MicrobesOnline Operon Predictions for Dichelobacter nodosus VCS1703A

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3356082 3356083 DNO_0001 DNO_0002 dnaA dnaN TRUE 0.687 210.000 0.328 1.000 Y NA
 3356083 3356084 DNO_0002 DNO_0003 dnaN   FALSE 0.268 66.000 0.000 1.000 N NA
 3356084 3356085 DNO_0003 DNO_0005     TRUE 0.817 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3356087 3356088 DNO_0006 DNO_0007     FALSE 0.079 141.000 0.000 NA   NA
 3356089 3356090 DNO_0008 DNO_0009     FALSE 0.280 48.000 0.000 NA   NA
 3356090 3356091 DNO_0009 DNO_0010     TRUE 0.384 30.000 0.000 NA   NA
 3356092 3356093 DNO_0011 DNO_0012 uspA   FALSE 0.044 215.000 0.000 1.000 N NA
 3356095 3356096 DNO_0014 DNO_0015     TRUE 0.801 74.000 0.143 1.000 Y NA
 3356099 3356100 DNO_0017 DNO_0019 relA   TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3356100 3356101 DNO_0019 DNO_0020   maeB TRUE 0.321 41.000 0.000 1.000 N NA
 3356102 3356103 DNO_0021 DNO_0022     TRUE 0.911 -10.000 0.013 NA   NA
 3356103 3356104 DNO_0022 DNO_0023     TRUE 0.975 3.000 0.054 NA   NA
 3356104 3356105 DNO_0023 DNO_0024     TRUE 0.689 -28.000 0.000 NA   NA
 3356105 3356106 DNO_0024 DNO_0025     FALSE 0.053 183.000 0.000 NA   NA
 3356107 3356108 DNO_0026 DNO_0027 queA truB TRUE 0.915 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3356108 3356109 DNO_0027 DNO_0028 truB rbfA TRUE 0.997 3.000 0.318 1.000 Y NA
 3356109 3356110 DNO_0028 DNO_0029 rbfA infB TRUE 0.999 0.000 0.530 1.000 Y NA
 3356110 3356111 DNO_0029 DNO_0030 infB nusA TRUE 0.986 21.000 0.342 1.000 N NA
 3356111 3356112 DNO_0030 DNO_0031 nusA   TRUE 0.997 19.000 0.759 NA   NA
 3356112 3356113 DNO_0031 DNO_0032     FALSE 0.244 66.000 0.000 NA   NA
 3356114 3356115 DNO_0033 DNO_0034     FALSE 0.184 186.000 0.000 0.004 Y NA
 3356115 3356116 DNO_0034 DNO_0035     FALSE 0.034 249.000 0.000 NA   NA
 3356116 3356117 DNO_0035 DNO_0036     FALSE 0.162 88.000 0.000 NA   NA
 3356118 3356119 DNO_0037 DNO_0038   secF FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 3356119 3356120 DNO_0038 DNO_0039 secF secD TRUE 0.997 11.000 0.206 0.002 Y NA
 3356120 3356121 DNO_0039 DNO_0040 secD   TRUE 0.658 68.000 0.045 NA Y NA
 3356121 3356122 DNO_0040 DNO_0041   xerC FALSE 0.054 181.000 0.000 NA N NA
 3356122 3356123 DNO_0041 DNO_0042 xerC dapF TRUE 0.935 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3356123 3356124 DNO_0042 DNO_0043 dapF   TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 3356125 3356126 DNO_0044 DNO_0045     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356126 3356127 DNO_0045 DNO_0046     TRUE 0.450 26.000 0.000 NA   NA
 3356127 3356128 DNO_0046 DNO_0047     TRUE 0.731 -16.000 0.000 NA   NA
 3356128 3356129 DNO_0047 DNO_0048     TRUE 0.812 -6.000 0.000 NA   NA
 3356129 3356130 DNO_0048 DNO_0049     TRUE 0.627 28.000 0.000 0.055 N NA
 3356131 3356132 DNO_0050 DNO_0051     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 3356132 3356133 DNO_0051 DNO_0052     FALSE 0.250 61.000 0.000 NA   NA
 3356134 3356135 DNO_0053 DNO_0054     TRUE 0.428 27.000 0.000 NA   NA
 3356135 3356136 DNO_0054 DNO_0055     TRUE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 3356136 3356137 DNO_0055 DNO_0056     TRUE 0.450 26.000 0.000 NA   NA
 3356138 3356139 DNO_0057 DNO_0058     FALSE 0.118 104.000 0.000 NA   NA
 3356140 3356141 DNO_0059 DNO_0060   rpmB TRUE 0.486 25.000 0.000 NA   NA
 3356141 3356142 DNO_0060 DNO_0061 rpmB rpmG TRUE 0.998 12.000 0.332 0.040 Y NA
 3356143 3356144 DNO_0062 DNO_0063   pth TRUE 0.889 4.000 0.000 1.000 N NA
 3356144 3356145 DNO_0063 DNO_0064 pth rplY TRUE 0.999 6.000 0.496 0.064 Y NA
 3356145 3356146 DNO_0064 DNO_0065 rplY prsA TRUE 0.722 77.000 0.122 1.000 N NA
 3356146 3356147 DNO_0065 DNO_0066 prsA   FALSE 0.262 52.000 0.000 NA   NA
 3356147 3356148 DNO_0066 DNO_0067     FALSE 0.094 121.000 0.000 NA   NA
 3356148 3356149 DNO_0067 DNO_0068     TRUE 0.948 -13.000 0.062 1.000   NA
 3356150 3356151 DNO_0069 DNO_0070 hemA   TRUE 0.732 17.000 0.000 NA   NA
 3356151 3356152 DNO_0070 DNO_0071   prfA TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356152 3356153 DNO_0071 DNO_0072 prfA   TRUE 0.994 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 3356156 3356157 DNO_0075 DNO_0076   uvrA TRUE 0.395 31.000 0.000 1.000   NA
 3356157 3356158 DNO_0076 DNO_0077 uvrA purE TRUE 0.944 7.000 0.002 1.000 N NA
 3356158 3356159 DNO_0077 DNO_0078 purE purK TRUE 0.996 4.000 0.141 0.002 Y NA
 3356162 3356163 DNO_0081 DNO_0082   ribF FALSE 0.096 137.000 0.000 1.000 N NA
 3356163 3356164 DNO_0082 DNO_0083 ribF ileS TRUE 0.966 11.000 0.029 1.000 N NA
 3356164 3356165 DNO_0083 DNO_0084 ileS lspA TRUE 0.989 0.000 0.147 1.000 N NA
 3356166 3356167 DNO_0085 DNO_0086     TRUE 0.876 7.000 0.000 NA   NA
 3356168 3356169 DNO_0087 DNO_0088 hemN-1 purF TRUE 0.317 43.000 0.000 1.000 N NA
 3356169 3356170 DNO_0088 DNO_0089 purF   TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356170 3356171 DNO_0089 DNO_0090     TRUE 0.865 11.000 0.000 NA   NA
 3356171 3356172 DNO_0090 DNO_0091     FALSE 0.196 83.000 0.000 1.000   NA
 3356172 3356173 DNO_0091 DNO_0092   gap FALSE 0.108 120.000 0.000 1.000   NA
 3356174 3356175 DNO_0093 DNO_0094     FALSE 0.266 51.000 0.000 NA   NA
 3356176 3356177 DNO_0095 DNO_0096 rfaE   TRUE 0.607 32.000 0.006 1.000 N NA
 3356178 3356179 DNO_0097 DNO_0098     FALSE 0.083 138.000 0.000 NA   NA
 3356179 3356180 DNO_0098 DNO_0099   cydB TRUE 0.831 13.000 0.000 NA   NA
 3356180 3356181 DNO_0099 DNO_0100 cydB cydA TRUE 1.000 3.000 0.667 0.034 Y NA
 3356181 3356182 DNO_0100 DNO_0101 cydA cydC TRUE 0.465 31.000 0.000 1.000 Y NA
 3356182 3356183 DNO_0101 DNO_0102 cydC cydD TRUE 0.999 -25.000 0.631 0.010 Y NA
 3356183 3356184 DNO_0102 DNO_0103 cydD   TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 3356184 3356185 DNO_0103 DNO_0104     FALSE 0.167 86.000 0.000 NA   NA
 3356185 3356186 DNO_0104 DNO_0105     FALSE 0.046 268.000 0.000 1.000 Y NA
 3356186 3356187 DNO_0105 DNO_0106     FALSE 0.048 192.000 0.000 NA   NA
 3356187 3356188 DNO_0106 DNO_0107     TRUE 0.981 14.000 0.157 NA   NA
 3356190 3356191 DNO_0109 DNO_0110 fimB fimA FALSE 0.079 141.000 0.000 NA   NA
 3356192 3356193 DNO_0111 DNO_0112 aroA cmk TRUE 0.981 -22.000 0.209 1.000 N NA
 3356193 3356194 DNO_0112 DNO_0113 cmk rpsA TRUE 0.977 21.000 0.281 1.000 N NA
 3356194 3356195 DNO_0113 DNO_0114 rpsA ihfB TRUE 0.918 63.000 0.292 1.000 N NA
 3356195 3356196 DNO_0114 DNO_0115 ihfB   FALSE 0.265 79.000 0.000 1.000 Y NA
 3356196 3356197 DNO_0115 DNO_0116   pcnB FALSE 0.180 88.000 0.000 1.000 N NA
 3356197 3356198 DNO_0116 DNO_0117 pcnB   TRUE 0.993 -3.000 0.234 1.000 N NA
 3356199 3356200 DNO_0118 DNO_0119 ptsI   TRUE 0.969 0.000 0.000 0.003 Y NA
 3356201 3356202 DNO_0120 DNO_0121     TRUE 0.669 -46.000 0.000 NA   NA
 3356203 3356204 DNO_0122 DNO_0123     FALSE 0.136 186.000 0.000 0.018   NA
 3356204 3356205 DNO_0123 DNO_0124     FALSE 0.288 44.000 0.000 NA   NA
 3356206 3356207 DNO_0125 DNO_0126   ssb-1 FALSE 0.246 65.000 0.000 NA   NA
 3356208 3356209 DNO_0127 DNO_0128     TRUE 0.831 13.000 0.000 NA   NA
 3356209 3356210 DNO_0128 DNO_0129   dacB TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356211 3356212 DNO_0130 DNO_0131   hemN-2 TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356212 3356213 DNO_0131 DNO_0132 hemN-2   FALSE 0.050 201.000 0.000 1.000 N NA
 3356213 3356214 DNO_0132 DNO_0133     FALSE 0.084 216.000 0.000 0.088   NA
 3356214 3356215 DNO_0133 DNO_0134     FALSE 0.029 303.000 0.000 NA   NA
 3356215 3356216 DNO_0134 DNO_0135     TRUE 0.955 16.000 0.077 NA   NA
 3356216 3356217 DNO_0135 DNO_0136   feoA TRUE 0.352 45.000 0.000 NA Y NA
 3356217 3356218 DNO_0136 DNO_0137 feoA feoB TRUE 0.999 -3.000 0.692 1.000 Y NA
 3356218 3356219 DNO_0137 DNO_0138 feoB   FALSE 0.024 369.000 0.000 NA   NA
 3356219 3356220 DNO_0138 DNO_0139     TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356221 3356222 DNO_0140 DNO_0141     FALSE 0.030 276.000 0.000 NA   NA
 3356222 3356223 DNO_0141 DNO_0142     FALSE 0.070 150.000 0.000 NA   NA
 3356224 3356225 DNO_0143 DNO_0144 ahpC   TRUE 0.970 74.000 0.551 1.000 Y NA
 3356226 3356227 DNO_0145 DNO_0146     TRUE 0.990 12.000 0.200 NA   NA
 3356227 3356228 DNO_0146 DNO_0147     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 3356228 3356229 DNO_0147 DNO_0148     FALSE 0.262 52.000 0.000 NA   NA
 3356231 3356232 DNO_0150 DNO_0151     FALSE 0.282 54.000 0.000 1.000   NA
 3356232 3356233 DNO_0151 DNO_0152   topA TRUE 0.813 15.000 0.000 1.000 N NA
 3356233 3356234 DNO_0152 DNO_0153 topA   TRUE 0.586 70.000 0.040 NA   NA
 3356234 3356235 DNO_0153 DNO_0154   dprA TRUE 0.986 5.000 0.124 NA   NA
 3356235 3356236 DNO_0154 DNO_0155 dprA   TRUE 0.965 0.000 0.017 1.000   NA
 3356237 3356238 DNO_0156 DNO_0157 def fmt TRUE 0.986 -3.000 0.050 0.062 Y NA
 3356238 3356239 DNO_0157 DNO_0158 fmt rsmB TRUE 0.939 52.000 0.305 1.000 Y NA
 3356239 3356240 DNO_0158 DNO_0159 rsmB   TRUE 0.982 4.000 0.094 NA   NA
 3356240 3356241 DNO_0159 DNO_0160   ntrY TRUE 0.993 30.000 0.810 NA   NA
 3356241 3356242 DNO_0160 DNO_0161 ntrY ntrX TRUE 0.857 61.000 0.171 1.000 Y NA
 3356242 3356243 DNO_0161 DNO_0162 ntrX   TRUE 0.342 85.000 0.000 0.038   NA
 3356243 3356244 DNO_0162 DNO_0163   pgi TRUE 0.755 17.000 0.000 1.000   NA
 3356248 3356249 DNO_0167 DNO_0168 csy1 csy2 TRUE 0.999 -3.000 0.895 NA   NA
 3356249 3356250 DNO_0168 DNO_0169 csy2 csy3 TRUE 0.998 16.000 0.787 NA   NA
 3356250 3356251 DNO_0169 DNO_0170 csy3 csy4 TRUE 0.919 28.000 0.191 NA   NA
 3356251 3356252 DNO_0170 DNO_0171 csy4   FALSE 0.022 698.000 0.000 NA   NA
 3356252 3356253 DNO_0171 DNO_0172     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356254 3356255 DNO_0173 DNO_0174 vrlS vrlR TRUE 0.987 -10.000 0.231 NA   NA
 3356255 3356256 DNO_0174 DNO_0175 vrlR vrlQ TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 3356256 3356257 DNO_0175 DNO_0176 vrlQ vrlP TRUE 0.999 0.000 0.826 NA   NA
 3356257 3356258 DNO_0176 DNO_0177 vrlP vrlO TRUE 0.991 -3.000 0.203 NA   NA
 3356258 3356259 DNO_0177 DNO_0178 vrlO vrlN TRUE 0.876 4.000 0.000 NA   NA
 3356259 3356260 DNO_0178 DNO_0179 vrlN vrlM TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356260 3356261 DNO_0179 DNO_0180 vrlM vrlL TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 3356261 3356262 DNO_0180 DNO_0181 vrlL vrlK TRUE 0.636 92.000 0.120 1.000   NA
 3356262 3356263 DNO_0181 DNO_0182 vrlK vrlJ TRUE 0.999 -3.000 0.636 1.000   NA
 3356263 3356264 DNO_0182 DNO_0183 vrlJ vrlI TRUE 0.994 10.000 0.222 1.000   NA
 3356264 3356265 DNO_0183 DNO_0184 vrlI vrlH FALSE 0.249 127.000 0.015 NA   NA
 3356265 3356266 DNO_0184 DNO_0185 vrlH vrlG TRUE 0.957 -3.000 0.020 NA   NA
 3356266 3356267 DNO_0185 DNO_0186 vrlG vrlF TRUE 0.994 -15.000 0.400 1.000   NA
 3356267 3356268 DNO_0186 DNO_0187 vrlF vrlE TRUE 0.853 12.000 0.000 NA   NA
 3356268 3356269 DNO_0187 DNO_0188 vrlE vrlD FALSE 0.034 247.000 0.000 NA   NA
 3356269 3356270 DNO_0188 DNO_0189 vrlD vrlC TRUE 0.831 13.000 0.000 NA   NA
 3356270 10692609 DNO_0189 DNO_0190 vrlC   FALSE 0.242 67.000 0.000 NA   NA
 3356271 3356272 DNO_0191 DNO_0192     FALSE 0.026 333.000 0.000 NA   NA
 3356273 3356274 DNO_0193 DNO_0194 ssrA   FALSE 0.274 49.000 0.000 NA   NA
 3356274 3356275 DNO_0194 DNO_0195     FALSE 0.302 39.000 0.000 NA   NA
 3356276 3356277 DNO_0196 DNO_0197 pncB nadE TRUE 0.984 -3.000 0.013 0.003 Y NA
 3356277 3356278 DNO_0197 DNO_0198 nadE ppa FALSE 0.177 89.000 0.000 1.000 N NA
 3356280 3356281 DNO_0200 DNO_0201   pepT-1 TRUE 0.977 12.000 0.089 NA N NA
 3356282 3356283 DNO_0202 DNO_0203 recF   TRUE 0.948 6.000 0.004 1.000 N NA
 3356283 3356284 DNO_0203 DNO_0204     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356284 3356285 DNO_0204 DNO_0205     TRUE 0.547 23.000 0.000 NA   NA
 3356285 3356286 DNO_0205 DNO_0206   polA TRUE 0.481 26.000 0.000 1.000   NA
 3356289 3356290 DNO_0209 DNO_0210     TRUE 0.955 19.000 0.028 0.006 Y NA
 3356290 3356291 DNO_0210 DNO_0211   lpxH TRUE 0.963 0.000 0.015 1.000   NA
 3356291 3356292 DNO_0211 DNO_0212 lpxH   FALSE 0.085 145.000 0.000 1.000   NA
 3356292 3356293 DNO_0212 DNO_0213   glpK TRUE 0.917 34.000 0.086 0.002 Y NA
 3356293 3356294 DNO_0213 DNO_0214 glpK glpF TRUE 0.988 5.000 0.131 1.000 N NA
 3356295 3356296 DNO_0215 DNO_0216     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 3356296 10692610 DNO_0216 DNO_0217     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 10692610 3356297 DNO_0217 DNO_0218     FALSE 0.150 92.000 0.000 NA   NA
 3356297 3356298 DNO_0218 DNO_0219     TRUE 0.877 2.000 0.000 NA   NA
 3356298 3356299 DNO_0219 DNO_0220   hsdR TRUE 0.998 9.000 0.411 1.000   NA
 3356299 3356300 DNO_0220 DNO_0221 hsdR   TRUE 0.947 -7.000 0.039 NA   NA
 3356300 3356301 DNO_0221 DNO_0222   hsdS TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356301 3356302 DNO_0222 DNO_0223 hsdS hsdM TRUE 0.976 -9.000 0.045 0.059 Y NA
 3356303 3356304 DNO_0224 DNO_0225     TRUE 0.995 11.000 0.286 1.000   NA
 3356305 3356306 DNO_0226 DNO_0227   lon FALSE 0.054 192.000 0.000 1.000 N NA
 3356306 3356307 DNO_0227 DNO_0228 lon clpX TRUE 0.990 14.000 0.201 1.000 Y NA
 3356307 3356308 DNO_0228 DNO_0229 clpX clpP TRUE 0.994 17.000 0.352 1.000 Y NA
 3356308 3356309 DNO_0229 DNO_0230 clpP tig TRUE 0.690 242.000 0.351 1.000 Y NA
 3356309 3356310 DNO_0230 DNO_0231 tig   FALSE 0.254 56.000 0.000 NA   NA
 3356310 3356311 DNO_0231 DNO_0232     TRUE 0.732 17.000 0.000 NA   NA
 3356311 3356312 DNO_0232 DNO_0233     FALSE 0.294 41.000 0.000 NA   NA
 3356313 3356314 DNO_0234 DNO_0235     TRUE 0.663 -67.000 0.000 NA   NA
 3356315 3356316 DNO_0236 DNO_0237 trpS   TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA Y NA
 3356316 3356317 DNO_0237 DNO_0238     FALSE 0.247 65.000 0.000 NA N NA
 3356318 3356319 DNO_0239 DNO_0240     TRUE 0.953 4.000 0.000 0.020   NA
 3356319 3356320 DNO_0240 DNO_0241     TRUE 0.873 9.000 0.000 NA   NA
 3356321 3356322 DNO_0242 DNO_0243     FALSE 0.199 78.000 0.000 NA   NA
 3356322 3356323 DNO_0243 DNO_0244   holA TRUE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 3356323 3356324 DNO_0244 DNO_0245 holA   TRUE 0.991 -3.000 0.199 NA   NA
 3356324 3356325 DNO_0245 DNO_0246   leuS TRUE 0.989 -3.000 0.182 NA   NA
 3356325 3356326 DNO_0246 DNO_0247 leuS lnt TRUE 0.708 -31.000 0.000 1.000 N NA
 3356326 3356327 DNO_0247 DNO_0248 lnt   FALSE 0.076 156.000 0.000 1.000   NA
 3356327 3356328 DNO_0248 DNO_0249     FALSE 0.276 59.000 0.000 1.000   NA
 3356330 3356331 DNO_0251 DNO_0252 recC   TRUE 0.671 19.000 0.000 1.000   NA
 3356332 3356333 DNO_0253 DNO_0254   dgt TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 3356334 3356335 DNO_0255 DNO_0256     TRUE 0.985 16.000 0.196 NA Y NA
 3356335 3356336 DNO_0256 DNO_0257     TRUE 0.999 -3.000 0.741 1.000 Y NA
 3356336 3356337 DNO_0257 DNO_0258   gepC FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 3356338 3356339 DNO_0259 DNO_0260 gepB gepA FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 3356339 3356340 DNO_0260 DNO_0261 gepA   FALSE 0.046 197.000 0.000 NA   NA
 3356341 3356342 DNO_0262 DNO_0263   regA1 TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356342 3356343 DNO_0263 DNO_0264 regA1   FALSE 0.048 192.000 0.000 NA   NA
 3356343 3356344 DNO_0264 DNO_0265   vapD2 FALSE 0.021 909.000 0.000 NA   NA
 3356344 3356345 DNO_0265 DNO_0266 vapD2 vapE2 FALSE 0.021 866.000 0.000 NA   NA
 3356345 3356346 DNO_0266 DNO_0267 vapE2 vapF TRUE 0.769 -10.000 0.000 NA   NA
 3356350 3356351 DNO_0270 DNO_0272   vapI FALSE 0.249 63.000 0.000 NA   NA
 3356351 3356352 DNO_0272 DNO_0273 vapI   TRUE 0.995 10.000 0.286 NA   NA
 3356353 3356354 DNO_0274 DNO_0275 toxA1 vapA1 TRUE 0.831 13.000 0.000 NA   NA
 3356354 3356355 DNO_0275 DNO_0276 vapA1 vapB1 FALSE 0.026 336.000 0.000 NA   NA
 3356355 3356356 DNO_0276 DNO_0277 vapB1 vapC1 TRUE 0.997 -3.000 0.359 NA   NA
 3356357 3356358 DNO_0278 DNO_0279 vapD1 vapE1 FALSE 0.022 638.000 0.000 NA   NA
 3356358 3356359 DNO_0279 DNO_0280 vapE1 vapG1 FALSE 0.139 96.000 0.000 NA   NA
 3356359 3356360 DNO_0280 DNO_0281 vapG1 vapH TRUE 0.705 -21.000 0.000 NA   NA
 3356360 3356361 DNO_0281 DNO_0282 vapH intA1 FALSE 0.142 95.000 0.000 NA   NA
 3356361 3356362 DNO_0282 DNO_0283 intA1   FALSE 0.041 207.000 0.000 NA   NA
 3356362 3356363 DNO_0283 DNO_0284   glpA FALSE 0.262 52.000 0.000 NA   NA
 3356363 3356364 DNO_0284 DNO_0285 glpA   TRUE 0.454 114.000 0.079 1.000 N NA
 3356364 3356365 DNO_0285 DNO_0286   alaS TRUE 0.978 5.000 0.065 1.000 N NA
 3356365 3356366 DNO_0286 DNO_0287 alaS recX TRUE 0.529 100.000 0.085 1.000   NA
 3356366 3356367 DNO_0287 DNO_0288 recX recA TRUE 0.991 -10.000 0.296 1.000   NA
 3356367 3356368 DNO_0288 DNO_0289 recA   FALSE 0.275 60.000 0.000 1.000   NA
 3356368 3356369 DNO_0289 DNO_0290   gmhA FALSE 0.065 171.000 0.000 1.000   NA
 3356370 3356371 DNO_0291 DNO_0292   secB FALSE 0.214 79.000 0.000 1.000 N NA
 3356371 3356372 DNO_0292 DNO_0293 secB   TRUE 0.993 0.000 0.206 1.000 N NA
 3356372 3356373 DNO_0293 DNO_0294   rluA TRUE 0.813 15.000 0.000 1.000 N NA
 3356374 3356375 DNO_0295 DNO_0296     FALSE 0.125 101.000 0.000 NA   NA
 3356375 3356376 DNO_0296 DNO_0297     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 3356376 3356377 DNO_0297 DNO_0298   hemD TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 11477889 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4349.000 0.000 NA   NA
 11620252 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4349.000 0.000 NA   NA
 11762644 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4349.000 0.000 NA   NA
 11477890 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4371.000 0.000 NA   NA
 11620253 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4371.000 0.000 NA   NA
 11762645 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4371.000 0.000 NA   NA
 11477891 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4397.000 0.000 NA   NA
 11620254 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4397.000 0.000 NA   NA
 11762646 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4397.000 0.000 NA   NA
 11477892 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4419.000 0.000 NA   NA
 11620255 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4419.000 0.000 NA   NA
 11762647 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4419.000 0.000 NA   NA
 11477893 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4445.000 0.000 NA   NA
 11620256 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4445.000 0.000 NA   NA
 11762648 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4445.000 0.000 NA   NA
 11477894 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4467.000 0.000 NA   NA
 11620257 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4467.000 0.000 NA   NA
 11762649 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4467.000 0.000 NA   NA
 11477895 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4493.000 0.000 NA   NA
 11620258 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4493.000 0.000 NA   NA
 11762650 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4493.000 0.000 NA   NA
 11477896 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4515.000 0.000 NA   NA
 11620259 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4515.000 0.000 NA   NA
 11762651 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4515.000 0.000 NA   NA
 11477897 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4541.000 0.000 NA   NA
 11620260 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4541.000 0.000 NA   NA
 11762652 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4541.000 0.000 NA   NA
 11477898 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4563.000 0.000 NA   NA
 11620261 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4563.000 0.000 NA   NA
 11762653 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4563.000 0.000 NA   NA
 11477899 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4589.000 0.000 NA   NA
 11620262 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4589.000 0.000 NA   NA
 11762654 3356372   DNO_0293     FALSE NA 4589.000 0.000 NA   NA
 3356377 3356378 DNO_0298 DNO_0299 hemD hemC TRUE 0.993 -16.000 0.205 0.004 Y NA
 3356381 3356382 DNO_0302 DNO_0303 rne   TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356382 3356383 DNO_0303 DNO_0304   kdsB TRUE 0.989 -10.000 0.265 NA   NA
 3356383 3356384 DNO_0304 DNO_0305 kdsB uvrC TRUE 0.953 -7.000 0.005 0.062 N NA
 3356384 3356385 DNO_0305 DNO_0306 uvrC pgsA TRUE 0.994 2.000 0.227 1.000 N NA
 3356385 3356386 DNO_0306 DNO_0307 pgsA rnt TRUE 0.885 10.000 0.000 1.000 N NA
 3356386 3356387 DNO_0307 DNO_0308 rnt   TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356389 3356390 DNO_0310 DNO_0311     FALSE 0.069 151.000 0.000 NA   NA
 3356390 3356391 DNO_0311 DNO_0312     FALSE 0.053 237.000 0.000 1.000 Y NA
 3356391 3356392 DNO_0312 DNO_0313     FALSE 0.030 273.000 0.000 NA   NA
 3356392 3356393 DNO_0313 DNO_0314   fabA TRUE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 3356393 3356394 DNO_0314 DNO_0315 fabA fabB TRUE 0.953 78.000 0.451 1.000 Y NA
 3356394 3356395 DNO_0315 DNO_0316 fabB   TRUE 0.877 5.000 0.000 NA   NA
 3356395 3356396 DNO_0316 DNO_0317     TRUE 0.831 13.000 0.000 NA   NA
 3356396 3356397 DNO_0317 DNO_0318     FALSE 0.056 176.000 0.000 NA   NA
 3356397 3356398 DNO_0318 DNO_0319   tgt FALSE 0.087 144.000 0.000 1.000   NA
 3356400 3356401 DNO_0321 DNO_0322 gyrA   FALSE 0.034 269.000 0.000 1.000   NA
 3356403 3356404 DNO_0324 DNO_0325 dnaB alr TRUE 0.990 1.000 0.154 1.000 N NA
 3356404 3356405 DNO_0325 DNO_0326 alr radA TRUE 0.915 -7.000 0.004 1.000 N NA
 3356405 3356406 DNO_0326 DNO_0327 radA galU TRUE 0.889 4.000 0.000 1.000 N NA
 3356406 3356407 DNO_0327 DNO_0328 galU   FALSE 0.232 75.000 0.000 1.000 N NA
 3356407 3356408 DNO_0328 DNO_0329   sucA TRUE 0.524 39.000 0.003 1.000 N NA
 3356408 3356409 DNO_0329 DNO_0331 sucA sucB TRUE 0.988 36.000 0.667 1.000 Y NA
 3356411 3356412 DNO_0332 DNO_0333     FALSE 0.035 242.000 0.000 NA   NA
 3356412 3356413 DNO_0333 DNO_0334     TRUE 0.309 47.000 0.000 1.000   NA
 3356413 3356414 DNO_0334 DNO_0335     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA   NA
 3356414 3356415 DNO_0335 DNO_0336     TRUE 0.981 10.000 0.076 NA Y NA
 3356415 10692611 DNO_0336 DNO_0337     TRUE 0.322 35.000 0.000 NA   NA
 10692611 3356416 DNO_0337 DNO_0338   glf TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356416 3356417 DNO_0338 DNO_0339 glf   TRUE 0.967 1.000 0.028 NA   NA
 3356417 3356418 DNO_0339 DNO_0340     TRUE 0.808 14.000 0.000 NA   NA
 3356420 3356421 DNO_0342 DNO_0343     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356421 3356422 DNO_0343 DNO_0344   pilM FALSE 0.032 260.000 0.000 NA N NA
 3356422 3356423 DNO_0344 DNO_0345 pilM pilN TRUE 0.990 0.000 0.143 NA Y NA
 3356423 3356424 DNO_0345 DNO_0346 pilN pilO TRUE 0.999 13.000 0.770 NA Y NA
 3356424 3356425 DNO_0346 DNO_0347 pilO pilP TRUE 0.998 16.000 0.680 NA Y NA
 3356425 3356426 DNO_0347 DNO_0348 pilP pilQ TRUE 0.995 23.000 0.668 NA Y NA
 3356426 3356427 DNO_0348 DNO_0349 pilQ gatB FALSE 0.274 61.000 0.000 1.000 N NA
 3356427 3356428 DNO_0349 DNO_0350 gatB typA FALSE 0.226 76.000 0.000 1.000 N NA
 3356428 3356429 DNO_0350 DNO_0351 typA valS FALSE 0.108 120.000 0.000 1.000 N NA
 3356429 3356430 DNO_0351 DNO_0352 valS   FALSE 0.047 206.000 0.000 1.000 N NA
 3356431 3356432 DNO_0353 DNO_0354 dksA   FALSE 0.276 59.000 0.000 1.000 N NA
 3356432 3356433 DNO_0354 DNO_0355     TRUE 0.999 -3.000 0.755 1.000 Y NA
 3356434 3356435 DNO_0356 DNO_0357 priA   FALSE 0.242 73.000 0.000 1.000   NA
 3356437 3356438 DNO_0359 DNO_0360 tilS pyrG TRUE 0.598 47.000 0.016 1.000 N NA
 3356438 3356439 DNO_0360 DNO_0361 pyrG kdsA TRUE 0.986 -3.000 0.138 1.000 N NA
 3356439 3356440 DNO_0361 DNO_0362 kdsA eno TRUE 0.985 -3.000 0.125 1.000 N NA
 3356440 3356441 DNO_0362 DNO_0363 eno   TRUE 0.898 58.000 0.241 1.000 N NA
 3356441 3356442 DNO_0363 DNO_0364     FALSE 0.144 100.000 0.000 1.000 N NA
 3356442 3356443 DNO_0364 DNO_0365   sbcD TRUE 0.892 1.000 0.000 1.000 N NA
 3356443 3356444 DNO_0365 DNO_0366 sbcD sbcC TRUE 0.999 -10.000 0.669 0.004 Y NA
 3356444 3356445 DNO_0366 DNO_0367 sbcC   TRUE 0.889 4.000 0.000 1.000 N NA
 3356446 3356447 DNO_0368 DNO_0369     TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 3356447 3356448 DNO_0369 DNO_0370     FALSE 0.122 102.000 0.000 NA   NA
 3356448 3356449 DNO_0370 DNO_0371     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356449 3356450 DNO_0371 DNO_0372     TRUE 0.715 -19.000 0.000 NA   NA
 3356450 3356451 DNO_0372 DNO_0373     TRUE 0.996 -3.000 0.313 NA Y NA
 3356452 3356453 DNO_0374 DNO_0375     TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356453 3356454 DNO_0375 DNO_0376   guaB FALSE 0.053 183.000 0.000 NA   NA
 3356454 3356455 DNO_0376 DNO_0377 guaB   FALSE 0.121 112.000 0.000 1.000 N NA
 3356455 3356456 DNO_0377 DNO_0378     TRUE 0.731 -16.000 0.000 NA   NA
 3356456 3356457 DNO_0378 DNO_0379     FALSE 0.297 40.000 0.000 NA   NA
 3356457 3356458 DNO_0379 DNO_0380   guaA TRUE 0.873 9.000 0.000 NA   NA
 10692613 3356462 DNO_0385 DNO_0386     FALSE 0.023 402.000 0.000 NA   NA
 3356464 3356465 DNO_0388 DNO_0389   ligA FALSE 0.118 104.000 0.000 NA N NA
 3356465 3356466 DNO_0389 DNO_0390 ligA   TRUE 0.956 -21.000 0.106 1.000   NA
 3356467 3356468 DNO_0391 DNO_0392     TRUE 0.943 5.000 0.000 0.070   NA
 3356468 3356469 DNO_0392 DNO_0393     FALSE 0.201 81.000 0.000 1.000   NA
 3356472 3356473 DNO_0396 DNO_0397   ubiA TRUE 0.889 7.000 0.000 1.000 N NA
 3356474 3356475 DNO_0398 DNO_0399     FALSE 0.072 149.000 0.000 NA   NA
 3356476 3356477 DNO_0400 DNO_0401     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356477 3356478 DNO_0401 DNO_0402     FALSE 0.309 37.000 0.000 NA   NA
 3356478 3356479 DNO_0402 DNO_0403     TRUE 0.831 13.000 0.000 NA   NA
 3356479 3356480 DNO_0403 DNO_0404   folC TRUE 0.946 6.000 0.004 NA N NA
 3356480 3356481 DNO_0404 DNO_0405 folC accD TRUE 0.997 -3.000 0.383 1.000 N NA
 3356481 3356482 DNO_0405 DNO_0406 accD   FALSE 0.021 771.000 0.000 NA   NA
 3356482 3356483 DNO_0406 DNO_0407     TRUE 0.853 12.000 0.000 NA   NA
 3356484 3356485 DNO_0408 DNO_0409 recD   FALSE 0.105 114.000 0.000 NA   NA
 3356485 3356486 DNO_0409 DNO_0410     TRUE 0.877 5.000 0.000 NA   NA
 3356486 3356487 DNO_0410 DNO_0411     FALSE 0.259 53.000 0.000 NA   NA
 3356488 3356489 DNO_0412 DNO_0413     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 3356489 3356490 DNO_0413 DNO_0414   apt FALSE 0.050 187.000 0.000 NA   NA
 3356491 3356492 DNO_0415 DNO_0416     TRUE 0.982 0.000 0.094 NA N NA
 3356492 3356493 DNO_0416 DNO_0417   rpmE FALSE 0.193 84.000 0.000 1.000 N NA
 3356493 3356494 DNO_0417 DNO_0418 rpmE dsbD FALSE 0.030 324.000 0.000 1.000 N NA
 3356494 3356495 DNO_0418 DNO_0419 dsbD aroQ FALSE 0.164 150.000 0.004 1.000 N NA
 3356495 3356496 DNO_0419 DNO_0420 aroQ accB TRUE 0.962 25.000 0.254 1.000 N NA
 3356496 3356497 DNO_0420 DNO_0421 accB accC TRUE 0.998 11.000 0.275 0.002 Y NA
 3356497 3356498 DNO_0421 DNO_0422 accC prmA TRUE 0.987 -3.000 0.152 1.000 N NA
 3356498 3356499 DNO_0422 DNO_0423 prmA   TRUE 0.979 1.000 0.042 1.000 Y NA
 3356499 3356500 DNO_0423 DNO_0425     TRUE 0.547 23.000 0.000 NA   NA
 3356501 3356502 DNO_0424 DNO_0426     TRUE 0.853 12.000 0.000 NA   NA
 3356502 3356503 DNO_0426 DNO_0427     TRUE 0.992 17.000 0.349 NA   NA
 3356505 3356506 DNO_0429 DNO_0430     FALSE 0.065 158.000 0.000 NA   NA
 3356506 3356507 DNO_0430 DNO_0431   xth-1 FALSE 0.159 89.000 0.000 NA   NA
 3356508 3356509 DNO_0432 DNO_0433     TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356509 3356510 DNO_0433 DNO_0434   pilS TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356510 3356511 DNO_0434 DNO_0435 pilS pilR TRUE 0.999 4.000 0.556 1.000 Y NA
 3356511 3356512 DNO_0435 DNO_0436 pilR murB TRUE 0.891 0.000 0.000 1.000 N NA
 3356512 3356513 DNO_0436 DNO_0437 murB   TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3356513 3356514 DNO_0437 DNO_0438     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356514 3356515 DNO_0438 DNO_0439   ubiE TRUE 0.977 3.000 0.074 NA   NA
 3356515 3356516 DNO_0439 DNO_0440 ubiE   TRUE 0.981 14.000 0.145 1.000   NA
 3356516 3356517 DNO_0440 DNO_0441   ubiB TRUE 0.995 -16.000 0.432 1.000   NA
 3356517 3356518 DNO_0441 DNO_0442 ubiB   FALSE 0.073 158.000 0.000 1.000   NA
 3356519 3356520 DNO_0443 DNO_0444     TRUE 0.884 65.000 0.118 0.009 Y NA
 3356520 3356521 DNO_0444 DNO_0445     TRUE 0.991 3.000 0.176 1.000 N NA
 3356522 3356523 DNO_0446 DNO_0447   ackA FALSE 0.051 200.000 0.000 1.000   NA
 3356523 3356524 DNO_0447 DNO_0448 ackA pta TRUE 0.879 11.000 0.000 1.000   NA
 3356524 3356525 DNO_0448 DNO_0449 pta   FALSE 0.114 115.000 0.000 1.000   NA
 3356525 3356526 DNO_0449 DNO_0450     TRUE 0.983 3.000 0.010 0.010 Y NA
 3356526 3356527 DNO_0450 DNO_0451   tatC TRUE 0.982 23.000 0.314 NA Y NA
 3356528 3356529 DNO_0452 DNO_0453     TRUE 0.656 -91.000 0.000 NA   NA
 3356530 3356531 DNO_0454 DNO_0455     TRUE 0.999 -30.000 0.870 0.023 Y NA
 3356531 3356532 DNO_0455 DNO_0456     TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000   NA
 3356532 3356533 DNO_0456 DNO_0457   holC TRUE 0.812 15.000 0.000 1.000   NA
 3356534 10692614 DNO_0458 DNO_0459     FALSE 0.089 135.000 0.000 NA   NA
 10692614 3356535 DNO_0459 DNO_0460     FALSE 0.287 45.000 0.000 NA   NA
 3356535 3356536 DNO_0460 DNO_0461     FALSE 0.033 251.000 0.000 NA   NA
 3356536 3356537 DNO_0461 DNO_0462     FALSE 0.253 57.000 0.000 NA   NA
 3356537 3356538 DNO_0462 DNO_0463     FALSE 0.023 480.000 0.000 NA   NA
 3356539 3356540 DNO_0464 DNO_0466   ispZ TRUE 0.886 9.000 0.000 1.000   NA
 3356541 3356542 DNO_0465 DNO_0467     TRUE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 3356542 3356543 DNO_0467 DNO_0468   fbp FALSE 0.246 65.000 0.000 NA   NA
 3356543 3356544 DNO_0468 DNO_0469 fbp   FALSE 0.197 83.000 0.000 1.000 N NA
 3356544 3356545 DNO_0469 DNO_0470   nusB FALSE 0.160 181.000 0.000 0.031 Y NA
 3356545 3356546 DNO_0470 DNO_0471 nusB ribH TRUE 0.997 -3.000 0.347 1.000 N NA
 3356546 3356547 DNO_0471 DNO_0472 ribH ribB TRUE 0.731 62.000 0.004 0.003 Y NA
 3356547 3356548 DNO_0472 DNO_0473 ribB ribE TRUE 0.943 13.000 0.004 1.000 Y NA
 3356548 3356549 DNO_0473 DNO_0474 ribE ribD TRUE 0.997 15.000 0.456 1.000 Y NA
 3356549 3356550 DNO_0474 DNO_0475 ribD nrdR TRUE 0.984 -28.000 0.277 NA N NA
 3356550 3356551 DNO_0475 DNO_0476 nrdR glyA TRUE 0.928 16.000 0.024 NA N NA
 3356552 3356553 DNO_0477 DNO_0478 scpA   TRUE 0.998 -3.000 0.570 NA   NA
 3356553 3356554 DNO_0478 DNO_0479   rluB TRUE 0.942 -16.000 0.074 NA N NA
 3356554 3356555 DNO_0479 DNO_0480 rluB lipA FALSE 0.132 104.000 0.000 1.000 N NA
 3356555 3356556 DNO_0480 DNO_0481 lipA   TRUE 0.377 32.000 0.000 1.000   NA
 3356556 3356557 DNO_0481 DNO_0482     TRUE 0.996 -3.000 0.315 NA   NA
 3356557 3356558 DNO_0482 DNO_0483   ftsK FALSE 0.118 104.000 0.000 NA N NA
 3356558 3356559 DNO_0483 DNO_0484 ftsK   TRUE 0.994 14.000 0.305 1.000 N NA
 3356559 3356560 DNO_0484 DNO_0485     TRUE 0.990 3.000 0.167 1.000 N NA
 3356560 3356561 DNO_0485 DNO_0486   rplU FALSE 0.232 75.000 0.000 1.000 N NA
 3356561 3356562 DNO_0486 DNO_0487 rplU rpmA TRUE 0.999 13.000 0.667 0.032 Y NA
 3356562 3356563 DNO_0487 DNO_0488 rpmA   TRUE 0.939 64.000 0.335 1.000   NA
 3356564 3356565 DNO_0489 DNO_0490   pyrB FALSE 0.226 76.000 0.000 1.000 N NA
 3356566 3356567 DNO_0491 DNO_0492 dtd maf-1 TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA N NA
 3356567 3356568 DNO_0492 DNO_0493 maf-1 rng TRUE 0.732 17.000 0.000 NA N NA
 3356568 3356569 DNO_0493 DNO_0494 rng   FALSE 0.075 157.000 0.000 1.000 N NA
 3356569 3356570 DNO_0494 DNO_0495     FALSE 0.106 260.000 0.000 0.023 Y NA
 3356571 3356572 DNO_0496 DNO_0497     TRUE 0.991 3.000 0.185 NA   NA
 3356572 3356573 DNO_0497 DNO_0498     TRUE 0.715 -19.000 0.000 NA   NA
 3356573 3356574 DNO_0498 DNO_0499     TRUE 0.332 34.000 0.000 NA   NA
 3356575 3356576 DNO_0500 DNO_0501   prfC FALSE 0.159 89.000 0.000 NA   NA
 3356576 3356577 DNO_0501 DNO_0502 prfC   FALSE 0.093 138.000 0.000 1.000 N NA
 3356577 3356578 DNO_0502 DNO_0503     FALSE 0.099 136.000 0.000 1.000   NA
 3356578 3356579 DNO_0503 DNO_0505     TRUE 0.885 10.000 0.000 1.000   NA
 3356580 3356581 DNO_0504 DNO_0506 mvaD fumC TRUE 0.886 9.000 0.000 1.000 N NA
 3356581 3356582 DNO_0506 DNO_0507 fumC dcd FALSE 0.306 48.000 0.000 1.000 N NA
 3356582 3356583 DNO_0507 DNO_0508 dcd   TRUE 0.900 25.000 0.112 1.000 N NA
 3356583 3356584 DNO_0508 DNO_0509   aroE TRUE 0.827 14.000 0.000 1.000 N NA
 3356584 3356585 DNO_0509 DNO_0510 aroE hemB TRUE 0.959 -3.000 0.018 1.000 N NA
 3356586 3356587 DNO_0511 DNO_0512 dsbA   TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356587 3356588 DNO_0512 DNO_0513     TRUE 0.996 -34.000 0.642 NA   NA
 3356588 3356589 DNO_0513 DNO_0514     FALSE 0.096 137.000 0.000 1.000   NA
 3356589 3356590 DNO_0514 DNO_0515     FALSE 0.166 92.000 0.000 1.000   NA
 3356590 3356591 DNO_0515 DNO_0516     TRUE 0.890 2.000 0.000 1.000   NA
 3356591 3356592 DNO_0516 DNO_0517   hisS TRUE 0.961 -3.000 0.021 1.000   NA
 3356592 3356593 DNO_0517 DNO_0518 hisS   TRUE 0.990 -9.000 0.259 1.000   NA
 3356593 3356594 DNO_0518 DNO_0519     TRUE 0.998 -3.000 0.492 1.000   NA
 3356594 3356595 DNO_0519 DNO_0520   engA TRUE 0.993 10.000 0.203 1.000   NA
 3356598 3356599 DNO_0523 DNO_0524   rplT FALSE 0.235 69.000 0.000 NA   NA
 3356599 3356600 DNO_0524 DNO_0525 rplT rpmI TRUE 1.000 12.000 0.928 0.032 Y NA
 3356600 10692615 DNO_0525 DNO_0526 rpmI   TRUE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 10692615 3356601 DNO_0526 DNO_0527   thrS TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356603 3356604 DNO_0529 DNO_0530     TRUE 0.790 -10.000 0.000 1.000   NA
 3356606 3356607 DNO_0532 DNO_0533 rpoN   TRUE 0.890 2.000 0.000 1.000   NA
 3356607 3356608 DNO_0533 DNO_0534     TRUE 0.998 -3.000 0.543 NA   NA
 3356608 3356609 DNO_0534 DNO_0535     TRUE 0.993 -58.000 0.459 NA   NA
 3356609 3356610 DNO_0535 DNO_0536     TRUE 0.772 30.000 0.051 NA   NA
 3356610 3356611 DNO_0536 DNO_0537   gph TRUE 0.517 25.000 0.000 1.000   NA
 3356611 3356612 DNO_0537 DNO_0538 gph ubiG TRUE 0.994 -3.000 0.259 1.000   NA
 3356612 3356613 DNO_0538 DNO_0539 ubiG   FALSE 0.256 55.000 0.000 NA   NA
 3356613 3356614 DNO_0539 DNO_0540   rpe FALSE 0.199 78.000 0.000 NA   NA
 3356615 3356616 DNO_0541 DNO_0542 birA   TRUE 0.907 -12.000 0.010 1.000 N NA
 3356618 3356619 DNO_0544 DNO_0545 aceE aceF TRUE 0.961 -19.000 0.031 0.041 Y NA
 3356619 3356620 DNO_0545 DNO_0546 aceF   TRUE 0.317 43.000 0.000 1.000 N NA
 3356620 3356621 DNO_0546 DNO_0547     TRUE 0.958 70.000 0.333 0.043 N NA
 3356621 3356622 DNO_0547 DNO_0549     TRUE 0.998 10.000 0.333 0.068 Y NA
 3356623 3356624 DNO_0548 DNO_0550 nth rnfE TRUE 0.982 -3.000 0.109 1.000 N NA
 3356624 3356625 DNO_0550 DNO_0551 rnfE rnfG TRUE 1.000 -10.000 0.908 0.028 Y NA
 3356625 3356626 DNO_0551 DNO_0552 rnfG rnfD TRUE 1.000 7.000 0.924 0.028 Y NA
 3356626 3356627 DNO_0552 DNO_0553 rnfD rnfC TRUE 1.000 -3.000 0.814 0.028 Y NA
 3356627 3356628 DNO_0553 DNO_0554 rnfC rnfB TRUE 0.998 -13.000 0.537 0.008 Y NA
 3356628 3356629 DNO_0554 DNO_0555 rnfB rnfA TRUE 0.999 -3.000 0.564 0.028 Y NA
 3356630 3356631 DNO_0556 DNO_0557     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356631 3356632 DNO_0557 DNO_0558   uvrB TRUE 0.789 16.000 0.000 1.000 N NA
 3356632 3356633 DNO_0558 DNO_0559 uvrB   TRUE 0.396 31.000 0.000 1.000 N NA
 3356635 3356636 DNO_0561 DNO_0562 dapB   FALSE 0.231 70.000 0.000 NA   NA
 3356636 3356637 DNO_0562 DNO_0563     TRUE 0.968 1.000 0.033 NA   NA
 3356637 3356638 DNO_0563 DNO_0564   pyrF TRUE 0.984 -3.000 0.125 1.000 N NA
 3356638 3356639 DNO_0564 DNO_0565 pyrF pssA TRUE 0.885 10.000 0.000 1.000 N NA
 3356639 3356640 DNO_0565 DNO_0566 pssA   TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356640 3356641 DNO_0566 DNO_0567     TRUE 0.877 2.000 0.000 NA   NA
 3356641 3356642 DNO_0567 DNO_0568   lgt TRUE 0.333 34.000 0.000 NA N NA
 3356642 3356643 DNO_0568 DNO_0569 lgt thyA TRUE 0.990 8.000 0.164 1.000 N NA
 3356643 3356644 DNO_0569 DNO_0570 thyA   TRUE 0.756 17.000 0.000 1.000 N NA
 3356644 3356645 DNO_0570 DNO_0571     FALSE 0.196 83.000 0.000 1.000   NA
 3356645 3356646 DNO_0571 DNO_0572     TRUE 0.885 10.000 0.000 1.000   NA
 3356646 3356647 DNO_0572 DNO_0573     TRUE 0.956 -13.000 0.082 1.000 N NA
 3356647 3356648 DNO_0573 DNO_0574     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3356648 3356649 DNO_0574 DNO_0575     TRUE 0.889 4.000 0.000 1.000   NA
 3356649 3356650 DNO_0575 DNO_0576     TRUE 0.915 -106.000 0.002 0.007   NA
 3356650 3356651 DNO_0576 DNO_0577   tldD TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356651 3356652 DNO_0577 DNO_0578 tldD   TRUE 0.979 -7.000 0.146 NA   NA
 3356652 3356653 DNO_0578 DNO_0579   tadA TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356653 3356654 DNO_0579 DNO_0580 tadA   TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356654 3356655 DNO_0580 DNO_0581     TRUE 0.999 11.000 0.724 NA   NA
 3356655 3356656 DNO_0581 DNO_0582     TRUE 0.879 11.000 0.000 1.000   NA
 3356656 3356657 DNO_0582 DNO_0583     TRUE 0.788 16.000 0.000 1.000   NA
 3356657 3356658 DNO_0583 DNO_0584   rluE TRUE 0.891 0.000 0.000 1.000 N NA
 3356658 3356659 DNO_0584 DNO_0585 rluE trpC FALSE 0.057 186.000 0.000 1.000 N NA
 3356659 3356660 DNO_0585 DNO_0586 trpC upp TRUE 0.890 2.000 0.000 1.000 N NA
 3356660 3356661 DNO_0586 DNO_0587 upp   TRUE 0.749 -13.000 0.000 NA   NA
 3356661 3356662 DNO_0587 DNO_0588     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356662 3356663 DNO_0588 DNO_0589     FALSE 0.226 71.000 0.000 NA   NA
 3356663 3356664 DNO_0589 DNO_0590   kamA FALSE 0.280 48.000 0.000 NA   NA
 3356664 3356665 DNO_0590 DNO_0592 kamA recJ TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3356666 3356667 DNO_0591 DNO_0593     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356667 3356668 DNO_0593 DNO_0594     TRUE 0.731 -16.000 0.000 NA   NA
 3356669 3356670 DNO_0595 DNO_0596 hfq hflX TRUE 0.731 80.000 0.141 1.000   NA
 3356670 3356671 DNO_0596 DNO_0597 hflX hflK TRUE 0.976 20.000 0.184 0.067   NA
 3356671 3356672 DNO_0597 DNO_0598 hflK hflC TRUE 1.000 3.000 0.947 0.016 Y NA
 3356672 3356673 DNO_0598 DNO_0599 hflC   TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 3356673 3356674 DNO_0599 DNO_0600   purA TRUE 0.689 18.000 0.000 NA   NA
 3356674 3356675 DNO_0600 DNO_0601 purA   TRUE 0.563 44.000 0.010 1.000 N NA
 3356675 3356676 DNO_0601 DNO_0602   trmH TRUE 0.993 -3.000 0.147 0.033 N NA
 3356676 3356677 DNO_0602 DNO_0603 trmH aprV5 FALSE 0.037 253.000 0.000 1.000 N NA
 3356677 3356678 DNO_0603 DNO_0604 aprV5   FALSE 0.214 79.000 0.000 1.000 N NA
 3356678 3356679 DNO_0604 DNO_0605   bprV FALSE 0.042 223.000 0.000 1.000   NA
 3356679 3356680 DNO_0605 DNO_0606 bprV   FALSE 0.040 238.000 0.000 1.000   NA
 3356681 3356682 DNO_0607 DNO_0608 nrdA   TRUE 0.994 -73.000 0.269 0.002 Y NA
 3356682 3356683 DNO_0608 DNO_0609     FALSE 0.071 161.000 0.000 1.000 N NA
 3356684 3356685 DNO_0610 DNO_0611   aroK TRUE 0.789 16.000 0.000 1.000 N NA
 3356686 3356687 DNO_0612 DNO_0613 gyrB   FALSE 0.080 140.000 0.000 NA   NA
 3356688 3356689 DNO_0614 DNO_0615 yfiA   FALSE 0.083 138.000 0.000 NA   NA
 3356689 3356690 DNO_0615 DNO_0616     TRUE 0.877 2.000 0.000 NA   NA
 3356690 3356691 DNO_0616 DNO_0617     TRUE 0.609 20.000 0.000 NA   NA
 3356691 3356692 DNO_0617 DNO_0618   ndh FALSE 0.062 163.000 0.000 NA   NA
 3356692 3356693 DNO_0618 DNO_0619 ndh sdaA FALSE 0.028 357.000 0.000 1.000 N NA
 3356693 3356694 DNO_0619 DNO_0620 sdaA   FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 3356694 3356695 DNO_0620 DNO_0621     TRUE 0.853 12.000 0.000 NA   NA
 3356695 3356696 DNO_0621 DNO_0622   hrpA TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356696 3356697 DNO_0622 DNO_0623 hrpA   TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356697 3356698 DNO_0623 DNO_0624   pfs TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 3356698 3356699 DNO_0624 DNO_0625 pfs mdoG FALSE 0.103 126.000 0.000 1.000 N NA
 3356699 3356700 DNO_0625 DNO_0626 mdoG mdoH TRUE 0.693 -27.000 0.000 NA N NA
 3356700 3356701 DNO_0626 DNO_0627 mdoH trmU TRUE 0.451 26.000 0.000 NA N NA
 3356701 3356702 DNO_0627 DNO_0629 trmU   TRUE 0.978 -13.000 0.180 NA   NA
 3356705 3356706 DNO_0631 DNO_0632 ung   TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 3356706 3356707 DNO_0632 DNO_0633     TRUE 0.685 -30.000 0.000 NA   NA
 3356707 3356708 DNO_0633 DNO_0634     TRUE 0.767 16.000 0.000 NA   NA
 3356708 3356709 DNO_0634 DNO_0635     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356709 3356710 DNO_0635 DNO_0636     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356710 3356711 DNO_0636 DNO_0637   telA TRUE 0.853 12.000 0.000 NA   NA
 3356711 3356712 DNO_0637 DNO_0638 telA   TRUE 0.769 -10.000 0.000 NA   NA
 3356712 3356713 DNO_0638 DNO_0639     FALSE 0.038 222.000 0.000 NA   NA
 3356715 3356716 DNO_0640 DNO_0642 yfeD yfeC TRUE 0.999 15.000 0.525 0.008 Y NA
 3356716 3356717 DNO_0642 DNO_0643 yfeC yfeB TRUE 1.000 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 3356717 3356718 DNO_0643 DNO_0644 yfeB yfeA TRUE 1.000 2.000 0.894 1.000 Y NA
 3356720 3356721 DNO_0646 DNO_0647   mutY TRUE 0.890 5.000 0.000 1.000 N NA
 3356721 3356722 DNO_0647 DNO_0648 mutY ispA TRUE 0.481 26.000 0.000 1.000 N NA
 3356722 3356723 DNO_0648 DNO_0649 ispA   TRUE 0.517 25.000 0.000 1.000   NA
 3356723 3356724 DNO_0649 DNO_0650     TRUE 0.889 7.000 0.000 1.000   NA
 3356724 3356725 DNO_0650 DNO_0651     FALSE 0.252 59.000 0.000 NA   NA
 3356729 3356730 DNO_0655 DNO_0656 clpA clpS TRUE 0.998 13.000 0.596 NA   NA
 3356731 3356732 DNO_0657 DNO_0658 pyrC   TRUE 0.310 47.000 0.000 1.000 N NA
 3356732 3356733 DNO_0658 DNO_0659     TRUE 0.600 22.000 0.000 1.000 N NA
 3356733 3356734 DNO_0659 DNO_0660     FALSE 0.249 63.000 0.000 NA   NA
 3356734 3356735 DNO_0660 DNO_0661     FALSE 0.250 61.000 0.000 NA   NA
 3356735 3356736 DNO_0661 DNO_0662     TRUE 0.350 35.000 0.000 1.000 N NA
 3356737 3356738 DNO_0663 DNO_0664 rdgB rph TRUE 0.995 3.000 0.262 1.000 N NA
 3356740 3356741 DNO_0666 DNO_0667 dsbB purB TRUE 0.440 28.000 0.000 1.000 N NA
 3356741 3356742 DNO_0667 DNO_0668 purB pgpA TRUE 0.885 10.000 0.000 1.000 N NA
 3356742 3356743 DNO_0668 DNO_0669 pgpA pyrD TRUE 0.890 5.000 0.000 1.000 N NA
 3356743 3356744 DNO_0669 DNO_0670 pyrD   TRUE 0.726 25.000 0.005 1.000 N NA
 3356744 3356745 DNO_0670 DNO_0671     TRUE 0.877 5.000 0.000 NA   NA
 3356745 3356746 DNO_0671 DNO_0672   gidA TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356746 3356747 DNO_0672 DNO_0673 gidA   TRUE 0.517 25.000 0.000 1.000   NA
 3356747 3356748 DNO_0673 DNO_0674   proC TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000   NA
 3356749 3356750 DNO_0675 DNO_0676 pilT pilU TRUE 0.939 13.000 0.000 0.038 Y NA
 3356750 3356751 DNO_0676 DNO_0677 pilU parE TRUE 0.890 6.000 0.000 1.000 N NA
 3356751 3356752 DNO_0677 DNO_0678 parE parC TRUE 0.994 10.000 0.106 0.003 Y NA
 3356752 3356753 DNO_0678 DNO_0679 parC   TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000   NA
 3356755 3356756 DNO_0681 DNO_0682     TRUE 0.998 8.000 0.354 1.000 Y NA
 3356756 3356757 DNO_0682 DNO_0683   lpxD TRUE 0.999 -19.000 0.814 1.000 Y NA
 3356757 3356758 DNO_0683 DNO_0684 lpxD fabZ TRUE 0.999 -3.000 0.796 1.000 N NA
 3356758 3356759 DNO_0684 DNO_0685 fabZ lpxA TRUE 1.000 0.000 0.850 1.000 N NA
 3356759 3356760 DNO_0685 DNO_0686 lpxA lpxB TRUE 0.996 7.000 0.289 1.000 Y NA
 3356760 3356761 DNO_0686 DNO_0687 lpxB rnhB TRUE 0.990 -3.000 0.186 1.000 N NA
 3356761 3356762 DNO_0687 DNO_0688 rnhB dnaE TRUE 0.835 35.000 0.104 1.000 Y NA
 3356763 3356764 DNO_0689 DNO_0690 mfd   FALSE 0.136 102.000 0.000 1.000   NA
 3356764 3356765 DNO_0690 DNO_0691   era FALSE 0.026 459.000 0.000 1.000   NA
 3356765 3356766 DNO_0691 DNO_0692 era rnc TRUE 0.968 -3.000 0.004 0.038   NA
 3356766 3356767 DNO_0692 DNO_0693 rnc lepB TRUE 0.986 0.000 0.117 1.000 N NA
 3356767 3356768 DNO_0693 DNO_0694 lepB lepA TRUE 0.988 13.000 0.187 1.000 N NA
 3356769 3356770 DNO_0695 DNO_0696     TRUE 0.996 2.000 0.159 0.002   NA
 3356770 3356771 DNO_0696 DNO_0697     TRUE 0.982 11.000 0.097 1.000   NA
 3356771 3356772 DNO_0697 DNO_0698     FALSE 0.167 92.000 0.000 1.000 N NA
 3356772 3356773 DNO_0698 DNO_0700     FALSE 0.250 61.000 0.000 NA   NA
 3356775 3356776 DNO_0701 DNO_0702 glyQ glyS TRUE 1.000 -3.000 0.651 0.002 Y NA
 3356776 3356777 DNO_0702 DNO_0703 glyS   FALSE 0.110 119.000 0.000 1.000 N NA
 3356777 3356778 DNO_0703 DNO_0704     TRUE 0.801 -13.000 0.000 NA Y NA
 3356778 3356779 DNO_0704 DNO_0705     TRUE 0.709 19.000 0.000 NA Y NA
 3356779 3356780 DNO_0705 DNO_0706     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3356780 3356781 DNO_0706 DNO_0707   zur FALSE 0.062 178.000 0.000 1.000 N NA
 3356781 3356782 DNO_0707 DNO_0708 zur   TRUE 0.888 8.000 0.000 1.000 N NA
 3356782 3356783 DNO_0708 DNO_0709   menA TRUE 0.879 11.000 0.000 1.000 N NA
 3356783 3356784 DNO_0709 DNO_0711 menA   FALSE 0.100 198.000 0.000 0.066   NA
 10692616 3356785 DNO_0710 DNO_0712   fimV TRUE 0.409 28.000 0.000 NA   NA
 3356787 3356788 DNO_0713 DNO_0715     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356790 3356791 DNO_0716 DNO_0718   cdsA TRUE 0.699 -39.000 0.000 1.000 N NA
 3356791 3356792 DNO_0718 DNO_0719 cdsA uppS TRUE 0.968 0.000 0.013 1.000 Y NA
 3356792 3356793 DNO_0719 DNO_0720 uppS frr TRUE 0.998 1.000 0.409 1.000 N NA
 3356793 3356794 DNO_0720 DNO_0721 frr pyrH TRUE 0.999 10.000 0.626 1.000 N NA
 3356794 3356795 DNO_0721 DNO_0722 pyrH tsf TRUE 0.815 160.000 0.416 1.000 N NA
 3356795 3356796 DNO_0722 DNO_0723 tsf rpsB TRUE 0.999 12.000 0.748 1.000 Y NA
 3356799 3356800 DNO_0726 DNO_0727     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356800 3356801 DNO_0727 DNO_0728     FALSE 0.274 49.000 0.000 NA   NA
 3356802 3356803 DNO_0729 DNO_0730     FALSE 0.302 39.000 0.000 NA   NA
 3356803 3356804 DNO_0730 DNO_0731     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA   NA
 3356804 3356805 DNO_0731 DNO_0732     TRUE 0.349 32.000 0.000 NA   NA
 3356805 3356806 DNO_0732 DNO_0733     TRUE 0.732 17.000 0.000 NA   NA
 3356806 3356807 DNO_0733 DNO_0734   gltX FALSE 0.167 86.000 0.000 NA   NA
 3356809 3356810 DNO_0736 DNO_0737 rho trxA TRUE 0.543 99.000 0.087 1.000   NA
 3356811 3356812 DNO_0738 DNO_0739     FALSE 0.231 70.000 0.000 NA   NA
 3356812 3356813 DNO_0739 DNO_0740     TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356813 3356814 DNO_0740 DNO_0741     TRUE 0.654 -97.000 0.000 NA   NA
 3356814 3356815 DNO_0741 DNO_0742     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356815 3356816 DNO_0742 DNO_0743     TRUE 0.701 -22.000 0.000 NA   NA
 3356816 3356817 DNO_0743 DNO_0744     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356817 3356818 DNO_0744 DNO_0745     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356818 3356819 DNO_0745 DNO_0746     FALSE 0.022 511.000 0.000 NA   NA
 3356819 3356820 DNO_0746 DNO_0747     TRUE 0.865 11.000 0.000 NA   NA
 3356820 3356821 DNO_0747 DNO_0748     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 3356821 3356822 DNO_0748 DNO_0749     TRUE 0.569 22.000 0.000 NA   NA
 3356822 3356823 DNO_0749 DNO_0750     TRUE 0.973 -3.000 0.075 NA   NA
 3356823 3356824 DNO_0750 DNO_0751     TRUE 0.715 -19.000 0.000 NA   NA
 3356824 3356825 DNO_0751 DNO_0752     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356825 3356826 DNO_0752 DNO_0753     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 3356826 3356827 DNO_0753 DNO_0754     TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 3356827 3356828 DNO_0754 DNO_0755     FALSE 0.309 37.000 0.000 NA   NA
 3356828 3356829 DNO_0755 DNO_0756     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356829 3356830 DNO_0756 DNO_0757     TRUE 0.873 9.000 0.000 NA   NA
 3356830 3356831 DNO_0757 DNO_0758     TRUE 0.877 2.000 0.000 NA   NA
 3356831 3356832 DNO_0758 DNO_0759     TRUE 0.658 -88.000 0.000 NA   NA
 3356832 3356833 DNO_0759 DNO_0760     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356833 3356834 DNO_0760 DNO_0761     TRUE 0.873 9.000 0.000 NA   NA
 3356835 3356836 DNO_0762 DNO_0763     TRUE 0.487 48.000 0.000 0.049   NA
 3356836 3356837 DNO_0763 DNO_0764     FALSE 0.274 49.000 0.000 NA   NA
 3356837 3356838 DNO_0764 DNO_0765     FALSE 0.068 152.000 0.000 NA   NA
 3356838 3356839 DNO_0765 DNO_0766     FALSE 0.094 121.000 0.000 NA   NA
 3356839 3356840 DNO_0766 DNO_0767   ssb-2 TRUE 0.689 18.000 0.000 NA   NA
 3356840 3356841 DNO_0767 DNO_0768 ssb-2   TRUE 0.881 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3356841 3356842 DNO_0768 DNO_0769     TRUE 0.970 -3.000 0.051 NA   NA
 3356842 3356843 DNO_0769 DNO_0770     TRUE 0.450 26.000 0.000 NA   NA
 3356843 3356844 DNO_0770 DNO_0771     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356844 3356845 DNO_0771 DNO_0772     FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 3356845 3356846 DNO_0772 DNO_0773   regA2 FALSE 0.090 129.000 0.000 NA   NA
 3356847 3356848 DNO_0774 DNO_0775     TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 3356848 3356849 DNO_0775 DNO_0776   dnaC TRUE 0.994 5.000 0.222 NA   NA
 3356849 3356850 DNO_0776 DNO_0780 dnaC   FALSE 0.031 2118.000 0.000 1.000 Y NA
 3356850 3356851 DNO_0780 DNO_0781     TRUE 0.831 -6.000 0.000 1.000   NA
 3356851 3356852 DNO_0781 DNO_0782     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3356852 3356853 DNO_0782 DNO_0783     TRUE 0.731 -16.000 0.000 NA   NA
 3356855 3356856 DNO_0785 DNO_0786     TRUE 0.320 41.000 0.000 1.000   NA
 3356856 3356857 DNO_0786 DNO_0787     FALSE 0.207 80.000 0.000 1.000 N NA
 3356857 3356858 DNO_0787 DNO_0789   folA TRUE 0.772 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3356859 3356860 DNO_0788 DNO_0790     FALSE 0.244 66.000 0.000 NA   NA
 3356860 3356861 DNO_0790 DNO_0791     FALSE 0.028 313.000 0.000 NA   NA
 3356861 3356862 DNO_0791 DNO_0792   msrA-B TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA N NA
 3356862 3356863 DNO_0792 DNO_0793 msrA-B   FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 3356864 3356865 DNO_0794 DNO_0795     TRUE 0.996 7.000 0.307 NA   NA
 3356865 3356866 DNO_0795 DNO_0796   mgtE FALSE 0.301 90.000 0.000 0.066 N NA
 3356866 3356867 DNO_0796 DNO_0797 mgtE   FALSE 0.266 67.000 0.000 1.000 N NA
 3356867 3356868 DNO_0797 DNO_0798     TRUE 0.962 0.000 0.013 1.000 N NA
 3356868 3356869 DNO_0798 DNO_0799     TRUE 0.984 -3.000 0.034 0.006 N NA
 3356869 3356870 DNO_0799 DNO_0800     TRUE 0.987 -3.000 0.035 0.006 Y NA
 3356870 3356871 DNO_0800 DNO_0801     FALSE 0.256 55.000 0.000 NA   NA
 3356874 3356875 DNO_0804 DNO_0805     TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3356875 3356876 DNO_0805 DNO_0806   nqrF TRUE 0.817 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3356876 3356877 DNO_0806 DNO_0807 nqrF nqrE TRUE 0.994 12.000 0.140 0.005 Y NA
 3356877 3356878 DNO_0807 DNO_0808 nqrE nqrD TRUE 0.998 0.000 0.240 0.005 Y NA
 3356878 3356879 DNO_0808 DNO_0809 nqrD nqrC TRUE 0.985 -7.000 0.058 0.005 Y NA
 3356879 3356880 DNO_0809 DNO_0810 nqrC nqrB TRUE 0.942 -7.000 0.000 0.005 Y NA
 3356880 3356881 DNO_0810 DNO_0811 nqrB nqrA TRUE 0.967 4.000 0.000 0.005 Y NA
 3356881 3356882 DNO_0811 DNO_0812 nqrA   FALSE 0.235 69.000 0.000 NA   NA
 3356882 3356883 DNO_0812 DNO_0813     TRUE 0.586 21.000 0.000 NA   NA
 3356883 3356884 DNO_0813 DNO_0814   tpiA TRUE 0.990 -3.000 0.184 1.000 N NA
 3356884 3356885 DNO_0814 DNO_0815 tpiA glmM TRUE 0.972 -7.000 0.082 1.000 Y NA
 3356885 3356886 DNO_0815 DNO_0816 glmM nhaA TRUE 0.890 6.000 0.000 1.000 N NA
 3356887 3356888 DNO_0817 DNO_0818 dapD   FALSE 0.085 145.000 0.000 1.000   NA
 3356888 3356889 DNO_0818 DNO_0820     TRUE 0.918 16.000 0.015 NA   NA
 3356890 3356891 DNO_0819 DNO_0821     TRUE 0.927 15.000 0.000 0.029 Y NA
 3356891 3356892 DNO_0821 DNO_0822     TRUE 0.870 18.000 0.000 0.009 N NA
 3356893 3356894 DNO_0823 DNO_0824 coaBC   TRUE 0.980 -19.000 0.201 1.000 N NA
 3356894 3356895 DNO_0824 DNO_0825   grpE FALSE 0.085 145.000 0.000 1.000 N NA
 3356895 3356896 DNO_0825 DNO_0826 grpE dnaK TRUE 0.634 109.000 0.049 0.009 Y NA
 3356896 3356897 DNO_0826 DNO_0827 dnaK dnaJ TRUE 0.959 54.000 0.236 0.003 Y NA
 3356897 3356898 DNO_0827 DNO_0828 dnaJ agcS FALSE 0.038 249.000 0.000 1.000 N NA
 3356901 3356902 DNO_0831 DNO_0832     FALSE 0.273 62.000 0.000 1.000   NA
 3356902 3356903 DNO_0832 DNO_0833     TRUE 0.974 3.000 0.042 1.000   NA
 3356903 3356904 DNO_0833 DNO_0834   sufS TRUE 0.958 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3356904 3356905 DNO_0834 DNO_0835 sufS sufD TRUE 0.983 -10.000 0.193 1.000 N NA
 3356905 3356906 DNO_0835 DNO_0836 sufD sufC TRUE 0.998 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 3356906 3356907 DNO_0836 DNO_0837 sufC sufB TRUE 0.982 31.000 0.466 1.000 Y NA
 3356907 3356908 DNO_0837 DNO_0838 sufB   TRUE 0.975 -3.000 0.078 NA N NA
 3356908 3356909 DNO_0838 DNO_0839     FALSE 0.217 74.000 0.000 NA N NA
 3356909 3356910 DNO_0839 DNO_0840     TRUE 0.394 29.000 0.000 NA   NA
 3356910 3356911 DNO_0840 DNO_0841     TRUE 0.749 -13.000 0.000 NA   NA
 3356911 3356912 DNO_0841 DNO_0842     TRUE 0.999 -3.000 0.739 NA   NA
 3356912 3356913 DNO_0842 DNO_0843   lpxK TRUE 0.868 12.000 0.000 1.000   NA
 3356914 3356915 DNO_0844 DNO_0845     FALSE 0.073 147.000 0.000 NA   NA
 3356915 3356916 DNO_0845 DNO_0846     FALSE 0.269 50.000 0.000 NA   NA
 3356917 3356918 DNO_0847 DNO_0848     FALSE 0.262 52.000 0.000 NA   NA
 3356918 3356919 DNO_0848 DNO_0849     FALSE 0.205 76.000 0.000 NA N NA
 3356919 3356920 DNO_0849 DNO_0850     FALSE 0.031 263.000 0.000 NA   NA
 3356920 3356921 DNO_0850 DNO_0851     TRUE 0.990 41.000 0.831 NA   NA
 3356921 3356922 DNO_0851 DNO_0852     FALSE 0.282 101.000 0.007 NA   NA
 3356922 3356923 DNO_0852 DNO_0853   murA TRUE 0.951 0.000 0.007 NA   NA
 3356923 3356924 DNO_0853 DNO_0854 murA   TRUE 0.986 0.000 0.129 NA N NA
 3356924 3356925 DNO_0854 DNO_0855     TRUE 0.908 -10.000 0.011 NA   NA
 3356925 3356926 DNO_0855 DNO_0856     TRUE 0.972 0.000 0.041 NA   NA
 3356926 3356927 DNO_0856 DNO_0857     TRUE 0.838 22.000 0.024 NA   NA
 3356927 3356928 DNO_0857 DNO_0858     TRUE 0.999 9.000 0.562 NA   NA
 3356928 3356929 DNO_0858 DNO_0859     TRUE 0.996 -16.000 0.530 NA Y NA
 3356929 3356930 DNO_0859 DNO_0860     TRUE 0.486 25.000 0.000 NA   NA
 3356930 3356931 DNO_0860 DNO_0861     TRUE 0.969 71.000 0.575 NA   NA
 3356931 3356932 DNO_0861 DNO_0862   mviN TRUE 0.889 3.000 0.000 1.000   NA
 3356932 3356933 DNO_0862 DNO_0863 mviN metF TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3356933 3356934 DNO_0863 DNO_0864 metF   TRUE 0.696 -25.000 0.000 NA   NA
 3356936 3356937 DNO_0866 DNO_0867     FALSE 0.210 75.000 0.000 NA   NA
 3356937 3356938 DNO_0867 DNO_0868     TRUE 0.793 15.000 0.000 NA   NA
 3356938 3356939 DNO_0868 DNO_0869     TRUE 0.848 13.000 0.000 1.000   NA
 3356940 3356941 DNO_0870 DNO_0871     TRUE 0.620 23.000 0.000 NA Y NA
 3356941 3356942 DNO_0871 DNO_0872     TRUE 0.997 0.000 0.258 0.065 N NA
 3356942 3356943 DNO_0872 DNO_0873     FALSE 0.155 90.000 0.000 NA   NA
 3356943 3356944 DNO_0873 DNO_0874   aspA FALSE 0.030 278.000 0.000 NA   NA
 3356944 3356945 DNO_0874 DNO_0875 aspA ftsY FALSE 0.074 158.000 0.000 1.000 N NA
 3356945 3356946 DNO_0875 DNO_0876 ftsY rpoH TRUE 0.847 19.000 0.008 1.000 N NA
 3356946 3356947 DNO_0876 DNO_0877 rpoH fur TRUE 0.539 47.000 0.000 0.015 N NA
 3356949 3356950 DNO_0879 DNO_0880     FALSE 0.222 72.000 0.000 NA   NA
 3356950 3356951 DNO_0880 DNO_0881     FALSE 0.031 479.000 0.000 NA Y NA
 3356952 3356953 DNO_0882 DNO_0883   rrfA FALSE 0.135 97.000 0.000 NA   NA
 3356953 3356954 DNO_0883 DNO_0884 rrfA rrlA FALSE 0.239 68.000 0.000 NA   NA
 3356954 3356955 DNO_0884 DNO_0885 rrlA   FALSE 0.027 320.000 0.000 NA   NA
 3356955 3356956 DNO_0885 DNO_0886     TRUE 0.689 18.000 0.000 NA   NA
 3356956 3356957 DNO_0886 DNO_0887   rrsA FALSE 0.309 37.000 0.000 NA   NA
 3356958 3356959 DNO_0888 DNO_0889   znuA TRUE 0.324 40.000 0.000 1.000 N NA
 3356960 3356961 DNO_0890 DNO_0891     TRUE 0.960 15.000 0.048 NA Y NA
 3356961 3356962 DNO_0891 DNO_0892     TRUE 0.877 2.000 0.000 NA   NA
 3356962 3356963 DNO_0892 DNO_0893     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3356963 3356964 DNO_0893 DNO_0894   pilV TRUE 0.980 10.000 0.087 NA   NA
 3356964 3356965 DNO_0894 DNO_0895 pilV pilC FALSE 0.248 64.000 0.000 NA   NA
 3356965 3356966 DNO_0895 DNO_0896 pilC   FALSE 0.302 39.000 0.000 NA   NA
 3356966 3356967 DNO_0896 DNO_0897   lipB TRUE 0.678 -33.000 0.000 NA   NA
 3356967 3356968 DNO_0897 DNO_0898 lipB   TRUE 0.993 2.000 0.219 NA   NA
 3356968 3356969 DNO_0898 DNO_0899     TRUE 0.865 11.000 0.000 NA   NA
 3356969 3356970 DNO_0899 DNO_0900     TRUE 0.324 40.000 0.000 1.000 N NA
 3356970 3356971 DNO_0900 DNO_0901     TRUE 0.972 95.000 0.733 1.000 Y NA
 3356973 3356974 DNO_0903 DNO_0904   orn FALSE 0.300 49.000 0.000 1.000 N NA
 3356974 3356975 DNO_0904 DNO_0905 orn   FALSE 0.299 49.000 0.000 1.000   NA
 3356975 3356976 DNO_0905 DNO_0906   dnaQ TRUE 0.599 22.000 0.000 1.000   NA
 3356976 3356977 DNO_0906 DNO_0907 dnaQ   TRUE 0.890 2.000 0.000 1.000 N NA
 3356977 3356978 DNO_0907 DNO_0908   deoA TRUE 0.518 25.000 0.000 1.000 N NA
 3356978 3356979 DNO_0908 DNO_0909 deoA deoC TRUE 0.993 15.000 0.286 1.000 Y NA
 3356979 3356980 DNO_0909 DNO_0910 deoC nrdD FALSE 0.064 203.000 0.000 1.000 Y NA
 3356980 3356981 DNO_0910 DNO_0911 nrdD nrdG TRUE 0.995 -3.000 0.282 1.000   NA
 3356981 3356982 DNO_0911 DNO_0912 nrdG hslR FALSE 0.027 383.000 0.000 1.000   NA
 3356982 3356983 DNO_0912 DNO_0913 hslR   TRUE 0.681 -31.000 0.000 NA   NA
 3356983 3356984 DNO_0913 DNO_0914   minD TRUE 0.999 -3.000 0.618 NA   NA
 3356984 3356985 DNO_0914 DNO_0915 minD minC TRUE 0.964 71.000 0.466 1.000 Y NA
 3356985 3356986 DNO_0915 DNO_0916 minC   TRUE 0.413 30.000 0.000 1.000   NA
 3356986 3356987 DNO_0916 DNO_0917   xth-2 TRUE 0.755 17.000 0.000 1.000   NA
 3356990 3356991 DNO_0920 DNO_0921 ostA   TRUE 0.841 22.000 0.020 1.000   NA
 3356991 3356992 DNO_0921 DNO_0922   ksgA TRUE 0.963 -3.000 0.028 1.000   NA
 3356992 3356993 DNO_0922 DNO_0923 ksgA   TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3356994 3356995 DNO_0924 DNO_0925 dsbG   FALSE 0.043 204.000 0.000 NA   NA
 3356998 3356999 DNO_0928 DNO_0929   pdxK FALSE 0.244 72.000 0.000 1.000   NA
 3356999 3357000 DNO_0929 DNO_0930 pdxK   FALSE 0.029 351.000 0.000 1.000   NA
 3357000 3357001 DNO_0930 DNO_0931   dcuC FALSE 0.044 215.000 0.000 1.000   NA
 3357002 3357003 DNO_0932 DNO_0933   rimI TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3357003 3357004 DNO_0933 DNO_0934 rimI metG TRUE 0.671 19.000 0.000 1.000   NA
 3357005 3357006 DNO_0935 DNO_0936     FALSE 0.251 60.000 0.000 NA   NA
 3357007 3357008 DNO_0937 DNO_0938   lysS TRUE 0.409 28.000 0.000 NA   NA
 3357008 3357009 DNO_0938 DNO_0939 lysS prfB TRUE 0.994 -3.000 0.162 0.052 Y NA
 3357010 3357011 DNO_0940 DNO_0941 purD galE TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3357013 3357014 DNO_0943 DNO_0944     FALSE 0.086 137.000 0.000 NA   NA
 3357015 3357016 DNO_0945 DNO_0946     FALSE 0.251 60.000 0.000 NA   NA
 3357016 3357017 DNO_0946 DNO_0947     FALSE 0.302 39.000 0.000 NA   NA
 3357017 3357018 DNO_0947 DNO_0948   trmE FALSE 0.129 100.000 0.000 NA   NA
 3357018 3357019 DNO_0948 DNO_0949 trmE   TRUE 0.993 -3.000 0.221 1.000   NA
 3357019 3357020 DNO_0949 DNO_0950     TRUE 0.996 -10.000 0.461 NA   NA
 3357020 3357021 DNO_0950 DNO_0951   rnpA TRUE 0.998 -3.000 0.540 NA   NA
 3357021 3357022 DNO_0951 DNO_0952 rnpA rpmH TRUE 0.999 3.000 0.787 1.000   NA
 3357022 3357023 DNO_0952 DNO_0953 rpmH recR FALSE 0.127 106.000 0.000 1.000   NA
 3357023 3357024 DNO_0953 DNO_0954 recR   TRUE 0.999 1.000 0.604 NA   NA
 3357024 3357025 DNO_0954 DNO_0955   dnaX TRUE 0.997 -3.000 0.411 NA   NA
 3357025 3357026 DNO_0955 DNO_0956 dnaX   FALSE 0.046 207.000 0.000 1.000   NA
 3357026 3357027 DNO_0956 DNO_0957     TRUE 0.886 9.000 0.000 1.000   NA
 3357027 3357028 DNO_0957 DNO_0958     TRUE 0.890 2.000 0.000 1.000   NA
 3357028 3357029 DNO_0958 DNO_0959   surE TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3357031 3357032 DNO_0961 DNO_0962     TRUE 0.893 19.000 0.021 NA Y NA
 3357032 3357033 DNO_0962 DNO_0963   rodA TRUE 0.979 -3.000 0.096 NA N NA
 3357033 3357034 DNO_0963 DNO_0964 rodA   TRUE 0.954 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3357034 3357035 DNO_0964 DNO_0965     TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3357035 3357036 DNO_0965 DNO_0966   mreC TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3357036 3357037 DNO_0966 DNO_0967 mreC mreB TRUE 0.999 2.000 0.689 1.000 N NA
 3357038 3357039 DNO_0968 DNO_0969 gatC gatA TRUE 1.000 3.000 0.643 0.002 Y NA
 3357040 3357041 DNO_0970 DNO_0971   metK TRUE 0.891 1.000 0.000 1.000   NA
 3357041 3357042 DNO_0971 DNO_0972 metK   TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3357042 3357043 DNO_0972 DNO_0973   secA TRUE 0.989 -3.000 0.168 1.000 N NA
 3357045 3357046 DNO_0975 DNO_0976 lpxC ftsZ TRUE 0.988 2.000 0.134 1.000 N NA
 3357046 3357047 DNO_0976 DNO_0977 ftsZ ftsA TRUE 0.996 17.000 0.460 1.000 Y NA
 3357047 3357048 DNO_0977 DNO_0978 ftsA   TRUE 0.992 18.000 0.389 NA N NA
 3357048 3357049 DNO_0978 DNO_0979     TRUE 0.965 39.000 0.372 NA Y NA
 3357049 3357050 DNO_0979 DNO_0980   murC TRUE 0.996 8.000 0.153 0.007 Y NA
 3357050 3357051 DNO_0980 DNO_0981 murC murG TRUE 0.996 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 3357051 3357052 DNO_0981 DNO_0982 murG ftsW TRUE 0.999 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3357052 3357053 DNO_0982 DNO_0983 ftsW murD TRUE 0.995 -16.000 0.297 0.005 N NA
 3357053 3357054 DNO_0983 DNO_0984 murD mraY TRUE 1.000 11.000 0.647 0.007 Y NA
 3357054 3357055 DNO_0984 DNO_0985 mraY murF TRUE 0.998 3.000 0.309 0.007 Y NA
 3357055 3357056 DNO_0985 DNO_0986 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 3357056 3357057 DNO_0986 DNO_0987 murE ftsI TRUE 0.923 -16.000 0.014 1.000 Y NA
 3357057 3357058 DNO_0987 DNO_0988 ftsI   TRUE 0.971 3.000 0.036 1.000   NA
 3357058 3357059 DNO_0988 DNO_0989   mraW TRUE 0.993 -3.000 0.227 1.000   NA
 3357059 3357060 DNO_0989 DNO_0990 mraW   FALSE 0.210 75.000 0.000 NA   NA
 3357060 3357061 DNO_0990 DNO_0991     TRUE 0.955 -13.000 0.086 NA   NA
 3357062 3357063 DNO_0992 DNO_0993 smpB   TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3357063 3357064 DNO_0993 DNO_0994     TRUE 0.827 14.000 0.000 1.000   NA
 3357064 3357065 DNO_0994 DNO_0995     FALSE 0.035 243.000 0.000 NA   NA
 3357066 3357067 DNO_0996 DNO_0997     FALSE 0.076 145.000 0.000 NA   NA
 3357067 3357068 DNO_0997 DNO_0998     TRUE 0.366 31.000 0.000 NA   NA
 3357070 3357071 DNO_0999 DNO_1001   rluC TRUE 0.979 4.000 0.014 0.039 N NA
 3357071 3357072 DNO_1001 DNO_1002 rluC   FALSE 0.112 118.000 0.000 1.000 N NA
 3357073 3357074 DNO_1003 DNO_1004     TRUE 0.350 35.000 0.000 1.000 N NA
 3357074 3357075 DNO_1004 DNO_1005   coaD TRUE 0.997 3.000 0.367 1.000 N NA
 3357075 3357076 DNO_1005 DNO_1006 coaD   FALSE 0.251 60.000 0.000 NA   NA
 3357076 3357077 DNO_1006 DNO_1007   rpsP FALSE 0.070 150.000 0.000 NA   NA
 3357077 3357078 DNO_1007 DNO_1008 rpsP   TRUE 0.999 0.000 0.342 0.028 Y NA
 3357078 3357079 DNO_1008 DNO_1009   trmD TRUE 0.997 -37.000 0.672 1.000 Y NA
 3357079 3357080 DNO_1009 DNO_1010 trmD rplS TRUE 0.999 0.000 0.567 1.000 Y NA
 3357080 3357081 DNO_1010 DNO_1011 rplS cysQ TRUE 0.638 20.000 0.000 1.000 N NA
 3357081 3357082 DNO_1011 DNO_1013 cysQ   FALSE 0.214 79.000 0.000 1.000 N NA
 3357084 3357085 DNO_1014 DNO_1015     TRUE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 3357088 3357089 DNO_1018 DNO_1019 recG   TRUE 0.978 3.000 0.076 NA N NA
 3357089 3357090 DNO_1019 DNO_1020   spoT TRUE 0.938 27.000 0.215 NA N NA
 3357090 3357091 DNO_1020 DNO_1021 spoT rpoZ TRUE 0.996 5.000 0.291 1.000 Y NA
 3357091 3357092 DNO_1021 DNO_1022 rpoZ   FALSE 0.155 96.000 0.000 1.000 N NA
 3357092 3357093 DNO_1022 DNO_1023   pdxH TRUE 0.868 12.000 0.000 1.000 N NA
 3357093 3357094 DNO_1023 DNO_1024 pdxH hemL TRUE 0.916 1.000 0.000 1.000 Y NA
 3357095 3357096 DNO_1025 DNO_1026 rpsT frdA FALSE 0.054 192.000 0.000 1.000 N NA
 3357096 3357097 DNO_1026 DNO_1027 frdA frdB TRUE 0.999 13.000 0.470 0.003 Y NA
 3357097 3357098 DNO_1027 DNO_1028 frdB frdC TRUE 0.999 2.000 0.454 0.003 Y NA
 3357098 3357099 DNO_1028 DNO_1029 frdC   TRUE 1.000 13.000 0.787 0.003 Y NA
 3357101 3357102 DNO_1031 DNO_1032     FALSE 0.120 113.000 0.000 1.000 N NA
 3357102 3357103 DNO_1032 DNO_1033     TRUE 0.667 -52.000 0.000 NA   NA
 3357103 3357104 DNO_1033 DNO_1034     TRUE 0.609 20.000 0.000 NA   NA
 3357104 3357105 DNO_1034 DNO_1035   tkt TRUE 0.885 10.000 0.000 1.000 N NA
 3357105 3357106 DNO_1035 DNO_1036 tkt pgk TRUE 0.906 16.000 0.002 1.000 Y NA
 3357106 3357107 DNO_1036 DNO_1037 pgk   FALSE 0.050 201.000 0.000 1.000   NA
 3357109 3357110 DNO_1039 DNO_1040 toxA2 vapA3 TRUE 0.831 13.000 0.000 NA   NA
 3357110 3357111 DNO_1040 DNO_1041 vapA3 vapB2 FALSE 0.026 336.000 0.000 NA   NA
 3357111 3357112 DNO_1041 DNO_1042 vapB2 vapC2 TRUE 0.997 -3.000 0.359 NA   NA
 3357113 3357114 DNO_1043 DNO_1044 vapE3 vapG3 FALSE 0.139 96.000 0.000 NA   NA
 3357114 3357115 DNO_1044 DNO_1045 vapG3 intA2 FALSE 0.024 395.000 0.000 NA   NA
 3357115 3357116 DNO_1045 DNO_1046 intA2   FALSE 0.041 208.000 0.000 NA   NA
 3357116 3357117 DNO_1046 DNO_1047   pnp TRUE 0.876 7.000 0.000 NA   NA
 3357117 3357118 DNO_1047 DNO_1048 pnp rpsO TRUE 0.990 19.000 0.335 1.000 Y NA
 3357118 3357119 DNO_1048 DNO_1049 rpsO azu FALSE 0.162 94.000 0.000 1.000 N NA
 3357119 3357120 DNO_1049 DNO_1050 azu   TRUE 0.366 31.000 0.000 NA   NA
 3357120 3357121 DNO_1050 DNO_1051   argS TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3357122 3357123 DNO_1052 DNO_1053 dusA asd TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3357125 3357126 DNO_1055 DNO_1056 pheS pheT TRUE 0.999 13.000 0.574 0.001 Y NA
 3357126 3357127 DNO_1056 DNO_1057 pheT ihfA TRUE 0.993 7.000 0.208 1.000 N NA
 3357128 3357129 DNO_1058 DNO_1059     TRUE 0.996 -3.000 0.310 1.000 N NA
 3357132 3357133 DNO_1062 DNO_1063   recN TRUE 0.987 13.000 0.170 1.000 N NA
 3357133 3357134 DNO_1063 DNO_1064 recN   TRUE 0.692 47.000 0.049 1.000 N NA
 3357134 3357135 DNO_1064 DNO_1065   serS TRUE 0.864 14.000 0.000 1.000 Y NA
 3357135 3357136 DNO_1065 DNO_1066 serS phoU FALSE 0.298 40.000 0.000 NA N NA
 3357136 3357137 DNO_1066 DNO_1067 phoU   TRUE 0.832 13.000 0.000 NA N NA
 3357137 3357138 DNO_1067 DNO_1068     TRUE 0.878 0.000 0.000 NA   NA
 3357139 3357140 DNO_1069 DNO_1070 gcvP gcvH TRUE 0.989 3.000 0.130 1.000 Y NA
 3357141 3357142 DNO_1071 DNO_1072 adk aroC TRUE 0.879 11.000 0.000 1.000 N NA
 3357143 3357144 DNO_1073 DNO_1074 arcC argF-1 TRUE 0.963 74.000 0.483 1.000 Y NA
 3357144 3357145 DNO_1074 DNO_1075 argF-1 arcA TRUE 0.767 68.000 0.100 1.000 Y NA
 3357145 3357146 DNO_1075 DNO_1076 arcA folB FALSE 0.045 212.000 0.000 1.000 N NA
 3357148 3357149 DNO_1078 DNO_1079 rpoD dnaG TRUE 0.836 101.000 0.299 1.000 N NA
 3357149 3357150 DNO_1079 DNO_1080 dnaG   TRUE 0.985 12.000 0.137 1.000   NA
 3357150 3357151 DNO_1080 DNO_1081   rpsU TRUE 0.995 3.000 0.173 0.045   NA
 3357151 3357152 DNO_1081 DNO_1082 rpsU   FALSE 0.055 178.000 0.000 NA   NA
 3357152 3357153 DNO_1082 DNO_1083     FALSE 0.287 45.000 0.000 NA   NA
 3357153 3357154 DNO_1083 DNO_1084   aroB FALSE 0.028 365.000 0.000 1.000 N NA
 3357154 3357155 DNO_1084 DNO_1085 aroB   TRUE 0.890 2.000 0.000 1.000 N NA
 3357155 3357156 DNO_1085 DNO_1086     TRUE 0.889 3.000 0.000 1.000 N NA
 3357156 3357157 DNO_1086 DNO_1087     FALSE 0.059 167.000 0.000 NA   NA
 3357157 3357158 DNO_1087 DNO_1088     FALSE 0.081 139.000 0.000 NA   NA
 3357159 3357160 DNO_1089 DNO_1090     TRUE 0.873 9.000 0.000 NA   NA
 3357161 3357162 DNO_1091 DNO_1092 accA   TRUE 0.889 3.000 0.000 1.000   NA
 3357162 3357163 DNO_1092 DNO_1093   chpA TRUE 0.932 -7.000 0.000 0.003   NA
 3357163 3357164 DNO_1093 DNO_1094 chpA pilJ TRUE 0.989 60.000 0.554 0.003 Y NA
 3357164 3357165 DNO_1094 DNO_1095 pilJ   TRUE 1.000 15.000 0.795 0.002 Y NA
 3357165 3357166 DNO_1095 DNO_1096   pilH TRUE 0.980 -3.000 0.076 1.000 Y NA
 3357166 3357167 DNO_1096 DNO_1097 pilH pilG TRUE 0.893 37.000 0.085 0.008 Y NA
 3357167 3357168 DNO_1097 DNO_1098 pilG   FALSE 0.137 102.000 0.000 1.000 N NA
 3357169 3357170 DNO_1099 DNO_1100 trxB lpdA TRUE 0.681 27.000 0.000 0.024 N NA
 3357170 3357171 DNO_1100 DNO_1101 lpdA psd FALSE 0.190 85.000 0.000 1.000 N NA
 3357171 3357172 DNO_1101 DNO_1102 psd rnhA TRUE 0.740 -19.000 0.000 1.000 N NA
 3357173 3357174 DNO_1103 DNO_1104 brnQ   FALSE 0.062 164.000 0.000 NA   NA
 3357175 3357176 DNO_1105 DNO_1106   ppk FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 3357176 3357177 DNO_1106 DNO_1107 ppk   TRUE 0.638 20.000 0.000 1.000 N NA
 3357177 3357178 DNO_1107 DNO_1108   glnS FALSE 0.144 100.000 0.000 1.000 N NA
 3357178 3357179 DNO_1108 DNO_1109 glnS   FALSE 0.292 51.000 0.000 1.000 N NA
 3357179 3357180 DNO_1109 DNO_1110     FALSE 0.114 116.000 0.000 1.000 N NA
 3357180 3357181 DNO_1110 DNO_1111     FALSE 0.127 106.000 0.000 1.000 N NA
 3357181 3357182 DNO_1111 DNO_1112   purC TRUE 0.890 5.000 0.000 1.000 N NA
 3357182 3357183 DNO_1112 DNO_1113 purC purM TRUE 0.967 0.000 0.012 1.000 Y NA
 3357183 3357184 DNO_1113 DNO_1114 purM dapA FALSE 0.296 92.000 0.002 1.000 N NA
 3357184 3357185 DNO_1114 DNO_1115 dapA   TRUE 0.929 18.000 0.041 NA Y NA
 3357185 3357186 DNO_1115 DNO_1116   mutL TRUE 0.876 7.000 0.000 NA N NA
 3357186 3357187 DNO_1116 DNO_1117 mutL miaA TRUE 0.992 0.000 0.188 1.000 N NA
 3357187 3357188 DNO_1117 DNO_1118 miaA aspS FALSE 0.037 352.000 0.000 1.000 Y NA
 3357189 3357190 DNO_1119 DNO_1120 rplI rpsR TRUE 0.999 13.000 0.499 0.028 Y NA
 3357190 3357191 DNO_1120 DNO_1121 rpsR rpsF TRUE 0.998 11.000 0.319 0.028 Y NA
 3357193 3357194 DNO_1122 DNO_1124 coaE fimP TRUE 0.984 -3.000 0.122 1.000 N NA
 3357194 3357195 DNO_1124 DNO_1125 fimP fimO TRUE 0.999 0.000 0.454 0.062 Y NA
 3357195 3357196 DNO_1125 DNO_1126 fimO fimN TRUE 0.995 20.000 0.362 0.008 Y NA
 3357196 3357197 DNO_1126 DNO_1127 fimN   TRUE 0.940 -3.000 0.000 0.034 N NA
 3357198 3357199 DNO_1128 DNO_1129 recO rplM FALSE 0.042 223.000 0.000 1.000 N NA
 3357199 3357200 DNO_1129 DNO_1130 rplM rpsI TRUE 0.999 10.000 0.601 0.028 Y NA
 3357202 3357203 DNO_1132 DNO_1133     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3357203 3357204 DNO_1133 DNO_1135   mutM TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3357205 3357206 DNO_1134 DNO_1136     TRUE 0.887 8.000 0.000 1.000   NA
 3357206 3357207 DNO_1136 DNO_1137   proS FALSE 0.277 58.000 0.000 1.000 N NA
 3357207 3357208 DNO_1137 DNO_1138 proS   FALSE 0.058 170.000 0.000 NA   NA
 3357208 3357209 DNO_1138 DNO_1139     FALSE 0.086 137.000 0.000 NA   NA
 3357209 3357210 DNO_1139 DNO_1140   glmU FALSE 0.269 50.000 0.000 NA   NA
 3357210 3357211 DNO_1140 DNO_1141 glmU atpC TRUE 0.388 126.000 0.067 1.000 N NA
 3357211 3357212 DNO_1141 DNO_1142 atpC atpD TRUE 1.000 12.000 0.837 0.006 Y NA
 3357212 3357213 DNO_1142 DNO_1143 atpD atpG TRUE 0.998 23.000 0.724 0.006 Y NA
 3357213 3357214 DNO_1143 DNO_1144 atpG atpA TRUE 1.000 10.000 0.846 0.006 Y NA
 3357214 3357215 DNO_1144 DNO_1145 atpA atpH TRUE 1.000 2.000 0.864 0.006 Y NA
 3357215 3357216 DNO_1145 DNO_1146 atpH atpF TRUE 0.998 2.000 0.242 0.006 Y NA
 3357216 3357217 DNO_1146 DNO_1147 atpF atpE TRUE 0.993 37.000 0.666 0.006   NA
 3357217 3357218 DNO_1147 DNO_1148 atpE atpB TRUE 0.990 36.000 0.557 0.006   NA
 3357218 3357219 DNO_1148 DNO_1149 atpB   FALSE 0.027 401.000 0.000 1.000 N NA
 3357219 3357220 DNO_1149 DNO_1150   gidB TRUE 0.545 35.000 0.003 1.000 N NA
 3357220 3357221 DNO_1150 DNO_1151 gidB   TRUE 0.817 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3357222 3357223 DNO_1152 DNO_1153     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.059   NA
 3357224 3357225 DNO_1154 DNO_1155     FALSE 0.274 49.000 0.000 NA   NA
 3357225 3357226 DNO_1155 DNO_1156     FALSE 0.187 80.000 0.000 NA   NA
 3357227 3357228 DNO_1157 DNO_1158     FALSE 0.251 60.000 0.000 NA   NA
 3357228 3357229 DNO_1158 DNO_1159     TRUE 0.689 18.000 0.000 NA   NA
 3357229 3357230 DNO_1159 DNO_1161   dam TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3357233 3357234 DNO_1163 DNO_1164 trmA   TRUE 0.876 4.000 0.000 NA   NA
 3357236 3357237 DNO_1166 DNO_1167   aprV2 FALSE 0.031 265.000 0.000 NA   NA
 3357237 3357238 DNO_1167 DNO_1168 aprV2   FALSE 0.036 229.000 0.000 NA   NA
 3357238 3357239 DNO_1168 DNO_1169     FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 3357239 3357240 DNO_1169 DNO_1170     TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 3357240 3357241 DNO_1170 DNO_1171   pal TRUE 0.946 25.000 0.199 1.000   NA
 3357241 3357242 DNO_1171 DNO_1172 pal tolB TRUE 0.992 24.000 0.592 1.000 N NA
 3357242 3357243 DNO_1172 DNO_1173 tolB tolA FALSE 0.220 137.000 0.000 0.009   NA
 3357243 3357244 DNO_1173 DNO_1174 tolA tolR TRUE 0.903 -7.000 0.000 0.062   NA
 3357244 3357245 DNO_1174 DNO_1175 tolR tolQ TRUE 0.999 13.000 0.556 0.037 Y NA
 3357245 3357246 DNO_1175 DNO_1176 tolQ ruvB TRUE 0.591 35.000 0.007 1.000 N NA
 3357246 3357247 DNO_1176 DNO_1177 ruvB ruvA TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.004 Y NA
 3357247 3357248 DNO_1177 DNO_1178 ruvA ruvC TRUE 0.999 -3.000 0.451 0.013 Y NA
 3357248 3357249 DNO_1178 DNO_1179 ruvC   TRUE 0.995 2.000 0.277 NA   NA
 3357250 3357251 DNO_1180 DNO_1181 pstS   TRUE 0.462 120.000 0.079 NA Y NA
 3357251 3357252 DNO_1181 DNO_1182     TRUE 0.999 9.000 0.485 0.003 Y NA
 3357252 3357253 DNO_1182 DNO_1183   pstB TRUE 0.999 6.000 0.402 0.003 Y NA
 3357253 3357254 DNO_1183 DNO_1184 pstB greA FALSE 0.048 204.000 0.000 1.000 N NA
 3357254 3357255 DNO_1184 DNO_1185 greA   FALSE 0.046 193.000 0.000 NA   NA
 3357255 3357256 DNO_1185 DNO_1186     TRUE 0.731 -16.000 0.000 NA   NA
 3357257 3357258 DNO_1187 DNO_1188     FALSE 0.105 114.000 0.000 NA   NA
 3357258 3357259 DNO_1188 DNO_1189     TRUE 0.797 -7.000 0.000 NA   NA
 3357260 3357261 DNO_1190 DNO_1191   acrF TRUE 0.880 26.000 0.105 1.000 N NA
 3357261 3357262 DNO_1191 DNO_1192 acrF   TRUE 0.999 5.000 0.368 0.019 N NA
 3357263 3357264 DNO_1193 DNO_1194     FALSE 0.254 56.000 0.000 NA   NA
 3357264 3357265 DNO_1194 DNO_1195     TRUE 0.856 -3.000 0.000 NA   NA
 3357265 3357266 DNO_1195 DNO_1196   iscS TRUE 0.879 1.000 0.000 NA   NA
 3357266 3357267 DNO_1196 DNO_1197 iscS gcvT FALSE 0.143 118.000 0.000 1.000 Y NA
 3357269 3357270 DNO_1199 DNO_1200   pyk TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 3357270 3357271 DNO_1200 DNO_1201 pyk   TRUE 0.879 11.000 0.000 1.000 N NA
 3357272 3357273 DNO_1202 DNO_1203 ampD   FALSE 0.292 42.000 0.000 NA   NA
 3357273 3357274 DNO_1203 DNO_1204     TRUE 0.340 33.000 0.000 NA   NA
 3357274 3357275 DNO_1204 DNO_1205   rpmF TRUE 0.999 1.000 0.599 NA   NA
 3357275 3357276 DNO_1205 DNO_1206 rpmF plsX TRUE 0.988 23.000 0.418 1.000 N NA
 3357276 3357277 DNO_1206 DNO_1207 plsX fabH TRUE 0.998 15.000 0.380 0.008 Y NA
 3357277 3357278 DNO_1207 DNO_1208 fabH fabD TRUE 0.994 14.000 0.182 0.008 Y NA
 3357278 3357279 DNO_1208 DNO_1209 fabD fabG TRUE 0.999 5.000 0.432 0.008 Y NA
 3357279 3357280 DNO_1209 DNO_1210 fabG acpP TRUE 0.971 65.000 0.321 0.008 Y NA
 3357280 3357281 DNO_1210 DNO_1211 acpP fabF TRUE 0.792 165.000 0.346 1.000 Y NA
 3357281 3357282 DNO_1211 DNO_1212 fabF   TRUE 0.956 -3.000 0.019 NA   NA
 3357282 3357283 DNO_1212 DNO_1213   tmk TRUE 0.985 -10.000 0.209 NA   NA
 3357283 3357284 DNO_1213 DNO_1214 tmk holB TRUE 0.967 -3.000 0.037 1.000 N NA
 3357284 3357285 DNO_1214 DNO_1215 holB pilZ TRUE 0.857 -3.000 0.000 NA N NA
 3357285 3357286 DNO_1215 DNO_1216 pilZ   FALSE 0.056 176.000 0.000 NA N NA
 3357288 3357289 DNO_1218 DNO_1219 gshB   FALSE 0.049 188.000 0.000 NA   NA
 3357290 3357291 DNO_1220 DNO_1221     FALSE 0.290 43.000 0.000 NA   NA
 3357291 3357292 DNO_1221 DNO_1222   pgl FALSE 0.105 114.000 0.000 NA   NA
 3357292 3357293 DNO_1222 DNO_1223 pgl zwf TRUE 0.966 1.000 0.011 1.000 Y NA
 3357293 3357294 DNO_1223 DNO_1224 zwf   TRUE 0.349 32.000 0.000 NA   NA
 3357294 3357295 DNO_1224 DNO_1225     TRUE 0.889 -202.000 0.034 NA   NA
 3357295 3357296 DNO_1225 DNO_1226     TRUE 0.905 17.000 0.016 NA   NA
 3357297 3357298 DNO_1227 DNO_1228     FALSE 0.295 41.000 0.000 NA N NA
 3357298 3357299 DNO_1228 DNO_1229     TRUE 0.998 -7.000 0.620 1.000 N NA
 3357300 3357301 DNO_1230 DNO_1231   rrfB FALSE 0.135 97.000 0.000 NA   NA
 3357301 3357302 DNO_1231 DNO_1232 rrfB rrlB FALSE 0.239 68.000 0.000 NA   NA
 3357302 3357303 DNO_1232 DNO_1233 rrlB   FALSE 0.027 320.000 0.000 NA   NA
 3357303 3357304 DNO_1233 DNO_1234     TRUE 0.689 18.000 0.000 NA   NA
 3357304 3357305 DNO_1234 DNO_1235   rrsB FALSE 0.309 37.000 0.000 NA   NA
 3357305 3357306 DNO_1235 DNO_1236 rrsB gnd FALSE 0.028 307.000 0.000 NA   NA
 3357306 3357307 DNO_1236 DNO_1237 gnd folP TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3357307 3357308 DNO_1237 DNO_1238 folP ftsH TRUE 0.997 0.000 0.325 1.000 N NA
 3357308 3357309 DNO_1238 DNO_1239 ftsH rrmJ TRUE 0.748 33.000 0.066 NA N NA
 3357311 3357312 DNO_1241 DNO_1242     TRUE 0.853 12.000 0.000 NA   NA
 3357312 3357313 DNO_1242 DNO_1243     FALSE 0.187 80.000 0.000 NA   NA
 3357313 3357314 DNO_1243 DNO_1244   phoH TRUE 0.994 -19.000 0.457 NA   NA
 3357314 3357315 DNO_1244 DNO_1245 phoH miaB TRUE 0.823 85.000 0.220 1.000 N NA
 3357315 3357316 DNO_1245 DNO_1246 miaB   FALSE 0.266 67.000 0.000 1.000   NA
 3357316 3357317 DNO_1246 DNO_1247   trmB TRUE 0.868 12.000 0.000 1.000   NA
 3357317 3357318 DNO_1247 DNO_1248 trmB   TRUE 0.868 12.000 0.000 1.000   NA
 3357318 3357319 DNO_1248 DNO_1249   hemH FALSE 0.155 96.000 0.000 1.000   NA
 3357319 3357320 DNO_1249 DNO_1250 hemH rplQ FALSE 0.271 65.000 0.000 1.000 N NA
 3357320 3357321 DNO_1250 DNO_1251 rplQ rpoA TRUE 0.996 27.000 0.873 1.000 N NA
 3357321 3357322 DNO_1251 DNO_1252 rpoA rpsD TRUE 0.981 32.000 0.549 1.000 N NA
 3357322 3357323 DNO_1252 DNO_1253 rpsD rpsK TRUE 0.998 16.000 0.509 0.037 Y NA
 3357323 3357324 DNO_1253 DNO_1254 rpsK rpsM TRUE 0.999 18.000 0.810 0.027 Y NA
 3357324 3357325 DNO_1254 DNO_1255 rpsM secY FALSE 0.286 110.000 0.011 1.000 N NA
 3357325 3357326 DNO_1255 DNO_1256 secY rplO TRUE 0.991 29.000 0.730 1.000 N NA
 3357326 3357327 DNO_1256 DNO_1257 rplO rpmD TRUE 1.000 3.000 0.653 0.005 Y NA
 3357327 3357328 DNO_1257 DNO_1258 rpmD rpsE TRUE 0.999 -10.000 0.789 0.037 Y NA
 3357328 3357329 DNO_1258 DNO_1259 rpsE rplR TRUE 1.000 10.000 0.814 0.037 Y NA
 3357329 3357330 DNO_1259 DNO_1260 rplR rplF TRUE 0.999 16.000 0.815 0.027 Y NA
 3357330 3357331 DNO_1260 DNO_1261 rplF rpsH TRUE 1.000 13.000 0.808 0.027 Y NA
 3357331 3357332 DNO_1261 DNO_1262 rpsH rpsN TRUE 0.956 71.000 0.295 0.027 Y NA
 3357332 3357333 DNO_1262 DNO_1263 rpsN rplE TRUE 0.998 5.000 0.309 0.027 Y NA
 3357333 3357334 DNO_1263 DNO_1264 rplE rplX TRUE 1.000 8.000 0.758 0.027 Y NA
 3357334 3357335 DNO_1264 DNO_1265 rplX rplN TRUE 0.999 15.000 0.810 0.037 Y NA
 3357335 3357336 DNO_1265 DNO_1266 rplN rpsQ TRUE 1.000 13.000 0.791 0.037 Y NA
 3357336 3357337 DNO_1266 DNO_1267 rpsQ rpmC TRUE 1.000 4.000 0.828 0.027 Y NA
 3357337 3357338 DNO_1267 DNO_1268 rpmC rplP TRUE 1.000 0.000 0.802 0.027 Y NA
 3357338 3357339 DNO_1268 DNO_1269 rplP rpsC TRUE 1.000 13.000 0.828 0.037 Y NA
 3357339 3357340 DNO_1269 DNO_1270 rpsC rplV TRUE 0.999 13.000 0.719 0.037 Y NA
 3357340 3357341 DNO_1270 DNO_1271 rplV rpsS TRUE 1.000 10.000 0.769 0.037 Y NA
 3357341 3357342 DNO_1271 DNO_1272 rpsS rplB TRUE 1.000 3.000 0.820 0.037 Y NA
 3357342 3357343 DNO_1272 DNO_1273 rplB rplW TRUE 0.999 13.000 0.849 1.000 Y NA
 3357343 3357344 DNO_1273 DNO_1274 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3357344 3357345 DNO_1274 DNO_1275 rplD rplC TRUE 0.999 10.000 0.486 0.027 Y NA
 3357345 3357346 DNO_1275 DNO_1276 rplC rpsJ TRUE 0.934 90.000 0.307 0.037 Y NA
 3357346 3357347 DNO_1276 DNO_1277 rpsJ tufA TRUE 0.997 6.000 0.318 1.000 Y NA
 3357347 3357348 DNO_1277 DNO_1278 tufA fusA TRUE 0.997 18.000 0.400 0.001 Y NA
 3357348 3357349 DNO_1278 DNO_1279 fusA rpsG TRUE 0.987 31.000 0.579 1.000 Y NA
 3357349 3357350 DNO_1279 DNO_1280 rpsG rpsL TRUE 0.999 18.000 0.620 0.006 Y NA
 3357350 3357351 DNO_1280 DNO_1281 rpsL rpoC TRUE 0.630 94.000 0.122 1.000 N NA
 3357351 3357352 DNO_1281 DNO_1282 rpoC rpoB TRUE 0.999 20.000 0.851 0.001   NA
 3357352 3357353 DNO_1282 DNO_1283 rpoB rplL TRUE 0.600 166.000 0.223 1.000   NA
 3357353 3357354 DNO_1283 DNO_1284 rplL rplJ TRUE 0.993 49.000 0.884 1.000 Y NA
 3357354 3357355 DNO_1284 DNO_1285 rplJ rplA TRUE 0.727 169.000 0.302 1.000 Y NA
 3357355 3357356 DNO_1285 DNO_1286 rplA rplK TRUE 1.000 5.000 0.838 0.037 Y NA
 3357356 3357357 DNO_1286 DNO_1287 rplK nusG TRUE 0.985 43.000 0.681 1.000 N NA
 3357357 3357358 DNO_1287 DNO_1288 nusG secE TRUE 1.000 1.000 0.843 1.000 N NA
 3357358 3357359 DNO_1288 DNO_1289 secE   TRUE 0.586 21.000 0.000 NA   NA
 3357359 10692617 DNO_1289 DNO_1290     FALSE 0.248 64.000 0.000 NA   NA
 10692617 3357360 DNO_1290 DNO_1291     FALSE 0.254 56.000 0.000 NA   NA
 3357360 3357361 DNO_1291 DNO_1292     TRUE 0.689 18.000 0.000 NA   NA
 3357361 3357362 DNO_1292 DNO_1293     TRUE 0.876 4.000 0.000 NA   NA
 3357362 3357363 DNO_1293 DNO_1294   apaH FALSE 0.253 57.000 0.000 NA   NA
 3357364 3357365 DNO_1295 DNO_1296   kdtA TRUE 0.722 -25.000 0.000 1.000 N NA
 3357366 3357367 DNO_1297 DNO_1298 fld folD TRUE 0.361 34.000 0.000 1.000 N NA
 3357367 3357368 DNO_1298 DNO_1299 folD   FALSE 0.300 49.000 0.000 1.000 N NA
 3357368 3357369 DNO_1299 DNO_1300     FALSE 0.279 56.000 0.000 1.000   NA
 3357369 3357370 DNO_1300 DNO_1301     FALSE 0.043 219.000 0.000 1.000   NA
 3357370 3357371 DNO_1301 DNO_1302     TRUE 0.616 21.000 0.000 1.000   NA
 3357371 3357372 DNO_1302 DNO_1303   mutS FALSE 0.129 105.000 0.000 1.000   NA
 3357372 3357373 DNO_1303 DNO_1304 mutS   FALSE 0.123 109.000 0.000 1.000   NA
 3357373 3357374 DNO_1304 DNO_1305   rrfC FALSE 0.135 97.000 0.000 NA   NA
 3357374 3357375 DNO_1305 DNO_1306 rrfC rrlC FALSE 0.239 68.000 0.000 NA   NA
 3357375 3357376 DNO_1306 DNO_1307 rrlC   FALSE 0.027 320.000 0.000 NA   NA
 3357376 3357377 DNO_1307 DNO_1308     TRUE 0.689 18.000 0.000 NA   NA
 3357377 3357378 DNO_1308 DNO_1309   rrsC FALSE 0.309 37.000 0.000 NA   NA
 3357378 3357379 DNO_1309 DNO_1310 rrsC comL FALSE 0.029 287.000 0.000 NA   NA
 3357380 3357381 DNO_1311 DNO_1312 rluD suC FALSE 0.079 150.000 0.000 1.000 N NA
 3357381 3357382 DNO_1312 DNO_1313 suC sucD TRUE 1.000 10.000 0.806 0.001 Y NA
 3357382 3357383 DNO_1313 DNO_1314 sucD   FALSE 0.079 141.000 0.000 NA   NA
 3357384 3357385 DNO_1315 DNO_1316     FALSE 0.262 52.000 0.000 NA   NA
 3357385 3357386 DNO_1316 DNO_1317   dsbC TRUE 0.440 28.000 0.000 1.000 N NA
 3357386 3357387 DNO_1317 DNO_1318 dsbC   FALSE 0.112 118.000 0.000 1.000 N NA
 3357387 3357388 DNO_1318 DNO_1319     FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 3357388 3357389 DNO_1319 DNO_1320     TRUE 0.757 -12.000 0.000 NA   NA
 3357389 3357390 DNO_1320 DNO_1321   tyrS TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3357391 3357392 DNO_1322 DNO_1323   anmK TRUE 0.951 1.000 0.006 NA N NA
 3357392 3357393 DNO_1323 DNO_1324 anmK   TRUE 0.547 23.000 0.000 NA N NA
 3357393 3357394 DNO_1324 DNO_1325   ychF FALSE 0.271 65.000 0.000 1.000 N NA
 3357394 3357395 DNO_1325 DNO_1326 ychF efp TRUE 0.645 23.000 0.000 1.000 Y NA
 3357395 3357396 DNO_1326 DNO_1327 efp   TRUE 0.586 21.000 0.000 NA   NA
 3357396 3357397 DNO_1327 DNO_1328     FALSE 0.064 159.000 0.000 NA   NA
 3357397 3357398 DNO_1328 DNO_1329     FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 3357398 3357399 DNO_1329 DNO_1330     FALSE 0.239 68.000 0.000 NA   NA
 3357400 3357401 DNO_1331 DNO_1332   hemE TRUE 0.832 13.000 0.000 NA N NA
 3357401 3357402 DNO_1332 DNO_1333 hemE pflA FALSE 0.059 183.000 0.000 1.000 N NA
 3357402 3357403 DNO_1333 DNO_1334 pflA pflB TRUE 0.621 86.000 0.092 1.000 N NA
 3357404 3357405 DNO_1335 DNO_1336 argF-2   TRUE 0.891 1.000 0.000 1.000   NA
 3357405 3357406 DNO_1336 DNO_1337     TRUE 0.360 34.000 0.000 1.000   NA
 3357406 3357407 DNO_1337 DNO_1338   ptrB TRUE 0.329 39.000 0.000 1.000 N NA
 3357408 3357409 DNO_1339 DNO_1340 groEL groES TRUE 0.783 25.000 0.000 0.008 Y NA
 3357409 3357410 DNO_1340 DNO_1341 groES   FALSE 0.028 305.000 0.000 NA N NA
 3357413 3357414 DNO_1344 DNO_1345     TRUE 0.890 6.000 0.000 1.000 N NA
 3357414 3357415 DNO_1345 DNO_1346   hslV FALSE 0.081 149.000 0.000 1.000 N NA
 3357415 3357416 DNO_1346 DNO_1347 hslV hslU TRUE 0.999 2.000 0.752 1.000 Y NA
 3357416 3357417 DNO_1347 DNO_1348 hslU   FALSE 0.064 173.000 0.000 1.000 N NA
 3357417 3357418 DNO_1348 DNO_1349   sdaC FALSE 0.025 658.000 0.000 1.000 N NA
 3357418 3357419 DNO_1349 DNO_1350 sdaC pepT-2 FALSE 0.043 292.000 0.000 1.000 Y NA
 3357419 3357420 DNO_1350 DNO_1351 pepT-2 dcpA FALSE 0.272 124.000 0.000 0.017 Y NA
 3357420 3357421 DNO_1351 DNO_1352 dcpA dcpB TRUE 0.387 103.000 0.000 0.001 Y NA
 3357421 3357422 DNO_1352 DNO_1353 dcpB dcuCA FALSE 0.163 146.000 0.000 0.057 N NA
 3357422 3357423 DNO_1353 DNO_1354 dcuCA dcuCB TRUE 0.977 19.000 0.097 0.003 Y NA
 3357423 3356082 DNO_1354 DNO_0001 dcuCB dnaA FALSE 0.055 189.000 0.000 1.000 N NA