MicrobesOnline Operon Predictions for Porphyromonas gingivalis W83

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
561429	561430	PG0001	PG0002	dnaA		TRUE	0.922	13.000	0.000	1.000	N	NA
561433	561434	PG0005	PG0006			TRUE	0.993	53.000	0.286	1.000		NA
561434	561435	PG0006	PGt01		tRNA-Asn-1	FALSE	0.093	179.000	0.000	NA		NA
561435	561436	PGt01	PGt02	tRNA-Asn-1	tRNA-Asn-2	TRUE	0.879	23.000	0.000	NA		NA
561436	561437	PGt02	PG0007	tRNA-Asn-2		FALSE	0.399	72.000	0.000	NA		NA
561437	561438	PG0007	PG0008			FALSE	0.099	172.000	0.000	NA		NA
561438	561439	PG0008	PG0009			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
561440	561441	PG0010	PG0011	clpC		FALSE	0.247	140.000	0.000	1.000	N	NA
561441	561442	PG0011	PG0012			TRUE	0.636	48.000	0.000	1.000	N	NA
561442	561443	PG0012	PG0013			TRUE	0.923	10.000	0.000	1.000	N	NA
561443	561444	PG0013	PG0016			FALSE	0.010	586.000	0.000	1.000	N	NA
561444	561445	PG0016	PG0017			TRUE	1.000	11.000	0.905	1.000	Y	NA
561445	561446	PG0017	PG0018			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
561446	561447	PG0018	PG0019			FALSE	0.166	146.000	0.000	NA		NA
561447	561448	PG0019	PG0020			FALSE	0.114	185.000	0.000	1.000	N	NA
561449	561450	PG0021	PG0022			TRUE	0.909	-3.000	0.000	1.000	N	NA
561451	561452	PG0024	PG0025			TRUE	0.977	69.000	0.092	1.000		NA
561452	561453	PG0025	PG0026			TRUE	0.924	118.000	0.046	1.000		NA
561453	561454	PG0026	PG0027			TRUE	0.991	76.000	0.373	1.000		NA
561454	561455	PG0027	PG0028		ispF	TRUE	0.995	7.000	0.023	1.000		NA
561456	561457	PGt03	PG0030	tRNA-Gln-1		FALSE	0.030	262.000	0.000	NA		NA
561458	561459	PG0031	PG0032			TRUE	0.541	48.000	0.000	NA		NA
561459	561460	PG0032	PG0033			TRUE	0.825	30.000	0.000	NA		NA
561460	561461	PG0033	PG0034		trx	FALSE	0.005	695.000	0.000	NA		NA
561461	561462	PG0034	PG0035	trx	dnaE	TRUE	0.983	49.000	0.047	1.000	N	NA
561463	561464	PG0037	PG0039	rplS		FALSE	0.005	753.000	0.000	NA		NA
561464	561465	PG0039	PG0040			FALSE	0.094	178.000	0.000	NA		NA
561465	561466	PG0040	PG0041			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
561466	561467	PG0041	PG0042		glyA	FALSE	0.027	314.000	0.000	1.000	N	NA
561467	561468	PG0042	PG0043	glyA	nahA	TRUE	0.799	157.000	0.020	1.000	N	NA
561468	561469	PG0043	PG0045	nahA	htpG	FALSE	0.008	660.000	0.000	1.000	N	NA
561470	561471	PG0046	PG0047	cdsA		TRUE	0.994	29.000	0.038	1.000		NA
561471	561472	PG0047	PG0048			FALSE	0.070	204.000	0.000	0.051	N	NA
561472	561473	PG0048	PG0049			TRUE	0.888	19.000	0.000	NA		NA
561474	561475	PG0050	PG0052			FALSE	0.004	1346.000	0.000	1.000	N	NA
561477	561478	PG0054	PG0055	recJ		TRUE	0.921	-3.000	0.000	NA	N	NA
561478	561479	PG0055	PG0056			FALSE	0.213	131.000	0.000	NA		NA
561479	561480	PG0056	PG0057		pncB	TRUE	0.777	33.000	0.000	NA		NA
561480	561481	PG0057	PG0058	pncB	nadD	TRUE	0.994	0.000	0.002	1.000	Y	NA
561481	561482	PG0058	PG0059	nadD		TRUE	0.987	14.000	0.002	NA		NA
561482	561483	PG0059	PG0060			TRUE	0.999	7.000	0.222	NA		NA
561483	561484	PG0060	PG0061		yngK-1	TRUE	0.558	47.000	0.000	NA		NA
561484	561485	PG0061	PG0062	yngK-1		TRUE	0.870	5.000	0.000	1.000		NA
561486	561487	PG0063	PG0064			TRUE	1.000	18.000	0.500	1.000	N	NA
561487	561488	PG0064	PG0065			TRUE	1.000	20.000	0.500	1.000	N	NA
561488	561489	PG0065	PG0066			FALSE	0.379	77.000	0.000	NA		NA
561491	561492	PG0069	PG0070		lpxA	TRUE	0.995	5.000	0.013	NA	N	NA
561492	561493	PG0070	PG0071	lpxA		TRUE	0.995	-3.000	0.007	1.000	Y	NA
561493	561494	PG0071	PG0072		lpxD	TRUE	0.998	-21.000	0.148	0.003	Y	NA
561494	561495	PG0072	PG0073	lpxD		TRUE	0.905	93.000	0.011	1.000	N	NA
561495	561496	PG0073	PG0074		prfA	TRUE	0.997	17.000	0.034	1.000	N	NA
561496	561497	PG0074	PG0075	prfA		TRUE	0.994	25.000	0.016	1.000	N	NA
561497	561498	PG0075	PG0076			TRUE	0.968	-46.000	0.004	1.000	N	NA
561498	561499	PG0076	PG0078			FALSE	0.040	233.000	0.000	NA		NA
561499	561500	PG0078	PG0079			TRUE	0.998	-27.000	0.429	NA		NA
561500	561501	PG0079	PG0080			TRUE	0.812	31.000	0.000	NA		NA
561502	561503	PG0081	PG0082			TRUE	0.438	62.000	0.000	NA		NA
561503	561504	PG0082	PG0083			TRUE	0.891	6.000	0.000	NA		NA
561504	561505	PG0083	PG0084		sda	FALSE	0.323	95.000	0.000	NA		NA
561505	561506	PG0084	PG0085	sda		FALSE	0.148	141.000	0.000	1.000		NA
561507	561508	PG0086	PG0087			FALSE	0.227	146.000	0.000	1.000	N	NA
561509	561510	PG0088	PG0090			FALSE	0.003	1032.000	0.000	1.000		NA
561511	561512	PG0091	PG0092			TRUE	0.997	59.000	0.917	NA		NA
561512	561513	PG0092	PG0093			TRUE	0.998	45.000	0.833	NA		NA
561513	561514	PG0093	PG0094			TRUE	0.998	50.000	0.667	1.000	N	NA
561514	561515	PG0094	PG0095		mutS	FALSE	0.006	895.000	0.000	1.000	N	NA
561515	561516	PG0095	PG0097	mutS		FALSE	0.022	293.000	0.000	NA		NA
561516	561517	PG0097	PG0098			TRUE	0.686	-39.000	0.000	NA		NA
561517	561518	PG0098	PG0099		pheT	TRUE	0.765	-16.000	0.000	NA		NA
561518	561519	PG0099	PG0100	pheT		FALSE	0.004	766.000	0.000	NA		NA
561520	561521	PG0101			Pg16SA	TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
561521	561522		PG0102	Pg16SA		FALSE	0.265	113.000	0.000	NA		NA
561522	561523	PG0102	PG0103			FALSE	0.223	129.000	0.000	NA		NA
561523	561524	PG0103	PGt04		tRNA-Ile-1	TRUE	0.891	10.000	0.000	NA		NA
561524	561525	PGt04	PGt05	tRNA-Ile-1	tRNA-Ala-1	TRUE	0.891	2.000	0.000	NA		NA
561525	561526	PGt05		tRNA-Ala-1	Pg23SA	FALSE	0.252	119.000	0.000	NA		NA
561526	561527			Pg23SA	Pg5SA	FALSE	0.158	147.000	0.000	NA		NA
561527	561528		PG0104	Pg5SA	topB-1	FALSE	0.008	529.000	0.000	NA		NA
561528	561529	PG0104	PG0106	topB-1		FALSE	0.004	1350.000	0.000	1.000	N	NA
561529	561530	PG0106	PG0108		epsD	FALSE	0.100	247.000	0.000	1.000	Y	NA
561530	561531	PG0108	PG0109	epsD		TRUE	0.883	22.000	0.000	NA		NA
561531	561532	PG0109	PG0110			TRUE	0.686	37.000	0.000	NA		NA
561532	561533	PG0110	PG0111			TRUE	0.623	49.000	0.000	1.000	N	NA
561533	10692446	PG0111	PG0112			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
10692446	561534	PG0112	PG0113			TRUE	0.734	35.000	0.000	NA		NA
561534	561535	PG0113	PG0114			TRUE	0.846	-3.000	0.000	1.000		NA
561535	561536	PG0114	PG0115			FALSE	0.213	120.000	0.000	1.000		NA
561536	561537	PG0115	PG0116			TRUE	0.802	-6.000	0.000	1.000		NA
561537	561538	PG0116	PG0117			TRUE	0.721	-25.000	0.000	NA		NA
561538	561539	PG0117	PG0118			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
561539	561540	PG0118	PG0119			TRUE	0.902	36.000	0.000	NA	Y	NA
561540	561541	PG0119	PG0120		epsC	TRUE	0.964	6.000	0.000	1.000	Y	NA
561541	561542	PG0120	PG0121	epsC	hup-1	FALSE	0.035	304.000	0.000	NA	N	NA
561542	561543	PG0121	PG0123	hup-1		FALSE	0.031	253.000	0.000	NA		NA
561544	561545	PG0124	PG0125			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
561545	561546	PG0125	PG0126			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
561547	561548	PG0127	PG0128	hemH		TRUE	0.870	7.000	0.000	1.000		NA
561548	561549	PG0128	PG0129			TRUE	0.865	17.000	0.000	1.000		NA
561552	561553	PG0133	PG0134		mgtE	TRUE	0.866	19.000	0.000	1.000		NA
561553	561554	PG0134	PG0135	mgtE	ksgA	TRUE	0.995	32.000	0.047	1.000	N	NA
561555	561556	PG0136	PG0137		pepD-1	TRUE	0.997	31.000	0.099	NA		NA
561556	561557	PG0137	PG0138	pepD-1	fabD	TRUE	0.818	115.000	0.003	1.000	N	NA
561558	561559	PG0139	PG0140			TRUE	0.999	10.000	0.299	NA		NA
561559	561560	PG0140	PG0141		spo0J	TRUE	0.998	20.000	0.098	NA		NA
561560	561561	PG0141	PG0142	spo0J	soj	TRUE	1.000	8.000	0.827	1.000	N	NA
561561	561562	PG0142	PG0143	soj		FALSE	0.041	216.000	0.000	1.000		NA
561562	561563	PG0143	PG0144			TRUE	0.999	18.000	0.364	NA		NA
561565	561566	PG0146	PG0147			TRUE	1.000	13.000	0.641	NA		NA
561566	561567	PG0147	PG0148			TRUE	0.998	-13.000	0.214	NA		NA
561567	561568	PG0148	PG0149			TRUE	0.846	28.000	0.000	NA		NA
561568	561569	PG0149	PG0150			TRUE	0.979	37.000	0.019	NA		NA
561569	561570	PG0150	PG0151		ftsY	TRUE	0.996	-3.000	0.028	1.000	N	NA
561570	561571	PG0151	PG0152	ftsY	nspC	TRUE	0.987	27.000	0.003	1.000	N	NA
561571	561572	PG0152	PG0153	nspC	aspS	TRUE	0.923	10.000	0.000	1.000	N	NA
561572	561573	PG0153	PG0155	aspS	ribD	FALSE	0.016	431.000	0.000	1.000	N	NA
561574	561575	PG0156	PG0157		recX	TRUE	0.995	-3.000	0.038	1.000		NA
561575	561576	PG0157	PG0158	recX		TRUE	0.982	-16.000	0.016	1.000		NA
561577	561578	PG0159	PG0160	pepO		TRUE	0.888	19.000	0.000	NA		NA
561578	561579	PG0160	PG0161			FALSE	0.085	182.000	0.000	NA		NA
561579	561580	PG0161	PG0162			FALSE	0.340	89.000	0.000	NA		NA
561580	561581	PG0162	PG0163		pfk	FALSE	0.204	150.000	0.000	1.000	N	NA
561581	561582	PG0163	PG0164	pfk		FALSE	0.064	196.000	0.000	NA		NA
561582	561583	PG0164	PG0165		hslR	TRUE	0.721	-25.000	0.000	NA		NA
561583	561584	PG0165	PG0166	hslR	pth	TRUE	0.998	6.000	0.024	1.000	Y	NA
561584	561585	PG0166	PG0167	pth	rplY	TRUE	0.989	142.000	0.496	0.052	Y	NA
561586	561587	PG0170	PG0171	metG		TRUE	0.874	30.000	0.000	1.000	N	NA
561587	561588	PG0171	PG0172			TRUE	0.846	-3.000	0.000	1.000		NA
561589	561590	PG0173	PG0174			TRUE	0.980	71.000	0.117	1.000		NA
10692447	561591	PG0176	PG0177			FALSE	0.238	126.000	0.000	NA		NA
561591	10692448	PG0177	PG0178			FALSE	0.389	74.000	0.000	NA		NA
10692448	561592	PG0178	PG0179			FALSE	0.365	80.000	0.000	NA		NA
561592	561593	PG0179	PG0180			FALSE	0.021	298.000	0.000	NA		NA
561593	561594	PG0180	PG0181			TRUE	0.891	9.000	0.000	NA		NA
561594	561595	PG0181	PG0182			FALSE	0.158	147.000	0.000	NA		NA
561595	561596	PG0182	PG0183			FALSE	0.063	197.000	0.000	NA		NA
561596	561597	PG0183	PG0184			FALSE	0.014	359.000	0.000	NA		NA
561597	561598	PG0184	PG0185		ragA	FALSE	0.003	842.000	0.000	1.000		NA
561598	561599	PG0185	PG0186	ragA	ragB	TRUE	0.999	30.000	0.500	1.000		NA
561599	561600	PG0186	PG0188	ragB		FALSE	0.003	1017.000	0.000	1.000		NA
561600	561601	PG0188	PG0189			TRUE	0.996	-13.000	0.095	1.000		NA
561601	561602	PG0189	PG0190		uppS	TRUE	0.834	78.000	0.002	1.000		NA
561602	561603	PG0190	PG0191	uppS		TRUE	0.997	18.000	0.036	1.000	N	NA
561603	561604	PG0191	PG0192		ompH-1	TRUE	0.997	57.000	0.326	1.000	Y	NA
561604	561605	PG0192	PG0193	ompH-1	ompH-2	TRUE	0.999	35.000	0.505	0.016	Y	NA
561605	561606	PG0193	PG0194	ompH-2		FALSE	0.019	288.000	0.000	1.000		NA
561606	561607	PG0194	PG0195			FALSE	0.041	216.000	0.000	1.000		NA
561607	561608	PG0195	PG0196			FALSE	0.037	279.000	0.000	1.000	N	NA
561611	561612	PG0199	PG0200			TRUE	0.982	-16.000	0.014	NA		NA
561612	561613	PG0200	PG0201		rnpA	TRUE	1.000	6.000	0.540	NA		NA
561613	561614	PG0201	PG0202	rnpA		TRUE	0.996	-3.000	0.028	1.000	N	NA
561614	561615	PG0202	PG0203			TRUE	0.987	-9.000	0.014	NA		NA
561615	561616	PG0203	PG0204			TRUE	0.501	51.000	0.000	NA		NA
561616	561617	PG0204	PG0205		prfC	TRUE	0.891	6.000	0.000	NA		NA
561619	561620	PG0210	PG0211		cbiGF	TRUE	0.998	-3.000	0.045	0.013	Y	NA
561620	561621	PG0211	PG0212	cbiGF	cobL	TRUE	0.999	14.000	0.071	0.013	Y	NA
561621	561622	PG0212	PG0213	cobL		TRUE	0.997	-7.000	0.056	0.013	Y	NA
561623	561624	PG0214	PG0215			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
561624	561625	PG0215	PG0216			TRUE	0.891	8.000	0.000	NA		NA
561625	561626	PG0216	PG0217			TRUE	0.755	34.000	0.000	NA		NA
561626	561627	PG0217	PG0218			TRUE	0.650	-88.000	0.000	NA		NA
561628	561629	PG0219	PG0221			TRUE	0.465	55.000	0.000	NA		NA
561629	561630	PG0221	PG0222			FALSE	0.368	79.000	0.000	NA		NA
561630	561631	PG0222	PG0223			FALSE	0.005	739.000	0.000	NA		NA
561631	561632	PG0223	PG0224			TRUE	0.934	4.000	0.000	NA	N	NA
561632	561633	PG0224	PG0225			FALSE	0.067	233.000	0.000	NA	N	NA
561633	561634	PG0225	PG0226			FALSE	0.064	196.000	0.000	NA		NA
561634	561635	PG0226	PG0227		radA	TRUE	0.438	62.000	0.000	NA		NA
561635	561636	PG0227	PG0228	radA		TRUE	0.943	46.000	0.002	1.000	N	NA
561637	561638	PG0229	PG0230			FALSE	0.298	102.000	0.000	NA		NA
561638	561639	PG0230	PG0231			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
561640	561641	PG0232	PG0234			FALSE	0.004	838.000	0.000	NA		NA
561642	561643	PG0235	PG0236			FALSE	0.399	72.000	0.000	NA		NA
561643	561644	PG0236	PG0237		ung	TRUE	0.755	34.000	0.000	NA		NA
561645	561646	PG0240	PG0241			TRUE	0.453	267.000	0.029	NA		NA
561646	561647	PG0241	PG0242			TRUE	0.930	45.000	0.002	NA		NA
561647	561648	PG0242	PG0243			TRUE	0.992	16.000	0.010	NA		NA
561648	561649	PG0243	PG0245			FALSE	0.018	321.000	0.000	NA		NA
561649	561650	PG0245	PG0246			TRUE	0.973	165.000	0.593	NA		NA
561650	561651	PG0246	PG0248			FALSE	0.028	269.000	0.000	NA		NA
561651	561652	PG0248	PG0249			TRUE	0.407	97.000	0.000	1.000	N	NA
561652	561653	PG0249	PG0250			FALSE	0.281	107.000	0.000	NA		NA
561654	561655	PG0253	PG0254			TRUE	0.998	47.000	0.759	NA		NA
561655	561656	PG0254	PG0255		infB	TRUE	0.991	96.000	0.342	1.000	N	NA
561656	561657	PG0255	PG0256	infB		TRUE	0.988	28.000	0.013	1.000		NA
561657	561658	PG0256	PG0257			TRUE	0.986	34.000	0.025	1.000		NA
561658	561659	PG0257	PG0258			TRUE	0.999	40.000	0.466	1.000	Y	NA
561659	561660	PG0258	PG0259			TRUE	1.000	7.000	0.482	1.000	Y	NA
561662	561663	PG0263	PG0264	tyrS		TRUE	0.989	20.000	0.004	NA		NA
561665	561666	PG0267	PG0268	argS	trmU	TRUE	0.993	5.000	0.002	0.054	Y	NA
561666	561667	PG0268	PG0269	trmU	xth	TRUE	0.682	45.000	0.000	1.000	N	NA
561667	561668	PG0269	PG0270	xth	oxyR	TRUE	0.490	73.000	0.000	1.000	N	NA
561668	561669	PG0270	PG0271	oxyR	ssb	TRUE	0.598	51.000	0.000	1.000	N	NA
561669	561670	PG0271	PG0272	ssb		TRUE	0.957	87.000	0.049	NA		NA
561670	561671	PG0272	PG0273			TRUE	0.997	36.000	0.233	NA		NA
561671	561672	PG0273	PG0274			TRUE	0.617	43.000	0.000	NA		NA
561673	561674	PG0275	PG0276			FALSE	0.194	138.000	0.000	NA		NA
561675	561676	PG0277	PG0278			TRUE	0.445	61.000	0.000	NA		NA
561677	561678	PG0279	PG0280	maeB		FALSE	0.013	343.000	0.000	1.000		NA
561678	561679	PG0280	PG0281			TRUE	0.828	22.000	0.000	0.087		NA
561679	561680	PG0281	PG0282			FALSE	0.136	221.000	0.000	1.000	Y	NA
561680	561681	PG0282	PG0283			TRUE	0.988	80.000	0.174	1.000	N	NA
561682	561683	PG0285	PG0286			FALSE	0.137	153.000	0.000	NA		NA
561683	561684	PG0286	PG0287			TRUE	0.957	83.000	0.046	NA		NA
561684	561685	PG0287	PG0288			TRUE	0.995	57.000	0.484	NA		NA
561685	561686	PG0288	PG0289			TRUE	0.997	-70.000	0.359	NA		NA
561686	561687	PG0289	PG0290			TRUE	1.000	4.000	0.955	NA		NA
561687	561688	PG0290	PG0291			TRUE	1.000	3.000	0.864	NA		NA
561688	10692449	PG0291	PG0292			FALSE	0.069	194.000	0.000	NA		NA
561689	561690	PG0293	PG0294			FALSE	0.006	600.000	0.000	NA		NA
561690	561691	PG0294	PG0295		dprA	TRUE	0.931	15.000	0.000	NA	N	NA
561691	561692	PG0295	PG0296	dprA		TRUE	0.873	-7.000	0.000	1.000	N	NA
561692	561693	PG0296	PG0297			FALSE	0.021	300.000	0.000	NA		NA
561694	561695	PG0300	PG0302			FALSE	0.014	357.000	0.000	NA		NA
561695	561696	PG0302	PG0303			TRUE	0.999	10.000	0.098	NA	N	NA
561696	561697	PG0303	PG0304			TRUE	0.998	36.000	0.215	0.015	Y	NA
561697	561698	PG0304	PG0305			TRUE	1.000	16.000	0.538	0.049	Y	NA
561698	561699	PG0305	PG0306			TRUE	1.000	27.000	0.571	0.049	Y	NA
561699	561700	PG0306	PG0307			TRUE	1.000	-3.000	0.362	0.049	Y	NA
561700	561701	PG0307	PG0308			TRUE	1.000	25.000	0.425	0.049	Y	NA
561702	561703	PG0309	PG0310	apbE		TRUE	1.000	-3.000	1.000	1.000	N	NA
561703	561704	PG0310	PG0311			TRUE	0.995	0.000	0.016	NA	N	NA
561704	561705	PG0311	PG0312			TRUE	0.999	-3.000	0.179	NA		NA
561706	561707	PG0313	PG0314		rplU	TRUE	0.445	61.000	0.000	NA		NA
561707	561708	PG0314	PG0315	rplU	rpmA	TRUE	1.000	28.000	0.667	0.033	Y	NA
561708	561709	PG0315	PG0316	rpmA	serS	TRUE	0.942	100.000	0.013	1.000	Y	NA
561711	561712	PG0319	PG0320			TRUE	0.999	32.000	0.500	NA		NA
561712	561713	PG0320	PG0321			TRUE	0.700	151.000	0.008	NA		NA
561713	561714	PG0321	PG0322			TRUE	0.898	29.000	0.000	NA	N	NA
561715	561716	PG0323	PG0324		hutH	FALSE	0.060	201.000	0.000	NA		NA
561716	561717	PG0324	PG0325	hutH		TRUE	0.998	3.000	0.036	1.000	Y	NA
561717	561718	PG0325	PG0326			TRUE	0.871	25.000	0.000	NA		NA
561718	561719	PG0326	PG0327			TRUE	0.654	-67.000	0.000	NA		NA
561719	561720	PG0327	PG0328		hutI	FALSE	0.283	94.000	0.000	1.000		NA
561720	561721	PG0328	PG0329	hutI		TRUE	0.962	101.000	0.059	1.000	N	NA
561721	561722	PG0329	PG0330			TRUE	0.477	49.000	0.000	1.000		NA
561723	561724	PG0332	PG0333	rho		FALSE	0.036	228.000	0.000	1.000		NA
561725	561726	PG0334	PG0335		miaA-1	TRUE	0.621	53.000	0.000	NA	N	NA
561726	561727	PG0335	PG0336	miaA-1		TRUE	0.999	17.000	0.168	NA		NA
561727	561728	PG0336	PG0337			FALSE	0.352	85.000	0.000	NA		NA
561729	561730	PG0338	PG0339			TRUE	1.000	5.000	1.000	NA		NA
561730	561731	PG0339	PG0340			FALSE	0.010	459.000	0.000	NA		NA
561732	561733	PG0343	PG0344	megL		FALSE	0.072	181.000	0.000	1.000		NA
561733	561734	PG0344	PG0345			TRUE	0.891	3.000	0.000	NA		NA
561735	561736	PG0346	PG0347		galE	TRUE	0.869	10.000	0.000	1.000		NA
561736	561737	PG0347	PG0348	galE	recG	TRUE	0.705	43.000	0.000	1.000	N	NA
561737	561738	PG0348	PG0349	recG		TRUE	0.866	18.000	0.000	1.000		NA
561740	561741	PG0351	PG0352			FALSE	0.137	153.000	0.000	NA		NA
561743	561744	PG0355	PG0356			TRUE	0.765	-16.000	0.000	NA		NA
561744	561745	PG0356	PG0357		pyrB	TRUE	0.558	47.000	0.000	NA		NA
561745	561746	PG0357	PG0358	pyrB	pyrI	TRUE	0.999	13.000	0.197	0.001	Y	NA
561746	561747	PG0358	PG0359	pyrI		TRUE	0.996	29.000	0.072	1.000		NA
561747	561748	PG0359	PG0360			TRUE	0.605	44.000	0.000	NA		NA
561748	561749	PG0360	PG0361			TRUE	0.991	22.000	0.010	NA		NA
561749	561750	PG0361	PG0362			TRUE	0.645	-100.000	0.000	NA		NA
561750	561751	PG0362	PG0363			TRUE	0.999	1.000	0.222	NA		NA
561752	561753	PG0364	PG0365			TRUE	0.998	-3.000	0.161	1.000		NA
561753	561754	PG0365	PG0366			TRUE	0.991	77.000	0.333	NA		NA
561755	561756	PG0368	PG0369		coaD	TRUE	0.992	31.000	0.021	1.000	N	NA
561756	561757	PG0369	PG0371	coaD		FALSE	0.013	372.000	0.000	NA		NA
561757	561758	PG0371	PG0373			FALSE	0.007	561.000	0.000	NA		NA
561760	561761	PG0375	PG0376	rplM	rpsI	TRUE	1.000	10.000	0.231	0.032	Y	NA
561761	561762	PG0376	PG0377	rpsI	rpsB	TRUE	0.959	135.000	0.060	0.042	Y	NA
561762	561763	PG0377	PG0378	rpsB	tsf	TRUE	0.994	139.000	0.748	1.000	Y	NA
561763	561764	PG0378	PG0380	tsf	uvrB	FALSE	0.019	374.000	0.000	1.000	N	NA
561766	561767	PG0382	PG0383			FALSE	0.253	103.000	0.000	1.000		NA
561767	561768	PG0383	PG0384			TRUE	0.990	10.000	0.002	1.000	N	NA
561768	561769	PG0384	PG0385		rpsU	FALSE	0.101	162.000	0.000	1.000		NA
561769	561770	PG0385	PG0386	rpsU		TRUE	0.980	77.000	0.141	1.000		NA
561770	561771	PG0386	PGt06		tRNA-Tyr-1	FALSE	0.181	140.000	0.000	NA		NA
561771	561772	PGt06	PGt07	tRNA-Tyr-1	tRNA-Thr-1	TRUE	0.825	30.000	0.000	NA		NA
561772	561773	PGt07	PG0387	tRNA-Thr-1	tuf	TRUE	0.418	68.000	0.000	NA		NA
561773	561774	PG0387	PGt08	tuf	tRNA-Trp-1	FALSE	0.404	71.000	0.000	NA		NA
561774	561775	PGt08	PG0389	tRNA-Trp-1	nusG	FALSE	0.036	238.000	0.000	NA		NA
561775	561776	PG0389	PG0390	nusG	rplK	TRUE	0.996	69.000	0.681	1.000	N	NA
561776	561777	PG0390	PG0391	rplK	rplA	TRUE	1.000	21.000	0.838	0.041	Y	NA
561777	561778	PG0391	PG0392	rplA	rplJ	TRUE	1.000	16.000	0.302	1.000	Y	NA
561778	561779	PG0392	PG0393	rplJ	rplL	TRUE	0.999	42.000	0.884	1.000	Y	NA
561779	561780	PG0393	PG0394	rplL	rpoB	TRUE	0.979	112.000	0.223	1.000		NA
561780	561781	PG0394	PG0395	rpoB	rpoC	TRUE	0.996	66.000	0.851	0.001		NA
561781	561782	PG0395	PG0396	rpoC		FALSE	0.035	288.000	0.000	1.000	N	NA
561783	561784	PG0397	PG0398		recF	TRUE	0.998	14.000	0.089	NA		NA
561784	561785	PG0398	PG0399	recF		TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
561785	561786	PG0399	PG0400			TRUE	0.999	8.000	0.138	NA		NA
561786	561787	PG0400	PG0401			FALSE	0.312	237.000	0.004	NA		NA
561787	561788	PG0401	PG0403			TRUE	0.902	147.000	0.064	NA		NA
561788	561789	PG0403	PG0404			TRUE	0.989	7.000	0.003	NA		NA
561789	561790	PG0404	PG0408			FALSE	0.004	846.000	0.000	NA		NA
561791	561792	PG0409	PG0410			FALSE	0.015	347.000	0.000	NA		NA
561792	561793	PG0410	PG0411			TRUE	0.868	0.000	0.000	1.000		NA
561794	561795	PG0412	PG0413	mutL		TRUE	0.991	-3.000	0.012	NA		NA
561795	561796	PG0413	PG0414			TRUE	0.812	-9.000	0.000	NA		NA
561796	561797	PG0414	PG0415			TRUE	0.438	62.000	0.000	NA		NA
561797	561798	PG0415	PG0416		recQ-1	TRUE	0.982	37.000	0.018	1.000	N	NA
561798	561799	PG0416	PG0417	recQ-1	clpX	TRUE	0.937	79.000	0.022	0.019	N	NA
561799	561800	PG0417	PG0418	clpX	clpP	TRUE	0.996	37.000	0.069	1.000	Y	NA
561800	561801	PG0418	PG0419	clpP		FALSE	0.013	373.000	0.000	NA		NA
561801	561802	PG0419	PG0421			FALSE	0.043	229.000	0.000	NA		NA
561802	561803	PG0421	PG0422			FALSE	0.036	238.000	0.000	NA		NA
561804	561805	PG0423	PG0424			TRUE	0.721	-25.000	0.000	NA		NA
561806	561807	PG0425	PG0426			FALSE	0.085	171.000	0.000	1.000		NA
561807	561808	PG0426	PG0427			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
561808	561809	PG0427	PG0428			FALSE	0.052	212.000	0.000	NA		NA
561810	561811	PG0429	PG0430			TRUE	1.000	27.000	0.832	0.004	Y	NA
561811	561812	PG0430	PG0431			TRUE	0.775	-15.000	0.000	NA		NA
561813	561814	PG0432	PG0433			TRUE	0.996	4.000	0.028	NA		NA
561814	561815	PG0433	PG0434			TRUE	0.622	38.000	0.000	1.000		NA
561815	561816	PG0434	PG0435			FALSE	0.055	195.000	0.000	1.000		NA
561816	561817	PG0435	PG0436			TRUE	0.964	10.000	0.000	1.000	Y	NA
561817	561818	PG0436	PG0437			TRUE	0.951	25.000	0.000	0.080	Y	NA
561819	561820	PG0438	PG0439			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
561820	561821	PG0439	PG0441			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
561823	561824	PG0443	PG0444			FALSE	0.076	189.000	0.000	NA		NA
561824	561825	PG0444	PG0445		pepT	TRUE	0.994	17.000	0.019	NA		NA
561825	561826	PG0445	PG0446	pepT	thiF	FALSE	0.291	130.000	0.000	1.000	N	NA
561826	561827	PG0446	PG0447	thiF		TRUE	0.559	56.000	0.000	1.000	N	NA
561827	561828	PG0447	PG0448			TRUE	0.995	-7.000	0.063	NA		NA
561828	561829	PG0448	PG0449			TRUE	0.890	12.000	0.000	NA		NA
561829	561830	PG0449	PG0450			TRUE	0.871	25.000	0.000	NA		NA
561830	561831	PG0450	PG0451			TRUE	0.997	-3.000	0.070	NA		NA
561831	561832	PG0451	PG0452			TRUE	0.971	107.000	0.134	NA		NA
561832	561833	PG0452	PG0453			FALSE	0.023	290.000	0.000	NA		NA
561833	561834	PG0453	PG0456			FALSE	0.003	1125.000	0.000	NA		NA
561834	561835	PG0456	PG0457			TRUE	0.751	-19.000	0.000	NA		NA
561836	561837	PG0458	PG0459			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
561839	561840	PG0461	PG0462			FALSE	0.185	130.000	0.000	1.000		NA
561840	561841	PG0462	PG0463		folC	TRUE	0.974	38.000	0.009	1.000	N	NA
561841	561842	PG0463	PG0464	folC	purA	TRUE	0.988	-3.000	0.002	1.000	N	NA
561842	561843	PG0464	PG0465	purA	fur	TRUE	0.883	29.000	0.000	1.000	N	NA
561843	561844	PG0465	PG0466	fur		FALSE	0.348	86.000	0.000	NA		NA
561844	561845	PG0466	PG0468		manA	FALSE	0.217	130.000	0.000	NA		NA
561845	561846	PG0468	PG0469	manA		TRUE	0.879	23.000	0.000	NA		NA
561846	561847	PG0469	PG0470			FALSE	0.368	79.000	0.000	NA		NA
561848	561849	PG0471	PG0472			TRUE	0.785	-13.000	0.000	NA		NA
561850	561851	PG0474	PG0475			TRUE	0.732	40.000	0.000	1.000	N	NA
561851	561852	PG0475	PG0476		yngK-2	TRUE	0.984	-3.000	0.002	1.000		NA
561852	561853	PG0476	PG0477	yngK-2	panC	TRUE	0.772	-10.000	0.000	1.000		NA
561855	561856	PG0480	PG0481		kbl	TRUE	0.542	113.000	0.000	1.000	Y	NA
561856	561857	PG0481	PG0482	kbl		TRUE	0.893	76.000	0.007	NA		NA
561857	561858	PG0482	PG0483			TRUE	0.891	107.000	0.019	NA		NA
561858	561859	PG0483	PG0484			TRUE	0.997	7.000	0.054	NA		NA
561859	561860	PG0484	PG0485		yajC	TRUE	0.925	128.000	0.047	NA		NA
561860	561861	PG0485	PG0486	yajC	ogt	TRUE	0.491	83.000	0.000	NA	N	NA
561861	561862	PG0486	PG0487	ogt		FALSE	0.052	342.000	0.000	1.000	Y	NA
561863	561864	PG0488	PG0489	ruvB		TRUE	0.955	47.000	0.016	1.000		NA
561864	561865	PG0489	PG0490			TRUE	0.974	100.000	0.132	NA		NA
561865	561866	PG0490	PG0491			TRUE	0.998	16.000	0.122	NA		NA
561867	561868	PG0492	PG0493			FALSE	0.389	74.000	0.000	NA		NA
561868	561869	PG0493	PG0494			FALSE	0.069	194.000	0.000	NA		NA
561870	561871	PG0495	PG0496			FALSE	0.019	312.000	0.000	NA		NA
561871	561872	PG0496	PG0497		mtn	TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
561872	561873	PG0497	PG0498	mtn	luxS	TRUE	0.998	25.000	0.076	1.000	N	NA
561873	561874	PG0498	PG0499	luxS		FALSE	0.030	262.000	0.000	NA		NA
561874	561875	PG0499	PG0500		tgt	FALSE	0.207	135.000	0.000	NA		NA
561875	561876	PG0500	PG0501	tgt		TRUE	0.998	17.000	0.124	1.000		NA
561876	561877	PG0501	PG0502		smpB	TRUE	0.740	33.000	0.000	1.000		NA
561877	561878	PG0502	PG0503	smpB	dpp	TRUE	0.955	40.000	0.002	1.000	N	NA
561878	561879	PG0503	PG0504	dpp	lipA	TRUE	0.920	103.000	0.021	1.000	N	NA
561879	561880	PG0504	PG0505	lipA		FALSE	0.265	113.000	0.000	NA		NA
561880	561881	PG0505	PG0506		prtRII	TRUE	0.888	18.000	0.000	NA		NA
561881	561882	PG0506	PG0507	prtRII		FALSE	0.013	371.000	0.000	NA		NA
561883	561884	PG0508	PG0509			TRUE	0.995	-10.000	0.045	1.000	N	NA
561884	561885	PG0509	PG0510			TRUE	0.887	17.000	0.000	NA		NA
561885	561886	PG0510	PG0511			TRUE	0.979	36.000	0.016	NA		NA
561886	561887	PG0511	PG0512		gmk	TRUE	0.866	20.000	0.000	1.000		NA
561887	561888	PG0512	PG0513	gmk		TRUE	0.998	33.000	0.276	NA		NA
561888	561889	PG0513	PG0514		secA	TRUE	0.842	92.000	0.003	NA		NA
561889	561890	PG0514	PG0515	secA		TRUE	0.964	93.000	0.081	1.000		NA
561890	561891	PG0515	PG0516			TRUE	0.997	-21.000	0.222	NA		NA
561891	561892	PG0516	PG0517			TRUE	0.812	31.000	0.000	NA		NA
561892	561893	PG0517	PG0518			FALSE	0.257	117.000	0.000	NA		NA
561895	561896	PGt09	PG0520	tRNA-Ser-1	groEL	FALSE	0.012	385.000	0.000	NA		NA
561896	561897	PG0520	PG0521	groEL	groES	TRUE	0.954	253.000	0.774	0.011	Y	NA
561897	561898	PG0521	PG0522	groES	miaA-2	FALSE	0.072	216.000	0.000	1.000	N	NA
561898	561899	PG0522	PG0523	miaA-2	guaB	TRUE	0.988	-3.000	0.002	1.000	N	NA
561900	561901	PG0524	PG0525		pyrG	FALSE	0.259	116.000	0.000	NA		NA
561901	561902	PG0525	PG0526	pyrG		TRUE	0.947	128.000	0.064	1.000	N	NA
561902	561903	PG0526	PG0528			TRUE	0.866	91.000	0.003	1.000	N	NA
561903	561904	PG0528	PG0529		carA	TRUE	0.996	34.000	0.041	1.000	Y	NA
561904	561905	PG0529	PG0530	carA	carB	TRUE	1.000	19.000	0.667	0.001	Y	NA
561906	561907	PG0531	PG0532	nadE		FALSE	0.274	110.000	0.000	NA		NA
561908	561909	PGt10	PGt11	tRNA-Tyr-2	tRNA-Gly-1	TRUE	0.755	34.000	0.000	NA		NA
561909	561910	PGt11	PGt12	tRNA-Gly-1	tRNA-Leu-1	TRUE	0.887	17.000	0.000	NA		NA
561910	561911	PGt12	PGt13	tRNA-Leu-1	tRNA-Gly-2	TRUE	0.528	49.000	0.000	NA		NA
561911	561912	PGt13	PG0534	tRNA-Gly-2		FALSE	0.011	413.000	0.000	NA		NA
561914	561915	PG0536	PG0537		pepD-2	TRUE	0.891	9.000	0.000	NA		NA
561915	561916	PG0537	PG0538	pepD-2		FALSE	0.006	828.000	0.000	1.000	N	NA
561916	561917	PG0538	PG0539			TRUE	0.998	44.000	0.246	1.000	Y	NA
561917	561918	PG0539	PG0540			TRUE	1.000	-3.000	0.810	0.078	N	NA
561918	561919	PG0540	PG0541			TRUE	0.998	-15.000	0.333	NA		NA
561921	561922	PG0543	PG0544			FALSE	0.060	192.000	0.000	1.000		NA
561922	561923	PG0544	PG0545			TRUE	0.990	45.000	0.125	0.090		NA
561925	561926	PG0547	PG0548			TRUE	0.898	189.000	0.185	1.000		NA
561927	561928	PG0549	PG0553			FALSE	0.002	1295.000	0.000	1.000		NA
561931	561932	PG0556	PG0557			TRUE	0.465	55.000	0.000	NA		NA
561933	561934	PG0558	PG0559			TRUE	0.999	20.000	0.078	1.000	Y	NA
561938	561939	PG0563	PG0564			TRUE	0.735	-22.000	0.000	NA		NA
561939	561940	PG0564	PG0565			FALSE	0.123	161.000	0.000	NA		NA
561940	561941	PG0565	PG0566			FALSE	0.023	292.000	0.000	NA		NA
561941	561942	PG0566	PG0568		efp-1	FALSE	0.006	558.000	0.000	1.000		NA
561942	561943	PG0568	PG0569	efp-1		FALSE	0.211	132.000	0.000	NA		NA
561946	561947	PG0573	PG0574	mraW		TRUE	0.991	0.000	0.008	NA		NA
561947	561948	PG0574	PG0575			TRUE	0.998	10.000	0.098	NA		NA
561948	561949	PG0575	PG0576		murE	TRUE	1.000	17.000	0.717	1.000	Y	NA
561949	561950	PG0576	PG0577	murE	mraY	TRUE	0.999	15.000	0.069	0.007	Y	NA
561950	561951	PG0577	PG0578	mraY	murD	TRUE	1.000	24.000	0.647	0.007	Y	NA
561951	561952	PG0578	PG0579	murD		TRUE	0.998	12.000	0.085	1.000	N	NA
561952	561953	PG0579	PG0580		murG	TRUE	0.999	-3.000	0.142	1.000	N	NA
561953	561954	PG0580	PG0581	murG	murC	TRUE	1.000	0.000	0.270	1.000	Y	NA
561954	561955	PG0581	PG0582	murC		TRUE	0.996	-6.000	0.065	NA		NA
561955	561956	PG0582	PG0583		ftsA	TRUE	0.986	49.000	0.086	NA		NA
561956	561957	PG0583	PG0584	ftsA	ftsz	TRUE	1.000	3.000	0.460	1.000	Y	NA
561957	561958	PG0584	PG0585	ftsz		TRUE	0.992	32.000	0.040	1.000		NA
561959	561960	PG0587	PG0588	yadS	panB	TRUE	0.492	52.000	0.000	NA		NA
561960	561961	PG0588	PG0589	panB	guaA	TRUE	0.883	71.000	0.002	1.000	N	NA
561962	561963	PG0590	PG0591			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
561963	561964	PG0591	PG0592		rpmE	FALSE	0.014	466.000	0.000	1.000	N	NA
561964	561965	PG0592	PG0593	rpmE	htrA	FALSE	0.069	217.000	0.000	1.000	N	NA
561965	561966	PG0593	PG0594	htrA	rpoD	TRUE	0.918	190.000	0.172	1.000	N	NA
561966	561967	PG0594	PG0595	rpoD	rpsF	TRUE	0.407	97.000	0.000	1.000	N	NA
561967	561968	PG0595	PG0596	rpsF	rpsR	TRUE	1.000	4.000	0.319	0.030	Y	NA
561968	561969	PG0596	PG0597	rpsR	rplI	TRUE	1.000	25.000	0.499	0.030	Y	NA
561969	561970	PG0597	PG0598	rplI		FALSE	0.022	276.000	0.000	1.000		NA
561970	561971	PG0598	PG0599		ribBA	TRUE	0.998	3.000	0.098	1.000		NA
561971	561972	PG0599	PG0602	ribBA		FALSE	0.004	848.000	0.000	NA		NA
561972	561973	PG0602	PG0603		cmk	TRUE	0.991	30.000	0.021	NA		NA
561973	561974	PG0603	PG0604	cmk	ispH	TRUE	0.998	-3.000	0.070	1.000	N	NA
561975	561976	PG0605	PG0606			TRUE	0.592	45.000	0.000	NA		NA
561977	561978	PG0607	PG0608			TRUE	0.812	31.000	0.000	NA		NA
561978	561979	PG0608	PG0609			FALSE	0.287	104.000	0.000	NA		NA
561981	561982	PG0611	PG0612			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
561982	561983	PG0612	PG0613			TRUE	0.876	24.000	0.000	NA		NA
561983	561984	PG0613	PG0614			TRUE	0.707	-28.000	0.000	NA		NA
561984	561985	PG0614	PG0615		typA	FALSE	0.056	206.000	0.000	NA		NA
561985	561986	PG0615	PG0616	typA		FALSE	0.253	103.000	0.000	1.000		NA
561986	561987	PG0616	PG0617			FALSE	0.338	90.000	0.000	NA		NA
561987	561988	PG0617	PG0618			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
561988	561989	PG0618	PG0619			TRUE	0.986	166.000	0.551	1.000	Y	NA
561989	561990	PG0619	PG0620		lon	FALSE	0.060	312.000	0.000	1.000	Y	NA
561990	561991	PG0620	PG0621	lon		TRUE	0.994	-3.000	0.023	NA		NA
561991	561992	PG0621	PG0622			TRUE	1.000	-3.000	0.708	NA		NA
561992	561993	PG0622	PG0623		tpiA	TRUE	0.999	32.000	0.330	NA		NA
561993	561994	PG0623	PG0624	tpiA		TRUE	0.989	62.000	0.191	NA		NA
561994	561995	PG0624	PG0625		folE	TRUE	0.999	4.000	0.296	NA		NA
561995	561996	PG0625	PG0626	folE		FALSE	0.042	231.000	0.000	NA		NA
561997	561998	PG0627	PG0628			FALSE	0.026	249.000	0.000	1.000		NA
561998	561999	PG0628	PG0629		ppnK	FALSE	0.402	59.000	0.000	1.000		NA
562000	562001	PG0630	PG0631	pdxJ		TRUE	0.844	158.000	0.031	1.000	N	NA
562001	562002	PG0631	PG0632			TRUE	1.000	-3.000	0.773	0.035	Y	NA
562002	562003	PG0632	PG0633			TRUE	0.998	5.000	0.062	0.077	N	NA
562003	562004	PG0633	PG0634			TRUE	0.995	15.000	0.024	NA		NA
562005	562006	PG0635	PG0636	prmA		TRUE	0.739	-66.000	0.000	1.000	N	NA
562006	562007	PG0636	PG0637		thiL	TRUE	0.873	-7.000	0.000	1.000	N	NA
562007	562008	PG0637	PG0638	thiL	lpxK	TRUE	0.992	6.000	0.006	1.000	N	NA
562008	562009	PG0638	PG0639	lpxK	sppA	TRUE	0.995	30.000	0.042	1.000	N	NA
562009	10692450	PG0639	PG0644	sppA		FALSE	0.003	1742.000	0.000	NA		NA
10692450	562010	PG0644	PG0645			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
562010	562011	PG0645	PG0646			FALSE	0.272	111.000	0.000	NA		NA
562011	562012	PG0646	PG0647			TRUE	0.964	8.000	0.000	1.000	Y	NA
562012	562013	PG0647	PG0648			TRUE	0.957	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
562015	562016	PG0650	PG0651			FALSE	0.281	107.000	0.000	NA		NA
562016	562017	PG0651	PGt14		tRNA-Leu-2	TRUE	0.856	27.000	0.000	NA		NA
562017	562018	PGt14	PG0652	tRNA-Leu-2		FALSE	0.108	167.000	0.000	NA		NA
562018	562019	PG0652	PG0653		serB	TRUE	0.890	12.000	0.000	NA		NA
562019	562020	PG0653	PG0654	serB		TRUE	0.451	59.000	0.000	NA		NA
562022	562023	PG0656	PG0657	rpmH	maf	TRUE	0.438	62.000	0.000	NA		NA
562023	562024	PG0657	PG0658	maf		TRUE	0.998	16.000	0.086	NA		NA
562024	562025	PG0658	PG0659			TRUE	0.999	17.000	0.202	1.000		NA
562025	562026	PG0659	PG0660			TRUE	0.988	-7.000	0.019	0.043		NA
562026	562027	PG0660	PG0661			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562028	562029	PG0662	PG0664			FALSE	0.048	217.000	0.000	NA		NA
562029	562030	PG0664	PG0665		lacZ-1	TRUE	0.508	47.000	0.000	1.000		NA
562030	10692451	PG0665	PG0666	lacZ-1		FALSE	0.213	131.000	0.000	NA		NA
10692451	562031	PG0666	PG0668			FALSE	0.003	1116.000	0.000	NA		NA
562031	562032	PG0668	PG0669		fetB	TRUE	1.000	29.000	0.917	1.000	N	NA
562032	562033	PG0669	PG0670	fetB		FALSE	0.336	118.000	0.000	1.000	N	NA
562033	562034	PG0670	PG0671			TRUE	1.000	-3.000	0.786	1.000	Y	NA
562034	562035	PG0671	PG0672			TRUE	0.999	44.000	0.632	1.000	Y	NA
562036	562037	PG0674	PG0675	iorB	iorA	TRUE	0.999	27.000	0.100	0.001	Y	NA
562037	562038	PG0675	PG0676	iorA		FALSE	0.327	78.000	0.000	1.000		NA
562039	562040	PG0677	PG0678	LYS1		TRUE	0.838	33.000	0.000	1.000	N	NA
562040	562041	PG0678	PG0679			FALSE	0.086	203.000	0.000	1.000	N	NA
562041	562042	PG0679	PG0680			TRUE	0.999	40.000	0.955	1.000	Y	NA
562044	562045	PG0682	PG0683			TRUE	0.908	33.000	0.000	0.076	Y	NA
562045	562046	PG0683	PG0684			TRUE	0.789	27.000	0.000	0.076		NA
562046	562047	PG0684	PG0685			FALSE	0.286	93.000	0.000	1.000		NA
562048	562049	PG0686	PG0687		sucD	FALSE	0.009	484.000	0.000	NA		NA
562049	562050	PG0687	PG0689	sucD	4hbD	TRUE	0.856	195.000	0.054	0.046	Y	NA
562050	562051	PG0689	PG0690	4hbD	abfT-1	TRUE	0.987	51.000	0.041	1.000	Y	NA
562051	562052	PG0690	PG0691	abfT-1		TRUE	1.000	6.000	0.400	1.000	N	NA
562052	562053	PG0691	PG0692		abfD	TRUE	0.982	73.000	0.098	1.000	N	NA
562053	562054	PG0692	PG0694	abfD		FALSE	0.008	701.000	0.000	1.000	N	NA
562054	562055	PG0694	PG0695			TRUE	0.999	47.000	1.000	0.009	Y	NA
562055	562056	PG0695	PG0698			FALSE	0.020	306.000	0.000	NA		NA
562056	562057	PG0698	PG0699		malP	TRUE	0.796	32.000	0.000	NA		NA
562057	562058	PG0699	PG0700	malP		FALSE	0.241	125.000	0.000	NA		NA
562059	562060	PG0701	PG0702	cobU		TRUE	0.993	53.000	0.104	1.000	Y	NA
562060	562061	PG0702	PG0703			TRUE	0.999	7.000	0.164	0.011	Y	NA
562061	562062	PG0703	PG0704			TRUE	0.999	2.000	0.102	1.000	N	NA
562062	562063	PG0704	PG0705		murI	TRUE	0.536	62.000	0.000	1.000	N	NA
562063	562064	PG0705	PG0706	murI		TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562065	562066	PG0707	PG0708			FALSE	0.157	166.000	0.000	1.000	N	NA
562066	562067	PG0708	PG0709		fkpA	TRUE	0.937	28.000	0.000	0.011	Y	NA
562067	562068	PG0709	PG0710	fkpA		TRUE	0.927	30.000	0.000	0.005	Y	NA
562070	562071	PG0712	PG0713		trpG	TRUE	0.883	22.000	0.000	NA		NA
562071	562072	PG0713	PG0714	trpG	cutC	FALSE	0.135	176.000	0.000	1.000	N	NA
562072	562073	PG0714	PG0715	cutC		TRUE	0.964	5.000	0.000	1.000	Y	NA
562073	562074	PG0715	PG0717			FALSE	0.012	395.000	0.000	NA		NA
562074	562075	PG0717	PG0718			TRUE	0.996	42.000	0.250	NA		NA
562075	562076	PG0718	PG0719			TRUE	0.972	123.000	0.161	NA		NA
562076	562077	PG0719	PG0720			TRUE	1.000	-3.000	0.969	1.000	Y	NA
562080	562081	PG0723	PG0724			TRUE	0.676	-46.000	0.000	NA		NA
562081	562082	PG0724	PG0725			TRUE	0.959	85.000	0.064	1.000		NA
562083	562084	PG0726	PG0727			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562084	562085	PG0727	PG0728			TRUE	0.577	46.000	0.000	NA		NA
562085	562086	PG0728	PG0729		ddlA	TRUE	0.996	19.000	0.033	1.000		NA
562086	10692452	PG0729	PG0730	ddlA		TRUE	0.421	67.000	0.000	NA		NA
10692452	562087	PG0730	PG0731			TRUE	0.514	50.000	0.000	NA		NA
562088	562089	PG0732	PG0733		ribE	FALSE	0.039	236.000	0.000	NA		NA
562089	562090	PG0733	PG0734	ribE		TRUE	0.993	-3.000	0.012	1.000	N	NA
562090	562091	PG0734	PG0735			TRUE	0.549	59.000	0.000	1.000	N	NA
562091	562092	PG0735	PG0736		rnhB	TRUE	0.992	11.000	0.004	1.000	N	NA
562092	562093	PG0736	PG0737	rnhB		TRUE	0.721	-25.000	0.000	NA		NA
562093	562094	PG0737	PG0738			TRUE	0.995	-3.000	0.029	NA		NA
562094	562095	PG0738	PG0739			TRUE	0.761	32.000	0.000	1.000		NA
562095	562096	PG0739	PG0740			TRUE	0.721	-25.000	0.000	NA		NA
562097	562098	PG0741	PG0742		pgaA	TRUE	0.996	-16.000	0.120	NA		NA
562098	562099	PG0742	PG0744	pgaA		FALSE	0.007	496.000	0.000	1.000		NA
562099	562100	PG0744	PG0745			TRUE	0.446	85.000	0.000	1.000	N	NA
562100	562101	PG0745	PG0746			FALSE	0.182	156.000	0.000	1.000	N	NA
562101	562102	PG0746	PG0747			TRUE	1.000	-3.000	0.857	1.000	Y	NA
562102	562103	PG0747	PG0749			FALSE	0.034	244.000	0.000	NA		NA
562103	562104	PG0749	PGt15		tRNA-Arg-1	FALSE	0.133	155.000	0.000	NA		NA
562104	562105	PGt15	PG0750	tRNA-Arg-1		TRUE	0.445	61.000	0.000	NA		NA
562105	562106	PG0750	PG0751		porT	FALSE	0.140	152.000	0.000	NA		NA
562107	562108	PG0752	PG0753		prtQ	TRUE	0.976	-16.000	0.002	1.000	N	NA
562108	562109	PG0753	PG0754	prtQ	topA	FALSE	0.007	735.000	0.000	1.000	N	NA
562109	10692453	PG0754	PG0755	topA		TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
562110	562111	PG0756	PG0757			TRUE	0.514	50.000	0.000	NA		NA
562111	562112	PG0757	PG0758		dcp-1	FALSE	0.274	97.000	0.000	1.000		NA
562112	562113	PG0758	PG0759	dcp-1		FALSE	0.327	78.000	0.000	1.000		NA
562115	562116	PG0766	PG0767	pnpA	malQ	FALSE	0.117	152.000	0.000	1.000		NA
562116	562117	PG0767	PG0768	malQ		FALSE	0.005	742.000	0.000	NA		NA
562117	562118	PG0768	PG0769			FALSE	0.096	174.000	0.000	NA		NA
562118	562119	PG0769	PG0770			TRUE	0.758	-18.000	0.000	NA		NA
562120	562121	PG0771	PG0772			FALSE	0.078	188.000	0.000	NA		NA
562121	562122	PG0772	PG0773			TRUE	0.891	7.000	0.000	NA		NA
562125	562126	PG0775	PG0776		etfA-1	TRUE	0.999	12.000	0.232	0.007	N	NA
562126	562127	PG0776	PG0777	etfA-1	etfB-1	TRUE	1.000	9.000	0.304	0.013	Y	NA
562127	562128	PG0777	PG0778	etfB-1		TRUE	0.856	91.000	0.002	1.000	N	NA
562128	562129	PG0778	PG0779			FALSE	0.034	231.000	0.000	1.000		NA
562129	562130	PG0779	PG0780			TRUE	0.999	16.000	0.422	0.026		NA
562130	562131	PG0780	PG0781			TRUE	0.999	36.000	0.667	NA		NA
562131	562132	PG0781	PG0782			TRUE	0.999	9.000	0.309	NA		NA
562132	562133	PG0782	PGt17		tRNA-Ser-2	TRUE	0.418	68.000	0.000	NA		NA
562133	562134	PGt17	PG0783	tRNA-Ser-2		FALSE	0.071	193.000	0.000	NA		NA
562134	562135	PG0783	PG0784			TRUE	0.972	47.000	0.017	NA	N	NA
562135	562136	PG0784	PG0785			TRUE	0.683	171.000	0.011	1.000	N	NA
562136	562137	PG0785	PG0786			TRUE	0.735	-22.000	0.000	NA		NA
562139	562140	PG0788	PG0789			TRUE	0.864	26.000	0.000	NA		NA
562140	562141	PG0789	PG0790		obg	TRUE	0.751	-19.000	0.000	NA		NA
562141	562142	PG0790	PG0791	obg	adk	TRUE	0.993	10.000	0.019	1.000		NA
562142	562143	PG0791	PG0792	adk	hpt	TRUE	0.999	1.000	0.044	1.000	Y	NA
562144	562145	PG0793	PG0794	fbp		TRUE	0.841	156.000	0.029	1.000	N	NA
562145	562146	PG0794	PG0795			TRUE	0.630	42.000	0.000	NA		NA
562148	562149	PG0798	PG0799			FALSE	0.007	587.000	0.000	NA		NA
562150	562151	PGt18	PG0800	tRNA-Gly-3		TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
562151	562152	PG0800	PG0801			TRUE	0.738	-15.000	0.000	1.000		NA
562152	562153	PG0801	PG0802		pdhD	FALSE	0.008	659.000	0.000	1.000	N	NA
562153	562154	PG0802	PG0803	pdhD	nagB	TRUE	0.924	5.000	0.000	1.000	N	NA
562154	562155	PG0803	PG0804	nagB		TRUE	0.740	39.000	0.000	1.000	N	NA
562155	562156	PG0804	PG0805		lgt	TRUE	0.981	34.000	0.006	1.000	N	NA
562156	562157	PG0805	PG0806	lgt		TRUE	0.967	37.000	0.010	1.000		NA
562157	562158	PG0806	PG0807			TRUE	0.622	38.000	0.000	1.000		NA
562158	562159	PG0807	PG0809			FALSE	0.017	340.000	0.000	NA		NA
562159	562160	PG0809	PG0810			TRUE	0.995	-37.000	0.125	NA		NA
562160	562161	PG0810	PG0811		ruvA	TRUE	0.976	34.000	0.007	NA		NA
562161	562162	PG0811	PG0814	ruvA		FALSE	0.003	2695.000	0.000	NA		NA
562164	10692454	PG0816	PG0817			TRUE	0.755	34.000	0.000	NA		NA
562165	562166	PG0819	PG0820			TRUE	1.000	26.000	0.889	0.014	Y	NA
562166	562167	PG0820	PG0821			TRUE	0.891	7.000	0.000	NA		NA
562169	562170	PG0823	PG0824			TRUE	0.667	38.000	0.000	NA		NA
562172	562173	PG0826	PG0827			TRUE	0.407	97.000	0.000	1.000	N	NA
562173	10692455	PG0827	PG0828			FALSE	0.024	286.000	0.000	NA		NA
562176	562177	PG0832	PG0833			TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
562177	562178	PG0833	PG0834			FALSE	0.011	425.000	0.000	NA		NA
562180	562181	PG0838	PG0839			FALSE	0.008	438.000	0.000	1.000		NA
562181	562182	PG0839	PG0840			TRUE	0.694	-22.000	0.000	1.000		NA
562183	562184	PG0841	PG0842			FALSE	0.203	136.000	0.000	NA		NA
562184	562185	PG0842	PG0843			TRUE	0.999	-3.000	0.200	NA		NA
562187	10692457	PGt19	PG0846	tRNA-Ser-3		FALSE	0.003	1367.000	0.000	NA		NA
562189	562190	PG0848	PG0849			TRUE	0.999	-15.000	0.455	NA		NA
562190	562191	PG0849	PG0850			TRUE	0.846	28.000	0.000	NA		NA
562191	562192	PG0850	PG0851			TRUE	0.795	-12.000	0.000	NA		NA
562193	562194	PG0853	PG0854			TRUE	0.890	1.000	0.000	NA		NA
562196	562197	PG0856	PG0857			FALSE	0.044	224.000	0.000	NA		NA
562197	562198	PG0857	PG0858			TRUE	0.999	-3.000	0.455	NA		NA
562198	562199	PG0858	PG0859			TRUE	0.999	-10.000	0.636	NA		NA
562199	562200	PG0859	PG0860			FALSE	0.352	85.000	0.000	NA		NA
562200	562201	PG0860	PG0861			TRUE	0.425	54.000	0.000	1.000		NA
562201	562202	PG0861	PG0862			TRUE	0.999	11.000	0.207	0.021		NA
562203	562204	PG0864	PG0865			TRUE	0.570	97.000	0.000	0.084	Y	NA
562206	562207	PG0867	PG0868			TRUE	1.000	-3.000	1.000	NA		NA
562207	562208	PG0868	PG0869			TRUE	0.999	-3.000	0.333	NA		NA
562208	562209	PG0869	PG0870			FALSE	0.303	101.000	0.000	NA		NA
562209	562210	PG0870	PG0871			FALSE	0.311	98.000	0.000	NA		NA
562210	562211	PG0871	PG0872			TRUE	0.891	10.000	0.000	NA		NA
562211	562212	PG0872	PG0873			FALSE	0.004	905.000	0.000	NA		NA
562212	562213	PG0873	PG0874			TRUE	0.984	102.000	0.250	NA		NA
562213	562214	PG0874	PG0875			FALSE	0.246	89.000	0.000	0.083		NA
562214	562215	PG0875	PG0876		thdF	FALSE	0.027	246.000	0.000	1.000		NA
562215	562216	PG0876	PG0877	thdF		TRUE	0.796	32.000	0.000	NA		NA
562216	562217	PG0877	PG0879			FALSE	0.012	386.000	0.000	NA		NA
562218	562219	PG0880	PG0881	bcp	recA	TRUE	0.996	21.000	0.022	1.000	N	NA
562219	562220	PG0881	PG0882	recA		FALSE	0.194	110.000	0.000	0.083		NA
562220	562221	PG0882	PG0883			TRUE	0.999	-3.000	0.400	NA		NA
562221	562222	PG0883	PG0884			TRUE	0.999	-3.000	0.500	NA		NA
562222	562223	PG0884	PG0885			TRUE	0.920	16.000	0.000	1.000	N	NA
562223	562224	PG0885	PG0886			TRUE	0.909	-3.000	0.000	1.000	N	NA
562224	562225	PG0886	PG0888			FALSE	0.020	304.000	0.000	NA		NA
562225	562226	PG0888	PG0889			TRUE	0.451	59.000	0.000	NA		NA
562226	562227	PG0889	PG0890			TRUE	0.995	36.000	0.083	1.000	N	NA
562228	562229	PG0893	PG0894		radC	FALSE	0.055	237.000	0.000	1.000	N	NA
562230	562231	PGt20	PG0896	tRNA-Met-1	lacZ-2	FALSE	0.026	277.000	0.000	NA		NA
562232	562233	PG0897	PG0898			TRUE	0.983	87.000	0.194	1.000		NA
562233	562234	PG0898	PG0899		cydB	FALSE	0.133	147.000	0.000	1.000		NA
562234	562235	PG0899	PG0900	cydB	cydA	TRUE	0.999	46.000	0.962	0.041	Y	NA
562235	562236	PG0900	PG0901	cydA		TRUE	1.000	26.000	0.887	NA		NA
562236	562237	PG0901	PG0902			FALSE	0.083	183.000	0.000	NA		NA
562237	562238	PG0902	PG0903			FALSE	0.199	127.000	0.000	1.000		NA
562240	562241	PG0908	PG0909			TRUE	0.887	17.000	0.000	NA		NA
562241	562242	PG0909	PG0910			TRUE	0.961	55.000	0.029	NA		NA
562242	562243	PG0910	PG0912			FALSE	0.241	125.000	0.000	NA		NA
562243	562244	PG0912	PG0914			FALSE	0.015	348.000	0.000	NA		NA
562246	562247	PGt21	PG0917	tRNA-Ala-2		TRUE	0.461	56.000	0.000	NA		NA
562247	562248	PG0917	PG0918			TRUE	0.998	-34.000	0.500	NA		NA
562248	562249	PG0918	PG0919		pyrC	FALSE	0.108	167.000	0.000	NA		NA
562249	562250	PG0919	PG0920	pyrC		TRUE	0.999	11.000	0.136	NA	N	NA
562250	562251	PG0920	PG0922			FALSE	0.190	203.000	0.000	NA	Y	NA
562251	562252	PG0922	PG0923		rbfA	TRUE	0.997	28.000	0.067	1.000	N	NA
562252	562253	PG0923	PG0924	rbfA		TRUE	0.612	39.000	0.000	1.000		NA
562253	562254	PG0924	PG0925		tmk	TRUE	0.986	-3.000	0.004	1.000		NA
562254	562255	PG0925	PG0926	tmk		FALSE	0.229	128.000	0.000	NA		NA
562255	562256	PG0926	PG0927			TRUE	0.994	0.000	0.018	NA		NA
562256	562257	PG0927	PG0928			TRUE	0.996	12.000	0.033	1.000		NA
562257	562258	PG0928	PG0929			TRUE	0.528	49.000	0.000	NA		NA
562258	562259	PG0929	PG0930			TRUE	1.000	4.000	0.667	NA		NA
562259	10692458	PG0930	PG0931			TRUE	0.891	8.000	0.000	NA		NA
562260	562261	PG0932	PG0933			FALSE	0.049	244.000	0.000	1.000	N	NA
562262	562263	PG0934	PG0935		ispE	TRUE	0.810	-21.000	0.000	1.000	N	NA
562263	562264	PG0935	PG0936	ispE		TRUE	0.806	29.000	0.000	1.000		NA
562264	562265	PG0936	PG0937			TRUE	0.998	21.000	0.125	NA		NA
562265	562266	PG0937	PG0938			TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
10692459	562267	PG0940	PG0942			TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
562267	562268	PG0942	PG0943			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
562269	562270	PG0945	PG0946			TRUE	1.000	5.000	0.619	NA		NA
562270	562271	PG0946	PG0947			TRUE	0.993	3.000	0.018	1.000		NA
562272	562273	PG0948	PG0949			TRUE	0.995	19.000	0.019	1.000	N	NA
562273	562274	PG0949	PG0950		gcvH	FALSE	0.149	168.000	0.000	1.000	N	NA
562274	562275	PG0950	PG0951	gcvH	purE	TRUE	0.995	1.000	0.017	1.000	N	NA
562275	562276	PG0951	PG0952	purE	ispG	TRUE	0.765	174.000	0.023	1.000	N	NA
562276	562277	PG0952	PG0953	ispG	dut	TRUE	0.922	57.000	0.004	1.000	N	NA
562277	562278	PG0953	PG0954	dut		TRUE	0.995	28.000	0.028	1.000	N	NA
562278	562279	PG0954	PG0955			TRUE	0.995	-93.000	0.162	NA		NA
562279	562280	PG0955	PG0956			TRUE	0.999	12.000	0.155	NA		NA
562280	562281	PG0956	PG0957		ribF	TRUE	0.852	-12.000	0.000	1.000	N	NA
562282	562283	PG0958	PG0959		mrp	FALSE	0.005	653.000	0.000	1.000		NA
562283	562284	PG0959	PG0960	mrp		TRUE	0.997	20.000	0.073	1.000		NA
562284	562285	PG0960	PG0961			TRUE	0.541	48.000	0.000	NA		NA
562285	562286	PG0961	PG0962		proS	TRUE	0.465	55.000	0.000	NA		NA
562286	562287	PG0962	PG0963	proS		FALSE	0.026	279.000	0.000	NA		NA
562287	10692460	PG0963	PG0964			TRUE	0.421	67.000	0.000	NA		NA
10692460	562288	PG0964	PG0965			TRUE	0.891	2.000	0.000	NA		NA
562289	562290	PG0968	PGt22	mrr	tRNA-Leu-3	FALSE	0.188	139.000	0.000	NA		NA
562292	562293	PG0970	PG0971			FALSE	0.069	183.000	0.000	1.000		NA
562293	562294	PG0971	PG0972			TRUE	0.995	7.000	0.025	NA		NA
562294	562295	PG0972	PG0973			FALSE	0.058	204.000	0.000	NA		NA
562295	562296	PG0973	PG0975			FALSE	0.006	802.000	0.000	1.000	N	NA
562296	562297	PG0975	PG0976			TRUE	0.981	50.000	0.055	0.098	N	NA
562297	562298	PG0976	PG0977		ubiE	TRUE	0.992	32.000	0.025	1.000	N	NA
562298	562299	PG0977	PG0978	ubiE	aroE	TRUE	0.995	-3.000	0.020	1.000	N	NA
562299	562300	PG0978	PG0979	aroE		TRUE	0.702	-30.000	0.000	NA		NA
562300	562301	PG0979	PG0980			TRUE	0.785	-13.000	0.000	NA		NA
562301	562302	PG0980	PGt23		tRNA-Phe-1	FALSE	0.005	709.000	0.000	NA		NA
562302	562303	PGt23	PG0982	tRNA-Phe-1		FALSE	0.012	392.000	0.000	NA		NA
562305	562306	PG0985	PG0986			TRUE	0.998	-10.000	0.154	NA		NA
562306	562307	PG0986	PG0987			TRUE	0.886	16.000	0.000	NA		NA
562308	562309	PG0989	PG0990	rplT	rpmI	TRUE	0.997	113.000	0.928	0.027	Y	NA
562309	562310	PG0990	PG0991	rpmI	infC	TRUE	0.997	78.000	0.652	1.000	Y	NA
562310	562311	PG0991	PG0992	infC	thrS	TRUE	0.981	104.000	0.080	1.000	Y	NA
562314	562315	PG0996	PG0997			FALSE	0.093	166.000	0.000	1.000		NA
562315	562316	PG0997	PG0998			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562316	562317	PG0998	PG0999			TRUE	0.891	2.000	0.000	NA		NA
562317	562318	PG0999	PG1000			TRUE	0.879	23.000	0.000	NA		NA
562318	562319	PG1000	PG1001			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
562319	562320	PG1001	PG1002			TRUE	0.891	5.000	0.000	NA		NA
562320	562321	PG1002	PG1003			FALSE	0.386	75.000	0.000	NA		NA
562322	562323	PG1004	PG1005			FALSE	0.019	311.000	0.000	NA		NA
562323	562324	PG1005	PG1006			TRUE	0.812	31.000	0.000	NA		NA
562324	562325	PG1006	PG1007			TRUE	0.732	40.000	0.000	1.000	N	NA
562325	562326	PG1007	PG1008			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562326	562327	PG1008	PG1009			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562327	562328	PG1009	PG1010			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
562328	562329	PG1010	PG1012			FALSE	0.007	753.000	0.000	1.000	N	NA
562330	562331	PG1013	PG1014			FALSE	0.012	533.000	0.000	1.000	N	NA
562333	562334	PG1017	PG1018	ppdK		TRUE	0.825	30.000	0.000	NA		NA
562334	562335	PG1018	PG1019			TRUE	0.889	13.000	0.000	NA		NA
562335	562336	PG1019	PG1020			TRUE	0.904	172.000	0.133	NA		NA
562339	562340	PG1024	PG1025			FALSE	0.016	345.000	0.000	NA		NA
562340	562341	PG1025	PG1026			TRUE	0.998	-52.000	0.714	NA		NA
562343	562344	PG1028	PG1029			TRUE	0.432	64.000	0.000	NA		NA
562344	562345	PG1029	PG1030			FALSE	0.170	144.000	0.000	NA		NA
562347	562348	PG1032	PG1033			FALSE	0.118	163.000	0.000	NA		NA
562348	562349	PG1033	PG1034			TRUE	1.000	19.000	0.482	NA	Y	NA
562349	562350	PG1034	PG1035			TRUE	0.735	-22.000	0.000	NA		NA
562350	562351	PG1035	PG1036		uvrA-1	FALSE	0.404	71.000	0.000	NA		NA
562351	562352	PG1036	PG1037	uvrA-1		TRUE	0.981	26.000	0.002	1.000		NA
562352	562353	PG1037	PG1038			TRUE	0.994	0.000	0.021	1.000		NA
562354	562355	PG1039	PG1040			FALSE	0.009	433.000	0.000	1.000		NA
562355	562356	PG1040	PG1041			TRUE	0.920	21.000	0.000	1.000	N	NA
562356	562357	PG1041	PG1042			TRUE	0.512	69.000	0.000	1.000	N	NA
562357	562358	PG1042	PG1043		feoB-1	TRUE	0.764	37.000	0.000	1.000	N	NA
562358	562359	PG1043	PG1044	feoB-1		TRUE	0.821	34.000	0.000	1.000	N	NA
562360	562361	PGt24	PG1048	tRNA-Thr-2		FALSE	0.071	193.000	0.000	NA		NA
562361	562362	PG1048	PG1049			TRUE	0.999	41.000	0.827	NA	N	NA
562362	562363	PG1049	PG1050			TRUE	0.891	7.000	0.000	NA		NA
562363	562364	PG1050	PG1051			TRUE	0.630	42.000	0.000	NA		NA
562364	562365	PG1051	PG1052			TRUE	0.429	65.000	0.000	NA		NA
562365	562366	PG1052	PG1053			TRUE	0.904	19.000	0.000	0.023	N	NA
562368	562369	PG1056	PG1057			TRUE	0.999	20.000	0.139	1.000	N	NA
562369	562370	PG1057	PG1058			TRUE	0.861	22.000	0.000	1.000		NA
562374	562375	PG1063	PG1064			TRUE	0.976	52.000	0.057	1.000		NA
562375	562376	PG1064	PG1065		pyrD	TRUE	0.999	-18.000	0.592	1.000	N	NA
562376	562377	PG1065	PG1066	pyrD	ctfA	FALSE	0.040	271.000	0.000	1.000	N	NA
562377	562378	PG1066	PG1067	ctfA		TRUE	0.991	54.000	0.200	NA		NA
562378	562379	PG1067	PG1068			TRUE	0.999	28.000	0.583	NA		NA
562379	562380	PG1068	PG1069			TRUE	0.996	42.000	0.250	1.000		NA
562380	562381	PG1069	PG1070		kamA	TRUE	0.978	87.000	0.093	1.000	N	NA
562381	562382	PG1070	PG1071	kamA		TRUE	0.957	129.000	0.113	NA		NA
562382	562383	PG1071	PG1072			TRUE	1.000	0.000	0.591	NA		NA
562383	562384	PG1072	PG1073		kamD	TRUE	0.999	28.000	0.406	1.000		NA
562384	562385	PG1073	PG1074	kamD	kamE	TRUE	0.999	-3.000	0.788	0.001		NA
562385	562386	PG1074	PG1075	kamE		TRUE	0.998	24.000	0.121	1.000		NA
562386	562387	PG1075	PG1076		acdA	TRUE	0.998	45.000	0.375	1.000	Y	NA
562387	562388	PG1076	PG1077	acdA	etfB-2	TRUE	0.999	15.000	0.250	0.040	N	NA
562388	562389	PG1077	PG1078	etfB-2	etfA-2	TRUE	1.000	14.000	0.250	0.012	Y	NA
562389	562390	PG1078	PG1079	etfA-2		TRUE	0.968	104.000	0.081	1.000	N	NA
562390	562391	PG1079	PG1080			TRUE	0.998	47.000	0.486	1.000	Y	NA
562392	562393	PG1081	PG1082	ackA	pta	TRUE	0.999	46.000	0.605	1.000	Y	NA
562393	562394	PG1082	PG1083	pta		FALSE	0.044	210.000	0.000	1.000		NA
562394	562395	PG1083	PG1084			TRUE	0.491	48.000	0.000	1.000		NA
562396	562397	PG1085	PG1087			FALSE	0.014	354.000	0.000	NA		NA
562398	562399	PG1088	PG1089		rprY	FALSE	0.274	97.000	0.000	1.000		NA
562400	562401	PG1091	PG1093			FALSE	0.276	109.000	0.000	NA		NA
562401	562402	PG1093	PG1094		pgm	TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
562402	562403	PG1094	PG1095	pgm		TRUE	0.932	84.000	0.017	1.000	N	NA
562403	562404	PG1095	PG1096			FALSE	0.048	217.000	0.000	NA		NA
562404	562405	PG1096	PG1097			TRUE	0.996	36.000	0.164	NA		NA
562406	562407	PG1098	PGt25		tRNA-Arg-2	TRUE	0.454	58.000	0.000	NA		NA
562407	562408	PGt25	PGt26	tRNA-Arg-2	tRNA-Arg-3	TRUE	0.713	36.000	0.000	NA		NA
562408	562409	PGt26	PG1099	tRNA-Arg-3		FALSE	0.323	95.000	0.000	NA		NA
562409	562410	PG1099	PG1100			TRUE	0.999	-7.000	0.591	NA		NA
562410	562411	PG1100	PG1101			TRUE	0.921	-3.000	0.000	NA	N	NA
562411	562412	PG1101	PG1102			FALSE	0.010	391.000	0.000	1.000		NA
562413	562414	PG1103	PG1104			TRUE	0.789	26.000	0.000	0.020		NA
562415	562416	PG1105	PG1106	rpoN	murF	TRUE	0.990	-6.000	0.014	1.000	N	NA
562418	562419	PG1108	PG1109			FALSE	0.018	317.000	0.000	NA		NA
562423	562424	PG1114	PG1115	panD	ffh	TRUE	0.871	77.000	0.002	1.000	N	NA
562424	562425	PG1115	PG1116	ffh	folD	TRUE	0.924	124.000	0.032	1.000	N	NA
562425	562426	PG1116	PG1117	folD		FALSE	0.109	189.000	0.000	1.000	N	NA
562429	10692463	PG1121	PG1122	asnS		TRUE	0.796	32.000	0.000	NA		NA
10692463	562430	PG1122	PG1123		purB	FALSE	0.005	665.000	0.000	NA		NA
562430	562431	PG1123	PG1124	purB		FALSE	0.176	135.000	0.000	1.000		NA
562431	562432	PG1124	PG1125			TRUE	0.990	35.000	0.040	NA		NA
562432	562433	PG1125	PG1126		uraA	TRUE	0.888	19.000	0.000	NA		NA
562434	562435	PG1127	PG1128		xseA	TRUE	0.652	47.000	0.000	1.000	N	NA
562435	562436	PG1128	PG1129	xseA	nrd	FALSE	0.037	279.000	0.000	1.000	N	NA
562436	562437	PG1129	PG1130	nrd		FALSE	0.253	103.000	0.000	1.000		NA
562437	562438	PG1130	PG1132		valS	FALSE	0.003	862.000	0.000	1.000		NA
562438	562439	PG1132	PG1133	valS		TRUE	0.984	29.000	0.004	NA		NA
562439	562440	PG1133	PGt27		tRNA-Thr-3	TRUE	0.445	61.000	0.000	NA		NA
562440	562441	PGt27	PG1134	tRNA-Thr-3	trxB	FALSE	0.069	194.000	0.000	NA		NA
562441	562442	PG1134	PG1135	trxB		FALSE	0.012	569.000	0.000	NA	N	NA
562443	562444	PG1136	PG1137		porS	TRUE	0.992	-37.000	0.079	1.000		NA
562444	562445	PG1137	PG1138	porS	porR	TRUE	0.996	-3.000	0.045	1.000		NA
562445	562446	PG1138	PG1139	porR		FALSE	0.075	180.000	0.000	1.000		NA
562446	562447	PG1139	PG1140			FALSE	0.272	111.000	0.000	NA		NA
562447	562448	PG1140	PG1141			TRUE	0.995	6.000	0.025	NA		NA
562448	562449	PG1141	PG1142			FALSE	0.017	337.000	0.000	NA		NA
562449	562450	PG1142	PG1143			FALSE	0.143	151.000	0.000	NA		NA
562450	10692464	PG1143	PG1144			TRUE	0.605	44.000	0.000	NA		NA
10692464	562451	PG1144	PG1145			FALSE	0.108	167.000	0.000	NA		NA
562452	562453	PG1148	PG1149			FALSE	0.015	346.000	0.000	NA		NA
562453	562454	PG1149	PG1150			FALSE	0.199	137.000	0.000	NA		NA
562454	562455	PG1150	PG1151			TRUE	0.751	-19.000	0.000	NA		NA
562456	562457	PG1152	PG1153			TRUE	0.825	30.000	0.000	NA		NA
562457	562458	PG1153	PG1154			TRUE	0.891	8.000	0.000	NA		NA
562459	562460	PG1155	PG1156			TRUE	0.727	-16.000	0.000	1.000		NA
562461	562462	PG1159	PG1160	cbiB		TRUE	0.998	14.000	0.090	0.010	N	NA
562462	10692465	PG1160	PG1161			TRUE	0.822	-7.000	0.000	NA		NA
10692465	562463	PG1161	PG1162			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562463	562464	PG1162	PG1163		cbiA	TRUE	0.995	23.000	0.042	0.010		NA
562464	562465	PG1163	PG1164	cbiA		FALSE	0.005	726.000	0.000	NA		NA
562465	562466	PG1164	PG1165			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562466	562467	PG1165	PG1166			FALSE	0.393	73.000	0.000	NA		NA
562470	562471	PG1170	PG1171			FALSE	0.030	320.000	0.000	NA	N	NA
562471	562472	PG1171	PG1172			TRUE	0.997	78.000	0.508	NA	Y	NA
562472	562473	PG1172	PG1173			TRUE	0.998	-24.000	0.508	0.002		NA
562474	562475	PG1174	PG1175			FALSE	0.009	463.000	0.000	NA		NA
562475	562476	PG1175	PG1176			TRUE	0.999	47.000	0.667	0.002	Y	NA
562476	562477	PG1176	PG1177			FALSE	0.204	150.000	0.000	1.000	N	NA
562477	562478	PG1177	PG1178			FALSE	0.087	181.000	0.000	NA		NA
562478	562479	PG1178	PG1179			TRUE	1.000	4.000	0.857	NA		NA
562479	562480	PG1179	PG1180			TRUE	0.995	78.000	0.714	NA		NA
562480	562481	PG1180	PG1181			TRUE	0.592	41.000	0.000	1.000		NA
562481	562482	PG1181	PG1184			FALSE	0.006	1080.000	0.000	NA	N	NA
562482	562483	PG1184	PG1185			TRUE	0.883	22.000	0.000	NA		NA
562483	562484	PG1185	PG1186			TRUE	0.542	-49.000	0.000	0.016		NA
562485	562486	PG1189	PG1190		hprA	FALSE	0.035	240.000	0.000	NA		NA
562486	562487	PG1190	PG1195	hprA	bioF-2	FALSE	0.012	914.000	0.000	1.000	Y	NA
562487	562488	PG1195	PG1196	bioF-2		TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
562490	562491	PG1198	PG1199			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
562492	10692466	PG1200	PG1201			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
10692466	562493	PG1201	PG1202			FALSE	0.125	160.000	0.000	NA		NA
562493	562494	PG1202	PG1203			FALSE	0.037	223.000	0.000	1.000		NA
562496	562497	PG1206	PG1207			TRUE	0.822	-7.000	0.000	NA		NA
562497	562498	PG1207	PG1208		dnaK	TRUE	0.438	62.000	0.000	NA		NA
562499	562500	PG1209	PG1210			TRUE	0.952	49.000	0.015	NA		NA
562500	562501	PG1210	PG1211			TRUE	0.987	-30.000	0.043	1.000		NA
562501	562502	PG1211	PG1212			TRUE	0.868	13.000	0.000	1.000		NA
562502	562503	PG1212	PG1213		rnhA	TRUE	0.818	28.000	0.000	1.000		NA
562503	562504	PG1213	PG1214	rnhA		TRUE	0.991	-51.000	0.071	NA		NA
562504	562505	PG1214	PG1215			FALSE	0.015	351.000	0.000	NA		NA
562505	562506	PG1215	PG1216			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562506	562507	PG1216	PG1217			TRUE	0.805	-10.000	0.000	NA		NA
562507	562508	PG1217	PG1218			TRUE	0.998	30.000	0.172	NA		NA
562508	562509	PG1218	PG1219			FALSE	0.027	276.000	0.000	NA		NA
562509	562510	PG1219	PG1220			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
562510	562511	PG1220	PG1221			TRUE	0.834	10.000	0.000	0.040		NA
562513	10692467	PG1223	PG1224			FALSE	0.039	235.000	0.000	NA		NA
10692467	562514	PG1224	PG1225			TRUE	0.864	26.000	0.000	NA		NA
562514	562515	PG1225	PG1226			TRUE	0.870	8.000	0.000	1.000		NA
562516	562517	PG1229	PG1230			FALSE	0.278	108.000	0.000	NA		NA
562517	562518	PG1230	PG1232		gdh	FALSE	0.056	206.000	0.000	NA		NA
562519	562520	PG1233	PG1234			FALSE	0.257	117.000	0.000	NA		NA
562522	562523	PG1236	PG1237			TRUE	1.000	-3.000	0.793	NA		NA
10692468	562524	PG1238	PG1239		fabG	TRUE	0.605	44.000	0.000	NA		NA
562524	562525	PG1239	PG1240	fabG		TRUE	0.989	84.000	0.204	1.000	N	NA
562525	562526	PG1240	PGt28		tRNA-Gln-2	FALSE	0.031	252.000	0.000	NA		NA
562527	562528	PG1241	PG1242	lepA	dnaB	TRUE	0.969	35.000	0.002	1.000	N	NA
562528	562529	PG1242	PG1244	dnaB		FALSE	0.023	513.000	0.000	0.075	Y	NA
562529	562530	PG1244	PG1246		alaS	FALSE	0.005	1180.000	0.000	1.000	N	NA
562530	562531	PG1246	PG1247	alaS	aroB	TRUE	0.991	15.000	0.003	1.000	N	NA
562531	562532	PG1247	PGt29	aroB	tRNA-Pro-2	TRUE	0.713	36.000	0.000	NA		NA
562533	562534	PG1248	PG1249			TRUE	0.931	15.000	0.000	NA	N	NA
562534	562535	PG1249	PG1250			TRUE	0.879	23.000	0.000	NA		NA
562537	562538	PG1252	PG1253		ligA	TRUE	0.922	13.000	0.000	1.000	N	NA
562538	562539	PG1253	PG1254	ligA		TRUE	0.852	-12.000	0.000	1.000	N	NA
562539	562540	PG1254	PG1255		recR	TRUE	0.924	7.000	0.000	1.000	N	NA
562540	562541	PG1255	PG1256	recR		TRUE	0.987	-3.000	0.002	1.000	N	NA
562541	562542	PG1256	PG1257			FALSE	0.061	199.000	0.000	NA		NA
562542	562543	PG1257	PG1258		hup-2	TRUE	0.812	31.000	0.000	NA		NA
562543	562544	PG1258	PG1259	hup-2	nrdG	FALSE	0.353	112.000	0.000	1.000	N	NA
562544	562545	PG1259	PG1260	nrdG		TRUE	0.999	33.000	0.315	1.000	N	NA
562547	562548	PG1262			Pg5SB	FALSE	0.005	739.000	0.000	NA		NA
562548	562549			Pg5SB	Pg23SB	FALSE	0.158	147.000	0.000	NA		NA
562549	562550		PGt30	Pg23SB	tRNA-Ala-3	FALSE	0.252	119.000	0.000	NA		NA
562550	562551	PGt30	PGt31	tRNA-Ala-3	tRNA-Ile-2	TRUE	0.891	2.000	0.000	NA		NA
562551	562552	PGt31	PG1264	tRNA-Ile-2		TRUE	0.891	10.000	0.000	NA		NA
562552	562553	PG1264	PG1265			FALSE	0.223	129.000	0.000	NA		NA
562553	562554	PG1265			Pg16SB	FALSE	0.265	113.000	0.000	NA		NA
562554	562555		PG1266	Pg16SB		TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
562556	562557	PG1267	PG1268			FALSE	0.036	238.000	0.000	NA		NA
562558	562559	PG1269	PG1270	pruA		FALSE	0.333	77.000	0.000	1.000		NA
562559	562560	PG1270	PG1271			TRUE	0.990	7.000	0.008	1.000		NA
562560	562561	PG1271	PG1273			FALSE	0.035	239.000	0.000	NA		NA
562562	562563	PG1274	PG1276	efp-2		FALSE	0.006	536.000	0.000	1.000		NA
562563	562564	PG1276	PG1277			FALSE	0.017	303.000	0.000	1.000		NA
562564	562565	PG1277	PG1278		serC	FALSE	0.025	333.000	0.000	1.000	N	NA
562565	562566	PG1278	PG1279	serC		TRUE	0.993	101.000	0.238	1.000	Y	NA
562566	562567	PG1279	PG1280			TRUE	0.998	19.000	0.109	1.000		NA
562567	562568	PG1280	PG1281			FALSE	0.233	127.000	0.000	NA		NA
562568	562569	PG1281	PG1282			TRUE	0.991	24.000	0.011	NA		NA
562569	562570	PG1282	PG1283			TRUE	0.926	63.000	0.016	1.000		NA
562570	562571	PG1283	PG1285			FALSE	0.077	179.000	0.000	1.000		NA
562573	562574	PG1288	PG1289	gmd	fcl	TRUE	0.926	-7.000	0.000	0.006	Y	NA
562574	562575	PG1289	PG1290	fcl	ilvE	FALSE	0.255	139.000	0.000	1.000	N	NA
562577	562578	PG1294	PG1296	feoB-2		FALSE	0.051	213.000	0.000	NA		NA
562578	562579	PG1296	PG1297		rpsA	FALSE	0.007	582.000	0.000	NA		NA
562580	562581	PG1300	PG1301			TRUE	0.978	37.000	0.017	NA		NA
562581	562582	PG1301	PG1302			TRUE	0.996	18.000	0.042	NA		NA
562584	562585	PG1304	PG1305		gcvP	FALSE	0.063	197.000	0.000	NA		NA
562585	562586	PG1305	PG1306	gcvP		TRUE	0.994	5.000	0.021	1.000		NA
562586	562587	PG1306	PG1307		gidB	TRUE	0.993	-3.000	0.024	1.000		NA
562587	562588	PG1307	PG1308	gidB		TRUE	0.974	34.000	0.005	NA		NA
562589	562590	PG1310	PG1311			TRUE	0.690	-37.000	0.000	NA		NA
562590	562591	PG1311	PG1312			TRUE	0.869	11.000	0.000	1.000		NA
562591	562592	PG1312	PG1313			FALSE	0.006	809.000	0.000	1.000	N	NA
562592	562593	PG1313	PGt32		tRNA-Arg-4	FALSE	0.393	73.000	0.000	NA		NA
562594	562595	PG1314	PG1315	aroC	slyD	TRUE	0.757	150.000	0.008	1.000	N	NA
562595	562596	PG1315	PG1316	slyD		TRUE	0.501	51.000	0.000	NA		NA
562596	562597	PG1316	PG1317			TRUE	0.996	-27.000	0.143	NA		NA
562597	562598	PG1317	PG1318			TRUE	0.988	48.000	0.095	NA		NA
562602	562603	PG1324	PG1325	ruvC		TRUE	0.922	73.000	0.016	NA		NA
562605	562606	PG1327	PG1328			TRUE	0.736	43.000	0.000	NA	N	NA
562607	10692469	PG1330	PG1331	mscL		FALSE	0.013	379.000	0.000	NA		NA
10692469	562608	PG1331	PG1332		pntB	TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562609	562610	PG1333	PG1334			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562610	562611	PG1334	PG1335			TRUE	0.999	28.000	0.259	NA	Y	NA
562612	562613	PG1337	PG1338	umuD	umuC	TRUE	0.870	8.000	0.000	1.000		NA
562615	562616	PG1341	PG1342		murB	TRUE	0.990	0.000	0.006	NA		NA
562616	562617	PG1342	PG1343	murB	lipB	TRUE	0.996	27.000	0.056	1.000		NA
562617	562618	PG1343	PG1345	lipB		FALSE	0.007	484.000	0.000	1.000		NA
562618	562619	PG1345	PG1346			TRUE	0.948	-3.000	0.000	0.016	Y	NA
562619	562620	PG1346	PG1347			FALSE	0.169	137.000	0.000	1.000		NA
562620	562621	PG1347	PG1348			TRUE	0.984	28.000	0.005	1.000		NA
562621	562622	PG1348	PG1350			FALSE	0.004	1377.000	0.000	1.000	N	NA
562623	562624	PG1351	PG1352			TRUE	0.982	-7.000	0.004	NA		NA
562624	562625	PG1352	PG1353		pyrE	TRUE	0.986	51.000	0.096	NA		NA
562625	562626	PG1353	PG1354	pyrE		FALSE	0.234	111.000	0.000	1.000		NA
562626	562627	PG1354	PG1355			TRUE	0.997	-3.000	0.082	1.000		NA
562627	562628	PG1355	PG1356			TRUE	0.985	69.000	0.144	NA		NA
562628	562629	PG1356	PG1357			FALSE	0.009	478.000	0.000	NA		NA
562629	562630	PG1357	PG1358			FALSE	0.067	195.000	0.000	NA		NA
562630	562631	PG1358	PG1359			FALSE	0.019	311.000	0.000	NA		NA
562631	562632	PG1359	PG1360		purD	TRUE	0.994	3.000	0.019	NA		NA
562632	562633	PG1360	PG1361	purD		TRUE	0.994	-3.000	0.017	1.000	N	NA
562633	562634	PG1361	PG1362			TRUE	0.994	32.000	0.035	1.000	N	NA
562636	562637	PG1364	PG1365	dxr		TRUE	0.992	-3.000	0.008	1.000	N	NA
562637	562638	PG1365	PG1366		murA	TRUE	0.996	7.000	0.024	1.000	N	NA
562638	562639	PG1366	PG1367	murA		TRUE	0.999	31.000	0.354	NA		NA
562639	562640	PG1367	PG1368		pgi	TRUE	0.990	20.000	0.005	NA		NA
562640	562641	PG1368	PG1369	pgi	gpsA	TRUE	0.995	33.000	0.055	1.000	N	NA
562641	562642	PG1369	PG1370	gpsA	lysS	TRUE	0.954	86.000	0.034	1.000	N	NA
562642	562643	PG1370	PG1371	lysS		FALSE	0.327	123.000	0.000	1.000	N	NA
562643	562644	PG1371	PG1372			TRUE	0.906	71.000	0.011	1.000		NA
562649	562650	PG1379	PG1380			TRUE	0.998	52.000	0.500	1.000	Y	NA
562650	562651	PG1380	PG1381			TRUE	1.000	-3.000	0.778	1.000	Y	NA
562651	562652	PG1381	PG1382			TRUE	0.683	-40.000	0.000	NA		NA
562652	562653	PG1382	PG1383			FALSE	0.061	199.000	0.000	NA		NA
562654	562655	PG1385	PG1386		gyrA	TRUE	0.988	34.000	0.031	1.000		NA
562655	562656	PG1386	PG1387	gyrA		FALSE	0.081	184.000	0.000	NA		NA
562656	562657	PG1387	PG1388			TRUE	0.686	37.000	0.000	NA		NA
562657	562658	PG1388	PG1389			TRUE	0.751	-19.000	0.000	NA		NA
562660	562661	PG1392	PG1393			TRUE	0.997	-10.000	0.161	1.000		NA
562661	562662	PG1393	PG1394			TRUE	0.998	-7.000	0.220	1.000		NA
562662	562663	PG1394	PG1395			TRUE	0.998	0.000	0.104	0.004		NA
562663	562664	PG1395	PG1396		mreB	TRUE	0.999	38.000	0.689	1.000	N	NA
562664	562665	PG1396	PG1397	mreB	purH	TRUE	0.960	103.000	0.059	1.000	N	NA
562667	562668	PG1401	PG1402			FALSE	0.052	253.000	0.000	NA	N	NA
562668	562669	PG1402	PG1403			TRUE	0.899	210.000	0.270	NA		NA
562669	562670	PG1403	PG1404			TRUE	0.999	32.000	0.817	0.035		NA
562670	562671	PG1404	PG1405			TRUE	0.992	27.000	0.020	1.000		NA
562671	562672	PG1405	PG1407			FALSE	0.008	443.000	0.000	1.000		NA
562677	562678	PG1414	PG1416		fabK	FALSE	0.009	433.000	0.000	1.000		NA
562678	562679	PG1416	PG1417	fabK	fumB	FALSE	0.018	297.000	0.000	1.000		NA
562679	562680	PG1417	PG1418	fumB	dnaX	FALSE	0.327	123.000	0.000	1.000	N	NA
562680	562681	PG1418	PG1419	dnaX		FALSE	0.241	125.000	0.000	NA		NA
562681	562682	PG1419	PG1420			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
562683	562684	PG1421	PG1422		dacB	FALSE	0.014	336.000	0.000	1.000		NA
562684	562685	PG1422	PG1423	dacB		TRUE	0.743	-21.000	0.000	NA		NA
562685	562686	PG1423	PG1424			TRUE	0.528	49.000	0.000	NA		NA
562686	562687	PG1424	PG1426			FALSE	0.016	345.000	0.000	NA		NA
562687	562688	PG1426	PG1427			FALSE	0.007	555.000	0.000	NA		NA
562688	562689	PG1427	PG1428		ribH	FALSE	0.148	141.000	0.000	1.000		NA
562689	562690	PG1428	PG1429	ribH		TRUE	0.751	-19.000	0.000	NA		NA
562690	562691	PG1429	PG1430			TRUE	0.890	1.000	0.000	NA		NA
562691	562692	PG1430	PG1431			FALSE	0.065	186.000	0.000	1.000		NA
562692	562693	PG1431	PG1432			TRUE	0.712	65.000	0.000	1.000	Y	NA
562694	562695	PG1433	PG1434		ispD	TRUE	0.964	-24.000	0.003	1.000		NA
562695	562696	PG1434	PGt33	ispD	tRNA-Asp-1	FALSE	0.043	229.000	0.000	NA		NA
562696	562697	PGt33	PG1435	tRNA-Asp-1		FALSE	0.020	308.000	0.000	NA		NA
562697	562698	PG1435	PG1436			FALSE	0.199	127.000	0.000	1.000		NA
562699	562700	PG1439	PG1440			TRUE	0.805	-10.000	0.000	NA		NA
562700	562701	PG1440	PG1441			FALSE	0.334	91.000	0.000	NA		NA
562701	562702	PG1441	PG1442			FALSE	0.379	77.000	0.000	NA		NA
10692470	562704	PG1445	PG1446			FALSE	0.024	286.000	0.000	NA		NA
562704	562705	PG1446	PG1447			FALSE	0.275	136.000	0.000	1.000	N	NA
562707	562708	PG1449	PG1450			TRUE	0.667	38.000	0.000	NA		NA
562710	562711	PG1452	PG1453			TRUE	0.891	7.000	0.000	NA		NA
562711	562712	PG1453	PG1454			TRUE	1.000	26.000	0.889	0.012	Y	NA
10692471	562713	PG1456	PG1457			FALSE	0.298	102.000	0.000	NA		NA
562713	562714	PG1457	PG1458			TRUE	0.856	27.000	0.000	NA		NA
562716	562717	PG1460	PG1461			TRUE	0.891	7.000	0.000	NA		NA
562717	562718	PG1461	PG1462			TRUE	0.889	13.000	0.000	NA		NA
562718	562719	PG1462	PG1463			TRUE	0.879	23.000	0.000	NA		NA
562719	562720	PG1463	PG1465			FALSE	0.006	591.000	0.000	NA		NA
562720	562721	PG1465	PG1466			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562721	562722	PG1466	PG1467			TRUE	0.931	15.000	0.000	NA	N	NA
562724	562725	PG1470	PG1471			FALSE	0.090	180.000	0.000	NA		NA
562725	562726	PG1471	PG1472			TRUE	0.734	35.000	0.000	NA		NA
562727	562728	PG1473	PG1474			TRUE	0.889	13.000	0.000	NA		NA
562728	562729	PG1474	PG1475			TRUE	0.832	-6.000	0.000	NA		NA
562729	562730	PG1475	PG1476			TRUE	1.000	23.000	1.000	NA		NA
562730	562731	PG1476	PG1477			TRUE	0.999	-10.000	0.667	NA		NA
562731	562732	PG1477	PG1478			TRUE	1.000	-3.000	0.667	NA		NA
562732	562733	PG1478	PG1479			TRUE	0.890	12.000	0.000	NA		NA
562733	562734	PG1479	PG1480			TRUE	0.796	32.000	0.000	NA		NA
562734	562735	PG1480	PG1481			TRUE	0.856	27.000	0.000	NA		NA
562735	562736	PG1481	PG1482			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562736	562737	PG1482	PG1483			TRUE	1.000	4.000	0.667	NA		NA
562737	562738	PG1483	PG1484			FALSE	0.074	190.000	0.000	NA		NA
562738	562739	PG1484	PG1485			TRUE	0.891	5.000	0.000	NA		NA
562739	562740	PG1485	PG1486			TRUE	0.999	-13.000	0.429	NA		NA
562741	562742	PG1487	PG1488			TRUE	0.846	28.000	0.000	NA		NA
562742	562743	PG1488	PG1489			TRUE	0.775	-15.000	0.000	NA		NA
562743	562744	PG1489	PG1490			TRUE	0.999	2.000	0.333	NA		NA
562744	562745	PG1490	PG1491			FALSE	0.018	317.000	0.000	NA		NA
562745	562746	PG1491	PG1492			FALSE	0.316	97.000	0.000	NA		NA
562746	562747	PG1492	PG1493			TRUE	0.887	17.000	0.000	NA		NA
562747	562748	PG1493	PG1494			FALSE	0.012	383.000	0.000	NA		NA
562748	562749	PG1494	PG1495		topB-2	FALSE	0.340	89.000	0.000	NA		NA
562749	562750	PG1495	PG1496	topB-2		TRUE	0.891	6.000	0.000	NA		NA
562750	562751	PG1496	PG1497			FALSE	0.009	468.000	0.000	NA		NA
562751	562752	PG1497	PG1498			FALSE	0.303	101.000	0.000	NA		NA
562752	562753	PG1498	PG1499			TRUE	0.676	-46.000	0.000	NA		NA
562753	562754	PG1499	PG1500			FALSE	0.373	78.000	0.000	NA		NA
562756	562757	PG1503	PG1504			TRUE	0.963	18.000	0.000	1.000	Y	NA
562757	562758	PG1504	PG1505			TRUE	0.478	64.000	0.000	0.034	N	NA
562758	562759	PG1505	PG1507			FALSE	0.008	499.000	0.000	NA		NA
562759	562760	PG1507	PG1508			TRUE	0.890	11.000	0.000	NA		NA
562760	562761	PG1508	PG1509			FALSE	0.358	83.000	0.000	NA		NA
562765	562766	PG1513	PG1514			TRUE	0.920	15.000	0.000	1.000	N	NA
562766	562767	PG1514	PG1515			TRUE	0.760	-12.000	0.000	1.000		NA
562767	562768	PG1515	PG1516			TRUE	0.623	-49.000	0.000	1.000		NA
562770	562771	PG1521	PG1522			TRUE	0.998	-3.000	0.104	0.037	N	NA
562771	562772	PG1522	PG1523		menB	TRUE	0.998	0.000	0.065	1.000	N	NA
562772	562773	PG1523	PG1524	menB	menD	TRUE	0.999	25.000	0.147	0.002	Y	NA
562773	562774	PG1524	PG1525	menD		TRUE	1.000	13.000	0.281	1.000	Y	NA
562774	562775	PG1525	PG1526			TRUE	0.557	67.000	0.000	NA	N	NA
562775	562776	PG1526	PG1527			FALSE	0.064	196.000	0.000	NA		NA
562777	562778	PG1528	PG1529			FALSE	0.233	127.000	0.000	NA		NA
562778	562779	PG1529	PG1530			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562779	10692473	PG1530	PG1531			FALSE	0.181	140.000	0.000	NA		NA
562780	562781	PG1532	PG1533			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562781	562782	PG1533	PG1534			TRUE	1.000	-3.000	0.667	NA		NA
562782	562783	PG1534	PG1535			TRUE	0.870	3.000	0.000	1.000		NA
562784	562785	PG1536	PG1537			TRUE	0.996	-25.000	0.155	NA		NA
562785	562786	PG1537	PG1538			TRUE	0.987	108.000	0.398	NA		NA
562786	10692474	PG1538	PG1539			TRUE	0.891	10.000	0.000	NA		NA
10692474	562787	PG1539	PG1540		queA	TRUE	0.888	18.000	0.000	NA		NA
562787	562788	PG1540	PG1541	queA	folK	TRUE	0.995	-3.000	0.023	1.000	N	NA
562788	562789	PG1541	PG1542	folK	prtC	TRUE	0.922	13.000	0.000	1.000	N	NA
562789	562790	PG1542	PG1543	prtC		TRUE	0.989	56.000	0.157	NA		NA
562790	562791	PG1543	PG1544		yaaA	FALSE	0.352	85.000	0.000	NA		NA
562791	562792	PG1544	PG1545	yaaA	sodB	FALSE	0.164	138.000	0.000	1.000		NA
562792	562793	PG1545	PG1546	sodB		TRUE	0.890	12.000	0.000	NA		NA
562793	562794	PG1546	PG1547			TRUE	0.785	-13.000	0.000	NA		NA
562794	562795	PG1547	PGt34		tRNA-Arg-5	TRUE	0.891	5.000	0.000	NA		NA
562795	10692475	PGt34	PG1548	tRNA-Arg-5		FALSE	0.168	145.000	0.000	NA		NA
562797	562798	PG1551	PG1552	hmuY	hmuR	TRUE	1.000	15.000	0.562	NA		NA
562798	562799	PG1552	PG1553	hmuR		TRUE	0.996	37.000	0.188	1.000		NA
562799	562800	PG1553	PG1554			TRUE	1.000	-3.000	0.750	NA		NA
562800	562801	PG1554	PG1555			TRUE	0.997	70.000	1.000	NA		NA
562801	562802	PG1555	PG1556			TRUE	1.000	6.000	1.000	NA		NA
562803	562804	PG1559	PG1560	gcvT	rfbB	TRUE	0.483	75.000	0.000	1.000	N	NA
562804	562805	PG1560	PG1561	rfbB	rfbD	TRUE	0.999	7.000	0.200	0.004	Y	NA
562805	562806	PG1561	PG1562	rfbD	rfbC	TRUE	0.999	-3.000	0.107	1.000	Y	NA
562806	562807	PG1562	PG1563	rfbC	rfbA	TRUE	0.962	15.000	0.000	1.000	Y	NA
562807	562808	PG1563	PG1564	rfbA		TRUE	0.537	115.000	0.000	1.000	Y	NA
562808	562809	PG1564	PG1565			TRUE	0.641	85.000	0.000	1.000	Y	NA
562809	562810	PG1565	PG1566		gltX	TRUE	0.997	25.000	0.041	1.000	N	NA
562810	562811	PG1566	PG1570	gltX		FALSE	0.005	1181.000	0.000	NA	N	NA
562811	562812	PG1570	PG1571			TRUE	0.992	-27.000	0.065	NA		NA
562812	562813	PG1571	PG1572			FALSE	0.286	93.000	0.000	1.000		NA
562813	562814	PG1572	PG1573			TRUE	0.992	65.000	0.333	1.000		NA
562814	562815	PG1573	PG1574			FALSE	0.022	293.000	0.000	NA		NA
562816	562817	PG1576	PG1577	nadB	nadC	TRUE	0.997	47.000	0.223	0.003	Y	NA
562817	562818	PG1577	PG1578	nadC	nadA	TRUE	0.999	20.000	0.198	0.003	Y	NA
562818	562819	PG1578	PG1579	nadA		FALSE	0.262	101.000	0.000	1.000		NA
562819	562820	PG1579	PG1580			TRUE	1.000	11.000	0.764	NA		NA
562820	562821	PG1580	PG1581			TRUE	0.999	-3.000	0.541	NA		NA
562821	562822	PG1581	PG1582		batA	TRUE	0.999	-3.000	0.538	NA		NA
562822	562823	PG1582	PG1583	batA	batB	TRUE	1.000	11.000	0.404	NA	Y	NA
562823	562824	PG1583	PG1584	batB	batC	TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562824	562825	PG1584	PG1585	batC	batD	FALSE	0.087	181.000	0.000	NA		NA
562825	562826	PG1585	PG1586	batD	batE	TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562826	562827	PG1586	PG1587	batE		TRUE	0.863	21.000	0.000	1.000		NA
562828	562829	PG1588	PG1589		folP	TRUE	0.986	61.000	0.133	NA		NA
562830	562831	PG1591	PGt35		tRNA-His-1	FALSE	0.368	79.000	0.000	NA		NA
562831	562832	PGt35	PG1592	tRNA-His-1		FALSE	0.050	216.000	0.000	NA		NA
562832	562833	PG1592	PG1593		aroK	TRUE	0.933	48.000	0.006	1.000		NA
562834	562835	PG1594	PG1595		rpe	TRUE	0.993	7.000	0.014	NA		NA
562836	562837	PG1596	PG1597			TRUE	0.987	70.000	0.135	1.000	N	NA
562837	562838	PG1597	PG1598			TRUE	0.999	4.000	0.157	1.000	N	NA
562838	562839	PG1598	PG1599			TRUE	0.999	-3.000	0.423	NA		NA
562840	562841	PG1600	PG1601			TRUE	0.693	35.000	0.000	1.000		NA
562841	562842	PG1601	PG1602			TRUE	0.988	-28.000	0.036	NA		NA
562843	562844	PG1603	PG1604			TRUE	0.977	-12.000	0.005	1.000		NA
562844	562845	PG1604	PG1605		pepC	FALSE	0.232	112.000	0.000	1.000		NA
562846	562847	PG1606	PG1608		mmdB	FALSE	0.003	1060.000	0.000	1.000		NA
562847	562848	PG1608	PG1609	mmdB	mmdC	TRUE	0.999	5.000	0.222	1.000	N	NA
562848	562849	PG1609	PG1610	mmdC		TRUE	0.667	38.000	0.000	NA		NA
562849	562850	PG1610	PG1611			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562850	562851	PG1611	PG1612		mmdA	TRUE	0.998	25.000	0.162	1.000		NA
562851	562852	PG1612	PG1613	mmdA		TRUE	0.954	99.000	0.067	1.000		NA
562852	562853	PG1613	PG1614		frdB	FALSE	0.034	232.000	0.000	1.000		NA
562853	562854	PG1614	PG1615	frdB	frdA	TRUE	1.000	29.000	0.470	0.002	Y	NA
562854	562855	PG1615	PG1616	frdA		TRUE	0.999	31.000	0.598	0.002		NA
562855	562856	PG1616	PG1617			TRUE	0.558	47.000	0.000	NA		NA
562857	562858	PG1618	PG1619			TRUE	0.997	-21.000	0.163	NA		NA
562859	562860	PG1620	PG1621			TRUE	0.994	-7.000	0.046	1.000		NA
562860	562861	PG1621	PG1622			TRUE	0.976	-13.000	0.005	1.000		NA
562861	562862	PG1622	PG1623			FALSE	0.396	61.000	0.000	1.000		NA
562862	562863	PG1623	PG1624			FALSE	0.003	823.000	0.000	1.000		NA
562864	562865	PG1625	PG1626			TRUE	0.957	104.000	0.074	NA		NA
562865	562866	PG1626	PG1630			FALSE	0.003	1366.000	0.000	NA		NA
562866	562867	PG1630	PG1632		galM	FALSE	0.056	206.000	0.000	NA		NA
562867	562868	PG1632	PG1633	galM	galK	TRUE	0.968	50.000	0.006	1.000	Y	NA
562869	562870	PG1634	PG1635			TRUE	0.425	66.000	0.000	NA		NA
562870	562871	PG1635	PG1636			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
562871	562872	PG1636	PG1638			FALSE	0.083	204.000	0.000	1.000	N	NA
562872	562873	PG1638	PG1639			FALSE	0.238	126.000	0.000	NA		NA
562873	562874	PG1639	PG1640		dinF	TRUE	0.886	16.000	0.000	NA		NA
562874	562875	PG1640	PG1641	dinF		TRUE	0.920	15.000	0.000	1.000	N	NA
562875	10692476	PG1641	PG1642			TRUE	0.891	8.000	0.000	NA		NA
10692476	562876	PG1642	PG1644			FALSE	0.010	458.000	0.000	NA		NA
562876	562877	PG1644	PG1645			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
562878	562879	PG1647	PG1648	cls		TRUE	0.516	68.000	0.000	1.000	N	NA
562881	562882	PG1651	PG1652			TRUE	0.829	27.000	0.000	1.000		NA
562882	562883	PG1652	PG1653			TRUE	0.847	25.000	0.000	1.000		NA
562883	562884	PG1653	PG1654			FALSE	0.320	80.000	0.000	1.000		NA
562884	562885	PG1654	PG1655			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
562885	562886	PG1655	PG1656		mutA	FALSE	0.133	155.000	0.000	NA		NA
562886	562887	PG1656	PG1657	mutA	mutB	TRUE	0.999	29.000	0.115	0.001	Y	NA
562888	562889	PG1658	PG1659			FALSE	0.010	451.000	0.000	NA		NA
562889	562890	PG1659	PG1660			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562891	562892	PG1661	PG1662			TRUE	0.751	-19.000	0.000	NA		NA
562892	562893	PG1662	PG1663			TRUE	0.888	19.000	0.000	NA		NA
562893	562894	PG1663	PG1664			TRUE	0.998	25.000	0.029	1.000	Y	NA
562894	562895	PG1664	PG1665			TRUE	0.999	23.000	0.083	0.060	Y	NA
562895	562896	PG1665	PG1666			TRUE	0.993	70.000	0.319	0.060	N	NA
562896	562897	PG1666	PG1667			TRUE	1.000	-3.000	0.528	1.000	Y	NA
562898	562899			Pg5SC	Pg23SC	FALSE	0.158	147.000	0.000	NA		NA
562899	562900		PGt36	Pg23SC	tRNA-Ala-4	FALSE	0.252	119.000	0.000	NA		NA
562900	562901	PGt36	PGt37	tRNA-Ala-4	tRNA-Ile-3	TRUE	0.891	2.000	0.000	NA		NA
562901	562902	PGt37	PG1669	tRNA-Ile-3		TRUE	0.891	10.000	0.000	NA		NA
562902	562903	PG1669	PG1670			FALSE	0.223	129.000	0.000	NA		NA
562903	562904	PG1670			Pg16SC	FALSE	0.265	113.000	0.000	NA		NA
562904	562905		PG1671	Pg16SC		TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
562906	562907	PG1672	PG1673			FALSE	0.007	584.000	0.000	NA		NA
562907	10692477	PG1673	PG1674			FALSE	0.233	127.000	0.000	NA		NA
10692477	562908	PG1674	PG1675			FALSE	0.151	148.000	0.000	NA		NA
562912	10692478	PG1679	PG1680			TRUE	0.713	36.000	0.000	NA		NA
10692478	562913	PG1680	PG1681			FALSE	0.008	487.000	0.000	NA		NA
562913	562914	PG1681	PG1682			TRUE	0.999	-3.000	0.153	1.000	Y	NA
562914	562915	PG1682	PG1683			TRUE	1.000	-3.000	0.429	1.000	Y	NA
562915	562916	PG1683	PG1684			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562917	562918	PG1685	PG1687			FALSE	0.004	814.000	0.000	NA		NA
562918	562919	PG1687	PG1688		greA	TRUE	0.999	15.000	0.108	1.000	N	NA
562919	562920	PG1688	PG1690	greA		FALSE	0.015	485.000	0.000	NA	N	NA
562920	562921	PG1690	PG1691			TRUE	0.891	7.000	0.000	NA		NA
562921	562922	PG1691	PG1692			TRUE	0.987	30.000	0.012	NA		NA
562922	562923	PG1692	PG1693			TRUE	0.997	-3.000	0.039	1.000	N	NA
562923	562924	PG1693	PG1694			TRUE	0.987	-3.000	0.003	NA		NA
562925	562926	PG1695	PG1696			FALSE	0.016	342.000	0.000	NA		NA
562926	562927	PG1696	PG1697			TRUE	1.000	10.000	0.542	NA		NA
562928	562929	PG1701	PG1702		gyrB	TRUE	0.984	-7.000	0.003	1.000	N	NA
562929	562930	PG1702	PG1703	gyrB		TRUE	0.405	58.000	0.000	1.000		NA
562930	562931	PG1703	PG1704			TRUE	0.989	18.000	0.006	1.000		NA
562931	10692479	PG1704	PG1705			TRUE	0.713	36.000	0.000	NA		NA
10692479	562932	PG1705	PG1706			TRUE	0.887	20.000	0.000	NA		NA
562932	562933	PG1706	PG1707			TRUE	0.994	21.000	0.021	NA		NA
562934	562935	PG1709	PG1710			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
562936	562937	PG1711	PG1712			TRUE	0.672	67.000	0.000	0.033	Y	NA
562937	562938	PG1712	PG1713			TRUE	0.494	82.000	0.000	NA	N	NA
562938	562939	PG1713	PG1714		pdxH	TRUE	0.791	37.000	0.000	NA	N	NA
562939	562940	PG1714	PG1715	pdxH		FALSE	0.003	901.000	0.000	1.000		NA
562940	562941	PG1715	PG1718			FALSE	0.009	476.000	0.000	NA		NA
562942	562943	PG1719	PG1720			TRUE	0.886	16.000	0.000	NA		NA
562943	562944	PG1720	PG1721		vacB	FALSE	0.181	140.000	0.000	NA		NA
562946	562947	PGt38	PG1723	tRNA-Glu-1	rpsT	TRUE	0.825	30.000	0.000	NA		NA
562947	562948	PG1723	PGt39	rpsT	tRNA-Glu-2	TRUE	0.429	65.000	0.000	NA		NA
562948	562949	PGt39	PG1724	tRNA-Glu-2	gcp	FALSE	0.025	282.000	0.000	NA		NA
562949	562950	PG1724	PG1725	gcp		TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
562950	562951	PG1725	PG1726			TRUE	0.975	33.000	0.004	NA		NA
562951	562952	PG1726	PG1727		yitL	TRUE	0.891	10.000	0.000	NA		NA
562952	562953	PG1727	PG1728	yitL		FALSE	0.399	72.000	0.000	NA		NA
562954	562955	PG1729	PG1730			TRUE	0.528	46.000	0.000	1.000		NA
562955	562956	PG1730	PG1731		aroQ	TRUE	0.868	101.000	0.014	1.000		NA
562958	562959	PG1733	PG1734			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562959	562960	PG1734	PG1735			TRUE	0.652	-33.000	0.000	1.000		NA
562960	10692480	PG1735	PG1737			TRUE	0.775	-15.000	0.000	NA		NA
10692480	562961	PG1737	PG1738			TRUE	0.605	44.000	0.000	NA		NA
562961	562962	PG1738	PG1739			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
562962	562963	PG1739	PG1741		aspA	FALSE	0.158	147.000	0.000	NA		NA
562965	562966	PG1743	PG1745	kdsA		FALSE	0.004	1087.000	0.000	0.014	N	NA
562966	562967	PG1745	PG1746			TRUE	0.480	76.000	0.000	1.000	N	NA
562967	562968	PG1746	PG1747			FALSE	0.208	148.000	0.000	1.000	N	NA
562968	562969	PG1747	PG1748		tkt	TRUE	0.991	87.000	0.144	1.000	Y	NA
562970	562971	PG1750	PG1751			FALSE	0.269	137.000	0.000	1.000	N	NA
562971	562972	PG1751	PG1752			TRUE	0.765	-16.000	0.000	NA		NA
562972	562973	PG1752	PG1753		selD	TRUE	0.988	-3.000	0.005	NA		NA
562973	562974	PG1753	PG1754	selD		TRUE	0.963	18.000	0.000	1.000	Y	NA
562975	562976	PG1755	PG1757	fbaB		FALSE	0.005	653.000	0.000	1.000		NA
562977	562978	PG1758	PG1759	rpsO		FALSE	0.341	116.000	0.000	1.000	N	NA
562978	562979	PG1759	PG1760			TRUE	1.000	-10.000	0.509	1.000	Y	NA
562979	562980	PG1760	PG1761			TRUE	0.616	-52.000	0.000	1.000		NA
562980	562981	PG1761	PG1762		secDF	FALSE	0.039	218.000	0.000	1.000		NA
562982	562983	PG1763	PG1764	rnc	fabF	TRUE	0.990	84.000	0.225	1.000	N	NA
562983	562984	PG1764	PG1765	fabF	acpP	TRUE	0.998	10.000	0.028	1.000	Y	NA
562985	562986	PG1766	PG1767	purN		TRUE	0.846	-3.000	0.000	1.000		NA
562986	562987	PG1767	PG1768			TRUE	0.839	26.000	0.000	1.000		NA
562987	562988	PG1768	PG1769			TRUE	0.891	5.000	0.000	NA		NA
562988	562989	PG1769	PG1770			FALSE	0.014	354.000	0.000	NA		NA
562989	562990	PG1770	PG1771		pheS	FALSE	0.379	77.000	0.000	NA		NA
562990	562991	PG1771	PG1772	pheS	nth	TRUE	0.991	19.000	0.004	1.000	N	NA
562991	562992	PG1772	PG1773	nth		TRUE	0.536	62.000	0.000	1.000	N	NA
562994	562995	PG1775	PG1776	grpE	dnaJ	TRUE	0.997	43.000	0.168	0.008	Y	NA
562995	562996	PG1776	PG1777	dnaJ		FALSE	0.348	86.000	0.000	NA		NA
562996	562997	PG1777	PG1778			TRUE	0.996	29.000	0.058	NA		NA
562997	562998	PG1778	PG1779			FALSE	0.361	82.000	0.000	NA		NA
562998	562999	PG1779	PG1780		bioF-3	FALSE	0.014	368.000	0.000	NA		NA
562999	563000	PG1780	PG1781	bioF-3	udk	TRUE	0.551	50.000	0.000	0.014	N	NA
563000	563001	PG1781	PG1782	udk		TRUE	0.630	42.000	0.000	NA		NA
563001	563002	PG1782	PG1783			TRUE	0.785	-13.000	0.000	NA		NA
563002	563003	PG1783	PG1784			TRUE	0.795	-12.000	0.000	NA		NA
563003	563004	PG1784	PGt40		tRNA-Val-1	FALSE	0.005	727.000	0.000	NA		NA
563004	563005	PGt40	PGt41	tRNA-Val-1	tRNA-Val-2	TRUE	0.617	43.000	0.000	NA		NA
563005	563006	PGt41	PG1786	tRNA-Val-2		FALSE	0.379	77.000	0.000	NA		NA
563009	563010	PG1789	PG1790	dcp-2		TRUE	0.887	17.000	0.000	NA		NA
563010	563011	PG1790	PG1791			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
563012	563013	PG1792	PG1793		glgB	TRUE	0.996	-3.000	0.033	1.000	N	NA
563013	563014	PG1793	PG1794	glgB	polA	TRUE	0.610	50.000	0.000	1.000	N	NA
563018	563019	PG1799	PG1801			FALSE	0.036	238.000	0.000	NA		NA
563019	563020	PG1801	PG1802			TRUE	1.000	4.000	0.667	NA		NA
563020	563021	PG1802	PG1803		atpA	TRUE	1.000	10.000	0.633	NA		NA
563021	563022	PG1803	PG1804	atpA	atpB	TRUE	1.000	12.000	0.806	0.002	Y	NA
563022	563023	PG1804	PG1805	atpB	atpD	TRUE	1.000	16.000	0.903	0.002	Y	NA
563023	563024	PG1805	PG1806	atpD	atpI	TRUE	0.999	-3.000	0.270	0.003	Y	NA
563024	563025	PG1806	PG1807	atpI	atpK	TRUE	0.897	55.000	0.006	0.003		NA
563026	563027	PG1808	PG1809	spoT		FALSE	0.047	248.000	0.000	1.000	N	NA
563027	563028	PG1809	PG1810			TRUE	1.000	29.000	0.797	0.003	Y	NA
563030	563031	PG1812	PG1813			TRUE	0.995	40.000	0.082	0.003	Y	NA
563031	563032	PG1813	PG1814		dnaG	FALSE	0.059	232.000	0.000	1.000	N	NA
563032	563033	PG1814	PG1815	dnaG	kdsB	TRUE	0.716	42.000	0.000	1.000	N	NA
563033	563034	PG1815	PG1816	kdsB		TRUE	0.846	-3.000	0.000	1.000		NA
563034	563035	PG1816	PG1817			FALSE	0.023	269.000	0.000	1.000		NA
563035	563036	PG1817	PG1818			TRUE	0.822	-7.000	0.000	NA		NA
563036	563037	PG1818	PG1819			TRUE	0.672	-48.000	0.000	NA		NA
563037	563038	PG1819	PG1820		nrfA	TRUE	0.991	71.000	0.286	NA		NA
563038	563039	PG1820	PG1821	nrfA	nrfH	TRUE	0.997	22.000	0.043	0.001	N	NA
563039	563040	PG1821	PGt42	nrfH	tRNA-Lys-1	FALSE	0.007	565.000	0.000	NA		NA
563042	563043	PG1824	PG1825	eno		FALSE	0.365	80.000	0.000	NA		NA
563043	563044	PG1825	PG1826			TRUE	0.721	-25.000	0.000	NA		NA
563046	563047	PG1828	PG1829			FALSE	0.102	171.000	0.000	NA		NA
563047	563048	PG1829	PG1831		recQ-2	FALSE	0.007	475.000	0.000	1.000		NA
563049	563050	PG1834	PG1835			TRUE	0.986	103.000	0.312	NA		NA
563050	563051	PG1835	PG1836		nupG	FALSE	0.293	103.000	0.000	NA		NA
563051	563052	PG1836	PG1837	nupG		FALSE	0.006	559.000	0.000	1.000		NA
563052	563053	PG1837	PG1840			FALSE	0.010	448.000	0.000	NA		NA
563053	563054	PG1840	PG1841			FALSE	0.323	95.000	0.000	NA		NA
563054	563055	PG1841	PG1842			TRUE	0.999	8.000	0.217	NA		NA
563055	10692481	PG1842	PG1844			FALSE	0.010	448.000	0.000	NA		NA
10692481	563056	PG1844	PG1846			FALSE	0.003	1161.000	0.000	NA		NA
563057	563058	PG1847	PG1848			TRUE	0.994	26.000	0.004	NA	Y	NA
563058	563059	PG1848	PG1849		recN	TRUE	0.993	-3.000	0.015	1.000	N	NA
563059	563060	PG1849	PG1850	recN		TRUE	0.997	15.000	0.053	NA		NA
563060	563061	PG1850	PG1851		coaBC	TRUE	0.996	-3.000	0.051	NA		NA
563061	563062	PG1851	PG1852	coaBC		TRUE	0.993	26.000	0.016	1.000	N	NA
563062	563063	PG1852	PG1853		dnaN	TRUE	0.997	13.000	0.025	0.004	Y	NA
563063	563064	PG1853	PG1854	dnaN		FALSE	0.080	206.000	0.000	1.000	N	NA
563064	563065	PG1854	PG1855			TRUE	0.984	-40.000	0.022	1.000	N	NA
563065	563066	PG1855	PG1856			TRUE	0.998	8.000	0.056	1.000	N	NA
563066	563067	PG1856	PG1857			FALSE	0.362	81.000	0.000	NA		NA
563067	563068	PG1857	PG1858			TRUE	0.967	165.000	0.462	NA		NA
563068	563069	PG1858	PG1859			FALSE	0.255	139.000	0.000	1.000	N	NA
563069	563070	PG1859	PG1860			FALSE	0.029	240.000	0.000	1.000		NA
563070	563071	PG1860	PG1861			FALSE	0.190	129.000	0.000	1.000		NA
563071	563072	PG1861	PG1862			TRUE	0.889	13.000	0.000	NA		NA
563072	563073	PG1862	PG1863			TRUE	0.890	1.000	0.000	NA		NA
563073	563074	PG1863	PG1864			TRUE	0.822	-7.000	0.000	NA		NA
563076	563077	PG1868	PG1869			TRUE	0.713	36.000	0.000	NA		NA
563077	563078	PG1869	PG1870			TRUE	0.577	46.000	0.000	NA		NA
563078	563079	PG1870	PG1871			TRUE	0.630	42.000	0.000	NA		NA
563079	563080	PG1871	PG1872		hutU	FALSE	0.393	73.000	0.000	NA		NA
563080	563081	PG1872	PG1874	hutU		FALSE	0.024	342.000	0.000	1.000	N	NA
563081	563082	PG1874	PG1875			TRUE	0.974	-13.000	0.003	NA		NA
563082	563083	PG1875	PG1876			TRUE	0.999	12.000	0.337	NA		NA
563083	563084	PG1876	PG1877		nhaA	TRUE	0.806	29.000	0.000	1.000		NA
563085	563086	PG1878	PG1879	cysS		TRUE	0.451	51.000	0.000	1.000		NA
563086	563087	PG1879	PG1880			TRUE	0.890	11.000	0.000	NA		NA
563087	563088	PG1880	PG1881			TRUE	0.777	33.000	0.000	NA		NA
563089	563090	PG1884	PG1885		ppk	TRUE	0.490	73.000	0.000	1.000	N	NA
563090	563091	PG1885	PG1886	ppk	hflX	FALSE	0.098	164.000	0.000	1.000		NA
563092	563093	PG1887	PG1888			TRUE	0.989	-3.000	0.008	1.000		NA
563093	563094	PG1888	PG1889			FALSE	0.176	141.000	0.000	NA		NA
563094	563095	PG1889	PG1890			FALSE	0.007	555.000	0.000	NA		NA
563095	563096	PG1890	PG1891			TRUE	0.432	64.000	0.000	NA		NA
563096	563097	PG1891	PG1892			FALSE	0.003	1060.000	0.000	NA		NA
563097	563098	PG1892	PG1893			FALSE	0.003	1149.000	0.000	NA		NA
563098	563099	PG1893	PG1894			FALSE	0.008	544.000	0.000	NA		NA
563099	563100	PG1894	PG1895			FALSE	0.006	607.000	0.000	NA		NA
563100	563101	PG1895	PG1896		metK	FALSE	0.011	426.000	0.000	NA		NA
563102	563103	PG1897	PG1898			TRUE	0.998	-3.000	0.035	1.000	Y	NA
563103	563104	PG1898	PG1899			TRUE	0.999	5.000	0.200	0.026	N	NA
563104	563105	PG1899	PG1900			FALSE	0.340	75.000	0.000	1.000		NA
563105	563106	PG1900	PG1901		frr	TRUE	0.915	85.000	0.020	1.000		NA
563106	563107	PG1901	PG1902	frr	pyrH	TRUE	0.999	37.000	0.626	1.000	N	NA
563107	563108	PG1902	PG1903	pyrH		FALSE	0.314	83.000	0.000	1.000		NA
563108	563109	PG1903	PG1904			FALSE	0.053	211.000	0.000	NA		NA
563110	563111	PG1906	PG1908			FALSE	0.003	1303.000	0.000	NA		NA
563112	563113	PG1910	PG1911	rplQ	rpoA	TRUE	1.000	6.000	0.873	1.000	N	NA
563113	563114	PG1911	PG1912	rpoA	rpsD	TRUE	1.000	13.000	0.549	1.000	N	NA
563114	563115	PG1912	PG1913	rpsD	rpsK	TRUE	0.985	160.000	0.509	0.029	Y	NA
563115	563116	PG1913	PG1914	rpsK	rpsM	TRUE	1.000	12.000	0.810	0.022	Y	NA
563116	563117	PG1914	PG1915	rpsM	rpmJ	TRUE	0.993	33.000	0.067	0.022		NA
563117	563118	PG1915	PG1916	rpmJ	infA	TRUE	0.998	17.000	0.078	1.000		NA
563118	563119	PG1916	PG1917	infA	map	TRUE	0.999	3.000	0.160	1.000	Y	NA
563119	563120	PG1917	PG1918	map	secY	TRUE	0.998	0.000	0.087	1.000	N	NA
563120	563121	PG1918	PG1919	secY	rplO	TRUE	1.000	5.000	0.730	1.000	N	NA
563121	563122	PG1919	PG1920	rplO	rpmD	TRUE	1.000	26.000	0.653	0.004	Y	NA
563122	563123	PG1920	PG1921	rpmD	rpsE	TRUE	1.000	20.000	0.789	0.029	Y	NA
563123	563124	PG1921	PG1922	rpsE	rplR	TRUE	1.000	6.000	0.814	0.029	Y	NA
563124	563125	PG1922	PG1923	rplR	rplF	TRUE	1.000	19.000	0.815	0.022	Y	NA
563125	563126	PG1923	PG1924	rplF	rpsH	TRUE	1.000	19.000	0.808	0.022	Y	NA
563126	563127	PG1924	PG1925	rpsH	rpsN	TRUE	0.997	51.000	0.295	0.022	Y	NA
563127	563128	PG1925	PG1926	rpsN	rplE	TRUE	1.000	2.000	0.309	0.022	Y	NA
563128	563129	PG1926	PG1927	rplE	rplX	TRUE	1.000	0.000	0.758	0.022	Y	NA
563129	563130	PG1927	PG1928	rplX	rplN	TRUE	1.000	23.000	0.810	0.029	Y	NA
563130	563131	PG1928	PG1929	rplN	rpsQ	TRUE	1.000	2.000	0.791	0.029	Y	NA
563131	563132	PG1929	PG1930	rpsQ	rpmC	TRUE	1.000	14.000	0.828	0.022		NA
563132	563133	PG1930	PG1931	rpmC	rplP	TRUE	1.000	6.000	0.802	0.022		NA
563133	563134	PG1931	PG1932	rplP	rpsC	TRUE	1.000	21.000	0.828	0.029	Y	NA
563134	563135	PG1932	PG1933	rpsC	rplV	TRUE	1.000	7.000	0.719	0.029	Y	NA
563135	563136	PG1933	PG1934	rplV	rpsS	TRUE	0.996	109.000	0.769	0.029	Y	NA
563136	563137	PG1934	PG1935	rpsS	rplB	TRUE	1.000	23.000	0.820	0.029	Y	NA
563137	563138	PG1935	PG1936	rplB	rplW	TRUE	1.000	7.000	0.849	0.016	Y	NA
563138	563139	PG1936	PG1937	rplW	rplD	TRUE	1.000	15.000	0.307	0.022	Y	NA
563139	563140	PG1937	PG1938	rplD	rplC	TRUE	1.000	0.000	0.544	0.022	Y	NA
563140	563141	PG1938	PG1939	rplC	rpsJ	TRUE	1.000	23.000	0.467	0.029	Y	NA
563141	563142	PG1939	PG1940	rpsJ	fusA	TRUE	0.999	16.000	0.075	1.000	Y	NA
563142	563143	PG1940	PG1941	fusA	rpsG	TRUE	0.999	13.000	0.077	1.000	Y	NA
563143	563144	PG1941	PG1942	rpsG	rpsL	TRUE	0.954	237.000	0.620	0.004	Y	NA
563144	563145	PG1942	PG1943	rpsL		FALSE	0.006	624.000	0.000	NA		NA
563146	563147	PG1944	PG1945	aroA		TRUE	0.991	22.000	0.013	1.000		NA
563147	563148	PG1945	PG1946			TRUE	0.997	-7.000	0.122	1.000		NA
563148	563149	PG1946	PG1947			TRUE	0.987	-7.000	0.015	1.000		NA
563149	563150	PG1947	PG1948			TRUE	0.847	25.000	0.000	1.000		NA
563152	563153	PG1950	PG1951		glnS	FALSE	0.013	382.000	0.000	NA		NA
563153	563154	PG1951	PG1952	glnS		TRUE	0.986	28.000	0.006	NA		NA
563154	563155	PG1952	PG1953			TRUE	0.457	57.000	0.000	NA		NA
563155	563156	PG1953	PG1954			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
563157	563158	PG1956	PG1959	abfT-2	rpmG	FALSE	0.004	707.000	0.000	1.000		NA
563158	563159	PG1959	PG1960	rpmG	rpmB	TRUE	0.999	19.000	0.332	0.022		NA
563159	563160	PG1960	PG1961	rpmB		FALSE	0.065	223.000	0.000	1.000	N	NA
563161	563162	PG1963	PG1964			TRUE	0.993	-3.000	0.011	NA	N	NA
563162	10692482	PG1964	PG1965			TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
563165	563166	PG1968	PG1969			TRUE	0.528	49.000	0.000	NA		NA
563166	563167	PG1969	PG1970			TRUE	0.698	-31.000	0.000	NA		NA
563171	563172	PG1977	PG1978			TRUE	0.825	30.000	0.000	NA		NA
563174	563175	PG1980	PG1981		cas2-1	FALSE	0.003	1285.000	0.000	NA		NA
11464649	563169		PG1974			FALSE	NA	5215.000	0.000	NA		NA
11607012	563169		PG1974			FALSE	NA	5215.000	0.000	NA		NA
11749404	563169		PG1974			FALSE	NA	5215.000	0.000	NA		NA
11464650	563169		PG1974			FALSE	NA	5252.000	0.000	NA		NA
11607013	563169		PG1974			FALSE	NA	5252.000	0.000	NA		NA
11749405	563169		PG1974			FALSE	NA	5252.000	0.000	NA		NA
11464651	563169		PG1974			FALSE	NA	5286.000	0.000	NA		NA
11607014	563169		PG1974			FALSE	NA	5286.000	0.000	NA		NA
11749406	563169		PG1974			FALSE	NA	5286.000	0.000	NA		NA
11464652	563169		PG1974			FALSE	NA	5323.000	0.000	NA		NA
11607015	563169		PG1974			FALSE	NA	5323.000	0.000	NA		NA
11749407	563169		PG1974			FALSE	NA	5323.000	0.000	NA		NA
11464653	563169		PG1974			FALSE	NA	5357.000	0.000	NA		NA
11607016	563169		PG1974			FALSE	NA	5357.000	0.000	NA		NA
11749408	563169		PG1974			FALSE	NA	5357.000	0.000	NA		NA
11464654	563169		PG1974			FALSE	NA	5394.000	0.000	NA		NA
11607017	563169		PG1974			FALSE	NA	5394.000	0.000	NA		NA
11749409	563169		PG1974			FALSE	NA	5394.000	0.000	NA		NA
11464655	563169		PG1974			FALSE	NA	5430.000	0.000	NA		NA
11607018	563169		PG1974			FALSE	NA	5430.000	0.000	NA		NA
11749410	563169		PG1974			FALSE	NA	5430.000	0.000	NA		NA
11464656	563169		PG1974			FALSE	NA	5467.000	0.000	NA		NA
11607019	563169		PG1974			FALSE	NA	5467.000	0.000	NA		NA
11749411	563169		PG1974			FALSE	NA	5467.000	0.000	NA		NA
11464657	563169		PG1974			FALSE	NA	5501.000	0.000	NA		NA
11607020	563169		PG1974			FALSE	NA	5501.000	0.000	NA		NA
11749412	563169		PG1974			FALSE	NA	5501.000	0.000	NA		NA
11464658	563169		PG1974			FALSE	NA	5538.000	0.000	NA		NA
11607021	563169		PG1974			FALSE	NA	5538.000	0.000	NA		NA
11749413	563169		PG1974			FALSE	NA	5538.000	0.000	NA		NA
11464659	563169		PG1974			FALSE	NA	5576.000	0.000	NA		NA
11607022	563169		PG1974			FALSE	NA	5576.000	0.000	NA		NA
11749414	563169		PG1974			FALSE	NA	5576.000	0.000	NA		NA
11464660	563169		PG1974			FALSE	NA	5613.000	0.000	NA		NA
11607023	563169		PG1974			FALSE	NA	5613.000	0.000	NA		NA
11749415	563169		PG1974			FALSE	NA	5613.000	0.000	NA		NA
11464661	563169		PG1974			FALSE	NA	5650.000	0.000	NA		NA
11607024	563169		PG1974			FALSE	NA	5650.000	0.000	NA		NA
11749416	563169		PG1974			FALSE	NA	5650.000	0.000	NA		NA
11464662	563169		PG1974			FALSE	NA	5687.000	0.000	NA		NA
11607025	563169		PG1974			FALSE	NA	5687.000	0.000	NA		NA
11749417	563169		PG1974			FALSE	NA	5687.000	0.000	NA		NA
11464663	563169		PG1974			FALSE	NA	5723.000	0.000	NA		NA
11607026	563169		PG1974			FALSE	NA	5723.000	0.000	NA		NA
11749418	563169		PG1974			FALSE	NA	5723.000	0.000	NA		NA
563175	563176	PG1981	PG1982	cas2-1		TRUE	0.963	20.000	0.000	1.000	Y	NA
563176	563177	PG1982	PG1983			TRUE	0.749	61.000	0.000	NA	Y	NA
563177	563178	PG1983	PG1984			TRUE	0.998	-3.000	0.103	NA		NA
563178	563179	PG1984	PG1985			TRUE	0.997	-3.000	0.064	NA		NA
563179	563180	PG1985	PG1986			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
563180	563181	PG1986	PG1987			TRUE	0.891	2.000	0.000	NA		NA
563181	563182	PG1987	PG1988			TRUE	0.822	-7.000	0.000	NA		NA
563182	563183	PG1988	PG1989			TRUE	0.886	16.000	0.000	NA		NA
563184	563185	PG1992	PG1993	gidA	uvrC	TRUE	0.978	34.000	0.004	1.000	N	NA
563185	563186	PG1993	PG1994	uvrC	dtd	TRUE	0.994	7.000	0.017	0.035	N	NA
563186	563187	PG1994	PG1995	dtd		TRUE	0.997	5.000	0.047	NA		NA
563187	563188	PG1995	PG1996		deoC	TRUE	0.996	-13.000	0.106	NA		NA
563188	563189	PG1996	PG1997	deoC		TRUE	0.640	41.000	0.000	NA		NA
563190	563191	PG1998	PG1999			FALSE	0.135	154.000	0.000	NA		NA
563191	563192	PG1999	PG2000			TRUE	0.999	21.000	0.203	NA		NA
563192	563193	PG2000	PG2001		lepB	TRUE	0.999	-10.000	0.193	0.001	Y	NA
563193	563194	PG2001	PG2002	lepB	dapB	TRUE	0.998	16.000	0.081	1.000	N	NA
563194	563195	PG2002	PG2003	dapB	dgt	TRUE	0.543	61.000	0.000	1.000	N	NA
563195	563196	PG2003	PG2004	dgt		FALSE	0.170	144.000	0.000	NA		NA
563197	563198	PG2006	PG2008			FALSE	0.022	297.000	0.000	NA		NA
563198	563199	PG2008	PG2009			FALSE	0.010	570.000	0.000	1.000	N	NA
563199	563200	PG2009	PG2010			FALSE	0.148	169.000	0.000	1.000	N	NA
11464664	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1761.000	0.000	NA		NA
11607027	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1761.000	0.000	NA		NA
11749419	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1761.000	0.000	NA		NA
11464665	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1725.000	0.000	NA		NA
11607028	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1725.000	0.000	NA		NA
11749420	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1725.000	0.000	NA		NA
11464666	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1695.000	0.000	NA		NA
11607029	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1695.000	0.000	NA		NA
11749421	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1695.000	0.000	NA		NA
11464667	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1660.000	0.000	NA		NA
11607030	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1660.000	0.000	NA		NA
11749422	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1660.000	0.000	NA		NA
11464668	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1630.000	0.000	NA		NA
11607031	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1630.000	0.000	NA		NA
11749423	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1630.000	0.000	NA		NA
11464669	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1595.000	0.000	NA		NA
11607032	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1595.000	0.000	NA		NA
11749424	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1595.000	0.000	NA		NA
11464670	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1565.000	0.000	NA		NA
11607033	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1565.000	0.000	NA		NA
11749425	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1565.000	0.000	NA		NA
11464671	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1530.000	0.000	NA		NA
11607034	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1530.000	0.000	NA		NA
11749426	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1530.000	0.000	NA		NA
11464672	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1500.000	0.000	NA		NA
11607035	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1500.000	0.000	NA		NA
11749427	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1500.000	0.000	NA		NA
11464673	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1463.000	0.000	NA		NA
11607036	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1463.000	0.000	NA		NA
11749428	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1463.000	0.000	NA		NA
11464674	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1433.000	0.000	NA		NA
11607037	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1433.000	0.000	NA		NA
11749429	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1433.000	0.000	NA		NA
11464675	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1396.000	0.000	NA		NA
11607038	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1396.000	0.000	NA		NA
11749430	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1396.000	0.000	NA		NA
11464676	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1366.000	0.000	NA		NA
11607039	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1366.000	0.000	NA		NA
11749431	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1366.000	0.000	NA		NA
11464677	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1329.000	0.000	NA		NA
11607040	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1329.000	0.000	NA		NA
11749432	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1329.000	0.000	NA		NA
11464678	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1299.000	0.000	NA		NA
11607041	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1299.000	0.000	NA		NA
11749433	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1299.000	0.000	NA		NA
11464679	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1263.000	0.000	NA		NA
11607042	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1263.000	0.000	NA		NA
11749434	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1263.000	0.000	NA		NA
11464680	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1233.000	0.000	NA		NA
11607043	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1233.000	0.000	NA		NA
11749435	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1233.000	0.000	NA		NA
11464681	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1199.000	0.000	NA		NA
11607044	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1199.000	0.000	NA		NA
11749436	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1199.000	0.000	NA		NA
11464682	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1169.000	0.000	NA		NA
11607045	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1169.000	0.000	NA		NA
11749437	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1169.000	0.000	NA		NA
11464683	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1134.000	0.000	NA		NA
11607046	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1134.000	0.000	NA		NA
11749438	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1134.000	0.000	NA		NA
11464684	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1104.000	0.000	NA		NA
11607047	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1104.000	0.000	NA		NA
11749439	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1104.000	0.000	NA		NA
11464685	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1067.000	0.000	NA		NA
11607048	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1067.000	0.000	NA		NA
11749440	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1067.000	0.000	NA		NA
11464686	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1037.000	0.000	NA		NA
11607049	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1037.000	0.000	NA		NA
11749441	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1037.000	0.000	NA		NA
11464687	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1002.000	0.000	NA		NA
11607050	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1002.000	0.000	NA		NA
11749442	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	1002.000	0.000	NA		NA
11464688	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	972.000	0.000	NA		NA
11607051	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	972.000	0.000	NA		NA
11749443	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	972.000	0.000	NA		NA
11464689	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	936.000	0.000	NA		NA
11607052	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	936.000	0.000	NA		NA
11749444	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	936.000	0.000	NA		NA
11464690	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	906.000	0.000	NA		NA
11607053	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	906.000	0.000	NA		NA
11749445	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	906.000	0.000	NA		NA
11464691	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	869.000	0.000	NA		NA
11607054	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	869.000	0.000	NA		NA
11749446	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	869.000	0.000	NA		NA
11464692	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	839.000	0.000	NA		NA
11607055	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	839.000	0.000	NA		NA
11749447	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	839.000	0.000	NA		NA
11464693	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	802.000	0.000	NA		NA
11607056	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	802.000	0.000	NA		NA
11749448	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	802.000	0.000	NA		NA
11464694	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	772.000	0.000	NA		NA
11607057	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	772.000	0.000	NA		NA
11749449	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	772.000	0.000	NA		NA
11464695	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	735.000	0.000	NA		NA
11607058	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	735.000	0.000	NA		NA
11749450	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	735.000	0.000	NA		NA
11464696	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	705.000	0.000	NA		NA
11607059	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	705.000	0.000	NA		NA
11749451	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	705.000	0.000	NA		NA
11464697	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	670.000	0.000	NA		NA
11607060	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	670.000	0.000	NA		NA
11749452	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	670.000	0.000	NA		NA
11464698	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	640.000	0.000	NA		NA
11607061	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	640.000	0.000	NA		NA
11749453	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	640.000	0.000	NA		NA
11464699	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	605.000	0.000	NA		NA
11607062	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	605.000	0.000	NA		NA
11749454	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	605.000	0.000	NA		NA
11464700	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	575.000	0.000	NA		NA
11607063	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	575.000	0.000	NA		NA
11749455	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	575.000	0.000	NA		NA
11464701	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	539.000	0.000	NA		NA
11607064	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	539.000	0.000	NA		NA
11749456	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	539.000	0.000	NA		NA
11464702	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	509.000	0.000	NA		NA
11607065	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	509.000	0.000	NA		NA
11749457	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	509.000	0.000	NA		NA
11464703	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	473.000	0.000	NA		NA
11607066	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	473.000	0.000	NA		NA
11749458	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	473.000	0.000	NA		NA
11464704	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	443.000	0.000	NA		NA
11607067	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	443.000	0.000	NA		NA
11749459	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	443.000	0.000	NA		NA
11464705	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	407.000	0.000	NA		NA
11607068	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	407.000	0.000	NA		NA
11749460	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	407.000	0.000	NA		NA
11464706	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	377.000	0.000	NA		NA
11607069	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	377.000	0.000	NA		NA
11749461	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	377.000	0.000	NA		NA
11464707	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	342.000	0.000	NA		NA
11607070	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	342.000	0.000	NA		NA
11749462	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	342.000	0.000	NA		NA
11464708	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	312.000	0.000	NA		NA
11607071	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	312.000	0.000	NA		NA
11749463	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	312.000	0.000	NA		NA
11464709	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	277.000	0.000	NA		NA
11607072	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	277.000	0.000	NA		NA
11749464	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	277.000	0.000	NA		NA
11464710	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	247.000	0.000	NA		NA
11607073	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	247.000	0.000	NA		NA
11749465	563201		PG2013		cas2-2	FALSE	NA	247.000	0.000	NA		NA
563201	563202	PG2013	PG2014	cas2-2	cas1	TRUE	0.999	0.000	0.065	NA	Y	NA
563202	563203	PG2014	PG2015	cas1	cas4	TRUE	0.999	-3.000	0.143	NA	Y	NA
563203	563204	PG2015	PG2016	cas4	cas3	TRUE	0.999	20.000	0.143	NA		NA
563204	563205	PG2016	PG2017	cas3		TRUE	0.996	-25.000	0.143	NA		NA
563205	563206	PG2017	PG2018			TRUE	1.000	11.000	0.667	NA		NA
563206	563207	PG2018	PG2019			TRUE	1.000	-3.000	1.000	NA		NA
563207	563208	PG2019	PG2020			TRUE	0.996	-54.000	0.200	NA		NA
563208	563209	PG2020	PG2021			FALSE	0.006	648.000	0.000	NA		NA
563209	563210	PG2021	PG2022			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
563210	563211	PG2022	PG2023		fmt	FALSE	0.112	166.000	0.000	NA		NA
563211	563212	PG2023	PGt43	fmt	tRNA-Asp-2	FALSE	0.044	224.000	0.000	NA		NA
563212	563213	PGt43	PG2024	tRNA-Asp-2	hagE	FALSE	0.033	247.000	0.000	NA		NA
563214	563215	PG2026	PG2027			TRUE	0.836	29.000	0.000	NA		NA
563215	563216	PG2027	PG2028			TRUE	0.891	9.000	0.000	NA		NA
563216	563217	PG2028	PG2029			TRUE	0.870	7.000	0.000	1.000		NA
563217	563218	PG2029	PG2030			FALSE	0.006	625.000	0.000	NA		NA
563218	563219	PG2030	PG2031			TRUE	0.890	11.000	0.000	NA		NA
563220	563221	PG2032	PG2033	priA	gltD	TRUE	0.974	34.000	0.002	1.000	N	NA
563221	563222	PG2033	PG2034	gltD		TRUE	0.980	107.000	0.174	0.029	N	NA
563223	563224	PG2035	PG2036	trmD		TRUE	0.761	32.000	0.000	1.000		NA
563225	563226	PG2037	PG2038			TRUE	0.999	-3.000	0.400	NA		NA
563226	563227	PG2038	PG2040			FALSE	0.061	191.000	0.000	1.000		NA
563227	563228	PG2040	PG2041			FALSE	0.011	361.000	0.000	1.000		NA
563228	563229	PG2041	PG2042			FALSE	0.179	133.000	0.000	1.000		NA
563230	563231	PG2043	PG2044			TRUE	0.999	18.000	0.342	NA		NA
563231	563232	PG2044	PG2046			FALSE	0.239	264.000	0.003	NA		NA
563233	563234	PG2047	PG2048			FALSE	0.334	91.000	0.000	NA		NA
563234	563235	PG2048	PG2049			TRUE	0.889	13.000	0.000	NA		NA
563235	563236	PG2049	PG2050			FALSE	0.030	255.000	0.000	NA		NA
563237	563238	PG2052	PG2053	dapA	bioD	TRUE	0.883	29.000	0.000	1.000	N	NA
563239	563240	PG2054	PG2055			TRUE	0.927	66.000	0.007	1.000	N	NA
563240	563241	PG2055	PGt44		tRNA-Lys-2	FALSE	0.003	1165.000	0.000	NA		NA
563241	563242	PGt44	PG2057	tRNA-Lys-2		FALSE	0.005	709.000	0.000	NA		NA
563242	563243	PG2057	PG2058			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
563244	563245	PG2060	PG2061	thyA	folA	TRUE	0.985	46.000	0.046	1.000	N	NA
563245	563246	PG2061	PG2062	folA	hisS	TRUE	0.543	61.000	0.000	1.000	N	NA
563248	563249	PG2064	PG2065			TRUE	0.577	46.000	0.000	NA		NA
563249	563250	PG2065	PG2066			FALSE	0.334	91.000	0.000	NA		NA
563250	563251	PG2066	PG2067		pdxA	TRUE	0.964	44.000	0.014	NA		NA
563251	563252	PG2067	PG2068	pdxA	tagD	TRUE	0.994	22.000	0.014	1.000	N	NA
563252	563253	PG2068	PG2069	tagD		TRUE	0.999	6.000	0.079	1.000	Y	NA
563253	563254	PG2069	PG2070			TRUE	1.000	12.000	0.600	1.000		NA
563254	563255	PG2070	PG2071			TRUE	0.992	-30.000	0.079	1.000		NA
563255	563256	PG2071	PG2072			TRUE	0.846	-3.000	0.000	1.000		NA
563257	563258			Pg5SD	Pg23SD	FALSE	0.158	147.000	0.000	NA		NA
563258	563259		PGt45	Pg23SD	tRNA-Ala-5	FALSE	0.252	119.000	0.000	NA		NA
563259	563260	PGt45	PGt46	tRNA-Ala-5	tRNA-Ile-4	TRUE	0.891	2.000	0.000	NA		NA
563260	563261	PGt46	PG2073	tRNA-Ile-4		TRUE	0.891	10.000	0.000	NA		NA
563261	563262	PG2073	PG2074			FALSE	0.223	129.000	0.000	NA		NA
563262	563263	PG2074			Pg16SD	FALSE	0.265	113.000	0.000	NA		NA
563263	563264		PG2075	Pg16SD		TRUE	0.889	0.000	0.000	NA		NA
563266	563267	PG2077	PG2078			TRUE	0.686	37.000	0.000	NA		NA
563267	563268	PG2078	PG2079			FALSE	0.023	290.000	0.000	NA		NA
563268	563269	PG2079	PG2080		bioA	TRUE	0.890	12.000	0.000	NA		NA
563269	563270	PG2080	PG2081	bioA	bioB	TRUE	0.999	-10.000	0.176	0.002	Y	NA
563270	563271	PG2081	PG2082	bioB		TRUE	0.546	182.000	0.003	1.000	N	NA
563271	563272	PG2082	PG2083			TRUE	0.998	26.000	0.154	NA		NA
563273	563274	PG2085	PG2086	trpS		TRUE	0.930	56.000	0.011	NA		NA
563274	563275	PG2086	PG2087			TRUE	0.988	0.000	0.003	NA		NA
563275	563276	PG2087	PG2088		msrA	TRUE	0.438	62.000	0.000	NA		NA
563276	563277	PG2088	PG2089	msrA		TRUE	0.457	57.000	0.000	NA		NA
563277	563278	PG2089	PG2090			FALSE	0.012	406.000	0.000	NA		NA
563278	563279	PG2090	PG2091		folB	TRUE	0.971	39.000	0.008	1.000	N	NA
563280	563281	PG2092	PG2094			FALSE	0.011	411.000	0.000	NA		NA
563281	563282	PG2094	PG2095			FALSE	0.036	422.000	0.000	1.000	Y	NA
563282	563283	PG2095	PG2096			TRUE	1.000	8.000	0.377	NA	Y	NA
563283	563284	PG2096	PG2097		prsA	TRUE	0.407	106.000	0.000	NA	N	NA
563284	563285	PG2097	PG2098	prsA		TRUE	0.870	-3.000	0.000	NA		NA
563285	563286	PG2098	PG2099			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
563286	563287	PG2099	PG2100			FALSE	0.006	595.000	0.000	NA		NA
563287	563288	PG2100	PG2101			FALSE	0.345	87.000	0.000	NA		NA
563288	563289	PG2101	PG2102			FALSE	0.143	151.000	0.000	NA		NA
563289	563290	PG2102	PG2103			FALSE	0.090	180.000	0.000	NA		NA
563290	563291	PG2103	PG2104			FALSE	0.241	125.000	0.000	NA		NA
563292	563293	PGt47	PG2105	tRNA-Met-2		FALSE	0.025	280.000	0.000	NA		NA
563293	563294	PG2105	PG2106			FALSE	0.067	195.000	0.000	NA		NA
563295	563296	PG2107	PG2108	thiH	thiG	TRUE	1.000	13.000	0.277	0.003	Y	NA
563296	563297	PG2108	PG2109	thiG		TRUE	0.688	59.000	0.000	0.003	Y	NA
563297	563298	PG2109	PG2110		thiC	TRUE	0.947	-3.000	0.000	0.003	Y	NA
563298	563299	PG2110	PG2111	thiC	thiS	TRUE	0.978	70.000	0.029	1.000	Y	NA
10692483	563302	PG2115	PG2116			FALSE	0.121	162.000	0.000	NA		NA
563305	563306	PG2120	PG2121		ansA	TRUE	0.437	53.000	0.000	1.000		NA
563307	563308	PG2123	PG2124		gapA	TRUE	0.890	11.000	0.000	NA		NA
563309	563310	PG2125	PG2126			FALSE	0.081	184.000	0.000	NA		NA
563310	563311	PG2126	PG2127			TRUE	0.994	-3.000	0.023	NA		NA
563311	563312	PG2127	PG2128			FALSE	0.018	315.000	0.000	NA		NA
563312	563313	PG2128	PG2129			TRUE	0.475	54.000	0.000	NA		NA
563314	563315	PG2130	PG2131			TRUE	0.864	26.000	0.000	NA		NA
563315	563316	PG2131	PG2132		fimA	TRUE	0.451	51.000	0.000	1.000		NA
563316	563317	PG2132	PG2133	fimA		FALSE	0.188	139.000	0.000	NA		NA
563317	563318	PG2133	PG2134			TRUE	0.887	14.000	0.000	NA		NA
563318	563319	PG2134	PG2135			TRUE	1.000	21.000	0.667	NA		NA
563319	563320	PG2135	PG2136			TRUE	0.856	27.000	0.000	NA		NA
563320	563321	PG2136	PG2139			FALSE	0.006	624.000	0.000	NA		NA
563321	563322	PG2139	PG2140		rpmF	TRUE	1.000	7.000	0.599	NA		NA
563322	563323	PG2140	PG2141	rpmF	fabH	TRUE	0.534	180.000	0.002	1.000	N	NA
563323	563324	PG2141	PG2142	fabH	era	TRUE	0.939	79.000	0.029	1.000		NA
563324	563325	PG2142	PG2143	era		TRUE	0.954	63.000	0.040	0.004		NA
563325	563326	PG2143	PG2144			TRUE	0.501	51.000	0.000	NA		NA
563326	563327	PG2144	PG2145			TRUE	0.988	43.000	0.068	NA		NA
563327	563328	PG2145	PG2146			TRUE	0.680	-43.000	0.000	NA		NA
563329	563330	PG2147	PG2148	xpt		TRUE	0.995	37.000	0.046	1.000	Y	NA
563330	563331	PG2148	PG2149			FALSE	0.121	162.000	0.000	NA		NA
563331	563332	PG2149	PG2150			TRUE	0.999	9.000	0.353	NA		NA
563333	10692484	PG2152	PG2153			TRUE	0.890	1.000	0.000	NA		NA
10692484	563334	PG2153	PGt48		tRNA-Pro-3	FALSE	0.334	91.000	0.000	NA		NA
563335	563336	PG2154	PG2155			TRUE	0.856	27.000	0.000	NA		NA
563336	563337	PG2155	PG2156			TRUE	0.686	37.000	0.000	NA		NA
563338	563339	PG2157	PG2158			TRUE	0.998	24.000	0.137	NA		NA
563339	563340	PG2158	PG2159			TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
563341	563342	PG2161	PG2162		lpxB	TRUE	0.909	-3.000	0.000	1.000	N	NA
563342	563343	PG2162	PG2163	lpxB	surE	TRUE	0.985	37.000	0.039	1.000		NA
563343	563344	PG2163	PG2164	surE		TRUE	0.989	-3.000	0.009	1.000		NA
563344	563345	PG2164	PG2165		glyS	TRUE	0.996	-3.000	0.038	1.000	N	NA
563347	563348	PG2167	PG2168			TRUE	0.997	45.000	0.400	NA		NA
563348	563349	PG2168	PG2170			FALSE	0.003	2528.000	0.000	NA		NA
563349	563350	PG2170	PG2171			TRUE	0.769	39.000	0.000	NA	N	NA
563350	563351	PG2171	PG2172			FALSE	0.046	219.000	0.000	NA		NA
563351	563352	PG2172	PG2173		omp28	TRUE	0.891	4.000	0.000	NA		NA
563352	563353	PG2173	PG2174	omp28		TRUE	1.000	20.000	0.600	NA		NA
563353	563354	PG2174	PG2175			TRUE	0.988	56.000	0.143	NA		NA
563354	563355	PG2175	PG2176			FALSE	0.399	99.000	0.000	1.000	N	NA
563357	563358	PG2177	PG2178	nqrF	nqrE	TRUE	1.000	19.000	0.708	0.003	Y	NA
563358	563359	PG2178	PG2179	nqrE	nqrD	TRUE	0.998	40.000	0.279	0.003	Y	NA
563359	563360	PG2179	PG2180	nqrD	nqrC	TRUE	1.000	6.000	0.288	0.003	Y	NA
563360	563361	PG2180	PG2181	nqrC	nqrB	TRUE	1.000	24.000	0.773	0.003	Y	NA
563361	563362	PG2181	PG2182	nqrB	nqrA	TRUE	1.000	31.000	0.747	0.003	Y	NA
563362	563363	PG2182	PG2185	nqrA		FALSE	0.004	778.000	0.000	1.000		NA
563363	563364	PG2185	PG2186			TRUE	0.693	35.000	0.000	1.000		NA
563364	563365	PG2186	PG2187		menA	FALSE	0.269	137.000	0.000	1.000	N	NA
563365	563366	PG2187	PG2188	menA	lysA	TRUE	0.860	-10.000	0.000	1.000	N	NA
563366	563367	PG2188	PG2189	lysA	lysC	TRUE	0.997	30.000	0.034	1.000	Y	NA
563367	563368	PG2189	PG2190	lysC	ftsE	TRUE	0.997	18.000	0.030	1.000	N	NA
563371	10692485	PG2197	PG2198			FALSE	0.053	211.000	0.000	NA		NA
563372	563373	PG2199	PG2200			TRUE	0.846	-3.000	0.000	1.000		NA
563373	563374	PG2200	PG2201		def	TRUE	0.998	36.000	0.321	1.000	N	NA
563374	563375	PG2201	PG2202	def		TRUE	0.941	105.000	0.035	1.000	N	NA
563376	563377	PG2204	PG2205		panE	TRUE	0.866	14.000	0.000	1.000		NA
563378	563379	PG2206	PG2207			FALSE	0.022	276.000	0.000	1.000		NA
563379	563380	PG2207	PG2208			FALSE	0.085	171.000	0.000	1.000		NA
563380	563381	PG2208	PG2209			FALSE	0.234	88.000	0.000	0.018		NA
563381	563382	PG2209	PG2210		uvrA-2	TRUE	0.852	24.000	0.000	1.000		NA
563382	563383	PG2210	PGt50	uvrA-2	tRNA-Leu-4	FALSE	0.241	125.000	0.000	NA		NA
563383	563384	PGt50	PGt51	tRNA-Leu-4	tRNA-Leu-5	TRUE	0.812	31.000	0.000	NA		NA
563384	563385	PGt51	PGt52	tRNA-Leu-5	tRNA-Gly-4	FALSE	0.342	88.000	0.000	NA		NA
563385	563386	PGt52	PG2212	tRNA-Gly-4		FALSE	0.079	186.000	0.000	NA		NA
563386	563387	PG2212	PG2213			FALSE	0.362	81.000	0.000	NA		NA
563387	563388	PG2213	PG2214			FALSE	0.028	271.000	0.000	NA		NA
563388	563389	PG2214	PG2215		manC	TRUE	0.984	35.000	0.021	NA		NA
563390	563391	PG2216	PG2217		dxs	FALSE	0.098	173.000	0.000	NA		NA
563391	563392	PG2217	PG2218	dxs	trkA	TRUE	0.584	53.000	0.000	1.000	N	NA
563392	563393	PG2218	PG2219	trkA	trkH	TRUE	0.941	27.000	0.000	0.004	Y	NA
563395	563396	PG2220	PG2221			FALSE	0.194	138.000	0.000	NA		NA
563396	563397	PG2221	PG2222			TRUE	0.995	-3.000	0.024	1.000	N	NA
563397	563398	PG2222	PG2223			TRUE	0.996	39.000	0.190	NA		NA
563398	563399	PG2223	PG2224			FALSE	0.085	182.000	0.000	NA		NA
563399	563400	PG2224	PG2225			TRUE	0.999	20.000	0.304	NA		NA
563400	563401	PG2225	PG2226			FALSE	0.365	80.000	0.000	NA		NA
563401	563402	PG2226	PG2227			TRUE	0.999	-3.000	0.422	NA		NA
563402	561429	PG2227	PG0001		dnaA	FALSE	0.005	673.000	0.000	NA		NA