851856 PAU_02006 PAU_02007     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6851856 6851857 PAU_02007 PAU_02008   afp16 TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6851857 6851858 PAU_02008 PAU_02009 afp16 cif FALSE 0.212 158.000 0.000 NA   NA
 6851858 6851859 PAU_02009 PAU_02010 cif tccC3 TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6851859 6851860 PAU_02010 PAU_02011 tccC3   FALSE 0.019 497.000 0.000 NA   NA
 6851860 6851861 PAU_02011 PAU_02012     TRUE 0.786 -28.000 0.000 NA   NA
 6851862 6851863 PAU_02013 PAU_02014     TRUE 0.995 3.000 0.186 1.000 Y NA
 6851863 6851864 PAU_02014 PAU_02015     TRUE 0.865 134.000 0.273 1.000 Y NA
 6851864 6851865 PAU_02015 PAU_02016   gclR TRUE 0.983 12.000 0.031 1.000 Y NA
 6851865 6851866 PAU_02016 PAU_02017 gclR orf37 TRUE 0.995 17.000 0.265 1.000 Y NA
 6851866 6851867 PAU_02017 PAU_02018 orf37   TRUE 0.891 -7.000 0.044 NA   NA
 6851867 6851868 PAU_02018 PAU_02019   orf39 TRUE 0.972 0.000 0.097 NA   NA
 6851870 6851871 PAU_t034 PAU_s015     FALSE 0.233 150.000 0.000 NA   NA
 6851873 6851874 PAU_02022 PAU_02023 purU   TRUE 0.850 60.000 0.200 NA   NA
 6851875 6851876 PAU_02024 PAU_02025 hnr galU FALSE 0.087 424.000 0.235 1.000 N NA
 6851876 6851877 PAU_02025 PAU_02026 galU ugd TRUE 0.987 24.000 0.157 1.000 Y NA
 6851877 6851878 PAU_02026 PAU_02027 ugd wbnF TRUE 0.990 5.000 0.091 1.000 Y NA
 6851882 6851883 PAU_02031 PAU_02032 ychE oppA1 FALSE 0.006 567.000 0.000 NA N NA
 6851883 6851884 PAU_02032 PAU_02033 oppA1 oppA2 TRUE 0.906 133.000 0.292 0.026 Y NA
 6851884 6851885 PAU_02033 PAU_02034 oppA2 oppB TRUE 0.896 85.000 0.151 0.026 Y NA
 6851885 6851886 PAU_02034 PAU_02035 oppB oppC TRUE 0.999 17.000 0.870 0.026 Y NA
 6851886 6851887 PAU_02035 PAU_02036 oppC oppD TRUE 0.999 10.000 0.554 1.000 Y NA
 6851887 6851888 PAU_02036 PAU_02037 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 6851889 6851890 PAU_02038 PAU_02039 yciU cls TRUE 0.725 113.000 0.231 NA   NA
 6851891 6851892 PAU_02040 PAU_02041   tonB TRUE 0.701 111.000 0.208 NA   NA
 6851893 6851894 PAU_02042 PAU_02043   ispZ TRUE 0.609 78.000 0.167 NA N NA
 6851895 6851896 PAU_02044 PAU_02045     TRUE 0.421 84.000 0.000 NA   NA
 6851896 6851897 PAU_02045 PAU_02046     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6851897 6851898 PAU_02046 PAU_02047   ompX FALSE 0.007 570.000 0.000 1.000 N NA
 6851901 6851902 PAU_02050 PAU_02051 trpA trpB TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 6851902 6851903 PAU_02051 PAU_02052 trpB trpC TRUE 0.984 43.000 0.221 0.001 Y NA
 6851903 6851904 PAU_02052 PAU_02053 trpC trpD TRUE 0.997 3.000 0.293 1.000 Y NA
 6851904 6851905 PAU_02053 PAU_02054 trpD trpG TRUE 0.988 14.000 0.083 1.000 Y NA
 6851905 6851906 PAU_02054 PAU_02055 trpG trpE TRUE 0.999 0.000 0.703 0.001 Y NA
 6851907 6851908 PAU_02056 PAU_02057   tccA2 TRUE 0.827 83.000 0.286 NA   NA
 6851908 6851909 PAU_02057 PAU_02058 tccA2 tccB2 TRUE 0.980 -7.000 0.286 NA   NA
 6851909 6851910 PAU_02058 PAU_02059 tccB2 chi TRUE 0.904 128.000 0.667 NA   NA
 6851910 6851911 PAU_02059 PAU_02060 chi pin FALSE 0.074 253.000 0.000 NA   NA
 6851912 6851913 PAU_02061 PAU_02062     TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6851914 6851915 PAU_02063 PAU_02064     TRUE 0.976 28.000 0.281 NA   NA
 6851915 6851916 PAU_02064 PAU_02065   rluB FALSE 0.098 456.000 0.075 NA Y NA
 6851917 6851918 PAU_02066 PAU_02067 btuR yciK TRUE 0.916 0.000 0.050 1.000 N NA
 6851920 6851921 PAU_02069 PAU_02070 pa-1L VP0380 FALSE 0.031 387.000 0.000 NA   NA
 6851922 6851923 PAU_02071 PAU_02072 sohB   FALSE 0.028 405.000 0.000 NA   NA
 6851923 6851924 PAU_02072 PAU_02073     FALSE 0.021 464.000 0.000 NA   NA
 6851924 6851925 PAU_02073 PAU_02074   topA FALSE 0.222 154.000 0.000 NA   NA
 6851925 6851926 PAU_02074 PAU_02075 topA cysB FALSE 0.012 305.000 0.008 1.000 N NA
 6851930 6851931 PAU_02079 PAU_02080 pgpB yciS FALSE 0.053 296.000 0.000 NA   NA
 6851931 6851932 PAU_02080 PAU_02081 yciS yciM TRUE 0.921 90.000 0.576 NA   NA
 6851932 6851933 PAU_02081 PAU_02082 yciM pyrF TRUE 0.797 45.000 0.125 1.000 N NA
 6851933 6851934 PAU_02082 PAU_02083 pyrF yciH TRUE 0.766 -10.000 0.045 1.000 N NA
 6851934 6851935 PAU_02083 PAU_02084 yciH   FALSE 0.034 386.000 0.000 1.000   NA
 6851935 6851936 PAU_02084 PAU_02085     TRUE 0.968 25.000 0.188 NA   NA
 6851937 6851938 PAU_02086 PAU_02087     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851940 6851941 PAU_02089 PAU_02090 dnt   FALSE 0.013 627.000 0.000 NA   NA
 6851944 6851945 PAU_02093 PAU_02094     TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6851946 6851947 PAU_02095 PAU_02096   yopT FALSE 0.371 100.000 0.000 NA   NA
 6851947 6851948 PAU_02096 PAU_02097 yopT   TRUE 0.389 96.000 0.000 NA   NA
 6851948 6851949 PAU_02097 PAU_02098     TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6851949 6851950 PAU_02098 PAU_02099     FALSE 0.175 173.000 0.000 NA   NA
 6851950 6851951 PAU_02099 PAU_02100     FALSE 0.236 149.000 0.000 NA   NA
 6851951 6851952 PAU_02100 PAU_02101     TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6851952 6851953 PAU_02101 PAU_02102     FALSE 0.277 134.000 0.000 NA   NA
 6851953 6851954 PAU_02102 PAU_02103     TRUE 0.991 29.000 0.600 NA   NA
 6851954 6851955 PAU_02103 PAU_02104     TRUE 0.854 84.000 0.333 NA   NA
 6851955 6851956 PAU_02104 PAU_02105     TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 6851956 6851957 PAU_02105 PAU_02106     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 6851957 6851958 PAU_02106 PAU_02107     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851958 6851959 PAU_02107 PAU_02108     TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6851959 6851960 PAU_02108 PAU_02109     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851960 6851961 PAU_02109 PAU_02110     TRUE 0.991 19.000 0.400 NA   NA
 6851961 6851962 PAU_02110 PAU_02111     TRUE 0.967 61.000 0.667 NA   NA
 6851962 6851963 PAU_02111 PAU_02112     TRUE 0.900 131.000 0.667 NA   NA
 6851963 6851964 PAU_02112 PAU_02113   rnb FALSE 0.010 795.000 0.000 1.000   NA
 6851964 6851965 PAU_02113 PAU_02114 rnb nth FALSE 0.075 136.000 0.005 1.000 N NA
 6851965 6851966 PAU_02114 PAU_02115 nth rnfE TRUE 0.959 3.000 0.109 1.000 N NA
 6851966 6851967 PAU_02115 PAU_02116 rnfE rnfG TRUE 0.999 -3.000 0.908 0.033 Y NA
 6851967 6851968 PAU_02116 PAU_02117 rnfG rnfD TRUE 1.000 10.000 0.924 0.033 Y NA
 6851968 6851969 PAU_02117 PAU_02118 rnfD rnfC TRUE 0.999 13.000 0.814 0.033 Y NA
 6851969 6851970 PAU_02118 PAU_02119 rnfC rnfB TRUE 0.998 -7.000 0.537 0.033 Y NA
 6851970 6851971 PAU_02119 PAU_02120 rnfB rnfA TRUE 0.999 0.000 0.564 0.033 Y NA
 6851971 6851972 PAU_02120 PAU_02121 rnfA   TRUE 0.609 109.000 0.148 NA   NA
 6851973 6851974 PAU_02122 PAU_02123   yfeH TRUE 0.932 43.000 0.207 1.000   NA
 6851974 6851975 PAU_02123 PAU_02124 yfeH   FALSE 0.009 804.000 0.000 1.000   NA
 6851975 6851976 PAU_02124 PAU_02125     TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6851976 6851977 PAU_02125 PAU_02126     TRUE 0.944 9.000 0.000 0.025 N NA
 6851977 6851978 PAU_02126 PAU_02127   waaV TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851978 6851979 PAU_02127 PAU_02128 waaV   TRUE 0.943 12.000 0.000 NA   NA
 6851979 6851980 PAU_02128 PAU_02129     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851980 6851981 PAU_02129 PAU_02130     TRUE 0.870 15.000 0.000 1.000 N NA
 6851981 6851982 PAU_02130 PAU_02131   suhB TRUE 0.894 7.000 0.000 1.000 N NA
 6851982 6851983 PAU_02131 PAU_02132 suhB kfoC TRUE 0.889 12.000 0.000 1.000 N NA
 6851983 6851984 PAU_02132 PAU_02133 kfoC yeeO TRUE 0.870 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6851984 6851985 PAU_02133 PAU_02134 yeeO   FALSE 0.037 355.000 0.000 NA   NA
 6851986 6851987 PAU_02135 PAU_02136   tccZ FALSE 0.207 160.000 0.000 NA   NA
 6851987 6851988 PAU_02136 PAU_02137 tccZ   FALSE 0.014 596.000 0.000 NA   NA
 6851989 6851990 PAU_02138 PAU_02139     FALSE 0.061 280.000 0.000 NA   NA
 6851990 6851991 PAU_02139 PAU_02140     FALSE 0.035 364.000 0.000 NA   NA
 6851993 6851994 PAU_02142 PAU_02143     FALSE 0.020 480.000 0.000 NA   NA
 6851995 6851996 PAU_02144 PAU_02145     FALSE 0.343 111.000 0.000 NA   NA
 6851996 6851997 PAU_02145 PAU_02146     TRUE 0.998 3.000 0.600 0.033   NA
 6851997 6851998 PAU_02146 PAU_02147     TRUE 0.981 16.000 0.179 1.000   NA
 6851998 6851999 PAU_02147 PAU_02148     TRUE 0.986 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 6851999 6852000 PAU_02148 PAU_02149     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6852001 6852002 PAU_02150 PAU_02151     FALSE 0.068 265.000 0.000 NA   NA
 6852002 6852003 PAU_02151 PAU_02152   yjhH FALSE 0.070 204.000 0.044 1.000 N NA
 6852003 6852004 PAU_02152 PAU_02153 yjhH   TRUE 0.744 42.000 0.044 0.050 N NA
 6852004 6852005 PAU_02153 PAU_02154     TRUE 0.441 105.000 0.119 1.000 N NA
 6852006 6852007 PAU_02155 PAU_02156 add ydgA TRUE 0.629 78.000 0.113 NA   NA
 6852007 6852008 PAU_02156 PAU_02157 ydgA manA TRUE 0.890 151.000 0.778 NA   NA
 6852009 6852010 PAU_02158 PAU_02159   fumC FALSE 0.356 106.000 0.000 NA   NA
 6852010 6852011 PAU_02159 PAU_02160 fumC   FALSE 0.253 142.000 0.000 NA   NA
 6852011 6852012 PAU_02160 PAU_02161   yddM TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852013 6852014 PAU_02162 PAU_02163     TRUE 0.993 -3.000 0.412 NA   NA
 6852015 6852016 PAU_02164 PAU_02165 AMV258   FALSE 0.267 137.000 0.000 NA   NA
 6852017 6852018 PAU_02166 PAU_02167   tus TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6852019 6852020 PAU_02168 PAU_02169   argO TRUE 0.831 -16.000 0.000 1.000   NA
 6852022 6852023 PAU_02171 PAU_02172 yjfI yjfJ TRUE 0.997 21.000 0.911 NA   NA
 6852023 6852024 PAU_02172 PAU_02173 yjfJ   TRUE 0.647 62.000 0.071 NA   NA
 6852024 6852025 PAU_02173 PAU_02174   yjfL TRUE 0.994 1.000 0.379 NA   NA
 6852025 6852026 PAU_02174 PAU_02175 yjfL ygiB TRUE 0.945 13.000 0.045 NA   NA
 6852026 6852027 PAU_02175 PAU_02176 ygiB ygiC FALSE 0.258 152.000 0.053 NA   NA
 6852027 6852028 PAU_02176 PAU_02177 ygiC   FALSE 0.055 292.000 0.000 NA   NA
 6852028 6852029 PAU_02177 PAU_02178     TRUE 0.994 -3.000 0.483 NA   NA
 6852030 6852031 PAU_02179 PAU_02180     FALSE 0.014 603.000 0.000 NA   NA
 6852032 6852033 PAU_02181 PAU_02182 ynfL mlc TRUE 0.916 130.000 0.408 NA Y NA
 6852033 6852034 PAU_02182 PAU_02183 mlc ynfK TRUE 0.612 180.000 0.455 NA N NA
 6852035 6852036 PAU_02184 PAU_02185   ynfB TRUE 0.996 0.000 0.500 NA   NA
 6852036 6852037 PAU_02185 PAU_02186 ynfB ydfG FALSE 0.304 115.000 0.029 NA   NA
 6852037 6852038 PAU_02186 PAU_02187 ydfG   TRUE 0.399 98.000 0.000 1.000   NA
 6852041 6852042 PAU_02190 PAU_02191     TRUE 0.406 89.000 0.000 NA   NA
 6852042 6852043 PAU_02191 PAU_02192     FALSE 0.048 313.000 0.000 NA   NA
 6852043 6852044 PAU_02192 PAU_02193     TRUE 0.644 52.000 0.000 NA   NA
 6852045 6852046 PAU_02194 PAU_02195 arsA arsD TRUE 0.997 14.000 0.700 1.000   NA
 6852046 6852047 PAU_02195 PAU_02196 arsD arsR TRUE 0.672 51.000 0.000 1.000   NA
 6852047 6852048 PAU_02196 PAU_02197 arsR   FALSE 0.089 177.000 0.000 1.000 N NA
 6852048 6852049 PAU_02197 PAU_02198     TRUE 0.967 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 6852049 6852050 PAU_02198 PAU_02199   macB TRUE 0.788 -7.000 0.000 1.000 N NA
 6852050 6852051 PAU_02199 PAU_02200 macB   TRUE 0.788 -7.000 0.000 1.000 N NA
 6852053 6852054 PAU_02202 PAU_02203     FALSE 0.212 158.000 0.000 NA   NA
 6852057 6852058 PAU_02206 PAU_02207     FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 6852059 6852060 PAU_02208 PAU_02209     FALSE 0.086 238.000 0.000 NA   NA
 6852060 6852061 PAU_02209 PAU_02210   abu-6 FALSE 0.018 511.000 0.000 NA   NA
 6852063 6852064 PAU_02212 PAU_02213     TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6852064 6852065 PAU_02213 PAU_02214     FALSE 0.134 196.000 0.000 NA   NA
 6852065 6852066 PAU_02214 PAU_02215     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852066 6852067 PAU_02215 PAU_02216     TRUE 0.774 26.000 0.000 1.000 N NA
 6852067 6852068 PAU_02216 PAU_02217   irp1/HMWP1 TRUE 0.996 31.000 0.500 0.009 Y NA
 6852068 6852069 PAU_02217 PAU_02218 irp1/HMWP1 syrE TRUE 0.994 -16.000 0.400 0.009 Y NA
 6852069 6852070 PAU_02218 PAU_02219 syrE   TRUE 0.692 82.000 0.167 0.050 N NA
 6852070 6852071 PAU_02219 PAU_02220   cfa8A TRUE 0.915 20.000 0.000 NA   NA
 6852071 6852072 PAU_02220 PAU_02221 cfa8A sypC2 FALSE 0.007 924.000 0.000 NA   NA
 6852072 6852073 PAU_02221 PAU_02222 sypC2 pab FALSE 0.133 205.000 0.000 1.000   NA
 6852073 6852074 PAU_02222 PAU_02223 pab   FALSE 0.043 340.000 0.000 1.000   NA
 6852075 6852076 PAU_02224 PAU_02225 slyA   FALSE 0.025 306.000 0.000 1.000 N NA
 6852076 6852077 PAU_02225 PAU_02226     TRUE 0.999 14.000 0.600 1.000 Y NA
 6852077 6852078 PAU_02226 PAU_02227     TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 6852078 6852079 PAU_02227 PAU_02228     TRUE 0.469 66.000 0.025 NA   NA
 6852079 6852080 PAU_02228 PAU_02229     TRUE 0.921 -3.000 0.025 NA   NA
 6852081 6852082 PAU_02230 PAU_02231     FALSE 0.217 156.000 0.000 NA   NA
 6852082 6852083 PAU_02231 PAU_02232     TRUE 0.870 27.000 0.000 NA   NA
 6852083 6852084 PAU_02232 PAU_02233     TRUE 0.864 28.000 0.000 NA   NA
 6852084 6852085 PAU_02233 PAU_02234     FALSE 0.120 207.000 0.000 NA   NA
 6852085 6852086 PAU_02234 PAU_02235     FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6852086 6852087 PAU_02235 PAU_02236     FALSE 0.117 208.000 0.000 NA   NA
 6852087 6852088 PAU_02236 PAU_02237     TRUE 0.731 44.000 0.000 NA   NA
 6852088 6852089 PAU_02237 PAU_02238   afp11 TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 6852089 6852090 PAU_02238 PAU_02239 afp11 afp10 TRUE 0.933 53.000 0.333 NA   NA
 6852090 6852091 PAU_02239 PAU_02240 afp10   TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 6852091 6852092 PAU_02240 PAU_02241     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA   NA
 6852092 6852093 PAU_02241 PAU_02242     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852093 6852094 PAU_02242 PAU_02243     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852094 6852095 PAU_02243 PAU_02244     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852095 6852096 PAU_02244 PAU_02245     TRUE 0.992 18.000 0.400 NA   NA
 6852096 6852097 PAU_02245 PAU_02246     FALSE 0.050 308.000 0.000 NA   NA
 6852097 6852098 PAU_02246 PAU_02247     TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6852098 6852099 PAU_02247 PAU_02248     TRUE 0.399 92.000 0.000 NA   NA
 6852099 6852100 PAU_02248 PAU_02249     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852101 6852102 PAU_02250 PAU_02251   ygfI FALSE 0.031 385.000 0.000 NA   NA
 6852103 6852104 PAU_02252 PAU_02253     TRUE 0.728 45.000 0.043 NA   NA
 6852104 6852105 PAU_02253 PAU_02254     TRUE 0.950 0.000 0.043 NA   NA
 6852107 6852108 PAU_02256 PAU_02257     FALSE 0.200 161.000 0.000 0.020 N NA
 6852108 6852109 PAU_02257 PAU_02258     TRUE 0.582 43.000 0.000 1.000 N NA
 6852110 6852111 PAU_02259 PAU_02260     FALSE 0.011 670.000 0.000 NA   NA
 6852111 6852112 PAU_02260 PAU_02261     FALSE 0.039 348.000 0.000 NA   NA
 6852112 6852113 PAU_02261 PAU_02262   wbmC TRUE 0.990 -18.000 0.667 NA   NA
 6852113 6852114 PAU_02262 PAU_02263 wbmC   TRUE 0.922 20.000 0.000 1.000   NA
 6852114 6852115 PAU_02263 PAU_02264   pa-1L FALSE 0.007 953.000 0.000 NA   NA
 6852116 6852117 PAU_02265 PAU_02266 pvpS pvpR TRUE 0.913 52.000 0.000 0.008 Y NA
 6852117 6852118 PAU_02266 PAU_02267 pvpR   TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6852118 6852119 PAU_02267 PAU_02268     TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6852119 6852120 PAU_02268 PAU_02269     TRUE 0.896 -7.000 0.047 NA   NA
 6852120 6852121 PAU_02269 PAU_02270     TRUE 0.939 16.000 0.050 NA   NA
 6852121 6852122 PAU_02270 PAU_02271     TRUE 0.997 -3.000 0.744 NA   NA
 6852122 6852123 PAU_02271 PAU_02272     TRUE 0.995 6.000 0.465 NA   NA
 6852123 6852124 PAU_02272 PAU_02273     TRUE 0.886 -10.000 0.059 NA   NA
 6852124 6852125 PAU_02273 PAU_02274     TRUE 0.909 -7.000 0.059 NA   NA
 6852125 6852126 PAU_02274 PAU_02275     TRUE 0.986 -3.000 0.231 NA   NA
 6852126 6852127 PAU_02275 PAU_02276     TRUE 0.826 35.000 0.000 NA   NA
 6852127 6852128 PAU_02276 PAU_02277     TRUE 0.984 23.000 0.300 NA   NA
 6852128 6852129 PAU_02277 PAU_02278     TRUE 0.978 -9.000 0.300 NA   NA
 6852129 6852130 PAU_02278 PAU_02279     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6852130 6852131 PAU_02279 PAU_02280     TRUE 0.586 58.000 0.000 NA   NA
 6852131 6852132 PAU_02280 PAU_02281     TRUE 0.545 64.000 0.042 NA   NA
 6852132 6852133 PAU_02281 PAU_02282     TRUE 0.998 8.000 0.920 NA   NA
 6852133 6852134 PAU_02282 PAU_02283     FALSE 0.011 667.000 0.000 NA   NA
 6852134 6852135 PAU_02283 PAU_02284     FALSE 0.288 131.000 0.000 NA   NA
 6852135 6852136 PAU_02284 PAU_02285   Sc/SvQ TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6852136 6852137 PAU_02285 PAU_02286 Sc/SvQ   FALSE 0.045 324.000 0.000 NA   NA
 6852137 6852138 PAU_02286 PAU_02287   Sc/SvQ TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6852139 6852140 PAU_02288 PAU_02289   fhaB2 FALSE 0.063 276.000 0.000 NA   NA
 6852140 6852141 PAU_02289 PAU_02290 fhaB2   FALSE 0.045 323.000 0.000 NA   NA
 6852141 6852142 PAU_02290 PAU_02291     TRUE 0.858 29.000 0.000 NA   NA
 6852143 6852144 PAU_02292 PAU_02293 stbB   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852144 6852145 PAU_02293 PAU_02294t   blaA TRUE 0.477 71.000 0.000 NA   NA
 6852145 10702243 PAU_02294t PAU_02294 blaA   TRUE 0.749 -98.000 0.000 NA   NA
 6852146 6852147 PAU_02295 PAU_02296     FALSE 0.026 424.000 0.000 NA   NA
 6852149 6852150 PAU_02298 PAU_02299   ybtX TRUE 0.952 -3.000 0.125 NA N NA
 6852150 6852151 PAU_02299 PAU_02300 ybtX ybtP TRUE 0.716 -10.000 0.000 NA N NA
 6852151 6852152 PAU_02300 PAU_02301 ybtP ybtP TRUE 0.991 -13.000 0.250 0.007 Y NA
 6852152 6852153 PAU_02301 PAU_02302 ybtP   TRUE 0.455 53.000 0.000 1.000 N NA
 6852153 6852154 PAU_02302 PAU_02303   irp1/HMWP1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.006 Y NA
 6852154 6852155 PAU_02303 PAU_02304 irp1/HMWP1   TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6852155 6852156 PAU_02304 PAU_02305   irp4 TRUE 0.998 0.000 0.406 1.000 Y NA
 6852156 6852157 PAU_02305 PAU_02306 irp4 ybtE TRUE 0.990 0.000 0.000 0.020 Y NA
 6852157 6852158 PAU_02306 PAU_02307 ybtE   FALSE 0.021 331.000 0.000 1.000 N NA
 6852158 6852159 PAU_02307 PAU_02308     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852160 6852161 PAU_02309 PAU_02310     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6852161 6852162 PAU_02310 PAU_02311     TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6852162 6852163 PAU_02311 PAU_02312     FALSE 0.007 1054.000 0.000 NA   NA
 6852163 6852164 PAU_02312 PAU_02313     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852164 6852165 PAU_02313 PAU_02314     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852165 6852166 PAU_02314 PAU_02315     FALSE 0.379 98.000 0.000 NA   NA
 6852166 6852167 PAU_02315 PAU_02316     FALSE 0.114 209.000 0.000 NA   NA
 6852167 6852168 PAU_02316 PAU_02317     TRUE 0.399 92.000 0.000 NA   NA
 6852168 6852169 PAU_02317 PAU_02318     TRUE 0.399 92.000 0.000 NA   NA
 6852169 6852170 PAU_02318 PAU_02319     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6852170 6852171 PAU_02319 PAU_02320     TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6852171 6852172 PAU_02320 PAU_02321     TRUE 0.936 14.000 0.000 NA   NA
 6852174 6852175 PAU_02323 PAU_02324   mclB TRUE 0.969 11.000 0.000 0.016   NA
 6852175 6852176 PAU_02324 PAU_02325 mclB mtfA TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852176 6852177 PAU_02325 PAU_02326 mtfA aco FALSE 0.043 330.000 0.000 NA   NA
 6852178 6852179 PAU_02327 PAU_02328     FALSE 0.045 321.000 0.000 NA   NA
 6852180 6852181 PAU_02329 PAU_02330 osmC   FALSE 0.043 239.000 0.000 1.000 N NA
 6852181 6852182 PAU_02330 PAU_02331     TRUE 0.983 46.000 0.375 1.000 Y NA
 6852182 6852183 PAU_02331 PAU_02332     FALSE 0.012 429.000 0.000 1.000 N NA
 6852185 6852186 PAU_02334 PAU_02335     TRUE 0.566 61.000 0.000 NA   NA
 6852186 6852187 PAU_02335 PAU_02336     TRUE 0.438 78.000 0.000 NA   NA
 6852188 6852189 PAU_02337 PAU_02338 dppA   FALSE 0.006 1212.000 0.000 NA   NA
 6852190 6852191 PAU_02339 PAU_02340     TRUE 0.846 -12.000 0.000 NA   NA
 6852191 6852192 PAU_02340 PAU_02341     TRUE 0.997 0.000 0.615 NA   NA
 6852193 6852194 PAU_02342 PAU_02343 oppA   FALSE 0.012 652.000 0.000 NA   NA
 6852195 6852196 PAU_02344 PAU_02345     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6852196 6852197 PAU_02345 PAU_02346   ribA TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6852197 6852198 PAU_02346 PAU_02347 ribA   TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6852198 6852199 PAU_02347 PAU_02348     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6852199 6852200 PAU_02348 PAU_02349     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6852200 6852201 PAU_02349 PAU_02350     TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6852201 6852202 PAU_02350 PAU_02351     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6852202 6852203 PAU_02351 PAU_02352   hcaD FALSE 0.011 675.000 0.000 NA   NA
 6852203 6852204 PAU_02352 PAU_02353 hcaD mhpB TRUE 0.941 14.000 0.000 1.000   NA
 6852204 6852205 PAU_02353 PAU_02354 mhpB hcaB TRUE 0.867 -10.000 0.000 1.000   NA
 6852205 6852206 PAU_02354 PAU_02355 hcaB hcaC TRUE 0.941 3.000 0.083 NA N NA
 6852206 6852207 PAU_02355 PAU_02356 hcaC hcaF TRUE 0.940 0.000 0.083 NA N NA
 6852207 6852208 PAU_02356 PAU_02357 hcaF hcaE TRUE 0.992 -3.000 0.333 0.001 N NA
 6852209 6852210 PAU_02358 PAU_02359 hcaR ohpC FALSE 0.331 116.000 0.000 NA   NA
 6852210 6852211 PAU_02359 PAU_02360 ohpC mhpD TRUE 0.486 70.000 0.000 NA   NA
 6852212 6852213 PAU_02361 PAU_02362     FALSE 0.275 207.000 0.008 NA Y NA
 6852213 6852214 PAU_02362 PAU_02363     FALSE 0.019 343.000 0.000 1.000 N NA
 6852214 6852215 PAU_02363 PAU_02364     TRUE 0.788 39.000 0.000 NA   NA
 6852215 6852216 PAU_02364 PAU_02365     TRUE 0.863 30.000 0.045 NA   NA
 6852216 6852217 PAU_02365 PAU_02366     TRUE 0.996 0.000 0.477 NA   NA
 6852217 6852218 PAU_02366 PAU_02367     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852218 6852219 PAU_02367 PAU_02368     TRUE 0.753 50.000 0.080 NA   NA
 6852219 6852220 PAU_02368 PAU_02369     FALSE 0.254 172.000 0.080 NA   NA
 6852220 6852221 PAU_02369 PAU_02370     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6852222 6852223 PAU_02371 PAU_02372 fnr uspE TRUE 0.956 128.000 0.619 1.000 Y NA
 6852223 6852224 PAU_02372 PAU_02373 uspE   FALSE 0.059 293.000 0.000 1.000   NA
 6852225 6852226 PAU_02374 PAU_02375   ureD FALSE 0.067 267.000 0.000 NA   NA
 6852226 6852227 PAU_02375 PAU_02376 ureD ureG TRUE 0.993 -3.000 0.095 0.002 Y NA
 6852227 6852228 PAU_02376 PAU_02377 ureG ureF TRUE 0.930 53.000 0.064 0.002 Y NA
 6852228 6852229 PAU_02377 PAU_02378 ureF ureE TRUE 0.999 -3.000 0.460 0.002 Y NA
 6852229 6852230 PAU_02378 PAU_02379 ureE ureC TRUE 0.759 52.000 0.067 0.001 N NA
 6852230 6852231 PAU_02379 PAU_02380 ureC ureB TRUE 0.994 27.000 0.267 0.001 Y NA
 6852231 6852232 PAU_02380 PAU_02381 ureB ureA TRUE 0.951 83.000 0.267 0.001 Y NA
 6852233 6852234 PAU_02382 PAU_02383     TRUE 0.894 24.000 0.000 NA   NA
 6852234 6852235 PAU_02383 PAU_02384     TRUE 0.432 80.000 0.000 NA   NA
 6852235 6852236 PAU_02384 PAU_02385     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852237 6852238 PAU_02386 PAU_02387     TRUE 0.432 80.000 0.000 NA   NA
 6852238 6852239 PAU_02387 PAU_02388     TRUE 0.697 31.000 0.000 NA N NA
 6852239 6852240 PAU_02388 PAU_02389     TRUE 0.790 40.000 0.000 1.000   NA
 6852240 6852241 PAU_02389 PAU_02390   tiorf56 TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852241 6852242 PAU_02390 PAU_02391 tiorf56   TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6852242 6852243 PAU_02391 PAU_02392     TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6852243 6852244 PAU_02392 PAU_02393   mat TRUE 0.973 -6.000 0.250 1.000 N NA
 6852244 6852245 PAU_02393 PAU_02394 mat nol TRUE 0.896 4.000 0.000 1.000 N NA
 6852245 6852246 PAU_02394 PAU_02395 nol   TRUE 0.516 69.000 0.000 1.000   NA
 6852246 6852247 PAU_02395 PAU_02396     FALSE 0.227 158.000 0.000 1.000   NA
 6852247 6852248 PAU_02396 PAU_02397   pntB FALSE 0.005 702.000 0.000 1.000 N NA
 6852248 6852249 PAU_02397 PAU_02398 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 6852251 6852252 PAU_02400 PAU_02401     FALSE 0.144 325.000 0.000 NA Y NA
 6852252 6852253 PAU_02401 PAU_02402   darA TRUE 0.997 5.000 0.656 NA   NA
 6852255 6852256 PAU_02404 PAU_02405 yfaD   FALSE 0.057 289.000 0.000 NA   NA
 6852257 6852258 PAU_02406 PAU_02407 lpfA lpfB TRUE 0.984 95.000 1.000 1.000 Y NA
 6852258 6852259 PAU_02407 PAU_02408 lpfB yraJ TRUE 0.996 43.000 1.000 1.000 Y NA
 6852259 6852260 PAU_02408 PAU_02409 yraJ mrkD TRUE 0.999 20.000 1.000 1.000 Y NA
 6852262 6852263 PAU_02411 PAU_02412     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852263 6852264 PAU_02412 PAU_02413     TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6852264 6852265 PAU_02413 PAU_02414     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6852266 6852267 PAU_02415 PAU_02416   hrpA FALSE 0.009 793.000 0.000 NA   NA
 6852269 6852270 PAU_02418 PAU_02419 ydbL ynbE TRUE 0.998 12.000 0.726 NA   NA
 6852270 6852271 PAU_02419 PAU_02420 ynbE   TRUE 0.918 -3.000 0.023 NA   NA
 6852272 6852273 PAU_02421 PAU_02422 ldhA hslJ TRUE 0.725 23.000 0.024 NA N NA
 6852273 6852274 PAU_02422 PAU_02423 hslJ   TRUE 0.536 64.000 0.000 NA   NA
 6852274 6852275 PAU_02423 PAU_02424     TRUE 0.426 82.000 0.000 NA   NA
 6852276 6852277 PAU_02425 PAU_02426   ycgN FALSE 0.134 196.000 0.000 NA   NA
 6852277 6852278 PAU_02426 PAU_02427 ycgN   TRUE 0.926 26.000 0.088 NA   NA
 6852278 6852279 PAU_02427 PAU_02428   ycgL FALSE 0.104 241.000 0.056 NA   NA
 6852280 6852281 PAU_02429 PAU_02430 minC minD TRUE 0.996 24.000 0.466 1.000 Y NA
 6852281 6852282 PAU_02430 PAU_02431 minD minE TRUE 0.999 4.000 0.618 NA Y NA
 6852283 6852284 PAU_02432 PAU_02433 rnd fadD TRUE 0.481 89.000 0.115 1.000 N NA
 6852286 6852287 PAU_02435 PAU_02436   yeaZ FALSE 0.037 220.000 0.024 1.000 N NA
 6852287 6852288 PAU_02436 PAU_02437 yeaZ   FALSE 0.202 163.000 0.000 NA   NA
 6852288 6852289 PAU_02437 PAU_02438     FALSE 0.027 412.000 0.000 NA   NA
 6852290 6852291 PAU_02439 PAU_02440 yoaB   TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6852292 6852293 PAU_02441 PAU_02442 mdtI mdtJ TRUE 1.000 2.000 0.869 0.053 Y NA
 6852293 6852294 PAU_02442 PAU_02443 mdtJ zwf FALSE 0.004 751.000 0.000 1.000 N NA
 6852296 6852297 PAU_02445 PAU_02446 orf42   TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 6852297 6852298 PAU_02446 PAU_02447   orf53 FALSE 0.101 219.000 0.000 NA   NA
 6852298 6852299 PAU_02447 PAU_02448 orf53 orf53 TRUE 0.477 71.000 0.000 NA   NA
 6852299 6852300 PAU_02448 PAU_02449 orf53   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852300 6852301 PAU_02449 PAU_02450     TRUE 0.858 29.000 0.000 NA   NA
 6852301 6852302 PAU_02450 PAU_02451     FALSE 0.011 683.000 0.000 NA   NA
 6852302 6852303 PAU_02451 PAU_02452     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852303 6852304 PAU_02452 PAU_02453     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6852304 6852305 PAU_02453 PAU_02454     FALSE 0.007 1080.000 0.000 NA   NA
 6852305 6852306 PAU_02454 PAU_02455     TRUE 0.442 71.000 0.029 NA   NA
 6852306 6852307 PAU_02455 PAU_02456   scoT TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6852307 6852308 PAU_02456 PAU_02457 scoT   TRUE 0.881 -7.000 0.036 NA   NA
 6852311 6852312 PAU_02459 PAU_02461     TRUE 0.996 9.000 0.500 NA   NA
 6852312 6852313 PAU_02461 PAU_02462     TRUE 0.953 2.000 0.094 1.000 N NA
 6852313 6852314 PAU_02462 PAU_02463   ydeM TRUE 0.930 27.000 0.094 1.000   NA
 6852315 6852316 PAU_02464 PAU_02465 msbB   TRUE 0.843 152.000 0.299 1.000 Y NA
 6852316 6852317 PAU_02465 PAU_02466   znuA TRUE 0.944 21.000 0.131 1.000 N NA
 6852318 6852319 PAU_02467 PAU_02468 znuC znuB TRUE 0.970 137.000 0.755 0.077 Y NA
 6852320 6852321 PAU_02469 PAU_02470 ruvB ruvA TRUE 0.999 17.000 0.549 0.001 Y NA
 6852321 6852322 PAU_02470 PAU_02471 ruvA ruvC TRUE 0.971 79.000 0.451 0.012 Y NA
 6852322 6852323 PAU_02471 PAU_02472 ruvC yebC TRUE 0.775 106.000 0.277 NA   NA
 6852323 6852324 PAU_02472 PAU_02473 yebC nudB FALSE 0.130 195.000 0.035 NA   NA
 6852324 6852325 PAU_02473 PAU_02474 nudB aspS TRUE 0.916 0.000 0.050 1.000 N NA
 6852326 6852327 PAU_02475 PAU_02476 yecN   FALSE 0.082 313.000 0.089 NA   NA
 6852327 6852328 PAU_02476 PAU_02477   yecP TRUE 0.993 1.000 0.315 NA   NA
 6852329 6852330 PAU_02478 PAU_02479 cutC yecM FALSE 0.334 132.000 0.057 NA   NA
 6852330 6852331 PAU_02479 PAU_02480 yecM OSJNBb0098I11.12 FALSE 0.385 97.000 0.000 NA   NA
 6852331 6852332 PAU_02480 PAU_02481 OSJNBb0098I11.12 orf43 FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6852332 6852333 PAU_02481 PAU_02482 orf43 orf43 TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6852333 6852334 PAU_02482 PAU_02483 orf43 pdl1 TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852334 6852335 PAU_02483 PAU_02484 pdl1 orf42 FALSE 0.035 364.000 0.000 NA   NA
 6852335 6852336 PAU_02484 PAU_02485 orf42   TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 6852336 6852337 PAU_02485 PAU_02486     TRUE 0.396 93.000 0.000 NA   NA
 6852337 6852338 PAU_02486 PAU_02487     FALSE 0.363 103.000 0.000 NA   NA
 6852338 6852339 PAU_02487 PAU_02488   orf43 FALSE 0.363 103.000 0.000 NA   NA
 6852339 6852340 PAU_02488 PAU_02489 orf43 pdl2 TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852340 6852341 PAU_02489 PAU_02490 pdl2 orf53 FALSE 0.011 694.000 0.000 NA   NA
 6852341 6852342 PAU_02490 PAU_02491 orf53   TRUE 0.536 64.000 0.000 NA   NA
 6852342 6852343 PAU_02491 PAU_02492     TRUE 0.409 88.000 0.000 NA   NA
 6852343 6852344 PAU_02492 PAU_02493   orf53 TRUE 0.409 88.000 0.000 NA   NA
 6852344 6852345 PAU_02493 PAU_02494 orf53 pdl3 TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6852345 6852346 PAU_02494 PAU_02495 pdl3   TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6852346 6852347 PAU_02495 PAU_02496     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6852347 6852348 PAU_02496 PAU_02497   yceI FALSE 0.012 647.000 0.000 NA   NA
 6852348 6852349 PAU_02497 PAU_02498 yceI   TRUE 0.994 27.000 0.676 NA   NA
 6852350 6852351 PAU_02499 PAU_02500     TRUE 0.580 59.000 0.000 NA   NA
 6852351 6852352 PAU_02500 PAU_02501   argS FALSE 0.155 185.000 0.000 NA   NA
 6852353 6852354 PAU_02502 PAU_02503 mviN rimJ FALSE 0.005 1228.000 0.008 1.000   NA
 6852355 6852356 PAU_02504 PAU_02505 mdtH yceB TRUE 0.942 38.000 0.196 NA   NA
 6852357 6852358 PAU_02506 PAU_02507 ycdY ycdW TRUE 0.600 62.000 0.046 1.000   NA
 6852359 6852360 PAU_t035 PAU_02508   higB FALSE 0.060 283.000 0.000 NA   NA
 6852360 6852361 PAU_02508 PAU_02509 higB yddM TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852362 6852363 PAU_02510 PAU_02511 luxE luxB FALSE 0.151 313.000 0.158 0.002 N NA
 6852363 6852364 PAU_02511 PAU_02512 luxB luxA TRUE 0.999 15.000 0.875 0.002 Y NA
 6852364 6852365 PAU_02512 PAU_02513 luxA luxD TRUE 0.871 182.000 0.889 1.000   NA
 6852365 6852366 PAU_02513 PAU_02514 luxD luxC TRUE 0.941 14.000 0.000 1.000   NA
 6852366 6852367 PAU_02514 PAU_02515 luxC   FALSE 0.014 588.000 0.000 NA   NA
 6852367 6852368 PAU_02515 PAU_02516     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852368 6852369 PAU_02516 PAU_02517     FALSE 0.006 1473.000 0.000 NA   NA
 6852369 6852370 PAU_02517 PAU_02518     FALSE 0.222 154.000 0.000 NA   NA
 6852370 6852371 PAU_02518 PAU_02519     TRUE 0.426 82.000 0.000 NA   NA
 6852371 6852372 PAU_02519 PAU_02520     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852374 6852375 PAU_02522 PAU_02523 kdsA sirB1 TRUE 0.956 19.000 0.089 1.000   NA
 6852375 6852376 PAU_02523 PAU_02524 sirB1 hemK TRUE 0.864 -16.000 0.059 1.000   NA
 6852376 6852377 PAU_02524 PAU_02525 hemK prfA TRUE 0.996 -3.000 0.229 0.037 Y NA
 6852377 6852378 PAU_02525 PAU_02526 prfA hemA TRUE 0.945 32.000 0.171 0.037 N NA
 6852379 6852380 PAU_02527 PAU_02528 lolB ispE TRUE 0.862 0.000 0.024 1.000 N NA
 6852380 6852381 PAU_02528 PAU_02529 ispE prs FALSE 0.275 64.000 0.022 1.000 N NA
 6852382 6852383 PAU_02530 PAU_02531 ychH   FALSE 0.011 673.000 0.000 NA   NA
 6852383 6852384 PAU_02531 PAU_02532     TRUE 0.396 93.000 0.000 NA   NA
 6852384 6852385 PAU_02532 PAU_02533     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852385 6852386 PAU_02533 PAU_02534     FALSE 0.185 169.000 0.000 NA   NA
 6852386 6852387 PAU_02534 PAU_02535     FALSE 0.069 264.000 0.000 NA   NA
 6852387 6852388 PAU_02535 PAU_02536     FALSE 0.026 419.000 0.000 NA   NA
 6852388 6852389 PAU_02536 PAU_02537     FALSE 0.008 905.000 0.000 NA   NA
 6852389 6852390 PAU_02537 PAU_02538   eaeH FALSE 0.335 114.000 0.000 NA   NA
 6852390 6852391 PAU_02538 PAU_02539 eaeH   FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 6852391 6852392 PAU_02539 PAU_02540     FALSE 0.019 490.000 0.000 NA   NA
 6852393 6852394 PAU_02541 PAU_02542 pth ychF TRUE 0.799 137.000 0.184 1.000 Y NA
 6852394 6852395 PAU_02542 PAU_02543 ychF   FALSE 0.137 144.000 0.000 1.000 N NA
 6852395 6852396 PAU_02543 PAU_02544     FALSE 0.028 410.000 0.000 NA   NA
 6852396 6852397 PAU_02544 PAU_02545     FALSE 0.020 483.000 0.000 NA   NA
 6852399 6852400 PAU_02547 PAU_02548 cioA cioB TRUE 0.970 -10.000 0.000 0.030 Y NA
 6852400 6852401 PAU_02548 PAU_02549 cioB narX FALSE 0.129 207.000 0.000 1.000   NA
 6852401 6852402 PAU_02549 PAU_02550 narX viuB FALSE 0.350 108.000 0.000 NA   NA
 6852403 6852404 PAU_02551 PAU_02552 sypC3 phoH FALSE 0.006 659.000 0.000 1.000 N NA
 6852404 6852405 PAU_02552 PAU_02553 phoH endA FALSE 0.005 706.000 0.000 1.000 N NA
 6852405 6852406 PAU_02553 PAU_02554 endA   FALSE 0.013 655.000 0.000 1.000   NA
 6852406 6852407 PAU_02554 PAU_02555     TRUE 0.759 43.000 0.000 1.000   NA
 6852407 6852408 PAU_02555 PAU_02556     TRUE 0.951 9.000 0.000 1.000   NA
 6852408 6852409 PAU_02556 PAU_02557   spuA TRUE 0.914 -13.000 0.000 0.002   NA
 6852409 6852410 PAU_02557 PAU_02558 spuA   FALSE 0.299 128.000 0.000 NA   NA
 6852410 6852411 PAU_02558 PAU_02559   ndk TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6852411 6852412 PAU_02559 PAU_02560 ndk   TRUE 0.688 49.000 0.000 1.000   NA
 6852412 6852413 PAU_02560 PAU_02561   aqpZ FALSE 0.006 624.000 0.000 1.000 N NA
 6852415 6852416 PAU_02563 PAU_02564 uspG   TRUE 0.515 116.000 0.111 NA   NA
 6852416 6852417 PAU_02564 PAU_02565   uspG FALSE 0.036 398.000 0.056 NA   NA
 6852418 6852419 PAU_02566 PAU_02567 uvrY uvrC TRUE 0.880 -16.000 0.086 0.027 N NA
 6852419 6852420 PAU_02567 PAU_02568 uvrC pgsA TRUE 0.829 58.000 0.227 1.000 N NA
 6852420 6852421 PAU_02568 PAU_t036 pgsA   FALSE 0.245 145.000 0.000 NA   NA
 6852421 6852422 PAU_t036 PAU_t037     TRUE 0.743 43.000 0.000 NA   NA
 6852422 6852423 PAU_t037 PAU_t038     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6852423 6852424 PAU_t038 PAU_02569     TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6852424 6852425 PAU_02569 PAU_02570   orf7 TRUE 0.991 -13.000 0.625 1.000   NA
 6852427 6852428 PAU_02572 PAU_02573     TRUE 0.684 132.000 0.000 0.027 Y NA
 6852428 6852429 PAU_02573 PAU_02574     FALSE 0.014 879.000 0.000 0.027   NA
 6852429 6852430 PAU_02574 PAU_02575     TRUE 0.722 57.000 0.000 0.027   NA
 6852430 6852431 PAU_02575 PAU_02576     TRUE 0.969 30.000 0.000 0.027 Y NA
 6852431 6852432 PAU_02576 PAU_02577     FALSE 0.352 149.000 0.000 0.027   NA
 6852433 6852434 PAU_02578 PAU_02579     FALSE 0.382 193.000 0.185 NA   NA
 6852434 6852435 PAU_02579 PAU_02580     TRUE 0.998 11.000 0.828 NA   NA
 6852435 6852436 PAU_02580 PAU_02581   php TRUE 0.992 11.000 0.312 NA   NA
 6852436 6852437 PAU_02581 PAU_02582 php yhfX TRUE 0.977 7.000 0.125 NA   NA
 6852437 6852438 PAU_02582 PAU_02583 yhfX   FALSE 0.294 253.000 0.233 NA   NA
 6852438 6852439 PAU_02583 PAU_02584     TRUE 0.992 26.000 0.562 NA   NA
 6852442 6852443 PAU_02587 PAU_02588     FALSE 0.171 176.000 0.000 NA   NA
 6852444 6852445 PAU_02589 PAU_02590   sgaB TRUE 0.996 13.000 0.377 0.007   NA
 6852445 6852446 PAU_02590 PAU_02591 sgaB sgcA TRUE 0.993 17.000 0.130 0.004 Y NA
 6852448 6852449 PAU_02593 PAU_02594     TRUE 0.864 28.000 0.000 NA   NA
 6852449 6852450 PAU_02594 PAU_02595     TRUE 0.516 66.000 0.000 NA   NA
 6852450 6852451 PAU_02595 PAU_02596     FALSE 0.028 408.000 0.000 NA   NA
 6852453 6852454 PAU_02598 PAU_02599 dsdA dsdX FALSE 0.183 289.000 0.037 1.000 Y NA
 6852455 6852456 PAU_02600 PAU_02601 dsdC   FALSE 0.009 499.000 0.000 1.000 N NA
 6852456 6852457 PAU_02601 PAU_02602     FALSE 0.032 382.000 0.000 NA   NA
 6852459 6852460 PAU_02603 PAU_02604 cycA wrbA FALSE 0.096 235.000 0.000 1.000   NA
 6852463 6852464 PAU_02607 PAU_02608 fliZ fliA TRUE 0.975 5.000 0.108 1.000   NA
 6852464 6852465 PAU_02608 PAU_02609 fliA fliC FALSE 0.049 223.000 0.000 1.000 N NA
 6852466 6852467 PAU_02610 PAU_02611 fliD fliS TRUE 0.998 13.000 0.284 0.002 Y NA
 6852467 6852468 PAU_02611 PAU_02612 fliS fliT TRUE 0.993 0.000 0.324 1.000   NA
 6852468 6852469 PAU_02612 PAU_02613 fliT   FALSE 0.010 750.000 0.000 1.000   NA
 6852471 6852472 PAU_02615 PAU_02616 fliF fliG TRUE 0.996 -3.000 0.220 0.005 Y NA
 6852472 6852473 PAU_02616 PAU_02617 fliG fliH TRUE 0.973 -7.000 0.005 0.003 Y NA
 6852473 6852474 PAU_02617 PAU_02618 fliH fliI TRUE 0.998 0.000 0.400 1.000 Y NA
 6852474 6852475 PAU_02618 PAU_02619 fliI fliJ TRUE 0.902 43.000 0.016 1.000 Y NA
 6852475 6852476 PAU_02619 PAU_02620 fliJ fliK TRUE 0.995 0.000 0.317 0.005   NA
 6852476 6852477 PAU_02620 PAU_02621 fliK fliL FALSE 0.205 227.000 0.119 1.000   NA
 6852477 6852478 PAU_02621 PAU_02622 fliL fliM TRUE 1.000 6.000 0.957 0.001 Y NA
 6852478 6852479 PAU_02622 PAU_02623 fliM fliN TRUE 0.981 -22.000 0.137 0.001 Y NA
 6852479 6852480 PAU_02623 PAU_02624 fliN fliO TRUE 0.998 2.000 0.443 1.000 Y NA
 6852480 6852481 PAU_02624 PAU_02625 fliO fliP TRUE 0.995 11.000 0.203 1.000 Y NA
 6852481 6852482 PAU_02625 PAU_02626 fliP fliQ TRUE 0.999 21.000 0.827 0.010 Y NA
 6852482 6852483 PAU_02626 PAU_02627 fliQ fliR TRUE 0.994 3.000 0.097 0.002 Y NA
 6852483 6852484 PAU_02627 PAU_02628 fliR   FALSE 0.003 1002.000 0.000 NA N NA
 6852485 6852486 PAU_02629 PAU_02630     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852486 6852487 PAU_02630 PAU_02631     TRUE 0.486 70.000 0.000 NA   NA
 6852487 6852488 PAU_02631 PAU_02632     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852488 6852489 PAU_02632 PAU_02633     TRUE 0.486 70.000 0.000 NA   NA
 6852489 6852490 PAU_02633 PAU_02634     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852490 6852491 PAU_02634 PAU_02635     TRUE 0.486 70.000 0.000 NA   NA
 6852491 6852492 PAU_02635 PAU_02636     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852492 6852493 PAU_02636 PAU_02637     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6852493 6852494 PAU_02637 PAU_02638     TRUE 0.826 35.000 0.000 NA   NA
 6852494 6852495 PAU_02638 PAU_02639     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852497 6852498 PAU_02641 PAU_02642 flgL flgK TRUE 0.906 85.000 0.142 0.001 Y NA
 6852498 6852499 PAU_02642 PAU_02643 flgK flgJ TRUE 0.975 130.000 0.705 0.002 Y NA
 6852499 6852500 PAU_02643 PAU_02644 flgJ flgI TRUE 0.992 0.000 0.048 0.005 Y NA
 6852500 6852501 PAU_02644 PAU_02645 flgI flgH TRUE 0.993 7.000 0.085 0.005 Y NA
 6852501 6852502 PAU_02645 PAU_02646 flgH flgG TRUE 0.953 74.000 0.268 0.005 Y NA
 6852502 6852503 PAU_02646 PAU_02647 flgG flgF TRUE 0.997 24.000 0.420 0.001 Y NA
 6852503 6852504 PAU_02647 PAU_02648 flgF flgE TRUE 0.990 19.000 0.095 0.005 Y NA
 6852504 6852505 PAU_02648 PAU_02649 flgE flgD TRUE 0.950 29.000 0.023 NA Y NA
 6852505 6852506 PAU_02649 PAU_02650 flgD flgC TRUE 0.991 13.000 0.128 NA Y NA
 6852506 6852507 PAU_02650 PAU_02651 flgC flgB TRUE 0.999 6.000 0.643 0.003 Y NA
 6852508 6852509 PAU_02652 PAU_02653 flgA flgM TRUE 0.897 126.000 0.330 NA Y NA
 6852509 6852510 PAU_02653 PAU_02654 flgM flgN TRUE 0.998 12.000 0.361 0.002 Y NA
 6852511 6852512 PAU_02655 PAU_02656     TRUE 0.894 24.000 0.000 NA   NA
 6852512 6852513 PAU_02656 PAU_02657     TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6852513 6852514 PAU_02657 PAU_02658     TRUE 0.412 87.000 0.000 NA   NA
 6852514 6852515 PAU_02658 PAU_02659     TRUE 0.477 71.000 0.000 NA   NA
 6852515 6852516 PAU_02659 PAU_02660     TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6852516 6852517 PAU_02660 PAU_02661     TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6852517 6852518 PAU_02661 PAU_02662     TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6852518 6852519 PAU_02662 PAU_02663     TRUE 0.450 75.000 0.000 NA   NA
 6852519 6852520 PAU_02663 PAU_02664     FALSE 0.008 896.000 0.000 NA   NA
 6852520 6852521 PAU_02664 PAU_02665   flhA FALSE 0.009 822.000 0.000 1.000   NA
 6852521 6852522 PAU_02665 PAU_02666 flhA flhB TRUE 0.995 -7.000 0.287 0.010 Y NA
 6852523 6852524 PAU_02667 PAU_02668 pyoS3A   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852524 6852525 PAU_02668 PAU_02669     FALSE 0.361 104.000 0.000 NA   NA
 6852526 6852527 PAU_02670 PAU_02671     FALSE 0.011 717.000 0.000 1.000   NA
 6852527 6852528 PAU_02671 PAU_02672     TRUE 0.894 -7.000 0.000 1.000   NA
 6852528 6852529 PAU_02672 PAU_02673     TRUE 0.940 10.000 0.000 0.046 N NA
 6852530 6852531 PAU_02674 PAU_02675   syrE FALSE 0.157 184.000 0.000 NA   NA
 6852531 6852532 PAU_02675 PAU_02677 syrE   TRUE 0.870 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6852532 6852533 PAU_02677 PAU_02678   acmB TRUE 0.743 29.000 0.000 1.000 N NA
 6852533 6852534 PAU_02678 PAU_02679 acmB   TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6852535 6852536 PAU_02680 PAU_02681 cheZ cheY TRUE 0.995 10.000 0.200 1.000 Y NA
 6852536 6852537 PAU_02681 PAU_02682 cheY cheB TRUE 0.721 197.000 0.200 0.008 Y NA
 6852537 6852538 PAU_02682 PAU_02683 cheB cheR TRUE 0.947 35.000 0.037 1.000 Y NA
 6852538 6852539 PAU_02683 PAU_02684 cheR tap TRUE 0.893 82.000 0.188 1.000 Y NA
 6852539 6852540 PAU_02684 PAU_02685 tap cheD TRUE 0.987 54.000 0.429 0.001 Y NA
 6852540 6852541 PAU_02685 PAU_02686 cheD cheW TRUE 0.755 168.000 0.149 0.003 Y NA
 6852541 6852542 PAU_02686 PAU_02687 cheW cheA TRUE 0.988 54.000 0.447 0.001 Y NA
 6852542 6852543 PAU_02687 PAU_02688u cheA motB1 TRUE 0.999 16.000 0.913 1.000 Y NA
 6852543 10702244 PAU_02688u PAU_02688 motB1   TRUE 0.740 -149.000 0.000 NA   NA
 10702244 6852544 PAU_02688 PAU_02689   motA TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852544 6852545 PAU_02689 PAU_02690 motA flhC TRUE 0.797 138.000 0.408 1.000   NA
 6852545 6852546 PAU_02690 PAU_02691 flhC flhD TRUE 0.993 3.000 0.208 0.001   NA
 6852546 6852547 PAU_02691 PAU_02692 flhD mgtA FALSE 0.006 2304.000 0.000 1.000   NA
 6852547 6852548 PAU_02692 PAU_02693 mgtA cox2 FALSE 0.039 359.000 0.000 1.000   NA
 6852548 6852549 PAU_02693 PAU_02694 cox2   FALSE 0.066 280.000 0.000 1.000   NA
 6852549 6852550 PAU_02694 PAU_02695   cspC FALSE 0.025 444.000 0.000 1.000   NA
 6852551 6852552 PAU_02696 PAU_t040 ylaC   FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6852554 6852555 PAU_t041 PAU_t042     FALSE 0.074 253.000 0.000 NA   NA
 6852555 6852556 PAU_t042 PAU_02698   pyrC TRUE 0.412 87.000 0.000 NA   NA
 6852556 6852557 PAU_02698 PAU_02699 pyrC yceP FALSE 0.127 202.000 0.000 NA   NA
 6852557 6852558 PAU_02699 PAU_02700 yceP rcsA FALSE 0.128 200.000 0.000 NA   NA
 6852559 6852560 PAU_02701 PAU_02702 yceA dinI FALSE 0.117 208.000 0.000 NA   NA
 6852561 6852562 PAU_02703 PAU_02704 htrB yceE FALSE 0.007 581.000 0.000 1.000 N NA
 6852563 6852564 PAU_02705 PAU_02706   csaA TRUE 0.539 57.000 0.014 1.000   NA
 6852564 6852565 PAU_02706 PAU_02707 csaA L0134 FALSE 0.245 145.000 0.000 NA   NA
 6852565 6852566 PAU_02707 PAU_02708 L0134   FALSE 0.120 207.000 0.000 NA   NA
 6852567 6852568 PAU_02709 PAU_02710     TRUE 0.952 2.000 0.093 1.000 N NA
 6852568 6852569 PAU_02710 PAU_02711   idhA FALSE 0.038 364.000 0.000 1.000   NA
 6852569 6852570 PAU_02711 PAU_02712 idhA yidK FALSE 0.355 114.000 0.000 1.000   NA
 6852570 6852571 PAU_02712 PAU_02713 yidK   FALSE 0.037 366.000 0.000 1.000   NA
 6852571 6852572 PAU_02713 PAU_02714     TRUE 0.558 73.000 0.064 1.000   NA
 6852572 6852573 PAU_02714 PAU_02715     TRUE 0.950 40.000 0.086 1.000 Y NA
 6852573 6852574 PAU_02715 PAU_02717     TRUE 0.962 48.000 0.199 1.000 Y NA
 11439028 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5320.000 0.000 NA   NA
 11581391 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5320.000 0.000 NA   NA
 11723783 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5320.000 0.000 NA   NA
 11439029 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5348.000 0.000 NA   NA
 11581392 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5348.000 0.000 NA   NA
 11723784 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5348.000 0.000 NA   NA
 11439030 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5380.000 0.000 NA   NA
 11581393 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5380.000 0.000 NA   NA
 11723785 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5380.000 0.000 NA   NA
 11439031 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5408.000 0.000 NA   NA
 11581394 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5408.000 0.000 NA   NA
 11723786 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5408.000 0.000 NA   NA
 11439032 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5440.000 0.000 NA   NA
 11581395 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5440.000 0.000 NA   NA
 11723787 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5440.000 0.000 NA   NA
 11439033 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5468.000 0.000 NA   NA
 11581396 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5468.000 0.000 NA   NA
 11723788 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5468.000 0.000 NA   NA
 11439034 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5500.000 0.000 NA   NA
 11581397 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5500.000 0.000 NA   NA
 11723789 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5500.000 0.000 NA   NA
 11439035 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5528.000 0.000 NA   NA
 11581398 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5528.000 0.000 NA   NA
 11723790 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5528.000 0.000 NA   NA
 11439036 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5560.000 0.000 NA   NA
 11581399 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5560.000 0.000 NA   NA
 11723791 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5560.000 0.000 NA   NA
 11439037 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5588.000 0.000 NA   NA
 11581400 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5588.000 0.000 NA   NA
 11723792 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5588.000 0.000 NA   NA
 11439038 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5620.000 0.000 NA   NA
 11581401 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5620.000 0.000 NA   NA
 11723793 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5620.000 0.000 NA   NA
 11439039 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5648.000 0.000 NA   NA
 11581402 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5648.000 0.000 NA   NA
 11723794 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5648.000 0.000 NA   NA
 11439040 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5680.000 0.000 NA   NA
 11581403 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5680.000 0.000 NA   NA
 11723795 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5680.000 0.000 NA   NA
 11439041 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5708.000 0.000 NA   NA
 11581404 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5708.000 0.000 NA   NA
 11723796 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5708.000 0.000 NA   NA
 11439042 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5740.000 0.000 NA   NA
 11581405 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5740.000 0.000 NA   NA
 11723797 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5740.000 0.000 NA   NA
 11439043 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5768.000 0.000 NA   NA
 11581406 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5768.000 0.000 NA   NA
 11723798 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5768.000 0.000 NA   NA
 11439044 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5800.000 0.000 NA   NA
 11581407 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5800.000 0.000 NA   NA
 11723799 6852570   PAU_02712   yidK FALSE NA 5800.000 0.000 NA   NA
 6852575 6852576 PAU_02718 PAU_02719     TRUE 0.995 10.000 0.468 NA   NA
 6852576 6852577 PAU_02719 PAU_02720     TRUE 0.996 23.000 0.787 NA   NA
 6852577 6852578 PAU_02720 PAU_02721     TRUE 0.998 -3.000 0.895 NA   NA
 6852578 6852579 PAU_02721 PAU_02722     FALSE 0.097 223.000 0.000 NA   NA
 6852579 6852580 PAU_02722 PAU_02723     FALSE 0.005 2311.000 0.000 NA   NA
 11439045 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1350.000 0.000 NA   NA
 11581408 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1350.000 0.000 NA   NA
 11723800 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1350.000 0.000 NA   NA
 11439046 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1379.000 0.000 NA   NA
 11581409 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1379.000 0.000 NA   NA
 11723801 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1379.000 0.000 NA   NA
 11439047 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1410.000 0.000 NA   NA
 11581410 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1410.000 0.000 NA   NA
 11723802 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1410.000 0.000 NA   NA
 11439048 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1439.000 0.000 NA   NA
 11581411 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1439.000 0.000 NA   NA
 11723803 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1439.000 0.000 NA   NA
 11439049 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1470.000 0.000 NA   NA
 11581412 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1470.000 0.000 NA   NA
 11723804 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1470.000 0.000 NA   NA
 11439050 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1499.000 0.000 NA   NA
 11581413 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1499.000 0.000 NA   NA
 11723805 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1499.000 0.000 NA   NA
 11439051 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1530.000 0.000 NA   NA
 11581414 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1530.000 0.000 NA   NA
 11723806 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1530.000 0.000 NA   NA
 11439052 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1559.000 0.000 NA   NA
 11581415 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1559.000 0.000 NA   NA
 11723807 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1559.000 0.000 NA   NA
 11439053 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11581416 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11723808 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1590.000 0.000 NA   NA
 11439054 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1619.000 0.000 NA   NA
 11581417 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1619.000 0.000 NA   NA
 11723809 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1619.000 0.000 NA   NA
 11439055 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1650.000 0.000 NA   NA
 11581418 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1650.000 0.000 NA   NA
 11723810 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1650.000 0.000 NA   NA
 11439056 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1679.000 0.000 NA   NA
 11581419 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1679.000 0.000 NA   NA
 11723811 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1679.000 0.000 NA   NA
 11439057 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1710.000 0.000 NA   NA
 11581420 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1710.000 0.000 NA   NA
 11723812 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1710.000 0.000 NA   NA
 11439058 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1739.000 0.000 NA   NA
 11581421 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1739.000 0.000 NA   NA
 11723813 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1739.000 0.000 NA   NA
 11439059 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1770.000 0.000 NA   NA
 11581422 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1770.000 0.000 NA   NA
 11723814 6852578   PAU_02721     FALSE NA 1770.000 0.000 NA   NA
 6852580 6852581 PAU_02723 PAU_02724     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852581 6852582 PAU_02724 PAU_02725     FALSE 0.016 543.000 0.000 NA   NA
 6852582 6852583 PAU_02725 PAU_02726     FALSE 0.385 97.000 0.000 NA   NA
 6852583 6852584 PAU_02726 PAU_02727     FALSE 0.281 133.000 0.000 NA   NA
 6852584 6852585 PAU_02727 PAU_02728   H0160 TRUE 0.960 -3.000 0.087 NA   NA
 6852585 6852586 PAU_02728 PAU_02729 H0160   FALSE 0.013 634.000 0.000 NA   NA
 6852586 6852587 PAU_02729 PAU_02730     FALSE 0.245 145.000 0.000 NA   NA
 6852587 6852588 PAU_02730 PAU_t043     FALSE 0.166 179.000 0.000 NA   NA
 6852592 6852593 PAU_02734 PAU_02735     FALSE 0.081 1393.000 0.528 NA   NA
 6852593 6852594 PAU_02735 PAU_02736     TRUE 0.997 -3.000 0.707 NA   NA
 6852594 6852595 PAU_02736 PAU_02737     FALSE 0.026 420.000 0.000 NA   NA
 11439060 6852594   PAU_02736     FALSE NA 140.000 0.000 NA   NA
 11581423 6852594   PAU_02736     FALSE NA 140.000 0.000 NA   NA
 11723815 6852594   PAU_02736     FALSE NA 140.000 0.000 NA   NA
 11439061 6852594   PAU_02736     FALSE NA 168.000 0.000 NA   NA
 11581424 6852594   PAU_02736     FALSE NA 168.000 0.000 NA   NA
 11723816 6852594   PAU_02736     FALSE NA 168.000 0.000 NA   NA
 11439062 6852594   PAU_02736     FALSE NA 200.000 0.000 NA   NA
 11581425 6852594   PAU_02736     FALSE NA 200.000 0.000 NA   NA
 11723817 6852594   PAU_02736     FALSE NA 200.000 0.000 NA   NA
 11439063 6852594   PAU_02736     FALSE NA 228.000 0.000 NA   NA
 11581426 6852594   PAU_02736     FALSE NA 228.000 0.000 NA   NA
 11723818 6852594   PAU_02736     FALSE NA 228.000 0.000 NA   NA
 11439064 6852594   PAU_02736     FALSE NA 260.000 0.000 NA   NA
 11581427 6852594   PAU_02736     FALSE NA 260.000 0.000 NA   NA
 11723819 6852594   PAU_02736     FALSE NA 260.000 0.000 NA   NA
 11439065 6852594   PAU_02736     FALSE NA 288.000 0.000 NA   NA
 11581428 6852594   PAU_02736     FALSE NA 288.000 0.000 NA   NA
 11723820 6852594   PAU_02736     FALSE NA 288.000 0.000 NA   NA
 11439066 6852594   PAU_02736     FALSE NA 320.000 0.000 NA   NA
 11581429 6852594   PAU_02736     FALSE NA 320.000 0.000 NA   NA
 11723821 6852594   PAU_02736     FALSE NA 320.000 0.000 NA   NA
 11439067 6852594   PAU_02736     FALSE NA 348.000 0.000 NA   NA
 11581430 6852594   PAU_02736     FALSE NA 348.000 0.000 NA   NA
 11723822 6852594   PAU_02736     FALSE NA 348.000 0.000 NA   NA
 11439068 6852594   PAU_02736     FALSE NA 380.000 0.000 NA   NA
 11581431 6852594   PAU_02736     FALSE NA 380.000 0.000 NA   NA
 11723823 6852594   PAU_02736     FALSE NA 380.000 0.000 NA   NA
 11439069 6852594   PAU_02736     FALSE NA 408.000 0.000 NA   NA
 11581432 6852594   PAU_02736     FALSE NA 408.000 0.000 NA   NA
 11723824 6852594   PAU_02736     FALSE NA 408.000 0.000 NA   NA
 6852595 6852596 PAU_02737 PAU_02738     FALSE 0.014 588.000 0.000 NA   NA
 11439070 6852594   PAU_02736     FALSE NA 440.000 0.000 NA   NA
 11581433 6852594   PAU_02736     FALSE NA 440.000 0.000 NA   NA
 11723825 6852594   PAU_02736     FALSE NA 440.000 0.000 NA   NA
 11439071 6852594   PAU_02736     FALSE NA 468.000 0.000 NA   NA
 11581434 6852594   PAU_02736     FALSE NA 468.000 0.000 NA   NA
 11723826 6852594   PAU_02736     FALSE NA 468.000 0.000 NA   NA
 11439072 6852594   PAU_02736     FALSE NA 500.000 0.000 NA   NA
 11581435 6852594   PAU_02736     FALSE NA 500.000 0.000 NA   NA
 11723827 6852594   PAU_02736     FALSE NA 500.000 0.000 NA   NA
 11439073 6852594   PAU_02736     FALSE NA 528.000 0.000 NA   NA
 11581436 6852594   PAU_02736     FALSE NA 528.000 0.000 NA   NA
 11723828 6852594   PAU_02736     FALSE NA 528.000 0.000 NA   NA
 11439074 6852594   PAU_02736     FALSE NA 560.000 0.000 NA   NA
 11581437 6852594   PAU_02736     FALSE NA 560.000 0.000 NA   NA
 11723829 6852594   PAU_02736     FALSE NA 560.000 0.000 NA   NA
 11439075 6852594   PAU_02736     FALSE NA 588.000 0.000 NA   NA
 11581438 6852594   PAU_02736     FALSE NA 588.000 0.000 NA   NA
 11723830 6852594   PAU_02736     FALSE NA 588.000 0.000 NA   NA
 11439076 6852594   PAU_02736     FALSE NA 620.000 0.000 NA   NA
 11581439 6852594   PAU_02736     FALSE NA 620.000 0.000 NA   NA
 11723831 6852594   PAU_02736     FALSE NA 620.000 0.000 NA   NA
 11439077 6852594   PAU_02736     FALSE NA 648.000 0.000 NA   NA
 11581440 6852594   PAU_02736     FALSE NA 648.000 0.000 NA   NA
 11723832 6852594   PAU_02736     FALSE NA 648.000 0.000 NA   NA
 11439078 6852594   PAU_02736     FALSE NA 680.000 0.000 NA   NA
 11581441 6852594   PAU_02736     FALSE NA 680.000 0.000 NA   NA
 11723833 6852594   PAU_02736     FALSE NA 680.000 0.000 NA   NA
 11439079 6852594   PAU_02736     FALSE NA 708.000 0.000 NA   NA
 11581442 6852594   PAU_02736     FALSE NA 708.000 0.000 NA   NA
 11723834 6852594   PAU_02736     FALSE NA 708.000 0.000 NA   NA
 11439080 6852594   PAU_02736     FALSE NA 740.000 0.000 NA   NA
 11581443 6852594   PAU_02736     FALSE NA 740.000 0.000 NA   NA
 11723835 6852594   PAU_02736     FALSE NA 740.000 0.000 NA   NA
 11439081 6852594   PAU_02736     FALSE NA 768.000 0.000 NA   NA
 11581444 6852594   PAU_02736     FALSE NA 768.000 0.000 NA   NA
 11723836 6852594   PAU_02736     FALSE NA 768.000 0.000 NA   NA
 11439082 6852594   PAU_02736     FALSE NA 800.000 0.000 NA   NA
 11581445 6852594   PAU_02736     FALSE NA 800.000 0.000 NA   NA
 11723837 6852594   PAU_02736     FALSE NA 800.000 0.000 NA   NA
 11439083 6852594   PAU_02736     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11581446 6852594   PAU_02736     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11723838 6852594   PAU_02736     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11439084 6852594   PAU_02736     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11581447 6852594   PAU_02736     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11723839 6852594   PAU_02736     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11439085 6852594   PAU_02736     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11581448 6852594   PAU_02736     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11723840 6852594   PAU_02736     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11439086 6852594   PAU_02736     FALSE NA 921.000 0.000 NA   NA
 11581449 6852594   PAU_02736     FALSE NA 921.000 0.000 NA   NA
 11723841 6852594   PAU_02736     FALSE NA 921.000 0.000 NA   NA
 11439087 6852594   PAU_02736     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11581450 6852594   PAU_02736     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11723842 6852594   PAU_02736     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11439088 6852594   PAU_02736     FALSE NA 981.000 0.000 NA   NA
 11581451 6852594   PAU_02736     FALSE NA 981.000 0.000 NA   NA
 11723843 6852594   PAU_02736     FALSE NA 981.000 0.000 NA   NA
 11439089 6852594   PAU_02736     FALSE NA 1009.000 0.000 NA   NA
 11581452 6852594   PAU_02736     FALSE NA 1009.000 0.000 NA   NA
 11723844 6852594   PAU_02736     FALSE NA 1009.000 0.000 NA   NA
 11439090 6852594   PAU_02736     FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11581453 6852594   PAU_02736     FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11723845 6852594   PAU_02736     FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 6852601 6852602 PAU_02743 PAU_02744 sulA ompA FALSE 0.008 558.000 0.000 1.000 N NA
 6852604 6852605 PAU_02746 PAU_02747   fabA TRUE 0.979 21.000 0.290 1.000 N NA
 6852605 6852606 PAU_02747 PAU_02748 fabA   FALSE 0.026 417.000 0.000 NA   NA
 6852607 6852608 PAU_02749 PAU_02750 ymbA pqiB TRUE 0.995 -3.000 0.531 NA   NA
 6852608 6852609 PAU_02750 PAU_02751 pqiB pqiA TRUE 0.997 21.000 0.819 NA   NA
 6852609 6852610 PAU_02751 PAU_02752 pqiA uup TRUE 0.454 89.000 0.054 NA   NA
 6852610 6852611 PAU_02752 PAU_02753 uup ycbY TRUE 0.962 6.000 0.061 1.000   NA
 6852612 6852613 PAU_02754 PAU_02755     FALSE 0.082 250.000 0.000 1.000   NA
 6852613 6852614 PAU_02755 PAU_02756     TRUE 0.451 212.000 0.000 0.001 Y NA
 6852614 6852615 PAU_02756 PAU_02757     TRUE 0.385 236.000 0.000 0.001 Y NA
 6852616 6852617 PAU_02758 PAU_02759   pyrD FALSE 0.208 192.000 0.081 NA   NA
 6852620 6852621 PAU_02762 PAU_02763 pncB asnS FALSE 0.168 122.000 0.034 1.000 N NA
 6852621 6852622 PAU_02763 PAU_02764 asnS ompN1 FALSE 0.022 324.000 0.000 1.000 N NA
 6852622 6852623 PAU_02764 PAU_02765 ompN1 ompN2 FALSE 0.093 504.000 0.000 0.022 Y NA
 6852623 6852624 PAU_02765 PAU_02766 ompN2 aspC FALSE 0.107 164.000 0.000 1.000 N NA
 6852625 6852626 PAU_02767 PAU_02768 ycbL ycbK TRUE 0.810 46.000 0.089 NA   NA
 6852626 6852627 PAU_02768 PAU_02769 ycbK   TRUE 0.923 61.000 0.372 NA   NA
 6852627 6852628 PAU_02769 PAU_02770     FALSE 0.026 442.000 0.000 1.000   NA
 6852629 6852630 PAU_02771 PAU_02772   JM12 FALSE 0.007 1178.000 0.000 1.000   NA
 6852631 6852632 PAU_02773 PAU_02774     TRUE 0.998 9.000 0.689 NA   NA
 6852634 6852635 PAU_02776 PAU_02777 bfpE pilQ TRUE 0.999 8.000 0.857 NA Y NA
 6852635 6852636 PAU_02777 PAU_02778 pilQ   TRUE 0.995 24.000 0.714 NA   NA
 6852636 6852637 PAU_02778 PAU_02779   pilO TRUE 0.900 23.000 0.000 NA   NA
 6852637 6852638 PAU_02779 PAU_02780 pilO pilN TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6852638 6852639 PAU_02780 PAU_02781 pilN pilL TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6852639 6852640 PAU_02781 PAU_02782 pilL   TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 6852640 6852641 PAU_02782 PAU_02783   pilV TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6852641 6852642 PAU_02783 PAU_02785 pilV pppA FALSE 0.333 115.000 0.000 NA   NA
 6852642 6852643 PAU_02785 PAU_02786 pppA   TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6852643 6852644 PAU_02786 PAU_02787     FALSE 0.012 643.000 0.000 NA   NA
 6852644 6852645 PAU_02787 PAU_02788     TRUE 0.999 2.000 1.000 NA   NA
 6852645 6852646 PAU_02788 PAU_02789     TRUE 0.878 25.000 0.033 NA   NA
 6852647 6852648 PAU_02790 PAU_02791 afp1 afp2 TRUE 0.726 215.000 0.667 NA   NA
 6852648 6852649 PAU_02791 PAU_02792 afp2 afp3 TRUE 0.943 12.000 0.000 NA   NA
 6852649 6852650 PAU_02792 PAU_02793 afp3 afp4 TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6852650 6852651 PAU_02793 PAU_02794 afp4 afp5 TRUE 0.993 14.000 0.400 NA   NA
 6852651 6852652 PAU_02794 PAU_02795 afp5 afp7 TRUE 0.719 163.000 0.400 NA   NA
 6852652 6852653 PAU_02795 PAU_02796 afp7   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852653 6852654 PAU_02796 PAU_02797   afp9 TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 6852654 6852655 PAU_02797 PAU_02798 afp9 afp10 TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 6852655 6852656 PAU_02798 PAU_02799 afp10 afp11 FALSE 0.114 209.000 0.000 NA   NA
 6852656 6852657 PAU_02799 PAU_02800 afp11 afp12 TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852657 6852658 PAU_02800 PAU_02801 afp12   FALSE 0.345 110.000 0.000 NA   NA
 6852658 6852659 PAU_02801 PAU_02802   orf25 TRUE 0.536 64.000 0.000 NA   NA
 6852659 6852660 PAU_02802 PAU_02803 orf25   TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6852660 6852661 PAU_02803 PAU_02804     TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6852661 6852662 PAU_02804 PAU_02805   hrpN TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6852662 6852663 PAU_02805 PAU_02806 hrpN   FALSE 0.141 192.000 0.000 NA   NA
 6852663 6852664 PAU_02806 PAU_02807     FALSE 0.014 578.000 0.000 NA   NA
 6852664 6852665 PAU_02807 PAU_02808     FALSE 0.016 550.000 0.000 NA   NA
 6852666 6852667 PAU_02809 PAU_02810 yfaD yefM FALSE 0.242 147.000 0.000 NA   NA
 6852667 6852668 PAU_02810 PAU_02811 yefM mukB FALSE 0.087 427.000 0.000 NA Y NA
 6852668 6852669 PAU_02811 PAU_02812 mukB mukE TRUE 0.999 -3.000 0.786 0.000 Y NA
 6852669 6852670 PAU_02812 PAU_02813 mukE mukF TRUE 0.974 -46.000 0.196 NA Y NA
 6852670 6852671 PAU_02813 PAU_02814 mukF smtA TRUE 0.986 -3.000 0.325 NA N NA
 6852673 6852674 PAU_02816 PAU_02817 kdsB ycaR TRUE 0.991 4.000 0.265 NA   NA
 6852674 6852675 PAU_02817 PAU_02818 ycaR lpxK FALSE 0.039 1009.000 0.263 NA   NA
 6852675 6852676 PAU_02818 PAU_02819 lpxK msbA TRUE 0.976 -3.000 0.205 1.000 N NA
 6852676 6852677 PAU_02819 PAU_02820 msbA ycaI TRUE 0.899 39.000 0.075 0.047   NA
 6852678 6852679 PAU_02821 PAU_02822     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6852680 6852681 PAU_02823 PAU_02824 imm2   FALSE 0.376 106.000 0.000 1.000   NA
 6852681 6852682 PAU_02824 PAU_02826     TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6852682 6852683 PAU_02826 PAU_02827   ihfB FALSE 0.007 953.000 0.000 NA   NA
 6852683 6852684 PAU_02827 PAU_02828 ihfB rpsA TRUE 0.835 65.000 0.292 1.000 N NA
 6852684 6852685 PAU_02828 PAU_02829 rpsA cmk TRUE 0.605 138.000 0.281 1.000 N NA
 6852685 6852686 PAU_02829 PAU_02830 cmk aroA FALSE 0.371 181.000 0.209 1.000 N NA
 6852686 6852687 PAU_02830 PAU_02831 aroA serC TRUE 0.633 120.000 0.033 1.000 Y NA
 6852687 6852688 PAU_02831 PAU_02832 serC   FALSE 0.208 166.000 0.000 1.000   NA
 6852688 6852689 PAU_02832 PAU_02833     TRUE 0.997 9.000 0.650 1.000   NA
 6852689 6852690 PAU_02833 PAU_02834   ansB FALSE 0.028 428.000 0.000 1.000   NA
 6852691 6852692 PAU_02835 PAU_02836 ycaO focA FALSE 0.047 317.000 0.000 NA   NA
 6852692 6852693 PAU_02836 PAU_02837 focA pflB TRUE 0.772 57.000 0.172 1.000 N NA
 6852693 6852694 PAU_02837 PAU_02838 pflB pflA FALSE 0.212 74.000 0.021 1.000 N NA
 6852694 6852695 PAU_02838 PAU_02839 pflA   FALSE 0.013 615.000 0.000 NA   NA
 6852695 6852696 PAU_02839 PAU_02840     FALSE 0.010 712.000 0.000 NA   NA
 6852697 6852698 PAU_02841 PAU_02842 serS ycaJ TRUE 0.432 105.000 0.078 0.069 N NA
 6852698 6852699 PAU_02842 PAU_02843 ycaJ lolA TRUE 0.975 8.000 0.167 1.000 N NA
 6852699 6852700 PAU_02843 PAU_02844 lolA ftsK TRUE 0.799 75.000 0.305 1.000 N NA
 6852700 6852701 PAU_02844 PAU_02845 ftsK lrp TRUE 0.708 131.000 0.345 1.000 N NA
 6852702 6852703 PAU_02846 PAU_02847 trxB cydD TRUE 0.639 129.000 0.049 1.000 Y NA
 6852703 6852704 PAU_02847 PAU_02848 cydD cydC TRUE 0.999 2.000 0.631 0.006 Y NA
 6852704 6852705 PAU_02848 PAU_02849 cydC aat TRUE 0.987 7.000 0.049 1.000 Y NA
 6852705 6852706 PAU_02849 PAU_02850 aat infA FALSE 0.092 145.000 0.020 1.000 N NA
 6852707 6852708 PAU_02851 PAU_02852 clpA clpS TRUE 0.992 26.000 0.596 NA   NA
 6852710 6852711 PAU_02854 PAU_02855 macB macA TRUE 0.998 0.000 0.789 0.059 N NA
 6852712 6852713 PAU_02856 PAU_02857 ybjE artP FALSE 0.051 302.000 0.000 NA   NA
 6852713 6852714 PAU_02857 PAU_02858 artP artI TRUE 0.983 20.000 0.081 1.000 Y NA
 6852714 6852715 PAU_02858 PAU_02859 artI artQ TRUE 0.990 14.000 0.065 0.033 Y NA
 6852715 6852716 PAU_02859 PAU_02860 artQ artM TRUE 0.999 0.000 0.714 0.013 Y NA
 6852717 6852718 PAU_02861 PAU_02862 rumB ybjN TRUE 0.946 25.000 0.119 NA   NA
 6852718 6852719 PAU_02862 PAU_02863 ybjN ybjC TRUE 0.741 86.000 0.194 NA   NA
 6852720 6852721 PAU_02864 PAU_s016 grxA   FALSE 0.188 168.000 0.000 NA   NA
 6852721 6852722 PAU_s016 PAU_02865   ybjG FALSE 0.078 247.000 0.000 NA   NA
 6852722 6852723 PAU_02865 PAU_02866 ybjG sdaC FALSE 0.008 919.000 0.000 1.000   NA
 6852723 6852724 PAU_02866 PAU_02867 sdaC cipA FALSE 0.009 744.000 0.000 NA   NA
 6852724 6852725 PAU_02867 PAU_02868 cipA cipA FALSE 0.008 850.000 0.000 NA   NA
 6852725 6852726 PAU_02868 PAU_02869 cipA   FALSE 0.011 679.000 0.000 NA   NA
 6852730 6852731 PAU_02873 PAU_02874 hisG hisCD TRUE 0.996 7.000 0.171 0.003 Y NA
 6852731 6852732 PAU_02874 PAU_02875 hisCD hisCD TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.000 Y NA
 6852732 6852733 PAU_02875 PAU_02876 hisCD hisB TRUE 0.998 0.000 0.341 0.003 Y NA
 6852733 6852734 PAU_02876 PAU_02877 hisB hisH TRUE 0.994 -3.000 0.128 0.003 Y NA
 6852734 6852735 PAU_02877 PAU_02878 hisH hisA1 TRUE 0.997 6.000 0.210 0.003 Y NA
 6852735 6852736 PAU_02878 PAU_02879 hisA1 hisF TRUE 0.995 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 6852736 6852737 PAU_02879 PAU_02880 hisF hisI TRUE 0.998 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 6852739 6852740 PAU_02882 PAU_02883   NCU04533.1 FALSE 0.010 716.000 0.000 NA   NA
 6852740 6852741 PAU_02883 PAU_02884 NCU04533.1 NCU04533.1 FALSE 0.008 848.000 0.000 NA   NA
 6852743 6852744 PAU_02886 PAU_02887 yegH   FALSE 0.046 412.000 0.000 0.043   NA
 6852745 6852746 PAU_02888 PAU_02889 asmA dcd TRUE 0.486 56.000 0.057 NA N NA
 6852746 6852747 PAU_02889 PAU_02890 dcd udk TRUE 0.984 22.000 0.098 1.000 Y NA
 6852747 6852748 PAU_02890 PAU_02891 udk mrp FALSE 0.056 327.000 0.073 0.069 N NA
 6852749 6852750 PAU_02892 PAU_02893 metG yohJ FALSE 0.266 164.000 0.062 1.000   NA
 6852750 6852751 PAU_02893 PAU_02894 yohJ yohK TRUE 0.994 3.000 0.340 1.000   NA
 6852751 6852752 PAU_02894 PAU_02895 yohK cdd TRUE 0.463 148.000 0.198 1.000 N NA
 6852752 6852753 PAU_02895 PAU_02896 cdd sfcA FALSE 0.043 207.000 0.022 1.000 N NA
 6852753 6852754 PAU_02896 PAU_02897 sfcA sanA TRUE 0.386 101.000 0.045 NA   NA
 6852755 6852756 PAU_02898 PAU_02899   folE TRUE 0.995 25.000 0.719 NA   NA
 6852756 6852757 PAU_02899 PAU_02900 folE yjiJ TRUE 0.603 158.000 0.250 NA   NA
 6852758 6852759 PAU_02901 PAU_02902   moeA FALSE 0.020 334.000 0.000 1.000 N NA
 6852759 6852760 PAU_02902 PAU_02903 moeA moeB TRUE 0.998 0.000 0.323 0.002 Y NA
 6852761 6852762 PAU_02904 PAU_02905   aac(6')-Ic FALSE 0.329 124.000 0.000 1.000   NA
 6852762 6852763 PAU_02905 PAU_02906 aac(6')-Ic yqhD FALSE 0.291 166.000 0.000 0.043   NA
 6852763 6852764 PAU_02906 PAU_02907 yqhD   TRUE 0.817 53.000 0.077 0.017   NA
 6852764 6852765 PAU_02907 PAU_02908   ydhM FALSE 0.313 123.000 0.000 NA   NA
 6852765 6852766 PAU_02908 PAU_02909 ydhM ydhM TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6852769 6852770 PAU_02912 PAU_02913 ybiF dps FALSE 0.068 284.000 0.044 1.000   NA
 6852770 6852771 PAU_02913 PAU_02914 dps   FALSE 0.346 206.000 0.000 1.000 Y NA
 6852773 6852774 PAU_02916 PAU_02917 sseA   FALSE 0.015 600.000 0.000 1.000   NA
 6852774 6852775 PAU_02917 PAU_02918     FALSE 0.034 524.000 0.000 0.003   NA
 6852775 6852776 PAU_02918 PAU_02919     FALSE 0.080 335.000 0.000 0.003   NA
 6852776 6852777 PAU_02919 PAU_02920     FALSE 0.041 470.000 0.000 0.003   NA
 6852778 6852779 PAU_02921 PAU_02922 dusC rhlE TRUE 0.727 84.000 0.033 1.000 Y NA
 6852780 6852781 PAU_02923 PAU_02924 ybiH ybhG TRUE 0.978 17.000 0.236 1.000 N NA
 6852781 6852782 PAU_02924 PAU_02925 ybhG ybhF TRUE 0.997 10.000 0.545 1.000   NA
 6852782 6852783 PAU_02925 PAU_02926 ybhF ybhS TRUE 0.997 -3.000 0.547 0.069   NA
 6852783 6852784 PAU_02926 PAU_02927 ybhS ybhR TRUE 0.999 13.000 0.609 0.006 Y NA
 6852785 6852786 PAU_02928 PAU_02929   kbl FALSE 0.202 110.000 0.000 1.000 N NA
 6852786 6852787 PAU_02929 PAU_02930 kbl ybhL FALSE 0.015 571.000 0.000 NA   NA
 6852787 6852788 PAU_02930 PAU_02931 ybhL moaE FALSE 0.138 181.000 0.025 NA   NA
 6852788 6852789 PAU_02931 PAU_02932 moaE moaD TRUE 0.999 4.000 0.501 0.002 Y NA
 6852789 6852790 PAU_02932 PAU_02933 moaD moaC TRUE 0.997 0.000 0.175 0.002 Y NA
 6852790 6852791 PAU_02933 PAU_02934 moaC moaA TRUE 0.961 38.000 0.039 0.002 Y NA
 6852793 6852794 PAU_02936 PAU_02937 uvrB bioD FALSE 0.008 745.000 0.000 0.069 N NA
 6852794 6852795 PAU_02937 PAU_02938 bioD bioC TRUE 0.982 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 6852795 6852796 PAU_02938 PAU_02939 bioC bioF TRUE 0.982 -16.000 0.133 0.002 Y NA
 6852796 6852797 PAU_02939 PAU_02940 bioF bioB TRUE 0.995 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 6852801 6852802 PAU_02944 PAU_02945 modC modB TRUE 0.998 -6.000 0.537 0.001 Y NA
 6852802 6852803 PAU_02945 PAU_02946 modB modA TRUE 0.999 12.000 0.627 0.001 Y NA
 6852804 6852805 PAU_02947 PAU_02948 modE modF TRUE 0.476 92.000 0.023 0.069   NA
 6852805 6852806 PAU_02948 PAU_02949 modF   FALSE 0.122 175.000 0.009 NA   NA
 6852806 6852807 PAU_02949 PAU_02950   gpmA FALSE 0.123 173.000 0.009 NA   NA
 6852808 6852809 PAU_02951 PAU_02952 aroG pnuC FALSE 0.040 246.000 0.000 1.000 N NA
 6852809 6852810 PAU_02952 PAU_02953 pnuC nadA FALSE 0.363 190.000 0.023 1.000 Y NA
 6852810 6852811 PAU_02953 PAU_02954 nadA ydaB FALSE 0.006 1235.000 0.000 NA   NA
 6852811 6852812 PAU_02954 PAU_02955 ydaB pirA FALSE 0.017 530.000 0.000 NA   NA
 6852814 6852815 PAU_t044 PAU_t045     FALSE 0.363 103.000 0.000 NA   NA
 6852815 6852816 PAU_t045 PAU_t046     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852816 6852817 PAU_t046 PAU_t047     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852817 6852818 PAU_t047 PAU_t048     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852818 6852819 PAU_t048 PAU_t049     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852819 6852820 PAU_t049 PAU_t050     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852820 6852821 PAU_t050 PAU_t051     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852821 6852822 PAU_t051 PAU_t052     FALSE 0.356 106.000 0.000 NA   NA
 6852822 6852823 PAU_t052 PAU_t053     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852823 6852824 PAU_t053 PAU_t054     FALSE 0.352 107.000 0.000 NA   NA
 6852824 6852825 PAU_t054 PAU_t055     TRUE 0.743 43.000 0.000 NA   NA
 6852825 6852826 PAU_t055 PAU_t056     TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6852826 6852827 PAU_t056 PAU_02957   ybgF FALSE 0.239 148.000 0.000 NA   NA
 6852827 6852828 PAU_02957 PAU_02958 ybgF pal TRUE 0.971 10.000 0.088 1.000   NA
 6852828 6852829 PAU_02958 PAU_02959 pal tolB TRUE 0.994 16.000 0.592 1.000 N NA
 6852829 6852830 PAU_02959 PAU_02960 tolB tolA FALSE 0.026 318.000 0.051 NA N NA
 6852830 6852831 PAU_02960 PAU_02961 tolA tolR TRUE 0.760 45.000 0.114 NA N NA
 6852831 6852832 PAU_02961 PAU_02962 tolR tolQ TRUE 0.999 15.000 0.556 0.033 Y NA
 6852832 6852833 PAU_02962 PAU_02963 tolQ   TRUE 0.997 0.000 0.593 1.000   NA
 6852833 6852834 PAU_02963 PAU_02964     TRUE 0.961 16.000 0.095 NA   NA
 6852834 6852835 PAU_02964 PAU_02965     TRUE 0.980 0.000 0.140 NA   NA
 6852835 6852836 PAU_02965 PAU_02966   cydB2 TRUE 0.989 13.000 0.261 NA   NA
 6852836 6852837 PAU_02966 PAU_02967 cydB2 cydA2 TRUE 0.998 15.000 0.348 0.028 Y NA
 6852838 6852839 PAU_02968 PAU_02969     FALSE 0.019 485.000 0.000 NA   NA
 6852839 6852840 PAU_02969 PAU_02970     FALSE 0.023 714.000 0.000 0.000   NA
 6852841 6852842 PAU_02971 PAU_02972 sucD sucC TRUE 1.000 0.000 0.806 0.000 Y NA
 6852842 6852843 PAU_02972 PAU_02973 sucC sucB TRUE 0.673 162.000 0.136 1.000 Y NA
 6852843 6852844 PAU_02973 PAU_02974 sucB sucA TRUE 0.999 15.000 0.667 1.000 Y NA
 6852844 6852845 PAU_02974 PAU_02975 sucA sdhB FALSE 0.263 265.000 0.067 1.000 Y NA
 6852845 6852846 PAU_02975 PAU_02976 sdhB sdhA TRUE 0.997 38.000 0.604 0.002 Y NA
 6852846 6852847 PAU_02976 PAU_02977 sdhA sdhD TRUE 0.999 1.000 0.705 0.002 Y NA
 6852847 6852848 PAU_02977 PAU_02978 sdhD sdhC TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 6852850 6852851 PAU_02980 PAU_02981     FALSE 0.107 188.000 0.010 NA   NA
 6852853 6852854 PAU_02983 PAU_02984     TRUE 0.812 -18.000 0.000 NA   NA
 6852854 6852855 PAU_02984 PAU_02985     TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6852856 6852857 PAU_02986 PAU_02987 kdpA kdpB TRUE 0.995 21.000 0.201 0.001 Y NA
 6852857 6852858 PAU_02987 PAU_02988 kdpB kdpC TRUE 1.000 12.000 0.877 0.001 Y NA
 6852858 6852859 PAU_02988 PAU_02989 kdpC kdpD TRUE 0.969 10.000 0.100 0.058 N NA
 6852859 6852860 PAU_02989 PAU_02990 kdpD kdpE TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 6852861 6852862 PAU_02991 PAU_02992     FALSE 0.020 474.000 0.000 NA   NA
 6852864 6852865 PAU_02994 PAU_02995 pgm seqA TRUE 0.720 60.000 0.151 1.000 N NA
 6852865 6852866 PAU_02995 PAU_02996 seqA   FALSE 0.039 342.000 0.000 NA   NA
 6852866 6852867 PAU_02996 PAU_02997   fhaB TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6852869 6852870 PAU_02999 PAU_03000   gene0030 FALSE 0.201 461.000 0.147 0.048 Y NA
 6852870 6852871 PAU_03000 PAU_03001 gene0030 gene0031 FALSE 0.016 547.000 0.000 NA   NA
 6852871 6852872 PAU_03001 PAU_03002 gene0031 gene0032 FALSE 0.104 217.000 0.000 NA   NA
 6852872 6852873 PAU_03002 PAU_03003 gene0032 gene0033 TRUE 0.962 -79.000 0.333 NA   NA
 6852873 6852874 PAU_03003 PAU_03004 gene0033 gene0034 FALSE 0.188 168.000 0.000 NA   NA
 6852874 6852875 PAU_03004 PAU_03005 gene0034 gene0035 FALSE 0.031 386.000 0.000 NA   NA
 6852875 6852876 PAU_03005 PAU_03006 gene0035 gene0036 TRUE 0.561 219.000 0.147 0.048 Y NA
 6852876 6852877 PAU_03006 PAU_03007 gene0036 gene0037 FALSE 0.020 481.000 0.000 NA   NA
 6852877 6852878 PAU_03007 PAU_03008 gene0037 gene0038 FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 6852878 6852879 PAU_03008 PAU_03009 gene0038 api89 TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6852879 6852880 PAU_03009 PAU_03010 api89 api90 TRUE 0.971 10.000 0.095 NA   NA
 6852880 6852881 PAU_03010 PAU_03011 api90   FALSE 0.015 569.000 0.000 NA   NA
 6852882 6852883 PAU_03012 PAU_03013 dctA   FALSE 0.006 1332.000 0.000 NA   NA
 6852883 6852884 PAU_03013 PAU_03014     TRUE 0.852 30.000 0.000 NA   NA
 6852884 6852885 PAU_03014 PAU_03015     FALSE 0.029 400.000 0.000 NA   NA
 6852885 6852886 PAU_03015 PAU_03016     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 6852887 6852888 PAU_03017 PAU_03018 yjiW   TRUE 0.556 62.000 0.000 NA   NA
 6852888 6852889 PAU_03018 PAU_03019     FALSE 0.008 901.000 0.000 NA   NA
 6852889 6852890 PAU_03019 PAU_03020   amiF FALSE 0.006 1482.000 0.000 1.000   NA
 6852890 6852891 PAU_03020 PAU_03021 amiF   FALSE 0.006 1281.000 0.000 NA   NA
 6852891 6852892 PAU_03021 PAU_03022     FALSE 0.191 167.000 0.000 NA   NA
 6852892 6852893 PAU_03022 PAU_03023     TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6852893 6852894 PAU_03023 PAU_03024     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6852894 6852895 PAU_03024 PAU_03025     TRUE 0.993 4.000 0.333 NA   NA
 6852895 6852896 PAU_03025 PAU_03026     FALSE 0.229 151.000 0.000 NA   NA
 6852896 6852897 PAU_03026 PAU_03027   rtxA FALSE 0.006 1408.000 0.000 NA   NA
 6852897 6852898 PAU_03027 PAU_03028 rtxA   FALSE 0.006 1227.000 0.000 NA   NA
 6852898 6852899 PAU_03028 PAU_03029   orf3 FALSE 0.003 1213.000 0.000 1.000 N NA
 6852899 6852900 PAU_03029 PAU_03030 orf3   TRUE 0.872 -13.000 0.115 1.000 N NA
 6852900 6852901 PAU_03030 PAU_03031     TRUE 0.646 158.000 0.385 1.000 N NA
 6852901 6852902 PAU_03031 PAU_03032     FALSE 0.154 229.000 0.000 0.029   NA
 6852903 6852904 PAU_03033 PAU_03034 afp17   FALSE 0.007 1164.000 0.000 1.000   NA
 6852904 6852905 PAU_03034 PAU_03035     TRUE 0.860 40.000 0.000 0.025   NA
 6852905 6852906 PAU_03035 PAU_03036     TRUE 0.975 26.000 0.000 0.025 Y NA
 6852907 6852908 PAU_03037 PAU_03038     FALSE 0.233 150.000 0.000 NA   NA
 6852908 6852909 PAU_03038 PAU_03039     TRUE 0.596 57.000 0.000 NA   NA
 6852909 6852910 PAU_03039 PAU_03040     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   NA
 6852910 6852911 PAU_03040 PAU_03041     TRUE 0.836 33.000 0.000 NA   NA
 6852911 6852912 PAU_03041 PAU_03042     TRUE 0.986 17.000 0.250 NA   NA
 6852912 6852913 PAU_03042 PAU_03043     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 6852913 6852914 PAU_03043 PAU_03044     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6852914 6852915 PAU_03044 PAU_03045     TRUE 0.995 -12.000 1.000 NA   NA
 6852915 6852916 PAU_03045 PAU_03046     TRUE 0.986 51.000 1.000 NA   NA
 6852916 6852917 PAU_03046 PAU_03047     TRUE 0.983 -19.000 0.500 NA   NA
 6852917 6852918 PAU_03047 PAU_03048   vgrG4 TRUE 0.996 4.000 0.500 NA   NA
 6852918 6852919 PAU_03048 PAU_03049 vgrG4   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852919 6852920 PAU_03049 PAU_03050     FALSE 0.081 244.000 0.000 NA   NA
 6852920 6852921 PAU_03050 PAU_03051     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6852921 6852922 PAU_03051 PAU_03052     TRUE 0.586 58.000 0.000 NA   NA
 6852922 6852923 PAU_03052 PAU_03053     TRUE 0.995 -12.000 1.000 NA   NA
 6852923 6852924 PAU_03053 PAU_03054     TRUE 0.986 51.000 1.000 NA   NA
 6852924 6852925 PAU_03054 PAU_03055     TRUE 0.986 51.000 1.000 NA   NA
 6852925 6852926 PAU_03055 PAU_03056     FALSE 0.288 131.000 0.000 NA   NA
 6852926 6852927 PAU_03056 PAU_03057     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6852927 6852928 PAU_03057 PAU_03058     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852928 6852929 PAU_03058 PAU_03059     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 6852929 6852930 PAU_03059 PAU_03060     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6852930 6852931 PAU_03060 PAU_03061     TRUE 0.574 60.000 0.000 NA   NA
 6852931 6852932 PAU_03061 PAU_03062     FALSE 0.007 935.000 0.000 NA   NA
 6852932 6852933 PAU_03062 PAU_03063   ofn31 FALSE 0.054 294.000 0.000 NA   NA
 6852933 6852934 PAU_03063 PAU_03064 ofn31 ofn32 TRUE 0.985 -3.000 0.214 NA   NA
 6852934 6852935 PAU_03064 PAU_03065 ofn32   FALSE 0.032 383.000 0.000 NA   NA
 6852935 6852936 PAU_03065 PAU_03066     TRUE 0.996 -3.000 0.286 NA Y NA
 6852936 6852937 PAU_03066 PAU_03067     FALSE 0.030 263.000 0.000 NA N NA
 6852938 6852939 PAU_03068 PAU_03069     TRUE 0.987 37.000 0.600 NA   NA
 6852939 6852940 PAU_03069 PAU_03070     TRUE 0.997 12.000 0.600 NA   NA
 6852941 6852942 PAU_03071 PAU_03072 doc yhhV TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6852942 6852943 PAU_03072 PAU_03073 yhhV   FALSE 0.070 262.000 0.000 NA   NA
 6852943 6852944 PAU_03073 PAU_03074   ISPlu8C4 FALSE 0.012 405.000 0.000 NA N NA
 6852944 6852945 PAU_03074 PAU_03075 ISPlu8C4 rtxC FALSE 0.004 857.000 0.000 1.000 N NA
 6852945 6852946 PAU_03075 PAU_03076 rtxC   TRUE 0.997 22.000 0.846 NA   NA
 6852947 6852948 PAU_03077 PAU_03078 rtxB rtxD TRUE 0.891 -7.000 0.000 0.007 N NA
 6852948 6852949 PAU_03078 PAU_03079 rtxD   TRUE 0.967 12.000 0.085 0.007 N NA
 6852949 6852950 PAU_03079 PAU_03080     TRUE 0.536 192.000 0.400 1.000 N NA
 6852950 6852951 PAU_03080 PAU_03081     FALSE 0.368 140.000 0.000 0.045   NA
 6852951 6852952 PAU_03081 PAU_03082   fldA TRUE 0.741 172.000 0.473 1.000   NA
 6852952 6852953 PAU_03082 PAU_03083 fldA fur FALSE 0.033 529.000 0.156 1.000 N NA
 6852954 6852955 PAU_03084 PAU_03085 chb glnS FALSE 0.004 826.000 0.000 1.000 N NA
 6852955 6852956 PAU_03085 PAU_03086 glnS   FALSE 0.010 742.000 0.000 NA   NA
 6852956 6852957 PAU_03086 PAU_03087     TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6852957 6852958 PAU_03087 PAU_03088   nagE FALSE 0.012 658.000 0.000 NA   NA
 6852959 6852960 PAU_03089 PAU_03090 nagB nagA TRUE 0.976 101.000 0.557 0.000 Y NA
 6852960 6852961 PAU_03090 PAU_03091 nagA nagC TRUE 0.998 16.000 0.571 1.000 Y NA
 6852961 6852962 PAU_03091 PAU_t057 nagC   FALSE 0.229 151.000 0.000 NA   NA
 6852962 6852963 PAU_t057 PAU_t058     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6852963 6852964 PAU_t058 PAU_t059     TRUE 0.836 33.000 0.000 NA   NA
 6852964 6852965 PAU_t059 PAU_t060     TRUE 0.755 42.000 0.000 NA   NA
 6852965 6852966 PAU_t060 PAU_t061     TRUE 0.864 28.000 0.000 NA   NA
 6852966 6852967 PAU_t061 PAU_t062     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6852968 6852969 PAU_03092 PAU_03093   gene0039 TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6852969 6852970 PAU_03093 PAU_03094 gene0039 gene0040 TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6852970 6852971 PAU_03094 PAU_03095 gene0040 gene0041 TRUE 0.962 -7.000 0.167 NA   NA
 6852971 6852972 PAU_03095 PAU_03096 gene0041 gene0042 TRUE 0.992 -16.000 0.800 NA   NA
 6852972 6852973 PAU_03096 PAU_03097 gene0042 gene0043 TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6852973 6852974 PAU_03097 PAU_03098 gene0043 gene0044 TRUE 0.981 -25.000 0.500 NA   NA
 6852974 6852975 PAU_03098 PAU_03099 gene0044 gene0045 TRUE 0.995 2.000 0.429 NA   NA
 6852975 6852976 PAU_03099 PAU_03100 gene0045 gene0046 TRUE 0.996 0.000 0.500 NA   NA
 6852976 6852977 PAU_03100 PAU_03101 gene0046 gene0047 FALSE 0.018 501.000 0.000 NA   NA
 6852977 6852978 PAU_03101 PAU_03102 gene0047 gene0048 FALSE 0.123 205.000 0.000 NA   NA
 6852979 6852980 PAU_03103 PAU_03104 gene0049 gene0050 TRUE 0.864 28.000 0.000 NA   NA
 6852981 6852982 PAU_03105 PAU_03106 gene0051 gene0052 FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6852982 6852983 PAU_03106 PAU_03107 gene0052 gene0053 TRUE 0.996 -3.000 0.571 NA   NA
 6852983 6852984 PAU_03107 PAU_03108 gene0053 gene0054 TRUE 0.992 19.000 0.429 NA   NA
 6852984 6852985 PAU_03108 PAU_03109 gene0054 gene0055 TRUE 0.998 4.000 0.800 NA   NA
 6852985 6852986 PAU_03109 PAU_03110 gene0055 gene0056 TRUE 0.988 44.000 0.800 NA   NA
 6852986 6852987 PAU_03110 PAU_03111 gene0056 gene0057 TRUE 0.992 5.000 0.300 NA   NA
 6852987 6852988 PAU_03111 PAU_03112 gene0057 gene0058 TRUE 0.990 -3.000 0.300 NA   NA
 6852988 6852989 PAU_03112 PAU_03113 gene0058 gene0059 TRUE 0.995 15.000 0.500 NA   NA
 6852989 6852990 PAU_03113 PAU_03114 gene0059 gene0060 TRUE 0.999 3.000 1.000 NA   NA
 6852990 6852991 PAU_03114 PAU_03115 gene0060 gene0061 TRUE 0.958 3.000 0.056 NA   NA
 6852991 6852992 PAU_03115 PAU_03116 gene0061 gene0062 TRUE 0.882 -39.000 0.111 NA   NA
 6852992 6852993 PAU_03116 PAU_03117 gene0062 gene0063 TRUE 0.977 -91.000 0.500 NA   NA
 6852993 6852994 PAU_03117 PAU_03118 gene0063 gene0064 TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6852994 6852995 PAU_03118 PAU_03119 gene0064 gene0065 TRUE 0.933 15.000 0.000 NA   NA
 6852995 6852996 PAU_03119 PAU_03120 gene0065 gene0066 FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6852996 6852997 PAU_03120 PAU_03121 gene0066 gene0067 FALSE 0.200 164.000 0.000 NA   NA
 6852997 6852998 PAU_03121 PAU_03122 gene0067 gene0068 TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6852998 6852999 PAU_03122 PAU_03123 gene0068 gene0069 TRUE 0.955 -13.000 0.200 NA   NA
 6852999 6853000 PAU_03123 PAU_03124 gene0069 gene0070 FALSE 0.015 577.000 0.000 NA   NA
 6853000 6853001 PAU_03124 PAU_03125 gene0070 gene0071 FALSE 0.233 150.000 0.000 NA   NA
 6853001 6853002 PAU_03125 PAU_03126 gene0071 gene0072 FALSE 0.062 278.000 0.000 NA   NA
 6853002 6853003 PAU_03126 PAU_03127 gene0072 gene0073 TRUE 0.933 15.000 0.000 NA   NA
 6853003 6853004 PAU_03127 PAU_03128 gene0073 gene0074 TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6853004 6853005 PAU_03128 PAU_03129 gene0074 gene0075 TRUE 0.976 -24.000 0.400 1.000   NA
 6853005 6853006 PAU_03129 PAU_03130 gene0075 cII FALSE 0.376 106.000 0.000 1.000   NA
 6853006 6853007 PAU_03130 PAU_03131 cII cro FALSE 0.279 138.000 0.000 1.000   NA
 6853008 6853009 PAU_03132 PAU_03133     FALSE 0.194 166.000 0.000 NA   NA
 6853009 6853010 PAU_03133 PAU_03134     TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 6853010 6853011 PAU_03134 PAU_03135     FALSE 0.027 414.000 0.000 NA   NA
 6853011 6853012 PAU_03135 PAU_03136   gene0076 FALSE 0.007 1037.000 0.000 NA   NA
 6853012 6853013 PAU_03136 PAU_03137 gene0076 gene0077 FALSE 0.259 139.000 0.000 NA   NA
 6853013 6853014 PAU_03137 PAU_03138 gene0077 gene0078 TRUE 0.924 -27.000 0.167 NA   NA
 6853014 6853015 PAU_03138 PAU_03139 gene0078 gene0079 FALSE 0.023 449.000 0.000 NA   NA
 6853015 6853016 PAU_03139 PAU_03140 gene0079   TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853016 6853017 PAU_03140 PAU_03141     FALSE 0.117 208.000 0.000 NA   NA
 6853017 6853018 PAU_03141 PAU_03142     TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6853018 6853019 PAU_03142 PAU_03143     FALSE 0.117 208.000 0.000 NA   NA
 6853020 10702245 PAU_03144a PAU_03144 ubiF   TRUE 0.759 -80.000 0.000 NA   NA
 6853021 6853022 PAU_03145 PAU_03146 miaB   TRUE 0.977 16.000 0.220 1.000 N NA
 6853022 6853023 PAU_03146 PAU_03147     TRUE 0.994 -3.000 0.457 NA   NA
 6853023 6853024 PAU_03147 PAU_03148   corC TRUE 0.716 73.000 0.150 NA   NA
 6853024 6853025 PAU_03148 PAU_03149a corC lnt TRUE 0.995 8.000 0.557 1.000 N NA
 6853025 10702246 PAU_03149a PAU_03149 lnt   TRUE 0.739 -158.000 0.000 NA   NA
 10702246 6853026 PAU_03149 PAU_03150     FALSE 0.006 1490.000 0.000 NA   NA
 6853026 6853027 PAU_03150 PAU_03151   92M18.3 FALSE 0.251 143.000 0.000 NA   NA
 6853027 10702247 PAU_03151 PAU_03152 92M18.3   FALSE 0.299 128.000 0.000 NA   NA
 6853028 6853029 PAU_03152a PAU_03153 gltI gltJ TRUE 0.823 134.000 0.150 0.021 Y NA
 10702247 6853028 PAU_03152 PAU_03152a   gltI TRUE 0.748 -110.000 0.000 NA   NA
 6853029 6853030 PAU_03153 PAU_03154 gltJ gltK TRUE 1.000 1.000 0.933 0.012 Y NA
 6853030 6853031 PAU_03154 PAU_03155 gltK gltL TRUE 0.998 0.000 0.379 1.000 Y NA
 6853031 6853032 PAU_03155 PAU_03156 gltL leuS FALSE 0.111 164.000 0.002 0.066 N NA
 6853032 6853033 PAU_03156 PAU_03157 leuS rlpB TRUE 0.972 14.000 0.182 NA N NA
 6853033 6853034 PAU_03157 PAU_03158 rlpB holA TRUE 0.973 -3.000 0.199 NA N NA
 6853034 6853035 PAU_03158 PAU_03159 holA nadD TRUE 0.708 -16.000 0.045 1.000 N NA
 6853035 6853036 PAU_03159 PAU_03160 nadD   FALSE 0.355 98.000 0.032 NA   NA
 6853036 6853037 PAU_03160 PAU_03161     TRUE 0.992 3.000 0.307 NA   NA
 6853037 6853038 PAU_03161 PAU_03162   pbpA TRUE 0.755 40.000 0.031 NA   NA
 6853038 6853039 PAU_03162 PAU_03163a pbpA rodA TRUE 0.908 9.000 0.046 1.000 N NA
 6853039 10702248 PAU_03163a PAU_03163 rodA   TRUE 0.747 -119.000 0.000 NA   NA
 10702248 6853040 PAU_03163 PAU_03164   rlpA FALSE 0.007 1007.000 0.000 NA   NA
 6853040 6853041 PAU_03164 PAU_03165 rlpA dacA TRUE 0.956 88.000 0.475 NA Y NA
 6853041 6853042 PAU_03165 PAU_03166 dacA   FALSE 0.334 148.000 0.081 NA   NA
 6853042 6853043 PAU_03166 PAU_03167   lipB TRUE 0.652 133.000 0.219 NA   NA
 6853043 6853044 PAU_03167 PAU_03168 lipB lipA TRUE 0.946 110.000 0.319 0.000 Y NA
 6853044 6853045 PAU_03168 PAU_03169 lipA crcB TRUE 0.743 15.000 0.004 1.000 N NA
 6853046 6853047 PAU_03170 PAU_03171 cspE ogt FALSE 0.061 188.000 0.027 1.000 N NA
 6853048 6853049 PAU_03172 PAU_03173   nrdI TRUE 0.993 8.000 0.440 NA N NA
 6853049 6853050 PAU_03173 PAU_03174 nrdI nrdE TRUE 0.994 -3.000 0.216 NA Y NA
 6853050 6853051 PAU_03174 PAU_03175 nrdE nrdF TRUE 0.994 22.000 0.190 0.001 Y NA
 6853051 6853052 PAU_03175 PAU_03176 nrdF   FALSE 0.051 303.000 0.000 NA   NA
 6853052 6853053 PAU_03176 PAU_03177   proV FALSE 0.149 188.000 0.000 NA   NA
 6853053 6853054 PAU_03177 PAU_03178 proV proW TRUE 0.998 -7.000 0.630 0.057 Y NA
 6853054 6853055 PAU_03178 PAU_03179 proW proX TRUE 0.996 42.000 0.695 0.021 Y NA
 6853055 6853056 PAU_03179 PAU_03180 proX ygaY FALSE 0.154 248.000 0.174 NA N NA
 6853056 6853057 PAU_03180 PAU_03181 ygaY   FALSE 0.284 97.000 0.060 NA N NA
 6853057 6853058 PAU_03181 PAU_03182     TRUE 0.998 -3.000 0.915 NA   NA
 6853058 6853059 PAU_03182 PAU_03183   mprA FALSE 0.366 130.000 0.065 NA   NA
 6853059 6853060 PAU_03183 PAU_03184 mprA emrA FALSE 0.104 239.000 0.107 1.000 N NA
 6853060 6853061 PAU_03184 PAU_03185 emrA emrB TRUE 0.997 15.000 0.875 1.000 N NA
 6853063 6853064 PAU_03187 PAU_03188     TRUE 0.833 68.000 0.222 NA   NA
 6853064 6853065 PAU_03188 PAU_03189   pssA FALSE 0.359 161.000 0.121 0.042 N NA
 6853066 6853067 PAU_r004 PAU_r005     FALSE 0.277 134.000 0.000 NA   NA
 6853067 6853068 PAU_r005 PAU_t063     FALSE 0.009 805.000 0.000 NA   NA
 6853068 6853069 PAU_t063 PAU_t064     FALSE 0.281 133.000 0.000 NA   NA
 6853069 6853070 PAU_t064 PAU_00407d   16S_rRNA FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6853070 6853071 PAU_00407d PAU_03190 16S_rRNA clpB FALSE 0.023 449.000 0.000 NA   NA
 6853071 6853072 PAU_03190 PAU_03191 clpB   TRUE 0.440 135.000 0.108 NA   NA
 6853072 6853073 PAU_03191 PAU_03192   rluD TRUE 0.984 1.000 0.168 NA   NA
 6853074 6853075 PAU_03193 PAU_03194 yfiO   FALSE 0.057 235.000 0.004 NA   NA
 6853075 6853076 PAU_03194 PAU_03195   pheA FALSE 0.014 286.000 0.015 NA N NA
 6853076 6853077 PAU_03195 PAU_03196 pheA hns FALSE 0.023 468.000 0.000 1.000   NA
 6853077 6853078 PAU_03196 PAU_03197 hns   FALSE 0.014 588.000 0.000 NA   NA
 6853079 6853080 PAU_03198 PAU_03199 tyrA aroF TRUE 0.985 6.000 0.038 1.000 Y NA
 6853080 6853081 PAU_03199 PAU_03200 aroF pcaD FALSE 0.009 853.000 0.000 1.000   NA
 6853081 6853082 PAU_03200 PAU_03201 pcaD rplS FALSE 0.021 483.000 0.000 1.000   NA
 6853082 6853083 PAU_03201 PAU_03202 rplS trmD TRUE 0.980 65.000 0.567 1.000 Y NA
 6853083 6853084 PAU_03202 PAU_03203 trmD rimM TRUE 0.995 40.000 0.672 1.000 Y NA
 6853084 6853085 PAU_03203 PAU_03204 rimM rpsP TRUE 0.998 10.000 0.342 0.009 Y NA
 6853085 6853086 PAU_03204 PAU_03205 rpsP ffh TRUE 0.696 137.000 0.361 1.000 N NA
 6853087 6853088 PAU_03206 PAU_03207 ypjD yfjD TRUE 0.966 41.000 0.349 NA   NA
 6853089 6853090 PAU_03208 PAU_03209 luxS gshA FALSE 0.227 151.000 0.087 1.000 N NA
 6853090 6853091 PAU_03209 PAU_t065 gshA   FALSE 0.169 177.000 0.000 NA   NA
 6853091 6853092 PAU_t065 PAU_t066     TRUE 0.406 89.000 0.000 NA   NA
 6853092 6853093 PAU_t066 PAU_t067     TRUE 0.401 91.000 0.000 NA   NA
 6853093 6853094 PAU_t067 PAU_t068     TRUE 0.401 91.000 0.000 NA   NA
 6853094 6853095 PAU_t068 PAU_t069     TRUE 0.401 91.000 0.000 NA   NA
 6853095 6853096 PAU_t069 PAU_t070     TRUE 0.936 14.000 0.000 NA   NA
 6853096 6853097 PAU_t070 PAU_03210     FALSE 0.019 487.000 0.000 NA   NA
 6853097 6853098 PAU_03210 PAU_03211     FALSE 0.024 257.000 0.020 1.000 N NA
 6853098 6853099 PAU_03211 PAU_03212     FALSE 0.013 638.000 0.054 0.066 N NA
 6853099 6853100 PAU_03212 PAU_03213     TRUE 0.477 104.000 0.082 NA   NA
 6853100 6853101 PAU_03213 PAU_03214     TRUE 0.935 11.000 0.026 NA   NA
 6853101 6853102 PAU_03214 PAU_03215     TRUE 0.977 6.000 0.124 NA   NA
 6853102 6853103 PAU_03215 PAU_03216     FALSE 0.178 100.000 0.027 1.000 N NA
 6853103 6853104 PAU_03216 PAU_03217     FALSE 0.374 177.000 0.006 1.000 Y NA
 6853104 6853105 PAU_03217 PAU_03218     TRUE 0.990 10.000 0.026 0.001 Y NA
 6853105 6853106 PAU_03218 PAU_03219     FALSE 0.080 176.000 0.000 NA N NA
 6853106 6853107 PAU_03219 PAU_03220     TRUE 0.919 9.000 0.060 NA N NA
 6853110 6853111 PAU_03223 PAU_03224     FALSE 0.231 97.000 0.000 1.000 N NA
 6853111 6853112 PAU_03224 PAU_03225     FALSE 0.255 85.000 0.000 1.000 N NA
 6853112 6853113 PAU_03225 PAU_03226     FALSE 0.007 1120.000 0.000 1.000   NA
 6853113 6853114 PAU_03226 PAU_03227     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853114 6853115 PAU_03227 PAU_03228     TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 6853115 6853116 PAU_03228 PAU_03229     TRUE 0.546 63.000 0.000 NA   NA
 6853116 6853117 PAU_03229 PAU_03230     TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6853117 6853118 PAU_03230 PAU_03231     TRUE 0.836 33.000 0.000 NA   NA
 6853118 6853119 PAU_03231 PAU_03232     TRUE 0.978 -10.000 0.316 NA   NA
 6853121 6853122 PAU_03234 PAU_03235     TRUE 0.994 31.000 0.791 NA   NA
 6853122 6853123 PAU_03235 PAU_03236     TRUE 0.995 24.000 0.660 1.000   NA
 6853123 6853124 PAU_03236 PAU_03237     TRUE 0.998 13.000 0.623 0.041   NA
 6853124 6853125 PAU_03237 PAU_03238     TRUE 0.998 -3.000 0.944 1.000   NA
 6853125 6853126 PAU_03238 PAU_03239     TRUE 0.972 -12.000 0.282 NA   NA
 6853126 6853127 PAU_03239 PAU_03240     TRUE 0.996 13.000 0.520 NA   NA
 6853127 6853128 PAU_03240 PAU_03241     FALSE 0.006 604.000 0.000 NA N NA
 6853128 6853129 PAU_03241 PAU_03242     FALSE 0.006 1252.000 0.000 NA   NA
 6853129 6853130 PAU_03242 PAU_03243     TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6853132 6853133 PAU_03245 PAU_03246     TRUE 0.798 38.000 0.000 NA   NA
 6853133 6853134 PAU_03246 PAU_03247     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853134 6853135 PAU_03247 PAU_03248     FALSE 0.024 439.000 0.000 NA   NA
 6853135 6853136 PAU_03248 PAU_03249     TRUE 0.994 -10.000 0.750 1.000   NA
 6853137 6853138 PAU_03250 PAU_03251     TRUE 0.995 14.000 0.481 NA   NA
 6853138 6853139 PAU_03251 PAU_03252     TRUE 0.594 205.000 0.519 1.000 N NA
 6853139 6853140 PAU_03252 PAU_03253     TRUE 0.999 16.000 0.551 0.001 Y NA
 6853140 6853141 PAU_03253 PAU_03254     TRUE 0.997 9.000 0.188 0.001 Y NA
 6853141 6853142 PAU_03254 PAU_03255     TRUE 0.996 -7.000 0.312 0.001 Y NA
 6853142 6853143 PAU_03255 PAU_03256     TRUE 0.998 -7.000 0.603 0.001 Y NA
 6853143 6853144 PAU_03256 PAU_03257     TRUE 1.000 4.000 0.854 0.001 Y NA
 6853146 6853147 PAU_03259 PAU_03260     TRUE 0.977 25.000 0.229 1.000   NA
 6853148 6853149 PAU_03261 PAU_03262     FALSE 0.020 339.000 0.000 1.000 N NA
 6853149 6853150 PAU_03262 PAU_03263     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 6853151 6853152 PAU_03264 PAU_03265     FALSE 0.160 183.000 0.000 NA   NA
 6853153 6853154 PAU_03266 PAU_03267     TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6853155 6853156 PAU_03268 PAU_03269     FALSE 0.069 263.000 0.000 NA   NA
 6853159 6853160 PAU_03272 PAU_03273     TRUE 0.942 32.000 0.157 NA   NA
 6853162 6853163 PAU_03275 PAU_03276     TRUE 0.984 11.000 0.173 NA   NA
 6853163 6853164 PAU_03276 PAU_03277     TRUE 0.415 108.000 0.120 NA N NA
 6853164 6853165 PAU_03277 PAU_03278     TRUE 0.986 1.000 0.263 NA N NA
 6853167 6853168 PAU_03280 PAU_03281     TRUE 0.945 26.000 0.125 NA   NA
 6853168 6853169 PAU_03281 PAU_03282     TRUE 0.973 19.000 0.152 1.000   NA
 6853169 6853170 PAU_03282 PAU_03283     TRUE 0.835 26.000 0.005 1.000   NA
 6853170 6853171 PAU_03283 PAU_03284     TRUE 0.961 -7.000 0.218 1.000 N NA
 6853171 6853172 PAU_03284 PAU_03285     FALSE 0.008 894.000 0.000 NA   NA
 6853173 6853174 PAU_03286 PAU_03287     TRUE 0.590 117.000 0.148 NA   NA
 6853174 6853175 PAU_03287 PAU_03288     TRUE 0.886 29.000 0.059 NA   NA
 6853175 6853176 PAU_03288 PAU_03289     TRUE 0.756 61.000 0.123 NA   NA
 6853176 6853177 PAU_03289 PAU_03290     TRUE 0.971 0.000 0.092 NA   NA
 6853178 6853179 PAU_03291 PAU_03292     TRUE 0.903 32.000 0.150 NA N NA
 6853179 6853180 PAU_03292 PAU_03293     FALSE 0.196 191.000 0.128 NA N NA
 6853180 6853181 PAU_03293 PAU_t071     FALSE 0.191 167.000 0.000 NA   NA
 6853182 6853183 PAU_03294 PAU_03295     TRUE 0.858 41.000 0.000 0.009   NA
 6853183 6853184 PAU_03295 PAU_03296     FALSE 0.169 177.000 0.000 NA   NA
 6853184 6853185 PAU_03296 PAU_03297     FALSE 0.057 287.000 0.000 NA   NA
 6853185 6853186 PAU_03297 PAU_03298     TRUE 0.516 66.000 0.000 NA   NA
 6853186 6853187 PAU_03298 PAU_03299     TRUE 0.769 100.000 0.250 NA   NA
 6853187 6853188 PAU_03299 PAU_03300     TRUE 0.486 191.000 0.250 NA   NA
 6853188 6853189 PAU_03300 PAU_03301     TRUE 0.915 78.000 0.500 NA   NA
 6853189 6853190 PAU_03301 PAU_03302     TRUE 0.996 0.000 0.500 NA   NA
 6853190 6853191 PAU_03302 PAU_03303     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 6853191 6853192 PAU_03303 PAU_03304     FALSE 0.013 620.000 0.000 NA   NA
 6853193 6853194 PAU_03305 PAU_03306     TRUE 0.912 21.000 0.000 NA   NA
 6853194 6853195 PAU_03306 PAU_03307   gene0080 FALSE 0.007 1257.000 0.000 1.000   NA
 6853195 6853196 PAU_03307 PAU_03308 gene0080 gene0081 TRUE 0.955 -13.000 0.147 0.046   NA
 6853196 6853197 PAU_03308 PAU_03309 gene0081 gene0082 FALSE 0.018 516.000 0.000 NA   NA
 6853197 6853198 PAU_03309 PAU_03310 gene0082   TRUE 0.617 55.000 0.000 NA   NA
 6853198 6853199 PAU_03310 PAU_03311   gene0083 FALSE 0.006 1233.000 0.000 NA   NA
 6853199 6853200 PAU_03311 PAU_03312 gene0083 gene0084 TRUE 0.983 -13.000 0.147 0.046 Y NA
 6853200 6853201 PAU_03312 PAU_03313 gene0084   FALSE 0.008 846.000 0.000 NA   NA
 6853201 6853202 PAU_03313 PAU_03314     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853202 6853203 PAU_03314 PAU_03315     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6853203 6853204 PAU_03315 PAU_03316     TRUE 0.846 -12.000 0.000 NA   NA
 6853204 6853205 PAU_03316 PAU_03317     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853205 6853206 PAU_03317 PAU_03318     TRUE 0.596 57.000 0.000 NA   NA
 6853206 6853207 PAU_03318 PAU_03319     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853207 6853208 PAU_03319 PAU_03320     TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6853208 6853209 PAU_03320 PAU_03321     FALSE 0.385 97.000 0.000 NA   NA
 6853211 6853212 PAU_03323 PAU_03324     FALSE 0.062 279.000 0.000 NA   NA
 6853212 6853213 PAU_03324 PAU_03325     TRUE 0.870 27.000 0.000 NA   NA
 6853213 6853214 PAU_03325 PAU_03326     TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6853214 6853215 PAU_03326 PAU_03327     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6853215 6853216 PAU_03327 PAU_03328     TRUE 0.566 61.000 0.000 NA   NA
 6853217 6853218 PAU_03329 PAU_03330     TRUE 0.587 61.000 0.000 1.000   NA
 6853218 6853219 PAU_03330 PAU_03331     FALSE 0.030 390.000 0.000 NA   NA
 6853219 6853220 PAU_03331 PAU_03332     FALSE 0.023 449.000 0.000 NA   NA
 6853220 6853221 PAU_03332 PAU_03333     FALSE 0.018 507.000 0.000 NA   NA
 6853221 6853222 PAU_03333 PAU_03334     FALSE 0.294 134.000 0.000 1.000   NA
 6853222 6853223 PAU_03334 PAU_03335     FALSE 0.085 239.000 0.000 NA   NA
 6853223 6853224 PAU_03335 PAU_03336     FALSE 0.323 120.000 0.000 NA   NA
 6853224 6853225 PAU_03336 PAU_03337     FALSE 0.038 351.000 0.000 NA   NA
 6853225 6853226 PAU_03337 PAU_03338     FALSE 0.044 326.000 0.000 NA   NA
 6853226 6853227 PAU_03338 PAU_03339     TRUE 0.421 84.000 0.000 NA   NA
 6853227 6853228 PAU_03339 PAU_03340     TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6853228 6853229 PAU_03340 PAU_03341     TRUE 0.596 57.000 0.000 NA   NA
 6853229 6853230 PAU_03341 PAU_03342     TRUE 0.580 59.000 0.000 NA   NA
 6853230 6853231 PAU_03342 PAU_03343     TRUE 0.993 -7.000 0.600 NA   NA
 6853231 6853232 PAU_03343 PAU_03344     TRUE 0.842 92.000 0.333 NA   NA
 6853232 6853233 PAU_03344 PAU_03345     TRUE 0.991 -3.000 0.333 NA   NA
 6853233 6853234 PAU_03345 PAU_03346     TRUE 0.997 14.000 0.667 NA   NA
 6853234 6853235 PAU_03346 PAU_03347     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853235 6853236 PAU_03347 PAU_03348     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853236 6853237 PAU_03348 PAU_03349     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853237 6853238 PAU_03349 PAU_03350     TRUE 0.993 16.000 0.400 NA   NA
 6853238 6853239 PAU_03350 PAU_03351     TRUE 0.993 29.000 0.667 NA   NA
 6853239 6853240 PAU_03351 PAU_03352     TRUE 0.995 24.000 0.667 NA   NA
 6853240 6853241 PAU_03352 PAU_03353     TRUE 0.988 39.000 0.667 NA   NA
 6853242 6853243 PAU_03354 PAU_03355     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853243 6853244 PAU_03355 PAU_03356     FALSE 0.010 734.000 0.000 NA   NA
 6853244 6853245 PAU_03356 PAU_03357     TRUE 0.998 4.000 0.250 0.005 Y NA
 6853245 6853246 PAU_03357 PAU_03358     FALSE 0.117 208.000 0.000 NA   NA
 6853246 6853247 PAU_03358 PAU_03359     TRUE 0.731 44.000 0.000 NA   NA
 6853250 6853251 PAU_03362 PAU_03363     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853251 6853252 PAU_03363 PAU_03364     FALSE 0.296 129.000 0.000 NA   NA
 6853252 6853253 PAU_03364 PAU_03365     FALSE 0.079 246.000 0.000 NA   NA
 6853253 6853254 PAU_03365 PAU_03366     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853256 6853257 PAU_03368 PAU_03369 albVII   FALSE 0.020 477.000 0.000 NA   NA
 6853257 6853258 PAU_03369 PAU_03370     FALSE 0.009 783.000 0.000 NA   NA
 6853258 6853259 PAU_03370 PAU_03371     TRUE 0.430 88.000 0.000 1.000   NA
 6853259 6853260 PAU_03371 PAU_03372     TRUE 0.672 51.000 0.000 1.000   NA
 6853260 6853261 PAU_03372 PAU_03373     TRUE 0.851 32.000 0.000 1.000   NA
 6853261 6853262 PAU_03373 PAU_03374   mtaC TRUE 0.996 12.000 0.500 1.000   NA
 6853262 6853263 PAU_03374 PAU_03375 mtaC   TRUE 0.771 -51.000 0.000 NA   NA
 6853263 6853264 PAU_03375 PAU_03376     FALSE 0.311 124.000 0.000 NA   NA
 6853268 6853269 PAU_03380 PAU_03381     TRUE 0.682 100.000 0.238 1.000 N NA
 6853269 6853270 PAU_03381 PAU_03382     TRUE 0.756 180.000 0.667 1.000 N NA
 6853270 6853271 PAU_03382 PAU_03383     FALSE 0.073 165.000 0.021 1.000 N NA
 6853271 6853272 PAU_03383 PAU_03384     FALSE 0.133 184.000 0.035 0.065 N NA
 6853272 6853273 PAU_03384 PAU_03385     FALSE 0.305 126.000 0.000 NA   NA
 6853273 6853274 PAU_03385 PAU_03386     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853274 6853275 PAU_03386 PAU_03387     TRUE 0.997 0.000 0.604 NA   NA
 6853275 6853276 PAU_03387 PAU_03388     TRUE 0.946 54.000 0.411 NA   NA
 6853276 6853277 PAU_03388 PAU_03389     TRUE 0.389 97.000 0.088 1.000 N NA
 6853278 6853279 PAU_03390 PAU_03391     TRUE 0.991 23.000 0.474 NA   NA
 6853282 6853283 PAU_03394 PAU_03395     TRUE 0.941 40.000 0.211 NA   NA
 6853283 6853284 PAU_03395 PAU_03396     TRUE 0.999 -3.000 0.729 1.000 Y NA
 6853284 6853285 PAU_03396 PAU_03397     FALSE 0.014 396.000 0.000 1.000 N NA
 6853286 6853287 PAU_03398 PAU_03399     TRUE 0.991 19.000 0.500 1.000 N NA
 6853287 6853288 PAU_03399 PAU_03400     FALSE 0.008 869.000 0.000 NA   NA
 6853288 6853289 PAU_03400 PAU_03401     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853290 6853291 PAU_s017 PAU_03402     FALSE 0.293 130.000 0.000 NA   NA
 6853293 6853294 PAU_03404 PAU_03405     TRUE 0.947 23.000 0.156 1.000 N NA
 6853294 6853295 PAU_03405 PAU_03406     FALSE 0.084 165.000 0.028 1.000 N NA
 6853295 6853296 PAU_03406 PAU_03407     TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 6853296 6853297 PAU_03407 PAU_03408     TRUE 0.643 81.000 0.179 1.000 N NA
 6853298 6853299 PAU_03409 PAU_03410 cysK1   TRUE 0.805 33.000 0.016 1.000   NA
 6853300 6853301 PAU_03411 PAU_03412     FALSE 0.353 100.000 0.027 1.000   NA
 6853301 6853302 PAU_03412 PAU_03413     FALSE 0.230 151.000 0.033 1.000   NA
 6853302 6853303 PAU_03413 PAU_03414     FALSE 0.214 169.000 0.046 1.000   NA
 6853303 6853304 PAU_03414 PAU_03415     FALSE 0.063 205.000 0.000 1.000 N NA
 6853304 6853305 PAU_03415 PAU_03416     TRUE 0.668 209.000 0.201 0.064 Y NA
 6853305 6853306 PAU_03416 PAU_03417     TRUE 0.887 143.000 0.352 1.000 Y NA
 6853307 6853308 PAU_03418 PAU_03419     FALSE 0.070 262.000 0.000 NA   NA
 6853308 6853309 PAU_03419 PAU_03420     FALSE 0.081 244.000 0.000 NA   NA
 6853309 6853310 PAU_03420 PAU_03421   waaQ TRUE 0.644 52.000 0.000 NA   NA
 6853311 6853312 PAU_03422 PAU_03423     FALSE 0.014 378.000 0.000 NA N NA
 6853313 6853314 PAU_03424 PAU_03425     TRUE 0.866 53.000 0.256 NA N NA
 6853314 6853315 PAU_03425 PAU_03426     FALSE 0.099 221.000 0.000 NA   NA
 6853315 6853316 PAU_03426 PAU_03427     FALSE 0.038 353.000 0.000 NA   NA
 6853316 6853317 PAU_03427 PAU_03428     TRUE 0.997 5.000 0.204 0.001 Y NA
 6853317 6853318 PAU_03428 PAU_03429     TRUE 0.998 -10.000 0.697 0.026 Y NA
 6853318 6853319 PAU_03429 PAU_03430     TRUE 0.999 0.000 0.485 0.026 Y NA
 6853319 6853320 PAU_03430 PAU_03431     TRUE 0.970 13.000 0.118 0.044 N NA
 6853320 6853321 PAU_03431 PAU_03432     FALSE 0.157 153.000 0.061 NA N NA
 6853323 6853324 PAU_03434 PAU_03435     TRUE 0.915 -37.000 0.155 NA   NA
 6853326 6853327 PAU_03437 PAU_03438     TRUE 0.887 5.000 0.035 1.000 N NA
 6853327 6853328 PAU_03438 PAU_03439     TRUE 0.847 63.000 0.060 1.000 Y NA
 6853329 6853330 PAU_03440 PAU_03441     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6853332 6853333 PAU_03443 PAU_03444     FALSE 0.051 305.000 0.000 NA   NA
 6853333 6853334 PAU_03444 PAU_03445     TRUE 0.998 7.000 1.000 NA   NA
 6853334 6853335 PAU_03445 PAU_03446     TRUE 0.998 12.000 1.000 NA   NA
 6853335 6853336 PAU_03446 PAU_03447     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 6853336 6853337 PAU_03447 PAU_03448     TRUE 0.975 24.000 0.214 NA   NA
 6853337 6853338 PAU_03448 PAU_03449     TRUE 0.923 26.000 0.136 1.000 N NA
 6853338 6853339 PAU_03449 PAU_03450     TRUE 0.987 16.000 0.182 0.008   NA
 6853339 6853340 PAU_03450 PAU_03451     TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 6853340 6853341 PAU_03451 PAU_03452     FALSE 0.385 97.000 0.000 NA   NA
 6853341 6853342 PAU_03452 PAU_03453     FALSE 0.054 293.000 0.000 NA   NA
 6853342 6853343 PAU_03453 PAU_03454     TRUE 0.996 28.000 1.000 NA   NA
 6853343 6853344 PAU_03454 PAU_03455     TRUE 0.995 -7.000 0.750 NA   NA
 6853344 6853345 PAU_03455 PAU_03456     TRUE 0.992 41.000 1.000 NA   NA
 6853345 6853346 PAU_03456 PAU_03457     TRUE 0.987 15.000 0.250 NA   NA
 6853346 6853347 PAU_03457 PAU_03458     FALSE 0.359 105.000 0.000 NA   NA
 6853347 6853348 PAU_03458 PAU_03459     FALSE 0.044 325.000 0.000 NA   NA
 6853348 6853349 PAU_03459 PAU_03460     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6853349 6853350 PAU_03460 PAU_03461     TRUE 0.994 19.000 0.500 NA   NA
 6853350 6853351 PAU_03461 PAU_03462     TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6853351 6853352 PAU_03462 PAU_03463     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6853352 6853353 PAU_03463 PAU_03464     FALSE 0.086 238.000 0.000 NA   NA
 6853353 6853354 PAU_03464 PAU_03465     FALSE 0.010 703.000 0.000 NA   NA
 6853354 6853355 PAU_03465 PAU_03466     TRUE 0.881 40.000 0.111 NA   NA
 6853355 6853356 PAU_03466 PAU_03467     TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6853356 6853357 PAU_03467 PAU_03468     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6853357 6853358 PAU_03468 PAU_03469     TRUE 0.855 65.000 0.235 NA   NA
 6853358 6853359 PAU_03469 PAU_03470     TRUE 0.922 42.000 0.000 1.000 Y NA
 6853359 6853360 PAU_03470 PAU_03471     TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6853360 6853361 PAU_03471 PAU_03472     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853361 6853362 PAU_03472 PAU_03473     TRUE 0.979 -3.000 0.167 NA   NA
 6853362 6853363 PAU_03473 PAU_03474     TRUE 0.836 56.000 0.167 NA   NA
 6853366 6853367 PAU_03477 PAU_03478     FALSE 0.308 125.000 0.000 NA   NA
 6853368 6853369 PAU_03479 PAU_03480     FALSE 0.003 1103.000 0.000 1.000 N NA
 6853369 6853370 PAU_03480 PAU_03481     TRUE 0.958 -7.000 0.206 1.000 N NA
 6853370 6853371 PAU_03481 PAU_03482     TRUE 0.674 98.000 0.225 1.000 N NA
 6853371 6853372 PAU_03482 PAU_03483     TRUE 0.976 27.000 0.347 1.000 N NA
 6853372 6853373 PAU_03483 PAU_03484     TRUE 0.735 126.000 0.034 0.001 Y NA
 6853373 6853374 PAU_03484 PAU_03485     TRUE 0.960 29.000 0.277 NA N NA
 6853374 6853375 PAU_03485 PAU_03486     TRUE 0.943 12.000 0.000 NA   NA
 6853375 6853376 PAU_03486 PAU_03487     TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6853376 6853377 PAU_03487 PAU_03488     TRUE 0.997 11.000 0.206 0.000 Y NA
 6853377 6853378 PAU_03488 PAU_03489     TRUE 0.960 28.000 0.045 NA Y NA
 6853378 6853379 PAU_03489 PAU_03490     TRUE 0.792 80.000 0.325 NA N NA
 6853379 6853380 PAU_03490 PAU_03491     TRUE 0.885 180.000 0.360 0.000 Y NA
 6853381 6853382 PAU_03492 PAU_03493     FALSE 0.075 231.000 0.014 1.000   NA
 6853382 6853383 PAU_03493 PAU_03494     FALSE 0.298 72.000 0.000 1.000 N NA
 6853383 6853384 PAU_03494 PAU_03495     TRUE 0.894 -19.000 0.000 0.003   NA
 6853385 6853386 PAU_03496 PAU_03497     TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6853386 6853387 PAU_03497 PAU_03498     FALSE 0.077 248.000 0.000 NA   NA
 6853389 6853390 PAU_03500 PAU_03501   phoR FALSE 0.019 351.000 0.000 1.000 N NA
 6853390 6853391 PAU_03501 PAU_03502 phoR phoB TRUE 0.997 24.000 0.453 0.008 Y NA
 6853392 6853393 PAU_03503 PAU_03504 sbcD sbcC TRUE 0.877 215.000 0.669 1.000 Y NA
 6853394 6853395 PAU_03505 PAU_03506     TRUE 0.569 -13.000 0.012 1.000 N NA
 6853395 6853396 PAU_03506 PAU_03507   cpdB FALSE 0.160 84.000 0.012 1.000 N NA
 6853397 6853398 PAU_03508 PAU_03509 rdgC   FALSE 0.013 646.000 0.000 1.000   NA
 6853398 6853399 PAU_03509 PAU_03510   fdp1 FALSE 0.294 134.000 0.000 1.000   NA
 6853401 6853402 PAU_03512 PAU_03513 PFE0360c FNV0471 FALSE 0.059 285.000 0.000 NA   NA
 6853403 6853404 PAU_03514 PAU_03515 exbD exbB TRUE 0.999 5.000 0.810 0.031 Y NA
 6853405 6853406 PAU_03516 PAU_03517 metC sohA FALSE 0.284 132.000 0.000 NA   NA
 6853406 6853407 PAU_03517 PAU_03518 sohA   TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 6853409 6853410 PAU_03520 PAU_03521   yghB FALSE 0.123 205.000 0.000 NA   NA
 6853410 6853411 PAU_03521 PAU_03522 yghB dkgA FALSE 0.070 260.000 0.040 NA   NA
 6853412 6853413 PAU_03523 PAU_03524   sufI TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6853413 6853414 PAU_03524 PAU_03525 sufI plsC FALSE 0.036 498.000 0.154 1.000 N NA
 6853414 6853415 PAU_03525 PAU_03526 plsC parC FALSE 0.141 148.000 0.043 1.000 N NA
 6853415 6853416 PAU_03526 PAU_03527 parC parE TRUE 0.969 43.000 0.106 0.001 Y NA
 6853416 6853417 PAU_03527 PAU_03528 parE yqiA TRUE 0.803 73.000 0.217 NA   NA
 6853417 6853418 PAU_03528 PAU_03529 yqiA icc TRUE 0.820 130.000 0.427 NA   NA
 6853418 6853419 PAU_03529 PAU_03530 icc nudF TRUE 0.536 100.000 0.092 1.000   NA
 6853420 6853421 PAU_03531 PAU_03532 tolC ygiB FALSE 0.170 551.000 0.480 NA   NA
 6853421 6853422 PAU_03532 PAU_03533 ygiB ygiC TRUE 0.997 7.000 0.632 NA   NA
 6853422 6853423 PAU_03533 PAU_03534 ygiC   FALSE 0.323 120.000 0.000 NA   NA
 6853424 6853425 PAU_03535 PAU_03536 ygiD ribB FALSE 0.168 192.000 0.048 1.000   NA
 6853425 6853426 PAU_03536 PAU_s018 ribB   FALSE 0.233 150.000 0.000 NA   NA
 6853427 6853428 PAU_03537 PAU_03538 yqiC   FALSE 0.012 664.000 0.000 NA   NA
 6853428 6853429 PAU_03538 PAU_03539     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6853429 6853430 PAU_03539 PAU_03540     TRUE 0.998 15.000 0.800 NA   NA
 6853430 6853431 PAU_03540 PAU_03541     TRUE 0.989 35.000 0.600 NA   NA
 6853431 6853432 PAU_03541 PAU_03542     TRUE 0.989 35.000 0.600 NA   NA
 6853432 6853433 PAU_03542 PAU_03543     TRUE 0.989 35.000 0.600 NA   NA
 6853433 6853434 PAU_03543 PAU_03544     TRUE 0.989 35.000 0.600 NA   NA
 6853434 6853435 PAU_03544 PAU_03545     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   NA
 6853436 6853437 PAU_03546 PAU_03547   hldE TRUE 0.546 63.000 0.000 NA   NA
 6853437 6853438 PAU_03547 PAU_03548 hldE glnE FALSE 0.373 96.000 0.083 1.000 N NA
 6853438 6853439 PAU_03548 PAU_03549 glnE ygiF TRUE 0.942 17.000 0.053 1.000   NA
 6853439 6853440 PAU_03549 PAU_03550 ygiF nfsA FALSE 0.041 354.000 0.000 1.000   NA
 6853441 6853442 PAU_03551 PAU_03552 ygiM cca TRUE 0.941 15.000 0.106 NA N NA
 6853443 6853444 PAU_03553 PAU_03554 uppP folB FALSE 0.239 179.000 0.128 1.000 N NA
 6853447 6853448 PAU_03557 PAU_03558 rpsU dnaG FALSE 0.269 121.000 0.067 1.000 N NA
 6853448 6853449 PAU_03558 PAU_03559 dnaG rpoD TRUE 0.829 67.000 0.299 1.000 N NA
 6853452 6853453 PAU_03561 PAU_03562     FALSE 0.033 484.000 0.000 0.045   NA
 6853453 6853454 PAU_03562 PAU_03563   gene0085 FALSE 0.117 208.000 0.000 NA   NA
 6853454 6853455 PAU_03563 PAU_03564 gene0085 gene0086 TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853455 6853456 PAU_03564 PAU_03565 gene0086 gene0087 FALSE 0.023 449.000 0.000 NA   NA
 6853456 6853457 PAU_03565 PAU_03566 gene0087 gene0088 TRUE 0.982 12.000 0.167 NA   NA
 6853457 6853458 PAU_03566 PAU_03567 gene0088 gene0089 TRUE 0.918 31.000 0.000 0.003   NA
 6853458 6853459 PAU_03567 PAU_03568 gene0089   FALSE 0.007 1037.000 0.000 NA   NA
 6853459 6853460 PAU_03568 PAU_03569     FALSE 0.020 480.000 0.000 NA   NA
 6853460 6853461 PAU_03569 PAU_03570     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853461 6853462 PAU_03570 PAU_03571     TRUE 0.546 63.000 0.000 NA   NA
 6853463 6853464 PAU_03572 PAU_03573 cro cII TRUE 0.432 124.000 0.000 0.045   NA
 6853464 6853465 PAU_03573 PAU_03574 cII gene0090 FALSE 0.376 106.000 0.000 1.000   NA
 6853465 6853466 PAU_03574 PAU_03575 gene0090 gene0091 TRUE 0.995 6.000 0.400 1.000   NA
 6853466 6853467 PAU_03575 PAU_03576 gene0091 gene0092 TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6853467 6853468 PAU_03576 PAU_03577 gene0092 gene0093 TRUE 0.933 15.000 0.000 NA   NA
 6853468 6853469 PAU_03577 PAU_03578 gene0093 gene0094 FALSE 0.062 278.000 0.000 NA   NA
 6853469 6853470 PAU_03578 PAU_03579 gene0094 gene0095 FALSE 0.233 150.000 0.000 NA   NA
 6853470 6853471 PAU_03579 PAU_03580 gene0095 gene0096 FALSE 0.013 604.000 0.000 NA   NA
 6853471 6853472 PAU_03580 PAU_03581 gene0096 gene0097 TRUE 0.955 -13.000 0.200 NA   NA
 6853472 6853473 PAU_03581 PAU_03582 gene0097 gene0098 TRUE 0.776 -78.000 0.000 1.000   NA
 6853473 6853474 PAU_03582 PAU_03583 gene0098 gene0099 FALSE 0.200 164.000 0.000 NA   NA
 6853474 6853475 PAU_03583 PAU_03584 gene0099 gene0100 FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6853475 6853476 PAU_03584 PAU_03585 gene0100 gene0101 TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853476 6853477 PAU_03585 PAU_03586 gene0101 gene0102 TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853477 6853478 PAU_03586 PAU_03587 gene0102 gene0103 TRUE 0.977 -91.000 0.500 NA   NA
 6853478 6853479 PAU_03587 PAU_03588 gene0103 gene0104 TRUE 0.882 -39.000 0.111 NA   NA
 6853479 6853480 PAU_03588 PAU_03589 gene0104 gene0105 TRUE 0.958 3.000 0.056 NA   NA
 6853480 6853481 PAU_03589 PAU_03590 gene0105 gene0106 TRUE 0.999 3.000 1.000 NA   NA
 6853481 6853482 PAU_03590 PAU_03591 gene0106 gene0107 FALSE 0.034 374.000 0.000 NA   NA
 6853482 6853483 PAU_03591 PAU_03592 gene0107 gene0108 FALSE 0.082 243.000 0.000 NA   NA
 6853483 6853484 PAU_03592 PAU_03593 gene0108 gene0109 TRUE 0.998 4.000 0.800 NA   NA
 6853484 6853485 PAU_03593 PAU_03594 gene0109 gene0110 TRUE 0.992 19.000 0.429 NA   NA
 6853485 6853486 PAU_03594 PAU_03595 gene0110 gene0111 TRUE 0.996 -3.000 0.571 NA   NA
 6853486 6853487 PAU_03595 PAU_03596 gene0111 gene0112 FALSE 0.245 145.000 0.000 NA   NA
 6853489 6853490 PAU_03598 PAU_03599 gene0114 gene0115 FALSE 0.379 98.000 0.000 NA   NA
 6853490 6853491 PAU_03599 PAU_03600 gene0115 gene0116 FALSE 0.123 205.000 0.000 NA   NA
 6853491 6853492 PAU_03600 PAU_03601 gene0116 gene0117 FALSE 0.018 501.000 0.000 NA   NA
 6853492 6853493 PAU_03601 PAU_03602 gene0117 gene0118 TRUE 0.996 0.000 0.500 NA   NA
 6853493 6853494 PAU_03602 PAU_03603 gene0118 gene0119 TRUE 0.977 -25.000 0.429 NA   NA
 6853494 6853495 PAU_03603 PAU_03604 gene0119 gene0120 TRUE 0.981 -25.000 0.500 NA   NA
 6853495 6853496 PAU_03604 PAU_03605 gene0120 gene0121 TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6853496 6853497 PAU_03605 PAU_03606 gene0121 gene0122 TRUE 0.990 -52.000 0.800 NA   NA
 6853497 6853498 PAU_03606 PAU_03607 gene0122 gene0123 TRUE 0.962 -7.000 0.167 NA   NA
 6853498 6853499 PAU_03607 PAU_03608 gene0123 gene0124 TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6853499 6853500 PAU_03608 PAU_03609 gene0124   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6853501 6853502 PAU_03610 PAU_03611     TRUE 0.879 -18.000 0.000 0.045   NA
 6853502 6853503 PAU_03611 PAU_03612     FALSE 0.015 763.000 0.000 0.045   NA
 6853503 6853504 PAU_03612 PAU_03613     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6853505 6853506 PAU_03614 PAU_03615     FALSE 0.007 1063.000 0.000 NA   NA
 6853506 6853507 PAU_03615 PAU_03616     TRUE 0.963 51.000 0.500 NA   NA
 6853512 6853513 PAU_03621 PAU_03622   idi2 FALSE 0.149 137.000 0.000 1.000 N NA
 6853517 6853518 PAU_03626 PAU_03627 ygjU alx FALSE 0.029 286.000 0.000 1.000 N NA
 6853518 6853519 PAU_03627 PAU_s019 alx   FALSE 0.359 105.000 0.000 NA   NA
 6853520 6853521 PAU_03628 PAU_03629   yqjA TRUE 0.501 68.000 0.000 NA   NA
 6853521 6853522 PAU_03629 PAU_03630 yqjA   FALSE 0.213 195.000 0.087 NA   NA
 6853522 6853523 PAU_03630 PAU_03631     TRUE 0.986 2.000 0.185 NA   NA
 6853523 6853524 PAU_03631 PAU_03632     TRUE 0.967 -7.000 0.185 NA   NA
 6853524 6853525 PAU_03632 PAU_03633     TRUE 0.455 159.000 0.161 NA   NA
 6853531 6853532 PAU_03638 PAU_03639     TRUE 0.814 62.000 0.172 NA   NA
 6853532 6853533 PAU_03639 PAU_03640   diaA TRUE 0.953 25.000 0.187 1.000 N NA
 6853533 6853534 PAU_03640 PAU_03641 diaA yraP TRUE 0.997 11.000 0.613 NA   NA
 6853535 6853536 PAU_03642 PAU_03643 mtgA elbB TRUE 0.961 5.000 0.066 NA   NA
 6853536 6853537 PAU_03643 PAU_03644 elbB arcB FALSE 0.043 224.000 0.000 NA N NA
 6853537 6853538 PAU_03644 PAU_03645 arcB   FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6853539 6853540 PAU_03646 PAU_03647   gltB TRUE 0.403 90.000 0.000 NA   NA
 6853540 6853541 PAU_03647 PAU_03648 gltB gltD TRUE 0.995 10.000 0.096 0.000 Y NA
 6853541 6853542 PAU_03648 PAU_03649 gltD   FALSE 0.087 236.000 0.000 NA   NA
 6853543 6853544 PAU_03650 PAU_03651 sspB sspA TRUE 0.998 4.000 0.831 NA   NA
 6853544 6853545 PAU_03651 PAU_03652 sspA rpsI FALSE 0.015 298.000 0.014 1.000 N NA
 6853545 6853546 PAU_03652 PAU_03653 rpsI rplM TRUE 0.999 16.000 0.601 0.009 Y NA
 6853546 6853547 PAU_03653 PAU_03654 rplM   FALSE 0.047 252.000 0.003 NA   NA
 6853548 6853549 PAU_03655 PAU_03656   degQ FALSE 0.092 382.000 0.154 NA   NA
 6853551 6853552 PAU_03658 PAU_03659 degS   FALSE 0.191 167.000 0.000 NA   NA
 6853552 6853553 PAU_03659 PAU_03660     FALSE 0.134 196.000 0.000 NA   NA
 6853553 6853554 PAU_03660 PAU_03661     TRUE 0.997 16.000 0.800 NA   NA
 6853554 6853555 PAU_03661 PAU_03662     TRUE 0.987 37.000 0.600 NA   NA
 6853555 6853556 PAU_03662 PAU_03663     TRUE 0.987 37.000 0.600 NA   NA
 6853556 6853557 PAU_03663 PAU_03664     TRUE 0.987 37.000 0.600 NA   NA
 6853558 6853559 PAU_03665 PAU_03666 murA yrbA TRUE 0.871 52.000 0.258 NA N NA
 6853561 6853562 PAU_03668 PAU_03669     TRUE 0.993 2.000 0.308 NA   NA
 6853562 6853563 PAU_03669 PAU_03670     TRUE 0.971 24.000 0.188 NA   NA
 6853563 6853564 PAU_03670 PAU_03671     TRUE 0.997 5.000 0.562 NA   NA
 6853564 6853565 PAU_03671 PAU_03672   yrbF TRUE 0.998 5.000 0.530 NA Y NA
 6853566 6853567 PAU_03673 PAU_03674 yrbG kdsD TRUE 0.966 24.000 0.226 1.000 N NA
 6853567 6853568 PAU_03674 PAU_03675 kdsD kdsC TRUE 0.996 18.000 0.598 1.000   NA
 6853568 6853569 PAU_03675 PAU_03676 kdsC   TRUE 0.996 18.000 0.617 NA   NA
 6853569 6853570 PAU_03676 PAU_03677   yhbN TRUE 0.980 -19.000 0.459 NA   NA
 6853570 6853571 PAU_03677 PAU_03678 yhbN yhbG TRUE 0.996 9.000 0.543 NA   NA
 6853571 6853572 PAU_03678 PAU_03679 yhbG rpoN TRUE 0.956 28.000 0.163 1.000   NA
 6853572 6853573 PAU_03679 PAU_03680 rpoN yhbH TRUE 0.994 24.000 0.820 NA N NA
 6853573 6853574 PAU_03680 PAU_03681 yhbH ptsN TRUE 0.847 146.000 0.728 NA N NA
 6853574 6853575 PAU_03681 PAU_03682 ptsN   TRUE 0.758 76.000 0.186 NA   NA
 6853575 6853576 PAU_03682 PAU_03683   ptsO TRUE 0.986 0.000 0.182 NA   NA
 6853576 6853577 PAU_03683 PAU_03684 ptsO rnk FALSE 0.058 190.000 0.026 1.000 N NA
 6853577 6853578 PAU_03684 PAU_03685 rnk   TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6853579 6853580 PAU_03686 PAU_03687     FALSE 0.057 289.000 0.000 NA   NA
 6853580 6853581 PAU_03687 PAU_03688     TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6853581 6853582 PAU_03688 PAU_03689     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 6853583 6853584 PAU_03690 PAU_03691 yhbX map FALSE 0.020 504.000 0.000 1.000   NA
 6853587 6853588 PAU_03694 PAU_03695     TRUE 0.993 5.000 0.329 NA   NA
 6853588 6853589 PAU_03695 PAU_03696   tldD TRUE 0.667 43.000 0.011 NA   NA
 6853589 6853590 PAU_03696 PAU_03697 tldD   TRUE 0.989 13.000 0.259 NA   NA
 6853590 6853591 PAU_03697 PAU_03698     TRUE 0.992 -3.000 0.358 NA   NA
 6853591 6853592 PAU_03698 PAU_03699   cafA TRUE 0.945 45.000 0.296 NA   NA
 6853592 6853593 PAU_03699 PAU_03700 cafA yhdE TRUE 0.990 -3.000 0.417 NA N NA
 6853593 6853594 PAU_03700 PAU_03701 yhdE mreD FALSE 0.079 389.000 0.206 NA N NA
 6853594 6853595 PAU_03701 PAU_03702 mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 6853595 6853596 PAU_03702 PAU_03703 mreC mreB TRUE 0.898 112.000 0.689 1.000 N NA
 6853597 6853598 PAU_03704 PAU_03705 yhdH aroQ FALSE 0.057 211.000 0.000 1.000 N NA
 6853598 6853599 PAU_03705 PAU_03706 aroQ accB TRUE 0.957 30.000 0.254 1.000 N NA
 6853599 6853600 PAU_03706 PAU_03707 accB accC TRUE 0.998 13.000 0.275 0.001 Y NA
 6853600 6853601 PAU_03707 PAU_03708 accC   FALSE 0.072 256.000 0.000 NA   NA
 6853603 6853604 PAU_03710 PAU_03711   panF TRUE 0.993 -10.000 0.682 NA   NA
 6853604 6853605 PAU_03711 PAU_03712 panF prmA TRUE 0.605 42.000 0.041 1.000 N NA
 6853605 6853606 PAU_03712 PAU_03713 prmA dusB FALSE 0.224 264.000 0.042 1.000 Y NA
 6853606 6853607 PAU_03713 PAU_03714 dusB fis TRUE 0.936 26.000 0.161 1.000 N NA
 6853610 6853611 PAU_03717 PAU_03718 PirB pirA FALSE 0.219 155.000 0.000 NA   NA
 6853611 6853612 PAU_03718 PAU_03719 pirA livF FALSE 0.007 1097.000 0.000 NA   NA
 6853612 6853613 PAU_03719 PAU_03720 livF livG TRUE 1.000 3.000 0.967 0.010 Y NA
 6853613 6853614 PAU_03720 PAU_03721 livG livM TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 6853614 6853615 PAU_03721 PAU_03722 livM livH TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.020 Y NA
 6853615 6853616 PAU_03722 PAU_03723 livH livK TRUE 0.941 63.000 0.217 1.000 Y NA
 6853618 6853619 PAU_03725 PAU_03726 garK rpoH FALSE 0.113 101.000 0.005 1.000 N NA
 6853619 6853620 PAU_03726 PAU_03727 rpoH ftsX FALSE 0.010 540.000 0.051 1.000 N NA
 6853620 6853621 PAU_03727 PAU_03728 ftsX ftsE TRUE 0.982 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 6853621 6853622 PAU_03728 PAU_03729 ftsE ftsY TRUE 0.973 7.000 0.117 0.062 N NA
 6853623 6853624 PAU_03730 PAU_03731     TRUE 0.929 22.000 0.063 NA   NA
 6853626 6853627 PAU_03733 PAU_03734 zntA   FALSE 0.054 215.000 0.000 1.000 N NA
 6853627 6853628 PAU_03734 PAU_03735     TRUE 0.982 -7.000 0.300 NA   NA
 6853630 6853631 PAU_03737 PAU_03738   gldA FALSE 0.078 247.000 0.000 NA   NA
 6853632 6853633 PAU_03739 PAU_03740     FALSE 0.092 231.000 0.000 NA   NA
 6853634 6853635 PAU_03741 PAU_03742 glpT glpQ TRUE 0.718 136.000 0.396 1.000 N NA
 6853636 6853637 PAU_03743 PAU_03744 poxA   FALSE 0.158 189.000 0.000 1.000   NA
 6853637 6853638 PAU_03744 PAU_03745     FALSE 0.011 692.000 0.000 NA   NA
 6853638 6853639 PAU_03745 PAU_03746     FALSE 0.018 515.000 0.000 NA   NA
 6853639 6853640 PAU_03746 PAU_03747     FALSE 0.036 359.000 0.000 NA   NA
 6853641 6853642 PAU_03748 PAU_03749 frdA frdB TRUE 0.997 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 6853642 6853643 PAU_03749 PAU_03750 frdB frdC TRUE 0.998 16.000 0.454 0.002 Y NA
 6853643 6853644 PAU_03750 PAU_03751 frdC frdD TRUE 0.999 17.000 0.787 0.002 Y NA
 6853645 6853646 PAU_03752 PAU_03753 sugE efp FALSE 0.042 242.000 0.000 1.000 N NA
 6853648 6853649 PAU_03755 PAU_03756   groL FALSE 0.014 699.000 0.062 NA   NA
 6853649 6853650 PAU_03756 PAU_03757 groL groS TRUE 0.987 65.000 0.631 0.062 Y NA
 6853650 6853651 PAU_03757 PAU_03758 groS fxsA FALSE 0.158 189.000 0.040 1.000   NA
 6853651 6853652 PAU_03758 PAU_03759 fxsA   TRUE 0.426 82.000 0.000 NA   NA
 6853653 6853654 PAU_03760 PAU_03761 aspA aspA FALSE 0.009 760.000 0.000 NA   NA
 6853654 6853655 PAU_03761 PAU_03762 aspA dcuA FALSE 0.259 139.000 0.000 NA   NA
 6853655 6853656 PAU_03762 PAU_03763 dcuA dsbD FALSE 0.173 182.000 0.000 1.000   NA
 6853656 6853657 PAU_03763 PAU_03764 dsbD   TRUE 0.984 17.000 0.217 1.000   NA
 6853657 6853658 PAU_03764 PAU_03765     FALSE 0.330 117.000 0.000 NA   NA
 6853658 6853659 PAU_03765 PAU_03766     FALSE 0.010 702.000 0.000 NA   NA
 6853659 6853660 PAU_03766 PAU_03767     FALSE 0.015 567.000 0.000 NA   NA
 6853660 6853661 PAU_03767 PAU_03768     TRUE 0.994 24.000 0.600 NA   NA
 6853661 6853662 PAU_03768 PAU_03769     TRUE 0.993 -7.000 0.600 NA   NA
 6853662 6853663 PAU_03769 PAU_03770     TRUE 0.389 96.000 0.000 NA   NA
 6853663 6853664 PAU_03770 PAU_03771     TRUE 0.476 74.000 0.000 1.000   NA
 6853664 6853665 PAU_03771 PAU_03772   yqeF TRUE 0.990 -3.000 0.286 1.000   NA
 6853668 6853669 PAU_03775 PAU_03776 yyaM   TRUE 0.950 11.000 0.000 1.000   NA
 6853671 6853672 PAU_03778 PAU_03779 cbeR   FALSE 0.006 1563.000 0.000 NA   NA
 6853672 6853673 PAU_03779 PAU_03780     TRUE 0.633 184.000 0.373 NA   NA
 6853673 6853674 PAU_03780 PAU_03781     FALSE 0.012 412.000 0.000 NA N NA
 6853674 6853675 PAU_03781 PAU_03782     TRUE 0.999 2.000 0.688 0.007 Y NA
 6853675 6853676 PAU_03782 PAU_03783     FALSE 0.012 433.000 0.000 1.000 N NA
 6853677 6853678 PAU_03784 PAU_03785     TRUE 0.936 14.000 0.000 NA   NA
 6853678 6853679 PAU_03785 PAU_03786     TRUE 0.983 26.000 0.333 NA   NA
 6853679 6853680 PAU_03786 PAU_03787     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853680 6853681 PAU_03787 PAU_03788     TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6853681 6853682 PAU_03788 PAU_03789     TRUE 0.951 11.000 0.047 NA   NA
 6853682 6853683 PAU_03789 PAU_03790     TRUE 0.864 100.000 0.419 NA   NA
 6853683 6853684 PAU_03790 PAU_03791     TRUE 0.994 -13.000 0.917 NA   NA
 6853684 6853685 PAU_03791 PAU_03792     TRUE 0.894 33.000 0.083 NA   NA
 6853685 6853686 PAU_03792 PAU_03793     FALSE 0.253 142.000 0.000 NA   NA
 6853687 6853688 PAU_03794 PAU_03795     FALSE 0.019 489.000 0.000 NA   NA
 6853690 6853691 PAU_03797 PAU_03798     FALSE 0.043 223.000 0.000 NA N NA
 6853691 6853692 PAU_03798 PAU_03799     TRUE 0.971 53.000 0.609 NA   NA
 6853692 6853693 PAU_03799 PAU_03800     TRUE 0.993 -3.000 0.391 NA   NA
 6853693 6853694 PAU_03800 PAU_03801     TRUE 0.990 4.000 0.244 NA   NA
 6853694 6853695 PAU_03801 PAU_03802     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6853695 6853696 PAU_03802 PAU_03803     TRUE 0.949 45.000 0.312 NA   NA
 6853696 6853697 PAU_03803 PAU_03804     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853697 6853698 PAU_03804 PAU_03805     TRUE 0.984 25.000 0.333 NA   NA
 6853699 6853700 PAU_03806 PAU_03807     FALSE 0.262 138.000 0.000 NA   NA
 6853701 6853702 PAU_03808 PAU_03809     TRUE 0.996 -3.000 0.545 1.000   NA
 6853702 6853703 PAU_03809 PAU_03810     TRUE 0.960 30.000 0.273 1.000 N NA
 6853703 6853704 PAU_03810 PAU_03811     TRUE 0.971 2.000 0.024 0.002   NA
 6853706 6853707 PAU_03813 PAU_03814     FALSE 0.022 455.000 0.000 NA   NA
 6853707 6853708 PAU_03814 PAU_03815     FALSE 0.072 255.000 0.000 NA   NA
 6853708 6853709 PAU_03815 PAU_03816     TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6853709 6853710 PAU_03816 PAU_03817     TRUE 0.731 44.000 0.000 NA   NA
 6853710 6853711 PAU_03817 PAU_03818     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6853711 6853712 PAU_03818 PAU_03819     TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6853712 6853713 PAU_03819 PAU_03820     TRUE 0.976 4.000 0.120 NA   NA
 6853713 6853714 PAU_03820 PAU_03821     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853714 6853715 PAU_03821 PAU_03822     TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6853715 6853716 PAU_03822 PAU_03823     TRUE 0.826 35.000 0.000 NA   NA
 6853716 6853717 PAU_03823 PAU_03824     FALSE 0.134 196.000 0.000 NA   NA
 6853717 6853718 PAU_03824 PAU_03825     FALSE 0.130 198.000 0.000 NA   NA
 6853718 6853719 PAU_03825 PAU_03826     FALSE 0.130 198.000 0.000 NA   NA
 6853719 6853720 PAU_03826 PAU_03827     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6853720 6853721 PAU_03827 PAU_03828     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6853721 6853722 PAU_03828 PAU_03829     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853722 6853723 PAU_03829 PAU_03830     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6853723 6853724 PAU_03830 PAU_03831     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6853724 6853725 PAU_03831 PAU_03832     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6853725 6853726 PAU_03832 PAU_03833     FALSE 0.290 242.000 0.208 NA   NA
 6853726 6853727 PAU_03833 PAU_03834     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6853727 6853728 PAU_03834 PAU_03835     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6853728 6853729 PAU_03835 PAU_03836     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853729 6853730 PAU_03836 PAU_03837     TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6853730 6853731 PAU_03837 PAU_03838     TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6853731 6853732 PAU_03838 PAU_03839     FALSE 0.125 204.000 0.000 NA   NA
 6853732 6853733 PAU_03839 PAU_03840     FALSE 0.031 385.000 0.000 NA   NA
 6853733 6853734 PAU_03840 PAU_03841     FALSE 0.092 231.000 0.000 NA   NA
 6853735 6853736 PAU_03842 PAU_03843 ydcM   FALSE 0.249 144.000 0.000 NA   NA
 6853737 6853738 PAU_03844 PAU_03845     FALSE 0.013 658.000 0.000 1.000   NA
 6853739 6853740 PAU_03846 PAU_03847     FALSE 0.028 409.000 0.000 NA   NA
 6853740 6853741 PAU_03847 PAU_03848     FALSE 0.018 514.000 0.000 NA   NA
 6853741 6853742 PAU_03848 PAU_03849     TRUE 0.586 58.000 0.000 NA   NA
 6853742 6853743 PAU_03849 PAU_03850     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6853747 6853748 PAU_03854 PAU_03855     TRUE 0.990 1.000 0.227 NA   NA
 6853748 6853749 PAU_03855 PAU_03856     TRUE 0.997 -3.000 0.679 NA   NA
 6853749 6853750 PAU_03856 PAU_03857     FALSE 0.008 904.000 0.000 NA   NA
 6853750 6853751 PAU_03857 PAU_03858     TRUE 0.978 68.000 0.571 1.000 Y NA
 6853751 6853752 PAU_03858 PAU_03859     TRUE 0.998 26.000 0.857 1.000 Y NA
 6853752 6853753 PAU_03859 PAU_03860   yehA TRUE 0.950 11.000 0.000 1.000   NA
 6853753 6853754 PAU_03860 PAU_03861 yehA bax FALSE 0.007 1289.000 0.000 1.000   NA
 6853754 6853755 PAU_03861 PAU_03862 bax gene0125 TRUE 0.421 84.000 0.000 NA   NA
 6853755 6853756 PAU_03862 PAU_03863 gene0125 gene0126 TRUE 0.556 62.000 0.000 NA   NA
 6853756 6853757 PAU_03863 PAU_03864 gene0126   TRUE 0.965 -13.000 0.244 NA   NA
 6853757 6853758 PAU_03864 PAU_03865     TRUE 0.993 -7.000 0.440 0.007   NA
 6853759 6853760 PAU_03866 PAU_03867 gntU gntK TRUE 0.998 0.000 0.500 1.000 Y NA
 6853760 6853761 PAU_03867 PAU_03868 gntK gntR FALSE 0.098 169.000 0.000 1.000 N NA
 6853765 6853766 PAU_03869 PAU_03870 hemG trkH TRUE 0.985 25.000 0.455 1.000 N NA
 6853766 6853767 PAU_03870 PAU_03871 trkH   TRUE 0.947 38.000 0.202 1.000   NA
 6853767 6853768 PAU_03871 PAU_03872   pepQ TRUE 0.980 0.000 0.127 1.000   NA
 6853769 6853770 PAU_03873 PAU_03874 fadB fadA TRUE 0.999 -3.000 0.607 1.000 Y NA
 6853771 6853772 PAU_03875 PAU_03876 fre ubiD TRUE 0.990 11.000 0.090 NA Y NA
 6853774 6853775 PAU_03878 PAU_03879 hemB tatC FALSE 0.128 107.000 0.021 NA N NA
 6853775 6853776 PAU_03879 PAU_03880 tatC tatB TRUE 0.995 23.000 0.333 NA Y NA
 6853776 6853777 PAU_03880 PAU_03881 tatB tatA TRUE 0.995 4.000 0.188 1.000 Y NA
 6853777 6853778 PAU_03881 PAU_03882 tatA ubiB FALSE 0.093 230.000 0.032 1.000   NA
 6853778 6853779 PAU_03882 PAU_03883 ubiB   TRUE 0.984 -13.000 0.432 1.000   NA
 6853779 6853780 PAU_03883 PAU_03884   ubiE TRUE 0.974 17.000 0.145 1.000   NA
 6853780 6853781 PAU_03884 PAU_03885 ubiE rmuC FALSE 0.145 197.000 0.047 NA   NA
 6853781 6853782 PAU_03885 PAU_03886 rmuC   TRUE 0.574 106.000 0.125 NA   NA
 6853782 6853783 PAU_03886 PAU_03887     TRUE 0.814 69.000 0.207 NA   NA
 6853783 6853784 PAU_03887 PAU_03888   udp FALSE 0.175 97.000 0.030 NA N NA
 6853786 6853787 PAU_03890 PAU_03891   metE FALSE 0.041 244.000 0.000 1.000 N NA
 6853789 6853790 PAU_03893 PAU_03894     FALSE 0.070 271.000 0.000 1.000   NA
 6853790 6853791 PAU_03894 PAU_03895     FALSE 0.064 274.000 0.000 NA   NA
 6853791 6853792 PAU_03895 PAU_03896     FALSE 0.090 234.000 0.000 NA   NA
 6853792 6853793 PAU_03896 PAU_03897     FALSE 0.078 247.000 0.000 NA   NA
 6853793 6853794 PAU_03897 PAU_03898     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA   NA
 6853795 6853796 PAU_03899 PAU_03900     FALSE 0.022 455.000 0.000 NA   NA
 6853797 6853798 PAU_03901 PAU_03902     FALSE 0.075 251.000 0.000 NA   NA
 6853798 6853799 PAU_03902 PAU_03903   pys2 TRUE 0.951 4.000 0.000 1.000   NA
 6853799 6853800 PAU_03903 PAU_03904 pys2 usp TRUE 0.962 18.000 0.000 0.002   NA
 6853801 6853802 PAU_03905 PAU_03906 adhC   TRUE 0.844 91.000 0.327 1.000   NA
 6853805 6853806 PAU_03909 PAU_03910   yeiC TRUE 0.715 -3.000 0.008 NA N NA
 6853806 6853807 PAU_03910 PAU_03911 yeiC tyrB FALSE 0.004 733.000 0.000 NA N NA
 6853807 6853808 PAU_03911 PAU_03912 tyrB alr FALSE 0.328 178.000 0.181 1.000 N NA
 6853808 6853809 PAU_03912 PAU_03913 alr dnaB TRUE 0.950 39.000 0.317 1.000 N NA
 6853811 6853812 PAU_03915 PAU_03916 dusA   FALSE 0.029 404.000 0.000 NA   NA
 6853812 6853813 PAU_03916 PAU_03917     TRUE 0.915 20.000 0.000 NA   NA
 6853813 6853814 PAU_03917 PAU_03918     FALSE 0.053 297.000 0.000 NA   NA
 6853816 6853817 PAU_03920 PAU_03921 yfdK   TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6853818 6853819 PAU_03922 PAU_03923   yceI FALSE 0.361 104.000 0.000 NA   NA
 6853822 6853823 PAU_03926 PAU_03927 pri-1 lexA TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6853823 6853824 PAU_03927 PAU_03928 lexA dgkA TRUE 0.453 120.000 0.141 1.000 N NA
 6853826 6853827 PAU_03930 PAU_03931 ubiA ubiC TRUE 0.993 21.000 0.248 NA Y NA
 6853827 6853828 PAU_03931 PAU_03932 ubiC pgi FALSE 0.044 222.000 0.000 NA N NA
 6853831 6853832 PAU_03935 PAU_03936     FALSE 0.025 431.000 0.000 NA   NA
 6853832 6853833 PAU_03936 PAU_03937   hsdM TRUE 0.916 63.000 0.112 0.043 Y NA
 6853833 6853834 PAU_03937 PAU_03938 hsdM hsdS TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.043 Y NA
 6853834 6853835 PAU_03938 PAU_03939 hsdS fecI FALSE 0.020 338.000 0.000 1.000 N NA
 6853835 6853836 PAU_03939 PAU_03940 fecI fecR TRUE 0.989 2.000 0.308 NA N NA
 6853836 6853837 PAU_03940 PAU_03941 fecR fecA TRUE 0.918 85.000 0.267 NA Y NA
 6853837 6853838 PAU_03941 PAU_03942 fecA fecB TRUE 0.945 60.000 0.211 1.000 Y NA
 6853838 6853839 PAU_03942 PAU_03943 fecB fecC TRUE 0.999 -3.000 0.864 1.000 Y NA
 6853839 6853840 PAU_03943 PAU_03944 fecC fecD TRUE 0.998 -3.000 0.340 0.020 Y NA
 6853840 6853841 PAU_03944 PAU_03945 fecD fecE TRUE 0.998 1.000 0.380 1.000 Y NA
 6853843 6853844 PAU_03947 PAU_03948     TRUE 0.831 -16.000 0.000 1.000   NA
 6853845 6853846 PAU_03949 PAU_03950     TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6853846 6853847 PAU_03950 PAU_03951     TRUE 0.719 45.000 0.000 NA   NA
 6853847 6853848 PAU_03951 PAU_03952     FALSE 0.046 318.000 0.000 NA   NA
 6853848 6853849 PAU_03952 PAU_03953     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853849 6853850 PAU_03953 PAU_03954     FALSE 0.129 199.000 0.000 NA   NA
 6853850 6853851 PAU_03954 PAU_03955   ykfI TRUE 0.918 114.000 0.667 NA   NA
 6853851 6853852 PAU_03955 PAU_03956 ykfI   TRUE 0.418 220.000 0.286 NA   NA
 6853852 6853853 PAU_03956 PAU_03957   yfjY TRUE 0.994 13.000 0.429 NA   NA
 6853853 6853854 PAU_03957 PAU_03958 yfjY yafZ TRUE 0.923 66.000 0.429 NA   NA
 6853854 6853855 PAU_03958 PAU_03959 yafZ   FALSE 0.323 120.000 0.000 NA   NA
 6853855 6853856 PAU_03959 PAU_03960     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6853856 6853857 PAU_03960 PAU_03961     TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6853857 6853858 PAU_03961 PAU_03962   yfjR TRUE 0.995 6.000 0.462 NA   NA
 6853858 6853859 PAU_03962 PAU_03963 yfjR   FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 6853859 6853860 PAU_03963 PAU_03964     TRUE 0.767 -55.000 0.000 NA   NA
 6853861 6853862 PAU_03965 PAU_03966 rox   TRUE 0.899 95.000 0.500 NA   NA
 6853862 6853863 PAU_03966 PAU_03967     FALSE 0.112 212.000 0.000 NA   NA
 6853863 6853864 PAU_03967 PAU_03968   hsdM FALSE 0.017 521.000 0.000 NA   NA
 6853864 6853865 PAU_03968 PAU_03969 hsdM prrC TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6853865 6853866 PAU_03969 PAU_03970 prrC hsdR TRUE 0.966 -7.000 0.178 NA   NA
 6853867 6853868 PAU_03971 PAU_03972     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853868 6853869 PAU_03972 PAU_03973     TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6853869 6853870 PAU_03973 PAU_03974     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 6853870 6853871 PAU_03974 PAU_03975     TRUE 0.576 85.000 0.000 0.008   NA
 6853872 6853873 PAU_03976 PAU_03977   alpA1 TRUE 0.997 4.000 0.667 NA   NA
 6853873 6853874 PAU_03977 PAU_03978 alpA1   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853874 6853875 PAU_03978 PAU_03979   yabA TRUE 0.399 92.000 0.000 NA   NA
 6853875 6853876 PAU_03979 PAU_03980 yabA   FALSE 0.022 460.000 0.000 NA   NA
 6853877 6853878 PAU_03981 PAU_t074     FALSE 0.188 168.000 0.000 NA   NA
 6853880 6853881 PAU_03983 PAU_03984 yjgQ yjgP TRUE 0.998 0.000 0.631 0.042   NA
 6853882 6853883 PAU_03985 PAU_03986 pepA holC TRUE 0.978 35.000 0.494 1.000 N NA
 6853883 6853884 PAU_03986 PAU_03987 holC valS TRUE 0.939 14.000 0.089 1.000 N NA
 6853884 6853885 PAU_03987 PAU_03988 valS   FALSE 0.315 90.000 0.002 1.000   NA
 6853885 6853886 PAU_03988 PAU_03989     TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6853886 6853887 PAU_03989 PAU_03990   yecS FALSE 0.007 593.000 0.000 1.000 N NA
 6853887 6853888 PAU_03990 PAU_03991 yecS yecS TRUE 0.810 271.000 0.594 0.029 Y NA
 6853888 6853889 PAU_03991 PAU_03992 yecS yecC TRUE 0.992 -22.000 0.481 1.000 Y NA
 6853889 6853890 PAU_03992 PAU_03993 yecC   TRUE 0.744 93.000 0.056 1.000 Y NA
 6853890 6853891 PAU_03993 PAU_03994   Cs-mech1 FALSE 0.003 965.000 0.000 NA N NA
 6853891 6853892 PAU_03994 PAU_03995 Cs-mech1   TRUE 0.887 111.000 0.667 NA N NA
 6853894 6853895 PAU_03997 PAU_03998 argI pyrL TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6853895 6853896 PAU_03998 PAU_03999 pyrL pyrB TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6853896 6853897 PAU_03999 PAU_04000 pyrB pyrI TRUE 0.862 144.000 0.197 0.001 Y NA
 6853897 6853898 PAU_04000 PAU_04001 pyrI yjgF FALSE 0.091 218.000 0.084 NA N NA
 6853898 6853899 PAU_04001 PAU_04002 yjgF nrdD FALSE 0.032 253.000 0.000 NA N NA
 6853899 6853900 PAU_04002 PAU_04003 nrdD nrdG TRUE 0.990 18.000 0.464 1.000 N NA
 6853901 6853902 PAU_04004 PAU_04005 yhbP ycfR FALSE 0.291 124.000 0.032 NA   NA
 6853904 6853905 PAU_04007 PAU_04008 yhbS yhbT TRUE 0.984 -6.000 0.295 NA   NA
 6853906 6853907 PAU_04009 PAU_04010     TRUE 0.919 21.000 0.000 1.000   NA
 6853907 6853908 PAU_04010 PAU_04011   ppsA FALSE 0.182 122.000 0.000 1.000 N NA
 6853908 6853909 PAU_04011 PAU_04012 ppsA   TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6853909 6853910 PAU_04012 PAU_04013     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853910 6853911 PAU_04013 PAU_04014     TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6853911 6853912 PAU_04014 PAU_04015     TRUE 0.867 -10.000 0.000 1.000   NA
 6853912 6853913 PAU_04015 PAU_04016     TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6853914 6853915 PAU_04017 PAU_04018     TRUE 0.968 0.000 0.086 NA   NA
 6853915 6853916 PAU_04018 PAU_04019     TRUE 0.999 8.000 0.538 NA Y NA
 6853917 6853918 PAU_04020 PAU_04021 yehU yehT TRUE 1.000 10.000 0.877 0.007 Y NA
 6853918 6853919 PAU_04021 PAU_04022 yehT cstA TRUE 0.442 171.000 0.031 1.000 Y NA
 6853920 6853921 PAU_04023 PAU_04024 deaD nlpI FALSE 0.254 159.000 0.053 1.000   NA
 6853921 6853922 PAU_04024 PAU_04025 nlpI pnp TRUE 0.408 126.000 0.071 1.000   NA
 6853924 6853925 PAU_04026 PAU_s022 rpsO   TRUE 0.765 -56.000 0.000 NA   NA
 6853925 6853926 PAU_s022 PAU_04027   truB TRUE 0.566 61.000 0.000 NA   NA
 6853926 6853927 PAU_04027 PAU_04028 truB rbfA TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 6853927 6853928 PAU_04028 PAU_04029 rbfA infB TRUE 0.977 66.000 0.530 1.000 Y NA
 6853928 6853929 PAU_04029 PAU_04030 infB nusA TRUE 0.979 25.000 0.342 1.000 N NA
 6853929 6853930 PAU_04030 PAU_04031 nusA yhbC TRUE 0.996 22.000 0.759 NA   NA
 6853930 6853931 PAU_04031 PAU_t075 yhbC   FALSE 0.112 212.000 0.000 NA   NA
 6853931 6853932 PAU_t075 PAU_t076     TRUE 0.556 62.000 0.000 NA   NA
 6853932 6853933 PAU_t076 PAU_04032   secG TRUE 0.596 57.000 0.000 NA   NA
 6853933 6853934 PAU_04032 PAU_04033 secG glmM FALSE 0.055 177.000 0.016 1.000 N NA
 6853934 6853935 PAU_04033 PAU_04034 glmM folP TRUE 0.969 -7.000 0.260 1.000 N NA
 6853935 6853936 PAU_04034 PAU_04035 folP mrsC TRUE 0.805 78.000 0.325 1.000 N NA
 6853936 6853937 PAU_04035 PAU_04036 mrsC rrmJ TRUE 0.796 49.000 0.152 1.000 N NA
 6853939 6853940 PAU_04038 PAU_04039 greA   TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6853942 6853943 PAU_04041 PAU_04042 yhbZ rpmA TRUE 0.792 127.000 0.335 1.000   NA
 6853943 6853944 PAU_04042 PAU_04043 rpmA rplU TRUE 0.999 19.000 0.667 0.008 Y NA
 6853946 6853947 PAU_04045 PAU_04046     TRUE 0.760 56.000 0.000 0.003   NA
 6853951 10702249 PAU_04050a PAU_04050 mpl   TRUE 0.752 -92.000 0.000 NA   NA
 6853952 6853953 PAU_04051 PAU_04052 fbp ppa FALSE 0.109 167.000 0.043 1.000 N NA
 6853954 6853955 PAU_04053 PAU_04054 ytfP ytfN TRUE 0.984 3.000 0.167 NA   NA
 6853955 6853956 PAU_04054 PAU_04055 ytfN ytfM TRUE 0.996 -3.000 0.575 NA   NA
 6853957 6853958 PAU_04056 PAU_04057 msrA ytfL FALSE 0.183 172.000 0.042 NA   NA
 6853961 6853962 PAU_04060 PAU_04061 cysQ fklB FALSE 0.193 148.000 0.065 1.000 N NA
 6853964 6853965 PAU_04063 PAU_04064     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6853965 6853966 PAU_04064 PAU_04065     FALSE 0.308 125.000 0.000 NA   NA
 6853966 6853967 PAU_04065 PAU_04066     TRUE 0.845 19.000 0.000 1.000 N NA
 6853967 6853968 PAU_04066 PAU_04067   argG TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6853968 6853969 PAU_04067 PAU_04068 argG   TRUE 0.958 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 6853969 6853970 PAU_04068 PAU_04069   rplI FALSE 0.005 682.000 0.000 1.000 N NA
 6853970 6853971 PAU_04069 PAU_04070 rplI rpsR TRUE 0.995 39.000 0.499 0.008 Y NA
 6853971 6853972 PAU_04070 PAU_04071 rpsR priB TRUE 0.965 5.000 0.128 1.000 N NA
 6853972 6853973 PAU_04071 PAU_04072 priB rpsF TRUE 0.963 6.000 0.122 1.000 N NA
 6853973 6853974 PAU_04072 PAU_04073 rpsF rlmB TRUE 0.468 157.000 0.017 1.000 Y NA
 6853974 6853975 PAU_04073 PAU_04074 rlmB rnr TRUE 0.660 89.000 0.147 0.012 N NA
 6853975 6853976 PAU_04074 PAU_04075 rnr yjeB TRUE 0.980 -3.000 0.038 NA Y NA
 6853976 6853977 PAU_04075 PAU_04076 yjeB purA2 FALSE 0.032 191.000 0.010 NA N NA
 6853977 6853978 PAU_04076 PAU_04077 purA2 hflC FALSE 0.097 138.000 0.019 1.000 N NA
 6853978 6853979 PAU_04077 PAU_04078 hflC hflK TRUE 1.000 3.000 0.947 0.007 Y NA
 6853979 6853980 PAU_04078 PAU_04079 hflK hflX TRUE 0.755 106.000 0.184 0.041   NA
 6853980 6853981 PAU_04079 PAU_04080 hflX hfq TRUE 0.651 95.000 0.141 1.000   NA
 6853981 6853982 PAU_04080 PAU_04081 hfq miaA TRUE 0.893 111.000 0.531 1.000   NA
 6853982 6853983 PAU_04081 PAU_04082 miaA mutL TRUE 0.966 -7.000 0.188 0.060 N NA
 6853983 6853984 PAU_04082 PAU_04083 mutL amiB TRUE 0.947 12.000 0.092 1.000 N NA
 6853984 6853985 PAU_04083 PAU_04084 amiB yjeE TRUE 0.967 -3.000 0.109 NA   NA
 6853989 6853990 PAU_t077 PAU_t078     TRUE 0.625 54.000 0.000 NA   NA
 6853990 6853991 PAU_t078 PAU_t079     TRUE 0.617 55.000 0.000 NA   NA
 6853991 6853992 PAU_t079 PAU_04088   orn FALSE 0.108 214.000 0.000 NA   NA
 6853993 6853994 PAU_04089 PAU_04090 yjeQ psd TRUE 0.611 77.000 0.095 1.000   NA
 6853994 6853995 PAU_04090 PAU_04091 psd yjeP TRUE 0.802 48.000 0.148 1.000 N NA
 6853997 6853998 PAU_04093 PAU_04094     TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6853998 6853999 PAU_04094 PAU_04095     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6853999 6854000 PAU_04095 PAU_04096     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 6854000 6854001 PAU_04096 PAU_04097     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6854001 6854002 PAU_04097 PAU_04098     TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6854002 6854003 PAU_04098 PAU_04099     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6854003 6854004 PAU_04099 PAU_04100     FALSE 0.196 165.000 0.000 NA   NA
 6854004 6854005 PAU_04100 PAU_04101     TRUE 0.864 28.000 0.000 NA   NA
 6854005 6854006 PAU_04101 PAU_04102     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6854006 6854007 PAU_04102 PAU_04103     FALSE 0.196 165.000 0.000 NA   NA
 6854007 6854008 PAU_04103 PAU_04104     TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6854008 6854009 PAU_04104 PAU_04105     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6854009 6854010 PAU_04105 PAU_04106     FALSE 0.200 164.000 0.000 NA   NA
 6854011 6854012 PAU_04107 PAU_04108     FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 6854012 6854013 PAU_04108 PAU_04109   yigL FALSE 0.008 848.000 0.000 NA   NA
 6854013 6854014 PAU_04109 PAU_04110 yigL pldB TRUE 0.993 22.000 0.524 1.000   NA
 6854014 6854015 PAU_04110 PAU_04111 pldB recQ TRUE 0.793 15.000 0.014 1.000 N NA
 6854016 6854017 PAU_04112 PAU_04113   rarD TRUE 0.475 122.000 0.099 NA   NA
 6854017 6854018 PAU_04113 PAU_04114 rarD   TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6854018 6854019 PAU_04114 PAU_04115     TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6854020 6854021 PAU_04116 PAU_04117 corA uvrD FALSE 0.170 96.000 0.021 1.000 N NA
 6854021 6854022 PAU_04117 PAU_04118 uvrD yigB TRUE 0.792 58.000 0.128 1.000   NA
 6854022 6854023 PAU_04118 PAU_04119 yigB xerC TRUE 0.994 0.000 0.367 1.000   NA
 6854023 6854024 PAU_04119 PAU_04120 xerC yigA TRUE 0.997 -3.000 0.714 NA   NA
 6854024 6854025 PAU_04120 PAU_04121 yigA dapF TRUE 0.946 34.000 0.175 NA   NA
 6854025 6854026 PAU_04121 PAU_04122 dapF yifL TRUE 0.572 34.000 0.021 NA N NA
 6854029 6854030 PAU_04125 PAU_04126 hemC hemD TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 6854030 6854031 PAU_04126 PAU_04127 hemD hemX TRUE 0.999 12.000 0.600 1.000 Y NA
 6854031 6854032 PAU_04127 PAU_04128 hemX hemY TRUE 0.993 4.000 0.144 1.000 Y NA
 6854033 6854034 PAU_04129 PAU_t080     FALSE 0.008 898.000 0.000 NA   NA
 6854034 6854035 PAU_t080 PAU_t081     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6854035 6854036 PAU_t081 PAU_t082     TRUE 0.915 20.000 0.000 NA   NA
 6854036 6854037 PAU_t082 PAU_t083     TRUE 0.432 80.000 0.000 NA   NA
 6854037 6854038 PAU_t083 PAU_04130   yifK FALSE 0.222 154.000 0.000 NA   NA
 6854038 6854039 PAU_04130 PAU_04131 yifK wecG FALSE 0.048 228.000 0.000 1.000 N NA
 6854039 6854040 PAU_04131 PAU_04132 wecG wzyE TRUE 0.944 -9.000 0.126 1.000   NA
 6854040 6854041 PAU_04132 PAU_04133 wzyE wecF TRUE 0.998 0.000 0.684 1.000   NA
 6854041 6854042 PAU_04133 PAU_04134 wecF wzxE TRUE 0.996 -3.000 0.605 1.000   NA
 6854042 6854043 PAU_04134 PAU_04135 wzxE wecE TRUE 0.989 2.000 0.218 1.000   NA
 6854043 6854044 PAU_04135 PAU_04136 wecE   TRUE 0.967 -13.000 0.248 1.000   NA
 6854044 6854045 PAU_04136 PAU_04137   rffH TRUE 0.922 -22.000 0.145 1.000   NA
 6854045 6854046 PAU_04137 PAU_04138 rffH rffG TRUE 0.999 18.000 0.739 0.002 Y NA
 6854046 6854047 PAU_04138 PAU_04139 rffG wecC TRUE 0.996 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 6854047 6854048 PAU_04139 PAU_04140 wecC wecB TRUE 0.998 5.000 0.348 1.000 Y NA
 6854048 6854049 PAU_04140 PAU_04141 wecB wzzE TRUE 0.975 128.000 0.677 0.003 Y NA
 6854049 6854050 PAU_04141 PAU_04142 wzzE wecA TRUE 0.998 27.000 0.735 0.003 Y NA
 6854050 6854051 PAU_04142 PAU_04143 wecA rho FALSE 0.028 287.000 0.000 1.000 N NA
 6854051 6854052 PAU_04143 PAU_04144 rho trxA FALSE 0.037 476.000 0.087 1.000   NA
 6854053 6854054 PAU_04145 PAU_04146 rhlB gppA TRUE 0.992 6.000 0.406 1.000 N NA
 6854055 6854056 PAU_04147 PAU_04148 rep ilvC FALSE 0.025 216.000 0.005 1.000 N NA
 6854057 6854058 PAU_04149 PAU_04150 ilvY   FALSE 0.053 581.000 0.000 1.000 Y NA
 6854060 6854061 PAU_04152 PAU_04153     TRUE 0.975 17.000 0.211 1.000 N NA
 6854061 6854062 PAU_04153 PAU_04154     TRUE 0.990 -3.000 0.400 1.000 N NA
 6854062 6854063 PAU_04154 PAU_04155     FALSE 0.326 125.000 0.000 1.000   NA
 6854063 6854064 PAU_04155 PAU_04156   fabF FALSE 0.232 156.000 0.000 1.000   NA
 6854064 6854065 PAU_04156 PAU_04157 fabF   TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6854065 6854066 PAU_04157 PAU_04158   fabG TRUE 0.728 56.000 0.000 0.037   NA
 6854066 6854067 PAU_04158 PAU_04159 fabG   FALSE 0.021 332.000 0.000 1.000 N NA
 6854067 6854068 PAU_04159 PAU_04160     TRUE 0.894 -7.000 0.000 1.000   NA
 6854069 6854070 PAU_04161 PAU_04162 ilvA ilvD TRUE 0.991 4.000 0.106 1.000 Y NA
 6854070 6854071 PAU_04162 PAU_04163 ilvD ilvE TRUE 0.819 72.000 0.075 1.000 Y NA
 6854071 6854072 PAU_04163 PAU_04164 ilvE ilvM TRUE 0.968 27.000 0.205 1.000   NA
 6854072 6854073 PAU_04164 PAU_04165 ilvM ilvG TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.001   NA
 6854078 6854079 PAU_04170 PAU_04171     TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6854080 6854081 PAU_t084 PAU_t085     TRUE 0.943 12.000 0.000 NA   NA
 6854081 6854082 PAU_t085 PAU_r006     TRUE 0.625 54.000 0.000 NA   NA
 6854082 6854083 PAU_r006 PAU_00407l   23S_rRNA FALSE 0.271 136.000 0.000 NA   NA
 6854083 6854084 PAU_00407l PAU_t086 23S_rRNA   FALSE 0.008 833.000 0.000 NA   NA
 6854084 6854085 PAU_t086 PAU_00407e   16S_rRNA FALSE 0.288 131.000 0.000 NA   NA
 6854087 6854088 PAU_04173 PAU_04174 aroE   TRUE 0.942 7.000 0.087 NA N NA
 6854088 6854089 PAU_04174 PAU_04175     TRUE 0.957 15.000 0.137 NA N NA
 6854089 6854090 PAU_04175 PAU_04176   smf TRUE 0.763 65.000 0.004 1.000 Y NA
 6854091 6854092 PAU_04177 PAU_04178 def fmt TRUE 0.981 25.000 0.058 0.013 Y NA
 6854092 6854093 PAU_04178 PAU_04179 fmt rsmB TRUE 0.986 39.000 0.305 1.000 Y NA
 6854093 6854094 PAU_04179 PAU_04180 rsmB trkA TRUE 0.691 56.000 0.122 1.000 N NA
 6854094 6854095 PAU_04180 PAU_04181 trkA   FALSE 0.056 290.000 0.000 NA   NA
 6854095 6854096 PAU_04181 PAU_04182     TRUE 0.774 -40.000 0.000 NA   NA
 6854096 6854097 PAU_04182 PAU_04183     TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6854097 6854098 PAU_04183 PAU_04184     FALSE 0.262 138.000 0.000 NA   NA
 6854098 6854099 PAU_04184 PAU_04185     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6854099 6854100 PAU_04185 PAU_04186     TRUE 0.894 -19.000 0.000 0.003   NA
 6854101 6854102 PAU_04187 PAU_04188     FALSE 0.191 167.000 0.000 NA   NA
 6854102 6854103 PAU_04188 PAU_04189   zntR TRUE 0.787 79.000 0.219 NA   NA
 6854103 6854104 PAU_04189 PAU_04190 zntR rplQ FALSE 0.027 209.000 0.005 1.000 N NA
 6854104 6854105 PAU_04190 PAU_04191 rplQ rpoA TRUE 0.987 41.000 0.873 1.000 N NA
 6854105 6854106 PAU_04191 PAU_04192 rpoA rpsD TRUE 0.988 26.000 0.549 1.000 N NA
 6854106 6854107 PAU_04192 PAU_04193 rpsD rpsK TRUE 0.996 36.000 0.509 0.011 Y NA
 6854107 6854108 PAU_04193 PAU_04194 rpsK rpsM TRUE 0.999 16.000 0.810 0.008 Y NA
 6854108 6854109 PAU_04194 PAU_s023 rpsM   TRUE 0.782 -32.000 0.000 NA   NA
 6854111 6854112 PAU_04196 PAU_04197 secY rplO TRUE 0.997 8.000 0.730 1.000 N NA
 6854112 6854113 PAU_04197 PAU_04198 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.001 Y NA
 6854113 6854114 PAU_04198 PAU_04199 rpmD rpsE TRUE 0.999 0.000 0.789 0.011 Y NA
 6854114 6854115 PAU_04199 PAU_04200 rpsE rplR TRUE 0.999 15.000 0.814 0.011 Y NA
 6854115 6854116 PAU_04200 PAU_04201 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.008 Y NA
 6854116 6854117 PAU_04201 PAU_04202 rplF rpsH TRUE 0.999 15.000 0.808 0.008 Y NA
 6854117 6854118 PAU_04202 PAU_04203 rpsH rpsN TRUE 0.994 40.000 0.473 0.008 Y NA
 6854118 6854119 PAU_04203 PAU_04204 rpsN rplE TRUE 0.999 13.000 0.496 0.008 Y NA
 6854119 6854120 PAU_04204 PAU_04205 rplE rplX TRUE 0.999 15.000 0.758 0.008 Y NA
 6854120 6854121 PAU_04205 PAU_04206 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.011 Y NA
 6854121 6854122 PAU_04206 PAU_04207 rplN rpsQ TRUE 0.959 168.000 0.791 0.011 Y NA
 6854122 6854123 PAU_04207 PAU_04208 rpsQ rplP TRUE 0.435 191.000 0.009 0.008 Y NA
 6854123 6854124 PAU_04208 PAU_04209 rplP rpsC TRUE 0.999 13.000 0.828 0.011 Y NA
 6854124 6854125 PAU_04209 PAU_04210 rpsC rplV TRUE 0.999 18.000 0.719 0.011 Y NA
 6854125 6854126 PAU_04210 PAU_04211 rplV rpsS TRUE 0.999 15.000 0.769 0.011 Y NA
 6854126 6854127 PAU_04211 PAU_04212 rpsS rplB TRUE 0.999 15.000 0.820 0.011 Y NA
 6854127 6854128 PAU_04212 PAU_04213 rplB rplW TRUE 0.999 19.000 0.849 0.011 Y NA
 6854128 6854129 PAU_04213 PAU_04214 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.008 Y NA
 6854129 6854130 PAU_04214 PAU_04215 rplD rplC TRUE 0.998 17.000 0.486 0.008 Y NA
 6854130 6854131 PAU_04215 PAU_04216 rplC rpsJ TRUE 0.993 33.000 0.307 0.011 Y NA
 6854133 6854134 PAU_04218 PAU_04219 bfr bfd TRUE 0.761 78.000 0.053 NA Y NA
 6854134 6854135 PAU_04219 PAU_04220 bfd   FALSE 0.256 140.000 0.000 NA   NA
 6854135 6854136 PAU_04220 PAU_04221   tufA FALSE 0.152 187.000 0.000 NA   NA
 6854136 6854137 PAU_04221 PAU_t087 tufA   FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6854137 6854138 PAU_t087 PAU_t088     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6854138 6854139 PAU_t088 PAU_t089     FALSE 0.347 109.000 0.000 NA   NA
 6854139 6854140 PAU_t089 PAU_t090     TRUE 0.915 20.000 0.000 NA   NA
 6854140 6854141 PAU_t090 PAU_04222     FALSE 0.212 158.000 0.000 NA   NA
 6854143 6854144 PAU_04224 PAU_04225 birA murB TRUE 0.977 -3.000 0.211 1.000 N NA
 6854144 6854145 PAU_04225 PAU_r007 murB   FALSE 0.262 138.000 0.000 NA   NA
 6854145 6854146 PAU_r007 PAU_t091     TRUE 0.870 27.000 0.000 NA   NA
 6854146 6854147 PAU_t091 PAU_r008     FALSE 0.155 185.000 0.000 NA   NA
 6854147 6854148 PAU_r008 PAU_00407m   23S_rRNA FALSE 0.271 136.000 0.000 NA   NA
 6854148 6854149 PAU_00407m PAU_t092 23S_rRNA   FALSE 0.009 805.000 0.000 NA   NA
 6854149 6854150 PAU_t092 PAU_t093     FALSE 0.281 133.000 0.000 NA   NA
 6854150 6854151 PAU_t093 PAU_00407f   16S_rRNA FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6854151 6854152 PAU_00407f PAU_04226 16S_rRNA murI FALSE 0.035 365.000 0.000 NA   NA
 6854152 6854153 PAU_04226 PAU_04227 murI btuB TRUE 0.860 5.000 0.025 1.000 N NA
 6854155 6854156 PAU_04229 PAU_04231 yijD yijC TRUE 0.972 24.000 0.194 NA   NA
 6854158 6854159 PAU_04233 PAU_04234 oxyR argH FALSE 0.055 152.000 0.002 1.000 N NA
 6854159 6854160 PAU_04234 PAU_04235 argH argG TRUE 0.834 151.000 0.278 1.000 Y NA
 6854160 6854161 PAU_04235 PAU_04236 argG argB TRUE 0.972 29.000 0.029 0.002 Y NA
 6854161 6854162 PAU_04236 PAU_04237 argB argC TRUE 0.986 26.000 0.097 0.002 Y NA
 6854163 6854164 PAU_04238 PAU_04239 argE ppc FALSE 0.037 286.000 0.053 1.000 N NA
 6854164 6854165 PAU_04239 PAU_04240 ppc   FALSE 0.059 284.000 0.000 NA   NA
 6854166 6854167 PAU_04241 PAU_04242 tcbA metF FALSE 0.013 612.000 0.000 NA   NA
 6854167 6854168 PAU_04242 PAU_04243 metF metL FALSE 0.116 341.000 0.017 1.000 Y NA
 6854168 6854169 PAU_04243 PAU_04244 metL metB TRUE 0.998 3.000 0.428 1.000 Y NA
 6854172 6854173 PAU_04247 PAU_04248 priA cytR FALSE 0.012 327.000 0.013 1.000 N NA
 6854173 6854174 PAU_04248 PAU_04249 cytR ftsN TRUE 0.768 70.000 0.245 NA N NA
 6854174 6854175 PAU_04249 PAU_04250 ftsN hslV FALSE 0.374 125.000 0.122 NA N NA
 6854175 6854176 PAU_04250 PAU_04251 hslV hslU TRUE 0.999 12.000 0.752 1.000 Y NA
 6854176 6854177 PAU_04251 PAU_04252 hslU menA FALSE 0.271 98.000 0.051 1.000 N NA
 6854177 6854178 PAU_04252 PAU_04253 menA rraA TRUE 0.822 109.000 0.158 NA Y NA
 6854179 6854180 PAU_04254 PAU_04255 yiiU   TRUE 0.912 21.000 0.000 NA   NA
 6854181 6854182 PAU_04256 PAU_04257 glpF glpK TRUE 0.584 30.000 0.010 1.000 N NA
 6854186 6854187 PAU_04261 PAU_04262   tpiA FALSE 0.326 135.000 0.058 NA   NA
 6854188 6854189 PAU_04263 PAU_04264 sbp pfkA FALSE 0.119 169.000 0.049 1.000 N NA
 6854189 6854190 PAU_04264 PAU_04265 pfkA   FALSE 0.032 394.000 0.000 1.000   NA
 6854190 6854191 PAU_04265 PAU_04266     TRUE 0.997 3.000 0.595 1.000   NA
 6854191 6854192 PAU_04266 PAU_04267     TRUE 0.991 -7.000 0.246 1.000 Y NA
 6854192 6854193 PAU_04267 PAU_04268   yacB FALSE 0.007 952.000 0.000 NA   NA
 6854193 6854194 PAU_04268 PAU_04269 yacB vco27AB TRUE 0.998 2.000 0.800 NA   NA
 6854196 6854197 PAU_04271 PAU_04272     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6854198 6854199 PAU_04273 PAU_04274     TRUE 0.993 -3.000 0.385 NA   NA
 6854200 6854201 PAU_04275 PAU_04276     TRUE 0.972 71.000 0.750 0.022   NA
 6854201 6854202 PAU_04276 PAU_04277   tfaD TRUE 0.403 90.000 0.000 NA   NA
 6854202 6854203 PAU_04277 PAU_04278 tfaD   TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6854203 6854204 PAU_04278 PAU_04279     TRUE 0.858 29.000 0.000 NA   NA
 6854204 6854205 PAU_04279 PAU_04280     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6854205 6854206 PAU_04280 PAU_04281     TRUE 0.768 -54.000 0.000 NA   NA
 6854206 6854207 PAU_04281 PAU_04282     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6854207 6854208 PAU_04282 PAU_04283     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6854208 6854209 PAU_04283 PAU_04284     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6854209 6854210 PAU_04284 PAU_04285     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6854210 6854211 PAU_04285 PAU_04286     TRUE 0.992 2.000 0.300 NA   NA
 6854211 6854212 PAU_04286 PAU_04287     FALSE 0.254 141.000 0.000 NA   NA
 6854212 6854213 PAU_04287 PAU_04288     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6854213 6854214 PAU_04288 PAU_04289     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6854214 6854215 PAU_04289 PAU_04290     TRUE 0.780 -36.000 0.000 NA   NA
 6854215 6854216 PAU_04290 PAU_04291     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6854216 6854217 PAU_04291 PAU_04292     TRUE 0.931 85.000 0.429 0.001   NA
 6854217 6854218 PAU_04292 PAU_04293     TRUE 0.989 -7.000 0.429 1.000   NA
 6854218 6854219 PAU_04293 PAU_04294     TRUE 0.997 15.000 0.750 1.000   NA
 6854220 6854221 PAU_04295 PAU_04296     TRUE 0.961 70.000 0.750 NA   NA
 6854222 6854223 PAU_04297 PAU_04298     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6854223 6854224 PAU_04298 PAU_04299     FALSE 0.077 248.000 0.000 NA   NA
 6854224 6854225 PAU_04299 PAU_04300     TRUE 0.959 19.000 0.000 0.003   NA
 6854225 6854226 PAU_04300 PAU_04301     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6854226 6854227 PAU_04301 PAU_04302     TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6854227 6854228 PAU_04302 PAU_04303     TRUE 0.421 84.000 0.000 NA   NA
 6854228 6854229 PAU_04303 PAU_04304     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6854229 6854230 PAU_04304 PAU_04305   cox FALSE 0.083 242.000 0.000 NA   NA
 6854231 6854232 PAU_04306 PAU_04307 c   FALSE 0.045 332.000 0.000 1.000   NA
 6854234 6854235 PAU_04309 PAU_04310 cpxR cpxA TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 6854235 6854236 PAU_04310 PAU_04311 cpxA udg FALSE 0.014 401.000 0.000 1.000 N NA
 6854236 6854237 PAU_04311 PAU_04312 udg wblB TRUE 0.970 14.000 0.060 0.024   NA
 6854237 6854238 PAU_04312 PAU_04313 wblB wblC TRUE 0.964 19.000 0.114 1.000   NA
 6854238 6854239 PAU_04313 PAU_04314 wblC wblD TRUE 0.983 15.000 0.048 1.000 Y NA
 6854239 6854240 PAU_04314 PAU_04315 wblD wzxA TRUE 0.954 6.000 0.045 1.000   NA
 6854240 6854241 PAU_04315 PAU_04316 wzxA wblE TRUE 0.953 2.000 0.000 1.000   NA
 6854241 6854242 PAU_04316 PAU_04317 wblE wblL TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6854242 6854243 PAU_04317 PAU_04318 wblL wblG TRUE 0.953 -3.000 0.071 NA   NA
 6854243 6854244 PAU_04318 PAU_04319 wblG wblH TRUE 0.991 6.000 0.099 1.000 Y NA
 6854244 6854245 PAU_04319 PAU_04320 wblH wblI TRUE 0.992 -3.000 0.146 1.000 Y NA
 6854245 6854246 PAU_04320 PAU_04321 wblI wblK TRUE 0.974 -7.000 0.065 1.000 Y NA
 6854246 6854247 PAU_04321 PAU_04322 wblK wblF TRUE 0.998 1.000 0.382 NA Y NA
 6854247 6854248 PAU_04322 PAU_04323 wblF wblM TRUE 0.983 10.000 0.027 NA Y NA
 6854248 6854249 PAU_04323 PAU_04324 wblM   FALSE 0.191 167.000 0.000 NA   NA
 6854249 6854250 PAU_04324 PAU_04325   wblN TRUE 0.826 35.000 0.000 NA   NA
 6854250 6854251 PAU_04325 PAU_04326 wblN wblO FALSE 0.010 751.000 0.000 1.000   NA
 6854251 6854252 PAU_04326 PAU_04327 wblO vioA TRUE 0.526 146.000 0.027 1.000 Y NA
 6854252 6854253 PAU_04327 PAU_04328 vioA wbqC TRUE 0.977 0.000 0.123 NA   NA
 6854253 6854254 PAU_04328 PAU_04329 wbqC purN TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6854254 6854255 PAU_04329 PAU_04330 purN   TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6854255 6854256 PAU_04330 PAU_04331   capG FALSE 0.051 316.000 0.000 1.000   NA
 6854256 6854257 PAU_04331 PAU_04332 capG wbqE FALSE 0.019 491.000 0.000 NA   NA
 6854257 6854258 PAU_04332 PAU_04333 wbqE wbqF TRUE 0.868 13.000 0.000 NA N NA
 6854258 6854259 PAU_04333 PAU_04334 wbqF wzy FALSE 0.375 99.000 0.000 NA   NA
 6854259 6854260 PAU_04334 PAU_04335 wzy wbnK TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6854260 6854261 PAU_04335 PAU_04336 wbnK wbfR TRUE 0.898 3.000 0.000 1.000 N NA
 6854261 6854262 PAU_04336 PAU_04337 wbfR gna FALSE 0.242 92.000 0.000 1.000 N NA
 6854262 6854263 PAU_04337 PAU_04338 gna wbpP TRUE 0.996 4.000 0.212 1.000 Y NA
 6854263 6854264 PAU_04338 PAU_04339 wbpP wfaH TRUE 0.778 71.000 0.000 1.000 Y NA
 6854264 6854265 PAU_04339 PAU_04340 wfaH wbfT TRUE 0.990 0.000 0.080 1.000 Y NA
 6854265 6854266 PAU_04340 PAU_04341 wbfT   TRUE 0.995 20.000 0.297 NA Y NA
 6854266 6854267 PAU_04341 PAU_04342   wbgZ TRUE 0.726 89.000 0.046 NA Y NA
 6854267 6854268 PAU_04342 PAU_04343 wbgZ galE TRUE 0.772 72.000 0.000 1.000 Y NA
 6854268 6854269 PAU_04343 PAU_04344 galE yibK FALSE 0.376 62.000 0.000 1.000 N NA
 6854270 6854271 PAU_04345 PAU_04346 cysE gpsA TRUE 0.969 38.000 0.429 1.000 N NA
 6854271 6854272 PAU_04346 PAU_04347 gpsA secB TRUE 0.982 0.000 0.206 1.000 N NA
 6854272 6854273 PAU_04347 PAU_04348 secB yibN TRUE 0.618 73.000 0.158 NA N NA
 6854274 6854275 PAU_04349 PAU_04350 yibP yibQ TRUE 0.971 5.000 0.088 1.000   NA
 6854276 6854277 PAU_04351 PAU_04352 tdh kbl TRUE 0.995 10.000 0.547 1.000 N NA
 6854278 6854279 PAU_04353 PAU_04354 hldD rfaF TRUE 0.993 11.000 0.146 1.000 Y NA
 6854279 6854280 PAU_04354 PAU_04355 rfaF rfaC TRUE 0.997 0.000 0.205 0.001 Y NA
 6854282 6854283 PAU_04357 PAU_04358   rfaG TRUE 0.995 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 6854283 6854284 PAU_04358 PAU_04359 rfaG walW TRUE 0.993 -3.000 0.111 0.015 Y NA
 6854284 6854285 PAU_04359 PAU_04360 walW kdtA TRUE 0.726 101.000 0.012 0.015 Y NA
 6854285 6854286 PAU_04360 PAU_04361 kdtA kdtX TRUE 0.990 1.000 0.083 NA Y NA
 6854286 6854287 PAU_04361 PAU_04362 kdtX coaD TRUE 0.823 12.000 0.023 NA N NA
 6854290 6854291 PAU_04365 PAU_04366 walM walN TRUE 0.997 0.000 0.188 0.015 Y NA
 6854291 6854292 PAU_04366 PAU_04367 walN waaQ TRUE 0.958 -3.000 0.083 NA   NA
 6854292 6854293 PAU_04367 PAU_04368 waaQ walR FALSE 0.278 187.000 0.111 NA   NA
 6854293 6854294 PAU_04368 PAU_04369 walR MAL13P1.17 TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6854294 6854295 PAU_04369 PAU_04370 MAL13P1.17 rpmG TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6854295 6854296 PAU_04370 PAU_04371 rpmG rpmB TRUE 0.998 12.000 0.332 0.008 Y NA
 6854296 6854297 PAU_04371 PAU_04372 rpmB radC FALSE 0.018 241.000 0.002 1.000 N NA
 6854297 6854298 PAU_04372 PAU_04373 radC   TRUE 0.396 93.000 0.000 NA   NA
 6854299 6854300 PAU_04374 PAU_04375 dfp dut TRUE 0.921 -19.000 0.201 1.000 N NA
 6854300 6854301 PAU_04375 PAU_04376 dut slmA FALSE 0.267 113.000 0.060 1.000 N NA
 6854302 6854303 PAU_04377 PAU_04378 pyrE rph TRUE 0.479 84.000 0.108 1.000 N NA
 6854304 6854305 PAU_04379 PAU_04380     FALSE 0.007 1023.000 0.000 NA   NA
 6854306 6854307 PAU_04381 PAU_04382     TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6854307 6854308 PAU_04382 PAU_04383     FALSE 0.005 672.000 0.000 1.000 N NA
 6854308 6854309 PAU_04383 PAU_04384   selB FALSE 0.100 133.000 0.015 1.000 N NA
 6854309 6854310 PAU_04384 PAU_04385 selB selA TRUE 0.989 36.000 0.569 0.000 N NA
 6854310 6854311 PAU_04385 PAU_04386 selA fdhE TRUE 0.893 22.000 0.083 NA N NA
 6854315 6854316 PAU_04390 PAU_04391 fdoI1 fdoH1 TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 6854316 6854317 PAU_04391 PAU_04392 fdoH1 fdoG1 TRUE 1.000 12.000 0.833 0.001 Y NA
 6854318 6854319 PAU_04393 PAU_04394 fdhD   FALSE 0.028 406.000 0.000 NA   NA
 6854319 6854320 PAU_04394 PAU_04395     TRUE 0.413 86.000 0.000 NA   NA
 6854321 6854322 PAU_04396 PAU_04397   trmE FALSE 0.316 122.000 0.000 NA   NA
 6854322 6854323 PAU_04397 PAU_04398 trmE oxaA TRUE 0.809 99.000 0.221 0.040   NA
 6854323 6854324 PAU_04398 PAU_04399 oxaA yidD TRUE 0.996 3.000 0.461 NA   NA
 6854324 6854325 PAU_04399 PAU_04400 yidD rnpA TRUE 0.982 -36.000 0.540 NA   NA
 6854325 6854326 PAU_04400 PAU_04401 rnpA rpmH TRUE 0.997 17.000 0.787 1.000   NA
 6849768 6849769 PAU_p0001 PAU_p0002 repA   FALSE 0.006 1219.000 0.000 NA   NA
 6849770 6849771 PAU_p0003 PAU_p0004     FALSE 0.046 320.000 0.000 NA   NA
 6849771 6849772 PAU_p0004 PAU_p0005     TRUE 0.536 64.000 0.000 NA   NA
 6849772 6849773 PAU_p0005 PAU_p0006     FALSE 0.066 270.000 0.000 NA   NA
 6849773 6849774 PAU_p0006 PAU_p0007     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 6849774 10702226 PAU_p0007 PAU_p0009     FALSE 0.104 217.000 0.000 NA   NA
 6849775 6849776 PAU_p0008 PAU_p0010     TRUE 0.951 5.000 0.000 1.000   NA
 6849777 6849778 PAU_p0011 PAU_p0012     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6849778 6849779 PAU_p0012 PAU_p0013     TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6849779 6849780 PAU_p0013 PAU_p0014     TRUE 0.424 83.000 0.000 NA   NA
 6849780 6849781 PAU_p0014 PAU_p0016     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6849781 6849782 PAU_p0016 PAU_p0017     TRUE 0.477 71.000 0.000 NA   NA
 6849782 6849783 PAU_p0017 PAU_p0018   tniR FALSE 0.139 193.000 0.000 NA   NA
 6849783 6849784 PAU_p0018 PAU_p0019 tniR   TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6849784 6849785 PAU_p0019 PAU_p0020     FALSE 0.017 529.000 0.000 NA   NA
 6849785 6849786 PAU_p0020 PAU_p0021   49 TRUE 0.880 71.000 0.333 NA   NA
 6849786 6849787 PAU_p0021 PAU_p0022 49 K TRUE 0.996 -7.000 0.800 NA   NA
 6849787 6849788 PAU_p0022 PAU_p0023 K L TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 6849788 6849789 PAU_p0023 PAU_p0024 L M TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6849789 6849790 PAU_p0024 PAU_p0025 M   TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6849790 6849791 PAU_p0025 PAU_p0026     TRUE 0.998 7.000 0.750 NA   NA
 6849791 6849792 PAU_p0026 PAU_p0027     FALSE 0.335 114.000 0.000 NA   NA
 6849792 6849793 PAU_p0027 PAU_p0028     TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6849794 6849768 PAU_p0029 PAU_p0001   repA FALSE 0.006 1914.000 0.000 NA   NA