MicrobesOnline Operon Predictions for Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1783087 1783088 CHU_0001 CHU_0002     TRUE 0.996 -3.000 0.118 NA Y NA
 1783088 1783089 CHU_0002 CHU_0003     FALSE 0.157 140.000 0.000 1.000 N NA
 1783089 1783090 CHU_0003 CHU_0004     TRUE 0.945 2.000 0.000 1.000   NA
 1783090 1783091 CHU_0004 CHU_0005   dedA TRUE 0.983 10.000 0.048 NA   NA
 1783091 1783092 CHU_0005 CHU_0006 dedA aroE TRUE 0.747 77.000 0.052 NA   NA
 1783094 1783095 CHU_0008 CHU_0009 uvrB dnaQ FALSE 0.236 220.000 0.000 0.065 Y NA
 1783095 1783096 CHU_0009 CHU_0010 dnaQ   FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783097 1783098 CHU_0011 CHU_0012     FALSE 0.397 60.000 0.000 NA N NA
 1783098 1783099 CHU_0012 CHU_0013   nagA TRUE 0.440 149.000 0.032 1.000 N NA
 1783100 1783101 CHU_0014 CHU_0015 mutL   TRUE 0.973 18.000 0.063 1.000   NA
 1783101 1783102 CHU_0015 CHU_0016     TRUE 0.996 17.000 0.817 0.069   NA
 1783102 1783103 CHU_0016 CHU_0017   paaG TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1783103 1783104 CHU_0017 CHU_0018 paaG cap TRUE 0.994 3.000 0.085 1.000   NA
 1783104 1783105 CHU_0018 CHU_0019 cap dut TRUE 0.975 14.000 0.042 1.000   NA
 1783105 1783106 CHU_0019 CHU_0020 dut rfbA TRUE 0.641 88.000 0.029 1.000 N NA
 1783106 1783107 CHU_0020 CHU_0021 rfbA   TRUE 0.975 -13.000 0.085 1.000   NA
 1783107 1783108 CHU_0021 CHU_0022     TRUE 0.924 -37.000 0.055 NA   NA
 1783108 1783109 CHU_0022 CHU_0023   yibP TRUE 0.966 -28.000 0.155 NA   NA
 1783109 1783110 CHU_0023 CHU_0024 yibP tatA TRUE 0.555 87.000 0.014 1.000 N NA
 1783110 1783111 CHU_0024 CHU_0025 tatA gatA TRUE 0.979 4.000 0.011 1.000 N NA
 1783111 1783112 CHU_0025 CHU_0026 gatA mltD TRUE 0.949 -10.000 0.018 1.000 N NA
 1783112 1783113 CHU_0026 CHU_0027 mltD maeB TRUE 0.780 52.000 0.022 1.000 N NA
 1783113 1783114 CHU_0027 CHU_0028 maeB ruvA TRUE 0.981 -3.000 0.033 1.000 N NA
 1783114 1783115 CHU_0028 CHU_0029 ruvA sprA TRUE 0.970 10.000 0.018 NA   NA
 1783115 1783116 CHU_0029 CHU_0030 sprA gcvH TRUE 0.848 61.000 0.072 NA   NA
 1783116 1783117 CHU_0030 CHU_0031 gcvH   TRUE 0.869 -34.000 0.020 NA   NA
 1783117 1783118 CHU_0031 CHU_0032   iap FALSE 0.311 75.000 0.000 NA   NA
 1783118 1783119 CHU_0032 CHU_0033 iap   FALSE 0.019 688.000 0.000 NA   NA
 1783119 1783120 CHU_0033 CHU_0034     FALSE 0.094 174.000 0.000 NA   NA
 1783120 1783121 CHU_0034 CHU_0035     TRUE 0.986 -10.000 0.182 NA   NA
 1783121 1783122 CHU_0035 CHU_0036   coiA FALSE 0.164 115.000 0.000 NA   NA
 1783122 1783123 CHU_0036 CHU_0037 coiA   TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1783123 1783124 CHU_0037 CHU_0038     TRUE 0.997 5.000 0.400 1.000   NA
 1783124 1783125 CHU_0038 CHU_0039     TRUE 0.993 -13.000 0.714 NA   NA
 1783125 1783126 CHU_0039 CHU_0040     TRUE 0.992 -10.000 0.429 NA   NA
 1783126 1783127 CHU_0040 CHU_0041     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783127 1783128 CHU_0041 CHU_0042     TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1783128 1783129 CHU_0042 CHU_0043     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783133 1783134 CHU_0047 CHU_0048     FALSE 0.161 117.000 0.000 NA   NA
 1783136 1783137 CHU_0050 CHU_0051 pinQ tnpX FALSE 0.100 707.000 0.000 0.002 Y NA
 1783138 1783139 CHU_0052 CHU_0053 degQ dhaL TRUE 0.722 75.000 0.032 1.000 N NA
 1783139 1783140 CHU_0053 CHU_0054 dhaL atoC TRUE 0.716 76.000 0.032 1.000 N NA
 1783141 1783142 CHU_0055 CHU_0056     FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1783142 1426502 CHU_0056 CHU_tAla01     FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1426502 1783143 CHU_tAla01 CHU_0057   nlpC TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783144 1783145 CHU_0058 CHU_0059 asnB gmd FALSE 0.267 94.000 0.000 1.000 N NA
 1783145 1783146 CHU_0059 CHU_0060 gmd wcaG TRUE 0.987 6.000 0.000 0.006 Y NA
 1783146 1783147 CHU_0060 CHU_0061 wcaG   TRUE 0.813 42.000 0.000 1.000 Y NA
 1783147 1783148 CHU_0061 CHU_0062     TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1783148 1783149 CHU_0062 CHU_0063     TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1783153 1783154 CHU_0067 CHU_0068 frvX adk FALSE 0.186 121.000 0.000 1.000 N NA
 1783154 1783155 CHU_0068 CHU_0069 adk yhbZ FALSE 0.340 195.000 0.040 1.000   NA
 1783155 1783156 CHU_0069 CHU_0070 yhbZ grpE TRUE 0.432 91.000 0.006 1.000   NA
 1783156 1783157 CHU_0070 CHU_0071 grpE dnaJ TRUE 0.999 4.000 0.168 0.011 Y NA
 1783159 1783160 CHU_0073 CHU_0074 thrA thrB TRUE 0.768 95.000 0.023 1.000 Y NA
 1783160 1783161 CHU_0074 CHU_0075 thrB thrC TRUE 0.915 102.000 0.233 1.000 Y NA
 1783162 1783163 CHU_0076 CHU_0077     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1783163 1783164 CHU_0077 CHU_0078     TRUE 0.683 27.000 0.000 NA   NA
 1783166 1783167 CHU_0080 CHU_0081 rfaQ   TRUE 0.966 17.000 0.037 1.000 N NA
 1783168 1783169 CHU_0082 CHU_0083   pyrR FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1783169 1783170 CHU_0083 CHU_0084 pyrR pyrB TRUE 0.993 9.000 0.034 1.000 Y NA
 1783172 1783173 CHU_0086 CHU_0087 cmk ispH TRUE 0.895 48.000 0.070 1.000 N NA
 1783173 1783174 CHU_0087 CHU_0088 ispH   TRUE 0.747 49.000 0.016 NA   NA
 1783174 1783175 CHU_0088 CHU_0089     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1783175 1783176 CHU_0089 CHU_0090     FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1783176 1783177 CHU_0090 CHU_0091     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1783177 1783178 CHU_0091 CHU_0092     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1783179 1783180 CHU_0093 CHU_0094 trxA dnaE TRUE 0.822 61.000 0.047 1.000   NA
 1783180 1783181 CHU_0094 CHU_0095 dnaE   FALSE 0.136 156.000 0.000 1.000   NA
 1783182 1783183 CHU_0096 CHU_0097 rpmH rnpA TRUE 0.977 45.000 0.787 1.000   NA
 1783183 1783184 CHU_0097 CHU_0098 rnpA prc TRUE 0.830 46.000 0.029 1.000 N NA
 1783184 1783185 CHU_0098 CHU_0099 prc   TRUE 0.597 83.000 0.009 0.037 N NA
 1783185 1783186 CHU_0099 CHU_0100     TRUE 0.936 15.000 0.010 NA   NA
 1783186 1426547 CHU_0100 CHU_r16S01     FALSE 0.019 665.000 0.000 NA   NA
 1426547 1426548 CHU_r16S01 CHU_r23S01     FALSE 0.023 428.000 0.000 NA   NA
 1426548 1426549 CHU_r23S01 CHU_r5S01     FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1783188 1783189 CHU_0103 CHU_0104 barA   TRUE 0.983 5.000 0.000 1.000 Y NA
 1783190 1783191 CHU_0105 CHU_0106   yvqE TRUE 0.985 7.000 0.000 0.029 Y NA
 1783193 1783194 CHU_0108 CHU_0109 sodA   TRUE 0.648 56.000 0.007 1.000 N NA
 1783194 1783195 CHU_0109 CHU_0110     TRUE 0.970 2.000 0.007 NA   NA
 1783196 1783197 CHU_0111 CHU_0112 aspS   FALSE 0.109 177.000 0.000 1.000 N NA
 1783198 1783199 CHU_0113 CHU_0114 secDF   FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1783199 1783200 CHU_0114 CHU_0115   udk TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783200 1783201 CHU_0115 CHU_0116 udk yggV TRUE 0.984 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 1783202 1783203 CHU_0117 CHU_0118 rpsP rimM TRUE 0.996 19.000 0.342 0.020 Y NA
 1783203 1783204 CHU_0118 CHU_0119 rimM trmD TRUE 0.998 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 1783204 1783205 CHU_0119 CHU_0120 trmD rplS TRUE 0.956 94.000 0.567 1.000 Y NA
 1783206 1426570 CHU_0121 CHU_tPhe01     FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1783207 1783208 CHU_0122 CHU_0123 ydbK ykgE TRUE 0.510 95.000 0.000 NA Y NA
 1783208 1783209 CHU_0123 CHU_0124 ykgE   TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783209 1783210 CHU_0124 CHU_0125   pal FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1783210 1783211 CHU_0125 CHU_0126 pal purM FALSE 0.298 86.000 0.000 1.000   NA
 1783211 1783212 CHU_0126 CHU_0127 purM dapF TRUE 0.601 38.000 0.000 1.000 N NA
 1783212 1783213 CHU_0127 CHU_0128 dapF secA FALSE 0.354 109.000 0.007 1.000 N NA
 1783213 1783214 CHU_0128 CHU_0129 secA   TRUE 0.938 -10.000 0.015 NA   NA
 1783214 1783215 CHU_0129 CHU_0130   ammA TRUE 0.994 2.000 0.100 NA   NA
 1783215 1783216 CHU_0130 CHU_0131 ammA   TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783217 1783218 CHU_0132 CHU_0133     FALSE 0.305 76.000 0.000 NA   NA
 1783218 1783219 CHU_0133 CHU_0134     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783219 1783220 CHU_0134 CHU_0135   tolA FALSE 0.140 134.000 0.000 NA   NA
 1783220 1783221 CHU_0135 CHU_0136 tolA metX FALSE 0.309 76.000 0.000 NA N NA
 1783223 1783224 CHU_0138 CHU_0139   asd FALSE 0.155 123.000 0.000 NA   NA
 1783225 1783226 CHU_0140 CHU_0141     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1783226 1783227 CHU_0141 CHU_0142     TRUE 0.962 10.000 0.011 NA N NA
 1783227 1783228 CHU_0142 CHU_0143   rluB TRUE 0.921 -22.000 0.031 NA N NA
 1783228 1783229 CHU_0143 CHU_0144 rluB   TRUE 0.561 42.000 0.000 1.000   NA
 1783229 1783230 CHU_0144 CHU_0145     FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783232 1426597 CHU_0147 CHU_tGly01 mutS   FALSE 0.093 175.000 0.000 NA   NA
 1426597 1426598 CHU_tGly01 CHU_tLeu01     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1426598 1783233 CHU_tLeu01 CHU_0148   cheY FALSE 0.118 152.000 0.000 NA   NA
 1783233 1783234 CHU_0148 CHU_0149 cheY bphO TRUE 0.917 10.000 0.000 1.000 N NA
 1783234 1783235 CHU_0149 CHU_0150 bphO barA TRUE 0.987 13.000 0.103 1.000 N NA
 1783235 1426602 CHU_0150 CHU_r16S02 barA   FALSE 0.019 663.000 0.000 NA   NA
 1426602 1426603 CHU_r16S02 CHU_tIle01     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1426603 1426604 CHU_tIle01 CHU_tAla02     FALSE 0.236 92.000 0.000 NA   NA
 1426604 1426605 CHU_tAla02 CHU_r23S02     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 1426605 1426606 CHU_r23S02 CHU_r5S02     FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1426606 1783236 CHU_r5S02 CHU_0152     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1783236 1783237 CHU_0152 CHU_0153     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783238 1783239 CHU_0154 CHU_0155     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1783240 1783241 CHU_0156 CHU_0157   mltD FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1783241 1783242 CHU_0157 CHU_0158 mltD uvrA TRUE 0.414 89.000 0.006 NA N NA
 1783242 1783243 CHU_0158 CHU_0159 uvrA   FALSE 0.151 126.000 0.000 NA   NA
 1783243 1783244 CHU_0159 CHU_0160     FALSE 0.273 83.000 0.000 NA   NA
 1783244 1783245 CHU_0160 CHU_0161   cusA FALSE 0.311 75.000 0.000 NA   NA
 1783245 1783246 CHU_0161 CHU_0162 cusA   TRUE 0.997 -3.000 0.636 1.000 N NA
 1783247 1783248 CHU_0163 CHU_0164 pepN   TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783248 1783249 CHU_0164 CHU_0165   hemN FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1783250 1783251 CHU_0166 CHU_0167     TRUE 0.904 26.000 0.000 1.000 Y NA
 1783251 1783252 CHU_0167 CHU_0168     TRUE 0.742 -18.000 0.000 NA   NA
 1783252 1783253 CHU_0168 CHU_0169   hemD TRUE 0.831 32.000 0.014 NA   NA
 1783253 1783254 CHU_0169 CHU_0170 hemD   TRUE 0.641 126.000 0.089 NA   NA
 1783254 1783255 CHU_0170 CHU_0171   gldK TRUE 0.641 175.000 0.222 NA   NA
 1783255 1783256 CHU_0171 CHU_0172 gldK gldL TRUE 0.831 73.000 0.094 NA   NA
 1783256 1783257 CHU_0172 CHU_0173 gldL gldM TRUE 0.968 58.000 0.955 NA   NA
 1783257 1783258 CHU_0173 CHU_0174 gldM   TRUE 0.951 18.000 0.030 NA   NA
 1783259 1783260 CHU_0175 CHU_0176 uvrC   TRUE 0.971 6.000 0.007 1.000 N NA
 1783260 1783261 CHU_0176 CHU_0177   sprE TRUE 0.970 35.000 0.300 1.000   NA
 1783262 1783263 CHU_0178 CHU_0179   atpB FALSE 0.031 318.000 0.000 NA   NA
 1783263 1783264 CHU_0179 CHU_0180 atpB atpE TRUE 0.981 40.000 0.628 0.004   NA
 1783264 1783265 CHU_0180 CHU_0181 atpE atpF TRUE 0.938 78.000 0.402 0.004   NA
 1783265 1783266 CHU_0181 CHU_0182 atpF atpH TRUE 0.998 11.000 0.222 0.004 Y NA
 1783266 1783267 CHU_0182 CHU_0183 atpH atpA TRUE 0.999 13.000 0.864 0.004 Y NA
 1783267 1783268 CHU_0183 CHU_0184 atpA atpG TRUE 1.000 4.000 0.846 0.004 Y NA
 1783268 1783269 CHU_0184 CHU_0185 atpG   FALSE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 1783269 1783270 CHU_0185 CHU_0186   sun TRUE 0.564 -57.000 0.000 NA   NA
 1783270 1783271 CHU_0186 CHU_0187 sun ompA FALSE 0.186 106.000 0.000 NA N NA
 1783272 1783273 CHU_0188 CHU_0189     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783273 1783274 CHU_0189 CHU_0190   moxR FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1783274 1783275 CHU_0190 CHU_0191 moxR surA TRUE 0.997 0.000 0.360 1.000   NA
 1783275 1783276 CHU_0191 CHU_0192 surA   TRUE 0.844 128.000 0.080 0.006 Y NA
 1783276 1783277 CHU_0192 CHU_0193     TRUE 0.815 126.000 0.400 NA N NA
 1783277 1783278 CHU_0193 CHU_0194   spoIIAA TRUE 0.999 1.000 0.600 NA Y NA
 1783278 1783279 CHU_0194 CHU_0195 spoIIAA rsbU TRUE 0.987 44.000 0.615 1.000 Y NA
 1783279 1783280 CHU_0195 CHU_0196 rsbU guaB TRUE 0.795 21.000 0.000 1.000 N NA
 1783281 1783282 CHU_0197 CHU_0198   ybiL FALSE 0.123 148.000 0.000 NA N NA
 1783282 1783283 CHU_0198 CHU_0199 ybiL   FALSE 0.033 312.000 0.000 NA   NA
 1783283 1783284 CHU_0199 CHU_0200     TRUE 0.609 -40.000 0.000 NA   NA
 1783285 1783286 CHU_0201 CHU_0202   hemG TRUE 0.490 52.000 0.000 1.000 N NA
 1783287 1783288 CHU_0203 CHU_0204 ribD   TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1783288 1783289 CHU_0204 CHU_0205   yeeZ TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1426664 1783293 CHU_tVal01 CHU_0209     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1783293 1783294 CHU_0209 CHU_0210     TRUE 0.540 -69.000 0.000 NA   NA
 1783294 1783295 CHU_0210 CHU_0211   atoS FALSE 0.023 680.000 0.000 1.000   NA
 1783295 1783296 CHU_0211 CHU_0212 atoS   TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1783299 1783300 CHU_0215 CHU_0216     FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1783301 1783302 CHU_0217 CHU_0218 ompA ybiT FALSE 0.054 253.000 0.000 1.000   NA
 1783305 1783306 CHU_0221 CHU_0223   atoS FALSE 0.105 164.000 0.000 NA   NA
 1783308 1783309 CHU_0224 CHU_0225     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783309 1783310 CHU_0225 CHU_0226     FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1783310 1783311 CHU_0226 CHU_0227     FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783311 1783312 CHU_0227 CHU_0228     TRUE 0.998 2.000 0.748 NA   NA
 1783314 1783315 CHU_0230 CHU_0231     FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 1783317 1783318 CHU_0233 CHU_0234 hsp20   FALSE 0.029 341.000 0.000 NA   NA
 1783320 1783321 CHU_0236 CHU_0237 tpn   FALSE 0.021 485.000 0.000 NA   NA
 1783321 1783322 CHU_0237 CHU_0238     FALSE 0.025 387.000 0.000 NA   NA
 1783323 1783324 CHU_0239 CHU_0240 thiS thiC TRUE 0.995 4.000 0.029 1.000 Y NA
 1783324 1783325 CHU_0240 CHU_0241 thiC thiD FALSE 0.382 176.000 0.004 1.000 Y NA
 1783325 1783326 CHU_0241 CHU_0242 thiD thiE TRUE 0.997 7.000 0.094 1.000 Y NA
 1783326 1783327 CHU_0242 CHU_0243 thiE thiG TRUE 0.727 163.000 0.044 0.004 Y NA
 1783327 1783328 CHU_0243 CHU_0244 thiG thiH TRUE 0.999 3.000 0.277 0.004 Y NA
 1783328 1783329 CHU_0244 CHU_0245 thiH thiF FALSE 0.144 274.000 0.000 1.000 Y NA
 1783331 1783332 CHU_0247 CHU_0248     FALSE 0.049 241.000 0.000 NA   NA
 1783335 1783336 CHU_0251 CHU_0252 gap ycfQ FALSE 0.208 108.000 0.000 1.000   NA
 1783336 1783337 CHU_0252 CHU_0253 ycfQ   FALSE 0.119 168.000 0.000 1.000   NA
 1783337 1783338 CHU_0253 CHU_0254   lytT FALSE 0.120 167.000 0.000 1.000   NA
 1783338 1783339 CHU_0254 CHU_0255 lytT ypdA TRUE 0.969 -7.000 0.000 0.028 Y NA
 1783339 1783340 CHU_0255 CHU_0256 ypdA   FALSE 0.144 149.000 0.000 1.000 N NA
 1783340 1783341 CHU_0256 CHU_0257     TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1783341 1783342 CHU_0257 CHU_0258     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783342 1783343 CHU_0258 CHU_0259     TRUE 0.978 48.000 1.000 1.000   NA
 1783343 1783344 CHU_0259 CHU_0260     FALSE 0.041 268.000 0.000 NA   NA
 1783344 1783345 CHU_0260 CHU_0261     TRUE 0.966 51.000 0.667 NA   NA
 1783345 1783346 CHU_0261 CHU_0262     TRUE 0.865 121.000 0.667 NA   NA
 1783346 1783347 CHU_0262 CHU_0263     FALSE 0.026 480.000 0.000 1.000   NA
 1783348 1783349 CHU_0264 CHU_0265     TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1783349 1783350 CHU_0265 CHU_0266   yajR FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1783351 1783352 CHU_0267 CHU_0268     FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783352 1783353 CHU_0268 CHU_0269     FALSE 0.062 209.000 0.000 NA   NA
 1783354 1783355 CHU_0270 CHU_0271     FALSE 0.103 211.000 0.000 0.024   NA
 1783358 1783359 CHU_0275 CHU_0276     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783359 1783360 CHU_0276 CHU_0277     TRUE 0.518 -99.000 0.000 NA   NA
 1783360 1783361 CHU_0277 CHU_0278     FALSE 0.329 72.000 0.000 NA   NA
 1783361 1783362 CHU_0278 CHU_0279   ydjH FALSE 0.117 153.000 0.000 NA   NA
 1783362 1783363 CHU_0279 CHU_0280 ydjH   FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783363 1783364 CHU_0280 CHU_0281     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1783365 1783366 CHU_0282 CHU_0283     TRUE 0.760 157.000 0.400 NA   NA
 1783366 1783367 CHU_0283 CHU_0284     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1783367 1783368 CHU_0284 CHU_0285     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1783369 1783370 CHU_0286 CHU_0287     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1783370 1783371 CHU_0287 CHU_0288     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1783371 1783372 CHU_0288 CHU_0289     TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1783372 1783373 CHU_0289 CHU_0290     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1783373 1783374 CHU_0290 CHU_0291   gldH TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783374 1783375 CHU_0291 CHU_0292 gldH   TRUE 0.995 2.000 0.138 NA   NA
 1783375 1783376 CHU_0292 CHU_0293     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1783376 1783377 CHU_0293 CHU_0294     FALSE 0.093 175.000 0.000 NA   NA
 1783377 1783378 CHU_0294 CHU_0295     TRUE 0.626 -37.000 0.000 NA   NA
 1783378 1783379 CHU_0295 CHU_0296   purD TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1783379 1783380 CHU_0296 CHU_0297 purD recQ FALSE 0.297 143.000 0.008 1.000 N NA
 1783381 1783382 CHU_0298 CHU_0299     TRUE 0.531 40.000 0.000 NA   NA
 1783382 1783383 CHU_0299 CHU_0300   manC FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1783384 1783385 CHU_0301 CHU_0302 gapN   TRUE 0.713 28.000 0.000 1.000 N NA
 1783385 1783386 CHU_0302 CHU_0303   yadF FALSE 0.054 256.000 0.000 1.000 N NA
 1783386 1783387 CHU_0303 CHU_0304 yadF   FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1783387 1783388 CHU_0304 CHU_0305     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1783388 1783389 CHU_0305 CHU_0306   trmH FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1783389 1783390 CHU_0306 CHU_0307 trmH   FALSE 0.158 119.000 0.000 NA   NA
 1783391 1783392 CHU_0308 CHU_0309 glgP   FALSE 0.067 203.000 0.000 NA   NA
 1783392 1783393 CHU_0309 CHU_0310     TRUE 0.481 96.000 0.015 NA   NA
 1783393 1783394 CHU_0310 CHU_0311     TRUE 0.979 21.000 0.171 NA   NA
 1783394 1783395 CHU_0311 CHU_0312   fecA TRUE 0.994 -7.000 0.448 1.000   NA
 1783396 1783397 CHU_0313 CHU_0314 rsaD   TRUE 0.683 27.000 0.000 NA   NA
 1783397 1783398 CHU_0314 CHU_0315   yhfE FALSE 0.022 463.000 0.000 NA   NA
 1783399 1783400 CHU_0316 CHU_0317 ppx atoS FALSE 0.062 236.000 0.000 1.000 N NA
 1783401 1783402 CHU_0318 CHU_0319   muiA TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1783403 1783404 CHU_0320 CHU_0321 ybiC ygcC FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1783404 1783405 CHU_0321 CHU_0323 ygcC   FALSE 0.147 129.000 0.000 NA   NA
 1783405 1783406 CHU_0323 CHU_0324   dnaJ FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1783406 1783407 CHU_0324 CHU_0325 dnaJ sotB TRUE 0.832 18.000 0.000 1.000   NA
 1783407 1783408 CHU_0325 CHU_0326 sotB menA TRUE 0.960 5.000 0.000 0.065 N NA
 1783408 1783409 CHU_0326 CHU_0327 menA fabG TRUE 0.941 6.000 0.000 1.000 N NA
 1783409 1783410 CHU_0327 CHU_0328 fabG   FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1783410 1783411 CHU_0328 CHU_0329     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1783411 1783412 CHU_0329 CHU_0330     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1783413 1783414 CHU_0331 CHU_0332     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783414 1783415 CHU_0332 CHU_0333   hemA TRUE 0.585 -46.000 0.000 NA   NA
 1783418 1783419 CHU_0336 CHU_0337 atpD atpC TRUE 0.970 70.000 0.837 0.004   NA
 1783421 1783422 CHU_0339 CHU_0340     FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1783423 1783424 CHU_0341 CHU_0342     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783424 1783425 CHU_0342 CHU_0343     TRUE 0.543 -66.000 0.000 NA   NA
 1783426 1783427 CHU_0344 CHU_0345     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1783427 1783428 CHU_0345 CHU_0346   rpoE FALSE 0.026 383.000 0.000 NA   NA
 1783428 1783429 CHU_0346 CHU_0347 rpoE   TRUE 0.998 7.000 0.750 NA   NA
 1783429 1783430 CHU_0347 CHU_0348     FALSE 0.097 171.000 0.000 NA   NA
 1783430 1783431 CHU_0348 CHU_0349     TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1783431 1783432 CHU_0349 CHU_0350     TRUE 0.974 -37.000 0.333 NA   NA
 1783432 1783433 CHU_0350 CHU_0351     FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1783436 1783437 CHU_0354 CHU_0355 ch1I lpcA TRUE 0.950 10.000 0.004 1.000 N NA
 1783437 1783438 CHU_0355 CHU_0356 lpcA   FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1783438 1783439 CHU_0356 CHU_0357   psd FALSE 0.175 109.000 0.000 NA   NA
 1783439 1783440 CHU_0357 CHU_0358 psd cdsA TRUE 0.736 98.000 0.052 0.002   NA
 1783440 1783441 CHU_0358 CHU_0359 cdsA   TRUE 0.907 -7.000 0.003 NA   NA
 1783442 1783443 CHU_0360 CHU_0361 yhdG   TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1783443 1783444 CHU_0361 CHU_0362   zraR FALSE 0.119 150.000 0.000 NA   NA
 1783448 1783449 CHU_0366 CHU_0367 pdhR   TRUE 0.444 60.000 0.000 1.000 N NA
 1783450 1783451 CHU_0368 CHU_0369 gltP aroC TRUE 0.960 -7.000 0.018 1.000 N NA
 1783451 1783452 CHU_0369 CHU_0370 aroC   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783454 1783455 CHU_0372 CHU_0373 yjeS ruvB TRUE 0.981 4.000 0.012 1.000 N NA
 1783456 1783457 CHU_0374 CHU_0375     TRUE 0.996 6.000 0.273 1.000   NA
 1783458 1783459 CHU_0376 CHU_0377     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1783459 1783460 CHU_0377 CHU_0378     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783460 1783461 CHU_0378 CHU_0379   tpn FALSE 0.018 916.000 0.000 NA   NA
 1783461 1783462 CHU_0379 CHU_0380 tpn   FALSE 0.018 1057.000 0.000 NA   NA
 1783462 1783463 CHU_0380 CHU_0381     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783465 1783466 CHU_0383 CHU_0384   fabF TRUE 0.996 4.000 0.190 NA   NA
 1783466 1783467 CHU_0384 CHU_0385 fabF dltC TRUE 0.998 4.000 0.476 1.000   NA
 1783467 1783468 CHU_0385 CHU_0386 dltC   TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1783468 1783469 CHU_0386 CHU_0387   yadG TRUE 0.981 2.000 0.000 NA Y NA
 1783469 1783470 CHU_0387 CHU_0388 yadG   TRUE 0.989 -12.000 0.320 NA   NA
 1783470 1783471 CHU_0388 CHU_0389     TRUE 0.986 -34.000 0.800 NA   NA
 1783471 1783472 CHU_0389 CHU_0390   fabH TRUE 0.967 40.000 0.438 NA   NA
 1783472 1783473 CHU_0390 CHU_0391 fabH   TRUE 0.998 6.000 0.656 NA   NA
 1783473 1783474 CHU_0391 CHU_0392     TRUE 0.989 10.000 0.094 NA   NA
 1783474 1783475 CHU_0392 CHU_0393     FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1783476 1783477 CHU_0394 CHU_0395     FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1783478 1783479 CHU_0396 CHU_0397 ycaK   TRUE 0.795 74.000 0.068 NA   NA
 1783479 1783480 CHU_0397 CHU_0398     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783481 1783482 CHU_0399 CHU_0400   otsA TRUE 0.993 19.000 0.195 1.000 Y NA
 1783483 1783484 CHU_0401 CHU_0402   folA TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1783484 1783485 CHU_0402 CHU_0403 folA   TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783485 1783486 CHU_0403 CHU_0404     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1783486 1783487 CHU_0404 CHU_0405     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783487 1783488 CHU_0405 CHU_0406     TRUE 0.638 -34.000 0.000 NA   NA
 1783488 1783489 CHU_0406 CHU_0407     TRUE 0.989 -27.000 1.000 NA   NA
 1783489 1783490 CHU_0407 CHU_0408     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1783490 1783491 CHU_0408 CHU_0409     FALSE 0.304 85.000 0.000 1.000   NA
 1783492 1783493 CHU_0410 CHU_0411     FALSE 0.110 160.000 0.000 NA   NA
 1783495 1783496 CHU_0413 CHU_0414   blc FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1783496 1783497 CHU_0414 CHU_0415 blc   TRUE 0.823 40.000 0.000 1.000 Y NA
 1783497 1783498 CHU_0415 CHU_0416   yiaD TRUE 0.503 101.000 0.000 1.000 Y NA
 1783499 1783500 CHU_0417 CHU_0418     FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 1783500 1783501 CHU_0418 CHU_0419     FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1783503 1783504 CHU_0421 CHU_0422     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783504 1783505 CHU_0422 CHU_0424     FALSE 0.305 76.000 0.000 NA   NA
 1783507 1783508 CHU_0425 CHU_0427     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783509 1783510 CHU_0428 CHU_0429 yhbW   FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1783510 1783511 CHU_0429 CHU_0430     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1783511 1783512 CHU_0430 CHU_0431     TRUE 0.585 -46.000 0.000 NA   NA
 1783512 1783513 CHU_0431 CHU_0432   damX FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1783513 1783514 CHU_0432 CHU_0433 damX   FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 1783515 1783516 CHU_0434 CHU_0435     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783516 1783517 CHU_0435 CHU_0436     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1783517 1783518 CHU_0436 CHU_0437     FALSE 0.204 99.000 0.000 NA   NA
 1783518 1783519 CHU_0437 CHU_0439     FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1783526 1783527 CHU_0445 CHU_0446     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1783527 1783528 CHU_0446 CHU_0447     FALSE 0.026 380.000 0.000 NA   NA
 1783528 1783529 CHU_0447 CHU_0448     TRUE 0.484 46.000 0.000 NA   NA
 1783532 1783533 CHU_0451 CHU_0452 nrdA nrdB TRUE 0.976 60.000 0.250 0.001 Y NA
 1783534 1783535 CHU_0453 CHU_0454 rplU rpmA TRUE 0.995 28.000 0.667 0.019 Y NA
 1783535 1783536 CHU_0454 CHU_0455 rpmA   FALSE 0.187 157.000 0.000 0.019   NA
 1783536 1783537 CHU_0455 CHU_0456     FALSE 0.263 94.000 0.000 1.000   NA
 1783538 1783539 CHU_0457 CHU_0458     TRUE 0.985 -3.000 0.056 NA   NA
 1783541 1783542 CHU_0460 CHU_0461   ispA TRUE 0.945 28.000 0.058 1.000   NA
 1783542 1783543 CHU_0461 CHU_0462 ispA rnr TRUE 0.797 45.000 0.018 1.000 N NA
 1783543 1783544 CHU_0462 CHU_0463 rnr yliA TRUE 0.926 9.000 0.000 1.000   NA
 1783544 1783545 CHU_0463 CHU_0464 yliA   FALSE 0.124 146.000 0.000 NA   NA
 1783545 1783546 CHU_0464 CHU_0466   lipB TRUE 0.683 61.000 0.016 NA   NA
 1783547 1783548 CHU_0465 CHU_0467   manA FALSE 0.377 72.000 0.000 1.000 N NA
 1783549 1783550 CHU_0468 CHU_0469     FALSE 0.073 196.000 0.000 NA   NA
 1783550 1783551 CHU_0469 CHU_0470   nagZ FALSE 0.165 116.000 0.000 NA N NA
 1783551 1783552 CHU_0470 CHU_0471 nagZ   TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1783552 1783553 CHU_0471 CHU_0472   pgi FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1783553 1783554 CHU_0472 CHU_0473 pgi   TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1783555 1783556 CHU_0474 CHU_0475     TRUE 0.705 25.000 0.000 NA   NA
 1783556 1783557 CHU_0475 CHU_0476     TRUE 0.513 -132.000 0.000 NA   NA
 1783558 1783559 CHU_0477 CHU_0478 htpG   FALSE 0.048 244.000 0.000 NA   NA
 1783559 1783560 CHU_0478 CHU_0479     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1783560 1783561 CHU_0479 CHU_0480     TRUE 0.406 57.000 0.000 NA   NA
 1783561 1783562 CHU_0480 CHU_0481     TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1783562 1783563 CHU_0481 CHU_0482   ompA FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783563 1783564 CHU_0482 CHU_0484 ompA   FALSE 0.070 199.000 0.000 NA   NA
 1783565 1783566 CHU_0483 CHU_0485 truA natA TRUE 0.876 -7.000 0.000 1.000   NA
 1783566 1783567 CHU_0485 CHU_0486 natA natB TRUE 0.996 -3.000 0.619 NA   NA
 1783568 1783569 CHU_0487 CHU_0488   pyrR TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1783570 1783571 CHU_0489 CHU_0490 rpmE   TRUE 0.814 72.000 0.063 1.000   NA
 1783571 1783572 CHU_0490 CHU_0491     TRUE 0.983 2.000 0.018 1.000   NA
 1783572 1783573 CHU_0491 CHU_0492   hemC TRUE 0.958 0.000 0.002 1.000 N NA
 1783573 1783574 CHU_0492 CHU_0493 hemC ppiC FALSE 0.073 342.000 0.007 1.000 N NA
 1783574 1783575 CHU_0493 CHU_0494 ppiC rfbD TRUE 0.463 246.000 0.179 1.000 N NA
 1783575 1783576 CHU_0494 CHU_0495 rfbD   FALSE 0.028 434.000 0.000 1.000 N NA
 1783576 1783577 CHU_0495 CHU_0496     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783577 1783578 CHU_0496 CHU_0497     FALSE 0.024 413.000 0.000 NA   NA
 1783580 1783581 CHU_0499 CHU_0500     FALSE 0.040 269.000 0.000 NA   NA
 1783581 1783582 CHU_0500 CHU_0501     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1783582 1783583 CHU_0501 CHU_0502     FALSE 0.033 308.000 0.000 NA   NA
 1783586 1783587 CHU_0506 CHU_0507 rsaD   TRUE 0.944 10.000 0.005 NA   NA
 1783588 1783589 CHU_0508 CHU_0509   nuoI TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1783589 1783590 CHU_0509 CHU_0510 nuoI hycG TRUE 0.992 24.000 0.168 0.005 Y NA
 1783590 1783591 CHU_0510 CHU_0511 hycG nuoC TRUE 0.999 -3.000 0.465 0.005 Y NA
 1783591 1783592 CHU_0511 CHU_0512 nuoC nuoD TRUE 0.990 44.000 0.618 0.011 Y NA
 1783592 1783593 CHU_0512 CHU_0513 nuoD   TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783593 1783594 CHU_0513 CHU_0514     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783596 1783597 CHU_0516 CHU_0517     TRUE 0.584 35.000 0.000 NA   NA
 1783597 1783598 CHU_0517 CHU_0519     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1783598 1783599 CHU_0519 CHU_0520     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1783599 1783600 CHU_0520 CHU_0521     TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1783600 1783601 CHU_0521 CHU_0522     FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1783601 1783602 CHU_0522 CHU_0523   ccpA TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783602 1783603 CHU_0523 CHU_0524 ccpA   TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783603 1783604 CHU_0524 CHU_0525     TRUE 0.659 -30.000 0.000 NA   NA
 1783604 1783605 CHU_0525 CHU_0526     FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 1783606 1783607 CHU_0527 CHU_0528     FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1783607 1783608 CHU_0528 CHU_0529     TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1783608 1783609 CHU_0529 CHU_0530     FALSE 0.397 59.000 0.000 NA   NA
 1783609 1783610 CHU_0530 CHU_0531     TRUE 0.506 43.000 0.000 NA   NA
 1783611 1783612 CHU_0532 CHU_0533     FALSE 0.046 250.000 0.000 NA   NA
 1783612 1783613 CHU_0533 CHU_0534     FALSE 0.281 81.000 0.000 NA   NA
 1783613 1783614 CHU_0534 CHU_0535     FALSE 0.035 296.000 0.000 NA   NA
 1783614 1783615 CHU_0535 CHU_0536     FALSE 0.030 334.000 0.000 NA   NA
 1783615 1783616 CHU_0536 CHU_0537     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1783616 1783617 CHU_0537 CHU_0538   acrB TRUE 0.969 53.000 0.750 1.000 N NA
 1783617 1783618 CHU_0538 CHU_0539 acrB cusC TRUE 0.998 7.000 0.500 0.027 N NA
 1783618 1783619 CHU_0539 CHU_0540 cusC   FALSE 0.276 92.000 0.000 1.000 N NA
 1783619 1783620 CHU_0540 CHU_0541     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1783620 1783621 CHU_0541 CHU_0542   ptpA TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1783621 1783622 CHU_0542 CHU_0543 ptpA   FALSE 0.136 156.000 0.000 1.000   NA
 1783622 1783623 CHU_0543 CHU_0544     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1783623 1783624 CHU_0544 CHU_0545     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1783624 1783625 CHU_0545 CHU_0546   ragA FALSE 0.051 264.000 0.000 1.000   NA
 1783625 1783626 CHU_0546 CHU_0547 ragA   TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783626 1783627 CHU_0547 CHU_0548     FALSE 0.058 217.000 0.000 NA   NA
 1783627 1783628 CHU_0548 CHU_0549     TRUE 0.983 37.000 1.000 NA   NA
 1783628 1783629 CHU_0549 CHU_0550     TRUE 0.990 -7.000 0.222 NA   NA
 1783629 1783630 CHU_0550 CHU_0551     TRUE 0.959 36.000 0.222 NA   NA
 1783630 1783631 CHU_0551 CHU_0552     TRUE 0.978 24.000 0.222 NA   NA
 1783631 1783632 CHU_0552 CHU_0553   ragA FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1783632 1783633 CHU_0553 CHU_0554 ragA   TRUE 0.992 20.000 0.667 NA   NA
 1783633 1783634 CHU_0554 CHU_0555     TRUE 0.978 37.000 0.667 NA   NA
 1783634 1783635 CHU_0555 CHU_0556     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1783635 1783636 CHU_0556 CHU_0557     TRUE 0.994 19.000 1.000 NA   NA
 1783636 1783637 CHU_0557 CHU_0558     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783637 1783638 CHU_0558 CHU_0559   cyc TRUE 0.457 50.000 0.000 NA   NA
 1783638 1783639 CHU_0559 CHU_0560 cyc soxD TRUE 0.942 -3.000 0.000 0.013   NA
 1783639 1783640 CHU_0560 CHU_0561 soxD soxC TRUE 0.997 -3.000 0.588 0.045   NA
 1783640 1783641 CHU_0561 CHU_0562 soxC pys TRUE 0.910 40.000 0.045 0.039   NA
 1783641 1783642 CHU_0562 CHU_0563 pys   TRUE 0.989 9.000 0.068 NA   NA
 1783642 1783643 CHU_0563 CHU_0564     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1783643 1783644 CHU_0564 CHU_0565   bcp TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1783644 1783645 CHU_0565 CHU_0566 bcp   FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 1783646 1783647 CHU_0567 CHU_0568   tpn FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783647 1783648 CHU_0568 CHU_0569 tpn   FALSE 0.025 386.000 0.000 NA   NA
 1783651 1783652 CHU_0572 CHU_0573     FALSE 0.152 144.000 0.000 1.000 N NA
 1783653 1783654 CHU_0574 CHU_0575     FALSE 0.065 206.000 0.000 NA   NA
 1783654 1783655 CHU_0575 CHU_0576   pepN TRUE 0.653 29.000 0.000 NA   NA
 1783656 1783657 CHU_0577 CHU_0578 pyrH frr TRUE 0.966 51.000 0.626 1.000 N NA
 1783659 1783660 CHU_0579 CHU_0581   tufB FALSE 0.101 167.000 0.000 NA   NA
 1783660 1783661 CHU_0581 CHU_0582 tufB   FALSE 0.236 92.000 0.000 NA   NA
 1783661 1783662 CHU_0582 CHU_0583     FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 1783662 1783663 CHU_0583 CHU_0584     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1783664 1783665 CHU_0585 CHU_0586     FALSE 0.025 394.000 0.000 NA   NA
 1783665 1783666 CHU_0586 CHU_0587   chuA TRUE 0.983 9.000 0.036 NA   NA
 1783669 1783670 CHU_0590 CHU_0591 iscS   TRUE 0.958 -22.000 0.070 1.000 N NA
 1783670 1783671 CHU_0591 CHU_0592   alcA TRUE 0.997 2.000 0.070 NA Y NA
 1783671 1783672 CHU_0592 CHU_0593 alcA   TRUE 0.992 0.000 0.095 NA   NA
 1783672 1783673 CHU_0593 CHU_0594     TRUE 0.515 -118.000 0.000 NA   NA
 1783674 1783675 CHU_0595 CHU_0596 ompA   TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1783675 1783676 CHU_0596 CHU_0597     FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1783676 1783677 CHU_0597 CHU_0598   nadD FALSE 0.022 463.000 0.000 NA   NA
 1783677 1783678 CHU_0598 CHU_0599 nadD gmk TRUE 0.833 59.000 0.050 1.000 N NA
 1783678 1783679 CHU_0599 CHU_0600 gmk   TRUE 0.968 6.000 0.008 NA   NA
 1783679 1783680 CHU_0600 CHU_0601   rpoE TRUE 0.992 12.000 0.244 NA   NA
 1783681 1783682 CHU_0602 CHU_0603     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1783683 1783684 CHU_0604 CHU_0605 wcaL lgtF TRUE 0.995 4.000 0.040 NA Y NA
 1783684 1783685 CHU_0605 CHU_0606 lgtF   TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1783685 1783686 CHU_0606 CHU_0607     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1783686 1783687 CHU_0607 CHU_0608     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1783687 1783688 CHU_0608 CHU_0609     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1783688 1783689 CHU_0609 CHU_0610   sahH TRUE 0.638 -34.000 0.000 NA   NA
 1783689 1783690 CHU_0610 CHU_0611 sahH birA FALSE 0.176 317.000 0.005 1.000 Y NA
 1783691 1783692 CHU_0612 CHU_0613   ftsH TRUE 0.954 27.000 0.084 NA   NA
 1783692 1783693 CHU_0613 CHU_0614 ftsH   TRUE 0.993 9.000 0.145 1.000   NA
 1783693 1783694 CHU_0614 CHU_0615   lpxH TRUE 0.905 -16.000 0.010 1.000   NA
 1783694 1783695 CHU_0615 CHU_0616 lpxH   TRUE 0.882 -33.000 0.023 NA   NA
 1783695 1783696 CHU_0616 CHU_0617     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1783696 1783697 CHU_0617 CHU_0618     TRUE 0.568 -55.000 0.000 NA   NA
 1783699 1427072 CHU_0620 CHU_tArg01     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1427072 1783700 CHU_tArg01 CHU_0621     FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1783700 1783701 CHU_0621 CHU_0622     FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1783701 1783702 CHU_0622 CHU_0623     FALSE 0.026 376.000 0.000 NA   NA
 1783702 1783703 CHU_0623 CHU_0624     TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1783703 1783704 CHU_0624 CHU_0625     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1783704 1783705 CHU_0625 CHU_0626     FALSE 0.046 251.000 0.000 NA   NA
 1783705 1783706 CHU_0626 CHU_0627   miaE FALSE 0.171 130.000 0.000 1.000   NA
 1783706 1783707 CHU_0627 CHU_0628 miaE   FALSE 0.089 178.000 0.000 NA   NA
 1783707 1783708 CHU_0628 CHU_0629     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 1783709 1783710 CHU_0630 CHU_0632   prc TRUE 0.845 -40.000 0.017 NA   NA
 1783711 1783712 CHU_0631 CHU_0633     FALSE 0.278 82.000 0.000 NA   NA
 1783713 1783714 CHU_0634 CHU_0635   cysN FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783714 1783715 CHU_0635 CHU_0636 cysN cysD TRUE 0.989 31.000 0.731 0.001 N NA
 1783715 1783716 CHU_0636 CHU_0637 cysD cysC TRUE 0.988 20.000 0.343 1.000 N NA
 1783717 1783718 CHU_0638 CHU_0639 cysQ   FALSE 0.042 265.000 0.000 NA   NA
 1783718 1783719 CHU_0639 CHU_0640     FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1783720 1783721 CHU_0641 CHU_0642     FALSE 0.104 179.000 0.000 1.000   NA
 1783721 1783722 CHU_0642 CHU_0643     TRUE 0.995 9.000 0.294 NA   NA
 1783722 1783723 CHU_0643 CHU_0644     FALSE 0.221 95.000 0.000 NA   NA
 1783723 1783724 CHU_0644 CHU_0645     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1783724 1783725 CHU_0645 CHU_0646   hemB TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1783725 1783726 CHU_0646 CHU_0647 hemB hemL FALSE 0.124 166.000 0.000 1.000 N NA
 1783727 1783728 CHU_0648 CHU_0649 rpmB rpmG TRUE 0.997 6.000 0.332 0.018   NA
 1783728 1783729 CHU_0649 CHU_0650 rpmG   TRUE 0.983 13.000 0.079 NA   NA
 1783729 1783730 CHU_0650 CHU_0651   ftsY TRUE 0.556 109.000 0.041 NA   NA
 1783730 1783731 CHU_0651 CHU_0652 ftsY   TRUE 0.630 -82.000 0.002 NA   NA
 1783731 1783732 CHU_0652 CHU_0653   yliG TRUE 0.960 13.000 0.019 NA   NA
 1783732 1783733 CHU_0653 CHU_0654 yliG pip TRUE 0.916 10.000 0.000 1.000   NA
 1783733 1783734 CHU_0654 CHU_0655 pip dbpA FALSE 0.062 234.000 0.000 1.000   NA
 1783735 1783736 CHU_0656 CHU_0657   galK TRUE 0.988 7.000 0.006 1.000 Y NA
 1783736 1783737 CHU_0657 CHU_0658 galK glmU TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1783738 1783739 CHU_0659 CHU_0660 fimZ   FALSE 0.029 342.000 0.000 NA   NA
 1783739 1783740 CHU_0660 CHU_0661     TRUE 0.612 32.000 0.000 NA   NA
 1783740 1783741 CHU_0661 CHU_0662     TRUE 0.647 -33.000 0.000 NA   NA
 1783741 1783742 CHU_0662 CHU_0663     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783742 1783743 CHU_0663 CHU_0664     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783743 1783744 CHU_0664 CHU_0665     TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1783744 1783745 CHU_0665 CHU_0666     FALSE 0.048 245.000 0.000 NA   NA
 1783745 1783746 CHU_0666 CHU_0667     TRUE 0.985 24.000 0.436 NA N NA
 1783746 1783747 CHU_0667 CHU_0668     TRUE 0.993 18.000 0.713 NA   NA
 1783747 1783748 CHU_0668 CHU_0669     TRUE 0.996 3.000 0.171 NA   NA
 1783748 1783749 CHU_0669 CHU_0670     FALSE 0.335 78.000 0.000 1.000   NA
 1783751 1783752 CHU_0672 CHU_0673     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783755 1783756 CHU_0676 CHU_0677     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1783756 1783757 CHU_0677 CHU_0678   fnr FALSE 0.050 237.000 0.000 NA   NA
 1783757 1783758 CHU_0678 CHU_0679 fnr   FALSE 0.044 258.000 0.000 NA   NA
 1783759 1783760 CHU_0680 CHU_0681     FALSE 0.065 206.000 0.000 NA   NA
 1783760 1783761 CHU_0681 CHU_0682     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783761 1783762 CHU_0682 CHU_0683     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783763 1783764 CHU_0684 CHU_0685 cysM cysE TRUE 0.646 192.000 0.042 0.001 Y NA
 1783765 1783766 CHU_0686 CHU_0687   ygfA TRUE 0.937 -7.000 0.009 NA   NA
 1783766 1783767 CHU_0687 CHU_0688 ygfA yiaD TRUE 0.947 4.000 0.000 1.000   NA
 1783768 1783769 CHU_0689 CHU_0690 ctpA   FALSE 0.033 312.000 0.000 NA   NA
 1783770 1783771 CHU_0691 CHU_0692     TRUE 0.967 0.000 0.008 NA N NA
 1783771 1783772 CHU_0692 CHU_0693   def FALSE 0.270 176.000 0.015 1.000 N NA
 1783772 1783773 CHU_0693 CHU_0694 def ybdL FALSE 0.164 136.000 0.000 1.000 N NA
 1783773 1783774 CHU_0694 CHU_0695 ybdL yafV TRUE 0.929 -12.000 0.011 1.000   NA
 1783774 1783775 CHU_0695 CHU_0696 yafV   TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783775 1783776 CHU_0696 CHU_0697   pgdA FALSE 0.077 191.000 0.000 NA   NA
 1783778 1783779 CHU_0699 CHU_0700 murF   TRUE 0.484 46.000 0.000 NA   NA
 1783779 1783780 CHU_0700 CHU_0701     FALSE 0.113 158.000 0.000 NA   NA
 1783781 1783782 CHU_0702 CHU_0703 pobR   TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1783782 1783783 CHU_0703 CHU_0704   yjjG TRUE 0.950 18.000 0.024 1.000   NA
 1783783 1783784 CHU_0704 CHU_0705 yjjG   TRUE 0.986 2.000 0.031 NA   NA
 1783784 1783785 CHU_0705 CHU_0706   arsR TRUE 0.584 85.000 0.021 NA N NA
 1783786 1783787 CHU_0707 CHU_0708     FALSE 0.022 468.000 0.000 NA   NA
 1783788 1783789 CHU_0709 CHU_0710     FALSE 0.019 645.000 0.000 NA   NA
 1783789 1783790 CHU_0710 CHU_0711     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783790 1783791 CHU_0711 CHU_0712     TRUE 0.647 -33.000 0.000 NA   NA
 1783791 1783792 CHU_0712 CHU_0713     FALSE 0.057 218.000 0.000 NA   NA
 1783792 1783793 CHU_0713 CHU_0714     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1783793 1783794 CHU_0714 CHU_0715     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783794 1783795 CHU_0715 CHU_0716     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783795 1783796 CHU_0716 CHU_0717   aroA FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1783796 1783797 CHU_0717 CHU_0718 aroA aroB TRUE 0.952 -13.000 0.002 1.000 Y NA
 1783797 1783798 CHU_0718 CHU_0719 aroB pheB TRUE 0.668 87.000 0.000 0.002 Y NA
 1783799 1783800 CHU_0720 CHU_0721 pdh   FALSE 0.052 261.000 0.000 1.000   NA
 1783800 1783801 CHU_0721 CHU_0722     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1783801 1783802 CHU_0722 CHU_0723   norM TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783802 1783803 CHU_0723 CHU_0724 norM   FALSE 0.087 179.000 0.000 NA   NA
 1783803 1783804 CHU_0724 CHU_0725     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1783806 1783807 CHU_0726 CHU_0728     FALSE 0.116 154.000 0.000 NA   NA
 1783807 1783808 CHU_0728 CHU_0729     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783808 1783809 CHU_0729 CHU_0730     TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1783811 1783812 CHU_0731 CHU_0733   yncD FALSE 0.161 117.000 0.000 NA   NA
 1783812 1783813 CHU_0733 CHU_0734 yncD rluD FALSE 0.335 78.000 0.000 1.000   NA
 1783813 1783814 CHU_0734 CHU_0735 rluD   FALSE 0.132 139.000 0.000 NA   NA
 1783814 1783815 CHU_0735 CHU_0736     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1783815 1783816 CHU_0736 CHU_0737     TRUE 0.477 47.000 0.000 NA   NA
 1783816 1783817 CHU_0737 CHU_0738     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783817 1783818 CHU_0738 CHU_0739     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783823 1783824 CHU_0744 CHU_0745   chpA FALSE 0.048 272.000 0.000 1.000   NA
 1783824 1783825 CHU_0745 CHU_0746 chpA   TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 1783825 1783826 CHU_0746 CHU_0747     FALSE 0.043 260.000 0.000 NA   NA
 1783826 1783827 CHU_0747 CHU_0748     TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1783827 1783828 CHU_0748 CHU_0749     TRUE 0.664 -28.000 0.000 NA   NA
 1783829 1783830 CHU_0750 CHU_0751     TRUE 0.991 23.000 0.827 NA N NA
 1783830 1783831 CHU_0751 CHU_0752   pccB FALSE 0.148 418.000 0.053 NA N NA
 1783831 1783832 CHU_0752 CHU_0753 pccB   TRUE 0.671 70.000 0.022 NA   NA
 1783832 1783833 CHU_0753 CHU_0754   msrB FALSE 0.044 256.000 0.000 NA   NA
 1783834 1783835 CHU_0755 CHU_0756   smt TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783835 1783836 CHU_0756 CHU_0757 smt   TRUE 0.474 53.000 0.000 1.000   NA
 1783836 1783837 CHU_0757 CHU_0758     TRUE 0.797 83.000 0.081 1.000   NA
 1783838 1783839 CHU_0759 CHU_0760   divIVA TRUE 0.864 26.000 0.011 NA   NA
 1783839 1783840 CHU_0760 CHU_0761 divIVA folQ TRUE 0.973 0.000 0.012 NA   NA
 1783842 1783843 CHU_0763 CHU_0764   pheA TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1783843 1783844 CHU_0764 CHU_0765 pheA   TRUE 0.983 -22.000 0.083 1.000 Y NA
 1783844 1783845 CHU_0765 CHU_0766     FALSE 0.170 112.000 0.000 NA   NA
 1783845 1783846 CHU_0766 CHU_0767     FALSE 0.055 227.000 0.000 NA   NA
 1783846 1783847 CHU_0767 CHU_0768     FALSE 0.137 198.000 0.000 0.001   NA
 1783849 1783850 CHU_0770 CHU_0771     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1783850 1783851 CHU_0771 CHU_0772     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783853 1783854 CHU_0774 CHU_0775 hemE   TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783854 1783855 CHU_0775 CHU_0776   ybiF TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1783855 1783856 CHU_0776 CHU_0777 ybiF   FALSE 0.151 126.000 0.000 NA   NA
 1783857 1783858 CHU_0778 CHU_0779     FALSE 0.116 154.000 0.000 NA   NA
 1783859 1783860 CHU_0780 CHU_0781 rpoE   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783860 1783861 CHU_0781 CHU_0782     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783862 1783863 CHU_0783 CHU_0784 rfaE aspB TRUE 0.901 -21.000 0.017 NA N NA
 1783864 1783865 CHU_0785 CHU_0786 yajF   FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1783865 1783866 CHU_0786 CHU_0787     FALSE 0.183 106.000 0.000 NA   NA
 1783866 1783867 CHU_0787 CHU_0788     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783867 1783868 CHU_0788 CHU_0789     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1783868 1783869 CHU_0789 CHU_0790     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1783871 1783872 CHU_0792 CHU_0793     FALSE 0.117 170.000 0.000 1.000   NA
 1783872 1783873 CHU_0793 CHU_0794     FALSE 0.027 363.000 0.000 NA   NA
 1783873 1783874 CHU_0794 CHU_0795     TRUE 0.545 39.000 0.000 NA N NA
 1783875 1783876 CHU_0796 CHU_0797   ftnA TRUE 0.576 -49.000 0.000 NA   NA
 1783876 1783877 CHU_0797 CHU_0798 ftnA   TRUE 0.669 195.000 0.423 NA   NA
 1783877 1783878 CHU_0798 CHU_0799     FALSE 0.034 302.000 0.000 NA   NA
 1783878 1783879 CHU_0799 CHU_0800     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1783879 1783880 CHU_0800 CHU_0801     FALSE 0.055 249.000 0.000 1.000   NA
 1783880 1783881 CHU_0801 CHU_0802     TRUE 0.998 12.000 0.429 1.000 Y NA
 1783884 1783885 CHU_0805 CHU_0806     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783885 1783886 CHU_0806 CHU_0807     FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783887 1783888 CHU_0808 CHU_0809     FALSE 0.111 159.000 0.000 NA   NA
 1783888 1783889 CHU_0809 CHU_0810   ydcN FALSE 0.135 137.000 0.000 NA   NA
 1783892 1783893 CHU_0813 CHU_0814     FALSE 0.044 255.000 0.000 NA   NA
 1783893 1783894 CHU_0814 CHU_0815     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783894 1783895 CHU_0815 CHU_0816     FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1783895 1783896 CHU_0816 CHU_0817     FALSE 0.190 103.000 0.000 NA   NA
 1783896 1783897 CHU_0817 CHU_0818     FALSE 0.081 187.000 0.000 NA   NA
 1783897 1783898 CHU_0818 CHU_0819     FALSE 0.038 286.000 0.000 NA   NA
 1783898 1783899 CHU_0819 CHU_0821   nhaA FALSE 0.269 84.000 0.000 NA   NA
 1783900 1783901 CHU_0822 CHU_0823     FALSE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 1783901 1783902 CHU_0823 CHU_0824     TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1783904 1783905 CHU_0826 CHU_0827     FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1783906 1783907 CHU_0828 CHU_0829   czcC FALSE 0.203 110.000 0.000 1.000   NA
 1783907 1783908 CHU_0829 CHU_0830 czcC czcB TRUE 0.937 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 1783908 1783909 CHU_0830 CHU_0831 czcB czcA TRUE 0.996 4.000 0.200 1.000 N NA
 1783911 1783912 CHU_0833 CHU_0834 galE   FALSE 0.027 362.000 0.000 NA   NA
 1783912 1783913 CHU_0834 CHU_0835     FALSE 0.052 233.000 0.000 NA   NA
 1783913 1783914 CHU_0835 CHU_0837     FALSE 0.031 319.000 0.000 NA   NA
 1783914 1783915 CHU_0837 CHU_0838     FALSE 0.022 475.000 0.000 NA   NA
 1783915 1783916 CHU_0838 CHU_0839     FALSE 0.020 533.000 0.000 NA   NA
 1783916 1783917 CHU_0839 CHU_0841     FALSE 0.021 484.000 0.000 NA   NA
 1783917 1783918 CHU_0841 CHU_0843     FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1783918 1783919 CHU_0843 CHU_0844     TRUE 0.992 4.000 0.069 NA   NA
 1783919 1783920 CHU_0844 CHU_0845   wza FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783920 1783921 CHU_0845 CHU_0846 wza wzc TRUE 0.997 23.000 0.750 0.088 Y NA
 1783921 1783922 CHU_0846 CHU_0847 wzc   TRUE 0.937 22.000 0.000 0.088 Y NA
 1783922 1783923 CHU_0847 CHU_0848   rgpD TRUE 0.998 10.000 0.366 1.000 Y NA
 1783923 1783924 CHU_0848 CHU_0849 rgpD lacA TRUE 0.497 51.000 0.000 1.000   NA
 1783924 1783925 CHU_0849 CHU_0850 lacA rfbB TRUE 0.994 -3.000 0.182 1.000   NA
 1783925 1783926 CHU_0850 CHU_0851 rfbB   TRUE 0.990 -24.000 0.217 1.000 Y NA
 1783926 1783927 CHU_0851 CHU_0852     TRUE 0.967 11.000 0.000 NA Y NA
 1783927 1783928 CHU_0852 CHU_0853     TRUE 0.731 53.000 0.000 NA Y NA
 1783928 1783929 CHU_0853 CHU_0854     TRUE 0.528 -79.000 0.000 NA   NA
 1783931 1783932 CHU_0855 CHU_0857     TRUE 0.578 52.000 0.000 0.025   NA
 1783932 1783933 CHU_0857 CHU_0858     TRUE 0.939 -3.000 0.000 0.025   NA
 1783933 1783934 CHU_0858 CHU_0859     TRUE 0.505 50.000 0.000 1.000   NA
 1783934 1783935 CHU_0859 CHU_0860     TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1783935 1783936 CHU_0860 CHU_0861     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1783936 1783937 CHU_0861 CHU_0862     TRUE 0.848 -10.000 0.000 1.000   NA
 1783937 1783938 CHU_0862 CHU_0863     FALSE 0.027 363.000 0.000 NA N NA
 1783938 1783939 CHU_0863 CHU_0864     TRUE 0.970 -3.000 0.000 NA Y NA
 1783939 1783940 CHU_0864 CHU_0865     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783940 1783941 CHU_0865 CHU_0866     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1783941 1783942 CHU_0866 CHU_0867     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1783942 1783943 CHU_0867 CHU_0868   wcaL TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1783943 1783944 CHU_0868 CHU_0869 wcaL   TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.025 Y NA
 1783944 1783945 CHU_0869 CHU_0870   wcaL FALSE 0.248 215.000 0.000 0.025 Y NA
 1783946 1783947 CHU_0871 CHU_0872     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783947 1783948 CHU_0872 CHU_0873     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1783948 1783949 CHU_0873 CHU_0874     FALSE 0.030 335.000 0.000 NA   NA
 1783949 1783950 CHU_0874 CHU_0876     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783950 1783951 CHU_0876 CHU_0878     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1783952 1783953 CHU_0879 CHU_0880 wza wzc TRUE 0.958 17.000 0.000 0.088 Y NA
 1783953 1783954 CHU_0880 CHU_0881 wzc   FALSE 0.335 93.000 0.000 0.088   NA
 1783954 1783955 CHU_0881 CHU_0882     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1783955 1783956 CHU_0882 CHU_0883     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1783956 1783957 CHU_0883 CHU_0884     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1783957 1783958 CHU_0884 CHU_0885     TRUE 0.914 22.000 0.000 NA Y NA
 1783958 1783959 CHU_0885 CHU_0886     TRUE 0.747 25.000 0.000 1.000 N NA
 1783960 1783961 CHU_0887 CHU_0888     TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1783961 1783962 CHU_0888 CHU_0889     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783963 1783964 CHU_0890 CHU_0891     TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA   NA
 1783964 1783965 CHU_0891 CHU_0892     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1783965 1783966 CHU_0892 CHU_0893     TRUE 0.959 -12.000 0.000 0.004 Y NA
 1783966 1783967 CHU_0893 CHU_0894     TRUE 0.725 -25.000 0.000 1.000 N NA
 1783967 1783968 CHU_0894 CHU_0895     TRUE 0.988 3.000 0.000 0.025 Y NA
 1783968 1783969 CHU_0895 CHU_0896     TRUE 0.955 -7.000 0.000 NA Y NA
 1783969 1783970 CHU_0896 CHU_0897     TRUE 0.854 14.000 0.000 NA N NA
 1783970 1783971 CHU_0897 CHU_0898     TRUE 0.419 159.000 0.000 0.004 Y NA
 1783972 1783973 CHU_0899 CHU_0900     FALSE 0.122 166.000 0.000 1.000   NA
 1783973 1783974 CHU_0900 CHU_0901   ugd FALSE 0.212 210.000 0.000 1.000 Y NA
 1783975 1783976 CHU_0902 CHU_0903     FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 1783976 1783977 CHU_0903 CHU_0904     FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1783977 1783978 CHU_0904 CHU_0905     FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783978 1783979 CHU_0905 CHU_0906     FALSE 0.026 380.000 0.000 NA   NA
 1783979 1783980 CHU_0906 CHU_0907     FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   NA
 1783981 1783982 CHU_0908 CHU_0909     TRUE 0.986 -7.000 0.105 1.000   NA
 1783982 1427356 CHU_0909 CHU_tMet01     FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1427356 1783983 CHU_tMet01 CHU_0910     FALSE 0.031 320.000 0.000 NA   NA
 1783985 1783986 CHU_0912 CHU_0913 ycdQ wca FALSE 0.393 60.000 0.000 NA   NA
 1783986 1783987 CHU_0913 CHU_0914 wca yneI FALSE 0.135 158.000 0.000 1.000 N NA
 1783988 1783989 CHU_0915 CHU_0916 glnB amtB TRUE 0.955 47.000 0.300 1.000 N NA
 1783989 1783990 CHU_0916 CHU_0917 amtB   FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1783990 1783991 CHU_0917 CHU_0918     FALSE 0.144 131.000 0.000 NA   NA
 1783992 1427367 CHU_0919 CHU_0920     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1427367 1783993 CHU_0920 CHU_0922     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783993 1783994 CHU_0922 CHU_0923     TRUE 0.940 17.000 0.017 NA   NA
 1783994 1783995 CHU_0923 CHU_0924   ddlA TRUE 0.990 2.000 0.043 1.000   NA
 1783995 1783996 CHU_0924 CHU_0925 ddlA   TRUE 0.869 32.000 0.019 1.000 N NA
 1783996 1783997 CHU_0925 CHU_0926   mrp TRUE 0.996 4.000 0.219 1.000 N NA
 1783998 1783999 CHU_0927 CHU_0928 dnaG rfaG TRUE 0.653 33.000 0.000 1.000 N NA
 1783999 1784000 CHU_0928 CHU_0929 rfaG   TRUE 0.984 8.000 0.000 0.025 Y NA
 1784000 1784001 CHU_0929 CHU_0930     TRUE 0.996 -3.000 0.065 0.025 Y NA
 1784001 1784002 CHU_0930 CHU_0931   ribA TRUE 0.822 37.000 0.014 1.000 N NA
 1784002 1784003 CHU_0931 CHU_0932 ribA surE TRUE 0.597 38.000 0.000 1.000   NA
 1784003 1784004 CHU_0932 CHU_0933 surE   FALSE 0.026 376.000 0.000 NA   NA
 1784004 1784005 CHU_0933 CHU_0934   guaA FALSE 0.105 164.000 0.000 NA   NA
 1784005 1784006 CHU_0934 CHU_0935 guaA   TRUE 0.802 -43.000 0.008 1.000   NA
 1784006 1784007 CHU_0935 CHU_0936   hemL TRUE 0.966 -10.000 0.035 1.000   NA
 1784007 1784008 CHU_0936 CHU_0937 hemL proC TRUE 0.536 46.000 0.000 1.000 N NA
 1784008 1784009 CHU_0937 CHU_0938 proC   TRUE 0.526 47.000 0.000 1.000   NA
 1784009 1784010 CHU_0938 CHU_0939     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1784011 1784012 CHU_0940 CHU_0941 ycdC acrD TRUE 0.466 55.000 0.000 1.000 N NA
 1784012 1784013 CHU_0941 CHU_0942 acrD acrA TRUE 0.994 16.000 0.629 1.000 N NA
 1784013 1427389 CHU_0942 CHU_0943 acrA   TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1427389 1784014 CHU_0943 CHU_0945   gldC FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 1784016 1784017 CHU_0947 CHU_0948 ribF truB TRUE 0.987 -3.000 0.062 1.000 N NA
 1784017 1784018 CHU_0948 CHU_0949 truB bacA TRUE 0.980 17.000 0.084 1.000 N NA
 1784018 1784019 CHU_0949 CHU_0950 bacA   TRUE 0.997 3.000 0.398 NA   NA
 1784019 1784020 CHU_0950 CHU_0951   ftsX TRUE 0.993 9.000 0.155 NA   NA
 1784020 1784021 CHU_0951 CHU_0952 ftsX   TRUE 0.592 52.000 0.005 NA   NA
 1784021 1784022 CHU_0952 CHU_0953   rpoE TRUE 0.998 3.000 0.750 NA   NA
 1784022 1784023 CHU_0953 CHU_0954 rpoE slyA TRUE 0.643 87.000 0.000 0.035 Y NA
 1784023 1784024 CHU_0954 CHU_0955 slyA folE TRUE 0.898 12.000 0.000 1.000 N NA
 1784024 1784025 CHU_0955 CHU_0956 folE ygcM TRUE 0.989 -37.000 0.317 1.000 Y NA
 1784026 1784027 CHU_0957 CHU_0958 cysH rfaD TRUE 0.895 20.000 0.006 1.000 N NA
 1784027 1784028 CHU_0958 CHU_0959 rfaD amyA TRUE 0.914 28.000 0.000 0.032 Y NA
 1784028 1784029 CHU_0959 CHU_0960 amyA fucP TRUE 0.829 39.000 0.000 1.000 Y NA
 1784030 1784031 CHU_0961 CHU_0962   comB FALSE 0.139 153.000 0.000 1.000   NA
 1784031 1784032 CHU_0962 CHU_0963 comB   FALSE 0.056 247.000 0.000 1.000   NA
 1784032 1784033 CHU_0963 CHU_0964     TRUE 0.406 57.000 0.000 NA   NA
 1784033 1784034 CHU_0964 CHU_0965     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1784034 1784035 CHU_0965 CHU_0966     FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1784035 1784036 CHU_0966 CHU_0967     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784036 1784037 CHU_0967 CHU_0968     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784037 1784038 CHU_0968 CHU_0969   fabA TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1784038 1784039 CHU_0969 CHU_0970 fabA   FALSE 0.199 112.000 0.000 1.000   NA
 1784039 1784040 CHU_0970 CHU_0971     FALSE 0.061 210.000 0.000 NA   NA
 1784040 1784041 CHU_0971 CHU_0972     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1784041 1784042 CHU_0972 CHU_0973     TRUE 0.466 157.000 0.051 NA   NA
 1784042 1784043 CHU_0973 CHU_0974     TRUE 0.996 6.000 0.226 NA   NA
 1784043 1784044 CHU_0974 CHU_0975     TRUE 0.996 4.000 0.236 NA   NA
 1784044 1784045 CHU_0975 CHU_0976   sufD TRUE 0.602 160.000 0.101 1.000 N NA
 1784045 1784046 CHU_0976 CHU_0977 sufD sufC TRUE 0.997 16.000 0.482 1.000 Y NA
 1784046 1784047 CHU_0977 CHU_0978 sufC sufB TRUE 0.883 166.000 0.466 1.000 Y NA
 1784047 1784048 CHU_0978 CHU_0979 sufB asnC FALSE 0.059 244.000 0.000 1.000 N NA
 1784048 1784049 CHU_0979 CHU_0980 asnC   FALSE 0.029 406.000 0.000 1.000   NA
 1784049 1784050 CHU_0980 CHU_0981     TRUE 0.608 37.000 0.000 1.000   NA
 1784050 1784051 CHU_0981 CHU_0982     TRUE 0.560 -58.000 0.000 NA   NA
 1784051 1784052 CHU_0982 CHU_0983     TRUE 0.868 -6.000 0.000 NA   NA
 1784052 1784053 CHU_0983 CHU_0984     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1784053 1784054 CHU_0984 CHU_0985     TRUE 0.608 37.000 0.000 1.000   NA
 1784055 1784056 CHU_0986 CHU_0987   yigR TRUE 0.621 178.000 0.174 1.000   NA
 1784057 1784058 CHU_0988 CHU_0989     FALSE 0.217 96.000 0.000 NA   NA
 1784058 1784059 CHU_0989 CHU_0990     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784061 1784062 CHU_0992 CHU_0993 arcB   TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1784062 1784063 CHU_0993 CHU_0994   maoC TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784063 1784064 CHU_0994 CHU_0995 maoC serC TRUE 0.961 2.000 0.000 0.051 N NA
 1784064 1784065 CHU_0995 CHU_0996 serC serA TRUE 0.592 139.000 0.009 0.051 Y NA
 1784072 1784073 CHU_1003 CHU_1004   glpD FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1784074 1784075 CHU_1005 CHU_1006 ugpQ rhlE FALSE 0.028 433.000 0.000 1.000 N NA
 1784076 1427453 CHU_1007 CHU_tHis01 pyrC   FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1427453 1784077 CHU_tHis01 CHU_1008     TRUE 0.506 43.000 0.000 NA   NA
 1784078 1784079 CHU_1009 CHU_1010     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784082 1784083 CHU_1013 CHU_1014 yhaH yhaH TRUE 0.614 46.000 0.000 0.056   NA
 1784084 1784085 CHU_1015 CHU_1016 yncD   FALSE 0.193 102.000 0.000 NA   NA
 1784085 1784086 CHU_1016 CHU_1017     FALSE 0.055 227.000 0.000 NA   NA
 1784086 1784087 CHU_1017 CHU_1018     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1784087 1784088 CHU_1018 CHU_1019   ykgF FALSE 0.029 342.000 0.000 NA   NA
 1784088 1784089 CHU_1019 CHU_1020 ykgF yfbL TRUE 0.993 5.000 0.073 1.000   NA
 1784090 1784091 CHU_1021 CHU_1022 gcvP   FALSE 0.027 467.000 0.000 1.000 N NA
 1784091 1784092 CHU_1022 CHU_1023     TRUE 0.996 13.000 0.667 1.000   NA
 1784092 1784093 CHU_1023 CHU_1024   yqiK FALSE 0.397 59.000 0.000 NA   NA
 1784093 1784094 CHU_1024 CHU_1025 yqiK   TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784094 1784095 CHU_1025 CHU_1026     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1784095 1784096 CHU_1026 CHU_1027     TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1784096 1784097 CHU_1027 CHU_1028     FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1784097 1784098 CHU_1028 CHU_1029     TRUE 0.586 229.000 0.409 NA   NA
 1784099 1784100 CHU_1030 CHU_1031     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1784101 1784102 CHU_1032 CHU_1033   qor FALSE 0.154 142.000 0.000 1.000 N NA
 1784102 1784103 CHU_1033 CHU_1034 qor   FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1784104 1784105 CHU_1035 CHU_1036   lpxA TRUE 0.996 0.000 0.219 1.000 N NA
 1784105 1784106 CHU_1036 CHU_1037 lpxA lpxC TRUE 0.997 3.000 0.091 1.000 Y NA
 1784106 1784107 CHU_1037 CHU_1038 lpxC lpxD TRUE 0.998 10.000 0.148 0.002 Y NA
 1784107 1784108 CHU_1038 CHU_1039 lpxD   TRUE 0.971 27.000 0.154 1.000   NA
 1784110 1784111 CHU_1041 CHU_1042 cab   TRUE 0.995 10.000 0.074 1.000 Y NA
 1784111 1784112 CHU_1042 CHU_1043     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1784112 1784113 CHU_1043 CHU_1044     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1784113 1784114 CHU_1044 CHU_1045   recR TRUE 0.935 -3.000 0.002 NA N NA
 1784114 1784115 CHU_1045 CHU_1046 recR   TRUE 0.760 41.000 0.011 NA   NA
 1784117 1784118 CHU_1048 CHU_1049     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1784120 1784121 CHU_1051 CHU_1052     TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1784122 1784123 CHU_1053 CHU_1054 phrB   TRUE 0.995 0.000 0.124 0.017   NA
 1784123 1784124 CHU_1054 CHU_1055     TRUE 0.462 168.000 0.034 0.017   NA
 1784124 1784125 CHU_1055 CHU_1056     TRUE 0.959 -7.000 0.018 1.000   NA
 1784125 1784126 CHU_1056 CHU_1057   fabG TRUE 0.990 8.000 0.042 0.036   NA
 1784126 1784127 CHU_1057 CHU_1058 fabG   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784128 1784129 CHU_1059 CHU_1060 folE rmeD TRUE 0.843 73.000 0.091 1.000 N NA
 1784130 1784131 CHU_1061 CHU_1062   xylR FALSE 0.130 160.000 0.000 1.000   NA
 1784133 1784134 CHU_1064 CHU_1065 pacS   FALSE 0.057 219.000 0.000 NA   NA
 1784134 1784135 CHU_1065 CHU_1066     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1784137 1784138 CHU_1068 CHU_1069 yhfC   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784139 1784140 CHU_1070 CHU_1071     FALSE 0.046 248.000 0.000 NA   NA
 1784140 1784141 CHU_1071 CHU_1072     FALSE 0.097 171.000 0.000 NA   NA
 1784141 1784142 CHU_1072 CHU_1073   ybgC TRUE 0.978 9.000 0.026 NA   NA
 1784142 1784143 CHU_1073 CHU_1074 ybgC   TRUE 0.969 -49.000 0.302 1.000   NA
 1784143 1784144 CHU_1074 CHU_1075     FALSE 0.063 231.000 0.000 1.000   NA
 1784144 1784145 CHU_1075 CHU_1076   yciO FALSE 0.085 183.000 0.000 NA N NA
 1784147 1784148 CHU_1077 CHU_1079   clpA FALSE 0.366 153.000 0.026 NA   NA
 1784148 1784149 CHU_1079 CHU_1080 clpA   FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 1784149 1784150 CHU_1080 CHU_1081     TRUE 0.993 -7.000 0.412 NA   NA
 1784150 1784151 CHU_1081 CHU_1082     FALSE 0.020 498.000 0.000 NA   NA
 1784152 1784153 CHU_1083 CHU_1084     FALSE 0.114 156.000 0.000 NA   NA
 1784153 1784154 CHU_1084 CHU_1085   fabG TRUE 0.741 137.000 0.237 NA   NA
 1784159 1784160 CHU_1090 CHU_1091   hdhA FALSE 0.333 72.000 0.000 NA N NA
 1784160 1784161 CHU_1091 CHU_1092 hdhA arcB FALSE 0.068 226.000 0.000 1.000 N NA
 1784161 1784162 CHU_1092 CHU_1093 arcB   FALSE 0.027 361.000 0.000 NA   NA
 1784162 1784163 CHU_1093 CHU_1094     TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1784163 1784164 CHU_1094 CHU_1095     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1784164 1784165 CHU_1095 CHU_1096     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1784165 1784166 CHU_1096 CHU_1097   araC TRUE 0.584 35.000 0.000 NA   NA
 1784166 1784167 CHU_1097 CHU_1098 araC   TRUE 0.402 67.000 0.000 1.000   NA
 1784167 1784168 CHU_1098 CHU_1099     TRUE 0.718 -21.000 0.000 NA   NA
 1784168 1784169 CHU_1099 CHU_1101     FALSE 0.397 59.000 0.000 NA   NA
 1784169 1784170 CHU_1101 CHU_1102     FALSE 0.370 64.000 0.000 NA   NA
 1784170 1784171 CHU_1102 CHU_1103     FALSE 0.020 528.000 0.000 NA   NA
 1784171 1784172 CHU_1103 CHU_1104     FALSE 0.232 93.000 0.000 NA   NA
 1784172 1784173 CHU_1104 CHU_1105     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784175 1784176 CHU_1107 CHU_1108     FALSE 0.052 233.000 0.000 NA   NA
 1784176 1784177 CHU_1108 CHU_1109   smtB FALSE 0.162 116.000 0.000 NA   NA
 1784177 1784178 CHU_1109 CHU_1110 smtB   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784178 1784179 CHU_1110 CHU_1111     TRUE 0.977 25.000 0.222 NA   NA
 1784180 1784181 CHU_1113 CHU_1114 ptpA   TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1784182 1784183 CHU_1115 CHU_1116     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1784185 1784186 CHU_1118 CHU_1119     FALSE 0.316 74.000 0.000 NA   NA
 1784188 1784189 CHU_1121 CHU_1122     TRUE 0.457 50.000 0.000 NA   NA
 1784189 1784190 CHU_1122 CHU_1123     FALSE 0.316 74.000 0.000 NA   NA
 1784190 1784191 CHU_1123 CHU_1124     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1784191 1784192 CHU_1124 CHU_1125     FALSE 0.107 162.000 0.000 NA   NA
 1784193 1784194 CHU_1126 CHU_1127     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1784194 1784195 CHU_1127 CHU_1128     TRUE 0.794 73.000 0.064 NA   NA
 1784195 1784196 CHU_1128 CHU_1129     TRUE 0.887 22.000 0.010 NA   NA
 1784196 1784197 CHU_1129 CHU_1130   pheS FALSE 0.362 98.000 0.006 NA   NA
 1784198 1784199 CHU_1131 CHU_1132 barA crp TRUE 0.998 15.000 0.462 0.060 Y NA
 1784199 1784200 CHU_1132 CHU_1133 crp copA TRUE 0.820 29.000 0.006 1.000 N NA
 1784200 1784201 CHU_1133 CHU_1134 copA   FALSE 0.117 153.000 0.000 NA   NA
 1784201 1784202 CHU_1134 CHU_1135   uspA FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784204 1784205 CHU_1137 CHU_1138   cyo TRUE 0.994 6.000 0.133 NA N NA
 1784205 1784206 CHU_1138 CHU_1139 cyo   TRUE 0.985 4.000 0.027 NA   NA
 1784206 1784207 CHU_1139 CHU_1140   cytC TRUE 0.976 14.000 0.053 NA   NA
 1784207 1784208 CHU_1140 CHU_1141 cytC   TRUE 0.995 30.000 0.774 0.015 Y NA
 1784208 1784209 CHU_1141 CHU_1142     TRUE 0.995 11.000 0.489 NA   NA
 1784209 1784210 CHU_1142 CHU_1143     TRUE 0.977 23.000 0.177 NA   NA
 1784210 1784211 CHU_1143 CHU_1144   hemN TRUE 0.959 -9.000 0.029 NA   NA
 1784211 1784212 CHU_1144 CHU_1145 hemN yegM FALSE 0.119 170.000 0.000 1.000 N NA
 1784212 1784213 CHU_1145 CHU_1146 yegM acrB TRUE 0.997 12.000 0.814 0.084 N NA
 1784213 1784214 CHU_1146 CHU_1147 acrB   FALSE 0.028 358.000 0.000 NA   NA
 1784216 1784217 CHU_1148 CHU_1150     FALSE 0.056 223.000 0.000 NA   NA
 1784218 1784219 CHU_1151 CHU_1152 yaeJ   TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784219 1784220 CHU_1152 CHU_1153     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1784220 1784221 CHU_1153 CHU_1154   hat FALSE 0.234 100.000 0.000 1.000   NA
 1784221 1784222 CHU_1154 CHU_1155 hat   FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 1784222 1784223 CHU_1155 CHU_1156     FALSE 0.077 191.000 0.000 NA   NA
 1784223 1784224 CHU_1156 CHU_1157     FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 1784224 1784225 CHU_1157 CHU_1158     FALSE 0.018 1041.000 0.000 NA   NA
 1784225 1784226 CHU_1158 CHU_1159     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784226 1784227 CHU_1159 CHU_1160     FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1784229 1784230 CHU_1162 CHU_1163     FALSE 0.050 238.000 0.000 NA   NA
 1784230 1784231 CHU_1163 CHU_1164   amiA FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1784231 1784232 CHU_1164 CHU_1165 amiA   TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1784233 1784234 CHU_1166 CHU_1167     FALSE 0.025 386.000 0.000 NA   NA
 1784234 1784235 CHU_1167 CHU_1168     FALSE 0.025 389.000 0.000 NA   NA
 1784238 1784239 CHU_1171 CHU_1172     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1784239 1784240 CHU_1172 CHU_1173     FALSE 0.188 104.000 0.000 NA   NA
 1784240 1784241 CHU_1173 CHU_1174     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784241 1784242 CHU_1174 CHU_1175     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784242 1784243 CHU_1175 CHU_1176     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 1784243 1784244 CHU_1176 CHU_1177     FALSE 0.117 153.000 0.000 NA   NA
 1784244 1784245 CHU_1177 CHU_1178     FALSE 0.023 441.000 0.000 NA   NA
 1784246 1784247 CHU_1179 CHU_1180     FALSE 0.113 158.000 0.000 NA   NA
 1784248 1784249 CHU_1181 CHU_1182 uhpA   TRUE 0.980 -19.000 0.200 1.000   NA
 1784250 1784251 CHU_1183 CHU_1184     TRUE 0.996 11.000 0.667 NA   NA
 1784251 1784252 CHU_1184 CHU_1185     FALSE 0.085 198.000 0.000 1.000   NA
 1784253 1784254 CHU_1186 CHU_1187     TRUE 0.975 -40.000 0.400 NA   NA
 1784254 1784255 CHU_1187 CHU_1188     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784255 1784256 CHU_1188 CHU_1189     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784256 1784257 CHU_1189 CHU_1190     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1784259 1784260 CHU_1192 CHU_1193 pbpC   TRUE 0.944 5.000 0.000 1.000   NA
 1784260 1784261 CHU_1193 CHU_1194   gidB TRUE 0.428 62.000 0.000 1.000   NA
 1784261 1784262 CHU_1194 CHU_1195 gidB rpoE TRUE 0.661 62.000 0.010 1.000 N NA
 1784262 1784263 CHU_1195 CHU_1196 rpoE   TRUE 0.990 -9.000 0.281 NA N NA
 1784264 1784265 CHU_1197 CHU_1198 tgt   TRUE 0.992 10.000 0.124 1.000   NA
 1784265 1784266 CHU_1198 CHU_1199   yggB FALSE 0.183 121.000 0.000 1.000   NA
 1784266 1784267 CHU_1199 CHU_1200 yggB   FALSE 0.027 362.000 0.000 NA   NA
 1784267 1784268 CHU_1200 CHU_1201     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1784268 1784269 CHU_1201 CHU_1202     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1784269 1784270 CHU_1202 CHU_1203     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784270 1784271 CHU_1203 CHU_1204     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784272 1784273 CHU_1206 CHU_1208     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784273 1784274 CHU_1208 CHU_1209     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1784274 1784275 CHU_1209 CHU_1210   ispE TRUE 0.595 -43.000 0.000 NA   NA
 1784276 1784277 CHU_1211 CHU_1212 wcaJ   TRUE 0.995 5.000 0.153 NA   NA
 1784277 1784278 CHU_1212 CHU_1213     TRUE 0.995 0.000 0.148 1.000   NA
 1784278 1784279 CHU_1213 CHU_1214     FALSE 0.051 263.000 0.000 1.000   NA
 1784280 1784281 CHU_1215 CHU_1216 evgS   TRUE 0.936 -3.000 0.000 0.099   NA
 1784281 1784282 CHU_1216 CHU_1217     TRUE 0.998 -7.000 0.522 0.099 Y NA
 1784282 1784283 CHU_1217 CHU_1218     TRUE 0.991 -31.000 0.454 NA Y NA
 1784283 1784284 CHU_1218 CHU_1219     TRUE 0.995 19.000 0.361 NA Y NA
 1784284 1784285 CHU_1219 CHU_1220   phoB TRUE 0.978 7.000 0.000 NA Y NA
 1784285 1784286 CHU_1220 CHU_1221 phoB   FALSE 0.023 651.000 0.000 1.000 N NA
 1784286 1784287 CHU_1221 CHU_1222   cpxA FALSE 0.162 137.000 0.000 1.000 N NA
 1784287 1784288 CHU_1222 CHU_1223 cpxA   FALSE 0.069 220.000 0.000 1.000 N NA
 1784288 1784289 CHU_1223 CHU_1224     TRUE 0.997 0.000 0.574 NA   NA
 1784289 1784290 CHU_1224 CHU_1225     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1784290 1784291 CHU_1225 CHU_1226     TRUE 0.552 54.000 0.000 0.049   NA
 1784291 1784292 CHU_1226 CHU_1227     TRUE 0.815 -13.000 0.000 1.000   NA
 1784292 1784293 CHU_1227 CHU_1228   icd FALSE 0.187 118.000 0.000 1.000   NA
 1784295 1784296 CHU_1230 CHU_1231 pqqL   FALSE 0.126 145.000 0.000 NA   NA
 1784296 1784297 CHU_1231 CHU_1232     FALSE 0.072 197.000 0.000 NA   NA
 1784297 1784298 CHU_1232 CHU_1233   dnaX FALSE 0.093 285.000 0.009 NA   NA
 1784299 1784300 CHU_1234 CHU_1235     FALSE 0.024 425.000 0.000 NA   NA
 1784300 1784301 CHU_1235 CHU_1237     TRUE 0.986 5.000 0.000 0.059 Y NA
 1784301 1784302 CHU_1237 CHU_1238     FALSE 0.036 1224.000 0.000 0.001   NA
 1784302 1784303 CHU_1238 CHU_1239     FALSE 0.040 479.000 0.000 0.009   NA
 1784303 1784304 CHU_1239 CHU_1240     FALSE 0.373 173.000 0.000 0.009 Y NA
 1784304 1784305 CHU_1240 CHU_1241     FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1784305 1784306 CHU_1241 CHU_1242     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784306 1784307 CHU_1242 CHU_1243   ipyR FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784307 1784308 CHU_1243 CHU_1244 ipyR   FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784308 1784309 CHU_1244 CHU_1245     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784309 1784310 CHU_1245 CHU_1246   adhP TRUE 0.522 48.000 0.000 1.000 N NA
 1784310 1784311 CHU_1246 CHU_1247 adhP yjhC TRUE 0.411 65.000 0.000 1.000   NA
 1784311 1784312 CHU_1247 CHU_1248 yjhC   FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784313 1784314 CHU_1249 CHU_1251     FALSE 0.055 226.000 0.000 NA   NA
 1784315 1784316 CHU_1250 CHU_1252   mrcA FALSE 0.142 133.000 0.000 NA   NA
 1784316 1784317 CHU_1252 CHU_1253 mrcA   FALSE 0.028 349.000 0.000 NA   NA
 1784317 1784318 CHU_1253 CHU_1254     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1784318 1784319 CHU_1254 CHU_1255   livG TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784319 1784320 CHU_1255 CHU_1256 livG livH TRUE 0.888 178.000 0.654 1.000 Y NA
 1784320 1784321 CHU_1256 CHU_1257 livH livM TRUE 0.996 27.000 0.758 0.023 Y NA
 1784321 1784322 CHU_1257 CHU_1258 livM livG TRUE 0.961 12.000 0.013 1.000   NA
 1784322 1784323 CHU_1258 CHU_1259 livG livF TRUE 0.811 58.000 0.025 0.015   NA
 1784323 1784324 CHU_1259 CHU_1260 livF ureA TRUE 0.718 109.000 0.025 1.000 Y NA
 1784324 1784325 CHU_1260 CHU_1261 ureA ureC TRUE 0.999 13.000 0.667 0.001 Y NA
 1784325 1784326 CHU_1261 CHU_1262 ureC ureF FALSE 0.154 189.000 0.000 0.001 N NA
 1784326 1784327 CHU_1262 CHU_1263 ureF ureG TRUE 0.991 13.000 0.027 0.002 Y NA
 1784329 1784330 CHU_1265 CHU_1266 narQ yfiK TRUE 0.758 64.000 0.000 0.023 Y NA
 1784331 1784332 CHU_1267 CHU_1268     FALSE 0.252 88.000 0.000 NA   NA
 1784333 1784334 CHU_1269 CHU_1270 hisC hisB TRUE 0.995 22.000 0.341 0.004 Y NA
 1784334 1784335 CHU_1270 CHU_1271 hisB hisH TRUE 0.883 123.000 0.128 0.004 Y NA
 1784335 1784336 CHU_1271 CHU_1272 hisH hisA TRUE 0.978 51.000 0.210 0.004 Y NA
 1784336 1784337 CHU_1272 CHU_1273 hisA hisF TRUE 0.948 107.000 0.433 0.004 Y NA
 1784337 1784338 CHU_1273 CHU_1274 hisF pdh TRUE 0.695 67.000 0.000 1.000 Y NA
 1784340 1784341 CHU_1276 CHU_1277     FALSE 0.278 82.000 0.000 NA   NA
 1784341 1784342 CHU_1277 CHU_1278     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1784342 1784343 CHU_1278 CHU_1279     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1784343 1784344 CHU_1279 CHU_1280   cel FALSE 0.115 155.000 0.000 NA   NA
 1784344 1784345 CHU_1280 CHU_1281 cel   TRUE 0.505 -217.000 0.000 NA   NA
 1784346 1784347 CHU_1282 CHU_1283     TRUE 0.978 5.000 0.011 1.000   NA
 1784352 1784353 CHU_1288 CHU_1289   thyA FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1784354 1784355 CHU_1290 CHU_1292     FALSE 0.029 338.000 0.000 NA   NA
 1784357 1784358 CHU_1293 CHU_1294     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1784358 1784359 CHU_1294 CHU_1295     FALSE 0.048 245.000 0.000 NA   NA
 1784359 1784360 CHU_1295 CHU_1296     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1784360 1784361 CHU_1296 CHU_1297   dfr FALSE 0.023 450.000 0.000 NA   NA
 1784361 1784362 CHU_1297 CHU_1298 dfr araC TRUE 0.449 59.000 0.000 1.000 N NA
 1784362 1784363 CHU_1298 CHU_1299 araC   FALSE 0.020 568.000 0.000 NA   NA
 1784363 1784364 CHU_1299 CHU_1300     FALSE 0.061 210.000 0.000 NA   NA
 1784364 1784365 CHU_1300 CHU_1301     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1784365 1784366 CHU_1301 CHU_1302   pabC FALSE 0.025 399.000 0.000 NA   NA
 1784366 1784367 CHU_1302 CHU_1303 pabC   FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1784367 1784368 CHU_1303 CHU_1304     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1784368 1784369 CHU_1304 CHU_1305     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784369 1784370 CHU_1305 CHU_1306     FALSE 0.060 213.000 0.000 NA   NA
 1784372 1784373 CHU_1308 CHU_1309 maf   TRUE 0.925 0.000 0.000 NA N NA
 1784374 1784375 CHU_1310 CHU_1311 kbl   TRUE 0.745 102.000 0.102 1.000   NA
 1784376 1784377 CHU_1312 CHU_1313 dapA ligA TRUE 0.589 92.000 0.023 1.000 N NA
 1784380 1784381 CHU_1316 CHU_1317 uhpB uhpA TRUE 0.987 4.000 0.000 0.023 Y NA
 1784383 1784384 CHU_1319 CHU_1320   napA TRUE 0.850 46.000 0.035 1.000 N NA
 1784384 1784385 CHU_1320 CHU_1321 napA norV TRUE 0.968 -7.000 0.000 0.040 Y NA
 1784385 1784386 CHU_1321 CHU_1322 norV moaA TRUE 0.850 -10.000 0.000 1.000 N NA
 1784386 1784387 CHU_1322 CHU_1323 moaA   TRUE 0.947 4.000 0.000 1.000   NA
 1784387 1784388 CHU_1323 CHU_1324   moaE TRUE 0.980 -40.000 0.501 1.000   NA
 1784388 1784389 CHU_1324 CHU_1325 moaE   TRUE 0.780 22.000 0.000 1.000   NA
 1784389 1784390 CHU_1325 CHU_1326   mobA FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1784390 1784391 CHU_1326 CHU_1327 mobA   TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784391 1784392 CHU_1327 CHU_1328     FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1784393 1784394 CHU_1329 CHU_1330 moeA moaC TRUE 0.992 2.000 0.006 0.002 Y NA
 1784394 1784395 CHU_1330 CHU_1331 moaC nirD FALSE 0.041 307.000 0.000 1.000 N NA
 1784395 1784396 CHU_1331 CHU_1332 nirD nirB TRUE 0.992 23.000 0.500 0.001 N NA
 1784397 1784398 CHU_1333 CHU_1334 folE   TRUE 0.790 50.000 0.027 NA   NA
 1784399 1784400 CHU_1335 CHU_1336     FALSE 0.040 476.000 0.000 0.009   NA
 1784402 1784403 CHU_1338 CHU_1339   phnA FALSE 0.322 82.000 0.000 1.000 N NA
 1784405 1784406 CHU_1341 CHU_1342 alf   FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784406 1784407 CHU_1342 CHU_1343     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1784407 1784408 CHU_1343 CHU_1344     TRUE 0.462 49.000 0.000 NA   NA
 1784408 1784409 CHU_1344 CHU_1345   glgB FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784409 1784410 CHU_1345 CHU_1346 glgB   FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 1784410 1784411 CHU_1346 CHU_1347     FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 1784411 1784412 CHU_1347 CHU_1348   mpl TRUE 0.984 0.000 0.026 1.000 N NA
 1784413 1784414 CHU_1349 CHU_1350 dnaB   FALSE 0.239 122.000 0.000 0.050   NA
 1784414 1784415 CHU_1350 CHU_1351     TRUE 0.709 -58.000 0.000 0.008   NA
 1784415 1784416 CHU_1351 CHU_1352     TRUE 0.709 -58.000 0.000 0.008   NA
 1784417 1784418 CHU_1353 CHU_1354 trxA   FALSE 0.077 206.000 0.000 1.000   NA
 1784419 1784420 CHU_1355 CHU_1356 arcB narL TRUE 0.955 0.000 0.000 0.022   NA
 1784421 1784422 CHU_1357 CHU_1358 ybbK   FALSE 0.107 177.000 0.000 1.000   NA
 1784423 1784424 CHU_1359 CHU_1360 fixA fixB TRUE 0.994 30.000 0.509 0.014 Y NA
 1784424 1784425 CHU_1360 CHU_1361 fixB   TRUE 0.987 14.000 0.125 1.000   NA
 1784427 1784428 CHU_1363 CHU_1364   dacB TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1784431 1784432 CHU_1367 CHU_1368 ygjT dedA FALSE 0.221 95.000 0.000 NA   NA
 1784432 1784433 CHU_1368 CHU_1369 dedA nuoN TRUE 0.996 1.000 0.240 NA   NA
 1784433 1784434 CHU_1369 CHU_1370 nuoN nuoM TRUE 0.996 20.000 0.370 0.002 Y NA
 1784434 1784435 CHU_1370 CHU_1371 nuoM nuoL TRUE 0.996 15.000 0.198 0.002 Y NA
 1784435 1784436 CHU_1371 CHU_1372 nuoL nuoK TRUE 0.998 20.000 0.790 0.009 Y NA
 1784436 1784437 CHU_1372 CHU_1373 nuoK nuoJ TRUE 0.998 13.000 0.306 0.004 Y NA
 1784437 1784438 CHU_1373 CHU_1374 nuoJ nuoI TRUE 0.995 19.000 0.210 0.009 Y NA
 1784438 1784439 CHU_1374 CHU_1375 nuoI nuoH TRUE 0.997 12.000 0.221 0.009 Y NA
 1784439 1784440 CHU_1375 CHU_1376 nuoH nuoG TRUE 0.992 -16.000 0.515 0.009   NA
 1784440 1784441 CHU_1376 CHU_1377 nuoG nuoF TRUE 0.982 15.000 0.054 0.009   NA
 1784441 1784442 CHU_1377 CHU_1378 nuoF nuoE TRUE 0.997 0.000 0.054 0.008 Y NA
 1784442 1784443 CHU_1378 CHU_1379 nuoE nuoD TRUE 0.996 13.000 0.097 0.008 Y NA
 1784443 1784444 CHU_1379 CHU_1380 nuoD nuoC TRUE 0.966 51.000 0.096 0.009 Y NA
 1784444 1784445 CHU_1380 CHU_1381 nuoC   TRUE 0.995 -10.000 0.125 0.004 Y NA
 1784445 1784446 CHU_1381 CHU_1382   nuoA TRUE 0.983 61.000 0.498 0.004 Y NA
 1784447 1784448 CHU_1383 CHU_1384     FALSE 0.087 179.000 0.000 NA   NA
 1784449 1784450 CHU_1386 CHU_1387   rfaD FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1784451 1784452 CHU_1388 CHU_1389 yadT fecD TRUE 0.996 -3.000 0.120 1.000 Y NA
 1784452 1784453 CHU_1389 CHU_1390 fecD ygcM TRUE 0.917 50.000 0.115 1.000 N NA
 1784453 1784454 CHU_1390 CHU_1391 ygcM lpxB TRUE 0.659 65.000 0.012 1.000 N NA
 1784455 1784456 CHU_1392 CHU_1393     FALSE 0.029 339.000 0.000 NA   NA
 1784458 1784459 CHU_1395 CHU_1396   rnc TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1784459 1784460 CHU_1396 CHU_1397 rnc fabF TRUE 0.997 4.000 0.245 1.000 N NA
 1784460 1784461 CHU_1397 CHU_1398 fabF acpP TRUE 0.944 39.000 0.034 1.000 Y NA
 1784462 1784463 CHU_1399 CHU_1400   pykF TRUE 0.997 7.000 0.559 NA   NA
 1784463 1784464 CHU_1400 CHU_1401 pykF cel FALSE 0.365 147.000 0.000 1.000 Y NA
 1784464 1784465 CHU_1401 CHU_1402 cel   FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1784465 1784466 CHU_1402 CHU_1403   gntT TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1784466 1784467 CHU_1403 CHU_1404 gntT gnd TRUE 0.744 55.000 0.000 1.000 Y NA
 1784468 1784469 CHU_1405 CHU_1406     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784469 1784470 CHU_1406 CHU_1407     FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1784470 1784471 CHU_1407 CHU_1408   caiA FALSE 0.116 157.000 0.000 NA N NA
 1784472 1784473 CHU_1409 CHU_1410     TRUE 0.942 1.000 0.000 1.000   NA
 1784473 1784474 CHU_1410 CHU_1411     FALSE 0.297 132.000 0.007 1.000   NA
 1784474 1784475 CHU_1411 CHU_1412     FALSE 0.062 560.000 0.015 NA   NA
 1784475 1784476 CHU_1412 CHU_1413   gyrB FALSE 0.349 88.000 0.002 NA   NA
 1784476 1784477 CHU_1413 CHU_1414 gyrB ppk TRUE 0.483 85.000 0.007 1.000 N NA
 1784479 1784480 CHU_1416 CHU_1417     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784480 1784481 CHU_1417 CHU_1418     FALSE 0.401 81.000 0.000 0.047   NA
 1784481 1784482 CHU_1418 CHU_1419     TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1784483 1784484 CHU_1420 CHU_1421     FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1784484 1784485 CHU_1421 CHU_1422     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784485 1784486 CHU_1422 CHU_1423     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1784486 1784487 CHU_1423 CHU_1424     FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1784487 1784488 CHU_1424 CHU_1425   fabG TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1784488 1784489 CHU_1425 CHU_1426 fabG   FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784489 1784490 CHU_1426 CHU_1427     TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1784490 1784491 CHU_1427 CHU_1428     FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 1784491 1784492 CHU_1428 CHU_1429   tolB TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1784492 1784493 CHU_1429 CHU_1430 tolB   FALSE 0.072 197.000 0.000 NA   NA
 1784493 1784494 CHU_1430 CHU_1431     FALSE 0.144 131.000 0.000 NA   NA
 1784494 1784495 CHU_1431 CHU_1432     FALSE 0.361 66.000 0.000 NA   NA
 1784496 1784497 CHU_1433 CHU_1434 metH metH TRUE 0.990 13.000 0.024 0.001 Y NA
 1784497 1784498 CHU_1434 CHU_1435 metH metF FALSE 0.330 745.000 0.057 0.002 Y NA
 1784498 1784499 CHU_1435 CHU_1436 metF leuA TRUE 0.993 0.000 0.025 1.000 Y NA
 1784499 1784500 CHU_1436 CHU_1437 leuA ykgE TRUE 0.936 31.000 0.070 NA N NA
 1784500 1784501 CHU_1437 CHU_1438 ykgE   TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1784501 1784502 CHU_1438 CHU_1439     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1784503 1784504 CHU_1440 CHU_1441     TRUE 0.542 62.000 0.000 0.008   NA
 1784504 1784505 CHU_1441 CHU_1442   pepN FALSE 0.129 161.000 0.000 1.000   NA
 1784505 1784506 CHU_1442 CHU_1443 pepN dnaJ TRUE 0.832 -12.000 0.000 1.000   NA
 1784506 1784507 CHU_1443 CHU_1444 dnaJ dprA FALSE 0.251 96.000 0.000 1.000   NA
 1784507 1784508 CHU_1444 CHU_1445 dprA   FALSE 0.083 316.000 0.008 1.000 N NA
 1784509 1784510 CHU_1446 CHU_1447 alaS gatB TRUE 0.957 22.000 0.008 1.000 Y NA
 1784510 1784511 CHU_1447 CHU_1448 gatB ccmG TRUE 0.945 5.000 0.000 1.000 N NA
 1784511 1784512 CHU_1448 CHU_1449 ccmG   TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1784513 1784514 CHU_1450 CHU_1451     FALSE 0.039 274.000 0.000 NA   NA
 1784514 1784515 CHU_1451 CHU_1452     TRUE 0.840 122.000 0.500 NA   NA
 1784515 1784516 CHU_1452 CHU_1453     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1784516 1784517 CHU_1453 CHU_1454     FALSE 0.087 179.000 0.000 NA   NA
 1784518 1784519 CHU_1455 CHU_1456 rhlE   FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784519 1784520 CHU_1456 CHU_1457     FALSE 0.031 320.000 0.000 NA   NA
 1784520 1784521 CHU_1457 CHU_1458     TRUE 0.885 96.000 0.250 0.003   NA
 1784521 1784522 CHU_1458 CHU_1459   tatA FALSE 0.286 89.000 0.000 1.000   NA
 1784522 1784523 CHU_1459 CHU_1460 tatA tatC TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1784526 1784527 CHU_1463 CHU_1464 xis   TRUE 0.457 50.000 0.000 NA   NA
 1784527 1784528 CHU_1464 CHU_1465   sms TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1784528 1784529 CHU_1465 CHU_1466 sms dpnA TRUE 0.948 3.000 0.000 1.000   NA
 1784529 1784530 CHU_1466 CHU_1467 dpnA   FALSE 0.255 87.000 0.000 NA   NA
 1784530 1784531 CHU_1467 CHU_1468   dpn TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1784531 1784532 CHU_1468 CHU_1469 dpn   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784532 1784533 CHU_1469 CHU_1470     TRUE 0.705 25.000 0.000 NA   NA
 1784533 1784534 CHU_1470 CHU_1471     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784534 1784535 CHU_1471 CHU_1472   flgJ FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784535 1784536 CHU_1472 CHU_1473 flgJ   TRUE 0.845 17.000 0.000 1.000   NA
 1784536 1784537 CHU_1473 CHU_1474     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1784537 1784538 CHU_1474 CHU_1475     TRUE 0.818 17.000 0.000 NA   NA
 1784538 1784539 CHU_1475 CHU_1476     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784539 1784540 CHU_1476 CHU_1477     FALSE 0.269 84.000 0.000 NA   NA
 1784540 1784541 CHU_1477 CHU_1478     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1784541 1784542 CHU_1478 CHU_1479     TRUE 0.803 -12.000 0.000 NA   NA
 1784542 1784543 CHU_1479 CHU_1480     TRUE 0.767 -15.000 0.000 NA   NA
 1784543 1784544 CHU_1480 CHU_1481     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1784544 1784545 CHU_1481 CHU_1482     FALSE 0.129 142.000 0.000 NA   NA
 1784545 1784546 CHU_1482 CHU_1483     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1784546 1784547 CHU_1483 CHU_1484     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784547 1784548 CHU_1484 CHU_1485     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784548 1784549 CHU_1485 CHU_1486     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 1784549 1784550 CHU_1486 CHU_1487     TRUE 0.626 -37.000 0.000 NA   NA
 1784550 1784551 CHU_1487 CHU_1488     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784551 1784552 CHU_1488 CHU_1489     FALSE 0.066 205.000 0.000 NA   NA
 1784552 1784553 CHU_1489 CHU_1490     TRUE 0.996 2.000 0.231 NA   NA
 1784554 1784555 CHU_1491 CHU_1492 umuD umuC TRUE 0.946 2.000 0.000 1.000 N NA
 1784555 1784556 CHU_1492 CHU_1493 umuC   FALSE 0.037 293.000 0.000 NA   NA
 1784557 1784558 CHU_1494 CHU_1495 radC   FALSE 0.255 87.000 0.000 NA   NA
 1784559 1784560 CHU_1496 CHU_1497     FALSE 0.036 331.000 0.000 1.000   NA
 1784561 1784562 CHU_1498 CHU_1499   copA TRUE 0.911 15.000 0.000 0.005   NA
 1784562 1784563 CHU_1499 CHU_1500 copA   FALSE 0.367 94.000 0.000 0.005 N NA
 1784563 1784564 CHU_1500 CHU_1501   cusB TRUE 0.945 5.000 0.000 1.000 N NA
 1784564 1784565 CHU_1501 CHU_1502 cusB cusB TRUE 0.997 22.000 0.667 0.006 Y NA
 1784565 1784566 CHU_1502 CHU_1503 cusB   TRUE 0.997 17.000 0.667 1.000 Y NA
 1784566 1784567 CHU_1503 CHU_1504   cusA TRUE 0.997 9.000 0.636 1.000 N NA
 1784567 1784568 CHU_1504 CHU_1505 cusA   FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1784568 1784569 CHU_1505 CHU_1506     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784569 1784570 CHU_1506 CHU_1507     FALSE 0.034 303.000 0.000 NA   NA
 1784572 1784573 CHU_1509 CHU_1510   zntA TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784573 1784574 CHU_1510 CHU_1511 zntA yegM TRUE 0.426 63.000 0.000 1.000 N NA
 1784574 1784575 CHU_1511 CHU_1512 yegM   TRUE 0.998 8.000 0.636 1.000 N NA
 1784576 1784577 CHU_1513 CHU_1514     TRUE 0.930 51.000 0.167 1.000   NA
 1784577 1784578 CHU_1514 CHU_1515     TRUE 0.669 31.000 0.000 1.000   NA
 1784578 1784579 CHU_1515 CHU_1516     TRUE 0.996 3.000 0.167 1.000   NA
 1784580 1784581 CHU_1517 CHU_1518 accA   TRUE 0.964 -3.000 0.010 1.000   NA
 1784581 1784582 CHU_1518 CHU_1519     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1784582 1784583 CHU_1519 CHU_1520     FALSE 0.028 355.000 0.000 NA   NA
 1784583 1784584 CHU_1520 CHU_1521     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1784584 1784585 CHU_1521 CHU_1522     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784585 1784586 CHU_1522 CHU_1523     FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1784586 1784587 CHU_1523 CHU_1524     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1784587 1784588 CHU_1524 CHU_1525     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784588 1784589 CHU_1525 CHU_1526     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1784590 1784591 CHU_1527 CHU_1528   tpn FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784593 1784594 CHU_1530 CHU_1531   efp FALSE 0.018 1420.000 0.000 NA   NA
 1784595 1784596 CHU_1532 CHU_1533     FALSE 0.053 231.000 0.000 NA   NA
 1784596 1784597 CHU_1533 CHU_1534     FALSE 0.135 137.000 0.000 NA   NA
 1784598 1784599 CHU_1535 CHU_1536   tyrS TRUE 0.926 9.000 0.000 1.000   NA
 1784600 1784601 CHU_1537 CHU_1538     TRUE 0.469 76.000 0.003 1.000   NA
 1784601 1784602 CHU_1538 CHU_1539     TRUE 0.990 -7.000 0.175 1.000   NA
 1784602 1784603 CHU_1539 CHU_1540     TRUE 0.995 1.000 0.159 NA   NA
 1784603 1784604 CHU_1540 CHU_1541     TRUE 0.839 52.000 0.048 NA   NA
 1784604 1784605 CHU_1541 CHU_1542   folC TRUE 0.990 4.000 0.051 NA   NA
 1784605 1784606 CHU_1542 CHU_1543 folC trmB TRUE 0.985 5.000 0.024 1.000   NA
 1784608 1784609 CHU_1545 CHU_1546 gldA gldF TRUE 0.993 9.000 0.163 NA   NA
 1784609 1784610 CHU_1546 CHU_1547 gldF gldG TRUE 0.995 -6.000 0.635 NA   NA
 1784610 1784611 CHU_1547 CHU_1548 gldG   TRUE 0.987 9.000 0.058 NA   NA
 1784611 1784612 CHU_1548 CHU_1549   dnaN FALSE 0.385 82.000 0.002 NA   NA
 1784612 1784613 CHU_1549 CHU_1550 dnaN   FALSE 0.097 171.000 0.000 NA   NA
 1784614 1784615 CHU_1551 CHU_1552   murA TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1784615 1784616 CHU_1552 CHU_1553 murA   TRUE 0.996 0.000 0.354 NA   NA
 1784616 1784617 CHU_1553 CHU_1554   uvrD TRUE 0.966 28.000 0.156 NA   NA
 1784618 1784619 CHU_1555 CHU_1556     FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1784620 1784621 CHU_1557 CHU_1558     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1784625 1784626 CHU_1562 CHU_1563   purB TRUE 0.940 6.000 0.000 1.000   NA
 1784627 1784628 CHU_1564 CHU_1565 paaE pepF TRUE 0.927 9.000 0.000 1.000 N NA
 1784630 1784631 CHU_1567 CHU_1568     TRUE 0.993 4.000 0.083 NA   NA
 1784632 1784633 CHU_1569 CHU_1570 folA fmt TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1784633 1784634 CHU_1570 CHU_1571 fmt   TRUE 0.451 80.000 0.006 NA   NA
 1784636 1784637 CHU_1573 CHU_1574 lgtD   TRUE 0.488 93.000 0.014 NA N NA
 1784640 1784641 CHU_1577 CHU_1579 argS btuE FALSE 0.248 127.000 0.002 1.000 N NA
 1784641 1784642 CHU_1579 CHU_1580 btuE pphA FALSE 0.214 106.000 0.000 1.000   NA
 1784642 1784643 CHU_1580 CHU_1581 pphA glgA TRUE 0.845 17.000 0.000 1.000   NA
 1784643 1784644 CHU_1581 CHU_1582 glgA   FALSE 0.055 227.000 0.000 NA   NA
 1784645 1784646 CHU_1583 CHU_1584   dmpI TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1784646 1784647 CHU_1584 CHU_1585 dmpI   FALSE 0.304 85.000 0.000 1.000   NA
 1784647 1784648 CHU_1585 CHU_1586   fabF FALSE 0.318 82.000 0.000 1.000   NA
 1784649 1784650 CHU_1587 CHU_1588 hslV arsC TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1784650 1784651 CHU_1588 CHU_1589 arsC   TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1784651 1784652 CHU_1589 CHU_1590     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1784652 1784653 CHU_1590 CHU_1591     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1784655 1784656 CHU_1593 CHU_1594     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1784657 1784658 CHU_1595 CHU_1596     FALSE 0.217 96.000 0.000 NA   NA
 1784658 1784659 CHU_1596 CHU_1597     TRUE 0.996 0.000 0.280 NA   NA
 1784659 1784660 CHU_1597 CHU_1598   deaD TRUE 0.968 3.000 0.006 NA   NA
 1784660 1784661 CHU_1598 CHU_1599 deaD ydgR FALSE 0.042 302.000 0.000 1.000 N NA
 1784661 1784662 CHU_1599 CHU_1600 ydgR pfkB FALSE 0.395 69.000 0.000 1.000 N NA
 1784662 1784663 CHU_1600 CHU_1601 pfkB   TRUE 0.770 23.000 0.000 1.000 N NA
 1784664 1784665 CHU_1602 CHU_1603 trmU   TRUE 0.961 1.000 0.004 NA   NA
 1784665 1784666 CHU_1603 CHU_1604     TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1784666 1784667 CHU_1604 CHU_1605   rpe TRUE 0.764 37.000 0.007 1.000   NA
 1784667 1784668 CHU_1605 CHU_1606 rpe   TRUE 0.893 25.000 0.013 1.000 N NA
 1784668 1784669 CHU_1606 CHU_1607     FALSE 0.047 402.000 0.000 0.006 N NA
 1784669 1784670 CHU_1607 CHU_1608     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1784670 1784671 CHU_1608 CHU_1609     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784673 1784674 CHU_1611 CHU_1612 3mgh   FALSE 0.081 188.000 0.000 NA   NA
 1784674 1784675 CHU_1612 CHU_1613   ppiA FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1784675 1784676 CHU_1613 CHU_1614 ppiA gyrB FALSE 0.030 402.000 0.000 1.000 N NA
 1784676 1784677 CHU_1614 CHU_1615 gyrB ybgR FALSE 0.162 137.000 0.000 1.000 N NA
 1784677 1784678 CHU_1615 CHU_1616 ybgR fecI FALSE 0.076 209.000 0.000 1.000 N NA
 1784678 1784679 CHU_1616 CHU_1617 fecI   TRUE 0.958 53.000 0.595 NA   NA
 1784679 1784680 CHU_1617 CHU_1618     TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1784681 1784682 CHU_1620 CHU_1621     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784682 1784683 CHU_1621 CHU_1622   accC FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1784683 1784684 CHU_1622 CHU_1623 accC accB TRUE 0.981 36.000 0.101 0.001 Y NA
 1784684 1784685 CHU_1623 CHU_1624 accB   TRUE 0.739 85.000 0.003 0.006 Y NA
 1784685 1784686 CHU_1624 CHU_1625   plsX TRUE 0.979 17.000 0.009 0.006 Y NA
 1784686 1784687 CHU_1625 CHU_1625a plsX rpmF TRUE 0.997 5.000 0.418 1.000 N NA
 1784687 1784688 CHU_1625a CHU_1626 rpmF   TRUE 0.996 11.000 0.599 NA   NA
 1784688 1784689 CHU_1626 CHU_1627   pdxA TRUE 0.630 95.000 0.042 NA   NA
 1784690 1784691 CHU_1628 CHU_1629 ksgA   TRUE 0.989 6.000 0.047 1.000 N NA
 1784691 1784692 CHU_1629 CHU_1630   ldhA TRUE 0.993 7.000 0.078 0.046 N NA
 1784692 1784693 CHU_1630 CHU_1631 ldhA greA FALSE 0.385 129.000 0.014 1.000 N NA
 1784693 1784694 CHU_1631 CHU_1632 greA ycfF TRUE 0.992 9.000 0.108 1.000 N NA
 1784696 1784697 CHU_1634 CHU_1635     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1784697 1784698 CHU_1635 CHU_1636     TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1784698 1784699 CHU_1636 CHU_1637   barA TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784701 1784702 CHU_1639 CHU_1640 gyrA   FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1784702 1784703 CHU_1640 CHU_1641     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1784703 1784704 CHU_1641 CHU_1642     TRUE 0.948 3.000 0.000 1.000   NA
 1784704 1784705 CHU_1642 CHU_1643   thrS FALSE 0.373 72.000 0.000 1.000   NA
 1784705 1784706 CHU_1643 CHU_1644 thrS infC TRUE 0.886 90.000 0.080 1.000 Y NA
 1784706 1784707 CHU_1644 CHU_1644a infC rpmI TRUE 0.993 29.000 0.652 1.000 Y NA
 1784707 1784708 CHU_1644a CHU_1645 rpmI rplT TRUE 0.972 99.000 0.928 0.015 Y NA
 1784708 1784709 CHU_1645 CHU_1646 rplT   FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1784710 1784711 CHU_1647 CHU_1648     TRUE 0.522 -82.000 0.000 NA   NA
 1784711 1428091 CHU_1648 CHU_tMet02     FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1784712 1784713 CHU_1649 CHU_1650 msrA   TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1784713 1784714 CHU_1650 CHU_1651     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1784714 1784715 CHU_1651 CHU_1653     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1784717 1784718 CHU_1655 CHU_1656 cel gluP FALSE 0.147 146.000 0.000 1.000   NA
 1784718 1784719 CHU_1656 CHU_1657 gluP nlpC FALSE 0.108 163.000 0.000 NA N NA
 1784719 1784720 CHU_1657 CHU_1658 nlpC   FALSE 0.144 133.000 0.000 NA N NA
 1784722 1784723 CHU_1660 CHU_1661 nagB gdh FALSE 0.224 103.000 0.000 1.000 N NA
 1784723 1784724 CHU_1661 CHU_1662 gdh crcB FALSE 0.134 159.000 0.000 1.000 N NA
 1784724 1784725 CHU_1662 CHU_1663 crcB rcsC FALSE 0.130 187.000 0.000 0.077 N NA
 1784725 1784726 CHU_1663 CHU_1664 rcsC   FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 1784726 1784727 CHU_1664 CHU_1665     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1784727 1784728 CHU_1665 CHU_1666     FALSE 0.147 129.000 0.000 NA   NA
 1784729 1784730 CHU_1667 CHU_1668 purL   FALSE 0.057 218.000 0.000 NA   NA
 1784730 1784731 CHU_1668 CHU_1669     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1784731 1784732 CHU_1669 CHU_1670   murI TRUE 0.803 -12.000 0.000 NA   NA
 1784733 1784734 CHU_1671 CHU_1672     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1784734 1784735 CHU_1672 CHU_1673     FALSE 0.023 439.000 0.000 NA   NA
 1784735 1784736 CHU_1673 CHU_1674     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1784737 1784738 CHU_1675 CHU_1676     FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784741 1784742 CHU_1679 CHU_1680 dinB dnaQ TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 1784743 1784744 CHU_1681 CHU_1682   gyrA FALSE 0.153 317.000 0.031 1.000   NA
 1428125 1428126 CHU_tThr01 CHU_tThr02     FALSE 0.049 242.000 0.000 NA   NA
 1784745 1784746 CHU_1683 CHU_1684 rfaQ   FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1784746 1784747 CHU_1684 CHU_1685     TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1784748 1784749 CHU_1686 CHU_1687   fklB FALSE 0.122 167.000 0.000 1.000 N NA
 1784749 1784750 CHU_1687 CHU_1688 fklB   FALSE 0.106 163.000 0.000 NA   NA
 1784750 1784751 CHU_1688 CHU_1689     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784751 1784752 CHU_1689 CHU_1690     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784752 1784753 CHU_1690 CHU_1691   yfeW FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 1784754 1784755 CHU_1692 CHU_1693     TRUE 0.990 -16.000 0.636 NA   NA
 1784755 1784756 CHU_1693 CHU_1694     TRUE 0.993 -13.000 0.727 NA   NA
 1784756 1784757 CHU_1694 CHU_1695     TRUE 0.986 -27.000 0.667 NA   NA
 1784757 1784758 CHU_1695 CHU_1696     TRUE 0.992 -13.000 0.667 NA   NA
 1784758 1784759 CHU_1696 CHU_1697     FALSE 0.061 211.000 0.000 NA   NA
 1784759 1428142 CHU_1697 CHU_r5S03     FALSE 0.050 237.000 0.000 NA   NA
 1428142 1428143 CHU_r5S03 CHU_r23S03     FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1428143 1428144 CHU_r23S03 CHU_r16S03     FALSE 0.023 428.000 0.000 NA   NA
 1428144 1784760 CHU_r16S03 CHU_1699     FALSE 0.018 904.000 0.000 NA   NA
 1784760 1784761 CHU_1699 CHU_1700   ybgR FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1784761 1784762 CHU_1700 CHU_1701 ybgR purA FALSE 0.114 174.000 0.000 1.000 N NA
 1784762 1784763 CHU_1701 CHU_1702 purA   TRUE 0.974 5.000 0.008 1.000 N NA
 1784763 1784764 CHU_1702 CHU_1703   furR TRUE 0.901 68.000 0.127 0.054 N NA
 1784764 1784765 CHU_1703 CHU_1704 furR relA TRUE 0.971 40.000 0.468 1.000 N NA
 1428151 1784766 CHU_tLeu02 CHU_1705   tig FALSE 0.255 87.000 0.000 NA   NA
 1784766 1784767 CHU_1705 CHU_1706 tig clpP TRUE 0.824 97.000 0.047 1.000 Y NA
 1784767 1784768 CHU_1706 CHU_1707 clpP clpX TRUE 0.803 120.000 0.069 1.000 Y NA
 1784768 1784769 CHU_1707 CHU_1708 clpX   FALSE 0.023 623.000 0.000 1.000   NA
 1784769 1784770 CHU_1708 CHU_1709     TRUE 0.576 -49.000 0.000 NA   NA
 1784771 1784772 CHU_1710 CHU_1711 ompA   FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784776 1784777 CHU_1715 CHU_1716   folD TRUE 0.449 120.000 0.020 1.000 N NA
 1784777 1784778 CHU_1716 CHU_1717 folD lepA FALSE 0.143 233.000 0.009 1.000 N NA
 1784779 1784780 CHU_1718 CHU_1719     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1784781 1784782 CHU_1720 CHU_1721     FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784784 1784785 CHU_1723 CHU_1724     FALSE 0.121 148.000 0.000 NA   NA
 1784785 1784786 CHU_1724 CHU_1725     TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1784786 1784787 CHU_1725 CHU_1726     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1784789 1784790 CHU_1728 CHU_1729     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784790 1784791 CHU_1729 CHU_1730     TRUE 0.769 45.000 0.016 NA   NA
 1784791 1784792 CHU_1730 CHU_1731   yobV TRUE 0.891 80.000 0.286 NA   NA
 1784792 1784793 CHU_1731 CHU_1732 yobV   FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1784793 1784794 CHU_1732 CHU_1733     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1784794 1784795 CHU_1733 CHU_1734   glnA FALSE 0.057 219.000 0.000 NA   NA
 1784795 1784796 CHU_1734 CHU_1735 glnA glnA FALSE 0.095 244.000 0.000 0.001   NA
 1784797 1784798 CHU_1736 CHU_1737     TRUE 0.751 50.000 0.008 0.045 N NA
 1784798 1784799 CHU_1737 CHU_1738     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784801 1784802 CHU_1740 CHU_1741   yneH FALSE 0.167 133.000 0.000 1.000   NA
 1784803 1784804 CHU_1742 CHU_1743     TRUE 0.991 8.000 0.091 NA   NA
 1784804 1784805 CHU_1743 CHU_1744     FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 1784805 1784806 CHU_1744 CHU_1745     FALSE 0.043 262.000 0.000 NA   NA
 1784806 1784807 CHU_1745 CHU_1746     FALSE 0.086 180.000 0.000 NA   NA
 1784810 1784811 CHU_1749 CHU_1750     FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1784811 1784812 CHU_1750 CHU_1751     FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 1784813 1784814 CHU_1752 CHU_1753   dfr TRUE 0.440 60.000 0.000 1.000   NA
 1784814 1784815 CHU_1753 CHU_1754 dfr   FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1784815 1784816 CHU_1754 CHU_1755   pdhC TRUE 0.664 -28.000 0.000 NA   NA
 1784816 1784817 CHU_1755 CHU_1756 pdhC gpm FALSE 0.065 229.000 0.000 1.000 N NA
 1784818 1784819 CHU_1757 CHU_1758   entC TRUE 0.991 2.000 0.011 NA Y NA
 1784819 1784820 CHU_1758 CHU_1759 entC menD TRUE 0.993 22.000 0.281 1.000 Y NA
 1784821 1784822 CHU_1760 CHU_1761     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1784822 1784823 CHU_1761 CHU_1762     FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1784824 1784825 CHU_1763 CHU_1764     FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1784826 1784827 CHU_1765 CHU_1766     FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1784827 1784828 CHU_1766 CHU_1767     TRUE 0.705 25.000 0.000 NA   NA
 1784828 1784829 CHU_1767 CHU_1768     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1784829 1784830 CHU_1768 CHU_1769     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1784830 1784831 CHU_1769 CHU_1770   ybhF TRUE 0.548 -64.000 0.000 NA   NA
 1784833 1784834 CHU_1772 CHU_1773     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1784835 1784836 CHU_1774 CHU_1775   pdxH TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1784837 1784838 CHU_1776 CHU_1777     TRUE 0.994 3.000 0.095 NA   NA
 1784838 1784839 CHU_1777 CHU_1778   trxB TRUE 0.967 11.000 0.015 1.000   NA
 1784840 1784841 CHU_1779 CHU_1780     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1784841 1784842 CHU_1780 CHU_1781     FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784842 1784843 CHU_1781 CHU_1782     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1784844 1784845 CHU_1783 CHU_1784 nhaP   FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1784845 1784846 CHU_1784 CHU_1785   rpoD FALSE 0.131 140.000 0.000 NA   NA
 1784846 1784847 CHU_1785 CHU_1786 rpoD pnp TRUE 0.607 76.000 0.014 1.000 N NA
 1784847 1784848 CHU_1786 CHU_1787 pnp rpsO TRUE 0.919 112.000 0.335 1.000 Y NA
 1784848 1784849 CHU_1787 CHU_1788 rpsO   TRUE 0.472 97.000 0.012 1.000   NA
 1784849 1784850 CHU_1788 CHU_1789     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1784850 1784851 CHU_1789 CHU_1790     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784851 1784852 CHU_1790 CHU_1791     FALSE 0.055 226.000 0.000 NA   NA
 1784852 1784853 CHU_1791 CHU_1792     TRUE 0.995 -3.000 0.098 NA Y NA
 1784853 1784854 CHU_1792 CHU_1793   pyrC TRUE 0.925 0.000 0.000 NA N NA
 1784854 1784855 CHU_1793 CHU_1794 pyrC   TRUE 0.988 5.000 0.039 NA   NA
 1784857 1784858 CHU_1796 CHU_1797 ompA   TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1784859 1784860 CHU_1798 CHU_1799     FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1784860 1784861 CHU_1799 CHU_1800     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784861 1784862 CHU_1800 CHU_1801     TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1784863 1784864 CHU_1802 CHU_1803     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784864 1784865 CHU_1803 CHU_1804   lpxK TRUE 0.767 51.000 0.022 NA   NA
 1784866 1784867 CHU_1805 CHU_1806     TRUE 0.997 1.000 0.342 NA   NA
 1784867 1784868 CHU_1806 CHU_1807     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784868 1784869 CHU_1807 CHU_1808   pabB TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1784869 1784870 CHU_1808 CHU_1809 pabB   TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1784871 1784872 CHU_1810 CHU_1811   mhpC FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784872 1784873 CHU_1811 CHU_1812 mhpC oahS TRUE 0.440 60.000 0.000 1.000   NA
 1784874 1784875 CHU_1813 CHU_1814     FALSE 0.033 308.000 0.000 NA   NA
 1784875 1784876 CHU_1814 CHU_1815   sufS TRUE 0.939 -64.000 0.132 NA   NA
 1784876 1784877 CHU_1815 CHU_1816 sufS cysE TRUE 0.964 29.000 0.033 1.000 Y NA
 1784878 1784879 CHU_1817 CHU_1818     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1784879 1784880 CHU_1818 CHU_1819   deaD FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1784881 1784882 CHU_1820 CHU_1821 yeeF miaB FALSE 0.112 175.000 0.000 1.000 N NA
 1784882 1784883 CHU_1821 CHU_1822 miaB   TRUE 0.688 80.000 0.031 1.000   NA
 1784883 1784884 CHU_1822 CHU_1823     TRUE 0.984 -25.000 0.505 NA   NA
 1784884 1784885 CHU_1823 CHU_1824     TRUE 0.987 -22.000 0.641 NA   NA
 1784885 1784886 CHU_1824 CHU_1825     TRUE 0.991 7.000 0.069 1.000   NA
 1784888 1784889 CHU_1827 CHU_1828 groES groEL TRUE 0.988 56.000 0.774 0.008 Y NA
 1784889 1784890 CHU_1828 CHU_1829 groEL   FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1784890 1784891 CHU_1829 CHU_1830   yqaB FALSE 0.161 117.000 0.000 NA   NA
 1784891 1784892 CHU_1830 CHU_1831 yqaB   TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784896 1784897 CHU_1834 CHU_1836     FALSE 0.121 148.000 0.000 NA   NA
 1784898 1784899 CHU_1837 CHU_1838     TRUE 0.962 2.000 0.000 0.022   NA
 1784899 1784900 CHU_1838 CHU_1839     FALSE 0.037 293.000 0.000 NA   NA
 1784900 1784901 CHU_1839 CHU_1840     FALSE 0.082 186.000 0.000 NA   NA
 1784901 1784902 CHU_1840 CHU_1841   cvrA FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784902 1784903 CHU_1841 CHU_1842 cvrA cel FALSE 0.085 201.000 0.000 1.000 N NA
 1784903 1784904 CHU_1842 CHU_1843 cel fecE FALSE 0.313 84.000 0.000 1.000 N NA
 1784904 1784905 CHU_1843 CHU_1844 fecE   TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1784906 1784907 CHU_1845 CHU_1846     FALSE 0.121 148.000 0.000 NA   NA
 1784907 1784908 CHU_1846 CHU_1847     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1784908 1784909 CHU_1847 CHU_1848     TRUE 0.595 -43.000 0.000 NA   NA
 1784910 1784911 CHU_1849 CHU_1850     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1784912 1784913 CHU_1851 CHU_1852 rpsT   FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1784913 1784914 CHU_1852 CHU_1854     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1784915 1784916 CHU_1855 CHU_1856     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1784916 1784917 CHU_1856 CHU_1857     TRUE 0.462 49.000 0.000 NA   NA
 1784917 1784918 CHU_1857 CHU_1858     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1784918 1784919 CHU_1858 CHU_1859     FALSE 0.020 496.000 0.000 NA   NA
 1784921 1784922 CHU_1861 CHU_1862 hisD hisG TRUE 0.758 214.000 0.171 0.004 Y NA
 1784923 1784924 CHU_1863 CHU_1864     TRUE 0.964 12.000 0.020 NA   NA
 1784924 1784925 CHU_1864 CHU_1865   yebU TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1784927 1784928 CHU_1867 CHU_1868     TRUE 0.998 2.000 0.875 NA   NA
 1784928 1784929 CHU_1868 CHU_1869     TRUE 0.983 -9.000 0.106 NA   NA
 1784929 1784930 CHU_1869 CHU_1870     TRUE 0.972 -16.000 0.106 NA   NA
 1784933 1784934 CHU_1873 CHU_1874   yeeB FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1784934 1784935 CHU_1874 CHU_1875 yeeB glk FALSE 0.238 99.000 0.000 1.000   NA
 1784935 1784936 CHU_1875 CHU_1876 glk nhaA FALSE 0.160 138.000 0.000 1.000 N NA
 1784938 1784939 CHU_1878 CHU_1879     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1784941 1784942 CHU_1881 CHU_1882 lexA   TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1784943 1784944 CHU_1883 CHU_1884     FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1784945 1784946 CHU_1885 CHU_1886 rhlE ymdC FALSE 0.285 90.000 0.000 1.000 N NA
 1784946 1784947 CHU_1886 CHU_1887 ymdC   TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1784947 1784948 CHU_1887 CHU_1888   mrcA FALSE 0.045 452.000 0.000 0.003 N NA
 1784948 1784949 CHU_1888 CHU_1889 mrcA   FALSE 0.263 94.000 0.000 1.000   NA
 1784949 1784950 CHU_1889 CHU_1890     FALSE 0.107 177.000 0.000 1.000   NA
 1784951 1784952 CHU_1891 CHU_1892 ycgM   TRUE 0.948 -37.000 0.087 1.000   NA
 1784952 1784953 CHU_1892 CHU_1893   bcp TRUE 0.975 -3.000 0.021 1.000   NA
 1784953 1784954 CHU_1893 CHU_1894 bcp tktA TRUE 0.923 14.000 0.004 1.000 N NA
 1784954 1784955 CHU_1894 CHU_1895 tktA tktC TRUE 0.987 29.000 0.117 0.001 Y NA
 1784955 1784956 CHU_1895 CHU_1896 tktC fabH FALSE 0.180 126.000 0.000 1.000 N NA
 1784956 1784957 CHU_1896 CHU_1897 fabH menB FALSE 0.351 76.000 0.000 1.000 N NA
 1784957 1784958 CHU_1897 CHU_1898 menB   TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1784960 1784961 CHU_1900 CHU_1901   arcB TRUE 0.859 40.000 0.000 0.020 Y NA
 1784962 1784963 CHU_1902 CHU_1903     FALSE 0.033 308.000 0.000 NA   NA
 1784963 1784964 CHU_1903 CHU_1904     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 1784965 1784966 CHU_1905 CHU_1906     FALSE 0.039 280.000 0.000 NA   NA
 1784967 1428354 CHU_1907 CHU_tPro01     FALSE 0.026 375.000 0.000 NA   NA
 1428354 1428355 CHU_tPro01 CHU_tArg02     FALSE 0.329 72.000 0.000 NA   NA
 1428355 1428356 CHU_tArg02 CHU_tPro02     FALSE 0.273 83.000 0.000 NA   NA
 1428356 1428357 CHU_tPro02 CHU_tSer02     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 1784968 1784969 CHU_1908 CHU_1909   batC TRUE 0.975 0.000 0.015 NA   NA
 1784969 1784970 CHU_1909 CHU_1910 batC atoB FALSE 0.100 183.000 0.000 1.000   NA
 1784970 1784971 CHU_1910 CHU_1911 atoB   TRUE 0.986 4.000 0.030 NA   NA
 1784971 1784972 CHU_1911 CHU_1912   purC FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1784972 1784973 CHU_1912 CHU_1913 purC spoIIA TRUE 0.890 32.000 0.028 1.000 N NA
 1784973 1784974 CHU_1913 CHU_1914 spoIIA   TRUE 0.987 6.000 0.033 1.000   NA
 1784974 1784975 CHU_1914 CHU_1915     TRUE 0.908 -16.000 0.014 NA   NA
 1784977 1784978 CHU_1917 CHU_1918   hemF TRUE 0.968 7.000 0.006 1.000 N NA
 1784978 1784979 CHU_1918 CHU_1919 hemF ybjG TRUE 0.967 0.000 0.006 1.000   NA
 1784979 1784980 CHU_1919 CHU_1920 ybjG   TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1784981 1784982 CHU_1921 CHU_1922     TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1784982 1784983 CHU_1922 CHU_1923     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784983 1784984 CHU_1923 CHU_1924     FALSE 0.188 104.000 0.000 NA   NA
 1784984 1784985 CHU_1924 CHU_1925     TRUE 0.927 66.000 0.286 1.000 N NA
 1784985 1784986 CHU_1925 CHU_1926   ribE FALSE 0.193 116.000 0.000 1.000 N NA
 1784986 1784987 CHU_1926 CHU_1927 ribE   FALSE 0.164 117.000 0.000 NA N NA
 1784988 1784989 CHU_1928 CHU_1929 pcm yciA TRUE 0.963 -3.000 0.011 NA N NA
 1784989 1784990 CHU_1929 CHU_1930 yciA   FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1784990 1784991 CHU_1930 CHU_1931     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784993 1784994 CHU_1933 CHU_1934     FALSE 0.124 146.000 0.000 NA   NA
 1784994 1784995 CHU_1934 CHU_1935     FALSE 0.022 460.000 0.000 NA   NA
 1784995 1784996 CHU_1935 CHU_1936     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1785002 1785003 CHU_1942 CHU_1943     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1785004 1785005 CHU_1944 CHU_1946 yliI   FALSE 0.105 164.000 0.000 NA   NA
 1785006 1785007 CHU_1945 CHU_1947     TRUE 0.462 49.000 0.000 NA   NA
 1785008 1785009 CHU_1948 CHU_1949     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1785009 1428400 CHU_1949 CHU_tCys01     FALSE 0.059 214.000 0.000 NA   NA
 1428400 1785010 CHU_tCys01 CHU_1950     TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1785010 1785011 CHU_1950 CHU_1951   rpsA TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1785013 1785014 CHU_1953 CHU_1954   nlpC FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1785014 1785015 CHU_1954 CHU_1955 nlpC smpB FALSE 0.077 191.000 0.000 NA   NA
 1785015 1785016 CHU_1955 CHU_1957 smpB gcp TRUE 0.988 3.000 0.002 1.000 Y NA
 1785017 1785018 CHU_1956 CHU_1958   phrB TRUE 0.775 31.000 0.006 NA   NA
 1785018 1785019 CHU_1958 CHU_1959 phrB   TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1785020 1785021 CHU_1960 CHU_1961   mscL TRUE 0.857 23.000 0.007 NA   NA
 1785022 1785023 CHU_1962 CHU_1963     TRUE 0.977 10.000 0.029 NA   NA
 1785023 1785024 CHU_1963 CHU_1964     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1785024 1785025 CHU_1964 CHU_1965   atoC FALSE 0.024 410.000 0.000 NA   NA
 1785026 1785027 CHU_1966 CHU_1967 nrtD msmK TRUE 0.983 44.000 0.250 0.013 Y NA
 1785027 1785028 CHU_1967 CHU_1968 msmK nrtB TRUE 0.977 64.000 0.549 1.000 Y NA
 1785028 1785029 CHU_1968 CHU_1969 nrtB nrtA TRUE 0.974 76.000 0.767 NA Y NA
 1785029 1785030 CHU_1969 CHU_1970 nrtA   TRUE 0.755 64.000 0.033 NA   NA
 1785030 1785031 CHU_1970 CHU_1971   crp FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1785031 1785032 CHU_1971 CHU_1973 crp   FALSE 0.194 114.000 0.000 1.000   NA
 1785033 1785034 CHU_1972 CHU_1974     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1785034 1785035 CHU_1974 CHU_1975   trxC FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   NA
 1785035 1785036 CHU_1975 CHU_1976 trxC   TRUE 0.962 72.000 0.677 0.004   NA
 1785037 1785038 CHU_1977 CHU_1978   flu FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1785038 1785039 CHU_1978 CHU_1979 flu chaA FALSE 0.059 240.000 0.000 1.000   NA
 1785039 1785040 CHU_1979 CHU_1980 chaA   TRUE 0.514 99.000 0.000 1.000 Y NA
 1785041 1785042 CHU_1981 CHU_1982 atoC kdpA FALSE 0.037 327.000 0.000 1.000 N NA
 1785042 1785043 CHU_1982 CHU_1983 kdpA kdpB TRUE 0.997 12.000 0.145 0.001 Y NA
 1785043 1785044 CHU_1983 CHU_1984 kdpB kdpC TRUE 0.999 14.000 0.877 0.001 Y NA
 1785044 1785045 CHU_1984 CHU_1985 kdpC   TRUE 0.923 27.000 0.031 1.000   NA
 1785045 1785046 CHU_1985 CHU_1986   kdpD TRUE 0.997 1.000 0.286 1.000   NA
 1785046 1785047 CHU_1986 CHU_1987 kdpD covS TRUE 0.996 1.000 0.122 0.011   NA
 1785048 1785049 CHU_1988 CHU_1989 atoS   FALSE 0.057 246.000 0.000 1.000 N NA
 1785049 1785050 CHU_1989 CHU_1990   yohF TRUE 0.974 31.000 0.286 1.000 N NA
 1785050 1785051 CHU_1990 CHU_1991 yohF   TRUE 0.783 22.000 0.000 1.000 N NA
 1785051 1785052 CHU_1991 CHU_1992   tktA FALSE 0.037 332.000 0.000 1.000 N NA
 1785055 1785056 CHU_1995 CHU_1996 alaDH   TRUE 0.937 0.000 0.000 1.000 N NA
 1785059 1785060 CHU_1999 CHU_2000     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1785060 1785061 CHU_2000 CHU_2001     TRUE 0.457 56.000 0.000 1.000   NA
 1785061 1785062 CHU_2001 CHU_2002   dcd FALSE 0.158 138.000 0.000 1.000   NA
 1785062 1785063 CHU_2002 CHU_2003 dcd   FALSE 0.115 207.000 0.005 NA   NA
 1785063 1785064 CHU_2003 CHU_2004   pfs FALSE 0.067 203.000 0.000 NA   NA
 1785065 1785066 CHU_2005 CHU_2006 apt   FALSE 0.084 183.000 0.000 NA   NA
 1785067 1785068 CHU_2007 CHU_2008 ydgJ yiaD TRUE 0.940 6.000 0.000 1.000   NA
 1785068 1785069 CHU_2008 CHU_2009 yiaD   TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1785069 1785070 CHU_2009 CHU_2010     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1785070 1785071 CHU_2010 CHU_2011     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1785071 1785072 CHU_2011 CHU_2012     FALSE 0.081 188.000 0.000 NA   NA
 1785072 1785073 CHU_2012 CHU_2013     TRUE 0.760 126.000 0.224 NA   NA
 1785073 1785074 CHU_2013 CHU_2014     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785074 1785075 CHU_2014 CHU_2015   tonB TRUE 0.818 17.000 0.000 NA   NA
 1785075 1785076 CHU_2015 CHU_2016 tonB   TRUE 0.962 4.000 0.000 0.072 N NA
 1785076 1785077 CHU_2016 CHU_2017     TRUE 0.997 7.000 0.275 0.021   NA
 1785077 1785078 CHU_2017 CHU_2018   exbB TRUE 0.995 20.000 0.980 0.027   NA
 1785079 1785080 CHU_2019 CHU_2020 paaH   TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1785081 1785082 CHU_2021 CHU_2022 dps dapD FALSE 0.050 267.000 0.000 1.000 N NA
 1785083 1785084 CHU_2023 CHU_2024     FALSE 0.396 173.000 0.036 1.000 N NA
 1785084 1785085 CHU_2024 CHU_2025   mtsA TRUE 0.923 38.000 0.071 1.000 N NA
 1785085 1785086 CHU_2025 CHU_2026 mtsA   TRUE 0.930 160.000 0.898 1.000 Y NA
 1785086 1785087 CHU_2026 CHU_2027   troC TRUE 0.915 145.000 0.432 0.086 Y NA
 1785087 1785088 CHU_2027 CHU_2028 troC mntD TRUE 0.885 184.000 0.443 0.003 Y NA
 1785088 1785089 CHU_2028 CHU_2029 mntD   FALSE 0.339 78.000 0.000 1.000 N NA
 1785089 1785090 CHU_2029 CHU_2030   trmE TRUE 0.947 4.000 0.000 1.000   NA
 1785090 1785091 CHU_2030 CHU_2031 trmE   FALSE 0.168 113.000 0.000 NA   NA
 1785091 1785092 CHU_2031 CHU_2032     FALSE 0.021 488.000 0.000 NA   NA
 1785092 1428484 CHU_2032 CHU_2033     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1428484 1785093 CHU_2033 CHU_2036   crtB TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785093 1785094 CHU_2036 CHU_2037 crtB   TRUE 0.977 5.000 0.014 NA   NA
 1785094 1785095 CHU_2037 CHU_2038   crtZ TRUE 0.656 90.000 0.041 NA   NA
 1785095 1785096 CHU_2038 CHU_2039 crtZ   TRUE 0.938 -142.000 0.164 NA   NA
 1785097 1785098 CHU_2040 CHU_2041     FALSE 0.086 256.000 0.000 0.003 N NA
 1785098 1785099 CHU_2041 CHU_2042     FALSE 0.094 242.000 0.000 0.003 N NA
 1785099 1785100 CHU_2042 CHU_2043     FALSE 0.098 235.000 0.000 0.003 N NA
 1785100 1785101 CHU_2043 CHU_2044     TRUE 0.774 64.000 0.000 0.003 Y NA
 1785101 1785102 CHU_2044 CHU_2045     FALSE 0.041 268.000 0.000 NA   NA
 1785103 1785104 CHU_2046 CHU_2047     TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1785104 1785105 CHU_2047 CHU_2048     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1785106 1785107 CHU_2049 CHU_2050 rsaD   FALSE 0.039 274.000 0.000 NA   NA
 1785107 1785108 CHU_2050 CHU_2051     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1785108 1785109 CHU_2051 CHU_2052     FALSE 0.188 104.000 0.000 NA   NA
 1785110 1785111 CHU_2053 CHU_2054     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785111 1785112 CHU_2054 CHU_2055     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1785113 1785114 CHU_2056 CHU_2057   atoS FALSE 0.120 167.000 0.000 1.000   NA
 1785117 1785118 CHU_2060 CHU_2061   xthA TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1785118 1785119 CHU_2061 CHU_2062 xthA   FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1785119 1785120 CHU_2062 CHU_2063   ucpA FALSE 0.018 743.000 0.000 NA   NA
 1785120 1785121 CHU_2063 CHU_2064 ucpA   FALSE 0.092 227.000 0.000 0.030   NA
 1785122 1785123 CHU_2065 CHU_2066 ordL   FALSE 0.083 201.000 0.000 1.000   NA
 1785127 1785128 CHU_2070 CHU_2071     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1785129 1785130 CHU_2072 CHU_2073     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1785131 1785132 CHU_2074 CHU_2075     FALSE 0.116 154.000 0.000 NA   NA
 1785132 1785133 CHU_2075 CHU_2076   dps FALSE 0.020 538.000 0.000 NA   NA
 1785133 1785134 CHU_2076 CHU_2077 dps arcB FALSE 0.072 214.000 0.000 1.000 N NA
 1785134 1785135 CHU_2077 CHU_2078 arcB cheB TRUE 0.815 -13.000 0.000 1.000   NA
 1785135 1785136 CHU_2078 CHU_2079 cheB cheR TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 1785136 1785137 CHU_2079 CHU_2080 cheR   FALSE 0.267 187.000 0.000 1.000 Y NA
 1785139 1785140 CHU_2082 CHU_2084 cheY rcsC TRUE 0.985 7.000 0.000 0.020 Y NA
 1785141 1785142 CHU_2083 CHU_2085   ompR FALSE 0.118 152.000 0.000 NA   NA
 1785142 1785143 CHU_2085 CHU_2086 ompR   FALSE 0.036 294.000 0.000 NA   NA
 1785146 1785147 CHU_2089 CHU_2090     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1785147 1785148 CHU_2090 CHU_2091     TRUE 0.626 -37.000 0.000 NA   NA
 1785152 1785153 CHU_2095 CHU_2096 nfsA   FALSE 0.318 145.000 0.015 NA   NA
 1785153 1785154 CHU_2096 CHU_2097     FALSE 0.089 178.000 0.000 NA   NA
 1785154 1785155 CHU_2097 CHU_2098   emrR TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA   NA
 1785157 1785158 CHU_2100 CHU_2101   dgt TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1785158 1785159 CHU_2101 CHU_2102 dgt   TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1785159 1785160 CHU_2102 CHU_2103   cel FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1785160 1785161 CHU_2103 CHU_2104 cel   TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1785161 1785162 CHU_2104 CHU_2105   xynT FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1785162 1785163 CHU_2105 CHU_2106 xynT   FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1785165 1785166 CHU_2108 CHU_2109     TRUE 0.990 -7.000 0.209 NA   NA
 1785166 1785167 CHU_2109 CHU_2110   fabZ TRUE 0.994 1.000 0.140 NA   NA
 1785167 1785168 CHU_2110 CHU_2111 fabZ   TRUE 0.993 2.000 0.087 NA   NA
 1785168 1785169 CHU_2111 CHU_2112     TRUE 0.955 -22.000 0.074 NA   NA
 1785169 1785170 CHU_2112 CHU_2113   yheN TRUE 0.992 -7.000 0.235 1.000 N NA
 1785170 1785171 CHU_2113 CHU_2114 yheN fabF TRUE 0.985 -13.000 0.200 1.000 N NA
 1785171 1785172 CHU_2114 CHU_2115 fabF fabG TRUE 0.999 -6.000 0.619 0.003 Y NA
 1785172 1785173 CHU_2115 CHU_2116 fabG acpP TRUE 0.990 19.000 0.381 1.000   NA
 1785173 1785174 CHU_2116 CHU_2117 acpP   TRUE 0.997 2.000 0.294 NA   NA
 1785174 1785175 CHU_2117 CHU_2118   fabF TRUE 0.997 5.000 0.353 NA   NA
 1785175 1785176 CHU_2118 CHU_2119 fabF   TRUE 0.996 4.000 0.174 NA   NA
 1785176 1785177 CHU_2119 CHU_2120     TRUE 0.992 5.000 0.083 NA   NA
 1785177 1785178 CHU_2120 CHU_2121     TRUE 0.918 29.000 0.042 NA   NA
 1785178 1785179 CHU_2121 CHU_2122     TRUE 0.907 32.000 0.036 1.000   NA
 1785179 1785180 CHU_2122 CHU_2123     TRUE 0.597 94.000 0.027 1.000   NA
 1785180 1785181 CHU_2123 CHU_2124   hutH TRUE 0.995 5.000 0.116 1.000 N NA
 1785181 1785182 CHU_2124 CHU_2125 hutH paaK TRUE 0.484 169.000 0.057 1.000 N NA
 1785182 1785183 CHU_2125 CHU_2126 paaK acpS TRUE 0.988 1.000 0.035 1.000 N NA
 1785183 1785184 CHU_2126 CHU_2127 acpS   TRUE 0.982 -3.000 0.035 1.000   NA
 1785185 1785186 CHU_2128 CHU_2129     TRUE 0.638 -34.000 0.000 NA   NA
 1785187 1785188 CHU_2130 CHU_2131     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 1785188 1785189 CHU_2131 CHU_2132     TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1785190 1785191 CHU_2133 CHU_2134     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785191 1785192 CHU_2134 CHU_2135     TRUE 0.991 -10.000 0.419 NA   NA
 1785192 1785193 CHU_2135 CHU_2136   yieN TRUE 0.996 0.000 0.302 NA   NA
 1785193 1785194 CHU_2136 CHU_2137 yieN   TRUE 0.997 -3.000 0.648 NA   NA
 1785197 1785198 CHU_2140 CHU_2141 tfdD   FALSE 0.046 281.000 0.000 1.000   NA
 1785198 1785199 CHU_2141 CHU_2142     FALSE 0.140 152.000 0.000 1.000   NA
 1785199 1785200 CHU_2142 CHU_2143   ate TRUE 0.724 27.000 0.000 1.000   NA
 1785200 1785201 CHU_2143 CHU_2144 ate   TRUE 0.684 30.000 0.000 1.000   NA
 1785203 1785204 CHU_2146 CHU_2147     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785204 1785205 CHU_2147 CHU_2148     FALSE 0.127 144.000 0.000 NA   NA
 1785205 1785206 CHU_2148 CHU_2149     FALSE 0.050 238.000 0.000 NA   NA
 1785206 1785207 CHU_2149 CHU_2150     FALSE 0.034 301.000 0.000 NA   NA
 1785207 1785208 CHU_2150 CHU_2151     TRUE 0.986 -22.000 0.506 NA   NA
 1785209 1785210 CHU_2152 CHU_2153 basR   TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1785210 1785211 CHU_2153 CHU_2154     TRUE 0.997 9.000 0.500 NA   NA
 1785211 1785212 CHU_2154 CHU_2155   chrA TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1785213 1785214 CHU_2156 CHU_2157     FALSE 0.311 75.000 0.000 NA   NA
 1785214 1785215 CHU_2157 CHU_2158   yahK FALSE 0.041 267.000 0.000 NA   NA
 1785215 1785216 CHU_2158 CHU_2159 yahK bcr FALSE 0.029 421.000 0.000 1.000   NA
 1785216 1785217 CHU_2159 CHU_2160 bcr   FALSE 0.113 204.000 0.000 0.020   NA
 1785217 1785218 CHU_2160 CHU_2161     FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1785220 1785221 CHU_2163 CHU_2164     TRUE 0.965 24.000 0.085 1.000   NA
 1785221 1785222 CHU_2164 CHU_2165     FALSE 0.046 287.000 0.000 1.000   NA
 1785223 1785224 CHU_2166 CHU_2167 gloA   FALSE 0.060 238.000 0.000 1.000   NA
 1785224 1785225 CHU_2167 CHU_2168   gatA FALSE 0.088 252.000 0.000 0.002   NA
 1785226 1785227 CHU_2169 CHU_2170 tpn tpn TRUE 0.960 0.000 0.000 0.004   NA
 1785227 1785228 CHU_2170 CHU_2171 tpn tpn TRUE 0.603 48.000 0.000 0.044   NA
 1428622 1785230 CHU_tSer03 CHU_2173     FALSE 0.053 229.000 0.000 NA   NA
 1785230 1785231 CHU_2173 CHU_2174   ycdQ FALSE 0.257 145.000 0.008 NA N NA
 1785231 1785232 CHU_2174 CHU_2175 ycdQ   TRUE 0.991 -3.000 0.135 NA N NA
 1785232 1785233 CHU_2175 CHU_2176     FALSE 0.179 125.000 0.000 1.000   NA
 1785234 1785235 CHU_2177 CHU_2178     TRUE 0.985 -3.000 0.057 NA   NA
 1785236 1785237 CHU_2179 CHU_2180 rsbU dppC TRUE 0.989 -6.000 0.129 1.000 N NA
 1785237 1785238 CHU_2180 CHU_2181 dppC   TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1785238 1785239 CHU_2181 CHU_2182   ycdQ TRUE 0.993 -3.000 0.175 NA   NA
 1785239 1785240 CHU_2182 CHU_2184 ycdQ   TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1785241 1785242 CHU_2183 CHU_2185 ruvC yiaD FALSE 0.043 299.000 0.000 1.000 N NA
 1785243 1785244 CHU_2186 CHU_2187     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1785244 1785245 CHU_2187 CHU_2188     TRUE 0.568 -55.000 0.000 NA   NA
 1785245 1785246 CHU_2188 CHU_2189     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1785246 1785247 CHU_2189 CHU_2190     TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1785247 1785248 CHU_2190 CHU_2191     FALSE 0.083 184.000 0.000 NA   NA
 1785248 1785249 CHU_2191 CHU_2192   ispG TRUE 0.609 -40.000 0.000 NA   NA
 1785249 1785250 CHU_2192 CHU_2193 ispG   FALSE 0.078 288.000 0.005 1.000   NA
 1785251 1785252 CHU_2194 CHU_2195     TRUE 0.991 29.000 0.482 NA Y NA
 1785253 1785254 CHU_2196 CHU_2197   atoS TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785254 1785255 CHU_2197 CHU_2198 atoS   TRUE 0.909 50.000 0.119 NA   NA
 1785255 1785256 CHU_2198 CHU_2199     TRUE 0.995 10.000 0.392 NA   NA
 1785256 1785257 CHU_2199 CHU_2200     TRUE 0.970 -19.000 0.124 NA   NA
 1785257 1785258 CHU_2200 CHU_2201     TRUE 0.930 43.000 0.140 NA   NA
 1785258 1785259 CHU_2201 CHU_2202   cox3 TRUE 0.981 29.000 0.488 NA   NA
 1785259 1785260 CHU_2202 CHU_2203 cox3 coxO TRUE 0.986 34.000 0.155 0.002 Y NA
 1785260 1785261 CHU_2203 CHU_2204 coxO cox15 TRUE 0.770 75.000 0.047 1.000 N NA
 1785261 1785262 CHU_2204 CHU_2205 cox15   TRUE 0.994 -7.000 0.112 1.000 Y NA
 1785262 1785263 CHU_2205 CHU_2206   coxN TRUE 0.450 136.000 0.028 1.000 N NA
 1785263 1785264 CHU_2206 CHU_2207 coxN ctaC TRUE 0.965 57.000 0.118 0.002 Y NA
 1785264 1785265 CHU_2207 CHU_2208 ctaC   TRUE 0.837 115.000 0.441 NA   NA
 1785265 1785266 CHU_2208 CHU_2209     TRUE 0.977 24.000 0.211 NA   NA
 1785266 1785267 CHU_2209 CHU_2210     TRUE 0.985 18.000 0.192 NA   NA
 1785267 1785268 CHU_2210 CHU_2211   nfrD TRUE 0.987 28.000 0.730 NA   NA
 1785268 1785269 CHU_2211 CHU_2212 nfrD nrfC TRUE 0.995 21.000 0.550 NA Y NA
 1785269 1785270 CHU_2212 CHU_2213 nrfC   TRUE 0.994 35.000 0.679 0.012 Y NA
 1785273 1785274 CHU_2216 CHU_2217 yheS   TRUE 0.994 3.000 0.123 NA   NA
 1785275 1785276 CHU_2218 CHU_2219   ychF TRUE 0.676 44.000 0.006 NA N NA
 1785276 1785277 CHU_2219 CHU_2220 ychF   FALSE 0.259 117.000 0.004 NA   NA
 1785278 1785279 CHU_2221 CHU_2222 rlpA   TRUE 0.988 3.000 0.035 NA   NA
 1785281 1785282 CHU_2224 CHU_2225     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1785283 1785284 CHU_2226 CHU_2227     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1785285 1785286 CHU_2228 CHU_2229   pgk FALSE 0.191 116.000 0.000 1.000   NA
 1785287 1785288 CHU_2230 CHU_2231     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1785288 1785289 CHU_2231 CHU_2232     FALSE 0.193 116.000 0.000 1.000 N NA
 1785289 1785290 CHU_2232 CHU_2233   rsaD TRUE 0.907 14.000 0.000 0.084 N NA
 1785291 1785292 CHU_2234 CHU_2235     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1785295 1785296 CHU_2238 CHU_2239     FALSE 0.048 245.000 0.000 NA   NA
 1785297 1785298 CHU_2240 CHU_2241 sucC   FALSE 0.114 157.000 0.000 NA   NA
 1785298 1785299 CHU_2241 CHU_2242     FALSE 0.232 93.000 0.000 NA   NA
 1785299 1428693 CHU_2242 CHU_tArg03     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1785303 1785304 CHU_2246 CHU_2247     FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1785304 1785305 CHU_2247 CHU_2248     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1785306 1785307 CHU_2249 CHU_2250 poxB gpmA TRUE 0.713 28.000 0.000 1.000 N NA
 1785307 1785308 CHU_2250 CHU_2251 gpmA   FALSE 0.192 115.000 0.000 1.000   NA
 1785309 1785310 CHU_2252 CHU_2253 osmC   FALSE 0.085 198.000 0.000 1.000   NA
 1785310 1785311 CHU_2253 CHU_2254     FALSE 0.037 290.000 0.000 NA   NA
 1785311 1785312 CHU_2254 CHU_2255     TRUE 0.984 23.000 0.324 NA   NA
 1785312 1785313 CHU_2255 CHU_2256     FALSE 0.217 96.000 0.000 NA   NA
 1785313 1785314 CHU_2256 CHU_2257     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785314 1785315 CHU_2257 CHU_2258   yciK TRUE 0.934 64.000 0.375 NA N NA
 1785315 1785316 CHU_2258 CHU_2259 yciK   TRUE 0.672 28.000 0.000 NA N NA
 1785316 1785317 CHU_2259 CHU_2260     TRUE 0.952 46.000 0.300 NA   NA
 1785317 1785318 CHU_2260 CHU_2261     TRUE 0.932 -64.000 0.105 NA   NA
 1785318 1785319 CHU_2261 CHU_2262     FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1785319 1785320 CHU_2262 CHU_2263     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1785322 1785323 CHU_2265 CHU_2266     TRUE 0.946 -13.000 0.030 NA   NA
 1785324 1785325 CHU_2267 CHU_2268   bglX FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1785325 1785326 CHU_2268 CHU_2270 bglX   FALSE 0.025 494.000 0.000 1.000   NA
 1785326 1785327 CHU_2270 CHU_2271     FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1785327 1785328 CHU_2271 CHU_2272     TRUE 0.533 -75.000 0.000 NA   NA
 1785328 1785329 CHU_2272 CHU_2273   bglX FALSE 0.129 142.000 0.000 NA   NA
 1785329 1785330 CHU_2273 CHU_2274 bglX   FALSE 0.070 215.000 0.000 1.000   NA
 1785330 1785331 CHU_2274 CHU_2275   yhjA TRUE 0.963 3.000 0.000 0.034   NA
 1785331 1785332 CHU_2275 CHU_2276 yhjA ispB FALSE 0.033 374.000 0.000 1.000 N NA
 1785332 1785333 CHU_2276 CHU_2278 ispB   TRUE 0.572 57.000 0.005 NA   NA
 1785334 1785335 CHU_2279 CHU_2280   htrB FALSE 0.076 209.000 0.000 1.000 N NA
 1785338 1785339 CHU_2283 CHU_2284     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1785339 1785340 CHU_2284 CHU_2285     FALSE 0.352 68.000 0.000 NA   NA
 1785340 1785341 CHU_2285 CHU_2286     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1785344 1785345 CHU_2289 CHU_2290   malQ FALSE 0.059 218.000 0.000 NA N NA
 1785346 1785347 CHU_2291 CHU_2292   yhdF TRUE 0.569 74.000 0.008 1.000 N NA
 1785347 1785348 CHU_2292 CHU_2293 yhdF   FALSE 0.102 181.000 0.000 1.000   NA
 1785348 1785349 CHU_2293 CHU_2294     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1785349 1785350 CHU_2294 CHU_2295     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1785351 1785352 CHU_2296 CHU_2297     TRUE 0.620 36.000 0.000 1.000   NA
 1785352 1785353 CHU_2297 CHU_2298     TRUE 0.526 47.000 0.000 1.000   NA
 1785354 1785355 CHU_2299 CHU_2300     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1785357 1785358 CHU_2302 CHU_2303     TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1785360 1785361 CHU_2305 CHU_2306 tpn tpn TRUE 0.965 63.000 0.667 0.043   NA
 1785362 1785363 CHU_2307 CHU_2308     FALSE 0.108 222.000 0.000 0.002   NA
 1785364 1785365 CHU_2309 CHU_2310 mta arcB FALSE 0.132 160.000 0.000 1.000 N NA
 1785365 1785366 CHU_2310 CHU_2311 arcB   FALSE 0.111 159.000 0.000 NA   NA
 1785366 1785367 CHU_2311 CHU_2312     FALSE 0.106 163.000 0.000 NA   NA
 1785367 1785368 CHU_2312 CHU_2313   arr FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1785368 1785369 CHU_2313 CHU_2314 arr recD TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1785369 1785370 CHU_2314 CHU_2315 recD bcd FALSE 0.060 240.000 0.000 1.000 N NA
 1785370 1785371 CHU_2315 CHU_2316 bcd   FALSE 0.221 95.000 0.000 NA   NA
 1785371 1785372 CHU_2316 CHU_2317     FALSE 0.039 277.000 0.000 NA   NA
 1785372 1785373 CHU_2317 CHU_2318     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785373 1785374 CHU_2318 CHU_2319     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1785374 1785375 CHU_2319 CHU_2321     FALSE 0.223 212.000 0.027 NA   NA
 1785375 1785376 CHU_2321 CHU_2322   tpn FALSE 0.033 307.000 0.000 NA   NA
 1785376 1785377 CHU_2322 CHU_2323 tpn tpn TRUE 0.965 63.000 0.667 0.043   NA
 1785377 1785378 CHU_2323 CHU_2324 tpn yiaD FALSE 0.061 211.000 0.000 NA   NA
 1785378 1785379 CHU_2324 CHU_2326 yiaD   FALSE 0.019 619.000 0.000 NA   NA
 1785379 1785380 CHU_2326 CHU_2327     FALSE 0.020 581.000 0.000 NA   NA
 1785380 1785381 CHU_2327 CHU_2328     FALSE 0.273 83.000 0.000 NA   NA
 1785381 1785382 CHU_2328 CHU_2330     FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1785382 1785383 CHU_2330 CHU_2331     FALSE 0.040 269.000 0.000 NA   NA
 1785384 1785385 CHU_2332 CHU_2333     TRUE 0.990 13.000 0.176 NA   NA
 1785385 1785386 CHU_2333 CHU_2334     TRUE 0.801 91.000 0.133 NA   NA
 1785387 1785388 CHU_2335 CHU_2336     FALSE 0.034 303.000 0.000 NA   NA
 1785388 1785389 CHU_2336 CHU_2337   hisI FALSE 0.022 458.000 0.000 NA   NA
 1785389 1785390 CHU_2337 CHU_2338 hisI   FALSE 0.038 319.000 0.000 1.000 N NA
 1785390 1785391 CHU_2338 CHU_2340     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1785393 1785394 CHU_2341 CHU_2342   sixA FALSE 0.082 185.000 0.000 NA   NA
 1785395 1785396 CHU_2343 CHU_2344 topA   FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1785396 1785397 CHU_2344 CHU_2345   npdA FALSE 0.053 231.000 0.000 NA   NA
 1785397 1785398 CHU_2345 CHU_2346 npdA cspB TRUE 0.471 130.000 0.000 0.042 Y NA
 1785398 1785399 CHU_2346 CHU_2347 cspB   FALSE 0.083 202.000 0.000 1.000 N NA
 1785399 1785400 CHU_2347 CHU_2348     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1785400 1785401 CHU_2348 CHU_2349     FALSE 0.100 168.000 0.000 NA   NA
 1785401 1785402 CHU_2349 CHU_2350     FALSE 0.032 314.000 0.000 NA   NA
 1785402 1785403 CHU_2350 CHU_2351     TRUE 0.406 57.000 0.000 NA   NA
 1785405 1785406 CHU_2353 CHU_2354     FALSE 0.024 413.000 0.000 NA   NA
 1785406 1785407 CHU_2354 CHU_2355     FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   NA
 1785407 1785408 CHU_2355 CHU_2356     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1785409 1785410 CHU_2357 CHU_2358   map TRUE 0.604 33.000 0.000 NA   NA
 1785410 1785411 CHU_2358 CHU_2359 map   FALSE 0.072 197.000 0.000 NA   NA
 1785412 1785413 CHU_2360 CHU_2361     TRUE 0.554 -61.000 0.000 NA   NA
 1785413 1785414 CHU_2361 CHU_2362     TRUE 0.537 -73.000 0.000 NA   NA
 1785414 1785415 CHU_2362 CHU_2363     TRUE 0.406 57.000 0.000 NA   NA
 1785415 1785416 CHU_2363 CHU_2364     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1785416 1785417 CHU_2364 CHU_2365     TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1785417 1785418 CHU_2365 CHU_2366     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1785419 1785420 CHU_2367 CHU_2368     TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1785420 1785421 CHU_2368 CHU_2369     FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 1785421 1785422 CHU_2369 CHU_2370     TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1785422 1785423 CHU_2370 CHU_2371     FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1785423 1785424 CHU_2371 CHU_2372     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1785424 1785425 CHU_2372 CHU_2373   yopH FALSE 0.305 76.000 0.000 NA   NA
 1785425 1785426 CHU_2373 CHU_2374 yopH   FALSE 0.150 144.000 0.000 1.000   NA
 1785426 1785427 CHU_2374 CHU_2375     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1785427 1785428 CHU_2375 CHU_2376     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1785428 1785429 CHU_2376 CHU_2377     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785429 1785430 CHU_2377 CHU_2378     FALSE 0.054 228.000 0.000 NA   NA
 1785430 1785431 CHU_2378 CHU_2379     FALSE 0.070 201.000 0.000 NA   NA
 1785433 1785434 CHU_2382 CHU_2383     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1785434 1785435 CHU_2383 CHU_2384     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 1785435 1785436 CHU_2384 CHU_2385     TRUE 0.506 43.000 0.000 NA   NA
 1785436 1785437 CHU_2385 CHU_2386     TRUE 0.803 -12.000 0.000 NA   NA
 1785437 1785438 CHU_2386 CHU_2387     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1785438 1785439 CHU_2387 CHU_2388     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1785439 1785440 CHU_2388 CHU_2389     FALSE 0.151 126.000 0.000 NA   NA
 1785440 1785441 CHU_2389 CHU_2390   spoT FALSE 0.236 92.000 0.000 NA   NA
 1785441 1785442 CHU_2390 CHU_2391 spoT   FALSE 0.136 155.000 0.000 1.000   NA
 1785444 1785445 CHU_2394 CHU_2395     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1785445 1785446 CHU_2395 CHU_2396     FALSE 0.083 184.000 0.000 NA   NA
 1785446 1785447 CHU_2396 CHU_2397   folA FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1785447 1785448 CHU_2397 CHU_2398 folA   TRUE 0.854 22.000 0.000 0.003   NA
 1785450 1785451 CHU_2400 CHU_2401     FALSE 0.030 328.000 0.000 NA   NA
 1785451 1785452 CHU_2401 CHU_2402   sucD FALSE 0.018 759.000 0.000 NA   NA
 1785452 1785453 CHU_2402 CHU_2403 sucD   FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1785453 1785454 CHU_2403 CHU_2404     FALSE 0.090 177.000 0.000 NA   NA
 1785454 1785455 CHU_2404 CHU_2405   ycaJ FALSE 0.126 145.000 0.000 NA   NA
 1785456 1785457 CHU_2406 CHU_2407 yedA   FALSE 0.072 213.000 0.000 1.000   NA
 1785458 1785459 CHU_2408 CHU_2409   amyA TRUE 0.747 25.000 0.000 1.000 N NA
 1785459 1785460 CHU_2409 CHU_2410 amyA   FALSE 0.044 256.000 0.000 NA   NA
 1785460 1785461 CHU_2410 CHU_2411   galE FALSE 0.273 83.000 0.000 NA   NA
 1785462 1785463 CHU_2412 CHU_2413     FALSE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 1785464 1785465 CHU_2414 CHU_2415   clcB TRUE 0.944 5.000 0.000 1.000   NA
 1785465 1785466 CHU_2415 CHU_2416 clcB   TRUE 0.737 26.000 0.000 1.000 N NA
 1785467 1785468 CHU_2417 CHU_2418     FALSE 0.024 404.000 0.000 NA   NA
 1785468 1785469 CHU_2418 CHU_2419   lgt FALSE 0.090 177.000 0.000 NA   NA
 1785469 1785470 CHU_2419 CHU_2420 lgt   TRUE 0.985 2.000 0.030 NA   NA
 1785470 1785471 CHU_2420 CHU_2421     FALSE 0.305 76.000 0.000 NA   NA
 1785471 1785472 CHU_2421 CHU_2422   prsA TRUE 0.805 44.000 0.000 1.000 Y NA
 1785472 1785473 CHU_2422 CHU_2423 prsA   TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1785473 1785474 CHU_2423 CHU_2424   nadV TRUE 0.410 56.000 0.000 NA   NA
 1785475 1785476 CHU_2425 CHU_2426 merR   TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1785476 1785477 CHU_2426 CHU_2427     FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 1785477 1785478 CHU_2427 CHU_2428     FALSE 0.186 105.000 0.000 NA   NA
 1785478 1785479 CHU_2428 CHU_2429   acsA FALSE 0.132 139.000 0.000 NA   NA
 1785480 1785481 CHU_2430 CHU_2431     FALSE 0.092 191.000 0.000 1.000   NA
 1785485 1785486 CHU_2435 CHU_2436 valS yiaD TRUE 0.699 29.000 0.000 1.000 N NA
 1785486 1785487 CHU_2436 CHU_2437 yiaD   FALSE 0.021 476.000 0.000 NA   NA
 1785488 1785489 CHU_2439 CHU_2440 pntA yjeE TRUE 0.565 100.000 0.029 1.000   NA
 1785489 1785490 CHU_2440 CHU_2441 yjeE coaE TRUE 0.570 41.000 0.000 1.000   NA
 1785490 1785491 CHU_2441 CHU_2442 coaE   TRUE 0.953 0.000 0.003 NA   NA
 1785491 1785492 CHU_2442 CHU_2443   yajC FALSE 0.343 94.000 0.003 NA   NA
 1785492 1785493 CHU_2443 CHU_2444 yajC   TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1785493 1785494 CHU_2444 CHU_2445   ttuC FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1785494 1785495 CHU_2445 CHU_2446 ttuC   TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1785495 1785496 CHU_2446 CHU_2447   nusB FALSE 0.349 107.000 0.008 NA   NA
 1785497 1785498 CHU_2448 CHU_2449 rsaD   FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1785498 1785499 CHU_2449 CHU_2450     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1785499 1785500 CHU_2450 CHU_2451     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1785500 1785501 CHU_2451 CHU_2452     TRUE 0.612 32.000 0.000 NA   NA
 1785501 1785502 CHU_2452 CHU_2453     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785503 1785504 CHU_2454 CHU_2455     TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1785505 1785506 CHU_2456 CHU_2457     TRUE 0.996 0.000 0.254 NA   NA
 1785506 1785507 CHU_2457 CHU_2458   dnaJ FALSE 0.086 197.000 0.000 1.000   NA
 1785507 1785508 CHU_2458 CHU_2459 dnaJ   FALSE 0.273 92.000 0.000 1.000   NA
 1785508 1785509 CHU_2459 CHU_2460     TRUE 0.414 80.000 0.000 0.025   NA
 1785509 1785510 CHU_2460 CHU_2462     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1785510 1785511 CHU_2462 CHU_2463     FALSE 0.021 489.000 0.000 NA   NA
 1785511 1785512 CHU_2463 CHU_2464     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1785513 1785514 CHU_2465 CHU_2466   bioB FALSE 0.093 175.000 0.000 NA   NA
 1785514 1785515 CHU_2466 CHU_2467 bioB sppA FALSE 0.258 126.000 0.003 1.000 N NA
 1785517 1785518 CHU_2469 CHU_2470 fabD   FALSE 0.212 147.000 0.005 NA   NA
 1785518 1785519 CHU_2470 CHU_2471     TRUE 0.671 -27.000 0.000 NA   NA
 1785520 1785521 CHU_2472 CHU_2473   sdhA TRUE 0.991 26.000 0.598 0.001   NA
 1785521 1785522 CHU_2473 CHU_2474 sdhA frdB TRUE 0.998 14.000 0.470 0.001 Y NA
 1785522 1785523 CHU_2474 CHU_2475 frdB   FALSE 0.023 448.000 0.000 NA   NA
 1785523 1785524 CHU_2475 CHU_2476     TRUE 0.998 3.000 0.800 NA   NA
 1785524 1785525 CHU_2476 CHU_2477     FALSE 0.062 209.000 0.000 NA   NA
 1785525 1785526 CHU_2477 CHU_2478     FALSE 0.052 233.000 0.000 NA   NA
 1785526 1785527 CHU_2478 CHU_2479     FALSE 0.062 209.000 0.000 NA   NA
 1785527 1785528 CHU_2479 CHU_2480     FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1785528 1785529 CHU_2480 CHU_2481     FALSE 0.018 1085.000 0.000 NA   NA
 1785529 1785530 CHU_2481 CHU_2482     FALSE 0.084 183.000 0.000 NA   NA
 1785530 1785531 CHU_2482 CHU_2483     FALSE 0.146 130.000 0.000 NA   NA
 1785531 1785532 CHU_2483 CHU_2484     FALSE 0.077 191.000 0.000 NA   NA
 1785532 1785533 CHU_2484 CHU_2485     FALSE 0.064 207.000 0.000 NA   NA
 1785533 1785534 CHU_2485 CHU_2486     FALSE 0.370 64.000 0.000 NA   NA
 1785534 1785535 CHU_2486 CHU_2487   algI FALSE 0.021 485.000 0.000 NA   NA
 1785535 1785536 CHU_2487 CHU_2488 algI   TRUE 0.681 -25.000 0.000 NA   NA
 1785538 1785539 CHU_2489 CHU_2491   hrpA FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1785539 1785540 CHU_2491 CHU_2492 hrpA   FALSE 0.131 140.000 0.000 NA   NA
 1785540 1785541 CHU_2492 CHU_2493   dsb TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1785541 1785542 CHU_2493 CHU_2494 dsb   FALSE 0.046 281.000 0.000 1.000   NA
 1785542 1785543 CHU_2494 CHU_2495     FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1785543 1785544 CHU_2495 CHU_2496     FALSE 0.126 145.000 0.000 NA   NA
 1785544 1785545 CHU_2496 CHU_2497     FALSE 0.073 196.000 0.000 NA   NA
 1785545 1785546 CHU_2497 CHU_2498     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1785550 1785551 CHU_2502 CHU_2503 glnA   TRUE 0.899 25.000 0.019 NA   NA
 1785551 1785552 CHU_2503 CHU_2504   nagD TRUE 0.738 58.000 0.024 NA   NA
 1785552 1785553 CHU_2504 CHU_2505 nagD   TRUE 0.604 33.000 0.000 NA   NA
 1785554 1785555 CHU_2506 CHU_2507   wzxE TRUE 0.922 -24.000 0.034 NA   NA
 1785555 1785556 CHU_2507 CHU_2508 wzxE   TRUE 0.794 61.000 0.043 NA   NA
 1785556 1785557 CHU_2508 CHU_2509     TRUE 0.989 4.000 0.043 NA   NA
 1785558 1785559 CHU_2510 CHU_2511     TRUE 0.977 2.000 0.009 1.000   NA
 1785559 1785560 CHU_2511 CHU_2512   cnhA FALSE 0.314 83.000 0.000 1.000   NA
 1785561 1785562 CHU_2513 CHU_2514 acrD acrB TRUE 0.983 37.000 0.889 NA N NA
 1785562 1785563 CHU_2514 CHU_2515 acrB   TRUE 0.992 39.000 0.822 1.000 Y NA
 1785563 1785564 CHU_2515 CHU_2516     TRUE 0.960 37.000 0.205 1.000 N NA
 1785564 1785565 CHU_2516 CHU_2517     FALSE 0.073 196.000 0.000 NA   NA
 1785566 1785567 CHU_2518 CHU_2519 rumA   FALSE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 1785567 1785568 CHU_2519 CHU_2520     TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1785574 1785575 CHU_2526 CHU_2527 cinA pdhC FALSE 0.287 191.000 0.025 1.000   NA
 1785577 1785578 CHU_2529 CHU_2530 talAB   TRUE 0.686 77.000 0.032 NA   NA
 1785578 1785579 CHU_2530 CHU_2531   ftsE TRUE 0.848 33.000 0.018 NA   NA
 1785579 1785580 CHU_2531 CHU_2532 ftsE   TRUE 0.925 0.000 0.000 NA N NA
 1785580 1785581 CHU_2532 CHU_2533   gloA FALSE 0.149 129.000 0.000 NA N NA
 1785581 1785582 CHU_2533 CHU_2534 gloA   TRUE 0.406 57.000 0.000 NA   NA
 1785585 1785586 CHU_2538 CHU_2539 tpn tpn TRUE 0.965 63.000 0.667 0.041   NA
 1785587 1785588 CHU_2540 CHU_2541     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1785588 1785589 CHU_2541 CHU_2542     FALSE 0.041 267.000 0.000 NA   NA
 1785589 1785590 CHU_2542 CHU_2543   tpn TRUE 0.965 63.000 0.667 0.041   NA
 1785592 1785593 CHU_2545 CHU_2546 kptA   FALSE 0.136 155.000 0.000 1.000   NA
 1785593 1785594 CHU_2546 CHU_2547     FALSE 0.179 125.000 0.000 1.000   NA
 1785594 1785595 CHU_2547 CHU_2548     FALSE 0.147 129.000 0.000 NA   NA
 1785595 1785596 CHU_2548 CHU_2549     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1785598 1785599 CHU_2551 CHU_2552     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1785599 1785600 CHU_2552 CHU_2553     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1785602 1785603 CHU_2555 CHU_2556     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1785603 1785604 CHU_2556 CHU_2557     FALSE 0.060 213.000 0.000 NA   NA
 1785604 1785605 CHU_2557 CHU_2558     FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1785607 1785608 CHU_2560 CHU_2561 soj spoOJ TRUE 0.991 25.000 0.827 1.000 N NA
 1785608 1785609 CHU_2561 CHU_2562 spoOJ   TRUE 0.992 0.000 0.098 NA   NA
 1785609 1785610 CHU_2562 CHU_2563   dapB TRUE 0.867 46.000 0.052 NA   NA
 1785610 1785611 CHU_2563 CHU_2564 dapB lepB TRUE 0.994 3.000 0.081 1.000 N NA
 1785611 1785612 CHU_2564 CHU_2565 lepB lepB TRUE 0.748 94.000 0.045 0.001   NA
 1785612 1785613 CHU_2565 CHU_2566 lepB   TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1785613 1785614 CHU_2566 CHU_2567     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1785615 1785616 CHU_2568 CHU_2569     FALSE 0.221 95.000 0.000 NA   NA
 1785620 1785621 CHU_2573 CHU_2574   rpoE FALSE 0.314 83.000 0.000 1.000   NA
 1785621 1785622 CHU_2574 CHU_2575 rpoE   TRUE 0.427 145.000 0.000 0.047 Y NA
 1785622 1785623 CHU_2575 CHU_2576   cheA TRUE 0.998 7.000 0.400 0.018   NA
 1785624 1785625 CHU_2577 CHU_2578 evgS   FALSE 0.170 112.000 0.000 NA   NA
 1785625 1785626 CHU_2578 CHU_2579     TRUE 0.997 -3.000 0.826 NA   NA
 1785626 1785627 CHU_2579 CHU_2580     TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1785627 1785628 CHU_2580 CHU_2581   dgkA TRUE 0.941 -25.000 0.056 NA   NA
 1785628 1785629 CHU_2581 CHU_2582 dgkA creD TRUE 0.824 -10.000 0.000 NA N NA
 1785629 1785630 CHU_2582 CHU_2583 creD   FALSE 0.035 299.000 0.000 NA   NA
 1785630 1785631 CHU_2583 CHU_2584     TRUE 0.818 17.000 0.000 NA   NA
 1785631 1785632 CHU_2584 CHU_2585     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1785634 1785635 CHU_2587 CHU_2588     TRUE 0.978 -3.000 0.031 NA   NA
 1785637 1785638 CHU_2590 CHU_2591   rpsF FALSE 0.078 190.000 0.000 NA   NA
 1785638 1785639 CHU_2591 CHU_2592 rpsF rpsR TRUE 0.999 0.000 0.319 0.013 Y NA
 1785639 1785640 CHU_2592 CHU_2593 rpsR rplI TRUE 0.996 23.000 0.499 0.013 Y NA
 1785640 1785641 CHU_2593 CHU_2594 rplI   FALSE 0.079 258.000 0.002 1.000   NA
 1785641 1785642 CHU_2594 CHU_2595     TRUE 0.990 4.000 0.043 1.000   NA
 1785642 1785643 CHU_2595 CHU_2596     TRUE 0.945 2.000 0.000 1.000   NA
 1785643 1785644 CHU_2596 CHU_2597   priA TRUE 0.434 61.000 0.000 1.000   NA
 1785644 1785645 CHU_2597 CHU_2598 priA   TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1785645 1785646 CHU_2598 CHU_2599     FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1785646 1785647 CHU_2599 CHU_2600     FALSE 0.055 227.000 0.000 NA   NA
 1785647 1785648 CHU_2600 CHU_2601     TRUE 0.889 31.000 0.030 NA N NA
 1785648 1785649 CHU_2601 CHU_2602   treC TRUE 0.698 26.000 0.000 NA N NA
 1785651 1785652 CHU_2604 CHU_2605     TRUE 0.868 -6.000 0.000 NA   NA
 1785652 1785653 CHU_2605 CHU_2606   ompA TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1785653 1785654 CHU_2606 CHU_2607 ompA   FALSE 0.161 117.000 0.000 NA   NA
 1785657 1785658 CHU_2610 CHU_2611     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1785658 1785659 CHU_2611 CHU_2612   purF FALSE 0.187 118.000 0.000 1.000   NA
 1785659 1785660 CHU_2612 CHU_2613 purF nuoN TRUE 0.887 13.000 0.000 1.000 N NA
 1785660 1785661 CHU_2613 CHU_2614 nuoN nuoM TRUE 0.970 40.000 0.066 0.002 Y NA
 1785661 1785662 CHU_2614 CHU_2616 nuoM nuoL TRUE 0.994 20.000 0.151 0.002 Y NA
 1785662 1785663 CHU_2616 CHU_2617 nuoL nuoK TRUE 0.999 2.000 0.253 0.007 Y NA
 1785663 1785664 CHU_2617 CHU_2618 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.506 0.004 Y NA
 1785664 1785665 CHU_2618 CHU_2619 nuoJ hyfH TRUE 0.999 3.000 0.223 0.007 Y NA
 1785665 1785666 CHU_2619 CHU_2620 hyfH hyfC TRUE 0.998 1.000 0.166 0.007 Y NA
 1785667 1785668 CHU_2621 CHU_2622     TRUE 0.992 -9.000 0.400 NA   NA
 1785669 1785670 CHU_2623 CHU_2624   murI FALSE 0.032 317.000 0.000 NA   NA
 1785670 1785671 CHU_2624 CHU_2625 murI pth TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1785671 1785672 CHU_2625 CHU_2626 pth rplY TRUE 0.797 254.000 0.496 0.020 Y NA
 1785672 1785673 CHU_2626 CHU_2627 rplY prsA TRUE 0.967 22.000 0.074 1.000 N NA
 1785673 1429068 CHU_2627 CHU_tGln01 prsA   FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1429068 1785674 CHU_tGln01 CHU_2628   kduD FALSE 0.020 610.000 0.000 NA   NA
 1785675 1785676 CHU_2629 CHU_2630 ompA   TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1785676 1785677 CHU_2630 CHU_2631     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1785677 1785678 CHU_2631 CHU_2632     TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1785679 1785680 CHU_2633 CHU_2634 napA naoX TRUE 0.491 103.000 0.000 1.000 Y NA
 1785680 1785681 CHU_2634 CHU_2635 naoX cysG FALSE 0.317 83.000 0.000 1.000 N NA
 1785681 1785682 CHU_2635 CHU_2636 cysG cysG TRUE 0.941 60.000 0.051 0.001 Y NA
 1785682 1785683 CHU_2636 CHU_2637 cysG cysI TRUE 0.990 3.000 0.038 1.000 N NA
 1785684 1785685 CHU_2638 CHU_2639   metC TRUE 0.763 64.000 0.031 1.000 N NA
 1785685 1785686 CHU_2639 CHU_2640 metC kch TRUE 0.832 18.000 0.000 1.000   NA
 1785686 1785687 CHU_2640 CHU_2641 kch   TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1785687 1785688 CHU_2641 CHU_2642     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1785690 1785691 CHU_2644 CHU_2645   ydhJ TRUE 0.990 -3.000 0.085 1.000 N NA
 1785691 1785692 CHU_2645 CHU_2646 ydhJ   TRUE 0.999 6.000 0.800 0.066 Y NA
 1785692 1785693 CHU_2646 CHU_2647     TRUE 0.999 6.000 1.000 1.000 Y NA
 1785695 1785696 CHU_2649 CHU_2650 rpoE   FALSE 0.286 89.000 0.000 1.000   NA
 1785696 1785697 CHU_2650 CHU_2651     TRUE 0.554 -61.000 0.000 NA   NA
 1785699 1785700 CHU_2653 CHU_2654     TRUE 0.981 -7.000 0.074 NA   NA
 1785700 1785701 CHU_2654 CHU_2655   batA TRUE 0.978 -7.000 0.057 NA   NA
 1785701 1785702 CHU_2655 CHU_2656 batA   TRUE 0.961 6.000 0.000 0.006   NA
 1785702 1785703 CHU_2656 CHU_2657     FALSE 0.078 205.000 0.000 1.000   NA
 1785703 1785704 CHU_2657 CHU_2658   yegN TRUE 0.999 3.000 0.814 0.066 N NA
 1785704 1785705 CHU_2658 CHU_2659 yegN tolC TRUE 0.996 12.000 0.597 1.000 N NA
 1785707 1785708 CHU_2661 CHU_2662     FALSE 0.117 265.000 0.013 NA   NA
 1785709 1785710 CHU_2663 CHU_2665   uvrD TRUE 0.436 206.000 0.104 NA   NA
 1785711 1785712 CHU_2664 CHU_2666 nudC   TRUE 0.661 176.000 0.263 NA   NA
 1785712 1785713 CHU_2666 CHU_2667   coaD TRUE 0.941 13.000 0.008 NA   NA
 1785717 1785718 CHU_2671 CHU_2672     FALSE 0.352 68.000 0.000 NA   NA
 1785718 1785719 CHU_2672 CHU_2673   hisS FALSE 0.036 330.000 0.000 1.000   NA
 1785719 1785720 CHU_2673 CHU_2674 hisS   TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1785720 1785721 CHU_2674 CHU_2675     TRUE 0.944 9.000 0.002 NA   NA
 1785721 1785722 CHU_2675 CHU_2676     TRUE 0.976 0.000 0.016 NA   NA
 1785723 1785724 CHU_2677 CHU_2678 yiaD   FALSE 0.155 123.000 0.000 NA   NA
 1785725 1785726 CHU_2679 CHU_2680   adhB FALSE 0.233 153.000 0.005 1.000   NA
 1785726 1785727 CHU_2680 CHU_2681 adhB yfdH FALSE 0.114 174.000 0.000 1.000 N NA
 1785727 1785728 CHU_2681 CHU_2682 yfdH   TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1785729 1785730 CHU_2683 CHU_2684   guaD FALSE 0.046 248.000 0.000 NA   NA
 1785732 1785733 CHU_2686 CHU_2687     FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1785733 1785734 CHU_2687 CHU_2688   typA FALSE 0.037 321.000 0.000 1.000   NA
 1785736 1785737 CHU_2690 CHU_2691 plsC   FALSE 0.035 299.000 0.000 NA   NA
 1785737 1785738 CHU_2691 CHU_2692     TRUE 0.402 189.000 0.059 NA   NA
 1785740 1785741 CHU_2695 CHU_2696     TRUE 0.795 -337.000 0.021 NA   NA
 1785743 1785744 CHU_2698 CHU_2699     TRUE 0.953 14.000 0.013 1.000 N NA
 1785744 1785745 CHU_2699 CHU_2700   ftsK TRUE 0.977 35.000 0.490 1.000 N NA
 1785745 1785746 CHU_2700 CHU_2701 ftsK pyrD FALSE 0.174 218.000 0.013 1.000 N NA
 1785746 1785747 CHU_2701 CHU_2702 pyrD xerD FALSE 0.040 314.000 0.000 1.000 N NA
 1785748 1785749 CHU_2703 CHU_2704 aroQ aspB TRUE 0.993 3.000 0.015 1.000 Y NA
 1785750 1785751 CHU_2705 CHU_2706   rnhA TRUE 0.976 7.000 0.006 0.012   NA
 1785751 1785752 CHU_2706 CHU_2707 rnhA lys FALSE 0.297 87.000 0.000 1.000 N NA
 1785752 1785753 CHU_2707 CHU_2708 lys   FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   NA
 1785753 1785754 CHU_2708 CHU_2709     FALSE 0.186 105.000 0.000 NA   NA
 1785754 1785755 CHU_2709 CHU_2710   ubiE TRUE 0.946 25.000 0.055 NA   NA
 1785755 1785756 CHU_2710 CHU_2712 ubiE   FALSE 0.060 213.000 0.000 NA   NA
 1785756 1785757 CHU_2712 CHU_2713     FALSE 0.236 92.000 0.000 NA   NA
 1785757 1785758 CHU_2713 CHU_2714   yiaD FALSE 0.062 234.000 0.000 1.000   NA
 1785758 1785759 CHU_2714 CHU_2715 yiaD   TRUE 0.923 13.000 0.000 0.011   NA
 1785760 1785761 CHU_2716 CHU_2717 yihA   TRUE 0.428 62.000 0.000 1.000   NA
 1785761 1785762 CHU_2717 CHU_2718     TRUE 0.531 40.000 0.000 NA   NA
 1785762 1785763 CHU_2718 CHU_2719     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1785764 1785765 CHU_2720 CHU_2721   ptpA TRUE 0.979 0.000 0.016 1.000 N NA
 1785766 1785767 CHU_2722 CHU_2723   fur FALSE 0.193 102.000 0.000 NA   NA
 1785767 1785768 CHU_2723 CHU_2724 fur ahpC TRUE 0.799 35.000 0.008 1.000 N NA
 1785770 1785771 CHU_2726 CHU_2727 kdtA yjeQ TRUE 0.968 -3.000 0.013 1.000   NA
 1785772 1785773 CHU_2728 CHU_2729     FALSE 0.146 130.000 0.000 NA   NA
 1785773 1785774 CHU_2729 CHU_2730     FALSE 0.071 198.000 0.000 NA   NA
 1785774 1785775 CHU_2730 CHU_2731     FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1785775 1785776 CHU_2731 CHU_2732     TRUE 0.973 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1785777 1785778 CHU_2733 CHU_2734     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785779 1785780 CHU_2735 CHU_2736 ftsZ ftsA TRUE 0.991 31.000 0.460 1.000 Y NA
 1785780 1785781 CHU_2736 CHU_2737 ftsA   TRUE 0.992 6.000 0.086 NA   NA
 1785781 1785782 CHU_2737 CHU_2738   murC TRUE 0.940 -31.000 0.065 NA   NA
 1785782 1785783 CHU_2738 CHU_2739 murC murG TRUE 0.998 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 1785783 1785784 CHU_2739 CHU_2740 murG ftsW TRUE 0.988 -7.000 0.142 1.000 N NA
 1785784 1785785 CHU_2740 CHU_2741 ftsW murD TRUE 0.993 5.000 0.085 1.000 N NA
 1785785 1785786 CHU_2741 CHU_2742 murD mraY TRUE 0.999 4.000 0.647 0.005 Y NA
 1785786 1785787 CHU_2742 CHU_2743 mraY   TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1785787 1785788 CHU_2743 CHU_2744     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785788 1785789 CHU_2744 CHU_2745   murE TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1785789 1785790 CHU_2745 CHU_2746 murE ftsI TRUE 0.999 2.000 0.717 1.000 Y NA
 1785790 1785791 CHU_2746 CHU_2747 ftsI   TRUE 0.990 -10.000 0.329 NA   NA
 1785791 1785792 CHU_2747 CHU_2748   mraW TRUE 0.983 5.000 0.022 NA   NA
 1785792 1785793 CHU_2748 CHU_2749 mraW   TRUE 0.997 8.000 0.635 NA   NA
 1785794 1785795 CHU_2750 CHU_2751 hupB   FALSE 0.047 246.000 0.000 NA   NA
 1785795 1785796 CHU_2751 CHU_2752   ugpQ TRUE 0.990 -3.000 0.111 NA   NA
 1785796 1785797 CHU_2752 CHU_2753 ugpQ   FALSE 0.081 188.000 0.000 NA   NA
 1785800 1785801 CHU_2756 CHU_2757 maa   TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1785801 1785802 CHU_2757 CHU_2758   neuB TRUE 0.457 50.000 0.000 NA   NA
 1785802 1785803 CHU_2758 CHU_2759 neuB   TRUE 0.878 -7.000 0.000 1.000 N NA
 1785803 1785804 CHU_2759 CHU_2760     TRUE 0.978 -3.000 0.032 NA N NA
 1785804 1785805 CHU_2760 CHU_2761   kdsB TRUE 0.921 106.000 0.355 NA Y NA
 1785805 1785806 CHU_2761 CHU_2762 kdsB   TRUE 0.983 11.000 0.043 1.000 N NA
 1785806 1785807 CHU_2762 CHU_2763     TRUE 0.906 11.000 0.000 1.000   NA
 1785807 1785808 CHU_2763 CHU_2764     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1785808 1785809 CHU_2764 CHU_2765     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1785809 1785810 CHU_2765 CHU_2766     TRUE 0.916 10.000 0.000 1.000   NA
 1785810 1785811 CHU_2766 CHU_2767     TRUE 0.506 43.000 0.000 NA   NA
 1785812 1785813 CHU_2768 CHU_2770     TRUE 0.767 -15.000 0.000 NA   NA
 1785814 1785815 CHU_2771 CHU_2772   wcaE TRUE 0.698 93.000 0.058 NA   NA
 1785816 1785817 CHU_2773 CHU_2774 pfkA   TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1785819 1785820 CHU_2775 CHU_2777 wecB rfbX TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1785821 1785822 CHU_2778 CHU_2779     TRUE 0.531 40.000 0.000 NA   NA
 1785822 1785823 CHU_2779 CHU_2780     FALSE 0.031 324.000 0.000 NA   NA
 1785823 1785824 CHU_2780 CHU_2781     FALSE 0.021 490.000 0.000 NA   NA
 1785824 1785825 CHU_2781 CHU_2782     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785825 1785826 CHU_2782 CHU_2783     TRUE 0.503 -336.000 0.000 NA   NA
 1785827 1785828 CHU_2784 CHU_2785 arcB rcsC TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.012 Y NA
 1785828 1785829 CHU_2785 CHU_2786 rcsC   TRUE 0.996 9.000 0.318 NA   NA
 1785829 1785830 CHU_2786 CHU_2787   phnP TRUE 0.986 2.000 0.032 NA   NA
 1785830 1785831 CHU_2787 CHU_2788 phnP   FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1785831 1785832 CHU_2788 CHU_2789     FALSE 0.170 112.000 0.000 NA   NA
 1785833 1785834 CHU_2790 CHU_2791     FALSE 0.052 233.000 0.000 NA   NA
 1785834 1785835 CHU_2791 CHU_2792     FALSE 0.042 264.000 0.000 NA   NA
 1785835 1785836 CHU_2792 CHU_2793   atoC FALSE 0.057 246.000 0.000 1.000 N NA
 1785837 1785838 CHU_2794 CHU_2795     TRUE 0.886 73.000 0.167 1.000   NA
 1785838 1785839 CHU_2795 CHU_2796   pgtB TRUE 0.995 13.000 0.500 1.000   NA
 1785839 1785840 CHU_2796 CHU_2797 pgtB zraS FALSE 0.136 189.000 0.000 0.016   NA
 1785840 1785841 CHU_2797 CHU_2799 zraS zraS TRUE 0.440 81.000 0.000 0.003   NA
 1785841 1785842 CHU_2799 CHU_2800 zraS zraS FALSE 0.170 175.000 0.000 0.003   NA
 1785843 1429239 CHU_2801 CHU_tLeu03 fbpS   TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1429239 1785844 CHU_tLeu03 CHU_2802   bglC TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1785844 1429241 CHU_2802 CHU_tLys01 bglC   FALSE 0.089 178.000 0.000 NA   NA
 1429241 1785845 CHU_tLys01 CHU_2803     FALSE 0.025 386.000 0.000 NA   NA
 1785845 1429243 CHU_2803 CHU_tLys02     FALSE 0.091 176.000 0.000 NA   NA
 1785848 1785849 CHU_2806 CHU_2807     TRUE 0.485 52.000 0.000 1.000   NA
 1785849 1785850 CHU_2807 CHU_2808     TRUE 0.997 22.000 0.857 1.000 Y NA
 1785850 1785851 CHU_2808 CHU_2809     TRUE 0.997 13.000 1.000 0.065 N NA
 1785852 1785853 CHU_2810 CHU_2811     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1785853 1785854 CHU_2811 CHU_2812     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785854 1785855 CHU_2812 CHU_2813     FALSE 0.146 130.000 0.000 NA   NA
 1785855 1785856 CHU_2813 CHU_2814     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1785857 1785858 CHU_2815 CHU_2816 dtd   TRUE 0.989 2.000 0.047 NA   NA
 1785858 1785859 CHU_2816 CHU_2817   ilvE FALSE 0.281 81.000 0.000 NA   NA
 1785859 1785860 CHU_2817 CHU_2818 ilvE   FALSE 0.093 175.000 0.000 NA   NA
 1785862 1785863 CHU_2820 CHU_2821     FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1785864 1785865 CHU_2822 CHU_2823 fixC   TRUE 0.634 35.000 0.000 1.000 N NA
 1785865 1785866 CHU_2823 CHU_2824   gcvT TRUE 0.617 128.000 0.065 1.000 N NA
 1785866 1785867 CHU_2824 CHU_2825 gcvT rnhB TRUE 0.686 40.000 0.002 1.000 N NA
 1785867 1785868 CHU_2825 CHU_2827 rnhB   TRUE 0.654 -31.000 0.000 NA   NA
 1785869 1785870 CHU_2826 CHU_2828   plsC TRUE 0.467 142.000 0.034 1.000   NA
 1785870 1785871 CHU_2828 CHU_2829 plsC gatC TRUE 0.974 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1785871 1785872 CHU_2829 CHU_2830 gatC   FALSE 0.339 134.000 0.010 1.000   NA
 1785872 1785873 CHU_2830 CHU_2831   pduO TRUE 0.804 20.000 0.000 1.000   NA
 1785873 1785874 CHU_2831 CHU_2832 pduO prfB FALSE 0.298 86.000 0.000 1.000   NA
 1785875 1785876 CHU_2833 CHU_2834     TRUE 0.609 -40.000 0.000 NA   NA
 1785876 1785877 CHU_2834 CHU_2835     FALSE 0.111 159.000 0.000 NA   NA
 1785879 1785880 CHU_2837 CHU_2838     TRUE 0.710 28.000 0.000 1.000   NA
 1785880 1785881 CHU_2838 CHU_2839     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1785881 1785882 CHU_2839 CHU_2840     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1785882 1785883 CHU_2840 CHU_2841     FALSE 0.168 113.000 0.000 NA   NA
 1785883 1785884 CHU_2841 CHU_2842     FALSE 0.052 233.000 0.000 NA   NA
 1785884 1785885 CHU_2842 CHU_2843     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1785886 1785887 CHU_2844 CHU_2845   kdsB TRUE 0.952 -10.000 0.020 1.000 N NA
 1785887 1785888 CHU_2845 CHU_2846 kdsB   FALSE 0.397 68.000 0.000 1.000   NA
 1785888 1785889 CHU_2846 CHU_2847     TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1785889 1785890 CHU_2847 CHU_2848     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1785890 1785891 CHU_2848 CHU_2849     TRUE 0.818 17.000 0.000 NA   NA
 1785891 1785892 CHU_2849 CHU_2850     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1785894 1785895 CHU_2852 CHU_2853     FALSE 0.056 222.000 0.000 NA   NA
 1785896 1785897 CHU_2854 CHU_2855   ppc FALSE 0.041 307.000 0.000 1.000 N NA
 1785898 1785899 CHU_2856 CHU_2857     TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1785899 1785900 CHU_2857 CHU_2858     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1785900 1785901 CHU_2858 CHU_2859   acrA FALSE 0.025 392.000 0.000 NA   NA
 1785901 1785902 CHU_2859 CHU_2860 acrA acrB TRUE 0.975 50.000 0.833 1.000 N NA
 1785902 1785903 CHU_2860 CHU_2861 acrB   TRUE 0.907 134.000 0.839 0.018 N NA
 1785904 1785905 CHU_2862 CHU_2863 envR fabF FALSE 0.335 79.000 0.000 1.000 N NA
 1785905 1785906 CHU_2863 CHU_2864 fabF   TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1785907 1785908 CHU_2865 CHU_2866   yidK TRUE 0.909 70.000 0.259 NA   NA
 1785908 1785909 CHU_2866 CHU_2867 yidK   FALSE 0.099 184.000 0.000 1.000   NA
 1785910 1785911 CHU_2868 CHU_2870     FALSE 0.043 259.000 0.000 NA   NA
 1785911 1785912 CHU_2870 CHU_2871     TRUE 0.531 40.000 0.000 NA   NA
 1785912 1785913 CHU_2871 CHU_2872     TRUE 0.892 76.000 0.250 NA   NA
 1785913 1785914 CHU_2872 CHU_2873     FALSE 0.115 155.000 0.000 NA   NA
 1785914 1785915 CHU_2873 CHU_2874     TRUE 0.972 -25.000 0.200 NA   NA
 1785915 1785916 CHU_2874 CHU_2875     FALSE 0.054 228.000 0.000 NA   NA
 1785916 1785917 CHU_2875 CHU_2876     FALSE 0.217 96.000 0.000 NA   NA
 1785917 1785918 CHU_2876 CHU_2877     TRUE 0.687 27.000 0.000 NA N NA
 1785918 1785919 CHU_2877 CHU_2878     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1785920 1785921 CHU_2879 CHU_2880 arcB atoC FALSE 0.341 179.000 0.000 0.018 Y NA
 1785921 1785922 CHU_2880 CHU_2881 atoC zraR FALSE 0.193 266.000 0.000 0.012 Y NA
 1785922 1785923 CHU_2881 CHU_2882 zraR yccZ TRUE 0.948 4.000 0.000 1.000 N NA
 1785923 1785924 CHU_2882 CHU_2883 yccZ wzxC TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1785924 1785925 CHU_2883 CHU_2884 wzxC wcaL TRUE 0.664 -28.000 0.000 NA   NA
 1785925 1785926 CHU_2884 CHU_2885 wcaL wzc TRUE 0.974 10.000 0.000 1.000 Y NA
 1785926 1785927 CHU_2885 CHU_2886 wzc   FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1785928 1785929 CHU_2887 CHU_2888   rfe TRUE 0.747 -22.000 0.000 1.000 N NA
 1785929 1785930 CHU_2888 CHU_2889 rfe rgpA TRUE 0.993 12.000 0.059 1.000 Y NA
 1785930 1785931 CHU_2889 CHU_2891 rgpA   TRUE 0.475 132.000 0.000 0.018 Y NA
 1785931 1785932 CHU_2891 CHU_2892   wcaL TRUE 0.988 4.000 0.000 0.018 Y NA
 1785932 1785933 CHU_2892 CHU_2893 wcaL   TRUE 0.959 14.000 0.000 1.000 Y NA
 1785933 1785934 CHU_2893 CHU_2894     TRUE 0.818 -13.000 0.000 1.000 N NA
 1785940 1785941 CHU_2901 CHU_2902     FALSE 0.027 361.000 0.000 NA   NA
 1785943 1429342 CHU_2904 CHU_tPhe02     FALSE 0.097 171.000 0.000 NA   NA
 1429342 1429344 CHU_tPhe02 CHU_tPseudo01     TRUE 0.612 32.000 0.000 NA   NA
 1429344 1785944 CHU_tPseudo01 CHU_2908     FALSE 0.038 287.000 0.000 NA   NA
 1785945 1785946 CHU_2909 CHU_2910     TRUE 0.742 -18.000 0.000 NA   NA
 1785946 1785947 CHU_2910 CHU_2911     FALSE 0.094 174.000 0.000 NA   NA
 1785947 1785948 CHU_2911 CHU_2912     FALSE 0.086 180.000 0.000 NA   NA
 1785948 1785949 CHU_2912 CHU_2913     TRUE 0.997 -3.000 0.700 NA   NA
 1785949 1785950 CHU_2913 CHU_2914     TRUE 0.978 31.000 0.450 NA   NA
 1785950 1785951 CHU_2914 CHU_2915     TRUE 0.929 46.000 0.152 NA   NA
 1785951 1785952 CHU_2915 CHU_2916     TRUE 0.609 -40.000 0.000 NA   NA
 1785952 1785953 CHU_2916 CHU_2917   folA TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1785953 1785954 CHU_2917 CHU_2918 folA   FALSE 0.281 81.000 0.000 NA   NA
 1785956 1785957 CHU_2920 CHU_2921     FALSE 0.027 361.000 0.000 NA   NA
 1785957 1785958 CHU_2921 CHU_2922     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1785958 1785959 CHU_2922 CHU_2923     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1785959 1785960 CHU_2923 CHU_2924     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1785960 1785961 CHU_2924 CHU_2925     TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1785961 1785962 CHU_2925 CHU_2926     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1785962 1785963 CHU_2926 CHU_2927   yhhT FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1785966 1785967 CHU_2930 CHU_2931     FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1785967 1785968 CHU_2931 CHU_2932     FALSE 0.031 324.000 0.000 NA   NA
 1785968 1785969 CHU_2932 CHU_2933     FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 1785969 1785970 CHU_2933 CHU_2934     TRUE 0.584 35.000 0.000 NA   NA
 1785972 1785973 CHU_2936 CHU_2937 hsdR   TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1785973 1785974 CHU_2937 CHU_2938     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1785974 1785975 CHU_2938 CHU_2939   hsdS TRUE 0.995 2.000 0.160 NA   NA
 1785975 1785976 CHU_2939 CHU_2940 hsdS   TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1785976 1785977 CHU_2940 CHU_2941     TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1785977 1785978 CHU_2941 CHU_2942     FALSE 0.038 287.000 0.000 NA   NA
 1785978 1785979 CHU_2942 CHU_2943     FALSE 0.018 1061.000 0.000 NA   NA
 1785979 1785980 CHU_2943 CHU_2944     FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1785980 1785981 CHU_2944 CHU_2945     FALSE 0.140 134.000 0.000 NA   NA
 1785981 1785982 CHU_2945 CHU_2946     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 1785982 1785983 CHU_2946 CHU_2947     FALSE 0.269 84.000 0.000 NA   NA
 1785983 1785984 CHU_2947 CHU_2948     TRUE 0.991 3.000 0.055 NA   NA
 1785984 1785985 CHU_2948 CHU_2949   gcr TRUE 0.485 52.000 0.000 1.000   NA
 1785985 1785986 CHU_2949 CHU_2950 gcr   TRUE 0.612 32.000 0.000 NA   NA
 1785986 1785987 CHU_2950 CHU_2951     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1785987 1785988 CHU_2951 CHU_2952     FALSE 0.065 206.000 0.000 NA   NA
 1785988 1785989 CHU_2952 CHU_2953     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785989 1785990 CHU_2953 CHU_2954     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785991 1785992 CHU_2955 CHU_2956     TRUE 0.997 2.000 0.364 NA   NA
 1785992 1785993 CHU_2956 CHU_2957     FALSE 0.162 116.000 0.000 NA   NA
 1785993 1785994 CHU_2957 CHU_2958     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1785997 1785998 CHU_2961 CHU_2962     TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1785998 1785999 CHU_2962 CHU_2963     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1785999 1786000 CHU_2963 CHU_2964     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1786004 1429406 CHU_2968 CHU_tLeu04     FALSE 0.017 1611.000 0.000 NA   NA
 1429406 1786005 CHU_tLeu04 CHU_2970     FALSE 0.071 198.000 0.000 NA   NA
 1786006 1786007 CHU_2971 CHU_2972 phoH   FALSE 0.185 120.000 0.000 1.000   NA
 1786007 1786008 CHU_2972 CHU_2973     FALSE 0.186 105.000 0.000 NA   NA
 1786008 1786009 CHU_2973 CHU_2974   paaF TRUE 0.673 48.000 0.008 NA   NA
 1786010 1786011 CHU_2975 CHU_2976   bioA TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1786011 1786012 CHU_2976 CHU_2977 bioA bioD TRUE 0.996 -7.000 0.124 0.001 Y NA
 1786012 1786013 CHU_2977 CHU_2978 bioD bioF TRUE 0.996 -3.000 0.097 1.000 Y NA
 1786013 1786014 CHU_2978 CHU_2979 bioF   TRUE 0.948 3.000 0.000 1.000   NA
 1786014 1786015 CHU_2979 CHU_2980   ldhA FALSE 0.194 114.000 0.000 1.000   NA
 1786015 1786016 CHU_2980 CHU_2981 ldhA   FALSE 0.040 270.000 0.000 NA   NA
 1786018 1786019 CHU_2983 CHU_2984     FALSE 0.047 246.000 0.000 NA   NA
 1786019 1786020 CHU_2984 CHU_2985   rsaD TRUE 0.999 4.000 0.500 NA Y NA
 1786020 1786021 CHU_2985 CHU_2986 rsaD   TRUE 0.999 2.000 0.667 NA Y NA
 1786021 1429424 CHU_2986 CHU_tGlu01     FALSE 0.019 654.000 0.000 NA   NA
 1429424 1429425 CHU_tGlu01 CHU_tGlu02     FALSE 0.193 102.000 0.000 NA   NA
 1786023 1786024 CHU_2988 CHU_2989     FALSE 0.026 376.000 0.000 NA   NA
 1786024 1786025 CHU_2989 CHU_2990   hslU TRUE 0.874 26.000 0.010 1.000   NA
 1786025 1786026 CHU_2990 CHU_2991 hslU   TRUE 0.934 15.000 0.010 NA   NA
 1786026 1786027 CHU_2991 CHU_2992   lon TRUE 0.904 56.000 0.148 NA   NA
 1786029 1786030 CHU_2994 CHU_2995 mltD yaeL TRUE 0.904 16.000 0.002 1.000   NA
 1786030 1786031 CHU_2995 CHU_2996 yaeL dxr TRUE 0.978 36.000 0.568 1.000 N NA
 1786031 1786032 CHU_2996 CHU_2997 dxr   TRUE 0.967 -3.000 0.012 1.000   NA
 1786032 1786033 CHU_2997 CHU_2998     FALSE 0.359 90.000 0.000 0.037   NA
 1786033 1786034 CHU_2998 CHU_2999     TRUE 0.962 -7.000 0.026 NA   NA
 1786034 1786035 CHU_2999 CHU_3000   wecE TRUE 0.988 -3.000 0.018 NA Y NA
 1786036 1786037 CHU_3001 CHU_3002     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1786037 1786038 CHU_3002 CHU_3003     TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1786038 1786039 CHU_3003 CHU_3004     FALSE 0.311 75.000 0.000 NA   NA
 1786041 1786042 CHU_3006 CHU_3007 htrA   TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1786043 1786044 CHU_3008 CHU_3009 dnaA   FALSE 0.033 370.000 0.000 1.000 N NA
 1786044 1786045 CHU_3009 CHU_3010     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1786045 1786046 CHU_3010 CHU_3011   fabI FALSE 0.168 113.000 0.000 NA   NA
 1786046 1786047 CHU_3011 CHU_3012 fabI recN TRUE 0.772 65.000 0.033 1.000 N NA
 1786047 1786048 CHU_3012 CHU_3013 recN   TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1786048 1786049 CHU_3013 CHU_3014     TRUE 0.462 49.000 0.000 NA   NA
 1786049 1786050 CHU_3014 CHU_3015   coaBC TRUE 0.984 -3.000 0.051 NA   NA
 1786050 1786051 CHU_3015 CHU_3016 coaBC   TRUE 0.987 9.000 0.050 1.000   NA
 1786051 1786052 CHU_3016 CHU_3017     TRUE 0.964 28.000 0.144 NA   NA
 1786052 1786053 CHU_3017 CHU_3019     FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1786054 1786055 CHU_3018 CHU_3020 tilS mdh TRUE 0.508 70.000 0.003 1.000 N NA
 1786056 1786057 CHU_3021 CHU_3022     FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1786057 1786058 CHU_3022 CHU_3023     FALSE 0.132 139.000 0.000 NA   NA
 1786058 1786059 CHU_3023 CHU_3024     TRUE 0.742 -18.000 0.000 NA   NA
 1786059 1786060 CHU_3024 CHU_3025   phhA TRUE 0.935 2.000 0.000 NA N NA
 1786061 1786062 CHU_3026 CHU_3027     TRUE 0.996 3.000 0.200 NA   NA
 1786063 1786064 CHU_3028 CHU_3029   barA TRUE 0.987 4.000 0.000 0.045 Y NA
 1786064 1786065 CHU_3029 CHU_3030 barA mltD FALSE 0.147 146.000 0.000 1.000   NA
 1786065 1786066 CHU_3030 CHU_3031 mltD   TRUE 0.991 7.000 0.070 1.000   NA
 1786066 1786067 CHU_3031 CHU_3032     TRUE 0.989 0.000 0.047 1.000   NA
 1786067 1786068 CHU_3032 CHU_3033     TRUE 0.685 38.000 0.000 0.022   NA
 1786069 1786070 CHU_3034 CHU_3035 pepP   FALSE 0.167 133.000 0.000 1.000   NA
 1786071 1786072 CHU_3036 CHU_3037 tsf rpsB TRUE 0.961 97.000 0.748 1.000 Y NA
 1786072 1786073 CHU_3037 CHU_3038 rpsB rpsI TRUE 0.984 25.000 0.060 0.016 Y NA
 1786073 1786074 CHU_3038 CHU_3039 rpsI rplM TRUE 0.998 12.000 0.231 0.012 Y NA
 1786074 1786075 CHU_3039 CHU_3040 rplM rluA TRUE 0.629 94.000 0.003 1.000 Y NA
 1786075 1786076 CHU_3040 CHU_3041 rluA phoR TRUE 0.965 -13.000 0.048 1.000 N NA
 1786076 1786077 CHU_3041 CHU_3042 phoR   TRUE 0.994 14.000 0.109 1.000 Y NA
 1786077 1786078 CHU_3042 CHU_3043     TRUE 0.927 9.000 0.000 1.000 N NA
 1786078 1786079 CHU_3043 CHU_3044     FALSE 0.110 160.000 0.000 NA   NA
 1786080 1786081 CHU_3045 CHU_3046 recA arcB FALSE 0.250 115.000 0.000 0.075 N NA
 1786081 1786082 CHU_3046 CHU_3047 arcB cpxR TRUE 0.987 2.000 0.000 0.017 Y NA
 1786083 1786084 CHU_3048 CHU_3049   dfr TRUE 0.484 46.000 0.000 NA   NA
 1786084 1786085 CHU_3049 CHU_3050 dfr ubiE FALSE 0.378 142.000 0.000 1.000 Y NA
 1786085 1786086 CHU_3050 CHU_3051 ubiE   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786086 1786087 CHU_3051 CHU_3052   eutC TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1786087 1786088 CHU_3052 CHU_3053 eutC eutB TRUE 0.996 31.000 0.859 0.001 Y NA
 1786089 1786090 CHU_3054 CHU_3055   queA FALSE 0.060 240.000 0.000 1.000 N NA
 1786091 1786092 CHU_3056 CHU_3057 tpn   TRUE 0.965 63.000 0.667 0.038   NA
 1786092 1786093 CHU_3057 CHU_3058     FALSE 0.168 113.000 0.000 NA   NA
 1786093 1786094 CHU_3058 CHU_3060   fbaA FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1786095 1786096 CHU_3059 CHU_3061     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1786096 1786097 CHU_3061 CHU_3062   hutG FALSE 0.082 202.000 0.000 1.000   NA
 1786097 1786098 CHU_3062 CHU_3063 hutG   TRUE 0.992 11.000 0.149 1.000   NA
 1786098 1786099 CHU_3063 CHU_3064     TRUE 0.728 155.000 0.292 NA   NA
 1786099 1786100 CHU_3064 CHU_3065     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786100 1786101 CHU_3065 CHU_3066     TRUE 0.988 -7.000 0.150 NA   NA
 1786102 1786103 CHU_3067 CHU_3068   kefB FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1786103 1786104 CHU_3068 CHU_3069 kefB yheR TRUE 0.997 11.000 0.778 1.000   NA
 1786104 1786105 CHU_3069 CHU_3070 yheR   FALSE 0.181 124.000 0.000 1.000   NA
 1786105 1786106 CHU_3070 CHU_3072     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1786106 1786107 CHU_3072 CHU_3073   engA FALSE 0.132 139.000 0.000 NA   NA
 1786107 1786108 CHU_3073 CHU_3074 engA era TRUE 0.990 8.000 0.040 0.002   NA
 1786108 1786109 CHU_3074 CHU_3075 era umuC FALSE 0.081 203.000 0.000 1.000   NA
 1786109 1786110 CHU_3075 CHU_3076 umuC umuD FALSE 0.167 133.000 0.000 1.000   NA
 1786110 1786111 CHU_3076 CHU_3077 umuD   FALSE 0.022 455.000 0.000 NA   NA
 1786111 1786112 CHU_3077 CHU_3078   purU TRUE 0.612 32.000 0.000 NA   NA
 1786113 1786114 CHU_3079 CHU_3080   argG TRUE 0.514 143.000 0.055 NA   NA
 1786114 1786115 CHU_3080 CHU_3081 argG argC TRUE 0.855 110.000 0.060 0.001 Y NA
 1786115 1786116 CHU_3081 CHU_3082 argC   TRUE 0.458 74.000 0.004 NA   NA
 1786116 1786117 CHU_3082 CHU_3083   astC TRUE 0.655 73.000 0.022 NA   NA
 1786117 1786118 CHU_3083 CHU_3084 astC ppiC FALSE 0.120 167.000 0.000 1.000   NA
 1786118 1786119 CHU_3084 CHU_3085 ppiC argF FALSE 0.145 147.000 0.000 1.000   NA
 1786119 1786120 CHU_3085 CHU_3086 argF argB TRUE 0.898 75.000 0.056 1.000 Y NA
 1786120 1786121 CHU_3086 CHU_3087 argB argE TRUE 0.780 117.000 0.053 1.000 Y NA
 1786121 1786122 CHU_3087 CHU_3088 argE argH TRUE 0.703 138.000 0.039 1.000 Y NA
 1786122 1786123 CHU_3088 CHU_3089 argH evgS FALSE 0.197 114.000 0.000 1.000 N NA
 1786123 1786124 CHU_3089 CHU_3090 evgS   TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1786124 1786125 CHU_3090 CHU_3091   rcsC FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1786126 1786127 CHU_3092 CHU_3093     TRUE 0.979 25.000 0.271 NA   NA
 1786127 1786128 CHU_3093 CHU_3094     TRUE 0.993 -16.000 0.914 NA   NA
 1786128 1786129 CHU_3094 CHU_3095     FALSE 0.352 68.000 0.000 NA   NA
 1786129 1786130 CHU_3095 CHU_3096     FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1786130 1786131 CHU_3096 CHU_3097     TRUE 0.991 0.000 0.080 NA   NA
 1786131 1786132 CHU_3097 CHU_3098     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1786132 1786133 CHU_3098 CHU_3099   mutT TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1786133 1786134 CHU_3099 CHU_3100 mutT ispD TRUE 0.471 54.000 0.000 1.000 N NA
 1786136 1786137 CHU_3102 CHU_3103     FALSE 0.190 103.000 0.000 NA   NA
 1786140 1786141 CHU_3106 CHU_3107   vdlC FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1786141 1786142 CHU_3107 CHU_3108 vdlC ppa FALSE 0.298 86.000 0.000 1.000   NA
 1786143 1786144 CHU_3109 CHU_3110   hrpB TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1786145 1786146 CHU_3111 CHU_3112     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 1786146 1786147 CHU_3112 CHU_3113     TRUE 0.895 36.000 0.043 NA   NA
 1786147 1786148 CHU_3113 CHU_3114     FALSE 0.193 102.000 0.000 NA   NA
 1786149 1786150 CHU_3115 CHU_3116 deaD yadQ FALSE 0.281 91.000 0.000 1.000 N NA
 1786150 1786151 CHU_3116 CHU_3117 yadQ   FALSE 0.257 95.000 0.000 1.000   NA
 1786151 1786152 CHU_3117 CHU_3118   yhjA TRUE 0.865 20.000 0.000 0.009   NA
 1786152 1786153 CHU_3118 CHU_3119 yhjA   TRUE 0.818 17.000 0.000 NA   NA
 1786158 1786159 CHU_3124 CHU_3125     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1786159 1786160 CHU_3125 CHU_3126     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1786162 1786163 CHU_3128 CHU_3129 yisS   TRUE 0.914 74.000 0.347 NA   NA
 1786164 1786165 CHU_3130 CHU_3131   ponA TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1786165 1786166 CHU_3131 CHU_3132 ponA   FALSE 0.327 80.000 0.000 1.000   NA
 1786166 1786167 CHU_3132 CHU_3133   eno TRUE 0.761 53.000 0.020 1.000   NA
 1786167 1786168 CHU_3133 CHU_3134 eno carA TRUE 0.828 31.000 0.008 1.000 N NA
 1786168 1786169 CHU_3134 CHU_3135 carA rplQ TRUE 0.545 99.000 0.023 1.000 N NA
 1786169 1786170 CHU_3135 CHU_3136 rplQ rpoA TRUE 0.998 6.000 0.873 1.000 N NA
 1786170 1786171 CHU_3136 CHU_3137 rpoA rpsD TRUE 0.984 29.000 0.549 1.000 N NA
 1786171 1786172 CHU_3137 CHU_3138 rpsD rpsK TRUE 0.991 38.000 0.509 0.016 Y NA
 1786172 1786173 CHU_3138 CHU_3139 rpsK rpsM TRUE 0.995 32.000 0.810 0.012 Y NA
 1786173 1786174 CHU_3139 CHU_3140 rpsM infA TRUE 0.784 162.000 0.075 0.011 Y NA
 1786174 1786175 CHU_3140 CHU_3141 infA map TRUE 0.997 9.000 0.160 1.000 Y NA
 1786175 1786176 CHU_3141 CHU_3142 map secY TRUE 0.992 8.000 0.087 1.000 N NA
 1786176 1786177 CHU_3142 CHU_3143 secY rplO TRUE 0.998 0.000 0.730 1.000 N NA
 1786177 1786178 CHU_3143 CHU_3144 rplO rpmD TRUE 0.999 6.000 0.653 0.002 Y NA
 1786178 1786179 CHU_3144 CHU_3145 rpmD rpsE TRUE 0.999 13.000 0.789 0.016 Y NA
 1786179 1786180 CHU_3145 CHU_3146 rpsE rplR TRUE 0.997 21.000 0.814 0.016 Y NA
 1786180 1786181 CHU_3146 CHU_3147 rplR rplF TRUE 0.999 8.000 0.815 0.012 Y NA
 1786181 1786182 CHU_3147 CHU_3148 rplF rpsH TRUE 0.997 24.000 0.808 0.012 Y NA
 1786182 1786183 CHU_3148 CHU_3149 rpsH rpsN TRUE 0.940 102.000 0.295 0.012 Y NA
 1786183 1786184 CHU_3149 CHU_3150 rpsN rplE TRUE 0.998 10.000 0.309 0.012 Y NA
 1786184 1786185 CHU_3150 CHU_3151 rplE rplX TRUE 0.999 0.000 0.758 0.012 Y NA
 1786185 1786186 CHU_3151 CHU_3152 rplX rplN TRUE 0.999 6.000 0.810 0.016 Y NA
 1786186 1786187 CHU_3152 CHU_3153 rplN rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.791 0.016 Y NA
 1786187 1786188 CHU_3153 CHU_3154 rpsQ rpmC TRUE 0.988 35.000 0.828 0.012   NA
 1786188 1786189 CHU_3154 CHU_3155 rpmC rplP TRUE 0.999 2.000 0.802 0.012   NA
 1786189 1786190 CHU_3155 CHU_3156 rplP rpsC TRUE 0.995 34.000 0.828 0.016 Y NA
 1786190 1786191 CHU_3156 CHU_3157 rpsC rplV TRUE 0.999 6.000 0.719 0.016 Y NA
 1786191 1786192 CHU_3157 CHU_3158 rplV rpsS TRUE 0.995 30.000 0.769 0.016 Y NA
 1786192 1786193 CHU_3158 CHU_3159 rpsS rplB TRUE 0.999 0.000 0.820 0.016 Y NA
 1786193 1786194 CHU_3159 CHU_3160 rplB rplW TRUE 0.998 17.000 0.849 1.000 Y NA
 1786194 1786195 CHU_3160 CHU_3161 rplW rplD TRUE 0.998 9.000 0.307 1.000 Y NA
 1786195 1786196 CHU_3161 CHU_3162 rplD rplC TRUE 0.999 3.000 0.544 0.012 Y NA
 1786196 1786197 CHU_3162 CHU_3163 rplC rpsJ TRUE 0.871 194.000 0.467 0.016 Y NA
 1786197 1786198 CHU_3163 CHU_3164 rpsJ fusA TRUE 0.997 5.000 0.075 1.000 Y NA
 1786198 1786199 CHU_3164 CHU_3165 fusA rpsG TRUE 0.989 19.000 0.077 1.000 Y NA
 1786199 1786200 CHU_3165 CHU_3166 rpsG rpsL TRUE 0.999 8.000 0.620 0.002 Y NA
 1786200 1786201 CHU_3166 CHU_3167 rpsL   FALSE 0.322 162.000 0.022 NA   NA
 1786201 1786202 CHU_3167 CHU_3168   rpoC TRUE 0.723 76.000 0.041 NA   NA
 1786202 1786203 CHU_3168 CHU_3169 rpoC rpoB TRUE 0.991 51.000 0.851 0.001 Y NA
 1786203 1786204 CHU_3169 CHU_3170 rpoB rplL TRUE 0.758 136.000 0.223 1.000 N NA
 1786204 1786205 CHU_3170 CHU_3171 rplL rplJ TRUE 0.987 66.000 0.884 0.012 Y NA
 1786205 1786206 CHU_3171 CHU_3172 rplJ rplA TRUE 0.992 28.000 0.302 0.016 Y NA
 1786206 1786207 CHU_3172 CHU_3173 rplA rplK TRUE 0.999 15.000 0.838 0.016 Y NA
 1786207 1786208 CHU_3173 CHU_3174 rplK nusG TRUE 0.998 5.000 0.681 1.000 N NA
 1786208 1786209 CHU_3174 CHU_3174a nusG secE TRUE 0.992 24.000 0.843 1.000   NA
 1786209 1429614 CHU_3174a CHU_tTrp01 secE   TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1429614 1786210 CHU_tTrp01 CHU_3175   tufB FALSE 0.173 110.000 0.000 NA   NA
 1786210 1429616 CHU_3175 CHU_tThr03 tufB   FALSE 0.393 60.000 0.000 NA   NA
 1429616 1429617 CHU_tThr03 CHU_tGly02     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1429617 1429618 CHU_tGly02 CHU_tTyr01     FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1429618 1786211 CHU_tTyr01 CHU_3176   asnS FALSE 0.097 172.000 0.000 NA   NA
 1786212 1786213 CHU_3177 CHU_3178 rpoN   TRUE 0.993 6.000 0.092 NA   NA
 1786213 1786214 CHU_3178 CHU_3179   phaB TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1786215 1786216 CHU_3180 CHU_3181 ispF   TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1786216 1786217 CHU_3181 CHU_3182   pqqL FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 1786218 1786219 CHU_3183 CHU_3184 dxs   FALSE 0.316 74.000 0.000 NA   NA
 1786219 1786220 CHU_3184 CHU_3185     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1786220 1786221 CHU_3185 CHU_3186     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1786223 1786224 CHU_3188 CHU_3189   lipA TRUE 0.485 95.000 0.015 NA   NA
 1786225 1786226 CHU_3190 CHU_3191     TRUE 0.609 -40.000 0.000 NA   NA
 1786226 1786227 CHU_3191 CHU_3192     TRUE 0.998 3.000 0.500 NA   NA
 1786227 1786228 CHU_3192 CHU_3193     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786228 1786229 CHU_3193 CHU_3194     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1786229 1786230 CHU_3194 CHU_3195   gspD TRUE 0.996 2.000 0.278 NA   NA
 1786230 1786231 CHU_3195 CHU_3196 gspD gspE TRUE 0.998 9.000 0.381 1.000 Y NA
 1786231 1786232 CHU_3196 CHU_3197 gspE   TRUE 0.994 5.000 0.095 1.000   NA
 1786232 1786233 CHU_3197 CHU_3198   gspG TRUE 0.996 4.000 0.222 NA   NA
 1786233 1786234 CHU_3198 CHU_3199 gspG gspF TRUE 0.912 80.000 0.105 NA Y NA
 1786234 1786235 CHU_3199 CHU_3200 gspF   TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1786235 1786236 CHU_3200 CHU_3201     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786236 1786237 CHU_3201 CHU_3202     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786237 1786238 CHU_3202 CHU_3203     FALSE 0.236 92.000 0.000 NA   NA
 1786238 1786239 CHU_3203 CHU_3204     FALSE 0.027 367.000 0.000 NA   NA
 1786239 1786240 CHU_3204 CHU_3205     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1786240 1786241 CHU_3205 CHU_3206     FALSE 0.019 631.000 0.000 NA   NA
 1786241 1786242 CHU_3206 CHU_3207   rhsD TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1786242 1786243 CHU_3207 CHU_3208 rhsD   TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1786243 1786244 CHU_3208 CHU_3209     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786244 1786245 CHU_3209 CHU_3210     TRUE 0.973 39.000 0.600 NA   NA
 1786245 1786246 CHU_3210 CHU_3211     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786246 1786247 CHU_3211 CHU_3212     TRUE 0.584 35.000 0.000 NA   NA
 1786247 1786248 CHU_3212 CHU_3213     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1786248 1786249 CHU_3213 CHU_3214     TRUE 0.653 29.000 0.000 NA   NA
 1786249 1786250 CHU_3214 CHU_3215     FALSE 0.028 345.000 0.000 NA   NA
 1786250 1786251 CHU_3215 CHU_3216     TRUE 0.817 19.000 0.000 1.000   NA
 1786251 1786252 CHU_3216 CHU_3217   atoS TRUE 0.709 300.000 0.333 0.017 Y NA
 1786253 1786254 CHU_3218 CHU_3219 panB   TRUE 0.964 -9.000 0.029 1.000 N NA
 1786257 1786258 CHU_3222 CHU_3223   folP TRUE 0.897 57.000 0.133 NA   NA
 1786259 1786260 CHU_3224 CHU_3225   dppB FALSE 0.329 72.000 0.000 NA   NA
 1786260 1786261 CHU_3225 CHU_3226 dppB aroK TRUE 0.974 10.000 0.000 1.000 Y NA
 1786263 1786264 CHU_3228 CHU_3229 proS   TRUE 0.846 27.000 0.009 NA   NA
 1786264 1786265 CHU_3229 CHU_3230     TRUE 0.994 10.000 0.258 NA   NA
 1786265 1786266 CHU_3230 CHU_3231     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1786267 1786268 CHU_3232 CHU_3233 ampC   TRUE 0.985 10.000 0.054 NA   NA
 1786268 1786269 CHU_3233 CHU_3234   thiO TRUE 0.985 4.000 0.028 NA   NA
 1786270 1786271 CHU_3235 CHU_3236 ycbL   TRUE 0.985 3.000 0.022 1.000   NA
 1786271 1786272 CHU_3236 CHU_3237     TRUE 0.518 78.000 0.009 NA   NA
 1786272 1786273 CHU_3237 CHU_3238     TRUE 0.956 47.000 0.373 NA   NA
 1786273 1786274 CHU_3238 CHU_3239     TRUE 0.995 0.000 0.169 NA   NA
 1786275 1786276 CHU_3240 CHU_3241     FALSE 0.168 113.000 0.000 NA   NA
 1786276 1786277 CHU_3241 CHU_3242   ccmF FALSE 0.072 197.000 0.000 NA   NA
 1786277 1786278 CHU_3242 CHU_3243 ccmF   TRUE 0.998 3.000 0.068 0.001 Y NA
 1786278 1786279 CHU_3243 CHU_3244     TRUE 0.911 15.000 0.005 NA   NA
 1786279 1786280 CHU_3244 CHU_3245   ccmC TRUE 0.841 -43.000 0.018 NA   NA
 1786280 1786281 CHU_3245 CHU_3246 ccmC ccmB TRUE 0.960 67.000 0.501 0.001   NA
 1786282 1786283 CHU_3247 CHU_3248 pheS   FALSE 0.032 316.000 0.000 NA   NA
 1786283 1786284 CHU_3248 CHU_3250     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1786284 1786285 CHU_3250 CHU_3251     FALSE 0.147 129.000 0.000 NA   NA
 1786286 1786287 CHU_3252 CHU_3253   yijO TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1786287 1786288 CHU_3253 CHU_3254 yijO   FALSE 0.037 333.000 0.000 1.000 N NA
 1786291 1786292 CHU_3257 CHU_3258 lnt suhB TRUE 0.825 -25.000 0.005 1.000 N NA
 1786295 1786296 CHU_3261 CHU_3263     TRUE 0.899 -9.000 0.000 0.036   NA
 1786298 1786299 CHU_3264 CHU_3265     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786299 1786300 CHU_3265 CHU_3266   uvrD FALSE 0.106 163.000 0.000 NA   NA
 1786300 1786301 CHU_3266 CHU_3267 uvrD   FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1786301 1786302 CHU_3267 CHU_3268     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1786302 1786303 CHU_3268 CHU_3269     FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1786303 1786304 CHU_3269 CHU_3270     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1786304 1786305 CHU_3270 CHU_3271     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1786305 1786306 CHU_3271 CHU_3272     TRUE 0.954 -7.000 0.018 NA   NA
 1786308 1786309 CHU_3274 CHU_3275     FALSE 0.322 147.000 0.016 NA   NA
 1786309 1786310 CHU_3275 CHU_3276   prmA TRUE 0.908 38.000 0.063 NA   NA
 1786310 1786311 CHU_3276 CHU_3277 prmA tpiA TRUE 0.682 159.000 0.175 1.000 N NA
 1786311 1786312 CHU_3277 CHU_3279 tpiA   FALSE 0.057 220.000 0.000 NA   NA
 1786313 1786314 CHU_3278 CHU_3280 carB   FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1786314 1786315 CHU_3280 CHU_3281   accD FALSE 0.093 175.000 0.000 NA   NA
 1786316 1786317 CHU_3282 CHU_3283 tpn   TRUE 0.966 63.000 0.667 0.037   NA
 1786317 1786318 CHU_3283 CHU_3284     FALSE 0.132 139.000 0.000 NA   NA
 1786318 1786319 CHU_3284 CHU_3285   fumB FALSE 0.168 113.000 0.000 NA   NA
 1786319 1786320 CHU_3285 CHU_3286 fumB   FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1786320 1786321 CHU_3286 CHU_3287     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1786324 1786325 CHU_3290 CHU_3291 trpE trpG TRUE 0.998 13.000 0.520 0.001 Y NA
 1786325 1786326 CHU_3291 CHU_3292 trpG trpD TRUE 0.511 240.000 0.058 1.000 Y NA
 1786326 1786327 CHU_3292 CHU_3293 trpD trpC TRUE 0.998 5.000 0.216 1.000 Y NA
 1786327 1786328 CHU_3293 CHU_3294 trpC trpF TRUE 0.985 35.000 0.264 1.000 Y NA
 1786328 1786329 CHU_3294 CHU_3295 trpF smt TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1786329 1786330 CHU_3295 CHU_3296 smt trpB FALSE 0.105 164.000 0.000 NA   NA
 1786330 1786331 CHU_3296 CHU_3297 trpB trpA TRUE 0.998 2.000 0.146 0.001 Y NA
 1786331 1786332 CHU_3297 CHU_3298 trpA   FALSE 0.125 164.000 0.000 1.000   NA
 1786332 1786333 CHU_3298 CHU_3299     FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1786333 1786334 CHU_3299 CHU_3300     TRUE 0.705 25.000 0.000 NA   NA
 1786335 1786336 CHU_3301 CHU_3302 recO   TRUE 0.955 0.000 0.003 NA   NA
 1786338 1786339 CHU_3304 CHU_3305 mrdB mrdA TRUE 0.987 0.000 0.035 1.000 N NA
 1786339 1786340 CHU_3305 CHU_3306 mrdA   TRUE 0.951 42.000 0.244 NA   NA
 1786340 1786341 CHU_3306 CHU_3307   mreC TRUE 0.990 -3.000 0.104 NA   NA
 1786341 1786342 CHU_3307 CHU_3308 mreC mreB TRUE 0.995 16.000 0.689 1.000 N NA
 1786342 1786343 CHU_3308 CHU_3309 mreB purH TRUE 0.646 110.000 0.059 1.000 N NA
 1786343 1786344 CHU_3309 CHU_3310 purH purN TRUE 0.974 16.000 0.009 1.000 Y NA
 1786344 1786345 CHU_3310 CHU_3311 purN ubiA FALSE 0.315 109.000 0.004 1.000 N NA
 1786345 1786346 CHU_3311 CHU_3312 ubiA   TRUE 0.995 7.000 0.203 1.000   NA
 1786346 1786347 CHU_3312 CHU_3313     TRUE 0.995 9.000 0.202 1.000   NA
 1786347 1786348 CHU_3313 CHU_3314   amtB FALSE 0.065 228.000 0.000 1.000   NA
 1786348 1786349 CHU_3314 CHU_3315 amtB   FALSE 0.269 84.000 0.000 NA   NA
 1786349 1786350 CHU_3315 CHU_3316     FALSE 0.124 146.000 0.000 NA   NA
 1786350 1786351 CHU_3316 CHU_3317   xseA TRUE 0.982 -10.000 0.059 0.001   NA
 1786351 1786352 CHU_3317 CHU_3318 xseA   FALSE 0.026 383.000 0.000 NA   NA
 1786352 1786353 CHU_3318 CHU_3319     FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1786355 1786356 CHU_3321 CHU_3322     TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1786357 1786358 CHU_3323 CHU_3324     FALSE 0.046 247.000 0.000 NA   NA
 1786358 1786359 CHU_3324 CHU_3326     TRUE 0.514 69.000 0.000 0.004 N NA
 1786359 1786360 CHU_3326 CHU_3327     TRUE 0.426 83.000 0.000 0.004   NA
 1786360 1429769 CHU_3327 CHU_3328   copA FALSE 0.113 158.000 0.000 NA   NA
 1429769 1786361 CHU_3328 CHU_3330 copA   FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1786361 1786362 CHU_3330 CHU_3331     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1786362 1786363 CHU_3331 CHU_3332     FALSE 0.190 103.000 0.000 NA   NA
 1786363 1786364 CHU_3332 CHU_3333   fabG TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1786365 1786366 CHU_3334 CHU_3335     FALSE 0.232 93.000 0.000 NA   NA
 1786366 1786367 CHU_3335 CHU_3336     FALSE 0.131 140.000 0.000 NA   NA
 1786368 1786369 CHU_3337 CHU_3338     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1786369 1786370 CHU_3338 CHU_3339   yxkH TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1786373 1786374 CHU_3342 CHU_3343   aefA FALSE 0.078 190.000 0.000 NA   NA
 1786374 1786375 CHU_3343 CHU_3344 aefA   FALSE 0.106 163.000 0.000 NA   NA
 1786375 1786376 CHU_3344 CHU_3345     TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1786376 1786377 CHU_3345 CHU_3346     TRUE 0.986 5.000 0.031 NA   NA
 1786377 1786378 CHU_3346 CHU_3347   rcsC FALSE 0.019 615.000 0.000 NA   NA
 1786378 1786379 CHU_3347 CHU_3348 rcsC mrr FALSE 0.135 158.000 0.000 1.000 N NA
 1786379 1786380 CHU_3348 CHU_3349 mrr hsdR TRUE 0.823 52.000 0.000 0.001 Y NA
 1786380 1786381 CHU_3349 CHU_3350 hsdR intQ FALSE 0.272 109.000 0.000 0.037 N NA
 1786383 1786384 CHU_3352 CHU_3353 hsdS   TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1786384 1786385 CHU_3353 CHU_3354   hsdM TRUE 0.921 18.000 0.011 NA   NA
 1786385 1786386 CHU_3354 CHU_3355 hsdM   FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1786386 1786387 CHU_3355 CHU_3356     TRUE 0.837 -9.000 0.000 NA   NA
 1786387 1429797 CHU_3356 CHU_tMet03     FALSE 0.054 228.000 0.000 NA   NA
 1429797 1786388 CHU_tMet03 CHU_3357     FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1786388 1786389 CHU_3357 CHU_3358     TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1786389 1786390 CHU_3358 CHU_3359     FALSE 0.146 130.000 0.000 NA   NA
 1786390 1786391 CHU_3359 CHU_3360   lpdA FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1786391 1786392 CHU_3360 CHU_3361 lpdA sucB TRUE 0.817 180.000 0.253 1.000 Y NA
 1786392 1786393 CHU_3361 CHU_3362 sucB sucA TRUE 0.984 55.000 0.667 1.000 Y NA
 1786394 1786395 CHU_3363 CHU_3364     TRUE 0.997 13.000 1.000 NA   NA
 1786395 1786396 CHU_3364 CHU_3365     TRUE 0.997 4.000 0.400 NA   NA
 1786396 1786397 CHU_3365 CHU_3366     TRUE 0.997 1.000 0.500 NA   NA
 1786397 1786398 CHU_3366 CHU_3367     FALSE 0.186 105.000 0.000 NA   NA
 1786398 1786399 CHU_3367 CHU_3368     TRUE 0.581 -48.000 0.000 NA   NA
 1786400 1786401 CHU_3369 CHU_3370   arnT FALSE 0.173 131.000 0.000 1.000 N NA
 1786401 1786402 CHU_3370 CHU_3371 arnT   TRUE 0.997 0.000 0.250 0.060   NA
 1786402 1786403 CHU_3371 CHU_3372     TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1786403 1786404 CHU_3372 CHU_3373   gltX TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1786404 1786405 CHU_3373 CHU_3374 gltX tdcF TRUE 0.639 95.000 0.007 NA Y NA
 1786405 1786406 CHU_3374 CHU_3375 tdcF   TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1786408 1786409 CHU_3377 CHU_3378     TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1786411 1786412 CHU_3380 CHU_3381   iscS TRUE 0.994 -3.000 0.180 1.000 N NA
 1786412 1786413 CHU_3381 CHU_3382 iscS nbaC TRUE 0.976 14.000 0.043 1.000   NA
 1786414 1786415 CHU_3383 CHU_3384     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1786415 1786416 CHU_3384 CHU_3385     FALSE 0.352 68.000 0.000 NA   NA
 1786416 1786417 CHU_3385 CHU_3386     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1786418 1786419 CHU_3387 CHU_3388 yraL phhB TRUE 0.906 -16.000 0.010 1.000   NA
 1786421 1786422 CHU_3390 CHU_3391 rfbA rfbB TRUE 0.995 22.000 0.267 0.004 Y NA
 1786422 1786423 CHU_3391 CHU_3392 rfbB wecC TRUE 0.991 3.000 0.008 1.000 Y NA
 1786423 1786424 CHU_3392 CHU_3393 wecC rfbB TRUE 0.974 10.000 0.000 1.000 Y NA
 1786424 1786425 CHU_3393 CHU_3394 rfbB ugd FALSE 0.212 210.000 0.000 1.000 Y NA
 1786426 1786427 CHU_3395 CHU_3396   mmgC FALSE 0.170 112.000 0.000 NA   NA
 1786427 1786428 CHU_3396 CHU_3397 mmgC rpsU TRUE 0.777 77.000 0.055 1.000   NA
 1786428 1786429 CHU_3397 CHU_3398 rpsU xerC TRUE 0.894 64.000 0.141 1.000   NA
 1786429 1786430 CHU_3398 CHU_3399 xerC   TRUE 0.969 27.000 0.161 NA N NA
 1786431 1786432 CHU_3400 CHU_3401 metK   TRUE 0.420 84.000 0.003 1.000   NA
 1786432 1786433 CHU_3401 CHU_3402   ybfF TRUE 0.526 47.000 0.000 1.000   NA
 1786433 1786434 CHU_3402 CHU_3403 ybfF pdxJ TRUE 0.428 62.000 0.000 1.000   NA
 1786435 1786436 CHU_3404 CHU_3405     TRUE 0.988 8.000 0.043 1.000   NA
 1786436 1786437 CHU_3405 CHU_3406   mhpC FALSE 0.353 105.000 0.006 1.000   NA
 1786437 1786438 CHU_3406 CHU_3407 mhpC   TRUE 0.848 -10.000 0.000 1.000   NA
 1786438 1786439 CHU_3407 CHU_3408   ppnK TRUE 0.932 11.000 0.000 0.036   NA
 1786439 1786440 CHU_3408 CHU_3409 ppnK   TRUE 0.541 88.000 0.017 NA   NA
 1786440 1786441 CHU_3409 CHU_3410     TRUE 0.995 3.000 0.159 NA   NA
 1786441 1786442 CHU_3410 CHU_3411   uppS TRUE 0.931 27.000 0.043 NA   NA
 1786442 1786443 CHU_3411 CHU_3412 uppS yaeT TRUE 0.992 1.000 0.065 1.000 N NA
 1786443 1786444 CHU_3412 CHU_3413 yaeT ompH TRUE 0.971 -76.000 0.113 1.000 Y NA
 1786444 1786445 CHU_3413 CHU_3414 ompH ompH TRUE 0.982 37.000 0.147 0.010 Y NA
 1786445 1786446 CHU_3414 CHU_3415 ompH ompH TRUE 0.956 53.000 0.071 0.010 Y NA
 1786446 1786447 CHU_3415 CHU_3416 ompH   TRUE 0.890 47.000 0.071 NA N NA
 1786448 1786449 CHU_3417 CHU_3418   cysS TRUE 0.933 -10.000 0.010 1.000   NA
 1786449 1786450 CHU_3418 CHU_3419 cysS   TRUE 0.892 15.000 0.002 NA   NA
 1786451 1786452 CHU_3420 CHU_3421   nusA TRUE 0.998 2.000 0.759 NA   NA
 1786452 1786453 CHU_3421 CHU_3422 nusA infB TRUE 0.982 27.000 0.342 1.000 N NA
 1786457 1786458 CHU_3426 CHU_3427 kup   TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1786459 1786460 CHU_3428 CHU_3429   ydiJ TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1786461 1786462 CHU_3430 CHU_3431 slyD   FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1786462 1786463 CHU_3431 CHU_3432     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1786463 1786464 CHU_3432 CHU_3433     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1786465 1786466 CHU_3434 CHU_3435     TRUE 0.815 158.000 0.667 NA   NA
 1786466 1786467 CHU_3435 CHU_3437     FALSE 0.042 264.000 0.000 NA   NA
 1786467 1786468 CHU_3437 CHU_3439     FALSE 0.119 151.000 0.000 NA   NA
 1786468 1786469 CHU_3439 CHU_3440     FALSE 0.111 159.000 0.000 NA   NA
 1786469 1786470 CHU_3440 CHU_3441     TRUE 0.680 43.000 0.000 0.001   NA
 1786470 1786471 CHU_3441 CHU_3442     FALSE 0.051 235.000 0.000 NA   NA
 1786472 1786473 CHU_3443 CHU_3444     TRUE 0.525 -81.000 0.000 NA   NA
 1786476 1786477 CHU_3447 CHU_3448     TRUE 0.681 -25.000 0.000 NA   NA
 1786477 1786478 CHU_3448 CHU_3449     TRUE 0.782 147.000 0.429 NA   NA
 1786478 1786479 CHU_3449 CHU_3450     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1786479 1786480 CHU_3450 CHU_3451     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 1786480 1786481 CHU_3451 CHU_3452     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1786482 1786483 CHU_3453 CHU_3454 mfd kinG TRUE 0.524 60.000 0.000 0.071 N NA
 1786484 1786485 CHU_3455 CHU_3456     FALSE 0.132 139.000 0.000 NA   NA
 1786486 1786487 CHU_3457 CHU_3458   ybiT FALSE 0.158 119.000 0.000 NA   NA
 1786488 1786489 CHU_3459 CHU_3460     FALSE 0.230 101.000 0.000 1.000   NA
 1786489 1786490 CHU_3460 CHU_3461     TRUE 0.803 69.000 0.058 NA   NA
 1786490 1786491 CHU_3461 CHU_3462     TRUE 0.965 12.000 0.020 NA   NA
 1786492 1786493 CHU_3463 CHU_3464 lpdA   TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1786493 1786494 CHU_3464 CHU_3465     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1786494 1786495 CHU_3465 CHU_3466   grx FALSE 0.135 137.000 0.000 NA   NA
 1786496 1786497 CHU_3467 CHU_3468   arcB TRUE 0.433 62.000 0.000 1.000 N NA
 1786497 1786498 CHU_3468 CHU_3469 arcB gltB TRUE 0.449 59.000 0.000 1.000 N NA
 1786498 1786499 CHU_3469 CHU_3470 gltB   TRUE 0.724 27.000 0.000 1.000   NA
 1786500 1786501 CHU_3471 CHU_3472     FALSE 0.142 133.000 0.000 NA   NA
 1786502 1786503 CHU_3473 CHU_3474   dsbD FALSE 0.090 177.000 0.000 NA   NA
 1786503 1786504 CHU_3474 CHU_3475 dsbD   TRUE 0.992 0.000 0.091 NA   NA
 1786504 1786505 CHU_3475 CHU_3476   dapE FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1786506 1786507 CHU_3477 CHU_3478     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1786509 1786510 CHU_3480 CHU_3481 rluD   FALSE 0.192 115.000 0.000 1.000   NA
 1786512 1786513 CHU_3484 CHU_3485 cpsG iscS TRUE 0.966 -19.000 0.083 1.000 N NA
 1786513 1786514 CHU_3485 CHU_3486 iscS   TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1786514 1786515 CHU_3486 CHU_3487     FALSE 0.047 246.000 0.000 NA   NA
 1786516 1786517 CHU_3488 CHU_3489     FALSE 0.035 296.000 0.000 NA   NA
 1786519 1786520 CHU_3491 CHU_3492 wcgH   FALSE 0.232 93.000 0.000 NA   NA
 1786521 1786522 CHU_3493 CHU_3494   gldJ FALSE 0.060 213.000 0.000 NA   NA
 1786524 1786525 CHU_3496 CHU_3497     TRUE 0.968 -3.000 0.016 NA   NA
 1786525 1786526 CHU_3497 CHU_3498   oppA FALSE 0.187 120.000 0.000 1.000 N NA
 1786526 1786527 CHU_3498 CHU_3499 oppA   FALSE 0.070 202.000 0.000 NA N NA
 1786527 1786528 CHU_3499 CHU_3500     FALSE 0.184 107.000 0.000 NA N NA
 1786528 1786529 CHU_3500 CHU_3501     TRUE 0.966 3.000 0.005 NA   NA
 1786529 1786530 CHU_3501 CHU_3502   gidA FALSE 0.106 825.000 0.045 NA   NA
 1786530 1786531 CHU_3502 CHU_3503 gidA   TRUE 0.987 3.000 0.029 1.000 N NA
 1786531 1786532 CHU_3503 CHU_3504     TRUE 0.992 0.000 0.094 NA   NA
 1786532 1786533 CHU_3504 CHU_3505     FALSE 0.023 452.000 0.000 NA   NA
 1786533 1786534 CHU_3505 CHU_3506     FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1786534 1786535 CHU_3506 CHU_3507     TRUE 0.998 8.000 0.833 NA   NA
 1786535 1786536 CHU_3507 CHU_3508     TRUE 0.604 33.000 0.000 NA   NA
 1786536 1786537 CHU_3508 CHU_3509     FALSE 0.193 102.000 0.000 NA   NA
 1786537 1786538 CHU_3509 CHU_3510     FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1786539 1786540 CHU_3511 CHU_3512     FALSE 0.361 66.000 0.000 NA   NA
 1786540 1786541 CHU_3512 CHU_3513     TRUE 0.449 58.000 0.000 1.000   NA
 1786541 1786542 CHU_3513 CHU_3514     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1786542 1786543 CHU_3514 CHU_3515     FALSE 0.186 105.000 0.000 NA   NA
 1786546 1786547 CHU_3518 CHU_3519 yehU   TRUE 0.776 -31.000 0.000 0.016   NA
 1786547 1786548 CHU_3519 CHU_3520     FALSE 0.149 146.000 0.000 1.000 N NA
 1786548 1786549 CHU_3520 CHU_3521   fadL FALSE 0.041 422.000 0.000 0.039 N NA
 1786549 1786550 CHU_3521 CHU_3522 fadL   TRUE 0.997 3.000 0.231 1.000   NA
 1786550 1786551 CHU_3522 CHU_3523     FALSE 0.077 206.000 0.000 1.000   NA
 1786551 1786552 CHU_3523 CHU_3524     TRUE 0.992 -16.000 0.751 1.000 N NA
 1786552 1786553 CHU_3524 CHU_3525   lhr TRUE 0.995 -3.000 0.214 0.071   NA
 1786553 1786554 CHU_3525 CHU_3526 lhr   TRUE 0.997 0.000 0.460 1.000   NA
 1786556 1786557 CHU_3528 CHU_3529 lemA htpX TRUE 0.988 19.000 0.307 NA   NA
 1786557 1786558 CHU_3529 CHU_3530 htpX rsaD FALSE 0.260 95.000 0.000 1.000 N NA
 1786559 1786560 CHU_3531 CHU_3532     FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1786560 1786561 CHU_3532 CHU_3533     TRUE 0.851 61.000 0.065 1.000   NA
 1786561 1786562 CHU_3533 CHU_3534     TRUE 0.999 -3.000 0.969 1.000 Y NA
 1786564 1786565 CHU_3536 CHU_3537 yiaD tpx FALSE 0.322 82.000 0.000 1.000 N NA
 1786566 1786567 CHU_3538 CHU_3539     FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1786567 1786568 CHU_3539 CHU_3540   rcsC TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1786568 1786569 CHU_3540 CHU_3541 rcsC cusS TRUE 0.954 19.000 0.000 0.009 Y NA
 1786569 1786570 CHU_3541 CHU_3542 cusS   FALSE 0.034 344.000 0.000 1.000   NA
 1786570 1786571 CHU_3542 CHU_3543     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1786571 1786572 CHU_3543 CHU_3544   ydiP FALSE 0.188 104.000 0.000 NA   NA
 1786572 1786573 CHU_3544 CHU_3545 ydiP glnG TRUE 0.983 36.000 0.625 0.042 N NA
 1786573 1786574 CHU_3545 CHU_3546 glnG cpxA TRUE 0.983 60.000 0.500 0.016 Y NA
 1786574 1786575 CHU_3546 CHU_3547 cpxA   FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1786575 1786576 CHU_3547 CHU_3548   rbn FALSE 0.113 158.000 0.000 NA   NA
 1786576 1786577 CHU_3548 CHU_3549 rbn   FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1786577 1786578 CHU_3549 CHU_3550     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1786578 1786579 CHU_3550 CHU_3551     FALSE 0.352 68.000 0.000 NA   NA
 1786579 1786580 CHU_3551 CHU_3552     FALSE 0.361 66.000 0.000 NA   NA
 1786580 1786581 CHU_3552 CHU_3553     TRUE 0.604 33.000 0.000 NA   NA
 1786581 1786582 CHU_3553 CHU_3554     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1786582 1786583 CHU_3554 CHU_3555     FALSE 0.035 299.000 0.000 NA   NA
 1786583 1786584 CHU_3555 CHU_3556     TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1786584 1786585 CHU_3556 CHU_3557     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1786585 1786586 CHU_3557 CHU_3558     FALSE 0.033 307.000 0.000 NA   NA
 1786586 1786587 CHU_3558 CHU_3559     FALSE 0.204 99.000 0.000 NA   NA
 1786587 1786588 CHU_3559 CHU_3560     TRUE 0.462 55.000 0.000 1.000   NA
 1786588 1786589 CHU_3560 CHU_3561   pgl TRUE 0.485 52.000 0.000 1.000   NA
 1786589 1786590 CHU_3561 CHU_3562 pgl rpoE FALSE 0.358 75.000 0.000 1.000 N NA
 1786590 1786591 CHU_3562 CHU_3563 rpoE   TRUE 0.545 39.000 0.000 NA N NA
 1786591 1786592 CHU_3563 CHU_3564     TRUE 0.960 34.000 0.200 NA   NA
 1786594 1786595 CHU_3565 CHU_3567     FALSE 0.023 429.000 0.000 NA   NA
 1786595 1786596 CHU_3567 CHU_3568     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1786596 1786597 CHU_3568 CHU_3569     FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   NA
 1786598 1786599 CHU_3570 CHU_3571 ychM amtB TRUE 0.754 65.000 0.000 0.022 Y NA
 1786599 1786600 CHU_3571 CHU_3572 amtB glnK TRUE 0.565 231.000 0.300 1.000 N NA
 1786601 1786602 CHU_3573 CHU_3574     FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1786602 1786603 CHU_3574 CHU_3575     FALSE 0.251 96.000 0.000 1.000   NA
 1786603 1786604 CHU_3575 CHU_3576   ydjG FALSE 0.051 264.000 0.000 1.000   NA
 1786604 1786605 CHU_3576 CHU_3577 ydjG bglX FALSE 0.245 98.000 0.000 1.000 N NA
 1786605 1786606 CHU_3577 CHU_3578 bglX   TRUE 0.585 -46.000 0.000 NA   NA
 1786606 1786607 CHU_3578 CHU_3579   exbB FALSE 0.089 178.000 0.000 NA   NA
 1786607 1786608 CHU_3579 CHU_3580 exbB   TRUE 0.999 -3.000 0.773 0.022 Y NA
 1786608 1786609 CHU_3580 CHU_3581   yeeF FALSE 0.238 124.000 0.000 0.059 N NA
 1786610 1786611 CHU_3582 CHU_3583     FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1786612 1786613 CHU_3584 CHU_3585     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1786614 1786615 CHU_3586 CHU_3587     FALSE 0.173 110.000 0.000 NA   NA
 1786615 1786616 CHU_3587 CHU_3588     FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1786616 1786617 CHU_3588 CHU_3589   ydiO FALSE 0.098 185.000 0.000 1.000   NA
 1786617 1786618 CHU_3589 CHU_3590 ydiO fadA TRUE 0.731 199.000 0.159 1.000 Y NA
 1786618 1786619 CHU_3590 CHU_3591 fadA fadB TRUE 0.950 100.000 0.588 1.000 Y NA
 1786619 1786620 CHU_3591 CHU_3592 fadB   TRUE 0.985 17.000 0.142 1.000 N NA
 1786620 1786621 CHU_3592 CHU_3593     FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1786621 1786622 CHU_3593 CHU_3594     FALSE 0.186 105.000 0.000 NA   NA
 1786623 1786624 CHU_3595 CHU_3596 fadD   FALSE 0.193 102.000 0.000 NA   NA
 1786624 1786625 CHU_3596 CHU_3597     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1786626 1786627 CHU_3598 CHU_3599 glnB amtB TRUE 0.907 11.000 0.000 1.000 N NA
 1786628 1786629 CHU_3600 CHU_3601     TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1786630 1786631 CHU_3602 CHU_3603 topB rho FALSE 0.027 466.000 0.000 1.000 N NA
 1786635 1786636 CHU_3607 CHU_3608 asnB   FALSE 0.183 106.000 0.000 NA   NA
 1786640 1786641 CHU_3612 CHU_3613 mgtC   TRUE 0.942 1.000 0.000 1.000   NA
 1786641 1786642 CHU_3613 CHU_3614   radA TRUE 0.942 1.000 0.000 1.000   NA
 1786642 1786643 CHU_3614 CHU_3615 radA   FALSE 0.255 87.000 0.000 NA   NA
 1786643 1786644 CHU_3615 CHU_3616   tpn FALSE 0.329 72.000 0.000 NA   NA
 1786644 1786645 CHU_3616 CHU_3617 tpn   TRUE 0.966 63.000 0.667 0.036   NA
 1786645 1786646 CHU_3617 CHU_3618     FALSE 0.205 109.000 0.000 1.000   NA
 1786646 1786647 CHU_3618 CHU_3619     TRUE 0.906 11.000 0.000 1.000   NA
 1786647 1786648 CHU_3619 CHU_3620     FALSE 0.110 175.000 0.000 1.000   NA
 1786648 1786649 CHU_3620 CHU_3621   ydfG TRUE 0.618 -54.000 0.000 1.000   NA
 1786649 1786650 CHU_3621 CHU_3622 ydfG   TRUE 0.991 16.000 0.333 NA   NA
 1786653 1786654 CHU_3625 CHU_3626   greA FALSE 0.175 109.000 0.000 NA   NA
 1786655 1786656 CHU_3627 CHU_3628     TRUE 0.462 150.000 0.037 1.000 N NA
 1786656 1786657 CHU_3628 CHU_3629   rbfA TRUE 0.962 23.000 0.067 1.000 N NA
 1786659 1786660 CHU_3631 CHU_3632 rpiB tatC TRUE 0.990 5.000 0.054 NA N NA
 1786660 1786661 CHU_3632 CHU_3633 tatC glyA TRUE 0.972 13.000 0.035 NA N NA
 1786663 1786664 CHU_3635 CHU_3637 modF rocF FALSE 0.092 191.000 0.000 1.000   NA
 1786665 1786666 CHU_3636 CHU_3638     TRUE 0.510 -136.000 0.000 NA   NA
 1786668 1786669 CHU_3640 CHU_3641 dsbC   TRUE 0.411 65.000 0.000 1.000   NA
 1786670 1786671 CHU_3642 CHU_3643 yfbB dxs FALSE 0.369 107.000 0.007 1.000   NA
 1786672 1786673 CHU_3644 CHU_3645     FALSE 0.217 96.000 0.000 NA   NA
 1786673 1786674 CHU_3645 CHU_3646     TRUE 0.983 24.000 0.333 NA   NA
 1786674 1786675 CHU_3646 CHU_3647     FALSE 0.142 133.000 0.000 NA   NA
 1786677 1786678 CHU_3649 CHU_3650     TRUE 0.888 -6.000 0.000 1.000   NA
 1786678 1786679 CHU_3650 CHU_3651     TRUE 0.983 9.000 0.000 0.006 Y NA
 1786679 1786680 CHU_3651 CHU_3652     TRUE 0.973 13.000 0.000 0.006 Y NA
 1786680 1786681 CHU_3652 CHU_3653     FALSE 0.097 186.000 0.000 1.000   NA
 1786681 1786682 CHU_3653 CHU_3654     FALSE 0.048 339.000 0.000 0.070   NA
 1786682 1786683 CHU_3654 CHU_3655     TRUE 0.815 158.000 0.667 NA   NA
 1786683 1786684 CHU_3655 CHU_3656     FALSE 0.311 75.000 0.000 NA   NA
 1786686 1786687 CHU_3658 CHU_3659     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1786689 1786690 CHU_3661 CHU_3662   corA TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1786691 1786692 CHU_3663 CHU_3665 fklB fkpA FALSE 0.041 481.000 0.000 0.003   NA
 1786693 1786694 CHU_3664 CHU_3666 fumC   FALSE 0.155 122.000 0.000 NA   NA
 1786694 1786695 CHU_3666 CHU_3667     FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1786695 1786696 CHU_3667 CHU_3668   recJ FALSE 0.089 178.000 0.000 NA   NA
 1786696 1786697 CHU_3668 CHU_3669 recJ   TRUE 0.984 4.000 0.020 1.000   NA
 1786697 1786698 CHU_3669 CHU_3670     TRUE 0.981 6.000 0.021 NA   NA
 1786698 1786699 CHU_3670 CHU_3671     FALSE 0.043 261.000 0.000 NA   NA
 1786699 1786700 CHU_3671 CHU_3672     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1786700 1786701 CHU_3672 CHU_3673     FALSE 0.066 205.000 0.000 NA   NA
 1786703 1786704 CHU_3675 CHU_3676   ileS TRUE 0.923 -10.000 0.007 1.000   NA
 1786704 1786705 CHU_3676 CHU_3677 ileS lspA FALSE 0.358 75.000 0.000 1.000 N NA
 1786705 1786706 CHU_3677 CHU_3678 lspA   FALSE 0.043 260.000 0.000 NA   NA
 1786706 1786707 CHU_3678 CHU_3679     FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1786707 1786708 CHU_3679 CHU_3680     TRUE 0.992 2.000 0.075 NA   NA
 1786708 1786709 CHU_3680 CHU_3681     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1786710 1786711 CHU_3682 CHU_3683 recG gldD TRUE 0.485 111.000 0.028 NA   NA
 1786711 1786712 CHU_3683 CHU_3684 gldD   TRUE 0.991 -10.000 0.395 NA   NA
 1786712 1786713 CHU_3684 CHU_3685   ssb TRUE 0.505 180.000 0.099 NA   NA
 1786713 1786714 CHU_3685 CHU_3686 ssb mutY TRUE 0.853 55.000 0.010 1.000 Y NA
 1786715 1786716 CHU_3687 CHU_3688     FALSE 0.335 78.000 0.000 1.000   NA
 1786716 1786717 CHU_3688 CHU_3689   cafA FALSE 0.070 215.000 0.000 1.000   NA
 1786720 1786721 CHU_3692 CHU_3693   asnB TRUE 0.988 0.000 0.041 1.000 N NA
 1786723 1786724 CHU_3695 CHU_3696 nth   TRUE 0.947 10.000 0.005 NA   NA
 1786724 1786725 CHU_3696 CHU_3697   rpoD TRUE 0.959 -25.000 0.101 NA   NA
 1786726 1786727 CHU_3698 CHU_3699 uvrA   FALSE 0.071 198.000 0.000 NA   NA
 1786727 1786728 CHU_3699 CHU_3700     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1786729 1786730 CHU_3701 CHU_3702     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1786730 1786731 CHU_3702 CHU_3703     TRUE 0.996 1.000 0.240 NA   NA
 1786731 1786732 CHU_3703 CHU_3704   lemA TRUE 0.994 9.000 0.169 NA   NA
 1786732 1786733 CHU_3704 CHU_3705 lemA   FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 1786733 1786734 CHU_3705 CHU_3706   prfA TRUE 0.485 52.000 0.000 1.000   NA
 1786734 1786735 CHU_3706 CHU_3707 prfA   FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1786736 1786737 CHU_3708 CHU_3709     TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1786737 1786738 CHU_3709 CHU_3710     TRUE 0.995 12.000 0.424 NA   NA
 1786740 1786741 CHU_3712 CHU_3713     FALSE 0.127 144.000 0.000 NA   NA
 1786742 1786743 CHU_3714 CHU_3715     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1786743 1786744 CHU_3715 CHU_3716     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1786744 1786745 CHU_3716 CHU_3717   recF TRUE 0.983 -7.000 0.089 NA   NA
 1786746 1786747 CHU_3718 CHU_3719 acoA   FALSE 0.273 92.000 0.000 1.000   NA
 1786747 1786748 CHU_3719 CHU_3720   ribH FALSE 0.322 81.000 0.000 1.000   NA
 1786748 1786749 CHU_3720 CHU_3721 ribH lysC TRUE 0.810 33.000 0.008 1.000 N NA
 1786751 1786752 CHU_3723 CHU_3724   alr TRUE 0.584 -73.000 0.000 1.000   NA
 1786752 1786753 CHU_3724 CHU_3725 alr feoA FALSE 0.388 153.000 0.024 1.000 N NA
 1786753 1786754 CHU_3725 CHU_3726 feoA feoB TRUE 0.977 34.000 0.112 1.000 Y NA
 1786754 1786755 CHU_3726 CHU_3727 feoB   FALSE 0.041 304.000 0.000 1.000 N NA
 1786756 1786757 CHU_3728 CHU_3729   nadC FALSE 0.311 102.000 0.005 NA   NA
 1786757 1786758 CHU_3729 CHU_3730 nadC   TRUE 0.633 87.000 0.032 NA   NA
 1786759 1786760 CHU_3731 CHU_3732 apgM   FALSE 0.020 570.000 0.000 NA   NA
 1786760 1786761 CHU_3732 CHU_3733   purK FALSE 0.190 103.000 0.000 NA   NA
 1786761 1786762 CHU_3733 CHU_3734 purK purE TRUE 0.997 -3.000 0.141 0.001 Y NA
 1786762 1786763 CHU_3734 CHU_3735 purE yiaD TRUE 0.907 11.000 0.000 1.000 N NA
 1786763 1786764 CHU_3735 CHU_3736 yiaD terC FALSE 0.380 86.000 0.000 0.038 N NA
 1786764 1786765 CHU_3736 CHU_3737 terC   TRUE 0.948 3.000 0.000 1.000 N NA
 1786766 1786767 CHU_3738 CHU_3739   yifB FALSE 0.190 103.000 0.000 NA   NA
 1786767 1786768 CHU_3739 CHU_3740 yifB   TRUE 0.816 151.000 0.645 NA   NA
 1786769 1786770 CHU_3741 CHU_3742 leuA leuC TRUE 0.950 53.000 0.088 1.000 Y NA
 1786770 1786771 CHU_3742 CHU_3743 leuC leuD TRUE 0.983 60.000 0.449 0.001 Y NA
 1786771 1786772 CHU_3743 CHU_3744 leuD leuB TRUE 0.698 160.000 0.032 0.001 Y NA
 1786772 1786773 CHU_3744 CHU_3745 leuB ilvD TRUE 0.977 9.000 0.000 1.000 Y NA
 1786773 1786774 CHU_3745 CHU_3746 ilvD ilvB TRUE 0.961 18.000 0.000 0.001 Y NA
 1786774 1786775 CHU_3746 CHU_3747 ilvB   FALSE 0.026 384.000 0.000 NA   NA
 1786775 1786776 CHU_3747 CHU_3748     FALSE 0.370 64.000 0.000 NA   NA
 1786776 1786777 CHU_3748 CHU_3749     FALSE 0.049 241.000 0.000 NA   NA
 1786777 1786778 CHU_3749 CHU_3750     FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1786778 1786779 CHU_3750 CHU_3751     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786779 1786780 CHU_3751 CHU_3752     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1786780 1786781 CHU_3752 CHU_3753     TRUE 0.987 13.000 0.095 1.000   NA
 1786783 1786784 CHU_3755 CHU_3756     TRUE 0.980 28.000 0.375 NA   NA
 1786784 1786785 CHU_3756 CHU_3757     FALSE 0.278 82.000 0.000 NA   NA
 1786786 1786787 CHU_3758 CHU_3759     FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1786787 1786788 CHU_3759 CHU_3760   ahpC TRUE 0.420 130.000 0.025 NA   NA
 1786789 1786790 CHU_3761 CHU_3762 oxyR   FALSE 0.143 150.000 0.000 1.000 N NA
 1786791 1786792 CHU_3763 CHU_3764     FALSE 0.038 290.000 0.000 NA N NA
 1786793 1786794 CHU_3765 CHU_3766   rluC TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1786797 1786798 CHU_3769 CHU_3770     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1786798 1786799 CHU_3770 CHU_3771     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1786799 1786800 CHU_3771 CHU_3773   arnT TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1786803 1786804 CHU_3776 CHU_3777 gltB gltD TRUE 0.995 -7.000 0.099 0.001 Y NA
 1786806 1786807 CHU_3779 CHU_3780     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1786807 1786808 CHU_3780 CHU_3781     TRUE 0.888 -6.000 0.000 1.000   NA
 1786808 1786809 CHU_3781 CHU_3782     FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1786809 1786810 CHU_3782 CHU_3783     TRUE 0.653 29.000 0.000 NA   NA
 1786810 1786811 CHU_3783 CHU_3784   bglX TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1786811 1786812 CHU_3784 CHU_3785 bglX metG TRUE 0.896 12.000 0.000 1.000   NA
 1786812 1786813 CHU_3785 CHU_3786 metG   FALSE 0.352 68.000 0.000 NA   NA
 1786815 1786816 CHU_3788 CHU_3789     TRUE 0.612 32.000 0.000 NA   NA
 1786816 1786817 CHU_3789 CHU_3790     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1786817 1786818 CHU_3790 CHU_3791     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1786818 1786819 CHU_3791 CHU_3792     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1786819 1786820 CHU_3792 CHU_3793     FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1786820 1786821 CHU_3793 CHU_3794   bcsA TRUE 0.971 11.000 0.019 1.000 N NA
 1786821 1786822 CHU_3794 CHU_3795 bcsA   TRUE 0.876 -7.000 0.000 1.000   NA
 1786822 1786823 CHU_3795 CHU_3796     TRUE 0.815 -13.000 0.000 1.000   NA
 1786823 1786824 CHU_3796 CHU_3797   araC TRUE 0.522 48.000 0.000 1.000 N NA
 1786824 1786825 CHU_3797 CHU_3798 araC   TRUE 0.684 82.000 0.037 NA   NA
 1786825 1786826 CHU_3798 CHU_3799   ada FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1786826 1786827 CHU_3799 CHU_3800 ada   TRUE 0.978 0.000 0.000 NA Y NA
 1786829 1786830 CHU_3802 CHU_3803   dnaJ FALSE 0.137 154.000 0.000 1.000   NA
 1786830 1786831 CHU_3803 CHU_3804 dnaJ   TRUE 0.994 -3.000 0.283 NA   NA
 1786831 1786832 CHU_3804 CHU_3805     FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1786832 1786833 CHU_3805 CHU_3806     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1786833 1786834 CHU_3806 CHU_3807     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1786835 1786836 CHU_3808 CHU_3809   yijE TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1786836 1786837 CHU_3809 CHU_3810 yijE   FALSE 0.134 294.000 0.000 1.000 Y NA
 1786837 1786838 CHU_3810 CHU_3811   blgA FALSE 0.203 216.000 0.000 1.000 Y NA
 1786838 1786839 CHU_3811 CHU_3812 blgA   TRUE 0.991 3.000 0.031 0.017   NA
 1786840 1786841 CHU_3813 CHU_3814     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1786843 1786844 CHU_3816 CHU_3817     FALSE 0.086 180.000 0.000 NA   NA
 1786844 1786845 CHU_3817 CHU_3818   pstS FALSE 0.170 112.000 0.000 NA   NA
 1786845 1786846 CHU_3818 CHU_3819 pstS pstC TRUE 0.953 16.000 0.000 1.000 Y NA
 1786846 1786847 CHU_3819 CHU_3820 pstC pstA TRUE 0.994 30.000 0.485 0.001 Y NA
 1786847 1786848 CHU_3820 CHU_3821 pstA   TRUE 0.781 98.000 0.016 0.001 Y NA
 1786848 1786849 CHU_3821 CHU_3822   phoU TRUE 0.983 61.000 0.826 NA Y NA
 1786849 1786850 CHU_3822 CHU_3823 phoU   FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1786850 1786851 CHU_3823 CHU_3824     FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1786851 1786852 CHU_3824 CHU_3825     TRUE 0.942 1.000 0.000 1.000   NA
 1786853 1786854 CHU_3826 CHU_3827   bcd TRUE 0.616 174.000 0.149 1.000 N NA
 1786856 1786857 CHU_3829 CHU_3830     FALSE 0.124 146.000 0.000 NA   NA
 1786857 1786858 CHU_3830 CHU_3831     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1786858 1786859 CHU_3831 CHU_3832   rfaE TRUE 0.984 5.000 0.026 NA   NA
 1786859 1786860 CHU_3832 CHU_3833 rfaE   TRUE 0.974 3.000 0.009 NA   NA
 1786860 1786861 CHU_3833 CHU_3834   panD TRUE 0.981 7.000 0.025 NA   NA
 1786861 1786862 CHU_3834 CHU_3835 panD panC TRUE 0.993 23.000 0.342 1.000 Y NA
 1786863 1786864 CHU_3836 CHU_3837 glgA   TRUE 0.865 -43.000 0.026 NA   NA
 1786864 1786865 CHU_3837 CHU_3838   glmS TRUE 0.952 8.000 0.003 NA   NA
 1786865 1786866 CHU_3838 CHU_3839 glmS nhaP FALSE 0.142 151.000 0.000 1.000 N NA
 1430277 1786867 CHU_tArg04 CHU_3840   hflX TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1786867 1786868 CHU_3840 CHU_3841 hflX   TRUE 0.958 0.000 0.002 1.000   NA
 1786869 1786870 CHU_3842 CHU_3843   rmlC TRUE 0.937 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 1786870 1786871 CHU_3843 CHU_3844 rmlC   TRUE 0.945 2.000 0.000 1.000   NA
 1786871 1783087 CHU_3844 CHU_0001     FALSE 0.185 2440.000 0.133 NA   NA