MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodobacter sphaeroides 2.4.1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1138444 1138445 RSP_4294 RSP_4324     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 1138445 1138446 RSP_4324 RSP_4325     FALSE 0.253 48.000 0.000 NA   NA
 1138446 1138447 RSP_4325 RSP_4295     FALSE 0.020 245.000 0.000 NA   NA
 1138447 1138448 RSP_4295 RSP_4293     FALSE 0.163 100.000 0.000 NA   NA
 1138448 1138449 RSP_4293 RSP_4307     FALSE 0.262 46.000 0.000 NA   NA
 1138451 1138452 RSP_1427 RSP_1428     FALSE 0.002 677.000 0.000 NA   NA
 1138452 1138453 RSP_1428 RSP_1430     FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 1138454 1138455 RSP_1432 RSP_1433     FALSE 0.005 411.000 0.000 NA   NA
 1138455 1138456 RSP_1433 RSP_1434     FALSE 0.466 20.000 0.000 NA   NA
 1138456 1138457 RSP_1434 RSP_1435     FALSE 0.324 16.000 0.000 1.000 N NA
 1138459 1138460 RSP_1437 RSP_1438     TRUE 0.987 -3.000 0.109 1.000 Y NA
 1138460 1138461 RSP_1438 RSP_1439     TRUE 0.996 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 1138461 1138462 RSP_1439 RSP_1440     TRUE 0.989 -6.000 0.286 1.000 Y NA
 1138463 1138464 RSP_1441 RSP_1442     TRUE 0.839 118.000 0.333 NA Y NA
 1138464 1138465 RSP_1442 RSP_1443     TRUE 0.862 68.000 0.074 0.079 Y NA
 1138465 1138466 RSP_1443 RSP_1444     TRUE 0.992 -3.000 0.074 0.079 Y NA
 1138466 1138467 RSP_1444 RSP_1445     TRUE 0.988 20.000 0.600 0.079 Y NA
 1138467 1138468 RSP_1445 RSP_1446     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA Y NA
 1138468 1138469 RSP_1446 RSP_1447     TRUE 0.866 27.000 0.375 NA N NA
 1138469 1138470 RSP_1447 RSP_1448     FALSE 0.115 55.000 0.000 1.000 N NA
 1138472 1138473 RSP_1450 RSP_1451     FALSE 0.095 73.000 0.000 1.000 N NA
 1138473 1138474 RSP_1451 RSP_1452     TRUE 0.897 79.000 0.163 0.079 Y NA
 1138474 1138475 RSP_1452 RSP_1453     TRUE 0.994 0.000 0.163 0.079 Y NA
 1138475 1138476 RSP_1453 RSP_1454     TRUE 0.989 2.000 0.636 1.000   NA
 1138476 1138477 RSP_1454 RSP_1455     TRUE 0.964 -7.000 0.231 1.000   NA
 1138477 1138478 RSP_1455 RSP_1456     TRUE 0.989 -3.000 0.714 NA N NA
 1138478 1138479 RSP_1456 RSP_1457     TRUE 0.996 -3.000 0.647 NA Y NA
 1138480 1138481 RSP_1458 RSP_6001     FALSE 0.029 225.000 0.000 NA   NA
 1138482 1138483 RSP_1459 RSP_1460     FALSE 0.126 142.000 0.010 NA   NA
 1138483 1138484 RSP_1460 RSP_1461   kdtA TRUE 0.918 12.000 0.198 NA   NA
 1138484 1138485 RSP_1461 RSP_1462 kdtA lpxK TRUE 0.979 0.000 0.046 1.000 Y NA
 1138486 1138487 RSP_1463 RSP_1464     TRUE 0.969 -3.000 0.235 NA N NA
 1138487 1138488 RSP_1464 RSP_1465     TRUE 0.977 -3.000 0.233 NA   NA
 1138489 1138490 RSP_1466 RSP_1467     FALSE 0.480 38.000 0.027 1.000   NA
 1138491 1138492 RSP_1468 RSP_1470   rnhB TRUE 0.693 89.000 0.048 1.000 Y NA
 1138492 1138493 RSP_1470 RSP_1471 rnhB   FALSE 0.074 156.000 0.000 NA   NA
 1138494 1138495 RSP_6002 RSP_1472     TRUE 0.945 -28.000 0.205 NA   NA
 1138497 1138498 RSP_1474 RSP_1475 nspC   TRUE 0.947 37.000 0.444 NA Y NA
 1138499 1138500 RSP_1476 RSP_6210     FALSE 0.191 79.000 0.000 NA   NA
 1138500 1138501 RSP_6210 RSP_1478     TRUE 0.760 27.000 0.111 NA   NA
 1138501 1138502 RSP_1478 RSP_1479   OppC TRUE 0.956 2.000 0.115 1.000   NA
 1138502 1138503 RSP_1479 RSP_1480 OppC OppB TRUE 0.998 -7.000 0.870 0.079 Y NA
 1138503 1138504 RSP_1480 RSP_1481 OppB OppA TRUE 0.921 57.000 0.192 0.079 Y NA
 1138504 1138505 RSP_1481 RSP_6240 OppA   FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 1138505 1138506 RSP_6240 RSP_6004     TRUE 0.807 1.000 0.000 NA   NA
 1138508 1138509 RSP_1484 RSP_1485     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1138510 1138511 RSP_1486 RSP_1487     FALSE 0.207 67.000 0.000 NA   NA
 1138511 1138512 RSP_1487 RSP_1488     TRUE 0.892 2.000 0.031 NA   NA
 1138512 1138513 RSP_1488 RSP_1489     FALSE 0.110 132.000 0.000 NA   NA
 1138513 1138514 RSP_1489 RSP_1490     TRUE 0.970 4.000 0.222 1.000   NA
 1138514 1138515 RSP_1490 RSP_1491     TRUE 0.966 -3.000 0.148 NA   NA
 1138517 1138518 RSP_1493 RSP_1494     FALSE 0.354 123.000 0.110 1.000 N NA
 1138518 1138519 RSP_1494 RSP_1495     TRUE 0.898 11.000 0.157 1.000 N NA
 1138519 1138520 RSP_1495 RSP_1497     FALSE 0.169 132.000 0.043 1.000 N NA
 1138523 1138524 RSP_1499 RSP_1500     FALSE 0.380 112.000 0.103 1.000 N NA
 1138524 1138525 RSP_1500 RSP_1501     TRUE 0.993 -10.000 0.621 1.000 Y NA
 1138526 1138527 RSP_1502 RSP_1503     FALSE 0.240 52.000 0.000 NA   NA
 1138530 1138531 RSP_1505 RSP_1507     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1138531 1138532 RSP_1507 RSP_4318     FALSE 0.004 462.000 0.000 NA   NA
 1138532 1138533 RSP_4318 RSP_1508     FALSE 0.063 167.000 0.000 NA   NA
 1138533 1138534 RSP_1508 RSP_6207     TRUE 0.964 11.000 0.408 NA   NA
 1138534 1138535 RSP_6207 RSP_6208     TRUE 0.708 68.000 0.263 NA   NA
 1138536 1138537 RSP_1509 RSP_1510     TRUE 0.924 -3.000 0.070 1.000 N NA
 1138537 1138538 RSP_1510 RSP_1511     TRUE 0.983 4.000 0.456 NA   NA
 1138538 1138539 RSP_1511 RSP_1512     TRUE 0.960 0.000 0.122 NA   NA
 1138539 1138540 RSP_1512 RSP_1513   trpB FALSE 0.010 308.000 0.000 NA   NA
 1138542 1138543 RSP_1515 RSP_1516     TRUE 0.918 -3.000 0.031 1.000   NA
 1138544 1138545 RSP_1517 RSP_1518 spbA prrA FALSE 0.081 236.000 0.000 0.095   NA
 1138545 1138546 RSP_1518 RSP_1519 prrA prrC TRUE 0.970 -7.000 0.286 1.000   NA
 1138547 1138548 RSP_1520 RSP_1521 prrB   TRUE 0.568 127.000 0.050 0.015   NA
 1138548 1138549 RSP_1521 RSP_1522     FALSE 0.018 284.000 0.003 1.000   NA
 1138549 1138550 RSP_1522 RSP_1523     TRUE 0.885 -7.000 0.047 NA   NA
 1138550 1138551 RSP_1523 RSP_1524     TRUE 0.980 -18.000 0.642 NA   NA
 1138551 1138552 RSP_1524 RSP_1525     TRUE 0.943 -7.000 0.196 1.000 N NA
 1138552 1138553 RSP_1525 RSP_1527     TRUE 0.990 29.000 0.863 0.052 Y NA
 1138553 1138554 RSP_1527 RSP_1529   trxA TRUE 0.673 59.000 0.173 1.000   NA
 1138556 1138557 RSP_1531 RSP_1532     TRUE 0.997 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 1138558 1138559 RSP_1533 RSP_1534     TRUE 0.576 0.000 0.000 NA N NA
 1138559 1138560 RSP_1534 RSP_1535     TRUE 0.927 61.000 0.500 NA Y NA
 1138560 1138561 RSP_1535 RSP_6005     TRUE 0.931 -19.000 0.000 NA Y NA
 1138561 1138562 RSP_6005 RSP_1536     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.046 Y NA
 1138563 1138564 RSP_1537 RSP_1538     FALSE 0.191 79.000 0.000 NA   NA
 1138565 1138566 RSP_1539 RSP_1540     FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 1138566 1138567 RSP_1540 RSP_1541     TRUE 0.983 -10.000 0.627 1.000   NA
 1138567 1138568 RSP_1541 RSP_1542     TRUE 0.989 -3.000 0.680 1.000 N NA
 1138568 1138569 RSP_1542 RSP_1543     FALSE 0.013 286.000 0.000 NA   NA
 1138569 1138570 RSP_1543 RSP_1544     TRUE 0.988 2.000 0.620 NA   NA
 1138570 1138571 RSP_1544 RSP_1545     TRUE 0.991 0.000 0.713 NA   NA
 1138571 1138572 RSP_1545 RSP_1546   bfr FALSE 0.050 179.000 0.017 1.000 N NA
 1138572 1138573 RSP_1546 RSP_1547 bfr   TRUE 0.798 -10.000 0.013 NA   NA
 1138573 1138574 RSP_1547 RSP_1548     FALSE 0.331 82.000 0.033 NA   NA
 1138574 1138575 RSP_1548 RSP_6006     FALSE 0.428 54.000 0.043 NA   NA
 1138579 1138580 RSP_1552 RSP_1553     FALSE 0.198 117.000 0.013 NA   NA
 1138580 1138581 RSP_1553 RSP_1554     TRUE 0.954 -3.000 0.091 NA   NA
 1138582 1138583 RSP_1555 RSP_1556   puc2B FALSE 0.024 244.000 0.000 1.000   NA
 1138583 1138584 RSP_1556 RSP_6158 puc2B puc2A TRUE 0.898 14.000 0.000 0.003   NA
 1138584 1138585 RSP_6158 RSP_1559 puc2A icd FALSE 0.005 445.000 0.000 1.000   NA
 1138586 1138587 RSP_1558 RSP_1561     TRUE 0.980 -3.000 0.345 1.000 N NA
 1138587 1138588 RSP_1561 RSP_1562     TRUE 0.771 133.000 0.065 0.029 Y NA
 1138588 1138589 RSP_1562 RSP_1563     FALSE 0.131 67.000 0.007 NA N NA
 1138589 1138590 RSP_1563 RSP_1564     FALSE 0.296 53.000 0.007 NA   NA
 1138590 1138591 RSP_1564 RSP_1565   appA FALSE 0.315 92.000 0.034 NA   NA
 1138593 1138594 RSP_1567 RSP_1568     FALSE 0.467 68.000 0.100 1.000 N NA
 1138594 1138595 RSP_1568 RSP_1569     TRUE 0.933 -3.000 0.082 1.000 N NA
 1138595 1138596 RSP_1569 RSP_1570   purK TRUE 0.789 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1138596 1138597 RSP_1570 RSP_1571 purK purE TRUE 0.995 -7.000 0.201 0.001 Y NA
 1138597 1138598 RSP_1571 RSP_6218 purE   FALSE 0.057 236.000 0.044 NA   NA
 1138599 1138600 RSP_1572 RSP_1573     TRUE 0.994 -3.000 0.955 NA   NA
 1138600 1138601 RSP_1573 RSP_1574     FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 1138602 1138603 RSP_1575 RSP_1576 sopT trxB FALSE 0.079 135.000 0.008 1.000 N NA
 1138605 1138606 RSP_1578 RSP_1579     TRUE 0.947 4.000 0.107 NA   NA
 1138606 1138607 RSP_1579 RSP_1580   lgt TRUE 0.970 -3.000 0.170 NA   NA
 1138608 1138609 RSP_1581 RSP_1582     FALSE 0.005 414.000 0.000 NA   NA
 1138609 1138610 RSP_1582 RSP_1583   cheY3 TRUE 0.934 -3.000 0.056 NA   NA
 1138610 1138611 RSP_1583 RSP_1584 cheY3 cheA2 TRUE 0.982 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 1138611 1138612 RSP_1584 RSP_1585 cheA2 cheW2 TRUE 0.999 -3.000 0.808 0.010 Y NA
 1138612 1138613 RSP_1585 RSP_1586 cheW2 cheW3 TRUE 0.864 124.000 0.130 0.010 Y NA
 1138613 1138614 RSP_1586 RSP_1587 cheW3 cheR2 TRUE 0.994 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 1138614 1138615 RSP_1587 RSP_1588 cheR2 cheB1 TRUE 0.996 3.000 0.672 1.000 Y NA
 1138615 1138616 RSP_1588 RSP_1589 cheB1 tlpC TRUE 0.937 -3.000 0.059 NA   NA
 1138616 1138617 RSP_1589 RSP_1591 tlpC   FALSE 0.387 48.000 0.025 NA   NA
 1138618 1138619 RSP_1590 RSP_6007     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA   NA
 1138619 1138620 RSP_6007 RSP_1592   acsA FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 1138620 1138621 RSP_1592 RSP_1593 acsA   FALSE 0.273 137.000 0.018 0.083 N NA
 1138622 1138623 RSP_1594 RSP_1595 cdd   TRUE 0.991 2.000 0.242 1.000 Y NA
 1138623 1138624 RSP_1595 RSP_1596   deoB TRUE 0.991 0.000 0.875 1.000 N NA
 1138624 1138625 RSP_1596 RSP_1597 deoB add TRUE 0.978 -3.000 0.325 1.000 N NA
 1138625 1138626 RSP_1597 RSP_1598 add   TRUE 0.963 -7.000 0.030 1.000 Y NA
 1138626 1138627 RSP_1598 RSP_6008     FALSE 0.313 67.000 0.021 NA   NA
 1138628 1138629 RSP_6009 RSP_1599     TRUE 0.772 81.000 0.407 NA   NA
 1138631 1138632 RSP_1601 RSP_1602     FALSE 0.026 174.000 0.000 1.000 N NA
 1138632 1138633 RSP_1602 RSP_1604     TRUE 0.972 25.000 0.571 NA Y NA
 1138633 1138634 RSP_1604 RSP_1605     TRUE 0.897 70.000 0.364 NA Y NA
 1138634 1138635 RSP_1605 RSP_1606     TRUE 0.746 24.000 0.130 1.000 N NA
 1138635 1138636 RSP_1606 RSP_1607     TRUE 0.867 113.000 0.087 0.006 Y NA
 1138637 1138638 RSP_1608 RSP_1609     TRUE 0.971 -7.000 0.147 0.046 N NA
 1138638 1138639 RSP_1609 RSP_1610     TRUE 0.994 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 1138639 1138640 RSP_1610 RSP_1611     FALSE 0.426 77.000 0.091 1.000 N NA
 1138640 1138641 RSP_1611 RSP_1612     TRUE 0.991 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 1138641 1138642 RSP_1612 RSP_1613     FALSE 0.036 211.000 0.000 NA   NA
 1138642 1138643 RSP_1613 RSP_1614     TRUE 0.787 104.000 0.588 NA   NA
 1138643 1138644 RSP_1614 RSP_1615     TRUE 0.986 -3.000 0.433 NA   NA
 1138645 1138646 RSP_1616 RSP_4302     FALSE 0.035 213.000 0.000 NA   NA
 1138646 1138647 RSP_4302 RSP_1618     FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 1138650 1138651 RSP_1620 RSP_1621     FALSE 0.023 238.000 0.000 NA   NA
 1138651 1138652 RSP_1621 RSP_1623     TRUE 0.949 -6.000 0.146 NA   NA
 1138653 1138654 RSP_1622 RSP_1624     TRUE 0.880 22.000 0.231 1.000   NA
 1138654 1138655 RSP_1624 RSP_1625     FALSE 0.034 214.000 0.000 NA   NA
 1138655 1138656 RSP_1625 RSP_1626     TRUE 0.895 13.000 0.154 NA   NA
 1138656 1138657 RSP_1626 RSP_1627     FALSE 0.264 54.000 0.000 1.000   NA
 1138658 1138659 RSP_1628 RSP_1629     TRUE 0.895 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1138660 1138661 RSP_1630 RSP_1631     FALSE 0.106 134.000 0.000 NA   NA
 1138661 1138662 RSP_1631 RSP_1632     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1138662 1138663 RSP_1632 RSP_1633     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1138663 1138664 RSP_1633 RSP_1635     FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1138664 1138665 RSP_1635 RSP_1636     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1138665 1138666 RSP_1636 RSP_1637     FALSE 0.217 63.000 0.000 NA   NA
 1138666 1138667 RSP_1637 RSP_1638     FALSE 0.186 84.000 0.000 NA   NA
 1138667 1138668 RSP_1638 RSP_1639     TRUE 0.988 3.000 0.625 NA   NA
 1138668 1138669 RSP_1639 RSP_6012     TRUE 0.893 10.000 0.077 NA   NA
 1138669 1138670 RSP_6012 RSP_6013     TRUE 0.896 4.000 0.038 NA   NA
 1138670 1138671 RSP_6013 RSP_1640     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 1138671 1138672 RSP_1640 RSP_1641     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138672 1138673 RSP_1641 RSP_1643     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138673 1138674 RSP_1643 RSP_1644     TRUE 0.774 5.000 0.000 NA   NA
 1138674 1138675 RSP_1644 RSP_1645     FALSE 0.108 133.000 0.000 NA   NA
 1138677 1138678 RSP_1647 RSP_1648     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138678 1138679 RSP_1648 RSP_1649     FALSE 0.146 114.000 0.000 NA   NA
 1138679 1138680 RSP_1649 RSP_1650     FALSE 0.009 319.000 0.000 NA   NA
 1138680 1138681 RSP_1650 RSP_1651     TRUE 0.959 -13.000 0.264 NA   NA
 1138681 1138682 RSP_1651 RSP_1652     FALSE 0.110 265.000 0.208 NA   NA
 1138682 1138683 RSP_1652 RSP_1653     FALSE 0.322 35.000 0.000 NA   NA
 1138683 1138684 RSP_1653 RSP_1654     FALSE 0.212 65.000 0.000 NA   NA
 1138684 1138685 RSP_1654 RSP_6014     FALSE 0.037 209.000 0.000 NA   NA
 1138685 1138686 RSP_6014 RSP_1655     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1138687 1138688 RSP_6209 RSP_1656     FALSE 0.013 285.000 0.000 NA   NA
 1138688 1138689 RSP_1656 RSP_1657     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138689 1138690 RSP_1657 RSP_1658     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138690 1138691 RSP_1658 RSP_1659     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1138691 1138692 RSP_1659 RSP_1660     FALSE 0.130 123.000 0.000 NA   NA
 1138692 1138693 RSP_1660 RSP_1661     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1138693 1138694 RSP_1661 RSP_6015     FALSE 0.192 76.000 0.000 NA   NA
 1138694 1138695 RSP_6015 RSP_1662     TRUE 0.646 12.000 0.000 1.000   NA
 1138698 1138699 RSP_1664 RSP_1665     TRUE 0.966 -3.000 0.146 NA   NA
 1138699 1138700 RSP_1665 RSP_1666   LytB TRUE 0.831 11.000 0.076 1.000 N NA
 1138700 1138701 RSP_1666 RSP_1667 LytB   FALSE 0.274 151.000 0.091 NA   NA
 1138702 1138703 RSP_1668 RSP_1669 FolK rpoZ FALSE 0.293 85.000 0.049 1.000 N NA
 1138703 1138704 RSP_1669 RSP_1670 rpoZ spoT/relA TRUE 0.944 31.000 0.291 1.000 Y NA
 1138704 1138705 RSP_1670 RSP_1671 spoT/relA   TRUE 0.806 17.000 0.086 NA   NA
 1138705 1138706 RSP_1671 RSP_1672   pdxJ FALSE 0.548 37.000 0.050 NA   NA
 1138706 1138707 RSP_1672 RSP_1673 pdxJ   TRUE 0.833 32.000 0.326 1.000 N NA
 1138707 1138708 RSP_1673 RSP_1674     TRUE 0.675 21.000 0.070 1.000 N NA
 1138708 1138709 RSP_1674 RSP_1675   rnc TRUE 0.915 -3.000 0.062 1.000 N NA
 1138709 1138710 RSP_1675 RSP_1676 rnc era TRUE 0.973 -7.000 0.098 0.050   NA
 1138710 1138711 RSP_1676 RSP_1677 era   TRUE 0.847 22.000 0.182 NA   NA
 1138711 1138712 RSP_1677 RSP_1678     FALSE 0.430 37.000 0.020 NA   NA
 1138713 1138714 RSP_1679 RSP_1680   pckA FALSE 0.001 736.000 0.000 1.000 N NA
 1138715 1138716 RSP_1681 RSP_1682     TRUE 0.982 23.000 0.829 1.000 Y NA
 1138716 1138717 RSP_1682 RSP_1683     TRUE 0.993 -3.000 0.304 0.012   NA
 1138717 1138718 RSP_1683 RSP_1684     TRUE 0.852 22.000 0.194 NA   NA
 1138718 1138719 RSP_1684 RSP_1685     TRUE 0.970 -3.000 0.171 NA   NA
 1138719 1138720 RSP_1685 RSP_1686     TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 1138720 1138721 RSP_1686 RSP_1688     FALSE 0.041 144.000 0.000 1.000 N NA
 1138724 1138725 RSP_1690 RSP_1691 etfA etfB TRUE 0.998 0.000 0.452 0.020 Y NA
 1138725 1138726 RSP_1691 RSP_1692 etfB pduO FALSE 0.224 131.000 0.030 1.000   NA
 1138726 1138727 RSP_1692 RSP_6016 pduO   TRUE 0.966 0.000 0.156 NA   NA
 1138727 1138728 RSP_6016 RSP_1694     FALSE 0.356 168.000 0.231 NA   NA
 1138728 1138729 RSP_1694 RSP_1695     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 1138730 1138731 RSP_1696 RSP_1697     FALSE 0.180 129.000 0.017 NA   NA
 1138731 1138732 RSP_1697 RSP_1707   tufA FALSE 0.235 101.000 0.016 NA   NA
 1138732 1138733 RSP_1707 RSP_1706 tufA   FALSE 0.080 168.000 0.002 1.000   NA
 1138733 1138734 RSP_1706 RSP_4298     FALSE 0.193 75.000 0.000 NA   NA
 1138734 1138735 RSP_4298 RSP_1705     FALSE 0.172 93.000 0.000 NA   NA
 1138735 1138736 RSP_1705 RSP_1704     TRUE 0.620 163.000 0.843 1.000 N NA
 1138736 1138737 RSP_1704 RSP_1703   rplK TRUE 0.795 93.000 0.681 1.000 N NA
 1138737 1138738 RSP_1703 RSP_1702 rplK rplA TRUE 0.998 4.000 0.838 0.020 Y NA
 1138738 1138739 RSP_1702 RSP_1701 rplA rplJ TRUE 0.614 239.000 0.302 0.020 Y NA
 1138739 1138740 RSP_1701 RSP_1700 rplJ rplL TRUE 0.979 70.000 0.884 0.015 Y NA
 1138740 1138741 RSP_1700 RSP_1699 rplL rpoB FALSE 0.154 245.000 0.223 1.000   NA
 1138741 1138742 RSP_1699 RSP_1712 rpoB rpoC TRUE 0.956 82.000 0.851 0.001   NA
 1138742 1138743 RSP_1712 RSP_1711 rpoC   FALSE 0.059 192.000 0.006 NA   NA
 1138743 1138744 RSP_1711 RSP_1710   rpsL FALSE 0.035 213.000 0.000 NA   NA
 1138744 1138745 RSP_1710 RSP_1709 rpsL rpsG TRUE 0.995 13.000 0.620 0.003 Y NA
 1138745 1138746 RSP_1709 RSP_1708 rpsG fusA1 TRUE 0.919 25.000 0.114 1.000 Y NA
 1138746 1138747 RSP_1708 RSP_1714 fusA1 tufA TRUE 0.923 75.000 0.102 0.001 Y NA
 1138747 1138748 RSP_1714 RSP_1715 tufA rpsJ TRUE 0.888 73.000 0.318 1.000 Y NA
 1138748 1138749 RSP_1715 RSP_1716 rpsJ rplC TRUE 0.989 14.000 0.307 0.020 Y NA
 1138749 1138750 RSP_1716 RSP_1717 rplC rplD TRUE 0.996 -10.000 0.486 0.015 Y NA
 1138750 1138751 RSP_1717 RSP_1718 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.015 Y NA
 1138751 1138752 RSP_1718 RSP_1719 rplW rplB TRUE 0.963 123.000 0.849 0.014 Y NA
 1138752 1138753 RSP_1719 RSP_1720 rplB rpsS TRUE 0.998 4.000 0.820 0.020 Y NA
 1138753 1138754 RSP_1720 RSP_1721 rpsS rplV TRUE 0.993 4.000 0.119 0.020 Y NA
 1138754 1138755 RSP_1721 RSP_1722 rplV rpsC TRUE 0.994 0.000 0.109 0.020 Y NA
 1138755 1138756 RSP_1722 RSP_1723 rpsC rplP TRUE 0.995 15.000 0.828 0.020 Y NA
 1138756 1138757 RSP_1723 RSP_1724 rplP rpmC TRUE 0.783 240.000 0.802 0.015 Y NA
 1138757 1138758 RSP_1724 RSP_6017 rpmC rpsQ TRUE 0.995 14.000 0.828 0.015 Y NA
 1138758 1138759 RSP_6017 RSP_1725 rpsQ rplN TRUE 0.974 74.000 0.791 0.020 Y NA
 1138759 1138760 RSP_1725 RSP_1726 rplN rplX TRUE 0.999 0.000 0.810 0.020 Y NA
 1138760 1138761 RSP_1726 RSP_1727 rplX rplE TRUE 0.999 0.000 0.758 0.015 Y NA
 1138761 1138762 RSP_1727 RSP_1728 rplE rpsN TRUE 0.985 20.000 0.309 0.015 Y NA
 1138762 1138763 RSP_1728 RSP_1729 rpsN rpsH TRUE 0.990 13.000 0.295 0.015 Y NA
 1138763 1138764 RSP_1729 RSP_1730 rpsH rplF TRUE 0.997 11.000 0.808 0.015 Y NA
 1138764 1138765 RSP_1730 RSP_1731 rplF rplR TRUE 0.996 12.000 0.815 0.015 Y NA
 1138765 1138766 RSP_1731 RSP_1732 rplR rpsE TRUE 0.996 12.000 0.814 0.020 Y NA
 1138766 1138767 RSP_1732 RSP_1733 rpsE rpmD TRUE 0.995 13.000 0.789 0.020 Y NA
 1138767 1138768 RSP_1733 RSP_1734 rpmD rplO TRUE 0.929 157.000 0.653 0.002 Y NA
 1138768 1138769 RSP_1734 RSP_1735 rplO secY TRUE 0.793 101.000 0.730 1.000 N NA
 1138769 1138770 RSP_1735 RSP_1736 secY adk TRUE 0.682 11.000 0.026 1.000 N NA
 1138770 1138771 RSP_1736 RSP_1737 adk rpsM FALSE 0.041 175.000 0.007 1.000 N NA
 1138771 1138772 RSP_1737 RSP_1738 rpsM rpsK TRUE 0.995 14.000 0.810 0.015 Y NA
 1138772 1138773 RSP_1738 RSP_1739 rpsK rpoA TRUE 0.593 116.000 0.308 1.000 N NA
 1138773 1138774 RSP_1739 RSP_1740 rpoA rplQ TRUE 0.823 101.000 0.873 1.000 N NA
 1138774 1138775 RSP_1740 RSP_1741 rplQ   FALSE 0.007 259.000 0.000 1.000 N NA
 1138775 1138776 RSP_1741 RSP_1742     FALSE 0.227 56.000 0.019 1.000 N NA
 1138776 1138777 RSP_1742 RSP_1743     FALSE 0.446 39.000 0.051 1.000 N NA
 1138777 1138778 RSP_1743 RSP_1744     FALSE 0.308 32.000 0.019 NA N NA
 1138778 1138779 RSP_1744 RSP_1745     TRUE 0.903 -3.000 0.059 NA N NA
 1138779 1138780 RSP_1745 RSP_1746     TRUE 0.813 0.000 0.024 NA N NA
 1138780 1138781 RSP_1746 RSP_1747   bztA FALSE 0.044 227.000 0.048 NA N NA
 1138781 1138782 RSP_1747 RSP_1748 bztA bztB TRUE 0.793 149.000 0.202 0.077 Y NA
 1138782 1138783 RSP_1748 RSP_1749 bztB bztC TRUE 0.999 2.000 0.815 0.011 Y NA
 1138783 1138784 RSP_1749 RSP_1750 bztC bztD TRUE 0.989 13.000 0.734 1.000 Y NA
 1138784 1138785 RSP_1750 RSP_1751 bztD   FALSE 0.016 210.000 0.000 1.000 N NA
 1138785 1138786 RSP_1751 RSP_1752     FALSE 0.004 309.000 0.000 1.000 N NA
 1138786 1138787 RSP_1752 RSP_1753     FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 1138787 1138788 RSP_1753 RSP_1754     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 1138790 1138791 RSP_1756 RSP_1757 panB panC TRUE 0.998 0.000 0.395 0.001 Y NA
 1138793 1138794 RSP_1759 RSP_1760     TRUE 0.975 8.000 0.411 NA   NA
 1138795 1138796 RSP_1761 RSP_1762 pheT   FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 1138796 1138797 RSP_1762 RSP_1763   pheS FALSE 0.361 34.000 0.002 NA   NA
 1138797 1138798 RSP_1763 RSP_1764 pheS rplT FALSE 0.202 205.000 0.000 1.000 Y NA
 1138798 1138799 RSP_1764 RSP_1765 rplT rpmI TRUE 0.958 13.000 0.000 0.015 Y NA
 1138799 1138800 RSP_1765 RSP_1766 rpmI pykA FALSE 0.090 116.000 0.003 1.000 N NA
 1138802 1138803 RSP_1768 RSP_1769     TRUE 0.981 3.000 0.233 0.081 N NA
 1138803 1138804 RSP_1769 RSP_1770     TRUE 0.688 111.000 0.344 NA   NA
 1138807 1138808 RSP_1772 RSP_1773 accA   TRUE 0.740 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1138808 1138809 RSP_1773 RSP_1774     FALSE 0.043 139.000 0.000 1.000 N NA
 1138810 1138811 RSP_1775 RSP_1776   greA TRUE 0.829 11.000 0.048 NA   NA
 1138812 1138813 RSP_1777 RSP_1778     FALSE 0.009 524.000 0.091 1.000 N NA
 1138813 1138814 RSP_1778 RSP_1779   ispE TRUE 0.913 -7.000 0.107 1.000 N NA
 1138814 1138815 RSP_1779 RSP_1780 ispE   FALSE 0.091 142.000 0.000 NA   NA
 1138816 1138817 RSP_1781 RSP_1782     TRUE 0.980 -7.000 0.488 NA   NA
 1138819 1138820 RSP_1784 RSP_1785     FALSE 0.022 373.000 0.000 0.092   NA
 1138821 1138822 RSP_1786 RSP_1787 fruB fruK TRUE 0.991 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 1138822 1138823 RSP_1787 RSP_1788 fruK fruA TRUE 0.996 -3.000 0.562 1.000 Y NA
 1138824 1138825 RSP_1789 RSP_1790     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1138829 1138830 RSP_1795 RSP_1796 serS sodC FALSE 0.096 107.000 0.003 1.000 N NA
 1138831 1138832 RSP_1797 RSP_1798 YajC SecD TRUE 0.941 16.000 0.099 NA Y NA
 1138832 1138833 RSP_1798 RSP_1799 SecD secF TRUE 0.995 10.000 0.244 0.001 Y NA
 1138833 1138834 RSP_1799 RSP_1800 secF   FALSE 0.143 176.000 0.052 NA   NA
 1138834 1138835 RSP_1800 RSP_1801   ccmA FALSE 0.509 68.000 0.085 NA   NA
 1138835 1138836 RSP_1801 RSP_1802 ccmA ccmB TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 1138836 1138837 RSP_1802 RSP_1803 ccmB ccmC TRUE 0.980 49.000 0.501 0.001 Y NA
 1138837 1138838 RSP_1803 RSP_1804 ccmC ccmD TRUE 0.989 -3.000 0.501 1.000   NA
 1138838 1138839 RSP_1804 RSP_1805 ccmD ccmG TRUE 0.939 -7.000 0.108 1.000   NA
 1138842 1138843 RSP_6019 RSP_1808   trpS TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138845 1138846 RSP_1810 RSP_1811 mviN glnD TRUE 0.953 -3.000 0.081 1.000   NA
 1138846 1138847 RSP_1811 RSP_1812 glnD   TRUE 0.773 -16.000 0.043 NA N NA
 1138848 1138849 RSP_1813 RSP_1814     TRUE 0.971 -3.000 0.165 1.000   NA
 1138849 1138850 RSP_1814 RSP_1815   gshB FALSE 0.416 53.000 0.064 1.000 N NA
 1138851 1138852 RSP_1816 RSP_1817     FALSE 0.178 89.000 0.000 NA   NA
 1138852 1138853 RSP_1817 RSP_1818   feoB TRUE 0.979 7.000 0.455 NA   NA
 1138853 1138854 RSP_1818 RSP_1819 feoB feoA1 TRUE 0.992 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 1138854 1138855 RSP_1819 RSP_6020 feoA1 feoA2 TRUE 0.987 7.000 0.049 0.017 Y NA
 1138855 1138856 RSP_6020 RSP_1820 feoA2   FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000   NA
 1138856 1138857 RSP_1820 RSP_1821     FALSE 0.238 184.000 0.143 1.000   NA
 1138862 1138863 RSP_1826 RSP_1827 coxII cox10 TRUE 0.605 71.000 0.064 0.065 N NA
 1138863 1138864 RSP_1827 RSP_6021 cox10   TRUE 0.925 2.000 0.059 NA   NA
 1138864 1138865 RSP_6021 RSP_1828   cox11 TRUE 0.950 -3.000 0.083 NA   NA
 1138865 1138866 RSP_1828 RSP_1829 cox11 coxIII TRUE 0.902 28.000 0.536 1.000 N NA
 1138866 1138867 RSP_1829 RSP_1830 coxIII surf-1 FALSE 0.161 201.000 0.096 NA   NA
 1138867 1138868 RSP_1830 RSP_1831 surf-1 thrC TRUE 0.787 12.000 0.040 NA   NA
 1138868 1138869 RSP_1831 RSP_1832 thrC   TRUE 0.965 -3.000 0.129 1.000   NA
 1138869 1138870 RSP_1832 RSP_1833     TRUE 0.991 0.000 0.674 1.000   NA
 1138870 1138871 RSP_1833 RSP_1834     FALSE 0.022 335.000 0.049 NA   NA
 1138871 1138872 RSP_1834 RSP_1835     TRUE 0.645 33.000 0.070 NA   NA
 1138873 1138874 RSP_1836 RSP_1837 apt   TRUE 0.989 5.000 0.026 0.004 Y NA
 1138874 1138875 RSP_1837 RSP_1838     FALSE 0.016 305.000 0.005 1.000   NA
 1138876 1138877 RSP_1839 RSP_1840     FALSE 0.224 219.000 0.237 NA   NA
 1138878 1138879 RSP_1841 RSP_1842     TRUE 0.858 12.000 0.082 NA   NA
 1138879 1138880 RSP_1842 RSP_1843   ftsY FALSE 0.199 116.000 0.013 NA   NA
 1138882 1138883 RSP_1845 RSP_1846 xseA   FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 1138886 1138887 RSP_1849 RSP_1850   ptsI TRUE 0.631 25.000 0.069 1.000 N NA
 1138887 1138888 RSP_1850 RSP_1851 ptsI metZ FALSE 0.053 159.000 0.007 1.000 N NA
 1138888 1138889 RSP_1851 RSP_1852 metZ   FALSE 0.421 96.000 0.065 1.000   NA
 1138889 1138890 RSP_1852 RSP_1853   TrkH2 FALSE 0.276 51.000 0.000 1.000   NA
 1138890 1138891 RSP_1853 RSP_1854 TrkH2 trkH3 TRUE 0.887 43.000 0.000 0.003 Y NA
 1138893 1138894 RSP_1856 RSP_1857 glyQ   TRUE 0.921 -3.000 0.041 NA   NA
 1138894 1138895 RSP_1857 RSP_1858   glyS TRUE 0.879 4.000 0.028 NA   NA
 1138895 1138896 RSP_1858 RSP_1859 glyS ppdK FALSE 0.169 119.000 0.030 1.000 N NA
 1138896 1138897 RSP_1859 RSP_1860 ppdK   FALSE 0.360 218.000 0.630 1.000 N NA
 1138897 1138898 RSP_1860 RSP_1861     TRUE 0.800 100.000 0.750 1.000 N NA
 1138898 1138899 RSP_1861 RSP_1862     TRUE 0.768 46.000 0.036 1.000 Y NA
 1138899 1138900 RSP_1862 RSP_1863     TRUE 0.973 -3.000 0.260 1.000 N NA
 1138900 1138901 RSP_1863 RSP_1864     FALSE 0.188 99.000 0.003 NA   NA
 1138903 1138904 RSP_1866 RSP_1867     TRUE 0.999 -3.000 0.964 0.022 Y NA
 1138904 1138905 RSP_1867 RSP_1868     FALSE 0.161 178.000 0.098 1.000 N NA
 1138906 1138907 RSP_1869 RSP_6022     FALSE 0.353 52.000 0.021 NA   NA
 1138907 1138908 RSP_6022 RSP_1870     FALSE 0.240 81.000 0.007 NA   NA
 1138910 1138911 RSP_1872 RSP_1873     FALSE 0.041 234.000 0.020 NA   NA
 1138911 1138912 RSP_1873 RSP_1874   carA FALSE 0.188 82.000 0.000 NA   NA
 1138914 1138915 RSP_1876 RSP_1877   coxI TRUE 0.740 14.000 0.036 NA   NA
 1138915 1138916 RSP_1877 RSP_1878 coxI lipB FALSE 0.003 415.000 0.003 1.000 N NA
 1138917 1138918 RSP_1880 RSP_4338     FALSE 0.133 122.000 0.000 NA   NA
 1138918 1138919 RSP_4338 RSP_1882     FALSE 0.012 290.000 0.000 NA   NA
 1138919 1138920 RSP_1882 RSP_1883     TRUE 0.827 55.000 0.108 1.000 Y NA
 1138920 1138921 RSP_1883 RSP_1884     TRUE 0.864 52.000 0.048 0.076 Y NA
 1138921 1138922 RSP_1884 RSP_1886     TRUE 0.943 79.000 0.386 0.076 Y NA
 1138922 1138923 RSP_1886 RSP_1887     FALSE 0.030 180.000 0.002 1.000 N NA
 1138923 1138924 RSP_1887 RSP_1888     FALSE 0.272 75.000 0.008 1.000   NA
 1138925 1138926 RSP_1889 RSP_6024     FALSE 0.431 131.000 0.149 NA   NA
 1138929 1138930 RSP_1892 RSP_1893     TRUE 0.645 89.000 0.294 1.000 N NA
 1138930 1138931 RSP_1893 RSP_1894     FALSE 0.005 439.000 0.000 1.000   NA
 1138931 1138932 RSP_1894 RSP_1895     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 1138934 1138935 RSP_1897 RSP_1898 mgtE   TRUE 0.849 -3.000 0.026 1.000 N NA
 1138936 1138937 RSP_1899 RSP_1900     TRUE 0.950 16.000 0.467 1.000   NA
 1138937 1138938 RSP_1900 RSP_1901     TRUE 0.990 3.000 0.733 1.000   NA
 1138938 1138939 RSP_1901 RSP_1902     TRUE 0.901 38.000 0.200 0.011   NA
 1138939 1138940 RSP_1902 RSP_1903     TRUE 0.963 7.000 0.220 1.000   NA
 1138940 1138941 RSP_1903 RSP_1904     TRUE 0.999 4.000 0.838 0.009 Y NA
 1138941 1138942 RSP_1904 RSP_1905     TRUE 0.996 8.000 0.968 1.000 Y NA
 1138942 1138943 RSP_1905 RSP_1907     TRUE 0.984 21.000 0.833 1.000 Y NA
 1138943 1138944 RSP_1907 RSP_1908     FALSE 0.032 347.000 0.149 1.000 N NA
 1138944 1138945 RSP_1908 RSP_1909     TRUE 0.979 6.000 0.511 1.000 N NA
 1138945 1138946 RSP_1909 RSP_1910     FALSE 0.273 254.000 0.190 NA Y NA
 1138946 1138947 RSP_1910 RSP_6219     FALSE 0.477 70.000 0.074 NA   NA
 1138947 1138948 RSP_6219 RSP_6025     FALSE 0.047 190.000 0.000 NA   NA
 1138950 1138951 RSP_1912 RSP_1913     TRUE 0.781 44.000 0.087 0.080   NA
 1138951 1138952 RSP_1913 RSP_1914     TRUE 0.987 16.000 0.200 0.001 Y NA
 1138953 1138954 RSP_4301 RSP_1915     FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 1138955 1138956 RSP_6026 RSP_1916     TRUE 0.936 -6.000 0.091 1.000   NA
 1138956 1138957 RSP_1916 RSP_1917     TRUE 0.912 -3.000 0.033 NA   NA
 1138958 1138959 RSP_1918 RSP_1919     FALSE 0.438 28.000 0.005 NA   NA
 1138960 1138961 RSP_1920 RSP_1921     TRUE 0.574 51.000 0.080 1.000   NA
 1138963 1138964 RSP_1923 RSP_1924 bioB   TRUE 0.872 -3.000 0.009 NA   NA
 1138964 1138965 RSP_1924 RSP_1925     FALSE 0.230 204.000 0.192 NA   NA
 1138966 1138967 RSP_1926 RSP_1927     FALSE 0.351 81.000 0.031 1.000   NA
 1138968 1138969 RSP_1928 RSP_1929 dnaB pyrE FALSE 0.020 269.000 0.031 1.000 N NA
 1138969 1138970 RSP_1929 RSP_1930 pyrE pyrC TRUE 0.832 43.000 0.072 1.000 Y NA
 1138971 1138972 RSP_1931 RSP_1932     TRUE 0.800 105.000 0.645 NA   NA
 1138972 1138973 RSP_1932 RSP_6241     FALSE 0.314 73.000 0.026 NA   NA
 1138973 1138974 RSP_6241 RSP_1933     FALSE 0.034 215.000 0.000 NA   NA
 1138974 1138975 RSP_1933 RSP_1934     FALSE 0.142 116.000 0.000 NA   NA
 1138975 1138976 RSP_1934 RSP_1935     TRUE 0.878 41.000 0.533 NA   NA
 1138976 1138977 RSP_1935 RSP_1936     TRUE 0.986 0.000 0.447 NA   NA
 1138980 1138981 RSP_1939 RSP_1940     TRUE 0.615 63.000 0.144 NA   NA
 1138981 1138982 RSP_1940 RSP_1941   cysH TRUE 0.965 -3.000 0.139 NA   NA
 1138982 1138983 RSP_1941 RSP_1942 cysH   TRUE 0.557 29.000 0.059 1.000 N NA
 1138983 1138984 RSP_1942 RSP_1943     TRUE 0.953 27.000 0.919 NA   NA
 1138984 1138985 RSP_1943 RSP_1944     TRUE 0.980 -3.000 0.282 NA   NA
 1138987 1138988 RSP_1946 RSP_1947   cbbJ FALSE 0.006 329.000 0.005 1.000 N NA
 1138988 1138989 RSP_1947 RSP_1948 cbbJ   FALSE 0.323 112.000 0.049 NA   NA
 1138989 1138990 RSP_1948 RSP_1949     TRUE 0.669 84.000 0.240 NA   NA
 1138992 1138993 RSP_1951 RSP_1952     TRUE 0.895 34.000 0.500 NA   NA
 1138993 1138994 RSP_1952 RSP_1953     FALSE 0.008 591.000 0.000 0.049 N NA
 1138995 1138996 RSP_1954 RSP_1955     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 1138996 1138997 RSP_1955 RSP_1956     FALSE 0.003 487.000 0.000 NA   NA
 1138998 1138999 RSP_1957 RSP_1958     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138999 1139000 RSP_1958 RSP_1959     FALSE 0.093 140.000 0.000 NA   NA
 1139000 1139001 RSP_1959 RSP_1960     TRUE 0.688 -60.000 0.000 NA   NA
 1139002 1139003 RSP_1961 RSP_1962     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 1139004 1139005 RSP_1963 RSP_1964     FALSE 0.382 28.000 0.000 NA   NA
 1139006 1139007 RSP_1965 RSP_1967     FALSE 0.002 645.000 0.000 NA   NA
 1139011 1139012 RSP_1969 RSP_1970 purM   TRUE 0.969 39.000 0.230 0.002 Y NA
 1139012 1139013 RSP_1970 RSP_1971   rnd FALSE 0.270 97.000 0.049 1.000 N NA
 1139016 1139017 RSP_1974 RSP_1975     TRUE 0.649 61.000 0.168 NA   NA
 1139017 1139018 RSP_1975 RSP_1976   cobT TRUE 0.943 0.000 0.107 1.000 N NA
 1139018 1139019 RSP_1976 RSP_6027 cobT   FALSE 0.335 52.000 0.016 NA   NA
 1139019 1139020 RSP_6027 RSP_6028     TRUE 0.993 2.000 1.000 NA   NA
 1139020 1139021 RSP_6028 RSP_1977   cobS TRUE 0.890 -3.000 0.019 NA   NA
 1139021 1139022 RSP_1977 RSP_1978 cobS   TRUE 0.692 46.000 0.148 1.000   NA
 1139024 1139025 RSP_1980 RSP_1981 glcB   FALSE 0.258 43.000 0.015 1.000 N NA
 1139026 1139027 RSP_1982 RSP_1983   sqdA FALSE 0.167 134.000 0.012 1.000   NA
 1139027 1139028 RSP_1983 RSP_1984 sqdA   FALSE 0.093 188.000 0.024 1.000   NA
 1139029 1139030 RSP_1985 RSP_1986   gatB FALSE 0.083 162.000 0.004 NA   NA
 1139032 1139033 RSP_1988 RSP_1989   valS FALSE 0.232 67.000 0.002 NA   NA
 1139033 1139034 RSP_1989 RSP_1990 valS   FALSE 0.092 119.000 0.004 1.000 N NA
 1139035 1139036 RSP_1991 RSP_1992     FALSE 0.548 79.000 0.120 NA   NA
 1139037 1139038 RSP_1993 RSP_1994   gltA FALSE 0.003 333.000 0.000 NA N NA
 1139038 1139039 RSP_1994 RSP_1995 gltA gltX FALSE 0.426 107.000 0.127 1.000 N NA
 1139041 1139042 RSP_1997 RSP_1998 lexA   TRUE 0.664 57.000 0.232 1.000 N NA
 1139042 1139043 RSP_1998 RSP_2000     TRUE 0.995 -3.000 0.093 0.004 Y NA
 1139043 1139044 RSP_2000 RSP_6214   trpC TRUE 0.945 0.000 0.113 1.000 N NA
 1139044 1139045 RSP_6214 RSP_2001 trpC trpD TRUE 0.944 31.000 0.293 1.000 Y NA
 1139045 1139046 RSP_2001 RSP_2002 trpD trpG TRUE 0.984 -3.000 0.070 1.000 Y NA
 1139048 1139049 RSP_2004 RSP_2005 trpE ybaU TRUE 0.904 11.000 0.106 1.000   NA
 1139052 1139053 RSP_2008 RSP_2009 argD argF TRUE 0.619 114.000 0.038 1.000 Y NA
 1139054 1139055 RSP_2010 RSP_2011     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 1139055 1139056 RSP_2011 RSP_2012     FALSE 0.225 26.000 0.000 1.000 N NA
 1139056 1139057 RSP_2012 RSP_2013     FALSE 0.021 479.000 0.000 1.000 Y NA
 1139057 1139058 RSP_2013 RSP_2014     FALSE 0.357 46.000 0.015 NA   NA
 1139059 1139060 RSP_2015 RSP_2016 argK rpmB FALSE 0.026 214.000 0.008 1.000 N NA
 1139060 1139061 RSP_2016 RSP_6029 rpmB   FALSE 0.046 191.000 0.000 NA   NA
 1139061 1139062 RSP_6029 RSP_2017     TRUE 0.592 30.000 0.045 NA   NA
 1139063 1139064 RSP_2018 RSP_2019     FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 1139064 1139065 RSP_2019 RSP_2020     FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 1139065 1139066 RSP_2020 RSP_2021   shp FALSE 0.541 15.000 0.000 NA   NA
 1139066 1139067 RSP_2021 RSP_2022 shp   TRUE 0.938 4.000 0.000 0.068   NA
 1139067 1139068 RSP_2022 RSP_2023     FALSE 0.047 190.000 0.000 NA   NA
 1139073 1139074 RSP_2028 RSP_2029   ucpA TRUE 0.987 -3.000 0.440 NA   NA
 1139076 1139077 RSP_2032 RSP_2033     FALSE 0.456 21.000 0.000 NA   NA
 1139077 1139078 RSP_2033 RSP_2034     FALSE 0.195 73.000 0.000 NA   NA
 1139078 1139079 RSP_2034 RSP_6030     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1139081 1139082 RSP_2036 RSP_2037     FALSE 0.218 62.000 0.000 NA   NA
 1139082 1139083 RSP_2037 RSP_2038     FALSE 0.004 469.000 0.000 NA   NA
 1139083 1139084 RSP_2038 RSP_2039   linC FALSE 0.079 239.000 0.000 0.079   NA
 1139084 1139085 RSP_2039 RSP_2040 linC   FALSE 0.273 44.000 0.000 NA   NA
 1139085 1139086 RSP_2040 RSP_2041     FALSE 0.139 118.000 0.000 NA   NA
 1139086 1139087 RSP_2041 RSP_2043     FALSE 0.116 130.000 0.000 NA   NA
 1139089 1139090 RSP_2044 RSP_2045     FALSE 0.003 477.000 0.000 NA   NA
 1139090 1139091 RSP_2045 RSP_2046     FALSE 0.461 119.000 0.130 NA   NA
 1139091 1139092 RSP_2046 RSP_2047     TRUE 0.987 -3.000 0.444 NA   NA
 1139092 1139093 RSP_2047 RSP_2048     TRUE 0.982 -7.000 0.500 1.000   NA
 1139094 1139095 RSP_2049 RSP_2050     TRUE 0.895 13.000 0.154 NA   NA
 1139095 1139096 RSP_2050 RSP_2052     FALSE 0.261 55.000 0.000 1.000   NA
 1139098 1139099 RSP_2054 RSP_2055     FALSE 0.099 137.000 0.000 NA   NA
 1139099 1139100 RSP_2055 RSP_2056     FALSE 0.410 25.000 0.000 NA   NA
 1139100 1139101 RSP_2056 RSP_2057     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1139101 1139102 RSP_2057 RSP_2058     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1139102 1139103 RSP_2058 RSP_2059     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1139103 1139104 RSP_2059 RSP_2061     FALSE 0.127 124.000 0.000 NA   NA
 1139104 1139105 RSP_2061 RSP_2062     FALSE 0.103 135.000 0.000 NA   NA
 1139105 1139106 RSP_2062 RSP_2063     TRUE 0.990 -3.000 0.625 NA   NA
 1139106 1139107 RSP_2063 RSP_2064     TRUE 0.893 10.000 0.077 NA   NA
 1139107 1139108 RSP_2064 RSP_2065     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1139108 1139109 RSP_2065 RSP_2066     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1139109 1139110 RSP_2066 RSP_6031     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139110 1139111 RSP_6031 RSP_6032     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139111 1139112 RSP_6032 RSP_2067     FALSE 0.198 71.000 0.000 NA   NA
 1139112 1139113 RSP_2067 RSP_2068     TRUE 0.891 13.000 0.148 NA   NA
 1139113 1139114 RSP_2068 RSP_2069     TRUE 0.964 -3.000 0.138 NA   NA
 1139114 1139115 RSP_2069 RSP_2070     TRUE 0.972 0.000 0.207 NA   NA
 1139115 1139116 RSP_2070 RSP_2071     TRUE 0.975 2.000 0.273 NA   NA
 1139116 1139117 RSP_2071 RSP_2072     FALSE 0.278 43.000 0.000 NA   NA
 1139117 1139118 RSP_2072 RSP_6033     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 1139118 1139119 RSP_6033 RSP_2073     TRUE 0.975 -3.000 0.222 NA   NA
 1139119 1139120 RSP_2073 RSP_2074     FALSE 0.040 204.000 0.000 NA   NA
 1139120 1139121 RSP_2074 RSP_6034     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1139121 1139122 RSP_6034 RSP_6035     FALSE 0.073 158.000 0.000 NA   NA
 1139125 1139126 RSP_2077 RSP_2078     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139126 1139127 RSP_2078 RSP_2079     FALSE 0.130 123.000 0.000 NA   NA
 1139127 1139128 RSP_2079 RSP_6036     FALSE 0.219 76.000 0.000 1.000   NA
 1139128 1139129 RSP_6036 RSP_2080     TRUE 0.844 0.000 0.000 1.000   NA
 1139130 1139131 RSP_4297 RSP_2081     FALSE 0.273 44.000 0.000 NA   NA
 1139131 1139132 RSP_2081 RSP_2082     FALSE 0.023 317.000 0.033 1.000   NA
 1139133 1139134 RSP_2083 RSP_2084 uvrB   FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 1139135 1139136 RSP_2085 RSP_2086     FALSE 0.320 101.000 0.043 NA   NA
 1139137 1139138 RSP_2087 RSP_6220     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 1139139 1139140 RSP_2088 RSP_4344 lepA   FALSE 0.005 408.000 0.000 NA   NA
 1139140 1139141 RSP_4344 RSP_2090   pycA FALSE 0.004 454.000 0.000 NA   NA
 1139143 1139144 RSP_2091 RSP_6037     FALSE 0.002 921.000 0.000 NA   NA
 1139145 1139146 RSP_2093 RSP_2095     FALSE 0.002 901.000 0.000 NA   NA
 1139146 1139147 RSP_2095 RSP_6038     TRUE 0.987 4.000 0.635 NA   NA
 1139147 1139148 RSP_6038 RSP_2097     TRUE 0.946 1.000 0.089 NA   NA
 1139148 1139149 RSP_2097 RSP_2098   ftsI TRUE 0.982 -3.000 0.315 NA   NA
 1139149 1139150 RSP_2098 RSP_2099 ftsI murE TRUE 0.944 15.000 0.091 1.000 Y NA
 1139150 1139151 RSP_2099 RSP_2100 murE murF TRUE 0.970 89.000 0.569 0.002 Y NA
 1139151 1139152 RSP_2100 RSP_2101 murF mraY TRUE 0.992 13.000 0.309 0.004 Y NA
 1139152 1139153 RSP_2101 RSP_2102 mraY   FALSE 0.186 97.000 0.002 NA   NA
 1139153 1139154 RSP_2102 RSP_2103   murD FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 1139154 1139155 RSP_2103 RSP_2104 murD   FALSE 0.283 57.000 0.002 1.000   NA
 1139157 1139158 RSP_2106 RSP_2107 ftsW murG TRUE 0.882 2.000 0.050 1.000 N NA
 1139158 1139159 RSP_2107 RSP_2108 murG murC TRUE 0.978 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 1139159 1139160 RSP_2108 RSP_2109 murC   TRUE 0.611 14.000 0.004 NA   NA
 1139160 1139161 RSP_2109 RSP_2110   murB TRUE 0.867 -3.000 0.007 NA   NA
 1139161 1139162 RSP_2110 RSP_2111 murB ddlA TRUE 0.952 40.000 0.135 0.004 Y NA
 1139162 1139163 RSP_2111 RSP_2112 ddlA ftsQ TRUE 0.989 -12.000 0.372 NA Y NA
 1139163 1139164 RSP_2112 RSP_2113 ftsQ ftsA TRUE 0.950 -3.000 0.137 NA N NA
 1139164 1139165 RSP_2113 RSP_2114 ftsA ftsZ1 FALSE 0.468 180.000 0.114 1.000 Y NA
 1139165 1139166 RSP_2114 RSP_2115 ftsZ1 envA FALSE 0.106 228.000 0.134 1.000 N NA
 1139166 1139167 RSP_2115 RSP_2117 envA comL FALSE 0.373 115.000 0.064 1.000   NA
 1139167 1139168 RSP_2117 RSP_2118 comL recN TRUE 0.772 28.000 0.117 1.000   NA
 1139169 1139170 RSP_2119 RSP_2120     TRUE 0.963 -3.000 0.130 NA   NA
 1139170 1139171 RSP_2120 RSP_2121     FALSE 0.242 136.000 0.053 NA   NA
 1139171 1139172 RSP_2121 RSP_2122   mtbC FALSE 0.382 205.000 0.436 NA   NA
 1139174 1139175 RSP_2124 RSP_2125     FALSE 0.220 212.000 0.205 NA   NA
 1139176 1139177 RSP_2126 RSP_2127 purC purS TRUE 0.981 15.000 0.460 1.000 Y NA
 1139177 1139178 RSP_2127 RSP_2128 purS purQ TRUE 0.822 232.000 0.656 0.001 Y NA
 1139178 1139179 RSP_2128 RSP_2129 purQ   FALSE 0.359 48.000 0.043 1.000 N NA
 1139179 1139180 RSP_2129 RSP_2130     TRUE 0.995 10.000 0.964 1.000 Y NA
 1139180 1139181 RSP_2130 RSP_2131   rne FALSE 0.001 507.000 0.000 1.000 N NA
 1139183 1139184 RSP_2134 RSP_2136 ccdA   TRUE 0.911 29.000 0.474 1.000   NA
 1139185 1139186 RSP_2135 RSP_2137     TRUE 0.986 -3.000 0.425 NA   NA
 1139186 1139187 RSP_2137 RSP_2138   fumC TRUE 0.908 0.000 0.033 NA   NA
 1139187 1139188 RSP_2138 RSP_2139 fumC   FALSE 0.162 167.000 0.054 NA   NA
 1139188 1139189 RSP_2139 RSP_2140     FALSE 0.232 103.000 0.016 NA   NA
 1139189 1139190 RSP_2140 RSP_4341   ssrA FALSE 0.282 42.000 0.000 NA   NA
 1139190 1139191 RSP_4341 RSP_2141 ssrA   FALSE 0.003 564.000 0.000 NA   NA
 1139192 1139193 RSP_2142 RSP_2143     FALSE 0.098 152.000 0.029 1.000 N NA
 1139193 1139194 RSP_2143 RSP_2144   cfaS FALSE 0.440 34.000 0.041 1.000 N NA
 1139194 1139195 RSP_2144 RSP_2145 cfaS trgA TRUE 0.909 26.000 0.435 NA   NA
 1139195 1139196 RSP_2145 RSP_2146 trgA trgB TRUE 0.962 0.000 0.132 NA   NA
 1139196 1139197 RSP_2146 RSP_2147 trgB cysK FALSE 0.044 333.000 0.114 1.000   NA
 1139197 1139198 RSP_2147 RSP_2148 cysK   TRUE 0.928 4.000 0.114 NA N NA
 1139198 1139199 RSP_2148 RSP_2149     TRUE 0.967 0.000 0.159 NA   NA
 1139200 1139201 RSP_2150 RSP_2151   yohD TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139201 1139202 RSP_2151 RSP_2152 yohD   TRUE 0.897 -3.000 0.023 NA   NA
 1139202 1139203 RSP_2152 RSP_2153     TRUE 0.887 0.000 0.013 1.000   NA
 1139203 1139204 RSP_2153 RSP_2154     FALSE 0.106 134.000 0.000 NA   NA
 1139204 1139205 RSP_2154 RSP_2155   hisD TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1139205 1139206 RSP_2155 RSP_2156 hisD   TRUE 0.955 10.000 0.038 1.000 Y NA
 1139206 1139207 RSP_2156 RSP_2157     TRUE 0.996 -3.000 0.300 0.073 Y NA
 1139207 1139208 RSP_2157 RSP_2158     FALSE 0.155 560.000 0.385 0.073 Y NA
 1139208 1139209 RSP_2158 RSP_2159     TRUE 0.969 20.000 0.154 0.073 Y NA
 1139209 1139210 RSP_2159 RSP_2160   gno FALSE 0.093 77.000 0.000 1.000 N NA
 1139210 1139211 RSP_2160 RSP_2161 gno bcrC FALSE 0.050 196.000 0.000 1.000   NA
 1139212 1139213 RSP_2163 RSP_4345     FALSE 0.234 54.000 0.000 NA   NA
 1139215 1139216 RSP_2166 RSP_2167 putA   TRUE 0.903 31.000 0.459 1.000   NA
 1139216 1139217 RSP_2167 RSP_2168     TRUE 0.969 -3.000 0.151 1.000   NA
 1139218 1139219 RSP_2169 RSP_2170 suhB   FALSE 0.069 132.000 0.003 1.000 N NA
 1139219 1139220 RSP_2170 RSP_2171   metR FALSE 0.101 128.000 0.012 1.000 N NA
 1139222 1139223 RSP_2173 RSP_2174     TRUE 0.908 14.000 0.211 NA   NA
 1139223 1139224 RSP_2174 RSP_2175     TRUE 0.993 -25.000 0.729 1.000 Y NA
 1139224 1139225 RSP_2175 RSP_2176C   gabT FALSE 0.013 303.000 0.000 1.000   NA
 1139225 1139226 RSP_2176C RSP_2176N gabT gabT TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.001   NA
 1139227 1139228 RSP_2177 RSP_2178   topA FALSE 0.339 248.000 0.238 1.000 Y NA
 1139229 1139230 RSP_2179 RSP_2180 proV proW TRUE 0.997 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 1139230 1139231 RSP_2180 RSP_2181 proW proX TRUE 0.939 105.000 0.469 0.073 Y NA
 1139232 1139233 RSP_2182 RSP_2183 betI betB TRUE 0.984 -3.000 0.459 1.000 N NA
 1139233 1139234 RSP_2183 RSP_2184 betB betA TRUE 0.974 10.000 0.634 1.000 N NA
 1139234 1139235 RSP_2184 RSP_2185 betA   FALSE 0.164 79.000 0.012 1.000 N NA
 1139236 1139237 RSP_2186 RSP_2187     TRUE 0.800 62.000 0.377 1.000   NA
 1139237 1139238 RSP_2187 RSP_2188     FALSE 0.415 37.000 0.016 NA   NA
 1139239 1139240 RSP_2189 RSP_6040 pccB   FALSE 0.181 152.000 0.044 NA   NA
 1139240 1139241 RSP_6040 RSP_2190     FALSE 0.028 422.000 0.161 NA   NA
 1139241 1139242 RSP_2190 RSP_6221     FALSE 0.010 315.000 0.000 NA   NA
 1139242 1139243 RSP_6221 RSP_2191   pccA FALSE 0.238 96.000 0.014 NA   NA
 1139245 1139246 RSP_2192 RSP_2193 mcmA gcvT FALSE 0.001 564.000 0.000 1.000 N NA
 1139246 1139247 RSP_2193 RSP_2194 gcvT gcvH TRUE 0.994 9.000 0.202 0.002 Y NA
 1139247 1139248 RSP_2194 RSP_2195 gcvH gcvP TRUE 0.985 4.000 0.130 1.000 Y NA
 1139249 1139250 RSP_2196 RSP_2197     TRUE 0.879 15.000 0.000 1.000 Y NA
 1139250 1139251 RSP_2197 RSP_2198     FALSE 0.331 71.000 0.022 1.000   NA
 1139251 1139252 RSP_2198 RSP_2199     TRUE 0.565 27.000 0.023 1.000   NA
 1139252 1139253 RSP_2199 RSP_2200     TRUE 0.884 19.000 0.287 1.000 N NA
 1139253 1139254 RSP_2200 RSP_2201     TRUE 0.913 122.000 0.250 0.007 Y NA
 1139255 1139256 RSP_2202 RSP_2203     TRUE 0.997 -3.000 0.845 NA Y NA
 1139256 1139257 RSP_2203 RSP_2204     TRUE 0.884 -7.000 0.082 NA N NA
 1139258 1139259 RSP_2205 RSP_2206     TRUE 0.990 -3.000 0.632 NA   NA
 1139259 1139260 RSP_2206 RSP_2207   deoD FALSE 0.423 86.000 0.057 1.000   NA
 1139260 1139261 RSP_2207 RSP_2208 deoD   TRUE 0.886 2.000 0.021 1.000   NA
 1139261 1139262 RSP_2208 RSP_2209     TRUE 0.996 -3.000 0.720 0.073   NA
 1139262 1139263 RSP_2209 RSP_2210     TRUE 0.972 0.000 0.184 1.000   NA
 1139263 1139264 RSP_2210 RSP_2211     TRUE 0.989 1.000 0.586 1.000   NA
 1139264 1139265 RSP_2211 RSP_2212   rimI FALSE 0.174 154.000 0.038 1.000   NA
 1139265 1139266 RSP_2212 RSP_2213 rimI   TRUE 0.976 -3.000 0.209 1.000   NA
 1139266 1139267 RSP_2213 RSP_2214     TRUE 0.968 -10.000 0.061 1.000 Y NA
 1139267 1139268 RSP_2214 RSP_2215     FALSE 0.381 147.000 0.151 1.000   NA
 1139268 1139269 RSP_2215 RSP_2216   ilvE FALSE 0.456 110.000 0.093 1.000   NA
 1139269 1139270 RSP_2216 RSP_2217 ilvE   TRUE 0.572 71.000 0.115 1.000   NA
 1139272 1139273 RSP_2219 RSP_2220     FALSE 0.066 299.000 0.214 1.000 N NA
 1139273 1139274 RSP_2220 RSP_6042     FALSE 0.504 60.000 0.071 NA   NA
 1139274 1139275 RSP_6042 RSP_2221   purB FALSE 0.136 127.000 0.002 NA   NA
 1139275 1139276 RSP_2221 RSP_2222 purB   FALSE 0.172 108.000 0.002 NA   NA
 1139276 1139277 RSP_2222 RSP_2223     FALSE 0.280 98.000 0.029 NA   NA
 1139277 1139278 RSP_2223 RSP_2224     TRUE 0.977 4.000 0.442 NA N NA
 1139280 1139281 RSP_2226 RSP_2227 glgX glgC TRUE 0.991 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1139281 1139282 RSP_2227 RSP_2228 glgC   FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000   NA
 1139283 1139284 RSP_2229 RSP_2230     TRUE 0.729 20.000 0.051 1.000   NA
 1139284 1139285 RSP_2230 RSP_2231     FALSE 0.028 227.000 0.000 NA   NA
 1139286 1139287 RSP_2232 RSP_2234     TRUE 0.932 33.000 0.748 1.000   NA
 1139287 1139288 RSP_2234 RSP_2235     FALSE 0.265 83.000 0.008 1.000   NA
 1139289 1139290 RSP_2236 RSP_2237     TRUE 0.983 -3.000 0.441 1.000 N NA
 1139290 1139291 RSP_2237 RSP_2238     TRUE 0.969 14.000 0.700 1.000   NA
 1139293 1139294 RSP_2239 RSP_2240     FALSE 0.056 189.000 0.003 NA   NA
 1139295 1139296 RSP_2241 RSP_2242 hisI hisF TRUE 0.995 -3.000 0.105 0.003 Y NA
 1139296 1139297 RSP_2242 RSP_2243 hisF hisA TRUE 0.930 135.000 0.433 0.003 Y NA
 1139299 1139300 RSP_2245 RSP_2246 hisH hisB TRUE 0.993 0.000 0.049 0.003 Y NA
 1139302 1139303 RSP_2249 RSP_2250     TRUE 0.745 31.000 0.125 NA   NA
 1139303 1139304 RSP_2250 RSP_2251     TRUE 0.938 -7.000 0.120 NA   NA
 1139304 1139305 RSP_2251 RSP_2252     FALSE 0.136 228.000 0.122 1.000   NA
 1139305 1139306 RSP_2252 RSP_2253     TRUE 0.982 -3.000 0.311 NA   NA
 1139307 1139308 RSP_2254 RSP_2255     FALSE 0.289 106.000 0.060 1.000 N NA
 1139309 1139310 RSP_2256 RSP_2257 dtd   TRUE 0.798 0.000 0.013 1.000 N NA
 1139310 1139311 RSP_2257 RSP_2258   purC FALSE 0.443 14.000 0.004 1.000 N NA
 1139311 1139312 RSP_2258 RSP_2259 purC   FALSE 0.271 67.000 0.004 1.000   NA
 1139312 1139313 RSP_2259 RSP_2260   ydjG TRUE 0.842 5.000 0.008 1.000   NA
 1139313 1139314 RSP_2260 RSP_2261 ydjG ydjI TRUE 0.963 2.000 0.167 NA   NA
 1139314 1139315 RSP_2261 RSP_2262 ydjI   FALSE 0.050 181.000 0.000 NA   NA
 1139315 1139316 RSP_2262 RSP_2263     TRUE 0.801 16.000 0.074 NA   NA
 1139316 1139317 RSP_2263 RSP_2264   telA TRUE 0.916 13.000 0.214 NA   NA
 1139317 1139318 RSP_2264 RSP_2265 telA   FALSE 0.399 149.000 0.198 NA   NA
 1139318 1139319 RSP_2265 RSP_2266   rluB FALSE 0.133 185.000 0.059 NA   NA
 1139322 1139323 RSP_6222 RSP_6043   gatC FALSE 0.380 44.000 0.010 1.000   NA
 1139323 1139324 RSP_6043 RSP_2270 gatC gatA TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.002 Y NA
 1139324 1139325 RSP_2270 RSP_2271 gatA   TRUE 0.809 -52.000 0.027 NA   NA
 1139325 1139326 RSP_2271 RSP_2272   ampD TRUE 0.969 4.000 0.226 NA   NA
 1139326 1139327 RSP_2272 RSP_4342 ampD rnpB FALSE 0.267 45.000 0.000 NA   NA
 1139328 1139329 RSP_2273 RSP_2274     TRUE 0.985 -3.000 0.479 1.000 N NA
 1139329 1139330 RSP_2274 RSP_2275     TRUE 0.904 87.000 0.464 NA Y NA
 1139330 1139331 RSP_2275 RSP_2276     TRUE 0.940 61.000 0.651 NA Y NA
 1139331 1139332 RSP_2276 RSP_2277     TRUE 0.997 4.000 0.556 0.072 Y NA
 1139332 1139333 RSP_2277 RSP_2278     TRUE 0.826 135.000 0.421 1.000 Y NA
 1139333 1139334 RSP_2278 RSP_2279     FALSE 0.140 289.000 0.474 1.000 N NA
 1139335 1139336 RSP_2280 RSP_2281     TRUE 0.999 -3.000 0.889 0.020 Y NA
 1139338 1139339 RSP_2283 RSP_2284 rpsD   FALSE 0.015 244.000 0.007 1.000 N NA
 1139339 1139340 RSP_2284 RSP_6215     TRUE 0.990 0.000 0.198 1.000 Y NA
 1139340 1139341 RSP_6215 RSP_2285     TRUE 0.879 6.000 0.038 NA   NA
 1139343 1139344 RSP_2287 RSP_2288     TRUE 0.683 74.000 0.243 NA   NA
 1139344 1139345 RSP_2288 RSP_2289     TRUE 0.926 4.000 0.068 NA   NA
 1139345 1139346 RSP_2289 RSP_2291     FALSE 0.010 332.000 0.000 1.000   NA
 1139347 1139348 RSP_2292 RSP_2293   clpA FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 1139348 1139349 RSP_2293 RSP_2294 clpA gloB FALSE 0.152 167.000 0.041 1.000   NA
 1139350 1139351 RSP_2295 RSP_2296   atpH FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 1139351 1139352 RSP_2296 RSP_2297 atpH atpA TRUE 0.999 1.000 0.864 0.005 Y NA
 1139352 1139353 RSP_2297 RSP_2298 atpA atpG TRUE 0.993 23.000 0.846 0.005 Y NA
 1139353 1139354 RSP_2298 RSP_2299 atpG atpD TRUE 0.994 18.000 0.724 0.005 Y NA
 1139354 1139355 RSP_2299 RSP_2300 atpD atpC TRUE 0.998 10.000 0.837 0.005 Y NA
 1139356 1139357 RSP_2301 RSP_2302 prsA   FALSE 0.466 132.000 0.007 1.000 Y NA
 1139357 1139358 RSP_2302 RSP_2303     TRUE 0.948 0.000 0.082 NA   NA
 1139358 1139359 RSP_2303 RSP_2304   ribF FALSE 0.505 40.000 0.044 NA   NA
 1139359 1139360 RSP_2304 RSP_2305 ribF   FALSE 0.511 28.000 0.044 1.000 N NA
 1139360 1139361 RSP_2305 RSP_2306     FALSE 0.274 226.000 0.216 0.077 N NA
 1139361 1139362 RSP_2306 RSP_2307     FALSE 0.093 151.000 0.025 1.000 N NA
 1139365 1139366 RSP_2310 RSP_2311 groES groEL TRUE 0.924 96.000 0.209 0.006 Y NA
 1139368 1139369 RSP_2313 RSP_2314     FALSE 0.010 328.000 0.000 1.000   NA
 1139369 1139370 RSP_2314 RSP_2315     TRUE 0.718 91.000 0.333 NA   NA
 1139371 1139372 RSP_2316 RSP_2317 dadA   FALSE 0.304 47.000 0.029 1.000 N NA
 1139372 1139373 RSP_2317 RSP_2318     TRUE 0.998 -3.000 0.706 0.043 Y NA
 1139373 1139374 RSP_2318 RSP_2319   glnA TRUE 0.935 13.000 0.361 1.000 N NA
 1139374 1139375 RSP_2319 RSP_2320 glnA   TRUE 0.662 76.000 0.289 1.000 N NA
 1139375 1139376 RSP_2320 RSP_2321     TRUE 0.959 57.000 0.938 NA Y NA
 1139376 1139377 RSP_2321 RSP_2322     TRUE 0.997 0.000 0.865 NA Y NA
 1139377 1139378 RSP_2322 RSP_2323     TRUE 0.939 5.000 0.162 NA N NA
 1139380 1139381 RSP_2325 RSP_2326 rodA pbpA TRUE 0.898 8.000 0.094 1.000 N NA
 1139381 1139382 RSP_2326 RSP_2327 pbpA   TRUE 0.984 -3.000 0.351 NA   NA
 1139382 1139383 RSP_2327 RSP_2328   mreC TRUE 0.865 -7.000 0.034 NA   NA
 1139383 1139384 RSP_2328 RSP_2329 mreC mreB TRUE 0.903 34.000 0.689 1.000 N NA
 1139393 1139394 RSP_2336 RSP_2337     FALSE 0.422 75.000 0.059 NA   NA
 1139394 1139395 RSP_2337 RSP_2338     TRUE 0.762 86.000 0.400 NA   NA
 1139396 1139397 RSP_2339 RSP_2340     FALSE 0.214 64.000 0.000 NA   NA
 1139397 1139398 RSP_2340 RSP_2341     FALSE 0.043 162.000 0.004 1.000 N NA
 1139398 1139399 RSP_2341 RSP_2342   gpt TRUE 0.614 29.000 0.076 1.000 N NA
 1139399 1139400 RSP_2342 RSP_2343 gpt   TRUE 0.802 10.000 0.048 1.000 N NA
 1139400 1139401 RSP_2343 RSP_2344   fabI1 TRUE 0.960 2.000 0.207 1.000 N NA
 1139402 1139403 RSP_2345 RSP_2346 pdxH   FALSE 0.222 117.000 0.046 1.000 N NA
 1139403 1139404 RSP_2346 RSP_2347     TRUE 0.908 15.000 0.226 NA   NA
 1139404 1139405 RSP_2347 RSP_4313     FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 1139406 1139407 RSP_2348 RSP_6223     FALSE 0.122 127.000 0.000 NA   NA
 1139407 1139408 RSP_6223 RSP_2349     FALSE 0.116 130.000 0.000 NA   NA
 1139408 1139409 RSP_2349 RSP_2350     FALSE 0.193 75.000 0.000 NA   NA
 1139409 1139410 RSP_2350 RSP_2351     FALSE 0.002 717.000 0.000 NA   NA
 1139410 1139411 RSP_2351 RSP_2352     TRUE 0.943 13.000 0.333 NA   NA
 1139411 1139412 RSP_2352 RSP_2353     TRUE 0.660 78.000 0.222 NA   NA
 1139412 1139413 RSP_2353 RSP_6046     TRUE 0.987 -3.000 0.444 NA   NA
 1139413 1139414 RSP_6046 RSP_6047     TRUE 0.991 3.000 0.818 NA   NA
 1139414 1139415 RSP_6047 RSP_2354     TRUE 0.972 -7.000 0.333 NA   NA
 1139417 1139418 RSP_2355 RSP_2357     TRUE 0.989 3.000 0.714 NA   NA
 1139418 1139419 RSP_2357 RSP_2358     TRUE 0.979 0.000 0.286 NA   NA
 1139419 1139420 RSP_2358 RSP_2359     FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 1139420 1139421 RSP_2359 RSP_2360     TRUE 0.980 -3.000 0.286 NA   NA
 1139421 1139422 RSP_2360 RSP_2361     TRUE 0.686 75.000 0.250 NA   NA
 1139423 1139424 RSP_2362 RSP_2363     FALSE 0.020 194.000 0.000 1.000 N NA
 1139424 1139425 RSP_2363 RSP_2364   fucA TRUE 0.598 5.000 0.000 1.000 N NA
 1139425 1139426 RSP_2364 RSP_2365 fucA   TRUE 0.604 66.000 0.000 NA Y NA
 1139426 1139427 RSP_2365 RSP_2366     FALSE 0.541 184.000 0.222 NA Y NA
 1139427 1139428 RSP_2366 RSP_2368     TRUE 0.963 7.000 0.222 1.000   NA
 1139428 1139429 RSP_2368 RSP_2367     TRUE 0.996 4.000 1.000 0.071   NA
 1139429 1139430 RSP_2367 RSP_2370     TRUE 0.936 16.000 0.087 NA Y NA
 1139430 1139431 RSP_2370 RSP_2371     TRUE 0.873 11.000 0.130 NA N NA
 1139431 1139432 RSP_2371 RSP_2372     FALSE 0.045 254.000 0.000 0.076 N NA
 1139432 1139433 RSP_2372 RSP_2373     TRUE 0.678 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1139433 1139434 RSP_2373 RSP_2374     FALSE 0.025 233.000 0.000 NA   NA
 1139434 1139435 RSP_2374 RSP_2375     FALSE 0.224 87.000 0.006 NA   NA
 1139435 1139436 RSP_2375 RSP_2376   kbl FALSE 0.322 45.000 0.006 NA   NA
 1139436 1139437 RSP_2376 RSP_2377 kbl tdh TRUE 0.986 0.000 0.547 1.000 N NA
 1139438 1139439 RSP_2378 RSP_2379 cypC   FALSE 0.280 111.000 0.034 NA   NA
 1139439 1139440 RSP_2379 RSP_2380   catC FALSE 0.475 36.000 0.029 NA   NA
 1139440 1139441 RSP_2380 RSP_6048 catC   FALSE 0.204 122.000 0.019 NA   NA
 1139442 1139443 RSP_2381 RSP_6049     FALSE 0.195 73.000 0.000 NA   NA
 1139444 1139445 RSP_2382 RSP_2383     TRUE 0.975 0.000 0.231 NA   NA
 1139445 1139446 RSP_2383 RSP_6050     TRUE 0.902 -13.000 0.077 NA   NA
 1139450 1139451 RSP_2386 RSP_2387     FALSE 0.177 112.000 0.004 NA   NA
 1139451 1139452 RSP_2387 RSP_2388     FALSE 0.306 72.000 0.023 NA   NA
 1139453 1139454 RSP_2389 RSP_2390   acuC1 FALSE 0.415 29.000 0.033 NA N NA
 1139454 1139455 RSP_2390 RSP_2391 acuC1   TRUE 0.709 -3.000 0.005 NA N NA
 1139456 1139457 RSP_2392 RSP_2394   kdtA FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 1139459 1139460 RSP_2396 RSP_2397     FALSE 0.012 292.000 0.000 NA   NA
 1139460 1139461 RSP_2397 RSP_2398     TRUE 0.987 28.000 0.769 0.071 Y NA
 1139461 1139462 RSP_2398 RSP_2399     TRUE 0.998 -7.000 0.909 0.071 Y NA
 1139462 1139463 RSP_2399 RSP_2400     TRUE 0.993 2.000 0.364 1.000 Y NA
 1139463 1139464 RSP_2400 RSP_2401     FALSE 0.085 91.000 0.000 1.000 N NA
 1139465 1139466 RSP_2402 RSP_2403     TRUE 0.926 -13.000 0.172 1.000 N NA
 1139466 1139467 RSP_2403 RSP_2404     TRUE 0.997 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 1139467 1139468 RSP_2404 RSP_2405     TRUE 0.997 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 1139468 1139469 RSP_2405 RSP_2406     TRUE 0.983 -3.000 0.308 1.000   NA
 1139470 1139471 RSP_2407 RSP_2408     TRUE 0.633 44.000 0.100 NA   NA
 1139472 1139473 RSP_2409 RSP_2410 rluD rpoH1 FALSE 0.115 161.000 0.046 1.000 N NA
 1139474 1139475 RSP_2411 RSP_2412   pepF FALSE 0.137 85.000 0.006 1.000 N NA
 1139475 1139476 RSP_2412 RSP_2413 pepF lig2 FALSE 0.078 172.000 0.032 1.000 N NA
 1139476 1139477 RSP_2413 RSP_2414 lig2   TRUE 0.990 -3.000 0.751 1.000 N NA
 1139478 1139479 RSP_2415 RSP_2416     TRUE 0.986 8.000 0.805 NA   NA
 1139479 1139480 RSP_2416 RSP_2417     TRUE 0.984 -3.000 0.365 NA   NA
 1139480 1139481 RSP_2417 RSP_2420     TRUE 0.847 32.000 0.383 NA N NA
 1139482 1139483 RSP_2418 RSP_2419 pldB   TRUE 0.898 -3.000 0.016 1.000   NA
 1139484 1139485 RSP_2421 RSP_2422   mgpS FALSE 0.211 85.000 0.000 1.000   NA
 1139485 1139486 RSP_2422 RSP_2423 mgpS   TRUE 0.791 6.000 0.000 1.000   NA
 1139486 1139487 RSP_2423 RSP_2424     FALSE 0.360 55.000 0.050 1.000 N NA
 1139487 1139488 RSP_2424 RSP_2425     FALSE 0.006 280.000 0.000 1.000 N NA
 1139491 1139492 RSP_2429 RSP_6052     TRUE 0.669 115.000 0.333 NA   NA
 1139494 1139495 RSP_2431 RSP_2432     FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 1139495 1139496 RSP_2432 RSP_2433   cheY2 TRUE 0.964 -3.000 0.133 NA   NA
 1139496 1139497 RSP_2433 RSP_2434 cheY2 cheR1 TRUE 0.969 -22.000 0.078 1.000 Y NA
 1139497 1139498 RSP_2434 RSP_2435 cheR1 cheW1 TRUE 0.988 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 1139498 1139499 RSP_2435 RSP_2436 cheW1 cheA1 TRUE 0.995 2.000 0.178 0.009 Y NA
 1139499 1139500 RSP_2436 RSP_2437 cheA1 cheY1 TRUE 0.994 8.000 0.711 1.000 Y NA
 1139500 1139501 RSP_2437 RSP_2438 cheY1 cheX TRUE 0.980 -9.000 0.525 NA   NA
 1139501 1139502 RSP_2438 RSP_2439 cheX cheD TRUE 0.920 -3.000 0.040 NA   NA
 1139502 1139503 RSP_2439 RSP_2440 cheD mcpA TRUE 0.592 123.000 0.040 1.000 Y NA
 1139503 1139504 RSP_2440 RSP_2441 mcpA tlpS FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 1139504 1139505 RSP_2441 RSP_2442 tlpS mcpB TRUE 0.865 104.000 1.000 NA   NA
 1139505 1139506 RSP_2442 RSP_2443 mcpB cheY5 TRUE 0.708 89.000 0.056 1.000 Y NA
 1139506 1139507 RSP_2443 RSP_2444 cheY5   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139508 1139509 RSP_2445 RSP_2446     TRUE 0.998 -3.000 0.544 0.005 Y NA
 1139509 1139510 RSP_2446 RSP_2448   glgB1 TRUE 0.991 -3.000 0.022 0.005 Y NA
 1139510 1139511 RSP_2448 RSP_2449 glgB1   TRUE 0.996 -3.000 0.121 0.003 Y NA
 1139511 1139512 RSP_2449 RSP_2450     TRUE 0.992 -3.000 0.027 0.003 Y NA
 1139512 1139513 RSP_2450 RSP_2451     TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.005 Y NA
 1139513 1139514 RSP_2451 RSP_2452     TRUE 0.996 -3.000 0.141 0.005 Y NA
 1139515 1139516 RSP_2453 RSP_2454   purF FALSE 0.435 120.000 0.100 1.000   NA
 1139516 1139517 RSP_2454 RSP_2455 purF   FALSE 0.532 85.000 0.101 1.000   NA
 1139517 1139518 RSP_2455 RSP_2456   radA TRUE 0.814 19.000 0.094 1.000   NA
 1139518 1139519 RSP_2456 RSP_2457 radA   FALSE 0.147 133.000 0.010 NA   NA
 1139519 1139520 RSP_2457 RSP_2458     TRUE 0.932 1.000 0.065 NA   NA
 1139520 1139521 RSP_2458 RSP_2459     TRUE 0.990 -3.000 0.178 1.000 Y NA
 1139521 1139522 RSP_2459 RSP_2460   alr TRUE 0.929 -3.000 0.077 1.000 N NA
 1139523 1139524 RSP_2461 RSP_2463 fabG acpP TRUE 0.829 179.000 0.321 0.004 Y NA
 1139524 1139525 RSP_2463 RSP_2464 acpP fabF FALSE 0.049 497.000 0.106 1.000 Y NA
 1139525 1139526 RSP_2464 RSP_2465 fabF   TRUE 0.964 -3.000 0.134 NA   NA
 1139526 1139527 RSP_2465 RSP_2466     FALSE 0.199 110.000 0.009 NA   NA
 1139527 1139528 RSP_2466 RSP_2467     TRUE 0.870 47.000 0.571 NA   NA
 1139528 1139529 RSP_2467 RSP_2468     TRUE 0.683 73.000 0.242 NA   NA
 1139529 1139530 RSP_2468 RSP_2469     TRUE 0.973 2.000 0.242 NA   NA
 1139530 1139531 RSP_2469 RSP_2470     TRUE 0.987 5.000 0.688 NA   NA
 1139531 1139532 RSP_2470 RSP_2471     TRUE 0.838 66.000 0.578 NA   NA
 1139532 1139533 RSP_2471 RSP_2472     TRUE 0.804 95.000 0.600 NA   NA
 1139533 1139534 RSP_2472 RSP_6053     TRUE 0.978 0.000 0.267 NA   NA
 1139534 1139535 RSP_6053 RSP_6054     TRUE 0.981 -3.000 0.291 NA   NA
 1139535 1139536 RSP_6054 RSP_2473     TRUE 0.821 38.000 0.299 NA   NA
 1139536 1139537 RSP_2473 RSP_2474     TRUE 0.989 0.000 0.577 NA   NA
 1139537 1139538 RSP_2474 RSP_2475     TRUE 0.706 23.000 0.062 NA   NA
 1139538 1139539 RSP_2475 RSP_2476     TRUE 0.981 10.000 0.678 NA   NA
 1139539 1139540 RSP_2476 RSP_2477     TRUE 0.987 0.000 0.475 NA   NA
 1139540 1139541 RSP_2477 RSP_2478     TRUE 0.993 -3.000 0.929 NA   NA
 1139541 1139542 RSP_2478 RSP_2479     TRUE 0.993 0.000 0.871 NA   NA
 1139542 1139543 RSP_2479 RSP_2480     TRUE 0.964 4.000 0.194 NA   NA
 1139543 1139544 RSP_2480 RSP_2481   cysE TRUE 0.913 -7.000 0.071 NA   NA
 1139545 1139546 RSP_4050 RSP_4049 pdhB pdhAb TRUE 0.981 11.000 0.254 1.000 Y NA
 1139546 1139547 RSP_4049 RSP_4047 pdhAb pdhAa TRUE 0.994 14.000 0.456 0.001 Y NA
 1139547 1139548 RSP_4047 RSP_4046 pdhAa   FALSE 0.096 223.000 0.104 1.000 N NA
 1139548 1139549 RSP_4046 RSP_4045   fbaB FALSE 0.009 279.000 0.004 1.000 N NA
 1139549 1139550 RSP_4045 RSP_4044 fbaB pgk TRUE 0.562 102.000 0.004 1.000 Y NA
 1139551 1139552 RSP_4043 RSP_4042     TRUE 0.997 -10.000 0.551 0.002 Y NA
 1139557 1139558 RSP_2491 RSP_2492 eno   FALSE 0.439 35.000 0.018 NA   NA
 1139558 1139559 RSP_2492 RSP_2494   fur FALSE 0.373 65.000 0.035 NA   NA
 1139560 1139561 RSP_2495 RSP_2496 nrd   FALSE 0.007 373.000 0.000 1.000   NA
 1139562 1139563 RSP_2497 RSP_2498     TRUE 0.731 8.000 0.000 NA   NA
 1139565 1139566 RSP_2501 RSP_2502   glmS FALSE 0.003 361.000 0.000 1.000 N NA
 1139566 1139567 RSP_2502 RSP_2503 glmS glmU TRUE 0.984 0.000 0.083 1.000 Y NA
 1139572 1139573 RSP_2508 RSP_2509 mccB mccA TRUE 0.926 97.000 0.158 0.001 Y NA
 1139573 1139574 RSP_2509 RSP_2510 mccA hmgL TRUE 0.975 -7.000 0.229 0.075 N NA
 1139574 1139575 RSP_2510 RSP_2511 hmgL   TRUE 0.947 13.000 0.218 0.075 N NA
 1139575 1139576 RSP_2511 RSP_2512   nuoA FALSE 0.030 221.000 0.018 1.000 N NA
 1139576 1139577 RSP_2512 RSP_2513 nuoA nuoB TRUE 0.998 -3.000 0.396 0.005 Y NA
 1139577 1139578 RSP_2513 RSP_2514 nuoB nuoC TRUE 0.993 11.000 0.262 0.005 Y NA
 1139578 1139579 RSP_2514 RSP_2515 nuoC nuoD TRUE 0.997 5.000 0.483 0.011 Y NA
 1139579 1139580 RSP_2515 RSP_2516 nuoD nuoE TRUE 0.997 0.000 0.355 0.011 Y NA
 1139580 1139581 RSP_2516 RSP_2517 nuoE   TRUE 0.873 0.000 0.012 NA   NA
 1139581 1139582 RSP_2517 RSP_2518   nuoF TRUE 0.845 11.000 0.056 NA   NA
 1139582 1139583 RSP_2518 RSP_2519 nuoF   TRUE 0.774 5.000 0.000 NA   NA
 1139583 1139584 RSP_2519 RSP_2521   nuoG FALSE 0.071 160.000 0.000 NA   NA
 1139584 1139585 RSP_2521 RSP_2520 nuoG   TRUE 0.927 4.000 0.069 NA   NA
 1139585 1139586 RSP_2520 RSP_2522   nuoH TRUE 0.659 28.000 0.060 NA   NA
 1139586 1139587 RSP_2522 RSP_2523 nuoH nuoI TRUE 0.998 2.000 0.500 0.011 Y NA
 1139587 1139588 RSP_2523 RSP_2524 nuoI   TRUE 0.932 -3.000 0.046 1.000   NA
 1139588 1139589 RSP_2524 RSP_2525   nuoJ TRUE 0.946 -3.000 0.066 1.000   NA
 1139589 1139590 RSP_2525 RSP_2526 nuoJ nuoK TRUE 0.900 160.000 0.484 0.005 Y NA
 1139590 1139591 RSP_2526 RSP_2527 nuoK nuoL TRUE 0.997 6.000 0.451 0.011 Y NA
 1139591 1139592 RSP_2527 RSP_2529 nuoL nuoM TRUE 0.997 0.000 0.251 0.003 Y NA
 1139592 1139593 RSP_2529 RSP_2530 nuoM nuoN TRUE 0.995 11.000 0.453 0.003 Y NA
 1139593 1139594 RSP_2530 RSP_2532 nuoN birA TRUE 0.916 17.000 0.372 1.000 N NA
 1139594 1139595 RSP_2532 RSP_2533 birA   TRUE 0.824 11.000 0.071 1.000 N NA
 1139595 1139596 RSP_2533 RSP_2534     TRUE 0.952 -3.000 0.080 1.000   NA
 1139597 1139598 RSP_2536 RSP_2537 rhlE prfC FALSE 0.154 226.000 0.000 1.000 Y NA
 1139599 1139600 RSP_2538 RSP_2539 fabG   TRUE 0.575 37.000 0.088 1.000 N NA
 1139600 1139601 RSP_2539 RSP_2540   tatA FALSE 0.318 168.000 0.176 1.000   NA
 1139601 1139602 RSP_2540 RSP_6059 tatA tatB TRUE 0.985 11.000 0.353 0.007   NA
 1139602 1139603 RSP_6059 RSP_2541 tatB tatC TRUE 0.996 -3.000 0.535 NA Y NA
 1139603 1139604 RSP_2541 RSP_2542 tatC   TRUE 0.948 -3.000 0.078 NA   NA
 1139605 1139606 RSP_2543 RSP_2544     FALSE 0.235 124.000 0.057 1.000 N NA
 1139606 1139607 RSP_2544 RSP_2545   surE TRUE 0.968 -3.000 0.147 1.000   NA
 1139608 1139609 RSP_2547 RSP_2548 exoY exoF TRUE 0.840 72.000 0.611 1.000   NA
 1139610 1139611 RSP_2549 RSP_2550 exoQ exoK TRUE 0.845 17.000 0.200 NA N NA
 1139613 1139614 RSP_2552 RSP_2553 exoU   TRUE 0.980 -3.000 0.286 NA   NA
 1139615 1139616 RSP_2554 RSP_2555     TRUE 0.817 87.000 0.600 NA   NA
 1139616 1139617 RSP_2555 RSP_2556     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 1139617 1139618 RSP_2556 RSP_2557   asnB TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139618 1139619 RSP_2557 RSP_2558 asnB   TRUE 0.993 -3.000 0.875 1.000   NA
 1139619 1139620 RSP_2558 RSP_2559     FALSE 0.510 66.000 0.073 1.000   NA
 1139621 1139622 RSP_6060 RSP_2561   exoP FALSE 0.006 373.000 0.000 NA   NA
 1139622 1139623 RSP_2561 RSP_2562 exoP exoM TRUE 0.554 51.000 0.080 NA   NA
 1139623 1139624 RSP_2562 RSP_2563 exoM exoA TRUE 0.965 -3.000 0.143 NA   NA
 1139624 1139625 RSP_2563 RSP_2564 exoA exoL TRUE 0.965 -3.000 0.143 NA   NA
 1139625 1139626 RSP_2564 RSP_2565 exoL ugpG TRUE 0.723 22.000 0.065 NA   NA
 1139626 1139627 RSP_2565 RSP_2567 ugpG sqdC FALSE 0.042 356.000 0.000 1.000 Y NA
 1139627 1139628 RSP_2567 RSP_2568 sqdC sqdD TRUE 0.993 -15.000 0.696 1.000 Y NA
 1139628 1139629 RSP_2568 RSP_2569 sqdD sqdB TRUE 0.808 55.000 0.086 1.000 Y NA
 1139629 1139630 RSP_2569 RSP_2570 sqdB pfpI FALSE 0.143 147.000 0.014 1.000   NA
 1139631 1139632 RSP_2571 RSP_2572   crpK FALSE 0.145 155.000 0.065 NA N NA
 1139632 1139633 RSP_2572 RSP_2573 crpK   TRUE 0.699 154.000 0.286 NA Y NA
 1139635 1139636 RSP_2575 RSP_2576   adhI FALSE 0.029 233.000 0.000 1.000   NA
 1139636 1139637 RSP_2576 RSP_2577 adhI cycI TRUE 0.818 130.000 0.333 1.000 Y NA
 1139637 1139638 RSP_2577 RSP_2578 cycI xoxF FALSE 0.097 210.000 0.000 0.064 N NA
 1139638 1139639 RSP_2578 RSP_2579 xoxF cycB TRUE 0.737 164.000 0.571 0.064   NA
 1139639 1139640 RSP_2579 RSP_2580 cycB xoxJ TRUE 0.975 -12.000 0.419 1.000   NA
 1139640 1139641 RSP_2580 RSP_2581 xoxJ   TRUE 0.988 -3.000 0.488 1.000   NA
 1139641 1139642 RSP_2581 RSP_2582     FALSE 0.327 109.000 0.049 NA   NA
 1139642 1139643 RSP_2582 RSP_2583     TRUE 0.906 45.000 0.793 NA   NA
 1139643 1139644 RSP_2583 RSP_2584     TRUE 0.701 27.000 0.074 NA   NA
 1139644 1139645 RSP_2584 RSP_2585     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1139645 1139646 RSP_2585 RSP_2586     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139646 1139647 RSP_2586 RSP_2587     TRUE 0.988 -3.000 0.635 1.000 N NA
 1139647 1139648 RSP_2587 RSP_2588     TRUE 0.957 10.000 0.281 NA   NA
 1139650 1139651 RSP_2590 RSP_2591   flhR FALSE 0.221 167.000 0.091 NA   NA
 1139651 1139652 RSP_2591 RSP_2592 flhR   TRUE 0.956 11.000 0.333 NA   NA
 1139652 1139653 RSP_2592 RSP_2593   flhS TRUE 0.965 -10.000 0.294 NA   NA
 1139653 1139654 RSP_2593 RSP_2594 flhS   TRUE 0.962 5.000 0.200 NA   NA
 1139654 1139655 RSP_2594 RSP_2595     TRUE 0.990 -3.000 0.600 NA   NA
 1139656 1139657 RSP_2596 RSP_2597     TRUE 0.985 -3.000 0.087 NA Y NA
 1139657 1139658 RSP_2597 RSP_2598     TRUE 0.949 20.000 0.200 NA Y NA
 1139658 1139659 RSP_2598 RSP_2599   phoB FALSE 0.103 114.000 0.005 1.000 N NA
 1139659 1139660 RSP_2599 RSP_2600 phoB phoU TRUE 0.933 0.000 0.096 NA N NA
 1139660 1139661 RSP_2600 RSP_2601 phoU pstB TRUE 0.977 11.000 0.222 NA Y NA
 1139661 1139662 RSP_2601 RSP_2602 pstB pstA TRUE 0.996 11.000 0.402 0.001 Y NA
 1139662 1139663 RSP_2602 RSP_2603 pstA pstC TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.001 Y NA
 1139663 1139664 RSP_2603 RSP_2604 pstC pstS TRUE 0.812 59.000 0.107 NA Y NA
 1139664 1139665 RSP_2604 RSP_2605 pstS   FALSE 0.006 376.000 0.000 NA   NA
 1139665 1139666 RSP_2605 RSP_2606     TRUE 0.762 11.000 0.022 NA   NA
 1139666 1139667 RSP_2606 RSP_2607     TRUE 0.702 37.000 0.111 1.000   NA
 1139669 1139670 RSP_2609 RSP_4331 dcd   FALSE 0.210 66.000 0.000 NA   NA
 1139670 1139671 RSP_4331 RSP_2610     FALSE 0.189 81.000 0.000 NA   NA
 1139671 1139672 RSP_2610 RSP_2611   ihfA TRUE 0.816 7.000 0.005 1.000   NA
 1139672 1139673 RSP_2611 RSP_2612 ihfA fabH TRUE 0.560 91.000 0.207 1.000 N NA
 1139673 1139674 RSP_2612 RSP_2613 fabH plsX TRUE 0.997 7.000 0.380 0.004 Y NA
 1139674 1139675 RSP_2613 RSP_2614 plsX rpmF TRUE 0.887 26.000 0.418 1.000 N NA
 1139675 1139676 RSP_2614 RSP_2615 rpmF   FALSE 0.530 178.000 0.599 NA   NA
 1139681 1139682 RSP_2620 RSP_2621   ctrA TRUE 0.628 96.000 0.213 1.000   NA
 1139682 1139683 RSP_2621 RSP_2622 ctrA ligA FALSE 0.178 94.000 0.022 1.000 N NA
 1139683 1139684 RSP_2622 RSP_2623N ligA recG TRUE 0.991 -3.000 0.029 0.011 Y NA
 1139684 1139685 RSP_2623N RSP_2624 recG   FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 1139688 1139689 RSP_2628 RSP_2629 gltX/glnS gid TRUE 0.850 -15.000 0.033 1.000   NA
 1139689 1139690 RSP_2629 RSP_2630 gid gyrA TRUE 0.713 4.000 0.005 1.000 N NA
 1139693 1139694 RSP_2633 RSP_2634 ccmF ccmH TRUE 0.997 -3.000 0.963 NA Y NA
 1139694 1139695 RSP_2634 RSP_2635 ccmH phaB/echH FALSE 0.037 210.000 0.000 NA   NA
 1139696 1139697 RSP_2636 RSP_2637 ilvH   TRUE 0.931 83.000 0.146 0.001 Y NA
 1139697 1139698 RSP_2637 RSP_2638     FALSE 0.005 295.000 0.000 1.000 N NA
 1139698 1139699 RSP_2638 RSP_2639     FALSE 0.001 490.000 0.000 1.000 N NA
 1139699 1139700 RSP_2639 RSP_2640     FALSE 0.496 107.000 0.128 NA   NA
 1139700 1139701 RSP_2640 RSP_2641     FALSE 0.082 310.000 0.240 NA   NA
 1139701 1139702 RSP_2641 RSP_2642     FALSE 0.008 439.000 0.025 NA   NA
 1139703 1139704 RSP_2643 RSP_2644 glnE   TRUE 0.883 -13.000 0.060 NA   NA
 1139705 1139706 RSP_2645 RSP_2646 eda edd FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 1139707 1139708 RSP_2647 RSP_2648     TRUE 0.964 -3.000 0.138 NA   NA
 1139709 1139710 RSP_2649 RSP_2650     FALSE 0.364 63.000 0.031 NA   NA
 1139710 1139711 RSP_2650 RSP_6205     FALSE 0.543 23.000 0.015 NA   NA
 1139711 1139712 RSP_6205 RSP_2651     TRUE 0.969 -3.000 0.160 NA   NA
 1139712 1139713 RSP_2651 RSP_2652     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 1139713 1139714 RSP_2652 RSP_2653     FALSE 0.488 39.000 0.030 1.000   NA
 1139715 1139716 RSP_2654 RSP_2656   nahG FALSE 0.454 96.000 0.131 1.000 N NA
 1139717 1139718 RSP_2655 RSP_2657   xthA FALSE 0.083 143.000 0.023 NA N NA
 1139718 1139719 RSP_2657 RSP_2658 xthA   FALSE 0.352 77.000 0.038 NA   NA
 1139720 1139721 RSP_2659 RSP_2660 dgt   TRUE 0.619 17.000 0.009 1.000   NA
 1139722 1139723 RSP_2661 RSP_2662   glpK TRUE 0.974 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 1139723 1139724 RSP_2662 RSP_2663 glpK   FALSE 0.008 389.000 0.034 1.000 N NA
 1139724 1139725 RSP_2663 RSP_2664     TRUE 0.856 62.000 0.640 NA   NA
 1139725 1139726 RSP_2664 RSP_2665     TRUE 0.991 2.000 0.854 NA   NA
 1139726 1139727 RSP_2665 RSP_2666     TRUE 0.985 38.000 0.922 0.069 Y NA
 1139727 1139728 RSP_2666 RSP_2667     TRUE 0.998 0.000 0.847 0.069 Y NA
 1139728 1139729 RSP_2667 RSP_2669     TRUE 0.997 11.000 0.865 0.005 Y NA
 1139729 1139730 RSP_2669 RSP_2670   glpD FALSE 0.342 130.000 0.125 1.000 N NA
 1139730 1139731 RSP_2670 RSP_2671 glpD   FALSE 0.004 461.000 0.000 NA   NA
 1139733 1139734 RSP_2673 RSP_2674     FALSE 0.041 203.000 0.000 NA   NA
 1139734 1139735 RSP_2674 RSP_2675     FALSE 0.002 637.000 0.000 NA   NA
 1139735 1139736 RSP_2675 RSP_2676     TRUE 0.768 123.000 0.667 NA   NA
 1139736 1139737 RSP_2676 RSP_6064     FALSE 0.002 1006.000 0.000 NA   NA
 1139739 1139740 RSP_2678 RSP_2679     TRUE 0.952 -3.000 0.087 NA   NA
 1139740 1139741 RSP_2679 RSP_6225     FALSE 0.002 771.000 0.000 NA   NA
 1139742 1139743 RSP_2681 RSP_2682 rpoE fabD FALSE 0.012 230.000 0.000 1.000 N NA
 1139744 1139745 RSP_2683 RSP_2684     TRUE 0.914 -3.000 0.035 NA   NA
 1139745 1139746 RSP_2684 RSP_2685     TRUE 0.874 -3.000 0.035 1.000 N NA
 1139747 1139748 RSP_2686 RSP_2687   fbcQ FALSE 0.483 80.000 0.083 NA   NA
 1139748 1139749 RSP_2687 RSP_2688 fbcQ soxD TRUE 0.618 40.000 0.083 NA   NA
 1139749 1139750 RSP_2688 RSP_2689 soxD soxA TRUE 0.998 -3.000 0.889 0.001   NA
 1139750 1139751 RSP_2689 RSP_2690 soxA   TRUE 0.996 -7.000 0.778 0.001   NA
 1139755 1139756 RSP_2695 RSP_2696     FALSE 0.301 86.000 0.020 1.000   NA
 1139756 1139757 RSP_2696 RSP_2697     FALSE 0.163 100.000 0.000 NA   NA
 1139757 1139758 RSP_2697 RSP_2698     TRUE 0.687 46.000 0.154 NA   NA
 1139758 1139759 RSP_2698 RSP_2699     TRUE 0.700 59.000 0.203 1.000   NA
 1139760 1139761 RSP_2700 RSP_2701     TRUE 0.941 -7.000 0.115 1.000   NA
 1139761 1139762 RSP_2701 RSP_2702     TRUE 0.997 0.000 0.478 0.069 Y NA
 1139762 1139763 RSP_2702 RSP_2703     TRUE 0.992 4.000 0.130 0.069 Y NA
 1139763 1139764 RSP_2703 RSP_2704   miaA FALSE 0.004 322.000 0.000 1.000 N NA
 1139765 1139766 RSP_2705 RSP_2706 pyrH frr TRUE 0.790 86.000 0.626 1.000 N NA
 1139766 1139767 RSP_2706 RSP_2707 frr uppS TRUE 0.745 70.000 0.409 1.000 N NA
 1139767 1139768 RSP_2707 RSP_2708 uppS cdsA TRUE 0.995 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 1139768 1139769 RSP_2708 RSP_2709 cdsA dxr TRUE 0.989 9.000 0.372 1.000 Y NA
 1139769 1139770 RSP_2709 RSP_2710 dxr   TRUE 0.979 7.000 0.568 1.000 N NA
 1139770 1139771 RSP_2710 RSP_6065     FALSE 0.063 167.000 0.000 NA   NA
 1139771 1139772 RSP_6065 RSP_2711     FALSE 0.171 94.000 0.000 NA   NA
 1139772 1139773 RSP_2711 RSP_6204     TRUE 0.992 0.000 0.241 1.000 Y NA
 1139773 1139774 RSP_6204 RSP_2712   fabZ FALSE 0.438 86.000 0.102 1.000 N NA
 1139774 1139775 RSP_2712 RSP_2714 fabZ lpxA TRUE 0.806 31.000 0.264 1.000 N NA
 1139775 1139776 RSP_2714 RSP_2715 lpxA   TRUE 0.989 -3.000 0.552 NA   NA
 1139776 1139777 RSP_2715 RSP_2716   lpxB TRUE 0.970 -3.000 0.173 NA   NA
 1139777 1139778 RSP_2716 RSP_2717 lpxB   FALSE 0.169 124.000 0.003 1.000   NA
 1139778 1139779 RSP_2717 RSP_2718     FALSE 0.041 213.000 0.000 1.000   NA
 1139779 1139780 RSP_2718 RSP_2719     FALSE 0.011 234.000 0.000 1.000 N NA
 1139780 1139781 RSP_2719 RSP_2720     FALSE 0.016 374.000 0.079 1.000 N NA
 1139783 1139784 RSP_2722 RSP_2723 cysS   FALSE 0.128 126.000 0.021 1.000 N NA
 1139784 1139785 RSP_2723 RSP_2724     TRUE 0.805 -3.000 0.013 1.000 N NA
 1139785 1139786 RSP_2724 RSP_2725     TRUE 0.860 -3.000 0.030 1.000 N NA
 1139788 1139789 RSP_2727 RSP_2728     TRUE 0.942 -3.000 0.069 NA   NA
 1139789 1139790 RSP_2728 RSP_2729     FALSE 0.005 531.000 0.018 NA   NA
 1139790 1139791 RSP_2729 RSP_2730     FALSE 0.005 295.000 0.000 1.000 N NA
 1139791 1139792 RSP_2730 RSP_2731   ArsH FALSE 0.013 283.000 0.000 NA   NA
 1139792 1139793 RSP_2731 RSP_2732 ArsH   TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 1139793 1139794 RSP_2732 RSP_2734   zwf FALSE 0.033 217.000 0.000 NA   NA
 1139794 1139795 RSP_2734 RSP_2735 zwf pgl TRUE 0.860 39.000 0.092 1.000 Y NA
 1139795 1139796 RSP_2735 RSP_2736 pgl pgi TRUE 0.926 20.000 0.089 1.000 Y NA
 1139798 1139799 RSP_2738 RSP_2739     TRUE 0.930 11.000 0.197 NA   NA
 1139799 1139800 RSP_2739 RSP_6066     TRUE 0.922 -3.000 0.042 NA   NA
 1139800 1139801 RSP_6066 RSP_2740     FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 1139801 1139802 RSP_2740 RSP_2741     TRUE 0.986 -3.000 0.519 1.000 N NA
 1139807 1139808 RSP_2746 RSP_2747     FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 1139808 1139809 RSP_2747 RSP_2748     FALSE 0.024 235.000 0.000 NA   NA
 1139810 1139811 RSP_2749 RSP_2750     FALSE 0.016 267.000 0.000 NA   NA
 1139811 1139812 RSP_2750 RSP_2751     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139812 1139813 RSP_2751 RSP_2753     TRUE 0.760 -6.000 0.000 NA   NA
 1139813 1139814 RSP_2753 RSP_6068     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139814 1139815 RSP_6068 RSP_2754     TRUE 0.710 -13.000 0.000 NA   NA
 1139815 1139816 RSP_2754 RSP_2755     FALSE 0.077 154.000 0.000 NA   NA
 1139816 1139817 RSP_2755 RSP_2756     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139817 1139818 RSP_2756 RSP_6069     FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1139818 1139819 RSP_6069 RSP_2757     FALSE 0.541 15.000 0.000 NA   NA
 1139819 1139820 RSP_2757 RSP_2758     TRUE 0.762 6.000 0.000 NA   NA
 1139820 1139821 RSP_2758 RSP_2759     TRUE 0.985 -7.000 0.667 NA   NA
 1139821 1139822 RSP_2759 RSP_2760     TRUE 0.981 -7.000 0.500 NA   NA
 1139822 1139823 RSP_2760 RSP_2761     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139825 1139826 RSP_2763 RSP_2764     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 1139826 1139827 RSP_2764 RSP_2765     FALSE 0.003 529.000 0.000 NA   NA
 1139827 1139828 RSP_2765 RSP_6070     FALSE 0.002 1292.000 0.000 NA   NA
 1139829 1139830 RSP_4305 RSP_6242     FALSE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 1139830 1139831 RSP_6242 RSP_2766     FALSE 0.190 80.000 0.000 NA   NA
 1139831 1139832 RSP_2766 RSP_2768     FALSE 0.176 135.000 0.018 1.000   NA
 1139832 1139833 RSP_2768 RSP_2769     TRUE 0.972 -3.000 0.179 1.000   NA
 1139833 1139834 RSP_2769 RSP_2770     TRUE 0.971 -13.000 0.391 NA   NA
 1139835 1139836 RSP_2771 RSP_2772   ftsJ TRUE 0.759 -3.000 0.011 NA N NA
 1139838 1139839 RSP_2774 RSP_2775   lpxD FALSE 0.524 49.000 0.057 1.000   NA
 1139839 1139840 RSP_2775 RSP_2776 lpxD acpP FALSE 0.379 34.000 0.029 1.000 N NA
 1139840 1139841 RSP_2776 RSP_2777 acpP   TRUE 0.973 12.000 0.212 1.000 Y NA
 1139842 1139843 RSP_2778 RSP_2779   catA FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 1139845 1139846 RSP_2781 RSP_2782   aqpZ FALSE 0.031 162.000 0.000 1.000 N NA
 1139848 1139849 RSP_2784 RSP_2785 cycG CycF TRUE 0.997 4.000 0.364 0.014 Y NA
 1139849 1139850 RSP_2785 RSP_2786 CycF HPRT FALSE 0.004 407.000 0.006 1.000 N NA
 1139851 1139852 RSP_2787 RSP_2788     FALSE 0.410 25.000 0.000 NA   NA
 1139855 1139856 RSP_2862 RSP_2861   TSF FALSE 0.002 387.000 0.000 1.000 N NA
 1139856 1139857 RSP_2861 RSP_2860 TSF rpsB TRUE 0.940 82.000 0.748 1.000 Y NA
 1139858 1139859 RSP_6216 RSP_2858     TRUE 0.948 -3.000 0.131 NA N NA
 1139862 1139863 RSP_2855 RSP_2854     TRUE 0.834 11.000 0.087 NA N NA
 1139863 1139864 RSP_2854 RSP_2853     TRUE 0.933 0.000 0.087 1.000 N NA
 1139865 1139866 RSP_2852 RSP_2851     TRUE 0.956 -3.000 0.147 1.000 N NA
 1139867 1139868 RSP_2850 RSP_2849 mfd   FALSE 0.309 77.000 0.026 NA   NA
 1139869 1139870 RSP_2848 RSP_2847 hemB   FALSE 0.267 115.000 0.033 NA   NA
 1139873 1139874 RSP_2844 RSP_2843   hfq FALSE 0.525 95.000 0.115 1.000   NA
 1139874 1139875 RSP_2843 RSP_2842 hfq trkH1 FALSE 0.438 158.000 0.252 1.000   NA
 1139875 1139876 RSP_2842 RSP_2841 trkH1 trkA TRUE 0.994 2.000 0.089 0.004 Y NA
 1139876 1139877 RSP_2841 RSP_2840 trkA ntrX FALSE 0.470 55.000 0.085 1.000 N NA
 1139877 1139878 RSP_2840 RSP_2839 ntrX ntrY TRUE 0.998 -3.000 0.533 0.022 Y NA
 1139878 1139879 RSP_2839 RSP_2838 ntrY ntrC TRUE 0.943 52.000 0.205 0.022 Y NA
 1139879 1139880 RSP_2838 RSP_2837 ntrC ntrB TRUE 0.996 0.000 0.297 0.082 Y NA
 1139880 1139881 RSP_2837 RSP_2836 ntrB nifR3 TRUE 0.940 -3.000 0.094 1.000 N NA
 1139882 1139883 RSP_2835 RSP_6071 ispD ispF TRUE 0.882 109.000 0.419 1.000 Y NA
 1139883 1139884 RSP_6071 RSP_2834 ispF pgpA TRUE 0.971 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 1139884 1139885 RSP_2834 RSP_2833 pgpA cinA TRUE 0.954 -3.000 0.091 NA   NA
 1139887 1139888 RSP_4327 RSP_4346     FALSE 0.175 91.000 0.000 NA   NA
 1139889 1139890 RSP_2831 RSP_2830 cobO   TRUE 0.710 -3.000 0.005 NA N NA
 1139891 1139892 RSP_2829 RSP_2828   cobW TRUE 0.974 -3.000 0.211 NA   NA
 1139892 1139893 RSP_2828 RSP_2827 cobW cobN TRUE 0.968 4.000 0.204 1.000   NA
 1139893 1139894 RSP_2827 RSP_6217 cobN cobH TRUE 0.905 0.000 0.025 1.000   NA
 1139894 1139895 RSP_6217 RSP_2826 cobH cobI TRUE 0.996 0.000 0.191 0.009 Y NA
 1139895 1139896 RSP_2826 RSP_2824 cobI cobJ TRUE 0.995 -3.000 0.138 0.009 Y NA
 1139898 1139899 RSP_2823 RSP_2822 cobL cobE TRUE 0.988 -3.000 0.139 0.009   NA
 1139899 1139900 RSP_2822 RSP_2821 cobE cobM TRUE 0.995 -3.000 0.397 0.009   NA
 1139900 1139901 RSP_2821 RSP_2820 cobM cobA TRUE 0.971 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 1139901 1139902 RSP_2820 RSP_2819 cobA cobF TRUE 0.770 91.000 0.106 1.000 Y NA
 1139903 1139904 RSP_2818 RSP_2817 aroB aroK TRUE 0.989 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 1139905 1139906 RSP_2816 RSP_2815   xerD TRUE 0.912 0.000 0.038 NA   NA
 1139906 1139907 RSP_2815 RSP_2814 xerD corB FALSE 0.226 69.000 0.025 1.000 N NA
 1139910 1139911 RSP_2813 RSP_2812 mttB   FALSE 0.193 116.000 0.011 NA   NA
 1139911 1139912 RSP_2812 RSP_2811     TRUE 0.919 3.000 0.054 NA   NA
 1139912 1139913 RSP_2811 RSP_2810     TRUE 0.991 4.000 0.294 NA Y NA
 1139913 1139914 RSP_2810 RSP_2809     TRUE 0.990 0.000 0.206 NA Y NA
 1139915 1139916 RSP_2808 RSP_2807     TRUE 0.774 5.000 0.000 NA   NA
 1139917 1139918 RSP_4328 RSP_2806   lon FALSE 0.004 455.000 0.000 NA   NA
 1139918 1139919 RSP_2806 RSP_2805 lon nemA FALSE 0.007 262.000 0.000 1.000 N NA
 1139919 1139920 RSP_2805 RSP_2804 nemA tgt FALSE 0.116 107.000 0.007 1.000 N NA
 1139920 1139921 RSP_2804 RSP_2803 tgt   FALSE 0.029 166.000 0.003 NA N NA
 1139921 1139922 RSP_2803 RSP_2802     TRUE 0.986 8.000 1.000 NA N NA
 1139923 1139924 RSP_2801 RSP_6075 tetR   FALSE 0.002 580.000 0.000 NA   NA
 1139924 1139925 RSP_6075 RSP_2800   acoR TRUE 0.711 45.000 0.176 NA   NA
 1139926 1139927 RSP_2799 RSP_2798   groEL3 FALSE 0.276 51.000 0.000 1.000   NA
 1139927 1139928 RSP_2798 RSP_2797 groEL3   TRUE 0.724 84.000 0.300 1.000   NA
 1139928 1139929 RSP_2797 RSP_2796     TRUE 0.956 5.000 0.150 1.000   NA
 1139929 1139930 RSP_2796 RSP_2795     TRUE 0.663 61.000 0.167 1.000   NA
 1139930 1139931 RSP_2795 RSP_2794     TRUE 0.990 12.000 0.708 0.006   NA
 1139931 1139932 RSP_2794 RSP_2793     TRUE 0.915 31.000 0.542 1.000   NA
 1139932 1139933 RSP_2793 RSP_2792     TRUE 0.837 71.000 0.591 1.000   NA
 1139934 1139935 RSP_2791 RSP_2790     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139935 1139936 RSP_2790 RSP_2789     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139936 1139937 RSP_2789 RSP_6076     TRUE 0.615 30.000 0.051 NA   NA
 1139937 1139938 RSP_6076 RSP_2867   rpoN4 FALSE 0.466 20.000 0.000 NA   NA
 1139939 1139940 RSP_2868 RSP_2869     FALSE 0.029 194.000 0.004 1.000 N NA
 1139940 1139941 RSP_2869 RSP_2870   aglK FALSE 0.001 530.000 0.000 1.000 N NA
 1139941 1139942 RSP_2870 RSP_2871 aglK aglG TRUE 0.953 25.000 0.097 0.068 Y NA
 1139942 1139943 RSP_2871 RSP_2872 aglG aglF TRUE 0.998 0.000 0.693 0.068 Y NA
 1139943 1139944 RSP_2872 RSP_2873 aglF aglE TRUE 0.964 77.000 0.670 0.068 Y NA
 1139945 1139946 RSP_2874 RSP_2875   glk TRUE 0.973 19.000 0.385 1.000 Y NA
 1139947 1139948 RSP_2876 RSP_2877   coxL TRUE 0.996 11.000 0.525 0.001 Y NA
 1139948 1139949 RSP_2877 RSP_2878 coxL coxS TRUE 0.989 29.000 0.512 0.001 Y NA
 1139949 1139950 RSP_2878 RSP_2879 coxS   TRUE 0.665 29.000 0.068 NA   NA
 1139950 1139951 RSP_2879 RSP_2880   gfdS FALSE 0.409 133.000 0.143 NA   NA
 1139951 1139952 RSP_2880 RSP_2881 gfdS gfdT TRUE 0.601 71.000 0.154 NA   NA
 1139952 1139953 RSP_2881 RSP_2882 gfdT   TRUE 0.862 98.000 0.923 NA   NA
 1139953 1139954 RSP_2882 RSP_2883   pgm FALSE 0.004 320.000 0.000 1.000 N NA
 1139954 1139955 RSP_2883 RSP_2884 pgm glgX TRUE 0.973 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 1139955 1139956 RSP_2884 RSP_2885 glgX glgA TRUE 0.997 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 1139956 1139957 RSP_2885 RSP_2886 glgA glgC TRUE 0.748 97.000 0.094 1.000 Y NA
 1139957 1139958 RSP_2886 RSP_2887 glgC glgP FALSE 0.012 767.000 0.000 1.000 Y NA
 1139960 1139961 RSP_2889 RSP_2890     TRUE 0.597 159.000 0.200 0.003 N NA
 1139962 1139963 RSP_2891 RSP_2892     FALSE 0.161 101.000 0.000 NA   NA
 1139965 1139966 RSP_2895 RSP_2896     TRUE 0.945 4.000 0.102 NA   NA
 1139966 1139967 RSP_2896 RSP_2897     FALSE 0.552 98.000 0.156 NA   NA
 1139968 1139969 RSP_2898 RSP_2899     TRUE 0.557 104.000 0.230 1.000 N NA
 1139970 1139971 RSP_2900 RSP_2901     TRUE 0.995 -3.000 0.631 0.057   NA
 1139971 1139972 RSP_2901 RSP_2902     TRUE 0.968 0.000 0.153 1.000   NA
 1139972 1139973 RSP_2902 RSP_2903     TRUE 0.844 17.000 0.181 1.000 N NA
 1139973 1139974 RSP_2903 RSP_2904   pdxA1 TRUE 0.836 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1139974 1139975 RSP_2904 RSP_2905 pdxA1 ksgA TRUE 0.570 78.000 0.197 1.000 N NA
 1139976 1139977 RSP_6078 RSP_2906     FALSE 0.029 258.000 0.021 NA   NA
 1139977 1139978 RSP_2906 RSP_2907   prfA TRUE 0.992 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 1139978 1139979 RSP_2907 RSP_2908 prfA   FALSE 0.110 147.000 0.006 NA   NA
 1139979 1139980 RSP_2908 RSP_2909     TRUE 0.924 6.000 0.078 NA   NA
 1139980 1139981 RSP_2909 RSP_2910     FALSE 0.077 273.000 0.124 1.000   NA
 1139982 1139983 RSP_2912 RSP_2913     FALSE 0.027 263.000 0.011 1.000   NA
 1139983 1139984 RSP_2913 RSP_2914     FALSE 0.012 227.000 0.000 1.000 N NA
 1139987 1139988 RSP_2917 RSP_2918     FALSE 0.319 83.000 0.023 1.000   NA
 1139988 1139989 RSP_2918 RSP_2919     TRUE 0.912 -3.000 0.027 1.000   NA
 1139989 1139990 RSP_2919 RSP_2920     TRUE 0.971 5.000 0.276 NA   NA
 1139993 1139994 RSP_2922 RSP_2923     FALSE 0.167 178.000 0.118 NA N NA
 1139994 1139995 RSP_2923 RSP_2924     TRUE 0.812 129.000 0.333 NA Y NA
 1139995 1139996 RSP_2924 RSP_2925     TRUE 0.960 93.000 0.582 0.026 Y NA
 1139996 1139997 RSP_2925 RSP_2926     TRUE 0.988 4.000 0.190 1.000 Y NA
 1139997 1139998 RSP_2926 RSP_2927     TRUE 0.998 -3.000 0.775 0.068 Y NA
 1139998 1139999 RSP_2927 RSP_2928     TRUE 0.927 5.000 0.075 NA   NA
 1140000 1140001 RSP_2930 RSP_4326     FALSE 0.002 820.000 0.000 NA   NA
 1140003 1140004 RSP_2932 RSP_2933 hutC hutF TRUE 0.865 0.000 0.033 1.000 N NA
 1140005 1140006 RSP_2934 RSP_2935 hutI hutH TRUE 0.985 0.000 0.192 0.033 N NA
 1140006 1140007 RSP_2935 RSP_2936 hutH hutU TRUE 0.995 11.000 0.315 0.001 Y NA
 1140007 1140008 RSP_2936 RSP_2937 hutU   FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 1140009 1140010 RSP_6080 RSP_2939     FALSE 0.007 356.000 0.000 NA   NA
 1140010 1140011 RSP_2939 RSP_2940     TRUE 0.989 -3.000 0.570 NA   NA
 1140011 1140012 RSP_2940 RSP_2941     TRUE 0.932 -7.000 0.103 NA   NA
 1140012 1140013 RSP_2941 RSP_2942     TRUE 0.951 -3.000 0.085 NA   NA
 1140013 1140014 RSP_2942 RSP_2943   argS FALSE 0.312 71.000 0.025 NA   NA
 1140014 1140015 RSP_2943 RSP_6081 argS   FALSE 0.231 67.000 0.002 NA   NA
 1140015 1140016 RSP_6081 RSP_2944     TRUE 0.974 -9.000 0.389 NA   NA
 1140016 1140017 RSP_2944 RSP_2945   cycJ FALSE 0.157 161.000 0.036 1.000   NA
 1140017 1140018 RSP_2945 RSP_2946 cycJ argC FALSE 0.505 23.000 0.032 1.000 N NA
 1140018 1140019 RSP_2946 RSP_2947 argC   FALSE 0.442 25.000 0.025 1.000 N NA
 1140019 1140020 RSP_2947 RSP_2948     FALSE 0.066 138.000 0.005 1.000 N NA
 1140021 1140022 RSP_2950 RSP_2951   purL FALSE 0.003 368.000 0.000 1.000 N NA
 1140022 1140023 RSP_2951 RSP_2952 purL   FALSE 0.069 234.000 0.093 NA N NA
 1140023 1140024 RSP_2952 RSP_2953     TRUE 0.622 60.000 0.216 NA N NA
 1140025 1140026 RSP_2954 RSP_2955     TRUE 0.826 -7.000 0.017 NA   NA
 1140028 1140029 RSP_2957 RSP_2958     FALSE 0.400 26.000 0.000 NA   NA
 1140030 1140031 RSP_2959 RSP_6082 gapB   FALSE 0.037 209.000 0.000 NA   NA
 1140032 1140033 RSP_2960 RSP_2961     TRUE 0.582 70.000 0.121 1.000   NA
 1140033 1140034 RSP_2961 RSP_2965     TRUE 0.731 55.000 0.229 1.000   NA
 1140035 1140036 RSP_2962 RSP_2963     FALSE 0.001 525.000 0.000 1.000 N NA
 1140036 1140037 RSP_2963 RSP_2964     FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 1140038 1140039 RSP_2966 RSP_2967 uvrA   FALSE 0.114 117.000 0.010 1.000 N NA
 1140039 1140040 RSP_2967 RSP_2968     FALSE 0.040 203.000 0.017 1.000 N NA
 1140040 1140041 RSP_2968 RSP_2969     FALSE 0.474 77.000 0.070 1.000   NA
 1140041 1140042 RSP_2969 RSP_2970     FALSE 0.068 207.000 0.017 1.000   NA
 1140042 1140043 RSP_2970 RSP_2971     FALSE 0.134 80.000 0.005 1.000 N NA
 1140043 1140044 RSP_2971 RSP_2972     FALSE 0.281 86.000 0.021 NA   NA
 1140045 1140046 RSP_2973 RSP_2974     FALSE 0.003 411.000 0.002 1.000 N NA
 1140046 1140047 RSP_2974 RSP_2975     TRUE 0.970 -10.000 0.484 NA N NA
 1140048 1140049 RSP_2976 RSP_2977   prfB FALSE 0.008 370.000 0.006 NA   NA
 1140049 1140050 RSP_2977 RSP_2978 prfB mrcA FALSE 0.226 109.000 0.041 1.000 N NA
 1140050 1140051 RSP_2978 RSP_2979 mrcA amiC TRUE 0.892 92.000 0.396 1.000 Y NA
 1140051 1140052 RSP_2979 RSP_2980 amiC aspAT FALSE 0.463 49.000 0.072 1.000 N NA
 1140054 1140055 RSP_2982 RSP_2983 gcpE   FALSE 0.523 131.000 0.233 NA   NA
 1140055 1140056 RSP_2983 RSP_2984   hemA FALSE 0.116 198.000 0.057 NA   NA
 1140056 1140057 RSP_2984 RSP_2985 hemA   FALSE 0.301 135.000 0.077 NA   NA
 1140058 1140059 RSP_2986 RSP_2987     TRUE 0.929 -3.000 0.043 1.000   NA
 1140060 1140061 RSP_4317 RSP_4316     FALSE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 1140061 1140062 RSP_4316 RSP_2988     FALSE 0.176 90.000 0.000 NA   NA
 1140064 1140065 RSP_2990 RSP_2991     FALSE 0.540 156.000 0.417 NA   NA
 1140065 1140066 RSP_2991 RSP_2992     FALSE 0.475 143.000 0.250 NA   NA
 1140066 1140067 RSP_2992 RSP_2993     TRUE 0.713 72.000 0.286 NA   NA
 1140067 1140068 RSP_2993 RSP_2994     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1140068 1140069 RSP_2994 RSP_6243     FALSE 0.002 1034.000 0.000 NA   NA
 1140069 1140070 RSP_6243 RSP_6244     FALSE 0.002 657.000 0.000 NA   NA
 1140070 1140071 RSP_6244 RSP_6245     FALSE 0.451 46.000 0.038 NA   NA
 1140071 1140072 RSP_6245 RSP_6246     TRUE 0.807 1.000 0.000 NA   NA
 1140072 1140073 RSP_6246 RSP_6247     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140073 1140074 RSP_6247 RSP_2995     FALSE 0.418 24.000 0.000 NA   NA
 1140074 1140075 RSP_2995 RSP_2996     FALSE 0.498 73.000 0.087 NA   NA
 1140075 1140076 RSP_2996 RSP_2997     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140076 1140077 RSP_2997 RSP_2998     FALSE 0.289 40.000 0.000 NA   NA
 1140077 1140078 RSP_2998 RSP_2999     TRUE 0.980 -13.000 0.600 NA   NA
 1140078 1140079 RSP_2999 RSP_3000     FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 1140079 1140080 RSP_3000 RSP_3001     FALSE 0.234 54.000 0.000 NA   NA
 1140080 1140081 RSP_3001 RSP_6248     TRUE 0.597 82.000 0.000 0.005   NA
 1140081 1140082 RSP_6248 RSP_6249     TRUE 0.692 -31.000 0.000 NA   NA
 1140082 1140083 RSP_6249 RSP_6250     FALSE 0.002 971.000 0.000 NA   NA
 1140083 1140084 RSP_6250 RSP_0002   spbB FALSE 0.002 3503.000 0.000 NA   NA
 1140084 1140085 RSP_0002 RSP_0003 spbB   FALSE 0.121 228.000 0.000 0.044   NA
 1140085 1140086 RSP_0003 RSP_0004     TRUE 0.690 -37.000 0.000 NA   NA
 1140087 1140088 RSP_0005 RSP_0006 guaA   FALSE 0.005 467.000 0.005 1.000   NA
 1140088 1140089 RSP_0006 RSP_0007     TRUE 0.773 79.000 0.381 1.000   NA
 1140089 1140090 RSP_0007 RSP_0008     FALSE 0.464 53.000 0.080 1.000 N NA
 1140090 1140091 RSP_0008 RSP_0009     FALSE 0.342 33.000 0.000 NA   NA
 1140091 1140092 RSP_0009 RSP_0010     FALSE 0.486 29.000 0.016 NA   NA
 1140092 1140093 RSP_0010 RSP_0011     TRUE 0.894 -10.000 0.056 1.000   NA
 1140093 1140094 RSP_0011 RSP_0013     TRUE 0.866 41.000 0.444 1.000   NA
 1140094 1140095 RSP_0013 RSP_0014     TRUE 0.985 -3.000 0.356 1.000   NA
 1140096 1140097 RSP_0015 RSP_0016     TRUE 0.997 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 1140097 1140098 RSP_0016 RSP_0017     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.067 Y NA
 1140098 1140099 RSP_0017 RSP_0018     FALSE 0.071 428.000 0.133 1.000 Y NA
 1140101 1140102 RSP_0020 RSP_0021   rpsI FALSE 0.008 341.000 0.000 NA   NA
 1140102 1140103 RSP_0021 RSP_0022 rpsI   TRUE 0.996 4.000 0.231 0.013 Y NA
 1140103 1140104 RSP_0022 RSP_6083     FALSE 0.039 205.000 0.000 NA   NA
 1140106 1140107 RSP_0025 RSP_0026     TRUE 0.943 -3.000 0.100 1.000 N NA
 1140107 1140108 RSP_0026 RSP_0027     FALSE 0.195 198.000 0.133 NA   NA
 1140109 1140110 RSP_0028 RSP_0029     FALSE 0.079 162.000 0.000 1.000   NA
 1140111 1140112 RSP_0030 RSP_6084     TRUE 0.606 47.000 0.095 NA   NA
 1140114 1140115 RSP_0032 RSP_0033 fliA   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140115 1140116 RSP_0033 RSP_0034   flhA TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1140117 1140118 RSP_0035 RSP_6086     TRUE 0.932 -3.000 0.052 NA   NA
 1140118 1140119 RSP_6086 RSP_0036   flgA TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 1140119 1140120 RSP_0036 RSP_0037 flgA flgM TRUE 0.579 22.000 0.021 NA   NA
 1140120 1140121 RSP_0037 RSP_6087 flgM   FALSE 0.504 29.000 0.021 NA   NA
 1140122 1140123 RSP_6088 RSP_6089     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1140124 1140125 RSP_6090 RSP_0038     FALSE 0.234 54.000 0.000 NA   NA
 1140126 1140127 RSP_0039 RSP_0040   fliS TRUE 0.955 -3.000 0.095 NA   NA
 1140127 1140128 RSP_0040 RSP_0041 fliS   FALSE 0.013 284.000 0.000 NA   NA
 1140128 1140129 RSP_0041 RSP_0042   cheA3 TRUE 0.648 138.000 0.500 NA   NA
 1140129 1140130 RSP_0042 RSP_0043 cheA3 cheY6 TRUE 0.978 27.000 0.750 1.000 Y NA
 1140130 1140131 RSP_0043 RSP_0044 cheY6 tlpT TRUE 0.666 204.000 0.500 1.000 Y NA
 1140131 1140132 RSP_0044 RSP_0045 tlpT slp TRUE 0.921 -3.000 0.069 1.000 N NA
 1140132 1140133 RSP_0045 RSP_0046 slp cheW4 TRUE 0.771 13.000 0.069 1.000 N NA
 1140133 1140134 RSP_0046 RSP_0047 cheW4 cheB2 TRUE 0.971 19.000 0.083 0.009 Y NA
 1140134 1140135 RSP_0047 RSP_0048 cheB2 cheR3 TRUE 0.985 0.000 0.083 1.000 Y NA
 1140135 1140136 RSP_0048 RSP_0049 cheR3 cheA4 TRUE 0.979 -3.000 0.250 1.000   NA
 1140136 1140137 RSP_0049 RSP_6091 cheA4   FALSE 0.468 145.000 0.250 NA   NA
 1140138 1140139 RSP_0051 RSP_0052 torF fliE TRUE 0.907 14.000 0.273 1.000 N NA
 1140139 1140140 RSP_0052 RSP_0053 fliE fliF1 TRUE 0.959 20.000 0.040 0.008 Y NA
 1140140 1140141 RSP_0053 RSP_0054 fliF1 fliG TRUE 0.996 2.000 0.220 0.008 Y NA
 1140141 1140142 RSP_0054 RSP_0055 fliG fliH TRUE 0.997 4.000 0.320 0.005 Y NA
 1140142 1140143 RSP_0055 RSP_0056 fliH fliI TRUE 0.973 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 1140143 1140144 RSP_0056 RSP_0057 fliI fliJ TRUE 0.961 2.000 0.154 NA   NA
 1140144 1140145 RSP_0057 RSP_0058 fliJ fliK FALSE 0.230 55.000 0.000 NA   NA
 1140145 1140146 RSP_0058 RSP_0059 fliK fliL TRUE 0.683 11.000 0.000 1.000   NA
 1140146 1140147 RSP_0059 RSP_0060 fliL fliM TRUE 0.990 4.000 0.016 0.001 Y NA
 1140147 1140148 RSP_0060 RSP_0061 fliM fliN FALSE 0.445 157.000 0.020 0.001   NA
 1140148 1140149 RSP_0061 RSP_0062 fliN fliO TRUE 0.667 132.000 0.443 1.000   NA
 1140149 1140150 RSP_0062 RSP_0063 fliO fliP TRUE 0.914 -3.000 0.029 1.000   NA
 1140150 1140151 RSP_0063 RSP_0064 fliP fliQ TRUE 0.996 0.000 0.177 0.008 Y NA
 1140151 1140152 RSP_0064 RSP_0065 fliQ fliR TRUE 0.997 0.000 0.215 0.002 Y NA
 1140152 1140153 RSP_0065 RSP_0066 fliR flhB TRUE 0.975 -13.000 0.111 1.000 Y NA
 1140153 1140154 RSP_0066 RSP_0067 flhB   TRUE 0.871 54.000 0.667 NA   NA
 1140154 1140155 RSP_0067 RSP_6092     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 1140156 1140157 RSP_0068 RSP_0069 rpoN2 fliC FALSE 0.448 176.000 0.500 1.000 N NA
 1140159 1140160 RSP_0071 RSP_0072 fleQ   TRUE 0.851 25.000 0.222 NA   NA
 1140160 1140161 RSP_0072 RSP_0073   flgL TRUE 0.976 7.000 0.375 NA   NA
 1140161 1140162 RSP_0073 RSP_0074 flgL flgK1 TRUE 0.997 8.000 0.357 0.001 Y NA
 1140162 1140163 RSP_0074 RSP_6093 flgK1 flgJ TRUE 0.594 108.000 0.217 NA   NA
 1140163 1140164 RSP_6093 RSP_0076 flgJ flgI TRUE 0.959 0.000 0.117 NA   NA
 1140164 1140165 RSP_0076 RSP_0077 flgI flgH TRUE 0.996 -3.000 0.149 0.010 Y NA
 1140165 1140166 RSP_0077 RSP_0078 flgH flgG TRUE 0.995 8.000 0.260 0.008 Y NA
 1140166 1140167 RSP_0078 RSP_0079 flgG flgF TRUE 0.863 54.000 0.174 1.000 Y NA
 1140167 1140168 RSP_0079 RSP_0080 flgF flgE TRUE 0.993 9.000 0.594 1.000 Y NA
 1140168 1140169 RSP_0080 RSP_0081 flgE flgD TRUE 0.981 25.000 0.875 NA Y NA
 1140169 1140170 RSP_0081 RSP_0082 flgD flgC TRUE 0.987 2.000 0.174 NA Y NA
 1140170 1140171 RSP_0082 RSP_0083 flgC flgB TRUE 0.997 0.000 0.222 0.005 Y NA
 1140173 1140174 RSP_0085 RSP_0086     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1140177 1140178 RSP_0089 RSP_0090   smoC TRUE 0.968 -3.000 0.145 1.000   NA
 1140178 1140179 RSP_0090 RSP_0091 smoC smoE TRUE 0.557 108.000 0.236 1.000 N NA
 1140179 1140180 RSP_0091 RSP_0092 smoE smoF TRUE 0.919 102.000 0.306 0.066 Y NA
 1140180 1140181 RSP_0092 RSP_0093 smoF smoG TRUE 0.998 2.000 0.918 0.066 Y NA
 1140181 1140182 RSP_0093 RSP_0094 smoG smoK TRUE 0.995 8.000 0.373 0.066 Y NA
 1140182 1140183 RSP_0094 RSP_0095 smoK smoS TRUE 0.973 2.000 0.309 1.000 N NA
 1140183 1140184 RSP_0095 RSP_0096 smoS mtlK TRUE 0.835 54.000 0.235 0.039 N NA
 1140184 1140185 RSP_0096 RSP_4304 mtlK   FALSE 0.034 215.000 0.000 NA   NA
 1140185 1140186 RSP_4304 RSP_0097   smoM FALSE 0.033 217.000 0.000 NA   NA
 1140187 1140188 RSP_6094 RSP_0099     TRUE 0.995 -3.000 0.465 NA Y NA
 1140189 1140190 RSP_0100 RSP_0101 nuoA nuoB TRUE 0.998 -3.000 0.377 0.005 Y NA
 1140190 1140191 RSP_0101 RSP_0102 nuoB nuoCD TRUE 0.999 -3.000 0.691 0.005 Y NA
 1140191 1140192 RSP_0102 RSP_0103 nuoCD nuoE TRUE 0.998 -3.000 0.407 0.011 Y NA
 1140192 1140193 RSP_0103 RSP_0104 nuoE nuoF TRUE 0.997 -3.000 0.236 0.011 Y NA
 1140193 1140194 RSP_0104 RSP_0105 nuoF nuoG TRUE 0.996 -3.000 0.184 0.011 Y NA
 1140194 1140195 RSP_0105 RSP_0106 nuoG nuoH TRUE 0.861 197.000 0.664 0.011 Y NA
 1140195 1140196 RSP_0106 RSP_0107 nuoH nuoI TRUE 0.998 -3.000 0.423 0.011 Y NA
 1140196 1140197 RSP_0107 RSP_0108 nuoI nuoJ TRUE 0.998 -3.000 0.428 0.011 Y NA
 1140197 1140198 RSP_0108 RSP_0109 nuoJ nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.005 Y NA
 1140198 1140199 RSP_0109 RSP_0110 nuoK nuoL TRUE 0.988 2.000 0.016 0.011 Y NA
 1140199 1140200 RSP_0110 RSP_0111N nuoL nuoM TRUE 0.730 -9.000 0.000 NA   NA
 1140200 1140201 RSP_0111N RSP_0111C nuoM nuoM FALSE 0.273 44.000 0.000 NA   NA
 1140201 1140202 RSP_0111C RSP_0112 nuoM nuoN TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140202 1140203 RSP_0112 RSP_0113 nuoN   FALSE 0.297 33.000 0.011 1.000 N NA
 1140203 1140204 RSP_0113 RSP_0114     TRUE 0.894 -3.000 0.022 NA   NA
 1140205 1140206 RSP_0115 RSP_0116     FALSE 0.400 26.000 0.000 NA   NA
 1140206 1140207 RSP_0116 RSP_0117     TRUE 0.971 11.000 0.542 NA   NA
 1140207 1140208 RSP_0117 RSP_0118     TRUE 0.999 -3.000 0.792 0.003 Y NA
 1140208 1140209 RSP_0118 RSP_0119     FALSE 0.019 335.000 0.000 0.099 N NA
 1140209 1140210 RSP_0119 RSP_6095     FALSE 0.019 253.000 0.000 NA   NA
 1140211 1140212 RSP_6096 RSP_0122   cerR TRUE 0.923 111.000 0.286 0.019 Y NA
 1140212 1140213 RSP_0122 RSP_6213 cerR cerA FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 1140213 1140214 RSP_6213 RSP_0123 cerA cerI TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140214 1140215 RSP_0123 RSP_0124 cerI   FALSE 0.508 115.000 0.154 NA   NA
 1140215 1140216 RSP_0124 RSP_0125   opgG FALSE 0.009 321.000 0.000 NA   NA
 1140216 1140217 RSP_0125 RSP_0126 opgG   TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140217 1140218 RSP_0126 RSP_0127   opgH TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1140218 1140219 RSP_0127 RSP_0128 opgH opgC TRUE 0.972 -7.000 0.333 NA   NA
 1140219 1140220 RSP_0128 RSP_4296 opgC   FALSE 0.220 61.000 0.000 NA   NA
 1140220 1140221 RSP_4296 RSP_0129   metN FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 1140221 1140222 RSP_0129 RSP_0130 metN metI TRUE 0.995 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 1140222 1140223 RSP_0130 RSP_0132 metI metQ TRUE 0.918 29.000 0.164 NA Y NA
 1140223 1140224 RSP_0132 RSP_0133 metQ   FALSE 0.007 236.000 0.000 NA N NA
 1140226 1140227 RSP_0134 RSP_0135     TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1140227 1140228 RSP_0135 RSP_0136     FALSE 0.137 119.000 0.000 NA   NA
 1140229 1140230 RSP_4322 RSP_0137     FALSE 0.147 113.000 0.000 NA   NA
 1140230 1140231 RSP_0137 RSP_0138     FALSE 0.097 138.000 0.000 NA   NA
 1140232 1140233 RSP_0139 RSP_0140     TRUE 0.985 21.000 0.319 0.013 Y NA
 1140233 1140234 RSP_0140 RSP_0141     TRUE 0.993 13.000 0.499 0.013 Y NA
 1140235 1140236 RSP_0142 RSP_4321     FALSE 0.410 25.000 0.000 NA   NA
 1140238 1140239 RSP_0144 RSP_0145     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140240 1140241 RSP_0146 RSP_0147 glnB glnA TRUE 0.810 82.000 0.145 1.000 Y NA
 1140242 1140243 RSP_0148 RSP_0149     TRUE 0.997 -3.000 0.273 0.018 Y NA
 1140243 1140244 RSP_0149 RSP_0150     TRUE 0.994 -3.000 0.341 1.000 Y NA
 1140245 1140246 RSP_0152 RSP_0151     TRUE 0.970 -3.000 0.172 NA   NA
 1140247 1140248 RSP_0153 RSP_0154     FALSE 0.218 147.000 0.056 NA   NA
 1140248 1140249 RSP_0154 RSP_0155     TRUE 0.993 -3.000 0.287 1.000 Y NA
 1140249 1140250 RSP_0155 RSP_0156     TRUE 0.994 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 1140250 1140251 RSP_0156 RSP_6098     FALSE 0.127 124.000 0.000 NA   NA
 1140251 1140252 RSP_6098 RSP_0157     FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 1140252 1140253 RSP_0157 RSP_0158     TRUE 0.897 14.000 0.238 1.000 N NA
 1140253 1140254 RSP_0158 RSP_0159   galE-2 TRUE 0.993 -16.000 0.667 1.000 Y NA
 1140254 1140255 RSP_0159 RSP_0160 galE-2   TRUE 0.993 -7.000 0.143 0.004 Y NA
 1140256 1140257 RSP_0161 RSP_0162     FALSE 0.140 117.000 0.000 NA   NA
 1140258 1140259 RSP_0163 RSP_0164     FALSE 0.388 153.000 0.200 NA   NA
 1140263 1140264 RSP_6099 RSP_0169     TRUE 0.623 125.000 0.328 NA   NA
 1140264 1140265 RSP_0169 RSP_0170     TRUE 0.985 0.000 0.406 NA   NA
 1140265 1140266 RSP_0170 RSP_0171     TRUE 0.986 -3.000 0.429 NA   NA
 1140266 1140267 RSP_0171 RSP_0172     FALSE 0.520 162.000 0.397 1.000   NA
 1140267 1140268 RSP_0172 RSP_0173     FALSE 0.208 137.000 0.033 1.000   NA
 1140268 1140269 RSP_0173 RSP_0174   ucpA TRUE 0.987 10.000 0.143 0.070 Y NA
 1140273 1140274 RSP_0179 RSP_0180     TRUE 0.965 30.000 0.539 NA Y NA
 1140274 1140275 RSP_0180 RSP_0181     TRUE 0.999 -3.000 0.855 0.066 Y NA
 1140275 1140276 RSP_0181 RSP_0182     FALSE 0.153 109.000 0.000 NA   NA
 1140276 1140277 RSP_0182 RSP_6100     FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1140277 1140278 RSP_6100 RSP_0183   dht TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140278 1140279 RSP_0183 RSP_0184 dht   FALSE 0.502 75.000 0.137 1.000 N NA
 1140280 1140281 RSP_0185 RSP_0186     TRUE 0.576 190.000 0.042 0.005 Y NA
 1140282 1140283 RSP_0187 RSP_0188     FALSE 0.256 73.000 0.010 NA   NA
 1140283 1140284 RSP_0188 RSP_0189     FALSE 0.306 64.000 0.017 NA   NA
 1140285 1140286 RSP_0190 RSP_0191 accB accC TRUE 0.994 8.000 0.153 0.001 Y NA
 1140286 1140287 RSP_0191 RSP_0192 accC aat TRUE 0.765 20.000 0.114 1.000 N NA
 1140288 1140289 RSP_0193 RSP_0194     TRUE 0.959 -3.000 0.108 NA   NA
 1140289 1140290 RSP_0194 RSP_0195     TRUE 0.971 0.000 0.199 NA   NA
 1140290 1140291 RSP_0195 RSP_0196   clpX FALSE 0.098 125.000 0.009 1.000 N NA
 1140291 1140292 RSP_0196 RSP_0197 clpX clpP TRUE 0.836 125.000 0.352 1.000 Y NA
 1140292 1140293 RSP_0197 RSP_0198 clpP   FALSE 0.040 167.000 0.004 1.000 N NA
 1140294 1140295 RSP_0200 RSP_0201     TRUE 0.995 -3.000 0.627 0.066   NA
 1140295 1140296 RSP_0201 RSP_6101     TRUE 0.990 -3.000 0.602 1.000   NA
 1140296 1140297 RSP_6101 RSP_0202     FALSE 0.108 133.000 0.000 NA   NA
 1140299 1140300 RSP_0204 RSP_4299     FALSE 0.222 60.000 0.000 NA   NA
 1140300 1140301 RSP_4299 RSP_0205     FALSE 0.418 24.000 0.000 NA   NA
 1140302 1140303 RSP_0206 RSP_0207     TRUE 0.888 36.000 0.500 NA   NA
 1140303 1140304 RSP_0207 RSP_0208     TRUE 0.986 2.000 0.500 NA   NA
 1140304 1140305 RSP_0208 RSP_0209     TRUE 0.976 2.000 0.286 NA   NA
 1140305 1140306 RSP_0209 RSP_0211     TRUE 0.946 0.000 0.080 NA   NA
 1140306 1140307 RSP_0211 RSP_0212     FALSE 0.345 87.000 0.040 NA   NA
 1140307 1140308 RSP_0212 RSP_0213     TRUE 0.730 -9.000 0.000 NA   NA
 1140308 1140309 RSP_0213 RSP_0214     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140309 1140310 RSP_0214 RSP_0215     FALSE 0.066 163.000 0.000 NA   NA
 1140310 1140311 RSP_0215 RSP_0216     FALSE 0.031 221.000 0.000 NA   NA
 1140311 1140312 RSP_0216 RSP_6102     FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 1140312 1140313 RSP_6102 RSP_0217   int FALSE 0.466 20.000 0.000 NA   NA
 1140316 1140317 RSP_0219 RSP_0220     FALSE 0.007 357.000 0.000 NA   NA
 1140317 1140318 RSP_0220 RSP_6103     FALSE 0.198 71.000 0.000 NA   NA
 1140318 1140319 RSP_6103 RSP_0221     FALSE 0.171 94.000 0.000 NA   NA
 1140319 1140320 RSP_0221 RSP_0223     TRUE 0.946 14.000 0.394 NA   NA
 1140320 1140321 RSP_0223 RSP_0224     TRUE 0.983 6.000 0.515 NA   NA
 1140322 1140323 RSP_4314 RSP_6104     FALSE 0.002 1046.000 0.000 NA   NA
 1140324 1140325 RSP_0226 RSP_0227     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1140325 1140326 RSP_0227 RSP_0229     TRUE 0.950 -13.000 0.044 0.055   NA
 1140327 1140328 RSP_0228 RSP_0230 hmuS   FALSE 0.208 87.000 0.000 1.000   NA
 1140328 1140329 RSP_0230 RSP_6105     FALSE 0.342 33.000 0.000 NA   NA
 1140329 1140330 RSP_6105 RSP_0231   motB FALSE 0.097 138.000 0.000 NA   NA
 1140330 1140331 RSP_0231 RSP_0233 motB motA TRUE 0.743 10.000 0.030 1.000 N NA
 1140331 1140332 RSP_0233 RSP_0234 motA tlpL FALSE 0.051 512.000 0.000 0.009 Y NA
 1140332 1140333 RSP_0234 RSP_6106 tlpL   FALSE 0.005 401.000 0.000 NA   NA
 1140335 1140336 RSP_0236 RSP_0237   argE TRUE 0.990 0.000 0.182 1.000 Y NA
 1140336 1140337 RSP_0237 RSP_0238 argE   FALSE 0.226 135.000 0.045 NA   NA
 1140337 1140338 RSP_0238 RSP_0239   PntB FALSE 0.019 285.000 0.012 NA   NA
 1140338 1140339 RSP_0239 RSP_0240 PntB pntA TRUE 0.997 11.000 0.745 0.001 Y NA
 1140339 1140340 RSP_0240 RSP_0241 pntA   FALSE 0.194 139.000 0.071 NA N NA
 1140341 1140342 RSP_0242 RSP_0243     FALSE 0.029 224.000 0.000 NA   NA
 1140343 1140344 RSP_0244 RSP_0245     FALSE 0.033 227.000 0.000 1.000   NA
 1140345 1140346 RSP_0246 RSP_0247     TRUE 0.827 -10.000 0.017 1.000   NA
 1140349 1140350 RSP_0250 RSP_0251     TRUE 0.785 131.000 0.852 NA   NA
 1140350 1140351 RSP_0251 RSP_0252     TRUE 0.570 48.000 0.121 1.000 N NA
 1140353 1140354 RSP_0254 RSP_0255 dxsA pufX FALSE 0.456 174.000 0.385 NA   NA
 1140354 1140355 RSP_0255 RSP_0256 pufX pufM TRUE 0.883 13.000 0.132 NA   NA
 1140355 1140356 RSP_0256 RSP_0257 pufM pufL TRUE 0.996 -7.000 0.895 0.003   NA
 1140356 1140357 RSP_0257 RSP_0258 pufL pufA TRUE 0.923 124.000 0.829 0.003   NA
 1140357 1140358 RSP_0258 RSP_6108 pufA pufB TRUE 0.992 14.000 0.946 0.003   NA
 1140358 1140359 RSP_6108 RSP_6109 pufB pufK TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140359 1140360 RSP_6109 RSP_0259 pufK pufQ FALSE 0.207 67.000 0.000 NA   NA
 1140360 1140361 RSP_0259 RSP_0260 pufQ bchZ TRUE 0.993 -3.000 0.231 0.002   NA
 1140361 1140362 RSP_0260 RSP_0261 bchZ bchY TRUE 0.997 0.000 0.632 0.002   NA
 1140362 1140363 RSP_0261 RSP_0262 bchY bchX TRUE 0.927 76.000 0.491 0.002   NA
 1140363 1140364 RSP_0262 RSP_0263 bchX bchC TRUE 0.997 -3.000 0.882 0.002 N NA
 1140364 1140365 RSP_0263 RSP_0264 bchC crtF TRUE 0.653 153.000 0.627 1.000   NA
 1140365 1140366 RSP_0264 RSP_0265 crtF crtE TRUE 0.850 53.000 0.500 1.000   NA
 1140367 1140368 RSP_0266 RSP_0267 crtD ctrC TRUE 0.932 66.000 0.434 0.001   NA
 1140369 1140370 RSP_0269 RSP_0270 tspO crtB FALSE 0.504 32.000 0.050 1.000 N NA
 1140370 1140371 RSP_0270 RSP_0271 crtB crtI TRUE 0.978 -3.000 0.332 1.000 N NA
 1140372 1140373 RSP_0272 RSP_0273 crtA bchI TRUE 0.949 5.000 0.131 NA   NA
 1140373 1140374 RSP_0273 RSP_0274 bchI bchD TRUE 0.998 -3.000 0.465 0.001 Y NA
 1140374 1140375 RSP_0274 RSP_0275 bchD bchO TRUE 0.962 3.000 0.152 1.000   NA
 1140376 1140377 RSP_0276 RSP_0277   bchP TRUE 0.880 3.000 0.050 1.000 N NA
 1140377 1140378 RSP_0277 RSP_0278 bchP   TRUE 0.978 3.000 0.314 NA   NA
 1140378 1140379 RSP_0278 RSP_0279   bchG TRUE 0.990 -3.000 0.640 NA   NA
 1140379 1140380 RSP_0279 RSP_0280 bchG bchJ TRUE 0.764 74.000 0.060 0.002   NA
 1140380 1140381 RSP_0280 RSP_0281 bchJ bchE TRUE 0.977 7.000 0.368 1.000   NA
 1140381 1140382 RSP_0281 RSP_0282 bchE ppsR FALSE 0.186 148.000 0.035 1.000   NA
 1140382 1140383 RSP_0282 RSP_0283 ppsR ppaA TRUE 0.797 59.000 0.357 1.000   NA
 1140384 1140385 RSP_0284 RSP_0285 bchF bchN TRUE 0.995 -3.000 0.311 0.001   NA
 1140385 1140386 RSP_0285 RSP_0286 bchN bchB TRUE 0.976 71.000 0.591 0.001 Y NA
 1140386 1140387 RSP_0286 RSP_0287 bchB bchH TRUE 0.984 -10.000 0.278 0.004 N NA
 1140387 1140388 RSP_0287 RSP_0288 bchH bchL TRUE 0.890 62.000 0.344 0.004 N NA
 1140388 1140389 RSP_0288 RSP_0289 bchL bchM TRUE 0.898 44.000 0.274 0.004 N NA
 1140389 1140390 RSP_0289 RSP_0290 bchM   TRUE 0.960 -3.000 0.111 NA   NA
 1140390 1140391 RSP_0290 RSP_0291   puhA TRUE 0.926 19.000 0.382 NA   NA
 1140391 1140392 RSP_0291 RSP_0292 puhA   TRUE 0.809 128.000 0.912 NA   NA
 1140392 1140393 RSP_0292 RSP_0293     TRUE 0.809 77.000 0.515 NA   NA
 1140393 1140394 RSP_0293 RSP_6110     TRUE 0.930 22.000 0.481 NA   NA
 1140394 1140395 RSP_6110 RSP_0294     TRUE 0.984 -3.000 0.361 NA   NA
 1140395 1140396 RSP_0294 RSP_0295     TRUE 0.789 62.000 0.375 NA   NA
 1140396 1140397 RSP_0295 RSP_0296   cycA FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 1140398 1140399 RSP_0297 RSP_0298     TRUE 0.996 -3.000 0.731 0.025   NA
 1140399 1140400 RSP_0298 RSP_0299     TRUE 0.993 -3.000 0.823 1.000   NA
 1140400 1140401 RSP_0299 RSP_0300     FALSE 0.177 367.000 0.121 0.065 Y NA
 1140401 1140402 RSP_0300 RSP_0301     TRUE 0.830 64.000 0.150 NA Y NA
 1140402 1140403 RSP_0301 RSP_0302   ureG FALSE 0.007 300.000 0.010 NA N NA
 1140403 1140404 RSP_0302 RSP_0303 ureG ureF TRUE 0.997 -3.000 0.283 0.003 Y NA
 1140404 1140405 RSP_0303 RSP_0304 ureF ureE TRUE 0.998 -3.000 0.330 0.003 Y NA
 1140405 1140406 RSP_0304 RSP_0305 ureE   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140406 1140407 RSP_0305 RSP_6111   ureC TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140409 1140410 RSP_0307 RSP_0308   ureB FALSE 0.496 25.000 0.010 NA   NA
 1140410 1140411 RSP_0308 RSP_0309 ureB ureA TRUE 0.982 51.000 0.595 0.001 Y NA
 1140411 1140412 RSP_0309 RSP_0310 ureA ureD TRUE 0.987 12.000 0.664 0.003 N NA
 1140413 1140414 RSP_0311 RSP_0312     TRUE 0.762 35.000 0.176 NA   NA
 1140414 1140415 RSP_0312 RSP_0313     FALSE 0.220 61.000 0.000 NA   NA
 1140415 1140416 RSP_0313 RSP_0314   pucB TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1140416 1140417 RSP_0314 RSP_6256 pucB pucA TRUE 0.991 16.000 1.000 0.003   NA
 1140417 1140418 RSP_6256 RSP_0315 pucA pucC FALSE 0.273 195.000 0.222 NA   NA
 1140418 1140419 RSP_0315 RSP_0316 pucC   FALSE 0.003 500.000 0.000 NA   NA
 1140420 1140421 RSP_0317 RSP_0318 hemN   FALSE 0.343 74.000 0.034 NA   NA
 1140421 1140422 RSP_0318 RSP_0319     TRUE 0.913 -3.000 0.034 NA   NA
 1140422 1140423 RSP_0319 RSP_0320   NnrT TRUE 0.984 -3.000 0.364 NA   NA
 1140423 1140424 RSP_0320 RSP_0321 NnrT norD TRUE 0.940 2.000 0.082 NA   NA
 1140424 1140425 RSP_0321 RSP_0322 norD norQ TRUE 0.996 5.000 0.590 0.001   NA
 1140425 1140426 RSP_0322 RSP_0323 norQ norB TRUE 0.997 -3.000 0.529 0.001   NA
 1140426 1140427 RSP_0323 RSP_0324 norB norC TRUE 0.991 14.000 0.794 0.001   NA
 1140428 1140429 RSP_0325 RSP_0326     FALSE 0.058 174.000 0.000 NA   NA
 1140431 1140432 RSP_0328 RSP_0329 nnrS   FALSE 0.141 134.000 0.041 NA N NA
 1140433 1140434 RSP_0330 RSP_0331     FALSE 0.470 23.000 0.000 1.000   NA
 1140434 1140435 RSP_0331 RSP_0332     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 1140435 1140436 RSP_0332 RSP_0333     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 1140436 1140437 RSP_0333 RSP_0334     TRUE 0.944 34.000 1.000 NA   NA
 1140439 1140440 RSP_0337 RSP_0338     TRUE 0.987 -3.000 0.446 1.000   NA
 1140440 1140441 RSP_0338 RSP_0339     FALSE 0.240 75.000 0.002 1.000   NA
 1140441 1140442 RSP_0339 RSP_0340     FALSE 0.078 161.000 0.002 NA   NA
 1140442 1140443 RSP_0340 RSP_0341     FALSE 0.067 190.000 0.012 NA   NA
 1140443 1140444 RSP_0341 RSP_0342     TRUE 0.967 0.000 0.151 1.000   NA
 1140444 1140445 RSP_0342 RSP_0343     TRUE 0.933 92.000 0.976 0.065   NA
 1140445 1140446 RSP_0343 RSP_0344     TRUE 0.988 -10.000 0.864 1.000   NA
 1140446 1140447 RSP_0344 RSP_0345     TRUE 0.990 -3.000 0.591 1.000   NA
 1140448 1140449 RSP_0346 RSP_0347     TRUE 0.656 155.000 0.301 0.065   NA
 1140449 1140450 RSP_0347 RSP_0348     TRUE 0.996 -3.000 0.774 0.065   NA
 1140450 1140451 RSP_0348 RSP_0349     TRUE 0.988 17.000 0.461 0.065 Y NA
 1140451 1140452 RSP_0349 RSP_0350     FALSE 0.438 54.000 0.045 NA   NA
 1140452 1140453 RSP_0350 RSP_0351     TRUE 0.963 4.000 0.182 NA   NA
 1140455 1140456 RSP_0353 RSP_0354     FALSE 0.014 279.000 0.000 NA   NA
 1140457 1140458 RSP_0355 RSP_0356     TRUE 0.757 153.000 0.084 0.008 Y NA
 1140458 1140459 RSP_0356 RSP_0357     TRUE 0.999 0.000 0.947 0.008 Y NA
 1140459 1140460 RSP_0357 RSP_0358   gor FALSE 0.285 56.000 0.032 1.000 N NA
 1140460 1140461 RSP_0358 RSP_0359 gor cbbI TRUE 0.799 5.000 0.026 1.000 N NA
 1140461 1140462 RSP_0359 RSP_0360 cbbI   FALSE 0.371 29.000 0.000 NA   NA
 1140463 1140464 RSP_0361 RSP_0362 sda   FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1140464 1140465 RSP_0362 RSP_0364     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140466 1140467 RSP_0363 RSP_0365     FALSE 0.240 52.000 0.000 NA   NA
 1140467 1140468 RSP_0365 RSP_6113     FALSE 0.159 103.000 0.000 NA   NA
 1140468 1140469 RSP_6113 RSP_0366     FALSE 0.322 80.000 0.030 NA   NA
 1140470 1140471 RSP_0367 RSP_0368     FALSE 0.173 163.000 0.083 1.000 N NA
 1140471 1140472 RSP_0368 RSP_0369     FALSE 0.061 179.000 0.003 NA   NA
 1140472 1140473 RSP_0369 RSP_0370     FALSE 0.277 81.000 0.017 NA   NA
 1140473 1140474 RSP_0370 RSP_0371     FALSE 0.421 164.000 0.290 NA   NA
 1140474 1140475 RSP_0371 RSP_0372     TRUE 0.964 43.000 0.774 1.000 Y NA
 1140475 1140476 RSP_0372 RSP_0373     TRUE 0.980 40.000 0.724 0.078 Y NA
 1140476 1140477 RSP_0373 RSP_0374     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.065 Y NA
 1140477 1140478 RSP_0374 RSP_0375     TRUE 0.994 5.000 0.481 1.000 Y NA
 1140478 1140479 RSP_0375 RSP_0376     TRUE 0.690 60.000 0.278 1.000 N NA
 1140479 1140480 RSP_0376 RSP_0377     TRUE 0.970 5.000 0.329 1.000 N NA
 1140480 1140481 RSP_0377 RSP_0378     TRUE 0.997 -3.000 0.706 1.000 Y NA
 1140481 1140482 RSP_0378 RSP_0379     FALSE 0.005 305.000 0.000 1.000 N NA
 1140483 1140484 RSP_0380 RSP_0381     FALSE 0.193 127.000 0.021 NA   NA
 1140484 1140485 RSP_0381 RSP_0382     FALSE 0.184 154.000 0.049 NA   NA
 1140488 1140489 RSP_0385 RSP_0386     FALSE 0.001 510.000 0.000 1.000 N NA
 1140490 1140491 RSP_0387 RSP_0388     FALSE 0.253 67.000 0.006 NA   NA
 1140491 1140492 RSP_0388 RSP_0389   folA FALSE 0.388 34.000 0.005 NA   NA
 1140492 1140493 RSP_0389 RSP_0390 folA   TRUE 0.975 0.000 0.295 1.000 N NA
 1140495 1140496 RSP_0393 RSP_0394     TRUE 0.895 15.000 0.277 NA N NA
 1140496 1140497 RSP_0394 RSP_0396     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 1140497 1140498 RSP_0396 RSP_0395   rpoD TRUE 0.659 12.000 0.004 NA   NA
 1140498 1140499 RSP_0395 RSP_0397 rpoD dnaG TRUE 0.614 105.000 0.299 1.000 N NA
 1140499 1140500 RSP_0397 RSP_0398 dnaG   FALSE 0.079 123.000 0.002 1.000 N NA
 1140501 1140502 RSP_0399 RSP_0400     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 1140502 1140503 RSP_0400 RSP_0401     TRUE 0.948 4.000 0.111 NA   NA
 1140505 1140506 RSP_0403 RSP_0404     FALSE 0.505 63.000 0.112 1.000 N NA
 1140506 1140507 RSP_0404 RSP_0405     TRUE 0.908 -3.000 0.055 1.000 N NA
 1140507 1140508 RSP_0405 RSP_4312     FALSE 0.198 71.000 0.000 NA   NA
 1140509 1140510 RSP_0406 RSP_0407     FALSE 0.026 213.000 0.008 1.000 N NA
 1140511 1140512 RSP_0408 RSP_0409     TRUE 0.967 -3.000 0.154 NA   NA
 1140513 1140514 RSP_0410 RSP_6114     TRUE 0.972 0.000 0.192 1.000   NA
 1140514 1140515 RSP_6114 RSP_0411     FALSE 0.477 64.000 0.067 NA   NA
 1140515 1140516 RSP_0411 RSP_0412     FALSE 0.199 122.000 0.017 NA   NA
 1140516 1140517 RSP_0412 RSP_6115     TRUE 0.603 56.000 0.118 NA   NA
 1140519 1140520 RSP_0414 RSP_6227     TRUE 0.977 2.000 0.292 NA   NA
 1140520 1140521 RSP_6227 RSP_0415     TRUE 0.951 2.000 0.109 NA   NA
 1140521 1140522 RSP_0415 RSP_0416     FALSE 0.093 77.000 0.000 1.000 N NA
 1140523 1140524 RSP_0418 RSP_0419     TRUE 0.967 -31.000 0.362 NA   NA
 1140525 1140526 RSP_0420 RSP_0421     TRUE 0.878 16.000 0.167 NA   NA
 1140526 1140527 RSP_0421 RSP_0422     TRUE 0.958 -12.000 0.250 NA   NA
 1140527 1140528 RSP_0422 RSP_0423     FALSE 0.257 79.000 0.012 NA   NA
 1140529 1140530 RSP_0424 RSP_0425   metG FALSE 0.089 144.000 0.000 NA   NA
 1140531 1140532 RSP_0426 RSP_0427     FALSE 0.365 74.000 0.041 NA   NA
 1140532 1140533 RSP_0427 RSP_0428     FALSE 0.007 344.000 0.000 NA   NA
 1140537 1140538 RSP_0431 RSP_0432     TRUE 0.938 10.000 0.176 NA   NA
 1140538 1140539 RSP_0432 RSP_0433     TRUE 0.994 -3.000 0.964 NA   NA
 1140539 1140540 RSP_0433 RSP_0434   SufD TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140540 1140541 RSP_0434 RSP_0437 SufD SufC TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140541 1140542 RSP_0437 RSP_0439 SufC   TRUE 0.734 10.000 0.004 NA   NA
 1140542 1140543 RSP_0439 RSP_0440   sufB FALSE 0.361 35.000 0.003 NA   NA
 1140543 1140544 RSP_0440 RSP_0442 sufB   FALSE 0.464 76.000 0.109 1.000 N NA
 1140544 1140545 RSP_0442 RSP_0443     FALSE 0.536 83.000 0.183 NA N NA
 1140546 1140547 RSP_0444 RSP_0445     TRUE 0.905 -3.000 0.022 1.000   NA
 1140547 1140548 RSP_0445 RSP_0446     FALSE 0.343 85.000 0.031 1.000   NA
 1140548 1140549 RSP_0446 RSP_0447     FALSE 0.013 311.000 0.008 NA   NA
 1140549 1140550 RSP_0447 RSP_0448     FALSE 0.186 100.000 0.002 NA   NA
 1140551 1140552 RSP_0449 RSP_0450     FALSE 0.200 156.000 0.060 NA   NA
 1140552 1140553 RSP_0450 RSP_0451   alaS TRUE 0.879 2.000 0.024 NA   NA
 1140553 1140554 RSP_0451 RSP_0452 alaS recA FALSE 0.307 87.000 0.054 1.000 N NA
 1140556 1140557 RSP_0454 RSP_0455     FALSE 0.228 100.000 0.045 NA N NA
 1140559 1140560 RSP_0456 RSP_0458     TRUE 0.969 2.000 0.208 NA   NA
 1140562 1140563 RSP_0460 RSP_0461     TRUE 0.931 -7.000 0.165 NA N NA
 1140565 1140566 RSP_0463 RSP_0464     FALSE 0.081 131.000 0.006 1.000 N NA
 1140566 1140567 RSP_0464 RSP_0465     TRUE 0.999 5.000 0.948 0.004 Y NA
 1140567 1140568 RSP_0465 RSP_0466     TRUE 0.980 0.000 0.381 1.000 N NA
 1140569 1140570 RSP_0467 RSP_0468 ubiD   TRUE 0.980 -3.000 0.051 NA Y NA
 1140571 1140572 RSP_0469 RSP_0470     FALSE 0.212 84.000 0.000 1.000   NA
 1140573 1140574 RSP_6116 RSP_0472     FALSE 0.249 105.000 0.022 NA   NA
 1140574 1140575 RSP_0472 RSP_0473     TRUE 0.934 -3.000 0.055 NA   NA
 1140575 1140576 RSP_0473 RSP_0474   cycP FALSE 0.014 220.000 0.000 1.000 N NA
 1140576 1140577 RSP_0474 RSP_0475 cycP   TRUE 0.987 4.000 0.035 0.058 Y NA
 1140582 1140583 RSP_0480 RSP_0481 uxuB   TRUE 0.949 17.000 0.318 0.068 N NA
 1140583 1140584 RSP_0481 RSP_0482   kduI TRUE 0.986 -3.000 0.529 1.000 N NA
 1140584 1140585 RSP_0482 RSP_0483 kduI   FALSE 0.235 142.000 0.059 NA   NA
 1140585 1140586 RSP_0483 RSP_0484     TRUE 0.883 8.000 0.050 NA   NA
 1140586 1140587 RSP_0484 RSP_0485     TRUE 0.993 3.000 0.390 NA Y NA
 1140587 1140588 RSP_0485 RSP_0487     TRUE 0.947 63.000 0.756 NA Y NA
 1140588 1140589 RSP_0487 RSP_0488   uxaC TRUE 0.916 26.000 0.115 1.000 Y NA
 1140590 1140591 RSP_0489 RSP_0490     FALSE 0.358 139.000 0.182 1.000 N NA
 1140591 1140592 RSP_0490 RSP_0491   hupT FALSE 0.002 427.000 0.000 1.000 N NA
 1140592 1140593 RSP_0491 RSP_0492 hupT hupU TRUE 0.978 -3.000 0.319 1.000 N NA
 1140593 1140594 RSP_0492 RSP_0493 hupU hupV TRUE 0.991 -3.000 0.194 1.000 Y NA
 1140594 1140595 RSP_0493 RSP_0494 hupV hypF FALSE 0.037 210.000 0.020 1.000 N NA
 1140595 1140596 RSP_0494 RSP_0495 hypF hupS FALSE 0.010 237.000 0.000 1.000 N NA
 1140596 1140597 RSP_0495 RSP_0496 hupS hupL TRUE 0.998 4.000 0.611 0.001 Y NA
 1140597 1140598 RSP_0496 RSP_0497 hupL   TRUE 0.826 12.000 0.097 NA N NA
 1140598 1140599 RSP_0497 RSP_0498   hupC FALSE 0.143 142.000 0.050 NA N NA
 1140599 1140600 RSP_0498 RSP_0499 hupC hupD FALSE 0.203 291.000 0.177 1.000 Y NA
 1140600 1140601 RSP_0499 RSP_0500 hupD   TRUE 0.977 0.000 0.250 NA   NA
 1140601 1140602 RSP_0500 RSP_0501   hupG TRUE 0.982 -3.000 0.308 NA   NA
 1140602 1140603 RSP_0501 RSP_0502 hupG hupH TRUE 0.975 12.000 0.769 NA   NA
 1140603 1140604 RSP_0502 RSP_0503 hupH hupJ TRUE 0.975 -3.000 0.218 NA   NA
 1140604 1140605 RSP_0503 RSP_0504 hupJ hupK TRUE 0.978 -3.000 0.255 NA   NA
 1140605 1140606 RSP_0504 RSP_0505 hupK hypA TRUE 0.965 -7.000 0.262 NA   NA
 1140606 1140607 RSP_0505 RSP_0506 hypA hypB TRUE 0.990 0.000 0.167 0.003   NA
 1140607 1140608 RSP_0506 RSP_0507 hypB   TRUE 0.961 0.000 0.180 1.000 N NA
 1140608 1140609 RSP_0507 RSP_0508   hypC TRUE 0.955 2.000 0.200 NA N NA
 1140609 1140610 RSP_0508 RSP_0509 hypC hypD TRUE 0.984 -3.000 0.080 NA Y NA
 1140610 1140611 RSP_0509 RSP_0510 hypD hypE TRUE 0.921 51.000 0.353 1.000 Y NA
 1140611 1140612 RSP_0510 RSP_6117 hypE   FALSE 0.070 68.000 0.000 NA N NA
 1140612 1140613 RSP_6117 RSP_0511     TRUE 0.736 53.000 0.333 NA N NA
 1140613 1140614 RSP_0511 RSP_0512     FALSE 0.364 214.000 0.000 0.017 Y NA
 1140615 1140616 RSP_0513 RSP_0514     FALSE 0.059 181.000 0.000 1.000   NA
 1140616 1140617 RSP_0514 RSP_0515     TRUE 0.786 62.000 0.367 NA   NA
 1140617 1140618 RSP_0515 RSP_0516     TRUE 0.942 -3.000 0.067 NA   NA
 1140618 1140619 RSP_0516 RSP_0517     TRUE 0.948 0.000 0.083 NA   NA
 1140619 1140620 RSP_0517 RSP_0518     TRUE 0.982 2.000 0.375 NA   NA
 1140620 1140621 RSP_0518 RSP_0519     TRUE 0.993 -3.000 0.290 1.000 Y NA
 1140621 1140622 RSP_0519 RSP_0520     TRUE 0.998 -3.000 0.355 0.004 Y NA
 1140623 1140624 RSP_0521 RSP_0522     TRUE 0.992 -9.000 0.621 0.038   NA
 1140624 1140625 RSP_0522 RSP_0523     TRUE 0.928 7.000 0.083 1.000   NA
 1140627 1140628 RSP_0525 RSP_0526     TRUE 0.893 10.000 0.077 NA   NA
 1140629 1140630 RSP_0527 RSP_0528 rpoN nifW FALSE 0.278 101.000 0.022 1.000   NA
 1140630 1140631 RSP_0528 RSP_0529 nifW nifV TRUE 0.675 109.000 0.300 1.000   NA
 1140631 1140632 RSP_0529 RSP_0530 nifV nifS TRUE 0.992 0.000 0.250 1.000 Y NA
 1140632 1140633 RSP_0530 RSP_0531 nifS nifU TRUE 0.834 0.000 0.023 1.000 N NA
 1140633 1140634 RSP_0531 RSP_0532 nifU   TRUE 0.834 10.000 0.037 NA   NA
 1140634 1140635 RSP_0532 RSP_0533   nifQ FALSE 0.011 564.000 0.094 NA   NA
 1140635 1140636 RSP_0533 RSP_0534 nifQ   TRUE 0.965 -19.000 0.307 1.000   NA
 1140636 1140637 RSP_0534 RSP_0535     FALSE 0.146 114.000 0.000 NA   NA
 1140637 1140638 RSP_0535 RSP_0536   nifX TRUE 0.938 -3.000 0.062 NA   NA
 1140638 1140639 RSP_0536 RSP_0537 nifX nifN TRUE 0.993 -28.000 0.663 0.004   NA
 1140639 1140640 RSP_0537 RSP_0538 nifN nifE TRUE 0.998 0.000 0.475 0.002 Y NA
 1140640 1140641 RSP_0538 RSP_0539 nifE nifK TRUE 0.685 247.000 0.380 0.002 Y NA
 1140641 1140642 RSP_0539 RSP_0540 nifK nifD TRUE 0.978 101.000 0.902 0.002 Y NA
 1140642 1140643 RSP_0540 RSP_0541 nifD nifH TRUE 0.701 62.000 0.039 0.002 N NA
 1140643 1140644 RSP_0541 RSP_0542 nifH   FALSE 0.004 444.000 0.000 NA   NA
 1140644 1140645 RSP_0542 RSP_0543   fixU TRUE 0.964 5.000 0.215 NA   NA
 1140645 1140646 RSP_0543 RSP_0544 fixU nifZ TRUE 0.995 -3.000 0.354 0.004   NA
 1140646 1140647 RSP_0544 RSP_0545 nifZ   TRUE 0.841 -13.000 0.028 1.000   NA
 1140647 1140648 RSP_0545 RSP_0546   nifB FALSE 0.045 207.000 0.000 1.000   NA
 1140648 1140649 RSP_0546 RSP_0547 nifB nifA FALSE 0.211 247.000 0.071 0.004   NA
 1140649 1140650 RSP_0547 RSP_0548 nifA   FALSE 0.004 280.000 0.000 NA N NA
 1140651 1140652 RSP_0549 RSP_0550     TRUE 0.577 119.000 0.231 NA   NA
 1140652 1140653 RSP_0550 RSP_0551     TRUE 0.825 13.000 0.099 1.000 N NA
 1140656 1140657 RSP_0553 RSP_0554 ruvB htpx FALSE 0.139 65.000 0.003 1.000 N NA
 1140657 1140658 RSP_0554 RSP_0555 htpx ruvA FALSE 0.088 119.000 0.003 1.000 N NA
 1140658 1140659 RSP_0555 RSP_0556 ruvA ruvC TRUE 0.998 -3.000 0.451 0.010 Y NA
 1140661 1140662 RSP_0558 RSP_0559   msrA FALSE 0.172 64.000 0.009 1.000 N NA
 1140662 1140663 RSP_0559 RSP_0560 msrA priA FALSE 0.013 222.000 0.000 1.000 N NA
 1140664 1140665 RSP_0561 RSP_0562     TRUE 0.840 23.000 0.183 NA   NA
 1140665 1140666 RSP_0562 RSP_0563     TRUE 0.954 -3.000 0.093 NA   NA
 1140666 1140667 RSP_0563 RSP_0564     FALSE 0.175 109.000 0.000 1.000   NA
 1140667 1140668 RSP_0564 RSP_0565     FALSE 0.192 96.000 0.000 1.000   NA
 1140669 1140670 RSP_0566 RSP_0567     FALSE 0.243 64.000 0.000 1.000   NA
 1140670 1140671 RSP_0567 RSP_6119     TRUE 0.914 -3.000 0.029 1.000   NA
 1140671 1140672 RSP_6119 RSP_0568     TRUE 0.735 -16.000 0.000 1.000   NA
 1140672 1140673 RSP_0568 RSP_0569     FALSE 0.056 195.000 0.005 NA   NA
 1140673 1140674 RSP_0569 RSP_0570     TRUE 0.834 101.000 0.791 NA   NA
 1140676 1140677 RSP_0572 RSP_0573   phoB TRUE 0.915 4.000 0.047 1.000   NA
 1140677 1140678 RSP_0573 RSP_0574 phoB   TRUE 0.952 2.000 0.114 NA   NA
 1140678 1140679 RSP_0574 RSP_0575     TRUE 0.972 11.000 0.567 NA   NA
 1140679 1140680 RSP_0575 RSP_0576     FALSE 0.530 64.000 0.079 1.000   NA
 1140680 1140681 RSP_0576 RSP_0577     TRUE 0.972 16.000 0.916 NA   NA
 1140681 1140682 RSP_0577 RSP_0578     FALSE 0.414 88.000 0.063 NA   NA
 1140682 1140683 RSP_0578 RSP_0579     TRUE 0.682 40.000 0.179 1.000 N NA
 1140683 1140684 RSP_0579 RSP_0580     FALSE 0.083 93.000 0.000 1.000 N NA
 1140685 1140686 RSP_0581 RSP_0582     FALSE 0.038 150.000 0.000 1.000 N NA
 1140688 1140689 RSP_0584 RSP_0585   osmC FALSE 0.002 458.000 0.000 1.000 N NA
 1140691 1140692 RSP_0587 RSP_0588     TRUE 0.855 -3.000 0.004 NA   NA
 1140696 1140697 RSP_0591 RSP_0592     FALSE 0.082 94.000 0.000 1.000 N NA
 1140697 1140698 RSP_0592 RSP_0594     FALSE 0.359 94.000 0.000 0.067 N NA
 1140699 1140700 RSP_0595 RSP_0596     FALSE 0.186 84.000 0.019 1.000 N NA
 1140700 1140701 RSP_0596 RSP_0597     FALSE 0.524 87.000 0.163 1.000 N NA
 1140701 1140702 RSP_0597 RSP_0598     TRUE 0.852 -3.000 0.027 1.000 N NA
 1140702 1140703 RSP_0598 RSP_0599     FALSE 0.521 106.000 0.201 1.000 N NA
 1140703 1140704 RSP_0599 RSP_0600     FALSE 0.301 63.000 0.014 NA   NA
 1140704 1140705 RSP_0600 RSP_0601   rpoH2 TRUE 0.953 -3.000 0.090 NA   NA
 1140706 1140707 RSP_0602 RSP_0603     TRUE 0.914 -3.000 0.069 NA N NA
 1140707 1140708 RSP_0603 RSP_4334     FALSE 0.097 138.000 0.000 NA   NA
 1140710 1140711 RSP_0605 RSP_0606     FALSE 0.003 513.000 0.000 NA   NA
 1140711 1140712 RSP_0606 RSP_0607     TRUE 0.974 -10.000 0.400 NA   NA
 1140712 1140713 RSP_0607 RSP_0609     FALSE 0.123 126.000 0.000 NA   NA
 1140714 1140715 RSP_0608 RSP_0610     FALSE 0.267 45.000 0.000 NA   NA
 1140718 1140719 RSP_0613 RSP_0614     FALSE 0.257 47.000 0.000 NA   NA
 1140721 1140722 RSP_0616 RSP_0617     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 1140724 1140725 RSP_0619 RSP_0620     FALSE 0.171 94.000 0.000 NA   NA
 1140725 1140726 RSP_0620 RSP_0621     FALSE 0.322 35.000 0.000 NA   NA
 1140727 1140728 RSP_4333 RSP_0623     FALSE 0.178 89.000 0.000 NA   NA
 1140728 1140729 RSP_0623 RSP_0624     TRUE 0.968 -3.000 0.154 NA   NA
 1140729 1140730 RSP_0624 RSP_0625     TRUE 0.949 -3.000 0.133 NA N NA
 1140730 1140731 RSP_0625 RSP_0626   infA TRUE 0.959 1.000 0.207 NA N NA
 1140731 1140732 RSP_0626 RSP_0627 infA   FALSE 0.349 175.000 0.228 1.000   NA
 1140732 1140733 RSP_0627 RSP_0628     TRUE 0.933 20.000 0.437 1.000   NA
 1140733 1140734 RSP_0628 RSP_0629     TRUE 0.984 -3.000 0.364 NA   NA
 1140734 1140735 RSP_0629 RSP_0630     TRUE 0.933 -13.000 0.140 NA   NA
 1140735 1140736 RSP_0630 RSP_0631     TRUE 0.992 -3.000 0.768 NA   NA
 1140736 1140737 RSP_0631 RSP_0632   hisD1 TRUE 0.959 4.000 0.157 NA   NA
 1140737 1140738 RSP_0632 RSP_6122 hisD1   FALSE 0.121 222.000 0.096 NA   NA
 1140738 1140739 RSP_6122 RSP_0633     TRUE 0.963 0.000 0.138 NA   NA
 1140741 1140742 RSP_0634 RSP_0635     TRUE 0.970 10.000 0.556 NA N NA
 1140742 1140743 RSP_0635 RSP_0636     TRUE 0.870 59.000 0.222 NA Y NA
 1140743 1140744 RSP_0636 RSP_0637     FALSE 0.182 87.000 0.000 NA   NA
 1140744 1140745 RSP_0637 RSP_0638     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140745 1140746 RSP_0638 RSP_0639     TRUE 0.961 2.000 0.000 1.000 Y NA
 1140746 1140747 RSP_0639 RSP_0640     TRUE 0.997 4.000 0.250 0.001 Y NA
 1140748 1140749 RSP_0641 RSP_0642     TRUE 0.566 7.000 0.000 1.000 N NA
 1140749 1140750 RSP_0642 RSP_0643     FALSE 0.005 305.000 0.000 1.000 N NA
 1140751 1140752 RSP_0644 RSP_0645     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1140752 1140753 RSP_0645 RSP_0646     TRUE 0.966 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1140753 1140754 RSP_0646 RSP_0647   thiD TRUE 0.831 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1140754 1140755 RSP_0647 RSP_0648 thiD thiE TRUE 0.995 -3.000 0.109 0.004 Y NA
 1140755 1140756 RSP_0648 RSP_0649 thiE thiM TRUE 0.991 -3.000 0.020 0.004 Y NA
 1140756 1140757 RSP_0649 RSP_0650 thiM   FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 1140757 1140758 RSP_0650 RSP_0651     TRUE 0.919 -3.000 0.039 NA   NA
 1140758 1140759 RSP_0651 RSP_0652     TRUE 0.813 11.000 0.067 1.000 N NA
 1140759 1140760 RSP_0652 RSP_0653     TRUE 0.966 10.000 0.071 1.000 Y NA
 1140760 1140761 RSP_0653 RSP_0654     TRUE 0.642 68.000 0.167 1.000   NA
 1140761 1140762 RSP_0654 RSP_0655     FALSE 0.085 177.000 0.016 NA   NA
 1140762 1140763 RSP_0655 RSP_0656     FALSE 0.300 95.000 0.032 NA   NA
 1140763 1140764 RSP_0656 RSP_0657     FALSE 0.287 113.000 0.031 1.000   NA
 1140765 1140766 RSP_0658 RSP_0659     TRUE 0.758 106.000 0.460 1.000   NA
 1140767 1140768 RSP_0660 RSP_0661     FALSE 0.273 115.000 0.036 NA   NA
 1140768 1140769 RSP_0661 RSP_0662     TRUE 0.913 -3.000 0.059 1.000 N NA
 1140769 1140770 RSP_0662 RSP_0663     FALSE 0.341 75.000 0.059 1.000 N NA
 1140770 1140771 RSP_0663 RSP_0664     FALSE 0.311 81.000 0.028 NA   NA
 1140771 1140772 RSP_0664 RSP_0665   ftsH FALSE 0.027 228.000 0.000 NA   NA
 1140772 1140773 RSP_0665 RSP_0666 ftsH   TRUE 0.683 79.000 0.145 0.099 N NA
 1140773 1140774 RSP_0666 RSP_0667     TRUE 0.953 0.000 0.085 1.000   NA
 1140774 1140775 RSP_0667 RSP_0668     TRUE 0.964 5.000 0.199 1.000   NA
 1140775 1140776 RSP_0668 RSP_0669     TRUE 0.784 85.000 0.592 1.000 N NA
 1140776 1140777 RSP_0669 RSP_0670     FALSE 0.467 70.000 0.070 NA   NA
 1140777 1140778 RSP_0670 RSP_0671     TRUE 0.960 11.000 0.366 NA   NA
 1140778 1140779 RSP_0671 RSP_0672   TolQ TRUE 0.994 4.000 0.220 0.076 Y NA
 1140779 1140780 RSP_0672 RSP_0673 TolQ   TRUE 0.744 127.000 0.593 1.000   NA
 1140781 1140782 RSP_6124 RSP_0674     FALSE 0.005 396.000 0.000 NA   NA
 1140782 1140783 RSP_0674 RSP_0675     TRUE 0.937 12.000 0.046 NA Y NA
 1140783 1140784 RSP_0675 RSP_0676     TRUE 0.963 0.000 0.139 NA   NA
 1140784 1140785 RSP_0676 RSP_0677     TRUE 0.948 -3.000 0.069 1.000   NA
 1140786 1140787 RSP_0678 RSP_6125     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 1140787 1140788 RSP_6125 RSP_0679   hemC FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 1140789 1140790 RSP_0680 RSP_0681 hemE   FALSE 0.065 175.000 0.002 NA   NA
 1140793 1140794 RSP_0684 RSP_0685     TRUE 0.834 13.000 0.109 1.000 N NA
 1140794 1140795 RSP_0685 RSP_0686     TRUE 0.772 17.000 0.066 NA   NA
 1140796 1140797 RSP_0687 RSP_0688     FALSE 0.280 99.000 0.022 1.000   NA
 1140798 1140799 RSP_0689 RSP_0690 rdxS rdxI TRUE 0.996 0.000 0.713 NA Y NA
 1140799 1140800 RSP_0690 RSP_0691 rdxI rdxH TRUE 0.988 4.000 0.206 NA Y NA
 1140800 1140801 RSP_0691 RSP_0692 rdxH rdxB TRUE 0.982 2.000 0.506 NA N NA
 1140801 1140802 RSP_0692 RSP_0693 rdxB ccoP TRUE 0.567 235.000 0.203 0.017 Y NA
 1140802 1140803 RSP_0693 RSP_0694 ccoP ccoQ TRUE 0.992 -3.000 0.290 0.003 N NA
 1140803 1140804 RSP_0694 RSP_0695 ccoQ ccoO TRUE 0.984 13.000 0.571 0.003 N NA
 1140804 1140805 RSP_0695 RSP_0696 ccoO ccoN TRUE 0.983 17.000 0.714 0.003 N NA
 1140809 1140810 RSP_0700 RSP_0701     TRUE 0.908 6.000 0.051 1.000   NA
 1140810 1140811 RSP_0701 RSP_0702     TRUE 0.992 -3.000 0.744 1.000   NA
 1140811 1140812 RSP_0702 RSP_0703     TRUE 0.996 2.000 0.882 0.063   NA
 1140812 1140813 RSP_0703 RSP_0704     TRUE 0.982 16.000 0.711 0.063   NA
 1140813 1140814 RSP_0704 RSP_0705     FALSE 0.258 169.000 0.188 1.000 N NA
 1140816 1140817 RSP_0707 RSP_0708     TRUE 0.648 38.000 0.091 NA   NA
 1140818 1140819 RSP_0709 RSP_4343 cpdB ffs FALSE 0.194 74.000 0.000 NA   NA
 1140819 1140820 RSP_4343 RSP_0710 ffs dnaX FALSE 0.084 149.000 0.000 NA   NA
 1140820 1140821 RSP_0710 RSP_0711 dnaX YbaB TRUE 0.953 13.000 0.411 NA   NA
 1140821 1140822 RSP_0711 RSP_0712 YbaB recR TRUE 0.988 2.000 0.604 NA   NA
 1140823 1140824 RSP_0713 RSP_0714     FALSE 0.188 124.000 0.016 NA   NA
 1140826 1140827 RSP_0716 RSP_0717     FALSE 0.416 144.000 0.179 1.000   NA
 1140828 1140829 RSP_0718 RSP_0719 rpsU   FALSE 0.017 274.000 0.000 1.000   NA
 1140829 1140830 RSP_0719 RSP_0720   pssA TRUE 0.998 4.000 0.466 0.002 Y NA
 1140830 1140831 RSP_0720 RSP_0721 pssA PmtA FALSE 0.432 24.000 0.022 1.000 N NA
 1140834 1140835 RSP_0724 RSP_0725 mscL   FALSE 0.002 462.000 0.000 1.000 N NA
 1140836 1140837 RSP_0726 RSP_0727     FALSE 0.092 152.000 0.002 NA   NA
 1140837 1140838 RSP_0727 RSP_0728     TRUE 0.944 2.000 0.091 NA   NA
 1140838 1140839 RSP_0728 RSP_0729   lysA FALSE 0.078 195.000 0.017 1.000   NA
 1140839 1140840 RSP_0729 RSP_0730 lysA   TRUE 0.651 29.000 0.062 NA   NA
 1140841 1140842 RSP_0731 RSP_0732     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140843 1140844 RSP_0733 RSP_0734     TRUE 0.989 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 1140844 1140845 RSP_0734 RSP_0735     TRUE 0.968 2.000 0.267 1.000 N NA
 1140846 1140847 RSP_0736 RSP_0737 mobC mobB TRUE 0.950 -3.000 0.074 1.000   NA
 1140847 1140848 RSP_0737 RSP_0738 mobB mobA TRUE 0.990 -3.000 0.005 0.004 Y NA
 1140849 1140850 RSP_0739 RSP_6126     TRUE 0.988 -3.000 0.482 NA   NA
 1140851 1140852 RSP_6127 RSP_6128     TRUE 0.759 35.000 0.171 NA   NA
 1140852 1140853 RSP_6128 RSP_0741     TRUE 0.593 60.000 0.118 NA   NA
 1140853 1140854 RSP_0741 RSP_0742     TRUE 0.984 -3.000 0.342 1.000   NA
 1140857 1140858 RSP_0745 RSP_0747     TRUE 0.865 100.000 0.319 1.000 Y NA
 1140859 1140860 RSP_0748 RSP_0749     TRUE 0.951 0.000 0.081 1.000   NA
 1140861 1140862 RSP_0750 RSP_0751     FALSE 0.014 291.000 0.000 1.000   NA
 1140864 1140865 RSP_0752 RSP_4336     FALSE 0.262 46.000 0.000 NA   NA
 1140866 1140867 RSP_0753 RSP_0754 SspA   FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 1140867 1140868 RSP_0754 RSP_0755   nusB FALSE 0.015 317.000 0.015 NA   NA
 1140868 1140869 RSP_0755 RSP_0756 nusB ribH1 TRUE 0.975 3.000 0.347 1.000 N NA
 1140869 1140870 RSP_0756 RSP_0757 ribH1 ribBA TRUE 0.993 4.000 0.051 0.001 Y NA
 1140870 1140871 RSP_0757 RSP_6130 ribBA   FALSE 0.020 313.000 0.032 NA   NA
 1140871 1140872 RSP_6130 RSP_0758     TRUE 0.847 2.000 0.009 NA   NA
 1140874 1140875 RSP_0760 RSP_0761 mucS   FALSE 0.426 78.000 0.061 NA   NA
 1140875 1140876 RSP_0761 RSP_0762     TRUE 0.933 -3.000 0.053 NA   NA
 1140878 1140879 RSP_0764 RSP_0765     FALSE 0.367 51.000 0.015 1.000   NA
 1140879 1140880 RSP_0765 RSP_0766     TRUE 0.896 -3.000 0.022 NA   NA
 1140880 1140881 RSP_0766 RSP_6131     FALSE 0.023 238.000 0.000 NA   NA
 1140881 1140882 RSP_6131 RSP_0768     FALSE 0.174 92.000 0.000 NA   NA
 1140883 1140884 RSP_0769 RSP_0772   parE FALSE 0.077 61.000 0.000 NA N NA
 1140885 1140886 RSP_0773 RSP_0774     FALSE 0.001 499.000 0.000 1.000 N NA
 1140886 1140887 RSP_0774 RSP_0775     FALSE 0.259 84.000 0.007 1.000   NA
 1140887 1140888 RSP_0775 RSP_0776   LolD FALSE 0.462 29.000 0.005 1.000   NA
 1140888 1140889 RSP_0776 RSP_0777 LolD LolE TRUE 0.980 -7.000 0.620 1.000 N NA
 1140889 1140890 RSP_0777 RSP_0778 LolE ProS FALSE 0.309 116.000 0.076 1.000 N NA
 1140891 1140892 RSP_0779 RSP_0780 perM   TRUE 0.985 -3.000 0.362 1.000   NA
 1140892 1140893 RSP_0780 RSP_0781     TRUE 0.629 60.000 0.134 1.000   NA
 1140893 1140894 RSP_0781 RSP_0782     TRUE 0.661 137.000 0.149 NA Y NA
 1140894 1140895 RSP_0782 RSP_0783     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140895 1140896 RSP_0783 RSP_0784     TRUE 0.788 23.000 0.113 NA   NA
 1140896 1140897 RSP_0784 RSP_0785     TRUE 0.583 32.000 0.073 1.000 N NA
 1140897 1140898 RSP_0785 RSP_0786     TRUE 0.941 1.000 0.080 NA   NA
 1140898 1140899 RSP_0786 RSP_0787     FALSE 0.003 516.000 0.000 NA   NA
 1140899 1140900 RSP_0787 RSP_0788     TRUE 0.964 -3.000 0.133 NA   NA
 1140900 1140901 RSP_0788 RSP_0789   cobC TRUE 0.633 10.000 0.017 NA N NA
 1140902 1140903 RSP_0790 RSP_0791 pqqE pqqD TRUE 0.995 0.000 0.361 0.002   NA
 1140903 1140904 RSP_0791 RSP_0792 pqqD pqqC TRUE 0.996 -3.000 0.404 0.002   NA
 1140904 1140905 RSP_0792 RSP_0793 pqqC pqqB TRUE 0.998 -3.000 0.825 0.002   NA
 1140905 1140906 RSP_0793 RSP_6132 pqqB pqqA TRUE 0.903 19.000 0.028 0.002   NA
 1140906 1140907 RSP_6132 RSP_0794 pqqA catR FALSE 0.030 231.000 0.000 1.000   NA
 1140907 1140908 RSP_0794 RSP_0795 catR   FALSE 0.134 121.000 0.000 NA   NA
 1140909 1140910 RSP_0796 RSP_6229 cobQ   FALSE 0.282 51.000 0.003 NA   NA
 1140912 1140913 RSP_0798 RSP_0799     FALSE 0.355 88.000 0.037 1.000   NA
 1140916 1140917 RSP_0802 RSP_0803   DppF TRUE 0.991 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 1140917 1140918 RSP_0803 RSP_0804 DppF DppD TRUE 0.999 0.000 0.875 0.024 Y NA
 1140918 1140919 RSP_0804 RSP_0805 DppD DppC TRUE 0.926 101.000 0.714 1.000 Y NA
 1140919 1140920 RSP_0805 RSP_0806 DppC DppB TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.062 Y NA
 1140920 1140921 RSP_0806 RSP_0807 DppB DdpA TRUE 0.995 1.000 0.200 0.062 Y NA
 1140922 1140923 RSP_0809 RSP_0810     TRUE 0.928 -3.000 0.075 1.000 N NA
 1140924 1140925 RSP_0811 RSP_0812     TRUE 0.970 -3.000 0.172 NA   NA
 1140927 1140928 RSP_0814 RSP_0815   aspS TRUE 0.963 4.000 0.007 1.000 Y NA
 1140928 1140929 RSP_0815 RSP_0816 aspS   FALSE 0.020 216.000 0.003 1.000 N NA
 1140929 1140930 RSP_0816 RSP_0817     TRUE 0.955 9.000 0.219 1.000   NA
 1140931 1140932 RSP_0818 RSP_0819 carB rhlE2 FALSE 0.006 601.000 0.000 0.098 N NA
 1140932 1140933 RSP_0819 RSP_6134 rhlE2   FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 1140933 1140934 RSP_6134 RSP_0820     TRUE 0.872 30.000 0.333 NA   NA
 1140943 1140944 RSP_0829 RSP_0830 lctB   FALSE 0.003 347.000 0.000 1.000 N NA
 1140944 1140945 RSP_0830 RSP_0831   trpA FALSE 0.137 45.000 0.000 1.000 N NA
 1140945 1140946 RSP_0831 RSP_6135 trpA thi FALSE 0.234 54.000 0.000 NA   NA
 1140947 1140948 RSP_0832 RSP_0834   xanB FALSE 0.003 341.000 0.000 1.000 N NA
 1140948 1140949 RSP_0834 RSP_0835 xanB manB TRUE 0.678 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1140949 1140950 RSP_0835 RSP_6136 manB   FALSE 0.020 246.000 0.000 NA   NA
 1140950 1140951 RSP_6136 RSP_0836     FALSE 0.071 160.000 0.000 NA   NA
 1140952 1140953 RSP_0837 RSP_0838     FALSE 0.180 106.000 0.000 1.000   NA
 1140953 1140954 RSP_0838 RSP_0839     TRUE 0.956 -3.000 0.097 NA   NA
 1140954 1140955 RSP_0839 RSP_0840   leuS TRUE 0.911 -13.000 0.090 NA   NA
 1140955 1140956 RSP_0840 RSP_0841 leuS   TRUE 0.601 32.000 0.051 NA   NA
 1140959 1140960 RSP_0843 RSP_0844     TRUE 0.800 -7.000 0.008 NA   NA
 1140961 1140962 RSP_0845 RSP_0846   ribA TRUE 0.961 -3.000 0.116 NA   NA
 1140963 1140964 RSP_0847 RSP_0848   xthA1 FALSE 0.052 349.000 0.070 0.041 N NA
 1140965 1140966 RSP_6137 RSP_6138     FALSE 0.479 52.000 0.054 NA   NA
 1140967 1140968 RSP_0850 RSP_0851     FALSE 0.019 359.000 0.044 1.000   NA
 1140968 1140969 RSP_0851 RSP_0852   fghA TRUE 0.897 16.000 0.200 1.000   NA
 1140969 1140970 RSP_0852 RSP_0853 fghA   TRUE 0.854 -7.000 0.029 NA   NA
 1140970 1140971 RSP_0853 RSP_0854     TRUE 0.860 -3.000 0.005 NA   NA
 1140973 1140974 RSP_0856 RSP_0857 btaA btaB TRUE 0.985 -3.000 0.347 1.000   NA
 1140975 1140976 RSP_4311 RSP_0858     FALSE 0.218 62.000 0.000 NA   NA
 1140976 1140977 RSP_0858 RSP_0859   leuB FALSE 0.189 365.000 0.345 1.000 Y NA
 1140977 1140978 RSP_0859 RSP_0860 leuB   FALSE 0.360 151.000 0.159 NA   NA
 1140978 1140979 RSP_0860 RSP_0861     TRUE 0.681 81.000 0.250 NA   NA
 1140979 1140980 RSP_0861 RSP_0862   leuD FALSE 0.080 152.000 0.000 NA   NA
 1140980 1140981 RSP_0862 RSP_6139 leuD   TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1140981 1140982 RSP_6139 RSP_0863   leuC FALSE 0.214 64.000 0.000 NA   NA
 1140983 1140984 RSP_0864 RSP_0865     FALSE 0.040 213.000 0.002 NA   NA
 1140984 1140985 RSP_0865 RSP_0866     TRUE 0.981 0.000 0.307 NA   NA
 1140985 1140986 RSP_0866 RSP_0867   rnhA FALSE 0.422 28.000 0.003 NA   NA
 1140986 1140987 RSP_0867 RSP_0868 rnhA   FALSE 0.420 33.000 0.003 1.000   NA
 1140987 1140988 RSP_0868 RSP_0869   osp FALSE 0.024 244.000 0.000 1.000   NA
 1140988 1140989 RSP_0869 RSP_0870 osp   FALSE 0.427 112.000 0.091 NA   NA
 1140991 1140992 RSP_0872 RSP_0873 def1   TRUE 0.999 0.000 0.536 0.001 Y NA
 1140992 1140993 RSP_0873 RSP_0874     TRUE 0.999 -3.000 0.519 0.001 Y NA
 1140993 1140994 RSP_0874 RSP_0875   fmt TRUE 0.987 4.000 0.023 0.019 Y NA
 1140997 1140998 RSP_0877 RSP_0879     TRUE 0.904 -3.000 0.028 NA   NA
 1141001 1141002 RSP_0882 RSP_0883 DapA   FALSE 0.035 261.000 0.058 1.000 N NA
 1141002 1141003 RSP_0883 RSP_0885   SseA FALSE 0.010 290.000 0.010 1.000 N NA
 1141003 1141004 RSP_0885 RSP_0886 SseA TyrB TRUE 0.973 8.000 0.481 1.000 N NA
 1141005 1141006 RSP_0888 RSP_0889 amtB glnK FALSE 0.398 27.000 0.020 1.000 N NA
 1141008 1141009 RSP_0890 RSP_0891   vacJ TRUE 0.974 -10.000 0.553 NA N NA
 1141010 1141011 RSP_0892 RSP_0893     TRUE 0.989 -3.000 0.148 0.006   NA
 1141011 1141012 RSP_0893 RSP_0894     FALSE 0.041 124.000 0.000 NA N NA
 1141012 1141013 RSP_0894 RSP_0895     TRUE 0.988 0.000 0.696 NA N NA
 1141013 1141014 RSP_0895 RSP_0896     TRUE 0.712 70.000 0.280 NA   NA
 1141014 1141015 RSP_0896 RSP_0897     TRUE 0.870 -3.000 0.008 NA   NA
 1141015 1141016 RSP_0897 RSP_0898   DCOHM TRUE 0.685 -7.000 0.008 1.000 N NA
 1141018 1141019 RSP_0900 RSP_0901     TRUE 0.922 -3.000 0.035 1.000   NA
 1141019 1141020 RSP_0901 RSP_0902     TRUE 0.886 -3.000 0.009 1.000   NA
 1141020 1141021 RSP_0902 RSP_0903     FALSE 0.222 73.000 0.000 1.000   NA
 1141021 1141022 RSP_0903 RSP_0904   sitA FALSE 0.213 83.000 0.000 1.000   NA
 1141022 1141023 RSP_0904 RSP_0905 sitA sitB TRUE 0.997 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 1141023 1141024 RSP_0905 RSP_0906 sitB sitC TRUE 0.997 -13.000 0.857 0.097 Y NA
 1141024 1141025 RSP_0906 RSP_0908 sitC sitD TRUE 0.998 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 1141026 1141027 RSP_0907 RSP_0909 dctR dctS TRUE 0.999 -3.000 0.759 0.020 Y NA
 1141028 1141029 RSP_0910 RSP_0911 dctP dctQ TRUE 0.801 86.000 0.151 NA Y NA
 1141029 1141030 RSP_0911 RSP_0912 dctQ dctM TRUE 0.997 2.000 0.882 NA Y NA
 1141031 1141032 RSP_0913 RSP_0914 crt   TRUE 0.996 -3.000 0.276 0.066 Y NA
 1141033 1141034 RSP_0915 RSP_0916   pmbA FALSE 0.042 271.000 0.054 NA   NA
 1141034 1141035 RSP_0916 RSP_0917 pmbA   TRUE 0.945 -13.000 0.182 NA   NA
 1141037 1141038 RSP_0919 RSP_0920   exbB FALSE 0.008 257.000 0.000 1.000 N NA
 1141038 1141039 RSP_0920 RSP_0921 exbB exbD TRUE 0.998 4.000 0.810 0.075 Y NA
 1141039 1141040 RSP_0921 RSP_0922 exbD   TRUE 0.921 -3.000 0.000 0.092 N NA
 1141042 1141043 RSP_0924 RSP_0925 cinA yobR TRUE 0.937 4.000 0.075 1.000   NA
 1141043 1141044 RSP_0925 RSP_0926 yobR   TRUE 0.966 -3.000 0.133 1.000   NA
 1141045 1141046 RSP_0927 RSP_0928 lyrS   FALSE 0.002 590.000 0.000 NA   NA
 1141047 1141048 RSP_0929 RSP_0930 accD folC TRUE 0.981 -3.000 0.383 1.000 N NA
 1141049 1141050 RSP_0931 RSP_0932 ialA ctpA TRUE 0.829 8.000 0.047 1.000 N NA
 1141050 1141051 RSP_0932 RSP_0933 ctpA   TRUE 0.967 8.000 0.408 NA N NA
 1141051 1141052 RSP_0933 RSP_0934   gpmI TRUE 0.958 -3.000 0.170 NA N NA
 1141052 1141053 RSP_0934 RSP_0935 gpmI   FALSE 0.248 31.000 0.003 1.000 N NA
 1141053 1141054 RSP_0935 RSP_0936   dapF TRUE 0.946 -3.000 0.109 1.000 N NA
 1141055 1141056 RSP_4329 RSP_0937     FALSE 0.051 180.000 0.000 NA   NA
 1141056 1141057 RSP_0937 RSP_0938     FALSE 0.171 94.000 0.000 NA   NA
 1141057 1141058 RSP_0938 RSP_0939     FALSE 0.041 200.000 0.000 NA   NA
 1141058 1141059 RSP_0939 RSP_0940     FALSE 0.162 149.000 0.033 NA   NA
 1141059 1141060 RSP_0940 RSP_0941     TRUE 0.889 58.000 0.281 NA Y NA
 1141060 1141061 RSP_0941 RSP_0942     TRUE 0.997 0.000 0.875 1.000 Y NA
 1141061 1141062 RSP_0942 RSP_0943   yhxA FALSE 0.305 109.000 0.069 1.000 N NA
 1141062 1141063 RSP_0943 RSP_0944 yhxA purU FALSE 0.004 311.000 0.000 1.000 N NA
 1141068 1141069 RSP_0948 RSP_0949 otsA ostB TRUE 0.992 -3.000 0.011 0.001 Y NA
 1141069 1141070 RSP_0949 RSP_0950 ostB   FALSE 0.028 167.000 0.000 1.000 N NA
 1141070 1141071 RSP_0950 RSP_0951     FALSE 0.007 345.000 0.000 NA   NA
 1141071 1141072 RSP_0951 RSP_0952     FALSE 0.350 32.000 0.000 NA   NA
 1141072 1141073 RSP_0952 RSP_0953     TRUE 0.990 1.000 0.734 NA   NA
 1141073 1141074 RSP_0953 RSP_0954     TRUE 0.990 0.000 0.667 NA   NA
 1141074 1141075 RSP_0954 RSP_0955     FALSE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 1141076 1141077 RSP_0956 RSP_0957   pyrD TRUE 0.959 -3.000 0.108 NA   NA
 1141078 1141079 RSP_0958 RSP_0959     FALSE 0.025 272.000 0.012 1.000   NA
 1141079 1141080 RSP_0959 RSP_0960     FALSE 0.038 217.000 0.000 1.000   NA
 1141082 1141083 RSP_0962 RSP_0963     FALSE 0.303 115.000 0.046 NA   NA
 1141083 1141084 RSP_0963 RSP_0964   sucB FALSE 0.300 56.000 0.011 NA   NA
 1141084 1141085 RSP_0964 RSP_0965 sucB sucA TRUE 0.996 0.000 0.667 1.000 Y NA
 1141085 1141086 RSP_0965 RSP_0966 sucA sucD TRUE 0.856 40.000 0.092 1.000 Y NA
 1141086 1141087 RSP_0966 RSP_0967 sucD sucC TRUE 0.997 5.000 0.256 0.001 Y NA
 1141087 1141088 RSP_0967 RSP_0968 sucC mdh FALSE 0.308 230.000 0.113 1.000 Y NA
 1141089 1141090 RSP_0969 RSP_0970     FALSE 0.344 87.000 0.032 1.000   NA
 1141090 1141091 RSP_0970 RSP_0971     TRUE 0.954 9.000 0.223 NA   NA
 1141091 1141092 RSP_0971 RSP_0972     TRUE 0.977 -3.000 0.243 NA   NA
 1141092 1141093 RSP_0972 RSP_0973     TRUE 0.981 1.000 0.347 NA   NA
 1141093 1141094 RSP_0973 RSP_0974     FALSE 0.016 211.000 0.000 1.000 N NA
 1141094 1141095 RSP_0974 RSP_0975     TRUE 0.993 12.000 0.291 0.001 Y NA
 1141095 1141096 RSP_0975 RSP_0976   sdhA TRUE 0.996 12.000 0.705 0.002 Y NA
 1141096 1141097 RSP_0976 RSP_0977 sdhA   TRUE 0.890 0.000 0.022 NA   NA
 1141097 1141098 RSP_0977 RSP_0978     TRUE 0.973 4.000 0.267 NA   NA
 1141098 1141099 RSP_0978 RSP_0979   sdhB TRUE 0.563 19.000 0.009 NA   NA
 1141100 1141101 RSP_6142 RSP_0981     FALSE 0.424 96.000 0.074 NA   NA
 1141101 1141102 RSP_0981 RSP_0982     TRUE 0.941 -3.000 0.065 NA   NA
 1141103 1141104 RSP_0983 RSP_4330     FALSE 0.137 119.000 0.000 NA   NA
 1141104 1141105 RSP_4330 RSP_6143     FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 1141108 1141109 RSP_0986 RSP_0988     TRUE 0.982 -3.000 0.121 0.097   NA
 1141109 1141110 RSP_0988 RSP_0989     TRUE 0.992 0.000 0.797 1.000   NA
 1141110 1141111 RSP_0989 RSP_0990     TRUE 0.778 175.000 0.676 NA Y NA
 1141112 1141113 RSP_0991 RSP_0992   phaA/B FALSE 0.120 125.000 0.017 1.000 N NA
 1141113 1141114 RSP_0992 RSP_0993 phaA/B phaC TRUE 0.999 0.000 0.881 0.010 Y NA
 1141114 1141115 RSP_0993 RSP_0994 phaC phaD TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.010 Y NA
 1141115 1141116 RSP_0994 RSP_0995 phaD phaE TRUE 0.998 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 1141116 1141117 RSP_0995 RSP_0996 phaE phaF TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.052 Y NA
 1141117 1141118 RSP_0996 RSP_0997 phaF phaG TRUE 0.996 6.000 0.937 1.000 Y NA
 1141118 1141119 RSP_0997 RSP_0998 phaG nhaD FALSE 0.422 134.000 0.000 1.000 Y NA
 1141123 1141124 RSP_1002 RSP_1003 pyrB pyrC TRUE 0.995 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 1141124 1141125 RSP_1003 RSP_1004 pyrC   FALSE 0.142 221.000 0.108 1.000   NA
 1141126 1141127 RSP_1005 RSP_1006 gshA   TRUE 0.710 53.000 0.213 NA   NA
 1141127 1141128 RSP_1006 RSP_1007     TRUE 0.902 -3.000 0.027 NA   NA
 1141129 1141130 RSP_1008 RSP_1009     TRUE 0.689 70.000 0.054 0.052   NA
 1141130 1141131 RSP_1009 RSP_1011     TRUE 0.806 120.000 0.800 NA   NA
 1141133 1141134 RSP_1012 RSP_1013 gabD4   FALSE 0.212 65.000 0.000 NA   NA
 1141134 1141135 RSP_1013 RSP_1014     FALSE 0.278 43.000 0.000 NA   NA
 1141135 1141136 RSP_1014 RSP_1015     TRUE 0.968 -3.000 0.147 1.000   NA
 1141137 1141138 RSP_1016 RSP_1017     FALSE 0.028 295.000 0.075 NA N NA
 1141138 1141139 RSP_1017 RSP_1018     TRUE 0.631 34.000 0.100 1.000 N NA
 1141139 1141140 RSP_1018 RSP_1019     TRUE 0.987 13.000 0.227 0.036 Y NA
 1141140 1141141 RSP_1019 RSP_1020   glcD TRUE 0.948 65.000 0.266 0.010 Y NA
 1141143 1141144 RSP_6144 RSP_1022     TRUE 0.993 -3.000 0.876 NA   NA
 1141144 1141145 RSP_1022 RSP_1023     TRUE 0.992 0.000 0.816 NA   NA
 1141145 1141146 RSP_1023 RSP_1024     TRUE 0.991 -3.000 0.697 NA   NA
 1141147 1141148 RSP_1025 RSP_1026     TRUE 0.878 -3.000 0.012 NA   NA
 1141148 1141149 RSP_1026 RSP_1027     FALSE 0.390 60.000 0.036 NA   NA
 1141149 1141150 RSP_1027 RSP_1028     FALSE 0.359 47.000 0.017 NA   NA
 1141151 1141152 RSP_1029 RSP_1030     FALSE 0.022 459.000 0.000 NA Y NA
 1141152 1141153 RSP_1030 RSP_1031     TRUE 0.843 -3.000 0.030 NA N NA
 1141154 1141155 RSP_1032 RSP_1033     FALSE 0.294 115.000 0.070 1.000 N NA
 1141155 1141156 RSP_1033 RSP_1034   pdhR FALSE 0.027 241.000 0.029 1.000 N NA
 1141157 1141158 RSP_1035 RSP_1036 atpF atpX TRUE 0.999 -3.000 0.863 0.005 Y NA
 1141158 1141159 RSP_1036 RSP_1037 atpX atpE TRUE 0.881 70.000 0.278 0.005   NA
 1141159 1141160 RSP_1037 RSP_1038 atpE atpB TRUE 0.948 53.000 0.628 0.005   NA
 1141160 1141161 RSP_1038 RSP_1039 atpB atpI FALSE 0.479 46.000 0.046 NA   NA
 1141163 1141164 RSP_1041 RSP_1042     FALSE 0.212 28.000 0.000 1.000 N NA
 1141164 1141165 RSP_1042 RSP_1043   rpmE FALSE 0.030 197.000 0.006 1.000 N NA
 1141165 1141166 RSP_1043 RSP_1044 rpmE rplS TRUE 0.968 13.000 0.027 0.012 Y NA
 1141166 1141167 RSP_1044 RSP_1045 rplS trmD TRUE 0.946 49.000 0.567 1.000 Y NA
 1141167 1141168 RSP_1045 RSP_1046 trmD   FALSE 0.249 59.000 0.002 NA   NA
 1141168 1141169 RSP_1046 RSP_1047   rimM FALSE 0.090 153.000 0.002 NA   NA
 1141169 1141170 RSP_1047 RSP_1048 rimM rpsP TRUE 0.941 101.000 0.342 0.012 Y NA
 1141170 1141171 RSP_1048 RSP_1049 rpsP pheAa FALSE 0.436 40.000 0.050 1.000 N NA
 1141171 1141172 RSP_1049 RSP_1050 pheAa   FALSE 0.427 39.000 0.047 1.000 N NA
 1141172 1141173 RSP_1050 RSP_1051     TRUE 0.996 -3.000 0.176 0.006 Y NA
 1141173 1141174 RSP_1051 RSP_1052     TRUE 0.992 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 1141174 1141175 RSP_1052 RSP_1053   ffh FALSE 0.115 77.000 0.002 1.000 N NA
 1141175 1141176 RSP_1053 RSP_6230 ffh   FALSE 0.013 281.000 0.000 NA   NA
 1141178 1141179 RSP_4320 RSP_1056     FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 1141179 1141180 RSP_1056 RSP_1057   merA1 TRUE 0.704 58.000 0.287 1.000 N NA
 1141180 1141181 RSP_1057 RSP_1058 merA1   TRUE 0.981 1.000 0.320 1.000   NA
 1141182 1141183 RSP_1059 RSP_1060 rpmH rnpA TRUE 0.954 23.000 0.787 1.000   NA
 1141183 1141184 RSP_1060 RSP_1061 rnpA   TRUE 0.989 -3.000 0.540 NA   NA
 1141184 1141185 RSP_1061 RSP_1062     FALSE 0.482 27.000 0.011 NA   NA
 1141185 1141186 RSP_1062 RSP_1063     FALSE 0.282 74.000 0.049 NA N NA
 1141186 1141187 RSP_1063 RSP_1064     FALSE 0.156 110.000 0.021 1.000 N NA
 1141187 1141188 RSP_1064 RSP_1065     TRUE 0.916 -3.000 0.030 1.000   NA
 1141188 1141189 RSP_1065 RSP_1066     TRUE 0.910 -3.000 0.025 1.000   NA
 1141191 1141192 RSP_1068 RSP_1069 argB   TRUE 0.893 0.000 0.023 NA   NA
 1141192 1141193 RSP_1069 RSP_1070     TRUE 0.971 -3.000 0.183 NA   NA
 1141194 1141195 RSP_1071 RSP_1072 moaE moaD TRUE 0.998 2.000 0.501 0.003 Y NA
 1141195 1141196 RSP_1072 RSP_1073 moaD pgsA TRUE 0.933 -3.000 0.082 1.000 N NA
 1141196 1141197 RSP_1073 RSP_1074 pgsA uvrC TRUE 0.607 80.000 0.227 1.000 N NA
 1141197 1141198 RSP_1074 RSP_1075 uvrC   FALSE 0.010 303.000 0.014 1.000 N NA
 1141198 1141199 RSP_1075 RSP_1076   sohB FALSE 0.050 155.000 0.004 1.000 N NA
 1141200 1141201 RSP_1077 RSP_1078   fdsG TRUE 0.575 101.000 0.243 1.000 N NA
 1141201 1141202 RSP_1078 RSP_1079 fdsG fdsB TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.010 Y NA
 1141202 1141203 RSP_1079 RSP_1080 fdsB fdsA TRUE 0.988 -3.000 0.466 1.000   NA
 1141203 1141204 RSP_1080 RSP_1081 fdsA fdsC TRUE 0.992 -3.000 0.180 0.001   NA
 1141204 1141205 RSP_1081 RSP_1082 fdsC fdsD TRUE 0.993 -10.000 0.458 0.001   NA
 1141208 1141209 RSP_1083 RSP_6231     FALSE 0.491 18.000 0.000 NA   NA
 1141210 1141211 RSP_1085 RSP_1086   sdh TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141212 1141213 RSP_1087 RSP_1088     TRUE 0.977 -3.000 0.240 NA   NA
 1141213 1141214 RSP_1088 RSP_1089     TRUE 0.977 4.000 0.323 NA   NA
 1141214 1141215 RSP_1089 RSP_1090     TRUE 0.936 -3.000 0.058 NA   NA
 1141215 1141216 RSP_1090 RSP_1091     TRUE 0.978 11.000 0.722 NA   NA
 1141217 1141218 RSP_1092 RSP_1093 rpoE chrR TRUE 0.983 9.000 0.898 NA N NA
 1141219 1141220 RSP_1094 RSP_1095   mutL TRUE 0.792 11.000 0.031 NA   NA
 1141220 1141221 RSP_1095 RSP_1096 mutL   FALSE 0.436 37.000 0.014 1.000   NA
 1141221 1141222 RSP_1096 RSP_1097     TRUE 0.997 -3.000 0.598 0.003   NA
 1141222 1141223 RSP_1097 RSP_1098     TRUE 0.610 80.000 0.173 NA   NA
 1141223 1141224 RSP_1098 RSP_1099   LspA TRUE 0.857 54.000 0.588 NA   NA
 1141224 1141225 RSP_1099 RSP_1100 LspA purH TRUE 0.826 2.000 0.027 1.000 N NA
 1141225 1141226 RSP_1100 RSP_1101 purH   TRUE 0.590 38.000 0.068 NA   NA
 1141226 1141227 RSP_1101 RSP_6147     TRUE 0.636 34.000 0.071 NA   NA
 1141230 1141231 RSP_1106 RSP_1107 rbfA   TRUE 0.828 -10.000 0.024 NA   NA
 1141231 1141232 RSP_1107 RSP_1108   TruB FALSE 0.344 68.000 0.030 NA   NA
 1141232 1141233 RSP_1108 RSP_1109 TruB cysK FALSE 0.014 221.000 0.000 1.000 N NA
 1141233 1141234 RSP_1109 RSP_1110 cysK   FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 1141234 1141235 RSP_1110 RSP_1111   rpsO FALSE 0.024 241.000 0.002 NA   NA
 1141235 1141236 RSP_1111 RSP_1112 rpsO Pnp TRUE 0.650 181.000 0.335 1.000 Y NA
 1141238 1141239 RSP_1114 RSP_1115     FALSE 0.009 319.000 0.000 NA   NA
 1141239 1141240 RSP_1115 RSP_1116     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1141240 1141241 RSP_1116 RSP_1117     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141241 1141242 RSP_1117 RSP_1118     TRUE 0.987 -3.000 0.462 NA   NA
 1141242 1141243 RSP_1118 RSP_1119     TRUE 0.776 -7.000 0.000 1.000   NA
 1141243 1141244 RSP_1119 RSP_1120     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.006   NA
 1141244 1141245 RSP_1120 RSP_1121     FALSE 0.227 70.000 0.000 1.000   NA
 1141245 1141246 RSP_1121 RSP_1122     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1141247 1141248 RSP_1123 RSP_1125 DnaE MltB FALSE 0.137 45.000 0.000 1.000 N NA
 1141248 1141249 RSP_1125 RSP_1126 MltB rnr FALSE 0.029 183.000 0.003 1.000 N NA
 1141249 1141250 RSP_1126 RSP_1127 rnr ElaA FALSE 0.345 46.000 0.005 1.000   NA
 1141250 1141251 RSP_1127 RSP_1128 ElaA dapE TRUE 0.912 -3.000 0.028 1.000   NA
 1141251 1141252 RSP_1128 RSP_1129 dapE   FALSE 0.345 53.000 0.020 NA   NA
 1141252 1141253 RSP_1129 RSP_1130     TRUE 0.694 -28.000 0.000 NA   NA
 1141253 1141254 RSP_1130 RSP_1131   dapD FALSE 0.118 129.000 0.000 NA   NA
 1141256 1141257 RSP_1133 RSP_1134   Dxs FALSE 0.014 280.000 0.000 NA   NA
 1141257 1141258 RSP_1134 RSP_1135 Dxs ispA TRUE 0.984 10.000 0.265 1.000 Y NA
 1141258 1141259 RSP_1135 RSP_1136 ispA xseB TRUE 0.916 -3.000 0.062 1.000 N NA
 1141259 1141260 RSP_1136 RSP_1137 xseB   TRUE 0.808 -3.000 0.021 NA N NA
 1141260 1141261 RSP_1137 RSP_1138     FALSE 0.351 121.000 0.117 NA N NA
 1141261 1141262 RSP_1138 RSP_1139     TRUE 0.997 -3.000 0.392 0.073 Y NA
 1141264 1141265 RSP_1141 RSP_1142     FALSE 0.202 69.000 0.000 NA   NA
 1141265 1141266 RSP_1142 RSP_1143     FALSE 0.371 29.000 0.000 NA   NA
 1141266 1141267 RSP_1143 RSP_1144   Gst TRUE 0.967 -3.000 0.213 1.000 N NA
 1141267 1141268 RSP_1144 RSP_1145 Gst   FALSE 0.485 81.000 0.075 1.000   NA
 1141268 1141269 RSP_1145 RSP_1146   gltB FALSE 0.046 254.000 0.041 1.000   NA
 1141269 1141270 RSP_1146 RSP_1147 gltB   TRUE 0.886 4.000 0.025 1.000   NA
 1141270 1141271 RSP_1147 RSP_1148     TRUE 0.960 -10.000 0.250 NA   NA
 1141271 1141272 RSP_1148 RSP_1149   gltD FALSE 0.429 90.000 0.070 NA   NA
 1141272 1141273 RSP_1149 RSP_1150 gltD bacA FALSE 0.131 165.000 0.060 1.000 N NA
 1141273 1141274 RSP_1150 RSP_1151 bacA   TRUE 0.598 33.000 0.082 1.000 N NA
 1141275 1141276 RSP_4332 RSP_1152   rnd FALSE 0.331 34.000 0.000 NA   NA
 1141276 1141277 RSP_1152 RSP_1153 rnd GutQ TRUE 0.797 23.000 0.108 1.000   NA
 1141277 1141278 RSP_1153 RSP_1154 GutQ   TRUE 0.951 4.000 0.122 NA   NA
 1141278 1141279 RSP_1154 RSP_1155     TRUE 0.678 24.000 0.055 NA   NA
 1141279 1141280 RSP_1155 RSP_1156     TRUE 0.989 -3.000 0.543 NA   NA
 1141280 1141281 RSP_1156 RSP_1157   PSrp1 FALSE 0.036 226.000 0.005 NA   NA
 1141281 1141282 RSP_1157 RSP_1158 PSrp1 PtsN TRUE 0.825 34.000 0.353 NA N NA
 1141283 1141284 RSP_1159 RSP_1160 galU kdsB FALSE 0.038 401.000 0.016 1.000 Y NA
 1141284 1141285 RSP_1160 RSP_1161 kdsB   FALSE 0.474 36.000 0.052 1.000 N NA
 1141286 1141287 RSP_1162 RSP_1163   nusA TRUE 0.919 37.000 0.759 NA   NA
 1141287 1141288 RSP_1163 RSP_1164 nusA   TRUE 0.936 15.000 0.075 NA Y NA
 1141288 1141289 RSP_1164 RSP_1165   InfB TRUE 0.967 -3.000 0.223 NA N NA
 1141290 1141291 RSP_1166 RSP_1167 mutT argJ TRUE 0.845 -3.000 0.024 1.000 N NA
 1141291 1141292 RSP_1167 RSP_1168 argJ surA TRUE 0.651 23.000 0.070 1.000 N NA
 1141293 1141294 RSP_1169 RSP_1170 secA   FALSE 0.104 115.000 0.006 1.000 N NA
 1141295 1141296 RSP_1171 RSP_1172 radC dnaJ FALSE 0.031 246.000 0.041 1.000 N NA
 1141296 1141297 RSP_1172 RSP_1173 dnaJ dnaK TRUE 0.948 73.000 0.236 0.002 Y NA
 1141297 1141298 RSP_1173 RSP_1174 dnaK pip FALSE 0.041 213.000 0.000 1.000   NA
 1141300 1141301 RSP_1176 RSP_1177 xylA xylB TRUE 0.986 -3.000 0.094 1.000 Y NA
 1141301 1141302 RSP_1177 RSP_1178 xylB   TRUE 0.976 0.000 0.225 1.000   NA
 1141302 1141303 RSP_1178 RSP_1179   xylH TRUE 0.984 -3.000 0.333 1.000   NA
 1141303 1141304 RSP_1179 RSP_1180 xylH xylF TRUE 0.829 88.000 0.208 NA Y NA
 1141305 1141306 RSP_1181 RSP_1182 xylR   FALSE 0.027 189.000 0.007 NA N NA
 1141306 1141307 RSP_1182 RSP_1183     TRUE 0.973 0.000 0.212 NA   NA
 1141308 1141309 RSP_1184 RSP_1185     TRUE 0.623 75.000 0.182 NA   NA
 1141309 1141310 RSP_1185 RSP_1186     TRUE 0.755 89.000 0.400 NA   NA
 1141310 1141311 RSP_1186 RSP_1187     TRUE 0.992 0.000 0.833 NA   NA
 1141311 1141312 RSP_1187 RSP_1188   wcaG TRUE 0.740 76.000 0.333 NA   NA
 1141312 1141313 RSP_1188 RSP_1189 wcaG wcaJ TRUE 0.616 148.000 0.143 NA Y NA
 1141313 1141314 RSP_1189 RSP_1190 wcaJ   TRUE 0.980 -3.000 0.052 NA Y NA
 1141314 1141315 RSP_1190 RSP_1191     TRUE 0.782 0.000 0.009 1.000 N NA
 1141315 1141316 RSP_1191 RSP_1192     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1141316 1141317 RSP_1192 RSP_1193     FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 1141317 1141318 RSP_1193 RSP_1194   grxC TRUE 0.774 5.000 0.000 NA   NA
 1141318 1141319 RSP_1194 RSP_1195 grxC comF TRUE 0.612 36.000 0.061 1.000   NA
 1141320 1141321 RSP_1196 RSP_1197   HemH TRUE 0.571 38.000 0.052 1.000   NA
 1141321 1141322 RSP_1197 RSP_1198 HemH   FALSE 0.129 154.000 0.022 NA   NA
 1141325 1141326 RSP_1201 RSP_1202   TrmA FALSE 0.195 98.000 0.004 NA   NA
 1141326 1141327 RSP_1202 RSP_1203 TrmA   TRUE 0.862 -3.000 0.038 NA N NA
 1141327 1141328 RSP_1203 RSP_1204     TRUE 0.999 -3.000 0.704 0.006 Y NA
 1141328 1141329 RSP_1204 RSP_1205     FALSE 0.281 63.000 0.034 1.000 N NA
 1141329 1141330 RSP_1205 RSP_1206     TRUE 0.960 -3.000 0.163 1.000 N NA
 1141330 1141331 RSP_1206 RSP_1207   hslO TRUE 0.836 -7.000 0.046 1.000 N NA
 1141336 1141337 RSP_1212 RSP_1213 argG   FALSE 0.177 106.000 0.002 NA   NA
 1141338 1141339 RSP_1214 RSP_1215   ilvE TRUE 0.990 -3.000 0.247 0.064   NA
 1141339 1141340 RSP_1215 RSP_1216 ilvE rbsK FALSE 0.245 67.000 0.029 1.000 N NA
 1141340 1141341 RSP_1216 RSP_1217 rbsK   TRUE 0.969 0.000 0.231 1.000 N NA
 1141343 1141344 RSP_1219 RSP_1220 grpE hrcA TRUE 0.949 -3.000 0.120 1.000 N NA
 1141345 1141346 RSP_1221 RSP_1222 rph ham1 TRUE 0.973 -3.000 0.262 1.000 N NA
 1141346 1141347 RSP_1222 RSP_1223 ham1 tdcF TRUE 0.720 -3.000 0.005 NA N NA
 1141347 1141348 RSP_1223 RSP_1224 tdcF hemN TRUE 0.689 3.000 0.007 NA N NA
 1141348 1141349 RSP_1224 RSP_1226 hemN   TRUE 0.856 2.000 0.012 NA   NA
 1141350 1141351 RSP_1225 RSP_1227 spo0J parA TRUE 0.991 -3.000 0.827 1.000 N NA
 1141351 1141352 RSP_1227 RSP_1228 parA gidB TRUE 0.967 -7.000 0.339 1.000 N NA
 1141352 1141353 RSP_1228 RSP_1229 gidB gidA TRUE 0.984 -3.000 0.466 1.000 N NA
 1141353 1141354 RSP_1229 RSP_1230 gidA thdF TRUE 0.980 -3.000 0.266 1.000   NA
 1141354 1141355 RSP_1230 RSP_1231 thdF rho TRUE 0.667 26.000 0.050 1.000   NA
 1141355 1141356 RSP_1231 RSP_1232 rho   FALSE 0.158 142.000 0.025 NA   NA
 1141357 1141358 RSP_1233 RSP_1234 maf aroE TRUE 0.958 -3.000 0.169 NA N NA
 1141358 1141359 RSP_1234 RSP_1235 aroE coaE TRUE 0.930 -3.000 0.078 1.000 N NA
 1141359 1141360 RSP_1235 RSP_1236 coaE dnaQ TRUE 0.904 -7.000 0.092 1.000 N NA
 1141361 1141362 RSP_1237 RSP_1238 secB fxsA TRUE 0.736 34.000 0.122 1.000   NA
 1141363 1141364 RSP_1239 RSP_1240     TRUE 0.983 0.000 0.324 1.000   NA
 1141364 1141365 RSP_1240 RSP_1241     TRUE 0.982 0.000 0.332 NA   NA
 1141366 1141367 RSP_1242 RSP_1243     TRUE 0.798 -3.000 0.018 NA N NA
 1141368 1141369 RSP_1244 RSP_1245     TRUE 0.988 -3.000 0.481 NA   NA
 1141369 1141370 RSP_1245 RSP_1247     TRUE 0.968 -3.000 0.148 1.000   NA
 1141370 1141371 RSP_1247 RSP_6150     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 1141371 1141372 RSP_6150 RSP_1249     TRUE 0.981 19.000 0.667 NA Y NA
 1141377 1141378 RSP_1254 RSP_1255     TRUE 0.989 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 1141378 1141379 RSP_1255 RSP_1256     TRUE 0.939 -13.000 0.063 0.064 N NA
 1141379 1141380 RSP_1256 RSP_1257   phbC TRUE 0.916 13.000 0.018 1.000 Y NA
 1141381 1141382 RSP_1258 RSP_1259     FALSE 0.323 82.000 0.031 NA   NA
 1141382 1141383 RSP_1259 RSP_1260     FALSE 0.501 56.000 0.069 NA   NA
 1141384 1141385 RSP_1261 RSP_1262 blrB   FALSE 0.223 72.000 0.000 1.000   NA
 1141385 1141386 RSP_1262 RSP_1263     FALSE 0.042 199.000 0.000 NA   NA
 1141387 1141388 RSP_1264 RSP_1265   kdpA TRUE 0.977 8.000 0.071 0.001   NA
 1141388 1141389 RSP_1265 RSP_1266 kdpA kdpB TRUE 0.990 9.000 0.059 0.001 Y NA
 1141389 1141390 RSP_1266 RSP_1267 kdpB kdpC TRUE 0.997 13.000 0.877 0.001 Y NA
 1141390 1141391 RSP_1267 RSP_1268 kdpC kdpD TRUE 0.923 4.000 0.014 0.090 N NA
 1141391 1141392 RSP_1268 RSP_1269 kdpD kdpE TRUE 0.993 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 1141393 1141394 RSP_1270 RSP_1271     TRUE 0.651 79.000 0.214 NA   NA
 1141394 1141395 RSP_1271 RSP_1272     TRUE 0.971 -3.000 0.237 1.000 N NA
 1141395 1141396 RSP_1272 RSP_1273     TRUE 0.978 -3.000 0.254 NA   NA
 1141399 1141400 RSP_1275 RSP_1276     FALSE 0.233 140.000 0.056 NA   NA
 1141401 1141402 RSP_1277 RSP_1278   cbbZ TRUE 0.899 -3.000 0.017 1.000   NA
 1141402 1141403 RSP_1278 RSP_1279 cbbZ cbbY TRUE 0.981 0.000 0.029 0.001   NA
 1141403 1141404 RSP_1279 RSP_1280 cbbY cbbX TRUE 0.928 -3.000 0.041 1.000   NA
 1141404 1141405 RSP_1280 RSP_1281 cbbX cbbS FALSE 0.551 75.000 0.106 1.000   NA
 1141405 1141406 RSP_1281 RSP_1282 cbbS cbbL TRUE 0.987 12.000 0.556 0.001 N NA
 1141406 1141407 RSP_1282 RSP_1283 cbbL cfxA TRUE 0.981 15.000 0.444 1.000 Y NA
 1141407 1141408 RSP_1283 RSP_1284 cfxA prkA FALSE 0.107 124.000 0.011 1.000 N NA
 1141408 1141409 RSP_1284 RSP_1285 prkA cbbF1 TRUE 0.935 7.000 0.011 0.012 N NA
 1141411 1141412 RSP_1287 RSP_1288     TRUE 0.995 2.000 0.214 0.023 Y NA
 1141412 1141413 RSP_1288 RSP_1289     TRUE 0.988 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 1141413 1141414 RSP_1289 RSP_1290     TRUE 0.995 -3.000 0.150 0.060 Y NA
 1141414 1141415 RSP_1290 RSP_1291     TRUE 0.993 3.000 0.364 NA Y NA
 1141417 1141418 RSP_1292 RSP_1293     TRUE 0.974 -3.000 0.087 0.064 N NA
 1141418 1141419 RSP_1293 RSP_1294     TRUE 0.991 -3.000 0.419 0.064 N NA
 1141419 1141420 RSP_1294 RSP_1295     FALSE 0.371 76.000 0.070 1.000 N NA
 1141423 1141424 RSP_1299 RSP_1300     TRUE 0.919 28.000 0.500 1.000   NA
 1141424 1141425 RSP_1300 RSP_1301     TRUE 0.993 2.000 1.000 1.000   NA
 1141425 1141426 RSP_1301 RSP_6154     TRUE 0.687 131.000 0.500 NA   NA
 1141426 1141427 RSP_6154 RSP_1302   motB FALSE 0.514 75.000 0.095 NA   NA
 1141427 1141428 RSP_1302 RSP_1303 motB flgE TRUE 0.944 95.000 0.905 1.000 Y NA
 1141428 1141429 RSP_1303 RSP_1304 flgE   TRUE 0.997 13.000 0.955 0.006 Y NA
 1141429 1141430 RSP_1304 RSP_1305     TRUE 0.997 1.000 0.864 0.006   NA
 1141430 1141431 RSP_1305 RSP_1307   flgI TRUE 0.997 0.000 0.950 0.006   NA
 1141434 1141435 RSP_1309 RSP_1310 fliP   TRUE 0.992 -3.000 0.704 1.000   NA
 1141435 1141436 RSP_1310 RSP_1311   fliH TRUE 0.982 -7.000 0.556 NA   NA
 1141436 1141437 RSP_1311 RSP_1312 fliH fliF TRUE 0.992 0.000 0.800 NA   NA
 1141438 1141439 RSP_1313 RSP_1314     TRUE 0.612 34.000 0.062 NA   NA
 1141439 1141440 RSP_1314 RSP_1315     TRUE 0.992 -3.000 0.722 NA   NA
 1141440 1141441 RSP_1315 RSP_1316   motA TRUE 0.743 57.000 0.279 NA   NA
 1141441 1141442 RSP_1316 RSP_1318 motA   TRUE 0.984 -3.000 0.349 NA   NA
 1141442 1141443 RSP_1318 RSP_1319     FALSE 0.056 296.000 0.118 NA   NA
 1141443 1141444 RSP_1319 RSP_1320   flhA TRUE 0.967 4.000 0.209 NA   NA
 1141444 1141445 RSP_1320 RSP_1321 flhA fliR TRUE 0.995 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 1141445 1141446 RSP_1321 RSP_1322 fliR fhlB TRUE 0.999 -3.000 0.952 0.089 Y NA
 1141446 1141447 RSP_1322 RSP_6155 fhlB   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141448 1141449 RSP_1323 RSP_1324   flgH FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 1141449 1141450 RSP_1324 RSP_1325 flgH   TRUE 0.980 11.000 0.810 NA   NA
 1141450 1141451 RSP_1325 RSP_1326     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 1141451 1141452 RSP_1326 RSP_1327     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.001 Y NA
 1141452 1141453 RSP_1327 RSP_1328     TRUE 0.997 2.000 0.905 1.000 Y NA
 1141453 1141454 RSP_1328 RSP_1329   fliE TRUE 0.995 0.000 0.404 1.000 Y NA
 1141454 1141455 RSP_1329 RSP_1330 fliE   TRUE 0.973 14.000 0.038 0.004 Y NA
 1141455 1141456 RSP_1330 RSP_1331     TRUE 0.991 -3.000 0.007 0.004 Y NA
 1141458 1141459 RSP_1333 RSP_1334     TRUE 0.989 -10.000 1.000 NA   NA
 1141460 1141461 RSP_1335 RSP_1336     TRUE 0.690 10.000 0.000 NA   NA
 1141462 1141463 RSP_1337 RSP_1338 aarF ubiE TRUE 0.640 50.000 0.115 1.000   NA
 1141464 1141465 RSP_1339 RSP_1340     FALSE 0.306 61.000 0.040 1.000 N NA
 1141465 1141466 RSP_1340 RSP_1341   rpsT FALSE 0.141 111.000 0.016 1.000 N NA
 1141466 1141467 RSP_1341 RSP_1342 rpsT dnaA FALSE 0.001 539.000 0.000 1.000 N NA
 1141467 1141468 RSP_1342 RSP_1343 dnaA   TRUE 0.843 118.000 0.328 1.000 Y NA
 1141468 1141469 RSP_1343 RSP_1344   recF TRUE 0.956 53.000 0.318 0.039 Y NA
 1141469 1141470 RSP_1344 RSP_1345 recF   TRUE 0.754 -3.000 0.010 NA N NA
 1141470 1141471 RSP_1345 RSP_1346     FALSE 0.080 92.000 0.002 NA N NA
 1141475 1141476 RSP_1351 RSP_1352 serC   TRUE 0.815 72.000 0.140 1.000 Y NA
 1141476 1141477 RSP_1352 RSP_1353     FALSE 0.295 99.000 0.027 1.000   NA
 1141477 1141478 RSP_1353 RSP_1354     TRUE 0.661 83.000 0.214 1.000   NA
 1141479 1141480 RSP_1355 RSP_1356     TRUE 0.988 -3.000 0.473 1.000   NA
 1141482 1141483 RSP_1358 RSP_1359   recQ TRUE 0.924 0.000 0.048 NA   NA
 1141483 1141484 RSP_1359 RSP_1360 recQ   FALSE 0.481 58.000 0.054 1.000   NA
 1141485 1141486 RSP_1361 RSP_1362     FALSE 0.369 95.000 0.053 NA   NA
 1141486 1141487 RSP_1362 RSP_1363   mepA TRUE 0.949 -3.000 0.079 NA   NA
 1141487 1141488 RSP_1363 RSP_1364 mepA   TRUE 0.912 12.000 0.175 NA   NA
 1141488 1141489 RSP_1364 RSP_1365     FALSE 0.522 82.000 0.105 NA   NA
 1141489 1141490 RSP_1365 RSP_1366     FALSE 0.017 280.000 0.005 NA   NA
 1141491 1141492 RSP_1367 RSP_1368   pncA TRUE 0.887 2.000 0.053 1.000 N NA
 1141493 1141494 RSP_1369 RSP_1371     TRUE 0.976 -3.000 0.300 1.000 N NA
 1141496 1141497 RSP_1372 RSP_1373     TRUE 0.822 93.000 0.040 0.051 Y NA
 1141497 1141498 RSP_1373 RSP_1374   lpsB FALSE 0.403 49.000 0.055 1.000 N NA
 1141498 1141499 RSP_1374 RSP_1375 lpsB   TRUE 0.928 -3.000 0.041 1.000   NA
 1141499 1141500 RSP_1375 RSP_1376   asd FALSE 0.163 129.000 0.005 1.000   NA
 1141502 1141503 RSP_1378 RSP_1379     TRUE 0.866 17.000 0.159 NA   NA
 1141503 1141504 RSP_1379 RSP_1380     TRUE 0.986 -3.000 0.408 NA   NA
 1141505 1141506 RSP_1381 RSP_1382     TRUE 0.579 15.000 0.002 NA   NA
 1141506 1141507 RSP_1382 RSP_1383     FALSE 0.147 139.000 0.018 NA   NA
 1141510 1141511 RSP_1387 RSP_1388     FALSE 0.355 129.000 0.132 1.000 N NA
 1141511 1141512 RSP_1388 RSP_1390     TRUE 0.820 70.000 0.500 1.000   NA
 1141514 1141515 RSP_1391 RSP_1392 thiB thiP TRUE 0.988 -24.000 0.697 0.072 N NA
 1141515 1141516 RSP_1392 RSP_1393 thiP thiQ TRUE 0.986 -13.000 0.522 0.072 N NA
 1141517 1141518 RSP_1394 RSP_1395 fbcC fbcB TRUE 0.994 18.000 0.630 0.001 Y NA
 1141518 1141519 RSP_1395 RSP_1396 fbcB fbcF TRUE 0.987 11.000 0.069 0.001 Y NA
 1141519 1141520 RSP_1396 RSP_1397 fbcF   FALSE 0.005 506.000 0.047 NA N NA
 1141520 1141521 RSP_1397 RSP_6156     TRUE 0.922 5.000 0.070 NA   NA
 1141521 1141522 RSP_6156 RSP_1398   rpmJ FALSE 0.113 131.000 0.000 NA   NA
 1141522 1141523 RSP_1398 RSP_4309 rpmJ   FALSE 0.200 70.000 0.000 NA   NA
 1141526 1141527 RSP_1401 RSP_6157     TRUE 0.989 -3.000 0.565 NA   NA
 1141527 1141528 RSP_6157 RSP_1403     FALSE 0.010 308.000 0.000 NA   NA
 1141534 1141535 RSP_1410 RSP_1411     TRUE 0.996 1.000 0.790 0.054   NA
 1141535 1138444 RSP_1411 RSP_4294     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 1141536 1141537 RSP_4347 RSP_4348     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 1141537 1141538 RSP_4348 RSP_4349     FALSE 0.253 48.000 0.000 NA   NA
 1141538 1141539 RSP_4349 RSP_4350     FALSE 0.020 245.000 0.000 NA   NA
 1141539 1141540 RSP_4350 RSP_4357     FALSE 0.163 100.000 0.000 NA   NA
 1141540 1141541 RSP_4357 RSP_4351     FALSE 0.262 46.000 0.000 NA   NA
 1141542 1141543 RSP_3806 RSP_3807     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1141543 1141544 RSP_3807 RSP_3808     FALSE 0.217 63.000 0.000 NA   NA
 1141544 1141545 RSP_3808 RSP_3809     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 1141545 1141546 RSP_3809 RSP_3810     TRUE 0.888 5.000 0.038 NA   NA
 1141546 1141547 RSP_3810 RSP_3811     FALSE 0.187 83.000 0.000 NA   NA
 1141548 1141549 RSP_3812 RSP_3813   parB TRUE 0.996 0.000 0.743 0.039   NA
 1141549 1141550 RSP_3813 RSP_3814 parB   TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.039   NA
 1141550 1141551 RSP_3814 RSP_3816     FALSE 0.003 640.000 0.000 1.000   NA
 1141552 1141553 RSP_6251 RSP_4308     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 1141554 1141555 RSP_6232 RSP_3819   rplU FALSE 0.012 288.000 0.000 NA   NA
 1141555 1141556 RSP_3819 RSP_3820 rplU rpmA TRUE 0.998 7.000 0.667 0.012 Y NA
 1141556 1141557 RSP_3820 RSP_3821 rpmA   TRUE 0.611 94.000 0.014 1.000 Y NA
 1141557 1141558 RSP_3821 RSP_3822     FALSE 0.278 95.000 0.019 1.000   NA
 1141558 1141559 RSP_3822 RSP_3823   proB1 TRUE 0.954 0.000 0.087 1.000   NA
 1141559 1141560 RSP_3823 RSP_3824 proB1 proA TRUE 0.928 51.000 0.065 0.001 Y NA
 1141562 1141563 RSP_6239 RSP_3826     FALSE 0.408 168.000 0.299 NA   NA
 1141563 1141564 RSP_3826 RSP_3827     TRUE 0.583 81.000 0.150 NA   NA
 1141566 1141567 RSP_3829 RSP_3830     FALSE 0.227 83.000 0.005 NA   NA
 1141567 1141568 RSP_3830 RSP_3831   cox15 FALSE 0.240 85.000 0.009 NA   NA
 1141568 1141569 RSP_3831 RSP_3832 cox15 cxp TRUE 0.948 -3.000 0.117 1.000 N NA
 1141573 1141574 RSP_6211 RSP_3836     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1141576 1141577 RSP_4352 RSP_4353     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 1141577 1141578 RSP_4353 RSP_4354     FALSE 0.253 48.000 0.000 NA   NA
 1141578 1141579 RSP_4354 RSP_4355     FALSE 0.020 245.000 0.000 NA   NA
 1141579 3385516 RSP_4355 RSP_r01     FALSE 0.165 98.000 0.000 NA   NA
 3385516 1141580 RSP_r01 RSP_4356     FALSE 0.267 45.000 0.000 NA   NA
 1141580 1141581 RSP_4356 RSP_3003     FALSE 0.006 375.000 0.000 NA   NA
 1141581 1141582 RSP_3003 RSP_3004     FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   NA
 1141585 1141586 RSP_3007 RSP_3008     FALSE 0.002 578.000 0.000 NA   NA
 1141586 1141587 RSP_3008 RSP_3009     TRUE 0.685 -129.000 0.000 NA   NA
 1141587 1141588 RSP_3009 RSP_3010     TRUE 0.686 -75.000 0.000 NA   NA
 1141588 1141589 RSP_3010 RSP_3012     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141589 1141590 RSP_3012 RSP_3014     FALSE 0.001 966.000 0.000 1.000 N NA
 1141590 1141591 RSP_3014 RSP_3015     TRUE 0.963 0.000 0.125 1.000   NA
 1141591 1141592 RSP_3015 RSP_3016     TRUE 0.705 58.000 0.222 NA   NA
 1141592 1141593 RSP_3016 RSP_3017     TRUE 0.646 37.000 0.087 NA   NA
 1141593 1141594 RSP_3017 RSP_3018     TRUE 0.860 74.000 0.304 0.054   NA
 1141594 1141595 RSP_3018 RSP_3019     TRUE 0.603 24.000 0.032 NA   NA
 1141595 1141596 RSP_3019 RSP_3020     TRUE 0.911 -3.000 0.032 NA   NA
 1141596 1141597 RSP_3020 RSP_3021     TRUE 0.980 -3.000 0.286 NA   NA
 1141601 1141602 RSP_3024 RSP_3026     FALSE 0.030 586.000 0.000 0.071 Y NA
 1141602 1141603 RSP_3026 RSP_3027   rdxA FALSE 0.056 128.000 0.000 1.000 N NA
 1141606 1141607 RSP_3030 RSP_3031     TRUE 0.995 2.000 0.222 0.059 Y NA
 1141607 1141608 RSP_3031 RSP_3032     TRUE 0.992 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 1141608 1141609 RSP_3032 RSP_3033     TRUE 0.996 -3.000 0.132 0.002 Y NA
 1141609 1141610 RSP_3033 RSP_3034     TRUE 0.727 38.000 0.000 1.000 Y NA
 1141610 1141611 RSP_3034 RSP_3035     FALSE 0.308 122.000 0.000 0.059 N NA
 1141611 1141612 RSP_3035 RSP_3036     FALSE 0.330 39.000 0.000 1.000   NA
 1141613 1141614 RSP_3037 RSP_3038     TRUE 0.851 21.000 0.235 1.000 N NA
 1141614 1141615 RSP_3038 RSP_3039     TRUE 0.997 9.000 0.738 0.059 Y NA
 1141615 1141616 RSP_3039 RSP_3040     TRUE 0.986 13.000 0.238 0.059 Y NA
 1141616 1141617 RSP_3040 RSP_3041     TRUE 0.931 60.000 0.500 1.000 Y NA
 1141618 1141619 RSP_3042 RSP_6160 dorX dorY FALSE 0.228 56.000 0.000 NA   NA
 1141619 1141620 RSP_6160 RSP_3043 dorY   FALSE 0.189 81.000 0.000 NA   NA
 1141620 1141621 RSP_3043 RSP_3044   dorS TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141623 1141624 RSP_3046 RSP_3047 dorC dorB TRUE 0.978 -3.000 0.062 0.054   NA
 1141624 1141625 RSP_3047 RSP_3048 dorB dorA TRUE 0.975 -3.000 0.046 0.054   NA
 1141625 1141626 RSP_3048 RSP_3049 dorA moeA FALSE 0.052 131.000 0.000 1.000 N NA
 1141626 1141627 RSP_3049 RSP_3050 moeA moaA TRUE 0.856 57.000 0.000 0.003 Y NA
 1141627 1141628 RSP_3050 RSP_3051 moaA   FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 1141630 1141631 RSP_3053 RSP_3054     FALSE 0.089 337.000 0.333 NA   NA
 1141634 1141635 RSP_3056 RSP_3057     FALSE 0.007 510.000 0.000 0.088 N NA
 1141635 1141636 RSP_3057 RSP_3058     TRUE 0.995 -7.000 0.400 0.088 Y NA
 1141636 1141637 RSP_3058 RSP_3059     TRUE 0.945 68.000 0.333 0.059 Y NA
 1141638 1141639 RSP_3060 RSP_3061 cysE   TRUE 0.720 27.000 0.083 NA   NA
 1141639 1141640 RSP_3061 RSP_3062   fabG TRUE 0.993 -3.000 0.895 NA   NA
 1141640 1141641 RSP_3062 RSP_3063 fabG   TRUE 0.992 2.000 0.111 0.062 Y NA
 1141641 1141642 RSP_3063 RSP_3064     FALSE 0.038 149.000 0.000 1.000 N NA
 1141642 1141643 RSP_3064 RSP_3065     FALSE 0.087 270.000 0.000 1.000 Y NA
 1141643 1141644 RSP_3065 RSP_3067     FALSE 0.294 139.000 0.083 NA   NA
 1141644 1141645 RSP_3067 RSP_3068     TRUE 0.993 -3.000 0.917 NA   NA
 1141648 1141649 RSP_3070 RSP_3072   sndh FALSE 0.263 239.000 0.000 0.022 Y NA
 1141652 1141653 RSP_3075 RSP_3076     TRUE 0.983 0.000 0.354 NA   NA
 1141654 1141655 RSP_3077 RSP_3078     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 1141657 1141658 RSP_3080 RSP_3081     FALSE 0.008 510.000 0.000 0.071 N NA
 1141660 1141661 RSP_3083 RSP_3084 mcpH   TRUE 0.558 14.000 0.000 NA   NA
 1141662 1141663 RSP_3085 RSP_3087   dgkA TRUE 0.918 11.000 0.143 1.000   NA
 1141664 1141665 RSP_3086 RSP_3088     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1141665 1141666 RSP_3088 RSP_3089     FALSE 0.015 286.000 0.000 1.000   NA
 1141668 1141669 RSP_3091 RSP_3092     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 1141669 1141670 RSP_3092 RSP_3093     TRUE 0.552 25.000 0.022 NA   NA
 1141670 1141671 RSP_3093 RSP_3094     TRUE 0.884 28.000 0.343 NA   NA
 1141671 1141672 RSP_3094 RSP_3095     TRUE 0.992 -7.000 0.475 NA Y NA
 1141672 1141673 RSP_3095 RSP_3096     FALSE 0.422 66.000 0.050 NA   NA
 1141673 1141674 RSP_3096 RSP_3097   qoxA TRUE 0.974 -3.000 0.211 NA   NA
 1141674 1141675 RSP_3097 RSP_3098 qoxA qoxB TRUE 0.999 -3.000 0.905 0.003 Y NA
 1141675 1141676 RSP_3098 RSP_3100 qoxB   FALSE 0.034 372.000 0.143 NA   NA
 1141676 1141677 RSP_3100 RSP_3101     FALSE 0.276 138.000 0.071 NA   NA
 1141677 1141678 RSP_3101 RSP_3102     FALSE 0.004 469.000 0.000 1.000   NA
 1141679 1141680 RSP_3103 RSP_3104   fdh TRUE 0.986 4.000 0.565 NA   NA
 1141681 1141682 RSP_3105 RSP_3106     FALSE 0.036 153.000 0.000 1.000 N NA
 1141682 1141683 RSP_3106 RSP_3107     FALSE 0.423 135.000 0.163 NA   NA
 1141683 1141684 RSP_3107 RSP_3108     FALSE 0.004 453.000 0.000 NA   NA
 1141684 1141685 RSP_3108 RSP_3109     FALSE 0.036 153.000 0.000 1.000 N NA
 1141686 1141687 RSP_3110 RSP_3111     TRUE 0.919 32.000 0.000 0.002 Y NA
 1141687 1141688 RSP_3111 RSP_3112     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 1141689 1141690 RSP_3113 RSP_3114 dadA   FALSE 0.003 479.000 0.000 NA   NA
 1141690 1141691 RSP_3114 RSP_3115     FALSE 0.186 84.000 0.000 NA   NA
 1141691 1141692 RSP_3115 RSP_3116     FALSE 0.492 58.000 0.067 NA   NA
 1141693 1141694 RSP_4319 RSP_3117     FALSE 0.003 525.000 0.000 NA   NA
 1141695 1141696 RSP_3118 RSP_3119     TRUE 0.693 28.000 0.074 NA   NA
 1141696 1141697 RSP_3119 RSP_3120     FALSE 0.004 467.000 0.000 NA   NA
 1141697 1141698 RSP_3120 RSP_6238     FALSE 0.187 83.000 0.000 NA   NA
 1141698 1141699 RSP_6238 RSP_3122     FALSE 0.137 119.000 0.000 NA   NA
 1141699 1141700 RSP_3122 RSP_3123     TRUE 0.932 11.000 0.188 1.000   NA
 1141701 1141702 RSP_3124 RSP_3125     TRUE 0.821 54.000 0.000 0.049 Y NA
 1141702 1141703 RSP_3125 RSP_3126     FALSE 0.439 36.000 0.044 1.000 N NA
 1141703 1141704 RSP_3126 RSP_3127   arsC TRUE 0.990 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 1141706 1141707 RSP_3129 RSP_3130     TRUE 0.984 -3.000 0.333 1.000   NA
 1141707 1141708 RSP_3130 RSP_3131     TRUE 0.893 -3.000 0.013 1.000   NA
 1141708 1141709 RSP_3131 RSP_3132     TRUE 0.875 0.000 0.013 NA   NA
 1141709 1141710 RSP_3132 RSP_3133     TRUE 0.906 -7.000 0.065 NA   NA
 1141710 1141711 RSP_3133 RSP_6164     TRUE 0.969 19.000 1.000 NA   NA
 1141711 1141712 RSP_6164 RSP_3134     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 1141712 1141713 RSP_3134 RSP_3135     TRUE 0.960 -3.000 0.111 NA   NA
 1141714 1141715 RSP_3136 RSP_3137     FALSE 0.002 626.000 0.000 NA   NA
 1141718 1141719 RSP_3140 RSP_3141     FALSE 0.002 650.000 0.000 NA   NA
 1141719 1141720 RSP_3141 RSP_3142     TRUE 0.991 -3.000 0.684 NA   NA
 1141721 1141722 RSP_3143 RSP_3144     TRUE 0.690 10.000 0.000 NA   NA
 1141722 1141723 RSP_3144 RSP_3145   ttdB TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141723 1141724 RSP_3145 RSP_3146 ttdB ttdA TRUE 0.998 -36.000 0.667 0.001 Y NA
 1141724 1141725 RSP_3146 RSP_3147 ttdA sdhA TRUE 0.985 -3.000 0.086 1.000 Y NA
 1141725 1141726 RSP_3147 RSP_3148 sdhA   TRUE 0.985 2.000 0.083 0.002   NA
 1141726 1141727 RSP_3148 RSP_3149     TRUE 0.987 -3.000 0.073 0.001   NA
 1141727 1141728 RSP_3149 RSP_3150   frdB TRUE 0.984 4.000 0.092 0.002   NA
 1141728 1141729 RSP_3150 RSP_3151 frdB   FALSE 0.004 278.000 0.000 NA N NA
 1141729 1141730 RSP_3151 RSP_3152     TRUE 0.964 0.000 0.000 NA Y NA
 1141730 1141731 RSP_3152 RSP_3153     FALSE 0.344 149.000 0.000 NA Y NA
 1141731 1141732 RSP_3153 RSP_3154     TRUE 0.993 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 1141732 1141733 RSP_3154 RSP_3155     TRUE 0.678 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1141734 1141735 RSP_6165 RSP_6166     TRUE 0.946 13.000 0.333 1.000   NA
 1141736 1141737 RSP_3157 RSP_3159     TRUE 0.992 2.000 0.292 0.006   NA
 1141737 1141738 RSP_3159 RSP_3160     TRUE 0.991 5.000 0.464 0.087   NA
 1141738 1141739 RSP_3160 RSP_3161     FALSE 0.032 219.000 0.000 NA   NA
 1141739 1141740 RSP_3161 RSP_3162     FALSE 0.002 1131.000 0.000 NA   NA
 1141740 1141741 RSP_3162 RSP_3163     TRUE 0.928 8.000 0.000 0.053   NA
 1141741 1141742 RSP_3163 RSP_3164     TRUE 0.997 4.000 0.300 0.001 Y NA
 1141742 1141743 RSP_3164 RSP_3165     FALSE 0.089 86.000 0.000 1.000 N NA
 1141743 1141744 RSP_3165 RSP_3166     TRUE 0.956 0.000 0.154 1.000 N NA
 1141744 1141745 RSP_3166 RSP_3167     TRUE 0.994 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 1141745 1141746 RSP_3167 RSP_3168     TRUE 0.993 0.000 0.308 1.000 Y NA
 1141747 1141748 RSP_3169 RSP_3170     FALSE 0.486 6.000 0.000 NA N NA
 1141748 1141749 RSP_3170 RSP_3171     TRUE 0.552 1.000 0.000 NA N NA
 1141749 1141750 RSP_3171 RSP_3172     TRUE 0.844 0.000 0.000 1.000   NA
 1141751 1141752 RSP_3174 RSP_3175     FALSE 0.025 233.000 0.000 NA   NA
 1141752 1141753 RSP_3175 RSP_3176   fabI FALSE 0.095 174.000 0.021 NA   NA
 1141753 1141754 RSP_3176 RSP_3177 fabI fabB TRUE 0.981 11.000 0.265 1.000 Y NA
 1141754 1141755 RSP_3177 RSP_3178 fabB fabA TRUE 0.974 20.000 0.451 1.000 Y NA
 1141756 1141757 RSP_3179 RSP_3180 fur   FALSE 0.227 131.000 0.071 NA N NA
 1141758 1141759 RSP_3181 RSP_3182     TRUE 0.678 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1141759 1141760 RSP_3182 RSP_3183     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1141760 1141761 RSP_3183 RSP_3184     TRUE 0.985 0.000 0.088 1.000 Y NA
 1141761 1141762 RSP_3184 RSP_3185   cobB FALSE 0.031 161.000 0.000 1.000 N NA
 1141762 1141763 RSP_3185 RSP_3186 cobB   FALSE 0.040 229.000 0.012 NA   NA
 1141765 1141766 RSP_3187 RSP_3188 mdoG   FALSE 0.008 253.000 0.000 1.000 N NA
 1141766 1141767 RSP_3188 RSP_3189     TRUE 0.801 5.000 0.000 1.000   NA
 1141767 1141768 RSP_3189 RSP_3190     TRUE 0.819 51.000 0.097 0.012   NA
 1141768 1141769 RSP_3190 RSP_3191   fprA TRUE 0.968 30.000 0.226 0.053 Y NA
 1141770 1141771 RSP_3192 RSP_3193 rnfA rnfB TRUE 0.967 20.000 0.098 0.053 Y NA
 1141771 1141772 RSP_3193 RSP_3194 rnfB rnfC TRUE 0.994 -3.000 0.092 0.015 Y NA
 1141772 1141773 RSP_3194 RSP_3195 rnfC rnfD TRUE 0.999 -3.000 0.905 0.053 Y NA
 1141773 1141774 RSP_3195 RSP_3196 rnfD rnfG TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.053 Y NA
 1141774 1141775 RSP_3196 RSP_3197 rnfG rnfE TRUE 0.995 16.000 1.000 0.053 Y NA
 1141775 1141776 RSP_3197 RSP_3198 rnfE rnfH TRUE 0.986 -3.000 0.419 NA   NA
 1141776 1141777 RSP_3198 RSP_3199 rnfH   FALSE 0.248 50.000 0.000 NA   NA
 1141777 1141778 RSP_3199 RSP_3200     FALSE 0.093 141.000 0.000 NA   NA
 1141780 1141781 RSP_3202 RSP_3203     FALSE 0.317 235.000 0.000 0.005 Y NA
 1141781 1141782 RSP_3203 RSP_3204     FALSE 0.029 164.000 0.000 1.000 N NA
 1141782 1141783 RSP_3204 RSP_3205     TRUE 0.995 -3.000 0.159 0.053 Y NA
 1141783 1141784 RSP_3205 RSP_3206     TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.053 Y NA
 1141784 1141785 RSP_3206 RSP_6168     FALSE 0.005 264.000 0.000 NA N NA
 1141785 1141786 RSP_6168 RSP_3207     TRUE 0.993 2.000 0.388 NA Y NA
 1141786 1141787 RSP_3207 RSP_3208     TRUE 0.964 2.000 0.175 NA   NA
 1141787 1141788 RSP_3208 RSP_3209   cbiQ TRUE 0.947 -3.000 0.075 NA   NA
 1141788 1141789 RSP_3209 RSP_3211 cbiQ cbiO TRUE 0.992 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 1141790 1141791 RSP_3210 RSP_3212 qxtB qxtA TRUE 0.987 2.000 0.027 0.053 Y NA
 1141791 1141792 RSP_3212 RSP_3213 qxtA   FALSE 0.006 367.000 0.000 NA   NA
 1141792 1141793 RSP_3213 RSP_3215     FALSE 0.009 319.000 0.000 NA   NA
 1141793 1141794 RSP_3215 RSP_3216     TRUE 0.961 0.000 0.115 1.000   NA
 1141796 1141797 RSP_6169 RSP_3217     FALSE 0.185 85.000 0.000 NA   NA
 1141798 1141799 RSP_3220 RSP_3221     TRUE 0.998 -7.000 0.870 0.058 Y NA
 1141799 1141800 RSP_3221 RSP_3222     TRUE 0.997 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 1141800 1141801 RSP_3222 RSP_3223     FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 1141801 1141802 RSP_3223 RSP_3225     FALSE 0.161 101.000 0.000 NA   NA
 1141802 1141803 RSP_3225 RSP_3226     FALSE 0.034 309.000 0.000 0.038 N NA
 1141803 1141804 RSP_3226 RSP_3227     FALSE 0.125 110.000 0.011 1.000 N NA
 1141804 1141805 RSP_3227 RSP_3228     FALSE 0.114 56.000 0.000 1.000 N NA
 1141806 1141807 RSP_3229 RSP_3230     FALSE 0.165 194.000 0.091 NA   NA
 1141808 1141809 RSP_3231 RSP_3232     TRUE 0.889 68.000 0.097 0.058 Y NA
 1141809 1141810 RSP_3232 RSP_3233     TRUE 0.997 8.000 0.779 0.058 Y NA
 1141810 1141811 RSP_3233 RSP_3235     TRUE 0.994 5.000 0.560 1.000 Y NA
 1141811 1141812 RSP_3235 RSP_3236     TRUE 0.996 0.000 0.500 0.004   NA
 1141812 1141813 RSP_3236 RSP_3237   lguL FALSE 0.127 153.000 0.012 1.000   NA
 1141813 1141814 RSP_3237 RSP_3238 lguL   FALSE 0.227 70.000 0.000 1.000   NA
 1141815 1141816 RSP_3240 RSP_3241     TRUE 0.987 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 1141817 1141818 RSP_3242 RSP_3245     FALSE 0.001 1094.000 0.000 1.000 N NA
 1141818 1141819 RSP_3245 RSP_3246     FALSE 0.061 123.000 0.000 1.000 N NA
 1141820 1141821 RSP_3248 RSP_3249     TRUE 0.985 -3.000 0.357 1.000   NA
 1141821 1141822 RSP_3249 RSP_3250     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1141822 1141823 RSP_3250 RSP_3251     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 1141823 1141824 RSP_3251 RSP_3252     FALSE 0.018 268.000 0.000 1.000   NA
 1141824 1141825 RSP_3252 RSP_3253     TRUE 0.986 -3.000 0.389 1.000   NA
 1141825 1141826 RSP_3253 RSP_3255     TRUE 0.973 6.000 0.389 1.000 N NA
 1141826 1141827 RSP_3255 RSP_3257     TRUE 0.982 22.000 0.333 0.058 Y NA
 1141827 1141828 RSP_3257 RSP_3258     TRUE 0.997 0.000 0.375 0.058 Y NA
 1141828 1141829 RSP_3258 RSP_3259     TRUE 0.964 -22.000 0.438 NA N NA
 1141829 1141830 RSP_3259 RSP_3260   amiC TRUE 0.992 -3.000 0.938 NA N NA
 1141831 1141832 RSP_3261 RSP_3262 bioA   TRUE 0.850 4.000 0.013 NA   NA
 1141833 1141834 RSP_3263 RSP_3264     FALSE 0.523 96.000 0.000 0.015   NA
 1141834 1141835 RSP_3264 RSP_3265     FALSE 0.072 159.000 0.000 NA   NA
 1141835 1141836 RSP_3265 RSP_6171     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141837 1141838 RSP_3266 RSP_3267 fbpB prkB TRUE 0.950 4.000 0.017 0.012 N NA
 1141838 1141839 RSP_3267 RSP_3268 prkB tklB FALSE 0.313 81.000 0.051 1.000 N NA
 1141839 1141840 RSP_3268 RSP_3269 tklB gapB TRUE 0.983 11.000 0.300 1.000 Y NA
 1141840 1141841 RSP_3269 RSP_3270 gapB cfxB TRUE 0.983 82.000 1.000 0.003 Y NA
 1141841 1141842 RSP_3270 RSP_3271 cfxB rbpL TRUE 0.897 27.000 0.081 1.000 Y NA
 1141843 1141844 RSP_3272 RSP_3273 ggt   FALSE 0.096 72.000 0.000 1.000 N NA
 1141844 1141845 RSP_3273 RSP_3274     TRUE 0.996 -3.000 0.303 0.091 Y NA
 1141846 1141847 RSP_3275 RSP_3276     TRUE 0.966 0.000 0.154 NA   NA
 1141847 1141848 RSP_3276 RSP_6252     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA   NA
 1141848 1141849 RSP_6252 RSP_3278     TRUE 0.964 -7.000 0.250 NA   NA
 1141849 1141850 RSP_3278 RSP_3280     TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 1141850 1141851 RSP_3280 RSP_3281     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1141851 1141852 RSP_3281 RSP_3282     TRUE 0.760 -6.000 0.000 NA   NA
 1141852 1141853 RSP_3282 RSP_3283     FALSE 0.278 43.000 0.000 NA   NA
 1141853 1141854 RSP_3283 RSP_3284   iolD FALSE 0.079 162.000 0.000 1.000   NA
 1141854 1141855 RSP_3284 RSP_3285 iolD iolE TRUE 0.964 10.000 0.438 1.000 N NA
 1141855 1141856 RSP_3285 RSP_3286 iolE iolB TRUE 0.633 109.000 0.038 1.000 Y NA
 1141857 1141858 RSP_3287 RSP_3288 upgC ugpE TRUE 0.997 1.000 0.464 0.058 Y NA
 1141858 1141859 RSP_3288 RSP_3289 ugpE ugpA TRUE 0.997 -7.000 0.559 0.058 Y NA
 1141859 1141860 RSP_3289 RSP_3290 ugpA ugpB TRUE 0.980 47.000 0.793 0.058 Y NA
 1141860 1141861 RSP_3290 RSP_3291 ugpB   FALSE 0.042 200.000 0.019 1.000 N NA
 1141861 1141862 RSP_3291 RSP_3292     FALSE 0.509 61.000 0.111 1.000 N NA
 1141862 1141863 RSP_3292 RSP_3293     TRUE 0.994 2.000 0.390 1.000 Y NA
 1141863 1141864 RSP_3293 RSP_3294     TRUE 0.998 2.000 0.902 0.058 Y NA
 1141864 1141865 RSP_3294 RSP_3295     TRUE 0.994 2.000 0.447 1.000 Y NA
 1141865 1141866 RSP_3295 RSP_3296     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.023 Y NA
 1141866 1141867 RSP_3296 RSP_3297     TRUE 0.995 3.000 0.548 NA Y NA
 1141868 1141869 RSP_3298 RSP_6235     FALSE 0.120 128.000 0.000 NA   NA
 1141869 1141870 RSP_6235 RSP_3299     FALSE 0.331 34.000 0.000 NA   NA
 1141870 1141871 RSP_3299 RSP_6253     FALSE 0.099 137.000 0.000 NA   NA
 1141871 1141872 RSP_6253 RSP_3301   eda FALSE 0.224 59.000 0.000 NA   NA
 1141872 1141873 RSP_3301 RSP_3302 eda cheY4 FALSE 0.032 160.000 0.000 1.000 N NA
 1141873 1141874 RSP_3302 RSP_3303 cheY4 mcpG TRUE 0.682 101.000 0.056 1.000 Y NA
 1141876 1141877 RSP_3305 RSP_3306 abc1   FALSE 0.216 112.000 0.015 NA   NA
 1141877 1141878 RSP_3306 RSP_3307     FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 1141879 1141880 RSP_3308 RSP_3309     FALSE 0.221 74.000 0.000 1.000   NA
 1141881 1141882 RSP_3310 RSP_3937     FALSE 0.008 333.000 0.000 NA   NA
 1141882 1141883 RSP_3937 RSP_4306     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 1141883 1141884 RSP_4306 RSP_3313     FALSE 0.058 174.000 0.000 NA   NA
 1141886 1141887 RSP_6175 RSP_3316     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141888 1141889 RSP_3317 RSP_3318   acrB FALSE 0.232 25.000 0.000 1.000 N NA
 1141889 1141890 RSP_3318 RSP_3321 acrB acrA TRUE 0.959 17.000 0.846 1.000 N NA
 1141890 1141891 RSP_3321 RSP_3322 acrA acoR FALSE 0.080 97.000 0.000 1.000 N NA
 1141892 1141893 RSP_3323 RSP_3324     FALSE 0.002 408.000 0.000 1.000 N NA
 1141893 1141894 RSP_3324 RSP_3325     TRUE 0.650 183.000 1.000 1.000   NA
 1141895 1141896 RSP_3326 RSP_3327     FALSE 0.119 144.000 0.003 1.000   NA
 1141896 1141897 RSP_3327 RSP_3328     FALSE 0.099 148.000 0.000 1.000   NA
 1141897 1141898 RSP_3328 RSP_6254     FALSE 0.021 241.000 0.000 NA   NA
 1141899 1141900 RSP_3329 RSP_3330   sac1 FALSE 0.003 508.000 0.000 NA   NA
 1141901 1141902 RSP_3331 RSP_3332     FALSE 0.253 59.000 0.000 1.000   NA
 1141902 1141903 RSP_3332 RSP_3333     TRUE 0.982 -7.000 0.500 1.000   NA
 1141903 1141904 RSP_3333 RSP_3334     FALSE 0.153 109.000 0.000 NA   NA
 1141904 1141905 RSP_3334 RSP_3335     TRUE 0.955 40.000 0.613 NA Y NA
 1141905 1141906 RSP_3335 RSP_3336     TRUE 0.997 2.000 0.381 0.058 Y NA
 1141906 1141907 RSP_3336 RSP_3337     FALSE 0.344 233.000 0.188 NA Y NA
 1141907 1141908 RSP_3337 RSP_3338     TRUE 0.977 26.000 0.737 NA Y NA
 1141909 1141910 RSP_3339 RSP_3341     FALSE 0.349 148.000 0.000 NA Y NA
 1141912 1141913 RSP_3342 RSP_3343 bfr   FALSE 0.001 680.000 0.000 1.000 N NA
 1141916 1141917 RSP_3346 RSP_3347     TRUE 0.992 -3.000 0.013 0.001 Y NA
 1141918 1141919 RSP_3349 RSP_3350     FALSE 0.182 87.000 0.000 NA   NA
 1141919 1141920 RSP_3350 RSP_3351     FALSE 0.007 353.000 0.000 NA   NA
 1141920 1141921 RSP_3351 RSP_6176     FALSE 0.005 420.000 0.000 NA   NA
 1141921 1141922 RSP_6176 RSP_6177   gpFI FALSE 0.097 138.000 0.000 NA   NA
 1141922 1141923 RSP_6177 RSP_6178 gpFI gpFII TRUE 0.608 12.000 0.000 NA   NA
 1141923 1141924 RSP_6178 RSP_3353 gpFII   FALSE 0.541 15.000 0.000 NA   NA
 1141924 1141925 RSP_3353 RSP_3355     FALSE 0.064 165.000 0.000 NA   NA
 1141925 1141926 RSP_3355 RSP_3357   gpU FALSE 0.429 23.000 0.000 NA   NA
 1141926 1141927 RSP_3357 RSP_3358 gpU gpX TRUE 0.968 -3.000 0.158 NA   NA
 1141927 1141928 RSP_3358 RSP_3359 gpX gpD TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141928 1141929 RSP_3359 RSP_3360 gpD   FALSE 0.057 183.000 0.000 1.000   NA
 1141929 1141930 RSP_3360 RSP_3361     FALSE 0.042 329.000 0.000 0.038   NA
 1141932 1141933 RSP_3363 RSP_3364   proC TRUE 0.721 82.000 0.308 NA   NA
 1141933 1141934 RSP_3364 RSP_3365 proC csaA TRUE 0.971 -3.000 0.163 1.000   NA
 1141934 1141935 RSP_3365 RSP_3366 csaA   TRUE 0.964 -3.000 0.117 1.000   NA
 1141935 1141936 RSP_3366 RSP_3367     FALSE 0.044 209.000 0.000 1.000   NA
 1141936 1141937 RSP_3367 RSP_4339     FALSE 0.224 59.000 0.000 NA   NA
 1141938 1141939 RSP_3368 RSP_6179     FALSE 0.110 132.000 0.000 NA   NA
 1141939 1141940 RSP_6179 RSP_3369     TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA   NA
 1141940 1141941 RSP_3369 RSP_3370     TRUE 0.975 -13.000 0.600 1.000 N NA
 1141941 1141942 RSP_3370 RSP_3371     TRUE 0.617 182.000 0.314 NA Y NA
 1141942 1141943 RSP_3371 RSP_3372     TRUE 0.770 52.000 0.057 NA Y NA
 1141943 1141944 RSP_3372 RSP_3373     FALSE 0.024 178.000 0.000 1.000 N NA
 1141944 1141945 RSP_3373 RSP_3374     TRUE 0.994 2.000 0.459 1.000 Y NA
 1141945 1141946 RSP_3374 RSP_3375     TRUE 0.877 63.000 0.929 1.000 N NA
 1141946 1141947 RSP_3375 RSP_3376   aroQ FALSE 0.102 67.000 0.000 1.000 N NA
 1141948 1141949 RSP_3377 RSP_3378     FALSE 0.214 64.000 0.000 NA   NA
 1141949 1141950 RSP_3378 RSP_3379     TRUE 0.980 0.000 0.300 NA   NA
 1141950 1141951 RSP_3379 RSP_3380     FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 1141952 1141953 RSP_3381 RSP_3382     TRUE 0.912 -3.000 0.033 NA   NA
 1141953 1141954 RSP_3382 RSP_3383     TRUE 0.691 44.000 0.150 NA   NA
 1141954 1141955 RSP_3383 RSP_3384     FALSE 0.059 171.000 0.000 NA   NA
 1141955 1141956 RSP_3384 RSP_3385     FALSE 0.092 81.000 0.000 1.000 N NA
 1141957 1141958 RSP_3386 RSP_3387     TRUE 0.979 10.000 0.636 NA   NA
 1141958 1141959 RSP_3387 RSP_3388     TRUE 0.746 15.000 0.043 NA   NA
 1141959 1141960 RSP_3388 RSP_3389     TRUE 0.984 11.000 0.039 0.001 Y NA
 1141961 1141962 RSP_3390 RSP_3391     TRUE 0.988 -3.000 0.130 1.000 Y NA
 1141962 1141963 RSP_3391 RSP_3392     TRUE 0.998 -3.000 0.958 1.000 Y NA
 1141963 1141964 RSP_3392 RSP_3393     FALSE 0.002 473.000 0.000 1.000 N NA
 1141964 1141965 RSP_3393 RSP_3395     TRUE 0.997 11.000 1.000 0.057 Y NA
 1141965 1141966 RSP_3395 RSP_3396     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.057 Y NA
 1141966 1141967 RSP_3396 RSP_3397     TRUE 0.998 2.000 0.667 0.057 Y NA
 1141967 1141968 RSP_3397 RSP_3398     TRUE 0.618 74.000 0.250 NA N NA
 1141968 1141969 RSP_3398 RSP_3399     TRUE 0.788 10.000 0.019 NA   NA
 1141969 1141970 RSP_3399 RSP_3400     FALSE 0.241 90.000 0.005 1.000   NA
 1141971 1141972 RSP_6180 RSP_3401     FALSE 0.190 80.000 0.000 NA   NA
 1141972 1141973 RSP_3401 RSP_3402     TRUE 0.952 7.000 0.000 0.004   NA
 1141975 1141976 RSP_3404 RSP_3405   gntR TRUE 0.819 33.000 0.235 NA   NA
 1141977 1141978 RSP_3406 RSP_3407 pdxA serA TRUE 0.966 26.000 0.118 0.009 Y NA
 1141978 1141979 RSP_3407 RSP_3408 serA dapA TRUE 0.994 -3.000 0.118 0.061 Y NA
 1141979 1141980 RSP_3408 RSP_3409 dapA   TRUE 0.952 4.000 0.125 NA   NA
 1141980 1141981 RSP_3409 RSP_3410     TRUE 0.721 61.000 0.250 NA   NA
 1141981 1141982 RSP_3410 RSP_3411     TRUE 0.808 36.000 0.250 NA   NA
 1141984 1141985 RSP_3413 RSP_3414     TRUE 0.994 -3.000 0.325 1.000 Y NA
 1141985 1141986 RSP_3414 RSP_3415     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.057 Y NA
 1141986 1141987 RSP_3415 RSP_3416     TRUE 0.819 168.000 0.778 1.000 Y NA
 1141989 1141990 RSP_3418 RSP_6181     TRUE 0.684 -192.000 0.000 NA   NA
 1141991 1141992 RSP_3419 RSP_3420     FALSE 0.031 221.000 0.000 NA   NA
 1141992 1141993 RSP_3420 RSP_3421     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1141993 1141994 RSP_3421 RSP_3422     TRUE 0.608 12.000 0.000 NA   NA
 1141997 1141998 RSP_3425 RSP_3426     TRUE 0.929 -3.000 0.049 NA   NA
 1141999 1142000 RSP_3427 RSP_3428     FALSE 0.276 51.000 0.000 1.000   NA
 1142000 1142001 RSP_3428 RSP_3429     TRUE 0.727 -28.000 0.000 1.000   NA
 1142001 1142002 RSP_3429 RSP_3430     FALSE 0.211 85.000 0.000 1.000   NA
 1142002 1142003 RSP_3430 RSP_3431     TRUE 0.991 -3.000 0.070 0.085 Y NA
 1142003 1142004 RSP_3431 RSP_3432     TRUE 0.579 178.000 0.035 0.011 Y NA
 1142004 1142005 RSP_3432 RSP_3433     FALSE 0.105 65.000 0.000 1.000 N NA
 1142009 1142010 RSP_3437 RSP_3438     TRUE 0.979 -3.000 0.364 NA N NA
 1142010 1142011 RSP_3438 RSP_3439     TRUE 0.640 49.000 0.200 NA N NA
 1142011 1142012 RSP_3439 RSP_3440     TRUE 0.604 66.000 0.200 1.000 N NA
 1142012 1142013 RSP_3440 RSP_3441     TRUE 0.822 17.000 0.160 NA N NA
 1142013 1142014 RSP_3441 RSP_3442     TRUE 0.656 95.000 0.043 NA Y NA
 1142015 1142016 RSP_3443 RSP_3444     TRUE 0.819 12.000 0.083 1.000 N NA
 1142016 1142017 RSP_3444 RSP_3445     TRUE 0.945 5.000 0.167 1.000 N NA
 1142017 1142018 RSP_3445 RSP_3446     TRUE 0.938 -3.000 0.091 1.000 N NA
 1142018 1142019 RSP_3446 RSP_3447     TRUE 0.987 -3.000 0.114 1.000 Y NA
 1142019 1142020 RSP_3447 RSP_3448     TRUE 0.985 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1142020 1142021 RSP_3448 RSP_3449     TRUE 0.987 -9.000 1.000 1.000 N NA
 1142021 1142022 RSP_3449 RSP_3450     TRUE 0.984 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 1142022 1142023 RSP_3450 RSP_3451     FALSE 0.378 54.000 0.054 1.000 N NA
 1142023 1142024 RSP_3451 RSP_3452     TRUE 0.972 10.000 0.625 NA N NA
 1142024 1142025 RSP_3452 RSP_3453     TRUE 0.981 10.000 0.875 NA N NA
 1142026 1142027 RSP_3454 RSP_3455     TRUE 0.810 12.000 0.043 1.000   NA
 1142027 1142028 RSP_3455 RSP_3456     TRUE 0.969 12.000 0.038 0.061 Y NA
 1142028 1142029 RSP_3456 RSP_3457     FALSE 0.019 509.000 0.000 1.000 Y NA
 1142029 1142030 RSP_3457 RSP_3458     TRUE 0.830 70.000 0.156 1.000 Y NA
 1142030 1142031 RSP_3458 RSP_3459     TRUE 0.985 5.000 0.156 1.000 Y NA
 1142031 1142032 RSP_3459 RSP_3460     TRUE 0.998 4.000 0.455 0.008 Y NA
 1142032 1142033 RSP_3460 RSP_3461     TRUE 0.898 38.000 0.571 1.000   NA
 1142033 1142034 RSP_3461 RSP_3462     TRUE 0.901 13.000 0.154 1.000   NA
 1142034 1142035 RSP_3462 RSP_3463     TRUE 0.968 -3.000 0.231 NA N NA
 1142035 1142036 RSP_3463 RSP_3464     TRUE 0.992 -3.000 1.000 NA N NA
 1142036 1142037 RSP_3464 RSP_3465     TRUE 0.981 -3.000 0.286 1.000   NA
 1142037 1142038 RSP_3465 RSP_3466     FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000   NA
 1142038 1142039 RSP_3466 RSP_3467     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1142039 1142040 RSP_3467 RSP_3468     TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1142040 1142041 RSP_3468 RSP_3469     TRUE 0.957 -3.000 0.100 NA   NA
 1142041 1142042 RSP_3469 RSP_3470     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142042 1142043 RSP_3470 RSP_3471     FALSE 0.429 23.000 0.000 NA   NA
 1142044 1142045 RSP_3472 RSP_3474     TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1142046 1142047 RSP_3475 RSP_3476     TRUE 0.578 98.000 0.182 NA   NA
 1142047 1142048 RSP_3476 RSP_3477     TRUE 0.953 19.000 0.667 NA   NA
 1142048 1142049 RSP_3477 RSP_3478     TRUE 0.993 -3.000 0.833 NA   NA
 1142049 1142050 RSP_3478 RSP_3479     TRUE 0.845 52.000 0.500 NA   NA
 1142050 1142051 RSP_3479 RSP_3480     TRUE 0.886 33.000 0.429 NA   NA
 1142051 1142052 RSP_3480 RSP_3481     TRUE 0.985 0.000 0.400 NA   NA
 1142052 1142053 RSP_3481 RSP_3482     TRUE 0.964 -36.000 0.333 NA   NA
 1142053 1142054 RSP_3482 RSP_3483     TRUE 0.986 -6.000 0.667 NA   NA
 1142054 1142055 RSP_3483 RSP_3484     TRUE 0.988 -7.000 0.857 NA   NA
 1142055 1142056 RSP_3484 RSP_3485     TRUE 0.984 9.000 0.714 NA   NA
 1142056 1142057 RSP_3485 RSP_3486     TRUE 0.866 65.000 0.714 NA   NA
 1142057 1142058 RSP_3486 RSP_3487     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 1142058 1142059 RSP_3487 RSP_3488     TRUE 0.924 -10.000 0.103 NA   NA
 1142060 1142061 RSP_3489 RSP_3490     TRUE 0.912 17.000 0.286 NA   NA
 1142061 1142062 RSP_3490 RSP_3491     TRUE 0.989 0.000 0.571 NA   NA
 1142062 1142063 RSP_3491 RSP_3492     TRUE 0.986 4.000 0.571 NA   NA
 1142065 1142066 RSP_3493 RSP_3495     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142066 1142067 RSP_3495 RSP_3496     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1142068 1142069 RSP_3497 RSP_6182     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142069 1142070 RSP_6182 RSP_3498     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1142071 1142072 RSP_3499 RSP_3500     FALSE 0.465 64.000 0.062 NA   NA
 1142072 1142073 RSP_3500 RSP_3501     TRUE 0.971 35.000 0.844 NA Y NA
 1142073 1142074 RSP_3501 RSP_3502     TRUE 0.999 -3.000 0.788 0.057 Y NA
 1142074 1142075 RSP_3502 RSP_3503     TRUE 0.995 -7.000 0.818 1.000 Y NA
 1142076 1142077 RSP_3505 RSP_3506     TRUE 0.964 4.000 0.250 1.000 N NA
 1142077 1142078 RSP_3506 RSP_3507     FALSE 0.401 30.000 0.000 1.000   NA
 1142078 1142079 RSP_3507 RSP_3508     FALSE 0.005 423.000 0.000 1.000   NA
 1142081 1142082 RSP_3510 RSP_3511     TRUE 0.984 0.000 0.344 1.000   NA
 1142082 1142083 RSP_3511 RSP_3512     TRUE 0.998 -3.000 0.963 1.000 Y NA
 1142083 1142084 RSP_3512 RSP_3513     FALSE 0.015 575.000 0.000 1.000 Y NA
 1142086 1142087 RSP_3515 RSP_3516     TRUE 0.977 7.000 0.000 0.057 Y NA
 1142087 1142088 RSP_3516 RSP_3517     TRUE 0.980 5.000 0.000 0.057 Y NA
 1142088 1142089 RSP_3517 RSP_3518     TRUE 0.997 2.000 0.423 0.057 Y NA
 1142089 1142090 RSP_3518 RSP_3519     TRUE 0.699 44.000 0.000 1.000 Y NA
 1142091 1142092 RSP_3520 RSP_3522     TRUE 0.991 4.000 0.833 1.000   NA
 1142092 1142093 RSP_3522 RSP_3523     TRUE 0.987 11.000 0.167 0.057 Y NA
 1142093 1142094 RSP_3523 RSP_3524     TRUE 0.962 66.000 0.500 0.057 Y NA
 1142094 1142095 RSP_3524 RSP_3525     TRUE 0.975 90.000 1.000 0.057 Y NA
 1142096 1142097 RSP_3526 RSP_3527     TRUE 0.973 8.000 0.500 NA N NA
 1142098 1142099 RSP_3528 RSP_3529     FALSE 0.365 77.000 0.034 1.000   NA
 1142099 1142100 RSP_3529 RSP_3530     TRUE 0.889 5.000 0.032 1.000   NA
 1142100 1142101 RSP_3530 RSP_3532     TRUE 0.981 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 1142101 1142102 RSP_3532 RSP_3533     TRUE 0.722 67.000 0.133 0.060 N NA
 1142102 1142103 RSP_3533 RSP_3534     TRUE 0.734 38.000 0.222 1.000 N NA
 1142104 1142105 RSP_3535 RSP_3536     TRUE 0.768 65.000 0.069 1.000 Y NA
 1142105 1142106 RSP_3536 RSP_3537     FALSE 0.047 204.000 0.000 1.000   NA
 1142107 1142108 RSP_3538 RSP_3539     FALSE 0.222 73.000 0.000 1.000   NA
 1142108 1142109 RSP_3539 RSP_3540     TRUE 0.741 38.000 0.000 0.004   NA
 1142112 1142113 RSP_3543 RSP_3544     FALSE 0.106 134.000 0.000 NA   NA
 1142113 1142114 RSP_3544 RSP_3545     FALSE 0.230 55.000 0.000 NA   NA
 1142115 1142116 RSP_3546 RSP_3547     FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000   NA
 1142118 1142119 RSP_3549 RSP_3550 hisG   TRUE 0.992 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 1142119 1142120 RSP_3550 RSP_3551   hisS TRUE 0.987 -3.000 0.097 0.000 N NA
 1142123 1142124 RSP_3554 RSP_3555 xdhA xdhB TRUE 0.994 -3.000 0.043 0.000 Y NA
 1142124 1142125 RSP_3555 RSP_3556 xdhB xdhC TRUE 0.749 -7.000 0.027 NA N NA
 1142125 1142126 RSP_3556 RSP_3557 xdhC   TRUE 0.983 -3.000 0.329 NA   NA
 1142126 1142127 RSP_3557 RSP_3558     TRUE 0.925 19.000 0.346 1.000   NA
 1142127 1142128 RSP_3558 RSP_3559     TRUE 0.992 0.000 0.346 0.057   NA
 1142128 1142129 RSP_3559 RSP_3560     TRUE 0.827 47.000 0.364 1.000   NA
 1142129 1142130 RSP_3560 RSP_3561     FALSE 0.027 228.000 0.000 NA   NA
 1142130 1142131 RSP_3561 RSP_3562   sqr FALSE 0.342 33.000 0.000 NA   NA
 1142131 1142132 RSP_3562 RSP_3563 sqr   FALSE 0.502 5.000 0.000 NA N NA
 1142132 1142133 RSP_3563 RSP_3564     TRUE 0.917 -3.000 0.038 NA   NA
 1142133 1142134 RSP_3564 RSP_3565     FALSE 0.024 260.000 0.009 NA   NA
 1142135 1142136 RSP_3566 RSP_3567   znuB FALSE 0.011 235.000 0.000 1.000 N NA
 1142136 1142137 RSP_3567 RSP_3568 znuB znuC TRUE 0.997 -7.000 0.755 0.089 Y NA
 1142137 1142138 RSP_3568 RSP_3569 znuC zur TRUE 0.994 -3.000 0.309 1.000 Y NA
 1142139 1142140 RSP_3571 RSP_3572 znuA galM FALSE 0.241 49.000 0.017 1.000 N NA
 1142140 1142141 RSP_3572 RSP_3573 galM gvpA FALSE 0.039 215.000 0.000 1.000   NA
 1142142 1142143 RSP_3574 RSP_3575 hutH gvpK FALSE 0.243 64.000 0.000 1.000   NA
 1142143 1142144 RSP_3575 RSP_6183 gvpK   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142144 1142145 RSP_6183 RSP_6233     FALSE 0.045 193.000 0.000 NA   NA
 1142145 1142146 RSP_6233 RSP_3576     TRUE 0.991 -3.000 0.143 0.001   NA
 1142146 1142147 RSP_3576 RSP_3577   gvpG FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 1142147 1142148 RSP_3577 RSP_3578 gvpG gvpF2 TRUE 0.979 0.000 0.286 NA   NA
 1142148 1142149 RSP_3578 RSP_3579 gvpF2   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142149 1142150 RSP_3579 RSP_3580   gvpJ TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1142150 1142151 RSP_3580 RSP_3581 gvpJ   TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1142151 1142152 RSP_3581 RSP_6184     TRUE 0.558 14.000 0.000 NA   NA
 1142152 1142153 RSP_6184 RSP_3582   gvpN TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142153 1142154 RSP_3582 RSP_3583 gvpN   FALSE 0.177 108.000 0.000 1.000   NA
 1142156 1142157 RSP_3585 RSP_3586     TRUE 0.647 15.000 0.008 1.000   NA
 1142157 1142158 RSP_3586 RSP_3587     TRUE 0.885 -3.000 0.009 1.000   NA
 1142158 1142159 RSP_3587 RSP_3588     TRUE 0.911 0.000 0.036 NA   NA
 1142159 1142160 RSP_3588 RSP_3589   ihfB TRUE 0.768 23.000 0.095 NA   NA
 1142160 1142161 RSP_3589 RSP_3590 ihfB   FALSE 0.332 175.000 0.292 1.000 N NA
 1142161 1142162 RSP_3590 RSP_3591     TRUE 0.589 108.000 0.281 1.000 N NA
 1142162 1142163 RSP_3591 RSP_3592   aroA TRUE 0.596 72.000 0.209 1.000 N NA
 1142163 1142164 RSP_3592 RSP_3593 aroA   FALSE 0.057 217.000 0.015 1.000   NA
 1142166 1142167 RSP_3595 RSP_3596 metK lnt FALSE 0.545 89.000 0.191 1.000 N NA
 1142167 1142168 RSP_3596 RSP_3597 lnt   FALSE 0.344 167.000 0.213 NA   NA
 1142168 1142169 RSP_3597 RSP_3598     TRUE 0.769 40.000 0.222 NA   NA
 1142169 1142170 RSP_3598 RSP_3599     TRUE 0.974 -16.000 0.457 NA   NA
 1142170 1142171 RSP_3599 RSP_3600   miaB FALSE 0.383 143.000 0.220 1.000 N NA
 1142171 1142172 RSP_3600 RSP_3601 miaB   FALSE 0.031 162.000 0.000 1.000 N NA
 1142173 1142174 RSP_3602 RSP_3603     TRUE 0.996 -3.000 0.626 1.000 Y NA
 1142174 1142175 RSP_3603 RSP_6185     TRUE 0.861 2.000 0.014 NA   NA
 1142175 1142176 RSP_6185 RSP_3604     FALSE 0.009 323.000 0.000 NA   NA
 1142176 1142177 RSP_3604 RSP_3605     TRUE 0.932 1.000 0.065 NA   NA
 1142177 1142178 RSP_3605 RSP_3606     FALSE 0.175 88.000 0.017 1.000 N NA
 1142178 1142179 RSP_3606 RSP_3607     FALSE 0.078 100.000 0.000 1.000 N NA
 1142179 1142180 RSP_3607 RSP_4303     FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1142181 1142182 RSP_3608 RSP_3609     FALSE 0.222 154.000 0.000 0.037 N NA
 1142182 1142183 RSP_3609 RSP_3610     FALSE 0.127 124.000 0.000 NA   NA
 1142183 1142184 RSP_3610 RSP_6186     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1142184 1142185 RSP_6186 RSP_6187     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142186 1142187 RSP_6188 RSP_3611     FALSE 0.106 134.000 0.000 NA   NA
 1142187 1142188 RSP_3611 RSP_3612     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1142188 1142189 RSP_3612 RSP_6189     FALSE 0.044 194.000 0.000 NA   NA
 1142189 1142190 RSP_6189 RSP_6190     FALSE 0.124 125.000 0.000 NA   NA
 1142190 1142191 RSP_6190 RSP_3613     FALSE 0.002 718.000 0.000 NA   NA
 1142192 1142193 RSP_3614 RSP_3615   groEL FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 1142196 1142197 RSP_6191 RSP_3617     FALSE 0.002 1160.000 0.000 NA   NA
 1142197 1142198 RSP_3617 RSP_6192     FALSE 0.515 113.000 0.154 NA   NA
 1142198 1142199 RSP_6192 RSP_3618     FALSE 0.282 42.000 0.000 NA   NA
 1142199 1142200 RSP_3618 RSP_3619     FALSE 0.006 368.000 0.000 NA   NA
 1142202 1142203 RSP_3621 RSP_3622     TRUE 0.895 34.000 0.500 NA   NA
 1142206 1142207 RSP_3624 RSP_3625     FALSE 0.010 306.000 0.000 NA   NA
 1142208 1142209 RSP_3626 RSP_3627     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142209 1142210 RSP_3627 RSP_3628     TRUE 0.713 9.000 0.000 NA   NA
 1142210 1142211 RSP_3628 RSP_6194     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142211 1142212 RSP_6194 RSP_3629     FALSE 0.036 212.000 0.000 NA   NA
 1142212 1142213 RSP_3629 RSP_3630     FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 1142213 1142214 RSP_3630 RSP_3631     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1142214 1142215 RSP_3631 RSP_3632     FALSE 0.106 134.000 0.000 NA   NA
 1142216 1142217 RSP_6195 RSP_3634     TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1142218 1142219 RSP_3635 RSP_3636     FALSE 0.261 55.000 0.000 1.000   NA
 1142219 1142220 RSP_3636 RSP_3637     TRUE 0.895 13.000 0.154 NA   NA
 1142222 1142223 RSP_3639 RSP_3640     FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 1142223 1142224 RSP_3640 RSP_3641     TRUE 0.990 3.000 0.750 NA   NA
 1142224 1142225 RSP_3641 RSP_3642   exsB TRUE 0.862 -3.000 0.005 NA   NA
 1142225 1142226 RSP_3642 RSP_3643 exsB   TRUE 0.862 -3.000 0.005 NA   NA
 1142227 1142228 RSP_3644 RSP_3645     FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 1142228 1142229 RSP_3645 RSP_3646     FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 1142229 1142230 RSP_3646 RSP_6196     FALSE 0.002 812.000 0.000 NA   NA
 1142230 1142231 RSP_6196 RSP_3647     FALSE 0.003 523.000 0.000 NA   NA
 1142231 1142232 RSP_3647 RSP_3648     FALSE 0.048 184.000 0.000 NA   NA
 1142233 1142234 RSP_3649 RSP_3650     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142236 1142237 RSP_3652 RSP_3653     TRUE 0.687 -63.000 0.000 NA   NA
 1142238 1142239 RSP_3654 RSP_3655     FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 1142239 1142240 RSP_3655 RSP_3656     FALSE 0.316 119.000 0.000 0.059 N NA
 1142240 1142241 RSP_3656 RSP_3657     FALSE 0.104 42.000 0.000 NA N NA
 1142241 1142242 RSP_3657 RSP_3658   hpcH TRUE 0.588 -3.000 0.000 NA N NA
 1142242 1142243 RSP_3658 RSP_3659 hpcH   TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1142243 1142244 RSP_3659 RSP_3661     FALSE 0.271 52.000 0.000 1.000   NA
 1142244 1142245 RSP_3661 RSP_3662     TRUE 0.613 68.000 0.000 1.000 Y NA
 1142245 1142246 RSP_3662 RSP_3663     TRUE 0.965 -3.000 0.000 NA Y NA
 1142246 1142247 RSP_3663 RSP_3664     FALSE 0.012 205.000 0.000 NA N NA
 1142250 1142251 RSP_3666 RSP_3667     TRUE 0.702 56.000 0.000 0.001   NA
 1142251 1142252 RSP_3667 RSP_3669     TRUE 0.801 5.000 0.000 1.000   NA
 1142253 1142254 RSP_3670 RSP_3671     TRUE 0.895 0.000 0.025 NA   NA
 1142254 1142255 RSP_3671 RSP_3672     TRUE 0.908 54.000 0.333 NA Y NA
 1142255 1142256 RSP_3672 RSP_3673     TRUE 0.998 0.000 0.667 0.056 Y NA
 1142256 1142257 RSP_3673 RSP_3674     TRUE 0.934 128.000 0.556 0.056 Y NA
 1142257 1142258 RSP_3674 RSP_3675     FALSE 0.433 48.000 0.062 1.000 N NA
 1142258 1142259 RSP_3675 RSP_3676     TRUE 0.916 -3.000 0.062 1.000 N NA
 1142260 1142261 RSP_3677 RSP_3678     FALSE 0.001 733.000 0.000 NA N NA
 1142262 1142263 RSP_3679 RSP_3680     FALSE 0.023 238.000 0.000 NA   NA
 1142266 1142267 RSP_3683 RSP_3684   solR FALSE 0.002 574.000 0.000 NA   NA
 1142267 1142268 RSP_3684 RSP_6198 solR   TRUE 0.866 103.000 1.000 NA   NA
 1142268 1142269 RSP_6198 RSP_6199     FALSE 0.023 237.000 0.000 NA   NA
 1142269 1142270 RSP_6199 RSP_3686     FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 1142270 1142271 RSP_3686 RSP_3687     TRUE 0.952 3.000 0.194 NA N NA
 1142271 1142272 RSP_3687 RSP_3688     TRUE 0.982 -3.000 0.323 NA   NA
 1142272 1142273 RSP_3688 RSP_3689   yphD TRUE 0.990 0.000 0.632 1.000   NA
 1142273 1142274 RSP_3689 RSP_3690 yphD   TRUE 0.989 -3.000 0.526 1.000   NA
 1142274 1142275 RSP_3690 RSP_3691     TRUE 0.949 23.000 0.733 NA   NA
 1142277 1142278 RSP_3693 RSP_3694     TRUE 0.890 -7.000 0.043 1.000   NA
 1142280 1142281 RSP_3696 RSP_3697 cysA cysP TRUE 0.979 -3.000 0.043 0.001 N NA
 1142281 1142282 RSP_3697 RSP_3698 cysP cysT TRUE 0.995 -3.000 0.479 0.002 N NA
 1142282 1142283 RSP_3698 RSP_3699 cysT cysW TRUE 0.996 -3.000 0.583 0.001 N NA
 1142285 1142286 RSP_3701 RSP_3702     TRUE 0.846 59.000 0.565 NA   NA
 1142286 1142287 RSP_3702 RSP_3703     TRUE 0.990 -3.000 0.565 1.000   NA
 1142287 1142288 RSP_3703 RSP_3704     TRUE 0.952 13.000 0.375 1.000   NA
 1142288 1142289 RSP_3704 RSP_3705     TRUE 0.737 74.000 0.306 1.000   NA
 1142292 1142293 RSP_3708 RSP_3710 mcpJ   FALSE 0.007 262.000 0.000 1.000 N NA
 1142293 1142294 RSP_3710 RSP_3711     TRUE 0.998 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 1142294 1142295 RSP_3711 RSP_3712     TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.047 Y NA
 1142295 1142296 RSP_3712 RSP_3713     TRUE 0.998 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 1142296 1142297 RSP_3713 RSP_3714     TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.009 Y NA
 1142297 1142298 RSP_3714 RSP_3715     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.009 Y NA
 1142300 1142301 RSP_3717 RSP_3718     TRUE 0.967 12.000 0.556 NA   NA
 1142302 1142303 RSP_3719 RSP_3720     TRUE 0.981 12.000 1.000 NA   NA
 1142303 1142304 RSP_3720 RSP_3721     FALSE 0.004 437.000 0.000 NA   NA
 1142305 1142306 RSP_3722 RSP_3723     FALSE 0.191 97.000 0.000 1.000   NA
 1142306 1142307 RSP_3723 RSP_3724     FALSE 0.025 177.000 0.000 1.000 N NA
 1142307 1142308 RSP_3724 RSP_3725     FALSE 0.015 284.000 0.000 1.000   NA
 1142308 1142309 RSP_3725 RSP_3727     TRUE 0.991 -3.000 0.200 0.004   NA
 1142309 1142310 RSP_3727 RSP_3728     FALSE 0.264 54.000 0.000 1.000   NA
 1142311 1142312 RSP_3729 RSP_3730     FALSE 0.045 193.000 0.000 NA   NA
 1142314 1142315 RSP_3732 RSP_3733     TRUE 0.946 82.000 0.875 NA Y NA
 1142315 1142316 RSP_3733 RSP_3734     TRUE 0.995 9.000 0.857 1.000 Y NA
 1142316 1142317 RSP_3734 RSP_3735     TRUE 0.996 13.000 1.000 0.056 Y NA
 1142317 1142318 RSP_3735 RSP_3736     TRUE 0.993 -3.000 0.857 1.000   NA
 1142318 1142319 RSP_3736 RSP_3738     TRUE 0.944 4.000 0.090 1.000   NA
 1142319 1142320 RSP_3738 RSP_3739     TRUE 0.842 -3.000 0.023 1.000 N NA
 1142320 1142321 RSP_3739 RSP_3740     TRUE 0.578 12.000 0.014 1.000 N NA
 1142322 1142323 RSP_3742 RSP_3743   speB1 TRUE 0.793 28.000 0.000 1.000 Y NA
 1142323 1142324 RSP_3743 RSP_3744 speB1   TRUE 0.958 4.000 0.000 1.000 Y NA
 1142324 1142325 RSP_3744 RSP_3745     TRUE 0.993 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 1142325 1142326 RSP_3745 RSP_3746     TRUE 0.981 -3.000 0.300 NA   NA
 1142330 1142331 RSP_3750 RSP_3751     TRUE 0.839 78.000 0.667 NA   NA
 1142331 1142332 RSP_3751 RSP_3752     TRUE 0.882 9.000 0.057 NA   NA
 1142332 1142333 RSP_3752 RSP_3753     FALSE 0.009 331.000 0.000 NA   NA
 1142335 1142336 RSP_3755 RSP_3756     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142336 1142337 RSP_3756 RSP_3757     TRUE 0.979 -13.000 0.514 1.000   NA
 1142337 1142338 RSP_3757 RSP_3759     FALSE 0.002 603.000 0.000 NA   NA
 1142338 1142339 RSP_3759 RSP_3758     TRUE 0.963 -7.000 0.238 NA   NA
 1142339 1142340 RSP_3758 RSP_3762     TRUE 0.910 52.000 0.086 0.036 Y NA
 1142340 1142341 RSP_3762 RSP_3761     FALSE 0.019 253.000 0.000 NA   NA
 1142341 1142342 RSP_3761 RSP_3760     TRUE 0.895 13.000 0.154 NA   NA
 1142342 1142343 RSP_3760 RSP_3769     FALSE 0.261 55.000 0.000 1.000   NA
 1142343 1142344 RSP_3769 RSP_3768     FALSE 0.006 369.000 0.000 NA   NA
 1142344 1142345 RSP_3768 RSP_3767     FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 1142345 1142346 RSP_3767 RSP_3766     FALSE 0.032 219.000 0.000 NA   NA
 1142346 1142347 RSP_3766 RSP_3765     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1142347 1142348 RSP_3765 RSP_3764     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1142348 1142349 RSP_3764 RSP_3763     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1142349 1142350 RSP_3763 RSP_3791     TRUE 0.982 0.000 0.333 NA   NA
 1142352 1142353 RSP_3789 RSP_3788     FALSE 0.065 164.000 0.000 NA   NA
 1142353 1142354 RSP_3788 RSP_3787     FALSE 0.165 98.000 0.000 NA   NA
 1142354 1142355 RSP_3787 RSP_6200     FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 1142355 1142356 RSP_6200 RSP_3786     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142356 1142357 RSP_3786 RSP_3785     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 1142357 1142358 RSP_3785 RSP_6201     FALSE 0.188 82.000 0.000 NA   NA
 1142358 1142359 RSP_6201 RSP_3784     FALSE 0.101 136.000 0.000 NA   NA
 1142359 1142360 RSP_3784 RSP_3783     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1142360 1142361 RSP_3783 RSP_3782     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1142361 1142362 RSP_3782 RSP_3781     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142362 1142363 RSP_3781 RSP_3780     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1142363 1142364 RSP_3780 RSP_3779     FALSE 0.049 198.000 0.000 1.000   NA
 1142364 1142365 RSP_3779 RSP_3778     FALSE 0.147 113.000 0.000 NA   NA
 1142365 1142366 RSP_3778 RSP_3777     FALSE 0.104 370.000 0.556 NA   NA
 1142366 1142367 RSP_3777 RSP_3776     FALSE 0.031 220.000 0.000 NA   NA
 1142367 1142368 RSP_3776 RSP_6202     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142368 1142369 RSP_6202 RSP_3775     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142369 1142370 RSP_3775 RSP_3774     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142370 1142371 RSP_3774 RSP_3773     FALSE 0.099 137.000 0.000 NA   NA
 1142371 1142372 RSP_3773 RSP_3772     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142373 1142374 RSP_3771 RSP_6203     FALSE 0.007 357.000 0.000 NA   NA
 1142374 1142375 RSP_6203 RSP_3799     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1142375 1142376 RSP_3799 RSP_3798     TRUE 0.795 3.000 0.000 NA   NA
 1142376 1142377 RSP_3798 RSP_3797     FALSE 0.222 60.000 0.000 NA   NA
 1142377 1142378 RSP_3797 RSP_3796     FALSE 0.481 19.000 0.000 NA   NA
 1142378 1142379 RSP_3796 RSP_3795     FALSE 0.002 644.000 0.000 NA   NA
 1142379 1142380 RSP_3795 RSP_3794     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 1142380 1142381 RSP_3794 RSP_3793     FALSE 0.084 149.000 0.000 NA   NA
 1142381 1142382 RSP_3793 RSP_3792     FALSE 0.010 306.000 0.000 NA   NA
 1142382 1142383 RSP_3792 RSP_3805     FALSE 0.021 244.000 0.000 NA   NA
 1142384 1142385 RSP_4337 RSP_3804     FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 1142385 1142386 RSP_3804 RSP_3803     TRUE 0.826 41.000 0.310 1.000   NA
 1142386 1142387 RSP_3803 RSP_3802     TRUE 0.877 5.000 0.056 1.000 N NA
 1142387 1142388 RSP_3802 RSP_1412     TRUE 0.853 22.000 0.195 NA   NA
 1142388 1142389 RSP_1412 RSP_1413     FALSE 0.551 79.000 0.122 NA   NA
 1142390 1142391 RSP_1414 RSP_1415     FALSE 0.049 326.000 0.000 0.011   NA
 1142391 1142392 RSP_1415 RSP_1416     TRUE 0.741 22.000 0.071 NA   NA
 1142392 1142393 RSP_1416 RSP_1417     TRUE 0.913 -7.000 0.071 NA   NA
 1142394 1142395 RSP_1418 RSP_1419     TRUE 0.991 1.000 0.812 NA   NA
 1142395 1142396 RSP_1419 RSP_1420     TRUE 0.994 -3.000 0.938 NA   NA
 1142396 1142397 RSP_1420 RSP_1421     FALSE 0.026 239.000 0.000 1.000   NA
 1142397 1142398 RSP_1421 RSP_1422     FALSE 0.005 427.000 0.000 1.000   NA
 1142398 1142399 RSP_1422 RSP_1423     TRUE 0.983 -22.000 0.700 1.000   NA
 1142400 1141536 RSP_1425 RSP_4347     FALSE 0.003 496.000 0.000 NA   NA
 1138154 1138155 RSP_4040 RSP_4039 y4bF   FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 1138155 1138156 RSP_4039 RSP_4038   glpR FALSE 0.001 546.000 0.000 NA N NA
 1138156 1138157 RSP_4038 RSP_4037 glpR   FALSE 0.275 174.000 0.000 1.000 Y NA
 1138157 1138158 RSP_4037 RSP_7366     TRUE 0.921 145.000 0.667 0.055 Y NA
 1138158 1138159 RSP_7366 RSP_4035     TRUE 0.996 0.000 0.267 0.055 Y NA
 1138159 1138160 RSP_4035 RSP_4034     TRUE 0.884 33.000 0.000 0.055 Y NA
 1138160 1138161 RSP_4034 RSP_4033   tdh FALSE 0.212 28.000 0.000 1.000 N NA
 1138161 1138162 RSP_4033 RSP_4032 tdh   FALSE 0.093 79.000 0.000 1.000 N NA
 1138162 1138163 RSP_4032 RSP_4031     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 1138163 1138164 RSP_4031 RSP_4030   yihT TRUE 0.628 30.000 0.000 0.058 N NA
 1138164 1138165 RSP_4030 RSP_4029 yihT yihV TRUE 0.793 26.000 0.000 NA Y NA
 1138165 1138166 RSP_4029 RSP_4028 yihV   FALSE 0.003 317.000 0.000 NA N NA
 1138166 1138167 RSP_4028 RSP_4027     FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1138168 1138169 RSP_7367 RSP_4025   fsr FALSE 0.012 288.000 0.000 NA   NA
 1138170 1138171 RSP_4024 RSP_4023   repA3 FALSE 0.060 170.000 0.000 NA   NA
 1138171 1138172 RSP_4023 RSP_4022 repA3 repB1 TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 N NA
 1138172 1138173 RSP_4022 RSP_4021 repB1 repC2 FALSE 0.074 157.000 0.000 NA   NA
 1138173 1138174 RSP_4021 RSP_4020 repC2 fumC FALSE 0.002 1626.000 0.000 NA   NA
 1138174 1138175 RSP_4020 RSP_4019 fumC   FALSE 0.008 337.000 0.000 NA   NA
 1138175 1138176 RSP_4019 RSP_4018     FALSE 0.002 407.000 0.000 1.000 N NA
 1138178 1138179 RSP_4016 RSP_4015 dctP dctQ TRUE 0.953 53.000 0.769 NA Y NA
 1138179 1138180 RSP_4015 RSP_4014 dctQ   TRUE 0.997 0.000 1.000 NA Y NA
 1138180 1138181 RSP_4014 RSP_4013     TRUE 0.798 18.000 0.087 NA   NA
 1138181 1138182 RSP_4013 RSP_4012   tauD TRUE 0.966 7.000 0.259 NA   NA
 1138182 1138183 RSP_4012 RSP_4011 tauD ilvB2 TRUE 0.959 13.000 0.121 1.000 Y NA
 1138183 1138184 RSP_4011 RSP_4010 ilvB2   FALSE 0.014 280.000 0.000 NA   NA
 1138184 1138185 RSP_4010 RSP_4009   pta TRUE 0.904 10.000 0.091 NA   NA
 1138185 1138186 RSP_4009 RSP_4008 pta   FALSE 0.076 103.000 0.000 1.000 N NA
 1138186 1138187 RSP_4008 RSP_4007     TRUE 0.707 55.000 0.286 1.000 N NA
 1138187 1138188 RSP_4007 RSP_4006     TRUE 0.881 9.000 0.000 0.058 N NA
 1138188 1138189 RSP_4006 RSP_4004     TRUE 0.993 -3.000 0.083 0.058 Y NA
 1138190 1138191 RSP_4005 RSP_4003   dhaL TRUE 0.961 -3.000 0.172 1.000 N NA
 1138191 1138192 RSP_4003 RSP_4002 dhaL   TRUE 0.994 2.000 0.690 0.058 N NA
 1138192 1138193 RSP_4002 RSP_7368     TRUE 0.794 18.000 0.125 1.000 N NA
 1138194 1138195 RSP_4000 RSP_3999 proV proW TRUE 0.989 0.000 0.051 0.082 Y NA
 1138195 1138196 RSP_3999 RSP_3998 proW   TRUE 0.983 36.000 0.695 0.055 Y NA
 1138196 1138197 RSP_3998 RSP_3997     FALSE 0.355 50.000 0.043 1.000 N NA
 1138197 1138198 RSP_3997 RSP_3995     FALSE 0.053 193.000 0.000 1.000   NA
 1138199 1138200 RSP_3994 RSP_3993     TRUE 0.741 88.000 0.364 NA   NA
 1138201 1138202 RSP_3992 RSP_3991     FALSE 0.093 141.000 0.000 NA   NA
 1138203 1138204 RSP_3990 RSP_7172     TRUE 0.895 34.000 0.474 1.000   NA
 1138204 1138205 RSP_7172 RSP_3989     FALSE 0.006 397.000 0.000 1.000   NA
 1138206 1138207 RSP_7124 RSP_3988     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138207 1138208 RSP_3988 RSP_3986     FALSE 0.178 89.000 0.000 NA   NA
 1138208 1138209 RSP_3986 RSP_3985     FALSE 0.015 271.000 0.000 NA   NA
 1138209 1138210 RSP_3985 RSP_3984   kaiC2 FALSE 0.014 280.000 0.000 NA   NA
 1138210 1138211 RSP_3984 RSP_3983 kaiC2 kaiB2 TRUE 0.989 3.000 0.676 1.000   NA
 1138211 1138212 RSP_3983 RSP_3982 kaiB2   TRUE 0.922 6.000 0.069 1.000   NA
 1138213 1138214 RSP_3981 RSP_3980     FALSE 0.253 48.000 0.000 NA   NA
 1138214 1138215 RSP_3980 RSP_3979     FALSE 0.009 241.000 0.000 1.000 N NA
 1138215 1138216 RSP_3979 RSP_3978     TRUE 0.990 4.000 0.444 0.050 N NA
 1138219 1138220 RSP_7369 RSP_3975     TRUE 0.996 3.000 0.657 1.000 Y NA
 1138220 1138221 RSP_3975 RSP_3974     FALSE 0.025 175.000 0.000 1.000 N NA
 1138222 1138223 RSP_3973 RSP_3972     FALSE 0.355 14.000 0.000 1.000 N NA
 1138223 1138224 RSP_3972 RSP_3971     TRUE 0.977 4.000 0.400 1.000 N NA
 1138225 1138226 RSP_3970 RSP_3969     TRUE 0.966 10.000 0.333 1.000   NA
 1138226 1138227 RSP_3969 RSP_3968     TRUE 0.779 63.000 0.333 1.000   NA
 1138227 1138228 RSP_3968 RSP_3967     TRUE 0.996 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 1138228 1138229 RSP_3967 RSP_3966     TRUE 0.998 0.000 0.600 0.055 Y NA
 1138229 1138230 RSP_3966 RSP_3965     TRUE 0.996 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 1138230 1138231 RSP_3965 RSP_3964     TRUE 0.988 -13.000 0.094 0.021 Y NA
 1138231 1138232 RSP_3964 RSP_3963     TRUE 0.629 23.000 0.062 1.000 N NA
 1138232 1138233 RSP_3963 RSP_3962   pcaD TRUE 0.977 11.000 0.667 1.000   NA
 1138235 1138236 RSP_3959 RSP_7371     TRUE 0.977 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 1138236 1138237 RSP_7371 RSP_3957     TRUE 0.724 10.000 0.000 1.000   NA
 1138238 1138239 RSP_3956 RSP_3955     FALSE 0.316 93.000 0.062 1.000 N NA
 1138239 1138240 RSP_3955 RSP_3954     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138240 1138241 RSP_3954 RSP_3953   gtpD TRUE 0.795 3.000 0.000 NA   NA
 1138241 1138242 RSP_3953 RSP_3952 gtpD gtpC TRUE 0.998 5.000 0.841 0.008 Y NA
 1138242 1138243 RSP_3952 RSP_3951 gtpC gtpB TRUE 0.894 61.000 0.083 0.055 Y NA
 1138243 1138244 RSP_3951 RSP_3950 gtpB aapP TRUE 0.736 66.000 0.049 1.000 Y NA
 1138245 1138246 RSP_3949 RSP_3947 ansB   TRUE 0.644 22.000 0.062 1.000 N NA
 1138247 1138248 RSP_3948 RSP_3946     TRUE 0.675 59.000 0.250 1.000 N NA
 1138248 1138249 RSP_3946 RSP_3945     TRUE 0.964 2.000 0.250 NA N NA
 1138249 1138250 RSP_3945 RSP_3944   frlC TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA Y NA
 1138250 1138251 RSP_3944 RSP_3943 frlC yurM TRUE 0.989 -3.000 0.154 NA Y NA
 1138251 1138252 RSP_3943 RSP_3942 yurM yurN TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.055 Y NA
 1138252 1138253 RSP_3942 RSP_3941 yurN yurO TRUE 0.998 0.000 0.688 0.055 Y NA
 1138253 1138254 RSP_3941 RSP_3940 yurO   TRUE 0.606 46.000 0.154 NA N NA
 1138254 1138255 RSP_3940 RSP_3939     TRUE 0.693 129.000 0.667 NA N NA
 1138256 1138257 RSP_4137 RSP_7258 y4bF   FALSE 0.116 130.000 0.000 NA   NA
 1138259 1138260 RSP_4052 RSP_4053 noeK xanB TRUE 0.946 2.000 0.143 1.000 N NA
 1138260 1138261 RSP_4053 RSP_4054 xanB   FALSE 0.004 485.000 0.000 1.000   NA
 1138262 1138263 RSP_7372 RSP_4056   spb FALSE 0.012 600.000 0.000 0.036   NA
 1138267 1138268 RSP_4059 RSP_4060 hipA blrA FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 1138270 1138271 RSP_4062 RSP_4063     TRUE 0.662 117.000 0.333 NA   NA
 1138271 1138272 RSP_4063 RSP_4064     TRUE 0.920 18.000 0.333 NA   NA
 1138276 1138277 RSP_7190 RSP_7191     TRUE 0.890 45.000 0.667 NA   NA
 1138277 1138278 RSP_7191 RSP_4067     FALSE 0.015 268.000 0.000 NA   NA
 1138278 1138279 RSP_4067 RSP_4068     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 1138279 1138280 RSP_4068 RSP_4069     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1138280 1138281 RSP_4069 RSP_4070     FALSE 0.005 415.000 0.000 NA   NA
 1138282 1138283 RSP_4071 RSP_4072     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 1138283 1138284 RSP_4072 RSP_4073     FALSE 0.003 563.000 0.000 1.000   NA
 1138285 1138286 RSP_4074 RSP_7197     FALSE 0.097 138.000 0.000 NA   NA
 1138286 1138287 RSP_7197 RSP_7374   mvpT FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 1138287 1138288 RSP_7374 RSP_4076 mvpT mvpA TRUE 0.991 0.000 0.727 NA   NA
 1138288 1138289 RSP_4076 RSP_4077 mvpA   FALSE 0.009 322.000 0.000 NA   NA
 1138289 1138290 RSP_4077 RSP_4078     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138292 1138293 RSP_4081 RSP_4082     TRUE 0.985 -3.000 0.372 NA   NA
 1138296 1138297 RSP_4084 RSP_4085     TRUE 0.990 -3.000 0.750 1.000 N NA
 1138297 1138298 RSP_4085 RSP_4086     TRUE 0.987 4.000 0.750 1.000 N NA
 1138298 1138299 RSP_4086 RSP_7375     FALSE 0.002 1442.000 0.000 1.000   NA
 1138300 1138301 RSP_4091 RSP_4092     FALSE 0.456 21.000 0.000 NA   NA
 1138302 1138303 RSP_4093 RSP_7376     FALSE 0.165 98.000 0.000 NA   NA
 1138303 1138304 RSP_7376 RSP_7377     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1138304 1138305 RSP_7377 RSP_7378     FALSE 0.161 101.000 0.000 NA   NA
 1138305 1138306 RSP_7378 RSP_7379     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 1138306 1138307 RSP_7379 RSP_4099     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 1138307 1138308 RSP_4099 RSP_4100   tISRso9 FALSE 0.118 129.000 0.000 NA   NA
 1138308 1138309 RSP_4100 RSP_4102 tISRso9   FALSE 0.002 578.000 0.000 NA   NA
 1138309 1138310 RSP_4102 RSP_4103     FALSE 0.187 83.000 0.000 NA   NA
 1138311 1138312 RSP_4104 RSP_4105     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 1138312 1138313 RSP_4105 RSP_4106     FALSE 0.006 372.000 0.000 NA   NA
 1138313 1138314 RSP_4106 RSP_4107     FALSE 0.541 15.000 0.000 NA   NA
 1138315 1138316 RSP_4108 RSP_4109 wcaG gmd TRUE 0.989 4.000 0.028 0.008 Y NA
 1138316 1138317 RSP_4109 RSP_4110 gmd wbyL TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138317 1138318 RSP_4110 RSP_7380 wbyL   FALSE 0.002 1330.000 0.000 NA   NA
 1138318 1138319 RSP_7380 RSP_2484     FALSE 0.002 1828.000 0.000 NA   NA
 1138320 1138321 RSP_2483 RSP_7211 repA repB TRUE 0.994 0.000 1.000 1.000   NA
 1138323 1138324 RSP_7212 RSP_4111   bhpP FALSE 0.306 68.000 0.051 NA N NA
 1138324 1138325 RSP_4111 RSP_4112 bhpP   FALSE 0.007 345.000 0.000 NA   NA
 1138325 1138326 RSP_4112 RSP_4113   napE TRUE 0.820 11.000 0.043 NA   NA
 1138326 1138327 RSP_4113 RSP_4114 napE napF TRUE 0.889 6.000 0.043 NA   NA
 1138327 1138328 RSP_4114 RSP_4115 napF napD TRUE 0.900 -7.000 0.059 NA   NA
 1138328 1138329 RSP_4115 RSP_4116 napD napA TRUE 0.960 -3.000 0.182 NA N NA
 1138329 1138330 RSP_4116 RSP_4117 napA napB TRUE 0.995 3.000 0.643 NA Y NA
 1138330 1138331 RSP_4117 RSP_4118 napB napC TRUE 0.994 2.000 0.490 NA Y NA
 1138332 1138333 RSP_4119 RSP_4120   yapH TRUE 0.903 64.000 1.000 NA   NA
 1138333 1138334 RSP_4120 RSP_4121 yapH   FALSE 0.002 608.000 0.000 NA   NA
 1138335 1138336 RSP_4122 RSP_4124     FALSE 0.002 1552.000 0.000 NA   NA
 1138338 1138339 RSP_4127 RSP_4129   omp31-1 FALSE 0.002 2682.000 0.000 1.000   NA
 1138342 1138343 RSP_4132 RSP_4133     FALSE 0.331 34.000 0.000 NA   NA
 1138343 1138344 RSP_4133 RSP_7381     FALSE 0.390 209.000 0.000 0.015 Y NA
 1138346 1138347 RSP_4138 RSP_4139   parA FALSE 0.002 2155.000 0.000 NA   NA
 1138347 1138348 RSP_4139 RSP_4144 parA   FALSE 0.002 3319.000 0.000 NA   NA
 1138348 1138349 RSP_4144 RSP_7383     FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 1138349 1138350 RSP_7383 RSP_7384     FALSE 0.091 142.000 0.000 NA   NA
 1138351 1138352 RSP_4148 RSP_4149     FALSE 0.244 51.000 0.000 NA   NA
 1138353 1138354 RSP_4150 RSP_4151     FALSE 0.214 64.000 0.000 NA   NA
 1138355 1138356 RSP_7385 RSP_4153     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1138356 1138357 RSP_4153 RSP_4154     FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 1138357 1138358 RSP_4154 RSP_4156     FALSE 0.007 347.000 0.000 NA   NA
 1138359 1138360 RSP_4157 RSP_4158     FALSE 0.347 134.000 0.000 0.057   NA
 1138360 1138361 RSP_4158 RSP_4159     FALSE 0.094 75.000 0.000 1.000 N NA
 1138361 1138362 RSP_4159 RSP_4160     FALSE 0.193 75.000 0.000 NA   NA
 1138362 1138363 RSP_4160 RSP_4161     TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1138363 1138364 RSP_4161 RSP_4162     FALSE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 1138364 1138365 RSP_4162 RSP_7386     TRUE 0.713 9.000 0.000 NA   NA
 1138366 1138367 RSP_4165 RSP_4166     TRUE 0.935 69.000 0.667 NA Y NA
 1138367 1138368 RSP_4166 RSP_4167     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 1138368 1138369 RSP_4167 RSP_4168     FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 1138370 1138371 RSP_4170 RSP_4171     FALSE 0.006 369.000 0.000 NA   NA
 1138373 1138374 RSP_7273 RSP_4178     FALSE 0.044 195.000 0.000 NA   NA
 1138374 1138375 RSP_4178 RSP_4179     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138375 1138376 RSP_4179 RSP_4180     TRUE 0.690 10.000 0.000 NA   NA
 1138376 1138377 RSP_4180 RSP_4181     FALSE 0.066 163.000 0.000 NA   NA
 1138377 1138378 RSP_4181 RSP_4182     FALSE 0.220 61.000 0.000 NA   NA
 1138378 1138379 RSP_4182 RSP_4183     FALSE 0.541 15.000 0.000 NA   NA
 1138380 1138381 RSP_7387 RSP_4185   repB FALSE 0.344 183.000 0.286 NA   NA
 1138381 1138382 RSP_4185 RSP_4186 repB repA TRUE 0.992 0.000 1.000 1.000 N NA
 1138383 1138384 RSP_7280 RSP_4188     TRUE 0.986 -10.000 0.800 NA   NA
 1138386 1138387 RSP_4190 RSP_4191   bhpP FALSE 0.392 -79.000 0.000 NA N NA
 1138389 1138390 RSP_4193 RSP_4194     TRUE 0.968 0.000 0.167 NA   NA
 1138390 1138391 RSP_4194 RSP_4195     TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.065 Y NA
 1138391 1138392 RSP_4195 RSP_7388     FALSE 0.008 337.000 0.000 NA   NA
 1138392 1138393 RSP_7388 RSP_4197     FALSE 0.099 137.000 0.000 NA   NA
 1138393 1138394 RSP_4197 RSP_7389     TRUE 0.608 12.000 0.000 NA   NA
 1138394 1138395 RSP_7389 RSP_4198   uspA TRUE 0.762 -4.000 0.000 NA   NA
 1138395 1138396 RSP_4198 RSP_4199 uspA   TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1138396 1138397 RSP_4199 RSP_4200     FALSE 0.401 32.000 0.029 1.000 N NA
 1138397 1138398 RSP_4200 RSP_4201     FALSE 0.027 171.000 0.000 1.000 N NA
 1138398 1138399 RSP_4201 RSP_4202     TRUE 0.935 -3.000 0.056 NA   NA
 1138399 1138400 RSP_4202 RSP_4203     TRUE 0.793 13.000 0.051 NA   NA
 1138400 1138401 RSP_4203 RSP_4204     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138401 1138402 RSP_4204 RSP_4206     FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 1138402 1138403 RSP_4206 RSP_4207     FALSE 0.002 633.000 0.000 NA   NA
 1138404 1138405 RSP_7332 RSP_4209     FALSE 0.023 238.000 0.000 NA   NA
 1138406 1138407 RSP_4210 RSP_4211   gapA-1 TRUE 0.957 0.000 0.158 1.000 N NA
 1138407 1138408 RSP_4211 RSP_4212 gapA-1   TRUE 0.897 44.000 0.689 NA   NA
 1138411 1138412 RSP_4215 RSP_7390     FALSE 0.003 548.000 0.000 NA   NA
 1138413 1138414 RSP_4219 RSP_4220 traA traL FALSE 0.207 67.000 0.000 NA   NA
 1138414 1138415 RSP_4220 RSP_4221 traL traE TRUE 0.973 0.000 0.000 0.001   NA
 1138415 1138416 RSP_4221 RSP_4222 traE traK TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.001   NA
 1138416 1138417 RSP_4222 RSP_4224 traK traB TRUE 0.844 0.000 0.000 1.000   NA
 1138417 1138418 RSP_4224 RSP_4225 traB traV TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138418 1138419 RSP_4225 RSP_4226 traV traC TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138419 1138420 RSP_4226 RSP_4227 traC   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138420 1138421 RSP_4227 RSP_4228   trbI TRUE 0.698 -22.000 0.000 NA   NA
 1138421 1138422 RSP_4228 RSP_4229 trbI traP TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138422 1138423 RSP_4229 RSP_4230 traP traW TRUE 0.696 -24.000 0.000 NA   NA
 1138423 1138424 RSP_4230 RSP_4231 traW traU TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138424 1138425 RSP_4231 RSP_4232 traU trbC TRUE 0.689 -39.000 0.000 NA   NA
 1138425 1138426 RSP_4232 RSP_4233 trbC traN TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138426 1138427 RSP_4233 RSP_4234 traN   TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1138427 1138428 RSP_4234 RSP_4235   traF TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1138428 1138429 RSP_4235 RSP_4236 traF   TRUE 0.731 8.000 0.000 NA   NA
 1138429 1138430 RSP_4236 RSP_4237   traH TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 1138430 1138431 RSP_4237 RSP_4238 traH traG TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1138431 1138432 RSP_4238 RSP_7391 traG   FALSE 0.002 751.000 0.000 1.000   NA
 1138432 1138433 RSP_7391 RSP_4242     FALSE 0.003 559.000 0.000 1.000   NA
 1138434 1138435 RSP_7392 RSP_4244     FALSE 0.002 867.000 0.000 NA   NA
 1138435 1138436 RSP_4244 RSP_4245     FALSE 0.004 425.000 0.000 NA   NA
 1138437 1138438 RSP_4246 RSP_7322     FALSE 0.158 105.000 0.000 NA   NA
 1138438 1138439 RSP_7322 RSP_4247     TRUE 0.987 -3.000 0.438 NA   NA
 1138439 1138440 RSP_4247 RSP_4248     TRUE 0.918 -19.000 0.107 NA   NA
 1138441 1138442 RSP_7393 RSP_4251     FALSE 0.007 344.000 0.000 NA   NA
 1138442 1138443 RSP_4251 RSP_4252     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1793435 1793436 RSP_3838 RSP_3839   rkpS TRUE 0.988 17.000 0.889 1.000 Y NA
 1793437 1793438 RSP_7084 RSP_3840   repA TRUE 0.821 125.000 0.889 1.000   NA
 1793439 1793440 RSP_6257 RSP_3842   rfbG FALSE 0.087 51.000 0.000 NA N NA
 1793440 1793441 RSP_3842 RSP_3843 rfbG rfbC TRUE 0.610 64.000 0.000 NA Y NA
 1793441 1793442 RSP_3843 RSP_3844 rfbC rffG/rfbB TRUE 0.992 4.000 0.337 1.000 Y NA
 1793442 1793443 RSP_3844 RSP_3845 rffG/rfbB rmlD/rfbD TRUE 0.996 -3.000 0.147 0.003 Y NA
 1793443 1793444 RSP_3845 RSP_3848 rmlD/rfbD rmlA/rfbA TRUE 0.997 -3.000 0.179 0.003 Y NA
 1793445 1793446 RSP_3846 RSP_6258     FALSE 0.006 367.000 0.000 NA   NA
 1793448 1793449 RSP_3850 RSP_7361     FALSE 0.470 23.000 0.000 1.000   NA
 1793449 1793450 RSP_7361 RSP_3852     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1793450 1793451 RSP_3852 RSP_3853     FALSE 0.068 115.000 0.000 1.000 N NA
 1793455 1793456 RSP_7362 RSP_3858   cysA FALSE 0.094 75.000 0.000 1.000 N NA
 1793456 1793457 RSP_3858 RSP_3859 cysA   TRUE 0.957 -42.000 0.045 1.000 Y NA
 1793457 1793458 RSP_3859 RSP_3860     TRUE 0.997 4.000 0.935 0.001 N NA
 1793458 1793459 RSP_3860 RSP_3861     TRUE 0.962 2.000 0.010 0.002 N NA
 1793459 1793460 RSP_3861 RSP_3862     FALSE 0.002 428.000 0.000 1.000 N NA
 1793462 1793463 RSP_3865 RSP_3866     FALSE 0.003 514.000 0.000 NA   NA
 1793465 1793466 RSP_3868 RSP_3869   modC FALSE 0.174 92.000 0.000 NA   NA
 1793466 1793467 RSP_3869 RSP_3871 modC modA FALSE 0.044 695.000 0.000 0.001 Y NA
 1793467 1793468 RSP_3871 RSP_3872 modA   FALSE 0.016 535.000 0.000 0.001 N NA
 1793468 1793469 RSP_3872 RSP_3873   modD FALSE 0.047 338.000 0.000 1.000 Y NA
 1793469 1793470 RSP_3873 RSP_3874 modD mopB FALSE 0.323 40.000 0.000 1.000   NA
 1793473 1793474 RSP_3878 RSP_3879 flaA flaF TRUE 0.760 90.000 0.105 NA Y NA
 1793474 1793475 RSP_3879 RSP_3880 flaF flbT TRUE 0.997 -3.000 0.850 NA Y NA
 1793475 1793476 RSP_3880 RSP_3881 flbT flgF TRUE 0.993 -3.000 0.850 NA   NA
 1793477 1793478 RSP_3882 RSP_3883     TRUE 0.991 0.000 0.000 0.001 Y NA
 1793478 1793479 RSP_3883 RSP_3884     FALSE 0.125 50.000 0.000 1.000 N NA
 1793479 1793480 RSP_3884 RSP_3885     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1793480 1793481 RSP_3885 RSP_3886     FALSE 0.491 18.000 0.000 NA   NA
 1793482 1793483 RSP_3887 RSP_3888   fabG TRUE 0.714 22.000 0.000 0.056 N NA
 1793484 1793485 RSP_3889 RSP_3890     FALSE 0.403 12.000 0.000 1.000 N NA
 1793485 1793486 RSP_3890 RSP_3891     TRUE 0.992 -10.000 0.200 0.053 Y NA
 1793486 1793487 RSP_3891 RSP_3892     TRUE 0.918 81.000 0.200 0.053 Y NA
 1793488 1793489 RSP_3893 RSP_3894 pdhR   FALSE 0.041 342.000 0.000 0.012   NA
 1793489 1793490 RSP_3894 RSP_3916     FALSE 0.189 81.000 0.000 NA   NA
 1793491 1793492 RSP_7363 RSP_3914     FALSE 0.061 168.000 0.000 NA   NA
 1793492 1793493 RSP_3914 RSP_7364     FALSE 0.002 1191.000 0.000 NA   NA
 1793493 1793494 RSP_7364 RSP_3910     FALSE 0.002 704.000 0.000 NA   NA
 1793494 1793495 RSP_3910 RSP_3909     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1793495 1793496 RSP_3909 RSP_3908     TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1793496 1793497 RSP_3908 RSP_3907     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1793497 1793498 RSP_3907 RSP_3906     FALSE 0.289 40.000 0.000 NA   NA
 1793499 1793500 RSP_3905 RSP_3904 traD traI TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1793500 1793501 RSP_3904 RSP_3903 traI   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1793501 1793502 RSP_3903 RSP_3902     TRUE 0.723 -10.000 0.000 NA   NA
 1793502 1793503 RSP_3902 RSP_3901   virC1 FALSE 0.005 422.000 0.000 NA   NA
 1793504 1793505 RSP_3899 RSP_3896   repC FALSE 0.002 2969.000 0.000 NA   NA
 1793507 1793508 RSP_3936 RSP_3935   atpA TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 1793508 1793509 RSP_3935 RSP_7012 atpA   TRUE 0.998 -10.000 0.697 0.004 Y NA
 1793509 1793510 RSP_7012 RSP_3933     FALSE 0.263 254.000 0.000 0.004 Y NA
 1793510 1793511 RSP_3933 RSP_3931     FALSE 0.099 254.000 0.151 NA   NA
 1793511 1793512 RSP_3931 RSP_3930   atpC-1 TRUE 0.991 -3.000 0.671 NA   NA
 1793512 1793513 RSP_3930 RSP_3929 atpC-1 atpD TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 1793514 1793515 RSP_3927 RSP_3926     FALSE 0.013 285.000 0.000 NA   NA
 1793515 1793516 RSP_3926 RSP_3925     FALSE 0.155 120.000 0.000 1.000   NA
 1793517 1793518 RSP_3924 RSP_3923     FALSE 0.176 90.000 0.000 NA   NA
 1793518 1793519 RSP_3923 RSP_3922     FALSE 0.142 116.000 0.000 NA   NA
 1793519 1793520 RSP_3922 RSP_3921     FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 1793522 1793523 RSP_3919 RSP_3918     TRUE 0.983 1.000 0.400 NA   NA
 1793523 1793524 RSP_3918 RSP_3917   rkpT1 TRUE 0.657 64.000 0.188 NA   NA
 1793525 1793526 RSP_4254 RSP_4255 rnk   FALSE 0.012 229.000 0.000 1.000 N NA
 1793526 1793527 RSP_4255 RSP_4257     FALSE 0.004 337.000 0.000 1.000 N NA
 1793527 1793528 RSP_4257 RSP_4258   usp TRUE 0.598 14.000 0.000 1.000   NA
 1793530 1793531 RSP_4260 RSP_7352 mexT   FALSE 0.008 333.000 0.000 NA   NA
 1793533 1793534 RSP_4262 RSP_4263     FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 1793534 1793535 RSP_4263 RSP_4264     TRUE 0.906 3.000 0.043 NA   NA
 1793538 1793539 RSP_7396 RSP_7397     FALSE 0.002 1242.000 0.000 NA   NA
 1793539 1793540 RSP_7397 RSP_4271   fhuB TRUE 0.966 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1793540 1793541 RSP_4271 RSP_4272 fhuB fhuD TRUE 0.994 4.000 0.500 1.000 Y NA
 1793541 1793542 RSP_4272 RSP_4273 fhuD fhuA TRUE 0.919 43.000 0.286 1.000 Y NA
 1793542 1793543 RSP_4273 RSP_4274 fhuA fecR FALSE 0.422 131.000 0.000 NA Y NA
 1793543 1793544 RSP_4274 RSP_4275 fecR   TRUE 0.986 -3.000 0.588 NA N NA
 1793544 1793545 RSP_4275 RSP_4276   zitB FALSE 0.004 335.000 0.000 1.000 N NA
 1793548 1793549 RSP_4279 RSP_7398     TRUE 0.938 30.000 0.800 NA   NA
 1793550 1793551 RSP_4282 RSP_4284     FALSE 0.004 443.000 0.000 NA   NA
 1793551 1793552 RSP_4284 RSP_4285     FALSE 0.146 114.000 0.000 NA   NA
 1793552 1793553 RSP_4285 RSP_4286     FALSE 0.073 158.000 0.000 NA   NA
 1793553 1793554 RSP_4286 RSP_4289     FALSE 0.002 1033.000 0.000 NA   NA
 1793555 1793556 RSP_7359 RSP_7360     FALSE 0.019 253.000 0.000 NA   NA