MicrobesOnline Operon Predictions for Listeria innocua Clip11262

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
159079	159080	lin0001	lin0002	dnaA	dnaN	FALSE	0.327	194.000	0.328	1.000	Y	NA
159080	159081	lin0002	lin0003	dnaN		FALSE	0.112	109.000	0.009	1.000	N	NA
159081	159082	lin0003	lin0004			FALSE	0.076	180.000	0.024	1.000		NA
159082	159083	lin0004	lin0005		RecF	TRUE	0.949	7.000	0.209	1.000		NA
159083	159084	lin0005	lin0006	RecF	gyrB	TRUE	0.904	49.000	0.249	0.005	Y	NA
159084	159085	lin0006	lin0007	gyrB	gyrA	TRUE	0.818	95.000	0.306	0.002	Y	NA
159085	159086	lin0007	lin0008	gyrA		FALSE	0.074	135.000	0.010	1.000	N	NA
159086	159087	lin0008	lin0009			TRUE	0.903	16.000	0.075	0.067	N	NA
159087	159088	lin0009	lin0010			FALSE	0.069	142.000	0.018	1.000	N	NA
159088	159089	lin0010	lin0011			TRUE	0.995	-91.000	0.281	0.005	Y	NA
159089	159090	lin0011	lin0012			TRUE	0.995	-22.000	0.312	0.006	Y	NA
159090	159091	lin0012	lin0013		qoxA	FALSE	0.007	344.000	0.000	1.000	N	NA
159091	159092	lin0013	lin0014	qoxA	qoxB	TRUE	0.988	18.000	0.489	0.003	Y	NA
159092	159093	lin0014	lin0015	qoxB	qoxC	TRUE	0.996	-12.000	0.957	0.030	Y	NA
159093	159094	lin0015	lin0016	qoxC	qoxD	TRUE	0.994	2.000	0.959	1.000	Y	NA
159094	159095	lin0016	lin0017	qoxD		FALSE	0.056	169.000	0.082	1.000	N	NA
159097	159098	lin0019	lin0020			TRUE	0.914	16.000	0.213	0.090	N	NA
159098	159099	lin0020	lin0021			TRUE	0.995	0.000	0.417	0.035	Y	NA
159099	159100	lin0021	lin0022			TRUE	0.972	23.000	0.733	0.035	Y	NA
159100	159101	lin0022	lin0023			TRUE	0.996	-25.000	0.733	0.035	Y	NA
159101	159102	lin0023	lin0024			TRUE	0.719	28.000	0.400	1.000		NA
159102	159103	lin0024	lin0025			TRUE	0.451	55.000	0.100	1.000		NA
159103	159104	lin0025	lin0026			FALSE	0.018	205.000	0.000	1.000	N	NA
159104	159105	lin0026	lin0027			FALSE	0.203	82.000	0.125	NA	N	NA
159105	159106	lin0027	lin0028			FALSE	0.030	233.000	0.000	NA		NA
159107	159108	lin0029	lin0030			TRUE	0.906	17.000	0.286	1.000		NA
159109	159110	lin0031	lin0032			TRUE	0.971	-3.000	0.529	1.000		NA
159110	159111	lin0032	lin0033			TRUE	0.959	13.000	0.800	1.000		NA
159111	159112	lin0033	lin0034			TRUE	0.967	1.000	0.450	1.000		NA
159112	159113	lin0034	lin0035			FALSE	0.041	203.000	0.000	NA		NA
159113	159114	lin0035	lin0036			FALSE	0.326	79.000	0.090	NA		NA
159114	159115	lin0036	lin0037		rpsF	FALSE	0.010	280.000	0.000	1.000	N	NA
159115	159116	lin0037	lin0038	rpsF	ssb	FALSE	0.241	56.000	0.012	1.000	N	NA
159116	159117	lin0038	lin0039	ssb	rpsR	FALSE	0.294	44.000	0.012	1.000	N	NA
159117	159118	lin0039	lin0040	rpsR		FALSE	0.096	156.000	0.012	1.000		NA
159118	159119	lin0040	lin0041			FALSE	0.026	256.000	0.000	1.000		NA
159119	159120	lin0041	lin0042			TRUE	0.960	-16.000	0.300	NA		NA
159120	159121	lin0042	lin0043			FALSE	0.324	96.000	0.312	NA		NA
159121	159122	lin0043	lin0044			TRUE	0.980	19.000	0.875	1.000	Y	NA
159122	159123	lin0044	lin0045			TRUE	0.414	167.000	0.344	1.000	Y	NA
159123	159124	lin0045	lin0046		rplI	TRUE	0.882	3.000	0.011	1.000	N	NA
159124	159125	lin0046	lin0047	rplI	dnaC	TRUE	0.535	25.000	0.064	1.000	N	NA
159125	159126	lin0047	lin0048	dnaC	purA	FALSE	0.017	259.000	0.018	1.000	N	NA
159126	159127	lin0048	lin0049	purA		FALSE	0.016	326.000	0.000	1.000		NA
159127	159128	lin0049	lin0050			FALSE	0.154	149.000	0.265	NA		NA
159128	159129	lin0050	lin0051			TRUE	0.958	-10.000	0.204	NA		NA
159129	159130	lin0051	lin0052			TRUE	0.893	18.000	0.289	NA		NA
159130	159131	lin0052	lin0053			TRUE	0.870	22.000	0.833	NA		NA
159131	159132	lin0053	lin0054			TRUE	0.949	14.000	0.623	NA		NA
159132	159133	lin0054	lin0055			TRUE	0.822	20.000	0.057	NA		NA
159133	159134	lin0055	lin0056			TRUE	0.965	-7.000	0.357	NA		NA
159134	159135	lin0056	lin0057			TRUE	0.972	-3.000	0.643	NA		NA
159135	159136	lin0057	lin0058			TRUE	0.966	1.000	0.444	NA		NA
159136	159137	lin0058	lin0059			TRUE	0.948	14.000	0.600	NA		NA
159137	159138	lin0059	lin0060			TRUE	0.939	15.000	0.500	NA		NA
159138	159139	lin0060	lin0061			FALSE	0.009	641.000	0.000	NA		NA
159139	159140	lin0061	lin0062			FALSE	0.064	169.000	0.000	NA		NA
159140	1789923	lin0062	lin0063			FALSE	0.095	144.000	0.000	NA		NA
1789923	159141	lin0063	lin0064			TRUE	0.890	13.000	0.000	NA		NA
159141	159142	lin0064	lin0065			FALSE	0.219	138.000	0.500	NA		NA
159142	159143	lin0065	lin0066			FALSE	0.025	258.000	0.000	NA		NA
159143	159144	lin0066	lin0067			FALSE	0.011	428.000	0.000	NA		NA
159144	159145	lin0067	lin0068			TRUE	0.942	-3.000	0.312	1.000	N	NA
159147	398352	lin0070	lint01		tRNA-Lys	FALSE	0.211	86.000	0.000	NA		NA
159148	159149	lin0071	lin0072			FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
159149	159150	lin0072	lin0073			FALSE	0.013	379.000	0.000	NA		NA
159153	159154	lin0076	lin0077			TRUE	0.899	12.000	0.000	NA		NA
159154	159155	lin0077	lin0078			TRUE	0.971	-3.000	0.600	NA		NA
159157	159158	lin0080	lin0081			FALSE	0.244	119.000	0.000	0.073		NA
159158	159159	lin0081	lin0082			TRUE	0.950	7.000	0.000	0.073		NA
159159	159160	lin0082	lin0083			TRUE	0.851	16.000	0.000	NA		NA
159160	159161	lin0083	lin0084			FALSE	0.030	233.000	0.000	NA		NA
159161	159162	lin0084	lin0085			TRUE	0.992	0.000	0.000	0.073	Y	NA
159162	159163	lin0085	lin0086			TRUE	0.943	21.000	0.000	NA	Y	NA
159163	159164	lin0086	lin0087			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
159164	159165	lin0087	lin0088			FALSE	0.019	294.000	0.000	NA		NA
159165	159166	lin0088	lin0089			TRUE	0.973	-3.000	0.667	NA		NA
159166	159167	lin0089	lin0090			TRUE	0.962	-3.000	0.250	NA		NA
159167	159168	lin0090	lin0091			FALSE	0.131	127.000	0.000	NA		NA
159168	159169	lin0091	lin0092			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
159169	159170	lin0092	lin0093			TRUE	0.971	-3.000	0.600	NA		NA
159170	159171	lin0093	lin0094			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
159171	159172	lin0094	lin0095			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
159172	159173	lin0095	lin0096			TRUE	0.961	-3.000	0.222	NA		NA
159173	159174	lin0096	lin0097			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
159174	159175	lin0097	lin0098			TRUE	0.885	19.000	0.333	NA		NA
159175	159176	lin0098	lin0099			TRUE	0.959	-55.000	0.333	NA		NA
159176	159177	lin0099	lin0100			TRUE	0.961	4.000	0.400	NA		NA
159177	159178	lin0100	lin0101			FALSE	0.197	141.000	0.400	NA		NA
159178	159179	lin0101	lin0102			FALSE	0.038	210.000	0.000	NA		NA
159179	159180	lin0102	lin0103			FALSE	0.317	59.000	0.000	NA		NA
159180	159181	lin0103	lin0104			TRUE	0.458	58.000	0.200	NA		NA
159181	159182	lin0104	lin0105			TRUE	0.979	-31.000	0.154	0.002		NA
159182	159183	lin0105	lin0106			TRUE	0.932	13.000	0.154	NA		NA
159183	159184	lin0106	lin0107			TRUE	0.950	1.000	0.067	NA		NA
159184	159185	lin0107	lin0108			TRUE	0.535	79.000	0.133	0.005		NA
159185	159186	lin0108	lin0109			TRUE	0.608	24.000	0.000	NA		NA
159186	159187	lin0109	lin0110			TRUE	0.961	0.000	0.250	NA		NA
159187	159188	lin0110	lin0111			TRUE	0.957	2.000	0.214	NA		NA
159188	159189	lin0111	lin0112			TRUE	0.965	0.000	0.357	NA		NA
159189	159190	lin0112	lin0113			TRUE	0.961	0.000	0.250	NA		NA
159190	159191	lin0113	lin0114			TRUE	0.964	0.000	0.312	NA		NA
159191	159192	lin0114	lin0115			TRUE	0.958	3.000	0.286	NA		NA
159192	1789924	lin0115	lin0116			TRUE	0.926	-10.000	0.000	NA		NA
1789924	159193	lin0116	lin0117			TRUE	0.344	53.000	0.000	NA		NA
159193	159194	lin0117	lin0118			TRUE	0.963	6.000	0.600	NA		NA
159194	159195	lin0118	lin0119			TRUE	0.959	11.000	0.600	NA		NA
159195	159196	lin0119	lin0120			TRUE	0.973	-3.000	0.667	NA		NA
159196	159197	lin0120	lin0121			TRUE	0.976	0.000	1.000	NA		NA
159197	159198	lin0121	lin0122			TRUE	0.963	1.000	0.333	NA		NA
159198	159199	lin0122	lin0123			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
159199	159200	lin0123	lin0124			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
159200	159201	lin0124	lin0125			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
159201	159202	lin0125	lin0126			TRUE	0.652	37.000	0.500	NA		NA
159202	159203	lin0126	lin0127			TRUE	0.945	13.000	0.364	NA		NA
159203	159204	lin0127	lin0128			TRUE	0.954	0.000	0.103	NA		NA
159204	159205	lin0128	lin0129			TRUE	0.680	25.000	0.069	NA		NA
159205	159206	lin0129	lin0130			FALSE	0.008	1025.000	0.000	NA		NA
159206	159207	lin0130	lin0131			FALSE	0.012	411.000	0.000	NA		NA
159207	159208	lin0131	lin0132			TRUE	0.366	114.000	1.000	NA		NA
159208	159209	lin0132	lin0133			TRUE	0.975	-3.000	0.818	NA		NA
159209	159210	lin0133	lin0134			TRUE	0.426	57.000	0.079	NA		NA
159210	159211	lin0134	lin0135			TRUE	0.968	12.000	0.088	0.008		NA
159211	159212	lin0135	lin0136			TRUE	0.975	-3.000	0.009	0.008		NA
159212	159213	lin0136	lin0137			TRUE	0.997	-3.000	0.846	0.008	Y	NA
159213	159214	lin0137	lin0138			TRUE	0.994	1.000	0.009	0.008	Y	NA
159214	159215	lin0138	lin0139			TRUE	0.992	13.000	0.143	0.008	Y	NA
159215	159216	lin0139	lin0140			TRUE	0.957	-3.000	0.143	NA		NA
159216	159217	lin0140	lin0141			FALSE	0.157	144.000	0.200	NA		NA
159217	159218	lin0141	lin0142			FALSE	0.169	162.000	0.667	NA		NA
159218	159219	lin0142	lin0143			FALSE	0.019	297.000	0.000	NA		NA
159219	159220	lin0143	lin0144			TRUE	0.970	24.000	0.943	0.034	Y	NA
159220	159221	lin0144	lin0145			TRUE	0.978	22.000	0.812	0.034	Y	NA
159221	159222	lin0145	lin0146			FALSE	0.274	127.000	0.583	NA		NA
159222	159223	lin0146	lin0147			FALSE	0.163	135.000	0.081	NA		NA
159224	159225	lin0148	lin0149			FALSE	0.276	107.000	0.235	NA		NA
159226	159227	lin0150	lin0151			TRUE	0.958	14.000	0.115	0.028		NA
159227	159228	lin0151	lin0152			FALSE	0.341	95.000	0.385	NA		NA
159228	159229	lin0152	lin0153			FALSE	0.019	294.000	0.000	NA		NA
159230	159231	lin0154	lin0155			FALSE	0.050	190.000	0.000	NA		NA
159231	159232	lin0155	lin0156			TRUE	0.997	-7.000	0.941	0.010	Y	NA
159233	159234	lin0157	lin0158			FALSE	0.038	150.000	0.000	NA	N	NA
159235	159236	lin0159	lin0160			FALSE	0.060	174.000	0.000	NA		NA
159236	159237	lin0160	lin0161			TRUE	0.957	6.000	0.364	NA		NA
159238	159239	lin0162	lin0163	lmaD	lmaC	TRUE	0.965	12.000	0.917	NA		NA
159239	159240	lin0163	lin0164	lmaC	lmaB	FALSE	0.021	280.000	0.000	NA		NA
159240	159241	lin0164	lin0165	lmaB	lmaA	TRUE	0.927	13.000	0.093	NA		NA
159241	159242	lin0165	lin0166	lmaA		TRUE	0.488	48.000	0.134	NA		NA
159242	159243	lin0166	lin0167			TRUE	0.373	111.000	0.929	NA		NA
159243	159244	lin0167	lin0168			TRUE	0.969	-13.000	0.625	NA		NA
159244	159245	lin0168	lin0169			TRUE	0.972	-3.000	0.625	NA		NA
159245	159246	lin0169	lin0170			TRUE	0.968	10.000	1.000	NA		NA
159246	159247	lin0170	lin0171			TRUE	0.973	-10.000	0.833	NA		NA
159247	159248	lin0171	lin0172			TRUE	0.952	15.000	0.900	NA		NA
159248	159249	lin0172	lin0173			TRUE	0.949	15.000	0.800	NA		NA
159249	159250	lin0173	lin0174			TRUE	0.974	-3.000	0.727	NA		NA
159250	159251	lin0174	lin0175			TRUE	0.908	19.000	0.667	NA		NA
159251	159252	lin0175	lin0176			TRUE	0.971	-19.000	0.750	NA		NA
159256	159257	lin0180	lin0181			TRUE	0.939	12.000	0.168	NA		NA
159257	159258	lin0181	lin0182			FALSE	0.016	326.000	0.000	1.000		NA
159258	159259	lin0182	lin0183			TRUE	0.801	102.000	0.688	0.040	Y	NA
159259	159260	lin0183	lin0184			TRUE	0.994	11.000	0.786	0.062	Y	NA
159260	159261	lin0184	lin0185			FALSE	0.073	202.000	0.214	NA		NA
159261	159262	lin0185	lin0186			TRUE	0.974	1.000	0.833	NA		NA
159262	159263	lin0186	lin0187			TRUE	0.960	-3.000	0.200	NA		NA
159263	159264	lin0187	lin0188			TRUE	0.608	24.000	0.000	NA		NA
159264	159265	lin0188	lin0189			TRUE	0.732	21.000	0.000	NA		NA
159267	159268	lin0191	lin0192			TRUE	0.985	14.000	0.212	1.000	Y	NA
159268	159269	lin0192	lin0193			TRUE	0.993	-51.000	0.673	1.000	Y	NA
159271	159272	lin0195	lin0196			TRUE	0.491	45.000	0.066	1.000		NA
159272	159273	lin0196	lin0197			FALSE	0.055	237.000	0.000	0.064		NA
159273	159274	lin0197	lin0198			TRUE	0.884	17.000	0.101	NA		NA
159274	159275	lin0198	lin0199			TRUE	0.911	16.000	0.200	NA		NA
159275	159276	lin0199	lin0200			TRUE	0.783	22.000	0.600	1.000	N	NA
159276	159277	lin0200	lin0201			TRUE	0.982	15.000	0.167	NA	Y	NA
159277	159278	lin0201	lin0202			FALSE	0.038	211.000	0.000	NA		NA
159278	159279	lin0202	lin0203			FALSE	0.254	188.000	0.818	0.002		NA
159281	159282	lin0205	lin0206			TRUE	0.957	6.000	0.372	NA		NA
159282	159283	lin0206	lin0207			TRUE	0.942	11.000	0.183	NA		NA
159283	159284	lin0207	lin0208			TRUE	0.455	58.000	0.193	NA		NA
159284	159285	lin0208	lin0209			TRUE	0.957	-16.000	0.209	1.000		NA
159285	159286	lin0209	lin0210			TRUE	0.952	-3.000	0.041	1.000		NA
159288	159289	lin0212	lin0213			TRUE	0.463	69.000	0.474	NA		NA
159291	159292	lin0215	lin0216		metS	FALSE	0.192	72.000	0.016	1.000	N	NA
159292	159293	lin0216	lin0217	metS		FALSE	0.047	164.000	0.014	1.000	N	NA
159293	159294	lin0217	lin0218			TRUE	0.889	35.000	0.257	1.000	Y	NA
159294	159295	lin0218	lin0219			TRUE	0.992	0.000	0.000	0.062	Y	NA
159295	159296	lin0219	lin0220			TRUE	0.930	28.000	0.053	0.062	Y	NA
159296	159297	lin0220	lin0221			TRUE	0.722	83.000	0.237	1.000	Y	NA
159297	159298	lin0221	lin0222			TRUE	0.995	3.000	0.444	0.010	Y	NA
159298	159299	lin0222	lin0223			TRUE	0.994	4.000	0.237	0.029	Y	NA
159299	159300	lin0223	lin0224			FALSE	0.124	100.000	0.015	NA	N	NA
159300	159301	lin0224	lin0225			FALSE	0.023	292.000	0.007	NA		NA
159301	159302	lin0225	lin0226			FALSE	0.232	102.000	0.024	1.000		NA
159302	159303	lin0226	lin0227		ksgA	TRUE	0.888	-7.000	0.003	1.000	N	NA
159303	159304	lin0227	lin0228	ksgA		FALSE	0.190	120.000	0.035	NA		NA
159304	159305	lin0228	lin0229			FALSE	0.143	139.000	0.046	NA		NA
159305	159306	lin0229	lin0230			TRUE	0.742	22.000	0.005	1.000		NA
159306	159307	lin0230	lin0231			FALSE	0.094	164.000	0.029	1.000		NA
159307	159308	lin0231	lin0232			FALSE	0.088	173.000	0.058	NA		NA
159308	159309	lin0232	lin0233			TRUE	0.495	49.000	0.182	NA		NA
159309	159310	lin0233	lin0234			TRUE	0.992	-3.000	0.182	1.000	Y	NA
159310	159311	lin0234	lin0235			FALSE	0.004	687.000	0.000	1.000	N	NA
159311	159312	lin0235	lin0236			TRUE	0.765	119.000	0.250	0.001	Y	NA
159312	159313	lin0236	lin0237		gcaD	FALSE	0.081	389.000	0.014	1.000	Y	NA
159313	159314	lin0237	lin0238	gcaD	prs	FALSE	0.310	51.000	0.069	1.000	N	NA
159314	159315	lin0238	lin0239	prs		FALSE	0.014	361.000	0.000	NA		NA
159316	159317	lin0240	lin0241			FALSE	0.280	67.000	0.000	NA		NA
159317	159318	lin0241	lin0242		ldh	FALSE	0.321	77.000	0.051	NA		NA
159319	159320	lin0243	lin0244	ctc		FALSE	0.247	91.000	0.013	1.000		NA
159320	159321	lin0244	lin0245		pth	FALSE	0.208	107.000	0.011	1.000		NA
159321	159322	lin0245	lin0246	pth	mfd	FALSE	0.128	124.000	0.137	1.000	N	NA
159322	159323	lin0246	lin0247	mfd		TRUE	0.584	31.000	0.033	1.000		NA
159323	159324	lin0247	lin0248			TRUE	0.722	23.000	0.034	1.000		NA
159324	159325	lin0248	lin0249			FALSE	0.025	226.000	0.053	1.000	N	NA
159325	159326	lin0249	lin0250			FALSE	0.077	151.000	0.134	1.000	N	NA
159326	159327	lin0250	lin0251			FALSE	0.123	111.000	0.031	1.000	N	NA
159327	159328	lin0251	lin0252		ftsH	FALSE	0.012	348.000	0.051	1.000	N	NA
159328	159329	lin0252	lin0253	ftsH		FALSE	0.114	116.000	0.029	1.000	N	NA
159329	159330	lin0253	lin0254			TRUE	0.822	16.000	0.060	1.000	N	NA
159330	159331	lin0254	lin0255		cysK	FALSE	0.123	117.000	0.053	1.000	N	NA
159331	159332	lin0255	lin0256	cysK	sul	FALSE	0.004	898.000	0.000	1.000	N	NA
159332	159333	lin0256	lin0257	sul	folA	TRUE	0.984	14.000	0.176	1.000	Y	NA
159333	159334	lin0257	lin0258	folA	folK	TRUE	0.991	-7.000	0.142	1.000	Y	NA
159334	159335	lin0258	lin0259	folK		FALSE	0.190	76.000	0.025	1.000	N	NA
159335	159336	lin0259	lin0260		lysS	TRUE	0.576	115.000	0.032	1.000	Y	NA
159336	1789925	lin0260	linr01	lysS		FALSE	0.010	446.000	0.000	NA		NA
1789925	1789926	linr01	linr02			FALSE	0.027	246.000	0.000	NA		NA
1789926	1789927	linr02	linr03			FALSE	0.227	81.000	0.000	NA		NA
1789927	398353	linr03	lint02		tRNA-Val	TRUE	0.827	17.000	0.000	NA		NA
398353	398354	lint02	lint03	tRNA-Val	tRNA-Thr	TRUE	0.908	8.000	0.000	NA		NA
398354	398355	lint03	lint04	tRNA-Thr	tRNA-Lys	TRUE	0.412	41.000	0.000	NA		NA
398355	398356	lint04	lint05	tRNA-Lys	tRNA-Leu	TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
398356	398357	lint05	lint06	tRNA-Leu	tRNA-Gly	TRUE	0.899	12.000	0.000	NA		NA
398357	398358	lint06	lint07	tRNA-Gly	tRNA-Leu	TRUE	0.696	22.000	0.000	NA		NA
398358	398359	lint07	lint08	tRNA-Leu	tRNA-Arg	TRUE	0.890	13.000	0.000	NA		NA
398359	398360	lint08	lint09	tRNA-Arg	tRNA-Pro	TRUE	0.903	11.000	0.000	NA		NA
398360	398361	lint09	lint10	tRNA-Pro	tRNA-Ala	TRUE	0.759	20.000	0.000	NA		NA
398361	1789928	lint10	linr04	tRNA-Ala		FALSE	0.022	275.000	0.000	NA		NA
1789928	1789929	linr04	linr05			FALSE	0.027	246.000	0.000	NA		NA
1789929	1789930	linr05	linr06			FALSE	0.227	81.000	0.000	NA		NA
1789930	159337	linr06	lin0261			FALSE	0.086	149.000	0.000	NA		NA
159337	159338	lin0261	lin0262			TRUE	0.956	13.000	0.681	NA		NA
159338	159339	lin0262	lin0263			TRUE	0.976	-3.000	0.848	1.000		NA
159339	159340	lin0263	lin0264		clpC	TRUE	0.594	29.000	0.425	1.000	N	NA
159340	159341	lin0264	lin0265	clpC		TRUE	0.529	155.000	0.062	0.013	Y	NA
159341	159342	lin0265	lin0266			FALSE	0.159	134.000	0.056	NA		NA
159342	159343	lin0266	lin0267			TRUE	0.835	20.000	0.108	NA		NA
159343	159344	lin0267	lin0268			TRUE	0.993	-7.000	0.419	1.000	Y	NA
159344	159345	lin0268	lin0269		gltX	TRUE	0.759	19.000	0.076	1.000	N	NA
159345	159346	lin0269	lin0270	gltX	cysE	FALSE	0.007	399.000	0.008	1.000	N	NA
159346	159347	lin0270	lin0271	cysE	cysS	TRUE	0.940	7.000	0.035	0.051	N	NA
159347	159348	lin0271	lin0272	cysS		TRUE	0.950	4.000	0.129	1.000		NA
159348	159349	lin0272	lin0273			TRUE	0.980	0.000	0.150	0.004		NA
159349	159350	lin0273	lin0274			TRUE	0.950	3.000	0.109	NA		NA
159350	159351	lin0274	lin0275		sigH	TRUE	0.383	81.000	0.361	NA		NA
159351	159352	lin0275	lin0276	sigH		FALSE	0.198	104.000	0.282	1.000	N	NA
159352	159353	lin0276	lin0277		secE	TRUE	0.728	20.000	0.080	1.000	N	NA
159353	159354	lin0277	lin0278	secE	nusG	FALSE	0.211	130.000	0.843	1.000	N	NA
159354	159355	lin0278	lin0279	nusG		TRUE	0.387	55.000	0.011	NA		NA
159355	159356	lin0279	lin0280		rplK	FALSE	0.157	127.000	0.009	NA		NA
159356	159357	lin0280	lin0281	rplK	rplA	TRUE	0.937	40.000	0.838	0.029	Y	NA
159357	159358	lin0281	lin0282	rplA	rplJ	FALSE	0.295	248.000	0.302	0.029	Y	NA
159358	159359	lin0282	lin0283	rplJ	rplL	TRUE	0.869	79.000	0.884	0.022	Y	NA
159359	159360	lin0283	lin0284	rplL		TRUE	0.453	143.000	0.050	1.000	Y	NA
159360	159361	lin0284	lin0285		rpoB	FALSE	0.006	570.000	0.008	1.000	N	NA
159361	159362	lin0285	lin0286	rpoB	rpoC	TRUE	0.630	170.000	0.851	0.002	Y	NA
159362	159363	lin0286	lin0287	rpoC		FALSE	0.299	76.000	0.010	1.000		NA
159363	159364	lin0287	lin0288			TRUE	0.482	66.000	0.458	1.000		NA
159364	159365	lin0288	lin0289			FALSE	0.065	163.000	0.125	1.000	N	NA
159365	159366	lin0289	lin0290			FALSE	0.034	224.000	0.000	1.000		NA
159366	159367	lin0290	lin0291			FALSE	0.263	101.000	0.091	1.000		NA
159367	159368	lin0291	lin0292			TRUE	0.938	7.000	0.545	1.000	N	NA
159368	159369	lin0292	lin0293			TRUE	0.371	71.000	0.647	1.000	N	NA
159369	159370	lin0293	lin0294			FALSE	0.292	84.000	0.529	1.000	N	NA
159371	159372	lin0295	lin0296			FALSE	0.191	135.000	0.235	NA		NA
159372	159373	lin0296	lin0297			TRUE	0.961	1.000	0.265	NA		NA
159373	159374	lin0297	lin0298			TRUE	0.347	120.000	0.917	1.000		NA
159376	159377	lin0300	lin0301			FALSE	0.028	242.000	0.000	NA		NA
159377	159378	lin0301	lin0302			TRUE	0.948	17.000	0.308	0.025		NA
159381	159382	lin0305	lin0306			TRUE	0.935	-7.000	0.240	1.000	N	NA
159382	159383	lin0306	lin0307			FALSE	0.013	238.000	0.000	1.000	N	NA
159383	159384	lin0307	lin0308			TRUE	0.955	2.000	0.182	NA		NA
159385	159386	lin0309	lin0310			FALSE	0.137	150.000	0.169	NA		NA
159386	159387	lin0310	lin0311			FALSE	0.307	91.000	0.169	1.000		NA
159387	159388	lin0311	lin0312			TRUE	0.994	-3.000	0.846	1.000	Y	NA
159388	159389	lin0312	lin0313			TRUE	0.988	15.000	0.880	NA	Y	NA
159390	159391	lin0314	lin0315			FALSE	0.017	212.000	0.000	1.000	N	NA
159391	159392	lin0315	lin0316			TRUE	0.481	184.000	0.597	0.082	Y	NA
159392	159393	lin0316	lin0317			TRUE	0.971	-3.000	0.575	NA		NA
159393	159394	lin0317	lin0318			TRUE	0.973	3.000	0.890	NA		NA
159394	159395	lin0318	lin0319			FALSE	0.231	118.000	0.176	NA		NA
159395	159396	lin0319	lin0320			FALSE	0.244	98.000	0.030	1.000		NA
159396	159397	lin0320	lin0321			FALSE	0.009	685.000	0.000	NA		NA
159399	159400	lin0323	lin0324			FALSE	0.038	211.000	0.000	NA		NA
159401	159402	lin0325	lin0326			TRUE	0.358	99.000	0.348	0.029	N	NA
159402	159403	lin0326	lin0327			TRUE	0.995	5.000	0.565	0.029	Y	NA
159403	159404	lin0327	lin0328			TRUE	0.984	17.000	0.786	1.000	Y	NA
159404	159405	lin0328	lin0329			TRUE	0.994	-7.000	0.714	1.000	Y	NA
159406	159407	lin0330	lin0331			TRUE	0.471	34.000	0.000	NA		NA
159411	159412	lin0335	lin0336			TRUE	0.931	15.000	0.333	NA		NA
159412	159413	lin0336	lin0337			FALSE	0.024	263.000	0.000	NA		NA
159413	159414	lin0337	lin0338			TRUE	0.380	46.000	0.000	NA		NA
159414	159415	lin0338	lin0339			TRUE	0.396	74.000	0.250	NA		NA
159415	159416	lin0339	lin0340			FALSE	0.035	223.000	0.000	1.000		NA
159416	159417	lin0340	lin0341			TRUE	0.904	-7.000	0.029	1.000	N	NA
159417	159418	lin0341	lin0342			TRUE	0.995	-3.000	0.044	0.004	Y	NA
159418	159419	lin0342	lin0343			TRUE	0.995	-3.000	0.142	0.004	Y	NA
159420	159421	lin0344	lin0345			FALSE	0.039	208.000	0.000	NA		NA
159422	159423	lin0346	lin0347			FALSE	0.100	167.000	0.094	NA		NA
159425	159426	lin0349	lin0350			FALSE	0.023	266.000	0.000	NA		NA
159426	159427	lin0350	lin0351			FALSE	0.276	163.000	0.778	0.024		NA
159427	159428	lin0351	lin0352			FALSE	0.066	213.000	0.200	1.000		NA
159428	159429	lin0352	lin0353			FALSE	0.253	138.000	0.800	NA		NA
159431	159432	lin0355	lin0356			TRUE	0.970	1.000	0.636	NA		NA
159432	159433	lin0356	lin0357			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
159433	159434	lin0357	lin0358			FALSE	0.144	122.000	0.000	1.000		NA
159435	159436	lin0359	lin0360			TRUE	0.404	66.000	0.167	NA		NA
159436	159437	lin0360	lin0361			TRUE	0.993	2.000	0.750	1.000	Y	NA
159437	159438	lin0361	lin0362			TRUE	0.377	47.000	0.192	1.000	N	NA
159438	159439	lin0362	lin0363			TRUE	0.598	25.000	0.212	1.000	N	NA
159439	159440	lin0363	lin0364			TRUE	0.989	7.000	0.208	1.000	Y	NA
159440	159441	lin0364	lin0365			TRUE	0.990	4.000	0.147	1.000	Y	NA
159441	159442	lin0365	lin0366			TRUE	0.974	22.000	0.162	0.003	Y	NA
159442	159443	lin0366	lin0367			TRUE	0.858	22.000	0.667	NA		NA
159443	159444	lin0367	lin0368			TRUE	0.945	16.000	0.889	NA		NA
159444	159445	lin0368	lin0369			TRUE	0.417	85.000	0.667	NA		NA
159446	159447	lin0370	lin0371			TRUE	0.416	66.000	0.182	1.000		NA
159447	159448	lin0371	lin0372			FALSE	0.280	99.000	0.145	1.000		NA
159450	159451	lin0374	lin0375			FALSE	0.166	173.000	0.095	0.028		NA
159451	159452	lin0375	lin0376			FALSE	0.084	201.000	0.308	1.000		NA
159452	159453	lin0376	lin0377			TRUE	0.993	14.000	0.692	0.029	Y	NA
159453	159454	lin0377	lin0378			TRUE	0.994	0.000	0.846	1.000	Y	NA
159454	159455	lin0378	lin0379			TRUE	0.841	57.000	0.500	1.000	Y	NA
159456	159457	lin0380	lin0381			TRUE	0.993	-3.000	0.393	NA	Y	NA
159457	159458	lin0381	lin0382			FALSE	0.220	74.000	0.066	1.000	N	NA
159459	159460	lin0383	lin0384			FALSE	0.088	129.000	0.024	NA	N	NA
159460	159461	lin0384	lin0385			TRUE	0.990	-3.000	0.040	NA	Y	NA
159461	159462	lin0385	lin0386			TRUE	0.982	18.000	0.812	NA	Y	NA
159462	159463	lin0386	lin0387			FALSE	0.220	73.000	0.072	NA	N	NA
159463	159464	lin0387	lin0388			FALSE	0.234	97.000	0.013	1.000		NA
159464	159465	lin0388	lin0389			TRUE	0.509	37.000	0.013	1.000		NA
159467	159468	lin0391	lin0392			TRUE	0.994	-7.000	0.857	1.000	Y	NA
159468	159469	lin0392	lin0393			TRUE	0.989	18.000	0.846	0.029	Y	NA
159469	159470	lin0393	lin0394			TRUE	0.424	87.000	0.750	NA		NA
159472	159473	lin0396	lin0397			FALSE	0.010	524.000	0.000	NA		NA
159473	159474	lin0397	lin0398			TRUE	0.975	-9.000	1.000	NA		NA
159474	159475	lin0398	lin0399			TRUE	0.921	3.000	0.000	NA		NA
159477	159478	lin0401	lin0402			TRUE	0.871	13.000	0.071	1.000	N	NA
159478	159479	lin0402	lin0403			TRUE	0.975	17.000	0.109	1.000	Y	NA
159479	159480	lin0403	lin0404			TRUE	0.879	12.000	0.064	1.000	N	NA
159480	159481	lin0404	lin0405			FALSE	0.171	132.000	0.081	NA		NA
159481	159482	lin0405	lin0406			TRUE	0.445	65.000	0.286	NA		NA
159484	159485	lin0408	lin0409			FALSE	0.177	165.000	0.846	NA		NA
159485	159486	lin0409	lin0410			TRUE	0.954	-3.000	0.086	NA		NA
159486	159487	lin0410	lin0411			TRUE	0.524	35.000	0.016	NA		NA
159487	159488	lin0411	lin0412			FALSE	0.091	146.000	0.000	NA		NA
159488	159489	lin0412	lin0413			TRUE	0.466	62.000	0.300	NA		NA
159491	159492	lin0415	lin0416			FALSE	0.325	122.000	0.818	1.000		NA
159492	159493	lin0416	lin0417			TRUE	0.916	18.000	0.636	NA		NA
159493	159494	lin0417	lin0418			TRUE	0.916	18.000	0.625	NA		NA
159494	159495	lin0418	lin0419			TRUE	0.994	-15.000	0.800	1.000	Y	NA
159495	159496	lin0419	lin0420			FALSE	0.030	233.000	0.000	NA		NA
159496	159497	lin0420	lin0421			FALSE	0.100	170.000	0.120	NA		NA
159497	159498	lin0421	lin0422			TRUE	0.996	-3.000	0.600	0.029	Y	NA
159498	159499	lin0422	lin0423			TRUE	0.995	4.000	0.800	0.029	Y	NA
159499	159500	lin0423	lin0424			TRUE	0.957	22.000	0.300	1.000	Y	NA
159500	159501	lin0424	lin0425			TRUE	0.492	33.000	0.207	1.000	N	NA
159501	159502	lin0425	lin0426			FALSE	0.201	134.000	0.276	NA		NA
159502	159503	lin0426	lin0427			TRUE	0.974	-9.000	0.846	NA		NA
159503	159504	lin0427	lin0428			FALSE	0.329	108.000	0.550	NA		NA
159504	159505	lin0428	lin0429			TRUE	0.838	16.000	0.110	1.000	N	NA
159505	159506	lin0429	lin0430			TRUE	0.385	69.000	0.120	1.000		NA
159506	159507	lin0430	lin0431			TRUE	0.944	13.000	0.333	NA		NA
159508	159509	lin0432	lin0433			FALSE	0.042	201.000	0.000	NA		NA
159510	159511	lin0434	lin0435			TRUE	0.647	27.000	0.066	NA		NA
159511	159512	lin0435	lin0436			FALSE	0.009	294.000	0.000	1.000	N	NA
159512	159513	lin0436	lin0437			FALSE	0.189	127.000	0.571	1.000	N	NA
159513	159514	lin0437	lin0438			TRUE	0.954	2.000	0.167	NA		NA
159517	159518	lin0441	lin0442			TRUE	0.967	-3.000	0.389	NA		NA
159518	159519	lin0442	lin0443			TRUE	0.954	3.000	0.200	NA		NA
159519	159520	lin0443	lin0444			FALSE	0.054	180.000	0.150	1.000	N	NA
159521	159522	lin0445	lin0446			TRUE	0.967	0.000	0.222	0.028	N	NA
159522	159523	lin0446	lin0448			FALSE	0.136	330.000	0.000	0.028	Y	NA
159523	159524	lin0448	lin0449			TRUE	0.985	16.000	0.600	1.000	Y	NA
159526	159527	lin0451	lin0452			TRUE	0.930	14.000	0.200	1.000		NA
159527	159528	lin0452	lin0453			FALSE	0.235	112.000	0.111	NA		NA
159528	159529	lin0453	lin0454			FALSE	0.026	254.000	0.000	NA		NA
159529	159530	lin0454	lin0455			FALSE	0.009	613.000	0.000	NA		NA
159530	159531	lin0455	lin0456			FALSE	0.012	397.000	0.000	NA		NA
159531	159532	lin0456	lin0457			FALSE	0.022	272.000	0.000	NA		NA
159535	159536	lin0460	lin0461			FALSE	0.195	127.000	0.086	1.000		NA
159537	159538	lin0462	lin0463			FALSE	0.204	139.000	0.407	NA		NA
159540	159541	lin0465	lin0466			FALSE	0.056	180.000	0.000	NA		NA
159542	159543	lin0467	lin0468			TRUE	0.856	20.000	0.250	NA		NA
159543	159544	lin0468	lin0469			FALSE	0.159	139.000	0.119	NA		NA
159544	159545	lin0469	lin0470			TRUE	0.972	-3.000	0.642	NA		NA
159545	159546	lin0470	lin0471			TRUE	0.967	5.000	0.714	NA		NA
159547	159548	lin0472	lin0473			FALSE	0.163	133.000	0.522	1.000	N	NA
159548	159549	lin0473	lin0474			TRUE	0.972	1.000	0.731	NA		NA
159549	159550	lin0474	lin0475			TRUE	0.955	-7.000	0.115	NA		NA
159550	159551	lin0475	lin0476			FALSE	0.008	747.000	0.000	NA		NA
159551	159552	lin0476	lin0477			FALSE	0.010	449.000	0.000	NA		NA
159552	159553	lin0477	lin0478			FALSE	0.011	439.000	0.000	NA		NA
159553	159554	lin0478	lin0479			FALSE	0.009	569.000	0.000	NA		NA
159554	159555	lin0479	lin0480			TRUE	0.692	28.000	0.286	NA		NA
159555	1789931	lin0480	lin0481			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
1789931	159556	lin0481	lin0482			FALSE	0.016	326.000	0.000	NA		NA
159556	159557	lin0482	lin0483			FALSE	0.290	110.000	0.344	NA		NA
159557	159558	lin0483	lin0484			FALSE	0.099	151.000	0.009	NA		NA
159558	159559	lin0484	lin0485			FALSE	0.243	89.000	0.011	NA		NA
159559	159560	lin0485	lin0486			FALSE	0.339	81.000	0.182	NA		NA
159560	159561	lin0486	lin0487			FALSE	0.307	86.000	0.133	NA		NA
159561	159562	lin0487	lin0488			FALSE	0.154	168.000	0.014	0.027		NA
159562	159563	lin0488	lin0489		rpmF	FALSE	0.209	65.000	0.012	1.000	N	NA
159563	159564	lin0489	lin0490	rpmF		FALSE	0.137	92.000	0.011	1.000	N	NA
159566	159567	lin0492	lin0493			FALSE	0.175	100.000	0.143	1.000	N	NA
159567	159568	lin0493	lin0494			TRUE	0.768	66.000	0.113	1.000	Y	NA
159568	159569	lin0494	lin0495			TRUE	0.632	97.000	0.025	1.000	Y	NA
159569	159570	lin0495	lin0496			TRUE	0.361	186.000	0.379	1.000	Y	NA
159570	159571	lin0496	lin0497			TRUE	0.376	75.000	0.196	NA		NA
159571	159572	lin0497	lin0498			FALSE	0.105	164.000	0.098	NA		NA
159572	159573	lin0498	lin0499			TRUE	0.994	-3.000	0.889	1.000	Y	NA
159573	159574	lin0499	lin0500			TRUE	0.995	7.000	0.889	0.028	Y	NA
159574	159575	lin0500	lin0501			FALSE	0.265	109.000	0.800	1.000	N	NA
159575	159576	lin0501	lin0502			TRUE	0.944	4.000	0.556	1.000	N	NA
159576	159577	lin0502	lin0503			TRUE	0.635	28.000	0.556	1.000	N	NA
159577	159578	lin0503	lin0504			TRUE	0.936	17.000	0.900	NA		NA
159578	159579	lin0504	lin0505			TRUE	0.950	11.000	0.321	NA		NA
159579	159580	lin0505	lin0506			TRUE	0.949	-3.000	0.429	1.000	N	NA
159580	159581	lin0506	lin0507			TRUE	0.886	16.000	0.417	1.000	N	NA
159581	159582	lin0507	lin0508			TRUE	0.985	15.000	0.000	0.032	Y	NA
159582	159583	lin0508	lin0509		prs	FALSE	0.049	140.000	0.000	1.000	N	NA
159583	159584	lin0509	lin0510	prs		FALSE	0.010	465.000	0.000	NA		NA
159584	159585	lin0510	lin0511			FALSE	0.322	79.000	0.077	NA		NA
159586	159587	lin0512	lin0513			TRUE	0.939	6.000	0.058	NA		NA
159588	159589	lin0514	lin0515			TRUE	0.393	76.000	0.250	1.000		NA
159590	159591	lin0516	lin0517			FALSE	0.164	90.000	0.059	NA	N	NA
159591	159592	lin0517	lin0518			FALSE	0.011	422.000	0.000	NA		NA
159593	159594	lin0519	lin0520			FALSE	0.206	132.000	0.268	NA		NA
159594	159595	lin0520	lin0521			FALSE	0.021	278.000	0.000	NA		NA
159595	159596	lin0521	lin0522			TRUE	0.863	48.000	0.028	0.067	Y	NA
159596	159597	lin0522	lin0523			TRUE	0.993	-3.000	0.011	0.067	Y	NA
159597	159598	lin0523	lin0524			FALSE	0.233	83.000	0.000	0.067	N	NA
159599	159600	lin0525	lin0526			FALSE	0.309	60.000	0.167	1.000	N	NA
159601	159602	lin0527	lin0528			FALSE	0.293	107.000	0.314	NA		NA
159603	159604	lin0529	lin0530			FALSE	0.038	152.000	0.000	1.000	N	NA
159605	159606	lin0531	lin0532			TRUE	0.951	-7.000	0.062	NA		NA
159606	159607	lin0532	lin0533			TRUE	0.942	11.000	0.180	NA		NA
159607	159608	lin0533	lin0534			TRUE	0.914	16.000	0.230	NA		NA
159608	159609	lin0534	lin0535			TRUE	0.937	14.000	0.333	NA		NA
159609	159610	lin0535	lin0536			TRUE	0.470	60.000	0.244	1.000		NA
159610	159611	lin0536	lin0537			FALSE	0.333	78.000	0.074	1.000		NA
159611	159612	lin0537	lin0538			TRUE	0.902	19.000	0.569	NA		NA
159614	159615	lin0540	lin0541			FALSE	0.213	104.000	0.360	1.000	N	NA
159615	159616	lin0541	lin0542			TRUE	0.982	-7.000	0.280	0.006		NA
159619	159620	lin0545	lin0546			FALSE	0.177	112.000	0.258	1.000	N	NA
159620	159621	lin0546	lin0547			TRUE	0.975	20.000	0.065	0.032	Y	NA
159621	159622	lin0547	lin0548			TRUE	0.968	22.000	0.125	0.032	Y	NA
159622	159623	lin0548	lin0549			TRUE	0.510	25.000	0.042	NA	N	NA
159623	159624	lin0549	lin0550			FALSE	0.270	55.000	0.042	NA	N	NA
159624	159625	lin0550	lin0551			FALSE	0.011	259.000	0.000	1.000	N	NA
159626	159627	lin0552	lin0553			TRUE	0.732	21.000	0.000	NA		NA
159627	159628	lin0553	lin0554			TRUE	0.910	20.000	1.000	1.000		NA
159628	159629	lin0554	lin0555			TRUE	0.523	47.000	0.222	NA		NA
159629	159630	lin0555	lin0556			TRUE	0.463	80.000	0.800	NA		NA
159630	159631	lin0556	lin0557			FALSE	0.015	346.000	0.000	NA		NA
159631	159632	lin0557	lin0558			TRUE	0.517	29.000	0.000	NA		NA
159632	159633	lin0558	lin0559			TRUE	0.517	29.000	0.000	NA		NA
159633	159634	lin0559	lin0560			TRUE	0.349	52.000	0.000	NA		NA
159634	159635	lin0560	lin0561			FALSE	0.237	79.000	0.000	NA		NA
159637	159638	lin0563	lin0564			TRUE	0.451	36.000	0.176	1.000	N	NA
159638	159639	lin0564	lin0565			FALSE	0.209	130.000	0.833	1.000	N	NA
159639	159640	lin0565	lin0566			TRUE	0.995	1.000	0.167	0.004	Y	NA
159643	159644	lin0569	lin0570			FALSE	0.056	535.000	0.000	1.000	Y	NA
159644	159645	lin0570	lin0571			TRUE	0.995	1.000	0.152	0.005	Y	NA
159645	159646	lin0571	lin0572		hisF	TRUE	0.996	-3.000	0.430	0.005	Y	NA
159646	159647	lin0572	lin0573	hisF	hisA	TRUE	0.994	-10.000	0.013	0.005	Y	NA
159647	159648	lin0573	lin0574	hisA	hisH	TRUE	0.994	-21.000	0.051	0.005	Y	NA
159648	159649	lin0574	lin0575	hisH	hisB	TRUE	0.995	1.000	0.125	0.005	Y	NA
159649	159650	lin0575	lin0576	hisB	hisD	TRUE	0.995	1.000	0.096	0.005	Y	NA
159650	159651	lin0576	lin0577	hisD	hisG	TRUE	0.996	-3.000	0.254	0.005	Y	NA
159651	159652	lin0577	lin0578	hisG	hisZ	TRUE	0.995	0.000	0.239	0.005	Y	NA
159657	159658	lin0583	lin0584			TRUE	0.492	44.000	0.545	1.000	N	NA
159658	159659	lin0584	lin0585			FALSE	0.011	425.000	0.000	NA		NA
159660	159661	lin0586	lin0587			TRUE	0.942	14.000	0.433	NA		NA
159662	159663	lin0588	lin0589			TRUE	0.792	23.000	0.345	NA		NA
159664	159665	lin0590	lin0591		iap	FALSE	0.296	89.000	0.125	NA		NA
159666	159667	lin0592	lin0593			FALSE	0.254	116.000	0.256	NA		NA
159667	159668	lin0593	lin0594			FALSE	0.024	261.000	0.000	NA		NA
159668	159669	lin0594	lin0595			TRUE	0.383	70.000	0.154	NA		NA
159669	159670	lin0595	lin0596			TRUE	0.915	18.000	0.615	NA		NA
159670	159671	lin0596	lin0597			FALSE	0.192	113.000	0.014	NA		NA
159671	159672	lin0597	lin0598			FALSE	0.132	138.000	0.015	NA		NA
159672	159673	lin0598	lin0599			TRUE	0.973	-3.000	0.688	NA		NA
159673	159674	lin0599	lin0600			TRUE	0.962	-3.000	0.210	1.000		NA
159674	159675	lin0600	lin0601			FALSE	0.214	126.000	0.194	NA		NA
159675	159676	lin0601	lin0602			FALSE	0.033	224.000	0.000	NA		NA
159677	159678	lin0603	lin0604			TRUE	0.973	17.000	0.027	1.000	Y	NA
159680	159681	lin0606	lin0607			TRUE	0.358	76.000	0.117	1.000		NA
159682	159683	lin0608	lin0609			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
159683	159684	lin0609	lin0610			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
159684	159685	lin0610	lin0611			FALSE	0.226	106.000	0.038	NA		NA
159686	159687	lin0612	lin0613			TRUE	0.621	53.000	1.000	NA		NA
159687	159688	lin0613	lin0614			FALSE	0.120	151.000	0.077	NA		NA
159689	159690	lin0615	lin0616			TRUE	0.810	20.000	0.419	1.000	N	NA
159690	159691	lin0616	lin0617			TRUE	0.997	-3.000	0.784	0.009	Y	NA
159691	159692	lin0617	lin0618			FALSE	0.151	114.000	0.159	1.000	N	NA
159693	159694	lin0619	lin0620			FALSE	0.070	165.000	0.000	1.000		NA
159695	159696	lin0621	lin0622			TRUE	0.938	-3.000	0.250	1.000	N	NA
159696	159697	lin0622	lin0623			FALSE	0.205	95.000	0.222	1.000	N	NA
159700	159701	lin0626	lin0627			FALSE	0.298	110.000	0.389	NA		NA
159702	159703	lin0628	lin0629			TRUE	0.463	56.000	0.185	NA		NA
159703	159704	lin0629	lin0630			FALSE	0.298	96.000	0.204	NA		NA
159704	159705	lin0630	lin0631			TRUE	0.384	84.000	0.440	NA		NA
159705	159706	lin0631	lin0632			TRUE	0.947	16.000	1.000	NA		NA
159707	159708	lin0633	lin0634			TRUE	0.631	37.000	0.353	1.000		NA
159708	159709	lin0634	lin0635			TRUE	0.358	83.000	0.294	NA		NA
159710	159711	lin0636	lin0637			TRUE	0.390	96.000	0.700	NA		NA
159711	159712	lin0637	lin0638			TRUE	0.539	43.000	0.196	NA		NA
159712	159713	lin0638	lin0639			TRUE	0.413	87.000	0.065	0.060		NA
159713	159714	lin0639	lin0640			FALSE	0.282	112.000	0.306	1.000		NA
159714	159715	lin0640	lin0641			TRUE	0.927	14.000	0.161	1.000		NA
159716	159717	lin0642	lin0643			TRUE	0.367	65.000	0.041	NA		NA
159717	159718	lin0643	lin0644			FALSE	0.024	266.000	0.000	1.000		NA
159718	159719	lin0644	lin0645			FALSE	0.227	99.000	0.018	NA		NA
159719	159720	lin0645	lin0646			FALSE	0.151	144.000	0.167	NA		NA
159722	159723	lin0648	lin0649			TRUE	0.391	90.000	0.571	1.000		NA
159725	159726	lin0651	lin0652			TRUE	0.700	24.000	0.545	1.000	N	NA
159726	159727	lin0652	lin0653			TRUE	0.545	42.000	0.174	1.000		NA
159727	159728	lin0653	lin0654			TRUE	0.513	47.000	0.174	1.000		NA
159729	159730	lin0655	lin0656			TRUE	0.956	-13.000	0.183	NA		NA
159731	159732	lin0657	lin0658			FALSE	0.317	74.000	0.026	NA		NA
159734	159735	lin0660	lin0661			FALSE	0.020	286.000	0.000	NA		NA
159735	159736	lin0661	lin0662			FALSE	0.095	145.000	0.000	1.000		NA
159738	159739	lin0664	lin0665			FALSE	0.022	276.000	0.000	1.000		NA
159740	159741	lin0666	lin0667		thiD	TRUE	0.423	63.000	0.143	1.000		NA
159741	159742	lin0667	lin0668	thiD		TRUE	0.694	26.000	0.157	1.000		NA
159743	159744	lin0669	lin0670			TRUE	0.957	-3.000	0.139	NA		NA
159744	159745	lin0670	lin0671			TRUE	0.929	10.000	0.029	NA		NA
159745	159746	lin0671	lin0672			FALSE	0.202	114.000	0.024	1.000		NA
159746	159747	lin0672	lin0673			TRUE	0.994	-7.000	0.688	1.000	Y	NA
159747	159748	lin0673	lin0674			FALSE	0.011	259.000	0.000	1.000	N	NA
159748	159749	lin0674	lin0675			TRUE	0.875	18.000	0.135	NA		NA
159749	159750	lin0675	lin0676			FALSE	0.192	124.000	0.073	NA		NA
159750	159751	lin0676	lin0677			FALSE	0.008	793.000	0.000	NA		NA
159751	159752	lin0677	lin0678			TRUE	0.453	36.000	0.000	NA		NA
159752	159753	lin0678	lin0679			FALSE	0.008	1181.000	0.000	NA		NA
159753	159754	lin0679	lin0680			FALSE	0.163	144.000	0.000	0.080		NA
159755	159756	lin0681	lin0682			TRUE	0.878	21.000	0.667	NA		NA
159757	159758	lin0683	lin0684			TRUE	0.952	-7.000	0.073	NA		NA
159758	159759	lin0684	lin0685			TRUE	0.992	13.000	0.162	0.003	Y	NA
159759	159760	lin0685	lin0686			TRUE	0.993	3.000	0.181	0.079	Y	NA
159760	159761	lin0686	lin0687			TRUE	0.987	16.000	0.259	0.079	Y	NA
159761	159762	lin0687	lin0688			TRUE	0.910	47.000	0.207	0.003	Y	NA
159762	159763	lin0688	lin0689			TRUE	0.972	22.000	0.440	0.079	Y	NA
159763	159764	lin0689	lin0690			TRUE	0.990	-3.000	0.045	1.000	Y	NA
159764	159765	lin0690	lin0691			TRUE	0.897	29.000	0.084	1.000	Y	NA
159765	159766	lin0691	lin0692			TRUE	0.688	25.000	0.092	NA		NA
159766	159767	lin0692	lin0693			TRUE	0.640	27.000	0.050	NA		NA
159767	159768	lin0693	lin0694		motB	TRUE	0.991	-40.000	0.257	1.000	Y	NA
159768	159769	lin0694	lin0695	motB		TRUE	0.943	10.000	0.175	NA		NA
159769	159770	lin0695	lin0696			TRUE	0.805	23.000	0.450	NA		NA
159770	159771	lin0696	lin0697			TRUE	0.881	13.000	0.117	1.000	N	NA
159771	159772	lin0697	lin0698		flaA	FALSE	0.157	237.000	0.000	1.000	Y	NA
159772	159773	lin0698	lin0699	flaA	cheY	FALSE	0.010	275.000	0.000	1.000	N	NA
159773	159774	lin0699	lin0700	cheY	cheA	TRUE	0.979	20.000	0.154	0.011	Y	NA
159774	159775	lin0700	lin0701	cheA		TRUE	0.992	13.000	0.059	0.004	Y	NA
159775	159776	lin0701	lin0702			TRUE	0.901	19.000	0.550	NA		NA
159776	159777	lin0702	lin0703			TRUE	0.944	16.000	0.846	NA		NA
159777	159778	lin0703	lin0704			TRUE	0.949	2.000	0.064	1.000		NA
159778	159779	lin0704	lin0705			TRUE	0.963	20.000	0.117	1.000	Y	NA
159779	159780	lin0705	lin0706			TRUE	0.968	14.000	0.293	0.007		NA
159780	159781	lin0706	lin0707			TRUE	0.912	21.000	0.079	0.002		NA
159781	159782	lin0707	lin0708			TRUE	0.996	3.000	0.508	0.002	Y	NA
159782	159783	lin0708	lin0709			TRUE	0.938	6.000	0.052	NA		NA
159783	159784	lin0709	lin0710			TRUE	0.848	23.000	0.917	NA		NA
159784	159785	lin0710	lin0711			FALSE	0.240	107.000	0.083	NA		NA
159785	159786	lin0711	lin0712			TRUE	0.936	10.000	0.076	NA		NA
159786	159787	lin0712	lin0713			TRUE	0.894	20.000	0.688	NA		NA
159787	159788	lin0713	lin0714			TRUE	0.994	12.000	0.177	0.001	Y	NA
159788	159789	lin0714	lin0715			TRUE	0.989	12.000	0.292	1.000	Y	NA
159789	159790	lin0715	lin0716			TRUE	0.988	19.000	0.608	0.002	Y	NA
159790	159791	lin0716	lin0717			TRUE	0.950	-28.000	0.127	NA		NA
159791	159792	lin0717	lin0718			TRUE	0.794	21.000	0.040	NA		NA
159792	159793	lin0718	lin0719			TRUE	0.995	12.000	0.804	0.005	Y	NA
159793	159794	lin0719	lin0720			TRUE	0.986	17.000	0.068	0.005	Y	NA
159794	159795	lin0720	lin0721			TRUE	0.844	68.000	0.076	0.007	Y	NA
159795	159796	lin0721	lin0722			TRUE	0.994	4.000	0.056	0.007	Y	NA
159796	159797	lin0722	lin0723			TRUE	0.966	-13.000	0.471	NA		NA
159797	159798	lin0723	lin0724			TRUE	0.957	-3.000	0.129	NA		NA
159798	159799	lin0724	lin0725			TRUE	0.794	17.000	0.076	NA	N	NA
159799	159800	lin0725	lin0726			TRUE	0.905	14.000	0.021	NA		NA
159800	159801	lin0726	lin0727			FALSE	0.142	121.000	0.000	NA		NA
159801	159802	lin0727	lin0728			TRUE	0.964	-7.000	0.342	NA		NA
159804	159805	lin0730	lin0731			FALSE	0.093	162.000	0.400	1.000	N	NA
159805	159806	lin0731	lin0732			TRUE	0.941	14.000	0.391	1.000		NA
159808	159809	lin0734	lin0735			FALSE	0.110	113.000	0.014	1.000	N	NA
159809	159810	lin0735	lin0736			FALSE	0.279	86.000	0.049	NA		NA
159810	159811	lin0736	lin0737			TRUE	0.921	14.000	0.111	NA		NA
159811	159812	lin0737	lin0738			FALSE	0.088	148.000	0.000	NA		NA
159812	159813	lin0738	lin0739			FALSE	0.030	236.000	0.000	NA		NA
159817	159818	lin0743	lin0744			TRUE	0.955	-16.000	0.750	1.000	N	NA
159818	159819	lin0744	lin0745			TRUE	0.974	-3.000	0.750	NA		NA
159819	159820	lin0745	lin0746			TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
159820	1789932	lin0746	lin0747			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
1789932	159821	lin0747	lin0748			TRUE	0.517	29.000	0.000	NA		NA
159821	159822	lin0748	lin0749			FALSE	0.096	143.000	0.000	NA		NA
159822	159823	lin0749	lin0750			TRUE	0.957	-28.000	0.850	1.000	N	NA
159823	159824	lin0750	lin0751			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
159824	159825	lin0751	lin0752			FALSE	0.131	127.000	0.000	NA		NA
159825	159826	lin0752	lin0753			TRUE	0.986	-3.000	0.526	0.004		NA
159826	159827	lin0753	lin0754			TRUE	0.947	8.000	0.200	1.000		NA
159827	159828	lin0754	lin0755			TRUE	0.942	10.000	0.123	1.000		NA
159828	159829	lin0755	lin0756			FALSE	0.016	327.000	0.000	1.000		NA
159829	159830	lin0756	lin0757			FALSE	0.338	66.000	0.010	1.000		NA
159830	159831	lin0757	lin0758			TRUE	0.964	-3.000	0.265	1.000		NA
159831	159832	lin0758	lin0759			FALSE	0.217	153.000	0.111	0.023		NA
159832	159833	lin0759	lin0760			TRUE	0.878	17.000	0.056	1.000		NA
159833	159834	lin0760	lin0761			TRUE	0.991	12.000	0.167	0.057	Y	NA
159834	159835	lin0761	lin0762			TRUE	0.978	21.000	0.500	0.057	Y	NA
159835	159836	lin0762	lin0763			TRUE	0.990	4.000	0.222	1.000	Y	NA
159838	159839	lin0765	lin0766			TRUE	0.728	35.000	1.000	NA		NA
159841	159842	lin0768	lin0769			TRUE	0.545	52.000	0.423	NA		NA
159845	159846	lin0772	lin0773			FALSE	0.024	263.000	0.000	NA		NA
159846	159847	lin0773	lin0774			FALSE	0.331	117.000	0.755	NA		NA
159847	159848	lin0774	lin0775			TRUE	0.987	19.000	0.939	0.031	Y	NA
159848	159849	lin0775	lin0776			TRUE	0.525	162.000	0.234	0.031	Y	NA
159849	159850	lin0776	lin0777			TRUE	0.996	0.000	0.550	0.031	Y	NA
159850	159851	lin0777	lin0778			FALSE	0.023	289.000	0.000	0.038	N	NA
159852	159853	lin0779	lin0780			FALSE	0.063	194.000	0.421	1.000	N	NA
159853	159854	lin0780	lin0781			FALSE	0.023	265.000	0.000	NA		NA
159855	159856	lin0782	lin0783			TRUE	0.636	26.000	0.018	1.000		NA
159857	159858	lin0784	lin0785			FALSE	0.334	100.000	0.429	NA		NA
159859	159860	lin0786	lin0787			FALSE	0.211	115.000	0.059	NA		NA
159860	159861	lin0787	lin0788			FALSE	0.265	88.000	0.026	1.000		NA
159861	159862	lin0788	lin0789			FALSE	0.210	110.000	0.028	NA		NA
159864	159865	lin0791	lin0792			FALSE	0.007	358.000	0.000	1.000	N	NA
159866	159867	lin0793	lin0794			FALSE	0.131	151.000	0.155	NA		NA
159867	159868	lin0794	lin0795			FALSE	0.191	130.000	0.113	1.000		NA
159868	159869	lin0795	lin0796			FALSE	0.018	210.000	0.000	1.000	N	NA
159869	159870	lin0796	lin0797			TRUE	0.875	16.000	0.326	1.000	N	NA
159870	159871	lin0797	lin0798			TRUE	0.996	0.000	0.928	0.036	Y	NA
159871	159872	lin0798	lin0799			TRUE	0.996	-3.000	0.492	0.036	Y	NA
159872	159873	lin0799	lin0800			TRUE	0.995	-3.000	0.253	0.036	Y	NA
159873	159874	lin0800	lin0801			FALSE	0.006	387.000	0.000	1.000	N	NA
159874	159875	lin0801	lin0802			TRUE	0.838	61.000	0.643	NA	Y	NA
159875	159876	lin0802	lin0803			FALSE	0.015	340.000	0.000	NA		NA
159876	159877	lin0803	lin0804			FALSE	0.043	200.000	0.000	NA		NA
159878	159879	lin0805	lin0806			FALSE	0.323	85.000	0.167	1.000		NA
159880	159881	lin0807	lin0808			FALSE	0.336	68.000	0.016	1.000		NA
159881	159882	lin0808	lin0809			FALSE	0.156	138.000	0.089	NA		NA
159882	159883	lin0809	lin0810			TRUE	0.440	85.000	0.818	NA		NA
159883	159884	lin0810	lin0811			FALSE	0.035	222.000	0.000	1.000		NA
159884	159885	lin0811	lin0812			TRUE	0.899	16.000	0.072	1.000		NA
159887	159888	lin0814	lin0815			TRUE	0.927	15.000	0.265	NA		NA
159888	159889	lin0815	lin0816			FALSE	0.259	112.000	0.220	NA		NA
159889	159890	lin0816	lin0817			TRUE	0.900	17.000	0.244	NA		NA
159892	159893	lin0819	lin0820			FALSE	0.271	111.000	0.265	NA		NA
159893	159894	lin0820	lin0821			TRUE	0.502	42.000	0.065	NA		NA
159894	159895	lin0821	lin0822			FALSE	0.058	197.000	0.013	1.000		NA
159895	159896	lin0822	lin0823			TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
159896	159897	lin0823	lin0824		nifJ	FALSE	0.101	156.000	0.032	NA		NA
159898	159899	lin0825	lin0826	fbp		FALSE	0.262	113.000	0.222	1.000		NA
159903	159904	lin0830	lin0831			FALSE	0.159	132.000	0.462	1.000	N	NA
159905	159906	lin0832	lin0833			FALSE	0.012	398.000	0.000	NA		NA
159906	159907	lin0833	lin0834			TRUE	0.963	-16.000	0.396	NA		NA
159907	159908	lin0834	lin0835			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
159910	159911	lin0837	lin0838			FALSE	0.011	256.000	0.000	NA	N	NA
159911	159912	lin0838	lin0839			FALSE	0.127	97.000	0.008	1.000	N	NA
159912	159913	lin0839	lin0840			FALSE	0.040	171.000	0.009	1.000	N	NA
159913	159914	lin0840	lin0841			TRUE	0.995	-7.000	0.414	0.056	Y	NA
159916	159917	lin0843	lin0844			FALSE	0.032	226.000	0.000	NA		NA
159917	159918	lin0844	lin0845			TRUE	0.362	82.000	0.297	NA		NA
159918	159919	lin0845	lin0846			TRUE	0.891	17.000	0.706	1.000	N	NA
159919	159920	lin0846	lin0847			TRUE	0.996	3.000	0.941	0.079	Y	NA
159920	159921	lin0847	lin0848		ddlA	FALSE	0.060	151.000	0.027	1.000	N	NA
159921	159922	lin0848	lin0849	ddlA	murF	TRUE	0.855	64.000	0.046	0.005	Y	NA
159922	159923	lin0849	lin0850	murF		TRUE	0.422	67.000	0.216	1.000		NA
159925	159926	lin0852	lin0853			TRUE	0.996	-3.000	0.733	0.036	Y	NA
159926	159927	lin0853	lin0854			TRUE	0.996	-13.000	0.711	0.036	Y	NA
159927	159928	lin0854	lin0855			TRUE	0.979	16.000	0.100	1.000	Y	NA
159928	159929	lin0855	lin0856			TRUE	0.961	2.000	0.300	NA		NA
159929	159930	lin0856	lin0857			TRUE	0.847	22.000	0.529	NA		NA
159930	159931	lin0857	lin0858			TRUE	0.993	-3.000	0.529	NA	Y	NA
159931	159932	lin0858	lin0859			FALSE	0.005	452.000	0.000	1.000	N	NA
159932	159933	lin0859	lin0860			FALSE	0.013	444.000	0.004	NA		NA
159935	159936	lin0862	lin0863			TRUE	0.879	17.000	0.074	NA		NA
159938	159939	lin0865	lin0866			TRUE	0.392	44.000	0.000	NA		NA
159939	159940	lin0866	lin0867			TRUE	0.931	-7.000	0.000	1.000		NA
159940	159941	lin0867	lin0868			TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
159943	159944	lin0870	lin0871			FALSE	0.018	208.000	0.000	1.000	N	NA
159944	159945	lin0871	lin0872			TRUE	0.951	15.000	0.600	0.027	N	NA
159945	159946	lin0872	lin0873			TRUE	0.996	1.000	0.733	0.027	Y	NA
159946	159947	lin0873	lin0874			TRUE	0.982	21.000	0.786	0.027	Y	NA
159947	159948	lin0874	lin0875			TRUE	0.951	23.000	0.440	1.000	Y	NA
159948	159949	lin0875	lin0876			TRUE	0.949	0.000	0.480	1.000	N	NA
159949	159950	lin0876	lin0877			TRUE	0.911	18.000	0.542	NA		NA
159950	1789933	lin0877	lin0878			TRUE	0.922	-21.000	0.000	NA		NA
1789933	159951	lin0878	lin0879			FALSE	0.153	115.000	0.000	NA		NA
159953	159954	lin0881	lin0882			TRUE	0.960	-7.000	0.216	NA		NA
159954	159955	lin0882	lin0883			FALSE	0.133	151.000	0.170	NA		NA
159955	159956	lin0883	lin0884			TRUE	0.891	2.000	0.017	1.000	N	NA
159956	159957	lin0884	lin0885			TRUE	0.766	19.000	0.093	1.000	N	NA
159957	159958	lin0885	lin0886			FALSE	0.036	206.000	0.108	1.000	N	NA
159958	159959	lin0886	lin0887			TRUE	0.958	4.000	0.260	0.064	N	NA
159959	159960	lin0887	lin0888		RsbR	FALSE	0.165	252.000	0.032	NA	Y	NA
159960	159961	lin0888	lin0889	RsbR	rsbS	TRUE	0.990	6.000	0.258	NA	Y	NA
159961	159962	lin0889	lin0890	rsbS	rsbT	TRUE	0.991	3.000	0.320	NA	Y	NA
159962	159963	lin0890	lin0891	rsbT	rsbU	TRUE	0.982	17.000	0.617	1.000	Y	NA
159963	159964	lin0891	lin0892	rsbU	rsbV	TRUE	0.494	150.000	0.440	1.000	Y	NA
159964	159965	lin0892	lin0893	rsbV	rsbW	TRUE	0.993	-16.000	0.714	1.000	Y	NA
159965	159966	lin0893	lin0894	rsbW	sigB	TRUE	0.957	-22.000	0.838	1.000	N	NA
159966	159967	lin0894	lin0895	sigB	rsbX	TRUE	0.961	1.000	0.243	1.000		NA
159967	159968	lin0895	lin0896	rsbX		FALSE	0.042	204.000	0.000	1.000		NA
159968	159969	lin0896	lin0897			FALSE	0.214	68.000	0.027	1.000	N	NA
159969	159970	lin0897	lin0898			TRUE	0.960	0.000	0.215	NA		NA
159970	398362	lin0898	lint12		tRNA-Ser	FALSE	0.121	131.000	0.000	NA		NA
398362	159971	lint12	lin0899	tRNA-Ser		FALSE	0.156	114.000	0.000	NA		NA
159971	159972	lin0899	lin0900			FALSE	0.152	142.000	0.123	NA		NA
159972	159973	lin0900	lin0901			FALSE	0.255	81.000	0.286	1.000	N	NA
159973	398363	lin0901	lint13		tRNA-Glu	FALSE	0.042	201.000	0.000	NA		NA
398363	398364	lint13	lint14	tRNA-Glu	tRNA-Asp	TRUE	0.551	27.000	0.000	NA		NA
398364	159974	lint14	lin0902	tRNA-Asp		FALSE	0.129	128.000	0.000	NA		NA
159974	159975	lin0902	lin0903			FALSE	0.207	117.000	0.061	NA		NA
159975	1789934	lin0903	lin0904			TRUE	0.921	-31.000	0.000	NA		NA
1789934	159976	lin0904	lin0905			FALSE	0.121	131.000	0.000	NA		NA
159976	159977	lin0905	lin0906			TRUE	0.462	36.000	0.000	1.000		NA
159977	159978	lin0906	lin0907			TRUE	0.398	29.000	0.006	1.000	N	NA
159980	159981	lin0909	lin0910			TRUE	0.964	3.000	0.474	NA		NA
159981	159982	lin0910	lin0911			FALSE	0.319	102.000	0.368	NA		NA
159982	159983	lin0911	lin0912			FALSE	0.268	115.000	0.310	NA		NA
159983	159984	lin0912	lin0913			FALSE	0.015	224.000	0.000	1.000	N	NA
159984	159985	lin0913	lin0914			FALSE	0.141	142.000	0.533	1.000	N	NA
159985	159986	lin0914	lin0915			TRUE	0.963	5.000	0.522	NA		NA
159986	1789935	lin0915	lin0916			TRUE	0.925	-13.000	0.000	NA		NA
1789935	159987	lin0916	lin0917			TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
159987	159988	lin0917	lin0918			TRUE	0.987	12.000	0.143	1.000	Y	NA
159988	159989	lin0918	lin0919			FALSE	0.237	73.000	0.100	1.000	N	NA
159989	159990	lin0919	lin0920			FALSE	0.020	291.000	0.000	1.000		NA
159990	159991	lin0920	lin0921			FALSE	0.213	122.000	0.139	NA		NA
159991	159992	lin0921	lin0922			TRUE	0.917	19.000	0.841	NA		NA
159992	159993	lin0922	lin0923			FALSE	0.257	89.000	0.026	NA		NA
159993	159994	lin0923	lin0924			FALSE	0.117	116.000	0.036	1.000	N	NA
159994	159995	lin0924	lin0925			TRUE	0.957	0.000	0.713	1.000	N	NA
159995	159996	lin0925	lin0926			TRUE	0.740	20.000	0.110	1.000	N	NA
159998	159999	lin0928	lin0929			FALSE	0.121	108.000	0.027	NA	N	NA
159999	160000	lin0929	lin0930			FALSE	0.212	120.000	0.100	NA		NA
160000	160001	lin0930	lin0931			TRUE	0.702	25.000	0.113	1.000		NA
398365	160003	lint15	lin0933	tRNA-Gly		FALSE	0.186	98.000	0.000	NA		NA
160003	160004	lin0933	lin0935			FALSE	0.088	543.000	0.000	0.025	Y	NA
160005	160006	lin0936	lin0937			FALSE	0.258	86.000	0.018	NA		NA
160006	160007	lin0937	lin0938			TRUE	0.913	13.000	0.016	NA		NA
160007	160008	lin0938	lin0939			FALSE	0.305	91.000	0.188	NA		NA
160008	1789936	lin0939	lin0940			TRUE	0.903	11.000	0.000	NA		NA
1789936	160009	lin0940	lin0941			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
160010	160011	lin0942	lin0943	fri		FALSE	0.030	235.000	0.000	NA		NA
160011	160012	lin0943	lin0944			FALSE	0.287	115.000	0.409	NA		NA
160012	160013	lin0944	lin0945			TRUE	0.957	10.000	0.481	NA		NA
160014	160015	lin0946	lin0947			TRUE	0.929	-3.000	0.162	1.000	N	NA
160017	160018	lin0949	lin0950			TRUE	0.853	20.000	0.222	NA		NA
160019	160020	lin0951	lin0952			TRUE	0.399	95.000	0.733	NA		NA
160020	160021	lin0952	lin0953			FALSE	0.058	219.000	0.167	NA		NA
160021	160022	lin0953	lin0954			TRUE	0.917	16.000	0.270	NA		NA
160022	160023	lin0954	lin0955			FALSE	0.042	189.000	0.083	NA	N	NA
160023	160024	lin0955	lin0956			TRUE	0.990	16.000	0.194	0.002	Y	NA
160024	160025	lin0956	lin0957			TRUE	0.827	16.000	0.075	1.000	N	NA
160025	160026	lin0957	lin0958			FALSE	0.123	135.000	0.245	1.000	N	NA
160026	160027	lin0958	lin0959			FALSE	0.149	114.000	0.149	1.000	N	NA
160027	160028	lin0959	lin0960			TRUE	0.992	14.000	0.156	0.002	Y	NA
160028	160029	lin0960	lin0961		lemA	FALSE	0.270	83.000	0.020	NA		NA
160029	160030	lin0961	lin0962	lemA		TRUE	0.770	23.000	0.222	NA		NA
160031	160032	lin0963	lin0964			FALSE	0.042	246.000	0.071	1.000		NA
160032	160033	lin0964	lin0965			TRUE	0.886	17.000	0.096	1.000		NA
160034	160035	lin0966	lin0967			TRUE	0.728	32.000	0.725	1.000		NA
160035	160036	lin0967	lin0968			TRUE	0.842	19.000	0.480	1.000	N	NA
160036	160037	lin0968	lin0969			FALSE	0.231	78.000	0.141	1.000	N	NA
160038	160039	lin0970	lin0971	dltD	dltC	TRUE	0.967	0.000	0.409	1.000		NA
160039	160040	lin0971	lin0972	dltC	dltB	TRUE	0.753	25.000	0.387	NA		NA
160040	160041	lin0972	lin0973	dltB	dltA	TRUE	0.947	-3.000	0.435	NA	N	NA
160043	160044	lin0975	lin0976			TRUE	0.890	17.000	0.159	NA		NA
160045	160046	lin0977	lin0978			FALSE	0.041	194.000	0.086	1.000	N	NA
160046	160047	lin0978	lin0979			TRUE	0.963	-3.000	0.860	1.000	N	NA
160049	160050	lin0981	lin0982			TRUE	0.880	13.000	0.106	1.000	N	NA
160050	160051	lin0982	lin0983			FALSE	0.111	137.000	0.216	NA	N	NA
160051	160052	lin0983	lin0984			TRUE	0.962	-3.000	0.235	NA		NA
160052	160053	lin0984	lin0985			TRUE	0.960	-3.000	0.189	NA		NA
160053	160054	lin0985	lin0986			TRUE	0.975	-7.000	0.849	1.000		NA
160054	160055	lin0986	lin0987			FALSE	0.273	82.000	0.014	1.000		NA
160055	160056	lin0987	lin0988			FALSE	0.116	110.000	0.017	1.000	N	NA
160056	160057	lin0988	lin0989			TRUE	0.457	53.000	0.625	1.000	N	NA
160057	160058	lin0989	lin0990			FALSE	0.010	281.000	0.000	1.000	N	NA
160058	160059	lin0990	lin0991			TRUE	0.756	105.000	0.381	0.077	Y	NA
160059	160060	lin0991	lin0992			TRUE	0.857	41.000	0.151	1.000	Y	NA
160061	160062	lin0993	lin0994			TRUE	0.674	30.000	0.303	NA		NA
160064	160065	lin0996	lin0997	clpE		FALSE	0.107	164.000	0.115	NA		NA
160067	160068	lin0999	lin1000			FALSE	0.279	104.000	0.214	NA		NA
160069	160070	lin1001	lin1002	ptsH		TRUE	0.994	0.000	0.140	0.026	Y	NA
160070	160071	lin1002	lin1003			FALSE	0.234	113.000	0.121	NA		NA
160071	160072	lin1003	lin1004			TRUE	0.923	13.000	0.058	NA		NA
160074	160075	lin1006	lin1007			FALSE	0.017	313.000	0.000	NA		NA
160075	160076	lin1007	lin1008			FALSE	0.045	217.000	0.017	NA		NA
160076	160077	lin1008	lin1009			TRUE	0.992	-3.000	0.214	1.000	Y	NA
160077	160078	lin1009	lin1010			TRUE	0.347	48.000	0.121	1.000	N	NA
160078	160079	lin1010	lin1011			TRUE	0.484	63.000	0.372	1.000		NA
160081	160082	lin1013	lin1014	gbuA	gbuB	TRUE	0.994	-7.000	0.042	0.006	Y	NA
160082	160083	lin1014	lin1015	gbuB	gbuC	TRUE	0.991	14.000	0.179	0.006	Y	NA
160083	160084	lin1015	lin1016	gbuC		FALSE	0.155	115.000	0.192	1.000	N	NA
160084	160085	lin1016	lin1017			FALSE	0.127	113.000	0.047	1.000	N	NA
160085	160086	lin1017	lin1018			FALSE	0.300	80.000	0.031	1.000		NA
160086	160087	lin1018	lin1019			FALSE	0.148	136.000	0.038	NA		NA
160087	160088	lin1019	lin1020			TRUE	0.973	-3.000	0.679	NA		NA
160088	160089	lin1020	lin1021			TRUE	0.997	-3.000	0.853	0.010	Y	NA
160089	160090	lin1021	lin1022			TRUE	0.792	19.000	0.194	1.000	N	NA
160090	160091	lin1022	lin1023			FALSE	0.151	145.000	0.184	NA		NA
160091	160092	lin1023	lin1024			TRUE	0.976	-3.000	0.900	NA		NA
160093	160094	lin1025	lin1026			FALSE	0.233	109.000	0.076	NA		NA
160094	160095	lin1026	lin1027			TRUE	0.961	7.000	0.576	NA		NA
160097	160098	lin1029	lin1030			FALSE	0.343	67.000	0.026	NA		NA
160098	160099	lin1030	lin1031			TRUE	0.941	-19.000	0.024	NA		NA
160099	160100	lin1031	lin1032			TRUE	0.951	3.000	0.103	1.000		NA
160101	160102	lin1033	lin1034			FALSE	0.152	95.000	0.036	1.000	N	NA
160102	160103	lin1034	lin1035			TRUE	0.994	-21.000	0.002	0.003	Y	NA
160103	160104	lin1035	lin1036			TRUE	0.995	-3.000	0.012	0.003	Y	NA
160104	160105	lin1036	lin1037			TRUE	0.996	-16.000	0.501	0.003	Y	NA
160105	160106	lin1037	lin1038			TRUE	0.993	13.000	0.175	0.003	Y	NA
160106	160107	lin1038	lin1039			TRUE	0.942	29.000	0.071	0.003	Y	NA
160108	160109	lin1040	lin1041			TRUE	0.986	12.000	0.044	1.000	Y	NA
160112	160113	lin1044	lin1045	pdhA	PdhB	TRUE	0.996	3.000	0.484	0.002	Y	NA
160113	160114	lin1045	lin1046	PdhB	pdhC	TRUE	0.791	111.000	0.883	0.057	Y	NA
160114	160115	lin1046	lin1047	pdhC	PdhD	TRUE	0.993	5.000	0.948	1.000	Y	NA
160115	160116	lin1047	lin1048	PdhD		FALSE	0.078	187.000	0.079	NA		NA
160116	160117	lin1048	lin1049			FALSE	0.196	129.000	0.158	NA		NA
160117	160118	lin1049	lin1050			TRUE	0.950	0.000	0.048	NA		NA
160118	160119	lin1050	lin1051			TRUE	0.820	21.000	0.145	NA		NA
160120	160121	lin1052	lin1053			FALSE	0.042	201.000	0.000	NA		NA
160122	160123	lin1054	lin1055			FALSE	0.035	192.000	0.024	1.000	N	NA
160123	160124	lin1055	lin1056			FALSE	0.069	182.000	0.010	1.000		NA
160126	160127	lin1058	lin1059			FALSE	0.115	173.000	0.300	NA		NA
160127	160128	lin1059	lin1060		pycA	FALSE	0.017	275.000	0.046	1.000	N	NA
160128	160129	lin1060	lin1061	pycA		FALSE	0.059	153.000	0.028	1.000	N	NA
160129	160130	lin1061	lin1062			FALSE	0.009	282.000	0.000	1.000	N	NA
160130	160131	lin1062	lin1063			TRUE	0.990	13.000	0.808	1.000	Y	NA
160131	160132	lin1063	lin1064			FALSE	0.024	188.000	0.000	1.000	N	NA
160134	160135	lin1066	lin1067			TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
160135	160136	lin1067	lin1068			FALSE	0.207	88.000	0.000	NA		NA
160136	160137	lin1068	lin1069			TRUE	0.975	-3.000	0.800	NA		NA
160139	160140	lin1071	lin1072			TRUE	0.943	-7.000	0.367	1.000	N	NA
160140	160141	lin1072	lin1073			FALSE	0.104	141.000	0.222	NA	N	NA
160141	160142	lin1073	lin1074			TRUE	0.992	0.000	0.250	NA	Y	NA
160142	160143	lin1074	lin1075			TRUE	0.992	13.000	0.069	0.001	Y	NA
160143	160144	lin1075	lin1076		tagD	TRUE	0.880	65.000	0.244	0.002	Y	NA
160144	160145	lin1076	lin1077	tagD		FALSE	0.124	118.000	0.064	1.000	N	NA
160145	160146	lin1077	lin1078			TRUE	0.993	12.000	0.194	0.003	Y	NA
160146	160147	lin1078	lin1079			TRUE	0.921	13.000	0.037	1.000		NA
160147	160148	lin1079	lin1080			TRUE	0.416	61.000	0.083	1.000		NA
160148	160149	lin1080	lin1081		guaA	FALSE	0.081	129.000	0.004	1.000	N	NA
160149	160150	lin1081	lin1082	guaA		FALSE	0.090	147.000	0.000	NA		NA
160150	160151	lin1082	lin1083			FALSE	0.099	142.000	0.000	NA		NA
160151	160152	lin1083	lin1084			FALSE	0.018	298.000	0.000	NA		NA
160152	160153	lin1084	lin1085			TRUE	0.973	1.000	0.800	NA		NA
160153	160154	lin1085	lin1086			TRUE	0.960	-3.000	0.200	NA		NA
160154	160155	lin1086	lin1087			TRUE	0.890	13.000	0.000	NA		NA
160155	160156	lin1087	lin1088			FALSE	0.337	86.000	0.250	NA		NA
160156	160157	lin1088	lin1089			TRUE	0.969	-10.000	0.583	NA		NA
160157	160158	lin1089	lin1090			FALSE	0.012	404.000	0.000	NA		NA
160158	160159	lin1090	lin1091			FALSE	0.042	202.000	0.000	NA		NA
160159	160160	lin1091	lin1092			FALSE	0.063	171.000	0.000	NA		NA
160160	160161	lin1092	lin1093			TRUE	0.955	-10.000	0.161	NA		NA
160162	160163	lin1094	lin1095			TRUE	0.949	-27.000	0.082	1.000		NA
160163	160164	lin1095	lin1096			TRUE	0.953	-3.000	0.057	1.000		NA
160165	160166	lin1097	lin1098			TRUE	0.996	2.000	0.576	0.009	Y	NA
160168	160169	lin1100	lin1101			FALSE	0.018	311.000	0.000	1.000		NA
160170	160171	lin1102	lin1103			TRUE	0.398	65.000	0.111	NA		NA
160171	160172	lin1103	lin1104			FALSE	0.193	128.000	0.111	NA		NA
160173	160174	lin1105	lin1106			FALSE	0.146	119.000	0.179	1.000	N	NA
160174	160175	lin1106	lin1107			TRUE	0.992	-3.000	0.289	NA	Y	NA
160175	160176	lin1107	lin1108			FALSE	0.102	148.000	0.316	NA	N	NA
160176	160177	lin1108	lin1109			TRUE	0.989	6.000	0.200	1.000	Y	NA
160177	160178	lin1109	lin1110			TRUE	0.691	25.000	0.100	NA		NA
160178	160179	lin1110	lin1111			TRUE	0.959	-7.000	0.205	NA		NA
160179	160180	lin1111	lin1112			TRUE	0.989	2.000	0.046	1.000	Y	NA
160180	160181	lin1112	lin1113			TRUE	0.898	1.000	0.023	1.000	N	NA
160183	160184	lin1115	lin1116			TRUE	0.928	-7.000	0.200	NA	N	NA
160184	160185	lin1116	lin1117			TRUE	0.780	19.000	0.150	1.000	N	NA
160185	160186	lin1117	lin1118			TRUE	0.807	38.000	0.455	0.001		NA
160186	160187	lin1118	lin1119			TRUE	0.969	17.000	0.759	0.001		NA
160187	160188	lin1119	lin1120			TRUE	0.597	45.000	0.500	NA		NA
160188	160189	lin1120	lin1121			TRUE	0.964	-3.000	0.295	NA		NA
160189	160190	lin1121	lin1122			TRUE	0.946	13.000	0.387	NA		NA
160190	160191	lin1122	lin1123			TRUE	0.938	26.000	0.645	NA	Y	NA
160191	160192	lin1123	lin1124			TRUE	0.991	4.000	0.364	NA	Y	NA
160192	160193	lin1124	lin1125			TRUE	0.772	21.000	0.364	NA	N	NA
160193	160194	lin1125	lin1126			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
160194	160195	lin1126	lin1127			TRUE	0.915	5.000	0.000	NA		NA
160195	160196	lin1127	lin1128			TRUE	0.927	15.000	0.268	NA		NA
160196	160197	lin1128	lin1129			TRUE	0.940	7.000	0.073	1.000		NA
160197	160198	lin1129	lin1130			TRUE	0.987	16.000	0.222	0.056	Y	NA
160198	160199	lin1130	lin1131		glpF	TRUE	0.606	28.000	0.407	1.000	N	NA
160199	160200	lin1131	lin1132	glpF	AckA2	FALSE	0.331	68.000	0.375	1.000	N	NA
160200	160201	lin1132	lin1133	AckA2	cobD	TRUE	0.901	14.000	0.346	1.000	N	NA
160201	160202	lin1133	lin1134	cobD		TRUE	0.937	-10.000	0.300	1.000	N	NA
160202	160203	lin1134	lin1135		pduQ	FALSE	0.004	591.000	0.000	1.000	N	NA
160203	160204	lin1135	lin1136	pduQ		FALSE	0.010	275.000	0.000	1.000	N	NA
160204	160205	lin1136	lin1137			TRUE	0.993	-7.000	0.388	1.000	Y	NA
160205	160206	lin1137	lin1138		eutA	FALSE	0.155	91.000	0.041	NA	N	NA
160206	160207	lin1138	lin1139	eutA	eutB	TRUE	0.864	42.000	0.286	NA	Y	NA
160207	160208	lin1139	lin1140	eutB	eutC	TRUE	0.982	20.000	0.119	0.001	Y	NA
160208	160209	lin1140	lin1141	eutC		TRUE	0.955	23.000	0.617	1.000	Y	NA
160209	160210	lin1141	lin1142			TRUE	0.900	15.000	0.468	NA	N	NA
160210	160211	lin1142	lin1143			TRUE	0.993	0.000	0.442	NA	Y	NA
160211	160212	lin1143	lin1144			TRUE	0.903	32.000	0.349	NA	Y	NA
160212	160213	lin1144	lin1145			FALSE	0.081	166.000	0.357	NA	N	NA
160213	160214	lin1145	lin1146			TRUE	0.916	13.000	0.452	NA	N	NA
160214	160215	lin1146	lin1147			TRUE	0.589	45.000	0.459	NA		NA
160215	160216	lin1147	lin1148			TRUE	0.938	15.000	0.487	NA		NA
160216	160217	lin1148	lin1149			TRUE	0.992	-7.000	0.385	NA	Y	NA
160217	160218	lin1149	lin1150			TRUE	0.893	16.000	0.552	NA	N	NA
160218	160219	lin1150	lin1151			TRUE	0.994	-7.000	0.759	1.000	Y	NA
160221	160222	lin1153	lin1154		cbiA	FALSE	0.015	332.000	0.000	NA		NA
160222	160223	lin1154	lin1155	cbiA		TRUE	0.995	-3.000	0.124	0.011	Y	NA
160223	160224	lin1155	lin1156			TRUE	0.991	13.000	0.107	0.011	Y	NA
160224	160225	lin1156	lin1157		cbiD	TRUE	0.988	16.000	0.168	0.011	Y	NA
160225	160226	lin1157	lin1158	cbiD	cbiE	TRUE	0.995	-3.000	0.126	0.011	Y	NA
160226	160227	lin1158	lin1159	cbiE		TRUE	0.996	-10.000	0.300	0.001	Y	NA
160227	160228	lin1159	lin1160		cbiF	TRUE	0.993	6.000	0.056	0.011	Y	NA
160228	160229	lin1160	lin1161	cbiF	cbiG	TRUE	0.995	-13.000	0.397	0.011	Y	NA
160229	160230	lin1161	lin1162	cbiG	cbiH	TRUE	0.996	-3.000	0.352	0.011	Y	NA
160230	160231	lin1162	lin1163	cbiH		TRUE	0.996	-3.000	0.423	0.011	Y	NA
160231	160232	lin1163	lin1164			TRUE	0.990	0.000	0.042	1.000	Y	NA
160232	160233	lin1164	lin1165		cbiK	TRUE	0.991	-3.000	0.084	1.000	Y	NA
160233	160234	lin1165	lin1166	cbiK	cbiL	TRUE	0.990	-7.000	0.048	1.000	Y	NA
160234	160235	lin1166	lin1167	cbiL		TRUE	0.370	81.000	0.058	0.011	N	NA
160235	160236	lin1167	lin1168			TRUE	0.997	-3.000	0.861	0.011	Y	NA
160236	160237	lin1168	lin1169		cbiQ	TRUE	0.997	-13.000	0.804	0.002	Y	NA
160237	160238	lin1169	lin1170	cbiQ		TRUE	0.993	13.000	0.152	0.002	Y	NA
160238	160239	lin1170	lin1171		cbiP	TRUE	0.906	0.000	0.033	1.000	N	NA
160239	160240	lin1171	lin1172	cbiP		TRUE	0.971	-36.000	0.021	0.011		NA
160241	160242	lin1173	lin1174			TRUE	0.941	15.000	0.545	NA		NA
160243	160244	lin1175	lin1176			FALSE	0.298	31.000	0.000	NA	N	NA
160244	160245	lin1176	lin1177			TRUE	0.967	3.000	0.600	NA		NA
160245	160246	lin1177	lin1178			FALSE	0.018	300.000	0.000	NA		NA
160246	160247	lin1178	lin1179			FALSE	0.180	297.000	0.000	0.004	Y	NA
160247	160248	lin1179	lin1180			FALSE	0.172	112.000	0.237	1.000	N	NA
160248	160249	lin1180	lin1181			TRUE	0.475	26.000	0.022	1.000	N	NA
160251	160252	lin1183	lin1184		pheS	FALSE	0.006	366.000	0.000	NA	N	NA
160252	160253	lin1184	lin1185	pheS	pheT	TRUE	0.997	0.000	0.574	0.001	Y	NA
160253	160254	lin1185	lin1186	pheT		FALSE	0.050	155.000	0.009	1.000	N	NA
160254	160255	lin1186	lin1187			TRUE	0.909	14.000	0.438	1.000	N	NA
160255	160256	lin1187	lin1188			FALSE	0.190	97.000	0.182	1.000	N	NA
160256	160257	lin1188	lin1189			TRUE	0.908	16.000	0.154	1.000		NA
160257	160258	lin1189	lin1190			FALSE	0.221	106.000	0.022	1.000		NA
160260	160261	lin1192	lin1193			TRUE	0.953	0.000	0.091	NA		NA
160261	160262	lin1193	lin1194			FALSE	0.274	93.000	0.066	1.000		NA
160262	160263	lin1194	lin1195			TRUE	0.938	23.000	0.114	1.000	Y	NA
160263	160264	lin1195	lin1196		trxA	FALSE	0.176	81.000	0.031	1.000	N	NA
160264	160265	lin1196	lin1197	trxA	uvrC	FALSE	0.172	76.000	0.008	1.000	N	NA
160265	160266	lin1197	lin1198	uvrC		FALSE	0.035	183.000	0.009	1.000	N	NA
160268	160269	lin1200	lin1201	racE		TRUE	0.864	13.000	0.048	1.000	N	NA
160269	160270	lin1201	lin1202			TRUE	0.927	4.000	0.262	1.000	N	NA
160270	160271	lin1202	lin1203			TRUE	0.550	38.000	0.085	1.000		NA
160271	398366	lin1203	lint16		tRNA-Arg	FALSE	0.162	111.000	0.000	NA		NA
398366	160272	lint16	lin1204	tRNA-Arg		FALSE	0.008	1279.000	0.000	NA		NA
160272	160273	lin1204	lin1205			FALSE	0.045	243.000	0.115	NA		NA
160274	160275	lin1206	lin1207			FALSE	0.269	118.000	0.364	NA		NA
160276	160277	lin1208	lin1209			FALSE	0.045	196.000	0.000	NA		NA
160277	160278	lin1209	lin1210			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
160278	160279	lin1210	lin1211			TRUE	0.908	8.000	0.000	NA		NA
160279	160280	lin1211	lin1212			FALSE	0.011	437.000	0.000	NA		NA
160282	160283	lin1214	lin1215			FALSE	0.059	454.000	0.000	1.000	Y	NA
160284	160285	lin1216	lin1217			TRUE	0.962	-3.000	0.239	NA		NA
160287	160288	lin1219	lin1220			FALSE	0.016	329.000	0.000	NA		NA
160290	160291	lin1222	lin1223			TRUE	0.978	19.000	0.650	1.000	Y	NA
160295	160296	lin1227	lin1228	proA	proB	TRUE	0.996	-16.000	0.281	0.002	Y	NA
160296	160297	lin1228	lin1229	proB		FALSE	0.137	136.000	0.015	NA		NA
160297	160298	lin1229	lin1230			TRUE	0.378	80.000	0.306	NA		NA
160298	160299	lin1230	lin1231			FALSE	0.017	317.000	0.000	1.000		NA
160299	160300	lin1231	lin1232			FALSE	0.246	77.000	0.000	NA		NA
160300	160301	lin1232	lin1233			TRUE	0.397	43.000	0.000	NA		NA
160301	160302	lin1233	lin1234			TRUE	0.685	17.000	0.000	1.000	N	NA
160303	160304	lin1235	lin1236			FALSE	0.246	77.000	0.000	NA		NA
160304	160305	lin1236	lin1237			TRUE	0.890	13.000	0.000	NA		NA
160305	160306	lin1237	lin1238			TRUE	0.976	-6.000	1.000	NA		NA
160306	160307	lin1238	lin1239			FALSE	0.084	150.000	0.000	NA		NA
160307	160308	lin1239	lin1240			FALSE	0.011	423.000	0.000	NA		NA
160308	160309	lin1240	lin1241			TRUE	0.925	-13.000	0.000	NA		NA
160309	160310	lin1241	lin1242			TRUE	0.940	4.000	0.040	NA		NA
160310	160311	lin1242	lin1243			TRUE	0.936	-61.000	0.011	1.000		NA
160311	160312	lin1243	lin1244			TRUE	0.916	12.000	0.005	NA		NA
160312	160313	lin1244	lin1245			TRUE	0.957	-124.000	0.286	NA		NA
160313	160314	lin1245	lin1246			FALSE	0.058	178.000	0.000	NA		NA
160314	160315	lin1246	lin1247			TRUE	0.920	-43.000	0.000	NA		NA
160315	160316	lin1247	lin1248			TRUE	0.923	-19.000	0.000	NA		NA
160316	160317	lin1248	lin1249			TRUE	0.749	22.000	0.018	NA		NA
160317	160318	lin1249	lin1250			TRUE	0.564	41.000	0.222	NA		NA
160318	160319	lin1250	lin1251			TRUE	0.968	-40.000	0.667	NA		NA
160319	160320	lin1251	lin1252			TRUE	0.951	12.000	0.400	NA		NA
160320	160321	lin1252	lin1253			TRUE	0.974	-3.000	0.714	NA		NA
160321	160322	lin1253	lin1254			FALSE	0.029	237.000	0.000	NA		NA
160322	160323	lin1254	lin1255			TRUE	0.940	13.000	0.000	0.061		NA
160323	160324	lin1255	lin1256			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
160326	160327	lin1258	lin1259			FALSE	0.242	78.000	0.000	NA		NA
160327	160328	lin1259	lin1260			TRUE	0.894	13.000	0.000	1.000		NA
160328	160329	lin1260	lin1261			FALSE	0.009	650.000	0.000	NA		NA
160329	160330	lin1261	lin1262			FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
160330	160331	lin1262	lin1263			TRUE	0.366	48.000	0.000	NA		NA
160331	160332	lin1263	lin1264			FALSE	0.124	130.000	0.000	NA		NA
160332	160333	lin1264	lin1265			TRUE	0.533	28.000	0.000	NA		NA
160333	160334	lin1265	lin1266			TRUE	0.344	53.000	0.000	NA		NA
160334	160335	lin1266	lin1267			TRUE	0.925	-13.000	0.000	NA		NA
160335	160336	lin1267	lin1268			TRUE	0.926	-10.000	0.000	NA		NA
160336	160337	lin1268	lin1269			TRUE	0.925	-13.000	0.000	NA		NA
160337	160338	lin1269	lin1270			FALSE	0.013	378.000	0.000	NA		NA
160338	160339	lin1270	lin1271			TRUE	0.851	16.000	0.000	NA		NA
160339	160340	lin1271	lin1272			TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
160340	160341	lin1272	lin1273			TRUE	0.899	12.000	0.000	NA		NA
160341	160342	lin1273	lin1274			TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
160342	160343	lin1274	lin1275			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
160343	160344	lin1275	lin1276			TRUE	0.955	10.000	0.400	NA		NA
160344	160345	lin1276	lin1277			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
160345	160346	lin1277	lin1278			TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
160346	160347	lin1278	lin1279			TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
160347	160348	lin1279	lin1280			FALSE	0.253	75.000	0.000	NA		NA
160348	1789937	lin1280	lin1281			TRUE	0.927	-9.000	0.000	NA		NA
1789937	160349	lin1281	lin1282			TRUE	0.851	16.000	0.000	NA		NA
160349	160350	lin1282	lin1283			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
160350	160351	lin1283	lin1284			TRUE	0.903	11.000	0.000	NA		NA
160351	160352	lin1284	lin1285			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
160352	160353	lin1285	lin1286			TRUE	0.926	15.000	0.250	NA		NA
160353	160354	lin1286	lin1287			TRUE	0.958	1.000	0.208	NA		NA
160354	160355	lin1287	lin1288			TRUE	0.962	11.000	0.708	NA		NA
160355	160356	lin1288	lin1289			TRUE	0.957	-3.000	0.118	NA		NA
160356	160357	lin1289	lin1290			TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
160357	160358	lin1290	lin1291			TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
160358	160359	lin1291	lin1292			TRUE	0.508	30.000	0.000	NA		NA
160359	160360	lin1292	lin1293			TRUE	0.497	31.000	0.000	NA		NA
160360	160361	lin1293	lin1294			TRUE	0.922	-24.000	0.000	NA		NA
160361	160362	lin1294	lin1295			FALSE	0.196	94.000	0.000	NA		NA
160362	160363	lin1295	lin1296			TRUE	0.962	3.000	0.400	NA		NA
160364	160365	lin1297	lin1298			TRUE	0.678	28.000	0.222	NA		NA
160365	160366	lin1298	lin1299			TRUE	0.950	14.000	0.667	NA		NA
160367	160368	lin1300	lin1301			TRUE	0.844	22.000	0.500	NA		NA
160368	160369	lin1301	lin1302			FALSE	0.013	371.000	0.000	NA		NA
160369	160370	lin1302	lin1303			FALSE	0.024	262.000	0.000	NA		NA
160370	160371	lin1303	lin1304			TRUE	0.935	16.000	0.600	NA		NA
160371	160372	lin1304	lin1305			FALSE	0.025	256.000	0.000	NA		NA
160372	160373	lin1305	lin1306		tig	FALSE	0.193	115.000	0.014	1.000		NA
160373	160374	lin1306	lin1307	tig	clpX	TRUE	0.443	185.000	0.033	0.003	Y	NA
160374	160375	lin1307	lin1308	clpX		FALSE	0.096	120.000	0.009	1.000	N	NA
160375	160376	lin1308	lin1309			TRUE	0.951	36.000	0.643	0.001	Y	NA
160376	160377	lin1309	lin1310			TRUE	0.844	103.000	0.769	0.001	Y	NA
160377	160378	lin1310	lin1311			TRUE	0.957	10.000	0.023	0.073		NA
160378	160379	lin1311	lin1312		rnhB	TRUE	0.959	-3.000	0.148	1.000		NA
160379	160380	lin1312	lin1313	rnhB		TRUE	0.489	135.000	0.037	1.000	Y	NA
160380	160381	lin1313	lin1314		topA	FALSE	0.178	270.000	0.238	1.000	Y	NA
160381	160382	lin1314	lin1315	topA	gid	FALSE	0.282	64.000	0.137	1.000	N	NA
160382	160383	lin1315	lin1316	gid	codV	FALSE	0.018	284.000	0.105	1.000	N	NA
160383	160384	lin1316	lin1317	codV	clpQ	TRUE	0.676	22.000	0.113	1.000	N	NA
160384	160385	lin1317	lin1318	clpQ	clpY	TRUE	0.989	14.000	0.752	1.000	Y	NA
160385	160386	lin1318	lin1319	clpY	codY	TRUE	0.718	21.000	0.131	1.000	N	NA
160386	160387	lin1319	lin1320	codY		FALSE	0.119	154.000	0.076	1.000		NA
160387	160388	lin1320	lin1321			TRUE	0.742	23.000	0.096	NA		NA
160388	160389	lin1321	lin1322			TRUE	0.949	3.000	0.105	NA		NA
160391	160392	lin1324	lin1325		parE	FALSE	0.081	176.000	0.030	1.000		NA
160392	160393	lin1325	lin1326	parE	parC	TRUE	0.997	-3.000	0.552	0.002	Y	NA
160393	160394	lin1326	lin1327	parC		FALSE	0.172	81.000	0.026	1.000	N	NA
160394	160395	lin1327	lin1328			FALSE	0.015	352.000	0.000	1.000		NA
160397	160398	lin1330	lin1331		glpD	FALSE	0.173	224.000	0.000	1.000	Y	NA
160398	160399	lin1331	lin1332	glpD	miaA	FALSE	0.087	125.000	0.004	1.000	N	NA
160399	160400	lin1332	lin1333	miaA		FALSE	0.228	122.000	0.192	1.000		NA
160400	160401	lin1333	lin1334			FALSE	0.210	108.000	0.014	1.000		NA
160401	160402	lin1334	lin1335			TRUE	0.952	-7.000	0.065	1.000		NA
160402	160403	lin1335	lin1336		glnR	FALSE	0.033	202.000	0.046	1.000	N	NA
160403	160404	lin1336	lin1337	glnR	glnA	FALSE	0.269	71.000	0.192	1.000	N	NA
160404	160405	lin1337	lin1338	glnA		FALSE	0.101	143.000	0.212	1.000	N	NA
160406	160407	lin1339	lin1340			TRUE	0.443	30.000	0.043	1.000	N	NA
160408	160409	lin1341	lin1342			TRUE	0.363	93.000	0.480	NA		NA
160409	160410	lin1342	lin1343		tkt	FALSE	0.182	147.000	0.440	NA		NA
160410	160411	lin1343	lin1344	tkt		FALSE	0.035	223.000	0.000	1.000		NA
160412	160413	lin1345	lin1346			TRUE	0.612	23.000	0.087	1.000	N	NA
160413	160414	lin1346	lin1347			TRUE	0.963	10.000	0.692	1.000		NA
160414	160415	lin1347	lin1348			TRUE	0.955	-10.000	0.123	1.000		NA
160415	160416	lin1348	lin1349			TRUE	0.950	-43.000	0.137	NA		NA
160417	160418	lin1350	lin1351	smbA	frr	TRUE	0.955	0.000	0.626	1.000	N	NA
160418	160419	lin1351	lin1352	frr		FALSE	0.042	230.000	0.409	1.000	N	NA
160419	160420	lin1352	lin1353		cdsA	TRUE	0.984	14.000	0.113	1.000	Y	NA
160420	160421	lin1353	lin1354	cdsA		TRUE	0.981	15.000	0.071	1.000	Y	NA
160421	160422	lin1354	lin1355			TRUE	0.917	14.000	0.568	1.000	N	NA
160422	160423	lin1355	lin1356		proS	TRUE	0.392	40.000	0.095	1.000	N	NA
160423	160424	lin1356	lin1357	proS	polC	FALSE	0.262	106.000	0.070	0.044	N	NA
160424	160425	lin1357	lin1358	polC		FALSE	0.078	182.000	0.059	NA		NA
160425	160426	lin1358	lin1359		nusA	TRUE	0.743	30.000	0.759	NA		NA
160426	160427	lin1359	lin1360	nusA		TRUE	0.984	15.000	0.323	NA	Y	NA
160427	160428	lin1360	lin1361			TRUE	0.944	-7.000	0.408	NA	N	NA
160428	160429	lin1361	lin1362		infB	TRUE	0.943	23.000	0.223	1.000	Y	NA
160429	160430	lin1362	lin1363	infB		TRUE	0.956	-3.000	0.102	NA		NA
160430	160431	lin1363	lin1364		rbfA	TRUE	0.902	16.000	0.113	NA		NA
160431	160432	lin1364	lin1365	rbfA	truB	TRUE	0.661	97.000	0.111	1.000	Y	NA
160432	160433	lin1365	lin1366	truB	ribC	FALSE	0.304	71.000	0.308	1.000	N	NA
160433	160434	lin1366	lin1367	ribC	rpsO	FALSE	0.101	137.000	0.119	1.000	N	NA
160434	160435	lin1367	lin1368	rpsO	pnpA	FALSE	0.214	248.000	0.335	1.000	Y	NA
160436	160437	lin1369	lin1370			FALSE	0.086	164.000	0.014	NA		NA
160437	160438	lin1370	lin1371			TRUE	0.610	28.000	0.031	NA		NA
160439	160440	lin1372	lin1373	rpmG		FALSE	0.276	56.000	0.045	1.000	N	NA
160440	160441	lin1373	lin1374			FALSE	0.246	99.000	0.037	1.000		NA
160441	160442	lin1374	lin1375			TRUE	0.944	13.000	0.347	NA		NA
160442	160443	lin1375	lin1376			TRUE	0.767	25.000	0.496	NA		NA
160443	160444	lin1376	lin1377			FALSE	0.090	171.000	0.058	NA		NA
160445	160446	lin1378	lin1379			TRUE	0.960	0.000	0.214	NA		NA
160446	160447	lin1379	lin1380			TRUE	0.954	-37.000	0.196	NA		NA
160447	160448	lin1380	lin1381			TRUE	0.957	-7.000	0.164	NA		NA
160448	160449	lin1381	lin1382			TRUE	0.992	-3.000	0.320	NA	Y	NA
160449	160450	lin1382	lin1383		comGB	TRUE	0.995	14.000	0.861	0.001	Y	NA
160450	160451	lin1383	lin1384	comGB	comGA	TRUE	0.993	-22.000	0.639	1.000	Y	NA
160452	160453	lin1385	lin1386			TRUE	0.989	16.000	0.092	0.002	Y	NA
160453	160454	lin1386	lin1387			TRUE	0.996	-3.000	0.316	0.001	Y	NA
160455	160456	lin1388	lin1389			TRUE	0.372	62.000	0.029	NA		NA
160456	160457	lin1389	lin1390			TRUE	0.923	14.000	0.140	NA		NA
160458	160459	lin1391	lin1392		efp	FALSE	0.173	103.000	0.160	1.000	N	NA
160459	160460	lin1392	lin1393	efp		FALSE	0.067	160.000	0.120	1.000	N	NA
160460	160461	lin1393	lin1394			TRUE	0.991	14.000	0.086	0.002	Y	NA
160461	160462	lin1394	lin1395			TRUE	0.962	3.000	0.373	NA		NA
160462	160463	lin1395	lin1396			TRUE	0.567	31.000	0.023	NA		NA
160463	160464	lin1396	lin1397		folD	FALSE	0.165	92.000	0.056	1.000	N	NA
160464	160465	lin1397	lin1398	folD		TRUE	0.750	19.000	0.058	1.000	N	NA
160465	160466	lin1398	lin1399			TRUE	0.996	-10.000	0.412	0.001	Y	NA
160466	160467	lin1399	lin1400			TRUE	0.912	3.000	0.100	1.000	N	NA
160467	160468	lin1400	lin1401		cspL	FALSE	0.040	199.000	0.108	1.000	N	NA
160468	160469	lin1401	lin1402	cspL	tktB	FALSE	0.046	165.000	0.015	1.000	N	NA
160469	160470	lin1402	lin1403	tktB		TRUE	0.791	19.000	0.189	1.000	N	NA
160470	160471	lin1403	lin1404			FALSE	0.041	191.000	0.064	1.000	N	NA
160471	160472	lin1404	lin1405		recN	TRUE	0.592	23.000	0.056	1.000	N	NA
160472	160473	lin1405	lin1406	recN		FALSE	0.085	130.000	0.013	1.000	N	NA
160473	160474	lin1406	lin1407			TRUE	0.579	137.000	0.562	1.000	Y	NA
160474	160475	lin1407	lin1408			TRUE	0.989	14.000	0.078	0.044	Y	NA
160475	160476	lin1408	lin1409			TRUE	0.937	25.000	0.414	1.000	Y	NA
160476	160477	lin1409	lin1410		BfmBAB	TRUE	0.992	17.000	0.897	0.002	Y	NA
160477	160478	lin1410	lin1411	BfmBAB		TRUE	0.951	31.000	0.882	0.054	Y	NA
160478	160479	lin1411	lin1412			FALSE	0.006	375.000	0.000	1.000	N	NA
160479	160480	lin1412	lin1413			FALSE	0.070	145.000	0.035	1.000	N	NA
160480	160481	lin1413	lin1414		lisR	FALSE	0.036	190.000	0.025	1.000	N	NA
160481	160482	lin1414	lin1415	lisR	lisK	TRUE	0.995	-3.000	0.438	0.071	Y	NA
160483	160484	lin1416	lin1417			TRUE	0.699	37.000	0.833	NA		NA
160484	160485	lin1417	lin1418			FALSE	0.303	86.000	0.115	NA		NA
160486	160487	lin1419	lin1420			TRUE	0.497	40.000	0.026	NA		NA
160489	160490	lin1422	lin1423			FALSE	0.113	151.000	0.042	NA		NA
160492	160493	lin1425	lin1426	tcsA		FALSE	0.016	434.000	0.048	1.000		NA
160493	160494	lin1426	lin1427			TRUE	0.968	-7.000	0.438	1.000		NA
160494	160495	lin1427	lin1428			TRUE	0.985	-3.000	0.720	0.033		NA
160495	160496	lin1428	lin1429			FALSE	0.215	118.000	0.077	1.000		NA
160496	160497	lin1429	lin1430			TRUE	0.986	-19.000	0.872	0.005		NA
160497	160498	lin1430	lin1431			FALSE	0.333	100.000	0.397	1.000		NA
160498	160499	lin1431	lin1432			TRUE	0.512	49.000	0.213	1.000		NA
160499	160500	lin1432	lin1433			FALSE	0.286	90.000	0.077	1.000		NA
160500	160501	lin1433	lin1434		cinA	TRUE	0.402	67.000	0.151	1.000		NA
160501	160502	lin1434	lin1435	cinA	recA	FALSE	0.036	270.000	0.083	1.000		NA
160502	160503	lin1435	lin1436	recA		FALSE	0.024	301.000	0.018	1.000		NA
160503	160504	lin1436	lin1437			FALSE	0.192	116.000	0.016	1.000		NA
160504	160505	lin1437	lin1438			TRUE	0.937	5.000	0.026	1.000		NA
160505	160506	lin1438	lin1439			TRUE	0.868	17.000	0.031	NA		NA
160506	160507	lin1439	lin1440		mutS	FALSE	0.212	110.000	0.031	NA		NA
160507	160508	lin1440	lin1441	mutS	mutL	TRUE	0.983	20.000	0.220	0.001	Y	NA
160508	160509	lin1441	lin1442	mutL		TRUE	0.682	20.000	0.020	1.000	N	NA
160509	160510	lin1442	lin1443		pflB	FALSE	0.005	426.000	0.000	1.000	N	NA
160510	160511	lin1443	lin1444	pflB	pflC	FALSE	0.230	78.000	0.135	1.000	N	NA
160513	160514	lin1446	lin1447			FALSE	0.152	132.000	0.024	NA		NA
160514	160515	lin1447	lin1448			TRUE	0.953	1.000	0.107	NA		NA
160515	160516	lin1448	lin1449			TRUE	0.437	40.000	0.214	1.000	N	NA
160517	160518	lin1450	lin1451			TRUE	0.789	19.000	0.000	NA		NA
160518	160519	lin1451	lin1452			FALSE	0.156	114.000	0.000	NA		NA
160519	160520	lin1452	lin1453			FALSE	0.063	171.000	0.000	NA		NA
160522	160523	lin1455	lin1456			FALSE	0.334	70.000	0.029	NA		NA
160523	160524	lin1456	lin1457			TRUE	0.852	19.000	0.068	1.000		NA
160524	160525	lin1457	lin1458			TRUE	0.425	63.000	0.152	1.000		NA
160525	160526	lin1458	lin1459			TRUE	0.608	28.000	0.021	1.000		NA
160527	160528	lin1460	lin1461			TRUE	0.972	-3.000	0.218	0.006	N	NA
160529	160530	lin1462	lin1463			FALSE	0.243	138.000	0.700	NA		NA
160530	160531	lin1463	lin1464		opuCD	TRUE	0.346	113.000	0.636	0.052	N	NA
160531	160532	lin1464	lin1465	opuCD	opuCC	TRUE	0.964	15.000	0.909	0.006	N	NA
160532	160533	lin1465	lin1466	opuCC	opuCB	TRUE	0.949	2.000	0.000	0.006	N	NA
160533	160534	lin1466	lin1467	opuCB	opuCA	TRUE	0.992	4.000	0.000	0.006	Y	NA
160534	160535	lin1467	lin1468	opuCA		FALSE	0.019	294.000	0.000	NA		NA
160535	160536	lin1468	lin1469			FALSE	0.027	248.000	0.000	NA		NA
160538	160539	lin1471	lin1472			TRUE	0.602	53.000	0.786	1.000		NA
160539	160540	lin1472	lin1473			FALSE	0.314	88.000	0.167	1.000		NA
160540	160541	lin1473	lin1474			TRUE	0.822	20.000	0.042	1.000		NA
160541	160542	lin1474	lin1475			TRUE	0.980	15.000	0.023	1.000	Y	NA
160542	160543	lin1475	lin1476			TRUE	0.986	12.000	0.091	1.000	Y	NA
160543	160544	lin1476	lin1477			FALSE	0.041	199.000	0.136	1.000	N	NA
160544	160545	lin1477	lin1478		sod	FALSE	0.122	130.000	0.169	1.000	N	NA
160546	160547	lin1479	lin1480			FALSE	0.049	215.000	0.033	NA		NA
160547	160548	lin1480	lin1481			TRUE	0.964	-9.000	0.338	NA		NA
160549	160550	lin1482	lin1483		zurR	FALSE	0.096	138.000	0.102	1.000	N	NA
160550	160551	lin1483	lin1484	zurR	zurM	TRUE	0.992	-19.000	0.480	1.000	Y	NA
160551	160552	lin1484	lin1485	zurM	zurA	TRUE	0.990	-25.000	0.130	1.000	Y	NA
160552	160553	lin1485	lin1486	zurA		FALSE	0.064	142.000	0.008	1.000	N	NA
160553	160554	lin1486	lin1487			TRUE	0.765	17.000	0.019	1.000	N	NA
160554	160555	lin1487	lin1488			TRUE	0.979	16.000	0.104	1.000	Y	NA
160555	160556	lin1488	lin1489			FALSE	0.077	179.000	0.032	NA		NA
160556	160557	lin1489	lin1490			TRUE	0.964	-3.000	0.283	NA		NA
160557	160558	lin1490	lin1491		rpoD	TRUE	0.417	68.000	0.239	NA		NA
160558	160559	lin1491	lin1492	rpoD	dnaG	FALSE	0.201	95.000	0.209	1.000	N	NA
160559	160560	lin1492	lin1493	dnaG		TRUE	0.813	20.000	0.033	NA		NA
160560	160561	lin1493	lin1494			FALSE	0.069	188.000	0.029	NA		NA
160561	160562	lin1494	lin1495		glyS	TRUE	0.520	35.000	0.013	NA		NA
160562	160563	lin1495	lin1496	glyS	glyQ	TRUE	0.997	-7.000	0.651	0.001	Y	NA
160563	160564	lin1496	lin1497	glyQ		FALSE	0.016	281.000	0.036	1.000	N	NA
160566	160567	lin1499	lin1500			TRUE	0.948	-3.000	0.019	1.000		NA
160567	160568	lin1500	lin1501			TRUE	0.550	25.000	0.090	1.000	N	NA
160568	160569	lin1501	lin1502			TRUE	0.951	-22.000	0.123	NA		NA
160569	160570	lin1502	lin1503			TRUE	0.893	17.000	0.182	NA		NA
160570	160571	lin1503	lin1504			TRUE	0.910	16.000	0.172	1.000		NA
160571	160572	lin1504	lin1505			FALSE	0.068	190.000	0.027	1.000		NA
160572	160573	lin1505	lin1506		rpsU	TRUE	0.909	20.000	0.150	0.028		NA
160573	160574	lin1506	lin1507	rpsU		FALSE	0.057	198.000	0.019	NA		NA
160574	160575	lin1507	lin1508			TRUE	0.959	1.000	0.227	NA		NA
160575	160576	lin1508	lin1509		dnaJ	FALSE	0.247	73.000	0.133	1.000	N	NA
160576	160577	lin1509	lin1510	dnaJ	dnaK	TRUE	0.641	143.000	0.196	0.003	Y	NA
160577	160578	lin1510	lin1511	dnaK	grpE	TRUE	0.936	34.000	0.224	0.006	Y	NA
160578	160579	lin1511	lin1512	grpE	hrcA	TRUE	0.439	42.000	0.286	1.000	N	NA
160579	160580	lin1512	lin1513	hrcA	hemN	FALSE	0.078	147.000	0.082	1.000	N	NA
160580	160581	lin1513	lin1514	hemN	lepA	FALSE	0.071	144.000	0.032	1.000	N	NA
160583	160584	lin1516	lin1517		comEC	TRUE	0.400	68.000	0.163	1.000		NA
160584	160585	lin1517	lin1518	comEC	comEB	TRUE	0.878	17.000	0.055	1.000		NA
160585	160586	lin1518	lin1519	comEB	comEA	FALSE	0.238	72.000	0.095	1.000	N	NA
160586	160587	lin1519	lin1520	comEA		FALSE	0.137	103.000	0.033	1.000	N	NA
160587	160588	lin1520	lin1521			TRUE	0.409	61.000	0.085	NA		NA
160588	160589	lin1521	lin1522			TRUE	0.947	5.000	0.149	NA		NA
160589	160590	lin1522	lin1523			TRUE	0.991	-13.000	0.199	1.000	Y	NA
160590	160591	lin1523	lin1524			TRUE	0.774	19.000	0.150	NA	N	NA
160591	160592	lin1524	lin1525			TRUE	0.916	0.000	0.089	NA	N	NA
160592	160593	lin1525	lin1526			TRUE	0.870	20.000	0.336	1.000		NA
160593	160594	lin1526	lin1527			TRUE	0.971	-3.000	0.555	1.000		NA
160596	160597	lin1529	lin1530			TRUE	0.436	51.000	0.041	NA		NA
160597	160598	lin1530	lin1531			TRUE	0.462	48.000	0.065	NA		NA
160598	160599	lin1531	lin1532		udk	FALSE	0.042	194.000	0.095	1.000	N	NA
160599	160600	lin1532	lin1533	udk		TRUE	0.951	-3.000	0.039	1.000		NA
160600	160601	lin1533	lin1534			TRUE	0.354	77.000	0.154	NA		NA
160603	160604	lin1536	lin1537			TRUE	0.937	16.000	0.651	NA		NA
160604	160605	lin1537	lin1538			TRUE	0.970	-3.000	0.537	NA		NA
160605	160606	lin1538	lin1539		alaS	FALSE	0.283	93.000	0.110	NA		NA
160606	160607	lin1539	lin1540	alaS		FALSE	0.008	308.000	0.000	1.000	N	NA
160607	160608	lin1540	lin1541			TRUE	0.991	9.000	0.565	1.000	Y	NA
160609	160610	lin1542	lin1543			TRUE	0.994	-3.000	0.586	1.000	Y	NA
160611	160612	lin1544	lin1545			TRUE	0.698	26.000	0.174	1.000		NA
160612	160613	lin1545	lin1546			TRUE	0.392	44.000	0.000	NA		NA
160613	160614	lin1546	lin1547			FALSE	0.148	118.000	0.000	NA		NA
160614	160615	lin1547	lin1548			TRUE	0.757	19.000	0.072	1.000	N	NA
160615	160616	lin1548	lin1549			FALSE	0.006	381.000	0.000	1.000	N	NA
160617	160618	lin1550	lin1551			FALSE	0.012	245.000	0.000	NA	N	NA
160618	160619	lin1551	lin1552			TRUE	0.891	14.000	0.259	1.000	N	NA
160619	160620	lin1552	lin1553			FALSE	0.169	150.000	0.407	NA		NA
160621	160622	lin1554	lin1555	aspS	hisS	TRUE	0.994	2.000	0.161	0.043	Y	NA
160624	160625	lin1557	lin1558		relA	TRUE	0.850	16.000	0.177	1.000	N	NA
160625	160626	lin1558	lin1559	relA	apt	FALSE	0.033	206.000	0.068	1.000	N	NA
160626	160627	lin1559	lin1560	apt		TRUE	0.921	-10.000	0.128	1.000	N	NA
160627	160628	lin1560	lin1561			FALSE	0.220	105.000	0.026	NA		NA
160628	160629	lin1561	lin1562			FALSE	0.252	97.000	0.048	NA		NA
160629	160630	lin1562	lin1563			FALSE	0.255	110.000	0.185	NA		NA
160630	160631	lin1563	lin1564			FALSE	0.124	141.000	0.013	NA		NA
160631	160632	lin1564	lin1565			TRUE	0.522	34.000	0.325	1.000	N	NA
160632	160633	lin1565	lin1566			TRUE	0.843	87.000	0.360	0.001	Y	NA
160633	160634	lin1566	lin1567		ruvB	TRUE	0.902	4.000	0.069	1.000	N	NA
160634	160635	lin1567	lin1568	ruvB	ruvA	TRUE	0.992	16.000	0.549	0.002	Y	NA
160635	160636	lin1568	lin1569	ruvA		FALSE	0.086	125.000	0.002	1.000	N	NA
160636	160637	lin1569	lin1570			FALSE	0.326	67.000	0.002	1.000		NA
160637	160638	lin1570	lin1571			FALSE	0.199	113.000	0.016	1.000		NA
160638	160639	lin1571	lin1572			FALSE	0.331	68.000	0.012	1.000		NA
160639	160640	lin1572	lin1573			FALSE	0.092	160.000	0.010	1.000		NA
160640	160641	lin1573	lin1574			FALSE	0.240	75.000	0.131	1.000	N	NA
160641	160642	lin1574	lin1575		rpmA	FALSE	0.006	367.000	0.000	1.000	N	NA
160642	160643	lin1575	lin1576	rpmA		TRUE	0.985	14.000	0.203	NA	Y	NA
160643	160644	lin1576	lin1577		rplU	TRUE	0.971	19.000	0.208	NA	Y	NA
160644	160645	lin1577	lin1578	rplU		TRUE	0.491	157.000	0.011	0.020	Y	NA
160645	160646	lin1578	lin1579		minD	FALSE	0.298	53.000	0.060	1.000	N	NA
160646	160647	lin1579	lin1580	minD	minC	TRUE	0.992	3.000	0.368	1.000	Y	NA
160647	160648	lin1580	lin1581	minC	mreD	FALSE	0.052	179.000	0.106	1.000	N	NA
160648	160649	lin1581	lin1582	mreD	mreC	TRUE	0.996	3.000	0.550	0.003	Y	NA
160649	160650	lin1582	lin1583	mreC	mreB	FALSE	0.312	86.000	0.689	1.000	N	NA
160650	160651	lin1583	lin1584	mreB		FALSE	0.005	453.000	0.000	1.000	N	NA
160651	160652	lin1584	lin1585		comC	TRUE	0.847	13.000	0.019	1.000	N	NA
160652	160653	lin1585	lin1586	comC	folC	FALSE	0.025	214.000	0.016	1.000	N	NA
160653	160654	lin1586	lin1587	folC	valS	FALSE	0.242	64.000	0.041	1.000	N	NA
160654	160655	lin1587	lin1588	valS	hemL	FALSE	0.007	322.000	0.000	1.000	N	NA
160655	160656	lin1588	lin1589	hemL	hemB	TRUE	0.993	13.000	0.126	0.002	Y	NA
160656	160657	lin1589	lin1590	hemB		TRUE	0.995	-3.000	0.042	0.002	Y	NA
160657	160658	lin1590	lin1591		hemC	TRUE	0.995	-3.000	0.020	0.002	Y	NA
160658	160659	lin1591	lin1592	hemC	hemA	TRUE	0.994	4.000	0.016	0.002	Y	NA
160659	160660	lin1592	lin1593	hemA		FALSE	0.167	128.000	0.020	1.000		NA
160660	160661	lin1593	lin1594		thrS	FALSE	0.210	106.000	0.010	1.000		NA
160661	160662	lin1594	lin1595	thrS	dnaI	FALSE	0.007	351.000	0.000	1.000	N	NA
160662	160663	lin1595	lin1596	dnaI	dnaB	TRUE	0.992	10.000	0.817	NA	Y	NA
160663	160664	lin1596	lin1597	dnaB		TRUE	0.901	6.000	0.109	NA	N	NA
160664	160665	lin1597	lin1598			FALSE	0.177	78.000	0.024	NA	N	NA
160665	160666	lin1598	lin1599		mutM	TRUE	0.797	17.000	0.066	1.000	N	NA
160666	160667	lin1599	lin1600	mutM	polA	TRUE	0.928	24.000	0.101	1.000	Y	NA
160667	160668	lin1600	lin1601	polA	citC	FALSE	0.043	166.000	0.008	1.000	N	NA
160668	160669	lin1601	lin1602	citC	citZ	TRUE	0.964	20.000	0.140	1.000	Y	NA
160669	160670	lin1602	lin1603	citZ		TRUE	0.528	37.000	0.039	NA		NA
160670	160671	lin1603	lin1604			FALSE	0.103	158.000	0.043	NA		NA
160671	160672	lin1604	lin1605		pykA	FALSE	0.212	120.000	0.082	1.000		NA
160672	160673	lin1605	lin1606	pykA		FALSE	0.264	282.000	0.261	0.005	Y	NA
160673	160674	lin1606	lin1607		accA	FALSE	0.016	285.000	0.047	1.000	N	NA
160674	160675	lin1607	lin1608	accA	accD	TRUE	0.996	-10.000	0.234	0.001	Y	NA
160675	160676	lin1608	lin1609	accD	dnaE	FALSE	0.047	216.000	0.003	0.059	N	NA
160676	160677	lin1609	lin1610	dnaE		FALSE	0.217	123.000	0.159	1.000		NA
160677	160678	lin1610	lin1611			TRUE	0.831	21.000	0.189	1.000		NA
160678	160679	lin1611	lin1612			TRUE	0.642	26.000	0.024	1.000		NA
160683	160684	lin1616	lin1617	ackA		TRUE	0.623	24.000	0.217	1.000	N	NA
160684	160685	lin1617	lin1618			FALSE	0.010	444.000	0.000	NA		NA
160685	160686	lin1618	lin1619			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
160686	160687	lin1619	lin1620			FALSE	0.145	120.000	0.000	NA		NA
160687	160688	lin1620	lin1621			TRUE	0.877	18.000	0.154	NA		NA
160688	160689	lin1621	lin1622			TRUE	0.963	-3.000	0.231	1.000		NA
160690	160691	lin1623	lin1624			TRUE	0.658	37.000	0.500	1.000		NA
160692	160693	lin1625	lin1626			TRUE	0.387	61.000	0.040	NA		NA
160693	160694	lin1626	lin1627			TRUE	0.830	20.000	0.087	NA		NA
160696	160697	lin1629	lin1630	argF	argD	TRUE	0.989	2.000	0.037	1.000	Y	NA
160697	160698	lin1630	lin1631	argD	argB	TRUE	0.993	-3.000	0.322	1.000	Y	NA
160698	160699	lin1631	lin1632	argB	argJ	TRUE	0.992	13.000	0.067	0.002	Y	NA
160699	160700	lin1632	lin1633	argJ	argC	TRUE	0.991	16.000	0.303	0.002	Y	NA
160700	160701	lin1633	lin1634	argC		FALSE	0.088	172.000	0.013	0.043	N	NA
160701	160702	lin1634	lin1635			TRUE	0.939	2.000	0.349	1.000	N	NA
160702	160703	lin1635	lin1636			FALSE	0.133	128.000	0.201	1.000	N	NA
160704	160705	lin1637	lin1638		rpsD	FALSE	0.022	212.000	0.005	NA	N	NA
160706	160707	lin1639	lin1640	tyrS	ccpA	FALSE	0.007	322.000	0.000	1.000	N	NA
160707	160708	lin1640	lin1641	ccpA	aroA	FALSE	0.020	235.000	0.017	1.000	N	NA
160708	160709	lin1641	lin1642	aroA		FALSE	0.035	219.000	0.000	NA		NA
160709	160710	lin1642	lin1643			TRUE	0.798	22.000	0.175	NA		NA
160712	160713	lin1645	lin1646		murC	FALSE	0.060	145.000	0.010	1.000	N	NA
160713	160714	lin1646	lin1647	murC		FALSE	0.036	296.000	0.017	0.004	N	NA
160714	160715	lin1647	lin1648		pheT	FALSE	0.029	309.000	0.143	1.000		NA
160715	160716	lin1648	lin1649	pheT		TRUE	0.961	6.000	0.511	NA		NA
160716	160717	lin1649	lin1650			TRUE	0.669	35.000	0.500	NA		NA
160717	160718	lin1650	lin1651			FALSE	0.234	114.000	0.140	NA		NA
160718	160719	lin1651	lin1652			TRUE	0.960	-7.000	0.224	NA		NA
160721	160722	lin1654	lin1655			FALSE	0.164	134.000	0.074	NA		NA
160722	160723	lin1655	lin1656			TRUE	0.423	62.000	0.117	1.000		NA
160723	160724	lin1656	lin1657			TRUE	0.946	7.000	0.154	1.000		NA
160724	160725	lin1657	lin1658			FALSE	0.019	204.000	0.000	1.000	N	NA
160725	160726	lin1658	lin1659			TRUE	0.933	3.000	0.297	1.000	N	NA
160726	160727	lin1659	lin1660		daaA	FALSE	0.015	224.000	0.000	1.000	N	NA
160727	160728	lin1660	lin1661	daaA		TRUE	0.652	113.000	0.347	1.000	Y	NA
160728	160729	lin1661	lin1662			FALSE	0.272	74.000	0.224	1.000	N	NA
160731	160732	lin1664	lin1665			TRUE	0.978	10.000	0.833	0.070		NA
160732	160733	lin1665	lin1666			TRUE	0.573	111.000	0.900	0.001		NA
160733	160734	lin1666	lin1667			TRUE	0.431	85.000	0.750	NA		NA
160734	160735	lin1667	lin1668		trpA	FALSE	0.326	71.000	0.024	NA		NA
160735	160736	lin1668	lin1669	trpA	trpB	TRUE	0.996	-7.000	0.248	0.001	Y	NA
160736	160737	lin1669	lin1670	trpB	trpF	TRUE	0.996	0.000	0.375	0.002	Y	NA
160737	160738	lin1670	lin1671	trpF	trpC	TRUE	0.996	-3.000	0.264	0.002	Y	NA
160738	160739	lin1671	lin1672	trpC	trpD	TRUE	0.992	-3.000	0.216	1.000	Y	NA
160739	160740	lin1672	lin1673	trpD	trpG	TRUE	0.988	-28.000	0.018	1.000	Y	NA
160740	160741	lin1673	lin1674	trpG	trpE	TRUE	0.996	-3.000	0.321	0.001	Y	NA
160742	160743	lin1675	lin1676			FALSE	0.303	124.000	0.750	NA		NA
160743	160744	lin1676	lin1677			TRUE	0.414	84.000	0.625	NA		NA
160744	160745	lin1677	lin1678			TRUE	0.971	-3.000	0.579	NA		NA
160746	160747	lin1679	lin1680			TRUE	0.895	0.000	0.019	NA	N	NA
160747	160748	lin1680	lin1681			TRUE	0.913	13.000	0.017	NA		NA
160748	160749	lin1681	lin1682		citB	FALSE	0.214	104.000	0.015	NA		NA
160749	160750	lin1682	lin1683	citB		FALSE	0.047	155.000	0.008	NA	N	NA
160750	160751	lin1683	lin1684			TRUE	0.785	24.000	0.500	NA		NA
160751	160752	lin1684	lin1685			TRUE	0.956	0.000	0.132	NA		NA
160752	160753	lin1685	lin1686		sbcC	TRUE	0.670	84.000	0.023	1.000	Y	NA
160753	160754	lin1686	lin1687	sbcC		TRUE	0.997	-3.000	0.669	0.003	Y	NA
160756	160757	lin1689	lin1690			FALSE	0.140	174.000	0.600	NA		NA
160757	160758	lin1690	lin1691			FALSE	0.195	81.000	0.083	NA	N	NA
160758	160759	lin1691	lin1692			TRUE	0.996	-16.000	0.911	0.008	Y	NA
160759	160760	lin1692	lin1693			FALSE	0.011	414.000	0.000	NA		NA
160760	160761	lin1693	lin1694			TRUE	0.938	16.000	0.667	NA		NA
160761	160762	lin1694	lin1695			FALSE	0.058	178.000	0.000	NA		NA
160762	160763	lin1695	lin1696			FALSE	0.012	387.000	0.000	NA		NA
160764	160765	lin1697	lin1698			TRUE	0.736	34.000	1.000	NA		NA
160765	160766	lin1698	lin1699			TRUE	0.962	5.000	0.500	NA		NA
160767	160768	lin1700	lin1701			TRUE	0.973	3.000	1.000	NA		NA
160768	160769	lin1701	lin1702			TRUE	0.963	0.000	0.286	NA		NA
160769	160770	lin1702	lin1703			TRUE	0.903	11.000	0.000	NA		NA
160770	160771	lin1703	lin1704			TRUE	0.789	19.000	0.000	NA		NA
160771	160772	lin1704	lin1705			TRUE	0.922	-24.000	0.000	NA		NA
160772	160773	lin1705	lin1706			TRUE	0.487	32.000	0.000	NA		NA
160773	160774	lin1706	lin1707			TRUE	0.508	30.000	0.000	NA		NA
160774	160775	lin1707	lin1708			TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
160775	160776	lin1708	lin1709			TRUE	0.732	21.000	0.000	NA		NA
160776	160777	lin1709	lin1710			TRUE	0.966	-10.000	0.444	NA		NA
160777	160778	lin1710	lin1711			TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
160778	160779	lin1711	lin1712			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
160779	160780	lin1712	lin1713			TRUE	0.962	1.000	0.300	NA		NA
160780	160781	lin1713	lin1714			TRUE	0.971	0.000	0.600	NA		NA
160781	160782	lin1714	lin1715			TRUE	0.961	0.000	0.250	NA		NA
160782	160783	lin1715	lin1716			TRUE	0.915	6.000	0.000	1.000		NA
160783	160784	lin1716	lin1717			TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
160784	160785	lin1717	lin1718			TRUE	0.965	-37.000	0.500	NA		NA
160785	160786	lin1718	lin1719			TRUE	0.621	53.000	1.000	NA		NA
160786	160787	lin1719	lin1720			TRUE	0.908	17.000	0.333	NA		NA
160787	160788	lin1720	lin1721			TRUE	0.953	5.000	0.250	NA		NA
160788	160789	lin1721	lin1722			TRUE	0.969	-10.000	0.600	NA		NA
160789	160790	lin1722	lin1723			TRUE	0.972	0.000	0.667	NA		NA
160790	160791	lin1723	lin1724			TRUE	0.972	0.000	0.667	NA		NA
160791	160792	lin1724	lin1725			TRUE	0.961	12.000	0.750	NA		NA
160792	160793	lin1725	lin1726			TRUE	0.751	23.000	0.136	NA		NA
160793	160794	lin1726	lin1727			TRUE	0.810	21.000	0.091	NA		NA
160794	160795	lin1727	lin1728			TRUE	0.953	0.000	0.087	NA		NA
160795	160796	lin1728	lin1729			TRUE	0.466	49.000	0.087	NA		NA
160796	160797	lin1729	lin1730			TRUE	0.958	-3.000	0.167	NA		NA
160797	160798	lin1730	lin1731			TRUE	0.964	-7.000	0.333	NA		NA
160798	160799	lin1731	lin1732			TRUE	0.945	14.000	0.500	NA		NA
160799	160800	lin1732	lin1733			TRUE	0.965	-22.000	0.500	NA		NA
160800	160801	lin1733	lin1734			TRUE	0.380	46.000	0.000	NA		NA
160801	160802	lin1734	lin1735			TRUE	0.533	28.000	0.000	NA		NA
160802	160803	lin1735	lin1736			FALSE	0.302	131.000	1.000	NA		NA
160803	160804	lin1736	lin1737			TRUE	0.643	48.000	1.000	NA		NA
160804	160805	lin1737	lin1738			FALSE	0.016	818.000	0.000	0.058		NA
160805	160806	lin1738	lin1739			TRUE	0.956	13.000	0.667	1.000		NA
160806	160807	lin1739	lin1740			TRUE	0.457	78.000	0.667	NA		NA
160807	160808	lin1740	lin1741			TRUE	0.944	12.000	0.250	NA		NA
160808	160809	lin1741	lin1742			FALSE	0.009	584.000	0.000	NA		NA
160809	160810	lin1742	lin1743			TRUE	0.941	13.000	0.000	0.057		NA
160810	160811	lin1743	lin1744			FALSE	0.029	237.000	0.000	NA		NA
160811	160812	lin1744	lin1745			TRUE	0.974	-3.000	0.714	NA		NA
160812	160813	lin1745	lin1746			TRUE	0.951	12.000	0.400	NA		NA
160813	160814	lin1746	lin1747			TRUE	0.968	-40.000	0.667	NA		NA
160814	160815	lin1747	lin1748			TRUE	0.564	41.000	0.222	NA		NA
160815	160816	lin1748	lin1749			TRUE	0.749	22.000	0.018	NA		NA
160816	160817	lin1749	lin1750			TRUE	0.923	-19.000	0.000	NA		NA
160817	160818	lin1750	lin1751			TRUE	0.920	-43.000	0.000	NA		NA
160818	160819	lin1751	lin1752			FALSE	0.058	178.000	0.000	NA		NA
160819	160820	lin1752	lin1753			TRUE	0.957	-124.000	0.286	NA		NA
160820	160821	lin1753	lin1754			TRUE	0.916	12.000	0.005	NA		NA
160821	160822	lin1754	lin1755			TRUE	0.936	-61.000	0.011	1.000		NA
160822	160823	lin1755	lin1756			TRUE	0.940	4.000	0.040	NA		NA
160823	160824	lin1756	lin1757			TRUE	0.920	-55.000	0.000	NA		NA
160824	160825	lin1757	lin1758			TRUE	0.809	18.000	0.000	NA		NA
160825	160826	lin1758	lin1759			FALSE	0.058	178.000	0.000	NA		NA
160826	160827	lin1759	lin1760			FALSE	0.009	627.000	0.000	NA		NA
160827	160828	lin1760	lin1761			FALSE	0.263	72.000	0.000	NA		NA
160829	160830	lin1762	lin1763			TRUE	0.439	23.000	0.000	NA	N	NA
160830	160831	lin1763	lin1764			TRUE	0.453	36.000	0.000	NA		NA
160831	160832	lin1764	lin1765			FALSE	0.222	82.000	0.000	NA		NA
160833	160834	lin1766	lin1767	tsf	rpsB	TRUE	0.790	80.000	0.748	1.000	Y	NA
160834	160835	lin1767	lin1768	rpsB		FALSE	0.046	195.000	0.000	NA		NA
160835	160836	lin1768	lin1769		leuS	FALSE	0.139	132.000	0.002	NA		NA
160837	160838	lin1770	lin1771			TRUE	0.968	-3.000	0.408	1.000		NA
160839	160840	lin1772	lin1773	ansB	metK	FALSE	0.099	137.000	0.108	1.000	N	NA
160842	160843	lin1775	lin1776			TRUE	0.891	17.000	0.167	NA		NA
160843	160844	lin1776	lin1777			TRUE	0.508	51.000	0.250	NA		NA
160845	160846	lin1778	lin1779			FALSE	0.107	149.000	0.007	1.000		NA
160847	160848	lin1780	lin1781	menE	menB	TRUE	0.944	16.000	0.193	0.001	N	NA
160848	160849	lin1781	lin1782	menB		TRUE	0.964	-3.000	0.280	1.000		NA
160849	160850	lin1782	lin1783		menD	TRUE	0.963	2.000	0.355	1.000		NA
160850	160851	lin1783	lin1784	menD	menF	TRUE	0.991	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
160853	160854	lin1786	lin1787			TRUE	0.991	-3.000	0.162	1.000	Y	NA
160854	160855	lin1787	lin1788			TRUE	0.997	-7.000	0.600	0.001	Y	NA
160855	160856	lin1788	lin1789			TRUE	0.943	22.000	0.017	1.000	Y	NA
160856	160857	lin1789	lin1790			FALSE	0.008	308.000	0.000	1.000	N	NA
160857	398416	lin1790	lint17		tRNA-Glu	FALSE	0.295	64.000	0.000	NA		NA
398416	398415	lint17	lint18	tRNA-Glu	tRNA-Ser	TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
398415	398414	lint18	lint19	tRNA-Ser	tRNA-Asn	TRUE	0.443	37.000	0.000	NA		NA
398414	398413	lint19	lint20	tRNA-Asn	tRNA-Ile	TRUE	0.910	7.000	0.000	NA		NA
398413	398412	lint20	lint21	tRNA-Ile	tRNA-Gly	TRUE	0.551	27.000	0.000	NA		NA
398412	398411	lint21	lint22	tRNA-Gly	tRNA-His	TRUE	0.646	23.000	0.000	NA		NA
398411	398410	lint22	lint23	tRNA-His	tRNA-Phe	TRUE	0.551	27.000	0.000	NA		NA
398410	398409	lint23	lint24	tRNA-Phe	tRNA-Asp	TRUE	0.915	5.000	0.000	NA		NA
398409	398408	lint24	lint25	tRNA-Asp	tRNA-Met	TRUE	0.915	5.000	0.000	NA		NA
398408	398407	lint25	lint26	tRNA-Met	tRNA-Ser	TRUE	0.397	43.000	0.000	NA		NA
398407	398406	lint26	lint27	tRNA-Ser	tRNA-Met	TRUE	0.646	23.000	0.000	NA		NA
398406	398405	lint27	lint28	tRNA-Met	tRNA-Met	TRUE	0.899	12.000	0.000	NA		NA
398405	398404	lint28	lint29	tRNA-Met	tRNA-Ala	FALSE	0.334	55.000	0.000	NA		NA
398404	398403	lint29	lint30	tRNA-Ala	tRNA-Pro	TRUE	0.759	20.000	0.000	NA		NA
398403	398402	lint30	lint31	tRNA-Pro	tRNA-Arg	TRUE	0.903	11.000	0.000	NA		NA
398402	398401	lint31	lint32	tRNA-Arg	tRNA-Leu	TRUE	0.906	10.000	0.000	NA		NA
398401	398400	lint32	lint33	tRNA-Leu	tRNA-Gly	TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
398400	398399	lint33	lint34	tRNA-Gly	tRNA-Leu	TRUE	0.851	16.000	0.000	NA		NA
398399	398398	lint34	lint35	tRNA-Leu	tRNA-Lys	TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
398398	398397	lint35	lint36	tRNA-Lys	tRNA-Thr	TRUE	0.412	41.000	0.000	NA		NA
398397	398396	lint36	lint37	tRNA-Thr	tRNA-Val	TRUE	0.907	9.000	0.000	NA		NA
398396	1789938	lint37	linr07	tRNA-Val		TRUE	0.827	17.000	0.000	NA		NA
1789938	1789939	linr07	linr08			FALSE	0.227	81.000	0.000	NA		NA
1789939	1789940	linr08	linr09			FALSE	0.027	246.000	0.000	NA		NA
1789940	160858	linr09	lin1791			FALSE	0.010	453.000	0.000	NA		NA
160858	160859	lin1791	lin1792			FALSE	0.210	83.000	0.146	1.000	N	NA
160860	160861	lin1793	lin1794	gsaB		FALSE	0.249	106.000	0.102	NA		NA
160862	160863	lin1795	lin1796			FALSE	0.065	155.000	0.088	NA	N	NA
160863	160864	lin1796	lin1797			TRUE	0.877	4.000	0.010	1.000	N	NA
160866	160867	lin1799	lin1800			TRUE	0.919	12.000	0.013	NA		NA
160867	160868	lin1800	lin1801			TRUE	0.940	2.000	0.015	NA		NA
160870	160871	lin1803	lin1804			TRUE	0.658	26.000	0.059	NA		NA
160874	160875	lin1807	lin1808			TRUE	0.714	28.000	0.400	NA		NA
160876	160877	lin1809	lin1810			TRUE	0.872	21.000	0.579	NA		NA
160877	160878	lin1810	lin1811			FALSE	0.135	71.000	0.000	NA	N	NA
160878	1789941	lin1811	lin1812			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
1789941	160879	lin1812	lin1813			TRUE	0.922	-21.000	0.000	NA		NA
160879	160880	lin1813	lin1814			TRUE	0.973	17.000	0.041	1.000	Y	NA
160880	160881	lin1814	lin1815			FALSE	0.011	267.000	0.000	1.000	N	NA
160881	160882	lin1815	lin1816			FALSE	0.262	65.000	0.090	1.000	N	NA
160886	160887	lin1820	lin1821			FALSE	0.122	129.000	0.156	1.000	N	NA
160888	160889	lin1822	lin1823			FALSE	0.131	138.000	0.355	1.000	N	NA
160889	160890	lin1823	lin1824			TRUE	0.681	103.000	0.323	1.000	Y	NA
160890	160891	lin1824	lin1825			FALSE	0.016	220.000	0.000	1.000	N	NA
160891	398367	lin1825	lint38		tRNA-Arg	FALSE	0.162	111.000	0.000	NA		NA
160894	160895	lin1828	lin1829			FALSE	0.032	232.000	0.000	1.000		NA
160895	160896	lin1829	lin1830			TRUE	0.870	22.000	0.800	1.000		NA
160896	160897	lin1830	lin1831			TRUE	0.890	70.000	1.000	0.023	Y	NA
160897	160898	lin1831	lin1832			FALSE	0.137	158.000	0.167	0.033	N	NA
160898	160899	lin1832	lin1833			TRUE	0.635	135.000	0.026	0.004	Y	NA
160899	160900	lin1833	lin1834			TRUE	0.489	43.000	0.052	NA		NA
160900	160901	lin1834	lin1835			TRUE	0.952	-7.000	0.071	NA		NA
160901	160902	lin1835	lin1836			TRUE	0.915	-7.000	0.071	1.000	N	NA
160902	160903	lin1836	lin1837			FALSE	0.229	121.000	0.182	1.000		NA
160903	160904	lin1837	lin1838			TRUE	0.459	60.000	0.205	1.000		NA
160904	160905	lin1838	lin1839			TRUE	0.404	48.000	0.293	1.000	N	NA
160905	160906	lin1839	lin1840			TRUE	0.992	-3.000	0.293	1.000	Y	NA
160907	160908	lin1841	lin1842			TRUE	0.891	61.000	0.660	0.031	Y	NA
160908	160909	lin1842	lin1843			TRUE	0.982	18.000	0.120	0.049	Y	NA
160910	160911	lin1844	lin1845			TRUE	0.992	15.000	0.222	0.001	Y	NA
160913	160914	lin1847	lin1848			TRUE	0.971	3.000	0.091	0.051		NA
160914	160915	lin1848	lin1849			FALSE	0.141	92.000	0.015	1.000	N	NA
160915	160916	lin1849	lin1850			TRUE	0.990	2.000	0.131	1.000	Y	NA
160916	160917	lin1850	lin1851			TRUE	0.988	11.000	0.136	1.000	Y	NA
160917	160918	lin1851	lin1852			FALSE	0.005	400.000	0.000	1.000	N	NA
160918	160919	lin1852	lin1853		adeC	TRUE	0.635	22.000	0.040	1.000	N	NA
160919	160920	lin1853	lin1854	adeC		TRUE	0.796	21.000	0.045	NA		NA
160920	160921	lin1854	lin1855			TRUE	0.814	21.000	0.104	NA		NA
160921	160922	lin1855	lin1856			FALSE	0.242	72.000	0.104	1.000	N	NA
160922	160923	lin1856	lin1857			TRUE	0.481	62.000	0.333	1.000		NA
160923	160924	lin1857	lin1859			TRUE	0.969	-43.000	0.667	1.000		NA
160924	160925	lin1859	lin1860			FALSE	0.194	130.000	0.167	NA		NA
160927	160928	lin1862	lin1863			FALSE	0.015	343.000	0.000	NA		NA
160928	160929	lin1863	lin1864			TRUE	0.712	24.000	0.103	NA		NA
160929	160930	lin1864	lin1865			FALSE	0.138	148.000	0.132	NA		NA
160930	160931	lin1865	lin1866		gatB	FALSE	0.075	142.000	0.034	1.000	N	NA
160931	160932	lin1866	lin1867	gatB	gatA	TRUE	0.995	12.000	0.492	0.001	Y	NA
160932	160933	lin1867	lin1868	gatA	gatC	TRUE	0.973	24.000	0.643	0.001	Y	NA
160933	160934	lin1868	lin1869	gatC		FALSE	0.166	124.000	0.013	NA		NA
160934	160935	lin1869	lin1870			TRUE	0.944	-3.000	0.010	NA		NA
160935	160936	lin1870	lin1871		pcrA	TRUE	0.956	24.000	0.103	0.013	Y	NA
160936	160937	lin1871	lin1872	pcrA		TRUE	0.380	65.000	0.054	1.000		NA
160939	160940	lin1874	lin1875			TRUE	0.849	19.000	0.068	NA		NA
160940	160941	lin1875	lin1876		purD	FALSE	0.133	138.000	0.011	1.000		NA
160941	160942	lin1876	lin1877	purD	purH	TRUE	0.919	27.000	0.238	1.000	Y	NA
160942	160943	lin1877	lin1878	purH	purN	TRUE	0.990	6.000	0.225	1.000	Y	NA
160943	160944	lin1878	lin1879	purN	purM	TRUE	0.996	-3.000	0.238	0.002	Y	NA
160944	160945	lin1879	lin1880	purM	purF	TRUE	0.972	19.000	0.248	1.000	Y	NA
160945	160946	lin1880	lin1881	purF	purQ	TRUE	0.991	-15.000	0.223	1.000	Y	NA
160946	160947	lin1881	lin1882	purQ	purL	TRUE	0.996	-7.000	0.346	0.001	Y	NA
160947	160948	lin1882	lin1883	purL		TRUE	0.996	4.000	0.656	0.001	Y	NA
160948	160949	lin1883	lin1884		purC	TRUE	0.990	12.000	0.460	1.000	Y	NA
160949	160950	lin1884	lin1885	purC	purB	TRUE	0.701	81.000	0.072	1.000	Y	NA
160950	160951	lin1885	lin1886	purB	purK	TRUE	0.963	19.000	0.010	1.000	Y	NA
160951	160952	lin1886	lin1887	purK	purE	TRUE	0.995	-7.000	0.011	0.001	Y	NA
160952	160953	lin1887	lin1888	purE		FALSE	0.037	214.000	0.000	NA		NA
160953	1789942	lin1888	linr10			FALSE	0.095	144.000	0.000	NA		NA
1789942	1789943	linr10	linr11			FALSE	0.227	81.000	0.000	NA		NA
1789943	1789944	linr11	linr12			FALSE	0.027	246.000	0.000	NA		NA
1789944	160954	linr12	lin1889			FALSE	0.015	337.000	0.000	NA		NA
160955	160956	lin1890	lin1891			TRUE	0.536	51.000	0.367	NA		NA
160957	160958	lin1892	lin1893			TRUE	0.458	58.000	0.200	NA		NA
160960	160961	lin1895	lin1896	rplT	rpmI	TRUE	0.942	40.000	0.928	0.018	Y	NA
160961	160962	lin1896	lin1897	rpmI	infC	TRUE	0.964	22.000	0.652	1.000	Y	NA
160962	160963	lin1897	lin1898	infC		FALSE	0.019	295.000	0.000	1.000		NA
160965	160966	lin1900	lin1901		rplS	FALSE	0.086	102.000	0.000	NA	N	NA
160967	160968	lin1902	lin1903			TRUE	0.955	0.000	0.102	1.000		NA
160968	160969	lin1903	lin1904			TRUE	0.812	21.000	0.080	1.000		NA
160970	160971	lin1905	lin1906		trmD	TRUE	0.825	19.000	0.012	NA		NA
160971	160972	lin1906	lin1907	trmD		TRUE	0.994	0.000	0.672	1.000	Y	NA
160972	160973	lin1907	lin1908			TRUE	0.932	10.000	0.041	NA		NA
160973	160974	lin1908	lin1909			TRUE	0.603	28.000	0.024	NA		NA
160974	160975	lin1909	lin1910			FALSE	0.197	110.000	0.005	1.000		NA
160975	160976	lin1910	lin1911		rpsP	TRUE	0.914	17.000	0.385	1.000		NA
160976	160977	lin1911	lin1912	rpsP		FALSE	0.216	103.000	0.009	1.000		NA
160977	160978	lin1912	lin1913			TRUE	0.419	74.000	0.316	1.000		NA
160978	160979	lin1913	lin1914			FALSE	0.010	490.000	0.000	1.000		NA
160979	160980	lin1914	lin1915		ffh	FALSE	0.063	142.000	0.006	1.000	N	NA
160980	160981	lin1915	lin1916	ffh		TRUE	0.933	13.000	0.151	1.000		NA
160981	160982	lin1916	lin1917			FALSE	0.229	113.000	0.081	1.000		NA
160982	160983	lin1917	lin1918		smc	TRUE	0.864	15.000	0.165	1.000	N	NA
160983	160984	lin1918	lin1919	smc	rncS	TRUE	0.627	23.000	0.120	1.000	N	NA
160984	160985	lin1919	lin1920	rncS	acpA	FALSE	0.106	198.000	0.068	0.001	N	NA
160985	160986	lin1920	lin1921	acpA	fabG	TRUE	0.757	107.000	0.100	0.004	Y	NA
160986	160987	lin1921	lin1922	fabG	fabD	TRUE	0.994	4.000	0.149	0.004	Y	NA
160987	160988	lin1922	lin1923	fabD	plsX	TRUE	0.995	-7.000	0.106	0.004	Y	NA
160988	160989	lin1923	lin1924	plsX		TRUE	0.660	21.000	0.035	NA	N	NA
160989	160990	lin1924	lin1925			FALSE	0.058	181.000	0.225	NA	N	NA
160990	160991	lin1925	lin1926			TRUE	0.937	-7.000	0.265	1.000	N	NA
160991	160992	lin1926	lin1927			TRUE	0.632	147.000	0.147	0.001	Y	NA
160992	160993	lin1927	lin1928			TRUE	0.512	39.000	0.029	1.000		NA
160993	160994	lin1928	lin1929			TRUE	0.942	15.000	0.567	NA		NA
160996	160997	lin1931	lin1932			FALSE	0.278	66.000	0.166	1.000	N	NA
160997	160998	lin1932	lin1933			TRUE	0.956	3.000	0.213	1.000		NA
160998	160999	lin1933	lin1934			TRUE	0.852	20.000	0.196	1.000		NA
160999	161000	lin1934	lin1935			TRUE	0.994	-3.000	0.704	1.000	Y	NA
161000	161001	lin1935	lin1936			TRUE	0.846	15.000	0.074	1.000	N	NA
161001	161002	lin1936	lin1937		fmt	TRUE	0.992	1.000	0.305	1.000	Y	NA
161002	161003	lin1937	lin1938	fmt	priA	TRUE	0.851	14.000	0.052	1.000	N	NA
161003	161004	lin1938	lin1939	priA		TRUE	0.905	5.000	0.099	1.000	N	NA
161004	161005	lin1939	lin1940			FALSE	0.080	154.000	0.192	1.000	N	NA
161005	161006	lin1940	lin1941			TRUE	0.949	0.000	0.471	1.000	N	NA
161006	161007	lin1941	lin1942			TRUE	0.879	19.000	0.276	NA		NA
161008	161009	lin1943	lin1944			FALSE	0.256	88.000	0.023	NA		NA
161010	161011	lin1945	lin1946	pyrE	pyrF	TRUE	0.991	-3.000	0.133	1.000	Y	NA
161011	161012	lin1946	lin1947	pyrF	pyrD	TRUE	0.996	-3.000	0.154	0.001	Y	NA
161012	161013	lin1947	lin1948	pyrD	pyrDII	TRUE	0.955	-3.000	0.592	1.000	N	NA
161013	161014	lin1948	lin1949	pyrDII	pyrAB	TRUE	0.633	23.000	0.147	1.000	N	NA
161014	161015	lin1949	lin1950	pyrAB	pyrAa	TRUE	0.996	-7.000	0.117	0.001	Y	NA
161015	161016	lin1950	lin1951	pyrAa	pyrC	TRUE	0.991	-3.000	0.155	1.000	Y	NA
161016	161017	lin1951	lin1952	pyrC	pyrB	TRUE	0.992	-12.000	0.452	1.000	Y	NA
161017	161018	lin1952	lin1953	pyrB	pyrP	TRUE	0.710	79.000	0.064	1.000	Y	NA
161018	161019	lin1953	lin1954	pyrP	pyrR	TRUE	0.715	129.000	0.140	0.001	Y	NA
161020	161021	lin1955	lin1956			FALSE	0.288	126.000	0.667	NA		NA
161022	161023	lin1957	lin1958		lsp	TRUE	0.893	0.000	0.011	1.000	N	NA
161023	161024	lin1958	lin1959	lsp		TRUE	0.436	82.000	0.087	0.067		NA
161026	161027	lin1961	lin1962			TRUE	0.992	-3.000	0.173	1.000	Y	NA
161027	161028	lin1962	lin1963			TRUE	0.993	3.000	0.174	0.099	Y	NA
161028	161029	lin1963	lin1964			FALSE	0.078	154.000	0.174	1.000	N	NA
161029	161030	lin1964	lin1965			TRUE	0.452	39.000	0.240	1.000	N	NA
161030	161031	lin1965	lin1966			FALSE	0.079	153.000	0.175	1.000	N	NA
161031	161032	lin1966	lin1967			TRUE	0.993	13.000	0.088	0.001	Y	NA
161032	161033	lin1967	lin1968			TRUE	0.931	15.000	0.333	NA		NA
161033	161034	lin1968	lin1969			FALSE	0.261	125.000	0.458	NA		NA
161034	161035	lin1969	lin1970		deoD	TRUE	0.347	58.000	0.253	1.000	N	NA
161035	161036	lin1970	lin1971	deoD		TRUE	0.934	13.000	0.159	1.000		NA
161036	161037	lin1971	lin1972			TRUE	0.410	63.000	0.098	1.000		NA
161037	161038	lin1972	lin1973			FALSE	0.310	84.000	0.098	1.000		NA
161038	161039	lin1973	lin1974			TRUE	0.995	7.000	0.262	0.001	Y	NA
161039	161040	lin1974	lin1975			TRUE	0.578	37.000	0.172	NA		NA
161040	161041	lin1975	lin1976			TRUE	0.943	16.000	0.828	NA		NA
161041	161042	lin1976	lin1977			TRUE	0.917	15.000	0.153	NA		NA
161043	161044	lin1978	lin1979			FALSE	0.203	121.000	0.064	1.000		NA
161044	161045	lin1979	lin1980			TRUE	0.934	13.000	0.179	NA		NA
161045	161046	lin1980	lin1981			TRUE	0.848	19.000	0.065	NA		NA
161047	161048	lin1982	lin1983			TRUE	0.947	4.000	0.102	NA		NA
161048	161049	lin1983	lin1984			FALSE	0.279	94.000	0.102	NA		NA
161049	161050	lin1984	lin1985			FALSE	0.153	140.000	0.083	1.000		NA
161050	161051	lin1985	lin1986			TRUE	0.372	69.000	0.082	1.000		NA
161051	161052	lin1986	lin1987			TRUE	0.422	53.000	0.027	1.000		NA
161052	161053	lin1987	lin1988			TRUE	0.870	16.000	0.295	1.000	N	NA
161053	161054	lin1988	lin1989			TRUE	0.921	13.000	0.036	1.000		NA
161054	161055	lin1989	lin1990			FALSE	0.280	120.000	0.022	0.099		NA
161055	161056	lin1990	lin1991			FALSE	0.063	160.000	0.083	1.000	N	NA
161057	161058	lin1992	lin1993	cspD		FALSE	0.134	123.000	0.167	1.000	N	NA
161059	161060	lin1994	lin1995			FALSE	0.179	78.000	0.020	1.000	N	NA
161060	161061	lin1995	lin1996			FALSE	0.098	123.000	0.020	1.000	N	NA
161061	161062	lin1996	lin1997			FALSE	0.056	192.000	0.270	1.000	N	NA
161062	161063	lin1997	lin1998			TRUE	0.987	7.000	0.051	1.000	Y	NA
161063	161064	lin1998	lin1999			FALSE	0.020	228.000	0.009	1.000	N	NA
161064	161065	lin1999	lin2000			TRUE	0.796	16.000	0.020	1.000	N	NA
161065	161066	lin2000	lin2001			FALSE	0.304	76.000	0.020	NA		NA
161066	161067	lin2001	lin2002			FALSE	0.050	220.000	0.059	NA		NA
161067	161068	lin2002	lin2003			FALSE	0.250	132.000	0.579	NA		NA
161068	161069	lin2003	lin2004			TRUE	0.958	-3.000	0.165	NA		NA
161070	161071	lin2005	lin2006	recU	pbpA	TRUE	0.591	32.000	0.062	1.000		NA
161072	161073	lin2007	lin2008		nth	TRUE	0.947	-7.000	0.034	NA		NA
161073	161074	lin2008	lin2009	nth	dnaD	TRUE	0.987	11.000	0.075	NA	Y	NA
161074	161075	lin2009	lin2010	dnaD	ansB	FALSE	0.097	145.000	0.234	NA	N	NA
161075	161076	lin2010	lin2011	ansB	aspB	TRUE	0.864	14.000	0.094	1.000	N	NA
161076	161077	lin2011	lin2012	aspB		TRUE	0.799	23.000	0.367	1.000		NA
161077	161078	lin2012	lin2013		dinG	FALSE	0.289	109.000	0.296	1.000		NA
161078	161079	lin2013	lin2014	dinG	panD	FALSE	0.156	97.000	0.053	1.000	N	NA
161079	161080	lin2014	lin2015	panD	panC	TRUE	0.991	4.000	0.342	1.000	Y	NA
161080	161081	lin2015	lin2016	panC	panB	TRUE	0.996	4.000	0.395	0.001	Y	NA
161081	161082	lin2016	lin2017	panB		FALSE	0.084	167.000	0.012	1.000		NA
161082	161083	lin2017	lin2018		birA	FALSE	0.123	148.000	0.039	1.000		NA
161083	161084	lin2018	lin2019	birA	cca	TRUE	0.922	-10.000	0.134	1.000	N	NA
161084	161085	lin2019	lin2020	cca		TRUE	0.824	15.000	0.029	1.000	N	NA
161085	161086	lin2020	lin2021		dapB	TRUE	0.903	16.000	0.044	0.041	N	NA
161086	161087	lin2021	lin2022	dapB		TRUE	0.951	-3.000	0.044	NA		NA
161090	161091	lin2025	lin2026			TRUE	0.985	21.000	0.667	0.001	Y	NA
161091	161092	lin2026	lin2027			TRUE	0.963	-3.000	0.225	1.000		NA
161092	161093	lin2027	lin2028			TRUE	0.856	19.000	0.100	NA		NA
161093	161094	lin2028	lin2029			FALSE	0.145	108.000	0.093	NA	N	NA
161094	161095	lin2029	lin2030			TRUE	0.925	3.000	0.209	1.000	N	NA
161095	161096	lin2030	lin2031		pflA	FALSE	0.018	208.000	0.000	1.000	N	NA
161097	161098	lin2032	lin2033			FALSE	0.202	112.000	0.017	1.000		NA
161098	161099	lin2033	lin2034			FALSE	0.293	86.000	0.083	NA		NA
161099	161100	lin2034	lin2035			FALSE	0.317	88.000	0.200	NA		NA
161100	161101	lin2035	lin2036			TRUE	0.603	32.000	0.104	NA		NA
161101	161102	lin2036	lin2037		aroE	FALSE	0.078	131.000	0.005	1.000	N	NA
161102	161103	lin2037	lin2038	aroE	tyrA	TRUE	0.983	14.000	0.069	1.000	Y	NA
161103	161104	lin2038	lin2039	tyrA	hisC	TRUE	0.957	21.000	0.098	1.000	Y	NA
161104	161105	lin2039	lin2040	hisC		TRUE	0.991	0.000	0.078	1.000	Y	NA
161105	161106	lin2040	lin2041		aroB	TRUE	0.990	-3.000	0.041	1.000	Y	NA
161106	161107	lin2041	lin2042	aroB	aroF	TRUE	0.995	3.000	0.110	0.001	Y	NA
161107	161108	lin2042	lin2043	aroF	ndk	FALSE	0.025	204.000	0.002	1.000	N	NA
161108	161109	lin2043	lin2044	ndk		TRUE	0.714	20.000	0.054	1.000	N	NA
161109	161110	lin2044	lin2045		menH	TRUE	0.990	11.000	0.476	1.000	Y	NA
161110	161111	lin2045	lin2046	menH		TRUE	0.835	23.000	0.708	1.000		NA
161111	161112	lin2046	lin2047			TRUE	0.437	59.000	0.114	1.000		NA
161112	161113	lin2047	lin2048		hup	FALSE	0.031	226.000	0.154	1.000	N	NA
161113	161114	lin2048	lin2049	hup		FALSE	0.005	414.000	0.000	1.000	N	NA
161114	161115	lin2049	lin2050		gpsA	FALSE	0.143	103.000	0.042	1.000	N	NA
161115	161116	lin2050	lin2051	gpsA		TRUE	0.738	23.000	0.068	1.000		NA
161116	161117	lin2051	lin2052			FALSE	0.129	144.000	0.032	1.000		NA
161117	161118	lin2052	lin2053		cmk	FALSE	0.011	360.000	0.047	1.000	N	NA
161118	161119	lin2053	lin2054	cmk		TRUE	0.797	16.000	0.021	1.000	N	NA
161119	161120	lin2054	lin2055			FALSE	0.285	81.000	0.021	1.000		NA
161120	161121	lin2055	lin2056		recS	FALSE	0.017	321.000	0.000	1.000		NA
161121	161122	lin2056	lin2057	recS		TRUE	0.957	-3.000	0.143	NA		NA
161124	161125	lin2059	lin2060			FALSE	0.011	442.000	0.000	NA		NA
161125	161126	lin2060	lin2061		resE	TRUE	0.841	16.000	0.157	NA	N	NA
161126	161127	lin2061	lin2062	resE	resD	TRUE	0.717	98.000	0.511	1.000	Y	NA
161127	161128	lin2062	lin2063	resD		FALSE	0.042	185.000	0.046	1.000	N	NA
161128	161129	lin2063	lin2064			TRUE	0.924	3.000	0.224	NA	N	NA
161129	161130	lin2064	lin2065			TRUE	0.971	-3.000	0.570	NA		NA
161130	161131	lin2065	lin2066		lysA	TRUE	0.881	16.000	0.013	1.000		NA
161131	161132	lin2066	lin2067	lysA	pnp	FALSE	0.038	180.000	0.014	1.000	N	NA
161132	161133	lin2067	lin2068	pnp	drm	TRUE	0.856	19.000	0.609	1.000	N	NA
161133	161134	lin2068	lin2069	drm		TRUE	0.428	29.000	0.024	1.000	N	NA
161134	161135	lin2069	lin2070		fur	FALSE	0.067	146.000	0.029	1.000	N	NA
161135	161136	lin2070	lin2071	fur	fhuG	FALSE	0.152	242.000	0.000	1.000	Y	NA
161136	161137	lin2071	lin2072	fhuG	fhuB	TRUE	0.995	0.000	0.214	0.031	Y	NA
161137	161138	lin2072	lin2073	fhuB		TRUE	0.656	102.000	0.167	1.000	Y	NA
161139	161140	lin2074	lin2075	fhuC		TRUE	0.940	-10.000	0.333	1.000	N	NA
161141	161142	lin2076	lin2077			TRUE	0.966	0.000	0.400	NA		NA
161142	161143	lin2077	lin2078			TRUE	0.965	-3.000	0.314	NA		NA
161143	161144	lin2078	lin2079			FALSE	0.004	563.000	0.000	1.000	N	NA
161145	161146	lin2080	lin2081			TRUE	0.962	-22.000	0.373	NA		NA
161147	161148	lin2082	lin2083			FALSE	0.224	109.000	0.040	1.000		NA
161148	161149	lin2083	lin2084			TRUE	0.944	5.000	0.074	1.000		NA
161150	161151	lin2085	lin2086			FALSE	0.218	119.000	0.116	NA		NA
161151	161152	lin2086	lin2087			TRUE	0.589	34.000	0.106	NA		NA
161153	161154	lin2088	lin2089			TRUE	0.960	-27.000	0.312	NA		NA
161155	161156	lin2090	lin2091	ilvD	ilvB	TRUE	0.984	19.000	0.089	0.001	Y	NA
161156	161157	lin2091	lin2092	ilvB	ilvN	TRUE	0.996	1.000	0.249	0.001	Y	NA
161157	161158	lin2092	lin2093	ilvN	ilvC	TRUE	0.798	98.000	0.130	0.001	Y	NA
161158	161159	lin2093	lin2094	ilvC	leuA	TRUE	0.399	158.000	0.103	1.000	Y	NA
161159	161160	lin2094	lin2095	leuA	leuB	TRUE	0.995	2.000	0.041	0.001	Y	NA
161160	161161	lin2095	lin2096	leuB	leuC	TRUE	0.995	2.000	0.080	0.001	Y	NA
161161	161162	lin2096	lin2097	leuC	leuD	TRUE	0.996	-13.000	0.477	0.001	Y	NA
161162	161163	lin2097	lin2098	leuD	ilvA	TRUE	0.969	19.000	0.100	1.000	Y	NA
161163	161164	lin2098	lin2099	ilvA		FALSE	0.039	192.000	0.056	1.000	N	NA
161165	161166	lin2100	lin2101		pdp	FALSE	0.025	185.000	0.000	1.000	N	NA
161166	161167	lin2101	lin2102	pdp		FALSE	0.096	131.000	0.044	1.000	N	NA
161167	161168	lin2102	lin2103		dra	FALSE	0.185	80.000	0.038	1.000	N	NA
161168	161169	lin2103	lin2104	dra		FALSE	0.265	63.000	0.077	1.000	N	NA
161169	161170	lin2104	lin2105			FALSE	0.192	98.000	0.200	1.000	N	NA
161170	161171	lin2105	lin2106			TRUE	0.855	17.000	0.333	1.000	N	NA
161171	161172	lin2106	lin2107			TRUE	0.889	23.000	0.300	0.004		NA
161172	161173	lin2107	lin2108			TRUE	0.957	13.000	0.692	1.000		NA
161173	161174	lin2108	lin2109			TRUE	0.995	-19.000	0.448	0.026	Y	NA
161174	161175	lin2109	lin2110			TRUE	0.973	23.000	0.800	0.026	Y	NA
161175	161176	lin2110	lin2111			TRUE	0.780	20.000	0.257	1.000	N	NA
161176	161177	lin2111	lin2112			TRUE	0.995	3.000	0.500	0.043	Y	NA
161177	161178	lin2112	lin2113			FALSE	0.061	169.000	0.148	1.000	N	NA
161178	161179	lin2113	lin2114		alsS	FALSE	0.141	115.000	0.111	1.000	N	NA
161179	161180	lin2114	lin2115	alsS		FALSE	0.048	187.000	0.111	1.000	N	NA
161180	161181	lin2115	lin2116			TRUE	0.987	19.000	1.000	0.031	Y	NA
161181	161182	lin2116	lin2117			TRUE	0.980	19.000	0.154	0.031	Y	NA
161182	161183	lin2117	lin2118			FALSE	0.132	113.000	0.065	1.000	N	NA
161183	161184	lin2118	lin2119			TRUE	0.995	0.000	0.226	0.009	Y	NA
161184	161185	lin2119	lin2120			TRUE	0.539	63.000	0.714	NA		NA
161185	161186	lin2120	lin2121			TRUE	0.532	60.000	0.579	NA		NA
161186	161187	lin2121	lin2122			TRUE	0.959	4.000	0.316	1.000		NA
161189	161190	lin2124	lin2125	cspB		FALSE	0.009	287.000	0.000	1.000	N	NA
161190	161191	lin2125	lin2126			TRUE	0.823	14.000	0.011	1.000	N	NA
161191	161192	lin2126	lin2127		ileS	FALSE	0.108	112.000	0.010	1.000	N	NA
161192	161193	lin2127	lin2128	ileS	divIVA	FALSE	0.013	283.000	0.012	1.000	N	NA
161193	161194	lin2128	lin2129	divIVA		FALSE	0.269	95.000	0.064	1.000		NA
161194	161195	lin2129	lin2130			TRUE	0.954	5.000	0.243	1.000		NA
161196	161197	lin2131	lin2132	nadB	nadC	TRUE	0.996	-3.000	0.223	0.002	Y	NA
161197	161198	lin2132	lin2133	nadC	nadA	TRUE	0.996	-3.000	0.198	0.002	Y	NA
161199	161200	lin2134	lin2135			FALSE	0.234	127.000	0.287	1.000		NA
161200	161201	lin2135	lin2136			TRUE	0.795	23.000	0.370	NA		NA
161201	161202	lin2136	lin2137			TRUE	0.952	4.000	0.194	NA		NA
161202	161203	lin2137	lin2138		ftsZ	FALSE	0.185	121.000	0.030	NA		NA
161203	161204	lin2138	lin2139	ftsZ	ftsA	TRUE	0.807	67.000	0.460	1.000	Y	NA
161204	161205	lin2139	lin2140	ftsA	divIB	FALSE	0.017	365.000	0.389	NA	N	NA
161205	161206	lin2140	lin2141	divIB	murG	TRUE	0.935	23.000	0.072	NA	Y	NA
161206	161207	lin2141	lin2142	murG	murD	TRUE	0.991	-3.000	0.060	1.000	Y	NA
161207	161208	lin2142	lin2143	murD	mraY	TRUE	0.713	139.000	0.647	0.004	Y	NA
161208	161209	lin2143	lin2144	mraY	murE	TRUE	0.891	47.000	0.025	0.004	Y	NA
161209	161210	lin2144	lin2145	murE	pbpB	TRUE	0.370	172.000	0.190	1.000	Y	NA
161210	161211	lin2145	lin2146	pbpB	ftsL	TRUE	0.943	-3.000	0.316	1.000	N	NA
161211	161212	lin2146	lin2147	ftsL		TRUE	0.801	17.000	0.077	1.000	N	NA
161212	161213	lin2147	lin2148			TRUE	0.954	13.000	0.635	NA		NA
161213	161214	lin2148	lin2149			FALSE	0.040	204.000	0.000	NA		NA
161216	161217	lin2151	lin2152			TRUE	0.954	-7.000	0.091	1.000		NA
161217	161218	lin2152	lin2153		rpmF	FALSE	0.053	151.000	0.008	1.000	N	NA
161218	161219	lin2153	lin2154	rpmF		TRUE	0.383	92.000	0.599	NA		NA
161220	161221	lin2155	lin2156			FALSE	0.264	83.000	0.014	NA		NA
161222	161223	lin2157	lin2158			TRUE	0.838	15.000	0.052	1.000	N	NA
161223	161224	lin2158	lin2159			TRUE	0.938	3.000	0.367	1.000	N	NA
161224	161225	lin2159	lin2160			FALSE	0.252	97.000	0.048	NA		NA
161225	161226	lin2160	lin2161			TRUE	0.700	31.000	0.500	NA		NA
161226	161227	lin2161	lin2162			TRUE	0.536	48.000	0.301	NA		NA
161227	161228	lin2162	lin2163		ctaB	FALSE	0.119	148.000	0.037	NA		NA
161229	161230	lin2164	lin2165	ctaA		FALSE	0.322	110.000	0.028	0.066		NA
161231	161232	lin2166	lin2167			TRUE	0.870	19.000	0.200	NA		NA
161232	161233	lin2167	lin2168			TRUE	0.953	13.000	0.600	NA		NA
161234	161235	lin2169	lin2170			TRUE	0.370	61.000	0.020	NA		NA
161236	161237	lin2171	lin2173			TRUE	0.658	45.000	0.917	NA		NA
161237	161238	lin2173	lin2174		groEL	FALSE	0.046	195.000	0.000	NA		NA
161238	161239	lin2174	lin2175	groEL	groES	TRUE	0.951	33.000	0.674	0.006	Y	NA
161240	161241	lin2176	lin2177			TRUE	0.971	2.000	0.714	NA		NA
161243	161244	lin2179	lin2180			TRUE	0.693	25.000	0.105	NA		NA
161245	161246	lin2181	lin2182			TRUE	0.956	-3.000	0.090	1.000		NA
161246	161247	lin2182	lin2183			TRUE	0.958	-3.000	0.127	1.000		NA
161247	161248	lin2183	lin2184			TRUE	0.961	-3.000	0.217	NA		NA
161248	161249	lin2184	lin2185			FALSE	0.210	106.000	0.015	NA		NA
161249	161250	lin2185	lin2186			FALSE	0.225	149.000	0.917	NA		NA
161250	161251	lin2186	lin2187			FALSE	0.313	96.000	0.262	NA		NA
161251	161252	lin2187	lin2188			TRUE	0.994	-10.000	0.229	0.066	Y	NA
161252	161253	lin2188	lin2189			FALSE	0.235	107.000	0.069	NA		NA
161253	161254	lin2189	lin2190			TRUE	0.962	-3.000	0.231	NA		NA
161255	161256	lin2191	lin2192			FALSE	0.009	593.000	0.000	1.000		NA
161256	161257	lin2192	lin2193			TRUE	0.889	15.000	0.323	1.000	N	NA
161257	161258	lin2193	lin2194			FALSE	0.193	110.000	0.323	1.000	N	NA
161259	161260	lin2195	lin2196	argG	argH	TRUE	0.991	4.000	0.278	1.000	Y	NA
161260	161261	lin2196	lin2197	argH	betL	FALSE	0.046	159.000	0.004	1.000	N	NA
161262	161263	lin2198	lin2199			TRUE	0.993	2.000	0.526	1.000	Y	NA
161263	161264	lin2199	lin2200			TRUE	0.979	18.000	0.526	1.000	Y	NA
161264	161265	lin2200	lin2201			TRUE	0.950	28.000	0.400	0.026	Y	NA
161265	161266	lin2201	lin2202			TRUE	0.995	6.000	0.846	0.023	Y	NA
161266	161267	lin2202	lin2203			TRUE	0.960	8.000	0.308	0.023	N	NA
161267	161268	lin2203	lin2204			FALSE	0.341	223.000	0.375	0.064	Y	NA
161269	161270	lin2205	lin2206			TRUE	0.992	2.000	0.488	NA	Y	NA
161272	161273	lin2208	lin2209			TRUE	0.992	-3.000	0.308	1.000	Y	NA
161273	161274	lin2209	lin2210			TRUE	0.931	16.000	0.517	NA		NA
161276	161277	lin2212	lin2213			TRUE	0.990	6.000	0.220	1.000	Y	NA
161277	161278	lin2213	lin2214			TRUE	0.638	42.000	0.615	1.000		NA
161279	161280	lin2215	lin2216			FALSE	0.244	80.000	0.216	1.000	N	NA
161281	161282	lin2217	lin2218			FALSE	0.297	83.000	0.054	1.000		NA
161282	161283	lin2218	lin2219			FALSE	0.063	200.000	0.045	1.000		NA
161283	161284	lin2219	lin2220			TRUE	0.972	-13.000	0.750	1.000		NA
161287	161288	lin2223	lin2224			FALSE	0.041	257.000	0.150	NA		NA
161288	161289	lin2224	lin2225			TRUE	0.969	0.000	0.502	NA		NA
161289	161290	lin2225	lin2226			FALSE	0.072	175.000	0.007	NA		NA
161290	161291	lin2226	lin2227			TRUE	0.901	16.000	0.103	NA		NA
161291	161292	lin2227	lin2228			TRUE	0.639	28.000	0.086	NA		NA
161292	161293	lin2228	lin2229			TRUE	0.996	1.000	0.714	0.031	Y	NA
161293	161294	lin2229	lin2230			TRUE	0.752	88.000	0.621	1.000	Y	NA
161294	161295	lin2230	lin2231			FALSE	0.229	215.000	0.065	1.000	Y	NA
161297	161298	lin2233	lin2234			FALSE	0.198	139.000	0.370	NA		NA
161298	161299	lin2234	lin2235			FALSE	0.009	597.000	0.000	NA		NA
398369	398370	lint40	lint41	tRNA-Glu	tRNA-Thr	FALSE	0.077	155.000	0.000	NA		NA
398370	398371	lint41	lint42	tRNA-Thr	tRNA-Tyr	TRUE	0.906	10.000	0.000	NA		NA
398371	398372	lint42	lint43	tRNA-Tyr	tRNA-Gln	TRUE	0.899	12.000	0.000	NA		NA
398372	398373	lint43	lint44	tRNA-Gln	tRNA-Lys	TRUE	0.910	7.000	0.000	NA		NA
161302	161303	lin2238	lin2239			TRUE	0.989	17.000	0.278	0.001	Y	NA
161303	161304	lin2239	lin2240			TRUE	0.977	18.000	0.364	1.000	Y	NA
161304	161305	lin2240	lin2241			TRUE	0.988	17.000	0.393	0.023	Y	NA
161305	161306	lin2241	lin2242			TRUE	0.993	13.000	0.464	0.023	Y	NA
161306	161307	lin2242	lin2243			TRUE	0.921	12.000	0.000	0.023	N	NA
161308	161309	lin2244	lin2245			TRUE	0.954	-7.000	0.103	NA		NA
161309	161310	lin2245	lin2246			TRUE	0.817	17.000	0.162	NA	N	NA
161311	161312	lin2248	lin2249			FALSE	0.034	222.000	0.000	NA		NA
161312	161313	lin2249	lin2250			FALSE	0.342	69.000	0.036	NA		NA
161314	161315	lin2251	lin2252			TRUE	0.434	56.000	0.086	NA		NA
161318	161319	lin2255	lin2256			FALSE	0.273	107.000	0.220	NA		NA
161319	161320	lin2256	lin2257			TRUE	0.970	-3.000	0.484	1.000		NA
161320	161321	lin2257	lin2258			TRUE	0.953	-3.000	0.550	1.000	N	NA
161321	161322	lin2258	lin2259			TRUE	0.893	56.000	0.101	0.001	Y	NA
161324	161325	lin2261	lin2262			FALSE	0.326	95.000	0.308	NA		NA
161325	161326	lin2262	lin2263			TRUE	0.775	23.000	0.244	NA		NA
161326	161327	lin2263	lin2264			TRUE	0.991	3.000	0.244	NA	Y	NA
161327	161328	lin2264	lin2265			TRUE	0.992	2.000	0.480	NA	Y	NA
161328	161329	lin2265	lin2266			TRUE	0.931	16.000	0.500	NA		NA
161329	161330	lin2266	lin2267			TRUE	0.471	75.000	0.625	1.000		NA
161330	161331	lin2267	lin2268			TRUE	0.357	69.000	0.562	NA	N	NA
161331	161332	lin2268	lin2269			FALSE	0.139	253.000	0.000	NA	Y	NA
161332	161333	lin2269	lin2270			TRUE	0.353	65.000	0.025	NA		NA
161334	161335	lin2271	lin2272			TRUE	0.662	26.000	0.068	NA		NA
161336	161337	lin2273	lin2274			TRUE	0.865	22.000	0.714	1.000		NA
161337	161338	lin2274	lin2275			TRUE	0.958	-3.000	0.700	1.000	N	NA
161338	161339	lin2275	lin2276			FALSE	0.015	230.000	0.000	1.000	N	NA
161339	161340	lin2276	lin2277			TRUE	0.657	106.000	0.233	1.000	Y	NA
161340	161341	lin2277	lin2278			FALSE	0.054	178.000	0.128	1.000	N	NA
161342	161343	lin2279	lin2280			FALSE	0.341	106.000	0.579	NA		NA
161344	161345	lin2281	lin2282			FALSE	0.222	270.000	0.000	0.002	Y	NA
161345	161346	lin2282	lin2283			FALSE	0.218	181.000	0.556	0.012		NA
161346	161347	lin2283	lin2284			FALSE	0.048	193.000	0.000	NA		NA
161347	161348	lin2284	lin2285			FALSE	0.309	61.000	0.000	NA		NA
161348	161349	lin2285	lin2286			TRUE	0.960	4.000	0.373	NA		NA
161349	161350	lin2286	lin2287			TRUE	0.993	-19.000	0.657	1.000	Y	NA
161350	161351	lin2287	lin2288			TRUE	0.994	-10.000	0.877	1.000	Y	NA
161351	161352	lin2288	lin2289			FALSE	0.259	84.000	0.382	NA	N	NA
161352	161353	lin2289	lin2290			TRUE	0.951	13.000	0.515	NA		NA
161353	161354	lin2290	lin2291			FALSE	0.036	216.000	0.000	NA		NA
161354	161355	lin2291	lin2292			FALSE	0.017	311.000	0.000	NA		NA
161355	161356	lin2292	lin2293			TRUE	0.433	73.000	0.398	NA		NA
161356	161357	lin2293	lin2294		mecA	FALSE	0.205	127.000	0.167	NA		NA
161357	161358	lin2294	lin2295	mecA		FALSE	0.027	222.000	0.063	NA	N	NA
161358	161359	lin2295	lin2296			FALSE	0.008	320.000	0.000	1.000	N	NA
161359	161360	lin2296	lin2297			TRUE	0.996	-3.000	0.238	0.001	Y	NA
161360	161361	lin2297	lin2298			TRUE	0.980	18.000	0.595	1.000	Y	NA
161361	161362	lin2298	lin2299			TRUE	0.995	0.000	0.299	0.030	Y	NA
161362	161363	lin2299	lin2300			FALSE	0.178	278.000	0.000	0.030	Y	NA
161365	161366	lin2302	lin2303			TRUE	0.935	-16.000	0.300	1.000	N	NA
161366	161367	lin2303	lin2304			FALSE	0.095	120.000	0.007	1.000	N	NA
161367	161368	lin2304	lin2305			TRUE	0.412	203.000	0.076	0.001	Y	NA
161368	161369	lin2305	lin2306			FALSE	0.132	116.000	0.081	1.000	N	NA
161371	161372	lin2308	lin2309		clpB	FALSE	0.140	91.000	0.013	1.000	N	NA
161372	161373	lin2309	lin2310	clpB		FALSE	0.108	148.000	0.011	NA		NA
161373	161374	lin2310	lin2311			FALSE	0.284	112.000	0.344	NA		NA
161374	161375	lin2311	lin2312			TRUE	0.584	64.000	0.256	0.049		NA
161375	161376	lin2312	lin2313			FALSE	0.242	122.000	0.256	1.000		NA
161376	161377	lin2313	lin2314		hemH	FALSE	0.104	154.000	0.020	1.000		NA
161377	161378	lin2314	lin2315	hemH	hemE	TRUE	0.988	7.000	0.131	1.000	Y	NA
161380	161381	lin2317	lin2318			TRUE	0.889	-16.000	0.021	NA	N	NA
161382	161383	lin2319	lin2320			TRUE	0.631	30.000	0.137	NA		NA
161383	161384	lin2320	lin2321			FALSE	0.095	180.000	0.190	NA		NA
161384	161385	lin2321	lin2322			FALSE	0.193	117.000	0.029	NA		NA
161386	161387	lin2323	lin2324			TRUE	0.554	45.000	0.291	NA		NA
161387	161388	lin2324	lin2325			TRUE	0.965	-3.000	0.330	NA		NA
161388	161389	lin2325	lin2326			FALSE	0.141	144.000	0.093	NA		NA
161389	161390	lin2326	lin2327			TRUE	0.368	82.000	0.321	NA		NA
161390	161391	lin2327	lin2328		citG	FALSE	0.214	104.000	0.014	NA		NA
161391	161392	lin2328	lin2330	citG		FALSE	0.004	864.000	0.000	1.000	N	NA
161392	161393	lin2330	lin2331			FALSE	0.008	303.000	0.000	1.000	N	NA
161394	161395	lin2332	lin2333			TRUE	0.430	63.000	0.750	1.000	N	NA
161395	161396	lin2333	lin2334			FALSE	0.026	258.000	0.000	1.000		NA
161398	161399	lin2336	lin2337			FALSE	0.303	70.000	0.320	NA	N	NA
161399	161400	lin2337	lin2338			TRUE	0.348	60.000	0.286	1.000	N	NA
161400	161401	lin2338	lin2339			TRUE	0.701	33.000	0.571	1.000		NA
161401	161402	lin2339	lin2340			FALSE	0.193	160.000	0.107	0.030		NA
161403	161404	lin2341	lin2342			TRUE	0.975	0.000	0.833	NA		NA
161404	161405	lin2342	lin2343			TRUE	0.928	-3.000	0.149	1.000	N	NA
161405	161406	lin2343	lin2344			FALSE	0.188	92.000	0.135	1.000	N	NA
161407	161408	lin2345	lin2346			TRUE	0.670	22.000	0.100	1.000	N	NA
161409	161410	lin2347	lin2348			TRUE	0.847	2.000	0.000	1.000	N	NA
161410	161411	lin2348	lin2349			TRUE	0.933	-3.000	0.000	1.000		NA
161412	161413	lin2350	lin2351			TRUE	0.983	14.000	0.100	NA	Y	NA
161413	161414	lin2351	lin2352			FALSE	0.055	192.000	0.256	1.000	N	NA
161414	161415	lin2352	lin2353			TRUE	0.991	-7.000	0.154	1.000	Y	NA
161415	161416	lin2353	lin2354			TRUE	0.738	74.000	0.088	1.000	Y	NA
161418	161419	lin2356	lin2357			TRUE	0.367	110.000	0.846	NA		NA
161420	161421	lin2358	lin2359			FALSE	0.010	502.000	0.000	NA		NA
161423	161424	lin2361	lin2362			TRUE	0.374	78.000	0.214	1.000		NA
161424	161425	lin2362	lin2363			TRUE	0.457	65.000	0.303	1.000		NA
161427	161428	lin2365	lin2366			TRUE	0.347	84.000	0.263	NA		NA
161428	161429	lin2366	lin2367			TRUE	0.844	20.000	0.169	NA		NA
161429	161430	lin2367	lin2368			TRUE	0.914	1.000	0.075	1.000	N	NA
161430	161431	lin2368	lin2369		addB	TRUE	0.996	2.000	0.408	0.002	Y	NA
161431	161432	lin2369	lin2370	addB		FALSE	0.123	150.000	0.076	NA		NA
161434	161435	lin2372	lin2373			FALSE	0.027	247.000	0.000	NA		NA
161435	161436	lin2373	lin2374			FALSE	0.006	363.000	0.000	NA	N	NA
161436	161437	lin2374	lin2375			TRUE	0.946	0.000	0.027	NA		NA
161437	161438	lin2375	lin2376			TRUE	0.946	0.000	0.027	NA		NA
161438	161439	lin2376	lin2377			TRUE	0.412	41.000	0.000	NA		NA
161439	161440	lin2377	lin2378			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
161440	161441	lin2378	lin2379			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
161441	161442	lin2379	lin2380			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
161442	161443	lin2380	lin2381			TRUE	0.964	-3.000	0.300	NA		NA
161443	161444	lin2381	lin2382			TRUE	0.947	13.000	0.400	NA		NA
161444	161445	lin2382	lin2383			TRUE	0.942	4.000	0.054	NA		NA
161445	161446	lin2383	lin2384			FALSE	0.017	313.000	0.000	NA		NA
161446	161447	lin2384	lin2385			TRUE	0.566	50.000	0.500	NA		NA
161447	161448	lin2385	lin2386			TRUE	0.959	5.000	0.400	NA		NA
161448	161449	lin2386	lin2387			FALSE	0.018	304.000	0.000	NA		NA
161449	161450	lin2387	lin2388			TRUE	0.976	0.000	1.000	NA		NA
161450	161451	lin2388	lin2389			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
161451	161452	lin2389	lin2390			TRUE	0.879	14.000	0.000	NA		NA
161452	161453	lin2390	lin2391			TRUE	0.800	23.000	0.400	NA		NA
161453	161454	lin2391	lin2392			TRUE	0.412	95.000	0.833	NA		NA
161454	161455	lin2392	lin2393			TRUE	0.962	5.000	0.500	NA		NA
161455	161456	lin2393	lin2394			TRUE	0.937	15.000	0.455	NA		NA
161456	161457	lin2394	lin2395			TRUE	0.969	-7.000	0.545	NA		NA
161457	161458	lin2395	lin2396			TRUE	0.682	40.000	0.833	NA		NA
161458	161459	lin2396	lin2397			FALSE	0.021	282.000	0.000	NA		NA
161459	161460	lin2397	lin2398			TRUE	0.449	88.000	1.000	NA		NA
161460	161461	lin2398	lin2399			TRUE	0.606	41.000	0.400	NA		NA
161461	161462	lin2399	lin2400			TRUE	0.961	4.000	0.400	NA		NA
161462	161463	lin2400	lin2401			TRUE	0.962	-55.000	0.400	NA		NA
161463	161464	lin2401	lin2402			TRUE	0.878	22.000	1.000	NA		NA
161464	161465	lin2402	lin2403			FALSE	0.013	377.000	0.000	NA		NA
161465	161466	lin2403	lin2404			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
161466	161467	lin2404	lin2405			FALSE	0.099	142.000	0.000	NA		NA
161467	161468	lin2405	lin2406			FALSE	0.036	215.000	0.000	NA		NA
161468	1789945	lin2406	lin2407			FALSE	0.317	59.000	0.000	NA		NA
1789945	161469	lin2407	lin2408			TRUE	0.921	-36.000	0.000	NA		NA
161469	161470	lin2408	lin2409			TRUE	0.955	13.000	0.667	NA		NA
161470	161471	lin2409	lin2410			TRUE	0.957	11.000	0.500	NA		NA
161471	161472	lin2410	lin2411			TRUE	0.865	21.000	0.500	NA		NA
161472	161473	lin2411	lin2412			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
161473	161474	lin2412	lin2413			TRUE	0.974	20.000	0.667	NA	Y	NA
161474	161475	lin2413	lin2414			TRUE	0.994	0.000	0.069	0.053	Y	NA
161475	161476	lin2414	lin2415			FALSE	0.031	232.000	0.000	NA		NA
161476	161477	lin2415	lin2416			TRUE	0.347	108.000	0.667	NA		NA
161477	161478	lin2416	lin2417			TRUE	0.985	-3.000	0.833	0.053		NA
161478	161479	lin2417	lin2418			FALSE	0.239	123.000	0.000	0.053		NA
161479	161480	lin2418	lin2419			FALSE	0.018	299.000	0.000	NA		NA
161480	161481	lin2419	lin2420			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
161481	161482	lin2420	lin2421			FALSE	0.038	210.000	0.000	NA		NA
161483	161484	lin2422	lin2423			FALSE	0.013	380.000	0.000	NA		NA
161484	161485	lin2423	lin2424			TRUE	0.896	16.000	0.069	NA		NA
161485	161486	lin2424	lin2425			TRUE	0.732	21.000	0.000	NA		NA
161486	161487	lin2425	lin2426		int	FALSE	0.290	65.000	0.000	NA		NA
161487	161488	lin2426	lin2427	int	'comK	TRUE	0.915	-9.000	0.100	NA	N	NA
161489	161490	lin2428	lin2429		fruA	FALSE	0.146	107.000	0.075	1.000	N	NA
161490	161491	lin2429	lin2430	fruA	fruB	TRUE	0.994	2.000	0.816	1.000	Y	NA
161491	161492	lin2430	lin2431	fruB		TRUE	0.994	-3.000	0.721	1.000	Y	NA
161494	161495	lin2433	lin2434			FALSE	0.302	80.000	0.042	NA		NA
161495	161496	lin2434	lin2435			TRUE	0.918	-3.000	0.085	NA	N	NA
161496	161497	lin2435	lin2436			FALSE	0.107	132.000	0.102	1.000	N	NA
161497	161498	lin2436	lin2437			FALSE	0.229	72.000	0.071	1.000	N	NA
161498	161499	lin2437	lin2438			TRUE	0.946	-3.000	0.368	1.000	N	NA
161499	161500	lin2438	lin2439			TRUE	0.949	-7.000	0.474	1.000	N	NA
161500	161501	lin2439	lin2440			TRUE	0.945	-3.000	0.353	1.000	N	NA
161501	161502	lin2440	lin2441			TRUE	0.993	-3.000	0.405	1.000	Y	NA
161502	161503	lin2441	lin2442			TRUE	0.993	14.000	0.476	0.008	Y	NA
161503	161504	lin2442	lin2443			TRUE	0.975	22.000	0.458	0.030	Y	NA
161504	161505	lin2443	lin2444			TRUE	0.914	17.000	0.391	1.000		NA
161505	161506	lin2444	lin2445			TRUE	0.904	16.000	0.108	1.000		NA
161508	161509	lin2447	lin2448			FALSE	0.177	130.000	0.062	1.000		NA
161509	161510	lin2448	lin2449			TRUE	0.954	4.000	0.208	1.000		NA
161510	161511	lin2449	lin2450			FALSE	0.060	200.000	0.042	NA		NA
161511	161512	lin2450	lin2451			FALSE	0.135	189.000	0.833	NA		NA
161512	161513	lin2451	lin2452			TRUE	0.952	15.000	0.846	1.000		NA
161513	161514	lin2452	lin2453			TRUE	0.649	44.000	0.769	1.000		NA
161514	161515	lin2453	lin2454			FALSE	0.220	122.000	0.154	1.000		NA
161515	161516	lin2454	lin2455			TRUE	0.554	21.000	0.000	1.000	N	NA
161516	161517	lin2455	lin2456			TRUE	0.928	16.000	0.400	1.000		NA
161517	161518	lin2456	lin2457			TRUE	0.948	14.000	0.571	1.000		NA
161518	161519	lin2457	lin2458			TRUE	0.996	0.000	0.714	0.022	Y	NA
161519	161520	lin2458	lin2459			TRUE	0.986	19.000	0.571	0.022	Y	NA
161520	161521	lin2459	lin2460			FALSE	0.125	155.000	0.167	NA		NA
161521	161522	lin2460	lin2461			TRUE	0.631	34.000	0.257	NA		NA
161523	161524	lin2462	lin2463			TRUE	0.990	13.000	0.700	1.000	Y	NA
161525	398395	lin2464	lint45		tRNA-Leu	FALSE	0.051	188.000	0.000	NA		NA
398395	398394	lint45	lint46	tRNA-Leu	tRNA-Cys	TRUE	0.380	46.000	0.000	NA		NA
398394	398393	lint46	lint47	tRNA-Cys	tRNA-Gly	TRUE	0.759	20.000	0.000	NA		NA
398393	398392	lint47	lint48	tRNA-Gly	tRNA-Gln	TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
398392	398391	lint48	lint49	tRNA-Gln	tRNA-His	TRUE	0.487	32.000	0.000	NA		NA
398391	398390	lint49	lint50	tRNA-His	tRNA-Trp	TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
398390	398389	lint50	lint51	tRNA-Trp	tRNA-Tyr	TRUE	0.908	8.000	0.000	NA		NA
398389	398388	lint51	lint52	tRNA-Tyr	tRNA-Phe	TRUE	0.646	23.000	0.000	NA		NA
398388	398387	lint52	lint53	tRNA-Phe	tRNA-Asp	TRUE	0.915	5.000	0.000	NA		NA
398387	398386	lint53	lint54	tRNA-Asp	tRNA-Met	TRUE	0.910	7.000	0.000	NA		NA
398386	398385	lint54	lint55	tRNA-Met	tRNA-Val	TRUE	0.696	22.000	0.000	NA		NA
398385	398384	lint55	lint56	tRNA-Val	tRNA-Glu	FALSE	0.326	57.000	0.000	NA		NA
398384	398383	lint56	lint57	tRNA-Glu	tRNA-Ser	TRUE	0.433	38.000	0.000	NA		NA
398383	398382	lint57	lint58	tRNA-Ser	tRNA-Asn	TRUE	0.910	7.000	0.000	NA		NA
398382	1789946	lint58	linr13	tRNA-Asn		TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
1789946	1789947	linr13	linr14			FALSE	0.227	81.000	0.000	NA		NA
1789947	398381	linr14	lint59		tRNA-Ala	FALSE	0.030	233.000	0.000	NA		NA
398381	398380	lint59	lint60	tRNA-Ala	tRNA-Ile	TRUE	0.373	47.000	0.000	NA		NA
398380	1789948	lint60	linr15	tRNA-Ile		FALSE	0.129	128.000	0.000	NA		NA
1789948	161526	linr15	lin2465			FALSE	0.014	361.000	0.000	NA		NA
161526	161527	lin2465	lin2466		pgi	TRUE	0.606	105.000	0.021	1.000	Y	NA
161527	161528	lin2466	lin2467	pgi		FALSE	0.118	103.000	0.007	1.000	N	NA
161528	161529	lin2467	lin2468			FALSE	0.058	150.000	0.015	1.000	N	NA
161530	161531	lin2469	lin2470			FALSE	0.095	139.000	0.110	1.000	N	NA
161531	161532	lin2470	lin2471			TRUE	0.953	0.000	0.591	1.000	N	NA
161535	161536	lin2474	lin2475			TRUE	0.388	69.000	0.160	NA		NA
161537	161538	lin2476	lin2477			FALSE	0.007	345.000	0.000	1.000	N	NA
161538	161539	lin2477	lin2478			TRUE	0.991	-13.000	0.268	NA	Y	NA
161539	161540	lin2478	lin2479			TRUE	0.992	0.000	0.317	NA	Y	NA
161540	161541	lin2479	lin2480			TRUE	0.996	-7.000	0.289	0.002	Y	NA
161541	161542	lin2480	lin2481			TRUE	0.992	7.000	0.842	1.000	Y	NA
161542	161543	lin2481	lin2482			TRUE	0.996	-3.000	0.829	0.064	Y	NA
161543	161544	lin2482	lin2483			TRUE	0.991	-16.000	0.293	1.000	Y	NA
161547	161548	lin2486	lin2487			TRUE	0.541	35.000	0.033	NA		NA
161548	161549	lin2487	lin2488			FALSE	0.316	84.000	0.148	NA		NA
161550	161551	lin2489	lin2490			FALSE	0.197	88.000	0.141	1.000	N	NA
161552	161553	lin2491	lin2492			TRUE	0.801	22.000	0.190	NA		NA
161553	161554	lin2492	lin2493			FALSE	0.029	241.000	0.000	NA		NA
161555	161556	lin2494	lin2495			FALSE	0.015	347.000	0.000	NA		NA
161556	161557	lin2495	lin2496			FALSE	0.082	174.000	0.028	1.000		NA
161557	161558	lin2496	lin2497		ltrC	FALSE	0.126	115.000	0.056	1.000	N	NA
161559	161560	lin2498	lin2499			TRUE	0.592	36.000	0.188	NA		NA
161560	161561	lin2499	lin2500			TRUE	0.619	50.000	0.113	0.048		NA
161561	161562	lin2500	lin2501			TRUE	0.865	20.000	0.320	NA		NA
161562	161563	lin2501	lin2502			TRUE	0.966	-3.000	0.347	NA		NA
161564	161565	lin2503	lin2504			TRUE	0.975	1.000	0.903	NA		NA
161566	161567	lin2505	lin2506			FALSE	0.016	371.000	0.004	NA		NA
161567	161568	lin2506	lin2507			TRUE	0.837	23.000	0.152	0.001	N	NA
161568	161569	lin2507	lin2508			TRUE	0.941	-3.000	0.292	1.000	N	NA
161569	161570	lin2508	lin2509			TRUE	0.952	1.000	0.606	1.000	N	NA
161570	161571	lin2509	lin2510			TRUE	0.969	19.000	0.139	1.000	Y	NA
161573	161574	lin2512	lin2513			TRUE	0.774	66.000	0.181	NA	Y	NA
161574	161575	lin2513	lin2514			TRUE	0.994	-3.000	0.642	1.000	Y	NA
161575	161576	lin2514	lin2515			FALSE	0.009	584.000	0.000	0.093	N	NA
161576	161577	lin2515	lin2516			TRUE	0.994	-10.000	0.932	1.000	Y	NA
161577	161578	lin2516	lin2517			FALSE	0.197	76.000	0.034	1.000	N	NA
161578	161579	lin2517	lin2518			FALSE	0.067	193.000	0.034	1.000		NA
161579	161580	lin2518	lin2519			TRUE	0.392	61.000	0.038	1.000		NA
161580	161581	lin2519	lin2520			TRUE	0.355	40.000	0.038	1.000	N	NA
161581	161582	lin2520	lin2521			FALSE	0.049	155.000	0.008	1.000	N	NA
161582	161583	lin2521	lin2522			TRUE	0.828	71.000	0.008	0.003	Y	NA
161583	161584	lin2522	lin2523			FALSE	0.135	141.000	0.455	1.000	N	NA
161584	161585	lin2523	lin2524			TRUE	0.993	-3.000	0.520	1.000	Y	NA
161585	161586	lin2524	lin2525			TRUE	0.994	0.000	0.889	1.000	Y	NA
161587	161588	lin2526	lin2527			FALSE	0.225	133.000	0.407	NA		NA
161595	161596	lin2534	lin2535			TRUE	0.445	55.000	0.103	NA		NA
161596	161597	lin2535	lin2536			TRUE	0.541	41.000	0.153	NA		NA
161597	161598	lin2536	lin2537			FALSE	0.009	647.000	0.000	NA		NA
161598	161599	lin2537	lin2538			TRUE	0.470	53.000	0.159	NA		NA
161599	161600	lin2538	lin2539			TRUE	0.910	15.000	0.068	1.000		NA
161600	161601	lin2539	lin2540			TRUE	0.482	59.000	0.273	1.000		NA
161603	161604	lin2542	lin2543			TRUE	0.925	16.000	0.143	0.018	N	NA
161604	161605	lin2543	lin2544			TRUE	0.576	34.000	0.060	1.000		NA
161605	161606	lin2544	lin2545			FALSE	0.034	259.000	0.032	1.000		NA
161606	161607	lin2545	lin2546			FALSE	0.248	90.000	0.012	1.000		NA
161607	161608	lin2546	lin2547			FALSE	0.097	183.000	0.238	NA		NA
161608	161609	lin2547	lin2548			FALSE	0.209	132.000	0.286	NA		NA
161609	161610	lin2548	lin2549		eno	FALSE	0.221	103.000	0.020	NA		NA
161610	161611	lin2549	lin2550	eno	pgm	TRUE	0.517	135.000	0.136	1.000	Y	NA
161611	161612	lin2550	lin2551	pgm	tpi	TRUE	0.990	2.000	0.138	1.000	Y	NA
161612	161613	lin2551	lin2552	tpi	pgk	TRUE	0.839	46.000	0.141	1.000	Y	NA
161613	161614	lin2552	lin2553	pgk	gap	TRUE	0.622	135.000	0.008	0.004	Y	NA
161614	161615	lin2553	lin2554	gap		TRUE	0.443	33.000	0.084	1.000	N	NA
161615	161616	lin2554	lin2555		sigL	FALSE	0.076	443.000	0.050	1.000	Y	NA
161616	161617	lin2555	lin2556	sigL		FALSE	0.074	151.000	0.103	1.000	N	NA
161617	161618	lin2556	lin2557			FALSE	0.341	79.000	0.113	1.000		NA
161618	161619	lin2557	lin2558			TRUE	0.951	7.000	0.237	1.000		NA
161619	161620	lin2558	lin2559			TRUE	0.902	17.000	0.263	NA		NA
161621	161622	lin2560	lin2561			FALSE	0.010	501.000	0.000	NA		NA
161623	161624	lin2562	lin2563			FALSE	0.006	363.000	0.000	NA	N	NA
161624	161625	lin2563	lin2564			FALSE	0.009	774.000	0.000	1.000		NA
161625	161626	lin2564	lin2565			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
161626	161627	lin2565	lin2566			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
161627	161628	lin2566	lin2567			TRUE	0.963	-18.000	0.375	NA		NA
161628	161629	lin2567	lin2568			TRUE	0.962	-3.000	0.250	NA		NA
161629	161630	lin2568	lin2569			TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
161630	161631	lin2569	lin2570			FALSE	0.253	75.000	0.000	NA		NA
161631	161632	lin2570	lin2571			TRUE	0.494	44.000	0.074	NA		NA
161632	161633	lin2571	lin2572			TRUE	0.955	1.000	0.148	NA		NA
161633	161634	lin2572	lin2573			TRUE	0.965	-3.000	0.333	NA		NA
161634	161635	lin2573	lin2574			TRUE	0.954	7.000	0.333	NA		NA
161635	161636	lin2574	lin2575			TRUE	0.969	-13.000	0.625	NA		NA
161636	161637	lin2575	lin2576			FALSE	0.054	184.000	0.000	NA		NA
161637	161638	lin2576	lin2577			TRUE	0.961	-9.000	0.273	NA		NA
161638	161639	lin2577	lin2578			TRUE	0.970	-3.000	0.538	NA		NA
161639	161640	lin2578	lin2579			TRUE	0.946	14.000	0.538	NA		NA
161640	161641	lin2579	lin2580			TRUE	0.968	-3.000	0.444	NA		NA
161641	161642	lin2580	lin2581			TRUE	0.535	41.000	0.125	NA		NA
161642	161643	lin2581	lin2582			FALSE	0.017	318.000	0.000	NA		NA
161643	161644	lin2582	lin2583			FALSE	0.285	98.000	0.160	1.000		NA
161644	161645	lin2583	lin2584			TRUE	0.932	13.000	0.160	NA		NA
161645	161646	lin2584	lin2585			FALSE	0.036	217.000	0.000	NA		NA
161646	161647	lin2585	lin2586			TRUE	0.947	3.000	0.080	NA		NA
161647	161648	lin2586	lin2587			FALSE	0.020	289.000	0.000	NA		NA
161648	161649	lin2587	lin2588			TRUE	0.790	23.000	0.333	NA		NA
161649	161650	lin2588	lin2589			TRUE	0.821	23.000	0.600	NA		NA
161650	161651	lin2589	lin2590			TRUE	0.479	64.000	0.400	NA		NA
161651	161652	lin2590	lin2591			TRUE	0.953	13.000	0.600	NA		NA
161652	161653	lin2591	lin2592			FALSE	0.013	382.000	0.000	NA		NA
161653	161654	lin2592	lin2593			TRUE	0.970	-3.000	0.500	NA		NA
161654	161655	lin2593	lin2594			FALSE	0.116	133.000	0.000	NA		NA
161655	161656	lin2594	lin2595			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
161656	161657	lin2595	lin2596			FALSE	0.041	203.000	0.000	NA		NA
161657	161658	lin2596	lin2597			FALSE	0.044	199.000	0.000	NA		NA
161658	161659	lin2597	lin2598			TRUE	0.977	-3.000	1.000	NA		NA
161659	161660	lin2598	lin2599			TRUE	0.976	-7.000	1.000	NA		NA
161660	161661	lin2599	lin2600			TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
161661	161662	lin2600	lin2601			TRUE	0.942	13.000	0.000	0.052		NA
161662	161663	lin2601	lin2602			TRUE	0.957	11.000	0.500	NA		NA
161663	161664	lin2602	lin2603			TRUE	0.732	21.000	0.000	NA		NA
161664	161665	lin2603	lin2604			FALSE	0.008	712.000	0.000	NA		NA
161665	161666	lin2604	lin2605			TRUE	0.791	22.000	0.132	NA		NA
161667	161668	lin2606	lin2607			FALSE	0.012	401.000	0.000	NA		NA
161668	161669	lin2607	lin2608			TRUE	0.935	17.000	0.857	NA		NA
161669	161670	lin2608	lin2609			TRUE	0.352	51.000	0.000	NA		NA
161670	161671	lin2609	lin2610			FALSE	0.118	132.000	0.000	NA		NA
398379	161672	lint61	lin2611	tRNA-Arg		FALSE	0.142	121.000	0.000	NA		NA
161674	161675	lin2613	lin2614			FALSE	0.013	240.000	0.000	1.000	N	NA
161675	161676	lin2614	lin2615			TRUE	0.638	26.000	0.028	NA		NA
161676	161677	lin2615	lin2616			TRUE	0.958	8.000	0.470	NA		NA
161677	161678	lin2616	lin2617			TRUE	0.957	2.000	0.214	NA		NA
161678	161679	lin2617	lin2618			FALSE	0.247	109.000	0.131	NA		NA
161679	161680	lin2618	lin2619			TRUE	0.897	45.000	0.122	0.021	Y	NA
161680	161681	lin2619	lin2620		galE	TRUE	0.840	16.000	0.120	1.000	N	NA
161681	161682	lin2620	lin2621	galE	trxB	FALSE	0.142	113.000	0.100	1.000	N	NA
161682	161683	lin2621	lin2622	trxB		FALSE	0.306	78.000	0.025	1.000		NA
161683	161684	lin2622	lin2623			FALSE	0.253	85.000	0.002	1.000		NA
161684	161685	lin2623	lin2624			TRUE	0.933	4.000	0.003	1.000		NA
161685	161686	lin2624	lin2625		lgt	TRUE	0.538	43.000	0.169	1.000		NA
161686	161687	lin2625	lin2626	lgt		FALSE	0.263	92.000	0.494	1.000	N	NA
161687	161688	lin2626	lin2627			FALSE	0.091	187.000	0.215	NA		NA
161688	161689	lin2627	lin2628			TRUE	0.948	9.000	0.241	NA		NA
161689	161690	lin2628	lin2629			TRUE	0.759	24.000	0.316	NA		NA
161690	161691	lin2629	lin2630			TRUE	0.501	68.000	0.667	NA		NA
161691	161692	lin2630	lin2631		uvrA	FALSE	0.038	209.000	0.000	NA		NA
161692	161693	lin2631	lin2632	uvrA	uvrB	TRUE	0.994	8.000	0.154	0.001	Y	NA
161693	161694	lin2632	lin2633	uvrB		FALSE	0.032	248.000	0.007	NA		NA
161694	161695	lin2633	lin2634			TRUE	0.782	22.000	0.093	NA		NA
161695	161696	lin2634	lin2635			TRUE	0.772	22.000	0.059	NA		NA
161696	161697	lin2635	lin2636			FALSE	0.297	107.000	0.333	NA		NA
161697	161698	lin2636	lin2637			FALSE	0.016	271.000	0.027	NA	N	NA
161698	161699	lin2637	lin2638			TRUE	0.986	13.000	0.182	NA	Y	NA
161699	161700	lin2638	lin2639			TRUE	0.991	15.000	0.086	0.001	Y	NA
161700	161701	lin2639	lin2640			TRUE	0.960	28.000	0.490	0.002	Y	NA
161701	161702	lin2640	lin2641			TRUE	0.997	-3.000	0.907	0.002	Y	NA
161702	161703	lin2641	lin2642			TRUE	0.666	94.000	0.093	1.000	Y	NA
161703	161704	lin2642	lin2643		phoR	FALSE	0.012	256.000	0.000	1.000	N	NA
161704	161705	lin2643	lin2644	phoR	phoP	TRUE	0.995	0.000	0.384	0.060	Y	NA
161705	161706	lin2644	lin2645	phoP		FALSE	0.168	141.000	0.188	1.000		NA
161706	161707	lin2645	lin2646			TRUE	0.615	31.000	0.094	1.000		NA
161707	161708	lin2646	lin2647			FALSE	0.216	122.000	0.692	1.000	N	NA
161708	161709	lin2647	lin2648		spl	FALSE	0.255	121.000	0.333	NA		NA
161709	161710	lin2648	lin2649	spl	ftsX	FALSE	0.305	76.000	0.021	NA		NA
161710	161711	lin2649	lin2650	ftsX	ftsE	TRUE	0.993	-10.000	0.431	1.000	Y	NA
161711	161712	lin2650	lin2652	ftsE		FALSE	0.010	505.000	0.000	NA		NA
161712	161713	lin2652	lin2653		prfB	TRUE	0.933	6.000	0.024	NA		NA
161713	161714	lin2653	lin2654	prfB	secA	FALSE	0.033	203.000	0.052	1.000	N	NA
161714	161715	lin2654	lin2655	secA		FALSE	0.023	230.000	0.041	NA	N	NA
161715	161716	lin2655	lin2656		comFC	FALSE	0.072	193.000	0.080	NA		NA
161716	161717	lin2656	lin2657	comFC	comFA	TRUE	0.957	-7.000	0.130	1.000		NA
161717	161718	lin2657	lin2658	comFA		FALSE	0.079	197.000	0.214	NA		NA
161718	161719	lin2658	lin2659			TRUE	0.832	21.000	0.210	NA		NA
161720	161721	lin2660	lin2661			TRUE	0.945	2.000	0.030	1.000		NA
161721	161722	lin2661	lin2662			FALSE	0.094	175.000	0.688	NA	N	NA
161723	161724	lin2663	lin2664			TRUE	0.989	8.000	0.273	1.000	Y	NA
161724	161725	lin2664	lin2665			TRUE	0.989	2.000	0.019	1.000	Y	NA
161725	161726	lin2665	lin2666			TRUE	0.547	123.000	0.038	1.000	Y	NA
161726	161727	lin2666	lin2667			FALSE	0.006	390.000	0.000	1.000	N	NA
161727	161728	lin2667	lin2668			FALSE	0.012	255.000	0.000	1.000	N	NA
161728	161729	lin2668	lin2669		mbl	TRUE	0.631	22.000	0.037	1.000	N	NA
161729	161730	lin2669	lin2670	mbl	murA	FALSE	0.065	163.000	0.126	1.000	N	NA
161730	161731	lin2670	lin2671	murA		FALSE	0.121	167.000	0.279	NA		NA
161731	161732	lin2671	lin2672		atpC	FALSE	0.183	123.000	0.039	NA		NA
161732	161733	lin2672	lin2673	atpC	atpD	TRUE	0.981	22.000	0.837	0.006	Y	NA
161733	161734	lin2673	lin2674	atpD	atpG	TRUE	0.906	61.000	0.724	0.006	Y	NA
161734	161735	lin2674	lin2675	atpG	atpA	TRUE	0.946	38.000	0.846	0.006	Y	NA
161735	161736	lin2675	lin2676	atpA	atpH	TRUE	0.966	27.000	0.864	0.006	Y	NA
161736	161737	lin2676	lin2677	atpH	atpF	TRUE	0.995	-3.000	0.222	0.006	Y	NA
161737	161738	lin2677	lin2678	atpF	atpE	TRUE	0.544	88.000	0.402	0.006		NA
161738	161739	lin2678	lin2679	atpE	atpB	TRUE	0.575	72.000	0.189	0.006		NA
161739	161740	lin2679	lin2680	atpB	atpI	TRUE	0.977	7.000	0.330	0.006		NA
161740	161741	lin2680	lin2681	atpI		FALSE	0.008	832.000	0.000	1.000		NA
161741	161742	lin2681	lin2682		upp	FALSE	0.100	118.000	0.011	1.000	N	NA
161742	161743	lin2682	lin2683	upp	glyA	FALSE	0.086	138.000	0.051	1.000	N	NA
161743	161744	lin2683	lin2684	glyA		FALSE	0.085	136.000	0.037	1.000	N	NA
161744	161745	lin2684	lin2685			TRUE	0.928	-3.000	0.176	NA	N	NA
161745	161746	lin2685	lin2686			FALSE	0.140	300.000	0.204	NA	Y	NA
161746	161747	lin2686	lin2687		prf1	TRUE	0.990	-13.000	0.084	1.000	Y	NA
161747	161748	lin2687	lin2688	prf1		TRUE	0.596	23.000	0.062	1.000	N	NA
161748	161749	lin2688	lin2689		thrB	FALSE	0.181	122.000	0.019	0.091	N	NA
161749	161750	lin2689	lin2690	thrB	thrC	TRUE	0.992	0.000	0.221	1.000	Y	NA
161750	161751	lin2690	lin2691	thrC	hom	TRUE	0.989	3.000	0.034	1.000	Y	NA
161751	161752	lin2691	lin2692	hom	rpmE	FALSE	0.016	222.000	0.000	1.000	N	NA
161752	161753	lin2692	lin2693	rpmE		FALSE	0.121	140.000	0.004	NA		NA
161753	161754	lin2693	lin2694		gtcA	TRUE	0.899	15.000	0.029	NA		NA
161754	161755	lin2694	lin2695	gtcA		TRUE	0.957	-3.000	0.129	NA		NA
161755	161756	lin2695	lin2696		rho	FALSE	0.148	81.000	0.007	NA	N	NA
161756	161757	lin2696	lin2697	rho	murZ	FALSE	0.111	115.000	0.022	1.000	N	NA
161757	161758	lin2697	lin2698	murZ		FALSE	0.208	118.000	0.072	NA		NA
161758	161759	lin2698	lin2699			TRUE	0.957	5.000	0.336	NA		NA
161759	161760	lin2699	lin2700			TRUE	0.996	-7.000	0.413	0.007	Y	NA
161760	161761	lin2700	lin2701		fbaA	FALSE	0.007	323.000	0.000	1.000	N	NA
161761	161762	lin2701	lin2702	fbaA		FALSE	0.065	169.000	0.189	1.000	N	NA
161764	161765	lin2704	lin2705	pyrG		FALSE	0.010	365.000	0.029	1.000	N	NA
161765	161766	lin2705	lin2706		argS	FALSE	0.009	367.000	0.010	1.000	N	NA
161766	161767	lin2706	lin2707	argS		TRUE	0.954	-3.000	0.079	NA		NA
161767	161768	lin2707	lin2708			FALSE	0.300	78.000	0.026	NA		NA
161770	161771	lin2710	lin2711			TRUE	0.831	24.000	0.082	0.018		NA
161771	161772	lin2711	lin2712			FALSE	0.017	318.000	0.000	NA		NA
161772	161773	lin2712	lin2713			TRUE	0.829	24.000	1.000	NA		NA
161773	161774	lin2713	lin2714			FALSE	0.147	155.000	0.333	NA		NA
161774	161775	lin2714	lin2715			FALSE	0.193	136.000	0.267	NA		NA
161775	161776	lin2715	lin2716			TRUE	0.668	24.000	0.018	NA		NA
161776	161777	lin2716	lin2717			TRUE	0.895	1.000	0.018	1.000	N	NA
161777	161778	lin2717	lin2718			TRUE	0.921	3.000	0.175	1.000	N	NA
161778	161779	lin2718	lin2719			FALSE	0.287	97.000	0.175	NA		NA
161779	161780	lin2719	lin2720			TRUE	0.467	49.000	0.090	NA		NA
161780	161781	lin2720	lin2721			FALSE	0.160	131.000	0.025	1.000		NA
161782	161783	lin2722	lin2723			TRUE	0.961	13.000	0.917	NA		NA
161784	161785	lin2724	lin2725			FALSE	0.015	351.000	0.000	1.000		NA
161785	161786	lin2725	lin2726			TRUE	0.994	0.000	0.852	1.000	Y	NA
161786	161787	lin2726	lin2727			TRUE	0.416	79.000	0.367	0.061	N	NA
161787	161788	lin2727	lin2728			TRUE	0.994	-3.000	0.833	1.000	Y	NA
161788	161789	lin2728	lin2729			TRUE	0.407	47.000	0.278	1.000	N	NA
161789	161790	lin2729	lin2730			TRUE	0.573	62.000	0.923	NA		NA
161790	161791	lin2730	lin2731			TRUE	0.964	0.000	0.333	NA		NA
161793	161794	lin2733	lin2734			FALSE	0.248	101.000	0.524	1.000	N	NA
161794	161795	lin2734	lin2735			FALSE	0.169	134.000	0.095	NA		NA
161795	161796	lin2735	lin2736			TRUE	0.937	17.000	1.000	NA		NA
161796	398378	lin2736	lint62		tRNA-Thr	FALSE	0.011	432.000	0.000	NA		NA
398378	398377	lint62	lint63	tRNA-Thr	tRNA-Asn	TRUE	0.585	25.000	0.000	NA		NA
398377	1789949	lint63	linr16	tRNA-Asn		TRUE	0.868	15.000	0.000	NA		NA
1789949	1789950	linr16	linr17			FALSE	0.118	132.000	0.000	NA		NA
1789950	398376	linr17	lint64		tRNA-Ala	FALSE	0.061	173.000	0.000	NA		NA
398376	398375	lint64	lint65	tRNA-Ala	tRNA-Ile	TRUE	0.373	47.000	0.000	NA		NA
398375	1789951	lint65	linr18	tRNA-Ile		FALSE	0.129	128.000	0.000	NA		NA
1789951	161797	linr18	lin2737			FALSE	0.021	281.000	0.000	NA		NA
161799	161800	lin2739	lin2740			TRUE	0.817	22.000	0.250	1.000		NA
161800	161801	lin2740	lin2741			FALSE	0.010	506.000	0.000	NA		NA
161801	161802	lin2741	lin2742			FALSE	0.008	884.000	0.000	NA		NA
161802	161803	lin2742	lin2743			TRUE	0.912	6.000	0.000	NA		NA
161803	161804	lin2743	lin2744			TRUE	0.968	1.000	0.546	NA		NA
161804	161805	lin2744	lin2745		rpsI	FALSE	0.011	439.000	0.000	1.000		NA
161805	161806	lin2745	lin2746	rpsI	rplM	TRUE	0.978	22.000	0.601	0.016	Y	NA
161806	161807	lin2746	lin2747	rplM	truA	FALSE	0.273	195.000	0.052	1.000	Y	NA
161807	161808	lin2747	lin2748	truA		TRUE	0.891	6.000	0.049	1.000	N	NA
161808	161809	lin2748	lin2749			TRUE	0.989	3.000	0.044	1.000	Y	NA
161809	161810	lin2749	lin2750			TRUE	0.995	-24.000	0.713	0.089	Y	NA
161811	161812	lin2751	lin2752			FALSE	0.251	118.000	0.238	1.000		NA
161813	161814	lin2753	lin2754		rplQ	FALSE	0.028	242.000	0.000	NA		NA
161814	161815	lin2754	lin2755	rplQ	rpoA	TRUE	0.902	17.000	0.873	1.000	N	NA
161815	161816	lin2755	lin2756	rpoA	rpsK	FALSE	0.191	110.000	0.308	1.000	N	NA
161816	161817	lin2756	lin2757	rpsK	rpsM	TRUE	0.975	23.000	0.810	0.016	Y	NA
161817	161818	lin2757	lin2758	rpsM	rpmJ	TRUE	0.931	19.000	0.194	0.016		NA
161818	161819	lin2758	lin2759	rpmJ	infA	FALSE	0.295	104.000	0.257	1.000		NA
161819	161820	lin2759	lin2760	infA	adk	FALSE	0.010	388.000	0.059	1.000	N	NA
161820	161821	lin2760	lin2761	adk	secY	FALSE	0.335	60.000	0.241	1.000	N	NA
161821	161822	lin2761	lin2762	secY	rplO	TRUE	0.958	0.000	0.730	1.000	N	NA
161822	161823	lin2762	lin2763	rplO	rpmD	TRUE	0.912	58.000	0.653	0.003	Y	NA
161823	161824	lin2763	lin2764	rpmD	rpsE	TRUE	0.990	17.000	0.789	0.021	Y	NA
161824	161825	lin2764	lin2765	rpsE	rplR	TRUE	0.980	22.000	0.814	0.021	Y	NA
161825	161826	lin2765	lin2766	rplR	rplF	TRUE	0.940	40.000	0.815	0.016	Y	NA
161826	161827	lin2766	lin2767	rplF	rpsH	TRUE	0.955	31.000	0.808	0.016	Y	NA
161827	161828	lin2767	lin2768	rpsH	rpsN	TRUE	0.947	31.000	0.473	0.016	Y	NA
161828	161829	lin2768	lin2769	rpsN	rplE	TRUE	0.947	31.000	0.496	0.016	Y	NA
161829	161830	lin2769	lin2770	rplE	rplX	TRUE	0.942	27.000	0.057	0.016	Y	NA
161830	161831	lin2770	lin2771	rplX	rplN	TRUE	0.910	38.000	0.071	0.021	Y	NA
161831	161832	lin2771	lin2772	rplN	rpsQ	TRUE	0.862	80.000	0.791	0.021	Y	NA
161832	161833	lin2772	lin2773	rpsQ	rpmC	TRUE	0.961	28.000	0.828	0.016	Y	NA
161833	161834	lin2773	lin2774	rpmC	rplP	TRUE	0.996	-10.000	0.802	0.016	Y	NA
161834	161835	lin2774	lin2775	rplP	rpsC	TRUE	0.996	3.000	0.828	0.021	Y	NA
161835	161836	lin2775	lin2776	rpsC	rplV	TRUE	0.996	4.000	0.719	0.021	Y	NA
161836	161837	lin2776	lin2777	rplV	rpsS	TRUE	0.982	21.000	0.769	0.021	Y	NA
161837	161838	lin2777	lin2778	rpsS	rplB	TRUE	0.845	88.000	0.820	0.021	Y	NA
161838	161839	lin2778	lin2779	rplB	rplW	TRUE	0.938	41.000	0.849	0.017	Y	NA
161839	161840	lin2779	lin2780	rplW	rplD	TRUE	0.995	0.000	0.307	0.016	Y	NA
161840	161841	lin2780	lin2781	rplD	rplC	TRUE	0.961	26.000	0.544	0.016	Y	NA
161841	161842	lin2781	lin2782	rplC	rpsJ	TRUE	0.938	35.000	0.467	0.021	Y	NA
161842	161843	lin2782	lin2783	rpsJ		FALSE	0.006	361.000	0.000	1.000	N	NA
161843	161844	lin2783	lin2784			TRUE	0.773	20.000	0.224	1.000	N	NA
161844	161845	lin2784	lin2785			TRUE	0.760	82.000	0.526	1.000	Y	NA
161845	161846	lin2785	lin2786			FALSE	0.138	163.000	0.333	1.000		NA
161847	161848	lin2787	lin2788			FALSE	0.099	177.000	0.190	NA		NA
161848	161849	lin2788	lin2789			TRUE	0.586	33.000	0.078	NA		NA
161849	161850	lin2789	lin2790			TRUE	0.793	22.000	0.118	1.000		NA
161850	161851	lin2790	lin2791			FALSE	0.322	91.000	0.222	1.000		NA
161852	161853	lin2792	lin2793			TRUE	0.663	27.000	0.103	NA		NA
161853	161854	lin2793	lin2794			FALSE	0.339	79.000	0.136	NA		NA
161854	161855	lin2794	lin2795			TRUE	0.960	1.000	0.264	NA		NA
161855	161856	lin2795	lin2796			TRUE	0.956	-40.000	0.245	NA		NA
161856	161857	lin2796	lin2797			TRUE	0.962	13.000	0.895	1.000		NA
161857	161858	lin2797	lin2798			TRUE	0.464	71.000	0.484	1.000		NA
161858	161859	lin2798	lin2799			TRUE	0.849	27.000	0.595	0.024		NA
161859	161860	lin2799	lin2800			TRUE	0.995	3.000	0.405	0.021	Y	NA
161860	161861	lin2800	lin2801			FALSE	0.123	194.000	0.471	0.021	N	NA
161861	161862	lin2801	lin2802		tufA	FALSE	0.049	155.000	0.006	1.000	N	NA
161862	161863	lin2802	lin2803	tufA	fus	TRUE	0.807	109.000	0.400	0.001	Y	NA
161863	161864	lin2803	lin2804	fus	rpsG	TRUE	0.819	66.000	0.579	1.000	Y	NA
161864	161865	lin2804	lin2805	rpsG	rpsL	TRUE	0.944	31.000	0.224	0.003	Y	NA
161865	161866	lin2805	lin2806	rpsL		FALSE	0.036	193.000	0.037	1.000	N	NA
161866	161867	lin2806	lin2807			TRUE	0.910	16.000	0.169	1.000		NA
161867	161868	lin2807	lin2808			FALSE	0.164	131.000	0.034	1.000		NA
161868	161869	lin2808	lin2809			TRUE	0.992	-3.000	0.200	1.000	Y	NA
161869	161870	lin2809	lin2810			TRUE	0.920	34.000	0.818	1.000	Y	NA
161870	161871	lin2810	lin2811			TRUE	0.992	9.000	0.786	1.000	Y	NA
161871	161872	lin2811	lin2812			FALSE	0.061	195.000	0.414	1.000	N	NA
161872	161873	lin2812	lin2813			TRUE	0.994	2.000	0.172	0.015	Y	NA
161873	161874	lin2813	lin2814			TRUE	0.526	37.000	0.455	1.000	N	NA
161874	161875	lin2814	lin2815			TRUE	0.880	62.000	0.407	0.024	Y	NA
161875	161876	lin2815	lin2816			TRUE	0.898	57.000	0.519	0.021	Y	NA
161876	161877	lin2816	lin2817			TRUE	0.757	34.000	0.800	0.021	N	NA
161877	161878	lin2817	lin2818			FALSE	0.013	370.000	0.000	NA		NA
161878	161879	lin2818	lin2819			TRUE	0.378	74.000	0.192	NA		NA
161880	161881	lin2820	lin2821			TRUE	0.400	46.000	0.233	1.000	N	NA
161881	161882	lin2821	lin2822			FALSE	0.076	199.000	0.200	NA		NA
161882	161883	lin2822	lin2823			TRUE	0.954	13.000	0.636	NA		NA
1789952	161884	lin2824	lin2825			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
161884	161885	lin2825	lin2826			TRUE	0.532	41.000	0.095	1.000		NA
161885	161886	lin2826	lin2827			TRUE	0.992	-3.000	0.250	1.000	Y	NA
161886	161887	lin2827	lin2828		kdpC	TRUE	0.842	19.000	0.017	0.060	N	NA
161887	161888	lin2828	lin2829	kdpC	kdpB	TRUE	0.994	15.000	0.877	0.002	Y	NA
161888	161889	lin2829	lin2830	kdpB	kdpA	TRUE	0.993	12.000	0.112	0.002	Y	NA
161890	161891	lin2831	lin2832			TRUE	0.678	137.000	0.429	0.021	Y	NA
161891	161892	lin2832	lin2833			TRUE	0.932	37.000	0.429	0.021	Y	NA
161893	161894	lin2834	lin2835			TRUE	0.995	-3.000	0.182	0.006	Y	NA
161894	161895	lin2835	lin2836			TRUE	0.933	1.000	0.000	0.061	N	NA
161895	161896	lin2836	lin2837			FALSE	0.004	555.000	0.000	1.000	N	NA
161898	161899	lin2839	lin2840			FALSE	0.009	637.000	0.000	NA		NA
161899	161900	lin2840	lin2841			FALSE	0.217	108.000	0.033	NA		NA
161900	161901	lin2841	lin2842			FALSE	0.289	53.000	0.045	1.000	N	NA
161902	161903	lin2843	lin2844			TRUE	0.977	22.000	0.316	0.002	Y	NA
161903	161904	lin2844	lin2845			TRUE	0.954	4.000	0.211	1.000		NA
161904	161905	lin2845	lin2846			FALSE	0.177	106.000	0.000	1.000		NA
161905	161906	lin2846	lin2847			FALSE	0.222	117.000	0.094	1.000		NA
161906	161907	lin2847	lin2848			FALSE	0.197	127.000	0.094	1.000		NA
161908	161909	lin2849	lin2850		recR	TRUE	0.908	15.000	0.071	NA		NA
161909	161910	lin2850	lin2851	recR		FALSE	0.332	110.000	0.604	NA		NA
161910	161911	lin2851	lin2852		dnaX	TRUE	0.609	30.000	0.071	NA		NA
161911	161912	lin2852	lin2853	dnaX		FALSE	0.026	251.000	0.000	NA		NA
161912	161913	lin2853	lin2854			TRUE	0.920	18.000	0.706	NA		NA
161913	161914	lin2854	lin2855			TRUE	0.969	3.000	0.706	NA		NA
161914	161915	lin2855	lin2856			FALSE	0.244	134.000	0.588	NA		NA
161919	161920	lin2860	lin2861			FALSE	0.254	112.000	0.200	NA		NA
161920	161921	lin2861	lin2862			TRUE	0.403	42.000	0.000	NA		NA
161921	161922	lin2862	lin2863		cydD	FALSE	0.135	142.000	0.034	1.000		NA
161922	161923	lin2863	lin2864	cydD	cydC	TRUE	0.995	0.000	0.168	0.007	Y	NA
161923	161924	lin2864	lin2865	cydC	cydB	TRUE	0.991	0.000	0.151	1.000	Y	NA
161924	161925	lin2865	lin2866	cydB	cydA	TRUE	0.994	-13.000	0.153	0.020	Y	NA
161925	161926	lin2866	lin2867	cydA		FALSE	0.006	390.000	0.000	1.000	N	NA
161929	161930	lin2870	lin2871			TRUE	0.475	54.000	0.172	1.000		NA
161931	161932	lin2872	lin2873			TRUE	0.517	58.000	0.440	NA		NA
161932	161933	lin2873	lin2874			TRUE	0.952	-3.000	0.520	1.000	N	NA
161934	161935	lin2875	lin2876			TRUE	0.353	85.000	0.196	0.043	N	NA
161935	161936	lin2876	lin2877			TRUE	0.981	0.000	0.524	0.058		NA
161937	161938	lin2878	lin2879			TRUE	0.951	14.000	0.692	NA		NA
161938	161939	lin2879	lin2880			FALSE	0.247	108.000	0.120	NA		NA
161939	161940	lin2880	lin2881			TRUE	0.384	68.000	0.122	NA		NA
161940	161941	lin2881	lin2882			FALSE	0.286	93.000	0.122	NA		NA
161941	161942	lin2882	lin2883			TRUE	0.958	-7.000	0.180	NA		NA
161942	161943	lin2883	lin2884			TRUE	0.956	-10.000	0.180	NA		NA
161943	161944	lin2884	lin2885			FALSE	0.275	117.000	0.375	NA		NA
161944	161945	lin2885	lin2886			TRUE	0.844	19.000	0.049	NA		NA
161945	161946	lin2886	lin2887			FALSE	0.074	145.000	0.049	1.000	N	NA
161948	161949	lin2889	lin2890		serS	TRUE	0.664	20.000	0.014	NA	N	NA
161949	161950	lin2890	lin2891	serS		FALSE	0.016	336.000	0.000	1.000		NA
161951	161952	lin2892	lin2893			TRUE	0.989	-3.000	0.006	1.000	Y	NA
161952	161953	lin2893	lin2894			FALSE	0.054	162.000	0.033	1.000	N	NA
161953	161954	lin2894	lin2895			TRUE	0.996	0.000	0.720	0.007	Y	NA
161954	161955	lin2895	lin2896			FALSE	0.040	205.000	0.000	NA		NA
161956	161957	lin2897	lin2898			FALSE	0.195	177.000	0.333	0.024		NA
161957	161958	lin2898	lin2900			FALSE	0.008	2285.000	0.000	1.000		NA
161958	161959	lin2900	lin2901		guaB	FALSE	0.061	160.000	0.072	1.000	N	NA
161959	161960	lin2901	lin2902	guaB		FALSE	0.020	289.000	0.000	NA		NA
161960	161961	lin2902	lin2903			TRUE	0.426	58.000	0.092	NA		NA
161962	161963	lin2904	lin2905			TRUE	0.885	46.000	0.765	1.000	Y	NA
161963	161964	lin2905	lin2906			TRUE	0.948	34.000	0.789	0.021	Y	NA
161964	161965	lin2906	lin2907			TRUE	0.990	12.000	0.524	1.000	Y	NA
161965	161966	lin2907	lin2908			TRUE	0.993	-7.000	0.429	1.000	Y	NA
161967	161968	lin2909	lin2910			FALSE	0.280	100.000	0.177	NA		NA
161968	161969	lin2910	lin2911			TRUE	0.476	53.000	0.177	NA		NA
161969	161970	lin2911	lin2912			TRUE	0.770	29.000	1.000	NA		NA
161972	161973	lin2914	lin2915			TRUE	0.969	-7.000	0.520	NA		NA
161975	161976	lin2917	lin2918			FALSE	0.035	219.000	0.000	NA		NA
161976	161977	lin2918	lin2919			FALSE	0.071	175.000	0.002	NA		NA
161977	161978	lin2919	lin2920		kat	FALSE	0.054	149.000	0.002	1.000	N	NA
161978	161979	lin2920	lin2921	kat		FALSE	0.118	149.000	0.040	NA		NA
161979	161980	lin2921	lin2922		parB	TRUE	0.919	13.000	0.039	NA		NA
161980	161981	lin2922	lin2923	parB	parA	TRUE	0.960	-7.000	0.827	1.000	N	NA
161981	161982	lin2923	lin2924	parA		FALSE	0.033	225.000	0.000	1.000		NA
161982	161983	lin2924	lin2925			FALSE	0.174	166.000	0.833	NA		NA
161983	161984	lin2925	lin2926			TRUE	0.934	12.000	0.098	NA		NA
161984	161985	lin2926	lin2927			FALSE	0.314	181.000	0.057	1.000	Y	NA
161985	161986	lin2927	lin2928			TRUE	0.992	-16.000	0.380	1.000	Y	NA
161986	161987	lin2928	lin2929			TRUE	0.930	25.000	0.270	1.000	Y	NA
161987	161988	lin2929	lin2930			TRUE	0.954	13.000	0.588	1.000		NA
161988	161989	lin2930	lin2931			TRUE	0.384	63.000	0.041	1.000		NA
161989	161990	lin2931	lin2932			TRUE	0.566	34.000	0.041	1.000		NA
161990	161991	lin2932	lin2933			TRUE	0.842	20.000	0.130	1.000		NA
161991	161992	lin2933	lin2934		gidB	FALSE	0.026	202.000	0.003	1.000	N	NA
161992	161993	lin2934	lin2935	gidB		FALSE	0.011	431.000	0.000	NA		NA
161993	161994	lin2935	lin2936			TRUE	0.976	-7.000	1.000	NA		NA
161994	161995	lin2936	lin2937			TRUE	0.965	3.000	0.500	NA		NA
161995	161996	lin2937	lin2938			FALSE	0.160	112.000	0.000	NA		NA
161996	161997	lin2938	lin2939			FALSE	0.214	128.000	0.222	NA		NA
161997	161998	lin2939	lin2940			FALSE	0.031	231.000	0.000	NA		NA
161998	161999	lin2940	lin2941			TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
161999	162000	lin2941	lin2942		gidA	FALSE	0.014	362.000	0.000	NA		NA
162000	162001	lin2942	lin2943	gidA		TRUE	0.737	25.000	0.266	1.000		NA
162003	162004	lin2945	lin2946			TRUE	0.947	-18.000	0.065	NA		NA
162004	162005	lin2946	lin2947			TRUE	0.848	20.000	0.196	NA		NA
162007	162008	lin2949	lin2950			FALSE	0.339	88.000	0.258	1.000		NA
162008	162009	lin2950	lin2951			TRUE	0.942	16.000	0.750	1.000		NA
162009	162010	lin2951	lin2952			TRUE	0.976	0.000	0.909	1.000		NA
162010	162011	lin2952	lin2953			FALSE	0.080	195.000	0.182	1.000		NA
162011	162012	lin2953	lin2954			FALSE	0.130	129.000	0.000	1.000		NA
162012	162013	lin2954	lin2955			TRUE	0.932	8.000	0.038	NA		NA
162013	162014	lin2955	lin2956			FALSE	0.292	89.000	0.109	NA		NA
162014	162015	lin2956	lin2957		serC	TRUE	0.992	-7.000	0.238	1.000	Y	NA
162015	1789953	lin2957	lin2958	serC		FALSE	0.013	371.000	0.000	NA		NA
1789953	162016	lin2958	lin2959			TRUE	0.921	-37.000	0.000	NA		NA
162016	162017	lin2959	lin2960			TRUE	0.945	14.000	0.474	1.000		NA
162017	162018	lin2960	lin2961			TRUE	0.353	104.000	0.632	NA		NA
162020	162021	lin2963	lin2964			FALSE	0.192	123.000	0.051	1.000		NA
162021	162022	lin2964	lin2965			TRUE	0.963	-3.000	0.231	1.000		NA
162022	162023	lin2965	lin2966			TRUE	0.991	-3.000	0.100	1.000	Y	NA
162023	162024	lin2966	lin2967			TRUE	0.956	-3.000	0.083	1.000		NA
162024	162025	lin2967	lin2968			TRUE	0.503	57.000	0.347	NA		NA
162025	162026	lin2968	lin2969			TRUE	0.899	13.000	0.261	NA	N	NA
162026	162027	lin2969	lin2970			TRUE	0.796	19.000	0.205	1.000	N	NA
162027	162028	lin2970	lin2971			TRUE	0.996	-13.000	0.805	0.027	Y	NA
162028	162029	lin2971	lin2972			TRUE	0.860	76.000	0.620	0.027	Y	NA
162029	162030	lin2972	lin2973			TRUE	0.993	-3.000	0.360	1.000	Y	NA
162031	398374	lin2974	lint66		tRNA-Val	TRUE	0.696	22.000	0.000	NA		NA
162032	162033	lin2975	lin2976			FALSE	0.051	181.000	0.143	NA	N	NA
162035	162036	lin2978	lin2979			TRUE	0.929	13.000	0.112	NA		NA
162036	162037	lin2979	lin2980			TRUE	0.987	13.000	0.247	1.000	Y	NA
162037	162038	lin2980	lin2981			TRUE	0.988	13.000	0.387	1.000	Y	NA
162038	162039	lin2981	lin2982			TRUE	0.970	19.000	0.158	1.000	Y	NA
162041	162042	lin2984	lin2985			TRUE	0.406	55.000	0.029	NA		NA
162042	162043	lin2985	lin2986			TRUE	0.957	-3.000	0.106	1.000		NA
162043	162044	lin2986	lin2987		rnpA	TRUE	0.357	41.000	0.052	1.000	N	NA
162044	162045	lin2987	lin2988	rnpA	rpmH	TRUE	0.624	90.000	0.787	0.001		NA
162045	162046	lin2988	lin2989	rpmH		FALSE	0.080	168.000	0.011	NA		NA
187259	187260			pli0001	pli0002	FALSE	0.239	114.000	0.167	NA		NA
187260	187261			pli0002	pli0003	TRUE	0.967	11.000	1.000	NA		NA
187261	187262			pli0003	pli0004	TRUE	0.627	85.000	0.000	1.000	Y	NA
187262	187263			pli0004	pli0005	TRUE	0.963	4.000	0.500	NA		NA
187265	187266			pli0007	pli0008	FALSE	0.156	114.000	0.000	NA		NA
187266	187267			pli0008	pli0009	FALSE	0.012	393.000	0.000	NA		NA
187267	187268			pli0009	pli0010	TRUE	0.929	-7.000	0.000	NA		NA
187268	187269			pli0010	pli0011	TRUE	0.955	12.000	0.500	NA		NA
187271	187272			pli0013	pli0014	TRUE	0.893	15.000	0.013	NA		NA
187272	187273			pli0014	pli0015	TRUE	0.855	16.000	0.000	1.000		NA
1789954	187274	pli0016			pli0017	FALSE	0.024	259.000	0.000	NA		NA
187274	1789955		pli0018	pli0017		FALSE	0.016	321.000	0.000	NA		NA
1789955	1789956	pli0018	pli0019			TRUE	0.497	31.000	0.000	NA		NA
187275	187276			pli0020	pli0021	FALSE	0.043	275.000	0.000	0.049		NA
187276	187277			pli0021	pli0022	TRUE	0.931	-3.000	0.000	NA		NA
187277	187278			pli0022	pli0023	TRUE	0.969	0.000	0.500	NA		NA
187278	187279			pli0023	pli0024	FALSE	0.136	258.000	0.000	1.000	Y	NA
187279	187280			pli0024	pli0025	FALSE	0.311	196.000	0.000	0.049	Y	NA
187281	187282			pli0026	pli0027	TRUE	0.524	36.000	0.024	NA		NA
187283	187284			pli0028	pli0029	TRUE	0.879	38.000	0.000	0.049	Y	NA
187284	187285			pli0029	pli0030	TRUE	0.957	3.000	0.253	NA		NA
187285	187286			pli0030	pli0031	TRUE	0.969	1.000	0.565	NA		NA
187287	1789957		pli0033	pli0032		FALSE	0.326	57.000	0.000	NA		NA
1789957	187288	pli0033			pli0034	FALSE	0.201	91.000	0.000	NA		NA
187288	187289			pli0034	pli0035	TRUE	0.927	2.000	0.000	1.000		NA
187289	187290			pli0035	pli0036	FALSE	0.118	134.000	0.000	1.000		NA
187290	187291			pli0036	pli0037	FALSE	0.274	36.000	0.000	1.000	N	NA
187291	187292			pli0037	pli0038	TRUE	0.684	87.000	0.093	1.000	Y	NA
187292	187293			pli0038	pli0039	TRUE	0.868	54.000	0.000	0.001	Y	NA
187293	187294			pli0039	pli0040	TRUE	0.739	21.000	0.000	1.000		NA
187294	187295			pli0040	pli0041	FALSE	0.021	282.000	0.000	1.000		NA
187295	187296			pli0041	pli0042	TRUE	0.433	38.000	0.000	NA		NA
187300	187301			pli0046	pli0047	FALSE	0.109	191.000	0.500	NA		NA
187301	187302			pli0047	pli0048	FALSE	0.010	463.000	0.000	NA		NA
187304	187305			pli0050	pli0051	TRUE	0.992	-7.000	0.243	1.000	Y	NA
187305	187306			pli0051	pli0052	FALSE	0.008	308.000	0.000	1.000	N	NA
187306	187307			pli0052	pli0053	TRUE	0.992	14.000	0.201	0.002	Y	NA
187307	187308			pli0053	pli0054	TRUE	0.403	50.000	0.006	NA		NA
187308	187309			pli0054	pli0055	TRUE	0.689	23.000	0.006	NA		NA
187310	187311			pli0056	pli0057	FALSE	0.031	231.000	0.000	NA		NA
187311	187312			pli0057	pli0058	TRUE	0.972	-7.000	0.667	NA		NA
187313	187314			pli0059	pli0060	FALSE	0.010	274.000	0.000	1.000	N	NA
187314	187315			pli0060	pli0061	TRUE	0.944	-3.000	0.333	1.000	N	NA
187317	187318			pli0063	pli0064	FALSE	0.035	220.000	0.000	NA		NA
187318	187319			pli0064	pli0065	TRUE	0.858	22.000	0.667	NA		NA
187319	187320			pli0065	pli0066	FALSE	0.144	162.000	0.400	NA		NA
187320	187321			pli0066	pli0067	TRUE	0.972	-12.000	0.800	NA		NA
187322	187323			pli0068	pli0069	TRUE	0.941	-7.000	0.006	NA		NA
187324	187325			pli0070	pli0071	FALSE	0.017	320.000	0.000	NA		NA
187325	187326			pli0071	pli0072	TRUE	0.988	14.000	0.000	0.007	Y	NA
187327	187328			pli0073	pli0074	TRUE	0.964	7.000	0.667	NA		NA
187328	187329			pli0074	pli0075	FALSE	0.278	110.000	0.286	NA		NA
187329	187330			pli0075	pli0076	FALSE	0.008	1019.000	0.000	NA		NA
187330	187331			pli0076	pli0077	TRUE	0.829	54.000	0.000	0.049	Y	NA
1789958	187332	pli0078			pli0079	FALSE	0.090	147.000	0.000	NA		NA
187332	187333			pli0079	pli0080	TRUE	0.827	17.000	0.000	NA		NA