MicrobesOnline Operon Predictions for Pirellula sp. 1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 554028 554029 RB8 RB13     FALSE 0.184 195.000 0.000 NA   NA
 554031 554032 RB16 RB17     FALSE 0.074 -312.000 0.000 NA   NA
 554032 554033 RB17 RB18     FALSE 0.074 -312.000 0.000 NA   NA
 554033 554034 RB18 RB19     FALSE 0.084 -130.000 0.000 NA   NA
 554034 554035 RB19 RB20     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554036 554037 RB24 RB27     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 554040 554041 RB33 RB34     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 554041 554042 RB34 RB35     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 554042 554043 RB35 RB36     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 554043 554044 RB36 RB37     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554046 554047 RB39 RB40     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 554047 554048 RB40 RB41     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 554048 554049 RB41 RB43     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 554049 554050 RB43 RB44     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554050 554051 RB44 RB45     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 554051 554052 RB45 RB46     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 554052 554053 RB46 RB50     FALSE 0.184 213.000 0.000 NA   NA
 554053 554054 RB50 RB52     FALSE 0.191 133.000 0.000 NA   NA
 554054 554055 RB52 RB54     FALSE 0.184 203.000 0.000 NA   NA
 554055 554056 RB54 RB56     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 554056 554057 RB56 RB59     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 554058 554059 RB60 RB61     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554059 554060 RB61 RB62     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554060 554061 RB62 RB66     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 554061 554062 RB66 RB68     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 554062 554063 RB68 RB71     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554063 554064 RB71 RB72     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554064 554065 RB72 RB73     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554065 554066 RB73 RB76     FALSE 0.190 141.000 0.000 NA   NA
 554066 554067 RB76 RB77     FALSE 0.072 -528.000 0.000 NA   NA
 554067 554068 RB77 RB80     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 554068 554069 RB80 RB81     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 554069 554070 RB81 RB82     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 554072 554073 RB85 RB87     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554073 554074 RB87 RB88   phoD FALSE 0.184 203.000 0.000 NA   NA
 554074 554075 RB88 RB89 phoD   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554076 554077 RB92 RB93 phoD   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554077 554078 RB93 RB95     FALSE 0.185 176.000 0.000 NA   NA
 554078 554079 RB95 RB98     FALSE 0.185 185.000 0.000 NA   NA
 554079 554080 RB98 RB100     FALSE 0.188 155.000 0.000 NA   NA
 554080 554081 RB100 RB101     FALSE 0.188 154.000 0.000 NA   NA
 554081 554082 RB101 RB104     FALSE 0.080 -150.000 0.000 NA   NA
 554083 554084 RB105 RB107     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554085 554086 RB110 RB112     FALSE 0.184 236.000 0.000 NA   NA
 554086 554087 RB112 RB115     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554087 554088 RB115 RB117     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554088 554089 RB117 RB118     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554089 554090 RB118 RB120     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 554090 554091 RB120 RB123     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 554091 554092 RB123 RB125     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554092 554093 RB125 RB127     FALSE 0.096 -84.000 0.000 NA   NA
 554093 554094 RB127 RB128   gspE TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554094 554095 RB128 RB129 gspE   FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 554097 554098 RB132 RB133     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554098 554099 RB133 RB135     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554100 554101 RB136 RB138     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554101 554102 RB138 RB140     TRUE 0.730 62.000 0.000 1.000 Y NA
 554103 554104 RB142 RB144     TRUE 0.930 -54.000 0.500 NA   NA
 554104 554105 RB144 RB146     TRUE 0.461 4.000 0.000 NA N NA
 554105 554106 RB146 RB148   secA TRUE 0.839 -3.000 0.000 0.096 N NA
 554106 554107 RB148 RB149 secA   TRUE 0.791 -15.000 0.000 1.000 Y NA
 554108 554109 RB150 RB152     FALSE 0.079 -157.000 0.000 NA   NA
 554109 554110 RB152 RB154     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 554110 554111 RB154 RB159     TRUE 0.750 -3.000 0.000 0.096   NA
 554115 554116 RBt02 RB164     FALSE 0.192 119.000 0.000 NA   NA
 554118 554119 RB166 RB168     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 554119 554120 RB168 RB170     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554120 554121 RB170 RB171     TRUE 0.832 3.000 0.000 0.070 Y NA
 554121 554122 RB171 RB172     TRUE 0.845 -10.000 0.000 0.070 Y NA
 554122 554123 RB172 RB174     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554123 554124 RB174 RB175     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554125 554126 RB177 RB180     FALSE 0.187 162.000 0.000 NA   NA
 554126 554127 RB180 RB182     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 554127 554128 RB182 RB183     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 554131 554132 RB188 RB191     TRUE 0.988 0.000 0.154 0.096 N NA
 554133 554134 RB192 RB193     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554134 554135 RB193 RB195   oprO TRUE 0.954 99.000 1.000 NA   NA
 554137 554138 RB198 RB200     TRUE 0.781 164.000 0.000 0.031 Y NA
 554138 554139 RB200 RB201     TRUE 0.400 237.000 0.000 NA N NA
 554139 554140 RB201 RB202     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554140 554141 RB202 RB203     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 554141 554142 RB203 RB206     FALSE 0.185 179.000 0.000 NA   NA
 554142 554143 RB206 RB207     FALSE 0.191 134.000 0.000 NA   NA
 554143 554144 RB207 RB210     TRUE 0.984 -3.000 0.724 NA   NA
 554145 554146 RB213 RB218     TRUE 0.956 119.000 0.600 NA   NA
 554146 554147 RB218 RB220     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 554148 554149 RB222 RB223     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 554149 554150 RB223 RB226     FALSE 0.186 173.000 0.000 NA   NA
 554153 554154 RB233 RB236     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 554154 554155 RB236 RB241     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 554155 554156 RB241 RB244     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 554156 554157 RB244 RB246     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 554158 554159 RB248 RB249     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554161 554162 RB251 RB252 hisS   TRUE 0.942 115.000 0.019 NA   NA
 554164 554165 RB257 RB259     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 554166 554167 RB262 RB264   rpsU FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 554167 554168 RB264 RBt03 rpsU   FALSE 0.188 152.000 0.000 NA   NA
 554169 554170 RB268 RB269     FALSE 0.186 171.000 0.000 NA   NA
 554170 554171 RB269 RB271     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554173 554174 RB273 RB275     FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 554175 554176 RB276 RB278     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 554176 554177 RB278 RB279     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 554178 554179 RB280 RB281   groS FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 554179 554180 RB281 RB282 groS   FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 554180 554181 RB282 RB283     FALSE 0.090 -100.000 0.000 NA   NA
 554181 554182 RB283 RB284   dgt FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 554182 554183 RB284 RB285 dgt   FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 554183 554184 RB285 RB287     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 554185 554186 RB286 RB289     FALSE 0.104 -72.000 0.000 NA   NA
 554186 554187 RB289 RB291     TRUE 0.984 1.000 0.143 1.000 N NA
 554187 554188 RB291 RB293   mobA TRUE 0.811 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 554188 554189 RB293 RB295 mobA moeA TRUE 0.746 11.000 0.000 0.002 Y NA
 554190 554191 RB296 RB297   amtB FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 554191 554192 RB297 RB298 amtB   FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554193 554194 RB299 RB301 htrA mutY TRUE 0.411 139.000 0.000 1.000   NA
 554194 554195 RB301 RB303 mutY   FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 554195 554196 RB303 RB304     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 554196 554197 RB304 RB306     FALSE 0.184 233.000 0.000 NA   NA
 554198 554199 RB307 RB309   chlI TRUE 0.575 120.000 0.000 1.000 N NA
 554199 554200 RB309 RB313 chlI   FALSE 0.184 223.000 0.000 NA   NA
 554201 554202 RB314 RB316 fabD fabG TRUE 0.984 134.000 0.006 0.004 Y NA
 554202 554203 RB316 RB318 fabG acpP TRUE 0.984 139.000 0.008 0.004 Y NA
 554203 554204 RB318 RB319 acpP   FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 554204 554205 RB319 RB320   fabF TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554205 554206 RB320 RB321 fabF   TRUE 0.449 -55.000 0.000 1.000 N NA
 554208 554209 RB324 RB327     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 554211 554212 RB331 RB334     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 554213 554214 RB335 RB336     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554217 554218 RB341 RB342   fkpA FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 554219 554220 RB343 RB344     TRUE 0.404 177.000 0.000 1.000   NA
 554220 554221 RB344 RB347     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 554221 554222 RB347 RB348     FALSE 0.212 -132.000 0.000 NA N NA
 554226 554227 RB357 RB360 ubiE   TRUE 0.984 -3.000 0.347 NA   NA
 554227 554228 RB360 RB362     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 554230 554231 RB365 RB367     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 554234 554235 RB370 RB372 nrtC nrtB TRUE 0.981 84.000 0.767 NA Y NA
 554235 554236 RB372 RB373 nrtB nrtC TRUE 0.995 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 554236 554237 RB373 RB374 nrtC nrtD TRUE 0.988 94.000 0.250 0.022 Y NA
 554237 554238 RB374 RB375 nrtD   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554238 554239 RB375 RB377     FALSE 0.102 -75.000 0.000 NA   NA
 554239 554240 RB377 RB378   narB TRUE 0.989 -3.000 0.054 0.083   NA
 554240 554241 RB378 RB379 narB nirA TRUE 0.986 -7.000 0.039 0.083 N NA
 554241 554242 RB379 RB380 nirA cysJ TRUE 0.989 78.000 0.640 0.014 Y NA
 554242 554243 RB380 RB381 cysJ   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554243 554244 RB381 RB382     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 554245 554246 RB383 RB384   kptA FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554246 554247 RB384 RB386 kptA   FALSE 0.277 36.000 0.000 1.000   NA
 554248 554249 RB388 RB390     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554249 554250 RB390 RB392     TRUE 0.563 0.000 0.000 1.000   NA
 554251 554252 RB393 RB394     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 554253 554254 RB395 RB398     TRUE 0.947 53.000 0.667 NA   NA
 554257 554258 RB404 RB406     FALSE 0.187 158.000 0.000 NA   NA
 554260 554261 RB410 RB412 trpD   FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 554261 554262 RB412 RB413     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554263 554264 RB417 RB418 iunH   FALSE 0.329 -46.000 0.000 1.000   NA
 554264 554265 RB418 RB419     TRUE 0.404 173.000 0.000 1.000   NA
 554265 554266 RB419 RB422   suhB TRUE 0.531 -36.000 0.000 1.000 N NA
 554266 554267 RB422 RB423 suhB   FALSE 0.372 -60.000 0.000 0.058   NA
 554269 554270 RB426 RB430     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 554270 554271 RB430 RB431     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 554271 554272 RB431 RB434     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554272 554273 RB434 RBt04     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554273 554274 RBt04 RB437     FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 554274 554275 RB437 RB439     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 554275 554276 RB439 RB442     FALSE 0.190 141.000 0.000 NA   NA
 554276 554277 RB442 RB443     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 554277 554278 RB443 RB444     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554279 554280 RB445 RB446     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 554280 554281 RB446 RB448     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 554281 554282 RB448 RB449     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554282 554283 RB449 RB450     FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 554284 554285 RB451 RB452     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 554285 554286 RB452 RB453     TRUE 0.984 -3.000 0.636 NA   NA
 554286 554287 RB453 RB454     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 554287 554288 RB454 RB457     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 554288 554289 RB457 RB459     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554289 554290 RB459 RB460     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 554290 554291 RB460 RB461     FALSE 0.307 13.000 0.000 1.000   NA
 554291 554292 RB461 RB463     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 554292 554293 RB463 RB464     FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 554294 554295 RB466 RB468     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 554295 554296 RB468 RB469     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554296 554297 RB469 RB470     FALSE 0.261 31.000 0.000 1.000   NA
 554297 554298 RB470 RB471     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 554299 554300 RB472 RB473     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554301 554302 RB475 RB479     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 554302 554303 RB479 RB481     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 554304 554305 RB483 RB484     FALSE 0.090 -100.000 0.000 NA   NA
 554305 554306 RB484 RB485     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 554306 554307 RB485 RB486     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 554307 554308 RB486 RB488     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 554308 554309 RB488 RB490     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554309 554310 RB490 RB492     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 554310 554311 RB492 RB497     FALSE 0.396 59.000 0.000 1.000   NA
 554311 554312 RB497 RB498     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554312 554313 RB498 RB500     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554313 554314 RB500 RB502     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554314 554315 RB502 RB505     FALSE 0.096 -84.000 0.000 NA   NA
 554315 554316 RB505 RB510     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554317 554318 RB512 RB514     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554318 554319 RB514 RB517     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 554325 554326 RB523 RB524     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 554326 554327 RB524 RB531     TRUE 0.402 213.000 0.000 1.000   NA
 554329 554330 RB534 RB535     FALSE 0.075 -225.000 0.000 NA   NA
 554330 554331 RB535 RB536   pdxJ TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554334 554335 RB539 RB541 cinA   FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 554335 554336 RB541 RB543     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 554336 554337 RB543 RB544     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 554337 554338 RB544 RB546     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554339 554340 RB548 RB549 glgB   FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554340 554341 RB549 RB550     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554342 554343 RB555 RB556     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 554343 554344 RB556 RB557     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 554345 554346 RB558 RB560     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 554346 554347 RB560 RB562     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 554347 554348 RB562 RB563     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 554348 554349 RB563 RB566     FALSE 0.183 257.000 0.000 NA   NA
 554349 554350 RB566 RB568     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554351 554352 RB569 RB573     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554352 554353 RB573 RB574     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 554354 554355 RB576 RB577     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 554355 554356 RB577 RB578     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554356 554357 RB578 RB580     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 554358 554359 RB583 RB588     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554359 554360 RB588 RB598     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 554360 554361 RB598 RB601     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 554361 554362 RB601 RB605     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 554362 554363 RB605 RB607     TRUE 0.758 56.000 0.000 0.093 Y NA
 554365 554366 RB612 RB614     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554366 554367 RB614 RB617     TRUE 0.494 322.000 0.000 0.080   NA
 554368 554369 RB621 RB624     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 554369 554370 RB624 RB625     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 554371 554372 RB626 RB629     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554372 554373 RB629 RB631     FALSE 0.185 178.000 0.000 NA   NA
 554375 554376 RB637 RB638     FALSE 0.265 17.000 0.000 1.000   NA
 554376 554377 RB638 RB641     TRUE 0.411 140.000 0.000 1.000   NA
 554378 554379 RB645 RB651     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 554379 554380 RB651 RB655     FALSE 0.184 203.000 0.000 NA   NA
 554380 554381 RB655 RB658     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554383 554384 RB661 RB663     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 554385 554386 RB666 RB668   pldB FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 554389 554390 RB674 RB675     TRUE 0.922 14.000 0.167 NA   NA
 554390 554391 RB675 RB678   rhaA TRUE 0.959 85.000 0.017 NA N NA
 554391 554392 RB678 RB679 rhaA   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554394 554395 RB681 RB683 fucA   TRUE 0.483 46.000 0.000 1.000 N NA
 554395 554396 RB683 RB684     TRUE 0.652 73.000 0.000 0.093 N NA
 554396 554397 RB684 RB686     TRUE 0.877 0.000 0.000 0.004 Y NA
 554397 554398 RB686 RB691     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554398 554399 RB691 RB693     FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 554399 554400 RB693 RB695     FALSE 0.343 49.000 0.000 1.000   NA
 554400 554401 RB695 RB700   ramA TRUE 0.418 107.000 0.000 1.000   NA
 554404 554405 RB704 RB706     TRUE 0.832 3.000 0.000 0.067 Y NA
 554406 554407 RB708 RB711     TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000 N NA
 554408 554409 RB713 RB714     FALSE 0.081 -139.000 0.000 NA   NA
 554409 554410 RB714 RB716     TRUE 0.891 -108.000 1.000 NA   NA
 554415 554416 RB724 RB728     TRUE 0.495 3.000 0.000 1.000   NA
 554418 554419 RB735 RB736     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 554421 554422 RB745 RB749     TRUE 0.403 180.000 0.000 1.000   NA
 554422 554423 RB749 RB751     FALSE 0.077 -187.000 0.000 NA   NA
 554424 554425 RB752 RB754     TRUE 0.954 165.000 0.500 NA   NA
 554426 554427 RB756 RB757     TRUE 0.749 -7.000 0.000 NA Y NA
 554427 554428 RB757 RB758     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 554429 554430 RB760 RB763     TRUE 0.793 90.000 0.000 0.030 Y NA
 554430 554431 RB763 RB767     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554431 554432 RB767 RB772     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 554432 554433 RB772 RB773     TRUE 0.560 -226.000 0.000 0.030 Y NA
 554433 554434 RB773 RB774     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554437 554438 RB778 RB779     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 554438 554439 RB779 RB782     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 554439 554440 RB782 RB783     TRUE 0.924 13.000 0.107 NA   NA
 554442 554443 RB787 RB790     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554443 554444 RB790 RB791     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554445 554446 RB792 RB794     FALSE 0.183 241.000 0.000 NA   NA
 554446 554447 RB794 RB795     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 554448 554449 RB796 RBt05     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 554449 554450 RBt05 RBt06     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554450 554451 RBt06 RBt07     FALSE 0.183 420.000 0.000 NA   NA
 554451 554452 RBt07 RB800     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554452 554453 RB800 RBt08     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 554455 554456 RBt09 RBt10     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554456 554457 RBt10 RBt11     FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 554457 554458 RBt11 RBt12     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554458 554459 RBt12 RBt13     FALSE 0.183 265.000 0.000 NA   NA
 554459 554460 RBt13 RB807     FALSE 0.183 306.000 0.000 NA   NA
 554460 554461 RB807 RB809     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 554461 554462 RB809 RB812     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 554462 554463 RB812 RB813     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554464 554465 RB814 RB815     TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.066 Y NA
 554467 554468 RB818 RB820     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554468 554469 RB820 RB821     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 554470 554471 RB822 RB825     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 554472 554473 RB827 RB828     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 554473 554474 RB828 RB829     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 554475 554476 RB832 RB834     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554476 554477 RB834 RB835     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 554477 554478 RB835 RB838     TRUE 0.616 -19.000 0.000 1.000 N NA
 554480 554481 RB841 RB842     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 554482 554483 RB844 RB850     TRUE 0.400 274.000 0.000 1.000   NA
 554486 554487 RB857 RB858     TRUE 0.984 -3.000 0.300 NA   NA
 554487 554488 RB858 RB861   tolQ TRUE 0.983 -3.000 0.125 NA   NA
 554491 554492 RB864 RB865     TRUE 0.954 133.000 0.286 NA   NA
 554494 554495 RB869 RB870     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 554497 554498 RB873 RB874     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 554499 554500 RB878 RB879 mtrA   FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 554501 554502 RB880 RB883     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554502 554503 RB883 RBt14     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 554503 554504 RBt14 RB885     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554507 554508 RB895 RB896     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 554510 554511 RB898 RB900     TRUE 0.955 144.000 0.500 NA   NA
 554511 554512 RB900 RB905     TRUE 0.415 118.000 0.000 1.000   NA
 554512 554513 RB905 RB908     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 554513 554514 RB908 RB912     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 554515 554516 RB913 RB916     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 554516 554517 RB916 RB918     FALSE 0.184 235.000 0.000 NA   NA
 554519 554520 RB921 RB922     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554520 554521 RB922 RB923     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 554522 554523 RB924 RB925     FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 554523 554524 RB925 RB927     TRUE 0.517 102.000 0.000 0.065   NA
 554524 554525 RB927 RB930     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 554526 554527 RB931 RB932     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554528 554529 RB933 RB934     FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 554529 554530 RB934 RB936     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 554530 554531 RB936 RB938     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 554531 554532 RB938 RB940     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 554532 554533 RB940 RB941     FALSE 0.076 -205.000 0.000 NA   NA
 554533 554534 RB941 RB943     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554534 554535 RB943 RB945   lldP TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554537 554538 RB950 RB951     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 554542 554543 RB955 RB956     FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 554543 554544 RB956 RB957     TRUE 0.754 -3.000 0.000 0.065   NA
 554544 554545 RB957 RB962     TRUE 0.458 -37.000 0.000 0.065   NA
 554546 554547 RB963 RB964     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554547 554548 RB964 RB965     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554549 554550 RB967 RB968     FALSE 0.076 -201.000 0.000 NA   NA
 554552 554553 RB971 RB973     TRUE 0.555 73.000 0.000 0.005   NA
 554554 554555 RB974 RB977   nagA FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 554555 554556 RB977 RB981 nagA   TRUE 0.996 -3.000 0.874 0.005 Y NA
 554556 554557 RB981 RB983     TRUE 0.403 185.000 0.000 1.000   NA
 554559 554560 RB990 RB993 tetA   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554562 554563 RB997 RB1002 ogt   TRUE 0.401 61.000 0.000 1.000   NA
 554565 554566 RB1009 RB1010     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554566 554567 RB1010 RB1012     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 554570 554571 RB1021 RB1022     FALSE 0.379 55.000 0.000 NA N NA
 554571 554572 RB1022 RB1027     TRUE 0.561 264.000 0.000 1.000 N NA
 554573 554574 RB1029 RB1033     FALSE 0.184 193.000 0.000 NA   NA
 554574 554575 RB1033 RB1036     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554575 554576 RB1036 RB1039   serS FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 554578 554579 RB1043 RB1044     TRUE 0.956 70.000 0.769 NA   NA
 554579 554580 RB1044 RB1046   recG FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 554580 554581 RB1046 RB1047 recG   FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 554581 554582 RB1047 RB1048     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554582 554583 RB1048 RB1050     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 554583 554584 RB1050 RB1052     FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 554585 554586 RB1056 RB1057     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554589 554590 RB1063 RB1065   glnB TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554591 554592 RB1066 RB1072     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 554593 554594 RB1074 RB1077 rbsC   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554594 554595 RB1077 RB1079   adk FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 554595 554596 RB1079 RB1081 adk   TRUE 0.798 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 554603 554604 RB1097 RB1100   capC TRUE 0.984 -3.000 0.733 NA   NA
 554604 554605 RB1100 RB1103 capC capB TRUE 0.984 2.000 0.545 0.001   NA
 554606 554607 RB1104 RB1105     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 554607 554608 RB1105 RB1106     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554609 554610 RB1107 RB1109     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 554612 554613 RB1118 RB1120     TRUE 0.419 101.000 0.000 1.000   NA
 554613 554614 RB1120 RB1122     FALSE 0.210 -135.000 0.000 NA N NA
 554614 554615 RB1122 RB1125     TRUE 0.654 80.000 0.000 NA Y NA
 554615 554616 RB1125 RB1129     FALSE 0.185 191.000 0.000 NA   NA
 554618 554619 RB1133 RB1134   ndhF FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554620 554621 RB1137 RB1138     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554622 554623 RB1140 RB1142     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554628 554629 RB1147 RB1148   tadB TRUE 0.995 -3.000 0.238 1.000 Y NA
 554629 554630 RB1148 RB1149 tadB   TRUE 0.996 -3.000 0.190 0.013 Y NA
 554630 554631 RB1149 RB1153     TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 554631 554632 RB1153 RB1154     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 554632 554633 RB1154 RB1155     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 554633 554634 RB1155 RB1156     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 554635 554636 RB1161 RB1164   exbD FALSE 0.256 19.000 0.000 1.000   NA
 554636 554637 RB1164 RB1165 exbD exbB TRUE 0.871 0.000 0.000 0.035 Y NA
 554637 554638 RB1165 RB1168 exbB   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554638 554639 RB1168 RB1170   degT FALSE 0.201 -168.000 0.000 1.000   NA
 554639 554640 RB1170 RB1172 degT   FALSE 0.183 264.000 0.000 NA   NA
 554642 554643 RB1175 RB1178     FALSE 0.184 223.000 0.000 NA   NA
 554644 554645 RB1179 RB1180     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 554645 554646 RB1180 RB1182     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 554646 554647 RB1182 RB1183     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 554648 554649 RB1184 RB1185     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554650 554651 RB1189 RB1190     TRUE 0.833 3.000 0.000 0.064 Y NA
 554652 554653 RB1191 RB1192     TRUE 0.924 15.000 0.667 NA   NA
 554653 554654 RB1192 RB1193     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 554654 554655 RB1193 RB1194     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 554656 554657 RB1196 RB1198     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 554657 554658 RB1198 RB1199     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 554658 554659 RB1199 RB1200     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 554662 554663 RB1203 RB1204     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 554663 554664 RB1204 RB1205     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 554668 554669 RB1212 RB1213 mgtE efp TRUE 0.591 79.000 0.000 1.000 N NA
 554670 554671 RB1214 RB1216 kamA   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554671 554672 RB1216 RB1220   galM FALSE 0.184 235.000 0.000 NA   NA
 554672 554673 RB1220 RB1222 galM   FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554673 554674 RB1222 RB1223     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554674 554675 RB1223 RB1224     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 554676 554677 RB1225 RB1230 dpp4   FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 554677 554678 RB1230 RB1231   lpd FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 554680 554681 RB1233 RB1235 rpsD   TRUE 0.400 297.000 0.000 1.000   NA
 554681 554682 RB1235 RB1237     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 554682 554683 RB1237 RB1238     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 554683 554684 RB1238 RB1239     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 554684 554685 RB1239 RB1240     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 554685 554686 RB1240 RB1246     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554687 554688 RB1248 RB1250     FALSE 0.193 114.000 0.000 NA   NA
 554688 554689 RB1250 RB1252     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 554689 554690 RB1252 RB1254     FALSE 0.185 184.000 0.000 NA   NA
 554691 554692 RB1255 RB1256     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 554692 554693 RB1256 RB1257     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 554693 554694 RB1257 RB1258     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554695 554696 RB1259 RB1260     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554699 554700 RB1266 RB1269     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554701 554702 RB1270 RB1272     FALSE 0.395 59.000 0.000 NA N NA
 554702 554703 RB1272 RB1274     TRUE 0.631 198.000 0.000 0.087 N NA
 554704 554705 RB1275 RB1276     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554706 554707 RB1277 RB1279     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 554707 554708 RB1279 RB1281     FALSE 0.089 -102.000 0.000 NA   NA
 554708 554709 RB1281 RB1284     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 554711 554712 RB1288 RB1289     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 554712 554713 RB1289 RB1291     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554715 554716 RB1297 RB1299     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554716 554717 RB1299 RB1300     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 554719 554720 RB1302 RB1304     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554720 554721 RB1304 RB1305     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 554721 554722 RB1305 RB1308     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554722 554723 RB1308 RB1310     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 554723 554724 RB1310 RB1311     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554724 554725 RB1311 RB1316     FALSE 0.185 178.000 0.000 NA   NA
 554725 554726 RB1316 RB1317   leuA FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 554726 554727 RB1317 RB1319 leuA valS TRUE 0.970 84.000 0.013 1.000 N NA
 554727 554728 RB1319 RB1321 valS   TRUE 0.578 108.000 0.000 1.000 N NA
 554728 554729 RB1321 RB1322     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554730 554731 RB1323 RB1324     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554732 554733 RB1325 RB1326     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554734 554735 RB1329 RB1331     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 554736 554737 RB1334 RB1336     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554738 554739 RB1337 RB1339     FALSE 0.123 -57.000 0.000 NA   NA
 554739 554740 RB1339 RB1341     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554741 554742 RB1342 RB1344 fliP fliQ TRUE 0.986 7.000 0.036 0.013 Y NA
 554742 554743 RB1344 RB1345 fliQ fliR TRUE 0.991 3.000 0.167 0.085 Y NA
 554743 554744 RB1345 RB1347 fliR flhB TRUE 0.993 -7.000 0.300 0.085 Y NA
 554744 554745 RB1347 RB1348 flhB   FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 554745 554746 RB1348 RB1350     FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 554746 554747 RB1350 RB1352     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554749 554750 RB1355 RB1356 nagB nagA TRUE 0.995 -3.000 0.389 1.000 Y NA
 554751 554752 RB1357 RB1358   glgC TRUE 0.520 52.000 0.000 1.000 N NA
 554753 554754 RB1359 RB1361     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 554754 554755 RB1361 RB1362     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 554756 554757 RB1363 RB1364 ald   FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554763 554764 RB1384 RB1386     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 554764 554765 RB1386 RB1389     FALSE 0.089 -102.000 0.000 NA   NA
 554765 554766 RB1389 RB1390     FALSE 0.078 -174.000 0.000 NA   NA
 554766 554767 RB1390 RB1391     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554767 554768 RB1391 RB1392   rpoD FALSE 0.230 -97.000 0.000 1.000   NA
 554768 554769 RB1392 RB1394 rpoD   FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554774 554775 RB1405 RB1408 outD   FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 554777 554778 RB1412 RB1413     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 554780 554781 RB1417 RB1420     FALSE 0.185 181.000 0.000 NA   NA
 554782 554783 RB1422 RB1427     FALSE 0.185 177.000 0.000 NA   NA
 554783 554784 RB1427 RB1428     TRUE 0.983 -3.000 0.189 NA   NA
 554784 554785 RB1428 RB1430     TRUE 0.984 -3.000 0.474 NA   NA
 554785 554786 RB1430 RB1431     TRUE 0.978 -66.000 0.162 0.002 Y NA
 554786 554787 RB1431 RB1432     TRUE 0.996 -3.000 0.426 0.002 Y NA
 554787 554788 RB1432 RB1433     TRUE 0.992 -3.000 0.093 NA Y NA
 554788 554789 RB1433 RB1434     TRUE 0.993 -3.000 0.360 NA Y NA
 554789 554790 RB1434 RB1436     TRUE 0.993 -3.000 0.253 NA Y NA
 554790 554791 RB1436 RB1439     TRUE 0.976 14.000 0.655 1.000 Y NA
 554791 554792 RB1439 RB1442     TRUE 0.996 -3.000 0.254 0.040 Y NA
 554794 554795 RB1444 RB1446     FALSE 0.356 -70.000 0.000 0.027   NA
 554798 554799 RB1453 RB1454   araC FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 554799 554800 RB1454 RB1456 araC   TRUE 0.576 118.000 0.000 1.000 N NA
 554800 554801 RB1456 RB1457     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554802 554803 RB1458 RB1461     TRUE 0.421 91.000 0.000 1.000   NA
 554803 554804 RB1461 RB1462     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554805 554806 RB1463 RB1464     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 554806 554807 RB1464 RB1467     TRUE 0.584 72.000 0.000 1.000 N NA
 554807 554808 RB1467 RB1470     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554808 554809 RB1470 RB1472     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554811 554812 RB1475 RB1476 arsB   FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554812 554813 RB1476 RB1477   atsA FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554813 554814 RB1477 RB1478 atsA   FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 554816 554817 RB1481 RB1483     TRUE 0.456 -19.000 0.000 1.000   NA
 554817 554818 RB1483 RB1485   polB TRUE 0.524 10.000 0.000 1.000 N NA
 554818 554819 RB1485 RB1487 polB   FALSE 0.262 32.000 0.000 1.000   NA
 554819 554820 RB1487 RB1488   trxB TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554822 554823 RB1492 RB1493     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 554824 554825 RB1495 RB1499   moxR TRUE 0.984 -3.000 0.409 NA   NA
 554826 554827 RB1501 RB1502     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 554827 554828 RB1502 RB1503     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 554831 554832 RB1509 RB1511     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554832 554833 RB1511 RB1513     FALSE 0.095 -88.000 0.000 NA   NA
 554835 554836 RB1516 RB1517   lolD TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554836 554837 RB1517 RB1518 lolD   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554837 554838 RB1518 RB1519     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554839 554840 RB1520 RB1522   gspG FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554840 554841 RB1522 RB1523 gspG   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554841 554842 RB1523 RB1526     FALSE 0.186 171.000 0.000 NA   NA
 554844 554845 RB1529 RB1531 slr0309   TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 554846 554847 RB1532 RB1533 pknA   FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 554852 554853 RB1545 RB1549 gspD   FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554853 554854 RB1549 RB1550     FALSE 0.103 -73.000 0.000 NA   NA
 554859 554860 RB1559 RB1561 pgaM rpe TRUE 0.995 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 554862 554863 RB1565 RB1566   comQ FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 554864 554865 RB1571 RB1572 dnlI   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554866 554867 RB1573 RB1574   sgbU FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 554868 554869 RB1577 RB1578 helX glnS FALSE 0.301 40.000 0.000 1.000   NA
 554870 554871 RB1579 RB1581     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554872 554873 RB1584 RB1586 hisD fabF TRUE 0.589 76.000 0.000 1.000 N NA
 554873 554874 RB1586 RB1588 fabF   TRUE 0.985 165.000 0.278 1.000 Y NA
 554874 554875 RB1588 RB1591   crtI TRUE 0.985 112.000 0.286 1.000 Y NA
 554875 554876 RB1591 RB1593 crtI icd TRUE 0.566 163.000 0.000 1.000 N NA
 554881 554882 RB1601 RB1602     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 554882 554883 RB1602 RB1603     FALSE 0.074 -283.000 0.000 NA   NA
 554883 554884 RB1603 RB1604     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554884 554885 RB1604 RB1606     TRUE 0.656 -48.000 0.000 1.000 Y NA
 554885 554886 RB1606 RB1608     TRUE 0.430 37.000 0.000 1.000 N NA
 554887 554888 RB1609 RB1610   aslA FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 554889 554890 RB1611 RB1617     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 554892 554893 RB1621 RB1624     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 554894 554895 RB1628 RB1629   glcK FALSE 0.193 115.000 0.000 NA   NA
 554895 554896 RB1629 RB1630 glcK lepA TRUE 0.952 48.000 0.003 1.000 N NA
 554896 554897 RB1630 RB1632 lepA   FALSE 0.184 217.000 0.000 NA   NA
 554901 554902 RB1637 RB1638     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554903 554904 RB1639 RB1641     FALSE 0.349 -114.000 0.000 1.000 N NA
 554904 554905 RB1641 RB1644     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 554905 554906 RB1644 RB1646     FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 554906 554907 RB1646 RB1648     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554910 554911 RB1651 RB1653   prnC FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 554912 554913 RB1656 RB1661     TRUE 0.401 254.000 0.000 1.000   NA
 554914 554915 RB1677 RB1680   czcB TRUE 0.985 -31.000 0.500 1.000 Y NA
 554917 554918 RB1685 RB1688     FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 554919 554920 RB1691 RB1695     FALSE 0.089 -103.000 0.000 NA   NA
 554920 554921 RB1695 RB1696     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 554921 554922 RB1696 RB1699     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 554922 554923 RB1699 RB1703     FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 554923 554924 RB1703 RB1704     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554925 554926 RB1705 RB1706   dnaA FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 554926 554927 RB1706 RB1708 dnaA dnaB TRUE 0.794 104.000 0.000 0.016 Y NA
 554928 554929 RB1709 RB1711     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554929 554930 RB1711 RB1713     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554932 554933 RB1716 RB1717     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554933 554934 RB1717 RB1721     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554939 554940 RB1731 RB1732     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 554940 554941 RB1732 RB1734     TRUE 0.404 -30.000 0.000 1.000   NA
 554943 554944 RB1739 RB1742   pyrK TRUE 0.429 82.000 0.000 NA N NA
 554945 554946 RB1743 RB1746     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 554946 554947 RB1746 RB1748     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 554947 554948 RB1748 RB1749     FALSE 0.081 -144.000 0.000 NA   NA
 554952 554953 RB1756 RB1758     TRUE 0.531 -9.000 0.000 1.000   NA
 554953 554954 RB1758 RB1759     TRUE 0.495 3.000 0.000 1.000   NA
 554954 554955 RB1759 RB1760     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554955 554956 RB1760 RB1764     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 554956 554957 RB1764 RB1766     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554957 554958 RB1766 RB1767     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554958 554959 RB1767 RB1771     FALSE 0.184 214.000 0.000 NA   NA
 554959 554960 RB1771 RB1773     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 554960 554961 RB1773 RB1775     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554966 554967 RB1784 RB1785 ugdH   FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 554969 554970 RB1789 RB1790   sigW TRUE 0.966 1.000 0.045 NA   NA
 554970 554971 RB1790 RB1792 sigW   FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 554971 554972 RB1792 RB1793     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 554972 554973 RB1793 RB1796     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 554973 554974 RB1796 RB1798   moxR FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 554974 554975 RB1798 RB1800 moxR   TRUE 0.971 -10.000 0.571 NA   NA
 554975 554976 RB1800 RB1802     TRUE 0.954 179.000 0.571 NA   NA
 554976 554977 RB1802 RB1805     TRUE 0.984 -3.000 0.571 NA   NA
 554978 554979 RB1809 RB1814     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 554980 554981 RB1819 RB1821 galE pknB TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 554983 554984 RB1827 RB1828     TRUE 0.916 32.000 0.500 NA   NA
 554986 554987 RB1831 RB1832 NqrA nqrB TRUE 0.988 6.000 0.088 0.002 Y NA
 554987 554988 RB1832 RB1833 nqrB nqrC TRUE 0.849 -13.000 0.000 0.002 Y NA
 554988 554989 RB1833 RB1835 nqrC nqrD TRUE 0.990 4.000 0.188 0.002 Y NA
 554989 554990 RB1835 RB1836 nqrD nqrE TRUE 0.991 4.000 0.240 0.002 Y NA
 554990 554991 RB1836 RB1837 nqrE nqrF TRUE 0.988 136.000 0.100 0.002 Y NA
 554991 554992 RB1837 RB1838 nqrF   FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554992 554993 RB1838 RB1839   apbE FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 554995 554996 RB1843 RB1845     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 554996 554997 RB1845 RB1849     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554999 555000 RB1856 RB1858     FALSE 0.258 26.000 0.000 1.000   NA
 555000 555001 RB1858 RB1859     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 555001 555002 RB1859 RB1860     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 555002 555003 RB1860 RB1862   gntR FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 555003 555004 RB1862 RB1866 gntR   TRUE 0.973 87.000 0.054 1.000 N NA
 555004 555005 RB1866 RB1868     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555005 555006 RB1868 RB1870     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555006 555007 RB1870 RB1872     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 555008 555009 RB1874 RB1877     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 555009 555010 RB1877 RB1878     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 555012 555013 RB1880 RB1883   gspA FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 555014 555015 RB1885 RB1887     FALSE 0.357 16.000 0.000 0.083   NA
 555015 555016 RB1887 RB1889     TRUE 0.401 236.000 0.000 1.000   NA
 555018 555019 RB1892 RB1893     TRUE 0.550 77.000 0.000 0.015   NA
 555023 555024 RB1898 RB1900 aroB   TRUE 0.579 105.000 0.000 1.000 N NA
 555024 555025 RB1900 RB1901     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 555025 555026 RB1901 RB1902   nirB FALSE 0.086 -114.000 0.000 NA   NA
 555026 555027 RB1902 RB1903 nirB   TRUE 0.955 -55.000 0.300 0.072   NA
 555027 555028 RB1903 RB1908     TRUE 0.956 114.000 0.417 NA   NA
 555028 555029 RB1908 RB1909     TRUE 0.914 34.000 0.250 NA   NA
 555030 555031 RB1910 RB1912     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555031 555032 RB1912 RB1917     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 555032 555033 RB1917 RB1920     FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 555033 555034 RB1920 RB1922     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 555035 555036 RB1923 RB1924     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 555036 555037 RB1924 RB1930     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555039 555040 RB1932 RB1934     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 555040 555041 RB1934 RB1935     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 555041 555042 RB1935 RB1936     FALSE 0.090 -100.000 0.000 NA   NA
 555042 555043 RB1936 RB1937     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555046 555047 RB1946 RB1950     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555047 555048 RB1950 RB1954     TRUE 0.945 53.000 0.286 NA   NA
 555048 555049 RB1954 RB1958     FALSE 0.186 173.000 0.000 NA   NA
 555050 555051 RB1961 RBt17     FALSE 0.184 230.000 0.000 NA   NA
 555051 555052 RBt17 RB1964   rpoA FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 555052 555053 RB1964 RB1970 rpoA tgt TRUE 0.954 6.000 0.004 1.000   NA
 555054 555055 RB1972 RB1974     TRUE 0.984 -3.000 0.600 NA   NA
 555056 555057 RB1977 RB1979     FALSE 0.184 209.000 0.000 NA   NA
 555059 555060 RB1988 RB1991 gdhP   FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 555060 555061 RB1991 RB1992     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 555065 555066 RB1998 RB1999 ppdK   FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 555066 555067 RB1999 RB2000     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555067 555068 RB2000 RB2001     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555068 555069 RB2001 RB2002     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 555069 555070 RB2002 RB2003     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555070 555071 RB2003 RB2006     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555072 555073 RB2007 RB2008     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 555074 555075 RB2010 RB2011     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555077 555078 RB2013 RB2015 secA   FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555078 555079 RB2015 RB2016     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 555081 555082 RB2019 RB2020     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 555082 555083 RB2020 RB2021     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 555084 555085 RB2022 RB2024   rpsA TRUE 0.414 126.000 0.000 1.000   NA
 555085 555086 RB2024 RB2027 rpsA   FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 555091 555092 RB2043 RB2044     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 555094 555095 RB2046 RB2050     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 555095 555096 RB2050 RB2051     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555098 555099 RB2053 RB2055     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 555099 555100 RB2055 RB2056     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555102 555103 RB2062 RB2066 degP   TRUE 0.976 -16.000 0.048 0.013   NA
 555103 555104 RB2066 RB2068     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555104 555105 RB2068 RB2071     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 555107 555108 RB2075 RB2077     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 555109 555110 RB2078 RB2080     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 555112 555113 RB2082 RB2084 pltG   FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 555114 555115 RB2085 RB2086 betC   TRUE 0.404 -30.000 0.000 1.000   NA
 555115 555116 RB2086 RB2088     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 555116 555117 RB2088 RB2090     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 555118 555119 RB2091 RB2092     FALSE 0.324 12.000 0.000 1.000   NA
 555119 555120 RB2092 RB2096     FALSE 0.184 219.000 0.000 NA   NA
 555125 555126 RB2102 RB2103     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 555128 555129 RB2107 RB2110     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555129 555130 RB2110 RB2114   citB TRUE 0.585 87.000 0.000 1.000 N NA
 555130 555131 RB2114 RB2115 citB speE FALSE 0.260 18.000 0.000 1.000   NA
 555131 555132 RB2115 RB2116 speE   FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 555133 555134 RB2117 RB2118   gcpE TRUE 0.404 175.000 0.000 1.000   NA
 555136 555137 RB2121 RB2123     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 555137 555138 RB2123 RB2125     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555139 555140 RBt18 RBt19     FALSE 0.191 128.000 0.000 NA   NA
 555141 555142 RB2132 RB2135     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555143 555144 RB2136 RB2140     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 555145 555146 RB2141 RB2142 rluA   TRUE 0.547 -33.000 0.000 1.000 N NA
 555146 555147 RB2142 RB2143   dxs TRUE 0.952 -45.000 0.004 1.000 N NA
 555147 555148 RB2143 RB2144 dxs ggpP TRUE 0.993 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 555148 555149 RB2144 RB2146 ggpP xseB TRUE 0.988 -3.000 0.005 1.000 N NA
 555149 555150 RB2146 RB2147 xseB   FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555152 555153 RB2150 RB2152     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 555153 555154 RB2152 RB2154     TRUE 0.418 107.000 0.000 1.000   NA
 555154 555155 RB2154 RB2155     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555155 555156 RB2155 RB2156     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 555156 555157 RB2156 RB2158     FALSE 0.110 -66.000 0.000 NA   NA
 555158 555159 RB2160 RB2162   pknH TRUE 0.528 53.000 0.000 1.000 N NA
 555160 555161 RB2163 RB2166     FALSE 0.184 221.000 0.000 NA   NA
 555162 555163 RB2168 RB2170     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555165 555166 RB2174 RB2175     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555166 555167 RB2175 RB2176     FALSE 0.079 -159.000 0.000 NA   NA
 555167 555168 RB2176 RB2178     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555168 555169 RB2178 RB2179     FALSE 0.183 303.000 0.000 NA   NA
 555169 555170 RB2179 RB2181     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 555171 555172 RB2182 RB2185     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 555172 555173 RB2185 RB2186   InsA FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555174 555175 RB2187 RB2188     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 555175 555176 RB2188 RB2190     FALSE 0.185 177.000 0.000 NA   NA
 555176 555177 RB2190 RB2191     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 555177 555178 RB2191 RB2193     FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 555182 555183 RB2201 RB2202     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555184 555185 RB2203 RB2204     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 555185 555186 RB2204 RB2205     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 555186 555187 RB2205 RB2206     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 555187 555188 RB2206 RB2209     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555189 555190 RB2211 RB2212     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 555196 555197 RB2226 RB2231     TRUE 0.913 29.000 0.300 NA   NA
 555197 555198 RB2231 RB2234     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 555198 555199 RB2234 RB2235     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 555202 555203 RB2239 RB2242     FALSE 0.351 -69.000 0.000 0.049   NA
 555205 555206 RB2247 RB2251     FALSE 0.183 249.000 0.000 NA   NA
 555206 555207 RB2251 RB2252     FALSE 0.078 -174.000 0.000 NA   NA
 555209 555210 RB2254 RB2255     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 555210 555211 RB2255 RB2258     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 555213 555214 RB2260 RB2261     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 555214 555215 RB2261 RB2262     FALSE 0.092 -96.000 0.000 NA   NA
 555216 555217 RB2263 RB2264     FALSE 0.189 146.000 0.000 NA   NA
 555217 555218 RB2264 RB2265     FALSE 0.376 -85.000 0.000 1.000 N NA
 555219 555220 RB2268 RB2269 msrB   FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 555220 555221 RB2269 RB2272     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555221 555222 RB2272 RB2274     FALSE 0.080 -150.000 0.000 NA   NA
 555222 555223 RB2274 RB2277     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555224 555225 RB2278 RB2279     FALSE 0.275 16.000 0.000 1.000   NA
 555227 555228 RB2281 RB2282     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555232 555233 RB2288 RB2290     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 555233 555234 RB2290 RB2291   parA FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 555234 555235 RB2291 RB2296 parA parB TRUE 0.986 -7.000 0.827 1.000 N NA
 555236 555237 RB2297 RB2298     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 555238 555239 RB2299 RB2302     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555239 555240 RB2302 RB2303   rpsH FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 555240 555241 RB2303 RB2304 rpsH   TRUE 0.983 -3.000 0.174 NA   NA
 555241 555242 RB2304 RB2306     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 555242 555243 RB2306 RB2308     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 555243 555244 RB2308 RBt20     FALSE 0.187 157.000 0.000 NA   NA
 555245 555246 RB2310 RB2312     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555248 555249 RB2316 RB2317     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 555251 555252 RB2320 RB2321     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555252 555253 RB2321 RB2326     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 555255 555256 RB2328 RB2329     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 555256 555257 RB2329 RB2330     FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 555257 555258 RB2330 RB2331     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 555258 555259 RB2331 RB2334     FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 555261 555262 RB2336 RB2337     FALSE 0.185 184.000 0.000 NA   NA
 555264 555265 RB2339 RB2340     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 555265 555266 RB2340 RB2341     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 555270 555271 RB2345 RB2346     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 555271 555272 RB2346 RB2349     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555273 555274 RB2350 RB2351     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 555275 555276 RB2353 RB2355     FALSE 0.193 112.000 0.000 NA   NA
 555276 555277 RB2355 RB2357     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 555279 555280 RB2359 RB2360     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 555283 555284 RB2364 RB2365     TRUE 0.412 -28.000 0.000 1.000   NA
 555285 555286 RB2367 RB2369     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555286 555287 RB2369 RB2370     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 555287 555288 RB2370 RB2371     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555291 555292 RB2374 RB2375     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 555292 555293 RB2375 RB2377   atsA FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 555293 555294 RB2377 RB2378 atsA   FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555295 555296 RB2379 RB2381   ibeB FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 555298 555299 RB2383 RB2384 mexB   FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 555299 555300 RB2384 RB2386   mexA FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555300 555301 RB2386 RB2391 mexA   FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555301 555302 RB2391 RB2394     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 555303 555304 RB2395 RB2396   atoC FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 555309 555310 RB2403 RB2404 uxuB   TRUE 0.936 19.000 0.615 NA N NA
 555311 555312 RB2408 RB2412     FALSE 0.183 329.000 0.000 NA   NA
 555312 555313 RB2412 RB2414     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555313 555314 RB2414 RB2415     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 555315 555316 RB2416 RB2418     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 555317 555318 RB2420 RB2424     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555318 555319 RB2424 RB2425     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555320 555321 RB2426 RB2428     TRUE 0.953 114.000 1.000 NA   NA
 555321 555322 RB2428 RB2429   dnaK TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 555322 555323 RB2429 RB2431 dnaK   FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555325 555326 RB2434 RB2435     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555326 555327 RB2435 RB2436     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555327 555328 RB2436 RB2440     FALSE 0.184 240.000 0.000 NA   NA
 555328 555329 RB2440 RB2442     TRUE 0.401 253.000 0.000 1.000   NA
 555329 555330 RB2442 RB2447     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 555331 555332 RB2448 RB2451     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 555332 555333 RB2451 RB2454     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555333 555334 RB2454 RB2456     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555334 555335 RB2456 RB2457     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555336 555337 RB2459 RB2460     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555337 555338 RB2460 RB2461     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555339 555340 RB2462 RB2463     FALSE 0.187 158.000 0.000 NA   NA
 555345 555346 RB2469 RB2470     TRUE 0.951 -21.000 0.033 NA   NA
 555346 555347 RB2470 RB2471     TRUE 0.958 217.000 0.033 1.000   NA
 555347 555348 RB2471 RB2472     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 555348 555349 RB2472 RB2473     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555349 555350 RB2473 RB2474     FALSE 0.364 32.000 0.000 0.016   NA
 555354 555355 RB2479 RB2480     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555355 555356 RB2480 RB2482     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555356 555357 RB2482 RB2484     TRUE 0.769 -3.000 0.000 0.016   NA
 555357 555358 RB2484 RB2485     TRUE 0.659 -7.000 0.000 0.016   NA
 555358 555359 RB2485 RB2487     TRUE 0.509 -12.000 0.000 1.000   NA
 555359 555360 RB2487 RB2489     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 555360 555361 RB2489 RB2490     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 555361 555362 RB2490 RB2491     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555365 555366 RB2494 RB2495     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 555369 555370 RB2498 RB2499     FALSE 0.394 8.000 0.000 1.000   NA
 555370 555371 RB2499 RB2500     TRUE 0.971 16.000 0.130 1.000 Y NA
 555371 555372 RB2500 RB2501     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 555372 555373 RB2501 RB2502     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555373 555374 RB2502 RB2503     TRUE 0.499 -13.000 0.000 1.000   NA
 555375 555376 RB2505 RB2506     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 555378 555379 RB2508 RB2509     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555379 555380 RB2509 RB2510     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 555380 555381 RB2510 RB2511     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 555384 555385 RB2514 RB2515     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 555386 555387 RB2516 RB2517     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 555389 555390 RB2519 RB2520     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555394 555395 RB2529 RB2530     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555395 555396 RB2530 RB2532   nagB FALSE 0.254 23.000 0.000 1.000   NA
 555396 555397 RB2532 RB2533 nagB   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555397 555398 RB2533 RB2534     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 555400 555401 RB2537 RB2543     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555403 555404 RB2547 RB2549   phyB TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 555404 555405 RB2549 RB2550 phyB   TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 555405 555406 RB2550 RB2551     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555406 555407 RB2551 RB2552   argC FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555407 555408 RB2552 RB2553 argC   FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000   NA
 555410 555411 RB2557 RB2558     FALSE 0.340 24.000 0.000 0.056   NA
 555411 555412 RB2558 RB2559     TRUE 0.954 15.000 0.667 0.056   NA
 555412 555413 RB2559 RB2560     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555414 555415 RB2562 RB2566   ldh TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555415 555416 RB2566 RB2568 ldh   TRUE 0.977 129.000 0.545 1.000 N NA
 555416 555417 RB2568 RB2571     TRUE 0.969 87.000 0.636 NA N NA
 555417 555418 RB2571 RB2574     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555418 555419 RB2574 RB2577     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 555419 555420 RB2577 RB2579   eutE TRUE 0.986 3.000 0.545 NA Y NA
 555420 555421 RB2579 RB2581 eutE eutN TRUE 0.977 54.000 0.500 NA Y NA
 555421 555422 RB2581 RB2582 eutN ackA TRUE 0.983 -19.000 0.500 NA Y NA
 555422 555423 RB2582 RB2585 ackA   TRUE 0.956 85.000 0.238 NA   NA
 555423 555424 RB2585 RB2586   eutM TRUE 0.955 71.000 0.238 NA   NA
 555424 555425 RB2586 RB2587 eutM   FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 555425 555426 RB2587 RB2588     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 555426 555427 RB2588 RB2590     TRUE 0.988 -3.000 0.182 NA N NA
 555427 555428 RB2590 RB2591     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 555428 555429 RB2591 RB2592     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 555430 555431 RB2593 RB2596     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 555431 555432 RB2596 RB2602     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555433 555434 RB2603 RB2604     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555434 555435 RB2604 RB2605     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 555437 555438 RB2613 RB2618     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 555439 555440 RB2619 RB2620     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555440 555441 RB2620 RB2621     FALSE 0.107 -69.000 0.000 NA   NA
 555447 555448 RB2630 RB2632     TRUE 0.911 17.000 0.004 1.000   NA
 555449 555450 RB2634 RB2636     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555451 555452 RB2637 RB2638 rnhA glgB TRUE 0.949 61.000 0.003 1.000   NA
 555453 555454 RB2640 RB2642     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555458 555459 RB2651 RB2654     FALSE 0.355 -39.000 0.000 1.000   NA
 555459 555460 RB2654 RB2656     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 555460 555461 RB2656 RB2658   xylA FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 555464 555465 RB2661 RB2662 murB   TRUE 0.916 11.000 0.007 NA   NA
 555465 555466 RB2662 RB2663     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555466 555467 RB2663 RB2665     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 555468 555469 RB2667 RB2669     FALSE 0.077 -177.000 0.000 NA   NA
 555469 555470 RB2669 RB2671     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 555470 555471 RB2671 RB2673     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 555471 555472 RB2673 RB2675     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555472 555473 RB2675 RB2676   truA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555475 555476 RB2680 RB2682     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 555479 555480 RB2686 RB2688     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555480 555481 RB2688 RB2690     TRUE 0.973 -7.000 0.400 NA   NA
 555481 555482 RB2690 RB2693     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555482 555483 RB2693 RB2697     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555484 555485 RB2700 RB2701     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555486 555487 RB2702 RB2704     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 555487 555488 RB2704 RB2705     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 555488 555489 RB2705 RB2706     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555494 555495 RB2714 RB2717     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 555495 555496 RB2717 RB2718   dldH TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555498 555499 RB2720 RB2724     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 555499 555500 RB2724 RB2725   lpxB FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 555501 555502 RB2726 RB2728     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555502 555503 RB2728 RB2731     TRUE 0.962 -136.000 0.294 1.000 Y NA
 555503 555504 RB2731 RB2732     TRUE 0.621 4.000 0.000 1.000 N NA
 555505 555506 RB2735 RB2737 g6pD   FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 555506 555507 RB2737 RB2739     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555507 555508 RB2739 RB2740     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 555508 555509 RB2740 RB2741     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 555510 555511 RB2743 RB2744     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555511 555512 RB2744 RB2745     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555512 555513 RB2745 RB2746   dapA FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 555513 555514 RB2746 RB2747 dapA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555515 555516 RB2748 RB2749   ubiA TRUE 0.982 62.000 0.062 1.000 Y NA
 555516 555517 RB2749 RB2750 ubiA ubiX TRUE 0.972 14.000 0.091 1.000 Y NA
 555517 555518 RB2750 RB2752 ubiX ubiE TRUE 0.993 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 555519 555520 RB2754 RB2761     TRUE 0.400 265.000 0.000 1.000   NA
 555521 555522 RB2763 RB2764     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555522 555523 RB2764 RB2771     TRUE 0.412 134.000 0.000 1.000   NA
 555524 555525 RB2774 RB2780   greA TRUE 0.500 272.000 0.000 0.058   NA
 555525 555526 RB2780 RB2781 greA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555526 555527 RB2781 RB2782     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 555528 555529 RB2784 RB2785     TRUE 0.983 -3.000 0.143 NA   NA
 555529 555530 RB2785 RB2788     TRUE 0.426 74.000 0.000 NA N NA
 555533 555534 RB2795 RB2797     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 555539 555540 RB2807 RB2809     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 555540 555541 RB2809 RB2810     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555543 555544 RB2817 RB2818 6pgD   FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 555545 555546 RB2819 RB2822     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 555546 555547 RB2822 RB2825   ugpQ FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555549 555550 RB2828 RB2829     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555550 555551 RB2829 RB2830     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 555553 555554 RB2833 RB2837     FALSE 0.396 59.000 0.000 1.000   NA
 555554 555555 RB2837 RB2838     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 555555 555556 RB2838 RB2839     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555556 555557 RB2839 RB2840     TRUE 0.403 181.000 0.000 1.000   NA
 555557 555558 RB2840 RB2842     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555558 555559 RB2842 RB2845     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 555559 555560 RB2845 RB2848     TRUE 0.952 63.000 1.000 NA   NA
 555561 555562 RB2849 RB2850     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555566 555567 RB2855 RB2856     TRUE 0.439 -22.000 0.000 1.000   NA
 555570 555571 RB2864 RB2867     TRUE 0.954 62.000 0.500 NA   NA
 555571 555572 RB2867 RB2871     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555573 555574 RB2872 RB2874     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555575 555576 RB2875 RB2877     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 555576 555577 RB2877 RB2878     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555579 555580 RB2883 RB2884   galE FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 555580 555581 RB2884 RB2885 galE   TRUE 0.951 -27.000 0.094 NA   NA
 555581 555582 RB2885 RB2886     TRUE 0.974 0.000 1.000 NA   NA
 555582 555583 RB2886 RB2889     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 555584 555585 RB2893 RB2894     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555585 555586 RB2894 RB2895     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.021 Y NA
 555587 555588 RB2897 RB2900     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 555588 555589 RB2900 RB2901     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555589 555590 RB2901 RB2905     FALSE 0.183 340.000 0.000 NA   NA
 555590 555591 RB2905 RB2907     TRUE 0.911 44.000 0.009 NA   NA
 555591 555592 RB2907 RB2908     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555592 555593 RB2908 RB2910     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 555595 555596 RB2914 RB2917     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 555598 555599 RB2922 RB2923     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555600 555601 RB2924 RB2926     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 555603 555604 RB2928 RB2929     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 555604 555605 RB2929 RB2930     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 555605 555606 RB2930 RB2931     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 555606 555607 RB2931 RB2932     FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 555607 555608 RB2932 RB2934     FALSE 0.182 516.000 0.000 NA   NA
 555608 555609 RB2934 RB2936     FALSE 0.191 133.000 0.000 NA   NA
 555609 555610 RB2936 RB2939     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 555613 555614 RB2943 RB2945     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555614 555615 RB2945 RB2946     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 555616 555617 RB2948 RB2949     FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 555617 555618 RB2949 RB2950     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 555618 555619 RB2950 RB2951     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555622 555623 RB2955 RB2956     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 555625 555626 RB2958 RB2960     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555628 555629 RB2963 RB2966     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555629 555630 RB2966 RB2968     TRUE 0.960 4.000 0.003 1.000   NA
 555630 555631 RB2968 RB2970     TRUE 0.405 170.000 0.000 1.000   NA
 555631 555632 RB2970 RB2971     FALSE 0.282 -60.000 0.000 NA N NA
 555632 555633 RB2971 RB2973     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555634 555635 RB2974 RB2975 glnD glnB TRUE 0.524 10.000 0.000 1.000 N NA
 555635 555636 RB2975 RB2976 glnB   FALSE 0.267 34.000 0.000 1.000   NA
 555637 555638 RB2978 RB2979     FALSE 0.362 52.000 0.000 1.000   NA
 555641 555642 RB2983 RB2985     TRUE 0.561 263.000 0.000 1.000 N NA
 555642 555643 RB2985 RB2986     FALSE 0.394 23.000 0.000 1.000 N NA
 555643 555644 RB2986 RB2988     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA Y NA
 555644 555645 RB2988 RB2990     TRUE 0.965 7.000 0.163 NA N NA
 555645 555646 RB2990 RB2991     TRUE 0.461 4.000 0.000 NA N NA
 555646 555647 RB2991 RB2992     TRUE 0.417 -108.000 0.000 NA Y NA
 555647 555648 RB2992 RB2993     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555648 555649 RB2993 RB2995     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 555649 555650 RB2995 RB2997     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555650 555651 RB2997 RB2998     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 555651 555652 RB2998 RB3001     TRUE 0.401 239.000 0.000 1.000   NA
 555654 555655 RB3005 RB3006     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 555656 555657 RB3009 RB3010   perA FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555660 555661 RB3014 RB3016     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 555661 555662 RB3016 RB3020     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 555662 555663 RB3020 RB3023     FALSE 0.185 180.000 0.000 NA   NA
 555663 555664 RB3023 RB3029     FALSE 0.186 171.000 0.000 NA   NA
 555664 555665 RB3029 RB3031     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555667 555668 RB3034 RB3036     TRUE 0.967 3.000 0.800 NA   NA
 555670 555671 RB3040 RB3042     FALSE 0.184 230.000 0.000 NA   NA
 555672 555673 RB3043 RB3044     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 555674 555675 RB3045 RB3047     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 555677 555678 RB3050 RB3052     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555678 555679 RB3052 RB3053     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 555679 555680 RB3053 RB3055     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 555680 555681 RB3055 RB3056     FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 555682 555683 RB3057 RB3059     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555684 555685 RB3060 RB3061     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 555685 555686 RB3061 RB3062     FALSE 0.080 -150.000 0.000 NA   NA
 555688 555689 RB3064 RB3065     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555689 555690 RB3065 RB3067     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 555691 555692 RB3068 RB3069     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 555693 555694 RB3070 RB3073     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 555694 555695 RB3073 RB3074     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 555695 555696 RB3074 RB3075     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 555696 555697 RB3075 RB3077     TRUE 0.531 61.000 0.000 0.006   NA
 555697 555698 RB3077 RB3097     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 555700 555701 RB3103 RB3107 dnaE   FALSE 0.186 170.000 0.000 NA   NA
 555702 555703 RB3109 RB3112 mauG   FALSE 0.186 169.000 0.000 NA   NA
 555704 555705 RB3114 RB3116     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 555705 555706 RB3116 RB3117     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555706 555707 RB3117 RB3118     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555707 555708 RB3118 RB3119     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 555708 555709 RB3119 RB3123     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555709 555710 RB3123 RB3125     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 555712 555713 RB3128 RB3131     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555713 555714 RB3131 RB3132     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555719 555720 RB3142 RB3144     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 555720 555721 RB3144 RB3145     TRUE 0.954 15.000 0.667 0.053   NA
 555721 555722 RB3145 RB3146     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555723 555724 RB3147 RB3148     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 555724 555725 RB3148 RB3149     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 555725 555726 RB3149 RB3151     FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 555726 555727 RB3151 RB3152     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555727 555728 RB3152 RB3153     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 555728 555729 RB3153 RB3154     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 555729 555730 RB3154 RB3155     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 555731 555732 RB3157 RB3158     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 555733 555734 RB3159 RB3160     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 555734 555735 RB3160 RB3164     FALSE 0.183 298.000 0.000 NA   NA
 555737 555738 RB3172 RB3174     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 555738 555739 RB3174 RBt21     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 555739 555740 RBt21 RB3176     FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 555740 555741 RB3176 RB3177     FALSE 0.399 26.000 0.000 1.000 N NA
 555741 555742 RB3177 RB3179     FALSE 0.220 -109.000 0.000 1.000   NA
 555742 555743 RB3179 RB3185     TRUE 0.417 112.000 0.000 1.000   NA
 555745 555746 RB3190 RB3192     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 555748 555749 RB3194 RB3195   ctpA FALSE 0.185 181.000 0.000 NA   NA
 555751 555752 RB3197 RB3200     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 555752 555753 RB3200 RB3201     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 555753 555754 RB3201 RB3202     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555758 555759 RB3208 RB3210     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555759 555760 RB3210 RB3212     FALSE 0.078 -174.000 0.000 NA   NA
 555760 555761 RB3212 RB3213     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 555761 555762 RB3213 RB3217   speD TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555762 555763 RB3217 RB3221 speD   FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 555766 555767 RB3228 RB3232     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555768 555769 RB3233 RB3234     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555769 555770 RB3234 RB3236     FALSE 0.379 -82.000 0.000 1.000 N NA
 555770 555771 RB3236 RB3237     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 555771 555772 RB3237 RB3239     TRUE 0.634 64.000 0.000 NA Y NA
 555774 555775 RB3242 RB3244     FALSE 0.089 -102.000 0.000 NA   NA
 555778 555779 RB3248 RB3251     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555780 555781 RB3252 RB3253     TRUE 0.974 0.000 0.833 NA   NA
 555782 555783 RB3255 RB3256 argJ   FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 555783 555784 RB3256 RB3257     FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 555787 555788 RB3260 RB3261     FALSE 0.097 -81.000 0.000 NA   NA
 555790 555791 RB3265 RB3266 gfo rluD TRUE 0.407 154.000 0.000 1.000   NA
 555791 555792 RB3266 RB3267 rluD   TRUE 0.425 86.000 0.000 1.000   NA
 555792 555793 RB3267 RB3268     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 555794 555795 RB3271 RB3272 pknB gyrB TRUE 0.750 -3.000 0.000 0.096   NA
 555798 555799 RB3277 RB3280     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 555799 555800 RB3280 RB3281   hup TRUE 0.967 -9.000 0.061 NA   NA
 555800 555801 RB3281 RB3283 hup   FALSE 0.189 143.000 0.000 NA   NA
 555804 555805 RB3287 RB3291 cysA   FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555805 555806 RB3291 RB3292   bioA FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 555807 555808 RB3293 RB3295     FALSE 0.184 197.000 0.000 NA   NA
 555808 555809 RB3295 RB3298     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555809 555810 RB3298 RB3299     FALSE 0.191 128.000 0.000 NA   NA
 555810 555811 RB3299 RB3301     FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 555811 555812 RB3301 RB3302     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 555812 555813 RB3302 RB3303     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 555813 555814 RB3303 RB3304     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 555815 555816 RB3305 RB3309     TRUE 0.415 119.000 0.000 1.000   NA
 555816 555817 RB3309 RB3312     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 555818 555819 RB3313 RB3314   ftsH TRUE 0.412 -28.000 0.000 1.000   NA
 555820 555821 RB3317 RB3320     FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 555822 555823 RB3321 RB3322     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 555823 555824 RB3322 RB3324     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555825 555826 RB3326 RB3327     FALSE 0.075 -268.000 0.000 NA   NA
 555826 555827 RB3327 RB3328     FALSE 0.097 -82.000 0.000 NA   NA
 555828 555829 RB3329 RB3330     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 555830 555831 RB3332 RB3333     FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 555832 555833 RB3337 RB3338   idh FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 555833 555834 RB3338 RB3340 idh   FALSE 0.372 -36.000 0.000 1.000   NA
 555834 555835 RB3340 RB3342     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555837 555838 RB3346 RB3348     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 555838 555839 RB3348 RB3349     TRUE 0.981 4.000 0.037 0.020 N NA
 555839 555840 RB3349 RB3352   nanA TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 555840 555841 RB3352 RB3353 nanA   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555842 555843 RB3354 RB3355     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555844 555845 RB3358 RB3359     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 555848 555849 RB3363 RB3365     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555849 555850 RB3365 RB3366     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 555853 555854 RB3370 RB3371     FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 555855 555856 RB3372 RB3373     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 555857 555858 RB3374 RB3375     FALSE 0.082 -135.000 0.000 NA   NA
 555860 555861 RB3379 RB3382     TRUE 0.632 -10.000 0.000 0.023   NA
 555861 555862 RB3382 RB3387     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 555865 555866 RB3393 RB3394     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555866 555867 RB3394 RB3395     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555867 555868 RB3395 RB3398     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 555870 555871 RB3400 RB3402     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 555872 555873 RB3403 RB3404     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 555873 555874 RB3404 RB3405     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555877 555878 RB3408 RB3410     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 555879 555880 RB3413 RB3416     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555880 555881 RB3416 RB3417     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555881 555882 RB3417 RB3418     TRUE 0.410 7.000 0.000 1.000   NA
 555882 555883 RB3418 RB3421   agrA FALSE 0.396 -31.000 0.000 1.000   NA
 555885 555886 RB3423 RB3424 aceF   TRUE 0.986 139.000 0.091 0.072 Y NA
 555888 555889 RB3427 RB3429 dcd   FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555890 555891 RB3430 RB3431   lon FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 555891 555892 RB3431 RB3433 lon   TRUE 0.400 320.000 0.000 1.000   NA
 555896 555897 RB3440 RB3441     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 555898 555899 RB3442 RB3446     TRUE 0.409 145.000 0.000 1.000   NA
 555899 555900 RB3446 RB3449     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555900 555901 RB3449 RB3450     FALSE 0.085 -117.000 0.000 NA   NA
 555905 555906 RB3456 RB3459     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 555906 555907 RB3459 RB3462     TRUE 0.910 18.000 1.000 NA   NA
 555908 555909 RB3464 RB3465   gyrA FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555909 555910 RB3465 RB3466 gyrA gyrB TRUE 0.986 89.000 0.023 0.002 Y NA
 555914 555915 RB3473 RB3476     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555917 555918 RB3479 RB3482     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555918 555919 RB3482 RB3484     TRUE 0.983 82.000 0.030 1.000 Y NA
 555920 555921 RB3485 RB3487   melR FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555924 555925 RB3491 RB3493 rbsD rbsB TRUE 0.947 25.000 0.015 NA Y NA
 555925 555926 RB3493 RB3495 rbsB   TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 555926 555927 RB3495 RB3496   rbsA TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 555927 555928 RB3496 RB3497 rbsA rbsC TRUE 0.991 -6.000 1.000 1.000 Y NA
 555928 555929 RB3497 RB3499 rbsC rbsK TRUE 0.810 2.000 0.000 1.000 Y NA
 555929 555930 RB3499 RB3500 rbsK   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555930 555931 RB3500 RB3501     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 555931 555932 RB3501 RB3504     FALSE 0.107 -69.000 0.000 NA   NA
 555932 555933 RB3504 RB3505     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555934 555935 RB3506 RB3507     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555936 555937 RB3508 RB3509 galE2   FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 555937 555938 RB3509 RB3513     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555938 555939 RB3513 RB3514     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555939 555940 RB3514 RB3517     FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 555940 555941 RB3517 RB3521   arsR FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 555941 555942 RB3521 RB3522 arsR   FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555943 555944 RB3524 RB3525     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555945 555946 RB3526 RB3527     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 555946 555947 RB3527 RB3532     TRUE 0.402 213.000 0.000 1.000   NA
 555948 555949 RB3534 RB3539     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 555949 555950 RB3539 RB3542     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 555952 555953 RB3546 RB3547     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 555953 555954 RB3547 RB3548     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 555956 555957 RB3550 RB3552     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 555958 555959 RB3555 RB3556 glcK gpi2 TRUE 0.654 44.000 0.000 1.000 Y NA
 555959 555960 RB3556 RB3557 gpi2   FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 555960 555961 RB3557 RB3559     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 555961 555962 RB3559 RB3562     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555962 555963 RB3562 RB3564     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555963 555964 RB3564 RB3565     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555964 555965 RB3565 RB3566     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555965 555966 RB3566 RB3567     FALSE 0.093 -93.000 0.000 NA   NA
 555967 555968 RB3568 RB3569     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555968 555969 RB3569 RB3570     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555969 555970 RB3570 RB3571     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555970 555971 RB3571 RB3574     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 555972 555973 RB3575 RB3577     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 555973 555974 RB3577 RB3579     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 555974 555975 RB3579 RB3582     FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 555977 555978 RB3584 RB3585     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555980 555981 RB3589 RB3591     TRUE 0.732 156.000 0.000 1.000 Y NA
 555981 555982 RB3591 RB3593     TRUE 0.911 -106.000 0.057 1.000   NA
 555982 555983 RB3593 RB3596   nifU TRUE 0.415 120.000 0.000 1.000   NA
 555983 555984 RB3596 RB3597 nifU   TRUE 0.992 -3.000 0.249 1.000 N NA
 555984 555985 RB3597 RB3598   xseA TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 555985 555986 RB3598 RB3599 xseA kel FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 555987 555988 RB3600 RB3601     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 555988 555989 RB3601 RB3603     FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 555989 555990 RB3603 RB3605     FALSE 0.185 176.000 0.000 NA   NA
 555990 555991 RB3605 RB3606   fixL TRUE 0.916 -3.000 0.000 0.020 Y NA
 555991 555992 RB3606 RB3607 fixL   FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 555992 555993 RB3607 RB3610     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 555994 555995 RB3611 RB3612     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 555995 555996 RB3612 RB3613     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 555997 555998 RB3614 RB3615 atoC atoS TRUE 0.983 -48.000 0.400 0.020 Y NA
 555998 555999 RB3615 RB3618 atoS   FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 556000 556001 RB3621 RB3622   nhaA FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 556003 556004 RB3624 RB3625     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 556005 556006 RB3626 RB3627     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556007 556008 RB3630 RB3632     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 556009 556010 RB3633 RB3634     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 556011 556012 RB3635 RB3639     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556012 556013 RB3639 RB3641     TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 556014 556015 RB3644 RB3645     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556017 556018 RB3647 RB3648     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 556019 556020 RB3650 RB3651     FALSE 0.085 -123.000 0.000 NA   NA
 556020 556021 RB3651 RB3653     FALSE 0.188 152.000 0.000 NA   NA
 556021 556022 RB3653 RB3654     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 556024 556025 RB3656 RB3657     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 556028 556029 RB3660 RB3661     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 556029 556030 RB3661 RB3662     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 556030 556031 RB3662 RB3663     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 556033 556034 RB3665 RB3668     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 556039 556040 RB3675 RB3678   apbE TRUE 0.403 188.000 0.000 1.000   NA
 556040 556041 RB3678 RB3680 apbE   FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 556041 556042 RB3680 RB3681     TRUE 0.971 -16.000 0.073 NA N NA
 556042 556043 RB3681 RB3682     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556043 556044 RB3682 RB3683     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 556045 556046 RB3684 RB3686     FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 556046 556047 RB3686 RB3688     FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 556047 556048 RB3688 RB3689     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 556048 556049 RB3689 RB3692     TRUE 0.978 85.000 0.667 1.000 N NA
 556049 556050 RB3692 RB3693     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556050 556051 RB3693 RB3694     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 556055 556056 RB3698 RB3700     TRUE 0.561 76.000 0.000 0.004   NA
 556057 556058 RB3701 RB3702     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556058 556059 RB3702 RB3703     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 556061 556062 RB3706 RB3707 apbE   FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 556062 556063 RB3707 RB3708   speA FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 556063 556064 RB3708 RB3710 speA   TRUE 0.422 90.000 0.000 1.000   NA
 556065 556066 RB3711 RB3713     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 556066 556067 RB3713 RB3714   fabB TRUE 0.405 170.000 0.000 1.000   NA
 556067 556068 RB3714 RB3716 fabB   TRUE 0.584 88.000 0.000 1.000 N NA
 556068 556069 RB3716 RB3718     TRUE 0.574 129.000 0.000 1.000 N NA
 556069 556070 RB3718 RB3719     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556070 556071 RB3719 RB3723     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 556074 556075 RB3730 RB3732     TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 556078 556079 RB3735 RB3739 panC   FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 556079 556080 RB3739 RB3741     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556083 556084 RB3745 RB3746     FALSE 0.076 -207.000 0.000 NA   NA
 556086 556087 RB3750 RB3751 fliS   TRUE 0.417 35.000 0.000 1.000 N NA
 556087 556088 RB3751 RB3753     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 556088 556089 RB3753 RB3755     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556090 556091 RB3758 RB3760     FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 556092 556093 RB3762 RB3763 glpK glpA TRUE 0.988 66.000 0.086 0.000 Y NA
 556094 556095 RB3764 RB3765     FALSE 0.104 -72.000 0.000 NA   NA
 556096 556097 RB3767 RB3768 leuB   TRUE 0.506 50.000 0.000 1.000 N NA
 556097 556098 RB3768 RB3770     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 556098 556099 RB3770 RB3771     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 556099 556100 RB3771 RB3772     FALSE 0.093 -93.000 0.000 NA   NA
 556100 556101 RB3772 RB3773     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556101 556102 RB3773 RB3774     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 556102 556103 RB3774 RB3775     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 556103 556104 RB3775 RB3777     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 556105 556106 RB3779 RB3783     FALSE 0.086 -115.000 0.000 NA   NA
 556106 556107 RB3783 RB3784     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 556107 556108 RB3784 RB3786     FALSE 0.183 367.000 0.000 NA   NA
 556108 556109 RB3786 RB3788     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 556109 556110 RB3788 RB3789     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556111 556112 RB3790 RB3792     FALSE 0.193 115.000 0.000 NA   NA
 556112 556113 RB3792 RB3794     TRUE 0.495 217.000 0.000 0.092   NA
 556113 556114 RB3794 RB3800     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 556116 556117 RB3804 RB3808     TRUE 0.881 -168.000 0.833 NA   NA
 556118 556119 RB3809 RB3810     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 556120 556121 RB3813 RB3814     FALSE 0.099 -78.000 0.000 NA   NA
 556121 556122 RB3814 RB3815     FALSE 0.191 127.000 0.000 NA   NA
 556122 556123 RB3815 RB3816     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556124 556125 RB3817 RB3818     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556125 556126 RB3818 RB3820   pss TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556126 556127 RB3820 RB3822 pss psd TRUE 0.981 -42.000 0.466 1.000 Y NA
 556130 556131 RB3828 RB3830     FALSE 0.342 11.000 0.000 1.000   NA
 556132 556133 RB3831 RB3832     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 556134 556135 RB3833 RB3835     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 556135 556136 RB3835 RB3836     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 556136 556137 RB3836 RB3838     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556137 556138 RB3838 RB3840     FALSE 0.188 151.000 0.000 NA   NA
 556138 556139 RB3840 RB3841     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 556141 556142 RB3845 RB3846     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 556143 556144 RB3847 RB3848     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 556147 556148 RB3854 RB3856     FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 556150 556151 RB3860 RB3864     FALSE 0.184 212.000 0.000 NA   NA
 556151 556152 RB3864 RB3865     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 556155 556156 RB3868 RB3870     FALSE 0.073 -318.000 0.000 NA   NA
 556157 556158 RB3871 RB3873     FALSE 0.308 41.000 0.000 1.000   NA
 556158 556159 RB3873 RB3876   arsA TRUE 0.430 80.000 0.000 1.000   NA
 556160 556161 RB3877 RB3880 aslA   FALSE 0.183 245.000 0.000 NA   NA
 556161 556162 RB3880 RB3881     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 556162 556163 RB3881 RB3882     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 556163 556164 RB3882 RB3883     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 556165 556166 RB3884 RB3886 pyrH FRR TRUE 0.986 1.000 0.626 1.000 N NA
 556166 556167 RB3886 RB3888 FRR   TRUE 0.410 7.000 0.000 1.000   NA
 556168 556169 RB3890 RB3891   proC TRUE 0.932 51.000 0.043 NA   NA
 556169 556170 RB3891 RB3893 proC   TRUE 0.476 44.000 0.000 1.000 N NA
 556170 556171 RB3893 RB3895   inlE TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 556171 556172 RB3895 RB3898 inlE PCP FALSE 0.349 50.000 0.000 1.000   NA
 556172 556173 RB3898 RB3899 PCP   FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 556173 556174 RB3899 RB3902     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556174 556175 RB3902 RB3904     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 556176 556177 RB3905 RB3906     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 556178 556179 RB3908 RB3911     FALSE 0.183 254.000 0.000 NA   NA
 556181 556182 RB3915 RB3916 dpoL   FALSE 0.256 19.000 0.000 1.000   NA
 556182 556183 RB3916 RB3917     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 556185 556186 RB3922 RB3923     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556186 556187 RB3923 RB3924     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556187 556188 RB3924 RB3925     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556188 556189 RB3925 RB3926     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 556191 556192 RB3929 RB3930     FALSE 0.080 -154.000 0.000 NA   NA
 556193 556194 RB3932 RB3933 tolQ   TRUE 0.994 0.000 0.667 0.027 Y NA
 556194 556195 RB3933 RB3934     TRUE 0.956 -57.000 0.333 0.019   NA
 556197 556198 RB3936 RB3938 trpG   TRUE 0.985 -3.000 0.013 1.000   NA
 556198 556199 RB3938 RB3940     TRUE 0.981 -3.000 0.058 NA   NA
 556201 556202 RB3944 RB3946     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 556202 556203 RB3946 RB3949     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 556203 556204 RB3949 RB3950     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 556205 556206 RB3951 RB3953     TRUE 0.981 -6.000 0.833 1.000   NA
 556206 556207 RB3953 RB3956   arsA TRUE 0.404 -30.000 0.000 1.000   NA
 556209 556210 RB3959 RB3960     TRUE 0.428 83.000 0.000 NA N NA
 556213 556214 RB3966 RB3967     TRUE 0.984 -3.000 0.217 NA   NA
 556216 556217 RB3971 RB3972     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 556219 556220 RB3974 RB3975     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 556220 556221 RB3975 RB3979     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556221 556222 RB3979 RB3981     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 556222 556223 RB3981 RB3982     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 556225 556226 RB3985 RB3988     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 556226 556227 RB3988 RB3989     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 556227 556228 RB3989 RB3990     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556230 556231 RB3992 RB3993     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556231 556232 RB3993 RB3994     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556233 556234 RB3995 RB3997     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556234 556235 RB3997 RB3999     TRUE 0.954 15.000 0.667 0.049   NA
 556236 556237 RB4000 RB4001     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 556237 556238 RB4001 RB4002     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 556239 556240 RB4005 RB4007     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 556240 556241 RB4007 RB4008     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 556241 556242 RB4008 RB4011     FALSE 0.349 23.000 0.000 0.029   NA
 556242 556243 RB4011 RB4013   hrpB FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000   NA
 556243 556244 RB4013 RB4014 hrpB   FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 556244 556245 RB4014 RB4015     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556246 556247 RB4017 RB4021 atsG   FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 556247 556248 RB4021 RB4022   estB FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556248 556249 RB4022 RB4023 estB   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556249 556250 RB4023 RB4024     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556250 556251 RB4024 RB4026     FALSE 0.189 146.000 0.000 NA   NA
 556251 556252 RB4026 RB4029     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 556253 556254 RB4031 RB4032 ppkA   FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 556259 556260 RB4046 RB4048     FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 556261 556262 RB4051 RB4053     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 556262 556263 RB4053 RB4054     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 556263 556264 RB4054 RB4059     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556264 556265 RB4059 RB4060     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556268 556269 RB4069 RB4071 moaA   FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 556269 556270 RB4071 RB4073     TRUE 0.934 -34.000 0.023 NA   NA
 556270 556271 RB4073 RB4077     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 556271 556272 RB4077 RB4079     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556272 556273 RB4079 RB4081   moxR TRUE 0.981 -3.000 0.056 NA   NA
 556273 556274 RB4081 RBt23 moxR   FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 556274 556275 RBt23 RB4083     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 556275 556276 RB4083 RB4084     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 556276 556277 RB4084 RB4087     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 556277 556278 RB4087 RB4090     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 556278 556279 RB4090 RB4091   ydcC TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556279 556280 RB4091 RB4093 ydcC   FALSE 0.187 157.000 0.000 NA   NA
 556280 556281 RB4093 RB4094     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 556281 556282 RB4094 RB4097     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 556282 556283 RB4097 RB4099     TRUE 0.545 -7.000 0.000 1.000   NA
 556283 556284 RB4099 RB4100     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 556284 556285 RB4100 RB4104     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 556285 556286 RB4104 RB4105   radC FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556291 556292 RB4111 RB4112     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556292 556293 RB4112 RB4113   ydcC FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 556295 556296 RB4115 RB4116   blaR FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000   NA
 556296 556297 RB4116 RB4118 blaR blaI TRUE 0.990 3.000 0.667 1.000 Y NA
 556298 556299 RB4121 RB4123     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 556299 556300 RB4123 RB4127     FALSE 0.184 227.000 0.000 NA   NA
 556300 556301 RB4127 RB4128     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 556301 556302 RB4128 RB4129     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556302 556303 RB4129 RB4131   yjjN FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 556305 556306 RB4136 RB4137 phoB hydH TRUE 0.964 -94.000 0.120 1.000 Y NA
 556306 556307 RB4137 RB4142 hydH   FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 556307 556308 RB4142 RB4143   gatA FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 556311 556312 RB4149 RB4150     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556312 556313 RB4150 RB4151     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 556314 556315 RB4152 RB4155     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556315 556316 RB4155 RB4156     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 556316 556317 RB4156 RB4160     TRUE 0.983 -3.000 0.170 NA   NA
 556317 556318 RB4160 RB4161   malQ TRUE 0.578 110.000 0.000 1.000 N NA
 556320 556321 RB4165 RB4166 algU   FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 556322 556323 RB4167 RB4172     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 556324 556325 RB4173 RB4174 ftsY   TRUE 0.585 6.000 0.000 1.000 N NA
 556329 556330 RB4182 RB4185     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 556331 556332 RB4186 RB4193 ppkA   FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 556335 556336 RB4195 RB4196     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556337 556338 RB4197 RB4199     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 556338 556339 RB4199 RB4201     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 556339 556340 RB4201 RB4203     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 556340 556341 RB4203 RB4204     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556342 556343 RB4205 RB4206     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 556343 556344 RB4206 RB4208     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 556344 556345 RB4208 RB4210     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 556348 556349 RB4215 RB4216     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 556350 556351 RB4217 RB4218     FALSE 0.078 -166.000 0.000 NA   NA
 556355 556356 RB4223 RB4224   dinP TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556356 556357 RB4224 RB4227 dinP   FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 556357 556358 RB4227 RB4228     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 556359 556360 RB4229 RB4230     TRUE 0.918 -66.000 0.354 NA   NA
 556362 556363 RB4233 RB4239     FALSE 0.096 -85.000 0.000 NA   NA
 556363 556364 RB4239 RB4241     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556365 556366 RB4243 RB4245     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 556366 556367 RB4245 RB4247   hrpA FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 556367 556368 RB4247 RB4248 hrpA   FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 556368 556369 RB4248 RB4250     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 556370 556371 RB4251 RB4252     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 556371 556372 RB4252 RB4255     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 556375 556376 RB4259 RB4260     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556377 556378 RB4262 RB4264     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556380 556381 RB4267 RB4269     TRUE 0.410 64.000 0.000 1.000   NA
 556381 556382 RB4269 RB4270     TRUE 0.418 69.000 0.000 1.000   NA
 556382 556383 RB4270 RB4271     FALSE 0.263 -69.000 0.000 1.000   NA
 556383 556384 RB4271 RB4272     TRUE 0.499 -13.000 0.000 1.000   NA
 556384 556385 RB4272 RB4273     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 556385 556386 RB4273 RB4275     TRUE 0.918 34.000 0.500 NA   NA
 556387 556388 RB4276 RB4277     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556389 556390 RB4278 RB4282     TRUE 0.412 132.000 0.000 1.000   NA
 556390 556391 RB4282 RB4283     TRUE 0.418 69.000 0.000 1.000   NA
 556393 556394 RB4285 RB4286     TRUE 0.461 4.000 0.000 1.000   NA
 556394 556395 RB4286 RB4288     TRUE 0.432 15.000 0.000 1.000 N NA
 556395 556396 RB4288 RB4289     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 556396 556397 RB4289 RB4292     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 556397 556398 RB4292 RB4293     FALSE 0.263 33.000 0.000 1.000   NA
 556398 556399 RB4293 RB4294     TRUE 0.428 75.000 0.000 1.000   NA
 556399 556400 RB4294 RB4296     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 556403 556404 RB4299 RB4300     TRUE 0.835 3.000 0.000 0.048 Y NA
 556406 556407 RB4302 RB4303     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 556408 556409 RB4304 RB4305     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 556409 556410 RB4305 RB4306     TRUE 0.419 97.000 0.000 1.000   NA
 556410 556411 RB4306 RB4308     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 556411 556412 RB4308 RB4309     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 556412 556413 RB4309 RB4310     TRUE 0.987 0.000 0.810 1.000 N NA
 556413 556414 RB4310 RB4311     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 556414 556415 RB4311 RB4314     TRUE 0.894 30.000 0.033 NA   NA
 556415 556416 RB4314 RB4317     FALSE 0.396 -31.000 0.000 1.000   NA
 556417 556418 RB4320 RB4322     FALSE 0.183 255.000 0.000 NA   NA
 556422 556423 RB4333 RB4336     TRUE 0.988 -3.000 0.158 1.000   NA
 556423 556424 RB4336 RB4337     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556425 556426 RB4338 RB4340     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 556430 556431 RB4348 RB4349     FALSE 0.079 -156.000 0.000 NA   NA
 556433 556434 RB4352 RB4353     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 556434 556435 RB4353 RB4354     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 556435 556436 RB4354 RB4356     FALSE 0.185 185.000 0.000 NA   NA
 556438 556439 RB4358 RB4360     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 556439 556440 RB4360 RB4361     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 556440 556441 RB4361 RB4362     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 556441 556442 RB4362 RB4364     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 556442 556443 RB4364 RB4366     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 556443 556444 RB4366 RB4369     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 556444 556445 RB4369 RB4371     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 556445 556446 RB4371 RB4373     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 556446 556447 RB4373 RB4375     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 556447 556448 RB4375 RB4376   katA TRUE 0.407 159.000 0.000 1.000   NA
 556448 556449 RB4376 RB4377 katA   FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 556449 556450 RB4377 RB4378     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556450 556451 RB4378 RB4381     FALSE 0.183 276.000 0.000 NA   NA
 556451 556452 RB4381 RB4382     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556452 556453 RB4382 RB4383     TRUE 0.882 -154.000 0.231 NA   NA
 556453 556454 RB4383 RB4386     TRUE 0.983 -3.000 0.152 NA   NA
 556454 556455 RB4386 RB4389     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 556455 556456 RB4389 RB4390     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556457 556458 RB4392 RB4393     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556458 556459 RB4393 RB4394     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556459 556460 RB4394 RB4395     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 556460 556461 RB4395 RB4396     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556461 556462 RB4396 RB4397     FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 556463 556464 RB4398 RB4399     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 556464 556465 RB4399 RB4400     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 556466 556467 RB4402 RB4404     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 556470 556471 RB4408 RB4410     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 556471 556472 RB4410 RB4414     TRUE 0.975 0.000 0.538 NA   NA
 556472 556473 RB4414 RB4416     TRUE 0.969 -12.000 0.542 NA   NA
 556473 556474 RB4416 RB4417     TRUE 0.996 -3.000 0.792 0.002 Y NA
 556476 556477 RB4420 RB4422     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 556477 556478 RB4422 RB4423     TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000 N NA
 556483 556484 RB4429 RB4432     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 556484 556485 RB4432 RB4433     TRUE 0.656 69.000 0.000 0.040 N NA
 556485 556486 RB4433 RB4436     TRUE 0.414 124.000 0.000 1.000   NA
 556486 556487 RB4436 RB4438     TRUE 0.407 155.000 0.000 1.000   NA
 556487 556488 RB4438 RB4440     TRUE 0.408 153.000 0.000 1.000   NA
 556491 556492 RB4448 RB4451     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 556493 556494 RB4452 RB4454   FliC FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 556496 556497 RB4456 RB4457     FALSE 0.077 -186.000 0.000 NA   NA
 556498 556499 RB4458 RB4459     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 556499 556500 RB4459 RB4460     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 556500 556501 RB4460 RB4461     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556501 556502 RB4461 RB4462     FALSE 0.087 -109.000 0.000 NA   NA
 556502 556503 RB4462 RB4464     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556503 556504 RB4464 RB4465     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 556505 556506 RB4466 RB4467     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 556507 556508 RB4468 RB4470     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 556508 556509 RB4470 RB4473     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 556510 556511 RB4474 RB4476     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 556511 556512 RB4476 RB4477     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556512 556513 RB4477 RB4478     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 556513 556514 RB4478 RB4480     TRUE 0.957 6.000 0.333 NA   NA
 556516 556517 RB4484 RB4485     TRUE 0.424 87.000 0.000 1.000   NA
 556517 556518 RB4485 RB4487   ntrC TRUE 0.422 89.000 0.000 1.000   NA
 556518 556519 RB4487 RB4489 ntrC   FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556520 556521 RB4492 RB4493     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 556523 556524 RB4498 RB4499     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556525 556526 RB4500 RB4502     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556526 556527 RB4502 RB4504     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 556527 556528 RB4504 RB4505     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 556528 556529 RB4505 RB4506     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556529 556530 RB4506 RB4508   cheY TRUE 0.460 -52.000 0.000 1.000 N NA
 556532 556533 RB4511 RB4512     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 556534 556535 RB4513 RB4514     FALSE 0.369 53.000 0.000 1.000   NA
 556536 556537 RB4517 RB4519     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556537 556538 RB4519 RB4522     FALSE 0.189 145.000 0.000 NA   NA
 556538 556539 RB4522 RB4526     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 556539 556540 RB4526 RB4527     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 556541 556542 RB4528 RB4529     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556542 556543 RB4529 RB4530   czcA TRUE 0.958 76.000 0.400 NA   NA
 556543 556544 RB4530 RB4532 czcA   TRUE 0.965 60.000 0.800 NA N NA
 556546 556547 RB4538 RB4540   czcC FALSE 0.189 147.000 0.000 NA   NA
 556547 556548 RB4540 RB4542 czcC   FALSE 0.183 247.000 0.000 NA   NA
 556548 556549 RB4542 RB4544     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556549 556550 RB4544 RB4547     FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 556553 556554 RB4552 RB4553     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 556554 556555 RB4553 RB4554     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 556557 556558 RB4556 RB4557     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 556560 556561 RB4561 RB4564   sglT TRUE 0.585 73.000 0.000 1.000 N NA
 556562 556563 RB4567 RB4571 chd1   TRUE 0.411 139.000 0.000 1.000   NA
 556563 556564 RB4571 RB4572     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 556566 556567 RB4576 RB4577   asnB TRUE 0.422 71.000 0.000 1.000   NA
 556567 556568 RB4577 RB4578 asnB   FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 556568 556569 RB4578 RB4579     TRUE 0.984 -3.000 0.222 NA   NA
 556569 556570 RB4579 RB4580     TRUE 0.983 -3.000 0.182 NA   NA
 556570 556571 RB4580 RB4582     TRUE 0.988 -3.000 0.172 1.000   NA
 556571 556572 RB4582 RB4583   cdS TRUE 0.966 107.000 0.004 1.000 N NA
 556572 556573 RB4583 RB4586 cdS TPX TRUE 0.581 92.000 0.000 1.000 N NA
 556573 556574 RB4586 RB4589 TPX   FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 556574 556575 RB4589 RB4590     FALSE 0.188 151.000 0.000 NA   NA
 556576 556577 RB4591 RB4593 recO   FALSE 0.399 60.000 0.000 1.000   NA
 556577 556578 RB4593 RB4595     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556580 556581 RB4598 RB4601     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 556582 556583 RB4603 RB4605   dapA FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 556583 556584 RB4605 RB4606 dapA   FALSE 0.382 9.000 0.000 1.000   NA
 556584 556585 RB4606 RB4607     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 556585 556586 RB4607 RB4608     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 556588 556589 RB4610 RB4611 ruvA nusB TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 556589 556590 RB4611 RB4613 nusB   FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 556590 556591 RB4613 RB4614     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 556592 556593 RB4616 RB4619     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 556594 556595 RB4621 RB4626     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556595 556596 RB4626 RB4627     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556596 556597 RB4627 RB4629     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 556597 556598 RB4629 RB4631     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 556599 556600 RB4632 RB4633   secD TRUE 0.920 37.000 0.006 NA N NA
 556602 556603 RB4638 RB4639 aslA   FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556604 556605 RB4640 RB4641     FALSE 0.074 -285.000 0.000 NA   NA
 556606 556607 RB4642 RB4643     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556607 556608 RB4643 RB4644     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 556609 556610 RB4645 RB4646   cox3 FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 556612 556613 RB4649 RB4650     FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 556613 556614 RB4650 RB4651     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556616 556617 RB4653 RB4654     TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 556619 556620 RB4658 RB4659     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556623 556624 RB4662 RB4663     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 556625 556626 RB4667 RB4670     FALSE 0.188 149.000 0.000 NA   NA
 556626 556627 RB4670 RB4673   ruvC FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 556627 556628 RB4673 RB4675 ruvC cysS TRUE 0.972 -18.000 0.005 1.000 N NA
 556628 556629 RB4675 RB4676 cysS   FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 556630 556631 RB4678 RB4679     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 556631 556632 RB4679 RB4681     FALSE 0.184 193.000 0.000 NA   NA
 556632 556633 RB4681 RB4682     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 556635 556636 RB4691 RB4692     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 556636 556637 RB4692 RB4694     FALSE 0.097 -81.000 0.000 NA   NA
 556637 556638 RB4694 RB4697     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 556638 556639 RB4697 RB4698     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 556640 556641 RB4699 RB4702     TRUE 0.413 128.000 0.000 1.000   NA
 556642 556643 RB4703 RB4704     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556644 556645 RB4705 RB4707     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 556645 556646 RB4707 RB4709     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 556647 556648 RB4711 RB4712     FALSE 0.187 156.000 0.000 NA   NA
 556648 556649 RB4712 RB4713     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 556649 556650 RB4713 RB4714     TRUE 0.931 43.000 0.190 NA   NA
 556650 556651 RB4714 RB4715     TRUE 0.931 -45.000 0.095 NA   NA
 556651 556652 RB4715 RB4716     TRUE 0.876 -192.000 1.000 NA   NA
 556656 556657 RB4723 RB4724     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 556657 556658 RB4724 RB4725     FALSE 0.301 40.000 0.000 1.000   NA
 556658 556659 RB4725 RB4727     FALSE 0.183 260.000 0.000 NA   NA
 556660 556661 RB4728 RB4729     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556663 556664 RB4732 RB4735     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 556665 556666 RB4736 RB4737   fbaB FALSE 0.184 200.000 0.000 NA   NA
 556667 556668 RB4738 RB4739     FALSE 0.267 34.000 0.000 1.000   NA
 556670 556671 RB4741 RB4742     TRUE 0.401 251.000 0.000 1.000   NA
 556671 556672 RB4742 RB4744     TRUE 0.692 15.000 0.000 0.002 Y NA
 556672 556673 RB4744 RB4746     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556678 556679 RB4753 RB4754     FALSE 0.084 -124.000 0.000 NA   NA
 556679 556680 RB4754 RB4756     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 556680 556681 RB4756 RB4757     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 556681 556682 RB4757 RB4758   atoS FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 556682 556683 RB4758 RB4759 atoS   TRUE 0.600 -124.000 0.000 0.010 Y NA
 556683 556684 RB4759 RB4760     TRUE 0.917 -3.000 0.000 0.018 Y NA
 556685 556686 RB4763 RB4766     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 556686 556687 RB4766 RB4769     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 556687 556688 RB4769 RB4770     FALSE 0.184 196.000 0.000 NA   NA
 556688 556689 RB4770 RB4771     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 556690 556691 RB4772 RB4773     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 556691 556692 RB4773 RB4775     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 556692 556693 RB4775 RB4777     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556693 556694 RB4777 RB4778     FALSE 0.105 -70.000 0.000 NA   NA
 556694 556695 RB4778 RB4781     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556697 556698 RB4784 RB4787 aslA   TRUE 0.707 42.000 0.000 0.021 Y NA
 556698 556699 RB4787 RB4788     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 556699 556700 RB4788 RB4790     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 556700 556701 RB4790 RB4792     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 556702 556703 RB4793 RB4794     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 556703 556704 RB4794 RB4796     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 556704 556705 RB4796 RB4797     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 556705 556706 RB4797 RB4798     FALSE 0.184 197.000 0.000 NA   NA
 556707 556708 RB4799 RB4800     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556710 556711 RB4802 RB4803     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 556713 556714 RB4805 RB4807     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 556714 556715 RB4807 RB4809     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 556717 556718 RB4811 RB4812     FALSE 0.103 -73.000 0.000 NA   NA
 556718 556719 RB4812 RB4813     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 556719 556720 RB4813 RB4814     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 556721 556722 RB4815 RB4818     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 556723 556724 RB4819 RB4823     FALSE 0.184 221.000 0.000 NA   NA
 556724 556725 RB4823 RB4825     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 556725 556726 RB4825 RB4826     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 556729 556730 RB4830 RB4831     FALSE 0.187 159.000 0.000 NA   NA
 556731 556732 RB4832 RB4833     FALSE 0.184 215.000 0.000 NA   NA
 556733 556734 RB4834 RB4835     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 556737 556738 RB4844 RB4846     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 556738 556739 RB4846 RB4850     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 556740 556741 RB4851 RB4854     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 556741 556742 RB4854 RB4856     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 556742 556743 RB4856 RB4858     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 556743 556744 RB4858 RB4859     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 556744 556745 RB4859 RB4862     FALSE 0.191 130.000 0.000 NA   NA
 556745 556746 RB4862 RB4864     FALSE 0.186 174.000 0.000 NA   NA
 556746 556747 RB4864 RB4866     TRUE 0.995 -3.000 0.605 1.000 Y NA
 556747 556748 RB4866 RB4867   smpB TRUE 0.980 0.000 0.002 1.000 N NA
 556750 556751 RB4869 RB4870     FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 556751 556752 RB4870 RB4872     TRUE 0.918 -51.000 0.043 NA   NA
 556752 556753 RB4872 RB4873     TRUE 0.987 -3.000 0.064 1.000   NA
 556756 556757 RB4877 RB4879     TRUE 0.524 10.000 0.000 1.000 N NA
 556757 556758 RB4879 RB4880     TRUE 0.574 125.000 0.000 1.000 N NA
 556758 556759 RB4880 RB4881     TRUE 0.402 214.000 0.000 1.000   NA
 556759 556760 RB4881 RB4883     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 556761 556762 RB4884 RB4886     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 556763 556764 RB4887 RB4890 hemG   FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 556765 556766 RB4891 RB4892     FALSE 0.097 -81.000 0.000 NA   NA
 556766 556767 RB4892 RB4894   glgX FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 556767 556768 RB4894 RB4897 glgX   FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556768 556769 RB4897 RB4900     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 556769 556770 RB4900 RB4901     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 556770 556771 RB4901 RB4902     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 556772 556773 RB4903 RB4904     TRUE 0.988 -18.000 0.182 1.000 Y NA
 556773 556774 RB4904 RB4906   atpD TRUE 0.566 166.000 0.000 1.000 N NA
 556774 556775 RB4906 RB4908 atpD atpC TRUE 0.996 -3.000 0.443 0.004 Y NA
 556775 556776 RB4908 RB4909 atpC   TRUE 0.954 16.000 0.671 0.004   NA
 556776 556777 RB4909 RB4910     TRUE 0.968 -13.000 0.491 NA   NA
 556777 556778 RB4910 RB4911   atpB TRUE 0.984 -3.000 0.767 NA   NA
 556778 556779 RB4911 RB4913 atpB   TRUE 0.989 82.000 0.900 0.004 Y NA
 556779 556780 RB4913 RB4915   atpF TRUE 0.978 17.000 0.767 0.004 Y NA
 556780 556781 RB4915 RB4916 atpF atpA TRUE 0.989 76.000 0.808 0.004 Y NA
 556781 556782 RB4916 RB4917 atpA atpG TRUE 0.992 -13.000 0.742 0.004 Y NA
 556787 556788 RB4923 RB4924     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556788 556789 RB4924 RB4925     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 556790 556791 RB4927 RB4928     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 556791 556792 RB4928 RB4931     TRUE 0.539 131.000 0.000 0.010   NA
 556792 556793 RB4931 RB4933     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 556793 556794 RB4933 RB4934   lpxC TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556794 556795 RB4934 RB4936 lpxC lpxA TRUE 0.980 74.000 0.007 1.000 Y NA
 556795 556796 RB4936 RB4937 lpxA   TRUE 0.985 -3.000 0.015 1.000   NA
 556796 556797 RB4937 RB4938     FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 556797 556798 RB4938 RB4940     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 556798 556799 RB4940 RB4941     FALSE 0.071 -585.000 0.000 NA   NA
 556799 556800 RB4941 RB4944   ppc FALSE 0.256 19.000 0.000 1.000   NA
 556802 556803 RB4949 RB4951     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 556803 556804 RB4951 RB4954     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 556804 556805 RB4954 RB4957     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 556809 556810 RB4963 RB4965     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 556811 556812 RB4966 RB4967     FALSE 0.183 339.000 0.000 NA   NA
 556813 556814 RB4968 RB4969 ephA   FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 556817 556818 RB4973 RB4974     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 556819 556820 RB4975 RB4977     FALSE 0.191 130.000 0.000 NA   NA
 556822 556823 RB4981 RB4982     TRUE 0.466 42.000 0.000 1.000 N NA
 556823 556824 RB4982 RB4983     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556825 556826 RB4984 RB4985     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 556827 556828 RB4987 RB4988     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556828 556829 RB4988 RB4989     FALSE 0.087 -109.000 0.000 NA   NA
 556829 556830 RB4989 RB4990     FALSE 0.363 -1064.000 0.000 NA Y NA
 556830 556831 RB4990 RB4991     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 556831 556832 RB4991 RB4992     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 556833 556834 RB4993 RB4994     TRUE 0.419 102.000 0.000 1.000   NA
 556834 556835 RB4994 RB4995   ribH TRUE 0.585 87.000 0.000 1.000 N NA
 556835 556836 RB4995 RB4997 ribH rho TRUE 0.556 59.000 0.000 1.000 N NA
 556836 556837 RB4997 RB4998 rho alkA TRUE 0.563 186.000 0.000 1.000 N NA
 556838 556839 RB5001 RB5003     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556839 556840 RB5003 RB5005   glnB TRUE 0.561 225.000 0.000 1.000 N NA
 556840 556841 RB5005 RB5007 glnB axeA FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 556841 556842 RB5007 RB5008 axeA   FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 556844 556845 RB5011 RB5012     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 556846 556847 RB5015 RB5016 rimI   FALSE 0.337 48.000 0.000 1.000   NA
 556847 556848 RB5016 RB5019     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 556848 556849 RB5019 RB5022     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 556851 556852 RB5028 RB5029     TRUE 0.571 140.000 0.000 1.000 N NA
 556852 556853 RB5029 RB5031     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 556856 556857 RB5036 RB5038   maoC FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 556858 556859 RB5039 RB5042 betA   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 556860 556861 RB5043 RB5050     TRUE 0.572 136.000 0.000 1.000 N NA
 556863 556864 RB5052 RB5053     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556864 556865 RB5053 RB5054     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 556866 556867 RB5055 RB5056 uup   TRUE 0.770 -3.000 0.000 0.014   NA
 556867 556868 RB5056 RB5057     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 556868 556869 RB5057 RB5060     TRUE 0.984 -3.000 0.429 NA   NA
 556869 556870 RB5060 RB5061     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 556870 556871 RB5061 RB5062     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 556872 556873 RB5064 RB5066     TRUE 0.946 10.000 0.500 NA   NA
 556874 556875 RB5067 RB5068     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 556875 556876 RB5068 RB5069     FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 556876 556877 RB5069 RB5071     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 556879 556880 RB5074 RB5076     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 556880 556881 RB5076 RB5078     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556881 556882 RB5078 RB5081     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 556882 556883 RB5081 RB5083     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556883 556884 RB5083 RB5084     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 556887 556888 RB5089 RB5092     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556888 556889 RB5092 RB5093     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 556892 556893 RB5097 RB5098     TRUE 0.932 33.000 0.002 1.000 N NA
 556893 556894 RB5098 RB5100     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 556897 556898 RB5103 RB5107     FALSE 0.193 113.000 0.000 NA   NA
 556898 556899 RB5107 RB5108     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 556899 556900 RB5108 RB5109     FALSE 0.085 -121.000 0.000 NA   NA
 556900 556901 RB5109 RB5110     FALSE 0.077 -181.000 0.000 NA   NA
 556902 556903 RB5111 RB5114     FALSE 0.183 245.000 0.000 NA   NA
 556904 556905 RB5116 RB5117     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA Y NA
 556906 556907 RB5118 RB5119     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 556908 556909 RB5123 RB5124     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556911 556912 RB5128 RB5133     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 556912 556913 RB5133 RB5134     TRUE 0.977 -3.000 0.005 NA   NA
 556914 556915 RB5135 RB5137     FALSE 0.183 273.000 0.000 NA   NA
 556915 556916 RB5137 RB5138     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 556917 556918 RB5139 RB5140     TRUE 0.917 17.000 0.429 NA   NA
 556918 556919 RB5140 RB5143     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 556919 556920 RB5143 RB5145     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 556920 556921 RB5145 RB5146     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556922 556923 RB5147 RB5149     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 556925 556926 RB5151 RB5152 ilvA   FALSE 0.254 20.000 0.000 1.000   NA
 556926 556927 RB5152 RB5154   lepB FALSE 0.253 22.000 0.000 1.000   NA
 556928 556929 RB5161 RB5162     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 556930 556931 RB5164 RB5167     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 556932 556933 RB5168 RB5170   cpaA FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 556933 556934 RB5170 RB5172 cpaA cpaB TRUE 0.627 193.000 0.000 NA Y NA
 556936 556937 RB5174 RB5175 cpaC cpaE TRUE 0.986 97.000 0.429 1.000 Y NA
 556937 556938 RB5175 RB5177 cpaE lnt TRUE 0.565 172.000 0.000 1.000 N NA
 556939 556940 RB5178 RB5179 proS carA TRUE 0.691 -18.000 0.000 0.082 N NA
 556941 556942 RB5180 RB5181     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 556943 556944 RB5182 RB5184     TRUE 0.913 27.000 0.333 NA   NA
 556944 556945 RB5184 RB5186     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 556945 556946 RB5186 RB5189     TRUE 0.418 69.000 0.000 1.000   NA
 556947 556948 RB5191 RB5195 queA   TRUE 0.563 187.000 0.000 1.000 N NA
 556949 556950 RB5196 RB5197   sps TRUE 0.938 -97.000 0.065 1.000 N NA
 556950 556951 RB5197 RB5198 sps scrK TRUE 0.962 42.000 0.194 1.000 N NA
 556952 556953 RB5200 RB5205     TRUE 0.578 109.000 0.000 1.000 N NA
 556954 556955 RB5207 RB5208     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 556956 556957 RB5209 RB5210     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 556957 556958 RB5210 RB5211     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 556958 556959 RB5211 RB5212     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 556960 556961 RB5213 RB5214     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 556963 556964 RB5220 RB5221     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556969 556970 RB5229 RB5230     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556971 556972 RB5231 RB5235     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 556973 556974 RB5238 RB5240     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 556974 556975 RB5240 RB5241     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556975 556976 RB5241 RB5243   xynB FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 556976 556977 RB5243 RB5245 xynB   TRUE 0.461 4.000 0.000 1.000   NA
 556978 556979 RB5246 RB5247     TRUE 0.419 97.000 0.000 1.000   NA
 556979 556980 RB5247 RB5253     TRUE 0.984 -3.000 0.222 NA   NA
 556980 556981 RB5253 RB5255     TRUE 0.984 -3.000 0.778 NA   NA
 556983 556984 RB5258 RB5259     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 556984 556985 RB5259 RB5261     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 556986 556987 RB5262 RB5263     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 556987 556988 RB5263 RB5264     FALSE 0.191 127.000 0.000 NA   NA
 556989 556990 RB5266 RB5267     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 556990 556991 RB5267 RB5268     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 556992 556993 RB5271 RB5272     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556995 556996 RB5277 RB5278 dapA dadA TRUE 0.540 -100.000 0.000 1.000 Y NA
 556996 556997 RB5278 RB5279 dadA   FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 556998 556999 RB5280 RB5281     FALSE 0.318 43.000 0.000 1.000   NA
 556999 557000 RB5281 RB5282     TRUE 0.873 0.000 0.000 0.020 Y NA
 557000 557001 RB5282 RB5284     FALSE 0.110 -66.000 0.000 NA   NA
 557001 557002 RB5284 RB5285     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 557002 557003 RB5285 RB5286     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 557003 557004 RB5286 RB5288     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 557004 557005 RB5288 RB5290     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557005 557006 RB5290 RB5294     FALSE 0.260 28.000 0.000 1.000   NA
 557006 557007 RB5294 RB5295     TRUE 0.787 7.000 0.000 0.020 Y NA
 557009 557010 RB5300 RB5302     FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 557010 557011 RB5302 RB5303     FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 557012 557013 RB5304 RB5305     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 557015 557016 RB5310 RB5312   pel FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 557016 557017 RB5312 RB5313 pel   FALSE 0.253 22.000 0.000 1.000   NA
 557017 557018 RB5313 RB5316     TRUE 0.467 -18.000 0.000 1.000   NA
 557018 557019 RB5316 RB5319     TRUE 0.739 114.000 0.000 1.000 Y NA
 557019 557020 RB5319 RB5320     TRUE 0.974 -28.000 0.150 1.000 N NA
 557020 557021 RB5320 RB5321     TRUE 0.967 86.000 0.150 NA N NA
 557021 557022 RB5321 RB5323     FALSE 0.266 -67.000 0.000 NA N NA
 557022 557023 RB5323 RB5326     TRUE 0.410 144.000 0.000 1.000   NA
 557023 557024 RB5326 RB5328     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 557025 557026 RB5332 RB5334     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 557027 557028 RB5336 RB5340 nasE   TRUE 0.585 73.000 0.000 1.000 N NA
 557028 557029 RB5340 RB5343     TRUE 0.996 -3.000 0.173 0.044 Y NA
 557029 557030 RB5343 RB5346     TRUE 0.775 276.000 0.000 0.044 Y NA
 557030 557031 RB5346 RB5347     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557033 557034 RB5350 RB5351     FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 557036 557037 RB5356 RB5359     FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 557037 557038 RB5359 RB5362     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 557038 557039 RB5362 RB5363     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 557039 557040 RB5363 RB5365     TRUE 0.515 63.000 0.000 0.037   NA
 557041 557042 RB5367 RB5368     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557042 557043 RB5368 RB5369     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 557043 557044 RB5369 RB5370     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 557046 557047 RB5373 RB5374     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 557047 557048 RB5374 RB5377     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 557048 557049 RB5377 RB5378     FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 557049 557050 RB5378 RB5380     TRUE 0.405 167.000 0.000 1.000   NA
 557050 557051 RB5380 RB5383     FALSE 0.274 -64.000 0.000 1.000   NA
 557051 557052 RB5383 RB5385     FALSE 0.185 175.000 0.000 NA   NA
 557052 557053 RB5385 RB5387     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557053 557054 RB5387 RB5389     FALSE 0.193 112.000 0.000 NA   NA
 557054 557055 RB5389 RB5390     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 557056 557057 RB5391 RB5392   tyrA FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 557057 557058 RB5392 RB5395 tyrA purL TRUE 0.968 70.000 0.008 1.000 N NA
 557058 557059 RB5395 RB5396 purL   FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 557059 557060 RB5396 RB5399     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 557061 557062 RB5401 RB5403     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 557062 557063 RB5403 RB5404     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 557063 557064 RB5404 RB5405   mthfs FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 557064 557065 RB5405 RB5406 mthfs   TRUE 0.420 16.000 0.000 1.000 N NA
 557066 557067 RB5407 RB5409     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 557067 557068 RB5409 RB5411     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 557070 557071 RB5414 RB5415 rpoB   FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 557071 557072 RB5415 RB5416   rpoC FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 557072 557073 RB5416 RB5417 rpoC   TRUE 0.560 291.000 0.000 1.000 N NA
 557075 557076 RB5420 RB5421     TRUE 0.912 -67.000 1.000 NA   NA
 557076 557077 RB5421 RB5424     TRUE 0.922 37.000 0.333 NA   NA
 557077 557078 RB5424 RB5426     TRUE 0.966 -30.000 0.333 1.000   NA
 557078 557079 RB5426 RB5428     TRUE 0.912 17.000 1.000 NA   NA
 557080 557081 RB5429 RB5430     FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 557082 557083 RB5432 RB5433     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557085 557086 RB5435 RB5437   pnp FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 557086 557087 RB5437 RB5439 pnp fwdC TRUE 0.456 -19.000 0.000 1.000   NA
 557089 557090 RB5444 RB5445 metK   FALSE 0.245 -79.000 0.000 1.000   NA
 557090 557091 RB5445 RBt26     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 557091 557092 RBt26 RB5447     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 557094 557095 RB5449 RB5450     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 557095 557096 RB5450 RB5451     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557100 557101 RB5457 RB5458     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 557102 557103 RB5460 RB5462     FALSE 0.186 173.000 0.000 NA   NA
 557104 557105 RB5464 RB5465     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 557105 557106 RB5465 RB5466     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 557107 557108 RB5468 RB5471     FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 557108 557109 RB5471 RB5472     TRUE 0.848 -12.000 0.000 0.015 Y NA
 557111 557112 RB5475 RB5476     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 557112 557113 RB5476 RB5477     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 557113 557114 RB5477 RB5478     TRUE 0.798 72.000 0.000 0.015 Y NA
 557114 557115 RB5478 RB5479     TRUE 0.795 96.000 0.000 0.015 Y NA
 557115 557116 RB5479 RB5482     TRUE 0.588 -136.000 0.000 0.015 Y NA
 557116 557117 RB5482 RB5485     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 557119 557120 RB5490 RB5495     TRUE 0.988 -3.000 0.800 NA N NA
 557122 557123 RB5499 RB5500     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 557123 557124 RB5500 RB5501     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 557126 557127 RB5503 RB5504 rbfA infB TRUE 0.985 153.000 0.530 1.000 Y NA
 557129 557130 RB5506 RB5507   nusA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557130 557131 RB5507 RB5508 nusA   FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 557131 557132 RB5508 RB5509     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557132 557133 RB5509 RB5511     TRUE 0.984 -3.000 0.429 NA   NA
 557133 557134 RB5511 RB5513   gspK FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 557134 557135 RB5513 RB5514 gspK   FALSE 0.086 -115.000 0.000 NA   NA
 557135 557136 RB5514 RB5515     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 557136 557137 RB5515 RB5516     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557137 557138 RB5516 RB5519   gspG FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 557138 557139 RB5519 RB5522 gspG   FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 557139 557140 RB5522 RB5523     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557141 557142 RB5524 RB5540     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 557145 557146 RB5544 RB5545     FALSE 0.075 -255.000 0.000 NA   NA
 557149 557150 RB5548 RB5549     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 557150 557151 RB5549 RB5550     FALSE 0.075 -247.000 0.000 NA   NA
 557151 557152 RB5550 RB5551     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557152 557153 RB5551 RB5554     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 557153 557154 RB5554 RB5555     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 557154 557155 RB5555 RB5557     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 557155 557156 RB5557 RB5559     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 557156 557157 RB5559 RB5560   trpA FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 557158 557159 RB5561 RB5562     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 557159 557160 RB5562 RB5566   ftsH FALSE 0.185 180.000 0.000 NA   NA
 557160 557161 RB5566 RB5567 ftsH   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557162 557163 RB5568 RB5571 dxr   TRUE 0.961 39.000 0.568 1.000 N NA
 557165 557166 RB5573 RB5575     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 557167 557168 RB5577 RB5581 gnl   FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 557170 557171 RB5585 RB5587     TRUE 0.417 110.000 0.000 1.000   NA
 557171 557172 RB5587 RB5590     FALSE 0.182 527.000 0.000 NA   NA
 557172 557173 RB5590 RB5593     FALSE 0.189 145.000 0.000 NA   NA
 557174 557175 RB5595 RB5597     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 557175 557176 RB5597 RB5601   hisI FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 557176 557177 RB5601 RB5603 hisI hisG TRUE 0.988 96.000 0.081 0.002 Y NA
 557177 557178 RB5603 RB5604 hisG   FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 557179 557180 RB5605 RB5606   uvrA FALSE 0.184 227.000 0.000 NA   NA
 557181 557182 RB5608 RB5611     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 557182 557183 RB5611 RB5612     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 557183 557184 RB5612 RB5613     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 557184 557185 RB5613 RB5614     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 557186 557187 RB5615 RB5616     FALSE 0.392 58.000 0.000 1.000   NA
 557187 557188 RB5616 RB5618     FALSE 0.186 169.000 0.000 NA   NA
 557188 557189 RB5618 RB5619     FALSE 0.183 252.000 0.000 NA   NA
 557191 557192 RB5622 RB5625     FALSE 0.183 434.000 0.000 NA   NA
 557193 557194 RB5627 RB5629 pepN   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557196 557197 RB5631 RB5634     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 557199 557200 RB5637 RB5638     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 557200 557201 RB5638 RB5641     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 557201 557202 RB5641 RB5642   fliG TRUE 0.572 139.000 0.000 1.000 N NA
 557203 557204 RB5643 RB5644     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 557204 557205 RB5644 RB5645     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 557205 557206 RB5645 RB5647     TRUE 0.542 9.000 0.000 1.000 N NA
 557208 557209 RB5649 RB5652     FALSE 0.075 -247.000 0.000 NA   NA
 557209 557210 RB5652 RB5653   gltD FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 557210 557211 RB5653 RB5654 gltD gltB TRUE 0.985 143.000 0.017 0.000 Y NA
 557211 557212 RB5654 RB5655 gltB   TRUE 0.975 69.000 0.160 1.000 N NA
 557212 557213 RB5655 RB5657     FALSE 0.183 273.000 0.000 NA   NA
 557215 557216 RB5663 RB5665     FALSE 0.184 206.000 0.000 NA   NA
 557216 557217 RB5665 RB5670   moeB FALSE 0.188 154.000 0.000 NA   NA
 557217 557218 RB5670 RB5671 moeB nadE TRUE 0.415 115.000 0.000 NA N NA
 557218 557219 RB5671 RB5674 nadE   TRUE 0.403 186.000 0.000 1.000   NA
 557219 557220 RB5674 RB5675     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 557220 557221 RB5675 RB5676     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557221 557222 RB5676 RB5678   fabH FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 557222 557223 RB5678 RBt27 fabH   FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 557227 557228 RB5691 RB5693     FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 557228 557229 RB5693 RB5694   bioD FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 557232 557233 RB5697 RB5699     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 557233 557234 RB5699 RB5701     FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 557234 557235 RB5701 RB5703   moaD TRUE 0.989 -3.000 0.012 1.000 N NA
 557235 557236 RB5703 RB5705 moaD moaE TRUE 0.995 -3.000 0.501 1.000 Y NA
 557236 557237 RB5705 RB5707 moaE   FALSE 0.189 146.000 0.000 NA   NA
 557238 557239 RB5708 RB5711   flgL FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 557239 557240 RB5711 RB5713 flgL   FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 557242 557243 RB5716 RB5717   sthA FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 557245 557246 RB5722 RB5724     FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 557247 557248 RB5725 RB5727 rph   FALSE 0.275 16.000 0.000 1.000   NA
 557248 557249 RB5727 RB5730     FALSE 0.387 -33.000 0.000 1.000   NA
 557249 557250 RB5730 RB5731     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 557251 557252 RB5732 RB5733     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 557256 557257 RB5738 RB5740 ilvE   TRUE 0.408 150.000 0.000 1.000   NA
 557257 557258 RB5740 RB5742     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 557259 557260 RB5743 RB5744   cya TRUE 0.423 72.000 0.000 1.000   NA
 557261 557262 RB5745 RB5747   argS FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 557262 557263 RB5747 RB5749 argS   TRUE 0.936 63.000 0.008 NA   NA
 557264 557265 RB5753 RB5754   dnaK TRUE 0.591 -67.000 0.000 1.000 Y NA
 557265 557266 RB5754 RB5755 dnaK dnaK TRUE 0.973 -88.000 0.600 0.079 Y NA
 557266 557267 RB5755 RB5756 dnaK   FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 557268 557269 RB5758 RB5761     TRUE 0.441 47.000 0.000 0.027   NA
 557269 557270 RB5761 RB5762     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557270 557271 RB5762 RB5763     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557271 557272 RB5763 RB5766   ndh FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 557272 557273 RB5766 RB5768 ndh kefA TRUE 0.578 106.000 0.000 1.000 N NA
 557274 557275 RB5771 RB5772     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 557275 557276 RB5772 RB5774     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 557280 557281 RB5779 RB5780     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 557282 557283 RB5781 RB5782   trx FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 557283 557284 RB5782 RB5785 trx   FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 557284 557285 RB5785 RB5786     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 557285 557286 RB5786 RB5787     TRUE 0.477 -16.000 0.000 1.000   NA
 557288 557289 RB5793 RB5794     FALSE 0.186 169.000 0.000 NA   NA
 557289 557290 RB5794 RB5795   ptsN FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 557291 557292 RB5797 RB5801   rpsO FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 557292 557293 RB5801 RB5802 rpsO   FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 557293 557294 RB5802 RB5804   pnp FALSE 0.078 -174.000 0.000 NA   NA
 557296 557297 RB5811 RB5813   phoD FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 557299 557300 RB5816 RB5820 fucA fucO TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 557300 557301 RB5820 RB5821 fucO fucP FALSE 0.301 40.000 0.000 NA N NA
 557304 557305 RB5825 RB5826     TRUE 0.422 90.000 0.000 1.000   NA
 557306 557307 RB5829 RB5830   cls TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557307 557308 RB5830 RB5831 cls   FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 557308 557309 RB5831 RB5832     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 557310 557311 RB5834 RB5837     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 557312 557313 RB5839 RB5841     FALSE 0.185 178.000 0.000 NA   NA
 557313 557314 RB5841 RB5846     FALSE 0.184 228.000 0.000 NA   NA
 557315 557316 RB5847 RB5848 apt dksA TRUE 0.567 159.000 0.000 1.000 N NA
 557316 557317 RB5848 RB5850 dksA   FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 557317 557318 RB5850 RB5851     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 557320 557321 RB5856 RB5858 adh   TRUE 0.582 -27.000 0.000 1.000 N NA
 557322 557323 RB5860 RB5861     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557323 557324 RB5861 RB5862     TRUE 0.951 -46.000 0.170 1.000   NA
 557324 557325 RB5862 RB5866     FALSE 0.399 440.000 0.000 1.000   NA
 557325 557326 RB5866 RB5867     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 557327 557328 RB5869 RB5871   ftsH TRUE 0.421 91.000 0.000 1.000   NA
 557330 557331 RB5873 RB5874     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 557331 557332 RB5874 RB5875     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 557332 557333 RB5875 RB5876     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 557335 557336 RB5878 RB5880     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 557336 557337 RB5880 RB5881     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 557337 557338 RB5881 RB5882     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 557338 557339 RB5882 RB5884     FALSE 0.095 -88.000 0.000 NA   NA
 557339 557340 RB5884 RB5886     TRUE 0.534 75.000 0.000 0.043   NA
 557340 557341 RB5886 RB5887     TRUE 0.624 -10.000 0.000 0.043   NA
 557341 557342 RB5887 RB5888     TRUE 0.836 3.000 0.000 0.043 Y NA
 557344 557345 RBt28 RB5895     FALSE 0.187 156.000 0.000 NA   NA
 557347 557348 RB5897 RB5899 trx   FALSE 0.110 -66.000 0.000 NA   NA
 557348 557349 RB5899 RB5901     FALSE 0.187 156.000 0.000 NA   NA
 557350 557351 RB5903 RB5905     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557352 557353 RB5907 RB5908     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557353 557354 RB5908 RB5909     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 557354 557355 RB5909 RB5913     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557357 557358 RB5915 RB5918   birA TRUE 0.564 179.000 0.000 1.000 N NA
 557358 557359 RB5918 RB5920 birA   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 557359 557360 RB5920 RB5921     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 557360 557361 RB5921 RB5924     TRUE 0.984 -3.000 0.700 NA   NA
 557361 557362 RB5924 RB5927     TRUE 0.957 77.000 0.300 NA   NA
 557364 557365 RB5930 RB5932     TRUE 0.940 83.000 0.006 NA   NA
 557365 557366 RB5932 RB5934   shc TRUE 0.989 -3.000 0.444 1.000   NA
 557369 557370 RB5939 RB5940   tadA FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 557370 557371 RB5940 RB5941 tadA tadB TRUE 0.972 38.000 0.105 1.000 Y NA
 557371 557372 RB5941 RB5942 tadB tadC TRUE 0.989 66.000 0.712 0.009 Y NA
 557373 557374 RB5943 RB5945     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 557374 557375 RB5945 RB5948   adh FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 557376 557377 RB5952 RB5955     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 557377 557378 RB5955 RB5957     FALSE 0.198 72.000 0.000 NA   NA
 557379 557380 RB5960 RB5961     FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 557385 557386 RB5968 RB5969   recQ TRUE 0.671 76.000 0.000 0.025 N NA
 557387 557388 RB5971 RB5972 rbsC rbsA TRUE 0.985 -27.000 1.000 1.000 Y NA
 557388 557389 RB5972 RB5973 rbsA rbsB TRUE 0.992 -3.000 0.044 NA Y NA
 557390 557391 RB5976 RB5979     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 557391 557392 RB5979 RB5982     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557392 557393 RB5982 RB5983   argB TRUE 0.404 172.000 0.000 NA N NA
 557393 557394 RB5983 RB5984 argB   TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 557394 557395 RB5984 RB5986   argF TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 557396 557397 RB5988 RB5989     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 557397 557398 RB5989 RB5990     FALSE 0.082 -138.000 0.000 NA   NA
 557399 557400 RB5991 RB5992     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 557400 557401 RB5992 RB5993     FALSE 0.091 -99.000 0.000 NA   NA
 557401 557402 RB5993 RB5995     FALSE 0.342 11.000 0.000 1.000   NA
 557405 557406 RB5999 RB6002     TRUE 0.893 29.000 0.029 NA   NA
 557406 557407 RB6002 RB6003     TRUE 0.961 -21.000 0.714 NA   NA
 557407 557408 RB6003 RB6005     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 557408 557409 RB6005 RB6007     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 557409 557410 RB6007 RB6009     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 557412 557413 RB6011 RB6012     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 557413 557414 RB6012 RB6013     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 557415 557416 RB6014 RB6016     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 557417 557418 RB6018 RB6019     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 557418 557419 RB6019 RB6021     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 557419 557420 RB6021 RB6025     FALSE 0.189 146.000 0.000 NA   NA
 557420 557421 RB6025 RB6030     FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 557421 557422 RB6030 RB6031     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 557422 557423 RB6031 RB6033     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557423 557424 RB6033 RB6034     TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 557424 557425 RB6034 RB6037     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 557425 557426 RB6037 RB6038     FALSE 0.094 -91.000 0.000 NA   NA
 557428 557429 RB6040 RB6042     TRUE 0.982 -3.000 0.065 NA   NA
 557429 557430 RB6042 RB6045     TRUE 0.984 -3.000 0.364 NA   NA
 557430 557431 RB6045 RB6049   cysC FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 557431 557432 RB6049 RB6051 cysC   FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 557432 557433 RB6051 RB6053     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 557433 557434 RB6053 RB6054     TRUE 0.927 -57.000 0.500 NA   NA
 557434 557435 RB6054 RB6056   moxR TRUE 0.422 90.000 0.000 1.000   NA
 557439 557440 RB6063 RB6065 corA smc TRUE 0.564 47.000 0.000 0.058 N NA
 557440 557441 RB6065 RB6067 smc   FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 557442 557443 RB6070 RB6071     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 557443 557444 RB6071 RBt30     FALSE 0.188 153.000 0.000 NA   NA
 557446 557447 RB6075 RB6078     TRUE 0.414 125.000 0.000 1.000   NA
 557448 557449 RB6081 RB6084     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 557450 557451 RB6087 RB6090   panD TRUE 0.517 2.000 0.000 1.000   NA
 557451 557452 RB6090 RB6092 panD   TRUE 0.461 4.000 0.000 1.000   NA
 557452 557453 RB6092 RB6095     TRUE 0.416 114.000 0.000 1.000   NA
 557453 557454 RB6095 RB6097     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 557454 557455 RB6097 RB6098     FALSE 0.075 -249.000 0.000 NA   NA
 557455 557456 RB6098 RB6100     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 557456 557457 RB6100 RB6101     TRUE 0.958 75.000 0.571 NA   NA
 557458 557459 RB6102 RB6104     FALSE 0.184 216.000 0.000 NA   NA
 557461 557462 RB6107 RB6108     FALSE 0.080 -153.000 0.000 NA   NA
 557462 557463 RB6108 RB6112     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 557464 557465 RB6114 RB6119 murE   FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 557465 557466 RB6119 RB6120   tolB TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557466 557467 RB6120 RB6122 tolB   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557467 557468 RB6122 RB6123     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 557468 557469 RB6123 RB6126   ribD FALSE 0.229 -99.000 0.000 1.000   NA
 557472 557473 RB6132 RB6133   purK FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 557473 557474 RB6133 RB6135 purK purE TRUE 0.996 -3.000 0.201 0.001 Y NA
 557474 557475 RB6135 RB6137 purE   FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 557476 557477 RB6139 RB6141     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 557478 557479 RB6142 RB6144 tas   FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 557480 557481 RB6145 RB6147   aroB FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 557481 557482 RB6147 RB6148 aroB   FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 557482 557483 RB6148 RB6150     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 557484 557485 RB6151 RB6154     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 557485 557486 RB6154 RB6155     FALSE 0.094 -91.000 0.000 NA   NA
 557486 557487 RB6155 RB6156     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 557487 557488 RB6156 RB6158     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 557491 557492 RB6163 RB6166     FALSE 0.183 293.000 0.000 NA   NA
 557492 557493 RB6166 RB6167     TRUE 0.760 -3.000 0.000 0.042   NA
 557493 557494 RB6167 RB6168     FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 557495 557496 RB6170 RB6171     FALSE 0.198 72.000 0.000 NA   NA
 557496 557497 RB6171 RB6172     FALSE 0.184 220.000 0.000 NA   NA
 557497 557498 RB6172 RB6174     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 557498 557499 RB6174 RB6175     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 557500 557501 RB6178 RB6180     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557501 557502 RB6180 RB6184     TRUE 0.858 2.000 0.000 0.002 Y NA
 557503 557504 RB6185 RB6188     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 557504 557505 RB6188 RB6189     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 557505 557506 RB6189 RB6190     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 557506 557507 RB6190 RB6193     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557507 557508 RB6193 RB6194     FALSE 0.088 -108.000 0.000 NA   NA
 557508 557509 RB6194 RB6196     FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 557509 557510 RB6196 RB6199     TRUE 0.404 172.000 0.000 1.000   NA
 557511 557512 RB6201 RB6207 mfd   FALSE 0.260 18.000 0.000 1.000   NA
 557512 557513 RB6207 RB6209     FALSE 0.231 -96.000 0.000 1.000   NA
 557513 557514 RB6209 RB6210     TRUE 0.404 -30.000 0.000 1.000   NA
 557516 557517 RB6215 RB6217 glyA   TRUE 0.967 66.000 0.008 1.000 N NA
 557517 557518 RB6217 RB6218     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 557518 557519 RB6218 RB6220     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 557520 557521 RB6221 RB6225     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 557521 557522 RB6225 RB6226     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 557522 557523 RB6226 RB6227     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 557523 557524 RB6227 RB6230     FALSE 0.185 178.000 0.000 NA   NA
 557524 557525 RB6230 RB6233     TRUE 0.984 -3.000 0.700 NA   NA
 557525 557526 RB6233 RB6236     TRUE 0.982 -3.000 0.100 NA   NA
 557528 557529 RB6238 RB6239     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 557531 557532 RB6241 RB6242     TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 557535 557536 RB6245 RB6246   serC TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557536 557537 RB6246 RB6248 serC serA TRUE 0.981 49.000 0.018 0.001 Y NA
 557537 557538 RB6248 RB6250 serA   FALSE 0.185 175.000 0.000 NA   NA
 557539 557540 RB6251 RB6254   manC FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 557540 557541 RB6254 RB6255 manC   FALSE 0.362 52.000 0.000 1.000   NA
 557541 557542 RB6255 RB6257     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 557542 557543 RB6257 RB6259   tolQ TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557543 557544 RB6259 RB6263 tolQ   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557544 557545 RB6263 RB6266     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557545 557546 RB6266 RB6269   galE FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 557548 557549 RB6272 RB6274 fabH   FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 557549 557550 RB6274 RB6276   hup FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 557550 557551 RB6276 RB6278 hup   TRUE 0.564 174.000 0.000 1.000 N NA
 557552 557553 RB6281 RB6282     FALSE 0.088 -108.000 0.000 NA   NA
 557554 557555 RB6283 RB6285   sahH FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 557556 557557 RB6286 RB6288     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557558 557559 RB6289 RB6291     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 557559 557560 RB6291 RB6292     FALSE 0.191 133.000 0.000 NA   NA
 557560 557561 RB6292 RB6296     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557562 557563 RB6298 RB6300   trpG FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 557565 557566 RB6304 RB6305     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 557566 557567 RB6305 RB6307     TRUE 0.928 -37.000 0.016 NA   NA
 557567 557568 RB6307 RB6310     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 557568 557569 RB6310 RB6314     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 557570 557571 RB6315 RB6319     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 557572 557573 RB6320 RB6322     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 557573 557574 RB6322 RB6323     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 557575 557576 RB6324 RB6325     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 557578 557579 RB6328 RB6330     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 557579 557580 RB6330 RB6331   thiE FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 557581 557582 RB6332 RB6333     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557585 557586 RB6337 RB6339     TRUE 0.914 -58.000 0.080 NA   NA
 557586 557587 RB6339 RB6340     FALSE 0.097 -81.000 0.000 NA   NA
 557587 557588 RB6340 RB6342     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 557589 557590 RB6344 RB6347 dnaG   TRUE 0.562 211.000 0.000 1.000 N NA
 557590 557591 RB6347 RB6349     FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 557591 557592 RB6349 RB6350     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 557592 557593 RB6350 RB6351     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 557593 557594 RB6351 RB6353     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557594 557595 RB6353 RB6355     TRUE 0.961 12.000 0.774 0.024   NA
 557595 557596 RB6355 RB6356     TRUE 0.968 3.000 0.489 NA   NA
 557596 557597 RB6356 RB6357     TRUE 0.968 2.000 0.177 NA   NA
 557597 557598 RB6357 RB6360     TRUE 0.934 10.000 0.038 NA   NA
 557598 557599 RB6360 RB6363     TRUE 0.993 -3.000 0.713 NA Y NA
 557599 557600 RB6363 RB6364     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 557602 557603 RB6369 RB6370   hydG FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 557603 557604 RB6370 RB6372 hydG   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557604 557605 RB6372 RB6373   trmE FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 557605 557606 RB6373 RB6374 trmE   FALSE 0.107 -69.000 0.000 NA   NA
 557606 557607 RB6374 RB6375     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 557611 557612 RB6380 RB6381     FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 557615 557616 RB6384 RB6386     TRUE 0.459 41.000 0.000 1.000 N NA
 557616 557617 RB6386 RB6387     FALSE 0.325 45.000 0.000 1.000   NA
 557617 557618 RB6387 RB6388     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 557618 557619 RB6388 RB6389     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 557624 557625 RB6395 RB6398     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 557625 557626 RB6398 RB6400     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 557626 557627 RB6400 RB6403     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557627 557628 RB6403 RBt31     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 557629 557630 RB6405 RB6407     FALSE 0.191 134.000 0.000 NA   NA
 557632 557633 RB6409 RB6411   truB FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 557633 557634 RB6411 RB6413 truB   FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 557634 557635 RB6413 RB6415     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 557636 557637 RB6416 RB6417     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 557637 557638 RB6417 RB6420     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 557638 557639 RB6420 RB6423     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 557639 557640 RB6423 RB6425   rpmJ FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 557640 557641 RB6425 RB6426 rpmJ   FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 557642 557643 RB6428 RB6429     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557645 557646 RB6431 RB6432     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 557646 557647 RB6432 RB6434     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 557647 557648 RB6434 RB6435   acpS FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 557648 557649 RB6435 RB6436 acpS trpS TRUE 0.973 4.000 0.011 1.000 N NA
 557649 557650 RB6436 RB6438 trpS   TRUE 0.401 225.000 0.000 1.000   NA
 557653 557654 RB6442 RB6443 metB metB TRUE 0.991 2.000 0.045 0.002 Y NA
 557656 557657 RB6446 RB6447     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557657 557658 RB6447 RB6448     FALSE 0.097 -81.000 0.000 NA   NA
 557658 557659 RB6448 RB6449     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557659 557660 RB6449 RB6452     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 557661 557662 RB6454 RB6457     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 557663 557664 RB6458 RB6459     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 557664 557665 RB6459 RB6462     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 557665 557666 RB6462 RB6463     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 557668 557669 RB6466 RB6467 typA   TRUE 0.524 10.000 0.000 1.000 N NA
 557669 557670 RB6467 RB6469     TRUE 0.572 137.000 0.000 1.000 N NA
 557670 557671 RB6469 RB6470   natB TRUE 0.989 -3.000 0.625 NA N NA
 557673 557674 RB6475 RB6477     FALSE 0.184 230.000 0.000 NA   NA
 557674 557675 RB6477 RB6480     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 557678 557679 RB6484 RB6485 folP hemN TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 557679 557680 RB6485 RB6486 hemN   FALSE 0.380 55.000 0.000 1.000   NA
 557682 557683 RB6489 RB6490   degP TRUE 0.600 -22.000 0.000 1.000 N NA
 557683 557684 RB6490 RB6491 degP   TRUE 0.607 -21.000 0.000 1.000 N NA
 557684 557685 RB6491 RB6492   recR TRUE 0.932 20.000 0.005 1.000 N NA
 557685 557686 RB6492 RB6493 recR   TRUE 0.984 -3.000 0.604 NA   NA
 557686 557687 RB6493 RB6494   dnaX TRUE 0.958 79.000 0.411 NA   NA
 557687 557688 RB6494 RB6495 dnaX   FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 557689 557690 RB6496 RB6497     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 557691 557692 RB6498 RB6499   rarD FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 557692 557693 RB6499 RB6500 rarD   TRUE 0.545 -7.000 0.000 1.000   NA
 557693 557694 RB6500 RB6502     TRUE 0.621 4.000 0.000 1.000 N NA
 557694 557695 RB6502 RB6503     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557695 557696 RB6503 RB6504     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 557696 557697 RB6504 RB6505     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 557697 557698 RB6505 RB6506     FALSE 0.083 -132.000 0.000 NA   NA
 557700 557701 RB6510 RB6511     TRUE 0.956 6.000 0.778 NA   NA
 557701 557702 RB6511 RB6515     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 557703 557704 RB6517 RB6518     TRUE 0.913 28.000 0.750 NA   NA
 557705 557706 RB6520 RB6523     TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 557706 557707 RB6523 RB6524   hpt TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 557707 557708 RB6524 RB6525 hpt   FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 557711 557712 RB6533 RB6534 aas   FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 557713 557714 RB6535 RB6536     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 557714 557715 RB6536 RB6537   galM FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 557715 557716 RB6537 RB6538 galM   TRUE 0.940 40.000 0.067 1.000   NA
 557717 557718 RB6539 RB6542     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 557720 557721 RB6549 RB6551     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 557722 557723 RB6552 RB6553 prfB   FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 557725 557726 RB6556 RB6557     TRUE 0.962 4.000 0.333 NA   NA
 557726 557727 RB6557 RB6559     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 557727 557728 RB6559 RB6562     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 557728 557729 RB6562 RB6563   kdsA FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 557729 557730 RB6563 RB6566 kdsA   TRUE 0.965 181.000 0.007 1.000 N NA
 557730 557731 RB6566 RB6567     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 557732 557733 RB6569 RB6571     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 557734 557735 RB6572 RB6574     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 557735 557736 RB6574 RB6576     FALSE 0.092 -94.000 0.000 NA   NA
 557739 557740 RB6581 RB6583     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557741 557742 RB6586 RB6587     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 557742 557743 RB6587 RB6588   punA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557744 557745 RB6590 RB6593     FALSE 0.105 -70.000 0.000 NA   NA
 557749 557750 RB6599 RB6603     FALSE 0.324 12.000 0.000 1.000   NA
 557750 557751 RB6603 RB6605     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 557751 557752 RB6605 RB6607     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557752 557753 RB6607 RB6609     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 557753 557754 RB6609 RB6610     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 557754 557755 RB6610 RB6615     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 557755 557756 RB6615 RB6616   purD FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 557757 557758 RB6619 RB6620   ppiD FALSE 0.246 -78.000 0.000 1.000   NA
 557759 557760 RB6623 RB6624 nadC   FALSE 0.391 58.000 0.000 NA N NA
 557760 557761 RB6624 RB6627     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 557761 557762 RB6627 RB6628     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 557762 557763 RB6628 RB6629     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 557763 557764 RB6629 RB6632     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 557764 557765 RB6632 RB6633     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557765 557766 RB6633 RB6634     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 557766 557767 RB6634 RB6636     FALSE 0.192 123.000 0.000 NA   NA
 557767 557768 RB6636 RB6637     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 557769 557770 RB6638 RB6639     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 557770 557771 RB6639 RB6643     TRUE 0.970 -10.000 0.667 NA   NA
 557771 557772 RB6643 RB6644     TRUE 0.740 111.000 0.000 1.000 Y NA
 557772 557773 RB6644 RB6653     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 557776 557777 RB6656 RB6658 galT   FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 557778 557779 RB6661 RB6663     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 557780 557781 RB6666 RB6667     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557781 557782 RB6667 RB6668     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 557782 557783 RB6668 RB6669     TRUE 0.967 3.000 0.711 NA   NA
 557783 557784 RB6669 RB6670     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 557785 557786 RB6671 RB6676     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 557787 557788 RB6677 RB6678     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 557788 557789 RB6678 RB6680     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 557789 557790 RB6680 RB6681     FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 557791 557792 RB6683 RB6684 gltA   FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 557792 557793 RB6684 RB6685     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557794 557795 RB6686 RB6688   sodA FALSE 0.397 25.000 0.000 1.000 N NA
 557795 557796 RB6688 RB6690 sodA fba TRUE 0.569 149.000 0.000 1.000 N NA
 557796 557797 RB6690 RB6691 fba   FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 557797 557798 RB6691 RB6693     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 557799 557800 RB6696 RB6697     TRUE 0.970 -10.000 0.750 NA   NA
 557800 557801 RB6697 RB6698     TRUE 0.970 2.000 0.750 NA   NA
 557802 557803 RB6699 RB6701     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 557804 557805 RB6702 RB6703     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 557805 557806 RB6703 RB6706     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 557806 557807 RB6706 RB6707     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 557807 557808 RB6707 RB6708     TRUE 0.625 -10.000 0.000 0.040   NA
 557808 557809 RB6708 RB6709     TRUE 0.836 3.000 0.000 0.040 Y NA
 557809 557810 RB6709 RB6711     FALSE 0.183 364.000 0.000 NA   NA
 557812 557813 RB6713 RB6716     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 557813 557814 RB6716 RB6719     FALSE 0.184 204.000 0.000 NA   NA
 557819 557820 RB6728 RB6729   deoC FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 557822 557823 RB6731 RB6732   tolB FALSE 0.073 -352.000 0.000 NA   NA
 557824 557825 RB6734 RB6735     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 557825 557826 RB6735 RB6736     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 557827 557828 RB6738 RB6740     TRUE 0.952 85.000 0.094 NA   NA
 557829 557830 RB6742 RB6745     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 557830 557831 RB6745 RB6746     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 557831 557832 RB6746 RB6747     TRUE 0.960 -37.000 0.043 0.056   NA
 557832 557833 RB6747 RB6749     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 557834 557835 RB6751 RB6753 clpC pabB FALSE 0.394 23.000 0.000 1.000 N NA
 557836 557837 RB6755 RB6756   rimK TRUE 0.729 -13.000 0.000 0.029 N NA
 557837 557838 RB6756 RB6759 rimK mch TRUE 0.971 -54.000 0.035 1.000 Y NA
 557839 557840 RB6761 RB6763     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557840 557841 RB6763 RB6765     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 557841 557842 RB6765 RB6766     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557843 557844 RB6767 RB6770 pcrA rpmA FALSE 0.399 26.000 0.000 1.000 N NA
 557844 557845 RB6770 RB6771 rpmA   TRUE 0.928 59.000 0.003 NA   NA
 557845 557846 RB6771 RB6774     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557847 557848 RB6776 RB6777     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 557848 557849 RB6777 RB6778     FALSE 0.123 -57.000 0.000 NA   NA
 557849 557850 RB6778 RB6780     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 557850 557851 RB6780 RB6781     TRUE 0.588 84.000 0.000 1.000 N NA
 557851 557852 RB6781 RB6782     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 557857 557858 RB6787 RB6789     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 557858 557859 RB6789 RB6790     FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 557859 557860 RB6790 RB6791     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 557860 557861 RB6791 RB6792     FALSE 0.080 -153.000 0.000 NA   NA
 557861 557862 RB6792 RB6793     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 557862 557863 RB6793 RB6795     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 557863 557864 RB6795 RB6796     TRUE 0.957 87.000 0.600 NA   NA
 557865 557866 RB6799 RB6802     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557866 557867 RB6802 RB6807     FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000   NA
 557868 557869 RB6808 RB6809 gcvH thiL FALSE 0.389 -76.000 0.000 1.000 N NA
 557869 557870 RB6809 RB6812 thiL   FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 557870 557871 RB6812 RB6813   dipZ FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 557871 557872 RB6813 RB6818 dipZ   TRUE 0.579 101.000 0.000 1.000 N NA
 557873 557874 RB6821 RB6822 aspC aroC TRUE 0.805 -12.000 0.000 1.000 Y NA
 557875 557876 RB6823 RB6824     FALSE 0.191 130.000 0.000 NA   NA
 557879 557880 RB6828 RB6831 hemC hemL TRUE 0.786 58.000 0.000 0.001 Y NA
 557880 557881 RB6831 RB6833 hemL   FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 557881 557882 RB6833 RB6838     FALSE 0.183 357.000 0.000 NA   NA
 557884 557885 RB6841 RB6844 glmU prsA TRUE 0.978 -7.000 0.077 1.000   NA
 557886 557887 RB6845 RB6847     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 557889 557890 RB6849 RB6850     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 557890 557891 RB6850 RB6851     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 557891 557892 RB6851 RB6852     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 557892 557893 RB6852 RB6856     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 557893 557894 RB6856 RB6858     FALSE 0.186 169.000 0.000 NA   NA
 557894 557895 RB6858 RB6860     TRUE 0.524 67.000 0.000 0.034   NA
 557895 557896 RB6860 RB6863     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 557897 557898 RB6864 RB6865     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 557899 557900 RB6866 RB6867     FALSE 0.093 -93.000 0.000 NA   NA
 557904 557905 RBt32 RB6880     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 557906 557907 RB6881 RB6883 lolC lolD TRUE 0.967 63.000 0.014 1.000 N NA
 557907 557908 RB6883 RB6884 lolD   FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 557909 557910 RB6885 RB6888     TRUE 0.913 30.000 0.273 NA   NA
 557910 557911 RB6888 RB6891     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 557911 557912 RB6891 RB6895   rfe TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 557912 557913 RB6895 RB6898 rfe   FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 557917 557918 RB6905 RB6906     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 557923 557924 RB6911 RB6912     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 557924 557925 RB6912 RB6914     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 557925 557926 RB6914 RB6916     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 557928 557929 RB6918 RB6920     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 557929 557930 RB6920 RB6923     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 557933 557934 RB6930 RB6932 gdhA cysK TRUE 0.585 32.000 0.000 1.000 Y NA
 557934 557935 RB6932 RB6933 cysK korB TRUE 0.626 -18.000 0.000 1.000 N NA
 557935 557936 RB6933 RB6935 korB korA TRUE 0.977 26.000 0.832 0.000 Y NA
 557938 557939 RB6938 RB6941     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 557940 557941 RB6945 RB6949 cyaA   FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 557942 557943 RB6950 RB6951 dgkA   TRUE 0.971 1.000 0.211 NA   NA
 557945 557946 RB6958 RB6959   ruvB FALSE 0.191 128.000 0.000 NA   NA
 557947 557948 RB6961 RB6962     TRUE 0.749 -7.000 0.000 NA Y NA
 557950 557951 RB6964 RB6967     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 557951 557952 RB6967 RB6968     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 557953 557954 RB6969 RB6971     TRUE 0.922 37.000 0.750 NA   NA
 557955 557956 RB6973 RB6977 tehB   TRUE 0.515 130.000 0.000 0.055   NA
 557956 557957 RB6977 RB6978     FALSE 0.324 -174.000 0.000 1.000 N NA
 557957 557958 RB6978 RB6982     TRUE 0.991 -3.000 1.000 1.000 N NA
 557958 557959 RB6982 RB6983     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 557959 557960 RB6983 RB6984     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 557960 557961 RB6984 RB6985     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 557962 557963 RB6989 RB6990     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 557963 557964 RB6990 RB6991     FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 557965 557966 RB6993 RB6994 cysH   TRUE 0.922 37.000 0.008 NA N NA
 557966 557967 RB6994 RB6995     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 557968 557969 RB6996 RB6999 fliC   FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 557970 557971 RB7000 RB7002 uvrC   FALSE 0.192 119.000 0.000 NA   NA
 557972 557973 RB7004 RB7008   hflX TRUE 0.965 3.000 0.003 1.000   NA
 557973 557974 RB7008 RB7010 hflX uvrC TRUE 0.535 91.000 0.000 0.024   NA
 557974 557975 RB7010 RB7012 uvrC   FALSE 0.183 252.000 0.000 NA   NA
 557975 557976 RB7012 RB7014     TRUE 0.963 4.000 0.429 NA   NA
 557976 557977 RB7014 RB7015     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 557979 557980 RB7019 RB7020   hemD FALSE 0.099 -78.000 0.000 NA   NA
 557982 557983 RB7023 RB7026     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557984 557985 RB7027 RB7028     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 557986 557987 RB7030 RB7033     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557991 557992 RB7039 RB7041     FALSE 0.185 180.000 0.000 NA   NA
 557993 557994 RB7042 RB7045     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 557994 557995 RB7045 RB7048     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 557995 557996 RB7048 RB7049     FALSE 0.123 -57.000 0.000 NA   NA
 557996 557997 RB7049 RB7050     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 557997 557998 RB7050 RB7052     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557998 557999 RB7052 RB7056     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 557999 558000 RB7056 RB7057     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 558000 558001 RB7057 RB7058     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 558004 558005 RB7065 RB7067     TRUE 0.893 -108.000 0.222 NA   NA
 558005 558006 RB7067 RB7070   rpoA FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 558006 558007 RB7070 RB7072 rpoA lplA TRUE 0.411 139.000 0.000 1.000   NA
 558007 558008 RB7072 RB7074 lplA   TRUE 0.616 -19.000 0.000 1.000 N NA
 558008 558009 RB7074 RB7077     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558011 558012 RB7080 RB7081     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 558012 558013 RB7081 RB7082     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 558013 558014 RB7082 RB7084   ppaC FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 558014 558015 RB7084 RB7085 ppaC   FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 558015 558016 RB7085 RB7087     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 558016 558017 RB7087 RB7088     TRUE 0.981 0.000 0.192 1.000   NA
 558017 558018 RB7088 RB7090   gmk TRUE 0.488 -15.000 0.000 1.000   NA
 558018 558019 RB7090 RB7091 gmk   TRUE 0.920 10.000 0.003 NA   NA
 558019 558020 RB7091 RB7093     TRUE 0.977 -3.000 0.006 NA   NA
 558020 558021 RB7093 RB7095   tpiA TRUE 0.957 -40.000 0.007 1.000 N NA
 558021 558022 RB7095 RB7096 tpiA aroA TRUE 0.990 -3.000 0.065 1.000 N NA
 558022 558023 RB7096 RB7097 aroA   FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 558024 558025 RB7098 RB7099     TRUE 0.927 50.000 0.029 NA   NA
 558026 558027 RB7100 RB7102     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 558027 558028 RB7102 RB7104     TRUE 0.973 -67.000 0.055 0.054 Y NA
 558029 558030 RB7106 RB7108     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 558035 558036 RB7114 RB7115 pheS rplT TRUE 0.982 10.000 0.202 1.000 Y NA
 558042 558043 RB7127 RB7128     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558044 558045 RB7129 RB7130   feoB TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 558046 558047 RB7131 RB7134     TRUE 0.963 4.000 0.400 NA   NA
 558047 558048 RB7134 RB7135     TRUE 0.985 0.000 0.018 NA Y NA
 558049 558050 RB7136 RB7137     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 558052 558053 RB7144 RB7146     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 558053 558054 RB7146 RB7147     TRUE 0.951 14.000 0.035 1.000 N NA
 558054 558055 RB7147 RB7149     FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 558056 558057 RB7151 RB7152     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558057 558058 RB7152 RB7157     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 558059 558060 RB7161 RB7162     TRUE 0.933 -45.000 0.139 NA   NA
 558060 558061 RB7162 RB7166     TRUE 0.937 46.000 0.368 NA   NA
 558061 558062 RB7166 RB7167   fabZ FALSE 0.348 50.000 0.000 NA N NA
 558062 558063 RB7167 RB7168 fabZ acpP TRUE 0.957 27.000 0.150 NA Y NA
 558063 558064 RB7168 RB7169 acpP fabZ TRUE 0.562 -43.000 0.000 NA Y NA
 558064 558065 RB7169 RB7171 fabZ fabF TRUE 0.635 7.000 0.000 NA Y NA
 558065 558066 RB7171 RB7172 fabF   FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 558067 558068 RB7173 RB7175   MoaC TRUE 0.980 100.000 0.007 1.000 Y NA
 558068 558069 RB7175 RB7176 MoaC   FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 558069 558070 RB7176 RB7177     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 558075 558076 RB7186 RB7188     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 558076 558077 RB7188 RB7190     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558077 558078 RB7190 RB7193     FALSE 0.261 29.000 0.000 1.000   NA
 558079 558080 RB7194 RB7195     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 558081 558082 RB7196 RB7198     TRUE 0.533 73.000 0.000 0.039   NA
 558082 558083 RB7198 RB7200     TRUE 0.737 -28.000 0.000 1.000 Y NA
 558085 558086 RB7203 RB7205     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 558086 558087 RB7205 RB7206   thiC FALSE 0.192 124.000 0.000 NA   NA
 558087 558088 RB7206 RB7207 thiC   FALSE 0.095 -90.000 0.000 NA   NA
 558088 558089 RB7207 RB7208     FALSE 0.104 -72.000 0.000 NA   NA
 558089 558090 RB7208 RB7209     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 558091 558092 RB7210 RB7211 phoU pstB TRUE 0.981 77.000 0.375 NA Y NA
 558092 558093 RB7211 RB7212 pstB pstA TRUE 0.959 10.000 0.012 0.001   NA
 558093 558094 RB7212 RB7213 pstA pstC TRUE 0.955 35.000 0.485 0.001   NA
 558094 558095 RB7213 RB7215 pstC sphX TRUE 0.739 114.000 0.000 1.000 Y NA
 558095 558096 RB7215 RB7217 sphX   FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 558096 558097 RB7217 RB7219     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 558097 558098 RB7219 RB7220   cstA FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 558098 558099 RB7220 RB7221 cstA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558100 558101 RB7223 RB7224 trx   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 558102 558103 RB7225 RB7228     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 558103 558104 RB7228 RB7229     TRUE 0.984 -3.000 0.750 NA   NA
 558104 558105 RB7229 RB7232     TRUE 0.428 75.000 0.000 1.000   NA
 558106 558107 RB7233 RB7235     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 558107 558108 RB7235 RB7237   mutS FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 558110 558111 RB7240 RB7243     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558112 558113 RB7244 RB7245 ppiB   FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 558114 558115 RB7246 RB7247   glnII FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 558115 558116 RB7247 RB7248 glnII   FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 558116 558117 RB7248 RB7249     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 558119 558120 RB7253 RB7254     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 558120 558121 RB7254 RB7259   ileS FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 558121 558122 RB7259 RB7260 ileS pur3 TRUE 0.988 -3.000 0.004 1.000 N NA
 558122 558123 RB7260 RB7262 pur3   FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 558123 558124 RB7262 RB7263     FALSE 0.105 -70.000 0.000 NA   NA
 558124 558125 RB7263 RB7267     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 558127 558128 RB7273 RB7275   ectB FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 558128 558129 RB7275 RB7276 ectB   TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 558129 558130 RB7276 RB7277     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558130 558131 RB7277 RB7279     FALSE 0.193 112.000 0.000 NA   NA
 558131 558132 RB7279 RB7280     FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 558132 558133 RB7280 RB7283     FALSE 0.198 72.000 0.000 NA   NA
 558133 558134 RB7283 RB7284     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558134 558135 RB7284 RB7285   htrB TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558136 558137 RB7287 RB7288     TRUE 0.993 -3.000 0.545 NA Y NA
 558137 558138 RB7288 RB7289   cysA TRUE 0.994 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 558138 558139 RB7289 RB7290 cysA   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 558142 558143 RB7296 RB7297     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 558146 558147 RB7300 RB7301 lpxK   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 558148 558149 RB7303 RB7306   livK FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 558149 558150 RB7306 RB7308 livK   TRUE 0.544 -7.000 0.000 NA N NA
 558151 558152 RB7309 RB7312     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 558152 558153 RB7312 RB7313     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 558154 558155 RB7314 RB7316 rbsB   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558155 558156 RB7316 RB7317   deaD TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558157 558158 RB7318 RB7319     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558159 558160 RB7321 RB7341     TRUE 0.554 101.000 0.000 0.003   NA
 558160 558161 RB7341 RB7359   proA TRUE 0.545 157.000 0.000 0.002   NA
 558161 558162 RB7359 RB7360 proA fliM TRUE 0.963 8.000 0.006 1.000 N NA
 558163 558164 RB7361 RB7362     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 558165 558166 RB7363 RB7364     FALSE 0.087 -109.000 0.000 NA   NA
 558166 558167 RB7364 RB7367   degP FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 558167 558168 RB7367 RB7368 degP degP TRUE 0.979 -57.000 0.092 0.003 Y NA
 558168 558169 RB7368 RB7371 degP degP TRUE 0.920 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 558169 558170 RB7371 RB7374 degP   FALSE 0.193 114.000 0.000 NA   NA
 558171 558172 RB7375 RB7376 pepT   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558172 558173 RB7376 RB7381     TRUE 0.955 135.000 0.400 NA   NA
 558173 558174 RB7381 RB7382     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 558174 558175 RB7382 RB7383     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558175 558176 RB7383 RB7385   sprE FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 558176 558177 RB7385 RB7386 sprE   FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 558178 558179 RB7388 RB7389 y4qJ y4qJ TRUE 0.761 -3.000 0.000 0.039   NA
 558179 558180 RB7389 RB7390 y4qJ   FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 558185 558186 RB7397 RB7398     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 558186 558187 RB7398 RB7399   y4qK FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 558188 558189 RB7401 RB7402     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 558190 558191 RB7404 RB7406     FALSE 0.373 27.000 0.000 0.004   NA
 558191 558192 RB7406 RB7408   ctpA TRUE 0.402 209.000 0.000 1.000   NA
 558192 558193 RB7408 RB7409 ctpA   FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 558193 558194 RB7409 RB7410     FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 558194 558195 RB7410 RB7411     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558198 558199 RB7415 RB7418     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558199 558200 RB7418 RB7424   nifS TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 558200 558201 RB7424 RB7425 nifS nadA TRUE 0.577 114.000 0.000 1.000 N NA
 558201 558202 RB7425 RB7428 nadA   FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 558202 558203 RB7428 RB7429   pyrB FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 558203 558204 RB7429 RB7430 pyrB pyrC TRUE 0.976 -57.000 0.452 1.000 Y NA
 558204 558205 RB7430 RB7431 pyrC rnpA TRUE 0.711 0.000 0.000 1.000 N NA
 558207 558208 RB7434 RB7435   bacA FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 558208 558209 RB7435 RB7437 bacA lexA TRUE 0.561 265.000 0.000 1.000 N NA
 558211 558212 RB7440 RB7442   flgB TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558212 558213 RB7442 RB7443 flgB flgC TRUE 0.963 36.000 0.804 NA Y NA
 558213 558214 RB7443 RB7444 flgC fliE TRUE 0.979 36.000 0.271 0.002 Y NA
 558214 558215 RB7444 RB7445 fliE fliF TRUE 0.982 11.000 0.056 0.003 Y NA
 558217 558218 RB7447 RB7451     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 558218 558219 RB7451 RB7452     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 558219 558220 RB7452 RB7453   nifS TRUE 0.410 141.000 0.000 1.000   NA
 558221 558222 RB7454 RB7455     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 558222 558223 RB7455 RB7460     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 558225 558226 RB7464 RB7465   sir FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 558228 558229 RB7469 RB7471     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 558234 558235 RB7479 RB7481   arsA FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 558236 558237 RB7482 RB7484 rfbE   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 558237 558238 RB7484 RB7486     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558239 558240 RB7488 RB7491 hydH   FALSE 0.188 153.000 0.000 NA   NA
 558240 558241 RB7491 RB7494     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 558243 558244 RB7500 RB7501 moxR   TRUE 0.984 -3.000 0.455 NA   NA
 558244 558245 RB7501 RB7502     TRUE 0.961 4.000 0.182 NA   NA
 558245 558246 RB7502 RB7503     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 558246 558247 RB7503 RB7507     FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 558248 558249 RB7509 RB7510     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558249 558250 RB7510 RB7512     FALSE 0.313 42.000 0.000 1.000   NA
 558251 558252 RB7514 RB7515     TRUE 0.879 -126.000 0.086 NA   NA
 558253 558254 RB7517 RB7518     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 558255 558256 RB7521 RB7522     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 558256 558257 RB7522 RB7523     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558258 558259 RB7525 RB7530     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 558259 558260 RB7530 RB7531     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 558261 558262 RB7532 RB7533     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 558262 558263 RB7533 RB7535     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 558263 558264 RB7535 RB7538     FALSE 0.192 119.000 0.000 NA   NA
 558264 558265 RB7538 RB7540     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 558265 558266 RB7540 RB7541     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 558266 558267 RB7541 RB7542     FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 558273 558274 RB7549 RB7550     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 558274 558275 RB7550 RB7554     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 558275 558276 RB7554 RB7555     FALSE 0.073 -342.000 0.000 NA   NA
 558276 558277 RB7555 RB7557     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 558277 558278 RB7557 RB7559     FALSE 0.354 51.000 0.000 NA N NA
 558279 558280 RB7560 RB7562 GALNS   TRUE 0.582 71.000 0.000 1.000 N NA
 558280 558281 RB7562 RB7563     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 558283 558284 RB7565 RB7566     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 558288 558289 RB7572 RB7574 pfkA   TRUE 0.573 134.000 0.000 1.000 N NA
 558289 558290 RB7574 RB7577     FALSE 0.187 156.000 0.000 NA   NA
 558291 558292 RB7578 RB7579 csrA atoC TRUE 0.737 127.000 0.000 1.000 Y NA
 558292 558293 RB7579 RB7580 atoC thiD TRUE 0.556 -31.000 0.000 1.000 N NA
 558294 558295 RB7581 RB7583   lplA FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 558295 558296 RB7583 RB7584 lplA yqhK TRUE 0.989 -3.000 0.021 1.000 N NA
 558296 558297 RB7584 RB7585 yqhK yqhJ TRUE 0.979 34.000 0.316 0.000 Y NA
 558297 558298 RB7585 RB7586 yqhJ gcvH TRUE 0.981 -37.000 0.249 1.000 Y NA
 558298 558299 RB7586 RB7587 gcvH gcvT TRUE 0.988 104.000 0.092 0.001 Y NA
 558299 558300 RB7587 RB7589 gcvT   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558300 558301 RB7589 RB7590     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 558304 558305 RB7596 RB7597   marR TRUE 0.970 -10.000 0.400 NA   NA
 558305 558306 RB7597 RB7598 marR   TRUE 0.418 -64.000 0.000 1.000 N NA
 558307 558308 RB7599 RB7600   gltX FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 558308 558309 RB7600 RB7601 gltX   FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 558309 558310 RB7601 RB7603     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 558311 558312 RB7607 RB7610     FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 558312 558313 RB7610 RB7612     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 558314 558315 RB7613 RB7615     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 558315 558316 RB7615 RB7616     TRUE 0.430 78.000 0.000 1.000   NA
 558316 558317 RB7616 RB7618     TRUE 0.957 -60.000 0.508 0.001   NA
 558317 558318 RB7618 RB7619     TRUE 0.961 31.000 0.508 NA Y NA
 558318 558319 RB7619 RB7620     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 558323 558324 RB7626 RB7627     FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 558324 558325 RB7627 RB7628     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558326 558327 RB7629 RB7631 mesJ   FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 558329 558330 RB7633 RB7634 natA natB TRUE 0.987 -3.000 0.062 NA N NA
 558333 558334 RB7641 RB7643     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 558334 558335 RB7643 RB7645     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 558336 558337 RB7646 RB7647     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 558338 558339 RB7648 RB7649     FALSE 0.074 -301.000 0.000 NA   NA
 558339 558340 RB7649 RB7651     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558343 558344 RB7658 RB7661   hisC FALSE 0.188 151.000 0.000 NA   NA
 558344 558345 RB7661 RB7662 hisC hisBD TRUE 0.995 -3.000 0.025 0.002 Y NA
 558348 558349 RB7666 RB7667     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558350 558351 RB7668 RB7672     FALSE 0.188 149.000 0.000 NA   NA
 558352 558353 RB7673 RB7675   trkH TRUE 0.412 -28.000 0.000 NA N NA
 558353 558354 RB7675 RB7678 trkH pcxB TRUE 0.564 62.000 0.000 1.000 N NA
 558354 558355 RB7678 RB7681 pcxB   FALSE 0.084 -130.000 0.000 NA   NA
 558356 558357 RB7682 RB7684     FALSE 0.185 179.000 0.000 NA   NA
 558357 558358 RB7684 RB7685     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 558358 558359 RB7685 RB7688     FALSE 0.193 113.000 0.000 NA   NA
 558359 558360 RB7688 RB7689     FALSE 0.092 -94.000 0.000 NA   NA
 558360 558361 RB7689 RB7692     TRUE 0.907 21.000 1.000 NA   NA
 558361 558362 RB7692 RB7694     TRUE 0.893 -117.000 0.333 NA   NA
 558362 558363 RB7694 RB7698     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558365 558366 RB7701 RB7702     FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 558366 558367 RB7702 RB7703     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 558368 558369 RB7705 RB7706 moaB ptfA TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 558369 558370 RB7706 RB7709 ptfA   FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 558370 558371 RB7709 RB7710     FALSE 0.081 -141.000 0.000 NA   NA
 558372 558373 RB7711 RB7712     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 558374 558375 RB7713 RB7714     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 558376 558377 RB7716 RB7717     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 558378 558379 RB7718 RB7722     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558383 558384 RB7728 RB7729     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 558384 558385 RB7729 RB7730     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 558385 558386 RB7730 RB7731     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 558386 558387 RB7731 RB7733     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 558389 558390 RB7736 RB7737     FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 558390 558391 RB7737 RB7739     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 558393 558394 RB7742 RB7743     TRUE 0.936 45.000 0.500 NA   NA
 558394 558395 RB7743 RB7744     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 558398 558399 RB7747 RB7748     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 558400 558401 RB7749 RB7750     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 558401 558402 RB7750 RB7752     TRUE 0.975 0.000 0.400 NA   NA
 558402 558403 RB7752 RB7753     TRUE 0.964 3.000 0.095 NA   NA
 558403 558404 RB7753 RB7754     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 558406 558407 RB7756 RB7757     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 558409 558410 RB7760 RB7762     TRUE 0.952 -31.000 0.600 NA   NA
 558410 558411 RB7762 RB7765     FALSE 0.184 197.000 0.000 NA   NA
 558411 558412 RB7765 RB7769   GALNS FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 558413 558414 RB7771 RB7772   atsA FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 558414 558415 RB7772 RB7773 atsA   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 558418 558419 RB7781 RB7785 cyaA   FALSE 0.077 -192.000 0.000 NA   NA
 558419 558420 RB7785 RB7786     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 558421 558422 RB7789 RB7790     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 558422 558423 RB7790 RB7791     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 558425 558426 RB7797 RB7798 nccH pkn TRUE 0.583 28.000 0.000 1.000 Y NA
 558427 558428 RB7799 RB7800     FALSE 0.184 218.000 0.000 NA   NA
 558428 558429 RB7800 RB7801     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 558429 558430 RB7801 RB7803   uroD TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558432 558433 RB7812 RB7813     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 558434 558435 RB7815 RB7818   rpsL FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 558435 558436 RB7818 RB7820 rpsL rpsG TRUE 0.987 75.000 0.029 0.001 Y NA
 558436 558437 RB7820 RB7821 rpsG fusA TRUE 0.979 63.000 0.006 1.000 Y NA
 558438 558439 RB7822 RB7823     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 558439 558440 RB7823 RB7824     FALSE 0.105 -70.000 0.000 NA   NA
 558440 558441 RB7824 RB7825     FALSE 0.073 -330.000 0.000 NA   NA
 558441 558442 RB7825 RB7826     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 558445 558446 RB7829 RB7832 rpsJ   FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 558446 558447 RB7832 RB7833   rplC FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 558447 558448 RB7833 RB7834 rplC rplD TRUE 0.983 12.000 0.486 0.008 Y NA
 558448 558449 RB7834 RB7836 rplD rplW TRUE 0.993 2.000 0.513 0.008 Y NA
 558449 558450 RB7836 RB7837 rplW rplB TRUE 0.988 98.000 0.849 0.008 Y NA
 558450 558451 RB7837 RB7838 rplB rpsS TRUE 0.978 35.000 0.820 0.011 Y NA
 558451 558452 RB7838 RB7839 rpsS rplV TRUE 0.988 61.000 0.769 0.011 Y NA
 558452 558453 RB7839 RB7840 rplV rpsC TRUE 0.989 96.000 0.719 0.011 Y NA
 558453 558454 RB7840 RB7841 rpsC rplP TRUE 0.979 -61.000 0.828 0.011 Y NA
 558454 558455 RB7841 RB7846 rplP rpmC TRUE 0.988 179.000 0.802 0.008 Y NA
 558455 558456 RB7846 RB7849 rpmC rpsQ TRUE 0.989 77.000 0.828 0.008 Y NA
 558456 558457 RB7849 RB7850 rpsQ rplN TRUE 0.987 55.000 0.791 0.011 Y NA
 558457 558458 RB7850 RB7851 rplN rplX TRUE 0.989 80.000 0.810 0.011 Y NA
 558458 558459 RB7851 RB7852 rplX rplE TRUE 0.988 59.000 0.758 0.008 Y NA
 558459 558460 RB7852 RB7854 rplE rpsN TRUE 0.989 99.000 0.496 0.008 Y NA
 558460 558461 RB7854 RB7855 rpsN rpsH TRUE 0.978 30.000 0.473 0.008 Y NA
 558461 558462 RB7855 RB7856 rpsH rplF TRUE 0.988 66.000 0.808 0.008 Y NA
 558462 558463 RB7856 RB7857 rplF rplR TRUE 0.992 3.000 0.815 0.008 Y NA
 558463 558464 RB7857 RB7859 rplR rpsE TRUE 0.984 48.000 0.814 0.011 Y NA
 558464 558465 RB7859 RB7863 rpsE rplO TRUE 0.987 164.000 0.148 0.011 Y NA
 558465 558466 RB7863 RB7866 rplO secY TRUE 0.975 278.000 0.730 1.000 N NA
 558466 558467 RB7866 RB7867 secY adk TRUE 0.974 -31.000 0.241 1.000 N NA
 558468 558469 RB7868 RB7869     TRUE 0.478 12.000 0.000 1.000 N NA
 558470 558471 RB7871 RB7875   arsA FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558471 558472 RB7875 RB7879 arsA GALNS TRUE 0.786 153.000 0.000 0.017 Y NA
 558474 558475 RB7883 RB7885 mutL pdxA TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 558475 558476 RB7885 RB7886 pdxA   FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 558476 558477 RB7886 RBt33     FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 558477 558478 RBt33 RBt34     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 558478 558479 RBt34 RBt35     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 558479 558480 RBt35 RBt36     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 558480 558481 RBt36 RB7894   tufA FALSE 0.184 215.000 0.000 NA   NA
 558481 558482 RB7894 RBt37 tufA   FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 558482 558483 RBt37 RB7897   secE FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 558483 558484 RB7897 RB7898 secE nusG TRUE 0.988 -3.000 0.005 1.000 N NA
 558484 558485 RB7898 RB7899 nusG rplK TRUE 0.976 149.000 0.681 1.000 N NA
 558486 558487 RB7900 RB7901 msrB   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 558488 558489 RB7902 RB7903     FALSE 0.110 -66.000 0.000 NA   NA
 558489 558490 RB7903 RB7906     FALSE 0.284 15.000 0.000 NA N NA
 558491 558492 RB7907 RB7909     FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 558492 558493 RB7909 RB7911     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 558493 558494 RB7911 RB7912     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 558494 558495 RB7912 RB7914     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 558495 558496 RB7914 RB7913     FALSE 0.076 -206.000 0.000 NA   NA
 558497 558498 RB7915 RB7916     TRUE 0.954 69.000 1.000 NA   NA
 558500 558501 RB7924 RB7926 sig   TRUE 0.797 96.000 0.000 0.011 Y NA
 558501 558502 RB7926 RB7928   pknB TRUE 0.738 125.000 0.000 1.000 Y NA
 558502 558503 RB7928 RB7929 pknB   FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 558503 558504 RB7929 RB7931     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558505 558506 RB7935 RB7937     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 558506 558507 RB7937 RB7938     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 558509 558510 RB7940 RB7941 dcp cysN TRUE 0.466 -51.000 0.000 1.000 N NA
 558510 558511 RB7941 RB7943 cysN cysD TRUE 0.982 144.000 0.500 0.000 N NA
 558511 558512 RB7943 RB7945 cysD gidB TRUE 0.578 106.000 0.000 1.000 N NA
 558512 558513 RB7945 RB7947 gidB   TRUE 0.562 198.000 0.000 1.000 N NA
 558514 558515 RB7950 RB7951     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558516 558517 RB7955 RB7957   topA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558517 558518 RB7957 RB7959 topA uvrA TRUE 0.574 22.000 0.000 1.000 Y NA
 558518 558519 RB7959 RB7960 uvrA yacI TRUE 0.534 54.000 0.000 1.000 N NA
 558519 558520 RB7960 RB7962 yacI yacH TRUE 0.988 -3.000 0.848 1.000   NA
 558521 558522 RB7965 RB7967   trpE FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 558522 558523 RB7967 RB7970 trpE   FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 558525 558526 RB7978 RB7980     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 558528 558529 RB7984 RB7985   ansA FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 558529 558530 RB7985 RB7987 ansA   FALSE 0.324 -48.000 0.000 1.000   NA
 558530 558531 RB7987 RB7989     FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 558531 558532 RB7989 RB7991     TRUE 0.932 45.000 1.000 NA   NA
 558534 558535 RB7998 RB7999     TRUE 0.987 5.000 0.750 1.000 Y NA
 558537 558538 RB8002 RB8008 GALNS   FALSE 0.399 320.000 0.000 NA N NA
 558538 558539 RB8008 RB8010     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 558540 558541 RB8011 RB8012     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 558541 558542 RB8012 RB8014     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 558543 558544 RB8016 RB8018 ncx   TRUE 0.402 201.000 0.000 1.000   NA
 558546 558547 RB8022 RB8026     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558547 558548 RB8026 RB8027     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 558548 558549 RB8027 RB8028   pknB TRUE 0.514 -136.000 0.000 1.000 Y NA
 558553 558554 RB8034 RB8035   trkA FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 558554 558555 RB8035 RB8037 trkA serB FALSE 0.334 -141.000 0.000 1.000 N NA
 558555 558556 RB8037 RB8038 serB OPLAH TRUE 0.504 -160.000 0.000 1.000 Y NA
 558557 558558 RB8039 RB8046   devC TRUE 0.402 195.000 0.000 1.000   NA
 558558 558559 RB8046 RB8049 devC   TRUE 0.563 0.000 0.000 NA N NA
 558559 558560 RB8049 RB8050     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 558561 558562 RB8052 RB8054     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 558563 558564 RB8055 RB8056     FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 558567 558568 RB8061 RB8062   yoaA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558569 558570 RB8064 RB8065     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 558570 558571 RB8065 RB8066     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 558571 558572 RB8066 RB8067     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 558573 558574 RB8068 RB8070     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558574 558575 RB8070 RB8071     FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 558575 558576 RB8071 RB8073   abf2 FALSE 0.189 143.000 0.000 NA   NA
 558576 558577 RB8073 RB8076 abf2   TRUE 0.404 178.000 0.000 1.000   NA
 558577 558578 RB8076 RB8077     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 558578 558579 RB8077 RB8078   arsA FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 558580 558581 RB8079 RB8080   hisA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558585 558586 RB8089 RB8091     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 558586 558587 RB8091 RB8093     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 558587 558588 RB8093 RB8095     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558588 558589 RB8095 RB8096     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 558589 558590 RB8096 RB8098     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558591 558592 RB8100 RB8101     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 558594 558595 RB8103 RB8107     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 558596 558597 RB8108 RB8113     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 558597 558598 RB8113 RB8116   gntR TRUE 0.972 128.000 0.054 1.000 N NA
 558599 558600 RB8117 RB8119     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 558600 558601 RB8119 RB8123   fabZ FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 558601 558602 RB8123 RB8125 fabZ fabI TRUE 0.992 -3.000 0.055 NA Y NA
 558602 558603 RB8125 RB8126 fabI ilvE TRUE 0.591 79.000 0.000 1.000 N NA
 558603 558604 RB8126 RB8127 ilvE   FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 558604 558605 RB8127 RB8132     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 558605 558606 RB8132 RB8134     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 558609 558610 RB8140 RB8143     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 558610 558611 RB8143 RB8144     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 558611 558612 RB8144 RB8146     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 558613 558614 RB8149 RBt38 csrA   FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 558617 558618 RB8153 RB8157     TRUE 0.984 -3.000 0.339 NA   NA
 558618 558619 RB8157 RB8158     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 558619 558620 RB8158 RB8161   exoA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558620 558621 RB8161 RB8163 exoA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558621 558622 RB8163 RB8165     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 558623 558624 RB8167 RB8171     TRUE 0.984 -3.000 0.750 NA   NA
 558624 558625 RB8171 RB8173   moxR TRUE 0.940 50.000 0.250 NA   NA
 558625 558626 RB8173 RB8174 moxR   TRUE 0.921 -49.000 0.054 NA   NA
 558626 558627 RB8174 RB8176     TRUE 0.982 -3.000 0.089 NA   NA
 558627 558628 RB8176 RB8177     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 558628 558629 RB8177 RB8181     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558629 558630 RB8181 RB8186     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 558630 558631 RB8186 RB8188     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558635 558636 RB8193 RB8194     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 558639 558640 RB8202 RB8205   mpg FALSE 0.313 42.000 0.000 1.000   NA
 558642 558643 RB8209 RB8210     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 558643 558644 RB8210 RB8214     TRUE 0.948 101.000 0.061 NA   NA
 558644 558645 RB8214 RB8217     FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 558646 558647 RB8219 RB8221 aspC   TRUE 0.803 73.000 0.000 0.007 Y NA
 558647 558648 RB8221 RB8222   metX TRUE 0.974 51.000 0.006 1.000 Y NA
 558649 558650 RB8223 RB8226     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 558650 558651 RB8226 RB8227     FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 558651 558652 RB8227 RB8228     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 558653 558654 RB8229 RB8231   ilvH FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 558654 558655 RB8231 RB8233 ilvH hemH TRUE 0.404 176.000 0.000 1.000   NA
 558657 558658 RB8236 RB8238   prdX2 FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 558658 558659 RB8238 RB8239 prdX2   FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 558659 558660 RB8239 RB8240     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 558661 558662 RB8243 RB8245     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 558662 558663 RB8245 RB8246     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558663 558664 RB8246 RB8247     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 558665 558666 RB8248 RB8253   aspS TRUE 0.562 197.000 0.000 1.000 N NA
 558666 558667 RB8253 RB8254 aspS   TRUE 0.563 191.000 0.000 1.000 N NA
 558670 558671 RB8260 RB8262   putA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558672 558673 RB8265 RB8266     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 558673 558674 RB8266 RB8268     TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 558677 558678 RB8275 RB8278     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 558679 558680 RB8279 RB8280     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 558681 558682 RB8281 RB8282     FALSE 0.184 231.000 0.000 NA   NA
 558682 558683 RB8282 RB8284     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 558683 558684 RB8284 RB8286   ribF TRUE 0.920 16.000 0.010 1.000   NA
 558684 558685 RB8286 RB8287 ribF   TRUE 0.951 119.000 0.003 NA N NA
 558692 558693 RB8306 RB8309     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 558694 558695 RB8310 RB8311 accA   TRUE 0.973 4.000 0.008 1.000 N NA
 558695 558696 RB8311 RB8313     TRUE 0.974 92.000 0.074 1.000 N NA
 558696 558697 RB8313 RB8316   whiG TRUE 0.542 9.000 0.000 1.000 N NA
 558697 558698 RB8316 RB8318 whiG   FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 558698 558699 RB8318 RB8319     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 558699 558700 RB8319 RB8320   flhF FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 558700 558701 RB8320 RB8323 flhF flhA TRUE 0.993 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 558701 558702 RB8323 RB8324 flhA   FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 558702 558703 RB8324 RB8325     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 558703 558704 RB8325 RB8326   pknB FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 558704 558705 RB8326 RB8327 pknB   FALSE 0.080 -151.000 0.000 NA   NA
 558706 558707 RB8328 RB8329     TRUE 0.467 -18.000 0.000 1.000   NA
 558709 558710 RB8333 RB8335     FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 558711 558712 RB8337 RB8342     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 558713 558714 RB8343 RB8344 purB   FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 558715 558716 RB8345 RB8348     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558716 558717 RB8348 RB8350     FALSE 0.187 158.000 0.000 NA   NA
 558718 558719 RB8353 RB8355     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 558719 558720 RB8355 RB8356     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 558722 558723 RB8359 RB8361 gatC   FALSE 0.191 127.000 0.000 NA   NA
 558724 558725 RB8362 RB8363 Pph1 pepT TRUE 0.561 243.000 0.000 1.000 N NA
 558725 558726 RB8363 RB8365 pepT   FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 558728 558729 RB8368 RB8370     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 558730 558731 RB8374 RB8375 guaA   TRUE 0.499 193.000 0.000 0.067   NA
 558731 558732 RB8375 RB8376     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 558732 558733 RB8376 RB8378     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 558733 558734 RB8378 RB8381     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 558734 558735 RB8381 RB8383   glgP FALSE 0.187 159.000 0.000 NA   NA
 558735 558736 RB8383 RB8384 glgP insA TRUE 0.568 153.000 0.000 1.000 N NA
 558736 558737 RB8384 RB8385 insA   FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 558738 558739 RB8387 RB8388     FALSE 0.184 216.000 0.000 NA   NA
 558739 558740 RB8388 RB8389     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 558740 558741 RB8389 RB8394     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 558741 558742 RB8394 RB8396   deaD TRUE 0.953 190.000 0.667 NA   NA
 558742 558743 RB8396 RB8397 deaD uvrB TRUE 0.794 160.000 0.000 0.002 Y NA
 558744 558745 RB8399 RB8402 tdk rnr TRUE 0.591 79.000 0.000 1.000 N NA
 558745 558746 RB8402 RB8404 rnr cobT TRUE 0.728 212.000 0.000 1.000 Y NA
 558747 558748 RB8406 RB8407     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 558749 558750 RB8409 RB8410     FALSE 0.092 -94.000 0.000 NA   NA
 558750 558751 RB8410 RB8411     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 558752 558753 RB8414 RB8415     TRUE 0.900 -72.000 0.071 NA   NA
 558756 558757 RB8420 RB8421     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558757 558758 RB8421 RB8422     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 558759 558760 RB8423 RB8430 atsG mntH TRUE 0.741 103.000 0.000 1.000 Y NA
 558761 558762 RB8432 RB8434     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 558762 558763 RB8434 RB8437   cti FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 558763 558764 RB8437 RB8440 cti   TRUE 0.955 7.000 0.500 NA   NA
 558765 558766 RB8441 RB8445     TRUE 0.656 12.000 0.000 1.000 Y NA
 558767 558768 RB8448 RB8450     FALSE 0.081 -148.000 0.000 NA   NA
 558768 558769 RB8450 RB8455   nadD TRUE 0.417 109.000 0.000 1.000   NA
 558769 558770 RB8455 RB8456 nadD   TRUE 0.425 6.000 0.000 1.000   NA
 558772 558773 RB8459 RB8462 rpsR   TRUE 0.905 18.000 0.002 1.000   NA
 558776 558777 RB8465 RB8468 fur csyQ FALSE 0.183 297.000 0.000 NA   NA
 558778 558779 RB8469 RB8472 odc cht1 TRUE 0.614 15.000 0.000 1.000 Y NA
 558779 558780 RB8472 RB8473 cht1   FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 558781 558782 RB8474 RB8476   ppiC FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 558782 558783 RB8476 RB8478 ppiC   FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 558784 558785 RB8479 RB8482   psd FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 558785 558786 RB8482 RB8484 psd   FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 558786 558787 RB8484 RB8485     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558790 558791 RB8492 RB8494 sigW   TRUE 0.410 34.000 0.000 1.000 N NA
 558793 558794 RB8499 RB8500     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 558796 558797 RB8503 RB8504     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 558797 558798 RB8504 RB8505     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 558798 558799 RB8505 RB8507     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 558804 558805 RB8513 RB8515   yqjH FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558809 558810 RB8520 RB8522     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 558810 558811 RB8522 RB8524   lcfA TRUE 0.655 -13.000 0.000 1.000 N NA
 558813 558814 RB8527 RB8528     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 558814 558815 RB8528 RB8529     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 558816 558817 RB8530 RB8531   tatC FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 558818 558819 RB8533 RB8534 pfpI   FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 558823 558824 RB8540 RB8541 argA celM TRUE 0.674 -10.000 0.000 1.000 N NA
 558825 558826 RB8542 RB8543 pyrH alaS TRUE 0.645 67.000 0.000 0.067 N NA
 558826 558827 RB8543 RB8546 alaS   FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558828 558829 RB8547 RB8548   accB TRUE 0.970 65.000 0.026 1.000 N NA
 558829 558830 RB8548 RB8550 accB accC TRUE 0.989 4.000 0.044 0.001 Y NA
 558830 558831 RB8550 RB8551 accC hpnA TRUE 0.580 70.000 0.000 1.000 N NA
 558833 558834 RB8553 RB8555 sigW pkn2 TRUE 0.827 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 558834 558835 RB8555 RB8557 pkn2   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558836 558837 RB8559 RB8561     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 558837 558838 RB8561 RB8562   pgm FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558838 558839 RB8562 RB8563 pgm glbN TRUE 0.413 131.000 0.000 1.000   NA
 558839 558840 RB8563 RB8565 glbN iolI FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 558840 558841 RB8565 RB8568 iolI   FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 558841 558842 RB8568 RB8572     FALSE 0.184 221.000 0.000 NA   NA
 558842 558843 RB8572 RB8573     FALSE 0.081 -144.000 0.000 NA   NA
 558843 558844 RB8573 RB8574     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 558844 558845 RB8574 RB8576     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 558846 558847 RB8580 RB8584   fruA TRUE 0.965 85.000 0.088 NA N NA
 558847 558848 RB8584 RB8588 fruA ptsH TRUE 0.984 140.000 0.007 0.002 Y NA
 558848 558849 RB8588 RB8590 ptsH   FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 558849 558850 RB8590 RB8591   ptsI FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 558850 558851 RB8591 RB8592 ptsI   TRUE 0.979 -3.000 0.015 NA   NA
 558851 558852 RB8592 RB8594     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558852 558853 RB8594 RB8595   rne FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 558853 558854 RB8595 RB8596 rne mdsA TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 558854 558855 RB8596 RB8597 mdsA GALNS TRUE 0.634 -79.000 0.000 0.016 Y NA
 558855 558856 RB8597 RB8598 GALNS fdhF FALSE 0.393 22.000 0.000 1.000 N NA
 558858 558859 RB8601 RB8604   ccsA FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 558859 558860 RB8604 RB8611 ccsA   FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 558861 558862 RB8612 RB8613 ubiG pfaS TRUE 0.740 -12.000 0.000 0.016 N NA
 558863 558864 RB8615 RB8622     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 558864 558865 RB8622 RB8625     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558865 558866 RB8625 RB8628     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 558866 558867 RB8628 RB8629     TRUE 0.499 58.000 0.000 0.036   NA
 558867 558868 RB8629 RB8630     FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 558868 558869 RB8630 RB8633   argD FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 558869 558870 RB8633 RB8634 argD   FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 558871 558872 RB8635 RB8637 ykuE sixA FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 558873 558874 RB8639 RB8641     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 558874 558875 RB8641 RB8644     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 558877 558878 RB8648 RB8649   cypH FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 558878 558879 RB8649 RB8651 cypH   FALSE 0.183 249.000 0.000 NA   NA
 558879 558880 RB8651 RB8652     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 558881 558882 RBr01 RBr02     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 558883 558884 RB8669 RB8670     FALSE 0.186 172.000 0.000 NA   NA
 558885 558886 RBt39 RBt40     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 558886 558887 RBt40 RB8672     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 558889 558890 RB8677 RB8679     FALSE 0.255 24.000 0.000 1.000   NA
 558890 558891 RB8679 RB8680     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 558892 558893 RB8681 RB8683     FALSE 0.123 -57.000 0.000 NA   NA
 558893 558894 RB8683 RB8684     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 558894 558895 RB8684 RB8686   ykfB TRUE 0.946 -36.000 0.258 NA   NA
 558895 558896 RB8686 RB8687 ykfB   TRUE 0.556 59.000 0.000 1.000 N NA
 558897 558898 RB8689 RB8690     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 558898 558899 RB8690 RB8693     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558899 558900 RB8693 RB8695     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 558900 558901 RB8695 RB8697     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 558902 558903 RB8700 RB8701   sigH TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558903 558904 RB8701 RB8703 sigH   FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 558904 558905 RB8703 RB8704     FALSE 0.093 -93.000 0.000 NA   NA
 558905 558906 RB8704 RB8707   pilC TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558906 558907 RB8707 RB8711 pilC tapC TRUE 0.914 -3.000 0.000 0.049 Y NA
 558907 558908 RB8711 RB8713 tapC   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558908 558909 RB8713 RB8715     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558909 558910 RB8715 RB8717     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558910 558911 RB8717 RB8718     TRUE 0.916 32.000 0.500 NA   NA
 558911 558912 RB8718 RB8722     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558912 558913 RB8722 RB8723     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 558913 558914 RB8723 RB8725   rpmG FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 558914 558915 RB8725 RB8726 rpmG recJ FALSE 0.301 40.000 0.000 1.000   NA
 558915 558916 RB8726 RB8728 recJ   TRUE 0.560 394.000 0.000 1.000 N NA
 558916 558917 RB8728 RB8731   kdgK TRUE 0.570 145.000 0.000 1.000 N NA
 558918 558919 RB8734 RB8736     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 558919 558920 RB8736 RB8738     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 558923 558924 RB8741 RB8742 aroH   FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 558924 558925 RB8742 RB8745     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 558925 558926 RB8745 RB8746     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558926 558927 RB8746 RB8747   dfp TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558927 558928 RB8747 RB8748 dfp pyrD FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 558929 558930 RB8749 RB8750     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 558930 558931 RB8750 RB8752     FALSE 0.184 198.000 0.000 NA   NA
 558931 558932 RB8752 RB8754   batD FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 558932 558933 RB8754 RB8759 batD batB FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 558933 558934 RB8759 RB8763 batB batA FALSE 0.089 -105.000 0.000 NA   NA
 558934 558935 RB8763 RB8764 batA   TRUE 0.980 -3.000 0.023 NA   NA
 558935 558936 RB8764 RB8767     TRUE 0.979 -3.000 0.014 NA   NA
 558936 558937 RB8767 RB8768     TRUE 0.962 4.000 0.764 NA   NA
 558937 558938 RB8768 RB8770     FALSE 0.183 277.000 0.000 NA   NA
 558938 558939 RB8770 RB8773     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 558939 558940 RB8773 RB8774     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 558940 558941 RB8774 RB8775     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 558942 558943 RB8776 RB8777   rho FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 558943 558944 RB8777 RBt41 rho   FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 558944 558945 RBt41 RB8779   sdaA FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 558948 558949 RB8783 RB8785   fucI TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 558949 558950 RB8785 RB8788 fucI araB TRUE 0.929 21.000 0.125 1.000   NA
 558950 558951 RB8788 RB8789 araB   TRUE 0.416 115.000 0.000 1.000   NA
 558951 558952 RB8789 RB8792   yidR FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 558954 558955 RB8797 RB8798   dapA TRUE 0.995 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 558955 558956 RB8798 RB8799 dapA   TRUE 0.408 149.000 0.000 1.000   NA
 558956 558957 RB8799 RB8803     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 558959 558960 RB8807 RB8812     TRUE 0.977 -3.000 0.004 NA   NA
 558961 558962 RB8813 RB8814     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 558965 558966 RB8818 RB8819     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 558967 558968 RB8820 RB8821     FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 558971 558972 RB8825 RB8827     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 558973 558974 RB8828 RB8833     TRUE 0.689 40.000 0.000 0.049 Y NA
 558974 558975 RB8833 RB8834   czcD TRUE 0.638 24.000 0.000 0.049 Y NA
 558975 558976 RB8834 RB8835 czcD   TRUE 0.430 77.000 0.000 1.000   NA
 558981 558982 RB8846 RB8848   ubiE FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 558982 558983 RB8848 RB8849 ubiE   TRUE 0.921 -45.000 0.024 NA   NA
 558983 558984 RB8849 RB8851   hpaG FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 558984 558985 RB8851 RB8853 hpaG chsA TRUE 0.747 85.000 0.000 1.000 Y NA
 558985 558986 RB8853 RB8854 chsA   TRUE 0.991 -3.000 0.120 1.000 N NA
 558986 558987 RB8854 RB8857     TRUE 0.989 -3.000 0.333 1.000   NA
 558987 558988 RB8857 RB8859   ldhA TRUE 0.757 -3.000 0.000 0.050   NA
 558988 558989 RB8859 RB8861 ldhA lgt TRUE 0.430 82.000 0.000 1.000   NA
 558989 558990 RB8861 RB8863 lgt   FALSE 0.186 172.000 0.000 NA   NA
 558993 558994 RB8866 RB8870     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 558994 558995 RB8870 RB8871   fabG TRUE 0.539 55.000 0.000 1.000 N NA
 558995 558996 RB8871 RB8872 fabG glpF TRUE 0.567 63.000 0.000 1.000 N NA
 559000 559001 RB8878 RB8880 yniI ydjG TRUE 0.923 -58.000 0.286 NA   NA
 559002 559003 RB8881 RB8882   pilE1 FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 559005 559006 RB8885 RB8886     FALSE 0.107 -69.000 0.000 NA   NA
 559006 559007 RB8886 RB8888     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 559009 559010 RB8890 RB8891     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 559011 559012 RB8892 RB8895   nanH FALSE 0.183 278.000 0.000 NA   NA
 559012 559013 RB8895 RB8898 nanH   FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 559013 559014 RB8898 RB8900     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 559014 559015 RB8900 RB8901     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 559016 559017 RB8902 RB8903     FALSE 0.191 133.000 0.000 NA   NA
 559018 559019 RB8904 RB8905 tyv   TRUE 0.985 111.000 0.304 1.000 Y NA
 559019 559020 RB8905 RB8908     FALSE 0.183 308.000 0.000 NA   NA
 559020 559021 RB8908 RB8909     FALSE 0.193 112.000 0.000 NA   NA
 559021 559022 RB8909 RB8910     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 559023 559024 RBt42 RB8913   trpF FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 559025 559026 RB8914 RB8917     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559026 559027 RB8917 RB8919   lueS FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 559029 559030 RB8923 RB8924   bcpC TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559030 559031 RB8924 RB8926 bcpC ask TRUE 0.971 79.000 0.018 1.000 N NA
 559032 559033 RB8927 RB8928 pbrT   FALSE 0.272 35.000 0.000 1.000   NA
 559033 559034 RB8928 RB8929     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559035 559036 RB8930 RB8932     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 559036 559037 RB8932 RB8935     TRUE 0.960 2.000 0.016 NA   NA
 559039 559040 RB8939 RB8941     TRUE 0.590 77.000 0.000 1.000 N NA
 559042 559043 RB8945 RB8947     FALSE 0.186 174.000 0.000 NA   NA
 559043 559044 RB8947 RB8957     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 559045 559046 RB8959 RB8964     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559047 559048 RB8965 RB8966   groEL FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 559048 559049 RB8966 RB8969 groEL groES TRUE 0.988 79.000 0.069 0.004 Y NA
 559049 559050 RB8969 RB8970 groES groEL TRUE 0.981 46.000 0.059 0.004 Y NA
 559050 559051 RB8970 RB8972 groEL dnaJ TRUE 0.984 170.000 0.007 0.001 Y NA
 559051 559052 RB8972 RB8974 dnaJ grpE TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.004 Y NA
 559054 559055 RB8976 RB8978     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 559055 559056 RB8978 RB8979     TRUE 0.401 230.000 0.000 1.000   NA
 559058 559059 RB8983 RB8985 moxR   TRUE 0.407 156.000 0.000 1.000   NA
 559061 559062 RB8988 RB8992     TRUE 0.984 -3.000 0.750 NA   NA
 559062 559063 RB8992 RB8999     FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 559065 559066 RB9002 RB9009     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 559066 559067 RB9009 RB9010     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 559067 559068 RB9010 RB9011     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559068 559069 RB9011 RB9012   cycX FALSE 0.074 -312.000 0.000 NA   NA
 559071 559072 RB9015 RB9017     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 559072 559073 RB9017 RB9019   pknB TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 559073 559074 RB9019 RB9020 pknB   FALSE 0.184 217.000 0.000 NA   NA
 559074 559075 RB9020 RB9022     FALSE 0.095 -88.000 0.000 NA   NA
 559075 559076 RB9022 RB9023     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 559077 559078 RB9024 RB9026     FALSE 0.186 173.000 0.000 NA   NA
 559079 559080 RB9029 RB9030     FALSE 0.189 143.000 0.000 NA   NA
 559082 559083 RB9034 RB9037     TRUE 0.543 87.000 0.000 0.016   NA
 559084 559085 RB9038 RB9039     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 559085 559086 RB9039 RB9042     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559090 559091 RB9057 RB9058     FALSE 0.084 -124.000 0.000 NA   NA
 559092 559093 RB9063 RB9066     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 559093 559094 RB9066 RB9067     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 559099 559100 RB9075 RB9076   ybiT FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 559102 559103 RB9079 RB9080     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 559104 559105 RB9083 RB9084     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 559105 559106 RB9084 RB9087     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 559107 559108 RB9089 RB9090 pgl panB TRUE 0.570 64.000 0.000 1.000 N NA
 559108 559109 RB9090 RB9091 panB atsA TRUE 0.400 27.000 0.000 1.000 N NA
 559110 559111 RB9094 RB9096 hasC   TRUE 0.982 0.000 0.269 1.000   NA
 559112 559113 RB9100 RB9101     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 559113 559114 RB9101 RB9103   clpB FALSE 0.186 169.000 0.000 NA   NA
 559114 559115 RB9103 RB9104 clpB   FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 559115 559116 RB9104 RB9105   dnaK FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 559118 559119 RB9108 RB9109 moxR gyrB TRUE 0.443 -40.000 0.000 0.065   NA
 559119 559120 RB9109 RB9110 gyrB   TRUE 0.416 115.000 0.000 1.000   NA
 559121 559122 RB9112 RB9113   pfpI FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 559122 559123 RB9113 RB9114 pfpI   FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 559123 559124 RB9114 RB9115     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 559129 559130 RB9128 RB9130     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 559131 559132 RB9132 RB9133   ispD FALSE 0.265 17.000 0.000 1.000   NA
 559132 559133 RB9133 RB9134 ispD tyrS TRUE 0.969 -21.000 0.003 1.000 N NA
 559133 559134 RB9134 RB9136 tyrS xlnC TRUE 0.652 3.000 0.000 1.000 N NA
 559134 559135 RB9136 RB9141 xlnC rsmC TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000 N NA
 559135 559136 RB9141 RB9142 rsmC titin FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 559139 559140 RB9146 RB9149     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 559144 559145 RB9157 RB9159     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559147 559148 RB9161 RB9164     FALSE 0.261 29.000 0.000 1.000   NA
 559148 559149 RB9164 RB9167     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 559149 559150 RB9167 RB9168     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 559152 559153 RB9170 RB9174     FALSE 0.184 207.000 0.000 NA   NA
 559154 559155 RB9176 RB9180     FALSE 0.185 184.000 0.000 NA   NA
 559155 559156 RB9180 RB9183   exoF TRUE 0.974 0.000 1.000 NA   NA
 559156 559157 RB9183 RB9188 exoF lysA TRUE 0.590 82.000 0.000 1.000 N NA
 559157 559158 RB9188 RB9190 lysA   TRUE 0.430 37.000 0.000 1.000 N NA
 559158 559159 RB9190 RB9191     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 559160 559161 RB9192 RB9195 arsA   FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 559162 559163 RB9196 RB9197     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 559163 559164 RB9197 RB9198     FALSE 0.088 -108.000 0.000 NA   NA
 559165 559166 RB9199 RB9200   nagD FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 559166 559167 RB9200 RB9201 nagD   TRUE 0.401 236.000 0.000 1.000   NA
 559169 559170 RB9210 RB9212 nifS dnl1 FALSE 0.259 27.000 0.000 1.000   NA
 559172 559173 RB9216 RB9218 ank2   FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 559173 559174 RB9218 RB9220     FALSE 0.086 -115.000 0.000 NA   NA
 559176 559177 RB9226 RB9227     FALSE 0.075 -268.000 0.000 NA   NA
 559178 559179 RB9228 RB9230     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 559181 559182 RB9232 RB9233     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 559182 559183 RB9233 RB9235   noeI FALSE 0.185 189.000 0.000 NA   NA
 559183 559184 RB9235 RB9236 noeI   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559184 559185 RB9236 RB9237     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 559185 559186 RB9237 RB9238   fucT2 FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 559186 559187 RB9238 RB9239 fucT2   FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 559187 559188 RB9239 RB9241     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 559189 559190 RB9243 RB9245   waaQ FALSE 0.184 194.000 0.000 NA   NA
 559190 559191 RB9245 RB9249 waaQ   FALSE 0.253 22.000 0.000 1.000   NA
 559192 559193 RB9255 RB9256 gidA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559193 559194 RB9256 RB9260     FALSE 0.182 621.000 0.000 NA   NA
 559194 559195 RB9260 RB9261     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 559195 559196 RB9261 RB9262     FALSE 0.293 14.000 0.000 NA N NA
 559196 559197 RB9262 RB9266     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559197 559198 RB9266 RB9268   flbD FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 559198 559199 RB9268 RB9269 flbD pomA TRUE 0.951 19.000 0.042 NA Y NA
 559199 559200 RB9269 RB9271 pomA motB TRUE 0.991 0.000 0.058 1.000 Y NA
 559200 559201 RB9271 RB9273 motB   TRUE 0.961 10.000 0.600 1.000   NA
 559201 559202 RB9273 RB9275   fliN TRUE 0.941 17.000 0.026 0.000   NA
 559202 559203 RB9275 RB9276 fliN   TRUE 0.994 -3.000 0.090 1.000 Y NA
 559204 559205 RB9278 RB9280 phr pds TRUE 0.535 88.000 0.000 0.030   NA
 559205 559206 RB9280 RB9283 pds crtB TRUE 0.988 -3.000 0.222 1.000   NA
 559206 559207 RB9283 RB9284 crtB ctrB TRUE 0.996 -3.000 0.216 0.010 Y NA
 559209 559210 RB9289 RB9292   glgX FALSE 0.258 26.000 0.000 1.000   NA
 559210 559211 RB9292 RB9294 glgX   FALSE 0.187 156.000 0.000 NA   NA
 559213 559214 RB9298 RB9301     FALSE 0.184 210.000 0.000 NA   NA
 559215 559216 RB9304 RB9305 rpmE prfA TRUE 0.994 -3.000 0.110 1.000 Y NA
 559216 559217 RB9305 RB9306 prfA hemK TRUE 0.988 4.000 0.040 0.016 Y NA
 559217 559218 RB9306 RB9307 hemK   FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 559220 559221 RB9310 RB9311     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 559221 559222 RB9311 RB9313     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 559222 559223 RB9313 RB9315     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559224 559225 RB9317 RB9320     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 559225 559226 RB9320 RB9322     FALSE 0.188 153.000 0.000 NA   NA
 559227 559228 RB9324 RB9326     FALSE 0.188 149.000 0.000 NA   NA
 559228 559229 RB9326 RB9327     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 559229 559230 RB9327 RB9329     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 559230 559231 RB9329 RB9330     FALSE 0.198 72.000 0.000 NA   NA
 559231 559232 RB9330 RB9337     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 559232 559233 RB9337 RB9338   fae FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 559235 559236 RB9342 RB9343     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 559236 559237 RB9343 RB9344     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 559240 559241 RB9347 RB9348     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 559245 559246 RB9352 RB9353     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 559248 559249 RB9356 RB9359   rtcA FALSE 0.185 185.000 0.000 NA   NA
 559249 559250 RB9359 RB9360 rtcA rtcB TRUE 0.948 -22.000 0.020 NA   NA
 559251 559252 RB9364 RB9365 rtcR   FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 559253 559254 RB9366 RB9367   lolI FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 559254 559255 RB9367 RB9369 lolI   FALSE 0.185 185.000 0.000 NA   NA
 559255 559256 RB9369 RB9372   hisH FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 559256 559257 RB9372 RB9374 hisH recQ TRUE 0.561 249.000 0.000 1.000 N NA
 559257 559258 RB9374 RB9376 recQ   FALSE 0.256 19.000 0.000 1.000   NA
 559258 559259 RB9376 RB9380     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 559261 559262 RB9384 RB9385 rbsC rbsA TRUE 0.994 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 559262 559263 RB9385 RB9386 rbsA fixW TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559268 559269 RB9395 RB9399     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 559269 559270 RB9399 RB9401   miaB TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559270 559271 RB9401 RB9402 miaB   TRUE 0.411 140.000 0.000 1.000   NA
 559271 559272 RB9402 RB9404     TRUE 0.990 -3.000 0.057 0.003   NA
 559272 559273 RB9404 RB9405     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 559274 559275 RB9409 RB9410     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559276 559277 RB9411 RB9412     FALSE 0.103 -73.000 0.000 NA   NA
 559279 559280 RB9415 RB9417     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 559281 559282 RB9418 RB9420   msaB TRUE 0.651 94.000 0.000 0.064 N NA
 559282 559283 RB9420 RB9421 msaB   FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 559286 559287 RB9427 RB9428     TRUE 0.954 7.000 0.357 NA   NA
 559287 559288 RB9428 RB9431   cheY TRUE 0.989 -15.000 0.643 1.000 Y NA
 559288 559289 RB9431 RB9432 cheY   FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 559290 559291 RB9433 RB9434     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 559291 559292 RB9434 RB9435   pkn2 FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 559294 559295 RB9438 RB9439     TRUE 0.960 67.000 0.034 1.000   NA
 559295 559296 RB9439 RB9442     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559297 559298 RB9445 RB9447     FALSE 0.318 43.000 0.000 1.000   NA
 559298 559299 RB9447 RB9448     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 559299 559300 RB9448 RB9450     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 559301 559302 RBr03 RB9460     FALSE 0.189 143.000 0.000 NA   NA
 559302 559303 RB9460 RB9462     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 559304 559305 RB9463 RB9469     FALSE 0.183 412.000 0.000 NA   NA
 559305 559306 RB9469 RB9470   ppk FALSE 0.202 -165.000 0.000 1.000   NA
 559306 559307 RB9470 RB9472 ppk   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559307 559308 RB9472 RB9474     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559308 559309 RB9474 RB9477     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 559309 559310 RB9477 RB9478     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559311 559312 RB9480 RB9481     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 559314 559315 RB9484 RB9485     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 559316 559317 RB9486 RB9488     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 559317 559318 RB9488 RB9491     TRUE 0.981 -3.000 0.054 NA   NA
 559318 559319 RB9491 RB9493     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 559320 559321 RB9494 RB9495     FALSE 0.184 200.000 0.000 NA   NA
 559322 559323 RB9496 RB9498   arsA FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 559323 559324 RB9498 RB9499 arsA moxR TRUE 0.413 131.000 0.000 1.000   NA
 559324 559325 RB9499 RB9500 moxR   TRUE 0.949 7.000 0.087 NA   NA
 559325 559326 RB9500 RB9501     TRUE 0.982 -3.000 0.065 NA   NA
 559326 559327 RB9501 RB9502     FALSE 0.102 -75.000 0.000 NA   NA
 559327 559328 RB9502 RB9504     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559328 559329 RB9504 RB9505     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 559329 559330 RB9505 RB9506     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559332 559333 RB9512 RB9513     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 559333 559334 RB9513 RB9518     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 559336 559337 RB9522 RB9526     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 559337 559338 RB9526 RB9527     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 559342 559343 RB9532 RB9533   cls TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559343 559344 RB9533 RB9535 cls ykbA TRUE 0.417 35.000 0.000 1.000 N NA
 559345 559346 RB9536 RB9540     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 559347 559348 RB9541 RB9542 mexE mexF TRUE 0.980 4.000 0.854 1.000 N NA
 559351 559352 RB9546 RB9547     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 559354 559355 RB9550 RB9551   arsA FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 559355 559356 RB9551 RB9555 arsA arsD TRUE 0.966 63.000 0.250 1.000   NA
 559356 559357 RB9555 RB9556 arsD   FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 559357 559358 RB9556 RB9557     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 559359 559360 RB9561 RB9563 sigE   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559363 559364 RB9567 RB9569   mip FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 559365 559366 RB9570 RB9572 hyfR   TRUE 0.574 125.000 0.000 1.000 N NA
 559367 559368 RB9574 RB9577 fabG   FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 559371 559372 RB9584 RB9585     TRUE 0.979 82.000 0.125 NA Y NA
 559372 559373 RB9585 RB9586     TRUE 0.981 0.000 0.188 NA N NA
 559373 559374 RB9586 RB9587     TRUE 0.410 64.000 0.000 1.000   NA
 559376 559377 RB9591 RB9592     TRUE 0.983 -3.000 0.111 NA   NA
 559377 559378 RB9592 RB9593   butB FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 559378 559379 RB9593 RB9598 butB   TRUE 0.955 7.000 0.600 NA   NA
 559381 559382 RB9600 RB9604     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559382 559383 RB9604 RB9606     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 559383 559384 RB9606 RB9610   acrA1 FALSE 0.189 147.000 0.000 NA   NA
 559385 559386 RB9611 RB9612   syrD TRUE 0.842 -3.000 0.000 0.064 N NA
 559386 559387 RB9612 RB9613 syrD   FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 559387 559388 RB9613 RB9614   sur1 FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559388 559389 RB9614 RB9617 sur1 mtfB FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 559389 559390 RB9617 RB9619 mtfB   FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 559390 559391 RB9619 RB9620     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 559391 559392 RB9620 RB9623     FALSE 0.099 -78.000 0.000 NA   NA
 559392 559393 RB9623 RB9624     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559393 559394 RB9624 RB9625     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 559395 559396 RB9626 RB9627   mtfA FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 559397 559398 RB9629 RB9631 desC   FALSE 0.184 210.000 0.000 NA   NA
 559398 559399 RB9631 RB9635     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 559402 559403 RB9641 RB9642     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 559403 559404 RB9642 RB9643     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 559405 559406 RB9646 RB9648 aprF   TRUE 0.625 286.000 0.000 NA Y NA
 559406 559407 RB9648 RB9650     TRUE 0.404 168.000 0.000 NA N NA
 559407 559408 RB9650 RB9651     TRUE 0.421 -27.000 0.000 1.000   NA
 559409 559410 RB9653 RB9654   pta FALSE 0.193 112.000 0.000 NA   NA
 559410 559411 RB9654 RB9655 pta ackA TRUE 0.934 -69.000 0.185 1.000   NA
 559411 559412 RB9655 RB9657 ackA   TRUE 0.735 141.000 0.000 1.000 Y NA
 559413 559414 RB9658 RB9659     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 559414 559415 RB9659 RB9660     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 559416 559417 RB9661 RB9664 araC   FALSE 0.185 175.000 0.000 NA   NA
 559417 559418 RB9664 RB9666     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559419 559420 RB9668 RB9669     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 559420 559421 RB9669 RB9670     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 559422 559423 RB9673 RB9674   pepX FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 559425 559426 RB9679 RB9684     TRUE 0.984 -3.000 0.744 NA   NA
 559426 559427 RB9684 RB9685     TRUE 0.908 34.000 0.100 NA   NA
 559427 559428 RB9685 RB9687     FALSE 0.188 151.000 0.000 NA   NA
 559428 559429 RB9687 RB9689     TRUE 0.946 66.000 0.047 NA   NA
 559429 559430 RB9689 RB9690     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 559430 559431 RB9690 RB9692     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 559431 559432 RB9692 RB9693     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 559432 559433 RB9693 RB9696     FALSE 0.185 180.000 0.000 NA   NA
 559433 559434 RB9696 RB9698     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 559434 559435 RB9698 RB9699     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 559435 559436 RB9699 RB9700     TRUE 0.956 83.000 0.240 NA   NA
 559436 559437 RB9700 RB9702     TRUE 0.973 0.000 0.160 NA   NA
 559437 559438 RB9702 RB9704     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 559438 559439 RB9704 RB9707     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 559440 559441 RB9710 RB9713     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 559441 559442 RB9713 RB9717     FALSE 0.183 315.000 0.000 NA   NA
 559444 559445 RB9722 RB9724     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 559445 559446 RB9724 RB9725     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 559446 559447 RB9725 RB9728   rfaY TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559448 559449 RB9731 RB9732     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559451 559452 RB9737 RB9739     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 559453 559454 RB9740 RB9742     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 559454 559455 RB9742 RB9744     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559456 559457 RB9745 RB9747 pknB   FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 559457 559458 RB9747 RB9748     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559458 559459 RB9748 RB9751     TRUE 0.938 78.000 0.003 NA   NA
 559460 559461 RB9752 RB9755   arsA FALSE 0.183 364.000 0.000 NA   NA
 559461 559462 RB9755 RB9757 arsA   FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 559462 559463 RB9757 RB9758     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 559465 559466 RB9765 RB9766     TRUE 0.945 15.000 0.565 1.000   NA
 559468 559469 RB9768 RB9769     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 559469 559470 RB9769 RB9771     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559472 559473 RB9774 RBt43     FALSE 0.188 151.000 0.000 NA   NA
 559475 559476 RB9782 RB9784     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 559476 559477 RB9784 RB9786     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 559477 559478 RB9786 RB9787     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 559481 559482 RB9791 RB9792 radC   FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 559483 559484 RB9793 RB9794   glnB FALSE 0.184 233.000 0.000 NA   NA
 559484 559485 RB9794 RB9795 glnB asd TRUE 0.585 32.000 0.000 1.000 Y NA
 559485 559486 RB9795 RB9797 asd   FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 559486 559487 RB9797 RB9798     FALSE 0.186 170.000 0.000 NA   NA
 559487 559488 RB9798 RB9800     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 559489 559490 RB9801 RB9805     FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 559490 559491 RB9805 RB9806     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 559491 559492 RB9806 RB9808   comM FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 559494 559495 RB9810 RB9811     FALSE 0.103 -73.000 0.000 NA   NA
 559496 559497 RB9813 RB9817     FALSE 0.184 217.000 0.000 NA   NA
 559497 559498 RB9817 RB9821     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 559498 559499 RB9821 RB9823     TRUE 0.517 2.000 0.000 1.000   NA
 559499 559500 RB9823 RB9826     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 559502 559503 RB9830 RB9832     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 559504 559505 RB9834 RB9835 fwdA ffsA TRUE 0.991 -7.000 0.125 1.000 Y NA
 559505 559506 RB9835 RB9836 ffsA fwdC TRUE 0.995 -3.000 0.323 1.000 Y NA
 559507 559508 RB9838 RB9839     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 559509 559510 RB9840 RB9844 comE   FALSE 0.272 35.000 0.000 1.000   NA
 559510 559511 RB9844 RB9848   hemA TRUE 0.987 -3.000 0.112 1.000   NA
 559511 559512 RB9848 RB9849 hemA   FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 559512 559513 RB9849 RB9852   cnrH FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 559513 559514 RB9852 RB9854 cnrH pknB TRUE 0.984 8.000 0.600 1.000 Y NA
 559515 559516 RB9855 RB9857   metH FALSE 0.250 -76.000 0.000 1.000   NA
 559519 559520 RB9860 RB9861     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 559520 559521 RB9861 RB9863     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 559522 559523 RB9867 RB9869   ilvC FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 559523 559524 RB9869 RB9871 ilvC ilvN TRUE 0.988 62.000 0.130 0.001 Y NA
 559525 559526 RB9872 RB9874   ypuG FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559526 559527 RB9874 RB9875 ypuG   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559527 559528 RB9875 RB9876   hemN TRUE 0.968 2.000 0.004 1.000   NA
 559528 559529 RB9876 RB9877 hemN   FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 559529 559530 RB9877 RB9878     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 559532 559533 RB9882 RB9884 pam   TRUE 0.422 71.000 0.000 1.000   NA
 559533 559534 RB9884 RB9886     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 559534 559535 RB9886 RB9890   yjlD FALSE 0.190 141.000 0.000 NA   NA
 559535 559536 RB9890 RB9892 yjlD cydA TRUE 0.682 38.000 0.000 0.029 Y NA
 559536 559537 RB9892 RB9894 cydA cydB TRUE 0.996 -3.000 0.622 0.041 Y NA
 559538 559539 RB9895 RB9897     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 559541 559542 RB9900 RB9902     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559542 559543 RB9902 RB9903     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559543 559544 RB9903 RB9904     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 559545 559546 RB9905 RB9907     TRUE 0.575 23.000 0.000 1.000 Y NA
 559546 559547 RB9907 RB9908     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 559548 559549 RB9909 RB9911     FALSE 0.184 240.000 0.000 NA   NA
 559549 559550 RB9911 RB9913     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 559550 559551 RB9913 RBt44     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 559551 559552 RBt44 RB9916   rplI FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 559552 559553 RB9916 RB9917 rplI ssb TRUE 0.970 79.000 0.009 1.000 N NA
 559555 559556 RB9920 RB9922 rpsF pth TRUE 0.978 42.000 0.029 0.011 Y NA
 559556 559557 RB9922 RB9923 pth rplY TRUE 0.996 -3.000 0.496 0.011 Y NA
 559557 559558 RB9923 RB9926 rplY   FALSE 0.185 178.000 0.000 NA   NA
 559558 559559 RB9926 RB9927   clpX FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 559559 559560 RB9927 RB9930 clpX   TRUE 0.400 319.000 0.000 1.000   NA
 559560 559561 RB9930 RB9932     FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 559562 559563 RB9936 RB9937     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 559564 559565 RB9941 RB9942     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 559566 559567 RB9943 RB9945 cnt1   FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 559568 559569 RB9948 RB9950     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 559569 559570 RB9950 RB9952   surE TRUE 0.416 113.000 0.000 1.000   NA
 559570 559571 RB9952 RB9953 surE   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 559571 559572 RB9953 RB9955     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 559572 559573 RB9955 RB9957     TRUE 0.970 2.000 0.500 NA   NA
 559573 559574 RB9957 RB9959     FALSE 0.192 124.000 0.000 NA   NA
 559576 559577 RB9964 RB9966     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 559578 559579 RB9969 RB9971     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 559581 559582 RB9977 RB9979     FALSE 0.074 -306.000 0.000 NA   NA
 559585 559586 RB9983 RB9985 pmi   FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 559586 559587 RB9985 RB9986     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559587 559588 RB9986 RB9989     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 559590 559591 RB9992 RB9995     TRUE 0.989 94.000 0.266 0.000 Y NA
 559591 559592 RB9995 RB9998     TRUE 0.984 59.000 0.466 1.000 Y NA
 559592 559593 RB9998 RB9999     TRUE 0.940 46.000 0.018 NA N NA
 559594 559595 RB10002 RB10004 gcd serA TRUE 0.636 -16.000 0.000 1.000 N NA
 559595 559596 RB10004 RB10005 serA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559598 559599 RB10007 RB10009   cspG FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 559600 559601 RB10010 RB10014     TRUE 0.970 -9.000 1.000 NA   NA
 559602 559603 RB10018 RB10019     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 559605 559606 RB10021 RB10022     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 559606 559607 RB10022 RB10023     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 559608 559609 RB10024 RB10025     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 559609 559610 RB10025 RB10026     TRUE 0.984 -3.000 0.734 NA   NA
 559610 559611 RB10026 RB10027     TRUE 0.954 176.000 0.667 NA   NA
 559611 559612 RB10027 RB10028     TRUE 0.981 -3.000 0.041 NA   NA
 559612 559613 RB10028 RB10030     TRUE 0.918 16.000 0.805 NA   NA
 559613 559614 RB10030 RB10032     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 559614 559615 RB10032 RB10033     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 559616 559617 RB10035 RB10036     FALSE 0.096 -84.000 0.000 NA   NA
 559617 559618 RB10036 RB10038     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 559619 559620 RB10039 RB10040   mtrA FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 559624 559625 RB10045 RB10046     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 559628 559629 RB10049 RB10051     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559629 559630 RB10051 RB10053     TRUE 0.952 65.000 1.000 NA   NA
 559632 559633 RB10060 RB10061     TRUE 0.419 97.000 0.000 1.000   NA
 559636 559637 RB10067 RB10069     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 559637 559638 RB10069 RB10074     FALSE 0.184 204.000 0.000 NA   NA
 559639 559640 RB10075 RB10077     FALSE 0.187 158.000 0.000 NA   NA
 559641 559642 RB10078 RB10081     TRUE 0.421 91.000 0.000 1.000   NA
 559643 559644 RB10085 RB10088     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 559648 559649 RB10097 RB10098     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 559649 559650 RB10098 RB10099     FALSE 0.193 113.000 0.000 NA   NA
 559650 559651 RB10099 RB10100     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559651 559652 RB10100 RB10103     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 559653 559654 RB10105 RB10106   cutA FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 559654 559655 RB10106 RB10107 cutA   FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 559656 559657 RB10108 RB10109 dnaN   TRUE 0.977 -3.000 0.006 NA   NA
 559657 559658 RB10109 RB10112   hisF FALSE 0.183 303.000 0.000 NA   NA
 559658 559659 RB10112 RB10113 hisF purH TRUE 0.576 115.000 0.000 1.000 N NA
 559659 559660 RB10113 RB10114 purH trpC TRUE 0.930 19.000 0.002 1.000 N NA
 559660 559661 RB10114 RB10115 trpC   FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 559661 559662 RB10115 RB10116   arsA FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 559662 559663 RB10116 RB10117 arsA atsG TRUE 0.804 -24.000 0.000 0.015 Y NA
 559664 559665 RB10119 RB10120 pknB rpoE TRUE 0.488 -15.000 0.000 1.000   NA
 559666 559667 RB10123 RB10124     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 559667 559668 RB10124 RB10125     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 559668 559669 RB10125 RB10126     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 559670 559671 RB10127 RB10129   mip TRUE 0.655 -13.000 0.000 1.000 N NA
 559671 559672 RB10129 RB10133 mip pknH TRUE 0.560 385.000 0.000 1.000 N NA
 559672 559673 RB10133 RB10134 pknH   FALSE 0.393 21.000 0.000 1.000 N NA
 559673 559674 RB10134 RB10135     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 559676 559677 RB10137 RB10138     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 559677 559678 RB10138 RB10139     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 559681 559682 RB10142 RB10144     FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 559683 559684 RB10145 RB10146     FALSE 0.103 -73.000 0.000 NA   NA
 559684 559685 RB10146 RB10148     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 559685 559686 RB10148 RB10149   1959133 FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 559686 559687 RB10149 RB10157 1959133   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559689 559690 RB10160 RB10164 pknB   FALSE 0.366 10.000 0.000 1.000   NA
 559690 559691 RB10164 RB10165     TRUE 0.416 68.000 0.000 1.000   NA
 559691 559692 RB10165 RB10167     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 559692 559693 RB10167 RB10168     FALSE 0.092 -94.000 0.000 NA   NA
 559695 559696 RB10172 RB10175     FALSE 0.188 154.000 0.000 NA   NA
 559696 559697 RB10175 RB10176     FALSE 0.089 -103.000 0.000 NA   NA
 559698 559699 RB10177 RB10178     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 559699 559700 RB10178 RB10179     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 559700 559701 RB10179 RB10180     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 559701 559702 RB10180 RB10181   rbsA FALSE 0.345 -123.000 0.000 1.000 N NA
 559703 559704 RB10182 RB10184     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559704 559705 RB10184 RB10188   upp TRUE 0.402 190.000 0.000 1.000   NA
 559705 559706 RB10188 RB10192 upp pyrC TRUE 0.738 124.000 0.000 1.000 Y NA
 559706 559707 RB10192 RB10194 pyrC   FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 559707 559708 RB10194 RB10195     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 559708 559709 RB10195 RB10196     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 559709 559710 RB10196 RB10199     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 559710 559711 RB10199 RB10200     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 559712 559713 RB10202 RB10204     FALSE 0.185 181.000 0.000 NA   NA
 559713 559714 RB10204 RB10206   atpB FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 559714 559715 RB10206 RB10208 atpB   FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 559715 559716 RB10208 RB10209   atpE FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 559716 559717 RB10209 RB10211 atpE atpF TRUE 0.978 -46.000 0.013 0.003 Y NA
 559717 559718 RB10211 RB10213 atpF atpD TRUE 0.984 11.000 0.222 0.003 Y NA
 559718 559719 RB10213 RB10215 atpD atpA TRUE 0.989 75.000 0.864 0.003 Y NA
 559719 559720 RB10215 RB10216 atpA atpG TRUE 0.976 22.000 0.846 0.003 Y NA
 559720 559721 RB10216 RB10217 atpG atpB TRUE 0.989 150.000 0.724 0.003 Y NA
 559721 559722 RB10217 RB10219 atpB atpE TRUE 0.990 4.000 0.837 0.003 Y NA
 559724 559725 RB10221 RB10223     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 559725 559726 RB10223 RB10224     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 559726 559727 RB10224 RB10226     TRUE 0.568 -22.000 0.000 0.008   NA
 559728 559729 RB10227 RB10228 hofB pilT TRUE 0.987 1.000 0.188 NA Y NA
 559730 559731 RB10231 RB10232 pyn yidJ TRUE 0.590 81.000 0.000 1.000 N NA
 559731 559732 RB10232 RB10235 yidJ   TRUE 0.638 224.000 0.000 0.047 N NA
 559732 559733 RB10235 RB10238     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 559733 559734 RB10238 RB10240     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 559736 559737 RB10243 RB10245   dhlA TRUE 0.948 77.000 0.036 NA   NA
 559737 559738 RB10245 RB10246 dhlA   TRUE 0.921 -46.000 0.029 NA   NA
 559740 559741 RB10252 RB10255     TRUE 0.417 110.000 0.000 1.000   NA
 559741 559742 RB10255 RB10256     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 559742 559743 RB10256 RB10258   surE FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 559744 559745 RB10261 RB10263 csrA   FALSE 0.184 198.000 0.000 NA   NA
 559745 559746 RB10263 RB10264   eIF-2B FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 559746 559747 RB10264 RB10266 eIF-2B   FALSE 0.261 31.000 0.000 1.000   NA
 559747 559748 RB10266 RB10269     FALSE 0.183 299.000 0.000 NA   NA
 559748 559749 RB10269 RB10270   crtI FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 559749 559750 RB10270 RB10271 crtI rnH TRUE 0.579 102.000 0.000 1.000 N NA
 559750 559751 RB10271 RB10272 rnH   TRUE 0.579 104.000 0.000 1.000 N NA
 559751 559752 RB10272 RB10275   bioB TRUE 0.672 2.000 0.000 1.000 N NA
 559752 559753 RB10275 RB10276 bioB   FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 559754 559755 RB10277 RB10279 pykA hsp20 FALSE 0.399 274.000 0.000 NA N NA
 559755 559756 RB10279 RB10283 hsp20 hsp20 TRUE 0.631 164.000 0.000 NA Y NA
 559757 559758 RB10286 RB10287     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 559758 559759 RB10287 RB10290     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 559761 559762 RB10295 RB10297 mtdA fae TRUE 0.410 64.000 0.000 1.000   NA
 559765 559766 RB10305 RB10307   gly1 FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 559766 559767 RB10307 RB10308 gly1   TRUE 0.590 82.000 0.000 1.000 N NA
 559768 559769 RB10309 RB10310 xylE nuoM TRUE 0.595 5.000 0.000 1.000 N NA
 559769 559770 RB10310 RB10313 nuoM ndhF TRUE 0.961 13.000 0.320 0.001   NA
 559770 559771 RB10313 RB10314 ndhF   TRUE 0.984 -3.000 0.348 NA   NA
 559772 559773 RB10319 RB10322     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 559773 559774 RB10322 RB10323   atoC TRUE 0.995 -3.000 0.077 0.061 Y NA
 559774 559775 RB10323 RB10324 atoC   FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 559775 559776 RB10324 RB10326     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 559776 559777 RB10326 RB10327   sui1 TRUE 0.402 28.000 0.000 1.000 N NA
 559778 559779 RB10328 RB10329     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 559779 559780 RB10329 RB10330     TRUE 0.918 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 559780 559781 RB10330 RB10332     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 559781 559782 RB10332 RB10333     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 559782 559783 RB10333 RB10335   uppS TRUE 0.590 81.000 0.000 1.000 N NA
 559783 559784 RB10335 RB10338 uppS flbA TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 559784 559785 RB10338 RB10339 flbA rpdD TRUE 0.711 0.000 0.000 1.000 N NA
 559788 559789 RB10343 RB10344     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 559789 559790 RB10344 RB10345     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 559791 559792 RB10346 RB10347     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 559792 559793 RB10347 RB10350     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 559794 559795 RB10354 RB10357     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559797 559798 RB10359 RB10361     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 559798 559799 RB10361 RB10362     FALSE 0.081 -142.000 0.000 NA   NA
 559799 559800 RB10362 RB10364     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 559800 559801 RB10364 RB10367     TRUE 0.522 89.000 0.000 0.061   NA
 559802 559803 RB10370 RB10372     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 559803 559804 RB10372 RB10374   lspA TRUE 0.759 -3.000 0.000 0.046   NA
 559804 559805 RB10374 RB10378 lspA trxA TRUE 0.569 147.000 0.000 1.000 N NA
 559805 559806 RB10378 RB10380 trxA   FALSE 0.185 183.000 0.000 NA   NA
 559806 559807 RB10380 RB10384     FALSE 0.183 302.000 0.000 NA   NA
 559807 559808 RB10384 RB10385     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 559809 559810 RB10386 RB10388     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 559810 559811 RB10388 RB10391     TRUE 0.963 -19.000 0.500 NA   NA
 559812 559813 RB10392 RB10395 upK smuG1 FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 559813 559814 RB10395 RB10396 smuG1   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559814 559815 RB10396 RB10397     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 559819 559820 RB10404 RB10406     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 559821 559822 RB10409 RB10410     FALSE 0.184 207.000 0.000 NA   NA
 559822 559823 RB10410 RB10412     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559827 559828 RB10420 RB10423     TRUE 0.928 42.000 0.154 NA   NA
 559829 559830 RB10427 RB10428     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 559830 559831 RB10428 RB10430     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 559831 559832 RB10430 RB10431     FALSE 0.096 -85.000 0.000 NA   NA
 559832 559833 RB10431 RB10433     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 559833 559834 RB10433 RB10434     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 559834 559835 RB10434 RB10436     TRUE 0.757 -37.000 0.000 0.010 Y NA
 559835 559836 RB10436 RB10439   amsG TRUE 0.742 70.000 0.000 1.000 Y NA
 559837 559838 RB10440 RB10441     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 559840 559841 RB10445 RB10446     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559841 559842 RB10446 RB10451     TRUE 0.621 4.000 0.000 1.000 N NA
 559842 559843 RB10451 RB10454   chcA TRUE 0.764 -7.000 0.000 0.028 N NA
 559843 559844 RB10454 RB10456 chcA   FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 559845 559846 RB10458 RB10459 grp hemY TRUE 0.419 97.000 0.000 1.000   NA
 559846 559847 RB10459 RB10460 hemY   FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 559848 559849 RB10462 RB10463   fpr FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 559849 559850 RB10463 RB10465 fpr glgC TRUE 0.582 71.000 0.000 1.000 N NA
 559851 559852 RB10466 RB10468 fabZ infA TRUE 0.402 188.000 0.000 NA N NA
 559852 559853 RB10468 RB10469 infA rpsI TRUE 0.639 13.000 0.000 1.000 Y NA
 559853 559854 RB10469 RB10471 rpsI rplM TRUE 0.983 43.000 0.601 0.007 Y NA
 559854 559855 RB10471 RB10472 rplM   FALSE 0.191 128.000 0.000 NA   NA
 559856 559857 RB10473 RB10478     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 559857 559858 RB10478 RB10479     TRUE 0.970 78.000 0.667 1.000   NA
 559858 559859 RB10479 RB10481     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 559859 559860 RB10481 RB10483     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 559860 559861 RB10483 RB10487   recQ FALSE 0.190 141.000 0.000 NA   NA
 559862 559863 RB10488 RB10491   cheY TRUE 0.638 -79.000 0.000 0.011 Y NA
 559866 559867 RB10500 RB10501 pgk   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559867 559868 RB10501 RB10503     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 559868 559869 RB10503 RB10507     TRUE 0.401 222.000 0.000 1.000   NA
 559870 559871 RB10508 RB10510 cinA cmk TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559871 559872 RB10510 RB10512 cmk   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559872 559873 RB10512 RB10515     TRUE 0.917 -49.000 0.029 NA   NA
 559873 559874 RB10515 RB10517   yeaC TRUE 0.954 7.000 0.739 NA   NA
 559874 559875 RB10517 RB10518 yeaC   FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 559876 559877 RB10519 RB10521 dprA   FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 559877 559878 RB10521 RB10524     FALSE 0.189 145.000 0.000 NA   NA
 559878 559879 RB10524 RB10530     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559879 559880 RB10530 RB10531     FALSE 0.198 72.000 0.000 NA   NA
 559881 559882 RB10533 RB10535 sun   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559882 559883 RB10535 RB10536   spoVG FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 559883 559884 RB10536 RB10537 spoVG ispE TRUE 0.961 10.000 0.012 1.000 N NA
 559884 559885 RB10537 RB10538 ispE   FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 559885 559886 RB10538 RB10539   lpdX TRUE 0.891 33.000 0.018 NA   NA
 559887 559888 RB10541 RB10547   glyS TRUE 0.576 116.000 0.000 1.000 N NA
 559888 559889 RB10547 RB10548 glyS   FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 559891 559892 RB10551 RB10552     FALSE 0.096 -87.000 0.000 NA   NA
 559892 559893 RB10552 RB10553   sdhC FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 559893 559894 RB10553 RB10554 sdhC sdhA TRUE 0.982 42.000 0.179 0.000 Y NA
 559894 559895 RB10554 RB10555 sdhA sdhB TRUE 0.989 89.000 0.231 0.000 Y NA
 559895 559896 RB10555 RB10556 sdhB   TRUE 0.536 1.000 0.000 1.000   NA
 559897 559898 RB10558 RB10560     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559900 559901 RB10566 RB10567 gntP ate1 TRUE 0.479 45.000 0.000 1.000 N NA
 559901 559902 RB10567 RB10569 ate1   FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 559902 559903 RB10569 RB10570     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 559908 559909 RB10580 RB10581     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 559909 559910 RB10581 RB10583     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 559910 559911 RB10583 RB10586   pepQ TRUE 0.417 110.000 0.000 1.000   NA
 559911 559912 RB10586 RB10587 pepQ   TRUE 0.488 -15.000 0.000 1.000   NA
 559912 559913 RB10587 RB10589     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 559913 559914 RB10589 RB10590     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559915 559916 RB10591 RB10592 pfk pyc TRUE 0.562 204.000 0.000 1.000 N NA
 559916 559917 RB10592 RB10593 pyc   FALSE 0.189 143.000 0.000 NA   NA
 559917 559918 RB10593 RB10595     FALSE 0.110 -66.000 0.000 NA   NA
 559918 559919 RB10595 RB10596     FALSE 0.077 -189.000 0.000 NA   NA
 559919 559920 RB10596 RB10599   arsB FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 559920 559921 RB10599 RB10601 arsB   FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 559924 559925 RB10608 RB10612     TRUE 0.404 178.000 0.000 1.000   NA
 559926 559927 RB10614 RB10616     TRUE 0.406 33.000 0.000 1.000 N NA
 559928 559929 RB10617 RB10619 sucC sucD TRUE 0.986 120.000 0.016 0.000 Y NA
 559930 559931 RB10620 RB10621     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 559931 559932 RB10621 RB10623     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 559933 559934 RB10627 RB10629 groES groEL TRUE 0.989 71.000 0.875 0.004 Y NA
 559934 559935 RB10629 RB10630 groEL   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559935 559936 RB10630 RB10631     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 559936 559937 RB10631 RB10634     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559937 559938 RB10634 RB10637     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 559938 559939 RB10637 RB10638   rpsB FALSE 0.183 383.000 0.000 NA   NA
 559939 559940 RB10638 RB10640 rpsB tsf TRUE 0.981 51.000 0.748 1.000 Y NA
 559941 559942 RB10641 RB10644   flgK TRUE 0.672 2.000 0.000 1.000 N NA
 559942 559943 RB10644 RB10648 flgK   FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 559944 559945 RB10650 RB10652 trpB   TRUE 0.579 97.000 0.000 1.000 N NA
 559945 559946 RB10652 RB10653   nifS TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 559946 559947 RB10653 RB10654 nifS coaD TRUE 0.570 7.000 0.000 1.000 N NA
 559947 559948 RB10654 RB10655 coaD   TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 559949 559950 RB10656 RB10657     FALSE 0.185 187.000 0.000 NA   NA
 559950 559951 RB10657 RB10659   yahN TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559951 559952 RB10659 RB10663 yahN   TRUE 0.952 -57.000 0.035 1.000 N NA
 559954 559955 RB10666 RB10668     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 559955 559956 RB10668 RB10670     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 559956 559957 RB10670 RB10672     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559957 559958 RB10672 RB10673     FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 559958 559959 RB10673 RB10674     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559959 559960 RB10674 RB10675     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 559961 559962 RB10678 RB10679     FALSE 0.193 114.000 0.000 NA   NA
 559963 559964 RB10680 RB10682     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 559965 559966 RB10683 RB10686     FALSE 0.183 304.000 0.000 NA   NA
 559969 559970 RB10689 RB10690     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 559974 559975 RB10697 RB10698     FALSE 0.190 137.000 0.000 NA   NA
 559976 559977 RB10699 RB10700   tolQ FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 559977 559978 RB10700 RB10702 tolQ   TRUE 0.994 0.000 0.385 0.018 Y NA
 559978 559979 RB10702 RB10704   exbD TRUE 0.989 75.000 0.385 0.012 Y NA
 559979 559980 RB10704 RB10706 exbD   TRUE 0.968 113.000 0.600 1.000   NA
 559980 559981 RB10706 RB10709     TRUE 0.965 6.000 0.080 1.000   NA
 559981 559982 RB10709 RB10710     TRUE 0.972 -18.000 0.160 1.000   NA
 559985 559986 RB10714 RB10716     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 559986 559987 RB10716 RB10719     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 559988 559989 RB10721 RB10727     TRUE 0.570 146.000 0.000 1.000 N NA
 559989 559990 RB10727 RB10728     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 559990 559991 RB10728 RB10729     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 559991 559992 RB10729 RB10730     FALSE 0.184 207.000 0.000 NA   NA
 559992 559993 RB10730 RB10731     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 559993 559994 RB10731 RB10733   fdh TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 559994 559995 RB10733 RB10734 fdh   TRUE 0.419 99.000 0.000 1.000   NA
 559995 559996 RB10734 RB10735     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 559997 559998 RB10736 RB10740     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 559998 559999 RB10740 RB10741     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 559999 560000 RB10741 RB10742     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 560001 560002 RB10743 RB10745     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 560008 560009 RB10753 RB10754     FALSE 0.105 -70.000 0.000 NA   NA
 560010 560011 RB10755 RB10757     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 560011 560012 RB10757 RB10761     FALSE 0.091 -99.000 0.000 NA   NA
 560012 560013 RB10761 RB10763     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560013 560014 RB10763 RB10764     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560016 560017 RB10767 RB10768 hsdS hsdM TRUE 0.996 -3.000 0.133 0.033 Y NA
 560017 560018 RB10768 RB10770 hsdM hsdR TRUE 0.976 22.000 0.567 0.033 Y NA
 560019 560020 RB10772 RB10774     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 560020 560021 RB10774 RB10775     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 560022 560023 RB10776 RB10778     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 560023 560024 RB10778 RB10780     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560024 560025 RB10780 RB10783     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 560025 560026 RB10783 RB10785     FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 560026 560027 RB10785 RBt46     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 560027 560028 RBt46 RB10787     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 560028 560029 RB10787 RB10789     FALSE 0.313 -51.000 0.000 NA N NA
 560029 560030 RB10789 RB10790   fabI TRUE 0.488 47.000 0.000 1.000 N NA
 560031 560032 RB10793 RB10797     FALSE 0.185 181.000 0.000 NA   NA
 560032 560033 RB10797 RB10799     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560033 560034 RB10799 RB10801     TRUE 0.886 -165.000 0.625 NA   NA
 560034 560035 RB10801 RB10805     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 560035 560036 RB10805 RB10806     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 560037 560038 RB10808 RB10810     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 560038 560039 RB10810 RB10814     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 560039 560040 RB10814 RB10816   holB FALSE 0.184 224.000 0.000 NA   NA
 560040 560041 RB10816 RB10817 holB rpiB TRUE 0.621 4.000 0.000 1.000 N NA
 560041 560042 RB10817 RB10818 rpiB   TRUE 0.621 4.000 0.000 1.000 N NA
 560043 560044 RB10820 RB10821     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560046 560047 RB10824 RB10825     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560047 560048 RB10825 RB10826   clpP FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 560048 560049 RB10826 RB10829 clpP clpP TRUE 0.987 59.000 0.118 0.000 Y NA
 560049 560050 RB10829 RBt47 clpP   FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 560050 560051 RBt47 RB10832     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 560055 560056 RB10841 RB10844 celD   FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 560057 560058 RB10845 RB10848     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560058 560059 RB10848 RB10851     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560059 560060 RB10851 RB10852   gatB FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 560060 560061 RB10852 RB10853 gatB   TRUE 0.414 67.000 0.000 NA N NA
 560061 560062 RB10853 RB10855     TRUE 0.986 -3.000 0.031 NA N NA
 560062 560063 RB10855 RB10858     TRUE 0.798 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 560063 560064 RB10858 RB10860     FALSE 0.186 166.000 0.000 NA   NA
 560065 560066 RB10861 RB10862     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 560066 560067 RB10862 RB10864     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560070 560071 RB10868 RB10871     FALSE 0.091 -97.000 0.000 NA   NA
 560071 560072 RB10871 RB10874     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 560072 560073 RB10874 RB10875     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560073 560074 RB10875 RB10876   uvrA FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 560074 560075 RB10876 RB10877 uvrA   TRUE 0.976 -3.000 0.003 NA   NA
 560075 560076 RB10877 RB10878   pgsA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560076 560077 RB10878 RB10880 pgsA   TRUE 0.954 48.000 0.006 1.000 N NA
 560077 560078 RB10880 RB10881     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560080 560081 RB10884 RB10886     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 560081 560082 RB10886 RB10887     TRUE 0.925 11.000 0.029 NA   NA
 560082 560083 RB10887 RB10890     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 560084 560085 RB10891 RB10892     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 560085 560086 RB10892 RB10893     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 560090 560091 RB10898 RB10902     FALSE 0.188 153.000 0.000 NA   NA
 560092 560093 RB10905 RB10907     TRUE 0.558 5.000 0.000 0.012   NA
 560095 560096 RB10911 RB10916     TRUE 0.785 -3.000 0.000 0.001   NA
 560098 560099 RB10920 RB10921     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 560099 560100 RB10921 RB10922     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 560102 560103 RB10924 RB10926     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 560106 560107 RB10931 RB10932     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 560107 560108 RB10932 RB10934     TRUE 0.955 66.000 0.667 NA   NA
 560108 560109 RB10934 RB10936     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 560111 560112 RB10939 RB10940     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 560113 560114 RB10942 RB10944 ogt   FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 560115 560116 RB10945 RB10948     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 560116 560117 RB10948 RB10950     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 560118 560119 RB10951 RB10954     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 560120 560121 RB10956 RB10957     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 560121 560122 RB10957 RB10958     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 560122 560123 RB10958 RB10960     FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 560123 560124 RB10960 RB10965   gufA FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 560125 560126 RB10966 RB10967     TRUE 0.430 81.000 0.000 1.000   NA
 560126 560127 RB10967 RB10968   gabD TRUE 0.969 4.000 0.069 1.000   NA
 560127 560128 RB10968 RB10971 gabD dltE TRUE 0.536 78.000 0.000 0.045   NA
 560128 560129 RB10971 RB10973 dltE   FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560130 560131 RB10974 RB10978   sugE FALSE 0.183 252.000 0.000 NA   NA
 560132 560133 RB10979 RB10980     FALSE 0.193 113.000 0.000 NA   NA
 560134 560135 RB10981 RB10984 mtrC acrD TRUE 0.988 -3.000 1.000 NA N NA
 560137 560138 RB10987 RB10989     FALSE 0.261 30.000 0.000 1.000   NA
 560138 560139 RB10989 RB10991     TRUE 0.401 237.000 0.000 1.000   NA
 560141 560142 RB10993 RB10995 sigG   TRUE 0.985 64.000 0.667 1.000 Y NA
 560142 560143 RB10995 RB10996     TRUE 0.548 57.000 0.000 1.000 N NA
 560143 560144 RB10996 RB10998     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 560144 560145 RB10998 RB10999   cft TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560146 560147 RB11000 RB11001     TRUE 0.973 -7.000 0.333 NA   NA
 560147 560148 RB11001 RB11003   celP TRUE 0.953 7.000 0.222 NA   NA
 560150 560151 RB11009 RB11010 piuB   TRUE 0.987 -3.000 0.062 1.000   NA
 560151 560152 RB11010 RB11011     TRUE 0.984 -3.000 0.808 NA   NA
 560152 560153 RB11011 RB11013     TRUE 0.910 19.000 0.848 NA   NA
 560153 560154 RB11013 RB11015     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 560154 560155 RB11015 RB11016     FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 560155 560156 RB11016 RB11019     FALSE 0.105 -70.000 0.000 NA   NA
 560156 560157 RB11019 RB11021     FALSE 0.192 124.000 0.000 NA   NA
 560157 560158 RB11021 RB11023     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 560160 560161 RB11027 RB11030     TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 560162 560163 RB11031 RB11033     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 560164 560165 RB11036 RB11037 ntrC ntrB TRUE 0.983 8.000 0.017 0.059 Y NA
 560166 560167 RB11041 RB11043     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 560168 560169 RB11047 RB11049     FALSE 0.254 -73.000 0.000 1.000   NA
 560169 560170 RB11049 RB11050   nptA FALSE 0.307 13.000 0.000 1.000   NA
 560170 560171 RB11050 RB11052 nptA   FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 560171 560172 RB11052 RB11055     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 560174 560175 RB11062 RB11063   sul1 FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 560177 560178 RB11067 RB11069   nhaP FALSE 0.184 209.000 0.000 NA   NA
 560180 560181 RB11072 RB11073 acrB acrA TRUE 0.952 -63.000 0.080 1.000 N NA
 560181 560182 RB11073 RB11075 acrA marR TRUE 0.576 116.000 0.000 1.000 N NA
 560182 560183 RB11075 RB11077 marR   TRUE 0.629 177.000 0.000 NA Y NA
 560184 560185 RB11079 RB11080     FALSE 0.084 -130.000 0.000 NA   NA
 560185 560186 RB11080 RB11081     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 560188 560189 RB11084 RB11088     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 560190 560191 RB11090 RB11091 cyaA   TRUE 0.687 38.000 0.000 0.013 Y NA
 560191 560192 RB11091 RB11095     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 560195 560196 RB11101 RB11104     TRUE 0.967 -15.000 0.429 NA   NA
 560205 560206 RB11118 RB11119     TRUE 0.983 -3.000 0.151 NA   NA
 560208 560209 RB11122 RB11123   aslA FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 560209 560210 RB11123 RB11127 aslA ids TRUE 0.787 155.000 0.000 0.014 Y NA
 560211 560212 RB11130 RB11131     FALSE 0.088 -108.000 0.000 NA   NA
 560214 560215 RB11133 RB11135   rpoE TRUE 0.416 114.000 0.000 1.000   NA
 560215 560216 RB11135 RB11136 rpoE   TRUE 0.586 -69.000 0.000 1.000 Y NA
 560216 560217 RB11136 RB11137     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 560217 560218 RB11137 RB11142     FALSE 0.184 220.000 0.000 NA   NA
 560220 560221 RB11146 RB11147   arsC TRUE 0.571 140.000 0.000 1.000 N NA
 560223 560224 RB11150 RB11151   yjgB TRUE 0.429 76.000 0.000 1.000   NA
 560225 560226 RB11152 RB11154 czcA   TRUE 0.988 -3.000 0.909 NA N NA
 560226 560227 RB11154 RB11155   ibeB TRUE 0.981 -55.000 0.429 0.044 Y NA
 560227 560228 RB11155 RB11156 ibeB   FALSE 0.254 20.000 0.000 1.000   NA
 560228 560229 RB11156 RB11157   arsC TRUE 0.540 72.000 0.000 0.019   NA
 560229 560230 RB11157 RB11160 arsC   TRUE 0.421 91.000 0.000 1.000   NA
 560230 560231 RB11160 RB11162     TRUE 0.536 1.000 0.000 1.000   NA
 560231 560232 RB11162 RB11165   nrfA FALSE 0.369 53.000 0.000 1.000   NA
 560232 560233 RB11165 RB11167 nrfA nrfC TRUE 0.980 70.000 0.072 0.000 N NA
 560233 560234 RB11167 RB11168 nrfC moaB TRUE 0.401 209.000 0.000 NA N NA
 560235 560236 RB11169 RB11171   merR TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560236 560237 RB11171 RB11173 merR   FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 560238 560239 RB11174 RB11176     FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 560240 560241 RB11177 RB11179   uspA FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 560241 560242 RB11179 RB11181 uspA   FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 560243 560244 RB11183 RB11184 uspA   FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 560244 560245 RB11184 RB11185   uspA FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 560245 560246 RB11185 RB11186 uspA sasR TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 560246 560247 RB11186 RB11190 sasR   FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 560251 560252 RB11199 RB11201   rcp1 FALSE 0.182 555.000 0.000 NA   NA
 560252 560253 RB11201 RB11203 rcp1 cph1 TRUE 0.445 -46.000 0.000 0.013   NA
 560253 560254 RB11203 RB11204 cph1   FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 560254 560255 RB11204 RB11205   merA FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 560255 560256 RB11205 RB11207 merA   FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 560257 560258 RB11208 RB11209     FALSE 0.073 -330.000 0.000 NA   NA
 560260 560261 RB11211 RB11216 yjhQ   TRUE 0.411 139.000 0.000 1.000   NA
 560262 560263 RB11217 RB11219     TRUE 0.956 64.000 0.015 NA N NA
 560263 560264 RB11219 RB11221     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 560264 560265 RB11221 RB11222     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 560266 560267 RB11223 RB11225 arsR   TRUE 0.966 112.000 0.200 NA N NA
 560267 560268 RB11225 RB11226     FALSE 0.104 -72.000 0.000 NA   NA
 560268 560269 RB11226 RB11227     TRUE 0.932 30.000 0.130 1.000   NA
 560271 560272 RB11230 RB11231 bfr   FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 560274 560275 RB11235 RB11236     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 560275 560276 RB11236 RB11238   czcB FALSE 0.190 137.000 0.000 NA   NA
 560276 560277 RB11238 RB11240 czcB czcA TRUE 0.992 -3.000 0.529 1.000 N NA
 560277 560278 RB11240 RB11242 czcA sigE TRUE 0.585 73.000 0.000 1.000 N NA
 560278 560279 RB11242 RB11244 sigE   TRUE 0.988 -18.000 1.000 1.000 Y NA
 560280 560281 RB11245 RB11247     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560281 560282 RB11247 RB11248     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560282 560283 RB11248 RB11249     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 560285 560286 RB11253 RB11255 pgsA   TRUE 0.785 -3.000 0.000 0.001   NA
 560286 560287 RB11255 RB11258     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560287 560288 RB11258 RB11260   dksA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560288 560289 RB11260 RB11262 dksA   TRUE 0.579 105.000 0.000 1.000 N NA
 560292 560293 RB11269 RB11271     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 560293 560294 RB11271 RB11273   bcr FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 560294 560295 RB11273 RB11276 bcr   TRUE 0.405 169.000 0.000 1.000   NA
 560295 560296 RB11276 RB11279     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 560300 560301 RB11284 RB11286   tspO FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 560301 560302 RB11286 RB11287 tspO   FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 560302 560303 RB11287 RB11288     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 560303 560304 RB11288 RB11289     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 560304 560305 RB11289 RB11291     FALSE 0.186 172.000 0.000 NA   NA
 560306 560307 RB11292 RB11293     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 560311 560312 RB11299 RB11300     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 560315 560316 RB11305 RB11307     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 560318 560319 RB11309 RB11310     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 560319 560320 RB11310 RB11311     FALSE 0.076 -214.000 0.000 NA   NA
 560320 560321 RB11311 RB11312     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560322 560323 RB11313 RB11314 lexA   FALSE 0.183 292.000 0.000 NA   NA
 560325 560326 RB11318 RB11319     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 560326 560327 RB11319 RB11320     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 560327 560328 RB11320 RB11321   afsR-g FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 560328 560329 RB11321 RB11323 afsR-g   TRUE 0.434 43.000 0.000 0.012   NA
 560329 560330 RB11323 RB11325     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 560331 560332 RB11328 RB11329 iuvY   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560332 560333 RB11329 RB11331     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 560333 560334 RB11331 RB11334     FALSE 0.362 52.000 0.000 1.000   NA
 560334 560335 RB11334 RB11336     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560335 560336 RB11336 RB11337     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560339 560340 RB11341 RB11342     FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 560342 560343 RB11345 RB11348     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560343 560344 RB11348 RB11352     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560344 560345 RB11352 RB11354     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 560345 560346 RB11354 RB11356     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 560346 560347 RB11356 RB11360     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 560347 560348 RB11360 RB11363     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 560348 560349 RB11363 RB11366     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560349 560350 RB11366 RB11367     TRUE 0.412 137.000 0.000 1.000   NA
 560350 560351 RB11367 RB11370     FALSE 0.272 35.000 0.000 1.000   NA
 560351 560352 RB11370 RB11371   hsdR TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560352 560353 RB11371 RB11373 hsdR   FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 560353 560354 RB11373 RB11374   yma TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560354 560355 RB11374 RB11377 yma hsdS TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560355 560356 RB11377 RB11379 hsdS   TRUE 0.915 -3.000 0.000 0.032 Y NA
 560357 560358 RB11381 RB11383     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 560360 560361 RB11387 RB11388     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 560363 560364 RB11390 RB11391     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 560364 560365 RB11391 RB11392     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 560365 560366 RB11392 RB11393     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560366 560367 RB11393 RB11395     TRUE 0.416 113.000 0.000 1.000   NA
 560367 560368 RB11395 RB11396     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560368 560369 RB11396 RB11397     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 560369 560370 RB11397 RB11399     TRUE 0.952 4.000 0.019 NA   NA
 560371 560372 RB11401 RB11403     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 560372 560373 RB11403 RB11405     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 560374 560375 RB11407 RB11408 hsdR   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560375 560376 RB11408 RB11411   hsdM TRUE 0.958 4.000 0.092 NA   NA
 560376 560377 RB11411 RB11412 hsdM hsdS TRUE 0.966 128.000 0.020 0.032   NA
 560377 560378 RB11412 RB11415 hsdS   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560378 560379 RB11415 RB11416     TRUE 0.959 5.000 0.500 NA   NA
 560380 560381 RB11418 RB11419 arr1 nfi TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560381 560382 RB11419 RB11420 nfi   FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 560382 560383 RB11420 RB11421   rsr FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 560384 560385 RB11424 RB11427     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560385 560386 RB11427 RB11429     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 560387 560388 RB11431 RB11432     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 560388 560389 RB11432 RB11434     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 560389 560390 RB11434 RB11436     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 560390 560391 RB11436 RB11437     FALSE 0.094 -92.000 0.000 NA   NA
 560391 560392 RB11437 RB11438     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 560394 560395 RBt48 RBt49     FALSE 0.184 204.000 0.000 NA   NA
 560395 560396 RBt49 RBt50     FALSE 0.184 200.000 0.000 NA   NA
 560396 560397 RBt50 RBt51     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 560397 560398 RBt51 RBt52     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560398 560399 RBt52 RBt53     FALSE 0.186 174.000 0.000 NA   NA
 560399 560400 RBt53 RBt54     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 560400 560401 RBt54 RBt55     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 560401 560402 RBt55 RBt56     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 560402 560403 RBt56 RBt57     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 560405 560406 RBt58 RBt59     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 560408 560409 RBt60 RB11452     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 560409 560410 RB11452 RBt61     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 560410 560411 RBt61 RBt62     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 560411 560412 RBt62 RBt63     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 560412 560413 RBt63 RBt64     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 560413 560414 RBt64 RBt65     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 560414 560415 RBt65 RBt66     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 560415 560416 RBt66 RBt67     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 560416 560417 RBt67 RBt68     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 560417 560418 RBt68 RBt69     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 560418 560419 RBt69 RBt70     FALSE 0.186 168.000 0.000 NA   NA
 560419 560420 RBt70 RB11461     FALSE 0.182 533.000 0.000 NA   NA
 560422 560423 RB11463 RB11468     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 560425 560426 RB11470 RB11471     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560426 560427 RB11471 RB11473     FALSE 0.355 -39.000 0.000 1.000   NA
 560428 560429 RB11475 RB11476     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 560429 560430 RB11476 RB11478     FALSE 0.185 188.000 0.000 NA   NA
 560430 560431 RB11478 RB11480     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 560431 560432 RB11480 RB11482     TRUE 0.595 5.000 0.000 1.000 N NA
 560434 560435 RB11485 RB11487     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 560435 560436 RB11487 RB11488     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560436 560437 RB11488 RB11489     TRUE 0.430 79.000 0.000 NA N NA
 560437 560438 RB11489 RB11490     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 560438 560439 RB11490 RB11492     TRUE 0.973 0.000 0.125 NA   NA
 560441 560442 RB11494 RB11496     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 560442 560443 RB11496 RB11497     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 560443 560444 RB11497 RB11498     FALSE 0.095 -88.000 0.000 NA   NA
 560444 560445 RB11498 RB11502     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 560446 560447 RB11504 RB11505     FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 560447 560448 RB11505 RB11506     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 560448 560449 RB11506 RB11509     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 560449 560450 RB11509 RB11510     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560451 560452 RB11512 RB11515     TRUE 0.412 133.000 0.000 1.000   NA
 560453 560454 RB11516 RB11518     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 560454 560455 RB11518 RB11519     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 560455 560456 RB11519 RB11521     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 560456 560457 RB11521 RB11522     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560457 560458 RB11522 RB11524     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560458 560459 RB11524 RB11525     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 560459 560460 RB11525 RB11527     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 560460 560461 RB11527 RB11529     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 560461 560462 RB11529 RB11533     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560462 560463 RB11533 RB11537     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560466 560467 RB11542 RB11543     FALSE 0.183 430.000 0.000 NA   NA
 560468 560469 RB11545 RB11548     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 560469 560470 RB11548 RB11550   drga FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 560470 560471 RB11550 RB11551 drga   FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 560471 560472 RB11551 RBt71     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 560472 560473 RBt71 RB11553     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 560474 560475 RB11559 RB11563     FALSE 0.183 439.000 0.000 NA   NA
 560475 560476 RB11563 RB11564     TRUE 0.986 3.000 0.417 NA Y NA
 560476 560477 RB11564 RB11566     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 560478 560479 RB11569 RB11573     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 560480 560481 RB11575 RB11578     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 560482 560483 RB11579 RB11582 dnaA   TRUE 0.950 25.000 0.167 1.000 N NA
 560483 560484 RB11582 RB11585     TRUE 0.983 -3.000 0.167 NA   NA
 560486 560487 RB11589 RB11593     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 560488 560489 RB11594 RB11595     TRUE 0.585 73.000 0.000 1.000 N NA
 560489 560490 RB11595 RB11597     TRUE 0.750 82.000 0.000 1.000 Y NA
 560490 560491 RB11597 RB11598     TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 560493 560494 RB11601 RB11603     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 560498 560499 RBt72 RBt73     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 560499 560500 RBt73 RB11615     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 560501 560502 RB11616 RB11617     FALSE 0.186 174.000 0.000 NA   NA
 560503 560504 RB11618 RB11619     TRUE 0.996 -3.000 0.306 0.031 Y NA
 560504 560505 RB11619 RB11622     TRUE 0.975 23.000 0.096 0.001 Y NA
 560505 560506 RB11622 RB11624     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 560507 560508 RB11626 RB11627     FALSE 0.185 189.000 0.000 NA   NA
 560508 560509 RB11627 RB11628     FALSE 0.191 135.000 0.000 NA   NA
 560509 560510 RB11628 RB11629     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 560511 560512 RB11631 RB11633     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 560512 560513 RB11633 RB11635   strR FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 560518 560519 RB11640 RB11641     FALSE 0.186 174.000 0.000 NA   NA
 560520 560521 RB11642 RB11643   hsdS TRUE 0.996 -3.000 0.122 0.031 Y NA
 560523 560524 RB11647 RB11649     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 560525 560526 RB11650 RB11652     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 560526 560527 RB11652 RB11654     FALSE 0.183 295.000 0.000 NA   NA
 560528 560529 RB11660 RB11662     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 560529 560530 RB11662 RB11663     FALSE 0.185 184.000 0.000 NA   NA
 560530 560531 RB11663 RB11664     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 560532 560533 RB11665 RB11667     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 560534 560535 RB11668 RB11669   atoC TRUE 0.913 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 560535 560536 RB11669 RB11670 atoC   FALSE 0.337 48.000 0.000 NA N NA
 560536 560537 RB11670 RB11671     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 560537 560538 RB11671 RB11672     FALSE 0.189 147.000 0.000 NA   NA
 560540 560541 RB11674 RB11675     FALSE 0.071 -615.000 0.000 NA   NA
 560542 560543 RB11676 RB11677     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 560544 560545 RB11678 RB11679     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 560548 560549 RB11682 RB11683     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 560549 560550 RB11683 RB11685     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 560551 560552 RB11686 RB11687     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560553 560554 RB11688 RB11690 kdtA SecA TRUE 0.969 146.000 0.018 1.000 N NA
 560554 560555 RB11690 RB11693 SecA   FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 560555 560556 RB11693 RB11698     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 560557 560558 RB11701 RB11703     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 560558 560559 RB11703 RB11704     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 560559 560560 RB11704 RB11706     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 560560 560561 RB11706 RB11707     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560561 560562 RB11707 RB11708     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 560562 560563 RB11708 RB11712     TRUE 0.975 0.000 0.429 NA   NA
 560564 560565 RB11716 RB11718     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 560566 560567 RB11720 RB11722     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 560567 560568 RB11722 RB11726     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 560568 560569 RB11726 RB11728     TRUE 0.921 36.000 0.385 NA   NA
 560572 560573 RB11731 RB11732     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 560576 560577 RB11739 RB11742     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 560577 560578 RB11742 RB11746     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 560578 560579 RB11746 RB11748     FALSE 0.186 171.000 0.000 NA   NA
 560579 560580 RB11748 RB11749     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 560580 560581 RB11749 RB11750     TRUE 0.837 3.000 0.000 0.031 Y NA
 560581 560582 RB11750 RB11751     TRUE 0.541 81.000 0.000 0.031   NA
 560583 560584 RB11752 RB11756   rrmA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560586 560587 RB11758 RB11759     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 560590 560591 RB11765 RB11766     FALSE 0.183 264.000 0.000 NA   NA
 560591 560592 RB11766 RB11767     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 560592 560593 RB11767 RB11768     FALSE 0.084 -131.000 0.000 NA   NA
 560593 560594 RB11768 RB11769     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 560594 560595 RB11769 RB11796     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 560595 560596 RB11796 RB11798     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 560596 560597 RB11798 RB11799     FALSE 0.185 191.000 0.000 NA   NA
 560597 560598 RB11799 RB11801     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560598 560599 RB11801 RB11802     FALSE 0.186 168.000 0.000 NA   NA
 560599 560600 RB11802 RB11803     TRUE 0.837 3.000 0.000 0.031 Y NA
 560601 560602 RB11804 RB11805     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 560605 560606 RB11811 RB11812     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 560606 560607 RB11812 RB11813     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560607 560608 RB11813 RB11816     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 560610 560611 RB11822 RB11823 guaB   TRUE 0.879 -67.000 0.003 NA   NA
 560611 560612 RB11823 RB11826     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 560612 560613 RB11826 RB11827     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 560613 560614 RB11827 RB11828     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 560615 560616 RB11831 RB11832   ndk FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 560616 560617 RB11832 RB11837 ndk   FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 560617 560618 RB11837 RB11839     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 560618 560619 RB11839 RB11843     FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 560621 560622 RB11845 RB11846     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 560623 560624 RB11847 RB11848 msrA   FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 560624 560625 RB11848 RB11851   hofF TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560625 560626 RB11851 RB11853 hofF folE TRUE 0.483 46.000 0.000 1.000 N NA
 560627 560628 RB11854 RB11855     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 560628 560629 RB11855 RB11856     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 560629 560630 RB11856 RB11857     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 560630 560631 RB11857 RB11859   phnP FALSE 0.184 208.000 0.000 NA   NA
 560631 560632 RB11859 RB11862 phnP   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560632 560633 RB11862 RB11863   recA FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 560635 560636 RB11868 RB11869     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 560637 560638 RB11870 RB11875     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 560638 560639 RB11875 RB11876   dsbB FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 560639 560640 RB11876 RB11877 dsbB trmE TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560640 560641 RB11877 RB11878 trmE msrA TRUE 0.423 88.000 0.000 1.000   NA
 560644 560645 RB11884 RB11886     TRUE 0.967 64.000 0.667 1.000   NA
 560645 560646 RB11886 RB11891     FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 560646 560647 RB11891 RB11894     FALSE 0.183 299.000 0.000 NA   NA
 560648 560649 RB11897 RB11898     FALSE 0.072 -516.000 0.000 NA   NA
 560651 560652 RB11902 RB11904     FALSE 0.188 149.000 0.000 NA   NA
 560652 560653 RB11904 RB11906     FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 560653 560654 RB11906 RB11907     TRUE 0.499 -13.000 0.000 1.000   NA
 560654 560655 RB11907 RB11909     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 560655 560656 RB11909 RB11913   moxR FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 560656 560657 RB11913 RB11914 moxR   TRUE 0.956 -28.000 0.500 NA   NA
 560657 560658 RB11914 RB11916     TRUE 0.980 -3.000 0.025 NA   NA
 560659 560660 RB11918 RB11919   ilvD TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560660 560661 RB11919 RB11920 ilvD   FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 560661 560662 RB11920 RB11922     FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 560662 560663 RB11922 RB11923     TRUE 0.956 4.000 0.062 NA   NA
 560664 560665 RB11925 RB11927     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 560666 560667 RB11928 RB11929     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 560667 560668 RB11929 RB11930     TRUE 0.989 -3.000 0.041 0.057   NA
 560668 560669 RB11930 RB11931   cyoE TRUE 0.960 11.000 0.027 1.000 N NA
 560669 560670 RB11931 RB11934 cyoE   TRUE 0.973 14.000 0.112 1.000 Y NA
 560670 560671 RB11934 RB11936     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560671 560672 RB11936 RB11937   pbrT TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560672 560673 RB11937 RB11938 pbrT   FALSE 0.076 -207.000 0.000 NA   NA
 560675 560676 RB11941 RB11942     FALSE 0.313 -51.000 0.000 NA N NA
 560676 560677 RB11942 RB11943     TRUE 0.991 -3.000 0.130 1.000 N NA
 560677 560678 RB11943 RB11945     TRUE 0.974 65.000 0.105 1.000 N NA
 560679 560680 RB11946 RB11947   atoC TRUE 0.556 -31.000 0.000 1.000 N NA
 560683 560684 RB11952 RB11955     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 560684 560685 RB11955 RB11958     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 560685 560686 RB11958 RB11959   dapB FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 560687 560688 RB11960 RB11961     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560688 560689 RB11961 RB11964     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 560689 560690 RB11964 RB11967   tesB TRUE 0.942 6.000 0.012 NA   NA
 560690 560691 RB11967 RB11969 tesB   FALSE 0.293 14.000 0.000 1.000   NA
 560697 560698 RB11981 RB11982     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 560699 560700 RB11983 RB11985 hisI   TRUE 0.542 9.000 0.000 1.000 N NA
 560700 560701 RB11985 RB11986     TRUE 0.590 77.000 0.000 1.000 N NA
 560701 560702 RB11986 RB11988     TRUE 0.612 -91.000 0.000 0.057 Y NA
 560702 560703 RB11988 RB11990     TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 560703 560704 RB11990 RB11991     TRUE 0.409 7.000 0.000 NA N NA
 560708 560709 RB11998 RB12002     FALSE 0.193 112.000 0.000 NA   NA
 560709 560710 RB12002 RB12005     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 560712 560713 RB12007 RB12009 phr   FALSE 0.230 -96.000 0.000 NA N NA
 560714 560715 RB12012 RB12013 xylB proB TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 560718 560719 RB12020 RB12021     FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 560719 560720 RB12021 RB12022     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560720 560721 RB12022 RB12024     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 560724 560725 RB12035 RB12038     TRUE 0.956 117.000 0.483 NA   NA
 560725 560726 RB12038 RB12039   glcD TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560726 560727 RB12039 RB12040 glcD glcE TRUE 0.992 -7.000 0.031 0.003 Y NA
 560727 560728 RB12040 RB12042 glcE glcF TRUE 0.995 -3.000 0.026 0.026 Y NA
 560728 560729 RB12042 RB12043 glcF   FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 560729 560730 RB12043 RB12046     FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 560730 560731 RB12046 RB12047     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560732 560733 RB12048 RB12053     TRUE 0.968 -16.000 0.028 1.000   NA
 560733 560734 RB12053 RB12055     TRUE 0.985 70.000 0.018 0.017 Y NA
 560734 560735 RB12055 RB12056     TRUE 0.985 -3.000 0.022 1.000   NA
 560735 560736 RB12056 RB12060     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 560736 560737 RB12060 RB12061   pyrG TRUE 0.891 39.000 0.003 NA   NA
 560737 560738 RB12061 RB12064 pyrG   FALSE 0.184 207.000 0.000 NA   NA
 560738 560739 RB12064 RB12065     FALSE 0.088 -108.000 0.000 NA   NA
 560740 560741 RB12066 RB12067     FALSE 0.073 -318.000 0.000 NA   NA
 560743 560744 RB12071 RB12072     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560749 560750 RB12080 RB12081     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 560750 560751 RB12081 RB12082     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 560751 560752 RB12082 RB12084     TRUE 0.942 -36.000 0.111 NA   NA
 560753 560754 RB12086 RB12087   ilvD FALSE 0.098 -79.000 0.000 NA   NA
 560755 560756 RB12088 RB12089     FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 560756 560757 RB12089 RB12092     TRUE 0.783 217.000 0.000 0.014 Y NA
 560758 560759 RB12097 RB12102     TRUE 0.915 31.000 0.600 NA   NA
 560759 560760 RB12102 RB12104     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 560761 560762 RB12107 RB12108 pepA   TRUE 0.539 55.000 0.000 1.000 N NA
 560762 560763 RB12108 RB12110     FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 560763 560764 RB12110 RB12112     FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 560764 560765 RB12112 RB12113   carB FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 560765 560766 RB12113 RB12114 carB   FALSE 0.086 -115.000 0.000 NA   NA
 560766 560767 RB12114 RB12116   dnaQ FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 560769 560770 RB12118 RB12124     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 560771 560772 RB12129 RB12131     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 560773 560774 RB12132 RB12133   dapE TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560775 560776 RB12137 RB12138     TRUE 0.883 34.000 0.006 NA   NA
 560776 560777 RB12138 RB12139     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560777 560778 RB12139 RB12142     FALSE 0.184 231.000 0.000 NA   NA
 560779 560780 RB12144 RB12145     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 560780 560781 RB12145 RBs01     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 560781 560782 RBs01 RB12148   prc FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 560784 560785 RB12151 RB12152     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 560785 560786 RB12152 RB12153     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 560787 560788 RB12155 RB12159     TRUE 0.926 -57.000 0.750 NA   NA
 560789 560790 RB12160 RB12164 trxA   TRUE 0.401 248.000 0.000 1.000   NA
 560790 560791 RB12164 RB12167     TRUE 0.415 117.000 0.000 NA N NA
 560791 560792 RB12167 RB12168     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 560792 560793 RB12168 RB12172     TRUE 0.945 93.000 0.031 NA   NA
 560793 560794 RB12172 RB12174   flgI TRUE 0.922 38.000 0.200 NA   NA
 560794 560795 RB12174 RB12175 flgI flgH TRUE 0.993 0.000 0.075 0.003 Y NA
 560795 560796 RB12175 RB12178 flgH   TRUE 0.981 -18.000 0.075 NA Y NA
 560796 560797 RB12178 RB12180   flgG TRUE 0.983 4.000 0.300 NA Y NA
 560797 560798 RB12180 RB12181 flgG flgF TRUE 0.983 41.000 0.500 0.001 Y NA
 560798 560799 RB12181 RB12183 flgF   TRUE 0.560 370.000 0.000 1.000 N NA
 560800 560801 RB12188 RB12189     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 560801 560802 RB12189 RB12190     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 560803 560804 RB12191 RB12193     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560804 560805 RB12193 RB12194     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560805 560806 RB12194 RB12196     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 560806 560807 RB12196 RB12197   infC FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 560809 560810 RB12200 RB12201     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560812 560813 RB12202 RB12204     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 560813 560814 RB12204 RB12205     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 560814 560815 RB12205 RB12206     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560817 560818 RB12209 RB12211   dnaB TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560818 560819 RB12211 RB12213 dnaB   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560819 560820 RB12213 RB12214     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 560820 560821 RB12214 RB12215     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 560821 560822 RB12215 RB12217     FALSE 0.192 124.000 0.000 NA   NA
 560822 560823 RB12217 RB12219     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 560823 560824 RB12219 RB12220     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 560824 560825 RB12220 RB12221     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 560827 560828 RB12227 RB12229     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 560828 560829 RB12229 RB12231     FALSE 0.183 318.000 0.000 NA   NA
 560830 560831 RB12232 RB12233     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560833 560834 RB12236 RB12238   osmY FALSE 0.079 -163.000 0.000 NA   NA
 560834 560835 RB12238 RB12239 osmY   FALSE 0.185 191.000 0.000 NA   NA
 560835 560836 RB12239 RB12240     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560838 560839 RB12243 RB12245     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560842 560843 RB12251 RB12255     FALSE 0.188 153.000 0.000 NA   NA
 560843 560844 RB12255 RB12256     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 560844 560845 RB12256 RB12260     FALSE 0.191 130.000 0.000 NA   NA
 560846 560847 RB12262 RB12264 fhp   FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 560849 560850 RB12266 RB12267     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 560851 560852 RB12268 RB12269     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 560853 560854 RB12271 RB12276     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 560854 560855 RB12276 RB12278     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 560856 560857 RB12279 RB12281     TRUE 0.943 -39.000 0.354 NA   NA
 560857 560858 RB12281 RB12282     FALSE 0.189 145.000 0.000 NA   NA
 560859 560860 RB12283 RB12285     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 560863 560864 RB12289 RB12290   pntB FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 560864 560865 RB12290 RB12291 pntB   TRUE 0.990 -3.000 0.090 0.000   NA
 560865 560866 RB12291 RB12292   pntA TRUE 0.952 34.000 0.829 0.000   NA
 560869 560870 RB12297 RB12301     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 560871 560872 RB12303 RB12305     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 560872 560873 RB12305 RB12310     FALSE 0.184 207.000 0.000 NA   NA
 560873 560874 RB12310 RB12312     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 560874 560875 RB12312 RB12313     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 560875 560876 RB12313 RB12314     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 560880 560881 RB12318 RB12319     FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 560882 560883 RB12320 RB12321     FALSE 0.189 145.000 0.000 NA   NA
 560883 560884 RB12321 RB12323     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 560886 560887 RB12325 RB12326     TRUE 0.583 89.000 0.000 1.000 N NA
 560889 560890 RB12328 RB12329     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 560890 560891 RB12329 RB12331     FALSE 0.185 176.000 0.000 NA   NA
 560892 560893 RB12333 RB12334     FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 560893 560894 RB12334 RB12337     TRUE 0.524 153.000 0.000 0.020   NA
 560894 560895 RB12337 RB12338     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 560895 560896 RB12338 RB12340     TRUE 0.973 -7.000 0.500 NA   NA
 560896 560897 RB12340 RB12342     TRUE 0.984 -3.000 0.600 NA   NA
 560897 560898 RB12342 RB12343     FALSE 0.342 11.000 0.000 1.000   NA
 560898 560899 RB12343 RB12344     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 560899 560900 RB12344 RB12347     FALSE 0.328 46.000 0.000 1.000   NA
 560900 560901 RB12347 RB12348   fxsA TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560903 560904 RB12357 RB12359 fliN   FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 560904 560905 RB12359 RB12360     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 560907 560908 RB12362 RB12363   pcrA TRUE 0.528 53.000 0.000 1.000 N NA
 560908 560909 RB12363 RB12367 pcrA   TRUE 0.415 120.000 0.000 1.000   NA
 560910 560911 RB12371 RB12372     FALSE 0.189 147.000 0.000 NA   NA
 560911 560912 RB12372 RB12375     TRUE 0.953 311.000 0.600 NA   NA
 560913 560914 RB12377 RB12379 ksgA ribE TRUE 0.966 123.000 0.005 1.000 N NA
 560916 560917 RB12382 RB12383     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 560918 560919 RB12385 RB12386     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560920 560921 RB12387 RB12388     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560921 560922 RB12388 RB12390     FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 560922 560923 RB12390 RB12391     FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 560923 560924 RB12391 RB12392     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 560924 560925 RB12392 RB12393     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 560925 560926 RB12393 RB12395     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560926 560927 RB12395 RB12396     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 560927 560928 RB12396 RB12398     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 560928 560929 RB12398 RB12400     FALSE 0.185 183.000 0.000 NA   NA
 560929 560930 RB12400 RB12403     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 560930 560931 RB12403 RB12404     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 560934 560935 RB12408 RB12409     FALSE 0.123 -57.000 0.000 NA   NA
 560935 560936 RB12409 RB12414     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560938 560939 RB12416 RB12419     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560939 560940 RB12419 RB12421     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 560940 560941 RB12421 RB12422     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 560941 560942 RB12422 RB12424     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560942 560943 RB12424 RB12426     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 560944 560945 RB12427 RB12428     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 560947 560948 RB12431 RB12432     TRUE 0.806 5.000 0.000 0.013 Y NA
 560948 560949 RB12432 RB12434   ogt TRUE 0.418 103.000 0.000 1.000   NA
 560949 560950 RB12434 RB12436 ogt mntB TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 560950 560951 RB12436 RB12437 mntB mntB TRUE 0.996 -3.000 0.443 0.001 Y NA
 560951 560952 RB12437 RB12438 mntB mntA TRUE 0.993 0.000 0.432 0.055 Y NA
 560952 560953 RB12438 RB12439 mntA   FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 560953 560954 RB12439 RB12440   mtsA FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 560954 560955 RB12440 RB12441 mtsA nudF TRUE 0.547 -33.000 0.000 1.000 N NA
 560955 560956 RB12441 RB12442 nudF   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560957 560958 RB12444 RB12445   tmk FALSE 0.104 -72.000 0.000 NA   NA
 560958 560959 RB12445 RB12447 tmk   FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 560960 560961 RB12449 RB12450     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 560961 560962 RB12450 RB12451     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 560962 560963 RB12451 RB12452     FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 560963 560964 RB12452 RB12454     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 560964 560965 RB12454 RB12455     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 560965 560966 RB12455 RB12456     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 560968 560969 RB12459 RB12460     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 560969 560970 RB12460 RB12461     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 560970 560971 RB12461 RB12464     FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 560971 560972 RB12464 RB12468     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 560972 560973 RB12468 RB12471     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 560974 560975 RB12473 RB12475     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 560975 560976 RB12475 RB12477     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 560977 560978 RB12479 RB12480   ribA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560981 560982 RB12485 RB12486     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 560985 560986 RB12492 RB12495   fliK FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 560986 560987 RB12495 RB12497 fliK   FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 560987 560988 RB12497 RB12499   fliJ TRUE 0.978 -3.000 0.010 NA   NA
 560988 560989 RB12499 RB12500 fliJ fliI TRUE 0.948 42.000 0.010 0.003   NA
 560989 560990 RB12500 RB12501 fliI   TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 560990 560991 RB12501 RB12502   fliG FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 560991 560992 RB12502 RB12504 fliG   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560993 560994 RB12506 RB12509     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 560995 560996 RB12510 RB12511 aroG   FALSE 0.189 146.000 0.000 NA   NA
 560996 560997 RB12511 RB12513   flgE FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 560997 560998 RB12513 RB12514 flgE flgD TRUE 0.963 81.000 0.047 1.000   NA
 560999 561000 RB12516 RB12518     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 561000 561001 RB12518 RB12519     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 561001 561002 RB12519 RB12521     FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 561002 561003 RB12521 RB12524     FALSE 0.267 34.000 0.000 1.000   NA
 561003 561004 RB12524 RB12526     TRUE 0.410 7.000 0.000 1.000   NA
 561004 561005 RB12526 RB12528     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 561005 561006 RB12528 RB12532     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 561006 561007 RB12532 RB12533     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 561007 561008 RB12533 RB12534     TRUE 0.966 3.000 1.000 NA   NA
 561008 561009 RB12534 RB12537     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 561009 561010 RB12537 RB12538     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 561010 561011 RB12538 RB12541     FALSE 0.185 181.000 0.000 NA   NA
 561012 561013 RB12543 RB12544     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561013 561014 RB12544 RB12549     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 561014 561015 RB12549 RB12550     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 561016 561017 RB12551 RB12554 scd   FALSE 0.183 256.000 0.000 NA   NA
 561018 561019 RB12556 RB12557     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 561022 561023 RB12562 RB12564 adh   TRUE 0.423 88.000 0.000 1.000   NA
 561024 561025 RB12566 RB12567     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561027 561028 RB12571 RB12572     TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 561029 561030 RB12576 RB12577   efp FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 561031 561032 RB12580 RB12581     FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 561033 561034 RB12583 RB12586     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 561035 561036 RB12588 RB12590     FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 561036 561037 RB12590 RB12596     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 561038 561039 RB12597 RB12598 leuB cdsA TRUE 0.426 85.000 0.000 1.000   NA
 561039 561040 RB12598 RB12599 cdsA   FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 561041 561042 RB12601 RB12602 wecG   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 561042 561043 RB12602 RB12604     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 561043 561044 RB12604 RB12606     TRUE 0.590 10.000 0.000 NA Y NA
 561044 561045 RB12606 RB12608     TRUE 0.629 62.000 0.000 NA Y NA
 561046 561047 RB12610 RB12611     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 561047 561048 RB12611 RB12612     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 561048 561049 RB12612 RB12614   thyA FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 561049 561050 RB12614 RB12617 thyA folA TRUE 0.976 98.000 0.295 1.000 N NA
 561052 561053 RB12623 RB12625 rpsM rpsK TRUE 0.988 67.000 0.810 0.007 Y NA
 561053 561054 RB12625 RB12626 rpsK rpoA TRUE 0.975 60.000 0.308 1.000 N NA
 561054 561055 RB12626 RB12628 rpoA rplQ TRUE 0.977 86.000 0.873 1.000 N NA
 561057 561058 RB12630 RB12631     FALSE 0.254 -73.000 0.000 1.000   NA
 561058 561059 RB12631 RB12633     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 561060 561061 RB12634 RB12636   acc TRUE 0.418 107.000 0.000 1.000   NA
 561061 561062 RB12636 RB12638 acc apbA TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 561062 561063 RB12638 RB12639 apbA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561063 561064 RB12639 RB12640     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 561066 561067 RB12645 RB12646     FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 561070 561071 RB12652 RB12653 glmS   FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 561071 561072 RB12653 RB12656   leuA FALSE 0.191 127.000 0.000 NA   NA
 561072 561073 RB12656 RB12658 leuA leuD TRUE 0.987 173.000 0.103 0.000 Y NA
 561073 561074 RB12658 RB12660 leuD   FALSE 0.185 189.000 0.000 NA   NA
 561074 561075 RB12660 RB12661   pyrF FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 561075 561076 RB12661 RB12662 pyrF   FALSE 0.123 -57.000 0.000 NA   NA
 561076 561077 RB12662 RB12663     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 561077 561078 RB12663 RB12664     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561078 561079 RB12664 RB12666     FALSE 0.297 -139.000 0.000 0.018   NA
 561081 561082 RB12669 RB12673     TRUE 0.957 85.000 0.730 NA   NA
 561082 561083 RB12673 RB12676     TRUE 0.906 35.000 0.064 NA   NA
 561083 561084 RB12676 RB12677     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 561084 561085 RB12677 RB12679     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 561085 561086 RB12679 RB12680     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 561086 561087 RB12680 RB12681   ctaC FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 561087 561088 RB12681 RB12683 ctaC ctaD TRUE 0.989 101.000 0.300 0.001 Y NA
 561090 561091 RB12685 RB12687 ctaE ctaF TRUE 0.965 63.000 0.007 0.001   NA
 561091 561092 RB12687 RB12689 ctaF   FALSE 0.183 247.000 0.000 NA   NA
 561093 561094 RB12690 RB12691 kpsU   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561096 561097 RB12693 RB12694     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 561098 561099 RB12696 RB12697     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 561100 561101 RB12700 RB12702     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 561101 561102 RB12702 RB12705     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561102 561103 RB12705 RB12707     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 561104 561105 RB12710 RB12711     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 561105 561106 RB12711 RB12713     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 561109 561110 RB12720 RB12724     TRUE 0.422 90.000 0.000 1.000   NA
 561110 561111 RB12724 RB12727     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 561111 561112 RB12727 RB12730     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 561112 561113 RB12730 RB12732     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 561113 561114 RB12732 RB12734     TRUE 0.956 118.000 0.556 NA   NA
 561116 561117 RB12739 RB12740   gnl FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 561117 561118 RB12740 RB12741 gnl   FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 561118 561119 RB12741 RB12744     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 561120 561121 RB12745 RB12746 purM mutM TRUE 0.565 169.000 0.000 1.000 N NA
 561121 561122 RB12746 RB12747 mutM   FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 561124 561125 RB12748 RB12751     FALSE 0.184 237.000 0.000 NA   NA
 561125 561126 RB12751 RB12752   degP FALSE 0.087 -109.000 0.000 NA   NA
 561127 561128 RB12755 RB12756   leuA FALSE 0.094 -91.000 0.000 NA   NA
 561131 561132 RB12760 RB12761     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 561132 561133 RB12761 RB12762   nrdA FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 561133 561134 RB12762 RB12766 nrdA   FALSE 0.398 610.000 0.000 NA N NA
 561134 561135 RB12766 RB12768   pilB TRUE 0.403 176.000 0.000 NA N NA
 561137 561138 RB12771 RB12773   pilT FALSE 0.183 268.000 0.000 NA   NA
 561138 561139 RB12773 RB12774 pilT pilB TRUE 0.981 41.000 0.093 0.001 Y NA
 561139 561140 RB12774 RB12778 pilB   FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 561140 561141 RB12778 RB12781   pilC FALSE 0.188 152.000 0.000 NA   NA
 561143 561144 RB12783 RB12785     TRUE 0.939 48.000 0.400 NA   NA
 561144 561145 RB12785 RB12786     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 561145 561146 RB12786 RB12787     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 561146 561147 RB12787 RB12790     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 561147 561148 RB12790 RB12795     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 561148 561149 RB12795 RB12797     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 561151 561152 RB12800 RB12802     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 561155 561156 RB12806 RB12808     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 561158 561159 RB12811 RB12812   fabH FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 561159 561160 RB12812 RB12813 fabH   FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 561160 561161 RB12813 RB12814     FALSE 0.188 154.000 0.000 NA   NA
 561161 561162 RB12814 RB12815     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561164 561165 RB12818 RB12820     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 561165 561166 RB12820 RB12821   rplS FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 561166 561167 RB12821 RB12823 rplS trmD TRUE 0.971 20.000 0.567 1.000 Y NA
 561167 561168 RB12823 RB12824 trmD rpsP TRUE 0.994 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 561168 561169 RB12824 RB12825 rpsP ffh TRUE 0.977 91.000 0.361 1.000 N NA
 561169 561170 RB12825 RB12827 ffh   FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 561172 561173 RB12830 RB12831     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 561174 561175 RB12833 RB12836     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 561175 561176 RB12836 RB12837     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561176 561177 RB12837 RB12839     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 561177 561178 RB12839 RB12840   rplJ TRUE 0.985 174.000 0.302 1.000 Y NA
 561178 561179 RB12840 RB12842 rplJ rplL TRUE 0.985 92.000 0.884 1.000 Y NA
 561182 561183 RB12847 RB12850     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 561185 561186 RB12853 RB12854   fmt FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 561186 561187 RB12854 RB12856 fmt def TRUE 0.985 -22.000 0.006 0.010 Y NA
 561187 561188 RB12856 RB12858 def oppF TRUE 0.548 57.000 0.000 1.000 N NA
 561188 561189 RB12858 RB12859 oppF oppD TRUE 0.989 -24.000 0.222 0.000 Y NA
 561189 561190 RB12859 RB12860 oppD oppC TRUE 0.994 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 561190 561191 RB12860 RB12861 oppC oppB TRUE 0.996 -3.000 0.870 0.011 Y NA
 561191 561192 RB12861 RB12862 oppB oppA TRUE 0.995 -3.000 0.021 0.011 Y NA
 561195 561196 RB12866 RB12870     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 561196 561197 RB12870 RB12873     FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 561197 561198 RB12873 RB12874     FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 561199 561200 RB12875 RB12877     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 561200 561201 RB12877 RB12879     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 561201 561202 RB12879 RB12881     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 561203 561204 RB12882 RB12885   rluD TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 561204 561205 RB12885 RB12886 rluD   TRUE 0.556 -31.000 0.000 1.000 N NA
 561205 561206 RB12886 RB12890     TRUE 0.430 80.000 0.000 1.000   NA
 561206 561207 RB12890 RB12891     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 561207 561208 RB12891 RB12892     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 561208 561209 RB12892 RB12895     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 561210 561211 RB12897 RB12902     TRUE 0.402 184.000 0.000 NA N NA
 561211 561212 RB12902 RB12904   accD TRUE 0.971 4.000 0.004 1.000 N NA
 561212 561213 RB12904 RB12905 accD   TRUE 0.542 9.000 0.000 1.000 N NA
 561214 561215 RB12907 RB12908     FALSE 0.073 -336.000 0.000 NA   NA
 561215 561216 RB12908 RB12915     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 561218 561219 RB12921 RB12924 tkt purA TRUE 0.562 201.000 0.000 1.000 N NA
 561220 561221 RB12925 RB12926     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 561223 561224 RB12932 RB12934     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 561224 561225 RB12934 RB12936     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 561226 561227 RB12940 RB12941     TRUE 0.838 3.000 0.000 0.030 Y NA
 561229 561230 RB12945 RB12946     TRUE 0.953 108.000 0.005 1.000   NA
 561230 561231 RB12946 RB12949     FALSE 0.275 16.000 0.000 1.000   NA
 561231 561232 RB12949 RB12952     TRUE 0.982 172.000 0.061 1.000 Y NA
 561233 561234 RB12953 RB12959     FALSE 0.184 215.000 0.000 NA   NA
 561234 561235 RB12959 RB12961     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 561237 561238 RB12963 RB12965     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 561242 561243 RB12974 RB12975     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561243 561244 RB12975 RB12978     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 561244 561245 RB12978 RB12982     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 561245 561246 RB12982 RB12984     TRUE 0.456 -19.000 0.000 1.000   NA
 561246 561247 RB12984 RB12989     FALSE 0.089 -105.000 0.000 NA   NA
 561247 561248 RB12989 RB12994     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561249 561250 RB12997 RB12998     FALSE 0.072 -442.000 0.000 NA   NA
 561254 561255 RBt75 RB13004     FALSE 0.183 286.000 0.000 NA   NA
 561255 561256 RB13004 RB13005     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 561256 561257 RB13005 RB13007     FALSE 0.184 202.000 0.000 NA   NA
 561257 561258 RB13007 RB13011     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 561258 561259 RB13011 RB13012     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 561259 561260 RB13012 RB13013     FALSE 0.092 -94.000 0.000 NA   NA
 561261 561262 RB13015 RB13016     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 561263 561264 RB13017 RB13021     FALSE 0.191 127.000 0.000 NA   NA
 561264 561265 RB13021 RB13024     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 561266 561267 RB13025 RB13026     TRUE 0.497 52.000 0.000 0.002   NA
 561269 561270 RB13029 RB13030     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561270 561271 RB13030 RB13032     FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 561271 561272 RB13032 RB13035     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561272 561273 RB13035 RB13037     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561273 561274 RB13037 RB13038     TRUE 0.984 -3.000 0.269 NA   NA
 561274 561275 RB13038 RB13042     TRUE 0.918 -64.000 0.778 NA   NA
 561275 561276 RB13042 RB13044     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 561279 561280 RB13053 RB13056     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 561282 561283 RB13059 RB13062     TRUE 0.955 148.000 0.500 NA   NA
 561283 561284 RB13062 RB13063     TRUE 0.924 37.000 0.500 NA   NA
 561284 561285 RB13063 RB13066     TRUE 0.958 79.000 0.667 NA   NA
 561285 561286 RB13066 RB13068     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 561286 561287 RB13068 RB13071     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 561287 561288 RB13071 RB13073     TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 561288 561289 RB13073 RB13074   tadB TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 561289 561290 RB13074 RB13077 tadB   TRUE 0.786 312.000 0.000 0.006 Y NA
 561290 561291 RB13077 RB13078     TRUE 0.882 -93.000 0.037 NA   NA
 561291 561292 RB13078 RB13080     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 561292 561293 RB13080 RB13082     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 561293 561294 RB13082 RB13084     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 561294 561295 RB13084 RB13086     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 561296 561297 RB13088 RB13089     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 561297 561298 RB13089 RB13090     TRUE 0.969 -12.000 0.400 NA   NA
 561298 561299 RB13090 RB13091     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561302 561303 RB13094 RB13095     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 561304 561305 RB13097 RB13098     FALSE 0.191 133.000 0.000 NA   NA
 561308 561309 RB13104 RB13106     TRUE 0.977 -10.000 1.000 1.000   NA
 561309 561310 RB13106 RB13107   pilF TRUE 0.989 -3.000 0.667 1.000   NA
 561312 561313 RB13110 RB13111 apaH nudH TRUE 0.461 4.000 0.000 1.000   NA
 561314 561315 RB13112 RB13114     FALSE 0.189 143.000 0.000 NA   NA
 561315 561316 RB13114 RB13115     FALSE 0.091 -99.000 0.000 NA   NA
 561317 561318 RB13116 RB13117     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 561318 561319 RB13117 RB13118   ntrC TRUE 0.566 -22.000 0.000 0.010   NA
 561322 561323 RB13124 RB13126     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 561324 561325 RB13127 RB13128     FALSE 0.186 172.000 0.000 NA   NA
 561325 561326 RB13128 RB13129     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 561326 561327 RB13129 RB13131     FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 561328 561329 RB13132 RB13137     TRUE 0.955 100.000 0.857 NA   NA
 561329 561330 RB13137 RB13139   xylR TRUE 0.401 220.000 0.000 1.000   NA
 561332 561333 RB13142 RB13143     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 561333 561334 RB13143 RB13146     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 561334 561335 RB13146 RB13147     FALSE 0.362 52.000 0.000 1.000   NA
 561335 561336 RB13147 RB13148     TRUE 0.757 10.000 0.000 0.013 Y NA
 561336 561337 RB13148 RB13150     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561337 561338 RB13150 RB13154     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 561338 561339 RB13154 RB13155     TRUE 0.666 63.000 0.000 0.003 N NA
 561339 561340 RB13155 RB13156     TRUE 0.458 -103.000 0.000 0.003 N NA
 561340 561341 RB13156 RB13157     TRUE 0.423 36.000 0.000 1.000 N NA
 561341 561342 RB13157 RB13162     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 561343 561344 RB13165 RB13168 xylR   FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 561345 561346 RB13170 RB13171     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 561346 561347 RB13171 RB13172     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 561348 561349 RB13173 RB13175     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 561349 561350 RB13175 RB13180     TRUE 0.811 -19.000 0.000 0.054 Y NA
 561350 561351 RB13180 RB13181     TRUE 0.869 0.000 0.000 0.054 Y NA
 561351 561352 RB13181 RB13183     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 561356 561357 RB13189 RB13190     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 561358 561359 RB13191 RB13193     TRUE 0.931 13.000 0.565 NA   NA
 561360 561361 RB13194 RB13198     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 561362 561363 RB13201 RB13202     FALSE 0.183 268.000 0.000 NA   NA
 561363 561364 RB13202 RB13205     FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 561364 561365 RB13205 RB13207     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 561365 561366 RB13207 RB13209     FALSE 0.183 303.000 0.000 NA   NA
 561366 561367 RB13209 RB13210     FALSE 0.198 72.000 0.000 NA   NA
 561367 561368 RB13210 RB13211     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561370 561371 RB13215 RB13217     TRUE 0.992 0.000 0.500 1.000 Y NA
 561371 561372 RB13217 RB13220     TRUE 0.957 92.000 0.667 NA   NA
 561374 561375 RB13222 RB13224     TRUE 0.941 99.000 0.015 NA   NA
 561376 561377 RB13225 RB13228 recQ   FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 561377 561378 RB13228 RB13230     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 561378 561379 RB13230 RB13231     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561381 561382 RB13235 RB13237     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 561382 561383 RB13237 RB13238     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 561384 561385 RB13239 RB13241     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 561385 561386 RB13241 RB13244     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561386 561387 RB13244 RB13245     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 561387 561388 RB13245 RB13247     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 561388 561389 RB13247 RB13250     FALSE 0.105 -70.000 0.000 NA   NA
 561390 561391 RB13251 RB13253     FALSE 0.192 119.000 0.000 NA   NA
 561391 561392 RB13253 RB13257     TRUE 0.417 111.000 0.000 1.000   NA
 561395 561396 RB13261 RB13263   asnC TRUE 0.918 -3.000 0.000 0.013 Y NA
 561397 561398 RB13264 RB13265 acs pknB TRUE 0.423 36.000 0.000 1.000 N NA
 561399 561400 RB13267 RB13271   ddlA FALSE 0.184 236.000 0.000 NA   NA
 561400 561401 RB13271 RB13273 ddlA   TRUE 0.946 58.000 0.100 NA   NA
 561401 561402 RB13273 RB13278     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 561402 561403 RB13278 RB13281     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 561403 561404 RB13281 RB13283     FALSE 0.096 -87.000 0.000 NA   NA
 561405 561406 RB13286 RB13290     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 561406 561407 RB13290 RB13291   outD FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 561407 561408 RB13291 RB13294 outD   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561408 561409 RB13294 RB13297     FALSE 0.183 357.000 0.000 NA   NA
 561409 561410 RB13297 RB13298   dur3 TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 561412 561413 RB13301 RB13303 pyrB asnB TRUE 0.969 69.000 0.014 1.000 N NA
 561413 561414 RB13303 RB13304 asnB amaB TRUE 0.524 -120.000 0.000 1.000 Y NA
 561414 561415 RB13304 RB13306 amaB   TRUE 0.943 19.000 0.040 1.000 N NA
 561415 561416 RB13306 RB13309     FALSE 0.185 180.000 0.000 NA   NA
 561416 561417 RB13309 RB13311     FALSE 0.184 216.000 0.000 NA   NA
 561418 561419 RB13312 RB13316     FALSE 0.185 185.000 0.000 NA   NA
 561419 561420 RB13316 RB13317     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 561420 561421 RB13317 RB13318     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 561421 561422 RB13318 RB13319     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 561423 561424 RB13323 RB13324     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 561425 561426 RB13325 RB13327     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 561426 561427 RB13327 RB13329     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 561427 561428 RB13329 RB13330     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 561428 554024 RB13330 RB2     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA