MicrobesOnline Operon Predictions for Sinorhizobium meliloti 1021

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 122676 122677 SMc02793 SMc02792     TRUE 0.691 48.000 0.135 NA   0.162
 122677 122678 SMc02792 SMc02791   aroE1 TRUE 0.943 -7.000 0.169 1.000 N -0.046
 122678 122679 SMc02791 SMc02790 aroE1   TRUE 0.943 -3.000 0.078 1.000 N -0.046
 122679 122680 SMc02790 SMc02789   dnaQ FALSE 0.211 194.000 0.092 1.000 N 0.239
 122681 122682 SMc02788 SMc02787 secB   FALSE 0.164 168.000 0.122 NA   -0.246
 122683 122684 SMc02786 SMc02785     TRUE 0.927 18.000 0.324 1.000   0.041
 122684 122685 SMc02785 SMc02784     TRUE 0.971 -7.000 0.332 NA   0.334
 122685 122686 SMc02784 SMc02783     TRUE 0.967 -3.000 0.183 NA   0.097
 122686 122687 SMc02783 SMc02782   gyrB FALSE 0.156 135.000 0.008 1.000   0.414
 122693 122694 SMc02776 SMc02775     TRUE 0.665 57.000 0.091 1.000 N 0.408
 122694 122695 SMc02775 SMc02774     FALSE 0.105 109.000 0.000 NA N 0.180
 122695 122696 SMc02774 SMc02773     TRUE 0.711 112.000 0.171 NA Y 0.128
 122696 122697 SMc02773 SMc02772     TRUE 0.975 34.000 0.195 0.021 Y 0.063
 122697 122698 SMc02772 SMc02771     TRUE 0.599 47.000 0.080 1.000 N -0.106
 122698 122699 SMc02771 SMc02770     FALSE 0.036 268.000 0.000 1.000 N 0.594
 122699 122700 SMc02770 SMc02769     FALSE 0.181 150.000 0.118 NA   -0.266
 122700 122701 SMc02769 SMc02768     FALSE 0.222 99.000 0.034 NA   0.077
 122701 122702 SMc02768 SMc02767   trpF FALSE 0.070 238.000 0.017 1.000   0.442
 122702 122703 SMc02767 SMc02766 trpF trpB TRUE 0.992 25.000 0.375 0.001 Y 0.075
 122703 122704 SMc02766 SMc02765 trpB trpA TRUE 0.998 6.000 0.344 0.000 Y 0.196
 122704 122705 SMc02765 SMc02764 trpA accD TRUE 0.811 54.000 0.232 1.000 N 0.344
 122705 122706 SMc02764 SMc02763 accD folC TRUE 0.947 16.000 0.383 1.000 N -0.005
 122706 122707 SMc02763 SMc02762 folC TRm22 FALSE 0.006 348.000 0.000 1.000 N -0.134
 122708 122709 SMc02761 SMc02760 trxA   TRUE 0.572 82.000 0.173 1.000   0.080
 122709 122710 SMc02760 SMc02759     TRUE 0.998 -10.000 0.863 0.065 Y -0.053
 122710 122711 SMc02759 SMc02758     TRUE 0.972 2.000 0.196 1.000 N 0.106
 122711 122712 SMc02758 SMc02757     TRUE 0.985 7.000 0.642 NA   0.123
 122712 122713 SMc02757 SMc02756     TRUE 0.891 10.000 0.085 NA   0.220
 122713 122714 SMc02756 SMc02755   ahcY FALSE 0.047 302.000 0.018 1.000 N 0.333
 122714 122715 SMc02755 SMc02754 ahcY   FALSE 0.139 157.000 0.012 1.000 N 0.188
 122715 122716 SMc02754 SMc02753     TRUE 0.999 0.000 0.420 0.001 Y -0.006
 122716 122717 SMc02753 SMc02752     FALSE 0.119 281.000 0.145 1.000   0.268
 122717 122718 SMc02752 SMc04446   chvG TRUE 0.995 -3.000 0.304 0.010   0.216
 122718 122719 SMc04446 SMc02560 chvG chvI TRUE 0.501 380.000 0.829 1.000 Y -0.105
 122720 122721 SMc02562 SMc02563 pckA   FALSE 0.274 104.000 0.025 1.000   0.425
 122721 122722 SMc02563 SMc02564     FALSE 0.190 86.000 0.007 1.000   0.023
 122722 122723 SMc02564 SMc02566   alkB FALSE 0.073 105.000 0.023 NA   -0.462
 122724 122725 SMc02567 SMc02568 coaA hisE TRUE 0.948 -3.000 0.086 1.000 N -0.023
 122725 122726 SMc02568 SMc02569 hisE hisF TRUE 0.946 65.000 0.105 0.003 Y 0.099
 122726 122727 SMc02569 SMc02570 hisF hisA TRUE 0.999 -3.000 0.433 0.003 Y 0.079
 122727 122728 SMc02570 SMc02572 hisA hisH TRUE 0.966 33.000 0.070 0.003 Y -0.086
 122728 122729 SMc02572 SMc02573 hisH   TRUE 0.987 0.000 0.417 NA   0.538
 122729 122730 SMc02573 SMc02574   hisB TRUE 0.663 27.000 0.041 NA   0.247
 122731 122732 SMc02575 SMc02576 hslV   TRUE 0.854 -10.000 0.009 1.000 N 0.708
 122732 122733 SMc02576 SMc02577   hslU TRUE 0.800 -3.000 0.007 1.000 N -0.307
 122733 122734 SMc02577 SMc02578 hslU   FALSE 0.066 207.000 0.021 NA   0.125
 122734 122735 SMc02578 SMc02579     FALSE 0.453 152.000 0.286 NA   0.320
 122735 122736 SMc02579 SMc02580     TRUE 0.666 131.000 0.136 1.000 Y 0.410
 122736 122737 SMc02580 SMc02581   glcB FALSE 0.166 161.000 0.022 1.000 N 0.301
 122740 122741 SMc02584 SMc02585 actR actS TRUE 0.786 187.000 0.560 1.000 Y 0.185
 122741 122742 SMc02585 SMc02586 actS helO FALSE 0.133 181.000 0.042 1.000 N -0.022
 122742 122743 SMc02586 SMc02587 helO   TRUE 0.917 0.000 0.015 1.000   0.496
 122743 122744 SMc02587 SMc02588     TRUE 0.991 1.000 0.602 1.000   0.140
 122744 122745 SMc02588 SMc02589     TRUE 0.989 -16.000 0.627 0.093   -0.114
 1782975 402982 SMc02676 SMc02621 rRNA-16S tRNA-ILE_GAT FALSE 0.014 257.000 0.000 NA   NA
 402982 402983 SMc02621 SMc02622 tRNA-ILE_GAT tRNA-ALA_TGC FALSE 0.044 140.000 0.000 NA   NA
 402983 1782976 SMc02622 SMc02668 tRNA-ALA_TGC rRNA-23S FALSE 0.003 608.000 0.000 NA   NA
 1782976 406806 SMc02668 SMc02669 rRNA-23S rRNA-5S FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 406806 402984 SMc02669 SMc02623 rRNA-5S tRNA-MET_CAT FALSE 0.022 211.000 0.000 NA   NA
 402984 122746 SMc02623 SMc02590 tRNA-MET_CAT   FALSE 0.019 228.000 0.000 NA   NA
 122747 122748 SMc02591 SMc02592     TRUE 0.987 -3.000 0.429 NA   0.184
 122748 122749 SMc02592 SMc02593     TRUE 0.988 -3.000 0.571 NA   -0.202
 122749 122750 SMc02593 SMc02594     FALSE 0.110 90.000 0.000 NA   0.242
 122750 122751 SMc02594 SMc02595   metB FALSE 0.258 30.000 0.000 1.000 N -0.110
 122752 122753 SMc02596 SMc04463     FALSE 0.273 76.000 0.000 1.000 N 0.423
 122756 122757 SMc02604 SMc02605 folD1 soxG TRUE 0.518 23.000 0.000 1.000 N 0.165
 122757 122758 SMc02605 SMc02606 soxG soxA1 TRUE 0.993 -7.000 0.370 0.003   0.255
 122758 122759 SMc02606 SMc02607 soxA1 soxD TRUE 0.998 -3.000 0.923 0.001   -0.468
 122759 122760 SMc02607 SMc02608 soxD soxB TRUE 0.997 26.000 0.846 0.001 Y 0.067
 122761 122762 SMc02609 SMc02610 glxA glxB TRUE 0.576 51.000 0.029 1.000 N 0.371
 122762 122763 SMc02610 SMc02611 glxB glxC TRUE 0.983 38.000 0.786 1.000 Y 0.513
 122763 122764 SMc02611 SMc02612 glxC glxD TRUE 0.994 15.000 0.901 1.000 Y 0.282
 122764 122765 SMc02612 SMc02613 glxD tRNA-Gln TRUE 0.917 82.000 0.493 1.000 Y 0.063
 122766 122767 SMc02614 SMc02615     TRUE 0.963 25.000 0.750 NA   0.215
 122767 122768 SMc02615 SMc02616     FALSE 0.021 106.000 0.000 NA   -0.021
 122768 122769 SMc02616 SMc02617     FALSE 0.084 15.000 0.000 NA   -0.062
 122769 122770 SMc02617 SMc02618     TRUE 0.977 14.000 0.750 NA   0.078
 122770 122771 SMc02618 SMc02619     TRUE 0.989 9.000 0.875 NA   0.226
 122772 122773 SMc02620 SMc04154   purU FALSE 0.059 204.000 0.000 1.000 N 0.255
 122773 122774 SMc04154 SMc04153 purU   FALSE 0.009 276.000 0.000 1.000 N -0.140
 122774 122775 SMc04153 SMc04152     TRUE 0.970 11.000 0.438 1.000   0.034
 122775 122776 SMc04152 SMc04151     TRUE 0.996 -3.000 0.565 0.019   -0.074
 122776 122777 SMc04151 SMc04150     TRUE 0.741 110.000 0.543 NA   0.399
 122777 122778 SMc04150 SMc04149     FALSE 0.499 68.000 0.122 NA   -0.055
 122781 122782 SMc04146 SMc04145     FALSE 0.374 148.000 0.000 1.000 Y 0.277
 122782 122783 SMc04145 SMc04144   ilvD3 TRUE 0.704 64.000 0.000 1.000 Y 0.375
 122784 122785 SMc04143 SMc04142     FALSE 0.015 275.000 0.000 1.000 N -0.029
 122786 122787 SMc04141 SMc04140 gst9   TRUE 0.885 -3.000 0.000 1.000 N 0.599
 122787 122788 SMc04140 SMc04139     TRUE 0.836 24.000 0.182 1.000   -0.032
 122788 122789 SMc04139 SMc04138     TRUE 0.990 2.000 0.190 0.053   0.269
 122789 122790 SMc04138 SMc04137     TRUE 0.816 23.000 0.190 1.000   -0.384
 122790 122791 SMc04137 SMc04136     TRUE 0.994 -7.000 0.714 1.000 Y -0.261
 122791 122792 SMc04136 SMc04135     TRUE 0.994 15.000 0.643 0.093 Y -0.048
 122793 122794 SMc04134 SMc04133     TRUE 0.725 123.000 0.667 1.000   -0.018
 122794 122795 SMc04133 SMc04132     TRUE 0.952 4.000 0.150 NA   0.214
 122795 122796 SMc04132 SMc04131     TRUE 0.613 11.000 0.000 NA   0.316
 122796 122797 SMc04131 SMc04130     FALSE 0.259 18.000 0.000 NA   0.052
 122797 122798 SMc04130 SMc04129     FALSE 0.493 55.000 0.111 NA   -0.325
 122798 122799 SMc04129 SMc04128     FALSE 0.037 98.000 0.000 1.000   -0.099
 122799 122800 SMc04128 SMc04127     FALSE 0.000 719.000 0.000 1.000   -0.233
 122800 122801 SMc04127 SMc04126     TRUE 0.966 -3.000 0.184 1.000   -0.058
 122801 122802 SMc04126 SMc04125     TRUE 0.994 5.000 0.720 0.093   -0.287
 122802 122803 SMc04125 SMc04124   cdd TRUE 0.907 4.000 0.060 1.000   0.016
 122803 122804 SMc04124 SMc04123 cdd deoD TRUE 0.993 -3.000 0.242 1.000 Y 0.283
 122804 122805 SMc04123 SMc04122 deoD deoA TRUE 0.984 1.000 0.045 1.000 Y 0.455
 122806 122807 SMc04121 SMc04120 upp add TRUE 0.534 111.000 0.030 1.000 Y -0.055
 122807 122808 SMc04120 SMc04119 add deoB TRUE 0.944 -3.000 0.086 1.000 N -0.081
 122808 122809 SMc04119 SMc04118 deoB   FALSE 0.058 221.000 0.055 NA N -0.524
 122809 122810 SMc04118 SMc04117     TRUE 0.995 8.000 0.857 NA Y -0.141
 122810 122811 SMc04117 SMc04116   TRm22 FALSE 0.027 226.000 0.000 NA N 0.119
 122811 122812 SMc04116 SMc04115 TRm22   FALSE 0.029 165.000 0.000 NA   0.102
 122813 122814 SMc04114 SMc04113 pilA1 cpaA1 TRUE 0.915 84.000 0.467 NA Y 0.427
 122814 122815 SMc04113 SMc04112 cpaA1 cpaB1 TRUE 0.830 128.000 0.611 NA Y -0.284
 122815 122816 SMc04112 SMc04111 cpaB1 cpaC1 TRUE 0.979 13.000 0.222 NA Y 0.479
 122816 122817 SMc04111 SMc04110 cpaC1   TRUE 0.640 57.000 0.133 NA N 0.048
 122817 122818 SMc04110 SMc04109   cpaE1 TRUE 0.935 23.000 0.467 NA N -0.051
 122818 122819 SMc04109 SMc02820 cpaE1 cpaF1 TRUE 0.899 131.000 0.765 1.000 Y 0.213
 122819 122820 SMc02820 SMc02821 cpaF1   TRUE 0.972 59.000 0.882 1.000 Y 0.025
 122820 122821 SMc02821 SMc02822     TRUE 0.999 8.000 0.941 0.008 Y 0.121
 122821 122822 SMc02822 SMc02823   TRm22 FALSE 0.032 229.000 0.000 1.000 N 0.069
 122824 122825 SMc02825 SMc02826     TRUE 0.502 88.000 0.130 1.000   0.147
 122825 122826 SMc02826 SMc02827     TRUE 0.929 9.000 0.150 NA   0.204
 122827 122828 SMc02828 SMc02829     TRUE 0.939 11.000 0.179 1.000   0.293
 122828 122829 SMc02829 SMc02830     TRUE 0.988 9.000 0.744 1.000   0.376
 122829 122830 SMc02830 SMc02831     TRUE 0.997 0.000 0.882 0.093   -0.234
 122830 122831 SMc02831 SMc02832     TRUE 0.540 181.000 0.197 0.093   0.526
 122832 122833 SMc02833 SMc02834 mepA mgsA FALSE 0.152 121.000 0.035 1.000 N -0.276
 122833 122834 SMc02834 SMc02835 mgsA glk TRUE 0.794 62.000 0.035 1.000 Y 0.295
 122834 122835 SMc02835 SMc02836 glk   FALSE 0.241 109.000 0.027 1.000 N 0.075
 122835 122836 SMc02836 SMc02837   dapB TRUE 0.737 18.000 0.017 1.000 N 0.249
 122836 122837 SMc02837 SMc02838 dapB gpmA TRUE 0.554 31.000 0.038 1.000 N -0.230
 122840 122841 SMc02840 SMc02841 TRm5N   FALSE 0.132 489.000 0.000 0.065 Y -0.007
 122841 122842 SMc02841 SMc02842     FALSE 0.443 77.000 0.142 NA   -0.253
 122845 122846 SMc02845 SMc02846     FALSE 0.049 141.000 0.016 NA   -0.201
 122846 122847 SMc02846 SMc02847     FALSE 0.263 38.000 0.000 1.000   0.065
 122851 122852 SMc02851 SMc02852     FALSE 0.428 99.000 0.160 1.000 N -0.316
 122852 122853 SMc02852 SMc02853     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   0.285
 122854 122855 SMc02854 SMc02855     FALSE 0.020 99.000 0.000 NA   -0.032
 122856 122857 SMc02856 SMc02857   dnaK FALSE 0.008 217.000 0.000 1.000 N -0.328
 122857 122858 SMc02857 SMc02858 dnaK dnaJ TRUE 0.671 275.000 0.236 0.003 Y 0.023
 122859 122860 SMc02859 SMc02860     TRUE 0.984 5.000 0.565 NA   -0.008
 122860 122861 SMc02860 SMc02861   pit FALSE 0.018 114.000 0.000 NA   -0.022
 122861 122862 SMc02861 SMc02862 pit   TRUE 0.995 0.000 0.396 NA Y 0.078
 122863 122864 SMc02863 SMc02864 recF thiF FALSE 0.406 39.000 0.019 1.000 N -0.247
 122864 122865 SMc02864 SMc02865 thiF   TRUE 0.936 8.000 0.196 1.000   -0.125
 122866 122867 SMc02866 SMc02867     TRUE 0.692 62.000 0.182 1.000 N 0.035
 122867 122868 SMc02867 SMc02868     TRUE 0.990 11.000 0.909 1.000 N 0.280
 122868 122869 SMc02868 SMc02869     FALSE 0.004 477.000 0.000 1.000 N -0.129
 122869 122870 SMc02869 SMc02870     TRUE 0.964 -31.000 0.463 1.000   -0.045
 122870 122871 SMc02870 SMc02871     TRUE 0.986 -3.000 0.415 1.000   0.020
 122871 122872 SMc02871 SMc02872     TRUE 0.996 13.000 0.708 0.092 Y 0.146
 122872 122873 SMc02872 SMc02873     TRUE 0.692 269.000 0.456 0.092 Y 0.067
 122873 122874 SMc02873 SMc02874     TRUE 0.726 56.000 0.175 1.000   0.237
 122875 122876 SMc02875 SMc02876     TRUE 0.994 -3.000 0.704 1.000 N 0.093
 122876 122877 SMc02876 SMc02877     TRUE 0.776 94.000 0.577 1.000 N -0.169
 122877 122878 SMc02877 SMc02878   nagA TRUE 0.988 -3.000 0.369 1.000 N 0.548
 122879 122880 SMc02879 SMc02880     TRUE 0.936 -3.000 0.033 NA N 0.836
 122880 122881 SMc02880 SMc02881     TRUE 0.837 -3.000 0.028 NA N -0.340
 122882 122883 SMc02882 SMc02883     FALSE 0.171 77.000 0.007 NA   0.013
 122884 122885 SMc02884 SMc02885   msrA1 FALSE 0.024 285.000 0.000 1.000   0.398
 122885 122886 SMc02885 SMc02886 msrA1   FALSE 0.474 53.000 0.026 NA   0.532
 122887 5451313 SMc02887 SMc05001     FALSE 0.442 -120.000 0.000 NA   NA
 5451313 122888 SMc05001 SMc02888     FALSE 0.091 88.000 0.000 NA   NA
 122889 122890 SMc02889 SMc02890     TRUE 0.950 -3.000 0.083 NA   0.356
 122890 122891 SMc02890 SMc02891     TRUE 0.894 12.000 0.083 1.000 N 0.143
 122896 122897 SMc02896 SMc02897 ilvE1   FALSE 0.082 172.000 0.000 1.000 N 0.286
 122898 122899 SMc02898 SMc02899 kdsB pheA TRUE 0.808 25.000 0.083 1.000 N 0.340
 122899 122900 SMc02899 SMc02900 pheA   FALSE 0.004 171.000 0.000 NA   -0.112
 122901 122902 SMc02901 SMc02902     TRUE 0.501 93.000 0.167 NA   0.160
 122902 122903 SMc02902 SMc02903     TRUE 0.854 7.000 0.028 NA N 0.117
 122903 122904 SMc02903 SMc02904     TRUE 0.959 3.000 0.108 1.000 N 0.346
 5451314 122905 SMc05021 SMc02905 SRP dnaX FALSE 0.079 97.000 0.000 NA   NA
 122905 122906 SMc02905 SMc02906 dnaX   TRUE 0.679 109.000 0.411 NA   0.463
 122906 122907 SMc02906 SMc02907     FALSE 0.016 76.000 0.000 NA   -0.125
 122907 122908 SMc02907 SMc02908   recR FALSE 0.340 51.000 0.000 1.000 N 0.185
 122908 122909 SMc02908 SMc02909 recR   FALSE 0.402 38.000 0.014 1.000 N -0.169
 122911 122912 SMc02911 SMc02912   nusA TRUE 0.942 46.000 0.759 NA   0.641
 122912 122913 SMc02912 SMc02913 nusA   TRUE 0.990 6.000 0.323 NA Y 0.145
 122913 122914 SMc02913 SMc02914   infB FALSE 0.417 106.000 0.171 NA N -0.097
 122914 122915 SMc02914 SMc00320 infB rbfA TRUE 0.805 160.000 0.530 1.000 Y 0.088
 122915 122916 SMc00320 SMc00321 rbfA truB TRUE 0.985 13.000 0.318 1.000 Y 0.354
 122916 122917 SMc00321 SMc00322 truB   FALSE 0.032 309.000 0.003 NA N 0.448
 122917 122918 SMc00322 SMc00323   rpsO FALSE 0.055 239.000 0.002 NA N 0.594
 122918 122919 SMc00323 SMc00324 rpsO pnp FALSE 0.349 368.000 0.335 1.000 Y 0.523
 122919 122920 SMc00324 SMc00325 pnp   TRUE 0.712 80.000 0.021 1.000 Y 0.387
 122921 122922 SMc00326 SMc00327 fabI2 fabB TRUE 0.989 5.000 0.265 1.000 Y 0.054
 122922 122923 SMc00327 SMc00328 fabB fabA TRUE 0.959 50.000 0.451 1.000 Y 0.389
 122925 122926 SMc00330 SMc00331     FALSE 0.384 64.000 0.018 NA   0.538
 122926 403033 SMc00331 SMc00435   tRNA-ALA_GGC FALSE 0.167 55.000 0.000 NA   NA
 403033 122927 SMc00435 SMc00332 tRNA-ALA_GGC   FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 122928 122929 SMc00333 SMc00334 aroA cmk TRUE 0.977 0.000 0.209 1.000 N 0.104
 122929 122930 SMc00334 SMc00335 cmk rpsA FALSE 0.465 164.000 0.281 1.000 N 0.275
 122934 122935 SMc00339 SMc00340 cyaA   FALSE 0.431 94.000 0.143 1.000 N -0.254
 122935 122936 SMc00340 SMc00341     TRUE 0.532 86.000 0.143 NA   0.422
 122937 122938 SMc00342 SMc00343   TRm20 FALSE 0.002 335.000 0.000 1.000   -0.137
 122938 122939 SMc00343 SMc00344 TRm20   FALSE 0.039 620.000 0.000 1.000 Y 0.052
 122942 122943 SMc00347 SMc00348 rnk   FALSE 0.001 399.000 0.000 NA   -0.257
 122943 122944 SMc00348 SMc00349   lepA TRUE 0.619 12.000 0.005 NA   0.039
 122944 122945 SMc00349 SMc00350 lepA   FALSE 0.336 59.000 0.002 1.000 N 0.056
 122946 122947 SMc00351 SMc00352     TRUE 0.974 2.000 0.205 1.000 N 0.107
 122950 122951 SMc00355 SMc00356   genX TRUE 0.970 -3.000 0.174 1.000 N 0.028
 122952 122953 SMc00357 SMc00358 efp cfa1 FALSE 0.085 213.000 0.002 1.000 N 0.567
 122953 122954 SMc00358 SMc00359 cfa1   FALSE 0.021 275.000 0.000 1.000   0.233
 122955 122956 SMc00360 SMc00361     FALSE 0.006 284.000 0.000 NA   0.050
 122957 122958 SMc00362 SMc00363 infC rpmI TRUE 0.712 241.000 0.652 1.000 Y 0.352
 122958 122959 SMc00363 SMc00364 rpmI rplT TRUE 0.995 37.000 0.928 0.010 Y 0.793
 122959 122960 SMc00364 SMc00365 rplT pheS TRUE 0.662 146.000 0.202 1.000 Y 0.081
 122960 122961 SMc00365 SMc00366 pheS pheT TRUE 0.993 34.000 0.574 0.000 Y -0.048
 122962 122963 SMc00367 SMc00368     FALSE 0.287 166.000 0.154 1.000   0.096
 122963 122964 SMc00368 SMc00369     TRUE 0.872 18.000 0.000 0.052   0.110
 122967 122968 SMc00372 SMc00373     FALSE 0.276 141.000 0.095 NA   0.547
 122972 122973 SMc00377 SMc00378     FALSE 0.102 119.000 0.000 1.000   0.254
 122973 122974 SMc00378 SMc00379     TRUE 0.858 0.000 0.007 1.000   0.040
 122977 122978 SMc00382 SMc00383   gst3 TRUE 0.648 71.000 0.127 1.000 N 0.473
 122980 122981 SMc00385 SMc00386     TRUE 0.879 4.000 0.018 NA   0.560
 122981 122982 SMc00386 SMc00387   tatA FALSE 0.062 209.000 0.000 1.000 N 0.432
 122982 122983 SMc00387 SMc00388 tatA   FALSE 0.164 98.000 0.000 1.000   0.654
 122983 122984 SMc00388 SMc00389     FALSE 0.125 98.000 0.000 NA   0.524
 122984 122985 SMc00389 SMc00390     TRUE 0.742 5.000 0.000 NA   0.523
 122986 122987 SMc00391 SMc00392     FALSE 0.032 44.000 0.000 NA   -0.112
 122987 122988 SMc00392 SMc00393     TRUE 0.984 0.000 0.333 NA   0.309
 122989 122990 SMc00394 SMc00395 guaA pfs TRUE 0.584 107.000 0.012 1.000 Y 0.437
 122990 122991 SMc00395 SMc00396 pfs   TRUE 0.944 -3.000 0.048 1.000 N 0.185
 122993 122994 SMc00460 SMc00399   corA1 FALSE 0.004 214.000 0.000 NA   -0.045
 122994 122995 SMc00399 SMc00400 corA1   FALSE 0.027 220.000 0.000 NA   0.264
 122995 122996 SMc00400 SMc00401     TRUE 0.992 0.000 0.713 NA   0.074
 122996 122997 SMc00401 SMc00402     TRUE 0.873 49.000 0.436 NA N 0.053
 122997 122998 SMc00402 SMc00403     FALSE 0.173 155.000 0.029 NA N 0.476
 122998 122999 SMc00403 SMc00404     FALSE 0.158 137.000 0.020 NA   0.585
 122999 123000 SMc00404 SMc00405     FALSE 0.006 461.000 0.000 NA   0.246
 123000 123001 SMc00405 SMc00406     TRUE 0.561 60.000 0.055 1.000 N 0.215
 123001 123002 SMc00406 SMc00407   gst4 TRUE 0.935 11.000 0.213 1.000 N -0.156
 123004 123005 SMc00409 SMc00410     FALSE 0.029 249.000 0.006 NA   0.088
 123005 123006 SMc00410 SMc00411     FALSE 0.168 121.000 0.028 NA   0.142
 123006 123007 SMc00411 SMc00412   pyrF FALSE 0.193 106.000 0.044 NA   -0.037
 123007 123008 SMc00412 SMc00413 pyrF   TRUE 0.839 8.000 0.018 NA N 0.192
 123008 123009 SMc00413 SMc00414     TRUE 0.908 15.000 0.256 NA N -0.218
 123009 123010 SMc00414 SMc00415   dnaN FALSE 0.060 204.000 0.002 1.000 N 0.008
 123011 123012 SMc00416 SMc00418     TRUE 0.910 -10.000 0.165 1.000   -0.273
 123012 123013 SMc00418 SMc00419   gshB1 FALSE 0.145 205.000 0.064 1.000 N 0.081
 123013 123014 SMc00419 SMc00420 gshB1   FALSE 0.159 186.000 0.041 1.000 N 0.179
 123015 123016 SMc00421 SMc00422 cysK1   TRUE 0.553 139.000 0.132 1.000 Y -0.246
 123022 123023 SMc00428 SMc00429     TRUE 0.593 85.000 0.281 NA   -0.168
 123025 123026 SMc00431 SMc00432   iolB FALSE 0.346 77.000 0.013 1.000   0.488
 123026 123027 SMc00432 SMc00433 iolB iolE FALSE 0.473 155.000 0.038 1.000 Y 0.241
 123027 123028 SMc00433 SMc01166 iolE iolD FALSE 0.024 172.000 0.000 1.000 N -0.163
 123028 123029 SMc01166 SMc01165 iolD iolC FALSE 0.349 50.000 0.014 1.000   -0.035
 123029 123030 SMc01165 SMc01164 iolC   FALSE 0.172 120.000 0.014 1.000   0.180
 123030 123031 SMc01164 SMc01163     FALSE 0.021 310.000 0.000 1.000   0.455
 123034 123035 SMc01160 SMc01159     TRUE 0.925 -10.000 0.195 NA N -0.216
 123036 123037 SMc01158 SMc01157     FALSE 0.062 105.000 0.000 NA   0.114
 123037 123038 SMc01157 SMc01156   aarF FALSE 0.096 88.000 0.000 1.000   0.036
 123038 123039 SMc01156 SMc01155 aarF ubiE TRUE 0.938 5.000 0.115 1.000   0.108
 123040 123041 SMc01154 SMc01153 fpg   FALSE 0.271 58.000 0.003 1.000 N -0.107
 123041 123042 SMc01153 SMc01152   rpsT FALSE 0.098 192.000 0.002 1.000 N 0.284
 123042 123043 SMc01152 SMc01167 rpsT dnaA FALSE 0.004 926.000 0.000 1.000 N -0.002
 123043 123044 SMc01167 SMc01151 dnaA   FALSE 0.050 124.000 0.002 1.000   -0.228
 123044 123045 SMc01151 SMc01150     TRUE 0.995 -3.000 0.867 1.000   0.085
 123045 123046 SMc01150 SMc01149     TRUE 0.539 75.000 0.152 NA   0.023
 123046 123047 SMc01149 SMc01148     TRUE 0.633 16.000 0.030 NA   -0.034
 123048 123049 SMc01147 SMc01146     TRUE 0.950 12.000 0.218 1.000 N 0.326
 123049 123050 SMc01146 SMc01145     TRUE 0.582 31.000 0.013 NA N 0.307
 123050 123051 SMc01145 SMc01144   rph FALSE 0.067 237.000 0.019 NA N 0.293
 123052 123053 SMc01143 SMc01142 hrcA grpE FALSE 0.206 159.000 0.120 NA N -0.147
 123054 123055 SMc01141 SMc01140 ptsN   FALSE 0.481 175.000 0.353 NA N 0.331
 123055 123056 SMc01140 SMc01139   rpoN FALSE 0.024 279.000 0.000 NA N 0.374
 123056 123057 SMc01139 SMc01138 rpoN   FALSE 0.069 176.000 0.000 1.000   0.392
 123057 123058 SMc01138 SMc01137     TRUE 0.966 14.000 0.543 NA   0.056
 123058 123059 SMc01137 SMc01136     TRUE 0.751 32.000 0.144 NA   0.032
 123060 123061 SMc01135 SMc01134   ihfB FALSE 0.474 104.000 0.142 1.000 N 0.123
 123061 123062 SMc01134 SMc01133 ihfB   FALSE 0.184 181.000 0.085 NA   0.242
 123064 123065 SMc01131 SMc01130     TRUE 0.976 -3.000 0.213 NA   0.393
 123065 123066 SMc01130 SMc01129   lspA TRUE 0.951 -3.000 0.104 1.000 N -0.090
 123066 123067 SMc01129 SMc01128 lspA   FALSE 0.028 507.000 0.062 1.000 N 0.098
 123067 123068 SMc01128 SMc01127     FALSE 0.300 118.000 0.130 NA   -0.049
 123070 123071 SMc01125 SMc01124 mutS glnD FALSE 0.237 102.000 0.021 1.000 N 0.049
 123071 123072 SMc01124 SMc01123 glnD mviN TRUE 0.920 -3.000 0.081 1.000   -0.268
 123072 123073 SMc01123 SMc01122 mviN   TRUE 0.879 -3.000 0.008 1.000   0.107
 123073 123074 SMc01122 SMc01121   trpS FALSE 0.244 92.000 0.016 1.000   0.124
 123074 123075 SMc01121 SMc01120 trpS   FALSE 0.424 53.000 0.042 1.000   -0.097
 123075 123076 SMc01120 SMc01119     FALSE 0.330 159.000 0.151 1.000   0.413
 123076 123077 SMc01119 SMc01118     FALSE 0.302 237.000 0.061 1.000 Y 0.186
 123077 123078 SMc01118 SMc01117   rimI TRUE 0.689 55.000 0.209 1.000   -0.227
 123078 123079 SMc01117 SMc01116 rimI olsA FALSE 0.444 120.000 0.022 0.094   0.271
 123079 123080 SMc01116 SMc01115 olsA   TRUE 0.560 50.000 0.030 1.000 N 0.211
 123080 123081 SMc01115 SMc01114     TRUE 0.966 5.000 0.220 1.000 N 0.092
 123081 123082 SMc01114 SMc01113     TRUE 0.953 17.000 0.457 NA   0.265
 123082 123083 SMc01113 SMc01112     TRUE 0.913 13.000 0.222 NA   -0.073
 123083 123084 SMc01112 SMc01111   lnt FALSE 0.316 154.000 0.213 NA   -0.046
 123084 123085 SMc01111 SMc01110 lnt phrR FALSE 0.472 139.000 0.231 1.000 N 0.171
 123085 123086 SMc01110 SMc01109 phrR metK FALSE 0.084 337.000 0.113 1.000 N 0.300
 123086 123087 SMc01109 SMc01108 metK   FALSE 0.255 166.000 0.112 1.000   0.187
 123088 123089 SMc01107 SMc01106     TRUE 0.948 49.000 0.955 NA   NA
 123091 123092 SMc01104 SMc01103 mcpX rbsK FALSE 0.003 355.000 0.000 1.000 N -0.272
 123092 123093 SMc01103 SMc01102 rbsK   FALSE 0.231 106.000 0.024 NA   0.424
 123094 123095 SMc01101 SMc01100 def1 fmt TRUE 0.899 70.000 0.050 0.016 Y -0.051
 123095 123096 SMc01100 SMc01099 fmt truA TRUE 0.985 0.000 0.069 1.000 Y 0.086
 123097 123098 SMc01098 SMc01394 TRm19C TRm19N TRUE 0.902 -133.000 0.000 0.016   -0.020
 123098 123099 SMc01394 SMc01097 TRm19N   FALSE 0.012 254.000 0.000 NA   0.106
 123099 123100 SMc01097 SMc01096   dapE TRUE 0.836 -13.000 0.050 NA   0.130
 123100 123101 SMc01096 SMc01095 dapE mexF1 FALSE 0.053 187.000 0.005 1.000 N -0.165
 123101 123102 SMc01095 SMc01094 mexF1 mexE1 TRUE 0.541 129.000 0.361 1.000 N -0.114
 123102 123103 SMc01094 SMc01093 mexE1   TRUE 0.791 52.000 0.298 1.000 N -0.249
 123105 123106 SMc01091 SMc01090   deaD FALSE 0.015 79.000 0.000 NA   -0.235
 123106 123107 SMc01090 SMc01089 deaD   FALSE 0.116 153.000 0.017 1.000   0.079
 123107 123108 SMc01089 SMc01732   dapD TRUE 0.773 3.000 0.009 1.000   -0.123
 123111 123112 SMc01729 SMc01728   ada FALSE 0.017 74.000 0.000 NA   -0.270
 123112 123113 SMc01728 SMc01727 ada   TRUE 0.806 38.000 0.160 1.000 N 0.201
 123115 123116 SMc01725 SMc01724     FALSE 0.099 108.000 0.000 NA   0.365
 123117 123118 SMc01723 SMc01722     FALSE 0.024 129.000 0.002 NA   -0.224
 123118 123119 SMc01722 SMc01721     FALSE 0.136 352.000 0.082 0.058   -0.033
 123119 123120 SMc01721 SMc01720   rnpA TRUE 0.966 -3.000 0.105 1.000 N 0.312
 123120 123121 SMc01720 SMc04434 rnpA rpmH TRUE 0.990 34.000 0.787 0.000   0.372
 123122 123123 SMc01719 SMc01718 mcpT   FALSE 0.032 244.000 0.000 1.000   0.334
 123123 123124 SMc01718 SMc01717   merA1 TRUE 0.981 23.000 0.320 0.001   0.381
 123124 123125 SMc01717 SMc01716 merA1   TRUE 0.697 75.000 0.287 1.000 N -0.202
 123125 402987 SMc01716 SMc01733   tRNA-ARG_ACG FALSE 0.056 120.000 0.000 NA   NA
 123127 123128 SMc01714 SMc01713     FALSE 0.026 209.000 0.000 NA   0.195
 123128 123129 SMc01713 SMc01712   lldD2 FALSE 0.419 22.000 0.000 NA   0.312
 123129 123130 SMc01712 SMc01711 lldD2   FALSE 0.001 627.000 0.000 1.000   -0.183
 123130 123131 SMc01711 SMc01710     TRUE 0.523 119.000 0.000 0.000   -0.064
 123131 123132 SMc01710 SMc01709     FALSE 0.472 -208.000 0.000 NA   0.190
 123132 123133 SMc01709 SMc01708     FALSE 0.006 663.000 0.000 NA   0.582
 123133 123134 SMc01708 SMc01707     TRUE 0.650 9.000 0.000 NA   0.325
 123134 123135 SMc01707 SMc01706     FALSE 0.052 110.000 0.000 NA   0.095
 123136 123137 SMc01705 SMc01704     FALSE 0.004 185.000 0.000 NA   -0.345
 123137 123138 SMc01704 SMc01703     FALSE 0.007 514.000 0.000 NA   0.551
 123138 123139 SMc01703 SMc01702     FALSE 0.439 23.000 0.023 NA   -0.139
 123139 123140 SMc01702 SMc01701     FALSE 0.094 89.000 0.005 1.000   -0.248
 123140 123141 SMc01701 SMc02181   putA FALSE 0.035 250.000 0.005 1.000   0.082
 123141 123142 SMc02181 SMc02180 putA   FALSE 0.092 187.000 0.038 NA   0.032
 123142 123143 SMc02180 SMc02179     FALSE 0.263 59.000 0.038 NA   -0.271
 123143 123144 SMc02179 SMc02178     FALSE 0.008 112.000 0.000 NA   -0.143
 123146 123147 SMc02176 SMc02175 cyaD1   TRUE 0.811 62.000 0.062 1.000 Y 0.154
 123149 123150 SMc02173 SMc02172     TRUE 0.987 5.000 0.188 1.000 Y 0.147
 123151 123152 SMc02171 SMc02170     TRUE 0.634 282.000 0.676 NA Y 0.652
 123152 123153 SMc02170 SMc02169     TRUE 0.998 0.000 0.797 0.020   0.163
 123153 123154 SMc02169 SMc02167     TRUE 0.891 -3.000 0.020 1.000   0.052
 123154 123155 SMc02167 SMc02166   pyrC FALSE 0.090 190.000 0.009 1.000 N 0.084
 123155 123156 SMc02166 SMc02165 pyrC pyrE TRUE 0.927 18.000 0.072 1.000 Y -0.104
 123156 123157 SMc02165 SMc02164 pyrE frk FALSE 0.477 57.000 0.039 1.000 N 0.000
 123158 123159 SMc02163 SMc02162 pgi fadD FALSE 0.045 316.000 0.018 1.000 N 0.481
 123160 123161 SMc02161 SMc02160     FALSE 0.140 60.000 0.000 NA   0.122
 123161 123162 SMc02160 SMc02159     FALSE 0.011 96.000 0.000 NA   -0.095
 123162 123163 SMc02159 SMc02158     TRUE 0.991 -3.000 0.246 1.000 Y -0.120
 123163 123164 SMc02158 SMc02157     TRUE 0.984 8.000 0.595 1.000   0.101
 123164 123165 SMc02157 SMc02156     FALSE 0.059 151.000 0.000 1.000   0.131
 123165 123166 SMc02156 SMc02187     FALSE 0.004 320.000 0.000 1.000   -0.102
 123166 123167 SMc02187 SMc02202     TRUE 0.955 -10.000 0.250 NA   0.253
 123167 123168 SMc02202 SMc02201     TRUE 0.515 157.000 0.400 NA   0.240
 123169 123170 SMc02189 SMc02200     TRUE 0.995 2.000 1.000 NA   0.288
 123171 123172 SMc02184 SMc02199     FALSE 0.001 280.000 0.000 NA   -0.204
 123172 123173 SMc02199 SMc02203     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA   0.223
 123174 123175 SMc02155 SMc02154     TRUE 0.896 15.000 0.259 NA   -0.291
 123175 123176 SMc02154 SMc04429     TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   0.348
 123176 123177 SMc04429 SMc02153     FALSE 0.225 2.000 0.000 NA   -0.224
 123177 123178 SMc02153 SMc02152     TRUE 0.980 -3.000 0.031 0.063   0.275
 123178 123179 SMc02152 SMc02151     FALSE 0.260 48.000 0.000 1.000   0.118
 123179 403032 SMc02151 SMc02183   tRNA-THR_CGT FALSE 0.003 830.000 0.000 NA   NA
 403032 123180 SMc02183 SMc02150 tRNA-THR_CGT   FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 123183 123184 SMc02147 SMc02146 phoR   FALSE 0.115 195.000 0.056 1.000 N -0.121
 123184 123185 SMc02146 SMc02145     FALSE 0.012 92.000 0.000 NA   -0.239
 123185 123186 SMc02145 SMc02144   pstC FALSE 0.102 -33.000 0.000 NA   -0.237
 123186 123187 SMc02144 SMc02143 pstC pstA TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.001 Y 0.432
 123187 123188 SMc02143 SMc02142 pstA pstB TRUE 0.996 14.000 0.402 0.001 Y 0.301
 123188 123189 SMc02142 SMc02141 pstB phoU TRUE 0.830 87.000 0.203 NA Y 0.464
 123189 123190 SMc02141 SMc02140 phoU phoB FALSE 0.323 111.000 0.128 NA N -0.162
 123192 123193 SMc02138 SMc02137 argD argF1 TRUE 0.781 75.000 0.058 1.000 Y 0.404
 123193 123194 SMc02137 SMc02136 argF1   FALSE 0.041 367.000 0.052 1.000 N 0.106
 123198 402988 SMc02218 SMc02206   tRNA-GLY_CCC FALSE 0.186 50.000 0.000 NA   NA
 402988 123199 SMc02206 SMc02219 tRNA-GLY_CCC   FALSE 0.455 -60.000 0.000 NA   NA
 123200 123201 SMc02220 SMc02221     FALSE 0.347 79.000 0.029 NA   0.416
 123201 123202 SMc02221 SMc02222     FALSE 0.411 113.000 0.143 NA   0.330
 123202 123203 SMc02222 SMc02223     TRUE 0.917 10.000 0.185 1.000   -0.256
 123207 123208 SMc02227 SMc02228 fadB fadA TRUE 0.983 22.000 0.562 1.000 Y 0.058
 123208 123209 SMc02228 SMc02229 fadA   TRUE 0.793 106.000 0.247 1.000 Y 0.076
 123210 123211 SMc02230 SMc02231     FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   -0.168
 123211 123212 SMc02231 SMc02232     FALSE 0.017 338.000 0.000 1.000   0.384
 123212 123213 SMc02232 SMc02234     TRUE 0.980 0.000 0.274 NA   0.266
 123213 123214 SMc02234 SMc02235     FALSE 0.110 99.000 0.012 NA   -0.051
 123215 123216 SMc02236 SMc02237     FALSE 0.282 244.000 0.460 1.000   -0.347
 123217 123218 SMc02238 SMc02239     TRUE 0.830 39.000 0.262 NA   0.119
 123219 123220 SMc02240 SMc02241     FALSE 0.340 109.000 0.162 NA   -0.205
 123221 123222 SMc02242 SMc02243     TRUE 0.971 3.000 0.275 NA   0.024
 123222 123223 SMc02243 SMc02244   dinF FALSE 0.263 47.000 0.030 NA   -0.407
 123224 123225 SMc02245 SMc02246 pyrD   TRUE 0.959 -3.000 0.108 NA   0.492
 123226 123227 SMc02247 SMc02248     FALSE 0.449 142.000 0.367 NA   -0.191
 123229 123230 SMc02250 SMc02251 mscL   FALSE 0.150 134.000 0.012 1.000 N 0.086
 123230 123231 SMc02251 SMc02252   galE FALSE 0.227 181.000 0.080 1.000 N 0.316
 123232 123233 SMc02253 SMc02254 pchB qxtB FALSE 0.017 235.000 0.000 1.000 N -0.088
 123233 123234 SMc02254 SMc02255 qxtB qxtA TRUE 0.987 -10.000 0.041 0.067 Y 0.261
 123234 123235 SMc02255 SMc02256 qxtA hipO2 TRUE 0.539 139.000 0.333 1.000   0.237
 123235 123236 SMc02256 SMc02257 hipO2   TRUE 0.936 -10.000 0.188 1.000   0.026
 123236 123237 SMc02257 SMc02258     TRUE 0.999 -3.000 0.938 0.011 Y 0.121
 123237 123238 SMc02258 SMc02259     TRUE 0.963 108.000 0.933 0.090 Y -0.109
 123238 123239 SMc02259 SMc02260     TRUE 0.985 37.000 0.933 1.000 Y 0.067
 123240 123241 SMc02261 SMc02262     TRUE 0.683 24.000 0.016 1.000 N 0.230
 123241 123242 SMc02262 SMc02263   ilvB1 TRUE 0.997 -3.000 0.714 1.000 Y -0.158
 123242 123243 SMc02263 SMc02264 ilvB1   FALSE 0.228 190.000 0.154 NA   0.131
 123243 123244 SMc02264 SMc02265   secD2 FALSE 0.322 94.000 0.077 NA   0.047
 123244 123245 SMc02265 SMc02266 secD2   FALSE 0.000 549.000 0.000 NA   -0.220
 123245 123246 SMc02266 SMc02267     FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   -0.198
 123246 123247 SMc02267 SMc02268   kpsF3 FALSE 0.053 184.000 0.000 NA N 0.215
 123248 123249 SMc02269 SMc02270 rkpJ rkpI TRUE 0.894 24.000 0.028 1.000 Y 0.044
 123249 123250 SMc02270 SMc02271 rkpI rkpH TRUE 0.612 82.000 0.039 0.093   0.083
 123250 123251 SMc02271 SMc02272 rkpH rkpG TRUE 0.850 40.000 0.300 1.000   0.057
 123251 123252 SMc02272 SMc02273 rkpG rkpA TRUE 0.998 -3.000 0.714 0.018 N 0.170
 123253 123254 SMc02274 SMc02275 rkpU pncA FALSE 0.014 310.000 0.000 1.000 N 0.028
 123254 123255 SMc02275 SMc02276 pncA pncB FALSE 0.221 117.000 0.053 1.000 N -0.122
 123255 123256 SMc02276 SMc02277 pncB   FALSE 0.054 136.000 0.000 NA   0.204
 123258 123259 SMc02279 SMc02280     FALSE 0.026 53.000 0.000 NA   -0.182
 123259 123260 SMc02280 SMc02281     TRUE 0.743 -3.000 0.000 NA   0.182
 123260 123261 SMc02281 SMc02282     TRUE 0.606 15.000 0.000 1.000 N 0.144
 123261 123262 SMc02282 SMc02283     TRUE 0.854 40.000 0.000 0.005 N 0.350
 123262 123263 SMc02283 SMc02284     FALSE 0.285 22.000 0.000 NA   0.094
 123263 123264 SMc02284 SMc02285   cyaE FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   0.111
 123264 123265 SMc02285 SMc02326 cyaE   FALSE 0.028 265.000 0.000 1.000   0.437
 123266 123267 SMc02327 SMc02328 rnhA2   FALSE 0.009 107.000 0.000 NA   -0.275
 123267 123268 SMc02328 SMc02286     FALSE 0.003 223.000 0.000 NA   -0.108
 123268 123269 SMc02286 SMc02287     FALSE 0.078 81.000 0.000 NA   0.080
 123269 123270 SMc02287 SMc02289   TRm11b FALSE 0.021 914.000 0.000 NA Y -0.339
 123271 123272 SMc02291 SMc02292 TRm11a hsdR FALSE 0.015 376.000 0.000 1.000 N 0.192
 123272 123273 SMc02292 SMc02295 hsdR hsdS TRUE 0.995 4.000 0.040 0.000 Y 0.154
 123273 123274 SMc02295 SMc02296 hsdS hsdM TRUE 0.994 -3.000 0.064 0.063 Y 0.071
 123274 123275 SMc02296 SMc02297 hsdM   FALSE 0.364 110.000 0.000 0.063   -0.141
 123276 123277 SMc02298 SMc02329 TRm1a TRm1b TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.063   -0.014
 123278 123279 SMc02300 SMc02301 TRm30.4 TRm30.3 TRUE 0.909 -10.000 0.188 NA   -0.296
 123279 123280 SMc02301 SMc02302 TRm30.3 TRm30.2 FALSE 0.095 -70.000 0.000 NA   -0.412
 123280 123281 SMc02302 SMc04430 TRm30.2 TRm30.1 FALSE 0.049 181.000 0.000 NA   0.394
 123283 123284 SMc02304 SMc02305   murA FALSE 0.044 171.000 0.028 NA   -0.425
 123284 123285 SMc02305 SMc02306 murA   FALSE 0.216 155.000 0.138 NA   -0.101
 123285 123286 SMc02306 SMc02307   hisD1 FALSE 0.411 65.000 0.096 NA   -0.259
 123286 123287 SMc02307 SMc02308 hisD1   TRUE 0.959 -3.000 0.157 NA   0.007
 123287 123288 SMc02308 SMc02309     TRUE 0.979 14.000 0.768 NA   0.163
 123288 123289 SMc02309 SMc02310   infA FALSE 0.403 158.000 0.293 1.000 N -0.200
 123289 123290 SMc02310 SMc02311 infA maf TRUE 0.573 98.000 0.207 NA N 0.240
 123290 123291 SMc02311 SMc02312 maf   TRUE 0.933 5.000 0.102 NA   0.287
 123291 402989 SMc02312 SMc02207   tRNA-PHE_GAA FALSE 0.016 240.000 0.000 NA   NA
 402989 123292 SMc02207 SMc04431 tRNA-PHE_GAA   FALSE 0.012 269.000 0.000 NA   NA
 123292 123293 SMc04431 SMc04432     TRUE 0.962 -3.000 0.200 NA   -0.129
 123295 123296 SMc02314 SMc02315     TRUE 0.541 -13.000 0.000 NA   0.170
 123296 123297 SMc02315 SMc02316     FALSE 0.041 203.000 0.000 NA   0.500
 123298 123299 SMc02317 SMc02318     FALSE 0.055 147.000 0.000 NA   0.275
 123299 123300 SMc02318 SMc02319     FALSE 0.079 80.000 0.008 NA   -0.221
 123300 123301 SMc02319 SMc02320     TRUE 0.826 71.000 0.500 NA   0.088
 123301 123302 SMc02320 SMc02321     FALSE 0.014 192.000 0.000 NA   0.033
 123302 123303 SMc02321 SMc02322     TRUE 0.868 14.000 0.147 NA   -0.017
 123304 123305 SMc02323 SMc02324     TRUE 0.827 114.000 0.357 NA Y 0.335
 123305 123306 SMc02324 SMc02325     TRUE 0.666 190.000 0.446 NA Y -0.183
 123306 123307 SMc02325 SMc03000     TRUE 0.999 -3.000 0.794 0.020 Y 0.251
 123307 123308 SMc03000 SMc03001     TRUE 0.999 0.000 0.515 0.020 Y 0.451
 123308 123309 SMc03001 SMc03002     TRUE 0.929 11.000 0.168 NA   0.297
 123309 123310 SMc03002 SMc03003     TRUE 0.966 -3.000 0.147 NA   0.352
 123310 123311 SMc03003 SMc03004   mcpE FALSE 0.008 707.000 0.000 1.000 N 0.272
 123311 123312 SMc03004 SMc03005 mcpE   TRUE 0.849 26.000 0.217 NA   0.059
 123312 123313 SMc03005 SMc03006   cheY1 TRUE 0.986 4.000 0.525 NA   0.165
 123313 123314 SMc03006 SMc03007 cheY1 cheA TRUE 0.989 21.000 0.711 1.000 Y 0.293
 123314 123315 SMc03007 SMc03008 cheA cheW1 TRUE 0.992 6.000 0.044 0.005 Y 0.135
 123315 123316 SMc03008 SMc03009 cheW1 cheR TRUE 0.983 -3.000 0.031 1.000 Y 0.364
 123316 123317 SMc03009 SMc03010 cheR cheB TRUE 0.996 -3.000 0.439 1.000 Y 0.182
 123317 123318 SMc03010 SMc03011 cheB cheY2 TRUE 0.997 0.000 0.258 0.016 Y -0.322
 123318 123319 SMc03011 SMc03012 cheY2 cheD TRUE 0.994 -3.000 0.320 1.000 Y -0.024
 123319 123320 SMc03012 SMc03013 cheD   TRUE 0.839 30.000 0.200 NA   0.243
 123320 123321 SMc03013 SMc03014   fliF FALSE 0.029 1066.000 0.158 NA   0.348
 123321 123322 SMc03014 SMc03015 fliF   FALSE 0.007 827.000 0.000 1.000 N 0.285
 123322 123323 SMc03015 SMc03016     TRUE 0.997 12.000 0.667 0.031 Y -0.396
 123324 123325 SMc03017 SMc03018   flhB TRUE 0.992 -3.000 0.595 NA   0.331
 123325 123326 SMc03018 SMc03019 flhB fliG TRUE 0.704 212.000 0.571 1.000 Y -0.021
 123326 123327 SMc03019 SMc03020 fliG fliN TRUE 0.985 88.000 0.875 0.003 Y 0.100
 123327 123328 SMc03020 SMc03021 fliN fliM TRUE 0.979 20.000 0.485 NA Y 0.039
 123328 123329 SMc03021 SMc03022 fliM motA TRUE 0.998 2.000 0.879 NA Y 0.205
 123330 123331 SMc03023 SMc03024   flgF TRUE 0.974 2.000 0.279 NA   0.061
 123331 123332 SMc03024 SMc03025 flgF fliI TRUE 0.969 46.000 0.529 1.000 Y 0.475
 123332 123333 SMc03025 SMc03026 fliI   TRUE 0.981 -3.000 0.275 NA   0.439
 123333 123334 SMc03026 SMc03027   flgB FALSE 0.046 308.000 0.040 NA   0.481
 123334 123335 SMc03027 SMc03028 flgB flgC TRUE 0.999 7.000 0.804 0.002 Y 0.085
 123335 123336 SMc03028 SMc03029 flgC fliE TRUE 0.997 0.000 0.115 0.002 Y 0.015
 123336 123337 SMc03029 SMc03030 fliE flgG TRUE 0.998 12.000 0.771 0.003 Y 0.020
 123337 123338 SMc03030 SMc03031 flgG flgA TRUE 0.961 22.000 0.252 NA Y 0.060
 123338 123339 SMc03031 SMc03032 flgA flgI TRUE 0.993 -3.000 0.261 NA Y 0.413
 123339 123340 SMc03032 SMc03033 flgI   TRUE 0.989 -3.000 0.531 NA   0.102
 123340 123341 SMc03033 SMc03034   flgH TRUE 0.991 -3.000 0.592 NA   0.227
 123341 123342 SMc03034 SMc03035 flgH fliL TRUE 0.979 16.000 0.043 0.004 Y -0.099
 123342 123343 SMc03035 SMc03036 fliL fliP TRUE 0.968 8.000 0.043 1.000 Y 0.132
 123343 123344 SMc03036 SMc03037 fliP flaA FALSE 0.105 271.000 0.000 1.000 Y -0.176
 123344 123345 SMc03037 SMc03038 flaA flaB FALSE 0.347 343.000 0.000 0.001 Y 0.669
 123345 123346 SMc03038 SMc03039 flaB flaD FALSE 0.447 266.000 0.000 0.001 Y 0.221
 123346 123347 SMc03039 SMc03040 flaD flaC FALSE 0.344 318.000 0.000 0.001 Y 0.125
 123347 123348 SMc03040 SMc03041 flaC   FALSE 0.009 356.000 0.000 NA   0.217
 123348 123349 SMc03041 SMc03042   motB TRUE 0.980 -3.000 0.263 NA   0.413
 123349 123350 SMc03042 SMc03043 motB motC TRUE 0.989 4.000 0.737 NA   -0.007
 123350 123351 SMc03043 SMc03044 motC motD TRUE 0.984 -3.000 0.379 NA   0.120
 123351 123352 SMc03044 SMc03045 motD   TRUE 0.926 -64.000 0.229 NA   0.143
 123352 123353 SMc03045 SMc03046     FALSE 0.005 272.000 0.000 NA N -0.097
 123353 123354 SMc03046 SMc03047   flgE TRUE 0.713 91.000 0.294 1.000 N 0.441
 123354 123355 SMc03047 SMc03048 flgE flgK TRUE 0.964 84.000 0.400 0.003 Y -0.046
 123355 123356 SMc03048 SMc03049 flgK flgL TRUE 0.999 3.000 0.667 0.003 Y -0.243
 123356 123357 SMc03049 SMc03050 flgL flaF TRUE 0.897 38.000 0.086 NA Y 0.567
 123357 123358 SMc03050 SMc03051 flaF flbT TRUE 0.998 -3.000 0.829 NA Y 0.341
 123358 123359 SMc03051 SMc03052 flbT flgD TRUE 0.993 -9.000 0.528 NA Y 0.273
 123359 123360 SMc03052 SMc03053 flgD fliQ TRUE 0.994 7.000 0.509 NA Y 0.563
 123360 123361 SMc03053 SMc03054 fliQ flhA TRUE 0.940 125.000 0.349 0.001 Y 0.256
 123361 123362 SMc03054 SMc03055 flhA fliR TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.001 Y 0.406
 123362 123363 SMc03055 SMc03056 fliR   TRUE 0.977 5.000 0.350 NA   0.443
 123363 123364 SMc03056 SMc03071     TRUE 0.669 99.000 0.360 NA   0.236
 123364 123365 SMc03071 SMc03072     TRUE 0.620 126.000 0.440 NA   0.255
 123365 123366 SMc03072 SMc03057     TRUE 0.982 0.000 0.438 NA   -0.218
 123370 123371 SMc03061 SMc03062 aglE aglF TRUE 0.824 252.000 0.670 0.089 Y 0.387
 123371 123372 SMc03062 SMc03063 aglF aglG TRUE 0.999 2.000 0.693 0.089 Y 0.309
 123372 123373 SMc03063 SMc03064 aglG aglA TRUE 0.970 30.000 0.387 1.000 Y 0.281
 123373 123374 SMc03064 SMc03065 aglA aglK TRUE 0.985 20.000 0.697 1.000 Y -0.243
 123374 123375 SMc03065 SMc03066 aglK   TRUE 0.528 102.000 0.303 NA   -0.293
 123376 123377 SMc03067 SMc03068 TRm22 edd FALSE 0.015 357.000 0.000 1.000 N 0.151
 123377 123378 SMc03068 SMc03069 edd pgl TRUE 0.831 92.000 0.202 1.000 Y 0.533
 123378 123379 SMc03069 SMc03070 pgl zwf TRUE 0.960 9.000 0.007 1.000 Y 0.676
 123379 123380 SMc03070 SMc00761 zwf ordL2 FALSE 0.072 197.000 0.029 1.000 N -0.254
 123380 123381 SMc00761 SMc00762 ordL2   TRUE 0.991 17.000 0.706 1.000 Y 0.446
 123382 123383 SMc00763 SMc00764     FALSE 0.004 271.000 0.000 NA   -0.008
 123383 123384 SMc00764 SMc00765   mcpZ FALSE 0.001 330.000 0.000 NA   -0.285
 123384 123385 SMc00765 SMc00766 mcpZ   FALSE 0.019 349.000 0.000 1.000 N 0.314
 123386 123387 SMc00767 SMc00768   aceA FALSE 0.255 112.000 0.056 NA   0.173
 123388 123389 SMc00769 SMc00770   potF FALSE 0.068 345.000 0.164 1.000   -0.077
 123389 123390 SMc00770 SMc00771 potF potG TRUE 0.886 118.000 0.541 1.000 Y 0.578
 123390 123391 SMc00771 SMc00772 potG potH TRUE 0.995 5.000 0.545 1.000 Y 0.102
 123391 123392 SMc00772 SMc00773 potH potI TRUE 0.998 4.000 0.758 0.089 Y -0.015
 123395 123396 SMc00775 SMc00776 fbpB   FALSE 0.289 123.000 0.095 1.000 N -0.064
 123397 402990 SMc00777 SMc00841   tRNA-HIS_GTG FALSE 0.036 163.000 0.000 NA   NA
 402990 123398 SMc00841 SMc00778 tRNA-HIS_GTG   FALSE 0.021 216.000 0.000 NA   NA
 123398 123399 SMc00778 SMc00779     TRUE 0.963 12.000 0.417 1.000 N -0.147
 123401 123402 SMc00781 SMc00782 iolA   FALSE 0.043 260.000 0.018 NA   0.259
 123402 123403 SMc00782 SMc00783     TRUE 0.983 -10.000 0.637 NA   0.267
 123405 123406 SMc00785 SMc00786   dppA1 FALSE 0.001 478.000 0.000 NA N -0.358
 123406 123407 SMc00786 SMc00787 dppA1 dppB1 TRUE 0.844 104.000 0.097 0.089 Y 0.388
 123407 123408 SMc00787 SMc00788 dppB1 dppC1 TRUE 0.995 11.000 0.779 1.000 Y 0.373
 123408 123409 SMc00788 SMc00789 dppC1 dppD1 TRUE 0.997 2.000 0.560 1.000 Y 0.525
 123409 123410 SMc00789 SMc00790 dppD1 dppF1 TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.007   0.437
 123410 123411 SMc00790 SMc00791 dppF1   FALSE 0.208 65.000 0.022 NA   -0.117
 123411 123412 SMc00791 SMc00792     FALSE 0.168 153.000 0.056 NA   0.150
 123412 123413 SMc00792 SMc00793     FALSE 0.228 102.000 0.047 NA   0.023
 123414 123415 SMc00794 SMc00795     FALSE 0.001 525.000 0.000 1.000   -0.237
 123416 123417 SMc00796 SMc00797     FALSE 0.002 241.000 0.000 NA   -0.151
 123417 123418 SMc00797 SMc00798     FALSE 0.169 155.000 0.091 NA   -0.064
 123419 123420 SMc00799 SMc00800     FALSE 0.264 111.000 0.080 NA   0.038
 123421 123422 SMc00801 SMc00802     FALSE 0.008 202.000 0.000 NA   -0.019
 123424 123425 SMc00804 SMc00805     TRUE 0.687 34.000 0.055 1.000   0.302
 123425 123426 SMc00805 SMc00806     FALSE 0.018 274.000 0.000 NA   0.346
 123427 123428 SMc00807 SMc00808   chrA FALSE 0.182 79.000 0.000 1.000 N 0.077
 123428 123429 SMc00808 SMc00809 chrA   FALSE 0.008 371.000 0.000 NA   0.193
 123429 403030 SMc00809 SMc00842   tRNA-GLN_CTG FALSE 0.003 995.000 0.000 NA   NA
 123430 123431 SMc00810 SMc00811   ftsJ TRUE 0.985 -3.000 0.316 NA N 0.360
 123431 123432 SMc00811 SMc00812 ftsJ   TRUE 0.864 5.000 0.035 NA   0.118
 123434 123435 SMc00814 SMc00815   guaB FALSE 0.049 191.000 0.002 1.000   -0.019
 123435 123436 SMc00815 SMc00816 guaB   FALSE 0.339 61.000 0.005 NA   0.429
 123436 123437 SMc00816 SMc00817     FALSE 0.069 115.000 0.000 NA   0.199
 123441 123442 SMc00821 SMc00822     FALSE 0.001 279.000 0.000 NA   -0.211
 123442 123443 SMc00822 SMc00823     TRUE 0.986 0.000 0.444 NA   0.048
 123444 123445 SMc00824 SMc00825   gsh1 FALSE 0.207 137.000 0.066 NA   0.134
 123445 123446 SMc00825 SMc00826 gsh1   FALSE 0.167 138.000 0.087 NA   -0.196
 123446 123447 SMc00826 SMc00827     TRUE 0.704 17.000 0.019 NA   0.429
 123447 123448 SMc00827 SMc00828     FALSE 0.186 143.000 0.069 1.000   -0.047
 123448 123449 SMc00828 SMc00829     FALSE 0.013 277.000 0.000 1.000   0.044
 123452 123453 SMc00832 SMc00833 glcD glcE TRUE 0.998 -3.000 0.266 0.002 Y 0.260
 123453 123454 SMc00833 SMc00926 glcE glcF TRUE 0.931 95.000 0.227 0.002 Y -0.145
 123455 123456 SMc00925 SMc00924     FALSE 0.262 191.000 0.172 NA   0.332
 123458 123459 SMc00922 SMc00921     FALSE 0.015 190.000 0.000 1.000   -0.086
 123459 123460 SMc00921 SMc00931     FALSE 0.052 74.000 0.000 NA   0.004
 123461 123462 SMc00919 SMc00918 hisS   TRUE 0.985 6.000 0.097 0.000 N -0.122
 123462 123463 SMc00918 SMc00917   hisG TRUE 0.993 -3.000 0.239 1.000 Y 0.329
 123463 123464 SMc00917 SMc00916 hisG gst11 FALSE 0.183 120.000 0.002 1.000 N 0.268
 123464 123465 SMc00916 SMc00915 gst11   TRUE 0.546 -225.000 0.000 NA   0.369
 123465 123466 SMc00915 SMc00914     FALSE 0.454 88.000 0.182 NA   -0.196
 123467 123468 SMc00913 SMc00912 groEL1 groES1 TRUE 0.982 76.000 0.565 0.006 Y 0.788
 123469 123470 SMc00911 SMc00910     FALSE 0.012 314.000 0.000 NA   0.267
 123470 123471 SMc00910 SMc00909   ribF TRUE 0.803 14.000 0.049 1.000 N -0.020
 123471 123472 SMc00909 SMc00908 ribF ileS FALSE 0.047 283.000 0.029 1.000 N 0.048
 123472 123473 SMc00908 SMc00907 ileS   FALSE 0.148 140.000 0.019 NA   0.413
 123473 123474 SMc00907 SMc00906     FALSE 0.270 63.000 0.037 NA   -0.160
 123476 123477 SMc00904 SMc00902     TRUE 0.891 7.000 0.079 1.000 N -0.147
 123477 123478 SMc00902 SMc00930     FALSE 0.142 73.000 0.013 1.000   -0.364
 123479 123480 SMc00900 SMc00899     TRUE 0.986 0.000 0.500 NA   -0.095
 123480 123481 SMc00899 SMc00898   kefB1 FALSE 0.006 139.000 0.000 NA   -0.131
 123482 123483 SMc00897 SMc00896 pmbA   FALSE 0.485 109.000 0.182 NA   0.453
 123483 123484 SMc00896 SMc00895     TRUE 0.839 61.000 0.515 NA   -0.096
 123484 123485 SMc00895 SMc00894   kdtA TRUE 0.714 38.000 0.099 NA   0.371
 123485 123486 SMc00894 SMc00893 kdtA   TRUE 0.597 37.000 0.062 1.000   -0.050
 123486 123487 SMc00893 SMc00892   lpxK FALSE 0.157 143.000 0.015 1.000   0.385
 123488 123489 SMc00934 SMc00891 TRm11b TRm11a TRUE 0.944 -66.000 0.103 NA Y -0.314
 123489 123490 SMc00891 SMc00933 TRm11a   FALSE 0.025 219.000 0.000 NA   0.224
 123490 123491 SMc00933 SMc00932   mutL FALSE 0.179 94.000 0.019 NA   0.051
 123492 123493 SMc00888 SMc00887     TRUE 0.997 -3.000 0.538 1.000 Y 0.384
 123496 123497 SMc00885 SMc00884   ilvD1 FALSE 0.007 365.000 0.000 NA   0.165
 123497 123498 SMc00884 SMc00883 ilvD1   TRUE 0.601 91.000 0.026 1.000 Y -0.100
 123498 123499 SMc00883 SMc00882     TRUE 0.979 -3.000 0.026 1.000 Y 0.036
 123499 123500 SMc00882 SMc00881   dgoK1 TRUE 0.958 15.000 0.091 1.000 Y 0.382
 123500 123501 SMc00881 SMc00880 dgoK1   TRUE 0.985 -3.000 0.367 1.000 N 0.030
 123502 123503 SMc00879 SMc00878     FALSE 0.197 228.000 0.000 1.000 Y 0.140
 123503 123504 SMc00878 SMc00877     TRUE 0.789 154.000 0.182 0.031 Y -0.195
 123504 123505 SMc00877 SMc00876     FALSE 0.014 462.000 0.000 1.000 N 0.404
 123505 123506 SMc00876 SMc00874   corA2 FALSE 0.015 295.000 0.000 1.000 N 0.010
 123506 123507 SMc00874 SMc00873 corA2 kup1 TRUE 0.887 50.000 0.133 1.000 Y 0.096
 123507 123508 SMc00873 SMc00928 kup1   FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000 N -0.092
 123508 123509 SMc00928 SMc00872   atpI FALSE 0.050 208.000 0.000 1.000   0.427
 123509 123510 SMc00872 SMc00871 atpI atpB TRUE 0.918 61.000 0.195 0.003   0.433
 123510 123511 SMc00871 SMc00870 atpB atpE TRUE 0.953 85.000 0.628 0.003   0.611
 123511 123512 SMc00870 SMc00869 atpE atpF2 TRUE 0.921 74.000 0.278 0.003   0.601
 123512 123513 SMc00869 SMc00868 atpF2 atpF TRUE 0.984 14.000 0.016 0.003 Y 0.658
 123514 123515 SMc00867 SMc00866 rnhB   FALSE 0.440 161.000 0.022 1.000 Y 0.373
 123517 123518 SMc00864 SMc00863   moaB FALSE 0.007 455.000 0.000 NA   0.307
 123518 123519 SMc00863 SMc00862 moaB ipk TRUE 0.841 8.000 0.018 1.000 N 0.072
 123519 123520 SMc00862 SMc00861 ipk   TRUE 0.920 8.000 0.107 1.000 N -0.005
 123520 123521 SMc00861 SMc00860   ispB FALSE 0.037 263.000 0.028 1.000 N -0.203
 123522 123523 SMc00859 SMc00858     TRUE 0.974 -31.000 0.525 1.000   0.240
 123523 123524 SMc00858 SMc00857     FALSE 0.172 139.000 0.061 1.000   -0.084
 123524 123525 SMc00857 SMc00856     FALSE 0.148 141.000 0.030 NA   0.182
 123525 123526 SMc00856 SMc00855   glyQ FALSE 0.127 127.000 0.006 NA   0.311
 123528 123529 SMc00853 SMc00852     FALSE 0.263 120.000 0.074 NA   0.173
 123529 123530 SMc00852 SMc00851   glyS FALSE 0.044 92.000 0.005 NA   -0.260
 123530 123531 SMc00851 SMc00850 glyS   FALSE 0.368 60.000 0.006 1.000   0.245
 123532 123533 SMc00849 SMc00993   purD FALSE 0.071 117.000 0.010 NA   -0.089
 123533 123534 SMc00993 SMc00992 purD   FALSE 0.127 127.000 0.002 1.000 N 0.055
 123534 123535 SMc00992 SMc00991     TRUE 0.992 -3.000 0.571 1.000 N 0.177
 123535 123536 SMc00991 SMc00990   fsr FALSE 0.408 107.000 0.015 0.089 N -0.269
 123537 123538 SMc00994 SMc00989     FALSE 0.002 371.000 0.000 NA N -0.153
 123538 123539 SMc00989 SMc00988   ubiA FALSE 0.066 73.000 0.000 NA N -0.082
 123542 123543 SMc00985 SMc00984     TRUE 0.703 48.000 0.158 1.000 N -0.159
 123543 123544 SMc00984 SMc00983     FALSE 0.332 66.000 0.053 NA   -0.101
 123545 123546 SMc00982 SMc00981     TRUE 0.994 3.000 0.455 0.066 N -0.011
 123550 123551 SMc00977 SMc00976     TRUE 0.988 10.000 0.303 1.000 Y 0.399
 123551 123552 SMc00976 SMc00975   mcpU FALSE 0.015 257.000 0.000 1.000 N -0.074
 123553 123554 SMc00974 SMc00973     TRUE 0.985 -3.000 0.062 NA Y 0.615
 123554 123555 SMc00973 SMc00972   dxs TRUE 0.781 52.000 0.189 1.000 N 0.291
 123555 123556 SMc00972 SMc00971 dxs   FALSE 0.040 197.000 0.017 NA   -0.091
 123556 123557 SMc00971 SMc00970     FALSE 0.034 217.000 0.003 NA   0.063
 123557 123558 SMc00970 SMc00969     TRUE 0.909 4.000 0.019 1.000 N 0.368
 123558 123559 SMc00969 SMc00968     FALSE 0.433 63.000 0.045 1.000 N -0.075
 123561 123562 SMc00966 SMc00965     TRUE 0.992 -16.000 0.576 1.000 Y 0.014
 123562 123563 SMc00965 SMc00964     TRUE 0.928 5.000 0.144 1.000   -0.237
 123563 123564 SMc00964 SMc00963     TRUE 0.857 32.000 0.211 1.000   0.342
 123564 123565 SMc00963 SMc00962     TRUE 0.996 -6.000 0.729 1.000 Y 0.293
 123566 123567 SMc00961 SMc00960     FALSE 0.099 104.000 0.005 NA   0.001
 123571 123572 SMc00002 SMc00003     FALSE 0.161 206.000 0.087 1.000   0.200
 123572 123573 SMc00003 SMc00005   fabI1 FALSE 0.464 201.000 0.404 1.000 N 0.234
 123573 123574 SMc00005 SMc00006 fabI1   TRUE 0.727 145.000 0.397 0.091 N 0.039
 123576 123577 SMc00007 SMc00008 aroC ribA FALSE 0.183 92.000 0.023 1.000 N -0.298
 123579 123580 SMc00009 SMc00010 ctaC ctaD TRUE 0.997 20.000 0.741 0.005 Y 0.808
 123580 123581 SMc00010 SMc00450 ctaD ctaB TRUE 0.991 -3.000 0.153 0.056 N 0.391
 123581 123582 SMc00450 SMc00130 ctaB   TRUE 0.903 0.000 0.038 NA   0.086
 123582 123583 SMc00130 SMc00012   ctaG TRUE 0.827 12.000 0.050 NA   0.177
 123583 123584 SMc00012 SMc00013 ctaG ctaE TRUE 0.964 62.000 0.536 0.005 N 0.283
 123584 123585 SMc00013 SMc00014 ctaE   FALSE 0.178 195.000 0.122 NA   0.085
 123585 123586 SMc00014 SMc00085     TRUE 0.970 8.000 0.340 NA   0.316
 123586 123587 SMc00085 SMc00016   lytB TRUE 0.625 52.000 0.105 NA   0.163
 123587 123588 SMc00016 SMc00017 lytB thrB FALSE 0.345 155.000 0.251 1.000   -0.280
 123588 123589 SMc00017 SMc00018 thrB rnhA1 TRUE 0.946 -3.000 0.104 1.000   -0.070
 123590 123591 SMc00072 SMc00073     TRUE 0.937 56.000 0.357 NA Y 0.426
 123593 123594 SMc00074 SMc00075   rimJ TRUE 0.979 0.000 0.293 1.000 N -0.147
 123594 123595 SMc00075 SMc00451 rimJ   FALSE 0.415 272.000 0.674 1.000   0.268
 123595 123596 SMc00451 SMc00077   thrC1 TRUE 0.857 19.000 0.129 1.000   0.248
 123598 123599 SMc00078 SMc00079 livJ   FALSE 0.093 129.000 0.000 1.000   0.299
 123599 123600 SMc00079 SMc00080     FALSE 0.030 185.000 0.000 1.000   0.025
 123602 123603 SMc00081 SMc00452   mutY FALSE 0.320 73.000 0.016 1.000   0.125
 123604 123605 SMc00022 SMc00023     TRUE 0.613 111.000 0.333 NA   0.310
 123605 5451316 SMc00023 SMc05003     FALSE 0.289 81.000 0.029 NA   NA
 5451316 123606 SMc05003 SMc00024   smc TRUE 0.535 -12.000 0.000 NA   NA
 123606 123607 SMc00024 SMc00025 smc ppdK FALSE 0.098 198.000 0.003 1.000 N 0.346
 123608 123609 SMc00083 SMc00084     FALSE 0.317 164.000 0.250 NA   -0.125
 402991 123612 SMc00125 SMc00027 tRNA-GLN_TTG   FALSE 0.004 587.000 0.000 NA   NA
 123612 123613 SMc00027 SMc00028     FALSE 0.066 152.000 0.000 NA   0.557
 402992 123615 SMc00126 SMc00029 tRNA-PRO_CGG   FALSE 0.017 237.000 0.000 NA   NA
 123616 123617 SMc00089 SMc00090   cysN FALSE 0.065 162.000 0.000 1.000   0.243
 123617 123618 SMc00090 SMc00091 cysN cysD TRUE 0.992 0.000 0.100 0.001 N 0.237
 123618 123619 SMc00091 SMc00092 cysD cysH TRUE 0.827 48.000 0.017 1.000 Y 0.304
 123620 123621 SMc00030 SMc00031     TRUE 0.986 0.000 0.393 NA   0.501
 123622 123623 SMc00093 SMc00094 betA betB FALSE 0.473 211.000 0.634 1.000 N -0.379
 123623 123624 SMc00094 SMc00127 betB betC TRUE 0.951 2.000 0.081 1.000 N 0.181
 123624 123625 SMc00127 SMc00095 betC betI FALSE 0.331 167.000 0.138 1.000 N 0.603
 123626 123627 SMc00032 SMc00033     FALSE 0.329 109.000 0.071 NA   0.625
 123627 123628 SMc00033 SMc00034     TRUE 0.581 97.000 0.214 1.000 N 0.065
 123630 123631 SMc00035 SMc00036   gst1 FALSE 0.339 91.000 0.028 1.000 N 0.212
 123631 123632 SMc00036 SMc00037 gst1   FALSE 0.015 388.000 0.000 1.000 N 0.211
 123634 123635 SMc00038 SMc00039     FALSE 0.027 237.000 0.000 NA   0.432
 123638 123639 SMc00099 SMc00100 phnA   TRUE 0.714 9.000 0.004 1.000   -0.012
 123641 123642 SMc00101 SMc00225   tam FALSE 0.007 458.000 0.000 1.000   0.120
 123642 123643 SMc00225 SMc00103 tam dhe TRUE 0.831 14.000 0.000 0.090   -0.115
 123643 123644 SMc00103 SMc00104 dhe   FALSE 0.041 181.000 0.000 NA   0.261
 123644 123645 SMc00104 SMc00105     FALSE 0.193 69.000 0.000 NA   0.420
 123650 123651 SMc00044 SMc00045   cycF FALSE 0.267 205.000 0.154 1.000 N 0.466
 123651 123652 SMc00045 SMc00086 cycF cycG TRUE 0.923 122.000 0.424 0.013 Y -0.107
 123653 123654 SMc00108 SMc00109     FALSE 0.043 160.000 0.000 1.000   0.062
 123656 123657 SMc00110 SMc00453 gcd   FALSE 0.010 289.000 0.014 NA   -0.251
 123657 123658 SMc00453 SMc00112     FALSE 0.008 239.000 0.000 NA   0.017
 123658 123659 SMc00112 SMc00454     TRUE 0.619 -9.000 0.000 NA   0.228
 123659 123660 SMc00454 SMc00114   ptrB TRUE 0.827 13.000 0.061 NA   0.170
 123660 123661 SMc00114 SMc00115 ptrB   FALSE 0.044 157.000 0.000 NA   0.202
 123662 123663 SMc00048 SMc00049     TRUE 0.802 61.000 0.043 1.000 Y 0.228
 123663 123664 SMc00049 SMc00455     FALSE 0.023 271.000 0.000 1.000   0.249
 123665 123666 SMc00116 SMc00117     FALSE 0.077 195.000 0.008 NA   0.425
 123667 123668 SMc00051 SMc00052 phaA2 phaB2 TRUE 0.990 -3.000 0.493 NA   0.522
 123668 123669 SMc00052 SMc00053 phaB2 phaC2 TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   0.489
 123669 123670 SMc00053 SMc00054 phaC2 phaD2 TRUE 0.999 7.000 0.896 0.010 Y 0.092
 123670 123671 SMc00054 SMc00055 phaD2 phaE2 TRUE 0.998 -3.000 0.810 1.000 Y 0.486
 123671 123672 SMc00055 SMc00056 phaE2 phaF2 TRUE 0.999 -3.000 0.644 0.056 Y 0.097
 123672 123673 SMc00056 SMc00057 phaF2 phaG2 TRUE 0.997 0.000 0.614 1.000 Y -0.056
 123673 123674 SMc00057 SMc00058 phaG2 mucR FALSE 0.005 406.000 0.000 1.000 N -0.128
 123675 123676 SMc00118 SMc00456     FALSE 0.101 188.000 0.032 NA   0.154
 123677 123678 SMc00059 SMc00060     TRUE 0.956 -28.000 0.259 1.000 N 0.414
 123678 123679 SMc00060 SMc00061     FALSE 0.457 72.000 0.071 NA   0.177
 123681 123682 SMc00062 SMc00063     FALSE 0.052 155.000 0.000 NA   0.288
 123683 123684 SMc00128 SMc00457     TRUE 0.989 -7.000 0.941 NA   -0.167
 123684 123685 SMc00457 SMc00122   pbp TRUE 0.754 98.000 0.582 NA   -0.006
 123688 123689 SMc00065 SMc00458   feuP TRUE 0.782 41.000 0.223 NA   0.000
 123689 123690 SMc00458 SMc00129 feuP feuQ TRUE 0.995 -10.000 0.713 1.000 Y 0.253
 123690 123691 SMc00129 SMc00067 feuQ lppA FALSE 0.131 212.000 0.069 NA N 0.190
 123691 123692 SMc00067 SMc02361 lppA cycH FALSE 0.262 175.000 0.163 NA N 0.013
 123692 123693 SMc02361 SMc02362 cycH cycJ TRUE 0.984 -3.000 0.096 1.000 Y -0.133
 123693 123694 SMc02362 SMc02363 cycJ cycK TRUE 0.997 -3.000 0.125 0.002 Y 0.294
 123694 123695 SMc02363 SMc02364 cycK cycL TRUE 0.960 61.000 0.644 NA Y 0.362
 123695 123696 SMc02364 SMc02365 cycL degP1 FALSE 0.278 300.000 0.200 NA Y 0.036
 123696 123697 SMc02365 SMc02366 degP1   FALSE 0.456 147.000 0.222 1.000 N 0.306
 123697 123698 SMc02366 SMc02367     TRUE 0.998 -3.000 0.733 1.000 Y 0.069
 123698 123699 SMc02367 SMc02368   glnE TRUE 0.897 35.000 0.081 1.000 Y 0.098
 123700 123701 SMc02369 SMc02370   pepN FALSE 0.032 363.000 0.025 1.000 N 0.136
 123703 123704 SMc02372 SMc02373     FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   0.231
 123704 123705 SMc02373 SMc02374     TRUE 0.846 38.000 0.250 NA   0.408
 123705 123706 SMc02374 SMc02375     FALSE 0.106 139.000 0.027 NA   -0.008
 123706 123707 SMc02375 SMc02376     FALSE 0.291 73.000 0.034 NA N -0.113
 123708 123709 SMc02377 SMc02378 etf   FALSE 0.008 489.000 0.000 1.000 N 0.055
 123709 123710 SMc02378 SMc02379     FALSE 0.176 221.000 0.000 1.000 Y -0.072
 123712 123713 SMc02381 SMc02382     FALSE 0.037 139.000 0.000 NA N -0.013
 123714 123715 SMc02383 SMc02384     TRUE 0.967 -7.000 0.019 1.000 Y 0.350
 123717 123718 SMc02386 SMc02387 amn   FALSE 0.181 80.000 0.011 NA   0.038
 123718 123719 SMc02387 SMc02388     TRUE 0.907 75.000 1.000 NA   0.002
 123719 123720 SMc02388 SMc02389     TRUE 0.986 14.000 1.000 NA   0.463
 123725 123726 SMc02394 SMc02461     TRUE 0.976 14.000 0.667 NA   0.250
 123731 123732 SMc02400 SMc02401     FALSE 0.032 214.000 0.000 NA   0.360
 123732 123733 SMc02401 SMc02403     FALSE 0.032 180.000 0.000 NA   0.149
 123734 123735 SMc02404 SMc02405 dapA1 smpB TRUE 0.917 0.000 0.058 1.000 N -0.242
 123739 123740 SMc02408 SMc02659 rpoZ relA TRUE 0.834 103.000 0.291 1.000 Y 0.213
 123740 123741 SMc02659 SMc02658 relA   TRUE 0.736 50.000 0.000 NA Y 0.215
 123741 123742 SMc02658 SMc02657     TRUE 0.974 -3.000 0.210 NA   0.264
 123742 123743 SMc02657 SMc02656     FALSE 0.006 132.000 0.000 NA   -0.192
 123743 123744 SMc02656 SMc02655     FALSE 0.063 222.000 0.022 NA   0.208
 123744 123745 SMc02655 SMc02654   acpS TRUE 0.904 -3.000 0.032 NA   0.133
 123745 123746 SMc02654 SMc02653 acpS lepB FALSE 0.116 160.000 0.012 1.000 N 0.069
 123746 123747 SMc02653 SMc02652 lepB rnc TRUE 0.915 0.000 0.010 1.000 N 0.249
 123747 123748 SMc02652 SMc02651 rnc era TRUE 0.988 -3.000 0.098 0.059   0.556
 123749 123750 SMc02650 SMc02649 arsH arsC TRUE 0.938 -7.000 0.211 1.000   -0.346
 123750 123751 SMc02649 SMc02648 arsC   TRUE 0.963 -3.000 0.127 1.000 N 0.050
 123751 123752 SMc02648 SMc02647     TRUE 0.501 0.000 0.000 1.000 N -0.318
 123752 123753 SMc02647 SMc02646     FALSE 0.343 58.000 0.000 1.000 N 0.359
 123754 123755 SMc02645 SMc02644 cfa2   FALSE 0.056 206.000 0.000 1.000 N 0.242
 123755 123756 SMc02644 SMc02642     FALSE 0.044 241.000 0.007 NA   0.333
 123757 123758 SMc02641 SMc02640 rkpK lpsL TRUE 0.697 147.000 0.333 1.000 Y -0.323
 123758 123759 SMc02640 SMc02639 lpsL   TRUE 0.643 72.000 0.133 1.000 N 0.332
 123760 123761 SMc02638 SMc02637     TRUE 0.733 10.000 0.038 NA   -0.153
 123765 123766 SMc02633 SMc02632     TRUE 0.893 -3.000 0.049 NA   -0.073
 123766 123767 SMc02632 SMc02631     TRUE 0.814 79.000 0.123 0.027   0.325
 123767 123768 SMc02631 SMc02603     FALSE 0.160 128.000 0.040 1.000   -0.052
 123768 123769 SMc02603 SMc02601   nadA FALSE 0.078 183.000 0.003 1.000 N 0.023
 123769 123770 SMc02601 SMc02599 nadA nadB TRUE 0.974 50.000 0.210 0.001 Y -0.052
 123770 123771 SMc02599 SMc02598 nadB nadC TRUE 0.978 50.000 0.223 0.001 Y 0.091
 123771 123772 SMc02598 SMc02597 nadC sodC FALSE 0.249 104.000 0.002 1.000 N 0.571
 123772 123773 SMc02597 SMc02661 sodC   FALSE 0.007 903.000 0.000 1.000 N 0.245
 123773 123774 SMc02661 SMc02571     TRUE 0.988 2.000 0.000 0.055 Y 0.096
 123774 123775 SMc02571 SMc02660     TRUE 0.988 -3.000 0.400 1.000 N 0.129
 123776 123777 SMc02565 SMc02561     TRUE 0.897 -46.000 0.147 NA   0.178
 123777 123778 SMc02561 SMc02559     TRUE 0.975 3.000 0.258 NA   0.342
 123778 123779 SMc02559 SMc02558     TRUE 0.882 -3.000 0.039 NA   -0.051
 123779 123780 SMc02558 SMc02557     FALSE 0.091 115.000 0.021 NA   -0.126
 123780 123781 SMc02557 SMc02556     TRUE 0.960 16.000 0.484 NA   0.366
 123781 123782 SMc02556 SMc02555     TRUE 0.556 159.000 0.462 NA   0.255
 123782 123783 SMc02555 SMc02554     TRUE 0.976 -3.000 0.259 NA   0.054
 123786 123787 SMc02551 SMc02550 cysS   FALSE 0.402 51.000 0.005 1.000   0.188
 123787 123788 SMc02550 SMc02549     TRUE 0.995 -3.000 0.263 0.003   0.206
 123788 123789 SMc02549 SMc02548     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.003   0.504
 123789 123790 SMc02548 SMc02547   pip1 TRUE 0.943 -3.000 0.052 1.000   0.312
 123790 123791 SMc02547 SMc02546 pip1 leuA2 FALSE 0.440 55.000 0.032 1.000   0.052
 123791 123792 SMc02546 SMc02545 leuA2   FALSE 0.028 214.000 0.026 NA   -0.313
 123794 123795 SMc02543 SMc00550     FALSE 0.293 198.000 0.290 1.000   -0.194
 123795 123796 SMc00550 SMc00551     FALSE 0.259 107.000 0.075 1.000 N -0.347
 123796 123797 SMc00551 SMc00552   pssA TRUE 0.992 10.000 0.466 1.000 Y 0.356
 123798 123799 SMc00553 SMc00554   purF TRUE 0.915 12.000 0.100 1.000 N 0.378
 123799 123800 SMc00554 SMc00555 purF cvpA FALSE 0.280 147.000 0.101 1.000   0.239
 123800 123801 SMc00555 SMc00556 cvpA radA FALSE 0.411 69.000 0.094 1.000   -0.553
 123801 123802 SMc00556 SMc00557 radA alr FALSE 0.298 64.000 0.002 1.000 N 0.017
 123803 123804 SMc00558 SMc00559     TRUE 0.889 65.000 0.625 NA N 0.212
 123804 123805 SMc00559 SMc00560     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   0.262
 123807 123808 SMc00562 SMc00563     TRUE 0.985 -3.000 0.357 1.000   0.110
 123808 123809 SMc00563 SMc00564     TRUE 0.984 -3.000 0.311 1.000   0.307
 123810 123811 SMc00565 SMc00566 rplI   TRUE 0.579 36.000 0.043 NA   0.147
 123811 123812 SMc00566 SMc00567   rpsR FALSE 0.117 194.000 0.033 NA   0.493
 123812 123813 SMc00567 SMc00568 rpsR rpsF TRUE 0.990 26.000 0.319 0.009 Y 0.535
 123816 123817 SMc00571 SMc00572 fabD fabG TRUE 0.992 25.000 0.432 0.003 Y 0.045
 123817 123818 SMc00572 SMc00573 fabG acpP TRUE 0.613 337.000 0.321 0.003 Y -0.111
 123818 123819 SMc00573 SMc00574 acpP fabF FALSE 0.243 306.000 0.106 1.000 Y 0.281
 123819 123820 SMc00574 SMc00575 fabF   FALSE 0.059 325.000 0.134 NA   -0.027
 123820 123821 SMc00575 SMc00576     FALSE 0.046 247.000 0.060 NA   -0.180
 123821 123822 SMc00576 SMc00577   gmk TRUE 0.972 4.000 0.276 NA   0.175
 123822 123823 SMc00577 SMc00578 gmk   FALSE 0.021 63.000 0.000 NA   -0.095
 123824 123825 SMc00579 SMc00580 ksgA pdxA1 TRUE 0.979 0.000 0.197 1.000 N 0.525
 123825 123826 SMc00580 SMc00581 pdxA1   TRUE 0.983 10.000 0.561 1.000 N 0.310
 123826 123827 SMc00581 SMc00582     FALSE 0.215 192.000 0.112 1.000 N 0.075
 123827 123828 SMc00582 SMc00583     TRUE 0.967 0.000 0.153 1.000   0.162
 123828 123829 SMc00583 SMc00584     TRUE 0.997 -3.000 0.631 0.055   -0.008
 123830 123831 SMc00585 SMc00586 pepA   TRUE 0.910 20.000 0.230 1.000 N 0.149
 123831 5451318 SMc00586 SMc05005     FALSE 0.423 227.000 0.000 0.061 Y NA
 123835 123836 SMc00591 SMc00592     FALSE 0.021 233.000 0.000 NA   0.205
 123838 123839 SMc00594 SMc00595 ligE ndk FALSE 0.272 103.000 0.010 1.000 N 0.580
 123840 123841 SMc00596 SMc00597     TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   -0.209
 123843 123844 SMc00599 SMc00600 moaE moaD TRUE 0.999 5.000 0.501 0.002 Y 0.327
 123844 123845 SMc00600 SMc00601 moaD pgsA TRUE 0.943 -3.000 0.082 1.000 N -0.081
 123845 123846 SMc00601 SMc00602 pgsA uvrC FALSE 0.200 235.000 0.227 1.000 N -0.131
 123846 123847 SMc00602 SMc00603 uvrC   TRUE 0.922 -3.000 0.014 1.000 N 0.270
 123849 123850 SMc00605 SMc00606     TRUE 0.944 -3.000 0.036 1.000 N 0.387
 123850 123851 SMc00606 SMc00607     TRUE 0.638 54.000 0.137 NA   0.072
 123851 123852 SMc00607 SMc00608     FALSE 0.389 52.000 0.014 NA   0.223
 123853 123854 SMc00609 SMc00610 dmsA   FALSE 0.158 208.000 0.123 1.000   -0.019
 123854 123855 SMc00610 SMc00611     FALSE 0.189 104.000 0.012 NA   0.315
 123855 123856 SMc00611 SMc00612     TRUE 0.653 50.000 0.176 NA   -0.167
 123856 123857 SMc00612 SMc00613   acvB FALSE 0.365 33.000 0.000 NA   0.468
 123858 123859 SMc00614 SMc00615 purN purM TRUE 0.998 -3.000 0.230 0.002 Y 0.065
 123860 123861 SMc00616 SMc00617 perM   TRUE 0.817 56.000 0.362 NA   0.102
 123861 123862 SMc00617 SMc00618   ppk TRUE 0.611 65.000 0.134 NA N 0.106
 123862 123863 SMc00618 SMc00619 ppk   TRUE 0.975 12.000 0.149 1.000 Y 0.251
 123864 123865 SMc00620 SMc00621   cyaB TRUE 0.638 71.000 0.195 NA   0.135
 123865 123866 SMc00621 SMc00622 cyaB rnd FALSE 0.109 206.000 0.015 1.000 N 0.445
 123866 123867 SMc00622 SMc01754 rnd   FALSE 0.181 82.000 0.017 1.000 N -0.420
 123867 123868 SMc01754 SMc01755     FALSE 0.081 257.000 0.071 1.000 N -0.017
 123869 123870 SMc01756 SMc01757 aspS   FALSE 0.057 177.000 0.000 NA N 0.224
 123871 123872 SMc01758 SMc01759 groEL4   FALSE 0.306 133.000 0.118 NA   0.269
 123872 123873 SMc01759 SMc01760     FALSE 0.217 177.000 0.118 NA   0.159
 123874 123875 SMc01761 SMc01762 parC   FALSE 0.076 159.000 0.003 1.000   0.036
 123876 123877 SMc01763 SMc01764     TRUE 0.806 4.000 0.024 NA   -0.046
 123877 123878 SMc01764 SMc01765     FALSE 0.412 96.000 0.128 NA   0.068
 123878 123879 SMc01765 SMc01766   hemB FALSE 0.349 83.000 0.055 NA   0.131
 123880 123881 SMc01767 SMc01768     FALSE 0.327 131.000 0.192 NA   -0.094
 123881 123882 SMc01768 SMc01769     FALSE 0.011 425.000 0.000 1.000   0.293
 123882 123883 SMc01769 SMc01770   glyA1 FALSE 0.188 185.000 0.123 1.000   -0.084
 123883 123884 SMc01770 SMc01771 glyA1   TRUE 0.857 13.000 0.052 NA N 0.438
 123884 123885 SMc01771 SMc01772   ribD TRUE 0.929 18.000 0.277 NA N 0.451
 123885 123886 SMc01772 SMc01773 ribD ribE TRUE 0.995 1.000 0.456 1.000 Y -0.042
 123887 123888 SMc01774 SMc01775     FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   0.092
 123888 123889 SMc01775 SMc01776     TRUE 0.708 37.000 0.110 1.000   0.025
 123890 123891 SMc01777 SMc01778 ribH1 nusB TRUE 0.987 -3.000 0.347 1.000 N 0.344
 123891 123892 SMc01778 SMc01779 nusB   TRUE 0.692 7.000 0.011 NA N -0.153
 123892 123893 SMc01779 SMc01780   rrpP FALSE 0.022 201.000 0.000 NA N -0.003
 123895 123896 SMc01782 SMc01783     FALSE 0.399 83.000 0.071 NA   0.188
 123896 123897 SMc01783 SMc01784   plsX FALSE 0.107 194.000 0.044 NA   0.124
 123897 123898 SMc01784 SMc01785 plsX fabH TRUE 0.992 19.000 0.380 0.003 Y -0.271
 123898 123899 SMc01785 SMc01786 fabH himA TRUE 0.596 94.000 0.207 1.000 N 0.108
 123899 123900 SMc01786 SMc01787 himA   TRUE 0.658 143.000 0.535 1.000 N 0.097
 402994 123902 SMc02182 SMc01789 tRNA-PRO_GGG   FALSE 0.002 1382.000 0.000 NA   NA
 123903 123904 SMc01902 SMc01790     FALSE 0.048 134.000 0.000 NA   0.154
 123904 123905 SMc01790 SMc01791     TRUE 0.893 -3.000 0.073 NA   -0.341
 123905 123906 SMc01791 SMc01792     TRUE 0.981 -3.000 0.357 NA   -0.012
 123906 123907 SMc01792 SMc01793     TRUE 0.955 59.000 0.500 1.000 Y 0.375
 123907 123908 SMc01793 SMc01794     TRUE 0.994 6.000 0.571 1.000 Y -0.148
 123912 123913 SMc01798 SMc01799     TRUE 0.679 12.000 0.024 NA   -0.048
 123915 123916 SMc01801 SMc01802 argC speB TRUE 0.746 94.000 0.124 1.000 Y 0.092
 123916 123917 SMc01802 SMc01803 speB rpsI FALSE 0.090 155.000 0.024 1.000 N -0.289
 123917 123918 SMc01803 SMc01804 rpsI rplM TRUE 0.997 3.000 0.231 0.009 Y 0.771
 123918 123919 SMc01804 SMc01805 rplM   FALSE 0.052 219.000 0.015 NA N 0.010
 123922 123923 SMc01808 SMc01809     TRUE 0.928 28.000 0.040 0.000   0.011
 123923 123924 SMc01809 SMc01810     TRUE 0.843 19.000 0.140 NA   0.179
 123924 123925 SMc01810 SMc04433   TRm20N FALSE 0.003 508.000 0.000 NA   0.081
 123925 123926 SMc04433 SMc01811 TRm20N TRm20C TRUE 0.855 -228.000 0.000 0.060   -0.292
 123928 123929 SMc01813 SMc04448     FALSE 0.253 109.000 0.055 NA   0.128
 123929 123930 SMc04448 SMc01903   clpP1 FALSE 0.034 277.000 0.000 1.000 N 0.671
 123930 123931 SMc01903 SMc01904 clpP1 clpX TRUE 0.738 294.000 0.352 0.002 Y 0.246
 123931 123932 SMc01904 SMc01905 clpX lon FALSE 0.168 474.000 0.201 1.000 Y 0.035
 123932 123933 SMc01905 SMc01906 lon hrm FALSE 0.089 222.000 0.043 1.000 N -0.021
 123933 123934 SMc01906 SMc01907 hrm   FALSE 0.010 231.000 0.000 1.000   -0.074
 123936 123937 SMc01909 SMc01910     TRUE 0.963 0.000 0.115 1.000   0.294
 123937 123938 SMc01910 SMc01911     FALSE 0.307 89.000 0.077 NA   -0.060
 402995 402996 SMc01936 SMc01937 tRNA-ASP_GTC tRNA-ASP_GTC FALSE 0.126 70.000 0.000 NA   NA
 402996 123939 SMc01937 SMc01912 tRNA-ASP_GTC nuoA1 FALSE 0.010 303.000 0.000 NA   NA
 123939 123940 SMc01912 SMc01913 nuoA1 nuoB1 TRUE 0.997 -9.000 0.396 0.003 Y 0.480
 123940 123941 SMc01913 SMc01914 nuoB1 nuoC1 TRUE 0.991 18.000 0.262 0.003 Y 0.037
 123941 123942 SMc01914 SMc01915 nuoC1 nuoD1 TRUE 0.984 57.000 0.483 0.009 Y 0.346
 123942 123943 SMc01915 SMc01916 nuoD1   TRUE 0.893 0.000 0.035 NA   0.040
 123943 123944 SMc01916 SMc01917   nuoE1 TRUE 0.654 17.000 0.022 NA   0.123
 123944 123945 SMc01917 SMc01918 nuoE1 nuoF1 TRUE 0.993 15.000 0.343 0.009 Y 0.072
 123945 123946 SMc01918 SMc01919 nuoF1   TRUE 0.968 7.000 0.024 0.009   0.054
 123946 123947 SMc01919 SMc01920   nuoG1 FALSE 0.354 201.000 0.006 0.009   0.367
 123947 123948 SMc01920 SMc01921 nuoG1 nuoH TRUE 0.994 21.000 0.515 0.009 Y 0.188
 123948 123949 SMc01921 SMc01922 nuoH nuoI TRUE 0.979 62.000 0.500 0.009 Y -0.076
 123949 123950 SMc01922 SMc01923 nuoI nuoJ TRUE 0.925 152.000 0.442 0.009 Y 0.355
 123950 123951 SMc01923 SMc01924 nuoJ nuoK1 TRUE 0.993 30.000 0.484 0.003 Y 0.605
 123951 123952 SMc01924 SMc01925 nuoK1 nuoL TRUE 0.998 8.000 0.451 0.009 Y 0.525
 123952 123953 SMc01925 SMc01926 nuoL nuoM TRUE 0.998 0.000 0.251 0.003 Y 0.420
 123953 123954 SMc01926 SMc01927 nuoM nuoN TRUE 0.995 20.000 0.453 0.003 Y 0.582
 123954 123955 SMc01927 SMc01928 nuoN birA TRUE 0.986 -3.000 0.372 1.000 N 0.069
 123955 123956 SMc01928 SMc01929 birA   TRUE 0.886 28.000 0.307 1.000   -0.035
 123956 123957 SMc01929 SMc01930     TRUE 0.642 59.000 0.105 1.000   0.352
 123957 123958 SMc01930 SMc01931     TRUE 0.853 23.000 0.172 NA   0.279
 123959 123960 SMc01932 SMc01933     TRUE 0.937 -6.000 0.200 NA   -0.172
 123961 123962 SMc01934 SMc01935 proS   FALSE 0.284 105.000 0.076 1.000 N -0.206
 123962 123963 SMc01935 SMc01376     TRUE 0.961 18.000 0.620 1.000 N -0.187
 123963 123964 SMc01376 SMc01375   dnaE1 FALSE 0.011 469.000 0.005 1.000 N -0.043
 123965 123966 SMc01374 SMc01373   dinP FALSE 0.180 131.000 0.025 1.000 N 0.069
 123966 123967 SMc01373 SMc01372 dinP   FALSE 0.241 207.000 0.228 NA   0.039
 123968 123969 SMc01371 SMc01370 celR1 celR2 TRUE 0.994 18.000 0.461 0.015 Y 0.824
 123970 123971 SMc01369 SMc01368 rpmG   FALSE 0.307 95.000 0.028 1.000 N 0.146
 123971 123972 SMc01368 SMc01367     TRUE 0.911 13.000 0.159 1.000   0.117
 123972 123973 SMc01367 SMc01366     TRUE 0.987 -3.000 0.406 NA   0.360
 123973 123974 SMc01366 SMc01365   rnr TRUE 0.604 37.000 0.050 NA   0.188
 123974 123975 SMc01365 SMc01364 rnr topA TRUE 0.937 3.000 0.045 1.000 N 0.330
 123975 123976 SMc01364 SMc01363 topA smf TRUE 0.630 192.000 0.238 1.000 Y 0.595
 123976 123977 SMc01363 SMc01362 smf   TRUE 0.952 0.000 0.070 1.000   0.422
 123977 123978 SMc01362 SMc01361     TRUE 0.790 30.000 0.108 1.000   0.332
 123978 123979 SMc01361 SMc01360   pyrB TRUE 0.996 -3.000 0.452 1.000 Y 0.375
 123982 123983 SMc01357 SMc01356     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   0.142
 123985 123986 SMc01354 SMc01353   gatC FALSE 0.245 105.000 0.024 1.000   0.220
 123986 123987 SMc01353 SMc01352 gatC gatA TRUE 0.991 49.000 0.643 0.001 Y 0.016
 123989 123990 SMc01350 SMc01349 gatB   TRUE 0.862 3.000 0.014 1.000   0.082
 123990 123991 SMc01349 SMc01348     FALSE 0.144 162.000 0.017 1.000   0.589
 123991 123992 SMc01348 SMc01347     TRUE 0.515 119.000 0.260 NA   0.215
 123993 123994 SMc01346 SMc01345 aat accC TRUE 0.935 10.000 0.114 1.000 N 0.724
 123994 123995 SMc01345 SMc01344 accC accB TRUE 0.996 7.000 0.153 0.001 Y 0.804
 123995 123996 SMc01344 SMc01343 accB aroQ TRUE 0.669 24.000 0.003 1.000 N 0.811
 123996 123997 SMc01343 SMc01342 aroQ   FALSE 0.308 140.000 0.080 1.000 N 0.635
 123997 123998 SMc01342 SMc01341     FALSE 0.026 54.000 0.000 NA   -0.359
 123999 124000 SMc01340 SMc01339   TRm11a FALSE 0.203 93.000 0.000 1.000 N 0.355
 124000 124001 SMc01339 SMc01338 TRm11a TRm11b TRUE 0.947 -66.000 0.103 NA Y -0.209
 124002 124003 SMc01337 SMc01336   rne FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   0.334
 124004 124005 SMc01335 SMc01334 amiC mrcA1 FALSE 0.381 365.000 0.396 1.000 Y 0.727
 124005 124006 SMc01334 SMc01333 mrcA1 prfB FALSE 0.154 202.000 0.041 1.000 N 0.518
 124007 124008 SMc01332 SMc01331     FALSE 0.322 87.000 0.080 NA   -0.059
 124009 124010 SMc04435 SMc01330     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   -0.337
 124011 124012 SMc01329 SMc01328 acpD   FALSE 0.327 109.000 0.095 NA   0.128
 402998 402999 SMc01378 SMc01379 tRNA-TYR_GTA tRNA-GLY_TCC FALSE 0.316 24.000 0.000 NA   NA
 402999 124014 SMc01379 SMc01326 tRNA-GLY_TCC tufB FALSE 0.013 263.000 0.000 NA   NA
 124014 124015 SMc01326 SMc01325 tufB   FALSE 0.001 348.000 0.000 NA   -0.201
 124015 124016 SMc01325 SMc01324     FALSE 0.021 126.000 0.000 NA   0.005
 124016 403000 SMc01324 SMc01381   tRNA-TRP_CCA FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 403000 124017 SMc01381 SMc01323 tRNA-TRP_CCA secE FALSE 0.030 184.000 0.000 NA   NA
 124017 124018 SMc01323 SMc01322 secE nusG TRUE 0.980 17.000 0.843 1.000 N 0.117
 124018 124019 SMc01322 SMc01321 nusG rplK TRUE 0.569 217.000 0.681 1.000 N 0.213
 124019 124020 SMc01321 SMc01320 rplK rplA TRUE 0.999 5.000 0.838 0.012 Y 0.615
 124020 124021 SMc01320 SMc01319 rplA rplJ TRUE 0.635 333.000 0.302 0.012 Y 0.610
 124021 124022 SMc01319 SMc01318 rplJ rplL TRUE 0.992 59.000 0.884 0.009 Y 0.624
 124022 124023 SMc01318 SMc01317 rplL rpoB FALSE 0.192 266.000 0.223 1.000   0.536
 124023 124024 SMc01317 SMc01316 rpoB rpoC TRUE 0.898 186.000 0.851 0.000   0.116
 124026 124027 SMc01314 SMc01313 rpsL rpsG TRUE 0.990 58.000 0.620 0.002 Y 0.760
 124027 124028 SMc01313 SMc01312 rpsG fusA1 TRUE 0.926 30.000 0.114 1.000 Y 0.154
 124028 124029 SMc01312 SMc01311 fusA1 tufA TRUE 0.949 72.000 0.102 0.001 Y 0.309
 124029 124030 SMc01311 SMc01310 tufA rpsJ TRUE 0.771 143.000 0.318 1.000 Y 0.700
 124030 124031 SMc01310 SMc01309 rpsJ rplC TRUE 0.923 123.000 0.307 0.012 Y 0.821
 124031 124032 SMc01309 SMc01308 rplC rplD TRUE 0.997 13.000 0.486 0.009 Y 0.679
 124032 124033 SMc01308 SMc01307 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.009 Y 0.417
 124033 124034 SMc01307 SMc01306 rplW rplB TRUE 0.994 44.000 0.849 0.010 Y 0.453
 124034 124035 SMc01306 SMc01305 rplB rpsS TRUE 0.997 16.000 0.820 0.012 Y 0.527
 124035 124036 SMc01305 SMc01304 rpsS rplV TRUE 0.996 3.000 0.119 0.012 Y 0.892
 124036 124037 SMc01304 SMc01303 rplV rpsC TRUE 0.996 0.000 0.109 0.012 Y 0.847
 124037 124038 SMc01303 SMc01302 rpsC rplP TRUE 0.994 39.000 0.828 0.012 Y 0.882
 124038 124039 SMc01302 SMc01301 rplP rpmC TRUE 0.998 13.000 0.802 0.009 Y 0.902
 124039 124040 SMc01301 SMc01300 rpmC rpsQ TRUE 0.998 14.000 0.828 0.009 Y 0.694
 124040 124041 SMc01300 SMc01299 rpsQ rplN TRUE 0.948 179.000 0.791 0.012 Y 0.569
 124041 124042 SMc01299 SMc01298 rplN rplX TRUE 0.998 15.000 0.810 0.012 Y 0.948
 124042 124043 SMc01298 SMc01297 rplX rplE TRUE 0.999 -7.000 0.758 0.009 Y 0.906
 124043 124044 SMc01297 SMc01296 rplE rpsN TRUE 0.986 35.000 0.309 0.009 Y 0.313
 124044 124045 SMc01296 SMc01295 rpsN rpsH TRUE 0.995 13.000 0.295 0.009 Y 0.451
 124045 124046 SMc01295 SMc01294 rpsH rplF TRUE 0.994 41.000 0.808 0.009 Y 0.662
 124046 124047 SMc01294 SMc01293 rplF rplR TRUE 0.998 13.000 0.815 0.009 Y 0.554
 124047 124048 SMc01293 SMc01292 rplR rpsE TRUE 0.966 134.000 0.814 0.012 Y 0.486
 124048 124049 SMc01292 SMc01291 rpsE rpmD TRUE 0.998 13.000 0.789 0.012 Y 0.727
 124049 124050 SMc01291 SMc01290 rpmD rplO TRUE 0.998 14.000 0.653 0.001 Y 0.708
 124050 124051 SMc01290 SMc01289 rplO secY TRUE 0.553 236.000 0.730 1.000 N 0.435
 124051 124052 SMc01289 SMc01288 secY adk TRUE 0.878 -3.000 0.011 1.000 N -0.030
 124052 124053 SMc01288 SMc01287 adk rpsM FALSE 0.068 231.000 0.006 1.000 N 0.253
 124053 124054 SMc01287 SMc01286 rpsM rpsK TRUE 0.896 227.000 0.810 0.009 Y -0.118
 124054 124055 SMc01286 SMc01285 rpsK rpoA TRUE 0.677 104.000 0.308 1.000 N 0.433
 124055 124056 SMc01285 SMc01283 rpoA rplQ TRUE 0.949 46.000 0.873 1.000 N -0.024
 124057 124058 SMc01282 SMc01281     TRUE 0.996 3.000 0.790 0.064   -0.133
 124059 124060 SMc01280 SMc01279 degP3   TRUE 0.953 -3.000 0.051 1.000 N 0.494
 124060 124061 SMc01279 SMc01278   sugE FALSE 0.135 166.000 0.002 1.000 N 0.507
 124062 124063 SMc01277 SMc01276   gph2 TRUE 0.957 -7.000 0.269 NA   0.012
 124063 124064 SMc01276 SMc01275 gph2 rluC TRUE 0.988 0.000 0.389 1.000   0.546
 124064 124065 SMc01275 SMc01274 rluC   TRUE 0.655 39.000 0.083 NA N 0.051
 124065 124066 SMc01274 SMc01273     FALSE 0.041 34.000 0.000 NA   -0.263
 124066 124067 SMc01273 SMc01272     TRUE 0.777 17.000 0.046 NA   0.486
 124067 124068 SMc01272 SMc01271     TRUE 0.579 23.000 0.012 NA   0.229
 124068 124069 SMc01271 SMc01270   adhC1 FALSE 0.017 74.000 0.000 NA   -0.585
 124069 124070 SMc01270 SMc01269 adhC1   FALSE 0.056 89.000 0.000 1.000   -0.062
 124070 124071 SMc01269 SMc01268   lipB FALSE 0.050 183.000 0.004 1.000   -0.066
 403001 124072 SMc01380 SMc01267 tRNA-LEU_GAG   FALSE 0.004 585.000 0.000 NA   NA
 124072 124073 SMc01267 SMc01266     TRUE 0.960 25.000 0.683 NA   0.254
 124073 124074 SMc01266 SMc01265     TRUE 0.982 13.000 0.761 NA   0.304
 124075 124076 SMc01264 SMc01263     FALSE 0.058 156.000 0.000 NA   0.386
 124076 124077 SMc01263 SMc01262   def2 FALSE 0.124 80.000 0.000 NA   0.211
 124078 124079 SMc01261 SMc01260     TRUE 0.552 85.000 0.118 1.000 N 0.304
 124080 124081 SMc01259 SMc01258     TRUE 0.883 4.000 0.059 NA   -0.027
 124081 124082 SMc01258 SMc01257     FALSE 0.265 140.000 0.118 NA   0.099
 124083 124084 SMc01256 SMc00995 sda   FALSE 0.489 87.000 0.140 NA   0.151
 124085 124086 SMc01068 SMc00996     TRUE 0.638 76.000 0.271 NA   -0.128
 124086 124087 SMc00996 SMc00997     FALSE 0.144 244.000 0.146 NA   0.316
 124087 124088 SMc00997 SMc00998     FALSE 0.031 230.000 0.000 NA   0.565
 124088 124089 SMc00998 SMc00999     FALSE 0.000 857.000 0.000 NA   -0.291
 124089 124090 SMc00999 SMc01000     TRUE 0.776 68.000 0.320 NA   0.364
 124091 124092 SMc01001 SMc01002     FALSE 0.002 396.000 0.000 1.000   -0.116
 124093 124094 SMc01003 SMc01004   hisI FALSE 0.025 347.000 0.017 1.000   0.120
 124094 124095 SMc01004 SMc01005 hisI folE FALSE 0.218 102.000 0.038 1.000 N -0.183
 124096 124097 SMc01006 SMc01007     TRUE 0.894 4.000 0.041 NA   0.198
 124097 124098 SMc01007 SMc01008     TRUE 0.862 -3.000 0.002 NA   0.270
 124098 124099 SMc01008 SMc01009     TRUE 0.970 -3.000 0.250 NA   -0.147
 124099 124100 SMc01009 SMc01010   thrS FALSE 0.222 109.000 0.023 NA   0.554
 124102 124103 SMc01012 SMc01013     TRUE 0.980 0.000 0.033 0.049   0.095
 124109 124110 SMc01019 SMc01020     FALSE 0.396 29.000 0.000 NA   0.450
 124111 124112 SMc01021 SMc01022     TRUE 0.943 -3.000 0.064 NA   0.398
 124113 124114 SMc01023 SMc01024 tpiA1   FALSE 0.369 123.000 0.184 1.000 N -0.269
 124114 124115 SMc01024 SMc01025   pyrG FALSE 0.220 144.000 0.083 1.000 N -0.093
 124115 124116 SMc01025 SMc01026 pyrG   FALSE 0.045 153.000 0.002 NA   -0.023
 124116 124117 SMc01026 SMc01027   kdsA TRUE 0.803 0.000 0.023 NA   -0.149
 124117 124118 SMc01027 SMc01028 kdsA eno FALSE 0.256 135.000 0.041 1.000 N 0.463
 124118 124119 SMc01028 SMc01029 eno   FALSE 0.008 808.000 0.032 1.000 N -0.440
 124119 124120 SMc01029 SMc01030   pdhAa FALSE 0.294 137.000 0.104 1.000 N 0.035
 124120 124121 SMc01030 SMc01031 pdhAa pdhAb TRUE 0.995 18.000 0.456 0.001 Y 0.200
 124121 124122 SMc01031 SMc01032 pdhAb pdhB TRUE 0.982 13.000 0.254 1.000 Y 0.619
 124122 124123 SMc01032 SMc01033 pdhB   TRUE 0.507 57.000 0.036 1.000 N 0.106
 124123 124124 SMc01033 SMc01034     TRUE 0.983 -3.000 0.273 1.000   0.438
 124124 124125 SMc01034 SMc01035   lpdA1 TRUE 0.628 18.000 0.028 1.000   -0.079
 124125 124126 SMc01035 SMc01036 lpdA1   FALSE 0.221 76.000 0.007 1.000   0.006
 124126 124127 SMc01036 SMc01037   lipA FALSE 0.023 135.000 0.000 1.000   -0.091
 124130 124131 SMc01039 SMc01040   ispDF TRUE 0.852 -19.000 0.061 NA   0.249
 124132 124133 SMc01041 SMc01042   ntrB TRUE 0.955 -3.000 0.094 1.000 N 0.043
 124133 124134 SMc01042 SMc01043 ntrB ntrC TRUE 0.997 -3.000 0.297 0.099 Y 0.409
 124134 124135 SMc01043 SMc01044 ntrC ntrY TRUE 0.608 234.000 0.205 0.099 Y 0.043
 124135 124136 SMc01044 SMc01045 ntrY ntrX TRUE 0.997 -10.000 0.533 0.099 Y 0.468
 124136 124137 SMc01045 SMc01046 ntrX trkA TRUE 0.669 55.000 0.085 1.000 N 0.714
 124137 124138 SMc01046 SMc01047 trkA   TRUE 0.683 12.000 0.008 1.000 N -0.122
 124138 124139 SMc01047 SMc01048   hfq FALSE 0.497 101.000 0.243 1.000   -0.346
 124139 124140 SMc01048 SMc01049 hfq hflX TRUE 0.940 7.000 0.115 1.000   0.539
 124141 124142 SMc01050 SMc01051 TRm20   FALSE 0.003 1353.000 0.000 1.000   0.030
 124142 124143 SMc01051 SMc01052     TRUE 0.731 4.000 0.015 1.000   -0.290
 124144 124145 SMc01053 SMc01054 cysG   TRUE 0.904 11.000 0.188 NA   -0.208
 124145 124146 SMc01054 SMc02124     TRUE 0.978 16.000 0.919 NA   -0.019
 124146 124147 SMc02124 SMc02123     TRUE 0.927 18.000 0.309 NA   0.267
 124147 124148 SMc02123 SMc02122   fpr FALSE 0.137 146.000 0.022 NA   0.314
 124149 124150 SMc04436 SMc02121 relE aapP FALSE 0.026 102.000 0.000 1.000 N -0.364
 124150 124151 SMc02121 SMc02120 aapP aapM TRUE 0.990 19.000 0.734 1.000 Y 0.304
 124151 124152 SMc02120 SMc02119 aapM aapQ TRUE 0.999 5.000 0.815 0.010 Y 0.065
 124152 124153 SMc02119 SMc02118 aapQ aapJ TRUE 0.950 105.000 0.548 0.085 Y 0.293
 124155 124156 SMc02116 SMc02115     TRUE 0.962 28.000 0.745 NA   0.442
 124157 124158 SMc02114 SMc02113   cysE FALSE 0.097 298.000 0.200 1.000   -0.177
 124158 124159 SMc02113 SMc02112 cysE   TRUE 0.544 138.000 0.386 NA   0.175
 124159 124160 SMc02112 SMc02111     FALSE 0.019 242.000 0.000 NA   0.201
 124160 124161 SMc02111 SMc02110     FALSE 0.038 272.000 0.011 NA   0.502
 124161 124162 SMc02110 SMc02109   clpA TRUE 0.981 10.000 0.596 NA   0.240
 124162 124163 SMc02109 SMc02108 clpA   FALSE 0.316 73.000 0.014 NA   0.385
 124163 124164 SMc02108 SMc02107     TRUE 0.961 6.000 0.275 NA   0.015
 124165 124166 SMc02106 SMc02105     TRUE 0.759 36.000 0.131 NA   0.318
 124166 124167 SMc02105 SMc02104     TRUE 0.971 5.000 0.280 NA   0.337
 124167 124168 SMc02104 SMc02103     TRUE 0.977 14.000 0.696 NA N 0.057
 124169 124170 SMc02102 SMc02101   rpsB FALSE 0.025 186.000 0.009 NA   -0.174
 124170 124171 SMc02101 SMc02100 rpsB tsf TRUE 0.723 253.000 0.748 1.000 Y 0.540
 124171 124172 SMc02100 SMc02099 tsf pyrH FALSE 0.434 184.000 0.416 1.000 N -0.290
 124172 124173 SMc02099 SMc02098 pyrH rrf TRUE 0.924 52.000 0.626 1.000 N 0.261
 124173 124174 SMc02098 SMc02097 rrf uppS TRUE 0.918 37.000 0.409 1.000 N 0.445
 124174 124175 SMc02097 SMc02096 uppS cdsA TRUE 0.994 0.000 0.400 1.000 Y -0.271
 124175 124176 SMc02096 SMc02095 cdsA   FALSE 0.199 131.000 0.080 1.000 N -0.385
 124176 124177 SMc02095 SMc02094   omp FALSE 0.422 249.000 0.204 1.000 Y 0.218
 124177 124178 SMc02094 SMc02093 omp lpxD TRUE 0.872 45.000 0.063 1.000 Y 0.226
 124178 124179 SMc02093 SMc02092 lpxD fabZ TRUE 0.965 -7.000 0.212 1.000 N 0.360
 124179 124180 SMc02092 SMc02091 fabZ lpxA TRUE 0.978 3.000 0.264 1.000 N 0.139
 124180 124181 SMc02091 SMc02090 lpxA   TRUE 0.991 0.000 0.552 NA   0.474
 124181 124182 SMc02090 SMc02089   lpxB TRUE 0.968 -3.000 0.173 NA   0.190
 124183 124184 SMc02088 SMc02087   gltA FALSE 0.007 538.000 0.000 1.000 N 0.058
 124185 124186 SMc02086 SMc02085   exbB FALSE 0.024 221.000 0.000 NA   0.211
 124186 124187 SMc02085 SMc02084 exbB exbD TRUE 0.996 7.000 0.810 1.000 Y 0.039
 124187 124188 SMc02084 SMc02083 exbD   FALSE 0.001 976.000 0.000 1.000 N -0.423
 124188 124189 SMc02083 SMc02082   tolC FALSE 0.081 277.000 0.047 1.000 N 0.653
 124189 124190 SMc02082 SMc02081 tolC   FALSE 0.062 225.000 0.024 NA   0.178
 124190 124191 SMc02081 SMc02080   valS FALSE 0.036 314.000 0.033 NA   0.220
 124191 124192 SMc02080 SMc02079 valS   FALSE 0.007 471.000 0.000 1.000 N -0.002
 124192 124193 SMc02079 SMc02078   exoR FALSE 0.003 371.000 0.000 1.000   -0.112
 124197 124198 SMc02074 SMc02073   argS FALSE 0.291 98.000 0.062 1.000 N -0.164
 124198 124199 SMc02073 SMc02072 argS   FALSE 0.323 64.000 0.027 NA   0.067
 124199 124200 SMc02072 SMc02071     FALSE 0.128 121.000 0.056 NA   -0.360
 124200 124201 SMc02071 SMc02070     TRUE 0.615 46.000 0.103 NA   0.004
 124201 124202 SMc02070 SMc02069     TRUE 0.983 -7.000 0.570 NA   0.138
 124202 124203 SMc02069 SMc02068     FALSE 0.388 65.000 0.011 NA N 0.488
 124203 124204 SMc02068 SMc02067     TRUE 0.547 95.000 0.176 1.000   0.266
 124204 124205 SMc02067 SMc02066   tatB TRUE 0.700 74.000 0.000 0.006   0.226
 124205 124206 SMc02066 SMc02065 tatB tatC TRUE 0.962 -3.000 0.000 1.000 Y -0.152
 124206 124207 SMc02065 SMc02064 tatC serS FALSE 0.222 137.000 0.065 1.000 N -0.032
 124207 124208 SMc02064 SMc02063 serS surE TRUE 0.637 28.000 0.058 1.000   -0.088
 124208 124209 SMc02063 SMc02062 surE pcm TRUE 0.728 36.000 0.147 1.000   -0.110
 124209 124210 SMc02062 SMc02061 pcm bioS FALSE 0.060 172.000 0.005 NA   0.084
 124210 124211 SMc02061 SMc02060 bioS lppB FALSE 0.012 324.000 0.000 NA   0.315
 124213 124214 SMc02058 SMc02057   secD1 FALSE 0.216 166.000 0.099 NA   0.198
 124214 124215 SMc02057 SMc02056 secD1   TRUE 0.942 -3.000 0.060 NA   0.470
 124215 124216 SMc02056 SMc02055   crtB TRUE 0.854 22.000 0.165 NA   0.292
 124216 124217 SMc02055 SMc02054 crtB   FALSE 0.321 95.000 0.059 NA   0.176
 124218 124219 SMc02053 SMc02052     FALSE 0.205 93.000 0.023 NA   0.075
 124219 124220 SMc02052 SMc02051     FALSE 0.016 307.000 0.000 NA   0.561
 403002 124221 SMc02125 SMc02050 tRNA-LEU_TAG tig FALSE 0.032 176.000 0.000 NA   NA
 124222 124223 SMc02049 SMc02048 gcvP gcvH TRUE 0.998 0.000 0.130 0.000 Y 0.408
 124223 124224 SMc02048 SMc02047 gcvH gcvT TRUE 0.992 17.000 0.202 0.002 Y 0.518
 124226 124227 SMc01241 SMc01240   TRm5 FALSE 0.001 1049.000 0.000 NA   0.006
 124227 124228 SMc01240 SMc01239 TRm5   FALSE 0.004 602.000 0.000 NA   0.158
 124230 124231 SMc01237 SMc01236 nrd   FALSE 0.000 896.000 0.000 NA   -0.123
 124231 124232 SMc01236 SMc01235   uvrA FALSE 0.146 90.000 0.005 NA   0.061
 124236 124237 SMc01230 SMc01229     FALSE 0.114 74.000 0.000 NA   0.129
 124237 124238 SMc01229 SMc01228     FALSE 0.027 172.000 0.000 1.000 N -0.139
 124238 124239 SMc01228 SMc01227   nerA TRUE 0.652 73.000 0.189 1.000 N 0.017
 124239 124240 SMc01227 SMc01226 nerA   TRUE 0.785 49.000 0.224 1.000 N -0.044
 124240 124241 SMc01226 SMc01225     FALSE 0.097 653.000 0.000 0.085 Y 0.229
 124241 124242 SMc01225 SMc01224   trxB FALSE 0.389 107.000 0.065 1.000 N 0.491
 124243 124244 SMc01223 SMc01222   lpsC FALSE 0.179 122.000 0.007 NA N 0.559
 124244 124245 SMc01222 SMc01221 lpsC lpsD TRUE 0.880 19.000 0.007 NA Y 0.003
 124245 124246 SMc01221 SMc01220 lpsD lpsE TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.017 Y 0.167
 124247 124248 SMc01219 SMc01218 lpsB greA FALSE 0.307 84.000 0.036 1.000 N -0.063
 124250 124251 SMc01216 SMc01215   carB FALSE 0.106 129.000 0.003 NA   0.213
 124251 124252 SMc01215 SMc01214 carB   FALSE 0.265 203.000 0.000 1.000 Y 0.319
 124253 124254 SMc01213 SMc01212     FALSE 0.017 353.000 0.000 1.000   0.864
 124254 124255 SMc01212 SMc01211     FALSE 0.019 448.000 0.015 1.000 N 0.094
 124257 124258 SMc01209 SMc01700 coaD ppiA TRUE 0.649 26.000 0.024 1.000 N 0.071
 124258 124259 SMc01700 SMc01208 ppiA ppiB TRUE 0.993 26.000 0.420 0.001 Y 0.142
 124259 124260 SMc01208 SMc01207 ppiB queA FALSE 0.165 177.000 0.031 1.000 N 0.286
 124260 124261 SMc01207 SMc01206 queA tgt TRUE 0.998 1.000 0.360 0.000 Y -0.392
 124261 124262 SMc01206 SMc01205 tgt   FALSE 0.008 449.000 0.000 1.000 N 0.045
 124263 124264 SMc01204 SMc01203     FALSE 0.000 792.000 0.000 1.000   -0.550
 124264 124265 SMc01203 SMc01202     FALSE 0.188 134.000 0.036 NA   0.367
 124265 124266 SMc01202 SMc01200     FALSE 0.005 492.000 0.000 NA   0.221
 124268 124269 SMc02814 SMc01199     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   -0.111
 124273 124274 SMc01195 SMc01194     FALSE 0.010 394.000 0.000 1.000   0.204
 124274 124275 SMc01194 SMc01193     TRUE 0.960 2.000 0.139 NA   0.367
 124275 124276 SMc01193 SMc01192   metS TRUE 0.917 15.000 0.221 NA N 0.107
 124278 124279 SMc01190 SMc01189   tmk TRUE 0.978 -3.000 0.254 1.000 N -0.051
 124279 124280 SMc01189 SMc01188 tmk dac TRUE 0.599 58.000 0.099 1.000 N -0.018
 124280 124281 SMc01188 SMc01187 dac rlpA TRUE 0.873 57.000 0.198 NA Y -0.046
 124282 403003 SMc01186 SMc01243   tRNA-SER_TGA FALSE 0.014 254.000 0.000 NA   NA
 403003 124283 SMc01243 SMc01185 tRNA-SER_TGA   FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 124283 124284 SMc01185 SMc01184     TRUE 0.728 76.000 0.333 NA   0.080
 124284 403004 SMc01184 SMc01244   tRNA-ALA_CGC FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 403004 124285 SMc01244 SMc01183 tRNA-ALA_CGC lexA FALSE 0.004 499.000 0.000 NA   NA
 124285 403005 SMc01183 SMc01251 lexA tRNA-CYS_GCA FALSE 0.020 221.000 0.000 NA   NA
 403006 124289 SMc01245 SMc01179 tRNA-ASN_GTT   FALSE 0.110 78.000 0.000 NA   NA
 124289 124290 SMc01179 SMc01178     TRUE 0.999 -3.000 0.869 0.054 Y 0.184
 124291 124292 SMc01177 SMc01176     TRUE 0.953 -3.000 0.093 NA   0.353
 124292 124293 SMc01176 SMc01175     FALSE 0.022 194.000 0.000 NA   0.095
 124294 124295 SMc01174 SMc01173 cysK2   TRUE 0.914 8.000 0.082 1.000   0.241
 124295 124296 SMc01173 SMc01172   sseA FALSE 0.294 198.000 0.222 1.000   0.113
 124296 124297 SMc01172 SMc01171 sseA   TRUE 0.943 6.000 0.200 1.000   -0.176
 124297 124298 SMc01171 SMc01170     FALSE 0.162 102.000 0.053 NA   -0.343
 124300 124301 SMc01168 SMc04449   cpdB FALSE 0.070 129.000 0.000 1.000 N 0.005
 124302 124303 SMc00935 SMc00936   ilvA FALSE 0.391 78.000 0.056 NA   0.184
 124304 124305 SMc00937 SMc00938 trkH   FALSE 0.095 85.000 0.000 NA   0.148
 403028 124306 SMc00957 SMc00939 tRNA-LEU_TAA   FALSE 0.130 68.000 0.000 NA   NA
 124306 124307 SMc00939 SMc00940     FALSE 0.003 206.000 0.000 NA   -0.111
 124307 124308 SMc00940 SMc00941     FALSE 0.001 492.000 0.000 NA   -0.058
 124308 124309 SMc00941 SMc00942     FALSE 0.012 89.000 0.000 NA   -0.200
 124309 124310 SMc00942 SMc00943   wrbA1 FALSE 0.009 355.000 0.000 NA   0.210
 124311 124312 SMc00944 SMc00945   gpt FALSE 0.152 170.000 0.052 1.000   0.065
 124314 124315 SMc00947 SMc00948 glnB glnA TRUE 0.822 83.000 0.145 1.000 Y 0.868
 124315 124316 SMc00948 SMc00949 glnA   FALSE 0.026 182.000 0.012 NA   -0.240
 124318 124319 SMc00951 SMc00952     TRUE 0.605 83.000 0.147 1.000 N 0.341
 124321 124322 SMc00954 SMc00955     FALSE 0.016 180.000 0.000 NA   0.033
 124322 124323 SMc00955 SMc00959     FALSE 0.001 486.000 0.000 NA   -0.197
 124323 124324 SMc00959 SMc00956   xthA1 TRUE 0.862 4.000 0.045 NA   -0.041
 124324 124325 SMc00956 SMc00958 xthA1   FALSE 0.248 -3.000 0.000 NA   -0.226
 124326 124327 SMc04450 SMc00227 mfd   TRUE 0.916 3.000 0.078 NA   0.029
 124329 124330 SMc00229 SMc00230     FALSE 0.414 19.000 0.012 NA   -0.099
 124330 124331 SMc00230 SMc00231   glmS TRUE 0.893 -3.000 0.027 1.000   -0.009
 124331 124332 SMc00231 SMc00232 glmS glmU FALSE 0.286 244.000 0.083 1.000 Y 0.034
 124332 124333 SMc00232 SMc00233 glmU   FALSE 0.144 156.000 0.002 1.000 N 0.563
 124334 124335 SMc00234 SMc00235 ppiD trpD TRUE 0.562 19.000 0.012 1.000   -0.017
 124335 124336 SMc00235 SMc00236 trpD trpC TRUE 0.986 10.000 0.293 1.000 Y 0.065
 124336 124337 SMc00236 SMc00237 trpC moaC TRUE 0.965 0.000 0.113 1.000 N 0.200
 124337 124338 SMc00237 SMc00238 moaC moeA TRUE 0.996 0.000 0.093 0.002 Y -0.031
 124339 124340 SMc00239 SMc00240     FALSE 0.022 211.000 0.000 NA   0.152
 124340 124341 SMc00240 SMc00241     FALSE 0.193 133.000 0.036 NA   0.406
 124341 124342 SMc00241 SMc00242     FALSE 0.073 173.000 0.000 1.000   0.496
 124342 124343 SMc00242 SMc00244     TRUE 0.957 -16.000 0.318 1.000   0.054
 124343 124344 SMc00244 SMc00243     TRUE 0.998 0.000 0.923 0.084   0.336
 124344 124345 SMc00243 SMc00245     TRUE 0.970 -10.000 0.418 1.000   -0.013
 124345 124346 SMc00245 SMc00246   qor FALSE 0.360 147.000 0.182 1.000   0.150
 124346 124347 SMc00246 SMc00247 qor pcs TRUE 0.617 53.000 0.108 1.000 N -0.105
 124349 124350 SMc00317 SMc00248   ccsA FALSE 0.250 140.000 0.075 1.000   0.202
 403007 124351 SMc00303 SMc00249 tRNA-LYS_TTT   FALSE 0.039 153.000 0.000 NA   NA
 124351 124352 SMc00249 SMc00250     FALSE 0.005 558.000 0.000 NA   0.306
 124352 124353 SMc00250 SMc00251     FALSE 0.191 40.000 0.000 NA   0.102
 124355 124356 SMc00253 SMc00254     FALSE 0.005 906.000 0.000 NA   0.490
 124356 124357 SMc00254 SMc04437     FALSE 0.081 109.000 0.000 NA   0.233
 124357 124358 SMc04437 SMc00255     FALSE 0.341 -18.000 0.000 NA   0.031
 124360 124361 SMc00257 SMc00258 ropB2   FALSE 0.005 158.000 0.000 NA   -0.095
 124362 124363 SMc00259 SMc00260     TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   0.262
 124363 124364 SMc00260 SMc00261     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.086 Y 0.074
 124364 124365 SMc00261 SMc00262     TRUE 0.989 -3.000 0.111 1.000 Y 0.391
 124365 124366 SMc00262 SMc00263     TRUE 0.983 -3.000 0.278 1.000 N 0.182
 124366 124367 SMc00263 SMc00264     TRUE 0.958 4.000 0.130 1.000 N 0.219
 124367 124368 SMc00264 SMc00265     TRUE 0.597 103.000 0.286 1.000 N -0.050
 124368 124369 SMc00265 SMc00266     TRUE 0.929 48.000 0.286 1.000 Y -0.039
 124369 124370 SMc00266 SMc00267     FALSE 0.116 290.000 0.000 NA Y 0.239
 124370 124371 SMc00267 SMc00268     FALSE 0.290 49.000 0.000 NA N 0.198
 124371 124372 SMc00268 SMc00269     TRUE 0.754 75.000 0.082 0.086 N 0.237
 124372 124373 SMc00269 SMc00270     TRUE 0.998 13.000 0.812 0.001 Y 0.439
 124374 124375 SMc00271 SMc00272     TRUE 0.995 0.000 0.400 NA Y 0.333
 124375 124376 SMc00272 SMc00273     TRUE 0.995 -3.000 0.400 NA Y 0.367
 124376 124377 SMc00273 SMc00274     TRUE 0.581 10.000 0.000 1.000 N -0.054
 124377 124378 SMc00274 SMc00275     FALSE 0.152 86.000 0.000 1.000 N 0.060
 124379 124380 SMc00276 SMc00277     TRUE 0.565 -13.000 0.000 1.000   0.063
 124381 124382 SMc00278 SMc00279     FALSE 0.086 183.000 0.000 1.000 N 0.616
 124382 124383 SMc00279 SMc00280     FALSE 0.015 274.000 0.000 NA   0.232
 124384 124385 SMc00281 SMc00282     FALSE 0.001 309.000 0.000 NA   -0.138
 124386 124387 SMc00283 SMc00284     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   0.195
 124387 124388 SMc00284 SMc00285   TRm5 FALSE 0.001 546.000 0.000 NA   -0.044
 124388 124389 SMc00285 SMc04866 TRm5   FALSE 0.000 647.000 0.000 NA   -0.299
 124389 124390 SMc04866 SMc00286     FALSE 0.013 307.000 0.000 NA   0.285
 403027 124391 SMc00308 SMc00287 tRNA-ARG_TCT   FALSE 0.370 18.000 0.000 NA   NA
 124391 403026 SMc00287 SMc00307   tRNA-PRO_TGG FALSE 0.174 53.000 0.000 NA   NA
 403026 124392 SMc00307 SMc00288 tRNA-PRO_TGG   FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 124392 124393 SMc00288 SMc00289   cspA5 TRUE 0.976 0.000 0.226 NA   0.325
 124394 124395 SMc00290 SMc00291 gloA   FALSE 0.007 392.000 0.000 NA   0.216
 124395 403008 SMc00291 SMc00304   tRNA-GLU_TTC FALSE 0.036 162.000 0.000 NA   NA
 403008 403010 SMc00304 SMc00305 tRNA-GLU_TTC tRNA-GLU_CTC FALSE 0.007 351.000 0.000 NA   NA
 403010 403011 SMc00305 SMc00306 tRNA-GLU_CTC tRNA-GLU_TTC FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 124396 124397 SMc00292 SMc00293 recJ thrA FALSE 0.092 130.000 0.009 1.000 N -0.173
 124397 124398 SMc00293 SMc00294 thrA   TRUE 0.841 81.000 0.202 1.000 Y 0.106
 124398 124399 SMc00294 SMc00295     FALSE 0.115 125.000 0.009 NA   0.156
 124400 124401 SMc00296 SMc00297 phbC sfsA FALSE 0.409 34.000 0.013 NA   0.054
 124401 124402 SMc00297 SMc00298 sfsA map1 TRUE 0.643 29.000 0.080 NA   -0.077
 124402 124403 SMc00298 SMc00299 map1 radC TRUE 0.972 -3.000 0.169 1.000 N 0.125
 124403 124404 SMc00299 SMc00300 radC   FALSE 0.103 142.000 0.000 1.000 N 0.265
 124405 124406 SMc00301 SMc00302     FALSE 0.366 96.000 0.083 NA   0.189
 124406 124407 SMc00302 SMc00533     TRUE 0.944 11.000 0.309 NA   -0.188
 124407 124408 SMc00533 SMc00532     TRUE 0.915 13.000 0.193 1.000 N -0.107
 124408 124409 SMc00532 SMc00531     TRUE 0.981 23.000 0.482 1.000 Y 0.317
 124409 124410 SMc00531 SMc00530     TRUE 0.908 78.000 0.466 1.000 Y -0.174
 124410 124411 SMc00530 SMc00529   nifS FALSE 0.293 155.000 0.109 1.000 N 0.185
 124412 5451319 SMc00528 SMc05006     FALSE 0.178 52.000 0.000 NA   NA
 124416 124417 SMc00524 SMc00523 bcp   TRUE 0.776 18.000 0.052 1.000   0.179
 124417 124418 SMc00523 SMc00540     TRUE 0.969 -9.000 0.011 0.003   0.186
 124418 124419 SMc00540 SMc00539     FALSE 0.254 124.000 0.054 1.000   0.222
 124419 124420 SMc00539 SMc00522   rhlE1 FALSE 0.079 200.000 0.058 1.000   -0.345
 124420 124421 SMc00522 SMc00521 rhlE1   TRUE 0.861 10.000 0.087 1.000 N -0.468
 124422 124423 SMc00520 SMc00519     TRUE 0.846 4.000 0.039 NA N -0.195
 124423 124424 SMc00519 SMc00518     TRUE 0.986 -3.000 0.447 NA N -0.106
 124424 124425 SMc00518 SMc00517     TRUE 0.985 4.000 0.533 NA   0.057
 124425 124426 SMc00517 SMc00516     TRUE 0.801 56.000 0.355 NA   0.005
 124426 124427 SMc00516 SMc00515     TRUE 0.986 6.000 0.645 NA   0.116
 124427 124428 SMc00515 SMc00514     TRUE 0.823 25.000 0.117 1.000   0.348
 124429 124430 SMc00513 SMc00512     TRUE 0.971 0.000 0.027 NA Y -0.230
 124430 124431 SMc00512 SMc00511   rpe FALSE 0.305 63.000 0.003 NA N 0.127
 124431 124432 SMc00511 SMc00510 rpe   TRUE 0.865 -3.000 0.015 NA   0.099
 124432 124433 SMc00510 SMc00509     TRUE 0.973 0.000 0.212 NA   0.180
 124433 124434 SMc00509 SMc00508   purB FALSE 0.294 64.000 0.008 NA   0.202
 124434 124435 SMc00508 SMc00507 purB   FALSE 0.023 222.000 0.002 NA   -0.015
 124439 124440 SMc00503 SMc00502     TRUE 0.984 -3.000 0.353 NA   0.187
 124440 124441 SMc00502 SMc00501     TRUE 0.798 41.000 0.176 1.000 N 0.139
 124441 124442 SMc00501 SMc00500     FALSE 0.225 2.000 0.000 NA   -0.061
 124442 124443 SMc00500 SMc00499     TRUE 0.772 59.000 0.286 NA   0.160
 124443 124444 SMc00499 SMc00498     TRUE 0.811 -3.000 0.000 NA   0.458
 124444 124445 SMc00498 SMc00497     FALSE 0.125 24.000 0.000 NA   -0.019
 124447 124448 SMc00495 SMc00494 purC   TRUE 0.982 19.000 0.460 1.000 Y 0.163
 124448 124449 SMc00494 SMc00493   purQ TRUE 0.978 82.000 0.656 0.001 Y -0.417
 124449 124450 SMc00493 SMc00492 purQ   FALSE 0.207 106.000 0.020 NA   0.296
 124452 124453 SMc00490 SMc00489     FALSE 0.407 92.000 0.078 NA   0.565
 124453 124454 SMc00489 SMc00488   purL FALSE 0.003 418.000 0.009 NA   -0.306
 124454 124455 SMc00488 SMc00487 purL   FALSE 0.249 126.000 0.093 NA N -0.055
 124455 124456 SMc00487 SMc00538     FALSE 0.073 415.000 0.216 NA N 0.037
 124456 124457 SMc00538 SMc00537     FALSE 0.094 351.000 0.147 1.000 N 0.422
 124457 124458 SMc00537 SMc00536     TRUE 0.745 142.000 0.042 0.053 Y 0.291
 124459 124460 SMc00535 SMc00534     TRUE 0.900 -3.000 0.005 NA N 0.361
 124460 124461 SMc00534 SMc00486   glsA FALSE 0.063 229.000 0.025 NA N 0.075
 124461 124462 SMc00486 SMc00485 glsA rpsD FALSE 0.168 146.000 0.011 1.000 N 0.358
 124462 124463 SMc00485 SMc00484 rpsD   FALSE 0.007 252.000 0.000 1.000   -0.096
 124463 124464 SMc00484 SMc00483   murI FALSE 0.107 138.000 0.005 1.000   0.094
 124464 124465 SMc00483 SMc00482 murI   TRUE 0.776 -13.000 0.025 1.000 N -0.111
 124465 124466 SMc00482 SMc00481     FALSE 0.383 51.000 0.014 NA   0.172
 124469 124470 SMc00549 SMc00478     FALSE 0.105 90.000 0.000 NA   0.214
 124470 124471 SMc00478 SMc00477     FALSE 0.498 56.000 0.077 NA   0.012
 124471 124472 SMc00477 SMc00476     FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   0.288
 124473 124474 SMc00475 SMc00760 alaS recA FALSE 0.187 240.000 0.054 0.097 N -0.119
 124475 124476 SMc00473 SMc00472     FALSE 0.380 139.000 0.131 1.000 N 0.547
 124480 124481 SMc00468 SMc00467     FALSE 0.161 169.000 0.072 NA   0.080
 124481 124482 SMc00467 SMc00466     TRUE 0.993 -3.000 0.791 NA   -0.048
 124482 124483 SMc00466 SMc00548     FALSE 0.180 135.000 0.059 NA   0.055
 124484 124485 SMc00465 SMc00463 folK folB TRUE 0.976 -13.000 0.142 1.000 Y 0.194
 124485 124486 SMc00463 SMc00462 folB folP TRUE 0.942 15.000 0.094 1.000 Y -0.218
 124488 124489 SMc00193 SMc00192   fdx FALSE 0.007 128.000 0.000 NA   -0.214
 124489 124490 SMc00192 SMc00191 fdx   FALSE 0.126 408.000 0.451 NA   -0.064
 124492 124493 SMc00189 SMc00188 fbcC fbcB TRUE 0.992 33.000 0.630 0.001 Y -0.390
 124493 124494 SMc00188 SMc00187 fbcB fbcF TRUE 0.986 15.000 0.029 0.001 Y 0.690
 124494 124495 SMc00187 SMc00186 fbcF   FALSE 0.020 315.000 0.000 1.000 N 0.175
 124495 124496 SMc00186 SMc00185     TRUE 0.976 60.000 0.385 0.006 Y -0.022
 124500 124501 SMc00196 SMc00181     FALSE 0.018 201.000 0.000 NA   0.076
 124502 124503 SMc00180 SMc00179 hemF   FALSE 0.170 84.000 0.004 NA   0.095
 124504 124505 SMc00178 SMc00177     FALSE 0.132 69.000 0.000 NA   0.158
 124505 124506 SMc00177 SMc00176     FALSE 0.477 82.000 0.109 NA   0.192
 124506 124507 SMc00176 SMc00175     TRUE 0.941 85.000 0.850 NA Y -0.101
 124507 124508 SMc00175 SMc00174     TRUE 0.998 12.000 0.889 0.024 Y -0.031
 124510 124511 SMc00172 SMc00171     FALSE 0.059 249.000 0.029 1.000   0.122
 124512 124513 SMc00169 SMc00170 dme   FALSE 0.060 206.000 0.000 1.000 N 0.305
 124513 124514 SMc00170 SMc00168     TRUE 0.687 157.000 0.667 1.000 N 0.110
 124514 124515 SMc00168 SMc00167     FALSE 0.239 168.000 0.105 NA   0.387
 124516 124517 SMc00166 SMc00165     FALSE 0.027 298.000 0.000 1.000 N 0.370
 124517 124518 SMc00165 SMc00164     FALSE 0.118 372.000 0.059 NA Y 0.043
 124520 124521 SMc00162 SMc00161   nadE2 TRUE 0.915 3.000 0.034 NA N 0.261
 124521 124522 SMc00161 SMc04438 nadE2 cgmB FALSE 0.031 212.000 0.000 NA   0.319
 124523 124524 SMc00195 SMc00159 cgmA   FALSE 0.005 627.000 0.000 NA N 0.161
 124524 124525 SMc00159 SMc00158     TRUE 0.981 2.000 0.353 NA   0.116
 124525 124526 SMc00158 SMc00157     FALSE 0.033 142.000 0.000 NA   0.087
 124527 124528 SMc00156 SMc00155   aroF FALSE 0.114 136.000 0.018 1.000   -0.021
 124528 124529 SMc00155 SMc00154 aroF gor FALSE 0.084 233.000 0.079 1.000 N -0.284
 124529 124530 SMc00154 SMc00153 gor   FALSE 0.264 205.000 0.200 NA   0.405
 124530 124531 SMc00153 SMc00152   rpiA FALSE 0.212 112.000 0.065 NA   -0.061
 124535 124536 SMc00148 SMc00147     FALSE 0.444 97.000 0.111 NA   0.525
 124539 124540 SMc00144 SMc00197 moaA   FALSE 0.111 247.000 0.125 NA N -0.016
 124540 124541 SMc00197 SMc00143   mobA TRUE 0.545 16.000 0.000 NA N 0.218
 124541 124542 SMc00143 SMc00142 mobA mobB TRUE 0.995 -3.000 0.013 0.002 Y 0.188
 124543 124544 SMc00141 SMc00198     FALSE 0.133 65.000 0.000 NA   0.138
 124545 124546 SMc00140 SMc00139     FALSE 0.364 263.000 0.185 1.000 Y 0.161
 124546 124547 SMc00139 SMc00138     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.010 Y 0.071
 124547 124548 SMc00138 SMc00137     TRUE 0.591 172.000 0.273 NA Y -0.250
 124549 124550 SMc00136 SMc00135     FALSE 0.091 120.000 0.000 NA   0.505
 124551 124552 SMc00134 SMc00133     FALSE 0.030 68.000 0.000 1.000   -0.173
 124552 124553 SMc00133 SMc00132     TRUE 0.941 -3.000 0.061 1.000 N 0.020
 124554 124555 SMc00131 SMc04210     FALSE 0.418 65.000 0.081 NA N -0.241
 124555 124556 SMc04210 SMc04211     TRUE 0.969 -7.000 0.050 NA Y 0.200
 124558 124559 SMc04213 SMc04214 dgkA cobU FALSE 0.141 205.000 0.042 1.000 N 0.279
 124560 124561 SMc04215 SMc04216 cobV   FALSE 0.471 47.000 0.028 NA   0.173
 124561 124562 SMc04216 SMc04217     TRUE 0.982 -3.000 0.305 NA   0.340
 124563 124564 SMc04218 SMc04219     TRUE 0.997 -3.000 0.303 0.096 Y 0.058
 124564 124565 SMc04219 SMc04220     FALSE 0.112 121.000 0.016 1.000 N -0.253
 124565 124566 SMc04220 SMc04221     FALSE 0.049 206.000 0.000 1.000   0.367
 124566 124567 SMc04221 SMc04222     TRUE 0.982 -7.000 0.483 1.000   0.234
 124567 124568 SMc04222 SMc04223     FALSE 0.054 140.000 0.000 NA   0.226
 124570 124571 SMc04225 SMc04226     FALSE 0.002 250.000 0.000 NA   -0.065
 124571 124572 SMc04226 SMc04227   mcpV FALSE 0.019 234.000 0.000 NA   0.172
 124573 124574 SMc04228 SMc04229     TRUE 0.899 12.000 0.182 NA   -0.102
 124576 124577 SMc04231 SMc04232 uvrB   FALSE 0.016 299.000 0.000 NA   0.397
 124583 124584 SMc04238 SMc04239     FALSE 0.001 444.000 0.000 NA   -0.209
 124584 124585 SMc04239 SMc04240     FALSE 0.045 187.000 0.000 NA   0.379
 124585 124586 SMc04240 SMc04241     FALSE 0.431 52.000 0.035 1.000   -0.042
 124587 124588 SMc04242 SMc04243 zur znuB TRUE 0.981 0.000 0.086 1.000 Y -0.442
 124588 124589 SMc04243 SMc04244 znuB znuC TRUE 0.997 -7.000 0.755 0.096 Y -0.092
 124591 124592 SMc04246 SMc04247     FALSE 0.126 129.000 0.049 NA   -0.145
 124593 124594 SMc04248 SMc04249     TRUE 0.995 -3.000 0.465 NA Y -0.107
 124594 124595 SMc04249 SMc04250   TRm20 FALSE 0.015 153.000 0.000 1.000 N -0.332
 5451320 124596 SMc05007 SMc04251     FALSE 0.046 136.000 0.000 NA   NA
 124596 124597 SMc04251 SMc04252     FALSE 0.016 292.000 0.000 1.000 N 0.012
 124597 124598 SMc04252 SMc04253     FALSE 0.169 293.000 0.029 0.047   0.171
 124598 124599 SMc04253 SMc04254     TRUE 0.970 17.000 0.722 NA   0.082
 124599 124600 SMc04254 SMc04255   manB TRUE 0.934 57.000 0.357 NA Y 0.345
 124600 124601 SMc04255 SMc04256 manB   TRUE 0.885 72.000 0.250 1.000 Y 0.111
 124601 124602 SMc04256 SMc04257     TRUE 0.998 7.000 0.889 0.083 Y 0.085
 124602 124603 SMc04257 SMc04258     TRUE 0.993 17.000 0.500 0.083 Y 0.102
 124603 124604 SMc04258 SMc04259     TRUE 0.801 193.000 0.333 0.083 Y 0.106
 124606 124607 SMc04261 SMc04262   gnd TRUE 0.708 -24.000 0.005 NA   0.268
 124608 124609 SMc04263 SMc04264     FALSE 0.178 82.000 0.000 1.000 N 0.095
 124609 124610 SMc04264 SMc04265     TRUE 0.582 133.000 0.073 0.028   0.297
 124610 124611 SMc04265 SMc04266     TRUE 0.931 -16.000 0.195 NA   0.196
 124612 124613 SMc04268 SMc04270 msbB   TRUE 0.979 -3.000 0.248 1.000 N 0.029
 124613 124614 SMc04270 SMc04273     FALSE 0.349 237.000 0.453 1.000 N -0.036
 124614 124615 SMc04273 SMc04275     TRUE 0.997 13.000 0.784 0.016 Y 0.028
 124615 124616 SMc04275 SMc04277     TRUE 0.994 3.000 0.490 NA Y -0.138
 124616 124617 SMc04277 SMc04278   acpXL TRUE 0.659 172.000 0.394 NA Y -0.391
 124617 124618 SMc04278 SMc04279 acpXL cobD FALSE 0.109 151.000 0.000 1.000 N 0.469
 124618 124619 SMc04279 SMc04281 cobD cobC TRUE 0.996 0.000 0.344 0.006 N 0.043
 124619 124620 SMc04281 SMc04282 cobC cobB TRUE 0.988 3.000 0.067 0.006 N 0.387
 124620 124621 SMc04282 SMc04284 cobB cobA TRUE 0.986 -3.000 0.139 1.000 Y -0.251
 124621 124622 SMc04284 SMc04285 cobA cobE FALSE 0.240 134.000 0.057 1.000   0.251
 124624 124625 SMc04288 SMc04290     TRUE 0.764 70.000 0.389 1.000   -0.115
 124625 124626 SMc04290 SMc04293     TRUE 0.962 -19.000 0.389 1.000 N -0.073
 124626 124627 SMc04293 SMc04294     TRUE 0.968 42.000 0.222 0.082 Y 0.200
 124627 124628 SMc04294 SMc04295     TRUE 0.972 0.000 0.000 1.000 Y 0.187
 124628 124629 SMc04295 SMc04297     TRUE 0.970 -19.000 0.438 NA N 0.176
 124629 124630 SMc04297 SMc04301     TRUE 0.995 -3.000 0.938 NA N 0.156
 124630 124631 SMc04301 SMc04302   cobO FALSE 0.004 197.000 0.000 NA N -0.193
 124631 124632 SMc04302 SMc04303 cobO cobN TRUE 0.967 11.000 0.054 1.000 Y 0.372
 124632 124633 SMc04303 SMc04304 cobN cobW TRUE 0.689 73.000 0.274 1.000   -0.089
 124633 124634 SMc04304 SMc04305 cobW cobP TRUE 0.928 4.000 0.063 1.000   0.219
 124636 124637 SMc04307 SMc04308 cyaD2   FALSE 0.110 125.000 0.000 NA N 0.496
 124637 124638 SMc04308 SMc04309   cobQ FALSE 0.027 93.000 0.000 NA N -0.133
 124639 124640 SMc04310 SMc04311     FALSE 0.001 464.000 0.000 NA   -0.159
 124640 124641 SMc04311 SMc04439     FALSE 0.081 377.000 0.000 1.000 Y 0.231
 124641 124642 SMc04439 SMc04312     FALSE 0.004 175.000 0.000 1.000   -0.325
 124642 124643 SMc04312 SMc04313     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   0.368
 124645 124646 SMc04315 SMc04325     FALSE 0.218 76.000 0.000 1.000 N 0.148
 124647 124648 SMc04326 SMc04327     TRUE 0.602 39.000 0.115 NA   -0.256
 124648 124649 SMc04327 SMc04328     FALSE 0.091 65.000 0.000 NA   0.060
 124649 124650 SMc04328 SMc04329     FALSE 0.353 74.000 0.036 NA   0.171
 124650 124651 SMc04329 SMc04330   mttB FALSE 0.432 108.000 0.143 NA   0.342
 124654 124655 SMc04333 SMc04334     FALSE 0.040 195.000 0.000 NA   0.362
 124658 124659 SMc04337 SMc04339     TRUE 0.907 -7.000 0.118 NA   -0.020
 124659 124660 SMc04339 SMc04340     TRUE 0.994 -3.000 0.875 NA   -0.065
 124660 124661 SMc04340 SMc04342     FALSE 0.251 121.000 0.045 1.000   0.255
 124661 124662 SMc04342 SMc04345     TRUE 0.811 3.000 0.018 NA   -0.017
 124662 124663 SMc04345 SMc04347     FALSE 0.108 20.000 0.000 NA   -0.039
 124663 124664 SMc04347 SMc04451     FALSE 0.104 55.000 0.000 NA   0.048
 124665 124666 SMc04161 SMc04162     TRUE 0.745 32.000 0.150 NA   -0.031
 124666 124667 SMc04162 SMc04163     TRUE 0.734 99.000 0.000 0.082 Y 0.252
 124671 124672 SMc04167 SMc04168     TRUE 0.950 -3.000 0.163 NA   -0.202
 124674 124675 SMc04170 SMc04171     FALSE 0.013 102.000 0.000 1.000   -0.192
 124676 124677 SMc04172 SMc04173 cyaH   FALSE 0.156 116.000 0.000 1.000 N 0.480
 124680 124681 SMc04176 SMc04177     FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   0.208
 124681 124682 SMc04177 SMc04178     FALSE 0.389 39.000 0.000 1.000   0.383
 124682 124683 SMc04178 SMc04179     TRUE 0.715 2.000 0.000 1.000   0.048
 124684 124685 SMc04180 SMc04181     FALSE 0.233 1.000 0.000 NA   -0.433
 124686 124687 SMc04182 SMc04183     FALSE 0.011 365.000 0.000 NA   0.387
 124689 124690 SMc04184 SMc04186     FALSE 0.003 639.000 0.000 NA   0.153
 124690 124691 SMc04186 SMc04187     TRUE 0.720 0.000 0.000 NA   0.151
 124696 124697 SMc04194 SMc04195   TRm3 FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   -0.056
 124698 124699 SMc04440 SMc04196     FALSE 0.003 214.000 0.000 NA   -0.105
 124699 124700 SMc04196 SMc04197     FALSE 0.168 142.000 0.087 NA   -0.137
 124701 124702 SMc04198 SMc04199     FALSE 0.022 186.000 0.000 NA   0.084
 124702 124703 SMc04199 SMc04200     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   0.075
 124704 124705 SMc04201 SMc04202     FALSE 0.015 225.000 0.000 NA   0.087
 124706 124707 SMc04203 SMc04204 fecI fecR TRUE 0.989 -10.000 1.000 NA N -0.100
 124707 124708 SMc04204 SMc04205 fecR   TRUE 0.642 122.000 0.133 NA Y 0.120
 124708 124709 SMc04205 SMc04206     FALSE 0.010 375.000 0.000 1.000   0.168
 124709 124710 SMc04206 SMc04207     FALSE 0.403 22.000 0.000 1.000   0.095
 124710 124711 SMc04207 SMc04208     TRUE 0.982 -13.000 0.167 0.005   0.170
 124712 124713 SMc04209 SMc04267     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   0.247
 124714 124715 SMc04441 SMc04269     TRUE 0.952 5.000 0.208 NA   -0.012
 403025 124716 SMc04364 SMc04271 tRNA-LYS_CTT   FALSE 0.049 129.000 0.000 NA   NA
 124716 124717 SMc04271 SMc04272     TRUE 0.513 177.000 0.444 1.000   0.107
 124717 124718 SMc04272 SMc04274     TRUE 0.874 3.000 0.056 1.000   -0.296
 124718 124719 SMc04274 SMc04276     FALSE 0.034 151.000 0.000 NA   0.105
 124719 124720 SMc04276 SMc04280     FALSE 0.000 788.000 0.000 NA   -0.163
 124720 124721 SMc04280 SMc04283     FALSE 0.001 533.000 0.000 NA   -0.126
 124721 124722 SMc04283 SMc04287     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   -0.247
 124722 124723 SMc04287 SMc04289     TRUE 0.974 41.000 0.743 NA Y -0.021
 124724 124725 SMc04291 SMc04292   cyaF3 FALSE 0.095 185.000 0.042 1.000 N -0.311
 124728 124729 SMc04299 SMc04300   afuC FALSE 0.068 159.000 0.000 1.000   0.261
 124729 124730 SMc04300 SMc04316 afuC afuB TRUE 0.982 -12.000 0.590 1.000 N 0.079
 124730 124731 SMc04316 SMc04317 afuB afuA TRUE 0.997 8.000 0.607 0.082 Y 0.330
 124732 124733 SMc04318 SMc04319 csp1   TRUE 0.521 171.000 0.444 NA   0.260
 124733 124734 SMc04319 SMc04320   rpsU1 TRUE 0.953 43.000 0.889 NA   0.270
 124734 124735 SMc04320 SMc04321 rpsU1 gst10 FALSE 0.016 314.000 0.000 1.000   0.232
 124735 124736 SMc04321 SMc04322 gst10 mocA FALSE 0.449 37.000 0.000 1.000 N 0.300
 124737 124738 SMc04323 SMc04324     FALSE 0.001 675.000 0.000 NA   0.022
 124738 124739 SMc04324 SMc04338     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   -0.147
 124739 124740 SMc04338 SMc04341     TRUE 0.969 -12.000 0.429 NA   0.107
 124740 124741 SMc04341 SMc04343   cyaJ FALSE 0.089 156.000 0.000 1.000 N 0.253
 124743 124744 SMc04346 SMc04348 ilvC   FALSE 0.320 59.000 0.019 1.000 N -0.167
 124745 124746 SMc04350 SMc04351     TRUE 0.992 9.000 0.943 1.000 N 0.544
 124748 124749 SMc04357 SMc04359     FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   0.010
 124750 124751 SMc04360 SMc04361     FALSE 0.005 154.000 0.000 NA   -0.089
 124751 124752 SMc04361 SMc04362     TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA N -0.057
 124752 124753 SMc04362 SMc04363     FALSE 0.010 472.000 0.000 1.000 N 0.115
 124753 124754 SMc04363 SMc04452   ndh FALSE 0.227 85.000 0.000 1.000 N 0.352
 124754 124755 SMc04452 SMc01403 ndh   FALSE 0.396 132.000 0.133 1.000 N 0.411
 124759 124760 SMc01488 SMc01406     FALSE 0.008 112.000 0.000 NA   -0.453
 124760 124761 SMc01406 SMc01407   pdxJ FALSE 0.086 187.000 0.004 1.000 N 0.081
 124762 124763 SMc01408 SMc01409     FALSE 0.030 231.000 0.000 NA   0.517
 124763 124764 SMc01409 SMc01410     FALSE 0.012 331.000 0.000 NA   0.363
 124764 124765 SMc01410 SMc01489     FALSE 0.084 18.000 0.000 1.000   -0.196
 124766 124767 SMc01490 SMc01411     TRUE 0.886 22.000 0.227 NA   0.199
 124767 124768 SMc01411 SMc01412     TRUE 0.776 34.000 0.227 NA   -0.323
 124768 124769 SMc01412 SMc01413     TRUE 0.971 8.000 0.368 NA   0.207
 124769 124770 SMc01413 SMc01491     TRUE 0.931 -16.000 0.263 NA   -0.190
 124775 124776 SMc01417 SMc01418     FALSE 0.004 293.000 0.000 NA   -0.005
 124776 124777 SMc01418 SMc01419   rpoE1 TRUE 0.986 -16.000 0.818 NA   0.408
 124777 124778 SMc01419 SMc01420 rpoE1   TRUE 0.998 -3.000 0.909 NA Y 0.562
 124778 124779 SMc01420 SMc01421     TRUE 0.780 3.000 0.000 NA   0.503
 124780 124781 SMc01422 SMc01423   nthB TRUE 0.997 -13.000 0.761 0.000   0.664
 124781 124782 SMc01423 SMc01424 nthB nthA TRUE 0.999 -3.000 0.761 0.001   0.416
 124782 124783 SMc01424 SMc01425 nthA   FALSE 0.251 68.000 0.025 1.000   -0.166
 124785 124786 SMc01427 SMc01428   cspA2 FALSE 0.054 157.000 0.000 NA   0.329
 124788 124789 SMc01430 SMc01431 ilvH ilvI TRUE 0.986 23.000 0.146 0.001 Y NA
 124790 124791 SMc01432 SMc01433     FALSE 0.045 113.000 0.000 NA   0.076
 124791 124792 SMc01433 SMc01434     FALSE 0.188 48.000 0.000 NA   0.133
 124794 124795 SMc01494 SMc01437 serB   TRUE 0.880 -3.000 0.014 1.000 N -0.050
 124796 124797 SMc01438 SMc01439 degP2   FALSE 0.003 210.000 0.000 NA   -0.115
 124797 124798 SMc01439 SMc01440   hflC FALSE 0.039 199.000 0.000 NA   0.377
 124798 124799 SMc01440 SMc01441 hflC hflK TRUE 0.999 -3.000 0.947 0.006 Y 0.697
 124799 124800 SMc01441 SMc01442 hflK folA FALSE 0.102 195.000 0.044 1.000 N -0.123
 124800 124801 SMc01442 SMc01443 folA gst6 TRUE 0.760 14.000 0.005 1.000 N 0.263
 124801 124802 SMc01443 SMc01444 gst6 thyA FALSE 0.328 62.000 0.000 1.000 N 0.395
 124802 124803 SMc01444 SMc01445 thyA   FALSE 0.056 154.000 0.000 NA   0.327
 124803 124804 SMc01445 SMc01446     TRUE 0.701 53.000 0.154 NA   0.279
 124804 124805 SMc01446 SMc01447     TRUE 0.948 11.000 0.250 NA   0.176
 1782978 124808 SMc04478 SMc01450 ssrA   FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 124808 124809 SMc01450 SMc01451     TRUE 0.794 22.000 0.118 NA   0.073
 124809 124810 SMc01451 SMc01452     TRUE 0.770 83.000 0.425 NA   0.341
 124810 124811 SMc01452 SMc01453   TRm22 FALSE 0.007 477.000 0.000 NA   0.392
 124812 124813 SMc01454 SMc01455   dld FALSE 0.465 101.000 0.156 NA   0.207
 124815 124816 SMc01457 SMc01458     TRUE 0.989 -3.000 0.442 NA N 0.450
 124817 124818 SMc01459 SMc01460     TRUE 0.859 17.000 0.150 NA   0.110
 124818 124819 SMc01460 SMc01461   uvrD1 FALSE 0.045 126.000 0.010 NA   -0.178
 124820 124821 SMc01462 SMc01463     TRUE 0.640 37.000 0.043 1.000   0.275
 124822 124823 SMc01464 SMc01465   creA FALSE 0.186 104.000 0.011 NA   0.315
 124825 124826 SMc01467 SMc01468   cheW2 FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   0.136
 124826 124827 SMc01468 SMc01469 cheW2 mcpW TRUE 0.999 3.000 0.636 0.005 Y 0.159
 124828 124829 SMc01470 SMc01471   senC FALSE 0.209 148.000 0.125 NA   -0.128
 124829 124830 SMc01471 SMc01472 senC prmA FALSE 0.135 162.000 0.025 1.000   0.176
 124833 124834 SMc01884 SMc01883     FALSE 0.327 117.000 0.133 NA   0.023
 124834 124835 SMc01883 SMc01882     TRUE 0.992 4.000 1.000 NA   -0.272
 124835 124836 SMc01882 SMc01881   panB FALSE 0.032 205.000 0.000 NA N 0.094
 124836 124837 SMc01881 SMc01880 panB panC TRUE 0.998 3.000 0.395 0.001 Y -0.294
 124839 124840 SMc01878 SMc01877 ligA recN TRUE 0.860 99.000 0.039 0.010 Y 0.212
 124840 124841 SMc01877 SMc01876 recN   TRUE 0.746 37.000 0.117 1.000   0.173
 124841 124842 SMc01876 SMc01875   lpxC FALSE 0.051 267.000 0.064 1.000   -0.140
 124842 124843 SMc01875 SMc01874 lpxC ftsZ1 FALSE 0.058 409.000 0.134 1.000 N 0.081
 124843 124844 SMc01874 SMc01873 ftsZ1 ftsA TRUE 0.753 94.000 0.114 1.000 Y 0.225
 124844 124845 SMc01873 SMc01872 ftsA ftsQ TRUE 0.967 -3.000 0.137 NA N 0.293
 124845 124846 SMc01872 SMc01871 ftsQ ddlB TRUE 0.989 -12.000 0.372 NA Y 0.291
 124846 124847 SMc01871 SMc01870 ddlB aqpZ1 FALSE 0.006 311.000 0.000 1.000 N -0.183
 124849 124850 SMc01868 SMc01867 murB murC TRUE 0.997 -3.000 0.108 0.003 Y 0.085
 124850 124851 SMc01867 SMc01866 murC murG TRUE 0.993 -3.000 0.283 1.000 Y 0.096
 124851 124852 SMc01866 SMc01865 murG ftsW TRUE 0.991 4.000 0.647 1.000 N 0.300
 124852 124853 SMc01865 SMc01864 ftsW murD TRUE 0.934 58.000 0.297 0.002 N -0.138
 124853 124854 SMc01864 SMc01863 murD mraY TRUE 0.998 7.000 0.647 0.003 Y 0.094
 124854 124855 SMc01863 SMc01862 mraY murF TRUE 0.769 242.000 0.309 0.003 Y -0.008
 124855 124856 SMc01862 SMc01861 murF murE TRUE 0.999 2.000 0.569 0.001 Y 0.272
 124856 124857 SMc01861 SMc01860 murE ftsI FALSE 0.288 167.000 0.004 1.000 Y -0.323
 124857 124858 SMc01860 SMc01859 ftsI   TRUE 0.829 0.000 0.033 NA   -0.209
 124858 124859 SMc01859 SMc01858     TRUE 0.897 7.000 0.089 NA   0.060
 124859 124860 SMc01858 SMc01857     TRUE 0.970 15.000 0.635 NA   0.135
 124861 124862 SMc01856 SMc01855     FALSE 0.075 138.000 0.000 NA N 0.196
 124862 124863 SMc01855 SMc01854     FALSE 0.102 199.000 0.026 NA N 0.206
 124863 124864 SMc01854 SMc01853     TRUE 0.963 -3.000 0.098 1.000 N 0.235
 124865 124866 SMc01852 SMc01851 pfk   FALSE 0.416 138.000 0.158 1.000 N 0.524
 124866 124867 SMc01851 SMc01850     FALSE 0.315 133.000 0.123 NA N 0.109
 124869 124870 SMc01848 SMc01847     TRUE 0.985 -3.000 0.347 NA N 0.160
 124870 124871 SMc01847 SMc01846     FALSE 0.223 162.000 0.058 1.000 N 0.294
 124871 124872 SMc01846 SMc01845     TRUE 0.727 137.000 0.235 1.000 Y 0.263
 124872 124873 SMc01845 SMc01844     FALSE 0.236 171.000 0.137 NA   0.102
 124874 124875 SMc01843 SMc01842 metF   TRUE 0.970 3.000 0.160 1.000 N 0.666
 124875 124876 SMc01842 SMc04454     FALSE 0.008 391.000 0.009 1.000   -0.228
 124876 124877 SMc04454 SMc02819     FALSE 0.096 127.000 0.016 1.000   -0.117
 124878 124879 SMc02818 SMc02817     TRUE 0.975 -3.000 0.227 NA   0.193
 124879 124880 SMc02817 SMc04455   ilvG FALSE 0.065 35.000 0.000 NA   -0.041
 124881 124882 SMc01573 SMc01574     TRUE 0.641 73.000 0.231 NA   -0.032
 124883 124884 SMc01575 SMc01576     FALSE 0.096 188.000 0.038 1.000   -0.055
 124885 124886 SMc01579 SMc01582     FALSE 0.124 209.000 0.029 1.000 N 0.397
 124886 124887 SMc01582 SMc01588     TRUE 0.999 -3.000 0.706 0.083 Y 0.054
 124887 124888 SMc01588 SMc01594     FALSE 0.419 198.000 0.361 1.000 N 0.093
 124888 124889 SMc01594 SMc01597     TRUE 0.758 93.000 0.108 1.000 Y 0.302
 124889 124890 SMc01597 SMc01600     TRUE 0.806 109.000 0.346 1.000 Y -0.134
 124891 124892 SMc01602 SMc01605     FALSE 0.239 186.000 0.132 1.000 N 0.034
 124892 124893 SMc01605 SMc01606     TRUE 0.627 153.000 0.301 0.081   -0.097
 124893 124894 SMc01606 SMc01607     TRUE 0.997 -3.000 0.774 0.081   -0.031
 124894 124895 SMc01607 SMc01608     TRUE 0.997 5.000 0.461 0.081 Y 0.186
 124895 124896 SMc01608 SMc01609   ribH2 FALSE 0.015 316.000 0.000 1.000 N 0.067
 124896 124897 SMc01609 SMc01610 ribH2   FALSE 0.044 226.000 0.000 1.000 N 0.203
 124897 124898 SMc01610 SMc01611   fhuA1 FALSE 0.378 161.000 0.214 1.000 N 0.065
 124899 124900 SMc01612 SMc01613 TRm5 rpiB FALSE 0.007 637.000 0.000 1.000 N 0.115
 124900 124901 SMc01613 SMc01614 rpiB tpiA2 TRUE 0.964 38.000 0.438 1.000 Y 0.146
 124901 124902 SMc01614 SMc01615 tpiA2   TRUE 0.988 -3.000 0.094 1.000 Y 0.467
 124902 124903 SMc01615 SMc01616   eryC FALSE 0.411 94.000 0.111 NA   0.127
 124903 124904 SMc01616 SMc01617 eryC   TRUE 0.887 14.000 0.222 NA   -0.344
 124904 124905 SMc01617 SMc01618     TRUE 0.988 -3.000 0.107 1.000 Y 0.123
 124905 124906 SMc01618 SMc01619     TRUE 0.916 -3.000 0.080 1.000   -0.348
 124906 124907 SMc01619 SMc01620   eryB TRUE 0.943 14.000 0.318 1.000   0.043
 124907 124908 SMc01620 SMc01621 eryB fucA1 TRUE 0.832 29.000 0.176 1.000 N 0.003
 124908 124909 SMc01621 SMc01622 fucA1   TRUE 0.938 10.000 0.143 1.000 N 0.201
 124909 124910 SMc01622 SMc01623   eriA TRUE 0.991 -3.000 0.476 1.000 N 0.624
 124910 124911 SMc01623 SMc01624 eriA   TRUE 0.997 0.000 0.550 1.000 Y 0.214
 124911 124912 SMc01624 SMc01625     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.006 Y 0.085
 124912 124913 SMc01625 SMc01626     TRUE 0.998 5.000 0.550 0.081 Y 0.098
 124913 124914 SMc01626 SMc01627     TRUE 0.998 12.000 0.950 0.081 Y 0.152
 124914 124915 SMc01627 SMc01628     TRUE 0.921 184.000 0.783 0.081 Y 0.255
 124915 124916 SMc01628 SMc01629   eryD TRUE 0.687 115.000 0.391 1.000 N 0.624
 124916 124917 SMc01629 SMc01630 eryD   FALSE 0.216 207.000 0.000 1.000 Y 0.034
 124918 124919 SMc01631 SMc01632     TRUE 0.960 52.000 0.500 1.000 Y 0.209
 124919 124920 SMc01632 SMc01633     TRUE 0.833 153.000 0.238 0.081 Y 0.313
 124920 124921 SMc01633 SMc01634     TRUE 0.999 0.000 0.738 0.081 Y -0.095
 124921 124922 SMc01634 SMc01635     TRUE 0.965 5.000 0.235 1.000 N -0.053
 124924 124925 SMc01637 SMc01638     TRUE 0.634 172.000 0.608 1.000   0.259
 124925 124926 SMc01638 SMc01639     FALSE 0.307 252.000 0.081 1.000 Y 0.428
 124926 124927 SMc01639 SMc01640     FALSE 0.342 195.000 0.250 1.000 N 0.079
 124927 124928 SMc01640 SMc01641     TRUE 0.929 -3.000 0.069 1.000 N -0.186
 124928 124929 SMc01641 SMc01642     FALSE 0.018 341.000 0.000 1.000 N 0.189
 124929 124930 SMc01642 SMc01643     TRUE 0.993 0.000 0.091 0.081 Y 0.034
 124930 124931 SMc01643 SMc01644     TRUE 0.997 -3.000 0.318 0.081 Y 0.184
 124931 124932 SMc01644 SMc01645     TRUE 0.957 -7.000 0.286 1.000   -0.187
 124934 124935 SMc01647 SMc01648     FALSE 0.160 80.000 0.000 1.000   0.162
 124936 124937 SMc01649 SMc01650     TRUE 0.627 8.000 0.000 NA   0.226
 124938 124939 SMc01651 SMc01652     FALSE 0.451 124.000 0.196 1.000 N 0.090
 124939 124940 SMc01652 SMc01653     TRUE 0.919 160.000 0.609 0.081 Y 0.699
 124940 124941 SMc01653 SMc01654     TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.081 Y 0.012
 124941 124942 SMc01654 SMc01655     TRUE 0.998 -10.000 0.821 0.081 Y 0.132
 124942 124943 SMc01655 SMc01656     TRUE 0.936 28.000 0.405 1.000 N 0.425
 124943 124944 SMc01656 SMc01657   fhuA2 FALSE 0.024 303.000 0.000 1.000 N 0.253
 124944 124945 SMc01657 SMc01658 fhuA2   TRUE 0.649 30.000 0.046 NA   0.216
 124945 124946 SMc01658 SMc01659     TRUE 0.901 3.000 0.046 NA   0.112
 124946 124947 SMc01659 SMc01660     FALSE 0.443 107.000 0.222 NA   -0.147
 124948 124949 SMc01661 SMc01662     TRUE 0.573 81.000 0.111 1.000 N 0.399
 124949 124950 SMc01662 SMc01663     TRUE 0.998 -3.000 0.148 0.002 Y 0.528
 124954 124955 SMc01667 SMc01668     TRUE 0.856 -3.000 0.000 1.000   0.521
 124957 124958 SMc01670 SMc01671     FALSE 0.137 50.000 0.000 NA   0.072
 124958 124959 SMc01671 SMc01540     FALSE 0.000 1352.000 0.000 NA   -0.279
 124959 124960 SMc01540 SMc01541     FALSE 0.397 137.000 0.200 NA   0.272
 124960 124961 SMc01541 SMc01542     TRUE 0.938 30.000 0.600 NA   0.034
 124961 124962 SMc01542 SMc01543     TRUE 0.923 18.000 0.333 NA   0.068
 124964 124965 SMc01545 SMc01546     FALSE 0.020 250.000 0.000 NA   0.292
 124966 124967 SMc01547 SMc01740   lldD1 FALSE 0.031 134.000 0.000 NA   0.062
 124967 124968 SMc01740 SMc01741 lldD1   FALSE 0.019 122.000 0.000 NA   -0.010
 124968 124969 SMc01741 SMc01742     FALSE 0.006 132.000 0.000 NA   -0.161
 124969 124970 SMc01742 SMc01745     FALSE 0.219 47.000 0.000 NA   0.185
 124970 124971 SMc01745 SMc04442     FALSE 0.390 103.000 0.000 0.083   0.085
 124971 124972 SMc04442 SMc01548     FALSE 0.053 143.000 0.000 NA   0.236
 124973 124974 SMc01744 SMc01549     FALSE 0.003 210.000 0.000 NA   -0.081
 124974 124975 SMc01549 SMc01749     FALSE 0.010 197.000 0.000 NA   -0.006
 124976 124977 SMc01550 SMc01551     FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   -0.080
 124977 124978 SMc01551 SMc01552     FALSE 0.118 82.000 0.000 NA   0.204
 124978 124979 SMc01552 SMc01553     FALSE 0.126 62.000 0.000 NA   0.106
 124979 124980 SMc01553 SMc01554     TRUE 0.742 39.000 0.000 NA Y -0.014
 124981 403024 SMc01555 SMc01596   tRNA-MET_CAT FALSE 0.040 150.000 0.000 NA   NA
 124983 124984 SMc01557 SMc01558     FALSE 0.002 257.000 0.000 NA   -0.497
 124984 124985 SMc01558 SMc01559     FALSE 0.056 109.000 0.004 NA   -0.113
 124985 124986 SMc01559 SMc01560     FALSE 0.171 114.000 0.009 NA   0.458
 124986 124987 SMc01560 SMc01561     FALSE 0.067 102.000 0.000 NA   0.120
 124987 124988 SMc01561 SMc01562     FALSE 0.009 369.000 0.000 NA   0.287
 124988 124989 SMc01562 SMc01563   sigA FALSE 0.013 222.000 0.000 NA   0.066
 124989 124990 SMc01563 SMc01564 sigA tdh FALSE 0.007 433.000 0.000 1.000 N -0.035
 124990 124991 SMc01564 SMc01565 tdh kbl TRUE 0.958 24.000 0.547 1.000 N 0.310
 124991 124992 SMc01565 SMc01566 kbl recQ FALSE 0.060 260.000 0.011 1.000 N 0.391
 124992 124993 SMc01566 SMc01567 recQ dnaG TRUE 0.822 46.000 0.008 1.000 Y 0.332
 124993 124994 SMc01567 SMc01568 dnaG   FALSE 0.111 234.000 0.137 1.000   -0.255
 124997 124998 SMc01571 SMc01572     FALSE 0.403 25.000 0.000 1.000   0.131
 124998 124999 SMc01572 SMc01577     TRUE 0.604 11.000 0.000 NA   0.292
 125001 125002 SMc01580 SMc01581     TRUE 0.991 -7.000 1.000 NA   0.046
 125002 125003 SMc01581 SMc01583     FALSE 0.007 126.000 0.000 NA   -0.114
 125003 125004 SMc01583 SMc01584     FALSE 0.007 189.000 0.000 NA   -0.031
 125004 125005 SMc01584 SMc01585   cspA3 FALSE 0.000 670.000 0.000 NA   -0.125
 125005 125006 SMc01585 SMc01586 cspA3   TRUE 0.561 144.000 0.438 NA   0.154
 125007 125008 SMc01587 SMc01589     FALSE 0.017 110.000 0.000 NA   -0.031
 125009 125010 SMc01590 SMc01591     FALSE 0.067 326.000 0.118 NA   0.210
 125010 125011 SMc01591 SMc01592     FALSE 0.046 193.000 0.000 NA   0.684
 125011 125012 SMc01592 SMc01593     TRUE 0.617 301.000 0.392 0.100 Y 0.257
 125012 125013 SMc01593 SMc01595     TRUE 0.975 35.000 0.592 1.000 Y 0.037
 125014 125015 SMc04456 SMc02677 csaA proC FALSE 0.407 108.000 0.163 1.000   -0.064
 125015 125016 SMc02677 SMc02678 proC   TRUE 0.976 2.000 0.308 NA   0.000
 125016 125017 SMc02678 SMc03744     FALSE 0.021 478.000 0.080 NA   -0.060
 125018 125019 SMc02681 SMc02682 lgt   TRUE 0.962 -3.000 0.170 NA   0.023
 125019 125020 SMc02682 SMc02683     FALSE 0.208 163.000 0.107 NA   0.071
 125020 125021 SMc02683 SMc02684     TRUE 0.829 2.000 0.023 NA   -0.042
 125021 125022 SMc02684 SMc02685     TRUE 0.607 148.000 0.485 NA   0.391
 125022 125023 SMc02685 SMc02686   prsA FALSE 0.133 285.000 0.209 NA   0.186
 125024 125025 SMc02687 SMc02688     FALSE 0.017 74.000 0.000 NA   -0.455
 125025 125026 SMc02688 SMc02689     FALSE 0.053 136.000 0.000 NA   0.192
 125026 125027 SMc02689 SMc02690     FALSE 0.018 264.000 0.000 1.000   0.107
 125028 125029 SMc02691 SMc02692   rplY FALSE 0.095 168.000 0.002 1.000 N 0.070
 125029 125030 SMc02692 SMc02693 rplY pth TRUE 0.675 362.000 0.496 0.014 Y 0.167
 125032 125033 SMc02695 SMc02696     FALSE 0.043 473.000 0.005 0.082 N -0.155
 125033 125034 SMc02696 SMc02697     TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.046 Y -0.064
 125037 125038 SMc02700 SMc02701     TRUE 0.962 -3.000 0.163 1.000   -0.057
 125038 125039 SMc02701 SMc02702     TRUE 0.984 -3.000 0.346 NA   0.325
 125040 125041 SMc02703 SMc02704     TRUE 0.988 4.000 0.697 NA   -0.055
 125041 125042 SMc02704 SMc02705     TRUE 0.993 -3.000 0.816 NA   -0.030
 125042 125043 SMc02705 SMc02706     TRUE 0.984 11.000 0.876 NA   -0.155
 125045 125046 SMc02708 SMc02709     FALSE 0.025 166.000 0.000 NA   0.076
 125046 125047 SMc02709 SMc02710   fic TRUE 0.826 63.000 0.400 NA   0.355
 125049 125050 SMc02712 SMc02713   rpoE3 FALSE 0.004 194.000 0.000 1.000   -0.400
 125050 125051 SMc02713 SMc02714 rpoE3   TRUE 0.997 4.000 0.909 NA Y 0.108
 125052 125053 SMc02715 SMc02716     TRUE 0.595 -3.000 0.000 NA   0.047
 125053 125054 SMc02716 SMc02717   leuA1 FALSE 0.006 138.000 0.000 NA   -0.137
 125054 125055 SMc02717 SMc02718 leuA1   FALSE 0.059 101.000 0.000 NA   0.091
 125055 125056 SMc02718 SMc02719   TRm22 FALSE 0.016 234.000 0.000 NA   0.122
 125056 125057 SMc02719 SMc02720 TRm22 clpP2 FALSE 0.075 173.000 0.000 1.000 N 0.202
 125059 125060 SMc02722 SMc02723     FALSE 0.179 32.000 0.000 NA   0.057
 125060 125061 SMc02723 SMc02724     TRUE 0.895 -3.000 0.025 1.000   0.025
 125061 125062 SMc02724 SMc02725   trpE FALSE 0.115 169.000 0.014 1.000 N 0.072
 125062 125063 SMc02725 SMc02726 trpE   FALSE 0.033 274.000 0.000 1.000 N 0.371
 125065 125066 SMc02728 SMc02729 fhs   FALSE 0.250 91.000 0.034 NA   0.084
 125066 125067 SMc02729 SMc02730     TRUE 0.820 4.000 0.045 NA   -0.229
 125069 125070 SMc02732 SMc02733     FALSE 0.042 113.000 0.000 1.000   -0.049
 125070 125071 SMc02733 SMc02734     TRUE 0.966 4.000 0.235 NA   0.106
 125071 125072 SMc02734 SMc02735     TRUE 0.832 62.000 0.438 NA   0.158
 125072 125073 SMc02735 SMc02736   tdk FALSE 0.027 161.000 0.010 NA   -0.246
 125074 125075 SMc02737 SMc02738 opuC opuB TRUE 0.803 157.000 0.469 1.000 Y 0.290
 125075 125076 SMc02738 SMc02739 opuB opuA TRUE 0.999 -3.000 0.844 0.005 Y 0.054
 125076 125077 SMc02739 SMc04457 opuA   TRUE 0.673 34.000 0.054 1.000 N 0.070
 125077 5451324 SMc04457 SMc05009     FALSE 0.373 95.000 0.054 1.000 N NA
 5451324 125078 SMc05009 SMc01535     FALSE 0.064 146.000 0.000 1.000   NA
 125078 125079 SMc01535 SMc01534     FALSE 0.070 90.000 0.000 1.000   -0.028
 125079 125080 SMc01534 SMc01533   adeC1 FALSE 0.291 88.000 0.009 1.000 N 0.222
 125082 125083 SMc01531 SMc01530 kdgK TRm5 FALSE 0.011 250.000 0.000 1.000 N -0.139
 125084 125085 SMc01529 SMc01528 dppF2 dppD2 TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.093 Y 0.486
 125085 125086 SMc01528 SMc01527 dppD2 dppC2 TRUE 0.997 -3.000 0.714 1.000 Y 0.082
 125086 125087 SMc01527 SMc01526 dppC2 dppB2 TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.004 Y 0.692
 125087 125088 SMc01526 SMc01525 dppB2 dppA2 TRUE 0.976 42.000 0.667 1.000 Y 0.191
 125088 125089 SMc01525 SMc01524 dppA2   TRUE 0.979 48.000 0.833 1.000 Y 0.212
 125089 125090 SMc01524 SMc01523   emrE FALSE 0.047 180.000 0.000 1.000 N 0.015
 125090 125091 SMc01523 SMc01522 emrE   TRUE 0.558 48.000 0.033 1.000 N 0.110
 125092 125093 SMc03949 SMc01521 ntrP ntrR1 TRUE 0.921 -3.000 0.105 NA   -0.368
 125093 125094 SMc01521 SMc01520 ntrR1   FALSE 0.007 128.000 0.000 NA   -0.149
 125094 125095 SMc01520 SMc01519     TRUE 0.804 6.000 0.026 NA   0.020
 125095 125096 SMc01519 SMc01748     FALSE 0.064 123.000 0.000 NA   0.218
 125097 125098 SMc01518 SMc01517     TRUE 0.975 13.000 0.583 NA   0.298
 125098 125099 SMc01517 SMc01516     TRUE 0.887 53.000 0.571 NA   0.045
 125099 125100 SMc01516 SMc01515     FALSE 0.291 124.000 0.091 NA   0.273
 125100 125101 SMc01515 SMc01514     TRUE 0.612 41.000 0.071 NA   0.123
 125102 125103 SMc01747 SMc01513   hmuS TRUE 0.976 5.000 0.077 NA Y 0.128
 125103 125104 SMc01513 SMc01512 hmuS hmuT TRUE 0.943 58.000 0.384 1.000 Y 0.556
 125104 125105 SMc01512 SMc01511 hmuT hmuU TRUE 0.996 5.000 0.852 1.000 Y -0.132
 125105 125106 SMc01511 SMc01510 hmuU hmuV TRUE 0.981 9.000 0.158 1.000 Y 0.240
 125106 125107 SMc01510 SMc01509 hmuV   FALSE 0.255 207.000 0.222 NA   0.153
 125107 125108 SMc01509 SMc01508     TRUE 0.698 48.000 0.125 NA   0.315
 125109 125110 SMc01507 SMc01506   rpoE2 FALSE 0.017 294.000 0.000 1.000 N 0.042
 125110 125111 SMc01506 SMc01505 rpoE2   TRUE 0.821 8.000 0.034 NA   0.068
 125113 125114 SMc01503 SMc01502     FALSE 0.451 84.000 0.125 1.000   -0.085
 125114 125115 SMc01502 SMc01501   mtlK TRUE 0.993 -3.000 0.308 0.082   0.671
 125115 125116 SMc01501 SMc01500 mtlK smoS TRUE 0.961 27.000 0.235 0.045 N 0.238
 125116 125117 SMc01500 SMc01499 smoS smoK TRUE 0.984 -3.000 0.309 1.000 N 0.103
 125117 125118 SMc01499 SMc01498 smoK smoG TRUE 0.983 31.000 0.373 0.080 Y 0.112
 125118 125119 SMc01498 SMc01497 smoG smoF TRUE 0.999 6.000 0.918 0.080 Y 0.397
 125119 125120 SMc01497 SMc01496 smoF smoE TRUE 0.817 190.000 0.306 0.080 Y 0.419
 125120 125121 SMc01496 SMc01495 smoE smoC FALSE 0.309 194.000 0.236 1.000 N -0.060
 125122 125123 SMc01814 SMc01815     TRUE 0.965 32.000 0.301 0.011 N NA
 125125 125126 SMc01817 SMc01818   cyaC FALSE 0.315 148.000 0.105 1.000 N 0.291
 125128 125129 SMc01820 SMc01821   dht FALSE 0.288 178.000 0.137 1.000 N 0.211
 125131 125132 SMc01823 SMc01824     TRUE 0.835 -10.000 0.050 1.000   -0.054
 125132 125133 SMc01824 SMc01825     TRUE 0.927 3.000 0.048 1.000   0.267
 125133 125134 SMc01825 SMc01826     TRUE 0.999 -3.000 0.855 0.080 Y 0.322
 125134 125135 SMc01826 SMc01827     TRUE 0.969 30.000 0.539 NA Y -0.234
 125135 125136 SMc01827 SMc01828     FALSE 0.006 605.000 0.000 NA N 0.207
 125136 125137 SMc01828 SMc01829     TRUE 0.808 16.000 0.087 NA N -0.011
 125138 125139 SMc01830 SMc01831 ureG ureF TRUE 0.984 37.000 0.283 0.002 Y -0.005
 125139 125140 SMc01831 SMc01832 ureF ureE TRUE 0.997 -7.000 0.330 0.002 Y 0.266
 125140 125141 SMc01832 SMc01833 ureE   TRUE 0.787 2.000 0.010 1.000   -0.128
 125141 125142 SMc01833 SMc01834     FALSE 0.236 190.000 0.000 0.045   -0.016
 125143 125144 SMc01995 SMc01836     TRUE 0.907 -16.000 0.174 NA   -0.039
 125144 1782979 SMc01836 SMc04443     FALSE 0.020 222.000 0.000 NA   NA
 125145 125146 SMc01837 SMc01838 ureC   TRUE 0.773 4.000 0.029 NA   -0.186
 125146 125147 SMc01838 SMc02046     TRUE 0.919 4.000 0.125 NA   -0.168
 125147 125148 SMc02046 SMc01939   ureB TRUE 0.902 -3.000 0.048 NA   -0.009
 125148 125149 SMc01939 SMc01940 ureB   TRUE 0.837 12.000 0.043 NA   0.367
 125149 125150 SMc01940 SMc01941   ureA TRUE 0.802 13.000 0.049 NA   0.140
 125150 125151 SMc01941 SMc01942 ureA ureD TRUE 0.988 29.000 0.664 0.002 N 0.182
 125151 125152 SMc01942 SMc01943 ureD   FALSE 0.240 66.000 0.000 1.000 N 0.120
 125152 125153 SMc01943 SMc01944     FALSE 0.055 122.000 0.000 1.000 N -0.084
 125155 125156 SMc01946 SMc01947 livK   FALSE 0.304 115.000 0.069 NA   0.583
 125156 125157 SMc01947 SMc01948   livF TRUE 0.933 26.000 0.475 NA   0.155
 125157 125158 SMc01948 SMc01949 livF livG TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.023 Y -0.026
 125158 125159 SMc01949 SMc01950 livG livM TRUE 0.994 0.000 0.386 1.000 Y -0.061
 125159 125160 SMc01950 SMc01951 livM livH TRUE 0.996 5.000 0.406 0.080 Y -0.104
 125162 125163 SMc01953 SMc01954     TRUE 0.573 125.000 0.111 0.099   0.446
 125164 125165 SMc01955 SMc01956     TRUE 0.943 -3.000 0.069 1.000   0.122
 125165 125166 SMc01956 SMc01957     FALSE 0.004 1103.000 0.000 NA   0.388
 125167 125168 SMc01994 SMc01959 TRm1b TRm1a TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.056 Y -0.039
 125168 125169 SMc01959 SMc01960 TRm1a   FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   -0.003
 125169 125170 SMc01960 SMc01961     FALSE 0.296 127.000 0.095 NA   0.343
 125170 125171 SMc01961 SMc01962     FALSE 0.220 160.000 0.065 1.000   0.371
 125171 125172 SMc01962 SMc01963     TRUE 0.914 -3.000 0.065 1.000   -0.184
 125172 125173 SMc01963 SMc01964     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.080 Y 0.058
 125173 125174 SMc01964 SMc01965     TRUE 0.995 -3.000 0.217 0.080 Y -0.389
 125174 125175 SMc01965 SMc01966     TRUE 0.741 175.000 0.130 0.080 Y 0.406
 125175 125176 SMc01966 SMc01967   speB2 FALSE 0.342 171.000 0.000 1.000 Y 0.443
 125177 125178 SMc01968 SMc01969     FALSE 0.360 46.000 0.008 1.000 N -0.110
 125179 125180 SMc01970 SMc01971     FALSE 0.109 194.000 0.071 NA   -0.049
 125180 125181 SMc01971 SMc01972   ordL1 FALSE 0.003 487.000 0.000 1.000 N -0.178
 125181 125182 SMc01972 SMc01973 ordL1   TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y 0.547
 125183 125184 SMc01974 SMc01975     FALSE 0.409 263.000 0.000 0.007 Y 0.240
 125184 125185 SMc01975 SMc01976     TRUE 0.988 -3.000 0.478 1.000 N -0.135
 125185 125186 SMc01976 SMc01977     TRUE 0.859 38.000 0.265 1.000 N 0.083
 125186 125187 SMc01977 SMc01978     TRUE 0.955 98.000 0.529 0.080 Y 0.314
 125187 125188 SMc01978 SMc01979     TRUE 0.998 5.000 0.647 0.080 Y 0.234
 125188 125189 SMc01979 SMc01980     TRUE 0.985 7.000 0.059 0.080 Y -0.129
 125189 125190 SMc01980 SMc01981     FALSE 0.020 201.000 0.000 1.000 N -0.139
 125190 125191 SMc01981 SMc01982   coxM TRUE 0.818 138.000 0.086 0.012 Y 0.292
 125191 125192 SMc01982 SMc01983 coxM coxN TRUE 0.984 34.000 0.344 0.005 Y -0.420
 125192 125193 SMc01983 SMc01984 coxN coxO TRUE 0.999 -3.000 0.786 0.005 Y 0.277
 125193 125194 SMc01984 SMc01985 coxO coxP TRUE 0.996 13.000 0.440 0.005 Y 0.270
 125194 125195 SMc01985 SMc01986 coxP   TRUE 0.992 12.000 0.488 0.005   0.106
 125195 125196 SMc01986 SMc01987     FALSE 0.013 261.000 0.000 1.000   0.023
 125199 125200 SMc01990 SMc01991     FALSE 0.103 132.000 0.000 1.000   0.497
 125200 125201 SMc01991 SMc01992     TRUE 0.525 81.000 0.080 1.000 N 0.487
 125201 125202 SMc01992 SMc01993     FALSE 0.265 63.000 0.000 1.000 N 0.150
 125202 125203 SMc01993 SMc02016     TRUE 0.688 67.000 0.000 0.001   -0.341
 125203 125204 SMc02016 SMc02017     FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   0.000
 125204 125205 SMc02017 SMc02018     FALSE 0.366 24.000 0.000 NA   0.229
 125205 125206 SMc02018 SMc02019     FALSE 0.442 21.000 0.000 NA   0.355
 125206 125207 SMc02019 SMc02020     TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.018   -0.098
 125207 125208 SMc02020 SMc02021     FALSE 0.010 101.000 0.000 NA   -0.118
 125208 125209 SMc02021 SMc02022     FALSE 0.007 402.000 0.000 NA N 0.076
 125211 125212 SMc02024 SMc02025     FALSE 0.350 163.000 0.200 1.000   0.158
 125212 125213 SMc02025 SMc02026     TRUE 0.896 24.000 0.300 1.000 N -0.142
 125213 125214 SMc02026 SMc02027     TRUE 0.885 29.000 0.308 1.000   -0.010
 125214 125215 SMc02027 SMc02028     TRUE 0.986 -3.000 0.474 1.000   -0.155
 125215 125216 SMc02028 SMc02029     TRUE 0.996 -3.000 0.474 1.000 Y -0.021
 125216 125217 SMc02029 SMc02030     FALSE 0.435 179.000 0.267 1.000 N 0.347
 125217 125218 SMc02030 SMc02031     FALSE 0.038 259.000 0.000 1.000 N 0.427
 125218 125219 SMc02031 SMc02032     TRUE 0.904 123.000 0.286 0.018 Y 0.151
 125219 125220 SMc02032 SMc02033     FALSE 0.289 133.000 0.000 NA Y -0.202
 125220 125221 SMc02033 SMc02034     FALSE 0.002 521.000 0.000 NA N -0.061
 125221 125222 SMc02034 SMc02035     FALSE 0.180 228.000 0.000 0.082 N 0.447
 125223 125224 SMc02036 SMc02037     FALSE 0.036 242.000 0.000 1.000 N 0.180
 125224 125225 SMc02037 SMc02038   gldA TRUE 0.751 36.000 0.000 0.082 N 0.081
 125225 125226 SMc02038 SMc02039 gldA   TRUE 0.848 18.000 0.000 0.082   0.234
 125226 125227 SMc02039 SMc02040     TRUE 0.916 -402.000 0.000 0.045   0.777
 125227 125228 SMc02040 SMc02041     TRUE 0.949 2.000 0.000 0.082   0.069
 125228 125229 SMc02041 SMc02042     FALSE 0.223 31.000 0.000 1.000 N -0.141
 125229 125230 SMc02042 SMc02043   eda1 TRUE 0.963 -3.000 0.000 1.000 Y -0.118
 125230 125231 SMc02043 SMc02044 eda1   TRUE 0.814 -3.000 0.000 NA N 0.187
 125231 125232 SMc02044 SMc02045     TRUE 0.956 5.000 0.000 NA Y 0.340
 125232 125233 SMc02045 SMc02332     TRUE 0.762 -3.000 0.000 1.000   0.073
 125233 125234 SMc02332 SMc02460     FALSE 0.159 13.000 0.000 1.000   -0.171
 125234 125235 SMc02460 SMc02333     TRUE 0.688 3.000 0.000 1.000 N -0.080
 125235 125236 SMc02333 SMc02334     FALSE 0.488 5.000 0.000 1.000 N -0.229
 125236 125237 SMc02334 SMc02335     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.016 Y 0.123
 125237 125238 SMc02335 SMc02336     FALSE 0.428 31.000 0.000 1.000 N 0.118
 125239 125240 SMc02452 SMc02337     TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.018 Y -0.301
 125240 125241 SMc02337 SMc02338     TRUE 0.987 50.000 0.545 0.018 Y 0.418
 125241 125242 SMc02338 SMc02339     FALSE 0.343 58.000 0.000 1.000 N 0.355
 125244 125245 SMc02341 SMc02342   tkt1 TRUE 0.836 27.000 0.000 1.000 Y 0.067
 125245 125246 SMc02342 SMc02343 tkt1   FALSE 0.144 94.000 0.000 1.000   0.242
 125246 125247 SMc02343 SMc02344     FALSE 0.315 142.000 0.000 0.079   0.296
 125247 125248 SMc02344 SMc02345     TRUE 0.834 59.000 0.000 0.079 Y -0.076
 125248 125249 SMc02345 SMc02346     TRUE 0.991 12.000 0.618 1.000 Y -0.058
 125249 125250 SMc02346 SMc02347   asfB TRUE 0.545 18.000 0.000 1.000 N 0.116
 125250 125251 SMc02347 SMc02349 asfB asfA TRUE 0.986 4.000 0.000 0.059 Y 0.091
 125251 125252 SMc02349 SMc02350 asfA   FALSE 0.101 68.000 0.000 1.000 N -0.154
 125252 125253 SMc02350 SMc02351     FALSE 0.017 226.000 0.000 1.000   -0.007
 125253 125254 SMc02351 SMc02352     FALSE 0.071 137.000 0.000 1.000   0.159
 125254 125255 SMc02352 SMc02353     TRUE 0.980 -10.000 0.600 1.000 N -0.217
 125256 125257 SMc02354 SMc02355     TRUE 0.930 -13.000 0.120 1.000 N 0.384
 125257 125258 SMc02355 SMc02356     FALSE 0.299 121.000 0.000 0.082 N -0.134
 125258 125259 SMc02356 SMc02357     TRUE 0.941 52.000 0.333 1.000 Y 0.244
 125259 125260 SMc02357 SMc02358     TRUE 0.995 -7.000 0.333 0.093 Y 0.090
 125260 125261 SMc02358 SMc02359     TRUE 0.990 4.000 0.222 1.000 Y 0.141
 125261 125262 SMc02359 SMc02360     TRUE 0.976 13.000 0.029 0.079 Y 0.110
 125262 125263 SMc02360 SMc02412     FALSE 0.413 -3.000 0.000 1.000 N -0.467
 125263 125264 SMc02412 SMc02413     TRUE 0.698 14.000 0.000 1.000 N 0.435
 125266 125267 SMc02415 SMc02416     FALSE 0.232 78.000 0.000 1.000 N 0.222
 125267 125268 SMc02416 SMc02417     FALSE 0.033 279.000 0.000 1.000 N 0.595
 125268 125269 SMc02417 SMc02418     TRUE 0.824 61.000 0.000 0.079 Y -0.108
 125269 125270 SMc02418 SMc02419     TRUE 0.900 35.000 0.097 1.000 Y 0.031
 125270 125271 SMc02419 SMc02420     TRUE 0.938 6.000 0.115 1.000 N 0.072
 125271 125272 SMc02420 SMc02421     TRUE 0.993 0.000 0.231 1.000 Y 0.314
 125272 125273 SMc02421 SMc02423     TRUE 0.940 -7.000 0.100 1.000 N 0.382
 125273 125274 SMc02423 SMc02424     TRUE 0.998 -3.000 0.388 0.002 Y 0.001
 125276 125277 SMc02426 SMc02427   hyuE TRUE 0.925 32.000 0.429 1.000   0.606
 125278 125279 SMc02428 SMc02429     FALSE 0.086 178.000 0.000 1.000 N 0.399
 125279 125280 SMc02429 SMc02430   TRm17 FALSE 0.031 265.000 0.000 1.000 N 0.255
 403023 406807 SMc02455 SMc02535 tRNA-MET_CAT rRNA-5S FALSE 0.022 211.000 0.000 NA   NA
 406807 1782980 SMc02535 SMc02462 rRNA-5S rRNA-23S FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 1782980 403022 SMc02462 SMc02454 rRNA-23S tRNA-ALA_TGC FALSE 0.003 608.000 0.000 NA   NA
 403022 403021 SMc02454 SMc02539 tRNA-ALA_TGC tRNA-ILE_GAT FALSE 0.044 140.000 0.000 NA   NA
 403021 1782981 SMc02539 SMc02675 tRNA-ILE_GAT rRNA-16S FALSE 0.014 257.000 0.000 NA   NA
 125283 125284 SMc02433 SMc02434 clpB   FALSE 0.018 342.000 0.006 NA   0.162
 125284 125285 SMc02434 SMc02435   hemK1 FALSE 0.025 332.000 0.021 NA   0.153
 125285 125286 SMc02435 SMc02436 hemK1 prfA TRUE 0.988 7.000 0.229 1.000 Y 0.349
 125286 125287 SMc02436 SMc02437 prfA ptsP TRUE 0.760 69.000 0.034 0.030 N 0.069
 125287 125288 SMc02437 SMc02438 ptsP lysC FALSE 0.177 191.000 0.069 1.000 N 0.121
 125289 125290 SMc02439 SMc02440   ubiG FALSE 0.389 152.000 0.004 1.000 Y 0.085
 125291 125292 SMc02441 SMc02442     TRUE 0.950 -3.000 0.097 NA   0.180
 125292 125293 SMc02442 SMc02443   grxC FALSE 0.467 97.000 0.121 1.000   0.250
 125293 125294 SMc02443 SMc02444 grxC   TRUE 0.580 40.000 0.061 1.000   -0.034
 125296 125297 SMc02446 SMc02447     TRUE 0.671 78.000 0.273 NA   0.064
 125297 125298 SMc02447 SMc02448   mutT FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   0.210
 125298 125299 SMc02448 SMc02449 mutT   TRUE 0.926 6.000 0.082 1.000   0.303
 125299 125300 SMc02449 SMc02450   argJ TRUE 0.704 -31.000 0.020 1.000   -0.045
 125300 125301 SMc02450 SMc02451 argJ   FALSE 0.206 161.000 0.070 1.000 N 0.057
 125302 125303 SMc04458 SMc00744 secA   FALSE 0.025 235.000 0.000 1.000 N 0.008
 125303 125304 SMc00744 SMc00743     FALSE 0.034 154.000 0.000 1.000   -0.007
 125304 125305 SMc00743 SMc00742     TRUE 0.978 4.000 0.378 NA   0.094
 125307 125308 SMc00740 SMc00739     TRUE 0.991 0.000 0.667 1.000   -0.081
 125310 125311 SMc00737 SMc00736     FALSE 0.333 106.000 0.050 1.000 N 0.192
 125314 125315 SMc00733 SMc00732     TRUE 0.866 23.000 0.231 NA   0.004
 125315 125316 SMc00732 SMc00731     TRUE 0.858 18.000 0.156 NA   0.139
 125316 125317 SMc00731 SMc00730     TRUE 0.616 39.000 0.033 1.000   0.395
 125317 125318 SMc00730 SMc00729   etfB1 FALSE 0.015 300.000 0.000 1.000   NA
 125318 125319 SMc00729 SMc00728 etfB1 etfA1 TRUE 0.960 117.000 0.667 0.016 Y NA
 125319 125320 SMc00728 SMc00727 etfA1 hbdA FALSE 0.082 144.000 0.000 1.000 N 0.112
 125322 125323 SMc00725 SMc00724 argH1   FALSE 0.074 196.000 0.008 NA   0.350
 125323 125324 SMc00724 SMc00723   lysA TRUE 0.556 15.000 0.013 NA   -0.013
 125324 125325 SMc00723 SMc00722 lysA   FALSE 0.228 141.000 0.062 NA   0.607
 125325 125326 SMc00722 SMc00721   TRm22 FALSE 0.016 292.000 0.000 NA   0.369
 125327 125328 SMc00720 SMc00719   hpt FALSE 0.079 226.000 0.031 1.000 N 0.015
 125328 125329 SMc00719 SMc00718 hpt   FALSE 0.347 64.000 0.021 NA   0.187
 125330 125331 SMc00717 SMc00716     TRUE 0.977 -7.000 0.139 NA Y -0.018
 125331 125332 SMc00716 SMc00715     TRUE 0.682 106.000 0.417 NA   0.271
 125332 125333 SMc00715 SMc00714     TRUE 0.521 102.000 0.250 NA   -0.035
 125336 125337 SMc00711 SMc00710 tyrC hisC1 TRUE 0.990 0.000 0.198 1.000 Y -0.059
 125337 125338 SMc00710 SMc00709 hisC1   FALSE 0.276 125.000 0.061 1.000   0.334
 125339 125340 SMc00708 SMc00707 gloB   TRUE 0.890 2.000 0.071 NA   -0.194
 125341 125342 SMc00706 SMc00705     FALSE 0.179 137.000 0.076 NA   -0.041
 125343 125344 SMc00704 SMc00703 rpmB   FALSE 0.190 136.000 0.025 1.000   0.383
 125345 125346 SMc00702 SMc00701   cobT FALSE 0.145 312.000 0.260 NA   0.345
 125346 125347 SMc00701 SMc00700 cobT cobS TRUE 0.970 50.000 0.433 0.001   0.467
 125347 125348 SMc00700 SMc00699 cobS   FALSE 0.448 76.000 0.065 1.000   0.115
 125350 125351 SMc00697 SMc00696   aroB TRUE 0.917 -3.000 0.040 1.000 N -0.073
 125351 125352 SMc00696 SMc00695 aroB aroK TRUE 0.985 5.000 0.147 1.000 Y 0.177
 125352 125353 SMc00695 SMc00694 aroK   FALSE 0.041 85.000 0.000 NA   0.004
 125353 125354 SMc00694 SMc00693     TRUE 0.629 -3.000 0.000 NA   0.065
 125355 125356 SMc00692 SMc00691   xerD TRUE 0.914 -3.000 0.043 NA   0.105
 125356 125357 SMc00691 SMc00690 xerD accA TRUE 0.528 64.000 0.058 1.000 N 0.128
 125357 125358 SMc00690 SMc00689 accA   FALSE 0.012 245.000 0.015 NA   -0.347
 125358 125359 SMc00689 SMc00688     TRUE 0.939 0.000 0.060 NA   0.345
 125360 125361 SMc00687 SMc00686     TRUE 0.993 0.000 0.727 NA   0.139
 125361 125362 SMc00686 SMc00684     FALSE 0.051 109.000 0.000 NA   0.088
 125362 125364 SMc00684 SMc00683     TRUE 0.950 14.000 0.458 NA   -0.179
 125365 125366 SMc00682 SMc00681 hipO1 lrp FALSE 0.342 23.000 0.012 1.000   -0.491
 125370 125371 SMc00677 SMc00676     TRUE 0.546 114.000 0.032 1.000 Y 0.012
 125372 125373 SMc00675 SMc00674   hutC TRUE 0.695 34.000 0.038 1.000 N 0.448
 125374 125375 SMc00673 SMc00672   hisX TRUE 0.546 38.000 0.013 1.000 N 0.145
 125375 125376 SMc00672 SMc00671 hisX hisW TRUE 0.628 137.000 0.133 1.000 Y 0.159
 125376 125377 SMc00671 SMc00670 hisW hisV TRUE 0.997 -7.000 0.485 0.005 Y -0.169
 125377 125378 SMc00670 SMc00669 hisV hutH2 TRUE 0.984 -7.000 0.212 1.000 Y -0.047
 125378 125379 SMc00669 SMc00668 hutH2   FALSE 0.244 32.000 0.000 1.000   0.003
 125379 125380 SMc00668 SMc00667     TRUE 0.836 -12.000 0.028 NA   0.593
 125381 125382 SMc00666 SMc00665     TRUE 0.683 75.000 0.250 NA   0.148
 125384 125385 SMc00663 SMc00662     TRUE 0.952 -18.000 0.286 NA   0.234
 125387 403019 SMc00660 SMc00758   tRNA-MET_CAT FALSE 0.003 1022.000 0.000 NA   NA
 403019 125388 SMc00758 SMc00659 tRNA-MET_CAT trmU FALSE 0.046 135.000 0.000 NA   NA
 125388 125389 SMc00659 SMc00658 trmU   FALSE 0.030 264.000 0.000 1.000 N 0.201
 125390 125391 SMc00657 SMc00656     FALSE 0.072 151.000 0.021 NA   -0.070
 125394 125395 SMc00653 SMc00652     FALSE 0.070 243.000 0.055 NA   0.118
 125396 125397 SMc00651 SMc00650     FALSE 0.105 149.000 0.027 NA   0.036
 125398 125399 SMc00649 SMc00648     TRUE 0.897 5.000 0.064 NA   0.095
 125400 125401 SMc00647 SMc00646 rluD rpoH1 FALSE 0.108 198.000 0.046 1.000 N -0.078
 125402 125403 SMc00644 SMc00643   purA FALSE 0.077 64.000 0.002 NA   -0.198
 125405 125406 SMc00641 SMc00640 serA serC TRUE 0.821 82.000 0.140 1.000 Y 0.589
 125406 125407 SMc00640 SMc00639 serC   FALSE 0.066 138.000 0.000 1.000 N 0.012
 125407 125408 SMc00639 SMc00638     FALSE 0.456 239.000 0.000 0.001 Y -0.121
 125408 125409 SMc00638 SMc00637     FALSE 0.007 448.000 0.004 1.000 N -0.364
 125409 125410 SMc00637 SMc04459   ftsH FALSE 0.020 324.000 0.012 1.000 N -0.106
 125410 125411 SMc04459 SMc02940 ftsH   TRUE 0.714 100.000 0.145 0.092 N 0.242
 125411 125412 SMc02940 SMc02941     TRUE 0.897 12.000 0.085 1.000   0.442
 125412 125413 SMc02941 SMc02942   pal FALSE 0.310 192.000 0.199 1.000   0.372
 125413 125414 SMc02942 SMc04461 pal tolB FALSE 0.349 266.000 0.592 1.000 N -0.074
 125414 125415 SMc04461 SMc03956 tolB tolA FALSE 0.240 72.000 0.005 NA   0.166
 125415 125416 SMc03956 SMc03957 tolA tolR TRUE 0.735 9.000 0.024 NA   -0.045
 125416 125417 SMc03957 SMc03958 tolR tolQ TRUE 0.954 28.000 0.220 1.000 Y 0.170
 125420 125421 SMc03961 SMc04081 sqdB sqdD TRUE 0.986 -3.000 0.086 1.000 Y 0.075
 125421 125422 SMc04081 SMc03963 sqdD sqdC TRUE 0.997 -3.000 0.696 1.000 Y 0.035
 125423 125424 SMc03964 SMc03965   ruvB TRUE 0.908 2.000 0.016 1.000   0.388
 125424 125425 SMc03965 SMc03966 ruvB ruvA TRUE 0.925 172.000 0.549 0.001 Y -0.149
 125425 125426 SMc03966 SMc03967 ruvA ruvC TRUE 0.974 75.000 0.451 0.008 Y 0.113
 125428 125429 SMc03969 SMc03970     FALSE 0.100 117.000 0.028 NA   -0.168
 125429 125430 SMc03970 SMc03971   mexF2 FALSE 0.102 173.000 0.014 NA   0.370
 125430 125431 SMc03971 SMc03972 mexF2 mexE2 TRUE 0.994 -3.000 0.720 1.000 N 0.151
 125431 125432 SMc03972 SMc03973 mexE2   FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   0.072
 125432 125433 SMc03973 SMc03974     FALSE 0.193 137.000 0.077 NA   0.018
 125434 5451325 SMc03975 SMc05023     FALSE 0.483 -26.000 0.000 NA   NA
 125435 125436 SMc03976 SMc03977     TRUE 0.806 13.000 0.068 NA   0.015
 125437 125438 SMc03978 SMc03979 tkt2 gap TRUE 0.936 70.000 0.439 1.000 Y 0.614
 125438 125439 SMc03979 SMc03980 gap   TRUE 0.893 6.000 0.051 NA   0.306
 125439 125440 SMc03980 SMc03981   pgk TRUE 0.880 0.000 0.004 NA   0.486
 125442 125443 SMc03983 SMc03984 fbaB   FALSE 0.072 175.000 0.016 1.000   -0.056
 125444 125445 SMc03985 SMc03986 cyaF2   FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   -0.301
 125446 125447 SMc03987 SMc03988     TRUE 0.946 -13.000 0.250 NA   0.119
 125447 125448 SMc03988 SMc03989     FALSE 0.060 364.000 0.141 NA   0.144
 125451 125452 SMc03992 SMc03993     TRUE 0.932 -3.000 0.081 NA   0.017
 125452 125453 SMc03993 SMc03994   suhB FALSE 0.029 315.000 0.014 NA   0.381
 125453 125454 SMc03994 SMc03995 suhB   FALSE 0.071 241.000 0.026 1.000   0.311
 125454 125455 SMc03995 SMc03996   thiE2 TRUE 0.941 10.000 0.181 1.000   0.210
 125456 125457 SMc03997 SMc03998     FALSE 0.295 81.000 0.056 1.000   -0.202
 125459 125460 SMc04000 SMc04001   purE TRUE 0.622 14.000 0.044 NA   -0.368
 125460 125461 SMc04001 SMc04002 purE purK TRUE 0.998 -3.000 0.201 0.000 Y -0.041
 125461 125462 SMc04002 SMc04003 purK rpmJ FALSE 0.097 174.000 0.045 1.000   -0.200
 125462 125463 SMc04003 SMc04004 rpmJ   FALSE 0.032 176.000 0.000 1.000   0.016
 125464 125465 SMc04005 SMc04006 pykA   TRUE 0.989 0.000 0.487 NA   0.254
 125466 125467 SMc04007 SMc04008     TRUE 0.911 20.000 0.254 NA   0.578
 125467 125468 SMc04008 SMc04009     FALSE 0.201 108.000 0.015 NA   0.440
 125469 125470 SMc04010 SMc04011   tacA FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   0.415
 125471 125472 SMc04012 SMc04013 pepF pabB TRUE 0.778 54.000 0.027 1.000 Y -0.026
 125472 125473 SMc04013 SMc04014 pabB   TRUE 0.979 -51.000 0.219 1.000 Y 0.291
 125475 125476 SMc04016 SMc04017 hss omp10 FALSE 0.204 311.000 0.385 NA   0.501
 125476 125477 SMc04017 SMc04018 omp10   FALSE 0.007 306.000 0.011 NA   -0.262
 125477 125478 SMc04018 SMc04019   hemH FALSE 0.333 120.000 0.061 1.000 N 0.435
 125478 125479 SMc04019 SMc04020 hemH   FALSE 0.391 104.000 0.092 NA N 0.230
 125479 125480 SMc04020 SMc04021     TRUE 0.988 10.000 0.313 NA Y 0.566
 125480 125481 SMc04021 SMc04022     FALSE 0.066 105.000 0.000 NA   0.129
 125483 125484 SMc04024 SMc04025     TRUE 0.601 103.000 0.346 1.000   -0.155
 125485 125486 SMc04026 SMc04028 gltD gltB TRUE 0.943 101.000 0.236 0.001 Y NA
 125487 125488 SMc04029 SMc04030     FALSE 0.039 234.000 0.000 1.000   0.520
 125489 125490 SMc04031 SMc04032 pip2   TRUE 0.831 66.000 0.520 1.000   -0.148
 125491 125492 SMc04033 SMc04034 pip3   TRUE 0.856 52.000 0.368 1.000   0.213
 125492 125493 SMc04034 SMc04035     TRUE 0.995 -3.000 0.316 1.000 Y 0.390
 125493 125494 SMc04035 SMc04036     TRUE 0.973 -3.000 0.174 1.000   0.335
 125494 125495 SMc04036 SMc04037     TRUE 0.926 19.000 0.357 1.000   -0.023
 125495 125496 SMc04037 SMc04038   TRm17N FALSE 0.069 151.000 0.000 NA N 0.212
 125496 125497 SMc04038 SMc04039 TRm17N TRm17C TRUE 0.645 58.000 0.000 NA Y -0.033
 125502 403012 SMc04044 SMc04060   tRNA-VAL_GAC FALSE 0.011 285.000 0.000 NA   NA
 403012 125503 SMc04060 SMc04045 tRNA-VAL_GAC ilvD2 FALSE 0.005 433.000 0.000 NA   NA
 125504 125505 SMc04046 SMc04047   azu2 FALSE 0.006 712.000 0.000 1.000   0.348
 125505 125506 SMc04047 SMc04048 azu2   TRUE 0.922 47.000 0.000 0.016 Y 0.334
 125506 125507 SMc04048 SMc04049     TRUE 0.718 73.000 0.018 0.058   0.422
 125507 125508 SMc04049 SMc04050     FALSE 0.079 145.000 0.027 NA   -0.112
 125508 125509 SMc04050 SMc04051   rpoE4 TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA Y -0.441
 125509 125510 SMc04051 SMc04052 rpoE4   TRUE 0.537 150.000 0.000 0.079 Y -0.077
 125511 125512 SMc04053 SMc04054     FALSE 0.170 206.000 0.123 NA   0.157
 125514 125515 SMc04056 SMc04057     FALSE 0.004 177.000 0.000 NA   -0.538
 125515 125516 SMc04057 SMc04058     TRUE 0.967 15.000 0.734 NA   -0.398
 125516 125517 SMc04058 SMc04059     FALSE 0.078 211.000 0.058 NA N -0.162
 125517 125518 SMc04059 SMc04460   glgP FALSE 0.017 234.000 0.000 NA N 0.026
 125518 125519 SMc04460 SMc03922 glgP glgB1 TRUE 0.992 -3.000 0.189 1.000 Y 0.334
 125519 125520 SMc03922 SMc03923 glgB1 glgC TRUE 0.903 114.000 0.205 0.001 Y -0.268
 125520 125521 SMc03923 SMc03924 glgC glgA1 TRUE 0.975 7.000 0.134 1.000 Y -0.210
 125521 125522 SMc03924 SMc03925 glgA1 pgm TRUE 0.969 5.000 0.032 1.000 Y 0.011
 125522 125523 SMc03925 SMc03926 pgm glgX1 FALSE 0.290 230.000 0.034 1.000 Y 0.239
 125523 125524 SMc03926 SMc03927 glgX1 nodN2 FALSE 0.155 153.000 0.029 1.000 N 0.050
 125524 125525 SMc03927 SMc03928 nodN2   TRUE 0.897 -7.000 0.059 NA   0.363
 125526 125527 SMc03929 SMc03930   soxG2 FALSE 0.033 196.000 0.000 1.000 N -0.035
 125527 125528 SMc03930 SMc03931 soxG2 soxA2 TRUE 0.992 -7.000 0.407 0.002   -0.315
 125528 125529 SMc03931 SMc03932 soxA2 soxD2 TRUE 0.999 -3.000 0.867 0.001   0.226
 125529 125530 SMc03932 SMc03933 soxD2 soxB2 TRUE 0.927 115.000 0.233 0.001 Y 0.108
 125531 125532 SMc03934 SMc03935 rpsU   FALSE 0.247 188.000 0.136 1.000   0.229
 125532 125533 SMc03935 SMc03936     FALSE 0.065 240.000 0.097 NA   -0.335
 125533 125534 SMc03936 SMc03937   cyaG1 FALSE 0.009 108.000 0.000 NA   -0.205
 125535 125536 SMc03938 SMc03939 pntB pntAb TRUE 0.982 10.000 0.087 0.001   0.332
 125536 125537 SMc03939 SMc03950 pntAb pntAa TRUE 0.998 2.000 0.829 0.001   0.221
 125537 125538 SMc03950 SMc03941 pntAa   FALSE 0.029 318.000 0.038 1.000   -0.064
 125538 125539 SMc03941 SMc03942     FALSE 0.021 203.000 0.000 1.000   -0.010
 125541 125542 SMc04462 SMc02975   pckR TRUE 0.732 74.000 0.308 1.000 N -0.083
 125542 125543 SMc02975 SMc02976 pckR   TRUE 0.931 106.000 0.368 0.053 Y 0.085
 125544 125545 SMc02977 SMc02978     TRUE 0.721 117.000 0.565 NA   0.269
 125545 125546 SMc02978 SMc02979     TRUE 0.733 65.000 0.231 NA   0.480
 125549 125550 SMc02982 SMc02983     TRUE 0.672 86.000 0.257 1.000   0.246
 125551 125552 SMc02984 SMc02985     TRUE 0.761 120.000 0.706 NA   0.206
 125552 125553 SMc02985 SMc02986     TRUE 0.957 -6.000 0.226 NA   0.078
 125554 125555 SMc02987 SMc02988     TRUE 0.988 0.000 0.500 NA   0.068
 125555 125556 SMc02988 SMc02989     FALSE 0.051 172.000 0.000 NA   0.369
 125556 125557 SMc02989 SMc03151     FALSE 0.248 -3.000 0.000 NA   -0.241
 125557 125558 SMc03151 SMc03152     FALSE 0.230 118.000 0.055 NA   0.141
 125558 125559 SMc03152 SMc03153   eda2 FALSE 0.049 242.000 0.042 NA   -0.038
 125560 125561 SMc03154 SMc03155     TRUE 0.985 -3.000 0.032 0.006   0.150
 125561 125562 SMc03155 SMc03156     FALSE 0.291 79.000 0.015 1.000   0.139
 125563 125564 SMc03157 SMc03158     TRUE 0.895 39.000 0.164 NA Y -0.125
 125564 125565 SMc03158 SMc03159     TRUE 0.996 -10.000 0.914 1.000 Y 0.054
 125565 125566 SMc03159 SMc03160     FALSE 0.015 338.000 0.000 1.000 N 0.081
 125566 125567 SMc03160 SMc03161     FALSE 0.008 257.000 0.000 1.000   -0.073
 125567 125568 SMc03161 SMc03162     FALSE 0.419 208.000 0.481 NA   0.088
 125568 125569 SMc03162 SMc03163   xylA FALSE 0.230 193.000 0.007 NA Y -0.242
 125569 125570 SMc03163 SMc03164 xylA xylB TRUE 0.680 95.000 0.094 1.000 Y -0.113
 125570 125571 SMc03164 SMc03165 xylB   TRUE 0.987 10.000 0.300 1.000 Y 0.191
 125571 125572 SMc03165 SMc03166     TRUE 0.524 96.000 0.125 1.000 N 0.429
 125572 125573 SMc03166 SMc03167     FALSE 0.159 170.000 0.048 1.000   0.131
 125573 125574 SMc03167 SMc03168     TRUE 0.952 29.000 0.586 1.000   0.645
 125575 125576 SMc03169 SMc03170     FALSE 0.391 120.000 0.000 0.078   0.429
 125576 125577 SMc03170 SMc03171     FALSE 0.240 167.000 0.083 1.000   0.578
 125577 125578 SMc03171 SMc03172   gltX FALSE 0.016 268.000 0.000 1.000 N -0.034
 125578 125579 SMc03172 SMc03173 gltX lysS TRUE 0.978 11.000 0.014 0.091 Y 0.174
 125581 125582 SMc03175 SMc03176     FALSE 0.039 183.000 0.000 1.000 N -0.030
 125582 125583 SMc03176 SMc03177     TRUE 0.990 4.000 0.751 1.000 N -0.228
 125583 125584 SMc03177 SMc03178     FALSE 0.117 140.000 0.012 1.000 N -0.036
 125584 125585 SMc03178 SMc03179   phaA1 FALSE 0.048 141.000 0.000 1.000 N -0.064
 125585 125586 SMc03179 SMc03180 phaA1 phaC1 TRUE 0.996 0.000 0.095 0.008 Y 0.227
 125586 125587 SMc03180 SMc03181 phaC1 phaD1 TRUE 0.999 -7.000 0.976 0.002 Y 0.059
 125587 125588 SMc03181 SMc03182 phaD1 phaE1 TRUE 0.999 3.000 0.944 0.002 Y 0.081
 125588 125589 SMc03182 SMc03183 phaE1 phaF1 TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.050 Y 0.146
 125589 125590 SMc03183 SMc03184 phaF1 phaG1 TRUE 0.998 -3.000 0.937 1.000 Y -0.075
 125593 125594 SMc03187 SMc03188 cobM cobL TRUE 0.938 39.000 0.016 0.006 Y -0.216
 125596 125597 SMc03190 SMc03191 cobJ cobI TRUE 0.997 -3.000 0.138 0.006 Y 0.429
 125597 125598 SMc03191 SMc03192 cobI cobH TRUE 0.998 -3.000 0.191 0.006 Y 0.546
 125598 125599 SMc03192 SMc03193 cobH cobG TRUE 0.974 3.000 0.255 1.000 N -0.028
 125599 125600 SMc03193 SMc03194 cobG cobF FALSE 0.325 126.000 0.082 1.000 N 0.257
 125600 125601 SMc03194 SMc03195 cobF ung FALSE 0.228 122.000 0.022 1.000 N 0.284
 125602 125603 SMc03196 SMc03197 modA modB TRUE 0.938 170.000 0.627 0.001 Y -0.086
 125603 125604 SMc03197 SMc03198 modB modC TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.001 Y 0.219
 125606 125607 SMc03200 SMc03201   bkdAa FALSE 0.007 324.000 0.000 1.000 N -0.143
 125607 125608 SMc03201 SMc03202 bkdAa bkdAb TRUE 0.999 2.000 0.558 0.001 Y 0.104
 125608 125609 SMc03202 SMc03203 bkdAb bkdB TRUE 0.992 4.000 0.152 0.080 Y -0.271
 125609 125610 SMc03203 SMc03204 bkdB lpdA3 TRUE 0.993 7.000 0.457 1.000 Y 0.230
 125611 125612 SMc03205 SMc03206 purU1 maiA FALSE 0.284 164.000 0.100 1.000 N 0.371
 125612 125613 SMc03206 SMc03207 maiA   TRUE 0.965 12.000 0.310 1.000 N 0.593
 125613 125614 SMc03207 SMc03208   hmgA TRUE 0.757 81.000 0.060 1.000 Y 0.346
 125619 125620 SMc03149 SMc03148     TRUE 0.650 138.000 0.533 NA   0.272
 125620 125621 SMc03148 SMc03147     TRUE 0.933 53.000 0.933 1.000   -0.186
 125621 125622 SMc03147 SMc03146     TRUE 0.999 3.000 1.000 0.005   0.602
 125622 125623 SMc03146 SMc03145     FALSE 0.013 87.000 0.000 NA   -0.305
 125623 125624 SMc03145 SMc03144     FALSE 0.039 142.000 0.000 NA   0.119
 125626 125627 SMc03142 SMc03141     FALSE 0.004 358.000 0.000 NA   0.058
 125629 125630 SMc03139 SMc03138     TRUE 0.799 80.000 0.429 NA N 0.347
 125631 125632 SMc03137 SMc03136     TRUE 0.986 -3.000 0.375 NA   0.471
 125632 125633 SMc03136 SMc03135     FALSE 0.049 149.000 0.000 NA N 0.072
 125633 125634 SMc03135 SMc03134     TRUE 0.957 15.000 0.500 NA   -0.003
 125634 125635 SMc03134 SMc03133     TRUE 0.824 -10.000 0.061 NA   -0.063
 125635 125636 SMc03133 SMc03132   ordL3 TRUE 0.951 18.000 0.091 1.000 Y 0.582
 125636 125637 SMc03132 SMc03131 ordL3   TRUE 0.872 67.000 0.190 1.000 Y 0.180
 125637 125638 SMc03131 SMc03130     FALSE 0.009 391.000 0.000 1.000 N 0.025
 125638 125639 SMc03130 SMc03129     FALSE 0.389 68.000 0.013 1.000 N 0.192
 125639 125640 SMc03129 SMc03128     TRUE 0.695 13.000 0.020 1.000 N -0.189
 125640 125641 SMc03128 SMc03127     TRUE 0.983 18.000 0.571 1.000 Y -0.161
 125641 125642 SMc03127 SMc03126     TRUE 0.997 -3.000 0.692 1.000 Y -0.114
 125642 125643 SMc03126 SMc03125     TRUE 0.997 -3.000 0.180 0.002 Y -0.068
 125643 125644 SMc03125 SMc03124     TRUE 0.778 94.000 0.180 1.000 Y 0.047
 403018 406808 SMc03075 SMc03221 tRNA-MET_CAT rRNA-5S FALSE 0.022 211.000 0.000 NA   NA
 406808 1782982 SMc03221 SMc03220 rRNA-5S rRNA-23S FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 1782982 403017 SMc03220 SMc03074 rRNA-23S tRNA-ALA_TGC FALSE 0.003 608.000 0.000 NA   NA
 403017 403016 SMc03074 SMc03073 tRNA-ALA_TGC tRNA-ILE_GAT FALSE 0.044 140.000 0.000 NA   NA
 403016 1782983 SMc03073 SMc03222 tRNA-ILE_GAT rRNA-16S FALSE 0.014 257.000 0.000 NA   NA
 1782983 125646 SMc03222 SMc03122 rRNA-16S   FALSE 0.004 556.000 0.000 NA   NA
 125647 125648 SMc03121 SMc03120     TRUE 0.990 12.000 0.548 NA Y 0.063
 125648 125649 SMc03120 SMc03119     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.022 Y -0.054
 125649 125650 SMc03119 SMc03118     TRUE 0.994 4.000 0.447 1.000 Y -0.027
 125650 125651 SMc03118 SMc03117     TRUE 0.999 -7.000 0.902 0.078 Y 0.327
 125651 125652 SMc03117 SMc03116     TRUE 0.951 48.000 0.390 1.000 Y 0.152
 125653 125654 SMc03115 SMc03114 TRm5C TRm3 TRUE 0.824 40.000 0.000 0.014   0.510
 125654 125655 SMc03114 SMc03113 TRm3 TRm5N TRUE 0.975 -90.000 0.000 0.014 Y 0.255
 125655 125656 SMc03113 SMc03112 TRm5N metH FALSE 0.005 294.000 0.000 1.000 N -0.269
 125656 125657 SMc03112 SMc03111 metH pmi FALSE 0.087 178.000 0.000 1.000 N 0.421
 125657 125658 SMc03111 SMc03110 pmi   TRUE 0.785 11.000 0.036 NA   0.047
 125658 125659 SMc03110 SMc03109     FALSE 0.178 76.000 0.000 NA   0.476
 403013 125660 SMc03076 SMc03108 tRNA-ARG_CCT   FALSE 0.006 390.000 0.000 NA   NA
 125661 125662 SMc03107 SMc03106     FALSE 0.047 46.000 0.000 NA   -0.046
 125664 125665 SMc03104 SMc03103 hemA   FALSE 0.007 346.000 0.000 1.000 N -0.119
 125665 125666 SMc03103 SMc03102     TRUE 0.997 16.000 0.525 0.002 Y 0.497
 125666 125667 SMc03102 SMc03101     TRUE 0.885 102.000 0.062 0.002 Y NA
 125670 125671 SMc03098 SMc03097     FALSE 0.008 338.000 0.000 1.000   0.033
 125671 125672 SMc03097 SMc03096     FALSE 0.466 123.000 0.212 1.000   0.163
 125672 125673 SMc03096 SMc03095     FALSE 0.069 143.000 0.000 NA   0.478
 125673 125674 SMc03095 SMc03094     FALSE 0.061 124.000 0.000 NA   0.204
 125675 125676 SMc03093 SMc03092     FALSE 0.050 209.000 0.000 1.000   0.483
 125677 125678 SMc03091 SMc03090 argI1 cheW3 FALSE 0.076 178.000 0.000 1.000 N 0.251
 125682 125683 SMc03086 SMc03085 fdsD fdsC TRUE 0.987 18.000 0.458 0.001   0.090
 125683 125684 SMc03085 SMc04444 fdsC fdsA TRUE 0.984 9.000 0.180 0.001   -0.132
 125684 125685 SMc04444 SMc02525 fdsA fdsB FALSE 0.299 260.000 0.466 1.000   0.027
 125685 125686 SMc02525 SMc02524 fdsB fdsG TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.008 Y 0.189
 125686 125687 SMc02524 SMc02523 fdsG   FALSE 0.404 177.000 0.243 1.000 N 0.216
 125687 125688 SMc02523 SMc02522     FALSE 0.059 158.000 0.000 1.000 N 0.044
 125689 125690 SMc02521 SMc02520 glpR glpD FALSE 0.244 131.000 0.036 1.000 N 0.333
 125690 125691 SMc02520 SMc02519 glpD   FALSE 0.474 39.000 0.019 1.000 N -0.072
 125691 125692 SMc02519 SMc02518     TRUE 0.996 24.000 0.865 0.008 Y -0.156
 125692 125693 SMc02518 SMc02517     TRUE 0.999 2.000 0.847 0.078 Y 0.093
 125693 125694 SMc02517 SMc02516     TRUE 0.995 21.000 0.922 0.078 Y -0.454
 125694 125695 SMc02516 SMc02515     TRUE 0.994 0.000 0.854 NA   0.130
 125695 125696 SMc02515 SMc02514     TRUE 0.850 82.000 0.640 NA   0.405
 125696 125697 SMc02514 SMc02513     FALSE 0.148 256.000 0.000 0.078 N 0.513
 125697 125698 SMc02513 SMc02512     FALSE 0.395 207.000 0.000 0.078 Y -0.080
 125698 125699 SMc02512 SMc02511     FALSE 0.027 127.000 0.000 NA N -0.081
 125701 125702 SMc02509 SMc02508 sitA sitB TRUE 0.998 -3.000 0.894 1.000 Y 0.208
 125702 125703 SMc02508 SMc02507 sitB sitC TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.091 Y 0.311
 125703 125704 SMc02507 SMc02506 sitC sitD TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.006 Y 0.039
 125704 125705 SMc02506 SMc02505 sitD   FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   -0.291
 125708 125709 SMc02502 SMc02501 atpC atpD TRUE 0.978 117.000 0.837 0.002 Y 0.393
 125709 125710 SMc02501 SMc02500 atpD atpG TRUE 0.996 25.000 0.724 0.002 Y 0.020
 125710 125711 SMc02500 SMc02499 atpG atpA TRUE 0.996 28.000 0.846 0.002 Y -0.102
 125711 125712 SMc02499 SMc02498 atpA atpH TRUE 0.999 0.000 0.864 0.002 Y 0.875
 125712 125713 SMc02498 SMc02497 atpH   FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   -0.339
 125713 125714 SMc02497 SMc02496   priA FALSE 0.131 123.000 0.014 NA   0.168
 125717 125718 SMc02493 SMc02492     TRUE 0.599 -3.000 0.000 NA   0.049
 125719 125720 SMc02491 SMc02490     TRUE 0.705 10.000 0.000 1.000   0.302
 125721 125722 SMc02489 SMc02488     FALSE 0.053 222.000 0.030 NA   0.006
 125723 125724 SMc02487 SMc02486 lpdA2   FALSE 0.474 37.000 0.015 1.000 N -0.060
 125724 125725 SMc02486 SMc02485     TRUE 0.987 -3.000 0.429 NA   0.257
 125725 125726 SMc02485 SMc02484     TRUE 0.945 0.000 0.091 NA   0.125
 125726 125727 SMc02484 SMc02483   sucB FALSE 0.050 256.000 0.005 1.000 N 0.191
 125727 125728 SMc02483 SMc02482 sucB sucA TRUE 0.860 123.000 0.667 1.000 Y -0.402
 125728 125729 SMc02482 SMc02481 sucA sucD FALSE 0.218 281.000 0.092 1.000 Y -0.081
 125729 125730 SMc02481 SMc02480 sucD sucC TRUE 0.996 7.000 0.256 0.001 Y -0.028
 125730 125731 SMc02480 SMc02479 sucC mdh TRUE 0.909 34.000 0.113 1.000 Y 0.034
 125731 125732 SMc02479 SMc02478 mdh   FALSE 0.121 183.000 0.032 NA   0.317
 125732 125733 SMc02478 SMc02477     FALSE 0.206 42.000 0.000 NA   0.131
 125733 125734 SMc02477 SMc02476     FALSE 0.444 8.000 0.000 NA   0.052
 125734 125735 SMc02476 SMc02475     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   0.267
 125735 125736 SMc02475 SMc02474     FALSE 0.057 196.000 0.000 1.000   0.423
 125736 125737 SMc02474 SMc02473     TRUE 0.971 37.000 0.190 0.078 Y 0.412
 125737 125738 SMc02473 SMc02472     TRUE 0.998 -7.000 0.833 0.078 Y 0.022
 125738 125739 SMc02472 SMc02471     TRUE 0.778 78.000 0.000 0.078 Y -0.063
 125740 125741 SMc02470 SMc02469     TRUE 0.775 43.000 0.229 1.000   -0.136
 125741 125742 SMc02469 SMc02468     TRUE 0.947 30.000 0.692 NA   0.043
 125743 125744 SMc02467 SMc02466 msrA2 sdhB FALSE 0.123 151.000 0.004 1.000 N 0.122
 125744 125745 SMc02466 SMc02465 sdhB sdhA TRUE 0.995 19.000 0.604 0.001 Y -0.206
 125745 125746 SMc02465 SMc02464 sdhA sdhD TRUE 0.999 8.000 0.705 0.001 Y 0.111
 125746 125747 SMc02464 SMc02463 sdhD sdhC TRUE 0.996 11.000 0.291 0.000 Y 0.012
 125749 125750 SMc03226 SMc03227     TRUE 0.641 15.000 0.031 NA   -0.053
 125750 125751 SMc03227 SMc03228     TRUE 0.931 7.000 0.122 NA   0.328
 125751 125752 SMc03228 SMc03229   gpsA TRUE 0.941 18.000 0.456 NA   -0.014
 125752 125753 SMc03229 SMc03230 gpsA gcp TRUE 0.876 11.000 0.070 1.000 N -0.008
 125754 125755 SMc03231 SMc03232 hemC hemD TRUE 0.994 5.000 0.056 0.001 Y -0.014
 125755 125756 SMc03232 SMc03233 hemD   FALSE 0.041 220.000 0.032 NA   -0.145
 125756 125757 SMc03233 SMc03234     TRUE 0.759 19.000 0.058 NA   0.259
 125757 125758 SMc03234 SMc03235     TRUE 0.682 36.000 0.108 NA   0.026
 125758 125759 SMc03235 SMc03236     TRUE 0.986 3.000 0.452 NA   0.322
 125764 125765 SMc03241 SMc03242   typA FALSE 0.006 344.000 0.002 1.000   -0.351
 125765 125766 SMc03242 SMc03243 typA   FALSE 0.145 136.000 0.003 1.000 N 0.170
 125766 125767 SMc03243 SMc03244     FALSE 0.062 157.000 0.000 NA   0.659
 125771 125772 SMc03748 SMc03312   TRm11b TRUE 0.781 -3.000 0.000 NA   0.290
 125772 125773 SMc03312 SMc03313 TRm11b TRm11a TRUE 0.944 -66.000 0.103 NA Y -0.308
 125774 5451328 SMc03246 SMc05011     FALSE 0.260 64.000 0.000 1.000 N NA
 5451328 125775 SMc05011 SMc03247     FALSE 0.016 291.000 0.000 1.000   NA
 125775 1782984 SMc03247 SMc03749   ISRm3 FALSE 0.013 261.000 0.000 NA   NA
 125776 125777 SMc03248 SMc03249     FALSE 0.484 -3.000 0.000 NA   -0.007
 125777 125778 SMc03249 SMc03751     FALSE 0.016 77.000 0.000 NA   -0.098
 125778 125779 SMc03751 SMc03250     TRUE 0.928 -19.000 0.000 NA Y 0.366
 125779 125780 SMc03250 SMc03251     FALSE 0.000 941.000 0.000 NA   -0.049
 125780 125781 SMc03251 SMc03252   proB2 FALSE 0.008 287.000 0.000 NA   0.076
 125781 125782 SMc03252 SMc03253 proB2   FALSE 0.015 378.000 0.000 1.000   0.880
 125782 125783 SMc03253 SMc03254   fixT3 FALSE 0.002 862.000 0.000 NA   0.042
 125784 125785 SMc03256 SMc03257   TRm18 FALSE 0.003 260.000 0.000 NA   -0.039
 125785 125786 SMc03257 SMc03258 TRm18   FALSE 0.015 211.000 0.000 1.000   -0.049
 125788 1782986 SMc03260 SMc04102 TRm17 f3 FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 1782986 125789 SMc04102 SMc03262 f3   FALSE 0.094 86.000 0.000 NA   NA
 125792 125793 SMc03265 SMc03267     FALSE 0.029 1593.000 0.000 1.000 Y 0.078
 125793 125794 SMc03267 SMc03268     TRUE 0.977 0.000 0.286 1.000   -0.108
 125794 125795 SMc03268 SMc03269     TRUE 0.689 70.000 0.286 1.000   -0.208
 125795 125796 SMc03269 SMc03754     TRUE 0.996 23.000 1.000 0.077 Y 0.412
 125796 125797 SMc03754 SMc03272     TRUE 0.981 13.000 0.250 1.000 Y 0.224
 125797 5451329 SMc03272     SMc05012 FALSE 0.037 157.000 0.000 NA   NA
 5451329 5451330   SMc05013 SMc05012   FALSE 0.334 22.000 0.000 NA   NA
 5451330 5451331 SMc05013 SMc05014     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 5451331 5451332 SMc05014 SMc05015     FALSE 0.161 57.000 0.000 NA   NA
 5451332 125798 SMc05015 SMc03277     FALSE 0.004 502.000 0.000 NA   NA
 125798 125799 SMc03277 SMc03278   TRm28.1 FALSE 0.005 147.000 0.000 NA   -0.130
 125799 125800 SMc03278 SMc03279 TRm28.1 TRm28.2 TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA Y -0.149
 125800 125801 SMc03279 SMc03280 TRm28.2 ISRm28.3 TRUE 0.736 49.000 0.000 NA Y 0.179
 125802 125803 SMc03281 SMc03282 TRm27.2 TRm27.1 TRUE 0.974 -3.000 0.182 1.000   0.384
 125804 125805 SMc03283 SMc03284 TRm18   FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   -0.215
 125806 125807 SMc03285 SMc03286     FALSE 0.002 382.000 0.000 NA   -0.021
 125807 125808 SMc03286 SMc03287     TRUE 0.824 -3.000 0.000 1.000   0.221
 125810 125811 SMc03289 SMc03290     FALSE 0.004 846.000 0.000 NA   0.335
 125811 125812 SMc03290 SMc04428     FALSE 0.002 890.000 0.000 NA   0.059
 125812 125813 SMc04428 SMc03293     FALSE 0.093 -118.000 0.000 NA   -0.084
 125813 125814 SMc03293 SMc03294     FALSE 0.001 360.000 0.000 NA   -0.296
 125815 125816 SMc03295 SMc03296 TRm1a TRm1b TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.054 Y 0.420
 125817 125818 SMc03297 SMc03298   TRm26.3 FALSE 0.000 1105.000 0.000 NA   -0.242
 125818 125819 SMc03298 SMc03300 TRm26.3 TRm26.2 TRUE 0.952 76.000 0.750 NA Y 0.143
 125819 125820 SMc03300 SMc03301 TRm26.2 TRm26.1 TRUE 0.771 -3.000 0.000 NA   0.254
 5451334 125821 SMc05018 SMc03761     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 125821 125822 SMc03761 SMc03762     TRUE 0.907 -34.000 0.143 NA   0.528
 125823 125824 SMc03763 SMc03764   vsr TRUE 0.606 134.000 0.000 0.054 Y -0.133
 125825 125826 SMc03765 SMc03766     FALSE 0.389 3.000 0.000 NA   -0.020
 125826 125827 SMc03766 SMc03767     FALSE 0.001 510.000 0.000 NA   -0.161
 125827 125828 SMc03767 SMc03768     FALSE 0.062 474.000 0.000 0.024   0.323
 125828 125829 SMc03768 SMc03769     FALSE 0.402 16.000 0.000 1.000   0.026
 125829 403015 SMc03769 SMc03779   tRNA-SER_CGA FALSE 0.003 869.000 0.000 NA   NA
 125830 125831 SMc03770 SMc03772 rplU rpmA TRUE 0.994 34.000 0.667 0.008 Y 0.470
 125831 125832 SMc03772 SMc03773 rpmA   FALSE 0.470 131.000 0.035 1.000 Y -0.062
 125832 125833 SMc03773 SMc03774     TRUE 0.998 -3.000 0.222 0.007 Y 0.394
 125833 125834 SMc03774 SMc03775   obgE FALSE 0.423 58.000 0.008 1.000   0.672
 125834 125835 SMc03775 SMc03776 obgE proB1 TRUE 0.938 3.000 0.087 1.000   0.077
 125835 125836 SMc03776 SMc03777 proB1 proA TRUE 0.992 -7.000 0.065 0.001 Y -0.107
 125836 125837 SMc03777 SMc03778 proA nadD TRUE 0.778 36.000 0.170 1.000 N -0.090
 125837 125838 SMc03778 SMc03780 nadD   TRUE 0.801 45.000 0.221 NA   0.311
 125838 125839 SMc03780 SMc03781     FALSE 0.472 153.000 0.307 NA   0.360
 125839 125840 SMc03781 SMc03782     FALSE 0.233 133.000 0.067 NA   0.260
 125840 125841 SMc03782 SMc03783   ctpA TRUE 0.976 -10.000 0.408 NA N 0.683
 125841 125842 SMc03783 SMc03784 ctpA   FALSE 0.310 182.000 0.210 1.000   0.055
 125842 125843 SMc03784 SMc03785   ialA FALSE 0.470 85.000 0.109 1.000   0.080
 125844 125845 SMc03786 SMc03787 bfr   TRUE 0.972 -34.000 0.588 NA   0.096
 125845 125846 SMc03787 SMc03788   dnaE2 FALSE 0.018 282.000 0.000 NA   0.427
 125846 125847 SMc03788 SMc03789 dnaE2   TRUE 0.994 -3.000 0.028 0.004 Y -0.092
 125847 125848 SMc03789 SMc03790     TRUE 0.955 -157.000 0.514 NA   -0.298
 125850 125851 SMc03792 SMc03793   citE TRUE 0.968 -3.000 0.179 NA   0.177
 125852 125853 SMc03794 SMc03795   leuD FALSE 0.146 148.000 0.038 NA   NA
 125853 125854 SMc03795 SMc03796 leuD   TRUE 0.837 9.000 0.025 NA N NA
 125854 125855 SMc03796 SMc03797   metA FALSE 0.013 264.000 0.000 NA N 0.038
 125855 125856 SMc03797 SMc03798 metA galM FALSE 0.350 81.000 0.016 1.000 N 0.243
 125856 125857 SMc03798 SMc03799 galM   FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   0.280
 125858 125859 SMc03800 SMc03801     TRUE 0.756 60.000 0.245 NA   0.334
 125859 125860 SMc03801 SMc03802     FALSE 0.438 145.000 0.222 1.000   0.334
 125860 125861 SMc03802 SMc03803     TRUE 0.909 9.000 0.148 1.000   -0.223
 125863 125864 SMc03805 SMc03806 tesB glnK FALSE 0.007 237.000 0.000 1.000 N -0.290
 125864 125865 SMc03806 SMc03807 glnK amtB TRUE 0.880 28.000 0.197 1.000 N 0.679
 125865 5451335 SMc03807 SMc05025 amtB   FALSE 0.245 35.000 0.000 NA   NA
 5451335 125866 SMc05025 SMc03808   ftsK FALSE 0.019 228.000 0.000 NA   NA
 125866 125867 SMc03808 SMc03809 ftsK   FALSE 0.154 136.000 0.035 1.000 N -0.107
 125868 125869 SMc03810 SMc03811     TRUE 0.990 -3.000 0.556 NA   0.207
 125869 125870 SMc03811 SMc03812     TRUE 0.994 0.000 0.889 NA   -0.026
 125870 125871 SMc03812 SMc03813     FALSE 0.005 493.000 0.000 NA   0.193
 125871 125872 SMc03813 SMc03814     TRUE 0.817 39.000 0.054 NA Y -0.344
 125872 125873 SMc03814 SMc03815     TRUE 0.848 18.000 0.000 0.017   -0.233
 125874 125875 SMc03816 SMc03817     TRUE 0.885 16.000 0.000 NA Y 0.139
 125875 125876 SMc03817 SMc03818   xthA3 FALSE 0.032 190.000 0.000 NA N 0.058
 125877 125878 SMc03819 SMc03820     TRUE 0.949 33.000 0.261 NA Y 0.170
 125880 125881 SMc03822 SMc03823   leuC FALSE 0.108 113.000 0.000 NA N 0.239
 125881 5451336 SMc03823 SMc05019 leuC   FALSE 0.441 79.000 0.086 NA   NA
 125882 125883 SMc03824 SMc03825     TRUE 0.947 -3.000 0.054 1.000 N 0.181
 125886 125887 SMc03828 SMc03829     TRUE 0.993 -3.000 0.771 1.000   -0.023
 125887 125888 SMc03829 SMc03830     TRUE 0.513 171.000 0.562 NA   -0.233
 125888 125889 SMc03830 SMc03831     FALSE 0.072 205.000 0.008 NA   0.676
 125889 125890 SMc03831 SMc03832     FALSE 0.017 256.000 0.006 NA   -0.049
 125890 125891 SMc03832 SMc03833     FALSE 0.001 552.000 0.000 NA   -0.040
 125891 125892 SMc03833 SMc03834   pcbD FALSE 0.253 132.000 0.094 NA   0.111
 125892 125893 SMc03834 SMc03835 pcbD ligT FALSE 0.144 131.000 0.005 1.000 N 0.109
 125893 125894 SMc03835 SMc03836 ligT tesA FALSE 0.358 115.000 0.077 1.000 N 0.263
 125895 125896 SMc03837 SMc03838     TRUE 0.996 -3.000 0.626 1.000 Y -0.207
 125896 125897 SMc03838 SMc03839     FALSE 0.085 247.000 0.101 1.000   -0.116
 125897 125898 SMc03839 SMc03840     FALSE 0.384 126.000 0.149 1.000   0.206
 125899 125900 SMc03841 SMc03842 clpP3   FALSE 0.460 45.000 0.028 NA   0.110
 125900 125901 SMc03842 SMc03843     TRUE 0.993 -3.000 0.727 NA   0.323
 125901 125902 SMc03843 SMc03844     FALSE 0.010 206.000 0.000 NA   0.011
 125902 125903 SMc03844 SMc03845     FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   -0.085
 125903 125904 SMc03845 SMc03846   acnA FALSE 0.039 243.000 0.038 NA   -0.092
 125905 125906 SMc03847 SMc03848 ccmA ccmB TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y 0.113
 125906 125907 SMc03848 SMc03849 ccmB ccmC TRUE 0.987 60.000 0.501 0.001 Y 0.186
 125907 125908 SMc03849 SMc03850 ccmC ccmD TRUE 0.987 -3.000 0.501 1.000   -0.228
 125908 125909 SMc03850 SMc03851 ccmD ccmG TRUE 0.974 -3.000 0.172 1.000   0.428
 125910 125911 SMc03852 SMc03853     TRUE 0.881 -3.000 0.037 NA   -0.039
 125911 125912 SMc03853 SMc03854   ftsY FALSE 0.371 98.000 0.050 1.000 N 0.250
 125912 125913 SMc03854 SMc03855 ftsY   TRUE 0.835 15.000 0.042 1.000 N 0.394
 125913 125914 SMc03855 SMc03856   dapF TRUE 0.966 -3.000 0.109 1.000 N 0.275
 125915 125916 SMc03857 SMc03858 ffh pheAa TRUE 0.690 13.000 0.023 1.000 N -0.255
 125916 125917 SMc03858 SMc03859 pheAa rpsP TRUE 0.687 39.000 0.050 1.000 N 0.372
 125917 125918 SMc03859 SMc03860 rpsP rimM TRUE 0.909 136.000 0.342 0.008 Y 0.023
 125918 125919 SMc03860 SMc03861 rimM trmD TRUE 0.994 11.000 0.672 1.000 Y 0.051
 125921 125922 SMc03863 SMc03864 rplS   FALSE 0.092 127.000 0.006 1.000 N -0.156
 125922 125923 SMc03864 SMc03865     TRUE 0.950 70.000 0.609 1.000 Y 0.127
 125924 125925 SMc03866 SMc03867     TRUE 0.963 5.000 0.030 0.089   0.272
 125925 125926 SMc03867 SMc03868     FALSE 0.246 78.000 0.005 1.000   0.106
 125927 125928 SMc03869 SMc03870     TRUE 0.942 32.000 0.697 1.000 N -0.341
 125928 125929 SMc03870 SMc03871     TRUE 0.996 -3.000 0.522 0.009 N -0.259
 125929 125930 SMc03871 SMc03872     FALSE 0.029 340.000 0.013 1.000   0.307
 125931 125932 SMc03873 SMc03874 rpoH2   FALSE 0.196 425.000 0.012 0.077 Y 0.302
 125932 125933 SMc03874 SMc03875     FALSE 0.006 410.000 0.000 1.000 N -0.068
 125933 125934 SMc03875 SMc03876     FALSE 0.045 385.000 0.050 1.000 N 0.377
 125934 125935 SMc03876 SMc03877     FALSE 0.138 316.000 0.013 1.000 Y 0.228
 125935 125936 SMc03877 SMc03878   phbB FALSE 0.009 675.000 0.000 1.000 N 0.406
 125936 125937 SMc03878 SMc03879 phbB phbA TRUE 0.818 118.000 0.319 1.000 Y 0.349
 125939 125940 SMc03881 SMc03882 rpmF gst8 FALSE 0.126 164.000 0.009 1.000 N 0.175
 125940 125941 SMc03882 SMc03883 gst8 mtgA FALSE 0.186 90.000 0.016 1.000   -0.047
 125942 125943 SMc03884 SMc03885 ispA hisC2 TRUE 0.877 5.000 0.035 1.000 N -0.048
 125946 125947 SMc03888 SMc03889 gcpE   FALSE 0.076 170.000 0.011 1.000 N -0.109
 125947 125948 SMc03889 SMc03890     TRUE 0.826 119.000 0.438 1.000 Y -0.041
 125949 125950 SMc03891 SMc03892   TRm21 FALSE 0.040 236.000 0.000 1.000 N 0.207
 125950 125951 SMc03892 SMc03893 TRm21   FALSE 0.040 232.000 0.000 1.000 N 0.185
 125951 125952 SMc03893 SMc03894     TRUE 0.999 -3.000 0.481 0.004 Y 0.215
 125953 125954 SMc03895 SMc03896 pyc   FALSE 0.089 391.000 0.018 0.027 N -0.105
 125954 125955 SMc03896 SMc03948   TRm1b TRUE 0.540 15.000 0.000 1.000 N 0.042
 125955 125956 SMc03948 SMc03898 TRm1b TRm1a TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.054 Y 0.319
 125956 125957 SMc03898 SMc03899 TRm1a   FALSE 0.410 25.000 0.000 NA   0.372
 125958 125959 SMc03900 SMc03901 ndvA   FALSE 0.016 226.000 0.000 1.000   -0.015
 125960 125961 SMc04381 SMc04382   ndvB FALSE 0.085 177.000 0.055 NA   -0.235
 125961 125962 SMc04382 SMc04882 ndvB   FALSE 0.014 441.000 0.000 1.000 N 0.404
 125963 125964 SMc04383 SMc04384     TRUE 0.890 11.000 0.080 NA   0.514
 125964 125965 SMc04384 SMc04385     TRUE 0.828 35.000 0.000 1.000 Y 0.421
 125965 125966 SMc04385 SMc04386   aatB TRUE 0.886 17.000 0.121 1.000 N 0.467
 125969 125970 SMc04389 SMc04390 ttuD1   TRUE 0.616 16.000 0.000 1.000 N 0.214
 125970 125971 SMc04390 SMc04391     FALSE 0.398 206.000 0.316 1.000 N 0.373
 125971 125972 SMc04391 SMc04392     TRUE 0.992 -3.000 0.583 1.000 N 0.168
 125972 125973 SMc04392 SMc04393     TRUE 0.991 9.000 0.474 0.077 N 0.083
 125973 125974 SMc04393 SMc04394     TRUE 0.997 4.000 0.421 0.077 Y -0.022
 125974 125975 SMc04394 SMc04395     TRUE 0.999 0.000 0.588 0.077 Y 0.354
 125975 125976 SMc04395 SMc04396     TRUE 0.831 185.000 0.412 0.077 Y -0.082
 125976 125977 SMc04396 SMc04397     FALSE 0.381 161.000 0.188 1.000 N 0.306
 125977 125978 SMc04397 SMc04398     TRUE 0.994 -6.000 0.562 0.079 N 0.376
 125978 125979 SMc04398 SMc04399     TRUE 0.998 -7.000 0.909 0.079 Y -0.031
 125979 125980 SMc04399 SMc04400     TRUE 0.985 0.000 0.455 1.000   -0.248
 125980 125981 SMc04400 SMc04401     TRUE 0.977 -3.000 0.231 1.000   0.102
 125983 125984 SMc04403 SMc04404 dcp   TRUE 0.601 86.000 0.029 1.000 Y -0.281
 125985 125986 SMc04405 SMc04406 leuB   FALSE 0.144 129.000 0.011 1.000   0.172
 125987 125988 SMc04407 SMc04881     FALSE 0.002 519.000 0.000 NA   0.021
 125988 125989 SMc04881 SMc04408     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   0.190
 125990 125991 SMc04409 SMc04410   asd FALSE 0.072 114.000 0.000 NA   0.209
 125991 125992 SMc04410 SMc04411 asd   FALSE 0.093 173.000 0.012 NA N 0.101
 125993 125994 SMc04083 SMc04084 cynT pdxK FALSE 0.261 174.000 0.089 1.000 N 0.548
 125995 125996 SMc04085 SMc04087     FALSE 0.107 126.000 0.006 NA   0.157
 125997 125998 SMc04088 SMc04089 purH   FALSE 0.220 142.000 0.068 NA   0.284
 125998 125999 SMc04089 SMc04090   sun FALSE 0.153 168.000 0.071 NA   0.053
 125999 126000 SMc04090 SMc04091 sun htpX TRUE 0.954 0.000 0.075 1.000 N 0.183
 126004 126005 SMc04095 SMc02812     FALSE 0.035 113.000 0.000 NA   0.041
 126006 126007 SMc02804 SMc02803 leuS   TRUE 0.867 -13.000 0.090 NA   0.042
 126007 126008 SMc02803 SMc02802     TRUE 0.831 13.000 0.097 NA   -0.056
 126009 126010 SMc02801 SMc02800 parB parA TRUE 0.966 33.000 0.827 1.000 N 0.441
 126010 126011 SMc02800 SMc02799 parA gidB TRUE 0.952 15.000 0.339 1.000 N 0.164
 126011 126012 SMc02799 SMc02798 gidB gidA TRUE 0.979 9.000 0.466 1.000 N 0.063
 126012 126013 SMc02798 SMc02797 gidA trmE FALSE 0.469 124.000 0.266 1.000   -0.059
 126013 126014 SMc02797 SMc02796 trmE rho FALSE 0.089 352.000 0.050 0.089   -0.065
 126014 126015 SMc02796 SMc02795 rho   FALSE 0.118 196.000 0.024 1.000   0.467
 126015 126016 SMc02795 SMc02794   hemE TRUE 0.831 11.000 0.044 1.000   0.038
 121319 121320 SMa0002 SMa0005 fdoG fdoH TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 121320 121321 SMa0005 SMa0007 fdoH fdoI TRUE 0.996 -22.000 0.333 0.001 Y NA
 121321 121322 SMa0007 SMa0009 fdoI fdhE TRUE 0.791 39.000 0.182 NA N NA
 121322 121323 SMa0009 SMa0011 fdhE selA TRUE 0.926 5.000 0.083 NA N NA
 121323 121324 SMa0011 SMa0013 selA   TRUE 0.557 -91.000 0.000 1.000   NA
 121324 121325 SMa0013 SMa0015   selB TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 121325 121326 SMa0015 SMa0017 selB   FALSE 0.014 254.000 0.000 NA   NA
 121327 121328 SMa0018 SMa0020     TRUE 0.813 66.000 0.103 NA Y NA
 403034 5451264 SMa0022 SMa5014 selC   FALSE 0.359 19.000 0.000 NA   NA
 121330 121331 SMa0025 SMa0026     FALSE 0.069 106.000 0.000 NA   NA
 121331 121332 SMa0026 SMa0028   selD TRUE 0.674 13.000 0.008 NA   NA
 121332 121333 SMa0028 SMa0031 selD   FALSE 0.010 295.000 0.000 NA   NA
 121333 121334 SMa0031 SMa0034     TRUE 0.973 17.000 0.750 NA   NA
 121338 121339 SMa0044 SMa0045   cah FALSE 0.035 165.000 0.000 NA   NA
 5451265 121341 SMa5015 SMa0050     FALSE 0.043 141.000 0.000 NA   NA
 121341 121342 SMa0050 SMa0052     TRUE 0.942 -9.000 0.000 0.044   NA
 121343 121344 SMa0056 SMa0058     FALSE 0.260 64.000 0.000 1.000 N NA
 121344 121345 SMa0058 SMa0059     TRUE 0.608 15.000 0.000 1.000 N NA
 121345 121346 SMa0059 SMa0060     TRUE 0.798 0.000 0.000 NA N NA
 121347 121348 SMa0062 SMa0063     TRUE 0.720 130.000 0.000 0.007 Y NA
 121348 121349 SMa0063 SMa0064     TRUE 0.975 3.000 0.231 1.000 N NA
 121349 121350 SMa0064 SMa0065     FALSE 0.264 63.000 0.000 1.000 N NA
 121350 121351 SMa0065 SMa0067     FALSE 0.225 58.000 0.000 NA N NA
 121351 121352 SMa0067 SMa0070     TRUE 0.791 186.000 0.625 NA Y NA
 121352 121353 SMa0070 SMa0072     TRUE 0.995 -3.000 0.400 0.017   NA
 121353 121354 SMa0072 SMa0074     TRUE 0.981 8.000 0.500 1.000   NA
 121354 121355 SMa0074 SMa0077     TRUE 0.993 0.000 0.667 1.000 N NA
 121355 121356 SMa0077 SMa0078     FALSE 0.034 242.000 0.000 1.000 N NA
 121356 121357 SMa0078 SMa0079     TRUE 0.657 125.000 0.444 1.000 N NA
 121357 121358 SMa0079 SMa0081     TRUE 0.998 11.000 0.667 0.009 Y NA
 121358 121359 SMa0081 SMa0082     TRUE 0.976 30.000 0.500 1.000 Y NA
 121359 121360 SMa0082 SMa0083     TRUE 0.897 16.000 0.000 1.000 Y NA
 121360 121361 SMa0083 SMa0085     TRUE 0.560 18.000 0.000 1.000 N NA
 121361 121362 SMa0085 SMa0087     TRUE 0.901 17.000 0.222 NA   NA
 121362 121363 SMa0087 SMa0089     FALSE 0.011 283.000 0.000 NA   NA
 121363 121364 SMa0089 SMa0091     FALSE 0.051 125.000 0.000 NA   NA
 121364 121365 SMa0091 SMa0093     FALSE 0.013 262.000 0.000 NA   NA
 121365 121366 SMa0093 SMa0095     TRUE 0.796 51.000 0.025 NA Y NA
 121368 121369 SMa0101 SMa0104     TRUE 0.856 57.000 0.429 1.000   NA
 121369 121370 SMa0104 SMa0105     TRUE 0.958 88.000 0.500 0.076 Y NA
 121370 121371 SMa0105 SMa0106     TRUE 0.997 6.000 0.500 0.099 Y NA
 121371 121372 SMa0106 SMa0108     TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 121372 121373 SMa0108 SMa0110     TRUE 0.998 -3.000 0.375 0.006 Y NA
 121373 5451266 SMa0110 SMa5001     FALSE 0.214 42.000 0.000 NA   NA
 121375 121376 SMa0113 SMa0114     TRUE 0.946 28.000 0.000 0.017 Y NA
 121376 121377 SMa0114 SMa0116     FALSE 0.008 546.000 0.000 1.000 N NA
 121377 121378 SMa0116 SMa0117     TRUE 0.956 -3.000 0.100 1.000   NA
 121378 121379 SMa0117 SMa0118     FALSE 0.029 227.000 0.000 1.000   NA
 121380 121381 SMa0121 SMa0123     TRUE 0.859 71.000 0.600 NA   NA
 121381 121382 SMa0123 SMa0124   groEL3 TRUE 0.877 80.000 0.800 NA   NA
 121382 121383 SMa0124 SMa0125 groEL3 groES3 TRUE 0.992 48.000 0.714 0.005 Y NA
 121384 121385 SMa0126 SMa0128     TRUE 0.666 121.000 0.500 NA   NA
 121385 121386 SMa0128 SMa0130     FALSE 0.343 86.000 0.057 NA   NA
 121386 121387 SMa0130 SMa0132     TRUE 0.718 0.000 0.000 NA   NA
 121388 5451267 SMa0134 SMa5002     FALSE 0.217 41.000 0.000 NA   NA
 121389 121390 SMa0136 SMa0137     FALSE 0.086 92.000 0.000 NA   NA
 121391 121392 SMa0139 SMa0142     FALSE 0.005 447.000 0.000 NA   NA
 121393 121394 SMa0143 SMa0144 rpoE6   TRUE 0.997 -3.000 0.714 NA Y NA
 121395 121396 SMa0146 SMa0148     FALSE 0.043 141.000 0.000 NA   NA
 121398 121399 SMa0150 SMa0151     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 121399 121400 SMa0151 SMa0155     TRUE 0.990 21.000 0.900 NA Y NA
 121400 121401 SMa0155 SMa0157     TRUE 0.926 67.000 0.436 NA Y NA
 121404 121405 SMa0163 SMa0164 pilQ2   TRUE 0.937 -3.000 0.071 NA   NA
 121405 121406 SMa0164 SMa0166     TRUE 0.916 22.000 0.333 NA   NA
 121406 121407 SMa0166 SMa0168     FALSE 0.145 84.000 0.000 1.000   NA
 121407 121408 SMa0168 SMa0169     FALSE 0.214 61.000 0.000 1.000   NA
 121411 121412 SMa0175 SMa0179     FALSE 0.005 1529.000 0.000 1.000 N NA
 121415 121416 SMa0185 SMa0187     FALSE 0.089 141.000 0.000 1.000 N NA
 121416 121417 SMa0187 SMa0189     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 121417 121418 SMa0189 SMa0190     FALSE 0.089 89.000 0.000 NA   NA
 121419 121420 SMa0191 SMa0193     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 121420 121421 SMa0193 SMa0196     FALSE 0.021 297.000 0.000 1.000 N NA
 121421 121422 SMa0196 SMa0197     TRUE 0.975 15.000 0.238 1.000 Y NA
 121422 121423 SMa0197 SMa0198     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.099 Y NA
 121423 121424 SMa0198 SMa0199     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.017 Y NA
 121424 121425 SMa0199 SMa0203     TRUE 0.957 59.000 0.619 NA Y NA
 121426 121427 SMa0204 SMa0206     TRUE 0.999 -3.000 0.529 0.017 Y NA
 121427 121428 SMa0206 SMa0209     FALSE 0.051 125.000 0.000 NA   NA
 121429 121430 SMa0210 SMa0211     FALSE 0.043 143.000 0.000 NA   NA
 121430 121431 SMa0211 SMa0214   kduI FALSE 0.020 218.000 0.000 NA   NA
 121431 121432 SMa0214 SMa0216 kduI   FALSE 0.356 32.000 0.000 1.000   NA
 121432 121433 SMa0216 SMa0217     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.017   NA
 121433 121434 SMa0217 SMa0218     TRUE 0.932 10.000 0.000 NA Y NA
 121434 121435 SMa0218 SMa0220     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA N NA
 121438 121439 SMa0224 SMa0226     FALSE 0.039 200.000 0.000 1.000   NA
 121439 121440 SMa0226 SMa0228   gdhA FALSE 0.072 167.000 0.000 1.000 N NA
 121440 121441 SMa0228 SMa0229 gdhA   FALSE 0.018 319.000 0.000 1.000 N NA
 121441 121442 SMa0229 SMa0232     TRUE 0.623 220.000 0.018 0.001 Y NA
 121443 121444 SMa0233 SMa0235 otsA   FALSE 0.067 415.000 0.000 1.000 Y NA
 121444 121445 SMa0235 SMa0237     TRUE 0.930 9.000 0.116 1.000 N NA
 121445 121446 SMa0237 SMa0241     TRUE 0.993 -3.000 0.182 0.010 N NA
 121447 121448 SMa0244 SMa0246     TRUE 0.962 15.000 0.444 1.000 N NA
 121448 121449 SMa0246 SMa0247     FALSE 0.052 171.000 0.000 1.000   NA
 121449 121450 SMa0247 SMa0249     TRUE 0.870 1.000 0.017 NA   NA
 121450 121451 SMa0249 SMa0250     TRUE 0.995 0.000 0.429 NA Y NA
 121451 121452 SMa0250 SMa0252     TRUE 0.923 52.000 0.250 1.000 Y NA
 121452 121453 SMa0252 SMa0254     FALSE 0.035 164.000 0.000 NA   NA
 121453 121454 SMa0254 SMa0255     FALSE 0.048 130.000 0.000 NA   NA
 121455 121456 SMa0257 SMa0259     FALSE 0.130 256.000 0.000 0.078 N NA
 121456 121457 SMa0259 SMa0260   gabD3 TRUE 0.962 16.000 0.190 0.078 N NA
 121457 121458 SMa0260 SMa0263 gabD3   TRUE 0.991 17.000 0.381 0.078 Y NA
 121458 121459 SMa0263 SMa0265     TRUE 0.984 22.000 0.194 0.043 Y NA
 121460 121461 SMa0267 SMa0270     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 121461 121462 SMa0270 SMa0271     TRUE 0.974 -34.000 0.000 0.017 Y NA
 121462 121463 SMa0271 SMa0273     TRUE 0.919 30.000 0.000 0.099 Y NA
 121463 121464 SMa0273 SMa0275     FALSE 0.083 121.000 0.000 1.000   NA
 121465 5451268 SMa0277 SMa5016     FALSE 0.016 242.000 0.000 NA   NA
 5451268 121467 SMa5016 SMa0279     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 121467 121468 SMa0279 SMa0280     FALSE 0.064 146.000 0.000 1.000   NA
 121470 121471 SMa0285 SMa0286     FALSE 0.249 201.000 0.200 NA   NA
 121471 121472 SMa0286 SMa0287     TRUE 0.523 11.000 0.000 NA   NA
 121472 121473 SMa0287 SMa0288     TRUE 0.994 -3.000 0.842 NA   NA
 1782974 121477 SMa0293 SMa0298     FALSE 0.010 373.000 0.000 1.000   NA
 121477 121478 SMa0298 SMa0299     TRUE 0.766 3.000 0.000 1.000   NA
 121478 121479 SMa0299 SMa0300     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.076 Y NA
 121479 121480 SMa0300 SMa0301     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121480 121481 SMa0301 SMa0302     FALSE 0.126 70.000 0.000 NA   NA
 121483 121484 SMa0306 SMa0307     FALSE 0.017 341.000 0.000 1.000 N NA
 121487 121488 SMa0312 SMa0314     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121488 121489 SMa0314 SMa0316     FALSE 0.099 83.000 0.000 NA   NA
 121489 121490 SMa0316 SMa0319     FALSE 0.004 504.000 0.000 NA   NA
 121490 121491 SMa0319 SMa0320     FALSE 0.064 145.000 0.000 1.000   NA
 121491 121492 SMa0320 SMa0322     TRUE 0.798 58.000 0.040 0.043   NA
 121492 121493 SMa0322 SMa0323     FALSE 0.481 51.000 0.040 NA   NA
 121493 121494 SMa0323 SMa0325     FALSE 0.074 101.000 0.000 NA   NA
 121494 121495 SMa0325 SMa0326     TRUE 0.987 21.000 0.667 0.043   NA
 121495 121496 SMa0326 SMa0329     TRUE 0.633 73.000 0.000 0.043   NA
 5451269 121497 SMa5017 SMa0333     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121497 121498 SMa0333 SMa0335     FALSE 0.031 181.000 0.000 NA   NA
 121498 121499 SMa0335 SMa0337     TRUE 0.523 -13.000 0.000 NA   NA
 121499 121500 SMa0337 SMa0339     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 121500 121501 SMa0339 SMa0340   wrbA2 FALSE 0.180 72.000 0.000 1.000   NA
 121503 121504 SMa0343 SMa0346     TRUE 0.940 4.000 0.118 NA   NA
 121506 121507 SMa0349 SMa0352     FALSE 0.241 36.000 0.000 NA   NA
 121508 121509 SMa0353 SMa0355     FALSE 0.246 175.000 0.000 0.076   NA
 121511 121512 SMa0357 SMa0359     TRUE 0.559 9.000 0.000 NA   NA
 121512 121513 SMa0359 SMa0360     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121514 121515 SMa0364 SMa0367     FALSE 0.202 46.000 0.000 NA   NA
 121515 121516 SMa0367 SMa0369     FALSE 0.077 98.000 0.000 NA   NA
 121519 121520 SMa0374 SMa0376     FALSE 0.076 318.000 0.100 1.000 N NA
 121520 5451270 SMa0376 SMa5018     TRUE 0.754 65.000 0.300 NA   NA
 5451270 121521 SMa5018 SMa0380     TRUE 0.965 0.000 0.164 NA   NA
 121521 5451271 SMa0380 SMa5019     FALSE 0.458 161.000 0.344 NA   NA
 5451271 121522 SMa5019 SMa0383     TRUE 0.988 -3.000 0.483 NA   NA
 121523 121524 SMa0384 SMa0387   hisC3 FALSE 0.037 232.000 0.000 1.000 N NA
 121525 121526 SMa0389 SMa0391     FALSE 0.020 306.000 0.000 1.000 N NA
 121526 121527 SMa0391 SMa0392     TRUE 0.919 34.000 0.000 0.076 Y NA
 121527 121528 SMa0392 SMa0394     TRUE 0.965 65.000 0.385 0.076 Y NA
 121528 121529 SMa0394 SMa0396     TRUE 0.997 -3.000 0.300 0.076 Y NA
 121529 121530 SMa0396 SMa0398   hisD2 TRUE 0.982 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 121530 121531 SMa0398 SMa0400 hisD2   TRUE 0.992 4.000 0.038 0.015 Y NA
 121531 121532 SMa0400 SMa0402     TRUE 0.533 63.000 0.057 1.000 N NA
 121532 121533 SMa0402 SMa0403     TRUE 0.774 -52.000 0.038 NA   NA
 121533 121534 SMa0403 SMa0404     TRUE 0.694 2.000 0.000 NA   NA
 121534 121535 SMa0404 SMa0405     FALSE 0.011 353.000 0.000 1.000   NA
 121535 121536 SMa0405 SMa0407     FALSE 0.007 353.000 0.000 NA   NA
 121539 121540 SMa0414 SMa0417     TRUE 0.766 61.000 0.000 0.002   NA
 121540 5451272 SMa0417 SMa5020     FALSE 0.261 32.000 0.000 NA   NA
 5451272 121541 SMa5020 SMa0421     TRUE 0.535 -12.000 0.000 NA   NA
 121541 5451273 SMa0421 SMa5021     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121542 121543 SMa0424 SMa0426     TRUE 0.991 -3.000 0.571 1.000   NA
 121543 121544 SMa0426 SMa0429     FALSE 0.016 294.000 0.000 1.000   NA
 121544 121545 SMa0429 SMa0431     TRUE 0.590 -7.000 0.000 NA   NA
 5451274 5451275 SMa5022 SMa5023     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121550 121551 SMa0444 SMa0445     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.053 Y NA
 121554 121556 SMa0450 SMa0453     FALSE 0.002 1883.000 0.000 NA   NA
 121556 121558 SMa0453 SMa0461     FALSE 0.002 1554.000 0.000 NA   NA
 121559 121560 SMa0462 SMa0464     FALSE 0.032 215.000 0.000 1.000   NA
 121561 121562 SMa0466 SMa0467     FALSE 0.364 238.000 0.000 0.075 Y NA
 121562 121563 SMa0467 SMa0469     TRUE 0.987 42.000 0.667 0.098 Y NA
 121563 121564 SMa0469 SMa0470     TRUE 0.665 9.000 0.000 1.000   NA
 121564 121565 SMa0470 SMa0471     FALSE 0.003 663.000 0.000 NA   NA
 121565 121566 SMa0471 SMa0473     TRUE 0.960 -3.000 0.139 NA   NA
 121566 121567 SMa0473 SMa0475     FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 121567 121568 SMa0475 SMa0476     FALSE 0.096 85.000 0.000 NA   NA
 121572 121573 SMa0483 SMa0485   thrC2 FALSE 0.313 53.000 0.000 1.000 N NA
 121573 121574 SMa0485 SMa0486 thrC2   TRUE 0.674 65.000 0.000 1.000 Y NA
 121574 121575 SMa0486 SMa0489     FALSE 0.357 148.000 0.000 1.000 Y NA
 121575 121576 SMa0489 SMa0492     TRUE 0.929 12.000 0.000 1.000 Y NA
 121576 121577 SMa0492 SMa0493     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.009 Y NA
 121577 121578 SMa0493 SMa0495     TRUE 0.893 40.000 0.000 0.100 Y NA
 121581 121582 SMa0499 SMa0501     FALSE 0.295 43.000 0.000 1.000   NA
 121582 121583 SMa0501 SMa0503     TRUE 0.991 2.000 0.000 0.009 Y NA
 121583 121584 SMa0503 SMa0506     TRUE 0.865 58.000 0.000 0.075 Y NA
 121584 121585 SMa0506 SMa0508     TRUE 0.749 50.000 0.000 1.000 Y NA
 121585 121586 SMa0508 SMa0510     FALSE 0.230 73.000 0.000 1.000 N NA
 121586 121587 SMa0510 SMa0512   idnD TRUE 0.963 11.000 0.300 1.000 N NA
 121587 121588 SMa0512 SMa0513 idnD idnO1 TRUE 0.780 70.000 0.308 1.000 N NA
 121588 121589 SMa0513 SMa0514 idnO1 idnK TRUE 0.982 2.000 0.308 1.000 N NA
 121589 121590 SMa0514 SMa0516 idnK   TRUE 0.979 -3.000 0.222 1.000 N NA
 121590 121591 SMa0516 SMa0518     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 121591 121592 SMa0518 SMa0520     FALSE 0.007 359.000 0.000 NA   NA
 121592 121593 SMa0520 SMa0522     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA N NA
 121593 121594 SMa0522 SMa0523     FALSE 0.499 -19.000 0.000 NA   NA
 121594 121595 SMa0523 SMa0525     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121595 121596 SMa0525 SMa0526     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.075 N NA
 121596 121597 SMa0526 SMa0527     TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5451277 121598 SMa5025 SMa0535     FALSE 0.253 52.000 0.000 1.000   NA
 121599 121600 SMa0537 SMa0538     TRUE 0.629 5.000 0.000 NA   NA
 121600 121601 SMa0538 SMa0541     FALSE 0.003 1130.000 0.000 NA   NA
 121601 121602 SMa0541 SMa0543     FALSE 0.044 139.000 0.000 NA   NA
 121603 121604 SMa0545 SMa0548     TRUE 0.718 0.000 0.000 NA   NA
 121605 121606 SMa0551 SMa0552     TRUE 0.608 93.000 0.000 0.005   NA
 121606 121607 SMa0552 SMa0554     FALSE 0.491 -22.000 0.000 NA   NA
 121609 121610 SMa0558 SMa0559     FALSE 0.227 58.000 0.000 1.000   NA
 121610 121611 SMa0559 SMa0561     FALSE 0.042 144.000 0.000 NA   NA
 121611 121612 SMa0561 SMa0563     TRUE 0.904 11.000 0.125 NA   NA
 121612 121613 SMa0563 SMa0564     FALSE 0.250 66.000 0.000 1.000 N NA
 121613 5451278 SMa0564 SMa5026     FALSE 0.145 84.000 0.000 1.000   NA
 5451278 121615 SMa5026 SMa0567     FALSE 0.059 154.000 0.000 1.000   NA
 121619 121620 SMa0575 SMa0576     FALSE 0.128 69.000 0.000 NA   NA
 121620 121621 SMa0576 SMa0579   cyaN FALSE 0.059 191.000 0.000 1.000 N NA
 121623 121624 SMa0581 SMa0583     TRUE 0.995 14.000 0.323 0.000 Y NA
 121624 121625 SMa0583 SMa0585     TRUE 0.971 63.000 0.915 NA Y NA
 121626 121627 SMa0590 SMa0591     FALSE 0.283 29.000 0.000 NA   NA
 121627 121628 SMa0591 SMa0592     FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 121628 121629 SMa0592 SMa0594     FALSE 0.487 -24.000 0.000 NA   NA
 121631 121632 SMa0599 SMa0601     FALSE 0.042 144.000 0.000 NA   NA
 121633 121634 SMa0604 SMa0606     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121634 121635 SMa0606 SMa0607     FALSE 0.174 53.000 0.000 NA   NA
 121635 121636 SMa0607 SMa0609     FALSE 0.158 58.000 0.000 NA   NA
 121636 121637 SMa0609 SMa0610     TRUE 0.608 6.000 0.000 NA   NA
 121637 121638 SMa0610 SMa0612   fixN3 FALSE 0.010 305.000 0.000 NA   NA
 121638 121639 SMa0612 SMa0615 fixN3 fixO3 TRUE 0.993 5.000 0.297 0.005 N NA
 121639 121640 SMa0615 SMa0616 fixO3 fixQ3 TRUE 0.981 23.000 0.393 0.005 N NA
 121640 121641 SMa0616 SMa0617 fixQ3 fixP3 TRUE 0.992 -9.000 0.357 0.005 N NA
 121641 121642 SMa0617 SMa0620 fixP3   FALSE 0.120 219.000 0.087 NA   NA
 121642 121643 SMa0620 SMa0621   fixI2 TRUE 0.864 3.000 0.020 NA   NA
 121643 121644 SMa0621 SMa0622 fixI2 fixS2 TRUE 0.997 -3.000 0.713 NA Y NA
 121644 121645 SMa0622 SMa0625 fixS2   FALSE 0.005 432.000 0.000 NA   NA
 121645 121646 SMa0625 SMa0626     FALSE 0.004 523.000 0.000 NA   NA
 121646 121647 SMa0626 SMa0627   aqpZ2 FALSE 0.071 387.000 0.000 0.048   NA
 121648 121649 SMa0629 SMa0630     FALSE 0.316 24.000 0.000 NA   NA
 121649 121650 SMa0630 SMa0631     FALSE 0.461 -52.000 0.000 NA   NA
 121650 121651 SMa0631 SMa0633     FALSE 0.032 179.000 0.000 NA   NA
 121652 121653 SMa0636 SMa0637     FALSE 0.005 440.000 0.000 NA   NA
 121653 121654 SMa0637 SMa0638     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121654 121655 SMa0638 SMa0639     FALSE 0.006 405.000 0.000 NA   NA
 121655 121656 SMa0639 SMa0640     FALSE 0.087 91.000 0.000 NA   NA
 121656 121657 SMa0640 SMa0643     FALSE 0.003 853.000 0.000 NA   NA
 121657 121658 SMa0643 SMa0645     FALSE 0.385 17.000 0.000 NA   NA
 121658 121659 SMa0645 SMa0647     FALSE 0.057 118.000 0.000 NA   NA
 121659 121660 SMa0647 SMa0649     FALSE 0.499 -19.000 0.000 NA   NA
 5451279 121662 SMa5027 SMa0656     FALSE 0.006 397.000 0.000 NA   NA
 121663 121664 SMa0657 SMa0659     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 121664 121665 SMa0659 SMa0661     FALSE 0.007 367.000 0.000 NA   NA
 121666 121667 SMa0662 SMa0663     FALSE 0.060 115.000 0.000 NA   NA
 121670 121671 SMa0667 SMa0669     TRUE 0.994 4.000 1.000 1.000   NA
 121671 121672 SMa0669 SMa0670     FALSE 0.096 110.000 0.000 1.000   NA
 121672 121673 SMa0670 SMa0673     FALSE 0.006 597.000 0.000 1.000   NA
 121674 121675 SMa0674 SMa0675     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121675 121676 SMa0675 SMa0677     FALSE 0.104 205.000 0.024 1.000 N NA
 121676 121677 SMa0677 SMa0678     TRUE 0.972 30.000 0.444 1.000 Y NA
 121677 121678 SMa0678 SMa0680     TRUE 0.973 28.000 0.429 1.000 Y NA
 121678 121679 SMa0680 SMa0682     TRUE 0.995 2.000 0.024 0.001 Y NA
 121679 121680 SMa0682 SMa0683     FALSE 0.049 206.000 0.000 1.000 N NA
 121680 121681 SMa0683 SMa0684     FALSE 0.286 146.000 0.000 0.097 N NA
 121681 121682 SMa0684 SMa0687     FALSE 0.004 514.000 0.000 NA   NA
 121682 121683 SMa0687 SMa0689     FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 121683 121684 SMa0689 SMa0690     TRUE 0.931 21.000 0.400 NA   NA
 121685 121686 SMa0693 SMa0695 arcA1 arcB TRUE 0.869 36.000 0.033 1.000 Y NA
 121686 121687 SMa0695 SMa0697 arcB arcC TRUE 0.995 3.000 0.483 1.000 Y NA
 121687 121688 SMa0697 SMa0699 arcC   FALSE 0.020 219.000 0.000 NA   NA
 121688 121689 SMa0699 SMa0702     FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 121691 121692 SMa0707 SMa0708     TRUE 0.997 -3.000 0.250 0.077 Y NA
 121692 121693 SMa0708 SMa0709     TRUE 0.847 33.000 0.200 1.000 N NA
 121693 121694 SMa0709 SMa0710     TRUE 0.998 -25.000 1.000 0.075 Y NA
 121694 121695 SMa0710 SMa0711     TRUE 0.998 12.000 1.000 0.075 Y NA
 121695 121696 SMa0711 SMa0713     TRUE 0.780 2.000 0.000 1.000   NA
 121696 121697 SMa0713 SMa0714     TRUE 0.957 -3.000 0.000 0.087   NA
 121697 121698 SMa0714 SMa0715     TRUE 0.780 2.000 0.000 1.000   NA
 121698 121699 SMa0715 SMa0717     TRUE 0.988 -21.000 0.400 1.000 Y NA
 121699 121700 SMa0717 SMa0719     TRUE 0.733 58.000 0.182 1.000 N NA
 121700 121701 SMa0719 SMa0722     FALSE 0.114 99.000 0.000 1.000   NA
 121701 121702 SMa0722 SMa0723     FALSE 0.230 38.000 0.000 NA   NA
 121702 121704 SMa0723 SMa0726     FALSE 0.004 590.000 0.000 NA   NA
 121704 121705 SMa0726 SMa0728     FALSE 0.005 422.000 0.000 NA   NA
 121705 121706 SMa0728 SMa0731     FALSE 0.275 341.000 0.667 NA   NA
 121706 121707 SMa0731 SMa0734     FALSE 0.026 196.000 0.000 NA   NA
 121707 121708 SMa0734 SMa0736     FALSE 0.417 15.000 0.000 NA   NA
 121709 121710 SMa0738 SMa0739 cspA6   FALSE 0.074 101.000 0.000 NA   NA
 121712 121713 SMa0742 SMa0744   groEL2 FALSE 0.005 420.000 0.000 NA   NA
 121713 121714 SMa0744 SMa0745 groEL2 groES2 TRUE 0.980 76.000 0.565 0.005 Y NA
 121715 121716 SMa0747 SMa0748     FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 5451280 121717 SMa5003 SMa0750     FALSE 0.182 71.000 0.000 1.000   NA
 121718 121719 SMa0751 SMa0752     TRUE 0.992 5.000 0.333 0.056 N NA
 121719 121720 SMa0752 SMa0753     FALSE 0.105 296.000 0.000 0.056   NA
 121720 121721 SMa0753 SMa0754     FALSE 0.011 284.000 0.000 NA   NA
 121721 121722 SMa0754 SMa0757   nodD2 FALSE 0.003 1148.000 0.000 NA   NA
 121722 121723 SMa0757 SMa0758 nodD2   FALSE 0.004 921.000 0.000 1.000   NA
 121723 121724 SMa0758 SMa0759     FALSE 0.028 231.000 0.000 1.000   NA
 121724 121725 SMa0759 SMa0760   fixT2 FALSE 0.190 49.000 0.000 NA   NA
 121725 121726 SMa0760 SMa0762 fixT2 fixK2 FALSE 0.105 80.000 0.000 NA   NA
 121726 121727 SMa0762 SMa0763 fixK2   TRUE 0.609 12.000 0.000 1.000   NA
 121727 121728 SMa0763 SMa0765   fixN2 FALSE 0.108 103.000 0.000 1.000   NA
 121728 121729 SMa0765 SMa0766 fixN2 fixO2 TRUE 0.949 12.000 0.000 0.005 N NA
 121729 121730 SMa0766 SMa0767 fixO2 fixQ2 TRUE 0.986 12.000 0.229 0.005 N NA
 121730 121731 SMa0767 SMa0769 fixQ2 fixP2 TRUE 0.993 4.000 0.232 0.005 N NA
 121731 121732 SMa0769 SMa0771 fixP2   FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 121732 121733 SMa0771 SMa0772   nodL FALSE 0.072 103.000 0.000 NA   NA
 121733 121734 SMa0772 SMa0773 nodL noeA FALSE 0.006 388.000 0.000 NA   NA
 121734 121735 SMa0773 SMa0774 noeA noeB TRUE 0.929 7.000 0.133 NA   NA
 121736 121737 SMa0775 SMa0776     FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 121737 121738 SMa0776 SMa0779     TRUE 0.995 13.000 1.000 NA Y NA
 5451281 121739 SMa5028 SMa0781     FALSE 0.031 181.000 0.000 NA   NA
 121739 121740 SMa0781 SMa0783     FALSE 0.325 23.000 0.000 NA   NA
 121740 121741 SMa0783 SMa0785     TRUE 0.936 -10.000 0.188 NA   NA
 121743 121745 SMa0789 SMa0791     FALSE 0.005 463.000 0.000 NA   NA
 121745 121746 SMa0791 SMa0792     TRUE 0.958 19.000 0.582 NA   NA
 121746 121747 SMa0792 SMa0793     TRUE 0.981 -3.000 0.273 1.000   NA
 121747 121748 SMa0793 SMa0794     TRUE 0.988 -3.000 0.452 1.000   NA
 121748 121749 SMa0794 SMa0796     TRUE 0.995 6.000 0.548 1.000 Y NA
 121749 121750 SMa0796 SMa0797     TRUE 0.971 6.000 0.333 NA   NA
 121750 121751 SMa0797 SMa0799     TRUE 0.741 38.000 0.143 NA   NA
 121751 121752 SMa0799 SMa0800     TRUE 0.861 93.000 0.087 0.075 Y NA
 121752 121753 SMa0800 SMa0802     TRUE 0.999 2.000 0.852 0.075 Y NA
 121753 121754 SMa0802 SMa0803     TRUE 0.999 -3.000 0.815 0.075 Y NA
 121754 121755 SMa0803 SMa0805   gabD4 FALSE 0.195 82.000 0.000 1.000 N NA
 121755 121756 SMa0805 SMa0806 gabD4   FALSE 0.011 360.000 0.000 1.000   NA
 121756 121757 SMa0806 SMa0809     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 121758 121759 SMa0810 SMa0811 fixU fdxN FALSE 0.126 188.000 0.038 1.000   NA
 121759 121760 SMa0811 SMa0814 fdxN nifB TRUE 0.735 31.000 0.087 1.000   NA
 121760 121761 SMa0814 SMa0815 nifB nifA FALSE 0.433 217.000 0.071 0.002   NA
 121761 121762 SMa0815 SMa0816 nifA fixX FALSE 0.107 220.000 0.039 1.000 N NA
 121762 121763 SMa0816 SMa0817 fixX fixC TRUE 0.988 13.000 0.461 1.000 Y NA
 121763 121764 SMa0817 SMa0819 fixC fixB TRUE 0.990 12.000 0.491 1.000 Y NA
 121764 121765 SMa0819 SMa0822 fixB fixA TRUE 0.986 32.000 0.330 0.015 Y NA
 121766 121767 SMa0824 SMa0825   nifH FALSE 0.028 231.000 0.000 1.000   NA
 121767 121768 SMa0825 SMa0827 nifH nifD TRUE 0.736 100.000 0.033 0.001 N NA
 121768 121769 SMa0827 SMa0829 nifD nifK TRUE 0.987 91.000 0.902 0.001 Y NA
 121769 121770 SMa0829 SMa0830 nifK nifE TRUE 0.984 54.000 0.380 0.001 Y NA
 121770 121771 SMa0830 SMa0831 nifE nifX FALSE 0.143 496.000 0.070 0.001   NA
 121771 121772 SMa0831 SMa0833 nifX   FALSE 0.013 543.000 0.025 NA   NA
 121772 121773 SMa0833 SMa0834   fdxB TRUE 0.977 -3.000 0.253 NA   NA
 121773 5451282 SMa0834 SMa5036 fdxB   FALSE 0.480 -28.000 0.000 NA   NA
 5451282 121774 SMa5036 SMa0835   orf10.5 FALSE 0.045 138.000 0.000 NA   NA
 121774 121775 SMa0835 SMa0838 orf10.5 syrA FALSE 0.040 151.000 0.000 NA   NA
 121777 5451283 SMa0841 SMa5004     TRUE 0.559 9.000 0.000 NA   NA
 5451283 5451284 SMa5004 SMa5029     FALSE 0.136 65.000 0.000 NA   NA
 5451284 121778 SMa5029 SMa0846     FALSE 0.342 21.000 0.000 NA   NA
 121778 121779 SMa0846 SMa0848     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 121779 121780 SMa0848 SMa0849   syrM FALSE 0.158 58.000 0.000 NA   NA
 121781 121782 SMa0850 SMa0851   nodH FALSE 0.047 134.000 0.000 NA   NA
 121783 121784 SMa0852 SMa0853 nodF nodE TRUE 0.994 1.000 0.800 1.000   NA
 121784 121785 SMa0853 SMa0854 nodE nodG FALSE 0.054 494.000 0.000 1.000 Y NA
 121785 121786 SMa0854 SMa0855 nodG nodP1 FALSE 0.012 412.000 0.000 1.000 N NA
 121786 121787 SMa0855 SMa0857 nodP1 nodQ1 TRUE 0.992 0.000 0.096 0.001 N NA
 121787 121788 SMa0857 SMa0861 nodQ1   FALSE 0.010 371.000 0.000 NA N NA
 121789 121790 SMa0863 SMa0864 nodJ nodI TRUE 0.999 4.000 0.643 0.001 Y NA
 121790 121791 SMa0864 SMa0866 nodI nodC TRUE 0.927 8.000 0.096 1.000 N NA
 121791 121792 SMa0866 SMa0868 nodC nodB TRUE 0.886 15.000 0.120 1.000 N NA
 121792 121793 SMa0868 SMa0869 nodB nodA TRUE 0.953 -3.000 0.091 1.000   NA
 121794 121795 SMa0870 SMa0872 nodD1 orf 110 FALSE 0.003 688.000 0.000 NA   NA
 121795 121796 SMa0872 SMa0873 orf 110 nifN TRUE 0.718 0.000 0.000 NA   NA
 121797 121798 SMa0874 SMa0875 nodN nolG TRUE 0.691 7.000 0.000 NA N NA
 121798 121799 SMa0875 SMa0876 nolG nolF TRUE 0.992 4.000 0.824 NA N NA
 121799 121800 SMa0876 SMa0878 nolF nodM TRUE 0.710 58.000 0.000 1.000 Y NA
 121800 121801 SMa0878 SMa0882 nodM   FALSE 0.003 674.000 0.000 NA   NA
 121803 5451285 SMa0886 SMa5005     TRUE 0.941 -396.000 0.015 0.009   NA
 121804 121805 SMa0887 SMa0888     FALSE 0.145 62.000 0.000 NA   NA
 121805 121806 SMa0888 SMa0890     TRUE 0.790 -46.000 0.042 NA   NA
 121806 121807 SMa0890 SMa0892   dnaE3 TRUE 0.995 0.000 0.028 0.004 Y NA
 121807 121808 SMa0892 SMa0894 dnaE3   FALSE 0.058 117.000 0.000 NA   NA
 121808 121809 SMa0894 SMa0896     FALSE 0.035 167.000 0.000 NA   NA
 121809 121810 SMa0896 SMa0900     FALSE 0.004 591.000 0.000 NA   NA
 121810 121811 SMa0900 SMa0903     FALSE 0.042 146.000 0.000 NA   NA
 121811 121812 SMa0903 SMa0905     FALSE 0.088 90.000 0.000 NA   NA
 121814 121815 SMa0909 SMa0911     TRUE 0.608 6.000 0.000 NA   NA
 121815 121816 SMa0911 SMa0914     FALSE 0.008 328.000 0.000 NA   NA
 121816 121817 SMa0914 SMa0917     FALSE 0.045 137.000 0.000 NA   NA
 121817 5451286 SMa0917 SMa5006     FALSE 0.004 567.000 0.000 NA   NA
 5451286 121819 SMa5006 SMa0922     FALSE 0.003 620.000 0.000 NA   NA
 121820 121821 SMa0929 SMa0930 traG traD TRUE 0.969 -9.000 0.333 1.000   NA
 121821 121822 SMa0930 SMa0933 traD traC TRUE 0.550 -10.000 0.000 NA   NA
 121825 121826 SMa0939 SMa0940     TRUE 0.957 5.000 0.000 1.000 Y NA
 121826 121827 SMa0940 SMa0941     TRUE 0.729 121.000 0.000 0.013 Y NA
 121827 121828 SMa0941 SMa0943     FALSE 0.037 232.000 0.000 1.000 N NA
 121828 121829 SMa0943 SMa0945     TRUE 0.852 63.000 0.500 NA   NA
 121829 121830 SMa0945 SMa0947     FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 121831 121832 SMa0950 SMa0951     TRUE 0.986 31.000 0.429 0.074 Y NA
 121832 121833 SMa0951 SMa0952     TRUE 0.998 -10.000 0.875 0.074 Y NA
 121833 121834 SMa0952 SMa0953     TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 121835 121836 SMa0955 SMa0956 atrA atrB TRUE 0.553 108.000 0.214 1.000 N NA
 121836 121837 SMa0956 SMa0958 atrB atrC TRUE 0.992 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 121837 121838 SMa0958 SMa0959 atrC   TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 N NA
 121838 121839 SMa0959 SMa0961     TRUE 0.964 21.000 0.600 1.000 N NA
 121840 121841 SMa0964 SMa0967     FALSE 0.040 149.000 0.000 NA   NA
 121842 121843 SMa0969 SMa0972     FALSE 0.064 183.000 0.000 1.000 N NA
 121843 121844 SMa0972 SMa0974     FALSE 0.167 55.000 0.000 NA   NA
 121845 121846 SMa0976 SMa0977     FALSE 0.248 327.000 0.000 0.052 Y NA
 121846 121847 SMa0977 SMa0981   ntrR2 FALSE 0.004 521.000 0.000 NA   NA
 121847 121848 SMa0981 SMa0983 ntrR2   FALSE 0.040 149.000 0.000 NA   NA
 121848 121849 SMa0983 SMa0985     FALSE 0.055 121.000 0.000 NA   NA
 121849 121850 SMa0985 SMa0988     FALSE 0.295 27.000 0.000 NA   NA
 121851 121852 SMa0990 SMa0992     FALSE 0.130 68.000 0.000 NA   NA
 5451287 121854 SMa5007 SMa0995     FALSE 0.009 525.000 0.000 1.000 N NA
 121855 121856 SMa0997 SMa0998     TRUE 0.871 24.000 0.000 0.013   NA
 121856 121857 SMa0998 SMa1001     FALSE 0.011 349.000 0.000 1.000   NA
 121857 121858 SMa1001 SMa1002     FALSE 0.038 155.000 0.000 NA   NA
 121860 121861 SMa1005 SMa1007     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 121865 121866 SMa1011 SMa1013   actP FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 121866 121867 SMa1013 SMa1014 actP hmrR TRUE 0.971 86.000 1.000 0.004 N NA
 121869 121870 SMa1017 SMa1018     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121871 121872 SMa1021 SMa1024     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 121872 121874 SMa1024 SMa1028     FALSE 0.005 449.000 0.000 NA   NA
 121874 121875 SMa1028 SMa1029     FALSE 0.056 119.000 0.000 NA   NA
 121875 121876 SMa1029 SMa1030     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.052 Y NA
 121876 121877 SMa1030 SMa1032     FALSE 0.091 88.000 0.000 NA   NA
 121878 121879 SMa1033 SMa1036     TRUE 0.945 53.000 1.000 NA   NA
 121879 121880 SMa1036 SMa1037     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 121880 121881 SMa1037 SMa1038     TRUE 0.986 15.000 1.000 1.000 N NA
 121881 121882 SMa1038 SMa1041     TRUE 0.965 7.000 0.000 0.004 N NA
 121882 121883 SMa1041 SMa1043     FALSE 0.350 20.000 0.000 NA   NA
 121883 121884 SMa1043 SMa1045     FALSE 0.084 93.000 0.000 NA   NA
 121884 121885 SMa1045 SMa1046     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121886 121887 SMa1050 SMa1052     TRUE 0.954 -3.000 0.115 NA   NA
 121887 121888 SMa1052 SMa1053     TRUE 0.940 -3.000 0.077 NA   NA
 121888 121889 SMa1053 SMa1056     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121889 121890 SMa1056 SMa1057     TRUE 0.991 -9.000 1.000 1.000   NA
 121892 121893 SMa1060 SMa1062     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121893 121894 SMa1062 SMa1063     FALSE 0.454 -64.000 0.000 NA   NA
 121894 121895 SMa1063 SMa1065     FALSE 0.178 52.000 0.000 NA   NA
 121896 121897 SMa1067 SMa1070     FALSE 0.005 787.000 0.000 NA N NA
 121897 121898 SMa1070 SMa1073     TRUE 0.923 -30.000 0.000 1.000 Y NA
 121900 121901 SMa1077 SMa1078 nex18   TRUE 0.620 30.000 0.042 NA   NA
 121901 121902 SMa1078 SMa1079   tspO TRUE 0.866 6.000 0.040 NA   NA
 121902 121903 SMa1079 SMa1081 tspO   TRUE 0.630 22.000 0.027 NA   NA
 121904 121905 SMa1082 SMa1084     FALSE 0.081 95.000 0.000 NA   NA
 121905 121906 SMa1084 SMa1086     FALSE 0.262 180.000 0.000 0.076 N NA
 121907 121908 SMa1087 SMa1089     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121908 121909 SMa1089 SMa1091     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121911 121912 SMa1093 SMa1095     FALSE 0.029 188.000 0.000 NA   NA
 121912 121913 SMa1095 SMa1096     FALSE 0.211 43.000 0.000 NA   NA
 121915 121916 SMa1099 SMa1100 cycB1   FALSE 0.010 371.000 0.000 1.000   NA
 121916 121917 SMa1100 SMa1101     TRUE 0.550 -10.000 0.000 NA   NA
 121917 121918 SMa1101 SMa1103     FALSE 0.491 -22.000 0.000 NA   NA
 121922 121923 SMa1115 SMa1118   hspC2 FALSE 0.005 793.000 0.000 NA N NA
 121923 121924 SMa1118 SMa1120 hspC2   FALSE 0.230 57.000 0.000 NA N NA
 121924 121925 SMa1120 SMa1122     TRUE 0.996 7.000 0.849 1.000 Y NA
 121925 121926 SMa1122 SMa1124     TRUE 0.996 4.000 0.819 0.096 N NA
 121927 121928 SMa1126 SMa1128   degP4 TRUE 0.731 54.000 0.000 0.018   NA
 121928 121929 SMa1128 SMa1131 degP4   FALSE 0.056 195.000 0.000 1.000 N NA
 121930 121931 SMa1132 SMa1134     FALSE 0.194 48.000 0.000 NA   NA
 121931 121932 SMa1134 SMa1136     FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 121933 121934 SMa1138 SMa1139     TRUE 0.958 -6.000 0.000 0.013   NA
 121935 121936 SMa1141 SMa1142     TRUE 0.987 0.000 0.000 0.091 Y NA
 121936 121937 SMa1142 SMa1146     FALSE 0.312 140.000 0.000 0.086 N NA
 121937 121938 SMa1146 SMa1147     FALSE 0.211 78.000 0.000 1.000 N NA
 121938 121939 SMa1147 SMa1149     TRUE 0.729 138.000 0.000 0.002 Y NA
 121941 121942 SMa1153 SMa1154     FALSE 0.084 93.000 0.000 NA   NA
 121942 121943 SMa1154 SMa1155     FALSE 0.114 76.000 0.000 NA   NA
 121944 121945 SMa1156 SMa1158     FALSE 0.128 110.000 0.000 1.000 N NA
 121945 121946 SMa1158 SMa1159     FALSE 0.031 181.000 0.000 NA   NA
 121946 121947 SMa1159 SMa1160     FALSE 0.461 -52.000 0.000 NA   NA
 121947 121948 SMa1160 SMa1161     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121948 121949 SMa1161 SMa1162     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 121950 121951 SMa1163 SMa1166     FALSE 0.090 115.000 0.000 1.000   NA
 121951 121952 SMa1166 SMa1168     FALSE 0.253 52.000 0.000 1.000   NA
 121952 121953 SMa1168 SMa1169     FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 121953 121954 SMa1169 SMa1170   cycB2 FALSE 0.145 62.000 0.000 NA   NA
 121955 121956 SMa1171 SMa1172     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 121956 121957 SMa1172 SMa1174     FALSE 0.448 -79.000 0.000 NA   NA
 121957 121958 SMa1174 SMa1176     FALSE 0.006 562.000 0.000 1.000   NA
 121958 121959 SMa1176 SMa1178     FALSE 0.018 280.000 0.000 1.000   NA
 121960 121961 SMa1179 SMa1182 nosR nosZ TRUE 0.893 26.000 0.064 0.095 N NA
 121961 121962 SMa1182 SMa1183 nosZ nosD TRUE 0.994 0.000 0.146 0.000 N NA
 121962 121963 SMa1183 SMa1184 nosD nosF TRUE 0.996 -3.000 0.963 1.000 N NA
 121963 121964 SMa1184 SMa1185 nosF nosY TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 121964 121965 SMa1185 SMa1186 nosY nosL TRUE 0.989 -3.000 0.519 NA   NA
 121965 121966 SMa1186 SMa1188 nosL nosX TRUE 0.980 -7.000 0.464 NA N NA
 121966 121967 SMa1188 SMa1191 nosX   FALSE 0.054 198.000 0.000 1.000 N NA
 121968 121969 SMa1192 SMa1194     FALSE 0.190 49.000 0.000 NA   NA
 121969 121970 SMa1194 SMa1195     TRUE 0.857 16.000 0.111 NA N NA
 121970 121971 SMa1195 SMa1197     FALSE 0.032 176.000 0.000 NA   NA
 121971 121972 SMa1197 SMa1198     FALSE 0.171 54.000 0.000 NA   NA
 121972 121973 SMa1198 SMa1200     FALSE 0.488 65.000 0.077 NA   NA
 121973 121974 SMa1200 SMa1201     FALSE 0.020 219.000 0.000 NA   NA
 121974 121975 SMa1201 SMa1207     FALSE 0.017 237.000 0.000 NA   NA
 121975 121976 SMa1207 SMa1208   fixS1 FALSE 0.173 74.000 0.000 NA N NA
 121976 121977 SMa1208 SMa1209 fixS1 fixI1 TRUE 0.997 -3.000 0.713 NA Y NA
 121977 121978 SMa1209 SMa1210 fixI1 fixH TRUE 0.991 -3.000 0.206 NA Y NA
 121978 121979 SMa1210 SMa1211 fixH fixG TRUE 0.990 -3.000 0.506 NA N NA
 121979 121980 SMa1211 SMa1213 fixG fixP1 TRUE 0.721 229.000 0.203 0.015 Y NA
 121980 121981 SMa1213 SMa1214 fixP1 fixQ1 TRUE 0.973 4.000 0.000 0.004 N NA
 121981 121982 SMa1214 SMa1216 fixQ1 fixO1 TRUE 0.945 13.000 0.000 0.004 N NA
 121982 121983 SMa1216 SMa1220 fixO1 fixN1 TRUE 0.939 14.000 0.000 0.004 N NA
 121983 121984 SMa1220 SMa1223 fixN1   FALSE 0.014 315.000 0.000 1.000   NA
 121984 121985 SMa1223 SMa1225   fixK1 FALSE 0.152 81.000 0.000 1.000   NA
 121985 121986 SMa1225 SMa1226 fixK1 fixT1 FALSE 0.105 80.000 0.000 NA   NA
 121986 121987 SMa1226 SMa1227 fixT1 fixJ FALSE 0.076 99.000 0.000 NA   NA
 121987 121988 SMa1227 SMa1229 fixJ fixL TRUE 0.993 -7.000 0.125 0.016 Y NA
 121990 121991 SMa1232 SMa1233 napC napB TRUE 0.995 4.000 0.490 1.000 Y NA
 121991 121992 SMa1233 SMa1236 napB napA TRUE 0.998 -30.000 0.643 0.001 Y NA
 121992 121993 SMa1236 SMa1239 napA napD TRUE 0.925 -25.000 0.182 NA N NA
 121993 121994 SMa1239 SMa1240 napD napF TRUE 0.928 -7.000 0.133 NA   NA
 121994 121995 SMa1240 SMa1241 napF napE TRUE 0.899 8.000 0.087 NA   NA
 121995 121996 SMa1241 SMa1243 napE azu1 FALSE 0.135 260.000 0.000 NA Y NA
 121996 121997 SMa1243 SMa1245 azu1   TRUE 0.603 111.000 0.286 1.000 N NA
 121997 121998 SMa1245 SMa1247   nirV FALSE 0.057 625.000 0.280 NA   NA
 121998 121999 SMa1247 SMa1250 nirV nirK FALSE 0.376 99.000 0.100 NA   NA
 122000 122002 SMa1252 SMa1253     FALSE 0.061 114.000 0.000 NA   NA
 122003 122004 SMa1255 SMa1256     TRUE 0.828 -13.000 0.043 NA   NA
 122004 122005 SMa1256 SMa1259     TRUE 0.972 4.000 0.286 NA   NA
 122005 122006 SMa1259 SMa1261     TRUE 0.707 46.000 0.143 NA   NA
 122010 122011 SMa1269 SMa1272 norD norQ TRUE 0.997 5.000 0.590 0.001   NA
 122011 122012 SMa1272 SMa1273 norQ norB TRUE 0.966 60.000 0.529 0.001   NA
 122012 122013 SMa1273 SMa1276 norB norC TRUE 0.991 25.000 0.794 0.001   NA
 122013 122014 SMa1276 SMa1279 norC norE FALSE 0.054 459.000 0.000 0.054   NA
 122016 122017 SMa1285 SMa1288     TRUE 0.982 -3.000 0.051 NA Y NA
 122018 122019 SMa1289 SMa1291     TRUE 0.737 -9.000 0.000 1.000 N NA
 122019 122020 SMa1291 SMa1292     TRUE 0.988 7.000 0.000 0.002 Y NA
 122020 122021 SMa1292 SMa1294     TRUE 0.921 -3.000 0.046 NA   NA
 122022 122023 SMa1296 SMa1297 adhA1   FALSE 0.015 248.000 0.000 NA   NA
 122025 122026 SMa1299 SMa1301     TRUE 0.934 35.000 0.522 1.000 N NA
 122027 122028 SMa1302 SMa1303 virB11 virB10 TRUE 0.993 11.000 0.600 1.000 Y NA
 122028 122029 SMa1303 SMa1306 virB10 virB9 TRUE 0.995 10.000 0.800 NA Y NA
 122029 122030 SMa1306 SMa1308 virB9 virB8 TRUE 0.998 0.000 1.000 NA Y NA
 122030 122031 SMa1308 SMa1310 virB8 virB7 TRUE 0.983 5.000 0.500 NA   NA
 122031 122032 SMa1310 SMa1311 virB7 virB6 TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 122032 122033 SMa1311 SMa1313 virB6 virB5 FALSE 0.018 230.000 0.000 NA   NA
 122033 122034 SMa1313 SMa1315 virB5 virB4 TRUE 0.986 0.000 0.429 NA   NA
 122034 122035 SMa1315 SMa1318 virB4 virB3 TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA Y NA
 122035 122036 SMa1318 SMa1319 virB3 virB2 TRUE 0.997 5.000 1.000 NA Y NA
 122036 122037 SMa1319 SMa1321 virB2 virB1 TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 122037 122038 SMa1321 SMa1322 virB1   TRUE 0.655 4.000 0.000 NA   NA
 122040 122041 SMa1325 SMa1326     FALSE 0.119 74.000 0.000 NA   NA
 122041 122042 SMa1326 SMa1327     FALSE 0.263 50.000 0.000 1.000   NA
 122042 122043 SMa1327 SMa1328     FALSE 0.005 598.000 0.000 1.000   NA
 122043 122044 SMa1328 SMa1329     FALSE 0.008 589.000 0.000 1.000 N NA
 122044 122045 SMa1329 SMa1331     TRUE 0.876 35.000 0.273 1.000 N NA
 122045 122046 SMa1331 SMa1332     TRUE 0.663 30.000 0.042 1.000   NA
 122046 122047 SMa1332 SMa1334     TRUE 0.828 12.000 0.053 NA   NA
 5451288 122049 SMa5030 SMa1337     FALSE 0.011 356.000 0.000 1.000   NA
 122049 122050 SMa1337 SMa1339     TRUE 0.942 143.000 0.750 0.073 Y NA
 122050 122051 SMa1339 SMa1341     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.073 Y NA
 122051 122052 SMa1341 SMa1344     TRUE 0.932 197.000 1.000 0.073 Y NA
 122052 122053 SMa1344 SMa1345     TRUE 0.999 0.000 0.600 0.005 Y NA
 122054 122055 SMa1347 SMa1349     TRUE 0.880 26.000 0.211 1.000 N NA
 122055 122056 SMa1349 SMa1351     TRUE 0.957 3.000 0.118 1.000 N NA
 122056 122057 SMa1351 SMa1353     TRUE 0.910 10.000 0.102 NA N NA
 122059 122060 SMa1355 SMa1356     FALSE 0.140 64.000 0.000 NA   NA
 122062 122063 SMa1361 SMa1362     FALSE 0.006 409.000 0.000 NA   NA
 122063 122064 SMa1362 SMa1363     TRUE 0.999 -3.000 0.825 0.073 Y NA
 122064 122065 SMa1363 SMa1364     TRUE 0.982 64.000 0.677 0.073 Y NA
 122065 5451289 SMa1364 SMa5008     FALSE 0.012 270.000 0.000 NA   NA
 5451289 122066 SMa5008 SMa1365     FALSE 0.027 193.000 0.000 NA   NA
 122066 122067 SMa1365 SMa1367     FALSE 0.058 155.000 0.000 1.000   NA
 122067 122068 SMa1367 SMa1368     TRUE 0.678 8.000 0.000 1.000   NA
 122068 122069 SMa1368 SMa1370     TRUE 0.799 0.000 0.000 1.000   NA
 122069 122070 SMa1370 SMa1371     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 122070 122071 SMa1371 SMa1374     TRUE 0.965 3.000 0.000 1.000 Y NA
 122071 122072 SMa1374 SMa1373     TRUE 0.987 0.000 0.000 0.095 Y NA
 122072 122073 SMa1373 SMa1375     TRUE 0.808 79.000 0.000 0.073 Y NA
 122073 122074 SMa1375 SMa1377     FALSE 0.452 30.000 0.000 1.000 N NA
 122074 122075 SMa1377 SMa1379     FALSE 0.071 169.000 0.000 1.000 N NA
 122075 122076 SMa1379 SMa1381     FALSE 0.148 101.000 0.000 1.000 N NA
 122076 5451290 SMa1381 SMa5031     TRUE 0.928 -13.000 0.000 0.054   NA
 5451290 122077 SMa5031 SMa1386     TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 122079 122080 SMa1389 SMa1391 etfA2 etfB2 TRUE 0.961 117.000 0.667 0.015 Y NA
 122080 122081 SMa1391 SMa1394 etfB2   FALSE 0.493 17.000 0.000 NA N NA
 122081 122082 SMa1394 SMa1397     TRUE 0.987 2.000 0.476 NA   NA
 122082 122083 SMa1397 SMa1398     TRUE 0.977 9.000 0.175 0.075   NA
 122083 122084 SMa1398 SMa1400     TRUE 0.997 -3.000 0.545 1.000 Y NA
 122086 122087 SMa1406 SMa1408 ttuD3   TRUE 0.657 13.000 0.000 1.000 N NA
 122087 122088 SMa1408 SMa1409     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.075 Y NA
 122090 122091 SMa1413 SMa1414     FALSE 0.039 228.000 0.000 1.000 N NA
 122091 122092 SMa1414 SMa1415     TRUE 0.982 0.000 0.267 1.000 N NA
 122092 122093 SMa1415 SMa1417     FALSE 0.342 163.000 0.000 0.042 N NA
 122093 122094 SMa1417 SMa1418     TRUE 0.547 19.000 0.000 1.000 N NA
 122094 122095 SMa1418 SMa1421     TRUE 0.998 8.000 0.778 0.016 Y NA
 122095 122096 SMa1421 SMa1424     TRUE 0.998 11.000 0.889 0.016 Y NA
 122096 122097 SMa1424 SMa1427     TRUE 0.962 75.000 0.889 NA Y NA
 122099 122100 SMa1430 SMa1431     FALSE 0.194 48.000 0.000 NA   NA
 122100 122101 SMa1431 SMa1434     FALSE 0.033 173.000 0.000 NA   NA
 122101 122102 SMa1434 SMa1435     TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000   NA
 122102 122103 SMa1435 SMa1437     TRUE 0.996 13.000 0.667 0.095 Y NA
 122103 122104 SMa1437 SMa1438     TRUE 0.985 78.000 1.000 0.073 Y NA
 122104 122105 SMa1438 SMa1440     TRUE 0.721 75.000 0.026 1.000 Y NA
 122105 122106 SMa1440 SMa1442     FALSE 0.460 61.000 0.026 1.000 N NA
 122108 122109 SMa1447 SMa1450     FALSE 0.010 489.000 0.000 1.000 N NA
 122109 122110 SMa1450 SMa1452     TRUE 0.982 25.000 0.575 1.000 Y NA
 122112 122113 SMa1455 SMa1456     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 122113 122114 SMa1456 SMa1459     FALSE 0.100 108.000 0.000 1.000   NA
 122114 122115 SMa1459 SMa1461     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.075 N NA
 122115 122116 SMa1461 SMa1462     FALSE 0.406 127.000 0.000 1.000 Y NA
 122116 122117 SMa1462 SMa1465     TRUE 0.968 24.000 0.403 0.097 N NA
 122117 122118 SMa1465 SMa1466     TRUE 0.998 -3.000 0.258 0.004 Y NA
 122118 122119 SMa1466 SMa1467     TRUE 0.999 -3.000 0.903 0.004 Y NA
 122119 122120 SMa1467 SMa1471     FALSE 0.236 151.000 0.065 1.000 N NA
 122120 122121 SMa1471 SMa1473     TRUE 0.983 0.000 0.286 1.000 N NA
 122121 122122 SMa1473 SMa1476     TRUE 0.679 92.000 0.286 1.000 N NA
 122122 122123 SMa1476 SMa1478     FALSE 0.361 44.000 0.000 1.000 N NA
 122124 122125 SMa1480 SMa1483     FALSE 0.173 236.000 0.143 1.000 N NA
 5451291 122126 SMa5009 SMa1485     TRUE 0.946 -3.000 0.091 NA   NA
 122126 122127 SMa1485 SMa1487     FALSE 0.039 229.000 0.000 1.000 N NA
 122127 122128 SMa1487 SMa1488     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.054 Y NA
 122128 122129 SMa1488 SMa1491     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.054 Y NA
 122130 122131 SMa1493 SMa1494     FALSE 0.092 87.000 0.000 NA   NA
 122131 122132 SMa1494 SMa1495     FALSE 0.005 429.000 0.000 NA   NA
 122133 122134 SMa1497 SMa1500 gst12   TRUE 0.984 11.000 0.667 1.000 N NA
 122134 122135 SMa1500 SMa1501     TRUE 0.985 25.000 0.667 1.000 Y NA
 122135 122136 SMa1501 SMa1503     TRUE 0.957 31.000 0.000 0.001 Y NA
 122137 122138 SMa1505 SMa1507     FALSE 0.244 54.000 0.000 1.000   NA
 122138 122139 SMa1507 SMa1509     FALSE 0.142 85.000 0.000 1.000   NA
 122139 122140 SMa1509 SMa1513     TRUE 0.952 26.000 0.590 1.000   NA
 122140 122141 SMa1513 SMa1514     TRUE 0.994 0.000 0.359 0.073   NA
 122143 122144 SMa1516 SMa1519 nuoH2   TRUE 0.958 70.000 0.221 0.008 Y NA
 122144 122145 SMa1519 SMa1521     FALSE 0.499 44.000 0.021 1.000   NA
 122146 122147 SMa1523 SMa1525 nuoG2 nuoF2 TRUE 0.859 30.000 0.000 0.008   NA
 122147 122148 SMa1525 SMa1526 nuoF2 nuoE2 TRUE 0.996 4.000 0.163 0.007 Y NA
 122148 122149 SMa1526 SMa1529 nuoE2 nuoD2 TRUE 0.973 19.000 0.012 0.007 Y NA
 122149 122150 SMa1529 SMa1531 nuoD2 nuoC2 TRUE 0.977 17.000 0.026 0.008 Y NA
 122150 122151 SMa1531 SMa1532 nuoC2 nuoB2 TRUE 0.995 -3.000 0.031 0.003 Y NA
 122151 122152 SMa1532 SMa1533 nuoB2 nuoA2 TRUE 0.996 -12.000 0.306 0.003 Y NA
 122152 122153 SMa1533 SMa1535 nuoA2 nuoN2 TRUE 0.580 216.000 0.016 0.008 Y NA
 122153 122154 SMa1535 SMa1536 nuoN2 nuoM2 TRUE 0.996 -3.000 0.049 0.002 Y NA
 122154 122155 SMa1536 SMa1538 nuoM2   TRUE 0.996 7.000 0.230 0.002 Y NA
 122157 122158 SMa1541 SMa1544   nuoK2 TRUE 0.995 5.000 0.140 0.008 Y NA
 122158 122159 SMa1544 SMa1545 nuoK2 nuoJ2 TRUE 0.995 0.000 0.029 0.003 Y NA
 122160 122161 SMa1547 SMa1548     FALSE 0.089 142.000 0.000 1.000 N NA
 122161 122162 SMa1548 SMa1550     TRUE 0.559 191.000 0.000 0.016 Y NA
 122162 122163 SMa1550 SMa1552     TRUE 0.505 154.000 0.064 1.000 Y NA
 122163 122164 SMa1552 SMa1554     TRUE 0.988 -3.000 0.106 1.000 Y NA
 122164 122165 SMa1554 SMa1556     TRUE 0.991 -67.000 0.150 0.004 Y NA
 122165 122166 SMa1556 SMa1558     TRUE 0.997 -13.000 0.400 0.004 Y NA
 122166 122167 SMa1558 SMa1561   cheB2 TRUE 0.997 10.000 0.375 0.004 Y NA
 122168 122169 SMa1562 SMa1564     TRUE 0.994 10.000 0.182 0.007 Y NA
 122169 122170 SMa1564 SMa1568   cpaF2 TRUE 0.981 29.000 0.618 1.000 Y NA
 122170 122171 SMa1568 SMa1570 cpaF2 pilA2 TRUE 0.752 44.000 0.000 NA Y NA
 122171 122172 SMa1570 SMa1572 pilA2   FALSE 0.081 345.000 0.000 NA Y NA
 122172 122173 SMa1572 SMa1573   CpaE2 TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA Y NA
 122173 122174 SMa1573 SMa1576 CpaE2 CpaB2 TRUE 0.996 7.000 0.750 NA Y NA
 122174 122175 SMa1576 SMa1578 CpaB2 cpaA2 TRUE 0.908 43.000 0.167 NA Y NA
 122176 122177 SMa1579 SMa1580     FALSE 0.062 113.000 0.000 NA   NA
 122178 122179 SMa1582 SMa1583   cyaF5 FALSE 0.023 249.000 0.000 1.000   NA
 122179 122180 SMa1583 SMa1585 cyaF5   FALSE 0.055 121.000 0.000 NA   NA
 122180 122181 SMa1585 SMa1586   syrB2 FALSE 0.003 898.000 0.000 NA   NA
 122183 122184 SMa1589 SMa1591     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 122184 122185 SMa1591 SMa1592     TRUE 0.570 -54.000 0.000 1.000   NA
 122185 122186 SMa1592 SMa1593     TRUE 0.940 -294.000 0.023 0.041 N NA
 122187 122188 SMa1594 SMa1595     FALSE 0.015 244.000 0.000 NA   NA
 122192 122193 SMa1604 SMa1606     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.041 N NA
 122194 122195 SMa1608 SMa1610     TRUE 0.986 0.000 0.429 NA   NA
 122195 122196 SMa1610 SMa1612     FALSE 0.064 110.000 0.000 NA   NA
 122196 122197 SMa1612 SMa1613     FALSE 0.190 49.000 0.000 NA   NA
 122197 122198 SMa1613 SMa1614     FALSE 0.054 122.000 0.000 NA   NA
 122198 122199 SMa1614 SMa1615     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.051 Y NA
 122200 122201 SMa1617 SMa1619     TRUE 0.999 -6.000 0.750 0.008 Y NA
 122201 122202 SMa1619 SMa1620     TRUE 0.999 -3.000 0.583 0.008 Y NA
 122203 122204 SMa1623 SMa1625     FALSE 0.043 218.000 0.000 1.000 N NA
 122210 122211 SMa1636 SMa1637     TRUE 0.809 31.000 0.000 NA Y NA
 122211 122213 SMa1637 SMa1639     FALSE 0.004 599.000 0.000 NA   NA
 122213 122214 SMa1639 SMa1641     TRUE 0.960 13.000 0.407 NA   NA
 122214 122215 SMa1641 SMa1643     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 122215 122216 SMa1643 SMa1644     FALSE 0.188 98.000 0.016 NA   NA
 122216 5451293 SMa1644 SMa5010     FALSE 0.032 178.000 0.000 NA   NA
 122217 122218 SMa1646 SMa1647     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 122218 122219 SMa1647 SMa1649     TRUE 0.997 -10.000 1.000 1.000 Y NA
 122219 122220 SMa1649 SMa1650     TRUE 0.985 -9.000 0.047 0.094 Y NA
 122220 122221 SMa1650 SMa1651     TRUE 0.978 14.000 0.047 0.073 Y NA
 122222 122223 SMa1652 SMa1653     TRUE 0.766 3.000 0.000 1.000   NA
 122223 122224 SMa1653 SMa1654     FALSE 0.055 163.000 0.000 1.000   NA
 122225 122226 SMa1657 SMa1658     TRUE 0.629 5.000 0.000 NA   NA
 122226 122227 SMa1658 SMa1660     FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 122227 122228 SMa1660 SMa1662     FALSE 0.008 437.000 0.000 1.000   NA
 122228 122229 SMa1662 SMa1664     TRUE 0.995 -3.000 0.842 1.000 N NA
 122229 122230 SMa1664 SMa1666     FALSE 0.008 337.000 0.000 NA   NA
 122231 122232 SMa1667 SMa1668 arcD1 arcD2 FALSE 0.238 420.000 0.000 0.002 Y NA
 122232 122233 SMa1668 SMa1670 arcD2 arcA2 TRUE 0.975 16.000 0.261 1.000 Y NA
 122233 122234 SMa1670 SMa1672 arcA2   FALSE 0.004 564.000 0.000 NA   NA
 122237 122238 SMa1676 SMa1677     FALSE 0.465 85.000 0.118 NA   NA
 122238 122239 SMa1677 SMa1678     FALSE 0.018 281.000 0.000 1.000   NA
 122239 122240 SMa1678 SMa1680     FALSE 0.020 264.000 0.000 1.000   NA
 122240 122241 SMa1680 SMa1682     TRUE 0.614 61.000 0.094 1.000 N NA
 122241 122242 SMa1682 SMa1683     TRUE 0.550 83.000 0.000 0.075 N NA
 122243 122244 SMa1684 SMa1686     TRUE 0.997 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 122244 122245 SMa1686 SMa1688     TRUE 0.840 82.000 0.000 0.013 Y NA
 122245 122246 SMa1688 SMa1691     FALSE 0.008 543.000 0.000 1.000 N NA
 122250 122251 SMa1697 SMa1698   syrB FALSE 0.013 261.000 0.000 NA   NA
 122254 122255 SMa1702 SMa1704     FALSE 0.004 584.000 0.000 NA   NA
 122260 122261 SMa1715 SMa1717 adeC3   FALSE 0.325 73.000 0.016 1.000   NA
 122261 122262 SMa1717 SMa1718   adeC4 FALSE 0.457 48.000 0.016 1.000   NA
 122269 122270 SMa1729 SMa1731   betB2 FALSE 0.057 194.000 0.000 1.000 N NA
 122270 122271 SMa1731 SMa1732 betB2   TRUE 0.884 20.000 0.000 0.041 N NA
 122271 122272 SMa1732 SMa1734     TRUE 0.974 12.000 0.500 1.000   NA
 122276 122277 SMa1740 SMa1741     TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA Y NA
 122277 122278 SMa1741 SMa1742     TRUE 0.994 0.000 0.325 1.000 Y NA
 122278 122279 SMa1742 SMa1745     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.072 Y NA
 122279 122280 SMa1745 SMa1746     TRUE 0.993 -57.000 0.778 1.000 Y NA
 122284 122285 SMa1751 SMa1753     TRUE 0.999 4.000 0.875 0.072 Y NA
 122285 122286 SMa1753 SMa1754     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 122286 122287 SMa1754 SMa1755     TRUE 0.882 99.000 0.438 1.000 Y NA
 122287 122288 SMa1755 SMa1757     FALSE 0.049 206.000 0.000 1.000 N NA
 122288 122289 SMa1757 SMa1759     TRUE 0.787 46.000 0.182 1.000 N NA
 122290 122291 SMa1760 SMa1761     TRUE 0.766 3.000 0.000 1.000   NA
 122292 122293 SMa1765 SMa1766     FALSE 0.290 28.000 0.000 NA   NA
 122294 122295 SMa1767 SMa1769     FALSE 0.009 317.000 0.000 NA   NA
 122299 122300 SMa1779 SMa1780     TRUE 0.559 9.000 0.000 NA   NA
 122302 122303 SMa1783 SMa1784     FALSE 0.105 80.000 0.000 NA   NA
 122303 122304 SMa1784 SMa1787     TRUE 0.575 40.000 0.051 NA   NA
 122307 122308 SMa1793 SMa1797     FALSE 0.002 1225.000 0.000 NA   NA
 122308 122309 SMa1797 SMa1798   kup2 FALSE 0.003 616.000 0.000 NA   NA
 122310 122311 SMa1799 SMa1801     TRUE 0.705 54.000 0.000 NA Y NA
 122311 122312 SMa1801 SMa1803     FALSE 0.044 595.000 0.000 1.000 Y NA
 122312 122314 SMa1803 SMa1808     FALSE 0.003 746.000 0.000 NA   NA
 122314 122315 SMa1808 SMa1809     FALSE 0.370 18.000 0.000 NA   NA
 122315 122316 SMa1809 SMa1811     TRUE 0.609 86.000 0.000 0.011   NA
 122316 122317 SMa1811 SMa1814     FALSE 0.440 22.000 0.000 1.000   NA
 122317 122318 SMa1814 SMa1817     TRUE 0.988 -3.000 0.483 NA   NA
 122318 122319 SMa1817 SMa1819     TRUE 0.947 14.000 0.344 NA   NA
 122319 122320 SMa1819 SMa1820     TRUE 0.906 0.000 0.033 NA   NA
 122320 122321 SMa1820 SMa1821     FALSE 0.465 68.000 0.071 NA   NA
 122321 122322 SMa1821 SMa1822     FALSE 0.040 226.000 0.000 1.000 N NA
 122322 122323 SMa1822 SMa1823     TRUE 0.839 216.000 0.400 0.011 Y NA
 122323 122324 SMa1823 SMa1825     TRUE 0.675 145.000 0.000 0.011 Y NA
 122324 122325 SMa1825 SMa1828     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.072 Y NA
 122330 122331 SMa1836 SMa1838 argE   TRUE 0.989 12.000 0.455 1.000 Y NA
 122331 122332 SMa1838 SMa1840     TRUE 0.758 90.000 0.476 NA   NA
 122332 122333 SMa1840 SMa1844     FALSE 0.112 333.000 0.235 NA   NA
 122333 122334 SMa1844 SMa1846     TRUE 0.996 10.000 0.412 0.074 Y NA
 122334 122335 SMa1846 SMa1848   gabD5 TRUE 0.986 35.000 0.481 0.074 Y NA
 122336 122337 SMa1850 SMa1851     TRUE 0.948 17.000 0.400 1.000   NA
 122338 122339 SMa1853 SMa1855     TRUE 0.821 15.000 0.064 1.000   NA
 122339 122340 SMa1855 SMa1857     TRUE 0.663 93.000 0.300 1.000   NA
 122340 122341 SMa1857 SMa1860     TRUE 0.795 70.000 0.375 1.000   NA
 122341 122342 SMa1860 SMa1862     TRUE 0.952 92.000 0.450 0.072 Y NA
 122342 122343 SMa1862 SMa1863     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.094 Y NA
 122343 122344 SMa1863 SMa1864     TRUE 0.995 0.000 0.900 1.000   NA
 122346 122347 SMa1869 SMa1871     FALSE 0.185 235.000 0.000 1.000 Y NA
 122347 122348 SMa1871 SMa1872     TRUE 0.990 6.000 0.300 1.000 Y NA
 122348 122349 SMa1872 SMa1874     FALSE 0.016 290.000 0.000 1.000   NA
 122350 122351 SMa1875 SMa1878     FALSE 0.005 665.000 0.000 1.000   NA
 122353 122354 SMa1882 SMa1884     TRUE 0.621 40.000 0.055 NA N NA
 122354 122355 SMa1884 SMa1885     TRUE 0.995 -3.000 0.857 NA N NA
 122356 122357 SMa1887 SMa1890     FALSE 0.118 97.000 0.000 1.000   NA
 122357 122358 SMa1890 SMa1891     TRUE 0.681 -82.000 0.014 NA   NA
 122358 122359 SMa1891 SMa1893     FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 122359 122360 SMa1893 SMa1894     FALSE 0.254 110.000 0.027 1.000 N NA
 122360 122361 SMa1894 SMa1896     TRUE 0.999 1.000 0.404 0.001 Y NA
 122361 122362 SMa1896 SMa1898     FALSE 0.049 206.000 0.000 1.000 N NA
 122362 122363 SMa1898 SMa1900     FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 122363 122364 SMa1900 SMa1902     FALSE 0.075 100.000 0.000 NA   NA
 122364 122365 SMa1902 SMa1903     FALSE 0.132 67.000 0.000 NA   NA
 122365 122366 SMa1903 SMa1905   mrcB FALSE 0.004 1006.000 0.000 1.000   NA
 122368 122369 SMa1910 SMa1913     FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 122370 122371 SMa1916 SMa1917     FALSE 0.008 341.000 0.000 NA   NA
 122372 122373 SMa1918 SMa1919     TRUE 0.945 -3.000 0.087 NA   NA
 122374 122375 SMa1921 SMa1924     FALSE 0.003 1133.000 0.000 NA   NA
 122377 122378 SMa1929 SMa1933     FALSE 0.003 665.000 0.000 NA   NA
 122379 122380 SMa1935 SMa1937 wrbA3   TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 122381 122382 SMa1939 SMa1943     FALSE 0.006 546.000 0.000 1.000   NA
 122383 122384 SMa1945 SMa1948     FALSE 0.005 775.000 0.000 1.000   NA
 122385 122386 SMa1951 SMa1952     FALSE 0.078 125.000 0.000 1.000   NA
 122386 122387 SMa1952 SMa1953     TRUE 0.555 221.000 0.000 0.001 Y NA
 122395 122396 SMa1965 SMa1966     FALSE 0.194 48.000 0.000 NA   NA
 122397 122398 SMa1967 SMa1968     FALSE 0.027 195.000 0.000 NA   NA
 122398 122399 SMa1968 SMa1969     FALSE 0.472 77.000 0.095 NA   NA
 122399 122400 SMa1969 SMa1971     FALSE 0.048 130.000 0.000 NA   NA
 122400 122401 SMa1971 SMa1973     TRUE 0.909 14.000 0.000 0.041   NA
 122401 122402 SMa1973 SMa1974     TRUE 0.718 0.000 0.000 NA   NA
 122403 122404 SMa1976 SMa1978     TRUE 0.837 27.000 0.167 1.000   NA
 122407 122409 SMa1987 SMa1990     FALSE 0.006 593.000 0.000 1.000   NA
 122410 122411 SMa1993 SMa1995     TRUE 0.910 30.000 0.333 1.000 N NA
 122411 122412 SMa1995 SMa1996     TRUE 0.998 3.000 0.667 0.093 Y NA
 122412 122413 SMa1996 SMa1998     TRUE 0.988 17.000 0.200 0.016 Y NA
 122413 122414 SMa1998 SMa2000     TRUE 0.865 61.000 0.167 NA Y NA
 122415 122416 SMa2002 SMa2004     TRUE 0.741 60.000 0.200 1.000 N NA
 122418 122419 SMa2009 SMa2011     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 122420 122421 SMa2012 SMa2014     FALSE 0.003 779.000 0.000 NA   NA
 122421 122422 SMa2014 SMa2015     FALSE 0.457 -55.000 0.000 NA   NA
 122425 122426 SMa2023 SMa2025     FALSE 0.391 188.000 0.300 1.000   NA
 122428 122429 SMa2029 SMa2031     TRUE 0.523 11.000 0.000 NA   NA
 122429 122430 SMa2031 SMa2032     FALSE 0.438 -162.000 0.000 NA   NA
 122430 122431 SMa2032 SMa2033     FALSE 0.004 533.000 0.000 NA   NA
 122432 122433 SMa2034 SMa2037     TRUE 0.956 10.000 0.250 1.000   NA
 122433 5451296 SMa2037 SMa5011     TRUE 0.998 3.000 0.583 0.053 Y NA
 5451296 122434 SMa5011 SMa2041     TRUE 0.999 0.000 0.583 0.001 Y NA
 122435 122436 SMa2043 SMa2045     TRUE 0.813 66.000 0.103 NA Y NA
 122436 122437 SMa2045 SMa2047     FALSE 0.250 191.000 0.000 NA Y NA
 122437 122438 SMa2047 SMa2049     FALSE 0.030 251.000 0.000 1.000 N NA
 122438 122439 SMa2049 SMa2051     TRUE 0.552 180.000 0.500 NA N NA
 122439 122440 SMa2051 SMa2053     TRUE 0.992 -3.000 0.636 NA N NA
 122440 122441 SMa2053 SMa2055     TRUE 0.801 75.000 0.455 NA   NA
 122442 122443 SMa2057 SMa2059     FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 122444 122445 SMa2061 SMa2063     TRUE 0.983 7.000 0.000 0.050 Y NA
 122445 122446 SMa2063 SMa2065     TRUE 0.929 12.000 0.000 1.000 Y NA
 122447 122448 SMa2067 SMa2069     TRUE 0.990 82.000 1.000 0.001 Y NA
 122448 122449 SMa2069 SMa2071     FALSE 0.004 553.000 0.000 NA   NA
 122449 122450 SMa2071 SMa2073     FALSE 0.003 707.000 0.000 NA   NA
 122450 122451 SMa2073 SMa2075     FALSE 0.178 88.000 0.000 1.000 N NA
 122451 122452 SMa2075 SMa2077     FALSE 0.016 687.000 0.031 1.000 N NA
 122452 122453 SMa2077 SMa2079     TRUE 0.868 15.000 0.094 1.000 N NA
 122453 122454 SMa2079 SMa2081     TRUE 0.999 -22.000 1.000 0.002 Y NA
 122454 122455 SMa2081 SMa2083     TRUE 0.995 3.000 0.444 1.000 Y NA
 122455 122456 SMa2083 SMa2085     TRUE 0.998 0.000 0.400 0.093 Y NA
 122457 122458 SMa2087 SMa2089     TRUE 0.961 14.000 0.429 1.000   NA
 122458 122459 SMa2089 SMa2091     TRUE 0.961 -9.000 0.000 0.002   NA
 122459 122460 SMa2091 SMa2093     TRUE 0.719 10.000 0.000 1.000 N NA
 122460 122461 SMa2093 SMa2095     TRUE 0.986 -3.000 0.333 1.000 N NA
 122461 122462 SMa2095 SMa2097     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 122462 122463 SMa2097 SMa2099     FALSE 0.467 19.000 0.000 1.000   NA
 122463 122464 SMa2099 SMa2101     TRUE 0.510 16.000 0.000 1.000   NA
 122468 122469 SMa2109 SMa2111     FALSE 0.005 808.000 0.000 1.000   NA
 122470 122471 SMa2113 SMa2115 adhC2 gst13 FALSE 0.337 49.000 0.000 1.000 N NA
 122471 122472 SMa2115 SMa2117 gst13   TRUE 0.983 12.000 0.667 1.000 N NA
 122472 122473 SMa2117 SMa2119     TRUE 0.975 43.000 0.667 1.000 Y NA
 122473 122474 SMa2119 SMa2121     TRUE 0.976 16.000 0.000 0.001 Y NA
 122474 122475 SMa2121 SMa2123     FALSE 0.009 408.000 0.000 1.000   NA
 122475 122476 SMa2123 SMa2125     TRUE 0.936 -7.000 0.000 0.072   NA
 122476 122477 SMa2125 SMa2127     TRUE 0.585 -31.000 0.000 1.000   NA
 122477 122478 SMa2127 SMa2129     FALSE 0.350 33.000 0.000 1.000   NA
 122478 122479 SMa2129 SMa2131     FALSE 0.023 246.000 0.000 1.000   NA
 122479 122480 SMa2131 SMa2133     FALSE 0.071 170.000 0.000 1.000 N NA
 122480 122481 SMa2133 SMa2135   glyA2 FALSE 0.089 142.000 0.000 1.000 N NA
 122481 122482 SMa2135 SMa2137 glyA2   FALSE 0.233 72.000 0.000 1.000 N NA
 122482 122483 SMa2137 SMa2139   sgaA TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.074 N NA
 122483 122484 SMa2139 SMa2141 sgaA   FALSE 0.163 94.000 0.000 1.000 N NA
 122484 122485 SMa2141 SMa2143     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 122485 122486 SMa2143 SMa2145     TRUE 0.719 56.000 0.000 1.000 Y NA
 122486 5451297 SMa2145 SMa5035     FALSE 0.006 377.000 0.000 NA   NA
 5451297 122487 SMa5035 SMa2147     FALSE 0.430 -406.000 0.000 NA   NA
 122488 122490 SMa2151 SMa2157     FALSE 0.004 1099.000 0.000 1.000   NA
 122490 122491 SMa2157 SMa2159     TRUE 0.778 -30.000 0.033 NA   NA
 122491 122493 SMa2159 SMa2163     FALSE 0.041 147.000 0.000 NA   NA
 122493 122494 SMa2163 SMa2165     FALSE 0.103 126.000 0.000 1.000 N NA
 122494 122495 SMa2165 SMa2167     FALSE 0.005 1125.000 0.000 1.000 N NA
 122495 403035 SMa2167 SMa2168   tRNA-Met FALSE 0.112 77.000 0.000 NA   NA
 122496 122497 SMa2169 SMa2171     FALSE 0.005 454.000 0.000 NA   NA
 122497 122498 SMa2171 SMa2175     FALSE 0.054 458.000 0.000 NA Y NA
 122498 122499 SMa2175 SMa2187     TRUE 0.999 -3.000 0.583 0.008 Y NA
 122499 122500 SMa2187 SMa2189     TRUE 0.999 -6.000 0.750 0.008 Y NA
 122500 122501 SMa2189 SMa2191     FALSE 0.485 207.000 0.000 0.050 Y NA
 122501 122502 SMa2191 SMa2193     FALSE 0.303 55.000 0.000 1.000 N NA
 122502 122503 SMa2193 SMa2195     TRUE 0.996 1.000 0.500 1.000 Y NA
 122503 122504 SMa2195 SMa2197     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.003 Y NA
 122504 122505 SMa2197 SMa2199     TRUE 0.979 64.000 0.667 0.095 Y NA
 122505 122506 SMa2199 SMa2201     FALSE 0.093 112.000 0.000 NA N NA
 122506 122507 SMa2201 SMa2203     FALSE 0.129 91.000 0.000 NA N NA
 122507 122508 SMa2203 SMa2205     TRUE 0.998 -3.000 0.462 0.072 Y NA
 122508 122509 SMa2205 SMa2207     TRUE 0.997 2.000 0.273 0.072 Y NA
 122509 122510 SMa2207 SMa2209     TRUE 0.887 111.000 0.222 0.072 Y NA
 122510 122511 SMa2209 SMa2211   ilvB2 TRUE 0.742 122.000 0.222 1.000 Y NA
 122511 122512 SMa2211 SMA2213 ilvB2   TRUE 0.949 17.000 0.375 1.000 N NA
 122513 122514 SMa2215 SMa2217     TRUE 0.687 23.000 0.020 1.000 N NA
 122514 122515 SMa2217 SMa2219     TRUE 0.984 3.000 0.092 1.000 Y NA
 122515 122516 SMa2219 SMa2221     TRUE 0.936 -3.000 0.070 NA   NA
 122516 122517 SMa2221 SMa2223     TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 122517 122518 SMa2223 SMa2225     FALSE 0.110 301.000 0.000 0.041   NA
 122519 122520 SMa2227 SMa2229     FALSE 0.083 191.000 0.022 NA   NA
 122525 122526 SMa2239 SMa2241     TRUE 0.860 36.000 0.300 NA   NA
 122527 122528 SMa2243 SMa2245     FALSE 0.108 79.000 0.000 NA   NA
 122530 122531 SMa2249 SMa2251     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 122531 122532 SMa2251 SMa2253     FALSE 0.003 958.000 0.000 NA   NA
 122532 122533 SMa2253 SMa2255     TRUE 0.992 3.000 0.750 NA   NA
 122533 122534 SMa2255 SMa2257     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 122537 122538 SMa2263 SMa2265     TRUE 0.550 -10.000 0.000 NA   NA
 122542 122543 SMa2273 SMa2275     TRUE 0.938 -19.000 0.231 NA   NA
 122543 122545 SMa2275 SMa2279     FALSE 0.003 834.000 0.000 NA   NA
 122545 122546 SMa2279 SMa2281     TRUE 0.989 -3.000 0.515 NA   NA
 122550 122551 SMa2289 SMa2291     TRUE 0.946 2.000 0.088 NA N NA
 122553 122554 SMa2294 SMa2295 mrcA2   TRUE 0.670 178.000 0.000 0.001 Y NA
 122554 122555 SMa2295 SMa2297     FALSE 0.006 405.000 0.000 NA   NA
 122556 122557 SMa2299 SMa2301     FALSE 0.010 305.000 0.000 NA   NA
 122557 122558 SMa2301 SMa2303     FALSE 0.189 84.000 0.000 1.000 N NA
 122559 122560 SMa2305 SMa2307     TRUE 0.957 78.000 0.375 0.071 Y NA
 122560 122561 SMa2307 SMa2309     TRUE 0.971 -24.000 0.000 0.071 Y NA
 122561 122562 SMa2309 SMa2311     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.071 Y NA
 122562 122563 SMa2311 SMa2313     TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 122563 122564 SMa2313 SMa2315     FALSE 0.072 132.000 0.000 1.000   NA
 122564 122565 SMa2315 SMa2317     TRUE 0.963 10.000 0.000 0.000   NA
 122565 122566 SMa2317 SMa2319   gst14 FALSE 0.100 108.000 0.000 1.000   NA
 122566 122567 SMa2319 SMa2321 gst14 uvrD2 FALSE 0.008 538.000 0.000 1.000 N NA
 122567 122568 SMa2321 SMa2323 uvrD2   FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 122569 122570 SMa2325 SMa2327     TRUE 0.999 -3.000 0.695 0.093 Y NA
 122570 122571 SMa2327 SMa2329   kdpC TRUE 0.932 19.000 0.106 0.093 N NA
 122571 122572 SMa2329 SMa2331 kdpC kdpB TRUE 0.999 3.000 0.877 0.001 Y NA
 122572 122573 SMa2331 SMa2333 kdpB kdpA TRUE 0.995 12.000 0.201 0.001 Y NA
 122573 122574 SMa2333 SMa2335 kdpA   FALSE 0.019 226.000 0.000 NA   NA
 122575 122576 SMa2337 SMa2400   rhbA FALSE 0.216 60.000 0.000 NA N NA
 122576 122577 SMa2400 SMa2402 rhbA rhbB TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.013 Y NA
 122577 122578 SMa2402 SMa2404 rhbB rhbC TRUE 0.704 -13.000 0.000 1.000 N NA
 122578 122579 SMa2404 SMa2406 rhbC rhbD TRUE 0.690 -7.000 0.000 NA N NA
 122579 122580 SMa2406 SMa2408 rhbD rhbE TRUE 0.800 -3.000 0.000 NA N NA
 122580 122581 SMa2408 SMa2410 rhbE rhbF TRUE 0.959 -16.000 0.042 1.000 Y NA
 122583 122584 SMa2414 SMa2339 rhtA   TRUE 0.799 0.000 0.000 1.000   NA
 122586 5451298 SMa2343 SMa5012     TRUE 0.512 55.000 0.060 NA   NA
 5451298 5451299 SMa5012 SMa5013     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 122589 122590 SMa2349 SMa2351     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.053 Y NA
 122590 122591 SMa2351 SMa2353     TRUE 0.999 5.000 0.917 0.002 Y NA
 122591 122592 SMa2353 SMa2355     FALSE 0.063 184.000 0.000 1.000 N NA
 122592 122593 SMa2355 SMa2357   cyaO FALSE 0.005 1827.000 0.000 1.000 N NA
 122595 122596 SMa2361 SMa2363     TRUE 0.931 12.000 0.188 1.000   NA
 122596 122597 SMa2363 SMa2365     TRUE 0.975 -3.000 0.208 1.000   NA
 122597 122598 SMa2365 SMa2367     TRUE 0.989 -10.000 0.864 1.000   NA
 122598 122599 SMa2367 SMa2369     TRUE 0.998 -3.000 0.976 0.071   NA
 122599 122600 SMa2369 SMa2371   codA1 TRUE 0.851 22.000 0.151 1.000   NA
 122600 5451300 SMa2371 SMa5034 codA1   FALSE 0.120 95.000 0.000 NA N NA
 5451300 122601 SMa5034 SMa2373     FALSE 0.124 93.000 0.000 NA N NA
 122601 122602 SMa2373 SMa2375     TRUE 0.813 66.000 0.103 NA Y NA
 122602 122603 SMa2375 SMa2377     FALSE 0.038 202.000 0.000 NA N NA
 122605 122606 SMa2381 SMa2383     FALSE 0.308 54.000 0.000 1.000 N NA
 122609 122610 SMa2389 SMa2391   repC2 FALSE 0.010 305.000 0.000 NA   NA
 122611 122612 SMa2393 SMa2395 repB2 repA2 TRUE 0.989 -3.000 0.429 1.000 N NA
 131316 131317 SMb21652 SMb21653 lacE lacF TRUE 0.952 94.000 0.463 0.071 Y NA
 131317 131318 SMb21653 SMb21654 lacF lacG TRUE 0.999 -3.000 0.926 0.093 Y NA
 131318 131319 SMb21654 SMb21655 lacG lacZ1 TRUE 0.971 6.000 0.037 1.000 Y NA
 131319 131320 SMb21655 SMb20002 lacZ1 lacK1 TRUE 0.986 -3.000 0.080 1.000 Y NA
 131320 131321 SMb20002 SMb20003 lacK1   FALSE 0.282 59.000 0.000 1.000 N NA
 131323 131324 SMb20005 SMb20006 gst15   FALSE 0.479 186.000 0.415 1.000   NA
 131324 131325 SMb20006 SMb20007   catC FALSE 0.090 115.000 0.000 1.000   NA
 131325 131326 SMb20007 SMb20008 catC   TRUE 0.659 26.000 0.019 1.000 N NA
 131328 131329 SMb20010 SMb20011     FALSE 0.040 227.000 0.000 1.000 N NA
 131330 131331 SMb20012 SMb20013     FALSE 0.235 56.000 0.000 1.000   NA
 131331 131332 SMb20013 SMb20014     TRUE 0.749 54.000 0.200 1.000   NA
 131332 131333 SMb20014 SMb20015     TRUE 0.954 14.000 0.333 1.000 N NA
 131333 131334 SMb20015 SMb20016     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.016 Y NA
 131334 131335 SMb20016 SMb20017     TRUE 0.999 0.000 0.875 0.016 Y NA
 131335 131336 SMb20017 SMb20018     TRUE 0.625 250.000 0.583 NA Y NA
 131336 131337 SMb20018 SMb20019   sucB FALSE 0.127 92.000 0.000 NA N NA
 131337 131338 SMb20019 SMb20020 sucB pdh TRUE 0.999 3.000 0.778 0.073 Y NA
 131339 131340 SMb20021 SMb20022     FALSE 0.007 648.000 0.000 1.000 N NA
 131342 131343 SMb20024 SMb20025     FALSE 0.022 250.000 0.000 1.000   NA
 131343 131344 SMb20025 SMb20026     FALSE 0.023 207.000 0.000 NA   NA
 131344 131345 SMb20026 SMb20027     TRUE 0.974 13.000 0.600 NA   NA
 131347 131348 SMb20029 SMb20030   sig TRUE 0.986 0.000 0.381 1.000   NA
 131349 131350 SMb20031 SMb20032     FALSE 0.079 97.000 0.000 NA   NA
 131350 131351 SMb20032 SMb20033     FALSE 0.006 390.000 0.000 NA   NA
 131352 131353 SMb20034 SMb20035     TRUE 0.993 11.000 0.667 NA Y NA
 131353 131354 SMb20035 SMb20036     TRUE 0.962 61.000 0.667 1.000 Y NA
 131354 131355 SMb20036 SMb20037   aroE2 TRUE 0.888 80.000 0.750 1.000 N NA
 131355 131356 SMb20037 SMb20038 aroE2   FALSE 0.021 217.000 0.000 NA   NA
 131358 131359 SMb20040 SMb20041     FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 131362 131363 SMb20044 SMb20045 repC1 repB1 FALSE 0.038 156.000 0.000 NA   NA
 131363 131364 SMb20045 SMb20046 repB1 repA1 TRUE 0.995 4.000 1.000 1.000 N NA
 131365 131366 SMb20047 SMb20048     FALSE 0.034 169.000 0.000 NA   NA
 131366 131367 SMb20048 SMb20049   fusA2 FALSE 0.115 119.000 0.000 1.000 N NA
 131368 131369 SMb20050 SMb20054   cpo FALSE 0.080 96.000 0.000 NA   NA
 131370 131371 SMb20055 SMb20056     FALSE 0.005 1660.000 0.000 1.000 N NA
 131371 131372 SMb20056 SMb20057     TRUE 0.998 -3.000 0.958 1.000 Y NA
 131372 131373 SMb20057 SMb20058     TRUE 0.995 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 131373 131374 SMb20058 SMb20059     TRUE 0.991 4.000 0.250 1.000 Y NA
 131374 131375 SMb20059 SMb20060   TRm5 FALSE 0.168 92.000 0.000 1.000 N NA
 131376 131377 SMb20061 SMb20062     FALSE 0.071 104.000 0.000 NA   NA
 131377 131378 SMb20062 SMb20063     TRUE 0.968 -10.000 0.385 NA   NA
 131380 131381 SMb20065 SMb20066     FALSE 0.035 167.000 0.000 NA   NA
 131383 131384 SMb20068 SMb20069     FALSE 0.004 534.000 0.000 NA   NA
 131385 131386 SMb20070 SMb20071     FALSE 0.225 218.000 0.000 0.045 N NA
 131386 131387 SMb20071 SMb20072     FALSE 0.052 472.000 0.000 NA Y NA
 131387 131388 SMb20072 SMb20073     FALSE 0.054 163.000 0.000 NA N NA
 131389 131390 SMb20074 SMb20075     TRUE 0.836 49.000 0.333 NA   NA
 131390 131391 SMb20075 SMb20076     FALSE 0.076 99.000 0.000 NA   NA
 131391 131392 SMb20076 SMb20077     FALSE 0.113 100.000 0.000 1.000   NA
 131392 131393 SMb20077 SMb20078     TRUE 0.972 0.000 0.000 0.016   NA
 131393 131394 SMb20078 SMb20079     FALSE 0.004 833.000 0.000 1.000   NA
 131394 131395 SMb20079 SM_b20080     FALSE 0.090 115.000 0.000 1.000   NA
 131396 131397 SMb20081 SMb20082     TRUE 0.973 -3.000 0.215 NA   NA
 131399 131400 SMb20084 SMb20085     FALSE 0.178 52.000 0.000 NA   NA
 131401 131402 SMb20086 SMb20087     FALSE 0.325 23.000 0.000 NA   NA
 131402 131403 SMb20087 SMb20088     FALSE 0.058 155.000 0.000 1.000   NA
 131404 131405 SMb20089 SMb20090     TRUE 0.969 4.000 0.250 NA   NA
 131410 131411 SMb20095 SMb20096     FALSE 0.283 29.000 0.000 NA   NA
 131411 131412 SMb20096 SMb20097     TRUE 0.949 2.000 0.118 NA   NA
 131412 131413 SMb20097 SMb20098     TRUE 0.984 9.000 0.667 NA   NA
 131413 131414 SMb20098 SMb20099     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131414 131415 SMb20099 SMb20100     TRUE 0.937 2.000 0.067 NA N NA
 131415 131416 SMb20100 SMb20101     FALSE 0.148 61.000 0.000 NA   NA
 131416 131417 SMb20101 SMb20102   acoR FALSE 0.135 88.000 0.000 1.000   NA
 131417 131418 SMb20102 SMb20103 acoR   FALSE 0.167 215.000 0.096 1.000 N NA
 131419 131420 SMb20104 SMb20105     FALSE 0.110 102.000 0.000 1.000   NA
 131421 131422 SMb20106 SMb20107     TRUE 0.707 68.000 0.200 1.000 N NA
 131422 131423 SMb20107 SMb20108     FALSE 0.417 124.000 0.000 1.000 Y NA
 131423 131424 SMb20108 SMb20109     TRUE 0.831 73.000 0.000 0.071 Y NA
 131424 131425 SMb20109 SMb20110     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.092 Y NA
 131425 131426 SMb20110 SMb20111     TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 131426 131427 SMb20111 SMb20112     TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 131428 131429 SMb20113 SMb20114     TRUE 0.961 3.000 0.000 NA Y NA
 131429 131430 SMb20114 SMb20115   ilvD4 FALSE 0.394 27.000 0.000 NA N NA
 131430 131431 SMb20115 SMb20116 ilvD4   FALSE 0.388 135.000 0.000 1.000 Y NA
 131431 131432 SMb20116 SMb20117     FALSE 0.099 130.000 0.000 1.000 N NA
 131432 131433 SMb20117 SMb20118     FALSE 0.007 481.000 0.000 NA N NA
 131433 131434 SMb20118 SMb20119     FALSE 0.325 23.000 0.000 NA   NA
 131434 5451303 SMb20119 SM_b22004     FALSE 0.499 -19.000 0.000 NA   NA
 5451303 131436 SM_b22004 SMb20121     TRUE 0.972 -55.000 0.591 NA   NA
 131436 131437 SMb20121 SMb20122     FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 131437 131438 SMb20122 SMb20123     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 131438 131439 SMb20123 SMb20124     FALSE 0.081 122.000 0.000 1.000   NA
 131439 131440 SMb20124 SMb20125     TRUE 0.650 10.000 0.000 1.000   NA
 131440 131441 SMb20125 SMb20126     TRUE 0.929 9.000 0.000 0.071   NA
 131441 131442 SMb20126 SMb20127     FALSE 0.060 153.000 0.000 1.000   NA
 131442 131443 SMb20127 SMb20128     FALSE 0.235 56.000 0.000 1.000   NA
 131444 131445 SMb20129 SMb20130     FALSE 0.325 51.000 0.000 1.000 N NA
 131445 131446 SMb20130 SMb20131     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.053 Y NA
 131446 131447 SMb20131 SMb20132     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.053 Y NA
 131447 131448 SMb20132 SMb20133     TRUE 0.718 0.000 0.000 NA   NA
 131449 131450 SMb20134 SMb20135     FALSE 0.207 79.000 0.000 1.000 N NA
 131450 131451 SMb20135 SMb20136     TRUE 0.907 31.000 0.092 NA Y NA
 131451 131452 SMb20136 SMb20137     FALSE 0.207 142.000 0.071 NA   NA
 131452 131453 SMb20137 SMb20138     TRUE 0.985 40.000 1.000 0.022   NA
 131455 131456 SMb20140 SMb20141 dapA2   TRUE 0.961 0.000 0.125 1.000   NA
 131456 131457 SMb20141 SMb20142     TRUE 0.992 -7.000 1.000 1.000   NA
 131457 131458 SMb20142 SMb20143     TRUE 0.996 15.000 0.800 0.092 Y NA
 131458 131459 SMb20143 SMb20144     TRUE 0.968 86.000 0.600 0.071 Y NA
 131460 131461 SMb20145 SMb20146   pdxA2 TRUE 0.931 0.000 0.031 1.000 N NA
 131461 131462 SMb20146 SMb20147 pdxA2   TRUE 0.972 -3.000 0.167 1.000 N NA
 131463 131464 SMb20148 SMb20149     TRUE 0.967 4.000 0.235 NA   NA
 131465 131466 SMb20150 SMb20151     TRUE 0.714 66.000 0.222 1.000   NA
 131466 131467 SMb20151 SMb20152     TRUE 0.978 -6.000 0.400 1.000   NA
 131467 131468 SMb20152 SMb20153     FALSE 0.145 84.000 0.000 1.000   NA
 131470 131471 SMb20155 SMb20156     TRUE 0.995 0.000 0.417 0.071 N NA
 131471 131472 SMb20156 SMb20157     TRUE 0.887 42.000 0.400 NA N NA
 131472 131473 SMb20157 SMb20158     TRUE 0.821 29.000 0.000 NA Y NA
 131473 131474 SMb20158 SMb20159     FALSE 0.242 54.000 0.000 NA N NA
 131474 5451304 SMb20159     SM_b22005 FALSE 0.005 679.000 0.000 1.000   NA
 5451304 131476   SMb20161 SM_b22005   TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131476 131477 SMb20161 SMb20162     FALSE 0.027 194.000 0.000 NA   NA
 131477 131478 SMb20162 SMb20163     TRUE 0.926 45.000 0.667 NA   NA
 131478 131479 SMb20163 SMb20164     TRUE 0.980 -3.000 0.294 NA   NA
 131479 131480 SMb20164 SMb20165     FALSE 0.483 107.000 0.200 NA   NA
 131480 131481 SMb20165 SMb20166     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 131485 131486 SMb20170 SM_b20171 fdh   TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 131486 131487 SM_b20171 SMb20172     TRUE 0.553 14.000 0.000 1.000   NA
 131487 131488 SMb20172 SMb20173     FALSE 0.304 178.000 0.000 0.053 N NA
 131488 131489 SMb20173 SMb20174     TRUE 0.937 79.000 0.571 0.053 N NA
 131489 131490 SMb20174 SM_b20175     TRUE 0.967 -43.000 0.419 1.000 N NA
 131490 131491 SM_b20175 SMb20176     TRUE 0.990 -3.000 0.488 1.000 N NA
 131493 131494 SMb20178 SMb20179     TRUE 0.993 2.000 0.793 NA   NA
 131494 131495 SMb20179 SMb20180     TRUE 0.970 4.000 0.259 NA   NA
 131495 131496 SMb20180 SMb20181     FALSE 0.167 55.000 0.000 NA   NA
 131496 131497 SMb20181 SMb20182     TRUE 0.997 -25.000 0.628 0.071 Y NA
 131497 131498 SMb20182 SMb20183     TRUE 0.998 -3.000 0.756 1.000 Y NA
 131498 131499 SMb20183 SMb20184     TRUE 0.978 -3.000 0.041 0.082 N NA
 131499 131500 SMb20184 SMb20185     TRUE 0.997 -3.000 0.635 0.082 N NA
 131500 131501 SMb20185 SMb20186     FALSE 0.083 121.000 0.000 1.000   NA
 131502 131503 SM_b20194 SMb20195   ppe TRUE 0.804 4.000 0.000 1.000 N NA
 131503 131504 SMb20195 SMb20196 ppe cbbX TRUE 0.874 -3.000 0.002 1.000   NA
 131504 131505 SMb20196 SMb20197 cbbX cbbS TRUE 0.897 12.000 0.106 1.000   NA
 131505 131506 SMb20197 SMb20198 cbbS cbbL TRUE 0.980 42.000 0.556 0.001 N NA
 131506 131507 SMb20198 SMb20199 cbbL cbbA TRUE 0.818 33.000 0.000 1.000 Y NA
 131507 131508 SMb20199 SMb20200 cbbA cbbT TRUE 0.965 3.000 0.000 1.000 Y NA
 131508 131509 SMb20200 SMb20201 cbbT cbbP TRUE 0.879 11.000 0.051 1.000 N NA
 131509 131510 SMb20201 SMb20202 cbbP cbbF TRUE 0.978 11.000 0.120 0.014 N NA
 131511 131512 SMb20203 SMb20204 cbbR pqqA FALSE 0.017 283.000 0.000 1.000   NA
 131512 131513 SMb20204 SMb20205 pqqA pqqB TRUE 0.884 42.000 0.018 0.001   NA
 131513 131514 SMb20205 SMb20206 pqqB pqqC TRUE 0.999 -3.000 0.825 0.001   NA
 131514 131515 SMb20206 SMb20207 pqqC pqqD TRUE 0.997 -3.000 0.404 0.000   NA
 131515 131516 SMb20207 SMb20208 pqqD pqqE TRUE 0.996 -3.000 0.361 0.001   NA
 131517 131518 SMb20209 SMb20210     FALSE 0.239 55.000 0.000 1.000   NA
 131518 131519 SMb20210 SMb20211     FALSE 0.089 142.000 0.000 1.000 N NA
 131520 131521 SMb20212 SMb20213     FALSE 0.230 38.000 0.000 NA   NA
 131521 131522 SMb20213 SMb20214     FALSE 0.141 264.000 0.000 0.040   NA
 131522 131523 SMb20214 SMb20215     FALSE 0.206 63.000 0.000 1.000   NA
 131523 131524 SMb20215 SMb20216     FALSE 0.066 141.000 0.000 1.000   NA
 131524 131525 SMb20216 SMb20217     FALSE 0.020 218.000 0.000 NA   NA
 131526 131527 SMb20218 SMb20219     TRUE 0.998 0.000 0.897 1.000 Y NA
 131527 5451305 SMb20219 SM_b22002     FALSE 0.086 92.000 0.000 NA   NA
 5451305 131528 SM_b22002 SMb20221     FALSE 0.441 -123.000 0.000 NA   NA
 131528 131529 SMb20221 SM_b20222     TRUE 0.935 10.000 0.167 1.000   NA
 131532 131533 SMb20226 SMb20227   ndiA-1 FALSE 0.037 157.000 0.000 NA   NA
 131533 131534 SMb20227 SMb20228 ndiA-1 ndiA-2 TRUE 0.987 -7.000 0.714 NA   NA
 131534 131535 SMb20228 SMb20229 ndiA-2 ndiB TRUE 0.994 -3.000 0.857 NA   NA
 131535 131536 SMb20229 SMb20230 ndiB smc22-r FALSE 0.018 232.000 0.000 NA   NA
 131536 131537 SMb20230 SMb20231 smc22-r   FALSE 0.277 60.000 0.000 1.000 N NA
 131537 131538 SMb20231 SMb20232     TRUE 0.988 58.000 0.857 0.070 Y NA
 131538 131539 SMb20232 SMb20233     TRUE 0.998 -10.000 0.857 0.070 Y NA
 131539 131540 SMb20233 SMb20234     TRUE 0.708 31.000 0.087 NA   NA
 131540 131541 SMb20234 SMb20235     TRUE 0.694 2.000 0.000 NA   NA
 131541 131542 SMb20235 SMb20236     FALSE 0.056 120.000 0.000 NA   NA
 131543 131544 SMb20238 SMb20239   rmlB TRUE 0.962 3.000 0.167 1.000   NA
 131544 131545 SMb20239 SMb20240 rmlB   TRUE 0.927 20.000 0.367 NA   NA
 131545 131546 SMb20240 SMb20241     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131546 131547 SMb20241 SMb20242     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131547 131548 SMb20242 SMb20243     TRUE 0.976 5.000 0.375 NA   NA
 131548 131549 SMb20243 SMb20244   tyv TRUE 0.994 -3.000 0.290 1.000 Y NA
 131549 131550 SMb20244 SMb20245 tyv   TRUE 0.998 -3.000 0.355 0.005 Y NA
 131551 131552 SMb20246 SMb20247     TRUE 0.996 5.000 0.621 0.040   NA
 131554 131555 SMb20249 SMb20250     TRUE 0.960 -3.000 0.097 1.000 N NA
 131555 131556 SMb20250 SMb20251     TRUE 0.751 72.000 0.038 1.000 Y NA
 131557 131558 SMb20252 SMb20253     TRUE 0.724 47.000 0.161 NA   NA
 131558 131559 SMb20253 SMb20254     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 131559 131560 SMb20254 SMb20255     FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 131560 131561 SMb20255 SMb20256     FALSE 0.047 132.000 0.000 NA   NA
 131562 131563 SMb20257 SMb20258     FALSE 0.139 105.000 0.000 1.000 N NA
 131563 131564 SMb20258 SMb20259     TRUE 0.516 121.000 0.227 1.000 N NA
 131565 131566 SMb20260 SMb20261     FALSE 0.140 64.000 0.000 NA   NA
 131567 131568 SMb20262 SMb20263     FALSE 0.282 187.000 0.154 1.000 N NA
 131568 131569 SMb20263 SMb20264     TRUE 0.981 67.000 0.692 0.070 Y NA
 131569 131570 SMb20264 SMb20265     TRUE 0.998 13.000 0.846 0.008 Y NA
 131570 131571 SMb20265 SMb20266     TRUE 0.995 -7.000 0.650 1.000 Y NA
 131571 131572 SMb20266 SMb20267     TRUE 0.992 1.000 0.238 1.000 Y NA
 131572 131573 SMb20267 SMb20268     TRUE 0.959 15.000 0.114 1.000 Y NA
 131573 131574 SMb20268 SMb20269     TRUE 0.930 -3.000 0.043 1.000   NA
 131574 131575 SMb20269 SMb20270     TRUE 0.732 51.000 0.167 1.000   NA
 131575 131576 SMb20270 SMb20271     FALSE 0.189 84.000 0.000 1.000 N NA
 131576 131577 SMb20271 SMb20272     FALSE 0.012 401.000 0.000 1.000 N NA
 131578 131579 SMb20273 SMb20274     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 131579 131580 SMb20274 SMb20275     FALSE 0.032 178.000 0.000 NA   NA
 131581 131582 SMb20276 SMb20277     TRUE 0.982 -3.000 0.268 1.000 N NA
 131583 131584 SMb20278 SMb20279     TRUE 0.989 2.000 0.588 NA   NA
 131584 131585 SMb20279 SMb20280     TRUE 0.845 32.000 0.235 NA   NA
 131585 131586 SMb20280 SMb20281     FALSE 0.404 82.000 0.059 NA N NA
 131586 131587 SMb20281 SMb20282     TRUE 0.996 4.000 0.625 1.000 Y NA
 131587 131588 SMb20282 SMb20283     TRUE 0.997 11.000 0.625 0.070 Y NA
 131588 131589 SMb20283 SMb20284     TRUE 0.978 85.000 0.833 0.070 Y NA
 131589 131590 SMb20284 SMb20285     TRUE 0.508 80.000 0.087 1.000 N NA
 131592 131593 SMb20287 SMb20288     TRUE 0.963 -3.000 0.131 1.000   NA
 131593 131594 SMb20288 SMb20289     TRUE 0.705 110.000 0.131 1.000 Y NA
 131596 131597 SMb20291 SMb20292     FALSE 0.177 188.000 0.098 NA   NA
 131598 131599 SMb20293 SMb20294     FALSE 0.047 132.000 0.000 NA   NA
 131599 131600 SMb20294 SMb20295     FALSE 0.461 29.000 0.000 1.000 N NA
 131600 131601 SMb20295 SMb20296     TRUE 0.695 56.000 0.000 NA Y NA
 131601 131602 SMb20296 SMb20297     TRUE 0.965 1.000 0.000 NA Y NA
 131602 131603 SMb20297 SMb20298     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 131603 131604 SMb20298 SMb20299   nanA TRUE 0.965 14.000 0.000 0.072 Y NA
 131604 131605 SMb20299 SMb20300 nanA cyaF7 FALSE 0.012 337.000 0.000 1.000   NA
 131606 131607 SMb20301 SMb20302     FALSE 0.041 148.000 0.000 NA   NA
 131611 131612 SMb20305 SMb20307 TRm2011-2N   FALSE 0.165 93.000 0.000 1.000 N NA
 131612 131613 SMb20307 SMb20312     TRUE 0.991 79.000 1.000 0.001 Y NA
 131613 131614 SMb20312 SM_b20313     TRUE 0.935 114.000 0.263 0.001 Y NA
 131614 131615 SM_b20313 SMb20314     TRUE 0.995 -31.000 0.263 0.001 Y NA
 131616 131617 SM_b20315 SMb20316     TRUE 0.963 80.000 1.000 NA Y NA
 131617 131618 SMb20316 SMb20317     TRUE 0.890 118.000 0.667 NA Y NA
 131618 131619 SMb20317 SMb20318     TRUE 0.998 2.000 0.333 0.016 Y NA
 131620 131621 SMb20319 SMb20320     FALSE 0.066 141.000 0.000 1.000   NA
 131621 131622 SMb20320 SMb20321     TRUE 0.964 29.000 0.312 1.000 Y NA
 131622 131623 SMb20321 SMb20322     TRUE 0.998 0.000 0.875 NA Y NA
 131626 131627 SMb20325 SMb20326 thuE thuF TRUE 0.891 88.000 0.121 0.070 Y NA
 131627 131628 SMb20326 SMb20327 thuF thuG TRUE 0.999 0.000 0.723 0.070 Y NA
 131628 131629 SMb20327 SMb20328 thuG thuK TRUE 0.988 10.000 0.085 0.070 Y NA
 131629 131630 SMb20328 SMb20329 thuK thuA TRUE 0.562 166.000 0.154 NA Y NA
 131630 131631 SMb20329 SMb20330 thuA thuB TRUE 0.968 -3.000 0.182 NA   NA
 131635 131636 SMb20334 SM_b20335     FALSE 0.020 221.000 0.000 NA   NA
 131636 131637 SM_b20335 SMb20336     FALSE 0.186 50.000 0.000 NA   NA
 131639 131640 SMb20338 SMb20339     FALSE 0.089 89.000 0.000 NA   NA
 131640 131641 SMb20339 SMb20340     FALSE 0.126 70.000 0.000 NA   NA
 131641 131642 SMb20340 SMb20341     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 131643 131644 SMb20342 SMb20343     TRUE 0.997 2.000 0.286 0.052 Y NA
 131644 131645 SMb20343 SMb20344     FALSE 0.025 277.000 0.000 1.000 N NA
 131645 131646 SMb20344 SMb20345     FALSE 0.068 137.000 0.000 NA N NA
 131646 131647 SMb20345 SMb20346     TRUE 0.947 29.000 0.583 NA N NA
 131647 131648 SMb20346 SMb20347     TRUE 0.580 93.000 0.188 1.000 N NA
 131649 131650 SMb20348 SMb20349     TRUE 0.773 69.000 0.320 1.000   NA
 131650 131651 SMb20349 SMb20350     TRUE 0.569 166.000 0.520 NA   NA
 131651 131652 SMb20350 SMb20351     TRUE 0.990 -3.000 0.542 NA   NA
 131652 131653 SMb20351 SMb20352     TRUE 0.998 0.000 0.793 0.016   NA
 131653 131654 SMb20352 SMb20353     TRUE 0.974 6.000 0.333 1.000   NA
 131654 131655 SMb20353 SMb20354     TRUE 0.987 -3.000 0.433 NA   NA
 131655 131656 SMb20354 SMb20355     FALSE 0.053 123.000 0.000 NA   NA
 131656 131657 SMb20355 SMb20356     TRUE 0.985 -3.000 0.400 NA   NA
 131657 131658 SMb20356 SMb20357     TRUE 0.978 25.000 0.105 0.013 Y NA
 131658 131659 SMb20357 SMb20358     TRUE 0.993 9.000 0.158 0.013 Y NA
 131659 131660 SMb20358 SMb20359     FALSE 0.058 117.000 0.000 NA   NA
 131660 131661 SMb20359 SMb20360     TRUE 0.954 41.000 0.917 NA   NA
 131662 131663 SMb20361 SMb20362     FALSE 0.130 91.000 0.000 1.000   NA
 131663 131664 SMb20362 SMb20363     TRUE 0.920 31.000 0.400 1.000 N NA
 131664 131665 SMb20363 SM_b20364     TRUE 0.997 -3.000 0.632 0.070 N NA
 131665 131666 SM_b20364 SMb20365     TRUE 0.922 175.000 0.800 0.093 Y NA
 131669 131670 SMb20368 SMb20369     TRUE 0.996 6.000 0.400 0.091 Y NA
 131670 131671 SMb20369 SMb20370     TRUE 0.988 -3.000 0.400 1.000 N NA
 131672 131673 SMb20371 SMb20372     TRUE 0.917 24.000 0.054 1.000 Y NA
 131673 131674 SMb20372 SMb20373     TRUE 0.973 12.000 0.167 NA Y NA
 131674 131675 SMb20373 SMb20374     TRUE 0.813 80.000 0.167 NA Y NA
 131675 131676 SMb20374 SMb20375     TRUE 0.929 21.000 0.105 0.087 N NA
 131676 131677 SMb20375 SMb20376     FALSE 0.037 204.000 0.000 NA N NA
 131677 131678 SMb20376 SMb20377     TRUE 0.752 44.000 0.000 NA Y NA
 131678 131679 SMb20377 SMb20378     FALSE 0.420 34.000 0.000 1.000 N NA
 131679 131680 SMb20378 SMb20379     TRUE 0.874 10.000 0.040 1.000 N NA
 131680 131681 SMb20379 SMb20380     FALSE 0.441 31.000 0.000 1.000 N NA
 131681 131682 SMb20380 SMb20381     TRUE 0.960 16.000 0.000 0.070 Y NA
 131682 131683 SMb20381 SMb20382     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.070 Y NA
 131683 131684 SMb20382 SMb20383     TRUE 0.657 126.000 0.000 0.070 Y NA
 131684 131685 SMb20383 SMb20384     FALSE 0.490 106.000 0.000 1.000 Y NA
 131685 131686 SMb20384 SMb20385     TRUE 0.553 14.000 0.000 1.000   NA
 131686 131687 SMb20385 SMb20386     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131687 131688 SMb20386 SMb20387     TRUE 0.694 2.000 0.000 NA   NA
 131688 131689 SMb20387 SMb20388     FALSE 0.013 394.000 0.000 1.000 N NA
 131689 131690 SMb20388 SMb20389     TRUE 0.608 15.000 0.000 1.000 N NA
 131691 131692 SMb20390 SMb20391     TRUE 0.983 -18.000 0.714 NA N NA
 131694 131695 SMb20393 SMb20394 rbcL   TRUE 0.946 24.000 0.541 NA   NA
 131696 131697 SMb20395 SMb20396     TRUE 0.977 44.000 0.192 0.002 Y NA
 131697 131698 SMb20396 SMb20397     TRUE 0.997 -3.000 0.231 0.052 Y NA
 131699 131700 SMb20398 SMb20399     FALSE 0.098 84.000 0.000 NA   NA
 131701 131702 SMb20400 SMb20401     FALSE 0.295 27.000 0.000 NA   NA
 131703 131704 SMb20402 SMb20403     TRUE 0.999 3.000 0.545 0.014 Y NA
 131704 131705 SMb20403 SMb20404     TRUE 0.998 0.000 0.423 0.052 Y NA
 131707 131708 SMb20406 SMb20407 hyuA hyuB TRUE 0.993 9.000 0.067 0.000 Y NA
 131708 131709 SMb20407 SMb20408 hyuB   TRUE 0.997 4.000 0.882 1.000 Y NA
 131709 131710 SMb20408 SMb20409     TRUE 0.984 -3.000 0.059 1.000 Y NA
 131710 131711 SMb20409 SMb20410     FALSE 0.241 69.000 0.000 1.000 N NA
 131712 131713 SMb20411 SMb20412     FALSE 0.268 31.000 0.000 NA   NA
 131713 131714 SMb20412 SMb20413     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 131714 131715 SMb20413 SMb20414     FALSE 0.031 181.000 0.000 NA   NA
 131715 131716 SMb20414 SMb20415     TRUE 0.984 0.000 0.364 NA   NA
 131717 131718 SMb20416 SMb20417 ugpB ugpA TRUE 0.960 118.000 0.793 0.070 Y NA
 131718 131719 SMb20417 SMb20418 ugpA ugpE TRUE 0.997 9.000 0.559 0.070 Y NA
 131719 131720 SMb20418 SMb20419 ugpE ugpC TRUE 0.998 0.000 0.464 0.070 Y NA
 131720 131721 SMb20419 SMb20420 ugpC   FALSE 0.109 122.000 0.000 1.000 N NA
 131721 131722 SMb20420 SMb20421   TRm21 FALSE 0.081 153.000 0.000 1.000 N NA
 131723 131724 SMb20422 SMb20423     TRUE 0.956 6.000 0.174 1.000 N NA
 131724 131725 SMb20423 SMb20424     TRUE 0.763 120.000 0.640 1.000 N NA
 131725 131726 SMb20424 SMb20425     FALSE 0.177 164.000 0.040 1.000 N NA
 131727 131728 SMb20426 SMb20427     TRUE 0.590 171.000 0.172 1.000 Y NA
 131728 131729 SMb20427 SMb20428     TRUE 0.903 59.000 0.224 1.000 Y NA
 131729 131730 SMb20428 SMb20429     TRUE 0.935 103.000 0.389 0.070 Y NA
 131730 131731 SMb20429 SMb20430     TRUE 0.999 3.000 0.842 0.008 Y NA
 131731 131732 SMb20430 SMb20431     TRUE 0.983 0.000 0.289 1.000 N NA
 131732 131733 SMb20431 SMb20432     TRUE 0.984 -3.000 0.293 1.000 N NA
 131733 131734 SMb20432 SMb20433     TRUE 0.998 -3.000 0.780 1.000 Y NA
 131734 131735 SMb20433 SMb20434     TRUE 0.948 45.000 0.333 1.000 Y NA
 131735 131736 SMb20434 SMb20435     TRUE 0.946 20.000 0.444 1.000   NA
 131736 131737 SMb20435 SMb20436     FALSE 0.009 398.000 0.000 1.000   NA
 131737 131738 SMb20436 SMb20441     FALSE 0.030 255.000 0.000 1.000 N NA
 131738 131739 SMb20441 SMb20442     TRUE 0.870 40.000 0.300 1.000 N NA
 131739 131740 SMb20442 SMb20443     TRUE 0.851 68.000 0.176 NA Y NA
 131740 131741 SMb20443 SMb20444     TRUE 0.996 6.000 0.824 NA Y NA
 131741 131742 SMb20444 SMb20445     TRUE 0.991 0.000 0.500 1.000 N NA
 131742 131743 SMb20445 SMb20446   uxuA TRUE 0.953 10.000 0.211 1.000 N NA
 131743 131744 SMb20446 SMb20447 uxuA   FALSE 0.025 276.000 0.000 1.000 N NA
 131744 131745 SMb20447 SMb20448     TRUE 0.841 76.000 0.583 NA   NA
 131745 131746 SMb20448 SMb20449     TRUE 0.782 117.000 0.769 NA   NA
 131746 131747 SMb20449 SMb20450     TRUE 0.991 -3.000 0.538 1.000 N NA
 131747 131748 SMb20450 SMb20451     TRUE 0.989 5.000 0.700 NA   NA
 131748 131749 SMb20451 SMb20452     TRUE 0.973 15.000 0.692 NA   NA
 131755 131756 SMb20458 SMb20459     TRUE 0.998 0.000 0.333 0.002 Y NA
 131756 131757 SMb20459 SMb20460     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 131757 131758 SMb20460 SMb20461     TRUE 0.523 11.000 0.000 NA   NA
 131758 131759 SMb20461 SMb20462     TRUE 0.969 -3.000 0.190 NA   NA
 131759 131760 SMb20462 SMb20463     TRUE 0.982 0.000 0.333 NA   NA
 131761 131762 SMb20464 SMb20465     FALSE 0.035 166.000 0.000 NA   NA
 131763 131764 SMb20466 SMb20467     FALSE 0.023 249.000 0.000 1.000   NA
 131764 131765 SMb20467 SMb20468     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.015   NA
 131767 131768 SMb20470 SMb20471     TRUE 0.803 31.000 0.172 NA   NA
 131768 131769 SMb20471 SMb20472     TRUE 0.917 14.000 0.214 NA   NA
 131770 131771 SMb20473 SMb20474     FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 131771 131772 SMb20474 SMb20475     TRUE 0.523 -13.000 0.000 NA   NA
 131773 131774 SMb20476 SMb20477     TRUE 0.965 78.000 0.462 0.070 Y NA
 131774 131775 SMb20477 SMb20478     TRUE 0.995 -3.000 0.129 0.070 Y NA
 131775 131776 SMb20478 SMb20479     TRUE 0.991 -3.000 0.125 0.006   NA
 131776 131777 SMb20479 SMb20480     TRUE 0.951 7.000 0.188 1.000   NA
 131777 131778 SMb20480 SMb20481   asnO FALSE 0.217 124.000 0.028 1.000 N NA
 131778 131779 SMb20481 SMb20482 asnO   TRUE 0.990 2.000 0.514 1.000 N NA
 131781 131782 SMb20484 SMb20485     TRUE 0.971 106.000 0.941 0.081 Y NA
 131782 131783 SMb20485 SMb20486     TRUE 0.999 -7.000 0.941 0.016 Y NA
 131783 131784 SMb20486 SMb20487     TRUE 0.999 -3.000 0.938 0.016 Y NA
 131784 131785 SMb20487 SMb20488     TRUE 0.993 3.000 0.375 NA Y NA
 131785 131786 SMb20488 SMb20489     TRUE 0.929 45.000 0.250 NA Y NA
 131786 131787 SMb20489 SMb20490   fucA2 TRUE 0.988 -7.000 0.273 1.000 Y NA
 5451307 131788 SM_b22020 SMb20491     FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 131788 131789 SMb20491 SMb20492     FALSE 0.230 322.000 0.000 0.072 Y NA
 131789 131790 SMb20492 SMb20493     TRUE 0.916 115.000 0.250 0.009 Y NA
 131791 131792 SMb20494 SMb20495     FALSE 0.004 881.000 0.000 1.000   NA
 131793 131794 SMb20496 SMb20497   lyx TRUE 0.915 9.000 0.083 1.000 N NA
 131794 131795 SMb20497 SMb20498 lyx   TRUE 0.934 31.000 0.154 1.000 Y NA
 131795 131796 SMb20498 SMb20499     TRUE 0.883 67.000 0.588 1.000 N NA
 131796 131797 SMb20499 SMb20500     TRUE 0.988 12.000 0.385 1.000 Y NA
 131797 131798 SMb20500 SM_b20501     TRUE 0.987 -3.000 0.364 1.000 N NA
 131798 131799 SM_b20501 SMb20502     TRUE 0.982 2.000 0.303 1.000 N NA
 131799 131800 SMb20502 SMb20503     TRUE 0.996 20.000 0.727 0.016 Y NA
 131800 131801 SMb20503 SMb20504     TRUE 0.884 66.000 0.239 NA Y NA
 131803 131804 SMb20506 SMb20507     TRUE 0.998 3.000 0.510 0.016 Y NA
 131804 131805 SMb20507 SMb20508     TRUE 0.988 65.000 0.857 0.016 Y NA
 131806 131807 SMb20509 SMb20510   dgoA TRUE 0.746 47.000 0.138 1.000 N NA
 131807 131808 SMb20510 SMb20511 dgoA   TRUE 0.807 31.000 0.000 0.072 N NA
 131808 5451308 SMb20511 SM_b22021     FALSE 0.070 349.000 0.000 0.072   NA
 5451308 131809 SM_b22021 SMb20513     FALSE 0.081 95.000 0.000 NA   NA
 131811 131812 SMb20515 SMb20516     FALSE 0.130 68.000 0.000 NA   NA
 131814 131815 SMb20518 SMb20519     FALSE 0.005 433.000 0.000 NA   NA
 131815 131816 SMb20519 SMb20520     FALSE 0.002 1778.000 0.000 NA   NA
 131816 131817 SMb20520 SMb20521     FALSE 0.010 293.000 0.000 NA   NA
 131817 131818 SMb20521 SMb20522     FALSE 0.010 292.000 0.000 NA   NA
 131821 131822 SMb20527 SMb20528     TRUE 0.582 80.000 0.184 NA   NA
 131822 131823 SMb20528 SMb20529     TRUE 0.970 -13.000 0.450 NA   NA
 131823 131824 SMb20529 SMb20530     TRUE 0.510 33.000 0.020 NA   NA
 131825 131826 SMb20531 SMb20532     TRUE 0.965 2.000 0.188 NA   NA
 131827 131828 SMb20533 SMb20534     FALSE 0.003 605.000 0.000 NA   NA
 131828 131829 SMb20534 SMb20535     TRUE 0.927 -3.000 0.039 NA N NA
 131829 131830 SMb20535 SMb20536     TRUE 0.971 -3.000 0.200 NA   NA
 131830 131831 SMb20536 SMb20537     TRUE 0.965 -3.000 0.167 NA   NA
 131832 131833 SMb20538 SMb20539   cyaF6 FALSE 0.005 1108.000 0.000 1.000 N NA
 131833 131834 SMb20539 SMb20540 cyaF6   FALSE 0.003 868.000 0.000 NA   NA
 131835 131836 SMb20541 SMb20542     TRUE 0.659 63.000 0.000 NA Y NA
 131838 131839 SMb20543 SMb20545     FALSE 0.004 593.000 0.000 NA   NA
 131839 131840 SMb20545 SMb20546     FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 131840 131841 SMb20546 SMb20547     FALSE 0.037 157.000 0.000 NA   NA
 131842 131843 SMb20548 SMb20549     FALSE 0.004 1624.000 0.000 1.000   NA
 131844 131845 SMb20550 SMb20551     FALSE 0.033 174.000 0.000 NA   NA
 131846 131847 SMb20552 SMb20553     FALSE 0.342 21.000 0.000 NA   NA
 131848 131849 SMb20554 SMb20555     TRUE 0.655 4.000 0.000 NA   NA
 131851 131852 SMb20557 SM_b20558     FALSE 0.003 721.000 0.000 NA   NA
 131854 131855 SMb20560 SMb20561     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 131855 131856 SMb20561 SMb20562     FALSE 0.048 131.000 0.000 NA   NA
 131856 131857 SMb20562 SMb20563     FALSE 0.060 115.000 0.000 NA   NA
 131858 131859 SMb20803 SMb20804 kdsB2   FALSE 0.211 43.000 0.000 NA   NA
 131859 131860 SMb20804 SMb20805     FALSE 0.143 63.000 0.000 NA   NA
 131864 131865 SMb20809 SMb20810 kpsF1   FALSE 0.124 113.000 0.000 1.000 N NA
 131865 131866 SMb20810 SMb20811     FALSE 0.042 146.000 0.000 NA   NA
 131868 131869 SM_b20813 SMb20814 msbA1   FALSE 0.008 338.000 0.000 NA   NA
 131870 131871 SMb20815 SMb20816     TRUE 0.641 66.000 0.000 NA Y NA
 131871 131872 SMb20816 SMb20817     FALSE 0.141 85.000 0.000 NA N NA
 131873 131874 SM_b20818 SMb20819 mocD mocE TRUE 0.963 43.000 1.000 1.000 N NA
 131874 131875 SMb20819 SMb20820 mocE mocF TRUE 0.912 110.000 0.727 0.051   NA
 131875 131876 SMb20820 SMb20821 mocF   FALSE 0.255 81.000 0.008 1.000   NA
 131876 131877 SMb20821 SMb20822   rkpT2 FALSE 0.032 245.000 0.000 1.000 N NA
 131878 131879 SMb20823 SMb20824 rkpZ2   FALSE 0.060 611.000 0.000 0.002   NA
 131880 131881 SMb20825 SMb20826     FALSE 0.130 68.000 0.000 NA   NA
 131881 131882 SMb20826 SMb20827     FALSE 0.186 224.000 0.000 NA Y NA
 131882 131883 SMb20827 SMb20828     FALSE 0.030 223.000 0.000 1.000   NA
 131883 131884 SMb20828 SMb21663     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131884 131885 SMb21663 SMb21664     FALSE 0.075 100.000 0.000 NA   NA
 131885 131886 SMb21664 SMb21665     FALSE 0.158 58.000 0.000 NA   NA
 131889 131890 SMb20831 SMb20832 rkpR/kpsE rkpS TRUE 0.549 380.000 0.889 NA Y NA
 131890 131891 SMb20832 SMb20833 rkpS rkpT1 TRUE 0.995 -3.000 0.111 0.080 Y NA
 131891 131892 SMb20833 SMb20834 rkpT1 rkpZ1 TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000   NA
 131892 131893 SMb20834 SMb20835 rkpZ1   FALSE 0.133 89.000 0.000 1.000   NA
 131893 131894 SMb20835 SMb20836     FALSE 0.499 -19.000 0.000 NA   NA
 131894 131895 SMb20836 SMb20837     FALSE 0.004 541.000 0.000 NA   NA
 131895 131896 SMb20837 SMb20838     FALSE 0.186 50.000 0.000 NA   NA
 131898 131899 SMb20840 SM_b20841     TRUE 0.505 -18.000 0.000 NA   NA
 131899 131900 SM_b20841 SMb20842     FALSE 0.007 348.000 0.000 NA   NA
 131900 131901 SMb20842 SMb20843   algI TRUE 0.655 4.000 0.000 NA   NA
 131901 131902 SMb20843 SMb21013 algI   FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 131902 131903 SMb21013 SMb21014     FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 131903 131904 SMb21014 SMb21015     FALSE 0.010 373.000 0.000 1.000   NA
 131904 131905 SMb21015 SMb21016     FALSE 0.459 65.000 0.062 NA   NA
 131905 131906 SMb21016 SMb21017     TRUE 0.997 3.000 0.844 NA Y NA
 131906 131907 SMb21017 SMb21018     TRUE 0.999 -3.000 0.788 0.016 Y NA
 131907 131908 SMb21018 SMb21019     TRUE 0.999 -7.000 0.818 0.016 Y NA
 131909 131910 SMb21021 SMb21022     TRUE 0.917 5.000 0.050 1.000 N NA
 131910 131911 SMb21022 SMb21023     TRUE 0.748 4.000 0.000 1.000   NA
 131911 131912 SMb21023 SMb21024     FALSE 0.034 169.000 0.000 NA   NA
 131913 131914 SMb21025 SMb21026     FALSE 0.042 144.000 0.000 NA   NA
 131914 131915 SMb21026 SMb21027     FALSE 0.003 697.000 0.000 NA   NA
 131915 131916 SMb21027 SMb21028     FALSE 0.021 215.000 0.000 NA   NA
 131918 131919 SMb21030 SM_b21031     TRUE 0.967 12.000 0.444 NA   NA
 131920 131921 SMb21032 SMb21034     FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 131923 131924 SMb21036 SMb21037     FALSE 0.036 163.000 0.000 NA   NA
 131924 131925 SMb21037 SMb21038     TRUE 0.994 7.000 0.222 0.069 Y NA
 131925 131926 SMb21038 SMb21039     TRUE 0.961 14.000 0.000 0.090 Y NA
 131926 131927 SMb21039 SMb21040     TRUE 0.801 -3.000 0.000 1.000   NA
 131927 131928 SMb21040 SMb21041     FALSE 0.091 88.000 0.000 NA   NA
 131928 131929 SMb21041 SMb21042   pepT FALSE 0.087 117.000 0.000 NA N NA
 131929 131930 SMb21042 SMb21043 pepT   FALSE 0.005 610.000 0.000 1.000   NA
 131931 131932 SMb21044 SMb21695     FALSE 0.003 722.000 0.000 NA   NA
 131932 131933 SMb21695 SMb21698     FALSE 0.006 411.000 0.000 NA   NA
 131933 131934 SMb21698 SMb21662   exoI2 FALSE 0.002 1718.000 0.000 NA   NA
 131935 131936 SMb21696 SMb21697     TRUE 0.523 -13.000 0.000 NA   NA
 131936 131937 SMb21697 SM_b21661   TRm10-1a FALSE 0.004 543.000 0.000 NA   NA
 131937 131938 SM_b21661 SM_b21711 TRm10-1a TRm10-1b-1 FALSE 0.481 -27.000 0.000 NA   NA
 131938 131939 SM_b21711 SMb21045 TRm10-1b-1   FALSE 0.004 512.000 0.000 NA   NA
 131939 131940 SMb21045 SM_b21046   TRm10-1b-2 TRUE 0.532 96.000 0.000 1.000 Y NA
 131941 131942 SMb21047 SMb21048     FALSE 0.050 127.000 0.000 NA   NA
 131942 131943 SMb21048 SMb21049     FALSE 0.202 46.000 0.000 NA   NA
 131946 131947 SMb21052 SMb21053     TRUE 0.875 20.000 0.000 1.000 Y NA
 131948 131949 SMb21054 SMb21055     FALSE 0.018 233.000 0.000 NA   NA
 131949 131950 SMb21055 SMb21056     FALSE 0.046 135.000 0.000 NA   NA
 131950 131951 SMb21056 SMb21057     FALSE 0.468 -34.000 0.000 NA   NA
 131952 131953 SMb21058 SMb21059     TRUE 0.910 24.000 0.000 0.000   NA
 131953 131954 SMb21059 SMb21060     TRUE 0.897 5.000 0.042 1.000   NA
 131954 131955 SMb21060 SMb21061     TRUE 0.906 23.000 0.280 1.000   NA
 131955 131956 SMb21061 SMb21062     FALSE 0.334 22.000 0.000 NA   NA
 131956 131957 SMb21062 SMb21063     FALSE 0.154 59.000 0.000 NA   NA
 131957 131958 SMb21063 SMb21064     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131959 131960 SMb21065 SMb21066     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 131960 131961 SMb21066 SMb21067     FALSE 0.399 16.000 0.000 NA   NA
 131961 131962 SMb21067 SMb21068     FALSE 0.014 309.000 0.000 NA N NA
 131963 131964 SM_b21069 SMb21070   exoP2 FALSE 0.010 381.000 0.000 1.000   NA
 131964 131965 SMb21070 SMb21071 exoP2   FALSE 0.068 414.000 0.000 1.000 Y NA
 131966 131967 SMb21072 SMb21073   exoF2 FALSE 0.005 428.000 0.000 NA   NA
 131967 131968 SMb21073 SMb21074 exoF2   FALSE 0.482 72.000 0.087 NA   NA
 131970 131971 SMb21076 SMb21077     FALSE 0.040 150.000 0.000 NA   NA
 131972 131973 SMb21078 SMb21079     FALSE 0.011 429.000 0.000 1.000 N NA
 131973 131974 SMb21079 SMb21080     FALSE 0.114 301.000 0.000 1.000 Y NA
 131974 131975 SMb21080 SMb21081   manB TRUE 0.530 37.000 0.007 1.000 N NA
 131975 131976 SMb21081 SMb21082 manB manC/manA TRUE 0.854 32.000 0.007 1.000 Y NA
 131976 131977 SMb21082 SMb21083 manC/manA   FALSE 0.094 136.000 0.000 1.000 N NA
 131977 131978 SMb21083 SMb21084     TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA Y NA
 131978 131979 SMb21084 SMb21085     TRUE 0.894 63.000 0.250 NA Y NA
 131983 131984 SMb21089 SMb21090     TRUE 0.864 86.000 0.750 NA N NA
 131984 131985 SMb21090 SMb21091   lysM FALSE 0.015 305.000 0.000 NA N NA
 131985 131986 SMb21091 SMb21092 lysM   TRUE 0.726 5.000 0.000 1.000   NA
 131988 131989 SMb21094 SMb21095 argH2   TRUE 0.977 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 131989 131990 SMb21095 SM_b21096     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.003 Y NA
 131990 131991 SM_b21096 SMb21097     TRUE 0.980 50.000 0.900 1.000 Y NA
 131991 131992 SMb21097 SMb21098     FALSE 0.147 83.000 0.000 1.000   NA
 131992 131993 SMb21098 SMb21099     FALSE 0.434 171.000 0.000 0.000   NA
 131993 131994 SMb21099 SMb21100     TRUE 0.632 11.000 0.000 1.000   NA
 131995 131996 SMb21101 SMb21102     TRUE 0.693 51.000 0.131 1.000   NA
 131997 131998 SMb21103 SM_b21104     TRUE 0.950 70.000 0.250 0.069 Y NA
 131998 131999 SM_b21104 SMb21105     TRUE 0.997 0.000 0.250 0.069 Y NA
 131999 132000 SMb21105 SMb21106     TRUE 0.996 7.000 0.318 0.069 Y NA
 132000 132001 SMb21106 SMb21107   manR TRUE 0.976 2.000 0.219 1.000 N NA
 132001 132002 SMb21107 SMb21108 manR   TRUE 0.893 13.000 0.140 NA   NA
 132002 132003 SMb21108 SMb21109     TRUE 0.906 -7.000 0.088 NA   NA
 132003 132004 SMb21109 SMb21110     TRUE 0.994 2.000 0.364 0.039   NA
 132004 132005 SMb21110 SMb21111     TRUE 0.995 -3.000 0.091 0.039 Y NA
 132005 132006 SMb21111 SMb21112   hpaG TRUE 0.990 23.000 0.429 0.071 Y NA
 132006 132007 SMb21112 SM_b21113 hpaG   TRUE 0.645 124.000 0.097 0.021 N NA
 132008 132009 SMb21114 SMb21115 nrtA   TRUE 0.937 26.000 0.466 NA N NA
 132009 132010 SMb21115 SMb21116     FALSE 0.021 214.000 0.000 NA   NA
 132010 132011 SMb21116 SMb21117     TRUE 0.666 84.000 0.286 NA   NA
 132013 132014 SM_b21119 SMb21120 gntK   FALSE 0.491 -22.000 0.000 NA   NA
 132014 132015 SMb21120 SMb21121   ivdH TRUE 0.590 -7.000 0.000 NA   NA
 132015 132016 SMb21121 SMb21122 ivdH mccA TRUE 0.965 28.000 0.316 1.000 Y NA
 132016 132017 SMb21122 SMb21123 mccA   TRUE 0.686 15.000 0.009 NA N NA
 132017 132018 SMb21123 SMb21124   mccB TRUE 0.668 17.000 0.012 NA N NA
 132018 132019 SMb21124 SMb21125 mccB hmgL TRUE 0.992 -3.000 0.229 0.071 N NA
 132019 132020 SMb21125 SMb21126 hmgL eccH2 TRUE 0.992 -3.000 0.218 0.071 N NA
 132020 132021 SMb21126 SMb21127 eccH2   FALSE 0.400 77.000 0.061 NA   NA
 132021 132022 SMb21127 SMb21128     TRUE 0.980 7.000 0.500 NA   NA
 132023 132024 SMb21129 SMb21130     FALSE 0.134 153.000 0.010 1.000 N NA
 132024 132025 SMb21130 SMb21131     TRUE 0.988 16.000 0.587 1.000 Y NA
 132025 132026 SMb21131 SMb21132     TRUE 0.997 -16.000 0.935 0.000 N NA
 132026 132027 SMb21132 SMb21133     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.001 N NA
 132027 132028 SMb21133 SMb21134     FALSE 0.027 265.000 0.000 1.000 N NA
 132029 132030 SMb21135 SMb21136     TRUE 0.990 40.000 0.706 0.069 Y NA
 132030 132031 SMb21136 SMb21137     TRUE 0.995 6.000 0.148 0.008 Y NA
 132031 132032 SMb21137 SMb21138     TRUE 0.964 14.000 0.125 1.000 Y NA
 132032 132033 SMb21138 SMb21139     TRUE 0.881 37.000 0.333 NA N NA
 132033 132034 SMb21139 SMb21140     TRUE 0.974 -3.000 0.200 NA N NA
 132035 132036 SMb21216 SMb21217     TRUE 0.990 -3.000 0.182 NA Y NA
 132036 132037 SMb21217 SMb21218     TRUE 0.992 3.000 0.727 NA N NA
 132037 132038 SMb21218 SMb21219     TRUE 0.987 3.000 0.444 1.000 N NA
 132038 132039 SMb21219 SM_b21220     TRUE 0.999 0.000 0.810 0.069 Y NA
 132039 132040 SM_b21220 SMb21221     TRUE 0.541 243.000 0.095 0.069 Y NA
 132041 132042 SMb21222 SMb21223   nodP2 FALSE 0.048 208.000 0.000 1.000 N NA
 132042 132043 SMb21223 SMb21224 nodP2 nodQ2 TRUE 0.992 0.000 0.096 0.001 N NA
 132043 132044 SMb21224 SMb21225 nodQ2   TRUE 0.986 -3.000 0.076 1.000 Y NA
 132044 132045 SMb21225 SMb21226     FALSE 0.349 47.000 0.000 1.000 N NA
 132045 132046 SMb21226 SMb21227     TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 132046 132047 SMb21227 SMb21228     TRUE 0.926 6.000 0.077 1.000 N NA
 132048 132049 SMb21229 SMb21230     FALSE 0.020 264.000 0.000 1.000   NA
 132049 132050 SMb21230 SMb21231     TRUE 0.930 69.000 0.089 0.014 Y NA
 132050 132051 SMb21231 SMb21232     FALSE 0.453 257.000 0.017 0.014 Y NA
 132051 132052 SMb21232 SMb21233   TRm1b TRUE 0.819 3.000 0.000 1.000 N NA
 132052 132053 SMb21233 SM_b21234 TRm1b TRm1a TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.048 Y NA
 132053 132054 SM_b21234 SMb21235 TRm1a   FALSE 0.010 481.000 0.000 1.000 N NA
 132055 132056 SMb21236 SMb21237     FALSE 0.099 83.000 0.000 NA   NA
 132056 132057 SMb21237 SMb21238     FALSE 0.217 41.000 0.000 NA   NA
 132057 132058 SMb21238 SMb21239     FALSE 0.499 -19.000 0.000 NA   NA
 132059 132060 SMb21240 SMb21241     FALSE 0.009 314.000 0.000 NA   NA
 132060 132061 SMb21241 SMb21242     TRUE 0.804 36.000 0.200 NA   NA
 132061 132062 SMb21242 SMb21243     FALSE 0.327 176.000 0.200 1.000   NA
 132062 132063 SMb21243 SMb21244     FALSE 0.028 231.000 0.000 1.000   NA
 132064 132065 SMb21245 SM_b21246 exoF3   TRUE 0.911 63.000 0.286 1.000 Y NA
 132065 132066 SM_b21246 SMb21247     TRUE 0.617 41.000 0.071 NA   NA
 132066 132067 SMb21247 SMb21248     FALSE 0.356 69.000 0.032 NA   NA
 132069 132070 SMb21250 SMb21251     TRUE 0.740 106.000 0.154 1.000 Y NA
 132070 132071 SMb21251 SMb21252     TRUE 0.745 78.000 0.051 1.000 Y NA
 132071 132072 SMb21252 SMb21253     TRUE 0.959 -3.000 0.111 1.000   NA
 132076 132077 SMb21257 SMb21258     TRUE 0.938 -33.000 0.000 0.005   NA
 132077 132078 SMb21258 SMb21259     TRUE 0.971 -3.000 0.200 NA   NA
 132078 132079 SMb21259 SMb21260     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 132079 132080 SMb21260 SMb21261     TRUE 0.994 -3.000 0.741 1.000   NA
 132080 132081 SMb21261 SMb21262     TRUE 0.999 2.000 0.821 0.068 Y NA
 132081 132082 SMb21262 SMb21263     TRUE 0.957 81.000 0.929 0.068   NA
 132082 132083 SMb21263 SMb21264   redA TRUE 0.582 80.000 0.158 1.000   NA
 132083 132084 SMb21264 SMb21265 redA redB TRUE 0.986 7.000 0.614 1.000   NA
 132084 132085 SMb21265 SMb21266 redB   TRUE 0.983 -3.000 0.318 1.000   NA
 132085 132086 SMb21266 SMb21267     FALSE 0.154 59.000 0.000 NA   NA
 132086 132087 SMb21267 SMb21268     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 132087 132088 SMb21268 SMb21269     TRUE 0.935 -52.000 0.000 0.005   NA
 132088 132089 SMb21269 SMb21270     FALSE 0.156 97.000 0.000 1.000 N NA
 132089 132090 SMb21270 SMb21271     TRUE 0.583 84.000 0.200 NA   NA
 132090 132091 SMb21271 SMb21272     FALSE 0.041 148.000 0.000 NA   NA
 132091 132092 SMb21272 SMb21273   potD TRUE 0.985 -3.000 0.318 1.000 N NA
 132092 132093 SMb21273 SMb21274 potD potB TRUE 0.992 17.000 0.409 0.068 Y NA
 132093 132094 SMb21274 SMb21275 potB potC TRUE 0.998 -3.000 0.350 0.068 Y NA
 132094 132096 SMb21275 SMb21277 potC   FALSE 0.006 1028.000 0.000 1.000 N NA
 132096 132097 SMb21277 SMb21278   adeC2 TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 132099 132100 SMb21280 SMb21281     FALSE 0.039 200.000 0.000 1.000   NA
 132100 5451309 SMb21281 SM_b22012     FALSE 0.012 273.000 0.000 NA   NA
 132102 132103 SMb21283 SMb21284     TRUE 0.826 10.000 0.013 1.000 N NA
 132104 132105 SMb21285 SMb21286   xdhA1 TRUE 0.947 6.000 0.154 1.000   NA
 132105 132106 SMb21286 SMb21287 xdhA1 xdhB1 TRUE 0.995 14.000 0.286 0.001 Y NA
 132106 132107 SMb21287 SMb21288 xdhB1 xdhC TRUE 0.898 27.000 0.292 NA N NA
 132111 132112 SMb21292 SMb21293   guaD1 TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000   NA
 132113 132114 SMb21294 SMb21295     FALSE 0.389 124.000 0.000 NA Y NA
 132116 132117 SMb21297 SMb21298 pbpC   TRUE 0.978 9.000 0.473 1.000   NA
 132118 132119 SMb21299 SMb21300 deoR deoC FALSE 0.264 95.000 0.014 1.000 N NA
 132119 132120 SMb21300 SMb21301 deoC   TRUE 0.974 5.000 0.277 1.000 N NA
 132120 132121 SMb21301 SMb21302     FALSE 0.279 125.000 0.061 1.000 N NA
 132121 132122 SMb21302 SMb21303     TRUE 0.529 21.000 0.000 1.000 N NA
 132122 132123 SMb21303 SMb21304     TRUE 0.644 34.000 0.032 1.000 N NA
 132125 132126 SMb21144 SMb21145     TRUE 0.930 78.000 0.521 0.068 N NA
 132126 132127 SMb21145 SMb21146     TRUE 0.996 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 132127 132128 SMb21146 SMb21147     TRUE 0.999 0.000 0.542 0.004 Y NA
 132128 132129 SMb21147 SMb21148     FALSE 0.044 189.000 0.000 1.000   NA
 132129 132130 SMb21148 SMb21149     TRUE 0.950 13.000 0.300 1.000   NA
 132130 132131 SMb21149 SMb21150     TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.068 Y NA
 132131 132132 SMb21150 SMb21151     TRUE 0.985 30.000 0.357 0.068 Y NA
 132132 132133 SMb21151 SMb21152     TRUE 0.950 89.000 0.400 0.068 Y NA
 132133 132134 SMb21152 SMb21153     TRUE 0.965 3.000 0.154 1.000 N NA
 132134 132135 SMb21153 SMb21154     FALSE 0.061 151.000 0.000 NA N NA
 132136 132137 SMb21155 SMb21156     TRUE 0.972 2.000 0.231 NA   NA
 132138 132139 SMb21157 SMb21158     TRUE 0.955 21.000 0.538 NA N NA
 132139 132140 SMb21158 SMb21159     TRUE 0.947 20.000 0.417 1.000 N NA
 132140 132141 SMb21159 SMb21160   hexA TRUE 0.899 25.000 0.250 1.000 N NA
 132141 132142 SMb21160 SMb21161 hexA   TRUE 0.908 9.000 0.109 NA   NA
 132142 132143 SMb21161 SMb21162     FALSE 0.428 74.000 0.065 NA   NA
 132144 132145 SMb21163 SMb21164 hutU hutG TRUE 0.983 3.000 0.081 1.000 Y NA
 132145 132146 SMb21164 SMb21165 hutG hutH1 TRUE 0.983 2.000 0.064 1.000 Y NA
 132146 132147 SMb21165 SM_b21166 hutH1 hutI TRUE 0.992 -3.000 0.192 0.026 N NA
 132147 132148 SM_b21166 SMb21167 hutI   FALSE 0.413 35.000 0.000 1.000 N NA
 132148 132149 SMb21167 SMb21168     FALSE 0.067 177.000 0.000 1.000 N NA
 132151 132152 SMb21170 SMb21171   phnM TRUE 0.990 -3.000 0.173 NA Y NA
 132153 132154 SMb21172 SMb21173     FALSE 0.105 80.000 0.000 NA   NA
 132155 132156 SMb21174 SMb21175 phoT phoE TRUE 0.998 10.000 0.491 0.000 Y NA
 132156 132157 SMb21175 SMb21176 phoE phoD TRUE 0.942 172.000 0.568 0.000 Y NA
 132157 132158 SMb21176 SMb21177 phoD phoC TRUE 0.978 92.000 0.589 0.001 Y NA
 132158 132159 SMb21177 SMb21178 phoC   FALSE 0.072 167.000 0.000 1.000 N NA
 132159 132160 SMb21178 SMb21179     FALSE 0.143 103.000 0.000 1.000 N NA
 132160 132161 SMb21179 SMb21180     FALSE 0.441 31.000 0.000 1.000 N NA
 132162 132163 SMb21181 SMb21182     TRUE 0.852 12.000 0.039 1.000 N NA
 132166 132167 SMb21185 SMb21186 gabD2 gabT TRUE 0.530 116.000 0.222 1.000 N NA
 132168 132169 SMb21187 SMb21188     FALSE 0.016 344.000 0.000 1.000 N NA
 132169 132170 SMb21188 SMb21189     TRUE 0.858 18.000 0.133 NA N NA
 132170 132171 SMb21189 SMb21190     TRUE 0.973 2.000 0.238 NA   NA
 132171 132172 SMb21190 SMb21191   msbA2 TRUE 0.954 10.000 0.267 NA   NA
 132176 132177 SMb21196 SMb21197 oppA oppB TRUE 0.959 52.000 0.192 0.068 Y NA
 132177 132178 SMb21197 SMb21198 oppB oppC TRUE 0.999 -7.000 0.870 0.068 Y NA
 132178 132179 SMb21198 SMb21199 oppC oppD TRUE 0.955 2.000 0.115 1.000   NA
 132180 132181 SMb21200 SMb21201     TRUE 0.998 -3.000 0.375 0.079 Y NA
 132182 132183 SMb21202 SMb21203     TRUE 0.810 101.000 0.667 1.000   NA
 132184 132185 SMb21666 SMb21204     FALSE 0.091 88.000 0.000 NA   NA
 132185 132186 SMb21204 SMb21205     TRUE 0.997 2.000 0.609 0.005 N NA
 132186 132187 SMb21205 SMb21206     TRUE 0.996 -3.000 0.547 0.079   NA
 132187 132188 SMb21206 SMb21207     TRUE 0.991 0.000 0.545 1.000   NA
 132188 132189 SMb21207 SM_b21208     TRUE 0.978 -3.000 0.236 1.000   NA
 132189 132190 SM_b21208 SMb21209     FALSE 0.120 96.000 0.000 1.000   NA
 132190 132191 SMb21209 SMb21210     TRUE 0.997 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 132192 132193 SMb21211 SMb21212     FALSE 0.364 112.000 0.125 NA   NA
 132193 132194 SMb21212 SMb21667     FALSE 0.125 71.000 0.000 NA   NA
 132194 132195 SMb21667 SMb21213   pphA TRUE 0.590 -7.000 0.000 NA   NA
 132195 132196 SMb21213 SMb21214 pphA orf24 TRUE 0.661 129.000 0.500 1.000   NA
 132197 132198 SMb21215 SMb21307 orf23 expE8 FALSE 0.057 118.000 0.000 NA   NA
 132198 132199 SMb21307 SMb21308 expE8 expE7 FALSE 0.205 45.000 0.000 NA   NA
 132199 132200 SMb21308 SMb21309 expE7 expE6 TRUE 0.988 -3.000 0.462 NA   NA
 132200 132201 SMb21309 SMb21310 expE6 expE5 TRUE 0.978 9.000 0.500 NA   NA
 132201 132202 SMb21310 SMb21311 expE5 expE4 TRUE 0.984 12.000 0.800 NA   NA
 132202 132203 SMb21311 SMb21312 expE4 expE3 TRUE 0.967 -3.000 0.152 1.000   NA
 132203 132204 SMb21312 SMb21313 expE3 expE2 TRUE 0.963 -3.000 0.152 NA   NA
 132204 132205 SMb21313 SMb21314 expE2 expE1 TRUE 0.765 131.000 0.833 NA   NA
 132205 132206 SMb21314 SMb21315 expE1 expD2 FALSE 0.018 275.000 0.000 1.000   NA
 132206 132207 SMb21315 SMb21316 expD2 expD1 TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.004   NA
 132208 132209 SMb21317 SMb21318 expG expC TRUE 0.731 138.000 0.667 1.000 N NA
 132209 132210 SMb21318 SMb21319 expC expA1 FALSE 0.030 184.000 0.000 NA   NA
 132210 132211 SMb21319 SMb21320 expA1 expA23 TRUE 0.979 -13.000 0.600 NA   NA
 132211 132212 SMb21320 SMb21321 expA23 expA4 TRUE 0.895 35.000 0.400 NA   NA
 132212 132213 SMb21321 SMb21322 expA4 expA5 TRUE 0.956 43.000 1.000 NA   NA
 132213 132214 SMb21322 SMb21323 expA5 expA6 TRUE 0.982 -13.000 0.667 NA   NA
 132214 132215 SMb21323 SMb21324 expA6 expA7 FALSE 0.430 23.000 0.000 1.000   NA
 132215 132216 SMb21324 SMb21325 expA7 expA8 TRUE 0.949 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 132216 132217 SMb21325 SMb21326 expA8 expA9 TRUE 0.929 12.000 0.000 1.000 Y NA
 132217 132218 SMb21326 SMb21327 expA9 expA10 TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 132219 132220 SMb21328 SMb21329     FALSE 0.154 59.000 0.000 NA   NA
 132221 132222 SM_b21330 SMb21331     FALSE 0.018 232.000 0.000 NA   NA
 132222 132223 SMb21331 SMb21332     FALSE 0.012 274.000 0.000 NA   NA
 132223 132224 SMb21332 SMb21333     FALSE 0.167 55.000 0.000 NA   NA
 132224 132225 SMb21333 SMb21334     FALSE 0.040 149.000 0.000 NA   NA
 132227 132228 SMb21336 SMb21337     FALSE 0.102 127.000 0.000 1.000 N NA
 132228 132229 SMb21337 SMb21338     TRUE 0.987 4.000 0.000 0.051 Y NA
 132229 132230 SMb21338 SMb21339     TRUE 0.965 2.000 0.000 0.051   NA
 132230 132231 SMb21339 SMb21340     TRUE 0.922 -27.000 0.000 0.039   NA
 132232 132233 SMb21341 SMb21342     TRUE 0.783 54.000 0.267 NA   NA
 132233 132234 SMb21342 SMb21343     TRUE 0.997 7.000 1.000 0.015   NA
 132234 132235 SMb21343 SMb21344     TRUE 0.996 2.000 0.500 0.015   NA
 132235 132236 SMb21344 SMb21345     TRUE 0.953 100.000 0.429 0.015 Y NA
 132238 132239 SMb21347 SMb21348     TRUE 0.796 10.000 0.025 NA   NA
 132239 132240 SMb21348 SMb21349     TRUE 0.991 -3.000 0.529 1.000 N NA
 132240 132241 SMb21349 SMb21350     FALSE 0.096 133.000 0.000 1.000 N NA
 132241 132242 SMb21350 SMb21351   dctM TRUE 0.934 9.000 0.125 1.000 N NA
 132242 132243 SMb21351 SMb21352 dctM dctQ TRUE 0.992 5.000 0.390 NA Y NA
 132243 132244 SMb21352 SMb21353 dctQ dctP TRUE 0.860 155.000 0.756 NA Y NA
 132244 132245 SMb21353 SMb21354 dctP uxaC TRUE 0.923 31.000 0.115 1.000 Y NA
 132246 132247 SMb21355 SMb21356     FALSE 0.121 95.000 0.000 1.000   NA
 132247 132248 SMb21356 SMb21357     FALSE 0.077 98.000 0.000 NA   NA
 132250 132251 SMb21359 SMb21360     FALSE 0.440 -133.000 0.000 NA   NA
 132251 132252 SMb21360 SMb21361     FALSE 0.133 66.000 0.000 NA   NA
 132252 132253 SMb21361 SMb21362     TRUE 0.741 124.000 0.704 NA   NA
 132253 132254 SMb21362 SMb21668     FALSE 0.043 141.000 0.000 NA   NA
 132254 132255 SMb21668 SMb21363     FALSE 0.158 58.000 0.000 NA   NA
 132256 132257 SMb21364 SMb21365     TRUE 0.979 -7.000 0.488 NA   NA
 132258 132259 SMb21669 SMb21366     FALSE 0.217 41.000 0.000 NA   NA
 132259 132260 SMb21366 SMb21367   cycA TRUE 0.565 -9.000 0.000 NA   NA
 132260 132261 SMb21367 SMb21368 cycA   TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 132261 132262 SMb21368 SMb21369     TRUE 0.804 4.000 0.000 1.000 N NA
 132262 132263 SMb21369 SMb21370     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.043 N NA
 132263 132264 SMb21370 SMb21371     TRUE 0.896 8.000 0.083 NA   NA
 132265 132266 SMb21372 SMb21373     FALSE 0.334 112.000 0.067 1.000 N NA
 132266 132267 SMb21373 SMb21374     TRUE 0.996 3.000 0.500 1.000 Y NA
 132267 132268 SMb21374 SMb21375     TRUE 0.965 24.000 0.273 1.000 Y NA
 132268 132269 SMb21375 SMb21376     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.015 Y NA
 132269 132270 SMb21376 SMb21377     TRUE 0.979 102.000 0.900 0.015 Y NA
 132270 132271 SMb21377 SMb21378     FALSE 0.056 158.000 0.000 1.000   NA
 132273 132274 SMb21380 SMb21381     FALSE 0.290 28.000 0.000 NA   NA
 132274 132275 SMb21381 SMb21382     FALSE 0.469 13.000 0.000 NA   NA
 132275 132276 SMb21382 SMb21383     FALSE 0.017 237.000 0.000 NA   NA
 132276 132277 SMb21383 SMb21384     TRUE 0.760 104.000 0.154 0.039 N NA
 132280 132281 SMb21526 SMb21527 tauA tauB TRUE 0.864 89.000 0.302 1.000 Y NA
 132281 132282 SMb21527 SMb21528 tauB tauC TRUE 0.996 -7.000 0.728 1.000 Y NA
 132282 132283 SMb21528 SM_b21670 tauC   FALSE 0.058 117.000 0.000 NA   NA
 132283 132284 SM_b21670 SMb21529   tauD TRUE 0.883 25.000 0.259 NA   NA
 132284 132285 SMb21529 SMb21530 tauD ilvB2 TRUE 0.901 42.000 0.121 1.000 Y NA
 132285 132286 SMb21530 SMb21531 ilvB2   TRUE 0.512 61.000 0.077 NA   NA
 132286 132287 SMb21531 SMb21532   pta TRUE 0.718 0.000 0.000 NA   NA
 132287 132288 SMb21532 SMb21533 pta   FALSE 0.088 143.000 0.000 1.000 N NA
 132288 132289 SMb21533 SMb21534     FALSE 0.203 80.000 0.000 1.000 N NA
 132291 132292 SMb21536 SMb21537     FALSE 0.085 147.000 0.000 1.000 N NA
 132292 132293 SMb21537 SMb21538   phnA TRUE 0.922 28.000 0.400 1.000   NA
 132293 132294 SMb21538 SMb21539 phnA   TRUE 0.986 -3.000 0.375 1.000   NA
 132294 132295 SMb21539 SMb21671     TRUE 0.590 7.000 0.000 NA   NA
 132295 132296 SMb21671 SMb21540     FALSE 0.019 223.000 0.000 NA   NA
 132296 132297 SMb21540 SMb21541     TRUE 0.605 65.000 0.000 0.090 N NA
 132297 132298 SMb21541 SMb21542     TRUE 0.992 6.000 0.400 0.068 N NA
 132298 132299 SMb21542 SMb21543     FALSE 0.063 185.000 0.000 1.000 N NA
 132299 132300 SMb21543 SMb21544     TRUE 0.560 125.000 0.364 NA   NA
 132301 132302 SMb21545 SMb21546     TRUE 0.997 -12.000 0.500 0.015 Y NA
 132303 132304 SMb21547 SMb21548     FALSE 0.089 89.000 0.000 NA   NA
 132304 132305 SMb21548 SMb21549   thtR FALSE 0.034 210.000 0.000 1.000   NA
 132305 132306 SMb21549 SMb21550 thtR   TRUE 0.591 81.000 0.197 NA   NA
 132306 132307 SMb21550 SMb21551     FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 132307 132308 SMb21551 SMb21552   aacC4 FALSE 0.034 169.000 0.000 NA   NA
 132308 132309 SMb21552 SMb21554 aacC4   FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 132309 132310 SMb21554 SMb21555   kefB2 FALSE 0.004 500.000 0.000 NA   NA
 132311 132312 SMb21556 SMb21557     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 132312 132313 SMb21557 SMb21558     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.050 Y NA
 132313 132314 SMb21558 SMb21559     TRUE 0.602 199.000 0.667 1.000 N NA
 132314 132315 SMb21559 SMb21560     FALSE 0.024 283.000 0.000 1.000 N NA
 132315 132316 SMb21560 SMb21561     TRUE 0.996 5.000 0.630 1.000 Y NA
 132316 132317 SMb21561 SMb21562     TRUE 0.947 37.000 0.296 NA Y NA
 132317 132318 SMb21562 SMb21563     FALSE 0.048 131.000 0.000 NA   NA
 132319 132320 SMb21564 SMb21565     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 132321 5451310 SMb21566 SM_b22023 groEL5 groES5 TRUE 0.930 47.000 0.000 0.004 Y NA
 132324 132325 SMb21569 SMb21570   stcD2 TRUE 0.732 47.000 0.171 NA   NA
 132326 132327 SMb21571 SMb21572     FALSE 0.154 98.000 0.000 1.000 N NA
 132327 132328 SMb21572 SMb21573     FALSE 0.118 97.000 0.000 1.000   NA
 132328 132329 SMb21573 SMb21574     FALSE 0.008 420.000 0.000 1.000   NA
 132330 132331 SMb21575 SMb21576     TRUE 0.831 2.000 0.000 1.000 N NA
 132331 132332 SMb21576 SMb21577     FALSE 0.005 416.000 0.000 NA   NA
 132333 132334 SMb21578 SMb21579 atcU2 hmrR2 TRUE 0.774 60.000 0.000 0.004 N NA
 132336 132337 SMb21581 SMb21582     FALSE 0.080 96.000 0.000 NA   NA
 132337 132338 SMb21582 SMb21583     FALSE 0.370 18.000 0.000 NA   NA
 132338 132339 SMb21583 SMb21584     FALSE 0.221 40.000 0.000 NA   NA
 132339 132340 SMb21584 SM_b21585     TRUE 0.951 -3.000 0.104 NA   NA
 132340 132341 SM_b21585 SMb21586   gshB2 TRUE 0.786 15.000 0.059 NA   NA
 132341 132342 SMb21586 SMb21587 gshB2   FALSE 0.082 152.000 0.000 1.000 N NA
 132342 132343 SMb21587 SMb21588     TRUE 0.957 143.000 0.804 0.015 Y NA
 132343 132344 SMb21588 SMb21589     TRUE 0.999 -3.000 0.506 0.015 Y NA
 132344 132345 SMb21589 SMb21590     TRUE 0.999 -3.000 0.865 0.015 Y NA
 132345 132346 SMb21590 SMb21591     TRUE 0.733 18.000 0.022 1.000 N NA
 132347 132348 SMb21592 SMb21593     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.068 Y NA
 132348 132349 SMb21593 SMb21594     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.068 Y NA
 132349 132350 SMb21594 SMb21595     TRUE 0.926 170.000 0.700 0.068 Y NA
 132350 132351 SMb21595 SMb21596     TRUE 0.939 65.000 0.500 NA Y NA
 132351 132352 SMb21596 SMb21597     TRUE 0.966 14.000 0.520 NA   NA
 132353 132354 SMb21598 SMb21599     FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 132355 132356 SMb21600 SMb21601 ampC   FALSE 0.024 282.000 0.000 1.000 N NA
 132356 132357 SMb21601 SMb21602     FALSE 0.102 127.000 0.000 1.000 N NA
 132357 132358 SMb21602 SMb21603     TRUE 0.999 4.000 1.000 0.068 Y NA
 132358 132359 SMb21603 SMb21604     TRUE 0.985 79.000 1.000 0.068 Y NA
 132359 132360 SMb21604 SMb21605     TRUE 0.967 87.000 0.571 0.068 Y NA
 132360 132361 SMb21605 SMb20924   abfA TRUE 0.976 62.000 1.000 1.000 Y NA
 132362 132363 SMb21672 SMb20925     FALSE 0.074 101.000 0.000 NA   NA
 132363 132364 SMb20925 SMb20926     FALSE 0.054 122.000 0.000 NA   NA
 132367 132368 SMb20929 SMb20930     TRUE 0.984 29.000 0.667 0.015   NA
 132371 132372 SMb20933 SMb20934 exsG exsF TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 132374 132375 SMb20936 SMb20937   exsE FALSE 0.225 39.000 0.000 NA   NA
 132376 132377 SMb20938 SMb20939 exsD exsC TRUE 0.976 -3.000 0.195 1.000 N NA
 132377 132378 SMb20939 SMb20940 exsC exsB TRUE 0.927 -3.000 0.055 NA   NA
 132378 132379 SMb20940 SMb20941 exsB exsA FALSE 0.042 145.000 0.000 NA   NA
 132381 132382 SMb20943 SMb20944 exoZ exoQ TRUE 0.715 51.000 0.150 NA N NA
 132382 132383 SMb20944 SMb20945 exoQ exoF1 TRUE 0.990 8.000 0.400 NA Y NA
 132383 132384 SMb20945 SMb20946 exoF1 exoY TRUE 0.965 53.000 0.611 1.000 Y NA
 132385 132386 SMb20947 SMb20948 exoX exoU FALSE 0.046 135.000 0.000 NA   NA
 132387 132388 SMb20949 SMb21690 exoV exoW FALSE 0.322 114.000 0.100 NA   NA
 132389 132390 SMb20950 SMb21673 exoT   FALSE 0.283 29.000 0.000 NA   NA
 132390 132391 SMb21673 SMb20951   exoI FALSE 0.061 114.000 0.000 NA   NA
 132391 132392 SMb20951 SMb20952 exoI   TRUE 0.978 20.000 1.000 NA   NA
 132392 132393 SMb20952 SMb20953     FALSE 0.087 91.000 0.000 NA   NA
 132393 132394 SMb20953 SMb20954   exoH FALSE 0.044 139.000 0.000 NA   NA
 132394 132395 SMb20954 SMb20955 exoH exoK TRUE 0.966 6.000 0.250 1.000   NA
 132395 132396 SMb20955 SMb20956 exoK exoL FALSE 0.433 96.000 0.129 NA   NA
 132396 132397 SMb20956 SMb20957 exoL exoA TRUE 0.961 -3.000 0.143 NA   NA
 132397 132398 SMb20957 SMb20958 exoA exoM TRUE 0.960 0.000 0.143 NA   NA
 132398 132399 SMb20958 SMb20959 exoM exoO TRUE 0.979 -3.000 0.280 NA   NA
 132399 132400 SMb20959 SMb20960 exoO exoN TRUE 0.991 5.000 0.357 NA Y NA
 132400 132401 SMb20960 SMb20961 exoN exoP TRUE 0.938 55.000 0.357 1.000 Y NA
 132403 132404 SMb20963 SMb20964     FALSE 0.070 105.000 0.000 NA   NA
 132405 132406 SMb20965 SMb20966   lacZ2 FALSE 0.131 109.000 0.000 1.000 N NA
 132406 132407 SMb20966 SMb20967 lacZ2   FALSE 0.059 190.000 0.000 1.000 N NA
 132407 132408 SMb20967 SMb20968     TRUE 0.987 8.000 0.667 1.000 N NA
 132408 132409 SMb20968 SMb20969     TRUE 0.996 4.000 0.667 1.000 Y NA
 132409 132410 SMb20969 SMb20970     TRUE 0.998 -7.000 0.667 0.088 Y NA
 132410 132411 SMb20970 SMb20971     TRUE 0.990 13.000 0.200 0.067 Y NA
 132411 132412 SMb20971 SMb20972     TRUE 0.994 -7.000 0.200 0.067 Y NA
 132412 132413 SMb20972 SMb20973     FALSE 0.135 107.000 0.000 1.000 N NA
 132413 132414 SMb20973 SMb20974     TRUE 0.553 14.000 0.000 1.000   NA
 132414 132415 SMb20974 SMb20975     TRUE 0.695 26.000 0.044 1.000   NA
 132415 132416 SMb20975 SMb20976     TRUE 0.835 74.000 0.000 0.067 Y NA
 132416 132417 SMb20976 SMb20977     TRUE 0.973 31.000 1.000 1.000 N NA
 132417 132418 SMb20977 SMb20978     FALSE 0.036 235.000 0.000 1.000 N NA
 132418 132419 SMb20978 SMb20979     FALSE 0.178 88.000 0.000 1.000 N NA
 132419 132420 SMb20979 SMb20980     TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA Y NA
 132420 132421 SMb20980 SMb20981     FALSE 0.270 182.000 0.000 NA Y NA
 132421 132422 SMb20981 SMb20982     FALSE 0.110 78.000 0.000 NA   NA
 132422 132423 SMb20982 SMb20983     FALSE 0.202 46.000 0.000 NA   NA
 132424 132425 SMb20984 SMb20985 nirB nirD TRUE 0.997 4.000 0.539 0.001 N NA
 132425 132426 SMb20985 SMb20986 nirD narB TRUE 0.993 3.000 0.294 0.050 N NA
 132426 132427 SMb20986 SMb20987 narB   TRUE 0.643 23.000 0.009 1.000 N NA
 132428 132429 SM_b20988 SMb20989     FALSE 0.009 532.000 0.000 1.000 N NA
 132429 132430 SMb20989 SMb20990   nfeD TRUE 0.994 -3.000 0.330 NA Y NA
 132430 132431 SMb20990 SMb20991 nfeD   FALSE 0.049 129.000 0.000 NA   NA
 132431 132432 SMb20991 SMb20992     FALSE 0.047 134.000 0.000 NA   NA
 132433 132434 SMb21674 SMb20993     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 132435 132436 SMb20994 SMb20995   engA FALSE 0.015 245.000 0.000 NA   NA
 132436 132437 SMb20995 SMb20996 engA   FALSE 0.184 124.000 0.026 1.000   NA
 132437 132438 SMb20996 SMb20997     FALSE 0.467 86.000 0.123 NA   NA
 132440 132441 SMb20999 SMb21000 bacA   TRUE 0.606 153.000 0.136 0.043 N NA
 132443 132444 SMb21002 SMb21003 map2   TRUE 0.620 65.000 0.112 1.000 N NA
 132444 132445 SMb21003 SM_b21004     FALSE 0.065 109.000 0.000 NA   NA
 132445 132446 SM_b21004 SMb21005     TRUE 0.872 22.000 0.208 NA   NA
 132446 132447 SMb21005 SMb21006     TRUE 0.936 10.000 0.194 NA   NA
 132447 132448 SMb21006 SMb21007     TRUE 0.902 38.000 0.458 NA   NA
 132448 132449 SMb21007 SMb21008     TRUE 0.994 -3.000 0.833 NA   NA
 132449 132450 SMb21008 SMb21009   glpK FALSE 0.031 248.000 0.000 1.000 N NA
 132451 132452 SMb21010 SMb21011 bdhA xdhA2 TRUE 0.793 44.000 0.182 1.000 N NA
 132452 132453 SMb21011 SMb20846 xdhA2 xdhB2 TRUE 0.587 208.000 0.000 0.001 Y NA
 132455 132456 SM_b20847 SMb20848     FALSE 0.399 89.000 0.071 1.000   NA
 132456 132457 SMb20848 SMb20849   guaD2 TRUE 0.919 -3.000 0.029 1.000   NA
 132457 132458 SMb20849 SMb20850 guaD2 lldD3 FALSE 0.263 115.000 0.036 1.000 N NA
 132459 132460 SMb20851 SMb20852     TRUE 0.987 -3.000 0.375 1.000 N NA
 132460 132461 SMb20852 SMb20853     TRUE 0.885 44.000 0.375 1.000 N NA
 132461 132462 SMb20853 SMb20854     FALSE 0.320 178.000 0.000 0.038 N NA
 132462 132463 SMb20854 SMb20855     TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.015 Y NA
 132463 132464 SMb20855 SMb20856     TRUE 0.970 88.000 0.545 0.015 Y NA
 132465 132466 SMb20857 SMb20858     FALSE 0.057 157.000 0.000 1.000   NA
 132466 132467 SMb20858 SMb20859     FALSE 0.006 516.000 0.000 1.000   NA
 132469 132470 SMb20860 SMb20861     TRUE 0.628 99.000 0.286 1.000   NA
 132470 132471 SMb20861 SMb20862     FALSE 0.044 140.000 0.000 NA   NA
 132472 132473 SMb20863 SMb20864     TRUE 0.895 73.000 0.750 1.000   NA
 132473 132474 SMb20864 SMb20865     TRUE 0.861 64.000 0.500 1.000   NA
 132474 132475 SMb20865 SMb20866     FALSE 0.063 147.000 0.000 1.000   NA
 132475 132476 SMb20866 SMb20867     FALSE 0.164 56.000 0.000 NA   NA
 132477 132478 SMb20868 SMb20869     FALSE 0.174 474.000 0.000 0.015 Y NA
 132481 132482 SMb20872 SMb20873   allA FALSE 0.117 768.000 0.571 1.000   NA
 132482 132483 SMb20873 SMb20874 allA   TRUE 0.573 97.000 0.214 1.000   NA
 132483 132484 SMb20874 SMb20875     TRUE 0.939 0.000 0.058 1.000   NA
 132484 132485 SMb20875 SMb20876     FALSE 0.413 78.000 0.052 1.000   NA
 132485 132486 SMb20876 SMb20877     FALSE 0.225 152.000 0.078 1.000   NA
 132490 132491 SMb20881 SMb20882     FALSE 0.190 49.000 0.000 NA   NA
 132491 132492 SMb20882 SMb20883     FALSE 0.030 184.000 0.000 NA   NA
 132492 132493 SMb20883 SMb20884     TRUE 0.915 43.000 0.571 NA   NA
 132493 132494 SMb20884 SMb20885     FALSE 0.190 49.000 0.000 NA   NA
 132495 132496 SMb20886 SMb20887     TRUE 0.990 5.000 0.805 NA   NA
 132496 132497 SMb20887 SMb20888     TRUE 0.937 17.000 0.365 NA   NA
 132498 132499 SMb20889 SMb20890   ilvD5 FALSE 0.031 183.000 0.000 NA   NA
 132499 132500 SMb20890 SMb20891 ilvD5   TRUE 0.830 59.000 0.087 0.069 N NA
 132500 132501 SMb20891 SMb20892   gguC TRUE 0.702 77.000 0.041 0.069   NA
 132501 132502 SMb20892 SMb20893 gguC gguB FALSE 0.468 147.000 0.286 1.000   NA
 132502 132503 SMb20893 SMb20894 gguB gguA TRUE 0.999 0.000 0.680 0.015 Y NA
 132503 132504 SMb20894 SMb20895 gguA chvE TRUE 0.873 208.000 0.500 0.015 Y NA
 132505 132506 SMb20896 SMb20897 gbpR   TRUE 0.775 65.000 0.333 NA   NA
 132508 132509 SMb21678 SMb20899   idhA FALSE 0.014 251.000 0.000 NA   NA
 132513 132514 SMb20902 SMb20903     TRUE 0.898 116.000 0.208 0.015 Y NA
 132514 132515 SMb20903 SMb20904     TRUE 0.982 15.000 0.333 0.015   NA
 132515 403036 SMb20904 SMb21712   tRNA-Arg FALSE 0.031 182.000 0.000 NA   NA
 132517 132518 SMb20906 SMb20907     TRUE 0.590 -7.000 0.000 NA   NA
 132519 132520 SMb20908 SMb21680     FALSE 0.268 31.000 0.000 NA   NA
 132522 132523 SMb20909 SMb20910     FALSE 0.154 59.000 0.000 NA   NA
 132523 132524 SMb20910 SMb20911     FALSE 0.019 225.000 0.000 NA   NA
 132524 132525 SMb20911 SMb20912     FALSE 0.316 24.000 0.000 NA   NA
 132526 132527 SMb20913 SMb21682     TRUE 0.590 -7.000 0.000 NA   NA
 132531 132532 SMb20918 SMb20919 TRm1a TRm1b TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.047 Y NA
 132533 132534 SMb20920 SMb20921     FALSE 0.167 55.000 0.000 NA   NA
 132534 132535 SMb20921 SMb20922     FALSE 0.444 -115.000 0.000 NA   NA
 132536 132537 SMb21395 SMb21396     FALSE 0.164 56.000 0.000 NA   NA
 132540 132541 SMb21399 SMb21683     FALSE 0.241 36.000 0.000 NA   NA
 132542 132543 SMb21400 SMb21401     FALSE 0.190 49.000 0.000 NA   NA
 132543 132544 SMb21401 SMb21402     FALSE 0.004 549.000 0.000 NA   NA
 132544 132545 SMb21402 SMb21403     FALSE 0.002 1426.000 0.000 NA   NA
 132545 132546 SMb21403 SMb21404     FALSE 0.101 82.000 0.000 NA   NA
 132546 132547 SMb21404 SMb21405     TRUE 0.535 -12.000 0.000 NA   NA
 132547 132548 SMb21405 SMb21406     FALSE 0.052 170.000 0.000 1.000   NA
 132548 132549 SMb21406 SMb21407     TRUE 0.953 12.000 0.000 0.001   NA
 132549 132550 SMb21407 SMb21408     FALSE 0.103 106.000 0.000 1.000   NA
 132550 5451311 SMb21408 SM_b22015     FALSE 0.121 73.000 0.000 NA   NA
 5451311 132552 SM_b22015 SMb21410     FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 132552 132553 SMb21410 SMb21411     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 132554 132555 SMb21412 SMb21413     FALSE 0.457 20.000 0.000 1.000   NA
 132555 132556 SMb21413 SMb21414     FALSE 0.174 74.000 0.000 1.000   NA
 132556 132557 SMb21414 SMb21415     TRUE 0.549 43.000 0.020 1.000 N NA
 132558 132559 SMb21416 SMb21417 ddhA ddhB TRUE 0.997 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 132559 132560 SMb21417 SMb21418 ddhB   TRUE 0.932 7.000 0.119 1.000   NA
 132562 132563 SMb21684 SMb21420     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 132563 132564 SMb21420 SMb21421     TRUE 0.610 74.000 0.000 NA Y NA
 132564 132565 SMb21421 SMb21422     TRUE 0.994 -3.000 0.308 NA Y NA
 132565 132566 SMb21422 SMb21423     TRUE 0.990 -7.000 0.308 0.015   NA
 132566 132567 SMb21423 SMb21424     TRUE 0.977 3.000 0.286 1.000   NA
 132568 132569 SMb21425 SMb21426     TRUE 0.874 2.000 0.009 NA N NA
 132569 132570 SMb21426 SMb21427     TRUE 0.887 0.000 0.009 1.000   NA
 132572 132573 SMb21429 SMb21430     TRUE 0.997 -6.000 0.833 1.000 Y NA
 132573 132574 SMb21430 SMb21431     FALSE 0.076 127.000 0.000 1.000   NA
 132574 132575 SMb21431 SMb21432     TRUE 0.977 3.000 0.000 0.001   NA
 132576 132577 SMb21433 SMb21685     FALSE 0.066 108.000 0.000 NA   NA
 132577 132578 SMb21685 SMb21434     TRUE 0.542 10.000 0.000 NA   NA
 132579 132580 SMb21435 SMb21436     TRUE 0.891 37.000 0.333 1.000 N NA
 132580 132581 SMb21436 SM_b21437     TRUE 0.995 -3.000 0.444 NA Y NA
 132581 132582 SM_b21437 SMb21438     TRUE 0.875 84.000 0.333 NA Y NA
 132582 132583 SMb21438 SMb21439     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA N NA
 132585 132586 SM_b21441 SMb21442     FALSE 0.469 13.000 0.000 NA   NA
 132586 132587 SMb21442 SMb21443     FALSE 0.178 52.000 0.000 NA   NA
 132589 132590 SM_b21445 SMb21446   glgX2 TRUE 0.868 -7.000 0.021 1.000 N NA
 132591 132592 SMb21447 SMb21448 glgB2   FALSE 0.291 87.000 0.013 1.000 N NA
 132594 132595 SMb21450 SMb21452     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 132596 132597 SMb21454 SMb21455     TRUE 0.677 3.000 0.000 NA   NA
 132597 132598 SMb21455 SMb21456     FALSE 0.011 284.000 0.000 NA   NA
 132598 132599 SMb21456 SMb21458     FALSE 0.042 145.000 0.000 NA   NA
 132599 132600 SMb21458 SMb21459     TRUE 0.997 12.000 0.723 0.067 Y NA
 132600 132601 SMb21459 SMb21460     TRUE 0.992 -3.000 0.019 0.067 Y NA
 132601 132602 SMb21460 SMb21461     TRUE 0.961 89.000 0.500 0.067 Y NA
 132602 132603 SMb21461 SMb21462     TRUE 0.787 36.000 0.000 NA Y NA
 132603 132604 SMb21462 SMb21463     TRUE 0.938 -9.000 0.000 NA Y NA
 132606 132607 SMb21465 SM_b21466 prsE prsD TRUE 0.998 -3.000 0.700 0.004   NA
 132607 132608 SM_b21466 SMb21467 prsD   FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 132608 132609 SMb21467 SMb21468     FALSE 0.023 208.000 0.000 NA   NA
 132610 132611 SMb21469 SMb21470     FALSE 0.064 110.000 0.000 NA   NA
 132611 132612 SMb21470 SMb21471     FALSE 0.491 -22.000 0.000 NA   NA
 132612 132613 SMb21471 SMb21472     FALSE 0.207 44.000 0.000 NA   NA
 132613 132614 SMb21472 SMb21473     TRUE 0.819 41.000 0.250 NA   NA
 132614 132615 SMb21473 SMb21474     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 132615 132616 SMb21474 SMb21475     FALSE 0.009 317.000 0.000 NA   NA
 132616 132617 SMb21475 SMb21476     TRUE 0.718 0.000 0.000 NA   NA
 132619 132620 SMb21478 SMb21479     FALSE 0.009 317.000 0.000 NA   NA
 132621 132622 SMb21480 SMb21481     TRUE 0.992 -6.000 1.000 NA   NA
 132622 132623 SMb21481 SMb21482     FALSE 0.010 297.000 0.000 NA   NA
 132623 132624 SMb21482 SMb21483     TRUE 0.760 93.000 0.500 NA   NA
 132624 132625 SMb21483 SMb21686     FALSE 0.385 17.000 0.000 NA   NA
 132626 132627 SMb21484 SMb21687 rpoE5   FALSE 0.133 66.000 0.000 NA   NA
 132627 132628 SMb21687 SMb21485     FALSE 0.043 143.000 0.000 NA   NA
 132630 132631 SMb21487 SMb21488 cyoA cyoB TRUE 0.995 38.000 0.915 0.010 Y NA
 132631 132632 SMb21488 SMb21489 cyoB cyoC TRUE 0.999 -3.000 0.847 0.049 Y NA
 132632 5451312 SMb21489 SM_b22024 cyoC cyoD TRUE 0.999 -3.000 0.906 0.049 Y NA
 5451312 132634 SM_b22024 SMb21490 cyoD   TRUE 0.761 136.000 0.849 NA   NA
 132635 132636 SM_b21491 SMb21492     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 132636 132637 SMb21492 SMb21493     TRUE 0.751 34.000 0.111 NA N NA
 132640 132641 SMb21495 SMb21496     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 132641 132642 SMb21496 SMb21497   acrE FALSE 0.010 295.000 0.000 NA   NA
 132642 132643 SMb21497 SMb21498 acrE acrF TRUE 0.990 4.000 0.600 1.000 N NA
 132644 132645 SMb21499 SMb21500     TRUE 0.969 -3.000 0.188 NA   NA
 132645 132646 SMb21500 SMb21501     TRUE 0.628 56.000 0.125 NA   NA
 132646 132647 SMb21501 SMb21502     TRUE 0.936 -3.000 0.069 NA   NA
 132647 132648 SMb21502 SMb21503     TRUE 0.834 232.000 0.459 0.013 Y NA
 132648 132649 SMb21503 SMb21504     TRUE 0.917 11.000 0.108 1.000 N NA
 132649 132650 SMb21504 SMb21505   wzy TRUE 0.967 -7.000 0.286 NA N NA
 132650 132651 SMb21505 SMb21506 wzy   TRUE 0.993 13.000 0.800 NA Y NA
 132654 132655 SMb21509 SMb21510     FALSE 0.434 -268.000 0.000 NA   NA
 132655 132656 SMb21510 SMb21511     FALSE 0.442 14.000 0.000 NA   NA
 132657 132658 SMb21512 SMb21513   wzx2 TRUE 0.967 -3.000 0.174 NA   NA
 132659 132660 SMb21514 SMb21515 hemK2   TRUE 0.874 -3.000 0.015 NA   NA
 132661 132662 SMb21516 SMb21517     FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 132662 132663 SMb21517 SMb21518     TRUE 0.946 22.000 0.500 NA   NA
 132664 132665 SMb21519 SMb21520     TRUE 0.997 -3.000 0.182 0.015 Y NA
 132666 132667 SMb21521 SMb21522   minE FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 132667 132668 SMb21522 SMb21523 minE minD TRUE 0.997 -3.000 0.618 NA Y NA
 132668 132669 SMb21523 SMb21524 minD minC TRUE 0.892 98.000 0.466 1.000 Y NA
 132669 132670 SMb21524 SMb20647 minC   FALSE 0.010 297.000 0.000 NA   NA
 132670 132671 SMb20647 SMb20648     FALSE 0.005 440.000 0.000 NA   NA
 132671 132672 SMb20648 SMb20649   nadE1 FALSE 0.009 527.000 0.000 1.000 N NA
 132672 132673 SMb20649 SMb20650 nadE1   TRUE 0.968 -3.000 0.133 1.000 N NA
 132673 132674 SMb20650 SMb20651     TRUE 0.907 28.000 0.367 NA   NA
 132674 132675 SMb20651 SMb20652   asnB TRUE 0.852 27.000 0.211 NA   NA
 132676 132677 SMb20654 SMb20655     FALSE 0.027 194.000 0.000 NA   NA
 132677 132678 SMb20655 SMb20656     FALSE 0.019 271.000 0.000 1.000   NA
 132678 132679 SMb20656 SMb20657     TRUE 0.759 39.000 0.167 NA   NA
 132680 132681 SMb20658 SMb20659     TRUE 0.997 15.000 0.917 0.066 Y NA
 132681 132682 SMb20659 SMb20660     TRUE 0.866 193.000 0.458 0.066 Y NA
 132682 132683 SMb20660 SMb20661     TRUE 0.916 135.000 0.450 0.066 Y NA
 132683 132684 SMb20661 SMb20662     FALSE 0.382 85.000 0.040 1.000 N NA
 132684 132685 SMb20662 SMb20663     TRUE 0.935 2.000 0.048 1.000 N NA
 132685 132686 SMb20663 SMb20664     FALSE 0.442 119.000 0.158 1.000 N NA
 132686 132687 SMb20664 SMb20665     FALSE 0.164 77.000 0.000 NA N NA
 132687 132688 SMb20665 SMb20666     FALSE 0.017 284.000 0.000 NA N NA
 132688 132689 SMb20666 SMb20667     TRUE 0.860 17.000 0.103 1.000 N NA
 132690 132691 SMb20668 SMb20669     TRUE 0.939 12.000 0.194 1.000 N NA
 132691 132692 SMb20669 SMb20670     TRUE 0.964 4.000 0.194 1.000   NA
 132693 132694 SMb20671 SMb20672     TRUE 0.993 -3.000 0.286 NA Y NA
 132694 132695 SMb20672 SMb20673     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.015 Y NA
 132697 132698 SMb20675 SMb20676     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 132698 132699 SMb20676 SMb20677     TRUE 0.516 99.000 0.200 NA   NA
 132699 132700 SMb20677 SMb20678   ttuD2 TRUE 0.796 48.000 0.200 1.000 N NA
 132700 132701 SMb20678 SMb20679 ttuD2 glxR FALSE 0.295 115.000 0.051 1.000 N NA
 132701 132702 SMb20679 SMb20680 glxR hyi TRUE 0.926 6.000 0.077 1.000 N NA
 132702 132703 SMb20680 SMb20681 hyi gcl FALSE 0.478 55.000 0.032 1.000   NA
 132706 132707 SMb20684 SMb20685     FALSE 0.436 38.000 0.013 NA   NA
 132707 132708 SMb20685 SMb20686     TRUE 0.711 93.000 0.375 1.000   NA
 132708 132709 SMb20686 SMb20687     TRUE 0.986 0.000 0.375 1.000   NA
 132709 132710 SMb20687 SMb20688     TRUE 0.891 2.000 0.029 NA   NA
 132710 132711 SMb20688 SMb20689   xthA4 TRUE 0.862 8.000 0.049 NA   NA
 132712 132713 SMb20690 SMb20691     FALSE 0.178 52.000 0.000 NA   NA
 132713 132714 SMb20691 SMb20692   idnO1 FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 132717 132718 SMb20695 SMb20696     TRUE 0.993 -3.000 0.727 NA   NA
 132718 132719 SMb20696 SMb20697     FALSE 0.073 102.000 0.000 NA   NA
 132719 132720 SMb20697 SMb20698     FALSE 0.061 152.000 0.000 1.000   NA
 132720 132721 SMb20698 SMb20699     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000   NA
 132721 132722 SMb20699 SMb20700     FALSE 0.138 87.000 0.000 1.000   NA
 132722 132723 SMb20700 SMb20701     TRUE 0.828 77.000 0.500 1.000   NA
 132726 132727 SMb20704 SMb20705 glgA2   FALSE 0.014 315.000 0.000 1.000   NA
 132727 132728 SMb20705 SMb20706     FALSE 0.299 134.000 0.000 0.086   NA
 132729 132730 SMb20707 SMb20708 cyaG2   TRUE 0.965 2.000 0.143 1.000 N NA
 132731 132732 SMb20709 SMb20710     FALSE 0.009 496.000 0.000 1.000 N NA
 132732 132733 SMb20710 SMb20711     FALSE 0.038 203.000 0.000 NA N NA
 132733 132734 SMb20711 SMb20712   mocB FALSE 0.160 240.000 0.000 NA Y NA
 132734 132735 SMb20712 SM_b20713 mocB   TRUE 0.803 187.000 0.200 0.015 Y NA
 132735 132736 SM_b20713 SMb20714     TRUE 0.869 97.000 0.061 0.015 Y NA
 132740 132741 SMb20718 SMb20719     TRUE 0.982 78.000 0.700 0.015 Y NA
 132741 132742 SMb20719 SMb20720     TRUE 0.875 66.000 0.217 NA Y NA
 132743 132744 SMb20721 SMb20722     TRUE 0.997 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 132745 132746 SMb20723 SMb20724     FALSE 0.026 235.000 0.000 1.000   NA
 132746 132747 SMb20724 SMb20725     TRUE 0.995 -3.000 0.938 NA   NA
 132747 132748 SMb20725 SMb20726     TRUE 0.785 120.000 0.812 NA   NA
 132748 132749 SMb20726 SMb20727     TRUE 0.709 75.000 0.286 NA   NA
 132750 132751 SMb20728 SMb20729     FALSE 0.065 109.000 0.000 NA   NA
 132751 132752 SMb20729 SMb20745   glnII FALSE 0.005 460.000 0.000 NA   NA
 132754 132755 SMb20747 SMb20748   pssF FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 132756 132757 SMb20749 SMb20750 uxuB   TRUE 0.868 20.000 0.000 0.068 N NA
 132758 132759 SMb20751 SMb20752     TRUE 0.836 47.000 0.032 1.000 Y NA
 132759 132760 SMb20752 SMb20753     TRUE 0.984 13.000 0.318 1.000 Y NA
 132760 132761 SMb20753 SMb20754     FALSE 0.168 117.000 0.013 1.000   NA
 132762 132763 SMb20755 SMb20756 pccB pccA TRUE 0.972 13.000 0.157 1.000 Y NA
 132763 132764 SMb20756 SMb20757 pccA bhbA TRUE 0.512 226.000 0.031 0.068 Y NA
 132766 132767 SMb20759 SMb20760 phnG phnH TRUE 1.000 0.000 0.967 0.001 Y NA
 132767 132768 SMb20760 SMb20761 phnH phnI TRUE 0.999 5.000 0.960 0.001 Y NA
 132768 132769 SMb20761 SMb20762 phnI phnJ TRUE 0.998 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 132769 132770 SMb20762 SMb20763 phnJ phnK TRUE 0.998 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 132770 132771 SMb20763 SMb20764 phnK phnL TRUE 0.993 34.000 0.859 0.077 Y NA
 132771 132772 SMb20764 SMb20765 phnL   TRUE 0.957 -3.000 0.104 1.000   NA
 132773 132774 SMb20766 SMb20767 TRm22 dak FALSE 0.072 168.000 0.000 1.000 N NA
 132774 132775 SMb20767 SMb20768 dak   TRUE 0.966 17.000 0.214 NA Y NA
 132775 132776 SMb20768 SMb20769     TRUE 0.743 54.000 0.214 NA   NA
 132776 132777 SMb20769 SMb20770     TRUE 0.888 35.000 0.375 NA   NA
 132777 132778 SMb20770 SMb20771     TRUE 0.675 106.000 0.429 NA   NA
 132778 132779 SMb20771 SMb20772   pdxA2 TRUE 0.516 76.000 0.097 1.000   NA
 132782 132783 SMb20775 SMb20776   cyaK TRUE 0.966 0.000 0.125 1.000 N NA
 132783 132784 SMb20776 SMb20777 cyaK TRm19 FALSE 0.038 230.000 0.000 1.000 N NA
 132787 132788 SMb20780 SM_b21702   TRm2011-2b-1 FALSE 0.004 512.000 0.000 NA   NA
 132790 132791 SMb20783 SMb20784 TRm2011-2a   FALSE 0.069 173.000 0.000 1.000 N NA
 132791 132792 SMb20784 SMb20785     TRUE 0.998 -19.000 0.824 0.019 Y NA
 132792 132793 SMb20785 SMb20786     TRUE 0.998 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 132793 132794 SMb20786 SMb20787     TRUE 0.999 7.000 1.000 0.066 Y NA
 132794 132795 SMb20787 SMb20568     TRUE 0.941 102.000 0.867 1.000 Y NA
 132795 132796 SMb20568 SMb20569     FALSE 0.090 140.000 0.000 1.000 N NA
 132796 132797 SMb20569 SMb20570     TRUE 0.975 11.000 0.130 1.000 Y NA
 132797 132798 SMb20570 SMb20571     TRUE 0.910 97.000 0.206 0.066 Y NA
 132798 132799 SMb20571 SMb21691     TRUE 0.913 17.000 0.206 1.000 N NA
 132799 132800 SMb21691 SMb20573     FALSE 0.133 89.000 0.000 1.000   NA
 132802 132803 SMb20575 SMb20576 pcaB pcaG TRUE 0.733 83.000 0.314 1.000 N NA
 132803 132804 SMb20576 SMb20577 pcaG pcaH TRUE 0.999 11.000 0.782 0.000 Y NA
 132804 132805 SMb20577 SMb20578 pcaH pcaC TRUE 0.818 17.000 0.080 1.000   NA
 132805 132806 SMb20578 SMb20579 pcaC pcaD TRUE 0.992 -3.000 0.636 1.000   NA
 132808 132809 SMb20581 SMb20582     FALSE 0.086 145.000 0.000 1.000 N NA
 132809 132810 SMb20582 SMb20583   pobA FALSE 0.168 92.000 0.000 1.000 N NA
 132811 132812 SM_b20584 SMb20585   ggt FALSE 0.099 210.000 0.038 1.000   NA
 132814 132815 SMb20587 SMb20588     TRUE 0.998 14.000 0.739 0.000 Y NA
 132815 132816 SMb20588 SMb20589   pcaF TRUE 0.989 0.000 0.135 1.000 Y NA
 132817 132818 SMb20590 SMb20591     FALSE 0.145 62.000 0.000 NA   NA
 132819 132820 SMb20592 SMb20593 rpo   TRUE 0.603 79.000 0.196 NA   NA
 132820 132821 SMb20593 SMb20594   amcY TRUE 0.985 9.000 0.673 NA   NA
 132822 132823 SMb20595 SMb20596 ftsK2   FALSE 0.417 15.000 0.000 NA   NA
 132824 132825 SMb20597 SMb20598   repA3 FALSE 0.038 156.000 0.000 NA   NA
 132825 132826 SMb20598 SMb20599 repA3 repB3 TRUE 0.995 4.000 1.000 1.000 N NA
 132827 132828 SMb20600 SMb21707     FALSE 0.033 172.000 0.000 NA   NA
 132828 132829 SMb21707 SMb20602     TRUE 0.989 19.000 0.731 0.019   NA
 132829 132830 SMb20602 SMb20603     TRUE 0.991 6.000 0.823 1.000   NA
 132830 132831 SMb20603 SMb20604     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.066 Y NA
 132831 132832 SMb20604 SMb20605     TRUE 0.852 143.000 0.654 NA Y NA
 132832 132833 SMb20605 SMb20606     FALSE 0.021 213.000 0.000 NA   NA
 132833 132834 SMb20606 SMb20607     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA   NA
 132834 132835 SMb20607 SMb20608     FALSE 0.256 33.000 0.000 NA   NA
 132836 132837 SMb20609 SMb20610     TRUE 0.989 -13.000 0.310 0.012 N NA
 132839 132840 SMb20612 SMb20613 dctB dctD TRUE 0.998 4.000 0.615 0.077 Y NA
 132842 132843 SMb20615 SMb20616 thiC thiO TRUE 0.913 2.000 0.022 1.000 N NA
 132843 132844 SMb20616 SMb20617 thiO thiG FALSE 0.088 197.000 0.006 1.000 N NA
 132844 132845 SMb20617 SMb20618 thiG thiE TRUE 0.997 -3.000 0.118 0.003 Y NA
 132845 132846 SMb20618 SMb20619 thiE   FALSE 0.238 70.000 0.000 1.000 N NA
 132847 132848 SMb20620 SMb20621     TRUE 0.944 47.000 0.355 NA Y NA
 132848 132849 SMb20621 SMb20622     TRUE 0.987 80.000 0.952 0.015 Y NA
 132850 132851 SMb20623 SMb20624     TRUE 0.957 -3.000 0.104 1.000   NA
 132854 132855 SMb20627 SMb20628     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 132855 132856 SMb20628 SMb20629     FALSE 0.094 86.000 0.000 NA   NA
 132856 132857 SMb20629 SMb20630     FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 132857 132858 SMb20630 SMb20631     TRUE 0.581 13.000 0.000 1.000   NA
 132858 132859 SMb20631 SMb20632     FALSE 0.457 20.000 0.000 1.000   NA
 132859 132860 SMb20632 SMb20633     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.066 Y NA
 132860 132861 SMb20633 SMb20634     TRUE 0.924 191.000 0.800 0.066 Y NA
 132861 132862 SMb20634 SMb21706     TRUE 0.935 53.000 0.818 NA N NA
 132862 132863 SMb21706 SM_b20636   TRm19 FALSE 0.008 456.000 0.000 NA N NA
 132863 132864 SM_b20636 SMb21630 TRm19   FALSE 0.028 263.000 0.000 1.000 N NA
 132864 132865 SMb21630 SMb21631   nspC TRUE 0.960 44.000 0.444 1.000 Y NA
 132865 132866 SMb21631 SMb21632 nspC   FALSE 0.113 120.000 0.000 1.000 N NA
 132868 132869 SMb21634 SM_b21635   paaZ TRUE 0.800 -3.000 0.000 NA N NA
 132869 132870 SM_b21635 SMb21636 paaZ paaE TRUE 0.848 51.000 0.062 1.000 Y NA
 132870 132871 SMb21636 SMb21637 paaE paaD TRUE 0.941 29.000 0.571 NA   NA
 132871 132872 SMb21637 SMb21638 paaD paaC TRUE 0.989 10.000 0.919 NA   NA
 132872 132873 SMb21638 SMb21639 paaC paaB TRUE 0.995 0.000 0.943 NA   NA
 132873 132874 SMb21639 SMb21640 paaB paaA TRUE 0.976 20.000 0.920 NA   NA
 132874 132875 SMb21640 SMb21641 paaA paaX FALSE 0.164 205.000 0.093 1.000   NA
 132875 132876 SMb21641 SMb21642 paaX   FALSE 0.015 245.000 0.000 NA   NA
 132876 132877 SMb21642 SMb21643   agaL2 FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 132877 132878 SMb21643 SMb21644 agaL2   TRUE 0.947 21.000 0.464 1.000   NA
 132878 132879 SMb21644 SMb21645     TRUE 0.987 12.000 0.857 1.000   NA
 132879 132880 SMb21645 SMb21646     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.066   NA
 132880 132881 SMb21646 SMb21647   agpA TRUE 0.966 118.000 0.867 0.066 Y NA
 132881 132882 SMb21647 SMb21648 agpA agaL1 FALSE 0.435 289.000 0.348 0.066 N NA
 132883 132884 SMb21649 SMb21650 agpT   TRUE 0.853 71.000 0.000 0.045 Y NA