MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pseudotuberculosis IP 32953

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
618601	618602	YPTB0001	YPTB0002		asnC	TRUE	0.408	93.000	0.165	1.000	N	NA
618604	618605	YPTB0004	YPTB0005			TRUE	0.994	4.000	0.443	NA		NA
618606	618607	YPTB0006	YPTB0007	kup		FALSE	0.007	205.000	0.010	1.000	N	NA
618607	618608	YPTB0007	YPTB0008			TRUE	0.759	51.000	0.010	1.000	Y	NA
618608	618609	YPTB0008	YPTB0009			TRUE	0.524	53.000	0.000	NA		NA
618610	618611	YPTB0010	YPTB0011			TRUE	0.565	80.000	0.133	1.000		NA
618612	618613	YPTB_RNA_93	YPTB_RNA_1		tRNA-Glu1	FALSE	0.290	134.000	0.000	NA		NA
618613	10149668	YPTB_RNA_1	YPTB_RNA_94	tRNA-Glu1		FALSE	0.096	253.000	0.000	NA		NA
10149668	618615	YPTB_RNA_94	YPTB_RNA_95			FALSE	0.313	109.000	0.000	NA		NA
618615	618616	YPTB_RNA_95	YPTB0012			FALSE	0.012	566.000	0.000	NA		NA
618617	618618	YPTB0013	YPTB0014	mobB	mobA	FALSE	0.111	244.000	0.000	NA		NA
618619	618620	YPTB0015	YPTB0016			TRUE	0.489	91.000	0.106	NA		NA
618620	618621	YPTB0016	YPTB0017		dsbA	TRUE	0.825	28.000	0.111	NA		NA
618621	618622	YPTB0017	YPTB0018	dsbA	polA	FALSE	0.015	491.000	0.000	1.000		NA
618622	10149669	YPTB0018	YPTB_RNA_89	polA	spf	FALSE	0.272	159.000	0.000	NA		NA
10149670	618626	YPTB_RNA_113	YPTB0020			FALSE	0.282	145.000	0.000	NA		NA
618626	618627	YPTB0020	YPTB0021		hemN	FALSE	0.336	187.000	0.107	NA		NA
618628	618629	YPTB0022	YPTB0023	ntrC	ntrB	TRUE	0.999	8.000	0.587	0.080	Y	NA
618629	618630	YPTB0023	YPTB0024	ntrB	glnA	FALSE	0.011	253.000	0.053	1.000	N	NA
618631	618632	YPTB0025	YPTB0026	bipA		FALSE	0.024	322.000	0.007	1.000		NA
618632	618633	YPTB0026	YPTB0027		rbn	FALSE	0.236	97.000	0.031	1.000		NA
618633	618634	YPTB0027	YPTB0028	rbn		TRUE	0.932	7.000	0.069	1.000		NA
618634	618635	YPTB0028	YPTB0029			FALSE	0.222	186.000	0.065	1.000		NA
618636	618637	YPTB0030	YPTB0031			TRUE	0.674	147.000	0.257	NA		NA
618639	618640	YPTB0033	YPTB0034	recG	trmH	TRUE	0.874	1.000	0.076	1.000	N	NA
618640	618641	YPTB0034	YPTB0035	trmH	spoT	TRUE	0.878	6.000	0.095	1.000	N	NA
618641	618642	YPTB0035	YPTB0036	spoT	rpoZ	TRUE	0.984	20.000	0.291	1.000	Y	NA
618642	618643	YPTB0036	YPTB0037	rpoZ	gmk	TRUE	0.872	55.000	0.471	1.000	N	NA
618645	618646	YPTB0039	YPTB0040			FALSE	0.015	521.000	0.000	NA		NA
618647	618648	YPTB0041	YPTB0042	rph	pyrE	FALSE	0.186	167.000	0.108	1.000	N	NA
618649	618650	YPTB0043	YPTB0044	ttk	dut	FALSE	0.074	122.000	0.060	1.000	N	NA
618650	618651	YPTB0044	YPTB0045	dut	dfp	TRUE	0.966	-19.000	0.201	1.000	N	NA
618652	618653	YPTB0046	YPTB0047	radC	rpmB	FALSE	0.003	263.000	0.002	1.000	N	NA
618653	618654	YPTB0047	YPTB0048	rpmB	rpmG	TRUE	0.997	12.000	0.332	0.016	Y	NA
618654	618655	YPTB0048	YPTB0049	rpmG	mutM	FALSE	0.017	83.000	0.034	1.000	N	NA
618656	618657	YPTB0050	YPTB0051	coaA	kdtX	TRUE	0.439	-3.000	0.023	NA	N	NA
618657	618658	YPTB0051	YPTB0052	kdtX	kdtA	TRUE	0.990	1.000	0.083	NA	Y	NA
618658	618659	YPTB0052	YPTB0053	kdtA	rfaC	FALSE	0.064	420.000	0.028	1.000	Y	NA
618659	618660	YPTB0053	YPTB0054	rfaC	rfaF	TRUE	0.999	0.000	0.205	0.001	Y	NA
618660	618661	YPTB0054	YPTB0055	rfaF	rfaD	TRUE	0.940	31.000	0.146	1.000	Y	NA
618662	618663	YPTB0056	YPTB0057	kbl	tdh	TRUE	0.989	10.000	0.547	1.000	N	NA
618664	618665	YPTB0058	YPTB0059	yibQ		TRUE	0.816	24.000	0.088	1.000		NA
618665	618666	YPTB0059	YPTB0060			TRUE	0.937	10.000	0.170	1.000	N	NA
618667	618668	YPTB0061	YPTB0062		grxC	FALSE	0.057	119.000	0.048	NA	N	NA
618668	618669	YPTB0062	YPTB0063	grxC	secB	FALSE	0.016	88.000	0.038	1.000	N	NA
618669	618670	YPTB0063	YPTB0064	secB	gpsA	TRUE	0.978	0.000	0.206	1.000	N	NA
618670	618671	YPTB0064	YPTB0065	gpsA		TRUE	0.470	60.000	0.000	NA		NA
618671	618672	YPTB0065	YPTB0066		cysE	TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
618675	618676	YPTB0069	YPTB0070	cpxA	cpxR	TRUE	0.999	-3.000	0.791	1.000	Y	NA
618677	618678	YPTB0071	YPTB0072	cpxP		FALSE	0.009	678.000	0.000	NA		NA
618678	618679	YPTB0072	YPTB0073			FALSE	0.013	562.000	0.000	NA		NA
618679	618680	YPTB0073	YPTB0074		pfkA	FALSE	0.006	218.000	0.040	1.000	N	NA
618680	618681	YPTB0074	YPTB0075	pfkA	sbp1	FALSE	0.014	221.000	0.049	1.000	N	NA
618682	618683	YPTB0076	YPTB0077			TRUE	0.762	118.000	0.000	0.072	Y	NA
618683	618684	YPTB0077	YPTB0078			FALSE	0.092	66.000	0.000	1.000	N	NA
618684	618685	YPTB0078	YPTB0079			TRUE	0.995	-3.000	0.353	NA		NA
618687	618688	YPTB0081	YPTB0082	tpiA		FALSE	0.306	129.000	0.058	NA		NA
618690	618691	YPTB0084	YPTB0085	fpr	glpX	FALSE	0.217	155.000	0.117	1.000	N	NA
618691	618692	YPTB0085	YPTB0086	glpX	glpK	FALSE	0.003	253.000	0.025	1.000	N	NA
618692	618693	YPTB0086	YPTB0087	glpK	glpF	FALSE	0.010	177.000	0.013	1.000	N	NA
618693	618694	YPTB0087	YPTB0088	glpF		TRUE	0.912	10.000	0.000	NA		NA
618696	618697	YPTB0090	YPTB0091			TRUE	0.996	-7.000	0.250	1.000	Y	NA
618698	618699	YPTB0092	YPTB0093			FALSE	0.243	175.000	0.000	NA		NA
618699	618700	YPTB0093	YPTB0094			FALSE	0.057	306.000	0.000	NA		NA
618701	618702	YPTB0095	YPTB0096	menG	menA	TRUE	0.767	142.000	0.158	NA	Y	NA
618702	618703	YPTB0096	YPTB0097	menA	hslU	FALSE	0.013	235.000	0.051	1.000	N	NA
618703	618704	YPTB0097	YPTB0098	hslU	hslV	TRUE	0.974	71.000	0.752	1.000	Y	NA
618704	618705	YPTB0098	YPTB0099	hslV	ftsN	FALSE	0.300	100.000	0.122	NA	N	NA
618705	10149671	YPTB0099	YPTB0100	ftsN	cytR	TRUE	0.668	66.000	0.245	NA	N	NA
10149671	618707	YPTB0100	YPTB0101	cytR	priA	FALSE	0.001	353.000	0.013	1.000	N	NA
618709	618710	YPTB0103	YPTB0104		metJ	FALSE	0.038	349.000	0.000	NA		NA
618711	618712	YPTB0105	YPTB0106	metB	metM	TRUE	0.998	3.000	0.428	1.000	Y	NA
618712	618713	YPTB0106	YPTB0107	metM	metF	FALSE	0.291	233.000	0.017	1.000	Y	NA
618714	618715	YPTB0108	YPTB0109	ppc	argE	FALSE	0.004	374.000	0.053	1.000	N	NA
618716	618717	YPTB0110	YPTB0111	argC	argB	TRUE	0.811	183.000	0.097	0.003	Y	NA
618717	618718	YPTB0111	YPTB0112	argB	argH	TRUE	0.491	167.000	0.017	1.000	Y	NA
618718	618719	YPTB0112	YPTB0113	argH		FALSE	0.002	599.000	0.000	1.000	N	NA
618719	618720	YPTB0113	YPTB0114		HasA	FALSE	0.138	228.000	0.000	NA		NA
618720	618721	YPTB0114	YPTB0115	HasA		FALSE	0.263	166.000	0.000	NA		NA
618721	618722	YPTB0115	YPTB0116			TRUE	0.981	76.000	1.000	0.011		NA
618722	618723	YPTB0116	YPTB0117			TRUE	0.954	65.000	0.667	0.011	N	NA
618724	618725	YPTB0118	YPTB0119			TRUE	0.756	94.000	0.204	0.006	N	NA
618728	618729	YPTB0122	YPTB0123	trmA	yijD	TRUE	0.990	13.000	0.508	NA		NA
618731	618732	YPTB_RNA_114	YPTB0125		btuB	TRUE	0.398	70.000	0.000	NA		NA
618732	618733	YPTB0125	YPTB0126	btuB	murI	FALSE	0.294	-55.000	0.025	1.000	N	NA
618733	618734	YPTB0126	YPTB_RNA_96	murI		FALSE	0.019	457.000	0.000	NA		NA
618734	618735	YPTB_RNA_96	YPTB_RNA_2		tRNA-Glu2	FALSE	0.290	134.000	0.000	NA		NA
618735	618736	YPTB_RNA_2	YPTB_RNA_97	tRNA-Glu2		FALSE	0.096	253.000	0.000	NA		NA
618736	618737	YPTB_RNA_97	YPTB_RNA_98			FALSE	0.313	109.000	0.000	NA		NA
618737	618738	YPTB_RNA_98	YPTB_RNA_3		tRNA-Asp-1	FALSE	0.304	124.000	0.000	NA		NA
618738	618739	YPTB_RNA_3	YPTB_RNA_4	tRNA-Asp-1	tRNA-Trp-1	TRUE	0.919	9.000	0.000	NA		NA
618739	618740	YPTB_RNA_4	YPTB0127	tRNA-Trp-1		FALSE	0.007	983.000	0.000	NA		NA
618740	618741	YPTB0127	YPTB0128			TRUE	0.973	86.000	0.804	NA	Y	NA
618741	618742	YPTB0128	YPTB0129			TRUE	0.998	12.000	0.506	0.016	Y	NA
618742	618743	YPTB0129	YPTB0130			TRUE	1.000	0.000	0.865	0.016	Y	NA
618747	618748	YPTB0134	YPTB0135	ilvG	ilvM	TRUE	1.000	-3.000	0.943	0.002		NA
618748	618749	YPTB0135	YPTB0136	ilvM	ilvE	TRUE	0.926	23.000	0.205	1.000		NA
618749	618750	YPTB0136	YPTB0137	ilvE	ilvD	FALSE	0.199	311.000	0.075	1.000	Y	NA
618750	618751	YPTB0137	YPTB0138	ilvD	ilvA	TRUE	0.987	6.000	0.106	1.000	Y	NA
618752	618753	YPTB0139	YPTB0140			TRUE	0.819	18.000	0.000	NA		NA
618753	618754	YPTB0140	YPTB0141			FALSE	0.368	80.000	0.000	NA		NA
618754	618755	YPTB0141	YPTB0142			TRUE	0.997	-16.000	0.667	NA		NA
618758	618759	YPTB0145	YPTB0146	ilvC		FALSE	0.012	577.000	0.000	NA		NA
618759	618760	YPTB0146	YPTB0147			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
618760	618761	YPTB0147	YPTB0148			FALSE	0.060	301.000	0.000	NA		NA
618761	618762	YPTB0148	YPTB0149			TRUE	0.919	9.000	0.000	NA		NA
618762	618763	YPTB0149	YPTB0150		pys2	FALSE	0.255	153.000	0.000	1.000		NA
618763	618764	YPTB0150	YPTB0151	pys2	imm2	TRUE	0.945	2.000	0.000	1.000		NA
618764	618765	YPTB0151	YPTB0152	imm2	pys2	FALSE	0.255	153.000	0.000	1.000		NA
618765	618766	YPTB0152	YPTB0153	pys2	imm	TRUE	0.957	-3.000	0.000	1.000		NA
618766	618767	YPTB0153	YPTB0154	imm		FALSE	0.012	558.000	0.000	1.000		NA
618767	618768	YPTB0154	YPTB0155			FALSE	0.011	611.000	0.000	NA		NA
618769	618770	YPTB0156	YPTB0157			TRUE	0.984	38.000	1.000	1.000		NA
618770	618771	YPTB0157	YPTB0158			TRUE	0.983	17.000	0.500	1.000		NA
618771	618772	YPTB0158	YPTB0159			TRUE	0.987	28.000	0.500	1.000	Y	NA
618772	618773	YPTB0159	YPTB0160			TRUE	0.986	64.000	1.000	1.000	Y	NA
618773	618774	YPTB0160	YPTB0161			FALSE	0.001	792.000	0.000	1.000	N	NA
618774	618775	YPTB0161	YPTB0162		ppiC	FALSE	0.108	239.000	0.000	1.000		NA
618777	618778	YPTB0164	YPTB0165		rhlB	TRUE	0.988	4.000	0.406	1.000	N	NA
618779	618780	YPTB0166	YPTB0167	trxA	rho	FALSE	0.007	480.000	0.087	1.000	N	NA
618780	618781	YPTB0167	YPTB0168	rho	rfe	FALSE	0.002	534.000	0.000	1.000	N	NA
618781	618782	YPTB0168	YPTB0169	rfe	wzzE	TRUE	0.996	36.000	0.735	0.004	Y	NA
618782	618783	YPTB0169	YPTB0170	wzzE	rffE	TRUE	0.823	349.000	0.677	0.004	Y	NA
618783	618784	YPTB0170	YPTB0171	rffE	rffD	TRUE	0.998	-3.000	0.348	1.000	Y	NA
618784	618785	YPTB0171	YPTB0172	rffD	rffG	TRUE	0.997	-3.000	0.273	1.000	Y	NA
618785	618786	YPTB0172	YPTB0173	rffG	rffH	TRUE	0.906	295.000	0.739	0.003	Y	NA
618786	618787	YPTB0173	YPTB0174	rffH	rffC	TRUE	0.766	47.000	0.145	1.000		NA
618787	618788	YPTB0174	YPTB0175	rffC	rffA	TRUE	0.989	2.000	0.248	1.000		NA
618788	618789	YPTB0175	YPTB0176	rffA	wzxE	TRUE	0.987	2.000	0.218	1.000		NA
618789	618790	YPTB0176	YPTB0177	wzxE		TRUE	0.982	23.000	0.605	1.000		NA
618790	618791	YPTB0177	YPTB0178		wecF	TRUE	0.998	-3.000	0.684	1.000		NA
618791	618792	YPTB0178	YPTB0179	wecF	wecG	TRUE	0.959	9.000	0.126	1.000		NA
618792	618793	YPTB0179	YPTB0180	wecG		FALSE	0.002	564.000	0.000	1.000	N	NA
618793	618794	YPTB0180	YPTB_RNA_5		tRNA-Arg1	FALSE	0.280	149.000	0.000	NA		NA
618794	618795	YPTB_RNA_5	YPTB_RNA_6	tRNA-Arg1	tRNA-His1	FALSE	0.358	84.000	0.000	NA		NA
618795	618796	YPTB_RNA_6	YPTB_RNA_7	tRNA-His1	tRNA-Leu1	TRUE	0.829	17.000	0.000	NA		NA
618796	618623	YPTB_RNA_7	YPTB_RNA_8	tRNA-Leu1	tRNA-Pro1	TRUE	0.379	76.000	0.000	NA		NA
618798	618799	YPTB0181	YPTB0182	hemY	hemX	TRUE	0.992	3.000	0.144	1.000	Y	NA
618799	618800	YPTB0182	YPTB0183	hemX	hemD	TRUE	0.988	31.000	0.600	1.000	Y	NA
618800	618801	YPTB0183	YPTB0184	hemD	hemC	TRUE	0.999	-3.000	0.205	0.002	Y	NA
618803	618804	YPTB0186	YPTB0187			TRUE	0.568	48.000	0.000	NA		NA
618804	618805	YPTB0187	YPTB0188		cyaY	FALSE	0.068	288.000	0.000	NA		NA
618806	618807	YPTB0189	YPTB0190		dapF	FALSE	0.011	168.000	0.021	NA	N	NA
618807	618808	YPTB0190	YPTB0191	dapF		TRUE	0.714	65.000	0.175	NA		NA
618808	618809	YPTB0191	YPTB0192		xerC	TRUE	0.998	-3.000	0.714	NA		NA
618809	618810	YPTB0192	YPTB0193	xerC		TRUE	0.995	0.000	0.367	1.000		NA
618810	618811	YPTB0193	YPTB0194		uvrD	TRUE	0.507	99.000	0.128	1.000		NA
618813	618814	YPTB0196	YPTB0197			TRUE	0.842	14.000	0.042	NA		NA
618814	618815	YPTB0197	YPTB0198		corA	FALSE	0.009	650.000	0.000	1.000		NA
618816	618817	YPTB0199	YPTB0200	rarD		TRUE	0.481	87.000	0.099	NA		NA
618818	618819	YPTB0201	YPTB0202	pldA	reqQ	FALSE	0.084	77.000	0.057	1.000	N	NA
618819	618820	YPTB0202	YPTB0203	reqQ	rhtC	FALSE	0.017	107.000	0.043	1.000	N	NA
618822	618823	YPTB0205	YPTB0206	pldB		TRUE	0.960	35.000	0.524	1.000		NA
618823	618824	YPTB0206	YPTB0207			FALSE	0.068	276.000	0.000	1.000		NA
618826	618827	YPTB0209	YPTB0210	glpA	glpB	TRUE	0.998	-10.000	0.650	0.001	N	NA
618827	618828	YPTB0210	YPTB0211	glpB	glpC	TRUE	0.999	-3.000	0.547	0.001	N	NA
618829	618830	YPTB0212	YPTB0213	drcB	yhhQ	FALSE	0.327	130.000	0.066	NA		NA
618832	618833	YPTB0215	YPTB0216	ATZN	yhhN	FALSE	0.222	414.000	0.325	0.094		NA
618834	618835	YPTB0217	YPTB0218			FALSE	0.176	212.000	0.058	NA		NA
618836	618837	YPTB0219	YPTB0220	yhhL		TRUE	0.953	-10.000	0.063	NA		NA
618838	618839	YPTB0221	YPTB0222	ftsY	ftsE	TRUE	0.910	6.000	0.117	1.000	N	NA
618839	618840	YPTB0222	YPTB0223	ftsE	ftsX	TRUE	0.991	-10.000	0.121	1.000	Y	NA
618840	618841	YPTB0223	YPTB0224	ftsX	rpoH	FALSE	0.006	311.000	0.051	1.000	N	NA
618843	618844	YPTB0226	YPTB0227	livK	livH	TRUE	0.765	181.000	0.217	1.000	Y	NA
618844	618845	YPTB0227	YPTB0228	livH	livM	TRUE	0.999	-3.000	0.574	0.071	Y	NA
618845	618846	YPTB0228	YPTB0229	livM	livG	TRUE	0.999	-3.000	0.574	1.000	Y	NA
618846	618847	YPTB0229	YPTB0230	livG	livF	TRUE	0.996	45.000	0.967	0.023	Y	NA
618847	618848	YPTB0230	YPTB0231	livF		FALSE	0.138	228.000	0.000	NA		NA
618849	618850	YPTB0232	YPTB0233			TRUE	0.872	225.000	1.000	NA		NA
618850	618851	YPTB0233	YPTB0234			TRUE	0.934	62.000	0.600	NA		NA
618851	618852	YPTB0234	YPTB0235			TRUE	0.996	-28.000	0.600	NA		NA
618852	618853	YPTB0235	YPTB0236			TRUE	0.964	18.000	0.286	NA		NA
618853	618854	YPTB0236	YPTB0237			FALSE	0.083	267.000	0.000	NA		NA
618855	618856	YPTB0238	YPTB0239	ugpB	ugpA	TRUE	0.878	298.000	0.793	0.071	Y	NA
618856	618857	YPTB0239	YPTB0240	ugpA	ugpE	TRUE	0.998	0.000	0.306	0.071	Y	NA
618857	618858	YPTB0240	YPTB0241	ugpE	ugpC	TRUE	0.997	7.000	0.272	0.071	Y	NA
618858	618859	YPTB0241	YPTB0242	ugpC	ugpQ	TRUE	0.439	-3.000	0.024	1.000	N	NA
618859	618860	YPTB0242	YPTB0243	ugpQ		FALSE	0.209	101.000	0.023	1.000		NA
618860	618861	YPTB0243	YPTB0244			FALSE	0.287	137.000	0.000	NA		NA
618861	618862	YPTB0244	YPTB0245			TRUE	0.952	13.000	0.152	NA		NA
618862	618863	YPTB0245	YPTB0246		MadN	TRUE	0.443	207.000	0.000	1.000	Y	NA
618867	618868	YPTB0250	YPTB0251	udp		FALSE	0.013	121.000	0.030	1.000	N	NA
618868	618869	YPTB0251	YPTB0252			FALSE	0.135	341.000	0.000	1.000	Y	NA
618869	618870	YPTB0252	YPTB0253			FALSE	0.011	537.000	0.041	NA		NA
618870	618871	YPTB0253	YPTB0254		rumC	FALSE	0.321	208.000	0.125	NA		NA
618871	618872	YPTB0254	YPTB0255	rumC	ubiE	FALSE	0.315	92.000	0.047	NA		NA
618872	618873	YPTB0255	YPTB0256	ubiE		TRUE	0.834	32.000	0.145	1.000		NA
618873	618874	YPTB0256	YPTB0257		aarF	TRUE	0.996	0.000	0.432	1.000		NA
618874	618875	YPTB0257	YPTB0258	aarF	tatA	FALSE	0.149	180.000	0.025	1.000		NA
618875	618876	YPTB0258	YPTB0259	tatA	tatB	TRUE	0.991	4.000	0.130	1.000	Y	NA
618876	618877	YPTB0259	YPTB0260	tatB	tatC	TRUE	0.997	3.000	0.333	NA	Y	NA
618877	618878	YPTB0260	YPTB0261	tatC		TRUE	0.475	56.000	0.121	NA	N	NA
618878	618879	YPTB0261	YPTB0262		hemB	FALSE	0.152	15.000	0.031	NA	N	NA
618881	618882	YPTB0264	YPTB0265		fadI	TRUE	0.834	55.000	0.090	1.000	Y	NA
618883	618884	YPTB0266	YPTB0267	fadA	fadB	TRUE	0.997	12.000	0.607	1.000	Y	NA
618885	618886	YPTB0268	YPTB0269	pepQ		TRUE	0.980	0.000	0.127	1.000		NA
618886	618887	YPTB0269	YPTB0270		trkH	TRUE	0.848	40.000	0.202	1.000		NA
618887	618888	YPTB0270	YPTB0271	trkH	hemG	TRUE	0.956	22.000	0.455	1.000	N	NA
618888	618889	YPTB0271	YPTB_RNA_99	hemG		FALSE	0.018	475.000	0.000	NA		NA
618889	618614	YPTB_RNA_99	YPTB_RNA_9		tRNA-Ile1	FALSE	0.322	100.000	0.000	NA		NA
618614	618891	YPTB_RNA_9	YPTB_RNA_10	tRNA-Ile1	tRNA-Ala1	TRUE	0.531	52.000	0.000	NA		NA
618891	618892	YPTB_RNA_10	YPTB_RNA_100	tRNA-Ala1		FALSE	0.158	219.000	0.000	NA		NA
618892	618893	YPTB_RNA_100	YPTB_RNA_101			FALSE	0.313	109.000	0.000	NA		NA
618893	618894	YPTB_RNA_101	YPTB0272		murB	FALSE	0.019	462.000	0.000	NA		NA
618894	618895	YPTB0272	YPTB0273	murB	birA	TRUE	0.981	-3.000	0.211	1.000	N	NA
618896	618897	YPTB0274	YPTB0275	coaA		FALSE	0.156	211.000	0.000	1.000		NA
618625	618899	YPTB_RNA_11	YPTB_RNA_12	tRNA-Thr1	tRNA-Tyr1	TRUE	0.810	19.000	0.000	NA		NA
618899	618900	YPTB_RNA_12	YPTB_RNA_13	tRNA-Tyr1	tRNA-Gly1	FALSE	0.279	150.000	0.000	NA		NA
618900	618901	YPTB_RNA_13	YPTB_RNA_14	tRNA-Gly1	tRNA-Thr2	TRUE	0.927	7.000	0.000	NA		NA
618901	618902	YPTB_RNA_14	YPTB0276	tRNA-Thr2	tufA	FALSE	0.313	109.000	0.000	NA		NA
618902	618903	YPTB0276	YPTB0277	tufA	secB	FALSE	0.003	251.000	0.009	1.000	N	NA
618903	618904	YPTB0277	YPTB0278	secB	nusG	TRUE	0.997	2.000	0.843	1.000	N	NA
618904	618905	YPTB0278	YPTB0279	nusG	rplK	TRUE	0.764	191.000	0.681	1.000	N	NA
618905	618906	YPTB0279	YPTB0280	rplK	rplA	TRUE	1.000	4.000	0.838	0.020	Y	NA
618906	618907	YPTB0280	YPTB0281	rplA	rplJ	TRUE	0.527	365.000	0.302	0.020	Y	NA
618907	618908	YPTB0281	YPTB0282	rplJ	rplL	TRUE	0.991	67.000	0.884	0.015	Y	NA
618908	618909	YPTB0282	YPTB0283	rplL	rpoB	FALSE	0.152	343.000	0.223	1.000		NA
618909	618910	YPTB0283	YPTB0284	rpoB	rpoC	TRUE	0.974	129.000	0.851	0.001		NA
618911	618912	YPTB0285	YPTB0286	thiH	thiG	TRUE	0.999	-7.000	0.277	0.003	Y	NA
618912	618913	YPTB0286	YPTB0287	thiG	thiS	TRUE	0.989	2.000	0.087	1.000	Y	NA
618913	618914	YPTB0287	YPTB0288	thiS	thiF	TRUE	0.999	-3.000	0.548	1.000	Y	NA
618914	618915	YPTB0288	YPTB0289	thiF	thiE	TRUE	0.996	-10.000	0.242	1.000	Y	NA
618915	618916	YPTB0289	YPTB0290	thiE	thiC	TRUE	0.987	14.000	0.063	0.003	Y	NA
618916	618917	YPTB0290	YPTB0291	thiC	rsd	FALSE	0.004	375.000	0.000	1.000	N	NA
618918	618919	YPTB0292	YPTB0293			FALSE	0.342	93.000	0.000	NA		NA
618919	618920	YPTB0293	YPTB0294		hemE	FALSE	0.307	119.000	0.000	NA		NA
618920	618921	YPTB0294	YPTB0295	hemE	nfi	FALSE	0.022	66.000	0.028	1.000	N	NA
618921	618922	YPTB0295	YPTB0296	nfi		TRUE	0.671	46.000	0.086	NA		NA
618922	618923	YPTB0296	YPTB0297		hupA	TRUE	0.685	189.000	0.355	NA		NA
618923	618924	YPTB0297	YPTB0298	hupA	yjaH	TRUE	0.994	2.000	0.375	NA		NA
618925	618926	YPTB0299	YPTB0300	purD	purH	TRUE	0.916	60.000	0.238	1.000	Y	NA
618927	618928	YPTB_RNA_102	YPTB_RNA_15		tRNA-Glu3	FALSE	0.290	134.000	0.000	NA		NA
618928	618929	YPTB_RNA_15	YPTB_RNA_103	tRNA-Glu3		FALSE	0.096	253.000	0.000	NA		NA
618929	618930	YPTB_RNA_103	YPTB_RNA_104			FALSE	0.314	108.000	0.000	NA		NA
618930	618931	YPTB_RNA_104	YPTB0301			FALSE	0.025	399.000	0.000	NA		NA
618931	618932	YPTB0301	YPTB0302			TRUE	0.595	78.000	0.000	0.067		NA
618933	618934	YPTB0303	YPTB0304			TRUE	0.988	0.000	0.000	1.000	Y	NA
618936	618937	YPTB0306	YPTB0307	PhaJ		TRUE	0.998	-3.000	0.733	NA		NA
618937	618938	YPTB0307	YPTB0308		rcs	TRUE	0.721	57.000	0.147	NA		NA
618940	618941	YPTB0310	YPTB0311			TRUE	0.999	13.000	0.688	0.013	Y	NA
618942	618943	YPTB0312	YPTB0313			TRUE	0.991	2.000	0.268	NA		NA
618943	618944	YPTB0313	YPTB0314			TRUE	0.919	19.000	0.146	NA		NA
618944	618945	YPTB0314	YPTB0315			TRUE	0.618	35.000	0.000	1.000		NA
618945	618946	YPTB0315	YPTB0316			TRUE	0.963	10.000	0.150	1.000		NA
618946	618947	YPTB0316	YPTB0317			TRUE	0.998	-3.000	0.650	NA		NA
618947	618948	YPTB0317	YPTB0318			TRUE	0.823	98.000	0.407	NA		NA
618948	618949	YPTB0318	YPTB0319			TRUE	0.998	-3.000	0.407	0.016		NA
618949	618950	YPTB0319	YPTB0320			TRUE	0.869	195.000	0.786	NA		NA
618950	618951	YPTB0320	YPTB0321			TRUE	0.997	-3.000	0.538	NA		NA
618951	618952	YPTB0321	YPTB0322			TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
618952	618953	YPTB0322	YPTB0323			TRUE	0.999	-13.000	0.647	0.011	Y	NA
618953	618954	YPTB0323	YPTB0324			TRUE	0.988	-3.000	0.176	NA		NA
618954	618955	YPTB0324	YPTB0325			TRUE	0.936	164.000	1.000	NA		NA
618955	618956	YPTB0325	YPTB0326			TRUE	0.950	20.000	0.231	NA		NA
618956	618957	YPTB0326	YPTB0327			TRUE	0.844	67.000	0.154	1.000	Y	NA
618957	618958	YPTB0327	YPTB0328			TRUE	0.997	-3.000	0.136	0.016	Y	NA
618958	618959	YPTB0328	YPTB0329			TRUE	0.999	2.000	0.516	0.093	Y	NA
618959	618960	YPTB0329	YPTB0330			TRUE	0.999	-10.000	0.406	0.093	Y	NA
618960	618961	YPTB0330	YPTB0331			FALSE	0.025	383.000	0.045	NA		NA
618961	618962	YPTB0331	YPTB0332			TRUE	0.999	-3.000	0.844	NA		NA
618964	618965	YPTB0334	YPTB0335		metC	TRUE	0.829	46.000	0.043	NA	Y	NA
618966	618967	YPTB0336	YPTB0337	hmuV	hmuU	TRUE	0.996	-7.000	0.220	1.000	Y	NA
618967	618968	YPTB0337	YPTB0338	hmuU	hmuT	TRUE	0.999	-3.000	0.852	1.000	Y	NA
618968	618969	YPTB0338	YPTB0339	hmuT	hmuS	TRUE	0.998	-3.000	0.384	1.000	Y	NA
618969	618970	YPTB0339	YPTB0340	hmuS	hmuR	TRUE	0.634	119.000	0.064	1.000	Y	NA
618970	618971	YPTB0340	YPTB0341	hmuR		TRUE	0.561	131.000	0.023	NA	Y	NA
618971	618972	YPTB0341	YPTB0342			FALSE	0.017	86.000	0.015	NA	N	NA
618972	618973	YPTB0342	YPTB0343			FALSE	0.189	34.000	0.054	1.000	N	NA
618973	618974	YPTB0343	YPTB0344			TRUE	0.962	-3.000	0.135	1.000	N	NA
618974	618975	YPTB0344	YPTB0345			FALSE	0.006	341.000	0.000	1.000	N	NA
618975	618976	YPTB0345	YPTB0346			FALSE	0.052	315.000	0.000	NA		NA
618976	618977	YPTB0346	YPTB0347			FALSE	0.026	397.000	0.000	NA		NA
618977	618978	YPTB0347	YPTB0348			TRUE	0.996	0.000	0.420	NA		NA
618978	618979	YPTB0348	YPTB0349			TRUE	0.992	-7.000	0.296	NA		NA
618979	618980	YPTB0349	YPTB0350			TRUE	0.978	-7.000	0.126	NA		NA
618980	618981	YPTB0350	YPTB0351			TRUE	0.970	12.000	0.217	1.000		NA
618982	618983	YPTB0352	YPTB0353	terZ	terA	TRUE	0.989	0.000	0.054	0.004		NA
618983	618984	YPTB0353	YPTB0354	terA	terB	TRUE	0.884	33.000	0.200	NA		NA
618984	618985	YPTB0354	YPTB0355	terB	terC	TRUE	0.932	22.000	0.000	NA	Y	NA
618985	618986	YPTB0355	YPTB0356	terC	terD	FALSE	0.098	64.000	0.000	1.000	N	NA
618986	618987	YPTB0356	YPTB0357	terD	terE	TRUE	0.921	184.000	0.310	0.004	Y	NA
618987	618988	YPTB0357	YPTB0358	terE		FALSE	0.009	713.000	0.000	NA		NA
618988	618989	YPTB0358	YPTB0359			FALSE	0.099	251.000	0.000	NA		NA
618989	618990	YPTB0359	YPTB0360			TRUE	0.961	72.000	0.571	NA	Y	NA
618990	618991	YPTB0360	YPTB0361			TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
618991	618992	YPTB0361	YPTB0362			FALSE	0.007	1165.000	0.000	NA		NA
618996	618997	YPTB0366	YPTB0367	ubiC	ubiA	TRUE	0.826	166.000	0.248	NA	Y	NA
618999	619000	YPTB0369	YPTB0370	dgkA	lexA	FALSE	0.314	125.000	0.141	1.000	N	NA
619002	619003	YPTB0372	YPTB0373			FALSE	0.019	516.000	0.070	NA		NA
619005	619006	YPTB0375	YPTB0376	dnaB	alr	TRUE	0.642	97.000	0.317	1.000	N	NA
619006	619007	YPTB0376	YPTB0377	alr	tyrB	FALSE	0.306	186.000	0.181	1.000	N	NA
619007	619008	YPTB0377	YPTB0378	tyrB		FALSE	0.015	527.000	0.000	NA		NA
619011	619012	YPTB0381	YPTB0382			TRUE	0.878	14.000	0.063	NA		NA
619012	619013	YPTB0382	YPTB0383		rhaD	TRUE	0.529	67.000	0.041	0.007	N	NA
619013	619014	YPTB0383	YPTB0384	rhaD	rhaA	TRUE	0.989	13.000	0.247	1.000	Y	NA
619014	619015	YPTB0384	YPTB0385	rhaA	rhaB	TRUE	0.998	-3.000	0.387	1.000	Y	NA
619016	619017	YPTB0386	YPTB0387	rhaS	rhaR	TRUE	0.981	133.000	0.800	0.022	Y	NA
619019	619020	YPTB0389	YPTB0390			TRUE	0.394	71.000	0.000	NA		NA
619022	619023	YPTB0392	YPTB0393			TRUE	0.853	15.000	0.000	NA		NA
619024	619025	YPTB0394	YPTB_RNA_85		tRNA-Phe2	FALSE	0.272	159.000	0.000	NA		NA
619025	619026	YPTB_RNA_85	YPTB0395	tRNA-Phe2		FALSE	0.282	145.000	0.000	NA		NA
619027	619028	YPTB0396	YPTB0397		hydN	TRUE	0.952	23.000	0.222	0.014	N	NA
619028	619029	YPTB0397	YPTB0398	hydN	fdhF	TRUE	0.969	23.000	0.231	0.047		NA
619030	619031	YPTB0399	YPTB0400	dsbD		TRUE	0.875	-24.000	0.092	1.000	N	NA
619031	619032	YPTB0400	YPTB0401		dcuA	FALSE	0.120	185.000	0.007	1.000		NA
619032	619033	YPTB0401	YPTB0402	dcuA	aspA	FALSE	0.197	120.000	0.023	1.000		NA
619034	619035	YPTB0403	YPTB0404		groES	FALSE	0.076	255.000	0.040	NA		NA
619035	619036	YPTB0404	YPTB0405	groES	groEL	TRUE	0.993	47.000	0.631	0.008	Y	NA
619036	619037	YPTB0405	YPTB0406	groEL		FALSE	0.011	636.000	0.000	NA		NA
619039	619040	YPTB0408	YPTB0409	efp	sugE	FALSE	0.016	247.000	0.000	1.000	N	NA
619041	619042	YPTB0410	YPTB0411	frdD	frdC	TRUE	0.999	17.000	0.787	0.003	Y	NA
619042	619043	YPTB0411	YPTB0412	frdC	frdB	TRUE	0.997	17.000	0.454	0.003	Y	NA
619043	619044	YPTB0412	YPTB0413	frdB	frdA	TRUE	0.999	-7.000	0.470	0.003	Y	NA
619046	619047	YPTB0415	YPTB0416	BspA	psd	TRUE	0.802	24.000	0.148	NA	N	NA
619047	619048	YPTB0416	YPTB0417	psd		FALSE	0.068	325.000	0.095	1.000		NA
619049	619050	YPTB0418	YPTB_RNA_16		tRNA-Gly2	FALSE	0.013	559.000	0.000	NA		NA
619050	619051	YPTB_RNA_16	YPTB_RNA_17	tRNA-Gly2	tRNA-Gly3	FALSE	0.344	92.000	0.000	NA		NA
619051	619052	YPTB_RNA_17	YPTB_RNA_18	tRNA-Gly3	tRNA-Gly4	TRUE	0.408	68.000	0.000	NA		NA
619054	619055	YPTB0420	YPTB0421			TRUE	0.948	11.000	0.118	NA		NA
619055	619056	YPTB0421	YPTB0422			TRUE	0.427	140.000	0.109	NA		NA
619056	619057	YPTB0422	YPTB0423		mutL	TRUE	0.716	16.000	0.092	1.000	N	NA
619057	619058	YPTB0423	YPTB0424	mutL	miaA	TRUE	0.972	-7.000	0.188	1.000	N	NA
619058	619059	YPTB0424	YPTB0425	miaA	ymr	TRUE	0.856	117.000	0.531	1.000		NA
619059	619060	YPTB0425	YPTB0426	ymr	hflX	TRUE	0.529	99.000	0.141	1.000		NA
619060	619061	YPTB0426	YPTB0427	hflX	hflK	TRUE	0.453	241.000	0.184	0.092		NA
619061	619062	YPTB0427	YPTB0428	hflK	hflC	TRUE	1.000	4.000	0.947	0.016	Y	NA
619062	619063	YPTB0428	YPTB0429	hflC		TRUE	0.724	172.000	0.348	NA		NA
619063	619064	YPTB0429	YPTB0430		purA	FALSE	0.306	100.000	0.051	NA		NA
619064	619065	YPTB0430	YPTB0431	purA		FALSE	0.001	389.000	0.010	NA	N	NA
619065	619066	YPTB0431	YPTB0432		rnr	FALSE	0.310	241.000	0.038	NA	Y	NA
619066	619067	YPTB0432	YPTB0433	rnr		TRUE	0.604	119.000	0.147	0.018	N	NA
619067	619068	YPTB0433	YPTB0434		aidB	FALSE	0.001	408.000	0.005	1.000	N	NA
619070	619071	YPTB0436	YPTB0437	rjfP		TRUE	0.381	75.000	0.000	NA		NA
619071	619072	YPTB0437	YPTB0438		rpsF	TRUE	0.866	14.000	0.000	NA		NA
619072	619073	YPTB0438	YPTB0439	rpsF	priB	TRUE	0.917	6.000	0.122	1.000	N	NA
619073	619074	YPTB0439	YPTB0440	priB	rpsR	TRUE	0.930	5.000	0.128	1.000	N	NA
619074	619075	YPTB0440	YPTB0441	rpsR	rplI	TRUE	0.989	40.000	0.499	0.015	Y	NA
619076	619077	YPTB0442	YPTB0443			FALSE	0.258	140.000	0.047	NA		NA
619079	619080	YPTB0445	YPTB0446		cpdB	FALSE	0.013	129.000	0.030	NA	N	NA
619084	619085	YPTB0450	YPTB0451		msrA	FALSE	0.062	278.000	0.042	NA		NA
619086	619087	YPTB0452	YPTB0453			TRUE	0.998	-3.000	0.575	NA		NA
619087	619088	YPTB0453	YPTB0454			TRUE	0.982	3.000	0.167	NA		NA
619089	619090	YPTB0455	YPTB0456	ppa	fbp	FALSE	0.009	200.000	0.043	1.000	N	NA
619092	619093	YPTB0458	YPTB0459		argR	FALSE	0.027	389.000	0.000	NA		NA
619098	619099	YPTB0464	YPTB0465	rplU	rpmA	TRUE	0.997	20.000	0.667	0.015	Y	NA
619099	619100	YPTB0465	YPTB0466	rpmA		FALSE	0.252	88.000	0.019	NA		NA
619100	619101	YPTB0466	YPTB0467			TRUE	0.925	1.000	0.015	NA		NA
619102	619103	YPTB0468	YPTB0469	basS	basR	TRUE	0.998	-3.000	0.381	1.000	Y	NA
619103	619104	YPTB0469	YPTB0470	basR	dacB	TRUE	0.887	6.000	0.101	1.000	N	NA
619107	619108	YPTB0473	YPTB0474	ftsJ	ftsH	TRUE	0.537	57.000	0.152	1.000	N	NA
619108	619109	YPTB0474	YPTB0475	ftsH	folP	TRUE	0.626	120.000	0.325	1.000	N	NA
619109	619110	YPTB0475	YPTB0476	folP	mrsA	TRUE	0.966	10.000	0.260	1.000	N	NA
619110	619111	YPTB0476	YPTB0477	mrsA	secG	FALSE	0.005	223.000	0.016	1.000	N	NA
619111	619112	YPTB0477	YPTB_RNA_19	secG	tRNA-Leu2	FALSE	0.342	93.000	0.000	NA		NA
619112	619113	YPTB_RNA_19	YPTB_RNA_20	tRNA-Leu2	tRNA-Met1	TRUE	0.463	61.000	0.000	NA		NA
619113	619114	YPTB_RNA_20	YPTB0478	tRNA-Met1		FALSE	0.165	216.000	0.000	NA		NA
619114	619115	YPTB0478	YPTB0479		nusA	TRUE	0.989	22.000	0.759	NA		NA
619115	619116	YPTB0479	YPTB0480	nusA	infB	TRUE	0.926	25.000	0.342	1.000	N	NA
619116	619117	YPTB0480	YPTB0481	infB	rbfA	TRUE	0.960	66.000	0.530	1.000	Y	NA
619117	619118	YPTB0481	YPTB0482	rbfA	truB	TRUE	0.997	0.000	0.318	1.000	Y	NA
619118	619119	YPTB0482	YPTB0483	truB	rspO	TRUE	0.822	122.000	0.211	1.000	Y	NA
619121	619122	YPTB0484	YPTB0485	pnp	nlpI	FALSE	0.325	125.000	0.071	1.000		NA
619122	619123	YPTB0485	YPTB0486	nlpI	deaD	FALSE	0.187	187.000	0.053	1.000		NA
619123	619124	YPTB0486	YPTB0487	deaD		TRUE	0.800	20.000	0.000	NA		NA
619124	619125	YPTB0487	YPTB0488			TRUE	0.594	43.000	0.000	NA		NA
619125	619126	YPTB0488	YPTB0489			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
619128	619129	YPTB0491	YPTB0492			TRUE	0.940	4.000	0.133	1.000	N	NA
619129	619130	YPTB0492	YPTB0493		ibeB	TRUE	0.994	2.000	0.367	0.069	N	NA
619131	619132	YPTB0494	YPTB0495			TRUE	0.999	12.000	0.948	0.003	Y	NA
619133	619134	YPTB0496	YPTB0497			TRUE	0.992	-6.000	0.295	1.000		NA
619135	619136	YPTB0498	YPTB0499			FALSE	0.124	228.000	0.000	1.000		NA
619136	619137	YPTB0499	YPTB0500			TRUE	0.989	24.000	0.400	0.001		NA
619138	619139	YPTB0501	YPTB0502			TRUE	0.999	8.000	0.611	0.069	Y	NA
619139	619140	YPTB0502	YPTB0503			TRUE	0.997	19.000	0.611	0.069	Y	NA
619140	619141	YPTB0503	YPTB0504			TRUE	0.997	12.000	0.364	0.069	Y	NA
619141	619142	YPTB0504	YPTB0505			TRUE	0.968	15.000	0.273	1.000		NA
619142	619143	YPTB0505	YPTB0506			FALSE	0.210	129.000	0.032	1.000		NA
619143	619144	YPTB0506	YPTB0507			FALSE	0.258	152.000	0.056	1.000		NA
619145	619146	YPTB0508	YPTB0509	phnP	phnN	TRUE	0.987	-9.000	0.214	NA		NA
619146	619147	YPTB0509	YPTB0510	phnN	phnM	TRUE	0.997	0.000	0.235	NA	Y	NA
619147	619148	YPTB0510	YPTB0511	phnM	phnL	TRUE	0.998	-3.000	0.320	1.000	Y	NA
619148	619149	YPTB0511	YPTB0512	phnL	phnK	TRUE	0.797	389.000	0.859	0.023	Y	NA
619149	619150	YPTB0512	YPTB0513	phnK	phnJ	TRUE	0.999	0.000	0.883	1.000	Y	NA
619150	619151	YPTB0513	YPTB0514	phnJ	phnI	TRUE	0.999	-7.000	0.880	1.000	Y	NA
619151	619152	YPTB0514	YPTB0515	phnI	phnH	TRUE	1.000	0.000	0.960	0.002	Y	NA
619152	619153	YPTB0515	YPTB0516	phnH	phnG	TRUE	1.000	0.000	0.967	0.002	Y	NA
619153	619154	YPTB0516	YPTB0517	phnG	phnF	TRUE	0.996	1.000	0.691	1.000	N	NA
619154	619155	YPTB0517	YPTB0518	phnF	nrdG	FALSE	0.007	328.000	0.000	1.000	N	NA
619155	619156	YPTB0518	YPTB0519	nrdG	nrdD	TRUE	0.583	207.000	0.464	1.000	N	NA
619156	619157	YPTB0519	YPTB0520	nrdD		FALSE	0.003	434.000	0.000	1.000	N	NA
619157	619158	YPTB0520	YPTB0521			TRUE	0.999	2.000	0.550	0.023	Y	NA
619158	619159	YPTB0521	YPTB0522			TRUE	0.997	-7.000	0.324	1.000	Y	NA
619159	619160	YPTB0522	YPTB0523			TRUE	0.995	19.000	0.441	0.069	Y	NA
619160	619161	YPTB0523	YPTB0524			TRUE	0.952	96.000	0.400	0.069	Y	NA
619165	619166	YPTB0528	YPTB0529	yjgM	valS	TRUE	0.513	143.000	0.008	1.000	Y	NA
619166	619167	YPTB0529	YPTB0530	valS	holC	TRUE	0.768	13.000	0.089	1.000	N	NA
619167	619168	YPTB0530	YPTB0531	holC	pepA	TRUE	0.725	151.000	0.494	1.000	N	NA
619169	619170	YPTB0532	YPTB0533	yjgP	yjgQ	TRUE	0.999	0.000	0.631	0.092		NA
619170	619171	YPTB0533	YPTB_RNA_21	yjgQ	tRNA-Leu3	FALSE	0.316	105.000	0.000	NA		NA
619171	619172	YPTB_RNA_21	YPTB0534	tRNA-Leu3		FALSE	0.196	199.000	0.000	NA		NA
619173	619174	YPTB0535	YPTB0536			TRUE	0.994	10.000	0.088	0.001	Y	NA
619174	619175	YPTB0536	YPTB0537			TRUE	0.994	2.000	0.072	0.065	Y	NA
619175	619176	YPTB0537	YPTB0538			FALSE	0.006	343.000	0.000	1.000	N	NA
619176	619177	YPTB0538	YPTB0539			TRUE	0.962	47.000	0.637	NA		NA
619178	619179	YPTB0540	YPTB0541			TRUE	0.945	2.000	0.000	1.000		NA
619180	619181	YPTB0542	YPTB0543	frwD	frwB	TRUE	0.837	93.000	0.000	0.007	Y	NA
619181	619182	YPTB0543	YPTB0544	frwB	frwC	TRUE	0.958	123.000	0.400	0.007	Y	NA
619184	619185	YPTB0546	YPTB0547		yneC	FALSE	0.049	323.000	0.000	NA		NA
619185	619186	YPTB0547	YPTB0548	yneC	yneB	FALSE	0.323	64.000	0.028	1.000		NA
619186	619187	YPTB0548	YPTB0549	yneB		TRUE	0.806	56.000	0.062	NA	Y	NA
619187	619188	YPTB0549	YPTB0550		ydeZ	TRUE	0.990	45.000	0.844	NA	Y	NA
619188	619189	YPTB0550	YPTB0551	ydeZ	ydeY	TRUE	1.000	-3.000	0.788	0.015	Y	NA
619189	619190	YPTB0551	YPTB0552	ydeY	ego	TRUE	0.999	-6.000	0.818	1.000	Y	NA
619191	619192	YPTB0553	YPTB0554	ydeW	ydeV	TRUE	0.381	171.000	0.200	1.000	N	NA
619192	619193	YPTB0554	YPTB0555	ydeV		FALSE	0.003	469.000	0.000	1.000	N	NA
619193	619194	YPTB0555	YPTB0556			TRUE	0.883	48.000	0.105	NA	Y	NA
619194	619195	YPTB0556	YPTB0557			FALSE	0.007	366.000	0.000	NA	N	NA
619195	619196	YPTB0557	YPTB0558			FALSE	0.156	47.000	0.000	1.000	N	NA
619196	619197	YPTB0558	YPTB0559			TRUE	0.946	2.000	0.056	1.000		NA
619197	619198	YPTB0559	YPTB0560			TRUE	0.951	2.000	0.000	NA		NA
619198	619199	YPTB0560	YPTB0561			TRUE	0.666	33.000	0.000	NA		NA
619201	619202	YPTB0563	YPTB0564			TRUE	0.725	27.000	0.000	NA		NA
619202	619203	YPTB0564	YPTB0565			TRUE	0.531	52.000	0.000	NA		NA
619203	619204	YPTB0565	YPTB0566			TRUE	0.977	0.000	0.185	NA	N	NA
619205	619206	YPTB0567	YPTB0568			TRUE	0.800	147.000	0.429	NA		NA
619210	619211	YPTB_RNA_84	YPTB_RNA_83	tRNA-Leu8	tRNA-Leu7	FALSE	0.334	96.000	0.000	NA		NA
619211	619212	YPTB_RNA_83	YPTB_RNA_82	tRNA-Leu7	tRNA-Leu6	FALSE	0.331	97.000	0.000	NA		NA
619212	619213	YPTB_RNA_82	YPTB0572	tRNA-Leu6	rsmC	FALSE	0.092	257.000	0.000	NA		NA
619214	619215	YPTB0573	YPTB0574	holD	rimI	TRUE	0.963	-55.000	0.121	1.000		NA
619215	619216	YPTB0574	YPTB0575	rimI	prfC	FALSE	0.155	178.000	0.026	1.000		NA
619216	619217	YPTB0575	YPTB0576	prfC	osmY	FALSE	0.046	328.000	0.000	NA		NA
619217	619218	YPTB0576	YPTB0577	osmY		TRUE	0.470	167.000	0.140	NA		NA
619218	619219	YPTB0577	YPTB0578		yjjU	TRUE	0.717	74.000	0.211	NA		NA
619219	619220	YPTB0578	YPTB0579	yjjU	yjjV	TRUE	0.633	37.000	0.057	NA		NA
619220	619221	YPTB0579	YPTB0580	yjjV		FALSE	0.000	535.000	0.027	NA	N	NA
619221	619222	YPTB0580	YPTB0581		deoC	FALSE	0.037	629.000	0.000	1.000	Y	NA
619222	619223	YPTB0581	YPTB0582	deoC	deoA	TRUE	0.866	121.000	0.286	1.000	Y	NA
619223	619224	YPTB0582	YPTB0583	deoA	deoB	TRUE	0.670	132.000	0.398	1.000	N	NA
619224	619225	YPTB0583	YPTB0584	deoB	deoD	TRUE	0.699	125.000	0.414	1.000	N	NA
619227	619228	YPTB0586	YPTB0587	serB	radA	FALSE	0.014	119.000	0.024	1.000	N	NA
619228	619229	YPTB0587	YPTB0588	radA	nadR	FALSE	0.011	159.000	0.021	1.000	N	NA
619229	619230	YPTB0588	YPTB0589	nadR		FALSE	0.251	157.000	0.000	1.000		NA
619231	619232	YPTB0590	YPTB0591	yjjK		FALSE	0.122	183.000	0.005	1.000		NA
619232	619233	YPTB0591	YPTB0592			TRUE	0.978	6.000	0.290	1.000	N	NA
619233	619234	YPTB0592	YPTB0593			TRUE	0.952	21.000	0.259	NA		NA
619234	619235	YPTB0593	YPTB0594			FALSE	0.030	375.000	0.000	NA		NA
619236	619237	YPTB0595	YPTB0596	slt	trpR	FALSE	0.107	271.000	0.167	1.000	N	NA
619243	619244	YPTB0602	YPTB0603	thrA	thrB	TRUE	0.992	3.000	0.133	1.000	Y	NA
619244	619245	YPTB0603	YPTB0604	thrB	thrC	TRUE	0.995	4.000	0.233	1.000	Y	NA
619247	619248	YPTB0606	YPTB0607	talB	mog	FALSE	0.002	288.000	0.042	1.000	N	NA
619248	619249	YPTB0607	YPTB0608	mog		FALSE	0.013	128.000	0.039	1.000	N	NA
619250	619251	YPTB0609	YPTB0610		yaaH	FALSE	0.066	291.000	0.000	NA		NA
619252	619253	YPTB0611	YPTB0612	dnaK	dnaJ	TRUE	0.936	112.000	0.236	0.003	Y	NA
619253	619254	YPTB0612	YPTB0613	dnaJ	nhaA	FALSE	0.004	243.000	0.022	1.000	N	NA
619254	619255	YPTB0613	YPTB0614	nhaA	nhaR	TRUE	0.578	130.000	0.292	1.000	N	NA
619257	619258	YPTB0616	YPTB0617	ribF	ileS	TRUE	0.848	32.000	0.254	1.000	N	NA
619258	619259	YPTB0617	YPTB0618	ileS	lspA	TRUE	0.530	0.000	0.045	1.000	N	NA
619259	619260	YPTB0618	YPTB0619	lspA	fkpB	TRUE	0.458	68.000	0.154	1.000	N	NA
619260	619261	YPTB0619	YPTB0620	fkpB	lytB	TRUE	0.994	-19.000	0.626	1.000	N	NA
619261	619262	YPTB0620	YPTB0621	lytB	tnp	FALSE	0.021	230.000	0.000	1.000	N	NA
619262	619263	YPTB0621	YPTB0622	tnp	dapB	FALSE	0.002	491.000	0.000	1.000	N	NA
619263	619264	YPTB0622	YPTB0623	dapB	carA	FALSE	0.052	473.000	0.034	1.000	Y	NA
619264	619265	YPTB0623	YPTB0624	carA	carB	TRUE	0.997	16.000	0.345	0.001	Y	NA
619267	619268	YPTB0626	YPTB0627	yjjP		TRUE	0.998	-9.000	0.704	NA		NA
619268	619269	YPTB0627	YPTB0628		folA	TRUE	0.408	150.000	0.104	NA		NA
619269	619270	YPTB0628	YPTB0629	folA		FALSE	0.016	491.000	0.000	NA		NA
619270	619271	YPTB0629	YPTB0630			TRUE	0.386	73.000	0.000	NA		NA
619272	619273	YPTB0631	YPTB0632	apaH	apaG	TRUE	0.937	17.000	0.267	NA	N	NA
619273	619274	YPTB0632	YPTB0633	apaG	ksgA	TRUE	0.735	14.000	0.078	NA	N	NA
619274	619275	YPTB0633	YPTB0634	ksgA	pdxA	TRUE	0.973	-7.000	0.197	1.000	N	NA
619275	619276	YPTB0634	YPTB0635	pdxA	surA	TRUE	0.993	-16.000	0.561	1.000	N	NA
619276	619277	YPTB0635	YPTB0636	surA	imp	TRUE	0.522	68.000	0.182	1.000	N	NA
619279	619280	YPTB0638	YPTB0639	rluA		FALSE	0.007	1223.000	0.000	NA		NA
619281	619282	YPTB0640	YPTB0641			TRUE	0.997	11.000	1.000	NA		NA
619282	619283	YPTB0641	YPTB0642			TRUE	0.998	0.000	0.700	NA		NA
619283	619284	YPTB0642	YPTB0643			TRUE	0.823	163.000	0.500	NA		NA
619284	619285	YPTB0643	YPTB0644			TRUE	0.934	74.000	0.714	NA		NA
619285	619286	YPTB0644	YPTB0645			TRUE	0.966	33.000	0.533	NA		NA
619286	619287	YPTB0645	YPTB0646			TRUE	0.997	-7.000	0.533	NA		NA
619287	619288	YPTB0646	YPTB0647		clpB	TRUE	0.994	3.000	0.400	NA		NA
619288	619289	YPTB0647	YPTB0648	clpB		FALSE	0.317	104.000	0.000	NA		NA
619289	619290	YPTB0648	YPTB0649			TRUE	0.878	13.000	0.000	NA		NA
619290	619291	YPTB0649	YPTB0650			TRUE	0.736	26.000	0.000	NA		NA
619291	619292	YPTB0650	YPTB0651			TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
619292	619293	YPTB0651	YPTB0652			TRUE	0.932	6.000	0.000	NA		NA
619293	619294	YPTB0652	YPTB0653			TRUE	0.998	-7.000	0.667	NA		NA
619294	619295	YPTB0653	YPTB0654			FALSE	0.307	120.000	0.000	NA		NA
619295	619296	YPTB0654	YPTB0655			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
619296	619297	YPTB0655	YPTB0656			TRUE	0.995	9.000	0.615	NA		NA
619297	619298	YPTB0656	YPTB0657			TRUE	0.993	22.000	1.000	NA		NA
619299	619300	YPTB0658	YPTB0659	rapA	polB	FALSE	0.163	461.000	0.098	0.064	Y	NA
619302	619303	YPTB0661	YPTB0662	thiQ	thiP	TRUE	0.996	-13.000	0.522	0.020	N	NA
619303	619304	YPTB0662	YPTB0663	thiP	tbpA	TRUE	0.997	-24.000	0.697	0.094	N	NA
619306	619307	YPTB0665	YPTB0666			TRUE	0.725	27.000	0.000	NA		NA
619307	619308	YPTB0666	YPTB0667		yabN	FALSE	0.260	143.000	0.000	1.000		NA
619310	619311	YPTB0669	YPTB0670	leuD	leuC	TRUE	0.996	15.000	0.309	0.001	Y	NA
619311	619312	YPTB0670	YPTB0671	leuC	leuB	TRUE	0.999	2.000	0.275	0.001	Y	NA
619312	619313	YPTB0671	YPTB0672	leuB	leuA	TRUE	0.997	3.000	0.126	0.001	Y	NA
619314	619315	YPTB0673	YPTB0674	leuO		FALSE	0.001	553.000	0.050	1.000	N	NA
619315	619316	YPTB0674	YPTB0675		ilvI	FALSE	0.003	460.000	0.000	1.000	N	NA
619316	619317	YPTB0675	YPTB0676	ilvI	ilvH	TRUE	0.999	3.000	0.371	0.002	Y	NA
619317	619318	YPTB0676	YPTB0677	ilvH	fruR	FALSE	0.004	468.000	0.063	1.000	N	NA
619320	619321	YPTB0679	YPTB0680	mraZ	mraW	TRUE	0.997	3.000	0.635	NA		NA
619321	619322	YPTB0680	YPTB0681	mraW	ftsL	TRUE	0.983	-3.000	0.227	1.000	N	NA
619322	619323	YPTB0681	YPTB0682	ftsL	ftsI	TRUE	0.381	66.000	0.124	1.000	N	NA
619323	619324	YPTB0682	YPTB0683	ftsI	murE	TRUE	0.986	2.000	0.059	1.000	Y	NA
619324	619325	YPTB0683	YPTB0684	murE	murF	TRUE	1.000	-3.000	0.569	0.002	Y	NA
619325	619326	YPTB0684	YPTB0685	murF	mraY	TRUE	0.999	-6.000	0.309	0.004	Y	NA
619326	619327	YPTB0685	YPTB0686	mraY	murD	TRUE	0.999	3.000	0.647	0.004	Y	NA
619327	619328	YPTB0686	YPTB0687	murD	ftsW	TRUE	0.996	0.000	0.297	0.003	N	NA
619328	619329	YPTB0687	YPTB0688	ftsW	murG	TRUE	0.996	-3.000	0.647	1.000	N	NA
619329	619330	YPTB0688	YPTB0689	murG	murC	TRUE	0.852	138.000	0.283	1.000	Y	NA
619330	619331	YPTB0689	YPTB0690	murC	ddlB	TRUE	0.998	-7.000	0.153	0.004	Y	NA
619331	619332	YPTB0690	YPTB0691	ddlB	ftsQ	TRUE	0.998	2.000	0.372	NA	Y	NA
619332	619333	YPTB0691	YPTB0692	ftsQ	ftsA	TRUE	0.932	27.000	0.389	NA	N	NA
619333	619334	YPTB0692	YPTB0693	ftsA	ftsZ	TRUE	0.943	73.000	0.460	1.000	Y	NA
619334	619335	YPTB0693	YPTB0694	ftsZ	lpxC	FALSE	0.330	97.000	0.134	1.000	N	NA
619337	619338	YPTB0696	YPTB0697	secM	secA	TRUE	0.381	78.000	0.065	1.000		NA
619338	619339	YPTB0697	YPTB0698	secA	mutT	FALSE	0.002	295.000	0.003	1.000	N	NA
619339	619340	YPTB0698	YPTB0699	mutT	tnpA	FALSE	0.027	215.000	0.000	1.000	N	NA
619341	619342	YPTB0700	YPTB0701	yacG	yacF	TRUE	0.636	208.000	0.356	NA		NA
619342	619343	YPTB0701	YPTB0702	yacF	coaE	TRUE	0.979	-3.000	0.110	NA		NA
619344	619345	YPTB0703	YPTB0704	guaC		FALSE	0.034	194.000	0.000	1.000	N	NA
619346	619347	YPTB0705	YPTB0706	hofC	hofB	TRUE	0.999	-3.000	0.571	1.000	Y	NA
619347	619348	YPTB0706	YPTB0707	hofB	ppdD	TRUE	0.999	-7.000	0.556	NA	Y	NA
619348	619349	YPTB0707	YPTB0708	ppdD	nadC	FALSE	0.007	203.000	0.015	NA	N	NA
619350	619351	YPTB0709	YPTB0710	ampD	ampE	TRUE	0.515	273.000	0.249	1.000	Y	NA
619353	619354	YPTB0712	YPTB0713	pdhR	aceE	TRUE	0.426	196.000	0.276	1.000	N	NA
619354	619355	YPTB0713	YPTB0714	aceE	aceF	TRUE	0.986	14.000	0.220	1.000	Y	NA
619355	619356	YPTB0714	YPTB0715	aceF	lpdA	TRUE	0.623	303.000	0.463	1.000	Y	NA
619356	619357	YPTB0715	YPTB0716	lpdA	acnB	FALSE	0.045	560.000	0.000	1.000	Y	NA
619357	619358	YPTB0716	YPTB0717	acnB		FALSE	0.073	299.000	0.068	NA		NA
619359	619360	YPTB0718	YPTB0719	yddG	speD	FALSE	0.022	438.000	0.000	NA		NA
619360	619361	YPTB0719	YPTB0720	speD	speE	TRUE	0.825	78.000	0.162	1.000	Y	NA
619361	619362	YPTB0720	YPTB0721	speE	yacC	TRUE	0.782	117.000	0.354	NA		NA
619363	619364	YPTB0722	YPTB0723	yacK	hpt	FALSE	0.006	220.000	0.010	1.000	N	NA
619366	619367	YPTB0725	YPTB0726	yadG	yadH	TRUE	0.999	-3.000	0.688	1.000	Y	NA
619367	619368	YPTB0726	YPTB0727	yadH	yadE	FALSE	0.007	322.000	0.000	1.000	N	NA
619369	619370	YPTB0728	YPTB0729	panD	panC	FALSE	0.310	411.000	0.342	1.000	Y	NA
619370	619371	YPTB0729	YPTB0730	panC	panB	TRUE	0.972	88.000	0.395	0.001	Y	NA
619371	619372	YPTB0730	YPTB0731	panB	folK	FALSE	0.346	266.000	0.117	1.000	Y	NA
619372	619373	YPTB0731	YPTB0732	folK	pcnB	TRUE	0.966	8.000	0.234	1.000	N	NA
619373	619374	YPTB0732	YPTB0733	pcnB	yadB	TRUE	0.780	89.000	0.131	1.000	Y	NA
619374	619375	YPTB0733	YPTB0734	yadB	dksA	FALSE	0.158	280.000	0.231	1.000	N	NA
619375	619376	YPTB0734	YPTB0735	dksA	sfsA	TRUE	0.485	170.000	0.151	NA		NA
619376	619377	YPTB0735	YPTB0736	sfsA	ligT	FALSE	0.276	113.000	0.045	NA		NA
619378	619379	YPTB0737	YPTB0738	hrp	mrcB	TRUE	0.632	109.000	0.158	0.016	N	NA
619379	619380	YPTB0738	YPTB0739	mrcB	fhuC	FALSE	0.007	322.000	0.000	1.000	N	NA
619380	619381	YPTB0739	YPTB0740	fhuC	fhuD	TRUE	0.991	0.000	0.094	1.000	Y	NA
619381	619382	YPTB0740	YPTB0741	fhuD	fhuB	TRUE	0.999	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
619384	619385	YPTB0743	YPTB0744	yadQ	yadR	FALSE	0.225	136.000	0.031	NA		NA
619386	619387	YPTB0745	YPTB0746	yadS	yadT	TRUE	0.990	0.000	0.213	NA		NA
619387	619388	YPTB0746	YPTB0747	yadT	mtn	TRUE	0.875	0.000	0.073	1.000	N	NA
619389	619390	YPTB0748	YPTB0749	dgt	htrA	FALSE	0.123	198.000	0.101	1.000	N	NA
619392	619393	YPTB0751	YPTB0752	relA		TRUE	0.546	50.000	0.000	NA		NA
619393	619394	YPTB0752	YPTB0753		mazG	TRUE	0.927	7.000	0.000	NA		NA
619394	619395	YPTB0753	YPTB0754	mazG	pyrG	FALSE	0.106	212.000	0.025	1.000		NA
619395	619396	YPTB0754	YPTB0755	pyrG	eno	FALSE	0.127	81.000	0.068	1.000	N	NA
619396	619397	YPTB0755	YPTB0756	eno	sodC	FALSE	0.004	372.000	0.000	1.000	N	NA
619397	619398	YPTB0756	YPTB0757	sodC	ygcF	FALSE	0.014	104.000	0.004	1.000	N	NA
619400	619401	YPTB0759	YPTB0760	cysJ	cysI	TRUE	1.000	0.000	0.791	0.001	Y	NA
619401	619402	YPTB0760	YPTB0761	cysI	cysH	TRUE	0.948	-3.000	0.116	1.000	N	NA
619403	619404	YPTB0762	YPTB0763			TRUE	0.393	175.000	0.118	NA		NA
619405	619406	YPTB0764	YPTB0765	cysG	cysD	TRUE	0.995	11.000	0.417	1.000	Y	NA
619406	619407	YPTB0765	YPTB0766	cysD	cysN	TRUE	0.937	93.000	0.574	0.001	N	NA
619407	619408	YPTB0766	YPTB0767	cysN	cysC	TRUE	0.997	2.000	0.340	1.000	Y	NA
619408	619409	YPTB0767	YPTB0768	cysC	ygbE	TRUE	0.496	191.000	0.198	NA		NA
619409	619410	YPTB0768	YPTB0769	ygbE	ygbQ	FALSE	0.036	317.000	0.028	NA		NA
619410	619411	YPTB0769	YPTB0770	ygbQ	ispD	TRUE	0.963	4.000	0.185	1.000	N	NA
619411	619412	YPTB0770	YPTB0771	ispD	ispF	TRUE	0.903	139.000	0.419	1.000	Y	NA
619412	619413	YPTB0771	YPTB0772	ispF	ygbO	TRUE	0.964	11.000	0.173	1.000		NA
619413	619414	YPTB0772	YPTB0773	ygbO	surE	TRUE	0.985	-22.000	0.235	1.000		NA
619414	619415	YPTB0773	YPTB0774	surE	pcm	TRUE	0.994	-6.000	0.353	1.000		NA
619415	619416	YPTB0774	YPTB0775	pcm	nlpD	FALSE	0.014	104.000	0.030	1.000	N	NA
619416	619417	YPTB0775	YPTB0776	nlpD	rpoS	TRUE	0.526	55.000	0.142	1.000	N	NA
619418	619419	YPTB0777	YPTB0778	tnpA	mutS	FALSE	0.151	326.000	0.000	1.000	Y	NA
619419	619420	YPTB0778	YPTB0779	mutS	rpiB	FALSE	0.001	843.000	0.000	1.000	N	NA
619421	619422	YPTB0780	YPTB0781	ydjJ		TRUE	0.524	64.000	0.000	0.027	N	NA
619422	619423	YPTB0781	YPTB0782			FALSE	0.080	87.000	0.058	1.000	N	NA
619423	619424	YPTB0782	YPTB0783			TRUE	0.998	7.000	0.211	0.001	Y	NA
619425	619426	YPTB0784	YPTB0785		arsB	FALSE	0.002	567.000	0.000	1.000	N	NA
619426	619427	YPTB0785	YPTB0786	arsB	arsR	FALSE	0.070	85.000	0.000	1.000	N	NA
619427	619428	YPTB0786	YPTB0787	arsR		FALSE	0.094	247.000	0.000	1.000		NA
619428	619429	YPTB0787	YPTB0788			FALSE	0.200	196.000	0.000	NA		NA
619429	619430	YPTB0788	YPTB0789			FALSE	0.023	421.000	0.000	NA		NA
619430	619431	YPTB0789	YPTB0790		yhjA	FALSE	0.095	65.000	0.000	1.000	N	NA
619431	619432	YPTB0790	YPTB0791	yhjA		FALSE	0.123	237.000	0.000	NA		NA
619433	619434	YPTB0792	YPTB0793			FALSE	0.021	442.000	0.000	NA		NA
619435	619436	YPTB0794	YPTB0795	map		TRUE	0.996	-3.000	0.410	NA		NA
619436	619437	YPTB0795	YPTB0796		fumA	FALSE	0.295	130.000	0.000	NA		NA
619437	619438	YPTB0796	YPTB0797	fumA	sgbK	FALSE	0.004	398.000	0.000	1.000	N	NA
619438	619439	YPTB0797	YPTB0798	sgbK	sgbU	TRUE	0.999	11.000	1.000	0.023	Y	NA
619439	619440	YPTB0798	YPTB0799	sgbU		TRUE	0.794	181.000	0.250	1.000	Y	NA
619440	619441	YPTB0799	YPTB0800			TRUE	0.999	13.000	0.938	0.093	Y	NA
619441	619442	YPTB0800	YPTB0801			TRUE	0.999	-7.000	0.941	1.000	Y	NA
619442	619443	YPTB0801	YPTB0802			TRUE	0.971	149.000	0.941	NA	Y	NA
619443	619444	YPTB0802	YPTB0803			TRUE	0.828	158.000	0.235	NA	Y	NA
619445	619446	YPTB0804	YPTB0805	araD	dmsA	FALSE	0.003	450.000	0.000	1.000	N	NA
619446	619447	YPTB0805	YPTB0806	dmsA	dmsB	TRUE	0.989	12.000	0.103	0.045	Y	NA
619447	619448	YPTB0806	YPTB0807	dmsB	dmsC	TRUE	0.996	2.000	0.500	1.000		NA
619448	619449	YPTB0807	YPTB0808	dmsC		TRUE	0.442	146.000	0.125	1.000		NA
619450	619451	YPTB0809	YPTB0810	cybB	cybC	TRUE	0.758	147.000	0.000	0.045	Y	NA
619451	619452	YPTB0810	YPTB0811	cybC	katY	TRUE	0.536	76.000	0.000	0.006	N	NA
619453	619454	YPTB0812	YPTB0813			TRUE	0.749	93.000	0.280	NA		NA
619454	619455	YPTB0813	YPTB0814			TRUE	0.993	0.000	0.292	NA		NA
619455	619456	YPTB0814	YPTB0815			TRUE	1.000	-3.000	0.793	0.015	Y	NA
619456	619457	YPTB0815	YPTB0816			TRUE	0.449	219.000	0.075	1.000	Y	NA
619457	619458	YPTB0816	YPTB0817			TRUE	1.000	-7.000	0.860	0.001	Y	NA
619458	619459	YPTB0817	YPTB0818			TRUE	0.994	3.000	0.596	1.000	N	NA
619459	619460	YPTB0818	YPTB0819			TRUE	0.771	21.000	0.127	1.000	N	NA
619461	619462	YPTB0820	YPTB0821			FALSE	0.093	248.000	0.000	1.000		NA
619463	619464	YPTB0822	YPTB0823	ygaD	recA	TRUE	0.386	115.000	0.082	NA		NA
619464	619465	YPTB0823	YPTB0824	recA	recX	FALSE	0.144	386.000	0.296	1.000		NA
619465	619466	YPTB0824	YPTB0825	recX	alaS	FALSE	0.345	140.000	0.085	1.000		NA
619466	619467	YPTB0825	YPTB0826	alaS	csrA	FALSE	0.003	250.000	0.020	1.000	N	NA
619467	619468	YPTB0826	YPTB_RNA_22	csrA	tRNA-Ser1	FALSE	0.034	363.000	0.000	NA		NA
619468	619469	YPTB_RNA_22	YPTB_RNA_23	tRNA-Ser1	tRNA-Arg2	TRUE	0.919	9.000	0.000	NA		NA
619469	619470	YPTB_RNA_23	YPTB_RNA_24	tRNA-Arg2	tRNA-Arg3	TRUE	0.484	58.000	0.000	NA		NA
619470	619471	YPTB_RNA_24	YPTB_RNA_25	tRNA-Arg3	tRNA-Arg4	FALSE	0.368	80.000	0.000	NA		NA
619471	619472	YPTB_RNA_25	YPTB_RNA_26	tRNA-Arg4	tRNA-Pseudo1	FALSE	0.368	80.000	0.000	NA		NA
619472	619473	YPTB_RNA_26	YPTB0827	tRNA-Pseudo1	yqaB	FALSE	0.051	319.000	0.000	NA		NA
619473	619474	YPTB0827	YPTB0828	yqaB	yqaA	TRUE	0.967	-3.000	0.067	NA		NA
619474	619475	YPTB0828	YPTB0829	yqaA	gshA	TRUE	0.410	83.000	0.071	NA		NA
619475	619476	YPTB0829	YPTB0830	gshA	luxS	FALSE	0.129	168.000	0.087	1.000	N	NA
619477	619478	YPTB0831	YPTB0832	yfjD	ypjD	TRUE	0.745	162.000	0.349	NA		NA
619479	619480	YPTB0833	YPTB0834	ffh	rpsP	TRUE	0.417	228.000	0.361	1.000	N	NA
619480	619481	YPTB0834	YPTB0835	rpsP	rimM	TRUE	0.993	22.000	0.342	0.015	Y	NA
619481	619482	YPTB0835	YPTB0836	rimM	trmD	TRUE	0.987	39.000	0.672	1.000	Y	NA
619482	619483	YPTB0836	YPTB0837	trmD	rplS	TRUE	0.954	81.000	0.567	1.000	Y	NA
619484	619485	YPTB0838	YPTB0839	ydiY	dcuB	FALSE	0.049	323.000	0.000	NA		NA
619485	619486	YPTB0839	YPTB0840	dcuB		FALSE	0.020	433.000	0.000	1.000		NA
619487	619488	YPTB0841	YPTB0842	aroF	tyrA	TRUE	0.954	13.000	0.023	1.000	Y	NA
619489	619490	YPTB0843	YPTB0844	pheA	yfiA	FALSE	0.001	362.000	0.015	NA	N	NA
619490	619491	YPTB0844	YPTB0845	yfiA	yfiO	FALSE	0.021	355.000	0.004	NA		NA
619492	619493	YPTB0846	YPTB0847	rluD	yfiH	TRUE	0.984	2.000	0.168	NA		NA
619493	619494	YPTB0847	YPTB0848	yfiH	clpB	TRUE	0.436	130.000	0.108	NA		NA
619494	619495	YPTB0848	YPTB_RNA_105	clpB		FALSE	0.015	517.000	0.000	NA		NA
619495	619496	YPTB_RNA_105	YPTB_RNA_27		tRNA-Ile2	FALSE	0.322	100.000	0.000	NA		NA
619496	619497	YPTB_RNA_27	YPTB_RNA_28	tRNA-Ile2	tRNA-Ala2	TRUE	0.531	52.000	0.000	NA		NA
619497	619498	YPTB_RNA_28	YPTB_RNA_106	tRNA-Ala2		FALSE	0.158	219.000	0.000	NA		NA
619498	619499	YPTB_RNA_106	YPTB_RNA_107			FALSE	0.313	109.000	0.000	NA		NA
619500	619501	YPTB0849	YPTB0850	yfiM	pssA	TRUE	0.565	62.000	0.089	NA		NA
619501	619502	YPTB0850	YPTB0851	pssA	yfiQ	TRUE	0.444	173.000	0.121	0.053	N	NA
619502	619503	YPTB0851	YPTB0852	yfiQ	yfiP	TRUE	0.867	43.000	0.222	NA		NA
619503	619504	YPTB0852	YPTB0853	yfiP	trxC	FALSE	0.328	171.000	0.084	NA		NA
619506	619507	YPTB0855	YPTB0856	emrB	emrA	TRUE	0.968	39.000	0.875	1.000	N	NA
619507	619508	YPTB0856	YPTB0857	emrA	emrR	FALSE	0.018	384.000	0.107	1.000	N	NA
619508	619509	YPTB0857	YPTB0858	emrR	ygaH	FALSE	0.278	172.000	0.065	NA		NA
619509	619510	YPTB0858	YPTB0859	ygaH	ygaZ	TRUE	0.999	-3.000	0.915	NA		NA
619510	619511	YPTB0859	YPTB0860	ygaZ		FALSE	0.085	160.000	0.060	NA	N	NA
619511	619512	YPTB0860	YPTB0861			FALSE	0.147	224.000	0.000	NA		NA
619512	619513	YPTB0861	YPTB0862			TRUE	0.902	29.000	0.203	NA		NA
619513	619514	YPTB0862	YPTB0863			TRUE	0.982	-3.000	0.122	NA		NA
619515	619516	YPTB0864	YPTB0865			TRUE	0.951	2.000	0.000	NA		NA
619516	619517	YPTB0865	YPTB0866			FALSE	0.312	111.000	0.000	NA		NA
619517	619518	YPTB0866	YPTB0867			TRUE	0.999	13.000	0.765	0.067	Y	NA
619518	619519	YPTB0867	YPTB0868			TRUE	0.999	-3.000	0.433	0.020	Y	NA
619519	619520	YPTB0868	YPTB0869			TRUE	0.998	-19.000	0.532	1.000	Y	NA
619520	619521	YPTB0869	YPTB0870			TRUE	0.882	32.000	0.054	1.000	Y	NA
619521	619522	YPTB0870	YPTB0871			TRUE	0.992	0.000	0.108	1.000	Y	NA
619523	619524	YPTB0872	YPTB0873	yafV	ybdL	TRUE	0.938	-12.000	0.055	1.000		NA
619525	619526	YPTB0874	YPTB0875			TRUE	0.974	-3.000	0.174	1.000	N	NA
619526	619527	YPTB0875	YPTB0876			TRUE	0.680	99.000	0.231	1.000		NA
619529	619530	YPTB0878	YPTB0879		rscB	FALSE	0.007	1203.000	0.000	NA		NA
619530	619531	YPTB0879	YPTB0880	rscB	rscA	TRUE	0.843	41.000	0.188	NA		NA
619531	619532	YPTB0880	YPTB0881	rscA	rcsC	TRUE	0.436	155.000	0.125	1.000		NA
619532	619533	YPTB0881	YPTB0882	rcsC		TRUE	0.945	2.000	0.000	1.000		NA
619535	619536	YPTB0884	YPTB0885	lpcA	yafJ	TRUE	0.504	203.000	0.229	1.000		NA
619538	619539	YPTB0887	YPTB0888	nqrA	nqrB	TRUE	1.000	4.000	0.854	0.002	Y	NA
619539	619540	YPTB0888	YPTB0889	nqrB	nqrC	TRUE	0.999	-10.000	0.603	0.002	Y	NA
619540	619541	YPTB0889	YPTB0890	nqrC	nqrD	TRUE	0.999	-7.000	0.312	0.002	Y	NA
619541	619542	YPTB0890	YPTB0891	nqrD	nqrE	TRUE	0.997	7.000	0.188	0.002	Y	NA
619542	619543	YPTB0891	YPTB0892	nqrE	nqrF	TRUE	0.998	16.000	0.551	0.002	Y	NA
619543	619544	YPTB0892	YPTB0893	nqrF	apbE	TRUE	0.921	41.000	0.519	1.000	N	NA
619544	619545	YPTB0893	YPTB0894	apbE		TRUE	0.988	13.000	0.481	NA		NA
619550	619551	YPTB0899	YPTB0900			FALSE	0.199	197.000	0.000	NA		NA
619552	619553	YPTB0901	YPTB0902	gpt	yafA	TRUE	0.470	127.000	0.120	NA		NA
619553	619554	YPTB0902	YPTB0903	yafA	crl	TRUE	0.593	60.000	0.095	NA		NA
619554	619555	YPTB0903	YPTB0904	crl	proB	TRUE	0.632	177.000	0.262	NA		NA
619555	619556	YPTB0904	YPTB0905	proB	proA	TRUE	0.991	10.000	0.026	0.001	Y	NA
619556	619557	YPTB0905	YPTB0906	proA		FALSE	0.010	328.000	0.000	NA	N	NA
619557	619558	YPTB0906	YPTB0907			FALSE	0.217	183.000	0.053	NA		NA
619558	619559	YPTB0907	YPTB0908		yafE	FALSE	0.107	246.000	0.000	NA		NA
619561	619562	YPTB0910	YPTB0911		aroL	FALSE	0.016	247.000	0.000	1.000	N	NA
619562	619563	YPTB0911	YPTB0912	aroL	yaiE	FALSE	0.010	497.000	0.016	NA		NA
619566	619567	YPTB0915	YPTB0916	sbcC	sbcD	TRUE	0.999	-3.000	0.669	0.001	N	NA
619568	619569	YPTB0917	YPTB0918	phoB	phoR	TRUE	0.993	25.000	0.453	0.074	Y	NA
619569	619570	YPTB0918	YPTB0919	phoR	pstS	TRUE	0.831	22.000	0.168	1.000	N	NA
619570	619571	YPTB0919	YPTB0920	pstS	brnQ	FALSE	0.002	474.000	0.000	1.000	N	NA
619571	619572	YPTB0920	YPTB0921	brnQ	proY	TRUE	0.934	76.000	0.261	0.089	Y	NA
619572	619573	YPTB0921	YPTB0922	proY	malZ	FALSE	0.009	595.000	0.123	1.000	N	NA
619573	619574	YPTB0922	YPTB0923	malZ		FALSE	0.191	155.000	0.031	1.000		NA
619575	619576	YPTB0924	YPTB0925	ggt	ahpC	FALSE	0.004	390.000	0.000	1.000	N	NA
619576	619577	YPTB0925	YPTB0926	ahpC	yajB	FALSE	0.022	339.000	0.014	1.000		NA
619578	619579	YPTB0927	YPTB0928	queA	tgt	TRUE	0.968	93.000	0.360	0.001	Y	NA
619579	619580	YPTB0928	YPTB0929	tgt	yajC	TRUE	0.645	112.000	0.325	NA	N	NA
619580	619581	YPTB0929	YPTB0930	yajC	secD	TRUE	0.898	28.000	0.045	NA	Y	NA
619581	619582	YPTB0930	YPTB0931	secD	secF	TRUE	0.997	11.000	0.206	0.001	Y	NA
619582	619583	YPTB0931	YPTB0932	secF		FALSE	0.098	252.000	0.000	NA		NA
619583	619584	YPTB0932	YPTB0933		ybaD	TRUE	0.394	71.000	0.000	NA		NA
619584	619585	YPTB0933	YPTB0934	ybaD	ribD	TRUE	0.554	150.000	0.277	NA	N	NA
619585	619586	YPTB0934	YPTB0935	ribD	ribH	TRUE	0.805	136.000	0.034	0.002	Y	NA
619586	619587	YPTB0935	YPTB0936	ribH	nusB	TRUE	0.941	21.000	0.347	1.000	N	NA
619587	619588	YPTB0936	YPTB0937	nusB	thiL	FALSE	0.230	241.000	0.225	1.000	N	NA
619588	619589	YPTB0937	YPTB0938	thiL	pgpA	TRUE	0.975	-7.000	0.206	1.000	N	NA
619590	619591	YPTB0939	YPTB0940	dxs	ispA	TRUE	0.588	156.000	0.060	1.000	Y	NA
619591	619592	YPTB0940	YPTB0941	ispA	xseB	FALSE	0.311	5.000	0.035	1.000	N	NA
619593	619594	YPTB0942	YPTB0943		thiI	FALSE	0.328	98.000	0.000	NA		NA
619595	619596	YPTB0944	YPTB0945	thiJ	panE	TRUE	0.975	-37.000	0.155	NA		NA
619598	619599	YPTB0947	YPTB0948	yajR	cyoE	FALSE	0.019	478.000	0.061	0.089	N	NA
619599	619600	YPTB0948	YPTB0949	cyoE	cyoD	TRUE	0.950	11.000	0.118	0.089	N	NA
619600	619601	YPTB0949	YPTB0950	cyoD	cyoC	TRUE	0.999	0.000	0.485	0.045	Y	NA
619601	619602	YPTB0950	YPTB0951	cyoC	cyoB	TRUE	0.999	-10.000	0.697	0.045	Y	NA
619602	619603	YPTB0951	YPTB0952	cyoB	cyoA	TRUE	0.997	5.000	0.204	0.006	Y	NA
619603	619604	YPTB0952	YPTB0953	cyoA	yfeN	FALSE	0.032	370.000	0.000	NA		NA
619604	619605	YPTB0953	YPTB0954	yfeN	ampG	FALSE	0.066	292.000	0.000	NA		NA
619605	619606	YPTB0954	YPTB0955	ampG	yajG	TRUE	0.565	117.000	0.256	NA	N	NA
619607	619608	YPTB0956	YPTB0957	bolA		FALSE	0.188	141.000	0.011	NA		NA
619608	619609	YPTB0957	YPTB0958		tig	FALSE	0.258	73.000	0.002	NA		NA
619609	619610	YPTB0958	YPTB0959	tig	clpP	FALSE	0.267	462.000	0.351	1.000	Y	NA
619610	619611	YPTB0959	YPTB0960	clpP	clpX	TRUE	0.809	206.000	0.352	1.000	Y	NA
619611	619612	YPTB0960	YPTB0961	clpX	lon	TRUE	0.716	195.000	0.201	1.000	Y	NA
619612	619613	YPTB0961	YPTB0962	lon	hupB	FALSE	0.006	218.000	0.005	1.000	N	NA
619613	619614	YPTB0962	YPTB0963	hupB	ppiD	FALSE	0.004	301.000	0.046	1.000	N	NA
619614	619615	YPTB0963	YPTB0964	ppiD		FALSE	0.052	140.000	0.000	1.000	N	NA
619615	619616	YPTB0964	YPTB0965		ybaW	FALSE	0.033	354.000	0.000	1.000		NA
619617	619618	YPTB0966	YPTB0967	ybaX		FALSE	0.029	313.000	0.019	1.000		NA
619621	619622	YPTB0970	YPTB0971	ybaO	mdlA	TRUE	0.420	102.000	0.179	1.000	N	NA
619622	619623	YPTB0971	YPTB0972	mdlA	mdlB	TRUE	1.000	-7.000	0.911	0.007	Y	NA
619623	619624	YPTB0972	YPTB0973	mdlB	glnK	FALSE	0.001	452.000	0.028	1.000	N	NA
619624	619625	YPTB0973	YPTB0974	glnK	amtB	TRUE	0.705	34.000	0.156	1.000	N	NA
619630	619631	YPTB0978	YPTB0979	ymoA		TRUE	0.632	49.000	0.080	NA		NA
619631	619632	YPTB0979	YPTB0980			TRUE	0.774	159.000	0.400	NA		NA
619632	619633	YPTB0980	YPTB0981			FALSE	0.007	864.000	0.000	1.000		NA
619633	619634	YPTB0981	YPTB0982		ykgM	TRUE	0.954	16.000	0.083	0.014		NA
619634	619635	YPTB0982	YPTB0983	ykgM	acrB	FALSE	0.009	186.000	0.008	1.000	N	NA
619635	619636	YPTB0983	YPTB0984	acrB	acrA	TRUE	0.972	17.000	0.500	1.000	N	NA
619637	619638	YPTB0985	YPTB0986	acrR	ychN	TRUE	0.747	13.000	0.075	NA	N	NA
619638	619639	YPTB0986	YPTB0987	ychN	kefA	FALSE	0.025	239.000	0.054	NA	N	NA
619640	619641	YPTB0988	YPTB0989	ybaM		TRUE	0.799	171.000	0.474	NA		NA
619642	619643	YPTB0990	YPTB0991	ybaN	apt	FALSE	0.101	239.000	0.043	NA		NA
619643	619644	YPTB0991	YPTB0992	apt	dnaX	FALSE	0.004	656.000	0.088	1.000	N	NA
619644	619645	YPTB0992	YPTB0993	dnaX	ybaB	TRUE	0.907	56.000	0.411	NA		NA
619645	619646	YPTB0993	YPTB0994	ybaB	recR	TRUE	0.998	0.000	0.604	NA		NA
619646	619647	YPTB0994	YPTB0995	recR	htpG	FALSE	0.008	192.000	0.028	1.000	N	NA
619647	619648	YPTB0995	YPTB0996	htpG	adk	FALSE	0.005	227.000	0.035	1.000	N	NA
619648	619649	YPTB0996	YPTB0997	adk	hemH	FALSE	0.016	90.000	0.008	1.000	N	NA
619649	619650	YPTB0997	YPTB0998	hemH	ddhD	FALSE	0.002	598.000	0.000	1.000	N	NA
619650	619651	YPTB0998	YPTB0999	ddhD	ddhA	FALSE	0.079	26.000	0.038	1.000	N	NA
619651	619652	YPTB0999	YPTB1000	ddhA	ddhB	TRUE	0.998	5.000	0.624	1.000	Y	NA
619652	619653	YPTB1000	YPTB1001	ddhB	ddhC	TRUE	0.983	18.000	0.247	1.000	Y	NA
619653	619654	YPTB1001	YPTB1002	ddhC	prt	TRUE	0.933	37.000	0.000	0.024	Y	NA
619654	619655	YPTB1002	YPTB1003	prt	wbyH	TRUE	0.811	1.000	0.000	NA	N	NA
619655	619656	YPTB1003	YPTB1004	wbyH	wzx	FALSE	0.349	89.000	0.000	NA		NA
619656	619657	YPTB1004	YPTB1005	wzx		TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
619657	619658	YPTB1005	YPTB1006		wbyJ	FALSE	0.250	172.000	0.000	NA		NA
619658	619659	YPTB1006	YPTB1007	wbyJ		TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
619659	619660	YPTB1007	YPTB1008		wbyK	FALSE	0.101	249.000	0.000	NA		NA
619660	619661	YPTB1008	YPTB1009	wbyK	gmd	TRUE	0.950	16.000	0.000	1.000	Y	NA
619661	619662	YPTB1009	YPTB1010	gmd	fcl	TRUE	0.998	6.000	0.254	0.009	Y	NA
619662	619663	YPTB1010	YPTB1011	fcl	manC	TRUE	0.511	166.000	0.028	1.000	Y	NA
619663	619664	YPTB1011	YPTB1012	manC	wbyL	TRUE	0.988	3.000	0.073	NA	Y	NA
619664	619665	YPTB1012	YPTB1013	wbyL	manB	TRUE	0.677	5.000	0.049	NA	N	NA
619665	619666	YPTB1013	YPTB1014	manB	wzz	FALSE	0.152	48.000	0.000	1.000	N	NA
619666	619667	YPTB1014	YPTB1015	wzz	gsk	FALSE	0.031	204.000	0.000	1.000	N	NA
619668	619669	YPTB1016	YPTB1017	rosB	rosA	TRUE	0.505	235.000	0.000	0.088	Y	NA
619671	619672	YPTB1019	YPTB1020			FALSE	0.043	337.000	0.000	NA		NA
619672	619673	YPTB1020	YPTB1021			FALSE	0.055	264.000	0.022	NA		NA
619673	619674	YPTB1021	YPTB1022		ATCU	FALSE	0.016	397.000	0.018	NA		NA
619676	619677	YPTB1024	YPTB1025			TRUE	0.997	3.000	0.313	NA	Y	NA
619677	619678	YPTB1025	YPTB1026			TRUE	0.540	195.000	0.075	NA	Y	NA
619678	619679	YPTB1026	YPTB1027			TRUE	0.529	77.000	0.118	1.000		NA
619679	619680	YPTB1027	YPTB1028		tesA	FALSE	0.031	387.000	0.072	1.000		NA
619681	619682	YPTB1029	YPTB1030	ybbA		TRUE	0.999	-3.000	0.535	NA	Y	NA
619683	619684	YPTB1031	YPTB1032	purK	purE	TRUE	0.998	-3.000	0.136	0.001	Y	NA
619684	619685	YPTB1032	YPTB1033	purE		FALSE	0.027	316.000	0.016	1.000		NA
619685	619686	YPTB1033	YPTB1034		ppiB	TRUE	0.976	11.000	0.237	1.000		NA
619688	619689	YPTB1036	YPTB1037		folD	TRUE	0.836	15.000	0.055	1.000		NA
619691	619692	YPTB1038	YPTB1039			FALSE	0.089	259.000	0.000	NA		NA
619692	619693	YPTB1039	YPTB1040			FALSE	0.310	114.000	0.000	NA		NA
619693	619694	YPTB1040	YPTB1041			TRUE	0.941	-15.000	0.000	NA		NA
619694	619695	YPTB1041	YPTB1042			FALSE	0.361	83.000	0.000	NA		NA
619696	619697	YPTB1043	YPTB1044			FALSE	0.025	400.000	0.000	NA		NA
619697	619698	YPTB1044	YPTB1045			TRUE	0.995	-7.000	0.179	0.003		NA
619698	619699	YPTB1045	YPTB1046			TRUE	0.979	10.000	0.238	1.000		NA
619699	619700	YPTB1046	YPTB1047			TRUE	0.990	-3.000	0.054	NA	Y	NA
619700	619701	YPTB1047	YPTB1048			TRUE	0.997	-7.000	0.285	NA	Y	NA
619701	619702	YPTB1048	YPTB1049			TRUE	0.900	12.000	0.063	NA		NA
619702	619703	YPTB1049	YPTB1050			FALSE	0.331	97.000	0.000	NA		NA
619703	619704	YPTB1050	YPTB1051			FALSE	0.059	303.000	0.000	NA		NA
619705	619706	YPTB1052	YPTB1053			TRUE	0.965	26.000	0.438	1.000		NA
619708	619709	YPTB1055	YPTB1056	bglB		FALSE	0.275	156.000	0.000	NA		NA
619709	619710	YPTB1056	YPTB1057			TRUE	0.960	-7.000	0.068	NA		NA
619711	619712	YPTB1058	YPTB1059			FALSE	0.162	218.000	0.000	NA		NA
619713	619714	YPTB1060	YPTB1061			FALSE	0.014	535.000	0.000	NA		NA
619715	619716	YPTB1062	YPTB1063			TRUE	0.612	39.000	0.000	NA		NA
619716	619717	YPTB1063	YPTB1064			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
619718	619719	YPTB1065	YPTB1066			FALSE	0.011	626.000	0.000	NA		NA
619721	619722	YPTB1068	YPTB1069	ponC		TRUE	0.638	57.000	0.116	1.000		NA
619722	619723	YPTB1069	YPTB1070			FALSE	0.009	662.000	0.000	1.000		NA
619724	619725	YPTB1071	YPTB1072			TRUE	0.760	14.000	0.093	1.000	N	NA
619725	619726	YPTB1072	YPTB1073			FALSE	0.058	294.000	0.000	1.000		NA
619726	619727	YPTB1073	YPTB1074			TRUE	0.838	126.000	0.500	1.000		NA
619727	619728	YPTB1074	YPTB1075			TRUE	0.992	49.000	0.667	0.014	Y	NA
619728	619729	YPTB1075	YPTB1076			TRUE	0.998	12.000	0.444	0.014	Y	NA
619729	619730	YPTB1076	YPTB1077			TRUE	0.908	24.000	0.176	1.000		NA
619730	619731	YPTB1077	YPTB1078			TRUE	0.560	49.000	0.064	1.000		NA
619731	619732	YPTB1078	YPTB1079			TRUE	0.505	207.000	0.086	1.000	Y	NA
619732	619733	YPTB1079	YPTB1080			TRUE	0.990	10.000	0.199	1.000	Y	NA
619736	619737	YPTB1083	YPTB1084			FALSE	0.010	655.000	0.000	NA		NA
619737	619738	YPTB1084	YPTB1085			FALSE	0.229	182.000	0.000	NA		NA
619744	619745	YPTB1091	YPTB1092	lipA	lipB	TRUE	0.929	193.000	0.319	0.001	Y	NA
619745	619746	YPTB1092	YPTB1093	lipB		TRUE	0.428	224.000	0.219	NA		NA
619746	619747	YPTB1093	YPTB1094		dacA	FALSE	0.255	198.000	0.081	NA		NA
619747	619748	YPTB1094	YPTB1095	dacA	rlpA	TRUE	0.424	403.000	0.475	NA	Y	NA
619748	619749	YPTB1095	YPTB1096	rlpA	rodA	FALSE	0.351	10.000	0.035	NA	N	NA
619749	619750	YPTB1096	YPTB1097	rodA	pbpA	FALSE	0.016	186.000	0.046	1.000	N	NA
619750	619751	YPTB1097	YPTB1098	pbpA		FALSE	0.290	82.000	0.031	NA		NA
619751	619752	YPTB1098	YPTB1099			TRUE	0.991	4.000	0.307	NA		NA
619752	619753	YPTB1099	YPTB1100		nadD	FALSE	0.113	223.000	0.032	NA		NA
619753	619754	YPTB1100	YPTB1101	nadD	holA	TRUE	0.455	-10.000	0.045	1.000	N	NA
619754	619755	YPTB1101	YPTB1102	holA	rlpB	TRUE	0.980	-3.000	0.199	NA	N	NA
619755	619756	YPTB1102	YPTB1103	rlpB	leuS	TRUE	0.910	15.000	0.182	NA	N	NA
619758	619759	YPTB1105	YPTB1106	gltL	gltK	TRUE	0.998	0.000	0.379	1.000	Y	NA
619759	619760	YPTB1106	YPTB1107	gltK	gltJ	TRUE	1.000	0.000	0.933	0.020	Y	NA
619760	619761	YPTB1107	YPTB1108	gltJ	ybeJ	TRUE	0.820	174.000	0.150	0.065	Y	NA
619761	619762	YPTB1108	YPTB1109	ybeJ	cutE	FALSE	0.001	749.000	0.000	1.000	N	NA
619762	619763	YPTB1109	YPTB1110	cutE	CorC	TRUE	0.991	8.000	0.557	1.000	N	NA
619763	619764	YPTB1110	YPTB1111	CorC		TRUE	0.545	118.000	0.150	NA		NA
619764	619765	YPTB1111	YPTB1112			TRUE	0.996	-3.000	0.457	NA		NA
619765	619766	YPTB1112	YPTB1113		miaB	FALSE	0.136	288.000	0.220	1.000	N	NA
619768	619769	YPTB_RNA_81	YPTB_RNA_80	tRNA-Gln3	tRNA-Met7	TRUE	0.932	6.000	0.000	NA		NA
619769	619770	YPTB_RNA_80	YPTB_RNA_79	tRNA-Met7	tRNA-Gln2	TRUE	0.666	33.000	0.000	NA		NA
619770	619771	YPTB_RNA_79	YPTB_RNA_78	tRNA-Gln2	tRNA-Gln1	FALSE	0.358	84.000	0.000	NA		NA
619771	619772	YPTB_RNA_78	YPTB_RNA_77	tRNA-Gln1	tRNA-Leu5	TRUE	0.694	30.000	0.000	NA		NA
619772	619773	YPTB_RNA_77	YPTB_RNA_76	tRNA-Leu5	tRNA-Met6	TRUE	0.923	8.000	0.000	NA		NA
619773	619774	YPTB_RNA_76	YPTB1115	tRNA-Met6	asnB	FALSE	0.019	458.000	0.000	NA		NA
619774	619775	YPTB1115	YPTB1116	asnB	nagD	FALSE	0.005	355.000	0.000	1.000	N	NA
619775	619776	YPTB1116	YPTB1117	nagD	nagC	TRUE	0.721	73.000	0.070	1.000	Y	NA
619776	619777	YPTB1117	YPTB1118	nagC	nagA	TRUE	0.994	17.000	0.571	1.000	Y	NA
619777	619778	YPTB1118	YPTB1119	nagA	nagB	TRUE	0.998	20.000	0.557	0.001	Y	NA
619779	619780	YPTB1120	YPTB1121	nagE	glnS	FALSE	0.006	215.000	0.018	1.000	N	NA
619780	619781	YPTB1121	YPTB1122	glnS		FALSE	0.008	706.000	0.000	1.000		NA
619781	619782	YPTB1122	YPTB1123			FALSE	0.041	328.000	0.000	1.000		NA
619783	619784	YPTB1124	YPTB1125	fur	fldA	FALSE	0.041	367.000	0.156	1.000	N	NA
619784	619785	YPTB1125	YPTB1126	fldA		TRUE	0.386	73.000	0.000	NA		NA
619785	619786	YPTB1126	YPTB1127			FALSE	0.309	116.000	0.000	NA		NA
619786	619787	YPTB1127	YPTB1128			FALSE	0.200	332.000	0.276	1.000		NA
619787	619788	YPTB1128	YPTB1129			FALSE	0.007	1125.000	0.000	NA		NA
619788	619789	YPTB1129	YPTB1130		trp1400A	FALSE	0.361	83.000	0.000	NA		NA
619789	619790	YPTB1130	YPTB1131	trp1400A	intA	TRUE	0.557	49.000	0.000	NA		NA
619791	619792	YPTB1132	YPTB1133			TRUE	0.988	0.000	0.000	1.000	Y	NA
619793	619794	YPTB1134	YPTB_RNA_88		ssrA	FALSE	0.203	195.000	0.000	NA		NA
619794	619795	YPTB_RNA_88	YPTB1135	ssrA	smpB	TRUE	0.557	49.000	0.000	NA		NA
619796	619797	YPTB1136	YPTB1137			TRUE	0.978	-7.000	0.124	NA		NA
619798	619799	YPTB1138	YPTB1139		RecN	FALSE	0.034	114.000	0.049	1.000	N	NA
619799	619800	YPTB1139	YPTB1140	RecN		TRUE	0.489	69.000	0.170	1.000	N	NA
619803	619804	YPTB1143	YPTB1144	sdhC	sdhD	TRUE	0.999	-6.000	0.453	0.001	Y	NA
619804	619805	YPTB1144	YPTB1145	sdhD	sdhA	TRUE	1.000	1.000	0.705	0.003	Y	NA
619805	619806	YPTB1145	YPTB1146	sdhA	sdhB	TRUE	0.992	50.000	0.604	0.003	Y	NA
619806	619807	YPTB1146	YPTB1147	sdhB	sucA	FALSE	0.130	356.000	0.067	1.000	Y	NA
619807	619808	YPTB1147	YPTB1148	sucA	sucB	TRUE	0.991	30.000	0.667	1.000	Y	NA
619808	619809	YPTB1148	YPTB1149	sucB	sucC	TRUE	0.756	113.000	0.136	1.000	Y	NA
619809	619810	YPTB1149	YPTB1150	sucC	sucD	TRUE	1.000	0.000	0.806	0.001	Y	NA
619810	619811	YPTB1150	YPTB1151	sucD	cydA	FALSE	0.029	768.000	0.000	1.000	Y	NA
619811	619812	YPTB1151	YPTB1152	cydA	cydB	TRUE	0.995	15.000	0.348	0.044	Y	NA
619812	619813	YPTB1152	YPTB1153	cydB		TRUE	0.951	13.000	0.149	NA		NA
619813	619814	YPTB1153	YPTB1154			TRUE	0.992	-10.000	0.310	NA		NA
619814	619815	YPTB1154	YPTB1155			TRUE	0.402	132.000	0.095	NA		NA
619815	619816	YPTB1155	YPTB1156		tolQ	TRUE	0.997	0.000	0.593	1.000		NA
619816	619817	YPTB1156	YPTB1157	tolQ	tolR	TRUE	0.998	13.000	0.556	0.090	Y	NA
619817	619818	YPTB1157	YPTB1158	tolR	tolA	FALSE	0.266	112.000	0.114	NA	N	NA
619818	619819	YPTB1158	YPTB1159	tolA	tolB	FALSE	0.065	120.000	0.051	NA	N	NA
619819	619820	YPTB1159	YPTB1160	tolB	pal	TRUE	0.917	51.000	0.592	1.000	N	NA
619820	619821	YPTB1160	YPTB1161	pal		TRUE	0.935	10.000	0.088	1.000		NA
619821	619822	YPTB1161	YPTB_RNA_30		tRNA-Lys1	FALSE	0.209	191.000	0.000	NA		NA
619822	619823	YPTB_RNA_30	YPTB_RNA_31	tRNA-Lys1	tRNA-Lys2	TRUE	0.714	28.000	0.000	NA		NA
619823	619824	YPTB_RNA_31	YPTB_RNA_32	tRNA-Lys2	tRNA-Lys3	TRUE	0.714	28.000	0.000	NA		NA
619824	619825	YPTB_RNA_32	YPTB_RNA_33	tRNA-Lys3	tRNA-Lys4	TRUE	0.714	28.000	0.000	NA		NA
619825	619826	YPTB_RNA_33	YPTB_RNA_34	tRNA-Lys4	tRNA-Lys5	TRUE	0.703	29.000	0.000	NA		NA
619826	619827	YPTB_RNA_34	YPTB_RNA_35	tRNA-Lys5	tRNA-Pseudo2	FALSE	0.328	98.000	0.000	NA		NA
619827	619828	YPTB_RNA_35	YPTB_RNA_36	tRNA-Pseudo2	tRNA-Lys6	FALSE	0.328	98.000	0.000	NA		NA
619828	619829	YPTB_RNA_36	YPTB1162	tRNA-Lys6	nadA	FALSE	0.032	369.000	0.000	NA		NA
619829	619830	YPTB1162	YPTB1163	nadA	pnuC	TRUE	0.556	122.000	0.023	1.000	Y	NA
619833	619834	YPTB1166	YPTB1167	gpmA	psiF	FALSE	0.039	347.000	0.000	NA		NA
619834	619835	YPTB1167	YPTB1168	psiF	galM	FALSE	0.066	293.000	0.000	NA		NA
619835	619836	YPTB1168	YPTB1169	galM	galK	TRUE	0.997	-6.000	0.083	0.001	Y	NA
619836	619837	YPTB1169	YPTB1170	galK	galT	TRUE	0.997	-3.000	0.370	0.001	N	NA
619837	619838	YPTB1170	YPTB1171	galT	galE	TRUE	0.963	10.000	0.053	0.001	N	NA
619838	619839	YPTB1171	YPTB1172	galE		FALSE	0.035	360.000	0.000	NA		NA
619839	619840	YPTB1172	YPTB1173		modF	FALSE	0.102	217.000	0.009	NA		NA
619840	619841	YPTB1173	YPTB1174	modF	modE	FALSE	0.212	110.000	0.028	1.000		NA
619842	619843	YPTB1175	YPTB1176		modA	FALSE	0.154	235.000	0.072	NA		NA
619843	619844	YPTB1176	YPTB1177	modA	modB	TRUE	1.000	0.000	0.627	0.001	Y	NA
619844	619845	YPTB1177	YPTB1178	modB	modC	TRUE	1.000	-6.000	0.537	0.001	Y	NA
619849	619850	YPTB1182	YPTB1183	bioB	bioF	TRUE	0.998	0.000	0.168	0.003	Y	NA
619850	619851	YPTB1183	YPTB1184	bioF	bioC	TRUE	0.997	-16.000	0.133	0.003	Y	NA
619851	619852	YPTB1184	YPTB1185	bioC	bioD	TRUE	0.995	-7.000	0.054	0.003	Y	NA
619854	619855	YPTB1187	YPTB1188	uvrB		FALSE	0.031	311.000	0.003	NA		NA
619857	619858	YPTB1190	YPTB1191	moaA	moaC	TRUE	0.633	223.000	0.039	0.003	Y	NA
619858	619859	YPTB1191	YPTB1192	moaC	moaD	TRUE	0.998	-3.000	0.175	0.003	Y	NA
619859	619860	YPTB1192	YPTB1193	moaD	moaE	TRUE	0.999	0.000	0.501	0.003	Y	NA
619860	619861	YPTB1193	YPTB1194	moaE		FALSE	0.210	143.000	0.025	NA		NA
619862	619863	YPTB1195	YPTB1196	betA	betB	TRUE	0.973	23.000	0.634	1.000	N	NA
619863	619864	YPTB1196	YPTB1197	betB	betI	TRUE	0.855	58.000	0.459	1.000	N	NA
619865	619866	YPTB1198	YPTB1199	betT		FALSE	0.018	241.000	0.000	1.000	N	NA
619868	619869	YPTB1201	YPTB1202	xapA	xapB	TRUE	0.411	139.000	0.111	1.000		NA
619871	619872	YPTB1204	YPTB1205		hydG	TRUE	0.993	-13.000	0.000	0.014	Y	NA
619872	619873	YPTB1205	YPTB1206	hydG	morB	FALSE	0.005	348.000	0.000	1.000	N	NA
619876	619877	YPTB1209	YPTB1210			TRUE	0.994	13.000	0.609	0.007	N	NA
619877	619878	YPTB1210	YPTB1211			TRUE	0.995	5.000	0.547	1.000		NA
619878	619879	YPTB1211	YPTB1212			TRUE	0.989	14.000	0.545	1.000		NA
619879	619880	YPTB1212	YPTB1213			TRUE	0.735	52.000	0.236	1.000	N	NA
619881	619882	YPTB1214	YPTB1215	rhlE		FALSE	0.031	373.000	0.000	NA		NA
619882	619883	YPTB1215	YPTB1216			FALSE	0.065	294.000	0.000	NA		NA
619883	619884	YPTB1216	YPTB1217		pbpG	FALSE	0.002	593.000	0.000	1.000	N	NA
619888	619889	YPTB1221	YPTB1222			TRUE	0.384	185.000	0.125	NA		NA
619889	619890	YPTB1222	YPTB1223		phnC	FALSE	0.119	208.000	0.032	1.000		NA
619890	619891	YPTB1223	YPTB1224	phnC	phnD	TRUE	0.994	37.000	0.589	0.002	Y	NA
619891	619892	YPTB1224	YPTB1225	phnD	phnE1	TRUE	0.975	164.000	0.568	0.001	Y	NA
619892	619893	YPTB1225	YPTB1226	phnE1	phnE2	TRUE	1.000	-3.000	0.491	0.001	Y	NA
619893	619894	YPTB1226	YPTB1227	phnE2		FALSE	0.109	245.000	0.000	NA		NA
619894	619895	YPTB1227	YPTB1228			FALSE	0.020	449.000	0.000	NA		NA
619895	619896	YPTB1228	YPTB1229			TRUE	0.951	124.000	0.654	1.000	Y	NA
619896	619897	YPTB1229	YPTB1230			TRUE	1.000	0.000	0.758	0.065	Y	NA
619897	619898	YPTB1230	YPTB1231			TRUE	0.999	-3.000	0.823	1.000		NA
619898	619899	YPTB1231	YPTB1232			TRUE	0.959	94.000	0.731	0.021		NA
619899	619900	YPTB1232	YPTB1233			FALSE	0.310	115.000	0.000	NA		NA
619900	619901	YPTB1233	YPTB1234			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
619903	619904	YPTB1236	YPTB1237			TRUE	0.426	261.000	0.521	1.000	N	NA
619904	619905	YPTB1237	YPTB1238			TRUE	0.999	-3.000	0.489	1.000	Y	NA
619905	619906	YPTB1238	YPTB1239			TRUE	0.999	-3.000	0.542	1.000	Y	NA
619906	619907	YPTB1239	YPTB1240			FALSE	0.068	454.000	0.000	1.000	Y	NA
619907	619908	YPTB1240	YPTB1241			TRUE	0.907	70.000	0.286	1.000	Y	NA
619909	619910	YPTB1242	YPTB1243			TRUE	0.432	125.000	0.103	NA		NA
619910	619911	YPTB1243	YPTB1244			FALSE	0.024	412.000	0.000	NA		NA
619915	619916	YPTB1248	YPTB1249	tyrP		FALSE	0.077	274.000	0.000	NA		NA
619918	619919	YPTB1251	YPTB1252	eco		TRUE	0.543	35.000	0.023	NA		NA
619919	619920	YPTB1252	YPTB1253		nrdB	FALSE	0.330	4.000	0.034	1.000	N	NA
619920	619921	YPTB1253	YPTB1254	nrdB	nrdA	TRUE	0.989	162.000	1.000	0.002	Y	NA
619921	619922	YPTB1254	YPTB1255	nrdA	ubiG	FALSE	0.002	494.000	0.000	1.000	N	NA
619923	619924	YPTB1256	YPTB1257	gyrA	rcsC	FALSE	0.008	188.000	0.013	1.000	N	NA
619925	619926	YPTB1258	YPTB1259	rcsB		TRUE	0.987	3.000	0.080	1.000	Y	NA
619926	619927	YPTB1259	YPTB1260			FALSE	0.305	24.000	0.000	1.000	N	NA
619927	619928	YPTB1260	YPTB_RNA_91		micF	FALSE	0.009	699.000	0.000	NA		NA
619929	619930	YPTB1261	YPTB_RNA_37		tRNA-Ser2	FALSE	0.028	384.000	0.000	NA		NA
619930	619931	YPTB_RNA_37	YPTB_RNA_38	tRNA-Ser2	tRNA-Thr3	TRUE	0.932	6.000	0.000	NA		NA
619932	619933	YPTB1262	YPTB1263	ampH		FALSE	0.017	275.000	0.000	NA	N	NA
619935	619936	YPTB1265	YPTB1266	tsr2	pla2	FALSE	0.003	407.000	0.000	1.000	N	NA
619936	619937	YPTB1266	YPTB1267	pla2	msgA	FALSE	0.229	172.000	0.000	1.000		NA
619937	619938	YPTB1267	YPTB1268	msgA		FALSE	0.166	206.000	0.000	1.000		NA
619939	619940	YPTB1269	YPTB1270			FALSE	0.192	202.000	0.000	NA		NA
619940	619941	YPTB1270	YPTB1271			FALSE	0.281	147.000	0.000	NA		NA
619941	619942	YPTB1271	YPTB1272			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
619942	619943	YPTB1272	YPTB1273			TRUE	0.997	-24.000	0.400	1.000	Y	NA
619943	619944	YPTB1273	YPTB1274			FALSE	0.011	596.000	0.000	NA		NA
619944	619945	YPTB1274	YPTB1275			TRUE	0.840	16.000	0.000	NA		NA
619945	619946	YPTB1275	YPTB1276			TRUE	0.995	5.000	0.500	NA		NA
619946	619947	YPTB1276	YPTB1277			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
619947	619948	YPTB1277	YPTB1278			TRUE	0.993	22.000	1.000	NA		NA
619948	619949	YPTB1278	YPTB1279			TRUE	0.999	2.000	1.000	NA		NA
619949	619950	YPTB1279	YPTB1280			TRUE	0.899	121.000	0.667	NA		NA
619950	619951	YPTB1280	YPTB1281			FALSE	0.105	267.000	0.074	NA		NA
619951	619952	YPTB1281	YPTB1282			TRUE	0.971	-3.000	0.074	NA		NA
619952	619953	YPTB1282	YPTB1283			TRUE	0.995	16.000	1.000	NA		NA
619953	619954	YPTB1283	YPTB1284			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
619954	619955	YPTB1284	YPTB1285			TRUE	0.998	4.000	1.000	NA		NA
619955	619956	YPTB1285	YPTB1286			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
619956	619957	YPTB1286	YPTB1287			FALSE	0.331	97.000	0.000	NA		NA
619957	619958	YPTB1287	YPTB1288			TRUE	0.951	2.000	0.000	NA		NA
619958	619959	YPTB1288	YPTB1289			FALSE	0.021	440.000	0.000	NA		NA
619959	619960	YPTB1289	YPTB1290		bglA	FALSE	0.091	291.000	0.000	0.022	N	NA
619961	619962	YPTB1291	YPTB1292			FALSE	0.012	586.000	0.000	NA		NA
619962	619963	YPTB1292	YPTB1293			TRUE	0.703	29.000	0.000	NA		NA
619963	619964	YPTB1293	YPTB1294			TRUE	0.951	2.000	0.000	NA		NA
619964	619965	YPTB1294	YPTB1295			FALSE	0.013	558.000	0.000	NA		NA
619965	619966	YPTB1295	YPTB_RNA_75		tRNA-Pro3	TRUE	0.546	50.000	0.000	NA		NA
619966	619967	YPTB_RNA_75	YPTB1296	tRNA-Pro3		FALSE	0.316	105.000	0.000	NA		NA
619967	619968	YPTB1296	YPTB1297			TRUE	0.667	28.000	0.040	NA		NA
619970	619971	YPTB1299	YPTB1300	rplY		FALSE	0.291	162.000	0.024	0.014	N	NA
619972	619973	YPTB1301	YPTB1302	rsuA	bcr	FALSE	0.256	179.000	0.145	1.000	N	NA
619973	619974	YPTB1302	YPTB1303	bcr		FALSE	0.007	1003.000	0.000	NA		NA
619975	619976	YPTB1304	YPTB1305	yejF	yejE	TRUE	0.998	2.000	0.758	1.000		NA
619976	619977	YPTB1305	YPTB1306	yejE	yejB	TRUE	0.999	0.000	0.833	0.064		NA
619977	619978	YPTB1306	YPTB1307	yejB	yejA	TRUE	0.998	10.000	0.848	0.064		NA
619978	619979	YPTB1307	YPTB1308	yejA		TRUE	0.749	82.000	0.394	NA	N	NA
619979	619980	YPTB1308	YPTB1309		spr	FALSE	0.027	586.000	0.219	NA	N	NA
619980	619981	YPTB1309	YPTB1310	spr		FALSE	0.021	442.000	0.000	NA		NA
619981	619982	YPTB1310	YPTB1311			TRUE	0.838	59.000	0.275	NA		NA
619983	619984	YPTB1312	YPTB1313			TRUE	0.634	109.000	0.200	NA		NA
619987	619988	YPTB1316	YPTB1317		mtr	FALSE	0.358	104.000	0.153	1.000	N	NA
619990	619991	YPTB1319	YPTB1320			TRUE	0.919	11.000	0.000	0.050	N	NA
619991	619992	YPTB1320	YPTB1321			TRUE	0.980	-3.000	0.017	0.050		NA
619993	619994	YPTB1322	YPTB1323			TRUE	0.783	4.000	0.065	1.000	N	NA
619994	619995	YPTB1323	YPTB1324		rpiA	TRUE	0.935	20.000	0.000	1.000	Y	NA
619995	619996	YPTB1324	YPTB1325	rpiA		TRUE	0.634	116.000	0.000	NA	Y	NA
619996	619997	YPTB1325	YPTB1326			TRUE	0.907	109.000	0.375	NA	Y	NA
619997	619998	YPTB1326	YPTB1327			TRUE	0.987	36.000	0.375	0.014	Y	NA
620000	620001	YPTB1329	YPTB1330	fruB	fruK	TRUE	0.993	-3.000	0.112	1.000	Y	NA
620001	620002	YPTB1330	YPTB1331	fruK	fruA	TRUE	0.995	15.000	0.562	1.000	Y	NA
620002	620003	YPTB1331	YPTB1332	fruA	psaE	FALSE	0.007	325.000	0.000	1.000	N	NA
620003	620004	YPTB1332	YPTB1333	psaE	psaF	TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
620004	620005	YPTB1333	YPTB1334	psaF	psaA	FALSE	0.014	545.000	0.000	NA		NA
620005	620006	YPTB1334	YPTB1335	psaA	psaB	TRUE	0.797	127.000	0.400	NA		NA
620006	620007	YPTB1335	YPTB1336	psaB	psaC	TRUE	0.669	84.000	0.000	1.000	Y	NA
620008	620009	YPTB1337	YPTB1338	nfo		FALSE	0.226	164.000	0.040	NA		NA
620010	620011	YPTB1339	YPTB1340		lysP	FALSE	0.181	258.000	0.222	1.000	N	NA
620011	620012	YPTB1340	YPTB1341	lysP		FALSE	0.010	286.000	0.000	1.000	N	NA
620012	620013	YPTB1341	YPTB1342			TRUE	0.678	199.000	0.175	1.000	Y	NA
620013	620014	YPTB1342	YPTB1343			TRUE	0.999	-3.000	0.833	1.000	Y	NA
620014	620015	YPTB1343	YPTB1344			FALSE	0.259	260.000	0.000	1.000	Y	NA
620016	620017	YPTB1345	YPTB1346			FALSE	0.031	205.000	0.056	1.000	N	NA
620018	620019	YPTB1347	YPTB1348			FALSE	0.340	228.000	0.174	NA		NA
620019	620020	YPTB1348	YPTB1349			TRUE	0.998	-3.000	0.323	NA	Y	NA
620020	620021	YPTB1349	YPTB1350			TRUE	0.992	-3.000	0.096	1.000	Y	NA
620021	620022	YPTB1350	YPTB1351		dacC	FALSE	0.006	335.000	0.000	1.000	N	NA
620023	620024	YPTB1352	YPTB1353	sdaC	deoR	FALSE	0.001	1101.000	0.000	1.000	N	NA
620024	620025	YPTB1353	YPTB1354	deoR	deoC	FALSE	0.005	231.000	0.030	1.000	N	NA
620025	620026	YPTB1354	YPTB1355	deoC		FALSE	0.081	258.000	0.000	1.000		NA
620026	620027	YPTB1355	YPTB1356			TRUE	0.975	0.000	0.106	1.000		NA
620027	620028	YPTB1356	YPTB1357			FALSE	0.040	333.000	0.000	1.000		NA
620028	620029	YPTB1357	YPTB1358		grxA	FALSE	0.021	410.000	0.000	1.000		NA
620030	620031	YPTB1359	YPTB1360			TRUE	0.593	142.000	0.194	NA		NA
620031	620032	YPTB1360	YPTB1361		potF	FALSE	0.013	553.000	0.000	NA		NA
620032	620033	YPTB1361	YPTB1362	potF	potG	TRUE	0.942	171.000	0.679	1.000	Y	NA
620033	620034	YPTB1362	YPTB1363	potG	potH	TRUE	0.995	25.000	0.857	1.000	Y	NA
620034	620035	YPTB1363	YPTB1364	potH	potI	TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620035	620036	YPTB1364	YPTB1365	potI		FALSE	0.302	125.000	0.000	NA		NA
620036	620037	YPTB1365	YPTB1366			TRUE	0.533	84.000	0.119	NA		NA
620039	620040	YPTB1368	YPTB1369			FALSE	0.007	369.000	0.000	NA	N	NA
620040	620041	YPTB1369	YPTB1370			TRUE	0.988	0.000	0.000	1.000	Y	NA
620041	620042	YPTB1370	YPTB1371			TRUE	0.989	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
620042	620043	YPTB1371	YPTB1372			TRUE	0.957	-3.000	0.000	1.000		NA
620043	620044	YPTB1372	YPTB1373			TRUE	0.993	-7.000	0.312	NA		NA
620044	620045	YPTB1373	YPTB1374			TRUE	0.982	-3.000	0.125	NA		NA
620046	620047	YPTB1375	YPTB1376	artM	artQ	TRUE	1.000	0.000	0.714	0.019	Y	NA
620047	620048	YPTB1376	YPTB1377	artQ	artI	TRUE	0.995	12.000	0.260	0.088	Y	NA
620048	620049	YPTB1377	YPTB1378	artI	artP	TRUE	0.984	21.000	0.323	1.000	Y	NA
620049	620050	YPTB1378	YPTB1379	artP		FALSE	0.198	295.000	0.000	1.000	Y	NA
620050	620051	YPTB1379	YPTB1380			FALSE	0.174	170.000	0.018	NA		NA
620051	620052	YPTB1380	YPTB1381			TRUE	0.600	97.000	0.167	NA		NA
620052	620053	YPTB1381	YPTB1382			TRUE	0.801	100.000	0.022	0.004	Y	NA
620053	620054	YPTB1382	YPTB1383		ltaA	TRUE	0.887	-3.000	0.074	1.000	N	NA
620054	620055	YPTB1383	YPTB1384	ltaA	poxB	FALSE	0.106	349.000	0.031	1.000	Y	NA
620055	620056	YPTB1384	YPTB1385	poxB	hcr	FALSE	0.012	144.000	0.017	1.000	N	NA
620056	620057	YPTB1385	YPTB1386	hcr	hcp	TRUE	0.833	114.000	0.085	0.013	Y	NA
620057	620058	YPTB1386	YPTB1387	hcp		FALSE	0.142	202.000	0.028	NA		NA
620061	620062	YPTB1390	YPTB1391			TRUE	0.997	0.000	0.789	1.000	N	NA
620064	620065	YPTB1393	YPTB1394		clpA	TRUE	0.979	26.000	0.596	NA		NA
620066	620067	YPTB1395	YPTB1396	infA	aat	FALSE	0.011	166.000	0.020	1.000	N	NA
620067	620068	YPTB1396	YPTB1397	aat	cydC	TRUE	0.391	219.000	0.049	1.000	Y	NA
620068	620069	YPTB1397	YPTB1398	cydC	cydD	TRUE	0.999	3.000	0.631	0.007	Y	NA
620069	620070	YPTB1398	YPTB1399	cydD	trxB	FALSE	0.069	441.000	0.049	1.000	Y	NA
620071	620072	YPTB1400	YPTB1401	lrp	ftsK	TRUE	0.649	123.000	0.345	1.000	N	NA
620072	620073	YPTB1401	YPTB1402	ftsK	lolA	TRUE	0.472	192.000	0.305	1.000	N	NA
620073	620074	YPTB1402	YPTB1403	lolA		TRUE	0.926	11.000	0.167	1.000	N	NA
620074	620075	YPTB1403	YPTB1404		serS	FALSE	0.043	242.000	0.078	1.000	N	NA
620075	620076	YPTB1404	YPTB1405	serS		FALSE	0.009	295.000	0.000	1.000	N	NA
620079	620080	YPTB1408	YPTB1409	pflB	focA	TRUE	0.594	56.000	0.172	1.000	N	NA
620080	620081	YPTB1409	YPTB1410	focA		FALSE	0.009	697.000	0.000	NA		NA
620082	620083	YPTB1411	YPTB1412	ansB		FALSE	0.045	319.000	0.000	1.000		NA
620083	620084	YPTB1412	YPTB1413			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
620084	620085	YPTB1413	YPTB1414		serC	FALSE	0.033	367.000	0.000	NA		NA
620085	620086	YPTB1414	YPTB1415	serC	aroA	TRUE	0.487	178.000	0.033	1.000	Y	NA
620086	620087	YPTB1415	YPTB1416	aroA	cmkA	FALSE	0.098	314.000	0.209	1.000	N	NA
620087	620088	YPTB1416	YPTB1417	cmkA	rpsA	TRUE	0.494	174.000	0.281	1.000	N	NA
620088	620089	YPTB1417	YPTB1418	rpsA	ihfB	TRUE	0.736	61.000	0.292	1.000	N	NA
620089	620090	YPTB1418	YPTB1419	ihfB		FALSE	0.007	533.000	0.003	1.000		NA
620090	620091	YPTB1419	YPTB1420		msbA	TRUE	0.833	36.000	0.075	0.085		NA
620091	620092	YPTB1420	YPTB1421	msbA	lpxK	TRUE	0.980	-3.000	0.205	1.000	N	NA
620094	620095	YPTB1423	YPTB1424	cspB		FALSE	0.008	548.000	0.004	NA		NA
620095	620096	YPTB1424	YPTB1425		kdsB	TRUE	0.993	-3.000	0.265	NA		NA
620096	620097	YPTB1425	YPTB1426	kdsB		FALSE	0.022	363.000	0.023	NA		NA
620097	620098	YPTB1426	YPTB1427		smtA	FALSE	0.008	828.000	0.000	NA		NA
620098	620099	YPTB1427	YPTB1428	smtA	mukF	TRUE	0.990	-3.000	0.325	NA	N	NA
620099	620100	YPTB1428	YPTB1429	mukF	mukE	TRUE	0.992	8.000	0.196	NA	Y	NA
620100	620101	YPTB1429	YPTB1430	mukE	mukB	TRUE	1.000	-3.000	0.786	0.001	Y	NA
620101	620102	YPTB1430	YPTB1431	mukB		FALSE	0.093	248.000	0.000	1.000		NA
620102	620103	YPTB1431	YPTB1432			TRUE	0.593	224.000	0.372	NA		NA
620103	620104	YPTB1432	YPTB1433			TRUE	0.571	61.000	0.089	NA		NA
620105	620106	YPTB1434	YPTB1435	aspC		FALSE	0.014	257.000	0.000	1.000	N	NA
620106	620107	YPTB1435	YPTB1436		asnS	FALSE	0.009	298.000	0.000	1.000	N	NA
620107	620108	YPTB1436	YPTB1437	asnS	pncB	FALSE	0.000	514.000	0.034	1.000	N	NA
620109	620110	YPTB1438	YPTB1439	pepN	pyrD	FALSE	0.000	645.000	0.014	1.000	N	NA
620110	620111	YPTB1439	YPTB1440	pyrD		FALSE	0.290	183.000	0.081	NA		NA
620113	620114	YPTB1442	YPTB1443		uup	TRUE	0.930	6.000	0.061	1.000		NA
620114	620115	YPTB1443	YPTB1444	uup	pqiA	FALSE	0.294	129.000	0.054	NA		NA
620115	620116	YPTB1444	YPTB1445	pqiA	pqiB	TRUE	0.995	14.000	0.819	NA		NA
620116	620117	YPTB1445	YPTB1446	pqiB		TRUE	0.997	-3.000	0.531	NA		NA
620117	620118	YPTB1446	YPTB1447			TRUE	0.557	49.000	0.000	NA		NA
620118	620119	YPTB1447	YPTB1448		rmf	FALSE	0.366	81.000	0.000	NA		NA
620120	620121	YPTB1449	YPTB1450	fabF2	fabA	FALSE	0.032	700.000	0.000	1.000	Y	NA
620121	620122	YPTB1450	YPTB1451	fabA		TRUE	0.684	69.000	0.290	1.000	N	NA
620124	620125	YPTB1453	YPTB1454	ompA	sulA	FALSE	0.005	358.000	0.000	1.000	N	NA
620127	620128	YPTB1456	YPTB1457			TRUE	0.779	30.000	0.090	NA		NA
620130	620131	YPTB1459	YPTB1460	mgsA		FALSE	0.234	179.000	0.055	NA		NA
620133	620134	YPTB1462	YPTB1463			TRUE	0.730	37.000	0.094	NA		NA
620137	620138	YPTB_RNA_39	YPTB1466	tRNA-Ser3		FALSE	0.234	180.000	0.000	NA		NA
620138	620139	YPTB1466	YPTB1468			FALSE	0.032	370.000	0.000	NA		NA
620140	620141	YPTB1469	YPTB1470			FALSE	0.347	154.000	0.000	0.025	N	NA
620142	620143	YPTB1471	YPTB1472			FALSE	0.045	330.000	0.000	NA		NA
620143	620144	YPTB1472	YPTB1473			TRUE	0.989	-10.000	0.083	NA	Y	NA
620144	620145	YPTB1473	YPTB1474			TRUE	0.987	-7.000	0.056	1.000	Y	NA
620145	620146	YPTB1474	YPTB1475			TRUE	0.989	16.000	0.333	1.000	Y	NA
620146	620147	YPTB1475	YPTB1476			TRUE	0.992	-7.000	0.120	1.000	Y	NA
620147	620148	YPTB1476	YPTB1477			TRUE	0.996	-7.000	0.120	0.023	Y	NA
620148	620149	YPTB1477	YPTB1478			TRUE	0.992	3.000	0.051	0.050	Y	NA
620149	620150	YPTB1478	YPTB1479			FALSE	0.353	87.000	0.000	NA		NA
620150	620151	YPTB1479	YPTB1480			TRUE	0.618	38.000	0.000	NA		NA
620151	620152	YPTB1480	YPTB1481			FALSE	0.300	99.000	0.000	1.000		NA
620152	620153	YPTB1481	YPTB1482			FALSE	0.274	157.000	0.000	NA		NA
620153	620154	YPTB1482	YPTB1483			FALSE	0.010	665.000	0.000	NA		NA
620154	620155	YPTB1483	YPTB1484			TRUE	0.594	43.000	0.000	NA		NA
620155	620156	YPTB1484	YPTB1485			TRUE	0.889	12.000	0.000	NA		NA
620156	620157	YPTB1485	YPTB1486			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
620157	620158	YPTB1486	YPTB1487			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
620158	620159	YPTB1487	YPTB1488			TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
620159	620160	YPTB1488	YPTB1489		clpB3	FALSE	0.038	388.000	0.083	NA		NA
620160	620161	YPTB1489	YPTB1490	clpB3		TRUE	0.982	-3.000	0.125	NA		NA
620161	620162	YPTB1490	YPTB1491			FALSE	0.308	118.000	0.000	NA		NA
620162	620163	YPTB1491	YPTB1492			TRUE	0.927	7.000	0.000	NA		NA
620163	620164	YPTB1492	YPTB1493			FALSE	0.052	316.000	0.000	NA		NA
620164	620165	YPTB1493	YPTB1494			TRUE	0.984	3.000	0.182	NA		NA
620165	620166	YPTB1494	YPTB1495			TRUE	0.919	9.000	0.000	NA		NA
620166	620167	YPTB1495	YPTB1496			TRUE	0.936	5.000	0.000	NA		NA
620167	620168	YPTB1496	YPTB1497			FALSE	0.007	954.000	0.000	NA		NA
620168	620169	YPTB1497	YPTB1498			TRUE	0.998	-3.000	0.625	NA		NA
620169	620170	YPTB1498	YPTB1499			TRUE	0.749	44.000	0.120	NA		NA
620170	620171	YPTB1499	YPTB1500			TRUE	0.784	18.000	0.040	NA		NA
620171	620172	YPTB1500	YPTB1501			TRUE	0.993	0.000	0.286	NA		NA
620172	620173	YPTB1501	YPTB1502			FALSE	0.153	221.000	0.000	NA		NA
620173	620174	YPTB1502	YPTB1503			TRUE	0.997	-36.000	0.750	NA		NA
620174	620175	YPTB1503	YPTB1504			TRUE	0.997	-124.000	0.750	NA		NA
620175	620176	YPTB1504	YPTB1505			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
620176	620177	YPTB1505	YPTB1506			TRUE	0.750	25.000	0.000	NA		NA
620179	620180	YPTB1508	YPTB1509	ybiT		FALSE	0.138	228.000	0.000	NA		NA
620181	620182	YPTB1510	YPTB1511	moeB	cspD	TRUE	0.999	2.000	0.323	0.003	Y	NA
620182	620183	YPTB1511	YPTB1512	cspD		FALSE	0.013	535.000	0.000	1.000		NA
620183	620184	YPTB1512	YPTB1513			TRUE	0.938	10.000	0.094	1.000		NA
620184	620185	YPTB1513	YPTB1514			TRUE	0.906	2.000	0.094	1.000	N	NA
620185	620186	YPTB1514	YPTB1515			TRUE	0.996	2.000	0.500	NA		NA
620186	620187	YPTB1515	YPTB1516			FALSE	0.013	553.000	0.000	NA		NA
620187	620188	YPTB1516	YPTB1517			TRUE	0.952	21.000	0.273	1.000		NA
620188	620189	YPTB1517	YPTB1518			TRUE	0.477	273.000	0.636	1.000	N	NA
620190	620191	YPTB1519	YPTB1520		folE	TRUE	0.670	142.000	0.250	NA		NA
620191	620192	YPTB1520	YPTB1521	folE	yeiB	TRUE	0.970	46.000	0.719	NA		NA
620192	620193	YPTB1521	YPTB1522	yeiB	mglB	FALSE	0.008	748.000	0.000	NA		NA
620193	620194	YPTB1522	YPTB1523	mglB	mglA	TRUE	0.677	230.000	0.250	NA	Y	NA
620194	620195	YPTB1523	YPTB1524	mglA	mglC	TRUE	0.998	21.000	0.905	0.014	Y	NA
620196	620197	YPTB1525	YPTB1526	sanA	sfcA	FALSE	0.063	281.000	0.045	NA		NA
620197	620198	YPTB1526	YPTB1527	sfcA	cdd	FALSE	0.001	356.000	0.022	1.000	N	NA
620198	620199	YPTB1527	YPTB1528	cdd	yohK	FALSE	0.087	326.000	0.198	NA	N	NA
620199	620200	YPTB1528	YPTB1529	yohK	yohJ	TRUE	0.995	-3.000	0.340	NA		NA
620200	620201	YPTB1529	YPTB1530	yohJ		FALSE	0.186	242.000	0.021	0.083		NA
620201	620202	YPTB1530	YPTB1531			FALSE	0.037	351.000	0.000	NA		NA
620202	620203	YPTB1531	YPTB1532			TRUE	0.938	18.000	0.177	NA		NA
620206	620207	YPTB1535	YPTB1536		udk	FALSE	0.036	245.000	0.073	1.000	N	NA
620207	620208	YPTB1536	YPTB1537	udk	dcd	TRUE	0.703	105.000	0.098	1.000	Y	NA
620208	620209	YPTB1537	YPTB1538	dcd		FALSE	0.060	187.000	0.057	NA	N	NA
620211	620212	YPTB1540	YPTB1541			FALSE	0.279	151.000	0.000	NA		NA
620212	620213	YPTB1541	YPTB1542		alcA	TRUE	0.955	35.000	0.667	1.000	N	NA
620213	620214	YPTB1542	YPTB1543	alcA	alcB	TRUE	0.828	0.000	0.000	NA	N	NA
620214	620215	YPTB1543	YPTB1544	alcB	alcC	TRUE	0.840	-3.000	0.000	NA	N	NA
620216	620217	YPTB1545	YPTB1546			TRUE	0.999	-3.000	0.583	1.000	Y	NA
620217	620218	YPTB1546	YPTB1547			TRUE	0.999	-13.000	0.818	0.063	Y	NA
620218	620219	YPTB1547	YPTB1548			TRUE	0.998	-3.000	0.455	1.000	Y	NA
620219	620220	YPTB1548	YPTB1549			TRUE	0.913	90.000	0.364	1.000	Y	NA
620220	620221	YPTB1549	YPTB1550			TRUE	0.730	230.000	0.455	0.003	N	NA
620222	620223	YPTB1551	YPTB1552	galU	galF	TRUE	0.912	84.000	0.111	0.001	Y	NA
620223	620224	YPTB1552	YPTB1553	galF	gnd	FALSE	0.004	386.000	0.000	1.000	N	NA
620224	620225	YPTB1553	YPTB1554	gnd	tnp	FALSE	0.007	321.000	0.000	1.000	N	NA
620226	620227	YPTB1555	YPTB1556	hisI	hisF	TRUE	0.999	-6.000	0.430	0.003	Y	NA
620227	620228	YPTB1556	YPTB1557	hisF	hisA	TRUE	0.999	-18.000	0.433	0.003	Y	NA
620228	620229	YPTB1557	YPTB1558	hisA	hisH	TRUE	0.997	6.000	0.210	0.003	Y	NA
620229	620230	YPTB1558	YPTB1559	hisH	hisB	TRUE	0.998	0.000	0.128	0.003	Y	NA
620230	620231	YPTB1559	YPTB1560	hisB	hisC	TRUE	0.999	-3.000	0.341	0.003	Y	NA
620231	620232	YPTB1560	YPTB1561	hisC	hisD	TRUE	0.999	3.000	0.294	0.003	Y	NA
620232	620233	YPTB1561	YPTB1562	hisD	hisG	TRUE	0.997	4.000	0.171	0.003	Y	NA
620235	620236	YPTB1564	YPTB1565			FALSE	0.007	1109.000	0.000	NA		NA
620236	620237	YPTB1565	YPTB1566			TRUE	1.000	-3.000	0.952	0.014	Y	NA
620238	620239	YPTB1567	YPTB1568		yeeF	FALSE	0.003	460.000	0.000	1.000	N	NA
620241	620242	YPTB1570	YPTB1571			FALSE	0.022	434.000	0.000	NA		NA
620246	620247	YPTB1575	YPTB1576			TRUE	0.978	48.000	0.333	0.049	Y	NA
620247	620248	YPTB1576	YPTB1577			TRUE	0.940	32.000	0.290	0.022	N	NA
620248	620249	YPTB1577	YPTB1578		lldD	FALSE	0.011	278.000	0.000	1.000	N	NA
620252	620253	YPTB1581	YPTB1582			TRUE	0.639	36.000	0.136	1.000	N	NA
620254	620255	YPTB1583	YPTB1584			FALSE	0.347	90.000	0.000	NA		NA
620255	620256	YPTB1584	YPTB1585			FALSE	0.009	713.000	0.000	NA		NA
620256	620257	YPTB1585	YPTB1586			TRUE	0.988	0.000	0.000	1.000	Y	NA
620258	620259	YPTB1587	YPTB1588			TRUE	0.893	-10.000	0.002	1.000		NA
620259	620260	YPTB1588	YPTB1589			TRUE	0.904	66.000	0.500	NA		NA
620260	620261	YPTB1589	YPTB1590			FALSE	0.040	344.000	0.000	NA		NA
620261	620262	YPTB1590	YPTB1591		fyuA	FALSE	0.008	873.000	0.000	NA		NA
620262	620263	YPTB1591	YPTB1592	fyuA	ybtE	FALSE	0.262	131.000	0.125	1.000	N	NA
620263	620264	YPTB1592	YPTB1593	ybtE	ybtT	TRUE	0.987	4.000	0.094	1.000	Y	NA
620264	620265	YPTB1593	YPTB1594	ybtT	ybtU	TRUE	0.994	12.000	0.406	1.000	Y	NA
620265	620266	YPTB1594	YPTB1595	ybtU	irp1	TRUE	0.999	-3.000	0.333	0.025	Y	NA
620266	620267	YPTB1595	YPTB1596	irp1	irp2	TRUE	0.926	88.000	0.158	0.002	Y	NA
620267	620268	YPTB1596	YPTB1597	irp2	ybtA	TRUE	0.512	191.000	0.333	1.000	N	NA
620269	620270	YPTB1598	YPTB1599	ybtP	ybtQ	TRUE	1.000	-13.000	0.913	0.007	Y	NA
620270	620271	YPTB1599	YPTB1600	ybtQ	ybtX	TRUE	0.956	-7.000	0.130	NA	N	NA
620271	620272	YPTB1600	YPTB1601	ybtX	ybtS	TRUE	0.805	28.000	0.176	NA	N	NA
620273	620274	YPTB1602	YPTB_RNA_74		tRNA-Asn3	FALSE	0.269	162.000	0.000	NA		NA
620274	620275	YPTB_RNA_74	YPTB1603	tRNA-Asn3		FALSE	0.021	446.000	0.000	NA		NA
620275	620276	YPTB1603	YPTB1604			FALSE	0.013	258.000	0.000	1.000	N	NA
620276	620277	YPTB1604	YPTB1605			TRUE	0.997	20.000	0.905	NA	Y	NA
620277	620278	YPTB1605	YPTB1606			TRUE	0.974	124.000	0.947	NA	Y	NA
620280	620281	YPTB1608	YPTB1609	rafA	lacY	FALSE	0.346	78.000	0.000	1.000		NA
620283	620284	YPTB_RNA_73	YPTB1611	tRNA-Asn2		FALSE	0.240	178.000	0.000	NA		NA
620284	620285	YPTB1611	YPTB1612			FALSE	0.026	390.000	0.000	NA		NA
620285	620286	YPTB1612	YPTB1613			FALSE	0.123	237.000	0.000	NA		NA
620286	620287	YPTB1613	YPTB1614			FALSE	0.014	103.000	0.021	1.000	N	NA
620287	620288	YPTB1614	YPTB1615			FALSE	0.001	902.000	0.000	1.000	N	NA
620291	620292	YPTB1618	YPTB1619			FALSE	0.170	263.000	0.125	NA		NA
620292	620293	YPTB1619	YPTB1620			TRUE	0.937	43.000	0.429	NA		NA
620293	620294	YPTB1620	YPTB1621		aroP	TRUE	0.589	237.000	0.429	NA		NA
620296	620297	YPTB1623	YPTB1624		cspC	TRUE	0.898	43.000	0.286	NA		NA
620300	620301	YPTB1627	YPTB1628			FALSE	0.152	222.000	0.000	NA		NA
620303	620304	YPTB1630	YPTB1631	yebN	yobD	FALSE	0.022	429.000	0.000	NA		NA
620304	620305	YPTB1631	YPTB1632	yobD	manZ	TRUE	0.859	200.000	0.755	NA		NA
620305	620306	YPTB1632	YPTB1633	manZ	manY	TRUE	1.000	7.000	0.939	0.009	Y	NA
620306	620307	YPTB1633	YPTB1634	manY	manX	TRUE	0.844	92.000	0.064	0.009	Y	NA
620310	620311	YPTB1637	YPTB1638	hpaG		TRUE	1.000	-3.000	0.618	0.001	Y	NA
620311	620312	YPTB1638	YPTB1639		hpaE	TRUE	0.997	-3.000	0.510	0.048	N	NA
620312	620313	YPTB1639	YPTB1640	hpaE	hpaD	TRUE	0.783	119.000	0.378	1.000		NA
620313	620314	YPTB1640	YPTB1641	hpaD	hpaF	TRUE	0.953	25.000	0.330	1.000		NA
620314	620315	YPTB1641	YPTB1642	hpaF	hpaH	TRUE	0.985	-6.000	0.282	1.000	N	NA
620315	620316	YPTB1642	YPTB1643	hpaH	hpaI	TRUE	0.981	11.000	0.439	1.000	N	NA
620316	620317	YPTB1643	YPTB1644	hpaI	hpaX	TRUE	0.960	26.000	0.175	1.000	Y	NA
620317	620318	YPTB1644	YPTB1645	hpaX	hpaB	FALSE	0.086	68.000	0.000	1.000	N	NA
620318	620319	YPTB1645	YPTB1646	hpaB	hpaC	TRUE	0.982	21.000	0.226	0.001		NA
620320	620321	YPTB1647	YPTB1648	sdaA		FALSE	0.075	708.000	0.409	1.000		NA
620321	620322	YPTB1648	YPTB1649		pabB	TRUE	0.979	-3.000	0.116	1.000		NA
620325	620326	YPTB1652	YPTB1653	dbpA		FALSE	0.233	94.000	0.014	NA		NA
620326	620327	YPTB1653	YPTB1654			TRUE	0.598	40.000	0.053	NA		NA
620327	620328	YPTB1654	YPTB1655			FALSE	0.291	107.000	0.048	NA		NA
620328	620329	YPTB1655	YPTB1656		ptrB	FALSE	0.055	310.000	0.000	NA		NA
620329	620330	YPTB1656	YPTB1657	ptrB	pip	FALSE	0.025	722.000	0.000	0.025		NA
620332	620333	YPTB1659	YPTB1660	ftnA		FALSE	0.018	379.000	0.029	1.000		NA
620333	620334	YPTB1660	YPTB1661			TRUE	0.997	3.000	0.613	1.000		NA
620334	620335	YPTB1661	YPTB1662		yebY	TRUE	0.927	82.000	0.704	NA		NA
620338	620339	YPTB1663	YPTB1664			TRUE	0.998	-6.000	0.800	NA		NA
620340	620341	YPTB1665	YPTB1666	flhB	flhA	TRUE	0.999	0.000	0.287	0.014	Y	NA
620341	620342	YPTB1666	YPTB1667	flhA	flhE	TRUE	0.988	0.000	0.053	0.004		NA
620342	620343	YPTB1667	YPTB1668	flhE		FALSE	0.010	610.000	0.000	1.000		NA
620344	620345	YPTB1669	YPTB1670	flgN	flgM	TRUE	0.995	19.000	0.361	0.004	Y	NA
620345	620346	YPTB1670	YPTB1671	flgM	flgA	TRUE	0.876	151.000	0.330	NA	Y	NA
620347	620348	YPTB1672	YPTB1673	flgB	flgC	TRUE	1.000	6.000	0.824	0.006	Y	NA
620348	620349	YPTB1673	YPTB1674	flgC	flgD	TRUE	0.983	15.000	0.186	NA	Y	NA
620349	620350	YPTB1674	YPTB1675	flgD	flgE	TRUE	0.479	202.000	0.000	NA	Y	NA
620350	620351	YPTB1675	YPTB1676	flgE	flgF	TRUE	0.979	22.000	0.095	0.007	Y	NA
620351	620352	YPTB1676	YPTB1677	flgF	flgG	TRUE	0.995	26.000	0.420	0.001	Y	NA
620352	620353	YPTB1677	YPTB1678	flgG	flgH	TRUE	0.925	144.000	0.268	0.011	Y	NA
620353	620354	YPTB1678	YPTB1679	flgH	flgI	TRUE	0.985	15.000	0.085	0.013	Y	NA
620354	620355	YPTB1679	YPTB1680	flgI	flgJ	TRUE	0.995	0.000	0.048	0.013	Y	NA
620355	620356	YPTB1680	YPTB1681	flgJ	flgK	TRUE	0.518	728.000	0.705	0.004	Y	NA
620356	620357	YPTB1681	YPTB1682	flgK	flgL	TRUE	0.907	106.000	0.142	0.002	Y	NA
620359	620360	YPTB1684	YPTB1685			FALSE	0.257	148.000	0.000	1.000		NA
620360	620361	YPTB1685	YPTB1686			TRUE	0.993	43.000	1.000	NA	Y	NA
620361	620362	YPTB1686	YPTB1687			TRUE	0.741	66.000	0.000	NA	Y	NA
620362	620363	YPTB1687	YPTB1688			TRUE	0.998	3.000	0.286	0.013	Y	NA
620363	620364	YPTB1688	YPTB1689			TRUE	0.830	49.000	0.000	NA	Y	NA
620365	620366	YPTB1690	YPTB1691		fliR	FALSE	0.018	473.000	0.000	NA		NA
620366	620367	YPTB1691	YPTB1692	fliR	fliQ	TRUE	0.995	3.000	0.069	0.004	Y	NA
620367	620368	YPTB1692	YPTB1693	fliQ	fliP	TRUE	0.985	106.000	0.827	0.014	Y	NA
620368	620369	YPTB1693	YPTB1694	fliP	fliO	TRUE	0.853	81.000	0.203	1.000	Y	NA
620369	620370	YPTB1694	YPTB1695	fliO	fliN	TRUE	0.800	228.000	0.443	1.000	Y	NA
620370	620371	YPTB1695	YPTB1696	fliN	fliM	TRUE	0.998	-3.000	0.137	0.002	Y	NA
620371	620372	YPTB1696	YPTB1697	fliM	fliL	TRUE	1.000	6.000	0.957	0.002	Y	NA
620372	620373	YPTB1697	YPTB1698	fliL	fliK	FALSE	0.306	286.000	0.119	1.000	Y	NA
620373	620374	YPTB1698	YPTB1699	fliK	fliJ	TRUE	0.999	-3.000	0.317	0.011	Y	NA
620374	620375	YPTB1699	YPTB1700	fliJ	fliI	TRUE	0.720	76.000	0.073	1.000	Y	NA
620375	620376	YPTB1700	YPTB1701	fliI	fliH	TRUE	0.993	0.000	0.115	1.000	Y	NA
620376	620377	YPTB1701	YPTB1702	fliH	fliG	TRUE	0.994	-7.000	0.007	0.006	Y	NA
620377	620378	YPTB1702	YPTB1703	fliG	fliF	TRUE	0.998	-3.000	0.220	0.011	Y	NA
620379	620380	YPTB1704	YPTB1705	fliE		FALSE	0.263	166.000	0.000	NA		NA
620380	620381	YPTB1705	YPTB1706			TRUE	0.750	25.000	0.000	NA		NA
620381	620382	YPTB1706	YPTB1707			TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
620383	620384	YPTB1708	YPTB1709			FALSE	0.011	161.000	0.006	1.000	N	NA
620384	620385	YPTB1709	YPTB1710			FALSE	0.005	354.000	0.000	1.000	N	NA
620385	620386	YPTB1710	YPTB1711		fliT	FALSE	0.054	301.000	0.000	1.000		NA
620386	620387	YPTB1711	YPTB1712	fliT	fliS	TRUE	0.983	11.000	0.324	1.000		NA
620387	620388	YPTB1712	YPTB1713	fliS	fliD	TRUE	0.997	11.000	0.284	0.004	Y	NA
620389	620390	YPTB1714	YPTB1715	fliC	fliA	FALSE	0.006	347.000	0.000	1.000	N	NA
620390	620391	YPTB1715	YPTB1716	fliA	fliZ	FALSE	0.199	235.000	0.108	1.000		NA
620391	620392	YPTB1716	YPTB1717	fliZ	YedO	FALSE	0.066	289.000	0.062	1.000		NA
620392	620393	YPTB1717	YPTB1718	YedO	fliY	TRUE	0.922	124.000	0.469	1.000	Y	NA
620393	620394	YPTB1718	YPTB1719	fliY	yecS	TRUE	0.996	0.000	0.100	0.085	Y	NA
620394	620395	YPTB1719	YPTB1720	yecS	yecC	TRUE	0.992	3.000	0.150	1.000	Y	NA
620396	620397	YPTB1721	YPTB1722			TRUE	0.962	0.000	0.061	NA		NA
620397	620398	YPTB1722	YPTB1723		putA	FALSE	0.016	496.000	0.000	NA		NA
620399	620400	YPTB1724	YPTB1725	putP		FALSE	0.007	324.000	0.000	1.000	N	NA
620400	620401	YPTB1725	YPTB1726			TRUE	0.979	30.000	0.356	NA	Y	NA
620401	620402	YPTB1726	YPTB1727			TRUE	0.995	11.000	0.378	NA	Y	NA
620406	620407	YPTB_RNA_40	YPTB1731	tRNA-Lys7	ail	FALSE	0.009	687.000	0.000	NA		NA
620407	620408	YPTB1731	YPTB1732	ail		FALSE	0.042	340.000	0.000	NA		NA
620409	620410	YPTB1733	YPTB1734	ydgC		TRUE	0.386	125.000	0.085	NA		NA
620411	620412	YPTB1735	YPTB1736	uvrY	uvrC	TRUE	0.966	-28.000	0.086	0.020	N	NA
620412	620413	YPTB1736	YPTB1737	uvrC	pgsA	TRUE	0.677	59.000	0.227	1.000	N	NA
620413	620414	YPTB1737	YPTB_RNA_41	pgsA	tRNA-Gly5	FALSE	0.282	145.000	0.000	NA		NA
620414	620415	YPTB_RNA_41	YPTB_RNA_42	tRNA-Gly5	tRNA-Cys1	TRUE	0.524	53.000	0.000	NA		NA
620415	620416	YPTB_RNA_42	YPTB_RNA_43	tRNA-Cys1	tRNA-Leu4	TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
620417	620418	YPTB1738	YPTB1739	ogrK		FALSE	0.344	92.000	0.000	NA		NA
620418	620419	YPTB1739	YPTB1740			TRUE	0.998	-3.000	0.600	NA		NA
620419	620420	YPTB1740	YPTB1741			TRUE	0.992	0.000	0.250	NA		NA
620420	620421	YPTB1741	YPTB1742			TRUE	0.997	-7.000	0.545	NA		NA
620421	620422	YPTB1742	YPTB1743			TRUE	0.981	33.000	0.786	NA		NA
620422	620423	YPTB1743	YPTB1744			TRUE	0.751	51.000	0.143	NA		NA
620423	620424	YPTB1744	YPTB1745			TRUE	0.992	14.000	0.667	NA		NA
620424	620425	YPTB1745	YPTB1746			FALSE	0.299	128.000	0.000	NA		NA
620425	620426	YPTB1746	YPTB1747			TRUE	0.889	12.000	0.000	NA		NA
620426	620427	YPTB1747	YPTB1748			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620427	620428	YPTB1748	YPTB1749			TRUE	0.998	-7.000	0.667	NA		NA
620428	620429	YPTB1749	YPTB1750			TRUE	0.995	5.000	0.500	NA		NA
620429	620430	YPTB1750	YPTB1751			TRUE	0.995	-3.000	0.333	NA		NA
620430	620431	YPTB1751	YPTB1752			TRUE	0.383	74.000	0.000	NA		NA
620431	620432	YPTB1752	YPTB1753			TRUE	0.991	-3.000	0.222	NA		NA
620432	620433	YPTB1753	YPTB1754			TRUE	0.656	96.000	0.200	NA		NA
620433	620434	YPTB1754	YPTB1755			TRUE	0.992	2.000	0.300	NA		NA
620434	620435	YPTB1755	YPTB1756			TRUE	0.995	-16.000	0.500	NA		NA
620435	620436	YPTB1756	YPTB1757			TRUE	0.991	-9.000	0.286	NA		NA
620436	620437	YPTB1757	YPTB1758			TRUE	0.990	0.000	0.222	NA		NA
620437	620438	YPTB1758	YPTB1759			TRUE	0.978	100.000	1.000	0.004		NA
620438	620439	YPTB1759	YPTB1760			TRUE	0.997	4.000	0.667	1.000		NA
620439	620440	YPTB1760	YPTB1761			FALSE	0.348	77.000	0.000	1.000		NA
620441	620442	YPTB1762	YPTB1763			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620442	620443	YPTB1763	YPTB1764			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620444	620445	YPTB1765	YPTB1766			TRUE	0.772	23.000	0.000	NA		NA
620445	620446	YPTB1766	YPTB1767			TRUE	0.997	-13.000	0.667	NA		NA
620446	620447	YPTB1767	YPTB1768			TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
620447	620448	YPTB1768	YPTB1769			FALSE	0.180	207.000	0.000	NA		NA
620448	620449	YPTB1769	YPTB1770			TRUE	0.510	55.000	0.000	NA		NA
620450	620451	YPTB1771	YPTB1772			TRUE	0.689	28.000	0.000	1.000		NA
620451	620452	YPTB1772	YPTB1773			TRUE	0.995	0.000	0.400	NA		NA
620452	620453	YPTB1773	YPTB1774			FALSE	0.307	120.000	0.000	NA		NA
620453	620454	YPTB1774	YPTB1775			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620455	620456	YPTB1776	YPTB1777			FALSE	0.050	320.000	0.000	NA		NA
620456	620457	YPTB1777	YPTB1778			TRUE	0.954	94.000	1.000	NA		NA
620457	620458	YPTB1778	YPTB1779			FALSE	0.293	132.000	0.000	NA		NA
620458	620459	YPTB1779	YPTB1780			FALSE	0.035	359.000	0.000	NA		NA
620459	620460	YPTB1780	YPTB1781			FALSE	0.123	237.000	0.000	NA		NA
620460	620461	YPTB1781	YPTB1782			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620461	620462	YPTB1782	YPTB1783			TRUE	0.586	45.000	0.000	NA		NA
620462	620463	YPTB1783	YPTB1784			TRUE	0.982	-13.000	0.080	0.057		NA
620463	620464	YPTB1784	YPTB1785			FALSE	0.060	301.000	0.000	NA		NA
620464	620465	YPTB1785	YPTB1786			TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
620465	620466	YPTB1786	YPTB1787			FALSE	0.008	865.000	0.000	NA		NA
620466	620467	YPTB1787	YPTB1788			FALSE	0.356	85.000	0.000	NA		NA
620467	620468	YPTB1788	YPTB1789			FALSE	0.075	278.000	0.000	NA		NA
620468	620469	YPTB1789	YPTB1790			TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
620470	620471	YPTB1791	YPTB1792			TRUE	0.819	18.000	0.000	NA		NA
620471	620472	YPTB1792	YPTB1793			FALSE	0.221	185.000	0.000	NA		NA
620472	620473	YPTB1793	YPTB1794			TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
620473	620474	YPTB1794	YPTB1795		rdgC	TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
620474	620475	YPTB1795	YPTB1796	rdgC		TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
620475	620476	YPTB1796	YPTB1797			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620476	620477	YPTB1797	YPTB1798		yfdM	TRUE	0.991	-3.000	0.000	0.002		NA
620477	620478	YPTB1798	YPTB1799	yfdM		TRUE	0.989	-3.000	0.033	0.002		NA
620478	620479	YPTB1799	YPTB1800			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620479	620480	YPTB1800	YPTB1801			FALSE	0.026	394.000	0.000	NA		NA
620480	620481	YPTB1801	YPTB1802			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620481	620482	YPTB1802	YPTB1803			FALSE	0.054	312.000	0.000	NA		NA
620482	620483	YPTB1803	YPTB1804			FALSE	0.247	173.000	0.000	NA		NA
620483	620484	YPTB1804	YPTB1805			TRUE	0.992	0.000	0.250	NA		NA
620484	620485	YPTB1805	YPTB1806			FALSE	0.293	132.000	0.000	NA		NA
620485	620486	YPTB1806	YPTB1807			FALSE	0.162	218.000	0.000	NA		NA
620486	620487	YPTB1807	YPTB1808			FALSE	0.315	107.000	0.000	NA		NA
620487	620488	YPTB1808	YPTB1809			TRUE	0.988	0.000	0.000	1.000	Y	NA
620488	620489	YPTB1809	YPTB1810			FALSE	0.308	118.000	0.000	NA		NA
620489	620490	YPTB1810	YPTB1811			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620490	620491	YPTB1811	YPTB1812			TRUE	0.989	0.000	0.208	NA		NA
620491	620492	YPTB1812	YPTB1813			FALSE	0.093	270.000	0.067	NA		NA
620492	620493	YPTB1813	YPTB1814			TRUE	0.944	60.000	0.643	NA		NA
620493	620494	YPTB1814	YPTB1815			TRUE	0.918	78.000	0.643	NA		NA
620494	620495	YPTB1815	YPTB1816			TRUE	0.967	66.000	1.000	NA		NA
620495	620496	YPTB1816	YPTB1817			TRUE	0.999	3.000	1.000	NA		NA
620496	620497	YPTB1817	YPTB1818			TRUE	0.997	0.000	0.600	NA		NA
620497	620498	YPTB1818	YPTB1819			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620498	620499	YPTB1819	YPTB1820			TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
620500	620501	YPTB1821	YPTB1822			TRUE	0.956	-6.000	0.000	NA		NA
620502	620503	YPTB1823	YPTB1824			TRUE	0.995	-3.000	0.333	NA		NA
620503	620504	YPTB1824	YPTB1825			TRUE	0.840	67.000	0.333	NA		NA
620504	620505	YPTB1825	YPTB1826			TRUE	0.935	-25.000	0.000	NA		NA
620505	620506	YPTB1826	YPTB1827			TRUE	0.991	8.000	0.400	NA		NA
620506	620507	YPTB1827	YPTB1828			TRUE	0.995	16.000	1.000	NA		NA
620507	620508	YPTB1828	YPTB1829			TRUE	0.998	0.000	0.700	NA		NA
620508	620509	YPTB1829	YPTB1830			TRUE	0.997	11.000	0.875	NA		NA
620509	620510	YPTB1830	YPTB1831			FALSE	0.044	334.000	0.000	NA		NA
620510	620511	YPTB1831	YPTB1832			TRUE	0.931	-46.000	0.000	NA		NA
620512	620513	YPTB1833	YPTB1834		ogrK	FALSE	0.008	879.000	0.000	NA		NA
620513	620514	YPTB1834	YPTB1835	ogrK		TRUE	0.381	75.000	0.000	NA		NA
620514	620515	YPTB1835	YPTB1836			TRUE	0.992	-3.000	0.250	NA		NA
620515	620516	YPTB1836	YPTB1837			TRUE	0.994	12.000	0.667	NA		NA
620516	620517	YPTB1837	YPTB1838			TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
620517	620518	YPTB1838	YPTB1839			TRUE	0.889	12.000	0.000	NA		NA
620518	620519	YPTB1839	YPTB1840			TRUE	0.977	54.000	1.000	NA		NA
620519	620520	YPTB1840	YPTB1841			TRUE	0.997	12.000	1.000	NA		NA
620520	620521	YPTB1841	YPTB1842			FALSE	0.290	134.000	0.000	NA		NA
620521	620522	YPTB1842	YPTB1843			TRUE	0.889	12.000	0.000	NA		NA
620522	620523	YPTB1843	YPTB1844			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620523	620524	YPTB1844	YPTB1845			TRUE	0.999	-7.000	1.000	NA		NA
620524	620525	YPTB1845	YPTB1846			TRUE	0.999	3.000	1.000	NA		NA
620525	620526	YPTB1846	YPTB1847			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
620526	620527	YPTB1847	YPTB1848			FALSE	0.045	331.000	0.000	NA		NA
620527	620528	YPTB1848	YPTB1849			FALSE	0.051	317.000	0.000	NA		NA
620528	620529	YPTB1849	YPTB1850			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
620529	620530	YPTB1850	YPTB1851			TRUE	0.907	99.000	0.667	NA		NA
620530	620531	YPTB1851	YPTB1852			TRUE	0.993	5.000	0.400	NA		NA
620531	620532	YPTB1852	YPTB1853			TRUE	0.994	-13.000	0.400	NA		NA
620532	620533	YPTB1853	YPTB1854			TRUE	0.966	30.000	0.500	NA		NA
620533	620534	YPTB1854	YPTB1855			TRUE	0.999	0.000	1.000	NA		NA
620534	620535	YPTB1855	YPTB1856			FALSE	0.373	234.000	0.000	0.003		NA
620535	620536	YPTB1856	YPTB1857			TRUE	0.993	7.000	0.500	1.000		NA
620536	620537	YPTB1857	YPTB1858			TRUE	0.953	37.000	0.500	1.000		NA
620538	620539	YPTB1859	YPTB1860			TRUE	0.568	48.000	0.000	NA		NA
620540	620541	YPTB1861	YPTB1862			FALSE	0.177	208.000	0.000	NA		NA
620541	620542	YPTB1862	YPTB1863		dam	FALSE	0.349	89.000	0.000	NA		NA
620542	620543	YPTB1863	YPTB1864	dam		TRUE	0.996	-3.000	0.000	0.014	Y	NA
620543	620544	YPTB1864	YPTB1865			TRUE	0.493	57.000	0.000	NA		NA
620544	620545	YPTB1865	YPTB1866			FALSE	0.361	83.000	0.000	NA		NA
620545	620546	YPTB1866	YPTB1867			TRUE	0.714	28.000	0.000	NA		NA
620546	620547	YPTB1867	YPTB1868			FALSE	0.284	142.000	0.000	NA		NA
620547	620548	YPTB1868	YPTB1869			FALSE	0.167	215.000	0.000	NA		NA
620549	620550	YPTB1870	YPTB1871		USO1	TRUE	0.790	21.000	0.000	NA		NA
620550	620551	YPTB1871	YPTB1872	USO1		TRUE	0.790	21.000	0.000	NA		NA
620551	620552	YPTB1872	YPTB1873			TRUE	0.403	69.000	0.000	NA		NA
620552	620553	YPTB1873	YPTB1874			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
620553	620554	YPTB1874	YPTB1875			FALSE	0.065	294.000	0.000	NA		NA
620556	620557	YPTB1878	YPTB1879			FALSE	0.032	370.000	0.000	NA		NA
620558	620559	YPTB1880	YPTB1881			TRUE	0.736	26.000	0.000	NA		NA
620559	620560	YPTB1881	YPTB1882		tnpA	FALSE	0.155	220.000	0.000	NA		NA
620560	620561	YPTB1882	YPTB1883	tnpA		TRUE	0.940	72.000	0.521	0.056		NA
620562	620563	YPTB1884	YPTB1885			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620563	620564	YPTB1885	YPTB1886			TRUE	0.995	-10.000	0.000	0.006	Y	NA
620564	620565	YPTB1886	YPTB1887			TRUE	0.945	-12.000	0.000	NA		NA
620565	620566	YPTB1887	YPTB1888			TRUE	0.941	-15.000	0.000	NA		NA
620566	620567	YPTB1888	YPTB1889		lysA	TRUE	0.628	-3.000	0.048	1.000	N	NA
620567	620568	YPTB1889	YPTB1890	lysA	yjcK	TRUE	0.663	-25.000	0.000	1.000	N	NA
620569	620570	YPTB1891	YPTB1892		tnpA	FALSE	0.103	338.000	0.000	0.056		NA
620570	620571	YPTB1892	YPTB1893	tnpA		FALSE	0.142	226.000	0.000	NA		NA
620571	620572	YPTB1893	YPTB1894			FALSE	0.358	84.000	0.000	NA		NA
620572	620573	YPTB1894	YPTB1895			FALSE	0.282	146.000	0.000	NA		NA
620573	620574	YPTB1895	YPTB1896			TRUE	0.936	5.000	0.000	NA		NA
620574	620575	YPTB1896	YPTB1897			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620575	620576	YPTB1897	YPTB1898			FALSE	0.022	435.000	0.000	NA		NA
620576	620577	YPTB1898	YPTB1899			TRUE	0.829	17.000	0.000	NA		NA
620577	620578	YPTB1899	YPTB1900			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
620579	620580	YPTB1901	YPTB1902			TRUE	0.979	8.000	0.200	NA		NA
620580	620581	YPTB1902	YPTB1903			TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
620581	620582	YPTB1903	YPTB1904			TRUE	0.568	48.000	0.000	NA		NA
620582	620583	YPTB1904	YPTB1905			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
620584	620585	YPTB1906	YPTB1907			TRUE	0.889	12.000	0.000	NA		NA
620586	620587	YPTB1908	YPTB1909			TRUE	0.725	27.000	0.000	NA		NA
620587	620588	YPTB1909	YPTB1910			FALSE	0.216	187.000	0.000	NA		NA
620590	620591	YPTB1912	YPTB1913			TRUE	0.668	30.000	0.000	1.000		NA
620591	620592	YPTB1913	YPTB1914			TRUE	0.841	67.000	0.000	0.059	Y	NA
620592	620593	YPTB1914	YPTB1915			TRUE	0.993	-7.000	0.000	0.059	Y	NA
620593	620594	YPTB1915	YPTB1916			TRUE	0.957	25.000	0.000	0.059	Y	NA
620595	620596	YPTB_RNA_72	YPTB1917	tRNA-Asn1		FALSE	0.059	303.000	0.000	NA		NA
620596	620597	YPTB1917	YPTB1918			TRUE	0.995	-3.000	0.333	NA		NA
620597	620598	YPTB1918	YPTB1919			TRUE	0.991	16.000	0.667	NA		NA
620598	620599	YPTB1919	YPTB1920			TRUE	0.974	49.000	0.500	1.000	Y	NA
620599	620600	YPTB1920	YPTB1921			TRUE	0.798	93.000	0.154	1.000	Y	NA
620600	620601	YPTB1921	YPTB1922			FALSE	0.004	381.000	0.000	1.000	N	NA
620601	620602	YPTB1922	YPTB1923			TRUE	0.992	-25.000	0.037	0.011	Y	NA
620602	620603	YPTB1923	YPTB1924			FALSE	0.001	827.000	0.000	1.000	N	NA
620603	620604	YPTB1924	YPTB1925			TRUE	0.948	23.000	0.417	1.000	N	NA
620604	620605	YPTB1925	YPTB1926			TRUE	0.921	50.000	0.600	1.000	N	NA
620607	620608	YPTB1928	YPTB1929			TRUE	0.750	25.000	0.000	NA		NA
620608	620609	YPTB1929	YPTB1930			FALSE	0.155	220.000	0.000	NA		NA
620609	620610	YPTB1930	YPTB1931			TRUE	0.872	66.000	0.417	1.000		NA
620614	620615	YPTB1935	YPTB1936	ansP		FALSE	0.001	765.000	0.000	1.000	N	NA
620616	620617	YPTB1937	YPTB1938			FALSE	0.014	111.000	0.028	1.000	N	NA
620617	620618	YPTB1938	YPTB1939			FALSE	0.002	600.000	0.000	NA	N	NA
620618	620619	YPTB1939	YPTB1940			TRUE	0.621	204.000	0.133	NA	Y	NA
620619	620620	YPTB1940	YPTB1941			FALSE	0.362	301.000	0.386	NA		NA
620620	620621	YPTB1941	YPTB1942			TRUE	0.997	3.000	0.625	NA		NA
620621	620622	YPTB1942	YPTB1943			TRUE	0.997	-10.000	0.878	NA	N	NA
620622	620623	YPTB1943	YPTB1944			TRUE	0.963	4.000	0.175	NA	N	NA
620623	620624	YPTB1944	YPTB1945			TRUE	0.826	-43.000	0.078	1.000	N	NA
620624	620625	YPTB1945	YPTB1946			TRUE	0.991	-3.000	0.176	0.012	N	NA
620625	620626	YPTB1946	YPTB1947		tehB	FALSE	0.085	173.000	0.071	1.000	N	NA
620626	620627	YPTB1947	YPTB1948	tehB		FALSE	0.100	141.000	0.071	1.000	N	NA
620627	620628	YPTB1948	YPTB1949		hmsH	FALSE	0.008	669.000	0.000	1.000		NA
620628	620629	YPTB1949	YPTB1950	hmsH	hmsF	TRUE	0.993	13.000	0.696	1.000		NA
620629	620630	YPTB1950	YPTB1951	hmsF	hmsR	TRUE	0.885	-10.000	0.087	1.000	N	NA
620630	620631	YPTB1951	YPTB1952	hmsR	hmsS	TRUE	0.986	-3.000	0.154	NA		NA
620631	620632	YPTB1952	YPTB1953	hmsS		FALSE	0.038	349.000	0.000	NA		NA
620632	620633	YPTB1953	YPTB1954			FALSE	0.021	439.000	0.000	NA		NA
620633	620634	YPTB1954	YPTB1955		phoH	TRUE	0.502	60.000	0.065	NA		NA
620635	620636	YPTB1956	YPTB1957	chaA	narX	FALSE	0.013	567.000	0.000	0.078	N	NA
620637	620638	YPTB1958	YPTB1959		astC	FALSE	0.078	661.000	0.000	0.015	Y	NA
620638	620639	YPTB1959	YPTB1960	astC	astA	TRUE	0.980	30.000	0.400	1.000	Y	NA
620639	620640	YPTB1960	YPTB1961	astA	astD	TRUE	0.706	-3.000	0.051	1.000	N	NA
620640	620641	YPTB1961	YPTB1962	astD	astB	TRUE	0.917	24.000	0.306	1.000	N	NA
620641	620642	YPTB1962	YPTB1963	astB	astE	TRUE	0.784	58.000	0.063	1.000	Y	NA
620642	620643	YPTB1963	YPTB1964	astE	ompC2	FALSE	0.001	727.000	0.000	1.000	N	NA
620644	620645	YPTB1965	YPTB1966	hutG	hutI	TRUE	0.439	-3.000	0.031	1.000	N	NA
620645	620646	YPTB1966	YPTB1967	hutI	hutC	FALSE	0.007	204.000	0.010	1.000	N	NA
620647	620648	YPTB1968	YPTB1969			TRUE	0.965	0.000	0.067	NA		NA
620650	620651	YPTB1971	YPTB1972			TRUE	0.922	14.000	0.200	1.000	N	NA
620651	620652	YPTB1972	YPTB1973			TRUE	0.978	-7.000	0.133	1.000		NA
620652	620653	YPTB1973	YPTB1974			TRUE	0.997	-3.000	0.550	NA		NA
620653	620654	YPTB1974	YPTB1975			FALSE	0.052	185.000	0.054	NA	N	NA
620654	620655	YPTB1975	YPTB1976			TRUE	0.954	0.000	0.000	1.000		NA
620655	620656	YPTB1976	YPTB1977			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620656	620657	YPTB1977	YPTB1978			TRUE	0.987	-3.000	0.167	NA		NA
620658	620659	YPTB1979	YPTB1980			FALSE	0.256	170.000	0.000	NA		NA
620659	620660	YPTB1980	YPTB1981			TRUE	0.718	64.000	0.000	0.013		NA
620661	620662	YPTB1982	YPTB1983			FALSE	0.094	247.000	0.000	1.000		NA
620663	620664	YPTB1984	YPTB1985			TRUE	0.558	105.000	0.000	0.046		NA
620664	620665	YPTB1985	YPTB1986			FALSE	0.041	341.000	0.000	NA		NA
620665	620666	YPTB1986	YPTB1987			TRUE	0.944	-13.000	0.000	NA		NA
620666	620667	YPTB1987	YPTB1988			TRUE	0.932	6.000	0.000	NA		NA
620667	620668	YPTB1988	YPTB1989			FALSE	0.008	780.000	0.000	NA		NA
620668	620669	YPTB1989	YPTB1990			FALSE	0.170	213.000	0.000	NA		NA
620669	620670	YPTB1990	YPTB1991			TRUE	0.731	55.000	0.154	1.000		NA
620670	620671	YPTB1991	YPTB1992			FALSE	0.068	277.000	0.000	1.000		NA
620671	620672	YPTB1992	YPTB1993		copR	TRUE	1.000	6.000	0.793	0.001	Y	NA
620673	620674	YPTB1994	YPTB1995			FALSE	0.209	191.000	0.000	NA		NA
620674	620675	YPTB1995	YPTB1996			TRUE	0.933	15.000	0.133	NA		NA
620676	620677	YPTB1997	YPTB1998		ychF	FALSE	0.315	107.000	0.000	NA		NA
620677	620678	YPTB1998	YPTB1999	ychF	pth	TRUE	0.766	165.000	0.184	1.000	Y	NA
620680	620681	YPTB2001	YPTB2002	prsA	ipk	FALSE	0.005	341.000	0.053	1.000	N	NA
620681	620682	YPTB2002	YPTB2003	ipk		TRUE	0.961	2.000	0.157	1.000	N	NA
620683	620684	YPTB2004	YPTB2005	hemA	prfA	TRUE	0.884	33.000	0.171	0.045	N	NA
620684	620685	YPTB2005	YPTB2006	prfA		TRUE	0.998	0.000	0.229	0.045	Y	NA
620685	620686	YPTB2006	YPTB2007			TRUE	0.599	64.000	0.109	NA		NA
620686	620687	YPTB2007	YPTB2008			TRUE	0.989	-3.000	0.195	NA		NA
620687	620688	YPTB2008	YPTB2009		kdsA	TRUE	0.413	96.000	0.089	1.000		NA
620688	620689	YPTB2009	YPTB2010	kdsA	tnp	FALSE	0.002	498.000	0.000	1.000	N	NA
620690	620691	YPTB2011	YPTB_RNA_71	ychM	tRNA-Ser5	FALSE	0.008	828.000	0.000	NA		NA
620691	620692	YPTB_RNA_71	YPTB2012	tRNA-Ser5		FALSE	0.284	142.000	0.000	NA		NA
620692	620693	YPTB2012	YPTB2013			FALSE	0.054	301.000	0.000	1.000		NA
620693	620694	YPTB2013	YPTB2014			TRUE	0.988	20.000	0.480	0.059		NA
620694	620695	YPTB2014	YPTB2015			TRUE	0.999	-3.000	0.440	0.059	Y	NA
620695	620696	YPTB2015	YPTB2016			TRUE	0.999	-3.000	0.400	0.059	Y	NA
620697	620698	YPTB2017	YPTB2018			TRUE	0.986	-28.000	0.375	NA	N	NA
620700	620701	YPTB2019	YPTB2020			TRUE	0.939	37.000	0.417	1.000		NA
620702	620703	YPTB2021	YPTB2022		yceL	FALSE	0.079	425.000	0.196	NA		NA
620704	620705	YPTB2023	YPTB2024	rimJ		TRUE	0.960	8.000	0.116	NA		NA
620705	620706	YPTB2024	YPTB2025			TRUE	0.940	11.000	0.103	NA		NA
620706	620707	YPTB2025	YPTB2026		mviN	FALSE	0.047	267.000	0.022	1.000		NA
620707	620708	YPTB2026	YPTB2027	mviN	HlyB	FALSE	0.020	447.000	0.000	NA		NA
620708	620709	YPTB2027	YPTB2028	HlyB	HlyA	TRUE	0.995	30.000	1.000	NA	Y	NA
620711	620712	YPTB2030	YPTB2031		cutC	FALSE	0.134	232.000	0.057	NA		NA
620713	620714	YPTB2032	YPTB2033			TRUE	0.994	-3.000	0.315	NA		NA
620714	620715	YPTB2033	YPTB2034			FALSE	0.288	191.000	0.089	NA		NA
620715	620716	YPTB2034	YPTB2035			TRUE	0.407	180.000	0.126	NA		NA
620717	620718	YPTB2036	YPTB2037	aspS	nudB	TRUE	0.671	0.000	0.050	1.000	N	NA
620718	620719	YPTB2037	YPTB2038	nudB		TRUE	0.413	58.000	0.035	NA		NA
620719	620720	YPTB2038	YPTB2039		ruvC	TRUE	0.549	209.000	0.277	NA		NA
620720	620721	YPTB2039	YPTB2040	ruvC	ruvA	TRUE	0.778	307.000	0.451	0.010	Y	NA
620721	620722	YPTB2040	YPTB2041	ruvA	ruvB	TRUE	0.974	162.000	0.549	0.001	Y	NA
620723	620724	YPTB2042	YPTB2043	znuB	znuC	TRUE	1.000	-3.000	0.755	0.098	Y	NA
620725	620726	YPTB2044	YPTB2045	znuA		TRUE	0.781	21.000	0.131	1.000	N	NA
620726	620727	YPTB2045	YPTB2046		msbB	FALSE	0.232	267.000	0.299	1.000	N	NA
620728	620729	YPTB2047	YPTB2048	pykA	hexR	FALSE	0.005	362.000	0.000	1.000	N	NA
620730	620731	YPTB2049	YPTB2050	zwf	eda	FALSE	0.283	242.000	0.034	1.000	Y	NA
620731	620732	YPTB2050	YPTB2051	eda		FALSE	0.001	694.000	0.000	1.000	N	NA
620732	620733	YPTB2051	YPTB2052			TRUE	1.000	-13.000	0.869	0.078	Y	NA
620735	620736	YPTB2054	YPTB2055			FALSE	0.196	72.000	0.082	1.000	N	NA
620736	620737	YPTB2055	YPTB2056			FALSE	0.012	137.000	0.024	1.000	N	NA
620737	620738	YPTB2056	YPTB2057		fadD	FALSE	0.014	654.000	0.169	1.000	N	NA
620738	620739	YPTB2057	YPTB2058	fadD	rnd	FALSE	0.209	160.000	0.115	1.000	N	NA
620740	620741	YPTB2059	YPTB2060	minE	minD	TRUE	0.999	4.000	0.618	NA	Y	NA
620741	620742	YPTB2060	YPTB2061	minD	minC	TRUE	0.988	25.000	0.466	1.000	Y	NA
620743	620744	YPTB2062	YPTB2063			TRUE	0.767	141.000	0.363	NA		NA
620744	620745	YPTB2063	YPTB2064			FALSE	0.073	71.000	0.046	NA	N	NA
620745	620746	YPTB2064	YPTB2065			TRUE	0.414	103.000	0.088	NA		NA
620747	620748	YPTB2066	YPTB2067			TRUE	0.909	4.000	0.019	NA		NA
620748	620749	YPTB2067	YPTB2068			TRUE	0.752	17.000	0.019	NA		NA
620751	620752	YPTB2070	YPTB2071	dsbB	nhaB	TRUE	0.658	236.000	0.723	1.000	N	NA
620756	620757	YPTB2075	YPTB2076			FALSE	0.084	265.000	0.000	NA		NA
620759	620760	YPTB2078	YPTB2079			FALSE	0.207	108.000	0.007	NA		NA
620760	620761	YPTB2079	YPTB2080			TRUE	0.892	150.000	0.683	NA		NA
620763	620764	YPTB2082	YPTB2083		gapA	FALSE	0.279	324.000	0.154	1.000	Y	NA
620765	620766	YPTB2084	YPTB2085			TRUE	0.733	71.000	0.216	NA		NA
620767	620768	YPTB2086	YPTB2087	pncA	ansA	FALSE	0.152	15.000	0.040	1.000	N	NA
620768	620769	YPTB2087	YPTB2088	ansA	sppA	FALSE	0.235	117.000	0.113	1.000	N	NA
620770	620771	YPTB2089	YPTB2090		selD	FALSE	0.005	225.000	0.033	1.000	N	NA
620771	620772	YPTB2090	YPTB2091	selD	topB	FALSE	0.028	59.000	0.041	1.000	N	NA
620772	620773	YPTB2091	YPTB2092	topB		TRUE	0.982	-3.000	0.123	NA		NA
620774	620775	YPTB2093	YPTB2094	nudG	xthA	FALSE	0.066	98.000	0.056	1.000	N	NA
620776	620777	YPTB2095	YPTB2096			FALSE	0.017	242.000	0.000	1.000	N	NA
620778	620779	YPTB_RNA_69	YPTB_RNA_68	tRNA-Tyr3	tRNA-Tyr2	TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
620779	620780	YPTB_RNA_68	YPTB2097	tRNA-Tyr2	purU	FALSE	0.280	149.000	0.000	NA		NA
620780	620781	YPTB2097	YPTB2098	purU		TRUE	0.680	84.000	0.200	NA		NA
620782	620783	YPTB2099	YPTB2100			FALSE	0.008	307.000	0.000	1.000	N	NA
620787	620788	YPTB2104	YPTB2105		oppA	FALSE	0.002	838.000	0.000	NA	N	NA
620788	620789	YPTB2105	YPTB2106	oppA	oppB	TRUE	0.887	87.000	0.151	0.058	Y	NA
620789	620790	YPTB2106	YPTB2107	oppB	oppC	TRUE	0.998	19.000	0.870	0.058	Y	NA
620790	620791	YPTB2107	YPTB2108	oppC	oppD	TRUE	0.996	12.000	0.554	1.000	Y	NA
620791	620792	YPTB2108	YPTB2109	oppD	oppF	TRUE	0.999	-3.000	0.420	0.001	Y	NA
620793	620794	YPTB2110	YPTB2111		cls	TRUE	0.628	165.000	0.231	NA		NA
620794	620795	YPTB2111	YPTB2112	cls		TRUE	0.403	69.000	0.000	NA		NA
620796	620797	YPTB2113	YPTB2114			FALSE	0.155	220.000	0.000	NA		NA
620798	620799	YPTB2115	YPTB2116			FALSE	0.122	238.000	0.000	NA		NA
620801	620802	YPTB2118	YPTB2119		ispZ	TRUE	0.465	80.000	0.167	NA	N	NA
620805	620806	YPTB2122	YPTB2123		ompW	FALSE	0.313	109.000	0.000	NA		NA
620807	620808	YPTB2124	YPTB2125		trpA	FALSE	0.025	343.000	0.018	NA		NA
620808	620809	YPTB2125	YPTB2126	trpA	trpB	TRUE	1.000	0.000	0.947	0.001	Y	NA
620809	620810	YPTB2126	YPTB2127	trpB	trpC	TRUE	0.934	135.000	0.221	0.001	Y	NA
620810	620811	YPTB2127	YPTB2128	trpC	trpD	TRUE	0.996	4.000	0.293	1.000	Y	NA
620811	620812	YPTB2128	YPTB2129	trpD	trpG	TRUE	0.963	15.000	0.083	1.000	Y	NA
620812	620813	YPTB2129	YPTB2130	trpG	trpE	TRUE	1.000	0.000	0.703	0.001	Y	NA
620813	620814	YPTB2130	YPTB2131	trpE		FALSE	0.228	116.000	0.023	NA		NA
620814	620815	YPTB2131	YPTB2132			TRUE	0.703	29.000	0.000	NA		NA
620816	620817	YPTB2133	YPTB2134	trpH		TRUE	0.966	17.000	0.281	NA		NA
620817	620818	YPTB2134	YPTB2135			FALSE	0.179	330.000	0.075	NA	Y	NA
620819	620820	YPTB2136	YPTB2137	btuR		FALSE	0.289	17.000	0.050	1.000	N	NA
620823	620824	YPTB2140	YPTB2141	topA	cysB	FALSE	0.001	397.000	0.008	1.000	N	NA
620824	620825	YPTB2141	YPTB2142	cysB		FALSE	0.043	336.000	0.000	NA		NA
620825	620826	YPTB2142	YPTB2143		acnA	FALSE	0.034	364.000	0.000	NA		NA
620828	620829	YPTB2145	YPTB2146	pgpB		TRUE	0.418	181.000	0.143	1.000		NA
620829	620830	YPTB2146	YPTB2147			TRUE	0.995	7.000	0.576	1.000		NA
620832	620833	YPTB2149	YPTB2150	pyrF		TRUE	0.541	0.000	0.045	1.000	N	NA
620838	620839	YPTB2155	YPTB2156		cstA	TRUE	0.981	-7.000	0.143	NA		NA
620839	620840	YPTB2156	YPTB2157	cstA	rnb	FALSE	0.005	350.000	0.000	1.000	N	NA
620841	620842	YPTB2158	YPTB2159			TRUE	0.754	80.000	0.103	1.000	Y	NA
620843	620844	YPTB2160	YPTB2161	nth		TRUE	0.944	-3.000	0.109	1.000	N	NA
620844	620845	YPTB2161	YPTB2162			TRUE	1.000	-3.000	0.908	0.039	Y	NA
620845	620846	YPTB2162	YPTB2163			TRUE	0.999	10.000	0.924	0.039	Y	NA
620848	620849	YPTB2165	YPTB2166			TRUE	0.999	-7.000	0.537	0.012	Y	NA
620849	620850	YPTB2166	YPTB2167			TRUE	0.999	0.000	0.564	0.039	Y	NA
620850	620851	YPTB2167	YPTB2168			TRUE	0.533	128.000	0.148	NA		NA
620852	620853	YPTB2169	YPTB2170			TRUE	0.940	65.000	0.170	0.009	Y	NA
620853	620854	YPTB2170	YPTB2171			TRUE	0.998	2.000	0.255	0.009	Y	NA
620855	620856	YPTB2172	YPTB2173	araA	araB	FALSE	0.030	84.000	0.046	1.000	N	NA
620857	620858	YPTB2174	YPTB2175	araF	araG	TRUE	0.988	98.000	0.917	0.013	Y	NA
620858	620859	YPTB2175	YPTB2176	araG	araH	TRUE	0.996	18.000	0.451	0.013	Y	NA
620859	620860	YPTB2176	YPTB2177	araH	araC	FALSE	0.240	221.000	0.196	1.000	N	NA
620860	620861	YPTB2177	YPTB2178	araC		TRUE	0.695	128.000	0.276	1.000		NA
620861	620862	YPTB2178	YPTB2179			FALSE	0.205	194.000	0.000	NA		NA
620867	620868	YPTB2184	YPTB2185		manA	TRUE	0.777	240.000	0.778	NA		NA
620870	620871	YPTB2187	YPTB2188	tus		FALSE	0.107	205.000	0.018	1.000		NA
620872	620873	YPTB2189	YPTB2190	ynfL	mlc	TRUE	0.881	179.000	0.408	NA	Y	NA
620873	620874	YPTB2190	YPTB2191	mlc	bioD	TRUE	0.531	224.000	0.455	NA	N	NA
620875	620876	YPTB2192	YPTB2193			FALSE	0.220	182.000	0.053	NA		NA
620876	620877	YPTB2193	YPTB2194			TRUE	0.720	214.000	0.500	NA		NA
620877	620878	YPTB2194	YPTB2195		ydfG	FALSE	0.103	227.000	0.029	NA		NA
620878	620879	YPTB2195	YPTB2196	ydfG		FALSE	0.285	114.000	0.000	1.000		NA
620883	620884	YPTB2200	YPTB2201			TRUE	0.944	-13.000	0.000	NA		NA
620884	620885	YPTB2201	YPTB2202			TRUE	0.932	-43.000	0.000	NA		NA
620885	620886	YPTB2202	YPTB2203			TRUE	0.444	64.000	0.000	NA		NA
620886	620887	YPTB2203	YPTB2204			FALSE	0.282	144.000	0.000	NA		NA
620887	620888	YPTB2204	YPTB2205			TRUE	0.956	219.000	0.727	0.013	Y	NA
620888	620889	YPTB2205	YPTB2206			TRUE	0.998	27.000	1.000	0.013	Y	NA
620889	620890	YPTB2206	YPTB2207			TRUE	0.998	-3.000	0.786	NA		NA
620891	620892	YPTB2208	YPTB2209			TRUE	0.999	4.000	0.520	0.058	Y	NA
620892	620893	YPTB2209	YPTB2210		tauB	TRUE	0.997	10.000	0.520	1.000	Y	NA
620895	620896	YPTB2212	YPTB2213			TRUE	0.965	5.000	0.111	NA		NA
620896	620897	YPTB2213	YPTB2214			TRUE	0.995	-3.000	0.333	NA		NA
620899	620900	YPTB2216	YPTB2217	ilvB	ilvN	TRUE	0.999	2.000	0.649	0.002		NA
620901	620902	YPTB2218	YPTB2219			FALSE	0.234	131.000	0.033	NA		NA
620902	620903	YPTB2219	YPTB2220		phoA	FALSE	0.014	546.000	0.000	NA		NA
620904	620905	YPTB2221	YPTB2222	ogt	fnr	FALSE	0.019	73.000	0.038	1.000	N	NA
620905	620906	YPTB2222	YPTB2223	fnr		TRUE	0.943	135.000	0.619	1.000	Y	NA
620907	620908	YPTB2224	YPTB2225	pntB	pntA	TRUE	0.990	73.000	0.745	0.001	Y	NA
620908	620909	YPTB2225	YPTB2226	pntA		FALSE	0.204	121.000	0.010	NA		NA
620910	620911	YPTB2227	YPTB2228			FALSE	0.185	270.000	0.143	NA		NA
620913	620914	YPTB2230	YPTB2231	rstA	rstB	TRUE	0.995	0.000	0.181	1.000	Y	NA
620914	620915	YPTB2231	YPTB2232	rstB		TRUE	0.668	78.000	0.300	1.000	N	NA
620915	620916	YPTB2232	YPTB2233			FALSE	0.001	839.000	0.000	1.000	N	NA
620917	620918	YPTB2234	YPTB2235			TRUE	0.983	26.000	0.676	NA		NA
620919	620920	YPTB2236	YPTB2237			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
620920	620921	YPTB2237	YPTB2238			FALSE	0.044	334.000	0.000	NA		NA
620922	620923	YPTB2239	YPTB2240			TRUE	0.971	-3.000	0.077	NA		NA
620923	620924	YPTB2240	YPTB2241		hrpA	FALSE	0.063	297.000	0.000	NA		NA
620928	620929	YPTB2245	YPTB2246			TRUE	0.996	10.000	0.726	NA		NA
620929	620930	YPTB2246	YPTB2247			TRUE	0.963	-3.000	0.057	NA		NA
620931	620932	YPTB2248	YPTB2249	ldhA	hslJ	FALSE	0.020	70.000	0.024	NA	N	NA
620936	620937	YPTB2253	YPTB2254	nifJ		FALSE	0.017	275.000	0.000	NA	N	NA
620937	620938	YPTB2254	YPTB2255			FALSE	0.018	271.000	0.000	NA	N	NA
620938	620939	YPTB2255	YPTB2256			FALSE	0.008	312.000	0.000	1.000	N	NA
620940	620941	YPTB2257	YPTB2258	ZntB	mppA	FALSE	0.004	243.000	0.019	1.000	N	NA
620946	620947	YPTB2263	YPTB2264			TRUE	0.851	79.000	0.412	NA		NA
620948	620949	YPTB2265	YPTB2266			TRUE	0.999	-3.000	0.791	NA		NA
620949	620950	YPTB2266	YPTB2267		pspD	TRUE	0.934	-19.000	0.052	NA		NA
620950	620951	YPTB2267	YPTB2268	pspD	pspC	TRUE	0.626	85.000	0.167	NA		NA
620951	620952	YPTB2268	YPTB2269	pspC	pspB	TRUE	0.999	0.000	0.913	NA		NA
620952	620953	YPTB2269	YPTB2270	pspB	pspA	TRUE	0.899	162.000	0.739	NA		NA
620954	620955	YPTB2271	YPTB2272	pspF	sapA	FALSE	0.110	599.000	0.402	0.046	N	NA
620955	620956	YPTB2272	YPTB2273	sapA	sapB	TRUE	0.994	-3.000	0.264	0.057	N	NA
620956	620957	YPTB2273	YPTB2274	sapB	sapC	TRUE	0.998	-13.000	0.284	0.057	Y	NA
620957	620958	YPTB2274	YPTB2275	sapC	sapD	TRUE	0.999	0.000	0.667	1.000	Y	NA
620958	620959	YPTB2275	YPTB2276	sapD	sapF	TRUE	1.000	0.000	0.684	0.019	Y	NA
620959	620960	YPTB2276	YPTB2277	sapF		FALSE	0.026	391.000	0.000	NA		NA
620960	620961	YPTB2277	YPTB2278			FALSE	0.010	643.000	0.000	NA		NA
620961	620962	YPTB2278	YPTB2279			FALSE	0.093	256.000	0.000	NA		NA
620962	620963	YPTB2279	YPTB2280			FALSE	0.107	246.000	0.000	NA		NA
620963	620964	YPTB2280	YPTB2281		gst	FALSE	0.119	245.000	0.062	NA		NA
620965	620966	YPTB2282	YPTB2283	pdxY	tyrS	FALSE	0.012	155.000	0.041	1.000	N	NA
620966	620967	YPTB2283	YPTB2284	tyrS	pdxH	FALSE	0.034	182.000	0.054	1.000	N	NA
620967	620968	YPTB2284	YPTB2285	pdxH		FALSE	0.280	91.000	0.034	NA		NA
620968	620969	YPTB2285	YPTB2286			TRUE	0.411	58.000	0.034	NA		NA
620971	620972	YPTB2288	YPTB2289	rovA		FALSE	0.007	798.000	0.000	1.000		NA
620972	620973	YPTB2289	YPTB2290			FALSE	0.261	132.000	0.045	NA		NA
620974	620975	YPTB2291	YPTB2292			FALSE	0.211	243.000	0.128	1.000		NA
620975	620976	YPTB2292	YPTB2293			TRUE	0.708	88.000	0.362	1.000	N	NA
620978	620979	YPTB2295	YPTB2296	gloA	rnt	FALSE	0.312	112.000	0.136	1.000	N	NA
620981	620982	YPTB2298	YPTB2299		sodB	FALSE	0.001	361.000	0.015	NA	N	NA
620982	620983	YPTB2299	YPTB2300	sodB	purR	FALSE	0.002	527.000	0.000	1.000	N	NA
620985	620986	YPTB2302	YPTB2303		cfa	FALSE	0.002	480.000	0.000	1.000	N	NA
620988	620989	YPTB2305	YPTB_RNA_44		tRNA-Val1	FALSE	0.113	243.000	0.000	NA		NA
620989	620990	YPTB_RNA_44	YPTB_RNA_45	tRNA-Val1	tRNA-Val2	TRUE	0.470	60.000	0.000	NA		NA
620990	620991	YPTB_RNA_45	YPTB_RNA_46	tRNA-Val2	tRNA-Val3	FALSE	0.256	170.000	0.000	NA		NA
620991	620992	YPTB_RNA_46	YPTB2306	tRNA-Val3	pykF	FALSE	0.012	575.000	0.000	NA		NA
620992	620993	YPTB2306	YPTB2307	pykF	lpp	FALSE	0.007	321.000	0.000	1.000	N	NA
620994	620995	YPTB2308	YPTB2309			FALSE	0.132	271.000	0.103	NA		NA
620995	620996	YPTB2309	YPTB2310			TRUE	0.649	89.000	0.183	NA		NA
620996	620997	YPTB2310	YPTB2311			TRUE	0.978	-3.000	0.193	1.000	N	NA
620997	620998	YPTB2311	YPTB2312			TRUE	0.998	-25.000	0.482	1.000	Y	NA
620998	620999	YPTB2312	YPTB2313			TRUE	0.884	185.000	0.466	1.000	Y	NA
620999	621000	YPTB2313	YPTB2314			TRUE	0.825	15.000	0.041	NA		NA
621000	621001	YPTB2314	YPTB2315			FALSE	0.011	595.000	0.000	NA		NA
621001	621002	YPTB2315	YPTB2316			FALSE	0.315	122.000	0.129	NA	N	NA
621005	621006	YPTB2319	YPTB2320		aroH	TRUE	0.511	157.000	0.165	1.000		NA
621007	621008	YPTB2321	YPTB2322		lplA	TRUE	0.390	52.000	0.006	NA		NA
621008	621009	YPTB2322	YPTB2323	lplA	nlpC	FALSE	0.196	125.000	0.091	NA	N	NA
621009	621010	YPTB2323	YPTB2324	nlpC	pmrM	FALSE	0.189	280.000	0.161	NA		NA
621010	621011	YPTB2324	YPTB2325	pmrM	pmrL	TRUE	0.999	-3.000	0.613	0.099		NA
621011	621012	YPTB2325	YPTB2326	pmrL	pmrK	TRUE	0.995	-3.000	0.227	0.099		NA
621012	621013	YPTB2326	YPTB2327	pmrK	pmrJ	TRUE	0.826	-3.000	0.061	1.000	N	NA
621013	621014	YPTB2327	YPTB2328	pmrJ	pmrI	TRUE	0.998	-3.000	0.447	1.000	Y	NA
621014	621015	YPTB2328	YPTB2329	pmrI	pmrF	TRUE	0.997	-3.000	0.220	NA	Y	NA
621015	621016	YPTB2329	YPTB2330	pmrF	pmrH	TRUE	0.997	-13.000	0.378	NA	Y	NA
621016	621017	YPTB2330	YPTB2331	pmrH	btuD	FALSE	0.035	350.000	0.129	1.000	N	NA
621017	621018	YPTB2331	YPTB2332	btuD	btuE	FALSE	0.099	22.000	0.036	1.000	N	NA
621018	621019	YPTB2332	YPTB2333	btuE	btuC	FALSE	0.210	70.000	0.084	1.000	N	NA
621019	621020	YPTB2333	YPTB2334	btuC		FALSE	0.122	227.000	0.044	NA		NA
621020	621021	YPTB2334	YPTB2335		ihfA	FALSE	0.044	334.000	0.000	NA		NA
621021	621022	YPTB2335	YPTB2336	ihfA	pheT	TRUE	0.966	5.000	0.208	1.000	N	NA
621022	621023	YPTB2336	YPTB2337	pheT	pheS	TRUE	0.999	14.000	0.574	0.001	Y	NA
621023	621024	YPTB2337	YPTB2338	pheS		FALSE	0.036	357.000	0.000	NA		NA
621024	621025	YPTB2338	YPTB2339		rplT	FALSE	0.328	98.000	0.000	NA		NA
621025	621026	YPTB2339	YPTB2340	rplT	rpmI	TRUE	0.996	38.000	0.928	0.012	Y	NA
621026	621027	YPTB2340	YPTB2341	rpmI	infC	TRUE	0.956	97.000	0.652	1.000	Y	NA
621027	621028	YPTB2341	YPTB2342	infC	thrS	TRUE	0.993	4.000	0.186	1.000	Y	NA
621029	621030	YPTB2343	YPTB2344			FALSE	0.055	310.000	0.000	NA		NA
621030	621031	YPTB2344	YPTB2345		marC	FALSE	0.010	642.000	0.000	NA		NA
621033	621034	YPTB2347	YPTB2348	yfeA	yfeB	TRUE	0.999	-3.000	0.894	1.000	Y	NA
621034	621035	YPTB2348	YPTB2349	yfeB	yfeC	TRUE	1.000	0.000	0.857	0.095	Y	NA
621035	621036	YPTB2349	YPTB2350	yfeC	yfeD	TRUE	0.999	-3.000	0.525	0.006	Y	NA
621036	621037	YPTB2350	YPTB2351	yfeD		TRUE	0.408	68.000	0.000	NA		NA
621037	621038	YPTB2351	YPTB2352			TRUE	0.750	25.000	0.000	NA		NA
621042	621043	YPTB2356	YPTB2357	kduI	kduD1	TRUE	0.476	92.000	0.192	1.000	N	NA
621043	621044	YPTB2357	YPTB2358	kduD1	pelW	FALSE	0.035	345.000	0.000	1.000		NA
621044	621045	YPTB2358	YPTB2359	pelW		TRUE	0.857	41.000	0.217	1.000		NA
621045	621046	YPTB2359	YPTB2360			TRUE	1.000	-7.000	0.917	0.057	Y	NA
621046	621047	YPTB2360	YPTB2361			TRUE	0.988	14.000	0.131	0.057	Y	NA
621047	621048	YPTB2361	YPTB2362			TRUE	0.982	16.000	0.101	0.057	Y	NA
621048	621049	YPTB2362	YPTB2363			FALSE	0.144	299.000	0.000	0.057		NA
621049	621050	YPTB2363	YPTB2364		ydjM	FALSE	0.017	477.000	0.000	NA		NA
621050	621051	YPTB2364	YPTB2365	ydjM	gltP	FALSE	0.286	204.000	0.102	NA		NA
621052	621053	YPTB2366	YPTB2367	ybjR	kdgR	FALSE	0.004	375.000	0.000	1.000	N	NA
621053	621054	YPTB2367	YPTB2368	kdgR	ogl	FALSE	0.044	187.000	0.059	1.000	N	NA
621056	621057	YPTB2370	YPTB2371			TRUE	0.995	-3.000	0.167	1.000	Y	NA
621057	621058	YPTB2371	YPTB2372		htrE	TRUE	0.995	-3.000	0.167	1.000	Y	NA
621058	621059	YPTB2372	YPTB2373	htrE	ecpD	TRUE	0.970	82.000	0.750	1.000	Y	NA
621059	621060	YPTB2373	YPTB2374	ecpD		TRUE	0.886	238.000	0.750	1.000	Y	NA
621060	621061	YPTB2374	YPTB2375		htpX	FALSE	0.001	658.000	0.000	1.000	N	NA
621061	621062	YPTB2375	YPTB2376	htpX	prc	FALSE	0.022	463.000	0.042	0.023	N	NA
621062	621063	YPTB2376	YPTB2377	prc	proQ	TRUE	0.936	20.000	0.304	NA	N	NA
621063	621064	YPTB2377	YPTB2378	proQ		TRUE	0.705	96.000	0.081	NA	Y	NA
621065	621066	YPTB2379	YPTB2380	yebS		TRUE	0.998	-31.000	0.840	NA		NA
621066	621067	YPTB2380	YPTB2381			FALSE	0.017	480.000	0.000	NA		NA
621067	621068	YPTB2381	YPTB2382			TRUE	0.980	6.000	0.192	NA		NA
621068	621069	YPTB2382	YPTB2383			TRUE	0.988	21.000	0.714	NA		NA
621069	621070	YPTB2383	YPTB2384			FALSE	0.125	236.000	0.000	NA		NA
621070	621071	YPTB2384	YPTB2385			FALSE	0.319	103.000	0.000	NA		NA
621071	621072	YPTB2385	YPTB2386			TRUE	0.874	206.000	0.848	NA		NA
621072	621073	YPTB2386	YPTB2387			FALSE	0.177	208.000	0.000	NA		NA
621074	621075	YPTB2388	YPTB2389			FALSE	0.008	800.000	0.000	NA		NA
621075	621076	YPTB2389	YPTB2390			FALSE	0.276	155.000	0.000	NA		NA
621076	621077	YPTB2390	YPTB2391			FALSE	0.026	393.000	0.000	NA		NA
621079	621080	YPTB2393	YPTB2394			FALSE	0.322	100.000	0.000	NA		NA
621080	621081	YPTB2394	YPTB2395			FALSE	0.005	357.000	0.000	1.000	N	NA
621081	621082	YPTB2395	YPTB2396		cheZ	FALSE	0.002	535.000	0.000	1.000	N	NA
621082	621083	YPTB2396	YPTB2397	cheZ	cheY	TRUE	0.995	10.000	0.333	1.000	Y	NA
621083	621084	YPTB2397	YPTB2398	cheY	cheB	TRUE	0.942	101.000	0.286	0.010	Y	NA
621084	621085	YPTB2398	YPTB2399	cheB	cheR	TRUE	0.991	0.000	0.087	1.000	Y	NA
621085	621086	YPTB2399	YPTB2400	cheR	tap	TRUE	0.754	173.000	0.188	1.000	Y	NA
621086	621087	YPTB2400	YPTB2401	tap	cheD	TRUE	0.953	185.000	0.429	0.001	Y	NA
621087	621088	YPTB2401	YPTB2402	cheD		FALSE	0.117	241.000	0.000	NA		NA
621088	621089	YPTB2402	YPTB2403			FALSE	0.289	135.000	0.000	NA		NA
621089	621090	YPTB2403	YPTB2404		cheW	FALSE	0.011	620.000	0.000	NA		NA
621090	621091	YPTB2404	YPTB2405	cheW	cheA	TRUE	0.960	163.000	0.447	0.003	Y	NA
621091	621092	YPTB2405	YPTB2406	cheA	motB	TRUE	0.999	11.000	0.913	1.000	Y	NA
621092	621093	YPTB2406	YPTB2407	motB	motA	TRUE	0.998	-3.000	0.429	1.000	Y	NA
621093	621094	YPTB2407	YPTB2408	motA	flhC	FALSE	0.072	282.000	0.000	NA		NA
621094	621095	YPTB2408	YPTB2409	flhC	flhD	TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
621095	621096	YPTB2409	YPTB2410	flhD	mgtB	FALSE	0.006	1188.000	0.000	1.000		NA
621096	621097	YPTB2410	YPTB2411	mgtB	mgtC1	FALSE	0.025	409.000	0.065	1.000		NA
621099	621100	YPTB2413	YPTB2414		cspC	FALSE	0.265	215.000	0.105	NA		NA
621101	621102	YPTB2415	YPTB2416	lacZ		FALSE	0.003	407.000	0.000	1.000	N	NA
621102	621103	YPTB2416	YPTB2417		ylaC	FALSE	0.071	283.000	0.000	NA		NA
621103	621104	YPTB2417	YPTB2418	ylaC		FALSE	0.015	525.000	0.000	NA		NA
621104	621105	YPTB2418	YPTB2419			FALSE	0.315	89.000	0.045	NA		NA
621105	621106	YPTB2419	YPTB2420			FALSE	0.059	303.000	0.000	NA		NA
621107	621108	YPTB2421	YPTB2422			FALSE	0.015	532.000	0.000	NA		NA
621109	621110	YPTB2423	YPTB2424		aer	FALSE	0.001	921.000	0.000	1.000	N	NA
621110	621111	YPTB2424	YPTB2425	aer		TRUE	0.493	120.000	0.125	NA		NA
621111	621112	YPTB2425	YPTB2426		cscR	FALSE	0.094	255.000	0.000	NA		NA
621114	621115	YPTB2428	YPTB2429	ymfC		TRUE	0.970	-7.000	0.182	1.000	N	NA
621115	621116	YPTB2429	YPTB2430		trmU	FALSE	0.261	187.000	0.158	1.000	N	NA
621116	621117	YPTB2430	YPTB2431	trmU		TRUE	0.759	58.000	0.180	NA		NA
621117	621118	YPTB2431	YPTB2432		purB	TRUE	0.578	61.000	0.093	NA		NA
621118	621119	YPTB2432	YPTB2433	purB		FALSE	0.112	188.000	0.002	1.000		NA
621119	621120	YPTB2433	YPTB2434		phoP	FALSE	0.156	211.000	0.000	1.000		NA
621120	621121	YPTB2434	YPTB2435	phoP	phoQ	TRUE	0.999	6.000	0.940	1.000	Y	NA
621121	621122	YPTB2435	YPTB2436	phoQ		TRUE	0.843	84.000	0.408	NA		NA
621123	621124	YPTB2437	YPTB2438	pepT	cobB	FALSE	0.001	330.000	0.019	1.000	N	NA
621124	621125	YPTB2438	YPTB2439	cobB		TRUE	0.881	49.000	0.119	1.000	Y	NA
621125	621126	YPTB2439	YPTB2440		lolE	TRUE	0.906	19.000	0.225	1.000	N	NA
621126	621127	YPTB2440	YPTB2441	lolE	lolD	TRUE	0.982	0.000	0.125	0.078	N	NA
621127	621128	YPTB2441	YPTB2442	lolD	lolC	TRUE	0.986	-7.000	0.175	0.078	N	NA
621130	621131	YPTB2444	YPTB2445	ycfJ		FALSE	0.054	311.000	0.000	NA		NA
621131	621132	YPTB2445	YPTB2446			TRUE	0.923	8.000	0.000	NA		NA
621132	621133	YPTB2446	YPTB2447		ndh	FALSE	0.012	585.000	0.000	NA		NA
621133	621134	YPTB2447	YPTB2448	ndh		FALSE	0.032	374.000	0.057	NA		NA
621134	621135	YPTB2448	YPTB2449		ycfO	TRUE	0.400	128.000	0.091	NA		NA
621135	621136	YPTB2449	YPTB2450	ycfO		FALSE	0.146	71.000	0.069	1.000	N	NA
621136	621137	YPTB2450	YPTB2451			TRUE	0.990	-19.000	0.310	NA		NA
621137	621138	YPTB2451	YPTB2452		ycfL	TRUE	0.953	41.000	0.516	NA		NA
621138	621139	YPTB2452	YPTB2453	ycfL		TRUE	0.630	35.000	0.051	NA		NA
621139	621140	YPTB2453	YPTB2454			FALSE	0.010	174.000	0.003	1.000	N	NA
621141	621142	YPTB2455	YPTB2456			FALSE	0.018	472.000	0.000	NA		NA
621143	621144	YPTB2457	YPTB2458			FALSE	0.310	113.000	0.000	NA		NA
621144	621145	YPTB2458	YPTB2459			FALSE	0.018	473.000	0.000	NA		NA
621145	621146	YPTB2459	YPTB2460			FALSE	0.016	514.000	0.000	NA		NA
621147	621148	YPTB2461	YPTB2462			FALSE	0.012	585.000	0.000	NA		NA
621149	621150	YPTB2463	YPTB2464	ptsG		FALSE	0.002	306.000	0.004	NA	N	NA
621150	621151	YPTB2464	YPTB2465		holB	TRUE	0.972	15.000	0.110	NA	Y	NA
621151	621152	YPTB2465	YPTB2466	holB	tmk	TRUE	0.979	0.000	0.211	1.000	N	NA
621152	621153	YPTB2466	YPTB2467	tmk	yceG	TRUE	0.986	-10.000	0.209	NA		NA
621153	621154	YPTB2467	YPTB2468	yceG	pabC	FALSE	0.219	289.000	0.204	NA		NA
621154	621155	YPTB2468	YPTB2469	pabC	fabF	FALSE	0.055	363.000	0.187	1.000	N	NA
621155	621156	YPTB2469	YPTB2470	fabF	acpP	TRUE	0.905	95.000	0.346	1.000	Y	NA
621156	621157	YPTB2470	YPTB2471	acpP	fabG	TRUE	0.944	154.000	0.321	0.003	Y	NA
621157	621158	YPTB2471	YPTB2472	fabG	fabD	TRUE	0.998	14.000	0.432	0.003	Y	NA
621158	621159	YPTB2472	YPTB2473	fabD	fabH	TRUE	0.976	38.000	0.182	0.003	Y	NA
621159	621160	YPTB2473	YPTB2474	fabH	plsX	TRUE	0.999	7.000	0.380	0.003	Y	NA
621160	621161	YPTB2474	YPTB2475	plsX	rpmF	TRUE	0.913	34.000	0.418	1.000	N	NA
621161	621162	YPTB2475	YPTB2476	rpmF		TRUE	0.992	13.000	0.599	NA		NA
621165	621166	YPTB_RNA_117	YPTB2479		rne	TRUE	0.736	26.000	0.000	NA		NA
621167	621168	YPTB2480	YPTB2481			FALSE	0.339	94.000	0.000	NA		NA
621169	621170	YPTB2482	YPTB2483	pyrC	dinI	FALSE	0.038	313.000	0.031	NA		NA
621170	621171	YPTB2483	YPTB2484	dinI	yceP	FALSE	0.016	506.000	0.000	NA		NA
621171	621172	YPTB2484	YPTB2485	yceP	solA	FALSE	0.099	251.000	0.000	NA		NA
621172	621173	YPTB2485	YPTB2486	solA		FALSE	0.012	267.000	0.000	1.000	N	NA
621174	621175	YPTB2487	YPTB2488			FALSE	0.221	149.000	0.033	NA		NA
621175	621176	YPTB2488	YPTB2489			FALSE	0.035	359.000	0.000	NA		NA
621177	621178	YPTB2490	YPTB2491	htrB	yceE	FALSE	0.010	697.000	0.000	0.074	N	NA
621179	621180	YPTB2492	YPTB2493		mdoH	TRUE	0.830	33.000	0.135	NA		NA
621180	621181	YPTB2493	YPTB2494	mdoH	mdoG	TRUE	0.993	-7.000	0.469	NA	N	NA
621182	621183	YPTB2495	YPTB2496			FALSE	0.183	206.000	0.000	NA		NA
621183	621184	YPTB2496	YPTB2497			FALSE	0.040	344.000	0.000	NA		NA
621187	621188	YPTB2500	YPTB2501	ypsR		FALSE	0.159	418.000	0.000	0.045	Y	NA
621189	621190	YPTB2502	YPTB2503			TRUE	0.884	47.000	0.286	1.000		NA
621190	621191	YPTB2503	YPTB2504			TRUE	0.995	11.000	0.714	1.000		NA
621192	621193	YPTB2505	YPTB2506			TRUE	0.990	11.000	0.468	NA		NA
621193	621194	YPTB2506	YPTB2507			TRUE	0.992	18.000	0.787	NA		NA
621194	621195	YPTB2507	YPTB2508			TRUE	0.999	-3.000	0.895	NA		NA
621195	621196	YPTB2508	YPTB2509			TRUE	0.841	156.000	0.528	NA		NA
621196	621197	YPTB2509	YPTB2510			TRUE	0.998	-3.000	0.707	NA		NA
11514557	621197		YPTB2510			FALSE	NA	354.000	0.000	NA		NA
11656920	621197		YPTB2510			FALSE	NA	354.000	0.000	NA		NA
11799312	621197		YPTB2510			FALSE	NA	354.000	0.000	NA		NA
11514558	621197		YPTB2510			FALSE	NA	382.000	0.000	NA		NA
11656921	621197		YPTB2510			FALSE	NA	382.000	0.000	NA		NA
11799313	621197		YPTB2510			FALSE	NA	382.000	0.000	NA		NA
11514559	621197		YPTB2510			FALSE	NA	414.000	0.000	NA		NA
11656922	621197		YPTB2510			FALSE	NA	414.000	0.000	NA		NA
11799314	621197		YPTB2510			FALSE	NA	414.000	0.000	NA		NA
11514560	621197		YPTB2510			FALSE	NA	442.000	0.000	NA		NA
11656923	621197		YPTB2510			FALSE	NA	442.000	0.000	NA		NA
11799315	621197		YPTB2510			FALSE	NA	442.000	0.000	NA		NA
11514561	621197		YPTB2510			FALSE	NA	474.000	0.000	NA		NA
11656924	621197		YPTB2510			FALSE	NA	474.000	0.000	NA		NA
11799316	621197		YPTB2510			FALSE	NA	474.000	0.000	NA		NA
11514562	621197		YPTB2510			FALSE	NA	502.000	0.000	NA		NA
11656925	621197		YPTB2510			FALSE	NA	502.000	0.000	NA		NA
11799317	621197		YPTB2510			FALSE	NA	502.000	0.000	NA		NA
11514563	621197		YPTB2510			FALSE	NA	534.000	0.000	NA		NA
11656926	621197		YPTB2510			FALSE	NA	534.000	0.000	NA		NA
11799318	621197		YPTB2510			FALSE	NA	534.000	0.000	NA		NA
11514564	621197		YPTB2510			FALSE	NA	562.000	0.000	NA		NA
11656927	621197		YPTB2510			FALSE	NA	562.000	0.000	NA		NA
11799319	621197		YPTB2510			FALSE	NA	562.000	0.000	NA		NA
11514565	621197		YPTB2510			FALSE	NA	594.000	0.000	NA		NA
11656928	621197		YPTB2510			FALSE	NA	594.000	0.000	NA		NA
11799320	621197		YPTB2510			FALSE	NA	594.000	0.000	NA		NA
11514566	621197		YPTB2510			FALSE	NA	622.000	0.000	NA		NA
11656929	621197		YPTB2510			FALSE	NA	622.000	0.000	NA		NA
11799321	621197		YPTB2510			FALSE	NA	622.000	0.000	NA		NA
11514567	621197		YPTB2510			FALSE	NA	655.000	0.000	NA		NA
11656930	621197		YPTB2510			FALSE	NA	655.000	0.000	NA		NA
11799322	621197		YPTB2510			FALSE	NA	655.000	0.000	NA		NA
11514568	621197		YPTB2510			FALSE	NA	683.000	0.000	NA		NA
11656931	621197		YPTB2510			FALSE	NA	683.000	0.000	NA		NA
11799323	621197		YPTB2510			FALSE	NA	683.000	0.000	NA		NA
11514569	621197		YPTB2510			FALSE	NA	715.000	0.000	NA		NA
11656932	621197		YPTB2510			FALSE	NA	715.000	0.000	NA		NA
11799324	621197		YPTB2510			FALSE	NA	715.000	0.000	NA		NA
11514570	621197		YPTB2510			FALSE	NA	743.000	0.000	NA		NA
11656933	621197		YPTB2510			FALSE	NA	743.000	0.000	NA		NA
11799325	621197		YPTB2510			FALSE	NA	743.000	0.000	NA		NA
11514571	621197		YPTB2510			FALSE	NA	775.000	0.000	NA		NA
11656934	621197		YPTB2510			FALSE	NA	775.000	0.000	NA		NA
11799326	621197		YPTB2510			FALSE	NA	775.000	0.000	NA		NA
11514572	621197		YPTB2510			FALSE	NA	803.000	0.000	NA		NA
11656935	621197		YPTB2510			FALSE	NA	803.000	0.000	NA		NA
11799327	621197		YPTB2510			FALSE	NA	803.000	0.000	NA		NA
11514573	621197		YPTB2510			FALSE	NA	836.000	0.000	NA		NA
11656936	621197		YPTB2510			FALSE	NA	836.000	0.000	NA		NA
11799328	621197		YPTB2510			FALSE	NA	836.000	0.000	NA		NA
11514574	621197		YPTB2510			FALSE	NA	864.000	0.000	NA		NA
11656937	621197		YPTB2510			FALSE	NA	864.000	0.000	NA		NA
11799329	621197		YPTB2510			FALSE	NA	864.000	0.000	NA		NA
11514575	621197		YPTB2510			FALSE	NA	896.000	0.000	NA		NA
11656938	621197		YPTB2510			FALSE	NA	896.000	0.000	NA		NA
11799330	621197		YPTB2510			FALSE	NA	896.000	0.000	NA		NA
11514576	621197		YPTB2510			FALSE	NA	924.000	0.000	NA		NA
11656939	621197		YPTB2510			FALSE	NA	924.000	0.000	NA		NA
11799331	621197		YPTB2510			FALSE	NA	924.000	0.000	NA		NA
11514577	621197		YPTB2510			FALSE	NA	956.000	0.000	NA		NA
11656940	621197		YPTB2510			FALSE	NA	956.000	0.000	NA		NA
11799332	621197		YPTB2510			FALSE	NA	956.000	0.000	NA		NA
11514578	621197		YPTB2510			FALSE	NA	984.000	0.000	NA		NA
11656941	621197		YPTB2510			FALSE	NA	984.000	0.000	NA		NA
11799333	621197		YPTB2510			FALSE	NA	984.000	0.000	NA		NA
11514579	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1016.000	0.000	NA		NA
11656942	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1016.000	0.000	NA		NA
11799334	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1016.000	0.000	NA		NA
11514580	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1044.000	0.000	NA		NA
11656943	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1044.000	0.000	NA		NA
11799335	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1044.000	0.000	NA		NA
11514581	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1076.000	0.000	NA		NA
11656944	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1076.000	0.000	NA		NA
11799336	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1076.000	0.000	NA		NA
11514582	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1104.000	0.000	NA		NA
11656945	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1104.000	0.000	NA		NA
11799337	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1104.000	0.000	NA		NA
11514583	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1136.000	0.000	NA		NA
11656946	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1136.000	0.000	NA		NA
11799338	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1136.000	0.000	NA		NA
11514584	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1164.000	0.000	NA		NA
11656947	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1164.000	0.000	NA		NA
11799339	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1164.000	0.000	NA		NA
11514585	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1196.000	0.000	NA		NA
11656948	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1196.000	0.000	NA		NA
11799340	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1196.000	0.000	NA		NA
11514586	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1224.000	0.000	NA		NA
11656949	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1224.000	0.000	NA		NA
11799341	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1224.000	0.000	NA		NA
11514587	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1257.000	0.000	NA		NA
11656950	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1257.000	0.000	NA		NA
11799342	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1257.000	0.000	NA		NA
11514588	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1285.000	0.000	NA		NA
11656951	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1285.000	0.000	NA		NA
11799343	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1285.000	0.000	NA		NA
11514589	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1317.000	0.000	NA		NA
11656952	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1317.000	0.000	NA		NA
11799344	621197		YPTB2510			FALSE	NA	1317.000	0.000	NA		NA
621199	621200	YPTB2512	YPTB2513			TRUE	0.612	39.000	0.000	NA		NA
621200	621201	YPTB2513	YPTB2514			FALSE	0.305	123.000	0.000	NA		NA
621201	621202	YPTB2514	YPTB2515			TRUE	0.725	27.000	0.000	NA		NA
621202	621203	YPTB2515	YPTB2516			TRUE	0.603	147.000	0.000	NA	Y	NA
621203	621204	YPTB2516	YPTB2517			TRUE	0.999	1.000	0.711	0.054	Y	NA
621204	621205	YPTB2517	YPTB2518			TRUE	0.979	109.000	0.733	0.054	Y	NA
621206	621207	YPTB2519	YPTB2520		manB	TRUE	0.399	17.000	0.000	1.000	N	NA
621207	621208	YPTB2520	YPTB2521	manB	mtlK	TRUE	0.632	100.000	0.000	1.000	Y	NA
621209	621210	YPTB2522	YPTB2523			FALSE	0.078	273.000	0.000	NA		NA
621210	621211	YPTB2523	YPTB2524			TRUE	0.415	67.000	0.000	NA		NA
621211	621212	YPTB2524	YPTB2525			FALSE	0.010	664.000	0.000	NA		NA
621212	621213	YPTB2525	YPTB2526			FALSE	0.109	245.000	0.000	NA		NA
621213	621214	YPTB2526	YPTB2527			TRUE	0.951	2.000	0.000	NA		NA
621214	621215	YPTB2527	YPTB2528			TRUE	0.580	155.000	0.000	1.000	Y	NA
621215	621216	YPTB2528	YPTB2529			FALSE	0.001	655.000	0.000	1.000	N	NA
621216	621217	YPTB2529	YPTB2530			TRUE	0.407	96.000	0.000	0.037	N	NA
621217	621218	YPTB2530	YPTB2531			TRUE	0.377	117.000	0.167	1.000	N	NA
621218	621219	YPTB2531	YPTB2532			FALSE	0.032	783.000	0.333	1.000	N	NA
621220	621221	YPTB2533	YPTB2534			FALSE	0.208	372.000	0.000	0.044	Y	NA
621222	621223	YPTB2535	YPTB2536			TRUE	0.997	-3.000	0.111	0.012	Y	NA
621223	621224	YPTB2536	YPTB2537			TRUE	0.935	57.000	0.125	0.012	Y	NA
621224	621225	YPTB2537	YPTB2538		gutB	FALSE	0.215	175.000	0.125	1.000	N	NA
621225	621226	YPTB2538	YPTB2539	gutB		FALSE	0.010	648.000	0.000	NA		NA
621226	621227	YPTB2539	YPTB2540			FALSE	0.226	183.000	0.000	NA		NA
621227	621228	YPTB2540	YPTB2541			FALSE	0.122	238.000	0.000	NA		NA
621228	621229	YPTB2541	YPTB2542		ompX	FALSE	0.007	316.000	0.000	1.000	N	NA
621230	621231	YPTB2543	YPTB2544			TRUE	0.729	16.000	0.016	1.000		NA
621231	621232	YPTB2544	YPTB2545		tam	TRUE	0.905	23.000	0.000	0.043		NA
621232	621233	YPTB2545	YPTB2546	tam	dps	FALSE	0.081	258.000	0.000	1.000		NA
621233	621234	YPTB2546	YPTB2547	dps		FALSE	0.045	320.000	0.000	1.000		NA
621234	621235	YPTB2547	YPTB2548		glnH	FALSE	0.011	569.000	0.000	1.000		NA
621235	621236	YPTB2548	YPTB2549	glnH	glnP	TRUE	0.948	35.000	0.103	0.075	Y	NA
621236	621237	YPTB2549	YPTB2550	glnP	glnQ	TRUE	0.989	-3.000	0.051	1.000	Y	NA
621238	621239	YPTB2551	YPTB2552			FALSE	0.020	455.000	0.000	NA		NA
621239	621240	YPTB2552	YPTB2553			TRUE	0.444	64.000	0.000	NA		NA
621242	621243	YPTB2555	YPTB2556	ybiB	menE	FALSE	0.092	66.000	0.000	1.000	N	NA
621243	621244	YPTB2556	YPTB2557	menE	menC	TRUE	0.995	-12.000	0.283	0.001	N	NA
621244	621245	YPTB2557	YPTB2558	menC	menB	TRUE	0.998	0.000	0.171	0.001	Y	NA
621245	621246	YPTB2558	YPTB2559	menB		TRUE	0.974	14.000	0.280	NA		NA
621246	621247	YPTB2559	YPTB2560		menD	TRUE	0.995	-3.000	0.355	NA		NA
621247	621248	YPTB2560	YPTB2561	menD	menF	TRUE	0.696	228.000	0.281	1.000	Y	NA
621248	621249	YPTB2561	YPTB2562	menF		FALSE	0.014	545.000	0.000	NA		NA
621249	621250	YPTB2562	YPTB2563		elaB	FALSE	0.013	555.000	0.000	NA		NA
621250	621251	YPTB2563	YPTB2564	elaB		FALSE	0.010	652.000	0.000	NA		NA
621251	621252	YPTB2564	YPTB2565		edd	TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
621252	621253	YPTB2565	YPTB2566	edd		TRUE	0.856	10.000	0.008	NA		NA
621253	621254	YPTB2566	YPTB2567			TRUE	0.636	30.000	0.036	NA		NA
621254	621255	YPTB2567	YPTB2568			FALSE	0.138	546.000	0.667	1.000	N	NA
621255	621256	YPTB2568	YPTB2569			FALSE	0.003	464.000	0.000	1.000	N	NA
621257	621258	YPTB2570	YPTB2571		idnO	FALSE	0.008	739.000	0.000	1.000		NA
621258	621259	YPTB2571	YPTB2572	idnO	idnK	TRUE	0.395	49.000	0.095	1.000	N	NA
621259	621260	YPTB2572	YPTB2573	idnK		TRUE	0.761	78.000	0.095	NA	Y	NA
621261	621262	YPTB2574	YPTB2575		nuoN	FALSE	0.073	239.000	0.011	NA		NA
621262	621263	YPTB2575	YPTB2576	nuoN	nuoM	TRUE	0.999	7.000	0.437	0.001	Y	NA
621263	621264	YPTB2576	YPTB2577	nuoM	nuoL	TRUE	0.996	40.000	0.713	0.001	Y	NA
621264	621265	YPTB2577	YPTB2578	nuoL	nuoK	TRUE	0.999	-3.000	0.211	0.003	Y	NA
621265	621266	YPTB2578	YPTB2579	nuoK	nuoJ	TRUE	0.999	-3.000	0.269	0.002	Y	NA
621266	621267	YPTB2579	YPTB2580	nuoJ	nuoI	TRUE	0.998	13.000	0.428	0.003	Y	NA
621267	621268	YPTB2580	YPTB2581	nuoI	nuoH	TRUE	0.997	15.000	0.423	0.003	Y	NA
621268	621269	YPTB2581	YPTB2582	nuoH	nuoG	TRUE	1.000	-3.000	0.664	0.003	Y	NA
621269	621270	YPTB2582	YPTB2583	nuoG	nuoF	TRUE	0.930	87.000	0.180	0.003	Y	NA
621270	621271	YPTB2583	YPTB2584	nuoF	nuoE	TRUE	0.998	-3.000	0.186	0.003	Y	NA
621271	621272	YPTB2584	YPTB2585	nuoE	nuoD	TRUE	0.999	3.000	0.407	0.003	Y	NA
621272	621273	YPTB2585	YPTB2586	nuoD	nuoB	TRUE	0.982	143.000	0.691	0.002	Y	NA
621273	621274	YPTB2586	YPTB2587	nuoB	nuoA	TRUE	0.964	102.000	0.377	0.002	Y	NA
621274	621275	YPTB2587	YPTB2588	nuoA	pecT	FALSE	0.001	677.000	0.000	1.000	N	NA
621276	621277	YPTB2589	YPTB2590	aat		TRUE	0.385	151.000	0.104	1.000		NA
621278	621279	YPTB2591	YPTB2592			FALSE	0.037	354.000	0.000	NA		NA
621279	621280	YPTB2592	YPTB2593			FALSE	0.256	232.000	0.136	1.000		NA
621280	621281	YPTB2593	YPTB2594			TRUE	0.754	165.000	0.375	NA		NA
621281	621282	YPTB2594	YPTB2595			FALSE	0.161	340.000	0.221	NA		NA
621283	621284	YPTB2596	YPTB2597		ackA	TRUE	0.947	-10.000	0.000	NA		NA
621284	621285	YPTB2597	YPTB2598	ackA	pta	TRUE	0.860	168.000	0.634	1.000		NA
621287	621288	YPTB2600	YPTB2601			TRUE	0.857	169.000	0.130	0.005	Y	NA
621288	621289	YPTB2601	YPTB2602			TRUE	0.993	13.000	0.377	0.008		NA
621290	621291	YPTB2603	YPTB2604			TRUE	0.551	222.000	0.143	0.009		NA
621291	621292	YPTB2604	YPTB2605			FALSE	0.214	188.000	0.000	NA		NA
621294	621295	YPTB2607	YPTB2608	hisP	hisM	TRUE	0.996	14.000	0.643	1.000	Y	NA
621295	621296	YPTB2608	YPTB2609	hisM	hisQ	TRUE	1.000	-3.000	0.900	0.016	Y	NA
621296	621297	YPTB2609	YPTB2610	hisQ	hisJ	TRUE	0.984	96.000	0.833	0.054	Y	NA
621297	621298	YPTB2610	YPTB2611	hisJ	ubiX	FALSE	0.002	543.000	0.000	1.000	N	NA
621298	621299	YPTB2611	YPTB2612	ubiX	purF	FALSE	0.016	247.000	0.056	1.000	N	NA
621299	621300	YPTB2612	YPTB2613	purF	cvpA	TRUE	0.973	13.000	0.262	1.000		NA
621300	621301	YPTB2613	YPTB2614	cvpA	dedD	FALSE	0.093	312.000	0.116	1.000		NA
621301	621302	YPTB2614	YPTB2615	dedD	folC	TRUE	0.636	120.000	0.216	1.000		NA
621302	621303	YPTB2615	YPTB2616	folC	accD	FALSE	0.352	249.000	0.383	1.000	N	NA
621303	621304	YPTB2616	YPTB2617	accD	dedA	FALSE	0.088	231.000	0.020	NA		NA
621304	621305	YPTB2617	YPTB2618	dedA	truA	FALSE	0.228	157.000	0.038	NA		NA
621305	621306	YPTB2618	YPTB2619	truA	asd	TRUE	0.418	0.000	0.040	1.000	N	NA
621306	621307	YPTB2619	YPTB2620	asd	pdxB	TRUE	0.817	170.000	0.097	0.009	Y	NA
621307	621308	YPTB2620	YPTB2621	pdxB		TRUE	0.394	-13.000	0.043	1.000	N	NA
621309	621310	YPTB2622	YPTB2623		flk	FALSE	0.132	285.000	0.118	NA		NA
621315	621316	YPTB2628	YPTB2629			TRUE	0.904	58.000	0.425	NA		NA
621316	621317	YPTB2629	YPTB2630		yfcA	TRUE	0.569	100.000	0.153	NA		NA
621317	621318	YPTB2630	YPTB2631	yfcA	mepA	TRUE	0.977	4.000	0.160	1.000		NA
621318	621319	YPTB2631	YPTB2632	mepA	aroC	FALSE	0.042	45.000	0.025	1.000	N	NA
621319	621320	YPTB2632	YPTB2633	aroC		FALSE	0.181	77.000	0.081	1.000	N	NA
621322	621323	YPTB2635	YPTB2636	sixA	faoA	FALSE	0.002	599.000	0.000	1.000	N	NA
621323	621324	YPTB2636	YPTB2637	faoA		TRUE	0.998	0.000	0.430	1.000	Y	NA
621324	621325	YPTB2637	YPTB2638			FALSE	0.074	287.000	0.061	NA		NA
621327	621328	YPTB2640	YPTB2641	vcaJ		TRUE	0.813	36.000	0.239	1.000	N	NA
621328	621329	YPTB2641	YPTB2642		ccmH	TRUE	0.999	0.000	0.727	NA	Y	NA
621329	621330	YPTB2642	YPTB2643	ccmH	ccmG	TRUE	0.999	-3.000	0.578	NA	Y	NA
621330	621331	YPTB2643	YPTB2644	ccmG	ccmF	TRUE	1.000	-3.000	0.804	0.002	Y	NA
621331	621332	YPTB2644	YPTB2645	ccmF	ccmE	TRUE	0.999	-3.000	0.211	0.002	Y	NA
621332	621333	YPTB2645	YPTB2646	ccmE	ccmD	TRUE	0.991	-3.000	0.344	1.000	N	NA
621333	621334	YPTB2646	YPTB2647	ccmD	ccmC	TRUE	0.995	-3.000	0.501	1.000	N	NA
621334	621335	YPTB2647	YPTB2648	ccmC	ccmB	TRUE	0.987	63.000	0.501	0.001	Y	NA
621335	621336	YPTB2648	YPTB2649	ccmB	ccmA	TRUE	0.999	-30.000	0.503	0.002	Y	NA
621336	621337	YPTB2649	YPTB2650	ccmA		FALSE	0.021	445.000	0.000	NA		NA
621337	621338	YPTB2650	YPTB_RNA_67		tRNA-Arg6	FALSE	0.093	256.000	0.000	NA		NA
621339	621340	YPTB2651	YPTB2652	lemA		TRUE	0.946	-55.000	0.074	NA		NA
621340	621341	YPTB2652	YPTB2653			FALSE	0.030	376.000	0.000	NA		NA
621342	621343	YPTB2654	YPTB2655			TRUE	0.927	7.000	0.000	NA		NA
621343	621344	YPTB2655	YPTB2656			TRUE	0.969	65.000	1.000	NA		NA
621344	621345	YPTB2656	YPTB2657			TRUE	0.992	20.000	0.833	NA		NA
621345	621346	YPTB2657	YPTB2658			TRUE	0.989	0.000	0.200	NA		NA
621346	621347	YPTB2658	YPTB2659			TRUE	0.689	80.000	0.200	NA		NA
621347	621348	YPTB2659	YPTB2660			FALSE	0.065	294.000	0.000	NA		NA
621348	621349	YPTB2660	YPTB2661			TRUE	0.982	9.000	0.235	NA		NA
621349	621350	YPTB2661	YPTB2662			TRUE	0.994	-3.000	0.294	NA		NA
621350	621351	YPTB2662	YPTB2663			TRUE	0.998	4.000	0.833	NA		NA
621351	621352	YPTB2663	YPTB2664			TRUE	0.439	253.000	0.333	NA		NA
621352	621353	YPTB2664	YPTB2665			TRUE	0.589	249.000	0.500	NA		NA
621353	621354	YPTB2665	YPTB2666			TRUE	0.989	24.000	0.800	NA		NA
621354	621355	YPTB2666	YPTB2667			TRUE	0.903	106.000	0.667	NA		NA
621355	621356	YPTB2667	YPTB2668			TRUE	0.999	-15.000	0.833	1.000	Y	NA
621356	621357	YPTB2668	YPTB2669			TRUE	0.980	89.000	1.000	1.000	Y	NA
621357	621358	YPTB2669	YPTB2670			TRUE	0.972	157.000	1.000	1.000	Y	NA
621358	621359	YPTB2670	YPTB2671		clpB5	TRUE	0.831	211.000	1.000	1.000	N	NA
621360	621361	YPTB2672	YPTB2673			TRUE	0.999	0.000	0.833	NA		NA
621361	621362	YPTB2673	YPTB2674			TRUE	0.951	99.000	1.000	NA		NA
621362	621363	YPTB2674	YPTB2675			TRUE	0.997	7.000	0.714	NA		NA
621363	621364	YPTB2675	YPTB2676			TRUE	0.972	40.000	0.714	NA		NA
621364	621365	YPTB2676	YPTB2677			TRUE	0.998	-3.000	0.600	NA		NA
621365	621366	YPTB2677	YPTB2678			TRUE	0.995	1.000	0.400	NA		NA
621366	621367	YPTB2678	YPTB2679			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
621368	621369	YPTB2680	YPTB2681		mltB	FALSE	0.001	1269.000	0.000	NA	N	NA
621370	621371	YPTB2682	YPTB2683	sfuA	sfuB	TRUE	0.992	55.000	0.824	0.054	Y	NA
621371	621372	YPTB2683	YPTB2684	sfuB	sfuC	TRUE	0.994	-3.000	0.275	0.054	N	NA
621376	621377	YPTB2688	YPTB2689	dmsA	dmsB	TRUE	0.998	12.000	0.500	0.036	Y	NA
621377	621378	YPTB2689	YPTB2690	dmsB	dmsC	TRUE	0.997	2.000	0.667	1.000		NA
621378	621379	YPTB2690	YPTB2691	dmsC		FALSE	0.015	482.000	0.000	1.000		NA
621379	621380	YPTB2691	YPTB2692			TRUE	0.997	-3.000	0.333	0.036		NA
621381	621382	YPTB2693	YPTB2694			TRUE	0.998	-3.000	0.740	NA		NA
621382	621383	YPTB2694	YPTB2695			TRUE	0.996	-18.000	0.625	NA		NA
621385	621386	YPTB2697	YPTB2698			FALSE	0.004	245.000	0.009	1.000	N	NA
621388	621389	YPTB2700	YPTB2701	glk		FALSE	0.210	181.000	0.048	NA		NA
621390	621391	YPTB2702	YPTB2703			FALSE	0.033	136.000	0.050	1.000	N	NA
621391	621392	YPTB2703	YPTB2704			FALSE	0.296	171.000	0.071	NA		NA
621395	621396	YPTB_RNA_66	YPTB_RNA_65	tRNA-Lys8	tRNA-Val6	FALSE	0.195	200.000	0.000	NA		NA
621396	621397	YPTB_RNA_65	YPTB_RNA_64	tRNA-Val6	tRNA-Val5	TRUE	0.586	45.000	0.000	NA		NA
621397	621398	YPTB_RNA_64	YPTB_RNA_63	tRNA-Val5	tRNA-Val4	TRUE	0.626	37.000	0.000	NA		NA
621399	621400	YPTB2707	YPTB_RNA_47	gltX	tRNA-Ala3	FALSE	0.131	232.000	0.000	NA		NA
621400	621401	YPTB_RNA_47	YPTB_RNA_48	tRNA-Ala3	tRNA-Ala4	FALSE	0.373	78.000	0.000	NA		NA
621401	621402	YPTB_RNA_48	YPTB2708	tRNA-Ala4		FALSE	0.211	190.000	0.000	NA		NA
621402	621403	YPTB2708	YPTB2709			FALSE	0.210	149.000	0.027	NA		NA
621404	621405	YPTB2710	YPTB2711		ligA	TRUE	0.709	20.000	0.017	NA		NA
621405	621406	YPTB2711	YPTB2712	ligA	zipA	FALSE	0.016	91.000	0.013	1.000	N	NA
621407	621408	YPTB2713	YPTB2714	cysZ	cysK	TRUE	0.696	157.000	0.122	1.000	Y	NA
621408	621409	YPTB2714	YPTB2715	cysK	ptsH	FALSE	0.000	499.000	0.019	1.000	N	NA
621409	621410	YPTB2715	YPTB2716	ptsH	ptsI	TRUE	0.916	49.000	0.033	0.006	Y	NA
621410	621411	YPTB2716	YPTB2717	ptsI	crr	TRUE	0.918	49.000	0.038	0.006	Y	NA
621412	621413	YPTB2718	YPTB2719			TRUE	0.968	26.000	0.216	1.000	Y	NA
621414	621415	YPTB2720	YPTB2721			TRUE	0.994	4.000	0.439	0.093	N	NA
621416	621417	YPTB2722	YPTB2723			TRUE	0.441	60.000	0.000	1.000		NA
621417	621418	YPTB2723	YPTB2724			TRUE	0.995	-3.000	0.357	NA		NA
621418	621419	YPTB2724	YPTB2725			FALSE	0.283	143.000	0.000	NA		NA
621419	621420	YPTB2725	YPTB2726			TRUE	0.873	34.000	0.000	1.000	Y	NA
621421	621422	YPTB2727	YPTB2728			FALSE	0.109	245.000	0.000	NA		NA
621422	621423	YPTB2728	YPTB2729			TRUE	0.989	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
621424	621425	YPTB2730	YPTB2731		cysM	FALSE	0.131	232.000	0.000	NA		NA
621425	621426	YPTB2731	YPTB2732	cysM	cysA	FALSE	0.025	171.000	0.049	1.000	N	NA
621426	621427	YPTB2732	YPTB2733	cysA	cysW	TRUE	0.994	-10.000	0.180	1.000	Y	NA
621427	621428	YPTB2733	YPTB2734	cysW	cysT	TRUE	0.999	0.000	0.583	0.001	N	NA
621428	621429	YPTB2734	YPTB2735	cysT	cysP	TRUE	0.998	0.000	0.479	0.002	N	NA
621429	621430	YPTB2735	YPTB2736	cysP	nanT	FALSE	0.006	333.000	0.000	1.000	N	NA
621430	621431	YPTB2736	YPTB2737	nanT		FALSE	0.002	605.000	0.000	1.000	N	NA
621431	621432	YPTB2737	YPTB2738			FALSE	0.266	190.000	0.154	NA	N	NA
621432	621433	YPTB2738	YPTB2739			TRUE	0.822	82.000	0.154	NA	Y	NA
621434	621435	YPTB2740	YPTB2741			FALSE	0.073	268.000	0.000	1.000		NA
621435	621436	YPTB2741	YPTB2742		nanA	FALSE	0.261	63.000	0.087	1.000	N	NA
621437	621438	YPTB2743	YPTB2744		yfeY	TRUE	0.700	178.000	0.333	NA		NA
621439	621440	YPTB2745	YPTB2746	ygiW		FALSE	0.012	569.000	0.000	NA		NA
621441	621442	YPTB2747	YPTB2748			FALSE	0.018	471.000	0.000	NA		NA
621442	621443	YPTB2748	YPTB2749			FALSE	0.271	160.000	0.000	NA		NA
621443	621444	YPTB2749	YPTB2750			TRUE	0.996	3.000	0.500	NA		NA
621444	621445	YPTB2750	YPTB2751			TRUE	0.984	-3.000	0.138	NA		NA
621448	621449	YPTB2754	YPTB2755	hemF		TRUE	0.934	0.000	0.016	NA		NA
621450	621451	YPTB2756	YPTB2757	maeB		FALSE	0.015	739.000	0.047	0.005	N	NA
621451	621452	YPTB2757	YPTB2758		napC	FALSE	0.093	157.000	0.070	1.000	N	NA
621452	621453	YPTB2758	YPTB2759	napC	napB	TRUE	0.987	28.000	0.490	NA	Y	NA
621453	621454	YPTB2759	YPTB2760	napB	napA	TRUE	0.644	83.000	0.031	NA	Y	NA
621454	621455	YPTB2760	YPTB2761	napA	napD	TRUE	0.998	-3.000	0.875	NA	N	NA
621455	621456	YPTB2761	YPTB2762	napD	napF	TRUE	0.986	-10.000	0.209	NA		NA
621459	621460	YPTB2765	YPTB2766			FALSE	0.133	231.000	0.000	NA		NA
621460	621461	YPTB2766	YPTB2767		ybcI	FALSE	0.067	289.000	0.000	NA		NA
621462	621463	YPTB2768	YPTB2769		ydeN	TRUE	0.939	57.000	0.600	1.000		NA
621463	621464	YPTB2769	YPTB2770	ydeN		FALSE	0.002	478.000	0.000	1.000	N	NA
621464	621465	YPTB2770	YPTB2771			TRUE	0.997	-7.000	0.585	0.053	N	NA
621465	621466	YPTB2771	YPTB2772			TRUE	0.979	95.000	0.688	0.053	Y	NA
621467	621468	YPTB2773	YPTB2774			FALSE	0.150	160.000	0.006	1.000		NA
621468	621469	YPTB2774	YPTB2775		dapE	TRUE	0.985	2.000	0.292	1.000	N	NA
621469	621470	YPTB2775	YPTB2776	dapE		TRUE	0.990	-3.000	0.163	0.022	N	NA
621470	621471	YPTB2776	YPTB2777			TRUE	0.617	68.000	0.130	NA		NA
621472	621473	YPTB2778	YPTB2779		yeaL	TRUE	0.971	2.000	0.100	NA		NA
621473	621474	YPTB2779	YPTB2780	yeaL		FALSE	0.239	94.000	0.018	NA		NA
621474	621475	YPTB2780	YPTB2781		purC	FALSE	0.081	219.000	0.004	1.000		NA
621475	621476	YPTB2781	YPTB2782	purC	dapX	FALSE	0.020	71.000	0.008	NA	N	NA
621476	621477	YPTB2782	YPTB2783	dapX	dapA	TRUE	0.936	18.000	0.032	NA	Y	NA
621478	621479	YPTB2784	YPTB2785	gcvR	bcp	TRUE	0.910	3.000	0.102	1.000	N	NA
621480	621481	YPTB2786	YPTB2787			TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
621484	621485	YPTB2790	YPTB2791		yfgD	TRUE	0.696	107.000	0.259	1.000		NA
621486	621487	YPTB2792	YPTB2793			FALSE	0.008	247.000	0.048	1.000	N	NA
621487	621488	YPTB2793	YPTB2794		upp	TRUE	0.664	157.000	0.101	1.000	Y	NA
621489	621490	YPTB2795	YPTB2796	purI	purN	TRUE	0.938	115.000	0.230	0.002	Y	NA
621490	621491	YPTB2796	YPTB2797	purN	speG	FALSE	0.005	229.000	0.017	1.000	N	NA
621492	621493	YPTB2798	YPTB2799	fliB	pstb	FALSE	0.130	233.000	0.000	NA		NA
621493	621494	YPTB2799	YPTB2800	pstb	pstA	TRUE	0.995	28.000	0.511	0.002	Y	NA
621494	621495	YPTB2800	YPTB2801	pstA	pstC	TRUE	0.998	0.000	0.489	0.093		NA
621496	621497	YPTB2802	YPTB2803	ppk	ppx	TRUE	0.996	11.000	0.486	1.000	Y	NA
621497	621498	YPTB2803	YPTB2804	ppx	yfgG	FALSE	0.240	165.000	0.047	NA		NA
621498	621499	YPTB2804	YPTB2805	yfgG	mgtE	TRUE	0.430	52.000	0.024	NA		NA
621499	621500	YPTB2805	YPTB2806	mgtE		FALSE	0.052	137.000	0.000	1.000	N	NA
621501	621502	YPTB2807	YPTB2808			TRUE	0.880	62.000	0.072	0.053	Y	NA
621502	621503	YPTB2808	YPTB2809			TRUE	0.912	47.000	0.000	0.053	Y	NA
621503	621504	YPTB2809	YPTB2810		goaG	TRUE	0.799	53.000	0.000	1.000	Y	NA
621505	621506	YPTB2811	YPTB2812			FALSE	0.096	383.000	0.000	1.000	Y	NA
621506	621507	YPTB2812	YPTB2813		yegM	FALSE	0.003	402.000	0.000	1.000	N	NA
621507	621508	YPTB2813	YPTB2814	yegM	yegN	TRUE	0.998	0.000	1.000	1.000	N	NA
621508	621509	YPTB2814	YPTB2815	yegN	yegO	TRUE	0.993	-3.000	0.094	NA	Y	NA
621509	621510	YPTB2815	YPTB2816	yegO	yegB	TRUE	0.922	34.000	0.438	NA	N	NA
621510	621511	YPTB2816	YPTB2817	yegB	baeS	TRUE	0.692	31.000	0.139	1.000	N	NA
621511	621512	YPTB2817	YPTB2818	baeS	baeR	TRUE	0.997	10.000	0.591	1.000	Y	NA
621512	621513	YPTB2818	YPTB2819	baeR		FALSE	0.307	137.000	0.062	NA		NA
621513	621514	YPTB2819	YPTB2820			FALSE	0.036	298.000	0.008	NA		NA
621514	621515	YPTB2820	YPTB2821			FALSE	0.001	637.000	0.000	1.000	N	NA
621519	621520	YPTB2825	YPTB2826			TRUE	0.478	59.000	0.000	NA		NA
621520	621521	YPTB2826	YPTB2827			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
621521	621522	YPTB2827	YPTB2828			TRUE	0.444	64.000	0.000	NA		NA
621522	621523	YPTB2828	YPTB2829			TRUE	0.618	38.000	0.000	NA		NA
621523	621524	YPTB2829	YPTB2830			TRUE	0.444	64.000	0.000	NA		NA
621524	621525	YPTB2830	YPTB2831			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
621526	621527	YPTB2832	YPTB2833	guaA	guaB	TRUE	0.786	180.000	0.190	0.001		NA
621529	621530	YPTB2835	YPTB2836			TRUE	0.555	49.000	0.055	NA		NA
621530	621531	YPTB2836	YPTB2837		engA	FALSE	0.065	347.000	0.003	0.070		NA
621531	621532	YPTB2837	YPTB2838	engA	yfgL	TRUE	0.586	148.000	0.203	1.000		NA
621532	621533	YPTB2838	YPTB2839	yfgL	yfgM	TRUE	0.989	12.000	0.492	1.000		NA
621533	621534	YPTB2839	YPTB2840	yfgM	hisS	TRUE	0.970	14.000	0.259	1.000		NA
621534	621535	YPTB2840	YPTB2841	hisS	aarC	FALSE	0.291	209.000	0.207	1.000	N	NA
621535	621536	YPTB2841	YPTB2842	aarC	yfgA	TRUE	0.674	104.000	0.233	1.000		NA
621536	621537	YPTB2842	YPTB2843	yfgA		TRUE	0.979	-10.000	0.153	1.000		NA
621537	621538	YPTB2843	YPTB2844			FALSE	0.288	154.000	0.067	1.000		NA
621538	621539	YPTB2844	YPTB2845		ndk	FALSE	0.200	262.000	0.156	1.000		NA
621539	621540	YPTB2845	YPTB2846	ndk		FALSE	0.046	328.000	0.000	NA		NA
621541	621542	YPTB2847	YPTB2848		yapA	FALSE	0.071	284.000	0.000	NA		NA
621542	621543	YPTB2848	YPTB2849	yapA	yapB2	FALSE	0.114	558.000	0.000	0.008	Y	NA
621543	621544	YPTB2849	YPTB2850	yapB2	yapB1	FALSE	0.099	607.000	0.000	0.007	Y	NA
621545	621546	YPTB2851	YPTB2852		pepB	TRUE	0.754	79.000	0.253	NA		NA
621546	621547	YPTB2852	YPTB2853	pepB		TRUE	0.539	140.000	0.171	1.000		NA
621547	621548	YPTB2853	YPTB2854		fdx	TRUE	0.975	30.000	0.625	1.000		NA
621548	621549	YPTB2854	YPTB2855	fdx	hscA	TRUE	0.996	3.000	0.794	1.000	N	NA
621549	621550	YPTB2855	YPTB2856	hscA	hscB	TRUE	0.844	243.000	0.634	1.000	Y	NA
621550	621551	YPTB2856	YPTB2857	hscB		TRUE	0.844	111.000	0.500	1.000		NA
621551	621552	YPTB2857	YPTB2858		nifU	TRUE	0.667	270.000	0.359	0.002		NA
621552	621553	YPTB2858	YPTB2859	nifU	iscS	TRUE	0.929	31.000	0.448	1.000	N	NA
621553	621554	YPTB2859	YPTB2860	iscS		TRUE	0.857	54.000	0.424	1.000	N	NA
621554	621555	YPTB2860	YPTB2861			FALSE	0.250	156.000	0.126	1.000	N	NA
621557	621558	YPTB2863	YPTB2864			TRUE	0.981	-9.000	0.150	NA		NA
621560	621561	YPTB2866	YPTB2867	hcaT	ail	FALSE	0.019	442.000	0.000	1.000		NA
621561	621562	YPTB2867	YPTB2868	ail		FALSE	0.313	109.000	0.000	NA		NA
621562	621563	YPTB2868	YPTB2869		glyA	FALSE	0.310	113.000	0.000	NA		NA
621564	621565	YPTB2870	YPTB2871	hmp	yhfZ	FALSE	0.019	464.000	0.000	NA		NA
621566	621567	YPTB2872	YPTB2873	glnB	nadE	TRUE	0.873	15.000	0.151	1.000	N	NA
621567	621568	YPTB2873	YPTB2874	nadE		FALSE	0.306	160.000	0.065	0.089	N	NA
621568	621569	YPTB2874	YPTB2875			TRUE	0.970	-37.000	0.130	NA		NA
621569	621570	YPTB2875	YPTB2876			TRUE	0.974	4.000	0.132	NA		NA
621571	621572	YPTB_RNA_118	YPTB2877			FALSE	0.012	580.000	0.000	NA		NA
621572	621573	YPTB2877	YPTB2878			FALSE	0.049	323.000	0.000	NA		NA
621576	621577	YPTB2881	YPTB2882		yfhB	FALSE	0.108	110.000	0.062	NA	N	NA
621577	621578	YPTB2882	YPTB2883	yfhB		FALSE	0.360	275.000	0.316	NA		NA
621579	621580	YPTB2884	YPTB2885		fdx	FALSE	0.247	162.000	0.056	1.000		NA
621581	621582	YPTB2886	YPTB2887	acpS	pdxJ	TRUE	0.989	0.000	0.326	1.000	N	NA
621582	621583	YPTB2887	YPTB2888	pdxJ	recO	FALSE	0.332	159.000	0.166	1.000	N	NA
621583	621584	YPTB2888	YPTB2889	recO	era	TRUE	0.947	10.000	0.109	1.000		NA
621584	621585	YPTB2889	YPTB2890	era	rnc	TRUE	0.992	-3.000	0.127	0.037		NA
621585	621586	YPTB2890	YPTB2891	rnc	lepB	FALSE	0.066	352.000	0.117	1.000		NA
621586	621587	YPTB2891	YPTB2892	lepB	lepA	TRUE	0.972	10.000	0.187	1.000		NA
621589	621590	YPTB2894	YPTB2895	rseC	rseB	TRUE	0.999	-3.000	0.609	NA	Y	NA
621590	621591	YPTB2895	YPTB2896	rseB	rseA	TRUE	0.999	0.000	0.856	NA	Y	NA
621591	621592	YPTB2896	YPTB2897	rseA	rpoE	TRUE	0.974	26.000	0.705	NA	N	NA
621596	621597	YPTB2901	YPTB2902	yplB	yplA	TRUE	0.835	78.000	0.375	NA		NA
621597	621598	YPTB2902	YPTB2903	yplA		FALSE	0.216	179.000	0.000	1.000		NA
621600	621601	YPTB2905	YPTB2906	pcp		TRUE	0.985	10.000	0.300	NA		NA
621601	621602	YPTB2906	YPTB2907			TRUE	0.999	-3.000	0.939	NA		NA
621602	621603	YPTB2907	YPTB2908			TRUE	0.639	85.000	0.173	NA		NA
621603	621604	YPTB2908	YPTB2909			TRUE	0.983	-42.000	0.211	NA		NA
621604	621605	YPTB2909	YPTB2910			TRUE	0.998	-6.000	0.379	NA	Y	NA
621605	621606	YPTB2910	YPTB2911			FALSE	0.010	619.000	0.050	NA		NA
621606	621607	YPTB2911	YPTB2912			FALSE	0.161	174.000	0.013	NA		NA
621607	621608	YPTB2912	YPTB2913		phrB	FALSE	0.366	-9.000	0.008	1.000	N	NA
621608	621609	YPTB2913	YPTB2914	phrB		FALSE	0.207	130.000	0.019	NA		NA
621609	621610	YPTB2914	YPTB2915		ybfA	FALSE	0.101	414.000	0.231	NA		NA
621611	621612	YPTB2916	YPTB2917	kdpA	kdpB	TRUE	0.941	94.000	0.201	0.001	Y	NA
621612	621613	YPTB2917	YPTB2918	kdpB	kdpC	TRUE	0.988	164.000	0.877	0.001	Y	NA
621613	621614	YPTB2918	YPTB2919	kdpC	kdpD	TRUE	0.948	10.000	0.100	0.092	N	NA
621614	621615	YPTB2919	YPTB2920	kdpD	kdpE	FALSE	0.229	541.000	0.385	1.000	Y	NA
621615	621616	YPTB2920	YPTB2921	kdpE		TRUE	0.520	95.000	0.129	1.000		NA
621617	621618	YPTB2922	YPTB2923		pgm	FALSE	0.031	374.000	0.000	NA		NA
621618	621619	YPTB2923	YPTB2924	pgm	seqA	TRUE	0.719	31.000	0.151	1.000	N	NA
621620	621621	YPTB2925	YPTB2926			FALSE	0.311	112.000	0.000	NA		NA
621622	621623	YPTB2927	YPTB2928		celD	TRUE	0.826	52.000	0.222	1.000		NA
621623	621624	YPTB2928	YPTB2929	celD	celC	TRUE	0.945	49.000	0.727	1.000	N	NA
621624	621625	YPTB2929	YPTB2930	celC	celB	FALSE	0.226	183.000	0.000	NA		NA
621625	621626	YPTB2930	YPTB2931	celB	celA	TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
621627	621628	YPTB2932	YPTB2933			TRUE	0.991	16.000	0.233	0.092	Y	NA
621631	621632	YPTB2936	YPTB2937			TRUE	0.410	149.000	0.095	0.070	N	NA
621632	621633	YPTB2937	YPTB2938		ureD	FALSE	0.007	379.000	0.065	1.000	N	NA
621633	621634	YPTB2938	YPTB2939	ureD	ureG	TRUE	0.997	-3.000	0.095	0.002	Y	NA
621634	621635	YPTB2939	YPTB2940	ureG	ureF	TRUE	0.843	127.000	0.064	0.002	Y	NA
621635	621636	YPTB2940	YPTB2941	ureF	ureE	TRUE	0.996	22.000	0.460	0.002	Y	NA
621636	621637	YPTB2941	YPTB2942	ureE	ureC	FALSE	0.165	296.000	0.067	0.001	N	NA
621637	621638	YPTB2942	YPTB2943	ureC	ureB	TRUE	0.957	90.000	0.267	0.001	Y	NA
621638	621639	YPTB2943	YPTB2944	ureB	ureA	TRUE	0.979	53.000	0.267	0.001	Y	NA
621639	621640	YPTB2944	YPTB2945	ureA		FALSE	0.025	1199.000	0.000	1.000	Y	NA
621640	621641	YPTB2945	YPTB2946			TRUE	0.998	-7.000	0.500	0.017		NA
621641	621642	YPTB2946	YPTB2947			TRUE	0.999	0.000	1.000	1.000		NA
621642	621643	YPTB2947	YPTB2948			TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.052	Y	NA
621643	621644	YPTB2948	YPTB2949			TRUE	1.000	-15.000	1.000	0.052	Y	NA
621644	621645	YPTB2949	YPTB2950		cspB	FALSE	0.001	796.000	0.000	1.000	N	NA
621646	621647	YPTB2951	YPTB2952		yicN	TRUE	0.522	165.000	0.167	NA		NA
621648	621649	YPTB2953	YPTB2954		asr	FALSE	0.017	479.000	0.000	NA		NA
621650	621651	YPTB2955	YPTB2956	nrdH	nrdI	TRUE	0.976	14.000	0.440	NA	N	NA
621651	621652	YPTB2956	YPTB2957	nrdI	nrdE	TRUE	0.994	-18.000	0.216	NA	Y	NA
621652	621653	YPTB2957	YPTB2958	nrdE	nrdF	TRUE	0.932	107.000	0.190	0.001	Y	NA
621653	621654	YPTB2958	YPTB2959	nrdF	proV	FALSE	0.001	676.000	0.000	1.000	N	NA
621654	621655	YPTB2959	YPTB2960	proV	proW	TRUE	0.999	-7.000	0.630	0.092	Y	NA
621655	621656	YPTB2960	YPTB2961	proW	proX	TRUE	0.992	48.000	0.695	0.052	Y	NA
621659	621660	YPTB_RNA_62	YPTB2964	tRNA-Asp3	dnaQ	FALSE	0.310	113.000	0.000	NA		NA
621663	621664	YPTB2967	YPTB2968	gloB	mltD	TRUE	0.899	33.000	0.233	1.000		NA
621665	621666	YPTB2969	YPTB2970			FALSE	0.029	382.000	0.000	NA		NA
621666	621667	YPTB2970	YPTB2971			TRUE	0.645	35.000	0.000	NA		NA
621667	621668	YPTB2971	YPTB_RNA_61		tRNA-Asp2	FALSE	0.020	450.000	0.000	NA		NA
621668	621669	YPTB_RNA_61	YPTB_RNA_108	tRNA-Asp2		FALSE	0.304	124.000	0.000	NA		NA
621669	621670	YPTB_RNA_108	YPTB_RNA_109			FALSE	0.314	108.000	0.000	NA		NA
621670	621671	YPTB_RNA_109	YPTB_RNA_60		tRNA-Glu4	FALSE	0.096	253.000	0.000	NA		NA
621671	621672	YPTB_RNA_60	YPTB_RNA_110	tRNA-Glu4		FALSE	0.290	134.000	0.000	NA		NA
621672	621673	YPTB_RNA_110	YPTB2972			FALSE	0.021	442.000	0.000	NA		NA
621674	621675	YPTB2973	YPTB2974			TRUE	0.999	-7.000	0.584	1.000	Y	NA
621675	621676	YPTB2974	YPTB2975			TRUE	0.950	64.000	0.411	NA	Y	NA
621676	621677	YPTB2975	YPTB2976		rcsF	TRUE	0.850	118.000	0.500	NA		NA
621677	621678	YPTB2976	YPTB2977	rcsF		TRUE	0.992	-3.000	0.247	NA		NA
621678	621679	YPTB2977	YPTB2978		proS	FALSE	0.294	104.000	0.048	NA		NA
621680	621681	YPTB2979	YPTB2980	cutF		FALSE	0.275	85.000	0.027	NA		NA
621681	621682	YPTB2980	YPTB2981			TRUE	0.905	-21.000	0.034	1.000		NA
621683	621684	YPTB2982	YPTB2983			TRUE	0.982	-13.000	0.179	NA		NA
621685	621686	YPTB2984	YPTB2985			FALSE	0.004	237.000	0.005	1.000	N	NA
621686	621687	YPTB2985	YPTB2986			TRUE	0.376	2.000	0.015	NA	N	NA
621687	621688	YPTB2986	YPTB2987		accA	FALSE	0.009	184.000	0.008	NA	N	NA
621688	621689	YPTB2987	YPTB2988	accA	dnaE	TRUE	0.853	13.000	0.122	1.000	N	NA
621689	621690	YPTB2988	YPTB2989	dnaE	rnhB	TRUE	0.690	130.000	0.104	1.000	Y	NA
621690	621691	YPTB2989	YPTB2990	rnhB	lpxB	TRUE	0.977	-3.000	0.186	1.000	N	NA
621691	621692	YPTB2990	YPTB2991	lpxB	lpxA	TRUE	0.996	4.000	0.289	1.000	Y	NA
621692	621693	YPTB2991	YPTB2992	lpxA	fabZ	TRUE	0.997	4.000	0.850	1.000	N	NA
621693	621694	YPTB2992	YPTB2993	fabZ	lpxD	TRUE	0.857	158.000	0.796	1.000	N	NA
621694	621695	YPTB2993	YPTB2994	lpxD	ompH	TRUE	0.999	4.000	0.814	1.000	Y	NA
621695	621696	YPTB2994	YPTB2995	ompH		TRUE	0.898	107.000	0.354	1.000	Y	NA
621696	621697	YPTB2995	YPTB2996			TRUE	0.944	37.000	0.204	1.000	Y	NA
621697	621698	YPTB2996	YPTB2997		cdsA	TRUE	0.455	29.000	0.080	1.000	N	NA
621698	621699	YPTB2997	YPTB2998	cdsA	uppS	TRUE	0.996	10.000	0.400	1.000	Y	NA
621699	621700	YPTB2998	YPTB2999	uppS	dxr	FALSE	0.334	224.000	0.025	1.000	Y	NA
621700	621701	YPTB2999	YPTB3000	dxr	frr	FALSE	0.006	214.000	0.032	1.000	N	NA
621701	621702	YPTB3000	YPTB3001	frr	pyrH	TRUE	0.808	136.000	0.626	1.000	N	NA
621702	621703	YPTB3001	YPTB3002	pyrH	tsf	TRUE	0.532	209.000	0.416	1.000	N	NA
621703	621704	YPTB3002	YPTB3003	tsf	rpsB	TRUE	0.959	129.000	0.748	1.000	Y	NA
621705	621706	YPTB3004	YPTB3005	ampM	glnD	TRUE	0.691	60.000	0.243	1.000	N	NA
621706	621707	YPTB3005	YPTB3006	glnD	dapD	FALSE	0.147	175.000	0.097	1.000	N	NA
621707	621708	YPTB3006	YPTB3007	dapD		FALSE	0.249	124.000	0.035	NA		NA
621709	621710	YPTB3008	YPTB3009			TRUE	0.830	28.000	0.209	1.000	N	NA
621710	621711	YPTB3009	YPTB3010			TRUE	0.997	0.000	0.518	NA		NA
621711	621712	YPTB3010	YPTB_RNA_90		csrB	FALSE	0.281	148.000	0.000	NA		NA
621712	621713	YPTB_RNA_90	YPTB3011	csrB	syd	FALSE	0.085	263.000	0.000	NA		NA
621714	621715	YPTB3012	YPTB3013			FALSE	0.343	153.000	0.079	NA		NA
621715	621716	YPTB3013	YPTB3014		xni	FALSE	0.244	260.000	0.178	NA		NA
621717	621718	YPTB3015	YPTB3016			TRUE	0.981	-7.000	0.144	NA		NA
621718	621719	YPTB3016	YPTB3017		gcvA	FALSE	0.332	166.000	0.081	NA		NA
621720	621721	YPTB3018	YPTB3019			TRUE	0.745	135.000	0.122	0.002		NA
621722	621723	YPTB3020	YPTB3021			FALSE	0.012	143.000	0.021	1.000	N	NA
621724	621725	YPTB_RNA_49	YPTB_RNA_50	tRNA-Met2	tRNA-Met3	FALSE	0.258	168.000	0.000	NA		NA
621725	621726	YPTB_RNA_50	YPTB_RNA_51	tRNA-Met3	tRNA-Met4	TRUE	0.463	61.000	0.000	NA		NA
621729	621730	YPTB3024	YPTB3025	recD	recB	TRUE	1.000	-3.000	0.688	0.001	Y	NA
621730	621731	YPTB3025	YPTB3026	recB	ptrA	TRUE	0.925	-3.000	0.092	1.000	N	NA
621731	621732	YPTB3026	YPTB3027	ptrA	recC	FALSE	0.216	82.000	0.092	1.000	N	NA
621732	621733	YPTB3027	YPTB3028	recC		FALSE	0.145	135.000	0.076	NA	N	NA
621733	621734	YPTB3028	YPTB3029			TRUE	0.966	33.000	0.538	NA		NA
621734	621735	YPTB3029	YPTB3030			TRUE	0.995	-3.000	0.373	NA		NA
621735	621736	YPTB3030	YPTB3031			TRUE	0.986	-9.000	0.000	NA	Y	NA
621736	621737	YPTB3031	YPTB3032			FALSE	0.305	123.000	0.000	NA		NA
621737	621738	YPTB3032	YPTB3033		thyA	TRUE	0.684	31.000	0.000	NA		NA
621738	621739	YPTB3033	YPTB3034	thyA	lgt	TRUE	0.944	7.000	0.164	1.000	N	NA
621739	621740	YPTB3034	YPTB3035	lgt	ptsP	FALSE	0.003	251.000	0.003	1.000	N	NA
621740	621741	YPTB3035	YPTB3036	ptsP		FALSE	0.182	13.000	0.012	1.000	N	NA
621742	621743	YPTB3037	YPTB3038	mutH	tas	FALSE	0.001	371.000	0.015	1.000	N	NA
621746	621747	YPTB3041	YPTB3042	ygeD	aas	TRUE	0.982	-3.000	0.124	NA		NA
621747	621748	YPTB3042	YPTB3043	aas	bisC	FALSE	0.003	449.000	0.000	1.000	N	NA
621752	621753	YPTB3047	YPTB3048			FALSE	0.004	385.000	0.000	1.000	N	NA
621754	621755	YPTB3049	YPTB3050			TRUE	0.546	113.000	0.157	1.000		NA
621756	621757	YPTB3051	YPTB3052	cheD		FALSE	0.190	203.000	0.000	NA		NA
621757	621758	YPTB3052	YPTB3053			TRUE	0.995	-15.000	0.500	NA		NA
621760	621761	YPTB3055	YPTB3056			TRUE	0.736	26.000	0.000	NA		NA
621761	621762	YPTB3056	YPTB3057		gspL	TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
621762	621763	YPTB3057	YPTB3058	gspL	gspK	TRUE	0.999	-16.000	0.537	0.069	Y	NA
621763	621764	YPTB3058	YPTB3059	gspK	gspJ	TRUE	0.997	9.000	0.461	1.000	Y	NA
621764	621765	YPTB3059	YPTB3060	gspJ	gspI	TRUE	0.999	-7.000	0.569	0.003		NA
621765	621766	YPTB3060	YPTB3061	gspI		TRUE	0.922	38.000	0.132	0.003		NA
621766	621767	YPTB3061	YPTB3062		gspG	TRUE	0.995	5.000	0.087	0.003	Y	NA
621767	621768	YPTB3062	YPTB3063	gspG	gspF	TRUE	0.997	20.000	0.599	0.003	Y	NA
621768	621769	YPTB3063	YPTB3064	gspF	gspE	TRUE	0.999	-13.000	0.653	0.003	Y	NA
621769	621770	YPTB3064	YPTB3065	gspE	gspD	TRUE	0.995	-3.000	0.012	0.003	Y	NA
621770	621771	YPTB3065	YPTB3066	gspD		TRUE	0.921	81.000	0.667	NA		NA
621771	621772	YPTB3066	YPTB3067			TRUE	0.970	38.000	0.667	NA		NA
621772	621773	YPTB3067	YPTB3068			FALSE	0.009	743.000	0.000	NA		NA
621774	621775	YPTB3069	YPTB3070			FALSE	0.027	387.000	0.000	NA		NA
621775	621776	YPTB3070	YPTB3071			TRUE	0.780	22.000	0.000	NA		NA
621776	621777	YPTB3071	YPTB3072			TRUE	0.716	115.000	0.286	1.000		NA
621777	621778	YPTB3072	YPTB3073			TRUE	0.870	70.000	0.444	1.000		NA
621780	621781	YPTB3075	YPTB3076		agaZ	TRUE	0.963	50.000	0.400	1.000	Y	NA
621781	621782	YPTB3076	YPTB3077	agaZ		TRUE	0.984	-3.000	0.240	1.000	N	NA
621782	621783	YPTB3077	YPTB3078		manX	TRUE	0.841	18.000	0.150	1.000	N	NA
621783	621784	YPTB3078	YPTB3079	manX		TRUE	0.996	47.000	0.909	0.007	Y	NA
621784	621785	YPTB3079	YPTB3080			TRUE	1.000	-10.000	0.917	0.007	Y	NA
621785	621786	YPTB3080	YPTB3081			TRUE	0.989	86.000	0.833	0.007	Y	NA
621786	621787	YPTB3081	YPTB3082			TRUE	0.990	3.000	0.104	1.000	Y	NA
621787	621788	YPTB3082	YPTB3083		kduD2	FALSE	0.033	196.000	0.000	1.000	N	NA
621788	621789	YPTB3083	YPTB3084	kduD2		TRUE	0.982	16.000	0.462	1.000		NA
621789	621790	YPTB3084	YPTB3085			FALSE	0.063	431.000	0.000	0.019		NA
621790	621791	YPTB3085	YPTB3086			TRUE	0.984	21.000	0.615	1.000		NA
621791	621792	YPTB3086	YPTB3087			TRUE	0.911	123.000	0.727	NA		NA
621792	621793	YPTB3087	YPTB3088		agaY	TRUE	0.708	111.000	0.261	NA		NA
621793	621794	YPTB3088	YPTB3089	agaY		TRUE	0.895	24.000	0.148	NA		NA
621795	621796	YPTB3090	YPTB3091			TRUE	0.947	-10.000	0.000	NA		NA
621797	621798	YPTB3092	YPTB3093			TRUE	0.877	149.000	0.341	1.000	Y	NA
621801	621802	YPTB3096	YPTB3097		bgaB	FALSE	0.311	112.000	0.000	NA		NA
621802	621803	YPTB3097	YPTB3098	bgaB		TRUE	0.966	51.000	0.190	0.004	Y	NA
621803	621804	YPTB3098	YPTB3099			TRUE	0.996	5.000	0.308	1.000	Y	NA
621804	621805	YPTB3099	YPTB3100			TRUE	0.999	12.000	0.885	0.052	Y	NA
621805	621806	YPTB3100	YPTB3101			TRUE	0.960	160.000	0.815	1.000	Y	NA
621807	621808	YPTB3102	YPTB3103			FALSE	0.091	539.000	0.000	0.087	Y	NA
621808	621809	YPTB3103	YPTB3104			TRUE	0.965	50.000	0.200	0.011	Y	NA
621809	621810	YPTB3104	YPTB3105			TRUE	0.377	417.000	0.217	0.011	Y	NA
621810	621811	YPTB3105	YPTB3106			FALSE	0.008	779.000	0.000	NA		NA
621811	621812	YPTB3106	YPTB3107			FALSE	0.030	376.000	0.000	NA		NA
621812	621813	YPTB3107	YPTB3108			FALSE	0.021	443.000	0.000	NA		NA
621813	621814	YPTB3108	YPTB3109			TRUE	0.964	0.000	0.065	NA		NA
621815	621816	YPTB3110	YPTB3111			FALSE	0.164	217.000	0.000	NA		NA
621816	621817	YPTB3111	YPTB3112			FALSE	0.011	605.000	0.000	NA		NA
621817	621818	YPTB3112	YPTB3113			TRUE	0.975	21.000	0.429	NA		NA
621818	621819	YPTB3113	YPTB3114			FALSE	0.092	257.000	0.000	NA		NA
621819	621820	YPTB3114	YPTB3115			TRUE	0.576	47.000	0.000	NA		NA
621820	621821	YPTB3115	YPTB3116			FALSE	0.016	513.000	0.000	NA		NA
621821	621822	YPTB3116	YPTB3117			FALSE	0.014	505.000	0.000	1.000		NA
621823	621824	YPTB3118	YPTB3119			TRUE	0.878	13.000	0.000	NA		NA
621824	621825	YPTB3119	YPTB3120			FALSE	0.229	182.000	0.000	NA		NA
621828	621829	YPTB3123	YPTB3124			TRUE	0.999	0.000	0.857	NA		NA
621829	621830	YPTB3124	YPTB3125			FALSE	0.283	143.000	0.000	NA		NA
621830	621831	YPTB3125	YPTB3126			TRUE	0.748	63.000	0.189	NA		NA
621832	621833	YPTB3127	YPTB3128			TRUE	0.936	5.000	0.000	NA		NA
621834	621835	YPTB3129	YPTB3130			TRUE	0.831	67.000	0.333	1.000		NA
621836	621837	YPTB3131	YPTB3132			FALSE	0.183	206.000	0.000	NA		NA
621837	621838	YPTB3132	YPTB3133			FALSE	0.013	559.000	0.000	NA		NA
621838	621839	YPTB3133	YPTB3134			FALSE	0.135	230.000	0.000	NA		NA
621839	621840	YPTB3134	YPTB3135			FALSE	0.056	307.000	0.000	NA		NA
621840	621841	YPTB3135	YPTB3136			TRUE	0.912	10.000	0.000	NA		NA
621841	621842	YPTB3136	YPTB3137			FALSE	0.039	347.000	0.000	NA		NA
621843	621844	YPTB3138	YPTB3139			TRUE	0.991	-3.000	0.212	NA		NA
621844	621845	YPTB3139	YPTB3140			TRUE	0.998	-3.000	0.636	NA		NA
621846	621847	YPTB3141	YPTB3142			TRUE	0.927	35.000	0.333	1.000		NA
621847	621848	YPTB3142	YPTB3143			TRUE	0.985	3.000	0.207	1.000		NA
621848	621849	YPTB3143	YPTB3144			TRUE	0.947	109.000	0.568	0.003		NA
621849	621850	YPTB3144	YPTB3145			TRUE	0.998	-3.000	0.659	NA		NA
621850	621851	YPTB3145	YPTB3146			TRUE	0.999	-3.000	0.848	NA		NA
621851	621852	YPTB3146	YPTB3147			TRUE	0.990	24.000	0.848	NA		NA
621852	621853	YPTB3147	YPTB3148			TRUE	0.998	3.000	0.939	NA		NA
621853	621854	YPTB3148	YPTB3149			TRUE	0.943	10.000	0.094	NA		NA
621854	621855	YPTB3149	YPTB3150			TRUE	0.995	-3.000	0.333	NA		NA
621855	621856	YPTB3150	YPTB3151			TRUE	0.990	0.000	0.222	NA		NA
621856	621857	YPTB3151	YPTB3152			FALSE	0.331	115.000	0.062	NA		NA
621857	621858	YPTB3152	YPTB3153			FALSE	0.322	226.000	0.156	NA		NA
621858	621859	YPTB3153	YPTB3154			TRUE	0.998	-3.000	0.645	NA		NA
621859	621860	YPTB3154	YPTB3155			TRUE	0.998	-3.000	0.738	NA		NA
621860	621861	YPTB3155	YPTB3156			TRUE	0.998	-7.000	0.738	NA		NA
621861	621862	YPTB3156	YPTB3157			TRUE	0.918	10.000	0.061	NA		NA
621862	621863	YPTB3157	YPTB3158			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
621863	621864	YPTB3158	YPTB3159			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
621864	621865	YPTB3159	YPTB3160			TRUE	0.996	-7.000	0.529	NA		NA
621865	621866	YPTB3160	YPTB3161			TRUE	0.964	-3.000	0.059	NA		NA
621867	621868	YPTB3162	YPTB_RNA_59	int	tRNA-Gly6	FALSE	0.263	166.000	0.000	NA		NA
621868	621869	YPTB_RNA_59	YPTB3163	tRNA-Gly6	lysS	FALSE	0.205	194.000	0.000	NA		NA
621869	621870	YPTB3163	YPTB3164	lysS		TRUE	0.994	10.000	0.162	0.039	Y	NA
621870	621871	YPTB3164	YPTB3165		recJ	FALSE	0.009	179.000	0.028	1.000	N	NA
621871	621872	YPTB3165	YPTB3166	recJ	dsbC	TRUE	0.828	7.000	0.082	1.000	N	NA
621872	621873	YPTB3166	YPTB3167	dsbC	xerD	TRUE	0.431	31.000	0.079	1.000	N	NA
621875	621876	YPTB3169	YPTB3170	creD	creC	TRUE	0.643	100.000	0.311	NA	N	NA
621876	621877	YPTB3170	YPTB3171	creC	creB	TRUE	0.998	11.000	0.776	1.000	Y	NA
621877	621878	YPTB3171	YPTB3172	creB		TRUE	0.956	0.000	0.051	NA		NA
621878	621879	YPTB3172	YPTB3173			TRUE	0.943	-19.000	0.061	NA		NA
621881	621882	YPTB3175	YPTB3176			FALSE	0.090	258.000	0.000	NA		NA
621882	621883	YPTB3176	YPTB3177			FALSE	0.193	201.000	0.000	NA		NA
621883	621884	YPTB3177	YPTB3178			FALSE	0.317	104.000	0.000	NA		NA
621884	621885	YPTB3178	YPTB3179			FALSE	0.007	1048.000	0.000	NA		NA
621885	621886	YPTB3179	YPTB3180		gcvP	FALSE	0.030	378.000	0.000	NA		NA
621886	621887	YPTB3180	YPTB3181	gcvP	gcsH	TRUE	0.721	212.000	0.249	1.000	Y	NA
621887	621888	YPTB3181	YPTB3182	gcsH	gcvT	TRUE	0.971	69.000	0.317	0.001	Y	NA
621888	621889	YPTB3182	YPTB3183	gcvT	visC	FALSE	0.000	721.000	0.004	1.000	N	NA
621889	621890	YPTB3183	YPTB3184	visC	ubiH	TRUE	0.964	173.000	0.474	0.001	Y	NA
621890	621891	YPTB3184	YPTB3185	ubiH	pepP	FALSE	0.066	52.000	0.047	1.000	N	NA
621891	621892	YPTB3185	YPTB3186	pepP		TRUE	0.407	88.000	0.073	NA		NA
621893	621894	YPTB3187	YPTB_RNA_92		ssrS	TRUE	0.502	56.000	0.000	NA		NA
621894	621895	YPTB_RNA_92	YPTB3188	ssrS		FALSE	0.300	127.000	0.000	NA		NA
621896	621897	YPTB3189	YPTB3190	serA	rpiA	FALSE	0.002	307.000	0.029	1.000	N	NA
621899	621900	YPTB3192	YPTB3193	yggE		FALSE	0.262	190.000	0.075	NA		NA
621900	621901	YPTB3193	YPTB3194			FALSE	0.069	263.000	0.049	1.000		NA
621901	621902	YPTB3194	YPTB3195		fbaA	FALSE	0.001	438.000	0.038	1.000	N	NA
621902	621903	YPTB3195	YPTB3196	fbaA	pgk	TRUE	0.811	133.000	0.056	0.004	Y	NA
621903	621904	YPTB3196	YPTB3197	pgk	epd	TRUE	0.844	103.000	0.070	0.004	Y	NA
621904	621905	YPTB3197	YPTB3198	epd	tktA	FALSE	0.099	379.000	0.000	1.000	Y	NA
621907	621908	YPTB3200	YPTB3201		tnp	FALSE	0.041	211.000	0.000	NA	N	NA
621908	621909	YPTB3201	YPTB3202	tnp	speA	FALSE	0.032	201.000	0.000	1.000	N	NA
621910	621911	YPTB3203	YPTB3204	metK	SprT	FALSE	0.137	193.000	0.030	1.000		NA
621911	621912	YPTB3204	YPTB3205	SprT	endA	TRUE	0.649	98.000	0.210	1.000		NA
621912	621913	YPTB3205	YPTB3206	endA		FALSE	0.148	336.000	0.201	NA		NA
621913	621914	YPTB3206	YPTB3207		gshB	TRUE	0.900	26.000	0.173	NA		NA
621914	621915	YPTB3207	YPTB3208	gshB		FALSE	0.281	116.000	0.120	NA	N	NA
621915	621916	YPTB3208	YPTB3209			TRUE	0.986	0.000	0.263	NA	N	NA
621916	621917	YPTB3209	YPTB3210			FALSE	0.126	180.000	0.004	1.000		NA
621917	621918	YPTB3210	YPTB3211			TRUE	0.959	4.000	0.095	1.000		NA
621920	621921	YPTB3213	YPTB3214		proC	TRUE	0.475	133.000	0.125	NA		NA
621921	621922	YPTB3214	YPTB3215	proC	yggT	FALSE	0.118	288.000	0.117	1.000		NA
621922	621923	YPTB3215	YPTB3216	yggT		TRUE	0.972	-3.000	0.081	NA		NA
621923	621924	YPTB3216	YPTB3217			FALSE	0.222	100.000	0.016	NA		NA
621924	621925	YPTB3217	YPTB3218			TRUE	0.977	-7.000	0.218	1.000	N	NA
621926	621927	YPTB3219	YPTB3220			FALSE	0.016	505.000	0.000	NA		NA
621927	621928	YPTB3220	YPTB3221			FALSE	0.362	88.000	0.059	NA		NA
621928	621929	YPTB3221	YPTB3222			TRUE	0.492	111.000	0.123	NA		NA
621929	621930	YPTB3222	YPTB3223			TRUE	0.973	0.000	0.092	NA		NA
621931	621932	YPTB3224	YPTB3225	mutY		FALSE	0.271	178.000	0.150	1.000	N	NA
621932	621933	YPTB3225	YPTB3226		mltC	FALSE	0.229	183.000	0.128	NA	N	NA
621933	621934	YPTB3226	YPTB3227	mltC		FALSE	0.016	282.000	0.000	NA	N	NA
621934	621935	YPTB3227	YPTB3228			TRUE	0.992	-7.000	0.128	1.000	Y	NA
621936	621937	YPTB3229	YPTB3230		mglA	TRUE	1.000	-3.000	0.727	0.011	Y	NA
621937	621938	YPTB3230	YPTB3231	mglA		TRUE	0.980	46.000	0.545	NA	Y	NA
621938	621939	YPTB3231	YPTB3232		speC	FALSE	0.003	565.000	0.000	NA	N	NA
621941	621942	YPTB3233	YPTB3234			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
621942	621943	YPTB3234	YPTB3235		insB	FALSE	0.011	629.000	0.000	NA		NA
621943	621944	YPTB3235	YPTB3236	insB	insA	TRUE	0.518	54.000	0.000	NA		NA
621944	621945	YPTB3236	YPTB3237	insA		FALSE	0.334	96.000	0.000	NA		NA
621945	621946	YPTB3237	YPTB3238			TRUE	0.944	-13.000	0.000	NA		NA
621946	621947	YPTB3238	YPTB3239			TRUE	0.853	15.000	0.000	NA		NA
621947	621948	YPTB3239	YPTB3240			FALSE	0.010	647.000	0.000	NA		NA
621948	621949	YPTB3240	YPTB3241		insB	TRUE	0.930	-259.000	0.000	NA		NA
621949	621950	YPTB3241	YPTB3242	insB	insA	TRUE	0.502	56.000	0.000	NA		NA
621950	621951	YPTB3242	YPTB3243	insA		FALSE	0.026	397.000	0.000	NA		NA
621951	621952	YPTB3243	YPTB3244			TRUE	0.954	1.000	0.000	NA		NA
621952	621953	YPTB3244	YPTB3245			TRUE	0.853	15.000	0.000	NA		NA
621953	621954	YPTB3245	YPTB3246		clpB3	TRUE	0.982	-3.000	0.125	NA		NA
621954	621955	YPTB3246	YPTB3247	clpB3		FALSE	0.033	418.000	0.083	NA		NA
621955	621956	YPTB3247	YPTB3248			TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
621956	621957	YPTB3248	YPTB3249			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
621957	621958	YPTB3249	YPTB3250			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
621958	621959	YPTB3250	YPTB3251			TRUE	0.889	12.000	0.000	NA		NA
621959	621960	YPTB3251	YPTB3252			TRUE	0.557	49.000	0.000	NA		NA
621960	621961	YPTB3252	YPTB3253			FALSE	0.007	1213.000	0.000	NA		NA
621961	621962	YPTB3253	YPTB3254			FALSE	0.017	490.000	0.000	NA		NA
621962	621963	YPTB3254	YPTB3255		insA	TRUE	0.912	10.000	0.000	NA		NA
621963	621964	YPTB3255	YPTB3256	insA		TRUE	0.408	68.000	0.000	NA		NA
621964	621965	YPTB3256	YPTB3257			FALSE	0.020	451.000	0.000	NA		NA
621968	621969	YPTB3260	YPTB3261			FALSE	0.024	388.000	0.000	1.000		NA
621971	621972	YPTB3263	YPTB3264	rhbC	iucB	TRUE	0.996	-16.000	0.609	1.000		NA
621972	621973	YPTB3264	YPTB3265	iucB	iucC	TRUE	0.992	-3.000	0.250	1.000		NA
621973	621974	YPTB3265	YPTB3266	iucC	iucD	TRUE	0.998	-3.000	0.417	1.000	Y	NA
621974	621975	YPTB3266	YPTB3267	iucD	iutA	FALSE	0.264	72.000	0.100	1.000	N	NA
621976	621977	YPTB3268	YPTB3269			TRUE	0.788	162.000	0.444	1.000		NA
621978	621979	YPTB3270	YPTB3271			FALSE	0.010	282.000	0.000	1.000	N	NA
621980	621981	YPTB3272	YPTB3273			FALSE	0.014	544.000	0.000	NA		NA
621981	621982	YPTB3273	YPTB3274			FALSE	0.076	275.000	0.000	NA		NA
621982	621983	YPTB3274	YPTB3275			FALSE	0.145	225.000	0.000	NA		NA
621983	621984	YPTB3275	YPTB3276			FALSE	0.295	130.000	0.000	NA		NA
621984	621985	YPTB3276	YPTB3277			TRUE	0.941	-15.000	0.000	NA		NA
621985	621986	YPTB3277	YPTB3278			TRUE	0.912	10.000	0.000	NA		NA
621986	621987	YPTB3278	YPTB3279			TRUE	0.502	56.000	0.000	NA		NA
621987	621988	YPTB3279	YPTB3280			FALSE	0.027	389.000	0.000	NA		NA
621988	621989	YPTB3280	YPTB3281			FALSE	0.040	344.000	0.000	NA		NA
621989	621990	YPTB3281	YPTB3282			TRUE	0.933	-34.000	0.000	NA		NA
621990	621991	YPTB3282	YPTB3283			TRUE	0.852	14.000	0.000	1.000		NA
621991	621992	YPTB3283	YPTB3284			TRUE	0.736	26.000	0.000	NA		NA
621992	621993	YPTB3284	YPTB3285			FALSE	0.012	586.000	0.000	NA		NA
621993	621994	YPTB3285	YPTB3286			FALSE	0.088	656.000	0.000	0.008	Y	NA
621994	621995	YPTB3286	YPTB3287		gntP	FALSE	0.001	1012.000	0.000	1.000	N	NA
621996	621997	YPTB3288	YPTB3289			FALSE	0.022	436.000	0.000	NA		NA
621998	621999	YPTB3290	YPTB3291			TRUE	0.995	-7.000	0.000	0.006	Y	NA
621999	622000	YPTB3291	YPTB3292			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
622000	622001	YPTB3292	YPTB3293			TRUE	0.947	-10.000	0.000	NA		NA
622001	622002	YPTB3293	YPTB3294			TRUE	0.989	-7.000	0.074	1.000	Y	NA
622002	622003	YPTB3294	YPTB3295			TRUE	0.957	-3.000	0.000	1.000		NA
622003	622004	YPTB3295	YPTB3296			TRUE	0.957	-3.000	0.000	1.000		NA
622004	622005	YPTB3296	YPTB3297			TRUE	0.989	13.000	0.000	0.001	Y	NA
622005	622006	YPTB3297	YPTB3298			FALSE	0.050	151.000	0.000	1.000	N	NA
622006	622007	YPTB3298	YPTB3299			FALSE	0.004	384.000	0.000	1.000	N	NA
622007	622008	YPTB3299	YPTB3300			FALSE	0.038	288.000	0.089	NA	N	NA
622009	622010	YPTB3301	YPTB3302			FALSE	0.145	225.000	0.000	NA		NA
622011	622012	YPTB3303	YPTB3304	yapH		FALSE	0.008	838.000	0.000	NA		NA
622014	622015	YPTB3306	YPTB3307			TRUE	0.992	13.000	0.842	1.000	N	NA
622016	622017	YPTB3308	YPTB3309			FALSE	0.038	183.000	0.000	1.000	N	NA
622017	622018	YPTB3309	YPTB3310			TRUE	0.897	54.000	0.167	1.000	Y	NA
622018	622019	YPTB3310	YPTB3311			FALSE	0.069	674.000	0.000	0.048	Y	NA
622019	622020	YPTB3311	YPTB3312			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
622020	622021	YPTB3312	YPTB3313		slyB	FALSE	0.101	249.000	0.000	NA		NA
622022	622023	YPTB3314	YPTB3315			TRUE	0.383	74.000	0.000	NA		NA
622023	622024	YPTB3315	YPTB3316			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
622024	622025	YPTB3316	YPTB3317			FALSE	0.047	326.000	0.000	NA		NA
622025	622026	YPTB3317	YPTB3318		motB	TRUE	0.403	69.000	0.000	NA		NA
622026	622027	YPTB3318	YPTB3319	motB	motA	TRUE	0.969	117.000	0.846	1.000	Y	NA
622027	622028	YPTB3319	YPTB3320	motA	fliA	TRUE	0.974	16.000	0.500	1.000	N	NA
622028	622029	YPTB3320	YPTB3321	fliA		TRUE	0.990	6.000	0.333	1.000		NA
622029	622030	YPTB3321	YPTB3322			TRUE	0.943	26.000	0.296	1.000		NA
622030	622031	YPTB3322	YPTB3323			TRUE	0.956	2.000	0.062	NA		NA
622031	622032	YPTB3323	YPTB3324		fliS	TRUE	0.950	2.000	0.054	NA		NA
622032	622033	YPTB3324	YPTB3325	fliS	fliD	TRUE	0.999	10.000	0.865	0.003	Y	NA
622033	622034	YPTB3325	YPTB3326	fliD	flaA	TRUE	0.399	220.000	0.000	1.000	Y	NA
622035	622036	YPTB3327	YPTB3328			TRUE	0.997	-19.000	0.714	NA		NA
622037	622038	YPTB3329	YPTB3330		flgL	TRUE	0.994	12.000	0.667	NA		NA
622038	622039	YPTB3330	YPTB3331	flgL	flgK	TRUE	0.990	29.000	0.576	0.002		NA
622039	622040	YPTB3331	YPTB3332	flgK	flgJ	TRUE	0.834	113.000	0.457	NA		NA
622040	622041	YPTB3332	YPTB3333	flgJ	flgI	TRUE	0.991	10.000	0.457	NA		NA
622041	622042	YPTB3333	YPTB3334	flgI	flgH	TRUE	0.999	14.000	0.912	0.011	Y	NA
622042	622043	YPTB3334	YPTB3335	flgH	flgG	TRUE	0.997	35.000	0.941	0.009	Y	NA
622043	622044	YPTB3335	YPTB3336	flgG	flgF	TRUE	0.994	68.000	0.971	0.001	Y	NA
622044	622045	YPTB3336	YPTB3337	flgF	flgE	TRUE	1.000	0.000	1.000	0.005	Y	NA
622045	622046	YPTB3337	YPTB3338	flgE	flgD	TRUE	0.989	55.000	0.970	NA	Y	NA
622046	622047	YPTB3338	YPTB3339	flgD	flgC	TRUE	0.999	3.000	0.914	NA	Y	NA
622047	622048	YPTB3339	YPTB3340	flgC	flgB	TRUE	1.000	3.000	0.972	0.005	Y	NA
622049	622050	YPTB3341	YPTB3342	flgA		FALSE	0.289	210.000	0.113	NA		NA
622050	622051	YPTB3342	YPTB3343			TRUE	0.998	7.000	0.585	0.003		NA
622052	622053	YPTB3344	YPTB3345		fliI	TRUE	0.913	4.000	0.035	1.000		NA
622053	622054	YPTB3345	YPTB3346	fliI	fliH	TRUE	0.999	-7.000	0.816	1.000	Y	NA
622054	622055	YPTB3346	YPTB3347	fliH	fliG	TRUE	1.000	5.000	0.789	0.005	Y	NA
622055	622056	YPTB3347	YPTB3348	fliG	fliF	TRUE	1.000	-28.000	0.970	0.009	Y	NA
622056	622057	YPTB3348	YPTB3349	fliF	fliE	TRUE	1.000	10.000	1.000	0.009	Y	NA
622057	622058	YPTB3349	YPTB3350	fliE	fleR	TRUE	0.978	17.000	0.576	1.000	N	NA
622059	622060	YPTB3351	YPTB3352	fliM	fliN	TRUE	0.977	-7.000	0.123	NA		NA
622060	622061	YPTB3352	YPTB3353	fliN	fliP	TRUE	0.999	-3.000	0.368	0.088	Y	NA
622061	622062	YPTB3353	YPTB3354	fliP	fliQ	TRUE	0.998	2.000	0.263	0.012	Y	NA
622062	622063	YPTB3354	YPTB3355	fliQ	fliR	TRUE	0.998	7.000	0.281	0.003	Y	NA
622063	622064	YPTB3355	YPTB3356	fliR	flhB	TRUE	1.000	0.000	1.000	0.088	Y	NA
622064	622065	YPTB3356	YPTB3357	flhB	flhA	TRUE	0.998	-13.000	0.333	0.012	Y	NA
622065	622066	YPTB3357	YPTB3358	flhA		FALSE	0.190	203.000	0.000	NA		NA
622069	622070	YPTB3361	YPTB3362			TRUE	0.915	25.000	0.000	1.000	Y	NA
622070	622071	YPTB3362	YPTB3363			TRUE	0.942	18.000	0.000	1.000	Y	NA
622071	622072	YPTB3363	YPTB3364		smfA	FALSE	0.178	307.000	0.000	1.000	Y	NA
622073	622074	YPTB3365	YPTB3366	chiC		TRUE	0.747	69.000	0.000	0.002		NA
622074	622075	YPTB3366	YPTB3367			FALSE	0.032	371.000	0.000	NA		NA
622075	622076	YPTB3367	YPTB3368			FALSE	0.007	921.000	0.000	NA		NA
622076	622077	YPTB3368	YPTB3369			FALSE	0.136	223.000	0.000	1.000		NA
622077	622078	YPTB3369	YPTB3370			TRUE	0.938	67.000	0.500	0.088		NA
622078	622079	YPTB3370	YPTB3371			TRUE	0.835	52.000	0.222	NA		NA
622079	622080	YPTB3371	YPTB3372		rcpA	TRUE	0.999	-3.000	0.889	NA		NA
622080	622081	YPTB3372	YPTB3373	rcpA		TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
622081	622082	YPTB3373	YPTB3374			TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
622082	622083	YPTB3374	YPTB3375			TRUE	0.998	12.000	0.727	NA	Y	NA
622083	622084	YPTB3375	YPTB3376			TRUE	0.999	-3.000	0.800	1.000	Y	NA
622084	622085	YPTB3376	YPTB3377			TRUE	1.000	-3.000	0.909	0.011	Y	NA
622085	622086	YPTB3377	YPTB3378			TRUE	0.995	-16.000	0.273	1.000	Y	NA
622086	622087	YPTB3378	YPTB3379			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
622087	622088	YPTB3379	YPTB3380			TRUE	0.983	-16.000	0.200	NA		NA
622088	622089	YPTB3380	YPTB3381			TRUE	0.974	25.000	0.500	NA		NA
622090	622091	YPTB3382	YPTB3383			TRUE	0.999	10.000	0.810	0.070	Y	NA
622092	622093	YPTB3384	YPTB3385	metC		TRUE	0.517	193.000	0.212	NA		NA
622095	622096	YPTB3387	YPTB3388			FALSE	0.020	419.000	0.000	1.000		NA
622097	622098	YPTB3389	YPTB3390		sufI	FALSE	0.002	308.000	0.025	1.000	N	NA
622098	622099	YPTB3390	YPTB3391	sufI	plsC	FALSE	0.275	179.000	0.154	1.000	N	NA
622099	622100	YPTB3391	YPTB3392	plsC	parC	FALSE	0.003	271.000	0.043	1.000	N	NA
622102	622103	YPTB3394	YPTB3395		parE	FALSE	0.330	4.000	0.022	1.000	N	NA
622103	622104	YPTB3395	YPTB3396	parE		TRUE	0.668	102.000	0.217	NA		NA
622104	622105	YPTB3396	YPTB3397		icc	TRUE	0.996	0.000	0.427	NA		NA
622105	622106	YPTB3397	YPTB3398	icc		TRUE	0.992	9.000	0.433	NA		NA
622106	622107	YPTB3398	YPTB3399			TRUE	0.953	34.000	0.443	NA		NA
622108	622109	YPTB3400	YPTB3401	hasF		TRUE	0.432	301.000	0.480	NA		NA
622109	622110	YPTB3401	YPTB3402			TRUE	0.995	10.000	0.632	NA		NA
622111	622112	YPTB3403	YPTB3404		ribB	FALSE	0.015	459.000	0.048	1.000		NA
622112	622113	YPTB3404	YPTB_RNA_119	ribB		FALSE	0.113	243.000	0.000	NA		NA
622115	622116	YPTB3406	YPTB3407	asoB	rfaE	FALSE	0.049	37.000	0.012	1.000	N	NA
622116	622117	YPTB3407	YPTB3408	rfaE	glnE	FALSE	0.137	135.000	0.083	1.000	N	NA
622117	622118	YPTB3408	YPTB3409	glnE		FALSE	0.249	148.000	0.053	1.000		NA
622119	622120	YPTB3410	YPTB3411		cca	FALSE	0.186	178.000	0.106	NA	N	NA
622121	622122	YPTB3412	YPTB3413	bacA	folB	FALSE	0.071	274.000	0.128	1.000	N	NA
622125	622126	YPTB3416	YPTB3417	rpsU	dnaG	FALSE	0.090	136.000	0.067	1.000	N	NA
622126	622127	YPTB3417	YPTB3418	dnaG	rpoD	TRUE	0.558	158.000	0.299	1.000	N	NA
622127	622128	YPTB3418	YPTB_RNA_53	rpoD	tRNA-Met5	FALSE	0.200	196.000	0.000	NA		NA
622129	622130	YPTB3419	YPTB3420			TRUE	0.829	17.000	0.000	NA		NA
622130	622131	YPTB3420	YPTB3421			TRUE	0.725	27.000	0.000	NA		NA
622131	622132	YPTB3421	YPTB3422			TRUE	0.919	9.000	0.000	NA		NA
622132	622133	YPTB3422	YPTB3423		'fic	FALSE	0.007	1073.000	0.000	NA		NA
622133	622134	YPTB3423	YPTB3424	'fic		FALSE	0.013	564.000	0.000	NA		NA
622135	622136	YPTB3425	YPTB3426			FALSE	0.088	260.000	0.000	NA		NA
622137	622138	YPTB3427	YPTB3428			FALSE	0.226	285.000	0.000	NA	Y	NA
622138	622139	YPTB3428	YPTB3429			TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
622139	622140	YPTB3429	YPTB3430			FALSE	0.290	134.000	0.000	NA		NA
622140	622141	YPTB3430	YPTB3431			TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
622141	622142	YPTB3431	YPTB3432			TRUE	0.978	-7.000	0.222	1.000	N	NA
622143	622144	YPTB3433	YPTB3434			FALSE	0.247	173.000	0.000	NA		NA
622144	622145	YPTB3434	YPTB3435			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
622145	622146	YPTB3435	YPTB3436			TRUE	0.996	10.000	0.778	NA		NA
622146	622147	YPTB3436	YPTB3437			TRUE	0.998	-16.000	0.889	NA		NA
622147	622148	YPTB3437	YPTB3438			TRUE	0.997	5.000	0.750	NA		NA
622149	622150	YPTB3439	YPTB3440			TRUE	0.909	51.000	0.375	NA		NA
622150	622151	YPTB3440	YPTB3441			TRUE	0.995	-3.000	0.375	NA		NA
622151	622152	YPTB3441	YPTB3442			TRUE	0.996	0.000	0.105	0.050	Y	NA
622152	622153	YPTB3442	YPTB3443			TRUE	0.991	54.000	0.733	0.050	Y	NA
622153	622154	YPTB3443	YPTB3444			FALSE	0.217	77.000	0.089	1.000	N	NA
622154	622155	YPTB3444	YPTB3445			FALSE	0.122	109.000	0.073	1.000	N	NA
622155	622156	YPTB3445	YPTB3446			TRUE	0.627	83.000	0.030	1.000	Y	NA
622157	622158	YPTB3447	YPTB3448			FALSE	0.220	102.000	0.016	NA		NA
622158	622159	YPTB3448	YPTB3449		yapF	TRUE	0.441	60.000	0.000	1.000		NA
622160	622161	YPTB3450	YPTB3451			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
622161	622162	YPTB3451	YPTB3452			TRUE	0.951	2.000	0.000	NA		NA
622162	622163	YPTB3452	YPTB3453			FALSE	0.070	285.000	0.000	NA		NA
622163	622164	YPTB3453	YPTB3454			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
622164	622165	YPTB3454	YPTB3455			FALSE	0.342	93.000	0.000	NA		NA
622165	622166	YPTB3455	YPTB3456			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
622166	622167	YPTB3456	YPTB3457			FALSE	0.025	406.000	0.000	NA		NA
622167	622168	YPTB3457	YPTB3458			FALSE	0.073	281.000	0.000	NA		NA
622168	622169	YPTB3458	YPTB3459			TRUE	0.932	6.000	0.000	NA		NA
622169	622170	YPTB3459	YPTB3460			FALSE	0.039	348.000	0.000	NA		NA
622170	622171	YPTB3460	YPTB3461			TRUE	0.837	45.000	0.000	1.000	Y	NA
622172	622173	YPTB3462	YPTB3463	terY	terX	TRUE	0.884	33.000	0.200	NA		NA
622173	622174	YPTB3463	YPTB3464	terX		TRUE	0.975	-61.000	0.164	NA		NA
622174	622175	YPTB3464	YPTB3465			TRUE	0.921	102.000	0.750	NA		NA
622175	622176	YPTB3465	YPTB3466			TRUE	0.998	0.000	0.789	NA		NA
622176	622177	YPTB3466	YPTB3467			TRUE	0.955	32.000	0.452	1.000		NA
622177	622178	YPTB3467	YPTB3468			FALSE	0.023	391.000	0.000	1.000		NA
622178	622179	YPTB3468	YPTB3469		fadH	FALSE	0.153	213.000	0.000	1.000		NA
622181	622182	YPTB3471	YPTB3472	YapG		FALSE	0.093	256.000	0.000	NA		NA
622182	622183	YPTB3472	YPTB3473			FALSE	0.195	218.000	0.072	NA		NA
622183	622184	YPTB3473	YPTB3474			FALSE	0.013	535.000	0.000	1.000		NA
622185	622186	YPTB3475	YPTB3476		uxaA	TRUE	0.465	153.000	0.126	NA		NA
622186	622187	YPTB3476	YPTB3477	uxaA	uxaB	TRUE	0.983	11.000	0.126	1.000	Y	NA
622187	622188	YPTB3477	YPTB3478	uxaB	uxaC	TRUE	0.552	199.000	0.095	1.000	Y	NA
622189	622190	YPTB3479	YPTB3480	exuT	exuR	FALSE	0.351	263.000	0.433	1.000	N	NA
622190	622191	YPTB3480	YPTB3481	exuR		FALSE	0.193	201.000	0.000	NA		NA
622191	622192	YPTB3481	YPTB3482		yqjA	FALSE	0.075	278.000	0.000	NA		NA
622192	622193	YPTB3482	YPTB3483	yqjA		TRUE	0.981	-3.000	0.118	NA		NA
622193	622194	YPTB3483	YPTB3484			TRUE	0.780	226.000	0.684	NA		NA
622194	622195	YPTB3484	YPTB3485			TRUE	0.869	155.000	0.609	NA		NA
622195	622196	YPTB3485	YPTB3486			TRUE	0.984	3.000	0.185	NA		NA
622196	622197	YPTB3486	YPTB3487			TRUE	0.989	-3.000	0.185	NA		NA
622197	622198	YPTB3487	YPTB3488			FALSE	0.153	304.000	0.161	NA		NA
622198	622199	YPTB3488	YPTB3489		yqjG	FALSE	0.354	86.000	0.000	NA		NA
622202	622203	YPTB_RNA_87	YPTB3492	rnpB		TRUE	0.800	20.000	0.000	NA		NA
622204	622205	YPTB3493	YPTB3494			TRUE	0.605	99.000	0.172	NA		NA
622205	622206	YPTB3494	YPTB3495			FALSE	0.126	271.000	0.187	1.000	N	NA
622206	622207	YPTB3495	YPTB3496			TRUE	0.994	11.000	0.613	NA		NA
622208	622209	YPTB3497	YPTB3498	mtgA	elbB	TRUE	0.967	-3.000	0.066	NA		NA
622209	622210	YPTB3498	YPTB3499	elbB		TRUE	0.694	30.000	0.000	NA		NA
622210	622211	YPTB3499	YPTB3500		arcB	TRUE	0.819	18.000	0.000	NA		NA
622211	622212	YPTB3500	YPTB3501	arcB		FALSE	0.119	284.000	0.113	1.000		NA
622213	622214	YPTB3502	YPTB3503	gltB	gltD	TRUE	0.995	10.000	0.096	0.000	Y	NA
622214	622215	YPTB3503	YPTB3504	gltD		FALSE	0.011	600.000	0.000	NA		NA
622216	622217	YPTB3505	YPTB3506	sspB	sspA	TRUE	0.998	6.000	0.831	NA		NA
622217	622218	YPTB3506	YPTB3507	sspA	rpsI	FALSE	0.001	374.000	0.014	NA	N	NA
622218	622219	YPTB3507	YPTB3508	rpsI	rplM	TRUE	0.998	15.000	0.601	0.011	Y	NA
622219	622220	YPTB3508	YPTB3509	rplM		FALSE	0.030	314.000	0.003	NA		NA
622221	622222	YPTB3510	YPTB3511		degQ	FALSE	0.195	271.000	0.154	NA		NA
622222	622223	YPTB3511	YPTB3512	degQ	degS	TRUE	0.953	90.000	0.262	0.002	Y	NA
622224	622225	YPTB3513	YPTB3514	murA		TRUE	0.528	154.000	0.258	NA	N	NA
622225	622226	YPTB3514	YPTB3515			TRUE	0.814	138.000	0.453	NA		NA
622226	622227	YPTB3515	YPTB3516		yrbC	TRUE	0.920	36.000	0.308	NA		NA
622227	622228	YPTB3516	YPTB3517	yrbC	yrbD	TRUE	0.963	13.000	0.188	NA		NA
622228	622229	YPTB3517	YPTB3518	yrbD	yrbE	TRUE	0.996	5.000	0.562	NA		NA
622229	622230	YPTB3518	YPTB3519	yrbE	yrbF	TRUE	0.868	218.000	0.530	NA	Y	NA
622231	622232	YPTB3520	YPTB3521	yrbG		TRUE	0.508	111.000	0.226	1.000	N	NA
622232	622233	YPTB3521	YPTB3522			FALSE	0.284	406.000	0.598	1.000		NA
622233	622234	YPTB3522	YPTB3523		yrbK	TRUE	0.998	-3.000	0.617	NA		NA
622234	622235	YPTB3523	YPTB3524	yrbK		TRUE	0.994	-16.000	0.459	NA		NA
622235	622236	YPTB3524	YPTB3525		yhbG	TRUE	0.995	7.000	0.543	NA		NA
622236	622237	YPTB3525	YPTB3526	yhbG	rpoN	TRUE	0.697	62.000	0.163	1.000		NA
622237	622238	YPTB3526	YPTB3527	rpoN	yhbH	TRUE	0.983	24.000	0.820	NA	N	NA
622238	622239	YPTB3527	YPTB3528	yhbH	ptsN	TRUE	0.866	119.000	0.728	NA	N	NA
622239	622240	YPTB3528	YPTB3529	ptsN		FALSE	0.177	306.000	0.186	NA		NA
622240	622241	YPTB3529	YPTB3530		ptsO	TRUE	0.989	-3.000	0.182	NA		NA
622241	622242	YPTB3530	YPTB3531	ptsO	pyrB	FALSE	0.006	338.000	0.000	1.000	N	NA
622242	622243	YPTB3531	YPTB3532	pyrB	pyrI	TRUE	0.997	9.000	0.197	0.000	Y	NA
622243	622244	YPTB3532	YPTB3533	pyrI		FALSE	0.164	138.000	0.084	NA	N	NA
622244	622245	YPTB3533	YPTB3534			FALSE	0.062	299.000	0.000	NA		NA
622245	622246	YPTB3534	YPTB3535		treR	FALSE	0.129	234.000	0.000	NA		NA
622246	622247	YPTB3535	YPTB3536	treR	treB	FALSE	0.003	411.000	0.000	1.000	N	NA
622247	622248	YPTB3536	YPTB3537	treB	treC	TRUE	0.957	95.000	0.650	1.000	Y	NA
622248	622249	YPTB3537	YPTB3538	treC	rnk	FALSE	0.005	353.000	0.000	1.000	N	NA
622250	622251	YPTB3539	YPTB3540			FALSE	0.177	208.000	0.000	NA		NA
622251	622252	YPTB3540	YPTB3541		pmbA	FALSE	0.295	130.000	0.000	NA		NA
622254	622255	YPTB3543	YPTB3544			TRUE	0.991	5.000	0.329	NA		NA
622255	622256	YPTB3544	YPTB3545			FALSE	0.155	195.000	0.043	1.000		NA
622256	622257	YPTB3545	YPTB3546		yhcP	FALSE	0.083	267.000	0.000	NA		NA
622257	622258	YPTB3546	YPTB3547	yhcP	yhcQ	TRUE	0.999	2.000	1.000	NA		NA
622258	622259	YPTB3547	YPTB3548	yhcQ		TRUE	0.970	8.000	0.150	NA		NA
622260	622261	YPTB3549	YPTB3550			TRUE	0.435	261.000	0.000	0.040	Y	NA
622261	622262	YPTB3550	YPTB3551			FALSE	0.125	236.000	0.000	NA		NA
622262	622263	YPTB3551	YPTB3552			TRUE	0.600	41.000	0.000	NA		NA
622263	622264	YPTB3552	YPTB3553		tcaC	TRUE	0.925	57.000	0.500	NA		NA
622264	622265	YPTB3553	YPTB3554	tcaC		FALSE	0.285	140.000	0.000	NA		NA
622265	622266	YPTB3554	YPTB3555			TRUE	0.878	13.000	0.000	NA		NA
622266	622267	YPTB3555	YPTB3556			TRUE	0.994	-12.000	0.400	NA		NA
622267	622268	YPTB3556	YPTB3557			TRUE	0.795	260.000	1.000	NA		NA
622269	622270	YPTB3558	YPTB3559	tldD		TRUE	0.977	12.000	0.259	NA		NA
622270	622271	YPTB3559	YPTB3560			TRUE	0.995	-3.000	0.358	NA		NA
622271	622272	YPTB3560	YPTB3561		cafA	TRUE	0.765	94.000	0.296	NA		NA
622272	622273	YPTB3561	YPTB3562	cafA	yhdE	TRUE	0.991	-10.000	0.417	NA	N	NA
622273	622274	YPTB3562	YPTB3563	yhdE	mreD	TRUE	0.961	8.000	0.206	NA	N	NA
622274	622275	YPTB3563	YPTB3564	mreD	mreC	TRUE	1.000	-3.000	0.550	0.002	Y	NA
622275	622276	YPTB3564	YPTB3565	mreC	mreB	TRUE	0.740	205.000	0.689	1.000	N	NA
622276	622277	YPTB3565	YPTB3566	mreB	yhdA	FALSE	0.006	337.000	0.000	1.000	N	NA
622278	622279	YPTB3567	YPTB3568	yhdH		FALSE	0.142	223.000	0.059	1.000		NA
622279	622280	YPTB3568	YPTB3569			TRUE	0.999	0.000	0.790	0.033		NA
622280	622281	YPTB3569	YPTB3570		aroQ	FALSE	0.042	263.000	0.006	1.000		NA
622281	622282	YPTB3570	YPTB3571	aroQ	accB	TRUE	0.546	113.000	0.254	1.000	N	NA
622282	622283	YPTB3571	YPTB3572	accB	accC	TRUE	0.997	12.000	0.275	0.000	Y	NA
622283	622284	YPTB3572	YPTB3573	accC	yhdT	FALSE	0.012	1482.000	0.103	NA		NA
622284	622285	YPTB3573	YPTB3574	yhdT	panF	TRUE	0.997	-10.000	0.682	NA		NA
622285	622286	YPTB3574	YPTB3575	panF	prmA	FALSE	0.018	76.000	0.041	1.000	N	NA
622286	622287	YPTB3575	YPTB3576	prmA		FALSE	0.037	589.000	0.042	1.000	Y	NA
622287	622288	YPTB3576	YPTB3577		fiS	TRUE	0.794	25.000	0.161	1.000	N	NA
622289	622290	YPTB3578	YPTB3579			TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
622290	622291	YPTB3579	YPTB3580			FALSE	0.068	90.000	0.000	1.000	N	NA
622291	622292	YPTB3580	YPTB3581			TRUE	0.387	154.000	0.105	1.000		NA
622292	622293	YPTB3581	YPTB3582			FALSE	0.272	205.000	0.105	1.000		NA
622293	622294	YPTB3582	YPTB3583			TRUE	0.406	65.000	0.000	1.000		NA
622295	622296	YPTB3584	YPTB3585	pcp	cspa1	FALSE	0.002	534.000	0.000	1.000	N	NA
622296	622297	YPTB3585	YPTB3586	cspa1	cspa1	TRUE	0.432	260.000	0.000	0.047	Y	NA
622297	622298	YPTB3586	YPTB3587	cspa1	cspa2	TRUE	0.432	260.000	0.000	0.047	Y	NA
622298	622299	YPTB3587	YPTB3588	cspa2		FALSE	0.006	336.000	0.000	1.000	N	NA
622302	622303	YPTB3591	YPTB3592			TRUE	0.983	-3.000	0.102	0.017	N	NA
622303	622304	YPTB3592	YPTB3593			TRUE	0.874	19.000	0.184	1.000	N	NA
622304	622305	YPTB3593	YPTB3594			TRUE	1.000	2.000	0.900	0.011	Y	NA
622305	622306	YPTB3594	YPTB3595			TRUE	1.000	-7.000	0.667	0.011	Y	NA
622306	622307	YPTB3595	YPTB3596			TRUE	0.927	204.000	0.714	NA	Y	NA
622308	622309	YPTB3597	YPTB3598	ddg		FALSE	0.278	152.000	0.000	NA		NA
622310	622311	YPTB3599	YPTB3600	yjcE	yjcD	FALSE	0.023	365.000	0.037	1.000		NA
622313	622314	YPTB3602	YPTB3603	ssuB	ssuC	TRUE	0.999	-3.000	0.472	1.000	Y	NA
622314	622315	YPTB3603	YPTB3604	ssuC	ssuD	TRUE	0.963	9.000	0.226	1.000	N	NA
622315	622316	YPTB3604	YPTB3605	ssuD	ssuA	TRUE	0.946	19.000	0.341	1.000	N	NA
622316	622317	YPTB3605	YPTB3606	ssuA	ssuE	TRUE	0.944	15.000	0.169	1.000		NA
622318	622319	YPTB3607	YPTB3608			FALSE	0.040	181.000	0.000	1.000	N	NA
622319	622320	YPTB3608	YPTB3609			TRUE	0.980	6.000	0.000	1.000	Y	NA
622322	622323	YPTB3611	YPTB3612			TRUE	0.996	-3.000	0.455	NA		NA
622324	622325	YPTB3613	YPTB3614			FALSE	0.213	189.000	0.000	NA		NA
622325	622326	YPTB3614	YPTB3615			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
622326	622327	YPTB3615	YPTB3616			TRUE	0.586	45.000	0.000	NA		NA
622327	622328	YPTB3616	YPTB3617			TRUE	0.946	3.000	0.000	NA		NA
622329	622330	YPTB3618	YPTB3619			FALSE	0.059	303.000	0.000	NA		NA
622331	622332	YPTB3620	YPTB3621			TRUE	0.900	11.000	0.000	NA		NA
622332	622333	YPTB3621	YPTB3622			TRUE	0.981	-7.000	0.143	NA		NA
622333	622334	YPTB3622	YPTB3623			TRUE	0.932	6.000	0.000	NA		NA
622334	622335	YPTB3623	YPTB3624			TRUE	0.924	22.000	0.182	NA		NA
622335	622336	YPTB3624	YPTB3625			TRUE	0.744	125.000	0.312	NA		NA
622336	622337	YPTB3625	YPTB3626			TRUE	0.981	32.000	0.750	NA		NA
622337	622338	YPTB3626	YPTB3627			TRUE	0.997	6.000	0.711	NA		NA
622338	622339	YPTB3627	YPTB3628			TRUE	0.960	-3.000	0.053	NA		NA
622339	622340	YPTB3628	YPTB3629		clpB2	TRUE	0.946	-3.000	0.039	1.000		NA
622340	622341	YPTB3629	YPTB3630	clpB2		TRUE	0.991	11.000	0.471	NA		NA
622341	622342	YPTB3630	YPTB3631			TRUE	0.998	0.000	0.673	NA		NA
622342	622343	YPTB3631	YPTB3632			TRUE	0.998	3.000	0.765	NA		NA
622343	622344	YPTB3632	YPTB3633			TRUE	0.999	0.000	0.862	NA		NA
622344	622345	YPTB3633	YPTB3634			TRUE	0.853	126.000	0.510	NA		NA
622345	622346	YPTB3634	YPTB3635			TRUE	0.998	-36.000	0.863	NA		NA
622346	622347	YPTB3635	YPTB3636			TRUE	0.997	0.000	0.552	NA		NA
622347	622348	YPTB3636	YPTB3637			TRUE	0.996	7.000	0.627	NA		NA
622348	622349	YPTB3637	YPTB3638			TRUE	0.952	68.000	0.821	NA		NA
622351	622352	YPTB3640	YPTB3641		malM	FALSE	0.018	472.000	0.000	NA		NA
622352	622353	YPTB3641	YPTB3642	malM	lamB	FALSE	0.106	241.000	0.000	1.000		NA
622353	622354	YPTB3642	YPTB3643	lamB	malK	TRUE	0.826	71.000	0.000	0.068	Y	NA
622354	622355	YPTB3643	YPTB3644	malK		TRUE	0.941	4.000	0.000	NA		NA
622356	622357	YPTB3645	YPTB3646	malE	malF	TRUE	0.510	187.000	0.060	1.000	Y	NA
622357	622358	YPTB3646	YPTB3647	malF	malG	TRUE	0.999	14.000	0.814	0.049	Y	NA
622359	622360	YPTB3648	YPTB3649	yjbA	pgi	FALSE	0.170	135.000	0.015	1.000		NA
622361	622362	YPTB3650	YPTB3651	lysC		FALSE	0.012	568.000	0.000	NA		NA
622362	622363	YPTB3651	YPTB3652			TRUE	0.398	70.000	0.000	NA		NA
622366	622367	YPTB3655	YPTB3656	aceK	aceA	TRUE	0.646	73.000	0.273	1.000	N	NA
622367	622368	YPTB3656	YPTB3657	aceA	aceB	TRUE	0.889	47.000	0.118	1.000	Y	NA
622368	622369	YPTB3657	YPTB3658	aceB	metA	FALSE	0.003	421.000	0.000	1.000	N	NA
622369	3391297	YPTB3658	YPTB_r01	metA		FALSE	0.008	746.000	0.000	NA		NA
3391297	622370	YPTB_r01	YPTB_RNA_58		tRNA-Thr4	TRUE	0.612	39.000	0.000	NA		NA
622370	622371	YPTB_RNA_58	YPTB_RNA_111	tRNA-Thr4		TRUE	0.866	14.000	0.000	NA		NA
622371	622372	YPTB_RNA_111	YPTB_RNA_112			FALSE	0.314	108.000	0.000	NA		NA
622372	622373	YPTB_RNA_112	YPTB_RNA_57		tRNA-Ala5	FALSE	0.158	219.000	0.000	NA		NA
622373	622374	YPTB_RNA_57	YPTB_RNA_56	tRNA-Ala5	tRNA-Ile3	TRUE	0.531	52.000	0.000	NA		NA
622374	622375	YPTB_RNA_56	YPTB_RNA_111.1	tRNA-Ile3		FALSE	0.322	100.000	0.000	NA		NA
622377	622378	YPTB3660	YPTB3661	aroE		TRUE	0.857	9.000	0.087	NA	N	NA
622378	622379	YPTB3661	YPTB3662			TRUE	0.957	2.000	0.137	NA	N	NA
622379	622380	YPTB3662	YPTB3663			TRUE	0.966	20.000	0.331	NA		NA
622380	622381	YPTB3663	YPTB3664			TRUE	0.968	-28.000	0.124	NA		NA
622382	622383	YPTB3665	YPTB3666	def	fmt	TRUE	0.963	25.000	0.058	0.016	Y	NA
622383	622384	YPTB3666	YPTB3667	fmt		TRUE	0.890	94.000	0.305	1.000	Y	NA
622384	622385	YPTB3667	YPTB3668		trkA	FALSE	0.030	56.000	0.007	1.000	N	NA
622385	622386	YPTB3668	YPTB3669	trkA	mscL	FALSE	0.012	139.000	0.007	1.000	N	NA
622387	622388	YPTB3670	YPTB3671			TRUE	0.701	88.000	0.219	NA		NA
622388	622389	YPTB3671	YPTB3672		rplQ	FALSE	0.001	447.000	0.005	1.000	N	NA
622389	622390	YPTB3672	YPTB3673	rplQ	rpoA	TRUE	0.966	41.000	0.873	1.000	N	NA
622390	622391	YPTB3673	YPTB3674	rpoA	rpsD	TRUE	0.959	26.000	0.549	1.000	N	NA
622391	622392	YPTB3674	YPTB3675	rpsD	rpsK	TRUE	0.993	31.000	0.509	0.014	Y	NA
622392	622393	YPTB3675	YPTB3676	rpsK	rpsM	TRUE	0.999	17.000	0.810	0.011	Y	NA
622393	622394	YPTB3676	YPTB3677	rpsM	rpmJ	TRUE	0.819	148.000	0.086	0.011	Y	NA
622394	622395	YPTB3677	YPTB3678	rpmJ	secY	FALSE	0.056	34.000	0.036	1.000	N	NA
622395	622396	YPTB3678	YPTB3679	secY	rplO	TRUE	0.994	8.000	0.730	1.000	N	NA
622396	622397	YPTB3679	YPTB3680	rplO	rpmD	TRUE	0.999	4.000	0.653	0.002	Y	NA
622397	622398	YPTB3680	YPTB3681	rpmD	rpsE	TRUE	1.000	3.000	0.789	0.014	Y	NA
622398	622399	YPTB3681	YPTB3682	rpsE	rplR	TRUE	0.999	15.000	0.814	0.014	Y	NA
622399	622400	YPTB3682	YPTB3683	rplR	rplF	TRUE	0.999	10.000	0.815	0.011	Y	NA
622400	622401	YPTB3683	YPTB3684	rplF	rpsH	TRUE	0.999	15.000	0.808	0.011	Y	NA
622401	622402	YPTB3684	YPTB3685	rpsH	rpsN	TRUE	0.992	34.000	0.473	0.011	Y	NA
622402	622403	YPTB3685	YPTB3686	rpsN	rplE	TRUE	0.998	14.000	0.496	0.011	Y	NA
622403	622404	YPTB3686	YPTB3687	rplE	rplX	TRUE	0.999	15.000	0.758	0.011	Y	NA
622404	622405	YPTB3687	YPTB3688	rplX	rplN	TRUE	0.999	11.000	0.810	0.014	Y	NA
622405	622406	YPTB3688	YPTB3689	rplN	rpsQ	TRUE	0.975	181.000	0.791	0.014	Y	NA
622406	622407	YPTB3689	YPTB3690	rpsQ	rpmC	TRUE	1.000	0.000	0.828	0.011	Y	NA
622407	622408	YPTB3690	YPTB3691	rpmC	rplP	TRUE	1.000	0.000	0.802	0.011	Y	NA
622408	622409	YPTB3691	YPTB3692	rplP	rpsC	TRUE	0.999	13.000	0.828	0.014	Y	NA
622409	622410	YPTB3692	YPTB3693	rpsC	rplV	TRUE	0.998	18.000	0.719	0.014	Y	NA
622410	622411	YPTB3693	YPTB3694	rplV	rpsS	TRUE	0.999	15.000	0.769	0.014	Y	NA
622411	622412	YPTB3694	YPTB3695	rpsS	rplB	TRUE	0.999	15.000	0.820	0.014	Y	NA
622412	622413	YPTB3695	YPTB3696	rplB	rplW	TRUE	0.999	17.000	0.849	0.013	Y	NA
622413	622414	YPTB3696	YPTB3697	rplW	rplD	TRUE	0.999	-3.000	0.513	0.011	Y	NA
622414	622415	YPTB3697	YPTB3698	rplD	rplC	TRUE	0.997	17.000	0.486	0.011	Y	NA
622415	622416	YPTB3698	YPTB3699	rplC	rpS10	TRUE	0.986	33.000	0.307	0.014	Y	NA
622416	622417	YPTB3699	YPTB3700	rpS10	bfr	FALSE	0.004	398.000	0.000	1.000	N	NA
622417	622418	YPTB3700	YPTB3701	bfr	bfd	TRUE	0.632	79.000	0.013	NA	Y	NA
622418	622419	YPTB3701	YPTB3702	bfd	tufA	FALSE	0.013	127.000	0.020	NA	N	NA
622419	622420	YPTB3702	YPTB3703	tufA	fusA	TRUE	0.863	72.000	0.005	0.001	Y	NA
622420	622421	YPTB3703	YPTB3704	fusA	rpsG	TRUE	0.950	94.000	0.579	1.000	Y	NA
622421	622422	YPTB3704	YPTB3705	rpsG	rpsl	TRUE	0.982	97.000	0.620	0.002	Y	NA
622422	622423	YPTB3705	YPTB3706	rpsl		FALSE	0.086	138.000	0.058	NA	N	NA
622423	622424	YPTB3706	YPTB3707			TRUE	0.996	20.000	0.804	NA	Y	NA
622424	622425	YPTB3707	YPTB3708			TRUE	0.999	0.000	0.790	NA	Y	NA
622425	622426	YPTB3708	YPTB3709			TRUE	0.990	0.000	0.220	NA		NA
622426	622427	YPTB3709	YPTB3710		fkpA	TRUE	0.409	254.000	0.310	NA		NA
622429	622430	YPTB3712	YPTB3713	slyD		FALSE	0.326	95.000	0.060	1.000		NA
622430	622431	YPTB3713	YPTB3714		kefB	TRUE	0.978	16.000	0.400	1.000		NA
622431	622432	YPTB3714	YPTB3715	kefB		TRUE	0.998	4.000	0.927	1.000		NA
622433	622434	YPTB3716	YPTB3717	yheS		FALSE	0.203	135.000	0.020	NA		NA
622434	622435	YPTB3717	YPTB3718			TRUE	0.661	93.000	0.053	NA	Y	NA
622436	622437	YPTB3719	YPTB3720	tauD	tauC	TRUE	0.981	-3.000	0.214	1.000	N	NA
622437	622438	YPTB3720	YPTB3721	tauC	tauB	TRUE	0.999	-3.000	0.728	1.000	Y	NA
622438	622439	YPTB3721	YPTB3722	tauB	tauA	TRUE	0.970	9.000	0.023	1.000	Y	NA
622439	622440	YPTB3722	YPTB3723	tauA		FALSE	0.031	203.000	0.000	1.000	N	NA
622441	622442	YPTB3724	YPTB3725			TRUE	0.991	-3.000	0.222	NA		NA
622442	622443	YPTB3725	YPTB3726		prk	TRUE	0.715	149.000	0.303	NA		NA
622444	622445	YPTB3727	YPTB3728			TRUE	0.390	72.000	0.000	NA		NA
622446	622447	YPTB3729	YPTB3730	crp		TRUE	0.511	86.000	0.111	NA		NA
622448	622449	YPTB3731	YPTB3732		pabA	TRUE	0.661	133.000	0.088	1.000	Y	NA
622449	622450	YPTB3732	YPTB3733	pabA		FALSE	0.056	244.000	0.007	1.000		NA
622450	622451	YPTB3733	YPTB3734		ppiA	FALSE	0.042	326.000	0.000	1.000		NA
622452	622453	YPTB3735	YPTB3736			FALSE	0.242	249.000	0.267	1.000	N	NA
622457	622458	YPTB3740	YPTB3741	nirB	nirD	TRUE	0.999	-3.000	0.829	0.000	N	NA
622458	622459	YPTB3741	YPTB3742	nirD	nirC	TRUE	0.835	167.000	0.283	1.000	Y	NA
622459	622460	YPTB3742	YPTB3743	nirC	cysG	FALSE	0.156	63.000	0.065	1.000	N	NA
622461	622462	YPTB3744	YPTB3745	trpS	gph	TRUE	0.973	2.000	0.118	1.000		NA
622462	622463	YPTB3745	YPTB3746	gph	rpe	TRUE	0.942	-7.000	0.050	1.000		NA
622463	622464	YPTB3746	YPTB3747	rpe	dam	FALSE	0.007	303.000	0.053	1.000	N	NA
622464	622465	YPTB3747	YPTB3748	dam		TRUE	0.728	84.000	0.234	NA		NA
622465	622466	YPTB3748	YPTB3749		aroB	FALSE	0.063	254.000	0.022	NA		NA
622466	622467	YPTB3749	YPTB3750	aroB	aroK	TRUE	0.909	57.000	0.208	1.000	Y	NA
622467	622468	YPTB3750	YPTB3751	aroK	hofQ	FALSE	0.204	349.000	0.319	1.000		NA
622468	622469	YPTB3751	YPTB3752	hofQ		FALSE	0.026	442.000	0.072	NA		NA
622469	622470	YPTB3752	YPTB3753			TRUE	0.979	-16.000	0.167	NA		NA
622470	622471	YPTB3753	YPTB3754			TRUE	0.985	-7.000	0.174	NA		NA
622471	622472	YPTB3754	YPTB3755			TRUE	0.999	0.000	0.870	NA		NA
622475	622476	YPTB3758	YPTB3759			TRUE	0.435	144.000	0.122	1.000		NA
622476	622477	YPTB3759	YPTB3760		hslR	TRUE	0.682	29.000	0.056	1.000		NA
622477	622478	YPTB3760	YPTB3761	hslR	hslO	FALSE	0.276	163.000	0.140	1.000	N	NA
622478	622479	YPTB3761	YPTB3762	hslO	pckA	FALSE	0.017	197.000	0.048	1.000	N	NA
622480	622481	YPTB3763	YPTB3764	envZ	ompR	TRUE	0.999	-3.000	0.584	1.000	Y	NA
622481	622482	YPTB3764	YPTB3765	ompR	greB	TRUE	0.778	136.000	0.067	0.046	Y	NA
622483	622484	YPTB3766	YPTB3767		feoA	FALSE	0.002	524.000	0.000	1.000	N	NA
622484	622485	YPTB3767	YPTB3768	feoA	feoB	TRUE	0.821	92.000	0.177	1.000	Y	NA
622485	622486	YPTB3768	YPTB3769	feoB		TRUE	0.951	36.000	0.455	NA		NA
622487	622488	YPTB3770	YPTB3771		bioH	FALSE	0.166	170.000	0.010	NA		NA
622489	622490	YPTB3772	YPTB3773			TRUE	0.480	60.000	0.066	1.000		NA
622491	622492	YPTB3774	YPTB3775	malQ		TRUE	0.991	13.000	0.137	0.016	Y	NA
622493	622494	YPTB3776	YPTB3777	malT		FALSE	0.004	375.000	0.000	1.000	N	NA
622494	622495	YPTB3777	YPTB3778		glpG	TRUE	0.976	18.000	0.405	1.000		NA
622495	622496	YPTB3778	YPTB3779	glpG	glpR	TRUE	0.860	35.000	0.190	1.000		NA
622497	622498	YPTB3780	YPTB3781			TRUE	0.946	3.000	0.000	NA		NA
622500	622501	YPTB3783	YPTB3784	glgP	glgA	TRUE	0.695	217.000	0.228	1.000	Y	NA
622501	622502	YPTB3784	YPTB3785	glgA	glgC	TRUE	0.768	211.000	0.307	1.000	Y	NA
622502	622503	YPTB3785	YPTB3786	glgC	glgX	TRUE	0.992	10.000	0.228	1.000	Y	NA
622503	622504	YPTB3786	YPTB3787	glgX	glgB	TRUE	0.996	2.000	0.069	0.002	Y	NA
622506	622507	YPTB3789	YPTB3790		asd	FALSE	0.006	1289.000	0.000	1.000		NA
622509	622510	YPTB3792	YPTB3793			FALSE	0.316	106.000	0.000	NA		NA
622510	622511	YPTB3793	YPTB3794			FALSE	0.315	107.000	0.000	NA		NA
622511	622512	YPTB3794	YPTB3795			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
622512	622513	YPTB3795	YPTB3796			FALSE	0.044	335.000	0.000	NA		NA
622515	622516	YPTB3798	YPTB3799	gntR		TRUE	0.416	108.000	0.091	NA		NA
622517	622518	YPTB3800	YPTB3801			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
622519	622520	YPTB3802	YPTB3803			TRUE	0.990	10.000	0.180	NA	Y	NA
622520	622521	YPTB3803	YPTB3804			TRUE	0.882	26.000	0.149	NA		NA
622521	622522	YPTB3804	YPTB3805			TRUE	0.499	75.000	0.095	NA		NA
622522	622523	YPTB3805	YPTB3806			TRUE	0.961	31.000	0.238	0.011		NA
622523	622524	YPTB3806	YPTB3807			TRUE	0.985	-7.000	0.000	0.011		NA
622529	622530	YPTB3812	YPTB3813	uspA	gdhA	FALSE	0.016	247.000	0.000	1.000	N	NA
622530	622531	YPTB3813	YPTB3814	gdhA		FALSE	0.017	244.000	0.000	1.000	N	NA
622532	622533	YPTB3815	YPTB3816		opdA	TRUE	0.964	4.000	0.098	NA		NA
622534	622535	YPTB3817	YPTB3818		gor	FALSE	0.375	153.000	0.100	1.000		NA
622535	622536	YPTB3818	YPTB3819	gor		FALSE	0.018	271.000	0.000	NA	N	NA
622536	622537	YPTB3819	YPTB3820			TRUE	0.520	178.000	0.290	NA	N	NA
622537	622538	YPTB3820	YPTB3821		glxK	TRUE	0.993	11.000	0.295	1.000	Y	NA
622539	622540	YPTB3822	YPTB3823			TRUE	0.944	-13.000	0.000	NA		NA
622540	622541	YPTB3823	YPTB3824		yapE	FALSE	0.351	88.000	0.000	NA		NA
622542	622543	YPTB3825	YPTB3826		cdh	TRUE	0.910	4.000	0.033	1.000		NA
622544	622545	YPTB3827	YPTB3828			FALSE	0.013	305.000	0.000	NA	N	NA
622546	622547	YPTB3829	YPTB3830		kdgK	FALSE	0.066	279.000	0.000	1.000		NA
622548	622549	YPTB3831	YPTB3832		dctA	FALSE	0.045	365.000	0.088	1.000		NA
622549	622550	YPTB3832	YPTB3833	dctA		FALSE	0.016	472.000	0.000	1.000		NA
622550	622551	YPTB3833	YPTB3834		pelY	TRUE	0.701	98.000	0.250	1.000		NA
622551	622552	YPTB3834	YPTB3835	pelY		FALSE	0.366	246.000	0.250	1.000		NA
622552	622553	YPTB3835	YPTB3836		yhjK	FALSE	0.024	641.000	0.000	0.085		NA
622553	622554	YPTB3836	YPTB3837	yhjK		FALSE	0.051	143.000	0.000	1.000	N	NA
622554	622555	YPTB3837	YPTB3838		dppF	FALSE	0.057	118.000	0.000	1.000	N	NA
622555	622556	YPTB3838	YPTB3839	dppF	dppD	TRUE	1.000	-3.000	0.500	0.001	Y	NA
622556	622557	YPTB3839	YPTB3840	dppD	dppC	TRUE	0.996	14.000	0.560	1.000	Y	NA
622557	622558	YPTB3840	YPTB3841	dppC	dppB	TRUE	0.999	11.000	0.779	0.048	Y	NA
622558	622559	YPTB3841	YPTB3842	dppB	dppA	TRUE	0.431	283.000	0.087	0.048	Y	NA
622559	622560	YPTB3842	YPTB3843	dppA		FALSE	0.002	669.000	0.000	NA	N	NA
622560	622561	YPTB3843	YPTB3844			TRUE	0.732	109.000	0.286	NA		NA
622561	622562	YPTB3844	YPTB_RNA_55		tRNA-Pro2	FALSE	0.054	312.000	0.000	NA		NA
622562	622563	YPTB_RNA_55	YPTB3845	tRNA-Pro2	uhpC	FALSE	0.309	117.000	0.000	NA		NA
622563	622564	YPTB3845	YPTB3846	uhpC	uhpB	TRUE	0.956	95.000	1.000	0.064	N	NA
622564	622565	YPTB3846	YPTB3847	uhpB	uhpA	TRUE	0.998	-3.000	0.148	0.011	Y	NA
622565	622566	YPTB3847	YPTB3848	uhpA	yhjW	TRUE	0.418	116.000	0.103	1.000		NA
622566	622567	YPTB3848	YPTB3849	yhjW		FALSE	0.015	529.000	0.000	NA		NA
622567	622568	YPTB3849	YPTB3850		hutT	FALSE	0.004	479.000	0.000	NA	N	NA
622568	622569	YPTB3850	YPTB3851	hutT	hutH	FALSE	0.070	386.000	0.006	1.000	Y	NA
622569	622570	YPTB3851	YPTB3852	hutH	hutU	TRUE	0.999	-3.000	0.315	0.000	Y	NA
622571	622572	YPTB3853	YPTB3854	cysM		TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
622572	622573	YPTB3854	YPTB3855			FALSE	0.361	83.000	0.000	NA		NA
622573	622574	YPTB3855	YPTB3856			TRUE	0.978	2.000	0.138	1.000		NA
622574	622575	YPTB3856	YPTB3857			FALSE	0.002	523.000	0.000	1.000	N	NA
622575	622576	YPTB3857	YPTB3858			TRUE	0.995	10.000	0.356	1.000	Y	NA
622576	622577	YPTB3858	YPTB3859			TRUE	1.000	-10.000	0.870	0.048	Y	NA
622577	622578	YPTB3859	YPTB3860			TRUE	0.999	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
622579	622580	YPTB3861	YPTB3862			TRUE	0.456	62.000	0.000	NA		NA
622580	622581	YPTB3862	YPTB3863			TRUE	0.772	23.000	0.000	NA		NA
622581	622582	YPTB3863	YPTB3864			FALSE	0.127	235.000	0.000	NA		NA
622582	622583	YPTB3864	YPTB3865			FALSE	0.034	363.000	0.000	NA		NA
622583	622584	YPTB3865	YPTB3866		ypjF	FALSE	0.147	224.000	0.000	NA		NA
622584	622585	YPTB3866	YPTB3867	ypjF	yagB	TRUE	0.997	-43.000	0.750	NA		NA
622585	622586	YPTB3867	YPTB3868	yagB	yfjY	TRUE	0.995	12.000	0.750	NA		NA
622586	622587	YPTB3868	YPTB3869	yfjY		TRUE	0.855	183.000	0.667	NA		NA
622587	622588	YPTB3869	YPTB3870			TRUE	0.958	28.000	0.400	NA		NA
622588	622589	YPTB3870	YPTB3871			FALSE	0.103	248.000	0.000	NA		NA
622589	622590	YPTB3871	YPTB3872			TRUE	0.568	48.000	0.000	NA		NA
622593	622594	YPTB3875	YPTB3876			TRUE	0.988	0.000	0.000	1.000	Y	NA
622595	622596	YPTB3877	YPTB3878			FALSE	0.288	136.000	0.000	NA		NA
622596	622597	YPTB3878	YPTB3879			TRUE	0.997	4.000	0.644	NA		NA
622597	622598	YPTB3879	YPTB3880			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
622598	622599	YPTB3880	YPTB3881			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
622599	622600	YPTB3881	YPTB3882		hsdM	TRUE	0.993	-10.000	0.000	0.046	Y	NA
622600	622601	YPTB3882	YPTB3883	hsdM		TRUE	0.967	7.000	0.036	0.046		NA
622603	622604	YPTB3885	YPTB3886			FALSE	0.051	318.000	0.000	NA		NA
622604	622605	YPTB3886	YPTB_RNA_54		tRNA-SeC(p)1	FALSE	0.101	249.000	0.000	NA		NA
622605	622606	YPTB_RNA_54	YPTB3887	tRNA-SeC(p)1		FALSE	0.295	130.000	0.000	NA		NA
622606	622607	YPTB3887	YPTB3888		xylH	FALSE	0.371	90.000	0.146	1.000	N	NA
622607	622608	YPTB3888	YPTB3889	xylH	xylG	TRUE	0.999	-13.000	0.469	0.011	Y	NA
622608	622609	YPTB3889	YPTB3890	xylG		TRUE	0.938	208.000	0.518	0.011	Y	NA
622610	622611	YPTB3891	YPTB3892	xylA	xylB	TRUE	0.550	124.000	0.020	1.000	Y	NA
622612	622613	YPTB3893	YPTB3894			TRUE	0.950	39.000	0.500	1.000		NA
622613	622614	YPTB3894	YPTB3895		yqiG	TRUE	0.939	93.000	0.500	1.000	Y	NA
622614	622615	YPTB3895	YPTB3896	yqiG		TRUE	0.947	76.000	0.500	1.000	Y	NA
622615	622616	YPTB3896	YPTB3897			FALSE	0.007	882.000	0.000	1.000		NA
622617	622618	YPTB3898	YPTB3899			TRUE	0.897	54.000	0.167	1.000	Y	NA
622619	622620	YPTB3900	YPTB3901			TRUE	0.997	-6.000	0.316	1.000	Y	NA
622623	622624	YPTB3904	YPTB3905	ibpA	ibpB	FALSE	0.302	281.000	0.099	NA	Y	NA
622624	622625	YPTB3905	YPTB3906	ibpB	yidE	FALSE	0.038	373.000	0.069	NA		NA
622626	622627	YPTB3907	YPTB3908	avtA		FALSE	0.019	456.000	0.000	NA		NA
622627	622628	YPTB3908	YPTB3909		malS	FALSE	0.025	405.000	0.000	NA		NA
622628	622629	YPTB3909	YPTB3910	malS		FALSE	0.008	308.000	0.000	1.000	N	NA
622631	622632	YPTB3912	YPTB3913	yiaD		FALSE	0.031	359.000	0.000	1.000		NA
622632	622633	YPTB3913	YPTB3914		tag	TRUE	0.938	-3.000	0.028	1.000		NA
622634	622635	YPTB3915	YPTB3916	glyQ	glyS	TRUE	0.999	10.000	0.651	0.000	Y	NA
622635	622636	YPTB3916	YPTB3917	glyS	yiaF	FALSE	0.010	467.000	0.003	NA		NA
622636	622637	YPTB3917	YPTB3918	yiaF	mtlA	FALSE	0.010	650.000	0.000	NA		NA
622637	622638	YPTB3918	YPTB3919	mtlA	mtlD	TRUE	0.859	137.000	0.292	1.000	Y	NA
622638	622639	YPTB3919	YPTB3920	mtlD	mtlR	FALSE	0.356	207.000	0.230	NA	N	NA
622639	622640	YPTB3920	YPTB3921	mtlR		FALSE	0.116	249.000	0.067	NA		NA
622641	622642	YPTB3922	YPTB3923			FALSE	0.015	534.000	0.000	NA		NA
622642	622643	YPTB3923	YPTB3924		tar	FALSE	0.211	190.000	0.000	NA		NA
622643	622644	YPTB3924	YPTB3925	tar	sodA	FALSE	0.006	344.000	0.000	1.000	N	NA
622644	622645	YPTB3925	YPTB3926	sodA	fdhD	FALSE	0.001	453.000	0.029	1.000	N	NA
622646	622647	YPTB3927	YPTB3928	fdoG	fdoH	TRUE	0.999	13.000	0.833	0.001	Y	NA
622647	622648	YPTB3928	YPTB3929	fdoH	fdoI	TRUE	1.000	-3.000	0.944	0.001	Y	NA
622648	622649	YPTB3929	YPTB3930	fdoI	fdhE	TRUE	0.976	0.000	0.182	NA	N	NA
622649	622650	YPTB3930	YPTB3931	fdhE	selA	FALSE	0.106	196.000	0.083	NA	N	NA
622650	622651	YPTB3931	YPTB3932	selA	selB	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.000	N	NA
622654	622655	YPTB3935	YPTB3936		mdfA	FALSE	0.009	710.000	0.000	NA		NA
622655	622656	YPTB3936	YPTB3937	mdfA		FALSE	0.002	559.000	0.000	1.000	N	NA
622656	622657	YPTB3937	YPTB3938			TRUE	0.897	54.000	0.167	1.000	Y	NA
622657	622658	YPTB3938	YPTB3939			FALSE	0.015	484.000	0.000	1.000		NA
622658	622659	YPTB3939	YPTB3940		gyrB	FALSE	0.246	216.000	0.003	0.081		NA
622659	622660	YPTB3940	YPTB3941	gyrB	recF	TRUE	0.993	20.000	0.249	0.003	Y	NA
622660	622661	YPTB3941	YPTB3942	recF	dnaN	TRUE	0.845	173.000	0.318	1.000	Y	NA
622661	622662	YPTB3942	YPTB3943	dnaN	dnaA	TRUE	0.996	5.000	0.328	1.000	Y	NA
622663	622664	YPTB3944	YPTB3945		rpmH	FALSE	0.029	383.000	0.000	NA		NA
622664	622665	YPTB3945	YPTB3946	rpmH	rnpA	TRUE	0.991	19.000	0.787	1.000		NA
622665	622666	YPTB3946	YPTB3947	rnpA		TRUE	0.995	-36.000	0.540	NA		NA
622666	622667	YPTB3947	YPTB3948		yidC	TRUE	0.995	3.000	0.461	NA		NA
622667	622668	YPTB3948	YPTB3949	yidC	thdF	TRUE	0.766	143.000	0.221	0.064		NA
622668	622669	YPTB3949	YPTB3950	thdF		FALSE	0.093	207.000	0.003	1.000		NA
622670	622671	YPTB3951	YPTB3952			TRUE	0.456	62.000	0.000	NA		NA
622671	622672	YPTB3952	YPTB3953		yieG	FALSE	0.014	545.000	0.000	NA		NA
622674	622675	YPTB3955	YPTB3956			TRUE	0.998	2.000	0.282	0.014	Y	NA
622675	622676	YPTB3956	YPTB3957			TRUE	0.885	183.000	0.263	0.048	Y	NA
622676	622677	YPTB3957	YPTB3958			FALSE	0.037	220.000	0.000	NA	N	NA
622677	622678	YPTB3958	YPTB3959		phoU	FALSE	0.014	296.000	0.000	NA	N	NA
622678	622679	YPTB3959	YPTB3960	phoU	pstB	TRUE	0.904	88.000	0.317	NA	Y	NA
622679	622680	YPTB3960	YPTB3961	pstB	pstA	TRUE	0.981	81.000	0.526	0.002	Y	NA
622680	622681	YPTB3961	YPTB3962	pstA	pstC	TRUE	0.999	2.000	0.537	0.002	Y	NA
622681	622682	YPTB3962	YPTB3963	pstC	pstS	TRUE	0.812	214.000	0.145	0.002	Y	NA
622682	622683	YPTB3963	YPTB3964	pstS	glmS	FALSE	0.002	483.000	0.000	1.000	N	NA
622683	622684	YPTB3964	YPTB3965	glmS	glmU	TRUE	0.464	201.000	0.055	1.000	Y	NA
622684	622685	YPTB3965	YPTB3966	glmU	atpC	FALSE	0.003	619.000	0.067	1.000	N	NA
622685	622686	YPTB3966	YPTB3967	atpC	atpD	TRUE	0.998	22.000	0.837	0.003	Y	NA
622686	622687	YPTB3967	YPTB3968	atpD	atpG	TRUE	0.981	156.000	0.724	0.003	Y	NA
622687	622688	YPTB3968	YPTB3969	atpG	atpA	TRUE	0.993	62.000	0.846	0.003	Y	NA
622688	622689	YPTB3969	YPTB3970	atpA	atpH	TRUE	0.999	15.000	0.864	0.003	Y	NA
622689	622690	YPTB3970	YPTB3971	atpH	atpF	TRUE	0.995	15.000	0.242	0.003	Y	NA
622690	622691	YPTB3971	YPTB3972	atpF	atpE	TRUE	0.990	62.000	0.666	0.003	Y	NA
622691	622692	YPTB3972	YPTB3973	atpE	atpB	TRUE	0.991	50.000	0.557	0.003	Y	NA
622692	622693	YPTB3973	YPTB3974	atpB	atpI	TRUE	0.984	40.000	0.291	0.003	Y	NA
622693	622694	YPTB3974	YPTB3975	atpI	gidB	FALSE	0.000	667.000	0.005	1.000	N	NA
622694	622695	YPTB3975	YPTB3976	gidB	gidA	TRUE	0.715	145.000	0.466	1.000	N	NA
622695	618601	YPTB3976	YPTB0001	gidA		FALSE	0.004	381.000	0.000	1.000	N	NA
618558	618559	pYptb0001	pYptb0002	rep		TRUE	0.719	128.000	0.286	NA		NA
618559	618560	pYptb0002	pYptb0003			FALSE	0.069	286.000	0.000	NA		NA
618560	618561	pYptb0003	pYptb0004		triA	FALSE	0.022	435.000	0.000	NA		NA
618561	618562	pYptb0004	pYptb0005	triA	triB	TRUE	0.993	5.000	0.400	NA		NA
618562	618563	pYptb0005	pYptb0006	triB	triC	TRUE	0.994	19.000	1.000	NA		NA
618563	618564	pYptb0006	pYptb0007	triC	triD	TRUE	0.435	65.000	0.000	NA		NA
618564	618565	pYptb0007	pYptb0008	triD		TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
618565	618566	pYptb0008	pYptb0009			TRUE	0.995	-3.000	0.366	NA		NA
618566	618567	pYptb0009	pYptb0010			FALSE	0.307	119.000	0.000	NA		NA
618567	618568	pYptb0010	pYptb0011		triE	TRUE	0.978	12.000	0.273	NA		NA
618568	618569	pYptb0011	pYptb0012	triE	triG	TRUE	0.568	171.000	0.000	NA	Y	NA
618569	618570	pYptb0012	pYptb0013	triG	triH	TRUE	0.989	0.000	0.000	NA	Y	NA
618570	618571	pYptb0013	pYptb0014	triH	triI	TRUE	0.999	-3.000	0.778	NA	Y	NA
618571	618572	pYptb0014	pYptb0015	triI	triJ	TRUE	0.415	217.000	0.000	1.000	Y	NA
618572	618573	pYptb0015	pYptb0016	triJ		TRUE	0.998	-3.000	0.600	NA		NA
618573	618574	pYptb0016	pYptb0017			FALSE	0.030	377.000	0.000	NA		NA
618574	618575	pYptb0017	pYptb0018			FALSE	0.283	143.000	0.000	NA		NA
618575	618576	pYptb0018	pYptb0019			TRUE	0.493	57.000	0.000	NA		NA
618576	618577	pYptb0019	pYptb0020			TRUE	0.810	19.000	0.000	NA		NA
618577	618578	pYptb0020	pYptb0021			TRUE	0.936	5.000	0.000	NA		NA
618578	618579	pYptb0021	pYptb0022			TRUE	0.780	22.000	0.000	NA		NA
618579	618580	pYptb0022	pYptb0023			FALSE	0.356	85.000	0.000	NA		NA
618580	618581	pYptb0023	pYptb0024			TRUE	0.927	7.000	0.000	NA		NA
618581	618582	pYptb0024	pYptb0025			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
618582	618583	pYptb0025	pYptb0026			TRUE	0.959	0.000	0.000	NA		NA
618583	618584	pYptb0026	pYptb0027			TRUE	0.714	28.000	0.000	NA		NA
618584	618585	pYptb0027	pYptb0028			TRUE	0.590	44.000	0.000	NA		NA
618585	618586	pYptb0028	pYptb0029		triK	FALSE	0.280	149.000	0.000	NA		NA
618586	618587	pYptb0029	pYptb0030	triK	triL	TRUE	0.923	8.000	0.000	NA		NA
618587	618588	pYptb0030	pYptb0031	triL	topB	TRUE	0.502	56.000	0.000	NA		NA
618588	618589	pYptb0031	pYptb0032	topB		TRUE	0.478	59.000	0.000	NA		NA
618589	618590	pYptb0032	pYptb0033			TRUE	0.675	32.000	0.000	NA		NA
618590	618591	pYptb0033	pYptb0034			FALSE	0.310	115.000	0.000	NA		NA
618593	618594	pYptb0036	pYptb0037		parA	TRUE	0.531	52.000	0.000	NA		NA
618594	618595	pYptb0037	pYptb0038	parA		TRUE	0.920	21.000	0.176	1.000		NA
618595	618596	pYptb0038	pYptb0039			TRUE	0.762	24.000	0.000	NA		NA
618596	618597	pYptb0039	pYptb0040			FALSE	0.281	147.000	0.000	NA		NA
618597	618598	pYptb0040	pYptb0041			TRUE	0.790	21.000	0.000	NA		NA
618598	618599	pYptb0041	pYptb0042			TRUE	0.853	15.000	0.000	NA		NA
618599	618600	pYptb0042	pYptb0043			TRUE	0.379	76.000	0.000	NA		NA
618600	618558	pYptb0043	pYptb0001		rep	FALSE	0.048	324.000	0.000	NA		NA
618459	618460	pYV0001	pYV0002			TRUE	0.987	8.000	0.308	1.000		NA
618460	618461	pYV0002	pYV0003			FALSE	0.088	252.000	0.000	1.000		NA
618461	618462	pYV0003	pYV0004			FALSE	0.250	172.000	0.000	NA		NA
618462	618463	pYV0004	pYV0005			FALSE	0.007	1173.000	0.000	NA		NA
618467	618468	pYV0009	pYV0010			FALSE	0.250	172.000	0.000	NA		NA
618470	618471	pYV0012	pYV0013			FALSE	0.305	123.000	0.000	NA		NA
618472	618473	pYV0014	pYV0015			TRUE	0.941	-15.000	0.000	NA		NA
618475	618476	pYV0017	pYV0018			FALSE	0.020	1051.000	0.000	0.045		NA
618476	618477	pYV0018	pYV0019			TRUE	0.899	24.000	0.000	0.045		NA
618478	618479	pYV0020	pYV0021			FALSE	0.035	345.000	0.000	1.000		NA
618479	618480	pYV0021	pYV0022			TRUE	0.999	0.000	1.000	1.000		NA
618484	618485	pYV0026	pYV0027			TRUE	0.990	-7.000	0.250	NA		NA
618485	618486	pYV0027	pYV0028			FALSE	0.312	111.000	0.000	NA		NA
618488	618489	pYV0030	pYV0031			FALSE	0.281	148.000	0.000	NA		NA
618489	618490	pYV0031	pYV0032			TRUE	0.992	-3.000	0.400	1.000	N	NA
618492	618493	pYV0034	pYV0035			TRUE	0.618	112.000	0.000	0.007		NA
618493	618494	pYV0035	pYV0036			TRUE	0.964	27.000	0.250	0.045		NA
618494	618495	pYV0036	pYV0037			FALSE	0.260	167.000	0.000	NA		NA
618495	618496	pYV0037	pYV0038			TRUE	0.800	20.000	0.000	NA		NA
618496	618497	pYV0038	pYV0039			FALSE	0.266	164.000	0.000	NA		NA
618497	618498	pYV0039	pYV0040			FALSE	0.286	138.000	0.000	NA		NA
618499	618500	pYV0041	pYV0042			TRUE	0.999	0.000	0.500	0.007		NA
618500	618501	pYV0042	pYV0043			FALSE	0.016	495.000	0.000	NA		NA
618501	618502	pYV0043	pYV0044			TRUE	0.829	17.000	0.000	NA		NA
618505	618506	pYV0047	pYV0048			FALSE	0.302	125.000	0.000	NA		NA
618506	618507	pYV0048	pYV0049			FALSE	0.316	105.000	0.000	NA		NA
618508	618509	pYV0050	pYV0051			TRUE	0.736	26.000	0.000	NA		NA
618509	618510	pYV0051	pYV0052			TRUE	0.645	35.000	0.000	NA		NA
618510	618511	pYV0052	pYV0053			FALSE	0.353	87.000	0.000	NA		NA
618512	618513	pYV0054	pYV0055			TRUE	0.983	19.000	0.526	NA		NA
618513	618514	pYV0055	pYV0056			TRUE	0.960	-22.000	0.105	1.000		NA
618514	618515	pYV0056	pYV0057			TRUE	0.976	13.000	0.286	1.000		NA
618515	618516	pYV0057	pYV0058			TRUE	0.997	2.000	0.556	NA		NA
618516	618517	pYV0058	pYV0059			TRUE	0.983	42.000	1.000	NA		NA
618517	618518	pYV0059	pYV0060			TRUE	0.993	-3.000	0.281	NA		NA
618518	618519	pYV0060	pYV0061			TRUE	0.943	-13.000	0.062	1.000		NA
618519	618520	pYV0061	pYV0062			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
618520	618521	pYV0062	pYV0063			TRUE	0.962	-3.000	0.000	NA		NA
618521	618522	pYV0063	pYV0064			TRUE	0.986	-13.000	0.214	NA		NA
618522	618523	pYV0064	pYV0065			TRUE	0.971	-19.000	0.125	NA		NA
618524	618525	pYV0066	pYV0067			TRUE	0.656	34.000	0.000	NA		NA
618525	618526	pYV0067	pYV0068			TRUE	0.994	-3.000	0.300	NA		NA
618526	618527	pYV0068	pYV0069			TRUE	0.984	0.000	0.150	NA		NA
618527	618528	pYV0069	pYV0070			TRUE	0.997	-3.000	0.235	0.009		NA
618528	618529	pYV0070	pYV0071			TRUE	0.999	-3.000	0.529	1.000	Y	NA
618529	618530	pYV0071	pYV0072			TRUE	0.995	2.000	0.000	0.011	Y	NA
618530	618531	pYV0072	pYV0073			TRUE	0.995	-3.000	0.000	0.063	Y	NA
618531	618532	pYV0073	pYV0074			TRUE	0.999	0.000	0.548	0.063	Y	NA
618532	618533	pYV0074	pYV0075			FALSE	0.012	576.000	0.000	NA		NA
618533	618534	pYV0075	pYV0076			TRUE	0.551	124.000	0.154	NA		NA
618534	618535	pYV0076	pYV0077			TRUE	0.623	79.000	0.154	NA		NA
618535	618536	pYV0077	pYV0078			FALSE	0.142	226.000	0.000	NA		NA
618536	618537	pYV0078	pYV0079			TRUE	0.997	6.000	0.750	1.000		NA
618537	618538	pYV0079	pYV0080			TRUE	0.991	-3.000	0.220	NA		NA
618538	618539	pYV0080	pYV0081			TRUE	0.993	-3.000	0.268	NA		NA
618539	618540	pYV0081	pYV0082			TRUE	0.998	1.000	0.417	0.007		NA
618540	618541	pYV0082	pYV0083			TRUE	0.999	2.000	0.556	0.007		NA
618541	618542	pYV0083	pYV0084			TRUE	0.999	-3.000	0.900	0.007		NA
618542	618543	pYV0084	pYV0085			TRUE	0.997	1.000	0.333	0.007		NA
618543	618544	pYV0085	pYV0086			TRUE	0.995	7.000	0.333	0.011		NA
618544	618545	pYV0086	pYV0087			TRUE	0.997	-21.000	0.800	1.000		NA
618545	618546	pYV0087	pYV0088			TRUE	0.997	-21.000	0.727	1.000		NA
618546	618547	pYV0088	pYV0089			FALSE	0.131	225.000	0.000	1.000		NA
618547	618548	pYV0089	pYV0090			FALSE	0.012	548.000	0.000	1.000		NA
618548	618549	pYV0090	pYV0091			TRUE	0.607	36.000	0.000	1.000		NA
618549	618550	pYV0091	pYV0092			TRUE	0.988	-3.000	0.000	0.011		NA
618550	618551	pYV0092	pYV0093			TRUE	0.932	6.000	0.000	NA		NA
618554	618555	pYV0096	pYV0097			FALSE	0.361	83.000	0.000	NA		NA
618555	618556	pYV0097	pYV0098			FALSE	0.073	281.000	0.000	NA		NA
618556	618557	pYV0098	pYV0099			TRUE	0.954	1.000	0.000	NA		NA
618557	618459	pYV0099	pYV0001			FALSE	0.087	261.000	0.000	NA		NA