MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodopseudomonas palustris CGA009

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 569419 569420 RPA0001 RPA0002 dnaA dnaN TRUE 0.640 235.000 0.328 1.000 Y NA
 569420 569421 RPA0002 RPA0003 dnaN recF TRUE 0.721 217.000 0.318 1.000 Y NA
 569421 569422 RPA0003 RPA0004 recF gyrB TRUE 0.803 217.000 0.249 0.004 Y NA
 569425 569426 RPA0007 RPA0008   kaiB TRUE 0.963 -3.000 0.400 1.000   NA
 569426 569427 RPA0008 RPA0009 kaiB kaiC TRUE 0.831 10.000 0.059 1.000   NA
 569427 569428 RPA0009 RPA0010 kaiC   FALSE 0.003 394.000 0.000 1.000 N NA
 569428 569429 RPA0010 RPA0011     FALSE 0.000 488.000 0.000 NA   NA
 569429 569430 RPA0011 RPA0012   rdxS TRUE 0.707 2.000 0.010 NA   NA
 569430 569431 RPA0012 RPA0013 rdxS rdxI TRUE 0.991 -9.000 0.713 NA Y NA
 569431 569432 RPA0013 RPA0014 rdxI rdxH TRUE 0.930 35.000 0.206 NA Y NA
 569432 569433 RPA0014 RPA0015 rdxH fixG TRUE 0.785 17.000 0.092 NA N NA
 569433 569434 RPA0015 RPA0016 fixG ccoP TRUE 0.852 117.000 0.116 0.019 Y NA
 569434 569435 RPA0016 RPA0017 ccoP ccoQ TRUE 0.954 8.000 0.101 0.002   NA
 569435 569436 RPA0017 RPA0018 ccoQ ccoO TRUE 0.982 10.000 0.500 0.002   NA
 569436 569437 RPA0018 RPA0019 ccoO ccoN TRUE 0.970 13.000 0.351 0.002 N NA
 569437 569438 RPA0019 RPA0020 ccoN panE1 FALSE 0.006 311.000 0.000 1.000 N NA
 569438 569439 RPA0020 RPA0021 panE1   FALSE 0.090 73.000 0.000 1.000 N NA
 569439 569440 RPA0021 RPA0022     TRUE 0.549 121.000 0.000 1.000 Y NA
 569442 569443 RPA0024 RPA0025   ggt1 FALSE 0.062 275.000 0.054 1.000 N NA
 569444 569445 RPA0026 RPA0027   aroG1 FALSE 0.023 216.000 0.000 1.000   NA
 569446 569447 RPA0028 RPA0029 purH   FALSE 0.242 186.000 0.068 NA   NA
 569447 569448 RPA0029 RPA0030     FALSE 0.308 167.000 0.071 NA   NA
 569449 569450 RPA0031 RPA0032     FALSE 0.328 86.000 0.062 NA   NA
 569453 569454 RPA0035 RPA0036 pheT   FALSE 0.174 145.000 0.005 1.000   NA
 569454 569455 RPA0036 RPA0037   pheS FALSE 0.032 261.000 0.003 1.000   NA
 569455 569456 RPA0037 RPA0038 pheS rplT TRUE 0.812 144.000 0.202 1.000 Y NA
 569456 569457 RPA0038 RPA0039 rplT rpmI TRUE 0.973 84.000 0.928 0.014 Y NA
 569457 569458 RPA0039 RPA0040 rpmI infC FALSE 0.424 334.000 0.652 1.000 Y NA
 569460 569461 RPA0042 RPA0043     TRUE 0.732 45.000 0.213 1.000 N NA
 5451006 569465 RPA_RNA3 RPA0046 tRNA-Leu1   FALSE 0.010 169.000 0.000 NA   NA
 569465 569466 RPA0046 RPA0047     FALSE 0.189 230.000 0.151 NA   NA
 569466 569467 RPA0047 RPA0048     TRUE 0.887 9.000 0.144 NA   NA
 569467 569468 RPA0048 RPA0049     TRUE 0.696 117.000 0.543 NA   NA
 569468 569469 RPA0049 RPA0050   rpoN FALSE 0.112 207.000 0.011 1.000   NA
 569469 569470 RPA0050 RPA0051 rpoN   FALSE 0.465 58.000 0.070 NA N NA
 569470 569471 RPA0051 RPA0052   ptsN1 FALSE 0.180 276.000 0.353 NA N NA
 569472 569473 RPA0053 RPA0054     TRUE 0.911 51.000 0.955 NA   NA
 569473 569474 RPA0054 RPA0055   ugpC FALSE 0.296 154.000 0.056 NA N NA
 569474 569475 RPA0055 RPA0056 ugpC ugpE TRUE 0.994 3.000 0.464 0.068 Y NA
 569475 569476 RPA0056 RPA0057 ugpE ugpA TRUE 0.995 0.000 0.559 0.068 Y NA
 569476 569477 RPA0057 RPA0058 ugpA ugpB1 TRUE 0.817 165.000 0.063 0.068 Y NA
 569477 569478 RPA0058 RPA0059 ugpB1   FALSE 0.291 223.000 0.214 1.000 N NA
 569478 5451007 RPA0059 RPA_RNA41   tRNA-Ala2 FALSE 0.009 179.000 0.000 NA   NA
 5451007 569480 RPA_RNA41 RPA0060 tRNA-Ala2   FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 569483 569484 RPA0063 RPA0064 cmk rpsA FALSE 0.122 301.000 0.281 1.000 N NA
 569484 569485 RPA0064 RPA0065 rpsA sppA FALSE 0.135 229.000 0.057 1.000 N NA
 569485 569486 RPA0065 RPA0066 sppA ihfB FALSE 0.467 166.000 0.142 1.000 N NA
 569486 569487 RPA0066 RPA0067 ihfB   TRUE 0.569 38.000 0.069 NA   NA
 569487 569488 RPA0067 RPA0068   trpF FALSE 0.226 59.000 0.007 NA   NA
 569488 569489 RPA0068 RPA0069 trpF trpB TRUE 0.991 14.000 0.375 0.001 Y NA
 569489 569490 RPA0069 RPA0070 trpB trpA TRUE 0.995 0.000 0.344 0.001 Y NA
 569490 569491 RPA0070 RPA0071 trpA accD FALSE 0.543 110.000 0.232 1.000 N NA
 569491 569492 RPA0071 RPA0072 accD folC TRUE 0.963 -3.000 0.383 1.000 N NA
 569493 569494 RPA0073 RPA0074 trxA   FALSE 0.501 97.000 0.173 1.000   NA
 569494 569495 RPA0074 RPA0075     TRUE 0.995 -3.000 0.863 NA Y NA
 569495 569496 RPA0075 RPA0076     TRUE 0.554 76.000 0.196 NA N NA
 569496 569497 RPA0076 RPA0077     FALSE 0.208 158.000 0.025 NA   NA
 569497 569498 RPA0077 RPA0078     FALSE 0.202 104.000 0.026 NA   NA
 569498 569499 RPA0078 RPA0079     TRUE 0.870 -3.000 0.085 NA   NA
 569499 569500 RPA0079 RPA0080   dut FALSE 0.143 187.000 0.005 1.000 N NA
 569500 569501 RPA0080 RPA0081 dut coaBC TRUE 0.934 -3.000 0.201 1.000 N NA
 569501 569502 RPA0081 RPA0082 coaBC ubiB FALSE 0.404 54.000 0.025 1.000   NA
 569502 569503 RPA0082 RPA0083 ubiB ubiE TRUE 0.906 -3.000 0.115 1.000   NA
 569506 569507 RPA0086 RPA0087 moeB   FALSE 0.061 125.000 0.000 1.000 N NA
 569508 569509 RPA0088 RPA0089     FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 569509 569510 RPA0089 RPA0090     FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 569510 569511 RPA0090 RPA0091     TRUE 0.864 79.000 1.000 NA   NA
 569511 569512 RPA0091 RPA0092     FALSE 0.000 541.000 0.000 NA   NA
 569513 569514 RPA0093 RPA0094     TRUE 0.935 -3.000 0.250 NA   NA
 569514 569515 RPA0094 RPA0095     FALSE 0.497 130.000 0.231 NA   NA
 569515 569516 RPA0095 RPA0096     TRUE 0.941 4.000 0.231 1.000 N NA
 569516 569517 RPA0096 RPA0097     FALSE 0.062 143.000 0.000 1.000 N NA
 569518 569519 RPA0098 RPA0099 oppF oppD TRUE 0.995 -3.000 0.444 0.002 Y NA
 569519 569520 RPA0099 RPA0100 oppD oppC TRUE 0.996 3.000 0.889 1.000 Y NA
 569520 569521 RPA0100 RPA0101 oppC oppB TRUE 0.991 24.000 0.889 0.068 Y NA
 569521 569522 RPA0101 RPA0102 oppB oppA TRUE 0.990 29.000 0.889 0.068 Y NA
 569522 569523 RPA0102 RPA0103 oppA   FALSE 0.451 90.000 0.143 NA   NA
 569523 569524 RPA0103 RPA0104     TRUE 0.904 -3.000 0.143 NA   NA
 569526 569527 RPA0106 RPA0107     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA Y NA
 569527 569528 RPA0107 RPA0108     TRUE 0.833 30.000 0.000 1.000 Y NA
 569528 569529 RPA0108 RPA0109     FALSE 0.155 41.000 0.000 1.000 N NA
 569531 569532 RPA0111 RPA0112   betB TRUE 0.960 9.000 0.444 1.000   NA
 569537 569538 RPA0117 RPA0118 rmlB rmlC FALSE 0.044 26.000 0.000 NA   NA
 569538 569539 RPA0118 RPA0119 rmlC rmlD TRUE 0.965 5.000 0.029 1.000 Y NA
 569539 569540 RPA0119 RPA0120 rmlD rmlA TRUE 0.996 2.000 0.500 0.004 Y NA
 569540 569541 RPA0120 RPA0121 rmlA   FALSE 0.000 446.000 0.000 NA   NA
 569541 569542 RPA0121 RPA0122   phyB3 FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 569542 569543 RPA0122 RPA0123 phyB3   TRUE 0.861 -7.000 0.080 1.000 N NA
 569544 569545 RPA0124 RPA0125     TRUE 0.975 -3.000 0.308 0.022   NA
 569545 569546 RPA0125 RPA0126     TRUE 0.818 65.000 0.538 1.000   NA
 569546 569547 RPA0126 RPA0127     TRUE 0.991 23.000 0.800 0.068 Y NA
 569547 569548 RPA0127 RPA0128     TRUE 0.996 -3.000 0.778 0.068 Y NA
 569548 569549 RPA0128 RPA0129     TRUE 0.991 -7.000 0.381 0.068 Y NA
 569551 569552 RPA0131 RPA0132     TRUE 0.882 -3.000 0.071 1.000 N NA
 569552 569553 RPA0132 RPA0133     TRUE 0.990 -10.000 0.643 NA Y NA
 569553 569554 RPA0133 RPA0134   hydC TRUE 0.766 16.000 0.080 NA   NA
 569554 569555 RPA0134 RPA0135 hydC   TRUE 0.966 0.000 0.185 0.019   NA
 569555 569556 RPA0135 RPA0136     FALSE 0.010 140.000 0.000 NA   NA
 569556 569557 RPA0136 RPA0137   cheB1 TRUE 0.906 5.000 0.157 NA   NA
 569557 569558 RPA0137 RPA0138 cheB1 cheR1 TRUE 0.985 21.000 0.672 1.000 Y NA
 569558 569559 RPA0138 RPA0139 cheR1   TRUE 0.582 162.000 0.000 1.000 Y NA
 569559 569560 RPA0139 RPA0140   cheW1-3 TRUE 0.900 67.000 0.087 0.014 Y NA
 569560 569561 RPA0140 RPA0141 cheW1-3 cheW1-1 TRUE 0.921 61.000 0.130 0.014 Y NA
 569561 569562 RPA0141 RPA0142 cheW1-1 cheA1 TRUE 0.997 0.000 0.808 0.014 Y NA
 569562 569563 RPA0142 RPA0143 cheA1 cheY1 TRUE 0.993 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 569563 569564 RPA0143 RPA0144 cheY1   TRUE 0.930 0.000 0.212 NA   NA
 569565 569566 RPA0145 RPA0146     FALSE 0.029 40.000 0.000 NA   NA
 569567 569568 RPA0147 RPA0148     TRUE 0.645 121.000 0.444 NA   NA
 569568 569569 RPA0148 RPA0149     TRUE 0.650 24.000 0.062 NA   NA
 569569 569570 RPA0149 RPA0150     TRUE 0.995 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 569570 569571 RPA0150 RPA0151     TRUE 0.991 2.000 0.422 1.000 Y NA
 569571 569572 RPA0151 RPA0152     TRUE 0.899 -3.000 0.133 NA   NA
 569573 569574 RPA0153 RPA0154     FALSE 0.400 57.000 0.000 0.082 N NA
 569574 569575 RPA0154 RPA0155     TRUE 0.991 13.000 0.500 0.082 Y NA
 569575 569576 RPA0155 RPA0156     TRUE 0.920 -3.000 0.143 1.000 N NA
 5451008 569578 RPA_RNA40 RPA0157 tRNA-Ser3   FALSE 0.011 153.000 0.000 NA   NA
 569579 569580 RPA0158 RPA0159 rplU rpmA TRUE 0.960 90.000 0.667 0.014 Y NA
 569580 569581 RPA0159 RPA0160 rpmA   TRUE 0.690 135.000 0.035 1.000 Y NA
 569583 569584 RPA0162 RPA0163   proB FALSE 0.379 139.000 0.087 1.000   NA
 569584 569585 RPA0163 RPA0164 proB proA TRUE 0.765 204.000 0.065 0.001 Y NA
 569585 569586 RPA0164 RPA0165 proA   TRUE 0.812 25.000 0.170 1.000 N NA
 569586 569587 RPA0165 RPA0166     FALSE 0.041 371.000 0.221 NA   NA
 569587 569588 RPA0166 RPA0167     TRUE 0.606 90.000 0.307 NA   NA
 569588 569589 RPA0167 RPA0168     TRUE 0.700 20.000 0.067 NA   NA
 569589 569590 RPA0168 RPA0169   ctpA TRUE 0.961 -3.000 0.408 NA N NA
 569590 569591 RPA0169 RPA0170 ctpA   FALSE 0.526 151.000 0.210 1.000   NA
 569591 569592 RPA0170 RPA0171   invA1 TRUE 0.674 39.000 0.109 1.000   NA
 569594 569595 RPA0173 RPA0174   invA2 TRUE 0.773 -3.000 0.010 1.000 N NA
 569596 569597 RPA0175 RPA0176 atpC atpD TRUE 0.965 114.000 0.837 0.003 Y NA
 569597 569598 RPA0176 RPA0177 atpD atpG TRUE 0.974 72.000 0.724 0.003 Y NA
 569598 569599 RPA0177 RPA0178 atpG atpA TRUE 0.966 144.000 0.846 0.003 Y NA
 569599 569600 RPA0178 RPA0179 atpA atpH TRUE 0.998 0.000 0.864 0.003 Y NA
 569603 569604 RPA0182 RPA0183 xerC   FALSE 0.177 141.000 0.020 NA   NA
 569605 569606 RPA0184 RPA0185   dldH FALSE 0.383 40.000 0.021 NA   NA
 569606 569607 RPA0185 RPA0186 dldH   FALSE 0.540 32.000 0.023 1.000 N NA
 569607 569608 RPA0186 RPA0187     TRUE 0.902 8.000 0.172 NA   NA
 569608 569609 RPA0187 RPA0188   sucB TRUE 0.633 12.000 0.014 NA   NA
 569609 569610 RPA0188 RPA0189 sucB sucA TRUE 0.923 105.000 0.667 1.000 Y NA
 569610 569611 RPA0189 RPA0190 sucA sucD TRUE 0.752 128.000 0.092 1.000 Y NA
 569611 569612 RPA0190 RPA0191 sucD sucC TRUE 0.948 65.000 0.256 0.001 Y NA
 569612 569613 RPA0191 RPA0192 sucC mdh TRUE 0.788 96.000 0.113 1.000 Y NA
 569613 569614 RPA0192 RPA0193 mdh   FALSE 0.212 146.000 0.032 NA   NA
 569614 569615 RPA0193 RPA0194     FALSE 0.221 83.000 0.021 NA   NA
 569615 569616 RPA0194 RPA0195   tesA FALSE 0.235 206.000 0.077 1.000 N NA
 569617 569618 RPA0196 RPA0197     TRUE 0.992 4.000 0.626 NA Y NA
 569618 569619 RPA0197 RPA0198     FALSE 0.032 341.000 0.101 NA   NA
 569619 569620 RPA0198 RPA0199     FALSE 0.316 155.000 0.069 NA   NA
 569621 569622 RPA0200 RPA0201     FALSE 0.000 404.000 0.000 NA   NA
 569622 569623 RPA0201 RPA0202   acnA FALSE 0.408 47.000 0.038 NA   NA
 569624 569625 RPA0203 RPA0204 cycV cycW TRUE 0.996 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 569625 569626 RPA0204 RPA0205 cycW cycZ TRUE 0.956 93.000 0.501 0.001 Y NA
 569626 569627 RPA0205 RPA0206 cycZ cycY TRUE 0.744 190.000 0.010 0.002 Y NA
 569627 569628 RPA0206 RPA0207 cycY   FALSE 0.010 140.000 0.000 NA   NA
 569629 569630 RPA0208 RPA0209 ispZ ftsY TRUE 0.857 -3.000 0.050 1.000 N NA
 569631 569632 RPA0210 RPA0211     FALSE 0.003 364.000 0.000 1.000   NA
 569632 569633 RPA0211 RPA0212     FALSE 0.000 383.000 0.000 NA   NA
 569634 569635 RPA0213 RPA0214     FALSE 0.002 246.000 0.000 NA   NA
 569635 569636 RPA0214 RPA0215     TRUE 0.923 0.000 0.188 NA   NA
 569636 569637 RPA0215 RPA0216   sdhB FALSE 0.056 238.000 0.006 1.000   NA
 569637 569638 RPA0216 RPA0217 sdhB sdhA TRUE 0.956 108.000 0.604 0.001 Y NA
 569638 569639 RPA0217 RPA0218 sdhA sdhD TRUE 0.997 4.000 0.705 0.001 Y NA
 569639 569640 RPA0218 RPA0219 sdhD sdhC TRUE 0.994 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 569643 569644 RPA0222 RPA0223     FALSE 0.025 222.000 0.000 1.000 N NA
 569644 569645 RPA0223 RPA0224     TRUE 0.776 116.000 0.476 0.083   NA
 569645 569646 RPA0224 RPA0225   sodC FALSE 0.050 273.000 0.035 1.000   NA
 569649 569650 RPA0228 RPA0229     FALSE 0.010 144.000 0.000 NA   NA
 569651 569652 RPA0230 RPA0231 asdB   FALSE 0.122 136.000 0.005 NA   NA
 569655 569656 RPA0234 RPA0235   leuD FALSE 0.001 749.000 0.000 1.000 N NA
 569656 569657 RPA0235 RPA0236 leuD   FALSE 0.469 86.000 0.112 1.000   NA
 569658 569659 RPA0237 RPA0238     TRUE 0.663 100.000 0.429 NA   NA
 569659 569660 RPA0238 RPA0239     TRUE 0.638 121.000 0.429 NA   NA
 569661 569662 RPA0240 RPA0241 leuC rplS FALSE 0.020 310.000 0.008 1.000 N NA
 569662 569663 RPA0241 RPA0242 rplS trmD TRUE 0.905 114.000 0.567 1.000 Y NA
 569663 569664 RPA0242 RPA0243 trmD rimM TRUE 0.922 143.000 0.672 1.000 Y NA
 569664 569665 RPA0243 RPA0244 rimM rpsP TRUE 0.989 13.000 0.342 0.014 Y NA
 569665 569666 RPA0244 RPA0245 rpsP ffh/ftsY TRUE 0.643 170.000 0.361 1.000 N NA
 569667 569668 RPA0246 RPA0247   romA TRUE 0.765 5.000 0.029 NA   NA
 569669 569670 RPA0248 RPA0249 bp26   TRUE 0.932 -3.000 0.235 NA   NA
 569671 569672 RPA0250 RPA0251 dapF   TRUE 0.914 0.000 0.109 1.000 N NA
 569673 569674 RPA0252 RPA0253     FALSE 0.123 185.000 0.012 NA   NA
 569674 569675 RPA0253 RPA0254   gpdA TRUE 0.812 3.000 0.042 NA   NA
 569675 569676 RPA0254 RPA0255 gpdA gcp TRUE 0.645 36.000 0.070 1.000 N NA
 569677 569678 RPA0256 RPA0257     FALSE 0.372 52.000 0.032 NA   NA
 569678 569679 RPA0257 RPA0258     TRUE 0.820 9.000 0.067 NA   NA
 569679 5451009 RPA0258 RPA_RNA4   tRNA-Thr2 FALSE 0.011 159.000 0.000 NA   NA
 569682 569683 RPA0260 RPA0261     FALSE 0.014 78.000 0.000 NA   NA
 569684 569685 RPA0262 RPA0263 rlp2   FALSE 0.468 115.000 0.212 NA   NA
 569687 569688 RPA0265 RPA0266 algJ   FALSE 0.127 3.000 0.000 NA   NA
 569688 5451010 RPA0266 RPA_RNA39   tRNA-Gly2 FALSE 0.006 206.000 0.000 NA   NA
 569690 569691 RPA0267 RPA0268 trx   TRUE 0.825 27.000 0.222 1.000   NA
 569691 569692 RPA0268 RPA0269     FALSE 0.459 90.000 0.148 NA   NA
 569694 569695 RPA0271 RPA0272 tesB glnK1 FALSE 0.188 192.000 0.026 1.000 N NA
 569695 569696 RPA0272 RPA0273 glnK1 amtB1 FALSE 0.492 75.000 0.095 1.000 N NA
 569696 569697 RPA0273 RPA0274 amtB1 glnK2 FALSE 0.006 310.000 0.000 1.000 N NA
 569697 569698 RPA0274 RPA0275 glnK2 amtB2 TRUE 0.760 38.000 0.197 1.000 N NA
 569698 569699 RPA0275 RPA0276 amtB2   FALSE 0.217 118.000 0.020 1.000   NA
 569699 569700 RPA0276 RPA0277     TRUE 0.793 153.000 0.778 NA   NA
 569700 569701 RPA0277 RPA0278     FALSE 0.329 54.000 0.023 NA   NA
 569701 569702 RPA0278 RPA0279     TRUE 0.820 14.000 0.081 1.000 N NA
 569702 569703 RPA0279 RPA0280     TRUE 0.704 18.000 0.035 1.000 N NA
 569703 569704 RPA0280 RPA0281   xthA1 FALSE 0.060 288.000 0.068 1.000 N NA
 569705 569706 RPA0282 RPA0283     TRUE 0.930 40.000 0.261 NA Y NA
 569709 569710 RPA0286 RPA0287   leuS FALSE 0.034 206.000 0.000 1.000 N NA
 569710 569711 RPA0287 RPA0288 leuS   TRUE 0.831 -13.000 0.090 NA   NA
 569711 569712 RPA0288 RPA0289     FALSE 0.520 57.000 0.097 NA   NA
 569713 569714 RPA0290 RPA0291   parB1 FALSE 0.048 24.000 0.000 NA   NA
 569714 569715 RPA0291 RPA0292 parB1 parA TRUE 0.807 173.000 0.827 1.000 N NA
 569715 569716 RPA0292 RPA0293 parA gidB TRUE 0.879 28.000 0.339 1.000 N NA
 569716 569717 RPA0293 RPA0294 gidB gidA TRUE 0.694 172.000 0.466 1.000 N NA
 569717 569718 RPA0294 RPA0295 gidA trmE TRUE 0.598 94.000 0.266 1.000   NA
 569718 569719 RPA0295 RPA0296 trmE rho FALSE 0.339 88.000 0.050 1.000   NA
 569719 569720 RPA0296 RPA0297 rho   FALSE 0.040 261.000 0.024 NA   NA
 569721 569722 RPA0298 RPA0299   maf1 TRUE 0.900 -3.000 0.135 NA   NA
 569722 569723 RPA0299 RPA0300 maf1 coaE FALSE 0.174 97.000 0.011 NA N NA
 569723 569724 RPA0300 RPA0301 coaE dnaQ TRUE 0.686 36.000 0.092 1.000 N NA
 569726 569727 RPA0303 RPA0304     TRUE 0.934 -91.000 0.324 1.000   NA
 569727 569728 RPA0304 RPA0305     TRUE 0.946 6.000 0.332 NA   NA
 569729 569730 RPA0306 RPA0307 hslU   FALSE 0.288 42.000 0.007 NA   NA
 569730 569731 RPA0307 RPA0308   hslV TRUE 0.662 -3.000 0.005 NA   NA
 569732 569733 RPA0309 RPA0310 hisB   TRUE 0.562 28.000 0.041 NA   NA
 569733 569734 RPA0310 RPA0311   hisH TRUE 0.960 -3.000 0.417 NA   NA
 569734 569735 RPA0311 RPA0312 hisH hisA TRUE 0.987 -3.000 0.070 0.003 Y NA
 569735 569736 RPA0312 RPA0313 hisA hisF TRUE 0.993 11.000 0.433 0.003 Y NA
 569736 569737 RPA0313 RPA0314 hisF hisE1 TRUE 0.934 54.000 0.105 0.003 Y NA
 569737 569738 RPA0314 RPA0315 hisE1 coaA FALSE 0.477 75.000 0.086 1.000 N NA
 569739 569740 RPA0316 RPA0317     FALSE 0.416 161.000 0.130 NA   NA
 569740 569741 RPA0317 RPA0318     FALSE 0.172 127.000 0.004 1.000 N NA
 569741 569742 RPA0318 RPA0319     FALSE 0.134 100.000 0.005 NA   NA
 569742 569743 RPA0319 RPA0320     TRUE 0.931 -3.000 0.231 NA   NA
 569743 569744 RPA0320 RPA0321     TRUE 0.597 86.000 0.231 1.000 N NA
 569744 569745 RPA0321 RPA0322   gshB FALSE 0.059 237.000 0.005 1.000 N NA
 569745 569746 RPA0322 RPA0323 gshB   FALSE 0.434 73.000 0.064 1.000 N NA
 569746 569747 RPA0323 RPA0324     TRUE 0.894 -13.000 0.165 1.000   NA
 569749 569750 RPA0326 RPA0327   hemN2 FALSE 0.000 405.000 0.000 NA N NA
 569750 569751 RPA0327 RPA0328 hemN2   TRUE 0.916 -10.000 0.218 1.000 N NA
 569751 569752 RPA0328 RPA0329   rph TRUE 0.748 52.000 0.262 1.000 N NA
 569753 569754 RPA0330 RPA0331 hrcA   FALSE 0.481 88.000 0.120 1.000 N NA
 569756 569757 RPA0333 RPA0334 dnaK dnaJ TRUE 0.812 215.000 0.236 0.003 Y NA
 569757 569758 RPA0334 RPA0335 dnaJ   FALSE 0.354 94.000 0.057 1.000 N NA
 569758 569759 RPA0335 RPA0336     FALSE 0.485 102.000 0.208 NA   NA
 569759 569760 RPA0336 RPA0337   pyrF TRUE 0.678 8.000 0.012 NA   NA
 569760 569761 RPA0337 RPA0338 pyrF   TRUE 0.584 26.000 0.044 NA   NA
 569761 569762 RPA0338 RPA0339   dapB FALSE 0.154 97.000 0.010 NA   NA
 569763 569764 RPA0340 RPA0341 pgm1 ogt FALSE 0.202 92.000 0.004 1.000 N NA
 569764 569765 RPA0341 RPA0342 ogt   TRUE 0.828 16.000 0.142 NA   NA
 569767 569768 RPA0344 RPA0345     FALSE 0.060 123.000 0.000 1.000 N NA
 569768 569769 RPA0345 RPA0346     FALSE 0.001 574.000 0.000 1.000 N NA
 569769 569770 RPA0346 RPA0347   aceK FALSE 0.225 88.000 0.007 1.000 N NA
 569770 569771 RPA0347 RPA0348 aceK   FALSE 0.001 324.000 0.000 NA   NA
 569772 569773 RPA0349 RPA0350 dcm vsr TRUE 0.980 -3.000 0.024 0.048 Y NA
 569773 569774 RPA0350 RPA0351 vsr   TRUE 0.751 5.000 0.024 NA   NA
 569777 569778 RPA0354 RPA0355     TRUE 0.995 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 569778 569779 RPA0355 RPA0356     FALSE 0.381 188.000 0.145 1.000   NA
 569779 569780 RPA0356 RPA0357   exoS TRUE 0.975 -3.000 0.304 0.018   NA
 569780 569781 RPA0357 RPA0358 exoS chvI TRUE 0.941 163.000 0.829 1.000 Y NA
 569782 569783 RPA0359 RPA0360   pckA FALSE 0.177 189.000 0.018 1.000 N NA
 569786 569787 RPA0363 RPA0364     FALSE 0.460 79.000 0.125 NA   NA
 569788 569789 RPA0365 RPA0366     TRUE 0.639 99.000 0.333 1.000   NA
 569790 569791 RPA0367 RPA0368 rpoH rluD FALSE 0.143 222.000 0.046 1.000 N NA
 569793 569794 RPA0369 RPA0370     FALSE 0.004 313.000 0.000 1.000   NA
 569794 569795 RPA0370 RPA0371   metB FALSE 0.037 201.000 0.000 1.000 N NA
 569797 569798 RPA0373 RPA0374 trxC   FALSE 0.050 140.000 0.000 1.000   NA
 569798 569799 RPA0374 RPA0375   chaB FALSE 0.015 74.000 0.000 NA   NA
 569800 569801 RPA0376 RPA0377 pimt1   TRUE 0.782 152.000 0.667 1.000   NA
 569803 569804 RPA0379 RPA0380 pfkB   FALSE 0.198 116.000 0.025 NA N NA
 569804 569805 RPA0380 RPA0381   glgC FALSE 0.010 272.000 0.000 1.000 N NA
 569805 569806 RPA0381 RPA0382 glgC glgA1 TRUE 0.976 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 569806 569807 RPA0382 RPA0383 glgA1   FALSE 0.063 146.000 0.000 1.000 N NA
 569807 569808 RPA0383 RPA0384     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 569815 569816 RPA0391 RPA0392   argG FALSE 0.016 242.000 0.000 1.000 N NA
 569816 569817 RPA0392 RPA0393 argG   FALSE 0.205 93.000 0.008 1.000   NA
 569817 569818 RPA0393 RPA0394     TRUE 0.951 -3.000 0.333 NA   NA
 569818 569819 RPA0394 RPA0395     TRUE 0.866 0.000 0.074 NA   NA
 569819 569820 RPA0395 RPA0396     TRUE 0.889 5.000 0.004 0.050   NA
 569820 569821 RPA0396 RPA0397     FALSE 0.151 112.000 0.012 NA   NA
 569821 569822 RPA0397 RPA0398     FALSE 0.194 154.000 0.021 NA   NA
 569822 569823 RPA0398 RPA0399     FALSE 0.061 128.000 0.000 1.000 N NA
 569827 569828 RPA0403 RPA0404   phhB FALSE 0.409 83.000 0.094 NA   NA
 569830 569831 RPA0406 RPA0407     TRUE 0.926 5.000 0.224 NA   NA
 569832 569833 RPA0408 RPA0409 bipA   FALSE 0.173 110.000 0.003 1.000 N NA
 569833 569834 RPA0409 RPA0410     FALSE 0.230 176.000 0.028 1.000   NA
 569834 569835 RPA0410 RPA0411   ppa FALSE 0.367 77.000 0.048 1.000   NA
 569835 569836 RPA0411 RPA0412 ppa CPS1 FALSE 0.477 36.000 0.013 1.000 N NA
 569837 569838 RPA0413 RPA0414     FALSE 0.203 107.000 0.029 NA   NA
 569838 569839 RPA0414 RPA0415     TRUE 0.717 14.000 0.048 NA   NA
 569841 569842 RPA0416 RPA0417     TRUE 0.676 82.000 0.375 NA   NA
 569842 569843 RPA0417 RPA0418     FALSE 0.257 104.000 0.048 NA   NA
 569843 569844 RPA0418 RPA0419     FALSE 0.306 121.000 0.057 1.000   NA
 569844 569845 RPA0419 RPA0420     FALSE 0.233 183.000 0.057 NA   NA
 569845 569846 RPA0420 RPA0421     FALSE 0.536 44.000 0.077 NA   NA
 569846 569847 RPA0421 RPA0422     FALSE 0.060 121.000 0.000 1.000 N NA
 569850 569851 RPA0425 RPA0426 fabA fabB TRUE 0.934 62.000 0.451 1.000 Y NA
 569851 569852 RPA0426 RPA0427 fabB   TRUE 0.827 176.000 0.265 1.000 Y NA
 569853 569854 RPA0428 RPA0429   katG FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 569856 569857 RPA0431 RPA0432   pnp FALSE 0.008 290.000 0.000 1.000 N NA
 569857 569858 RPA0432 RPA0433 pnp rpsO FALSE 0.281 339.000 0.335 1.000 Y NA
 569858 569859 RPA0433 RPA0434 rpsO truB TRUE 0.984 3.000 0.211 1.000 Y NA
 569859 569860 RPA0434 RPA0435 truB rbfA TRUE 0.989 0.000 0.318 1.000 Y NA
 569860 569861 RPA0435 RPA0436 rbfA infB TRUE 0.899 174.000 0.530 1.000 Y NA
 569861 569862 RPA0436 RPA0437 infB   TRUE 0.593 -7.000 0.002 NA N NA
 569862 569863 RPA0437 RPA0438   nusA TRUE 0.727 62.000 0.002 NA Y NA
 569863 569864 RPA0438 RPA0439 nusA   TRUE 0.980 3.000 0.759 NA   NA
 569865 569866 RPA0440 RPA0441     FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 569867 569868 RPA0442 RPA0443     FALSE 0.288 75.000 0.018 1.000   NA
 569868 569869 RPA0443 RPA0444   lnt FALSE 0.410 201.000 0.231 1.000 N NA
 569869 569870 RPA0444 RPA0445 lnt   TRUE 0.925 -3.000 0.213 NA   NA
 569870 569871 RPA0445 RPA0446     TRUE 0.931 2.000 0.222 NA   NA
 569871 569872 RPA0446 RPA0447     TRUE 0.967 0.000 0.457 NA   NA
 569872 569873 RPA0447 RPA0448   miaB FALSE 0.483 181.000 0.220 1.000 N NA
 569873 569874 RPA0448 RPA0449 miaB   FALSE 0.385 120.000 0.008 0.050   NA
 569874 569875 RPA0449 RPA0450     FALSE 0.413 88.000 0.082 1.000   NA
 569875 569876 RPA0450 RPA0451   rimI FALSE 0.455 63.000 0.061 1.000   NA
 569876 569877 RPA0451 RPA0452 rimI   TRUE 0.838 23.000 0.209 1.000   NA
 569877 569878 RPA0452 RPA0453     TRUE 0.722 137.000 0.061 1.000 Y NA
 569878 569879 RPA0453 RPA0454     FALSE 0.426 146.000 0.151 NA   NA
 569879 569880 RPA0454 RPA0455   trpS FALSE 0.174 192.000 0.042 NA   NA
 569880 569881 RPA0455 RPA0456 trpS   FALSE 0.533 56.000 0.078 1.000   NA
 569883 569884 RPA0458 RPA0459     TRUE 0.772 -351.000 0.000 0.050   NA
 569884 569885 RPA0459 RPA0460     FALSE 0.346 130.000 0.073 1.000   NA
 569888 569889 RPA0463 RPA0464     FALSE 0.196 25.000 0.000 1.000   NA
 569890 569891 RPA0465 RPA0466     FALSE 0.010 140.000 0.000 NA   NA
 569891 569892 RPA0466 RPA0467     TRUE 0.965 3.000 0.405 1.000   NA
 569892 569893 RPA0467 RPA0468     TRUE 0.954 0.000 0.282 1.000 N NA
 569893 569894 RPA0468 RPA0469   AtsC TRUE 0.994 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 569894 569895 RPA0469 RPA0470 AtsC   TRUE 0.992 9.000 0.702 NA Y NA
 569896 569897 RPA0471 RPA0472     FALSE 0.016 234.000 0.000 1.000   NA
 569899 569900 RPA0474 RPA0475     FALSE 0.058 92.000 0.000 1.000   NA
 569902 569903 RPA0476 RPA0477     FALSE 0.373 134.000 0.111 NA   NA
 569903 569904 RPA0477 RPA0478     TRUE 0.811 58.000 0.500 NA   NA
 569906 569907 RPA0480 RPA0481     TRUE 0.985 27.000 0.476 0.009 Y NA
 569907 569908 RPA0481 RPA0482     TRUE 0.975 34.000 0.636 1.000 Y NA
 569909 569910 RPA0483 RPA0484   paaG1 TRUE 0.937 3.000 0.250 NA   NA
 569910 569911 RPA0484 RPA0485 paaG1   TRUE 0.693 177.000 0.556 NA N NA
 569912 569913 RPA0486 RPA0487     TRUE 0.925 12.000 0.277 1.000   NA
 569914 569915 RPA0488 RPA0489     FALSE 0.004 697.000 0.012 1.000 N NA
 569915 569916 RPA0489 RPA0490     FALSE 0.276 75.000 0.011 1.000 N NA
 569916 569917 RPA0490 RPA0491     FALSE 0.519 73.000 0.116 1.000   NA
 569917 569918 RPA0491 RPA0492     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 569919 569920 RPA0493 RPA0494 rpmB   FALSE 0.008 289.000 0.000 1.000 N NA
 569921 569922 RPA0495 RPA0496   cobT2 TRUE 0.837 25.000 0.260 NA   NA
 569922 569923 RPA0496 RPA0497 cobT2   FALSE 0.417 -3.000 0.000 1.000   NA
 569923 569924 RPA0497 RPA0498   cobS2 FALSE 0.407 5.000 0.000 1.000   NA
 569928 569929 RPA0502 RPA0503   aroB FALSE 0.245 48.000 0.005 NA   NA
 569929 569930 RPA0503 RPA0504 aroB aroK TRUE 0.974 11.000 0.147 1.000 Y NA
 569931 569932 RPA0505 RPA0506     TRUE 0.674 17.000 0.043 NA   NA
 569934 569935 RPA0508 RPA0509 accA   FALSE 0.008 333.000 0.003 NA   NA
 569940 569941 RPA0514 RPA0515 FarB   TRUE 0.980 4.000 0.700 1.000 N NA
 569941 569942 RPA0515 RPA0516     TRUE 0.918 -7.000 0.206 1.000 N NA
 569943 569944 RPA0517 RPA0518     FALSE 0.185 165.000 0.016 NA N NA
 569944 569945 RPA0518 RPA0519   gcpE TRUE 0.567 -16.000 0.002 NA N NA
 569947 569948 RPA0521 RPA0522     TRUE 0.931 18.000 0.444 1.000   NA
 569949 569950 RPA0523 RPA0524     TRUE 0.852 8.000 0.085 NA   NA
 569951 569952 RPA0525 RPA0526   rpmF FALSE 0.229 162.000 0.016 1.000   NA
 569952 569953 RPA0526 RPA0527 rpmF   FALSE 0.047 243.000 0.016 NA   NA
 569957 569958 RPA0531 RPA0532     TRUE 0.693 183.000 0.071 1.000 Y NA
 569958 569959 RPA0532 RPA0533     FALSE 0.395 77.000 0.080 NA   NA
 569960 569961 RPA0534 RPA0535   hrpB FALSE 0.233 130.000 0.024 1.000   NA
 569963 569964 RPA0537 RPA0538     FALSE 0.001 740.000 0.000 1.000   NA
 569966 5451014 RPA0540 RPA_RNA37   tRNA-Leu5 FALSE 0.001 309.000 0.000 NA   NA
 569970 569971 RPA0543 RPA0544     TRUE 0.553 154.000 0.263 NA   NA
 569971 569972 RPA0544 RPA0545     TRUE 0.931 -3.000 0.231 NA   NA
 569972 569973 RPA0545 RPA0546     FALSE 0.012 95.000 0.000 NA   NA
 569976 569977 RPA0549 RPA0550 ChrR   TRUE 0.983 -3.000 0.898 NA N NA
 569977 569978 RPA0550 RPA0551     FALSE 0.032 629.000 0.000 0.061 Y NA
 569979 569980 RPA0552 RPA0553 dctA1   FALSE 0.456 38.000 0.033 NA   NA
 569980 569981 RPA0553 RPA0554     TRUE 0.815 -3.000 0.046 NA   NA
 569982 569983 RPA0555 RPA0556     FALSE 0.051 144.000 0.000 1.000   NA
 569985 569986 RPA0558 RPA0559 purC1   FALSE 0.233 71.000 0.016 NA   NA
 569986 569987 RPA0559 RPA0560   MLYCD FALSE 0.443 130.000 0.182 NA   NA
 569987 569988 RPA0560 RPA0561 MLYCD   FALSE 0.052 166.000 0.000 1.000   NA
 569988 569989 RPA0561 RPA0562     FALSE 0.517 76.000 0.125 1.000   NA
 569992 569993 RPA0565 RPA0566     FALSE 0.010 129.000 0.000 NA   NA
 569994 569995 RPA0567 RPA0568     FALSE 0.009 261.000 0.000 1.000   NA
 569995 569996 RPA0568 RPA0569     FALSE 0.136 90.000 0.004 NA   NA
 569998 569999 RPA0571 RPA0572 regR regS TRUE 0.919 92.000 0.560 1.000 Y NA
 570000 570001 RPA0573 RPA0574     TRUE 0.975 -3.000 0.594 1.000   NA
 570001 570002 RPA0574 RPA0575     FALSE 0.488 139.000 0.188 1.000   NA
 570002 570003 RPA0575 RPA0576     FALSE 0.010 257.000 0.000 1.000   NA
 570006 570007 RPA0579 RPA0580     FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 570007 570008 RPA0580 RPA0581     FALSE 0.178 151.000 0.017 NA   NA
 570009 570010 RPA0582 RPA0583     FALSE 0.396 95.000 0.108 NA   NA
 570010 570011 RPA0583 RPA0584     FALSE 0.044 192.000 0.000 1.000 N NA
 570012 570013 RPA0585 RPA0586     FALSE 0.099 66.000 0.000 1.000 N NA
 570013 570014 RPA0586 RPA0587     FALSE 0.206 30.000 0.000 1.000 N NA
 570014 570015 RPA0587 RPA0588     FALSE 0.155 41.000 0.000 1.000 N NA
 570017 570018 RPA0590 RPA0591 prc glnD FALSE 0.067 164.000 0.000 1.000 N NA
 570019 570020 RPA0592 RPA0593 argJ   FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 570020 570021 RPA0593 RPA0594   mutT FALSE 0.109 8.000 0.000 NA   NA
 570022 570023 RPA0595 RPA0596     FALSE 0.420 27.000 0.010 NA   NA
 570024 570025 RPA0597 RPA0598     FALSE 0.453 43.000 0.027 1.000   NA
 570025 570026 RPA0598 RPA0599     TRUE 0.827 -3.000 0.035 1.000   NA
 570026 570027 RPA0599 RPA0600     TRUE 0.749 -3.000 0.022 NA   NA
 570027 570028 RPA0600 RPA0601     FALSE 0.078 222.000 0.021 NA   NA
 570029 570030 RPA0602 RPA0603   ubiG FALSE 0.129 128.000 0.006 NA   NA
 570031 570032 RPA0604 RPA0605 lysC ptsP FALSE 0.239 201.000 0.069 1.000 N NA
 570032 570033 RPA0605 RPA0606 ptsP prfA TRUE 0.651 57.000 0.034 0.033 N NA
 570033 570034 RPA0606 RPA0607 prfA hemK TRUE 0.984 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 570034 570035 RPA0607 RPA0608 hemK   FALSE 0.006 452.000 0.021 NA   NA
 570037 570038 RPA0610 RPA0611     TRUE 0.853 -3.000 0.071 NA   NA
 570039 570040 RPA0612 RPA0613     TRUE 0.815 -3.000 0.024 1.000 N NA
 570040 570041 RPA0613 RPA0614     TRUE 0.903 5.000 0.108 1.000 N NA
 570042 570043 RNA_60 RPA0615 ffs dnaX FALSE 0.009 181.000 0.000 NA   NA
 570043 570044 RPA0615 RPA0616 dnaX   TRUE 0.902 22.000 0.411 NA   NA
 570044 570045 RPA0616 RPA0617   recR TRUE 0.749 96.000 0.604 NA   NA
 570045 570046 RPA0617 RPA0618 recR   FALSE 0.473 20.000 0.008 NA   NA
 570047 570048 RPA0619 RPA0620 ampG   FALSE 0.135 149.000 0.006 NA   NA
 570049 570050 RPA0621 RPA0622 def fmt TRUE 0.856 79.000 0.050 0.020 Y NA
 570050 570051 RPA0622 RPA0623 fmt truA TRUE 0.707 178.000 0.069 1.000 Y NA
 570052 570053 RPA0624 RPA0625 dapE   TRUE 0.777 0.000 0.010 1.000   NA
 570053 570054 RPA0625 RPA0626   dapD TRUE 0.582 19.000 0.009 1.000   NA
 570054 570055 RPA0626 RPA0627 dapD   FALSE 0.293 185.000 0.071 1.000   NA
 570055 570056 RPA0627 RPA0628     TRUE 0.912 -3.000 0.041 0.095   NA
 570056 570057 RPA0628 RPA0629   argB TRUE 0.783 0.000 0.012 1.000   NA
 570057 570058 RPA0629 RPA0630 argB   FALSE 0.147 125.000 0.012 NA   NA
 570058 570059 RPA0630 RPA0631     TRUE 0.764 0.000 0.022 NA   NA
 570059 570060 RPA0631 RPA0632     TRUE 0.550 152.000 0.082 0.063   NA
 570060 570061 RPA0632 RPA0633   rnpA TRUE 0.824 17.000 0.105 1.000 N NA
 570061 570062 RPA0633 RPA0634 rnpA rpmH TRUE 0.950 24.000 0.787 1.000   NA
 570063 5451015 RPA0635 RPA_RNA7   tRNA-Arg1 FALSE 0.002 250.000 0.000 NA   NA
 570065 570066 RPA0636 RPA0637     TRUE 0.775 27.000 0.182 NA   NA
 570066 570067 RPA0637 RPA0638     FALSE 0.416 77.000 0.088 NA   NA
 570068 570069 RPA0639 RPA0640 sigE fliC TRUE 0.659 143.000 0.389 1.000 N NA
 570069 570070 RPA0640 RPA0641 fliC fliD TRUE 0.800 62.000 0.037 1.000 Y NA
 570070 570071 RPA0641 RPA0642 fliD   TRUE 0.987 0.000 0.043 0.002 Y NA
 570071 570072 RPA0642 RPA0643     TRUE 0.937 0.000 0.238 NA   NA
 570072 570073 RPA0643 RPA0644   flgD FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 570073 570074 RPA0644 RPA0645 flgD flgE TRUE 0.962 20.000 0.250 NA Y NA
 570074 570075 RPA0645 RPA0646 flgE   TRUE 0.922 6.000 0.222 NA   NA
 570075 570076 RPA0646 RPA0647     TRUE 0.895 16.000 0.286 NA   NA
 570076 570077 RPA0647 RPA0648   flgK1 TRUE 0.969 22.000 0.583 0.002   NA
 570077 570078 RPA0648 RPA0649 flgK1 flgL TRUE 0.994 16.000 0.750 0.005 Y NA
 570079 570080 RPA0650 RPA0651 badK aliA TRUE 0.958 28.000 0.105 0.049 Y NA
 570080 570081 RPA0651 RPA0652 aliA aliB TRUE 0.908 57.000 0.250 1.000 Y NA
 570081 570082 RPA0652 RPA0653 aliB badI TRUE 0.660 65.000 0.225 1.000 N NA
 570082 570083 RPA0653 RPA0654 badI badH TRUE 0.968 31.000 1.000 0.095 N NA
 570084 570085 RPA0655 RPA0656 badR badC TRUE 0.618 74.000 0.222 1.000   NA
 570085 570086 RPA0656 RPA0657 badC badD FALSE 0.010 171.000 0.000 NA   NA
 570086 570087 RPA0657 RPA0658 badD badE TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA Y NA
 570087 570088 RPA0658 RPA0659 badE badF TRUE 0.974 12.000 0.875 NA   NA
 570088 570089 RPA0659 RPA0660 badF badG TRUE 0.919 93.000 0.875 0.001   NA
 570089 570090 RPA0660 RPA0661 badG badA TRUE 0.813 117.000 0.222 1.000 Y NA
 570090 570091 RPA0661 RPA0662 badA badB TRUE 0.823 17.000 0.111 1.000   NA
 570092 570093 RPA0663 RPA0664 badM badL TRUE 0.839 55.000 0.545 NA N NA
 570093 570094 RPA0664 RPA0665 badL hbaH FALSE 0.067 99.000 0.000 1.000 N NA
 570094 570095 RPA0665 RPA0666 hbaH hbaG TRUE 0.987 -3.000 0.115 0.033 Y NA
 570095 570096 RPA0666 RPA0667 hbaG hbaF TRUE 0.991 3.000 0.269 0.065 Y NA
 570096 570097 RPA0667 RPA0668 hbaF hbaE TRUE 0.895 86.000 0.429 NA Y NA
 570097 570098 RPA0668 RPA0669 hbaE hbaA TRUE 0.759 177.000 0.750 NA N NA
 570099 570100 RPA0670 RPA0671 hbaB hbaC TRUE 0.996 -3.000 0.714 0.080 Y NA
 570100 570101 RPA0671 RPA0672 hbaC hbaD TRUE 0.996 -3.000 0.714 0.054 Y NA
 570103 570104 RPA0674 RPA0675     FALSE 0.422 36.000 0.021 NA   NA
 570104 570105 RPA0675 RPA0676     FALSE 0.280 129.000 0.063 NA   NA
 570105 570106 RPA0676 RPA0677     TRUE 0.837 171.000 1.000 1.000   NA
 570106 570107 RPA0677 RPA0678   gltA FALSE 0.036 327.000 0.000 0.006   NA
 570108 570109 RPA0679 RPA0680     FALSE 0.098 67.000 0.000 1.000 N NA
 570110 570111 RPA0681 RPA0682     TRUE 0.968 -3.000 0.464 1.000   NA
 570111 570112 RPA0682 RPA0683     TRUE 0.954 -3.000 0.083 0.004   NA
 570114 570115 RPA0685 RPA0686     TRUE 0.616 161.000 0.300 1.000   NA
 570116 570117 RPA0687 RPA0688   phnN TRUE 0.806 -19.000 0.056 1.000   NA
 570117 570118 RPA0688 RPA0689 phnN phnM1 TRUE 0.973 -3.000 0.068 1.000 Y NA
 570118 570119 RPA0689 RPA0690 phnM1 phnL TRUE 0.905 39.000 0.104 1.000 Y NA
 570119 570120 RPA0690 RPA0691 phnL phnK TRUE 0.997 6.000 0.859 0.033 Y NA
 570120 570121 RPA0691 RPA0692 phnK phnJ TRUE 0.994 -7.000 0.883 1.000 Y NA
 570121 570122 RPA0692 RPA0693 phnJ phnI TRUE 0.995 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 570122 570123 RPA0693 RPA0694 phnI phnH TRUE 0.998 4.000 0.960 0.003 Y NA
 570123 570124 RPA0694 RPA0695 phnH phnG TRUE 0.998 3.000 0.967 0.003 Y NA
 570126 570127 RPA0697 RPA0698 phnE1 phnE2 TRUE 0.996 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 570127 570128 RPA0698 RPA0699 phnE2 phnD TRUE 0.970 69.000 0.568 0.001 Y NA
 570128 570129 RPA0699 RPA0700 phnD phnC TRUE 0.951 110.000 0.589 0.003 Y NA
 570130 570131 RPA0701 RPA0702   phnM2 TRUE 0.845 -3.000 0.041 1.000 N NA
 570131 570132 RPA0702 RPA0703 phnM2   TRUE 0.605 23.000 0.041 NA   NA
 570134 570135 RPA0705 RPA0706     FALSE 0.004 498.000 0.017 NA   NA
 570137 570138 RPA0708 RPA0709     FALSE 0.010 115.000 0.000 NA   NA
 570138 570139 RPA0709 RPA0710     FALSE 0.026 43.000 0.000 NA   NA
 570140 570141 RPA0711 RPA0712   cobT FALSE 0.542 27.000 0.013 1.000 N NA
 570142 570143 RPA0713 RPA0714   cobU TRUE 0.712 -3.000 0.013 NA   NA
 570143 570144 RPA0714 RPA0715 cobU cobW TRUE 0.867 4.000 0.063 1.000   NA
 570144 570145 RPA0715 RPA0716 cobW cobN TRUE 0.575 135.000 0.274 1.000   NA
 570145 570146 RPA0716 RPA0717 cobN cobO TRUE 0.971 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 570146 570147 RPA0717 RPA0718 cobO cobQ1 TRUE 0.850 148.000 0.078 0.008 Y NA
 570148 570149 RPA0719 RPA0720 cobD   FALSE 0.487 2.000 0.000 1.000 N NA
 570151 570152 RPA0722 RPA0723 fecE   TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 570152 570153 RPA0723 RPA0724   nxiA TRUE 0.980 8.000 0.188 1.000 Y NA
 570153 570154 RPA0724 RPA0725 nxiA sugE FALSE 0.127 333.000 0.000 0.063 Y NA
 570154 570155 RPA0725 RPA0726 sugE btaB TRUE 0.833 -3.000 0.033 1.000 N NA
 570156 570157 RPA0727 RPA0728     FALSE 0.000 556.000 0.000 NA N NA
 570157 570158 RPA0728 RPA0729     TRUE 0.991 11.000 0.750 NA Y NA
 570158 570159 RPA0729 RPA0730     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA Y NA
 570159 570160 RPA0730 RPA0731     FALSE 0.000 534.000 0.000 NA N NA
 570160 570161 RPA0731 RPA0732   fdsG FALSE 0.171 264.000 0.243 1.000 N NA
 570161 570162 RPA0732 RPA0733 fdsG fdsB TRUE 0.997 -3.000 0.870 0.008 Y NA
 570162 570163 RPA0733 RPA0734 fdsB fdsA TRUE 0.950 13.000 0.466 1.000   NA
 570163 570164 RPA0734 RPA0735 fdsA fdsC TRUE 0.972 0.000 0.180 0.001   NA
 570164 570165 RPA0735 RPA0736 fdsC fdsD TRUE 0.980 -10.000 0.458 0.001   NA
 570165 570166 RPA0736 RPA0737 fdsD   TRUE 0.827 10.000 0.057 1.000   NA
 570166 570167 RPA0737 RPA0738     FALSE 0.051 107.000 0.000 1.000   NA
 570167 570168 RPA0738 RPA0739   cyc FALSE 0.276 145.000 0.036 1.000 N NA
 570168 570169 RPA0739 RPA0740 cyc   FALSE 0.330 75.000 0.000 0.080 N NA
 570169 570170 RPA0740 RPA0741     TRUE 0.875 -3.000 0.070 1.000   NA
 570170 570171 RPA0741 RPA0742     TRUE 0.978 0.000 0.674 NA   NA
 570171 570172 RPA0742 RPA0743     FALSE 0.009 178.000 0.000 NA   NA
 570173 570174 RPA0744 RPA0745     TRUE 0.551 141.000 0.250 1.000   NA
 570174 570175 RPA0745 RPA0746     TRUE 0.701 100.000 0.500 NA   NA
 570175 570176 RPA0746 RPA0747   cysA FALSE 0.000 775.000 0.000 NA   NA
 570176 570177 RPA0747 RPA0748 cysA cysW TRUE 0.965 -10.000 0.070 1.000 Y NA
 570177 570178 RPA0748 RPA0749 cysW cysT TRUE 0.993 5.000 0.935 0.001 N NA
 570178 570179 RPA0749 RPA0750 cysT sbp FALSE 0.174 293.000 0.097 0.001 N NA
 570179 570180 RPA0750 RPA0751 sbp cysH FALSE 0.227 125.000 0.019 1.000 N NA
 570181 570182 RPA0752 RPA0753 cysD cysN TRUE 0.980 22.000 0.830 0.001 N NA
 570183 570184 RPA0754 RPA0755     FALSE 0.104 63.000 0.000 1.000 N NA
 570184 570185 RPA0755 RPA0756     TRUE 0.930 1.000 0.161 1.000 N NA
 570185 570186 RPA0756 RPA0757     TRUE 0.974 -3.000 0.625 NA   NA
 570186 570187 RPA0757 RPA0758     TRUE 0.858 14.000 0.179 NA   NA
 570187 570188 RPA0758 RPA0759     TRUE 0.994 5.000 0.742 1.000 Y NA
 570188 570189 RPA0759 RPA0760     TRUE 0.997 5.000 0.871 0.065 Y NA
 570189 570190 RPA0760 RPA0761     TRUE 0.906 198.000 0.593 0.065 Y NA
 570191 570192 RPA0762 RPA0763     FALSE 0.067 153.000 0.000 1.000 N NA
 570193 570194 RPA0764 RPA0765     FALSE 0.222 21.000 0.000 1.000   NA
 570195 570196 RPA0766 RPA0767     TRUE 0.565 106.000 0.000 1.000 Y NA
 570196 570197 RPA0767 RPA0768     FALSE 0.001 491.000 0.000 1.000   NA
 570197 570198 RPA0768 RPA0769     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 570199 570200 RPA0770 RPA0771     TRUE 0.928 -6.000 0.077 0.047   NA
 570203 5451016 RPA0774 RPA_RNA8   tRNA-Arg2 FALSE 0.009 183.000 0.000 NA   NA
 5451016 570205 RPA_RNA8 RPA0775 tRNA-Arg2   FALSE 0.012 89.000 0.000 NA   NA
 570206 570207 RPA0776 RPA0777     FALSE 0.060 119.000 0.000 1.000 N NA
 570207 570208 RPA0777 RPA0778     FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 570210 570211 RPA0780 RPA0781     TRUE 0.897 81.000 0.833 0.080   NA
 570211 570212 RPA0781 RPA0782     TRUE 0.978 3.000 0.714 NA   NA
 570212 570213 RPA0782 RPA0783     FALSE 0.475 189.000 0.294 NA   NA
 570215 570216 RPA0785 RPA0786     FALSE 0.411 121.000 0.111 1.000 N NA
 570217 570218 RPA0787 RPA0788     FALSE 0.010 253.000 0.000 1.000   NA
 570219 570220 RPA0789 RPA0790     FALSE 0.420 56.000 0.054 NA   NA
 570220 570221 RPA0790 RPA0791   exoI1 TRUE 0.565 34.000 0.057 NA   NA
 570221 570222 RPA0791 RPA0792 exoI1   TRUE 0.919 24.000 0.538 NA   NA
 570224 570225 RPA0794 RPA0795 acaP   FALSE 0.345 87.000 0.045 1.000 N NA
 570226 570227 RPA0796 RPA0797   uraI TRUE 0.887 -3.000 0.108 NA   NA
 570228 570229 RPA0798 RPA0799     FALSE 0.346 144.000 0.071 1.000   NA
 570229 570230 RPA0799 RPA0800   matE1 FALSE 0.175 180.000 0.009 1.000 N NA
 570230 570231 RPA0800 RPA0801 matE1   FALSE 0.470 19.000 0.006 NA   NA
 570231 570232 RPA0801 RPA0802     FALSE 0.030 39.000 0.000 NA   NA
 570232 570233 RPA0802 RPA0803     TRUE 0.982 -3.000 0.751 1.000 N NA
 570236 570237 RPA0806 RPA0807     FALSE 0.165 176.000 0.020 NA   NA
 570237 570238 RPA0807 RPA0808     FALSE 0.319 245.000 0.460 NA   NA
 570240 570241 RPA0810 RPA0811     FALSE 0.013 86.000 0.000 NA   NA
 570242 570243 RPA0812 RPA0813     TRUE 0.941 -3.000 0.274 NA   NA
 570243 570244 RPA0813 RPA0814     FALSE 0.075 236.000 0.019 1.000   NA
 570245 570246 RPA0815 RPA0816     FALSE 0.349 94.000 0.080 NA   NA
 570246 570247 RPA0816 RPA0817     TRUE 0.827 171.000 0.247 1.000 Y NA
 570247 570248 RPA0817 RPA0818     TRUE 0.905 125.000 0.562 1.000 Y NA
 570248 570249 RPA0818 RPA0819     FALSE 0.000 424.000 0.000 NA   NA
 570251 570252 RPA0821 RPA0822   gshA TRUE 0.716 28.000 0.082 1.000 N NA
 570252 570253 RPA0822 RPA0823 gshA   FALSE 0.318 146.000 0.057 1.000   NA
 570254 570255 RPA0824 RPA0825 lepB1   TRUE 0.738 -3.000 0.018 NA   NA
 570256 570257 RPA0826 RPA0827     TRUE 0.915 0.000 0.154 NA   NA
 570257 570258 RPA0827 RPA0828     FALSE 0.013 82.000 0.000 NA   NA
 570258 570259 RPA0828 RPA0829   ohr TRUE 0.620 115.000 0.333 1.000 N NA
 570261 570262 RPA0831 RPA0832 coxB coxA TRUE 0.976 68.000 0.741 0.002 Y NA
 570262 570263 RPA0832 RPA0833 coxA coxE TRUE 0.799 46.000 0.153 0.062 N NA
 570263 570264 RPA0833 RPA0834 coxE CoxF TRUE 0.724 0.000 0.012 NA   NA
 570264 570265 RPA0834 RPA0835 CoxF coxG TRUE 0.730 -3.000 0.017 NA   NA
 570265 570266 RPA0835 RPA0836 coxG coxC TRUE 0.806 72.000 0.536 1.000 N NA
 570266 570267 RPA0836 RPA0837 coxC   FALSE 0.405 163.000 0.122 NA   NA
 570267 570268 RPA0837 RPA0838     TRUE 0.926 -3.000 0.220 NA   NA
 570268 570269 RPA0838 RPA0839   thrC FALSE 0.130 135.000 0.006 NA   NA
 570269 570270 RPA0839 RPA0840 thrC mpp TRUE 0.911 -3.000 0.129 1.000   NA
 570270 570271 RPA0840 RPA0841 mpp   TRUE 0.883 53.000 0.674 1.000   NA
 570271 570272 RPA0841 RPA0842     FALSE 0.404 98.000 0.120 NA   NA
 570273 570274 RPA0843 RPA0844 atpF1 atpF2 TRUE 0.997 6.000 0.863 0.003 Y NA
 570274 570275 RPA0844 RPA0845 atpF2 atpE TRUE 0.856 58.000 0.278 0.003   NA
 570275 570276 RPA0845 RPA0846 atpE atpB TRUE 0.936 49.000 0.628 0.003   NA
 570276 570277 RPA0846 RPA0847 atpB atpI TRUE 0.569 70.000 0.195 NA   NA
 570278 570279 RPA0848 RPA0849     TRUE 0.737 46.000 0.267 NA   NA
 570279 570280 RPA0849 RPA0850     FALSE 0.478 24.000 0.015 NA   NA
 570283 570284 RPA0853 RPA0854   hemO FALSE 0.380 187.000 0.133 1.000 N NA
 570284 570285 RPA0854 RPA0855 hemO   FALSE 0.246 221.000 0.143 1.000   NA
 570285 570286 RPA0855 RPA0856     FALSE 0.052 166.000 0.000 1.000   NA
 570286 570287 RPA0856 RPA0857     FALSE 0.029 215.000 0.000 1.000 N NA
 570288 570289 RPA0858 RPA0859     TRUE 0.991 5.000 0.465 1.000 Y NA
 570289 570290 RPA0859 RPA0860     TRUE 0.989 6.000 0.400 1.000 Y NA
 570290 570291 RPA0860 RPA0861     FALSE 0.376 108.000 0.112 NA   NA
 570291 570292 RPA0861 RPA0862     TRUE 0.903 -3.000 0.141 NA   NA
 570292 570293 RPA0862 RPA0863     FALSE 0.489 35.000 0.036 NA   NA
 570293 570294 RPA0863 RPA0864     FALSE 0.288 61.000 0.022 NA   NA
 570295 570296 RPA0865 RPA0866   rnk TRUE 0.599 110.000 0.300 1.000 N NA
 570296 570297 RPA0866 RPA0867 rnk   FALSE 0.001 295.000 0.000 NA N NA
 570297 570298 RPA0867 RPA0868     FALSE 0.262 98.000 0.045 NA   NA
 570298 570299 RPA0868 RPA0869     TRUE 0.725 11.000 0.032 NA   NA
 570299 570300 RPA0869 RPA0870     TRUE 0.560 143.000 0.257 1.000   NA
 570300 570301 RPA0870 RPA0871     FALSE 0.000 665.000 0.000 NA   NA
 570302 570303 RPA0872 RPA0873     TRUE 0.855 5.000 0.077 NA   NA
 570303 570304 RPA0873 RPA0874     TRUE 0.961 -3.000 0.420 NA   NA
 570304 570305 RPA0874 RPA0875   hemZ FALSE 0.316 176.000 0.067 1.000   NA
 570305 570306 RPA0875 RPA0876 hemZ   FALSE 0.380 157.000 0.092 NA N NA
 570306 570307 RPA0876 RPA0877     TRUE 0.973 17.000 0.313 NA Y NA
 570308 570309 RPA0878 RPA0879   kpsF FALSE 0.006 306.000 0.000 1.000 N NA
 570310 570311 RPA0880 RPA0881     FALSE 0.513 112.000 0.250 NA   NA
 570312 570313 RPA0882 RPA0883     TRUE 0.942 110.000 0.914 1.000 Y NA
 570313 570314 RPA0883 RPA0884     FALSE 0.389 202.000 0.000 NA Y NA
 570314 570315 RPA0884 RPA0885     FALSE 0.010 128.000 0.000 NA   NA
 570317 570318 RPA0887 RPA0888 exoN   FALSE 0.282 124.000 0.041 1.000 N NA
 570321 570322 RPA0891 RPA0892 gltB gltD TRUE 0.907 173.000 0.236 0.001 Y NA
 570322 570323 RPA0892 RPA0893 gltD   FALSE 0.003 347.000 0.000 1.000   NA
 570324 570325 RPA0894 RPA0895     FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 570327 570328 RPA0897 RPA0898   dapA2 FALSE 0.276 147.000 0.038 1.000   NA
 570328 570329 RPA0898 RPA0899 dapA2   FALSE 0.023 535.000 0.000 1.000 Y NA
 570331 570332 RPA0901 RPA0902     FALSE 0.497 33.000 0.034 NA   NA
 570334 570335 RPA0904 RPA0905     FALSE 0.000 564.000 0.000 NA N NA
 570335 570336 RPA0905 RPA0906     FALSE 0.014 151.000 0.000 NA N NA
 570337 5451017 RPA0907 RPA_RNA9   tRNA-Val1 FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 5451017 570339 RPA_RNA9 RPA0908 tRNA-Val1   FALSE 0.003 231.000 0.000 NA   NA
 570340 570341 RPA0909 RPA0910 wrbA   TRUE 0.570 163.000 0.286 NA   NA
 570345 570346 RPA0914 RPA0915     FALSE 0.450 123.000 0.143 1.000 N NA
 570347 570348 RPA0916 RPA0917     FALSE 0.021 421.000 0.141 NA   NA
 570351 570352 RPA0920 RPA0921     FALSE 0.546 147.000 0.236 1.000   NA
 570352 570353 RPA0921 RPA0922     TRUE 0.865 0.000 0.073 NA   NA
 570354 570355 RPA0923 RPA0924     TRUE 0.955 -3.000 0.324 1.000   NA
 570355 570356 RPA0924 RPA0925     FALSE 0.001 283.000 0.000 NA   NA
 570356 570357 RPA0925 RPA0926     TRUE 0.858 84.000 1.000 NA   NA
 570358 570359 RPA0927 RPA0928     TRUE 0.855 4.000 0.073 NA   NA
 570361 570362 RPA0930 RPA0931   ubiD TRUE 0.967 -3.000 0.051 NA Y NA
 570363 570364 RPA0932 RPA0933     TRUE 0.962 4.000 0.381 1.000 N NA
 570364 570365 RPA0933 RPA0934     TRUE 0.981 69.000 0.948 0.003 Y NA
 570368 570369 RPA0937 RPA0938     FALSE 0.245 105.000 0.026 1.000   NA
 570369 570370 RPA0938 RPA0939     TRUE 0.861 17.000 0.181 1.000   NA
 570370 570371 RPA0939 RPA0940     TRUE 0.879 6.000 0.078 1.000 N NA
 570371 570372 RPA0940 RPA0941     FALSE 0.415 55.000 0.026 1.000 N NA
 570372 570373 RPA0941 RPA0942     TRUE 0.901 -3.000 0.135 NA   NA
 570373 570374 RPA0942 RPA0943   cbbK FALSE 0.128 99.000 0.004 NA   NA
 570374 570375 RPA0943 RPA0944 cbbK cbbG TRUE 0.606 222.000 0.011 0.003 Y NA
 570375 570376 RPA0944 RPA0945 cbbG cbbT2 TRUE 0.773 216.000 0.439 1.000 Y NA
 570377 570378 RPA0946 RPA0947     TRUE 0.848 -3.000 0.068 NA   NA
 570379 570380 RPA0948 RPA0949   matE2 FALSE 0.371 47.000 0.009 1.000 N NA
 570380 570381 RPA0949 RPA0950 matE2 tly FALSE 0.289 63.000 0.006 1.000 N NA
 570381 570382 RPA0950 RPA0951 tly   TRUE 0.717 3.000 0.010 NA N NA
 570382 570383 RPA0951 RPA0952   dxs FALSE 0.060 223.000 0.007 NA N NA
 570383 570384 RPA0952 RPA0953 dxs xseB FALSE 0.010 414.000 0.020 1.000 N NA
 570384 570385 RPA0953 RPA0954 xseB   FALSE 0.211 84.000 0.015 NA N NA
 570385 570386 RPA0954 RPA0955     FALSE 0.331 106.000 0.078 NA N NA
 570388 570389 RPA0957 RPA0958     TRUE 0.844 174.000 0.303 1.000 Y NA
 5451018 570391 RPA_RNA10 RPA0959 tRNA-Gln1 hupU FALSE 0.010 131.000 0.000 NA   NA
 570391 570392 RPA0959 RPA0960 hupU hupV FALSE 0.102 -4.000 0.000 NA   NA
 570392 570393 RPA0960 RPA0962 hupV hupS FALSE 0.003 236.000 0.000 NA   NA
 570393 570394 RPA0962 RPA0963 hupS hupL TRUE 0.971 19.000 0.056 0.001 Y NA
 570394 570395 RPA0963 RPA0964 hupL hupC TRUE 0.985 17.000 0.355 0.079 Y NA
 570395 570396 RPA0964 RPA0965 hupC hupD TRUE 0.877 62.000 0.177 1.000 Y NA
 570396 570397 RPA0965 RPA0966 hupD hupE TRUE 0.703 14.000 0.038 NA N NA
 570397 570398 RPA0966 RPA0967 hupE hupF FALSE 0.053 21.000 0.000 NA   NA
 570398 570399 RPA0967 RPA0968 hupF hupG FALSE 0.344 221.000 0.308 NA   NA
 570399 570400 RPA0968 RPA0969 hupG hupH TRUE 0.979 -3.000 0.769 NA   NA
 570400 570401 RPA0969 RPA0970 hupH hupI TRUE 0.926 -3.000 0.219 NA   NA
 570401 570402 RPA0970 RPA0971 hupI hupJ TRUE 0.912 -10.000 0.247 NA   NA
 570402 570403 RPA0971 RPA0972 hupJ hupK TRUE 0.855 -3.000 0.073 NA   NA
 570403 570404 RPA0972 RPA0973 hupK hypA TRUE 0.946 -7.000 0.095 0.003   NA
 570404 570405 RPA0973 RPA0974 hypA hypB TRUE 0.959 0.000 0.086 0.003   NA
 570405 570406 RPA0974 RPA0975 hypB hypF TRUE 0.962 5.000 0.018 1.000 Y NA
 570406 570407 RPA0975 RPA0976 hypF hypC TRUE 0.973 0.000 0.069 NA Y NA
 570407 570408 RPA0976 RPA0977 hypC hypD TRUE 0.995 -3.000 0.917 NA Y NA
 570408 570409 RPA0977 RPA0978 hypD hypE TRUE 0.976 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 570409 570410 RPA0978 RPA0979 hypE hoxA FALSE 0.475 41.000 0.024 1.000 N NA
 570410 570411 RPA0979 RPA0980 hoxA   TRUE 0.984 -10.000 0.200 0.093 Y NA
 570411 570412 RPA0980 RPA0981     TRUE 0.720 106.000 0.000 0.015 Y NA
 570414 570415 RPA0983 RPA0984   glnA4 TRUE 0.967 -3.000 0.444 1.000 N NA
 570415 570416 RPA0984 RPA0985 glnA4   TRUE 0.895 47.000 0.133 1.000 Y NA
 570416 570417 RPA0985 RPA0986     TRUE 0.883 212.000 0.867 1.000 Y NA
 570417 570418 RPA0986 RPA0987     TRUE 0.997 3.000 1.000 0.063 Y NA
 570418 570419 RPA0987 RPA0988     TRUE 0.995 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 570419 570420 RPA0988 RPA0989     TRUE 0.996 -19.000 0.824 0.032 Y NA
 570424 570425 RPA0993 RPA0994     FALSE 0.000 443.000 0.000 NA   NA
 570426 570427 RPA0995 RPA0996     FALSE 0.053 375.000 0.000 1.000 Y NA
 570431 570432 RPA1000 RPA1001     TRUE 0.725 14.000 0.052 NA   NA
 570435 570436 RPA1004 RPA1005     FALSE 0.301 79.000 0.045 NA   NA
 570436 570437 RPA1005 RPA1006     FALSE 0.245 114.000 0.030 1.000   NA
 570437 570438 RPA1006 RPA1007   mhpB TRUE 0.981 16.000 0.688 0.001   NA
 570442 570443 RPA1011 RPA1012     FALSE 0.050 131.000 0.000 1.000   NA
 570444 570445 RPA1013 RPA1014 fixG   FALSE 0.476 119.000 0.222 NA   NA
 570446 570447 RPA1015 RPA1016   petA FALSE 0.311 89.000 0.036 1.000 N NA
 570447 570448 RPA1016 RPA1017 petA   FALSE 0.002 250.000 0.000 NA   NA
 570450 570451 RPA1019 RPA1020     TRUE 0.940 2.000 0.212 1.000 N NA
 570451 570452 RPA1020 RPA1021     TRUE 0.914 -3.000 0.165 NA N NA
 570452 570453 RPA1021 RPA1022     FALSE 0.289 62.000 0.019 NA N NA
 570453 570454 RPA1022 RPA1023     FALSE 0.005 209.000 0.000 NA   NA
 570454 570455 RPA1023 RPA1024     TRUE 0.972 5.000 0.600 NA   NA
 570455 570456 RPA1024 RPA1025     TRUE 0.986 -3.000 1.000 1.000   NA
 570458 570459 RPA1027 RPA1028   moaB FALSE 0.226 139.000 0.038 NA   NA
 570459 570460 RPA1028 RPA1029 moaB   FALSE 0.209 164.000 0.009 1.000 N NA
 570460 570461 RPA1029 RPA1030     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.092 Y NA
 570462 570463 RPA1031 RPA1032     FALSE 0.267 99.000 0.050 NA   NA
 570464 570465 RPA1033 RPA1034   rnh2 TRUE 0.696 95.000 0.022 1.000 Y NA
 570465 570466 RPA1034 RPA1035 rnh2   TRUE 0.685 -3.000 0.009 NA   NA
 570468 570469 RPA1037 RPA1038     FALSE 0.103 258.000 0.091 1.000   NA
 570469 570470 RPA1038 RPA1039   ispE FALSE 0.415 105.000 0.107 1.000   NA
 570472 570473 RPA1041 RPA1042     TRUE 0.965 -7.000 0.525 1.000   NA
 570473 570474 RPA1042 RPA1043     FALSE 0.098 246.000 0.061 1.000   NA
 570476 570477 RPA1045 RPA1046 sygA   FALSE 0.182 130.000 0.008 1.000   NA
 570477 570478 RPA1046 RPA1047   sygB TRUE 0.788 0.000 0.013 1.000   NA
 570478 570479 RPA1047 RPA1048 sygB   FALSE 0.000 760.000 0.000 NA   NA
 570481 570482 RPA1050 RPA1051     FALSE 0.011 377.000 0.028 NA   NA
 570482 570483 RPA1051 RPA1052     FALSE 0.004 316.000 0.000 1.000   NA
 570484 570485 RPA1053 RPA1054 nadC nadB TRUE 0.984 17.000 0.223 0.002 Y NA
 570485 570486 RPA1054 RPA1055 nadB nadA TRUE 0.911 94.000 0.210 0.002 Y NA
 570487 570488 RPA1056 RPA1057     TRUE 0.743 115.000 0.667 NA   NA
 570488 570489 RPA1057 RPA1058     FALSE 0.000 612.000 0.000 NA   NA
 570489 570490 RPA1058 RPA1059     FALSE 0.076 86.000 0.000 1.000 N NA
 570490 570491 RPA1059 RPA1060     FALSE 0.109 8.000 0.000 NA   NA
 570491 570492 RPA1060 RPA1061   tcmP FALSE 0.099 -7.000 0.000 NA   NA
 570493 570494 RPA1062 RPA1063     FALSE 0.438 52.000 0.053 NA   NA
 570494 570495 RPA1063 RPA1064     TRUE 0.919 -3.000 0.147 1.000   NA
 570495 570496 RPA1064 RPA1065     TRUE 0.677 67.000 0.258 1.000   NA
 570498 570499 RPA1067 RPA1068 tag   TRUE 0.848 -3.000 0.047 1.000   NA
 570500 570501 RPA1069 RPA1070 pyrC   FALSE 0.000 509.000 0.000 NA   NA
 570502 570503 RPA1071 RPA1072     TRUE 0.665 131.000 0.462 NA   NA
 570503 570504 RPA1072 RPA1073     TRUE 0.942 0.000 0.259 NA   NA
 570504 570505 RPA1073 RPA1074     TRUE 0.850 6.000 0.077 NA   NA
 570507 570508 RPA1076 RPA1077     FALSE 0.220 119.000 0.035 NA N NA
 570509 570510 RPA1078 RPA1079     FALSE 0.416 126.000 0.111 1.000 N NA
 570510 570511 RPA1079 RPA1080     TRUE 0.935 -7.000 0.278 1.000   NA
 570511 5451019 RPA1080 RPA_RNA11   tRNA-Pro1 FALSE 0.010 121.000 0.000 NA   NA
 570514 570515 RPA1082 RPA1083     FALSE 0.010 115.000 0.000 NA   NA
 570515 570516 RPA1083 RPA1084   csgB FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 570516 570517 RPA1084 RPA1085 csgB   FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 570517 570518 RPA1085 RPA1086   csgG TRUE 0.893 37.000 0.596 NA   NA
 570518 570519 RPA1086 RPA1087 csgG   TRUE 0.887 3.000 0.103 NA   NA
 570521 570522 RPA1089 RPA1090     FALSE 0.364 148.000 0.100 NA   NA
 570522 570523 RPA1090 RPA1091     FALSE 0.424 116.000 0.167 NA   NA
 570523 570524 RPA1091 RPA1092     TRUE 0.631 77.000 0.286 NA   NA
 570524 570525 RPA1092 RPA1093   ribB FALSE 0.210 105.000 0.030 NA   NA
 570525 570526 RPA1093 RPA1094 ribB   FALSE 0.544 61.000 0.091 1.000 N NA
 570526 570527 RPA1094 RPA1095     FALSE 0.295 149.000 0.045 1.000   NA
 570531 570532 RPA1099 RPA1100 ruvC ruvA TRUE 0.921 185.000 0.451 0.007 Y NA
 570532 570533 RPA1100 RPA1101 ruvA   TRUE 0.764 -3.000 0.008 1.000 N NA
 570533 570534 RPA1101 RPA1102   ruvB FALSE 0.165 178.000 0.005 1.000 N NA
 570534 570535 RPA1102 RPA1103 ruvB   TRUE 0.871 8.000 0.082 1.000   NA
 570535 570536 RPA1103 RPA1104   ndh FALSE 0.199 100.000 0.009 1.000   NA
 570536 570537 RPA1104 RPA1105 ndh   FALSE 0.011 146.000 0.000 NA   NA
 570537 570538 RPA1105 RPA1106     TRUE 0.576 58.000 0.143 NA   NA
 570538 570539 RPA1106 RPA1107     TRUE 0.797 17.000 0.111 NA   NA
 570539 570540 RPA1107 RPA1108     FALSE 0.048 120.000 0.000 1.000   NA
 570540 570541 RPA1108 RPA1109     TRUE 0.984 -3.000 0.867 1.000   NA
 570542 570543 RPA1110 RPA1111     FALSE 0.000 493.000 0.000 NA   NA
 570544 570545 RPA1112 RPA1113     FALSE 0.235 138.000 0.041 NA   NA
 570545 570546 RPA1113 RPA1114     FALSE 0.502 143.000 0.233 NA   NA
 570546 570547 RPA1114 RPA1115     FALSE 0.251 150.000 0.044 NA   NA
 570547 570548 RPA1115 RPA1116     TRUE 0.938 -16.000 0.381 NA   NA
 570548 570549 RPA1116 RPA1117   TolQ FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000 N NA
 570549 570550 RPA1117 RPA1118 TolQ TolR TRUE 0.959 35.000 0.220 0.076 Y NA
 570550 570551 RPA1118 RPA1119 TolR TolA TRUE 0.661 49.000 0.195 NA   NA
 570551 570552 RPA1119 RPA1120 TolA TolB FALSE 0.320 73.000 0.043 NA   NA
 570552 570553 RPA1120 RPA1121 TolB   FALSE 0.179 171.000 0.005 1.000 N NA
 570553 570554 RPA1121 RPA1122     FALSE 0.388 195.000 0.226 NA   NA
 570554 570555 RPA1122 RPA1123     FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   NA
 570555 570556 RPA1123 RPA1124     FALSE 0.519 156.000 0.199 1.000   NA
 570556 570557 RPA1124 RPA1125     TRUE 0.557 55.000 0.085 1.000   NA
 570557 570558 RPA1125 RPA1126   ftsH FALSE 0.212 232.000 0.145 1.000 N NA
 570558 570559 RPA1126 RPA1127 ftsH   FALSE 0.014 133.000 0.000 NA N NA
 570559 570560 RPA1127 RPA1128     TRUE 0.887 -3.000 0.108 NA   NA
 570560 570561 RPA1128 RPA1129     FALSE 0.001 283.000 0.000 NA   NA
 570561 570562 RPA1129 RPA1130   glcD FALSE 0.210 124.000 0.017 1.000   NA
 570562 570563 RPA1130 RPA1131 glcD   TRUE 0.908 163.000 0.266 0.017 Y NA
 570563 570564 RPA1131 RPA1132   glcF TRUE 0.990 -3.000 0.227 0.052 Y NA
 570564 570565 RPA1132 RPA1133 glcF   FALSE 0.015 75.000 0.000 NA   NA
 570565 570566 RPA1133 RPA1134     FALSE 0.000 419.000 0.000 NA   NA
 570568 570569 RPA1136 RPA1137 ictP   FALSE 0.383 145.000 0.118 NA   NA
 570570 570571 RPA1138 RPA1139     FALSE 0.456 113.000 0.200 NA   NA
 570571 570572 RPA1139 RPA1140   groEL1 TRUE 0.607 215.000 0.750 NA   NA
 570572 570573 RPA1140 RPA1141 groEL1 groES1 TRUE 0.987 40.000 0.833 0.006 Y NA
 570574 570575 RPA1142 RPA1143     TRUE 0.796 44.000 0.357 NA   NA
 570578 570579 RPA1146 RPA1147     FALSE 0.376 116.000 0.122 NA   NA
 570579 570580 RPA1147 RPA1148     TRUE 0.960 -3.000 0.412 NA   NA
 570580 570581 RPA1148 RPA1149   hisG FALSE 0.185 94.000 0.012 NA N NA
 570581 570582 RPA1149 RPA1150 hisG   TRUE 0.985 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 570582 570583 RPA1150 RPA1151     FALSE 0.174 145.000 0.018 NA   NA
 570584 570585 RPA1152 RPA1153   ubiA TRUE 0.671 -3.000 0.007 NA   NA
 570587 570588 RPA1155 RPA1156     TRUE 0.606 59.000 0.182 NA   NA
 570588 570589 RPA1156 RPA1157     TRUE 0.879 38.000 0.515 NA   NA
 570589 570590 RPA1157 RPA1158     FALSE 0.411 70.000 0.074 NA   NA
 570590 570591 RPA1158 RPA1159   lpxK TRUE 0.959 -7.000 0.037 1.000 Y NA
 570592 570593 RPA1160 RPA1161   xseA FALSE 0.346 41.000 0.015 NA   NA
 570594 570595 RPA1162 RPA1163 garS   FALSE 0.186 164.000 0.006 1.000   NA
 570597 570598 RPA1165 RPA1166     FALSE 0.176 224.000 0.079 1.000 N NA
 570599 570600 RPA1167 RPA1168 yfcB moaE TRUE 0.810 0.000 0.017 1.000 N NA
 570600 570601 RPA1168 RPA1169 moaE moaD TRUE 0.988 26.000 0.501 0.002 Y NA
 570601 570602 RPA1169 RPA1170 moaD pgsA TRUE 0.890 -3.000 0.082 1.000 N NA
 570602 570603 RPA1170 RPA1171 pgsA uvrC FALSE 0.537 140.000 0.227 1.000 N NA
 570605 570606 RPA1173 RPA1174 cspA1   FALSE 0.017 229.000 0.000 1.000   NA
 570608 570609 RPA1176 RPA1177     FALSE 0.111 213.000 0.030 NA   NA
 570609 570610 RPA1177 RPA1178     FALSE 0.248 140.000 0.029 1.000   NA
 570611 570612 RPA1179 RPA1180     FALSE 0.372 97.000 0.089 NA N NA
 570612 570613 RPA1180 RPA1181     TRUE 0.853 13.000 0.135 NA N NA
 570614 570615 RPA1182 RPA1183     TRUE 0.810 167.000 0.876 NA   NA
 570615 570616 RPA1183 RPA1184     TRUE 0.981 -3.000 0.816 NA   NA
 570616 570617 RPA1184 RPA1185     TRUE 0.979 0.000 0.697 NA   NA
 570618 570619 RPA1186 RPA1187     TRUE 0.943 9.000 0.346 NA   NA
 570619 570620 RPA1187 RPA1188     FALSE 0.146 257.000 0.163 1.000 N NA
 570621 570622 RPA1189 RPA1190     FALSE 0.167 78.000 0.006 NA   NA
 570622 570623 RPA1190 RPA1191     TRUE 0.757 11.000 0.022 1.000 N NA
 570624 570625 RPA1192 RPA1193     TRUE 0.937 41.000 0.045 0.001 Y NA
 570625 570626 RPA1193 RPA1194     FALSE 0.233 159.000 0.013 1.000 N NA
 570627 570628 RPA1195 RPA1196 fixR1 pdxH TRUE 0.829 -3.000 0.032 1.000 N NA
 570629 570630 RPA1197 RPA1198     TRUE 0.690 120.000 0.519 NA   NA
 570630 570631 RPA1198 RPA1199     FALSE 0.002 399.000 0.000 1.000 N NA
 570631 570632 RPA1199 RPA1200     TRUE 0.664 108.000 0.397 1.000 N NA
 570632 570633 RPA1200 RPA1201   aroC FALSE 0.187 116.000 0.008 1.000 N NA
 570633 570634 RPA1201 RPA1202 aroC   FALSE 0.186 104.000 0.005 1.000 N NA
 570637 570638 RPA1205 RPA1206     TRUE 0.598 189.000 0.000 0.091 Y NA
 570640 570641 RPA1208 RPA1209     TRUE 0.727 42.000 0.231 NA   NA
 570641 570642 RPA1209 RPA1210     TRUE 0.891 -7.000 0.172 NA   NA
 570642 570643 RPA1210 RPA1211     TRUE 0.761 19.000 0.094 NA   NA
 570643 570644 RPA1211 RPA1212     TRUE 0.721 165.000 0.556 NA   NA
 570644 570645 RPA1212 RPA1213     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 570645 570646 RPA1213 RPA1214     FALSE 0.519 136.000 0.250 NA   NA
 570646 570647 RPA1214 RPA1215     TRUE 0.829 109.000 0.917 1.000   NA
 570647 570648 RPA1215 RPA1216     TRUE 0.995 14.000 1.000 0.062 Y NA
 570648 570649 RPA1216 RPA1217     TRUE 0.847 165.000 0.267 1.000 Y NA
 570653 570654 RPA1221 RPA1222     TRUE 0.801 29.000 0.231 NA   NA
 570654 570655 RPA1222 RPA1223     TRUE 0.869 17.000 0.231 NA   NA
 570656 570657 RPA1224 RPA1225 iorA   TRUE 0.971 42.000 0.312 0.001 Y NA
 570657 570658 RPA1225 RPA1226     TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.077 Y NA
 570658 570659 RPA1226 RPA1227   oorB TRUE 0.988 2.000 0.057 0.001 Y NA
 570659 570660 RPA1227 RPA1228 oorB   TRUE 0.993 15.000 0.505 0.001 Y NA
 570660 570661 RPA1228 RPA1229     TRUE 0.704 24.000 0.061 1.000 N NA
 570661 570662 RPA1229 RPA1230     FALSE 0.033 210.000 0.000 1.000 N NA
 570662 570663 RPA1230 RPA1231     TRUE 0.997 3.000 1.000 0.062 Y NA
 570663 570664 RPA1231 RPA1232     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 570664 570665 RPA1232 RPA1233     TRUE 0.992 4.000 0.286 0.032 Y NA
 570665 570666 RPA1233 RPA1234     FALSE 0.383 -16.000 0.000 1.000 N NA
 570666 570667 RPA1234 RPA1235     FALSE 0.159 40.000 0.000 1.000 N NA
 570668 570669 RPA1236 RPA1237     TRUE 0.990 19.000 0.500 0.008 Y NA
 570669 570670 RPA1237 RPA1238     TRUE 0.982 4.000 0.174 1.000 Y NA
 570671 570672 RPA1239 RPA1240 exbB1 exbD1 TRUE 0.996 5.000 0.667 0.075 Y NA
 570672 570673 RPA1240 RPA1241 exbD1   TRUE 0.976 -3.000 0.600 1.000 N NA
 570675 570676 RPA1243 RPA1244     TRUE 0.671 16.000 0.038 NA   NA
 570676 570677 RPA1244 RPA1245     TRUE 0.838 -13.000 0.096 NA   NA
 570677 570678 RPA1245 RPA1246     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 570678 570679 RPA1246 RPA1247   rbn2 FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 570680 570681 RPA1248 RPA1249     TRUE 0.960 -10.000 0.242 0.021 N NA
 570682 570683 RPA1250 RPA1251     TRUE 0.862 167.000 0.367 NA Y NA
 570683 570684 RPA1251 RPA1252     TRUE 0.994 15.000 0.888 0.062 Y NA
 570684 570685 RPA1252 RPA1253     TRUE 0.969 11.000 0.639 1.000   NA
 570685 570686 RPA1253 RPA1254     TRUE 0.981 11.000 0.600 0.032   NA
 570686 570687 RPA1254 RPA1255   fmdA TRUE 0.837 37.000 0.312 1.000 N NA
 570687 570688 RPA1255 RPA1256 fmdA fmdB TRUE 0.599 189.000 0.478 NA   NA
 570690 570691 RPA1258 RPA1259     FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 570691 570692 RPA1259 RPA1260     FALSE 0.430 89.000 0.087 1.000 N NA
 570692 570693 RPA1260 RPA1261     FALSE 0.484 97.000 0.143 1.000 N NA
 570695 570696 RPA1263 RPA1264   fliF FALSE 0.298 200.000 0.113 1.000   NA
 570696 570697 RPA1264 RPA1265 fliF fliG TRUE 0.997 7.000 0.762 0.005 Y NA
 570697 570698 RPA1265 RPA1266 fliG   TRUE 0.978 0.000 0.121 NA Y NA
 570698 570699 RPA1266 RPA1267   fliY TRUE 0.952 18.000 0.127 NA Y NA
 570699 570700 RPA1267 RPA1268 fliY flbD TRUE 0.850 48.000 0.484 1.000 N NA
 570701 570702 RPA1269 RPA1270     TRUE 0.872 55.000 0.714 NA   NA
 570702 570703 RPA1270 RPA1271     TRUE 0.670 38.000 0.130 NA   NA
 570704 570705 RPA1272 RPA1273     FALSE 0.262 132.000 0.054 NA   NA
 570705 570706 RPA1273 RPA1274     FALSE 0.001 716.000 0.000 1.000   NA
 570707 570708 RPA1275 RPA1276   carA FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 570709 570710 RPA1277 RPA1278     FALSE 0.190 158.000 0.006 1.000   NA
 570713 570714 RPA1281 RPA1282     TRUE 0.941 -7.000 0.355 NA   NA
 570719 570720 RPA1287 RPA1288 dnaG rpoD FALSE 0.211 260.000 0.299 1.000 N NA
 570720 570721 RPA1288 RPA1289 rpoD   FALSE 0.445 19.000 0.004 NA   NA
 570722 570723 RPA1290 RPA1291     TRUE 0.956 10.000 0.467 NA   NA
 570723 570724 RPA1291 RPA1292     FALSE 0.002 275.000 0.000 NA   NA
 570724 570725 RPA1292 RPA1293     TRUE 0.836 -36.000 0.000 0.003   NA
 570726 570727 RPA1294 RPA1295     FALSE 0.010 173.000 0.000 NA   NA
 570727 570728 RPA1295 RPA1296     FALSE 0.366 215.000 0.000 1.000 Y NA
 570729 570730 RPA1297 RPA1298     FALSE 0.470 191.000 0.000 1.000 Y NA
 570731 570732 RPA1299 RPA1300     FALSE 0.004 226.000 0.000 NA   NA
 570732 570733 RPA1300 RPA1301   pfpI FALSE 0.045 178.000 0.000 1.000   NA
 570736 570737 RPA1304 RPA1305     TRUE 0.947 13.000 0.050 NA Y NA
 570738 570739 RPA1306 RPA1307 trmU   TRUE 0.646 20.000 0.024 1.000 N NA
 570739 5451020 RPA1307 RPA_RNA12   tRNA-Met1 FALSE 0.000 502.000 0.000 NA   NA
 570742 570743 RPA1309 RPA1310     FALSE 0.000 457.000 0.000 NA   NA
 570743 570744 RPA1310 RPA1311     FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 570744 570745 RPA1311 RPA1312     FALSE 0.003 229.000 0.000 NA   NA
 570745 570746 RPA1312 RPA1313     FALSE 0.000 407.000 0.000 NA   NA
 570746 570747 RPA1313 RPA1314     FALSE 0.465 56.000 0.000 0.026   NA
 570747 570748 RPA1314 RPA1315     TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.021 Y NA
 570750 570751 RPA1318 RPA1319 cydA cioB FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 570751 570752 RPA1319 RPA1320 cioB   FALSE 0.051 108.000 0.000 1.000   NA
 570752 570753 RPA1320 RPA1321     FALSE 0.320 184.000 0.083 1.000   NA
 570753 570754 RPA1321 RPA1322     FALSE 0.009 197.000 0.000 NA N NA
 570756 570757 RPA1324 RPA1324a     TRUE 0.771 14.000 0.074 NA   NA
 570757 570758 RPA1324a RPA1325     TRUE 0.856 -3.000 0.074 NA   NA
 570760 570761 RPA1327 RPA1328     FALSE 0.142 38.000 0.000 1.000   NA
 570761 570762 RPA1328 RPA1329   fumC1 FALSE 0.050 131.000 0.000 1.000   NA
 570762 570763 RPA1329 RPA1330 fumC1   TRUE 0.651 2.000 0.003 NA   NA
 570763 570764 RPA1330 RPA1331   mqoB FALSE 0.000 395.000 0.000 NA   NA
 570764 570765 RPA1331 RPA1332 mqoB   FALSE 0.108 50.000 0.000 1.000   NA
 570765 570766 RPA1332 RPA1333     FALSE 0.018 225.000 0.000 1.000   NA
 570766 570767 RPA1333 RPA1334     TRUE 0.971 -3.000 0.500 1.000   NA
 570767 570768 RPA1334 RPA1335     TRUE 0.953 21.000 0.800 NA N NA
 570768 570769 RPA1335 RPA1336     FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 570769 570770 RPA1336 RPA1337     FALSE 0.085 -105.000 0.000 NA   NA
 570770 570771 RPA1337 RPA1338     FALSE 0.000 1102.000 0.000 NA   NA
 570771 570772 RPA1338 RPA1339     TRUE 0.971 -3.000 0.500 1.000   NA
 570772 570773 RPA1339 RPA1340     TRUE 0.801 62.000 0.500 NA N NA
 570773 570774 RPA1340 RPA1341     FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 570776 570777 RPA1343 RPA1344     FALSE 0.360 50.000 0.028 NA   NA
 570777 570778 RPA1344 RPA1345     FALSE 0.011 152.000 0.000 NA   NA
 570778 570779 RPA1345 RPA1346     TRUE 0.916 17.000 0.333 1.000   NA
 570779 570780 RPA1346 RPA1347     TRUE 0.818 136.000 0.833 1.000 N NA
 570780 570781 RPA1347 RPA1348   fecR3 FALSE 0.004 340.000 0.000 1.000 N NA
 570781 570782 RPA1348 RPA1349 fecR3   FALSE 0.002 260.000 0.000 NA N NA
 570782 570783 RPA1349 RPA1350   exbB2 TRUE 0.991 0.000 0.472 NA Y NA
 570783 570784 RPA1350 RPA1351 exbB2 exbD2 TRUE 0.995 5.000 0.655 0.074 Y NA
 570784 570785 RPA1351 RPA1352 exbD2   TRUE 0.920 -3.000 0.200 NA   NA
 570785 570786 RPA1352 RPA1353     TRUE 0.918 -3.000 0.190 NA   NA
 570786 570787 RPA1353 RPA1354     TRUE 0.816 40.000 0.360 NA   NA
 570787 570788 RPA1354 RPA1355     TRUE 0.913 3.000 0.160 NA   NA
 570788 570789 RPA1355 RPA1356     TRUE 0.920 -3.000 0.200 NA   NA
 570789 570790 RPA1356 RPA1357     TRUE 0.855 42.000 0.500 NA   NA
 570790 570791 RPA1357 RPA1358     TRUE 0.790 21.000 0.143 NA   NA
 570791 570792 RPA1358 RPA1359     TRUE 0.833 -3.000 0.057 NA   NA
 570792 570793 RPA1359 RPA1360     TRUE 0.861 6.000 0.086 NA   NA
 570795 570796 RPA1362 RPA1363     TRUE 0.992 -3.000 0.286 0.061 Y NA
 570796 570797 RPA1363 RPA1364     TRUE 0.945 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 570797 570798 RPA1364 RPA1365     TRUE 0.773 42.000 0.000 1.000 Y NA
 570799 570800 RPA1366 RPA1367 soxZ1 soxY1 FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 570801 570802 RPA1368 RPA1369     FALSE 0.051 107.000 0.000 1.000   NA
 570803 570804 RPA1370 RPA1371   vnfX FALSE 0.124 4.000 0.000 NA   NA
 570804 570805 RPA1371 RPA1372 vnfX vnfN TRUE 0.869 -3.000 0.084 NA   NA
 570805 570806 RPA1372 RPA1373 vnfN vnfE TRUE 0.993 12.000 0.475 0.002 Y NA
 570807 570808 RPA1374 RPA1375 vnfA   FALSE 0.120 5.000 0.000 NA   NA
 570809 570810 RPA1376 RPA1377 vnfH   FALSE 0.102 64.000 0.000 1.000 N NA
 570811 570812 RPA1378 RPA1379 vnfD vnfG TRUE 0.991 -3.000 0.833 0.006   NA
 570812 570813 RPA1379 RPA1380 vnfG vnfK TRUE 0.930 64.000 0.800 0.006   NA
 570813 570814 RPA1380 RPA1381 vnfK   FALSE 0.088 -21.000 0.000 NA   NA
 570814 570815 RPA1381 RPA1382     FALSE 0.473 31.000 0.025 NA   NA
 570815 570816 RPA1382 RPA1383     FALSE 0.012 95.000 0.000 NA   NA
 570817 570818 RPA1384 RPA1385 ptxC ptxB TRUE 0.998 -3.000 0.828 0.001 Y NA
 570818 570819 RPA1385 RPA1386 ptxB ptxA TRUE 0.982 -15.000 0.080 0.003 Y NA
 570819 570820 RPA1386 RPA1387 ptxA   FALSE 0.017 67.000 0.000 NA   NA
 570821 570822 RPA1388 RPA1389     FALSE 0.118 -12.000 0.000 NA N NA
 570822 570823 RPA1389 RPA1390     FALSE 0.122 -9.000 0.000 NA N NA
 570823 570824 RPA1390 RPA1391     FALSE 0.472 -3.000 0.000 1.000 N NA
 570824 570825 RPA1391 RPA1392     TRUE 0.770 0.000 0.006 1.000 N NA
 570825 570826 RPA1392 RPA1393     FALSE 0.058 91.000 0.000 1.000   NA
 570828 570829 RPA1395 RPA1396     TRUE 0.972 34.000 0.333 0.061 Y NA
 570829 570830 RPA1396 RPA1397     TRUE 0.996 0.000 0.636 0.061 Y NA
 570830 570831 RPA1397 RPA1398     TRUE 0.995 -3.000 0.571 0.061 Y NA
 570831 570832 RPA1398 RPA1399     TRUE 0.996 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 570832 570833 RPA1399 RPA1400     FALSE 0.445 7.000 0.000 1.000 N NA
 570833 570834 RPA1400 RPA1401   glnAIII FALSE 0.326 15.000 0.000 1.000 N NA
 570834 570835 RPA1401 RPA1402 glnAIII   FALSE 0.437 8.000 0.000 1.000 N NA
 570835 570836 RPA1402 RPA1403     FALSE 0.472 4.000 0.000 1.000 N NA
 570837 570838 RPA1404 RPA1405     FALSE 0.472 -3.000 0.000 1.000 N NA
 570838 570839 RPA1405 RPA1406     TRUE 0.982 3.000 0.835 NA   NA
 570839 570840 RPA1406 RPA1407     TRUE 0.984 3.000 0.931 NA   NA
 570840 570841 RPA1407 RPA1408     TRUE 0.646 39.000 0.118 NA   NA
 570841 570842 RPA1408 RPA1409     TRUE 0.937 -3.000 0.220 1.000 N NA
 570842 570843 RPA1409 RPA1410     TRUE 0.985 35.000 0.719 0.061 Y NA
 570843 570844 RPA1410 RPA1411     FALSE 0.003 375.000 0.000 1.000 N NA
 570847 570848 RPA1414 RPA1415     FALSE 0.013 126.000 0.000 NA N NA
 570848 570849 RPA1415 RPA1416     TRUE 0.981 8.000 0.250 NA Y NA
 570849 570850 RPA1416 RPA1417     TRUE 0.985 -7.000 0.133 0.031 Y NA
 570850 570851 RPA1417 RPA1418     TRUE 0.964 14.000 0.133 1.000 Y NA
 570851 570852 RPA1418 RPA1419     TRUE 0.996 -3.000 0.750 0.061 Y NA
 570853 570854 RPA1420 RPA1421 ybdE   TRUE 0.972 -3.000 0.500 1.000 N NA
 570854 570855 RPA1421 RPA1422     TRUE 0.706 77.000 0.400 NA   NA
 570856 570857 RPA1423 RPA1424     TRUE 0.829 -13.000 0.088 NA   NA
 570857 570858 RPA1424 RPA1425   cysE1 TRUE 0.714 165.000 0.044 1.000 Y NA
 570858 570859 RPA1425 RPA1426 cysE1   FALSE 0.298 175.000 0.052 1.000 N NA
 570859 570860 RPA1426 RPA1427     TRUE 0.994 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 570860 570861 RPA1427 RPA1428     TRUE 0.909 29.000 0.073 NA Y NA
 570862 570863 RPA1429 RPA1430     TRUE 0.958 -3.000 0.385 NA N NA
 570865 570866 RPA1432 RPA1433     FALSE 0.363 58.000 0.038 NA   NA
 570866 570867 RPA1433 RPA1434     TRUE 0.900 -3.000 0.135 NA   NA
 570867 570868 RPA1434 RPA1435   anfK TRUE 0.702 80.000 0.412 NA   NA
 570868 570869 RPA1435 RPA1436 anfK anfG TRUE 0.987 13.000 0.941 0.006   NA
 570869 570870 RPA1436 RPA1437 anfG anfD TRUE 0.988 13.000 1.000 0.006   NA
 570870 570871 RPA1437 RPA1438 anfD anfH TRUE 0.868 50.000 0.267 0.006 N NA
 570871 570872 RPA1438 RPA1439 anfH anfA FALSE 0.001 524.000 0.000 1.000 N NA
 570872 570873 RPA1439 RPA1440 anfA   FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 570873 570874 RPA1440 RPA1441     FALSE 0.009 183.000 0.000 NA   NA
 570874 570875 RPA1441 RPA1442     TRUE 0.984 10.000 0.545 0.001   NA
 570875 570876 RPA1442 RPA1443     FALSE 0.006 293.000 0.000 1.000   NA
 570877 570878 RPA1444 RPA1445     TRUE 0.988 -3.000 0.080 0.002 Y NA
 570878 570879 RPA1445 RPA1446     TRUE 0.983 -9.000 0.300 1.000 Y NA
 570879 570880 RPA1446 RPA1447     TRUE 0.983 41.000 0.800 0.061 Y NA
 570880 570881 RPA1447 RPA1448     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.061 Y NA
 570881 570882 RPA1448 RPA1449     TRUE 0.765 27.000 0.118 1.000 N NA
 570882 570883 RPA1449 RPA1450     TRUE 0.938 64.000 0.316 0.089 Y NA
 570883 570884 RPA1450 RPA1451     TRUE 0.684 31.000 0.105 NA   NA
 570886 570887 RPA1453 RPA1454 norE   TRUE 0.882 5.000 0.107 NA   NA
 570887 570888 RPA1454 RPA1455   norC FALSE 0.206 112.000 0.032 NA   NA
 570888 570889 RPA1455 RPA1456 norC norB TRUE 0.967 35.000 0.794 0.001   NA
 570889 570890 RPA1456 RPA1457 norB norQ TRUE 0.925 55.000 0.529 0.001   NA
 570890 570891 RPA1457 RPA1458 norQ norD TRUE 0.860 126.000 0.590 0.001   NA
 570892 570893 RPA1460 RPA1461     FALSE 0.010 119.000 0.000 NA   NA
 570893 570894 RPA1461 RPA1462     FALSE 0.050 23.000 0.000 NA   NA
 570898 570899 RPA1466 RPA1467     TRUE 0.945 -3.000 0.250 1.000 N NA
 570899 570900 RPA1467 RPA1468     TRUE 0.636 78.000 0.300 NA   NA
 570900 570901 RPA1468 RPA1469   gatA1 TRUE 0.920 3.000 0.189 NA   NA
 570901 570902 RPA1469 RPA1470 gatA1   FALSE 0.016 232.000 0.000 1.000   NA
 570902 570903 RPA1470 RPA1471     TRUE 0.822 156.000 0.818 1.000   NA
 570903 570904 RPA1471 RPA1472     TRUE 0.997 5.000 0.818 0.061 Y NA
 570904 570905 RPA1472 RPA1473     TRUE 0.938 170.000 0.556 0.061 Y NA
 570905 570906 RPA1473 RPA1474     FALSE 0.001 328.000 0.000 NA   NA
 570906 570907 RPA1474 RPA1475     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 570908 570909 RPA1476 RPA1477     TRUE 0.946 48.000 0.870 0.061 N NA
 570909 570910 RPA1477 RPA1478     TRUE 0.986 5.000 0.660 0.061 N NA
 570910 570911 RPA1478 RPA1479     TRUE 0.996 -3.000 0.632 0.061 Y NA
 570911 570912 RPA1479 RPA1480   cpdA TRUE 0.912 -3.000 0.132 1.000   NA
 570912 570913 RPA1480 RPA1481 cpdA   TRUE 0.573 137.000 0.273 1.000   NA
 570913 570914 RPA1481 RPA1482     FALSE 0.361 131.000 0.080 1.000   NA
 570916 570917 RPA1484 RPA1485 pgm2 nnrU FALSE 0.139 103.000 0.007 NA   NA
 570917 570918 RPA1485 RPA1486 nnrU   FALSE 0.185 216.000 0.090 NA   NA
 570918 570919 RPA1486 RPA1487     TRUE 0.625 39.000 0.102 NA   NA
 570920 570921 RPA1488 RPA1489     FALSE 0.062 133.000 0.000 1.000 N NA
 570921 570922 RPA1489 RPA1490   phyB4 TRUE 0.990 20.000 0.600 0.025 Y NA
 570923 570924 RPA1491 RPA1492 pucBe pucAe TRUE 0.816 13.000 0.000 0.004   NA
 570924 570925 RPA1492 RPA1493 pucAe pucC TRUE 0.781 187.000 1.000 NA   NA
 570925 570926 RPA1493 RPA1494 pucC   TRUE 0.966 19.000 1.000 NA   NA
 570926 570927 RPA1494 RPA1495     FALSE 0.068 16.000 0.000 NA   NA
 570927 570928 RPA1495 RPA1496     FALSE 0.010 141.000 0.000 NA   NA
 570928 570929 RPA1496 RPA1497   mexC1 FALSE 0.003 355.000 0.000 1.000 N NA
 570929 570930 RPA1497 RPA1498 mexC1 mexD2 TRUE 0.968 11.000 0.600 1.000 N NA
 570930 570931 RPA1498 RPA1499 mexD2   FALSE 0.400 137.000 0.133 NA   NA
 570932 570933 RPA1500 RPA1501     TRUE 0.876 -37.000 0.133 1.000   NA
 570933 570934 RPA1501 RPA1502     TRUE 0.547 61.000 0.133 NA   NA
 570934 570935 RPA1502 RPA1503     FALSE 0.133 0.000 0.000 NA   NA
 570935 570936 RPA1503 RPA1504     FALSE 0.133 0.000 0.000 NA   NA
 570937 570938 RPA1505 RPA1506   bchI TRUE 0.956 6.000 0.005 1.000 Y NA
 570938 570939 RPA1506 RPA1507 bchI bchD TRUE 0.996 -3.000 0.465 0.001 Y NA
 570940 570941 RPA1508 RPA1509   hemE FALSE 0.000 382.000 0.000 NA   NA
 570942 570943 RPA1510 RPA1511     TRUE 0.923 11.000 0.286 NA   NA
 570943 570944 RPA1511 RPA1512   crtI FALSE 0.367 76.000 0.041 1.000 N NA
 570944 570945 RPA1512 RPA1513 crtI crtB TRUE 0.957 -3.000 0.332 1.000 N NA
 570945 570946 RPA1513 RPA1514 crtB hemF FALSE 0.020 302.000 0.004 1.000 N NA
 570949 570950 RPA1517 RPA1518 crtC crtD TRUE 0.979 5.000 0.434 0.050   NA
 570951 570952 RPA1519 RPA1520 crtE crtF TRUE 0.849 50.000 0.500 1.000   NA
 570952 570953 RPA1520 RPA1521 crtF bchC TRUE 0.787 89.000 0.627 1.000   NA
 570953 570954 RPA1521 RPA1522 bchC bchX TRUE 0.993 0.000 0.882 0.002 N NA
 570954 570955 RPA1522 RPA1523 bchX bchY TRUE 0.961 24.000 0.491 0.002   NA
 570955 570956 RPA1523 RPA1524 bchY bchZ TRUE 0.990 0.000 0.632 0.002   NA
 570956 570957 RPA1524 RPA1525 bchZ pufB FALSE 0.010 456.000 0.038 1.000   NA
 570957 570958 RPA1525 RPA1526 pufB pufA TRUE 0.985 16.000 0.946 0.004   NA
 570958 570959 RPA1526 RPA1527 pufA pufL TRUE 0.893 132.000 0.829 0.004   NA
 570959 570960 RPA1527 RPA1528 pufL pufM TRUE 0.975 28.000 0.895 0.004   NA
 570960 570961 RPA1528 RPA1529 pufM ppsR1 FALSE 0.069 263.000 0.053 1.000   NA
 570961 570962 RPA1529 RPA1530 ppsR1 bchG TRUE 0.912 -7.000 0.200 1.000   NA
 570962 570963 RPA1530 RPA1531 bchG   TRUE 0.987 3.000 0.640 0.059 N NA
 570963 570964 RPA1531 RPA1532   bchP TRUE 0.958 2.000 0.314 1.000 N NA
 570964 570965 RPA1532 RPA1533 bchP tspO TRUE 0.768 20.000 0.078 1.000 N NA
 570965 570966 RPA1533 RPA1534 tspO   TRUE 0.856 37.000 0.429 NA   NA
 570968 570969 RPA1536 RPA1537 ppsR2   FALSE 0.131 1.000 0.000 NA   NA
 570970 570971 RPA1539 RPA1540     FALSE 0.529 61.000 0.089 1.000   NA
 570972 570973 RPA1541 RPA1542 bchF bchN TRUE 0.980 -3.000 0.311 0.001   NA
 570973 570974 RPA1542 RPA1543 bchN bchB TRUE 0.997 3.000 0.591 0.001 Y NA
 570974 570975 RPA1543 RPA1544 bchB bchH TRUE 0.966 -25.000 0.278 0.003 N NA
 570975 570976 RPA1544 RPA1545 bchH bchL TRUE 0.981 -3.000 0.344 0.003 N NA
 570976 570977 RPA1545 RPA1546 bchL bchM TRUE 0.978 0.000 0.274 0.003   NA
 570977 570978 RPA1546 RPA1547 bchM lhaA TRUE 0.860 -3.000 0.077 NA   NA
 570978 570979 RPA1547 RPA1548 lhaA puhA TRUE 0.851 23.000 0.265 NA   NA
 570979 570980 RPA1548 RPA1549 puhA   TRUE 0.983 -3.000 0.912 NA   NA
 570980 570981 RPA1549 RPA1550     TRUE 0.932 16.000 0.455 NA   NA
 570981 570982 RPA1550 RPA1551     TRUE 0.970 3.000 0.519 NA   NA
 570982 570983 RPA1551 RPA1552     TRUE 0.954 -3.000 0.361 NA   NA
 570983 570984 RPA1552 RPA1553     TRUE 0.924 14.000 0.375 NA   NA
 570984 570985 RPA1553 RPA1554   hemA TRUE 0.916 -3.000 0.184 NA   NA
 570987 570988 RPA1556 RPA1557     TRUE 0.928 22.000 0.000 0.021 Y NA
 570988 570989 RPA1557 RPA1558     TRUE 0.984 16.000 0.250 0.021 Y NA
 570989 570990 RPA1558 RPA1559   cbbL FALSE 0.038 200.000 0.000 1.000 N NA
 570990 570991 RPA1559 RPA1560 cbbL cbbS TRUE 0.989 14.000 1.000 0.001 N NA
 570991 570992 RPA1560 RPA1561 cbbS cbbX TRUE 0.922 3.000 0.149 1.000   NA
 570994 570995 RPA1563 RPA1564     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 570995 570996 RPA1564 RPA1565     TRUE 0.964 9.000 0.066 NA Y NA
 570996 570997 RPA1565 RPA1566     TRUE 0.980 -3.000 0.033 0.060 Y NA
 570997 570998 RPA1566 RPA1567     TRUE 0.978 -13.000 0.065 0.031 Y NA
 570999 571000 RPA1568 RPA1569     TRUE 0.974 4.000 0.556 1.000   NA
 571000 571001 RPA1569 RPA1570     TRUE 0.730 157.000 0.051 1.000 Y NA
 571002 571003 RPA1571 RPA1572 dapA1   FALSE 0.206 225.000 0.111 1.000 N NA
 571003 571004 RPA1572 RPA1573     FALSE 0.186 78.000 0.010 NA   NA
 571004 571005 RPA1573 RPA1574     TRUE 0.872 5.000 0.091 NA   NA
 571005 571006 RPA1574 RPA1575     TRUE 0.830 14.000 0.127 NA   NA
 571009 571010 RPA1578 RPA1579 fpr   FALSE 0.091 317.000 0.000 1.000 Y NA
 571010 571011 RPA1579 RPA1580   putA TRUE 0.695 165.000 0.030 1.000 Y NA
 571013 571014 RPA1582 RPA1583 cyaA   FALSE 0.007 193.000 0.000 NA   NA
 571014 571015 RPA1583 RPA1584     TRUE 0.980 -3.000 0.791 NA   NA
 571016 571017 RPA1585 RPA1586     TRUE 0.711 60.000 0.267 1.000   NA
 571017 571018 RPA1586 RPA1587     FALSE 0.006 198.000 0.000 NA   NA
 571019 571020 RPA1588 RPA1589   rpsD FALSE 0.005 313.000 0.000 1.000 N NA
 571020 571021 RPA1589 RPA1590 rpsD   FALSE 0.007 190.000 0.000 NA   NA
 571021 571022 RPA1590 RPA1591     TRUE 0.957 0.000 0.350 NA   NA
 571022 571023 RPA1591 RPA1592   murI FALSE 0.241 54.000 0.006 NA   NA
 571023 571024 RPA1592 RPA1593 murI   FALSE 0.017 83.000 0.000 NA N NA
 571025 571026 RPA1594 RPA1595 trpB-1   FALSE 0.003 338.000 0.000 1.000   NA
 571026 571027 RPA1595 RPA1596     FALSE 0.002 392.000 0.000 1.000   NA
 571027 571028 RPA1596 RPA1597   purQ FALSE 0.002 396.000 0.000 1.000   NA
 571029 571030 RPA1598 RPA1599     FALSE 0.418 75.000 0.085 NA   NA
 571034 571035 RPA1603 RPA1604     FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 571035 571036 RPA1604 RPA1605     TRUE 0.788 46.000 0.354 NA   NA
 571037 571038 RPA1606 RPA1607     TRUE 0.843 -3.000 0.064 NA   NA
 571038 571039 RPA1607 RPA1608     FALSE 0.413 60.000 0.059 NA   NA
 571040 571041 RPA1609 RPA1610 mdlC   FALSE 0.080 270.000 0.100 NA   NA
 571041 571042 RPA1610 RPA1611     TRUE 0.939 13.000 0.433 NA   NA
 571042 571043 RPA1611 RPA1612     FALSE 0.375 201.000 0.200 1.000 N NA
 571043 571044 RPA1612 RPA1613     TRUE 0.862 34.000 0.200 0.074 N NA
 571045 571046 RPA1614 RPA1615 ivd2   FALSE 0.069 96.000 0.000 1.000 N NA
 571047 571048 RPA1616 RPA1617     TRUE 0.569 87.000 0.250 NA   NA
 571049 571050 RPA1618 RPA1619 ilvX   TRUE 0.588 56.000 0.143 NA   NA
 5451021 571054 RPA_RNA36 RPA1622 tRNA-Val3   FALSE 0.010 143.000 0.000 NA   NA
 571054 571055 RPA1622 RPA1623     FALSE 0.003 240.000 0.000 NA   NA
 571058 571059 RPA1626 RPA1627   cheA2 FALSE 0.257 191.000 0.085 NA   NA
 571059 571060 RPA1627 RPA1628 cheA2 cheW2 TRUE 0.983 -3.000 0.043 0.012 Y NA
 571060 571061 RPA1628 RPA1629 cheW2 cheY2 TRUE 0.910 68.000 0.333 1.000 Y NA
 571061 571062 RPA1629 RPA1630 cheY2 cheB2 TRUE 0.851 79.000 0.042 0.021 Y NA
 571062 571063 RPA1630 RPA1631 cheB2 cheR2 TRUE 0.981 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 571065 571066 RPA1633 RPA1634 fliI   FALSE 0.333 110.000 0.067 1.000   NA
 571066 571067 RPA1634 RPA1635     FALSE 0.221 177.000 0.025 1.000   NA
 571067 571068 RPA1635 RPA1636     TRUE 0.942 0.000 0.254 NA   NA
 571069 571070 RPA1637 RPA1638   flhA FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 5451022 571074 RPA_RNA13 RPA1641 tRNA-Met2   FALSE 0.009 181.000 0.000 NA   NA
 571074 571075 RPA1641 RPA1642     FALSE 0.003 381.000 0.000 1.000 N NA
 571075 571076 RPA1642 RPA1643     FALSE 0.009 197.000 0.000 NA N NA
 571077 571078 RPA1644 RPA1645     TRUE 0.808 -10.000 0.070 NA   NA
 571078 571079 RPA1645 RPA1646     FALSE 0.506 99.000 0.222 NA   NA
 571079 571080 RPA1646 RPA1647     FALSE 0.545 77.000 0.200 NA   NA
 571081 571082 RPA1648 RPA1649     TRUE 0.990 -3.000 0.484 NA Y NA
 571082 571083 RPA1649 RPA1650     TRUE 0.969 -7.000 0.647 NA N NA
 571086 571087 RPA1653 RPA1654     FALSE 0.010 135.000 0.000 NA   NA
 571087 571088 RPA1654 RPA1655     FALSE 0.015 161.000 0.000 NA N NA
 571092 571093 RPA1659 RPA1660     TRUE 0.661 142.000 0.455 NA   NA
 571095 571096 RPA1662 RPA1663   hpaD FALSE 0.231 108.000 0.040 NA   NA
 571096 571097 RPA1663 RPA1664 hpaD   TRUE 0.828 28.000 0.032 0.002   NA
 571097 571098 RPA1664 RPA1665     FALSE 0.268 156.000 0.048 NA   NA
 571098 571099 RPA1665 RPA1666   hemN1 FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 571099 571100 RPA1666 RPA1667 hemN1 bchJ TRUE 0.747 29.000 0.119 1.000   NA
 571100 571101 RPA1667 RPA1668 bchJ bchE TRUE 0.910 20.000 0.368 1.000   NA
 571101 571102 RPA1668 RPA1669 bchE   FALSE 0.322 158.000 0.070 NA   NA
 571103 571104 RPA1670 RPA1671     TRUE 0.977 4.000 0.633 1.000   NA
 571106 571107 RPA1673 RPA1674   cheY3 TRUE 0.654 178.000 0.429 1.000 N NA
 571107 571108 RPA1674 RPA1675 cheY3   FALSE 0.030 647.000 0.000 0.088 Y NA
 571108 571109 RPA1675 RPA1676   cheA3 TRUE 0.690 179.000 0.000 0.012 Y NA
 571109 571110 RPA1676 RPA1677 cheA3 cheW3 TRUE 0.983 -3.000 0.043 0.012 Y NA
 571110 571111 RPA1677 RPA1678 cheW3 cheR3 TRUE 0.931 54.000 0.333 1.000 Y NA
 571111 571112 RPA1678 RPA1679 cheR3   TRUE 0.961 12.000 0.625 NA   NA
 571112 571113 RPA1679 RPA1680     FALSE 0.260 229.000 0.250 NA   NA
 571117 571118 RPA1684 RPA1685     FALSE 0.001 484.000 0.000 1.000   NA
 571119 571120 RPA1686 RPA1687     TRUE 0.746 71.000 0.381 1.000 N NA
 5451023 571122 RPA_RNA14 RPA1688 tRNA-Met3   FALSE 0.004 219.000 0.000 NA   NA
 571122 571123 RPA1688 RPA1689     FALSE 0.001 327.000 0.000 NA   NA
 571124 571125 RPA1690 RPA1691   matE3 TRUE 0.784 132.000 0.800 NA   NA
 571126 571127 RPA1692 RPA1693   sodB FALSE 0.124 202.000 0.009 1.000 N NA
 571127 571128 RPA1693 RPA1694 sodB crcB FALSE 0.208 78.000 0.011 NA N NA
 571131 571132 RPA1697 RPA1698     FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 571134 571135 RPA1700 RPA1701     FALSE 0.000 382.000 0.000 NA   NA
 571135 571136 RPA1701 RPA1702     FALSE 0.412 195.000 0.250 NA   NA
 571136 571137 RPA1702 RPA1703     FALSE 0.436 279.000 0.300 1.000 Y NA
 571138 571139 RPA1704 RPA1705     FALSE 0.493 139.000 0.182 1.000 N NA
 571139 571140 RPA1705 RPA1706     TRUE 0.705 224.000 0.211 0.087 Y NA
 571140 571141 RPA1706 RPA1707   fcs1 TRUE 0.952 51.000 0.316 0.087 Y NA
 571141 571142 RPA1707 RPA1708 fcs1   TRUE 0.871 167.000 0.357 1.000 Y NA
 571142 571143 RPA1708 RPA1709     TRUE 0.953 137.000 0.636 0.008 Y NA
 571143 571144 RPA1709 RPA1710     TRUE 0.954 151.000 0.625 0.008 Y NA
 571144 571145 RPA1710 RPA1711   pnbA TRUE 0.643 163.000 0.175 0.074 N NA
 571147 571148 RPA1713 RPA1714     TRUE 0.808 54.000 0.455 NA   NA
 571148 571149 RPA1714 RPA1715     FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 571149 571150 RPA1715 RPA1716     FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 571153 571154 RPA1719 RPA1720     FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 571155 571156 RPA1721 RPA1722   alkB TRUE 0.739 -3.000 0.015 NA N NA
 571157 571158 RPA1723 RPA1724 paaK paaI TRUE 0.827 15.000 0.124 NA N NA
 571159 571160 RPA1725 RPA1726     TRUE 0.822 57.000 0.000 0.049 Y NA
 571160 571161 RPA1726 RPA1727     FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   NA
 571162 571163 RPA1728 RPA1729     FALSE 0.000 742.000 0.000 NA   NA
 571163 571164 RPA1729 RPA1730     FALSE 0.356 53.000 0.012 1.000   NA
 571164 571165 RPA1730 RPA1731     FALSE 0.226 179.000 0.031 1.000   NA
 571165 571166 RPA1731 RPA1732     TRUE 0.801 23.000 0.038 0.074   NA
 571166 571167 RPA1732 RPA1733   fdxA TRUE 0.853 69.000 0.778 NA N NA
 571167 571168 RPA1733 RPA1734 fdxA   FALSE 0.543 100.000 0.250 NA N NA
 571170 571171 RPA1736 RPA1737 bglA   FALSE 0.049 186.000 0.000 1.000 N NA
 571171 571172 RPA1737 RPA1738     FALSE 0.121 43.000 0.000 1.000   NA
 571172 571173 RPA1738 RPA1739     TRUE 0.977 0.000 0.600 1.000   NA
 571173 571174 RPA1739 RPA1740     TRUE 0.996 2.000 0.650 0.059 Y NA
 571174 571175 RPA1740 RPA1741     FALSE 0.411 197.000 0.000 NA Y NA
 571177 571178 RPA1743 RPA1744   serA FALSE 0.420 141.000 0.150 NA   NA
 571178 571179 RPA1744 RPA1745 serA   TRUE 0.905 35.000 0.074 1.000 Y NA
 571179 571180 RPA1745 RPA1746     FALSE 0.525 70.000 0.103 1.000 N NA
 571181 571182 RPA1747 RPA1748     FALSE 0.483 58.000 0.082 NA   NA
 571182 571183 RPA1748 RPA1749     TRUE 0.912 173.000 0.679 NA Y NA
 571183 571184 RPA1749 RPA1750     TRUE 0.997 0.000 0.957 0.059 Y NA
 571184 571185 RPA1750 RPA1751     TRUE 0.995 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 571185 571186 RPA1751 RPA1752     TRUE 0.994 -16.000 0.636 0.030 Y NA
 571186 571187 RPA1752 RPA1753     FALSE 0.042 194.000 0.000 1.000 N NA
 571187 571188 RPA1753 RPA1754   ragC FALSE 0.007 213.000 0.000 NA N NA
 571188 571189 RPA1754 RPA1755 ragC ragD TRUE 0.968 -10.000 0.667 NA N NA
 571190 571191 RPA1756 RPA1757     TRUE 0.645 40.000 0.094 1.000   NA
 571192 571193 RPA1758 RPA1759     TRUE 0.905 8.000 0.143 1.000   NA
 571193 571194 RPA1759 RPA1760     TRUE 0.904 19.000 0.367 NA   NA
 571197 571198 RPA1763 RPA1764     FALSE 0.167 337.000 0.021 0.087 Y NA
 571199 571200 RPA1765 RPA1766     TRUE 0.797 149.000 0.050 0.087 Y NA
 571201 571202 RPA1767 RPA1768     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 571202 571203 RPA1768 RPA1769     FALSE 0.006 206.000 0.000 NA   NA
 571203 571204 RPA1769 RPA1770     TRUE 0.877 -3.000 0.092 NA   NA
 571205 571206 RPA1771 RPA1772   ppc FALSE 0.145 101.000 0.008 NA   NA
 571206 571207 RPA1772 RPA1773 ppc   FALSE 0.063 138.000 0.000 1.000 N NA
 571207 571208 RPA1773 RPA1774     FALSE 0.013 409.000 0.000 0.058 N NA
 571209 571210 RPA1775 RPA1776     FALSE 0.396 285.000 0.308 NA Y NA
 571210 571211 RPA1776 RPA1777     TRUE 0.977 6.000 0.750 NA   NA
 571212 571213 RPA1778 RPA1779     TRUE 0.943 -7.000 0.326 1.000   NA
 571214 571215 RPA1780 RPA1781   phbH FALSE 0.125 198.000 0.020 NA N NA
 571216 571217 RPA1782 RPA1783     TRUE 0.932 86.000 0.700 NA Y NA
 571217 571218 RPA1783 RPA1784     TRUE 0.993 7.000 0.750 NA Y NA
 571218 571219 RPA1784 RPA1785     TRUE 0.663 168.000 0.217 0.057   NA
 571219 571220 RPA1785 RPA1786     FALSE 0.005 298.000 0.000 1.000   NA
 571220 571221 RPA1786 RPA1787   fcs2 TRUE 0.996 9.000 0.778 0.045 Y NA
 571221 571222 RPA1787 RPA1788 fcs2   FALSE 0.186 239.000 0.200 NA   NA
 571222 571223 RPA1788 RPA1789     TRUE 0.704 80.000 0.417 NA   NA
 571223 571224 RPA1789 RPA1790     FALSE 0.001 315.000 0.000 NA N NA
 571225 571226 RPA1791 RPA1792     TRUE 0.983 -3.000 0.050 0.030 Y NA
 571226 571227 RPA1792 RPA1793     TRUE 0.983 6.000 0.075 0.059 Y NA
 571231 571232 RPA1797 RPA1798     FALSE 0.446 199.000 0.300 NA N NA
 571232 571233 RPA1798 RPA1799   ung FALSE 0.003 243.000 0.000 NA N NA
 571233 571234 RPA1799 RPA1800 ung   TRUE 0.804 97.000 0.748 1.000   NA
 571235 571236 RPA1801 RPA1802     TRUE 0.835 53.000 0.514 NA   NA
 571236 571237 RPA1802 RPA1803   dnaE2 TRUE 0.880 154.000 0.366 1.000 Y NA
 571239 571240 RPA1805 RPA1806     FALSE 0.113 47.000 0.000 1.000   NA
 571240 571241 RPA1806 RPA1807     FALSE 0.021 220.000 0.000 1.000   NA
 571241 571242 RPA1807 RPA1808   czcA1 TRUE 0.737 157.000 0.500 1.000 N NA
 571242 571243 RPA1808 RPA1809 czcA1   FALSE 0.237 200.000 0.091 NA   NA
 571244 571245 RPA1810 RPA1811     FALSE 0.442 175.000 0.143 1.000 N NA
 571245 571246 RPA1811 RPA1812     TRUE 0.784 84.000 0.643 NA   NA
 571247 571248 RPA1813 RPA1814     TRUE 0.980 -3.000 0.812 NA   NA
 571248 571249 RPA1814 RPA1815     FALSE 0.454 81.000 0.125 NA   NA
 571249 571250 RPA1815 RPA1816     TRUE 0.725 61.000 0.333 NA   NA
 571251 571252 RPA1817 RPA1818     TRUE 0.728 38.000 0.200 NA   NA
 571253 571254 RPA1819 RPA1820     TRUE 0.980 -3.000 0.786 NA   NA
 571254 571255 RPA1820 RPA1821     FALSE 0.000 487.000 0.000 NA   NA
 571255 571256 RPA1821 RPA1822     FALSE 0.000 439.000 0.000 NA   NA
 571256 571257 RPA1822 RPA1823     FALSE 0.002 482.000 0.000 1.000 N NA
 571257 571258 RPA1823 RPA1824     FALSE 0.012 96.000 0.000 NA   NA
 571259 571260 RPA1825 RPA1826     FALSE 0.010 133.000 0.000 NA   NA
 571260 571261 RPA1826 RPA1827     FALSE 0.301 106.000 0.069 NA   NA
 571261 571262 RPA1827 RPA1828     FALSE 0.534 67.000 0.143 NA   NA
 571262 571263 RPA1828 RPA1829   argK TRUE 0.861 -3.000 0.054 1.000 N NA
 571263 571264 RPA1829 RPA1830 argK   FALSE 0.061 87.000 0.000 1.000   NA
 571264 571265 RPA1830 RPA1831     TRUE 0.866 -9.000 0.000 0.001   NA
 571265 571266 RPA1831 RPA1832     FALSE 0.006 199.000 0.000 NA   NA
 571266 571267 RPA1832 RPA1833     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 571267 571268 RPA1833 RPA1834     FALSE 0.115 6.000 0.000 NA   NA
 571268 571269 RPA1834 RPA1835   mutB FALSE 0.023 64.000 0.000 NA N NA
 571269 571270 RPA1835 RPA1836 mutB   TRUE 0.552 63.000 0.028 0.086   NA
 571270 571271 RPA1836 RPA1837     TRUE 0.945 -3.000 0.117 0.086   NA
 571271 571272 RPA1837 RPA1838   folK FALSE 0.226 158.000 0.012 1.000 N NA
 571272 571273 RPA1838 RPA1839 folK folB TRUE 0.970 2.000 0.037 1.000 Y NA
 571273 571274 RPA1839 RPA1840 folB folP TRUE 0.991 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 571274 571275 RPA1840 RPA1841 folP   FALSE 0.478 66.000 0.077 1.000   NA
 571275 571276 RPA1841 RPA1842     TRUE 0.789 18.000 0.111 NA   NA
 571277 571278 RPA1843 RPA1844     FALSE 0.108 209.000 0.025 NA   NA
 571278 571279 RPA1844 RPA1845     FALSE 0.004 335.000 0.000 1.000 N NA
 571279 571280 RPA1845 RPA1846     FALSE 0.454 114.000 0.200 NA   NA
 571280 571281 RPA1846 RPA1847     TRUE 0.945 -3.000 0.300 NA   NA
 571281 571282 RPA1847 RPA1848     TRUE 0.830 62.000 0.625 NA   NA
 571282 571283 RPA1848 RPA1849     TRUE 0.979 -3.000 0.750 NA   NA
 571284 571285 RPA1850 RPA1851     FALSE 0.002 456.000 0.000 1.000 N NA
 571288 571289 RPA1854 RPA1855     FALSE 0.010 122.000 0.000 NA   NA
 571290 571291 RPA1856 RPA1857     FALSE 0.288 116.000 0.069 NA   NA
 571292 571293 RPA1858 RPA1859     TRUE 0.945 -7.000 0.333 1.000   NA
 571293 571294 RPA1859 RPA1860     FALSE 0.340 153.000 0.082 NA   NA
 571295 571296 RPA1861 RPA1862     FALSE 0.398 152.000 0.118 NA   NA
 571296 571297 RPA1862 RPA1863     TRUE 0.679 80.000 0.375 NA   NA
 571299 571300 RPA1865 RPA1866     TRUE 0.984 -3.000 0.941 NA   NA
 571300 571301 RPA1866 RPA1867     TRUE 0.865 44.000 0.582 NA   NA
 571302 571303 RPA1868 RPA1869     FALSE 0.022 55.000 0.000 NA   NA
 571305 571306 RPA1871 RPA1872   thcC TRUE 0.970 10.000 0.385 0.073 N NA
 571306 571307 RPA1872 RPA1873 thcC   TRUE 0.708 76.000 0.385 NA N NA
 571308 571309 RPA1874 RPA1875     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571309 571310 RPA1875 RPA1876     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571312 571313 RPA1878 RPA1879     FALSE 0.060 116.000 0.000 1.000 N NA
 571314 571315 RPA1880 RPA1881     FALSE 0.319 124.000 0.083 NA   NA
 571315 571316 RPA1881 RPA1882     TRUE 0.575 85.000 0.250 NA   NA
 571316 571317 RPA1882 RPA1883     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 571317 571318 RPA1883 RPA1884     FALSE 0.000 594.000 0.000 NA   NA
 571318 571319 RPA1884 RPA1885     FALSE 0.010 140.000 0.000 NA   NA
 571319 571320 RPA1885 RPA1886     TRUE 0.644 26.000 0.066 NA   NA
 571320 571321 RPA1886 RPA1887     FALSE 0.001 305.000 0.000 NA   NA
 571321 571322 RPA1887 RPA1888     TRUE 0.591 172.000 0.345 NA   NA
 571322 571323 RPA1888 RPA1889     FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 571325 571326 RPA1891 RPA1892     TRUE 0.868 77.000 1.000 NA   NA
 571326 571327 RPA1892 RPA1893     TRUE 0.652 98.000 0.400 NA   NA
 571328 571329 RPA1894 RPA1895     FALSE 0.013 82.000 0.000 NA   NA
 571330 571331 RPA1896 RPA1897 GTA GTA TRUE 0.877 -3.000 0.093 NA   NA
 571331 571332 RPA1897 RPA1898 GTA GTA TRUE 0.754 -3.000 0.023 NA   NA
 571332 571333 RPA1898 RPA1899 GTA GTA TRUE 0.683 13.000 0.031 NA   NA
 571333 1759862 RPA1899 RPA1900 GTA GTA TRUE 0.964 10.000 0.577 NA   NA
 1759862 571336 RPA1900 RPA1902 GTA GTA FALSE 0.189 200.000 0.062 NA   NA
 571336 571337 RPA1902 RPA1903 GTA GTA TRUE 0.772 162.000 0.678 NA   NA
 571337 571338 RPA1903 RPA1904 GTA   FALSE 0.010 113.000 0.000 NA   NA
 571338 571339 RPA1904 RPA1905   GTA FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 571339 571340 RPA1905 RPA1906 GTA GTA TRUE 0.862 40.000 0.500 NA   NA
 571340 571341 RPA1906 RPA1907 GTA   FALSE 0.017 65.000 0.000 NA   NA
 571343 571344 RPA1909 RPA1910     TRUE 0.956 2.000 0.353 NA   NA
 571344 571345 RPA1910 RPA1911     FALSE 0.044 26.000 0.000 NA   NA
 571345 571346 RPA1911 RPA1912     FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 571346 571347 RPA1912 RPA1913     TRUE 0.846 10.000 0.091 NA   NA
 571347 571348 RPA1913 RPA1914     FALSE 0.541 124.000 0.286 NA   NA
 571348 571349 RPA1914 RPA1915   feuP FALSE 0.000 687.000 0.000 NA   NA
 571349 571350 RPA1915 RPA1916 feuP feuQ TRUE 0.989 16.000 0.713 1.000 Y NA
 571350 571351 RPA1916 RPA1917 feuQ lipA1 FALSE 0.328 97.000 0.069 NA N NA
 571351 571352 RPA1917 RPA1918 lipA1   FALSE 0.010 169.000 0.000 NA   NA
 571352 571353 RPA1918 RPA1919   cycH FALSE 0.467 163.000 0.184 NA   NA
 571353 571354 RPA1919 RPA1920 cycH cycJ TRUE 0.753 114.000 0.096 1.000 Y NA
 571354 571355 RPA1920 RPA1921 cycJ cycK TRUE 0.990 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 571355 571356 RPA1921 RPA1922 cycK cycL TRUE 0.993 2.000 0.644 NA Y NA
 571357 571358 RPA1923 RPA1924 aimE   FALSE 0.010 120.000 0.000 NA   NA
 571358 571359 RPA1924 RPA1925     FALSE 0.003 243.000 0.000 NA   NA
 571361 571362 RPA1927 RPA1928     TRUE 0.980 -42.000 0.556 0.005   NA
 571363 571364 RPA1929 RPA1930     FALSE 0.020 233.000 0.000 1.000 N NA
 571364 571365 RPA1930 RPA1931     FALSE 0.479 223.000 0.000 0.024 Y NA
 571365 571366 RPA1931 RPA1932     TRUE 0.547 213.000 0.000 0.016 Y NA
 571366 571367 RPA1932 RPA1933   glnE TRUE 0.975 -3.000 0.081 1.000 Y NA
 571368 571369 RPA1934 RPA1935     FALSE 0.011 101.000 0.000 NA   NA
 571370 571371 RPA1936 RPA1937     FALSE 0.003 356.000 0.000 1.000   NA
 571372 571373 RPA1938 RPA1939     FALSE 0.242 186.000 0.043 1.000 N NA
 571373 571374 RPA1939 RPA1940     FALSE 0.454 131.000 0.140 1.000 N NA
 571374 571375 RPA1940 RPA1941     TRUE 0.665 43.000 0.130 1.000   NA
 571375 571376 RPA1941 RPA1942     FALSE 0.014 238.000 0.000 1.000   NA
 571376 571377 RPA1942 RPA1943   panE FALSE 0.350 156.000 0.059 1.000 N NA
 571377 571378 RPA1943 RPA1944 panE oxlT FALSE 0.073 89.000 0.000 1.000 N NA
 571378 571379 RPA1944 RPA1945 oxlT   FALSE 0.060 121.000 0.000 1.000 N NA
 571379 571380 RPA1945 RPA1946     TRUE 0.559 69.000 0.129 1.000 N NA
 571381 571382 RPA1947 RPA1948 pqqB pqqC TRUE 0.992 -3.000 0.825 0.001   NA
 571382 571383 RPA1948 RPA1949 pqqC pqqD TRUE 0.983 5.000 0.404 0.001   NA
 571383 571384 RPA1949 RPA1950 pqqD pqqE TRUE 0.916 42.000 0.361 0.001   NA
 571385 571386 RPA1951 RPA1952     TRUE 0.875 -3.000 0.091 NA   NA
 571386 571387 RPA1952 RPA1953     FALSE 0.133 0.000 0.000 NA   NA
 571389 571390 RPA1955 RPA1956     FALSE 0.055 98.000 0.000 1.000   NA
 571390 571391 RPA1956 RPA1957     FALSE 0.010 127.000 0.000 NA   NA
 571391 571392 RPA1957 RPA1958     FALSE 0.013 112.000 0.000 NA N NA
 571393 571394 RPA1959 RPA1960     TRUE 0.997 -3.000 0.826 0.011 Y NA
 571394 571395 RPA1960 RPA1961     TRUE 0.979 -3.000 0.739 NA N NA
 571395 571396 RPA1961 RPA1962     TRUE 0.912 2.000 0.150 NA   NA
 571396 571397 RPA1962 RPA1963     TRUE 0.914 29.000 0.600 NA   NA
 571397 571398 RPA1963 RPA1964     TRUE 0.909 59.000 1.000 1.000   NA
 571399 571400 RPA1965 RPA1966     FALSE 0.011 267.000 0.000 1.000 N NA
 571401 571402 RPA1967 RPA1968     TRUE 0.986 0.000 1.000 NA N NA
 571402 571403 RPA1968 RPA1969   yjbN FALSE 0.013 111.000 0.000 NA N NA
 571404 571405 RPA1970 RPA1971     TRUE 0.867 23.000 0.305 NA   NA
 571405 571406 RPA1971 RPA1972     TRUE 0.856 -3.000 0.074 NA   NA
 571406 571407 RPA1972 RPA1973     FALSE 0.285 166.000 0.037 1.000 N NA
 571408 571409 RPA1974 RPA1975     FALSE 0.145 251.000 0.138 1.000 N NA
 571410 571411 RPA1976 RPA1977     TRUE 0.863 38.000 0.465 NA   NA
 571411 571412 RPA1977 RPA1978   moaA FALSE 0.255 174.000 0.051 NA N NA
 571412 571413 RPA1978 RPA1979 moaA   TRUE 0.608 107.000 0.312 1.000   NA
 571413 571414 RPA1979 RPA1980   cbbZ FALSE 0.437 164.000 0.116 1.000   NA
 571415 571416 RPA1981 RPA1982 cbbI   TRUE 0.844 -3.000 0.065 NA   NA
 571416 571417 RPA1982 RPA1983   gor TRUE 0.844 18.000 0.200 NA   NA
 571417 571418 RPA1983 RPA1984 gor aroG2 FALSE 0.299 189.000 0.079 1.000 N NA
 571418 571419 RPA1984 RPA1985 aroG2   FALSE 0.345 131.000 0.067 1.000 N NA
 571419 571420 RPA1985 RPA1986   nadE TRUE 0.548 44.000 0.057 1.000 N NA
 571421 571422 RPA1987 RPA1988     FALSE 0.004 226.000 0.000 NA   NA
 571423 571424 RPA1989 RPA1990     FALSE 0.011 167.000 0.000 NA   NA
 571424 571425 RPA1990 RPA1991     FALSE 0.111 12.000 0.000 NA N NA
 571426 571427 RPA1992 RPA1993     TRUE 0.966 -3.000 0.487 NA   NA
 571429 571430 RPA1995 RPA1996     FALSE 0.008 186.000 0.000 NA   NA
 571431 571432 RPA1997 RPA1998 cysS   FALSE 0.003 530.000 0.004 NA   NA
 571432 571433 RPA1998 RPA1999     TRUE 0.831 -3.000 0.057 NA   NA
 571433 571434 RPA1999 RPA2000   leuA TRUE 0.849 -3.000 0.048 1.000   NA
 571434 571435 RPA2000 RPA2001 leuA   FALSE 0.543 194.000 0.006 1.000 Y NA
 571435 571436 RPA2001 RPA2002     TRUE 0.925 12.000 0.267 1.000 N NA
 571437 571438 RPA2003 RPA2004     FALSE 0.158 183.000 0.024 NA   NA
 571439 571440 RPA2005 RPA2006   psd TRUE 0.570 49.000 0.075 1.000 N NA
 571440 571441 RPA2006 RPA2007 psd pssA TRUE 0.970 30.000 0.466 1.000 Y NA
 571441 571442 RPA2007 RPA2008 pssA   FALSE 0.161 136.000 0.011 NA N NA
 571442 571443 RPA2008 RPA2009     FALSE 0.004 232.000 0.000 NA N NA
 571443 571444 RPA2009 RPA2010   motB1 TRUE 0.891 31.000 0.030 1.000 Y NA
 571444 571445 RPA2010 RPA2011 motB1   FALSE 0.065 150.000 0.000 1.000 N NA
 571445 571446 RPA2011 RPA2012     FALSE 0.531 210.000 0.056 NA Y NA
 571446 571447 RPA2012 RPA2013     TRUE 0.671 23.000 0.061 NA N NA
 571447 571448 RPA2013 RPA2014     TRUE 0.968 8.000 0.061 1.000 Y NA
 571448 571449 RPA2014 RPA2015     FALSE 0.049 113.000 0.000 1.000   NA
 571450 571451 RPA2016 RPA2017     FALSE 0.008 287.000 0.000 1.000 N NA
 571451 571452 RPA2017 RPA2018     TRUE 0.948 0.000 0.248 1.000 N NA
 571452 571453 RPA2018 RPA2019     TRUE 0.713 97.000 0.453 1.000 N NA
 571453 571454 RPA2019 RPA2020     TRUE 0.996 11.000 0.784 0.014 Y NA
 571454 571455 RPA2020 RPA2021     TRUE 0.988 -7.000 0.490 NA Y NA
 571455 571456 RPA2021 RPA2022     TRUE 0.966 26.000 0.394 NA Y NA
 571456 571457 RPA2022 RPA2023     FALSE 0.011 167.000 0.000 NA   NA
 571464 571465 RPA2030 RPA2031 miaA ilvI FALSE 0.018 366.000 0.038 1.000 N NA
 571465 571466 RPA2031 RPA2032 ilvI ilvH TRUE 0.780 216.000 0.146 0.001 Y NA
 571468 571469 RPA2034 RPA2035   ilvC FALSE 0.078 195.000 0.003 NA   NA
 571469 571470 RPA2035 RPA2036 ilvC   FALSE 0.008 290.000 0.000 1.000 N NA
 571470 571471 RPA2036 RPA2037     FALSE 0.393 99.000 0.105 NA N NA
 571471 571472 RPA2037 RPA2038     FALSE 0.241 127.000 0.045 NA   NA
 571473 571474 RPA2039 RPA2040     TRUE 0.879 -3.000 0.075 1.000   NA
 571475 571476 RPA2041 RPA2042     TRUE 0.809 227.000 0.706 1.000 Y NA
 571476 571477 RPA2042 RPA2043     TRUE 0.936 59.000 0.235 0.058 Y NA
 571477 571478 RPA2043 RPA2044     TRUE 0.913 8.000 0.167 1.000   NA
 571480 571481 RPA2046 RPA2047 leuI dctP1 FALSE 0.075 224.000 0.005 1.000 N NA
 571481 571482 RPA2047 RPA2048 dctP1 dctQ1 TRUE 0.773 139.000 0.151 NA Y NA
 571482 571483 RPA2048 RPA2049 dctQ1 dctM1 TRUE 0.995 -3.000 0.882 NA Y NA
 571483 571484 RPA2049 RPA2050 dctM1   FALSE 0.288 133.000 0.065 NA   NA
 571484 5451024 RPA2050 RPA_RNA15   tRNA-Lys1 FALSE 0.001 345.000 0.000 NA   NA
 5451024 571486 RPA_RNA15 RPA2051 tRNA-Lys1   FALSE 0.000 397.000 0.000 NA   NA
 571486 571487 RPA2051 RPA2052     TRUE 0.967 -46.000 0.650 1.000 N NA
 571487 571488 RPA2052 RPA2053     FALSE 0.010 122.000 0.000 NA   NA
 571488 571489 RPA2053 RPA2054     FALSE 0.022 55.000 0.000 NA   NA
 571489 571490 RPA2054 RPA2055     FALSE 0.417 -3.000 0.000 1.000   NA
 571490 571491 RPA2055 RPA2056   czcA2 FALSE 0.172 30.000 0.000 1.000   NA
 571491 571492 RPA2056 RPA2057 czcA2   FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571493 571494 RPA2058 RPA2059     FALSE 0.015 74.000 0.000 NA   NA
 571495 571496 RPA2060 RPA2061 nosR nosZ TRUE 0.755 19.000 0.064 1.000 N NA
 571496 571497 RPA2061 RPA2062 nosZ nosD TRUE 0.968 3.000 0.146 0.002 N NA
 571497 571498 RPA2062 RPA2063 nosD nosF TRUE 0.986 -3.000 0.963 1.000 N NA
 571498 571499 RPA2063 RPA2064 nosF nosY TRUE 0.967 -3.000 0.500 NA   NA
 571499 571500 RPA2064 RPA2065 nosY nosL TRUE 0.969 -3.000 0.519 NA   NA
 571500 571501 RPA2065 RPA2066 nosL nosX TRUE 0.945 13.000 0.464 NA N NA
 571501 571502 RPA2066 RPA2067 nosX   FALSE 0.034 36.000 0.000 NA   NA
 571502 571503 RPA2067 RPA2068     FALSE 0.013 87.000 0.000 NA   NA
 571503 571504 RPA2068 RPA2069     TRUE 0.893 -3.000 0.119 NA   NA
 571504 571505 RPA2069 RPA2070     TRUE 0.961 12.000 0.625 NA   NA
 571506 571507 RPA2071 RPA2072     FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 571507 571508 RPA2072 RPA2073     FALSE 0.018 62.000 0.000 NA   NA
 571508 571509 RPA2073 RPA2074     FALSE 0.079 68.000 0.000 1.000   NA
 571509 571510 RPA2074 RPA2075     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 571510 571511 RPA2075 RPA2076     FALSE 0.032 428.000 0.000 NA Y NA
 571511 571512 RPA2076 RPA2077     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA Y NA
 571513 571514 RPA2078 RPA2079     FALSE 0.008 188.000 0.000 NA   NA
 571517 571518 RPA2082 RPA2083 cobA cobB TRUE 0.980 0.000 0.115 1.000 Y NA
 571518 571519 RPA2083 RPA2084 cobB cobM TRUE 0.980 -13.000 0.065 0.007 Y NA
 571519 571520 RPA2084 RPA2085 cobM CbiG TRUE 0.981 -3.000 0.397 0.007   NA
 571520 571521 RPA2085 RPA2086 CbiG cobL TRUE 0.961 -3.000 0.139 0.007   NA
 571523 571524 RPA2088 RPA2089 cobJ cobI TRUE 0.989 -3.000 0.138 0.007 Y NA
 571524 571525 RPA2089 RPA2090 cobI cobH TRUE 0.991 -3.000 0.191 0.007 Y NA
 571525 571526 RPA2090 RPA2091 cobH   TRUE 0.762 -3.000 0.025 NA   NA
 571526 571527 RPA2091 RPA2092     FALSE 0.000 401.000 0.000 NA   NA
 571527 571528 RPA2092 RPA2093     TRUE 0.978 -13.000 0.618 0.071   NA
 571529 571530 RPA2094 RPA2095 cobT1   TRUE 0.980 -3.000 0.005 0.007 Y NA
 571530 571531 RPA2095 RPA2096   cobQ2 TRUE 0.845 87.000 0.036 0.007 Y NA
 571531 571532 RPA2096 RPA2097 cobQ2 cobF TRUE 0.872 32.000 0.010 1.000 Y NA
 571532 571533 RPA2097 RPA2098 cobF   FALSE 0.060 120.000 0.000 1.000 N NA
 571535 571536 RPA2100 RPA2101     FALSE 0.004 312.000 0.000 1.000   NA
 571536 571537 RPA2101 RPA2102     TRUE 0.955 2.000 0.344 NA   NA
 571537 571538 RPA2102 RPA2103     TRUE 0.793 20.000 0.138 NA   NA
 571538 571539 RPA2103 RPA2104     TRUE 0.979 -3.000 0.750 NA   NA
 571540 571541 RPA2105 RPA2106     FALSE 0.024 215.000 0.000 1.000   NA
 571541 571542 RPA2106 RPA2107     FALSE 0.053 165.000 0.000 1.000   NA
 571542 571543 RPA2107 RPA2108     TRUE 0.949 -13.000 0.400 1.000   NA
 571543 571544 RPA2108 RPA2109     TRUE 0.877 89.000 0.667 0.020   NA
 571547 571548 RPA2112 RPA2113 nrtA nrtB TRUE 0.919 147.000 0.703 NA Y NA
 571548 571549 RPA2113 RPA2114 nrtB nrtC1 TRUE 0.997 6.000 0.730 0.001 Y NA
 571549 571550 RPA2114 RPA2115 nrtC1 cynS TRUE 0.901 43.000 0.128 1.000 Y NA
 571551 571552 RPA2116 RPA2117     TRUE 0.902 -21.000 0.231 NA   NA
 571552 571553 RPA2117 RPA2118     FALSE 0.036 203.000 0.000 1.000 N NA
 571553 571554 RPA2118 RPA2119     TRUE 0.987 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 571554 571555 RPA2119 RPA2120     TRUE 0.995 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 571555 571556 RPA2120 RPA2121     TRUE 0.810 -3.000 0.044 NA   NA
 571557 571558 RPA2122 RPA2123     TRUE 0.926 -12.000 0.261 1.000   NA
 571558 571559 RPA2123 RPA2124     FALSE 0.234 218.000 0.118 1.000   NA
 571559 571560 RPA2124 RPA2125     TRUE 0.832 77.000 0.700 1.000   NA
 571560 571561 RPA2125 RPA2126     TRUE 0.794 17.000 0.108 NA   NA
 571561 571562 RPA2126 RPA2127   exbB3 TRUE 0.771 -7.000 0.041 NA N NA
 571562 571563 RPA2127 RPA2128 exbB3 exbD3 TRUE 0.964 6.000 0.000 0.070 Y NA
 571563 571564 RPA2128 RPA2129 exbD3   FALSE 0.472 -3.000 0.000 1.000 N NA
 571566 571567 RPA2131 RPA2132     FALSE 0.324 129.000 0.083 NA   NA
 571567 571568 RPA2132 RPA2133     TRUE 0.983 5.000 0.917 NA   NA
 571568 571569 RPA2133 RPA2134     FALSE 0.011 161.000 0.000 NA   NA
 571571 571572 RPA2136 RPA2137     TRUE 0.628 103.000 0.160 0.071 N NA
 571572 571573 RPA2137 RPA2138     TRUE 0.848 150.000 0.070 0.008 Y NA
 571573 571574 RPA2138 RPA2139     FALSE 0.321 194.000 0.105 1.000 N NA
 571574 571575 RPA2139 RPA2140     FALSE 0.066 165.000 0.000 1.000 N NA
 571575 571576 RPA2140 RPA2141     FALSE 0.048 121.000 0.000 1.000   NA
 571576 571577 RPA2141 RPA2142     TRUE 0.639 168.000 0.161 0.043   NA
 571577 571578 RPA2142 RPA2143     FALSE 0.456 240.000 0.102 1.000 Y NA
 571578 571579 RPA2143 RPA2144     TRUE 0.991 -3.000 0.184 0.002 Y NA
 571579 571580 RPA2144 RPA2145     TRUE 0.870 120.000 0.227 0.084 Y NA
 571580 571581 RPA2145 RPA2146     TRUE 0.812 176.000 0.091 0.084 Y NA
 571581 571582 RPA2146 RPA2147     TRUE 0.575 155.000 0.250 1.000   NA
 571584 571585 RPA2149 RPA2150     TRUE 0.558 31.000 0.030 1.000   NA
 571585 571586 RPA2150 RPA2151     FALSE 0.117 219.000 0.045 NA   NA
 571586 571587 RPA2151 RPA2152     FALSE 0.015 95.000 0.000 NA N NA
 571587 571588 RPA2152 RPA2153     FALSE 0.015 247.000 0.000 1.000 N NA
 571588 571589 RPA2153 RPA2154     FALSE 0.090 73.000 0.000 1.000 N NA
 571589 571590 RPA2154 RPA2155   ilvD3 FALSE 0.005 327.000 0.000 1.000 N NA
 571592 571593 RPA2157 RPA2158     FALSE 0.426 136.000 0.154 NA   NA
 571594 571595 RPA2159 RPA2160     FALSE 0.010 126.000 0.000 NA   NA
 571596 571597 RPA2161 RPA2162     FALSE 0.001 655.000 0.000 1.000   NA
 571598 571599 RPA2163 RPA2164   groEL2 FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 571599 571600 RPA2164 RPA2165 groEL2 groES2 TRUE 0.952 166.000 0.600 0.006 Y NA
 571602 571603 RPA2167 RPA2168     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 571604 571605 RPA2169 RPA2170 rlp1   TRUE 0.876 -10.000 0.114 1.000   NA
 571605 571606 RPA2170 RPA2171     FALSE 0.000 517.000 0.000 NA   NA
 571607 571608 RPA2172 RPA2173     TRUE 0.712 33.000 0.024 0.084   NA
 571608 571609 RPA2173 RPA2174     TRUE 0.598 19.000 0.012 1.000   NA
 571609 571610 RPA2174 RPA2175     FALSE 0.442 214.000 0.383 NA N NA
 571610 571611 RPA2175 RPA2176     TRUE 0.782 50.000 0.365 NA   NA
 571611 571612 RPA2176 RPA2177     TRUE 0.798 152.000 0.805 NA   NA
 571613 571614 RPA2178 RPA2179     FALSE 0.294 121.000 0.052 1.000   NA
 571614 571615 RPA2179 RPA2180     FALSE 0.029 305.000 0.024 1.000   NA
 571617 571618 RPA2182 RPA2183     FALSE 0.043 420.000 0.278 1.000 N NA
 571618 571619 RPA2183 RPA2184     TRUE 0.919 0.000 0.125 1.000 N NA
 571619 571620 RPA2184 RPA2185     FALSE 0.348 92.000 0.054 1.000 N NA
 571620 571621 RPA2185 RPA2186     TRUE 0.978 19.000 0.222 0.048 Y NA
 571621 571622 RPA2186 RPA2187     FALSE 0.278 204.000 0.011 0.048   NA
 571623 571624 RPA2188 RPA2189     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571624 571625 RPA2189 RPA2190     FALSE 0.052 104.000 0.000 1.000   NA
 571625 571626 RPA2190 RPA2191     TRUE 0.712 11.000 0.028 NA   NA
 571627 571628 RPA2192 RPA2193     FALSE 0.224 195.000 0.074 NA   NA
 571634 571635 RPA2199 RPA2200   guaB FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 571635 571636 RPA2200 RPA2201 guaB   FALSE 0.005 299.000 0.000 1.000   NA
 571636 571637 RPA2201 RPA2202     FALSE 0.007 191.000 0.000 NA   NA
 571637 571638 RPA2202 RPA2203   guaA FALSE 0.022 292.000 0.013 NA N NA
 571638 571639 RPA2203 RPA2204 guaA   FALSE 0.025 283.000 0.002 1.000 N NA
 571640 571641 RPA2205 RPA2206     FALSE 0.339 84.000 0.044 1.000   NA
 571642 571643 RPA2207 RPA2208   parB2 TRUE 0.989 -3.000 0.743 0.041 N NA
 571643 571644 RPA2208 RPA2209 parB2   TRUE 0.991 2.000 0.857 0.041   NA
 571644 571645 RPA2209 RPA2210     FALSE 0.001 291.000 0.000 NA   NA
 571646 571647 RPA2211 RPA2212     TRUE 0.975 -10.000 0.833 NA   NA
 571647 571648 RPA2212 RPA2213     TRUE 0.975 -10.000 0.844 NA   NA
 571648 571649 RPA2213 RPA2214     FALSE 0.462 53.000 0.062 NA   NA
 571649 571650 RPA2214 RPA2215     TRUE 0.963 20.000 0.067 0.041 Y NA
 571650 571651 RPA2215 RPA2216     TRUE 0.989 0.000 0.667 0.011   NA
 571652 571653 RPA2217 RPA2218     FALSE 0.036 34.000 0.000 NA   NA
 571653 571654 RPA2218 RPA2219     TRUE 0.916 -3.000 0.047 0.099   NA
 571654 571655 RPA2219 RPA2220     FALSE 0.089 -16.000 0.000 NA   NA
 571655 571656 RPA2220 RPA2221     TRUE 0.675 14.000 0.034 NA   NA
 571656 571657 RPA2221 RPA2222     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 571658 571659 RPA2223 RPA2224   trbI1 TRUE 0.949 5.000 0.333 NA   NA
 571659 571660 RPA2224 RPA2225 trbI1 trbG1 TRUE 0.992 -3.000 0.556 NA Y NA
 571660 571661 RPA2225 RPA2226 trbG1 trbF1 TRUE 0.992 0.000 0.500 NA Y NA
 571661 571662 RPA2226 RPA2227 trbF1 trbL TRUE 0.945 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 571662 571663 RPA2227 RPA2228 trbL trbK FALSE 0.133 0.000 0.000 NA   NA
 571663 571664 RPA2228 RPA2229 trbK trbJ FALSE 0.104 9.000 0.000 NA   NA
 571664 571665 RPA2229 RPA2230 trbJ trbE1 TRUE 0.937 -3.000 0.000 NA Y NA
 571665 571666 RPA2230 RPA2231 trbE1 trbD TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA Y NA
 571666 571667 RPA2231 RPA2232 trbD trbC1 TRUE 0.942 0.000 0.000 NA Y NA
 571667 571668 RPA2232 RPA2233 trbC1 trbB1 TRUE 0.937 -3.000 0.000 NA Y NA
 571668 571669 RPA2233 RPA2234 trbB1   TRUE 0.633 137.000 0.400 NA   NA
 571669 571670 RPA2234 RPA2235   traG2 TRUE 0.973 -3.000 0.600 NA   NA
 571670 571671 RPA2235 RPA2236 traG2   FALSE 0.522 111.000 0.000 NA Y NA
 571671 571672 RPA2236 RPA2237     FALSE 0.002 269.000 0.000 NA   NA
 571672 571673 RPA2237 RPA2238     FALSE 0.000 515.000 0.000 NA   NA
 571673 571674 RPA2238 RPA2239     FALSE 0.003 239.000 0.000 NA   NA
 571674 571675 RPA2239 RPA2240     FALSE 0.008 203.000 0.000 NA N NA
 571675 571676 RPA2240 RPA2241     FALSE 0.000 432.000 0.000 NA   NA
 571676 571677 RPA2241 RPA2242     FALSE 0.001 346.000 0.000 NA   NA
 571679 571680 RPA2244 RPA2245     FALSE 0.000 628.000 0.000 NA   NA
 571682 571683 RPA2247 RPA2248     FALSE 0.124 4.000 0.000 NA   NA
 571683 571684 RPA2248 RPA2249     FALSE 0.091 -13.000 0.000 NA   NA
 571684 571685 RPA2249 RPA2250     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 571685 571686 RPA2250 RPA2251     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571686 571687 RPA2251 RPA2252     FALSE 0.060 120.000 0.000 1.000 N NA
 571689 571690 RPA2254 RPA2255     FALSE 0.025 45.000 0.000 NA   NA
 571691 571692 RPA2256 RPA2257   arsC1 TRUE 0.929 12.000 0.286 1.000 N NA
 571692 571693 RPA2257 RPA2258 arsC1 arsB TRUE 0.949 0.000 0.000 1.000 Y NA
 571693 571694 RPA2258 RPA2259 arsB arsH FALSE 0.133 0.000 0.000 NA   NA
 571694 571695 RPA2259 RPA2260 arsH   FALSE 0.000 440.000 0.000 NA   NA
 571695 571696 RPA2260 RPA2261     FALSE 0.028 204.000 0.000 1.000   NA
 571697 571698 RPA2262 RPA2263 gltS   FALSE 0.009 178.000 0.000 NA   NA
 571698 571699 RPA2263 RPA2264     TRUE 0.980 0.000 0.750 NA   NA
 571699 571700 RPA2264 RPA2265     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571701 571702 RPA2266 RPA2267 gst1   FALSE 0.003 229.000 0.000 NA   NA
 571702 571703 RPA2267 RPA2268     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 571704 571705 RPA2269 RPA2270     FALSE 0.178 188.000 0.038 NA   NA
 571705 571706 RPA2270 RPA2271     FALSE 0.336 114.000 0.091 NA   NA
 571707 571708 RPA2272 RPA2273     FALSE 0.007 196.000 0.000 NA   NA
 571708 571709 RPA2273 RPA2274     FALSE 0.096 -9.000 0.000 NA   NA
 571709 571710 RPA2274 RPA2275     FALSE 0.008 186.000 0.000 NA   NA
 571710 571711 RPA2275 RPA2276     TRUE 0.989 -7.000 0.254 0.029 Y NA
 571711 571712 RPA2276 RPA2277     TRUE 0.919 39.000 0.158 1.000 Y NA
 571712 571713 RPA2277 RPA2278     TRUE 0.997 2.000 0.902 0.057 Y NA
 571715 571716 RPA2280 RPA2281     TRUE 0.979 15.000 0.396 NA Y NA
 571717 571718 RPA2282 RPA2283     TRUE 0.736 43.000 0.250 NA   NA
 571718 571719 RPA2283 RPA2284     FALSE 0.012 89.000 0.000 NA   NA
 571724 571725 RPA2289 RPA2290     TRUE 0.940 12.000 0.400 NA   NA
 571725 571726 RPA2290 RPA2291     FALSE 0.010 136.000 0.000 NA   NA
 571727 571728 RPA2292 RPA2293     FALSE 0.008 188.000 0.000 NA   NA
 571729 571730 RPA2294 RPA2295     FALSE 0.001 473.000 0.000 1.000   NA
 571730 571731 RPA2295 RPA2296     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571731 571732 RPA2296 RPA2297     FALSE 0.002 250.000 0.000 NA   NA
 571732 571733 RPA2297 RPA2298     TRUE 0.670 69.000 0.000 1.000 Y NA
 571733 571734 RPA2298 RPA2299     FALSE 0.061 129.000 0.000 1.000 N NA
 571734 571735 RPA2299 RPA2300     FALSE 0.470 225.000 0.000 0.016 Y NA
 571737 571738 RPA2302 RPA2303     TRUE 0.978 19.000 0.250 0.083 Y NA
 571738 571739 RPA2303 RPA2304     TRUE 0.950 59.000 0.575 1.000 Y NA
 571739 571740 RPA2304 RPA2305     TRUE 0.991 8.000 0.529 1.000 Y NA
 571740 571741 RPA2305 RPA2306     FALSE 0.017 362.000 0.000 0.070 N NA
 571743 571744 RPA2308 RPA2309     TRUE 0.987 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 571744 571745 RPA2309 RPA2310     TRUE 0.995 -3.000 0.792 1.000 Y NA
 571746 571747 RPA2311 RPA2312     TRUE 0.967 -3.000 0.500 NA   NA
 571747 571748 RPA2312 RPA2313     FALSE 0.086 -46.000 0.000 NA   NA
 571749 571750 RPA2314 RPA2315     TRUE 0.981 4.000 0.047 0.070 Y NA
 571751 571752 RPA2316 RPA2317   gctB TRUE 0.906 25.000 0.000 0.083 Y NA
 571752 571753 RPA2317 RPA2318 gctB gctA TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.083 Y NA
 571753 571754 RPA2318 RPA2319 gctA   FALSE 0.050 128.000 0.000 1.000   NA
 571754 571755 RPA2319 RPA2320     FALSE 0.014 78.000 0.000 NA   NA
 571755 571756 RPA2320 RPA2321     TRUE 0.962 0.000 0.400 NA   NA
 571757 571758 RPA2322 RPA2323   goaT FALSE 0.452 168.000 0.133 1.000 N NA
 571758 571759 RPA2323 RPA2324 goaT gabD2 TRUE 0.716 38.000 0.133 1.000 N NA
 571759 571760 RPA2324 RPA2325 gabD2   TRUE 0.874 50.000 0.600 1.000 N NA
 571760 571761 RPA2325 RPA2326     TRUE 0.983 0.000 0.167 1.000 Y NA
 571761 571762 RPA2326 RPA2327     TRUE 0.840 79.000 0.167 1.000 Y NA
 571762 571763 RPA2327 RPA2328     TRUE 0.989 -3.000 0.200 0.057 Y NA
 571763 571764 RPA2328 RPA2329     TRUE 0.983 13.000 0.200 0.057 Y NA
 571764 571765 RPA2329 RPA2330     TRUE 0.982 -3.000 0.800 1.000   NA
 571765 571766 RPA2330 RPA2331   ggt2 FALSE 0.072 75.000 0.000 1.000   NA
 571766 571767 RPA2331 RPA2332 ggt2   FALSE 0.007 294.000 0.000 1.000 N NA
 571768 571769 RPA2333 RPA2334 ctpC   TRUE 0.751 -3.000 0.022 NA   NA
 571769 571770 RPA2334 RPA2335     TRUE 0.958 -7.000 0.500 NA   NA
 571770 571771 RPA2335 RPA2336     TRUE 0.966 -13.000 0.667 NA   NA
 571771 571772 RPA2336 RPA2337     TRUE 0.800 18.000 0.125 NA   NA
 571772 571773 RPA2337 RPA2338     FALSE 0.109 8.000 0.000 NA   NA
 571775 571776 RPA2340 RPA2341   ilvD TRUE 0.666 52.000 0.167 1.000   NA
 571776 571777 RPA2341 RPA2342 ilvD   TRUE 0.868 65.000 0.167 1.000 Y NA
 571779 571780 RPA2344 RPA2345     FALSE 0.131 1.000 0.000 NA   NA
 571780 571781 RPA2345 RPA2346     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 571781 571782 RPA2346 RPA2347     FALSE 0.027 42.000 0.000 NA   NA
 571782 571783 RPA2347 RPA2348     TRUE 0.976 0.000 0.000 0.005 Y NA
 571783 571784 RPA2348 RPA2349   metY FALSE 0.023 225.000 0.000 1.000 N NA
 571786 571787 RPA2351 RPA2352     FALSE 0.007 281.000 0.000 1.000   NA
 571787 571788 RPA2352 RPA2353   nifH1 FALSE 0.121 43.000 0.000 1.000   NA
 571788 571789 RPA2353 RPA2354 nifH1 nifB2 FALSE 0.115 46.000 0.000 1.000   NA
 571789 571790 RPA2354 RPA2355 nifB2   FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571791 571792 RPA2356 RPA2357     TRUE 0.989 2.000 0.133 0.015 Y NA
 571794 571795 RPA2359 RPA2360     TRUE 0.978 9.000 0.222 NA Y NA
 571795 571796 RPA2360 RPA2361     TRUE 0.957 -46.000 0.055 1.000 Y NA
 571796 571797 RPA2361 RPA2362     FALSE 0.181 36.000 0.000 1.000 N NA
 571797 571798 RPA2362 RPA2363   NifD1 FALSE 0.212 29.000 0.000 1.000 N NA
 571798 571799 RPA2363 RPA2364 NifD1   TRUE 0.947 13.000 0.000 0.070 Y NA
 571802 571803 RPA2367 RPA2368     FALSE 0.417 -3.000 0.000 1.000   NA
 571803 571804 RPA2368 RPA2369     TRUE 0.579 38.000 0.000 0.019   NA
 571804 571805 RPA2369 RPA2369a     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571805 571806 RPA2369a RPA2370     FALSE 0.120 5.000 0.000 NA   NA
 571807 571808 RPA2371 RPA2372 mexA mexB TRUE 0.986 -3.000 1.000 1.000 N NA
 571808 571809 RPA2372 RPA2373 mexB   TRUE 0.968 9.000 0.312 0.056 N NA
 571809 571810 RPA2373 RPA2374     FALSE 0.102 -6.000 0.000 NA   NA
 571810 571811 RPA2374 RPA2375     FALSE 0.010 173.000 0.000 NA   NA
 571811 571812 RPA2375 RPA2376     FALSE 0.010 120.000 0.000 NA   NA
 571813 571814 RPA2377 RPA2378     FALSE 0.335 115.000 0.091 NA   NA
 571814 571815 RPA2378 RPA2379     FALSE 0.476 148.000 0.150 1.000 N NA
 571815 571816 RPA2379 RPA2380     TRUE 0.870 14.000 0.150 1.000 N NA
 571816 571817 RPA2380 RPA2381   fecR4 TRUE 0.811 99.000 0.214 NA Y NA
 571817 571818 RPA2381 RPA2382 fecR4   TRUE 0.658 93.000 0.012 NA Y NA
 571818 571819 RPA2382 RPA2383     TRUE 0.995 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 571819 571820 RPA2383 RPA2384     TRUE 0.996 -7.000 0.870 0.056 Y NA
 571820 571821 RPA2384 RPA2385     TRUE 0.989 -3.000 0.356 1.000 Y NA
 571821 571822 RPA2385 RPA2386     FALSE 0.122 -9.000 0.000 NA N NA
 571822 571823 RPA2386 RPA2387     TRUE 0.963 0.000 0.412 NA   NA
 571823 571824 RPA2387 RPA2388     TRUE 0.944 -3.000 0.292 NA   NA
 571824 571825 RPA2388 RPA2389     TRUE 0.988 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 571825 571826 RPA2389 RPA2390     TRUE 0.988 29.000 0.571 0.000 Y NA
 571829 571830 RPA2394 RPA2395 prpC prpB TRUE 0.963 11.000 0.502 1.000 N NA
 571830 571831 RPA2395 RPA2396 prpB   FALSE 0.402 30.000 0.010 NA   NA
 571831 571832 RPA2396 RPA2397   metE FALSE 0.001 350.000 0.000 NA   NA
 571832 571833 RPA2397 RPA2398 metE   FALSE 0.001 865.000 0.000 1.000 N NA
 571833 571834 RPA2398 RPA2399     FALSE 0.425 9.000 0.000 1.000 N NA
 571834 571835 RPA2399 RPA2400     TRUE 0.949 3.000 0.263 1.000 N NA
 571835 571836 RPA2400 RPA2401     TRUE 0.981 0.000 0.778 NA   NA
 571836 571837 RPA2401 RPA2402     FALSE 0.001 361.000 0.000 NA   NA
 571837 571838 RPA2402 RPA2403     FALSE 0.000 535.000 0.000 NA   NA
 571840 571841 RPA2404 RPA2405   draT2 TRUE 0.815 73.000 0.600 1.000   NA
 571841 571842 RPA2405 RPA2406 draT2 draG TRUE 0.884 12.000 0.147 1.000   NA
 571844 571845 RPA2408 RPA2409 amiC1   TRUE 0.984 -3.000 0.938 NA N NA
 571845 571846 RPA2409 RPA2410     TRUE 0.937 12.000 0.375 NA N NA
 571846 571847 RPA2410 RPA2411     TRUE 0.933 119.000 0.909 NA Y NA
 571847 571848 RPA2411 RPA2412     TRUE 0.995 12.000 0.833 0.056 Y NA
 571848 571849 RPA2412 RPA2413     TRUE 0.995 0.000 0.833 1.000 Y NA
 571849 571850 RPA2413 RPA2414     TRUE 0.995 -7.000 0.625 0.029 Y NA
 571850 571851 RPA2414 RPA2415     TRUE 0.926 26.000 0.562 1.000 N NA
 571851 571852 RPA2415 RPA2416     TRUE 0.945 15.000 0.152 0.000   NA
 571852 571853 RPA2416 RPA2417     TRUE 0.731 16.000 0.042 1.000   NA
 571854 5451026 RPA2418 RPA_RNA34   tRNA-Ser1 FALSE 0.000 896.000 0.000 NA   NA
 571861 571862 RPA2424 RPA2425     FALSE 0.287 14.000 0.000 1.000   NA
 571864 571865 RPA2427 RPA2428     FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 571865 571866 RPA2428 RPA2429   aat FALSE 0.115 124.000 0.004 NA   NA
 571866 571867 RPA2429 RPA2430 aat   FALSE 0.239 55.000 0.006 NA   NA
 571867 571868 RPA2430 RPA2431     FALSE 0.037 33.000 0.000 NA   NA
 571868 571869 RPA2431 RPA2432     FALSE 0.062 133.000 0.000 1.000 N NA
 571869 571870 RPA2432 RPA2433     TRUE 0.988 -3.000 0.114 0.019 Y NA
 571870 571871 RPA2433 RPA2434     TRUE 0.989 -3.000 0.341 1.000 Y NA
 571871 571872 RPA2434 RPA2435   accC FALSE 0.429 188.000 0.072 0.097 N NA
 571872 571873 RPA2435 RPA2436 accC accB TRUE 0.887 118.000 0.153 0.001 Y NA
 571873 571874 RPA2436 RPA2437 accB aroQ2 FALSE 0.475 39.000 0.020 1.000 N NA
 571874 571875 RPA2437 RPA2438 aroQ2   FALSE 0.001 294.000 0.000 NA   NA
 571876 571877 RPA2439 RPA2440     FALSE 0.001 338.000 0.000 NA   NA
 571877 571878 RPA2440 RPA2441     FALSE 0.340 -12.000 0.000 1.000   NA
 571879 571880 RPA2442 RPA2443     FALSE 0.470 191.000 0.000 1.000 Y NA
 571880 571881 RPA2443 RPA2444     FALSE 0.011 152.000 0.000 NA   NA
 571881 571882 RPA2444 RPA2445     FALSE 0.008 186.000 0.000 NA   NA
 571883 571884 RPA2446 RPA2447     FALSE 0.156 99.000 0.010 NA   NA
 571884 571885 RPA2447 RPA2448   dctA2 TRUE 0.569 99.000 0.286 NA   NA
 571886 571887 RPA2449 RPA2450   rne FALSE 0.010 114.000 0.000 NA   NA
 571888 571889 RPA2451 RPA2452     TRUE 0.742 220.000 0.396 1.000 Y NA
 571889 571890 RPA2452 RPA2453   prfB FALSE 0.051 281.000 0.041 1.000 N NA
 571890 571891 RPA2453 RPA2454 prfB   TRUE 0.733 7.000 0.005 1.000 N NA
 571892 571893 RPA2455 RPA2456     FALSE 0.226 97.000 0.015 1.000   NA
 571895 571896 RPA2458 RPA2459     FALSE 0.136 221.000 0.000 0.054 N NA
 571896 571897 RPA2459 RPA2460   tyrS FALSE 0.254 85.000 0.012 1.000 N NA
 571900 571901 RPA2463 RPA2464 nifS1 sufB FALSE 0.483 83.000 0.109 1.000 N NA
 571901 571902 RPA2464 RPA2465 sufB sufC TRUE 0.892 133.000 0.466 1.000 Y NA
 571902 571903 RPA2465 RPA2466 sufC sufD TRUE 0.985 24.000 0.482 0.029 Y NA
 571903 571904 RPA2466 RPA2467 sufD sufS TRUE 0.931 -3.000 0.193 1.000 N NA
 571904 571905 RPA2467 RPA2468 sufS   TRUE 0.947 -3.000 0.309 NA   NA
 571905 571906 RPA2468 RPA2469     FALSE 0.434 29.000 0.014 NA   NA
 571906 571907 RPA2469 RPA2470     FALSE 0.157 130.000 0.013 NA   NA
 571907 571908 RPA2470 RPA2471     FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 571908 571909 RPA2471 RPA2472     FALSE 0.115 6.000 0.000 NA   NA
 571909 571910 RPA2472 RPA2473     FALSE 0.157 -3.000 0.000 NA N NA
 571910 571911 RPA2473 RPA2474     FALSE 0.017 86.000 0.000 NA N NA
 571911 571912 RPA2474 RPA2475     FALSE 0.060 25.000 0.000 NA N NA
 571913 571914 RPA2476 RPA2477     FALSE 0.482 99.000 0.144 1.000 N NA
 571914 571915 RPA2477 RPA2478     FALSE 0.157 274.000 0.000 1.000 Y NA
 571916 571917 RPA2479 RPA2480     FALSE 0.420 178.000 0.143 1.000   NA
 571920 571921 RPA2483 RPA2484     TRUE 0.725 31.000 0.143 NA   NA
 571924 571925 RPA2487 RPA2488     TRUE 0.642 86.000 0.333 NA   NA
 571927 571928 RPA2490 RPA2491   argC TRUE 0.759 15.000 0.046 1.000 N NA
 571928 571929 RPA2491 RPA2492 argC   FALSE 0.427 56.000 0.037 1.000   NA
 571929 571930 RPA2492 RPA2493     FALSE 0.010 255.000 0.000 1.000   NA
 571930 571931 RPA2493 RPA2494     FALSE 0.003 235.000 0.000 NA   NA
 571932 571933 RPA2495 RPA2496     FALSE 0.001 347.000 0.000 NA N NA
 571934 571935 RPA2497 RPA2498     TRUE 0.996 0.000 0.876 1.000 Y NA
 571935 571936 RPA2498 RPA2499     TRUE 0.847 66.000 0.112 1.000 Y NA
 571936 571937 RPA2499 RPA2500     TRUE 0.705 71.000 0.308 1.000 N NA
 571939 571940 RPA2502 RPA2503     FALSE 0.162 185.000 0.027 NA   NA
 571940 571941 RPA2503 RPA2504   HDH TRUE 0.852 79.000 0.202 1.000 Y NA
 571941 571942 RPA2504 RPA2505 HDH glpX TRUE 0.563 63.000 0.112 1.000 N NA
 571942 571943 RPA2505 RPA2506 glpX   FALSE 0.205 109.000 0.013 1.000   NA
 571943 571944 RPA2506 RPA2507     TRUE 0.560 65.000 0.035 0.081   NA
 571944 571945 RPA2507 RPA2508   recJ FALSE 0.454 29.000 0.005 1.000   NA
 571946 571947 RPA2509 RPA2510     FALSE 0.370 85.000 0.079 NA   NA
 571947 571948 RPA2510 RPA2511     TRUE 0.803 18.000 0.128 NA   NA
 571951 571952 RPA2514 RPA2515   kamA TRUE 0.928 -3.000 0.174 1.000 N NA
 571952 571953 RPA2515 RPA2516 kamA   FALSE 0.238 161.000 0.037 NA   NA
 571955 571956 RPA2518 RPA2519     FALSE 0.020 58.000 0.000 NA   NA
 571962 571963 RPA2524 RPA2525   cspA2 TRUE 0.736 204.000 0.082 0.040 Y NA
 571963 571964 RPA2525 RPA2526 cspA2   FALSE 0.439 184.000 0.226 NA   NA
 571964 5451028 RPA2526 RPA_RNA16   tRNA-Pro2 FALSE 0.014 81.000 0.000 NA   NA
 571967 571968 RPA2528 RPA2529     FALSE 0.032 38.000 0.000 NA   NA
 571968 571969 RPA2529 RPA2530     FALSE 0.023 50.000 0.000 NA   NA
 571969 571970 RPA2530 RPA2531     FALSE 0.012 96.000 0.000 NA   NA
 571970 571971 RPA2531 RPA2532     FALSE 0.002 262.000 0.000 NA   NA
 571971 571972 RPA2532 RPA2533     FALSE 0.011 165.000 0.000 NA   NA
 571972 571973 RPA2533 RPA2534     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 571973 571974 RPA2534 RPA2535   waaG FALSE 0.001 593.000 0.000 1.000   NA
 571976 571977 RPA2537 RPA2538     FALSE 0.208 149.000 0.012 1.000   NA
 571977 571978 RPA2538 RPA2539     TRUE 0.967 14.000 0.158 1.000 Y NA
 571978 571979 RPA2539 RPA2540   hmgL FALSE 0.432 121.000 0.036 0.081 N NA
 571980 571981 RPA2541 RPA2542     TRUE 0.995 -3.000 0.900 NA Y NA
 571981 571982 RPA2542 RPA2543     TRUE 0.988 -3.000 0.359 NA Y NA
 571983 571984 RPA2544 RPA2545     FALSE 0.000 531.000 0.000 NA   NA
 571984 571985 RPA2545 RPA2546     FALSE 0.056 177.000 0.000 1.000 N NA
 571987 571988 RPA2548 RPA2549     TRUE 0.977 -3.000 0.704 NA   NA
 571991 5451029 RPA2552 RPA_RNA32   tRNA-Arg4 FALSE 0.010 119.000 0.000 NA   NA
 571993 571994 RPA2553 RPA2554     TRUE 0.969 -3.000 0.473 1.000   NA
 571994 571995 RPA2554 RPA2555     TRUE 0.877 51.000 0.098 1.000 Y NA
 571995 571996 RPA2555 RPA2556     TRUE 0.956 2.000 0.310 1.000   NA
 571996 571997 RPA2556 RPA2557     FALSE 0.545 64.000 0.143 NA   NA
 571997 571998 RPA2557 RPA2558     TRUE 0.923 0.000 0.187 NA   NA
 572000 572001 RPA2560 RPA2561 aapJ-1 aapQ-1 TRUE 0.969 21.000 0.129 0.055 Y NA
 572001 572002 RPA2561 RPA2562 aapQ-1 aapM-1 TRUE 0.997 -3.000 0.815 0.006 Y NA
 572002 572003 RPA2562 RPA2563 aapM-1 aapP-1 TRUE 0.957 16.000 0.101 1.000 Y NA
 572004 572005 RPA2564 RPA2565     FALSE 0.011 146.000 0.000 NA   NA
 572006 572007 RPA2566 RPA2567     FALSE 0.104 9.000 0.000 NA   NA
 572008 572009 RPA2568 RPA2569   cfa1 FALSE 0.287 111.000 0.041 1.000 N NA
 572009 572010 RPA2569 RPA2570 cfa1   FALSE 0.421 60.000 0.062 NA   NA
 572010 572011 RPA2570 RPA2571     TRUE 0.979 2.000 0.722 NA   NA
 572012 572013 RPA2572 RPA2573     TRUE 0.988 -10.000 0.484 1.000 Y NA
 572013 572014 RPA2573 RPA2574     TRUE 0.816 71.000 0.630 NA N NA
 572014 572015 RPA2574 RPA2575     TRUE 0.996 0.000 0.963 NA Y NA
 572015 572016 RPA2575 RPA2576     TRUE 0.880 8.000 0.122 NA   NA
 572018 572019 RPA2577 RPA2578     TRUE 0.968 3.000 0.500 NA   NA
 572020 5451031 RPA2579 RPA_RNA30   tRNA-Asn1 FALSE 0.007 192.000 0.000 NA   NA
 572022 572023 RPA2580 RPA2581     FALSE 0.424 46.000 0.019 1.000 N NA
 572023 572024 RPA2581 RPA2582     FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 572024 572025 RPA2582 RPA2583   valS FALSE 0.213 142.000 0.033 NA   NA
 572025 572026 RPA2583 RPA2584 valS   FALSE 0.124 4.000 0.000 NA   NA
 572026 572027 RPA2584 RPA2585     FALSE 0.006 202.000 0.000 NA   NA
 572029 572030 RPA2587 RPA2588 lipA2   TRUE 0.681 27.000 0.081 NA N NA
 572031 572032 RPA2589 RPA2590 cinA ispD TRUE 0.844 3.000 0.061 NA   NA
 572033 572034 RPA2591 RPA2592 nifR3 ntrB TRUE 0.900 -3.000 0.094 1.000 N NA
 572034 572035 RPA2592 RPA2593 ntrB ntrC TRUE 0.989 10.000 0.297 0.081 Y NA
 572035 572036 RPA2593 RPA2594 ntrC ntrY TRUE 0.879 160.000 0.205 0.081 Y NA
 572036 572037 RPA2594 RPA2595 ntrY ntrX TRUE 0.989 17.000 0.533 0.081 Y NA
 572037 572038 RPA2595 RPA2596 ntrX   TRUE 0.633 41.000 0.085 1.000 N NA
 572038 572039 RPA2596 RPA2597     FALSE 0.499 182.000 0.243 1.000   NA
 572039 572040 RPA2597 RPA2598     FALSE 0.425 105.000 0.115 1.000   NA
 572040 572041 RPA2598 RPA2599   gyrA FALSE 0.098 203.000 0.003 1.000   NA
 572041 572042 RPA2599 RPA2600 gyrA   FALSE 0.008 185.000 0.000 NA   NA
 572042 572043 RPA2600 RPA2601   kdtB FALSE 0.010 174.000 0.000 NA   NA
 572043 572044 RPA2601 RPA2602 kdtB   TRUE 0.694 17.000 0.027 1.000 N NA
 572044 572045 RPA2602 RPA2603     TRUE 0.944 10.000 0.375 NA   NA
 572045 572046 RPA2603 RPA2604     TRUE 0.880 -24.000 0.180 NA   NA
 572046 572047 RPA2604 RPA2605   queA FALSE 0.284 157.000 0.031 1.000 N NA
 572047 572048 RPA2605 RPA2606 queA tgt TRUE 0.995 -3.000 0.360 0.000 Y NA
 572049 572050 RPA2607 RPA2608     FALSE 0.001 565.000 0.000 1.000 N NA
 572050 572051 RPA2608 RPA2609     FALSE 0.055 162.000 0.000 1.000   NA
 572051 572052 RPA2609 RPA2610   ssuB TRUE 0.779 11.000 0.036 1.000   NA
 572052 572053 RPA2610 RPA2611 ssuB   TRUE 0.991 5.000 0.472 1.000 Y NA
 572053 572054 RPA2611 RPA2612   msuD TRUE 0.865 -3.000 0.057 1.000 N NA
 572054 572055 RPA2612 RPA2613 msuD   TRUE 0.562 45.000 0.065 1.000 N NA
 572056 572057 RPA2614 RPA2615   nifH2 TRUE 0.608 40.000 0.075 1.000   NA
 572057 572058 RPA2615 RPA2616 nifH2   TRUE 0.977 2.000 0.364 0.068 N NA
 572058 572059 RPA2616 RPA2617     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.046 Y NA
 572062 572063 RPA2620 RPA2621     FALSE 0.037 32.000 0.000 NA   NA
 572063 572064 RPA2621 RPA2622     TRUE 0.833 29.000 0.244 1.000 N NA
 572064 572065 RPA2622 RPA2623     TRUE 0.989 0.000 0.318 1.000 Y NA
 572065 572066 RPA2623 RPA2624     TRUE 0.954 124.000 0.795 0.055 Y NA
 572066 572067 RPA2624 RPA2625     FALSE 0.001 553.000 0.000 1.000 N NA
 572067 572068 RPA2625 RPA2626     FALSE 0.092 242.000 0.000 0.042   NA
 572069 572070 RPA2627 RPA2628   aapJ-2 FALSE 0.201 31.000 0.000 1.000 N NA
 572070 572071 RPA2628 RPA2629 aapJ-2 aapQ-2 TRUE 0.960 21.000 0.068 0.055 Y NA
 572071 572072 RPA2629 RPA2630 aapQ-2 aapM-2 TRUE 0.954 -3.000 0.085 0.006 N NA
 572072 572073 RPA2630 RPA2631 aapM-2   FALSE 0.020 548.000 0.000 NA Y NA
 572073 572074 RPA2631 RPA2632     TRUE 0.916 11.000 0.000 NA Y NA
 572074 572075 RPA2632 RPA2633     TRUE 0.994 0.000 0.630 1.000 Y NA
 572075 572076 RPA2633 RPA2634   nifB1 FALSE 0.001 843.000 0.000 1.000   NA
 572076 572077 RPA2634 RPA2635 nifB1 nifH3 FALSE 0.136 39.000 0.000 1.000   NA
 572077 572078 RPA2635 RPA2636 nifH3 NifD2 FALSE 0.477 66.000 0.000 0.005 N NA
 572078 572079 RPA2636 RPA2637 NifD2   TRUE 0.962 12.000 0.000 0.005 Y NA
 572079 572080 RPA2637 RPA2638     FALSE 0.043 295.000 0.000 0.046 N NA
 572081 572082 RPA2639 RPA2640     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 572082 572083 RPA2640 RPA2641     FALSE 0.472 -3.000 0.000 1.000 N NA
 572085 572086 RPA2643 RPA2644     TRUE 0.986 -3.000 1.000 1.000   NA
 572086 572087 RPA2644 RPA2645     TRUE 0.997 5.000 1.000 0.055 Y NA
 572087 572088 RPA2645 RPA2646     TRUE 0.989 25.000 0.714 0.055 Y NA
 572088 572089 RPA2646 RPA2647     FALSE 0.050 170.000 0.000 1.000   NA
 572089 572090 RPA2647 RPA2648     FALSE 0.172 30.000 0.000 1.000   NA
 572093 572094 RPA2651 RPA2652     FALSE 0.260 91.000 0.041 NA   NA
 572095 572096 RPA2653 RPA2654 pucAa pucBa TRUE 0.947 26.000 0.400 0.004   NA
 572096 5451032 RPA2654 RPA_RNA29 pucBa tRNA-Lys2 FALSE 0.001 360.000 0.000 NA   NA
 5451032 572098 RPA_RNA29 RPA2655 tRNA-Lys2   FALSE 0.011 156.000 0.000 NA   NA
 572098 572099 RPA2655 RPA2656     FALSE 0.255 188.000 0.078 NA   NA
 572102 572103 RPA2659 RPA2660 glmU glmS TRUE 0.741 126.000 0.083 1.000 Y NA
 572103 572104 RPA2660 RPA2661 glmS   FALSE 0.065 259.000 0.059 NA   NA
 572107 572108 RPA2664 RPA2665     TRUE 0.875 49.000 0.667 NA   NA
 572108 572109 RPA2665 RPA2666     TRUE 0.910 5.000 0.127 1.000 N NA
 572111 572112 RPA2668 RPA2669     FALSE 0.027 42.000 0.000 NA   NA
 572115 572116 RPA2672 RPA2673     TRUE 0.877 -3.000 0.068 1.000 N NA
 572116 572117 RPA2673 RPA2674     TRUE 0.558 87.000 0.200 1.000 N NA
 572118 572119 RPA2675 RPA2676     FALSE 0.002 400.000 0.000 1.000 N NA
 572120 572121 RPA2677 RPA2678     TRUE 0.996 8.000 0.857 0.055 Y NA
 572121 572122 RPA2678 RPA2679     TRUE 0.992 -7.000 0.692 1.000 Y NA
 572122 572123 RPA2679 RPA2680     TRUE 0.960 2.000 0.333 1.000 N NA
 572124 572125 RPA2681 RPA2682   uahA TRUE 0.825 28.000 0.261 NA   NA
 572125 572126 RPA2682 RPA2683 uahA dur1 TRUE 0.991 -3.000 0.518 NA Y NA
 572127 572128 RPA2684 RPA2685     TRUE 0.874 13.000 0.194 NA   NA
 572128 572129 RPA2685 RPA2686   dapA2 FALSE 0.050 129.000 0.000 1.000   NA
 572129 572130 RPA2686 RPA2687 dapA2 mscL TRUE 0.952 11.000 0.020 1.000 Y NA
 572130 572131 RPA2687 RPA2688 mscL SmpB FALSE 0.455 38.000 0.012 1.000 N NA
 572131 572132 RPA2688 RPA2689 SmpB   TRUE 0.900 23.000 0.007 1.000 Y NA
 572133 572134 RPA2690 RPA2691     TRUE 0.916 6.000 0.204 NA   NA
 572135 572136 RPA2692 RPA2693 rnpO relA FALSE 0.474 266.000 0.291 1.000 Y NA
 572136 572137 RPA2693 RPA2694 relA pdxJ FALSE 0.261 150.000 0.026 1.000 N NA
 572137 572138 RPA2694 RPA2695 pdxJ acpS TRUE 0.957 -3.000 0.326 1.000 N NA
 572138 572139 RPA2695 RPA2696 acpS lepB2 FALSE 0.121 242.000 0.070 1.000 N NA
 572139 572140 RPA2696 RPA2697 lepB2   TRUE 0.871 -3.000 0.062 1.000 N NA
 572140 572141 RPA2697 RPA2698   era TRUE 0.932 -10.000 0.098 0.037   NA
 572141 572142 RPA2698 RPA2699 era   TRUE 0.869 -3.000 0.084 NA   NA
 572142 572143 RPA2699 RPA2700     FALSE 0.305 43.000 0.010 NA   NA
 572145 572146 RPA2702 RPA2703   parC TRUE 0.606 10.000 0.003 NA N NA
 572146 572147 RPA2703 RPA2704 parC   FALSE 0.076 86.000 0.000 1.000 N NA
 572151 572152 RPA2708 RPA2708a     TRUE 0.943 -10.000 0.391 NA   NA
 572152 572153 RPA2708a RPA2709     TRUE 0.930 -3.000 0.227 NA   NA
 572154 572155 RPA2710 RPA2711     FALSE 0.507 69.000 0.128 NA   NA
 572155 572156 RPA2711 RPA2712   hemB FALSE 0.357 71.000 0.055 NA   NA
 572157 572158 RPA2713 RPA2714     FALSE 0.379 78.000 0.075 NA   NA
 572158 572159 RPA2714 RPA2715     FALSE 0.003 353.000 0.000 1.000 N NA
 572159 572160 RPA2715 RPA2716     FALSE 0.005 215.000 0.000 NA   NA
 572160 572161 RPA2716 RPA2717     TRUE 0.966 17.000 0.889 NA   NA
 572161 572162 RPA2717 RPA2718     TRUE 0.857 18.000 0.222 NA   NA
 572162 572163 RPA2718 RPA2719     FALSE 0.032 38.000 0.000 NA   NA
 572166 572167 RPA2722 RPA2723     FALSE 0.004 226.000 0.000 NA   NA
 572168 572169 RPA2724 RPA2725 glyA1   FALSE 0.279 103.000 0.052 NA N NA
 572169 572170 RPA2725 RPA2726   ribD TRUE 0.943 -3.000 0.277 NA N NA
 572170 572171 RPA2726 RPA2727 ribD ribC TRUE 0.988 11.000 0.456 1.000 Y NA
 572171 572172 RPA2727 RPA2728 ribC ribE TRUE 0.830 131.000 0.030 0.001 Y NA
 572172 572173 RPA2728 RPA2729 ribE nusB TRUE 0.956 6.000 0.347 1.000 N NA
 572173 572174 RPA2729 RPA2730 nusB thiL FALSE 0.435 194.000 0.225 1.000 N NA
 572174 572175 RPA2730 RPA2731 thiL   FALSE 0.021 229.000 0.000 1.000 N NA
 572175 572176 RPA2731 RPA2732     FALSE 0.011 162.000 0.000 NA   NA
 572176 572177 RPA2732 RPA2733     FALSE 0.001 325.000 0.000 NA   NA
 572177 572178 RPA2733 RPA2734     TRUE 0.664 38.000 0.125 NA   NA
 572178 572179 RPA2734 RPA2735   mexC2 FALSE 0.033 196.000 0.000 1.000   NA
 572179 572180 RPA2735 RPA2736 mexC2 mexD2 TRUE 0.970 19.000 1.000 1.000 N NA
 572182 572183 RPA2738 RPA2739     TRUE 0.732 18.000 0.071 NA   NA
 572183 572184 RPA2739 RPA2740   plsX FALSE 0.076 241.000 0.044 NA   NA
 572184 572185 RPA2740 RPA2741 plsX fabH TRUE 0.994 -3.000 0.380 0.003 Y NA
 572185 572186 RPA2741 RPA2742 fabH himA FALSE 0.517 134.000 0.207 1.000 N NA
 572186 572187 RPA2742 RPA2743 himA   TRUE 0.637 15.000 0.008 1.000 N NA
 572187 5451033 RPA2743 RPA_RNA17   tRNA-Pro3 FALSE 0.001 319.000 0.000 NA   NA
 5451033 572189 RPA_RNA17 RPA2744 tRNA-Pro3   FALSE 0.011 156.000 0.000 NA   NA
 572189 572190 RPA2744 RPA2745     FALSE 0.001 317.000 0.000 NA   NA
 572190 572191 RPA2745 RPA2746     FALSE 0.055 160.000 0.000 1.000   NA
 572193 572194 RPA2748 RPA2749     TRUE 0.622 39.000 0.100 NA   NA
 572195 572196 RPA2750 RPA2751     TRUE 0.888 111.000 0.500 NA Y NA
 572204 572205 RPA2759 RPA2760     FALSE 0.487 2.000 0.000 1.000 N NA
 572207 572208 RPA2762 RPA2763     TRUE 0.640 28.000 0.070 NA   NA
 572208 572209 RPA2763 RPA2764     FALSE 0.251 95.000 0.040 NA   NA
 572209 572210 RPA2764 RPA2765     FALSE 0.170 150.000 0.015 NA   NA
 572211 572212 RPA2766 RPA2767   rplM FALSE 0.188 156.000 0.015 NA N NA
 572212 572213 RPA2767 RPA2768 rplM rpsI TRUE 0.992 2.000 0.231 0.011 Y NA
 572213 572214 RPA2768 RPA2769 rpsI   FALSE 0.009 275.000 0.000 1.000 N NA
 572214 572215 RPA2769 RPA2770     FALSE 0.419 79.000 0.074 1.000   NA
 572219 572220 RPA2774 RPA2775     TRUE 0.905 3.000 0.099 1.000 N NA
 572220 572221 RPA2775 RPA2776     TRUE 0.945 -3.000 0.254 1.000   NA
 572221 572222 RPA2776 RPA2777   metG FALSE 0.417 81.000 0.075 1.000   NA
 572222 572223 RPA2777 RPA2778 metG   TRUE 0.929 4.000 0.221 NA N NA
 572223 572224 RPA2778 RPA2779     TRUE 0.752 26.000 0.139 NA   NA
 572225 572226 RPA2780 RPA2781   dctQ2 TRUE 0.832 55.000 0.467 1.000 N NA
 572226 572227 RPA2781 RPA2782 dctQ2 dctP2 TRUE 0.984 13.000 0.409 1.000 Y NA
 572227 572228 RPA2782 RPA2783 dctP2   FALSE 0.000 365.000 0.000 NA   NA
 572230 572231 RPA2785 RPA2786     FALSE 0.472 91.000 0.167 NA   NA
 572234 572235 RPA2789 RPA2790 phaA phaC TRUE 0.997 -9.000 0.881 0.009 Y NA
 572235 572236 RPA2790 RPA2791 phaC phaD TRUE 0.998 -3.000 0.976 0.009 Y NA
 572236 572237 RPA2791 RPA2792 phaD phaE TRUE 0.996 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 572237 572238 RPA2792 RPA2793 phaE phaF TRUE 0.997 -3.000 0.937 0.053 Y NA
 572238 572239 RPA2793 RPA2794 phaF phaG TRUE 0.980 39.000 0.937 1.000 Y NA
 572240 572241 RPA2795 RPA2796   glyA2 TRUE 0.784 21.000 0.136 NA   NA
 572241 572242 RPA2796 RPA2797 glyA2   TRUE 0.871 154.000 0.121 0.014 Y NA
 572243 572244 RPA2798 RPA2799 BenE pdxK TRUE 0.925 -3.000 0.160 1.000 N NA
 572245 572246 RPA2800 RPA2801     FALSE 0.003 244.000 0.000 NA   NA
 572248 572249 RPA2803 RPA2804     FALSE 0.015 73.000 0.000 NA   NA
 572250 572251 RPA2805 RPA2806 nthA nthB TRUE 0.991 -3.000 0.761 0.001   NA
 572251 572252 RPA2806 RPA2807 nthB   TRUE 0.992 0.000 0.761 0.000   NA
 572252 572253 RPA2807 RPA2808     FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 572254 572255 RPA2809 RPA2810     FALSE 0.215 82.000 0.005 1.000   NA
 572256 572257 RPA2811 RPA2812 mazG   FALSE 0.170 79.000 0.007 NA   NA
 572257 572258 RPA2812 RPA2813     TRUE 0.875 -3.000 0.091 NA   NA
 572260 572261 RPA2815 RPA2816   uvrA FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000 N NA
 572264 572265 RPA2819 RPA2820     FALSE 0.127 3.000 0.000 NA   NA
 572266 572267 RPA2821 RPA2822     FALSE 0.032 38.000 0.000 NA   NA
 572267 572268 RPA2822 RPA2823     FALSE 0.001 280.000 0.000 NA   NA
 572268 572269 RPA2823 RPA2824     FALSE 0.010 133.000 0.000 NA   NA
 572271 572272 RPA2826 RPA2827   gid FALSE 0.000 788.000 0.000 NA   NA
 572273 572274 RPA2828 RPA2829     TRUE 0.911 -3.000 0.165 NA   NA
 572274 572275 RPA2829 RPA2830   secF FALSE 0.397 162.000 0.113 NA   NA
 572275 572276 RPA2830 RPA2831 secF secD TRUE 0.984 26.000 0.356 0.000 Y NA
 572276 572277 RPA2831 RPA2832 secD yajC TRUE 0.876 45.000 0.099 NA Y NA
 572278 572279 RPA2833 RPA2834     FALSE 0.141 169.000 0.009 NA   NA
 572282 572283 RPA2837 RPA2838 lppB pimt2 FALSE 0.381 121.000 0.089 1.000 N NA
 572285 572286 RPA2840 RPA2841   surE FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
 572286 572287 RPA2841 RPA2843 surE   FALSE 0.010 142.000 0.000 NA   NA
 572287 572288 RPA2843 RPA2844     FALSE 0.002 248.000 0.000 NA   NA
 572288 572289 RPA2844 RPA2845   serS TRUE 0.620 6.000 0.004 NA   NA
 572289 572290 RPA2845 RPA2846 serS   FALSE 0.010 125.000 0.000 NA   NA
 572290 572291 RPA2846 RPA2847   tatC FALSE 0.010 141.000 0.000 NA   NA
 572291 572292 RPA2847 RPA2848 tatC tatB TRUE 0.960 -3.000 0.019 NA Y NA
 572292 572293 RPA2848 RPA2849 tatB tatAE FALSE 0.323 217.000 0.000 NA Y NA
 572293 572294 RPA2849 RPA2850 tatAE   FALSE 0.290 147.000 0.060 NA N NA
 572294 572295 RPA2850 RPA2851     TRUE 0.931 21.000 0.570 NA   NA
 572295 572296 RPA2851 RPA2852     TRUE 0.884 -3.000 0.103 NA   NA
 572296 572297 RPA2852 RPA2853     FALSE 0.402 49.000 0.038 NA   NA
 572297 572298 RPA2853 RPA2854   argS FALSE 0.163 103.000 0.013 NA   NA
 572298 572299 RPA2854 RPA2855 argS   FALSE 0.528 52.000 0.062 1.000 N NA
 572300 572301 RPA2856 RPA2857     FALSE 0.007 195.000 0.000 NA   NA
 572301 572302 RPA2857 RPA2858     TRUE 0.930 -3.000 0.227 NA   NA
 572303 572304 RPA2859 RPA2860     FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 572306 572307 RPA2862 RPA2863 exoR   FALSE 0.001 663.000 0.000 1.000   NA
 572307 572308 RPA2863 RPA2864     TRUE 0.830 76.000 0.121 1.000 Y NA
 572308 572309 RPA2864 RPA2865     TRUE 0.690 13.000 0.033 NA   NA
 572309 572310 RPA2865 RPA2866     TRUE 0.781 5.000 0.035 NA   NA
 572310 572311 RPA2866 RPA2867     TRUE 0.970 59.000 0.456 0.001 Y NA
 572311 572312 RPA2867 RPA2868     FALSE 0.433 153.000 0.104 1.000 N NA
 572312 572313 RPA2868 RPA2869     FALSE 0.194 89.000 0.017 NA   NA
 572313 572314 RPA2869 RPA2870     FALSE 0.265 140.000 0.056 NA   NA
 572316 572317 RPA2872 RPA2873     FALSE 0.259 85.000 0.035 NA   NA
 572317 572318 RPA2873 RPA2874   eno FALSE 0.226 111.000 0.018 1.000 N NA
 572319 572320 RPA2875 RPA2876     FALSE 0.001 443.000 0.000 1.000   NA
 572320 572321 RPA2876 RPA2877     TRUE 0.886 -12.000 0.169 NA N NA
 572322 572323 RPA2878 RPA2879   kdsA TRUE 0.813 0.000 0.018 1.000 N NA
 572323 572324 RPA2879 RPA2880 kdsA   TRUE 0.686 -3.000 0.009 NA   NA
 572324 572325 RPA2880 RPA2881     FALSE 0.469 96.000 0.176 NA   NA
 572328 572329 RPA2884 RPA2885     FALSE 0.010 110.000 0.000 NA   NA
 572330 572331 RPA2886 RPA2887 pyrG secG FALSE 0.388 167.000 0.083 1.000 N NA
 572331 572332 RPA2887 RPA2888 secG cbbJ FALSE 0.473 176.000 0.184 1.000 N NA
 572333 572334 RPA2889 RPA2890   trpD FALSE 0.177 37.000 0.000 1.000 N NA
 572334 572335 RPA2890 RPA2891 trpD trpC TRUE 0.904 65.000 0.293 1.000 Y NA
 572335 572336 RPA2891 RPA2892 trpC moaC TRUE 0.879 11.000 0.113 1.000 N NA
 572336 572337 RPA2892 RPA2893 moaC   FALSE 0.404 38.000 0.004 1.000 N NA
 572339 572340 RPA2895 RPA2896     TRUE 0.592 169.000 0.333 NA   NA
 572342 572343 RPA2898 RPA2899     TRUE 0.608 31.000 0.067 NA   NA
 572343 572344 RPA2899 RPA2900     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 572346 572347 RPA2902 RPA2903 moeA lexA TRUE 0.691 60.000 0.232 1.000 N NA
 572348 572349 RPA2904 RPA2905   glnS FALSE 0.152 93.000 0.008 NA   NA
 572350 572351 RPA2906 RPA2907 gltX cisY FALSE 0.455 151.000 0.127 1.000 N NA
 572352 572353 RPA2908 RPA2909   lpxB FALSE 0.065 150.000 0.000 1.000 N NA
 572353 572354 RPA2909 RPA2910 lpxB   TRUE 0.914 -3.000 0.173 NA   NA
 572354 572355 RPA2910 RPA2911   lpxA TRUE 0.936 19.000 0.552 NA   NA
 572355 572356 RPA2911 RPA2912 lpxA   TRUE 0.937 9.000 0.264 1.000 N NA
 572356 572357 RPA2912 RPA2913   lpxD TRUE 0.941 0.000 0.212 1.000 N NA
 572357 572358 RPA2913 RPA2914 lpxD   TRUE 0.876 30.000 0.008 1.000 Y NA
 572358 572359 RPA2914 RPA2915     TRUE 0.621 173.000 0.004 1.000 Y NA
 572359 572360 RPA2915 RPA2916   dxr TRUE 0.875 46.000 0.568 1.000 N NA
 572360 572361 RPA2916 RPA2917 dxr cdsA TRUE 0.989 5.000 0.372 1.000 Y NA
 572361 572362 RPA2917 RPA2918 cdsA uppS TRUE 0.989 6.000 0.400 1.000 Y NA
 572362 572363 RPA2918 RPA2919 uppS rrf FALSE 0.503 212.000 0.409 1.000 N NA
 572363 572364 RPA2919 RPA2920 rrf pyrH TRUE 0.840 66.000 0.626 1.000 N NA
 572364 572365 RPA2920 RPA2921 pyrH tsf TRUE 0.771 68.000 0.416 1.000 N NA
 572365 572366 RPA2921 RPA2922 tsf rpsB TRUE 0.926 125.000 0.748 1.000 Y NA
 572366 572367 RPA2922 RPA2923 rpsB   FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000   NA
 572367 572368 RPA2923 RPA2924   dnaE FALSE 0.181 162.000 0.005 1.000   NA
 572370 572371 RPA2926 RPA2927     TRUE 0.966 12.000 0.620 1.000 N NA
 572371 572372 RPA2927 RPA2928   proS FALSE 0.430 80.000 0.076 1.000 N NA
 572372 572373 RPA2928 RPA2929 proS   FALSE 0.175 176.000 0.006 1.000 N NA
 572373 572374 RPA2929 RPA2930     TRUE 0.793 18.000 0.115 NA   NA
 572374 572375 RPA2930 RPA2931     TRUE 0.978 0.000 0.667 NA   NA
 572375 572376 RPA2931 RPA2932     TRUE 0.650 126.000 0.444 NA   NA
 572376 572377 RPA2932 RPA2933     FALSE 0.000 619.000 0.000 NA   NA
 572377 572378 RPA2933 RPA2934     TRUE 0.913 4.000 0.172 NA   NA
 572378 572379 RPA2934 RPA2935     TRUE 0.646 42.000 0.105 1.000   NA
 572379 572380 RPA2935 RPA2936   birA TRUE 0.956 0.000 0.307 1.000   NA
 572380 572381 RPA2936 RPA2937 birA nuoN1 TRUE 0.964 1.000 0.372 1.000 N NA
 572381 572382 RPA2937 RPA2938 nuoN1 nuoM1 TRUE 0.989 20.000 0.453 0.003 Y NA
 572382 572383 RPA2938 RPA2939 nuoM1 nuoL1 TRUE 0.993 1.000 0.251 0.003 Y NA
 572383 572384 RPA2939 RPA2940 nuoL1 nuoK1 TRUE 0.964 60.000 0.451 0.009 Y NA
 572384 572385 RPA2940 RPA2941 nuoK1 nuoJ1 TRUE 0.995 -3.000 0.484 0.004 Y NA
 572385 572386 RPA2941 RPA2942 nuoJ1 nuoI1 TRUE 0.993 10.000 0.442 0.009 Y NA
 572386 572387 RPA2942 RPA2943 nuoI1 nuoH1 TRUE 0.995 8.000 0.500 0.009 Y NA
 572387 572388 RPA2943 RPA2944 nuoH1 nuoG1 TRUE 0.994 10.000 0.515 0.009 Y NA
 572388 572389 RPA2944 RPA2945 nuoG1 nuoF1 TRUE 0.994 -3.000 0.395 0.009 Y NA
 572389 572390 RPA2945 RPA2946 nuoF1   TRUE 0.579 19.000 0.024 NA   NA
 572390 572391 RPA2946 RPA2947   nuoE1 TRUE 0.742 -3.000 0.019 NA   NA
 572391 572392 RPA2947 RPA2948 nuoE1 fkbM TRUE 0.773 3.000 0.027 NA   NA
 572392 572393 RPA2948 RPA2949 fkbM nuoD TRUE 0.799 -3.000 0.039 NA   NA
 572393 572394 RPA2949 RPA2950 nuoD nuoC TRUE 0.971 52.000 0.483 0.009 Y NA
 572394 572395 RPA2950 RPA2951 nuoC nuoB1 TRUE 0.987 14.000 0.262 0.004 Y NA
 572395 572396 RPA2951 RPA2952 nuoB1 nuoA1 TRUE 0.992 12.000 0.396 0.004 Y NA
 572396 5451034 RPA2952 RPA_RNA28 nuoA1 tRNA-Asp1 FALSE 0.000 988.000 0.000 NA   NA
 572398 572399 RPA2953 RPA2954 hupA pepT FALSE 0.114 252.000 0.089 1.000 N NA
 572399 572400 RPA2954 RPA2955 pepT mex FALSE 0.065 150.000 0.000 1.000 N NA
 572400 572401 RPA2955 RPA2956 mex mexF TRUE 0.949 29.000 0.854 1.000 N NA
 572401 5451035 RPA2956 RPA_RNA18 mexF tRNA-Val2 FALSE 0.012 93.000 0.000 NA   NA
 5451035 572403 RPA_RNA18 RPA2957 tRNA-Val2   FALSE 0.001 330.000 0.000 NA   NA
 572404 572405 RPA2958 RPA2959   lon FALSE 0.007 195.000 0.000 NA   NA
 572405 572406 RPA2959 RPA2960 lon clpX FALSE 0.354 310.000 0.201 0.093 Y NA
 572406 572407 RPA2960 RPA2961 clpX clpP FALSE 0.202 393.000 0.352 1.000 Y NA
 572407 572408 RPA2961 RPA2962 clpP tig FALSE 0.345 314.000 0.351 1.000 Y NA
 572408 5451036 RPA2962 RPA_RNA27 tig tRNA-Leu4 FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 5451036 572410 RPA_RNA27 RPA2963 tRNA-Leu4   FALSE 0.011 159.000 0.000 NA   NA
 572413 572414 RPA2966 RPA2967 glnB glnA TRUE 0.814 90.000 0.145 1.000 Y NA
 572414 572415 RPA2967 RPA2968 glnA   FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 572415 572416 RPA2968 RPA2969     TRUE 0.715 13.000 0.041 NA   NA
 572417 572418 RPA2970 RPA2971 bioA bioD TRUE 0.990 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 572418 572419 RPA2971 RPA2972 bioD bioF TRUE 0.982 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 572419 572420 RPA2972 RPA2973 bioF   FALSE 0.010 141.000 0.000 NA   NA
 572420 572421 RPA2973 RPA2974     TRUE 0.561 89.000 0.250 NA   NA
 572421 572422 RPA2974 RPA2975   serA1 FALSE 0.431 200.000 0.250 1.000 N NA
 572422 572423 RPA2975 RPA2976 serA1   FALSE 0.010 109.000 0.000 NA   NA
 572424 572425 RPA2977 RPA2978 nrd   FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 572425 572426 RPA2978 RPA2979     FALSE 0.011 164.000 0.000 NA   NA
 572427 572428 RPA2980 RPA2981     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 572428 572429 RPA2981 RPA2982     TRUE 0.831 -6.000 0.077 NA   NA
 572434 572435 RPA2987 RPA2988   yrkN FALSE 0.283 87.000 0.000 0.078   NA
 572435 572436 RPA2988 RPA2989 yrkN   FALSE 0.128 41.000 0.000 1.000   NA
 572437 572438 RPA2990 RPA2991     FALSE 0.010 122.000 0.000 NA   NA
 572438 572439 RPA2991 RPA2992     FALSE 0.001 308.000 0.000 NA   NA
 572439 572440 RPA2992 RPA2993     FALSE 0.039 30.000 0.000 NA   NA
 572440 572441 RPA2993 RPA2994     FALSE 0.010 132.000 0.000 NA   NA
 572442 572443 RPA2995 RPA2996 nuoL3   TRUE 0.946 22.000 0.750 NA   NA
 572443 572444 RPA2996 RPA2997     FALSE 0.011 157.000 0.000 NA   NA
 572444 572445 RPA2997 RPA2998   dapA1 FALSE 0.124 4.000 0.000 NA   NA
 572446 572447 RPA2999 RPA3000 ptsN2 kdpE TRUE 0.950 24.000 0.169 1.000 Y NA
 572447 572448 RPA3000 RPA3001 kdpE kdpD TRUE 0.993 6.000 0.695 1.000 Y NA
 572448 572449 RPA3001 RPA3002 kdpD kdpC TRUE 0.635 46.000 0.106 1.000 N NA
 572449 572450 RPA3002 RPA3003 kdpC kdpB TRUE 0.996 13.000 0.877 0.001 Y NA
 572450 572451 RPA3003 RPA3004 kdpB kdpA TRUE 0.990 10.000 0.201 0.001 Y NA
 572452 572453 RPA3005 RPA3006     FALSE 0.001 306.000 0.000 NA   NA
 572453 572454 RPA3006 RPA3007     FALSE 0.109 8.000 0.000 NA   NA
 572456 1759863 RPA3009 RPA3010 pucBc pucAc FALSE 0.080 13.000 0.000 NA   NA
 572457 572458 RPA3011 RPA3012   pucAd FALSE 0.011 151.000 0.000 NA   NA
 572458 572459 RPA3012 RPA3013 pucAd pucBd TRUE 0.816 13.000 0.000 0.004   NA
 572460 572461 RPA3014 RPA3015   phyB1 FALSE 0.434 224.000 0.000 0.078 Y NA
 572461 572462 RPA3015 RPA3016 phyB1 phyB2 TRUE 0.997 4.000 0.800 0.001 Y NA
 572462 572463 RPA3016 RPA3017 phyB2 rphyB TRUE 0.997 1.000 0.833 0.078 Y NA
 572463 572464 RPA3017 RPA3018 rphyB   TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.018 Y NA
 572465 572466 RPA3019 RPA3020 mexF mexE FALSE 0.010 130.000 0.000 NA   NA
 572467 572468 RPA3021 RPA3022     FALSE 0.062 131.000 0.000 1.000 N NA
 572468 572469 RPA3022 RPA3023     FALSE 0.063 134.000 0.000 1.000 N NA
 572471 572472 RPA3025 RPA3026     TRUE 0.880 46.000 0.667 NA   NA
 572473 572474 RPA3027 RPA3028 kup1   FALSE 0.009 261.000 0.000 1.000   NA
 572475 572476 RPA3029 RPA3030     FALSE 0.221 176.000 0.042 NA   NA
 572477 572478 RPA3031 RPA3032     FALSE 0.056 255.000 0.043 NA   NA
 572478 572479 RPA3032 RPA3033   argE FALSE 0.511 148.000 0.227 NA N NA
 572481 572482 RPA3035 RPA3036     FALSE 0.010 112.000 0.000 NA   NA
 572482 572483 RPA3036 RPA3037     FALSE 0.000 882.000 0.000 NA   NA
 572484 572485 RPA3038 RPA3039     TRUE 0.724 154.000 0.545 NA   NA
 572485 572486 RPA3039 RPA3040     TRUE 0.939 38.000 0.909 1.000 N NA
 572487 572488 RPA3041 RPA3042   mao FALSE 0.336 95.000 0.075 NA   NA
 572488 572489 RPA3042 RPA3043 mao aspS FALSE 0.481 31.000 0.009 1.000 N NA
 572490 572491 RPA3044 RPA3045   rnd FALSE 0.153 104.000 0.011 NA   NA
 572491 572492 RPA3045 RPA3046 rnd   TRUE 0.668 -3.000 0.006 NA   NA
 572493 572494 RPA3047 RPA3048     TRUE 0.969 13.000 0.149 1.000 Y NA
 572494 572495 RPA3048 RPA3049     TRUE 0.553 70.000 0.134 1.000   NA
 572495 572496 RPA3049 RPA3050     TRUE 0.607 31.000 0.045 1.000   NA
 572497 572498 RPA3051 RPA3052 purM purN TRUE 0.991 9.000 0.230 0.002 Y NA
 572501 572502 RPA3055 RPA3056     FALSE 0.271 73.000 0.009 1.000 N NA
 572504 572505 RPA3058 RPA3059     FALSE 0.189 128.000 0.025 NA   NA
 572505 572506 RPA3059 RPA3060     TRUE 0.921 11.000 0.230 1.000 N NA
 572507 572508 RPA3061 RPA3062     TRUE 0.975 14.000 0.631 0.052   NA
 572508 572509 RPA3062 RPA3063     TRUE 0.926 0.000 0.153 1.000   NA
 572509 572510 RPA3063 RPA3064     FALSE 0.492 79.000 0.116 1.000   NA
 572510 572511 RPA3064 RPA3065   pdxA FALSE 0.450 61.000 0.056 1.000   NA
 572511 572512 RPA3065 RPA3066 pdxA ksgA TRUE 0.932 -3.000 0.197 1.000 N NA
 572512 572513 RPA3066 RPA3067 ksgA   TRUE 0.602 17.000 0.009 1.000   NA
 572513 572514 RPA3067 RPA3068     TRUE 0.783 42.000 0.312 NA   NA
 572515 572516 RPA3069 RPA3070 kguA   TRUE 0.950 3.000 0.276 1.000   NA
 572516 572517 RPA3070 RPA3071     FALSE 0.287 102.000 0.060 NA   NA
 572517 572518 RPA3071 RPA3072   fabF FALSE 0.274 203.000 0.134 NA   NA
 572518 572519 RPA3072 RPA3073 fabF acpP TRUE 0.782 97.000 0.106 1.000 Y NA
 572519 572520 RPA3073 RPA3074 acpP fabG2 FALSE 0.530 305.000 0.321 0.003 Y NA
 572520 572521 RPA3074 RPA3075 fabG2 fabD TRUE 0.988 20.000 0.432 0.003 Y NA
 572522 572523 RPA3076 RPA3077   RPS6 FALSE 0.060 172.000 0.000 1.000 N NA
 572523 572524 RPA3077 RPA3078 RPS6 RPS18 TRUE 0.993 6.000 0.319 0.011 Y NA
 572524 572525 RPA3078 RPA3079 RPS18   FALSE 0.209 127.000 0.033 NA   NA
 572525 572526 RPA3079 RPA3080   RPL9 FALSE 0.509 36.000 0.043 NA   NA
 572530 572531 RPA3084 RPA3085 dnaB   FALSE 0.521 68.000 0.096 1.000 N NA
 572532 572533 RPA3086 RPA3087     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 572533 572534 RPA3087 RPA3088     FALSE 0.000 460.000 0.000 NA   NA
 572535 572536 RPA3089 RPA3090 RadA   FALSE 0.230 214.000 0.094 1.000   NA
 572536 572537 RPA3090 RPA3091   purF TRUE 0.761 24.000 0.101 1.000   NA
 572537 572538 RPA3091 RPA3092 purF   FALSE 0.394 130.000 0.100 1.000   NA
 572538 572539 RPA3092 RPA3093     FALSE 0.174 84.000 0.009 NA   NA
 572540 572541 RPA3094 RPA3095     TRUE 0.890 -3.000 0.004 0.052   NA
 572541 572542 RPA3095 RPA3096     FALSE 0.219 74.000 0.014 NA   NA
 572542 572543 RPA3096 RPA3097     TRUE 0.615 46.000 0.132 NA   NA
 572543 572544 RPA3097 RPA3098   panB FALSE 0.193 130.000 0.026 NA   NA
 572544 572545 RPA3098 RPA3099 panB   TRUE 0.737 3.000 0.017 NA   NA
 572547 572548 RPA3101 RPA3102     FALSE 0.011 104.000 0.000 NA   NA
 572548 572549 RPA3102 RPA3103     FALSE 0.000 675.000 0.000 NA   NA
 572549 572550 RPA3103 RPA3104   gatB FALSE 0.000 461.000 0.000 NA   NA
 572550 572551 RPA3104 RPA3105 gatB   FALSE 0.189 96.000 0.005 1.000   NA
 572551 572552 RPA3105 RPA3106     FALSE 0.293 142.000 0.048 1.000   NA
 572552 572553 RPA3106 RPA3107   GatA2 FALSE 0.231 77.000 0.004 1.000 N NA
 572554 572555 RPA3108 RPA3109     TRUE 0.928 -52.000 0.333 NA   NA
 572556 572557 RPA3110 RPA3111   gatC TRUE 0.627 12.000 0.013 NA   NA
 572557 572558 RPA3111 RPA3112 gatC   FALSE 0.226 88.000 0.010 1.000   NA
 572559 572560 RPA3113 RPA3114     FALSE 0.408 22.000 0.004 NA   NA
 572561 572562 RPA3115 RPA3116   ipdC FALSE 0.140 46.000 0.000 1.000 N NA
 572563 572564 RPA3117 RPA3118 pyrB pyr TRUE 0.978 20.000 0.452 1.000 Y NA
 572564 572565 RPA3118 RPA3119 pyr   FALSE 0.409 144.000 0.108 1.000   NA
 572565 572566 RPA3119 RPA3120   DprA FALSE 0.338 127.000 0.070 1.000   NA
 572566 572567 RPA3120 RPA3121 DprA   FALSE 0.016 91.000 0.000 NA N NA
 572567 572568 RPA3121 RPA3122     FALSE 0.120 5.000 0.000 NA   NA
 572570 572571 RPA3124 RPA3125 TopA RNR TRUE 0.857 3.000 0.045 1.000 N NA
 572571 572572 RPA3125 RPA3126 RNR   TRUE 0.833 0.000 0.050 NA   NA
 572572 572573 RPA3126 RPA3127     TRUE 0.734 70.000 0.406 NA   NA
 572576 572577 RPA3130 RPA3131     TRUE 0.949 11.000 0.444 NA   NA
 572577 572578 RPA3131 RPA3132     FALSE 0.034 36.000 0.000 NA   NA
 572578 572579 RPA3132 RPA3133     TRUE 0.993 11.000 0.461 0.018 Y NA
 572580 572581 RPA3134 RPA3135   dinP TRUE 0.930 -3.000 0.228 NA   NA
 572583 572584 RPA3137 RPA3138     TRUE 0.951 19.000 0.696 NA N NA
 572584 572585 RPA3138 RPA3139     TRUE 0.944 3.000 0.280 NA   NA
 572585 572586 RPA3139 RPA3140     TRUE 0.884 8.000 0.131 NA   NA
 572587 572588 RPA3141 RPA3142     TRUE 0.564 49.000 0.100 NA   NA
 572588 572589 RPA3142 RPA3143     TRUE 0.941 -3.000 0.275 NA   NA
 572593 572594 RPA3147 RPA3148 clpA   TRUE 0.632 194.000 0.596 NA   NA
 572595 572596 RPA3149 RPA3150     FALSE 0.001 357.000 0.000 NA N NA
 572597 572598 RPA3151 RPA3152     TRUE 0.714 56.000 0.286 NA   NA
 572598 572599 RPA3152 RPA3153     FALSE 0.014 80.000 0.000 NA   NA
 572599 572600 RPA3153 RPA3154     FALSE 0.002 272.000 0.000 NA   NA
 572602 572603 RPA3156 RPA3157     TRUE 0.670 39.000 0.140 NA   NA
 572603 572604 RPA3157 RPA3158     TRUE 0.681 180.000 0.571 NA   NA
 572604 572605 RPA3158 RPA3159     FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
 572605 572606 RPA3159 RPA3160     FALSE 0.002 409.000 0.000 1.000   NA
 572606 572607 RPA3160 RPA3161   yafB FALSE 0.415 75.000 0.064 1.000   NA
 572607 572608 RPA3161 RPA3162 yafB   TRUE 0.792 55.000 0.375 1.000   NA
 572608 572609 RPA3162 RPA3163   mgtE TRUE 0.572 45.000 0.069 1.000 N NA
 572610 572611 RPA3164 RPA3165     TRUE 0.967 84.000 0.692 0.005 Y NA
 572611 572612 RPA3165 RPA3166     FALSE 0.016 72.000 0.000 NA   NA
 572612 572613 RPA3166 RPA3167     TRUE 0.970 0.000 0.500 NA   NA
 5451037 572615 RPA_RNA26 RPA3168 tRNA-Leu3   FALSE 0.014 79.000 0.000 NA   NA
 572616 572617 RPA3169 RPA3170 lipB   FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 572620 572621 RPA3173 RPA3174     TRUE 0.855 0.000 0.041 1.000 N NA
 572621 572622 RPA3174 RPA3175     TRUE 0.916 7.000 0.050 0.077 N NA
 572624 572625 RPA3177 RPA3178     FALSE 0.018 63.000 0.000 NA   NA
 572626 572627 RPA3179 RPA3180     FALSE 0.067 79.000 0.000 1.000   NA
 572633 572634 RPA3185 RPA3186     FALSE 0.011 165.000 0.000 NA   NA
 572635 572636 RPA3187 RPA3188     TRUE 0.562 136.000 0.250 1.000 N NA
 572636 572637 RPA3188 RPA3189     FALSE 0.544 154.000 0.222 1.000   NA
 572637 572638 RPA3189 RPA3190     TRUE 0.911 5.000 0.135 1.000   NA
 572638 572639 RPA3190 RPA3191     FALSE 0.535 103.000 0.077 0.077 N NA
 572639 572640 RPA3191 RPA3192     TRUE 0.900 147.000 0.273 0.044 Y NA
 572640 572641 RPA3192 RPA3193     FALSE 0.499 187.000 0.308 NA   NA
 572641 572642 RPA3193 RPA3194     TRUE 0.972 0.000 0.538 NA   NA
 572642 572643 RPA3194 RPA3195     FALSE 0.008 289.000 0.000 1.000 N NA
 572644 572645 RPA3196 RPA3197     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 572646 572647 RPA3198 RPA3199     TRUE 0.637 106.000 0.400 NA   NA
 572647 572648 RPA3199 RPA3200     FALSE 0.012 89.000 0.000 NA   NA
 572648 572649 RPA3200 RPA3201     TRUE 0.947 5.000 0.275 1.000 N NA
 572649 572650 RPA3201 RPA3202     FALSE 0.001 731.000 0.000 1.000 N NA
 572650 572651 RPA3202 RPA3203   pccB FALSE 0.032 211.000 0.000 1.000 N NA
 572653 572654 RPA3205 RPA3206     TRUE 0.807 -3.000 0.025 1.000   NA
 572654 572655 RPA3206 RPA3207     FALSE 0.245 70.000 0.018 NA   NA
 572655 572656 RPA3207 RPA3208   rluC FALSE 0.008 418.000 0.024 NA N NA
 572656 572657 RPA3208 RPA3209 rluC   FALSE 0.006 205.000 0.000 NA   NA
 572657 572658 RPA3209 RPA3210     FALSE 0.025 46.000 0.000 NA   NA
 572659 572660 RPA3211 RPA3212     FALSE 0.041 29.000 0.000 NA   NA
 572660 572661 RPA3212 RPA3213     FALSE 0.131 1.000 0.000 NA   NA
 572661 572662 RPA3213 RPA3214     FALSE 0.133 0.000 0.000 NA   NA
 572662 572663 RPA3214 RPA3215     FALSE 0.010 138.000 0.000 NA   NA
 572663 572664 RPA3215 RPA3216     FALSE 0.035 205.000 0.000 1.000 N NA
 572665 572666 RPA3217 RPA3218     FALSE 0.011 106.000 0.000 NA   NA
 572666 572667 RPA3218 RPA3219     FALSE 0.016 70.000 0.000 NA   NA
 572667 572668 RPA3219 RPA3220     FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 572668 572669 RPA3220 RPA3221     FALSE 0.144 223.000 0.051 1.000 N NA
 572669 572670 RPA3221 RPA3222     FALSE 0.330 83.000 0.056 NA N NA
 572672 572673 RPA3224 RPA3225   rplQ FALSE 0.008 285.000 0.000 1.000 N NA
 572673 572674 RPA3225 RPA3226 rplQ rpoA TRUE 0.838 156.000 0.873 1.000 N NA
 572674 572675 RPA3226 RPA3227 rpoA rpsK TRUE 0.610 134.000 0.308 1.000 N NA
 572675 572676 RPA3227 RPA3228 rpsK rpsM TRUE 0.961 131.000 0.810 0.011 Y NA
 572676 572677 RPA3228 RPA3229 rpsM adk FALSE 0.162 185.000 0.009 1.000 N NA
 572677 572678 RPA3229 RPA3230 adk secY TRUE 0.765 -3.000 0.008 1.000 N NA
 572678 572679 RPA3230 RPA3231 secY rplO TRUE 0.803 153.000 0.730 1.000 N NA
 572679 572680 RPA3231 RPA3232 rplO rpmD TRUE 0.995 13.000 0.653 0.002 Y NA
 572680 572681 RPA3232 RPA3233 rpmD rpsE TRUE 0.978 59.000 0.789 0.014 Y NA
 572681 572682 RPA3233 RPA3234 rpsE rplR TRUE 0.978 61.000 0.814 0.014 Y NA
 572682 572683 RPA3234 RPA3235 rplR rplF TRUE 0.996 12.000 0.815 0.011 Y NA
 572683 572684 RPA3235 RPA3236 rplF rpsH TRUE 0.960 113.000 0.808 0.011 Y NA
 572684 572685 RPA3236 RPA3237 rpsH rpsN TRUE 0.986 16.000 0.295 0.011 Y NA
 572685 572686 RPA3237 RPA3238 rpsN rplE TRUE 0.964 44.000 0.309 0.011 Y NA
 572686 572687 RPA3238 RPA3239 rplE rplX TRUE 0.996 -7.000 0.758 0.011 Y NA
 572687 572688 RPA3239 RPA3240 rplX rplN TRUE 0.997 0.000 0.810 0.014 Y NA
 572688 572689 RPA3240 RPA3241 rplN rpsQ TRUE 0.976 64.000 0.791 0.014 Y NA
 572689 572690 RPA3241 RPA3242 rpsQ rpmC TRUE 0.995 13.000 0.828 0.011 Y NA
 572690 572691 RPA3242 RPA3243 rpmC rplP TRUE 0.997 6.000 0.802 0.011 Y NA
 572691 572692 RPA3243 RPA3244 rplP rpsC TRUE 0.988 36.000 0.828 0.014 Y NA
 572692 572693 RPA3244 RPA3245 rpsC rplV TRUE 0.968 23.000 0.109 0.014 Y NA
 572693 572694 RPA3245 RPA3246 rplV rpsS TRUE 0.984 11.000 0.119 0.014 Y NA
 572694 572695 RPA3246 RPA3247 rpsS rplB TRUE 0.996 12.000 0.820 0.014 Y NA
 572695 572696 RPA3247 RPA3248 rplB rplW TRUE 0.995 14.000 0.849 0.009 Y NA
 572696 572697 RPA3248 RPA3249 rplW rplD TRUE 0.996 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 572697 572698 RPA3249 RPA3250 rplD rplC TRUE 0.995 2.000 0.486 0.011 Y NA
 572698 572699 RPA3250 RPA3251 rplC rpsJ TRUE 0.958 51.000 0.307 0.014 Y NA
 572699 572700 RPA3251 RPA3252 rpsJ tufA TRUE 0.879 88.000 0.318 1.000 Y NA
 572700 572701 RPA3252 RPA3253 tufA fusA TRUE 0.954 39.000 0.102 0.001 Y NA
 572701 572702 RPA3253 RPA3254 fusA rpsG TRUE 0.927 31.000 0.114 1.000 Y NA
 572702 572703 RPA3254 RPA3255 rpsG rpsL TRUE 0.993 16.000 0.620 0.002 Y NA
 572707 572708 RPA3259 RPA3260     FALSE 0.012 406.000 0.000 0.077 N NA
 572710 572711 RPA3262 RPA3263   phnB FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 572713 572714 RPA3265 RPA3266     TRUE 0.675 120.000 0.438 1.000 N NA
 572714 572715 RPA3266 RPA3267   rpoC FALSE 0.006 303.000 0.000 1.000 N NA
 572715 572716 RPA3267 RPA3268 rpoC rpoB TRUE 0.905 137.000 0.851 0.001   NA
 572716 572717 RPA3268 RPA3269 rpoB rplL FALSE 0.027 466.000 0.223 1.000   NA
 572717 572718 RPA3269 RPA3270 rplL rplJ TRUE 0.983 56.000 0.884 0.011 Y NA
 572718 572719 RPA3270 RPA3271 rplJ   FALSE 0.001 902.000 0.000 1.000 N NA
 572719 572720 RPA3271 RPA3272   rplA FALSE 0.223 88.000 0.007 1.000 N NA
 572720 572721 RPA3272 RPA3273 rplA rplK TRUE 0.997 8.000 0.838 0.014 Y NA
 572721 572722 RPA3273 RPA3274 rplK nusG TRUE 0.571 223.000 0.681 1.000 N NA
 572722 572723 RPA3274 RPA3275 nusG secE TRUE 0.968 17.000 0.843 1.000 N NA
 572723 572724 RPA3275 RPA3276 secE   FALSE 0.011 265.000 0.000 1.000 N NA
 572724 572725 RPA3276 RPA3277   exbD TRUE 0.810 -3.000 0.000 0.098 N NA
 572725 572726 RPA3277 RPA3278 exbD exbB TRUE 0.941 15.000 0.000 0.064 Y NA
 572726 572727 RPA3278 RPA3279 exbB pigA FALSE 0.157 -3.000 0.000 NA N NA
 572727 572728 RPA3279 RPA3280 pigA hasR FALSE 0.534 105.000 0.000 NA Y NA
 572728 572729 RPA3280 RPA3281 hasR   TRUE 0.670 61.000 0.000 NA Y NA
 572729 572730 RPA3281 RPA3282     FALSE 0.014 143.000 0.000 NA N NA
 572730 5451039 RPA3282 RPA_RNA25   tRNA-Trp1 FALSE 0.001 349.000 0.000 NA   NA
 5451039 572732 RPA_RNA25 RPA3283 tRNA-Trp1 tuf FALSE 0.000 422.000 0.000 NA   NA
 572734 572735 RPA3285 RPA3286     FALSE 0.496 183.000 0.233 1.000 N NA
 572737 572738 RPA3288 RPA3289     TRUE 0.600 152.000 0.286 1.000   NA
 572740 572741 RPA3291 RPA3292     FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 572741 572742 RPA3292 RPA3293     FALSE 0.001 326.000 0.000 NA   NA
 572742 572743 RPA3293 RPA3294     TRUE 0.996 -3.000 0.628 0.027 Y NA
 572743 572744 RPA3294 RPA3295     TRUE 0.945 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 572744 572745 RPA3295 RPA3296     TRUE 0.967 5.000 0.000 0.052 Y NA
 572745 572746 RPA3296 RPA3297     TRUE 0.580 247.000 0.377 NA Y NA
 572746 572747 RPA3297 RPA3298     FALSE 0.000 446.000 0.000 NA   NA
 572747 572748 RPA3298 RPA3299     FALSE 0.011 164.000 0.000 NA   NA
 572748 572749 RPA3299 RPA3300     TRUE 0.958 -82.000 0.500 1.000 N NA
 572750 572751 RPA3301 RPA3302     TRUE 0.984 11.000 0.375 NA Y NA
 572751 572752 RPA3302 RPA3303     TRUE 0.992 -3.000 0.625 NA Y NA
 572752 572753 RPA3303 RPA3304   fabG3 TRUE 0.973 24.000 0.250 0.077 Y NA
 572753 572754 RPA3304 RPA3305 fabG3 paaG2 TRUE 0.919 21.000 0.000 0.077 Y NA
 572754 572755 RPA3305 RPA3306 paaG2 nirK1 FALSE 0.011 265.000 0.000 1.000 N NA
 572756 5451040 RPA3307 RPA_RNA24 xthA3 tRNA-Gly1 FALSE 0.009 179.000 0.000 NA   NA
 572758 572759 RPA3308 RPA3309     TRUE 0.862 15.000 0.200 NA   NA
 572759 572760 RPA3309 RPA3310   katE FALSE 0.010 144.000 0.000 NA   NA
 572760 572761 RPA3310 RPA3311 katE   FALSE 0.028 216.000 0.000 1.000 N NA
 572761 572762 RPA3311 RPA3312     TRUE 0.622 159.000 0.333 NA N NA
 572763 572764 RPA3313 RPA3314   degP FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 572765 572766 RPA3315 RPA3316     FALSE 0.001 1207.000 0.000 1.000   NA
 572767 572768 RPA3317 RPA3318     FALSE 0.325 12.000 0.000 1.000   NA
 572769 572770 RPA3319 RPA3320     FALSE 0.000 510.000 0.000 NA   NA
 572771 572772 RPA3321 RPA3322 algC manC FALSE 0.360 47.000 0.007 1.000 N NA
 572772 572773 RPA3322 RPA3323 manC   FALSE 0.003 237.000 0.000 NA   NA
 572773 572774 RPA3323 RPA3324     FALSE 0.001 342.000 0.000 NA   NA
 572775 572776 RPA3325 RPA3326     FALSE 0.000 389.000 0.000 NA   NA
 572776 572777 RPA3326 RPA3327     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 572778 572779 RPA3328 RPA3329     FALSE 0.002 379.000 0.000 1.000   NA
 572780 572781 RPA3330 RPA3331     FALSE 0.090 -15.000 0.000 NA   NA
 572781 572782 RPA3331 RPA3332     FALSE 0.037 33.000 0.000 NA   NA
 572782 572783 RPA3332 RPA3333   csgG TRUE 0.837 57.000 0.596 NA   NA
 572784 572785 RPA3334 RPA3335     FALSE 0.010 135.000 0.000 NA   NA
 572785 572786 RPA3335 RPA3336     FALSE 0.000 566.000 0.000 NA   NA
 572786 572787 RPA3336 RPA3337     FALSE 0.317 16.000 0.000 1.000 N NA
 572787 572788 RPA3337 RPA3338     TRUE 0.659 72.000 0.000 1.000 Y NA
 572788 572789 RPA3338 RPA3339   mcyE TRUE 0.990 -3.000 0.167 0.012 Y NA
 572789 572790 RPA3339 RPA3340 mcyE   TRUE 0.976 23.000 0.167 0.002 Y NA
 572791 572792 RPA3341 RPA3342     FALSE 0.070 76.000 0.000 1.000   NA
 572792 572793 RPA3342 RPA3343   mtfB FALSE 0.085 63.000 0.000 1.000   NA
 572793 572794 RPA3343 RPA3344 mtfB   FALSE 0.060 122.000 0.000 1.000 N NA
 572796 572797 RPA3346 RPA3347     TRUE 0.716 23.000 0.087 NA   NA
 572798 572799 RPA3348 RPA3349     FALSE 0.050 142.000 0.000 1.000   NA
 572800 572801 RPA3350 RPA3351     TRUE 0.645 76.000 0.000 1.000 Y NA
 572801 572802 RPA3351 RPA3352     TRUE 0.828 31.000 0.000 1.000 Y NA
 572804 572805 RPA3354 RPA3355     TRUE 0.851 59.000 0.667 NA   NA
 572805 572806 RPA3355 RPA3356     TRUE 0.814 57.000 0.500 NA   NA
 572806 572807 RPA3356 RPA3357     FALSE 0.000 902.000 0.000 NA   NA
 572807 572808 RPA3357 RPA3358     FALSE 0.000 724.000 0.000 NA   NA
 572809 572810 RPA3359 RPA3360   pssN TRUE 0.872 -3.000 0.087 NA   NA
 572811 572812 RPA3361 RPA3362     FALSE 0.003 229.000 0.000 NA   NA
 572813 5451041 RPA3363 RPA_RNA23   tRNA-Tyr1 FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 572816 572817 RPA3365 RPA3366     TRUE 0.902 58.000 1.000 NA   NA
 572819 572820 RPA3367 RPA3368     FALSE 0.010 125.000 0.000 NA   NA
 572821 572822 RPA3369 RPA3370     FALSE 0.010 115.000 0.000 NA   NA
 572823 572824 RPA3371 RPA3372     FALSE 0.499 180.000 0.273 NA   NA
 572824 572825 RPA3372 RPA3373     FALSE 0.012 93.000 0.000 NA   NA
 572827 572828 RPA3375 RPA3376     FALSE 0.099 -7.000 0.000 NA   NA
 572828 572829 RPA3376 RPA3377     FALSE 0.001 469.000 0.000 1.000   NA
 572829 572830 RPA3377 RPA3378     FALSE 0.000 478.000 0.000 NA   NA
 572830 572831 RPA3378 RPA3379     FALSE 0.000 368.000 0.000 NA   NA
 572832 572833 RPA3380 RPA3381     TRUE 0.907 18.000 0.357 NA   NA
 572835 572836 RPA3383 RPA3384     TRUE 0.993 -3.000 0.700 NA Y NA
 572836 572837 RPA3384 RPA3385   nrtC2 TRUE 0.963 -3.000 0.031 NA Y NA
 572837 572838 RPA3385 RPA3386 nrtC2   FALSE 0.088 61.000 0.000 1.000   NA
 572838 572839 RPA3386 RPA3387     FALSE 0.359 10.000 0.000 1.000   NA
 572842 572843 RPA3390 RPA3391 his3 gch1 TRUE 0.612 29.000 0.038 1.000 N NA
 572847 572848 RPA3395 RPA3396     FALSE 0.010 113.000 0.000 NA   NA
 572848 572849 RPA3396 RPA3397     TRUE 0.985 2.000 1.000 NA   NA
 572849 572850 RPA3397 RPA3398     FALSE 0.011 153.000 0.000 NA   NA
 572851 572852 RPA3399 RPA3400 cspA4   TRUE 0.736 101.000 0.600 NA   NA
 572852 572853 RPA3400 RPA3401     FALSE 0.026 44.000 0.000 NA   NA
 572854 572855 RPA3402 RPA3403     TRUE 0.789 5.000 0.038 NA   NA
 572861 572862 RPA3409 RPA3410     FALSE 0.056 95.000 0.000 1.000   NA
 572862 572863 RPA3410 RPA3411     FALSE 0.005 211.000 0.000 NA   NA
 572865 572866 RPA3413 RPA3414     TRUE 0.779 29.000 0.158 1.000   NA
 572868 572869 RPA3416 RPA3417     FALSE 0.053 238.000 0.005 1.000   NA
 572872 572873 RPA3420 RPA3421     FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 572875 572876 RPA3423 RPA3424     FALSE 0.000 424.000 0.000 NA   NA
 572877 572878 RPA3425 RPA3426     FALSE 0.390 60.000 0.050 NA   NA
 572880 572881 RPA3428 RPA3429   cysE2 TRUE 0.647 157.000 0.386 NA   NA
 572881 572882 RPA3429 RPA3430 cysE2   FALSE 0.255 221.000 0.200 NA   NA
 572882 572883 RPA3430 RPA3431     FALSE 0.491 170.000 0.226 NA   NA
 572884 572885 RPA3432 RPA3433     TRUE 0.952 19.000 0.745 NA   NA
 572885 572886 RPA3433 RPA3434     FALSE 0.003 393.000 0.000 1.000 N NA
 572886 572887 RPA3434 RPA3435     FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 572887 572888 RPA3435 RPA3436     TRUE 0.844 26.000 0.286 NA   NA
 572888 572889 RPA3436 RPA3437     FALSE 0.001 591.000 0.000 1.000   NA
 572890 5451043 RPA3438 RPA_RNA22   tRNA-Leu2 FALSE 0.002 264.000 0.000 NA   NA
 572892 572893 RPA3439 RPA3440     TRUE 0.910 -7.000 0.194 1.000   NA
 572893 572894 RPA3440 RPA3441     FALSE 0.501 93.000 0.148 1.000 N NA
 572895 572896 RPA3442 RPA3443     TRUE 0.769 27.000 0.171 NA   NA
 572898 572899 RPA3445 RPA3446     TRUE 0.888 161.000 0.400 1.000 Y NA
 572899 572900 RPA3446 RPA3447     TRUE 0.925 34.000 0.128 1.000 Y NA
 572900 572901 RPA3447 RPA3448     TRUE 0.988 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 572901 572902 RPA3448 RPA3449     TRUE 0.781 -3.000 0.032 NA   NA
 572902 572903 RPA3449 RPA3450     FALSE 0.001 279.000 0.000 NA   NA
 572903 572904 RPA3450 RPA3451     FALSE 0.365 160.000 0.065 1.000 N NA
 572904 572905 RPA3451 RPA3452     TRUE 0.621 74.000 0.250 NA N NA
 572906 572907 RPA3453 RPA3454     FALSE 0.061 125.000 0.000 1.000 N NA
 572908 572909 RPA3455 RPA3456     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 572910 572911 RPA3457 RPA3458     FALSE 0.008 184.000 0.000 NA   NA
 572911 572912 RPA3458 RPA3459     TRUE 0.952 28.000 1.000 NA   NA
 572912 572913 RPA3459 RPA3460     FALSE 0.507 121.000 0.250 NA   NA
 572914 572915 RPA3461 RPA3462     TRUE 0.978 -3.000 0.714 NA   NA
 572915 572916 RPA3462 RPA3463     FALSE 0.497 104.000 0.214 NA N NA
 572918 572919 RPA3465 RPA3466     TRUE 0.947 21.000 0.111 1.000 Y NA
 572919 572920 RPA3466 RPA3467     FALSE 0.135 249.000 0.111 1.000 N NA
 572920 572921 RPA3467 RPA3468     TRUE 0.842 134.000 0.273 1.000 Y NA
 572921 572922 RPA3468 RPA3469     TRUE 0.996 -7.000 0.917 0.052 Y NA
 572922 572923 RPA3469 RPA3470     FALSE 0.490 218.000 0.000 0.052 Y NA
 572923 572924 RPA3470 RPA3471     TRUE 0.928 77.000 0.300 0.052 Y NA
 572925 572926 RPA3472 RPA3473 ilvD1 ucpA TRUE 0.602 134.000 0.143 0.075 N NA
 572926 572927 RPA3473 RPA3474 ucpA fabG4 TRUE 0.924 84.000 0.333 0.075 Y NA
 572928 572929 RPA3475 RPA3476     FALSE 0.002 430.000 0.000 1.000 N NA
 572929 572930 RPA3476 RPA3477   exbD5 TRUE 0.868 105.000 0.818 0.096 N NA
 572930 572931 RPA3477 RPA3478 exbD5 exbB5 TRUE 0.991 4.000 0.273 0.062 Y NA
 572931 572932 RPA3478 RPA3479 exbB5   TRUE 0.743 204.000 1.000 1.000   NA
 572932 572933 RPA3479 RPA3480   fiu TRUE 0.944 26.000 0.750 1.000   NA
 572933 572934 RPA3480 RPA3481 fiu   FALSE 0.000 464.000 0.000 NA   NA
 572935 572936 RPA3482 RPA3483     TRUE 0.966 3.000 0.458 NA N NA
 572939 572940 RPA3485 RPA3486     FALSE 0.013 110.000 0.000 NA N NA
 572940 572941 RPA3486 RPA3487     FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 572941 572942 RPA3487 RPA3488     TRUE 0.697 6.000 0.013 NA   NA
 572942 572943 RPA3488 RPA3489     FALSE 0.249 215.000 0.150 NA   NA
 572943 572944 RPA3489 RPA3490   hflC FALSE 0.269 243.000 0.348 NA   NA
 572944 572945 RPA3490 RPA3491 hflC hflK TRUE 0.998 -3.000 0.947 0.010 Y NA
 572945 572946 RPA3491 RPA3492 hflK dyr FALSE 0.278 145.000 0.037 1.000 N NA
 572946 572947 RPA3492 RPA3493 dyr thyA TRUE 0.917 -3.000 0.134 1.000 N NA
 572947 572948 RPA3493 RPA3494 thyA   FALSE 0.162 172.000 0.004 1.000   NA
 572948 572949 RPA3494 RPA3495     FALSE 0.501 102.000 0.222 NA   NA
 572949 572950 RPA3495 RPA3496     TRUE 0.979 11.000 1.000 NA   NA
 572950 572951 RPA3496 RPA3497     FALSE 0.444 73.000 0.094 NA   NA
 572951 572952 RPA3497 RPA3498     TRUE 0.995 -3.000 0.357 0.001 Y NA
 572953 572954 RNA_56 RPA3499 tmRNA   FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 572954 572955 RPA3499 RPA3500   fumC2 FALSE 0.265 106.000 0.054 NA   NA
 572955 572956 RPA3500 RPA3501 fumC2   FALSE 0.000 450.000 0.000 NA   NA
 572957 572958 RPA3502 RPA3503     FALSE 0.437 136.000 0.156 NA N NA
 572961 572962 RPA3506 RPA3507 uvrD   TRUE 0.712 0.000 0.010 NA   NA
 572962 572963 RPA3507 RPA3508     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 572963 572964 RPA3508 RPA3509     TRUE 0.978 3.000 0.411 0.089 N NA
 572968 572969 RPA3513 RPA3514     FALSE 0.001 770.000 0.000 1.000 N NA
 572969 572970 RPA3514 RPA3515     FALSE 0.011 415.000 0.027 1.000 N NA
 572970 572971 RPA3515 RPA3516     FALSE 0.012 373.000 0.013 1.000 N NA
 572974 572975 RPA3519 RPA3520 recN   TRUE 0.857 13.000 0.117 1.000   NA
 572975 572976 RPA3520 RPA3521   lpxC FALSE 0.144 227.000 0.064 1.000   NA
 572976 572977 RPA3521 RPA3522 lpxC ftsZ FALSE 0.137 254.000 0.134 1.000 N NA
 572977 572978 RPA3522 RPA3523 ftsZ ftsA TRUE 0.792 94.000 0.114 1.000 Y NA
 572978 572979 RPA3523 RPA3524 ftsA ftsQ TRUE 0.905 -3.000 0.137 NA N NA
 572979 572980 RPA3524 RPA3525 ftsQ ddlA FALSE 0.320 319.000 0.372 NA Y NA
 572980 572981 RPA3525 RPA3526 ddlA   FALSE 0.125 110.000 0.005 NA   NA
 572983 572984 RPA3528 RPA3529 murB murC TRUE 0.948 41.000 0.108 0.003 Y NA
 572984 572985 RPA3529 RPA3530 murC murG TRUE 0.845 137.000 0.283 1.000 Y NA
 572985 572986 RPA3530 RPA3531 murG ftsW TRUE 0.977 5.000 0.647 1.000 N NA
 572986 572987 RPA3531 RPA3532 ftsW murD FALSE 0.459 242.000 0.297 0.002 N NA
 572987 572988 RPA3532 RPA3533 murD mraY TRUE 0.941 188.000 0.647 0.003 Y NA
 572988 572989 RPA3533 RPA3534 mraY murF TRUE 0.991 11.000 0.309 0.003 Y NA
 572989 572990 RPA3534 RPA3535 murF murE TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 572990 572991 RPA3535 RPA3536 murE   TRUE 0.696 113.000 0.043 1.000 Y NA
 572991 572992 RPA3536 RPA3537     TRUE 0.930 -3.000 0.228 NA   NA
 572992 572993 RPA3537 RPA3538     TRUE 0.873 -3.000 0.089 NA   NA
 572994 572995 RPA3539 RNA_59   rnpB FALSE 0.018 63.000 0.000 NA   NA
 572996 572997 RPA3540 RPA3541     TRUE 0.958 2.000 0.375 NA   NA
 572997 572998 RPA3541 RPA3542   emrB1 FALSE 0.436 49.000 0.048 NA   NA
 572998 572999 RPA3542 RPA3543 emrB1   TRUE 0.751 151.000 0.586 1.000   NA
 573001 573002 RPA3545 RPA3546     FALSE 0.385 58.000 0.045 NA   NA
 573002 573003 RPA3546 RPA3547     FALSE 0.009 182.000 0.000 NA   NA
 573003 573004 RPA3547 RPA3548     FALSE 0.034 36.000 0.000 NA   NA
 573005 573006 RPA3549 RPA3550     FALSE 0.019 365.000 0.000 0.039   NA
 573006 573007 RPA3550 RPA3551     TRUE 0.815 -3.000 0.000 0.075   NA
 573007 573008 RPA3551 RPA3552     TRUE 0.844 -3.000 0.000 0.043   NA
 573009 573010 RPA3553 RPA3554   arsC2 TRUE 0.830 164.000 0.222 1.000 Y NA
 573010 573011 RPA3554 RPA3555 arsC2 arsC3 TRUE 0.980 0.000 0.273 0.001 N NA
 573011 573012 RPA3555 RPA3556 arsC3 arsR2 TRUE 0.910 -7.000 0.182 1.000 N NA
 573012 573013 RPA3556 RPA3557 arsR2   FALSE 0.022 55.000 0.000 NA   NA
 573013 573014 RPA3557 RPA3558     TRUE 0.799 12.000 0.073 NA   NA
 573014 573015 RPA3558 RPA3559   arsR3 TRUE 0.831 -3.000 0.056 NA   NA
 573016 573017 RPA3560 RPA3561     FALSE 0.014 238.000 0.000 1.000   NA
 573017 573018 RPA3561 RPA3562     FALSE 0.397 -10.000 0.000 1.000 N NA
 573019 573020 RPA3563 RPA3564     FALSE 0.002 251.000 0.000 NA   NA
 573021 573022 RPA3565 RPA3566     FALSE 0.007 190.000 0.000 NA   NA
 573022 573023 RPA3566 RPA3567     FALSE 0.011 157.000 0.000 NA   NA
 573024 573025 RPA3568 RPA3569     FALSE 0.001 288.000 0.000 NA   NA
 573026 573027 RPA3570 RPA3571     TRUE 0.995 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 573029 573030 RPA3573 RPA3574 thiO thiS TRUE 0.947 -9.000 0.351 1.000 N NA
 573030 573031 RPA3574 RPA3575 thiS thiG FALSE 0.380 253.000 0.095 1.000 Y NA
 573031 573032 RPA3575 RPA3576 thiG thiE TRUE 0.963 -13.000 0.000 0.005 Y NA
 573032 573033 RPA3576 RPA3577 thiE thiC FALSE 0.446 235.000 0.000 0.005 Y NA
 573033 573034 RPA3577 RPA3578 thiC   FALSE 0.010 171.000 0.000 NA   NA
 573034 573035 RPA3578 RPA3579     FALSE 0.002 258.000 0.000 NA   NA
 573035 573036 RPA3579 RPA3580     TRUE 0.943 -3.000 0.077 0.037   NA
 573037 573038 RPA3581 RPA3582     FALSE 0.010 121.000 0.000 NA   NA
 573038 573039 RPA3582 RPA3583     TRUE 0.967 -12.000 0.667 NA   NA
 573041 573042 RPA3585 RPA3586     FALSE 0.001 308.000 0.000 NA   NA
 573047 573048 RPA3591 RPA3592     FALSE 0.004 220.000 0.000 NA   NA
 573048 573049 RPA3592 RPA3593     FALSE 0.011 106.000 0.000 NA   NA
 573052 573053 RPA3596 RPA3597     TRUE 0.865 -13.000 0.135 NA   NA
 573054 573055 RPA3598 RPA3599     FALSE 0.010 138.000 0.000 NA   NA
 573057 573058 RPA3601 RPA3602     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 573059 573060 RPA3603 RPA3604     TRUE 0.802 -630.000 0.078 NA   NA
 573060 573061 RPA3604 RPA3605     FALSE 0.243 175.000 0.051 NA   NA
 573062 573063 RPA3606 RPA3607     FALSE 0.001 290.000 0.000 NA   NA
 573063 573064 RPA3607 RPA3608     TRUE 0.924 -3.000 0.210 NA   NA
 573069 573070 RPA3613 RPA3614     TRUE 0.740 117.000 0.111 NA Y NA
 573070 573071 RPA3614 RPA3615     FALSE 0.250 146.000 0.046 NA   NA
 573072 573073 RPA3616 RPA3617     FALSE 0.050 170.000 0.000 1.000   NA
 573073 573074 RPA3617 RPA3618     FALSE 0.245 115.000 0.030 1.000   NA
 573074 573075 RPA3618 RPA3619   vanA FALSE 0.002 418.000 0.000 1.000   NA
 573075 573076 RPA3619 RPA3620 vanA vanR TRUE 0.950 4.000 0.277 1.000 N NA
 573076 573077 RPA3620 RPA3621 vanR vanB TRUE 0.894 31.000 0.450 1.000 N NA
 573078 573079 RPA3622 RPA3623     FALSE 0.249 140.000 0.048 NA   NA
 573079 573080 RPA3623 RPA3624     FALSE 0.354 149.000 0.067 1.000 N NA
 573082 573083 RPA3626 RPA3627     TRUE 0.857 -3.000 0.075 NA   NA
 573083 573084 RPA3627 RPA3628     TRUE 0.736 19.000 0.054 1.000 N NA
 573084 573085 RPA3628 RPA3629     TRUE 0.687 72.000 0.333 NA   NA
 573088 573089 RPA3632 RPA3633     FALSE 0.056 20.000 0.000 NA   NA
 573089 573090 RPA3633 RPA3634   tal FALSE 0.257 144.000 0.051 NA   NA
 573090 573091 RPA3634 RPA3635 tal gnd TRUE 0.871 187.000 0.208 0.002 Y NA
 573091 573092 RPA3635 RPA3636 gnd zwf TRUE 0.979 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 573092 573093 RPA3636 RPA3637 zwf pgl TRUE 0.980 3.000 0.130 1.000 Y NA
 573093 573094 RPA3637 RPA3638 pgl   TRUE 0.965 -31.000 0.087 1.000 Y NA
 573094 573095 RPA3638 RPA3639   cof TRUE 0.684 124.000 0.462 1.000   NA
 573096 573097 RPA3640 RPA3641   malQ TRUE 0.984 5.000 0.242 1.000 Y NA
 573098 573099 RPA3642 RPA3643     TRUE 0.982 11.000 0.544 0.003   NA
 573099 573100 RPA3643 RPA3644   glgB TRUE 0.985 -3.000 0.049 0.003 Y NA
 573100 573101 RPA3644 RPA3645 glgB glgX TRUE 0.881 239.000 0.812 0.002 Y NA
 573101 573102 RPA3645 RPA3646 glgX   TRUE 0.987 -3.000 0.067 0.002 Y NA
 573102 573103 RPA3646 RPA3647     TRUE 0.993 0.000 0.263 0.003 Y NA
 573108 573109 RPA3652 RPA3653     FALSE 0.287 61.000 0.021 NA   NA
 573111 573112 RPA3655 RPA3656     FALSE 0.516 79.000 0.136 1.000   NA
 573114 573115 RPA3658 RPA3659 ureF   FALSE 0.002 430.000 0.000 1.000   NA
 573115 573116 RPA3659 RPA3660   ureC FALSE 0.099 214.000 0.010 1.000   NA
 573116 573117 RPA3660 RPA3661 ureC   TRUE 0.793 -3.000 0.019 1.000   NA
 573117 573118 RPA3661 RPA3662   ureB TRUE 0.828 0.000 0.029 1.000   NA
 573118 573119 RPA3662 RPA3663 ureB ureA TRUE 0.958 162.000 0.595 0.001 Y NA
 573119 573120 RPA3663 RPA3664 ureA ureD TRUE 0.942 47.000 0.664 0.003 N NA
 573120 573121 RPA3664 RPA3665 ureD   FALSE 0.405 199.000 0.221 1.000 N NA
 573121 573122 RPA3665 RPA3666     TRUE 0.724 220.000 0.731 0.026   NA
 573122 573123 RPA3666 RPA3667     TRUE 0.983 -3.000 0.823 1.000   NA
 573123 573124 RPA3667 RPA3668     TRUE 0.969 74.000 0.758 0.051 Y NA
 573124 573125 RPA3668 RPA3669     TRUE 0.911 110.000 0.654 NA Y NA
 573126 573127 RPA3670 RPA3671   infA TRUE 0.920 25.000 0.055 1.000 Y NA
 573127 573128 RPA3671 RPA3672 infA cspA5 FALSE 0.017 240.000 0.000 1.000 N NA
 573129 573130 RPA3673 RPA3674     TRUE 0.969 13.000 0.194 NA Y NA
 573131 573132 RPA3675 RPA3676     FALSE 0.074 328.000 0.000 NA Y NA
 573132 573133 RPA3676 RPA3677     TRUE 0.557 107.000 0.292 NA   NA
 573133 573134 RPA3677 RPA3678     TRUE 0.948 15.000 0.583 NA   NA
 573134 573135 RPA3678 RPA3679     TRUE 0.927 20.000 0.500 NA N NA
 573135 573136 RPA3679 RPA3680     TRUE 0.965 -3.000 0.462 NA N NA
 573136 573137 RPA3680 RPA3681     TRUE 0.875 93.000 0.324 1.000 Y NA
 573137 573138 RPA3681 RPA3682     TRUE 0.989 13.000 0.618 1.000 Y NA
 573138 573139 RPA3682 RPA3683     TRUE 0.996 9.000 0.818 0.010 Y NA
 573141 573142 RPA3685 RPA3686     TRUE 0.949 -7.000 0.408 NA   NA
 573143 573144 RPA3687 RPA3688     TRUE 0.828 8.000 0.046 1.000   NA
 573144 573145 RPA3688 RPA3689     TRUE 0.979 6.000 0.744 1.000   NA
 573145 573146 RPA3689 RPA3690     TRUE 0.991 0.000 0.882 0.051   NA
 573146 573147 RPA3690 RPA3691     TRUE 0.988 2.000 0.711 0.051   NA
 573147 573148 RPA3691 RPA3692     TRUE 0.988 15.000 0.391 0.051 Y NA
 573148 573149 RPA3692 RPA3693     FALSE 0.119 249.000 0.087 1.000 N NA
 573150 573151 RPA3694 RPA3695 kdsB   FALSE 0.480 72.000 0.083 1.000 N NA
 573153 573154 RPA3697 RPA3698 emrA emrB2 TRUE 0.906 -3.000 0.107 1.000 N NA
 573154 573155 RPA3698 RPA3699 emrB2   FALSE 0.306 17.000 0.000 1.000 N NA
 573157 573158 RPA3701 RPA3702 metF metH TRUE 0.976 13.000 0.037 0.002 Y NA
 573158 573159 RPA3702 RPA3703 metH   FALSE 0.010 176.000 0.000 NA   NA
 573159 573160 RPA3703 RPA3704     FALSE 0.000 677.000 0.000 NA   NA
 573162 573163 RPA3706 RPA3707 nasT   TRUE 0.966 -3.000 0.466 NA N NA
 573163 573164 RPA3707 RPA3708     FALSE 0.076 19.000 0.000 NA N NA
 573164 573165 RPA3708 RPA3709     FALSE 0.138 354.000 0.000 0.001 Y NA
 573165 573166 RPA3709 RPA3710   nirA TRUE 0.569 43.000 0.000 0.010 N NA
 573166 573167 RPA3710 RPA3711 nirA   TRUE 0.996 -3.000 0.640 0.063 Y NA
 573168 573169 RPA3712 RPA3713 pimE pimD FALSE 0.011 150.000 0.000 NA   NA
 573169 573170 RPA3713 RPA3714 pimD pimC TRUE 0.957 169.000 0.688 0.007 Y NA
 573170 573171 RPA3714 RPA3715 pimC pimB TRUE 0.752 215.000 0.364 1.000 Y NA
 573171 573172 RPA3715 RPA3716 pimB pimA TRUE 0.977 32.000 0.667 1.000 Y NA
 573172 573173 RPA3716 RPA3717 pimA pimF TRUE 0.862 179.000 0.400 1.000 Y NA
 573174 573175 RPA3718 RPA3719   ilvG TRUE 0.880 31.000 0.389 1.000 N NA
 573175 573176 RPA3719 RPA3720 ilvG ilvF TRUE 0.995 -3.000 0.533 0.026 Y NA
 573176 573177 RPA3720 RPA3721 ilvF   TRUE 0.989 11.000 0.500 1.000 Y NA
 573177 573178 RPA3721 RPA3722   ilvM TRUE 0.997 3.000 0.857 0.051 Y NA
 573178 573179 RPA3722 RPA3723 ilvM   TRUE 0.668 199.000 0.143 NA Y NA
 573179 573180 RPA3723 RPA3724   ilvK TRUE 0.913 181.000 0.800 NA Y NA
 573180 573181 RPA3724 RPA3725 ilvK ilvJ FALSE 0.057 348.000 0.000 NA Y NA
 573183 573184 RPA3727 RPA3728     FALSE 0.046 189.000 0.000 1.000 N NA
 573186 573187 RPA3730 RPA3731     FALSE 0.437 0.000 0.000 1.000   NA
 573188 573189 RPA3732 RPA3733 argD1   FALSE 0.021 332.000 0.020 1.000 N NA
 573190 573191 RPA3734 RPA3735 lytB1   TRUE 0.803 40.000 0.293 1.000   NA
 573192 573193 RPA3736 RPA3737 pstS2   TRUE 0.753 34.000 0.154 1.000   NA
 573195 573196 RPA3739 RPA3740   sqhC TRUE 0.977 -3.000 0.633 1.000 N NA
 573196 573197 RPA3740 RPA3741 sqhC   TRUE 0.823 34.000 0.269 1.000   NA
 573197 573198 RPA3741 RPA3742     TRUE 0.958 0.000 0.315 1.000   NA
 573198 573199 RPA3742 RPA3743     TRUE 0.993 -3.000 0.255 0.001 Y NA
 573199 573200 RPA3743 RPA3744     FALSE 0.134 205.000 0.020 1.000   NA
 573202 573203 RPA3746 RPA3747   eutC FALSE 0.121 208.000 0.016 1.000   NA
 573203 573204 RPA3747 RPA3748 eutC   TRUE 0.823 8.000 0.039 1.000 N NA
 573204 573205 RPA3748 RPA3749   eutB FALSE 0.022 228.000 0.000 1.000 N NA
 573205 573206 RPA3749 RPA3750 eutB   FALSE 0.361 62.000 0.022 1.000 N NA
 573206 573207 RPA3750 RPA3751     TRUE 0.637 54.000 0.185 NA   NA
 573207 573208 RPA3751 RPA3752     FALSE 0.006 204.000 0.000 NA   NA
 573208 573209 RPA3752 RPA3753     TRUE 0.978 -3.000 0.734 NA   NA
 573209 573210 RPA3753 RPA3754     TRUE 0.930 26.000 0.667 NA   NA
 573210 573211 RPA3754 RPA3755   hpcH FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 573211 573212 RPA3755 RPA3756 hpcH   FALSE 0.461 184.000 0.206 1.000 N NA
 573212 573213 RPA3756 RPA3757     TRUE 0.725 41.000 0.176 1.000 N NA
 573214 573215 RPA3758 RPA3759 hpcG hpcD TRUE 0.724 21.000 0.058 1.000 N NA
 573215 573216 RPA3759 RPA3760 hpcD hpcC TRUE 0.932 -7.000 0.252 1.000 N NA
 573216 573217 RPA3760 RPA3761 hpcC   FALSE 0.430 197.000 0.245 1.000   NA
 573217 573218 RPA3761 RPA3762     FALSE 0.443 131.000 0.138 1.000   NA
 573218 573219 RPA3762 RPA3763   ilvB TRUE 0.843 29.000 0.261 1.000 N NA
 573220 573221 RPA3764 RPA3765   paaD TRUE 0.965 9.000 0.571 NA   NA
 573221 573222 RPA3765 RPA3766 paaD paaC TRUE 0.979 -6.000 0.919 NA   NA
 573222 573223 RPA3766 RPA3767 paaC paaB TRUE 0.812 117.000 0.943 NA   NA
 573223 573224 RPA3767 RPA3768 paaB paaA TRUE 0.808 173.000 0.920 NA   NA
 573226 573227 RPA3770 RPA3771     FALSE 0.005 212.000 0.000 NA   NA
 573227 573228 RPA3771 RPA3772     FALSE 0.024 49.000 0.000 NA   NA
 573228 573229 RPA3772 RPA3773     TRUE 0.763 19.000 0.095 NA   NA
 573229 573230 RPA3773 RPA3774     FALSE 0.449 91.000 0.143 NA   NA
 573230 573231 RPA3774 RPA3775     FALSE 0.300 279.000 0.625 1.000 N NA
 573231 573232 RPA3775 RPA3776     TRUE 0.706 142.000 0.304 0.094 N NA
 573232 573233 RPA3776 RPA3777     TRUE 0.976 2.000 0.565 1.000 N NA
 573234 573235 RPA3778 RPA3779     FALSE 0.010 172.000 0.000 NA   NA
 573238 573239 RPA3782 RPA3783     FALSE 0.461 125.000 0.161 1.000   NA
 573239 573240 RPA3783 RPA3784     TRUE 0.909 8.000 0.153 1.000   NA
 573241 573242 RPA3785 RPA3786     FALSE 0.011 146.000 0.000 NA   NA
 573242 573243 RPA3786 RPA3787     TRUE 0.582 98.000 0.300 NA   NA
 573244 573245 RPA3788 RPA3789     TRUE 0.986 -3.000 0.671 0.087 N NA
 573245 573246 RPA3789 RPA3790     TRUE 0.994 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 573246 573247 RPA3790 RPA3791     TRUE 0.910 -3.000 0.117 1.000 N NA
 573247 573248 RPA3791 RPA3792     FALSE 0.093 71.000 0.000 1.000 N NA
 573248 573249 RPA3792 RPA3793     FALSE 0.000 388.000 0.000 NA   NA
 573249 573250 RPA3793 RPA3794     FALSE 0.472 62.000 0.086 NA   NA
 573250 573251 RPA3794 RPA3795     FALSE 0.011 149.000 0.000 NA   NA
 573253 573254 RPA3797 RPA3798     TRUE 0.963 -3.000 0.447 NA   NA
 573254 573255 RPA3798 RPA3799     TRUE 0.900 31.000 0.533 NA   NA
 573255 573256 RPA3799 RPA3800     TRUE 0.835 36.000 0.355 NA   NA
 573256 573257 RPA3800 RPA3801     FALSE 0.175 326.000 0.645 NA   NA
 573257 573258 RPA3801 RPA3802     TRUE 0.849 20.000 0.200 1.000   NA
 573258 573259 RPA3802 RPA3803     TRUE 0.975 76.000 0.800 0.002 Y NA
 573259 573260 RPA3803 RPA3804     TRUE 0.707 176.000 0.600 NA   NA
 573260 573261 RPA3804 RPA3805     FALSE 0.340 196.000 0.182 NA   NA
 573262 573263 RPA3806 RPA3807 livH livM TRUE 0.990 13.000 0.406 0.050 Y NA
 573263 573264 RPA3807 RPA3808 livM livG TRUE 0.990 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 573264 573265 RPA3808 RPA3809 livG livF TRUE 0.964 137.000 0.881 0.026 Y NA
 573265 573266 RPA3809 RPA3810 livF livK TRUE 0.747 179.000 0.119 1.000 Y NA
 573267 573268 RPA3811 RPA3812     FALSE 0.009 279.000 0.000 1.000 N NA
 573274 573275 RPA3818 RPA3819 purL   FALSE 0.020 57.000 0.000 NA   NA
 573275 573276 RPA3819 RPA3820     FALSE 0.048 24.000 0.000 NA   NA
 573276 573277 RPA3820 RPA3821   purC2 TRUE 0.871 182.000 0.460 1.000 Y NA
 573278 573279 RPA3822 RPA3823     FALSE 0.000 572.000 0.000 NA   NA
 573280 573281 RPA3824 RPA3825     FALSE 0.060 89.000 0.000 1.000   NA
 573282 573283 RPA3826 RPA3827     TRUE 0.977 4.000 0.679 NA   NA
 573283 573284 RPA3827 RPA3828     FALSE 0.010 125.000 0.000 NA   NA
 573285 573286 RPA3829 RPA3830     FALSE 0.102 13.000 0.000 NA N NA
 573286 573287 RPA3830 RPA3831     FALSE 0.029 40.000 0.000 NA   NA
 573287 573288 RPA3831 RPA3832     FALSE 0.012 95.000 0.000 NA   NA
 573288 573289 RPA3832 RPA3833   rrm2 FALSE 0.065 103.000 0.000 1.000 N NA
 573291 573292 RPA3835 RPA3836     FALSE 0.001 953.000 0.000 1.000   NA
 573292 573293 RPA3836 RPA3837     TRUE 0.943 -3.000 0.077 0.036   NA
 573294 573295 RPA3838 RPA3839   pchR FALSE 0.049 171.000 0.000 1.000   NA
 573295 573296 RPA3839 RPA3840 pchR   FALSE 0.472 141.000 0.154 1.000 N NA
 573296 573297 RPA3840 RPA3841     FALSE 0.053 21.000 0.000 NA   NA
 573297 573298 RPA3841 RPA3842     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 573300 573301 RPA3844 RPA3845 kefB   FALSE 0.003 230.000 0.000 NA   NA
 573302 573303 RPA3846 RPA3847   alaS FALSE 0.431 2.000 0.000 1.000   NA
 573304 573305 RPA3848 RPA3849 gcvT2   TRUE 0.990 10.000 0.202 0.001 Y NA
 573305 573306 RPA3849 RPA3850   gcvP TRUE 0.787 102.000 0.130 1.000 Y NA
 573307 573308 RPA3851 RPA3852 recA   FALSE 0.014 417.000 0.000 0.036   NA
 573309 573310 RPA3853 RPA3854     FALSE 0.011 151.000 0.000 NA   NA
 573310 573311 RPA3854 RPA3855     FALSE 0.001 341.000 0.000 NA   NA
 573311 573312 RPA3855 RPA3856     FALSE 0.124 4.000 0.000 NA   NA
 573316 573317 RPA3860 RPA3861     FALSE 0.000 385.000 0.000 NA   NA
 573318 573319 RPA3862 RPA3863     FALSE 0.042 28.000 0.000 NA   NA
 573319 573320 RPA3863 RPA3864     TRUE 0.764 74.000 0.500 NA   NA
 573324 573325 RPA3868 RPA3869     FALSE 0.433 73.000 0.069 1.000   NA
 573328 573329 RPA3872 RPA3873     FALSE 0.011 151.000 0.000 NA   NA
 573332 573333 RPA3876 RPA3877 fumA   FALSE 0.000 1551.000 0.000 NA   NA
 573334 573335 RPA3878 RPA3879     FALSE 0.000 529.000 0.000 NA   NA
 573336 573337 RPA3880 RPA3881     FALSE 0.266 121.000 0.040 1.000   NA
 573337 573338 RPA3881 RPA3882   cckA FALSE 0.021 339.000 0.035 1.000   NA
 573338 573339 RPA3882 RPA3883 cckA flhB TRUE 0.639 104.000 0.200 0.094 N NA
 573339 573340 RPA3883 RPA3884 flhB fliR TRUE 0.983 27.000 0.788 1.000 Y NA
 573340 573341 RPA3884 RPA3885 fliR fliQ TRUE 0.972 107.000 0.929 0.001 Y NA
 573341 573342 RPA3885 RPA3886 fliQ   TRUE 0.896 158.000 0.444 1.000 Y NA
 573342 573343 RPA3886 RPA3887   flgC TRUE 0.984 36.000 0.556 0.003 Y NA
 573343 573344 RPA3887 RPA3888 flgC   TRUE 0.966 22.000 0.066 0.003 Y NA
 573345 573346 RPA3889 RPA3890   fliP TRUE 0.964 -3.000 0.414 1.000   NA
 573349 573350 RPA3893 RPA3894     FALSE 0.228 26.000 0.000 1.000 N NA
 573350 573351 RPA3894 RPA3895     FALSE 0.009 178.000 0.000 NA   NA
 573351 573352 RPA3895 RPA3896     TRUE 0.956 -3.000 0.381 NA   NA
 573352 573353 RPA3896 RPA3897   fliM TRUE 0.867 -3.000 0.083 NA   NA
 573353 573354 RPA3897 RPA3898 fliM fliL TRUE 0.994 7.000 0.323 0.001 Y NA
 573355 573356 RPA3899 RPA3900 flgF flgG TRUE 0.991 13.000 0.353 0.001 Y NA
 573356 573357 RPA3900 RPA3901 flgG   TRUE 0.986 13.000 0.529 NA Y NA
 573357 573358 RPA3901 RPA3902   flgH TRUE 0.992 6.000 0.652 NA Y NA
 573359 573360 RPA3903 RPA3904 mexD3 mexC3 TRUE 0.976 13.000 0.909 1.000 N NA
 573361 573362 RPA3905 RPA3906     FALSE 0.007 197.000 0.000 NA   NA
 573363 573364 RPA3907 RPA3908 dksA   FALSE 0.324 121.000 0.086 NA   NA
 573365 573366 RPA3909 RPA3910 flgI   TRUE 0.938 -3.000 0.261 NA   NA
 573366 573367 RPA3910 RPA3911     TRUE 0.866 18.000 0.239 NA   NA
 573367 573368 RPA3911 RPA3912     FALSE 0.522 180.000 0.300 NA   NA
 573369 573370 RPA3913 RPA3914     TRUE 0.939 4.000 0.263 NA   NA
 573370 573371 RPA3914 RPA3915     FALSE 0.358 216.000 0.000 1.000 Y NA
 573373 573374 RPA3917 RPA3918     FALSE 0.203 24.000 0.000 1.000   NA
 573374 573375 RPA3918 RPA3919     FALSE 0.417 -3.000 0.000 1.000   NA
 573375 573376 RPA3919 RPA3920     TRUE 0.995 -3.000 0.438 0.012 Y NA
 573376 573377 RPA3920 RPA3921     TRUE 0.913 6.000 0.143 1.000 N NA
 573377 573378 RPA3921 RPA3922     TRUE 0.719 151.000 0.047 1.000 Y NA
 573378 573379 RPA3922 RPA3923     TRUE 0.979 11.000 0.026 0.001 Y NA
 573379 573380 RPA3923 RPA3924     TRUE 0.883 -3.000 0.005 0.073   NA
 573380 573381 RPA3924 RPA3925     TRUE 0.882 9.000 0.103 1.000   NA
 573381 573382 RPA3925 RPA3926     TRUE 0.989 -3.000 0.111 0.003 Y NA
 573382 573383 RPA3926 RPA3927     FALSE 0.062 142.000 0.000 1.000 N NA
 573383 573384 RPA3927 RPA3928     FALSE 0.010 123.000 0.000 NA   NA
 573384 573385 RPA3928 RPA3929     FALSE 0.010 114.000 0.000 NA   NA
 573385 573386 RPA3929 RPA3930     FALSE 0.054 308.000 0.000 0.001   NA
 573386 573387 RPA3930 RPA3931   flgK2 TRUE 0.991 9.000 0.923 0.004   NA
 573387 573388 RPA3931 RPA3932 flgK2   TRUE 0.976 39.000 0.786 1.000 Y NA
 573389 573390 RPA3933 RPA3934     TRUE 0.959 -33.000 0.000 0.012 Y NA
 573390 573391 RPA3934 RPA3935     FALSE 0.464 190.000 0.286 NA   NA
 573392 573393 RPA3936 RPA3937     FALSE 0.213 152.000 0.024 NA N NA
 573393 573394 RPA3937 RPA3938     FALSE 0.373 134.000 0.080 1.000 N NA
 573395 573396 RPA3939 RPA3940     TRUE 0.856 44.000 0.063 NA Y NA
 573400 573401 RPA3944 RPA3945     TRUE 0.734 61.000 0.350 NA   NA
 573402 573403 RPA3946 RPA3947     FALSE 0.009 180.000 0.000 NA   NA
 573403 573404 RPA3947 RPA3948     FALSE 0.228 90.000 0.028 NA   NA
 573404 573405 RPA3948 RPA3949   wbpX TRUE 0.880 11.000 0.158 NA   NA
 573406 573407 RPA3950 RPA3951   gmd FALSE 0.486 69.000 0.111 NA   NA
 573407 573408 RPA3951 RPA3952 gmd   TRUE 0.995 0.000 0.444 0.007 Y NA
 573409 573410 RPA3953 RPA3954     FALSE 0.063 168.000 0.000 1.000 N NA
 573412 573413 RPA3956 RPA3957     TRUE 0.680 97.000 0.451 NA   NA
 573414 573415 RPA3958 RPA3959     FALSE 0.002 424.000 0.000 1.000   NA
 573415 573416 RPA3959 RPA3960     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 573417 573418 RPA3961 RPA3962     TRUE 0.889 138.000 0.500 NA Y NA
 573418 573419 RPA3962 RPA3963     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA Y NA
 573423 573424 RPA3967 RPA3968     TRUE 0.608 50.000 0.098 1.000 N NA
 573424 573425 RPA3968 RPA3969     TRUE 0.949 0.000 0.255 1.000   NA
 573425 573426 RPA3969 RPA3970     FALSE 0.404 54.000 0.025 1.000   NA
 573426 573427 RPA3970 RPA3971   thiD TRUE 0.797 93.000 0.122 1.000 Y NA
 573427 573428 RPA3971 RPA3972 thiD   FALSE 0.003 391.000 0.000 1.000 N NA
 573428 573429 RPA3972 RPA3973     TRUE 0.971 34.000 0.269 0.010 Y NA
 573429 573430 RPA3973 RPA3974     TRUE 0.855 112.000 0.150 0.062 Y NA
 573430 573431 RPA3974 RPA3975     FALSE 0.002 246.000 0.000 NA   NA
 573433 573434 RPA3977 RPA3978   wpbE FALSE 0.215 127.000 0.018 1.000   NA
 573434 573435 RPA3978 RPA3979 wpbE   TRUE 0.585 58.000 0.117 1.000   NA
 573435 573436 RPA3979 RPA3980   wbnF FALSE 0.196 141.000 0.011 1.000   NA
 573437 573438 RPA3981 RPA3982     FALSE 0.313 55.000 0.020 NA   NA
 573439 573440 RPA3983 RPA3984   rfaE TRUE 0.971 -61.000 0.017 0.012 Y NA
 573440 573441 RPA3984 RPA3985 rfaE   TRUE 0.972 25.000 0.191 0.010 Y NA
 573442 573443 RPA3986 RPA3987   lpcA FALSE 0.410 71.000 0.050 1.000 N NA
 573443 573444 RPA3987 RPA3988 lpcA   TRUE 0.886 -3.000 0.077 1.000 N NA
 573446 573447 RPA3990 RPA3991 galE1   FALSE 0.242 122.000 0.025 1.000 N NA
 573447 573448 RPA3991 RPA3992     FALSE 0.393 61.000 0.030 1.000 N NA
 573449 573450 RPA3993 RPA3994     FALSE 0.060 116.000 0.000 1.000 N NA
 573452 573453 RPA3996 RPA3997     FALSE 0.010 144.000 0.000 NA   NA
 573453 573454 RPA3997 RPA3998     FALSE 0.127 3.000 0.000 NA   NA
 573454 573455 RPA3998 RPA3999     FALSE 0.120 5.000 0.000 NA   NA
 573456 573457 RPA4000 RPA4001     FALSE 0.412 204.000 0.000 1.000 Y NA
 573459 573460 RPA4003 RPA4004     FALSE 0.000 492.000 0.000 NA   NA
 573462 573463 RPA4006 RPA4007     FALSE 0.011 165.000 0.000 NA   NA
 573463 573464 RPA4007 RPA4008     FALSE 0.006 199.000 0.000 NA   NA
 573464 573465 RPA4008 RPA4009     FALSE 0.075 72.000 0.000 1.000   NA
 573465 573466 RPA4009 RPA4010     TRUE 0.945 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 573466 573467 RPA4010 RPA4011     FALSE 0.004 345.000 0.000 1.000 N NA
 573467 573468 RPA4011 RPA4012     FALSE 0.001 736.000 0.000 1.000 N NA
 573471 573472 RPA4015 RPA4016 ahcY metK FALSE 0.418 261.000 0.005 0.001 Y NA
 573472 573473 RPA4016 RPA4017 metK   FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 573474 573475 RPA4018 RPA4019     FALSE 0.010 270.000 0.000 1.000 N NA
 573475 573476 RPA4019 RPA4020     TRUE 0.880 150.000 0.385 1.000 Y NA
 573476 573477 RPA4020 RPA4021     TRUE 0.996 1.000 0.591 0.050 Y NA
 573477 573478 RPA4021 RPA4022     TRUE 0.992 -3.000 0.545 1.000 Y NA
 573478 573479 RPA4022 RPA4023     TRUE 0.994 -7.000 0.550 0.025 Y NA
 573480 573481 RPA4024 RPA4025     TRUE 0.961 16.000 0.128 1.000 Y NA
 573481 573482 RPA4025 RPA4026     TRUE 0.993 21.000 0.913 0.025 Y NA
 573482 573483 RPA4026 RPA4027     TRUE 0.942 132.000 0.913 1.000 Y NA
 573483 573484 RPA4027 RPA4028     TRUE 0.997 0.000 0.913 0.050 Y NA
 573484 573485 RPA4028 RPA4029     TRUE 0.876 151.000 0.409 NA Y NA
 573486 573487 RPA4030 RPA4031     TRUE 0.723 56.000 0.300 NA   NA
 573489 573490 RPA4033 RPA4034 hemD   FALSE 0.003 247.000 0.000 NA N NA
 573490 573491 RPA4034 RPA4035     TRUE 0.786 129.000 0.194 NA Y NA
 573491 573492 RPA4035 RPA4036     TRUE 0.995 -3.000 0.549 0.050 Y NA
 573492 573493 RPA4036 RPA4037     TRUE 0.993 -3.000 0.647 1.000 Y NA
 573493 573494 RPA4037 RPA4038     TRUE 0.992 0.000 0.257 0.025 Y NA
 573494 573495 RPA4038 RPA4039     FALSE 0.011 166.000 0.000 NA   NA
 573495 573496 RPA4039 RPA4040     FALSE 0.452 123.000 0.200 NA   NA
 573496 573497 RPA4040 RPA4041     FALSE 0.009 183.000 0.000 NA   NA
 573497 573498 RPA4041 RPA4042     TRUE 0.966 -3.000 0.421 1.000 N NA
 573498 573499 RPA4042 RPA4043     TRUE 0.834 68.000 0.621 1.000 N NA
 573499 573500 RPA4043 RPA4044     TRUE 0.943 106.000 0.589 0.050 Y NA
 573500 573501 RPA4044 RPA4045     TRUE 0.949 58.000 0.615 NA Y NA
 573501 573502 RPA4045 RPA4046     TRUE 0.642 270.000 0.732 NA Y NA
 573504 573505 RPA4048 RPA4049 rfbF rfbG TRUE 0.993 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 573505 573506 RPA4049 RPA4050 rfbG   FALSE 0.359 10.000 0.000 1.000   NA
 573506 573507 RPA4050 RPA4051     FALSE 0.196 25.000 0.000 1.000   NA
 573507 573508 RPA4051 RPA4052     TRUE 0.755 -16.000 0.024 1.000 N NA
 573508 573509 RPA4052 RPA4053     TRUE 0.845 -3.000 0.041 1.000 N NA
 573509 573510 RPA4053 RPA4054     TRUE 0.829 -7.000 0.054 1.000 N NA
 573510 573511 RPA4054 RPA4055     FALSE 0.437 0.000 0.000 1.000   NA
 573511 573512 RPA4055 RPA4056     FALSE 0.094 -10.000 0.000 NA   NA
 573512 573513 RPA4056 RPA4057     TRUE 0.824 0.000 0.044 NA   NA
 573514 573515 RPA4058 RPA4059     FALSE 0.011 101.000 0.000 NA   NA
 573515 573516 RPA4059 RPA4060     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 573516 573517 RPA4060 RPA4061     FALSE 0.011 106.000 0.000 NA   NA
 573518 573519 RPA4062 RPA4063     FALSE 0.000 1011.000 0.000 NA   NA
 573521 573522 RPA4065 RPA4066     FALSE 0.000 450.000 0.000 NA   NA
 573522 573523 RPA4066 RPA4067     FALSE 0.011 158.000 0.000 NA   NA
 573524 573525 RPA4068 RPA4069     FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 573525 573526 RPA4069 RPA4070   msrA1 TRUE 0.962 31.000 0.087 0.001 Y NA
 5451045 573528 RPA_RNA1 RPA4071 tRNA-Undet1 carB FALSE 0.010 176.000 0.000 NA   NA
 573528 573529 RPA4071 RPA4072 carB greA FALSE 0.308 224.000 0.241 1.000 N NA
 573529 573530 RPA4072 RPA4073 greA   FALSE 0.154 179.000 0.005 1.000   NA
 573532 573533 RPA4075 RPA4076 trxB   TRUE 0.852 9.000 0.065 1.000 N NA
 573534 573535 RPA4077 RPA4078     FALSE 0.333 212.000 0.233 NA   NA
 573535 573536 RPA4078 RPA4079     FALSE 0.429 94.000 0.133 NA   NA
 573536 573537 RPA4079 RPA4080     TRUE 0.631 142.000 0.400 NA   NA
 573537 573538 RPA4080 RPA4081     FALSE 0.010 171.000 0.000 NA   NA
 573539 573540 RPA4082 RPA4083     FALSE 0.000 713.000 0.000 NA   NA
 573540 573541 RPA4083 RPA4084     TRUE 0.776 -40.000 0.061 NA   NA
 573541 573542 RPA4084 RPA4085     FALSE 0.439 70.000 0.061 1.000 N NA
 573543 573544 RPA4086 RPA4087     TRUE 0.951 3.000 0.065 0.003   NA
 573544 573545 RPA4087 RPA4088     TRUE 0.952 -3.000 0.154 0.092   NA
 573545 573546 RPA4088 RPA4089     TRUE 0.583 44.000 0.077 1.000   NA
 573546 573547 RPA4089 RPA4090     TRUE 0.705 163.000 0.500 NA   NA
 573549 573550 RPA4092 RPA4093     TRUE 0.680 190.000 0.667 NA   NA
 573550 573551 RPA4093 RPA4094     FALSE 0.468 93.000 0.167 NA   NA
 573551 573552 RPA4094 RPA4095     TRUE 0.743 38.000 0.167 1.000 N NA
 573552 573553 RPA4095 RPA4096     TRUE 0.978 5.000 0.667 1.000 N NA
 573554 573555 RPA4097 RPA4098     FALSE 0.097 370.000 0.000 0.046 Y NA
 573555 573556 RPA4098 RPA4099     FALSE 0.469 45.000 0.054 NA   NA
 573556 573557 RPA4099 RPA4100     TRUE 0.940 22.000 0.667 NA   NA
 573557 573558 RPA4100 RPA4101     FALSE 0.216 135.000 0.034 NA   NA
 573558 573559 RPA4101 RPA4102     TRUE 0.660 41.000 0.103 1.000 N NA
 573559 573560 RPA4102 RPA4103     TRUE 0.933 4.000 0.200 1.000 N NA
 573562 573563 RPA4105 RPA4106 rmrA rmrB TRUE 0.984 -3.000 0.880 1.000   NA
 573563 573564 RPA4106 RPA4107 rmrB oprN TRUE 0.782 184.000 0.520 0.049   NA
 573564 573565 RPA4107 RPA4108 oprN   TRUE 0.814 20.000 0.125 1.000 N NA
 573565 573566 RPA4108 RPA4109     TRUE 0.878 72.000 1.000 NA   NA
 573566 573567 RPA4109 RPA4110   mycA FALSE 0.000 558.000 0.000 NA   NA
 573567 573568 RPA4110 RPA4111 mycA   FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 573568 573569 RPA4111 RPA4112     FALSE 0.000 1465.000 0.000 NA   NA
 573569 573570 RPA4112 RPA4113     FALSE 0.001 692.000 0.000 1.000 N NA
 573570 573571 RPA4113 RPA4114     FALSE 0.294 120.000 0.000 0.033 N NA
 573572 573573 RPA4115 RPA4116 trbI2 trbG2 TRUE 0.996 0.000 1.000 NA Y NA
 573573 573574 RPA4116 RPA4117 trbG2 trbF2 TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA Y NA
 573574 573575 RPA4117 RPA4118 trbF2   TRUE 0.992 4.000 0.500 1.000 Y NA
 573575 573576 RPA4118 RPA4119     TRUE 0.967 4.000 0.500 NA   NA
 573576 573577 RPA4119 RPA4120     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 573577 573578 RPA4120 RPA4121   trbE2 TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA Y NA
 573578 573579 RPA4121 RPA4122 trbE2   TRUE 0.988 10.000 0.500 NA Y NA
 573579 573580 RPA4122 RPA4123   trbC2 TRUE 0.996 0.000 1.000 NA Y NA
 573580 573581 RPA4123 RPA4124 trbC2 trbB2 TRUE 0.985 -3.000 0.286 NA Y NA
 573581 573582 RPA4124 RPA4125 trbB2   FALSE 0.001 358.000 0.000 NA   NA
 573582 573583 RPA4125 RPA4126     TRUE 0.971 -43.000 0.818 NA   NA
 573583 573584 RPA4126 RPA4127     TRUE 0.964 -25.000 0.652 NA   NA
 573584 573585 RPA4127 RPA4128     FALSE 0.068 16.000 0.000 NA   NA
 573586 573587 RPA4129 RPA4130     TRUE 0.971 -3.000 0.500 1.000   NA
 573588 573589 RPA4131 RPA4132   traG1 TRUE 0.982 10.000 1.000 1.000   NA
 573589 573590 RPA4132 RPA4133 traG1   TRUE 0.551 134.000 0.286 NA   NA
 5451046 573595 RPA_RNA49 RPA4137 tRNA-His1   FALSE 0.010 176.000 0.000 NA   NA
 573595 573596 RPA4137 RPA4138     FALSE 0.237 224.000 0.200 NA   NA
 573596 573597 RPA4138 RPA4139     FALSE 0.001 342.000 0.000 NA   NA
 573598 573599 RPA4140 RPA4141     FALSE 0.001 549.000 0.000 1.000   NA
 573599 573600 RPA4141 RPA4142     TRUE 0.955 -3.000 0.364 NA   NA
 573600 573601 RPA4142 RPA4143   nnrR FALSE 0.447 84.000 0.125 NA   NA
 573603 573604 RPA4145 RPA4146 nirK2   FALSE 0.359 169.000 0.100 NA   NA
 573604 573605 RPA4146 RPA4147     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 573605 573606 RPA4147 RPA4148   prsA TRUE 0.988 -3.000 0.314 1.000 Y NA
 573606 573607 RPA4148 RPA4149 prsA   TRUE 0.841 -3.000 0.038 1.000 N NA
 573609 573610 RPA4151 RPA4152   fbpA FALSE 0.060 120.000 0.000 1.000 N NA
 573610 573611 RPA4152 RPA4153 fbpA fpbB TRUE 0.847 78.000 0.043 0.049 Y NA
 573611 573612 RPA4153 RPA4154 fpbB   FALSE 0.477 117.000 0.222 NA   NA
 573613 573614 RPA4155 RPA4156     TRUE 0.996 12.000 0.833 0.000 Y NA
 573616 573617 RPA4158 RPA4159 potI potH TRUE 0.656 308.000 0.758 0.049 Y NA
 573617 573618 RPA4159 RPA4160 potH   TRUE 0.986 -3.000 0.258 1.000 Y NA
 573618 573619 RPA4160 RPA4161     FALSE 0.066 101.000 0.000 1.000 N NA
 573620 573621 RPA4162 RPA4163     TRUE 0.920 12.000 0.000 1.000 Y NA
 573621 573622 RPA4163 RPA4164     TRUE 0.685 64.000 0.000 1.000 Y NA
 573622 573623 RPA4164 RPA4165     FALSE 0.096 57.000 0.000 1.000   NA
 573623 573624 RPA4165 RPA4166     TRUE 0.909 12.000 0.222 1.000   NA
 573626 573627 RPA4168 RPA4169     FALSE 0.058 91.000 0.000 1.000   NA
 573627 573628 RPA4169 RPA4170     FALSE 0.002 276.000 0.000 NA N NA
 573629 573630 RPA4171 RPA4172     FALSE 0.013 83.000 0.000 NA   NA
 573630 573631 RPA4172 RPA4173     FALSE 0.088 -19.000 0.000 NA   NA
 573632 573633 RPA4174 RPA4175 purE purK TRUE 0.992 -3.000 0.201 0.000 Y NA
 573633 573634 RPA4175 RPA4176 purK rpsU FALSE 0.204 157.000 0.009 1.000   NA
 573635 573636 RPA4177 RPA4178     FALSE 0.430 150.000 0.147 NA   NA
 573638 573639 RPA4180 RPA4181 pntB pntA TRUE 0.964 14.000 0.306 0.001   NA
 573639 573640 RPA4181 RPA4182 pntA pntA TRUE 0.867 26.000 0.058 0.001   NA
 573640 573641 RPA4182 RPA4183 pntA   FALSE 0.108 200.000 0.017 NA   NA
 573644 573645 RPA4186 RPA4187     FALSE 0.300 96.000 0.037 1.000 N NA
 573645 573646 RPA4187 RPA4188     FALSE 0.003 350.000 0.000 1.000   NA
 573646 573647 RPA4188 RPA4189     FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 573648 573649 RPA4190 RPA4191     FALSE 0.444 71.000 0.090 NA   NA
 573650 573651 RPA4192 RPA4193   pyk TRUE 0.966 -3.000 0.487 NA   NA
 573652 573653 RPA4194 RPA4195 osmC   TRUE 0.811 -3.000 0.026 1.000   NA
 573653 573654 RPA4195 RPA4196     FALSE 0.076 71.000 0.000 1.000   NA
 573654 573655 RPA4196 RPA4197   rpmJ FALSE 0.055 98.000 0.000 1.000   NA
 573656 573657 RPA4198 RPA4199     FALSE 0.395 149.000 0.012 0.071   NA
 573657 573658 RPA4199 RPA4200     FALSE 0.205 77.000 0.013 NA   NA
 573659 573660 RPA4201 RPA4202     TRUE 0.713 174.000 0.600 NA   NA
 573660 573661 RPA4202 RPA4203     TRUE 0.980 -25.000 0.600 0.012   NA
 573661 573662 RPA4203 RPA4204     FALSE 0.003 236.000 0.000 NA   NA
 573664 573665 RPA4206 RPA4207     TRUE 0.718 49.000 0.222 1.000   NA
 573665 573666 RPA4207 RPA4208     TRUE 0.619 95.000 0.333 NA   NA
 573666 573667 RPA4208 RPA4209   glnA FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 573669 573670 RPA4211 RPA4212 glsA   FALSE 0.011 147.000 0.000 NA   NA
 573670 573671 RPA4212 RPA4213     TRUE 0.928 -13.000 0.309 NA   NA
 573671 573672 RPA4213 RPA4214     TRUE 0.977 11.000 0.919 NA   NA
 573672 573673 RPA4214 RPA4215   cysG TRUE 0.866 -3.000 0.082 NA   NA
 573674 573675 RPA4216 RPA4217 glcB   FALSE 0.151 191.000 0.030 NA   NA
 573676 573677 RPA4218 RPA4219     TRUE 0.683 157.000 0.455 NA   NA
 573677 573678 RPA4219 RPA4220     TRUE 0.959 23.000 1.000 NA   NA
 573680 573681 RPA4222 RPA4223     FALSE 0.000 376.000 0.000 NA   NA
 573682 573683 RPA4224 RPA4225     TRUE 0.932 0.000 0.220 NA   NA
 573684 573685 RPA4226 RPA4227   ureG FALSE 0.170 153.000 0.010 NA N NA
 573686 573687 RPA4228 RPA4229     FALSE 0.059 19.000 0.000 NA   NA
 573687 573688 RPA4229 RPA4230     FALSE 0.000 466.000 0.000 NA   NA
 573691 573692 RPA4233 RPA4234   aadR TRUE 0.916 53.000 0.250 1.000 Y NA
 573694 573695 RPA4236 RPA4237     TRUE 0.973 13.000 0.917 NA   NA
 573695 573696 RPA4237 RPA4238     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA Y NA
 573698 573699 RPA4240 RPA4241     FALSE 0.462 140.000 0.041 0.071 N NA
 573701 573702 RPA4243 RPA4244 phaC   FALSE 0.107 267.000 0.125 1.000   NA
 573703 573704 RPA4245 RPA4246     TRUE 0.752 87.000 0.500 1.000   NA
 573704 573705 RPA4246 RPA4247   fixL FALSE 0.519 145.000 0.208 1.000 N NA
 573705 573706 RPA4247 RPA4248 fixL fixJ TRUE 0.994 -7.000 0.583 0.020 Y NA
 573706 573707 RPA4248 RPA4249 fixJ   TRUE 0.945 86.000 0.455 0.017 Y NA
 573707 573708 RPA4249 RPA4250   fixK2 TRUE 0.874 199.000 0.417 0.072 Y NA
 573708 573709 RPA4250 RPA4251 fixK2 oahs FALSE 0.005 330.000 0.000 1.000 N NA
 573710 573711 RPA4252 RPA4253 nuoN2 nuoM2 TRUE 0.993 11.000 0.437 0.002 Y NA
 573711 573712 RPA4253 RPA4254 nuoM2 nuoL2 TRUE 0.982 -9.000 0.057 0.002 Y NA
 573712 573713 RPA4254 RPA4255 nuoL2 nuoK2 TRUE 0.982 3.000 0.016 0.008 Y NA
 573713 573714 RPA4255 RPA4256 nuoK2 nuoJ2 TRUE 0.993 -3.000 0.269 0.004 Y NA
 573714 573715 RPA4256 RPA4257 nuoJ2 nuoI2 TRUE 0.995 -3.000 0.428 0.008 Y NA
 573715 573716 RPA4257 RPA4258 nuoI2 nuoH2 TRUE 0.995 -3.000 0.423 0.008 Y NA
 573716 573717 RPA4258 RPA4259 nuoH2 nuoG2 TRUE 0.996 -3.000 0.664 0.008 Y NA
 573717 573718 RPA4259 RPA4260 nuoG2 nuoF2 TRUE 0.990 -3.000 0.184 0.008 Y NA
 573718 573719 RPA4260 RPA4261 nuoF2 nuoE2 TRUE 0.992 -3.000 0.236 0.006 Y NA
 573719 573720 RPA4261 RPA4262 nuoE2 nuoCD TRUE 0.995 -3.000 0.407 0.006 Y NA
 573720 573721 RPA4262 RPA4263 nuoCD nuoB2 TRUE 0.997 -3.000 0.691 0.004 Y NA
 573721 573722 RPA4263 RPA4264 nuoB2 nuoA2 TRUE 0.994 -3.000 0.377 0.004 Y NA
 573723 573724 RPA4265 RPA4266 ndvA   FALSE 0.495 170.000 0.188 1.000 N NA
 573724 573725 RPA4266 RPA4267     FALSE 0.106 272.000 0.125 1.000 N NA
 573725 573726 RPA4267 RPA4268     FALSE 0.103 240.000 0.048 1.000 N NA
 573727 573728 RPA4269 RPA4270   thrB TRUE 0.901 -3.000 0.104 1.000   NA
 573728 573729 RPA4270 RPA4271 thrB lytB2 TRUE 0.574 100.000 0.251 1.000   NA
 573731 573732 RPA4273 RPA4274     FALSE 0.000 595.000 0.000 NA   NA
 573733 573734 RPA4275 RPA4276     FALSE 0.010 139.000 0.000 NA   NA
 573734 573735 RPA4276 RPA4277     FALSE 0.000 2111.000 0.000 NA   NA
 573735 573736 RPA4277 RPA4278     FALSE 0.017 65.000 0.000 NA   NA
 573736 573737 RPA4278 RPA4279     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 573739 573740 RPA4281 RPA4282     FALSE 0.008 187.000 0.000 NA   NA
 573742 573743 RPA4284 RPA4285     FALSE 0.014 77.000 0.000 NA   NA
 573743 573744 RPA4285 RPA4286     FALSE 0.513 43.000 0.000 0.040   NA
 573746 573747 RPA4288 RPA4289     TRUE 0.838 0.000 0.054 NA   NA
 573747 573748 RPA4289 RPA4290     FALSE 0.050 133.000 0.000 1.000   NA
 573748 573749 RPA4290 RPA4291   pucBb FALSE 0.025 336.000 0.000 0.047   NA
 573749 573750 RPA4291 RPA4292 pucBb pucAb TRUE 0.822 13.000 0.000 0.003   NA
 573750 573751 RPA4292 RPA4293 pucAb   FALSE 0.000 469.000 0.000 NA   NA
 573752 573753 RPA4294 RPA4295   purA FALSE 0.313 38.000 0.006 NA   NA
 573753 573754 RPA4295 RPA4296 purA   FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 573755 573756 RPA4297 RPA4298     FALSE 0.010 253.000 0.000 1.000   NA
 573756 573757 RPA4298 RPA4299     FALSE 0.055 160.000 0.000 1.000   NA
 573757 573758 RPA4299 RPA4300     FALSE 0.038 534.000 0.000 0.091 Y NA
 573759 573760 RPA4301 RPA4302     FALSE 0.002 262.000 0.000 NA   NA
 573760 573761 RPA4302 RPA4303     FALSE 0.215 130.000 0.018 1.000   NA
 573763 573764 RPA4305 RPA4306     TRUE 0.686 84.000 0.400 NA   NA
 573764 573765 RPA4306 RPA4307     TRUE 0.578 207.000 0.000 0.010 Y NA
 573765 573766 RPA4307 RPA4308   serA2 FALSE 0.015 245.000 0.000 1.000 N NA
 573766 573767 RPA4308 RPA4309 serA2 serC TRUE 0.783 170.000 0.140 1.000 Y NA
 573767 573768 RPA4309 RPA4310 serC   FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 573768 573769 RPA4310 RPA4311     FALSE 0.030 39.000 0.000 NA   NA
 573769 573770 RPA4311 RPA4312     TRUE 0.977 -25.000 0.500 0.012   NA
 573770 573771 RPA4312 RPA4313     FALSE 0.229 173.000 0.024 1.000   NA
 573771 573772 RPA4313 RPA4314   gstA2 TRUE 0.812 12.000 0.061 1.000   NA
 573772 573773 RPA4314 RPA4315 gstA2   FALSE 0.521 66.000 0.098 1.000   NA
 573773 573774 RPA4315 RPA4316     TRUE 0.806 107.000 0.412 0.005   NA
 573774 573775 RPA4316 RPA4317     FALSE 0.060 311.000 0.015 0.047 N NA
 573775 573776 RPA4317 RPA4318   mrsA TRUE 0.697 84.000 0.008 1.000 Y NA
 573776 573777 RPA4318 RPA4319 mrsA   FALSE 0.006 202.000 0.000 NA   NA
 573778 573779 RPA4320 RPA4321 lldA paaG3 FALSE 0.190 192.000 0.027 1.000 N NA
 573779 573780 RPA4321 RPA4322 paaG3   FALSE 0.065 149.000 0.000 1.000 N NA
 573780 573781 RPA4322 RPA4323     FALSE 0.010 110.000 0.000 NA   NA
 573781 573782 RPA4323 RPA4324     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 573783 573784 RPA4325 RPA4326 aroE sulP FALSE 0.217 102.000 0.011 1.000 N NA
 573784 573785 RPA4326 RPA4327 sulP   FALSE 0.448 42.000 0.023 1.000   NA
 573785 573786 RPA4327 RPA4328     FALSE 0.213 168.000 0.015 1.000   NA
 573786 573787 RPA4328 RPA4329     FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
 573787 573788 RPA4329 RPA4330     FALSE 0.003 230.000 0.000 NA   NA
 573788 573789 RPA4330 RPA4331   aatA FALSE 0.275 125.000 0.062 NA   NA
 573790 573791 RPA4332 RPA4333 gstA1   FALSE 0.002 419.000 0.000 1.000 N NA
 573791 573792 RPA4333 RPA4334     FALSE 0.030 214.000 0.000 1.000 N NA
 573794 573795 RPA4336 RPA4337     FALSE 0.001 450.000 0.000 1.000   NA
 573798 573799 RPA4340 RPA4341 ligE   FALSE 0.010 189.000 0.000 NA N NA
 573800 573801 RPA4342 RPA4343   uvrB FALSE 0.003 507.000 0.004 NA   NA
 573801 573802 RPA4343 RPA4344 uvrB   FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 573803 573804 RPA4345 RPA4346     FALSE 0.001 347.000 0.000 NA   NA
 573805 573806 RPA4347 RPA4348     FALSE 0.000 485.000 0.000 NA   NA
 573806 573807 RPA4348 RPA4349     TRUE 0.580 118.000 0.333 NA   NA
 573808 573809 RPA4350 RPA4351     FALSE 0.349 149.000 0.090 NA   NA
 573809 573810 RPA4351 RPA4352     TRUE 0.993 9.000 0.433 0.040 Y NA
 573812 573813 RPA4354 RPA4355   pth TRUE 0.800 128.000 0.184 1.000 Y NA
 573813 573814 RPA4355 RPA4356 pth ctc TRUE 0.987 22.000 0.496 0.015 Y NA
 573814 573815 RPA4356 RPA4357 ctc   FALSE 0.001 298.000 0.000 NA   NA
 573816 573817 RPA4358 RPA4359 lgt   TRUE 0.913 -3.000 0.170 NA   NA
 573817 573818 RPA4359 RPA4360     TRUE 0.886 -3.000 0.107 NA   NA
 573818 573819 RPA4360 RPA4361     FALSE 0.049 233.000 0.010 NA   NA
 573819 573820 RPA4361 RPA4362   ribP FALSE 0.475 169.000 0.209 NA   NA
 573822 573823 RPA4364 RPA4365     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 573823 573824 RPA4365 RPA4366   proC FALSE 0.060 88.000 0.000 1.000   NA
 573825 573826 RPA4367 RPA4368     TRUE 0.580 279.000 0.592 1.000 Y NA
 573826 573827 RPA4368 RPA4369     TRUE 0.993 -3.000 0.392 0.071 Y NA
 573829 573830 RPA4371 RPA4372 mutL   FALSE 0.051 236.000 0.002 1.000   NA
 573830 573831 RPA4372 RPA4373     FALSE 0.015 343.000 0.014 1.000   NA
 573831 573832 RPA4373 RPA4374     TRUE 0.988 -3.000 0.598 0.003   NA
 573832 573833 RPA4374 RPA4375     FALSE 0.395 79.000 0.083 NA   NA
 573833 573834 RPA4375 RPA4376   lspA TRUE 0.682 64.000 0.294 NA   NA
 573834 573835 RPA4376 RPA4377 lspA ileS FALSE 0.300 109.000 0.045 1.000 N NA
 573835 573836 RPA4377 RPA4378 ileS   FALSE 0.137 182.000 0.003 1.000   NA
 573836 573837 RPA4378 RPA4379   ribF TRUE 0.754 -3.000 0.008 1.000   NA
 573837 573838 RPA4379 RPA4380 ribF   FALSE 0.190 123.000 0.008 1.000 N NA
 573838 573839 RPA4380 RPA4381     FALSE 0.411 105.000 0.137 NA   NA
 573840 573841 RPA4382 RPA4383     TRUE 0.962 10.000 0.550 NA   NA
 573841 573842 RPA4383 RPA4384     FALSE 0.010 142.000 0.000 NA   NA
 573842 573843 RPA4384 RPA4385   PA0781 FALSE 0.062 18.000 0.000 NA   NA
 573843 573844 RPA4385 RPA4386 PA0781   FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
 573844 573845 RPA4386 RPA4387     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 573846 573847 RPA4388 RPA4389     TRUE 0.884 8.000 0.098 1.000   NA
 573847 573848 RPA4389 RPA4390     FALSE 0.482 52.000 0.043 1.000 N NA
 573850 573851 RPA4392 RPA4393     FALSE 0.002 264.000 0.000 NA   NA
 573851 573852 RPA4393 RPA4394   aceA TRUE 0.677 25.000 0.077 NA   NA
 573853 573854 RPA4395 RPA4396     FALSE 0.001 1302.000 0.000 1.000   NA
 573854 573855 RPA4396 RPA4397     FALSE 0.365 100.000 0.089 NA N NA
 573855 573856 RPA4397 RPA4398     TRUE 0.928 162.000 0.750 NA Y NA
 573856 573857 RPA4398 RPA4399     TRUE 0.954 142.000 0.708 0.025 Y NA
 573857 573858 RPA4399 RPA4400     TRUE 0.994 -3.000 0.746 1.000 Y NA
 573858 573859 RPA4400 RPA4401     TRUE 0.996 -3.000 0.687 0.048 Y NA
 573859 573860 RPA4401 RPA4402     FALSE 0.000 371.000 0.000 NA   NA
 573860 573861 RPA4402 RPA4403     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 573862 573863 RPA4404 RPA4405     TRUE 0.810 73.000 0.640 NA   NA
 573863 573864 RPA4405 RPA4406     TRUE 0.979 8.000 0.854 NA   NA
 573864 573865 RPA4406 RPA4407     TRUE 0.997 0.000 0.922 0.048 Y NA
 573865 573866 RPA4407 RPA4408     TRUE 0.997 0.000 0.847 0.048 Y NA
 573866 573867 RPA4408 RPA4409     TRUE 0.996 13.000 0.865 0.002 Y NA
 573867 573868 RPA4409 RPA4410   glpD TRUE 0.886 -3.000 0.077 1.000 N NA
 573868 573869 RPA4410 RPA4411 glpD glpR FALSE 0.291 196.000 0.089 1.000 N NA
 573869 573870 RPA4411 RPA4412 glpR   FALSE 0.281 188.000 0.071 1.000   NA
 573870 573871 RPA4412 RPA4413     TRUE 0.959 18.000 0.727 1.000   NA
 573871 573872 RPA4413 RPA4414     TRUE 0.961 18.000 0.818 NA N NA
 573872 573873 RPA4414 RPA4415     TRUE 0.953 22.000 0.818 NA N NA
 573873 573874 RPA4415 RPA4416     FALSE 0.222 112.000 0.038 NA   NA
 573874 573875 RPA4416 RPA4417     FALSE 0.203 107.000 0.029 NA   NA
 573879 573880 RPA4421 RPA4422     FALSE 0.004 335.000 0.000 1.000 N NA
 573880 573881 RPA4422 RPA4423     FALSE 0.010 131.000 0.000 NA   NA
 573882 573883 RPA4424 RPA4425     TRUE 0.649 110.000 0.385 1.000   NA
 573883 573884 RPA4425 RPA4426     FALSE 0.405 119.000 0.140 NA N NA
 573885 573886 RPA4427 RPA4428 ogt1   FALSE 0.024 47.000 0.000 NA   NA
 573886 573887 RPA4428 RPA4429     FALSE 0.010 121.000 0.000 NA   NA
 573887 573888 RPA4429 RPA4430     TRUE 0.882 5.000 0.106 NA   NA
 573888 573889 RPA4430 RNA_57   rrnB FALSE 0.000 640.000 0.000 NA   NA
 573889 5451047 RNA_57 RPA_RNA50 rrnB rrna FALSE 0.085 -509.000 0.000 NA   NA
 5451047 573891 RPA_RNA50 RNA_51 rrna 23S rRNA FALSE 0.014 77.000 0.000 NA   NA
 573891 5451048 RNA_51 RPA_RNA48 23S rRNA tRNA-Ala4 FALSE 0.001 345.000 0.000 NA   NA
 5451048 5451049 RPA_RNA48 RPA_RNA47 tRNA-Ala4 tRNA-Ile2 FALSE 0.036 34.000 0.000 NA   NA
 5451049 573894 RPA_RNA47 RNA_52 tRNA-Ile2 16S rRNA FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 573895 573896 RPA4431 RPA4432     FALSE 0.486 142.000 0.188 1.000   NA
 573899 573900 RPA4435 RPA4436     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 573900 573901 RPA4436 RPA4437   metX TRUE 0.970 3.000 0.509 NA   NA
 573902 573903 RPA4438 RPA4439 aro hisC TRUE 0.885 43.000 0.084 1.000 Y NA
 573903 573904 RPA4439 RPA4440 hisC tyrC TRUE 0.983 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 573906 573907 RPA4442 RPA4443     FALSE 0.000 1504.000 0.000 NA   NA
 573907 573908 RPA4443 RPA4444     FALSE 0.000 831.000 0.000 NA   NA
 573909 573910 RPA4445 RPA4446     FALSE 0.014 79.000 0.000 NA   NA
 573910 573911 RPA4446 RPA4447     TRUE 0.976 -3.000 0.667 NA   NA
 573911 573912 RPA4447 RPA4448     TRUE 0.779 -3.000 0.031 NA   NA
 573913 573914 RPA4449 RPA4450     FALSE 0.027 208.000 0.000 1.000   NA
 573914 573915 RPA4450 RPA4451     FALSE 0.094 -10.000 0.000 NA   NA
 573915 573916 RPA4451 RPA4452     TRUE 0.889 -3.000 0.111 NA   NA
 573917 573918 RPA4453 RPA4454     TRUE 0.886 2.000 0.077 1.000   NA
 573919 573920 RPA4455 RPA4456     FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 573921 573922 RPA4457 RPA4458     TRUE 0.628 24.000 0.048 NA N NA
 573922 573923 RPA4458 RPA4459   dhsU2 FALSE 0.060 25.000 0.000 NA N NA
 573923 573924 RPA4459 RPA4460 dhsU2 dhsU1 TRUE 0.912 40.000 0.800 NA   NA
 573924 573925 RPA4460 RPA4461 dhsU1   TRUE 0.814 28.000 0.211 1.000   NA
 573925 573926 RPA4461 RPA4462     TRUE 0.726 37.000 0.143 1.000   NA
 573926 573927 RPA4462 RPA4463     FALSE 0.392 185.000 0.143 1.000   NA
 573927 573928 RPA4463 RPA4464   soxC TRUE 0.953 -16.000 0.250 0.059   NA
 573928 573929 RPA4464 RPA4465 soxC soxB TRUE 0.804 70.000 0.518 1.000   NA
 573929 573930 RPA4465 RPA4466 soxB soxZ2 FALSE 0.417 143.000 0.147 NA   NA
 573930 573931 RPA4466 RPA4467 soxZ2 soxY2 TRUE 0.688 39.000 0.156 NA   NA
 573932 573933 RPA4468 RPA4469     TRUE 0.986 14.000 0.926 0.010   NA
 573933 573934 RPA4469 RPA4470     FALSE 0.432 165.000 0.148 NA   NA
 573935 573936 RPA4471 RPA4472     TRUE 0.923 29.000 0.111 NA Y NA
 573937 573938 RPA4473 RPA4474     TRUE 0.740 39.000 0.190 1.000   NA
 573938 573939 RPA4474 RPA4475     TRUE 0.589 77.000 0.238 NA   NA
 573940 573941 RPA4476 RPA4477     FALSE 0.342 172.000 0.095 NA   NA
 573941 573942 RPA4477 RPA4478     FALSE 0.006 200.000 0.000 NA   NA
 573942 573943 RPA4478 RPA4479   czcA3 TRUE 0.940 -3.000 0.270 NA   NA
 573943 573944 RPA4479 RPA4480 czcA3 czcB TRUE 0.976 1.000 0.567 1.000 N NA
 573944 573945 RPA4480 RPA4481 czcB   FALSE 0.178 194.000 0.000 0.090 N NA
 573945 573946 RPA4481 RPA4482     TRUE 0.809 -37.000 0.000 0.012   NA
 573946 573947 RPA4482 RPA4483     FALSE 0.317 170.000 0.000 0.012   NA
 573947 573948 RPA4483 RPA4484     TRUE 0.615 35.000 0.000 0.012   NA
 573948 573949 RPA4484 RPA4485   mutY FALSE 0.046 177.000 0.000 1.000   NA
 573950 573951 RPA4486 RPA4487     TRUE 0.590 143.000 0.333 NA   NA
 573951 573952 RPA4487 RPA4488     FALSE 0.001 1014.000 0.000 1.000 N NA
 573952 573953 RPA4488 RPA4489     FALSE 0.002 450.000 0.000 1.000 N NA
 573953 573954 RPA4489 RPA4490     FALSE 0.027 275.000 0.012 NA N NA
 573957 573958 RPA4493 RPA4494     TRUE 0.584 59.000 0.154 NA   NA
 573958 573959 RPA4494 RPA4495   htpX FALSE 0.245 181.000 0.061 NA   NA
 573959 573960 RPA4495 RPA4497 htpX lemA FALSE 0.010 136.000 0.000 NA   NA
 573960 573961 RPA4497 RPA4498 lemA trpG FALSE 0.010 132.000 0.000 NA   NA
 573961 573962 RPA4498 RPA4499 trpG   FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 573964 573965 RPA4501 RPA4502     FALSE 0.199 134.000 0.009 1.000 N NA
 573965 573966 RPA4502 RPA4503     FALSE 0.070 233.000 0.028 NA   NA
 573966 573967 RPA4503 RPA4504     FALSE 0.163 179.000 0.022 NA   NA
 573967 573968 RPA4504 RPA4505     FALSE 0.043 181.000 0.000 1.000   NA
 573968 573969 RPA4505 RPA4506     FALSE 0.039 186.000 0.000 1.000   NA
 573969 573970 RPA4506 RPA4507     FALSE 0.275 100.000 0.000 0.070 N NA
 573970 573971 RPA4507 RPA4508     FALSE 0.000 1064.000 0.000 NA   NA
 573971 573972 RPA4508 RPA4509     TRUE 0.962 -3.000 0.433 NA   NA
 573972 573973 RPA4509 RPA4510     TRUE 0.722 147.000 0.588 NA   NA
 573975 573976 RPA4512 RPA4513     FALSE 0.022 55.000 0.000 NA   NA
 573977 573978 RPA4514 RPA4515     FALSE 0.051 136.000 0.000 1.000   NA
 573978 573979 RPA4515 RPA4516   vieA FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   NA
 573982 573983 RPA4519 RPA4520     TRUE 0.570 136.000 0.308 NA   NA
 573985 573986 RPA4522 RPA4523 cbbY   FALSE 0.007 276.000 0.000 1.000   NA
 573986 573987 RPA4523 RPA4524     FALSE 0.186 260.000 0.000 1.000 Y NA
 573988 573989 RPA4525 RPA4526     FALSE 0.000 470.000 0.000 NA   NA
 5451050 573991 RPA_RNA46 RPA4527 tRNA-Phe1 maf2 FALSE 0.001 308.000 0.000 NA   NA
 573991 573992 RPA4527 RPA4528 maf2   TRUE 0.693 1.000 0.008 NA   NA
 573992 573993 RPA4528 RPA4529   arsC4 FALSE 0.000 583.000 0.000 NA   NA
 573993 573994 RPA4529 RPA4530 arsC4   TRUE 0.877 56.000 0.768 NA   NA
 573994 573995 RPA4530 RPA4531   hisD TRUE 0.909 -3.000 0.157 NA   NA
 573995 573996 RPA4531 RPA4532 hisD   FALSE 0.343 124.000 0.096 NA   NA
 573996 573997 RPA4532 RPA4533   murA TRUE 0.793 20.000 0.138 NA   NA
 573997 573998 RPA4533 RPA4534 murA   FALSE 0.143 159.000 0.007 NA   NA
 574001 5451051 RPA4537 RPA_RNA2   tRNA-Thr1 FALSE 0.008 185.000 0.000 NA   NA
 574003 574004 RPA4538 RPA4539     FALSE 0.112 7.000 0.000 NA   NA
 574008 574009 RPA4543 RPA4544     TRUE 0.959 -3.000 0.400 NA   NA
 574009 574010 RPA4544 RPA4545     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 574010 574011 RPA4545 RPA4546     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 574011 574012 RPA4546 RPA4547     FALSE 0.011 147.000 0.000 NA   NA
 574012 574013 RPA4547 RPA4548     FALSE 0.124 -3.000 0.000 NA   NA
 574013 574014 RPA4548 RPA4549     FALSE 0.000 421.000 0.000 NA   NA
 574015 574016 RPA4550 RPA4551     FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 574017 574018 RPA4552 RPA4553     FALSE 0.222 27.000 0.000 1.000 N NA
 574018 574019 RPA4553 RPA4554   dctM2 TRUE 0.598 54.000 0.100 1.000 N NA
 574019 574020 RPA4554 RPA4555 dctM2   TRUE 0.986 12.000 0.500 NA Y NA
 574020 574021 RPA4555 RPA4556     TRUE 0.888 34.000 0.500 NA N NA
 574022 574023 RPA4557 RPA4558     TRUE 0.688 45.000 0.043 0.069 N NA
 574023 574024 RPA4558 RPA4559     TRUE 0.860 0.000 0.043 1.000 N NA
 574024 574025 RPA4559 RPA4560     TRUE 0.893 41.000 0.600 1.000 N NA
 574029 574030 RPA4564 RPA4565     FALSE 0.181 178.000 0.024 NA N NA
 574031 574032 RPA4566 RPA4567 ackA pta TRUE 0.945 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 574032 574033 RPA4567 RPA4568 pta   FALSE 0.241 24.000 0.000 1.000 N NA
 574033 574034 RPA4568 RPA4569     FALSE 0.193 83.000 0.013 NA   NA
 574036 574037 RPA4571 RPA4572   htrA/degQ/degS FALSE 0.003 231.000 0.000 NA   NA
 574037 574038 RPA4572 RPA4573 htrA/degQ/degS   FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 574038 574039 RPA4573 RPA4574     FALSE 0.010 109.000 0.000 NA   NA
 574040 574041 RPA4575 RPA4576     TRUE 0.950 -16.000 0.418 1.000   NA
 574041 574042 RPA4576 RPA4577     TRUE 0.987 -13.000 0.923 0.048   NA
 574042 574043 RPA4577 RPA4578     TRUE 0.670 82.000 0.318 1.000   NA
 574044 574045 RPA4579 RPA4580     FALSE 0.124 42.000 0.000 1.000   NA
 574046 574047 RPA4581 RPA4582   galE2 TRUE 0.674 31.000 0.098 NA   NA
 574047 574048 RPA4582 RPA4583 galE2   FALSE 0.300 228.000 0.000 1.000 Y NA
 574049 574050 RPA4584 RPA4585     FALSE 0.317 16.000 0.000 1.000 N NA
 574051 574052 RPA4586 RPA4587     TRUE 0.940 22.000 0.667 NA   NA
 574055 574056 RPA4590 RPA4591   metY TRUE 0.949 13.000 0.037 1.000 Y NA
 574057 574058 RPA4592 RPA4593     TRUE 0.935 0.000 0.058 0.069 N NA
 574060 574061 RPA4595 RPA4596   fabG5 TRUE 0.995 -7.000 0.769 0.069 Y NA
 574062 574063 RPA4597 RPA4598     FALSE 0.477 35.000 0.016 1.000   NA
 574064 574065 RPA4599 RPA4600     FALSE 0.455 74.000 0.103 NA   NA
 574065 574066 RPA4600 RPA4601     FALSE 0.009 177.000 0.000 NA   NA
 574067 574068 RPA4602 RPA4603 fixX fixC TRUE 0.978 34.000 0.461 0.059 Y NA
 574068 574069 RPA4603 RPA4604 fixC fixB TRUE 0.992 13.000 0.491 0.013 Y NA
 574069 574070 RPA4604 RPA4605 fixB fixA TRUE 0.980 25.000 0.330 0.013 Y NA
 574070 574071 RPA4605 RPA4606 fixA nifW FALSE 0.060 333.000 0.189 1.000   NA
 574071 574072 RPA4606 RPA4607 nifW nifV TRUE 0.855 29.000 0.300 1.000   NA
 574072 574073 RPA4607 RPA4608 nifV nifS2 TRUE 0.981 -7.000 0.250 1.000 Y NA
 574073 574074 RPA4608 RPA4609 nifS2 nifU TRUE 0.981 -3.000 0.716 1.000 N NA
 574074 574075 RPA4609 RPA4610 nifU   TRUE 0.790 28.000 0.210 NA   NA
 574075 574076 RPA4610 RPA4611   nifQ FALSE 0.018 408.000 0.094 NA   NA
 574076 574077 RPA4611 RPA4612 nifQ fdxB TRUE 0.904 18.000 0.307 1.000   NA
 574077 574078 RPA4612 RPA4613 fdxB   TRUE 0.668 61.000 0.253 NA   NA
 574078 574079 RPA4613 RPA4614     TRUE 0.926 19.000 0.486 NA   NA
 574079 574080 RPA4614 RPA4615   nifX TRUE 0.950 2.000 0.309 NA   NA
 574080 574081 RPA4615 RPA4616 nifX nifN TRUE 0.929 56.000 0.663 0.006   NA
 574081 574082 RPA4616 RPA4617 nifN nifE TRUE 0.994 11.000 0.475 0.002 Y NA
 574082 574083 RPA4617 RPA4618 nifE nifK TRUE 0.974 40.000 0.380 0.005 Y NA
 574083 574084 RPA4618 RPA4619 nifK nifD TRUE 0.973 89.000 0.902 0.005 Y NA
 574084 574085 RPA4619 RPA4620 nifD nifH4 TRUE 0.627 72.000 0.033 0.005 N NA
 574085 574086 RPA4620 RPA4621 nifH4   FALSE 0.000 577.000 0.000 NA   NA
 574086 574087 RPA4621 RPA4622     TRUE 0.813 16.000 0.120 NA   NA
 574087 574088 RPA4622 RPA4623   fixU TRUE 0.899 3.000 0.127 NA   NA
 574088 574089 RPA4623 RPA4624 fixU   TRUE 0.827 38.000 0.089 0.006   NA
 574089 574090 RPA4624 RPA4625   nifZ TRUE 0.977 0.000 0.286 0.006   NA
 574090 574091 RPA4625 RPA4626 nifZ   TRUE 0.924 -3.000 0.171 1.000   NA
 574091 574092 RPA4626 RPA4627     TRUE 0.974 -10.000 0.385 0.008   NA
 574092 574093 RPA4627 RPA4628   hesB TRUE 0.932 4.000 0.233 NA   NA
 574093 574094 RPA4628 RPA4629 hesB ferN TRUE 0.680 11.000 0.020 NA   NA
 574094 574095 RPA4629 RPA4630 ferN nifB TRUE 0.694 24.000 0.061 1.000   NA
 574095 574096 RPA4630 RPA4631 nifB fer1 FALSE 0.400 159.000 0.087 1.000   NA
 574096 574097 RPA4631 RPA4632 fer1 nifA FALSE 0.008 273.000 0.000 1.000   NA
 574097 574098 RPA4632 RPA4633 nifA fixR2 FALSE 0.005 313.000 0.000 1.000 N NA
 574100 574101 RPA4635 RPA4636 feoB   TRUE 0.965 38.000 0.500 1.000 Y NA
 574103 574104 RPA4638 RPA4639     FALSE 0.109 379.000 0.000 0.003 Y NA
 574104 574105 RPA4639 RPA4640     FALSE 0.006 206.000 0.000 NA   NA
 574105 574106 RPA4640 RPA4641   cbbM FALSE 0.001 297.000 0.000 NA   NA
 574106 574107 RPA4641 RPA4642 cbbM cbbA TRUE 0.872 59.000 0.135 1.000 Y NA
 574107 574108 RPA4642 RPA4643 cbbA cbbT1 TRUE 0.956 62.000 0.692 1.000 Y NA
 574108 574109 RPA4643 RPA4644 cbbT1 cbbP FALSE 0.370 83.000 0.051 1.000 N NA
 574109 574110 RPA4644 RPA4645 cbbP cbbF TRUE 0.845 38.000 0.120 0.009 N NA
 574112 574113 RPA4647 RPA4648 kdgR   TRUE 0.689 81.000 0.333 1.000 N NA
 574113 574114 RPA4648 RPA4649     TRUE 0.958 34.000 0.750 0.047 N NA
 574114 574115 RPA4649 RPA4650   potA TRUE 0.966 -3.000 0.429 1.000 N NA
 574116 574117 RPA4651 RPA4652     TRUE 0.997 0.000 0.750 0.001 Y NA
 574117 574118 RPA4652 RPA4653   bisC FALSE 0.194 33.000 0.000 1.000 N NA
 574118 574119 RPA4653 RPA4654 bisC   TRUE 0.582 17.000 0.019 NA   NA
 574119 574120 RPA4654 RPA4655   fucA FALSE 0.013 82.000 0.000 NA   NA
 574120 574121 RPA4655 RPA4656 fucA   TRUE 0.808 31.000 0.000 NA Y NA
 574121 574122 RPA4656 RPA4657   kduD TRUE 0.618 47.000 0.130 NA N NA
 574122 574123 RPA4657 RPA4658 kduD   FALSE 0.194 33.000 0.000 1.000 N NA
 574123 574124 RPA4658 RPA4659     FALSE 0.069 77.000 0.000 1.000   NA
 574125 574126 RNA_58 RNA_53 rrnA 5S rRNA FALSE 0.085 -185.000 0.000 NA   NA
 574126 574127 RNA_53 RNA_54 5S rRNA 23S rRNA FALSE 0.014 77.000 0.000 NA   NA
 574127 5451052 RNA_54 RPA_RNA45 23S rRNA tRNA-Ala3 FALSE 0.001 345.000 0.000 NA   NA
 5451052 5451053 RPA_RNA45 RPA_RNA44 tRNA-Ala3 tRNA-Ile1 FALSE 0.036 34.000 0.000 NA   NA
 5451053 574130 RPA_RNA44 RNA_55 tRNA-Ile1 16S rRNA FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 574130 5451054 RNA_55 RPA_RNA43 16S rRNA tRNA-Ser4 FALSE 0.000 866.000 0.000 NA   NA
 5451054 574132 RPA_RNA43 RPA4660 tRNA-Ser4 otsA FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 574132 574133 RPA4660 RPA4661 otsA otsB TRUE 0.836 157.000 0.021 0.001 Y NA
 574133 574134 RPA4661 RPA4662 otsB   TRUE 0.973 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 574134 574135 RPA4662 RPA4663     FALSE 0.245 181.000 0.037 1.000 N NA
 574135 574136 RPA4663 RPA4664     FALSE 0.060 119.000 0.000 1.000 N NA
 574137 574138 RPA4665 RPA4666 leuA coxS FALSE 0.005 321.000 0.000 1.000 N NA
 574138 574139 RPA4666 RPA4667 coxS coxL TRUE 0.877 111.000 0.125 0.002 Y NA
 574139 574140 RPA4667 RPA4668 coxL coxM TRUE 0.949 109.000 0.525 0.002 Y NA
 574140 574141 RPA4668 RPA4669 coxM   TRUE 0.681 185.000 0.068 1.000 Y NA
 574142 574143 RPA4670 RPA4671 fahA maiA FALSE 0.136 292.000 0.045 0.001 N NA
 574143 574144 RPA4671 RPA4672 maiA hmgA TRUE 0.869 -3.000 0.060 1.000 N NA
 574144 574145 RPA4672 RPA4673 hmgA cphA1 FALSE 0.544 57.000 0.085 1.000   NA
 574145 574146 RPA4673 RPA4674 cphA1   FALSE 0.140 227.000 0.081 NA   NA
 574146 574147 RPA4674 RPA4675     FALSE 0.267 290.000 0.681 NA   NA
 574148 574149 RPA4676 RPA4677     FALSE 0.049 171.000 0.000 1.000   NA
 574149 574150 RPA4677 RPA4678     TRUE 0.667 105.000 0.400 1.000   NA
 574150 574151 RPA4678 RPA4679     TRUE 0.795 159.000 0.167 NA Y NA
 574151 574152 RPA4679 RPA4680     TRUE 0.984 0.000 0.857 NA N NA
 574152 574153 RPA4680 RPA4681     FALSE 0.391 42.000 0.022 NA N NA
 574153 574154 RPA4681 RPA4682     TRUE 0.729 7.000 0.022 NA   NA
 574157 574158 RPA4685 RPA4686 lysS   TRUE 0.612 34.000 0.050 1.000 N NA
 574160 574161 RPA4688 RPA4689     FALSE 0.529 176.000 0.286 NA   NA
 574162 574163 RPA4690 RPA4691     FALSE 0.009 178.000 0.000 NA   NA
 574163 574164 RPA4691 RPA4692     FALSE 0.011 149.000 0.000 NA   NA
 574166 574167 RPA4694 RPA4695   ligR TRUE 0.854 22.000 0.227 1.000   NA
 574167 574168 RPA4695 RPA4696 ligR FldA FALSE 0.435 127.000 0.175 NA   NA
 574168 574169 RPA4696 RPA4697 FldA ligJ TRUE 0.559 170.000 0.300 NA   NA
 574169 574170 RPA4697 RPA4698 ligJ FldZ TRUE 0.963 3.000 0.382 1.000   NA
 574170 574171 RPA4698 RPA4699 FldZ FldX TRUE 0.933 0.000 0.176 1.000 N NA
 574171 574172 RPA4699 RPA4700 FldX ligI FALSE 0.123 254.000 0.117 1.000   NA
 574172 574173 RPA4700 RPA4701 ligI ligA TRUE 0.591 107.000 0.294 1.000   NA
 574173 574174 RPA4701 RPA4702 ligA ligB TRUE 0.992 0.000 0.750 0.001   NA
 574174 574175 RPA4702 RPA4703 ligB ligC TRUE 0.985 2.000 0.588 0.058   NA
 574175 574176 RPA4703 RPA4704 ligC   FALSE 0.007 193.000 0.000 NA   NA
 574176 574177 RPA4704 RPA4705   hisE2 FALSE 0.011 106.000 0.000 NA   NA
 574177 574178 RPA4705 RPA4706 hisE2   FALSE 0.188 102.000 0.021 NA   NA
 574178 574179 RPA4706 RPA4707     FALSE 0.453 53.000 0.059 NA   NA
 574179 574180 RPA4707 RPA4708     FALSE 0.350 146.000 0.093 NA   NA
 574180 574181 RPA4708 RPA4709     FALSE 0.248 158.000 0.040 NA   NA
 574181 574182 RPA4709 RPA4710     TRUE 0.551 123.000 0.300 NA   NA
 574182 574183 RPA4710 RPA4711     TRUE 0.766 154.000 0.667 NA   NA
 574186 574187 RPA4714 RPA4715   modC FALSE 0.189 148.000 0.008 1.000   NA
 574187 574188 RPA4715 RPA4716 modC modB TRUE 0.994 -3.000 0.308 0.001 Y NA
 574188 574189 RPA4716 RPA4717 modB modA TRUE 0.865 238.000 0.660 0.001 Y NA
 574189 574190 RPA4717 RPA4718 modA modE FALSE 0.540 145.000 0.026 0.001   NA
 574193 574194 RPA4721 RPA4722     TRUE 0.966 -3.000 0.231 0.058 N NA
 574194 574195 RPA4722 RPA4723   polA FALSE 0.001 999.000 0.000 1.000 N NA
 574195 574196 RPA4723 RPA4724 polA pyrE FALSE 0.005 318.000 0.000 1.000 N NA
 574196 574197 RPA4724 RPA4725 pyrE   FALSE 0.181 103.000 0.019 NA   NA
 574199 574200 RPA4727 RPA4728 glgA2   FALSE 0.037 281.000 0.039 NA   NA
 574200 574201 RPA4728 RPA4729   rocF FALSE 0.291 56.000 0.017 NA   NA
 574201 574202 RPA4729 RPA4730 rocF   FALSE 0.011 248.000 0.000 1.000   NA
 574205 574206 RPA4733 RPA4734 plsC   TRUE 0.891 14.000 0.250 NA   NA
 574206 574207 RPA4734 RPA4735     FALSE 0.011 103.000 0.000 NA   NA
 574207 574208 RPA4735 RPA4736   ftsE FALSE 0.005 214.000 0.000 NA   NA
 574209 574210 RPA4737 RPA4738     FALSE 0.515 60.000 0.104 NA   NA
 574213 574214 RPA4741 RPA4742 lysA   TRUE 0.621 9.000 0.006 NA   NA
 574214 574215 RPA4742 RPA4743   argH FALSE 0.232 55.000 0.005 NA   NA
 574217 574218 RPA4745 RPA4746     FALSE 0.294 67.000 0.029 NA   NA
 574220 574221 RPA4748 RPA4749 hbdA etfA FALSE 0.407 166.000 0.092 1.000 N NA
 574221 574222 RPA4749 RPA4750 etfA etfB TRUE 0.992 0.000 0.242 0.013 Y NA
 574222 574223 RPA4750 RPA4751 etfB   FALSE 0.248 106.000 0.028 1.000   NA
 574225 574226 RPA4753 RPA4754     FALSE 0.419 100.000 0.022 0.082   NA
 574229 574230 RPA4757 RPA4758     FALSE 0.000 436.000 0.000 NA   NA
 574232 574233 RPA4760 RPA4761     FALSE 0.001 280.000 0.000 NA   NA
 574240 574241 RPA4767 RPA4768     TRUE 0.960 0.000 0.333 1.000   NA
 574241 574242 RPA4768 RPA4769   opgC TRUE 0.947 -3.000 0.308 NA   NA
 574244 574245 RPA4771 RPA4772   argF FALSE 0.065 272.000 0.052 1.000 N NA
 574245 574246 RPA4772 RPA4773 argF argD TRUE 0.972 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 574248 574249 RPA4775 RPA4776 phoB phoU FALSE 0.478 78.000 0.128 NA N NA
 574249 574250 RPA4776 RPA4777 phoU pstB TRUE 0.937 24.000 0.126 NA Y NA
 574250 574251 RPA4777 RPA4778 pstB pstA TRUE 0.996 -3.000 0.526 0.001 Y NA
 574251 574252 RPA4778 RPA4779 pstA pstC TRUE 0.996 2.000 0.537 0.001 Y NA
 574252 574253 RPA4779 RPA4780 pstC pstS1 TRUE 0.802 214.000 0.178 0.001 Y NA
 574253 574254 RPA4780 RPA4781 pstS1 phoR FALSE 0.239 149.000 0.019 1.000 N NA
 574254 574255 RPA4781 RPA4782 phoR   TRUE 0.722 4.000 0.015 NA   NA
 574255 574256 RPA4782 RPA4783     FALSE 0.211 248.000 0.286 NA   NA
 574256 574257 RPA4783 RPA4784     TRUE 0.982 4.000 0.846 NA   NA
 574258 574259 RPA4785 RPA4786   rhlG TRUE 0.684 61.000 0.240 1.000   NA
 574259 574260 RPA4786 RPA4787 rhlG   FALSE 0.024 223.000 0.000 1.000 N NA
 574262 574263 RPA4789 RPA4790     TRUE 0.955 57.000 0.310 0.011 Y NA
 574263 574264 RPA4790 RPA4791     TRUE 0.994 -3.000 0.414 0.016 Y NA
 574264 574265 RPA4791 RPA4792     TRUE 0.761 205.000 0.150 0.069 Y NA
 574265 574266 RPA4792 RPA4793   QxtA FALSE 0.001 508.000 0.000 1.000 N NA
 574266 574267 RPA4793 RPA4794 QxtA qxtB TRUE 0.987 14.000 0.324 0.058 Y NA
 574267 574268 RPA4794 RPA4795 qxtB   TRUE 0.940 -3.000 0.270 NA   NA
 574268 574269 RPA4795 RPA4796     TRUE 0.582 42.000 0.091 NA   NA
 574269 574270 RPA4796 RPA4797     TRUE 0.621 47.000 0.140 NA   NA
 574271 574272 RPA4798 RPA4799     TRUE 0.964 167.000 0.808 0.006 Y NA
 574272 574273 RPA4799 RPA4800     FALSE 0.001 766.000 0.000 1.000 N NA
 574273 574274 RPA4800 RPA4801     FALSE 0.394 89.000 0.091 NA N NA
 574274 574275 RPA4801 RPA4802     FALSE 0.248 76.000 0.024 NA   NA
 574276 574277 RPA4803 RPA4804     FALSE 0.318 157.000 0.069 NA   NA
 574277 574278 RPA4804 RPA4805     FALSE 0.010 174.000 0.000 NA   NA
 574282 574283 RPA4809 RPA4810     TRUE 0.980 -3.000 0.680 1.000 N NA
 574283 574284 RPA4810 RPA4811     TRUE 0.968 -10.000 0.627 1.000   NA
 574284 574285 RPA4811 RPA4812     FALSE 0.472 67.000 0.098 NA   NA
 574286 574287 RPA4813 RPA4814     FALSE 0.414 86.000 0.097 NA N NA
 574287 574288 RPA4814 RPA4815   htpG FALSE 0.207 88.000 0.004 1.000 N NA
 574288 574289 RPA4815 RPA4816 htpG   FALSE 0.398 88.000 0.003 0.081 N NA
 574289 574290 RPA4816 RPA4817     TRUE 0.997 -3.000 0.963 0.088 Y NA
 574290 574291 RPA4817 RPA4818     TRUE 0.961 0.000 0.344 1.000   NA
 574291 574292 RPA4818 RPA4819     FALSE 0.268 98.000 0.049 NA   NA
 574292 574293 RPA4819 RPA4820   eIF-2B FALSE 0.106 184.000 0.006 NA   NA
 574293 574294 RPA4820 RPA4821 eIF-2B   FALSE 0.259 174.000 0.034 1.000 N NA
 574295 574296 RPA4822 RPA4823     TRUE 0.789 166.000 0.444 0.068 N NA
 574298 574299 RPA4825 RPA4826   recQ FALSE 0.087 76.000 0.000 1.000 N NA
 574299 574300 RPA4826 RPA4827 recQ   FALSE 0.220 68.000 0.011 NA   NA
 574304 574305 RPA4831 RPA4832   clcD FALSE 0.021 56.000 0.000 NA   NA
 574306 574307 RPA4833 RPA4834   msrA2 FALSE 0.242 136.000 0.022 1.000 N NA
 574307 574308 RPA4834 RPA4835 msrA2   FALSE 0.213 168.000 0.032 NA   NA
 574309 569419 RPA4836 RPA0001 rpsT dnaA FALSE 0.001 1234.000 0.000 1.000 N NA
 1759855 1759856 pRPA1 pRPA2 repA parA FALSE 0.000 486.000 0.000 NA N NA
 1759856 1759857 pRPA2 pRPA3 parA endo FALSE 0.054 153.000 0.000 1.000   NA
 1759857 1759858 pRPA3 pRPA4 endo meth TRUE 0.983 -3.000 0.500 0.034   NA
 1759858 1759859 pRPA4 pRPA5 meth res FALSE 0.291 141.000 0.000 0.034   NA
 1759861 1759855 pRPA7 pRPA1   repA FALSE 0.000 807.000 0.000 NA   NA