MicrobesOnline Operon Predictions for Synechococcus elongatus PCC 6301

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 932434 932435 syc0003_d syc0004_d     TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 932435 932436 syc0004_d syc0005_d     TRUE 0.684 -22.000 0.000 NA   NA
 932438 932439 syc0007_d syc0008_d umuD umuC TRUE 0.778 57.000 0.118 1.000 N NA
 932439 932440 syc0008_d syc0009_d umuC   FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 932444 932445 syc0013_d syc0014_d     FALSE 0.460 38.000 0.000 NA   NA
 932447 932448 syc0016_d syc0017_d     TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 932448 932449 syc0017_d syc0018_d     FALSE 0.055 176.000 0.000 NA   NA
 932450 932451 syc0019_c syc0020_c     FALSE 0.247 74.000 0.000 NA   NA
 932451 932452 syc0020_c syc0021_c     FALSE 0.019 1618.000 0.000 NA   NA
 932455 932456 syc0023_d syc0024_d   ppk FALSE 0.445 39.000 0.000 NA   NA
 932457 932458 syc0025_c syc0026_c     FALSE 0.306 58.000 0.000 NA   NA
 932458 932459 syc0026_c syc0027_c   pacS TRUE 0.911 34.000 0.196 NA   NA
 932460 932461 syc0028_d syc0029_d     FALSE 0.020 467.000 0.000 1.000 N NA
 932461 932462 syc0029_d syc0030_d     FALSE 0.247 69.000 0.000 1.000 N NA
 932462 932463 syc0030_d syc0031_d     FALSE 0.157 101.000 0.000 1.000   NA
 932463 932464 syc0031_d syc0032_d   malQ TRUE 0.934 13.000 0.069 1.000   NA
 932464 932465 syc0032_d syc0033_d malQ   FALSE 0.374 43.000 0.000 1.000 N NA
 932466 932467 syc0034_c syc0035_c argS tatC FALSE 0.051 157.000 0.000 NA N NA
 932473 932474 syc0041_c syc0042_c     FALSE 0.427 41.000 0.000 NA   NA
 932476 932477 syc0044_c syc0045_c     FALSE 0.051 191.000 0.000 NA   NA
 932477 932478 syc0045_c syc0046_c   pmbA FALSE 0.070 147.000 0.000 NA   NA
 932478 932479 syc0046_c syc0047_c pmbA   TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 932479 932480 syc0047_c syc0048_c   nbp1 TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 932481 932482 syc0049_d syc0050_d     TRUE 0.959 22.000 0.465 1.000   NA
 932482 932483 syc0050_d syc0051_d     TRUE 0.985 15.000 0.659 0.043   NA
 932483 932484 syc0051_d syc0052_d   accA TRUE 0.924 10.000 0.033 1.000   NA
 932484 932485 syc0052_d syc0053_d accA acdS FALSE 0.359 118.000 0.033 1.000   NA
 932485 932486 syc0053_d syc0054_d acdS folE TRUE 0.886 49.000 0.391 1.000   NA
 932486 932487 syc0054_d syc0055_d folE   TRUE 0.769 8.000 0.000 1.000   NA
 932487 932488 syc0055_d syc0056_d     TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000   NA
 932488 932489 syc0056_d syc0057_d     TRUE 0.973 6.000 0.212 1.000   NA
 932491 932492 syc0059_d syc0060_d   ampC FALSE 0.050 277.000 0.005 1.000 N NA
 932492 932493 syc0060_d syc0061_d ampC   TRUE 0.729 10.000 0.000 NA   NA
 932497 932498 syc0065_d syc0066_d manC   FALSE 0.108 112.000 0.000 1.000 N NA
 932499 932500 syc0067_c syc0068_c pntB pntA TRUE 0.986 -3.000 0.090 0.002   NA
 932500 932501 syc0068_c syc0069_c pntA pntA TRUE 0.994 -3.000 0.829 0.002   NA
 932502 932503 syc0070_d syc0071_d   rpl34 TRUE 0.673 48.000 0.027 NA   NA
 932503 932504 syc0071_d syc0072_d rpl34 rnpA TRUE 0.983 6.000 0.787 1.000   NA
 932504 932505 syc0072_d syc0073_d rnpA   TRUE 0.920 -13.000 0.041 NA   NA
 932505 932506 syc0073_d syc0074_d   yidC FALSE 0.198 203.000 0.043 NA   NA
 932506 932507 syc0074_d syc0075_d yidC   TRUE 0.975 -3.000 0.254 1.000   NA
 932507 932508 syc0075_d syc0076_d     TRUE 0.800 3.000 0.000 1.000   NA
 932508 932509 syc0076_d syc0077_d     TRUE 0.711 11.000 0.000 NA   NA
 932509 932510 syc0077_d syc0078_d   ycf46 TRUE 0.853 -3.000 0.007 NA   NA
 932512 932513 syc0080_d syc0081_d     FALSE 0.251 73.000 0.000 NA   NA
 932514 932515 syc0082_c syc0083_c ribC   TRUE 0.657 -21.000 0.000 1.000 N NA
 932515 932516 syc0083_c syc0084_c     FALSE 0.070 147.000 0.000 NA   NA
 932516 932517 syc0084_c syc0085_c     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 932517 932518 syc0085_c syc0086_c     TRUE 0.719 -9.000 0.000 NA   NA
 932519 932520 syc0087_d syc0088_d     FALSE 0.147 100.000 0.000 NA   NA
 932520 932521 syc0088_d syc0089_d   petJ FALSE 0.041 221.000 0.000 NA   NA
 932521 932522 syc0089_d syc0090_d petJ   TRUE 0.801 1.000 0.000 1.000   NA
 932522 932523 syc0090_d syc0091_d     FALSE 0.472 95.000 0.000 0.026   NA
 932523 932524 syc0091_d syc0092_d     FALSE 0.021 597.000 0.000 NA   NA
 932525 932526 syc0093_c syc0094_c     FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 932527 932528 syc0095_d syc0096_d     FALSE 0.152 470.000 0.121 NA N NA
 932528 932529 syc0096_d syc0097_d     FALSE 0.085 131.000 0.000 NA   NA
 932529 932530 syc0097_d syc0098_d     FALSE 0.304 109.000 0.023 NA   NA
 932530 932531 syc0098_d syc0099_d     FALSE 0.288 64.000 0.000 NA   NA
 932532 932533 syc0100_c syc0101_c plsC   TRUE 0.902 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 932533 932534 syc0101_c syc0102_c   fabH TRUE 0.902 54.000 0.019 0.006 Y NA
 932534 932535 syc0102_c syc0103_c fabH plsX TRUE 0.959 70.000 0.380 0.006 Y NA
 932535 932536 syc0103_c syc0104_c plsX   FALSE 0.574 64.000 0.026 1.000 N NA
 932538 932539 syc0106_c syc0107_c   pstB FALSE 0.406 43.000 0.000 NA   NA
 932541 932542 syc0109_c syc0110_c nadA icfA FALSE 0.445 36.000 0.000 1.000 N NA
 932543 932544 syc0111_d syc0112_d     FALSE 0.129 106.000 0.000 NA   NA
 932545 932546 syc0113_c sycRNA002_c     FALSE 0.037 242.000 0.000 NA   NA
 932546 932547 sycRNA002_c syc0114_c     FALSE 0.261 71.000 0.000 NA   NA
 932548 932549 syc0115_d syc0116_d   thrB FALSE 0.198 81.000 0.000 1.000 N NA
 932549 932550 syc0116_d syc0117_d thrB ndhD FALSE 0.064 143.000 0.000 1.000 N NA
 932550 932551 syc0117_d syc0118_d ndhD pmgA FALSE 0.061 139.000 0.000 NA N NA
 932551 932552 syc0118_d syc0119_d pmgA pmgA FALSE 0.089 129.000 0.000 NA   NA
 932552 932553 syc0119_d syc0120_d pmgA   FALSE 0.029 325.000 0.000 NA   NA
 932553 932554 syc0120_d syc0121_d   menD FALSE 0.478 36.000 0.000 NA   NA
 932554 932555 syc0121_d syc0122_d menD   FALSE 0.103 121.000 0.000 NA   NA
 932559 932560 syc0126_d syc0127_d     FALSE 0.354 49.000 0.000 NA   NA
 932561 932562 sycRNA003_c syc0128_c ssaA purK TRUE 0.606 22.000 0.000 NA   NA
 932562 932563 syc0128_c syc0129_c purK rbcS FALSE 0.125 102.000 0.000 1.000 N NA
 932563 932564 syc0129_c syc0130_c rbcS rbcL FALSE 0.561 91.000 0.000 0.002 N NA
 932564 932565 syc0130_c syc0131_c rbcL ccmO FALSE 0.020 391.000 0.000 NA N NA
 932565 932566 syc0131_c syc0132_c ccmO ccmN TRUE 0.662 42.000 0.020 NA   NA
 932566 932567 syc0132_c syc0133_c ccmN ccmM TRUE 0.926 36.000 0.040 0.006   NA
 932567 932568 syc0133_c syc0134_c ccmM ccmL TRUE 0.833 66.000 0.333 NA   NA
 932568 932569 syc0134_c syc0135_c ccmL ccmK FALSE 0.244 147.000 0.000 NA Y NA
 932569 932570 syc0135_c syc0136_c ccmK chlN FALSE 0.113 330.000 0.000 NA Y NA
 932570 932571 syc0136_c syc0137_c chlN chlL TRUE 0.853 64.000 0.039 0.002 N NA
 932571 932572 syc0137_c syc0138_c chlL   FALSE 0.021 602.000 0.000 NA   NA
 932572 932573 syc0138_c syc0139_c   topA TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 932574 932575 syc0140_d syc0141_d ndhB   TRUE 0.620 96.000 0.134 1.000 N NA
 932577 932578 syc0143_d syc0144_d     TRUE 0.943 10.000 0.063 NA   NA
 932578 932579 syc0144_d syc0145_d   leuA FALSE 0.201 80.000 0.000 1.000 N NA
 932580 932581 syc0146_c syc0147_c     FALSE 0.028 292.000 0.000 1.000 N NA
 932581 932582 syc0147_c syc0148_c   futB FALSE 0.034 232.000 0.000 1.000 N NA
 932585 932586 syc0151_d syc0152_d     FALSE 0.096 130.000 0.000 1.000   NA
 932588 932589 syc0154_d syc0155_d     FALSE 0.127 351.000 0.000 0.013   NA
 932589 932590 syc0155_d syc0156_d     TRUE 0.622 -67.000 0.000 1.000 N NA
 932590 932591 syc0156_d syc0157_d     TRUE 0.979 18.000 0.500 0.092 N NA
 932594 932595 syc0160_c syc0161_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 932595 932596 syc0161_c syc0162_c     FALSE 0.099 128.000 0.000 1.000   NA
 932599 932600 syc0165_d syc0166_d   psbAII FALSE 0.154 102.000 0.000 1.000   NA
 932601 932602 syc0167_c syc0168_c     TRUE 0.709 -21.000 0.000 1.000   NA
 932603 932604 syc0169_d syc0170_d     FALSE 0.191 88.000 0.000 NA   NA
 932607 932608 syc0173_c syc0174_c     FALSE 0.019 963.000 0.000 NA   NA
 932608 932609 syc0174_c syc0175_c     TRUE 0.749 8.000 0.000 NA   NA
 932609 932610 syc0175_c syc0176_c     FALSE 0.234 82.000 0.000 1.000   NA
 932610 932611 syc0176_c syc0177_c   accC FALSE 0.374 43.000 0.000 1.000 N NA
 932612 932613 sycRNA004_d syc0178_d     FALSE 0.261 71.000 0.000 NA   NA
 932615 932616 syc0180_d syc0181_d     FALSE 0.048 200.000 0.000 NA   NA
 932616 932617 syc0181_d syc0182_d   rluA FALSE 0.214 71.000 0.000 NA N NA
 932617 932618 syc0182_d syc0183_d rluA   FALSE 0.024 301.000 0.000 NA N NA
 932621 932622 syc0186_c syc0187_c recR   FALSE 0.036 246.000 0.000 NA   NA
 932622 932623 syc0187_c syc0188_c     FALSE 0.557 28.000 0.000 NA   NA
 932624 932625 syc0189_d syc0190_d menA   FALSE 0.058 142.000 0.000 NA N NA
 932626 932627 syc0191_c syc0192_c     FALSE 0.022 530.000 0.000 NA   NA
 932627 932628 syc0192_c syc0193_c     FALSE 0.208 84.000 0.000 NA   NA
 932628 932629 syc0193_c syc0194_c     TRUE 0.929 33.000 0.333 NA   NA
 932630 932631 syc0195_d syc0196_d     FALSE 0.028 416.000 0.000 1.000   NA
 932631 932632 syc0196_d syc0197_d     FALSE 0.033 317.000 0.000 1.000   NA
 932632 932633 syc0197_d syc0198_d   phy TRUE 0.949 16.000 0.000 0.050 Y NA
 932633 932634 syc0198_d syc0199_d phy   TRUE 0.992 -3.000 0.143 0.020 Y NA
 932634 932635 syc0199_d syc0200_d     TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 932636 932637 syc0201_c syc0202_c     FALSE 0.022 507.000 0.000 NA   NA
 932637 932638 syc0202_c syc0203_c     FALSE 0.036 250.000 0.000 NA   NA
 932639 932640 syc0204_d syc0205_d     FALSE 0.029 333.000 0.000 NA   NA
 932640 932641 syc0205_d syc0206_d   ldhA FALSE 0.028 353.000 0.000 NA   NA
 932642 932643 syc0207_c syc0208_c ndhE ndhG TRUE 0.992 19.000 0.506 0.005 Y NA
 932643 932644 syc0208_c syc0209_c ndhG ndhI TRUE 0.994 4.000 0.192 0.014 Y NA
 932644 932645 syc0209_c syc0210_c ndhI ndhA TRUE 0.973 43.000 0.242 0.014 Y NA
 932645 932646 syc0210_c syc0211_c ndhA   FALSE 0.039 215.000 0.000 1.000 N NA
 932646 932647 syc0211_c syc0212_c     FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 932648 932649 syc0213_d syc0214_d     TRUE 0.784 88.000 0.511 NA   NA
 932649 932650 syc0214_d syc0215_d     TRUE 0.832 65.000 0.321 NA   NA
 932651 932652 syc0216_c syc0217_c     FALSE 0.293 62.000 0.000 NA   NA
 932652 932653 syc0217_c syc0218_c     TRUE 0.727 -7.000 0.000 NA   NA
 932653 932654 syc0218_c syc0219_c     FALSE 0.032 290.000 0.000 NA   NA
 932654 932655 syc0219_c syc0220_c   trpE TRUE 0.986 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 932655 932656 syc0220_c syc0221_c trpE   TRUE 0.940 -3.000 0.037 1.000   NA
 932656 932657 syc0221_c syc0222_c     TRUE 0.978 0.000 0.270 1.000   NA
 932657 932658 syc0222_c syc0223_c     TRUE 0.789 5.000 0.000 1.000   NA
 932658 932659 syc0223_c syc0224_c     FALSE 0.048 215.000 0.000 1.000   NA
 932659 932660 syc0224_c syc0225_c     TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 932660 932661 syc0225_c syc0226_c     FALSE 0.029 320.000 0.000 NA   NA
 932661 932662 syc0226_c syc0227_c     FALSE 0.023 474.000 0.000 NA   NA
 932662 932663 syc0227_c syc0228_c   dnaB FALSE 0.559 81.000 0.000 1.000 Y NA
 932665 932666 syc0230_c syc0231_c fpg psaE FALSE 0.164 238.000 0.040 1.000   NA
 932667 932668 syc0232_d syc0233_d     FALSE 0.110 118.000 0.000 NA   NA
 932669 932670 syc0234_c syc0235_c   mntB FALSE 0.255 66.000 0.000 1.000 N NA
 932670 932671 syc0235_c syc0236_c mntB mntA TRUE 0.990 7.000 0.600 1.000 Y NA
 932672 932673 syc0237_d syc0238_d mntC   FALSE 0.151 94.000 0.000 1.000 N NA
 932673 932674 syc0238_d syc0239_d   ftsH FALSE 0.053 166.000 0.000 1.000 N NA
 932676 932677 syc0241_d syc0242_d     FALSE 0.247 60.000 0.000 NA N NA
 932678 932679 syc0243_c syc0244_c     FALSE 0.236 71.000 0.000 1.000 N NA
 932679 932680 syc0244_c syc0245_c   trpS TRUE 0.905 -3.000 0.024 1.000 N NA
 932680 932681 syc0245_c syc0246_c trpS   FALSE 0.253 67.000 0.000 1.000 N NA
 932682 932683 syc0247_d syc0248_d     FALSE 0.230 78.000 0.000 NA   NA
 932683 932684 syc0248_d syc0249_d     FALSE 0.164 96.000 0.000 NA   NA
 932684 932685 syc0249_d syc0250_d     TRUE 0.729 10.000 0.000 NA   NA
 932686 932687 syc0251_c syc0252_c   recQ FALSE 0.142 97.000 0.000 1.000 N NA
 932687 932688 syc0252_c syc0253_c recQ   FALSE 0.278 58.000 0.000 1.000 N NA
 932690 932691 syc0255_c syc0256_c     FALSE 0.017 788.000 0.000 1.000 N NA
 932691 932692 syc0256_c syc0257_c     FALSE 0.029 317.000 0.000 NA   NA
 932695 932696 syc0260_d syc0261_d pheT dnaG FALSE 0.064 143.000 0.000 1.000 N NA
 932699 932700 syc0264_c syc0265_c pmbA   FALSE 0.030 307.000 0.000 NA   NA
 932700 932701 syc0265_c syc0266_c     FALSE 0.060 166.000 0.000 NA   NA
 932701 932702 syc0266_c syc0267_c   moeA FALSE 0.025 515.000 0.000 1.000   NA
 932703 932704 syc0268_d syc0269_d moaC   TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 932704 932705 syc0269_d syc0270_d     TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 932705 932706 syc0270_d syc0271_d   moaA TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 932706 932707 syc0271_d syc0272_d moaA   FALSE 0.021 644.000 0.000 NA   NA
 932707 932708 syc0272_d syc0273_d     TRUE 0.764 6.000 0.000 NA   NA
 932708 932709 syc0273_d syc0274_d   rpl35 FALSE 0.033 275.000 0.000 NA   NA
 932709 932710 syc0274_d syc0275_d rpl35 rpl20 TRUE 0.980 45.000 0.928 0.024 Y NA
 932710 932711 syc0275_d syc0276_d rpl20 gtrC TRUE 0.807 11.000 0.008 1.000 N NA
 932711 932712 syc0276_d syc0277_d gtrC   FALSE 0.524 31.000 0.000 NA   NA
 932712 932713 syc0277_d syc0278_d   ycf37 FALSE 0.537 30.000 0.000 NA   NA
 932715 932716 syc0280_d syc0281_d     FALSE 0.302 59.000 0.000 NA   NA
 932718 932719 syc0283_d syc0284_d     FALSE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 932719 932720 syc0284_d syc0285_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 932720 932721 syc0285_d syc0286_d     FALSE 0.041 203.000 0.000 1.000 N NA
 932723 932724 syc0288_d syc0289_d     FALSE 0.310 64.000 0.000 1.000   NA
 932724 932725 syc0289_d syc0290_d   tpi FALSE 0.420 44.000 0.000 1.000   NA
 932726 932727 syc0291_c syc0292_c     FALSE 0.566 73.000 0.000 0.089   NA
 932727 932728 syc0292_c syc0293_c     TRUE 0.807 48.000 0.095 NA   NA
 932728 932729 syc0293_c syc0294_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 932729 932730 syc0294_c syc0295_c   gst FALSE 0.308 52.000 0.000 1.000 N NA
 932732 932733 syc0297_c syc0298_c     FALSE 0.016 627.000 0.000 NA N NA
 932733 932734 syc0298_c syc0299_c     FALSE 0.247 69.000 0.000 1.000 N NA
 932735 932736 syc0300_d syc0301_d psaF psaJ TRUE 0.976 26.000 0.455 0.026   NA
 932737 932738 syc0302_c syc0303_c     TRUE 0.968 -10.000 0.278 NA   NA
 932738 932739 syc0303_c syc0304_c     TRUE 0.970 5.000 0.173 NA   NA
 932739 932740 syc0304_c syc0305_c     FALSE 0.024 458.000 0.000 NA   NA
 932740 932741 syc0305_c syc0306_c     FALSE 0.027 371.000 0.000 NA   NA
 932743 932744 syc0308_c syc0309_c ntcB nirB TRUE 0.739 -9.000 0.000 1.000   NA
 932745 932746 syc0310_d syc0311_d nirA nrtA TRUE 0.879 65.000 0.128 NA Y NA
 932746 932747 syc0311_d syc0312_d nrtA nrtB TRUE 0.842 57.000 0.043 NA Y NA
 932747 932748 syc0312_d syc0313_d nrtB nrtC TRUE 0.961 15.000 0.000 0.005 Y NA
 932748 932749 syc0313_d syc0314_d nrtC nrtD TRUE 0.972 10.000 0.000 0.005 Y NA
 932749 932750 syc0314_d syc0315_d nrtD narB FALSE 0.043 198.000 0.000 1.000 N NA
 932752 932753 syc0317_d syc0318_d   petC FALSE 0.031 301.000 0.000 NA   NA
 932753 932754 syc0318_d syc0319_d petC petA TRUE 0.956 46.000 0.881 0.072   NA
 932754 932755 syc0319_d syc0320_d petA   TRUE 0.803 84.000 0.476 1.000   NA
 932755 932756 syc0320_d syc0321_d   cobM TRUE 0.917 -46.000 0.061 1.000 N NA
 932758 932759 syc0323_d sycRNA005_d radC   FALSE 0.419 42.000 0.000 NA   NA
 932761 932762 syc0325_d syc0326_d     TRUE 0.777 89.000 0.455 1.000   NA
 932762 932763 syc0326_d syc0327_d     TRUE 0.993 -16.000 0.769 0.089 Y NA
 932766 932767 syc0330_c syc0331_c rpl27 rpl21 TRUE 0.985 35.000 0.667 0.024 Y NA
 932768 932769 syc0332_d syc0333_d kaiA kaiB TRUE 0.798 90.000 0.732 1.000   NA
 932769 932770 syc0333_d syc0334_d kaiB kaiC TRUE 0.912 50.000 0.927 1.000   NA
 932771 932772 syc0335_c syc0336_c   gpx1 FALSE 0.539 26.000 0.000 1.000 N NA
 932772 932773 syc0336_c syc0337_c gpx1   FALSE 0.085 131.000 0.000 NA   NA
 932774 932775 syc0338_d syc0339_d   mobA TRUE 0.974 5.000 0.227 NA   NA
 932775 932776 syc0339_d syc0340_d mobA   TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 932776 932777 syc0340_d syc0341_d     TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 932777 932778 syc0341_d syc0342_d     FALSE 0.101 122.000 0.000 NA   NA
 932778 932779 syc0342_d syc0343_d     TRUE 0.971 -7.000 0.326 NA   NA
 932780 932781 syc0344_c syc0345_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 932782 932783 syc0346_d syc0347_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 932783 932784 syc0347_d syc0348_d     FALSE 0.191 88.000 0.000 NA   NA
 932784 932785 syc0348_d syc0349_d     TRUE 0.938 4.000 0.000 NA Y NA
 932785 932786 syc0349_d syc0350_d     FALSE 0.416 110.000 0.047 NA   NA
 932786 932787 syc0350_d syc0351_d     TRUE 0.670 -31.000 0.000 NA   NA
 932787 932788 syc0351_d syc0352_d   phdD TRUE 0.767 59.000 0.115 1.000 N NA
 932788 932789 syc0352_d syc0353_d phdD trpC TRUE 0.628 77.000 0.057 1.000 N NA
 932790 932791 syc0354_c syc0355_c     FALSE 0.235 77.000 0.000 NA   NA
 932791 932792 syc0355_c syc0356_c   pdxJ FALSE 0.557 28.000 0.000 NA   NA
 932793 932794 syc0357_d syc0358_d     FALSE 0.230 78.000 0.000 NA   NA
 932796 932797 syc0360_d syc0361_d     FALSE 0.161 91.000 0.000 1.000 N NA
 932798 932799 syc0362_c syc0363_c     FALSE 0.320 118.000 0.028 NA   NA
 932799 932800 syc0363_c syc0364_c   ribD TRUE 0.970 7.000 0.200 NA   NA
 932800 932801 syc0364_c syc0365_c ribD   TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 932801 932802 syc0365_c syc0366_c     FALSE 0.039 232.000 0.000 NA   NA
 932802 932803 syc0366_c syc0367_c     FALSE 0.584 25.000 0.000 NA   NA
 932803 932804 syc0367_c syc0368_c   ndhJ FALSE 0.064 158.000 0.000 NA   NA
 932804 932805 syc0368_c syc0369_c ndhJ ndhK TRUE 0.995 -7.000 0.406 0.004 Y NA
 932805 932806 syc0369_c syc0370_c ndhK ndhC TRUE 0.994 -9.000 0.428 0.004 Y NA
 932807 932808 syc0371_d syc0372_d rub   TRUE 0.941 33.000 0.521 NA   NA
 932808 932809 syc0372_d syc0373_d   psbE TRUE 0.866 65.000 0.625 NA   NA
 932809 932810 syc0373_d syc0374_d psbE psbF TRUE 0.987 22.000 0.837 0.002   NA
 932810 932811 syc0374_d syc0375_d psbF psbL TRUE 0.990 13.000 0.872 0.004   NA
 932811 932812 syc0375_d syc0376_d psbL psbJ TRUE 0.934 77.000 0.878 0.004   NA
 932814 932815 syc0378_d syc0379_d     FALSE 0.471 39.000 0.000 1.000   NA
 932815 932816 syc0379_d syc0380_d     FALSE 0.036 279.000 0.000 1.000   NA
 932816 932817 syc0380_d syc0381_d     TRUE 0.779 -34.000 0.009 1.000 N NA
 932817 932818 syc0381_d syc0382_d   cpmA TRUE 0.894 -7.000 0.022 1.000   NA
 932818 932819 syc0382_d syc0383_d cpmA   TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000   NA
 932822 932823 syc0386_c syc0387_c     FALSE 0.019 925.000 0.000 NA   NA
 932823 932824 syc0387_c syc0388_c     TRUE 0.646 16.000 0.000 NA   NA
 932824 932825 syc0388_c syc0389_c     TRUE 0.966 4.000 0.119 NA   NA
 932825 932826 syc0389_c syc0390_c     FALSE 0.354 49.000 0.000 NA   NA
 932827 932828 syc0391_d syc0392_d     FALSE 0.105 308.000 0.000 0.048 N NA
 932829 932830 syc0393_c syc0394_c     TRUE 0.974 -13.000 0.020 0.039 Y NA
 932830 932831 syc0394_c syc0395_c     FALSE 0.031 302.000 0.000 NA   NA
 932832 932833 syc0396_d syc0397_d     TRUE 0.983 -3.000 0.087 0.014   NA
 932833 932834 syc0397_d syc0398_d     FALSE 0.021 600.000 0.000 NA   NA
 932834 932835 syc0398_d syc0399_d   panC FALSE 0.092 204.000 0.011 NA   NA
 932835 932836 syc0399_d syc0400_d panC   FALSE 0.068 149.000 0.000 NA   NA
 932840 932841 syc0403_d syc0404_d     FALSE 0.151 99.000 0.000 NA   NA
 932841 932842 syc0404_d syc0405_d     TRUE 0.863 46.000 0.220 NA N NA
 932842 932843 syc0405_d sycRNA007_d     FALSE 0.276 68.000 0.000 NA   NA
 932844 932845 syc0406_c syc0407_c     FALSE 0.129 223.000 0.026 NA   NA
 932845 932846 syc0407_c syc0408_c   metS FALSE 0.517 79.000 0.027 NA   NA
 932847 932848 syc0409_d syc0410_d     TRUE 0.945 19.000 0.185 NA   NA
 932848 932849 syc0410_d syc0411_d     FALSE 0.118 114.000 0.000 NA   NA
 932853 932854 syc0415_d syc0416_d     FALSE 0.014 1854.000 0.000 NA N NA
 932854 932855 syc0416_d syc0417_d     TRUE 0.765 42.000 0.000 1.000 Y NA
 932856 932857 syc0418_c syc0419_c     FALSE 0.353 139.000 0.065 1.000   NA
 932857 932858 syc0419_c syc0420_c     FALSE 0.312 57.000 0.000 NA   NA
 932858 932859 syc0420_c syc0421_c     FALSE 0.226 79.000 0.000 NA   NA
 932859 932860 syc0421_c syc0422_c   tldD FALSE 0.022 507.000 0.000 NA   NA
 932862 932863 syc0424_c syc0425_c   rnb FALSE 0.159 97.000 0.000 NA   NA
 932863 932864 syc0425_c syc0426_c rnb rps18 TRUE 0.840 22.000 0.027 1.000 N NA
 932864 932865 syc0426_c syc0427_c rps18 rpl33 TRUE 0.858 56.000 0.002 0.024 Y NA
 932866 932867 syc0428_d syc0429_d     FALSE 0.037 245.000 0.000 NA   NA
 932867 932868 syc0429_d syc0430_d     FALSE 0.021 566.000 0.000 NA   NA
 932868 932869 syc0430_d syc0431_d     TRUE 0.827 30.000 0.000 0.052   NA
 932870 932871 syc0432_c syc0433_c     FALSE 0.046 205.000 0.000 NA   NA
 932872 932873 syc0434_d syc0435_d     TRUE 0.914 -3.000 0.023 1.000   NA
 932873 932874 syc0435_d syc0436_d     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 932874 932875 syc0436_d syc0437_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 932875 932876 syc0437_d syc0438_d     TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 932877 932878 syc0439_c syc0440_c   hisC FALSE 0.055 161.000 0.000 1.000 N NA
 932878 932879 syc0440_c syc0441_c hisC   TRUE 0.921 19.000 0.091 1.000 N NA
 932880 932881 syc0442_d syc0443_d     FALSE 0.075 141.000 0.000 NA   NA
 932881 932882 syc0443_d syc0444_d   mrp FALSE 0.072 144.000 0.000 NA   NA
 932882 932883 syc0444_d syc0445_d mrp rodA TRUE 0.927 32.000 0.041 1.000 Y NA
 932883 932884 syc0445_d syc0446_d rodA   FALSE 0.138 98.000 0.000 1.000 N NA
 932885 932886 syc0447_c syc0448_c     TRUE 0.699 12.000 0.000 NA   NA
 932887 932888 syc0449_d syc0450_d dnaA ubiE FALSE 0.066 141.000 0.000 1.000 N NA
 932888 932889 syc0450_d syc0451_d ubiE   FALSE 0.332 90.000 0.013 NA   NA
 932893 932894 syc0455_d syc0456_d tenA   FALSE 0.062 138.000 0.000 NA N NA
 932894 932895 syc0456_d syc0457_d     TRUE 0.690 -19.000 0.000 NA   NA
 932898 932899 syc0460_c syc0461_c   petE FALSE 0.067 140.000 0.000 1.000 N NA
 932899 932900 syc0461_c syc0462_c petE   TRUE 0.942 29.000 0.404 1.000 N NA
 932900 932901 syc0462_c syc0463_c   hemE TRUE 0.858 22.000 0.032 1.000 N NA
 932901 932902 syc0463_c syc0464_c hemE glgB FALSE 0.564 60.000 0.024 1.000 N NA
 932904 932905 syc0466_c syc0467_c     FALSE 0.028 283.000 0.000 1.000 N NA
 932905 932906 syc0467_c syc0468_c     FALSE 0.083 905.000 0.000 1.000 Y NA
 932906 932907 syc0468_c syc0469_c     TRUE 0.976 7.000 0.000 0.004 Y NA
 932907 932908 syc0469_c syc0470_c   recG FALSE 0.018 630.000 0.000 1.000 N NA
 932908 932909 syc0470_c syc0471_c recG   TRUE 0.913 10.000 0.029 NA   NA
 932909 932910 syc0471_c syc0472_c     FALSE 0.117 115.000 0.000 NA   NA
 932911 932912 syc0473_d syc0474_d sis   FALSE 0.069 148.000 0.000 NA   NA
 932912 932913 syc0474_d syc0475_d     FALSE 0.213 83.000 0.000 NA   NA
 932915 932916 syc0477_d syc0478_d cobO   FALSE 0.096 124.000 0.000 NA   NA
 932916 932917 syc0478_d syc0479_d     FALSE 0.152 296.000 0.054 NA   NA
 932917 932918 syc0479_d syc0480_d     TRUE 0.710 -12.000 0.000 NA   NA
 932919 932920 syc0481_c syc0482_c pdhC   FALSE 0.049 196.000 0.000 NA   NA
 932920 932921 syc0482_c syc0483_c     FALSE 0.036 250.000 0.000 NA   NA
 932921 932922 syc0483_c syc0484_c     TRUE 0.992 -3.000 0.054 0.001 Y NA
 932922 932923 syc0484_c syc0485_c     FALSE 0.034 265.000 0.000 NA   NA
 932923 932924 syc0485_c syc0486_c     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 932924 932925 syc0486_c syc0487_c     TRUE 0.729 10.000 0.000 NA   NA
 932925 932926 syc0487_c syc0488_c     FALSE 0.039 226.000 0.000 NA   NA
 932926 932927 syc0488_c syc0489_c     FALSE 0.050 192.000 0.000 NA   NA
 932927 932928 syc0489_c syc0490_c   ycf40 FALSE 0.415 113.000 0.048 NA   NA
 932928 932929 syc0490_c syc0491_c ycf40 thiE TRUE 0.976 18.000 0.219 1.000 Y NA
 932929 932930 syc0491_c syc0492_c thiE   FALSE 0.471 39.000 0.000 1.000   NA
 932930 932931 syc0492_c syc0493_c   cpcF FALSE 0.592 27.000 0.000 1.000   NA
 932931 932932 syc0493_c syc0494_c cpcF cpcE TRUE 0.987 7.000 0.231 0.024   NA
 932932 932933 syc0494_c syc0495_c cpcE cpcA FALSE 0.196 91.000 0.000 1.000   NA
 932933 932934 syc0495_c syc0496_c cpcA cpcB TRUE 0.739 52.000 0.000 0.005   NA
 932934 932935 syc0496_c syc0497_c cpcB cpcD FALSE 0.109 510.000 0.000 0.008   NA
 932935 932936 syc0497_c syc0498_c cpcD cpcC FALSE 0.532 92.000 0.000 0.008   NA
 932936 932937 syc0498_c syc0499_c cpcC cpcC TRUE 0.951 48.000 0.455 0.008   NA
 932937 932938 syc0499_c syc0500_c cpcC cpcA TRUE 0.735 106.000 0.091 0.008   NA
 932938 932939 syc0500_c syc0501_c cpcA cpcB TRUE 0.739 52.000 0.000 0.005   NA
 932939 932940 syc0501_c syc0502_c cpcB   FALSE 0.021 629.000 0.000 NA   NA
 932941 932942 syc0503_d syc0504_d     FALSE 0.198 81.000 0.000 1.000 N NA
 932942 932943 syc0504_d syc0505_d     FALSE 0.097 118.000 0.000 1.000 N NA
 932944 932945 syc0506_c syc0507_c     FALSE 0.027 366.000 0.000 NA   NA
 932947 932948 syc0509_c syc0510_c     TRUE 0.749 10.000 0.000 1.000   NA
 932948 932949 syc0510_c syc0511_c     FALSE 0.419 42.000 0.000 NA   NA
 932951 932952 syc0513_c syc0514_c     TRUE 0.958 4.000 0.075 NA   NA
 932952 932953 syc0514_c syc0515_c     TRUE 0.966 20.000 0.805 NA   NA
 932953 932954 syc0515_c syc0516_c   hisC FALSE 0.023 497.000 0.000 NA   NA
 932954 932955 syc0516_c syc0517_c hisC livE TRUE 0.839 30.000 0.000 1.000 Y NA
 932960 932961 syc0522_d syc0523_d     TRUE 0.620 20.000 0.000 NA   NA
 932961 932962 syc0523_d syc0524_d     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 932963 932964 syc0525_c syc0526_c menE menC TRUE 0.964 -15.000 0.283 1.000 N NA
 932964 932965 syc0526_c syc0527_c menC   TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 932965 932966 syc0527_c syc0528_c     FALSE 0.191 88.000 0.000 NA   NA
 932967 932968 syc0529_d syc0530_d   cheW FALSE 0.035 262.000 0.000 NA   NA
 932968 932969 syc0530_d syc0531_d cheW   TRUE 0.993 16.000 0.762 0.004 Y NA
 932969 932970 syc0531_d syc0532_d     TRUE 0.996 3.000 0.524 0.004 Y NA
 932970 932971 syc0532_d syc0533_d   sphR FALSE 0.194 887.000 0.000 0.013 Y NA
 932971 932972 syc0533_d syc0534_d sphR sphS TRUE 0.957 13.000 0.000 0.047 Y NA
 932972 932973 syc0534_d syc0535_d sphS   TRUE 0.627 15.000 0.000 1.000 N NA
 932973 932974 syc0535_d syc0536_d     FALSE 0.152 234.000 0.036 NA   NA
 932974 932975 syc0536_d syc0537_d   purU FALSE 0.060 165.000 0.000 NA   NA
 932975 932976 syc0537_d syc0538_d purU   FALSE 0.437 37.000 0.000 1.000 N NA
 932977 932978 syc0539_c syc0540_c     FALSE 0.160 100.000 0.000 1.000   NA
 932980 932981 syc0542_c syc0543_c trpE psaD FALSE 0.248 219.000 0.091 1.000   NA
 932982 932983 syc0544_d syc0545_d lysC   FALSE 0.023 481.000 0.000 NA   NA
 932986 932987 syc0548_c syc0549_c   ycf20 TRUE 0.842 50.000 0.189 NA   NA
 932988 932989 syc0550_d syc0551_d     TRUE 0.598 23.000 0.000 NA   NA
 932991 932992 syc0553_d syc0554_d pxcA cobP TRUE 0.749 10.000 0.000 1.000   NA
 932992 932993 syc0554_d syc0555_d cobP   TRUE 0.729 39.000 0.025 NA   NA
 932993 932994 syc0555_d syc0556_d   ycf54 FALSE 0.132 105.000 0.000 NA   NA
 932994 932995 syc0556_d syc0557_d ycf54 fur FALSE 0.040 225.000 0.000 NA   NA
 932996 932997 syc0558_c syc0559_c     FALSE 0.363 44.000 0.000 1.000 N NA
 932997 932998 syc0559_c syc0560_c     TRUE 0.667 -16.000 0.000 1.000 N NA
 932998 932999 syc0560_c syc0561_c   deoC TRUE 0.872 -3.000 0.014 1.000 N NA
 932999 933000 syc0561_c syc0562_c deoC   TRUE 0.620 20.000 0.000 NA   NA
 933001 933002 syc0563_d sycRNA008_d   ssrA FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 933002 933003 sycRNA008_d syc0564_d ssrA   TRUE 0.667 -32.000 0.000 NA   NA
 933003 933004 syc0564_d syc0565_d     FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 933008 933009 syc0569_d syc0570_d   ugd FALSE 0.365 117.000 0.000 1.000 Y NA
 933016 933017 syc0577_c syc0578_c     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 933018 933019 syc0579_d syc0580_d   sun FALSE 0.403 74.000 0.014 1.000 N NA
 933020 933021 syc0581_c syc0582_c     FALSE 0.151 89.000 0.000 NA N NA
 933022 933023 syc0583_d syc0584_d   purN FALSE 0.062 175.000 0.000 1.000   NA
 933024 933025 syc0585_c syc0586_c cobO   TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 933026 933027 syc0587_d syc0588_d     TRUE 0.827 -28.000 0.015 NA   NA
 933027 933028 syc0588_d syc0589_d     FALSE 0.306 58.000 0.000 NA   NA
 933028 933029 syc0589_d syc0590_d     FALSE 0.096 124.000 0.000 NA   NA
 933031 933032 syc0592_d syc0593_d     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.030 Y NA
 933032 933033 syc0593_d syc0594_d     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.030 Y NA
 933033 933034 syc0594_d syc0595_d   ggtA TRUE 0.991 5.000 0.092 0.030 Y NA
 933037 933038 syc0598_c syc0599_c folC argD TRUE 0.968 -3.000 0.181 1.000 N NA
 933039 933040 syc0600_d syc0601_d ftsH   FALSE 0.059 184.000 0.000 1.000   NA
 933040 933041 syc0601_d syc0602_d     FALSE 0.027 425.000 0.000 1.000   NA
 933042 933043 syc0603_c syc0604_c cysC   FALSE 0.207 78.000 0.000 1.000 N NA
 933044 933045 syc0605_d syc0606_d     TRUE 0.822 47.000 0.111 NA   NA
 933045 933046 syc0606_d syc0607_d     TRUE 0.959 5.000 0.083 NA   NA
 933049 933050 syc0610_c syc0611_c lpxB lpxA TRUE 0.981 1.000 0.062 1.000 Y NA
 933050 933051 syc0611_c syc0612_c lpxA fabA TRUE 0.950 7.000 0.071 1.000 N NA
 933051 933052 syc0612_c syc0613_c fabA lpxC TRUE 0.918 19.000 0.083 1.000 N NA
 933052 933053 syc0613_c syc0614_c lpxC   TRUE 0.972 10.000 0.052 1.000 Y NA
 933053 933054 syc0614_c syc0615_c   purC FALSE 0.118 466.000 0.058 1.000 N NA
 933054 933055 syc0615_c syc0616_c purC   FALSE 0.583 28.000 0.000 1.000   NA
 933056 933057 syc0617_d syc0618_d purD nblS FALSE 0.159 172.000 0.025 1.000 N NA
 933057 933058 syc0618_d syc0619_d nblS   FALSE 0.308 52.000 0.000 1.000 N NA
 933058 933059 syc0619_d syc0620_d   gltX TRUE 0.760 0.000 0.000 1.000 N NA
 933059 933060 syc0620_d syc0621_d gltX   TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933060 933061 syc0621_d syc0622_d   psaK FALSE 0.110 118.000 0.000 NA   NA
 933062 933063 syc0623_c syc0624_c   fadD TRUE 0.980 1.000 0.388 NA   NA
 933065 933066 sycRNA009_c sycRNA010_c     TRUE 0.711 11.000 0.000 NA   NA
 933067 933068 syc0626_d syc0627_d   aroQ TRUE 0.969 11.000 0.333 NA   NA
 933068 933069 syc0627_d syc0628_d aroQ   TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 933069 933070 syc0628_d syc0629_d     TRUE 0.943 0.000 0.034 1.000   NA
 933071 933072 syc0630_c syc0631_c dnaX   FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 933072 933073 syc0631_c syc0632_c     TRUE 0.729 10.000 0.000 NA   NA
 933073 933074 syc0632_c syc0633_c   ycf57 FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 933074 933075 syc0633_c syc0634_c ycf57   FALSE 0.069 148.000 0.000 NA   NA
 933075 933076 syc0634_c syc0635_c     FALSE 0.243 75.000 0.000 NA   NA
 933076 933077 syc0635_c syc0636_c     FALSE 0.019 1606.000 0.000 NA   NA
 933078 933079 syc0637_d syc0638_d acnB   FALSE 0.315 62.000 0.000 1.000   NA
 933081 933082 syc0640_d syc0641_d     FALSE 0.071 145.000 0.000 NA   NA
 933083 933084 sycRNA011_c syc0642_c     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 933084 933085 syc0642_c syc0643_c   minE TRUE 0.714 -3.000 0.000 NA N NA
 933085 933086 syc0643_c syc0644_c minE minD TRUE 0.981 15.000 0.347 NA Y NA
 933087 933088 syc0645_d syc0646_d   aroK FALSE 0.298 68.000 0.000 1.000   NA
 933091 933092 syc0649_c syc0650_c   glsF FALSE 0.027 378.000 0.000 NA   NA
 933093 933094 syc0651_d syc0652_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933094 933095 syc0652_d syc0653_d   rps12 FALSE 0.058 156.000 0.000 1.000 N NA
 933095 933096 syc0653_d syc0654_d rps12 rps7 TRUE 0.829 168.000 0.620 0.004 Y NA
 933096 933097 syc0654_d syc0655_d rps7 fus TRUE 0.914 75.000 0.579 1.000 Y NA
 933097 933098 syc0655_d syc0656_d fus tufA TRUE 0.990 27.000 0.400 0.002 Y NA
 933098 933099 syc0656_d syc0657_d tufA rps10 TRUE 0.897 74.000 0.318 1.000 Y NA
 933099 933100 syc0657_d syc0658_d rps10 lon FALSE 0.140 210.000 0.025 1.000   NA
 933103 933104 syc0661_c syc0662_c rnhB rne TRUE 0.959 -16.000 0.033 0.023 N NA
 933104 933105 syc0662_c syc0663_c rne   FALSE 0.024 350.000 0.000 1.000 N NA
 933105 933106 syc0663_c syc0664_c   alaS FALSE 0.044 192.000 0.000 1.000 N NA
 933107 933108 syc0665_d syc0666_d     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 933108 933109 syc0666_d syc0667_d     FALSE 0.050 194.000 0.000 NA   NA
 933111 933112 syc0669_d syc0670_d     TRUE 0.970 -7.000 0.300 NA   NA
 933113 933114 syc0671_c syc0672_c     TRUE 0.743 9.000 0.000 NA   NA
 933114 933115 syc0672_c syc0673_c     TRUE 0.983 1.000 0.591 NA   NA
 933115 933116 syc0673_c syc0674_c     FALSE 0.091 127.000 0.000 NA   NA
 933116 933117 syc0674_c syc0675_c     FALSE 0.291 63.000 0.000 NA   NA
 933117 933118 syc0675_c syc0676_c     FALSE 0.494 73.000 0.021 NA   NA
 933118 933119 syc0676_c syc0677_c     FALSE 0.346 187.000 0.177 NA   NA
 933119 933120 syc0677_c syc0678_c     TRUE 0.853 54.000 0.274 NA   NA
 933122 933123 syc0680_c syc0681_c     TRUE 0.970 11.000 0.000 0.004 Y NA
 933123 933124 syc0681_c syc0682_c   pixJ TRUE 0.994 9.000 0.231 0.004 Y NA
 933124 933125 syc0682_c syc0683_c pixJ   TRUE 0.958 72.000 0.385 0.004 Y NA
 933125 933126 syc0683_c syc0684_c     TRUE 0.880 20.000 0.000 1.000 Y NA
 933126 933127 syc0684_c syc0685_c   pixG TRUE 0.883 45.000 0.000 0.013 Y NA
 933127 933128 syc0685_c syc0686_c pixG   FALSE 0.017 1000.000 0.000 1.000 N NA
 933128 933129 syc0686_c syc0687_c   aspB FALSE 0.080 128.000 0.000 1.000 N NA
 933129 933130 syc0687_c syc0688_c aspB   TRUE 0.647 -13.000 0.000 NA N NA
 933130 933131 syc0688_c syc0689_c   purM FALSE 0.053 149.000 0.000 NA N NA
 933132 933133 syc0690_d syc0691_d     FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 933133 933134 syc0691_d syc0692_d   uvrA FALSE 0.023 475.000 0.000 NA   NA
 933134 933135 syc0692_d syc0693_d uvrA pilT3 FALSE 0.120 104.000 0.000 1.000 N NA
 933135 933136 syc0693_d syc0694_d pilT3   FALSE 0.412 39.000 0.000 1.000 N NA
 933138 933139 syc0696_d syc0697_d     FALSE 0.357 164.000 0.130 NA   NA
 933139 933140 syc0697_d syc0698_d   gor FALSE 0.151 99.000 0.000 NA   NA
 933142 933143 syc0700_d syc0701_d   merR TRUE 0.940 37.000 0.791 NA   NA
 933143 933144 syc0701_d syc0702_d merR   TRUE 0.979 -7.000 0.660 1.000   NA
 933144 933145 syc0702_d syc0703_d     TRUE 0.972 31.000 0.623 0.056   NA
 933145 933146 syc0703_d syc0704_d     TRUE 0.985 -3.000 0.944 1.000   NA
 933147 933148 syc0705_c syc0706_c ruvB   FALSE 0.025 426.000 0.000 NA   NA
 933148 933149 syc0706_c syc0707_c     FALSE 0.025 401.000 0.000 NA   NA
 933150 933151 syc0708_d syc0709_d     FALSE 0.026 395.000 0.000 NA   NA
 933153 933154 syc0711_d syc0712_d   cobW FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 933157 933158 syc0715_c syc0716_c     TRUE 0.680 -25.000 0.000 NA   NA
 933158 933159 syc0716_c syc0717_c   appB FALSE 0.216 82.000 0.000 NA   NA
 933159 933160 syc0717_c syc0718_c appB ddpA TRUE 0.992 -13.000 0.267 0.029 Y NA
 933160 933161 syc0718_c syc0719_c ddpA   FALSE 0.216 82.000 0.000 NA   NA
 933161 933162 syc0719_c syc0720_c   purL FALSE 0.120 113.000 0.000 NA   NA
 933162 933163 syc0720_c syc0721_c purL   TRUE 0.996 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 933164 933165 syc0722_d syc0723_d     FALSE 0.207 78.000 0.000 1.000 N NA
 933166 933167 syc0724_c syc0725_c livF   TRUE 0.959 7.000 0.114 1.000 N NA
 933167 933168 syc0725_c syc0726_c   hisZ TRUE 0.757 33.000 0.024 1.000 N NA
 933168 933169 syc0726_c syc0727_c hisZ   TRUE 0.678 26.000 0.006 1.000 N NA
 933169 933170 syc0727_c syc0728_c     FALSE 0.083 125.000 0.000 1.000 N NA
 933170 933171 syc0728_c syc0729_c     FALSE 0.020 387.000 0.000 NA N NA
 933173 933174 syc0731_c syc0732_c     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 933174 933175 syc0732_c syc0733_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933175 933176 syc0733_c syc0734_c   pdxA TRUE 0.801 0.000 0.000 1.000   NA
 933178 933179 syc0736_c syc0737_c   sodB FALSE 0.022 540.000 0.000 NA   NA
 933180 933181 syc0738_d syc0739_d     FALSE 0.282 71.000 0.000 1.000   NA
 933181 933182 syc0739_d syc0740_d   ruvC TRUE 0.619 -276.000 0.000 1.000 N NA
 933184 933185 syc0742_d syc0743_d     FALSE 0.047 203.000 0.000 NA   NA
 933185 933186 syc0743_d syc0744_d     FALSE 0.403 199.000 0.057 NA Y NA
 933186 933187 syc0744_d syc0745_d     FALSE 0.062 162.000 0.000 NA   NA
 933187 933188 syc0745_d syc0746_d   pcnB FALSE 0.594 24.000 0.000 NA   NA
 933188 933189 syc0746_d syc0747_d pcnB rbp3 FALSE 0.275 263.000 0.191 1.000   NA
 933189 933190 syc0747_d syc0748_d rbp3   FALSE 0.117 115.000 0.000 NA   NA
 933190 933191 syc0748_d syc0749_d   gst1 FALSE 0.164 96.000 0.000 NA   NA
 933192 933193 syc0750_c syc0751_c phoA   FALSE 0.284 65.000 0.000 NA   NA
 933193 933194 syc0751_c syc0752_c   pbpA FALSE 0.122 111.000 0.000 NA   NA
 933194 933195 syc0752_c syc0753_c pbpA   FALSE 0.213 83.000 0.000 NA   NA
 933196 933197 syc0754_d syc0755_d hisG   TRUE 0.727 33.000 0.021 1.000 N NA
 933197 933198 syc0755_d syc0756_d   ppsA FALSE 0.033 240.000 0.000 1.000 N NA
 933198 933199 syc0756_d syc0757_d ppsA   TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 933201 933202 syc0759_d syc0760_d folD crtE TRUE 0.945 43.000 0.250 1.000 Y NA
 933202 933203 syc0760_d syc0761_d crtE   TRUE 0.976 0.000 0.214 1.000   NA
 933205 933206 syc0763_d syc0764_d ycf52   TRUE 0.658 15.000 0.000 NA   NA
 933206 933207 syc0764_d syc0765_d     FALSE 0.087 130.000 0.000 NA   NA
 933208 933209 syc0766_c syc0767_c     TRUE 0.784 1.000 0.000 NA   NA
 933209 933210 syc0767_c syc0768_c     FALSE 0.445 39.000 0.000 NA   NA
 933210 933211 syc0768_c syc0769_c     FALSE 0.022 543.000 0.000 NA   NA
 933211 933212 syc0769_c syc0770_c     FALSE 0.044 214.000 0.000 NA   NA
 933213 933214 syc0771_d syc0772_d     TRUE 0.913 -31.000 0.000 0.010   NA
 933214 933215 syc0772_d syc0773_d     FALSE 0.024 428.000 0.000 NA   NA
 933215 933216 syc0773_d syc0774_d     FALSE 0.022 503.000 0.000 NA   NA
 933217 933218 syc0775_c syc0776_c     FALSE 0.059 167.000 0.000 NA   NA
 933218 933219 syc0776_c syc0777_c     FALSE 0.019 1704.000 0.000 NA   NA
 933219 933220 syc0777_c syc0778_c     FALSE 0.026 397.000 0.000 NA   NA
 933220 933221 syc0778_c syc0779_c     FALSE 0.034 270.000 0.000 NA   NA
 933221 933222 syc0779_c syc0780_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933222 933223 syc0780_c syc0781_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933223 933224 syc0781_c syc0782_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933224 933225 syc0782_c syc0783_c     FALSE 0.025 418.000 0.000 NA   NA
 933225 933226 syc0783_c syc0784_c     TRUE 0.966 -3.000 0.133 NA   NA
 933226 933227 syc0784_c syc0785_c     FALSE 0.126 108.000 0.000 NA   NA
 933227 933228 syc0785_c syc0786_c     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 933228 933229 syc0786_c syc0787_c     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 933229 933230 syc0787_c syc0788_c     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 933230 933231 syc0788_c syc0789_c     TRUE 0.978 4.000 0.333 NA   NA
 933231 933232 syc0789_c syc0790_c     TRUE 0.694 99.000 0.333 NA   NA
 933232 933233 syc0790_c syc0791_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933233 933234 syc0791_c syc0792_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933234 933235 syc0792_c syc0793_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933235 933236 syc0793_c syc0794_c     FALSE 0.020 891.000 0.000 NA   NA
 933236 933237 syc0794_c syc0795_c     TRUE 0.676 -28.000 0.000 NA   NA
 933237 933238 syc0795_c syc0796_c     TRUE 0.764 6.000 0.000 NA   NA
 933238 933239 syc0796_c syc0797_c     FALSE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 933239 933240 syc0797_c syc0798_c     TRUE 0.946 23.000 0.267 NA   NA
 933240 933241 syc0798_c syc0799_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933241 933242 syc0799_c syc0800_c     FALSE 0.090 128.000 0.000 NA   NA
 933242 933243 syc0800_c syc0801_c     FALSE 0.030 309.000 0.000 NA   NA
 933243 933244 syc0801_c syc0802_c     FALSE 0.044 215.000 0.000 NA   NA
 933244 933245 syc0802_c syc0803_c     FALSE 0.584 25.000 0.000 NA   NA
 933245 933246 syc0803_c syc0804_c     FALSE 0.034 270.000 0.000 NA   NA
 933246 933247 syc0804_c syc0805_c     TRUE 0.696 -16.000 0.000 NA   NA
 933247 933248 syc0805_c syc0806_c     TRUE 0.948 -7.000 0.080 NA   NA
 933248 933249 syc0806_c syc0807_c     FALSE 0.042 219.000 0.000 NA   NA
 933250 933251 syc0808_d syc0809_d     FALSE 0.031 296.000 0.000 NA   NA
 933251 933252 syc0809_d syc0810_d     FALSE 0.022 554.000 0.000 NA   NA
 933252 933253 syc0810_d syc0811_d     FALSE 0.042 220.000 0.000 NA   NA
 933253 933254 syc0811_d syc0812_d     TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000   NA
 933254 933255 syc0812_d syc0813_d   dcd FALSE 0.592 27.000 0.000 1.000   NA
 933256 933257 syc0814_c sycRNA012_c     FALSE 0.050 194.000 0.000 NA   NA
 933257 933258 sycRNA012_c syc0815_c   murZ FALSE 0.373 47.000 0.000 NA   NA
 933259 933260 sycRNA013_d syc0816_d   amiA FALSE 0.064 159.000 0.000 NA   NA
 933260 933261 syc0816_d syc0817_d amiA   FALSE 0.236 71.000 0.000 1.000 N NA
 933261 933262 syc0817_d syc0818_d     FALSE 0.359 100.000 0.026 1.000 N NA
 933265 933266 syc0821_c syc0822_c     FALSE 0.337 52.000 0.000 NA   NA
 933267 933268 syc0823_d syc0824_d ldcC cobL TRUE 0.948 -19.000 0.130 1.000 N NA
 933269 933270 syc0825_c syc0826_c   act TRUE 0.704 -13.000 0.000 NA   NA
 933270 933271 syc0826_c syc0827_c act smf FALSE 0.533 33.000 0.000 1.000   NA
 933271 933272 syc0827_c syc0828_c smf   TRUE 0.658 15.000 0.000 NA   NA
 933272 933273 syc0828_c syc0829_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933275 933276 syc0831_c syc0832_c psbM   TRUE 0.612 100.000 0.139 1.000   NA
 933277 933278 syc0833_d syc0834_d psbB psbT TRUE 0.906 77.000 0.651 0.080   NA
 933278 933279 syc0834_d syc0835_d psbT   FALSE 0.151 210.000 0.028 NA   NA
 933279 933280 syc0835_d syc0836_d   rps1 FALSE 0.102 278.000 0.025 NA   NA
 933280 933281 syc0836_d syc0837_d rps1   FALSE 0.575 101.000 0.112 1.000   NA
 933281 933282 syc0837_d syc0838_d     FALSE 0.293 62.000 0.000 NA   NA
 933282 933283 syc0838_d syc0839_d     FALSE 0.023 476.000 0.000 NA   NA
 933283 933284 syc0839_d syc0840_d     FALSE 0.258 414.000 0.378 NA   NA
 933285 933286 syc0841_c syc0842_c     TRUE 0.680 -25.000 0.000 NA   NA
 933286 933287 syc0842_c syc0843_c     TRUE 0.714 -10.000 0.000 NA   NA
 933287 933288 syc0843_c syc0844_c   groEL2 FALSE 0.021 430.000 0.000 1.000 N NA
 933288 933289 syc0844_c syc0845_c groEL2 fabG FALSE 0.452 107.000 0.059 1.000 N NA
 933289 933290 syc0845_c syc0846_c fabG   TRUE 0.796 58.000 0.156 1.000 N NA
 933290 933291 syc0846_c syc0847_c     FALSE 0.437 37.000 0.000 1.000 N NA
 933293 933294 syc0849_c syc0850_c   rbp1 FALSE 0.039 226.000 0.000 NA   NA
 933294 933295 syc0850_c sycRNA014_c rbp1   FALSE 0.033 273.000 0.000 NA   NA
 933295 933296 sycRNA014_c syc0851_c   rnd FALSE 0.445 39.000 0.000 NA   NA
 933300 933301 syc0855_c syc0856_c hemF mutT FALSE 0.025 341.000 0.000 1.000 N NA
 933301 933302 syc0856_c syc0857_c mutT rpoD3 TRUE 0.836 0.000 0.002 1.000 N NA
 933302 933303 syc0857_c syc0858_c rpoD3   FALSE 0.043 216.000 0.000 NA   NA
 933303 933304 syc0858_c syc0859_c   pyrB TRUE 0.646 16.000 0.000 NA   NA
 933304 933305 syc0859_c syc0860_c pyrB mpg TRUE 0.885 -3.000 0.019 1.000 N NA
 933305 933306 syc0860_c syc0861_c mpg   FALSE 0.039 229.000 0.000 NA   NA
 933306 933307 syc0861_c syc0862_c     FALSE 0.040 224.000 0.000 NA   NA
 933309 933310 syc0864_c syc0865_c   cya2 TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 933310 933311 syc0865_c syc0866_c cya2   FALSE 0.104 120.000 0.000 NA   NA
 933311 933312 syc0866_c syc0867_c     FALSE 0.298 60.000 0.000 NA   NA
 933312 933313 syc0867_c syc0868_c   tyrA TRUE 0.656 -61.000 0.000 NA   NA
 933314 933315 syc0869_d syc0870_d     TRUE 0.630 84.000 0.072 NA   NA
 933315 933316 syc0870_d syc0871_d     FALSE 0.057 170.000 0.000 NA   NA
 933317 933318 syc0872_c syc0873_c psbC psbDI TRUE 0.991 -16.000 0.878 0.004   NA
 933319 933320 syc0874_d syc0875_d ycf4 ppiB TRUE 0.976 2.000 0.220 1.000   NA
 933320 933321 syc0875_d syc0876_d ppiB   TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 933323 933324 syc0878_d syc0879_d   rpoD1 FALSE 0.050 208.000 0.000 1.000   NA
 933325 933326 syc0880_c syc0881_c   hemL FALSE 0.027 355.000 0.000 NA   NA
 933326 933327 syc0881_c syc0882_c hemL cikA FALSE 0.047 184.000 0.000 1.000 N NA
 933328 933329 syc0883_d syc0884_d bcp sdhA FALSE 0.078 129.000 0.000 1.000 N NA
 933330 933331 syc0885_c syc0886_c   eno FALSE 0.031 256.000 0.000 1.000 N NA
 933332 933333 syc0887_d syc0888_d gloA clpB FALSE 0.252 88.000 0.003 1.000 N NA
 933333 933334 syc0888_d syc0889_d clpB secE FALSE 0.117 105.000 0.000 1.000 N NA
 933334 933335 syc0889_d syc0890_d secE nusG TRUE 0.983 -3.000 0.843 1.000 N NA
 933335 933336 syc0890_d syc0891_d nusG rpl11 TRUE 0.980 8.000 0.681 1.000 N NA
 933336 933337 syc0891_d syc0892_d rpl11 rpl1 TRUE 0.959 75.000 0.838 0.028 Y NA
 933337 933338 syc0892_d syc0893_d rpl1 rpl10 TRUE 0.674 229.000 0.302 0.028 Y NA
 933338 933339 syc0893_d syc0894_d rpl10 rpl12 TRUE 0.970 60.000 0.884 0.022 Y NA
 933340 933341 syc0895_c syc0896_c     FALSE 0.031 295.000 0.000 NA   NA
 933341 933342 syc0896_c syc0897_c     FALSE 0.365 51.000 0.000 1.000   NA
 933342 933343 syc0897_c sycRNA015_c     TRUE 0.630 19.000 0.000 NA   NA
 933343 933344 sycRNA015_c syc0898_c   ilvD FALSE 0.067 151.000 0.000 NA   NA
 933344 933345 syc0898_c syc0899_c ilvD ycf45 FALSE 0.061 177.000 0.000 1.000   NA
 933345 933346 syc0899_c syc0900_c ycf45 ldpA TRUE 0.974 0.000 0.189 1.000   NA
 933346 933347 syc0900_c syc0901_c ldpA trxB TRUE 0.908 10.000 0.000 0.064 N NA
 933347 933348 syc0901_c syc0902_c trxB   FALSE 0.321 60.000 0.000 1.000   NA
 933348 933349 syc0902_c syc0903_c     TRUE 0.606 22.000 0.000 NA   NA
 933349 933350 syc0903_c syc0904_c     FALSE 0.071 145.000 0.000 NA   NA
 933350 933351 syc0904_c syc0905_c     FALSE 0.230 78.000 0.000 NA   NA
 933351 933352 syc0905_c syc0906_c   ahcY TRUE 0.619 53.000 0.024 NA   NA
 933354 933355 syc0908_c syc0909_c hrcA   TRUE 0.615 58.000 0.031 NA N NA
 933356 933357 syc0910_d syc0911_d     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 933357 933358 syc0911_d syc0912_d   gltA FALSE 0.549 114.000 0.171 1.000 N NA
 933359 933360 syc0913_c syc0914_c mutS   FALSE 0.524 28.000 0.000 1.000 N NA
 933360 933361 syc0914_c syc0915_c   ndhD4 FALSE 0.117 105.000 0.000 1.000 N NA
 933361 933362 syc0915_c syc0916_c ndhD4   FALSE 0.226 84.000 0.000 1.000   NA
 933362 933363 syc0916_c syc0917_c     FALSE 0.084 132.000 0.000 NA   NA
 933364 933365 syc0918_d syc0919_d aat   TRUE 0.727 -7.000 0.000 NA   NA
 933367 933368 syc0921_d syc0922_d glgC   TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 933368 933369 syc0922_d syc0923_d     FALSE 0.020 787.000 0.000 NA   NA
 933369 933370 syc0923_d syc0924_d     FALSE 0.323 124.000 0.000 1.000 Y NA
 933371 933372 sycRNA016_c syc0925_c     FALSE 0.037 243.000 0.000 NA   NA
 933375 933376 syc0928_d syc0929_d     TRUE 0.670 -31.000 0.000 NA   NA
 933376 933377 syc0929_d syc0930_d     FALSE 0.156 377.000 0.080 NA   NA
 933377 933378 syc0930_d syc0931_d   pfkA FALSE 0.557 28.000 0.000 NA   NA
 933379 933380 syc0932_c syc0933_c     TRUE 0.976 5.000 0.055 0.079   NA
 933380 933381 syc0933_c syc0934_c     TRUE 0.771 47.000 0.055 NA   NA
 933383 933384 syc0936_c sycRNA017_c valS   FALSE 0.061 164.000 0.000 NA   NA
 933384 933385 sycRNA017_c sycRNA018_c     FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 933385 933386 sycRNA018_c sycRNA019_c     FALSE 0.046 205.000 0.000 NA   NA
 933386 933387 sycRNA019_c sycRNA020_c     FALSE 0.497 34.000 0.000 NA   NA
 933387 933388 sycRNA020_c sycRNA021_c     FALSE 0.062 162.000 0.000 NA   NA
 933389 933390 syc0937_d syc0938_d     FALSE 0.074 151.000 0.000 1.000   NA
 933390 933391 syc0938_d syc0939_d   rpiA FALSE 0.168 89.000 0.000 1.000 N NA
 933393 933394 syc0941_d syc0942_d     FALSE 0.445 39.000 0.000 NA   NA
 933394 933395 syc0942_d syc0943_d     FALSE 0.159 97.000 0.000 NA   NA
 933396 933397 syc0944_c syc0945_c sqdX sqdB TRUE 0.976 16.000 0.194 1.000 Y NA
 933397 933398 syc0945_c syc0946_c sqdB   FALSE 0.315 94.000 0.014 NA   NA
 933398 933399 syc0946_c syc0947_c   thiG FALSE 0.296 84.000 0.003 NA   NA
 933401 933402 syc0949_c sycRNA022_c     FALSE 0.029 324.000 0.000 NA   NA
 933403 933404 syc0950_d syc0951_d   melB TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 933404 933405 syc0951_d syc0952_d melB dnaE FALSE 0.151 103.000 0.000 1.000   NA
 933405 933406 syc0952_d syc0953_d dnaE rpoD4 FALSE 0.044 225.000 0.000 1.000   NA
 933406 933407 syc0953_d syc0954_d rpoD4 codA FALSE 0.490 31.000 0.000 1.000 N NA
 933407 933408 syc0954_d syc0955_d codA   TRUE 0.971 3.000 0.174 1.000 N NA
 933409 933410 syc0956_c syc0957_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933410 933411 syc0957_c syc0958_c     FALSE 0.143 101.000 0.000 NA   NA
 933413 933414 syc0960_c syc0961_c     FALSE 0.175 92.000 0.000 NA   NA
 933415 933416 syc0962_d syc0963_d   hsp33 TRUE 0.668 33.000 0.012 1.000 N NA
 933419 933420 syc0966_c syc0967_c     FALSE 0.145 105.000 0.000 1.000   NA
 933422 933423 syc0969_c syc0970_c nfrC   FALSE 0.496 106.000 0.077 NA   NA
 933423 933424 syc0970_c syc0971_c     FALSE 0.023 462.000 0.000 NA   NA
 933424 933425 syc0971_c syc0972_c     TRUE 0.953 9.000 0.086 NA   NA
 933426 933427 syc0973_d syc0974_d     FALSE 0.312 57.000 0.000 NA   NA
 933428 933429 syc0975_c syc0976_c nhaS4   FALSE 0.427 41.000 0.000 NA   NA
 933429 933430 syc0976_c syc0977_c     TRUE 0.692 -18.000 0.000 NA   NA
 933432 933433 syc0979_c syc0980_c lipA   FALSE 0.034 297.000 0.000 1.000   NA
 933433 933434 syc0980_c syc0981_c     TRUE 0.977 4.000 0.308 NA   NA
 933434 933435 syc0981_c syc0982_c     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 933435 933436 syc0982_c syc0983_c   tktA FALSE 0.164 96.000 0.000 NA   NA
 933436 933437 syc0983_c syc0984_c tktA fabF FALSE 0.303 147.000 0.062 1.000 N NA
 933437 933438 syc0984_c syc0985_c fabF   TRUE 0.913 68.000 0.346 1.000 Y NA
 933439 933440 syc0986_d syc0987_d psaC glmS FALSE 0.242 147.000 0.031 1.000   NA
 933440 933441 syc0987_d syc0988_d glmS   TRUE 0.646 16.000 0.000 NA   NA
 933441 933442 syc0988_d syc0989_d     TRUE 0.967 -3.000 0.143 NA   NA
 933443 933444 syc0990_c syc0991_c     FALSE 0.551 25.000 0.000 1.000 N NA
 933444 933445 syc0991_c syc0992_c   devB TRUE 0.754 4.000 0.000 1.000 N NA
 933446 933447 syc0993_d syc0994_d     FALSE 0.027 355.000 0.000 NA   NA
 933449 933450 syc0996_d syc0997_d     FALSE 0.288 64.000 0.000 NA   NA
 933450 933451 syc0997_d syc0998_d     FALSE 0.175 92.000 0.000 NA   NA
 933452 933453 syc0999_c syc1000_c     TRUE 0.764 6.000 0.000 NA   NA
 933453 933454 syc1000_c syc1001_c     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 933454 933455 syc1001_c syc1002_c     FALSE 0.406 43.000 0.000 NA   NA
 933456 933457 syc1003_d syc1004_d recJ ctpB FALSE 0.089 122.000 0.000 1.000 N NA
 933457 933458 syc1004_d syc1005_d ctpB   TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933458 933459 syc1005_d syc1006_d     TRUE 0.911 20.000 0.066 NA   NA
 933459 933460 syc1006_d syc1007_d     TRUE 0.645 54.000 0.027 NA   NA
 933460 933461 syc1007_d syc1008_d   ycf84 FALSE 0.434 93.000 0.026 1.000   NA
 933461 933462 syc1008_d syc1009_d ycf84 ccsA TRUE 0.833 45.000 0.105 1.000   NA
 933462 933463 syc1009_d syc1010_d ccsA   FALSE 0.574 22.000 0.000 1.000 N NA
 933464 933465 syc1011_c syc1012_c     FALSE 0.445 39.000 0.000 NA   NA
 933465 933466 syc1012_c syc1013_c   rrf TRUE 0.896 7.000 0.022 1.000 N NA
 933466 933467 syc1013_c syc1014_c rrf pyrH TRUE 0.974 -13.000 0.626 1.000 N NA
 933468 933469 syc1015_d syc1016_d glpX hemA FALSE 0.288 132.000 0.038 1.000 N NA
 933469 933470 syc1016_d syc1017_d hemA   TRUE 0.938 0.000 0.000 0.046   NA
 933470 933471 syc1017_d syc1018_d     TRUE 0.801 0.000 0.000 1.000   NA
 933471 933472 syc1018_d syc1019_d     FALSE 0.551 25.000 0.000 1.000 N NA
 933472 933473 syc1019_d syc1020_d     TRUE 0.749 10.000 0.000 1.000   NA
 933473 933474 syc1020_d syc1021_d     FALSE 0.431 43.000 0.000 1.000   NA
 933476 933477 syc1023_d syc1024_d     TRUE 0.953 5.000 0.062 NA   NA
 933477 933478 syc1024_d syc1025_d     FALSE 0.126 108.000 0.000 NA   NA
 933478 933479 syc1025_d syc1026_d     TRUE 0.970 -3.000 0.182 NA   NA
 933486 933487 syc1033_c syc1034_c pyrC gpm TRUE 0.831 7.000 0.007 1.000 N NA
 933488 933489 syc1035_d syc1036_d     FALSE 0.044 213.000 0.000 NA   NA
 933489 933490 syc1036_d syc1037_d     TRUE 0.964 3.000 0.098 NA   NA
 933491 933492 syc1038_c syc1039_c     FALSE 0.041 244.000 0.000 1.000   NA
 933493 933494 syc1040_d syc1041_d     TRUE 0.760 0.000 0.000 1.000 N NA
 933494 933495 syc1041_d syc1042_d   ycf19 TRUE 0.813 31.000 0.000 0.077   NA
 933498 933499 syc1045_c syc1046_c     FALSE 0.249 78.000 0.000 1.000   NA
 933499 933500 syc1046_c syc1047_c   lacG FALSE 0.231 83.000 0.000 1.000   NA
 933500 933501 syc1047_c syc1048_c lacG   FALSE 0.079 138.000 0.000 NA   NA
 933502 933503 syc1049_d syc1050_d pgm secG TRUE 0.879 21.000 0.041 1.000 N NA
 933503 933504 syc1050_d syc1051_d secG   TRUE 0.807 -31.000 0.014 1.000 N NA
 933506 933507 syc1053_d syc1054_d     FALSE 0.073 143.000 0.000 NA   NA
 933507 933508 syc1054_d syc1055_d     TRUE 0.783 13.000 0.004 NA   NA
 933508 933509 syc1055_d syc1056_d     TRUE 0.801 0.000 0.000 1.000   NA
 933509 933510 syc1056_d syc1057_d     FALSE 0.312 57.000 0.000 NA   NA
 933510 933511 syc1057_d syc1058_d     FALSE 0.159 97.000 0.000 NA   NA
 933511 933512 syc1058_d syc1059_d     FALSE 0.084 140.000 0.000 1.000   NA
 933512 933513 syc1059_d syc1060_d     TRUE 0.783 6.000 0.000 1.000   NA
 933514 933515 syc1061_c syc1062_c   psbK FALSE 0.043 216.000 0.000 NA   NA
 933515 933516 syc1062_c syc1063_c psbK tgt TRUE 0.692 54.000 0.034 1.000   NA
 933521 933522 syc1068_d syc1069_d nifU serS FALSE 0.492 44.000 0.004 1.000 N NA
 933522 933523 syc1069_d syc1070_d serS   TRUE 0.638 47.000 0.024 1.000 N NA
 933523 933524 syc1070_d syc1071_d   nth TRUE 0.883 -3.000 0.018 1.000 N NA
 933524 933525 syc1071_d syc1072_d nth rps14 TRUE 0.676 30.000 0.010 1.000 N NA
 933525 933526 syc1072_d syc1073_d rps14 oppC FALSE 0.238 81.000 0.000 1.000   NA
 933526 933527 syc1073_d syc1074_d oppC   FALSE 0.028 343.000 0.000 NA   NA
 933527 933528 syc1074_d syc1075_d     FALSE 0.433 40.000 0.000 NA   NA
 933529 933530 syc1076_c syc1077_c amt1 purE FALSE 0.033 243.000 0.000 1.000 N NA
 933531 933532 syc1078_d syc1079_d nagA chlM TRUE 0.834 46.000 0.128 1.000 N NA
 933533 933534 syc1080_c syc1081_c     FALSE 0.030 313.000 0.000 NA   NA
 933534 933535 syc1081_c syc1082_c     TRUE 0.658 15.000 0.000 NA   NA
 933535 933536 syc1082_c syc1083_c     TRUE 0.966 11.000 0.241 NA   NA
 933538 933539 syc1084_c syc1085_c     FALSE 0.026 387.000 0.000 NA   NA
 933539 933540 syc1085_c syc1086_c     TRUE 0.686 -10.000 0.000 1.000 N NA
 933540 933541 syc1086_c syc1087_c   dxs TRUE 0.940 12.000 0.090 1.000 N NA
 933542 933543 syc1088_d syc1089_d   leuA FALSE 0.261 71.000 0.000 NA   NA
 933543 933544 syc1089_d syc1090_d leuA   FALSE 0.490 31.000 0.000 1.000 N NA
 933544 933545 syc1090_d syc1091_d     TRUE 0.722 17.000 0.003 1.000 N NA
 933545 933546 syc1091_d syc1092_d     FALSE 0.169 94.000 0.000 NA   NA
 933550 933551 syc1096_d syc1097_d     FALSE 0.514 32.000 0.000 NA   NA
 933551 933552 syc1097_d syc1098_d   bioB FALSE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 933553 933554 syc1099_c syc1100_c     FALSE 0.557 135.000 0.423 NA   NA
 933554 933555 syc1100_c syc1101_c     TRUE 0.808 79.000 0.404 1.000   NA
 933557 933558 syc1103_c sycRNA024_c     FALSE 0.419 42.000 0.000 NA   NA
 933559 933560 syc1104_d syc1105_d ndhL   TRUE 0.986 1.000 0.925 NA   NA
 933560 933561 syc1105_d syc1106_d   trpA FALSE 0.524 31.000 0.000 NA   NA
 933561 933562 syc1106_d syc1107_d trpA   FALSE 0.058 169.000 0.000 NA   NA
 933565 933566 syc1110_c syc1111_c   holA FALSE 0.298 85.000 0.004 NA   NA
 933567 933568 syc1112_d syc1113_d prfB   FALSE 0.048 199.000 0.000 NA   NA
 933568 933569 syc1113_d syc1114_d   dgkA FALSE 0.139 1141.000 0.123 NA   NA
 933569 933570 syc1114_d syc1115_d dgkA trpG TRUE 0.811 65.000 0.231 1.000 N NA
 933570 933571 syc1115_d syc1116_d trpG   TRUE 0.917 34.000 0.231 NA   NA
 933572 933573 syc1117_c syc1118_c   lim17 FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 933573 933574 syc1118_c syc1119_c lim17 purH FALSE 0.486 38.000 0.000 1.000   NA
 933574 933575 syc1119_c syc1120_c purH   FALSE 0.033 314.000 0.000 1.000   NA
 933578 933579 syc1123_d syc1124_d mltA   FALSE 0.044 225.000 0.000 1.000   NA
 933579 933580 syc1124_d syc1125_d   chrA FALSE 0.196 91.000 0.000 1.000   NA
 933580 933581 syc1125_d syc1126_d chrA rfaG FALSE 0.032 249.000 0.000 1.000 N NA
 933582 933583 syc1127_c syc1128_c     TRUE 0.863 5.000 0.008 NA   NA
 933584 933585 syc1129_d syc1130_d chlP   FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 933585 933586 syc1130_d syc1131_d     FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 933586 933587 syc1131_d syc1132_d     FALSE 0.433 40.000 0.000 NA   NA
 933587 933588 syc1132_d syc1133_d     FALSE 0.123 110.000 0.000 NA   NA
 933589 933590 syc1134_c syc1135_c     TRUE 0.964 22.000 0.762 NA   NA
 933590 933591 syc1135_c syc1136_c   ycf63 FALSE 0.327 54.000 0.000 NA   NA
 933592 933593 syc1137_d syc1138_d   pqqE FALSE 0.323 55.000 0.000 NA   NA
 933593 933594 syc1138_d syc1139_d pqqE ymxG TRUE 0.985 -3.000 0.113 0.009   NA
 933594 933595 syc1139_d syc1140_d ymxG   FALSE 0.020 905.000 0.000 NA   NA
 933596 933597 syc1141_c syc1142_c   metA FALSE 0.460 38.000 0.000 NA   NA
 933597 933598 syc1142_c syc1143_c metA metY TRUE 0.712 49.000 0.000 1.000 Y NA
 933598 933599 syc1143_c syc1144_c metY   FALSE 0.230 162.000 0.000 1.000 Y NA
 933599 933600 syc1144_c syc1145_c   xseA FALSE 0.417 103.000 0.000 0.016 N NA
 933602 933603 syc1147_c syc1148_c     FALSE 0.041 244.000 0.000 1.000   NA
 933603 933604 syc1148_c syc1149_c     FALSE 0.039 260.000 0.000 1.000   NA
 933604 933605 syc1149_c syc1150_c     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 933605 933606 syc1150_c syc1151_c     TRUE 0.955 26.000 0.561 NA   NA
 933606 933607 syc1151_c syc1152_c   cp12 FALSE 0.481 125.000 0.146 NA   NA
 933610 933611 syc1155_d syc1156_d     TRUE 0.924 31.000 0.226 NA   NA
 933611 933612 syc1156_d syc1157_d   ycf33 FALSE 0.020 729.000 0.000 NA   NA
 933612 933613 syc1157_d syc1158_d ycf33 rbfA TRUE 0.667 52.000 0.030 NA   NA
 933613 933614 syc1158_d syc1159_d rbfA bgl FALSE 0.568 63.000 0.025 1.000 N NA
 933617 933618 syc1162_c syc1163_c ycf22   TRUE 0.844 28.000 0.000 NA Y NA
 933619 933620 syc1164_d syc1165_d   recA FALSE 0.117 115.000 0.000 NA   NA
 933621 933622 syc1166_c syc1167_c     FALSE 0.065 157.000 0.000 NA   NA
 933623 933624 syc1168_d syc1169_d birA   FALSE 0.488 85.000 0.030 1.000 N NA
 933625 933626 syc1170_c syc1171_c psb27   FALSE 0.306 58.000 0.000 NA   NA
 933626 933627 syc1171_c syc1172_c     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 933627 933628 syc1172_c syc1173_c     TRUE 0.690 -19.000 0.000 NA   NA
 933628 933629 syc1173_c syc1174_c     TRUE 0.975 -3.000 0.292 NA   NA
 933629 933630 syc1174_c syc1175_c   petF FALSE 0.063 161.000 0.000 NA   NA
 933630 933631 syc1175_c syc1176_c petF atpC FALSE 0.391 109.000 0.000 1.000 Y NA
 933631 933632 syc1176_c syc1177_c atpC atpA TRUE 0.973 63.000 0.846 0.004 Y NA
 933632 933633 syc1177_c syc1178_c atpA atpD TRUE 0.981 47.000 0.864 0.004 Y NA
 933633 933634 syc1178_c syc1179_c atpD atpF TRUE 0.992 10.000 0.132 0.004 Y NA
 933634 933635 syc1179_c syc1180_c atpF atpG TRUE 0.986 35.000 0.569 0.004 Y NA
 933635 933636 syc1180_c syc1181_c atpG atpH TRUE 0.836 145.000 0.368 0.004 Y NA
 933636 933637 syc1181_c syc1182_c atpH atpI TRUE 0.863 143.000 0.679 0.004 Y NA
 933637 933638 syc1182_c syc1183_c atpI atp1 TRUE 0.912 26.000 0.099 1.000   NA
 933638 933639 syc1183_c syc1184_c atp1   FALSE 0.131 187.000 0.020 1.000   NA
 933640 933641 syc1185_d syc1186_d apcE apcA FALSE 0.139 366.000 0.000 0.004   NA
 933641 933642 syc1186_d syc1187_d apcA apcB TRUE 0.955 57.000 0.906 0.004   NA
 933642 933643 syc1187_d syc1188_d apcB apcC TRUE 0.887 92.000 0.531 0.007   NA
 933643 933644 syc1188_d syc1189_d apcC ftsW FALSE 0.213 271.000 0.103 1.000   NA
 933644 933645 syc1189_d syc1190_d ftsW ccdA TRUE 0.943 20.000 0.202 1.000 N NA
 933645 933646 syc1190_d syc1191_d ccdA ccs1 TRUE 0.989 -3.000 0.371 NA Y NA
 933646 933647 syc1191_d syc1192_d ccs1 glnB FALSE 0.039 194.000 0.000 NA N NA
 933648 933649 syc1193_c syc1194_c galE   FALSE 0.503 30.000 0.000 1.000 N NA
 933649 933650 syc1194_c syc1195_c     FALSE 0.284 65.000 0.000 NA   NA
 933650 933651 syc1195_c syc1196_c     FALSE 0.033 272.000 0.000 NA   NA
 933652 933653 syc1197_d syc1198_d   purB FALSE 0.330 85.000 0.009 NA   NA
 933653 933654 syc1198_d syc1199_d purB   FALSE 0.397 47.000 0.000 1.000   NA
 933656 933657 syc1201_d syc1202_d   ksgA TRUE 0.740 15.000 0.003 1.000 N NA
 933657 933658 syc1202_d syc1203_d ksgA ispE TRUE 0.839 -3.000 0.007 1.000 N NA
 933658 933659 syc1203_d syc1204_d ispE ndhF4 FALSE 0.021 430.000 0.000 1.000 N NA
 933659 933660 syc1204_d syc1205_d ndhF4 cupB FALSE 0.524 31.000 0.000 NA   NA
 933660 933661 syc1205_d syc1206_d cupB nhaS5 TRUE 0.734 -6.000 0.000 NA   NA
 933661 933662 syc1206_d syc1207_d nhaS5 chlP FALSE 0.027 363.000 0.000 NA   NA
 933663 933664 syc1208_c syc1209_c     FALSE 0.063 136.000 0.000 NA N NA
 933667 933668 syc1212_d syc1213_d     TRUE 0.880 25.000 0.043 1.000   NA
 933668 933669 syc1213_d syc1214_d     TRUE 0.988 -39.000 0.550 0.003   NA
 933670 933671 syc1215_c syc1216_c ftsH   FALSE 0.390 107.000 0.000 0.030   NA
 933671 933672 syc1216_c syc1217_c   met3 FALSE 0.219 124.000 0.018 1.000   NA
 933672 933673 syc1217_c syc1218_c met3 psbO FALSE 0.258 190.000 0.064 1.000   NA
 933675 933676 syc1220_c syc1221_c dfp   TRUE 0.933 4.000 0.030 NA   NA
 933678 933679 syc1222_c syc1223_c pyrD secA TRUE 0.911 9.000 0.000 0.074 N NA
 933681 933682 syc1225_c syc1226_c     FALSE 0.032 291.000 0.000 NA   NA
 933682 933683 syc1226_c syc1227_c   ccmK FALSE 0.203 85.000 0.000 NA   NA
 933683 933684 syc1227_c syc1228_c ccmK ccmK TRUE 0.960 45.000 0.938 NA Y NA
 933687 933688 syc1231_d syc1232_d gylA   TRUE 0.926 23.000 0.137 1.000 N NA
 933688 933689 syc1232_d syc1233_d   cinA TRUE 0.921 10.000 0.032 1.000   NA
 933690 933691 syc1234_c syc1235_c hoxF   TRUE 0.996 0.000 0.667 0.008 Y NA
 933692 933693 syc1236_d syc1237_d lig glcD FALSE 0.481 32.000 0.000 1.000 N NA
 933694 933695 syc1238_c syc1239_c     TRUE 0.714 -10.000 0.000 NA   NA
 933695 933696 syc1239_c syc1240_c     FALSE 0.486 38.000 0.000 1.000   NA
 933696 933697 syc1240_c syc1241_c   hemD TRUE 0.925 -21.000 0.003 1.000 Y NA
 933697 933698 syc1241_c syc1242_c hemD cobA TRUE 0.923 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 933698 933699 syc1242_c syc1243_c cobA   TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 933700 933701 syc1244_d syc1245_d     TRUE 0.699 12.000 0.000 NA   NA
 933703 933704 syc1247_d syc1248_d dnaJ   TRUE 0.974 -22.000 0.744 NA   NA
 933705 933706 syc1249_c syc1250_c uppS   TRUE 0.942 -3.000 0.043 NA   NA
 933706 933707 syc1250_c syc1251_c   lysA FALSE 0.579 80.000 0.040 NA   NA
 933708 933709 syc1252_d syc1253_d rimI clpC FALSE 0.442 99.000 0.032 1.000   NA
 933710 933711 syc1254_c syc1255_c     FALSE 0.076 140.000 0.000 NA   NA
 933716 933717 syc1260_d syc1261_d   cp12 FALSE 0.487 35.000 0.000 NA   NA
 933718 933719 syc1262_c syc1263_c     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 933719 933720 syc1263_c syc1264_c   bgtA TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 933720 933721 syc1264_c syc1265_c bgtA   TRUE 0.932 19.000 0.128 1.000 N NA
 933721 933722 syc1265_c syc1266_c   bgtB TRUE 0.991 2.000 0.356 0.009 N NA
 933722 933723 syc1266_c syc1267_c bgtB   TRUE 0.995 1.000 0.424 0.026 Y NA
 933724 933725 syc1268_d syc1269_d gap1 glgP TRUE 0.913 12.000 0.000 1.000 Y NA
 933725 933726 syc1269_d syc1270_d glgP hliC FALSE 0.160 100.000 0.000 1.000   NA
 933726 933727 syc1270_d syc1271_d hliC   FALSE 0.154 102.000 0.000 1.000   NA
 933729 933730 syc1273_d syc1274_d apcD petJ FALSE 0.216 161.000 0.000 0.059   NA
 933730 933731 syc1274_d syc1275_d petJ   TRUE 0.942 7.000 0.000 0.009   NA
 933731 933732 syc1275_d syc1276_d     TRUE 0.914 0.000 0.022 NA   NA
 933733 933734 syc1277_c syc1278_c     FALSE 0.111 341.000 0.000 NA Y NA
 933735 933736 syc1279_d syc1280_d     FALSE 0.135 104.000 0.000 NA   NA
 933736 933737 syc1280_d syc1281_d   aroA FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 933737 933738 syc1281_d syc1282_d aroA   TRUE 0.723 8.000 0.000 1.000 N NA
 933738 933739 syc1282_d syc1283_d     FALSE 0.155 98.000 0.000 NA   NA
 933740 933741 syc1284_c syc1285_c     FALSE 0.132 105.000 0.000 NA   NA
 933741 933742 syc1285_c syc1286_c   pth TRUE 0.781 29.000 0.022 NA   NA
 933742 933743 syc1286_c syc1287_c pth   TRUE 0.849 -3.000 0.009 1.000 N NA
 933743 933744 syc1287_c syc1288_c   psbH TRUE 0.666 94.000 0.167 1.000   NA
 933746 933747 syc1290_c syc1291_c   glk TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 933748 933749 syc1292_d syc1293_d minD   TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 933749 933750 syc1293_d syc1294_d     FALSE 0.093 125.000 0.000 NA   NA
 933751 933752 sycRNA026_c syc1295_c     FALSE 0.318 56.000 0.000 NA   NA
 933753 933754 syc1296_d syc1297_d     FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 933757 933758 syc1300_c syc1301_c aroC cobQ FALSE 0.176 87.000 0.000 1.000 N NA
 933758 933759 syc1301_c syc1302_c cobQ   TRUE 0.913 12.000 0.036 NA   NA
 933761 933762 syc1304_c syc1305_c     FALSE 0.027 306.000 0.000 1.000 N NA
 933762 933763 syc1305_c syc1306_c     FALSE 0.382 148.000 0.022 1.000 Y NA
 933764 933765 syc1307_d syc1308_d   ribD TRUE 0.882 -7.000 0.021 NA   NA
 933765 933766 syc1308_d syc1309_d ribD ccoN FALSE 0.019 525.000 0.000 1.000 N NA
 933766 933767 syc1309_d syc1310_d ccoN   TRUE 0.950 -3.000 0.000 0.002 N NA
 933767 933768 syc1310_d syc1311_d     FALSE 0.288 64.000 0.000 NA   NA
 933768 933769 syc1311_d syc1312_d     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933769 933770 syc1312_d syc1313_d   ndbC TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933770 933771 syc1313_d syc1314_d ndbC   FALSE 0.065 168.000 0.000 1.000   NA
 933771 933772 syc1314_d syc1315_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933774 933775 syc1317_d syc1318_d polA   FALSE 0.053 184.000 0.000 NA   NA
 933775 933776 syc1318_d syc1319_d   ycf60 TRUE 0.772 61.000 0.118 NA   NA
 933778 933779 syc1321_d syc1322_d cbiD guaA FALSE 0.196 138.000 0.023 1.000 N NA
 933782 933783 syc1325_c syc1326_c ggt pit TRUE 0.667 -16.000 0.000 1.000 N NA
 933783 933784 syc1326_c syc1327_c pit   TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933785 933786 syc1328_d syc1329_d     FALSE 0.030 364.000 0.000 1.000   NA
 933786 933787 syc1329_d syc1330_d     TRUE 0.978 -3.000 0.400 NA   NA
 933789 933790 syc1332_d syc1333_d     TRUE 0.982 -3.000 0.648 NA   NA
 933791 933792 syc1334_c syc1335_c     FALSE 0.029 322.000 0.000 NA   NA
 933794 933795 syc1337_c syc1338_c cysM glnN FALSE 0.026 450.000 0.000 1.000   NA
 933795 933796 syc1338_c syc1339_c glnN   FALSE 0.024 428.000 0.000 NA   NA
 933796 933797 syc1339_c sycRNA027_c     FALSE 0.024 448.000 0.000 NA   NA
 933797 933798 sycRNA027_c syc1340_c     FALSE 0.164 96.000 0.000 NA   NA
 933798 933799 syc1340_c syc1341_c   ycf36 TRUE 0.983 -3.000 0.810 NA   NA
 933799 933800 syc1341_c syc1342_c ycf36   TRUE 0.880 19.000 0.033 NA   NA
 933800 933801 syc1342_c syc1343_c     FALSE 0.460 38.000 0.000 NA   NA
 933801 933802 syc1343_c syc1344_c     TRUE 0.764 6.000 0.000 NA   NA
 933802 933803 syc1344_c syc1345_c     FALSE 0.151 99.000 0.000 NA   NA
 933803 933804 syc1345_c syc1346_c   era FALSE 0.276 103.000 0.014 1.000   NA
 933805 933806 syc1347_d syc1348_d   moeB TRUE 0.905 27.000 0.093 NA   NA
 933806 933807 syc1348_d syc1349_d moeB   FALSE 0.024 436.000 0.000 NA   NA
 933807 933808 syc1349_d syc1350_d     FALSE 0.048 201.000 0.000 NA   NA
 933810 933811 syc1352_d syc1353_d   mraY TRUE 0.921 6.000 0.027 NA   NA
 933813 933814 syc1355_d syc1356_d     TRUE 0.723 8.000 0.000 1.000 N NA
 933820 933821 syc1362_d syc1363_d pdhB secD TRUE 0.859 37.000 0.091 1.000 N NA
 933821 933822 syc1363_d syc1364_d secD secF TRUE 0.995 10.000 0.516 0.001 Y NA
 933822 933823 syc1364_d syc1365_d secF   TRUE 0.915 -13.000 0.037 NA   NA
 933824 933825 syc1366_c syc1367_c ilvB   FALSE 0.040 250.000 0.000 1.000   NA
 933825 933826 syc1367_c syc1368_c   hemH FALSE 0.087 138.000 0.000 1.000   NA
 933827 933828 syc1369_d syc1370_d   rapQ TRUE 0.869 55.000 0.367 1.000   NA
 933829 933830 syc1371_c syc1372_c     TRUE 0.665 105.000 0.348 NA   NA
 933831 933832 syc1373_d syc1374_d     FALSE 0.044 226.000 0.000 1.000   NA
 933833 933834 syc1375_c syc1376_c     TRUE 0.943 -3.000 0.047 NA   NA
 933834 933835 syc1376_c syc1377_c   ntcA TRUE 0.770 93.000 0.612 NA   NA
 933836 933837 syc1378_d syc1379_d fabI hisB TRUE 0.837 15.000 0.021 1.000 N NA
 933837 933838 syc1379_d syc1380_d hisB   FALSE 0.295 69.000 0.000 1.000   NA
 933842 933843 syc1382_d syc1383_d     TRUE 0.620 20.000 0.000 NA   NA
 933843 933844 syc1383_d syc1384_d     FALSE 0.043 216.000 0.000 NA   NA
 933845 933846 syc1385_c syc1386_c   gatB TRUE 0.729 10.000 0.000 NA   NA
 933846 933847 syc1386_c syc1387_c gatB   FALSE 0.041 221.000 0.000 NA   NA
 933847 933848 syc1387_c syc1388_c   cscK FALSE 0.110 118.000 0.000 NA   NA
 933850 933851 syc1390_c syc1391_c   petL FALSE 0.445 39.000 0.000 NA   NA
 933851 933852 syc1391_c syc1392_c petL phrA FALSE 0.318 56.000 0.000 NA   NA
 933852 933853 syc1392_c syc1393_c phrA dnaK FALSE 0.203 79.000 0.000 1.000 N NA
 933853 933854 syc1393_c syc1394_c dnaK   FALSE 0.306 65.000 0.000 1.000   NA
 933854 933855 syc1394_c syc1395_c     TRUE 0.775 7.000 0.000 1.000   NA
 933855 933856 syc1395_c syc1396_c     TRUE 0.888 19.000 0.035 1.000   NA
 933857 933858 syc1397_d syc1398_d   nadD TRUE 0.705 13.000 0.000 1.000   NA
 933858 933859 syc1398_d syc1399_d nadD nadE TRUE 0.987 -3.000 0.023 0.003 Y NA
 933859 933860 syc1399_d syc1400_d nadE   FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 933860 933861 syc1400_d syc1401_d     TRUE 0.704 -13.000 0.000 NA   NA
 933862 933863 syc1402_c syc1403_c   ndbA FALSE 0.238 81.000 0.000 1.000   NA
 933866 933867 syc1406_d syc1407_d pyk cobN FALSE 0.071 136.000 0.000 1.000 N NA
 933867 933868 syc1407_d syc1408_d cobN   FALSE 0.184 90.000 0.000 NA   NA
 933868 933869 syc1408_d syc1409_d   rpaA FALSE 0.025 425.000 0.000 NA   NA
 933870 933871 syc1410_c syc1411_c holB tmk TRUE 0.973 -3.000 0.254 1.000 N NA
 933872 933873 syc1412_d syc1413_d   ycf21 FALSE 0.035 257.000 0.000 NA   NA
 933875 933876 syc1415_d sycRNA030_d clcD   FALSE 0.203 85.000 0.000 NA   NA
 933878 933879 syc1417_d syc1418_d   glgX TRUE 0.763 9.000 0.000 1.000   NA
 933879 933880 syc1418_d syc1419_d glgX   FALSE 0.431 43.000 0.000 1.000   NA
 933881 933882 syc1420_c syc1421_c     FALSE 0.298 60.000 0.000 NA   NA
 933882 933883 syc1421_c syc1422_c   mdlB TRUE 0.729 10.000 0.000 NA   NA
 933884 933885 syc1423_d syc1424_d     FALSE 0.126 116.000 0.000 1.000   NA
 933885 933886 syc1424_d syc1425_d   ycf41 FALSE 0.262 64.000 0.000 1.000 N NA
 933886 933887 syc1425_d syc1426_d ycf41   FALSE 0.243 75.000 0.000 NA   NA
 933888 933889 syc1427_c syc1428_c     FALSE 0.259 76.000 0.000 1.000   NA
 933889 933890 syc1428_c syc1429_c   pepP TRUE 0.942 3.000 0.000 1.000 Y NA
 933891 933892 syc1430_d syc1431_d   lytB FALSE 0.123 110.000 0.000 NA   NA
 933892 933893 syc1431_d syc1432_d lytB   TRUE 0.881 40.000 0.175 NA   NA
 933893 933894 syc1432_d syc1433_d   degT FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 933894 933895 syc1433_d syc1434_d degT   TRUE 0.801 2.000 0.000 1.000   NA
 933895 933896 syc1434_d syc1435_d     FALSE 0.027 434.000 0.000 1.000   NA
 933896 933897 syc1435_d syc1436_d     TRUE 0.983 5.000 0.710 NA   NA
 933897 933898 syc1436_d syc1437_d     TRUE 0.979 5.000 0.379 NA   NA
 933898 933899 syc1437_d syc1438_d   infC FALSE 0.089 117.000 0.000 NA N NA
 933899 933900 syc1438_d syc1439_d infC   FALSE 0.036 281.000 0.000 1.000   NA
 933900 933901 syc1439_d syc1440_d   rfbF FALSE 0.021 1024.000 0.000 1.000   NA
 933901 933902 syc1440_d syc1441_d rfbF rfbG TRUE 0.991 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 933902 933903 syc1441_d syc1442_d rfbG rfbC FALSE 0.307 520.000 0.139 1.000 Y NA
 933903 933904 syc1442_d syc1443_d rfbC   TRUE 0.980 -3.000 0.457 1.000   NA
 933904 933905 syc1443_d syc1444_d   rfbE TRUE 0.962 4.000 0.081 1.000   NA
 933905 933906 syc1444_d syc1445_d rfbE   FALSE 0.126 751.000 0.107 NA N NA
 933906 933907 syc1445_d syc1446_d     FALSE 0.214 71.000 0.000 NA N NA
 933907 933908 syc1446_d syc1447_d     FALSE 0.056 174.000 0.000 NA   NA
 933908 933909 syc1447_d syc1448_d     TRUE 0.725 -13.000 0.000 1.000   NA
 933911 933912 syc1450_d syc1451_d pilA pilA FALSE 0.051 189.000 0.000 NA   NA
 933913 933914 syc1452_c syc1453_c     TRUE 0.769 8.000 0.000 1.000   NA
 933914 933915 syc1453_c syc1454_c     FALSE 0.042 237.000 0.000 1.000   NA
 933915 933916 syc1454_c syc1455_c     FALSE 0.166 95.000 0.000 NA   NA
 933917 933918 syc1456_d syc1457_d   rpl28 FALSE 0.433 40.000 0.000 NA   NA
 933919 933920 syc1458_c syc1459_c   folB FALSE 0.025 338.000 0.000 1.000 N NA
 933920 933921 syc1459_c syc1460_c folB gnd FALSE 0.182 85.000 0.000 1.000 N NA
 933921 933922 syc1460_c syc1461_c gnd mutT FALSE 0.049 175.000 0.000 1.000 N NA
 933922 933923 syc1461_c syc1462_c mutT   FALSE 0.031 353.000 0.000 1.000   NA
 933924 933925 syc1463_d syc1464_d     FALSE 0.020 852.000 0.000 NA   NA
 933925 933926 syc1464_d syc1465_d     TRUE 0.975 -28.000 1.000 NA   NA
 933927 933928 syc1466_c syc1467_c bioA bioD TRUE 0.992 -7.000 0.124 0.001 Y NA
 933928 933929 syc1467_c syc1468_c bioD   TRUE 0.739 6.000 0.000 1.000 N NA
 933929 933930 syc1468_c syc1469_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933930 933931 syc1469_c syc1470_c   bioF TRUE 0.952 12.000 0.128 NA   NA
 933934 933935 syc1473_d syc1474_d     FALSE 0.298 60.000 0.000 NA   NA
 933935 933936 syc1474_d syc1475_d     TRUE 0.676 -28.000 0.000 NA   NA
 933936 933937 syc1475_d syc1476_d   cobK TRUE 0.764 6.000 0.000 NA   NA
 933938 933939 syc1477_c syc1478_c   sir TRUE 0.784 1.000 0.000 NA   NA
 933940 933941 syc1479_d syc1480_d glyS eda TRUE 0.653 13.000 0.000 1.000 N NA
 933943 933944 syc1482_d syc1483_d     FALSE 0.060 166.000 0.000 NA   NA
 933946 933947 syc1485_d syc1486_d rps6   FALSE 0.067 152.000 0.000 NA   NA
 933947 933948 syc1486_d syc1487_d     FALSE 0.104 120.000 0.000 NA   NA
 933950 933951 syc1489_d syc1490_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933951 933952 syc1490_d syc1491_d     TRUE 0.972 -3.000 0.215 NA   NA
 933952 933953 syc1491_d syc1492_d     FALSE 0.251 73.000 0.000 NA   NA
 933954 933955 syc1493_c syc1494_c purF purL TRUE 0.859 85.000 0.223 1.000 Y NA
 933955 933956 syc1494_c syc1495_c purL   TRUE 0.754 44.000 0.039 NA   NA
 933956 933957 syc1495_c syc1496_c   dnaN TRUE 0.805 25.000 0.022 NA   NA
 933960 933961 syc1499_d syc1500_d   cobA FALSE 0.221 85.000 0.000 1.000   NA
 933962 933963 syc1501_c syc1502_c     FALSE 0.048 202.000 0.000 NA   NA
 933964 933965 syc1503_d syc1504_d xthA thrS FALSE 0.207 78.000 0.000 1.000 N NA
 933965 933966 syc1504_d syc1505_d thrS   FALSE 0.034 271.000 0.000 NA   NA
 933967 933968 syc1506_c syc1507_c ctaE ctaD TRUE 0.953 52.000 0.079 0.002 Y NA
 933968 933969 syc1507_c syc1508_c ctaD ctaC TRUE 0.954 60.000 0.132 0.002 Y NA
 933970 933971 syc1509_d syc1510_d   ctaB TRUE 0.969 -40.000 0.090 1.000 Y NA
 933971 933972 syc1510_d syc1511_d ctaB   FALSE 0.072 144.000 0.000 NA   NA
 933972 933973 syc1511_d syc1512_d     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933974 933975 syc1513_c syc1514_c   mviM TRUE 0.705 13.000 0.000 1.000   NA
 933975 933976 syc1514_c syc1515_c mviM   TRUE 0.780 52.000 0.078 1.000   NA
 933976 933977 syc1515_c syc1516_c     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 933981 933982 syc1519_c syc1520_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 933982 933983 syc1520_c syc1521_c     FALSE 0.037 245.000 0.000 NA   NA
 933984 933985 syc1522_d syc1523_d ubiD   TRUE 0.630 19.000 0.000 NA   NA
 933988 933989 syc1526_c syc1527_c csgA   TRUE 0.729 10.000 0.000 NA   NA
 933989 933990 syc1527_c syc1528_c   impA FALSE 0.191 88.000 0.000 NA   NA
 933990 933991 syc1528_c syc1529_c impA petF TRUE 0.942 4.000 0.042 1.000 N NA
 933992 933993 sycRNA032_d syc1530_d   dnaK FALSE 0.089 129.000 0.000 NA   NA
 933993 933994 syc1530_d syc1531_d dnaK dnaJ TRUE 0.971 10.000 0.000 0.006 Y NA
 933994 933995 syc1531_d syc1532_d dnaJ   TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 933995 933996 syc1532_d syc1533_d     TRUE 0.983 1.000 0.634 NA   NA
 933996 933997 syc1533_d syc1534_d     TRUE 0.918 35.000 0.237 1.000   NA
 933997 933998 syc1534_d sycRNA033_d     FALSE 0.055 178.000 0.000 NA   NA
 933998 933999 sycRNA033_d sycRNA034_d     FALSE 0.062 162.000 0.000 NA   NA
 933999 934000 sycRNA034_d sycRNA035_d     FALSE 0.497 34.000 0.000 NA   NA
 934000 934001 sycRNA035_d sycRNA036_d     FALSE 0.046 205.000 0.000 NA   NA
 934001 934002 sycRNA036_d sycRNA037_d     FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 934004 934005 syc1536_d syc1537_d mntA mntB TRUE 0.995 1.000 0.500 0.099 Y NA
 934005 934006 syc1537_d syc1538_d mntB   FALSE 0.077 139.000 0.000 NA   NA
 934008 934009 syc1540_d syc1541_d tyrS pyrF TRUE 0.924 4.000 0.027 1.000 N NA
 934009 934010 syc1541_d syc1542_d pyrF   TRUE 0.887 -3.000 0.017 NA   NA
 934011 934012 syc1543_c syc1544_c thiL ppiB TRUE 0.886 14.000 0.031 1.000 N NA
 934013 934014 syc1545_d syc1546_d efp accB TRUE 0.850 42.000 0.120 1.000 N NA
 934015 934016 syc1547_c syc1548_c     FALSE 0.342 47.000 0.000 1.000 N NA
 934021 934022 syc1553_d syc1554_d hoxU hoxY TRUE 0.987 -12.000 0.404 0.011   NA
 934022 934023 syc1554_d syc1555_d hoxY hoxH TRUE 0.986 10.000 0.322 1.000 Y NA
 934023 934024 syc1555_d syc1556_d hoxH   TRUE 0.989 9.000 0.441 1.000 Y NA
 934024 934025 syc1556_d syc1557_d   hypA TRUE 0.935 -12.000 0.055 1.000   NA
 934025 934026 syc1557_d syc1558_d hypA hypB TRUE 0.988 1.000 0.105 0.001   NA
 934026 934027 syc1558_d syc1559_d hypB hypF TRUE 0.832 72.000 0.064 1.000 Y NA
 934027 934028 syc1559_d syc1560_d hypF hypC TRUE 0.976 -52.000 0.181 NA Y NA
 934029 934030 syc1561_c syc1562_c   leuD FALSE 0.024 456.000 0.000 NA   NA
 934030 934031 syc1562_c syc1563_c leuD   FALSE 0.155 98.000 0.000 NA   NA
 934031 934032 syc1563_c syc1564_c     FALSE 0.354 49.000 0.000 NA   NA
 934032 934033 syc1564_c syc1565_c   aspC FALSE 0.581 77.000 0.000 1.000 Y NA
 934034 934035 syc1566_d syc1567_d     TRUE 0.895 30.000 0.094 NA   NA
 934035 934036 syc1567_d syc1568_d   petJ TRUE 0.608 17.000 0.000 1.000 N NA
 934037 934038 sycRNA038_c sycRNA039_c     FALSE 0.045 207.000 0.000 NA   NA
 934038 934039 sycRNA039_c syc1569_c   rpl19 FALSE 0.382 46.000 0.000 NA   NA
 934040 934041 syc1570_d syc1571_d     FALSE 0.054 181.000 0.000 NA   NA
 934041 934042 syc1571_d syc1572_d   clpP FALSE 0.074 142.000 0.000 NA   NA
 934042 934043 syc1572_d syc1573_d clpP clpP TRUE 0.984 43.000 0.745 0.002 Y NA
 934043 934044 syc1573_d syc1574_d clpP   TRUE 0.783 6.000 0.000 1.000   NA
 934049 934050 syc1579_c syc1580_c tsf rps2 TRUE 0.739 103.000 0.748 1.000   NA
 934050 934051 syc1580_c syc1581_c rps2   FALSE 0.019 1000.000 0.000 NA   NA
 934051 934052 syc1581_c syc1582_c     FALSE 0.594 24.000 0.000 NA   NA
 934052 934053 syc1582_c syc1583_c   clpX TRUE 0.869 -3.000 0.009 1.000   NA
 934053 934054 syc1583_c syc1584_c clpX clpP TRUE 0.961 13.000 0.037 1.000 Y NA
 934054 934055 syc1584_c syc1585_c clpP tig TRUE 0.655 92.000 0.025 1.000 Y NA
 934056 934057 syc1586_d syc1587_d gpsA   TRUE 0.942 9.000 0.054 NA   NA
 934057 934058 syc1587_d syc1588_d     FALSE 0.033 274.000 0.000 NA   NA
 934058 934059 syc1588_d syc1589_d   glgA FALSE 0.374 43.000 0.000 1.000 N NA
 934059 934060 syc1589_d syc1590_d glgA   TRUE 0.606 22.000 0.000 NA   NA
 934063 934064 syc1592_c syc1593_c argF btpA FALSE 0.275 72.000 0.000 1.000   NA
 934065 934066 syc1594_d syc1595_d     TRUE 0.764 6.000 0.000 NA   NA
 934067 934068 syc1596_c syc1597_c infA   FALSE 0.275 72.000 0.000 1.000   NA
 934068 934069 syc1597_c syc1598_c   ndbB TRUE 0.972 10.000 0.324 1.000   NA
 934070 934071 syc1599_d syc1600_d   cysH FALSE 0.433 40.000 0.000 NA   NA
 934073 934074 syc1602_d syc1603_d   por FALSE 0.045 208.000 0.000 NA   NA
 934074 934075 syc1603_d syc1604_d por   FALSE 0.035 251.000 0.000 NA   NA
 934077 934078 syc1606_d syc1607_d     TRUE 0.932 41.000 0.867 NA   NA
 934078 934079 syc1607_d syc1608_d     TRUE 0.985 0.000 0.867 NA   NA
 934079 934080 syc1608_d syc1609_d   ndk FALSE 0.147 100.000 0.000 NA   NA
 934080 934081 syc1609_d syc1610_d ndk livK FALSE 0.472 30.000 0.000 NA N NA
 934081 934082 syc1610_d syc1611_d livK livH TRUE 0.991 0.000 0.558 NA Y NA
 934082 934083 syc1611_d syc1612_d livH livM TRUE 0.996 4.000 0.617 0.025 Y NA
 934083 934084 syc1612_d syc1613_d livM livG TRUE 0.988 -3.000 0.255 1.000 Y NA
 934084 934085 syc1613_d syc1614_d livG livF TRUE 0.994 -7.000 0.417 0.018 Y NA
 934088 934089 syc1617_c syc1618_c     FALSE 0.101 122.000 0.000 NA   NA
 934089 934090 syc1618_c syc1619_c     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 934091 934092 syc1620_d syc1621_d     FALSE 0.020 736.000 0.000 NA   NA
 934092 934093 syc1621_d syc1622_d     FALSE 0.042 217.000 0.000 NA   NA
 934093 934094 syc1622_d syc1623_d     FALSE 0.021 612.000 0.000 NA   NA
 934094 934095 syc1623_d syc1624_d     TRUE 0.710 -12.000 0.000 NA   NA
 934097 934098 syc1626_d syc1627_d psb28   TRUE 0.929 16.000 0.082 1.000   NA
 934099 934100 syc1628_c syc1629_c   argH FALSE 0.155 98.000 0.000 NA   NA
 934100 934101 syc1629_c syc1630_c argH   FALSE 0.237 108.000 0.013 NA   NA
 934101 934102 syc1630_c syc1631_c     TRUE 0.808 56.000 0.146 NA   NA
 934102 934103 syc1631_c syc1632_c   ffh FALSE 0.104 180.000 0.013 1.000 N NA
 934103 934104 syc1632_c syc1633_c ffh nusB TRUE 0.795 15.000 0.013 1.000 N NA
 934104 934105 syc1633_c syc1634_c nusB   FALSE 0.224 147.000 0.029 NA   NA
 934105 934106 syc1634_c syc1635_c     FALSE 0.053 185.000 0.000 NA   NA
 934106 934107 syc1635_c syc1636_c   dnaK FALSE 0.055 178.000 0.000 NA   NA
 934110 934111 syc1639_d syc1640_d     FALSE 0.058 169.000 0.000 NA   NA
 934111 934112 syc1640_d syc1641_d   metK FALSE 0.077 130.000 0.000 1.000 N NA
 934112 934113 syc1641_d syc1642_d metK xylB TRUE 0.892 12.000 0.028 1.000 N NA
 934113 934114 syc1642_d syc1643_d xylB   FALSE 0.151 89.000 0.000 NA N NA
 934114 934115 syc1643_d syc1644_d     FALSE 0.077 123.000 0.000 NA N NA
 934116 934117 syc1645_c sycRNA041_c     FALSE 0.076 140.000 0.000 NA   NA
 934117 934118 sycRNA041_c syc1646_c   comE FALSE 0.460 38.000 0.000 NA   NA
 934118 934119 syc1646_c syc1647_c comE glyQ FALSE 0.479 54.000 0.009 NA   NA
 934119 934120 syc1647_c syc1648_c glyQ   FALSE 0.117 115.000 0.000 NA   NA
 934120 934121 syc1648_c syc1649_c     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 934122 934123 syc1650_d syc1651_d apt   FALSE 0.079 238.000 0.016 1.000 N NA
 934123 934124 syc1651_d syc1652_d   pilM FALSE 0.065 142.000 0.000 1.000 N NA
 934124 934125 syc1652_d syc1653_d pilM   TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 934125 934126 syc1653_d syc1654_d     FALSE 0.470 37.000 0.000 NA   NA
 934126 934127 syc1654_d syc1655_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 934127 934128 syc1655_d syc1656_d   pilQ FALSE 0.338 216.000 0.240 NA   NA
 934129 934130 syc1657_c syc1658_c   hflX FALSE 0.169 98.000 0.000 1.000   NA
 934130 934131 syc1658_c syc1659_c hflX   FALSE 0.068 149.000 0.000 NA   NA
 934132 934133 syc1660_d syc1661_d map sphX FALSE 0.059 153.000 0.000 1.000 N NA
 934133 934134 syc1661_d syc1662_d sphX pstS FALSE 0.268 280.000 0.000 0.024 Y NA
 934134 934135 syc1662_d syc1663_d pstS pstC FALSE 0.452 119.000 0.014 1.000 Y NA
 934135 934136 syc1663_d syc1664_d pstC pstA TRUE 0.996 0.000 0.485 0.002 Y NA
 934136 934137 syc1664_d syc1665_d pstA pstB TRUE 0.891 48.000 0.000 0.002 Y NA
 934137 934138 syc1665_d syc1666_d pstB pnp FALSE 0.055 162.000 0.000 1.000 N NA
 934139 934140 syc1667_c sycRNA042_c crtR   FALSE 0.042 219.000 0.000 NA   NA
 934141 934142 syc1668_d syc1669_d   ileS FALSE 0.528 72.000 0.025 NA   NA
 934142 934143 syc1669_d syc1670_d ileS msrA FALSE 0.274 59.000 0.000 1.000 N NA
 934144 934145 syc1671_c syc1672_c   ilvN TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 934145 934146 syc1672_c syc1673_c ilvN   TRUE 0.914 17.000 0.065 1.000 N NA
 934146 934147 syc1673_c syc1674_c     TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000   NA
 934148 934149 syc1675_d syc1676_d     FALSE 0.055 177.000 0.000 NA   NA
 934149 934150 syc1676_d syc1677_d   exbB2 FALSE 0.412 39.000 0.000 1.000 N NA
 934150 934151 syc1677_d syc1678_d exbB2   TRUE 0.986 34.000 0.810 0.034 Y NA
 934153 934154 syc1680_d syc1681_d petM ycf39 FALSE 0.117 119.000 0.000 1.000   NA
 934154 934155 syc1681_d syc1682_d ycf39   FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 934155 934156 syc1682_d syc1683_d   gidA FALSE 0.354 49.000 0.000 NA   NA
 934156 934157 syc1683_d syc1684_d gidA   FALSE 0.594 24.000 0.000 NA   NA
 934157 934158 syc1684_d syc1685_d     FALSE 0.220 81.000 0.000 NA   NA
 934159 934160 syc1686_c syc1687_c cysE   FALSE 0.295 61.000 0.000 NA   NA
 934161 934162 syc1688_d syc1689_d lrrA   FALSE 0.298 54.000 0.000 1.000 N NA
 934162 934163 syc1689_d syc1690_d   srrA FALSE 0.583 107.000 0.185 1.000 N NA
 934163 934164 syc1690_d syc1691_d srrA lysS FALSE 0.563 70.000 0.027 1.000 N NA
 934164 934165 syc1691_d syc1692_d lysS   FALSE 0.040 206.000 0.000 1.000 N NA
 934165 934166 syc1692_d syc1693_d     FALSE 0.025 335.000 0.000 1.000 N NA
 934167 934168 syc1694_c syc1695_c     FALSE 0.584 25.000 0.000 NA   NA
 934169 934170 syc1696_d syc1697_d purA   FALSE 0.195 76.000 0.000 NA N NA
 934171 934172 syc1698_c syc1699_c     TRUE 0.655 -64.000 0.000 NA   NA
 934174 934175 sycRNA043_c syc1701_c     TRUE 0.663 -34.000 0.000 NA   NA
 934175 934176 syc1701_c syc1702_c     FALSE 0.466 59.000 0.011 NA   NA
 934176 934177 syc1702_c syc1703_c     FALSE 0.030 309.000 0.000 NA   NA
 934178 934179 syc1704_d syc1705_d hspA   FALSE 0.083 133.000 0.000 NA   NA
 934179 934180 syc1705_d syc1706_d     TRUE 0.868 58.000 0.467 NA   NA
 934180 934181 syc1706_d syc1707_d     TRUE 0.938 7.000 0.042 NA   NA
 934181 934182 syc1707_d syc1708_d     TRUE 0.938 6.000 0.038 NA   NA
 934182 934183 syc1708_d syc1709_d     TRUE 0.976 4.000 0.264 NA   NA
 934183 934184 syc1709_d syc1710_d     FALSE 0.038 239.000 0.000 NA   NA
 934184 934185 syc1710_d syc1711_d     TRUE 0.729 54.000 0.054 NA   NA
 934186 934187 syc1712_c syc1713_c gltX   FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 934187 934188 syc1713_c syc1714_c     FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 934188 934189 syc1714_c syc1715_c     TRUE 0.654 19.000 0.000 1.000   NA
 934190 934191 syc1716_d syc1717_d     FALSE 0.038 270.000 0.000 1.000   NA
 934191 934192 syc1717_d syc1718_d     TRUE 0.867 44.000 0.200 1.000 N NA
 934193 934194 syc1719_c syc1720_c hypD   TRUE 0.760 2.000 0.000 1.000 N NA
 934194 934195 syc1720_c syc1721_c   nifJ TRUE 0.977 0.000 0.286 1.000 N NA
 934195 934196 syc1721_c syc1722_c nifJ ycf81 FALSE 0.096 124.000 0.000 NA   NA
 934199 934200 sycRNA044_d syc1725_d ffs   FALSE 0.085 131.000 0.000 NA   NA
 934201 934202 syc1726_c syc1727_c thiD ftsZ TRUE 0.857 0.000 0.007 1.000 N NA
 934202 934203 syc1727_c syc1728_c ftsZ   FALSE 0.200 220.000 0.067 NA N NA
 934203 934204 syc1728_c syc1729_c     TRUE 0.845 19.000 0.024 NA   NA
 934204 934205 syc1729_c syc1730_c     TRUE 0.947 4.000 0.046 NA   NA
 934205 934206 syc1730_c syc1731_c     TRUE 0.729 32.000 0.020 1.000 N NA
 934207 934208 syc1732_d syc1733_d     TRUE 0.977 3.000 0.258 NA   NA
 934208 934209 syc1733_d syc1734_d     FALSE 0.427 41.000 0.000 NA   NA
 934210 934211 syc1735_c syc1736_c acrF   FALSE 0.582 21.000 0.000 1.000 N NA
 934211 934212 syc1736_c sycRNA045_c     FALSE 0.029 325.000 0.000 NA   NA
 934215 934216 syc1739_d syc1740_d     TRUE 0.663 -34.000 0.000 NA   NA
 934217 934218 syc1741_c syc1742_c sds murI TRUE 0.657 44.000 0.024 1.000 N NA
 934218 934219 syc1742_c syc1743_c murI amiA TRUE 0.906 13.000 0.000 1.000 Y NA
 934219 934220 syc1743_c syc1744_c amiA   FALSE 0.317 50.000 0.000 1.000 N NA
 934220 934221 syc1744_c syc1745_c     FALSE 0.471 39.000 0.000 1.000   NA
 934222 934223 syc1746_d syc1747_d   cysR FALSE 0.059 167.000 0.000 NA   NA
 934223 934224 syc1747_d syc1748_d cysR   FALSE 0.180 91.000 0.000 NA   NA
 934224 934225 syc1748_d syc1749_d     TRUE 0.818 53.000 0.148 NA   NA
 934230 934231 syc1754_c syc1755_c pilT2 queA FALSE 0.219 75.000 0.000 1.000 N NA
 934236 934237 syc1760_d syc1761_d psaI psaL TRUE 0.635 198.000 0.583 0.020   NA
 934238 934239 syc1762_c syc1763_c     TRUE 0.917 10.000 0.029 1.000   NA
 934239 934240 syc1763_c syc1764_c   rfaE TRUE 0.639 34.000 0.004 1.000   NA
 934240 934241 syc1764_c syc1765_c rfaE   FALSE 0.394 44.000 0.000 NA   NA
 934242 934243 syc1766_d syc1767_d   fbpI FALSE 0.022 768.000 0.000 1.000   NA
 934243 934244 syc1767_d syc1768_d fbpI zwf TRUE 0.806 47.000 0.015 1.000 Y NA
 934244 934245 syc1768_d syc1769_d zwf opcA TRUE 0.922 40.000 0.080 1.000 Y NA
 934246 934247 syc1770_c syc1771_c petD petB TRUE 0.846 97.000 0.471 0.068   NA
 934248 934249 syc1772_d syc1773_d ctpA   TRUE 0.853 -7.000 0.011 1.000   NA
 934254 934255 syc1778_c syc1779_c gshB grxC TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 934255 934256 syc1779_c syc1780_c grxC gatC FALSE 0.053 165.000 0.000 1.000 N NA
 934256 934257 syc1780_c syc1781_c gatC ycf3 TRUE 0.865 12.000 0.020 1.000   NA
 934257 934258 syc1781_c syc1782_c ycf3   FALSE 0.460 38.000 0.000 NA   NA
 934258 934259 syc1782_c syc1783_c     FALSE 0.058 169.000 0.000 NA   NA
 934259 934260 syc1783_c syc1784_c     FALSE 0.497 34.000 0.000 NA   NA
 934262 934263 syc1786_c syc1787_c atpE atpB TRUE 0.968 71.000 0.837 0.004 Y NA
 934264 934265 syc1788_d syc1789_d groES groEL1 TRUE 0.979 48.000 0.905 0.009 Y NA
 934267 934268 syc1791_d sycRNA046_d     FALSE 0.273 69.000 0.000 NA   NA
 934268 934269 sycRNA046_d syc1792_d     FALSE 0.025 402.000 0.000 NA   NA
 934269 934270 syc1792_d syc1793_d   tpx FALSE 0.255 66.000 0.000 1.000 N NA
 934271 934272 syc1794_c syc1795_c gcvT   FALSE 0.087 130.000 0.000 NA   NA
 934272 934273 syc1795_c syc1796_c   nblR FALSE 0.020 724.000 0.000 NA   NA
 934273 934274 syc1796_c syc1797_c nblR   TRUE 0.887 45.000 0.341 1.000 N NA
 934274 934275 syc1797_c syc1798_c   folP FALSE 0.131 100.000 0.000 1.000 N NA
 934277 934278 syc1800_c syc1801_c   rps15 TRUE 0.937 6.000 0.037 NA   NA
 934278 934279 syc1801_c syc1802_c rps15 ruvA TRUE 0.894 7.000 0.021 1.000 N NA
 934280 934281 syc1803_d syc1804_d tal glnA FALSE 0.073 134.000 0.000 1.000 N NA
 934282 934283 syc1805_c syc1806_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 934283 934284 syc1806_c syc1807_c     FALSE 0.507 33.000 0.000 NA   NA
 934284 934285 syc1807_c syc1808_c     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 934286 934287 syc1809_d syc1810_d     TRUE 0.936 15.000 0.020 1.000 Y NA
 934287 934288 syc1810_d syc1811_d   ccmA TRUE 0.980 -18.000 0.032 0.041 Y NA
 934288 934289 syc1811_d syc1812_d ccmA   TRUE 0.935 -3.000 0.032 1.000   NA
 934289 934290 syc1812_d syc1813_d     FALSE 0.419 42.000 0.000 NA   NA
 934290 934291 syc1813_d syc1814_d     FALSE 0.196 87.000 0.000 NA   NA
 934291 934292 syc1814_d syc1815_d   gldA FALSE 0.092 126.000 0.000 NA   NA
 934292 934293 syc1815_d syc1816_d gldA todF TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000   NA
 934298 934299 syc1821_c syc1822_c amt1   FALSE 0.027 374.000 0.000 NA   NA
 934300 934301 syc1823_d syc1824_d     FALSE 0.035 257.000 0.000 NA   NA
 934302 934303 sycRNA047_c syc1825_c   chlD FALSE 0.021 586.000 0.000 NA   NA
 934303 934304 syc1825_c syc1826_c chlD   FALSE 0.406 43.000 0.000 NA   NA
 934305 934306 syc1827_d syc1828_d folK   TRUE 0.936 0.000 0.033 1.000 N NA
 934306 934307 syc1828_d syc1829_d     FALSE 0.427 38.000 0.000 1.000 N NA
 934307 934308 syc1829_d syc1830_d     FALSE 0.547 29.000 0.000 NA   NA
 934308 934309 syc1830_d syc1831_d     TRUE 0.958 -10.000 0.155 NA   NA
 934309 934310 syc1831_d syc1832_d     FALSE 0.051 390.000 0.015 NA N NA
 934312 934313 syc1834_d syc1835_d   hisS FALSE 0.107 113.000 0.000 1.000 N NA
 934313 934314 syc1835_d syc1836_d hisS   TRUE 0.678 38.000 0.018 NA   NA
 934314 934315 syc1836_d syc1837_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 934315 934316 syc1837_d syc1838_d     FALSE 0.046 205.000 0.000 NA   NA
 934317 934318 syc1839_c syc1840_c rimM   TRUE 0.845 4.000 0.005 1.000 N NA
 934319 934320 syc1841_d syc1842_d     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 934322 934323 syc1844_d syc1845_d     FALSE 0.110 118.000 0.000 NA   NA
 934323 934324 syc1845_d syc1846_d   ppc TRUE 0.873 57.000 0.457 1.000   NA
 934324 934325 syc1846_d syc1847_d ppc   TRUE 0.978 8.000 0.500 NA   NA
 934327 934328 syc1848_d syc1849_d recF   FALSE 0.061 579.000 0.024 1.000 N NA
 934328 934329 syc1849_d syc1850_d   himA FALSE 0.025 335.000 0.000 1.000 N NA
 934330 934331 syc1851_c syc1852_c mutS   FALSE 0.050 170.000 0.000 1.000 N NA
 934332 934333 syc1853_d syc1854_d   ribH TRUE 0.927 10.000 0.037 1.000   NA
 934333 934334 syc1854_d sycRNA049_d ribH   FALSE 0.293 62.000 0.000 NA   NA
 934334 934335 sycRNA049_d syc1855_d   proA FALSE 0.064 158.000 0.000 NA   NA
 934335 934336 syc1855_d syc1856_d proA   TRUE 0.730 7.000 0.000 1.000 N NA
 934337 934338 syc1857_c syc1858_c   ycf52 FALSE 0.323 55.000 0.000 NA   NA
 934339 934340 syc1859_d syc1860_d   glcP FALSE 0.050 208.000 0.000 1.000   NA
 934340 934341 syc1860_d syc1861_d glcP   FALSE 0.082 142.000 0.000 1.000   NA
 934341 934342 syc1861_d syc1862_d     TRUE 0.763 9.000 0.000 1.000   NA
 934343 934344 syc1863_c syc1864_c trmD   TRUE 0.783 6.000 0.000 1.000   NA
 934345 934346 syc1865_d syc1866_d rpl3 rpl4 TRUE 0.974 45.000 0.361 0.018 Y NA
 934346 934347 syc1866_d syc1867_d rpl4 rpl23 TRUE 0.994 -7.000 0.513 0.018 Y NA
 934347 934348 syc1867_d syc1868_d rpl23 rpl2 TRUE 0.989 30.000 0.849 0.019 Y NA
 934348 934349 syc1868_d syc1869_d rpl2 rps19 TRUE 0.987 32.000 0.820 0.024 Y NA
 934349 934350 syc1869_d syc1870_d rps19 rpl22 TRUE 0.992 19.000 0.769 0.024 Y NA
 934350 934351 syc1870_d syc1871_d rpl22 rps3 TRUE 0.990 25.000 0.719 0.024 Y NA
 934351 934352 syc1871_d syc1872_d rps3 rpl16 TRUE 0.995 9.000 0.828 0.024 Y NA
 934352 934353 syc1872_d syc1873_d rpl16 rpl29 TRUE 0.996 3.000 0.802 0.018 Y NA
 934353 934354 syc1873_d syc1874_d rpl29 rps17 TRUE 0.986 35.000 0.828 0.018 Y NA
 934354 934355 syc1874_d syc1875_d rps17 rpl14 TRUE 0.994 12.000 0.791 0.024 Y NA
 934355 934356 syc1875_d syc1876_d rpl14 rpl24 TRUE 0.996 0.000 0.810 0.024 Y NA
 934356 934357 syc1876_d syc1877_d rpl24 rpl5 TRUE 0.980 43.000 0.758 0.018 Y NA
 934357 934358 syc1877_d syc1878_d rpl5 rps8 TRUE 0.974 28.000 0.059 0.018 Y NA
 934358 934359 syc1878_d syc1879_d rps8 rpl6 TRUE 0.985 37.000 0.808 0.018 Y NA
 934359 934360 syc1879_d syc1880_d rpl6 rpl18 TRUE 0.996 0.000 0.815 0.018 Y NA
 934360 934361 syc1880_d syc1881_d rpl18 rps5 TRUE 0.996 4.000 0.814 0.024 Y NA
 934361 934362 syc1881_d syc1882_d rps5 rpl15 TRUE 0.972 38.000 0.148 0.024 Y NA
 934362 934363 syc1882_d syc1883_d rpl15 secY TRUE 0.647 122.000 0.730 1.000 N NA
 934363 934364 syc1883_d syc1884_d secY adk TRUE 0.903 0.000 0.020 1.000 N NA
 934364 934365 syc1884_d syc1885_d adk rpl36 FALSE 0.268 74.000 0.000 1.000   NA
 934365 934366 syc1885_d syc1886_d rpl36 rps13 TRUE 0.625 155.000 0.194 0.018   NA
 934366 934367 syc1886_d syc1887_d rps13 rps11 TRUE 0.965 70.000 0.810 0.018 Y NA
 934367 934368 syc1887_d syc1888_d rps11 rpoA TRUE 0.880 46.000 0.308 1.000 N NA
 934368 934369 syc1888_d syc1889_d rpoA rpl17 TRUE 0.942 36.000 0.873 1.000 N NA
 934369 934370 syc1889_d syc1890_d rpl17 truA TRUE 0.984 3.000 0.102 1.000 Y NA
 934370 934371 syc1890_d syc1891_d truA rpl13 TRUE 0.962 16.000 0.058 1.000 Y NA
 934371 934372 syc1891_d syc1892_d rpl13 rps9 TRUE 0.996 0.000 0.601 0.018 Y NA
 934372 934373 syc1892_d syc1893_d rps9 rpl31 TRUE 0.971 31.000 0.062 0.018 Y NA
 934373 934374 syc1893_d syc1894_d rpl31 prfA TRUE 0.741 102.000 0.110 1.000 Y NA
 934376 934377 syc1896_d sycRNA050_d alr   FALSE 0.445 39.000 0.000 NA   NA
 934377 934378 sycRNA050_d syc1897_d     FALSE 0.098 123.000 0.000 NA   NA
 934378 934379 syc1897_d syc1898_d   dnaE FALSE 0.329 58.000 0.000 1.000   NA
 934380 934381 syc1899_c syc1900_c     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 934382 934383 syc1901_d syc1902_d   cya2 TRUE 0.980 4.000 0.400 NA   NA
 934383 934384 syc1902_d syc1903_d cya2   FALSE 0.337 52.000 0.000 NA   NA
 934384 934385 syc1903_d syc1904_d     TRUE 0.687 -21.000 0.000 NA   NA
 934389 934390 syc1908_d syc1909_d menF   FALSE 0.547 29.000 0.000 NA   NA
 934391 934392 syc1910_c syc1911_c     FALSE 0.034 266.000 0.000 NA   NA
 934392 934393 syc1911_c syc1912_c     FALSE 0.203 85.000 0.000 NA   NA
 934394 934395 syc1913_d syc1914_d rnhA   FALSE 0.027 431.000 0.000 1.000   NA
 934395 934396 syc1914_d syc1915_d     FALSE 0.356 53.000 0.000 1.000   NA
 934396 934397 syc1915_d syc1916_d     FALSE 0.076 131.000 0.000 1.000 N NA
 934397 934398 syc1916_d syc1917_d     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 934400 934401 syc1919_d syc1920_d   idiA FALSE 0.120 104.000 0.000 1.000 N NA
 934402 934403 syc1921_c syc1922_c     FALSE 0.159 97.000 0.000 NA   NA
 934403 934404 syc1922_c syc1923_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 934409 934410 syc1928_d syc1929_d     FALSE 0.064 159.000 0.000 NA   NA
 934410 934411 syc1929_d syc1930_d     FALSE 0.113 117.000 0.000 NA   NA
 934412 934413 syc1931_c syc1932_c     FALSE 0.216 82.000 0.000 NA   NA
 934413 934414 syc1932_c syc1933_c     FALSE 0.023 462.000 0.000 NA   NA
 934414 934415 syc1933_c syc1934_c   spt TRUE 0.705 13.000 0.000 1.000   NA
 934415 934416 syc1934_c syc1935_c spt   TRUE 0.704 -13.000 0.000 NA   NA
 934416 934417 syc1935_c syc1936_c   apcF FALSE 0.184 90.000 0.000 NA   NA
 934418 934419 syc1937_d syc1938_d   glnA FALSE 0.247 74.000 0.000 NA   NA
 934419 934420 syc1938_d syc1939_d glnA   FALSE 0.230 78.000 0.000 NA   NA
 934420 934421 syc1939_d syc1940_d     FALSE 0.019 1090.000 0.000 NA   NA
 934421 934422 syc1940_d syc1941_d     TRUE 0.942 30.000 0.500 NA N NA
 934423 934424 syc1942_c syc1943_c   ycf38 FALSE 0.032 222.000 0.000 NA N NA
 934424 934425 syc1943_c syc1944_c ycf38   TRUE 0.941 52.000 0.107 0.094 Y NA
 934425 934426 syc1944_c syc1945_c     FALSE 0.159 97.000 0.000 NA   NA
 934427 934428 syc1946_d syc1947_d     TRUE 0.783 6.000 0.000 1.000   NA
 934431 934432 syc1950_c syc1951_c     FALSE 0.026 379.000 0.000 NA   NA
 934432 934433 syc1951_c syc1952_c     FALSE 0.024 557.000 0.000 1.000   NA
 934433 934434 syc1952_c syc1953_c     FALSE 0.138 98.000 0.000 1.000 N NA
 934434 934435 syc1953_c syc1954_c     FALSE 0.021 643.000 0.000 NA   NA
 934435 934436 syc1954_c syc1955_c   chlH FALSE 0.019 1371.000 0.000 NA   NA
 934437 934438 syc1956_d syc1957_d dapB   TRUE 0.906 10.000 0.027 NA   NA
 934438 934439 syc1957_d syc1958_d   amiA FALSE 0.284 65.000 0.000 NA   NA
 934439 934440 syc1958_d syc1959_d amiA   FALSE 0.079 138.000 0.000 NA   NA
 934443 934444 syc1962_c syc1963_c     TRUE 0.943 8.000 0.054 NA   NA
 934449 934450 syc1968_d syc1969_d bcp trpD FALSE 0.244 61.000 0.000 NA N NA
 934450 934451 syc1969_d syc1970_d trpD carA TRUE 0.759 66.000 0.021 1.000 Y NA
 934451 934452 syc1970_d syc1971_d carA   FALSE 0.572 51.000 0.020 1.000 N NA
 934452 934453 syc1971_d syc1972_d     FALSE 0.486 120.000 0.113 1.000   NA
 934453 934454 syc1972_d syc1973_d     TRUE 0.944 42.000 0.150 0.005   NA
 934454 934455 syc1973_d syc1974_d     FALSE 0.342 116.000 0.031 NA   NA
 934455 934456 syc1974_d syc1975_d   gatA FALSE 0.338 100.000 0.022 NA   NA
 934456 934457 syc1975_d syc1976_d gatA   TRUE 0.842 5.000 0.006 1.000 N NA
 934457 934458 syc1976_d syc1977_d     FALSE 0.068 162.000 0.000 1.000   NA
 934459 934460 sycRNA051_c syc1978_c   sasA FALSE 0.172 93.000 0.000 NA   NA
 934460 934461 syc1978_c syc1979_c sasA kprS FALSE 0.255 66.000 0.000 1.000 N NA
 934465 934466 syc1983_c syc1984_c     FALSE 0.323 55.000 0.000 NA   NA
 934467 934468 syc1985_d syc1986_d   cynA FALSE 0.487 35.000 0.000 NA   NA
 934468 934469 syc1986_d syc1987_d cynA cynB TRUE 0.983 10.000 0.189 NA Y NA
 934469 934470 syc1987_d syc1988_d cynB cynD TRUE 0.994 4.000 0.162 0.003 Y NA
 934470 934471 syc1988_d syc1989_d cynD cynS TRUE 0.953 11.000 0.021 1.000 Y NA
 934471 934472 syc1989_d syc1990_d cynS   FALSE 0.042 217.000 0.000 NA   NA
 934473 934474 syc1991_c syc1992_c   rfbA TRUE 0.721 12.000 0.000 1.000   NA
 934474 934475 syc1992_c syc1993_c rfbA rfbB TRUE 0.993 -3.000 0.138 0.004 Y NA
 934475 934476 syc1993_c syc1994_c rfbB rfbD TRUE 0.994 -3.000 0.180 0.003 Y NA
 934476 934477 syc1994_c syc1995_c rfbD rfbC TRUE 0.936 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 934479 934480 syc1997_c syc1998_c     FALSE 0.039 229.000 0.000 NA   NA
 934480 934481 syc1998_c syc1999_c     FALSE 0.037 245.000 0.000 NA   NA
 934481 934482 syc1999_c syc2000_c   cupA TRUE 0.896 47.000 0.455 NA   NA
 934482 934483 syc2000_c syc2001_c cupA ndhD3 TRUE 0.909 49.000 0.857 NA   NA
 934483 934484 syc2001_c syc2002_c ndhD3 ndhF3 TRUE 0.995 12.000 0.714 0.004 Y NA
 934484 934485 syc2002_c syc2003_c ndhF3 thrA FALSE 0.031 251.000 0.000 1.000 N NA
 934487 934488 syc2005_c syc2006_c   hisF FALSE 0.417 86.000 0.021 NA   NA
 934489 934490 syc2007_d syc2008_d     TRUE 0.940 32.000 0.467 NA   NA
 934490 934491 syc2008_d syc2009_d   chlG FALSE 0.424 157.000 0.190 1.000   NA
 934493 934494 syc2011_d syc2012_d fus wcaA FALSE 0.223 80.000 0.000 NA   NA
 934496 934497 syc2014_d syc2015_d ackA   TRUE 0.717 9.000 0.000 1.000 N NA
 934498 934499 syc2016_c syc2017_c     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 934499 934500 syc2017_c syc2018_c     TRUE 0.952 -3.000 0.058 1.000   NA
 934500 934501 syc2018_c syc2019_c   dnaJ TRUE 0.980 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 934501 934502 syc2019_c syc2020_c dnaJ dnaK TRUE 0.803 142.000 0.196 0.006 Y NA
 934502 934503 syc2020_c syc2021_c dnaK grpE TRUE 0.889 105.000 0.224 0.009 Y NA
 934504 934505 syc2022_d syc2023_d pilB pilT1 TRUE 0.941 71.000 0.178 0.017 Y NA
 934505 934506 syc2023_d syc2024_d pilT1 pilC TRUE 0.971 25.000 0.218 1.000 Y NA
 934506 934507 syc2024_d syc2025_d pilC   TRUE 0.942 6.000 0.044 NA   NA
 934509 934510 syc2027_d syc2028_d     FALSE 0.310 64.000 0.000 1.000   NA
 934512 934513 syc2030_d syc2031_d surE crtL FALSE 0.282 71.000 0.000 1.000   NA
 934513 934514 syc2031_d syc2032_d crtL   FALSE 0.101 122.000 0.000 NA   NA
 934514 934515 syc2032_d syc2033_d     TRUE 0.898 25.000 0.065 NA   NA
 934515 934516 syc2033_d syc2034_d     FALSE 0.395 166.000 0.194 NA   NA
 934516 934517 syc2034_d syc2035_d   proC FALSE 0.492 136.000 0.224 NA   NA
 934518 934519 syc2036_c syc2037_c     FALSE 0.076 140.000 0.000 NA   NA
 934519 934520 syc2037_c syc2038_c   ubiH FALSE 0.047 203.000 0.000 NA   NA
 934523 934524 syc2041_d syc2042_d     TRUE 0.732 11.000 0.000 1.000   NA
 934526 934527 syc2044_d syc2045_d psaA psaB TRUE 0.985 20.000 0.513 0.003   NA
 934528 934529 syc2046_c syc2047_c gcvP gcvH TRUE 0.915 59.000 0.249 1.000 Y NA
 934530 934531 syc2048_d syc2049_d     FALSE 0.072 144.000 0.000 NA   NA
 934531 934532 syc2049_d syc2050_d     FALSE 0.031 305.000 0.000 NA   NA
 934532 934533 syc2050_d syc2051_d     FALSE 0.113 117.000 0.000 NA   NA
 934534 934535 syc2052_c syc2053_c     TRUE 0.982 -3.000 0.048 0.001   NA
 934536 934537 syc2054_d syc2055_d sfsA   FALSE 0.208 84.000 0.000 NA   NA
 934537 934538 syc2055_d syc2056_d     FALSE 0.023 474.000 0.000 NA   NA
 934538 934539 syc2056_d syc2057_d     FALSE 0.047 204.000 0.000 NA   NA
 934539 934540 syc2057_d syc2058_d     TRUE 0.680 -25.000 0.000 NA   NA
 934540 934541 syc2058_d syc2059_d     TRUE 0.939 4.000 0.000 0.030   NA
 934541 934542 syc2059_d syc2060_d     TRUE 0.666 -33.000 0.000 NA   NA
 934543 934544 syc2061_c syc2062_c     FALSE 0.027 372.000 0.000 NA   NA
 934544 934545 syc2062_c syc2063_c   norA TRUE 0.606 22.000 0.000 NA   NA
 934546 934547 syc2064_d syc2065_d   cpcG FALSE 0.108 123.000 0.000 1.000   NA
 934548 934549 syc2066_c syc2067_c pgi rfbW FALSE 0.087 123.000 0.000 1.000 N NA
 934549 934550 syc2067_c syc2068_c rfbW   TRUE 0.658 15.000 0.000 NA   NA
 934550 934551 syc2068_c syc2069_c     TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 934551 934552 syc2069_c syc2070_c   rfaG TRUE 0.939 3.000 0.000 NA Y NA
 934553 934554 syc2071_d syc2072_d     FALSE 0.060 165.000 0.000 NA   NA
 934554 934555 syc2072_d syc2073_d   nusA TRUE 0.887 57.000 0.759 NA   NA
 934555 934556 syc2073_d syc2074_d nusA   TRUE 0.988 -3.000 0.323 NA Y NA
 934556 934557 syc2074_d syc2075_d   infB FALSE 0.387 151.000 0.171 NA N NA
 934557 934558 syc2075_d syc2076_d infB   FALSE 0.321 83.000 0.007 NA   NA
 934562 934563 syc2079_d syc2080_d psbX ycf66 FALSE 0.414 118.000 0.056 NA   NA
 934563 934564 syc2080_d syc2081_d ycf66   TRUE 0.743 9.000 0.000 NA   NA
 934564 934565 syc2081_d syc2082_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 934567 934568 syc2084_d syc2085_d ycf56 psbV FALSE 0.511 70.000 0.020 1.000   NA
 934569 934570 syc2086_c syc2087_c     TRUE 0.721 12.000 0.000 1.000   NA
 934571 934572 syc2088_d syc2089_d coaD   TRUE 0.883 -3.000 0.015 NA   NA
 934573 934574 syc2090_c syc2091_c   sigI TRUE 0.981 10.000 1.000 NA   NA
 934574 934575 syc2091_c syc2092_c sigI   FALSE 0.041 222.000 0.000 NA   NA
 934575 934576 syc2092_c syc2093_c     FALSE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 934577 934578 syc2094_d syc2095_d   minC TRUE 0.710 -12.000 0.000 NA   NA
 934578 934579 syc2095_d syc2096_d minC   FALSE 0.051 168.000 0.000 1.000 N NA
 934579 934580 syc2096_d syc2097_d   rbp2 FALSE 0.045 223.000 0.000 1.000   NA
 934582 934583 syc2099_d syc2100_d hliA   FALSE 0.053 185.000 0.000 NA   NA
 934583 934584 syc2100_d syc2101_d   hisIE FALSE 0.318 56.000 0.000 NA   NA
 934585 934586 syc2102_c syc2103_c masA   TRUE 0.968 6.000 0.174 1.000 N NA
 934587 934588 syc2104_d syc2105_d eIF2BA   FALSE 0.253 67.000 0.000 1.000 N NA
 934588 934589 syc2105_d syc2106_d     FALSE 0.097 393.000 0.000 0.065   NA
 934589 934590 syc2106_d syc2107_d     TRUE 0.706 47.000 0.000 0.065   NA
 934590 934591 syc2107_d syc2108_d     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 934593 934594 syc2110_d syc2111_d pqqL   TRUE 0.942 -7.000 0.057 1.000   NA
 934595 934596 syc2112_c syc2113_c pys pds TRUE 0.830 81.000 0.691 1.000   NA
 934597 934598 syc2114_d syc2115_d     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 934600 934601 syc2117_d syc2118_d   trxA FALSE 0.269 218.000 0.124 NA   NA
 934601 934602 syc2118_d syc2119_d trxA ndhF FALSE 0.364 81.000 0.009 1.000   NA
 934602 934603 syc2119_d syc2120_d ndhF ndhD TRUE 0.658 170.000 0.050 0.004 Y NA
 934603 934604 syc2120_d syc2121_d ndhD   TRUE 0.930 30.000 0.244 NA   NA
 934604 934605 syc2121_d syc2122_d     FALSE 0.114 186.000 0.016 NA   NA
 934605 934606 syc2122_d syc2123_d     TRUE 0.627 68.000 0.034 NA   NA
 934606 934607 syc2123_d syc2124_d     FALSE 0.184 94.000 0.000 1.000   NA
 934607 934608 syc2124_d syc2125_d   ama TRUE 0.844 66.000 0.365 1.000   NA
 934609 934610 syc2126_c syc2127_c     FALSE 0.024 436.000 0.000 NA   NA
 934610 934611 syc2127_c syc2128_c   cacA TRUE 0.763 47.000 0.055 1.000 N NA
 934611 934612 syc2128_c syc2129_c cacA   FALSE 0.243 75.000 0.000 NA   NA
 934612 934613 syc2129_c syc2130_c   ppx FALSE 0.497 34.000 0.000 NA   NA
 934614 934615 syc2131_d syc2132_d ubiA   TRUE 0.714 -3.000 0.000 NA N NA
 934616 934617 syc2133_c syc2134_c psbY   FALSE 0.397 47.000 0.000 1.000   NA
 934620 934621 syc2137_d syc2138_d     FALSE 0.180 91.000 0.000 NA   NA
 934623 934624 syc2140_d syc2141_d pyrG   TRUE 0.754 4.000 0.000 1.000 N NA
 934625 934626 syc2142_c sycRNA053_c     FALSE 0.497 34.000 0.000 NA   NA
 934626 934627 sycRNA053_c syc2143_c     FALSE 0.180 91.000 0.000 NA   NA
 934627 934628 syc2143_c syc2144_c     FALSE 0.051 189.000 0.000 NA   NA
 934628 934629 syc2144_c syc2145_c     TRUE 0.803 77.000 0.359 NA   NA
 934629 934630 syc2145_c syc2146_c     TRUE 0.871 64.000 0.667 NA   NA
 934631 934632 syc2147_d syc2148_d     FALSE 0.113 117.000 0.000 NA   NA
 934632 934633 syc2148_d syc2149_d   uvrC FALSE 0.288 64.000 0.000 NA   NA
 934636 934637 syc2152_c syc2153_c     FALSE 0.276 68.000 0.000 NA   NA
 934637 934638 syc2153_c syc2154_c     FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 934638 934639 syc2154_c syc2155_c   gap1 TRUE 0.982 -3.000 0.689 NA   NA
 934640 934641 syc2156_d syc2157_d   msrA FALSE 0.176 87.000 0.000 1.000 N NA
 934641 934642 syc2157_d syc2158_d msrA   FALSE 0.107 119.000 0.000 NA   NA
 934642 934643 syc2158_d syc2159_d   pilD TRUE 0.933 6.000 0.033 NA   NA
 934644 934645 syc2160_c syc2161_c dacB   TRUE 0.620 -102.000 0.000 1.000 N NA
 934645 934646 syc2161_c syc2162_c     TRUE 0.743 9.000 0.000 NA   NA
 934646 934647 syc2162_c syc2163_c     FALSE 0.041 222.000 0.000 NA   NA
 934647 934648 syc2163_c syc2164_c     TRUE 0.953 7.000 0.073 NA   NA
 934648 934649 syc2164_c syc2165_c   nifS TRUE 0.967 12.000 0.324 NA   NA
 934649 934650 syc2165_c syc2166_c nifS   FALSE 0.327 54.000 0.000 NA   NA
 934650 934651 syc2166_c syc2167_c   dapF TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 934652 934653 syc2168_d syc2169_d     FALSE 0.288 64.000 0.000 NA   NA
 934653 934654 syc2169_d syc2170_d     TRUE 0.682 -24.000 0.000 NA   NA
 934654 934655 syc2170_d syc2171_d   sigG FALSE 0.136 309.000 0.047 NA   NA
 934655 934656 syc2171_d syc2172_d sigG   FALSE 0.400 84.000 0.019 NA   NA
 934658 934659 syc2174_d syc2175_d leuS   FALSE 0.038 270.000 0.000 1.000   NA
 934660 934661 syc2176_c syc2177_c     FALSE 0.235 190.000 0.054 1.000   NA
 934662 934663 syc2178_d syc2179_d sppA aroH TRUE 0.821 57.000 0.207 1.000 N NA
 934664 934665 syc2180_c syc2181_c     TRUE 0.868 36.000 0.091 NA   NA
 934665 934666 syc2181_c syc2182_c   psaM FALSE 0.410 157.000 0.184 NA   NA
 934667 934668 syc2183_d syc2184_d phoU zam FALSE 0.125 318.000 0.049 NA N NA
 934668 934669 syc2184_d syc2185_d zam ubiX TRUE 0.969 -3.000 0.188 1.000 N NA
 934669 934670 syc2185_d syc2186_d ubiX   TRUE 0.783 3.000 0.000 NA   NA
 934670 934671 syc2186_d syc2187_d     FALSE 0.295 61.000 0.000 NA   NA
 934671 934672 syc2187_d syc2188_d   ycf59 FALSE 0.411 154.000 0.181 NA   NA
 934672 934673 syc2188_d syc2189_d ycf59   FALSE 0.067 164.000 0.000 1.000   NA
 934673 934674 syc2189_d syc2190_d   hlyB TRUE 0.922 15.000 0.000 0.003   NA
 934674 934675 syc2190_d syc2191_d hlyB hlyD TRUE 0.910 42.000 0.000 0.003 Y NA
 934675 934676 syc2191_d syc2192_d hlyD   TRUE 0.670 16.000 0.000 1.000   NA
 934676 934677 syc2192_d syc2193_d     TRUE 0.789 5.000 0.000 1.000   NA
 934677 934678 syc2193_d syc2194_d     TRUE 0.919 93.000 0.286 0.015 Y NA
 934680 934681 syc2196_d syc2197_d   leuC FALSE 0.293 62.000 0.000 NA   NA
 934681 934682 syc2197_d syc2198_d leuC   TRUE 0.801 1.000 0.000 1.000   NA
 934682 934683 syc2198_d syc2199_d   argJ FALSE 0.563 30.000 0.000 1.000   NA
 934685 934686 syc2201_d syc2202_d natC natA TRUE 0.918 65.000 0.361 1.000 Y NA
 934687 934688 syc2203_c syc2204_c     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 934688 934689 syc2204_c syc2205_c     FALSE 0.064 158.000 0.000 NA   NA
 934691 934692 syc2207_c syc2208_c     FALSE 0.487 35.000 0.000 NA   NA
 934692 934693 syc2208_c syc2209_c   recJ FALSE 0.303 53.000 0.000 1.000 N NA
 934694 934695 syc2210_d syc2211_d     TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000   NA
 934695 934696 syc2211_d syc2212_d   ycf53 TRUE 0.968 0.000 0.122 NA   NA
 934696 934697 syc2212_d syc2213_d ycf53 psbU FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 934697 934698 syc2213_d syc2214_d psbU nadB FALSE 0.299 133.000 0.036 1.000   NA
 934698 934699 syc2214_d syc2215_d nadB moxR FALSE 0.025 487.000 0.000 1.000   NA
 934699 934700 syc2215_d syc2216_d moxR   TRUE 0.982 -3.000 0.739 NA   NA
 934700 934701 syc2216_d syc2217_d     TRUE 0.982 -3.000 0.727 NA   NA
 934701 934702 syc2217_d syc2218_d     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 934702 934703 syc2218_d syc2219_d     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 934703 934704 syc2219_d syc2220_d     FALSE 0.235 77.000 0.000 NA   NA
 934705 934706 syc2221_c syc2222_c     TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.064 Y NA
 934706 934707 syc2222_c syc2223_c     FALSE 0.135 110.000 0.000 1.000   NA
 934708 934709 syc2224_d syc2225_d     TRUE 0.963 -3.000 0.132 NA N NA
 934710 934711 syc2226_c syc2227_c     TRUE 0.986 4.000 0.122 0.014   NA
 934713 934714 syc2229_c syc2230_c     FALSE 0.025 277.000 0.000 NA N NA
 934714 934715 syc2230_c syc2231_c   hemG TRUE 0.990 6.000 0.444 NA Y NA
 934715 934716 syc2231_c syc2232_c hemG   TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 934717 934718 syc2233_d syc2234_d natB ycf29 FALSE 0.057 158.000 0.000 1.000 N NA
 934719 934720 syc2235_c syc2236_c   ho1 FALSE 0.085 124.000 0.000 1.000 N NA
 934722 934723 syc2238_c syc2239_c cumB cobB FALSE 0.236 71.000 0.000 1.000 N NA
 934723 934724 syc2239_c syc2240_c cobB cobJ TRUE 0.977 4.000 0.000 0.011 Y NA
 934724 934725 syc2240_c syc2241_c cobJ cobI TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 934725 934726 syc2241_c syc2242_c cobI   TRUE 0.982 -3.000 0.012 0.011 Y NA
 934726 934727 syc2242_c syc2243_c     TRUE 0.924 25.000 0.149 1.000 N NA
 934730 934731 syc2246_d syc2247_d asd dapA TRUE 0.958 17.000 0.052 1.000 Y NA
 934731 934732 syc2247_d syc2248_d dapA   TRUE 0.901 49.000 0.605 1.000   NA
 934734 934735 syc2250_d syc2251_d     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 934737 934738 syc2253_d syc2254_d murF   FALSE 0.406 43.000 0.000 NA   NA
 934738 934739 syc2254_d syc2255_d     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 934739 934740 syc2255_d syc2256_d   chlB FALSE 0.080 137.000 0.000 NA   NA
 934740 934741 syc2256_d syc2257_d chlB   FALSE 0.312 57.000 0.000 NA   NA
 934741 934742 syc2257_d syc2258_d     TRUE 0.967 13.000 0.379 NA   NA
 934743 934744 syc2259_c syc2260_c     FALSE 0.406 43.000 0.000 NA   NA
 934744 934745 syc2260_c syc2261_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 934746 934747 syc2262_d syc2263_d   guaB FALSE 0.374 133.000 0.076 NA   NA
 934747 934748 syc2263_d syc2264_d guaB trxA FALSE 0.034 306.000 0.000 1.000   NA
 934749 934750 syc2265_c syc2266_c hisA   FALSE 0.497 34.000 0.000 NA   NA
 934750 934751 syc2266_c syc2267_c     TRUE 0.784 1.000 0.000 NA   NA
 934754 934755 syc2270_d syc2271_d   nblB TRUE 0.801 1.000 0.000 1.000   NA
 934756 934757 syc2272_c syc2273_c     FALSE 0.306 58.000 0.000 NA   NA
 934760 934761 syc2276_d syc2277_d     FALSE 0.191 88.000 0.000 NA   NA
 934761 934762 syc2277_d syc2278_d     FALSE 0.435 166.000 0.000 0.010 Y NA
 934762 934763 syc2278_d syc2279_d     TRUE 0.970 -7.000 0.000 0.010 Y NA
 934763 934764 syc2279_d syc2280_d     TRUE 0.890 -76.000 0.000 NA Y NA
 934764 934765 syc2280_d syc2281_d   htpG FALSE 0.072 127.000 0.000 NA N NA
 934766 934767 syc2282_c syc2283_c   dfa3 FALSE 0.029 271.000 0.000 1.000 N NA
 934767 934768 syc2283_c syc2284_c dfa3 dfa1 TRUE 0.771 216.000 0.457 0.003 Y NA
 934770 934771 syc2286_c syc2287_c mutT bcp FALSE 0.430 56.000 0.007 1.000 N NA
 934772 934773 syc2288_d syc2289_d     FALSE 0.276 68.000 0.000 NA   NA
 934773 934774 syc2289_d syc2290_d     FALSE 0.295 61.000 0.000 NA   NA
 934774 934775 syc2290_d syc2291_d     FALSE 0.417 206.000 0.444 1.000   NA
 934776 934777 syc2292_c syc2293_c     FALSE 0.038 237.000 0.000 NA   NA
 934777 934778 syc2293_c syc2294_c   hypE FALSE 0.487 35.000 0.000 NA   NA
 934778 934779 syc2294_c syc2295_c hypE   FALSE 0.025 408.000 0.000 NA   NA
 934779 934780 syc2295_c syc2296_c     FALSE 0.024 458.000 0.000 NA   NA
 934781 934782 syc2297_d syc2298_d   smpB TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 934783 934784 syc2299_c syc2300_c   trxA TRUE 0.851 65.000 0.477 1.000 N NA
 934784 934785 syc2300_c syc2301_c trxA hemB FALSE 0.062 146.000 0.000 1.000 N NA
 934787 934788 syc2303_c syc2304_c mbpA dnaJ FALSE 0.056 160.000 0.000 1.000 N NA
 934788 934789 syc2304_c syc2305_c dnaJ   FALSE 0.101 122.000 0.000 NA   NA
 934790 934791 syc2306_d syc2307_d nifU ycf51 TRUE 0.859 -3.000 0.008 NA   NA
 934791 934792 syc2307_d syc2308_d ycf51   TRUE 0.727 -7.000 0.000 NA   NA
 934793 934794 syc2309_c syc2310_c sigF2   FALSE 0.033 314.000 0.000 1.000   NA
 934795 934796 syc2311_d syc2312_d thrC   TRUE 0.721 86.000 0.215 1.000 N NA
 934797 934798 syc2313_c syc2314_c mutL recN FALSE 0.561 74.000 0.000 0.089   NA
 934800 934801 syc2316_c syc2317_c     FALSE 0.020 395.000 0.000 NA N NA
 934801 934802 syc2317_c syc2318_c   rps21 FALSE 0.175 127.000 0.010 1.000   NA
 934802 934803 syc2318_c syc2319_c rps21   FALSE 0.298 60.000 0.000 NA   NA
 934803 934804 syc2319_c syc2320_c   rps16 FALSE 0.063 160.000 0.000 NA   NA
 934804 934805 syc2320_c syc2321_c rps16 ftsY TRUE 0.666 104.000 0.361 1.000 N NA
 934807 934808 syc2323_c syc2324_c     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 934809 934810 syc2325_d syc2326_d cydA cydB TRUE 0.973 49.000 0.750 0.051 Y NA
 934810 934811 syc2326_d syc2327_d cydB   TRUE 0.614 21.000 0.000 NA   NA
 934812 934813 syc2328_c syc2329_c     TRUE 0.646 16.000 0.000 NA   NA
 934813 934814 syc2329_c syc2330_c     TRUE 0.649 125.000 0.115 1.000 Y NA
 934814 934815 syc2330_c syc2331_c     FALSE 0.342 47.000 0.000 1.000 N NA
 934815 934816 syc2331_c syc2332_c   ald FALSE 0.048 181.000 0.000 1.000 N NA
 934817 934818 syc2333_d syc2334_d     TRUE 0.721 12.000 0.000 1.000   NA
 934820 934821 syc2336_d syc2337_d     TRUE 0.972 -3.000 0.213 NA   NA
 934821 934822 syc2337_d syc2338_d     TRUE 0.971 -9.000 0.353 NA   NA
 934822 934823 syc2338_d syc2339_d     FALSE 0.551 120.000 0.190 1.000   NA
 934823 934824 syc2339_d syc2340_d     FALSE 0.274 240.000 0.175 NA   NA
 934824 934825 syc2340_d syc2341_d   ycf35 TRUE 0.928 43.000 1.000 NA   NA
 934825 934826 syc2341_d syc2342_d ycf35   TRUE 0.959 0.000 0.075 NA   NA
 934826 934827 syc2342_d syc2343_d     TRUE 0.759 3.000 0.000 1.000 N NA
 934827 934828 syc2343_d syc2344_d     FALSE 0.583 28.000 0.000 1.000   NA
 934828 934829 syc2344_d syc2345_d   rpoD2 FALSE 0.048 216.000 0.000 1.000   NA
 934829 934830 syc2345_d syc2346_d rpoD2   FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 934831 934832 syc2347_c syc2348_c   ndhH FALSE 0.077 147.000 0.000 1.000   NA
 934832 934833 syc2348_c syc2349_c ndhH gap2 FALSE 0.152 259.000 0.000 0.006 N NA
 934834 934835 syc2350_d syc2351_d murC murB TRUE 0.991 11.000 0.136 0.005 Y NA
 934836 934837 syc2352_c syc2353_c   nifS FALSE 0.031 297.000 0.000 NA   NA
 934837 934838 syc2353_c syc2354_c nifS   TRUE 0.946 10.000 0.081 1.000 N NA
 934838 934839 syc2354_c syc2355_c   ycf16 TRUE 0.991 0.000 0.482 1.000 Y NA
 934839 934840 syc2355_c syc2356_c ycf16   TRUE 0.951 46.000 0.466 1.000 Y NA
 934840 934841 syc2356_c syc2357_c   ftrC FALSE 0.558 48.000 0.016 1.000 N NA
 934842 934843 syc2358_d syc2359_d     TRUE 0.972 -3.000 0.212 NA   NA
 934843 934844 syc2359_d syc2360_d     TRUE 0.765 -3.000 0.000 NA   NA
 934845 934846 syc2361_c syc2362_c   kdpD FALSE 0.387 48.000 0.000 1.000   NA
 934846 934847 syc2362_c syc2363_c kdpD   TRUE 0.661 -39.000 0.000 NA   NA
 934848 934849 syc2364_d syc2365_d   lspA TRUE 0.952 28.000 0.554 NA   NA
 934853 934854 syc2369_d syc2370_d sbpA   FALSE 0.034 227.000 0.000 1.000 N NA
 934856 934857 syc2372_d syc2373_d icd glcE TRUE 0.832 31.000 0.000 1.000 Y NA
 934857 934858 syc2373_d syc2374_d glcE glcF TRUE 0.992 -3.000 0.153 0.029 Y NA
 934858 934859 syc2374_d syc2375_d glcF   FALSE 0.247 69.000 0.000 1.000 N NA
 934859 934860 syc2375_d syc2376_d   upp FALSE 0.445 36.000 0.000 1.000 N NA
 934861 934862 syc2377_c syc2378_c metX   TRUE 0.967 -3.000 0.156 1.000 N NA
 934862 934863 syc2378_c syc2379_c     FALSE 0.083 141.000 0.000 1.000   NA
 934863 934864 syc2379_c syc2380_c     TRUE 0.977 6.000 0.357 NA   NA
 934864 934865 syc2380_c syc2381_c   rpoZ TRUE 0.901 -3.000 0.021 NA   NA
 934867 934868 syc2383_c syc2384_c opdA   FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 934868 934869 syc2384_c syc2385_c     FALSE 0.045 207.000 0.000 NA   NA
 934869 934870 syc2385_c syc2386_c   psbI FALSE 0.436 169.000 0.324 NA   NA
 934870 934871 syc2386_c syc2387_c psbI   FALSE 0.482 113.000 0.081 NA   NA
 934874 934875 syc2390_d syc2391_d wcaG   FALSE 0.342 47.000 0.000 1.000 N NA
 934877 934878 syc2393_d syc2394_d     FALSE 0.068 150.000 0.000 NA   NA
 934879 934880 syc2395_c syc2396_c   gyrA FALSE 0.065 133.000 0.000 NA N NA
 934881 934882 syc2397_d syc2398_d divK   FALSE 0.168 89.000 0.000 1.000 N NA
 934883 934884 syc2399_c syc2400_c     TRUE 0.935 9.000 0.042 NA   NA
 934884 934885 syc2400_c syc2401_c     FALSE 0.032 279.000 0.000 NA   NA
 934885 934886 syc2401_c syc2402_c   cysW FALSE 0.516 142.000 0.000 0.004 Y NA
 934886 934887 syc2402_c syc2403_c cysW cysU TRUE 0.955 0.000 0.000 0.002 N NA
 934887 934888 syc2403_c syc2404_c cysU sbpA TRUE 0.950 0.000 0.000 0.004 N NA
 934888 934889 syc2404_c syc2405_c sbpA cysW FALSE 0.475 160.000 0.000 0.004 Y NA
 934889 934890 syc2405_c syc2406_c cysW cysR FALSE 0.351 46.000 0.000 1.000 N NA
 934890 934891 syc2406_c syc2407_c cysR   FALSE 0.557 28.000 0.000 NA   NA
 934891 934892 syc2407_c syc2408_c   cysT FALSE 0.594 24.000 0.000 NA   NA
 934892 934893 syc2408_c syc2409_c cysT sbpA TRUE 0.793 75.000 0.031 0.004 N NA
 934896 934897 syc2412_d syc2413_d     TRUE 0.963 14.000 0.339 NA   NA
 934897 934898 syc2413_d syc2414_d     FALSE 0.524 31.000 0.000 NA   NA
 934898 934899 syc2414_d syc2415_d     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 934899 934900 syc2415_d syc2416_d     FALSE 0.117 115.000 0.000 NA   NA
 934900 934901 syc2416_d syc2417_d     TRUE 0.784 1.000 0.000 NA   NA
 934902 934903 syc2418_c syc2419_c vanY kdpC FALSE 0.317 61.000 0.000 1.000   NA
 934903 934904 syc2419_c syc2420_c kdpC kdpB FALSE 0.517 151.000 0.000 0.001 Y NA
 934904 934905 syc2420_c syc2421_c kdpB kdpA TRUE 0.910 43.000 0.000 0.001 Y NA
 934905 934906 syc2421_c syc2422_c kdpA murD FALSE 0.019 526.000 0.000 1.000 N NA
 934909 934910 syc2425_d syc2426_d   cysS FALSE 0.066 154.000 0.000 NA   NA
 934911 934912 syc2427_c syc2428_c     FALSE 0.049 195.000 0.000 NA   NA
 934912 934913 syc2428_c syc2429_c     FALSE 0.329 58.000 0.000 1.000   NA
 934914 934915 syc2430_d syc2431_d   katG FALSE 0.020 707.000 0.000 NA   NA
 934915 934916 syc2431_d syc2432_d katG   FALSE 0.021 687.000 0.000 NA   NA
 934916 934917 syc2432_d syc2433_d   gldA FALSE 0.120 113.000 0.000 NA   NA
 934918 934919 syc2434_c syc2435_c   rffM TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 934923 934924 syc2439_c syc2440_c     FALSE 0.049 196.000 0.000 NA   NA
 934924 934925 syc2440_c syc2441_c   rnc FALSE 0.033 273.000 0.000 NA   NA
 934925 934926 syc2441_c sycRNA054_c rnc rnpB TRUE 0.699 12.000 0.000 NA   NA
 934926 934927 sycRNA054_c syc2442_c rnpB   FALSE 0.104 120.000 0.000 NA   NA
 934927 934928 syc2442_c syc2443_c     FALSE 0.178 96.000 0.000 1.000   NA
 934928 934929 syc2443_c syc2444_c     FALSE 0.138 103.000 0.000 NA   NA
 934929 934930 syc2444_c syc2445_c     FALSE 0.020 766.000 0.000 NA   NA
 934930 934931 syc2445_c syc2446_c     FALSE 0.411 87.000 0.021 NA   NA
 934931 934932 syc2446_c syc2447_c     FALSE 0.311 184.000 0.117 NA   NA
 934933 934934 syc2448_d syc2449_d psbDII dcoH FALSE 0.028 413.000 0.000 1.000   NA
 934934 934935 syc2449_d syc2450_d dcoH somB FALSE 0.275 72.000 0.000 1.000   NA
 934935 934936 syc2450_d syc2451_d somB somA FALSE 0.164 225.000 0.000 0.022   NA
 934936 934937 syc2451_d syc2452_d somA   FALSE 0.062 162.000 0.000 NA   NA
 934937 934938 syc2452_d syc2453_d   cysM FALSE 0.324 215.000 0.235 NA N NA
 934938 934939 syc2453_d syc2454_d cysM   FALSE 0.213 87.000 0.000 1.000   NA
 934940 934941 syc2455_c syc2456_c     TRUE 0.990 -3.000 0.489 NA Y NA
 934941 934942 syc2456_c syc2457_c     TRUE 0.977 -7.000 0.605 NA   NA
 934942 934943 syc2457_c syc2458_c     TRUE 0.981 -3.000 0.605 NA   NA
 934943 934944 syc2458_c syc2459_c   ndhD2 FALSE 0.026 380.000 0.000 NA   NA
 934944 934945 syc2459_c syc2460_c ndhD2   TRUE 0.995 -3.000 0.306 0.010 Y NA
 934945 934946 syc2460_c syc2461_c   sbtA FALSE 0.025 420.000 0.000 NA   NA
 934948 934949 syc2463_c syc2464_c   cytM FALSE 0.230 78.000 0.000 NA   NA
 934951 934952 syc2466_c syc2467_c   hisH TRUE 0.845 -3.000 0.008 1.000 N NA
 934954 934955 syc2469_c syc2470_c   murE TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000 N NA
 934955 934956 syc2470_c syc2471_c murE   TRUE 0.881 25.000 0.049 NA   NA
 934956 934957 syc2471_c syc2472_c     TRUE 0.895 -9.000 0.025 NA   NA
 934958 934959 syc2473_d syc2474_d rps4 cmpA FALSE 0.015 951.000 0.000 NA N NA
 934959 934960 syc2474_d syc2475_d cmpA cmpB TRUE 0.945 56.000 0.867 NA Y NA
 934960 934961 syc2475_d syc2476_d cmpB cmpC TRUE 0.991 29.000 0.867 0.003 Y NA
 934961 934962 syc2476_d syc2477_d cmpC cmpD TRUE 0.991 25.000 0.600 0.003 Y NA
 934962 934963 syc2477_d syc2478_d cmpD   FALSE 0.034 268.000 0.000 NA   NA
 934963 934964 syc2478_d syc2479_d     TRUE 0.924 7.000 0.029 NA   NA
 934965 934966 syc2480_c syc2481_c     FALSE 0.557 28.000 0.000 NA   NA
 934966 934967 syc2481_c syc2482_c   argB TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000   NA
 934967 934968 syc2482_c syc2483_c argB   TRUE 0.908 -7.000 0.027 NA   NA
 934968 934969 syc2483_c syc2484_c   petF FALSE 0.022 526.000 0.000 NA   NA
 934969 934970 syc2484_c syc2485_c petF prmA FALSE 0.111 249.000 0.027 1.000 N NA
 934970 934971 syc2485_c syc2486_c prmA serA TRUE 0.949 0.000 0.053 1.000 N NA
 934972 934973 syc2487_d syc2488_d     TRUE 0.784 1.000 0.000 NA   NA
 934973 934974 syc2488_d syc2489_d     FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 934975 934976 syc2490_c syc2491_c leuB   FALSE 0.127 107.000 0.000 NA   NA
 934978 934979 syc2492_c syc2493_c lipA   FALSE 0.052 186.000 0.000 NA   NA
 934981 934982 syc2495_c syc2496_c sigF1   FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 934982 934983 syc2496_c syc2497_c   zds TRUE 0.931 40.000 0.800 NA   NA
 934984 934985 syc2498_d syc2499_d dxr   TRUE 0.701 10.000 0.000 1.000 N NA
 934985 934986 syc2499_d syc2500_d     TRUE 0.799 -30.000 0.012 1.000 N NA
 934987 934988 syc2501_c syc2502_c     TRUE 0.617 -28.000 0.000 NA N NA
 934991 934992 syc2505_d syc2506_d rps20 tatD TRUE 0.603 67.000 0.034 NA N NA
 934992 934993 syc2506_d syc2507_d tatD rpoB FALSE 0.325 83.000 0.012 NA N NA
 934993 934994 syc2507_d syc2508_d rpoB rpoC1 TRUE 0.919 119.000 0.851 0.001 Y NA
 934994 934995 syc2508_d syc2509_d rpoC1 rpoC2 TRUE 0.915 70.000 0.031 0.001 Y NA
 934995 934996 syc2509_d syc2510_d rpoC2 typA FALSE 0.024 357.000 0.000 1.000 N NA
 934996 934997 syc2510_d syc2511_d typA typA TRUE 0.956 9.000 0.012 0.010   NA
 934997 934998 syc2511_d syc2512_d typA   FALSE 0.196 87.000 0.000 NA   NA
 934998 934999 syc2512_d syc2513_d     FALSE 0.060 165.000 0.000 NA   NA
 935003 935004 syc2517_d syc2518_d modA   TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 935004 935005 syc2518_d syc2519_d   sdhB FALSE 0.290 56.000 0.000 1.000 N NA
 935005 935006 syc2519_d syc2520_d sdhB   FALSE 0.108 123.000 0.000 1.000   NA
 935006 935007 syc2520_d syc2521_d   rbcX FALSE 0.470 37.000 0.000 NA   NA
 935007 935008 syc2521_d syc2522_d rbcX   TRUE 0.714 -10.000 0.000 NA   NA
 935008 935009 syc2522_d syc2523_d     FALSE 0.026 387.000 0.000 NA   NA
 935010 935011 syc2524_c syc2525_c     FALSE 0.460 38.000 0.000 NA   NA
 935011 932432 syc2525_c syc0001_c   isiB FALSE 0.481 90.000 0.031 NA   NA
 932432 932433 syc0001_c syc0002_c isiB isiA FALSE 0.383 185.000 0.214 1.000   NA