MicrobesOnline Operon Predictions for Haemophilus influenzae 86-028NP

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 858119 858120 NTHI0001 NTHI0002 gapA   FALSE 0.019 170.000 0.000 1.000 N NA
 858121 858122 NTHI0003 NTHI0004     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 858122 858123 NTHI0004 NTHI0006   fdhD FALSE 0.020 262.000 0.000 NA   NA
 858124 858125 NTHI0007 NTHI0010 fdxG fdxH TRUE 0.994 2.000 0.143 0.002 Y NA
 858125 858126 NTHI0010 NTHI0011 fdxH fdxI TRUE 0.994 -7.000 0.381 0.002 Y NA
 858126 858127 NTHI0011 NTHI0012 fdxI fdhE TRUE 0.574 70.000 0.030 NA N NA
 858128 858129 NTHI0013 NTHI0015 rimI holD TRUE 0.983 3.000 0.121 1.000   NA
 858131 858132 NTHI0018 NTHI0019 era rnc TRUE 0.979 -3.000 0.127 0.034   NA
 858132 858133 NTHI0019 NTHI0020 rnc lepB TRUE 0.977 2.000 0.117 1.000 N NA
 858133 858134 NTHI0020 NTHI0021 lepB lepA TRUE 0.985 9.000 0.187 1.000 N NA
 858134 858135 NTHI0021 NTHI0022 lepA   FALSE 0.120 169.000 0.004 1.000   NA
 858137 858138 NTHI0026 NTHI0027     FALSE 0.004 383.000 0.000 1.000 N NA
 858138 858139 NTHI0027 NTHI0028   citG TRUE 0.980 2.000 0.129 1.000 N NA
 858139 858140 NTHI0028 NTHI0029 citG citF FALSE 0.335 181.000 0.152 1.000 N NA
 858140 858141 NTHI0029 NTHI0030 citF citE TRUE 0.993 15.000 0.373 0.001 N NA
 858141 858142 NTHI0030 NTHI0031 citE citD TRUE 0.993 -3.000 0.537 0.002 N NA
 858142 858143 NTHI0031 NTHI0032 citD citC TRUE 0.982 38.000 0.426 1.000 Y NA
 858143 858144 NTHI0032 NTHI0033 citC lipA FALSE 0.007 251.000 0.000 1.000 N NA
 858144 858145 NTHI0033 NTHI0034 lipA lipB TRUE 0.974 54.000 0.319 0.001 Y NA
 858145 858146 NTHI0034 NTHI0035 lipB   TRUE 0.991 2.000 0.219 NA   NA
 858146 858147 NTHI0035 NTHI0036   dacA TRUE 0.582 56.000 0.007 NA   NA
 858147 858148 NTHI0036 NTHI0037 dacA rlpA TRUE 0.966 16.000 0.023 NA Y NA
 858148 858149 NTHI0037 NTHI0038 rlpA mrdB TRUE 0.575 53.000 0.014 NA N NA
 858149 858150 NTHI0038 NTHI0039 mrdB mrdA TRUE 0.803 -10.000 0.016 1.000 N NA
 858150 858151 NTHI0039 NTHI0041 mrdA   TRUE 0.876 22.000 0.013 NA   NA
 858151 858152 NTHI0041 NTHI0042     TRUE 0.935 54.000 0.307 NA   NA
 858152 858153 NTHI0042 NTHI0043     FALSE 0.114 125.000 0.000 NA   NA
 858154 858155 NTHI0044 NTHI0045   mreB FALSE 0.084 130.000 0.000 1.000   NA
 858155 858156 NTHI0045 NTHI0046 mreB mreC TRUE 0.923 80.000 0.689 1.000 N NA
 858156 858157 NTHI0046 NTHI0047 mreC mreD TRUE 0.998 0.000 0.550 0.005 Y NA
 858158 858159 NTHI0048 NTHI0049   xthA TRUE 0.971 10.000 0.056 NA   NA
 858159 858160 NTHI0049 NTHI0050 xthA rluA2 FALSE 0.180 48.000 0.000 1.000 N NA
 858160 858161 NTHI0050 NTHI0051 rluA2   TRUE 0.776 0.000 0.000 1.000   NA
 858161 858162 NTHI0051 NTHI0052     FALSE 0.266 60.000 0.000 1.000   NA
 858166 858167 NTHI0055 NTHI0056 eda uxuC TRUE 0.990 9.000 0.118 1.000 Y NA
 858167 858168 NTHI0056 NTHI0057 uxuC   TRUE 0.970 10.000 0.091 1.000 N NA
 858168 858169 NTHI0057 NTHI0058   kdgK TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 858169 858170 NTHI0058 NTHI0060 kdgK   TRUE 0.698 20.000 0.000 NA   NA
 858170 858171 NTHI0060 NTHI0061     TRUE 0.997 10.000 0.400 NA Y NA
 858171 858172 NTHI0061 NTHI0062     TRUE 0.977 39.000 0.294 NA Y NA
 858172 858173 NTHI0062 NTHI0063     TRUE 0.932 27.000 0.118 1.000 N NA
 858174 858175 NTHI0064 NTHI0065 uxuR uxuA FALSE 0.333 28.000 0.000 1.000 N NA
 858176 858177 NTHI0066 NTHI0067   uvrC FALSE 0.073 98.000 0.000 1.000 N NA
 858177 858178 NTHI0067 NTHI0068 uvrC kdsB TRUE 0.922 2.000 0.005 0.076 N NA
 858178 858179 NTHI0068 NTHI0069 kdsB lpxK TRUE 0.807 71.000 0.054 1.000 Y NA
 858179 858180 NTHI0069 NTHI0072 lpxK msbA TRUE 0.831 73.000 0.205 1.000 N NA
 858180 858181 NTHI0072 NTHI0073 msbA rec2 TRUE 0.893 41.000 0.075 0.085   NA
 858182 858183 NTHI0074 NTHI0076 dksA pcnB FALSE 0.058 248.000 0.023 1.000 N NA
 858183 858184 NTHI0076 NTHI0077 pcnB folK TRUE 0.988 9.000 0.234 1.000 N NA
 858184 858185 NTHI0077 NTHI0078 folK   FALSE 0.243 76.000 0.000 NA   NA
 858185 858186 NTHI0078 NTHI0079   amiB TRUE 0.983 8.000 0.109 NA   NA
 858186 858187 NTHI0079 NTHI0080 amiB mutL TRUE 0.971 1.000 0.092 1.000 N NA
 858187 858188 NTHI0080 NTHI0081 mutL miaA TRUE 0.986 8.000 0.188 1.000 N NA
 858188 858189 NTHI0081 NTHI0082 miaA glnE TRUE 0.634 6.000 0.000 1.000 N NA
 858190 858191 NTHI0083 NTHI0084 recN ppnK TRUE 0.687 112.000 0.170 1.000 N NA
 858193 858194 NTHI0086 NTHI0087     TRUE 0.632 -7.000 0.000 1.000   NA
 858195 858196 NTHI0088 NTHI0089 nrdD tesB FALSE 0.050 119.000 0.000 1.000 N NA
 858198 858199 NTHI0092 NTHI0093 ppiB   TRUE 0.812 4.000 0.000 1.000   NA
 858199 858200 NTHI0093 NTHI0095     FALSE 0.084 142.000 0.000 NA   NA
 858200 858201 NTHI0095 NTHI0096     FALSE 0.299 62.000 0.000 NA   NA
 858201 858202 NTHI0096 NTHI0097     TRUE 0.793 11.000 0.000 1.000   NA
 858203 858204 NTHI0098 NTHI0099 trxA ddh FALSE 0.276 120.000 0.006 1.000   NA
 858204 858205 NTHI0099 NTHI0100 ddh metB TRUE 0.900 13.000 0.012 1.000 N NA
 858206 858207 NTHIT0002 NTHIT0003     TRUE 0.840 7.000 0.000 NA   NA
 858207 858208 NTHIT0003 NTHIT0004     TRUE 0.602 28.000 0.000 NA   NA
 858208 858209 NTHIT0004 NTHI0101     FALSE 0.243 76.000 0.000 NA   NA
 858209 858210 NTHI0101 NTHI0102   dnaB2 TRUE 0.988 2.000 0.250 1.000 N NA
 858210 858211 NTHI0102 NTHI0103 dnaB2   TRUE 0.979 -7.000 0.200 0.073   NA
 858211 858212 NTHI0103 NTHI0104     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 858212 858213 NTHI0104 NTHI0106     FALSE 0.073 150.000 0.000 NA   NA
 858213 858214 NTHI0106 NTHI0107     FALSE 0.016 297.000 0.000 NA   NA
 858214 858215 NTHI0107 NTHI0108     TRUE 0.994 0.000 0.500 NA   NA
 858215 858216 NTHI0108 NTHI0109   ssb2 FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 858216 858217 NTHI0109 NTHI0110 ssb2   TRUE 0.619 27.000 0.000 NA   NA
 858219 858220 NTHI0112 NTHI0113 topB2   FALSE 0.010 885.000 0.000 NA   NA
 858220 858221 NTHI0113 NTHI0114     TRUE 0.821 12.000 0.000 NA   NA
 858221 858222 NTHI0114 NTHI0115     TRUE 0.824 11.000 0.000 NA   NA
 858222 858223 NTHI0115 NTHI0116     FALSE 0.517 35.000 0.000 NA   NA
 858223 858224 NTHI0116 NTHI0117   radC2 FALSE 0.185 101.000 0.000 NA   NA
 858224 858225 NTHI0117 NTHI0118 radC2   FALSE 0.201 93.000 0.000 NA   NA
 858225 858226 NTHI0118 NTHI0119     FALSE 0.319 58.000 0.000 NA   NA
 858226 858227 NTHI0119 NTHI0120   pilL FALSE 0.189 99.000 0.000 NA   NA
 858227 858228 NTHI0120 NTHI0121 pilL   TRUE 0.996 4.000 0.667 NA   NA
 858228 858229 NTHI0121 NTHI0122     TRUE 0.986 -21.000 0.667 NA   NA
 858229 858230 NTHI0122 NTHI0123     TRUE 0.993 16.000 0.500 NA   NA
 858230 858231 NTHI0123 NTHI0125     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 858231 858232 NTHI0125 NTHI0126     FALSE 0.015 319.000 0.000 NA   NA
 858232 858233 NTHI0126 NTHI0127     TRUE 0.811 131.000 0.500 NA   NA
 858233 858234 NTHI0127 NTHI0128     FALSE 0.019 269.000 0.000 NA   NA
 858234 858235 NTHI0128 NTHI0129     TRUE 0.698 20.000 0.000 NA   NA
 858235 858236 NTHI0129 NTHI0130     TRUE 0.995 12.000 0.600 NA   NA
 858236 858237 NTHI0130 NTHI0131     TRUE 0.990 0.000 0.263 NA   NA
 858237 858238 NTHI0131 NTHI0132     TRUE 0.991 11.000 0.263 NA   NA
 858238 858239 NTHI0132 NTHI0133     TRUE 0.997 10.000 1.000 NA   NA
 858239 858240 NTHI0133 NTHI0134     TRUE 0.990 16.000 0.312 NA   NA
 858240 858241 NTHI0134 NTHI0135     TRUE 0.985 8.000 0.125 NA   NA
 858241 858242 NTHI0135 NTHI0136     TRUE 0.996 10.000 0.667 NA   NA
 858242 858243 NTHI0136 NTHI0137     TRUE 0.996 9.000 0.667 NA   NA
 858244 858245 NTHI0139 NTHI0141   tnpA FALSE 0.064 158.000 0.000 NA   NA
 858246 858247 NTHI0140 NTHI0142   tnpR FALSE 0.009 1047.000 0.000 NA   NA
 858247 3396256 NTHI0142 NTHI2055 tnpR   TRUE 0.967 48.000 0.800 1.000 N NA
 3396256 858248 NTHI2055 NTHI0143     FALSE 0.028 224.000 0.000 NA   NA
 858249 858250 NTHI0144 NTHI0145     TRUE 0.974 16.000 0.111 NA   NA
 858250 858251 NTHI0145 NTHI0146     TRUE 0.984 15.000 0.167 NA   NA
 858251 858252 NTHI0146 NTHI0147     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 858253 858254 NTHI0148 NTHI0149     FALSE 0.223 85.000 0.000 NA   NA
 858254 858255 NTHI0149 NTHI0150     TRUE 0.840 3.000 0.000 NA   NA
 858255 858256 NTHI0150 NTHI0151     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 858256 858257 NTHI0151 NTHI0152   traC FALSE 0.099 131.000 0.000 NA   NA
 858257 858258 NTHI0152 NTHI0153 traC   FALSE 0.175 104.000 0.000 NA   NA
 858258 858259 NTHI0153 NTHI0154     FALSE 0.028 226.000 0.000 NA   NA
 858259 858260 NTHI0154 NTHI0155     FALSE 0.473 40.000 0.000 NA   NA
 858260 858261 NTHI0155 NTHI0156     TRUE 0.639 -10.000 0.000 NA   NA
 858261 858262 NTHI0156 NTHI0157     TRUE 0.572 -22.000 0.000 NA   NA
 858263 858264 NTHI0158 NTHI0159     TRUE 0.791 15.000 0.000 NA   NA
 858264 858265 NTHI0159 NTHI0160     FALSE 0.011 469.000 0.000 NA   NA
 858266 858267 NTHI0161 NTHI0162     FALSE 0.010 720.000 0.000 NA   NA
 858267 858268 NTHI0162 NTHI0163     FALSE 0.082 143.000 0.000 NA   NA
 858268 858269 NTHI0163 NTHI0164     TRUE 0.949 61.000 0.571 1.000   NA
 858269 858270 NTHI0164 NTHIT0005     FALSE 0.014 351.000 0.000 NA   NA
 858271 858272 NTHI0165 NTHI0166 thrC thrB TRUE 0.967 43.000 0.233 1.000 Y NA
 858272 858273 NTHI0166 NTHI0167 thrB thrA TRUE 0.990 13.000 0.133 1.000 Y NA
 858275 858276 NTHI0169 NTHI0171 grk   TRUE 0.992 9.000 0.136 1.000 Y NA
 858276 858277 NTHI0171 NTHI0172     TRUE 0.748 122.000 0.290 NA N NA
 858277 858278 NTHI0172 NTHI0173     FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 858281 858282 NTHI0176 NTHI0177   hitA FALSE 0.070 152.000 0.000 NA   NA
 858282 858283 NTHI0177 NTHI0179 hitA hitB TRUE 0.932 118.000 0.529 0.040 Y NA
 858283 858284 NTHI0179 NTHI0180 hitB hitC TRUE 0.962 2.000 0.037 0.040 N NA
 858285 858286 NTHI0181 NTHI0182   dapE TRUE 0.987 2.000 0.163 0.033 N NA
 858286 858287 NTHI0182 NTHI0184 dapE   TRUE 0.967 28.000 0.292 1.000 N NA
 858287 858288 NTHI0184 NTHI0185   htpG FALSE 0.338 79.000 0.006 1.000 N NA
 858289 858290 NTHI0186 NTHI0188   hsdM1 FALSE 0.041 174.000 0.000 1.000   NA
 858290 858291 NTHI0188 NTHI0190 hsdM1   FALSE 0.021 183.000 0.000 NA N NA
 858291 858292 NTHI0190 NTHI0192   hsdS1 FALSE 0.026 172.000 0.000 NA N NA
 858292 858293 NTHI0192 NTHI0193 hsdS1 hsdR1 TRUE 0.886 100.000 0.150 0.004 Y NA
 858295 858296 NTHI0196 NTHI0197 corB   TRUE 0.639 21.000 0.000 1.000   NA
 858296 858297 NTHI0197 NTHI0198     TRUE 0.996 2.000 0.704 NA   NA
 858299 858300 NTHI0200 NTHI0201 serS gst FALSE 0.005 335.000 0.000 1.000 N NA
 858303 858304 NTHIR0001 NTHIR0002     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 858304 858305 NTHIR0002 NTHIT0006     FALSE 0.019 271.000 0.000 NA   NA
 858305 858306 NTHIT0006 NTHIR0003     FALSE 0.097 132.000 0.000 NA   NA
 858306 858307 NTHIR0003 NTHIT0007     FALSE 0.045 180.000 0.000 NA   NA
 858307 858308 NTHIT0007 NTHIT0008     TRUE 0.673 22.000 0.000 NA   NA
 858308 858309 NTHIT0008 NTHIT0009     TRUE 0.619 27.000 0.000 NA   NA
 858309 858310 NTHIT0009 NTHI0203     FALSE 0.070 152.000 0.000 NA   NA
 858310 858311 NTHI0203 NTHIT0010     FALSE 0.101 130.000 0.000 NA   NA
 858312 858313 NTHI0205 NTHI0206 mltA   TRUE 0.908 0.000 0.016 1.000 N NA
 858313 858314 NTHI0206 NTHI0208   znuA FALSE 0.102 178.000 0.016 1.000 N NA
 858315 858316 NTHI0209 NTHI0210   mpl FALSE 0.126 113.000 0.000 1.000   NA
 858316 858317 NTHI0210 NTHI0211 mpl metC FALSE 0.004 385.000 0.000 1.000 N NA
 858318 858319 NTHI0212 NTHI0213 tsaA pgsA FALSE 0.069 101.000 0.000 1.000 N NA
 858319 858320 NTHI0213 NTHIT0011 pgsA   FALSE 0.067 156.000 0.000 NA   NA
 858320 858321 NTHIT0011 NTHIT0012     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 858321 858322 NTHIT0012 NTHIT0013     FALSE 0.368 51.000 0.000 NA   NA
 858324 858325 NTHI0215 NTHI0218   udk FALSE 0.024 223.000 0.000 1.000   NA
 858325 858326 NTHI0218 NTHI0219 udk dcd TRUE 0.969 9.000 0.010 1.000 Y NA
 858326 858327 NTHI0219 NTHI0220 dcd   TRUE 0.953 4.000 0.017 NA   NA
 858327 858328 NTHI0220 NTHI0221     TRUE 0.971 0.000 0.068 NA   NA
 858329 858330 NTHI0222 NTHIT0014 engA   FALSE 0.011 418.000 0.000 NA   NA
 858330 858331 NTHIT0014 NTHIT0015     TRUE 0.646 24.000 0.000 NA   NA
 858331 858332 NTHIT0015 NTHI0223   dnaQ FALSE 0.214 88.000 0.000 NA   NA
 858333 858334 NTHI0224 NTHI0225 rnhA ompP2 FALSE 0.007 266.000 0.000 1.000 N NA
 858335 858336 NTHI0226 NTHI0227 nagA nagB TRUE 0.915 137.000 0.557 0.001 Y NA
 858336 858337 NTHI0227 NTHI0228 nagB nanA FALSE 0.080 336.000 0.083 1.000 N NA
 858337 858338 NTHI0228 NTHI0229 nanA   TRUE 0.988 11.000 0.273 1.000 N NA
 858338 858339 NTHI0229 NTHI0230   nanK TRUE 0.989 -7.000 0.300 1.000 Y NA
 858339 858340 NTHI0230 NTHI0231 nanK nanE TRUE 0.969 45.000 0.286 1.000 Y NA
 858341 858342 NTHI0232 NTHI0234   siaT TRUE 0.945 65.000 0.286 1.000 Y NA
 858342 858343 NTHI0234 NTHI0235 siaT   FALSE 0.474 164.000 0.143 NA   NA
 858343 858344 NTHI0235 NTHI0236     FALSE 0.062 162.000 0.000 NA   NA
 858345 858346 NTHI0237 NTHI0239 hflC hflK TRUE 0.998 0.000 0.947 0.015 Y NA
 858346 858347 NTHI0239 NTHI0240 hflK   FALSE 0.272 110.000 0.010 1.000 N NA
 858347 858348 NTHI0240 NTHI0242   dcuB2 FALSE 0.266 60.000 0.000 1.000   NA
 858348 858349 NTHI0242 NTHI0243 dcuB2 acpP FALSE 0.028 204.000 0.000 1.000   NA
 858349 858350 NTHI0243 NTHI0244 acpP fabG TRUE 0.579 260.000 0.321 0.006 Y NA
 858350 858351 NTHI0244 NTHI0245 fabG fabD TRUE 0.996 17.000 0.432 0.006 Y NA
 858351 858352 NTHI0245 NTHI0247 fabD fabH FALSE 0.293 500.000 0.182 0.006 Y NA
 858352 858353 NTHI0247 NTHI0248 fabH rpmF FALSE 0.088 186.000 0.014 1.000 N NA
 858353 858354 NTHI0248 NTHI0249 rpmF   TRUE 0.989 23.000 0.599 NA   NA
 858356 858357 NTHI0251 NTHI0252 gor   FALSE 0.010 216.000 0.000 1.000 N NA
 858358 858359 NTHI0253 NTHI0254 bolA nqrA FALSE 0.017 291.000 0.000 NA   NA
 858359 858360 NTHI0254 NTHI0255 nqrA nqrB TRUE 0.999 3.000 0.854 0.004 Y NA
 858360 858361 NTHI0255 NTHI0256 nqrB nqrC TRUE 0.996 -7.000 0.603 0.004 Y NA
 858361 858362 NTHI0256 NTHI0257 nqrC nqrD TRUE 0.996 0.000 0.312 0.004 Y NA
 858362 858363 NTHI0257 NTHI0258 nqrD nqrE TRUE 0.995 4.000 0.188 0.004 Y NA
 858363 858364 NTHI0258 NTHI0259 nqrE nqrF TRUE 0.998 13.000 0.551 0.004 Y NA
 858364 858365 NTHI0259 NTHI0260 nqrF apbE TRUE 0.727 144.000 0.519 1.000 N NA
 858365 858366 NTHI0260 NTHI0261 apbE   TRUE 0.983 3.000 0.113 NA   NA
 858366 858367 NTHI0261 NTHI0262   trmU FALSE 0.501 75.000 0.009 NA   NA
 858368 858369 NTHI0263 NTHI0264   rluD TRUE 0.987 2.000 0.168 1.000   NA
 858371 858372 NTHI0267 NTHI0268   pflA TRUE 0.545 32.000 0.000 NA   NA
 858372 858373 NTHI0268 NTHI0269 pflA pflB FALSE 0.240 125.000 0.018 1.000 N NA
 858373 858374 NTHI0269 NTHI0270 pflB focA TRUE 0.935 32.000 0.172 1.000 N NA
 858375 858376 NTHI0273 NTHI0274     FALSE 0.129 179.000 0.028 1.000 N NA
 858377 858378 NTHI0275 NTHI0276   adhC TRUE 0.838 9.000 0.000 NA   NA
 858379 858380 NTHI0278 NTHI0279   tatA FALSE 0.022 158.000 0.000 1.000 N NA
 858380 858381 NTHI0279 NTHI0280 tatA tatB TRUE 0.932 4.000 0.000 1.000 Y NA
 858381 858382 NTHI0280 NTHI0282 tatB tatC TRUE 0.996 10.000 0.333 NA Y NA
 858382 858383 NTHI0282 NTHI0283 tatC gdhA FALSE 0.006 361.000 0.000 NA N NA
 858384 858385 NTHI0284 NTHI0285 fur fldA TRUE 0.940 29.000 0.156 1.000 N NA
 858385 858386 NTHI0285 NTHI0286 fldA   FALSE 0.165 97.000 0.000 1.000   NA
 858387 858388 NTHI0289 NTHI0290 seqA menE TRUE 0.944 3.000 0.029 1.000 N NA
 858388 858389 NTHI0290 NTHI0291 menE   TRUE 0.813 28.000 0.024 1.000 N NA
 858389 858390 NTHI0291 NTHI0292   aroC TRUE 0.893 10.000 0.007 1.000 N NA
 858390 858391 NTHI0292 NTHI0294 aroC mepA FALSE 0.139 173.000 0.025 1.000 N NA
 858391 858392 NTHI0294 NTHI0295 mepA   TRUE 0.974 18.000 0.160 1.000   NA
 858392 858393 NTHI0295 NTHI0296   msbB TRUE 0.838 47.000 0.049 0.081   NA
 858393 858394 NTHI0296 NTHI0297 msbB selD FALSE 0.038 127.000 0.000 1.000 N NA
 858395 858396 NTHI0298 NTHI0299 rplS trmD TRUE 0.986 37.000 0.567 1.000 Y NA
 858396 858397 NTHI0299 NTHI0300 trmD rimM TRUE 0.988 38.000 0.672 1.000 Y NA
 858397 858398 NTHI0300 NTHI0301 rimM rpsP TRUE 0.980 45.000 0.342 0.029 Y NA
 858399 858400 NTHI0302 NTHI0303   nadN TRUE 0.978 23.000 0.250 NA   NA
 858400 858401 NTHI0303 NTHI0305 nadN aroK FALSE 0.006 285.000 0.000 1.000 N NA
 858401 858402 NTHI0305 NTHI0306 aroK aroB TRUE 0.987 20.000 0.208 1.000 Y NA
 858402 858403 NTHI0306 NTHI0307 aroB dam TRUE 0.912 2.000 0.011 1.000 N NA
 858403 858404 NTHI0307 NTHI0307_1 dam   FALSE 0.009 965.000 0.000 NA   NA
 858407 858408 NTHI0310 NTHI0311     TRUE 0.921 -7.000 0.038 NA   NA
 858409 858410 NTHI0312 NTHI0314 prlC hsdM2 FALSE 0.009 232.000 0.000 1.000 N NA
 858410 858411 NTHI0314 NTHI0315 hsdM2 hsdS2 TRUE 0.830 85.000 0.072 0.069 Y NA
 858411 858412 NTHI0315 NTHI0316 hsdS2 prrC TRUE 0.987 2.000 0.122 0.069   NA
 858412 858413 NTHI0316 NTHI0317 prrC   TRUE 0.982 3.000 0.102 NA   NA
 858413 858414 NTHI0317 NTHI0318   hsdR2 TRUE 0.824 11.000 0.000 NA   NA
 858415 858416 NTHI0319 NTHI0321   arcB FALSE 0.031 214.000 0.000 NA   NA
 858416 858417 NTHI0321 NTHI0322 arcB   FALSE 0.153 69.000 0.000 NA N NA
 858417 858418 NTHI0322 NTHIR0004     FALSE 0.033 205.000 0.000 NA   NA
 858418 858419 NTHIR0004 NTHIR0005     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 858419 858420 NTHIR0005 NTHIT0016     FALSE 0.019 271.000 0.000 NA   NA
 858420 858421 NTHIT0016 NTHIR0006     FALSE 0.097 132.000 0.000 NA   NA
 858421 858422 NTHIR0006 NTHI0323   birA FALSE 0.013 360.000 0.000 NA   NA
 858423 858424 NTHI0324 NTHI0326 guaB guaA TRUE 0.900 110.000 0.190 0.001 Y NA
 858429 858430 NTHI0332 NTHI0333     TRUE 0.619 27.000 0.000 NA   NA
 858431 858432 NTHI0334 NTHI0335 pnp nlpL TRUE 0.682 82.000 0.071 1.000   NA
 858432 858433 NTHI0335 NTHI0337 nlpL deaD FALSE 0.481 120.000 0.053 1.000   NA
 858433 858434 NTHI0337 NTHI0338 deaD   FALSE 0.016 178.000 0.000 1.000 N NA
 858434 858435 NTHI0338 NTHI0339     TRUE 0.960 5.000 0.026 NA   NA
 858436 858437 NTHI0340 NTHI0342     TRUE 0.799 57.000 0.082 NA   NA
 858437 858438 NTHI0342 NTHI0343   arsC TRUE 0.608 68.000 0.020 NA   NA
 858440 858441 NTHI0345 NTHI0346 secF secD TRUE 0.996 8.000 0.206 0.001 Y NA
 858441 858442 NTHI0346 NTHI0347 secD yajC TRUE 0.811 70.000 0.045 NA Y NA
 858442 858443 NTHI0347 NTHI0348 yajC   FALSE 0.269 108.000 0.005 NA N NA
 858443 858444 NTHI0348 NTHI0349     TRUE 0.969 -3.000 0.104 NA   NA
 858444 858445 NTHI0349 NTHI0350   tgt FALSE 0.527 65.000 0.005 NA   NA
 858445 858446 NTHI0350 NTHI0351 tgt queA FALSE 0.522 345.000 0.360 0.001 Y NA
 858446 858447 NTHI0351 NTHI0353 queA   FALSE 0.117 124.000 0.000 NA   NA
 858447 858448 NTHI0353 NTHI0354   hap FALSE 0.082 143.000 0.000 NA   NA
 858448 858449 NTHI0354 NTHI0355 hap uvrA FALSE 0.005 318.000 0.000 1.000 N NA
 858451 858452 NTHI0358 NTHI0359 tonB exbD TRUE 0.996 10.000 0.733 0.078 N NA
 858452 858453 NTHI0359 NTHI0360 exbD exbB TRUE 0.999 4.000 1.000 0.057 Y NA
 858453 858454 NTHI0360 NTHI0361 exbB bcp FALSE 0.019 169.000 0.000 1.000 N NA
 858455 858456 NTHI0362 NTHI0363 dapA   TRUE 0.891 111.000 0.267 NA Y NA
 858456 858457 NTHI0363 NTHI0364     FALSE 0.019 190.000 0.000 NA N NA
 858458 858459 NTHIT0017 NTHI0365   lgtC FALSE 0.043 184.000 0.000 NA   NA
 858459 858460 NTHI0365 NTHI0366 lgtC orfM FALSE 0.112 68.000 0.000 1.000 N NA
 858460 858461 NTHI0366 NTHI0367 orfM kdkA TRUE 0.601 12.000 0.000 1.000 N NA
 858462 858463 NTHI0368 NTHI0369 opsX hxuC FALSE 0.005 322.000 0.000 1.000 N NA
 858463 858464 NTHI0369 NTHI0370 hxuC hxuB TRUE 0.712 76.000 0.095 NA N NA
 858464 858465 NTHI0370 NTHI0371 hxuB hxuA TRUE 0.994 12.000 0.400 NA   NA
 858467 858468 NTHI0373 NTHI0374   narQ FALSE 0.412 42.000 0.000 1.000   NA
 858468 858469 NTHI0374 NTHI0375 narQ murB TRUE 0.907 10.000 0.011 1.000 N NA
 858469 858470 NTHI0375 NTHI0376 murB rpoH FALSE 0.039 126.000 0.000 1.000 N NA
 858471 858472 NTHI0377 NTHI0379 dusC djlA TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 858472 858473 NTHI0379 NTHI0380 djlA pyrE FALSE 0.394 79.000 0.012 1.000 N NA
 858473 858474 NTHI0380 NTHI0381 pyrE rph TRUE 0.934 24.000 0.108 1.000 N NA
 858474 858475 NTHI0381 NTHIT0018 rph   FALSE 0.079 145.000 0.000 NA   NA
 858475 858476 NTHIT0018 NTHI0382   gltX FALSE 0.231 81.000 0.000 NA   NA
 858477 858478 NTHIT0019 NTHIT0020     FALSE 0.440 44.000 0.000 NA   NA
 858478 858479 NTHIT0020 NTHIT0021     FALSE 0.314 59.000 0.000 NA   NA
 858479 858480 NTHIT0021 NTHIT0022     FALSE 0.350 53.000 0.000 NA   NA
 858480 858481 NTHIT0022 NTHI0383   lpt6 FALSE 0.121 123.000 0.000 NA   NA
 858482 858483 NTHI0384 NTHI0386 rbn   TRUE 0.918 -3.000 0.017 NA   NA
 858483 858484 NTHI0386 NTHI0387     TRUE 0.988 3.000 0.167 NA   NA
 858486 858487 NTHI0390 NTHI0391     FALSE 0.329 56.000 0.000 NA   NA
 858487 858488 NTHI0391 NTHI0392   menD TRUE 0.932 61.000 0.355 NA   NA
 858488 858489 NTHI0392 NTHI0393 menD menF TRUE 0.993 16.000 0.281 1.000 Y NA
 858490 858491 NTHI0395 NTHI0396 aspC3 mtr FALSE 0.300 117.000 0.000 1.000 Y NA
 858492 858493 NTHI0397 NTHI0398 sdaA sdaC TRUE 0.971 35.000 0.200 1.000 Y NA
 858493 858494 NTHI0398 NTHI0399 sdaC   FALSE 0.022 223.000 0.000 0.079 N NA
 858494 858495 NTHI0399 NTHI0400   merP TRUE 0.563 -25.000 0.000 NA   NA
 858499 858500 NTHI0406 NTHI0407 pilD pilC TRUE 0.986 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 858500 858501 NTHI0407 NTHI0408 pilC pilB TRUE 0.996 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 858501 858502 NTHI0408 NTHI0409 pilB pilA TRUE 0.996 -3.000 0.556 NA Y NA
 858503 858504 NTHI0411 NTHI0412 ampD corC FALSE 0.003 622.000 0.000 1.000 N NA
 858504 858505 NTHI0412 NTHI0413 corC lnt TRUE 0.980 -16.000 0.557 1.000 N NA
 858505 858506 NTHI0413 NTHI0414 lnt   FALSE 0.379 50.000 0.000 NA   NA
 858506 858507 NTHI0414 NTHI0415     TRUE 0.921 -3.000 0.019 NA   NA
 858507 858508 NTHI0415 NTHI0416   ruvX TRUE 0.988 0.000 0.263 NA N NA
 858512 858513 NTHI0421 NTHI0422     TRUE 0.975 9.000 0.065 NA   NA
 858513 858514 NTHI0422 NTHI0423     FALSE 0.010 535.000 0.000 NA   NA
 858514 858515 NTHI0423 NTHI0424     FALSE 0.389 49.000 0.000 NA   NA
 858517 858518 NTHI0426 NTHI0427 proC hcaT TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 858518 858519 NTHI0427 NTHI0428 hcaT xerD TRUE 0.556 31.000 0.000 NA   NA
 858519 858520 NTHI0428 NTHI0429 xerD   FALSE 0.043 173.000 0.000 1.000   NA
 858521 858522 NTHI0430 NTHI0431 ruvB ruvA TRUE 0.998 8.000 0.549 0.003 Y NA
 858522 858523 NTHI0431 NTHI0432 ruvA ruvC TRUE 0.970 63.000 0.451 0.017 Y NA
 858523 858524 NTHI0432 NTHI0433 ruvC   TRUE 0.945 47.000 0.277 NA   NA
 858524 858525 NTHI0433 NTHI0434   ntpA TRUE 0.960 12.000 0.035 NA   NA
 858525 858526 NTHI0434 NTHI0435 ntpA aspS TRUE 0.901 22.000 0.050 1.000 N NA
 858527 858528 NTHI0436 NTHI0438     TRUE 0.621 53.000 0.013 1.000   NA
 858528 858529 NTHI0438 NTHI0439     FALSE 0.201 93.000 0.000 NA   NA
 858529 858530 NTHI0439 NTHI0440     TRUE 0.986 -3.000 0.250 NA   NA
 858530 858531 NTHI0440 NTHI0441   gloA FALSE 0.282 67.000 0.000 NA   NA
 858531 858532 NTHI0441 NTHI0442 gloA rnt TRUE 0.769 74.000 0.136 1.000 N NA
 858532 858533 NTHI0442 NTHI0443 rnt   FALSE 0.110 314.000 0.084 1.000   NA
 858533 858534 NTHI0443 NTHI0444     TRUE 0.891 33.000 0.059 NA   NA
 858535 858536 NTHIT0023 NTHI0446   efp FALSE 0.032 211.000 0.000 NA   NA
 858537 858538 NTHI0447 NTHI0448   oapA FALSE 0.484 99.000 0.037 NA N NA
 858538 858539 NTHI0448 NTHI0449 oapA oapB TRUE 0.840 59.000 0.116 NA   NA
 858539 858540 NTHI0449 NTHI0450 oapB recO TRUE 0.840 3.000 0.000 NA   NA
 858540 858541 NTHI0450 NTHI0451 recO rumA TRUE 0.884 0.000 0.008 1.000 N NA
 858541 858542 NTHI0451 NTHI0452 rumA relA TRUE 0.650 78.000 0.082 1.000 N NA
 858542 858543 NTHI0452 NTHI0453 relA dgkA TRUE 0.950 15.000 0.059 1.000 N NA
 858543 858544 NTHI0453 NTHI0454 dgkA mogA FALSE 0.088 83.000 0.000 1.000 N NA
 858544 858545 NTHI0454 NTHI0456 mogA glnB TRUE 0.933 2.000 0.022 1.000 N NA
 858545 858546 NTHI0456 NTHI0457 glnB   TRUE 0.963 0.000 0.045 NA   NA
 858548 858549 NTHI0459 NTHI0460 trmB   TRUE 0.735 85.000 0.092 NA   NA
 858549 858550 NTHI0460 NTHI0461   napF FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 858550 858551 NTHI0461 NTHI0462 napF napD TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 858551 858552 NTHI0462 NTHI0463 napD napA TRUE 0.991 22.000 0.875 NA N NA
 858552 858553 NTHI0463 NTHI0464 napA napG TRUE 0.931 54.000 0.243 0.041   NA
 858553 858554 NTHI0464 NTHI0465 napG napH TRUE 0.997 0.000 0.795 0.016   NA
 858554 858555 NTHI0465 NTHI0466 napH napB TRUE 0.993 -3.000 0.316 NA Y NA
 858555 858556 NTHI0466 NTHI0467 napB napC TRUE 0.996 15.000 0.490 NA Y NA
 858557 858558 NTHI0468 NTHI0469 adk lic3C TRUE 0.579 85.000 0.029 NA   NA
 858558 858559 NTHI0469 NTHI0471 lic3C galE TRUE 0.588 142.000 0.160 NA   NA
 858559 858560 NTHI0471 NTHI0472 galE lic3A FALSE 0.052 173.000 0.000 NA   NA
 858561 858562 NTHI0473 NTHI0474     TRUE 0.996 -3.000 0.741 1.000 Y NA
 858562 858563 NTHI0474 NTHI0475     TRUE 0.988 22.000 0.196 0.038 Y NA
 858563 858564 NTHI0475 NTHI0476     TRUE 0.985 10.000 0.189 1.000 N NA
 858565 858566 NTHI0477 NTHI0478 hfeD hfeC TRUE 0.995 -7.000 0.525 0.008 Y NA
 858566 858567 NTHI0478 NTHI0479 hfeC hfeB TRUE 0.998 4.000 0.857 1.000 Y NA
 858567 858568 NTHI0479 NTHI0481 hfeB hfeA TRUE 0.998 0.000 0.894 1.000 Y NA
 858571 858572 NTHI0485 NTHI0486     TRUE 0.617 100.000 0.067 1.000   NA
 858572 858573 NTHI0486 NTHI0487     TRUE 0.830 72.000 0.153 1.000   NA
 858573 858574 NTHI0487 NTHI0488   ispG TRUE 0.990 9.000 0.233 1.000   NA
 858574 858575 NTHI0488 NTHI0489 ispG hisS TRUE 0.986 10.000 0.207 1.000 N NA
 858575 858576 NTHI0489 NTHI0490 hisS   TRUE 0.983 18.000 0.259 1.000   NA
 858577 858578 NTHI0491 NTHI0492   fdx TRUE 0.995 0.000 0.625 1.000   NA
 858578 858579 NTHI0492 NTHI0493 fdx hscA TRUE 0.975 40.000 0.794 1.000 N NA
 858579 858580 NTHI0493 NTHI0494 hscA   TRUE 0.907 19.000 0.019 NA   NA
 858580 858581 NTHI0494 NTHI0495   hscB TRUE 0.626 51.000 0.007 NA   NA
 858581 858582 NTHI0495 NTHI0496 hscB   TRUE 0.994 13.000 0.500 1.000   NA
 858582 858583 NTHI0496 NTHI0497   nifU TRUE 0.951 58.000 0.359 0.003   NA
 858583 858584 NTHI0497 NTHI0498 nifU nifS2 TRUE 0.922 60.000 0.448 1.000 N NA
 858584 858585 NTHI0498 NTHI0499 nifS2   TRUE 0.917 61.000 0.424 1.000 N NA
 858585 858586 NTHI0499 NTHI0500     TRUE 0.832 53.000 0.126 1.000 N NA
 858586 858587 NTHI0500 NTHIT0024     FALSE 0.161 111.000 0.000 NA   NA
 858587 858588 NTHIT0024 NTHIT0025     TRUE 0.646 24.000 0.000 NA   NA
 858588 858589 NTHIT0025 NTHI0501   pal FALSE 0.068 155.000 0.000 NA   NA
 858589 858590 NTHI0501 NTHI0502 pal tolB TRUE 0.988 24.000 0.592 1.000   NA
 858590 858591 NTHI0502 NTHI0503 tolB tolA TRUE 0.933 42.000 0.215 NA N NA
 858591 858592 NTHI0503 NTHI0504 tolA tolR TRUE 0.990 16.000 0.460 NA N NA
 858592 858593 NTHI0504 NTHI0505 tolR tolQ TRUE 0.970 71.000 0.556 0.055 Y NA
 858593 858594 NTHI0505 NTHI0506 tolQ   TRUE 0.992 17.000 0.593 1.000   NA
 858595 858596 NTHI0507 NTHI0508 dinG   TRUE 0.963 13.000 0.082 1.000 N NA
 858596 858597 NTHI0508 NTHI0509     TRUE 0.747 25.000 0.006 1.000 N NA
 858597 858598 NTHI0509 NTHI0510   lcfA TRUE 0.840 42.000 0.085 1.000 N NA
 858598 858599 NTHI0510 NTHI0511 lcfA rnd TRUE 0.799 56.000 0.115 1.000 N NA
 858600 858601 NTHI0512 NTHI0513     FALSE 0.099 74.000 0.000 1.000 N NA
 858601 858602 NTHI0513 NTHI0514   pth TRUE 0.951 48.000 0.184 1.000 Y NA
 858603 858604 NTHI0516 NTHI0517     TRUE 0.965 3.000 0.035 NA   NA
 858604 858605 NTHI0517 NTHI0518   xseA TRUE 0.957 2.000 0.006 0.002   NA
 858605 858606 NTHI0518 NTHI0519 xseA adpP FALSE 0.040 177.000 0.000 1.000   NA
 858606 858607 NTHI0519 NTHI0520 adpP icc TRUE 0.978 10.000 0.092 1.000   NA
 858609 858610 NTHI0522 NTHI0523 ompP1 ogt TRUE 0.645 46.000 0.019 1.000 N NA
 858610 858611 NTHI0523 NTHI0524 ogt mutH TRUE 0.967 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 858612 858613 NTHI0525 NTHI0526 mesJ   TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 858613 858614 NTHI0526 NTHI0528   accA FALSE 0.256 73.000 0.000 NA   NA
 858614 858615 NTHI0528 NTHI0529 accA znuB FALSE 0.081 89.000 0.000 1.000 N NA
 858615 858616 NTHI0529 NTHI0531 znuB znuC TRUE 0.997 0.000 0.755 1.000 Y NA
 858617 858618 NTHI0532 NTHI0534   tyrR FALSE 0.053 115.000 0.000 1.000 N NA
 858619 858620 NTHI0535 NTHI0536 hfq rluC FALSE 0.280 91.000 0.000 0.033   NA
 858621 858622 NTHI0538 NTHI0539 rne   FALSE 0.022 232.000 0.000 1.000   NA
 858622 858623 NTHI0539 NTHI0540   thiM FALSE 0.012 324.000 0.000 1.000   NA
 858623 858624 NTHI0540 NTHI0541 thiM thiD TRUE 0.954 -7.000 0.017 0.006 Y NA
 858624 858625 NTHI0541 NTHI0542 thiD thiE TRUE 0.988 11.000 0.063 0.006 Y NA
 858625 858626 NTHI0542 NTHI0543 thiE   TRUE 0.767 -16.000 0.015 1.000 N NA
 858634 858635 NTHI0551 NTHI0552 nhaB dsbB TRUE 0.995 10.000 0.723 1.000 N NA
 858636 858637 NTHI0553 NTHI0554 glmS hupA FALSE 0.055 113.000 0.000 1.000 N NA
 858637 858638 NTHI0554 NTHI0555 hupA   TRUE 0.993 2.000 0.355 1.000   NA
 858638 858639 NTHI0555 NTHI0557   nudC FALSE 0.456 36.000 0.000 1.000   NA
 858639 858640 NTHI0557 NTHI0558 nudC orfG FALSE 0.243 67.000 0.000 1.000   NA
 858640 858641 NTHI0558 NTHI0559 orfG comF TRUE 0.691 76.000 0.066 1.000   NA
 858641 858642 NTHI0559 NTHI0560 comF comE TRUE 0.781 13.000 0.000 1.000   NA
 858642 858643 NTHI0560 NTHI0562 comE comD TRUE 0.996 10.000 0.668 NA   NA
 858643 858644 NTHI0562 NTHI0563 comD comC TRUE 0.933 -3.000 0.028 NA   NA
 858644 858645 NTHI0563 NTHI0564 comC comB TRUE 0.969 -3.000 0.105 NA   NA
 858645 858646 NTHI0564 NTHI0566 comB comA TRUE 0.830 1.000 0.000 NA   NA
 858647 858648 NTHI0567 NTHI0568 mrcA   TRUE 0.539 73.000 0.017 1.000   NA
 858648 858649 NTHI0568 NTHI0569     FALSE 0.095 133.000 0.000 NA   NA
 858649 858650 NTHI0569 NTHI0570   recR TRUE 0.840 131.000 0.604 NA   NA
 858650 858651 NTHI0570 NTHI0571 recR topB TRUE 0.961 16.000 0.004 0.008 Y NA
 858651 858652 NTHI0571 NTHI0572 topB secG FALSE 0.268 109.000 0.008 1.000 N NA
 858652 858653 NTHI0572 NTHIT0026 secG   TRUE 0.635 25.000 0.000 NA   NA
 858654 858655 NTHI0573 NTHI0574 fruA fruK TRUE 0.997 2.000 0.562 1.000 Y NA
 858655 858656 NTHI0574 NTHI0575 fruK fruB TRUE 0.980 2.000 0.035 1.000 Y NA
 858656 858657 NTHI0575 NTHI0576 fruB   TRUE 0.901 72.000 0.308 1.000   NA
 858657 858658 NTHI0576 NTHI0577   vapD FALSE 0.184 87.000 0.000 1.000   NA
 858658 858659 NTHI0577 NTHI0578 vapD vapX TRUE 0.995 9.000 0.462 NA   NA
 858659 858660 NTHI0578 NTHI0579 vapX   FALSE 0.261 72.000 0.000 NA   NA
 858660 858661 NTHI0579 NTHI0580     TRUE 0.820 51.000 0.069 NA   NA
 858661 858662 NTHI0580 NTHI0581     TRUE 0.848 27.000 0.013 NA   NA
 858662 858663 NTHI0581 NTHI0582   holB TRUE 0.910 55.000 0.110 NA Y NA
 858663 858664 NTHI0582 NTHI0584 holB   TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 858666 858667 NTHI0586 NTHI0587 tdk   TRUE 0.973 -10.000 0.209 NA   NA
 858667 858668 NTHI0587 NTHI0588   surA FALSE 0.270 70.000 0.000 NA   NA
 858668 858669 NTHI0588 NTHI0589 surA pyrR FALSE 0.479 70.000 0.018 1.000 N NA
 858672 858673 NTHI0593 NTHI0594 lon   FALSE 0.051 117.000 0.000 1.000 N NA
 858673 858674 NTHI0594 NTHI0595   rpiA FALSE 0.197 134.000 0.017 1.000 N NA
 858674 858675 NTHI0595 NTHI0596 rpiA serA TRUE 0.807 30.000 0.029 1.000 N NA
 858676 858677 NTHI0597 NTHI0598     TRUE 0.947 10.000 0.016 NA   NA
 858678 858679 NTHI0599 NTHI0600 hisG hisD TRUE 0.903 93.000 0.171 0.007 Y NA
 858679 858680 NTHI0600 NTHI0601 hisD hisC TRUE 0.956 69.000 0.294 0.007 Y NA
 858680 858681 NTHI0601 NTHI0602 hisC hisB TRUE 0.924 112.000 0.341 0.007 Y NA
 858681 858682 NTHI0602 NTHI0603 hisB hisH TRUE 0.923 66.000 0.128 0.007 Y NA
 858682 858683 NTHI0603 NTHI0604 hisH hisA TRUE 0.979 36.000 0.210 0.007 Y NA
 858683 858684 NTHI0604 NTHI0605 hisA hisF TRUE 0.991 -18.000 0.433 0.007 Y NA
 858684 858685 NTHI0605 NTHI0606 hisF hisI TRUE 0.997 0.000 0.430 0.007 Y NA
 858685 858686 NTHI0606 NTHI0606_1 hisI   FALSE 0.229 82.000 0.000 NA   NA
 858686 858687 NTHI0606_1 NTHI0607   tyrP TRUE 0.572 30.000 0.000 NA   NA
 858688 858689 NTHI0608 NTHI0609 atpC atpD TRUE 0.994 30.000 0.837 0.006 Y NA
 858689 858690 NTHI0609 NTHI0610 atpD atpG TRUE 0.997 17.000 0.724 0.006 Y NA
 858690 858691 NTHI0610 NTHI0611 atpG atpA TRUE 0.998 16.000 0.846 0.006 Y NA
 858691 858692 NTHI0611 NTHI0612 atpA atpH TRUE 0.998 13.000 0.864 0.006 Y NA
 858692 858693 NTHI0612 NTHI0613 atpH atpF TRUE 0.995 13.000 0.242 0.006 Y NA
 858693 858694 NTHI0613 NTHI0614 atpF atpE TRUE 0.975 50.000 0.666 0.006   NA
 858694 858695 NTHI0614 NTHI0615 atpE atpB TRUE 0.965 56.000 0.557 0.006   NA
 858695 858696 NTHI0615 NTHI0616 atpB   TRUE 0.983 37.000 0.291 0.006 Y NA
 858696 858697 NTHI0616 NTHI0617   gidB FALSE 0.165 126.000 0.005 1.000 N NA
 858697 858698 NTHI0617 NTHI0618 gidB   FALSE 0.073 140.000 0.000 1.000   NA
 858699 858700 NTHI0619 NTHI0620     TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 858700 858701 NTHI0620 NTHI0621   luxS FALSE 0.138 185.000 0.016 NA   NA
 858703 858704 NTHI0624 NTHI0625 hslV hslU TRUE 0.998 11.000 0.752 1.000 Y NA
 858706 858707 NTHI0627 NTHI0628 ordL rmuC FALSE 0.059 164.000 0.000 NA   NA
 858707 858708 NTHI0628 NTHI0629 rmuC rbsD FALSE 0.059 164.000 0.000 NA   NA
 858708 858709 NTHI0629 NTHI0630 rbsD rbsA TRUE 0.995 14.000 0.337 1.000 Y NA
 858709 858710 NTHI0630 NTHI0631 rbsA rbsC TRUE 0.997 13.000 0.504 1.000 Y NA
 858710 858711 NTHI0631 NTHI0632 rbsC rbsB TRUE 0.996 20.000 0.847 NA Y NA
 858711 858712 NTHI0632 NTHI0633 rbsB rbsK TRUE 0.928 98.000 0.347 NA Y NA
 858712 858713 NTHI0633 NTHI0634 rbsK rbsR TRUE 0.978 28.000 0.500 1.000 N NA
 858713 858714 NTHI0634 NTHI0635 rbsR   FALSE 0.171 106.000 0.000 NA   NA
 858715 858716 NTHI0636 NTHI0637 menG menA TRUE 0.939 52.000 0.158 NA Y NA
 858718 858719 NTHI0639 NTHI0640 tehA rpoC FALSE 0.024 152.000 0.000 1.000 N NA
 858719 858720 NTHI0640 NTHI0641 rpoC rpoB TRUE 0.738 207.000 0.851 0.002   NA
 858720 858721 NTHI0641 NTHI0642 rpoB rplA FALSE 0.010 384.000 0.000 1.000   NA
 858721 858722 NTHI0642 NTHI0643 rplA rplK TRUE 0.998 5.000 0.838 0.037 Y NA
 858722 858723 NTHI0643 NTHI0644 rplK deoD FALSE 0.018 173.000 0.000 1.000 N NA
 858723 858724 NTHI0644 NTHI0645 deoD   TRUE 0.747 84.000 0.041 1.000 Y NA
 858724 858725 NTHI0645 NTHI0646     FALSE 0.071 99.000 0.000 1.000 N NA
 858725 858726 NTHI0646 NTHI0647     TRUE 0.997 9.000 0.810 NA   NA
 858728 858729 NTHI0649 NTHI0650 waaQ fba FALSE 0.239 38.000 0.000 1.000 N NA
 858729 858730 NTHI0650 NTHI0651 fba pgk TRUE 0.755 111.000 0.056 0.009 Y NA
 858730 858731 NTHI0651 NTHI0652 pgk   FALSE 0.274 96.000 0.004 1.000 N NA
 858733 858734 NTHI0654 NTHI0655 tyrQ tdk FALSE 0.246 37.000 0.000 1.000 N NA
 858734 858735 NTHI0655 NTHI0656 tdk gcp TRUE 0.884 9.000 0.003 1.000 N NA
 858736 858737 NTHI0657 NTHI0658 rpsU dnaG FALSE 0.358 134.000 0.067 1.000 N NA
 858737 858738 NTHI0658 NTHI0659 dnaG rpoD TRUE 0.877 71.000 0.299 1.000 N NA
 858739 858740 NTHI0660 NTHI0661 aspA ureH FALSE 0.026 147.000 0.000 1.000 N NA
 858740 858741 NTHI0661 NTHI0662 ureH ureG TRUE 0.957 75.000 0.337 0.005 Y NA
 858741 858742 NTHI0662 NTHI0663 ureG ureF TRUE 0.945 103.000 0.439 0.005 Y NA
 858742 858743 NTHI0663 NTHI0664 ureF ureE TRUE 0.992 -15.000 0.460 0.005 Y NA
 858743 858744 NTHI0664 NTHI0665 ureE ureC FALSE 0.122 128.000 0.000 0.002 N NA
 858744 858745 NTHI0665 NTHI0666 ureC ureB TRUE 0.953 12.000 0.000 0.002 Y NA
 858745 858746 NTHI0666 NTHI0667 ureB ureA TRUE 0.764 77.000 0.014 0.002 Y NA
 858747 858748 NTHI0668 NTHI0669 groES groEL TRUE 0.995 23.000 0.631 0.012 Y NA
 858749 858750 NTHI0670 NTHI0671 rplI rpsR TRUE 0.996 17.000 0.499 0.028 Y NA
 858750 858751 NTHI0671 NTHI0672 rpsR priB TRUE 0.976 13.000 0.128 1.000 N NA
 858751 858752 NTHI0672 NTHI0673 priB rpsF TRUE 0.935 -13.000 0.122 1.000 N NA
 858752 858753 NTHI0673 NTHI0674 rpsF infA FALSE 0.094 192.000 0.000 1.000 Y NA
 858754 858755 NTHI0675 NTHI0676 lic2C ksgA FALSE 0.226 84.000 0.000 NA   NA
 858757 858758 NTHI0679 NTHI0680 apaH   TRUE 0.954 10.000 0.006 0.002   NA
 858759 858760 NTHI0681 NTHI0683 gnd   FALSE 0.207 116.000 0.005 1.000 N NA
 858760 858761 NTHI0683 NTHI0684     FALSE 0.492 83.000 0.012 NA   NA
 858761 858762 NTHI0684 NTHI0685   devB FALSE 0.270 70.000 0.000 NA   NA
 858762 858763 NTHI0685 NTHI0686 devB zwf TRUE 0.727 143.000 0.188 1.000 Y NA
 858763 858764 NTHI0686 NTHI0687 zwf cysQ TRUE 0.666 76.000 0.085 1.000 N NA
 858764 858765 NTHI0687 NTHI0688 cysQ   TRUE 0.958 5.000 0.023 NA   NA
 858765 858766 NTHI0688 NTHI0689     TRUE 0.737 57.000 0.043 NA   NA
 858774 858775 NTHI0697 NTHI0698 gph rpe TRUE 0.888 46.000 0.120 1.000   NA
 858775 858776 NTHI0698 NTHI0699 rpe gyrB FALSE 0.046 122.000 0.000 1.000 N NA
 858776 858777 NTHI0699 NTHI0701 gyrB   FALSE 0.039 126.000 0.000 1.000 N NA
 858779 858780 NTHI0703 NTHI0704   oxyR TRUE 0.981 0.000 0.034 0.032 Y NA
 858783 858784 NTHI0707 NTHI0708 fkbY   TRUE 0.875 90.000 0.310 1.000   NA
 858784 858785 NTHI0708 NTHI0709     TRUE 0.989 0.000 0.220 NA   NA
 858785 858786 NTHI0709 NTHI0710     TRUE 0.997 -3.000 0.790 NA Y NA
 858786 858787 NTHI0710 NTHI0711     TRUE 0.998 9.000 0.804 NA Y NA
 858788 858789 NTHI0712 NTHIT0027 tuf   FALSE 0.173 105.000 0.000 NA   NA
 858789 858790 NTHIT0027 NTHIT0028     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 858790 858791 NTHIT0028 NTHIT0029     FALSE 0.453 43.000 0.000 NA   NA
 858791 858792 NTHIT0029 NTHIT0030     TRUE 0.572 30.000 0.000 NA   NA
 858794 858795 NTHI0716 NTHI0718 rseB rseA TRUE 0.971 80.000 0.856 NA Y NA
 858795 858796 NTHI0718 NTHI0719 rseA rpoE TRUE 0.987 25.000 0.705 NA N NA
 858796 858797 NTHI0719 NTHI0720 rpoE   FALSE 0.440 109.000 0.019 NA   NA
 858797 858798 NTHI0720 NTHI0721   mscL FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 858798 858799 NTHI0721 NTHI0722 mscL trkA TRUE 0.548 73.000 0.035 1.000 N NA
 858799 858800 NTHI0722 NTHI0723 trkA sun TRUE 0.975 13.000 0.122 1.000 N NA
 858800 858801 NTHI0723 NTHI0724 sun fmt TRUE 0.995 0.000 0.305 1.000 Y NA
 858801 858802 NTHI0724 NTHI0725 fmt def TRUE 0.776 101.000 0.058 0.041 Y NA
 858802 858803 NTHI0725 NTHI0726 def   FALSE 0.039 190.000 0.000 NA   NA
 858803 858804 NTHI0726 NTHI0727     TRUE 0.572 -22.000 0.000 NA   NA
 858804 858805 NTHI0727 NTHIR0007     FALSE 0.021 257.000 0.000 NA   NA
 858805 858806 NTHIR0007 NTHIR0008     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 858806 858807 NTHIR0008 NTHIT0031     FALSE 0.012 401.000 0.000 NA   NA
 858807 858808 NTHIT0031 NTHIT0032     FALSE 0.220 86.000 0.000 NA   NA
 858808 858809 NTHIT0032 NTHIR0009     FALSE 0.234 80.000 0.000 NA   NA
 858809 858810 NTHIR0009 NTHI0728   sxy FALSE 0.016 298.000 0.000 NA   NA
 858811 858812 NTHI0729 NTHI0730 recA recX TRUE 0.885 79.000 0.296 1.000   NA
 858813 858814 NTHI0731 NTHI0732 ccrB   TRUE 0.942 0.000 0.023 1.000   NA
 858815 858816 NTHI0733 NTHI0734 argF arcC TRUE 0.997 10.000 0.483 1.000 Y NA
 858816 858817 NTHI0734 NTHI0735 arcC   TRUE 0.644 105.000 0.091 1.000   NA
 858817 858818 NTHI0735 NTHI0736   hgpD FALSE 0.011 410.000 0.000 NA   NA
 858818 858819 NTHI0736 NTHI0738 hgpD pepE FALSE 0.009 1072.000 0.000 NA   NA
 858819 858820 NTHI0738 NTHI0739 pepE   FALSE 0.467 18.000 0.000 1.000 N NA
 858820 858821 NTHI0739 NTHI0740   abgA TRUE 0.653 72.000 0.043 1.000   NA
 858821 858822 NTHI0740 NTHI0741 abgA cpdB FALSE 0.171 93.000 0.000 1.000   NA
 858823 858824 NTHI0742 NTHI0743     TRUE 0.935 10.000 0.025 1.000 N NA
 858825 858826 NTHI0744 NTHI0745 gidA rpsL FALSE 0.015 182.000 0.000 1.000 N NA
 858826 858827 NTHI0745 NTHI0746 rpsL rpsG, TRUE 0.883 157.000 0.620 0.005 Y NA
 858827 858828 NTHI0746 NTHI0747 rpsG, fusA TRUE 0.957 84.000 0.579 1.000 Y NA
 858828 858829 NTHI0747 NTHI0748 fusA tuf TRUE 0.648 65.000 0.000 0.002 Y NA
 858829 858830 NTHI0748 NTHI0749 tuf   FALSE 0.011 460.000 0.000 NA   NA
 858830 858831 NTHI0749 NTHI0751     TRUE 0.653 -9.000 0.000 NA   NA
 858831 858832 NTHI0751 NTHI0753   dusA TRUE 0.840 3.000 0.000 NA   NA
 858833 858834 NTHI0754 NTHI0755   trpS TRUE 0.797 23.000 0.000 0.001   NA
 858835 858836 NTHI0757 NTHI0758   purB TRUE 0.950 23.000 0.093 NA   NA
 858836 858837 NTHI0758 NTHI0759 purB rplJ FALSE 0.006 272.000 0.000 1.000 N NA
 858837 858838 NTHI0759 NTHI0761 rplJ rplL TRUE 0.985 55.000 0.884 0.027 Y NA
 858838 858839 NTHI0761 NTHI0762 rplL glmU FALSE 0.022 159.000 0.000 1.000 N NA
 858840 858841 NTHI0763 NTHIT0033     FALSE 0.197 96.000 0.000 NA   NA
 858841 858842 NTHIT0033 NTHIT0034     FALSE 0.319 58.000 0.000 NA   NA
 858842 858843 NTHIT0034 NTHIT0035     TRUE 0.685 21.000 0.000 NA   NA
 858843 858844 NTHIT0035 NTHI0764   pldB FALSE 0.137 119.000 0.000 NA   NA
 858844 858845 NTHI0764 NTHI0765 pldB asd TRUE 0.537 54.000 0.014 1.000 N NA
 858845 858846 NTHI0765 NTHI0766 asd   FALSE 0.048 166.000 0.000 1.000   NA
 858848 858849 NTHI0768 NTHI0769 mdaB rep FALSE 0.015 279.000 0.000 1.000   NA
 858849 858850 NTHI0769 NTHI0770 rep   TRUE 0.955 6.000 0.024 1.000   NA
 858850 858851 NTHI0770 NTHI0771   coaD TRUE 0.709 -3.000 0.000 1.000   NA
 858851 858852 NTHI0771 NTHI0772 coaD kdtA TRUE 0.887 -3.000 0.020 1.000 N NA
 858854 858855 NTHI0774 NTHI0775 tag   FALSE 0.145 115.000 0.000 NA   NA
 858855 858856 NTHI0775 NTHI0776   aroE TRUE 0.821 12.000 0.000 NA   NA
 858856 858857 NTHI0776 NTHI0777 aroE   TRUE 0.973 4.000 0.087 NA N NA
 858857 858858 NTHI0777 NTHI0778     TRUE 0.964 16.000 0.099 NA N NA
 858858 858859 NTHI0778 NTHI0779     TRUE 0.800 10.000 0.000 1.000   NA
 858859 858860 NTHI0779 NTHI0780     FALSE 0.035 185.000 0.000 1.000   NA
 858860 858861 NTHI0780 NTHI0781     TRUE 0.954 -7.000 0.095 NA   NA
 858861 858862 NTHI0781 NTHI0782   hgpB FALSE 0.019 270.000 0.000 NA   NA
 858863 858864 NTHI0783 NTHI0785     TRUE 0.912 -7.000 0.031 0.008 N NA
 858865 858866 NTHI0786 NTHI0787     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 858866 858867 NTHI0787 NTHI0788     TRUE 0.626 -12.000 0.000 NA   NA
 858867 858868 NTHI0788 NTHI0789   glpX FALSE 0.027 205.000 0.000 1.000   NA
 858869 858870 NTHI0790 NTHI0791   mioC TRUE 0.594 99.000 0.057 1.000   NA
 858870 858871 NTHI0791 NTHI0792 mioC dtd FALSE 0.495 -3.000 0.000 1.000 N NA
 858872 858873 NTHI0793 NTHI0794 ispF ispD TRUE 0.994 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 858873 858874 NTHI0794 NTHI0795 ispD ftsB TRUE 0.982 0.000 0.185 1.000 N NA
 858874 858875 NTHI0795 NTHI0796 ftsB gpt FALSE 0.043 123.000 0.000 1.000 N NA
 858877 858878 NTHI0798 NTHI0799 xerC   TRUE 0.658 -6.000 0.000 1.000   NA
 858880 858881 NTHI0801 NTHI0802 glpE   TRUE 0.800 1.000 0.000 1.000   NA
 858881 858882 NTHI0802 NTHI0803   ilvY TRUE 0.841 32.000 0.030 1.000   NA
 858884 858885 NTHI0805 NTHI0806 glpC glpB TRUE 0.995 11.000 0.547 0.039 N NA
 858885 858886 NTHI0806 NTHI0808 glpB glpA TRUE 0.990 -10.000 0.650 0.002 N NA
 858887 858888 NTHI0809 NTHI0811 glpT glpQ TRUE 0.883 104.000 0.396 0.002 N NA
 858888 858889 NTHI0811 NTHI0812 glpQ glpF FALSE 0.033 230.000 0.000 0.002 N NA
 858889 858890 NTHI0812 NTHI0813 glpF glpK TRUE 0.805 21.000 0.010 1.000 N NA
 858892 858893 NTHI0815 NTHI0816   hel FALSE 0.110 126.000 0.000 NA   NA
 858893 858894 NTHI0816 NTHI0817 hel rluE FALSE 0.048 167.000 0.000 1.000   NA
 858895 858896 NTHI0818 NTHI0820 ppx   TRUE 0.560 -28.000 0.000 NA   NA
 858896 858897 NTHI0820 NTHI0821     TRUE 0.996 10.000 0.575 NA   NA
 858897 858898 NTHI0821 NTHI0822   slyD FALSE 0.025 151.000 0.000 1.000 N NA
 858898 858899 NTHI0822 NTHI0823 slyD   TRUE 0.563 78.000 0.022 NA   NA
 858900 858901 NTHI0824 NTHI0825 truD surE TRUE 0.990 10.000 0.235 1.000   NA
 858901 858902 NTHI0825 NTHI0826 surE   TRUE 0.966 9.000 0.038 NA   NA
 858902 858903 NTHI0826 NTHI0827     TRUE 0.962 9.000 0.030 NA   NA
 858903 858904 NTHI0827 NTHI0830   lppB TRUE 0.898 35.000 0.081 NA   NA
 858904 858905 NTHI0830 NTHI0831 lppB tnaA FALSE 0.004 368.000 0.000 1.000 N NA
 858905 858906 NTHI0831 NTHI0832 tnaA tnaB TRUE 0.930 84.000 0.308 1.000 Y NA
 858906 858907 NTHI0832 NTHI0834 tnaB mutS FALSE 0.121 141.000 0.003 1.000 N NA
 858909 858910 NTHI0835 NTHI0836 selA selB TRUE 0.993 -3.000 0.569 0.001 N NA
 858910 858911 NTHI0836 NTHI0837 selB   TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 858911 858912 NTHI0837 NTHI0838   relB FALSE 0.134 120.000 0.000 NA   NA
 858912 858913 NTHI0838 NTHI0839 relB   TRUE 0.996 0.000 0.800 NA   NA
 858915 858916 NTHI0843 NTHI0844 tig clpP TRUE 0.875 123.000 0.351 1.000 Y NA
 858916 858917 NTHI0844 NTHI0846 clpP clpX TRUE 0.996 10.000 0.352 1.000 Y NA
 858917 858918 NTHI0846 NTHI0847 clpX secE FALSE 0.027 145.000 0.000 1.000 N NA
 858918 858919 NTHI0847 NTHI0848 secE nusG TRUE 0.996 2.000 0.843 1.000 N NA
 858919 858920 NTHI0848 NTHI0849 nusG vacJ FALSE 0.025 151.000 0.000 1.000 N NA
 858920 858921 NTHI0849 NTHI0851 vacJ   FALSE 0.198 54.000 0.000 NA N NA
 858921 858922 NTHI0851 NTHI0852   htpX FALSE 0.028 168.000 0.000 NA N NA
 858924 858925 NTHI0854 NTHI0855   trkH TRUE 0.990 3.000 0.202 1.000   NA
 858925 858926 NTHI0855 NTHIR0010 trkH   FALSE 0.013 360.000 0.000 NA   NA
 858926 858927 NTHIR0010 NTHIT0037     FALSE 0.097 132.000 0.000 NA   NA
 858927 858928 NTHIT0037 NTHIR0011     FALSE 0.019 271.000 0.000 NA   NA
 858928 858929 NTHIR0011 NTHIR0012     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 858929 858930 NTHIR0012 NTHIR0013     FALSE 0.379 50.000 0.000 NA   NA
 858930 858931 NTHIR0013 NTHIT0038     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 858931 858932 NTHIT0038 NTHIT0039     TRUE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 858932 858933 NTHIT0039 NTHI0856   psiE FALSE 0.027 230.000 0.000 NA   NA
 858934 858935 NTHI0857 NTHI0858 hemY hemX TRUE 0.991 11.000 0.144 1.000 Y NA
 858936 858937 NTHI0859 NTHI0860 cyaA gpsA FALSE 0.099 74.000 0.000 1.000 N NA
 858937 858938 NTHI0860 NTHI0861 gpsA cysE TRUE 0.987 17.000 0.429 1.000 N NA
 858938 858939 NTHI0861 NTHI0862 cysE aroE TRUE 0.980 10.000 0.024 0.065 Y NA
 858939 858940 NTHI0862 NTHI0863 aroE   FALSE 0.031 138.000 0.000 1.000 N NA
 858942 858943 NTHIT0040 NTHIT0041     FALSE 0.400 48.000 0.000 NA   NA
 858944 858945 NTHI0865 NTHI0866 fucP fucA TRUE 0.729 39.000 0.000 NA Y NA
 858945 858946 NTHI0866 NTHI0867 fucA fucU TRUE 0.995 20.000 0.417 0.001 Y NA
 858946 858947 NTHI0867 NTHI0870 fucU fucK TRUE 0.994 14.000 0.263 1.000 Y NA
 858947 858948 NTHI0870 NTHI0871 fucK fucI TRUE 0.932 73.000 0.269 1.000 Y NA
 858948 858949 NTHI0871 NTHI0872 fucI fucR FALSE 0.116 230.000 0.000 0.001 Y NA
 858950 858951 NTHI0873 NTHI0874 hepA rluA TRUE 0.990 3.000 0.294 1.000 N NA
 858951 858952 NTHI0874 NTHI0875 rluA glpG TRUE 0.571 27.000 0.000 1.000   NA
 858952 858953 NTHI0875 NTHI0876 glpG glpR TRUE 0.958 30.000 0.190 1.000   NA
 858954 858955 NTHI0877 NTHI0878 metQ metI TRUE 0.974 39.000 0.205 0.035 Y NA
 858955 858956 NTHI0878 NTHI0879 metI metN TRUE 0.971 -10.000 0.112 1.000 Y NA
 858957 858958 NTHI0880 NTHIR0014     FALSE 0.014 340.000 0.000 NA   NA
 858958 858959 NTHIR0014 NTHIT0042     FALSE 0.234 80.000 0.000 NA   NA
 858959 858960 NTHIT0042 NTHIT0043     FALSE 0.220 86.000 0.000 NA   NA
 858960 858961 NTHIT0043 NTHIR0015     FALSE 0.011 407.000 0.000 NA   NA
 858961 858962 NTHIR0015 NTHIR0016     FALSE 0.023 247.000 0.000 NA   NA
 858962 858963 NTHIR0016 NTHI0881     FALSE 0.047 178.000 0.000 NA   NA
 858963 858964 NTHI0881 NTHI0882     TRUE 0.996 4.000 0.679 NA   NA
 858965 858966 NTHI0883 NTHI0884 narP lysA FALSE 0.011 206.000 0.000 1.000 N NA
 858966 858967 NTHI0884 NTHI0885 lysA   TRUE 0.839 48.000 0.071 NA   NA
 858968 858969 NTHI0886 NTHI0887 cyaY recQ TRUE 0.949 2.000 0.030 NA N NA
 858969 858970 NTHI0887 NTHI0888 recQ proS FALSE 0.086 85.000 0.000 1.000 N NA
 858971 858972 NTHI0889 NTHI0890 ostA sufI FALSE 0.043 123.000 0.000 1.000 N NA
 858972 858973 NTHI0890 NTHI0891 sufI plsC TRUE 0.982 2.000 0.154 1.000 N NA
 858976 858977 NTHI0894 NTHI0895 ilvG ilvD FALSE 0.412 42.000 0.000 1.000   NA
 858977 858978 NTHI0895 NTHI0896 ilvD thd1 TRUE 0.846 80.000 0.106 1.000 Y NA
 858981 858982 NTHI0900 NTHI0901 secB   TRUE 0.980 14.000 0.158 NA N NA
 858983 858984 NTHI0902 NTHI0903 dcuB ndhA FALSE 0.028 204.000 0.000 1.000   NA
 858986 858987 NTHI0905 NTHI0906 lexA dapF FALSE 0.029 143.000 0.000 1.000 N NA
 858989 858990 NTHI0909 NTHI0910 purL lex2A FALSE 0.037 196.000 0.000 NA   NA
 858990 858991 NTHI0910 NTHI0913 lex2A lex2B FALSE 0.261 72.000 0.000 NA   NA
 858992 858993 NTHI0914 NTHI0915     TRUE 0.973 0.000 0.088 1.000   NA
 858996 858997 NTHI0919 NTHI0920 mutY   TRUE 0.934 -22.000 0.150 1.000 N NA
 858997 858998 NTHI0920 NTHI0921   mltC TRUE 0.943 15.000 0.043 NA N NA
 858998 858999 NTHI0921 NTHIT0044 mltC   FALSE 0.025 239.000 0.000 NA   NA
 858999 859000 NTHIT0044 NTHIT0045     TRUE 0.840 3.000 0.000 NA   NA
 859001 859002 NTHI0922 NTHI0923   nadR TRUE 0.983 -3.000 0.137 0.001   NA
 859003 859004 NTHI0925 NTHI0926 ribB lpsA TRUE 0.555 15.000 0.000 1.000 N NA
 859005 859006 NTHI0927 NTHI0928     TRUE 0.617 10.000 0.000 1.000 N NA
 859007 859008 NTHI0929 NTHI0930 ftsY ftsE TRUE 0.966 19.000 0.117 0.017 N NA
 859008 859009 NTHI0930 NTHI0931 ftsE ftsX TRUE 0.990 10.000 0.121 1.000 Y NA
 859010 859011 NTHI0932 NTHI0933 atoB atoE TRUE 0.983 15.000 0.087 1.000 Y NA
 859011 859012 NTHI0933 NTHI0934 atoE atoA TRUE 0.993 3.000 0.174 1.000 Y NA
 859012 859013 NTHI0934 NTHI0935 atoA atoD TRUE 0.998 11.000 0.600 0.001 Y NA
 859014 859015 NTHI0936 NTHI0937   rpsJ FALSE 0.009 237.000 0.000 1.000 N NA
 859015 859016 NTHI0937 NTHI0938 rpsJ rplC TRUE 0.994 17.000 0.307 0.035 Y NA
 859016 859017 NTHI0938 NTHI0939 rplC rplD TRUE 0.996 16.000 0.486 0.026 Y NA
 859017 859018 NTHI0939 NTHI0940 rplD rplW TRUE 0.996 -3.000 0.513 0.026 Y NA
 859018 859019 NTHI0940 NTHI0941 rplW rplB TRUE 0.997 18.000 0.849 0.031 Y NA
 859019 859020 NTHI0941 NTHI0942 rplB rpsS TRUE 0.995 26.000 0.820 0.035 Y NA
 859020 859021 NTHI0942 NTHI0943 rpsS rplV TRUE 0.998 12.000 0.769 0.035 Y NA
 859021 859022 NTHI0943 NTHI0945 rplV rpsC TRUE 0.997 18.000 0.719 0.035 Y NA
 859022 859023 NTHI0945 NTHI0946 rpsC rplP TRUE 0.998 14.000 0.828 0.035 Y NA
 859023 859024 NTHI0946 NTHI0947 rplP rpmC TRUE 0.998 0.000 0.802 0.026 Y NA
 859024 859025 NTHI0947 NTHI0948 rpmC rpsQ TRUE 0.998 0.000 0.828 0.026 Y NA
 859025 859026 NTHI0948 NTHI0950 rpsQ   FALSE 0.012 390.000 0.000 NA   NA
 859026 859027 NTHI0950 NTHI0951   rplN FALSE 0.018 281.000 0.000 NA   NA
 859027 859028 NTHI0951 NTHI0952 rplN rplX TRUE 0.998 11.000 0.810 0.035 Y NA
 859028 859029 NTHI0952 NTHI0953 rplX rplE TRUE 0.997 18.000 0.758 0.026 Y NA
 859029 859030 NTHI0953 NTHI0954 rplE rpsN TRUE 0.997 12.000 0.496 0.026 Y NA
 859030 859031 NTHI0954 NTHI0955 rpsN rpsH TRUE 0.987 37.000 0.473 0.026 Y NA
 859031 859032 NTHI0955 NTHI0956 rpsH rplF TRUE 0.998 16.000 0.808 0.026 Y NA
 859032 859033 NTHI0956 NTHI0957 rplF rplR TRUE 0.998 14.000 0.815 0.026 Y NA
 859033 859034 NTHI0957 NTHI0958 rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.035 Y NA
 859034 859035 NTHI0958 NTHI0959 rpsE rpmD TRUE 0.998 7.000 0.789 0.035 Y NA
 859035 859036 NTHI0959 NTHI0960 rpmD rplO TRUE 0.998 4.000 0.653 0.004 Y NA
 859036 859037 NTHI0960 NTHI0961 rplO secY TRUE 0.995 8.000 0.730 1.000 N NA
 859037 859038 NTHI0961 NTHI0962 secY rpsM FALSE 0.035 282.000 0.011 1.000 N NA
 859038 859039 NTHI0962 NTHI0963 rpsM rpsK TRUE 0.998 16.000 0.810 0.026 Y NA
 859039 859040 NTHI0963 NTHI0964 rpsK rpsD TRUE 0.992 28.000 0.509 0.035 Y NA
 859040 859041 NTHI0964 NTHI0965 rpsD rpoA TRUE 0.975 32.000 0.549 1.000 N NA
 859041 859042 NTHI0965 NTHI0966 rpoA rplQ TRUE 0.977 41.000 0.873 1.000 N NA
 859043 859044 NTHI0967 NTHI0968     FALSE 0.137 119.000 0.000 NA   NA
 859046 859047 NTHI0971 NTHI0972 dxr frr FALSE 0.395 110.000 0.032 1.000 N NA
 859047 859048 NTHI0972 NTHI0973 frr pckA FALSE 0.024 152.000 0.000 1.000 N NA
 859048 859049 NTHI0973 NTHI0974 pckA hslO FALSE 0.190 173.000 0.048 1.000 N NA
 859049 859050 NTHI0974 NTHI0975 hslO argH FALSE 0.027 145.000 0.000 1.000 N NA
 859050 859051 NTHI0975 NTHI0976 argH galU FALSE 0.032 135.000 0.000 1.000 N NA
 859051 859052 NTHI0976 NTHI0977 galU csrA TRUE 0.966 22.000 0.200 1.000 N NA
 859052 859053 NTHI0977 NTHI0978 csrA alaS FALSE 0.379 78.000 0.010 1.000 N NA
 859053 859054 NTHI0978 NTHI0979 alaS uspA FALSE 0.067 187.000 0.006 1.000 N NA
 859054 859055 NTHI0979 NTHI0980 uspA pepP FALSE 0.068 102.000 0.000 1.000 N NA
 859055 859056 NTHI0980 NTHI0981 pepP   TRUE 0.972 12.000 0.066 NA   NA
 859056 859057 NTHI0981 NTHI0982   galM FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 859057 859058 NTHI0982 NTHI0983 galM galK TRUE 0.991 7.000 0.083 0.003 Y NA
 859058 859059 NTHI0983 NTHI0984 galK galT TRUE 0.973 35.000 0.370 0.003 N NA
 859060 859061 NTHI0986 NTHI0987 galR mglB TRUE 0.654 91.000 0.091 NA N NA
 859061 859062 NTHI0987 NTHI0988 mglB mglA TRUE 0.911 66.000 0.139 NA Y NA
 859062 859063 NTHI0988 NTHI0989 mglA mglC TRUE 0.997 17.000 0.905 1.000 Y NA
 859063 859064 NTHI0989 NTHI0990 mglC   FALSE 0.077 146.000 0.000 NA   NA
 859064 859065 NTHI0990 NTHI0991   ispZ TRUE 0.958 6.000 0.024 NA   NA
 859065 859066 NTHI0991 NTHI0992 ispZ   TRUE 0.982 0.000 0.167 NA N NA
 859066 859067 NTHI0992 NTHI0994     TRUE 0.971 17.000 0.114 NA   NA
 859067 859068 NTHI0994 NTHI0995   slt TRUE 0.919 16.000 0.012 NA   NA
 859068 859069 NTHI0995 NTHI0996 slt trpR TRUE 0.918 38.000 0.167 1.000 N NA
 859069 859070 NTHI0996 NTHI0997 trpR mtgA TRUE 0.868 -13.000 0.025 1.000   NA
 859071 859072 NTHI0998 NTHI0999 frdD frdC TRUE 0.998 13.000 0.787 0.002 Y NA
 859072 859073 NTHI0999 NTHI1000 frdC frdB TRUE 0.997 11.000 0.454 0.002 Y NA
 859073 859074 NTHI1000 NTHI1002 frdB frdA TRUE 0.995 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 859076 859077 NTHI1004 NTHI1005 cpxR smpA TRUE 0.622 54.000 0.029 1.000 N NA
 859077 859078 NTHI1005 NTHI1006 smpA ndpA TRUE 0.721 66.000 0.049 NA   NA
 859079 859080 NTHI1007 NTHI1008     TRUE 0.986 2.000 0.133 NA   NA
 859080 859081 NTHI1008 NTHI1009     FALSE 0.036 198.000 0.000 NA   NA
 859083 859084 NTHI1011 NTHI1012   dsbA TRUE 0.989 11.000 0.196 NA   NA
 859084 859085 NTHI1012 NTHI1013 dsbA   TRUE 0.836 62.000 0.119 NA   NA
 859085 859086 NTHI1013 NTHI1014   trmA FALSE 0.359 144.000 0.049 NA   NA
 859086 859087 NTHI1014 NTHI1015 trmA   FALSE 0.170 189.000 0.030 NA   NA
 859087 859088 NTHI1015 NTHI1016     TRUE 0.702 -6.000 0.000 NA   NA
 859088 859089 NTHI1016 NTHI1019   mobB FALSE 0.034 401.000 0.022 NA N NA
 859089 859090 NTHI1019 NTHI1020 mobB   TRUE 0.951 -3.000 0.059 1.000   NA
 859090 859091 NTHI1020 NTHI1021   hbpA FALSE 0.396 141.000 0.067 1.000   NA
 859091 859092 NTHI1021 NTHI1022 hbpA   FALSE 0.017 176.000 0.000 1.000 N NA
 859093 859094 NTHI1023 NTHI1024   polA TRUE 0.791 15.000 0.000 NA   NA
 859095 859096 NTHI1025 NTHI1027     FALSE 0.072 323.000 0.034 NA   NA
 859096 859097 NTHI1027 NTHI1028   clpB FALSE 0.037 128.000 0.000 1.000 N NA
 859098 859099 NTHI1029 NTHI1030   vacB TRUE 0.872 56.000 0.147 0.031 N NA
 859099 859100 NTHI1030 NTHI1031 vacB   FALSE 0.038 192.000 0.000 NA   NA
 859102 859103 NTHI1033 NTHI1034 typA lic3A2 FALSE 0.229 127.000 0.002 NA   NA
 859104 859105 NTHI1036 NTHI1037 glnA rmlB FALSE 0.083 87.000 0.000 1.000 N NA
 859105 859106 NTHI1037 NTHI1038 rmlB pepB FALSE 0.094 77.000 0.000 1.000 N NA
 859106 859107 NTHI1038 NTHI1039 pepB ndk TRUE 0.926 7.000 0.017 1.000 N NA
 859108 859109 NTHI1040 NTHI1041 obgE   TRUE 0.553 28.000 0.000 1.000   NA
 859109 859110 NTHI1041 NTHI1042   rpmA FALSE 0.091 80.000 0.000 1.000 N NA
 859110 859111 NTHI1042 NTHI1043 rpmA rplU TRUE 0.996 21.000 0.667 0.026 Y NA
 859112 859113 NTHI1044 NTHI1045 ispB   TRUE 0.670 51.000 0.014 NA   NA
 859114 859115 NTHI1046 NTHI1047   arcA FALSE 0.004 400.000 0.000 1.000 N NA
 859116 859117 NTHI1048 NTHI1049 dipZ   FALSE 0.396 117.000 0.024 1.000   NA
 859117 859118 NTHI1049 NTHI1051   purH FALSE 0.078 189.000 0.000 0.001   NA
 859118 859119 NTHI1051 NTHI1052 purH purD TRUE 0.899 96.000 0.238 1.000 Y NA
 859119 859120 NTHI1052 NTHI1053 purD   FALSE 0.067 156.000 0.000 NA   NA
 859120 859121 NTHI1053 NTHI1054   glyA FALSE 0.121 123.000 0.000 NA   NA
 859121 859122 NTHI1054 NTHI1055 glyA coaE FALSE 0.131 59.000 0.000 1.000 N NA
 859122 859123 NTHI1055 NTHI1056 coaE   TRUE 0.906 -7.000 0.033 1.000   NA
 859123 859124 NTHI1056 NTHI1057   rhlB FALSE 0.140 109.000 0.000 1.000   NA
 859124 859125 NTHI1057 NTHI1058 rhlB   FALSE 0.061 242.000 0.000 1.000 Y NA
 859125 859126 NTHI1058 NTHI1059     TRUE 0.924 32.000 0.138 1.000 N NA
 859126 859127 NTHI1059 NTHI1060     TRUE 0.995 0.000 0.900 NA N NA
 859127 859128 NTHI1060 NTHI1061     FALSE 0.005 535.000 0.000 NA N NA
 859129 859130 NTHI1062 NTHI1063 emrB emrA TRUE 0.997 10.000 1.000 1.000   NA
 859130 859131 NTHI1063 NTHI1065 emrA folA FALSE 0.018 173.000 0.000 1.000 N NA
 859132 859133 NTHI1066 NTHI1068 proB nudH FALSE 0.090 81.000 0.000 1.000 N NA
 859133 859134 NTHI1068 NTHI1069 nudH   TRUE 0.945 0.000 0.024 1.000   NA
 859134 859135 NTHI1069 NTHI1071   lgt TRUE 0.963 9.000 0.038 1.000   NA
 859135 859136 NTHI1071 NTHI1072 lgt thyA TRUE 0.982 10.000 0.164 1.000 N NA
 859136 859137 NTHI1072 NTHI1073 thyA   TRUE 0.960 0.000 0.007 1.000 Y NA
 859139 859140 NTHI1075 NTHI1076   secA FALSE 0.390 125.000 0.031 NA   NA
 859140 859141 NTHI1076 NTHI1077 secA mutT TRUE 0.829 65.000 0.168 1.000 N NA
 859141 859142 NTHI1077 NTHI1078 mutT kefB FALSE 0.062 109.000 0.000 1.000 N NA
 859142 859143 NTHI1078 NTHI1079 kefB   FALSE 0.069 101.000 0.000 1.000 N NA
 859143 859144 NTHI1079 NTHI1080   rpsB FALSE 0.016 178.000 0.000 1.000 N NA
 859144 859145 NTHI1080 NTHI1081 rpsB tsf TRUE 0.903 134.000 0.748 1.000 Y NA
 859146 859147 NTHI1082 NTHI1083 lpxD omp26 TRUE 0.998 13.000 0.814 1.000 Y NA
 859147 859148 NTHI1083 NTHI1084 omp26   TRUE 0.912 108.000 0.354 1.000 Y NA
 859148 859149 NTHI1084 NTHI1085     TRUE 0.987 20.000 0.204 1.000 Y NA
 859149 859150 NTHI1085 NTHI1087   cdsA TRUE 0.966 10.000 0.080 1.000 N NA
 859150 859151 NTHI1087 NTHI1088 cdsA uppS TRUE 0.993 18.000 0.400 1.000 Y NA
 859152 859153 NTHI1090 NTHI1091 leuS   TRUE 0.893 50.000 0.182 NA N NA
 859153 859154 NTHI1091 NTHI1092   holA TRUE 0.984 0.000 0.199 NA N NA
 859155 859156 NTHIT0046 NTHI1093   glyS FALSE 0.220 86.000 0.000 NA   NA
 859156 859157 NTHI1093 NTHI1094 glyS   FALSE 0.419 46.000 0.000 NA   NA
 859157 859158 NTHI1094 NTHI1095     FALSE 0.088 140.000 0.000 NA   NA
 859158 859159 NTHI1095 NTHI1097     TRUE 0.572 30.000 0.000 NA   NA
 859159 859160 NTHI1097 NTHI1098   glyQ FALSE 0.471 59.000 0.006 NA N NA
 859162 859163 NTHI1100 NTHI1101     TRUE 0.992 1.000 0.286 NA   NA
 859163 859164 NTHI1101 NTHI1102     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 859164 859165 NTHI1102 NTHI1103   eno FALSE 0.368 51.000 0.000 NA   NA
 859165 859166 NTHI1103 NTHI1104 eno   FALSE 0.109 121.000 0.000 1.000   NA
 859166 859167 NTHI1104 NTHI1105   nrfF TRUE 0.901 -3.000 0.013 1.000   NA
 859167 859168 NTHI1105 NTHI1106 nrfF dsbE2 TRUE 0.982 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 859168 859169 NTHI1106 NTHI1107 dsbE2 nrfE TRUE 0.997 0.000 0.375 0.006 Y NA
 859169 859170 NTHI1107 NTHI1108 nrfE suhB FALSE 0.062 109.000 0.000 1.000 N NA
 859171 859172 NTHI1109 NTHI1110     TRUE 0.997 0.000 0.500 NA Y NA
 859172 859173 NTHI1110 NTHI1111     TRUE 0.992 -3.000 0.545 NA   NA
 859173 859174 NTHI1111 NTHI1112     TRUE 0.997 5.000 1.000 NA   NA
 859174 859175 NTHI1112 NTHI1113   recC TRUE 0.799 46.000 0.038 NA   NA
 859175 859176 NTHI1113 NTHI1114 recC   FALSE 0.193 55.000 0.000 NA N NA
 859176 859177 NTHI1114 NTHI1115   ribD TRUE 0.990 3.000 0.277 NA N NA
 859177 859178 NTHI1115 NTHI1116 ribD degS TRUE 0.899 1.000 0.008 1.000 N NA
 859179 859180 NTHI1118 NTHI1119 mutM ddc FALSE 0.009 232.000 0.000 1.000 N NA
 859180 859181 NTHI1119 NTHI1120 ddc   TRUE 0.698 20.000 0.000 NA   NA
 859181 859182 NTHI1120 NTHI1121     TRUE 0.996 0.000 0.727 NA   NA
 859182 859183 NTHI1121 NTHI1122   dat FALSE 0.076 147.000 0.000 NA   NA
 859183 859184 NTHI1122 NTHI1123 dat rpmG FALSE 0.005 347.000 0.000 1.000 N NA
 859184 859185 NTHI1123 NTHI1124 rpmG rpmB TRUE 0.997 12.000 0.332 0.026 Y NA
 859185 859186 NTHI1124 NTHI1125 rpmB radC FALSE 0.043 214.000 0.002 1.000 N NA
 859187 859188 NTHI1126 NTHI1127 dfp dut TRUE 0.904 48.000 0.201 1.000 N NA
 859188 859189 NTHI1127 NTHI1128 dut slmA TRUE 0.964 4.000 0.060 1.000 N NA
 859189 859190 NTHI1128 NTHI1129 slmA   TRUE 0.935 22.000 0.058 NA   NA
 859190 859191 NTHI1129 NTHI1130   crp TRUE 0.933 -15.000 0.087 NA   NA
 859192 859193 NTHI1131 NTHI1132 rumB nagZ TRUE 0.842 -7.000 0.019 1.000 N NA
 859193 859194 NTHI1132 NTHI1133 nagZ   TRUE 0.952 4.000 0.022 1.000   NA
 859194 859195 NTHI1133 NTHI1134     TRUE 0.962 0.000 0.051 1.000   NA
 859195 859196 NTHI1134 NTHI1135   ileS FALSE 0.098 75.000 0.000 1.000 N NA
 859196 859197 NTHI1135 NTHI1136 ileS ribF TRUE 0.960 29.000 0.254 1.000 N NA
 859197 859198 NTHI1136 NTHI1137 ribF mviN TRUE 0.961 35.000 0.169 0.001   NA
 859201 859202 NTHI1141 NTHI1142 menB menC TRUE 0.691 170.000 0.171 0.003 Y NA
 859202 859203 NTHI1142 NTHI1143 menC aroQ FALSE 0.461 57.000 0.008 1.000 N NA
 859203 859204 NTHI1143 NTHI1144 aroQ accB TRUE 0.554 154.000 0.254 1.000 N NA
 859204 859205 NTHI1144 NTHI1145 accB accC TRUE 0.753 177.000 0.275 0.001 Y NA
 859205 859206 NTHI1145 NTHI1146 accC   FALSE 0.322 205.000 0.103 0.004   NA
 859206 859207 NTHI1146 NTHI1147   panF TRUE 0.993 -3.000 0.682 1.000   NA
 859207 859208 NTHI1147 NTHI1148 panF   FALSE 0.109 121.000 0.000 1.000   NA
 859208 859209 NTHI1148 NTHI1149   prmA FALSE 0.466 35.000 0.000 1.000   NA
 859209 859210 NTHI1149 NTHI1151 prmA dusB FALSE 0.457 147.000 0.042 1.000 Y NA
 859210 859211 NTHI1151 NTHI1152 dusB fis TRUE 0.964 -6.000 0.161 1.000 N NA
 859212 859213 NTHI1153 NTHI1154 smpB pfkA FALSE 0.008 239.000 0.000 1.000 N NA
 859213 859214 NTHI1154 NTHI1155 pfkA   FALSE 0.332 96.000 0.000 0.001   NA
 859214 859215 NTHI1155 NTHI1156     TRUE 0.889 -7.000 0.017 NA   NA
 859215 859216 NTHI1156 NTHI1157   smf TRUE 0.572 -22.000 0.000 NA   NA
 859217 859218 NTHI1160 NTHI1161 leuA leuB TRUE 0.671 163.000 0.126 0.002 Y NA
 859218 859219 NTHI1161 NTHI1162 leuB leuC TRUE 0.747 177.000 0.275 0.002 Y NA
 859219 859220 NTHI1162 NTHI1163 leuC leuD TRUE 0.992 25.000 0.309 0.001 Y NA
 859221 859222 NTHI1164 NTHI1165 iga1 recF FALSE 0.023 227.000 0.000 1.000   NA
 859222 859223 NTHI1165 NTHI1166 recF dnaN TRUE 0.996 2.000 0.318 1.000 Y NA
 859223 859224 NTHI1166 NTHI1167 dnaN dnaA TRUE 0.656 193.000 0.328 1.000 Y NA
 859224 859225 NTHI1167 NTHI1168 dnaA tbp1 FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000   NA
 859225 859226 NTHI1168 NTHI1169 tbp1 tbp2 TRUE 0.973 45.000 0.667 1.000   NA
 859227 859228 NTHI1171 NTHI1172   rpmH FALSE 0.040 176.000 0.000 1.000   NA
 859228 859229 NTHI1172 NTHI1173 rpmH rnpA TRUE 0.996 13.000 0.787 1.000   NA
 859229 859230 NTHI1173 NTHI1174 rnpA   TRUE 0.982 -36.000 0.540 NA   NA
 859230 859231 NTHI1174 NTHI1175   yidC TRUE 0.994 0.000 0.461 NA   NA
 859231 859232 NTHI1175 NTHI1178 yidC trmE FALSE 0.189 871.000 0.221 0.071   NA
 859232 859233 NTHI1178 NTHI1179 trmE ppiD FALSE 0.033 189.000 0.000 1.000   NA
 859233 859234 NTHI1179 NTHI1180 ppiD   FALSE 0.182 88.000 0.000 1.000   NA
 859234 859235 NTHI1180 NTHI1181   lspA FALSE 0.232 70.000 0.000 1.000   NA
 859235 859236 NTHI1181 NTHI1182 lspA ispH TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 859236 859237 NTHI1182 NTHI1183 ispH   FALSE 0.128 169.000 0.006 1.000   NA
 859237 859238 NTHI1183 NTHI1185   tbpA FALSE 0.019 247.000 0.000 1.000   NA
 859238 859239 NTHI1185 NTHI1186 tbpA thiP TRUE 0.996 5.000 0.697 0.051 N NA
 859239 859240 NTHI1186 NTHI1187 thiP thiQ TRUE 0.982 -22.000 0.522 0.023 N NA
 859240 859241 NTHI1187 NTHI1188 thiQ bioB FALSE 0.510 113.000 0.009 1.000 Y NA
 859243 859244 NTHI1192 NTHI1194 serB   TRUE 0.902 18.000 0.014 NA   NA
 859244 859245 NTHI1194 NTHI1195   corA FALSE 0.016 296.000 0.000 NA   NA
 859245 859246 NTHI1195 NTHI1196 corA   TRUE 0.939 -9.000 0.058 0.070   NA
 859247 859248 NTHI1197 NTHI1198     FALSE 0.066 157.000 0.000 NA   NA
 859250 859251 NTHI1201 NTHI1203     FALSE 0.011 468.000 0.000 NA   NA
 859251 859252 NTHI1203 NTHI1204     TRUE 0.994 0.000 0.375 0.037   NA
 859252 859253 NTHI1204 NTHI1205   dmsC TRUE 0.906 112.000 0.750 1.000   NA
 859253 859254 NTHI1205 NTHI1206 dmsC dmsB TRUE 0.997 2.000 0.833 1.000   NA
 859254 859255 NTHI1206 NTHI1207 dmsB dmsA TRUE 0.994 11.000 0.172 0.037 Y NA
 859256 859257 NTHI1208 NTHI1209     TRUE 0.885 44.000 0.092 NA   NA
 859257 859258 NTHI1209 NTHI1211     TRUE 0.993 9.000 0.300 NA   NA
 859259 859260 NTHI1212 NTHI1213     TRUE 0.560 79.000 0.044 1.000 N NA
 859262 859263 NTHI1215 NTHI1216   res TRUE 0.841 6.000 0.000 NA   NA
 859263 859264 NTHI1216 NTHI1217 res mod TRUE 0.639 -10.000 0.000 NA   NA
 859264 859265 NTHI1217 NTHI1219 mod rnhB FALSE 0.030 216.000 0.000 NA   NA
 859265 859266 NTHI1219 NTHI1220 rnhB lpxB TRUE 0.964 -7.000 0.186 1.000 N NA
 859266 859267 NTHI1220 NTHI1222 lpxB lpxA TRUE 0.943 67.000 0.289 1.000 Y NA
 859267 859268 NTHI1222 NTHI1223 lpxA fabZ TRUE 0.995 14.000 0.850 1.000 N NA
 859268 859269 NTHI1223 NTHI1224 fabZ   FALSE 0.208 76.000 0.000 1.000   NA
 859271 859272 NTHI1226 NTHI1227 nrfD nrfC TRUE 0.995 -3.000 0.927 0.002 N NA
 859272 859273 NTHI1227 NTHI1229 nrfC nrfB TRUE 0.988 -3.000 0.220 0.002   NA
 859273 859274 NTHI1229 NTHI1230 nrfB nrfA TRUE 0.986 44.000 1.000 0.002   NA
 859274 859275 NTHI1230 NTHI1231 nrfA hrpA FALSE 0.021 162.000 0.000 1.000 N NA
 859275 859276 NTHI1231 NTHI1232 hrpA   FALSE 0.519 69.000 0.011 1.000   NA
 859276 859277 NTHI1232 NTHI1233     TRUE 0.940 1.000 0.011 NA   NA
 859277 859278 NTHI1233 NTHI1235   cyoB FALSE 0.020 266.000 0.000 NA   NA
 859278 859279 NTHI1235 NTHI1236 cyoB cyoA TRUE 0.998 15.000 0.714 0.037 Y NA
 859281 859282 NTHI1240 NTHI1241 pnuC   FALSE 0.015 182.000 0.000 1.000 N NA
 859282 859283 NTHI1241 NTHI1242     TRUE 0.997 4.000 0.481 1.000 Y NA
 859283 859284 NTHI1242 NTHI1243     TRUE 0.995 23.000 0.594 0.034 Y NA
 859284 859285 NTHI1243 NTHI1244   murA FALSE 0.005 301.000 0.000 1.000 N NA
 859285 859286 NTHI1244 NTHI1245 murA   TRUE 0.988 11.000 0.258 1.000 N NA
 859286 859287 NTHI1245 NTHI1246     TRUE 0.987 21.000 0.453 NA   NA
 859287 859288 NTHI1246 NTHI1247     TRUE 0.992 11.000 0.308 NA   NA
 859288 859289 NTHI1247 NTHI1248     TRUE 0.954 33.000 0.188 NA   NA
 859289 859290 NTHI1248 NTHI1249     TRUE 0.995 10.000 0.562 NA   NA
 859290 859291 NTHI1249 NTHI1250     TRUE 0.995 -3.000 0.530 NA Y NA
 859291 859292 NTHI1250 NTHI1251   sodA FALSE 0.004 406.000 0.000 1.000 N NA
 859293 859294 NTHI1253 NTHI1254 ccmA ccmB TRUE 0.998 5.000 0.503 0.006 Y NA
 859294 859295 NTHI1254 NTHI1255 ccmB ccmC TRUE 0.976 61.000 0.501 0.002 Y NA
 859295 859296 NTHI1255 NTHI1256 ccmC ccmD TRUE 0.961 43.000 0.501 1.000 N NA
 859296 859297 NTHI1256 NTHI1257 ccmD ccmE TRUE 0.985 -3.000 0.344 1.000 N NA
 859297 859298 NTHI1257 NTHI1258 ccmE ccmF TRUE 0.993 -3.000 0.211 0.006 Y NA
 859298 859299 NTHI1258 NTHI1259 ccmF dsbE TRUE 0.920 143.000 0.804 0.006 Y NA
 859299 859300 NTHI1259 NTHI1260 dsbE ccmH TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 859300 859301 NTHI1260 NTHI1262 ccmH   FALSE 0.131 121.000 0.000 NA   NA
 859301 859302 NTHI1262 NTHI1263     TRUE 0.837 2.000 0.000 NA   NA
 859303 859304 NTHI1265 NTHI1266 ligA zipA TRUE 0.584 112.000 0.106 1.000 N NA
 859305 859306 NTHI1268 NTHI1269 cysZ cysK TRUE 0.828 99.000 0.122 1.000 Y NA
 859306 859307 NTHI1269 NTHI1270 cysK   FALSE 0.022 248.000 0.000 NA   NA
 859308 859309 NTHI1272 NTHI1273 rfaF xylR FALSE 0.096 76.000 0.000 1.000 N NA
 859309 859310 NTHI1273 NTHI1274 xylR   FALSE 0.412 112.000 0.039 1.000 N NA
 859310 859311 NTHI1274 NTHI1275   aspC2 TRUE 0.989 2.000 0.269 1.000 N NA
 859312 859313 NTHI1276 NTHI1277 xylA xylB TRUE 0.988 3.000 0.091 1.000 Y NA
 859314 859315 NTHI1278 NTHI1279 rfaD   FALSE 0.151 53.000 0.000 1.000 N NA
 859317 859318 NTHI1282 NTHI1283 comM engB FALSE 0.312 115.000 0.008 1.000   NA
 859320 859321 NTHI1286 NTHI1287 oppF oppD TRUE 0.996 -3.000 0.420 0.003 Y NA
 859321 859322 NTHI1287 NTHI1288 oppD oppC TRUE 0.997 10.000 0.554 1.000 Y NA
 859322 859323 NTHI1288 NTHI1289 oppC oppB TRUE 0.998 10.000 0.870 0.034 Y NA
 859323 859324 NTHI1289 NTHI1292 oppB oppA TRUE 0.785 81.000 0.034 0.034 Y NA
 859325 859326 NTHI1293 NTHI1295 talB   FALSE 0.003 1061.000 0.000 1.000 N NA
 859326 859327 NTHI1295 NTHI1296   mraZ FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 859327 859328 NTHI1296 NTHI1297 mraZ mraW TRUE 0.984 31.000 0.635 NA   NA
 859328 859329 NTHI1297 NTHI1298 mraW ftsL TRUE 0.988 3.000 0.227 1.000 N NA
 859329 859330 NTHI1298 NTHI1299 ftsL ftsI TRUE 0.947 13.000 0.044 1.000 N NA
 859330 859331 NTHI1299 NTHI1300 ftsI murE TRUE 0.974 10.000 0.022 1.000 Y NA
 859331 859332 NTHI1300 NTHI1301 murE murF TRUE 0.998 14.000 0.569 0.004 Y NA
 859332 859333 NTHI1301 NTHI1302 murF mraY TRUE 0.993 -6.000 0.309 0.008 Y NA
 859333 859334 NTHI1302 NTHI1303 mraY murD TRUE 0.952 112.000 0.647 0.008 Y NA
 859334 859335 NTHI1303 NTHI1304 murD ftsW TRUE 0.981 23.000 0.297 0.006 N NA
 859335 859336 NTHI1304 NTHI1305 ftsW murG TRUE 0.994 12.000 0.647 1.000 N NA
 859336 859337 NTHI1305 NTHI1307 murG murC TRUE 0.802 138.000 0.283 1.000 Y NA
 859337 859338 NTHI1307 NTHI1308 murC ddl TRUE 0.927 69.000 0.153 0.008 Y NA
 859338 859339 NTHI1308 NTHI1309 ddl ftsQ TRUE 0.996 0.000 0.372 NA Y NA
 859339 859340 NTHI1309 NTHI1310 ftsQ ftsA TRUE 0.985 19.000 0.389 NA N NA
 859340 859341 NTHI1310 NTHI1311 ftsA ftsZ TRUE 0.946 84.000 0.460 1.000 Y NA
 859341 859342 NTHI1311 NTHI1312 ftsZ lpxC TRUE 0.900 39.000 0.134 1.000 N NA
 859342 859343 NTHI1312 NTHI1313 lpxC pheA FALSE 0.159 127.000 0.005 1.000 N NA
 859344 859345 NTHI1314 NTHI1315   ptsN TRUE 0.979 18.000 0.186 NA   NA
 859345 859346 NTHI1315 NTHI1316 ptsN   TRUE 0.946 3.000 0.017 1.000   NA
 859346 859347 NTHI1316 NTHI1317     TRUE 0.996 4.000 0.543 NA   NA
 859347 859348 NTHI1317 NTHI1318     TRUE 0.981 -19.000 0.459 NA   NA
 859348 859349 NTHI1318 NTHI1319     FALSE 0.379 50.000 0.000 NA   NA
 859350 859351 NTHI1320 NTHI1321 pmbA hpt FALSE 0.033 375.000 0.004 NA   NA
 859351 859352 NTHI1321 NTHI1323 hpt   FALSE 0.013 306.000 0.000 1.000   NA
 859353 859354 NTHI1324 NTHI1325 nrdG cydC FALSE 0.056 248.000 0.000 1.000 Y NA
 859354 859355 NTHI1325 NTHI1326 cydC cydD TRUE 0.998 0.000 0.631 0.007 Y NA
 859355 859356 NTHI1326 NTHI1327 cydD trxB TRUE 0.797 72.000 0.049 1.000 Y NA
 859356 859357 NTHI1327 NTHI1328 trxB   TRUE 0.682 74.000 0.012 1.000 Y NA
 859357 859358 NTHI1328 NTHI1329   hemH FALSE 0.093 79.000 0.000 1.000 N NA
 859358 859359 NTHI1329 NTHI1330 hemH   TRUE 0.963 -3.000 0.111 NA N NA
 859359 859360 NTHI1330 NTHI1331     TRUE 0.962 14.000 0.076 NA N NA
 859361 859362 NTHI1332 NTHI1333 ompP5   FALSE 0.057 112.000 0.000 1.000 N NA
 859363 859364 NTHI1334 NTHI1335   serC TRUE 0.737 88.000 0.020 0.014 Y NA
 859366 859367 NTHI1337 NTHI1338     TRUE 0.993 0.000 0.219 1.000 Y NA
 859368 859369 NTHI1339 NTHI1340 trpG2 metK FALSE 0.428 85.000 0.000 1.000 Y NA
 859369 859370 NTHI1340 NTHI1341 metK sprT FALSE 0.071 295.000 0.030 1.000   NA
 859370 859371 NTHI1341 NTHI1342 sprT opa TRUE 0.647 51.000 0.014 1.000   NA
 859372 859373 NTHI1344 NTHI1345   artM FALSE 0.032 207.000 0.000 NA   NA
 859373 859374 NTHI1345 NTHI1346 artM artQ TRUE 0.998 0.000 0.714 0.022 Y NA
 859374 859375 NTHI1346 NTHI1347 artQ artI TRUE 0.996 4.000 0.273 0.034 Y NA
 859375 859376 NTHI1347 NTHI1348 artI artP TRUE 0.992 18.000 0.339 1.000 Y NA
 859376 859377 NTHI1348 NTHI1350 artP gmhA FALSE 0.288 126.000 0.030 1.000 N NA
 859379 859380 NTHI1353 NTHI1354 dppF dppD TRUE 0.998 3.000 0.500 0.003 Y NA
 859380 859381 NTHI1354 NTHI1355 dppD dppC TRUE 0.997 10.000 0.560 1.000 Y NA
 859381 859382 NTHI1355 NTHI1357 dppC dppB TRUE 0.998 15.000 0.779 0.034 Y NA
 859382 859383 NTHI1357 NTHI1359 dppB uvrD FALSE 0.080 90.000 0.000 1.000 N NA
 859383 859384 NTHI1359 NTHI1360 uvrD   FALSE 0.003 607.000 0.000 1.000 N NA
 859384 859385 NTHI1360 NTHI1361     TRUE 0.947 1.000 0.037 1.000 N NA
 859385 859386 NTHI1361 NTHI1362     TRUE 0.934 -7.000 0.062 1.000   NA
 859389 859390 NTHI1365 NTHI1366 gcvA   TRUE 0.932 -7.000 0.051 NA   NA
 859390 859391 NTHI1366 NTHI1367   sucC FALSE 0.506 36.000 0.000 NA   NA
 859391 859392 NTHI1367 NTHI1368 sucC sucD TRUE 0.998 0.000 0.806 0.001 Y NA
 859392 859393 NTHI1368 NTHI1369 sucD   FALSE 0.067 121.000 0.000 NA N NA
 859393 859394 NTHI1369 NTHI1370   rluB TRUE 0.909 48.000 0.075 NA Y NA
 859394 859395 NTHI1370 NTHI1371 rluB cysB TRUE 0.934 11.000 0.026 1.000 N NA
 859398 859399 NTHI1374 NTHI1375 pta ackA TRUE 0.946 68.000 0.634 1.000   NA
 859400 859401 NTHI1376 NTHI1377   cvpA FALSE 0.457 87.000 0.009 NA   NA
 859401 859402 NTHI1377 NTHI1378 cvpA purF TRUE 0.990 11.000 0.262 1.000   NA
 859403 859404 NTHI1379 NTHI1380 sulA argR TRUE 0.979 0.000 0.118 1.000   NA
 859406 859407 NTHI1382 NTHI1383 lysS prfB TRUE 0.856 112.000 0.162 0.062 Y NA
 859408 859409 NTHI1384 NTHI1385 dsbC recJ FALSE 0.094 288.000 0.082 1.000 N NA
 859409 859410 NTHI1385 NTHI1387 recJ   TRUE 0.845 -7.000 0.007 1.000   NA
 859410 859411 NTHI1387 NTHI1389   mtnA TRUE 0.925 -3.000 0.025 1.000   NA
 859412 859413 NTHI1390 NTHI1391 hup   FALSE 0.005 300.000 0.000 1.000 N NA
 859417 859418 NTHI1396 NTHI1397 sapZ sapF TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000   NA
 859418 859419 NTHI1397 NTHI1398 sapF sapD TRUE 0.998 0.000 0.684 0.014 Y NA
 859419 859420 NTHI1398 NTHI1399 sapD sapC TRUE 0.998 4.000 0.667 1.000 Y NA
 859420 859421 NTHI1399 NTHI1400 sapC sapB TRUE 0.977 -10.000 0.111 0.034 Y NA
 859421 859422 NTHI1400 NTHI1401 sapB sapA TRUE 0.977 0.000 0.103 0.034 N NA
 859424 859425 NTHI1403 NTHI1404 ppc purR FALSE 0.015 183.000 0.000 1.000 N NA
 859427 859428 NTHI1407 NTHI1408 purA   FALSE 0.201 129.000 0.002 1.000   NA
 859429 859430 NTHIT0047 NTHIT0048     TRUE 0.841 6.000 0.000 NA   NA
 859430 859431 NTHIT0048 NTHIT0049     TRUE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 859431 859432 NTHIT0049 NTHIT0050     FALSE 0.400 48.000 0.000 NA   NA
 859435 859436 NTHI1413 NTHI1414     TRUE 0.556 31.000 0.000 NA   NA
 859437 859438 NTHI1415 NTHI1416     TRUE 0.963 1.000 0.036 NA   NA
 859440 859441 NTHI1418 NTHI1419     TRUE 0.976 13.000 0.091 NA   NA
 859441 859442 NTHI1419 NTHI1420   cbiM TRUE 0.959 0.000 0.037 NA   NA
 859442 859443 NTHI1420 NTHI1421 cbiM   TRUE 0.990 0.000 0.100 0.004 Y NA
 859443 859444 NTHI1421 NTHI1422   cbiO TRUE 0.992 2.000 0.153 1.000 Y NA
 859445 859446 NTHI1423 NTHI1424 aspC purK FALSE 0.279 140.000 0.044 1.000 N NA
 859446 859447 NTHI1424 NTHI1425 purK purE TRUE 0.929 70.000 0.136 0.001 Y NA
 859448 859449 NTHI1426 NTHI1427 hicA hicB TRUE 0.990 -3.000 0.424 NA   NA
 859449 859450 NTHI1427 NTHI1428 hicB pepN FALSE 0.391 44.000 0.000 1.000   NA
 859452 859453 NTHI1430 NTHI1431 norM sfsA TRUE 0.838 9.000 0.000 NA   NA
 859453 859454 NTHI1431 NTHI1432 sfsA tyrS FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 859455 859456 NTHI1433 NTHI1434 prsA ispE TRUE 0.959 2.000 0.053 1.000 N NA
 859456 859457 NTHI1434 NTHI1435 ispE lolB TRUE 0.979 0.000 0.157 1.000 N NA
 859457 859458 NTHI1435 NTHI1436 lolB cca FALSE 0.457 63.000 0.011 1.000 N NA
 859458 859459 NTHI1436 NTHI1437 cca   TRUE 0.977 7.000 0.106 NA N NA
 859459 859460 NTHI1437 NTHI1438     TRUE 0.897 66.000 0.233 NA   NA
 859460 859461 NTHI1438 NTHI1439     TRUE 0.991 25.000 0.937 NA   NA
 859462 859463 NTHI1440 NTHI1441     TRUE 0.900 39.000 0.092 NA   NA
 859463 859464 NTHI1441 NTHI1443     TRUE 0.923 30.000 0.087 NA   NA
 859464 859465 NTHI1443 NTHI1444     TRUE 0.991 -10.000 0.914 NA   NA
 859465 859466 NTHI1444 NTHI1445     FALSE 0.009 1108.000 0.000 NA   NA
 859466 859467 NTHI1445 NTHI1446     FALSE 0.012 398.000 0.000 NA   NA
 859468 859469 NTHI1447 NTHI1448   hmw2C FALSE 0.039 190.000 0.000 NA   NA
 859469 859470 NTHI1448 NTHI1449 hmw2C hmw2B FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 859470 859471 NTHI1449 NTHI1450 hmw2B hmw2A FALSE 0.072 151.000 0.000 NA   NA
 859472 859473 NTHI1451 NTHI1453   radA FALSE 0.066 233.000 0.008 1.000   NA
 859473 859474 NTHI1453 NTHI1454 radA lrp FALSE 0.312 80.000 0.003 1.000 N NA
 859474 859475 NTHI1454 NTHI1455 lrp ftsK TRUE 0.991 2.000 0.345 1.000 N NA
 859475 859476 NTHI1455 NTHI1456 ftsK lolA TRUE 0.982 18.000 0.305 1.000 N NA
 859476 859477 NTHI1456 NTHI1458 lolA   TRUE 0.836 61.000 0.167 1.000 N NA
 859478 859479 NTHI1459 NTHI1460     TRUE 0.989 10.000 0.188 NA   NA
 859479 859480 NTHI1460 NTHI1462   aroA FALSE 0.007 255.000 0.000 1.000 N NA
 859480 859481 NTHI1462 NTHI1463 aroA purU TRUE 0.583 0.000 0.000 1.000 N NA
 859481 859482 NTHI1463 NTHI1464 purU hns TRUE 0.716 70.000 0.064 1.000   NA
 859483 859484 NTHI1465 NTHI1466     FALSE 0.239 68.000 0.000 1.000   NA
 859484 859485 NTHI1466 NTHI1468   ilvI FALSE 0.333 50.000 0.000 1.000   NA
 859485 859486 NTHI1468 NTHI1469 ilvI ilvH TRUE 0.997 0.000 0.371 0.002 Y NA
 859488 859489 NTHI1471 NTHI1472     TRUE 0.714 79.000 0.075 NA   NA
 859489 859490 NTHI1472 NTHI1473   pcp TRUE 0.985 23.000 0.417 NA   NA
 859491 859492 NTHI1474 NTHI1474_1 lgtD   FALSE 0.282 67.000 0.000 NA   NA
 859492 859493 NTHI1474_1 NTHI1475   pgi FALSE 0.251 74.000 0.000 NA   NA
 859493 859494 NTHI1475 NTHI1476 pgi alr FALSE 0.498 97.000 0.045 1.000 N NA
 859494 859495 NTHI1476 NTHI1477 alr dnaB TRUE 0.990 10.000 0.317 1.000 N NA
 859495 859496 NTHI1477 NTHI1479 dnaB pykA TRUE 0.591 34.000 0.000 0.001 N NA
 859497 859498 NTHIT0051 NTHI1480     FALSE 0.027 230.000 0.000 NA   NA
 859499 859500 NTHI1482 NTHI1483     FALSE 0.173 105.000 0.000 NA   NA
 859500 859501 NTHI1483 NTHI1484     TRUE 0.639 -10.000 0.000 NA   NA
 859501 859502 NTHI1484 NTHI1485     FALSE 0.261 72.000 0.000 NA   NA
 859502 859503 NTHI1485 NTHI1486     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 859503 859504 NTHI1486 NTHI1487     TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 859504 859505 NTHI1487 NTHI1488   rdgC FALSE 0.026 606.000 0.000 1.000 Y NA
 859505 859506 NTHI1488 NTHI1489 rdgC   FALSE 0.114 125.000 0.000 NA   NA
 859506 859507 NTHI1489 NTHI1490   ssb3 FALSE 0.299 62.000 0.000 NA   NA
 859507 859508 NTHI1490 NTHI1491 ssb3   TRUE 0.776 0.000 0.000 1.000   NA
 859508 859509 NTHI1491 NTHI1492     TRUE 0.981 -19.000 0.364 0.059   NA
 859509 859510 NTHI1492 NTHI1493     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 859510 859511 NTHI1493 NTHI1494     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859511 859512 NTHI1494 NTHI1495     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 859512 859513 NTHI1495 NTHI1497     FALSE 0.206 91.000 0.000 NA   NA
 859513 859514 NTHI1497 NTHI1498     TRUE 0.639 -10.000 0.000 NA   NA
 859514 859515 NTHI1498 NTHI1499     FALSE 0.137 119.000 0.000 NA   NA
 859515 859516 NTHI1499 NTHI1501     FALSE 0.012 386.000 0.000 NA   NA
 859516 859517 NTHI1501 NTHI1502     FALSE 0.062 161.000 0.000 NA   NA
 859517 859518 NTHI1502 NTHI1503     TRUE 0.824 11.000 0.000 NA   NA
 859518 859519 NTHI1503 NTHI1504     FALSE 0.296 63.000 0.000 NA   NA
 859519 859520 NTHI1504 NTHI1505     TRUE 0.837 2.000 0.000 NA   NA
 859521 859522 NTHI1507 NTHI1508     TRUE 0.955 31.000 0.176 NA   NA
 859523 859524 NTHI1509 NTHI1510     TRUE 0.991 5.000 0.211 NA   NA
 859524 859525 NTHI1510 NTHI1511     TRUE 0.989 -3.000 0.400 1.000   NA
 859525 859526 NTHI1511 NTHI1512     TRUE 0.605 -15.000 0.000 NA   NA
 859526 859527 NTHI1512 NTHI1513     TRUE 0.837 2.000 0.000 NA   NA
 859527 859528 NTHI1513 NTHI1515     FALSE 0.419 46.000 0.000 NA   NA
 859528 859529 NTHI1515 NTHI1516     FALSE 0.440 44.000 0.000 NA   NA
 859530 859531 NTHI1517 NTHI1518     FALSE 0.037 194.000 0.000 NA   NA
 859531 859532 NTHI1518 NTHI1519     TRUE 0.617 -13.000 0.000 NA   NA
 859532 859533 NTHI1519 NTHI1520     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859533 859534 NTHI1520 NTHI1521     TRUE 0.563 -25.000 0.000 NA   NA
 859534 859535 NTHI1521 NTHI1522     TRUE 0.838 9.000 0.000 NA   NA
 859535 859536 NTHI1522 NTHI1523     TRUE 0.580 -21.000 0.000 NA   NA
 859538 859539 NTHI1526 NTHI1527     TRUE 0.769 14.000 0.000 1.000   NA
 859539 859540 NTHI1527 NTHI1528     TRUE 0.837 2.000 0.000 NA   NA
 859540 859541 NTHI1528 NTHI1529     TRUE 0.952 -70.000 0.167 NA   NA
 859541 859542 NTHI1529 NTHI1530     TRUE 0.989 6.000 0.174 NA   NA
 859542 859543 NTHI1530 NTHI1531     TRUE 0.973 14.000 0.087 NA   NA
 859543 859544 NTHI1531 NTHI1532     TRUE 0.980 8.000 0.091 NA   NA
 859544 859545 NTHI1532 NTHI1533     TRUE 0.840 3.000 0.000 NA   NA
 859545 859546 NTHI1533 NTHI1534     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 859546 859547 NTHI1534 NTHI1535     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 859547 859548 NTHI1535 NTHI1536     TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 859548 859549 NTHI1536 NTHI1537     TRUE 0.997 2.000 1.000 NA   NA
 859549 859550 NTHI1537 NTHI1538     TRUE 0.973 -13.000 0.250 NA   NA
 859550 859551 NTHI1538 NTHI1539     TRUE 0.943 46.000 0.250 NA   NA
 859551 859552 NTHI1539 NTHI1540     TRUE 0.993 0.000 0.429 NA   NA
 859552 859553 NTHI1540 NTHI1541     FALSE 0.506 36.000 0.000 NA   NA
 859553 859554 NTHI1541 NTHI1542     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859556 859557 NTHI1544 NTHI1546     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 859557 859558 NTHI1546 NTHI1547     TRUE 0.987 -3.000 0.286 NA   NA
 859558 859559 NTHI1547 NTHI1548     TRUE 0.996 3.000 0.571 NA   NA
 859559 859560 NTHI1548 NTHI1549     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859560 859561 NTHI1549 NTHI1550     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 859561 859562 NTHI1550 NTHI1551     TRUE 0.838 9.000 0.000 NA   NA
 859562 859563 NTHI1551 NTHI1552     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 859563 859564 NTHI1552 NTHI1553     TRUE 0.997 12.000 1.000 NA   NA
 859564 859565 NTHI1553 NTHI1554     TRUE 0.983 -3.000 0.200 NA   NA
 859565 859566 NTHI1554 NTHI1555     FALSE 0.287 66.000 0.000 NA   NA
 859570 859571 NTHI1561 NTHI1562     FALSE 0.308 60.000 0.000 NA   NA
 859571 859572 NTHI1562 NTHI1563     FALSE 0.182 102.000 0.000 NA   NA
 859572 859573 NTHI1563 NTHI1564     TRUE 0.785 33.000 0.011 NA   NA
 859573 859574 NTHI1564 NTHI1565     FALSE 0.029 201.000 0.000 1.000   NA
 859574 859575 NTHI1565 NTHI1566     TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 859575 859576 NTHI1566 NTHI1567     TRUE 0.821 12.000 0.000 NA   NA
 859576 859577 NTHI1567 NTHI1568     TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 859577 859578 NTHI1568 NTHI1569     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 859578 859579 NTHI1569 NTHI1570     TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 859579 859580 NTHI1570 NTHI1571     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 859580 859581 NTHI1571 NTHI1572   prfA FALSE 0.015 276.000 0.000 1.000   NA
 859581 859582 NTHI1572 NTHI1573 prfA   TRUE 0.812 23.000 0.003 1.000   NA
 859582 859583 NTHI1573 NTHI1574   hemK TRUE 0.920 0.000 0.009 1.000   NA
 859583 859584 NTHI1574 NTHI1575 hemK   TRUE 0.965 0.000 0.059 1.000   NA
 859584 859585 NTHI1575 NTHI1576   kdsA TRUE 0.970 15.000 0.089 1.000   NA
 859585 859586 NTHI1576 NTHI1577 kdsA   FALSE 0.469 60.000 0.011 1.000 N NA
 859586 859587 NTHI1577 NTHI1578   lolC TRUE 0.961 0.000 0.080 1.000 N NA
 859587 859588 NTHI1578 NTHI1579 lolC bioA TRUE 0.857 12.000 0.000 0.001 N NA
 859588 859589 NTHI1579 NTHI1580 bioA bioF TRUE 0.989 9.000 0.056 0.003 Y NA
 859589 859590 NTHI1580 NTHI1581 bioF   TRUE 0.993 10.000 0.389 1.000   NA
 859590 859591 NTHI1581 NTHI1582   bioC TRUE 0.920 -12.000 0.065 1.000   NA
 859591 859592 NTHI1582 NTHI1583 bioC bioD TRUE 0.990 10.000 0.081 0.003 Y NA
 859592 859593 NTHI1583 NTHI1585 bioD lolD FALSE 0.089 82.000 0.000 1.000 N NA
 859593 859594 NTHI1585 NTHI1586 lolD lolE TRUE 0.980 0.000 0.125 0.047 N NA
 859594 859595 NTHI1586 NTHI1587 lolE aroG FALSE 0.127 219.000 0.058 1.000 N NA
 859597 859598 NTHI1589 NTHI1590     FALSE 0.106 122.000 0.000 1.000   NA
 859598 859599 NTHI1590 NTHI1591     TRUE 0.983 0.000 0.146 1.000   NA
 859602 859603 NTHI1594 NTHI1595 licD licC TRUE 0.990 0.000 0.133 NA Y NA
 859603 859604 NTHI1595 NTHI1596 licC licB TRUE 0.981 -3.000 0.200 1.000   NA
 859604 859605 NTHI1596 NTHI1597 licB licA TRUE 0.995 0.000 0.600 NA   NA
 859605 859606 NTHI1597 NTHI1599 licA mnmC FALSE 0.115 88.000 0.000 NA N NA
 859610 859611 NTHI1603 NTHI1604 gltS parC FALSE 0.220 42.000 0.000 1.000 N NA
 859611 859612 NTHI1604 NTHI1605 parC parE TRUE 0.910 67.000 0.106 0.003 Y NA
 859612 859613 NTHI1605 NTHI1606 parE htrB FALSE 0.099 74.000 0.000 1.000 N NA
 859615 859616 NTHI1609 NTHI1611     FALSE 0.031 212.000 0.000 NA   NA
 859617 859618 NTHI1612 NTHI1613 uupA2 uppB TRUE 0.896 -3.000 0.007 NA   NA
 859619 859620 NTHI1614 NTHI1615   asnC FALSE 0.096 76.000 0.000 1.000 N NA
 859621 859622 NTHI1616 NTHI1617 ribH nusB TRUE 0.992 4.000 0.347 1.000 N NA
 859622 859623 NTHI1617 NTHI1618 nusB thiL TRUE 0.858 67.000 0.225 1.000 N NA
 859623 859624 NTHI1618 NTHI1619 thiL pgpA TRUE 0.977 -3.000 0.206 1.000 N NA
 859624 859625 NTHI1619 NTHI1620 pgpA   TRUE 0.923 0.000 0.024 1.000 N NA
 859625 859626 NTHI1620 NTHI1621   dapB TRUE 0.944 17.000 0.007 1.000 Y NA
 859628 859629 NTHI1623 NTHI1624   pheS FALSE 0.075 149.000 0.000 NA   NA
 859629 859630 NTHI1624 NTHI1625 pheS pheT TRUE 0.992 34.000 0.574 0.001 Y NA
 859630 859631 NTHI1625 NTHI1626 pheT himA TRUE 0.987 2.000 0.208 1.000 N NA
 859631 859632 NTHI1626 NTHI1627 himA   TRUE 0.644 53.000 0.026 NA N NA
 859632 859633 NTHI1627 NTHI1628     TRUE 0.711 9.000 0.000 NA N NA
 859633 859634 NTHI1628 NTHI1629     FALSE 0.314 59.000 0.000 NA   NA
 859634 859635 NTHI1629 NTHI1630     TRUE 0.594 -16.000 0.000 NA   NA
 859637 859638 NTHI1632 NTHI1634 ftsK2   TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859638 859639 NTHI1634 NTHI1635     TRUE 0.583 0.000 0.000 1.000 N NA
 859639 859640 NTHI1635 NTHI1636     FALSE 0.204 78.000 0.000 1.000   NA
 859640 859641 NTHI1636 NTHI1637     FALSE 0.241 77.000 0.000 NA   NA
 859641 859642 NTHI1637 NTHI1638     FALSE 0.055 170.000 0.000 NA   NA
 859642 859643 NTHI1638 NTHI1639     TRUE 0.654 20.000 0.000 1.000   NA
 859643 859644 NTHI1639 NTHI1640     FALSE 0.443 82.000 0.008 1.000   NA
 859644 859645 NTHI1640 NTHI1641   infC FALSE 0.007 268.000 0.000 1.000 N NA
 859645 859646 NTHI1641 NTHI1642 infC rpmI TRUE 0.726 211.000 0.652 1.000 Y NA
 859646 859647 NTHI1642 NTHI1643 rpmI rplT TRUE 0.983 66.000 0.928 0.024 Y NA
 859647 859648 NTHI1643 NTHI1644 rplT recB FALSE 0.055 113.000 0.000 1.000 N NA
 859648 859649 NTHI1644 NTHI1646 recB recD TRUE 0.998 0.000 0.688 0.002 Y NA
 859651 859652 NTHI1648 NTHI1649 lonB fabA TRUE 0.531 169.000 0.290 1.000 N NA
 859652 859653 NTHI1649 NTHI1650 fabA   FALSE 0.026 236.000 0.000 NA   NA
 859653 859654 NTHI1650 NTHI1651     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859654 859655 NTHI1651 NTHI1652   rpsO FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 859656 859657 NTHI1653 NTHI1654     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859657 859658 NTHI1654 NTHI1655   dacB FALSE 0.030 216.000 0.000 NA   NA
 859661 859662 NTHI1660 NTHI1662 rrmJ ftsH TRUE 0.736 91.000 0.152 1.000 N NA
 859662 859663 NTHI1662 NTHI1663 ftsH folP TRUE 0.800 112.000 0.325 1.000 N NA
 859663 859664 NTHI1663 NTHI1664 folP mrsA TRUE 0.951 33.000 0.260 1.000 N NA
 859664 859665 NTHI1664 NTHI1666 mrsA sixA FALSE 0.400 59.000 0.003 1.000 N NA
 859665 859666 NTHI1666 NTHI1667 sixA   FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 859668 859669 NTHI1669 NTHI1671     TRUE 0.702 -6.000 0.000 NA   NA
 859669 859670 NTHI1671 NTHI1672     FALSE 0.247 75.000 0.000 NA   NA
 859670 859671 NTHI1672 NTHI1673     FALSE 0.243 76.000 0.000 NA   NA
 859671 859672 NTHI1673 NTHI1674     TRUE 0.984 10.000 0.128 NA   NA
 859674 859675 NTHI1677 NTHI1678 msaB   TRUE 0.996 12.000 0.400 1.000 Y NA
 859675 859676 NTHI1678 NTHI1679     TRUE 0.977 45.000 0.444 1.000 Y NA
 859677 859678 NTHI1680 NTHI1681   moeB FALSE 0.282 67.000 0.000 NA   NA
 859678 859679 NTHI1681 NTHI1682 moeB moeA TRUE 0.997 4.000 0.323 0.005 Y NA
 859680 859681 NTHI1683 NTHI1684 folE   TRUE 0.812 4.000 0.000 1.000   NA
 859681 859682 NTHI1684 NTHI1685   bioD FALSE 0.292 103.000 0.000 0.002   NA
 859684 859685 NTHI1687 NTHI1688 rplM rpsI TRUE 0.997 17.000 0.601 0.024 Y NA
 859685 859686 NTHI1688 NTHI1689 rpsI sspA FALSE 0.104 181.000 0.014 NA N NA
 859686 859687 NTHI1689 NTHI1690 sspA sspB TRUE 0.996 0.000 0.831 NA   NA
 859688 859689 NTHI1691 NTHI1692 dxs ispA TRUE 0.969 42.000 0.246 1.000 Y NA
 859689 859690 NTHI1692 NTHI1693 ispA xseB TRUE 0.981 0.000 0.177 1.000 N NA
 859691 859692 NTHI1694 NTHI1695 thiI   TRUE 0.791 15.000 0.000 NA   NA
 859692 859693 NTHI1695 NTHI1696   truC TRUE 0.990 -6.000 0.518 NA   NA
 859693 859694 NTHI1696 NTHI1697 truC   TRUE 0.936 -7.000 0.058 NA   NA
 859694 859695 NTHI1697 NTHI1698   cspD FALSE 0.264 149.000 0.024 NA   NA
 859698 859699 NTHI1701 NTHI1702 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 859699 859700 NTHI1702 NTHI1703 trpB   TRUE 0.921 17.000 0.024 1.000   NA
 859701 859702 NTHI1704 NTHI1706 purM purN TRUE 0.962 55.000 0.230 0.003 Y NA
 859703 859704 NTHI1707 NTHI1708   uspE FALSE 0.116 198.000 0.029 NA N NA
 859704 859705 NTHI1708 NTHI1709 uspE fnr TRUE 0.919 122.000 0.619 1.000 Y NA
 859706 859707 NTHIT0052 NTHI1711     FALSE 0.022 249.000 0.000 NA   NA
 859708 859709 NTHI1712 NTHI1713     FALSE 0.016 305.000 0.000 NA   NA
 859709 859710 NTHI1713 NTHI1714     FALSE 0.014 338.000 0.000 NA   NA
 859712 859713 NTHI1716 NTHI1717     FALSE 0.015 328.000 0.000 NA   NA
 859713 859714 NTHI1717 NTHI1718     FALSE 0.009 927.000 0.000 NA   NA
 859714 859715 NTHI1718 NTHI1719     TRUE 0.990 3.000 0.200 NA   NA
 859715 859716 NTHI1719 NTHI1720     FALSE 0.314 52.000 0.000 1.000   NA
 859717 859718 NTHI1721 NTHI1722     FALSE 0.389 49.000 0.000 NA   NA
 859718 859719 NTHI1722 NTHI1723     TRUE 0.895 49.000 0.133 NA   NA
 859719 859720 NTHI1723 NTHI1724     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859720 859721 NTHI1724 NTHI1725     TRUE 0.605 -15.000 0.000 NA   NA
 859721 859722 NTHI1725 NTHI1726     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859722 859723 NTHI1726 NTHI1727   ninB FALSE 0.498 37.000 0.000 NA   NA
 859723 859724 NTHI1727 NTHI1728_1 ninB ninG FALSE 0.020 268.000 0.000 NA   NA
 859724 859725 NTHI1728_1 NTHI1729 ninG   TRUE 0.698 20.000 0.000 NA   NA
 859725 859726 NTHI1729 NTHI1730     FALSE 0.117 124.000 0.000 NA   NA
 859728 859729 NTHI1733 NTHI1734     TRUE 0.556 31.000 0.000 NA   NA
 859729 859730 NTHI1734 NTHI1735     FALSE 0.117 124.000 0.000 NA   NA
 859730 859731 NTHI1735 NTHI1736     TRUE 0.940 80.000 0.667 NA   NA
 859731 859732 NTHI1736 NTHI1737     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 859732 859733 NTHI1737 NTHI1738     TRUE 0.553 -88.000 0.000 NA   NA
 859735 859736 NTHI1740 NTHI1741     TRUE 0.753 -13.000 0.000 0.002   NA
 859736 859737 NTHI1741 NTHI1742     TRUE 0.837 2.000 0.000 NA   NA
 859737 859738 NTHI1742 NTHI1743   traN TRUE 0.982 29.000 0.500 NA   NA
 859738 859739 NTHI1743 NTHI1744 traN   FALSE 0.482 146.000 0.111 NA   NA
 859739 859740 NTHI1744 NTHI1745   pyrD FALSE 0.059 164.000 0.000 NA   NA
 859740 859741 NTHI1745 NTHI1746 pyrD trpH TRUE 0.914 0.000 0.006 1.000   NA
 859742 859743 NTHI1748 NTHI1749   fumC FALSE 0.269 128.000 0.010 NA   NA
 859743 859744 NTHI1749 NTHI1750 fumC   FALSE 0.025 150.000 0.000 1.000 N NA
 859745 859746 NTHI1751 NTHI1753   holC FALSE 0.179 103.000 0.000 NA   NA
 859746 859747 NTHI1753 NTHI1754 holC   FALSE 0.223 85.000 0.000 NA   NA
 859747 859748 NTHI1754 NTHI1755     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 859748 859749 NTHI1755 NTHI1756     TRUE 0.602 28.000 0.000 NA   NA
 859749 859750 NTHI1756 NTHI1757     TRUE 0.619 27.000 0.000 NA   NA
 859750 859751 NTHI1757 NTHI1758     FALSE 0.440 44.000 0.000 NA   NA
 859751 859752 NTHI1758 NTHI1760   valS FALSE 0.360 52.000 0.000 NA   NA
 859753 859754 NTHI1762 NTHI1763   trpC FALSE 0.017 288.000 0.000 NA   NA
 859754 859755 NTHI1763 NTHI1764 trpC trpD TRUE 0.976 38.000 0.293 1.000 Y NA
 859755 859756 NTHI1764 NTHI1765 trpD   TRUE 0.548 53.000 0.003 1.000   NA
 859756 859757 NTHI1765 NTHI1767   trpG TRUE 0.823 49.000 0.032 0.002   NA
 859757 859758 NTHI1767 NTHI1768 trpG trpE TRUE 0.998 13.000 0.703 0.002 Y NA
 859758 859759 NTHI1768 NTHI1769 trpE   FALSE 0.182 102.000 0.000 NA   NA
 859759 859760 NTHI1769 NTHI1772   ftnB FALSE 0.121 123.000 0.000 NA   NA
 859760 859761 NTHI1772 NTHI1773 ftnB ftnA TRUE 0.998 16.000 0.700 0.001 Y NA
 859762 859763 NTHI1774 NTHI1775 pstS pstC TRUE 0.835 92.000 0.072 0.003 Y NA
 859763 859764 NTHI1775 NTHI1776 pstC pstA TRUE 0.998 2.000 0.537 0.003 Y NA
 859764 859765 NTHI1776 NTHI1777 pstA pstB TRUE 0.998 10.000 0.526 0.003 Y NA
 859765 859766 NTHI1777 NTHI1778 pstB phoB FALSE 0.434 97.000 0.008 0.003 N NA
 859766 859767 NTHI1778 NTHI1779 phoB phoR TRUE 0.996 -3.000 0.453 0.004 Y NA
 859768 859769 NTHI1780 NTHI1781 sbcB   TRUE 0.954 13.000 0.029 NA   NA
 859769 859770 NTHI1781 NTHI1782     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 859770 859771 NTHI1782 NTHI1784   mukB FALSE 0.270 70.000 0.000 NA   NA
 859771 859772 NTHI1784 NTHI1785 mukB   TRUE 0.998 0.000 0.750 0.002 Y NA
 859772 859773 NTHI1785 NTHI1786   haeIIR TRUE 0.812 4.000 0.000 1.000   NA
 859773 859774 NTHI1786 NTHI1787 haeIIR haeIIM TRUE 0.996 3.000 0.571 1.000   NA
 859774 859775 NTHI1787 NTHI1788 haeIIM mukF TRUE 0.676 13.000 0.000 NA N NA
 859776 859777 NTHI1789 NTHI1790     TRUE 0.710 2.000 0.000 NA N NA
 859777 859778 NTHI1790 NTHI1793   mop FALSE 0.063 108.000 0.000 1.000 N NA
 859778 859779 NTHI1793 NTHI1794 mop   FALSE 0.043 184.000 0.000 NA   NA
 859779 859780 NTHI1794 NTHI1796   pqqL FALSE 0.175 104.000 0.000 NA   NA
 859785 859786 NTHI1801 NTHI1802 pntB pntA TRUE 0.998 11.000 0.745 0.001 Y NA
 859786 859787 NTHI1802 NTHI1803 pntA glgP FALSE 0.007 261.000 0.000 1.000 N NA
 859787 859788 NTHI1803 NTHI1806 glgP glgA FALSE 0.450 247.000 0.228 1.000 Y NA
 859788 859789 NTHI1806 NTHI1807 glgA glgC TRUE 0.902 108.000 0.307 1.000 Y NA
 859789 859790 NTHI1807 NTHI1808 glgC glgX TRUE 0.984 -10.000 0.228 1.000 Y NA
 859790 859791 NTHI1808 NTHI1809 glgX glgB TRUE 0.854 99.000 0.098 0.002 Y NA
 859791 859792 NTHI1809 NTHI1810 glgB malQ TRUE 0.998 10.000 0.429 0.002 Y NA
 859792 859793 NTHI1810 NTHI1811 malQ   TRUE 0.629 62.000 0.019 NA   NA
 859793 859794 NTHI1811 NTHI1812   glnS FALSE 0.529 66.000 0.006 NA   NA
 859794 859795 NTHI1812 NTHI1813 glnS cafA FALSE 0.038 420.000 0.000 0.057 Y NA
 859796 859797 NTHI1814 NTHI1815 putP   TRUE 0.924 -3.000 0.021 NA   NA
 859801 859802 NTHI1820 NTHI1821 potA potB TRUE 0.993 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 859802 859803 NTHI1821 NTHI1822 potB potC TRUE 0.996 0.000 0.286 0.031 Y NA
 859803 859804 NTHI1822 NTHI1823 potC potD1 TRUE 0.881 47.000 0.024 0.031 Y NA
 859805 859806 NTHI1824 NTHI1825 uupA   FALSE 0.406 94.000 0.009 1.000   NA
 859806 859807 NTHI1825 NTHI1826     FALSE 0.498 93.000 0.042 1.000 N NA
 859807 859808 NTHI1826 NTHI1827     TRUE 0.943 19.000 0.062 1.000   NA
 859809 859810 NTHI1828 NTHI1829   nifS TRUE 0.991 2.000 0.321 1.000 N NA
 859810 859811 NTHI1829 NTHI1830 nifS   TRUE 0.972 -3.000 0.116 NA   NA
 859811 859812 NTHI1830 NTHI1831     TRUE 0.653 -9.000 0.000 NA   NA
 859812 859813 NTHI1831 NTHI1832   queF TRUE 0.814 44.000 0.038 NA   NA
 859814 859815 NTHI1833 NTHI1834 tyrA truB FALSE 0.080 90.000 0.000 1.000 N NA
 859815 859816 NTHI1834 NTHI1835 truB rbfA TRUE 0.995 0.000 0.318 1.000 Y NA
 859817 859818 NTHI1838 NTHI1839 hsdM3 hsdS3 TRUE 0.985 -7.000 0.150 0.055 Y NA
 859818 859819 NTHI1839 NTHI1841 hsdS3   TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 859819 859820 NTHI1841 NTHI1843   hsdR3 TRUE 0.973 2.000 0.059 NA   NA
 859821 859822 NTHI1844 NTHI1845 infB nusA TRUE 0.990 12.000 0.342 1.000 N NA
 859822 859823 NTHI1845 NTHI1846 nusA   TRUE 0.994 17.000 0.759 NA   NA
 859823 859824 NTHI1846 NTHIT0053     FALSE 0.029 222.000 0.000 NA   NA
 859824 859825 NTHIT0053 NTHI1849     FALSE 0.009 1363.000 0.000 NA   NA
 859825 859826 NTHI1849 NTHI1850     TRUE 0.996 4.000 0.667 NA   NA
 859826 859827 NTHI1850 NTHI1851     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 859827 859828 NTHI1851 NTHI1852     TRUE 0.748 17.000 0.000 NA   NA
 859828 859829 NTHI1852 NTHI1853     TRUE 0.996 14.000 1.000 NA   NA
 859829 859830 NTHI1853 NTHI1855     FALSE 0.323 57.000 0.000 NA   NA
 859830 859831 NTHI1855 NTHI1856     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859831 859832 NTHI1856 NTHI1857     TRUE 0.821 12.000 0.000 NA   NA
 859832 859833 NTHI1857 NTHI1858     TRUE 0.995 9.000 0.500 NA   NA
 859833 859834 NTHI1858 NTHI1860     TRUE 0.986 -10.000 0.500 NA   NA
 859834 859835 NTHI1860 NTHI1861     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 859835 859836 NTHI1861 NTHI1862     TRUE 0.991 2.000 0.222 NA   NA
 859836 859837 NTHI1862 NTHI1863     FALSE 0.175 104.000 0.000 NA   NA
 859837 859838 NTHI1863 NTHI1864     TRUE 0.838 9.000 0.000 NA   NA
 859838 859839 NTHI1864 NTHI1865     FALSE 0.192 98.000 0.000 NA   NA
 859839 859840 NTHI1865 NTHI1866     TRUE 0.572 -22.000 0.000 NA   NA
 859840 859841 NTHI1866 NTHI1867     FALSE 0.440 44.000 0.000 NA   NA
 859841 859842 NTHI1867 NTHI1869     FALSE 0.453 43.000 0.000 NA   NA
 859846 859847 NTHI1873 NTHI1874     TRUE 0.990 0.000 0.261 NA   NA
 859847 859848 NTHI1874 NTHI1875     FALSE 0.379 50.000 0.000 NA   NA
 859848 859849 NTHI1875 NTHI1876     TRUE 0.533 33.000 0.000 NA   NA
 859849 859850 NTHI1876 NTHI1878     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859850 859851 NTHI1878 NTHI1879     FALSE 0.050 175.000 0.000 NA   NA
 859851 859852 NTHI1879 NTHI1880     TRUE 0.605 -15.000 0.000 NA   NA
 859852 859853 NTHI1880 NTHI1881     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 859853 859854 NTHI1881 NTHI1882     TRUE 0.837 2.000 0.000 NA   NA
 859854 859855 NTHI1882 NTHI1883     TRUE 0.989 0.000 0.222 NA   NA
 859855 859856 NTHI1883 NTHI1884     FALSE 0.032 294.000 0.000 0.002   NA
 859856 859857 NTHI1884 NTHI1885     TRUE 0.991 12.000 0.286 1.000   NA
 859857 859858 NTHI1885 NTHI1887     TRUE 0.988 21.000 0.500 1.000   NA
 859859 859860 NTHI1888 NTHI1890     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 859864 859865 NTHI1894 NTHI1895 metG tehB FALSE 0.133 111.000 0.000 0.055 N NA
 859866 859867 NTHI1896 NTHI1897 gloB   FALSE 0.314 52.000 0.000 1.000   NA
 859868 859869 NTHI1898 NTHI1899     FALSE 0.091 137.000 0.000 NA   NA
 859869 859870 NTHI1899 NTHI1900   gyrA FALSE 0.010 600.000 0.000 NA   NA
 859873 859874 NTHI1903 NTHI1904 folC accD TRUE 0.981 -7.000 0.383 1.000 N NA
 859876 859877 NTHI1906 NTHI1907 mfd   FALSE 0.182 102.000 0.000 NA   NA
 859877 859878 NTHI1907 NTHI1908     TRUE 0.749 -3.000 0.000 NA   NA
 859878 859879 NTHI1908 NTHI1910     TRUE 0.812 5.000 0.000 1.000   NA
 859879 859880 NTHI1910 NTHI1911     FALSE 0.259 62.000 0.000 1.000   NA
 859880 859881 NTHI1911 NTHI1912     FALSE 0.050 163.000 0.000 1.000   NA
 859881 859882 NTHI1912 NTHI1913     TRUE 0.994 11.000 0.429 NA   NA
 859883 859884 NTHI1914 NTHI1915     TRUE 0.982 3.000 0.100 NA   NA
 859887 859888 NTHI1918 NTHI1920   mao2 FALSE 0.022 241.000 0.000 0.029 N NA
 859889 859890 NTHI1921 NTHI1922   rsuA FALSE 0.110 91.000 0.000 NA N NA
 859890 859891 NTHI1922 NTHI1923 rsuA bcr TRUE 0.985 2.000 0.182 1.000 N NA
 859893 859894 NTHI1925 NTHI1926   proA TRUE 0.851 21.000 0.005 NA   NA
 859895 859896 NTHI1928 NTHI1929 dnaJ dnaK TRUE 0.933 87.000 0.236 0.004 Y NA
 859899 859900 NTHI1933 NTHI1934 aceE aceF TRUE 0.935 63.000 0.220 1.000 Y NA
 859900 859901 NTHI1934 NTHI1935 aceF lpdA TRUE 0.912 114.000 0.463 1.000 Y NA
 859903 859904 NTHI1938 NTHI1939 apt dnaX TRUE 0.967 12.000 0.088 1.000 N NA
 859904 859905 NTHI1939 NTHI1940 dnaX upp FALSE 0.031 140.000 0.000 1.000 N NA
 859905 859906 NTHI1940 NTHI1941 upp uraA TRUE 0.845 104.000 0.101 0.002 Y NA
 859906 859907 NTHI1941 NTHI1942 uraA   TRUE 0.697 66.000 0.048 1.000   NA
 859908 859909 NTHI1943 NTHI1944   pyrF TRUE 0.956 7.000 0.045 1.000 N NA
 859909 859910 NTHI1944 NTHI1945 pyrF   TRUE 0.943 24.000 0.125 1.000 N NA
 859910 859911 NTHI1945 NTHI1946     TRUE 0.995 0.000 0.576 NA   NA
 859911 859912 NTHI1946 NTHI1947   ihfB TRUE 0.868 75.000 0.208 NA   NA
 859912 859913 NTHI1947 NTHI1948 ihfB rpsA TRUE 0.726 123.000 0.292 1.000 N NA
 859913 859914 NTHI1948 NTHI1949 rpsA cmk TRUE 0.799 103.000 0.281 1.000 N NA
 859915 859916 NTHI1950 NTHI1951     TRUE 0.997 1.000 0.488 NA Y NA
 859919 859920 NTHI1954 NTHI1955 nlpC tldD FALSE 0.150 113.000 0.000 NA   NA
 859920 859921 NTHI1955 NTHI1956 tldD   FALSE 0.182 102.000 0.000 NA   NA
 859922 859923 NTHI1957 NTHI1958     TRUE 0.985 0.000 0.172 1.000   NA
 859923 859924 NTHI1958 NTHI1959     TRUE 0.983 13.000 0.187 1.000 N NA
 859924 859925 NTHI1959 NTHI1960     TRUE 0.958 57.000 0.613 NA   NA
 859925 859926 NTHI1960 NTHI1961   nrdA FALSE 0.021 255.000 0.000 NA   NA
 859926 859927 NTHI1961 NTHI1962 nrdA nrdB FALSE 0.302 142.000 0.000 0.001 Y NA
 859928 859929 NTHI1963 NTHI1964 sucB kgd TRUE 0.947 103.000 0.667 1.000 Y NA
 859929 859930 NTHI1964 NTHI1965 kgd   FALSE 0.053 158.000 0.000 1.000   NA
 859930 859931 NTHI1965 NTHI1966     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 859931 859932 NTHI1966 NTHI1967     FALSE 0.360 52.000 0.000 NA   NA
 859932 859933 NTHI1967 NTHI1968     TRUE 0.991 16.000 0.372 NA   NA
 859933 859934 NTHI1968 NTHI1969   prc TRUE 0.608 74.000 0.033 1.000   NA
 859934 859935 NTHI1969 NTHI1970 prc proQ TRUE 0.978 22.000 0.304 NA N NA
 859936 859937 NTHI1972 NTHI1973     TRUE 0.989 -16.000 0.840 NA   NA
 859938 859939 NTHI1974 NTHI1976 moaE moaD TRUE 0.998 1.000 0.501 0.005 Y NA
 859939 859940 NTHI1976 NTHI1977 moaD moaC TRUE 0.995 2.000 0.175 0.005 Y NA
 859940 859941 NTHI1977 NTHI1978 moaC moaA TRUE 0.783 92.000 0.039 0.005 Y NA
 859942 859943 NTHI1979 NTHI1980     TRUE 0.809 0.000 0.000 NA   NA
 859943 859944 NTHI1980 NTHI1981     FALSE 0.010 537.000 0.000 NA   NA
 859944 859945 NTHI1981 NTHI1982   yrbI TRUE 0.984 10.000 0.133 1.000   NA
 859945 859946 NTHI1982 NTHI1983 yrbI hmw1A FALSE 0.009 431.000 0.000 1.000   NA
 859946 859947 NTHI1983 NTHI1984 hmw1A hmw1B FALSE 0.072 151.000 0.000 NA   NA
 859947 859948 NTHI1984 NTHI1985 hmw1B hmw1C FALSE 0.037 194.000 0.000 NA   NA
 859949 859950 NTHI1986 NTHI1987     FALSE 0.278 68.000 0.000 NA   NA
 859951 859952 NTHI1988 NTHI1989 sohB rnfA FALSE 0.006 284.000 0.000 1.000 N NA
 859952 859953 NTHI1989 NTHI1990 rnfA rnfB TRUE 0.962 88.000 0.564 0.032 Y NA
 859953 859954 NTHI1990 NTHI1992 rnfB rnfC TRUE 0.998 1.000 0.537 0.014 Y NA
 859954 859955 NTHI1992 NTHI1993 rnfC rnfD TRUE 0.933 130.000 0.814 0.032 Y NA
 859955 859956 NTHI1993 NTHI1994 rnfD rnfG TRUE 0.998 0.000 0.924 0.032 Y NA
 859956 859957 NTHI1994 NTHI1995 rnfG   TRUE 0.999 2.000 0.908 0.032 Y NA
 859957 859958 NTHI1995 NTHI1996   nth TRUE 0.530 122.000 0.109 1.000 N NA
 859958 859959 NTHI1996 NTHI1997 nth   FALSE 0.525 59.000 0.005 1.000   NA
 859960 859961 NTHI1998 NTHI1999 modC modB TRUE 0.994 -13.000 0.537 0.002 Y NA
 859961 859962 NTHI1999 NTHI2000 modB modA TRUE 0.857 174.000 0.627 0.002 Y NA
 859964 859965 NTHI2002 NTHI2003 lsgF lsgE TRUE 0.978 2.000 0.084 NA   NA
 859965 859966 NTHI2003 NTHI2004 lsgE lsgD TRUE 0.821 12.000 0.000 NA   NA
 859966 859967 NTHI2004 NTHI2005 lsgD lsgC TRUE 0.923 12.000 0.000 1.000 Y NA
 859967 859968 NTHI2005 NTHI2006 lsgC lsgB TRUE 0.808 2.000 0.000 1.000   NA
 859968 859969 NTHI2006 NTHI2007 lsgB lsgA TRUE 0.987 -3.000 0.294 1.000   NA
 859971 859972 NTHI2009 NTHI2011 metE   FALSE 0.037 194.000 0.000 NA   NA
 859972 859973 NTHI2011 NTHI2012     TRUE 0.994 -3.000 0.631 0.061   NA
 859975 859976 NTHI2014 NTHI2015   qseC FALSE 0.013 295.000 0.000 0.060 N NA
 859976 859977 NTHI2015 NTHI2016 qseC qseB TRUE 0.995 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 859977 859978 NTHI2016 NTHI2017 qseB   TRUE 0.722 64.000 0.048 NA   NA
 859978 859979 NTHI2017 NTHI2018   pmi FALSE 0.145 115.000 0.000 NA   NA
 859979 859980 NTHI2018 NTHI2020 pmi crr FALSE 0.013 370.000 0.000 NA   NA
 859980 859981 NTHI2020 NTHI2021 crr ptsI TRUE 0.937 60.000 0.139 0.003 Y NA
 859981 859982 NTHI2021 NTHI2022 ptsI ptsH TRUE 0.899 80.000 0.121 0.003 Y NA
 859982 859983 NTHI2022 NTHI2023 ptsH engC FALSE 0.052 159.000 0.000 1.000   NA
 859984 859985 NTHI2024 NTHIT0055 orn   FALSE 0.199 94.000 0.000 NA   NA
 859985 859986 NTHIT0055 NTHIT0056     TRUE 0.635 25.000 0.000 NA   NA
 859987 859988 NTHI2025 NTHI2026 wecA glnD FALSE 0.098 75.000 0.000 1.000 N NA
 859988 859989 NTHI2026 NTHI2027 glnD map TRUE 0.801 94.000 0.243 1.000 N NA
 859990 859991 NTHI2029 NTHI2030     TRUE 0.945 2.000 0.012 NA   NA
 859991 859992 NTHI2030 NTHI2031   mrcB TRUE 0.968 7.000 0.042 NA   NA
 859992 859993 NTHI2031 NTHI2033 mrcB hemH FALSE 0.041 125.000 0.000 1.000 N NA
 859993 859994 NTHI2033 NTHI2034 hemH argG FALSE 0.052 156.000 0.000 0.094 N NA
 859995 859996 NTHI2035 NTHI2036     TRUE 0.828 44.000 0.055 1.000   NA
 859996 859997 NTHI2036 NTHI2037     TRUE 0.900 -13.000 0.046 1.000   NA
 859997 859998 NTHI2037 NTHI2038     TRUE 0.985 -3.000 0.086 0.004 Y NA
 859998 859999 NTHI2038 NTHI2041   rnb FALSE 0.007 262.000 0.000 1.000 N NA
 859999 860000 NTHI2041 NTHI2042 rnb fabI TRUE 0.594 98.000 0.085 1.000 N NA
 860002 860003 NTHI2045 NTHI2046     FALSE 0.426 103.000 0.013 NA   NA
 860003 860004 NTHI2046 NTHI2047     TRUE 0.997 -3.000 0.915 NA Y NA
 860004 860005 NTHI2047 NTHI2048   metR TRUE 0.946 10.000 0.035 1.000 N NA
 860005 860006 NTHI2048 NTHIR0017 metR   FALSE 0.025 237.000 0.000 NA   NA
 860006 860007 NTHIR0017 NTHIR0018     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 860007 860008 NTHIR0018 NTHIT0057     FALSE 0.012 400.000 0.000 NA   NA
 860008 860009 NTHIT0057 NTHIT0058     FALSE 0.220 86.000 0.000 NA   NA
 860009 860010 NTHIT0058 NTHIR0019     FALSE 0.234 80.000 0.000 NA   NA
 860010 860011 NTHIR0019 NTHI2049   lldD FALSE 0.013 368.000 0.000 NA   NA
 860011 860012 NTHI2049 NTHI2050 lldD murI FALSE 0.010 212.000 0.000 1.000 N NA
 860012 860013 NTHI2050 NTHI2051 murI recG TRUE 0.667 30.000 0.004 1.000 N NA
 860013 860014 NTHI2051 NTHI2052 recG spoT TRUE 0.965 -3.000 0.034 1.000 Y NA
 860014 860015 NTHI2052 NTHI2053 spoT rpoZ TRUE 0.936 73.000 0.291 1.000 Y NA
 860015 860016 NTHI2053 NTHI2054 rpoZ gmk TRUE 0.920 63.000 0.471 1.000 N NA