MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus thuringiensis str. 97-27

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 595198 595199 BT9727_0001 BT9727_0002 dnaA dnaN TRUE 0.671 179.000 0.328 1.000 Y NA
 595199 595200 BT9727_0002 BT9727_0003 dnaN   FALSE 0.347 116.000 0.103 1.000   NA
 595200 595201 BT9727_0003 BT9727_0004   recF TRUE 0.672 13.000 0.209 1.000   NA
 595201 595202 BT9727_0004 BT9727_0005 recF gyrB TRUE 0.967 39.000 0.249 0.005 Y NA
 595202 595203 BT9727_0005 BT9727_0006 gyrB gyrA TRUE 0.942 89.000 0.306 0.001 Y NA
 595203 5459410 BT9727_0006 rRNA-16SrRNA_1 gyrA   FALSE 0.001 269.000 0.000 NA   NA
 5459410 5459411 rRNA-16SrRNA_1 tRNA-Ile-2     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 5459411 5459412 tRNA-Ile-2 tRNA-Ala-5     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459412 5459413 tRNA-Ala-5 rRNA-23SrRNA_1     FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 5459413 5459414 rRNA-23SrRNA_1 rRNA-5SrRNA_1     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 595210 595211 BT9727_0009 BT9727_0010 guaB dacA TRUE 0.667 105.000 0.304 1.000 N NA
 595211 595212 BT9727_0010 BT9727_0011 dacA pdx1 FALSE 0.334 162.000 0.017 1.000 N NA
 595212 595213 BT9727_0011 BT9727_0012 pdx1 guaA TRUE 0.958 19.000 0.488 NA Y NA
 595213 595214 BT9727_0012 BT9727_0013 guaA serS FALSE 0.033 328.000 0.010 NA N NA
 595214 5459415 BT9727_0013 tRNA-Ser-5 serS   FALSE 0.009 157.000 0.000 NA   NA
 5459415 595216 tRNA-Ser-5 BT9727_0014     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 595217 595218 BT9727_0015 BT9727_0016 dck dgk TRUE 0.978 3.000 0.255 0.001 Y NA
 595218 595219 BT9727_0016 BT9727_0017 dgk pncA FALSE 0.512 126.000 0.058 1.000 N NA
 595220 595221 BT9727_0018 BT9727_0019   dnaX FALSE 0.015 477.000 0.000 1.000 N NA
 595221 595222 BT9727_0019 BT9727_0020 dnaX   FALSE 0.474 23.000 0.071 NA   NA
 595222 595223 BT9727_0020 BT9727_0021   recR TRUE 0.781 15.000 0.604 NA   NA
 595223 595224 BT9727_0021 BT9727_0022 recR   FALSE 0.447 15.000 0.071 NA   NA
 595224 595225 BT9727_0022 BT9727_0023   bofA FALSE 0.111 216.000 0.417 NA   NA
 595225 5459416 BT9727_0023 rRNA-16SrRNA_2 bofA   FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5459416 5459417 rRNA-16SrRNA_2 tRNA-Ile-4     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 5459417 5459418 tRNA-Ile-4 tRNA-Ala-1     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459418 5459419 tRNA-Ala-1 rRNA-23SrRNA_2     FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 5459419 5459420 rRNA-23SrRNA_2 rRNA-5SrRNA_2     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 5459420 595231 rRNA-5SrRNA_2 BT9727_0025   cad FALSE 0.000 440.000 0.000 NA   NA
 595231 595232 BT9727_0025 BT9727_0026 cad tmk TRUE 0.805 2.000 0.009 1.000 N NA
 595232 595233 BT9727_0026 BT9727_0027 tmk holB TRUE 0.759 36.000 0.009 1.000 N NA
 595233 595234 BT9727_0027 BT9727_0028 holB   TRUE 0.760 -3.000 0.372 NA   NA
 595234 595235 BT9727_0028 BT9727_0029     TRUE 0.605 0.000 0.183 NA   NA
 595235 595236 BT9727_0029 BT9727_0030     FALSE 0.362 121.000 0.193 1.000   NA
 595236 595237 BT9727_0030 BT9727_0031     TRUE 0.797 -13.000 0.209 1.000   NA
 595237 595238 BT9727_0031 BT9727_0032     TRUE 0.742 -31.000 0.041 1.000   NA
 595240 595241 BT9727_0034 BT9727_0035 metS tatD FALSE 0.329 166.000 0.221 NA N NA
 595241 595242 BT9727_0035 BT9727_0036 tatD rnmV FALSE 0.390 215.000 0.058 NA Y NA
 595242 595243 BT9727_0036 BT9727_0037 rnmV ksgA TRUE 0.863 -3.000 0.093 1.000 N NA
 595243 595244 BT9727_0037 BT9727_0038 ksgA   FALSE 0.146 111.000 0.022 NA   NA
 595244 595245 BT9727_0038 BT9727_0039   veg FALSE 0.038 239.000 0.116 NA   NA
 595245 595246 BT9727_0039 BT9727_0040 veg ispE FALSE 0.004 459.000 0.046 NA   NA
 595246 595247 BT9727_0040 BT9727_0041 ispE purR TRUE 0.727 55.000 0.062 1.000 N NA
 595247 595248 BT9727_0041 BT9727_0042 purR purR FALSE 0.507 123.000 0.227 NA N NA
 595248 595249 BT9727_0042 BT9727_0043 purR spoVG FALSE 0.471 153.000 0.377 NA N NA
 595249 595250 BT9727_0043 BT9727_0044 spoVG gcaD FALSE 0.167 325.000 0.014 1.000 Y NA
 595250 595251 BT9727_0044 BT9727_0045 gcaD prs TRUE 0.820 19.000 0.069 1.000 N NA
 595251 595252 BT9727_0045 BT9727_0046 prs spoVC TRUE 0.629 73.000 0.010 1.000 N NA
 595252 595253 BT9727_0046 BT9727_0047 spoVC   FALSE 0.235 71.000 0.033 NA   NA
 595253 595254 BT9727_0047 BT9727_0048   mfd FALSE 0.184 100.000 0.035 NA   NA
 595254 595255 BT9727_0048 BT9727_0049 mfd spoVT TRUE 0.728 137.000 0.026 NA Y NA
 595255 595256 BT9727_0049 BT9727_0050 spoVT   FALSE 0.042 231.000 0.147 NA   NA
 595256 595257 BT9727_0050 BT9727_0051     TRUE 0.592 13.000 0.058 1.000   NA
 595257 595258 BT9727_0051 BT9727_0052   hslR FALSE 0.583 15.000 0.054 1.000   NA
 595258 595259 BT9727_0052 BT9727_0053 hslR   FALSE 0.453 41.000 0.108 NA   NA
 595259 595260 BT9727_0053 BT9727_0054     TRUE 0.874 -3.000 0.774 NA   NA
 595260 595261 BT9727_0054 BT9727_0055   divIC FALSE 0.556 -3.000 0.074 NA   NA
 595261 595262 BT9727_0055 BT9727_0056 divIC   TRUE 0.645 88.000 0.134 1.000 N NA
 595262 5459421 BT9727_0056 tRNA-Met-1     FALSE 0.008 161.000 0.000 NA   NA
 5459421 5459422 tRNA-Met-1 tRNA-Glu-7     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459422 595265 tRNA-Glu-7 BT9727_0057   spoIIE FALSE 0.001 302.000 0.000 NA   NA
 595265 595266 BT9727_0057 BT9727_0058 spoIIE mesJ FALSE 0.134 234.000 0.041 1.000 N NA
 595266 595267 BT9727_0058 BT9727_0059 mesJ hprT TRUE 0.921 -3.000 0.067 0.050 N NA
 595267 595268 BT9727_0059 BT9727_0060 hprT ftsH TRUE 0.666 86.000 0.192 1.000 N NA
 595268 595269 BT9727_0060 BT9727_0061 ftsH   FALSE 0.143 225.000 0.029 1.000 N NA
 595269 595270 BT9727_0061 BT9727_0062   hslO TRUE 0.811 7.000 0.060 1.000 N NA
 595270 595271 BT9727_0062 BT9727_0063 hslO cysK FALSE 0.572 105.000 0.053 1.000 N NA
 595271 595272 BT9727_0063 BT9727_0064 cysK pabB FALSE 0.432 221.000 0.107 1.000 Y NA
 595272 595273 BT9727_0064 BT9727_0065 pabB pabA TRUE 0.981 6.000 0.452 0.001 Y NA
 595273 595274 BT9727_0065 BT9727_0066 pabA pabC TRUE 0.977 -6.000 0.532 1.000 Y NA
 595274 595275 BT9727_0066 BT9727_0067 pabC sul TRUE 0.977 -7.000 0.519 1.000 Y NA
 595275 595276 BT9727_0067 BT9727_0068 sul folB TRUE 0.955 1.000 0.176 1.000 Y NA
 595276 595277 BT9727_0068 BT9727_0069 folB folK TRUE 0.960 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 595277 595278 BT9727_0069 BT9727_0070 folK   TRUE 0.888 -48.000 0.027 1.000 N NA
 595278 595279 BT9727_0070 BT9727_0071     TRUE 0.789 24.000 0.016 1.000 N NA
 595279 595280 BT9727_0071 BT9727_0072   lysS TRUE 0.675 160.000 0.021 1.000 Y NA
 595280 5459423 BT9727_0072 rRNA-16SrRNA_3 lysS   FALSE 0.000 401.000 0.000 NA   NA
 5459423 5459424 rRNA-16SrRNA_3 rRNA-23SrRNA_3     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459424 5459425 rRNA-23SrRNA_3 rRNA-5SrRNA_3     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459425 5459426 rRNA-5SrRNA_3 tRNA-Val-5     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459426 5459427 tRNA-Val-5 tRNA-Thr-1     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459427 5459428 tRNA-Thr-1 tRNA-Lys-4     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459428 5459429 tRNA-Lys-4 tRNA-Leu-8     FALSE 0.052 13.000 0.000 NA   NA
 5459429 5459430 tRNA-Leu-8 tRNA-Gly-2     FALSE 0.055 27.000 0.000 NA   NA
 5459430 5459431 tRNA-Gly-2 tRNA-Leu-6     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459431 5459432 tRNA-Leu-6 tRNA-Arg-5     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459432 5459433 tRNA-Arg-5 tRNA-Pro-2     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459433 5459434 tRNA-Pro-2 tRNA-Ala-3     FALSE 0.057 7.000 0.000 NA   NA
 5459434 5459435 tRNA-Ala-3 rRNA-16SrRNA_4     FALSE 0.020 102.000 0.000 NA   NA
 5459435 5459436 rRNA-16SrRNA_4 rRNA-23SrRNA_4     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459436 5459437 rRNA-23SrRNA_4 rRNA-5SrRNA_4     FALSE 0.041 48.000 0.000 NA   NA
 5459437 595296 rRNA-5SrRNA_4 BT9727_0075   ctsR FALSE 0.004 204.000 0.000 NA   NA
 595296 595297 BT9727_0075 BT9727_0076 ctsR   FALSE 0.320 174.000 0.681 NA   NA
 595297 595298 BT9727_0076 BT9727_0077   karG TRUE 0.884 5.000 0.848 1.000   NA
 595298 595299 BT9727_0077 BT9727_0078 karG clpC TRUE 0.884 23.000 0.425 1.000 N NA
 595299 595300 BT9727_0078 BT9727_0079 clpC radA TRUE 0.912 97.000 0.062 0.011 Y NA
 595300 595301 BT9727_0079 BT9727_0080 radA   TRUE 0.670 4.000 0.126 1.000   NA
 595301 595302 BT9727_0080 BT9727_0081     FALSE 0.119 161.000 0.088 NA   NA
 595302 595303 BT9727_0081 BT9727_0082   ispD FALSE 0.507 17.000 0.108 NA   NA
 595303 595304 BT9727_0082 BT9727_0083 ispD ispF TRUE 0.876 115.000 0.419 1.000 Y NA
 595304 595305 BT9727_0083 BT9727_0084 ispF gltX TRUE 0.626 90.000 0.076 1.000 N NA
 595305 595306 BT9727_0084 BT9727_0085 gltX cysE FALSE 0.023 433.000 0.008 1.000 N NA
 595306 595307 BT9727_0085 BT9727_0086 cysE cysS TRUE 0.937 -19.000 0.039 0.050 N NA
 595307 595308 BT9727_0086 BT9727_0087 cysS   TRUE 0.677 3.000 0.129 1.000   NA
 595308 595309 BT9727_0087 BT9727_0088     TRUE 0.894 -3.000 0.150 0.003   NA
 595309 595310 BT9727_0088 BT9727_0089     FALSE 0.528 4.000 0.109 NA   NA
 595310 595311 BT9727_0089 BT9727_0090   spo0H FALSE 0.532 68.000 0.361 NA   NA
 595311 595312 BT9727_0090 BT9727_0091 spo0H secE FALSE 0.040 314.000 0.000 1.000 N NA
 595312 595313 BT9727_0091 BT9727_0092 secE nusG TRUE 0.777 119.000 0.843 1.000 N NA
 595313 595314 BT9727_0092 BT9727_0093 nusG rplK FALSE 0.563 168.000 0.681 1.000 N NA
 595314 595315 BT9727_0093 BT9727_0094 rplK rplA TRUE 0.861 177.000 0.838 0.017 Y NA
 595315 595316 BT9727_0094 BT9727_0095 rplA rplJ FALSE 0.585 233.000 0.302 0.017 Y NA
 595316 595317 BT9727_0095 BT9727_0096 rplJ rplL TRUE 0.971 68.000 0.884 0.013 Y NA
 595317 595318 BT9727_0096 BT9727_0097 rplL   TRUE 0.871 77.000 0.050 1.000 Y NA
 595318 595319 BT9727_0097 BT9727_0098   rpoB FALSE 0.064 294.000 0.008 1.000 N NA
 595319 595320 BT9727_0098 BT9727_0099 rpoB rpoC TRUE 0.984 38.000 0.851 0.001 Y NA
 595320 595321 BT9727_0099 BT9727_0100 rpoC   FALSE 0.559 81.000 0.065 NA N NA
 595321 595322 BT9727_0100 BT9727_0101   rpsl TRUE 0.820 115.000 0.239 NA Y NA
 595322 595323 BT9727_0101 BT9727_0102 rpsl rpsG TRUE 0.972 30.000 0.224 0.002 Y NA
 595323 595324 BT9727_0102 BT9727_0103 rpsG fusA TRUE 0.623 208.000 0.579 1.000 Y NA
 595324 595325 BT9727_0103 BT9727_0104 fusA tufA TRUE 0.930 118.000 0.400 0.001 Y NA
 595325 595326 BT9727_0104 BT9727_0105 tufA rpsJ FALSE 0.145 399.000 0.318 1.000 Y NA
 595326 595327 BT9727_0105 BT9727_0106 rpsJ rplC TRUE 0.975 35.000 0.467 0.017 Y NA
 595327 595328 BT9727_0106 BT9727_0107 rplC rplD TRUE 0.979 26.000 0.544 0.013 Y NA
 595328 595329 BT9727_0107 BT9727_0108 rplD rplW TRUE 0.978 0.000 0.307 0.013 Y NA
 595329 595330 BT9727_0108 BT9727_0109 rplW rplB TRUE 0.984 29.000 0.849 0.017 Y NA
 595330 595331 BT9727_0109 BT9727_0110 rplB rpsS TRUE 0.973 61.000 0.820 0.017 Y NA
 595331 595332 BT9727_0110 BT9727_0111 rpsS rplV TRUE 0.984 18.000 0.769 0.017 Y NA
 595332 595333 BT9727_0111 BT9727_0112 rplV rpsC TRUE 0.984 4.000 0.719 0.017 Y NA
 595333 595334 BT9727_0112 BT9727_0113 rpsC rplP TRUE 0.986 2.000 0.828 0.017 Y NA
 595334 595335 BT9727_0113 BT9727_0114 rplP rpmC TRUE 0.992 -34.000 0.802 0.013 Y NA
 595335 595336 BT9727_0114 BT9727_0115 rpmC rpsQ TRUE 0.985 21.000 0.828 0.013 Y NA
 595336 595337 BT9727_0115 BT9727_0116 rpsQ rplN TRUE 0.979 44.000 0.791 0.017 Y NA
 595337 595338 BT9727_0116 BT9727_0117 rplN rplX TRUE 0.960 39.000 0.071 0.017 Y NA
 595338 595339 BT9727_0117 BT9727_0118 rplX rplE TRUE 0.965 27.000 0.057 0.013 Y NA
 595339 595340 BT9727_0118 BT9727_0119 rplE rpsN TRUE 0.976 34.000 0.496 0.013 Y NA
 595340 595341 BT9727_0119 BT9727_0120 rpsN rpsH TRUE 0.977 30.000 0.473 0.013 Y NA
 595341 595342 BT9727_0120 BT9727_0121 rpsH rplF TRUE 0.983 33.000 0.808 0.013 Y NA
 595342 595343 BT9727_0121 BT9727_0122 rplF rplR TRUE 0.983 32.000 0.815 0.013 Y NA
 595343 595344 BT9727_0122 BT9727_0123 rplR rplR TRUE 0.985 22.000 0.814 0.017 Y NA
 595344 595345 BT9727_0123 BT9727_0124 rplR rpmD TRUE 0.982 14.000 0.789 0.017 Y NA
 595345 595346 BT9727_0124 BT9727_0125 rpmD rplO TRUE 0.982 34.000 0.653 0.002 Y NA
 595346 595347 BT9727_0125 BT9727_0126 rplO secY TRUE 0.933 0.000 0.730 1.000 N NA
 595347 595348 BT9727_0126 BT9727_0127 secY adk TRUE 0.769 57.000 0.241 1.000 N NA
 595348 595349 BT9727_0127 BT9727_0128 adk map TRUE 0.881 0.000 0.290 1.000 N NA
 595349 595350 BT9727_0128 BT9727_0129 map infA TRUE 0.898 69.000 0.160 1.000 Y NA
 595350 595351 BT9727_0129 BT9727_0130 infA rpsM TRUE 0.762 171.000 0.075 0.018 Y NA
 595351 595352 BT9727_0130 BT9727_0131 rpsM rpsK TRUE 0.984 25.000 0.810 0.013 Y NA
 595352 595353 BT9727_0131 BT9727_0132 rpsK rpoA FALSE 0.367 181.000 0.308 1.000 N NA
 595353 595354 BT9727_0132 BT9727_0133 rpoA rplQ TRUE 0.920 36.000 0.873 1.000 N NA
 595354 595355 BT9727_0133 BT9727_0134 rplQ   TRUE 0.770 44.000 0.074 1.000 N NA
 595355 595356 BT9727_0134 BT9727_0135     TRUE 0.991 -24.000 0.713 0.031 Y NA
 595356 595357 BT9727_0135 BT9727_0136     TRUE 0.968 -12.000 0.139 1.000 Y NA
 595357 595358 BT9727_0136 BT9727_0137   truA TRUE 0.817 15.000 0.170 1.000 N NA
 595358 595359 BT9727_0137 BT9727_0138 truA rplM TRUE 0.722 153.000 0.052 1.000 Y NA
 595359 595360 BT9727_0138 BT9727_0139 rplM   TRUE 0.982 22.000 0.601 0.013 Y NA
 595360 595361 BT9727_0139 BT9727_0140     FALSE 0.068 163.000 0.021 NA   NA
 595361 595362 BT9727_0140 BT9727_0141   cwlD FALSE 0.416 67.000 0.211 NA   NA
 595362 595363 BT9727_0141 BT9727_0142 cwlD mrp FALSE 0.507 145.000 0.211 1.000 N NA
 595367 5459438 BT9727_0146 rRNA-16SrRNA_5     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 5459438 5459439 rRNA-16SrRNA_5 rRNA-23SrRNA_5     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459439 5459440 rRNA-23SrRNA_5 rRNA-5SrRNA_5     FALSE 0.023 86.000 0.000 NA   NA
 5459440 5459441 rRNA-5SrRNA_5 tRNA-Asn-3     FALSE 0.055 10.000 0.000 NA   NA
 5459441 5459442 tRNA-Asn-3 tRNA-Thr-3     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459442 5459443 tRNA-Thr-3 tRNA-Glu-4     FALSE 0.058 22.000 0.000 NA   NA
 5459443 5459444 tRNA-Glu-4 tRNA-Val-6     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459444 5459445 tRNA-Val-6 tRNA-Tyr-2     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 5459445 5459446 tRNA-Tyr-2 tRNA-Gln-4     FALSE 0.032 63.000 0.000 NA   NA
 5459446 5459447 tRNA-Gln-4 tRNA-Lys-1     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459447 5459448 tRNA-Lys-1 tRNA-Gly-6     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459448 5459449 tRNA-Gly-6 tRNA-Ala-2     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459449 595380 tRNA-Ala-2 BT9727_0148   garK FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 595380 595381 BT9727_0148 BT9727_0149 garK rocF FALSE 0.132 210.000 0.000 1.000 N NA
 595381 595382 BT9727_0149 BT9727_0150 rocF   FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 595382 595383 BT9727_0150 BT9727_0151     TRUE 0.839 -7.000 0.502 NA   NA
 595383 595384 BT9727_0151 BT9727_0152   glmM TRUE 0.640 -7.000 0.150 NA   NA
 595384 595385 BT9727_0152 BT9727_0153 glmM glmS FALSE 0.020 486.000 0.030 1.000 N NA
 595387 595388 BT9727_0155 BT9727_0156   gntR FALSE 0.000 408.000 0.000 NA   NA
 595388 595389 BT9727_0156 BT9727_0157 gntR gntK TRUE 0.945 -7.000 0.680 1.000 N NA
 595389 595390 BT9727_0157 BT9727_0158 gntK gntP TRUE 0.903 117.000 0.696 1.000 Y NA
 595390 595391 BT9727_0158 BT9727_0159 gntP gntZ FALSE 0.247 265.000 0.000 1.000 Y NA
 595391 595392 BT9727_0159 BT9727_0160 gntZ   FALSE 0.047 340.000 0.047 1.000 N NA
 595392 595393 BT9727_0160 BT9727_0161     FALSE 0.216 119.000 0.100 NA   NA
 595394 595395 BT9727_0162 BT9727_0163     FALSE 0.002 241.000 0.000 NA   NA
 595398 595399 BT9727_0166 BT9727_0167     FALSE 0.199 133.000 0.137 NA   NA
 595399 595400 BT9727_0167 BT9727_0168     TRUE 0.677 -3.000 0.052 1.000   NA
 595400 595401 BT9727_0168 BT9727_0169     FALSE 0.206 76.000 0.026 NA   NA
 595401 595402 BT9727_0169 BT9727_0170   tcaB FALSE 0.218 119.000 0.104 NA   NA
 595402 595403 BT9727_0170 BT9727_0171 tcaB   FALSE 0.002 251.000 0.000 NA   NA
 595405 595406 BT9727_0173 BT9727_0174 oppB oppC TRUE 0.985 18.000 0.909 0.050 Y NA
 595406 595407 BT9727_0174 BT9727_0175 oppC oppD TRUE 0.975 -43.000 0.233 1.000 Y NA
 595407 595408 BT9727_0175 BT9727_0176 oppD oppF TRUE 0.980 -3.000 0.233 0.004 Y NA
 595408 595409 BT9727_0176 BT9727_0177 oppF oppA TRUE 0.949 14.000 0.292 1.000 Y NA
 595411 595412 BT9727_0179 BT9727_0180     FALSE 0.311 276.000 0.000 0.065 Y NA
 595412 595413 BT9727_0180 BT9727_0181     FALSE 0.554 59.000 0.333 NA   NA
 595414 595415 BT9727_0182 BT9727_0183 oppA oppA FALSE 0.182 388.000 0.000 0.001 Y NA
 595415 595416 BT9727_0183 BT9727_0184 oppA   FALSE 0.005 393.000 0.000 1.000   NA
 595416 595417 BT9727_0184 BT9727_0185   proC TRUE 0.825 2.000 0.471 1.000   NA
 595419 595420 BT9727_0187 BT9727_0188 glcU modB FALSE 0.089 302.000 0.000 0.085 N NA
 595420 595421 BT9727_0188 BT9727_0189 modB modA TRUE 0.981 6.000 0.430 0.001 Y NA
 595424 595425 BT9727_0192 BT9727_0193     FALSE 0.000 534.000 0.000 NA   NA
 595425 595426 BT9727_0193 BT9727_0194     FALSE 0.015 475.000 0.000 1.000 N NA
 595426 595427 BT9727_0194 BT9727_0195     FALSE 0.472 150.000 0.778 NA   NA
 595427 595428 BT9727_0195 BT9727_0196     FALSE 0.583 119.000 0.778 NA   NA
 595428 595429 BT9727_0196 BT9727_0197     FALSE 0.483 138.000 0.667 NA   NA
 595429 595430 BT9727_0197 BT9727_0198     FALSE 0.000 743.000 0.000 NA   NA
 595430 595431 BT9727_0198 BT9727_0199     FALSE 0.177 97.000 0.028 NA   NA
 595435 595436 BT9727_0203 BT9727_0204     FALSE 0.215 125.000 0.140 NA   NA
 595436 595437 BT9727_0204 BT9727_0205   oppA FALSE 0.002 898.000 0.000 1.000   NA
 595437 595438 BT9727_0205 BT9727_0206 oppA oppB TRUE 0.929 104.000 0.444 0.050 Y NA
 595438 595439 BT9727_0206 BT9727_0207 oppB oppC TRUE 0.983 16.000 0.850 0.050 Y NA
 595439 595440 BT9727_0207 BT9727_0208 oppC oppD TRUE 0.971 11.000 0.750 1.000 Y NA
 595440 595441 BT9727_0208 BT9727_0209 oppD oppF TRUE 0.986 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 595445 595446 BT9727_0213 BT9727_0214 hppD   TRUE 0.710 67.000 0.118 1.000 N NA
 595446 595447 BT9727_0214 BT9727_0215     TRUE 0.972 -34.000 0.101 1.000 Y NA
 595447 595448 BT9727_0215 BT9727_0216     FALSE 0.097 234.000 0.000 1.000 N NA
 595448 595449 BT9727_0216 BT9727_0217   ddl FALSE 0.023 383.000 0.000 1.000 N NA
 595449 595450 BT9727_0217 BT9727_0218 ddl murF TRUE 0.943 61.000 0.044 0.007 Y NA
 595450 595451 BT9727_0218 BT9727_0219 murF deaD FALSE 0.055 306.000 0.004 1.000 N NA
 595451 595452 BT9727_0219 BT9727_0220 deaD   TRUE 0.838 97.000 0.013 1.000 Y NA
 595454 595455 BT9727_0222 BT9727_0223 acpS   FALSE 0.510 94.000 0.038 NA N NA
 595455 595456 BT9727_0223 BT9727_0224   alr TRUE 0.802 119.000 0.194 NA Y NA
 595456 595457 BT9727_0224 BT9727_0225 alr   FALSE 0.050 310.000 0.108 NA N NA
 595457 595458 BT9727_0225 BT9727_0226     TRUE 0.818 5.000 0.260 NA N NA
 595458 595459 BT9727_0226 BT9727_0227     TRUE 0.698 62.000 0.045 1.000 N NA
 595459 595460 BT9727_0227 BT9727_0228     FALSE 0.013 370.000 0.215 NA   NA
 595460 5459450 BT9727_0228 tRNA-Asn-1     FALSE 0.017 115.000 0.000 NA   NA
 5459450 5459451 tRNA-Asn-1 tRNA-Ser-2     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459451 5459452 tRNA-Ser-2 tRNA-Glu-1     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459452 5459453 tRNA-Glu-1 tRNA-Val-3     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459453 5459454 tRNA-Val-3 tRNA-Asp-4     FALSE 0.043 44.000 0.000 NA   NA
 5459454 5459455 tRNA-Asp-4 tRNA-Gln-3     FALSE 0.023 85.000 0.000 NA   NA
 5459455 5459456 tRNA-Gln-3 tRNA-Lys-5     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459456 5459457 tRNA-Lys-5 tRNA-Leu-5     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459457 5459458 tRNA-Leu-5 tRNA-Arg-3     FALSE 0.022 93.000 0.000 NA   NA
 5459458 595470 tRNA-Arg-3 tRNA-Pro-4     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 595470 5459459 tRNA-Pro-4 tRNA-Gly-3     FALSE 0.070 -1.000 0.000 NA   NA
 5459459 5459460 tRNA-Gly-3 rRNA-16SrRNA_6     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459460 5459461 rRNA-16SrRNA_6 rRNA-23SrRNA_6     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459461 5459462 rRNA-23SrRNA_6 rRNA-5SrRNA_6     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 5459462 5459463 rRNA-5SrRNA_6 tRNA-Met-4     FALSE 0.055 10.000 0.000 NA   NA
 5459463 5459464 tRNA-Met-4 tRNA-Asp-1     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459464 595477 tRNA-Asp-1 BT9727_0230     FALSE 0.006 172.000 0.000 NA   NA
 595477 595478 BT9727_0230 BT9727_0231     TRUE 0.722 -19.000 0.217 NA   NA
 595478 595479 BT9727_0231 BT9727_0232   rimI TRUE 0.630 14.000 0.127 1.000   NA
 595479 595480 BT9727_0232 BT9727_0233 rimI gcP TRUE 0.687 0.000 0.090 1.000   NA
 595483 595484 BT9727_0236 BT9727_0237     FALSE 0.564 -3.000 0.080 NA   NA
 595485 595486 BT9727_0238 BT9727_0239 groES groEL TRUE 0.979 39.000 0.674 0.006 Y NA
 595486 595487 BT9727_0239 BT9727_0240 groEL guaA FALSE 0.022 399.000 0.000 1.000 N NA
 595487 595488 BT9727_0240 BT9727_0241 guaA   FALSE 0.005 385.000 0.000 1.000   NA
 595488 595489 BT9727_0241 BT9727_0242     FALSE 0.276 145.000 0.146 1.000   NA
 595489 595490 BT9727_0242 BT9727_0243     TRUE 0.991 -16.000 0.800 0.023 Y NA
 595490 5459465 BT9727_0243 rRNA-16SrRNA_7     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 5459465 5459466 rRNA-16SrRNA_7 rRNA-23SrRNA_7     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459466 5459467 rRNA-23SrRNA_7 rRNA-5SrRNA_7     FALSE 0.041 48.000 0.000 NA   NA
 5459467 595494 rRNA-5SrRNA_7 BT9727_0245     FALSE 0.000 724.000 0.000 NA   NA
 595494 595495 BT9727_0245 BT9727_0246   frnE FALSE 0.002 233.000 0.000 NA   NA
 595495 5459468 BT9727_0246 rRNA-16SrRNA_8 frnE   FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 5459468 5459469 rRNA-16SrRNA_8 rRNA-23SrRNA_8     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459469 5459470 rRNA-23SrRNA_8 rRNA-5SrRNA_8     FALSE 0.041 47.000 0.000 NA   NA
 5459470 595499 rRNA-5SrRNA_8 BT9727_0248   galE FALSE 0.000 486.000 0.000 NA   NA
 595499 595500 BT9727_0248 BT9727_0249 galE galE FALSE 0.139 239.000 0.000 0.001   NA
 595500 5459471 BT9727_0249 rRNA-16SrRNA_9 galE   FALSE 0.000 1135.000 0.000 NA   NA
 595504 595505 BT9727_0251 BT9727_0252 bacA bcrB TRUE 0.606 18.000 0.240 NA   NA
 595505 595506 BT9727_0252 BT9727_0253 bcrB bcrA TRUE 0.818 -16.000 0.400 NA   NA
 595506 595507 BT9727_0253 BT9727_0254 bcrA   TRUE 0.820 69.000 0.556 1.000 N NA
 595507 595508 BT9727_0254 BT9727_0255     TRUE 0.981 -19.000 0.538 1.000 Y NA
 5459473 5459474 rRNA-16SrRNA_10 rRNA-23SrRNA_9     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459474 3396254 rRNA-23SrRNA_9 BT9727_r02     FALSE 0.041 47.000 0.000 NA   NA
 3396254 595511 BT9727_r02 BT9727_0257     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 3396255 5459475 BT9727_r01 rRNA-23SrRNA_10     FALSE 0.008 159.000 0.000 NA   NA
 5459475 5459476 rRNA-23SrRNA_10 rRNA-5SrRNA_10     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 5459476 595515 rRNA-5SrRNA_10 BT9727_0260   purE FALSE 0.000 724.000 0.000 NA   NA
 595515 595516 BT9727_0260 BT9727_0261 purE purK TRUE 0.978 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 595516 595517 BT9727_0261 BT9727_0262 purK purB TRUE 0.954 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 595517 595518 BT9727_0262 BT9727_0263 purB purC TRUE 0.862 89.000 0.072 1.000 Y NA
 595518 595519 BT9727_0263 BT9727_0264 purC purS TRUE 0.976 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 595519 595520 BT9727_0264 BT9727_0265 purS purQ TRUE 0.988 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 595520 595521 BT9727_0265 BT9727_0266 purQ purL TRUE 0.988 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 595521 595522 BT9727_0266 BT9727_0267 purL purF TRUE 0.971 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 595522 595523 BT9727_0267 BT9727_0268 purF purM TRUE 0.858 107.000 0.248 1.000 Y NA
 595523 595524 BT9727_0268 BT9727_0269 purM purN TRUE 0.981 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 595524 595525 BT9727_0269 BT9727_0270 purN purH TRUE 0.949 25.000 0.225 1.000 Y NA
 595525 595526 BT9727_0270 BT9727_0271 purH purD TRUE 0.834 121.000 0.238 1.000 Y NA
 595527 595528 BT9727_0272 BT9727_0273     FALSE 0.003 210.000 0.000 NA   NA
 595529 595530 BT9727_0274 BT9727_0275   pcrA FALSE 0.466 1.000 0.049 NA   NA
 595530 595531 BT9727_0275 BT9727_0276 pcrA ligA TRUE 0.967 16.000 0.103 0.012 Y NA
 595531 595532 BT9727_0276 BT9727_0277 ligA   FALSE 0.314 17.000 0.009 NA   NA
 595532 595533 BT9727_0277 BT9727_0278     TRUE 0.657 96.000 0.800 NA   NA
 595533 595534 BT9727_0278 BT9727_0279   rocA FALSE 0.262 154.000 0.205 1.000   NA
 595536 595537 BT9727_0281 BT9727_0282     TRUE 0.970 -10.000 0.233 1.000 Y NA
 595537 595538 BT9727_0282 BT9727_0283     TRUE 0.941 22.000 0.233 NA Y NA
 595539 595540 BT9727_0284 BT9727_0285   arsA TRUE 0.886 -22.000 0.636 NA   NA
 595540 595541 BT9727_0285 BT9727_0286 arsA   TRUE 0.818 77.000 0.667 1.000 N NA
 595542 595543 BT9727_0287 BT9727_0288   gatC FALSE 0.087 142.000 0.009 NA   NA
 595543 595544 BT9727_0288 BT9727_0289 gatC gatA TRUE 0.983 16.000 0.643 0.001 Y NA
 595544 595545 BT9727_0289 BT9727_0290 gatA gatB TRUE 0.979 15.000 0.492 0.001 Y NA
 595545 595546 BT9727_0290 BT9727_0291 gatB   FALSE 0.022 471.000 0.034 1.000 N NA
 595546 595547 BT9727_0291 BT9727_0292     FALSE 0.221 140.000 0.028 1.000   NA
 595547 595548 BT9727_0292 BT9727_0293   gabT FALSE 0.188 155.000 0.045 1.000   NA
 595548 595549 BT9727_0293 BT9727_0294 gabT   TRUE 0.686 113.000 0.409 1.000 N NA
 595549 595550 BT9727_0294 BT9727_0295   gadD TRUE 0.937 -7.000 0.583 1.000 N NA
 595550 595551 BT9727_0295 BT9727_0296 gadD   TRUE 0.774 48.000 0.157 1.000 N NA
 595552 595553 BT9727_0297 BT9727_0298 ampS   FALSE 0.417 117.000 0.258 1.000   NA
 595556 595557 BT9727_0301 BT9727_0302     TRUE 0.837 97.000 0.008 1.000 Y NA
 595557 595558 BT9727_0302 BT9727_0303     FALSE 0.046 301.000 0.000 1.000 N NA
 595558 595559 BT9727_0303 BT9727_0304     FALSE 0.177 78.000 0.014 NA   NA
 595559 595560 BT9727_0304 BT9727_0305     FALSE 0.000 402.000 0.000 NA   NA
 595560 595561 BT9727_0305 BT9727_0306     FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   NA
 595562 595563 BT9727_0307 BT9727_0308     TRUE 0.811 15.000 0.189 0.088   NA
 595566 595567 BT9727_0311 BT9727_0312 amhX   FALSE 0.217 152.000 0.263 NA   NA
 595568 595569 BT9727_0313 BT9727_0314 ahpF ahpC TRUE 0.962 15.000 0.551 1.000 Y NA
 595570 595571 BT9727_0315 BT9727_0316 mtrK   FALSE 0.586 10.000 0.042 1.000   NA
 595571 595572 BT9727_0316 BT9727_0317   fucA TRUE 0.700 55.000 0.017 1.000 N NA
 595573 595574 BT9727_0318 BT9727_0319 fhuG fhuB TRUE 0.981 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 595574 595575 BT9727_0319 BT9727_0320 fhuB fhuD TRUE 0.924 73.000 0.487 1.000 Y NA
 595578 595579 BT9727_0323 BT9727_0324   cotB FALSE 0.002 236.000 0.000 NA   NA
 595579 595580 BT9727_0324 BT9727_0325 cotB cotB FALSE 0.058 21.000 0.000 NA   NA
 595580 595581 BT9727_0325 BT9727_0326 cotB   FALSE 0.008 163.000 0.000 NA   NA
 595581 595582 BT9727_0326 BT9727_0327     FALSE 0.002 236.000 0.000 NA   NA
 595582 595583 BT9727_0327 BT9727_0328     FALSE 0.000 816.000 0.000 NA   NA
 595585 595586 BT9727_0330 BT9727_0331     FALSE 0.184 122.000 0.068 NA   NA
 595587 595588 BT9727_0332 BT9727_0333     FALSE 0.516 49.000 0.053 1.000   NA
 595590 595591 BT9727_0335 BT9727_0336     TRUE 0.842 146.000 0.130 0.062 Y NA
 595591 595592 BT9727_0336 BT9727_0337   glnQ TRUE 0.852 122.000 0.348 1.000 Y NA
 595592 595593 BT9727_0337 BT9727_0338 glnQ mcp FALSE 0.344 171.000 0.133 1.000 N NA
 595594 595595 BT9727_0339 BT9727_0340 mcpA argR FALSE 0.432 154.000 0.139 1.000 N NA
 595595 595596 BT9727_0340 BT9727_0341 argR arcA FALSE 0.056 281.000 0.000 1.000 N NA
 595596 595597 BT9727_0341 BT9727_0342 arcA arcB TRUE 0.942 31.000 0.146 1.000 Y NA
 595597 595598 BT9727_0342 BT9727_0343 arcB arcD TRUE 0.862 100.000 0.188 1.000 Y NA
 595598 595599 BT9727_0343 BT9727_0344 arcD arcC TRUE 0.969 38.000 0.818 1.000 Y NA
 595599 595600 BT9727_0344 BT9727_0345 arcC   FALSE 0.232 200.000 0.088 1.000 N NA
 595600 595601 BT9727_0345 BT9727_0346     FALSE 0.172 152.000 0.176 NA   NA
 595601 595602 BT9727_0346 BT9727_0347     FALSE 0.000 390.000 0.000 NA   NA
 595602 595603 BT9727_0347 BT9727_0348   ptsG FALSE 0.510 206.000 0.167 1.000 Y NA
 595603 595604 BT9727_0348 BT9727_0349 ptsG   TRUE 0.806 5.000 0.610 NA   NA
 595604 595605 BT9727_0349 BT9727_0350     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 595607 595608 BT9727_0352 BT9727_0353 thiM thiE TRUE 0.968 17.000 0.061 0.004 Y NA
 595610 595611 BT9727_0355 BT9727_0356 cheW   FALSE 0.002 264.000 0.000 NA   NA
 595611 595612 BT9727_0356 BT9727_0357     TRUE 0.824 -52.000 0.364 NA   NA
 595612 595613 BT9727_0357 BT9727_0358     TRUE 0.971 -3.000 0.584 NA Y NA
 595613 595614 BT9727_0358 BT9727_0359     TRUE 0.970 -3.000 0.554 NA Y NA
 595614 595615 BT9727_0359 BT9727_0360     FALSE 0.245 68.000 0.032 NA   NA
 595615 595616 BT9727_0360 BT9727_0361     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 595618 595619 BT9727_0363 BT9727_0364     FALSE 0.451 11.000 0.065 NA   NA
 595619 595620 BT9727_0364 BT9727_0365     FALSE 0.375 14.000 0.037 NA   NA
 595620 595621 BT9727_0365 BT9727_0366     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 595621 595622 BT9727_0366 BT9727_0367     TRUE 0.763 67.000 0.714 1.000   NA
 595622 595623 BT9727_0367 BT9727_0368     TRUE 0.653 57.000 0.333 1.000   NA
 595623 595624 BT9727_0368 BT9727_0369     FALSE 0.417 52.000 0.143 NA   NA
 595625 595626 BT9727_0370 BT9727_0371     FALSE 0.336 109.000 0.068 1.000   NA
 595627 595628 BT9727_0372 BT9727_0373   proS FALSE 0.001 348.000 0.000 NA   NA
 595630 595631 BT9727_0375 BT9727_0376   terD FALSE 0.533 129.000 0.145 1.000 N NA
 595631 595632 BT9727_0376 BT9727_0377 terD terD TRUE 0.978 18.000 0.364 0.003 Y NA
 595632 595633 BT9727_0377 BT9727_0378 terD   TRUE 0.956 81.000 0.571 0.003 Y NA
 595633 595634 BT9727_0378 BT9727_0379     TRUE 0.742 74.000 0.308 1.000 N NA
 595634 595635 BT9727_0379 BT9727_0380     FALSE 0.326 110.000 0.256 NA   NA
 595635 595636 BT9727_0380 BT9727_0381     TRUE 0.834 19.000 0.727 NA   NA
 595637 595638 BT9727_0382 BT9727_0383 pacL   FALSE 0.074 192.000 0.125 NA   NA
 595639 595640 BT9727_0384 BT9727_0385 ptp   FALSE 0.256 54.000 0.019 NA   NA
 595640 595641 BT9727_0385 BT9727_0386   rbn TRUE 0.630 7.000 0.273 NA   NA
 595642 595643 BT9727_0387 BT9727_0388     FALSE 0.324 34.000 0.018 NA   NA
 595644 595645 BT9727_0389 BT9727_0390     FALSE 0.148 123.000 0.039 NA   NA
 595650 595651 BT9727_0395 BT9727_0396     FALSE 0.000 409.000 0.000 NA   NA
 595652 595653 BT9727_0397 BT9727_0398     FALSE 0.356 82.000 0.212 NA   NA
 595655 595656 BT9727_0400 BT9727_0401   fumA FALSE 0.055 207.000 0.093 NA   NA
 595656 595657 BT9727_0401 BT9727_0402 fumA   FALSE 0.554 127.000 0.185 1.000 N NA
 595657 595658 BT9727_0402 BT9727_0403   alkA TRUE 0.740 60.000 0.160 1.000 N NA
 595658 595659 BT9727_0403 BT9727_0404 alkA   TRUE 0.825 11.000 0.164 1.000 N NA
 595659 595660 BT9727_0404 BT9727_0405   truA TRUE 0.941 57.000 0.016 0.018 Y NA
 595661 595662 BT9727_0406 BT9727_0407   rocR FALSE 0.432 84.000 0.304 NA   NA
 595663 595664 BT9727_0408 BT9727_0409   rocE FALSE 0.562 107.000 0.636 NA   NA
 595664 595665 BT9727_0409 BT9727_0410 rocE argE TRUE 0.876 96.000 0.259 1.000 Y NA
 595668 595669 BT9727_0413 BT9727_0414   glsA FALSE 0.169 176.000 0.320 NA   NA
 595670 595671 BT9727_0415 BT9727_0416 nagE pbpX FALSE 0.104 228.000 0.000 1.000 N NA
 595671 595672 BT9727_0416 BT9727_0417 pbpX   FALSE 0.359 84.000 0.222 NA   NA
 595672 595673 BT9727_0417 BT9727_0418     FALSE 0.151 167.000 0.231 NA   NA
 595673 595674 BT9727_0418 BT9727_0419     TRUE 0.899 -31.000 0.692 NA   NA
 595674 595675 BT9727_0419 BT9727_0420     TRUE 0.795 14.000 0.667 NA   NA
 595675 595676 BT9727_0420 BT9727_0421     TRUE 0.975 -10.000 0.533 NA Y NA
 595676 595677 BT9727_0421 BT9727_0422   galE TRUE 0.957 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 595677 595678 BT9727_0422 BT9727_0423 galE   FALSE 0.582 -19.000 0.050 NA   NA
 595678 595679 BT9727_0423 BT9727_0424   pflB FALSE 0.001 340.000 0.000 NA   NA
 595679 595680 BT9727_0424 BT9727_0425 pflB pflA TRUE 0.699 70.000 0.135 1.000 N NA
 595680 595681 BT9727_0425 BT9727_0426 pflA ugtP FALSE 0.020 413.000 0.000 1.000 N NA
 595682 595683 BT9727_0427 BT9727_0428   hutI FALSE 0.061 242.000 0.000 NA N NA
 595683 595684 BT9727_0428 BT9727_0429 hutI   FALSE 0.313 141.000 0.200 1.000   NA
 595685 595686 BT9727_0430 BT9727_0431 recX   FALSE 0.412 10.000 0.045 NA   NA
 595686 595687 BT9727_0431 BT9727_0432     FALSE 0.005 541.000 0.116 NA   NA
 595691 595692 BT9727_0436 BT9727_0437 sspE   FALSE 0.152 189.000 0.364 NA   NA
 595692 595693 BT9727_0437 BT9727_0438     FALSE 0.030 233.000 0.058 NA   NA
 595693 595694 BT9727_0438 BT9727_0439     TRUE 0.669 55.000 0.077 NA N NA
 595695 595696 BT9727_0440 BT9727_0441   gltB FALSE 0.023 261.000 0.066 NA   NA
 595696 595697 BT9727_0441 BT9727_0442 gltB gsaB FALSE 0.212 199.000 0.036 1.000 N NA
 595698 595699 BT9727_0443 BT9727_0444     TRUE 0.829 -7.000 0.488 NA   NA
 595699 595700 BT9727_0444 BT9727_0445     TRUE 0.768 5.000 0.500 NA   NA
 595700 595701 BT9727_0445 BT9727_0446   lctB FALSE 0.373 73.000 0.188 NA   NA
 595701 595702 BT9727_0446 BT9727_0447 lctB bcp FALSE 0.278 45.000 0.015 NA   NA
 595702 595703 BT9727_0447 BT9727_0448 bcp perR FALSE 0.064 293.000 0.005 1.000 N NA
 5459477 5459478 rRNA-16SrRNA_11 rRNA-23SrRNA_11     FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 5459478 5459479 rRNA-23SrRNA_11 rRNA-5SrRNA_11     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459479 5459480 rRNA-5SrRNA_11 tRNA-Asn-4     FALSE 0.055 9.000 0.000 NA   NA
 5459480 5459481 tRNA-Asn-4 tRNA-Ser-3     FALSE 0.068 0.000 0.000 NA   NA
 5459481 5459482 tRNA-Ser-3 tRNA-Glu-3     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 5459482 5459483 tRNA-Glu-3 tRNA-Val-4     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459483 5459484 tRNA-Val-4 tRNA-Met-3     FALSE 0.058 22.000 0.000 NA   NA
 5459484 5459485 tRNA-Met-3 tRNA-Asp-5     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459485 5459486 tRNA-Asp-5 tRNA-Phe-2     FALSE 0.057 7.000 0.000 NA   NA
 5459486 5459487 tRNA-Phe-2 tRNA-Thr-5     FALSE 0.054 16.000 0.000 NA   NA
 5459487 5459488 tRNA-Thr-5 tRNA-Tyr-1     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459488 5459489 tRNA-Tyr-1 tRNA-Trp-2     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 5459489 5459490 tRNA-Trp-2 tRNA-His-1     FALSE 0.056 17.000 0.000 NA   NA
 5459490 5459491 tRNA-His-1 tRNA-Gln-2     FALSE 0.033 61.000 0.000 NA   NA
 5459491 595720 tRNA-Gln-2 tRNA-Gly-9     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 595720 5459492 tRNA-Gly-9 tRNA-Cys-1     FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 5459492 5459493 tRNA-Cys-1 tRNA-Leu-2     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 595724 595725 BT9727_0453 BT9727_0454   mutT FALSE 0.072 151.000 0.008 NA   NA
 595725 595726 BT9727_0454 BT9727_0455 mutT   FALSE 0.003 487.000 0.000 1.000   NA
 595726 595727 BT9727_0455 BT9727_0456   bdbD FALSE 0.146 182.000 0.123 1.000   NA
 595727 5459494 BT9727_0456 tRNA-Gly-8 bdbD   FALSE 0.017 116.000 0.000 NA   NA
 5459494 595729 tRNA-Gly-8 BT9727_0457     FALSE 0.004 196.000 0.000 NA   NA
 595729 595730 BT9727_0457 BT9727_0458     FALSE 0.476 45.000 0.174 NA   NA
 595730 595731 BT9727_0458 BT9727_0459   cspR FALSE 0.374 59.000 0.097 NA   NA
 595731 595732 BT9727_0459 BT9727_0460 cspR   FALSE 0.475 128.000 0.016 1.000 N NA
 595732 595733 BT9727_0460 BT9727_0461   prkA FALSE 0.092 392.000 0.000 1.000 Y NA
 595733 595734 BT9727_0461 BT9727_0462 prkA   FALSE 0.027 446.000 0.683 NA   NA
 595734 595735 BT9727_0462 BT9727_0463     FALSE 0.172 87.000 0.018 NA   NA
 595735 595736 BT9727_0463 BT9727_0464     FALSE 0.369 162.000 0.500 1.000   NA
 595738 595739 BT9727_0466 BT9727_0467 colA   FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 595739 595740 BT9727_0467 BT9727_0468     TRUE 0.730 13.000 0.464 NA   NA
 595740 595741 BT9727_0468 BT9727_0469   cheW FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 595741 595742 BT9727_0469 BT9727_0470 cheW citS TRUE 0.896 152.000 0.600 0.016 Y NA
 595742 595743 BT9727_0470 BT9727_0471 citS   TRUE 0.985 0.000 0.818 0.087 Y NA
 595745 595746 BT9727_0473 BT9727_0474     FALSE 0.198 132.000 0.125 NA   NA
 595746 595747 BT9727_0474 BT9727_0475     FALSE 0.000 410.000 0.000 NA   NA
 595747 595748 BT9727_0475 BT9727_0476   glpP FALSE 0.000 559.000 0.000 NA   NA
 595748 595749 BT9727_0476 BT9727_0477 glpP   TRUE 0.920 -36.000 0.262 1.000 N NA
 595749 595750 BT9727_0477 BT9727_0478     TRUE 0.979 0.000 0.391 0.048 Y NA
 595750 595751 BT9727_0478 BT9727_0479     TRUE 0.988 -3.000 0.848 0.048 Y NA
 595751 595752 BT9727_0479 BT9727_0480     TRUE 0.982 22.000 0.708 0.048 Y NA
 595752 595753 BT9727_0480 BT9727_0481   pphA FALSE 0.004 420.000 0.000 1.000   NA
 595753 595754 BT9727_0481 BT9727_0482 pphA llrF FALSE 0.238 150.000 0.091 1.000   NA
 595754 595755 BT9727_0482 BT9727_0483 llrF   TRUE 0.976 -3.000 0.606 1.000 Y NA
 595755 595756 BT9727_0483 BT9727_0484     FALSE 0.003 207.000 0.000 NA   NA
 595756 595757 BT9727_0484 BT9727_0485     TRUE 0.792 8.000 0.600 NA   NA
 595757 595758 BT9727_0485 BT9727_0486   mcpA FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 595758 595759 BT9727_0486 BT9727_0487 mcpA   TRUE 0.935 79.000 0.229 0.006 Y NA
 595759 595760 BT9727_0487 BT9727_0488     TRUE 0.976 -3.000 0.229 0.087 Y NA
 595760 595761 BT9727_0488 BT9727_0489   maeN FALSE 0.584 123.000 0.243 1.000 N NA
 595761 595762 BT9727_0489 BT9727_0490 maeN sfcA TRUE 0.935 60.000 0.432 1.000 Y NA
 595763 595764 BT9727_0491 BT9727_0492     FALSE 0.438 116.000 0.429 NA   NA
 595766 595767 BT9727_0494 BT9727_0495     FALSE 0.505 147.000 0.636 1.000   NA
 595767 595768 BT9727_0495 BT9727_0496   llrF TRUE 0.948 66.000 0.727 1.000 Y NA
 595768 595769 BT9727_0496 BT9727_0497 llrF   FALSE 0.010 834.000 0.000 1.000 N NA
 595769 595770 BT9727_0497 BT9727_0498   fdhD FALSE 0.102 229.000 0.000 1.000 N NA
 595771 595772 BT9727_0499 BT9727_0500 fdhF   TRUE 0.744 13.000 0.500 NA   NA
 595772 595773 BT9727_0500 BT9727_0502   glpQ FALSE 0.141 157.000 0.143 NA   NA
 595773 595774 BT9727_0502 BT9727_0503 glpQ ald FALSE 0.026 369.000 0.000 1.000 N NA
 595774 595775 BT9727_0503 BT9727_0504 ald   TRUE 0.927 104.000 0.889 1.000 Y NA
 595775 595776 BT9727_0504 BT9727_0505   arsR FALSE 0.067 267.000 0.000 1.000 N NA
 595776 595777 BT9727_0505 BT9727_0506 arsR   TRUE 0.837 25.000 0.203 1.000 N NA
 595779 595780 BT9727_0508 BT9727_0509 nprR npr FALSE 0.012 295.000 0.000 1.000   NA
 595782 595783 BT9727_0511 BT9727_0512     TRUE 0.819 16.000 0.727 NA   NA
 595785 595786 BT9727_0514 BT9727_0515     TRUE 0.887 135.000 0.333 0.052 Y NA
 595787 595788 BT9727_0516 BT9727_0517 lytR nupC FALSE 0.120 264.000 0.333 NA N NA
 595789 595790 BT9727_0518 BT9727_0519 gloA   FALSE 0.127 108.000 0.010 NA   NA
 595790 595791 BT9727_0519 BT9727_0520   aspA FALSE 0.156 163.000 0.222 NA   NA
 595793 595794 BT9727_0522 BT9727_0523 arsR sspH FALSE 0.394 123.000 0.261 1.000   NA
 595795 595796 BT9727_0524 BT9727_0525 ptr2 fecB FALSE 0.024 382.000 0.000 1.000 N NA
 595797 595798 BT9727_0526 BT9727_0527   fecD TRUE 0.978 -3.000 0.273 0.048 Y NA
 595798 595799 BT9727_0527 BT9727_0528 fecD fecE TRUE 0.948 13.000 0.273 1.000 Y NA
 595801 595802 BT9727_0530 BT9727_0531 bioF   TRUE 0.784 45.000 0.165 1.000 N NA
 595802 595803 BT9727_0531 BT9727_0532   pyrE FALSE 0.580 89.000 0.009 1.000 N NA
 595803 595804 BT9727_0532 BT9727_0533 pyrE   TRUE 0.866 -13.000 0.012 1.000 N NA
 595805 595806 BT9727_0534 BT9727_0535   norQ TRUE 0.855 4.000 0.822 NA   NA
 595806 595807 BT9727_0535 BT9727_0536 norQ cls FALSE 0.324 128.000 0.156 1.000   NA
 595808 595809 BT9727_0537 BT9727_0538     TRUE 0.715 31.000 0.429 NA   NA
 595809 595810 BT9727_0538 BT9727_0539     FALSE 0.001 359.000 0.000 NA   NA
 595812 595813 BT9727_0541 BT9727_0542 treR treB FALSE 0.490 142.000 0.115 1.000 N NA
 595813 595814 BT9727_0542 BT9727_0543 treB treC TRUE 0.966 14.000 0.650 1.000 Y NA
 595815 595816 BT9727_0544 BT9727_0545 gerKC gerKB TRUE 0.964 -19.000 0.833 0.009   NA
 595816 595817 BT9727_0545 BT9727_0546 gerKB gerKA TRUE 0.940 -19.000 0.412 0.009   NA
 595818 595819 BT9727_0547 BT9727_0548     TRUE 0.705 24.000 0.385 NA   NA
 595819 595820 BT9727_0548 BT9727_0549   alsT FALSE 0.299 158.000 0.462 NA   NA
 595820 595821 BT9727_0549 BT9727_0551 alsT glnQ TRUE 0.792 134.000 0.093 1.000 Y NA
 595821 595822 BT9727_0551 BT9727_0552 glnQ glnH TRUE 0.955 13.000 0.389 1.000 Y NA
 595822 595823 BT9727_0552 BT9727_0553 glnH glnP TRUE 0.948 63.000 0.280 0.060 Y NA
 595823 595824 BT9727_0553 BT9727_0554 glnP glnP TRUE 0.988 1.000 0.947 0.007 Y NA
 595824 595825 BT9727_0554 BT9727_0555 glnP rocE FALSE 0.543 205.000 0.000 0.082 Y NA
 595825 595826 BT9727_0555 BT9727_0556 rocE   TRUE 0.914 -25.000 0.242 1.000 N NA
 595826 595827 BT9727_0556 BT9727_0557     TRUE 0.722 63.000 0.111 1.000 N NA
 595827 595828 BT9727_0557 BT9727_0558   rpoD FALSE 0.301 178.000 0.079 1.000 N NA
 595828 595829 BT9727_0558 BT9727_0559 rpoD   TRUE 0.672 -34.000 0.100 NA   NA
 595832 595833 BT9727_0562 BT9727_0563 lcoS lcoR TRUE 0.963 12.000 0.538 1.000 Y NA
 595834 595835 BT9727_0564 BT9727_0565     FALSE 0.428 158.000 0.778 NA   NA
 595835 595836 BT9727_0565 BT9727_0566   uspA TRUE 0.841 66.000 0.615 1.000 N NA
 595837 595838 BT9727_0567 BT9727_0568 oppA oppC TRUE 0.964 15.000 0.195 0.048 Y NA
 595838 595839 BT9727_0568 BT9727_0569 oppC oppB TRUE 0.983 19.000 0.727 0.048 Y NA
 595839 595840 BT9727_0569 BT9727_0570 oppB oppF TRUE 0.850 15.000 0.727 1.000   NA
 595840 595841 BT9727_0570 BT9727_0571 oppF oppD TRUE 0.947 -13.000 0.477 0.003   NA
 595841 595842 BT9727_0571 BT9727_0572 oppD glpT FALSE 0.054 285.000 0.000 1.000 N NA
 595843 595844 BT9727_0573 BT9727_0574     TRUE 0.876 20.000 0.351 1.000 N NA
 595844 595845 BT9727_0574 BT9727_0575   rbsR FALSE 0.587 138.000 0.333 1.000 N NA
 595845 595846 BT9727_0575 BT9727_0576 rbsR rbsK TRUE 0.807 14.000 0.109 1.000 N NA
 595846 595847 BT9727_0576 BT9727_0577 rbsK rbsD TRUE 0.961 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 595847 595848 BT9727_0577 BT9727_0578 rbsD rbsA TRUE 0.953 19.000 0.243 1.000 Y NA
 595848 595849 BT9727_0578 BT9727_0579 rbsA rbsC TRUE 0.980 3.000 0.358 0.002 Y NA
 595849 595850 BT9727_0579 BT9727_0580 rbsC rbsB TRUE 0.985 15.000 0.847 0.002 Y NA
 595850 595851 BT9727_0580 BT9727_0581 rbsB tal TRUE 0.931 35.000 0.032 1.000 Y NA
 595851 595852 BT9727_0581 BT9727_0582 tal inA FALSE 0.009 318.000 0.000 1.000   NA
 595852 595853 BT9727_0582 BT9727_0583 inA   FALSE 0.001 319.000 0.000 NA   NA
 595855 595856 BT9727_0585 BT9727_0586 adhB   FALSE 0.180 119.000 0.059 NA   NA
 595856 595857 BT9727_0586 BT9727_0587   plc FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 595857 595858 BT9727_0587 BT9727_0588 plc spH TRUE 0.797 -61.000 0.125 1.000   NA
 595858 595859 BT9727_0588 BT9727_0589 spH   FALSE 0.206 108.000 0.063 NA   NA
 595859 595860 BT9727_0589 BT9727_0590     TRUE 0.926 -12.000 0.571 NA N NA
 595863 595864 BT9727_0593 BT9727_0594 bacA mcpC FALSE 0.510 133.000 0.085 1.000 N NA
 595865 595866 BT9727_0595 BT9727_0596     TRUE 0.639 104.000 0.233 1.000 N NA
 595866 595867 BT9727_0596 BT9727_0597     TRUE 0.834 -7.000 0.500 NA   NA
 595867 595868 BT9727_0597 BT9727_0598     FALSE 0.442 117.000 0.438 NA   NA
 595870 595871 BT9727_0600 BT9727_0601 brnQ   FALSE 0.189 136.000 0.121 NA   NA
 595872 595873 BT9727_0602 BT9727_0603   proY FALSE 0.157 182.000 0.171 1.000   NA
 595874 595875 BT9727_0604 BT9727_0605     FALSE 0.583 138.000 0.750 1.000   NA
 595875 595876 BT9727_0605 BT9727_0606     TRUE 0.710 5.000 0.375 NA   NA
 595877 595878 BT9727_0607 BT9727_0608     FALSE 0.491 15.000 0.125 NA   NA
 595878 595879 BT9727_0608 BT9727_0609   napA FALSE 0.283 72.000 0.062 NA   NA
 595879 595880 BT9727_0609 BT9727_0610 napA qoxD FALSE 0.202 223.000 0.000 0.081 N NA
 595880 595881 BT9727_0610 BT9727_0611 qoxD qoxC TRUE 0.979 1.000 0.959 1.000 Y NA
 595881 595882 BT9727_0611 BT9727_0612 qoxC qoxB TRUE 0.983 14.000 0.957 0.041 Y NA
 595882 595883 BT9727_0612 BT9727_0613 qoxB qoxA TRUE 0.972 25.000 0.234 0.007 Y NA
 595883 595884 BT9727_0613 BT9727_0614 qoxA   FALSE 0.001 282.000 0.000 NA   NA
 595885 595886 BT9727_0615 BT9727_0616   amaA FALSE 0.526 132.000 0.727 NA   NA
 595886 595887 BT9727_0616 BT9727_0617 amaA   TRUE 0.669 2.000 0.286 NA   NA
 595887 595888 BT9727_0617 BT9727_0618     TRUE 0.813 -3.000 0.500 NA   NA
 595888 595889 BT9727_0618 BT9727_0619   gerLA FALSE 0.520 102.000 0.353 1.000   NA
 595889 595890 BT9727_0619 BT9727_0620 gerLA gerLB TRUE 0.936 1.000 0.706 0.009   NA
 595890 595891 BT9727_0620 BT9727_0621 gerLB gerLC TRUE 0.925 -25.000 0.235 0.009   NA
 595892 595893 BT9727_0622 BT9727_0623 feoB feoB TRUE 0.955 -22.000 0.556 0.003   NA
 595893 595894 BT9727_0623 BT9727_0624 feoB feoA TRUE 0.772 -3.000 0.250 1.000   NA
 595895 595896 BT9727_0625 BT9727_0626 pstS pstC TRUE 0.904 68.000 0.206 1.000 Y NA
 595896 595897 BT9727_0626 BT9727_0627 pstC pstA TRUE 0.988 3.000 0.907 0.002 Y NA
 595897 595898 BT9727_0627 BT9727_0628 pstA   FALSE 0.058 186.000 0.048 NA   NA
 5459495 5459496 rRNA-16SrRNA_12 rRNA-23SrRNA_12     FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 5459496 5459497 rRNA-23SrRNA_12 rRNA-5SrRNA_12     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459497 595903 rRNA-5SrRNA_12 tRNA-Val-7     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 595903 5459498 tRNA-Val-7 tRNA-Tyr-3     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459498 5459499 tRNA-Tyr-3 tRNA-Gln-1     FALSE 0.055 9.000 0.000 NA   NA
 5459499 595906 tRNA-Gln-1 tRNA-Lys-6     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 595906 5459500 tRNA-Lys-6 tRNA-Leu-1     FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 5459500 5459501 tRNA-Leu-1 tRNA-Gly-4     FALSE 0.055 27.000 0.000 NA   NA
 5459501 5459502 tRNA-Gly-4 tRNA-Leu-7     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459502 5459503 tRNA-Leu-7 tRNA-Arg-1     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459503 5459504 tRNA-Arg-1 tRNA-Pro-3     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459504 5459505 tRNA-Pro-3 tRNA-Ala-6     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459505 5459506 tRNA-Ala-6 tRNA-Ser-6     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 5459506 5459507 tRNA-Ser-6 tRNA-Ser-1     FALSE 0.037 53.000 0.000 NA   NA
 5459507 5459508 tRNA-Ser-1 tRNA-Met-6     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 5459508 5459509 tRNA-Met-6 tRNA-Asp-3     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459509 5459510 tRNA-Asp-3 tRNA-Phe-1     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459510 595918 tRNA-Phe-1 tRNA-Thr-6     FALSE 0.057 7.000 0.000 NA   NA
 595918 5459511 tRNA-Thr-6 tRNA-Trp-1     FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 5459511 5459512 tRNA-Trp-1 tRNA-Ile-3     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459512 5459513 tRNA-Ile-3 tRNA-Asn-5     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459513 5459514 tRNA-Asn-5 tRNA-Glu-5     FALSE 0.070 -1.000 0.000 NA   NA
 5459514 595923 tRNA-Glu-5 BT9727_0631     FALSE 0.014 127.000 0.000 NA   NA
 595923 595924 BT9727_0631 BT9727_0632     FALSE 0.001 295.000 0.000 NA   NA
 595925 595926 BT9727_0633 BT9727_0634     TRUE 0.835 6.000 0.750 NA   NA
 595927 595928 BT9727_0635 BT9727_0636 tenA   TRUE 0.905 -31.000 0.145 1.000 N NA
 595928 595929 BT9727_0636 BT9727_0637     TRUE 0.978 0.000 0.826 1.000 Y NA
 595929 595930 BT9727_0637 BT9727_0638     TRUE 0.975 -3.000 0.135 0.047 Y NA
 595930 595931 BT9727_0638 BT9727_0639   thiE TRUE 0.800 11.000 0.054 1.000 N NA
 595931 595932 BT9727_0639 BT9727_0640 thiE goxB TRUE 0.890 -7.000 0.194 1.000 N NA
 595932 595933 BT9727_0640 BT9727_0641 goxB thiS TRUE 0.838 16.000 0.239 1.000 N NA
 595933 595934 BT9727_0641 BT9727_0642 thiS thiG TRUE 0.956 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 595934 595935 BT9727_0642 BT9727_0643 thiG thiF TRUE 0.975 -7.000 0.012 0.045 Y NA
 595935 595936 BT9727_0643 BT9727_0644 thiF thiD TRUE 0.945 16.000 0.195 1.000 Y NA
 595936 595937 BT9727_0644 BT9727_0645 thiD   FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 595939 595940 BT9727_0647 BT9727_0648 kdpA kdpB TRUE 0.969 11.000 0.035 0.001 Y NA
 595940 595941 BT9727_0648 BT9727_0649 kdpB kdpC TRUE 0.987 17.000 0.877 0.001 Y NA
 595941 595942 BT9727_0649 BT9727_0650 kdpC kdpD FALSE 0.499 57.000 0.066 1.000   NA
 595944 595945 BT9727_0652 BT9727_0653     FALSE 0.510 129.000 0.500 1.000   NA
 595945 595946 BT9727_0653 BT9727_0654     FALSE 0.116 193.000 0.286 NA   NA
 595946 595947 BT9727_0654 BT9727_0655     TRUE 0.592 119.000 0.800 NA   NA
 595947 595948 BT9727_0655 BT9727_0656     TRUE 0.819 1.000 0.600 NA   NA
 595948 595949 BT9727_0656 BT9727_0657     TRUE 0.862 1.000 0.800 NA   NA
 595949 595950 BT9727_0657 BT9727_0658     TRUE 0.870 -19.000 0.571 NA   NA
 595951 595952 BT9727_0659 BT9727_0660 rbsC rbsA TRUE 0.993 -16.000 0.952 0.002 Y NA
 595952 595953 BT9727_0660 BT9727_0661 rbsA rbsB TRUE 0.960 0.000 0.403 NA Y NA
 595953 595954 BT9727_0661 BT9727_0662 rbsB   FALSE 0.001 287.000 0.000 NA   NA
 595955 595956 BT9727_0663 BT9727_0664     TRUE 0.593 67.000 0.438 NA   NA
 595956 595957 BT9727_0664 BT9727_0665     TRUE 0.747 56.000 0.727 NA   NA
 595958 595959 BT9727_0666 BT9727_0667 scrK scrB TRUE 0.960 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 595959 595960 BT9727_0667 BT9727_0668 scrB scrA TRUE 0.946 18.000 0.100 1.000 Y NA
 595960 595961 BT9727_0668 BT9727_0669 scrA scrR FALSE 0.527 129.000 0.113 1.000 N NA
 595961 595962 BT9727_0669 BT9727_0670 scrR   FALSE 0.180 118.000 0.056 NA   NA
 595962 595963 BT9727_0670 BT9727_0671   trxA FALSE 0.341 73.000 0.148 NA   NA
 595963 595964 BT9727_0671 BT9727_0672 trxA dsbB TRUE 0.833 13.000 0.073 0.005   NA
 595964 595965 BT9727_0672 BT9727_0673 dsbB   FALSE 0.117 166.000 0.127 NA   NA
 595965 595966 BT9727_0673 BT9727_0674     FALSE 0.385 118.000 0.364 NA   NA
 595966 595967 BT9727_0674 BT9727_0675     TRUE 0.675 46.000 0.444 NA   NA
 595967 595968 BT9727_0675 BT9727_0676   gerAC TRUE 0.910 13.000 0.600 0.009   NA
 595968 595969 BT9727_0676 BT9727_0677 gerAC gerA TRUE 0.953 -3.000 0.867 0.009   NA
 595969 595970 BT9727_0677 BT9727_0678 gerA   FALSE 0.418 127.000 0.462 NA   NA
 595971 595972 BT9727_0679 BT9727_0680   spoVR FALSE 0.136 116.000 0.019 NA   NA
 595972 595973 BT9727_0680 BT9727_0681 spoVR   FALSE 0.135 108.000 0.014 NA   NA
 595973 595974 BT9727_0681 BT9727_0682     FALSE 0.006 174.000 0.000 NA   NA
 595974 595975 BT9727_0682 BT9727_0683     TRUE 0.776 -9.000 0.333 NA   NA
 595975 595976 BT9727_0683 BT9727_0684   ndh FALSE 0.000 477.000 0.000 NA   NA
 595976 595977 BT9727_0684 BT9727_0685 ndh   FALSE 0.084 186.000 0.143 NA   NA
 595977 595978 BT9727_0685 BT9727_0686     FALSE 0.289 89.000 0.127 NA   NA
 595978 595979 BT9727_0686 BT9727_0687     TRUE 0.692 39.000 0.286 1.000   NA
 595979 595980 BT9727_0687 BT9727_0688     TRUE 0.671 32.000 0.207 1.000   NA
 595980 595981 BT9727_0688 BT9727_0689     TRUE 0.768 31.000 0.154 NA N NA
 595981 595982 BT9727_0689 BT9727_0690     TRUE 0.947 15.000 0.410 NA Y NA
 595982 595983 BT9727_0690 BT9727_0691     FALSE 0.440 61.000 0.211 NA   NA
 595983 595984 BT9727_0691 BT9727_0692     FALSE 0.532 34.000 0.184 NA   NA
 595985 595986 BT9727_0693 BT9727_0694     FALSE 0.432 149.000 0.667 NA   NA
 595986 595987 BT9727_0694 BT9727_0695   trk FALSE 0.015 388.000 0.000 NA N NA
 595987 595988 BT9727_0695 BT9727_0696 trk   FALSE 0.242 267.000 0.000 1.000 Y NA
 595988 595989 BT9727_0696 BT9727_0697   norA FALSE 0.035 331.000 0.000 1.000 N NA
 595990 595991 BT9727_0698 BT9727_0699   licT FALSE 0.476 73.000 0.149 1.000   NA
 595991 595992 BT9727_0699 BT9727_0700 licT celC TRUE 0.761 112.000 0.149 0.006 N NA
 595992 595993 BT9727_0700 BT9727_0701 celC celA TRUE 0.986 2.000 0.778 0.006 Y NA
 595993 595994 BT9727_0701 BT9727_0702 celA celB TRUE 0.954 83.000 0.583 0.006 Y NA
 595994 595995 BT9727_0702 BT9727_0703 celB   TRUE 0.877 -24.000 0.583 NA   NA
 595995 595996 BT9727_0703 BT9727_0704     TRUE 0.885 -10.000 0.700 NA   NA
 595997 595998 BT9727_0706 BT9727_0707     FALSE 0.008 571.000 0.000 NA N NA
 595998 595999 BT9727_0707 BT9727_0708     TRUE 0.973 3.000 0.889 NA Y NA
 595999 596000 BT9727_0708 BT9727_0709     TRUE 0.949 -3.000 0.889 1.000 N NA
 596001 596002 BT9727_0710 BT9727_0711   oppB FALSE 0.446 88.000 0.333 NA   NA
 596002 596003 BT9727_0711 BT9727_0712 oppB oppC TRUE 0.986 2.000 0.875 0.047 Y NA
 596004 596005 BT9727_0713 BT9727_0714 brnQ cotJC FALSE 0.112 219.000 0.000 1.000 N NA
 596005 596006 BT9727_0714 BT9727_0715 cotJC cotJB TRUE 0.783 13.000 0.438 1.000   NA
 596006 596007 BT9727_0715 BT9727_0716 cotJB cotJA TRUE 0.820 -3.000 0.516 NA   NA
 596008 596009 BT9727_0717 BT9727_0718     TRUE 0.593 15.000 0.259 NA   NA
 596011 596012 BT9727_0720 BT9727_0721   dedA TRUE 0.687 11.000 0.368 NA   NA
 596012 596013 BT9727_0721 BT9727_0722 dedA   FALSE 0.489 111.000 0.500 NA   NA
 596013 596014 BT9727_0722 BT9727_0723     TRUE 0.817 21.000 0.667 NA   NA
 596014 596015 BT9727_0723 BT9727_0724     FALSE 0.043 44.000 0.000 NA   NA
 596017 596018 BT9727_0726 BT9727_0727     FALSE 0.505 80.000 0.400 NA   NA
 596020 596021 BT9727_0729 BT9727_0730 napA   FALSE 0.561 126.000 0.778 NA   NA
 596021 596022 BT9727_0730 BT9727_0731     TRUE 0.602 30.000 0.259 NA   NA
 596022 596023 BT9727_0731 BT9727_0732     FALSE 0.518 155.000 0.156 0.001   NA
 596023 596024 BT9727_0732 BT9727_0733   scrA TRUE 0.762 24.000 0.344 1.000   NA
 596024 596025 BT9727_0733 BT9727_0734 scrA   TRUE 0.693 49.000 0.357 1.000   NA
 596025 596026 BT9727_0734 BT9727_0735   yfiD FALSE 0.126 161.000 0.113 NA   NA
 596026 596027 BT9727_0735 BT9727_0736 yfiD   FALSE 0.292 156.000 0.429 NA   NA
 596027 596028 BT9727_0736 BT9727_0737     TRUE 0.794 0.000 0.500 NA   NA
 596030 596031 BT9727_0739 BT9727_0740     FALSE 0.480 129.000 0.027 1.000 N NA
 596031 596032 BT9727_0740 BT9727_0741     FALSE 0.009 1016.000 0.000 1.000 N NA
 596032 596033 BT9727_0741 BT9727_0742     TRUE 0.984 3.000 0.846 0.080 Y NA
 596033 596034 BT9727_0742 BT9727_0743     TRUE 0.676 130.000 0.538 1.000 N NA
 596034 596035 BT9727_0743 BT9727_0744   blT FALSE 0.128 211.000 0.000 1.000 N NA
 596037 596038 BT9727_0746 BT9727_0747     TRUE 0.634 20.000 0.267 NA   NA
 596041 596042 BT9727_0750 BT9727_0751     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 596042 596043 BT9727_0751 BT9727_0752   katB TRUE 0.676 24.000 0.176 1.000   NA
 596043 596044 BT9727_0752 BT9727_0753 katB   FALSE 0.182 204.000 0.160 NA N NA
 596044 596045 BT9727_0753 BT9727_0754   arcD TRUE 0.737 61.000 0.320 NA N NA
 596046 596047 BT9727_0755 BT9727_0756 racE   FALSE 0.115 113.000 0.005 NA   NA
 596049 596050 BT9727_0758 BT9727_0759     TRUE 0.989 -3.000 0.844 0.005 Y NA
 596050 596051 BT9727_0759 BT9727_0760     FALSE 0.126 272.000 0.000 0.059 N NA
 596051 596052 BT9727_0760 BT9727_0761     TRUE 0.980 5.000 0.594 0.047 Y NA
 596052 596053 BT9727_0761 BT9727_0762     TRUE 0.961 29.000 0.481 1.000 Y NA
 596056 596057 BT9727_0765 BT9727_0766 yheD yheC TRUE 0.793 21.000 0.583 NA   NA
 596058 596059 BT9727_0767 BT9727_0768 yheB yheA FALSE 0.290 143.000 0.321 NA   NA
 596060 596061 BT9727_0769 BT9727_0770     TRUE 0.779 22.000 0.545 NA   NA
 596062 596063 BT9727_0771 BT9727_0772 alsS alsD TRUE 0.864 17.000 0.323 1.000 N NA
 596066 596067 BT9727_0775 BT9727_0776     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 596068 596069 BT9727_0777 BT9727_0778 hemN fadD FALSE 0.078 315.000 0.000 0.084 N NA
 596071 596072 BT9727_0780 BT9727_0781     FALSE 0.002 244.000 0.000 NA   NA
 596072 596073 BT9727_0781 BT9727_0782     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 596074 596075 BT9727_0783 BT9727_0784   secA TRUE 0.777 5.000 0.519 NA   NA
 596076 596077 BT9727_0785 BT9727_0786 csaA csaB FALSE 0.344 89.000 0.032 1.000   NA
 596079 596080 BT9727_0788 BT9727_0789 lytB/lytA   FALSE 0.000 542.000 0.000 NA   NA
 596082 596083 BT9727_0791 BT9727_0792 crt   FALSE 0.380 102.000 0.292 NA   NA
 596083 596084 BT9727_0792 BT9727_0793     TRUE 0.776 18.000 0.538 NA   NA
 596084 596085 BT9727_0793 BT9727_0795   yhfE FALSE 0.001 328.000 0.000 NA   NA
 596085 596086 BT9727_0795 BT9727_0796 yhfE   FALSE 0.096 235.000 0.000 1.000 N NA
 596086 596087 BT9727_0796 BT9727_0797     FALSE 0.527 133.000 0.318 NA N NA
 596089 596090 BT9727_0799 BT9727_0800 prdF arcB TRUE 0.947 20.000 0.109 1.000 Y NA
 596090 596091 BT9727_0800 BT9727_0801 arcB   FALSE 0.005 185.000 0.000 NA   NA
 596091 596092 BT9727_0801 BT9727_0802     FALSE 0.009 157.000 0.000 NA   NA
 596092 596093 BT9727_0802 BT9727_0803     TRUE 0.727 38.000 0.500 NA   NA
 596093 596094 BT9727_0803 BT9727_0804     FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 596094 596095 BT9727_0804 BT9727_0805     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 596095 596096 BT9727_0805 BT9727_0806     TRUE 0.705 2.000 0.333 NA   NA
 596096 596097 BT9727_0806 BT9727_0807     TRUE 0.618 43.000 0.333 NA   NA
 596097 596098 BT9727_0807 BT9727_0808     FALSE 0.109 -46.000 0.000 NA   NA
 596100 596101 BT9727_0810 BT9727_0811     FALSE 0.023 84.000 0.000 NA   NA
 596101 596102 BT9727_0811 BT9727_0812     FALSE 0.019 106.000 0.000 NA   NA
 596102 596103 BT9727_0812 BT9727_0813     FALSE 0.579 35.000 0.250 NA   NA
 596103 596104 BT9727_0813 BT9727_0814     FALSE 0.001 297.000 0.000 NA   NA
 596104 596105 BT9727_0814 BT9727_0815     FALSE 0.046 40.000 0.000 NA   NA
 596105 596106 BT9727_0815 BT9727_0816   syd FALSE 0.000 468.000 0.000 NA   NA
 596106 596107 BT9727_0816 BT9727_0817 syd   FALSE 0.001 355.000 0.000 NA   NA
 596107 596108 BT9727_0817 BT9727_0818     FALSE 0.000 437.000 0.000 NA   NA
 596108 596109 BT9727_0818 BT9727_0819     FALSE 0.001 359.000 0.000 NA   NA
 596109 596110 BT9727_0819 BT9727_0820     FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   NA
 596112 596113 BT9727_0822 BT9727_0823 oppA oppB TRUE 0.970 56.000 0.688 0.046 Y NA
 596113 596114 BT9727_0823 BT9727_0824 oppB oppC TRUE 0.983 7.000 0.786 0.046 Y NA
 596114 596115 BT9727_0824 BT9727_0825 oppC oppD TRUE 0.952 27.000 0.286 1.000 Y NA
 596115 596116 BT9727_0825 BT9727_0826 oppD oppF TRUE 0.989 -16.000 0.436 0.002 Y NA
 596116 596117 BT9727_0826 BT9727_0827 oppF   FALSE 0.011 447.000 0.000 NA N NA
 596117 596118 BT9727_0827 BT9727_0828     FALSE 0.357 70.000 0.154 NA   NA
 596118 596119 BT9727_0828 BT9727_0829     TRUE 0.825 44.000 1.000 NA   NA
 596119 596120 BT9727_0829 BT9727_0830     TRUE 0.895 -3.000 1.000 NA   NA
 596120 596121 BT9727_0830 BT9727_0831     TRUE 0.883 0.000 1.000 NA   NA
 596121 596122 BT9727_0831 BT9727_0832     FALSE 0.408 15.000 0.053 NA   NA
 596122 596123 BT9727_0832 BT9727_0833     FALSE 0.482 0.000 0.053 NA   NA
 596123 596124 BT9727_0833 BT9727_0834     TRUE 0.873 3.000 1.000 NA   NA
 596124 596125 BT9727_0834 BT9727_0835     FALSE 0.000 520.000 0.000 NA   NA
 596127 596128 BT9727_0837 BT9727_0838 citS citT TRUE 0.983 20.000 0.833 0.083 Y NA
 596128 596129 BT9727_0838 BT9727_0839 citT   TRUE 0.917 -72.000 0.611 1.000   NA
 596135 596136 BT9727_0845 BT9727_0846     FALSE 0.013 134.000 0.000 NA   NA
 596136 596137 BT9727_0846 BT9727_0847     FALSE 0.515 53.000 0.267 NA   NA
 596137 596138 BT9727_0847 BT9727_0848     FALSE 0.089 193.000 0.200 NA   NA
 596138 596139 BT9727_0848 BT9727_0849   dnaB FALSE 0.545 -12.000 0.041 NA   NA
 596141 596142 BT9727_0851 BT9727_0852     FALSE 0.029 69.000 0.000 NA   NA
 596145 596146 BT9727_0855 BT9727_0856     FALSE 0.514 -18.000 0.023 NA   NA
 596146 596147 BT9727_0856 BT9727_0857     FALSE 0.477 -7.000 0.023 NA   NA
 596147 596148 BT9727_0857 BT9727_0858     FALSE 0.000 710.000 0.000 NA   NA
 596148 596149 BT9727_0858 BT9727_0859     TRUE 0.683 6.000 0.333 NA   NA
 596150 596151 BT9727_0860 BT9727_0861     FALSE 0.217 76.000 0.000 1.000   NA
 596152 596153 BT9727_0862 BT9727_0864     FALSE 0.034 58.000 0.000 NA   NA
 596154 596155 BT9727_0865 BT9727_0866     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 596155 596156 BT9727_0866 BT9727_0867     FALSE 0.053 31.000 0.000 NA   NA
 596156 5459515 BT9727_0867 tRNA-Cys-2     FALSE 0.001 276.000 0.000 NA   NA
 5459515 596158 tRNA-Cys-2 BT9727_0868     FALSE 0.000 418.000 0.000 NA   NA
 596160 596161 BT9727_0870 BT9727_0871     FALSE 0.228 117.000 0.109 NA   NA
 596161 596162 BT9727_0871 BT9727_0872     FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 596163 596164 BT9727_0874 BT9727_0875     FALSE 0.001 291.000 0.000 NA   NA
 596165 596166 BT9727_0876 BT9727_0877 licT bglP FALSE 0.293 147.000 0.208 1.000   NA
 596166 596167 BT9727_0877 BT9727_0878 bglP bglH TRUE 0.869 96.000 0.208 1.000 Y NA
 596167 596168 BT9727_0878 BT9727_0879 bglH marR FALSE 0.482 159.000 0.333 1.000 N NA
 596168 596169 BT9727_0879 BT9727_0880 marR pssA TRUE 0.789 20.000 0.004 1.000 N NA
 596169 596170 BT9727_0880 BT9727_0881 pssA atpI FALSE 0.551 23.000 0.013 1.000   NA
 596171 596172 BT9727_0882 BT9727_0883   lytB FALSE 0.112 -118.000 0.000 NA   NA
 596172 596173 BT9727_0883 BT9727_0885 lytB   FALSE 0.019 103.000 0.000 NA   NA
 596175 596176 BT9727_0887 BT9727_0888 dhaL   TRUE 0.913 20.000 0.625 1.000 N NA
 596177 596178 BT9727_0889 BT9727_0890 dhaL   FALSE 0.027 223.000 0.000 1.000   NA
 596181 596182 BT9727_0893 BT9727_0894     FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 596182 596183 BT9727_0894 BT9727_0896   tnpA TRUE 0.688 56.000 0.400 1.000   NA
 596184 596185 BT9727_0895 BT9727_0897     FALSE 0.001 311.000 0.000 NA   NA
 596185 596186 BT9727_0897 BT9727_0898     FALSE 0.000 815.000 0.000 NA   NA
 596188 596189 BT9727_0900 BT9727_0901     FALSE 0.198 130.000 0.114 NA   NA
 596189 596190 BT9727_0901 BT9727_0902     TRUE 0.732 14.000 0.486 NA   NA
 596190 596191 BT9727_0902 BT9727_0903     FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 596192 596193 BT9727_0905 BT9727_0906     FALSE 0.002 232.000 0.000 NA   NA
 596194 596195 BT9727_0907 BT9727_0908 yflT   TRUE 0.794 51.000 0.875 NA   NA
 596195 596196 BT9727_0908 BT9727_0909   ydaS FALSE 0.580 76.000 0.500 NA   NA
 596198 596199 BT9727_0911 BT9727_0912 rsbV rsbW TRUE 0.971 7.000 0.714 1.000 Y NA
 596199 596200 BT9727_0912 BT9727_0913 rsbW sigB TRUE 0.963 -37.000 0.838 1.000 N NA
 596200 596201 BT9727_0913 BT9727_0914 sigB   TRUE 0.662 70.000 0.038 1.000 N NA
 596201 596202 BT9727_0914 BT9727_0915   rsbU FALSE 0.285 176.000 0.032 1.000 N NA
 596203 596204 BT9727_0916 BT9727_0917 cheR   TRUE 0.946 17.000 0.169 1.000 Y NA
 596204 596205 BT9727_0917 BT9727_0918     FALSE 0.036 206.000 0.000 1.000   NA
 596206 596207 BT9727_0919 BT9727_0920     TRUE 0.689 61.000 0.600 NA   NA
 596207 596208 BT9727_0920 BT9727_0921     FALSE 0.012 143.000 0.000 NA   NA
 596210 596211 BT9727_0923 BT9727_0924 mrsR2 mrsK2 TRUE 0.959 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 596211 596212 BT9727_0924 BT9727_0925 mrsK2 mrsF TRUE 0.670 76.000 0.111 1.000 N NA
 596212 596213 BT9727_0925 BT9727_0926 mrsF mrsG TRUE 0.794 0.000 0.500 NA   NA
 596213 596214 BT9727_0926 BT9727_0927 mrsG mrsE TRUE 0.713 13.000 0.429 NA   NA
 596218 596219 BT9727_0931 BT9727_0932   yhaN TRUE 0.736 -3.000 0.330 NA   NA
 596219 596220 BT9727_0932 BT9727_0933 yhaN   FALSE 0.589 42.000 0.291 NA   NA
 596220 596221 BT9727_0933 BT9727_0934     FALSE 0.012 295.000 0.000 1.000   NA
 596221 596222 BT9727_0934 BT9727_0935     FALSE 0.000 504.000 0.000 NA   NA
 596222 596223 BT9727_0935 BT9727_0936     TRUE 0.598 52.000 0.368 NA   NA
 596223 596224 BT9727_0936 BT9727_0937     FALSE 0.002 256.000 0.000 NA   NA
 596224 596225 BT9727_0937 BT9727_0938     FALSE 0.068 0.000 0.000 NA   NA
 596225 596226 BT9727_0938 BT9727_0939     FALSE 0.002 228.000 0.000 NA   NA
 596226 596227 BT9727_0939 BT9727_0940   yhaL FALSE 0.427 81.000 0.292 NA   NA
 596227 596228 BT9727_0940 BT9727_0941 yhaL   FALSE 0.107 176.000 0.167 NA   NA
 596228 596229 BT9727_0941 BT9727_0942     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 596229 596230 BT9727_0942 BT9727_0943     TRUE 0.750 29.000 0.500 NA   NA
 596230 596231 BT9727_0943 BT9727_0944     FALSE 0.000 532.000 0.000 NA   NA
 596231 596232 BT9727_0944 BT9727_0945   glpP TRUE 0.855 98.000 0.083 1.000 Y NA
 596232 596233 BT9727_0945 BT9727_0946 glpP glpF FALSE 0.186 214.000 0.083 1.000 N NA
 596233 596234 BT9727_0946 BT9727_0947 glpF glpK TRUE 0.791 14.000 0.057 1.000 N NA
 596234 596235 BT9727_0947 BT9727_0948 glpK glpD TRUE 0.874 134.000 0.013 0.001 Y NA
 596237 596238 BT9727_0950 BT9727_0951     TRUE 0.649 -28.000 0.080 NA   NA
 596240 596241 BT9727_0953 BT9727_0954     TRUE 0.960 5.000 0.533 NA Y NA
 596241 596242 BT9727_0954 BT9727_0955     TRUE 0.845 8.000 0.389 NA N NA
 596244 596245 BT9727_0957 BT9727_0958     FALSE 0.219 162.000 0.333 NA   NA
 596245 596246 BT9727_0958 BT9727_0959     TRUE 0.933 23.000 0.333 0.005 N NA
 596247 596248 BT9727_0960 BT9727_0961   uvrD FALSE 0.549 88.000 0.500 NA   NA
 596248 596249 BT9727_0961 BT9727_0962 uvrD prsA FALSE 0.004 461.000 0.000 1.000   NA
 596251 596252 BT9727_0964 BT9727_0965 hpr yhaH FALSE 0.015 299.000 0.063 NA   NA
 596252 596253 BT9727_0965 BT9727_0966 yhaH hit FALSE 0.106 172.000 0.137 NA   NA
 596253 596254 BT9727_0966 BT9727_0967 hit   FALSE 0.069 156.000 0.011 NA   NA
 596255 596256 BT9727_0968 BT9727_0969 ecsA ecsB TRUE 0.874 -7.000 0.271 NA N NA
 596256 596257 BT9727_0969 BT9727_0970 ecsB ecsC TRUE 0.623 14.000 0.292 NA   NA
 596257 596258 BT9727_0970 BT9727_0971 ecsC   FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 596258 596259 BT9727_0971 BT9727_0972     TRUE 0.913 -39.000 0.778 NA   NA
 596259 596260 BT9727_0972 BT9727_0973   ydbS TRUE 0.679 80.000 0.778 NA   NA
 596260 596261 BT9727_0973 BT9727_0974 ydbS   TRUE 0.852 -16.000 0.500 NA   NA
 596261 596262 BT9727_0974 BT9727_0975     FALSE 0.000 926.000 0.000 NA   NA
 596262 596263 BT9727_0975 BT9727_0976     FALSE 0.000 714.000 0.000 NA   NA
 596265 596266 BT9727_0978 BT9727_0979     FALSE 0.003 226.000 0.000 NA   NA
 596266 596267 BT9727_0979 BT9727_0980   ydbS FALSE 0.485 75.000 0.333 NA   NA
 596267 596268 BT9727_0980 BT9727_0981 ydbS ydbT TRUE 0.891 -7.000 0.778 NA   NA
 596270 596271 BT9727_0983 BT9727_0984 pbpF hemE FALSE 0.260 180.000 0.020 1.000 N NA
 596271 596272 BT9727_0984 BT9727_0985 hemE hemH TRUE 0.940 15.000 0.131 1.000 Y NA
 596272 596273 BT9727_0985 BT9727_0986 hemH hemY TRUE 0.945 20.000 0.069 1.000 Y NA
 596275 596276 BT9727_0988 BT9727_0989     FALSE 0.199 154.000 0.250 NA   NA
 596278 596279 BT9727_0991 BT9727_0992   yhgE FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 596279 596280 BT9727_0992 BT9727_0993 yhgE   FALSE 0.275 144.000 0.300 NA   NA
 596280 596281 BT9727_0993 BT9727_0994     TRUE 0.842 21.000 0.778 NA   NA
 596282 596283 BT9727_0995 BT9727_0996     FALSE 0.385 65.000 0.160 NA   NA
 596283 596284 BT9727_0996 BT9727_0997     FALSE 0.000 583.000 0.000 NA   NA
 596284 596285 BT9727_0997 BT9727_0998     FALSE 0.383 93.000 0.273 NA   NA
 596286 596287 BT9727_0999 BT9727_1000 cytR yhfI FALSE 0.007 348.000 0.000 1.000   NA
 596287 596288 BT9727_1000 BT9727_1001 yhfI lplA TRUE 0.681 10.000 0.200 1.000   NA
 596288 596289 BT9727_1001 BT9727_1002 lplA   FALSE 0.030 253.000 0.098 NA   NA
 596289 596290 BT9727_1002 BT9727_1003   fadD FALSE 0.408 162.000 0.778 NA   NA
 596290 596291 BT9727_1003 BT9727_1004 fadD   FALSE 0.297 113.000 0.222 NA   NA
 596291 596292 BT9727_1004 BT9727_1005     FALSE 0.483 90.000 0.400 NA   NA
 596292 596293 BT9727_1005 BT9727_1006     FALSE 0.036 54.000 0.000 NA   NA
 596295 596296 BT9727_1009 BT9727_1010   ydhJ FALSE 0.071 215.000 0.055 1.000   NA
 596297 596298 BT9727_1011 BT9727_1012 yhdL sigM TRUE 0.683 6.000 0.333 NA   NA
 596299 596300 BT9727_1013 BT9727_1014     FALSE 0.521 60.000 0.294 NA   NA
 596300 596301 BT9727_1014 BT9727_1015     FALSE 0.401 126.000 0.429 NA   NA
 596302 596303 BT9727_1016 BT9727_1017 mrsK2 mrsR2 TRUE 0.964 10.000 0.533 1.000 Y NA
 596304 596305 BT9727_1018 BT9727_1019     TRUE 0.658 2.000 0.273 NA   NA
 596305 596306 BT9727_1019 BT9727_1020     TRUE 0.742 -3.000 0.333 NA   NA
 596306 596307 BT9727_1020 BT9727_1021   yhfN FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 596307 596308 BT9727_1021 BT9727_1022 yhfN yxxF FALSE 0.137 96.000 0.006 NA   NA
 596308 596309 BT9727_1022 BT9727_1023 yxxF   FALSE 0.001 346.000 0.000 NA   NA
 596311 596312 BT9727_1025 BT9727_1026   aceB FALSE 0.004 200.000 0.000 NA   NA
 596312 596313 BT9727_1026 BT9727_1027 aceB aceA TRUE 0.944 24.000 0.084 1.000 Y NA
 596316 596317 BT9727_1030 BT9727_1031     FALSE 0.002 258.000 0.000 NA   NA
 596318 596319 BT9727_1032 BT9727_1033 comK comP FALSE 0.017 374.000 0.000 NA N NA
 596319 596320 BT9727_1033 BT9727_1035 comP comA TRUE 0.943 45.000 0.000 0.021 Y NA
 596320 596321 BT9727_1035 BT9727_1036 comA   FALSE 0.001 271.000 0.000 NA   NA
 596321 596322 BT9727_1036 BT9727_1037     TRUE 0.683 18.000 0.333 NA   NA
 596322 596323 BT9727_1037 BT9727_1038   yhjE FALSE 0.000 442.000 0.000 NA   NA
 596323 596324 BT9727_1038 BT9727_1039 yhjE sipT FALSE 0.479 57.000 0.246 NA   NA
 596324 596325 BT9727_1039 BT9727_1040 sipT addB FALSE 0.563 117.000 0.086 1.000 N NA
 596325 596326 BT9727_1040 BT9727_1041 addB addA TRUE 0.984 -3.000 0.408 0.003 Y NA
 596326 596327 BT9727_1041 BT9727_1042 addA   TRUE 0.787 13.000 0.035 0.049   NA
 596328 596329 BT9727_1043 BT9727_1044 gerPF gerPE FALSE 0.522 43.000 0.222 NA   NA
 596329 596330 BT9727_1044 BT9727_1045 gerPE gerPD TRUE 0.640 16.000 0.296 NA   NA
 596330 596331 BT9727_1045 BT9727_1046 gerPD gerPC FALSE 0.301 7.000 0.003 NA   NA
 596331 596332 BT9727_1046 BT9727_1047 gerPC gerPB FALSE 0.178 68.000 0.003 NA   NA
 596332 596333 BT9727_1047 BT9727_1048 gerPB gerPA TRUE 0.844 15.000 0.889 NA   NA
 596333 596334 BT9727_1048 BT9727_1049 gerPA   FALSE 0.400 97.000 0.296 NA   NA
 596336 596337 BT9727_1051 BT9727_1052   rocD FALSE 0.154 106.000 0.023 NA   NA
 596340 596341 BT9727_1055 BT9727_1056 asnO hemH FALSE 0.225 189.000 0.011 1.000 N NA
 596341 596342 BT9727_1056 BT9727_1057 hemH katB TRUE 0.682 60.000 0.013 1.000 N NA
 596344 596345 BT9727_1058 BT9727_1060     FALSE 0.100 -19.000 0.000 NA   NA
 596345 596346 BT9727_1060 BT9727_1061     FALSE 0.020 251.000 0.000 1.000   NA
 596347 596348 BT9727_1062 BT9727_1063     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 596348 596349 BT9727_1063 BT9727_1064     FALSE 0.014 133.000 0.000 NA   NA
 596353 596354 BT9727_1068 BT9727_1069     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 596354 596355 BT9727_1069 BT9727_1070     FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 596356 596357 BT9727_1071 BT9727_1072   clpB FALSE 0.023 212.000 0.009 NA   NA
 596359 596360 BT9727_1074 BT9727_1075     FALSE 0.340 57.000 0.065 NA   NA
 596360 596361 BT9727_1075 BT9727_1076   comZ FALSE 0.466 6.000 0.065 NA   NA
 596361 596362 BT9727_1076 BT9727_1077 comZ fabH1 FALSE 0.000 391.000 0.000 NA   NA
 596362 596363 BT9727_1077 BT9727_1078 fabH1 fabF TRUE 0.938 32.000 0.076 1.000 Y NA
 596363 596364 BT9727_1078 BT9727_1079 fabF   FALSE 0.472 107.000 0.039 NA N NA
 596364 596365 BT9727_1079 BT9727_1080     FALSE 0.287 144.000 0.321 NA   NA
 596366 596367 BT9727_1081 BT9727_1082 trpS   FALSE 0.000 398.000 0.000 NA   NA
 596368 596369 BT9727_1083 BT9727_1084 oppA oppB TRUE 0.861 128.000 0.031 0.044 Y NA
 596369 596370 BT9727_1084 BT9727_1085 oppB oppC TRUE 0.976 -3.000 0.165 0.044 Y NA
 596370 596371 BT9727_1085 BT9727_1086 oppC oppD TRUE 0.972 19.000 0.706 1.000 Y NA
 596371 596372 BT9727_1086 BT9727_1087 oppD oppF TRUE 0.932 -7.000 0.375 0.003   NA
 596378 596379 BT9727_1093 BT9727_1094 mecA cls TRUE 0.692 73.000 0.314 NA N NA
 596379 596380 BT9727_1094 BT9727_1095 cls coiA FALSE 0.340 82.000 0.189 NA   NA
 596380 596381 BT9727_1095 BT9727_1096 coiA pepF TRUE 0.614 52.000 0.398 NA   NA
 596382 596383 BT9727_1097 BT9727_1098     FALSE 0.570 0.000 0.138 NA   NA
 596383 596384 BT9727_1098 BT9727_1099     FALSE 0.130 181.000 0.063 1.000   NA
 596385 596386 BT9727_1100 BT9727_1101     TRUE 0.641 22.000 0.283 NA   NA
 596386 596387 BT9727_1101 BT9727_1102   ppnK TRUE 0.867 19.000 0.725 1.000   NA
 596387 596388 BT9727_1102 BT9727_1103 ppnK rluD TRUE 0.886 16.000 0.480 1.000 N NA
 596389 596390 BT9727_1104 BT9727_1105   prpA FALSE 0.207 141.000 0.017 1.000   NA
 596390 596391 BT9727_1105 BT9727_1106 prpA ftsW FALSE 0.376 75.000 0.028 1.000   NA
 596391 596392 BT9727_1106 BT9727_1107 ftsW   FALSE 0.232 143.000 0.238 NA   NA
 596392 596393 BT9727_1107 BT9727_1108     TRUE 0.604 7.000 0.242 NA   NA
 596393 596394 BT9727_1108 BT9727_1109   cloP FALSE 0.354 128.000 0.212 1.000   NA
 596394 596395 BT9727_1109 BT9727_1110 cloP bclA FALSE 0.334 123.000 0.154 1.000   NA
 596396 596397 BT9727_1111 BT9727_1112     FALSE 0.280 152.000 0.222 1.000   NA
 596397 596398 BT9727_1112 BT9727_1113     TRUE 0.796 -3.000 0.444 NA   NA
 596398 596399 BT9727_1113 BT9727_1114     TRUE 0.732 13.000 0.471 NA   NA
 596399 596400 BT9727_1114 BT9727_1115   rfbA TRUE 0.729 15.000 0.471 NA   NA
 596400 596401 BT9727_1115 BT9727_1116 rfbA rfbC TRUE 0.943 9.000 0.096 1.000 Y NA
 596401 596402 BT9727_1116 BT9727_1117 rfbC rfbB TRUE 0.947 17.000 0.183 1.000 Y NA
 596402 596403 BT9727_1117 BT9727_1118 rfbB rbfD TRUE 0.969 12.000 0.088 0.002 Y NA
 596403 596404 BT9727_1118 BT9727_1119 rbfD fabI FALSE 0.580 109.000 0.082 1.000 N NA
 596404 596405 BT9727_1119 BT9727_1120 fabI   FALSE 0.181 142.000 0.129 NA   NA
 596407 596408 BT9727_1122 BT9727_1123     FALSE 0.482 102.000 0.438 NA   NA
 596409 596410 BT9727_1125 BT9727_1126 exsF cotZ FALSE 0.007 168.000 0.000 NA   NA
 596410 596411 BT9727_1126 BT9727_1127 cotZ pcrA FALSE 0.476 144.000 0.700 NA   NA
 596411 596412 BT9727_1127 BT9727_1128 pcrA   FALSE 0.443 100.000 0.222 1.000   NA
 596412 596413 BT9727_1128 BT9727_1129     TRUE 0.720 2.000 0.213 1.000   NA
 596413 596414 BT9727_1129 BT9727_1131     TRUE 0.628 93.000 0.287 NA N NA
 596415 596416 BT9727_1130 BT9727_1132     FALSE 0.226 149.000 0.267 NA   NA
 596417 596418 BT9727_1133 BT9727_1134   opuE FALSE 0.025 271.000 0.130 NA   NA
 596419 596420 BT9727_1135 BT9727_1136   trpE FALSE 0.000 395.000 0.000 NA   NA
 596420 596421 BT9727_1136 BT9727_1137 trpE pabA TRUE 0.983 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 596421 596422 BT9727_1137 BT9727_1138 pabA trpD TRUE 0.956 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 596422 596423 BT9727_1138 BT9727_1139 trpD trpC TRUE 0.955 2.000 0.216 1.000 Y NA
 596423 596424 BT9727_1139 BT9727_1140 trpC trpF TRUE 0.982 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 596424 596425 BT9727_1140 BT9727_1141 trpF trpB TRUE 0.985 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 596425 596426 BT9727_1141 BT9727_1142 trpB trpA TRUE 0.977 4.000 0.248 0.001 Y NA
 596426 596427 BT9727_1142 BT9727_1143 trpA   FALSE 0.188 75.000 0.015 NA   NA
 596427 596428 BT9727_1143 BT9727_1145   lldP FALSE 0.236 115.000 0.119 NA   NA
 596428 596429 BT9727_1145 BT9727_1146 lldP   FALSE 0.304 93.000 0.167 NA   NA
 596433 596434 BT9727_1150 BT9727_1151     FALSE 0.379 102.000 0.098 1.000   NA
 596434 596435 BT9727_1151 BT9727_1152     FALSE 0.210 145.000 0.208 NA   NA
 596436 596437 BT9727_1153 BT9727_1154   noxC FALSE 0.388 93.000 0.077 1.000   NA
 596437 596438 BT9727_1154 BT9727_1155 noxC   TRUE 0.839 17.000 0.786 NA   NA
 596438 596439 BT9727_1155 BT9727_1156     TRUE 0.869 -3.000 0.733 NA   NA
 596439 596440 BT9727_1156 BT9727_1157   odhB FALSE 0.113 125.000 0.014 NA   NA
 596440 596441 BT9727_1157 BT9727_1158 odhB odhA TRUE 0.878 134.000 0.667 1.000 Y NA
 596442 596443 BT9727_1159 BT9727_1160     TRUE 0.865 3.000 0.875 NA   NA
 596443 596444 BT9727_1160 BT9727_1161     TRUE 0.803 29.000 0.667 NA   NA
 596444 596445 BT9727_1161 BT9727_1162     FALSE 0.490 135.000 0.667 NA   NA
 596445 596446 BT9727_1162 BT9727_1163     TRUE 0.748 19.000 0.444 NA   NA
 596446 596447 BT9727_1163 BT9727_1164     FALSE 0.494 73.000 0.333 NA   NA
 596447 596448 BT9727_1164 BT9727_1165     FALSE 0.301 153.000 0.417 NA   NA
 5459516 596450 tRNA-Val-2 BT9727_1166     FALSE 0.005 190.000 0.000 NA   NA
 596450 596451 BT9727_1166 BT9727_1167     FALSE 0.022 279.000 0.103 NA   NA
 596452 596453 BT9727_1168 BT9727_1169   dacF FALSE 0.410 156.000 0.700 NA   NA
 596453 596454 BT9727_1169 BT9727_1170 dacF sigW FALSE 0.331 194.000 0.320 0.036   NA
 596454 596455 BT9727_1170 BT9727_1171 sigW calY FALSE 0.528 63.000 0.320 NA   NA
 596455 596456 BT9727_1171 BT9727_1172 calY   FALSE 0.476 149.000 0.778 NA   NA
 596456 596457 BT9727_1172 BT9727_1173   calY FALSE 0.001 274.000 0.000 NA   NA
 596459 596460 BT9727_1175 BT9727_1176 ina   FALSE 0.154 172.000 0.069 1.000   NA
 596460 596461 BT9727_1176 BT9727_1177   potA FALSE 0.105 227.000 0.000 1.000 N NA
 596461 596462 BT9727_1177 BT9727_1178 potA potB TRUE 0.988 -3.000 0.789 0.044 Y NA
 596462 596463 BT9727_1178 BT9727_1179 potB potC TRUE 0.972 7.000 0.286 0.044 Y NA
 596463 596464 BT9727_1179 BT9727_1180 potC potD TRUE 0.957 39.000 0.067 0.044 Y NA
 596464 596465 BT9727_1180 BT9727_1181 potD pbpB TRUE 0.684 90.000 0.267 1.000 N NA
 596465 596466 BT9727_1181 BT9727_1182 pbpB   FALSE 0.484 111.000 0.333 1.000   NA
 596466 596467 BT9727_1182 BT9727_1183     FALSE 0.416 101.000 0.333 NA   NA
 596467 596468 BT9727_1183 BT9727_1184   rluD FALSE 0.254 100.000 0.089 NA   NA
 596468 596469 BT9727_1184 BT9727_1185 rluD   FALSE 0.268 92.000 0.089 NA   NA
 596470 596471 BT9727_1186 BT9727_1187   glcF FALSE 0.000 466.000 0.000 NA   NA
 596471 596472 BT9727_1187 BT9727_1188 glcF glcD TRUE 0.984 -3.000 0.342 0.001 Y NA
 596472 596473 BT9727_1188 BT9727_1189 glcD cdaR TRUE 0.605 118.000 0.247 1.000 N NA
 596474 596475 BT9727_1190 BT9727_1191   resD TRUE 0.844 -7.000 0.543 NA   NA
 596475 596476 BT9727_1191 BT9727_1192 resD resE TRUE 0.970 4.000 0.621 1.000 Y NA
 596476 596477 BT9727_1192 BT9727_1193 resE   FALSE 0.073 261.000 0.000 1.000 N NA
 596477 596478 BT9727_1193 BT9727_1194     FALSE 0.462 168.000 0.395 1.000 N NA
 596478 596479 BT9727_1194 BT9727_1195     TRUE 0.976 17.000 0.947 1.000 Y NA
 596479 596480 BT9727_1195 BT9727_1196     TRUE 0.933 0.000 0.500 0.001   NA
 596480 596481 BT9727_1196 BT9727_1197   comC FALSE 0.279 113.000 0.022 1.000   NA
 596481 596482 BT9727_1197 BT9727_1198 comC   FALSE 0.284 15.000 0.005 NA   NA
 596483 596484 BT9727_1199 BT9727_1200 nirC   FALSE 0.434 204.000 0.000 1.000 Y NA
 596484 596485 BT9727_1200 BT9727_1201   ktrB FALSE 0.273 295.000 0.000 0.075 Y NA
 596485 596486 BT9727_1201 BT9727_1202 ktrB sasP-C3 FALSE 0.541 115.000 0.455 1.000   NA
 596486 596487 BT9727_1202 BT9727_1203 sasP-C3 crt FALSE 0.491 148.000 0.615 1.000   NA
 596487 596488 BT9727_1203 BT9727_1204 crt phaP FALSE 0.571 102.000 0.615 NA   NA
 596488 596489 BT9727_1204 BT9727_1205 phaP phaQ FALSE 0.565 43.000 0.273 NA   NA
 596490 596491 BT9727_1206 BT9727_1207 phaR phaB FALSE 0.326 152.000 0.450 NA   NA
 596491 596492 BT9727_1207 BT9727_1208 phaB phaC TRUE 0.936 83.000 0.161 0.001 Y NA
 596492 596493 BT9727_1208 BT9727_1209 phaC   TRUE 0.626 96.000 0.113 1.000 N NA
 596493 596494 BT9727_1209 BT9727_1210   ktrB TRUE 0.821 24.000 0.096 1.000 N NA
 596496 596497 BT9727_1212 BT9727_1213 afuA   TRUE 0.951 -78.000 0.111 0.044 N NA
 596497 596498 BT9727_1213 BT9727_1214   afuB TRUE 0.903 7.000 0.125 0.044 N NA
 596498 596499 BT9727_1214 BT9727_1215 afuB phnX TRUE 0.640 22.000 0.079 1.000   NA
 596499 596500 BT9727_1215 BT9727_1216 phnX phnW TRUE 0.852 16.000 0.315 0.079   NA
 596500 596501 BT9727_1216 BT9727_1217 phnW lys1 TRUE 0.944 -3.000 0.029 NA Y NA
 596501 596502 BT9727_1217 BT9727_1218 lys1   TRUE 0.687 41.000 0.029 NA N NA
 596502 596503 BT9727_1218 BT9727_1219     TRUE 0.601 72.000 0.500 NA   NA
 596503 596504 BT9727_1219 BT9727_1220   inlA FALSE 0.447 133.000 0.556 NA   NA
 596504 596505 BT9727_1220 BT9727_1221 inlA   FALSE 0.020 249.000 0.000 1.000   NA
 596505 596506 BT9727_1221 BT9727_1222     FALSE 0.291 126.000 0.267 NA   NA
 596510 596511 BT9727_1226 BT9727_1227   pepF FALSE 0.393 161.000 0.129 1.000 N NA
 596511 596512 BT9727_1227 BT9727_1228 pepF   FALSE 0.184 139.000 0.114 NA   NA
 596514 596515 BT9727_1230 BT9727_1231   ygcM TRUE 0.661 0.000 0.062 1.000   NA
 596515 596516 BT9727_1231 BT9727_1232 ygcM   TRUE 0.903 -7.000 0.280 1.000 N NA
 596516 596517 BT9727_1232 BT9727_1233   folE TRUE 0.658 19.000 0.101 1.000   NA
 596521 596522 BT9727_1237 BT9727_1238     FALSE 0.585 27.000 0.229 NA   NA
 596522 596523 BT9727_1238 BT9727_1239   nrdIB FALSE 0.000 477.000 0.000 NA   NA
 596523 596524 BT9727_1239 BT9727_1240 nrdIB nrdE FALSE 0.095 -13.000 0.000 NA   NA
 596524 596525 BT9727_1240 BT9727_1241 nrdE nrdE FALSE 0.024 473.000 0.000 0.001   NA
 596525 596526 BT9727_1241 BT9727_1242 nrdE nrdF TRUE 0.957 94.000 0.625 0.001 Y NA
 596526 596527 BT9727_1242 BT9727_1243 nrdF   FALSE 0.115 217.000 0.000 1.000 N NA
 596527 596528 BT9727_1243 BT9727_1244     TRUE 0.890 -3.000 0.280 1.000 N NA
 596528 596529 BT9727_1244 BT9727_1245     TRUE 0.876 -3.000 0.778 NA   NA
 596529 596530 BT9727_1245 BT9727_1246   bcrA TRUE 0.812 15.000 0.727 NA   NA
 596530 596531 BT9727_1246 BT9727_1247 bcrA bcrB TRUE 0.784 0.000 0.471 NA   NA
 596531 596532 BT9727_1247 BT9727_1248 bcrB   FALSE 0.042 203.000 0.040 NA   NA
 596533 596534 BT9727_1249 BT9727_1250   lrpC FALSE 0.352 101.000 0.258 NA   NA
 596535 596536 BT9727_1251 BT9727_1252     TRUE 0.686 -10.000 0.194 NA   NA
 596536 596537 BT9727_1252 BT9727_1253   sseB FALSE 0.293 87.000 0.127 NA   NA
 596540 596541 BT9727_1256 BT9727_1257 dltD dltC TRUE 0.690 -3.000 0.064 1.000   NA
 596541 596542 BT9727_1257 BT9727_1258 dltC dltB FALSE 0.545 69.000 0.387 NA   NA
 596542 596543 BT9727_1258 BT9727_1259 dltB dltA TRUE 0.892 -3.000 0.435 NA N NA
 596543 596544 BT9727_1259 BT9727_1260 dltA dltX TRUE 0.761 13.000 0.549 NA   NA
 596545 596546 BT9727_1261 BT9727_1262 amaA fldA FALSE 0.005 396.000 0.000 1.000   NA
 596546 596547 BT9727_1262 BT9727_1263 fldA   TRUE 0.723 25.000 0.421 NA   NA
 596549 596550 BT9727_1265 BT9727_1266     FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 596553 596554 BT9727_1269 BT9727_1271     FALSE 0.229 67.000 0.022 NA   NA
 596560 596561 BT9727_1277 BT9727_1278     FALSE 0.266 118.000 0.195 NA   NA
 596562 596563 BT9727_1279 BT9727_1280   ilvE FALSE 0.187 142.000 0.150 NA   NA
 596563 596564 BT9727_1280 BT9727_1281 ilvE alsS FALSE 0.164 308.000 0.000 1.000 Y NA
 596564 596565 BT9727_1281 BT9727_1282 alsS ilvH TRUE 0.982 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 596565 596566 BT9727_1282 BT9727_1283 ilvH ilvC TRUE 0.971 27.000 0.130 0.002 Y NA
 596566 596567 BT9727_1283 BT9727_1284 ilvC leuA TRUE 0.951 2.000 0.103 1.000 Y NA
 596567 596568 BT9727_1284 BT9727_1285 leuA leuB TRUE 0.932 78.000 0.041 0.001 Y NA
 596568 596569 BT9727_1285 BT9727_1286 leuB leuC TRUE 0.977 0.000 0.080 0.001 Y NA
 596569 596570 BT9727_1286 BT9727_1287 leuC leuD TRUE 0.990 -22.000 0.477 0.001 Y NA
 596570 596571 BT9727_1287 BT9727_1288 leuD hisZ FALSE 0.160 311.000 0.000 1.000 Y NA
 596571 596572 BT9727_1288 BT9727_1289 hisZ hisG TRUE 0.986 -24.000 0.239 0.004 Y NA
 596572 596573 BT9727_1289 BT9727_1290 hisG hisD TRUE 0.972 12.000 0.254 0.004 Y NA
 596573 596574 BT9727_1290 BT9727_1291 hisD hisB TRUE 0.975 0.000 0.096 0.004 Y NA
 596574 596575 BT9727_1291 BT9727_1292 hisB hisH TRUE 0.974 1.000 0.125 0.004 Y NA
 596575 596576 BT9727_1292 BT9727_1293 hisH hisA TRUE 0.984 -27.000 0.124 0.004 Y NA
 596576 596577 BT9727_1293 BT9727_1294 hisA hisF TRUE 0.986 -6.000 0.433 0.004 Y NA
 596577 596578 BT9727_1294 BT9727_1295 hisF hisI TRUE 0.984 -3.000 0.430 0.004 Y NA
 596578 596579 BT9727_1295 BT9727_1296 hisI hisE TRUE 0.969 11.000 0.152 0.004 Y NA
 596579 596580 BT9727_1296 BT9727_1297 hisE hisK TRUE 0.964 12.000 0.016 0.004 Y NA
 596580 596581 BT9727_1297 BT9727_1298 hisK serA FALSE 0.024 382.000 0.000 1.000 N NA
 596582 596583 BT9727_1299 BT9727_1300 pssA   FALSE 0.249 182.000 0.011 1.000 N NA
 596584 596585 BT9727_1301 BT9727_1302   lysA FALSE 0.000 457.000 0.000 NA   NA
 596585 596586 BT9727_1302 BT9727_1303 lysA cysH FALSE 0.058 530.000 0.000 1.000 Y NA
 596586 596587 BT9727_1303 BT9727_1304 cysH sat TRUE 0.780 39.000 0.065 1.000 N NA
 596587 596588 BT9727_1304 BT9727_1305 sat   TRUE 0.970 13.000 0.101 0.001 Y NA
 596588 596589 BT9727_1305 BT9727_1306   nirA TRUE 0.939 12.000 0.067 1.000 Y NA
 596589 596590 BT9727_1306 BT9727_1307 nirA   TRUE 0.800 11.000 0.647 NA   NA
 596590 596591 BT9727_1307 BT9727_1308   cysG FALSE 0.402 87.000 0.281 NA   NA
 596591 596592 BT9727_1308 BT9727_1309 cysG   TRUE 0.753 2.000 0.281 1.000   NA
 596592 596593 BT9727_1309 BT9727_1310   cysG TRUE 0.868 -25.000 0.375 1.000   NA
 596593 596594 BT9727_1310 BT9727_1311 cysG   FALSE 0.004 420.000 0.000 1.000   NA
 596595 596596 BT9727_1312 BT9727_1313     TRUE 0.888 135.000 0.333 0.048 Y NA
 596596 596597 BT9727_1313 BT9727_1314     FALSE 0.058 276.000 0.000 1.000 N NA
 596598 596599 BT9727_1315 BT9727_1316 gltT   TRUE 0.642 68.000 0.556 NA   NA
 596599 596600 BT9727_1316 BT9727_1317   nhaC FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 596600 596601 BT9727_1317 BT9727_1318 nhaC yvqI FALSE 0.029 229.000 0.046 NA   NA
 596601 596602 BT9727_1318 BT9727_1319 yvqI   TRUE 0.687 51.000 0.514 NA   NA
 596602 596603 BT9727_1319 BT9727_1320   yvqF FALSE 0.253 107.000 0.135 NA   NA
 596603 596604 BT9727_1320 BT9727_1321 yvqF   FALSE 0.534 0.000 0.080 NA   NA
 596604 596605 BT9727_1321 BT9727_1322     TRUE 0.989 -3.000 0.853 0.020 Y NA
 596605 596606 BT9727_1322 BT9727_1323     FALSE 0.173 133.000 0.075 NA   NA
 596612 596613 BT9727_1329 BT9727_1330     FALSE 0.485 16.000 0.092 NA   NA
 596613 596614 BT9727_1330 BT9727_1331   hmp FALSE 0.094 160.000 0.049 NA   NA
 596617 596618 BT9727_1334 BT9727_1335   pit FALSE 0.347 118.000 0.136 1.000   NA
 596618 596619 BT9727_1335 BT9727_1336 pit ykaA TRUE 0.929 12.000 0.100 NA Y NA
 596621 596622 BT9727_1338 BT9727_1339     FALSE 0.099 196.000 0.250 NA   NA
 596622 596623 BT9727_1339 BT9727_1340     FALSE 0.047 190.000 0.000 1.000   NA
 596625 596626 BT9727_1342 BT9727_1343     FALSE 0.458 120.000 0.500 NA   NA
 596626 596627 BT9727_1343 BT9727_1344     FALSE 0.549 99.000 0.389 1.000   NA
 596627 596628 BT9727_1344 BT9727_1345   deoD FALSE 0.374 157.000 0.040 1.000 N NA
 596629 596630 BT9727_1346 BT9727_1347     FALSE 0.000 393.000 0.000 NA   NA
 596632 596633 BT9727_1349 BT9727_1350     TRUE 0.739 22.000 0.435 NA   NA
 596633 596634 BT9727_1350 BT9727_1351   sodF FALSE 0.245 106.000 0.101 NA   NA
 596634 596635 BT9727_1351 BT9727_1352 sodF dacB FALSE 0.581 112.000 0.101 1.000 N NA
 596635 596636 BT9727_1352 BT9727_1353 dacB spmA TRUE 0.799 -7.000 0.252 1.000   NA
 596636 596637 BT9727_1353 BT9727_1354 spmA spmB TRUE 0.945 -3.000 0.655 0.003   NA
 596637 596638 BT9727_1354 BT9727_1355 spmB rluB FALSE 0.031 290.000 0.063 1.000   NA
 596638 596639 BT9727_1355 BT9727_1356 rluB resA TRUE 0.612 95.000 0.069 1.000 N NA
 596639 596640 BT9727_1356 BT9727_1357 resA resB TRUE 0.845 122.000 0.306 1.000 Y NA
 596640 596641 BT9727_1357 BT9727_1358 resB resC TRUE 0.948 15.000 0.278 1.000 Y NA
 596641 596642 BT9727_1358 BT9727_1359 resC resD FALSE 0.078 303.000 0.178 1.000 N NA
 596642 596643 BT9727_1359 BT9727_1360 resD resE TRUE 0.970 0.000 0.111 0.078 Y NA
 596643 596644 BT9727_1360 BT9727_1361 resE yvqK FALSE 0.287 138.000 0.108 1.000   NA
 596644 596645 BT9727_1361 BT9727_1362 yvqK   FALSE 0.420 86.000 0.108 1.000   NA
 596649 596650 BT9727_1366 BT9727_1367   recQ TRUE 0.633 -10.000 0.103 NA   NA
 596650 596651 BT9727_1367 BT9727_1368 recQ   TRUE 0.611 0.000 0.192 NA   NA
 596651 596652 BT9727_1368 BT9727_1369     TRUE 0.643 14.000 0.320 NA   NA
 596652 596653 BT9727_1369 BT9727_1370     FALSE 0.586 58.000 0.233 1.000   NA
 596653 596654 BT9727_1370 BT9727_1371     TRUE 0.842 -3.000 0.433 1.000   NA
 596654 596655 BT9727_1371 BT9727_1372     TRUE 0.710 78.000 0.417 NA N NA
 596655 596656 BT9727_1372 BT9727_1373   gdhA FALSE 0.092 268.000 0.222 NA N NA
 596656 596657 BT9727_1373 BT9727_1374 gdhA   FALSE 0.380 79.000 0.233 NA   NA
 596657 596658 BT9727_1374 BT9727_1375     TRUE 0.624 94.000 0.700 NA   NA
 596658 596659 BT9727_1375 BT9727_1376     TRUE 0.663 80.000 0.727 NA   NA
 596659 596660 BT9727_1376 BT9727_1377   trxB FALSE 0.310 110.000 0.044 1.000   NA
 596662 596663 BT9727_1379 BT9727_1380 cmk rpsA FALSE 0.049 334.000 0.047 1.000 N NA
 596663 596664 BT9727_1380 BT9727_1381 rpsA fni TRUE 0.796 13.000 0.061 1.000 N NA
 596666 596667 BT9727_1383 BT9727_1384   yphB TRUE 0.850 -7.000 0.567 NA   NA
 596667 596668 BT9727_1384 BT9727_1385 yphB   TRUE 0.848 -3.000 0.633 NA   NA
 596668 596669 BT9727_1385 BT9727_1386     FALSE 0.112 125.000 0.014 NA   NA
 596669 596670 BT9727_1386 BT9727_1387   gpsA TRUE 0.634 19.000 0.068 1.000   NA
 596670 596671 BT9727_1387 BT9727_1388 gpsA yjcC FALSE 0.176 106.000 0.039 NA   NA
 596671 596672 BT9727_1388 BT9727_1389 yjcC yphE FALSE 0.002 268.000 0.000 NA   NA
 596672 596673 BT9727_1389 BT9727_1390 yphE   TRUE 0.732 65.000 0.771 NA   NA
 596673 596674 BT9727_1390 BT9727_1391   spoIVA FALSE 0.032 243.000 0.081 NA   NA
 596674 596675 BT9727_1391 BT9727_1392 spoIVA hup FALSE 0.001 299.000 0.000 NA   NA
 596675 596676 BT9727_1392 BT9727_1393 hup mtrA FALSE 0.559 121.000 0.154 1.000 N NA
 596676 596677 BT9727_1393 BT9727_1394 mtrA hepS FALSE 0.101 205.000 0.114 1.000   NA
 596677 596678 BT9727_1394 BT9727_1395 hepS menG TRUE 0.852 30.000 0.708 1.000   NA
 596678 596679 BT9727_1395 BT9727_1396 menG hepT TRUE 0.963 23.000 0.476 1.000 Y NA
 596679 596680 BT9727_1396 BT9727_1397 hepT ndk FALSE 0.512 125.000 0.054 1.000 N NA
 596680 596681 BT9727_1397 BT9727_1398 ndk aroC FALSE 0.079 271.000 0.002 1.000 N NA
 596681 596682 BT9727_1398 BT9727_1399 aroC aroB TRUE 0.977 0.000 0.110 0.001 Y NA
 596682 596683 BT9727_1399 BT9727_1400 aroB hisC TRUE 0.771 132.000 0.009 1.000 Y NA
 596683 596684 BT9727_1400 BT9727_1401 hisC   FALSE 0.009 313.000 0.000 1.000   NA
 596684 596685 BT9727_1401 BT9727_1402   ypiB FALSE 0.517 74.000 0.375 NA   NA
 596685 596686 BT9727_1402 BT9727_1403 ypiB ypiF FALSE 0.373 154.000 0.583 NA   NA
 596686 596687 BT9727_1403 BT9727_1404 ypiF qcrA FALSE 0.404 144.000 0.540 NA   NA
 596687 596688 BT9727_1404 BT9727_1405 qcrA qcrB TRUE 0.907 1.000 0.447 0.037   NA
 596688 596689 BT9727_1405 BT9727_1406 qcrB qcrC TRUE 0.788 44.000 0.095 0.037   NA
 596689 596690 BT9727_1406 BT9727_1407 qcrC ypjA FALSE 0.173 129.000 0.069 NA   NA
 596690 596691 BT9727_1407 BT9727_1408 ypjA   FALSE 0.502 26.000 0.104 NA   NA
 596691 596692 BT9727_1408 BT9727_1409     FALSE 0.242 108.000 0.104 NA   NA
 596692 596693 BT9727_1409 BT9727_1410   yugP FALSE 0.185 110.000 0.050 NA   NA
 596693 596694 BT9727_1410 BT9727_1411 yugP ung FALSE 0.299 102.000 0.020 1.000   NA
 596696 596697 BT9727_1413 BT9727_1414 ypjD dapB FALSE 0.464 0.000 0.044 NA   NA
 596697 596698 BT9727_1414 BT9727_1415 dapB mgsA TRUE 0.882 15.000 0.044 0.043 N NA
 596698 596699 BT9727_1415 BT9727_1416 mgsA ypjG FALSE 0.472 12.000 0.081 NA   NA
 596699 596700 BT9727_1416 BT9727_1417 ypjG   TRUE 0.651 -3.000 0.210 NA   NA
 596700 596701 BT9727_1417 BT9727_1418   pcnB TRUE 0.892 -13.000 0.126 1.000 N NA
 596701 596702 BT9727_1418 BT9727_1419 pcnB birA TRUE 0.894 -15.000 0.134 1.000 N NA
 596704 596705 BT9727_1421 BT9727_1422 panB panC TRUE 0.985 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 596705 596706 BT9727_1422 BT9727_1423 panC panD TRUE 0.953 13.000 0.342 1.000 Y NA
 596706 596707 BT9727_1423 BT9727_1424 panD dinG FALSE 0.499 129.000 0.053 1.000 N NA
 596707 596708 BT9727_1424 BT9727_1425 dinG ypmB FALSE 0.019 429.000 0.296 1.000   NA
 596708 596709 BT9727_1425 BT9727_1426 ypmB aspB TRUE 0.776 19.000 0.367 1.000   NA
 596709 596710 BT9727_1426 BT9727_1427 aspB dnaD FALSE 0.453 122.000 0.072 NA N NA
 596710 596711 BT9727_1427 BT9727_1428 dnaD nth TRUE 0.927 16.000 0.075 NA Y NA
 596711 596712 BT9727_1428 BT9727_1429 nth   FALSE 0.410 4.000 0.034 NA   NA
 596713 596714 BT9727_1430 BT9727_1431   recU FALSE 0.454 66.000 0.056 1.000   NA
 596715 596716 BT9727_1432 BT9727_1433     FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 596716 596717 BT9727_1433 BT9727_1434   yppE FALSE 0.513 16.000 0.148 NA   NA
 596719 596720 BT9727_1436 BT9727_1437   cotD FALSE 0.233 156.000 0.318 NA   NA
 596720 596721 BT9727_1437 BT9727_1438 cotD ypsA FALSE 0.356 57.000 0.074 NA   NA
 596721 596722 BT9727_1438 BT9727_1439 ypsA divIVA FALSE 0.563 98.000 0.579 NA   NA
 596722 596723 BT9727_1439 BT9727_1440 divIVA   FALSE 0.000 659.000 0.000 NA   NA
 596723 596724 BT9727_1440 BT9727_1441     FALSE 0.222 62.000 0.014 NA   NA
 596724 596725 BT9727_1441 BT9727_1442   dinG FALSE 0.252 138.000 0.250 NA   NA
 596725 596726 BT9727_1442 BT9727_1443 dinG   TRUE 0.597 106.000 0.118 1.000 N NA
 596726 596727 BT9727_1443 BT9727_1444     FALSE 0.465 48.000 0.014 1.000   NA
 596729 596730 BT9727_1446 BT9727_1447 map xpt FALSE 0.037 325.000 0.000 1.000 N NA
 596730 596731 BT9727_1447 BT9727_1448 xpt pbuX TRUE 0.945 4.000 0.056 1.000 Y NA
 596732 596733 BT9727_1449 BT9727_1450     FALSE 0.007 166.000 0.000 NA   NA
 596736 596737 BT9727_1453 BT9727_1454     FALSE 0.474 22.000 0.069 NA   NA
 596737 596738 BT9727_1454 BT9727_1455     FALSE 0.445 3.000 0.046 NA   NA
 596738 596739 BT9727_1455 BT9727_1456     FALSE 0.006 1000.000 0.000 NA N NA
 596741 596742 BT9727_1458 BT9727_1459     TRUE 0.844 4.000 0.765 NA   NA
 596742 596743 BT9727_1459 BT9727_1460     TRUE 0.837 -3.000 0.588 NA   NA
 596743 596744 BT9727_1460 BT9727_1461     FALSE 0.000 693.000 0.000 NA   NA
 596744 596745 BT9727_1461 BT9727_1462     FALSE 0.317 131.000 0.157 1.000   NA
 596745 596746 BT9727_1462 BT9727_1463     FALSE 0.010 828.000 0.000 1.000 N NA
 596746 596747 BT9727_1463 BT9727_1464     TRUE 0.932 1.000 0.750 1.000 N NA
 596747 596748 BT9727_1464 BT9727_1465   cpsD TRUE 0.927 -7.000 0.625 NA N NA
 596748 596749 BT9727_1465 BT9727_1466 cpsD   TRUE 0.904 19.000 0.714 NA N NA
 596749 596750 BT9727_1466 BT9727_1467     TRUE 0.842 25.000 0.625 1.000   NA
 596750 596751 BT9727_1467 BT9727_1468     TRUE 0.773 4.000 0.500 NA   NA
 596751 596752 BT9727_1468 BT9727_1469     FALSE 0.585 -25.000 0.046 NA   NA
 596752 596753 BT9727_1469 BT9727_1470     FALSE 0.507 -3.000 0.050 NA   NA
 596753 596754 BT9727_1470 BT9727_1471     FALSE 0.237 75.000 0.041 NA   NA
 596759 596760 BT9727_1478 BT9727_1479   rnhA FALSE 0.517 8.000 0.133 NA   NA
 596760 596761 BT9727_1479 BT9727_1480 rnhA   TRUE 0.685 70.000 0.076 1.000 N NA
 596762 596763 BT9727_1481 BT9727_1482     FALSE 0.179 153.000 0.200 NA   NA
 596764 596765 BT9727_1483 BT9727_1484   cspB FALSE 0.516 120.000 0.619 NA   NA
 596766 596767 BT9727_1485 BT9727_1486     FALSE 0.294 139.000 0.308 NA   NA
 596767 596768 BT9727_1486 BT9727_1487     TRUE 0.768 20.000 0.500 NA   NA
 596768 596769 BT9727_1487 BT9727_1488     FALSE 0.398 80.000 0.259 NA   NA
 596769 596770 BT9727_1488 BT9727_1489     FALSE 0.003 224.000 0.000 NA   NA
 596770 596771 BT9727_1489 BT9727_1490     TRUE 0.762 3.000 0.455 NA   NA
 596771 596772 BT9727_1490 BT9727_1491   bioA FALSE 0.204 190.000 0.364 1.000   NA
 596772 596773 BT9727_1491 BT9727_1492 bioA   TRUE 0.610 85.000 0.444 1.000   NA
 596775 596776 BT9727_1494 BT9727_1495     FALSE 0.429 98.000 0.188 1.000   NA
 596776 596777 BT9727_1495 BT9727_1496     FALSE 0.544 139.000 0.250 1.000 N NA
 596779 596780 BT9727_1498 BT9727_1499     FALSE 0.267 146.000 0.300 NA   NA
 596780 596781 BT9727_1499 BT9727_1500     FALSE 0.025 274.000 0.143 NA   NA
 596781 596782 BT9727_1500 BT9727_1501     FALSE 0.460 51.000 0.190 NA   NA
 596782 596783 BT9727_1501 BT9727_1502     FALSE 0.201 189.000 0.500 NA   NA
 596783 596784 BT9727_1502 BT9727_1503     TRUE 0.865 -7.000 0.625 NA   NA
 596785 596786 BT9727_1504 BT9727_1505     FALSE 0.272 125.000 0.235 NA   NA
 596786 596787 BT9727_1505 BT9727_1506     TRUE 0.687 20.000 0.333 NA   NA
 596787 596788 BT9727_1506 BT9727_1507     FALSE 0.201 129.000 0.118 NA   NA
 596788 596789 BT9727_1507 BT9727_1508     FALSE 0.524 8.000 0.147 NA   NA
 596789 596790 BT9727_1508 BT9727_1509     FALSE 0.197 169.000 0.333 NA   NA
 596791 596792 BT9727_1510 BT9727_1511   hfq TRUE 0.781 49.000 0.778 NA   NA
 596792 596793 BT9727_1511 BT9727_1512 hfq   FALSE 0.015 125.000 0.000 NA   NA
 596793 596794 BT9727_1512 BT9727_1513     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 596796 596797 BT9727_1515 BT9727_1516 motA motB TRUE 0.949 23.000 0.192 1.000 Y NA
 596797 596798 BT9727_1516 BT9727_1517 motB cheY FALSE 0.450 151.000 0.143 1.000 N NA
 596798 596799 BT9727_1517 BT9727_1518 cheY cheA TRUE 0.877 130.000 0.154 0.020 Y NA
 596799 596800 BT9727_1518 BT9727_1519 cheA cheC TRUE 0.753 174.000 0.036 0.005 Y NA
 596800 596801 BT9727_1519 BT9727_1520 cheC   FALSE 0.397 30.000 0.042 NA   NA
 596801 596802 BT9727_1520 BT9727_1521     TRUE 0.851 28.000 0.889 NA   NA
 596803 596804 BT9727_1522 BT9727_1523 cheR   FALSE 0.432 25.000 0.053 NA   NA
 596805 596806 BT9727_1524 BT9727_1525     FALSE 0.438 17.000 0.056 NA   NA
 596806 596807 BT9727_1525 BT9727_1526   flgK FALSE 0.426 18.000 0.045 NA   NA
 596807 596808 BT9727_1526 BT9727_1527 flgK flgL TRUE 0.650 206.000 0.028 0.001 Y NA
 596808 596809 BT9727_1527 BT9727_1528 flgL fliD TRUE 0.956 21.000 0.292 1.000 Y NA
 596809 596810 BT9727_1528 BT9727_1529 fliD fliS TRUE 0.984 23.000 0.608 0.001 Y NA
 596810 596811 BT9727_1529 BT9727_1530 fliS   TRUE 0.650 -16.000 0.101 NA   NA
 596811 596812 BT9727_1530 BT9727_1531   flgB FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
 596812 596813 BT9727_1531 BT9727_1532 flgB flgC TRUE 0.986 21.000 0.804 0.002 Y NA
 596813 596814 BT9727_1532 BT9727_1533 flgC fliE TRUE 0.970 17.000 0.068 0.002 Y NA
 596814 596815 BT9727_1533 BT9727_1534 fliE fliF TRUE 0.969 23.000 0.076 0.004 Y NA
 596815 596816 BT9727_1534 BT9727_1535 fliF fliG TRUE 0.965 14.000 0.056 0.004 Y NA
 596816 596817 BT9727_1535 BT9727_1536 fliG   TRUE 0.839 -13.000 0.471 NA   NA
 596817 596818 BT9727_1536 BT9727_1537   fliI TRUE 0.596 -3.000 0.129 NA   NA
 596818 596819 BT9727_1537 BT9727_1538 fliI   FALSE 0.189 117.000 0.061 NA   NA
 596819 596820 BT9727_1538 BT9727_1539     FALSE 0.087 -7.000 0.000 NA   NA
 596820 596821 BT9727_1539 BT9727_1540   flgD FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 596821 596822 BT9727_1540 BT9727_1541 flgD flgE FALSE 0.519 22.000 0.117 NA   NA
 596822 596823 BT9727_1541 BT9727_1542 flgE   FALSE 0.468 50.000 0.195 NA   NA
 596823 596824 BT9727_1542 BT9727_1543     FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 596824 596825 BT9727_1543 BT9727_1544   cheV FALSE 0.165 121.000 0.050 NA   NA
 596825 596826 BT9727_1544 BT9727_1545 cheV   FALSE 0.000 626.000 0.000 NA   NA
 596827 596828 BT9727_1546 BT9727_1547 fliC hag FALSE 0.137 240.000 0.000 0.001   NA
 596829 596830 BT9727_1548 BT9727_1549 slt fliN FALSE 0.349 63.000 0.083 NA   NA
 596830 596831 BT9727_1549 BT9727_1550 fliN fliM TRUE 0.853 15.000 0.079 0.001   NA
 596831 596832 BT9727_1550 BT9727_1551 fliM fliN TRUE 0.968 11.000 0.032 0.001 Y NA
 596832 596833 BT9727_1551 BT9727_1552 fliN fliN TRUE 0.695 13.000 0.400 NA   NA
 596833 596834 BT9727_1552 BT9727_1553 fliN fliP FALSE 0.554 -3.000 0.073 NA   NA
 596834 596835 BT9727_1553 BT9727_1554 fliP fliQ TRUE 0.968 34.000 0.162 0.003 Y NA
 596835 596836 BT9727_1554 BT9727_1555 fliQ fliR TRUE 0.945 16.000 0.181 1.000 Y NA
 596836 596837 BT9727_1555 BT9727_1556 fliR flhB TRUE 0.950 11.000 0.259 1.000 Y NA
 596837 596838 BT9727_1556 BT9727_1557 flhB flhA TRUE 0.972 24.000 0.207 0.003 Y NA
 596838 596839 BT9727_1557 BT9727_1558 flhA flhF TRUE 0.958 15.000 0.440 1.000 Y NA
 596839 596840 BT9727_1558 BT9727_1559 flhF flhG TRUE 0.923 43.000 0.045 1.000 Y NA
 596840 596841 BT9727_1559 BT9727_1560 flhG   FALSE 0.378 118.000 0.200 1.000   NA
 596841 596842 BT9727_1560 BT9727_1561     TRUE 0.798 18.000 0.600 NA   NA
 596842 596843 BT9727_1561 BT9727_1562   azlC TRUE 0.846 -7.000 0.133 NA N NA
 596843 596844 BT9727_1562 BT9727_1563 azlC   TRUE 0.782 -9.000 0.338 NA   NA
 596845 596846 BT9727_1564 BT9727_1565     FALSE 0.551 1.000 0.114 NA   NA
 596846 596847 BT9727_1565 BT9727_1566   yqjZ TRUE 0.627 3.000 0.051 1.000   NA
 596847 596848 BT9727_1566 BT9727_1567 yqjZ   FALSE 0.004 433.000 0.000 1.000   NA
 596849 596850 BT9727_1568 BT9727_1569     TRUE 0.680 76.000 0.571 1.000   NA
 596852 596853 BT9727_1571 BT9727_1572     TRUE 0.963 -22.000 0.419 0.042 N NA
 596853 596854 BT9727_1572 BT9727_1573     TRUE 0.981 13.000 0.750 0.042 Y NA
 596854 596855 BT9727_1573 BT9727_1574     TRUE 0.923 -51.000 0.278 1.000 N NA
 596855 596856 BT9727_1574 BT9727_1575     TRUE 0.609 21.000 0.241 NA   NA
 596858 596859 BT9727_1577 BT9727_1578     TRUE 0.593 102.000 0.500 1.000   NA
 596859 596860 BT9727_1578 BT9727_1579   ynaE FALSE 0.421 51.000 0.143 NA   NA
 596860 596861 BT9727_1579 BT9727_1580 ynaE gpm FALSE 0.135 159.000 0.143 NA   NA
 596861 596862 BT9727_1580 BT9727_1581 gpm   FALSE 0.462 90.000 0.368 NA   NA
 596863 596864 BT9727_1582 BT9727_1583     FALSE 0.463 37.000 0.096 NA   NA
 596864 596865 BT9727_1583 BT9727_1584     TRUE 0.734 -16.000 0.247 NA   NA
 596868 596869 BT9727_1587 BT9727_1588     TRUE 0.851 -3.000 0.643 NA   NA
 596869 596870 BT9727_1588 BT9727_1589   topB FALSE 0.000 930.000 0.000 NA   NA
 596870 596871 BT9727_1589 BT9727_1590 topB   FALSE 0.041 47.000 0.000 NA   NA
 596873 596874 BT9727_1592 BT9727_1593     TRUE 0.750 21.000 0.000 0.046   NA
 596874 596875 BT9727_1593 BT9727_1594     FALSE 0.000 599.000 0.000 NA   NA
 596875 596876 BT9727_1594 BT9727_1595     FALSE 0.000 502.000 0.000 NA   NA
 596878 596879 BT9727_1597 BT9727_1598     FALSE 0.000 963.000 0.000 NA   NA
 596879 596880 BT9727_1598 BT9727_1599     FALSE 0.003 227.000 0.000 NA   NA
 596880 596881 BT9727_1599 BT9727_1600     FALSE 0.578 4.000 0.188 NA   NA
 596881 596882 BT9727_1600 BT9727_1601     TRUE 0.745 5.000 0.438 NA   NA
 596882 596883 BT9727_1601 BT9727_1602     FALSE 0.000 478.000 0.000 NA   NA
 596883 596884 BT9727_1602 BT9727_1603     FALSE 0.000 1303.000 0.000 NA   NA
 596884 596885 BT9727_1603 BT9727_1604     FALSE 0.006 179.000 0.000 NA   NA
 596885 596886 BT9727_1604 BT9727_1605     FALSE 0.023 85.000 0.000 NA   NA
 596889 596890 BT9727_1608 BT9727_1609 gntR   TRUE 0.790 17.000 0.194 NA N NA
 596890 596891 BT9727_1609 BT9727_1611   cobW FALSE 0.082 183.000 0.097 NA   NA
 596892 596893 BT9727_1610 BT9727_1612 ycgR ycgQ TRUE 0.830 17.000 0.750 NA   NA
 596893 596894 BT9727_1612 BT9727_1613 ycgQ   FALSE 0.241 113.000 0.125 NA   NA
 596894 596895 BT9727_1613 BT9727_1614   nhaC FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 596896 596897 BT9727_1615 BT9727_1616     TRUE 0.893 -40.000 0.462 1.000   NA
 596899 596900 BT9727_1618 BT9727_1619     FALSE 0.001 362.000 0.000 NA   NA
 596901 596902 BT9727_1620 BT9727_1621   matE FALSE 0.267 99.000 0.111 NA   NA
 596904 596905 BT9727_1623 BT9727_1624     FALSE 0.248 108.000 0.125 NA   NA
 596905 596906 BT9727_1624 BT9727_1625     TRUE 0.814 5.000 0.250 NA N NA
 596906 596907 BT9727_1625 BT9727_1626   ccdA TRUE 0.902 54.000 0.171 NA Y NA
 596907 596908 BT9727_1626 BT9727_1627 ccdA   TRUE 0.952 19.000 0.241 1.000 Y NA
 596908 596909 BT9727_1627 BT9727_1628   lgt FALSE 0.521 15.000 0.011 1.000   NA
 596911 596912 BT9727_1630 BT9727_1631   dsdA FALSE 0.002 248.000 0.000 NA   NA
 596912 596913 BT9727_1631 BT9727_1632 dsdA   FALSE 0.140 146.000 0.065 NA   NA
 596914 596915 BT9727_1633 BT9727_1634     FALSE 0.551 -3.000 0.071 NA   NA
 596915 596916 BT9727_1634 BT9727_1635     TRUE 0.795 -7.000 0.393 NA   NA
 596916 596917 BT9727_1635 BT9727_1636   sigW TRUE 0.799 -3.000 0.455 NA   NA
 596918 596919 BT9727_1637 BT9727_1638     TRUE 0.985 5.000 0.857 0.020 Y NA
 596919 596920 BT9727_1638 BT9727_1639     TRUE 0.824 118.000 0.667 0.100 N NA
 596920 596921 BT9727_1639 BT9727_1640     TRUE 0.779 38.000 0.250 NA N NA
 596921 596922 BT9727_1640 BT9727_1641     TRUE 0.946 2.000 0.227 NA Y NA
 596922 596923 BT9727_1641 BT9727_1642   cls TRUE 0.607 106.000 0.160 1.000 N NA
 596923 596924 BT9727_1642 BT9727_1643 cls   FALSE 0.001 353.000 0.000 NA   NA
 596924 596925 BT9727_1643 BT9727_1644     FALSE 0.068 0.000 0.000 NA   NA
 596925 596926 BT9727_1644 BT9727_1645   yeeF FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 596926 596927 BT9727_1645 BT9727_1646 yeeF   FALSE 0.046 41.000 0.000 NA   NA
 596929 596930 BT9727_1648 BT9727_1649 gltT aspA TRUE 0.734 25.000 0.000 1.000 N NA
 596930 596931 BT9727_1649 BT9727_1650 aspA   TRUE 0.636 55.000 0.000 1.000 N NA
 596931 596932 BT9727_1650 BT9727_1651     TRUE 0.700 66.000 0.500 1.000   NA
 596932 596933 BT9727_1651 BT9727_1652     TRUE 0.851 3.000 0.600 1.000   NA
 596933 596934 BT9727_1652 BT9727_1653     TRUE 0.826 118.000 0.113 1.000 Y NA
 596934 596935 BT9727_1653 BT9727_1654     FALSE 0.001 294.000 0.000 NA   NA
 596937 596938 BT9727_1655 BT9727_1657 asnA   FALSE 0.016 333.000 0.016 1.000   NA
 596940 596941 BT9727_1659 BT9727_1660 yndG yndH TRUE 0.737 4.000 0.417 NA   NA
 596941 596942 BT9727_1660 BT9727_1661 yndH yndJ TRUE 0.719 6.000 0.400 NA   NA
 596944 596945 BT9727_1663 BT9727_1664     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 596945 596946 BT9727_1664 BT9727_1665     TRUE 0.692 -7.000 0.222 NA   NA
 596948 596949 BT9727_1667 BT9727_1668 cstA   FALSE 0.161 90.000 0.015 NA   NA
 596949 596950 BT9727_1668 BT9727_1669     FALSE 0.065 177.000 0.044 NA   NA
 596950 596951 BT9727_1669 BT9727_1670     FALSE 0.530 36.000 0.194 NA   NA
 596951 596952 BT9727_1670 BT9727_1671     FALSE 0.142 204.000 0.000 0.072   NA
 596954 596955 BT9727_1673 BT9727_1674   hflX FALSE 0.003 484.000 0.000 1.000   NA
 596956 596957 BT9727_1675 BT9727_1676 oppA oppA FALSE 0.457 117.000 0.000 0.042   NA
 596958 596959 BT9727_1677 BT9727_1678 fsr cysK TRUE 0.803 11.000 0.059 1.000 N NA
 596959 596960 BT9727_1678 BT9727_1679 cysK   FALSE 0.449 78.000 0.143 1.000   NA
 596960 596961 BT9727_1679 BT9727_1680     TRUE 0.730 82.000 0.778 1.000   NA
 596965 596966 BT9727_1684 BT9727_1685 yraL   FALSE 0.194 180.000 0.412 NA   NA
 596966 596967 BT9727_1685 BT9727_1686     FALSE 0.413 111.000 0.375 NA   NA
 596968 596969 BT9727_1687 BT9727_1688   msrB FALSE 0.291 67.000 0.056 NA   NA
 596969 596970 BT9727_1688 BT9727_1689 msrB   TRUE 0.655 92.000 0.194 1.000 N NA
 596971 596972 BT9727_1690 BT9727_1691 ilvE ilvB TRUE 0.937 23.000 0.017 1.000 Y NA
 596972 596973 BT9727_1691 BT9727_1692 ilvB   TRUE 0.902 -12.000 0.006 0.001   NA
 596973 596974 BT9727_1692 BT9727_1693   ilvC FALSE 0.508 15.000 0.003 1.000   NA
 596974 596975 BT9727_1693 BT9727_1694 ilvC ilvD TRUE 0.955 47.000 0.022 0.002 Y NA
 596975 596976 BT9727_1694 BT9727_1695 ilvD ilvA TRUE 0.931 32.000 0.012 1.000 Y NA
 596978 596979 BT9727_1697 BT9727_1698 ydfK   FALSE 0.405 4.000 0.032 NA   NA
 596979 596980 BT9727_1698 BT9727_1699     FALSE 0.166 169.000 0.075 1.000   NA
 596982 596983 BT9727_1701 BT9727_1702   pfs FALSE 0.449 115.000 0.000 1.000 N NA
 596983 596984 BT9727_1702 BT9727_1703 pfs   FALSE 0.007 169.000 0.000 NA   NA
 596984 596985 BT9727_1703 BT9727_1704     FALSE 0.477 128.000 0.588 NA   NA
 596985 596986 BT9727_1704 BT9727_1705     FALSE 0.033 210.000 0.000 1.000   NA
 596986 596987 BT9727_1705 BT9727_1706   yunG FALSE 0.562 28.000 0.207 NA   NA
 596987 596988 BT9727_1706 BT9727_1707 yunG   FALSE 0.294 72.000 0.069 NA   NA
 596990 596991 BT9727_1709 BT9727_1710 oppA   FALSE 0.000 514.000 0.000 NA   NA
 596991 596992 BT9727_1710 BT9727_1711     FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 596992 596993 BT9727_1711 BT9727_1712     FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   NA
 596993 596994 BT9727_1712 BT9727_1713     FALSE 0.055 277.000 0.000 0.075   NA
 596996 596997 BT9727_1715 BT9727_1716   vanS TRUE 0.982 -70.000 0.455 1.000 Y NA
 596997 596998 BT9727_1716 BT9727_1717 vanS   FALSE 0.435 83.000 0.143 1.000   NA
 597002 597003 BT9727_1721 BT9727_1722     FALSE 0.036 54.000 0.000 NA   NA
 597003 597004 BT9727_1722 BT9727_1723   panE FALSE 0.001 284.000 0.000 NA   NA
 597004 597005 BT9727_1723 BT9727_1724 panE   FALSE 0.000 614.000 0.000 NA   NA
 597005 597006 BT9727_1724 BT9727_1725     FALSE 0.534 -126.000 0.019 NA   NA
 597006 597007 BT9727_1725 BT9727_1726     TRUE 0.717 65.000 0.019 0.005   NA
 597007 597008 BT9727_1726 BT9727_1727   nheA FALSE 0.003 594.000 0.000 1.000   NA
 597008 597009 BT9727_1727 BT9727_1728 nheA   TRUE 0.903 32.000 0.500 0.004   NA
 597009 597010 BT9727_1728 BT9727_1729   nheC TRUE 0.787 108.000 0.625 0.004   NA
 597010 597011 BT9727_1729 BT9727_1730 nheC   FALSE 0.231 163.000 0.222 1.000   NA
 597011 597012 BT9727_1730 BT9727_1731   deoR FALSE 0.029 358.000 0.000 1.000 N NA
 597012 597013 BT9727_1731 BT9727_1732 deoR deoC FALSE 0.068 306.000 0.077 1.000 N NA
 597013 597014 BT9727_1732 BT9727_1733 deoC nupC TRUE 0.832 103.000 0.026 1.000 Y NA
 597014 597015 BT9727_1733 BT9727_1734 nupC pyn TRUE 0.929 37.000 0.031 1.000 Y NA
 597015 597016 BT9727_1734 BT9727_1735 pyn cdd TRUE 0.932 34.000 0.031 1.000 Y NA
 597016 597017 BT9727_1735 BT9727_1736 cdd ccdC FALSE 0.483 42.000 0.167 NA   NA
 597018 597019 BT9727_1737 BT9727_1738 ynzC ccdA FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 597019 597020 BT9727_1738 BT9727_1739 ccdA   TRUE 0.807 52.000 0.750 1.000   NA
 597021 597022 BT9727_1740 BT9727_1741 pepP   FALSE 0.518 118.000 0.027 1.000 N NA
 597022 597023 BT9727_1741 BT9727_1742     FALSE 0.012 606.000 0.000 1.000 N NA
 597025 597026 BT9727_1744 BT9727_1745 topB   FALSE 0.001 374.000 0.000 NA   NA
 597026 597027 BT9727_1745 BT9727_1746     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 597027 597028 BT9727_1746 BT9727_1747     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 597028 597029 BT9727_1747 BT9727_1748     FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
 597031 597032 BT9727_1750 BT9727_1751 azr brnQ FALSE 0.093 240.000 0.000 1.000 N NA
 597032 597033 BT9727_1751 BT9727_1752 brnQ   FALSE 0.319 84.000 0.010 1.000   NA
 597033 597034 BT9727_1752 BT9727_1753     FALSE 0.007 345.000 0.000 1.000   NA
 597034 597035 BT9727_1753 BT9727_1754   ycnI FALSE 0.534 113.000 0.600 NA   NA
 597036 597037 BT9727_1755 BT9727_1756     FALSE 0.101 177.000 0.158 NA   NA
 597038 597039 BT9727_1757 BT9727_1758     TRUE 0.834 121.000 0.389 NA Y NA
 597039 597040 BT9727_1758 BT9727_1759     TRUE 0.630 72.000 0.158 NA N NA
 597040 597041 BT9727_1759 BT9727_1760     TRUE 0.750 58.000 0.123 0.036   NA
 597041 597042 BT9727_1760 BT9727_1761   gatA FALSE 0.006 369.000 0.000 1.000   NA
 597042 597043 BT9727_1761 BT9727_1762 gatA ydbI FALSE 0.092 179.000 0.128 NA   NA
 597045 597046 BT9727_1764 BT9727_1765   cobW FALSE 0.351 105.000 0.273 NA   NA
 597046 597047 BT9727_1765 BT9727_1766 cobW   FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 597047 597048 BT9727_1766 BT9727_1767   livG TRUE 0.915 90.000 0.750 NA Y NA
 597048 597049 BT9727_1767 BT9727_1768 livG livF TRUE 0.991 -22.000 0.708 0.026 Y NA
 597049 597050 BT9727_1768 BT9727_1769 livF livH TRUE 0.972 22.000 0.746 1.000 Y NA
 597050 597051 BT9727_1769 BT9727_1770 livH livM TRUE 0.984 2.000 0.687 0.042 Y NA
 597055 597056 BT9727_1774 BT9727_1775     FALSE 0.006 368.000 0.000 1.000   NA
 597056 597057 BT9727_1775 BT9727_1776     FALSE 0.533 120.000 0.259 NA N NA
 597057 597058 BT9727_1776 BT9727_1777   cydA FALSE 0.040 618.000 0.000 NA Y NA
 597058 597059 BT9727_1777 BT9727_1778 cydA cydB TRUE 0.979 -13.000 0.051 0.036 Y NA
 597059 597060 BT9727_1778 BT9727_1779 cydB cydD TRUE 0.955 0.000 0.151 1.000 Y NA
 597060 597061 BT9727_1779 BT9727_1780 cydD cydC TRUE 0.974 3.000 0.168 0.004 Y NA
 597061 597062 BT9727_1780 BT9727_1781 cydC   FALSE 0.002 233.000 0.000 NA   NA
 597062 597063 BT9727_1781 BT9727_1782     FALSE 0.452 91.000 0.353 NA   NA
 597065 597066 BT9727_1784 BT9727_1785 dacA   FALSE 0.021 248.000 0.000 1.000   NA
 597070 597071 BT9727_1789 BT9727_1790     TRUE 0.877 2.000 0.306 1.000 N NA
 597071 597072 BT9727_1790 BT9727_1791     TRUE 0.962 15.000 0.538 1.000 Y NA
 597074 597075 BT9727_1793 BT9727_1794 fabG aadK FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   NA
 597075 597076 BT9727_1794 BT9727_1795 aadK pdaA FALSE 0.232 118.000 0.136 NA   NA
 597076 597077 BT9727_1795 BT9727_1796 pdaA   TRUE 0.596 69.000 0.467 NA   NA
 597079 597080 BT9727_1797 BT9727_1799   hom FALSE 0.002 967.000 0.000 1.000   NA
 597080 597081 BT9727_1799 BT9727_1800 hom thrC TRUE 0.959 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 597081 597082 BT9727_1800 BT9727_1801 thrC thrB TRUE 0.963 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 597082 597083 BT9727_1801 BT9727_1802 thrB   FALSE 0.112 121.000 0.011 NA   NA
 597083 597084 BT9727_1802 BT9727_1803     FALSE 0.003 208.000 0.000 NA   NA
 597084 597085 BT9727_1803 BT9727_1804     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 597085 597086 BT9727_1804 BT9727_1805     FALSE 0.267 164.000 0.444 NA   NA
 597086 597087 BT9727_1805 BT9727_1806   phoP FALSE 0.585 14.000 0.057 1.000   NA
 597087 597088 BT9727_1806 BT9727_1807 phoP   TRUE 0.973 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 597088 597089 BT9727_1807 BT9727_1808     TRUE 0.616 101.000 0.129 1.000 N NA
 597089 597090 BT9727_1808 BT9727_1809     FALSE 0.486 15.000 0.111 NA   NA
 597090 597091 BT9727_1809 BT9727_1810   sapB FALSE 0.127 160.000 0.111 NA   NA
 597091 597092 BT9727_1810 BT9727_1811 sapB   FALSE 0.353 95.000 0.049 1.000   NA
 597092 597093 BT9727_1811 BT9727_1812     FALSE 0.011 299.000 0.000 1.000   NA
 597093 597094 BT9727_1812 BT9727_1813     TRUE 0.954 65.000 0.163 0.000 Y NA
 597094 597095 BT9727_1813 BT9727_1814     TRUE 0.974 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 597095 597096 BT9727_1814 BT9727_1815     TRUE 0.821 -3.000 0.526 NA   NA
 597096 597097 BT9727_1815 BT9727_1816     TRUE 0.778 16.000 0.583 NA   NA
 597097 597098 BT9727_1816 BT9727_1817     TRUE 0.683 38.000 0.412 NA   NA
 597098 597099 BT9727_1817 BT9727_1818   sspA FALSE 0.224 120.000 0.137 NA   NA
 597099 597100 BT9727_1818 BT9727_1819 sspA   FALSE 0.192 169.000 0.167 1.000   NA
 597101 597102 BT9727_1820 BT9727_1821     FALSE 0.004 427.000 0.000 1.000   NA
 597103 597104 BT9727_1822 BT9727_1823     FALSE 0.309 146.000 0.375 NA   NA
 597104 597105 BT9727_1823 BT9727_1824     TRUE 0.654 104.000 0.875 NA   NA
 597105 597106 BT9727_1824 BT9727_1825     TRUE 0.826 32.000 0.778 NA   NA
 597108 597109 BT9727_1827 BT9727_1828   abrB FALSE 0.336 117.000 0.286 NA   NA
 597109 597110 BT9727_1828 BT9727_1829 abrB isp FALSE 0.040 275.000 0.000 NA N NA
 597112 597113 BT9727_1831 BT9727_1832     TRUE 0.841 49.000 0.429 1.000 N NA
 597114 597115 BT9727_1833 BT9727_1834     TRUE 0.846 13.000 0.889 NA   NA
 597116 597117 BT9727_1835 BT9727_1836   yloQ FALSE 0.181 135.000 0.091 NA   NA
 597117 597118 BT9727_1836 BT9727_1837 yloQ mcpA FALSE 0.037 205.000 0.000 1.000   NA
 597118 597119 BT9727_1837 BT9727_1838 mcpA   FALSE 0.236 195.000 0.667 NA   NA
 597119 597120 BT9727_1838 BT9727_1839     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 597122 597123 BT9727_1841 BT9727_1842 dps   FALSE 0.246 107.000 0.111 NA   NA
 597123 597124 BT9727_1842 BT9727_1843     FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 597125 597126 BT9727_1844 BT9727_1845     FALSE 0.483 106.000 0.467 NA   NA
 597127 597128 BT9727_1846 BT9727_1847     TRUE 0.815 76.000 0.636 1.000 N NA
 597131 597132 BT9727_1850 BT9727_1851 bltD znuA FALSE 0.499 136.000 0.083 1.000 N NA
 597135 597136 BT9727_1854 BT9727_1855 ogt   FALSE 0.434 8.000 0.054 NA   NA
 597136 597137 BT9727_1855 BT9727_1856   oppA FALSE 0.287 139.000 0.296 NA   NA
 597137 597138 BT9727_1856 BT9727_1857 oppA fosB TRUE 0.893 59.000 0.129 NA Y NA
 597138 597139 BT9727_1857 BT9727_1858 fosB   FALSE 0.369 13.000 0.032 NA   NA
 597139 597140 BT9727_1858 BT9727_1859   pgm FALSE 0.419 13.000 0.056 NA   NA
 597142 597143 BT9727_1862 BT9727_1863 cotH   FALSE 0.495 106.000 0.062 NA N NA
 597143 597144 BT9727_1863 BT9727_1864     FALSE 0.210 105.000 0.062 NA   NA
 597144 597145 BT9727_1864 BT9727_1865     FALSE 0.511 103.000 0.500 NA   NA
 597145 597146 BT9727_1865 BT9727_1866   corA FALSE 0.235 185.000 0.033 0.099   NA
 597146 597147 BT9727_1866 BT9727_1867 corA   FALSE 0.049 199.000 0.053 NA   NA
 597147 597148 BT9727_1867 BT9727_1868   ycgQ TRUE 0.857 4.000 0.841 NA   NA
 597148 597149 BT9727_1868 BT9727_1869 ycgQ   FALSE 0.096 187.000 0.195 NA   NA
 597149 597150 BT9727_1869 BT9727_1870   cls FALSE 0.128 425.000 0.000 0.039 Y NA
 597150 597151 BT9727_1870 BT9727_1871 cls   TRUE 0.833 31.000 0.800 NA   NA
 597151 597152 BT9727_1871 BT9727_1872     FALSE 0.252 154.000 0.333 NA   NA
 597152 597153 BT9727_1872 BT9727_1873     FALSE 0.323 103.000 0.227 NA   NA
 597154 597155 BT9727_1874 BT9727_1875     FALSE 0.424 2.000 0.034 NA   NA
 597155 597156 BT9727_1875 BT9727_1876     FALSE 0.003 209.000 0.000 NA   NA
 597157 597158 BT9727_1877 BT9727_1878   brnQ FALSE 0.000 429.000 0.000 NA   NA
 597158 597159 BT9727_1878 BT9727_1879 brnQ csaA FALSE 0.418 67.000 0.032 1.000   NA
 597159 597160 BT9727_1879 BT9727_1880 csaA   FALSE 0.392 18.000 0.032 NA   NA
 597161 597162 BT9727_1881 BT9727_1882     TRUE 0.690 -10.000 0.200 NA   NA
 597163 597164 BT9727_1883 BT9727_1884 spoIIP   FALSE 0.063 215.000 0.214 NA   NA
 597164 597165 BT9727_1884 BT9727_1885     TRUE 0.897 12.000 0.571 1.000 N NA
 597165 597166 BT9727_1885 BT9727_1886     TRUE 0.800 24.000 0.444 1.000   NA
 597166 597167 BT9727_1886 BT9727_1887   gatA FALSE 0.188 185.000 0.286 1.000   NA
 597169 597170 BT9727_1889 BT9727_1890     TRUE 0.947 3.000 0.259 NA Y NA
 597170 597171 BT9727_1890 BT9727_1891     FALSE 0.549 105.000 0.021 1.000 N NA
 597171 597172 BT9727_1891 BT9727_1892     TRUE 0.771 7.000 0.368 1.000   NA
 597175 597176 BT9727_1895 BT9727_1896     TRUE 0.789 -13.000 0.185 1.000   NA
 597176 597177 BT9727_1896 BT9727_1897     FALSE 0.587 24.000 0.222 NA   NA
 597178 597179 BT9727_1898 BT9727_1899   yqfU FALSE 0.353 168.000 0.700 NA   NA
 597181 597182 BT9727_1901 BT9727_1902     FALSE 0.210 148.000 0.043 1.000   NA
 597182 597183 BT9727_1902 BT9727_1903     TRUE 0.887 -28.000 0.000 0.002   NA
 597184 597185 BT9727_1904 BT9727_1906     FALSE 0.105 -28.000 0.000 NA   NA
 597186 597187 BT9727_1907 BT9727_1908     FALSE 0.546 89.000 0.000 0.024   NA
 597187 597188 BT9727_1908 BT9727_1909     FALSE 0.476 13.000 0.090 NA   NA
 597188 597189 BT9727_1909 BT9727_1910     TRUE 0.758 -3.000 0.368 NA   NA
 597189 597190 BT9727_1910 BT9727_1911     FALSE 0.514 32.000 0.158 NA   NA
 597190 597191 BT9727_1911 BT9727_1912   yfjA FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   NA
 597191 597192 BT9727_1912 BT9727_1913 yfjA   FALSE 0.188 128.000 0.082 NA   NA
 597192 597193 BT9727_1913 BT9727_1914     TRUE 0.675 -28.000 0.122 NA   NA
 597193 597194 BT9727_1914 BT9727_1915     FALSE 0.547 5.000 0.158 NA   NA
 597194 597195 BT9727_1915 BT9727_1916     TRUE 0.721 73.000 0.833 NA   NA
 597195 597196 BT9727_1916 BT9727_1917     TRUE 0.764 40.000 0.623 NA   NA
 597196 597197 BT9727_1917 BT9727_1918     FALSE 0.381 13.000 0.038 NA   NA
 597197 597198 BT9727_1918 BT9727_1919     FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 597198 597199 BT9727_1919 BT9727_1920     FALSE 0.052 13.000 0.000 NA   NA
 597199 597200 BT9727_1920 BT9727_1921     FALSE 0.052 32.000 0.000 NA   NA
 597200 597201 BT9727_1921 BT9727_1923     FALSE 0.017 113.000 0.000 NA   NA
 597201 597202 BT9727_1923 BT9727_1924     TRUE 0.813 -3.000 0.500 NA   NA
 597202 597203 BT9727_1924 BT9727_1925     FALSE 0.000 712.000 0.000 NA   NA
 597203 597204 BT9727_1925 BT9727_1926     FALSE 0.019 104.000 0.000 NA   NA
 597204 597205 BT9727_1926 BT9727_1927     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 597205 597206 BT9727_1927 BT9727_1928     FALSE 0.000 418.000 0.000 NA   NA
 597206 597207 BT9727_1928 BT9727_1929     FALSE 0.032 63.000 0.000 NA   NA
 597207 597208 BT9727_1929 BT9727_1930     FALSE 0.448 153.000 0.750 NA   NA
 597210 597211 BT9727_1932 BT9727_1933     FALSE 0.346 89.000 0.216 NA   NA
 597211 597212 BT9727_1933 BT9727_1934     FALSE 0.474 52.000 0.216 NA   NA
 597212 597213 BT9727_1934 BT9727_1935     TRUE 0.757 67.000 0.889 NA   NA
 597215 597216 BT9727_1937 BT9727_1938   fhs TRUE 0.739 64.000 0.200 1.000 N NA
 597216 597217 BT9727_1938 BT9727_1939 fhs   FALSE 0.480 79.000 0.355 NA   NA
 597217 597218 BT9727_1939 BT9727_1940     FALSE 0.481 20.000 0.070 NA   NA
 597218 597219 BT9727_1940 BT9727_1941     FALSE 0.107 143.000 0.026 NA   NA
 597219 597220 BT9727_1941 BT9727_1942     FALSE 0.457 56.000 0.211 NA   NA
 597221 597222 BT9727_1943 BT9727_1944   qor FALSE 0.581 30.000 0.233 NA   NA
 597223 597224 BT9727_1945 BT9727_1946     TRUE 0.880 -3.000 0.800 NA   NA
 597225 597226 BT9727_1947 BT9727_1948     FALSE 0.436 32.000 0.064 NA   NA
 597226 597227 BT9727_1948 BT9727_1949     FALSE 0.242 89.000 0.064 NA   NA
 597229 597230 BT9727_1951 BT9727_1952   yeaD TRUE 0.851 -3.000 0.642 NA   NA
 597230 597231 BT9727_1952 BT9727_1953 yeaD moxR TRUE 0.851 0.000 0.714 NA   NA
 597232 597233 BT9727_1954 BT9727_1955 narG narH TRUE 0.989 -10.000 0.429 0.000 Y NA
 597233 597234 BT9727_1955 BT9727_1956 narH narJ TRUE 0.986 20.000 0.750 0.001 Y NA
 597234 597235 BT9727_1956 BT9727_1957 narJ narI TRUE 0.978 21.000 0.294 0.001 Y NA
 597237 597238 BT9727_1959 BT9727_1960 moaA moeB TRUE 0.983 18.000 0.778 0.039 Y NA
 597238 597239 BT9727_1960 BT9727_1961 moeB moeA TRUE 0.954 42.000 0.500 1.000 Y NA
 597239 597240 BT9727_1961 BT9727_1962 moeA moaE TRUE 0.953 45.000 0.006 0.004 Y NA
 597240 597241 BT9727_1962 BT9727_1963 moaE moaD TRUE 0.986 -3.000 0.501 0.004 Y NA
 597241 597242 BT9727_1963 BT9727_1964 moaD narK TRUE 0.605 81.000 0.021 1.000 N NA
 597242 597243 BT9727_1964 BT9727_1965 narK   FALSE 0.029 353.000 0.000 0.070   NA
 597244 597245 BT9727_1966 BT9727_1967     TRUE 0.754 -7.000 0.143 1.000   NA
 597245 597246 BT9727_1967 BT9727_1968     TRUE 0.825 -3.000 0.381 1.000   NA
 597246 597247 BT9727_1968 BT9727_1969   nasE TRUE 0.707 62.000 0.061 1.000 N NA
 597247 597248 BT9727_1969 BT9727_1970 nasE nirB TRUE 0.921 16.000 0.091 0.000 N NA
 597248 597249 BT9727_1970 BT9727_1971 nirB scdA FALSE 0.088 211.000 0.000 NA N NA
 597254 597255 BT9727_1976 BT9727_1977   spoVS FALSE 0.000 700.000 0.000 NA   NA
 597259 597260 BT9727_1981 BT9727_1982     TRUE 0.653 -3.000 0.031 1.000   NA
 597260 597261 BT9727_1982 BT9727_1983     FALSE 0.199 76.000 0.022 NA   NA
 597261 597262 BT9727_1983 BT9727_1984     FALSE 0.191 106.000 0.049 NA   NA
 597262 597263 BT9727_1984 BT9727_1985   ssb FALSE 0.393 159.000 0.700 NA   NA
 597264 597265 BT9727_1986 BT9727_1987     FALSE 0.564 117.000 0.088 1.000 N NA
 597266 597267 BT9727_1988 BT9727_1989     FALSE 0.395 4.000 0.028 NA   NA
 597267 597268 BT9727_1989 BT9727_1990     FALSE 0.194 84.000 0.028 NA   NA
 597268 597269 BT9727_1990 BT9727_1991   pcmT FALSE 0.390 50.000 0.081 NA   NA
 597269 597270 BT9727_1991 BT9727_1992 pcmT argS FALSE 0.011 301.000 0.000 1.000   NA
 597270 597271 BT9727_1992 BT9727_1993 argS   FALSE 0.237 134.000 0.032 1.000   NA
 597271 597272 BT9727_1993 BT9727_1994     FALSE 0.005 382.000 0.000 1.000   NA
 597272 597273 BT9727_1994 BT9727_1995   ileS FALSE 0.005 392.000 0.000 1.000   NA
 597273 597274 BT9727_1995 BT9727_1996 ileS   FALSE 0.037 326.000 0.000 1.000 N NA
 597276 597277 BT9727_1998 BT9727_1999 murF aspS FALSE 0.051 387.000 0.000 0.040 N NA
 597277 597278 BT9727_1999 BT9727_2000 aspS   FALSE 0.003 481.000 0.000 1.000   NA
 597278 597279 BT9727_2000 BT9727_2001   pip TRUE 0.638 41.000 0.206 1.000   NA
 597280 597281 BT9727_2002 BT9727_2003     FALSE 0.477 33.000 0.095 NA   NA
 597282 597283 BT9727_2004 BT9727_2005 gph gntP FALSE 0.033 210.000 0.000 1.000   NA
 597283 597284 BT9727_2005 BT9727_2006 gntP gbsB TRUE 0.858 53.000 0.583 1.000 N NA
 597284 597285 BT9727_2006 BT9727_2007 gbsB racD FALSE 0.416 148.000 0.032 1.000 N NA
 597285 597286 BT9727_2007 BT9727_2008 racD   FALSE 0.196 88.000 0.032 NA   NA
 597286 597287 BT9727_2008 BT9727_2009     FALSE 0.590 -3.000 0.113 NA   NA
 597288 597289 BT9727_2010 BT9727_2011     FALSE 0.557 30.000 0.027 1.000   NA
 597290 597291 BT9727_2012 BT9727_2013     TRUE 0.755 -7.000 0.308 NA   NA
 597291 597292 BT9727_2013 BT9727_2014   ypjP FALSE 0.001 283.000 0.000 NA   NA
 597292 597293 BT9727_2014 BT9727_2015 ypjP gph FALSE 0.197 101.000 0.045 NA   NA
 597293 597294 BT9727_2015 BT9727_2016 gph   TRUE 0.619 2.000 0.038 1.000   NA
 597294 597295 BT9727_2016 BT9727_2017     FALSE 0.472 13.000 0.085 NA   NA
 597297 597298 BT9727_2019 BT9727_2020 ramA thyA FALSE 0.264 107.000 0.004 1.000   NA
 597298 597299 BT9727_2020 BT9727_2021 thyA dfrA TRUE 0.865 20.000 0.295 1.000 N NA
 597299 597300 BT9727_2021 BT9727_2022 dfrA pbp3 FALSE 0.361 156.000 0.015 1.000 N NA
 597300 597301 BT9727_2022 BT9727_2023 pbp3   TRUE 0.609 63.000 0.000 1.000 N NA
 597301 597302 BT9727_2023 BT9727_2024     TRUE 0.889 135.000 0.333 0.044 Y NA
 597302 597303 BT9727_2024 BT9727_2025   yvaB FALSE 0.084 249.000 0.000 1.000 N NA
 597303 597304 BT9727_2025 BT9727_2026 yvaB plsC TRUE 0.847 112.000 0.206 1.000 Y NA
 597306 597307 BT9727_2028 BT9727_2029 tatA tatC TRUE 0.944 43.000 0.500 NA Y NA
 597307 597308 BT9727_2029 BT9727_2030 tatC ypmP FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 597308 597309 BT9727_2030 BT9727_2031 ypmP   FALSE 0.376 153.000 0.577 NA   NA
 597313 597314 BT9727_2035 BT9727_2036 asnB   FALSE 0.404 94.000 0.108 1.000   NA
 597314 597315 BT9727_2036 BT9727_2037     TRUE 0.749 49.000 0.667 NA   NA
 597315 597316 BT9727_2037 BT9727_2038     FALSE 0.000 434.000 0.000 NA   NA
 597316 597317 BT9727_2038 BT9727_2039   daaA TRUE 0.736 132.000 0.778 1.000 N NA
 597317 597318 BT9727_2039 BT9727_2040 daaA   TRUE 0.635 99.000 0.175 1.000 N NA
 597318 597319 BT9727_2040 BT9727_2041     FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 597319 597320 BT9727_2041 BT9727_2042     FALSE 0.455 68.000 0.263 NA   NA
 597320 597321 BT9727_2042 BT9727_2043   pncA FALSE 0.169 112.000 0.039 NA   NA
 597323 597324 BT9727_2045 BT9727_2046 hsp   FALSE 0.031 300.000 0.000 NA N NA
 597324 597325 BT9727_2046 BT9727_2047   yhcY FALSE 0.554 151.000 0.400 1.000 N NA
 597325 597326 BT9727_2047 BT9727_2048 yhcY yhcZ TRUE 0.968 14.000 0.250 0.019 Y NA
 597326 597327 BT9727_2048 BT9727_2049 yhcZ   FALSE 0.240 147.000 0.071 1.000   NA
 597327 597328 BT9727_2049 BT9727_2050   adhB FALSE 0.012 290.000 0.000 1.000   NA
 597329 597330 BT9727_2051 BT9727_2052 oppC oppB TRUE 0.968 -33.000 0.500 0.040 N NA
 597331 597332 BT9727_2053 BT9727_2055     FALSE 0.352 154.000 0.000 0.011   NA
 597332 597333 BT9727_2055 BT9727_2056   gntK FALSE 0.004 458.000 0.000 1.000   NA
 597333 597334 BT9727_2056 BT9727_2057 gntK gntK TRUE 0.770 43.000 0.000 0.001   NA
 597334 597335 BT9727_2057 BT9727_2058 gntK   FALSE 0.097 152.000 0.000 1.000   NA
 597335 597336 BT9727_2058 BT9727_2059     FALSE 0.482 35.000 0.115 NA   NA
 597336 597337 BT9727_2059 BT9727_2060   azr FALSE 0.219 146.000 0.231 NA   NA
 597337 597338 BT9727_2060 BT9727_2061 azr   TRUE 0.690 2.000 0.150 1.000   NA
 597338 597339 BT9727_2061 BT9727_2062     FALSE 0.366 64.000 0.117 NA   NA
 597339 597340 BT9727_2062 BT9727_2063   opuCA FALSE 0.355 103.000 0.269 NA   NA
 597340 597341 BT9727_2063 BT9727_2064 opuCA opuBB TRUE 0.909 4.000 0.218 0.097 N NA
 597341 597342 BT9727_2064 BT9727_2065 opuBB arcD FALSE 0.124 214.000 0.000 1.000 N NA
 597342 597343 BT9727_2065 BT9727_2066 arcD   FALSE 0.590 77.000 0.533 NA   NA
 597343 597344 BT9727_2066 BT9727_2067     FALSE 0.469 97.000 0.400 NA   NA
 597344 597345 BT9727_2067 BT9727_2069     TRUE 0.807 -10.000 0.400 NA   NA
 597345 597346 BT9727_2069 BT9727_2070     FALSE 0.001 277.000 0.000 NA   NA
 597348 597349 BT9727_2072 BT9727_2073 corC gabD FALSE 0.590 134.000 0.333 0.073   NA
 597353 597354 BT9727_2077 BT9727_2078   atoD TRUE 0.944 -3.000 0.792 1.000 N NA
 597354 597355 BT9727_2078 BT9727_2079 atoD atoA TRUE 0.992 -15.000 0.760 0.000 Y NA
 597355 597356 BT9727_2079 BT9727_2080 atoA argE TRUE 0.876 16.000 0.419 1.000 N NA
 597356 597357 BT9727_2080 BT9727_2081 argE   TRUE 0.958 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 597357 597358 BT9727_2081 BT9727_2082   rocR FALSE 0.559 100.000 0.013 1.000 N NA
 597358 597359 BT9727_2082 BT9727_2083 rocR kamA FALSE 0.132 210.000 0.000 1.000 N NA
 597359 597360 BT9727_2083 BT9727_2084 kamA   TRUE 0.593 -3.000 0.124 NA   NA
 597360 597361 BT9727_2084 BT9727_2085     FALSE 0.323 73.000 0.102 NA   NA
 597361 597362 BT9727_2085 BT9727_2086     FALSE 0.052 191.000 0.045 NA   NA
 597364 597365 BT9727_2088 BT9727_2089 yozD   TRUE 0.709 -3.000 0.286 NA   NA
 597365 597366 BT9727_2089 BT9727_2090     FALSE 0.583 0.000 0.158 NA   NA
 597366 597367 BT9727_2090 BT9727_2091   spo0M TRUE 0.732 -18.000 0.237 NA   NA
 597367 597368 BT9727_2091 BT9727_2092 spo0M pgpB FALSE 0.412 72.000 0.233 NA   NA
 597369 597370 BT9727_2093 BT9727_2094 czcD trx FALSE 0.057 279.000 0.000 1.000 N NA
 597370 597371 BT9727_2094 BT9727_2095 trx intA FALSE 0.207 80.000 0.000 1.000   NA
 597371 597372 BT9727_2095 BT9727_2096 intA   FALSE 0.005 183.000 0.000 NA   NA
 597372 597373 BT9727_2096 BT9727_2097     TRUE 0.614 22.000 0.250 NA   NA
 597373 597374 BT9727_2097 BT9727_2098     FALSE 0.015 125.000 0.000 NA   NA
 597375 597376 BT9727_2099 BT9727_2100     FALSE 0.100 -19.000 0.000 NA   NA
 597377 597378 BT9727_2101 BT9727_2102     FALSE 0.352 37.000 0.000 1.000   NA
 597379 597380 BT9727_2103 BT9727_2104     FALSE 0.001 298.000 0.000 NA   NA
 597380 597381 BT9727_2104 BT9727_2105     TRUE 0.922 -58.000 0.667 1.000   NA
 597382 597383 BT9727_2106 BT9727_2107     FALSE 0.000 413.000 0.000 NA   NA
 597384 597385 BT9727_2108 BT9727_2109     FALSE 0.000 468.000 0.000 NA   NA
 597385 597386 BT9727_2109 BT9727_2110     FALSE 0.000 390.000 0.000 NA   NA
 597386 597387 BT9727_2110 BT9727_2111     FALSE 0.000 462.000 0.000 NA   NA
 597387 597388 BT9727_2111 BT9727_2112     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 597388 597389 BT9727_2112 BT9727_2113     FALSE 0.458 120.000 0.500 NA   NA
 597391 597392 BT9727_2115 BT9727_2116 prsA   FALSE 0.000 505.000 0.000 NA   NA
 597392 597393 BT9727_2116 BT9727_2117     FALSE 0.005 185.000 0.000 NA   NA
 597393 597394 BT9727_2117 BT9727_2118     FALSE 0.000 430.000 0.000 NA   NA
 597396 597397 BT9727_2120 BT9727_2121     FALSE 0.002 242.000 0.000 NA   NA
 597397 597398 BT9727_2121 BT9727_2122   pbp1A FALSE 0.002 745.000 0.000 1.000   NA
 597398 597399 BT9727_2122 BT9727_2123 pbp1A glpT FALSE 0.012 615.000 0.000 1.000 N NA
 597399 597400 BT9727_2123 BT9727_2124 glpT   TRUE 0.595 16.000 0.250 NA   NA
 597400 597401 BT9727_2124 BT9727_2125   mmgD FALSE 0.000 402.000 0.000 NA   NA
 597401 597402 BT9727_2125 BT9727_2126 mmgD mmgE FALSE 0.442 99.000 0.216 1.000   NA
 597402 597403 BT9727_2126 BT9727_2127 mmgE prpB TRUE 0.704 19.000 0.218 1.000   NA
 597403 597404 BT9727_2127 BT9727_2128 prpB mmgC FALSE 0.381 155.000 0.033 1.000 N NA
 597404 597405 BT9727_2128 BT9727_2129 mmgC garR TRUE 0.964 17.000 0.500 1.000 Y NA
 597405 597406 BT9727_2129 BT9727_2130 garR mmsA TRUE 0.945 37.000 0.545 0.001 N NA
 597407 597408 BT9727_2131 BT9727_2132 rhtB phaB FALSE 0.299 184.000 0.167 1.000 N NA
 597409 597410 BT9727_2133 BT9727_2134     FALSE 0.119 184.000 0.250 NA   NA
 597410 597411 BT9727_2134 BT9727_2135   sbcD FALSE 0.330 16.000 0.016 NA   NA
 597411 597412 BT9727_2135 BT9727_2136 sbcD sbcC TRUE 0.988 -3.000 0.669 0.002 Y NA
 597412 597413 BT9727_2136 BT9727_2137 sbcC   FALSE 0.069 410.000 0.000 NA Y NA
 597413 597414 BT9727_2137 BT9727_2138     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 597418 597419 BT9727_2142 BT9727_2143   entA FALSE 0.012 584.000 0.000 1.000 N NA
 597419 597420 BT9727_2143 BT9727_2144 entA entC TRUE 0.947 27.000 0.210 1.000 Y NA
 597420 597421 BT9727_2144 BT9727_2145 entC entE TRUE 0.962 13.000 0.511 1.000 Y NA
 597421 597422 BT9727_2145 BT9727_2146 entE entB TRUE 0.966 25.000 0.581 1.000 Y NA
 597422 597423 BT9727_2146 BT9727_2147 entB entF TRUE 0.978 32.000 0.424 0.001 Y NA
 597423 597424 BT9727_2147 BT9727_2148 entF mbtH TRUE 0.785 -3.000 0.424 NA   NA
 597424 597425 BT9727_2148 BT9727_2149 mbtH imrB TRUE 0.752 0.000 0.400 NA   NA
 597425 597426 BT9727_2149 BT9727_2150 imrB sfp TRUE 0.829 34.000 0.229 1.000 N NA
 597426 597427 BT9727_2150 BT9727_2151 sfp   FALSE 0.340 36.000 0.025 NA   NA
 597429 597430 BT9727_2153 BT9727_2154   dinB FALSE 0.558 15.000 0.219 NA   NA
 597431 597432 BT9727_2155 BT9727_2156     FALSE 0.105 227.000 0.000 1.000 N NA
 597432 597433 BT9727_2156 BT9727_2157     FALSE 0.000 445.000 0.000 NA   NA
 597434 597435 BT9727_2158 BT9727_2159   ydbC FALSE 0.096 205.000 0.286 NA   NA
 597435 597436 BT9727_2159 BT9727_2160 ydbC   FALSE 0.098 177.000 0.148 NA   NA
 597436 597437 BT9727_2160 BT9727_2161   thrS FALSE 0.048 652.000 0.000 1.000 Y NA
 597437 597438 BT9727_2161 BT9727_2162 thrS   FALSE 0.148 254.000 0.000 0.095 N NA
 597438 597439 BT9727_2162 BT9727_2163     TRUE 0.863 12.000 0.778 1.000   NA
 597439 597440 BT9727_2163 BT9727_2164     FALSE 0.016 268.000 0.000 1.000   NA
 597440 597441 BT9727_2164 BT9727_2165     FALSE 0.034 58.000 0.000 NA   NA
 597441 597442 BT9727_2165 BT9727_2166   oppC FALSE 0.002 264.000 0.000 NA   NA
 597444 597445 BT9727_2168 BT9727_2169     FALSE 0.312 105.000 0.036 1.000   NA
 597446 597447 BT9727_2170 BT9727_2171 iunH   FALSE 0.482 37.000 0.137 NA   NA
 597450 597451 BT9727_2174 BT9727_2175 rimI   TRUE 0.635 67.000 0.368 1.000   NA
 597455 597456 BT9727_2179 BT9727_2180 cat   FALSE 0.007 360.000 0.000 1.000   NA
 597456 597457 BT9727_2180 BT9727_2181   rimI FALSE 0.498 148.000 0.171 0.023   NA
 597458 597459 BT9727_2182 BT9727_2183   cgeB TRUE 0.759 17.000 0.500 NA   NA
 597460 597461 BT9727_2184 BT9727_2185     FALSE 0.144 104.000 0.015 NA   NA
 597463 597464 BT9727_2187 BT9727_2188     FALSE 0.000 1037.000 0.000 NA   NA
 597465 597466 BT9727_2189 BT9727_2190     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 597468 597469 BT9727_2192 BT9727_2193     FALSE 0.002 231.000 0.000 NA   NA
 597470 597471 BT9727_2194 BT9727_2195     FALSE 0.031 66.000 0.000 NA   NA
 597471 597472 BT9727_2195 BT9727_2196     FALSE 0.003 227.000 0.000 NA   NA
 597472 597473 BT9727_2196 BT9727_2197     FALSE 0.000 632.000 0.000 NA   NA
 597474 597475 BT9727_2198 BT9727_2199   uspA FALSE 0.171 104.000 0.000 1.000   NA
 597475 597476 BT9727_2199 BT9727_2200 uspA sulP TRUE 0.739 23.000 0.000 1.000 N NA
 597477 597478 BT9727_2201 BT9727_2202 tnpR   FALSE 0.069 229.000 0.000 NA N NA
 597478 597479 BT9727_2202 BT9727_2203   chrA TRUE 0.773 19.000 0.078 NA N NA
 597479 597480 BT9727_2203 BT9727_2204 chrA   FALSE 0.000 406.000 0.000 NA   NA
 597480 597481 BT9727_2204 BT9727_2205     FALSE 0.048 38.000 0.000 NA   NA
 597481 597482 BT9727_2205 BT9727_2206     FALSE 0.384 9.000 0.000 1.000   NA
 597482 597483 BT9727_2206 BT9727_2207     FALSE 0.078 162.000 0.000 1.000   NA
 597485 597486 BT9727_2209 BT9727_2210     FALSE 0.528 34.000 0.179 NA   NA
 597486 597487 BT9727_2210 BT9727_2211     FALSE 0.000 422.000 0.000 NA   NA
 597487 597488 BT9727_2211 BT9727_2212   hemY TRUE 0.716 61.000 0.500 1.000   NA
 597491 597492 BT9727_2215 BT9727_2216 ydjO cspA FALSE 0.449 87.000 0.333 NA   NA
 597493 597494 BT9727_2217 BT9727_2218     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 597496 597497 BT9727_2220 BT9727_2221     FALSE 0.282 117.000 0.214 NA   NA
 597497 597498 BT9727_2221 BT9727_2222     TRUE 0.638 141.000 0.500 1.000 N NA
 597499 597500 BT9727_2223 BT9727_2224     FALSE 0.000 408.000 0.000 NA   NA
 597502 597503 BT9727_2226 BT9727_2227     FALSE 0.000 423.000 0.000 NA   NA
 597504 597505 BT9727_2228 BT9727_2229 asd   FALSE 0.164 166.000 0.058 1.000   NA
 597505 597506 BT9727_2229 BT9727_2230     FALSE 0.578 43.000 0.286 NA   NA
 597508 597509 BT9727_2232 BT9727_2233 yflK   FALSE 0.017 262.000 0.000 1.000   NA
 597509 597510 BT9727_2233 BT9727_2234     FALSE 0.544 1.000 0.100 NA   NA
 597510 597511 BT9727_2234 BT9727_2235     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 597511 597512 BT9727_2235 BT9727_2236     TRUE 0.983 -7.000 0.240 0.004 Y NA
 597512 597513 BT9727_2236 BT9727_2237     FALSE 0.012 604.000 0.000 1.000 N NA
 597521 597522 BT9727_2246 BT9727_2247     FALSE 0.281 94.000 0.127 NA   NA
 597522 597523 BT9727_2247 BT9727_2248   rpoE TRUE 0.901 -22.000 0.145 1.000 N NA
 597523 597524 BT9727_2248 BT9727_2249 rpoE   FALSE 0.003 503.000 0.000 1.000   NA
 597524 597525 BT9727_2249 BT9727_2250     FALSE 0.007 350.000 0.000 1.000   NA
 597525 597526 BT9727_2250 BT9727_2251     TRUE 0.781 25.000 0.571 NA   NA
 597528 597529 BT9727_2253 BT9727_2254 celA celB TRUE 0.982 12.000 0.667 0.005 Y NA
 597529 597530 BT9727_2254 BT9727_2255 celB   FALSE 0.435 80.000 0.296 NA   NA
 597530 597531 BT9727_2255 BT9727_2256     FALSE 0.342 23.000 0.015 NA   NA
 597531 597532 BT9727_2256 BT9727_2257     TRUE 0.728 21.000 0.013 NA N NA
 597532 597533 BT9727_2257 BT9727_2258     FALSE 0.447 133.000 0.556 NA   NA
 597533 597534 BT9727_2258 BT9727_2259     FALSE 0.428 71.000 0.250 NA   NA
 597534 597535 BT9727_2259 BT9727_2260   tdcB TRUE 0.911 87.000 0.017 0.015 Y NA
 597536 597537 BT9727_2261 BT9727_2262     FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 597537 597538 BT9727_2262 BT9727_2263     FALSE 0.009 157.000 0.000 NA   NA
 597538 597539 BT9727_2263 BT9727_2264     FALSE 0.110 -51.000 0.000 NA   NA
 597539 597540 BT9727_2264 BT9727_2265     FALSE 0.000 407.000 0.000 NA   NA
 597543 597544 BT9727_2268 BT9727_2269   deaD FALSE 0.339 74.000 0.150 NA   NA
 597544 597545 BT9727_2269 BT9727_2270 deaD   FALSE 0.455 33.000 0.075 NA   NA
 597547 597548 BT9727_2272 BT9727_2273     TRUE 0.790 57.000 0.300 1.000 N NA
 597548 597549 BT9727_2273 BT9727_2274     TRUE 0.832 7.000 0.167 1.000 N NA
 597549 597550 BT9727_2274 BT9727_2275     TRUE 0.891 3.000 0.412 1.000 N NA
 597550 597551 BT9727_2275 BT9727_2276     TRUE 0.637 99.000 0.182 1.000 N NA
 597551 597552 BT9727_2276 BT9727_2277     FALSE 0.222 120.000 0.130 NA   NA
 597552 597553 BT9727_2277 BT9727_2278     FALSE 0.008 344.000 0.037 NA   NA
 597555 597556 BT9727_2280 BT9727_2281 marR gpm FALSE 0.315 168.000 0.023 1.000 N NA
 597556 597557 BT9727_2281 BT9727_2282 gpm   FALSE 0.037 186.000 0.009 NA   NA
 597561 597562 BT9727_2286 BT9727_2287   rpoD FALSE 0.117 216.000 0.000 1.000 N NA
 597562 597563 BT9727_2287 BT9727_2288 rpoD   TRUE 0.873 -10.000 0.636 NA   NA
 597565 597566 BT9727_2290 BT9727_2291 pbpA bla FALSE 0.112 219.000 0.000 1.000 N NA
 597570 597571 BT9727_2295 BT9727_2296   iolC FALSE 0.335 100.000 0.042 1.000   NA
 597571 597572 BT9727_2296 BT9727_2297 iolC iolA TRUE 0.816 78.000 0.667 1.000 N NA
 597572 597573 BT9727_2297 BT9727_2298 iolA iolD FALSE 0.369 156.000 0.023 1.000 N NA
 597573 597574 BT9727_2298 BT9727_2299 iolD iolE FALSE 0.417 123.000 0.000 1.000 N NA
 597574 597575 BT9727_2299 BT9727_2300 iolE fbaA TRUE 0.747 129.000 0.000 1.000 Y NA
 597575 597576 BT9727_2300 BT9727_2301 fbaA iolB TRUE 0.838 106.000 0.069 1.000 Y NA
 597578 597579 BT9727_2303 BT9727_2304   cpdC FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 597585 597586 BT9727_2310 BT9727_2311   hlyII FALSE 0.010 306.000 0.000 1.000   NA
 597586 597587 BT9727_2311 BT9727_2312 hlyII hlyIIR FALSE 0.005 408.000 0.000 1.000   NA
 597589 597590 BT9727_2314 BT9727_2315     FALSE 0.000 765.000 0.000 NA   NA
 597590 597591 BT9727_2315 BT9727_2316     FALSE 0.000 792.000 0.000 NA   NA
 597591 597592 BT9727_2316 BT9727_2317     FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 597592 597593 BT9727_2317 BT9727_2318     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 597593 597594 BT9727_2318 BT9727_2319   gloB FALSE 0.414 67.000 0.208 NA   NA
 597594 597595 BT9727_2319 BT9727_2320 gloB   FALSE 0.162 129.000 0.059 NA   NA
 597595 597596 BT9727_2320 BT9727_2321     FALSE 0.003 210.000 0.000 NA   NA
 597596 597597 BT9727_2321 BT9727_2322     FALSE 0.102 164.000 0.069 NA   NA
 597597 597598 BT9727_2322 BT9727_2323     TRUE 0.961 -3.000 0.713 0.094 N NA
 597598 597599 BT9727_2323 BT9727_2324     TRUE 0.803 25.000 0.049 1.000 N NA
 597601 597602 BT9727_2326 BT9727_2327   acdA FALSE 0.003 217.000 0.000 NA   NA
 597602 597603 BT9727_2327 BT9727_2328 acdA pcc TRUE 0.939 16.000 0.067 1.000 Y NA
 597603 597604 BT9727_2328 BT9727_2329 pcc accB TRUE 0.821 27.000 0.553 1.000   NA
 597604 597605 BT9727_2329 BT9727_2330 accB mvaB TRUE 0.873 22.000 0.778 1.000   NA
 597605 597606 BT9727_2330 BT9727_2331 mvaB crt TRUE 0.952 5.000 0.690 0.037 N NA
 597606 597607 BT9727_2331 BT9727_2332 crt pccB TRUE 0.964 3.000 0.426 1.000 Y NA
 597607 597608 BT9727_2332 BT9727_2333 pccB acs TRUE 0.923 50.000 0.167 1.000 Y NA
 597608 597609 BT9727_2333 BT9727_2334 acs   FALSE 0.076 170.000 0.045 NA   NA
 597609 597610 BT9727_2334 BT9727_2335     FALSE 0.215 145.000 0.219 NA   NA
 597610 597611 BT9727_2335 BT9727_2336   udk TRUE 0.778 49.000 0.188 1.000 N NA
 597611 597612 BT9727_2336 BT9727_2337 udk   TRUE 0.692 -7.000 0.222 NA   NA
 597612 597613 BT9727_2337 BT9727_2338     TRUE 0.604 3.000 0.214 NA   NA
 597614 597615 BT9727_2339 BT9727_2340 dacA vanS FALSE 0.301 182.000 0.143 1.000 N NA
 597615 597616 BT9727_2340 BT9727_2341 vanS vanR TRUE 0.991 -10.000 0.932 0.019 Y NA
 597617 597618 BT9727_2342 BT9727_2343     FALSE 0.001 269.000 0.000 NA   NA
 597618 597619 BT9727_2343 BT9727_2344   pfs FALSE 0.509 24.000 0.107 NA   NA
 597619 597620 BT9727_2344 BT9727_2345 pfs   TRUE 0.867 17.000 0.333 1.000 N NA
 597620 597621 BT9727_2345 BT9727_2346     FALSE 0.396 94.000 0.091 1.000   NA
 597621 597622 BT9727_2346 BT9727_2347     FALSE 0.258 108.000 0.152 NA   NA
 597622 597623 BT9727_2347 BT9727_2348   npr FALSE 0.354 171.000 0.750 NA   NA
 597623 597624 BT9727_2348 BT9727_2349 npr   FALSE 0.004 202.000 0.000 NA   NA
 597624 597625 BT9727_2349 BT9727_2350     FALSE 0.001 270.000 0.000 NA   NA
 597625 597626 BT9727_2350 BT9727_2351     FALSE 0.030 216.000 0.036 NA   NA
 597626 597627 BT9727_2351 BT9727_2352     TRUE 0.801 -3.000 0.462 NA   NA
 597627 597628 BT9727_2352 BT9727_2353     TRUE 0.701 0.000 0.304 NA   NA
 597628 597629 BT9727_2353 BT9727_2354     FALSE 0.574 122.000 0.208 1.000 N NA
 597631 597632 BT9727_2356 BT9727_2357     FALSE 0.005 182.000 0.000 NA   NA
 597632 597633 BT9727_2357 BT9727_2358     FALSE 0.199 118.000 0.071 NA   NA
 597637 597638 BT9727_2362 BT9727_2363   gntR FALSE 0.428 71.000 0.250 NA   NA
 597638 597639 BT9727_2363 BT9727_2364 gntR   FALSE 0.189 137.000 0.125 NA   NA
 597641 597642 BT9727_2366 BT9727_2367   adhB FALSE 0.007 169.000 0.000 NA   NA
 597642 597643 BT9727_2367 BT9727_2368 adhB   FALSE 0.003 568.000 0.000 1.000   NA
 597643 597644 BT9727_2368 BT9727_2369     FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 597647 597648 BT9727_2372 BT9727_2373     TRUE 0.681 -3.000 0.250 NA   NA
 597649 597650 BT9727_2374 BT9727_2375   lysS FALSE 0.000 413.000 0.000 NA   NA
 597652 597653 BT9727_2377 BT9727_2378     TRUE 0.597 109.000 0.156 1.000 N NA
 597653 597654 BT9727_2378 BT9727_2379     TRUE 0.987 -24.000 0.875 1.000 Y NA
 597656 597657 BT9727_2381 BT9727_2382 expZ   TRUE 0.770 21.000 0.350 1.000   NA
 597657 597658 BT9727_2382 BT9727_2383     FALSE 0.075 259.000 0.000 1.000 N NA
 597658 597659 BT9727_2383 BT9727_2384     TRUE 0.926 -25.000 0.750 1.000   NA
 597659 597660 BT9727_2384 BT9727_2385     TRUE 0.711 69.000 0.750 NA   NA
 597662 597663 BT9727_2387 BT9727_2388 lipA hom FALSE 0.409 88.000 0.090 1.000   NA
 597663 597664 BT9727_2388 BT9727_2389 hom   TRUE 0.800 122.000 0.038 1.000 Y NA
 597664 597665 BT9727_2389 BT9727_2390   ddlB FALSE 0.294 169.000 0.005 1.000 N NA
 597665 597666 BT9727_2390 BT9727_2391 ddlB tenA FALSE 0.046 302.000 0.000 1.000 N NA
 597666 597667 BT9727_2391 BT9727_2392 tenA   FALSE 0.001 274.000 0.000 NA   NA
 597668 597669 BT9727_2393 BT9727_2394     FALSE 0.000 1833.000 0.000 NA   NA
 597670 597671 BT9727_2395 BT9727_2396     FALSE 0.003 219.000 0.000 NA   NA
 597671 597672 BT9727_2396 BT9727_2397     FALSE 0.003 219.000 0.000 NA   NA
 597672 597673 BT9727_2397 BT9727_2398     FALSE 0.000 591.000 0.000 NA   NA
 597673 597674 BT9727_2398 BT9727_2399     FALSE 0.000 600.000 0.000 NA   NA
 597674 597675 BT9727_2399 BT9727_2400   ftsK FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 597675 597676 BT9727_2400 BT9727_2401 ftsK xtmA FALSE 0.001 298.000 0.000 NA   NA
 597676 597677 BT9727_2401 BT9727_2402 xtmA   FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 597677 597678 BT9727_2402 BT9727_2403     FALSE 0.003 209.000 0.000 NA   NA
 597678 597679 BT9727_2403 BT9727_2404     FALSE 0.014 127.000 0.000 NA   NA
 597679 597680 BT9727_2404 BT9727_2405     FALSE 0.423 141.000 0.556 NA   NA
 597682 597683 BT9727_2407 BT9727_2408     FALSE 0.011 147.000 0.000 NA   NA
 597683 597684 BT9727_2408 BT9727_2409     FALSE 0.010 149.000 0.000 NA   NA
 597684 597685 BT9727_2409 BT9727_2410   cypA FALSE 0.134 158.000 0.125 NA   NA
 597685 597686 BT9727_2410 BT9727_2411 cypA   FALSE 0.016 269.000 0.000 1.000   NA
 597686 597687 BT9727_2411 BT9727_2412   vat TRUE 0.724 -10.000 0.056 1.000   NA
 597689 597690 BT9727_2414 BT9727_2415 cypA   TRUE 0.715 114.000 0.412 0.008   NA
 597691 597692 BT9727_2416 BT9727_2417     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 597693 597694 BT9727_2418 BT9727_2419     FALSE 0.004 477.000 0.000 1.000   NA
 597694 597695 BT9727_2419 BT9727_2420     FALSE 0.109 223.000 0.000 1.000 N NA
 597695 597696 BT9727_2420 BT9727_2421     FALSE 0.034 337.000 0.000 1.000 N NA
 597698 597699 BT9727_2423 BT9727_2424     TRUE 0.727 11.000 0.435 NA   NA
 597699 597700 BT9727_2424 BT9727_2425   cbiQ TRUE 0.905 -70.000 0.530 1.000   NA
 597701 597702 BT9727_2426 BT9727_2427 kinB   TRUE 0.656 88.000 0.222 0.093   NA
 597703 597704 BT9727_2428 BT9727_2429 yqkA   FALSE 0.084 171.000 0.062 NA   NA
 597704 597705 BT9727_2429 BT9727_2430     FALSE 0.017 262.000 0.000 1.000   NA
 597705 597706 BT9727_2430 BT9727_2431     FALSE 0.009 314.000 0.000 1.000   NA
 597706 597707 BT9727_2431 BT9727_2432     FALSE 0.003 637.000 0.000 1.000   NA
 597707 597708 BT9727_2432 BT9727_2433     FALSE 0.328 111.000 0.063 1.000   NA
 597708 597709 BT9727_2433 BT9727_2434     TRUE 0.611 5.000 0.048 1.000   NA
 597709 597710 BT9727_2434 BT9727_2435     FALSE 0.004 199.000 0.000 NA   NA
 597710 597711 BT9727_2435 BT9727_2436     FALSE 0.066 200.000 0.125 NA   NA
 597715 597716 BT9727_2440 BT9727_2441 adP   FALSE 0.029 217.000 0.000 1.000   NA
 597716 597717 BT9727_2441 BT9727_2442     FALSE 0.153 117.000 0.000 1.000   NA
 597717 597718 BT9727_2442 BT9727_2443     FALSE 0.470 113.000 0.471 NA   NA
 597720 597721 BT9727_2445 BT9727_2446   glpQ TRUE 0.831 46.000 0.778 1.000   NA
 597725 597726 BT9727_2450 BT9727_2451   bltD FALSE 0.323 107.000 0.051 1.000   NA
 597726 597727 BT9727_2451 BT9727_2452 bltD   TRUE 0.828 31.000 0.600 1.000   NA
 597727 597728 BT9727_2452 BT9727_2453     TRUE 0.777 26.000 0.400 1.000   NA
 597728 597729 BT9727_2453 BT9727_2454     FALSE 0.181 204.000 0.400 1.000   NA
 597729 597730 BT9727_2454 BT9727_2455     FALSE 0.175 102.000 0.000 1.000   NA
 597730 597731 BT9727_2455 BT9727_2456     FALSE 0.017 454.000 0.000 1.000 N NA
 597731 597732 BT9727_2456 BT9727_2457     FALSE 0.043 271.000 0.000 NA N NA
 597732 597733 BT9727_2457 BT9727_2458     FALSE 0.099 190.000 0.222 NA   NA
 597733 597734 BT9727_2458 BT9727_2459     FALSE 0.030 215.000 0.000 1.000   NA
 597734 597735 BT9727_2459 BT9727_2460   dnaN TRUE 0.931 31.000 0.007 1.000 Y NA
 597735 597736 BT9727_2460 BT9727_2461 dnaN   TRUE 0.938 20.000 0.004 1.000 Y NA
 597736 597737 BT9727_2461 BT9727_2462     FALSE 0.165 98.000 0.021 NA   NA
 597738 597739 BT9727_2463 BT9727_2464     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 597740 597741 BT9727_2465 BT9727_2466     FALSE 0.255 136.000 0.250 NA   NA
 597741 597742 BT9727_2466 BT9727_2467     FALSE 0.221 119.000 0.111 NA   NA
 597743 597744 BT9727_2468 BT9727_2469     FALSE 0.284 79.000 0.082 NA   NA
 597744 597745 BT9727_2469 BT9727_2470     FALSE 0.107 -33.000 0.000 NA   NA
 597745 597746 BT9727_2470 BT9727_2471     FALSE 0.001 304.000 0.000 NA   NA
 597746 597747 BT9727_2471 BT9727_2472     FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 597747 597748 BT9727_2472 BT9727_2473     TRUE 0.790 13.000 0.636 NA   NA
 597750 597751 BT9727_2475 BT9727_2476   yfiT FALSE 0.542 2.000 0.108 NA   NA
 597751 597752 BT9727_2476 BT9727_2477 yfiT   FALSE 0.507 17.000 0.108 NA   NA
 597752 597753 BT9727_2477 BT9727_2478     TRUE 0.668 64.000 0.171 NA N NA
 597753 597754 BT9727_2478 BT9727_2479   bacA TRUE 0.639 83.000 0.280 NA N NA
 597756 597757 BT9727_2481 BT9727_2482 uvrC   FALSE 0.212 78.000 0.000 1.000   NA
 597757 597758 BT9727_2482 BT9727_2483     FALSE 0.054 28.000 0.000 NA   NA
 597758 597759 BT9727_2483 BT9727_2484     FALSE 0.103 181.000 0.179 NA   NA
 597760 597761 BT9727_2485 BT9727_2486     TRUE 0.836 32.000 0.833 NA   NA
 597762 597763 BT9727_2487 BT9727_2488 pknB ntpA FALSE 0.010 311.000 0.000 1.000   NA
 597763 597764 BT9727_2488 BT9727_2489 ntpA dadA FALSE 0.039 203.000 0.000 1.000   NA
 597764 597765 BT9727_2489 BT9727_2490 dadA   FALSE 0.201 126.000 0.099 NA   NA
 597765 597766 BT9727_2490 BT9727_2491   nhoA FALSE 0.177 148.000 0.167 NA   NA
 597766 597767 BT9727_2491 BT9727_2492 nhoA   FALSE 0.178 139.000 0.097 NA   NA
 597767 597768 BT9727_2492 BT9727_2493     FALSE 0.267 88.000 0.081 NA   NA
 597768 597769 BT9727_2493 BT9727_2494     FALSE 0.177 137.000 0.088 NA   NA
 597770 597771 BT9727_2495 BT9727_2496     FALSE 0.000 428.000 0.000 NA   NA
 597772 597773 BT9727_2497 BT9727_2498 bcrC pulA FALSE 0.004 426.000 0.000 1.000   NA
 597773 597774 BT9727_2498 BT9727_2499 pulA nprE FALSE 0.015 483.000 0.000 1.000 N NA
 597774 597775 BT9727_2499 BT9727_2500 nprE   FALSE 0.000 460.000 0.000 NA   NA
 597775 597776 BT9727_2500 BT9727_2501   sigX TRUE 0.659 1.000 0.265 NA   NA
 597776 597777 BT9727_2501 BT9727_2502 sigX   FALSE 0.056 251.000 0.000 NA N NA
 597779 597780 BT9727_2504 BT9727_2505     FALSE 0.197 135.000 0.143 NA   NA
 597781 597782 BT9727_2506 BT9727_2507 gntR estA FALSE 0.004 450.000 0.000 1.000   NA
 597783 597784 BT9727_2508 BT9727_2509     TRUE 0.846 12.000 0.875 NA   NA
 597786 597787 BT9727_2511 BT9727_2512     TRUE 0.672 72.000 0.667 NA   NA
 597787 597788 BT9727_2512 BT9727_2513   ygaE FALSE 0.019 105.000 0.000 NA   NA
 597788 597789 BT9727_2513 BT9727_2514 ygaE   FALSE 0.317 108.000 0.240 NA   NA
 597789 597790 BT9727_2514 BT9727_2515     TRUE 0.628 26.000 0.280 NA   NA
 597790 597791 BT9727_2515 BT9727_2516   ylaJ FALSE 0.246 113.000 0.143 NA   NA
 597791 597792 BT9727_2516 BT9727_2517 ylaJ   FALSE 0.500 27.000 0.105 NA   NA
 597792 597793 BT9727_2517 BT9727_2518   sleB TRUE 0.774 16.000 0.408 1.000   NA
 597795 597796 BT9727_2520 BT9727_2521     FALSE 0.551 117.000 0.066 1.000 N NA
 597796 597797 BT9727_2521 BT9727_2522     TRUE 0.645 34.000 0.165 1.000   NA
 597797 597798 BT9727_2522 BT9727_2523   kynU TRUE 0.792 3.000 0.382 1.000   NA
 597802 597803 BT9727_2527 BT9727_2528     FALSE 0.282 153.000 0.385 NA   NA
 597803 597804 BT9727_2528 BT9727_2529     FALSE 0.557 123.000 0.750 NA   NA
 597804 597805 BT9727_2529 BT9727_2530   acoR FALSE 0.314 114.000 0.250 NA   NA
 597805 597806 BT9727_2530 BT9727_2531 acoR   FALSE 0.254 125.000 0.208 NA   NA
 597806 597807 BT9727_2531 BT9727_2532     TRUE 0.850 -15.000 0.500 NA   NA
 597807 597808 BT9727_2532 BT9727_2533     TRUE 0.678 28.000 0.350 NA   NA
 597808 597809 BT9727_2533 BT9727_2534     TRUE 0.861 13.000 0.350 1.000 N NA
 597809 597810 BT9727_2534 BT9727_2535     FALSE 0.054 285.000 0.000 1.000 N NA
 597810 597811 BT9727_2535 BT9727_2536   acoL FALSE 0.031 348.000 0.000 1.000 N NA
 597811 597812 BT9727_2536 BT9727_2537 acoL acoC TRUE 0.952 16.000 0.294 1.000 Y NA
 597812 597813 BT9727_2537 BT9727_2538 acoC acoB TRUE 0.969 28.000 0.295 0.070 Y NA
 597813 597814 BT9727_2538 BT9727_2539 acoB acoA TRUE 0.987 18.000 0.804 0.001 Y NA
 597814 597815 BT9727_2539 BT9727_2540 acoA   FALSE 0.088 170.000 0.065 NA   NA
 597816 597817 BT9727_2541 BT9727_2542 ydfG yqkA FALSE 0.464 42.000 0.143 NA   NA
 597818 597819 BT9727_2543 BT9727_2544 udk ywrE TRUE 0.786 45.000 0.750 NA   NA
 597819 597820 BT9727_2544 BT9727_2545 ywrE   TRUE 0.739 20.000 0.429 NA   NA
 597820 597821 BT9727_2545 BT9727_2546     TRUE 0.778 36.000 0.625 NA   NA
 597821 597822 BT9727_2546 BT9727_2547     FALSE 0.278 132.000 0.267 NA   NA
 597822 597823 BT9727_2547 BT9727_2548   opuAB FALSE 0.002 726.000 0.000 1.000   NA
 597823 597824 BT9727_2548 BT9727_2549 opuAB opuAA TRUE 0.977 -7.000 0.094 0.093 Y NA
 597826 597827 BT9727_2551 BT9727_2552 clpP   TRUE 0.913 22.000 0.647 1.000 N NA
 597828 597829 BT9727_2553 BT9727_2554 fdx rpiA TRUE 0.793 5.000 0.011 1.000 N NA
 597829 597830 BT9727_2554 BT9727_2555 rpiA   FALSE 0.271 108.000 0.011 1.000   NA
 597831 597832 BT9727_2556 BT9727_2557 chb flaR FALSE 0.004 438.000 0.000 1.000   NA
 597832 597833 BT9727_2557 BT9727_2558 flaR yjgA FALSE 0.028 210.000 0.018 NA   NA
 597833 597834 BT9727_2558 BT9727_2559 yjgA yyaQ FALSE 0.003 216.000 0.000 NA   NA
 597834 597835 BT9727_2559 BT9727_2560 yyaQ   FALSE 0.498 13.000 0.135 NA   NA
 597836 597837 BT9727_2561 BT9727_2562     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 597838 597839 BT9727_2564 BT9727_2565 ampD   FALSE 0.036 207.000 0.000 1.000   NA
 597839 597840 BT9727_2565 BT9727_2566     TRUE 0.849 27.000 0.875 NA   NA
 597840 597841 BT9727_2566 BT9727_2567     TRUE 0.813 -3.000 0.500 NA   NA
 597841 597842 BT9727_2567 BT9727_2568   pat FALSE 0.114 145.000 0.035 NA   NA
 597842 597843 BT9727_2568 BT9727_2569 pat   FALSE 0.398 35.000 0.049 NA   NA
 597843 597844 BT9727_2569 BT9727_2570     TRUE 0.741 -13.000 0.262 NA   NA
 597844 597845 BT9727_2570 BT9727_2571     FALSE 0.060 170.000 0.021 NA   NA
 597845 597846 BT9727_2571 BT9727_2572   uvrD FALSE 0.035 57.000 0.000 NA   NA
 597848 597849 BT9727_2574 BT9727_2575     FALSE 0.098 179.000 0.156 NA   NA
 597849 597850 BT9727_2575 BT9727_2576   recQ FALSE 0.424 26.000 0.050 NA   NA
 597851 597852 BT9727_2577 BT9727_2578     FALSE 0.469 129.000 0.583 NA   NA
 597852 597853 BT9727_2578 BT9727_2579     FALSE 0.508 134.000 0.700 NA   NA
 597854 597855 BT9727_2580 BT9727_2581   yfjM FALSE 0.001 298.000 0.000 NA   NA
 597855 597856 BT9727_2581 BT9727_2582 yfjM   FALSE 0.509 21.000 0.094 NA   NA
 597858 597859 BT9727_2584 BT9727_2585   ppx FALSE 0.536 106.000 0.010 1.000 N NA
 597859 597860 BT9727_2585 BT9727_2586 ppx chb FALSE 0.144 162.000 0.018 1.000   NA
 597860 597861 BT9727_2586 BT9727_2588 chb   FALSE 0.078 197.000 0.014 1.000   NA
 597863 597864 BT9727_2589 BT9727_2590     FALSE 0.471 82.000 0.206 1.000   NA
 597864 597865 BT9727_2590 BT9727_2591   aldA TRUE 0.681 108.000 0.368 1.000 N NA
 597865 597866 BT9727_2591 BT9727_2592 aldA dapA TRUE 0.895 19.000 0.474 1.000 N NA
 597866 597867 BT9727_2592 BT9727_2593 dapA   TRUE 0.963 23.000 0.474 1.000 Y NA
 597867 597868 BT9727_2593 BT9727_2594     TRUE 0.989 -3.000 0.750 0.001 Y NA
 597868 597869 BT9727_2594 BT9727_2595   soxB TRUE 0.965 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 597870 597871 BT9727_2596 BT9727_2597     FALSE 0.347 75.000 0.167 NA   NA
 597871 597872 BT9727_2597 BT9727_2598   soxA TRUE 0.871 -3.000 0.750 NA   NA
 597872 597873 BT9727_2598 BT9727_2599 soxA soxA TRUE 0.916 -3.000 0.222 0.000   NA
 597874 597875 BT9727_2600 BT9727_2601     TRUE 0.891 -12.000 0.722 NA   NA
 597876 597877 BT9727_2602 BT9727_2603 ykrK   FALSE 0.002 235.000 0.000 NA   NA
 597880 597881 BT9727_2606 BT9727_2607 dltD   FALSE 0.067 267.000 0.000 1.000 N NA
 597881 597882 BT9727_2607 BT9727_2608   oppA TRUE 0.702 118.000 0.500 1.000 N NA
 597882 597883 BT9727_2608 BT9727_2609 oppA   TRUE 0.832 21.000 0.308 NA N NA
 597883 597884 BT9727_2609 BT9727_2610   ykfB TRUE 0.920 40.000 0.147 NA Y NA
 597884 597885 BT9727_2610 BT9727_2611 ykfB   FALSE 0.144 153.000 0.101 NA   NA
 597885 597886 BT9727_2611 BT9727_2612   divIC FALSE 0.002 261.000 0.000 NA   NA
 597886 597887 BT9727_2612 BT9727_2614 divIC   FALSE 0.000 1004.000 0.000 NA   NA
 597887 597888 BT9727_2614 BT9727_2615     FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 597888 597889 BT9727_2615 BT9727_2616     FALSE 0.004 202.000 0.000 NA   NA
 597891 597892 BT9727_2618 BT9727_2619 pepX prsA FALSE 0.034 209.000 0.000 1.000   NA
 597892 597893 BT9727_2619 BT9727_2620 prsA   FALSE 0.221 176.000 0.000 1.000 N NA
 597893 597894 BT9727_2620 BT9727_2621     TRUE 0.969 -7.000 0.256 1.000 Y NA
 597896 597897 BT9727_2623 BT9727_2624     FALSE 0.002 268.000 0.000 NA   NA
 597897 597898 BT9727_2624 BT9727_2625   pfs FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 597898 597899 BT9727_2625 BT9727_2626 pfs pfs TRUE 0.818 -115.000 0.188 1.000   NA
 597899 597900 BT9727_2626 BT9727_2627 pfs   TRUE 0.797 18.000 0.024 1.000 N NA
 597900 597901 BT9727_2627 BT9727_2628   pepF TRUE 0.781 13.000 0.029 1.000 N NA
 597901 597902 BT9727_2628 BT9727_2629 pepF   FALSE 0.001 361.000 0.000 NA   NA
 597903 597904 BT9727_2630 BT9727_2631     FALSE 0.000 1148.000 0.000 NA   NA
 597905 597906 BT9727_2632 BT9727_2633 emrB yhbF TRUE 0.734 25.000 0.438 NA   NA
 597906 597907 BT9727_2633 BT9727_2634 yhbF   TRUE 0.819 19.000 0.667 NA   NA
 597907 597908 BT9727_2634 BT9727_2635   yhbD TRUE 0.767 14.000 0.577 NA   NA
 597908 597909 BT9727_2635 BT9727_2636 yhbD oppA FALSE 0.263 161.000 0.269 1.000   NA
 597911 597912 BT9727_2638 BT9727_2639     TRUE 0.598 28.000 0.250 NA   NA
 597912 597913 BT9727_2639 BT9727_2640     FALSE 0.080 193.000 0.167 NA   NA
 597913 597914 BT9727_2640 BT9727_2641   ydaS FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 597914 597915 BT9727_2641 BT9727_2642 ydaS iunH FALSE 0.109 146.000 0.000 1.000   NA
 597915 597916 BT9727_2642 BT9727_2643 iunH   TRUE 0.685 78.000 0.778 NA   NA
 597916 597917 BT9727_2643 BT9727_2644     FALSE 0.281 71.000 0.060 NA   NA
 597917 597918 BT9727_2644 BT9727_2645     FALSE 0.051 196.000 0.051 NA   NA
 597919 597920 BT9727_2646 BT9727_2647     FALSE 0.002 265.000 0.000 NA   NA
 597922 597923 BT9727_2649 BT9727_2650   aspB FALSE 0.005 531.000 0.080 NA   NA
 597923 597924 BT9727_2650 BT9727_2651 aspB fabZ TRUE 0.676 57.000 0.120 NA N NA
 597924 597925 BT9727_2651 BT9727_2652 fabZ   FALSE 0.541 93.000 0.072 NA N NA
 597926 597927 BT9727_2653 BT9727_2654   ccdC FALSE 0.424 118.000 0.019 NA N NA
 597927 597928 BT9727_2654 BT9727_2655 ccdC   TRUE 0.812 38.000 0.778 NA   NA
 597928 597929 BT9727_2655 BT9727_2656     TRUE 0.849 -3.000 0.636 NA   NA
 597929 597930 BT9727_2656 BT9727_2657     TRUE 0.933 -3.000 0.636 1.000 N NA
 597930 597931 BT9727_2657 BT9727_2658     FALSE 0.232 126.000 0.172 NA   NA
 597931 597932 BT9727_2658 BT9727_2659     FALSE 0.549 15.000 0.207 NA   NA
 597932 597933 BT9727_2659 BT9727_2660     FALSE 0.000 1668.000 0.000 NA   NA
 597935 597936 BT9727_2662 BT9727_2663 ssuD ssuC TRUE 0.629 77.000 0.034 1.000 N NA
 597936 597937 BT9727_2663 BT9727_2664 ssuC ssuA TRUE 0.955 17.000 0.000 0.038 Y NA
 597937 597938 BT9727_2664 BT9727_2665 ssuA ssuB TRUE 0.973 18.000 0.750 1.000 Y NA
 597938 597939 BT9727_2665 BT9727_2666 ssuB   FALSE 0.002 228.000 0.000 NA   NA
 597939 597940 BT9727_2666 BT9727_2667     TRUE 0.632 -3.000 0.182 NA   NA
 597940 597941 BT9727_2667 BT9727_2668     FALSE 0.003 210.000 0.000 NA   NA
 597941 597942 BT9727_2668 BT9727_2669     FALSE 0.336 104.000 0.250 NA   NA
 597942 597943 BT9727_2669 BT9727_2670     TRUE 0.711 -7.000 0.250 NA   NA
 597943 597944 BT9727_2670 BT9727_2671     FALSE 0.566 13.000 0.222 NA   NA
 597944 597945 BT9727_2671 BT9727_2672   coaBC FALSE 0.115 115.000 0.007 NA   NA
 597945 597946 BT9727_2672 BT9727_2673 coaBC yokD FALSE 0.300 16.000 0.008 NA   NA
 597948 597949 BT9727_2675 BT9727_2676 gspS   TRUE 0.847 21.000 0.800 NA   NA
 597949 597950 BT9727_2676 BT9727_2677     FALSE 0.554 100.000 0.571 NA   NA
 597950 597951 BT9727_2677 BT9727_2678   yjlA TRUE 0.673 57.000 0.538 NA   NA
 597951 597952 BT9727_2678 BT9727_2679 yjlA ykkA FALSE 0.507 70.000 0.333 NA   NA
 597952 597953 BT9727_2679 BT9727_2680 ykkA   TRUE 0.736 16.000 0.467 NA   NA
 597953 597954 BT9727_2680 BT9727_2681     TRUE 0.976 35.000 0.500 0.022 Y NA
 597954 597955 BT9727_2681 BT9727_2682     TRUE 0.665 16.000 0.179 1.000   NA
 597955 597956 BT9727_2682 BT9727_2683     FALSE 0.552 17.000 0.179 NA   NA
 597956 597957 BT9727_2683 BT9727_2684     FALSE 0.001 366.000 0.000 NA   NA
 597958 597959 BT9727_2685 BT9727_2686 pgd   FALSE 0.001 274.000 0.000 NA   NA
 597959 597960 BT9727_2686 BT9727_2687     FALSE 0.018 111.000 0.000 NA   NA
 597961 597962 BT9727_2688 BT9727_2689     FALSE 0.003 517.000 0.000 1.000   NA
 597962 597963 BT9727_2689 BT9727_2690     FALSE 0.001 366.000 0.000 NA   NA
 597963 597964 BT9727_2690 BT9727_2691     FALSE 0.001 336.000 0.000 NA   NA
 597964 597965 BT9727_2691 BT9727_2692     FALSE 0.060 245.000 0.105 1.000   NA
 597965 597966 BT9727_2692 BT9727_2693     FALSE 0.010 310.000 0.000 1.000   NA
 597966 597967 BT9727_2693 BT9727_2694   aroA FALSE 0.026 273.000 0.005 1.000   NA
 597967 597968 BT9727_2694 BT9727_2695 aroA tyrA TRUE 0.942 17.000 0.069 1.000 Y NA
 597968 597969 BT9727_2695 BT9727_2696 tyrA hisC TRUE 0.962 -7.000 0.062 1.000 Y NA
 597969 597970 BT9727_2696 BT9727_2697 hisC aroF TRUE 0.936 18.000 0.007 1.000 Y NA
 597970 597971 BT9727_2697 BT9727_2698 aroF aroA FALSE 0.356 283.000 0.000 0.001 Y NA
 597971 597972 BT9727_2698 BT9727_2699 aroA   FALSE 0.000 832.000 0.000 NA   NA
 597974 597975 BT9727_2701 BT9727_2702     TRUE 0.880 45.000 0.231 0.068 N NA
 597975 597976 BT9727_2702 BT9727_2703     FALSE 0.568 14.000 0.231 NA   NA
 597980 597981 BT9727_2707 BT9727_2708 gntP crt TRUE 0.769 106.000 0.667 1.000 N NA
 597981 597982 BT9727_2708 BT9727_2709 crt caiC TRUE 0.962 45.000 0.286 0.036 Y NA
 597982 597983 BT9727_2709 BT9727_2710 caiC   FALSE 0.092 241.000 0.000 1.000 N NA
 597983 597984 BT9727_2710 BT9727_2711     FALSE 0.001 361.000 0.000 NA   NA
 597986 597987 BT9727_2713 BT9727_2714     TRUE 0.977 -3.000 0.844 NA Y NA
 597987 597988 BT9727_2714 BT9727_2715     TRUE 0.991 -30.000 0.788 0.038 Y NA
 597988 597989 BT9727_2715 BT9727_2716     TRUE 0.981 -3.000 0.818 1.000 Y NA
 597990 597991 BT9727_2717 BT9727_2718   ydeV TRUE 0.895 -6.000 0.250 1.000 N NA
 597991 597992 BT9727_2718 BT9727_2719 ydeV   TRUE 0.940 26.000 0.062 1.000 Y NA
 597992 597993 BT9727_2719 BT9727_2720   fbaA TRUE 0.939 7.000 0.031 1.000 Y NA
 597996 597997 BT9727_2723 BT9727_2724     FALSE 0.453 60.000 0.222 NA   NA
 597997 597998 BT9727_2724 BT9727_2725   yetG FALSE 0.241 97.000 0.071 NA   NA
 597998 597999 BT9727_2725 BT9727_2726 yetG   FALSE 0.465 88.000 0.214 1.000   NA
 597999 598000 BT9727_2726 BT9727_2727   arsR TRUE 0.771 52.000 0.600 1.000   NA
 598001 598002 BT9727_2728 BT9727_2729   nupC FALSE 0.004 204.000 0.000 NA   NA
 598003 598004 BT9727_2730 BT9727_2731 proA proB TRUE 0.974 30.000 0.281 0.002 Y NA
 598006 598007 BT9727_2733 BT9727_2734     TRUE 0.705 77.000 0.250 1.000 N NA
 598009 598010 BT9727_2736 BT9727_2737     FALSE 0.001 276.000 0.000 NA   NA
 598010 598011 BT9727_2737 BT9727_2738   phoB FALSE 0.060 274.000 0.000 1.000 N NA
 598012 598013 BT9727_2739 BT9727_2740 yoaS   TRUE 0.797 11.000 0.636 NA   NA
 598014 598015 BT9727_2741 BT9727_2742     FALSE 0.358 107.000 0.286 NA   NA
 598015 598016 BT9727_2742 BT9727_2743     TRUE 0.756 -3.000 0.364 NA   NA
 598016 598017 BT9727_2743 BT9727_2744     FALSE 0.388 90.000 0.273 NA   NA
 598017 598018 BT9727_2744 BT9727_2745     TRUE 0.965 0.000 0.375 1.000 Y NA
 598020 598021 BT9727_2747 BT9727_2748   udk TRUE 0.763 15.000 0.400 1.000   NA
 598021 598022 BT9727_2748 BT9727_2749 udk   TRUE 0.915 0.000 0.533 1.000 N NA
 598022 598023 BT9727_2749 BT9727_2750     TRUE 0.856 15.000 0.333 1.000 N NA
 598025 598026 BT9727_2752 BT9727_2753     TRUE 0.711 8.000 0.400 NA   NA
 598027 598028 BT9727_2754 BT9727_2755 moxR   TRUE 0.862 -3.000 0.700 NA   NA
 598028 598029 BT9727_2755 BT9727_2756     TRUE 0.905 -25.000 0.750 NA   NA
 598032 598033 BT9727_2759 BT9727_2760     FALSE 0.000 616.000 0.000 NA   NA
 598033 598034 BT9727_2760 BT9727_2761     TRUE 0.867 -16.000 0.571 NA   NA
 598034 598035 BT9727_2761 BT9727_2762     FALSE 0.002 250.000 0.000 NA   NA
 598035 598036 BT9727_2762 BT9727_2763   argD FALSE 0.011 298.000 0.000 1.000   NA
 598038 598039 BT9727_2765 BT9727_2766   ade FALSE 0.256 114.000 0.162 NA   NA
 598039 598040 BT9727_2766 BT9727_2767 ade   FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 598040 598041 BT9727_2767 BT9727_2768     FALSE 0.001 319.000 0.000 NA   NA
 598041 598042 BT9727_2768 BT9727_2769   adp FALSE 0.010 752.000 0.000 1.000 N NA
 598042 598043 BT9727_2769 BT9727_2770 adp   FALSE 0.002 259.000 0.000 NA   NA
 598043 598044 BT9727_2770 BT9727_2771     FALSE 0.131 195.000 0.333 NA   NA
 598044 598045 BT9727_2771 BT9727_2772     TRUE 0.719 16.000 0.429 NA   NA
 598045 598046 BT9727_2772 BT9727_2773     TRUE 0.866 -3.000 0.714 NA   NA
 598046 598047 BT9727_2773 BT9727_2774     FALSE 0.003 213.000 0.000 NA   NA
 598047 598048 BT9727_2774 BT9727_2775     FALSE 0.016 119.000 0.000 NA   NA
 598048 598049 BT9727_2775 BT9727_2776     FALSE 0.051 34.000 0.000 NA   NA
 598049 598050 BT9727_2776 BT9727_2777   kptA FALSE 0.007 170.000 0.000 NA   NA
 598050 598051 BT9727_2777 BT9727_2778 kptA   FALSE 0.087 -7.000 0.000 NA   NA
 598051 598052 BT9727_2778 BT9727_2779     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 598052 598053 BT9727_2779 BT9727_2780     FALSE 0.002 232.000 0.000 NA   NA
 598053 598054 BT9727_2780 BT9727_2781     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 598054 598055 BT9727_2781 BT9727_2782     FALSE 0.000 530.000 0.000 NA   NA
 598055 598056 BT9727_2782 BT9727_2783     FALSE 0.056 17.000 0.000 NA   NA
 598056 598057 BT9727_2783 BT9727_2784     FALSE 0.000 501.000 0.000 NA   NA
 598057 598058 BT9727_2784 BT9727_2785     FALSE 0.212 139.000 0.182 NA   NA
 598058 598059 BT9727_2785 BT9727_2786     FALSE 0.177 199.000 0.500 NA   NA
 598059 598060 BT9727_2786 BT9727_2787     FALSE 0.019 104.000 0.000 NA   NA
 598060 598061 BT9727_2787 BT9727_2788     FALSE 0.000 402.000 0.000 NA   NA
 598061 598062 BT9727_2788 BT9727_2789     FALSE 0.056 17.000 0.000 NA   NA
 598062 598063 BT9727_2789 BT9727_2790     FALSE 0.000 922.000 0.000 NA   NA
 598063 598064 BT9727_2790 BT9727_2791     FALSE 0.000 568.000 0.000 NA   NA
 598064 598065 BT9727_2791 BT9727_2792     FALSE 0.055 27.000 0.000 NA   NA
 598065 598066 BT9727_2792 BT9727_2793     FALSE 0.010 152.000 0.000 NA   NA
 598066 598067 BT9727_2793 BT9727_2794     TRUE 0.786 28.000 0.600 NA   NA
 598067 598068 BT9727_2794 BT9727_2795     TRUE 0.841 -3.000 0.600 NA   NA
 598068 598069 BT9727_2795 BT9727_2796     TRUE 0.810 41.000 0.800 NA   NA
 598069 598070 BT9727_2796 BT9727_2797   ycnE FALSE 0.003 211.000 0.000 NA   NA
 598070 598071 BT9727_2797 BT9727_2798 ycnE   TRUE 0.894 39.000 0.588 0.027   NA
 598071 598072 BT9727_2798 BT9727_2799     TRUE 0.933 19.000 0.882 1.000 N NA
 598074 598075 BT9727_2801 BT9727_2802     TRUE 0.666 -40.000 0.087 NA   NA
 598075 598076 BT9727_2802 BT9727_2803     FALSE 0.105 -28.000 0.000 NA   NA
 598076 598077 BT9727_2803 BT9727_2804     FALSE 0.012 140.000 0.000 NA   NA
 598077 598078 BT9727_2804 BT9727_2805     TRUE 0.626 30.000 0.286 NA   NA
 598078 598079 BT9727_2805 BT9727_2806     TRUE 0.890 -12.000 0.714 NA   NA
 598079 598080 BT9727_2806 BT9727_2807     TRUE 0.952 -12.000 0.750 1.000 N NA
 598082 598083 BT9727_2809 BT9727_2810     FALSE 0.462 52.000 0.200 NA   NA
 598083 598084 BT9727_2810 BT9727_2811     FALSE 0.296 186.000 0.182 1.000 N NA
 598084 598085 BT9727_2811 BT9727_2812     TRUE 0.800 0.000 0.364 1.000   NA
 598085 598086 BT9727_2812 BT9727_2813     TRUE 0.911 6.000 0.667 0.090   NA
 598086 598087 BT9727_2813 BT9727_2814     TRUE 0.628 66.000 0.500 NA   NA
 598087 598088 BT9727_2814 BT9727_2815     FALSE 0.003 208.000 0.000 NA   NA
 598088 598089 BT9727_2815 BT9727_2816   araC TRUE 0.820 25.000 0.096 1.000 N NA
 598089 598090 BT9727_2816 BT9727_2817 araC   TRUE 0.757 49.000 0.082 1.000 N NA
 598090 598091 BT9727_2817 BT9727_2818     FALSE 0.571 18.000 0.194 NA   NA
 598097 598098 BT9727_2824 BT9727_2825     TRUE 0.973 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 598098 598099 BT9727_2825 BT9727_2826   ybdG TRUE 0.701 35.000 0.421 NA   NA
 598099 598100 BT9727_2826 BT9727_2827 ybdG   FALSE 0.339 107.000 0.263 NA   NA
 598100 598101 BT9727_2827 BT9727_2828     FALSE 0.225 129.000 0.172 NA   NA
 598101 598102 BT9727_2828 BT9727_2829   prpA FALSE 0.168 173.000 0.114 1.000   NA
 598102 598103 BT9727_2829 BT9727_2830 prpA   FALSE 0.510 14.000 0.159 NA   NA
 598103 598104 BT9727_2830 BT9727_2832     FALSE 0.399 15.000 0.047 NA   NA
 598107 598108 BT9727_2834 BT9727_2835 lysP   FALSE 0.182 174.000 0.333 NA   NA
 598108 598109 BT9727_2835 BT9727_2836   yhaZ FALSE 0.418 34.000 0.057 NA   NA
 598114 598115 BT9727_2841 BT9727_2842 sipP   TRUE 0.827 83.000 0.778 1.000 N NA
 598115 598116 BT9727_2842 BT9727_2843     FALSE 0.016 469.000 0.000 1.000 N NA
 598116 598117 BT9727_2843 BT9727_2844   pcp TRUE 0.670 67.000 0.029 1.000 N NA
 598117 598118 BT9727_2844 BT9727_2845 pcp   TRUE 0.642 16.000 0.300 NA   NA
 598118 598119 BT9727_2845 BT9727_2846     TRUE 0.875 2.000 0.939 NA   NA
 598119 598120 BT9727_2846 BT9727_2847     FALSE 0.449 27.000 0.064 NA   NA
 598120 598121 BT9727_2847 BT9727_2848     TRUE 0.807 19.000 0.447 1.000   NA
 598121 598122 BT9727_2848 BT9727_2849     TRUE 0.989 -9.000 0.596 0.002 Y NA
 598122 598123 BT9727_2849 BT9727_2850     TRUE 0.839 15.000 0.267 1.000 N NA
 598123 598124 BT9727_2850 BT9727_2851   sipU FALSE 0.135 259.000 0.231 1.000 N NA
 598124 598125 BT9727_2851 BT9727_2852 sipU cutC TRUE 0.800 24.000 0.038 1.000 N NA
 598127 598128 BT9727_2854 BT9727_2855 spoIIP   FALSE 0.036 204.000 0.028 NA   NA
 598130 598131 BT9727_2857 BT9727_2858     FALSE 0.137 153.000 0.083 NA   NA
 598131 598132 BT9727_2858 BT9727_2859     FALSE 0.001 331.000 0.000 NA   NA
 598132 598133 BT9727_2859 BT9727_2860     FALSE 0.003 632.000 0.000 1.000   NA
 598134 598135 BT9727_2861 BT9727_2862     TRUE 0.889 135.000 0.333 0.041 Y NA
 598136 598137 BT9727_2863 BT9727_2864     FALSE 0.508 4.000 0.083 NA   NA
 598137 598138 BT9727_2864 BT9727_2865     FALSE 0.153 163.000 0.033 1.000   NA
 598138 598139 BT9727_2865 BT9727_2866     FALSE 0.134 161.000 0.154 NA   NA
 598141 598142 BT9727_2868 BT9727_2869 ppsA   FALSE 0.014 133.000 0.000 NA   NA
 598144 598145 BT9727_2871 BT9727_2872     TRUE 0.800 -10.000 0.383 NA   NA
 598145 598146 BT9727_2872 BT9727_2873   cotF FALSE 0.001 343.000 0.000 NA   NA
 598147 598148 BT9727_2874 BT9727_2875     FALSE 0.385 92.000 0.273 NA   NA
 598149 598150 BT9727_2876 BT9727_2877   sasP FALSE 0.006 376.000 0.000 1.000   NA
 598152 598153 BT9727_2879 BT9727_2880 yvdQ sasP FALSE 0.020 294.000 0.143 NA   NA
 598154 598155 BT9727_2881 BT9727_2882 adhB   FALSE 0.289 158.000 0.000 1.000 N NA
 598156 598157 BT9727_2883 BT9727_2884 ansB aspG TRUE 0.907 54.000 0.037 1.000 Y NA
 598159 598160 BT9727_2886 BT9727_2887 gerIC gerIB TRUE 0.921 3.000 0.556 0.007   NA
 598160 598161 BT9727_2887 BT9727_2888 gerIB gerIA TRUE 0.938 21.000 0.833 0.007   NA
 598161 598162 BT9727_2888 BT9727_2889 gerIA kinA FALSE 0.006 361.000 0.000 1.000   NA
 598162 598163 BT9727_2889 BT9727_2890 kinA hblA FALSE 0.010 667.000 0.000 0.090   NA
 598163 598164 BT9727_2890 BT9727_2891 hblA hblB FALSE 0.033 377.000 0.000 0.003   NA
 598164 598165 BT9727_2891 BT9727_2892 hblB hblD TRUE 0.929 37.000 0.833 0.003   NA
 598165 598166 BT9727_2892 BT9727_2893 hblD hblC TRUE 0.879 62.000 0.667 0.003   NA
 598166 598167 BT9727_2893 BT9727_2894 hblC trrA FALSE 0.002 1184.000 0.000 1.000   NA
 598167 598168 BT9727_2894 BT9727_2895 trrA sasP FALSE 0.002 1304.000 0.000 1.000   NA
 598168 598169 BT9727_2895 BT9727_2896 sasP uvrC FALSE 0.303 167.000 0.400 1.000   NA
 598169 598170 BT9727_2896 BT9727_2897 uvrC   FALSE 0.369 168.000 0.571 1.000   NA
 598170 598171 BT9727_2897 BT9727_2898   brnQ FALSE 0.324 273.000 0.000 0.064 Y NA
 598171 598172 BT9727_2898 BT9727_2899 brnQ proC FALSE 0.426 205.000 0.000 1.000 Y NA
 598172 598173 BT9727_2899 BT9727_2900 proC   FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   NA
 598173 598174 BT9727_2900 BT9727_2901     FALSE 0.054 16.000 0.000 NA   NA
 598174 598175 BT9727_2901 BT9727_2902   gerAC FALSE 0.010 149.000 0.000 NA   NA
 598175 598176 BT9727_2902 BT9727_2903 gerAC   TRUE 0.933 -3.000 0.529 0.007   NA
 598176 598177 BT9727_2903 BT9727_2904   gerA TRUE 0.901 27.000 0.471 0.007   NA
 598177 598178 BT9727_2904 BT9727_2905 gerA   FALSE 0.002 939.000 0.000 1.000   NA
 598178 598179 BT9727_2905 BT9727_2906     TRUE 0.968 5.000 0.583 1.000 Y NA
 598179 598180 BT9727_2906 BT9727_2907     FALSE 0.097 234.000 0.000 1.000 N NA
 598180 598181 BT9727_2907 BT9727_2908   alsT TRUE 0.757 125.000 0.000 1.000 Y NA
 598184 598185 BT9727_2911 BT9727_2912     FALSE 0.505 24.000 0.100 NA   NA
 598186 598187 BT9727_2913 BT9727_2914 ushA katA FALSE 0.011 693.000 0.000 1.000 N NA
 598187 598188 BT9727_2914 BT9727_2915 katA   FALSE 0.158 114.000 0.000 1.000   NA
 598189 598190 BT9727_2916 BT9727_2917     TRUE 0.774 174.000 0.235 0.035 Y NA
 598190 598191 BT9727_2917 BT9727_2918     TRUE 0.752 -3.000 0.206 1.000   NA
 598191 598192 BT9727_2918 BT9727_2919     TRUE 0.611 8.000 0.059 1.000   NA
 598193 598194 BT9727_2921 BT9727_2922   corA FALSE 0.009 1113.000 0.000 1.000 N NA
 598194 598195 BT9727_2922 BT9727_2923 corA   FALSE 0.000 458.000 0.000 NA   NA
 598195 598196 BT9727_2923 BT9727_2924     TRUE 0.829 36.000 0.833 NA   NA
 598196 598197 BT9727_2924 BT9727_2925     TRUE 0.659 75.000 0.667 NA   NA
 598197 598198 BT9727_2925 BT9727_2926     FALSE 0.001 335.000 0.000 NA   NA
 598198 598199 BT9727_2926 BT9727_2927     FALSE 0.017 114.000 0.000 NA   NA
 598199 598200 BT9727_2927 BT9727_2928     FALSE 0.000 434.000 0.000 NA   NA
 598202 598203 BT9727_2930 BT9727_2931     TRUE 0.664 12.000 0.333 NA   NA
 598205 598206 BT9727_2933 BT9727_2934     FALSE 0.416 104.000 0.200 1.000   NA
 598206 598207 BT9727_2934 BT9727_2935   phrB FALSE 0.520 113.000 0.010 1.000 N NA
 598207 598208 BT9727_2935 BT9727_2936 phrB   FALSE 0.311 165.000 0.004 1.000 N NA
 598208 598209 BT9727_2936 BT9727_2937   ybcD FALSE 0.308 80.000 0.136 NA   NA
 598209 598210 BT9727_2937 BT9727_2938 ybcD ndhF TRUE 0.700 0.000 0.303 NA   NA
 598210 598211 BT9727_2938 BT9727_2939 ndhF   FALSE 0.000 643.000 0.000 NA   NA
 598211 598212 BT9727_2939 BT9727_2940     FALSE 0.000 404.000 0.000 NA   NA
 598212 598213 BT9727_2940 BT9727_2941     FALSE 0.052 13.000 0.000 NA   NA
 598213 598214 BT9727_2941 BT9727_2942     TRUE 0.840 0.000 0.667 NA   NA
 598214 598215 BT9727_2942 BT9727_2943     FALSE 0.004 437.000 0.000 1.000   NA
 598216 598217 BT9727_2944 BT9727_2945     TRUE 0.934 -3.000 0.667 0.064   NA
 598217 598218 BT9727_2945 BT9727_2946     FALSE 0.015 121.000 0.000 NA   NA
 598221 598222 BT9727_2949 BT9727_2950 menA   FALSE 0.000 431.000 0.000 NA   NA
 598222 598223 BT9727_2950 BT9727_2951     FALSE 0.006 179.000 0.000 NA   NA
 598223 598224 BT9727_2951 BT9727_2952     FALSE 0.310 48.000 0.000 1.000   NA
 598226 598227 BT9727_2954 BT9727_2955   cgeB FALSE 0.433 77.000 0.286 NA   NA
 598228 598229 BT9727_2956 BT9727_2957   salY TRUE 0.874 24.000 0.800 1.000   NA
 598229 598230 BT9727_2957 BT9727_2958 salY salK FALSE 0.459 76.000 0.148 1.000   NA
 598230 598231 BT9727_2958 BT9727_2959 salK salR TRUE 0.971 8.000 0.704 1.000 Y NA
 598234 598235 BT9727_2962 BT9727_2963   arsC FALSE 0.361 154.000 0.556 NA   NA
 598235 598236 BT9727_2963 BT9727_2964 arsC acr3 TRUE 0.898 27.000 0.556 1.000 N NA
 598236 598237 BT9727_2964 BT9727_2965 acr3   TRUE 0.845 19.000 0.208 1.000 N NA
 598237 598238 BT9727_2965 BT9727_2966   arsR TRUE 0.731 61.000 0.126 1.000 N NA
 598238 598239 BT9727_2966 BT9727_2967 arsR   FALSE 0.000 446.000 0.000 NA   NA
 598241 598242 BT9727_2969 BT9727_2970     TRUE 0.765 59.000 0.244 1.000 N NA
 598242 598243 BT9727_2970 BT9727_2971   ydfG FALSE 0.034 334.000 0.000 1.000 N NA
 598245 598246 BT9727_2973 BT9727_2974 amaA   FALSE 0.394 22.000 0.000 1.000   NA
 598246 598247 BT9727_2974 BT9727_2975     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 598248 598249 BT9727_2976 BT9727_2977 gloA   FALSE 0.001 276.000 0.000 NA   NA
 598250 598251 BT9727_2978 BT9727_2979   ydgD FALSE 0.038 218.000 0.065 NA   NA
 598251 598252 BT9727_2979 BT9727_2980 ydgD   FALSE 0.038 327.000 0.455 NA   NA
 598252 598253 BT9727_2980 BT9727_2981     FALSE 0.055 283.000 0.000 1.000 N NA
 598253 598254 BT9727_2981 BT9727_2982     FALSE 0.003 567.000 0.000 1.000   NA
 598256 598257 BT9727_2984 BT9727_2985     FALSE 0.000 720.000 0.000 NA   NA
 598257 598258 BT9727_2985 BT9727_2986     FALSE 0.000 552.000 0.000 NA   NA
 598258 598259 BT9727_2986 BT9727_2987   tetV TRUE 0.674 12.000 0.200 1.000   NA
 598259 598260 BT9727_2987 BT9727_2988 tetV   FALSE 0.000 1014.000 0.000 NA   NA
 598260 598261 BT9727_2988 BT9727_2989     FALSE 0.001 330.000 0.000 NA   NA
 598261 598262 BT9727_2989 BT9727_2991     FALSE 0.000 930.000 0.000 NA   NA
 598264 598265 BT9727_2992 BT9727_2993     FALSE 0.001 367.000 0.000 NA   NA
 598265 598266 BT9727_2993 BT9727_2994   orfY FALSE 0.059 20.000 0.000 NA   NA
 598266 598267 BT9727_2994 BT9727_2995 orfY orfX TRUE 0.889 135.000 0.333 0.041 Y NA
 598267 598268 BT9727_2995 BT9727_2996 orfX   FALSE 0.572 -82.000 0.000 1.000   NA
 598268 598269 BT9727_2996 BT9727_2997     FALSE 0.042 197.000 0.000 1.000   NA
 598269 598270 BT9727_2997 BT9727_2998     FALSE 0.000 429.000 0.000 NA   NA
 598270 598271 BT9727_2998 BT9727_2999     TRUE 0.615 -3.000 0.162 NA   NA
 598271 598272 BT9727_2999 BT9727_3000     TRUE 0.827 -3.000 0.550 NA   NA
 598272 598273 BT9727_3000 BT9727_3001     TRUE 0.765 -3.000 0.233 1.000   NA
 598273 598274 BT9727_3001 BT9727_3002     TRUE 0.873 -3.000 0.100 0.035   NA
 598274 598275 BT9727_3002 BT9727_3003   fabH TRUE 0.735 -10.000 0.067 1.000   NA
 598275 598276 BT9727_3003 BT9727_3004 fabH yktD FALSE 0.012 428.000 0.000 NA N NA
 598277 598278 BT9727_3005 BT9727_3006     FALSE 0.256 150.000 0.316 NA   NA
 598279 598280 BT9727_3007 BT9727_3008     TRUE 0.899 0.000 0.852 1.000   NA
 598281 598282 BT9727_3009 BT9727_3010 arsR   FALSE 0.053 215.000 0.156 NA   NA
 598282 598283 BT9727_3010 BT9727_3011     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 598284 598285 BT9727_3012 BT9727_3013     TRUE 0.950 2.000 0.083 1.000 Y NA
 598285 598286 BT9727_3013 BT9727_3014   yitT FALSE 0.128 147.000 0.056 NA   NA
 598286 598287 BT9727_3014 BT9727_3015 yitT   FALSE 0.001 339.000 0.000 NA   NA
 598287 598288 BT9727_3015 BT9727_3016     FALSE 0.179 180.000 0.375 NA   NA
 598289 598290 BT9727_3017 BT9727_3018     FALSE 0.000 586.000 0.000 NA   NA
 598290 598291 BT9727_3018 BT9727_3019     FALSE 0.276 76.000 0.068 NA   NA
 598292 598293 BT9727_3020 BT9727_3021     FALSE 0.099 133.000 0.010 NA   NA
 598293 598294 BT9727_3021 BT9727_3022   serA FALSE 0.483 14.000 0.109 NA   NA
 598294 598295 BT9727_3022 BT9727_3023 serA serC TRUE 0.946 13.000 0.238 1.000 Y NA
 598295 598296 BT9727_3023 BT9727_3024 serC   FALSE 0.001 289.000 0.000 NA   NA
 598296 598297 BT9727_3024 BT9727_3025     TRUE 0.794 -18.000 0.333 NA   NA
 598297 598298 BT9727_3025 BT9727_3026   sigM TRUE 0.891 -10.000 0.733 NA   NA
 598298 598299 BT9727_3026 BT9727_3027 sigM   FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 598299 598300 BT9727_3027 BT9727_3028     FALSE 0.276 90.000 0.097 NA   NA
 598300 598301 BT9727_3028 BT9727_3029   ydbB FALSE 0.024 226.000 0.023 NA   NA
 598301 598302 BT9727_3029 BT9727_3030 ydbB araC FALSE 0.056 282.000 0.000 1.000 N NA
 598302 598303 BT9727_3030 BT9727_3031 araC   FALSE 0.003 554.000 0.000 1.000   NA
 598303 598304 BT9727_3031 BT9727_3032     FALSE 0.389 80.000 0.250 NA   NA
 598304 598305 BT9727_3032 BT9727_3033   amiB FALSE 0.001 291.000 0.000 NA   NA
 598305 598306 BT9727_3033 BT9727_3034 amiB   FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   NA
 598306 598307 BT9727_3034 BT9727_3035     FALSE 0.014 130.000 0.000 NA   NA
 598307 598308 BT9727_3035 BT9727_3036     FALSE 0.584 104.000 0.667 NA   NA
 598310 598311 BT9727_3038 BT9727_3039     FALSE 0.015 122.000 0.000 NA   NA
 598311 598312 BT9727_3039 BT9727_3040     FALSE 0.034 59.000 0.000 NA   NA
 598312 598313 BT9727_3040 BT9727_3041     FALSE 0.000 460.000 0.000 NA   NA
 598313 598314 BT9727_3041 BT9727_3042     FALSE 0.382 114.000 0.333 NA   NA
 598316 598317 BT9727_3044 BT9727_3045     FALSE 0.160 196.000 0.429 NA   NA
 598317 598318 BT9727_3045 BT9727_3046     FALSE 0.017 115.000 0.000 NA   NA
 598318 598319 BT9727_3046 BT9727_3047     FALSE 0.022 88.000 0.000 NA   NA
 598319 598320 BT9727_3047 BT9727_3048     TRUE 0.700 57.000 0.600 NA   NA
 598320 598321 BT9727_3048 BT9727_3049     TRUE 0.785 29.000 0.600 NA   NA
 598321 598322 BT9727_3049 BT9727_3050     TRUE 0.596 73.000 0.500 NA   NA
 598322 598323 BT9727_3050 BT9727_3051     FALSE 0.483 114.000 0.500 NA   NA
 598323 598324 BT9727_3051 BT9727_3052     FALSE 0.004 202.000 0.000 NA   NA
 598324 598325 BT9727_3052 BT9727_3053     TRUE 0.797 33.000 0.667 NA   NA
 598325 598326 BT9727_3053 BT9727_3054     FALSE 0.001 368.000 0.000 NA   NA
 598326 598327 BT9727_3054 BT9727_3055     FALSE 0.575 -7.000 0.065 NA   NA
 598327 598328 BT9727_3055 BT9727_3056     FALSE 0.000 643.000 0.000 NA   NA
 598328 598329 BT9727_3056 BT9727_3057     FALSE 0.426 19.000 0.043 NA   NA
 598329 598330 BT9727_3057 BT9727_3058     FALSE 0.021 95.000 0.000 NA   NA
 598330 598331 BT9727_3058 BT9727_3059     FALSE 0.001 271.000 0.000 NA   NA
 598331 598332 BT9727_3059 BT9727_3060     FALSE 0.000 679.000 0.000 NA   NA
 598332 598333 BT9727_3060 BT9727_3061     FALSE 0.000 443.000 0.000 NA   NA
 598333 598334 BT9727_3061 BT9727_3062     TRUE 0.784 16.000 0.600 NA   NA
 598334 598335 BT9727_3062 BT9727_3063     FALSE 0.001 297.000 0.000 NA   NA
 598335 598336 BT9727_3063 BT9727_3064     FALSE 0.449 -16.000 0.007 NA   NA
 598336 598337 BT9727_3064 BT9727_3065     FALSE 0.092 -10.000 0.000 NA   NA
 598337 598338 BT9727_3065 BT9727_3066   tpn FALSE 0.019 106.000 0.000 NA   NA
 598338 598339 BT9727_3066 BT9727_3067 tpn   FALSE 0.298 159.000 0.000 0.040   NA
 598339 598340 BT9727_3067 BT9727_3068     FALSE 0.000 711.000 0.000 NA   NA
 598340 598341 BT9727_3068 BT9727_3069     FALSE 0.048 38.000 0.000 NA   NA
 598341 598342 BT9727_3069 BT9727_3070     FALSE 0.001 275.000 0.000 NA   NA
 598342 598343 BT9727_3070 BT9727_3071     TRUE 0.638 8.000 0.286 NA   NA
 598343 598344 BT9727_3071 BT9727_3072     FALSE 0.000 483.000 0.000 NA   NA
 598344 598345 BT9727_3072 BT9727_3073     FALSE 0.001 378.000 0.000 NA   NA
 598345 598346 BT9727_3073 BT9727_3074     FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 598346 598347 BT9727_3074 BT9727_3075     FALSE 0.051 34.000 0.000 NA   NA
 598347 598348 BT9727_3075 BT9727_3076     TRUE 0.811 0.000 0.556 NA   NA
 598348 598349 BT9727_3076 BT9727_3077     TRUE 0.805 8.000 0.643 NA   NA
 598349 598350 BT9727_3077 BT9727_3078     TRUE 0.724 27.000 0.429 NA   NA
 598354 598355 BT9727_3082 BT9727_3083 yebG   TRUE 0.672 -16.000 0.154 NA   NA
 598355 598356 BT9727_3083 BT9727_3084   pcaD FALSE 0.216 141.000 0.025 1.000   NA
 598357 598358 BT9727_3085 BT9727_3086   norA TRUE 0.836 16.000 0.225 1.000 N NA
 598358 598359 BT9727_3086 BT9727_3087 norA   TRUE 0.715 101.000 0.412 1.000 N NA
 598360 598361 BT9727_3088 BT9727_3089     TRUE 0.700 -3.000 0.275 NA   NA
 598361 598362 BT9727_3089 BT9727_3090     TRUE 0.611 -3.000 0.157 NA   NA
 598364 598365 BT9727_3092 BT9727_3093     TRUE 0.599 -3.000 0.137 NA   NA
 598365 598366 BT9727_3093 BT9727_3094     TRUE 0.807 15.000 0.098 1.000 N NA
 598366 598367 BT9727_3094 BT9727_3095     FALSE 0.001 386.000 0.000 NA   NA
 598367 598368 BT9727_3095 BT9727_3096     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 598370 598371 BT9727_3098 BT9727_3099     TRUE 0.817 -39.000 0.350 NA   NA
 598371 598372 BT9727_3099 BT9727_3100     TRUE 0.764 24.000 0.350 1.000   NA
 598372 598373 BT9727_3100 BT9727_3101     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 598375 598376 BT9727_3103 BT9727_3104     FALSE 0.085 184.000 0.125 NA   NA
 598376 598377 BT9727_3104 BT9727_3105     TRUE 0.834 -27.000 0.412 NA   NA
 598377 598378 BT9727_3105 BT9727_3106     TRUE 0.917 -21.000 0.673 1.000   NA
 598378 598379 BT9727_3106 BT9727_3107     FALSE 0.528 23.000 0.145 NA   NA
 598379 598380 BT9727_3107 BT9727_3108     FALSE 0.574 58.000 0.364 NA   NA
 598380 598381 BT9727_3108 BT9727_3109   rraA FALSE 0.001 339.000 0.000 NA   NA
 598381 598382 BT9727_3109 BT9727_3110 rraA   FALSE 0.002 244.000 0.000 NA   NA
 598382 598383 BT9727_3110 BT9727_3111     FALSE 0.001 306.000 0.000 NA   NA
 598383 598384 BT9727_3111 BT9727_3112     FALSE 0.000 437.000 0.000 NA   NA
 598384 598385 BT9727_3112 BT9727_3113     TRUE 0.761 13.000 0.133 NA N NA
 598385 598386 BT9727_3113 BT9727_3114     FALSE 0.000 596.000 0.000 NA   NA
 598386 598387 BT9727_3114 BT9727_3115     FALSE 0.000 411.000 0.000 NA   NA
 598387 598388 BT9727_3115 BT9727_3116     FALSE 0.000 621.000 0.000 NA   NA
 598389 598390 BT9727_3117 BT9727_3118 hisS   FALSE 0.058 162.000 0.008 NA   NA
 598390 598391 BT9727_3118 BT9727_3119     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 598393 598394 BT9727_3121 BT9727_3122     FALSE 0.146 154.000 0.125 NA   NA
 598395 598396 BT9727_3123 BT9727_3124 pykA   FALSE 0.196 82.000 0.028 NA   NA
 598396 598397 BT9727_3124 BT9727_3125     FALSE 0.001 339.000 0.000 NA   NA
 598397 598398 BT9727_3125 BT9727_3126     FALSE 0.395 57.000 0.130 NA   NA
 598398 598399 BT9727_3126 BT9727_3127     TRUE 0.809 -7.000 0.426 NA   NA
 598399 598400 BT9727_3127 BT9727_3128     FALSE 0.307 88.000 0.159 NA   NA
 598401 598402 BT9727_3129 BT9727_3130     TRUE 0.710 -12.000 0.222 NA   NA
 598403 598404 BT9727_3131 BT9727_3132     FALSE 0.083 174.000 0.067 NA   NA
 598406 598407 BT9727_3134 BT9727_3135     FALSE 0.158 177.000 0.136 1.000   NA
 598408 598409 BT9727_3136 BT9727_3137     TRUE 0.824 18.000 0.700 NA   NA
 598410 598411 BT9727_3138 BT9727_3139     TRUE 0.701 62.000 0.050 1.000 N NA
 598411 598412 BT9727_3139 BT9727_3140   maa FALSE 0.005 399.000 0.000 1.000   NA
 598412 598413 BT9727_3140 BT9727_3141 maa   FALSE 0.010 307.000 0.000 1.000   NA
 598413 598414 BT9727_3141 BT9727_3142     TRUE 0.932 -3.000 0.625 1.000 N NA
 598414 598415 BT9727_3142 BT9727_3143   trpS FALSE 0.219 215.000 0.000 0.086 N NA
 598417 598418 BT9727_3145 BT9727_3146     FALSE 0.437 55.000 0.179 NA   NA
 598420 598421 BT9727_3148 BT9727_3149 ubiE   TRUE 0.610 41.000 0.312 NA   NA
 598424 598425 BT9727_3152 BT9727_3153     TRUE 0.637 77.000 0.636 NA   NA
 598426 598427 BT9727_3154 BT9727_3155     FALSE 0.040 199.000 0.030 NA   NA
 598427 598428 BT9727_3155 BT9727_3156     FALSE 0.479 53.000 0.039 1.000   NA
 598428 598429 BT9727_3156 BT9727_3157     FALSE 0.388 120.000 0.235 1.000   NA
 598431 598432 BT9727_3159 BT9727_3160     FALSE 0.000 558.000 0.000 NA   NA
 598432 598433 BT9727_3160 BT9727_3161   gntK TRUE 0.848 121.000 0.316 1.000 Y NA
 598433 598434 BT9727_3161 BT9727_3162 gntK   TRUE 0.924 56.000 0.263 1.000 Y NA
 598434 598435 BT9727_3162 BT9727_3163   tal FALSE 0.093 390.000 0.000 1.000 Y NA
 598435 598436 BT9727_3163 BT9727_3164 tal gnd TRUE 0.948 52.000 0.545 1.000 Y NA
 598436 598437 BT9727_3164 BT9727_3165 gnd tkt TRUE 0.908 105.000 0.636 1.000 Y NA
 598437 598438 BT9727_3165 BT9727_3166 tkt zwf TRUE 0.958 40.000 0.545 1.000 Y NA
 598438 598439 BT9727_3166 BT9727_3167 zwf   FALSE 0.011 633.000 0.000 1.000 N NA
 598441 598442 BT9727_3169 BT9727_3170   npr FALSE 0.012 588.000 0.000 1.000 N NA
 598442 598443 BT9727_3170 BT9727_3171 npr   FALSE 0.334 155.000 0.000 0.018   NA
 598443 598444 BT9727_3171 BT9727_3172     FALSE 0.008 342.000 0.000 1.000   NA
 598444 598445 BT9727_3172 BT9727_3173     FALSE 0.001 383.000 0.000 NA   NA
 598445 598446 BT9727_3173 BT9727_3174     FALSE 0.000 408.000 0.000 NA   NA
 598446 598447 BT9727_3174 BT9727_3175     FALSE 0.014 131.000 0.000 NA   NA
 598447 598448 BT9727_3175 BT9727_3176     FALSE 0.001 276.000 0.000 NA   NA
 598448 598449 BT9727_3176 BT9727_3177   sdaC FALSE 0.128 171.000 0.200 NA   NA
 598449 598450 BT9727_3177 BT9727_3178 sdaC   FALSE 0.000 1014.000 0.000 NA   NA
 598450 598451 BT9727_3178 BT9727_3179     FALSE 0.402 83.000 0.273 NA   NA
 598451 598452 BT9727_3179 BT9727_3180     FALSE 0.216 128.000 0.154 NA   NA
 598452 598453 BT9727_3180 BT9727_3181     FALSE 0.008 589.000 0.000 NA N NA
 598455 598456 BT9727_3183 BT9727_3184     TRUE 0.675 33.000 0.217 1.000   NA
 598456 598457 BT9727_3184 BT9727_3185   cfa FALSE 0.028 219.000 0.000 1.000   NA
 598457 598458 BT9727_3185 BT9727_3186 cfa   FALSE 0.025 323.000 0.000 NA N NA
 598458 598459 BT9727_3186 BT9727_3187     TRUE 0.665 192.000 0.667 NA Y NA
 598460 598461 BT9727_3188 BT9727_3189 fdh   FALSE 0.404 79.000 0.262 NA   NA
 598462 598463 BT9727_3190 BT9727_3191     TRUE 0.595 29.000 0.250 NA   NA
 598463 598464 BT9727_3191 BT9727_3192     TRUE 0.598 28.000 0.250 NA   NA
 598466 598467 BT9727_3194 BT9727_3195     TRUE 0.630 12.000 0.093 1.000   NA
 598467 598468 BT9727_3195 BT9727_3196     TRUE 0.903 -6.000 0.300 0.065   NA
 598468 598469 BT9727_3196 BT9727_3197     TRUE 0.880 -3.000 0.238 0.065   NA
 598469 598470 BT9727_3197 BT9727_3198     FALSE 0.533 146.000 0.000 0.065 N NA
 598470 598471 BT9727_3198 BT9727_3199     FALSE 0.112 144.000 0.000 1.000   NA
 598473 598474 BT9727_3201 BT9727_3202     FALSE 0.102 229.000 0.000 1.000 N NA
 598474 598475 BT9727_3202 BT9727_3203     FALSE 0.091 178.000 0.108 NA   NA
 598475 598476 BT9727_3203 BT9727_3204   fliA3 TRUE 0.869 -10.000 0.605 NA   NA
 598476 598477 BT9727_3204 BT9727_3205 fliA3   FALSE 0.000 555.000 0.000 NA   NA
 598477 598478 BT9727_3205 BT9727_3206     FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 598478 598479 BT9727_3206 BT9727_3207     FALSE 0.032 64.000 0.000 NA   NA
 598483 598484 BT9727_3211 BT9727_3212   drrB FALSE 0.012 290.000 0.000 1.000   NA
 598484 598485 BT9727_3212 BT9727_3213 drrB drrA TRUE 0.960 1.000 0.860 0.086 N NA
 598485 598486 BT9727_3213 BT9727_3214 drrA   FALSE 0.166 155.000 0.186 NA   NA
 598486 598487 BT9727_3214 BT9727_3215     FALSE 0.442 76.000 0.289 NA   NA
 598487 598488 BT9727_3215 BT9727_3216   hcp FALSE 0.013 424.000 0.000 NA N NA
 598490 598491 BT9727_3218 BT9727_3219 bla   FALSE 0.241 139.000 0.045 1.000   NA
 598491 598492 BT9727_3219 BT9727_3220     FALSE 0.488 35.000 0.130 NA   NA
 598495 598496 BT9727_3223 BT9727_3224   pbp TRUE 0.609 24.000 0.250 NA   NA
 598497 598498 BT9727_3225 BT9727_3226   noxC FALSE 0.001 278.000 0.000 NA   NA
 598498 598499 BT9727_3226 BT9727_3227 noxC   FALSE 0.079 172.000 0.056 NA   NA
 598499 598500 BT9727_3227 BT9727_3228     FALSE 0.466 14.000 0.085 NA   NA
 598501 598502 BT9727_3229 BT9727_3230     TRUE 0.683 14.000 0.386 NA   NA
 598502 598503 BT9727_3230 BT9727_3231     FALSE 0.270 105.000 0.159 NA   NA
 598506 598507 BT9727_3234 BT9727_3235     FALSE 0.025 603.000 0.000 0.062 N NA
 598509 598510 BT9727_3238 BT9727_3239     FALSE 0.001 300.000 0.000 NA   NA
 598510 598511 BT9727_3239 BT9727_3240     FALSE 0.000 631.000 0.000 NA   NA
 598511 598512 BT9727_3240 BT9727_3241     FALSE 0.001 379.000 0.000 NA   NA
 598512 598513 BT9727_3241 BT9727_3242     FALSE 0.540 16.000 0.178 NA   NA
 598515 598516 BT9727_3244 BT9727_3245     FALSE 0.000 605.000 0.000 NA   NA
 598516 598517 BT9727_3245 BT9727_3246   fhuG TRUE 0.975 22.000 0.833 1.000 Y NA
 598517 598518 BT9727_3246 BT9727_3247 fhuG fhuB TRUE 0.987 1.000 0.909 0.036 Y NA
 598520 598521 BT9727_3249 BT9727_3250     FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 598521 598522 BT9727_3250 BT9727_3251     FALSE 0.001 270.000 0.000 NA   NA
 598524 598525 BT9727_3253 BT9727_3254     TRUE 0.779 18.000 0.545 NA   NA
 598525 598526 BT9727_3254 BT9727_3255     FALSE 0.001 302.000 0.000 NA   NA
 598528 598529 BT9727_3257 BT9727_3258     FALSE 0.349 163.000 0.467 1.000   NA
 598529 598530 BT9727_3258 BT9727_3259   mutS TRUE 0.659 7.000 0.137 1.000   NA
 598533 598534 BT9727_3262 BT9727_3263 yvcN pepF FALSE 0.564 118.000 0.113 1.000 N NA
 598538 598539 BT9727_3267 BT9727_3268     TRUE 0.793 -7.000 0.389 NA   NA
 598539 598540 BT9727_3268 BT9727_3269     FALSE 0.529 16.000 0.167 NA   NA
 598541 598542 BT9727_3270 BT9727_3271 glpQ   FALSE 0.093 390.000 0.000 1.000 Y NA
 598543 598544 BT9727_3272 BT9727_3273     TRUE 0.638 111.000 0.276 1.000 N NA
 598544 598545 BT9727_3273 BT9727_3274     FALSE 0.063 165.000 0.017 NA   NA
 598546 598547 BT9727_3275 BT9727_3276 rapE   FALSE 0.110 153.000 0.050 NA   NA
 598547 598548 BT9727_3276 BT9727_3277     FALSE 0.407 13.000 0.049 NA   NA
 598548 598549 BT9727_3277 BT9727_3278     TRUE 0.641 5.000 0.074 1.000   NA
 598549 598550 BT9727_3278 BT9727_3279     FALSE 0.206 170.000 0.368 NA   NA
 598550 598551 BT9727_3279 BT9727_3280   rfaG FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 598551 598552 BT9727_3280 BT9727_3281 rfaG   TRUE 0.803 -19.000 0.200 1.000   NA
 598552 598553 BT9727_3281 BT9727_3282   vioB FALSE 0.004 440.000 0.000 1.000   NA
 598553 598554 BT9727_3282 BT9727_3283 vioB   TRUE 0.965 -7.000 0.144 1.000 Y NA
 598554 598555 BT9727_3283 BT9727_3284     FALSE 0.574 20.000 0.021 1.000   NA
 598555 598556 BT9727_3284 BT9727_3285   caiD TRUE 0.647 154.000 0.750 0.065   NA
 598556 598557 BT9727_3285 BT9727_3286 caiD colA FALSE 0.008 339.000 0.000 1.000   NA
 598557 598558 BT9727_3286 BT9727_3287 colA   FALSE 0.119 204.000 0.200 1.000   NA
 598559 598560 BT9727_3288 BT9727_3289     FALSE 0.551 -3.000 0.071 NA   NA
 598561 598562 BT9727_3290 BT9727_3291     FALSE 0.146 175.000 0.263 NA   NA
 598563 598564 BT9727_3292 BT9727_3293     FALSE 0.258 118.000 0.182 NA   NA
 598567 598568 BT9727_3296 BT9727_3297   cspB FALSE 0.232 191.000 0.033 1.000 N NA
 598568 598569 BT9727_3297 BT9727_3298 cspB   FALSE 0.003 217.000 0.000 NA   NA
 598569 598570 BT9727_3298 BT9727_3299     FALSE 0.111 -64.000 0.000 NA   NA
 598570 598571 BT9727_3299 BT9727_3300     FALSE 0.109 -49.000 0.000 NA   NA
 598571 598572 BT9727_3300 BT9727_3301     FALSE 0.291 142.000 0.160 1.000   NA
 598572 598573 BT9727_3301 BT9727_3302     FALSE 0.508 87.000 0.280 1.000   NA
 598573 598574 BT9727_3302 BT9727_3303     TRUE 0.627 -3.000 0.175 NA   NA
 598578 598579 BT9727_3307 BT9727_3308   argH FALSE 0.483 67.000 0.086 1.000   NA
 598579 598580 BT9727_3308 BT9727_3309 argH   FALSE 0.530 102.000 0.099 NA N NA
 598580 598581 BT9727_3309 BT9727_3310     TRUE 0.756 117.000 0.889 NA N NA
 598581 598582 BT9727_3310 BT9727_3311     TRUE 0.731 102.000 0.471 1.000 N NA
 598582 598583 BT9727_3311 BT9727_3312     FALSE 0.565 4.000 0.170 NA   NA
 598585 598586 BT9727_3314 BT9727_3315   sqhC FALSE 0.179 355.000 0.000 0.064 Y NA
 598586 598587 BT9727_3315 BT9727_3316 sqhC   FALSE 0.192 100.000 0.040 NA   NA
 598587 598588 BT9727_3316 BT9727_3317   rarD FALSE 0.191 80.000 0.023 NA   NA
 598588 598589 BT9727_3317 BT9727_3318 rarD   FALSE 0.176 91.000 0.023 NA   NA
 598589 598590 BT9727_3318 BT9727_3319     FALSE 0.062 169.000 0.022 NA   NA
 598590 598591 BT9727_3319 BT9727_3320     TRUE 0.676 43.000 0.429 NA   NA
 598591 598592 BT9727_3320 BT9727_3321   mrp TRUE 0.719 16.000 0.429 NA   NA
 598592 598593 BT9727_3321 BT9727_3322 mrp moaD TRUE 0.656 67.000 0.010 1.000 N NA
 598593 598594 BT9727_3322 BT9727_3323 moaD moaE TRUE 0.990 -25.000 0.501 0.004 Y NA
 598594 598595 BT9727_3323 BT9727_3324 moaE moeA TRUE 0.981 -19.000 0.008 0.004 Y NA
 598595 598596 BT9727_3324 BT9727_3325 moeA moeB TRUE 0.976 19.000 0.900 1.000 Y NA
 598596 598597 BT9727_3325 BT9727_3326 moeB   TRUE 0.883 25.000 0.429 1.000 N NA
 598597 598598 BT9727_3326 BT9727_3327   moaA FALSE 0.302 190.000 0.250 1.000 N NA
 598598 598599 BT9727_3327 BT9727_3328 moaA fdhD TRUE 0.882 21.000 0.400 1.000 N NA
 598599 598600 BT9727_3328 BT9727_3329 fdhD   TRUE 0.773 17.000 0.545 NA   NA
 598600 598601 BT9727_3329 BT9727_3330     FALSE 0.438 116.000 0.429 NA   NA
 598601 598602 BT9727_3330 BT9727_3331   fdhF TRUE 0.849 13.000 0.929 NA   NA
 598603 598604 BT9727_3332 BT9727_3333 gerKA gerIB TRUE 0.898 -3.000 0.231 0.007   NA
 598604 598605 BT9727_3333 BT9727_3334 gerIB gerQC TRUE 0.948 1.000 0.923 0.007   NA
 598606 598607 BT9727_3335 BT9727_3336     TRUE 0.593 74.000 0.500 NA   NA
 598607 598608 BT9727_3336 BT9727_3337     FALSE 0.002 251.000 0.000 NA   NA
 598610 598611 BT9727_3339 BT9727_3340   oppA TRUE 0.610 83.000 0.032 1.000 N NA
 598612 598613 BT9727_3341 BT9727_3342     FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 598613 598614 BT9727_3342 BT9727_3343     FALSE 0.032 64.000 0.000 NA   NA
 598615 598616 BT9727_3344 BT9727_3345 oppA oppA FALSE 0.162 377.000 0.000 0.036 Y NA
 598616 598617 BT9727_3345 BT9727_3346 oppA dctA FALSE 0.031 348.000 0.000 1.000 N NA
 598617 598618 BT9727_3346 BT9727_3347 dctA lytR FALSE 0.353 146.000 0.037 NA N NA
 598618 598619 BT9727_3347 BT9727_3348 lytR   TRUE 0.830 16.000 0.778 NA   NA
 598619 598620 BT9727_3348 BT9727_3349     TRUE 0.825 13.000 0.778 NA   NA
 598620 598621 BT9727_3349 BT9727_3350     FALSE 0.096 192.000 0.222 NA   NA
 598621 598622 BT9727_3350 BT9727_3351   berA TRUE 0.787 -7.000 0.375 NA   NA
 598624 598625 BT9727_3353 BT9727_3354   parC FALSE 0.192 152.000 0.035 1.000   NA
 598625 598626 BT9727_3354 BT9727_3355 parC parE TRUE 0.985 2.000 0.552 0.001 Y NA
 598626 598627 BT9727_3355 BT9727_3356 parE   FALSE 0.006 376.000 0.030 NA   NA
 598627 598628 BT9727_3356 BT9727_3357   htrA FALSE 0.175 80.000 0.015 NA   NA
 598628 598629 BT9727_3357 BT9727_3358 htrA   FALSE 0.253 203.000 0.222 1.000 N NA
 598629 598630 BT9727_3358 BT9727_3359   pflA TRUE 0.809 20.000 0.042 1.000 N NA
 598630 598631 BT9727_3359 BT9727_3360 pflA nrdD TRUE 0.897 -3.000 0.315 1.000 N NA
 598632 598633 BT9727_3361 BT9727_3362     FALSE 0.185 109.000 0.048 NA   NA
 598636 598637 BT9727_3365 BT9727_3366   dnaE FALSE 0.000 563.000 0.000 NA   NA
 598637 598638 BT9727_3366 BT9727_3367 dnaE   TRUE 0.659 116.000 0.348 1.000 N NA
 598640 598641 BT9727_3369 BT9727_3370   citB TRUE 0.636 72.000 0.013 1.000 N NA
 598641 598642 BT9727_3370 BT9727_3371 citB   FALSE 0.015 483.000 0.000 1.000 N NA
 598642 598643 BT9727_3371 BT9727_3372     FALSE 0.356 131.000 0.381 NA   NA
 598645 598646 BT9727_3374 BT9727_3375     TRUE 0.605 58.000 0.412 NA   NA
 598650 598651 BT9727_3379 BT9727_3380 mmgA fadD TRUE 0.979 -7.000 0.576 1.000 Y NA
 598651 598652 BT9727_3380 BT9727_3381 fadD bioY TRUE 0.700 -150.000 0.144 NA   NA
 598652 598653 BT9727_3381 BT9727_3382 bioY alkK FALSE 0.133 124.000 0.028 NA   NA
 598653 598654 BT9727_3382 BT9727_3383 alkK   FALSE 0.000 598.000 0.000 NA   NA
 598655 598656 BT9727_3384 BT9727_3385     FALSE 0.231 171.000 0.429 NA   NA
 598659 598660 BT9727_3388 BT9727_3389   cwlC FALSE 0.450 15.000 0.073 NA   NA
 598660 598661 BT9727_3389 BT9727_3390 cwlC   TRUE 0.721 16.000 0.286 1.000   NA
 598665 598666 BT9727_3394 BT9727_3395     FALSE 0.548 25.000 0.175 NA   NA
 598666 598667 BT9727_3395 BT9727_3396   opuE FALSE 0.129 342.000 0.000 1.000 Y NA
 598667 598668 BT9727_3396 BT9727_3397 opuE gltB FALSE 0.202 285.000 0.000 1.000 Y NA
 598668 598669 BT9727_3397 BT9727_3398 gltB   TRUE 0.790 68.000 0.412 1.000 N NA
 598669 598670 BT9727_3398 BT9727_3399     FALSE 0.022 241.000 0.000 1.000   NA
 598670 598671 BT9727_3399 BT9727_3400     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 598671 598672 BT9727_3400 BT9727_3401     FALSE 0.009 557.000 0.000 NA N NA
 598672 598673 BT9727_3401 BT9727_3402   hutG FALSE 0.067 267.000 0.000 1.000 N NA
 598673 598674 BT9727_3402 BT9727_3403 hutG hutI TRUE 0.904 -21.000 0.171 1.000 N NA
 598674 598675 BT9727_3403 BT9727_3404 hutI hutU TRUE 0.807 14.000 0.110 1.000 N NA
 598675 598676 BT9727_3404 BT9727_3405 hutU hutH TRUE 0.977 24.000 0.315 0.001 Y NA
 598676 598677 BT9727_3405 BT9727_3406 hutH hutP FALSE 0.187 105.000 0.044 NA   NA
 598679 598680 BT9727_3408 BT9727_3409 thiJ   FALSE 0.339 116.000 0.286 NA   NA
 598681 598682 BT9727_3410 BT9727_3411     FALSE 0.308 104.000 0.211 NA   NA
 598683 598684 BT9727_3412 BT9727_3413     TRUE 0.769 50.000 0.750 NA   NA
 598686 598687 BT9727_3416 BT9727_3417 ccdC ccdA TRUE 0.848 91.000 0.200 NA Y NA
 598688 598689 BT9727_3418 BT9727_3419     FALSE 0.500 88.000 0.269 1.000   NA
 598690 598691 BT9727_3420 BT9727_3421 bcrB bcrA TRUE 0.867 -7.000 0.636 NA   NA
 598691 598692 BT9727_3421 BT9727_3422 bcrA   TRUE 0.833 7.000 0.750 NA   NA
 598692 598693 BT9727_3422 BT9727_3423     FALSE 0.002 231.000 0.000 NA   NA
 598694 598695 BT9727_3424 BT9727_3425     TRUE 0.908 -3.000 0.840 1.000   NA
 598698 598699 BT9727_3428 BT9727_3429     FALSE 0.000 410.000 0.000 NA   NA
 598699 598700 BT9727_3429 BT9727_3430     FALSE 0.170 148.000 0.154 NA   NA
 598700 598701 BT9727_3430 BT9727_3431     TRUE 0.709 7.000 0.389 NA   NA
 598701 598702 BT9727_3431 BT9727_3432     FALSE 0.140 119.000 0.028 NA   NA
 598702 598703 BT9727_3432 BT9727_3433     TRUE 0.989 0.000 0.911 0.004 Y NA
 598703 598704 BT9727_3433 BT9727_3434     FALSE 0.364 124.000 0.214 1.000   NA
 598704 598705 BT9727_3434 BT9727_3435     FALSE 0.353 79.000 0.197 NA   NA
 598705 598706 BT9727_3435 BT9727_3436   tkt FALSE 0.204 157.000 0.280 NA   NA
 598706 598707 BT9727_3436 BT9727_3437 tkt   FALSE 0.021 400.000 0.000 1.000 N NA
 598707 598708 BT9727_3437 BT9727_3438   phnE FALSE 0.047 299.000 0.000 1.000 N NA
 598708 598709 BT9727_3438 BT9727_3439 phnE phnE TRUE 0.987 0.000 0.689 0.001 Y NA
 598709 598710 BT9727_3439 BT9727_3440 phnE phnC TRUE 0.988 -3.000 0.654 0.001 Y NA
 598710 598711 BT9727_3440 BT9727_3441 phnC phnD TRUE 0.944 84.000 0.308 0.001 Y NA
 598713 598714 BT9727_3443 BT9727_3445     FALSE 0.405 46.000 0.078 NA   NA
 598716 598717 BT9727_3446 BT9727_3447     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 598717 598718 BT9727_3447 BT9727_3448     TRUE 0.873 -7.000 0.667 NA   NA
 598718 598719 BT9727_3448 BT9727_3449   glnA FALSE 0.017 368.000 0.000 NA N NA
 598719 598720 BT9727_3449 BT9727_3450 glnA   TRUE 0.850 49.000 0.481 1.000 N NA
 598720 598721 BT9727_3450 BT9727_3451     FALSE 0.330 175.000 0.138 1.000 N NA
 598721 598722 BT9727_3451 BT9727_3452   hflx TRUE 0.722 -7.000 0.065 1.000   NA
 598725 598726 BT9727_3455 BT9727_3456     FALSE 0.158 114.000 0.000 1.000   NA
 598727 598728 BT9727_3458 BT9727_3459 hfq miaA TRUE 0.688 22.000 0.192 1.000   NA
 598730 598731 BT9727_3461 BT9727_3462   fruA FALSE 0.030 349.000 0.000 1.000 N NA
 598731 598732 BT9727_3462 BT9727_3463 fruA fruB TRUE 0.971 15.000 0.816 1.000 Y NA
 598732 598733 BT9727_3463 BT9727_3464 fruB fruR TRUE 0.979 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 598733 598734 BT9727_3464 BT9727_3465 fruR bdhA FALSE 0.346 159.000 0.016 1.000 N NA
 598734 598735 BT9727_3465 BT9727_3466 bdhA   FALSE 0.136 117.000 0.021 NA   NA
 598735 598736 BT9727_3466 BT9727_3467     FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 598736 598737 BT9727_3467 BT9727_3468   gabP FALSE 0.494 85.000 0.400 NA   NA
 598738 598739 BT9727_3469 BT9727_3470 chiA   TRUE 0.640 24.000 0.286 NA   NA
 598741 598742 BT9727_3472 BT9727_3473 fdhC hup FALSE 0.513 143.000 0.207 1.000 N NA
 598743 598744 BT9727_3474 BT9727_3475     FALSE 0.452 171.000 0.019 0.064 N NA
 598744 598745 BT9727_3475 BT9727_3476   copP TRUE 0.928 96.000 0.154 0.001 Y NA
 598745 598746 BT9727_3476 BT9727_3477 copP   FALSE 0.160 189.000 0.385 NA   NA
 598746 598747 BT9727_3477 BT9727_3478     FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 598747 598748 BT9727_3478 BT9727_3479     FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 598748 598749 BT9727_3479 BT9727_3480     TRUE 0.832 17.000 0.583 1.000   NA
 598749 598750 BT9727_3480 BT9727_3481     TRUE 0.962 15.000 0.545 1.000 Y NA
 598750 598751 BT9727_3481 BT9727_3482   fecD TRUE 0.990 -7.000 0.909 0.035 Y NA
 598751 598752 BT9727_3482 BT9727_3483 fecD feuA TRUE 0.958 28.000 0.409 1.000 Y NA
 598752 598753 BT9727_3483 BT9727_3484 feuA exoA FALSE 0.055 284.000 0.000 1.000 N NA
 598754 598755 BT9727_3485 BT9727_3486 adaA ogt TRUE 0.963 -19.000 0.265 0.001 N NA
 598755 598756 BT9727_3486 BT9727_3487 ogt alkA TRUE 0.965 -3.000 0.269 1.000 Y NA
 598759 598760 BT9727_3490 BT9727_3491   pgm FALSE 0.001 324.000 0.000 NA   NA
 598760 598761 BT9727_3491 BT9727_3492 pgm   TRUE 0.601 31.000 0.063 1.000   NA
 598761 598762 BT9727_3492 BT9727_3493     FALSE 0.046 184.000 0.021 NA   NA
 598763 598764 BT9727_3494 BT9727_3495     FALSE 0.191 146.000 0.176 NA   NA
 598764 598765 BT9727_3495 BT9727_3496     TRUE 0.844 -94.000 0.412 NA   NA
 598766 598767 BT9727_3497 BT9727_3498     TRUE 0.705 22.000 0.375 NA   NA
 598767 598768 BT9727_3498 BT9727_3499     TRUE 0.818 34.000 0.583 1.000   NA
 598768 598769 BT9727_3499 BT9727_3500     FALSE 0.068 187.000 0.069 NA   NA
 598769 598770 BT9727_3500 BT9727_3501     FALSE 0.001 359.000 0.000 NA   NA
 598770 598771 BT9727_3501 BT9727_3502     FALSE 0.192 178.000 0.250 1.000   NA
 598772 598773 BT9727_3503 BT9727_3504 cwlJ   FALSE 0.017 264.000 0.000 1.000   NA
 598773 598774 BT9727_3504 BT9727_3505     FALSE 0.004 469.000 0.000 1.000   NA
 598777 598778 BT9727_3508 BT9727_3509 cbaH mutL FALSE 0.076 258.000 0.000 1.000 N NA
 598778 598779 BT9727_3509 BT9727_3510 mutL mutS TRUE 0.974 9.000 0.220 0.001 Y NA
 598779 598780 BT9727_3510 BT9727_3511 mutS cotE FALSE 0.052 182.000 0.027 NA   NA
 598780 598781 BT9727_3511 BT9727_3512 cotE   FALSE 0.252 126.000 0.209 NA   NA
 598781 598782 BT9727_3512 BT9727_3513     FALSE 0.427 4.000 0.041 NA   NA
 598782 598783 BT9727_3513 BT9727_3514   porB FALSE 0.023 429.000 0.004 1.000 N NA
 598783 598784 BT9727_3514 BT9727_3515 porB porA TRUE 0.989 -13.000 0.437 0.000 Y NA
 598784 598785 BT9727_3515 BT9727_3516 porA   FALSE 0.143 228.000 0.041 1.000 N NA
 598785 598786 BT9727_3516 BT9727_3517   spoVS FALSE 0.470 60.000 0.247 NA   NA
 598786 598787 BT9727_3517 BT9727_3518 spoVS   FALSE 0.161 149.000 0.139 NA   NA
 598787 598788 BT9727_3518 BT9727_3519     FALSE 0.231 166.000 0.245 1.000   NA
 598788 598789 BT9727_3519 BT9727_3520   recA FALSE 0.007 483.000 0.018 1.000   NA
 598789 598790 BT9727_3520 BT9727_3521 recA recA FALSE 0.079 307.000 0.007 0.001   NA
 598790 598791 BT9727_3521 BT9727_3522 recA cinA FALSE 0.257 145.000 0.083 1.000   NA
 598791 598792 BT9727_3522 BT9727_3523 cinA pgsA TRUE 0.670 21.000 0.151 1.000   NA
 598792 598793 BT9727_3523 BT9727_3524 pgsA   FALSE 0.487 64.000 0.077 1.000   NA
 598793 598794 BT9727_3524 BT9727_3525     TRUE 0.774 22.000 0.371 1.000   NA
 598794 598795 BT9727_3525 BT9727_3526     FALSE 0.336 140.000 0.388 NA   NA
 598795 598796 BT9727_3526 BT9727_3527   fabG FALSE 0.510 76.000 0.386 NA   NA
 598796 598797 BT9727_3527 BT9727_3528 fabG   FALSE 0.534 104.000 0.397 1.000   NA
 598797 598798 BT9727_3528 BT9727_3529     TRUE 0.946 1.000 0.872 0.007   NA
 598798 598799 BT9727_3529 BT9727_3530     FALSE 0.105 199.000 0.077 1.000   NA
 598799 598800 BT9727_3530 BT9727_3531     TRUE 0.933 1.000 0.720 0.035   NA
 598800 598801 BT9727_3531 BT9727_3532     TRUE 0.862 -7.000 0.438 1.000   NA
 598801 598802 BT9727_3532 BT9727_3533     FALSE 0.310 109.000 0.042 1.000   NA
 598802 598803 BT9727_3533 BT9727_3534     FALSE 0.408 90.000 0.100 1.000   NA
 598803 598804 BT9727_3534 BT9727_3535   ftsK FALSE 0.022 539.000 0.115 1.000 N NA
 598804 598805 BT9727_3535 BT9727_3536 ftsK   FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   NA
 598805 598806 BT9727_3536 BT9727_3537   tepA FALSE 0.523 -3.000 0.057 NA   NA
 598806 598807 BT9727_3537 BT9727_3538 tepA   FALSE 0.449 104.000 0.257 1.000   NA
 598809 598810 BT9727_3540 BT9727_3541 dapA dapG TRUE 0.940 12.000 0.085 1.000 Y NA
 598810 598811 BT9727_3541 BT9727_3542 dapG asd TRUE 0.942 24.000 0.065 1.000 Y NA
 598811 598812 BT9727_3542 BT9727_3543 asd dapB FALSE 0.194 148.000 0.025 1.000   NA
 598812 598813 BT9727_3543 BT9727_3544 dapB dapA TRUE 0.936 -3.000 0.450 0.001   NA
 598813 598814 BT9727_3544 BT9727_3545 dapA   FALSE 0.040 275.000 0.292 NA   NA
 598814 598815 BT9727_3545 BT9727_3546     FALSE 0.202 127.000 0.104 NA   NA
 598815 598816 BT9727_3546 BT9727_3547     FALSE 0.424 87.000 0.127 1.000   NA
 598816 598817 BT9727_3547 BT9727_3548   pnpA FALSE 0.410 152.000 0.048 1.000 N NA
 598817 598818 BT9727_3548 BT9727_3549 pnpA rpsO TRUE 0.753 161.000 0.335 1.000 Y NA
 598818 598819 BT9727_3549 BT9727_3550 rpsO ribC TRUE 0.614 101.000 0.119 1.000 N NA
 598819 598820 BT9727_3550 BT9727_3551 ribC truB TRUE 0.827 44.000 0.308 1.000 N NA
 598820 598821 BT9727_3551 BT9727_3552 truB rbfA TRUE 0.869 87.000 0.111 1.000 Y NA
 598821 598822 BT9727_3552 BT9727_3553 rbfA   FALSE 0.498 16.000 0.113 NA   NA
 598822 598823 BT9727_3553 BT9727_3554   infB FALSE 0.585 -3.000 0.102 NA   NA
 598823 598824 BT9727_3554 BT9727_3555 infB   TRUE 0.942 5.000 0.223 NA Y NA
 598824 598825 BT9727_3555 BT9727_3556     TRUE 0.870 1.000 0.408 NA N NA
 598825 598826 BT9727_3556 BT9727_3557   nusA TRUE 0.951 3.000 0.323 NA Y NA
 598826 598827 BT9727_3557 BT9727_3558 nusA   TRUE 0.837 18.000 0.759 NA   NA
 598827 598828 BT9727_3558 BT9727_3559   polC FALSE 0.010 333.000 0.059 NA   NA
 598828 598829 BT9727_3559 BT9727_3560 polC proS TRUE 0.694 125.000 0.070 0.035 N NA
 598829 598830 BT9727_3560 BT9727_3561 proS   FALSE 0.582 110.000 0.095 1.000 N NA
 598830 598831 BT9727_3561 BT9727_3562   dxr TRUE 0.898 11.000 0.568 1.000 N NA
 598831 598832 BT9727_3562 BT9727_3563 dxr cdsA TRUE 0.943 24.000 0.071 1.000 Y NA
 598832 598833 BT9727_3563 BT9727_3564 cdsA uppS TRUE 0.946 18.000 0.113 1.000 Y NA
 598833 598834 BT9727_3564 BT9727_3565 uppS frr TRUE 0.742 86.000 0.409 1.000 N NA
 598834 598835 BT9727_3565 BT9727_3566 frr smbA TRUE 0.917 3.000 0.626 1.000 N NA
 598835 598836 BT9727_3566 BT9727_3567 smbA tsf TRUE 0.795 67.000 0.416 1.000 N NA
 598836 598837 BT9727_3567 BT9727_3568 tsf rpsB TRUE 0.918 104.000 0.748 1.000 Y NA
 598837 598838 BT9727_3568 BT9727_3569 rpsB codY FALSE 0.038 352.000 0.006 1.000 N NA
 598838 598839 BT9727_3569 BT9727_3570 codY hslU TRUE 0.666 78.000 0.131 1.000 N NA
 598839 598840 BT9727_3570 BT9727_3571 hslU hslV TRUE 0.973 23.000 0.752 1.000 Y NA
 598840 598841 BT9727_3571 BT9727_3572 hslV xerD TRUE 0.782 43.000 0.113 1.000 N NA
 598841 598842 BT9727_3572 BT9727_3573 xerD gidA TRUE 0.712 66.000 0.105 1.000 N NA
 598842 598843 BT9727_3573 BT9727_3574 gidA topA TRUE 0.758 51.000 0.137 1.000 N NA
 598843 598844 BT9727_3574 BT9727_3575 topA smf TRUE 0.789 145.000 0.238 1.000 Y NA
 598844 598845 BT9727_3575 BT9727_3576 smf sucD TRUE 0.605 88.000 0.037 1.000 N NA
 598845 598846 BT9727_3576 BT9727_3577 sucD sucC TRUE 0.976 20.000 0.173 0.000 Y NA
 598846 598847 BT9727_3577 BT9727_3578 sucC rnhB FALSE 0.213 194.000 0.015 1.000 N NA
 598847 598848 BT9727_3578 BT9727_3579 rnhB   FALSE 0.559 52.000 0.148 1.000   NA
 598848 598849 BT9727_3579 BT9727_3580   sipS TRUE 0.810 21.000 0.049 0.060   NA
 598849 598850 BT9727_3580 BT9727_3581 sipS rplS FALSE 0.558 102.000 0.020 1.000 N NA
 598850 598851 BT9727_3581 BT9727_3582 rplS trmD TRUE 0.841 147.000 0.567 1.000 Y NA
 598851 598852 BT9727_3582 BT9727_3583 trmD rimM TRUE 0.975 0.000 0.672 1.000 Y NA
 598852 598853 BT9727_3583 BT9727_3584 rimM   FALSE 0.443 121.000 0.324 1.000   NA
 598853 598854 BT9727_3584 BT9727_3585   rpsP TRUE 0.758 15.000 0.385 1.000   NA
 598854 598855 BT9727_3585 BT9727_3586 rpsP ftsY TRUE 0.698 101.000 0.361 1.000 N NA
 598855 598856 BT9727_3586 BT9727_3587 ftsY   TRUE 0.642 13.000 0.151 1.000   NA
 598856 598857 BT9727_3587 BT9727_3588   ftsY FALSE 0.284 134.000 0.081 1.000   NA
 598857 598858 BT9727_3588 BT9727_3589 ftsY smc TRUE 0.909 16.000 0.165 0.008 N NA
 598858 598859 BT9727_3589 BT9727_3590 smc rncS FALSE 0.466 147.000 0.120 1.000 N NA
 598859 598860 BT9727_3590 BT9727_3591 rncS acpA TRUE 0.720 59.000 0.068 1.000 N NA
 598860 598861 BT9727_3591 BT9727_3592 acpA fabG TRUE 0.941 70.000 0.100 0.003 Y NA
 598861 598862 BT9727_3592 BT9727_3593 fabG fabD TRUE 0.976 0.000 0.149 0.003 Y NA
 598862 598863 BT9727_3593 BT9727_3594 fabD plsX TRUE 0.967 15.000 0.106 0.003 Y NA
 598863 598864 BT9727_3594 BT9727_3595 plsX   TRUE 0.795 -3.000 0.035 NA N NA
 598864 598865 BT9727_3595 BT9727_3596   recG TRUE 0.894 -70.000 0.225 NA N NA
 598865 598866 BT9727_3596 BT9727_3597 recG dhaK FALSE 0.017 365.000 0.074 1.000   NA
 598866 598867 BT9727_3597 BT9727_3598 dhaK   TRUE 0.783 23.000 0.567 NA   NA
 598869 598870 BT9727_3600 BT9727_3601   rpe FALSE 0.515 138.000 0.166 1.000 N NA
 598870 598871 BT9727_3601 BT9727_3602 rpe   TRUE 0.713 3.000 0.213 1.000   NA
 598871 598872 BT9727_3602 BT9727_3603     FALSE 0.051 269.000 0.196 1.000   NA
 598872 598873 BT9727_3603 BT9727_3604     TRUE 0.970 9.000 0.704 1.000 Y NA
 598873 598874 BT9727_3604 BT9727_3605     TRUE 0.659 5.000 0.105 1.000   NA
 598874 598875 BT9727_3605 BT9727_3606   sun TRUE 0.667 5.000 0.135 1.000   NA
 598875 598876 BT9727_3606 BT9727_3607 sun fmt TRUE 0.967 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 598876 598877 BT9727_3607 BT9727_3608 fmt def TRUE 0.965 24.000 0.031 0.014 Y NA
 598877 598878 BT9727_3608 BT9727_3609 def priA TRUE 0.786 12.000 0.029 1.000 N NA
 598878 598879 BT9727_3609 BT9727_3610 priA dfp TRUE 0.864 -3.000 0.099 1.000 N NA
 598879 598880 BT9727_3610 BT9727_3611 dfp rpoZ FALSE 0.354 173.000 0.192 1.000 N NA
 598880 598881 BT9727_3611 BT9727_3612 rpoZ gmk TRUE 0.900 3.000 0.471 1.000 N NA
 598881 598882 BT9727_3612 BT9727_3613 gmk   TRUE 0.660 -13.000 0.143 NA   NA
 598882 598883 BT9727_3613 BT9727_3614     FALSE 0.395 68.000 0.189 NA   NA
 598883 598884 BT9727_3614 BT9727_3615   pacL FALSE 0.325 101.000 0.037 1.000   NA
 598885 598886 BT9727_3616 BT9727_3617   pepQ FALSE 0.024 328.000 0.000 NA N NA
 598886 598887 BT9727_3617 BT9727_3618 pepQ   FALSE 0.170 85.000 0.016 NA   NA
 598888 598889 BT9727_3619 BT9727_3620     TRUE 0.784 16.000 0.600 NA   NA
 598890 598891 BT9727_3621 BT9727_3622     FALSE 0.109 168.000 0.100 NA   NA
 598891 598892 BT9727_3622 BT9727_3623     FALSE 0.335 23.000 0.013 NA   NA
 598893 598894 BT9727_3624 BT9727_3625 pyrE pyrF TRUE 0.959 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 598894 598895 BT9727_3625 BT9727_3626 pyrF pyrD TRUE 0.985 -15.000 0.154 0.001 Y NA
 598895 598896 BT9727_3626 BT9727_3627 pyrD pyrK TRUE 0.929 -3.000 0.592 1.000 N NA
 598896 598897 BT9727_3627 BT9727_3628 pyrK carB TRUE 0.868 -3.000 0.147 1.000 N NA
 598897 598898 BT9727_3628 BT9727_3629 carB carA TRUE 0.985 -15.000 0.117 0.000 Y NA
 598898 598899 BT9727_3629 BT9727_3630 carA pyrC TRUE 0.960 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 598899 598900 BT9727_3630 BT9727_3631 pyrC pyrB TRUE 0.979 -16.000 0.452 1.000 Y NA
 598900 598901 BT9727_3631 BT9727_3632 pyrB uraA TRUE 0.741 149.000 0.064 1.000 Y NA
 598901 598902 BT9727_3632 BT9727_3633 uraA upp TRUE 0.836 114.000 0.140 1.000 Y NA
 598902 598903 BT9727_3633 BT9727_3634 upp rluD FALSE 0.207 203.000 0.048 1.000 N NA
 598903 598904 BT9727_3634 BT9727_3635 rluD lspA TRUE 0.800 5.000 0.022 1.000 N NA
 598904 598905 BT9727_3635 BT9727_3636 lspA   FALSE 0.264 125.000 0.038 1.000   NA
 598905 598906 BT9727_3636 BT9727_3637   ileS FALSE 0.385 156.000 0.010 0.018   NA
 598906 598907 BT9727_3637 BT9727_3638 ileS divIVA FALSE 0.029 348.000 0.012 NA N NA
 598907 598908 BT9727_3638 BT9727_3639 divIVA   FALSE 0.580 90.000 0.579 NA   NA
 598908 598909 BT9727_3639 BT9727_3640     TRUE 0.645 16.000 0.138 1.000   NA
 598909 598910 BT9727_3640 BT9727_3641     FALSE 0.537 7.000 0.158 NA   NA
 598910 598911 BT9727_3641 BT9727_3642     FALSE 0.576 20.000 0.194 NA   NA
 598911 598912 BT9727_3642 BT9727_3643     FALSE 0.530 -3.000 0.061 NA   NA
 598912 598913 BT9727_3643 BT9727_3644     FALSE 0.159 118.000 0.039 NA   NA
 598913 598914 BT9727_3644 BT9727_3645   sigG FALSE 0.166 169.000 0.276 NA   NA
 598914 598915 BT9727_3645 BT9727_3646 sigG sigE TRUE 0.964 68.000 0.602 0.007 Y NA
 598915 598916 BT9727_3646 BT9727_3647 sigE spoIIGA TRUE 0.885 20.000 0.856 1.000   NA
 598916 598917 BT9727_3647 BT9727_3648 spoIIGA ftsZ FALSE 0.022 304.000 0.024 1.000   NA
 598917 598918 BT9727_3648 BT9727_3649 ftsZ ftsA TRUE 0.954 40.000 0.460 1.000 Y NA
 598918 598919 BT9727_3649 BT9727_3650 ftsA ftsQ FALSE 0.041 401.000 0.389 NA N NA
 598919 598920 BT9727_3650 BT9727_3651 ftsQ murB TRUE 0.823 99.000 0.070 NA Y NA
 598920 598921 BT9727_3651 BT9727_3652 murB murG TRUE 0.901 62.000 0.061 1.000 Y NA
 598921 598922 BT9727_3652 BT9727_3653 murG spoVE TRUE 0.597 106.000 0.120 1.000 N NA
 598922 598923 BT9727_3653 BT9727_3654 spoVE murD TRUE 0.794 91.000 0.067 0.003 N NA
 598923 598924 BT9727_3654 BT9727_3655 murD murY TRUE 0.985 1.000 0.647 0.005 Y NA
 598924 598925 BT9727_3655 BT9727_3656 murY murE TRUE 0.966 23.000 0.025 0.005 Y NA
 598925 598926 BT9727_3656 BT9727_3657 murE spoVD FALSE 0.503 209.000 0.181 1.000 Y NA
 598926 598927 BT9727_3657 BT9727_3658 spoVD   TRUE 0.934 82.000 0.096 0.001 Y NA
 598927 598928 BT9727_3658 BT9727_3659   ftsL TRUE 0.826 22.000 0.101 1.000 N NA
 598928 598929 BT9727_3659 BT9727_3660 ftsL mraW TRUE 0.808 16.000 0.077 1.000 N NA
 598929 598930 BT9727_3660 BT9727_3661 mraW   FALSE 0.004 370.000 0.003 NA   NA
 598930 598931 BT9727_3661 BT9727_3662   panE FALSE 0.239 80.000 0.053 NA   NA
 598933 598934 BT9727_3664 BT9727_3665   rpmF FALSE 0.214 130.000 0.007 1.000   NA
 598934 598935 BT9727_3665 BT9727_3666 rpmF   TRUE 0.682 62.000 0.599 NA   NA
 598937 598938 BT9727_3668 BT9727_3669 lon   TRUE 0.743 -7.000 0.095 1.000   NA
 598940 598941 BT9727_3671 BT9727_3672 coaD   TRUE 0.833 -3.000 0.009 1.000 N NA
 598943 598944 BT9727_3675 BT9727_3676     FALSE 0.480 115.000 0.500 NA   NA
 598944 598945 BT9727_3676 BT9727_3677     FALSE 0.209 117.000 0.078 NA   NA
 598945 598946 BT9727_3677 BT9727_3678     FALSE 0.285 77.000 0.078 NA   NA
 598946 598947 BT9727_3678 BT9727_3679     TRUE 0.843 12.000 0.852 NA   NA
 598947 598948 BT9727_3679 BT9727_3680     FALSE 0.246 146.000 0.276 NA   NA
 598950 598951 BT9727_3682 BT9727_3683   ctaG FALSE 0.003 227.000 0.000 NA   NA
 598951 598952 BT9727_3683 BT9727_3684 ctaG ctaF TRUE 0.645 86.000 0.707 NA   NA
 598952 598953 BT9727_3684 BT9727_3685 ctaF ctaE TRUE 0.988 4.000 0.950 0.002 Y NA
 598953 598954 BT9727_3685 BT9727_3686 ctaE ctaD TRUE 0.989 0.000 0.925 0.002 Y NA
 598954 598955 BT9727_3686 BT9727_3687 ctaD ctaC TRUE 0.984 34.000 0.755 0.001 Y NA
 598955 598956 BT9727_3687 BT9727_3688 ctaC ctaB TRUE 0.760 94.000 0.084 0.060 N NA
 598958 598959 BT9727_3690 BT9727_3691 pyc ftsW FALSE 0.037 324.000 0.000 1.000 N NA
 598959 598960 BT9727_3691 BT9727_3692 ftsW   FALSE 0.211 126.000 0.133 NA   NA
 598962 598963 BT9727_3694 BT9727_3695     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 598963 598964 BT9727_3695 BT9727_3696     FALSE 0.304 129.000 0.000 NA N NA
 598964 598965 BT9727_3696 BT9727_3697     FALSE 0.042 248.000 0.025 1.000   NA
 598967 598968 BT9727_3699 BT9727_3700     TRUE 0.719 16.000 0.429 NA   NA
 598968 598969 BT9727_3700 BT9727_3701   typA FALSE 0.087 157.000 0.032 NA   NA
 598971 598972 BT9727_3703 BT9727_3704 suhB   FALSE 0.453 89.000 0.342 NA   NA
 598975 598976 BT9727_3707 BT9727_3708 cad tgl FALSE 0.426 75.000 0.068 1.000   NA
 598977 598978 BT9727_3709 BT9727_3710     FALSE 0.001 326.000 0.000 NA   NA
 598980 598981 BT9727_3712 BT9727_3713 pdhD pdhC TRUE 0.976 6.000 0.948 1.000 Y NA
 598981 598982 BT9727_3713 BT9727_3714 pdhC pdhB TRUE 0.957 93.000 0.883 0.063 Y NA
 598982 598983 BT9727_3714 BT9727_3715 pdhB pdhA TRUE 0.983 4.000 0.484 0.001 Y NA
 598986 598987 BT9727_3718 BT9727_3719     TRUE 0.793 5.000 0.576 NA   NA
 598988 598989 BT9727_3720 BT9727_3721 ktrA cydB FALSE 0.316 84.000 0.163 NA   NA
 598989 598990 BT9727_3721 BT9727_3722 cydB   FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 598990 598991 BT9727_3722 BT9727_3723     TRUE 0.655 62.000 0.372 1.000   NA
 598991 598992 BT9727_3723 BT9727_3724     TRUE 0.690 72.000 0.121 1.000 N NA
 598992 598993 BT9727_3724 BT9727_3725     TRUE 0.790 143.000 0.214 1.000 Y NA
 598993 598994 BT9727_3725 BT9727_3726     FALSE 0.105 171.000 0.120 NA   NA
 598994 598995 BT9727_3726 BT9727_3727     FALSE 0.281 106.000 0.176 NA   NA
 598995 598996 BT9727_3727 BT9727_3728     FALSE 0.005 436.000 0.044 NA   NA
 598998 598999 BT9727_3730 BT9727_3731     FALSE 0.088 183.000 0.139 NA   NA
 598999 599000 BT9727_3731 BT9727_3732     FALSE 0.079 256.000 0.043 NA N NA
 599001 599002 BT9727_3733 BT9727_3734     TRUE 0.630 47.000 0.381 NA   NA
 599003 599004 BT9727_3735 BT9727_3736 ppk ppx TRUE 0.830 109.000 0.056 1.000 Y NA
 599006 599007 BT9727_3738 BT9727_3739     FALSE 0.000 655.000 0.000 NA   NA
 599010 599011 BT9727_3742 BT9727_3743     TRUE 0.711 92.000 0.500 NA N NA
 599011 599012 BT9727_3743 BT9727_3744   metE FALSE 0.006 927.000 0.000 NA N NA
 599013 599014 BT9727_3745 BT9727_3746 comJ comI TRUE 0.731 37.000 0.500 NA   NA
 599017 599018 BT9727_3749 BT9727_3750     FALSE 0.244 123.000 0.184 NA   NA
 599019 599020 BT9727_3751 BT9727_3752 malR malD FALSE 0.056 281.000 0.000 1.000 N NA
 599020 599021 BT9727_3752 BT9727_3753 malD malC TRUE 0.987 1.000 0.885 0.035 Y NA
 599021 599022 BT9727_3753 BT9727_3754 malC   TRUE 0.952 66.000 0.815 1.000 Y NA
 599026 599027 BT9727_3758 BT9727_3759     FALSE 0.001 341.000 0.000 NA   NA
 599029 599030 BT9727_3761 BT9727_3762     FALSE 0.481 36.000 0.125 NA   NA
 599031 599032 BT9727_3763 BT9727_3764     FALSE 0.376 11.000 0.031 NA   NA
 599033 599034 BT9727_3765 BT9727_3766 thl   FALSE 0.511 140.000 0.171 1.000 N NA
 599034 599035 BT9727_3766 BT9727_3767     FALSE 0.557 73.000 0.429 NA   NA
 599037 599038 BT9727_3769 BT9727_3770     TRUE 0.714 52.000 0.600 NA   NA
 599038 599039 BT9727_3770 BT9727_3771     TRUE 0.677 14.000 0.375 NA   NA
 599039 599040 BT9727_3771 BT9727_3772     TRUE 0.607 0.000 0.185 NA   NA
 599042 599043 BT9727_3774 BT9727_3775   mtnK TRUE 0.717 -3.000 0.104 1.000   NA
 599043 599044 BT9727_3775 BT9727_3776 mtnK   FALSE 0.010 306.000 0.000 1.000   NA
 599045 599046 BT9727_3777 BT9727_3778   rbcL FALSE 0.132 237.000 0.043 1.000 N NA
 599046 599047 BT9727_3778 BT9727_3779 rbcL   TRUE 0.955 -3.000 0.304 0.000 N NA
 599047 599048 BT9727_3779 BT9727_3780     TRUE 0.885 -3.000 0.253 1.000 N NA
 599048 599049 BT9727_3780 BT9727_3781     TRUE 0.773 -22.000 0.087 1.000   NA
 599049 599050 BT9727_3781 BT9727_3782     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 599051 599052 BT9727_3783 BT9727_3784     FALSE 0.477 2.000 0.058 NA   NA
 599052 599053 BT9727_3784 BT9727_3785     FALSE 0.019 426.000 0.000 1.000 N NA
 599054 599055 BT9727_3786 BT9727_3787     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 599055 599056 BT9727_3787 BT9727_3788     FALSE 0.302 188.000 0.800 NA   NA
 599057 599058 BT9727_3789 BT9727_3790 ptsI ptsH TRUE 0.975 0.000 0.132 0.006 Y NA
 599058 599059 BT9727_3790 BT9727_3791 ptsH ptsG TRUE 0.866 136.000 0.054 0.006 Y NA
 599059 599060 BT9727_3791 BT9727_3792 ptsG glcT FALSE 0.008 340.000 0.000 1.000   NA
 599062 599063 BT9727_3794 BT9727_3795   nagB TRUE 0.895 -70.000 0.044 1.000 N NA
 599063 599064 BT9727_3795 BT9727_3796 nagB nagA TRUE 0.976 5.000 0.194 0.000 Y NA
 599064 599065 BT9727_3796 BT9727_3797 nagA   FALSE 0.070 209.000 0.028 1.000   NA
 599065 599066 BT9727_3797 BT9727_3798     FALSE 0.169 79.000 0.012 NA   NA
 599066 599067 BT9727_3798 BT9727_3799     FALSE 0.337 159.000 0.570 NA   NA
 599069 599070 BT9727_3801 BT9727_3802 ribT ppiB FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000   NA
 599072 599073 BT9727_3804 BT9727_3805   spoVAF FALSE 0.399 115.000 0.219 1.000   NA
 599073 599074 BT9727_3805 BT9727_3806 spoVAF spoVAE TRUE 0.880 -13.000 0.650 NA   NA
 599074 599075 BT9727_3806 BT9727_3807 spoVAE spoVAE TRUE 0.719 6.000 0.400 NA   NA
 599075 599076 BT9727_3807 BT9727_3808 spoVAE spoVAD TRUE 0.854 4.000 0.808 NA   NA
 599076 599077 BT9727_3808 BT9727_3809 spoVAD spoVAC TRUE 0.782 14.000 0.615 NA   NA
 599077 599078 BT9727_3809 BT9727_3810 spoVAC spoVAB TRUE 0.595 15.000 0.260 NA   NA
 599078 599079 BT9727_3810 BT9727_3811 spoVAB spoVAA TRUE 0.906 -7.000 0.923 NA   NA
 599079 599080 BT9727_3811 BT9727_3812 spoVAA   FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 599080 599081 BT9727_3812 BT9727_3813   sigF FALSE 0.264 138.000 0.067 1.000   NA
 599081 599082 BT9727_3813 BT9727_3814 sigF spoIIAB TRUE 0.922 13.000 0.842 1.000 N NA
 599082 599083 BT9727_3814 BT9727_3815 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.987 1.000 0.669 0.001 Y NA
 599083 599084 BT9727_3815 BT9727_3816 spoIIAA dacF FALSE 0.393 171.000 0.276 1.000 N NA
 599085 599086 BT9727_3817 BT9727_3818     TRUE 0.906 -34.000 0.149 1.000 N NA
 599086 599087 BT9727_3818 BT9727_3819     TRUE 0.807 -10.000 0.400 NA   NA
 599087 599088 BT9727_3819 BT9727_3820     TRUE 0.658 13.000 0.333 NA   NA
 599089 599090 BT9727_3821 BT9727_3822     TRUE 0.638 103.000 0.800 NA   NA
 599091 599092 BT9727_3823 BT9727_3824     FALSE 0.152 135.000 0.058 NA   NA
 599093 599094 BT9727_3825 BT9727_3826 corA pdp TRUE 0.637 75.000 0.031 1.000 N NA
 599094 599095 BT9727_3826 BT9727_3827 pdp deoD TRUE 0.943 8.000 0.084 1.000 Y NA
 599095 599096 BT9727_3827 BT9727_3828 deoD deoB TRUE 0.901 13.000 0.609 1.000 N NA
 599096 599097 BT9727_3828 BT9727_3829 deoB   FALSE 0.000 406.000 0.000 NA   NA
 599097 599098 BT9727_3829 BT9727_3830   xerD FALSE 0.181 147.000 0.167 NA   NA
 599098 599099 BT9727_3830 BT9727_3831 xerD   TRUE 0.753 7.000 0.476 NA   NA
 599099 599100 BT9727_3831 BT9727_3832   fur FALSE 0.497 62.000 0.284 NA   NA
 599100 599101 BT9727_3832 BT9727_3833 fur spoIIM FALSE 0.405 107.000 0.341 NA   NA
 599102 599103 BT9727_3834 BT9727_3835     FALSE 0.308 128.000 0.000 NA N NA
 599103 599104 BT9727_3835 BT9727_3836     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 599107 599108 BT9727_3839 BT9727_3840     FALSE 0.404 129.000 0.444 NA   NA
 599108 599109 BT9727_3840 BT9727_3841     FALSE 0.537 70.000 0.381 NA   NA
 599112 599113 BT9727_3844 BT9727_3845     FALSE 0.270 132.000 0.059 1.000   NA
 599114 599115 BT9727_3846 BT9727_3847 rbsR   FALSE 0.364 100.000 0.068 1.000   NA
 599118 599119 BT9727_3849 BT9727_3851   ribD FALSE 0.000 646.000 0.000 NA   NA
 599119 599120 BT9727_3851 BT9727_3852 ribD ribE TRUE 0.979 -18.000 0.456 1.000 Y NA
 599120 599121 BT9727_3852 BT9727_3853 ribE ribA TRUE 0.934 13.000 0.040 1.000 Y NA
 599121 599122 BT9727_3853 BT9727_3854 ribA ribH TRUE 0.971 19.000 0.034 0.001 Y NA
 599123 599124 BT9727_3855 BT9727_3856   bioB FALSE 0.041 183.000 0.010 NA   NA
 599124 599125 BT9727_3856 BT9727_3857 bioB bioC TRUE 0.922 2.000 0.022 0.001 N NA
 599125 599126 BT9727_3857 BT9727_3858 bioC bioH TRUE 0.801 -34.000 0.163 1.000   NA
 599126 599127 BT9727_3858 BT9727_3859 bioH bioF TRUE 0.723 -3.000 0.128 1.000   NA
 599127 599128 BT9727_3859 BT9727_3860 bioF bioD TRUE 0.986 -34.000 0.107 0.001 Y NA
 599128 599129 BT9727_3860 BT9727_3861 bioD bioA TRUE 0.976 0.000 0.053 0.001 Y NA
 599129 599130 BT9727_3861 BT9727_3862 bioA   FALSE 0.111 123.000 0.012 NA   NA
 599133 599134 BT9727_3865 BT9727_3866     TRUE 0.778 73.000 0.421 1.000 N NA
 599135 599136 BT9727_3867 BT9727_3868     TRUE 0.695 59.000 0.600 NA   NA
 599136 599137 BT9727_3868 BT9727_3869     FALSE 0.000 551.000 0.000 NA   NA
 599137 599138 BT9727_3869 BT9727_3870     FALSE 0.095 -13.000 0.000 NA   NA
 599138 599139 BT9727_3870 BT9727_3871     FALSE 0.000 656.000 0.000 NA   NA
 599139 599140 BT9727_3871 BT9727_3872     FALSE 0.002 244.000 0.000 NA   NA
 599140 599141 BT9727_3872 BT9727_3873     FALSE 0.006 177.000 0.000 NA   NA
 599141 599142 BT9727_3873 BT9727_3874     FALSE 0.033 62.000 0.000 NA   NA
 599142 599143 BT9727_3874 BT9727_3875   argF FALSE 0.000 437.000 0.000 NA   NA
 599143 599144 BT9727_3875 BT9727_3876 argF argD TRUE 0.934 13.000 0.037 1.000 Y NA
 599144 599145 BT9727_3876 BT9727_3877 argD argB TRUE 0.967 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 599145 599146 BT9727_3877 BT9727_3878 argB argJ TRUE 0.944 69.000 0.067 0.001 Y NA
 599146 599147 BT9727_3878 BT9727_3879 argJ argC TRUE 0.977 8.000 0.303 0.001 Y NA
 599149 599150 BT9727_3881 BT9727_3882     TRUE 0.676 10.000 0.188 1.000   NA
 599152 599153 BT9727_3884 BT9727_3885 sdhA sdhB TRUE 0.980 19.000 0.353 0.000 Y NA
 599153 599154 BT9727_3885 BT9727_3886 sdhB   FALSE 0.302 80.000 0.118 NA   NA
 599154 599155 BT9727_3886 BT9727_3887     FALSE 0.001 349.000 0.000 NA   NA
 599159 599160 BT9727_3891 BT9727_3892 pepT rimI FALSE 0.509 128.000 0.062 1.000 N NA
 599160 599161 BT9727_3892 BT9727_3893 rimI   FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 599161 599162 BT9727_3893 BT9727_3894     FALSE 0.464 67.000 0.267 NA   NA
 599162 599163 BT9727_3894 BT9727_3895     TRUE 0.606 17.000 0.250 NA   NA
 599163 599164 BT9727_3895 BT9727_3896     FALSE 0.261 101.000 0.110 NA   NA
 599164 599165 BT9727_3896 BT9727_3897     TRUE 0.980 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 599165 599166 BT9727_3897 BT9727_3898     TRUE 0.961 37.000 0.154 0.044 Y NA
 599166 599167 BT9727_3898 BT9727_3899     FALSE 0.002 251.000 0.000 NA   NA
 599167 599168 BT9727_3899 BT9727_3900     FALSE 0.194 122.000 0.078 NA   NA
 599168 599169 BT9727_3900 BT9727_3901     FALSE 0.331 84.000 0.182 NA   NA
 599169 599170 BT9727_3901 BT9727_3902     FALSE 0.254 167.000 0.000 1.000 N NA
 599170 599171 BT9727_3902 BT9727_3903     FALSE 0.032 342.000 0.000 1.000 N NA
 599171 599172 BT9727_3903 BT9727_3904   bfmbAb TRUE 0.983 16.000 0.882 0.062 Y NA
 599172 599173 BT9727_3904 BT9727_3905 bfmbAb bfmbAa TRUE 0.982 14.000 0.897 0.062 Y NA
 599173 599174 BT9727_3905 BT9727_3906 bfmbAa bfmbC TRUE 0.958 28.000 0.414 1.000 Y NA
 599174 599175 BT9727_3906 BT9727_3907 bfmbC ackA TRUE 0.970 5.000 0.172 0.034 Y NA
 599175 599176 BT9727_3907 BT9727_3908 ackA dhlE TRUE 0.760 88.000 0.490 1.000 N NA
 599176 599177 BT9727_3908 BT9727_3909 dhlE ptb TRUE 0.872 35.000 0.431 1.000 N NA
 599177 599178 BT9727_3909 BT9727_3910 ptb   FALSE 0.316 196.000 0.333 1.000 N NA
 599180 599181 BT9727_3912 BT9727_3913 glpQ   FALSE 0.001 363.000 0.000 NA   NA
 599181 599182 BT9727_3913 BT9727_3914   spo0A FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 599182 599183 BT9727_3914 BT9727_3915 spo0A spoIVB FALSE 0.184 252.000 0.393 1.000 N NA
 599183 599184 BT9727_3915 BT9727_3916 spoIVB recN FALSE 0.548 119.000 0.079 1.000 N NA
 599184 599185 BT9727_3916 BT9727_3917 recN argR FALSE 0.096 268.000 0.056 1.000 N NA
 599185 599186 BT9727_3917 BT9727_3918 argR   FALSE 0.466 143.000 0.064 1.000 N NA
 599186 599187 BT9727_3918 BT9727_3919   dxs TRUE 0.845 4.000 0.189 1.000 N NA
 599187 599188 BT9727_3919 BT9727_3920 dxs ispA FALSE 0.204 302.000 0.024 1.000 Y NA
 599188 599189 BT9727_3920 BT9727_3921 ispA xseB TRUE 0.849 0.000 0.100 1.000 N NA
 599189 599190 BT9727_3921 BT9727_3922 xseB xseA TRUE 0.988 -10.000 0.412 0.000 Y NA
 599190 599191 BT9727_3922 BT9727_3923 xseA folD TRUE 0.804 27.000 0.058 1.000 N NA
 599191 599192 BT9727_3923 BT9727_3924 folD nusB TRUE 0.808 24.000 0.056 1.000 N NA
 599192 599193 BT9727_3924 BT9727_3925 nusB   FALSE 0.007 348.000 0.023 NA   NA
 599193 599194 BT9727_3925 BT9727_3926   accC TRUE 0.700 23.000 0.373 NA   NA
 599194 599195 BT9727_3926 BT9727_3927 accC accB TRUE 0.972 17.000 0.086 0.001 Y NA
 599195 599196 BT9727_3927 BT9727_3928 accB spoIIIAH FALSE 0.002 758.000 0.020 NA   NA
 599196 599197 BT9727_3928 BT9727_3929 spoIIIAH spoIIIAG TRUE 0.757 16.000 0.509 NA   NA
 599197 599198 BT9727_3929 BT9727_3930 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.911 -10.000 0.907 NA   NA
 599198 599199 BT9727_3930 BT9727_3931 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.848 13.000 0.918 NA   NA
 599199 599200 BT9727_3931 BT9727_3932 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.846 11.000 0.864 NA   NA
 599200 599201 BT9727_3932 BT9727_3933 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.646 111.000 0.895 NA   NA
 599201 599202 BT9727_3933 BT9727_3934 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.847 15.000 0.926 NA   NA
 599202 599203 BT9727_3934 BT9727_3935 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.857 -6.000 0.604 NA   NA
 599203 599204 BT9727_3935 BT9727_3936 spoIIIAA   FALSE 0.513 29.000 0.148 NA   NA
 599205 599206 BT9727_3937 BT9727_3938     TRUE 0.873 -19.000 0.583 NA   NA
 599207 599208 BT9727_3939 BT9727_3940 efp pepQ TRUE 0.833 22.000 0.160 1.000 N NA
 599208 599209 BT9727_3940 BT9727_3941 pepQ aroQ TRUE 0.949 5.000 0.168 1.000 Y NA
 599209 599210 BT9727_3941 BT9727_3942 aroQ   FALSE 0.315 53.000 0.044 NA   NA
 599211 599212 BT9727_3943 BT9727_3944     FALSE 0.309 80.000 0.140 NA   NA
 599213 599214 BT9727_3945 BT9727_3946     FALSE 0.519 51.000 0.064 1.000   NA
 599214 599215 BT9727_3946 BT9727_3948   splB FALSE 0.478 145.000 0.110 1.000 N NA
 599216 599217 BT9727_3947 BT9727_3949     FALSE 0.514 6.000 0.103 NA   NA
 599217 599218 BT9727_3949 BT9727_3950     TRUE 0.698 8.000 0.375 NA   NA
 599218 599219 BT9727_3950 BT9727_3951     FALSE 0.004 201.000 0.000 NA   NA
 599221 599222 BT9727_3953 BT9727_3954     FALSE 0.056 250.000 0.000 NA N NA
 599222 599223 BT9727_3954 BT9727_3955     TRUE 0.914 103.000 0.258 0.045 Y NA
 599223 599224 BT9727_3955 BT9727_3956     TRUE 0.729 72.000 0.258 1.000 N NA
 599224 599225 BT9727_3956 BT9727_3957     TRUE 0.984 2.000 0.727 0.059 Y NA
 599225 599226 BT9727_3957 BT9727_3958     TRUE 0.823 16.000 0.750 NA   NA
 599229 599230 BT9727_3961 BT9727_3962     TRUE 0.659 17.000 0.308 NA   NA
 599230 599231 BT9727_3962 BT9727_3963     FALSE 0.589 61.000 0.400 NA   NA
 599231 599232 BT9727_3963 BT9727_3964     TRUE 0.692 15.000 0.400 NA   NA
 599232 599233 BT9727_3964 BT9727_3965     TRUE 0.689 -19.000 0.167 NA   NA
 599233 599234 BT9727_3965 BT9727_3966     TRUE 0.867 4.000 0.292 1.000 N NA
 599234 599235 BT9727_3966 BT9727_3967     TRUE 0.594 117.000 0.778 NA   NA
 599235 599236 BT9727_3967 BT9727_3968     TRUE 0.834 38.000 0.889 NA   NA
 599236 599237 BT9727_3968 BT9727_3969     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 599237 599238 BT9727_3969 BT9727_3970     TRUE 0.984 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 599238 599239 BT9727_3970 BT9727_3971   gcvT TRUE 0.973 21.000 0.092 0.001 Y NA
 599240 599241 BT9727_3972 BT9727_3973     FALSE 0.095 -13.000 0.000 NA   NA
 599244 599245 BT9727_3976 BT9727_3977   aroK TRUE 0.658 39.000 0.375 NA   NA
 599245 599246 BT9727_3977 BT9727_3978 aroK   FALSE 0.439 121.000 0.318 1.000   NA
 599246 599247 BT9727_3978 BT9727_3979   comGG FALSE 0.499 128.000 0.636 NA   NA
 599247 599248 BT9727_3979 BT9727_3980 comGG comGF TRUE 0.799 -3.000 0.455 NA   NA
 599248 599249 BT9727_3980 BT9727_3981 comGF   TRUE 0.723 24.000 0.417 NA   NA
 599249 599250 BT9727_3981 BT9727_3982   comGD FALSE 0.542 2.000 0.109 NA   NA
 599250 599251 BT9727_3982 BT9727_3983 comGD comGC TRUE 0.734 -3.000 0.320 NA   NA
 599251 599252 BT9727_3983 BT9727_3984 comGC comGB TRUE 0.986 12.000 0.861 0.001 Y NA
 599252 599253 BT9727_3984 BT9727_3985 comGB comGA TRUE 0.980 -7.000 0.639 1.000 Y NA
 599254 599255 BT9727_3986 BT9727_3987     FALSE 0.406 126.000 0.432 NA   NA
 599255 599256 BT9727_3987 BT9727_3988     FALSE 0.183 108.000 0.045 NA   NA
 599259 599260 BT9727_3991 BT9727_3992     FALSE 0.520 35.000 0.175 NA   NA
 599260 599261 BT9727_3992 BT9727_3993     FALSE 0.305 96.000 0.175 NA   NA
 599261 599262 BT9727_3993 BT9727_3994   murG FALSE 0.146 96.000 0.010 NA   NA
 599262 599263 BT9727_3994 BT9727_3995 murG metH TRUE 0.794 19.000 0.013 1.000 N NA
 599263 599264 BT9727_3995 BT9727_3996 metH metE TRUE 0.979 -3.000 0.045 0.000 Y NA
 599265 599266 BT9727_3997 BT9727_3998 metC metC TRUE 0.988 -3.000 0.600 0.001 Y NA
 599266 599267 BT9727_3998 BT9727_3999 metC   TRUE 0.677 129.000 0.055 0.032 N NA
 599267 599268 BT9727_3999 BT9727_4000     FALSE 0.019 423.000 0.000 1.000 N NA
 599269 599270 BT9727_4001 BT9727_4003     FALSE 0.351 10.000 0.021 NA   NA
 599272 599273 BT9727_4004 BT9727_4005 glcK   TRUE 0.762 20.000 0.496 NA   NA
 599273 599274 BT9727_4005 BT9727_4006     FALSE 0.159 83.000 0.010 NA   NA
 599274 599275 BT9727_4006 BT9727_4007     FALSE 0.037 324.000 0.000 1.000 N NA
 599275 599276 BT9727_4007 BT9727_4008   phoU FALSE 0.016 376.000 0.000 NA N NA
 599276 599277 BT9727_4008 BT9727_4009 phoU pstB TRUE 0.642 164.000 0.118 NA Y NA
 599277 599278 BT9727_4009 BT9727_4010 pstB pstA TRUE 0.971 29.000 0.125 0.001 Y NA
 599278 599279 BT9727_4010 BT9727_4011 pstA pstC TRUE 0.984 2.000 0.485 0.001 Y NA
 599279 599280 BT9727_4011 BT9727_4012 pstC pstS TRUE 0.941 28.000 0.077 1.000 Y NA
 599280 599281 BT9727_4012 BT9727_4013 pstS pbpA FALSE 0.035 333.000 0.000 1.000 N NA
 599281 599282 BT9727_4013 BT9727_4014 pbpA   FALSE 0.376 110.000 0.157 1.000   NA
 599282 599283 BT9727_4014 BT9727_4015   sodA FALSE 0.364 116.000 0.157 1.000   NA
 599283 5459517 BT9727_4015 tRNA-Met-7 sodA   FALSE 0.003 219.000 0.000 NA   NA
 599285 599286 BT9727_4016 BT9727_4017     FALSE 0.383 72.000 0.195 NA   NA
 599286 599287 BT9727_4017 BT9727_4018   gcpE FALSE 0.080 156.000 0.022 NA   NA
 599288 599289 BT9727_4019 BT9727_4020   znuB TRUE 0.959 14.000 0.480 1.000 Y NA
 599289 599290 BT9727_4020 BT9727_4021 znuB   TRUE 0.978 0.000 0.389 0.081 Y NA
 599290 599291 BT9727_4021 BT9727_4022     FALSE 0.091 242.000 0.440 NA   NA
 599293 599294 BT9727_4024 BT9727_4025 nfo deaD FALSE 0.402 231.000 0.104 1.000 Y NA
 599295 599296 BT9727_4026 BT9727_4028 vrrA lytB FALSE 0.283 90.000 0.115 NA   NA
 599297 599298 BT9727_4029 BT9727_4030     TRUE 0.599 -3.000 0.138 NA   NA
 599298 599299 BT9727_4030 BT9727_4031   cccA FALSE 0.090 166.000 0.057 NA   NA
 599299 599300 BT9727_4031 BT9727_4032 cccA sigA FALSE 0.010 386.000 0.009 1.000   NA
 599300 599301 BT9727_4032 BT9727_4033 sigA dnaG TRUE 0.753 60.000 0.209 1.000 N NA
 599301 599302 BT9727_4033 BT9727_4034 dnaG   FALSE 0.002 854.000 0.011 NA   NA
 599302 599303 BT9727_4034 BT9727_4035   tlyC TRUE 0.790 30.000 0.621 NA   NA
 599303 599304 BT9727_4035 BT9727_4036 tlyC recO FALSE 0.274 108.000 0.013 1.000   NA
 599304 599305 BT9727_4036 BT9727_4037 recO era FALSE 0.020 354.000 0.108 1.000   NA
 599305 599306 BT9727_4037 BT9727_4038 era cdd TRUE 0.744 -7.000 0.098 1.000   NA
 599306 599307 BT9727_4038 BT9727_4039 cdd dgkA TRUE 0.634 100.000 0.179 1.000 N NA
 599307 599308 BT9727_4039 BT9727_4040 dgkA   TRUE 0.593 -3.000 0.123 NA   NA
 599308 599309 BT9727_4040 BT9727_4041     TRUE 0.633 -3.000 0.182 NA   NA
 599309 599310 BT9727_4041 BT9727_4042   phoH FALSE 0.131 194.000 0.172 1.000   NA
 599310 599311 BT9727_4042 BT9727_4043 phoH spoIV FALSE 0.530 4.000 0.114 NA   NA
 599311 599312 BT9727_4043 BT9727_4044 spoIV   FALSE 0.357 177.000 0.851 NA   NA
 599312 599313 BT9727_4044 BT9727_4045     FALSE 0.159 109.000 0.029 NA   NA
 599313 599314 BT9727_4045 BT9727_4046   rpsU TRUE 0.838 16.000 0.150 0.014   NA
 599314 599315 BT9727_4046 BT9727_4047 rpsU   FALSE 0.016 333.000 0.016 1.000   NA
 599315 599316 BT9727_4047 BT9727_4048     FALSE 0.541 7.000 0.163 NA   NA
 599316 599317 BT9727_4048 BT9727_4049   prmA FALSE 0.217 146.000 0.227 NA   NA
 599317 599318 BT9727_4049 BT9727_4050 prmA dnaJ TRUE 0.817 29.000 0.133 1.000 N NA
 599318 599319 BT9727_4050 BT9727_4051 dnaJ dnaK TRUE 0.693 205.000 0.196 0.001 Y NA
 599319 599320 BT9727_4051 BT9727_4052 dnaK grpE TRUE 0.972 27.000 0.224 0.004 Y NA
 599320 599321 BT9727_4052 BT9727_4053 grpE hrcA TRUE 0.633 115.000 0.286 1.000 N NA
 599321 599322 BT9727_4053 BT9727_4054 hrcA hemN FALSE 0.504 134.000 0.082 1.000 N NA
 599322 599323 BT9727_4054 BT9727_4055 hemN   TRUE 0.678 53.000 0.084 NA N NA
 599323 599324 BT9727_4055 BT9727_4056   lepA FALSE 0.368 132.000 0.007 NA N NA
 599324 599325 BT9727_4056 BT9727_4057 lepA   FALSE 0.023 211.000 0.008 NA   NA
 599325 599326 BT9727_4057 BT9727_4058   gpR TRUE 0.693 -3.000 0.265 NA   NA
 599328 599329 BT9727_4060 BT9727_4061   comEC FALSE 0.010 510.000 0.163 1.000   NA
 599329 599330 BT9727_4061 BT9727_4062 comEC comEB FALSE 0.584 15.000 0.055 1.000   NA
 599330 599331 BT9727_4062 BT9727_4064 comEB comEA TRUE 0.716 64.000 0.095 1.000 N NA
 599333 599334 BT9727_4065 BT9727_4066     FALSE 0.572 -3.000 0.085 NA   NA
 599334 599335 BT9727_4066 BT9727_4067     TRUE 0.605 -3.000 0.149 NA   NA
 599335 599336 BT9727_4067 BT9727_4068   nadD TRUE 0.969 -10.000 0.199 1.000 Y NA
 599336 599337 BT9727_4068 BT9727_4069 nadD   FALSE 0.451 132.000 0.150 NA N NA
 599337 599338 BT9727_4069 BT9727_4070   aroE TRUE 0.874 -66.000 0.089 NA N NA
 599338 599339 BT9727_4070 BT9727_4071 aroE   TRUE 0.751 16.000 0.336 1.000   NA
 599339 599340 BT9727_4071 BT9727_4072     TRUE 0.789 4.000 0.555 NA   NA
 599340 599341 BT9727_4072 BT9727_4073   psd FALSE 0.002 550.000 0.015 NA   NA
 599341 599342 BT9727_4073 BT9727_4074 psd sigK FALSE 0.051 291.000 0.000 1.000 N NA
 599345 599346 BT9727_4076 BT9727_4078     TRUE 0.890 135.000 0.333 0.037 Y NA
 599349 599350 BT9727_4081 BT9727_4082     FALSE 0.534 55.000 0.292 NA   NA
 599351 599352 BT9727_4083 BT9727_4084     TRUE 0.844 16.000 0.667 1.000   NA
 599353 599354 BT9727_4085 BT9727_4086     FALSE 0.002 264.000 0.000 NA   NA
 599354 599355 BT9727_4086 BT9727_4088     TRUE 0.722 19.000 0.400 NA   NA
 599358 599359 BT9727_4090 BT9727_4091 vpr pah FALSE 0.010 738.000 0.000 1.000 N NA
 599359 599360 BT9727_4091 BT9727_4092 pah dcoH TRUE 0.884 -19.000 0.044 1.000 N NA
 599361 599362 BT9727_4093 BT9727_4095     FALSE 0.464 22.000 0.064 NA   NA
 599364 599365 BT9727_4096 BT9727_4097 maoC   TRUE 0.699 112.000 0.438 0.061   NA
 599365 599366 BT9727_4097 BT9727_4098     TRUE 0.730 57.000 0.081 0.061   NA
 599366 599367 BT9727_4098 BT9727_4099     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 599367 599368 BT9727_4099 BT9727_4100   fhuC TRUE 0.791 -33.000 0.300 NA   NA
 599368 599369 BT9727_4100 BT9727_4101 fhuC fhuG TRUE 0.975 -13.000 0.360 1.000 Y NA
 599369 599370 BT9727_4101 BT9727_4102 fhuG fhuD TRUE 0.982 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 599370 599371 BT9727_4102 BT9727_4103 fhuD   FALSE 0.174 157.000 0.222 NA   NA
 599371 599372 BT9727_4103 BT9727_4104     TRUE 0.686 40.000 0.429 NA   NA
 599372 599373 BT9727_4104 BT9727_4105   metC FALSE 0.074 260.000 0.000 1.000 N NA
 599373 599374 BT9727_4105 BT9727_4106 metC cysM TRUE 0.984 4.000 0.690 0.012 Y NA
 599374 599375 BT9727_4106 BT9727_4107 cysM mtnA TRUE 0.621 83.000 0.048 1.000 N NA
 599375 599376 BT9727_4107 BT9727_4108 mtnA   TRUE 0.792 15.000 0.057 1.000 N NA
 599378 599379 BT9727_4110 BT9727_4111   pbp FALSE 0.231 117.000 0.119 NA   NA
 599379 599380 BT9727_4111 BT9727_4112 pbp greA TRUE 0.617 93.000 0.070 1.000 N NA
 599380 599381 BT9727_4112 BT9727_4113 greA udk FALSE 0.090 279.000 0.095 1.000 N NA
 599381 599382 BT9727_4113 BT9727_4114 udk   TRUE 0.826 18.000 0.100 1.000 N NA
 599382 599383 BT9727_4114 BT9727_4115     TRUE 0.972 19.000 0.156 0.003 Y NA
 599383 599384 BT9727_4115 BT9727_4116     TRUE 0.656 8.000 0.142 1.000   NA
 599384 599385 BT9727_4116 BT9727_4117   pabC FALSE 0.067 203.000 0.154 NA   NA
 599385 599386 BT9727_4117 BT9727_4118 pabC   FALSE 0.049 218.000 0.151 NA   NA
 599386 599387 BT9727_4118 BT9727_4119     TRUE 0.794 13.000 0.651 NA   NA
 599387 599388 BT9727_4119 BT9727_4120     TRUE 0.783 4.000 0.537 NA   NA
 599388 599389 BT9727_4120 BT9727_4121   alaS FALSE 0.309 77.000 0.110 NA   NA
 599393 599394 BT9727_4125 BT9727_4126   recD FALSE 0.201 128.000 0.107 NA   NA
 599394 599395 BT9727_4126 BT9727_4127 recD   FALSE 0.490 96.000 0.281 1.000   NA
 599395 599396 BT9727_4127 BT9727_4128   trmU FALSE 0.301 111.000 0.038 1.000   NA
 599396 599397 BT9727_4128 BT9727_4129 trmU   TRUE 0.814 17.000 0.072 1.000 N NA
 599397 599398 BT9727_4129 BT9727_4130     TRUE 0.770 36.000 0.201 NA N NA
 599399 599400 BT9727_4131 BT9727_4132   rsfA TRUE 0.825 38.000 0.106 0.006   NA
 599400 599401 BT9727_4132 BT9727_4133 rsfA   FALSE 0.001 291.000 0.000 NA   NA
 599402 599403 BT9727_4134 BT9727_4135   aspS FALSE 0.039 350.000 0.008 1.000 N NA
 599403 599404 BT9727_4135 BT9727_4136 aspS hisS TRUE 0.965 13.000 0.161 0.033 Y NA
 599404 599405 BT9727_4136 BT9727_4138 hisS   FALSE 0.001 355.000 0.000 NA   NA
 599405 599406 BT9727_4138 BT9727_4139   dtD FALSE 0.034 188.000 0.004 NA   NA
 599406 599407 BT9727_4139 BT9727_4140 dtD relA TRUE 0.837 18.000 0.177 1.000 N NA
 599407 599408 BT9727_4140 BT9727_4141 relA apt FALSE 0.191 210.000 0.068 1.000 N NA
 599408 599409 BT9727_4141 BT9727_4142 apt recJ TRUE 0.769 48.000 0.128 1.000 N NA
 599409 599410 BT9727_4142 BT9727_4143 recJ czcD FALSE 0.553 102.000 0.015 1.000 N NA
 599410 599411 BT9727_4143 BT9727_4144 czcD secDF FALSE 0.559 154.000 0.060 0.081 N NA
 599411 599412 BT9727_4144 BT9727_4145 secDF   FALSE 0.030 271.000 0.185 NA   NA
 599416 599417 BT9727_4149 BT9727_4150   tgt TRUE 0.825 28.000 0.325 NA N NA
 599417 599418 BT9727_4150 BT9727_4151 tgt queA TRUE 0.978 13.000 0.360 0.000 Y NA
 599418 599419 BT9727_4151 BT9727_4152 queA   FALSE 0.416 20.000 0.039 NA   NA
 599419 599420 BT9727_4152 BT9727_4153   ruvB FALSE 0.484 -3.000 0.040 NA   NA
 599420 599421 BT9727_4153 BT9727_4154 ruvB ruvA TRUE 0.987 -3.000 0.549 0.002 Y NA
 599423 599424 BT9727_4156 BT9727_4157 bofC   FALSE 0.214 121.000 0.107 NA   NA
 599424 599425 BT9727_4157 BT9727_4158   arsR FALSE 0.587 68.000 0.000 1.000 N NA
 599427 599428 BT9727_4160 BT9727_4161   safA FALSE 0.160 179.000 0.320 NA   NA
 599428 599429 BT9727_4161 BT9727_4162 safA nadA FALSE 0.006 375.000 0.000 1.000   NA
 599429 599430 BT9727_4162 BT9727_4163 nadA nadC TRUE 0.971 31.000 0.198 0.002 Y NA
 599430 599431 BT9727_4163 BT9727_4164 nadC nadB TRUE 0.968 20.000 0.014 0.002 Y NA
 599432 599433 BT9727_4165 BT9727_4166 nifS   TRUE 0.727 3.000 0.243 1.000   NA
 599433 599434 BT9727_4166 BT9727_4167     FALSE 0.388 82.000 0.057 1.000   NA
 599435 599436 BT9727_4168 BT9727_4169 pheA   FALSE 0.321 97.000 0.025 1.000   NA
 599436 599437 BT9727_4169 BT9727_4170     TRUE 0.897 50.000 0.889 0.081   NA
 599437 599438 BT9727_4170 BT9727_4171     TRUE 0.937 -25.000 0.889 1.000   NA
 599438 599439 BT9727_4171 BT9727_4172   yvcQ TRUE 0.833 94.000 0.471 0.080 N NA
 599439 599440 BT9727_4172 BT9727_4173 yvcQ   TRUE 0.983 -40.000 0.588 1.000 Y NA
 599440 599441 BT9727_4173 BT9727_4174   obG FALSE 0.198 140.000 0.008 1.000   NA
 599441 599442 BT9727_4174 BT9727_4175 obG spo0B FALSE 0.402 0.000 0.021 NA   NA
 599442 599443 BT9727_4175 BT9727_4176 spo0B rpmA FALSE 0.216 64.000 0.013 NA   NA
 599443 599444 BT9727_4176 BT9727_4177 rpmA   TRUE 0.942 4.000 0.203 NA Y NA
 599444 599445 BT9727_4177 BT9727_4178   rplU TRUE 0.922 12.000 0.036 NA Y NA
 599445 599446 BT9727_4178 BT9727_4179 rplU   TRUE 0.653 170.000 0.076 1.000 Y NA
 599446 599447 BT9727_4179 BT9727_4180   spoIVFB FALSE 0.544 68.000 0.229 1.000   NA
 599447 599448 BT9727_4180 BT9727_4181 spoIVFB spoIVFA TRUE 0.909 -7.000 0.219 0.007   NA
 599448 599449 BT9727_4181 BT9727_4182 spoIVFA minD FALSE 0.490 134.000 0.060 1.000 N NA
 599449 599450 BT9727_4182 BT9727_4183 minD minC TRUE 0.962 3.000 0.368 1.000 Y NA
 599450 599451 BT9727_4183 BT9727_4184 minC mreD TRUE 0.802 36.000 0.106 1.000 N NA
 599451 599452 BT9727_4184 BT9727_4185 mreD mreC TRUE 0.980 15.000 0.550 0.002 Y NA
 599452 599453 BT9727_4185 BT9727_4186 mreC mreB TRUE 0.895 42.000 0.689 1.000 N NA
 599453 599454 BT9727_4186 BT9727_4187 mreB radC FALSE 0.342 159.000 0.011 1.000 N NA
 599454 599455 BT9727_4187 BT9727_4188 radC maf TRUE 0.661 47.000 0.023 NA N NA
 599455 599456 BT9727_4188 BT9727_4189 maf   FALSE 0.024 222.000 0.020 NA   NA
 599456 599457 BT9727_4189 BT9727_4190   folC FALSE 0.125 166.000 0.159 NA   NA
 599457 599458 BT9727_4190 BT9727_4191 folC valS TRUE 0.735 94.000 0.041 0.080 N NA
 599458 599459 BT9727_4191 BT9727_4192 valS   FALSE 0.000 396.000 0.000 NA   NA
 599459 599460 BT9727_4192 BT9727_4193   spoVID TRUE 0.639 63.000 0.500 NA   NA
 599460 599461 BT9727_4193 BT9727_4194 spoVID hemL FALSE 0.457 110.000 0.288 1.000   NA
 599461 599462 BT9727_4194 BT9727_4195 hemL hemB TRUE 0.977 0.000 0.126 0.001 Y NA
 599462 599463 BT9727_4195 BT9727_4196 hemB hemD TRUE 0.972 21.000 0.061 0.001 Y NA
 599463 599464 BT9727_4196 BT9727_4197 hemD hemC TRUE 0.972 3.000 0.028 0.001 Y NA
 599464 599465 BT9727_4197 BT9727_4198 hemC hemX TRUE 0.792 16.000 0.040 1.000 N NA
 599465 599466 BT9727_4198 BT9727_4199 hemX hemA TRUE 0.910 18.000 0.613 1.000 N NA
 599467 599468 BT9727_4200 BT9727_4201 ohrR ohrA TRUE 0.889 3.000 0.400 1.000 N NA
 599469 599470 BT9727_4202 BT9727_4203   lonA TRUE 0.681 -3.000 0.055 1.000   NA
 599470 599471 BT9727_4203 BT9727_4204 lonA lonB TRUE 0.813 184.000 0.435 0.001 Y NA
 599471 599472 BT9727_4204 BT9727_4205 lonB clpX TRUE 0.910 104.000 0.042 0.002 Y NA
 599472 599473 BT9727_4205 BT9727_4206 clpX tig FALSE 0.446 265.000 0.033 0.002 Y NA
 599473 599474 BT9727_4206 BT9727_4207 tig   FALSE 0.018 310.000 0.011 1.000   NA
 599474 599475 BT9727_4207 BT9727_4208     FALSE 0.068 198.000 0.125 NA   NA
 599475 599476 BT9727_4208 BT9727_4209     FALSE 0.001 289.000 0.000 NA   NA
 599479 599480 BT9727_4212 BT9727_4214     FALSE 0.001 274.000 0.000 NA   NA
 599480 599481 BT9727_4214 BT9727_4215     FALSE 0.005 191.000 0.000 NA   NA
 5459518 599483 tRNA-Gly-7 BT9727_4216     FALSE 0.018 108.000 0.000 NA   NA
 599483 599484 BT9727_4216 BT9727_4217     TRUE 0.616 14.000 0.085 1.000   NA
 599484 599485 BT9727_4217 BT9727_4218   rph TRUE 0.863 3.000 0.262 1.000 N NA
 599485 599486 BT9727_4218 BT9727_4219 rph gerM FALSE 0.141 129.000 0.040 NA   NA
 599486 599487 BT9727_4219 BT9727_4220 gerM murI FALSE 0.122 131.000 0.026 NA   NA
 599487 599488 BT9727_4220 BT9727_4221 murI bctl FALSE 0.128 211.000 0.000 1.000 N NA
 599490 599491 BT9727_4223 BT9727_4224     FALSE 0.147 156.000 0.154 NA   NA
 599491 599492 BT9727_4224 BT9727_4225     FALSE 0.150 155.000 0.154 NA   NA
 599492 599493 BT9727_4225 BT9727_4226   gerE FALSE 0.088 174.000 0.075 NA   NA
 599493 599494 BT9727_4226 BT9727_4227 gerE yieG FALSE 0.382 166.000 0.175 1.000 N NA
 599494 599495 BT9727_4227 BT9727_4228 yieG   TRUE 0.677 40.000 0.000 0.081   NA
 599495 599496 BT9727_4228 BT9727_4229     FALSE 0.188 94.000 0.000 1.000   NA
 599496 599497 BT9727_4229 BT9727_4230     TRUE 0.984 -7.000 0.286 0.004 Y NA
 599497 599498 BT9727_4230 BT9727_4231   oppA TRUE 0.746 110.000 0.600 1.000 N NA
 599499 599500 BT9727_4232 BT9727_4233 oppC oppB TRUE 0.982 16.000 0.765 0.034 Y NA
 599500 599501 BT9727_4233 BT9727_4234 oppB oppD TRUE 0.946 15.000 0.245 1.000 Y NA
 599501 599502 BT9727_4234 BT9727_4235 oppD oppF TRUE 0.978 2.000 0.265 0.002 Y NA
 599502 599503 BT9727_4235 BT9727_4236 oppF   TRUE 0.741 70.000 0.294 0.080   NA
 599503 599504 BT9727_4236 BT9727_4237     TRUE 0.919 -3.000 0.412 0.016   NA
 599504 599505 BT9727_4237 BT9727_4238     TRUE 0.839 4.000 0.158 1.000 N NA
 599505 599506 BT9727_4238 BT9727_4239     FALSE 0.068 230.000 0.000 NA N NA
 599508 599509 BT9727_4241 BT9727_4242   aqpZ FALSE 0.117 143.000 0.035 NA   NA
 599510 599511 BT9727_4243 BT9727_4244     TRUE 0.709 118.000 0.700 NA N NA
 599511 599512 BT9727_4244 BT9727_4245     TRUE 0.868 3.000 0.889 NA   NA
 599514 599515 BT9727_4247 BT9727_4248 motB motA TRUE 0.971 -10.000 0.257 1.000 Y NA
 599517 599518 BT9727_4250 BT9727_4251   sdhB FALSE 0.249 93.000 0.072 NA   NA
 599518 599519 BT9727_4251 BT9727_4252 sdhB   TRUE 0.984 -7.000 0.231 0.001 Y NA
 599519 599520 BT9727_4252 BT9727_4253   sdhC TRUE 0.971 14.000 0.184 0.001 Y NA
 599522 599523 BT9727_4255 BT9727_4256 uvrC trxA FALSE 0.403 149.000 0.023 1.000 N NA
 599523 599524 BT9727_4256 BT9727_4257 trxA etfA TRUE 0.599 212.000 0.055 0.008 Y NA
 599524 599525 BT9727_4257 BT9727_4258 etfA etfB TRUE 0.972 37.000 0.373 0.008 Y NA
 599525 599526 BT9727_4258 BT9727_4259 etfB phaB TRUE 0.708 79.000 0.275 1.000 N NA
 599526 599527 BT9727_4259 BT9727_4260 phaB tetR TRUE 0.853 12.000 0.294 1.000 N NA
 599527 599528 BT9727_4260 BT9727_4261 tetR lcfA TRUE 0.696 107.000 0.406 1.000 N NA
 599528 599529 BT9727_4261 BT9727_4263 lcfA   FALSE 0.130 183.000 0.071 1.000   NA
 599530 599531 BT9727_4264 BT9727_4265 fhuD fhuB TRUE 0.962 8.000 0.448 1.000 Y NA
 599531 599532 BT9727_4265 BT9727_4266 fhuB   FALSE 0.206 114.000 0.069 NA   NA
 599533 599534 BT9727_4267 BT9727_4268     TRUE 0.717 27.000 0.417 NA   NA
 599534 599535 BT9727_4268 BT9727_4269     TRUE 0.687 38.000 0.417 NA   NA
 599535 599536 BT9727_4269 BT9727_4270     FALSE 0.095 189.000 0.200 NA   NA
 599536 599537 BT9727_4270 BT9727_4271   resE TRUE 0.813 126.000 0.680 0.080 N NA
 599537 599538 BT9727_4271 BT9727_4272 resE   TRUE 0.985 2.000 0.750 0.016 Y NA
 599540 599541 BT9727_4274 BT9727_4275     FALSE 0.325 90.000 0.020 1.000   NA
 599543 599544 BT9727_4277 BT9727_4278   fhuC TRUE 0.680 32.000 0.373 NA   NA
 599544 599545 BT9727_4278 BT9727_4279 fhuC fhuB TRUE 0.981 -10.000 0.657 1.000 Y NA
 599545 599546 BT9727_4279 BT9727_4280 fhuB   TRUE 0.974 28.000 0.877 1.000 Y NA
 599546 599547 BT9727_4280 BT9727_4281     TRUE 0.754 76.000 0.382 1.000 N NA
 599547 599548 BT9727_4281 BT9727_4282     TRUE 0.772 22.000 0.515 NA   NA
 599548 599549 BT9727_4282 BT9727_4283   brnQ FALSE 0.000 498.000 0.000 NA   NA
 599549 599550 BT9727_4283 BT9727_4284 brnQ   FALSE 0.015 478.000 0.000 1.000 N NA
 599550 599551 BT9727_4284 BT9727_4285     FALSE 0.208 196.000 0.015 1.000 N NA
 599551 599552 BT9727_4285 BT9727_4286     TRUE 0.947 20.000 0.114 1.000 Y NA
 599552 599553 BT9727_4286 BT9727_4287   cvpA FALSE 0.503 56.000 0.066 1.000   NA
 599553 599554 BT9727_4287 BT9727_4288 cvpA   FALSE 0.530 2.000 0.091 NA   NA
 599555 599556 BT9727_4289 BT9727_4290 rnh   FALSE 0.156 117.000 0.034 NA   NA
 599556 599557 BT9727_4290 BT9727_4291     TRUE 0.856 -3.000 0.667 NA   NA
 599558 599559 BT9727_4292 BT9727_4293 asnS pheT FALSE 0.094 499.000 0.000 0.080 Y NA
 599559 599560 BT9727_4293 BT9727_4294 pheT pheS TRUE 0.984 19.000 0.574 0.000 Y NA
 599560 599561 BT9727_4294 BT9727_4295 pheS spoU FALSE 0.172 321.000 0.006 1.000 Y NA
 599562 599563 BT9727_4296 BT9727_4297 sspI yqfF FALSE 0.141 162.000 0.175 NA   NA
 599563 599564 BT9727_4297 BT9727_4298 yqfF   FALSE 0.188 141.000 0.147 NA   NA
 599565 599566 BT9727_4299 BT9727_4300 emrB emrA TRUE 0.784 13.000 0.441 1.000   NA
 599568 599569 BT9727_4302 BT9727_4303 yhfE   FALSE 0.590 70.000 0.463 NA   NA
 599569 599570 BT9727_4303 BT9727_4304   rplT FALSE 0.000 471.000 0.000 NA   NA
 599570 599571 BT9727_4304 BT9727_4305 rplT rpmI TRUE 0.983 38.000 0.928 0.008 Y NA
 599571 599572 BT9727_4305 BT9727_4306 rpmI infC TRUE 0.970 22.000 0.652 1.000 Y NA
 599572 599573 BT9727_4306 BT9727_4307 infC thrS FALSE 0.160 311.000 0.000 1.000 Y NA
 599573 599574 BT9727_4307 BT9727_4308 thrS   FALSE 0.001 308.000 0.000 NA   NA
 599574 599575 BT9727_4308 BT9727_4309   dnaI FALSE 0.015 281.000 0.048 NA   NA
 599575 599576 BT9727_4309 BT9727_4310 dnaI dnaB TRUE 0.965 34.000 0.817 NA Y NA
 599576 599577 BT9727_4310 BT9727_4311 dnaB   FALSE 0.453 128.000 0.109 NA N NA
 599577 599578 BT9727_4311 BT9727_4312   speD FALSE 0.048 286.000 0.003 NA N NA
 599578 599579 BT9727_4312 BT9727_4313 speD gap FALSE 0.024 381.000 0.000 1.000 N NA
 599579 599580 BT9727_4313 BT9727_4314 gap coaE FALSE 0.534 110.000 0.020 1.000 N NA
 599580 599581 BT9727_4314 BT9727_4315 coaE ytaF FALSE 0.304 52.000 0.038 NA   NA
 599581 599582 BT9727_4315 BT9727_4316 ytaF mutM FALSE 0.260 73.000 0.050 NA   NA
 599582 599583 BT9727_4316 BT9727_4317 mutM polA TRUE 0.940 13.000 0.101 1.000 Y NA
 599583 599584 BT9727_4317 BT9727_4318 polA phoR FALSE 0.111 244.000 0.006 1.000 N NA
 599584 599585 BT9727_4318 BT9727_4319 phoR phoP TRUE 0.978 -7.000 0.159 0.061 Y NA
 599585 599586 BT9727_4319 BT9727_4320 phoP   FALSE 0.007 688.000 0.082 1.000   NA
 599586 599587 BT9727_4320 BT9727_4321   mdh FALSE 0.057 217.000 0.022 1.000   NA
 599587 599588 BT9727_4321 BT9727_4322 mdh citC TRUE 0.947 20.000 0.115 1.000 Y NA
 599588 599589 BT9727_4322 BT9727_4323 citC citZ TRUE 0.769 146.000 0.140 1.000 Y NA
 599589 599590 BT9727_4323 BT9727_4324 citZ   FALSE 0.005 421.000 0.039 NA   NA
 599592 599593 BT9727_4326 BT9727_4327 fxsA pykA FALSE 0.105 200.000 0.082 1.000   NA
 599593 599594 BT9727_4327 BT9727_4328 pykA pfk TRUE 0.960 54.000 0.261 0.003 Y NA
 599594 599595 BT9727_4328 BT9727_4329 pfk accA FALSE 0.495 129.000 0.047 1.000 N NA
 599595 599596 BT9727_4329 BT9727_4330 accA accD TRUE 0.985 -12.000 0.234 0.001 Y NA
 599596 599597 BT9727_4330 BT9727_4331 accD gntR FALSE 0.247 186.000 0.032 1.000 N NA
 599597 599598 BT9727_4331 BT9727_4332 gntR mdh TRUE 0.887 15.000 0.514 1.000 N NA
 599598 599599 BT9727_4332 BT9727_4333 mdh dnaE TRUE 0.605 104.000 0.127 1.000 N NA
 599600 599601 BT9727_4334 BT9727_4335     TRUE 0.806 -3.000 0.481 NA   NA
 599604 599605 BT9727_4338 BT9727_4339     TRUE 0.598 48.000 0.333 NA   NA
 599605 599606 BT9727_4339 BT9727_4340     FALSE 0.548 127.000 0.750 NA   NA
 599606 599607 BT9727_4340 BT9727_4341     FALSE 0.142 155.000 0.120 NA   NA
 599611 599612 BT9727_4345 BT9727_4346     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 599612 599613 BT9727_4346 BT9727_4347     FALSE 0.014 127.000 0.000 NA   NA
 599613 599614 BT9727_4347 BT9727_4348     TRUE 0.663 21.000 0.300 NA   NA
 599616 599617 BT9727_4350 BT9727_4351     TRUE 0.773 16.000 0.571 NA   NA
 599617 599618 BT9727_4351 BT9727_4352     TRUE 0.665 -19.000 0.125 NA   NA
 599618 599619 BT9727_4352 BT9727_4353     FALSE 0.211 124.000 0.120 NA   NA
 599619 599620 BT9727_4353 BT9727_4354     TRUE 0.656 3.000 0.280 NA   NA
 599620 599621 BT9727_4354 BT9727_4355     TRUE 0.758 -3.000 0.368 NA   NA
 599621 599622 BT9727_4355 BT9727_4356     FALSE 0.158 148.000 0.105 NA   NA
 599622 599623 BT9727_4356 BT9727_4357   ald FALSE 0.310 106.000 0.222 NA   NA
 599623 599624 BT9727_4357 BT9727_4358 ald fabG FALSE 0.124 214.000 0.000 1.000 N NA
 599627 599628 BT9727_4361 BT9727_4362     FALSE 0.430 96.000 0.333 NA   NA
 599629 599630 BT9727_4363 BT9727_4364 argH argG TRUE 0.965 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 599635 599636 BT9727_4369 BT9727_4370     FALSE 0.343 70.000 0.125 NA   NA
 599637 599638 BT9727_4371 BT9727_4372 ackA   FALSE 0.085 300.000 0.217 1.000 N NA
 599638 599639 BT9727_4372 BT9727_4373   tpx FALSE 0.249 194.000 0.089 1.000 N NA
 599639 599640 BT9727_4373 BT9727_4374 tpx ytfJ FALSE 0.106 135.000 0.018 NA   NA
 599640 599641 BT9727_4374 BT9727_4375 ytfJ ytfI TRUE 0.831 13.000 0.800 NA   NA
 599643 599644 BT9727_4377 BT9727_4378     FALSE 0.352 70.000 0.146 NA   NA
 599644 599645 BT9727_4378 BT9727_4379   acsA FALSE 0.273 103.000 0.156 NA   NA
 599645 599646 BT9727_4379 BT9727_4380 acsA sasP FALSE 0.142 183.000 0.111 1.000   NA
 599646 599647 BT9727_4380 BT9727_4381 sasP thiI FALSE 0.339 81.000 0.018 1.000   NA
 599647 599648 BT9727_4381 BT9727_4382 thiI   TRUE 0.872 7.000 0.349 1.000 N NA
 599648 599649 BT9727_4382 BT9727_4383   ezrA FALSE 0.377 169.000 0.201 1.000 N NA
 599649 599650 BT9727_4383 BT9727_4384 ezrA   FALSE 0.138 208.000 0.000 1.000 N NA
 599655 599656 BT9727_4389 BT9727_4390 rpsD   FALSE 0.001 289.000 0.000 NA   NA
 599657 599658 BT9727_4391 BT9727_4392 tyrS   FALSE 0.106 342.000 0.000 NA Y NA
 599658 599659 BT9727_4392 BT9727_4393     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 599659 599660 BT9727_4393 BT9727_4394   acsA FALSE 0.013 139.000 0.000 NA   NA
 599661 599662 BT9727_4395 BT9727_4396 acuA acuB TRUE 0.830 18.000 0.143 0.060   NA
 599662 599663 BT9727_4396 BT9727_4397 acuB acuC TRUE 0.859 -3.000 0.075 1.000 N NA
 599663 599664 BT9727_4397 BT9727_4398 acuC   FALSE 0.355 98.000 0.056 1.000   NA
 599665 599666 BT9727_4399 BT9727_4400     FALSE 0.233 119.000 0.150 NA   NA
 599666 599667 BT9727_4400 BT9727_4401     TRUE 0.983 -10.000 0.725 1.000 Y NA
 599668 599669 BT9727_4402 BT9727_4403     FALSE 0.234 80.000 0.049 NA   NA
 599669 599670 BT9727_4403 BT9727_4404   mscL FALSE 0.224 129.000 0.012 1.000   NA
 599672 599673 BT9727_4407 BT9727_4408     TRUE 0.697 82.000 0.857 NA   NA
 599673 599674 BT9727_4408 BT9727_4409     TRUE 0.862 -10.000 0.583 NA   NA
 599675 599676 BT9727_4410 BT9727_4411 ccpA   FALSE 0.000 592.000 0.000 NA   NA
 599676 599677 BT9727_4411 BT9727_4412   ytxJ FALSE 0.193 119.000 0.069 NA   NA
 599677 599678 BT9727_4412 BT9727_4413 ytxJ ytxG FALSE 0.563 -3.000 0.079 NA   NA
 599680 599681 BT9727_4415 BT9727_4416     FALSE 0.131 195.000 0.333 NA   NA
 599681 599682 BT9727_4416 BT9727_4417     FALSE 0.275 90.000 0.097 NA   NA
 599683 599684 BT9727_4418 BT9727_4419     TRUE 0.871 -3.000 0.750 NA   NA
 599685 599686 BT9727_4420 BT9727_4421 murC pncB FALSE 0.099 253.000 0.002 1.000 N NA
 599686 599687 BT9727_4421 BT9727_4422 pncB ftsK TRUE 0.720 62.000 0.084 1.000 N NA
 599687 599688 BT9727_4422 BT9727_4423 ftsK   FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 599688 599689 BT9727_4423 BT9727_4424     FALSE 0.010 312.000 0.034 NA   NA
 599689 599690 BT9727_4424 BT9727_4425   ytpQ TRUE 0.819 -3.000 0.511 NA   NA
 599690 599691 BT9727_4425 BT9727_4426 ytpQ trx FALSE 0.565 80.000 0.500 NA   NA
 599691 599692 BT9727_4426 BT9727_4427 trx   FALSE 0.246 84.000 0.062 NA   NA
 599692 599693 BT9727_4427 BT9727_4428     FALSE 0.034 241.000 0.084 NA   NA
 599695 599696 BT9727_4430 BT9727_4431     FALSE 0.479 70.000 0.117 1.000   NA
 599698 599699 BT9727_4433 BT9727_4434   amyX FALSE 0.115 230.000 0.078 NA N NA
 599699 599700 BT9727_4434 BT9727_4435 amyX   FALSE 0.496 138.000 0.086 1.000 N NA
 599700 599701 BT9727_4435 BT9727_4436     TRUE 0.607 104.000 0.138 1.000 N NA
 599703 599704 BT9727_4438 BT9727_4439     FALSE 0.580 42.000 0.082 1.000   NA
 599705 599706 BT9727_4440 BT9727_4441     FALSE 0.017 265.000 0.000 1.000   NA
 599707 599708 BT9727_4442 BT9727_4443 arsR yndB TRUE 0.753 1.000 0.413 NA   NA
 599710 599711 BT9727_4445 BT9727_4446   yusG TRUE 0.645 2.000 0.258 NA   NA
 599713 599714 BT9727_4448 BT9727_4449 gdh glcU TRUE 0.908 14.000 0.700 1.000 N NA
 599714 599715 BT9727_4449 BT9727_4450 glcU   TRUE 0.833 37.000 0.875 NA   NA
 599715 599716 BT9727_4450 BT9727_4451   moaD FALSE 0.156 94.000 0.014 NA   NA
 599716 599717 BT9727_4451 BT9727_4452 moaD moaE TRUE 0.982 3.000 0.501 0.003 Y NA
 599717 599718 BT9727_4452 BT9727_4453 moaE mobB TRUE 0.976 -3.000 0.040 0.003 Y NA
 599718 599719 BT9727_4453 BT9727_4454 mobB moeA TRUE 0.986 -30.000 0.200 0.003 Y NA
 599721 599722 BT9727_4456 BT9727_4457 moeB moaA TRUE 0.983 17.000 0.778 0.031 Y NA
 599722 599723 BT9727_4457 BT9727_4458 moaA bclA FALSE 0.228 168.000 0.250 1.000   NA
 599723 599724 BT9727_4458 BT9727_4459 bclA   FALSE 0.172 162.000 0.250 NA   NA
 599724 599725 BT9727_4459 BT9727_4460     TRUE 0.847 21.000 0.800 NA   NA
 599725 599726 BT9727_4460 BT9727_4461     FALSE 0.500 78.000 0.381 NA   NA
 599729 599730 BT9727_4464 BT9727_4465 gerHA gerHB TRUE 0.904 18.000 0.450 0.007   NA
 599730 599731 BT9727_4465 BT9727_4466 gerHB gerHC TRUE 0.965 -30.000 0.800 0.007   NA
 599731 599732 BT9727_4466 BT9727_4467 gerHC   TRUE 0.690 79.000 0.800 NA   NA
 599732 599733 BT9727_4467 BT9727_4468     FALSE 0.078 189.000 0.121 NA   NA
 599734 599735 BT9727_4471 BT9727_4472 vrrB leuS FALSE 0.002 257.000 0.000 NA   NA
 599735 599736 BT9727_4472 BT9727_4473 leuS   FALSE 0.016 472.000 0.000 1.000 N NA
 599736 599737 BT9727_4473 BT9727_4474   napA FALSE 0.217 328.000 0.000 0.057 Y NA
 599737 599738 BT9727_4474 BT9727_4475 napA trkA TRUE 0.976 4.000 0.875 1.000 Y NA
 599738 599739 BT9727_4475 BT9727_4476 trkA   TRUE 0.831 34.000 0.636 1.000   NA
 599739 599740 BT9727_4476 BT9727_4477     FALSE 0.007 351.000 0.000 1.000   NA
 599740 599741 BT9727_4477 BT9727_4478     TRUE 0.765 19.000 0.333 1.000   NA
 599741 599742 BT9727_4478 BT9727_4479     FALSE 0.001 339.000 0.000 NA   NA
 599742 599743 BT9727_4479 BT9727_4480     FALSE 0.001 302.000 0.000 NA   NA
 599744 599745 BT9727_4481 BT9727_4482   mraW TRUE 0.833 -3.000 0.408 1.000   NA
 599745 599746 BT9727_4482 BT9727_4483 mraW   FALSE 0.085 199.000 0.031 1.000   NA
 599746 599747 BT9727_4483 BT9727_4484     FALSE 0.586 19.000 0.208 NA   NA
 599747 599748 BT9727_4484 BT9727_4485     TRUE 0.605 25.000 0.250 NA   NA
 599748 599749 BT9727_4485 BT9727_4486     TRUE 0.751 -3.000 0.200 1.000   NA
 599750 599751 BT9727_4487 BT9727_4488     FALSE 0.551 -3.000 0.071 NA   NA
 599753 599754 BT9727_4490 BT9727_4491     TRUE 0.662 -64.000 0.080 NA   NA
 599754 599755 BT9727_4491 BT9727_4492     TRUE 0.673 26.000 0.333 NA   NA
 599756 599757 BT9727_4493 BT9727_4494   pgpB FALSE 0.202 144.000 0.019 1.000   NA
 599757 599758 BT9727_4494 BT9727_4495 pgpB   TRUE 0.857 13.000 0.333 1.000 N NA
 599759 599760 BT9727_4496 BT9727_4497 mobA mobB TRUE 0.977 -3.000 0.056 0.003 Y NA
 599760 599761 BT9727_4497 BT9727_4498 mobB   FALSE 0.009 158.000 0.000 NA   NA
 599764 599765 BT9727_4501 BT9727_4502 pckA   FALSE 0.001 282.000 0.000 NA   NA
 599768 599769 BT9727_4505 BT9727_4506     FALSE 0.001 298.000 0.000 NA   NA
 599770 599771 BT9727_4507 BT9727_4508     FALSE 0.330 25.000 0.013 NA   NA
 599772 599773 BT9727_4509 BT9727_4510     TRUE 0.985 -3.000 0.500 0.011 Y NA
 599775 599776 BT9727_4512 BT9727_4513     FALSE 0.004 203.000 0.000 NA   NA
 599776 599777 BT9727_4513 BT9727_4515     TRUE 0.922 -45.000 0.875 NA   NA
 599778 599779 BT9727_4514 BT9727_4516     TRUE 0.955 12.000 0.528 NA Y NA
 599779 599780 BT9727_4516 BT9727_4517     TRUE 0.984 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 599781 599782 BT9727_4518 BT9727_4519     FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 599784 599785 BT9727_4521 BT9727_4522     FALSE 0.239 109.000 0.101 NA   NA
 599785 599786 BT9727_4522 BT9727_4523     FALSE 0.419 85.000 0.292 NA   NA
 599791 599792 BT9727_4528 BT9727_4529 cydA cydB TRUE 0.991 -10.000 0.939 0.028 Y NA
 599793 599794 BT9727_4530 BT9727_4531     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 599794 599795 BT9727_4531 BT9727_4532     FALSE 0.002 261.000 0.000 NA   NA
 599795 599796 BT9727_4532 BT9727_4533     FALSE 0.454 102.000 0.400 NA   NA
 599797 599798 BT9727_4534 BT9727_4535     FALSE 0.134 187.000 0.300 NA   NA
 599799 599800 BT9727_4536 BT9727_4537     FALSE 0.366 98.000 0.263 NA   NA
 599800 599801 BT9727_4537 BT9727_4538     TRUE 0.645 13.000 0.316 NA   NA
 599801 599802 BT9727_4538 BT9727_4539     TRUE 0.656 22.000 0.294 NA   NA
 599802 599803 BT9727_4539 BT9727_4540   pspA TRUE 0.653 81.000 0.706 NA   NA
 599805 599806 BT9727_4542 BT9727_4543 feoB feoA TRUE 0.967 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 599808 599809 BT9727_4545 BT9727_4546     TRUE 0.981 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 599809 599810 BT9727_4546 BT9727_4547     TRUE 0.896 40.000 0.875 NA N NA
 599810 599811 BT9727_4547 BT9727_4548     TRUE 0.686 90.000 0.875 NA   NA
 599811 599812 BT9727_4548 BT9727_4549     FALSE 0.006 177.000 0.000 NA   NA
 599812 599813 BT9727_4549 BT9727_4550     FALSE 0.005 184.000 0.000 NA   NA
 599814 599815 BT9727_4551 BT9727_4552 hpt   FALSE 0.097 259.000 0.015 1.000 N NA
 599817 599818 BT9727_4554 BT9727_4555     FALSE 0.512 69.000 0.333 NA   NA
 599819 599820 BT9727_4556 BT9727_4557     TRUE 0.919 -13.000 0.750 1.000   NA
 599820 599821 BT9727_4557 BT9727_4558     FALSE 0.003 217.000 0.000 NA   NA
 599821 599822 BT9727_4558 BT9727_4559     TRUE 0.653 76.000 0.667 NA   NA
 599822 599823 BT9727_4559 BT9727_4560     FALSE 0.001 299.000 0.000 NA   NA
 599823 599824 BT9727_4560 BT9727_4561     TRUE 0.840 0.000 0.667 NA   NA
 599825 599826 BT9727_4562 BT9727_4563     FALSE 0.000 414.000 0.000 NA   NA
 599827 599828 BT9727_4564 BT9727_4565     TRUE 0.913 -13.000 0.700 1.000   NA
 599829 599830 BT9727_4566 BT9727_4567     FALSE 0.163 203.000 0.000 0.036   NA
 599830 599831 BT9727_4567 BT9727_4568     TRUE 0.974 3.000 0.727 1.000 Y NA
 599831 599832 BT9727_4568 BT9727_4569     TRUE 0.812 95.000 0.800 0.079   NA
 599832 599833 BT9727_4569 BT9727_4570     TRUE 0.826 75.000 0.700 0.079   NA
 599833 599834 BT9727_4570 BT9727_4571     TRUE 0.862 21.000 0.700 1.000   NA
 599834 599835 BT9727_4571 BT9727_4572     TRUE 0.892 -3.000 0.700 1.000   NA
 599836 599837 BT9727_4573 BT9727_4574   gntP FALSE 0.335 169.000 0.667 NA   NA
 599837 599838 BT9727_4574 BT9727_4575 gntP   FALSE 0.018 107.000 0.000 NA   NA
 599838 599839 BT9727_4575 BT9727_4576     FALSE 0.007 669.000 0.000 NA N NA
 599839 599840 BT9727_4576 BT9727_4577   kdgK TRUE 0.889 0.000 0.333 1.000 N NA
 599840 599841 BT9727_4577 BT9727_4578 kdgK   TRUE 0.734 -7.000 0.283 NA   NA
 599841 599842 BT9727_4578 BT9727_4579   selA TRUE 0.835 2.000 0.679 NA   NA
 599842 599843 BT9727_4579 BT9727_4580 selA   TRUE 0.925 -22.000 0.750 1.000   NA
 599843 599844 BT9727_4580 BT9727_4581   vanY FALSE 0.009 318.000 0.000 1.000   NA
 599844 599845 BT9727_4581 BT9727_4582 vanY vanS TRUE 0.827 83.000 0.778 1.000 N NA
 599845 599846 BT9727_4582 BT9727_4583 vanS vanR TRUE 0.990 -7.000 0.778 0.015 Y NA
 599846 599847 BT9727_4583 BT9727_4584 vanR   FALSE 0.124 256.000 0.143 1.000 N NA
 599847 599848 BT9727_4584 BT9727_4585   menE TRUE 0.820 1.000 0.029 1.000 N NA
 599848 599849 BT9727_4585 BT9727_4586 menE menB TRUE 0.856 73.000 0.193 0.001 N NA
 599849 599850 BT9727_4586 BT9727_4587 menB   FALSE 0.565 70.000 0.280 1.000   NA
 599850 599851 BT9727_4587 BT9727_4588   menD TRUE 0.817 -3.000 0.355 1.000   NA
 599851 599852 BT9727_4588 BT9727_4589 menD menF TRUE 0.960 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 599853 599854 BT9727_4590 BT9727_4591 menA   TRUE 0.629 110.000 0.250 1.000 N NA
 599856 599857 BT9727_4593 BT9727_4594     FALSE 0.057 165.000 0.010 NA   NA
 599858 599859 BT9727_4595 BT9727_4596 glgP glgA TRUE 0.957 19.000 0.314 1.000 Y NA
 599859 599860 BT9727_4596 BT9727_4597 glgA glgD TRUE 0.957 47.000 0.630 1.000 Y NA
 599860 599861 BT9727_4597 BT9727_4598 glgD glgC TRUE 0.976 19.000 0.210 0.000 Y NA
 599861 599862 BT9727_4598 BT9727_4599 glgC glgB TRUE 0.989 -52.000 0.296 0.001 Y NA
 599862 599863 BT9727_4599 BT9727_4600 glgB ldhP FALSE 0.009 991.000 0.000 1.000 N NA
 599863 599864 BT9727_4600 BT9727_4601 ldhP   FALSE 0.000 577.000 0.000 NA   NA
 599864 599865 BT9727_4601 BT9727_4602     FALSE 0.087 -7.000 0.000 NA   NA
 599865 5459519 BT9727_4602 tRNA-Glu-2     FALSE 0.002 265.000 0.000 NA   NA
 5459519 5459520 tRNA-Glu-2 tRNA-Ser-7     FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 5459520 5459521 tRNA-Ser-7 tRNA-Asn-2     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 5459521 5459522 tRNA-Asn-2 tRNA-Ile-1     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 5459522 5459523 tRNA-Ile-1 tRNA-Gly-1     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459523 5459524 tRNA-Gly-1 tRNA-Lys-3     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459524 5459525 tRNA-Lys-3 tRNA-Thr-2     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459525 5459526 tRNA-Thr-2 tRNA-Phe-3     FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 5459526 5459527 tRNA-Phe-3 tRNA-Asp-2     FALSE 0.055 10.000 0.000 NA   NA
 5459527 5459528 tRNA-Asp-2 tRNA-Met-5     FALSE 0.070 -1.000 0.000 NA   NA
 5459528 5459529 tRNA-Met-5 tRNA-Ser-4     FALSE 0.056 25.000 0.000 NA   NA
 5459529 5459530 tRNA-Ser-4 tRNA-Met-8     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 5459530 5459531 tRNA-Met-8 tRNA-Met-2     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459531 5459532 tRNA-Met-2 tRNA-Ala-4     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 5459532 5459533 tRNA-Ala-4 tRNA-Pro-1     FALSE 0.052 13.000 0.000 NA   NA
 5459533 5459534 tRNA-Pro-1 tRNA-Arg-4     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459534 5459535 tRNA-Arg-4 tRNA-Leu-4     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459535 5459536 tRNA-Leu-4 tRNA-Gly-5     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459536 5459537 tRNA-Gly-5 tRNA-Leu-3     FALSE 0.055 27.000 0.000 NA   NA
 5459537 5459538 tRNA-Leu-3 tRNA-His-2     FALSE 0.059 20.000 0.000 NA   NA
 5459538 5459539 tRNA-His-2 tRNA-Thr-4     FALSE 0.057 7.000 0.000 NA   NA
 5459539 5459540 tRNA-Thr-4 tRNA-Val-1     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459540 5459541 tRNA-Val-1 rRNA-5SrRNA_13     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 5459541 5459542 rRNA-5SrRNA_13 rRNA-23SrRNA_13     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459542 5459543 rRNA-23SrRNA_13 rRNA-16SrRNA_13     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 599891 599892 BT9727_4604 BT9727_4605 mgtC kch FALSE 0.447 96.000 0.212 1.000   NA
 599893 599894 BT9727_4606 BT9727_4607   pgi FALSE 0.167 102.000 0.027 NA   NA
 599894 599895 BT9727_4607 BT9727_4608 pgi   FALSE 0.464 -31.000 0.005 NA   NA
 599897 599898 BT9727_4610 BT9727_4611   aspC FALSE 0.108 254.000 0.033 1.000 N NA
 599898 599899 BT9727_4611 BT9727_4612 aspC   TRUE 0.949 -3.000 0.894 1.000 N NA
 599900 599901 BT9727_4613 BT9727_4614     FALSE 0.363 110.000 0.117 1.000   NA
 599904 599905 BT9727_4617 BT9727_4618 sodC   FALSE 0.369 69.000 0.163 NA   NA
 599910 599911 BT9727_4623 BT9727_4624   glyS FALSE 0.021 348.000 0.000 NA N NA
 599913 599914 BT9727_4626 BT9727_4627   bioY FALSE 0.563 51.000 0.308 NA   NA
 599914 599915 BT9727_4627 BT9727_4628 bioY   FALSE 0.013 136.000 0.000 NA   NA
 599915 599916 BT9727_4628 BT9727_4629     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 599917 599918 BT9727_4630 BT9727_4631 gtaB manB FALSE 0.550 109.000 0.037 1.000 N NA
 599920 599921 BT9727_4633 BT9727_4634 pepA   FALSE 0.258 147.000 0.111 1.000   NA
 599921 599922 BT9727_4634 BT9727_4635     FALSE 0.586 54.000 0.361 NA   NA
 599922 599923 BT9727_4635 BT9727_4636     TRUE 0.681 -3.000 0.250 NA   NA
 599928 599929 BT9727_4641 BT9727_4642     FALSE 0.067 176.000 0.043 NA   NA
 599932 599933 BT9727_4645 BT9727_4646     FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 599933 599934 BT9727_4646 BT9727_4647   dapF FALSE 0.378 3.000 0.020 NA   NA
 599934 599935 BT9727_4647 BT9727_4649 dapF   FALSE 0.014 245.000 0.002 NA   NA
 599936 599937 BT9727_4650 BT9727_4651     FALSE 0.280 78.000 0.075 NA   NA
 599937 599938 BT9727_4651 BT9727_4652     FALSE 0.340 55.000 0.062 NA   NA
 599938 599939 BT9727_4652 BT9727_4653     FALSE 0.581 -16.000 0.053 NA   NA
 599940 599941 BT9727_4654 BT9727_4655 phnA   FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 599941 599942 BT9727_4655 BT9727_4656     FALSE 0.001 331.000 0.000 NA   NA
 599942 599943 BT9727_4656 BT9727_4657     FALSE 0.465 99.000 0.400 NA   NA
 599943 599944 BT9727_4657 BT9727_4658     TRUE 0.680 -31.000 0.127 NA   NA
 599945 599946 BT9727_4659 BT9727_4660 nifU   FALSE 0.014 264.000 0.019 NA   NA
 599949 599950 BT9727_4663 BT9727_4664     FALSE 0.014 503.000 0.000 1.000 N NA
 599950 599951 BT9727_4664 BT9727_4665     TRUE 0.940 -19.000 0.500 1.000 N NA
 599953 599954 BT9727_4667 BT9727_4668     FALSE 0.179 116.000 0.052 NA   NA
 599954 599955 BT9727_4668 BT9727_4669     FALSE 0.563 110.000 0.059 1.000 N NA
 599955 599956 BT9727_4669 BT9727_4670     FALSE 0.302 72.000 0.074 NA   NA
 599957 599958 BT9727_4671 BT9727_4672 fbp   TRUE 0.714 18.000 0.394 NA   NA
 599958 599959 BT9727_4672 BT9727_4673     FALSE 0.002 242.000 0.000 NA   NA
 599959 599960 BT9727_4673 BT9727_4674     FALSE 0.156 192.000 0.250 1.000   NA
 599966 599967 BT9727_4680 BT9727_4681 gpmA ybaK FALSE 0.420 75.000 0.259 NA   NA
 599970 599971 BT9727_4684 BT9727_4685     FALSE 0.467 55.000 0.221 NA   NA
 599971 599972 BT9727_4685 BT9727_4686     FALSE 0.445 66.000 0.241 NA   NA
 599974 599975 BT9727_4688 BT9727_4689 sufB nifU TRUE 0.894 49.000 0.152 0.001 N NA
 599975 599976 BT9727_4689 BT9727_4690 nifU csd TRUE 0.911 -10.000 0.292 1.000 N NA
 599976 599977 BT9727_4690 BT9727_4691 csd sufB TRUE 0.923 0.000 0.606 1.000 N NA
 599977 599978 BT9727_4691 BT9727_4692 sufB sufC TRUE 0.942 16.000 0.139 1.000 Y NA
 599978 599979 BT9727_4692 BT9727_4693 sufC   FALSE 0.063 240.000 0.000 NA N NA
 599979 599980 BT9727_4693 BT9727_4694     TRUE 0.928 75.000 0.750 NA Y NA
 599980 599981 BT9727_4694 BT9727_4695     TRUE 0.931 24.000 0.074 NA Y NA
 599981 599982 BT9727_4695 BT9727_4696     TRUE 0.982 -13.000 0.642 1.000 Y NA
 599982 599983 BT9727_4696 BT9727_4697     FALSE 0.005 411.000 0.000 1.000   NA
 599983 599984 BT9727_4697 BT9727_4698     FALSE 0.229 155.000 0.131 1.000   NA
 599984 599985 BT9727_4698 BT9727_4699     TRUE 0.809 4.000 0.443 1.000   NA
 599985 599986 BT9727_4699 BT9727_4700   gcvH FALSE 0.026 429.000 0.043 1.000 N NA
 599986 599987 BT9727_4700 BT9727_4701 gcvH arsC TRUE 0.796 42.000 0.170 1.000 N NA
 599987 599988 BT9727_4701 BT9727_4702 arsC   FALSE 0.000 531.000 0.000 NA   NA
 599988 599989 BT9727_4702 BT9727_4703     FALSE 0.000 481.000 0.000 NA   NA
 599993 599994 BT9727_4707 BT9727_4708   ldhB TRUE 0.680 23.000 0.333 NA   NA
 599994 599995 BT9727_4708 BT9727_4709 ldhB   FALSE 0.092 -10.000 0.000 NA   NA
 599995 599996 BT9727_4709 BT9727_4710     TRUE 0.832 14.000 0.828 NA   NA
 599996 599997 BT9727_4710 BT9727_4711     FALSE 0.191 147.000 0.185 NA   NA
 599997 599998 BT9727_4711 BT9727_4712     FALSE 0.000 422.000 0.000 NA   NA
 599998 599999 BT9727_4712 BT9727_4713     TRUE 0.895 -3.000 1.000 NA   NA
 599999 600000 BT9727_4713 BT9727_4714     FALSE 0.141 181.000 0.286 NA   NA
 600000 600001 BT9727_4714 BT9727_4715     FALSE 0.269 99.000 0.118 NA   NA
 600001 600002 BT9727_4715 BT9727_4716     TRUE 0.749 4.000 0.289 1.000   NA
 600002 600003 BT9727_4716 BT9727_4717   acdA FALSE 0.298 139.000 0.156 1.000   NA
 600003 600004 BT9727_4717 BT9727_4718 acdA acaB FALSE 0.544 197.000 0.124 1.000 Y NA
 600004 600005 BT9727_4718 BT9727_4719 acaB fadB TRUE 0.968 22.000 0.588 1.000 Y NA
 600007 600008 BT9727_4721 BT9727_4722 putA   FALSE 0.001 310.000 0.000 NA   NA
 600008 600009 BT9727_4722 BT9727_4723     FALSE 0.278 49.000 0.021 NA   NA
 600009 600010 BT9727_4723 BT9727_4724   mcpA FALSE 0.198 78.000 0.024 NA   NA
 600012 600013 BT9727_4726 BT9727_4727     FALSE 0.003 521.000 0.000 1.000   NA
 600013 600014 BT9727_4727 BT9727_4728     TRUE 0.595 119.000 0.233 1.000 N NA
 600014 600015 BT9727_4728 BT9727_4730     FALSE 0.003 596.000 0.000 1.000   NA
 600015 600016 BT9727_4730 BT9727_4731   spoIIIJ FALSE 0.211 130.000 0.003 1.000   NA
 600016 600017 BT9727_4731 BT9727_4732 spoIIIJ   TRUE 0.850 29.000 0.889 NA   NA
 600020 600021 BT9727_4735 BT9727_4736     FALSE 0.111 -64.000 0.000 NA   NA
 600022 600023 BT9727_4737 BT9727_4738 cylI   TRUE 0.689 13.000 0.389 NA   NA
 600023 600024 BT9727_4738 BT9727_4739     TRUE 0.662 -13.000 0.149 NA   NA
 600027 600028 BT9727_4742 BT9727_4743     TRUE 0.817 31.000 0.727 NA   NA
 600028 600029 BT9727_4743 BT9727_4744     FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 600029 600030 BT9727_4744 BT9727_4745   resE TRUE 0.982 -22.000 0.571 1.000 Y NA
 600030 600031 BT9727_4745 BT9727_4746 resE   TRUE 0.633 140.000 0.500 0.078   NA
 600033 600034 BT9727_4748 BT9727_4749     FALSE 0.005 414.000 0.000 1.000   NA
 600034 600035 BT9727_4749 BT9727_4750     FALSE 0.507 226.000 0.000 0.004 Y NA
 600035 600036 BT9727_4750 BT9727_4751     FALSE 0.361 118.000 0.167 1.000   NA
 600037 600038 BT9727_4752 BT9727_4753 nprB pirA FALSE 0.221 142.000 0.214 NA   NA
 600038 600039 BT9727_4753 BT9727_4754 pirA   FALSE 0.536 52.000 0.286 NA   NA
 600039 600040 BT9727_4754 BT9727_4755     FALSE 0.402 113.000 0.364 NA   NA
 600040 600041 BT9727_4755 BT9727_4756     FALSE 0.308 165.000 0.556 NA   NA
 600041 600042 BT9727_4756 BT9727_4757     TRUE 0.978 1.000 0.875 1.000 Y NA
 600043 600044 BT9727_4758 BT9727_4759     FALSE 0.125 213.000 0.000 1.000 N NA
 600044 600045 BT9727_4759 BT9727_4760     FALSE 0.000 607.000 0.000 NA   NA
 600046 600047 BT9727_4761 BT9727_4762     FALSE 0.145 119.000 0.031 NA   NA
 600048 600049 BT9727_4763 BT9727_4764     FALSE 0.280 54.000 0.029 NA   NA
 600050 600051 BT9727_4765 BT9727_4766   nupC FALSE 0.580 96.000 0.600 NA   NA
 600051 600052 BT9727_4766 BT9727_4767 nupC   FALSE 0.226 352.000 0.000 0.001 Y NA
 600052 600053 BT9727_4767 BT9727_4768     FALSE 0.097 297.000 0.000 0.078 N NA
 600055 600056 BT9727_4770 BT9727_4771     FALSE 0.000 572.000 0.000 NA   NA
 600056 600057 BT9727_4771 BT9727_4772     FALSE 0.018 108.000 0.000 NA   NA
 600057 600058 BT9727_4772 BT9727_4773     FALSE 0.387 17.000 0.000 1.000   NA
 600059 600060 BT9727_4774 BT9727_4775     FALSE 0.000 436.000 0.000 NA   NA
 600060 600061 BT9727_4775 BT9727_4776     TRUE 0.593 45.000 0.310 NA   NA
 600062 600063 BT9727_4777 BT9727_4778 tyrS murB FALSE 0.027 365.000 0.000 1.000 N NA
 600063 600064 BT9727_4778 BT9727_4779 murB   FALSE 0.004 457.000 0.000 1.000   NA
 600064 600065 BT9727_4779 BT9727_4780     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 600065 600066 BT9727_4780 BT9727_4781     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 600066 600067 BT9727_4781 BT9727_4782   mcpA FALSE 0.212 158.000 0.107 1.000   NA
 600067 600068 BT9727_4782 BT9727_4783 mcpA   FALSE 0.479 28.000 0.083 NA   NA
 600069 600070 BT9727_4784 BT9727_4785 crcB crcB TRUE 0.976 -3.000 0.229 0.077 Y NA
 600071 600072 BT9727_4786 BT9727_4787     TRUE 0.642 79.000 0.667 NA   NA
 600072 600073 BT9727_4787 BT9727_4788   speG FALSE 0.227 70.000 0.027 NA   NA
 600073 600074 BT9727_4788 BT9727_4789 speG phoH FALSE 0.218 144.000 0.034 1.000   NA
 600074 600075 BT9727_4789 BT9727_4790 phoH   TRUE 0.617 50.000 0.385 NA   NA
 600077 600078 BT9727_4792 BT9727_4793   fhuG TRUE 0.981 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 600078 600079 BT9727_4793 BT9727_4794 fhuG fhuG TRUE 0.989 -3.000 0.870 0.032 Y NA
 600079 600080 BT9727_4794 BT9727_4795 fhuG   TRUE 0.948 20.000 0.150 1.000 Y NA
 600080 600081 BT9727_4795 BT9727_4796     FALSE 0.031 348.000 0.000 1.000 N NA
 600081 600082 BT9727_4796 BT9727_4797     FALSE 0.003 561.000 0.000 1.000   NA
 600082 600083 BT9727_4797 BT9727_4798     TRUE 0.844 16.000 0.667 1.000   NA
 600083 600084 BT9727_4798 BT9727_4799     TRUE 0.820 46.000 1.000 NA   NA
 600084 600085 BT9727_4799 BT9727_4800     FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 600085 600086 BT9727_4800 BT9727_4801     TRUE 0.976 -16.000 0.000 0.015 Y NA
 600086 600087 BT9727_4801 BT9727_4802     TRUE 0.714 42.000 0.500 NA   NA
 600087 600088 BT9727_4802 BT9727_4803     TRUE 0.840 0.000 0.667 NA   NA
 600088 600089 BT9727_4803 BT9727_4804     FALSE 0.001 324.000 0.000 NA   NA
 600091 600092 BT9727_4806 BT9727_4807 smpB   FALSE 0.047 39.000 0.000 NA   NA
 600092 600093 BT9727_4807 BT9727_4808   vacB FALSE 0.020 100.000 0.000 NA   NA
 600093 600094 BT9727_4808 BT9727_4809 vacB est FALSE 0.244 143.000 0.060 1.000   NA
 600094 600095 BT9727_4809 BT9727_4810 est secG FALSE 0.164 159.000 0.032 1.000   NA
 600095 600096 BT9727_4810 BT9727_4811 secG lrgB FALSE 0.566 95.000 0.008 1.000 N NA
 600096 600097 BT9727_4811 BT9727_4812 lrgB   TRUE 0.905 -3.000 0.800 1.000   NA
 600099 600100 BT9727_4814 BT9727_4815 eno gpmI TRUE 0.941 31.000 0.136 1.000 Y NA
 600100 600101 BT9727_4815 BT9727_4816 gpmI tpiA TRUE 0.960 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 600101 600102 BT9727_4816 BT9727_4817 tpiA pgk TRUE 0.940 33.000 0.141 1.000 Y NA
 600102 600103 BT9727_4817 BT9727_4818 pgk gap TRUE 0.868 140.000 0.063 0.003 Y NA
 600103 600104 BT9727_4818 BT9727_4819 gap cggR TRUE 0.867 27.000 0.348 1.000 N NA
 600104 600105 BT9727_4819 BT9727_4820 cggR   FALSE 0.288 136.000 0.101 1.000   NA
 600105 600106 BT9727_4820 BT9727_4821   sigL TRUE 0.653 10.000 0.145 1.000   NA
 600106 5459544 BT9727_4821 tRNA-Arg-2 sigL   FALSE 0.002 256.000 0.000 NA   NA
 600108 600109 BT9727_4822 BT9727_4823     FALSE 0.049 37.000 0.000 NA   NA
 600109 600110 BT9727_4823 BT9727_4824   spoVAC TRUE 0.747 31.000 0.500 NA   NA
 600110 600111 BT9727_4824 BT9727_4825 spoVAC spoVAD TRUE 0.711 1.000 0.333 NA   NA
 600111 600112 BT9727_4825 BT9727_4826 spoVAD spoVAE FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 600112 600113 BT9727_4826 BT9727_4827 spoVAE   FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 600113 600114 BT9727_4827 BT9727_4828     TRUE 0.720 21.000 0.400 NA   NA
 600114 600115 BT9727_4828 BT9727_4829   clpP FALSE 0.002 242.000 0.000 NA   NA
 600116 600117 BT9727_4830 BT9727_4831 ptsH   FALSE 0.506 24.000 0.101 NA   NA
 600117 600118 BT9727_4831 BT9727_4832     FALSE 0.527 90.000 0.470 NA   NA
 600118 600119 BT9727_4832 BT9727_4833     TRUE 0.596 4.000 0.214 NA   NA
 600119 600120 BT9727_4833 BT9727_4834   mutT TRUE 0.629 21.000 0.263 NA   NA
 600120 600121 BT9727_4834 BT9727_4835 mutT   FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 600121 600122 BT9727_4835 BT9727_4836   trxB FALSE 0.101 163.000 0.067 NA   NA
 600122 600123 BT9727_4836 BT9727_4837 trxB   FALSE 0.480 76.000 0.183 1.000   NA
 600123 600124 BT9727_4837 BT9727_4838     FALSE 0.302 140.000 0.169 1.000   NA
 600124 600125 BT9727_4838 BT9727_4839     TRUE 0.789 24.000 0.417 1.000   NA
 600125 600126 BT9727_4839 BT9727_4840   lgt FALSE 0.511 68.000 0.169 1.000   NA
 600126 600127 BT9727_4840 BT9727_4841 lgt hprK TRUE 0.891 25.000 0.494 1.000 N NA
 600127 600128 BT9727_4841 BT9727_4842 hprK   FALSE 0.171 157.000 0.215 NA   NA
 600128 600129 BT9727_4842 BT9727_4843     FALSE 0.230 115.000 0.103 NA   NA
 600129 600130 BT9727_4843 BT9727_4844   uvrA FALSE 0.205 60.000 0.006 NA   NA
 600130 600131 BT9727_4844 BT9727_4845 uvrA uvrB TRUE 0.974 6.000 0.154 0.001 Y NA
 600131 600132 BT9727_4845 BT9727_4846 uvrB   FALSE 0.070 151.000 0.006 NA   NA
 600132 600133 BT9727_4846 BT9727_4847     FALSE 0.577 46.000 0.294 NA   NA
 600133 600134 BT9727_4847 BT9727_4848   mta TRUE 0.719 -3.000 0.294 NA   NA
 600134 600135 BT9727_4848 BT9727_4849 mta   FALSE 0.559 98.000 0.571 NA   NA
 600135 600136 BT9727_4849 BT9727_4850     TRUE 0.782 17.000 0.571 NA   NA
 600136 600137 BT9727_4850 BT9727_4851     TRUE 0.880 -3.000 0.800 NA   NA
 600137 600138 BT9727_4851 BT9727_4852     TRUE 0.801 19.000 0.600 NA   NA
 600138 600139 BT9727_4852 BT9727_4853     TRUE 0.687 12.000 0.375 NA   NA
 600139 600140 BT9727_4853 BT9727_4854     FALSE 0.012 375.000 0.023 1.000   NA
 600141 600142 BT9727_4855 BT9727_4856   merR2 TRUE 0.949 52.000 0.125 0.042 Y NA
 600142 600143 BT9727_4856 BT9727_4857 merR2   TRUE 0.785 5.000 0.389 1.000   NA
 600143 600144 BT9727_4857 BT9727_4858   vba FALSE 0.037 265.000 0.042 1.000   NA
 600145 600146 BT9727_4859 BT9727_4860     FALSE 0.331 65.000 0.075 NA   NA
 600146 600147 BT9727_4860 BT9727_4861     FALSE 0.009 314.000 0.000 1.000   NA
 600147 600148 BT9727_4861 BT9727_4862     TRUE 0.704 92.000 0.224 0.006   NA
 600148 600149 BT9727_4862 BT9727_4863   ftsX FALSE 0.507 119.000 0.021 1.000 N NA
 600149 600150 BT9727_4863 BT9727_4864 ftsX ftsE TRUE 0.977 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 600150 600151 BT9727_4864 BT9727_4865 ftsE cccB FALSE 0.053 287.000 0.000 1.000 N NA
 600151 600152 BT9727_4865 BT9727_4866 cccB   FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 600152 600153 BT9727_4866 BT9727_4867   prfB FALSE 0.341 0.000 0.002 NA   NA
 600153 600154 BT9727_4867 BT9727_4868 prfB secA FALSE 0.103 263.000 0.052 1.000 N NA
 600154 600155 BT9727_4868 BT9727_4869 secA   FALSE 0.059 277.000 0.041 NA N NA
 600155 600156 BT9727_4869 BT9727_4870   cspC FALSE 0.025 324.000 0.000 NA N NA
 600156 600157 BT9727_4870 BT9727_4871 cspC comFC FALSE 0.235 121.000 0.008 1.000   NA
 600157 600158 BT9727_4871 BT9727_4872 comFC comFA TRUE 0.698 0.000 0.130 1.000   NA
 600158 600159 BT9727_4872 BT9727_4873 comFA   FALSE 0.387 128.000 0.014 NA N NA
 600159 600160 BT9727_4873 BT9727_4874     FALSE 0.072 254.000 0.010 NA N NA
 600160 600161 BT9727_4874 BT9727_4875   degV FALSE 0.103 165.000 0.072 NA   NA
 600162 600163 BT9727_4876 BT9727_4877   lytR FALSE 0.233 75.000 0.039 NA   NA
 600164 600165 BT9727_4878 BT9727_4879   ugd TRUE 0.911 75.000 0.375 1.000 Y NA
 600166 600167 BT9727_4880 BT9727_4881   pdaA FALSE 0.273 201.000 0.263 1.000 N NA
 600167 600168 BT9727_4881 BT9727_4882 pdaA levR TRUE 0.707 105.000 0.421 1.000 N NA
 600171 600172 BT9727_4885 BT9727_4886   celF TRUE 0.842 49.000 0.350 0.010   NA
 600172 600173 BT9727_4886 BT9727_4887 celF celC TRUE 0.962 4.000 0.400 1.000 Y NA
 600173 600174 BT9727_4887 BT9727_4888 celC celB TRUE 0.830 183.000 0.615 0.004 Y NA
 600174 600175 BT9727_4888 BT9727_4889 celB licB TRUE 0.970 17.000 0.154 0.004 Y NA
 600176 600177 BT9727_4890 BT9727_4891 speE speD FALSE 0.578 28.000 0.039 1.000   NA
 600178 600179 BT9727_4892 BT9727_4893     TRUE 0.723 4.000 0.392 NA   NA
 600179 600180 BT9727_4893 BT9727_4894   celC FALSE 0.013 134.000 0.000 NA   NA
 600180 600181 BT9727_4894 BT9727_4895 celC celB TRUE 0.959 10.000 0.000 0.004 Y NA
 600181 600182 BT9727_4895 BT9727_4896 celB celA TRUE 0.982 15.000 0.700 0.004 Y NA
 600183 600184 BT9727_4897 BT9727_4898 gltT   FALSE 0.275 149.000 0.192 1.000   NA
 600184 600185 BT9727_4898 BT9727_4899   glxI TRUE 0.667 43.000 0.269 1.000   NA
 600188 600189 BT9727_4902 BT9727_4903     FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   NA
 600189 600190 BT9727_4903 BT9727_4904     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 600191 600192 BT9727_4905 BT9727_4906 cydA cydB TRUE 0.990 -7.000 0.880 0.027 Y NA
 600192 600193 BT9727_4906 BT9727_4907 cydB arsB FALSE 0.030 349.000 0.000 1.000 N NA
 600194 600195 BT9727_4908 BT9727_4909 thiC lldP FALSE 0.047 300.000 0.000 1.000 N NA
 600197 600198 BT9727_4911 BT9727_4912     FALSE 0.313 51.000 0.041 NA   NA
 600199 600200 BT9727_4913 BT9727_4914   dat FALSE 0.032 479.000 0.000 0.057 N NA
 600200 600201 BT9727_4914 BT9727_4915 dat   FALSE 0.128 211.000 0.000 1.000 N NA
 600201 600202 BT9727_4915 BT9727_4916     FALSE 0.032 343.000 0.000 1.000 N NA
 600202 600203 BT9727_4916 BT9727_4917     FALSE 0.020 252.000 0.000 1.000   NA
 600203 600204 BT9727_4917 BT9727_4918     FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 600206 600207 BT9727_4920 BT9727_4921     TRUE 0.710 80.000 0.889 NA   NA
 600208 600209 BT9727_4922 BT9727_4923     TRUE 0.812 14.000 0.727 NA   NA
 600209 600210 BT9727_4923 BT9727_4924     TRUE 0.835 6.000 0.750 NA   NA
 600211 600212 BT9727_4925 BT9727_4926     TRUE 0.881 -16.000 0.458 1.000   NA
 600214 600215 BT9727_4928 BT9727_4929     FALSE 0.580 56.000 0.361 NA   NA
 600218 600219 BT9727_4932 BT9727_4933 rpoD   FALSE 0.002 246.000 0.000 NA   NA
 600219 600220 BT9727_4933 BT9727_4934     TRUE 0.759 17.000 0.500 NA   NA
 600220 600221 BT9727_4934 BT9727_4935     FALSE 0.382 114.000 0.333 NA   NA
 600221 600222 BT9727_4935 BT9727_4936     TRUE 0.978 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 600222 600223 BT9727_4936 BT9727_4937     TRUE 0.921 -3.000 0.500 1.000 N NA
 600224 600225 BT9727_4938 BT9727_4939     TRUE 0.615 1.000 0.211 NA   NA
 600226 600227 BT9727_4940 BT9727_4941 glpT   TRUE 0.796 20.000 0.182 NA N NA
 600227 600228 BT9727_4941 BT9727_4942     TRUE 0.883 -3.000 0.818 NA   NA
 600228 600229 BT9727_4942 BT9727_4943   resE TRUE 0.668 67.000 0.600 NA   NA
 600229 600230 BT9727_4943 BT9727_4944 resE lcoR TRUE 0.966 12.000 0.600 1.000 Y NA
 600230 600231 BT9727_4944 BT9727_4945 lcoR galE TRUE 0.715 122.000 0.600 1.000 N NA
 600231 600232 BT9727_4945 BT9727_4946 galE   FALSE 0.456 90.000 0.208 1.000   NA
 600232 600233 BT9727_4946 BT9727_4947   lytR FALSE 0.271 99.000 0.125 NA   NA
 600233 600234 BT9727_4947 BT9727_4948 lytR cysE FALSE 0.401 94.000 0.000 NA N NA
 600234 600235 BT9727_4948 BT9727_4949 cysE   TRUE 0.720 32.000 0.000 1.000 N NA
 600235 600236 BT9727_4949 BT9727_4950     TRUE 0.943 3.000 0.022 1.000 Y NA
 600236 600237 BT9727_4950 BT9727_4951     FALSE 0.509 45.000 0.034 1.000   NA
 600237 600238 BT9727_4951 BT9727_4952     TRUE 0.616 34.000 0.286 NA   NA
 600238 600239 BT9727_4952 BT9727_4953     FALSE 0.325 32.000 0.016 NA   NA
 600239 600240 BT9727_4953 BT9727_4954     TRUE 0.675 -28.000 0.122 NA   NA
 600240 600241 BT9727_4954 BT9727_4955   epsE FALSE 0.363 51.000 0.067 NA   NA
 600241 600242 BT9727_4955 BT9727_4956 epsE gtaB TRUE 0.942 3.000 0.182 NA Y NA
 600242 600243 BT9727_4956 BT9727_4957 gtaB epsC FALSE 0.309 241.000 0.000 1.000 Y NA
 600243 600244 BT9727_4957 BT9727_4958 epsC   FALSE 0.576 104.000 0.054 1.000 N NA
 600244 600245 BT9727_4958 BT9727_4959   capA TRUE 0.949 -10.000 0.316 0.077 N NA
 600245 600246 BT9727_4959 BT9727_4960 capA   FALSE 0.119 274.000 0.000 0.077 N NA
 600246 600247 BT9727_4960 BT9727_4961   fabZ FALSE 0.028 362.000 0.000 1.000 N NA
 600247 600248 BT9727_4961 BT9727_4962 fabZ mbl FALSE 0.018 558.000 0.037 1.000 N NA
 600248 600249 BT9727_4962 BT9727_4963 mbl spoIIID FALSE 0.265 162.000 0.284 1.000   NA
 600249 600250 BT9727_4963 BT9727_4964 spoIIID spoIIQ FALSE 0.004 455.000 0.000 1.000   NA
 600250 600251 BT9727_4964 BT9727_4965 spoIIQ   FALSE 0.121 162.000 0.105 NA   NA
 600251 600252 BT9727_4965 BT9727_4966   bcrA TRUE 0.833 0.000 0.636 NA   NA
 600252 600253 BT9727_4966 BT9727_4967 bcrA   TRUE 0.831 181.000 0.667 0.020 Y NA
 600253 600254 BT9727_4967 BT9727_4968   spoIID FALSE 0.516 129.000 0.079 1.000 N NA
 600254 600255 BT9727_4968 BT9727_4969 spoIID murA FALSE 0.236 209.000 0.243 1.000 N NA
 600255 600256 BT9727_4969 BT9727_4970 murA   TRUE 0.638 40.000 0.346 NA   NA
 600256 600257 BT9727_4970 BT9727_4971     FALSE 0.514 46.000 0.228 NA   NA
 600257 600258 BT9727_4971 BT9727_4972   nuoN FALSE 0.036 214.000 0.047 NA   NA
 600258 600259 BT9727_4972 BT9727_4973 nuoN nuoM TRUE 0.976 2.000 0.128 0.001 Y NA
 600259 600260 BT9727_4973 BT9727_4974 nuoM nuoL TRUE 0.978 -3.000 0.041 0.001 Y NA
 600260 600261 BT9727_4974 BT9727_4975 nuoL nuoK TRUE 0.973 30.000 0.253 0.002 Y NA
 600261 600262 BT9727_4975 BT9727_4976 nuoK nuoJ TRUE 0.989 -7.000 0.506 0.001 Y NA
 600262 600263 BT9727_4976 BT9727_4977 nuoJ nuoI TRUE 0.981 -3.000 0.223 0.002 Y NA
 600263 600264 BT9727_4977 BT9727_4978 nuoI nuoH TRUE 0.968 26.000 0.035 0.002 Y NA
 600264 600265 BT9727_4978 BT9727_4979 nuoH nuoD TRUE 0.979 0.000 0.258 0.002 Y NA
 600265 600266 BT9727_4979 BT9727_4980 nuoD nuoC TRUE 0.974 5.000 0.182 0.002 Y NA
 600266 600267 BT9727_4980 BT9727_4981 nuoC nuoB TRUE 0.987 -3.000 0.524 0.001 Y NA
 600267 600268 BT9727_4981 BT9727_4982 nuoB nuoA TRUE 0.986 -30.000 0.091 0.001 Y NA
 600270 600271 BT9727_4984 BT9727_4985     TRUE 0.706 48.000 0.538 NA   NA
 600271 600272 BT9727_4985 BT9727_4986   atpC FALSE 0.209 133.000 0.006 1.000   NA
 600272 600273 BT9727_4986 BT9727_4987 atpC atpD TRUE 0.987 21.000 0.837 0.002 Y NA
 600273 600274 BT9727_4987 BT9727_4988 atpD atpG FALSE 0.389 364.000 0.724 0.002 Y NA
 600274 600275 BT9727_4988 BT9727_4989 atpG   FALSE 0.007 170.000 0.000 NA   NA
 600275 600276 BT9727_4989 BT9727_4990   atpA FALSE 0.294 10.000 0.003 NA   NA
 600276 600277 BT9727_4990 BT9727_4991 atpA atpH TRUE 0.985 12.000 0.864 0.002 Y NA
 600277 600278 BT9727_4991 BT9727_4992 atpH atpF TRUE 0.981 -3.000 0.222 0.002 Y NA
 600278 600279 BT9727_4992 BT9727_4993 atpF atpE TRUE 0.688 130.000 0.402 0.002   NA
 600279 600280 BT9727_4993 BT9727_4994 atpE atpB TRUE 0.798 57.000 0.189 0.003   NA
 600280 600281 BT9727_4994 BT9727_4995 atpB atpI TRUE 0.889 8.000 0.330 0.003   NA
 600281 600282 BT9727_4995 BT9727_4996 atpI   TRUE 0.636 -3.000 0.187 NA   NA
 600282 600283 BT9727_4996 BT9727_4997   upp FALSE 0.000 481.000 0.000 NA   NA
 600283 600284 BT9727_4997 BT9727_4998 upp glyA FALSE 0.089 273.000 0.051 1.000 N NA
 600284 600285 BT9727_4998 BT9727_4999 glyA   FALSE 0.089 214.000 0.145 1.000   NA
 600285 600286 BT9727_4999 BT9727_5000   rpi FALSE 0.543 67.000 0.218 1.000   NA
 600286 600287 BT9727_5000 BT9727_5001 rpi   TRUE 0.610 97.000 0.072 1.000 N NA
 600290 600291 BT9727_5004 BT9727_5005     FALSE 0.124 160.000 0.099 NA   NA
 600292 600293 BT9727_5006 BT9727_5007     TRUE 0.797 -58.000 0.300 NA   NA
 600293 600294 BT9727_5007 BT9727_5008     FALSE 0.003 224.000 0.000 NA   NA
 600294 600295 BT9727_5008 BT9727_5009   sua5 FALSE 0.381 78.000 0.230 NA   NA
 600295 600296 BT9727_5009 BT9727_5010 sua5   FALSE 0.515 109.000 0.133 NA N NA
 600296 600297 BT9727_5010 BT9727_5011   spoIIR FALSE 0.437 50.000 0.158 NA   NA
 600297 600298 BT9727_5011 BT9727_5012 spoIIR   FALSE 0.288 104.000 0.178 NA   NA
 600298 600299 BT9727_5012 BT9727_5013   prfA TRUE 0.972 0.000 0.084 0.031 Y NA
 600299 600300 BT9727_5013 BT9727_5014 prfA tdk FALSE 0.474 140.000 0.062 1.000 N NA
 600300 600301 BT9727_5014 BT9727_5015 tdk rpmE FALSE 0.543 109.000 0.028 1.000 N NA
 600301 600302 BT9727_5015 BT9727_5016 rpmE rho FALSE 0.016 703.000 0.049 1.000 N NA
 600302 600303 BT9727_5016 BT9727_5017 rho fbp FALSE 0.028 394.000 0.005 1.000 N NA
 600303 600304 BT9727_5017 BT9727_5018 fbp murA2 FALSE 0.579 118.000 0.170 1.000 N NA
 600304 600305 BT9727_5018 BT9727_5019 murA2   FALSE 0.035 332.000 0.000 1.000 N NA
 600305 600306 BT9727_5019 BT9727_5020   spo0F FALSE 0.097 211.000 0.170 1.000   NA
 600308 600309 BT9727_5022 BT9727_5023 ctrA rpoE FALSE 0.102 258.000 0.029 1.000 N NA
 600309 600310 BT9727_5023 BT9727_5024 rpoE   TRUE 0.718 155.000 0.068 1.000 Y NA
 600310 600311 BT9727_5024 BT9727_5025     TRUE 0.807 65.000 0.432 1.000 N NA
 600311 600312 BT9727_5025 BT9727_5026   mmgC TRUE 0.977 22.000 0.270 0.001 Y NA
 600312 600313 BT9727_5026 BT9727_5027 mmgC hbd TRUE 0.888 73.000 0.110 1.000 Y NA
 600313 600314 BT9727_5027 BT9727_5028 hbd atoB TRUE 0.920 50.000 0.118 1.000 Y NA
 600314 600315 BT9727_5028 BT9727_5029 atoB fdx TRUE 0.608 112.000 0.205 1.000 N NA
 600316 600317 BT9727_5030 BT9727_5031 cls   TRUE 0.891 33.000 0.545 1.000 N NA
 600317 600318 BT9727_5031 BT9727_5032     TRUE 0.600 129.000 0.308 1.000 N NA
 600319 600320 BT9727_5032.1 BT9727_5033 papR plcR TRUE 0.591 90.000 0.600 NA   NA
 600320 600321 BT9727_5033 BT9727_5034 plcR   FALSE 0.012 717.000 0.000 0.014   NA
 600321 600322 BT9727_5034 BT9727_5035     TRUE 0.989 -3.000 0.867 0.015 Y NA
 600322 600323 BT9727_5035 BT9727_5036     TRUE 0.921 1.000 0.800 NA N NA
 600323 600324 BT9727_5036 BT9727_5037     TRUE 0.951 -3.000 0.136 NA Y NA
 600325 600326 BT9727_5038 BT9727_5039 map   FALSE 0.010 810.000 0.000 1.000 N NA
 600326 600327 BT9727_5039 BT9727_5040     FALSE 0.003 485.000 0.000 1.000   NA
 600327 600328 BT9727_5040 BT9727_5041     FALSE 0.446 149.000 0.700 NA   NA
 600329 600330 BT9727_5042 BT9727_5043     TRUE 0.912 -16.000 0.857 NA   NA
 600330 600331 BT9727_5043 BT9727_5044     TRUE 0.848 -13.000 0.500 NA   NA
 600331 600332 BT9727_5044 BT9727_5045   argS FALSE 0.062 272.000 0.000 1.000 N NA
 600332 600333 BT9727_5045 BT9727_5046 argS   FALSE 0.532 0.000 0.079 NA   NA
 600337 600338 BT9727_5050 BT9727_5051 speB speE FALSE 0.443 218.000 0.141 1.000 Y NA
 600338 600339 BT9727_5051 BT9727_5052 speE   FALSE 0.273 187.000 0.096 1.000 N NA
 600339 600340 BT9727_5052 BT9727_5053     TRUE 0.842 6.000 0.205 1.000 N NA
 600341 600342 BT9727_5054 BT9727_5055 glpQ   FALSE 0.589 100.000 0.051 1.000 N NA
 600343 600344 BT9727_5056 BT9727_5058     FALSE 0.411 26.000 0.044 NA   NA
 600346 600347 BT9727_5059 BT9727_5060     FALSE 0.201 147.000 0.028 1.000   NA
 600347 600348 BT9727_5060 BT9727_5061     TRUE 0.592 192.000 0.250 1.000 Y NA
 600348 600349 BT9727_5061 BT9727_5062     TRUE 0.966 16.000 0.609 1.000 Y NA
 600349 600350 BT9727_5062 BT9727_5063   fhuB TRUE 0.976 -3.000 0.130 0.032 Y NA
 600350 600351 BT9727_5063 BT9727_5064 fhuB   FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 600356 600357 BT9727_5069 BT9727_5070     FALSE 0.004 202.000 0.000 NA   NA
 600357 600358 BT9727_5070 BT9727_5071   cwlJ FALSE 0.150 174.000 0.069 1.000   NA
 600358 600359 BT9727_5071 BT9727_5072 cwlJ   TRUE 0.819 28.000 0.722 NA   NA
 600360 600361 BT9727_5073 BT9727_5074     FALSE 0.276 65.000 0.042 NA   NA
 600361 600362 BT9727_5074 BT9727_5075     TRUE 0.710 7.000 0.391 NA   NA
 600363 600364 BT9727_5076 BT9727_5077     FALSE 0.327 173.000 0.062 0.040   NA
 600364 600365 BT9727_5077 BT9727_5078     FALSE 0.003 210.000 0.000 NA   NA
 600366 600367 BT9727_5079 BT9727_5080 ung   FALSE 0.507 20.000 0.088 NA   NA
 600367 600368 BT9727_5080 BT9727_5081     TRUE 0.893 -7.000 0.791 NA   NA
 600368 600369 BT9727_5081 BT9727_5082     TRUE 0.947 -3.000 0.850 1.000 N NA
 600369 600370 BT9727_5082 BT9727_5083     TRUE 0.665 83.000 0.175 1.000 N NA
 600372 600373 BT9727_5085 BT9727_5086 hom metA TRUE 0.754 142.000 0.021 1.000 Y NA
 600373 600374 BT9727_5086 BT9727_5087 metA cysD TRUE 0.966 -16.000 0.051 1.000 Y NA
 600374 600375 BT9727_5087 BT9727_5088 cysD   FALSE 0.004 472.000 0.000 1.000   NA
 600377 600378 BT9727_5090 BT9727_5091     FALSE 0.379 192.000 0.471 1.000 N NA
 600378 600379 BT9727_5091 BT9727_5092     TRUE 0.983 21.000 0.667 0.015 Y NA
 600381 600382 BT9727_5094 BT9727_5095     FALSE 0.185 147.000 0.171 NA   NA
 600382 600383 BT9727_5095 BT9727_5096   cstA TRUE 0.740 -28.000 0.229 NA   NA
 600383 600384 BT9727_5096 BT9727_5097 cstA   TRUE 0.863 122.000 0.421 1.000 Y NA
 600384 600385 BT9727_5097 BT9727_5098     FALSE 0.132 210.000 0.000 1.000 N NA
 600385 600386 BT9727_5098 BT9727_5099   tarA FALSE 0.064 271.000 0.000 1.000 N NA
 600386 600387 BT9727_5099 BT9727_5100 tarA   TRUE 0.966 16.000 0.083 0.010 Y NA
 600387 600388 BT9727_5100 BT9727_5101     FALSE 0.280 78.000 0.075 NA   NA
 600389 600390 BT9727_5102 BT9727_5103     FALSE 0.281 133.000 0.276 NA   NA
 600392 600393 BT9727_5105 BT9727_5106     FALSE 0.153 177.000 0.000 NA N NA
 600393 600394 BT9727_5106 BT9727_5107     FALSE 0.438 64.000 0.222 NA   NA
 600394 600395 BT9727_5107 BT9727_5108     FALSE 0.015 273.000 0.000 1.000   NA
 600395 600396 BT9727_5108 BT9727_5109     FALSE 0.022 91.000 0.000 NA   NA
 600398 600399 BT9727_5111 BT9727_5112     FALSE 0.352 37.000 0.000 1.000   NA
 600402 600403 BT9727_5115 BT9727_5116 msrA   FALSE 0.058 178.000 0.000 1.000   NA
 600403 600404 BT9727_5116 BT9727_5117     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 600404 600405 BT9727_5117 BT9727_5118     FALSE 0.012 140.000 0.000 NA   NA
 600405 600406 BT9727_5118 BT9727_5120     FALSE 0.001 327.000 0.000 NA   NA
 600406 600407 BT9727_5120 BT9727_5121     TRUE 0.868 35.000 0.869 1.000   NA
 600407 600408 BT9727_5121 BT9727_5122   lytR FALSE 0.324 133.000 0.178 1.000   NA
 600408 600409 BT9727_5122 BT9727_5123 lytR lytS TRUE 0.989 -22.000 0.538 0.015 Y NA
 600411 600412 BT9727_5125 BT9727_5126 opuD nos FALSE 0.027 363.000 0.000 1.000 N NA
 600414 600415 BT9727_5128 BT9727_5129     FALSE 0.350 106.000 0.073 1.000   NA
 600417 600418 BT9727_5131 BT9727_5132 galE   FALSE 0.027 225.000 0.000 1.000   NA
 600420 600421 BT9727_5134 BT9727_5135   deaD FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 600421 600422 BT9727_5135 BT9727_5136 deaD   FALSE 0.101 189.000 0.037 1.000   NA
 600423 600424 BT9727_5137 BT9727_5138 guaC   FALSE 0.252 135.000 0.049 1.000   NA
 600425 600426 BT9727_5139 BT9727_5140     FALSE 0.087 137.000 0.004 NA   NA
 600426 600427 BT9727_5140 BT9727_5141     FALSE 0.256 60.000 0.025 NA   NA
 600427 600428 BT9727_5141 BT9727_5142     TRUE 0.645 54.000 0.452 NA   NA
 600428 600429 BT9727_5142 BT9727_5143     FALSE 0.467 64.000 0.060 1.000   NA
 600429 600430 BT9727_5143 BT9727_5144     TRUE 0.690 -16.000 0.176 NA   NA
 600430 600431 BT9727_5144 BT9727_5145     TRUE 0.918 -19.000 0.890 NA   NA
 600431 600432 BT9727_5145 BT9727_5146     TRUE 0.833 -3.000 0.575 NA   NA
 600432 600433 BT9727_5146 BT9727_5147     TRUE 0.982 4.000 0.597 0.015 Y NA
 600433 5459545 BT9727_5147 tRNA-Phe-4     FALSE 0.000 401.000 0.000 NA   NA
 5459545 5459546 tRNA-Phe-4 tRNA-Asp-6     FALSE 0.047 39.000 0.000 NA   NA
 5459546 5459547 tRNA-Asp-6 tRNA-Glu-6     FALSE 0.059 20.000 0.000 NA   NA
 5459547 5459548 tRNA-Glu-6 tRNA-Lys-2     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459548 600438 tRNA-Lys-2 BT9727_5148   purA FALSE 0.012 141.000 0.000 NA   NA
 600438 600439 BT9727_5148 BT9727_5149 purA dnaC FALSE 0.258 216.000 0.018 0.075 N NA
 600439 600440 BT9727_5149 BT9727_5150 dnaC rplI TRUE 0.805 28.000 0.064 1.000 N NA
 600440 600441 BT9727_5150 BT9727_5151 rplI   TRUE 0.838 -3.000 0.020 1.000 N NA
 600441 600442 BT9727_5151 BT9727_5152     FALSE 0.305 79.000 0.116 NA   NA
 600442 600443 BT9727_5152 BT9727_5153   rpsR FALSE 0.272 78.000 0.069 NA   NA
 600443 600444 BT9727_5153 BT9727_5154 rpsR ssb TRUE 0.731 46.000 0.015 1.000 N NA
 600444 600445 BT9727_5154 BT9727_5155 ssb rpsF TRUE 0.782 27.000 0.015 1.000 N NA
 600445 600446 BT9727_5155 BT9727_5156 rpsF ychF FALSE 0.532 192.000 0.029 1.000 Y NA
 600446 600447 BT9727_5156 BT9727_5157 ychF   FALSE 0.196 116.000 0.064 NA   NA
 600447 600448 BT9727_5157 BT9727_5158     FALSE 0.557 21.000 0.171 NA   NA
 600450 600451 BT9727_5160 BT9727_5161 spo0J soj TRUE 0.853 74.000 0.827 1.000 N NA
 600451 600452 BT9727_5161 BT9727_5162 soj spoOJ FALSE 0.250 191.000 0.069 1.000 N NA
 600452 600453 BT9727_5162 BT9727_5163 spoOJ gidB TRUE 0.594 105.000 0.089 1.000 N NA
 600453 600454 BT9727_5163 BT9727_5164 gidB gidA TRUE 0.892 22.000 0.466 1.000 N NA
 600454 600455 BT9727_5164 BT9727_5165 gidA trmE TRUE 0.650 47.000 0.266 1.000   NA
 600455 600456 BT9727_5165 BT9727_5166 trmE jag FALSE 0.073 227.000 0.116 1.000   NA
 600456 600457 BT9727_5166 BT9727_5167 jag spoIIIJ TRUE 0.699 -3.000 0.071 1.000   NA
 600457 600458 BT9727_5167 BT9727_5168 spoIIIJ rnpA TRUE 0.757 40.000 0.025 1.000 N NA
 1800117 1800118 pBT9727_0002 pBT9727_0003     FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 1800118 1800119 pBT9727_0003 pBT9727_0004     FALSE 0.090 -9.000 0.000 NA   NA
 1800119 1800120 pBT9727_0004 pBT9727_0005     FALSE 0.035 57.000 0.000 NA   NA
 1800120 1800121 pBT9727_0005 pBT9727_0006     FALSE 0.025 76.000 0.000 NA   NA
 1800121 1800122 pBT9727_0006 pBT9727_0007     FALSE 0.056 25.000 0.000 NA   NA
 1800122 1800123 pBT9727_0007 pBT9727_0008     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 1800123 1800124 pBT9727_0008 pBT9727_0009     TRUE 0.777 15.000 0.600 NA   NA
 1800124 1800125 pBT9727_0009 pBT9727_0010     FALSE 0.035 57.000 0.000 NA   NA
 1800125 1800126 pBT9727_0010 pBT9727_0011     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 1800126 1800127 pBT9727_0011 pBT9727_0012     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 1800127 1800128 pBT9727_0012 pBT9727_0013     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 1800128 1800129 pBT9727_0013 pBT9727_0014     TRUE 0.773 35.000 0.600 NA   NA
 1800129 1800130 pBT9727_0014 pBT9727_0015     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 1800130 1800131 pBT9727_0015 pBT9727_0016     FALSE 0.039 50.000 0.000 NA   NA
 1800131 1800132 pBT9727_0016 pBT9727_0017     FALSE 0.032 63.000 0.000 NA   NA
 1800132 1800133 pBT9727_0017 pBT9727_0018     FALSE 0.005 185.000 0.000 NA   NA
 1800133 1800134 pBT9727_0018 pBT9727_0019     TRUE 0.767 56.000 0.800 NA   NA
 1800134 1800135 pBT9727_0019 pBT9727_0020     TRUE 0.880 -3.000 0.800 NA   NA
 1800135 1800136 pBT9727_0020 pBT9727_0021     TRUE 0.633 35.000 0.308 NA   NA
 1800136 1800137 pBT9727_0021 pBT9727_0022     TRUE 0.666 18.000 0.308 NA   NA
 1800137 1800138 pBT9727_0022 pBT9727_0023     FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 1800138 1800139 pBT9727_0023 pBT9727_0024     FALSE 0.059 20.000 0.000 NA   NA
 1800139 1800140 pBT9727_0024 pBT9727_0025     FALSE 0.009 158.000 0.000 NA   NA
 1800140 1800141 pBT9727_0025 pBT9727_0026     FALSE 0.016 118.000 0.000 NA   NA
 1800141 1800142 pBT9727_0026 pBT9727_0027     FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   NA
 1800142 1800143 pBT9727_0027 pBT9727_0028     FALSE 0.005 186.000 0.000 NA   NA
 1800143 1800144 pBT9727_0028 pBT9727_0029     FALSE 0.108 -39.000 0.000 NA   NA
 1800144 1800145 pBT9727_0029 pBT9727_0030     FALSE 0.102 -22.000 0.000 NA   NA
 1800145 1800146 pBT9727_0030 pBT9727_0031     FALSE 0.001 304.000 0.000 NA   NA
 1800146 1800147 pBT9727_0031 pBT9727_0032     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 1800147 1800148 pBT9727_0032 pBT9727_0033     FALSE 0.010 150.000 0.000 NA   NA
 1800148 1800149 pBT9727_0033 pBT9727_0034     FALSE 0.000 697.000 0.000 NA   NA
 1800149 1800150 pBT9727_0034 pBT9727_0035     FALSE 0.020 100.000 0.000 NA   NA
 1800150 1800151 pBT9727_0035 pBT9727_0036     FALSE 0.090 -9.000 0.000 NA   NA
 1800151 1800152 pBT9727_0036 pBT9727_0037     FALSE 0.000 617.000 0.000 NA   NA
 1800152 1800153 pBT9727_0037 pBT9727_0038     FALSE 0.000 1034.000 0.000 NA   NA
 1800153 1800154 pBT9727_0038 pBT9727_0039     FALSE 0.000 460.000 0.000 NA   NA
 1800154 1800155 pBT9727_0039 pBT9727_0040     FALSE 0.032 64.000 0.000 NA   NA
 1800156 1800157 pBT9727_0041 pBT9727_0042     FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 1800157 1800158 pBT9727_0042 pBT9727_0043   tnp FALSE 0.004 425.000 0.000 1.000   NA
 1800158 1800159 pBT9727_0043 pBT9727_0044 tnp   FALSE 0.005 418.000 0.000 1.000   NA
 1800160 1800161 pBT9727_0045 pBT9727_0046   rep FALSE 0.005 187.000 0.000 NA   NA
 1800162 1800163 pBT9727_0047 pBT9727_0048 repB   TRUE 0.834 -7.000 0.500 NA   NA
 1800163 1800164 pBT9727_0048 pBT9727_0049     FALSE 0.000 451.000 0.000 NA   NA
 1800164 1800165 pBT9727_0049 pBT9727_0050     FALSE 0.044 43.000 0.000 NA   NA
 1800165 1800166 pBT9727_0050 pBT9727_0051   pagR FALSE 0.095 -13.000 0.000 NA   NA
 1800166 1800167 pBT9727_0051 pBT9727_0052 pagR   FALSE 0.055 27.000 0.000 NA   NA
 1800168 1800169 pBT9727_0053 pBT9727_0054     FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 1800169 1800170 pBT9727_0054 pBT9727_0055   oppA FALSE 0.001 369.000 0.000 NA   NA
 1800170 1800171 pBT9727_0055 pBT9727_0056 oppA   FALSE 0.000 900.000 0.000 NA   NA
 1800171 1800172 pBT9727_0056 pBT9727_0057     FALSE 0.016 119.000 0.000 NA   NA
 1800172 1800173 pBT9727_0057 pBT9727_0058     TRUE 0.801 31.000 0.000 0.001   NA
 1800173 1800174 pBT9727_0058 pBT9727_0059     FALSE 0.004 448.000 0.000 1.000   NA
 1800175 1800176 pBT9727_0060 pBT9727_0061     FALSE 0.075 164.000 0.000 1.000   NA
 1800176 1800177 pBT9727_0061 pBT9727_0062     FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 1800177 1800178 pBT9727_0062 pBT9727_0063     FALSE 0.041 47.000 0.000 NA   NA
 1800180 1800181 pBT9727_0065 pBT9727_0066 res   TRUE 0.960 18.000 0.000 0.006 Y NA
 1800182 1800183 pBT9727_0067 pBT9727_0068     FALSE 0.001 301.000 0.000 NA   NA
 1800183 1800184 pBT9727_0068 pBT9727_0069     FALSE 0.044 43.000 0.000 NA   NA
 1800184 1800185 pBT9727_0069 pBT9727_0070     FALSE 0.000 500.000 0.000 NA   NA
 1800185 1800186 pBT9727_0070 pBT9727_0071     FALSE 0.039 50.000 0.000 NA   NA
 1800186 1800187 pBT9727_0071 pBT9727_0072   topA FALSE 0.522 17.000 0.143 NA   NA
 1800187 1800188 pBT9727_0072 pBT9727_0073 topA   FALSE 0.011 146.000 0.000 NA   NA
 1800188 1800189 pBT9727_0073 pBT9727_0074     FALSE 0.002 246.000 0.000 NA   NA
 1800189 1800190 pBT9727_0074 pBT9727_0075     FALSE 0.007 166.000 0.000 NA   NA
 1800190 1800191 pBT9727_0075 pBT9727_0076     FALSE 0.056 25.000 0.000 NA   NA
 1800191 1800192 pBT9727_0076 pBT9727_0077     FALSE 0.031 66.000 0.000 NA   NA
 1800192 1800193 pBT9727_0077 pBT9727_0078     FALSE 0.084 -6.000 0.000 NA   NA
 1800193 1800194 pBT9727_0078 pBT9727_0079     FALSE 0.057 23.000 0.000 NA   NA
 1800194 1800195 pBT9727_0079 pBT9727_0080     FALSE 0.050 36.000 0.000 NA   NA
 1800195 1800116 pBT9727_0080 pBT9727_0001     FALSE 0.059 20.000 0.000 NA   NA
 1800116 1800117 pBT9727_0001 pBT9727_0002     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA