MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pestis biovar Medievalis 91001

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
678007	678008	YP0001	YP0002	fldA1	asnC	TRUE	0.553	93.000	0.165	1.000	N	NA
678010	678011	YP0004	YP0005			TRUE	0.992	4.000	0.443	NA		NA
678012	678013	YP0006	YP0007	kup	rbsD1	FALSE	0.033	205.000	0.010	1.000	N	NA
678013	678014	YP0007	YP0008	rbsD1	rbsK1	TRUE	0.821	51.000	0.010	1.000	Y	NA
678014	678015	YP0008	YP0009	rbsK1	purR1	TRUE	0.667	20.000	0.000	NA		NA
678016	678017	YP0010	YP0011	proP1	fadR1	TRUE	0.631	80.000	0.133	1.000		NA
5437983	678596	YP_r1	YP_t1			FALSE	0.198	164.000	0.000	NA		NA
678596	678020	YP_t1	YP_r2			FALSE	0.070	253.000	0.000	NA		NA
678020	678021	YP_r2	YP_r3			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
678021	678022	YP_r3	YP0012			FALSE	0.010	514.000	0.000	NA		NA
678023	678024	YP0013	YP0014	mobB	mobA	TRUE	0.976	-27.000	0.064	0.003	Y	NA
678025	678026	YP0015	YP0016			TRUE	0.513	91.000	0.106	NA		NA
678026	678027	YP0016	YP0017		dsbA	TRUE	0.774	28.000	0.111	NA		NA
678027	678028	YP0017	YP0018	dsbA	polA	FALSE	0.012	492.000	0.000	1.000		NA
678028	678029	YP0018	YP_s1	polA	spf	FALSE	0.205	160.000	0.000	NA		NA
678029	678030	YP_s1	YP0019	spf	tnp_1	FALSE	0.293	95.000	0.000	NA		NA
678032	678033	YP0021	YP_0022		hemN1	FALSE	0.336	183.000	0.107	NA		NA
678034	678035	YP_0023	YP_0024	glnG	glnL	TRUE	0.998	8.000	0.587	0.089	Y	NA
678035	678036	YP_0024	YP0025	glnL	glnA	FALSE	0.052	253.000	0.053	1.000	N	NA
678036	678037	YP0025	YP0026	glnA		FALSE	0.110	186.000	0.003	NA		NA
678038	678039	YP0027	YP0028	bipA		FALSE	0.026	322.000	0.007	1.000		NA
678039	678040	YP0028	YP0029		rbn1	TRUE	0.521	37.000	0.031	1.000		NA
678040	678041	YP0029	YP0030	rbn1	dtd	TRUE	0.913	7.000	0.069	1.000		NA
678042	678043	YP0031	YP0032	dnaC_1		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678045	678046	YP0034	YP0035		uraA	FALSE	0.070	502.000	0.257	NA		NA
678048	678049	YP0037	YP0038	recG	trmH	TRUE	0.932	1.000	0.076	1.000	N	NA
678049	678050	YP0038	YP0039	trmH	spoT	TRUE	0.908	6.000	0.095	1.000	N	NA
678050	678051	YP0039	YP0040	spoT	rpoZ	TRUE	0.984	20.000	0.291	1.000	Y	NA
678051	678052	YP0040	YP0041	rpoZ	gmk	TRUE	0.894	55.000	0.471	1.000	N	NA
678054	678055	YP0043	YP0044			FALSE	0.017	403.000	0.000	NA		NA
678056	678057	YP0045	YP0046	rph	pyrE	FALSE	0.287	167.000	0.108	1.000	N	NA
678058	678059	YP0047	YP0048	ttk	dut	FALSE	0.221	122.000	0.060	1.000	N	NA
678059	678060	YP0048	YP_0049	dut	dfp	TRUE	0.877	-34.000	0.201	1.000	N	NA
678061	678062	YP0050	YP0051	radC	rpmB	FALSE	0.011	263.000	0.002	1.000	N	NA
678062	678063	YP0051	YP0052	rpmB	rpmG	TRUE	0.995	12.000	0.332	0.016	Y	NA
678063	678064	YP0052	YP0053	rpmG	mutM	FALSE	0.182	83.000	0.034	1.000	N	NA
678065	678066	YP0054	YP0055	coaD	kdtX	TRUE	0.773	-3.000	0.023	NA	N	NA
678066	678067	YP0055	YP0056	kdtX	kdtA	TRUE	0.991	1.000	0.083	NA	Y	NA
678067	678068	YP0056	YP0057	kdtA	rfaC	FALSE	0.201	312.000	0.028	1.000	Y	NA
678068	678069	YP0057	YP_0058	rfaC	rfaF	TRUE	0.991	-24.000	0.205	0.001	Y	NA
678069	678070	YP_0058	YP_0059	rfaF	rfaD	TRUE	0.949	31.000	0.146	1.000	Y	NA
678071	678072	YP_0060	YP0061	kbl	tdh1	TRUE	0.985	10.000	0.547	1.000	N	NA
2213959	678073	YP_0062	YP0063		nlpD1	TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
678073	678074	YP0063	YP0064	nlpD1	gpmI	TRUE	0.932	10.000	0.170	1.000	N	NA
678075	678076	YP0065	YP0066	pspE1	grxC	FALSE	0.158	119.000	0.048	NA	N	NA
678076	678077	YP0066	YP0067	grxC	secB	FALSE	0.189	88.000	0.038	1.000	N	NA
678077	678078	YP0067	YP0068	secB	gpsA	TRUE	0.982	0.000	0.206	1.000	N	NA
678078	678079	YP0068	YP0069	gpsA		FALSE	0.393	60.000	0.000	NA		NA
678079	678080	YP0069	YP_0070		cysE	FALSE	0.367	66.000	0.000	NA		NA
678083	678084	YP0073	YP0074	cpxA	cpxR1	TRUE	0.999	-3.000	0.791	1.000	Y	NA
678085	678086	YP0075	YP0076	cpxP		FALSE	0.013	457.000	0.000	NA		NA
678086	678087	YP0076	YP0077			TRUE	0.465	45.000	0.000	NA		NA
678089	678090	YP0079	YP0080	mMT11	pfkA	FALSE	0.063	218.000	0.040	1.000	N	NA
678090	678091	YP0080	YP0081	pfkA	sbp	FALSE	0.114	188.000	0.049	1.000	N	NA
678092	678093	YP0082	YP0083	modA1	citT1	TRUE	0.847	76.000	0.000	0.068	Y	NA
678093	5437984	YP0083	YP_0084	citT1		FALSE	0.367	66.000	0.000	NA		NA
5437984	678094	YP_0084	YP0085		dnaC_2	TRUE	0.475	-1076.000	0.000	NA		NA
678094	678095	YP0085	YP0086	dnaC_2		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678095	678096	YP0086	YP0087			FALSE	0.008	574.000	0.000	NA		NA
678098	678099	YP0089	YP0090	tpiA		FALSE	0.311	129.000	0.058	NA		NA
678101	678102	YP0092	YP_0093	fpr	glpX	FALSE	0.332	155.000	0.117	1.000	N	NA
678102	678103	YP_0093	YP0094	glpX	glpK1	FALSE	0.034	237.000	0.025	1.000	N	NA
678103	678104	YP0094	YP0095	glpK1	glpF	FALSE	0.051	177.000	0.013	1.000	N	NA
678104	678105	YP0095	YP0096	glpF		TRUE	0.815	10.000	0.000	NA		NA
678109	678110	YP0100	YP0101	sunT	acrA1	TRUE	0.995	-7.000	0.250	1.000	Y	NA
678111	678112	YP0102	YP0103			FALSE	0.181	175.000	0.000	NA		NA
678112	678113	YP0103	YP0104			FALSE	0.040	303.000	0.000	NA		NA
678114	678115	YP0105	YP0106	menG	menA	TRUE	0.823	142.000	0.158	NA	Y	NA
678115	678116	YP0106	YP0107	menA	hslU	FALSE	0.071	224.000	0.051	1.000	N	NA
678116	678117	YP0107	YP0108	hslU	hslV	TRUE	0.982	71.000	0.752	1.000	Y	NA
678117	678118	YP0108	YP0109	hslV	ftsN	FALSE	0.412	100.000	0.122	NA	N	NA
678118	678119	YP0109	YP0110	ftsN	cytR1	TRUE	0.736	66.000	0.245	NA	N	NA
678119	678120	YP0110	YP0111	cytR1	priA	FALSE	0.006	353.000	0.013	1.000	N	NA
678124	678125	YP0115	YP0116		metJ	TRUE	0.694	-28.000	0.000	NA		NA
678126	678127	YP0117	YP0118	metC1	metL	TRUE	0.998	3.000	0.428	1.000	Y	NA
678127	678128	YP0118	YP0119	metL	metF1	FALSE	0.375	233.000	0.017	1.000	Y	NA
678129	678130	YP0120	YP0121	tra5A		TRUE	0.924	54.000	0.167	1.000	Y	NA
678130	678131	YP0121	YP0122		glpR1	FALSE	0.227	64.000	0.000	1.000	N	NA
678131	678132	YP0122	YP0123	glpR1	glpG	TRUE	0.850	35.000	0.190	1.000		NA
678132	678133	YP0123	YP_0124	glpG	glpE	TRUE	0.966	18.000	0.405	1.000		NA
678133	678134	YP_0124	YP0125	glpE	malT	FALSE	0.010	375.000	0.000	1.000	N	NA
5437985	678135	YP_0126	YP0127	malP	malQ	TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
678136	678137	YP0128	YP0129		comFC	TRUE	0.527	60.000	0.066	1.000		NA
678138	678139	YP0130	YP0131	bioH		FALSE	0.147	161.000	0.010	NA		NA
678140	678141	YP0132	YP0133		feoB	TRUE	0.939	36.000	0.455	NA		NA
678141	678142	YP0133	YP0134	feoB	feoA	TRUE	0.886	92.000	0.177	1.000	Y	NA
678142	678143	YP0134	YP0135	feoA		FALSE	0.005	524.000	0.000	1.000	N	NA
678144	678145	YP0136	YP0137	greB	ompR1	TRUE	0.803	136.000	0.067	0.088	Y	NA
678145	678146	YP0137	YP0138	ompR1	envZ	TRUE	0.999	-3.000	0.584	1.000	Y	NA
678147	678148	YP0139	YP0140	pckA	hslO	FALSE	0.101	197.000	0.048	1.000	N	NA
678148	678149	YP0140	YP0141	hslO	hslR	FALSE	0.375	163.000	0.140	1.000	N	NA
678149	678150	YP0141	YP0142	hslR		TRUE	0.669	29.000	0.056	1.000		NA
678150	678151	YP0142	YP0143			TRUE	0.476	144.000	0.122	1.000		NA
678152	678153	YP0144	YP0145		mutT1	FALSE	0.263	113.000	0.000	NA		NA
678155	678156	YP0147	YP0148	ftsA1		TRUE	0.989	18.000	0.870	NA		NA
678156	678157	YP0148	YP0149			TRUE	0.851	-52.000	0.174	NA		NA
678157	678158	YP0149	YP0150			TRUE	0.882	-34.000	0.167	NA		NA
678160	678161	YP0152	YP0153	gspD1	aroK1	FALSE	0.210	349.000	0.319	1.000		NA
678161	678162	YP0153	YP0154	aroK1	aroB	TRUE	0.934	57.000	0.208	1.000	Y	NA
678162	678163	YP0154	YP0155	aroB	damX	FALSE	0.056	254.000	0.022	NA		NA
678163	678164	YP0155	YP0156	damX	dam	TRUE	0.752	84.000	0.234	NA		NA
678164	678165	YP0156	YP0157	dam	rpe	FALSE	0.034	291.000	0.053	1.000	N	NA
678165	678166	YP0157	YP_0158	rpe	gph	TRUE	0.909	-7.000	0.050	1.000		NA
678166	678167	YP_0158	YP_0159	gph	trpS	TRUE	0.970	2.000	0.118	1.000		NA
678168	678169	YP0160	YP0161	cysG1	nirC	FALSE	0.297	88.000	0.065	1.000	N	NA
678169	678170	YP0161	YP0162	nirC	nirD	TRUE	0.861	179.000	0.283	1.000	Y	NA
678170	678171	YP0162	YP0163	nirD	nirB	TRUE	0.999	-3.000	0.829	0.001	N	NA
678175	5437986	YP0167	YP_0168	purR2		FALSE	0.074	249.000	0.000	NA		NA
678176	678177	YP0169	YP0170	ppiA		FALSE	0.036	326.000	0.000	1.000		NA
678177	678178	YP0170	YP0171		pabA	FALSE	0.062	243.000	0.007	1.000		NA
678178	678179	YP0171	YP0172	pabA	argD	TRUE	0.773	121.000	0.088	1.000	Y	NA
678180	678181	YP0173	YP0174		crp	TRUE	0.540	86.000	0.111	NA		NA
678182	678183	YP0175	YP0176		proP3	FALSE	0.348	72.000	0.000	NA		NA
678184	678185	YP0177	YP0178	prk		TRUE	0.755	113.000	0.303	NA		NA
678185	678186	YP0178	YP0179			TRUE	0.988	-3.000	0.222	NA		NA
678187	678188	YP0180	YP0181	rhtB1	tauA1	FALSE	0.071	203.000	0.000	1.000	N	NA
678188	678189	YP0181	YP0182	tauA1	tauB1	TRUE	0.970	9.000	0.023	1.000	Y	NA
678189	678190	YP0182	YP0183	tauB1	tauC1	TRUE	0.999	-3.000	0.728	1.000	Y	NA
678190	678191	YP0183	YP_0184	tauC1	tauD	TRUE	0.983	-3.000	0.214	1.000	N	NA
5437987	678192	YP_0185	YP0186		wcaA	FALSE	0.298	93.000	0.000	NA		NA
678192	678193	YP0186	YP0187	wcaA	uup1	FALSE	0.194	135.000	0.020	NA		NA
678194	678195	YP0188	YP0189	mdaB1	kefB	TRUE	0.998	4.000	0.927	1.000		NA
678195	678196	YP0189	YP0190	kefB		TRUE	0.969	16.000	0.400	1.000		NA
678196	678197	YP0190	YP0191		slyD	TRUE	0.499	62.000	0.060	1.000		NA
678197	678198	YP0191	YP0192	slyD	proP4	TRUE	0.806	-15.000	0.000	NA		NA
678200	678201	YP0194	YP0195	fkpA		FALSE	0.443	242.000	0.310	NA		NA
678201	678202	YP0195	YP0196		dsrE1	TRUE	0.988	0.000	0.220	NA		NA
678202	678203	YP0196	YP0197	dsrE1	dsrF	TRUE	0.999	0.000	0.790	NA	Y	NA
678203	678204	YP0197	YP0198	dsrF	dsrH	TRUE	0.995	20.000	0.804	NA	Y	NA
678204	678205	YP0198	YP0199	dsrH	rpsL	FALSE	0.182	138.000	0.058	NA	N	NA
678205	678206	YP0199	YP0200	rpsL	rpsG	TRUE	0.982	97.000	0.620	0.003	Y	NA
678206	678207	YP0200	YP0201	rpsG	fusA	TRUE	0.967	94.000	0.579	1.000	Y	NA
678207	678208	YP0201	YP0202	fusA	tufA1	TRUE	0.871	73.000	0.005	0.001	Y	NA
678208	678209	YP0202	YP0203	tufA1	tnp_3	FALSE	0.121	152.000	0.000	1.000	N	NA
678209	678210	YP0203	YP0204	tnp_3	bfd	FALSE	0.070	188.000	0.000	NA	N	NA
678210	678211	YP0204	YP0205	bfd	bfr	TRUE	0.740	79.000	0.013	NA	Y	NA
678211	678212	YP0205	YP0206	bfr	rpsJ	FALSE	0.008	414.000	0.000	1.000	N	NA
678212	678213	YP0206	YP0207	rpsJ	rplC	TRUE	0.983	33.000	0.307	0.021	Y	NA
678213	678214	YP0207	YP0208	rplC	rplD	TRUE	0.995	17.000	0.486	0.016	Y	NA
678214	678215	YP0208	YP0209	rplD	rplW	TRUE	0.999	-3.000	0.513	0.016	Y	NA
678215	678216	YP0209	YP0210	rplW	rplB	TRUE	0.998	17.000	0.849	0.018	Y	NA
678216	678217	YP0210	YP0211	rplB	rpsS	TRUE	0.998	15.000	0.820	0.021	Y	NA
678217	678218	YP0211	YP0212	rpsS	rplV	TRUE	0.998	15.000	0.769	0.021	Y	NA
678218	678219	YP0212	YP0213	rplV	rpsC	TRUE	0.997	18.000	0.719	0.021	Y	NA
678219	678220	YP0213	YP0214	rpsC	rplP	TRUE	0.998	13.000	0.828	0.021	Y	NA
678220	678221	YP0214	YP0215	rplP	rpmC	TRUE	1.000	0.000	0.802	0.016	Y	NA
678221	678222	YP0215	YP0216	rpmC	rpsQ	TRUE	1.000	0.000	0.828	0.016	Y	NA
678222	678223	YP0216	YP0217	rpsQ	rplN	TRUE	0.973	181.000	0.791	0.021	Y	NA
678223	678224	YP0217	YP0218	rplN	rplX	TRUE	0.999	11.000	0.810	0.021	Y	NA
678224	678225	YP0218	YP0219	rplX	rplE	TRUE	0.998	15.000	0.758	0.016	Y	NA
678225	678226	YP0219	YP0220	rplE	rpsN	TRUE	0.996	14.000	0.496	0.016	Y	NA
678226	678227	YP0220	YP0221	rpsN	rpsH	TRUE	0.990	34.000	0.473	0.016	Y	NA
678227	678228	YP0221	YP0222	rpsH	rplF	TRUE	0.998	15.000	0.808	0.016	Y	NA
678228	678229	YP0222	YP0223	rplF	rplR	TRUE	0.999	10.000	0.815	0.016	Y	NA
678229	678230	YP0223	YP0224	rplR	rpsE	TRUE	0.998	15.000	0.814	0.021	Y	NA
678230	678231	YP0224	YP0225	rpsE	rpmD	TRUE	0.999	3.000	0.789	0.021	Y	NA
678231	678232	YP0225	YP0226	rpmD	rplO	TRUE	0.999	4.000	0.653	0.002	Y	NA
678232	678233	YP0226	YP0227	rplO	secY	TRUE	0.992	8.000	0.730	1.000	N	NA
678233	678234	YP0227	YP0228	secY	rpmJ1	FALSE	0.355	34.000	0.036	1.000	N	NA
678234	678235	YP0228	YP0229	rpmJ1	rpsM	TRUE	0.833	148.000	0.086	0.016	Y	NA
678235	678236	YP0229	YP0230	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	17.000	0.810	0.016	Y	NA
678236	678237	YP0230	YP0231	rpsK	rpsD	TRUE	0.991	31.000	0.509	0.021	Y	NA
678237	678238	YP0231	YP0232	rpsD	rpoA	TRUE	0.957	26.000	0.549	1.000	N	NA
678238	678239	YP0232	YP0233	rpoA	rplQ	TRUE	0.969	41.000	0.873	1.000	N	NA
678239	678240	YP0233	YP_0234	rplQ	zntR	FALSE	0.003	447.000	0.005	1.000	N	NA
678240	678241	YP_0234	YP0235	zntR		TRUE	0.723	88.000	0.219	NA		NA
678242	678243	YP0236	YP0237	mscL	trkA	FALSE	0.060	130.000	0.007	1.000	N	NA
678243	678244	YP0237	YP_0238	trkA	sun	FALSE	0.123	56.000	0.007	1.000	N	NA
678244	678245	YP_0238	YP0239	sun	fmt	TRUE	0.929	94.000	0.305	1.000	Y	NA
678245	678246	YP0239	YP0240	fmt	def	TRUE	0.955	25.000	0.058	0.024	Y	NA
678247	678248	YP0241	YP0242	smf	smg	TRUE	0.867	-28.000	0.124	NA		NA
678248	678249	YP0242	YP0243	smg	topA1	TRUE	0.951	20.000	0.331	NA		NA
678249	678250	YP0243	YP0244	topA1	sUA5A	TRUE	0.961	2.000	0.137	NA	N	NA
678250	678251	YP0244	YP0245	sUA5A	aroE1	TRUE	0.856	9.000	0.087	NA	N	NA
678253	678254	YP_r4	YP_t2			FALSE	0.240	130.000	0.000	NA		NA
678254	678255	YP_t2	YP_t3			FALSE	0.430	52.000	0.000	NA		NA
678255	678256	YP_t3	YP_r5			FALSE	0.110	219.000	0.000	NA		NA
678256	678257	YP_r5	YP_r6			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
678257	678258	YP_r6	YP0247			FALSE	0.013	459.000	0.000	NA		NA
678258	678259	YP0247	YP0248		tra5B	TRUE	0.788	24.000	0.000	0.095		NA
678260	678261	YP0249	YP0250	dnaC_3		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678263	678264	YP0252	YP0253			TRUE	0.680	186.000	0.356	NA		NA
678264	678265	YP0253	YP0254		coaE	TRUE	0.972	-3.000	0.110	NA		NA
678265	678266	YP0254	YP0255	coaE		TRUE	0.815	10.000	0.000	NA		NA
678268	678269	YP0257	YP0258	hofC	hofB	TRUE	0.999	-3.000	0.571	1.000	Y	NA
678269	678270	YP0258	YP0259	hofB	ppdD	TRUE	0.994	-25.000	0.556	NA	Y	NA
678270	678271	YP0259	YP_0260	ppdD	nadC	FALSE	0.026	203.000	0.015	NA	N	NA
678272	678273	YP0261	YP0262	ampD1	ampE	TRUE	0.600	273.000	0.249	1.000	Y	NA
678275	678276	YP_0264	YP0265	pdhR	aceE	TRUE	0.509	196.000	0.276	1.000	N	NA
678276	678277	YP0265	YP0266	aceE	aceF	TRUE	0.985	14.000	0.220	1.000	Y	NA
678277	678278	YP0266	YP0267	aceF		TRUE	0.688	18.000	0.000	NA		NA
678278	678279	YP0267	YP0268		lpdA	FALSE	0.246	124.000	0.000	NA		NA
678279	678280	YP0268	YP0269	lpdA	tnp_5	FALSE	0.083	192.000	0.000	1.000	N	NA
678280	678281	YP0269	YP0270	tnp_5	acnB	FALSE	0.004	570.000	0.000	1.000	N	NA
678281	678282	YP0270	YP0271	acnB		FALSE	0.067	299.000	0.068	NA		NA
678283	678284	YP0272	YP0273	rhaT1	speD	FALSE	0.014	438.000	0.000	NA		NA
678284	678285	YP0273	YP_0274	speD	speE	TRUE	0.892	78.000	0.162	1.000	Y	NA
678285	678286	YP_0274	YP0275	speE		TRUE	0.786	117.000	0.354	NA		NA
678287	678288	YP_0276	YP_0277	sufI1	hpt	FALSE	0.027	220.000	0.010	1.000	N	NA
678290	678291	YP0279	YP0280	ccmA1		TRUE	0.999	-3.000	0.688	1.000	Y	NA
678291	5437988	YP0280	YP_0281			FALSE	0.126	207.000	0.000	NA		NA
678292	678293	YP0282	YP0283	panD	panC	FALSE	0.378	411.000	0.342	1.000	Y	NA
678293	678294	YP0283	YP0284	panC	panB	TRUE	0.973	88.000	0.395	0.001	Y	NA
678294	678295	YP0284	YP0285	panB	folK	FALSE	0.428	269.000	0.117	1.000	Y	NA
678295	678296	YP0285	YP_0286	folK	pcnB	TRUE	0.963	8.000	0.234	1.000	N	NA
678296	678297	YP_0286	YP_0287	pcnB	glnS1	TRUE	0.860	89.000	0.131	1.000	Y	NA
678297	678298	YP_0287	YP_0288	glnS1	dksA1	FALSE	0.208	280.000	0.231	1.000	N	NA
678298	678299	YP_0288	YP0289	dksA1	sfsA	TRUE	0.461	170.000	0.151	NA		NA
678299	678300	YP0289	YP0290	sfsA	ligT	TRUE	0.744	-25.000	0.045	NA		NA
678301	678302	YP0291	YP0292	hrpB	mrcB	TRUE	0.711	88.000	0.158	0.016	N	NA
678302	678303	YP0292	YP0293	mrcB	fhuC	FALSE	0.017	322.000	0.000	1.000	N	NA
678303	678304	YP0293	YP_0294	fhuC	fhuD	TRUE	0.993	0.000	0.094	1.000	Y	NA
678304	678305	YP_0294	YP0295	fhuD	fhuB	TRUE	0.999	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
678307	678308	YP0297	YP0298	eriC1	iscA1	FALSE	0.234	121.000	0.031	NA		NA
678309	678310	YP0299	YP0300		fecB1	TRUE	0.883	-48.000	0.213	NA		NA
678310	678311	YP0300	YP0301	fecB1	mtn	TRUE	0.937	0.000	0.073	1.000	N	NA
678312	678313	YP0302	YP0303	dgt	gsrA	FALSE	0.210	198.000	0.101	1.000	N	NA
678315	678316	YP0305	YP0306		relA	FALSE	0.221	151.000	0.000	NA		NA
678316	678317	YP0306	YP0307	relA		TRUE	0.511	37.000	0.000	NA		NA
678317	678318	YP0307	YP0308		mazG	TRUE	0.855	7.000	0.000	NA		NA
678318	678319	YP0308	YP0309	mazG	pyrG	FALSE	0.116	212.000	0.025	1.000		NA
678319	678320	YP0309	YP0310	pyrG	eno	FALSE	0.328	81.000	0.068	1.000	N	NA
678320	678321	YP0310	YP0311	eno	sodC	FALSE	0.011	372.000	0.000	1.000	N	NA
678321	678322	YP0311	YP0312	sodC	nrdG1	FALSE	0.066	104.000	0.004	1.000	N	NA
678324	678325	YP_0314	YP0315	cysJ	cysI	TRUE	1.000	0.000	0.791	0.001	Y	NA
678325	5437989	YP0315	YP_0316	cysI	cysH	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
678326	678327	YP0317	YP0318			TRUE	0.594	70.000	0.118	NA		NA
678328	5437990	YP0319	YP_0320		cysG2	FALSE	0.041	301.000	0.000	NA		NA
5437990	678329	YP_0320	YP0321	cysG2	cysD	TRUE	0.794	11.000	0.000	NA		NA
678329	678330	YP0321	YP0322	cysD	cysN	TRUE	0.991	12.000	0.574	0.001	N	NA
678330	678331	YP0322	YP0323	cysN	cysC	TRUE	0.976	-61.000	0.340	1.000	Y	NA
678331	678332	YP0323	YP0324	cysC		TRUE	0.530	173.000	0.198	NA		NA
678332	678333	YP0324	YP0325			FALSE	0.031	314.000	0.028	NA		NA
678333	678334	YP0325	YP0326		ispD	TRUE	0.968	4.000	0.185	1.000	N	NA
678334	678335	YP0326	YP0327	ispD	ispF	TRUE	0.935	130.000	0.419	1.000	Y	NA
678335	678336	YP0327	YP0328	ispF		TRUE	0.946	11.000	0.173	1.000		NA
678336	678337	YP0328	YP0329		surE	TRUE	0.951	-22.000	0.235	1.000		NA
678337	678338	YP0329	YP0330	surE	pcm	TRUE	0.989	-6.000	0.353	1.000		NA
678338	678339	YP0330	YP0331	pcm	nlpD2	FALSE	0.135	104.000	0.030	1.000	N	NA
678339	678340	YP0331	YP0332	nlpD2	rpoS	TRUE	0.632	55.000	0.142	1.000	N	NA
678341	678342	YP0333	YP0334	mutS	rpiB1	FALSE	0.003	775.000	0.000	1.000	N	NA
678343	678344	YP0335	YP0336	tdh2	fabG1	TRUE	0.501	64.000	0.000	0.028	N	NA
678344	678345	YP0336	YP0337	fabG1	dAK1_1	TRUE	0.919	0.000	0.058	1.000	N	NA
678345	678346	YP0337	YP0338	dAK1_1	dAK1_2	TRUE	0.996	7.000	0.211	0.001	Y	NA
678347	678348	YP0339	YP0340	deoR5	arsB	FALSE	0.004	567.000	0.000	1.000	N	NA
678348	678349	YP0340	YP0341	arsB	arsR1	FALSE	0.185	85.000	0.000	1.000	N	NA
678349	678350	YP0341	YP0342	arsR1		FALSE	0.084	247.000	0.000	1.000		NA
678350	678351	YP0342	YP0343			FALSE	0.149	196.000	0.000	NA		NA
678351	678352	YP0343	YP0344		artI1	FALSE	0.016	421.000	0.000	NA		NA
678352	678353	YP0344	YP0345	artI1	mauG	FALSE	0.224	65.000	0.000	1.000	N	NA
678353	678354	YP0345	YP0346	mauG		FALSE	0.087	237.000	0.000	NA		NA
678355	678356	YP_0347	YP0348	cirA2		FALSE	0.015	433.000	0.000	NA		NA
678356	678357	YP0348	YP0349		wbbJ	FALSE	0.200	163.000	0.000	NA		NA
678358	678359	YP0350	YP0351	map		TRUE	0.994	-3.000	0.410	NA		NA
678359	678360	YP0351	YP0352		fumA	FALSE	0.241	129.000	0.000	NA		NA
678360	678361	YP0352	YP0353	fumA	sgbK	FALSE	0.009	398.000	0.000	1.000	N	NA
678361	678362	YP0353	YP0354	sgbK	sgbU	TRUE	0.999	11.000	1.000	0.020	Y	NA
678362	678363	YP0354	YP0355	sgbU	araH1	TRUE	0.792	206.000	0.250	1.000	Y	NA
678363	678364	YP0355	YP0356	araH1	araH2	TRUE	0.999	13.000	0.938	0.014	Y	NA
678364	678365	YP0356	YP0357	araH2	mglA1	TRUE	0.999	-7.000	0.941	0.014	Y	NA
678365	678366	YP0357	YP0358	mglA1	rbsB1	TRUE	0.976	149.000	0.941	NA	Y	NA
678366	678367	YP0358	YP0359	rbsB1	glpR2	TRUE	0.935	62.000	0.235	NA	Y	NA
678368	678369	YP_0360	YP0361	araD	dmsA1	FALSE	0.007	442.000	0.000	1.000	N	NA
678369	678370	YP0361	YP0362	dmsA1	dmsB1	TRUE	0.985	12.000	0.103	0.046	Y	NA
678370	678371	YP0362	YP0363	dmsB1	dmsC1	TRUE	0.952	-61.000	0.500	1.000		NA
678371	678372	YP0363	YP0364	dmsC1	torD1	TRUE	0.483	146.000	0.125	1.000		NA
678373	678374	YP_0365	YP0366	cybB1	cybC	TRUE	0.770	148.000	0.000	0.046	Y	NA
678374	678375	YP0366	YP0367	cybC	katG	TRUE	0.510	77.000	0.000	0.006	N	NA
678376	678377	YP0368	YP0369	rbsB2		TRUE	0.767	93.000	0.280	NA		NA
678377	678378	YP0369	YP0370		mglA2	TRUE	0.991	0.000	0.292	NA		NA
678378	678379	YP0370	YP0371	mglA2	araH3	TRUE	1.000	-3.000	0.793	0.014	Y	NA
678379	678380	YP0371	YP0372	araH3	tktA1	FALSE	0.441	246.000	0.075	1.000	Y	NA
678380	678381	YP0372	YP0373	tktA1	tktA2	TRUE	0.999	-7.000	0.860	0.001	Y	NA
678381	678382	YP0373	YP0374	tktA2	glpK2	TRUE	0.994	3.000	0.596	1.000	N	NA
678382	678383	YP0374	YP0375	glpK2		TRUE	0.804	21.000	0.127	1.000	N	NA
678384	678385	YP0376	YP0377	deoR1	proP5	FALSE	0.083	248.000	0.000	1.000		NA
678386	678387	YP0378	YP0379	cinA	recA	FALSE	0.400	115.000	0.082	NA		NA
678387	678388	YP0379	YP0380	recA	recX	TRUE	0.733	138.000	0.296	1.000		NA
678388	678389	YP0380	YP0381	recX	alaS	FALSE	0.395	140.000	0.085	1.000		NA
678389	678390	YP0381	YP0382	alaS	csrA	FALSE	0.023	250.000	0.020	1.000	N	NA
678390	678391	YP0382	YP_t4	csrA		FALSE	0.024	363.000	0.000	NA		NA
678391	678392	YP_t4	YP_t5			TRUE	0.833	9.000	0.000	NA		NA
678392	678393	YP_t5	YP_t6			FALSE	0.332	80.000	0.000	NA		NA
678393	678394	YP_t6	YP0383			FALSE	0.015	423.000	0.000	NA		NA
678394	678395	YP0383	YP0384			TRUE	0.956	-3.000	0.067	NA		NA
678395	678396	YP0384	YP0385		gshA	TRUE	0.597	44.000	0.071	NA		NA
678396	678397	YP0385	YP0386	gshA	luxS	FALSE	0.235	168.000	0.087	1.000	N	NA
678398	678399	YP_0387	YP0388		ccmC1	TRUE	0.727	162.000	0.349	NA		NA
678402	678403	YP0391	YP_0392	rpsP	rimM	TRUE	0.991	22.000	0.342	0.016	Y	NA
678403	678404	YP_0392	YP0393	rimM	trmD	TRUE	0.997	-18.000	0.672	1.000	Y	NA
678404	678405	YP0393	YP0394	trmD	rplS	TRUE	0.971	81.000	0.567	1.000	Y	NA
678406	5437991	YP0395	YP_0396		dcuB	FALSE	0.053	278.000	0.000	NA		NA
5437991	678407	YP_0396	YP0397	dcuB	lytT	FALSE	0.015	429.000	0.000	NA		NA
678408	678409	YP0398	YP0399	aroF	tyrA	TRUE	0.954	13.000	0.023	1.000	Y	NA
678410	678411	YP0400	YP0401	pheA1	dnaC_4	FALSE	0.028	272.000	0.000	1.000	N	NA
678411	678412	YP0401	YP0402	dnaC_4		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678413	678414	YP0404	YP0405	putP1		TRUE	0.998	-3.000	0.733	NA		NA
678414	678415	YP0405	YP_0406		acs	TRUE	0.708	57.000	0.147	NA		NA
678417	678418	YP0408	YP0409	citB1	baeS1	TRUE	0.998	13.000	0.688	0.012	Y	NA
678419	678420	YP0410	YP0411	gspD2		TRUE	0.972	-13.000	0.268	NA		NA
678420	678421	YP0411	YP0412			TRUE	0.881	19.000	0.146	NA		NA
678421	678422	YP0412	YP0413		araC1	FALSE	0.297	107.000	0.000	1.000		NA
678422	678423	YP0413	YP0414	araC1		TRUE	0.945	10.000	0.150	1.000		NA
678423	678424	YP0414	YP0415			TRUE	0.997	-3.000	0.650	NA		NA
678424	678425	YP0415	YP0416			TRUE	0.834	98.000	0.407	NA		NA
678425	678426	YP0416	YP0417		fliF1	TRUE	0.997	-3.000	0.407	0.015		NA
678426	678427	YP0417	YP0418	fliF1		TRUE	0.881	172.000	0.786	NA		NA
678427	678428	YP0418	YP0419			TRUE	0.898	84.000	0.538	NA		NA
678428	678429	YP0419	YP0420		flhA1	TRUE	0.822	-13.000	0.000	NA		NA
678429	678430	YP0420	YP0421	flhA1	fliI1	TRUE	0.998	-16.000	0.647	0.010	Y	NA
678430	678431	YP0421	YP0422	fliI1	sbcC	TRUE	0.984	-3.000	0.176	NA		NA
678431	678432	YP0422	YP0423	sbcC		TRUE	0.994	-19.000	1.000	NA		NA
678432	678433	YP0423	YP0424		fliN1	TRUE	0.947	-22.000	0.231	NA		NA
678433	678434	YP0424	YP_0425	fliN1	fliP1	TRUE	0.899	67.000	0.154	1.000	Y	NA
678434	678435	YP_0425	YP0426	fliP1	fliQ1	TRUE	0.997	-3.000	0.136	0.015	Y	NA
678435	678436	YP0426	YP0427	fliQ1	fliR1	TRUE	0.999	2.000	0.516	0.089	Y	NA
678436	678437	YP0427	YP0428	fliR1	flhB1	TRUE	0.996	-13.000	0.406	0.089	Y	NA
678437	678438	YP0428	YP0429	flhB1		FALSE	0.023	383.000	0.045	NA		NA
678438	678439	YP0429	YP0430		sirA1	TRUE	0.998	-3.000	0.844	NA		NA
678441	678442	YP0432	YP0433	sdaC1	metC2	TRUE	0.856	46.000	0.043	NA	Y	NA
678443	678444	YP0434	YP0435	hmuV	hmuU	TRUE	0.994	-7.000	0.220	1.000	Y	NA
678444	678445	YP0435	YP0436	hmuU	hmuT	TRUE	0.999	-3.000	0.852	1.000	Y	NA
678445	678446	YP0436	YP0437	hmuT	hmuS	TRUE	0.998	-3.000	0.384	1.000	Y	NA
678446	678447	YP0437	YP0438	hmuS	hmuR	TRUE	0.746	119.000	0.064	1.000	Y	NA
678447	678448	YP0438	YP0439	hmuR		FALSE	0.205	130.000	0.023	NA		NA
678448	678449	YP0439	YP0440			FALSE	0.248	86.000	0.015	NA		NA
678449	678450	YP0440	YP0441			TRUE	0.461	34.000	0.054	1.000	N	NA
678450	5437993	YP0441	YP_0442			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
5437993	678451	YP_0442	YP0443		dnaC_5	FALSE	0.455	-1814.000	0.000	NA		NA
678451	678452	YP0443	YP0444	dnaC_5		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678452	678453	YP0444	YP0445		metF2	FALSE	0.003	780.000	0.000	1.000	N	NA
678453	678454	YP0445	YP0446	metF2		FALSE	0.035	315.000	0.000	NA		NA
678454	678455	YP0446	YP0447		citE1	FALSE	0.018	397.000	0.000	NA		NA
678455	678456	YP0447	YP0448	citE1		TRUE	0.994	0.000	0.420	NA		NA
678456	678457	YP0448	YP0449			TRUE	0.984	-7.000	0.296	NA		NA
678457	678458	YP0449	YP0450			TRUE	0.932	-13.000	0.126	NA		NA
678458	678459	YP0450	YP0451			TRUE	0.955	12.000	0.217	1.000		NA
678460	678461	YP0452	YP0453	terZ	terA	TRUE	0.950	9.000	0.054	0.004		NA
678461	678462	YP0453	YP0454	terA	terB	TRUE	0.857	33.000	0.200	NA		NA
678462	678463	YP0454	YP0455	terB	terC1	TRUE	0.923	22.000	0.000	NA	Y	NA
678463	678464	YP0455	YP0456	terC1	terD	FALSE	0.246	58.000	0.000	1.000	N	NA
678464	678465	YP0456	YP0457	terD	terE	TRUE	0.921	184.000	0.310	0.004	Y	NA
678465	678466	YP0457	YP0458	terE		FALSE	0.006	713.000	0.000	NA		NA
678466	678467	YP0458	YP0459		fimD1	FALSE	0.072	251.000	0.000	NA		NA
678467	678468	YP0459	YP0460	fimD1	fimC1	TRUE	0.972	72.000	0.571	NA	Y	NA
678468	678469	YP0460	YP0461	fimC1	proP6	TRUE	0.843	8.000	0.000	NA		NA
678469	678470	YP0461	YP0462	proP6		FALSE	0.005	1112.000	0.000	NA		NA
678470	678471	YP0462	YP0463			FALSE	0.015	423.000	0.000	NA		NA
678471	678472	YP0463	YP0464		glcD1	FALSE	0.031	332.000	0.000	NA		NA
678474	678475	YP_0466	YP0467	ubiC	ubiA	TRUE	0.853	166.000	0.248	NA	Y	NA
678477	678478	YP0469	YP0470	dgkA	lexA1	FALSE	0.439	125.000	0.141	1.000	N	NA
678480	678481	YP0472	YP0473		malF1	FALSE	0.017	516.000	0.070	NA		NA
678483	678484	YP0475	YP0476	dnaB	alr	TRUE	0.741	97.000	0.317	1.000	N	NA
678484	678485	YP0476	YP0477	alr	tyrB	FALSE	0.401	186.000	0.181	1.000	N	NA
678485	678486	YP0477	YP0478	tyrB	mmcQ	FALSE	0.010	527.000	0.000	NA		NA
678489	678490	YP0481	YP0482		eutG	TRUE	0.853	11.000	0.063	NA		NA
678490	678491	YP0482	YP0483	eutG	rhaD	TRUE	0.545	67.000	0.041	0.007	N	NA
678491	678492	YP0483	YP0484	rhaD	rhaA	TRUE	0.988	13.000	0.247	1.000	Y	NA
678492	678493	YP0484	YP0485	rhaA	rhaB	TRUE	0.996	-9.000	0.387	1.000	Y	NA
678494	678495	YP0486	YP0487	purM	rhaS	FALSE	0.103	222.000	0.000	NA		NA
678495	678496	YP0487	YP0488	rhaS	rhaR	TRUE	0.982	133.000	0.800	0.035	Y	NA
678500	678501	YP0492	YP0493			TRUE	0.731	15.000	0.000	NA		NA
678502	678503	YP_t7	YP0494		acrR1	FALSE	0.230	145.000	0.000	NA		NA
678504	678505	YP0495	YP0496		gltD1	FALSE	0.136	203.000	0.000	NA		NA
678505	678506	YP0496	YP0497	gltD1	hydN	TRUE	0.936	23.000	0.222	0.013	N	NA
678506	678507	YP0497	YP0498	hydN	fdhF	TRUE	0.950	23.000	0.231	0.046		NA
678508	678509	YP0499	YP0500	dsbD	cutA	TRUE	0.787	-24.000	0.092	1.000	N	NA
678509	678510	YP0500	YP0501	cutA	dcuA	FALSE	0.133	185.000	0.007	1.000		NA
678510	678511	YP0501	YP0502	dcuA	aspA	FALSE	0.236	120.000	0.023	1.000		NA
678511	678512	YP0502	YP0503	aspA		FALSE	0.018	399.000	0.000	NA		NA
678513	678514	YP_0504	YP0505	fxsA	groES	FALSE	0.072	255.000	0.040	NA		NA
678514	678515	YP0505	YP0506	groES	groEL	TRUE	0.991	47.000	0.631	0.007	Y	NA
678515	678516	YP0506	YP0507	groEL		FALSE	0.263	113.000	0.000	NA		NA
678516	678517	YP0507	YP0508			FALSE	0.054	275.000	0.000	NA		NA
678519	678520	YP_0510	YP0511	efp1	sugE	FALSE	0.161	100.000	0.000	1.000	N	NA
678521	678522	YP0512	YP0513	frdD	frdC	TRUE	0.998	17.000	0.787	0.003	Y	NA
678522	678523	YP0513	YP0514	frdC	frdB	TRUE	0.995	17.000	0.454	0.003	Y	NA
678523	678524	YP0514	YP0515	frdB	frdA	TRUE	0.999	-7.000	0.470	0.003	Y	NA
678525	678526	YP0516	YP0517			FALSE	0.205	160.000	0.000	NA		NA
678527	678528	YP0518	YP0519		psd	TRUE	0.799	24.000	0.148	NA	N	NA
678528	678529	YP0519	YP0520	psd		FALSE	0.073	325.000	0.095	1.000		NA
678534	678535	YP0524	YP0525			TRUE	0.913	11.000	0.118	NA		NA
678535	678536	YP0525	YP0526		amiB	TRUE	0.931	8.000	0.109	NA		NA
678536	678537	YP0526	YP0527	amiB	mutL1	TRUE	0.775	16.000	0.092	1.000	N	NA
678537	678538	YP0527	YP0528	mutL1	miaA	TRUE	0.963	-7.000	0.188	1.000	N	NA
678538	678539	YP0528	YP0529	miaA	ymr	TRUE	0.869	116.000	0.531	1.000		NA
678539	678540	YP0529	YP0530	ymr	hflX	TRUE	0.588	99.000	0.141	1.000		NA
678540	678541	YP0530	YP0531	hflX	hflK	FALSE	0.412	241.000	0.184	0.088		NA
678541	678542	YP0531	YP0532	hflK	hflC1	TRUE	1.000	4.000	0.947	0.018	Y	NA
678542	678543	YP0532	YP0533	hflC1		TRUE	0.862	64.000	0.348	NA		NA
678543	678544	YP0533	YP0534		purA	FALSE	0.362	88.000	0.051	NA		NA
678544	678545	YP0534	YP_0535	purA		FALSE	0.003	369.000	0.010	NA	N	NA
678545	678546	YP_0535	YP0536		rnr	FALSE	0.380	241.000	0.038	NA	Y	NA
678546	678547	YP0536	YP0537	rnr	spoU	TRUE	0.629	119.000	0.147	0.018	N	NA
678547	678548	YP0537	YP_0538	spoU	aidB	FALSE	0.003	408.000	0.005	1.000	N	NA
678550	678551	YP0540	YP0541			FALSE	0.342	75.000	0.000	NA		NA
678551	678552	YP0541	YP0542		rpsF	TRUE	0.747	14.000	0.000	NA		NA
678552	678553	YP0542	YP0543	rpsF	priB	TRUE	0.929	6.000	0.122	1.000	N	NA
678553	678554	YP0543	YP0544	priB	rpsR	TRUE	0.942	5.000	0.128	1.000	N	NA
678554	678555	YP0544	YP0545	rpsR	rplI	TRUE	0.988	40.000	0.499	0.016	Y	NA
678555	678556	YP0545	YP0546	rplI		FALSE	0.020	304.000	0.000	1.000	N	NA
678556	678557	YP0546	YP0547		dnaC_6	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678557	678558	YP0547	YP0548	dnaC_6	tnp	TRUE	0.686	131.000	0.000	1.000	Y	NA
678559	678560	YP0549	YP0550		oapA	FALSE	0.265	140.000	0.047	NA		NA
678562	678563	YP0552	YP0553		cpdB	FALSE	0.079	155.000	0.030	NA	N	NA
678567	678568	YP0557	YP0558		msrA	FALSE	0.057	278.000	0.042	NA		NA
678569	5437994	YP0559	YP_0560			TRUE	0.996	-3.000	0.575	NA		NA
5437994	10140402	YP_0560	YP_0561			TRUE	0.977	3.000	0.167	NA		NA
678572	678573	YP0562	YP0563	ppa	fbp	FALSE	0.088	200.000	0.043	1.000	N	NA
678575	678576	YP0565	YP0566		argR	FALSE	0.019	389.000	0.000	NA		NA
678581	10140403	YP_0571	YP_0572	rplU	rpmA	TRUE	0.996	20.000	0.667	0.016	Y	NA
10140403	678583	YP_0572	YP0573	rpmA	rhaT3	FALSE	0.256	88.000	0.019	NA		NA
678583	678584	YP0573	YP0574	rhaT3	obg	TRUE	0.896	1.000	0.015	NA		NA
678585	678586	YP0575	YP0576	basS	basR	TRUE	0.998	-3.000	0.381	1.000	Y	NA
678586	678587	YP0576	YP0577	basR	dacB	TRUE	0.913	6.000	0.101	1.000	N	NA
678590	10140404	YP_0580	YP_0581	rrmJ	hflB	TRUE	0.689	48.000	0.152	1.000	N	NA
10140404	678592	YP_0581	YP0582	hflB	folP	TRUE	0.713	120.000	0.325	1.000	N	NA
678592	678593	YP0582	YP0583	folP	mrsA	TRUE	0.961	10.000	0.260	1.000	N	NA
678593	678594	YP0583	YP0584	mrsA	secG	FALSE	0.029	223.000	0.016	1.000	N	NA
678594	678595	YP0584	YP_t9	secG		FALSE	0.298	93.000	0.000	NA		NA
678595	10140405	YP_t9	YP_t11			FALSE	0.389	61.000	0.000	NA		NA
10140405	678597	YP_t11	YP_0585			FALSE	0.115	216.000	0.000	NA		NA
678597	678598	YP_0585	YP0586		nusA	TRUE	0.996	4.000	0.759	NA		NA
678598	678599	YP0586	YP0587	nusA	infB	TRUE	0.926	25.000	0.342	1.000	N	NA
678599	678600	YP0587	YP_0588	infB	rbfA	TRUE	0.973	66.000	0.530	1.000	Y	NA
678600	678601	YP_0588	YP0589	rbfA	truB	TRUE	0.998	0.000	0.318	1.000	Y	NA
678601	5437996	YP0589	YP_0590	truB	rpsO	TRUE	0.875	122.000	0.211	1.000	Y	NA
5437996	10140406	YP_0590	YP_0591	rpsO		FALSE	0.221	66.000	0.000	1.000	N	NA
10140406	678604	YP_0591	YP0592		tra5C	TRUE	0.924	54.000	0.167	1.000	Y	NA
678604	678605	YP0592	YP0593	tra5C	pnp	FALSE	0.101	171.000	0.000	1.000	N	NA
678605	678606	YP0593	YP0594	pnp	nlpI	FALSE	0.371	125.000	0.071	1.000		NA
678606	678607	YP0594	YP_0595	nlpI	deaD	FALSE	0.216	187.000	0.053	1.000		NA
678607	678608	YP_0595	YP0596	deaD		TRUE	0.667	20.000	0.000	NA		NA
678608	678609	YP0596	YP0597			TRUE	0.476	43.000	0.000	NA		NA
678609	678610	YP0597	YP0598		hipB1	TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
678612	678613	YP0600	YP0601	acrA2	acrB1	TRUE	0.953	4.000	0.133	1.000	N	NA
678613	678614	YP0601	YP0602	acrB1	ibeB	TRUE	0.993	2.000	0.367	0.065	N	NA
678615	678616	YP0603	YP0604			TRUE	0.999	-9.000	0.948	0.003	Y	NA
678616	678617	YP0604	YP0605			FALSE	0.269	110.000	0.000	NA		NA
678618	678619	YP0606	YP0607			TRUE	0.987	-6.000	0.295	1.000		NA
678620	678621	YP0608	YP0609			FALSE	0.102	231.000	0.000	1.000		NA
678621	678622	YP0609	YP0610			TRUE	0.977	24.000	0.400	0.001		NA
678623	678624	YP0611	YP0612	ugpB1	malF2	TRUE	0.998	8.000	0.611	0.065	Y	NA
678624	678625	YP0612	YP0613	malF2	malG1	TRUE	0.996	19.000	0.611	0.065	Y	NA
678625	5437997	YP0613	YP_0614	malG1		TRUE	0.780	12.000	0.000	NA		NA
5437997	678626	YP_0614	YP0615			TRUE	0.731	15.000	0.000	NA		NA
678626	678627	YP0615	YP0616			FALSE	0.267	117.000	0.032	1.000		NA
678627	678628	YP0616	YP0617			FALSE	0.299	152.000	0.056	1.000		NA
678629	678630	YP0618	YP0619	phnP	phnN	TRUE	0.972	-9.000	0.214	NA		NA
678630	678631	YP0619	YP0620	phnN	phnM	TRUE	0.997	0.000	0.235	NA	Y	NA
678631	678632	YP0620	YP0621	phnM	phnL1	TRUE	0.998	-3.000	0.320	1.000	Y	NA
678634	678635	YP_0623	YP0624	phnK	phnJ	TRUE	0.999	0.000	0.883	1.000	Y	NA
678635	678636	YP0624	YP0625	phnJ	phnI	TRUE	0.999	-7.000	0.880	1.000	Y	NA
678636	678637	YP0625	YP0626	phnI	phnH	TRUE	1.000	0.000	0.960	0.002	Y	NA
678637	678638	YP0626	YP0627	phnH	phnG	TRUE	1.000	-3.000	0.967	0.002	Y	NA
678638	678639	YP0627	YP0628	phnG	phnF1	TRUE	0.996	1.000	0.691	1.000	N	NA
678639	678640	YP0628	YP0629	phnF1		TRUE	0.610	25.000	0.000	NA		NA
678640	678641	YP0629	YP0630		nrdG2	FALSE	0.243	127.000	0.000	NA		NA
678641	678642	YP0630	YP0631	nrdG2	nrdD	TRUE	0.629	207.000	0.464	1.000	N	NA
678642	678643	YP0631	YP0632	nrdD	oppF1	FALSE	0.007	434.000	0.000	1.000	N	NA
678643	678644	YP0632	YP0633	oppF1	dppD1	TRUE	0.998	-13.000	0.550	0.023	Y	NA
678644	678645	YP0633	YP0634	dppD1	dppC1	TRUE	0.983	-37.000	0.324	1.000	Y	NA
678645	678646	YP0634	YP0635	dppC1	dppB1	TRUE	0.993	19.000	0.441	0.065	Y	NA
678646	5437998	YP0635	YP_0636	dppB1	ddpA	FALSE	0.291	96.000	0.000	NA		NA
678650	678651	YP0640	YP0641	wecD2	valS	TRUE	0.640	143.000	0.008	1.000	Y	NA
678651	678652	YP0641	YP0642	valS	holC	TRUE	0.814	13.000	0.089	1.000	N	NA
678652	678653	YP0642	YP0643	holC	pepA	TRUE	0.780	151.000	0.494	1.000	N	NA
678654	678655	YP0644	YP0645			TRUE	0.998	0.000	0.631	0.087		NA
678655	678656	YP0645	YP_t12			FALSE	0.275	105.000	0.000	NA		NA
678656	678657	YP_t12	YP0646		intB	FALSE	0.200	163.000	0.000	NA		NA
678657	678658	YP0646	YP0647	intB		FALSE	0.430	52.000	0.000	NA		NA
678658	5437999	YP0647	YP_0648			TRUE	0.766	-19.000	0.000	NA		NA
678659	678660	YP0649	YP0650	dnaC_7		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678662	678663	YP0652	YP0653		nrfG1	FALSE	0.045	253.000	0.004	NA		NA
678664	678665	YP0654	YP0655	rluD		TRUE	0.979	2.000	0.168	NA		NA
678665	678666	YP0655	YP0656		clpB1	TRUE	0.479	109.000	0.108	NA		NA
678666	678667	YP0656	YP_r7	clpB1		FALSE	0.009	544.000	0.000	NA		NA
678667	678668	YP_r7	YP_t13			FALSE	0.240	130.000	0.000	NA		NA
678668	678669	YP_t13	YP_t14			FALSE	0.430	52.000	0.000	NA		NA
678669	678670	YP_t14	YP_r8			FALSE	0.110	219.000	0.000	NA		NA
678670	678671	YP_r8	YP_r9			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
678672	678673	YP0657	YP0658		pssA	TRUE	0.565	62.000	0.089	NA		NA
678673	678674	YP0658	YP0659	pssA		FALSE	0.457	173.000	0.121	0.050	N	NA
678674	678675	YP0659	YP0660			TRUE	0.844	43.000	0.222	NA		NA
678675	678676	YP0660	YP0661		trxC	FALSE	0.312	170.000	0.084	NA		NA
678678	678679	YP0663	YP0664	emrB	emrA	TRUE	0.970	39.000	0.875	1.000	N	NA
678681	678682	YP0666	YP0667	emrR		FALSE	0.315	148.000	0.065	NA		NA
678682	678683	YP0667	YP0668		azlC	TRUE	0.998	-3.000	0.915	NA		NA
678683	678684	YP0668	YP0669	azlC	proP7	FALSE	0.162	160.000	0.060	NA	N	NA
678684	678685	YP0669	YP0670	proP7		FALSE	0.095	228.000	0.000	NA		NA
678685	678686	YP0670	YP0671		gatA	TRUE	0.874	29.000	0.203	NA		NA
678686	678687	YP0671	YP0672	gatA		TRUE	0.975	-3.000	0.122	NA		NA
678688	678689	YP0673	YP0674		rpiR1	FALSE	0.187	171.000	0.000	NA		NA
678689	678690	YP0674	YP0675	rpiR1		TRUE	0.919	2.000	0.000	NA		NA
678690	678691	YP0675	YP0676		artI2	FALSE	0.268	111.000	0.000	NA		NA
678691	678692	YP0676	YP0677	artI2	artM1	TRUE	0.998	13.000	0.765	0.065	Y	NA
678692	678693	YP0677	YP0678	artM1	artM2	TRUE	0.999	-3.000	0.433	0.020	Y	NA
678693	678694	YP0678	YP0679	artM2	glnQ1	TRUE	0.995	-19.000	0.532	1.000	Y	NA
678694	5438000	YP0679	YP_0680	glnQ1		TRUE	0.548	32.000	0.000	NA		NA
678695	678696	YP0681	YP0682	dnaC_8		TRUE	0.999	-3.000	0.667	1.000	Y	NA
678697	678698	YP0683	YP0684	argE1	hxuB	FALSE	0.002	1089.000	0.000	NA	N	NA
678698	678699	YP0684	YP0685	hxuB	hmwA	TRUE	0.819	41.000	0.188	NA		NA
678699	678700	YP0685	YP0686	hmwA	hmwC	TRUE	0.461	155.000	0.125	1.000		NA
678700	678701	YP0686	YP0687	hmwC		TRUE	0.927	2.000	0.000	1.000		NA
678703	678704	YP0689	YP0690	lpcA		TRUE	0.531	197.000	0.229	1.000		NA
678705	678706	YP0691	YP0692			FALSE	0.136	203.000	0.000	NA		NA
678707	678708	YP0693	YP0694	nqrA1	nqrB1	TRUE	1.000	4.000	0.854	0.002	Y	NA
678708	678709	YP0694	YP0695	nqrB1	nqrC1	TRUE	0.993	-67.000	0.603	0.002	Y	NA
678709	678710	YP0695	YP0696	nqrC1	nqrD1	TRUE	0.998	-7.000	0.312	0.002	Y	NA
678710	678711	YP0696	YP0697	nqrD1	nqrE1	TRUE	0.998	1.000	0.188	0.002	Y	NA
678711	678712	YP0697	YP0698	nqrE1	nqrF	TRUE	0.997	16.000	0.551	0.002	Y	NA
678712	678713	YP0698	YP0699	nqrF	apbE	TRUE	0.979	-19.000	0.519	1.000	N	NA
678713	678714	YP0699	YP0700	apbE		TRUE	0.980	13.000	0.481	NA		NA
678718	678719	YP0704	YP0705		lysR3	FALSE	0.006	722.000	0.000	NA		NA
678720	678721	YP0706	YP0707		proP8	FALSE	0.147	197.000	0.000	NA		NA
678722	678723	YP0708	YP_0709	gpt	frsA	TRUE	0.469	127.000	0.120	NA		NA
678723	678724	YP_0709	YP0710	frsA	crl	TRUE	0.587	60.000	0.095	NA		NA
678724	678725	YP0710	YP0711	crl	proB	TRUE	0.614	177.000	0.262	NA		NA
678725	678726	YP0711	YP0712	proB	proA	TRUE	0.984	10.000	0.026	0.001	Y	NA
678726	678727	YP0712	YP0713	proA		FALSE	0.285	99.000	0.000	NA		NA
678727	678728	YP0713	YP0714			FALSE	0.357	68.000	0.000	NA		NA
678728	678729	YP0714	YP0715			FALSE	0.210	183.000	0.053	NA		NA
678729	678730	YP0715	YP0716			TRUE	0.740	-22.000	0.000	NA		NA
678730	678731	YP0716	YP0717		smtA1	FALSE	0.372	65.000	0.000	NA		NA
678733	678734	YP0719	YP0720	ksgA1	aroK2	FALSE	0.038	247.000	0.000	1.000	N	NA
678734	678735	YP0720	YP0721	aroK2		FALSE	0.067	256.000	0.000	NA		NA
678735	678736	YP0721	YP0722			FALSE	0.376	64.000	0.000	NA		NA
678739	678740	YP0725	YP0726	sbcC2	sbcD	TRUE	1.000	-3.000	0.669	0.002	Y	NA
678741	678742	YP0727	YP0728	phoB	phoR	TRUE	0.991	25.000	0.453	0.083	Y	NA
678742	678743	YP0728	YP0729	phoR	pstS1	TRUE	0.849	22.000	0.168	1.000	N	NA
678743	678744	YP0729	YP0730	pstS1	brnQ	FALSE	0.006	474.000	0.000	1.000	N	NA
678744	678745	YP0730	YP0731	brnQ	ansP1	TRUE	0.952	76.000	0.261	0.086	Y	NA
678745	678746	YP0731	YP0732	ansP1	malZ	FALSE	0.017	561.000	0.123	1.000	N	NA
678746	678747	YP0732	YP0733	malZ	fabG2	FALSE	0.220	155.000	0.031	1.000		NA
678748	678749	YP0735	YP0736			TRUE	0.596	26.000	0.000	NA		NA
678750	678751	YP0737	YP0738	ahpC		FALSE	0.028	319.000	0.014	1.000		NA
678752	678753	YP0739	YP0740	queA	tgt	TRUE	0.970	93.000	0.360	0.001	Y	NA
678753	678754	YP0740	YP_0741	tgt	yajC	TRUE	0.716	112.000	0.325	NA	N	NA
678754	678755	YP_0741	YP0742	yajC	secD1	TRUE	0.905	28.000	0.045	NA	Y	NA
678755	678756	YP0742	YP_0743	secD1	secF	TRUE	0.994	11.000	0.206	0.001	Y	NA
678756	678757	YP_0743	YP0744	secF	v1	FALSE	0.116	156.000	0.000	1.000	N	NA
678757	678758	YP0744	YP0745	v1		FALSE	0.043	298.000	0.000	NA		NA
678758	678759	YP0745	YP0746			TRUE	0.540	33.000	0.000	NA		NA
678759	678760	YP0746	YP0747			FALSE	0.350	71.000	0.000	NA		NA
678760	678761	YP0747	YP0748		ribD	TRUE	0.618	150.000	0.277	NA	N	NA
678761	678762	YP0748	YP_0749	ribD	ribH	TRUE	0.815	136.000	0.034	0.002	Y	NA
678762	678763	YP_0749	YP0750	ribH	nusB	TRUE	0.940	21.000	0.347	1.000	N	NA
678763	678764	YP0750	YP0751	nusB	thiL	FALSE	0.297	241.000	0.225	1.000	N	NA
678764	678765	YP0751	YP0752	thiL	pgpA	TRUE	0.967	-7.000	0.206	1.000	N	NA
678765	678766	YP0752	YP0753	pgpA	tnp_7	FALSE	0.109	163.000	0.000	1.000	N	NA
678767	678768	YP0754	YP0755	dxs	ispA	TRUE	0.693	156.000	0.060	1.000	Y	NA
678768	678769	YP0755	YP_0756	ispA	xseB	TRUE	0.779	5.000	0.035	1.000	N	NA
678770	678771	YP0757	YP0758		thiI	FALSE	0.287	98.000	0.000	NA		NA
678772	678773	YP0759	YP0760	thiJ1	apbA	TRUE	0.851	-43.000	0.155	NA		NA
678775	678776	YP0762	YP0763	proP9	cyoE	FALSE	0.022	478.000	0.061	0.086	N	NA
678776	678777	YP0763	YP0764	cyoE	cyoD	TRUE	0.960	-7.000	0.118	0.086	N	NA
678777	678778	YP0764	YP0765	cyoD	cyoC	TRUE	0.999	0.000	0.485	0.044	Y	NA
678778	678779	YP0765	YP0766	cyoC	cyoB	TRUE	0.999	-10.000	0.697	0.044	Y	NA
678779	678780	YP0766	YP0767	cyoB	cyoA	TRUE	0.996	5.000	0.204	0.006	Y	NA
678780	678781	YP0767	YP_0768	cyoA		FALSE	0.022	370.000	0.000	NA		NA
678781	678782	YP_0768	YP_0769		ampG	FALSE	0.046	292.000	0.000	NA		NA
678782	678783	YP_0769	YP_0770	ampG		TRUE	0.638	118.000	0.256	NA	N	NA
678784	678785	YP0771	YP0772	bolA1		FALSE	0.173	141.000	0.011	NA		NA
678785	678786	YP0772	YP0773		tig	FALSE	0.244	73.000	0.002	NA		NA
678786	678787	YP0773	YP0774	tig	clpP	FALSE	0.316	462.000	0.351	1.000	Y	NA
678787	678788	YP0774	YP0775	clpP	clpX	TRUE	0.846	206.000	0.352	1.000	Y	NA
678788	678789	YP0775	YP0776	clpX	lon	TRUE	0.861	141.000	0.201	1.000	Y	NA
678789	678790	YP0776	YP0777	lon	hupB	FALSE	0.024	218.000	0.005	1.000	N	NA
678790	678791	YP0777	YP0778	hupB	ppiD	FALSE	0.026	301.000	0.046	1.000	N	NA
678791	678792	YP0778	YP0779	ppiD	comEA	FALSE	0.130	140.000	0.000	1.000	N	NA
678792	678793	YP0779	YP0780	comEA	fcbC1	FALSE	0.033	336.000	0.000	1.000		NA
678794	678795	YP0781	YP0782		oppA1	FALSE	0.053	265.000	0.019	1.000		NA
678798	678799	YP0785	YP0786	lrp1	mdlA	TRUE	0.563	102.000	0.179	1.000	N	NA
678799	678800	YP0786	YP_0787	mdlA	mdlB1	TRUE	0.999	-7.000	0.911	0.007	Y	NA
678800	678801	YP_0787	YP0788	mdlB1	glnK	FALSE	0.010	353.000	0.028	1.000	N	NA
678801	678802	YP0788	YP0789	glnK	amtB	TRUE	0.575	82.000	0.156	1.000	N	NA
678805	678806	YP0792	YP_s2		ffs	FALSE	0.334	79.000	0.000	NA		NA
678806	678807	YP_s2	YP0793	ffs	ymoA	FALSE	0.009	534.000	0.000	NA		NA
678807	678808	YP0793	YP0794	ymoA		TRUE	0.599	49.000	0.080	NA		NA
678808	678809	YP0794	YP0795			TRUE	0.759	159.000	0.400	NA		NA
678809	678810	YP0795	YP0796		rpmJ2	FALSE	0.006	874.000	0.000	1.000		NA
678810	678811	YP0796	YP_0797	rpmJ2	rpmE2	TRUE	0.915	16.000	0.083	0.015		NA
678811	678812	YP_0797	YP0798	rpmE2	acrB2	FALSE	0.041	186.000	0.008	1.000	N	NA
678812	678813	YP0798	YP0799	acrB2	acrA3	TRUE	0.968	17.000	0.500	1.000	N	NA
678814	678815	YP0800	YP0801	acrR2	dsrE2	TRUE	0.765	13.000	0.075	NA	N	NA
678815	678816	YP0801	YP_0802	dsrE2	aefA	FALSE	0.057	239.000	0.054	NA	N	NA
678817	678818	YP0803	YP0804		priC	TRUE	0.800	159.000	0.474	NA		NA
678819	678820	YP0805	YP0806		apt1	FALSE	0.094	239.000	0.043	NA		NA
678820	678821	YP0806	YP0807	apt1	dnaX	FALSE	0.009	656.000	0.088	1.000	N	NA
678821	678822	YP0807	YP0808	dnaX		TRUE	0.898	56.000	0.411	NA		NA
678822	678823	YP0808	YP0809		recR	TRUE	0.997	0.000	0.604	NA		NA
678823	678824	YP0809	YP0810	recR		TRUE	0.731	15.000	0.000	NA		NA
678824	678825	YP0810	YP0811		htpG	TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
678825	678826	YP0811	YP0812	htpG	adk	FALSE	0.049	227.000	0.035	1.000	N	NA
678826	678827	YP0812	YP0813	adk	hemH	FALSE	0.087	90.000	0.008	1.000	N	NA
678827	678828	YP0813	YP0814	hemH	ddhD	FALSE	0.004	598.000	0.000	1.000	N	NA
678828	678829	YP0814	YP0815	ddhD	ddhA	FALSE	0.428	26.000	0.038	1.000	N	NA
678829	678830	YP0815	YP0816	ddhA	wcaG1	TRUE	0.988	-64.000	0.624	1.000	Y	NA
678830	678831	YP0816	YP0817	wcaG1	ddhC	TRUE	0.982	18.000	0.247	1.000	Y	NA
678831	678832	YP0817	YP0818	ddhC	prt	TRUE	0.826	97.000	0.000	0.022	Y	NA
678832	678833	YP0818	YP0819	prt	hemY	TRUE	0.826	1.000	0.000	NA	N	NA
678833	5438002	YP0819	YP_0820	hemY		FALSE	0.384	62.000	0.000	NA		NA
5438002	5438003	YP_0820	YP_0821		wbyI	TRUE	0.794	11.000	0.000	NA		NA
5438003	678834	YP_0821	YP0822	wbyI	wbyJ	FALSE	0.186	172.000	0.000	NA		NA
678834	5438004	YP0822	YP_0823	wbyJ	wzy	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
5438004	678835	YP_0823	YP0824	wzy	wbyK	FALSE	0.119	213.000	0.000	NA		NA
678835	5438005	YP0824	YP_0825	wbyK		TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
5438005	678836	YP_0825	YP0826		wcaG2	TRUE	0.870	6.000	0.000	NA		NA
678836	2213979	YP0826	YP_0827	wcaG2	manC	FALSE	0.161	188.000	0.000	NA		NA
2213979	678837	YP_0827	YP0828	manC	wbyL	TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
678837	678838	YP0828	YP0829	wbyL	manB1	TRUE	0.808	5.000	0.049	NA	N	NA
678838	678839	YP0829	YP0830	manB1	wzz	FALSE	0.288	48.000	0.000	1.000	N	NA
678839	678840	YP0830	YP0831	wzz	gsk	FALSE	0.069	204.000	0.000	1.000	N	NA
678841	678842	YP0832	YP0833	rosB	rosA	TRUE	0.506	235.000	0.000	0.086	Y	NA
678843	678844	YP0835	YP0836		ebsC	FALSE	0.046	292.000	0.000	NA		NA
678844	678845	YP0836	YP0837	ebsC		FALSE	0.055	255.000	0.022	NA		NA
678845	678846	YP0837	YP0838		zntA1	FALSE	0.007	521.000	0.018	NA		NA
678848	678849	YP0840	YP0841		hflC2	TRUE	0.997	3.000	0.313	NA	Y	NA
678849	678850	YP0841	YP0842	hflC2		TRUE	0.617	195.000	0.075	NA	Y	NA
678850	678851	YP0842	YP0843		fabG3	TRUE	0.598	77.000	0.118	1.000		NA
678851	678852	YP0843	YP0844	fabG3	tesA	FALSE	0.036	387.000	0.072	1.000		NA
678853	678854	YP0845	YP0846	phnL2		TRUE	0.996	-15.000	0.535	NA	Y	NA
678855	678856	YP0847	YP0848	purK	purE	TRUE	0.998	-3.000	0.136	0.001	Y	NA
678858	678859	YP0850	YP0851		ppiB	TRUE	0.964	11.000	0.237	1.000		NA
678860	678861	YP0852	YP0853	cysS	tnp_8	FALSE	0.022	296.000	0.000	1.000	N	NA
678862	678863	YP0854	YP0855		folD	TRUE	0.802	15.000	0.055	1.000		NA
678866	678867	YP0857	YP0858			FALSE	0.064	259.000	0.000	NA		NA
678867	678868	YP0858	YP0859			FALSE	0.261	114.000	0.000	NA		NA
678868	678869	YP0859	YP0860			TRUE	0.806	-15.000	0.000	NA		NA
678869	10692437	YP0860	YP_0861			FALSE	0.325	83.000	0.000	NA		NA
678870	678871	YP0862	YP0863			TRUE	0.541	-60.000	0.000	NA		NA
678871	678872	YP0863	YP0864		pgsA1	FALSE	0.097	227.000	0.000	NA		NA
678872	678873	YP0864	YP0865	pgsA1	cdsA1	TRUE	0.986	-7.000	0.179	0.003		NA
678873	678874	YP0865	YP0866	cdsA1	plsC1	TRUE	0.968	10.000	0.238	1.000		NA
678874	678875	YP0866	YP0867	plsC1	pldB1	TRUE	0.991	-3.000	0.054	NA	Y	NA
678875	678876	YP0867	YP0868	pldB1	pgpB1	TRUE	0.995	-7.000	0.285	NA	Y	NA
678876	678877	YP0868	YP0869	pgpB1		TRUE	0.844	-18.000	0.063	NA		NA
678877	678878	YP0869	YP0870			FALSE	0.289	97.000	0.000	NA		NA
678879	678880	YP0871	YP0872	dnaC_9		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
678880	5438007	YP0872	YP_0873		fabF1	FALSE	0.314	87.000	0.000	NA		NA
678882	678883	YP_0875	YP0876	fabA	lonB	TRUE	0.777	69.000	0.290	1.000	N	NA
678885	678886	YP0878	YP0879	tnp_9		FALSE	0.223	150.000	0.000	NA		NA
678887	678888	YP_0880	YP0881			TRUE	0.591	28.000	0.040	NA		NA
678888	678889	YP0881	YP_t16			FALSE	0.275	105.000	0.000	NA		NA
678889	5438008	YP_t16	YP_0882			FALSE	0.440	50.000	0.000	NA		NA
5438008	678890	YP_0882	YP0883			FALSE	0.025	357.000	0.000	NA		NA
678890	678891	YP0883	YP0884			TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
678891	678892	YP0884	YP0885			FALSE	0.008	613.000	0.000	NA		NA
678893	678894	YP0886	YP0887	bglA	rpiR2	FALSE	0.100	264.000	0.000	0.019	N	NA
678894	678895	YP0887	YP0888	rpiR2	stf	FALSE	0.043	298.000	0.000	NA		NA
678895	678896	YP0888	YP0889	stf		FALSE	0.289	97.000	0.000	NA		NA
678896	678897	YP0889	YP0890			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
678897	678898	YP0890	YP0891		xkdT	TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA		NA
678898	678899	YP0891	YP0892	xkdT		TRUE	0.998	4.000	1.000	NA		NA
678899	678900	YP0892	YP0893			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
678900	678901	YP0893	YP0894			TRUE	0.992	16.000	1.000	NA		NA
678901	678902	YP0894	YP0895			TRUE	0.961	-3.000	0.074	NA		NA
678902	678903	YP0895	YP0896			FALSE	0.098	267.000	0.074	NA		NA
678903	678904	YP0896	YP0897			TRUE	0.894	121.000	0.667	NA		NA
678904	678905	YP0897	YP0898			TRUE	0.998	2.000	1.000	NA		NA
678905	678906	YP0898	YP0899			TRUE	0.989	22.000	1.000	NA		NA
678906	678907	YP0899	YP0900			TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA		NA
678907	678908	YP0900	YP0901			TRUE	0.992	5.000	0.500	NA		NA
678908	678909	YP0901	YP0902			TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
678909	678910	YP0902	YP0903		hfi1	FALSE	0.007	614.000	0.000	NA		NA
678910	678911	YP0903	YP0904	hfi1	glpR3	TRUE	0.991	-24.000	0.400	1.000	Y	NA
678911	678912	YP0904	YP0905	glpR3	araD2	TRUE	0.750	80.000	0.015	1.000	Y	NA
678912	678913	YP0905	YP0906	araD2		TRUE	0.940	-3.000	0.044	NA		NA
678913	678914	YP0906	YP0907			FALSE	0.139	202.000	0.000	NA		NA
678915	678916	YP0908	YP0909	lexA2	msgA	FALSE	0.142	206.000	0.000	1.000		NA
678916	678917	YP0909	YP0910	msgA	pla2	FALSE	0.204	172.000	0.000	1.000		NA
678917	678918	YP0910	YP0911	pla2	tar1	FALSE	0.010	380.000	0.000	1.000	N	NA
678920	678921	YP0913	YP0914	melB1		TRUE	0.747	14.000	0.000	NA		NA
678921	678922	YP0914	YP0915		ampH	FALSE	0.310	88.000	0.000	NA		NA
678923	678924	YP_t17	YP_t18			TRUE	0.870	6.000	0.000	NA		NA
678924	678925	YP_t18	YP0916		ompC1	FALSE	0.020	384.000	0.000	NA		NA
678925	678926	YP0916	YP_s3	ompC1	micF	FALSE	0.069	254.000	0.000	NA		NA
678927	5438009	YP0917	YP_0918	proP10		TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
5438009	678928	YP_0918	YP0919		rcsB	TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
678929	678930	YP0920	YP0921	rcsC	gyrA	FALSE	0.044	188.000	0.013	1.000	N	NA
678931	678932	YP0922	YP0923	ubiG	nrdA	FALSE	0.005	494.000	0.000	1.000	N	NA
678932	678933	YP0923	YP_0924	nrdA	nrdB	TRUE	0.987	163.000	1.000	0.002	Y	NA
678933	678934	YP_0924	YP0925	nrdB	fdx1	TRUE	0.802	4.000	0.034	1.000	N	NA
678934	678935	YP0925	YP0926	fdx1	eco	TRUE	0.473	35.000	0.023	NA		NA
678937	678938	YP0928	YP0929		tyrP	FALSE	0.055	274.000	0.000	NA		NA
678942	678943	YP0933	YP0934	ompC_1	rhaT4	FALSE	0.016	412.000	0.000	NA		NA
678943	678944	YP0934	YP0935	rhaT4		TRUE	0.466	110.000	0.103	NA		NA
678945	678946	YP0936	YP0937	adiA	potE1	TRUE	0.941	70.000	0.286	1.000	Y	NA
678946	678947	YP0937	YP0938	potE1	proW1	FALSE	0.073	484.000	0.000	1.000	Y	NA
678947	678948	YP0938	YP0939	proW1	proV1	TRUE	0.999	-3.000	0.542	1.000	Y	NA
678948	678949	YP0939	YP0940	proV1	proW2	TRUE	0.999	-3.000	0.489	1.000	Y	NA
678949	5438010	YP0940	YP_0941	proW2		FALSE	0.063	261.000	0.000	NA		NA
678951	678952	YP0943	YP0944	dcd1		TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
678952	678953	YP0944	YP0945		livF1	FALSE	0.260	115.000	0.000	NA		NA
678953	678954	YP0945	YP0946	livF1	livG1	TRUE	0.984	31.000	0.731	0.022		NA
678954	678955	YP0946	YP0947	livG1	livM1	TRUE	0.998	-3.000	0.823	1.000		NA
678955	678956	YP0947	YP0948	livM1	livM2	TRUE	1.000	0.000	0.758	0.063	Y	NA
678956	678957	YP0948	YP0949	livM2	livK1	TRUE	0.968	109.000	0.654	1.000	Y	NA
678957	678958	YP0949	YP0950	livK1		FALSE	0.017	405.000	0.000	NA		NA
678958	678959	YP0950	YP0951			FALSE	0.077	246.000	0.000	NA		NA
678959	678960	YP0951	YP0952			TRUE	0.999	-3.000	0.491	0.001	Y	NA
678960	678961	YP0952	YP0953		phnD	TRUE	0.981	103.000	0.568	0.001	Y	NA
678961	678962	YP0953	YP0954	phnD	phnC	TRUE	0.993	37.000	0.589	0.002	Y	NA
678962	678963	YP0954	YP0955	phnC		FALSE	0.192	172.000	0.032	1.000		NA
678963	678964	YP0955	YP0956			TRUE	0.519	110.000	0.125	NA		NA
678964	678965	YP0956	YP0957			FALSE	0.233	142.000	0.000	NA		NA
678971	678972	YP0963	YP0964			FALSE	0.045	294.000	0.000	NA		NA
678972	678973	YP0964	YP0965		tnp_10	FALSE	0.017	410.000	0.000	NA		NA
678973	5438011	YP0965	YP_0966	tnp_10	rhlE	FALSE	0.205	160.000	0.000	NA		NA
5438011	5438012	YP_0966	YP_0967	rhlE		TRUE	0.919	2.000	0.000	NA		NA
5438012	678974	YP_0967	YP0968			FALSE	0.301	92.000	0.000	NA		NA
678974	678975	YP0968	YP0969			FALSE	0.122	211.000	0.000	NA		NA
678975	678976	YP0969	YP0970		dnaJ1	TRUE	0.657	21.000	0.000	NA		NA
678976	678977	YP0970	YP0971	dnaJ1		FALSE	0.225	149.000	0.000	NA		NA
678977	678978	YP0971	YP0972			FALSE	0.010	529.000	0.000	NA		NA
678978	678979	YP0972	YP0973		srmB1	FALSE	0.013	452.000	0.000	NA		NA
678980	678981	YP0974	YP0975	acrR3	acrA4	TRUE	0.789	52.000	0.236	1.000	N	NA
678981	678982	YP0975	YP0976	acrA4	ccmA2	TRUE	0.983	14.000	0.545	1.000		NA
678982	678983	YP0976	YP0977	ccmA2		TRUE	0.951	-88.000	0.547	1.000		NA
678983	678984	YP0977	YP0978			TRUE	0.990	13.000	0.609	0.007	N	NA
678985	678986	YP0979	YP0980			TRUE	0.843	8.000	0.000	NA		NA
678988	678989	YP0982	YP0983	nemA1	atoC1	FALSE	0.013	348.000	0.000	1.000	N	NA
678989	678990	YP0983	YP0984	atoC1	baeS2	TRUE	0.889	59.000	0.000	0.014	Y	NA
5438013	678992	YP_0986	YP0987	xapB	tnp_11	TRUE	0.473	-1176.000	0.000	NA		NA
678992	678993	YP0987	YP0988	tnp_11	xapA	FALSE	0.003	929.000	0.000	1.000	N	NA
678995	678996	YP0990	YP0991	lysR5	betT1	FALSE	0.046	232.000	0.000	1.000	N	NA
678997	678998	YP0992	YP0993	betI	betB	TRUE	0.886	58.000	0.459	1.000	N	NA
678998	678999	YP0993	YP0994	betB	betA	TRUE	0.970	23.000	0.634	1.000	N	NA
679000	679001	YP0995	YP0996	tnp_12		FALSE	0.169	184.000	0.000	NA		NA
679001	679002	YP0996	YP0997		moaE	FALSE	0.204	143.000	0.025	NA		NA
679002	679003	YP0997	YP0998	moaE	moaD	TRUE	0.999	-3.000	0.501	0.003	Y	NA
679003	679004	YP0998	YP0999	moaD	moaC	TRUE	0.998	-3.000	0.175	0.003	Y	NA
679004	679005	YP0999	YP1000	moaC	moaA	TRUE	0.627	220.000	0.039	0.003	Y	NA
679007	679008	YP1002	YP1003		uvrB	FALSE	0.029	292.000	0.003	NA		NA
679009	679010	YP1004	YP1005		livF2	FALSE	0.005	910.000	0.000	NA		NA
679011	679012	YP1006	YP1007	bioD1	bioC	TRUE	0.978	-22.000	0.054	0.003	Y	NA
679012	679013	YP1007	YP1008	bioC	bioF	TRUE	0.990	-16.000	0.133	0.003	Y	NA
679013	679014	YP1008	YP1009	bioF	bioB	TRUE	0.998	0.000	0.168	0.003	Y	NA
679018	679019	YP1013	YP1014	modC	modB	TRUE	0.999	-6.000	0.537	0.001	Y	NA
679019	679020	YP1014	YP1015	modB	modA2	TRUE	1.000	0.000	0.627	0.001	Y	NA
679020	679021	YP1015	YP1016	modA2		FALSE	0.162	223.000	0.072	NA		NA
679022	679023	YP1017	YP_1018	modE	modF	FALSE	0.267	110.000	0.028	1.000		NA
679023	679024	YP_1018	YP1019	modF		FALSE	0.080	217.000	0.009	NA		NA
679024	679025	YP1019	YP1020		galE	FALSE	0.024	360.000	0.000	NA		NA
679025	679026	YP1020	YP1021	galE	galT	TRUE	0.930	10.000	0.053	0.001	N	NA
679026	679027	YP1021	YP1022	galT	galK	TRUE	0.996	-3.000	0.370	0.001	N	NA
679027	5438014	YP1022	YP_1023	galK	galM	TRUE	0.894	-6.000	0.000	NA		NA
5438014	679028	YP_1023	YP1024	galM	psiF	FALSE	0.045	293.000	0.000	NA		NA
679028	679029	YP1024	YP1025	psiF	gpmA	FALSE	0.062	263.000	0.000	NA		NA
679032	679033	YP1028	YP1029	pnuC	nadA	TRUE	0.677	122.000	0.023	1.000	Y	NA
679033	679034	YP1029	YP_t19	nadA		FALSE	0.023	369.000	0.000	NA		NA
679034	679035	YP_t19	YP_t20			TRUE	0.570	29.000	0.000	NA		NA
679035	679036	YP_t20	YP_t21			TRUE	0.577	28.000	0.000	NA		NA
679036	679037	YP_t21	YP1030			FALSE	0.158	191.000	0.000	NA		NA
679037	679038	YP1030	YP1031		pal	TRUE	0.907	10.000	0.088	1.000		NA
679038	679039	YP1031	YP1032	pal	tolB	TRUE	0.928	51.000	0.592	1.000	N	NA
679039	679040	YP1032	YP_1033	tolB	tolA	FALSE	0.165	120.000	0.051	NA	N	NA
679040	679041	YP_1033	YP1034	tolA	tolR	FALSE	0.372	112.000	0.114	NA	N	NA
679041	679042	YP1034	YP1035	tolR	tolQ	TRUE	0.997	13.000	0.556	0.087	Y	NA
679042	679043	YP1035	YP1036	tolQ	fcbC2	TRUE	0.997	0.000	0.593	1.000		NA
679043	679044	YP1036	YP1037	fcbC2		FALSE	0.406	132.000	0.095	NA		NA
679044	679045	YP1037	YP1038		cydB	FALSE	0.362	164.000	0.100	NA		NA
679045	679046	YP1038	YP1039	cydB	cydA	TRUE	0.994	15.000	0.348	0.043	Y	NA
679046	679047	YP1039	YP1040	cydA	sucD	FALSE	0.040	767.000	0.000	1.000	Y	NA
679047	679048	YP1040	YP1041	sucD	sucC	TRUE	1.000	0.000	0.806	0.001	Y	NA
679048	679049	YP1041	YP1042	sucC	sucB	TRUE	0.837	113.000	0.136	1.000	Y	NA
679049	679050	YP1042	YP1043	sucB	sucA	TRUE	0.991	30.000	0.667	1.000	Y	NA
679050	679051	YP1043	YP1044	sucA	sdhB	FALSE	0.187	356.000	0.067	1.000	Y	NA
679051	679052	YP1044	YP1045	sdhB	sdhA	TRUE	0.990	50.000	0.604	0.003	Y	NA
679052	679053	YP1045	YP1046	sdhA	sdhD	TRUE	1.000	1.000	0.705	0.003	Y	NA
679053	679054	YP1046	YP1047	sdhD	sdhC	TRUE	0.999	-6.000	0.453	0.001	Y	NA
679057	679058	YP_1050	YP1051	ppnK	recN	TRUE	0.904	-21.000	0.170	1.000	N	NA
679058	679059	YP1051	YP_1052	recN	smpA	FALSE	0.191	114.000	0.049	1.000	N	NA
679060	679061	YP1053	YP1054			TRUE	0.954	-7.000	0.124	NA		NA
679064	679065	YP1056	YP1057	tnp_13	intA1	TRUE	0.663	191.000	0.000	0.088	Y	NA
679065	679066	YP1057	YP1058	intA1		FALSE	0.334	79.000	0.000	NA		NA
679066	679067	YP1058	YP1059		smc1	TRUE	0.842	51.000	0.250	NA		NA
679069	679070	YP1061	YP1062			FALSE	0.301	92.000	0.000	NA		NA
679070	679071	YP1062	YP1063		xerC1	TRUE	0.970	13.000	0.333	NA		NA
679071	679072	YP1063	YP1064	xerC1	alpA1	TRUE	0.995	-7.000	0.667	NA		NA
679072	679073	YP1064	YP1065	alpA1		TRUE	0.998	0.000	0.750	NA		NA
679073	679074	YP1065	YP1066			TRUE	0.965	-37.000	0.500	NA		NA
679074	679075	YP1066	YP1067			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679076	679077	YP1068	YP1069			FALSE	0.273	108.000	0.000	NA		NA
679077	679078	YP1069	YP1070			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
5438015	679079	YP_1071	YP1072	intA2		TRUE	0.470	-1212.000	0.000	NA		NA
679079	679080	YP1072	YP1073			TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679080	679081	YP1073	YP1074		trp1400A	FALSE	0.010	547.000	0.000	1.000		NA
679081	5438016	YP1074	YP_1075	trp1400A		FALSE	0.325	83.000	0.000	NA		NA
679083	679084	YP1077	YP1078	mhpC1		FALSE	0.205	332.000	0.276	1.000		NA
679084	679085	YP1078	YP1079			FALSE	0.291	96.000	0.000	NA		NA
679085	679086	YP1079	YP1080		fldA2	FALSE	0.346	73.000	0.000	NA		NA
679086	679087	YP1080	YP1081	fldA2	fur2	FALSE	0.061	368.000	0.156	1.000	N	NA
5438017	679088	YP_1082	YP1083	chb		FALSE	0.035	316.000	0.000	NA		NA
679088	679089	YP1083	YP_1084		glnS2	FALSE	0.007	706.000	0.000	1.000		NA
679089	679090	YP_1084	YP1085	glnS2	nagE	FALSE	0.035	215.000	0.018	1.000	N	NA
679091	679092	YP1086	YP1087	nagB	nagA1	TRUE	0.996	20.000	0.557	0.001	Y	NA
679092	679093	YP1087	YP1088	nagA1	nagC2	TRUE	0.995	-22.000	0.571	1.000	Y	NA
679093	5438018	YP1088	YP_1089	nagC2		FALSE	0.346	73.000	0.000	NA		NA
5438018	679094	YP_1089	YP1090		asnB	FALSE	0.025	355.000	0.000	NA		NA
679096	679097	YP_t22	YP_t23			TRUE	0.843	8.000	0.000	NA		NA
679097	679098	YP_t23	YP_t24			TRUE	0.563	30.000	0.000	NA		NA
679098	679099	YP_t24	YP_t25			FALSE	0.321	84.000	0.000	NA		NA
679099	679100	YP_t25	YP_t26			TRUE	0.540	33.000	0.000	NA		NA
679100	679101	YP_t26	YP_t27			TRUE	0.870	6.000	0.000	NA		NA
679103	679104	YP1093	YP1094	miaB	phoH1	FALSE	0.182	288.000	0.220	1.000	N	NA
679104	679105	YP1094	YP1095	phoH1		TRUE	0.995	-3.000	0.457	NA		NA
679105	679106	YP1095	YP1096		corC	TRUE	0.553	118.000	0.150	NA		NA
679106	679107	YP1096	YP1097	corC	lnt	TRUE	0.969	-31.000	0.557	1.000	N	NA
679107	679108	YP1097	YP1098	lnt	glnH1	FALSE	0.003	765.000	0.000	1.000	N	NA
679108	679109	YP1098	YP1099	glnH1	gltJ1	TRUE	0.884	123.000	0.150	0.062	Y	NA
679109	679110	YP1099	YP1100	gltJ1	gltK	TRUE	1.000	0.000	0.933	0.019	Y	NA
679110	679111	YP1100	YP1101	gltK	gltL	TRUE	0.998	-3.000	0.379	1.000	Y	NA
679113	679114	YP1103	YP1104	leuS	rlpB	TRUE	0.897	15.000	0.182	NA	N	NA
679114	679115	YP1104	YP1105	rlpB	holA	TRUE	0.980	-3.000	0.199	NA	N	NA
679115	679116	YP1105	YP1106	holA	nadD	TRUE	0.487	-40.000	0.045	1.000	N	NA
679116	679117	YP1106	YP1107	nadD		FALSE	0.093	224.000	0.032	NA		NA
679117	679118	YP1107	YP1108			TRUE	0.987	4.000	0.307	NA		NA
679118	679119	YP1108	YP1109		pbpA	FALSE	0.308	82.000	0.031	NA		NA
679119	679120	YP1109	YP1110	pbpA	ftsW1	FALSE	0.126	171.000	0.046	1.000	N	NA
679120	679121	YP1110	YP1111	ftsW1	rlpA	TRUE	0.628	10.000	0.035	NA	N	NA
679121	679122	YP1111	YP1112	rlpA	dacA	TRUE	0.467	403.000	0.475	NA	Y	NA
679122	679123	YP1112	YP1113	dacA		FALSE	0.242	198.000	0.081	NA		NA
679123	679124	YP1113	YP_1114		lipB	FALSE	0.391	224.000	0.219	NA		NA
679124	679125	YP_1114	YP1115	lipB	lipA	TRUE	0.901	211.000	0.319	0.001	Y	NA
679125	679126	YP1115	YP1116	lipA		TRUE	0.610	25.000	0.000	NA		NA
679128	679129	YP1118	YP1119	crcB1		FALSE	0.016	414.000	0.000	NA		NA
679133	679134	YP1123	YP1124			FALSE	0.173	182.000	0.000	NA		NA
679137	679138	YP1127	YP1128	mdlB2		FALSE	0.006	465.000	0.000	1.000	N	NA
679138	679139	YP1128	YP1129		iolE	TRUE	0.989	10.000	0.199	1.000	Y	NA
679139	679140	YP1129	YP1130	iolE	rbsK2	TRUE	0.965	15.000	0.086	1.000	Y	NA
679140	679141	YP1130	YP1131	rbsK2	mviM1	FALSE	0.352	125.000	0.064	1.000		NA
679141	679142	YP1131	YP1132	mviM1	araH4	TRUE	0.900	21.000	0.176	1.000		NA
679142	679143	YP1132	YP1133	araH4	rbsA1	TRUE	0.996	12.000	0.444	0.013	Y	NA
679143	679144	YP1133	YP1134	rbsA1	rbsB3	TRUE	0.991	49.000	0.667	0.013	Y	NA
679144	5438019	YP1134	YP_1135	rbsB3		FALSE	0.243	126.000	0.000	NA		NA
5438019	679145	YP_1135	YP1136		ilvB1	FALSE	0.045	294.000	0.000	NA		NA
679145	679146	YP1136	YP1137	ilvB1	putA1	TRUE	0.690	-40.000	0.093	1.000	N	NA
679149	679150	YP1140	YP1141			FALSE	0.022	371.000	0.000	NA		NA
679150	679151	YP1141	YP1142		mrcA2	TRUE	0.658	57.000	0.116	1.000		NA
679152	679153	YP1143	YP1144	nlp-2		FALSE	0.019	388.000	0.000	NA		NA
679154	679155	YP1145	YP1146			FALSE	0.348	72.000	0.000	NA		NA
679155	679156	YP1146	YP1147			TRUE	0.585	-46.000	0.000	NA		NA
679156	679157	YP1147	YP1148			TRUE	0.499	39.000	0.000	NA		NA
679157	679158	YP1148	YP1149			TRUE	0.878	-7.000	0.000	NA		NA
679159	679160	YP1150	YP1151	hcp1		TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
679160	679161	YP1151	YP1152			TRUE	0.499	39.000	0.000	NA		NA
679162	679163	YP1153	YP1154	yapC		FALSE	0.009	535.000	0.000	NA		NA
5438020	679164	YP_1155	YP1156			FALSE	0.334	79.000	0.000	NA		NA
679165	679166	YP1157	YP1158		proP11	TRUE	0.518	36.000	0.000	NA		NA
679166	679167	YP1158	YP1159	proP11		TRUE	0.922	-7.000	0.068	NA		NA
679167	679168	YP1159	YP1160		bglB	FALSE	0.208	159.000	0.000	NA		NA
679170	679171	YP1162	YP1163	aRA11	tas1	TRUE	0.962	23.000	0.438	1.000		NA
679173	679174	YP1165	YP1166		dnaC_10	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679174	5438021	YP1166	YP_1167	dnaC_10	fabF2	TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
679175	679176	YP1168	YP1169	tnp_14	rmf	FALSE	0.105	147.000	0.000	NA	N	NA
679176	679177	YP1169	YP1170	rmf		FALSE	0.330	81.000	0.000	NA		NA
679177	679178	YP1170	YP1171			FALSE	0.447	49.000	0.000	NA		NA
679178	679179	YP1171	YP1172		pqiB1	TRUE	0.996	-3.000	0.531	NA		NA
679179	679180	YP1172	YP1173	pqiB1	pqiA1	TRUE	0.983	-40.000	0.819	NA		NA
679180	679181	YP1173	YP1174	pqiA1	uup2	FALSE	0.299	129.000	0.054	NA		NA
679181	679182	YP1174	YP1175	uup2		TRUE	0.915	6.000	0.061	1.000		NA
679184	679185	YP1177	YP1178		pyrD	FALSE	0.280	183.000	0.081	NA		NA
679185	679186	YP1178	YP1179	pyrD	pepN	FALSE	0.002	669.000	0.014	1.000	N	NA
679187	679188	YP1180	YP1181	pncB	asnS	FALSE	0.005	514.000	0.034	1.000	N	NA
679188	679189	YP1181	YP1182	asnS	ompC2	FALSE	0.025	283.000	0.000	1.000	N	NA
679189	679190	YP1182	YP_1183	ompC2	aspC	FALSE	0.033	257.000	0.000	1.000	N	NA
679191	679192	YP1184	YP1185	gloB1		TRUE	0.570	61.000	0.089	NA		NA
679192	679193	YP1185	YP1186			TRUE	0.550	224.000	0.372	NA		NA
679193	679194	YP1186	YP1187		tnp_15	FALSE	0.055	284.000	0.000	1.000		NA
679194	679195	YP1187	YP1188	tnp_15	mukB1	FALSE	0.255	165.000	0.000	0.085	N	NA
679195	679196	YP1188	YP1189	mukB1	mukE	TRUE	1.000	-3.000	0.786	0.001	Y	NA
679196	679197	YP1189	YP1190	mukE	mukF	TRUE	0.990	8.000	0.196	NA	Y	NA
679197	679198	YP1190	YP1191	mukF	smtA2	TRUE	0.990	-3.000	0.325	NA	N	NA
679198	679199	YP1191	YP1192	smtA2		FALSE	0.006	767.000	0.000	NA		NA
679199	679200	YP1192	YP1193		kdsB	FALSE	0.027	324.000	0.023	NA		NA
679200	679201	YP1193	YP1194	kdsB		TRUE	0.990	-3.000	0.265	NA		NA
679201	679202	YP1194	YP1195		cspE2	FALSE	0.007	497.000	0.004	NA		NA
679204	679205	YP1197	YP1198	lpxK	msbA	TRUE	0.982	-3.000	0.205	1.000	N	NA
679205	679206	YP1198	YP1199	msbA	comEC	TRUE	0.459	165.000	0.075	0.081		NA
679206	679207	YP1199	YP1200	comEC	ihfB	FALSE	0.006	547.000	0.003	1.000		NA
679207	679208	YP1200	YP1201	ihfB	rpsA	TRUE	0.803	61.000	0.292	1.000	N	NA
679208	679209	YP1201	YP1202	rpsA	cmk	TRUE	0.572	174.000	0.281	1.000	N	NA
679209	679210	YP1202	YP1203	cmk	aroA	FALSE	0.133	313.000	0.209	1.000	N	NA
679210	679211	YP1203	YP_1204	aroA	serC	TRUE	0.625	164.000	0.033	1.000	Y	NA
679211	679212	YP_1204	YP1205	serC		FALSE	0.023	367.000	0.000	NA		NA
679212	679213	YP1205	YP1206			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
679213	679214	YP1206	YP1207		ansB	FALSE	0.064	269.000	0.000	1.000		NA
679215	679216	YP1208	YP1209		focA	FALSE	0.006	696.000	0.000	NA		NA
679216	679217	YP1209	YP1210	focA	pflB	TRUE	0.924	-16.000	0.172	1.000	N	NA
679220	679221	YP1213	YP1214	proP12	serS	FALSE	0.038	247.000	0.000	1.000	N	NA
679221	679222	YP1214	YP1215	serS		FALSE	0.094	242.000	0.078	1.000	N	NA
679222	679223	YP1215	YP_1216		lolA	TRUE	0.922	11.000	0.167	1.000	N	NA
679223	679224	YP_1216	YP1217	lolA	ftsK	TRUE	0.551	193.000	0.305	1.000	N	NA
679224	679225	YP1217	YP1218	ftsK	lrp2	TRUE	0.726	123.000	0.345	1.000	N	NA
679226	679227	YP1219	YP1220	trxB	cydD	FALSE	0.098	441.000	0.049	1.000	Y	NA
679227	679228	YP1220	YP1221	cydD	cydC	TRUE	0.999	3.000	0.631	0.007	Y	NA
679228	679229	YP1221	YP1222	cydC	aat1	TRUE	0.579	195.000	0.049	1.000	Y	NA
679229	679230	YP1222	YP1223	aat1	infA	FALSE	0.068	166.000	0.020	1.000	N	NA
679231	679232	YP1224	YP1225	tnp_16	clpA1	FALSE	0.050	227.000	0.000	1.000	N	NA
679232	679233	YP1225	YP1226	clpA1		TRUE	0.977	20.000	0.596	NA		NA
679233	679234	YP1226	YP1227			TRUE	0.669	-31.000	0.000	NA		NA
679236	679237	YP1229	YP_1230		acrA5	TRUE	0.997	0.000	0.789	1.000	N	NA
679238	679239	YP1231	YP1232		virK	TRUE	0.577	28.000	0.000	NA		NA
679241	679242	YP1234	YP1235		hcp2	FALSE	0.122	203.000	0.028	NA		NA
679242	679243	YP1235	YP1236	hcp2	hcr	TRUE	0.909	66.000	0.085	0.012	Y	NA
679243	679244	YP1236	YP1237	hcr	poxB	FALSE	0.075	144.000	0.017	1.000	N	NA
679244	679245	YP1237	YP1238	poxB		FALSE	0.273	107.000	0.000	NA		NA
679245	679246	YP1238	YP1239		ltaA	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679246	679247	YP1239	YP1240	ltaA		TRUE	0.938	-3.000	0.074	1.000	N	NA
679247	679248	YP1240	YP1241		wcaG3	TRUE	0.828	100.000	0.022	0.004	Y	NA
679248	679249	YP1241	YP1242	wcaG3		TRUE	0.623	97.000	0.167	NA		NA
679249	679250	YP1242	YP1243		pheA2	FALSE	0.148	170.000	0.018	NA		NA
679250	679251	YP1243	YP1244	pheA2	artP	FALSE	0.242	295.000	0.000	1.000	Y	NA
679251	679252	YP1244	YP1245	artP	artI3	TRUE	0.998	-3.000	0.323	1.000	Y	NA
679252	679253	YP1245	YP1246	artI3	artQ	TRUE	0.993	12.000	0.260	0.085	Y	NA
679253	679254	YP1246	YP1247	artQ	artM3	TRUE	1.000	0.000	0.714	0.018	Y	NA
679255	679256	YP1248	YP1249	rhaT6		TRUE	0.912	-18.000	0.125	NA		NA
679256	679257	YP1249	YP1250		smtA3	TRUE	0.937	-37.000	0.312	NA		NA
679257	679258	YP1250	YP1251	smtA3	fepC	TRUE	0.851	-12.000	0.000	1.000		NA
679258	679259	YP1251	YP1252	fepC	btuC1	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679259	679260	YP1252	YP1253	btuC1	fecB2	TRUE	0.481	214.000	0.000	1.000	Y	NA
679260	679261	YP1253	YP1254	fecB2	hflC3	FALSE	0.009	367.000	0.000	NA	N	NA
679261	679262	YP1254	YP1255	hflC3		FALSE	0.028	341.000	0.000	NA		NA
679264	679265	YP1257	YP1258	trmA1		TRUE	0.563	84.000	0.119	NA		NA
679265	679266	YP1258	YP1259		potI	TRUE	0.704	125.000	0.264	NA		NA
679266	679267	YP1259	YP1260	potI	potH	TRUE	0.999	-3.000	0.528	0.060	Y	NA
679267	679268	YP1260	YP1261	potH	potG	TRUE	0.995	25.000	0.857	1.000	Y	NA
679268	679269	YP1261	YP1262	potG	potF	TRUE	0.954	171.000	0.679	1.000	Y	NA
679269	679270	YP1262	YP1263	potF		FALSE	0.018	401.000	0.000	NA		NA
679270	679271	YP1263	YP1264			TRUE	0.600	142.000	0.194	NA		NA
679272	679273	YP1265	YP1266	grxA		FALSE	0.019	410.000	0.000	1.000		NA
679273	679274	YP1266	YP1267		pgpB2	FALSE	0.034	333.000	0.000	1.000		NA
679274	679275	YP1267	YP1268	pgpB2	pgpB3	TRUE	0.973	0.000	0.106	1.000		NA
679275	679276	YP1268	YP1269	pgpB3	deoC1	FALSE	0.072	258.000	0.000	1.000		NA
679276	679277	YP1269	YP1270	deoC1	deoR3	FALSE	0.010	335.000	0.030	NA	N	NA
679277	679278	YP1270	YP1271	deoR3	sdaC2	FALSE	0.002	1078.000	0.000	NA	N	NA
679279	679280	YP1272	YP1273	dacC		FALSE	0.042	242.000	0.000	1.000	N	NA
679280	679281	YP1273	YP1274		abc1	TRUE	0.993	-3.000	0.096	1.000	Y	NA
679281	679282	YP1274	YP1275	abc1	nlpA1	TRUE	0.998	-3.000	0.323	NA	Y	NA
679282	679283	YP1275	YP1276	nlpA1	pcbC	FALSE	0.313	228.000	0.174	NA		NA
679284	679285	YP1277	YP1278	serB1	gst1	FALSE	0.236	100.000	0.056	1.000	N	NA
679286	679287	YP1279	YP1280	yiuR	yiuC	FALSE	0.320	260.000	0.000	1.000	Y	NA
679287	679288	YP1280	YP1281	yiuC	yiuB	TRUE	0.999	-3.000	0.833	1.000	Y	NA
679288	679289	YP1281	YP1282	yiuB	yiuA	TRUE	0.761	195.000	0.175	1.000	Y	NA
679289	679290	YP1282	YP1283	yiuA	lysP	FALSE	0.019	307.000	0.000	1.000	N	NA
679290	679291	YP1283	YP1284	lysP	lysR6	FALSE	0.238	258.000	0.222	1.000	N	NA
679292	679293	YP1285	YP1286		nfo	FALSE	0.248	137.000	0.040	NA		NA
679294	679295	YP1287	YP1288	psaC	psaB	TRUE	0.865	42.000	0.000	1.000	Y	NA
679295	679296	YP1288	YP1289	psaB	psaA	TRUE	0.794	127.000	0.400	NA		NA
679296	679297	YP1289	YP1290	psaA	psaF	FALSE	0.010	530.000	0.000	NA		NA
679297	679298	YP1290	YP1291	psaF	psaE	TRUE	0.995	-15.000	1.000	NA		NA
679298	679299	YP1291	YP1292	psaE	fruA	FALSE	0.016	325.000	0.000	1.000	N	NA
679299	679300	YP1292	YP1293	fruA	fruK	TRUE	0.995	15.000	0.562	1.000	Y	NA
679300	679301	YP1293	YP1294	fruK	fruB	TRUE	0.994	-3.000	0.112	1.000	Y	NA
679303	679304	YP1296	YP1297	araH5	mglA3	TRUE	0.986	36.000	0.375	0.013	Y	NA
679304	679305	YP1297	YP1298	mglA3	rbsB4	TRUE	0.934	109.000	0.375	NA	Y	NA
679305	679306	YP1298	YP1299	rbsB4	rpiA1	TRUE	0.669	140.000	0.000	NA	Y	NA
679306	679307	YP1299	YP1300	rpiA1	xylB1	TRUE	0.952	-22.000	0.000	1.000	Y	NA
679307	679308	YP1300	YP1301	xylB1	gabD1	TRUE	0.891	4.000	0.065	1.000	N	NA
679309	679310	YP1302	YP1303	mhpD1	serA1	TRUE	0.967	-3.000	0.017	0.047		NA
679310	679311	YP1303	YP1304	serA1	fabG4	TRUE	0.861	11.000	0.000	0.047	N	NA
679311	679312	YP1304	YP1305	fabG4		TRUE	0.740	-22.000	0.000	NA		NA
679312	679313	YP1305	YP1306		mtr	FALSE	0.032	328.000	0.000	NA		NA
679313	679314	YP1306	YP_1307	mtr	efp2	TRUE	0.507	104.000	0.153	1.000	N	NA
679317	679318	YP1310	YP1311	uxuR		TRUE	0.600	148.000	0.200	NA		NA
679319	679320	YP1312	YP1313		pgpB4	TRUE	0.834	59.000	0.275	NA		NA
679320	679321	YP1313	YP1314	pgpB4	spr1	FALSE	0.014	442.000	0.000	NA		NA
679321	679322	YP1314	YP1315	spr1	rtn1	FALSE	0.026	696.000	0.219	NA	N	NA
679322	679323	YP1315	YP1316	rtn1	oppA2	TRUE	0.809	82.000	0.394	NA	N	NA
679323	679324	YP1316	YP1317	oppA2	dppB2	TRUE	0.996	10.000	0.848	0.060		NA
679324	679325	YP1317	YP1318	dppB2	dppC2	TRUE	0.997	6.000	0.833	0.060		NA
679325	679326	YP1318	YP1319	dppC2		TRUE	0.985	-31.000	0.758	1.000		NA
679327	679328	YP1320	YP1321		bcr	FALSE	0.005	985.000	0.000	NA		NA
679328	679329	YP1321	YP1322	bcr	rsuA1	TRUE	0.462	119.000	0.145	1.000	N	NA
679330	679331	YP1323	YP1324	sSL2	rplY	FALSE	0.288	162.000	0.024	0.014	N	NA
679332	679333	YP1325	YP1326	tnp_17	ompA1	FALSE	0.131	139.000	0.000	1.000	N	NA
679333	679334	YP1326	YP1327	ompA1	sulA	FALSE	0.016	328.000	0.000	1.000	N	NA
679336	679337	YP1329	YP1330			TRUE	0.729	30.000	0.090	NA		NA
679339	679340	YP1332	YP1333	mgsA		FALSE	0.224	179.000	0.055	NA		NA
679342	679343	YP1335	YP1336			TRUE	0.693	37.000	0.094	NA		NA
679346	679347	YP_t28	YP1339			FALSE	0.017	402.000	0.000	NA		NA
679347	2213996	YP1339	YP_1340			FALSE	0.024	364.000	0.000	NA		NA
2213996	679348	YP_1340	YP1341			FALSE	0.448	-2318.000	0.000	NA		NA
679348	679349	YP1341	YP1342		dnaC_11	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679350	679351	YP1343	YP1344	glcD2	fabG5	FALSE	0.336	142.000	0.000	0.025	N	NA
679352	679353	YP1345	YP1346		fabZ1	FALSE	0.060	264.000	0.000	NA		NA
679353	679354	YP1346	YP1347	fabZ1	fabF3	TRUE	0.981	-10.000	0.083	NA	Y	NA
679354	679355	YP1347	YP1348	fabF3	fabG6	TRUE	0.914	-52.000	0.056	1.000	Y	NA
679355	679356	YP1348	YP1349	fabG6	pksG	TRUE	0.989	16.000	0.333	1.000	Y	NA
679356	679357	YP1349	YP1350	pksG	caiD1	TRUE	0.938	-58.000	0.120	1.000	Y	NA
679357	679358	YP1350	YP1351	caiD1	caiD2	TRUE	0.983	-22.000	0.120	0.021	Y	NA
679358	679359	YP1351	YP1352	caiD2	fabG7	TRUE	0.992	3.000	0.051	0.046	Y	NA
679359	679360	YP1352	YP1353	fabG7		TRUE	0.499	39.000	0.000	NA		NA
679360	679361	YP1353	YP1354		acpP1	TRUE	0.505	38.000	0.000	NA		NA
679361	679362	YP1354	YP1355	acpP1	fabD1	FALSE	0.309	99.000	0.000	1.000		NA
679362	679363	YP1355	YP1356	fabD1		FALSE	0.005	986.000	0.000	NA		NA
679363	679364	YP1356	YP1357			TRUE	0.476	43.000	0.000	NA		NA
679364	679365	YP1357	YP1358			TRUE	0.780	12.000	0.000	NA		NA
679365	679366	YP1358	YP1359			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
679366	679367	YP1359	YP1360		ompA2	TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
679367	679368	YP1360	YP1361	ompA2	hcp3	TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
679368	679369	YP1361	YP1362	hcp3	clpA2	FALSE	0.037	388.000	0.083	NA		NA
679369	679370	YP1362	YP1363	clpA2	vgrG1	TRUE	0.968	3.000	0.125	NA		NA
679370	679371	YP1363	YP1364	vgrG1		TRUE	0.968	16.000	0.400	NA		NA
679371	679372	YP1364	YP1365		uvrA2	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679372	679373	YP1365	YP1366	uvrA2	mdlB3	FALSE	0.217	154.000	0.000	NA		NA
679373	679374	YP1366	YP1367	mdlB3		TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
679374	679375	YP1367	YP1368			TRUE	0.787	173.000	0.500	NA		NA
679377	679378	YP1370	YP1371		icmF1	TRUE	0.997	-3.000	0.625	NA		NA
679378	5438022	YP1371	YP_1372	icmF1		TRUE	0.470	44.000	0.000	NA		NA
5438022	679379	YP_1372	YP1373			TRUE	0.861	-9.000	0.000	NA		NA
679379	679380	YP1373	YP1374			TRUE	0.991	0.000	0.286	NA		NA
679380	679381	YP1374	YP1375			FALSE	0.105	221.000	0.000	NA		NA
679381	679382	YP1375	YP1376			TRUE	0.982	-36.000	0.750	NA		NA
679382	679383	YP1376	YP1377			TRUE	0.988	-25.000	0.750	NA		NA
679383	679384	YP1377	YP1378			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
679384	679385	YP1378	YP1379			TRUE	0.610	25.000	0.000	NA		NA
679387	679388	YP1381	YP1382	uup3		FALSE	0.095	228.000	0.000	NA		NA
679389	679390	YP1383	YP1384		moeB	FALSE	0.104	167.000	0.000	1.000	N	NA
679390	679391	YP1384	YP1385	moeB	moeA	TRUE	0.993	-28.000	0.323	0.003	Y	NA
679391	679392	YP1385	YP1386	moeA	aslB1	FALSE	0.010	535.000	0.000	1.000		NA
679392	679393	YP1386	YP1387	aslB1	phnL3	TRUE	0.911	10.000	0.094	1.000		NA
679393	679394	YP1387	YP1388	phnL3	acrA6	TRUE	0.941	2.000	0.094	1.000	N	NA
679394	679395	YP1388	YP1389	acrA6		TRUE	0.995	2.000	0.500	NA		NA
679395	679396	YP1389	YP1390			FALSE	0.321	84.000	0.000	NA		NA
679396	679397	YP1390	YP1391			FALSE	0.066	257.000	0.000	NA		NA
679397	679398	YP1391	YP1392		adhC	TRUE	0.939	21.000	0.273	1.000		NA
679398	679399	YP1392	YP1393	adhC	lysR7	TRUE	0.523	274.000	0.636	1.000	N	NA
679400	679401	YP1394	YP1395	proP13	folE	TRUE	0.686	130.000	0.250	NA		NA
679401	679402	YP1395	YP1396	folE		TRUE	0.954	55.000	0.719	NA		NA
679402	679403	YP1396	YP1397		mglB	FALSE	0.007	637.000	0.000	NA		NA
679403	679404	YP1397	YP1398	mglB	mglA4	TRUE	0.717	230.000	0.250	NA	Y	NA
679404	679405	YP1398	YP1399	mglA4	mglC	TRUE	0.998	21.000	0.905	0.013	Y	NA
679406	679407	YP1400	YP1401	sanA	sfcA1	FALSE	0.058	281.000	0.045	NA		NA
679407	679408	YP1401	YP1402	sfcA1	cdd	FALSE	0.008	356.000	0.022	1.000	N	NA
679408	679409	YP1402	YP1403	cdd	lrgB	FALSE	0.105	326.000	0.198	NA	N	NA
679409	679410	YP1403	YP1404	lrgB		TRUE	0.993	-3.000	0.340	NA		NA
679410	679411	YP1404	YP1405		ydeF	FALSE	0.239	203.000	0.021	0.079		NA
679411	679412	YP1405	YP1406	ydeF		FALSE	0.036	314.000	0.000	NA		NA
679412	679413	YP1406	YP1407		rbsB5	TRUE	0.924	15.000	0.177	NA		NA
679414	679415	YP1408	YP1409			TRUE	0.493	40.000	0.000	NA		NA
679415	679416	YP1409	YP1410		tnp_18	TRUE	0.849	-10.000	0.000	NA		NA
679418	679419	YP1412	YP_1413	mrp	udk	FALSE	0.085	245.000	0.073	1.000	N	NA
679419	679420	YP_1413	YP_1414	udk	dcd	TRUE	0.806	105.000	0.098	1.000	Y	NA
679420	679421	YP_1414	YP1415	dcd	asmA1	FALSE	0.034	289.000	0.057	NA	N	NA
679423	679424	YP1417	YP1418	ysuF	ysuJ	FALSE	0.220	152.000	0.000	NA		NA
679424	679425	YP1418	YP1419	ysuJ	alcA	TRUE	0.957	35.000	0.667	1.000	N	NA
679425	679426	YP1419	YP1420	alcA	alcB	FALSE	0.316	33.000	0.000	NA	N	NA
679426	679427	YP1420	YP1421	alcB	ysuG	FALSE	0.349	-48.000	0.000	NA	N	NA
679428	679429	YP1422	YP1423	ysuD	ysuC	TRUE	0.999	-3.000	0.583	1.000	Y	NA
679429	679430	YP1423	YP1424	ysuC	ysuB	TRUE	0.999	-13.000	0.818	0.059	Y	NA
679430	679431	YP1424	YP1425	ysuB	ysuA	TRUE	0.999	-3.000	0.455	1.000	Y	NA
679431	679432	YP1425	YP1426	ysuA	ysuR	TRUE	0.968	51.000	0.364	1.000	Y	NA
679432	679433	YP1426	YP1427	ysuR		TRUE	0.753	213.000	0.455	0.002	N	NA
679434	679435	YP1428	YP1429	galU1	galF	TRUE	0.921	84.000	0.111	0.001	Y	NA
679435	679436	YP1429	YP1430	galF	gnd	FALSE	0.015	335.000	0.000	1.000	N	NA
679437	679438	YP1431	YP1432	hisI	hisF	TRUE	0.999	-6.000	0.430	0.003	Y	NA
679438	679439	YP1432	YP1433	hisF	hisA	TRUE	0.997	-18.000	0.433	0.003	Y	NA
679439	679440	YP1433	YP1434	hisA	hisH	TRUE	0.996	6.000	0.210	0.003	Y	NA
679440	679441	YP1434	YP1435	hisH	hisB1	TRUE	0.997	0.000	0.128	0.003	Y	NA
679441	679442	YP1435	YP1436	hisB1	hisC	TRUE	0.999	-3.000	0.341	0.003	Y	NA
679442	679443	YP1436	YP1437	hisC	hisD	TRUE	0.998	3.000	0.294	0.003	Y	NA
679443	679444	YP1437	YP1438	hisD	hisG	TRUE	0.996	4.000	0.171	0.003	Y	NA
679445	679446	YP1439	YP1440		wcaG4	FALSE	0.018	392.000	0.000	NA		NA
679447	679448	YP1441	YP1442		araH6	FALSE	0.078	245.000	0.000	NA		NA
679448	5438023	YP1442	YP_1443	araH6		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679449	679450	YP1444	YP1445	gldA	potE2	FALSE	0.006	460.000	0.000	1.000	N	NA
679452	679453	YP1447	YP1448	wcaG5		FALSE	0.015	434.000	0.000	NA		NA
2213999	679454	YP_1449	YP1450			FALSE	0.007	670.000	0.000	NA		NA
679457	679458	YP1453	YP1454	ucpA	mhpD2	TRUE	0.978	48.000	0.333	0.046	Y	NA
679458	679459	YP1454	YP1455	mhpD2	dgoA1	TRUE	0.929	32.000	0.290	0.020	N	NA
679459	679460	YP1455	YP1456	dgoA1		FALSE	0.334	79.000	0.000	NA		NA
679460	679461	YP1456	YP1457		lldD	TRUE	0.465	45.000	0.000	NA		NA
679464	679465	YP1460	YP1461	proP15	cDA11	TRUE	0.970	-3.000	0.136	1.000	N	NA
679466	679467	YP1462	YP_1463			FALSE	0.305	90.000	0.000	NA		NA
679468	679469	YP_t29	YP1464		uhpA1	FALSE	0.014	446.000	0.000	NA		NA
679469	679470	YP1464	YP1465	uhpA1		FALSE	0.033	257.000	0.000	1.000	N	NA
679470	679471	YP1465	YP1466			TRUE	0.996	20.000	0.905	NA	Y	NA
679471	679472	YP1466	YP1467		dctP	TRUE	0.979	124.000	0.947	NA	Y	NA
679474	679475	YP1469	YP1470	galA	lacY	TRUE	0.651	24.000	0.000	1.000		NA
679477	679478	YP_t30	YP1472			FALSE	0.178	178.000	0.000	NA		NA
679478	679479	YP1472	YP1473			FALSE	0.019	390.000	0.000	NA		NA
679479	679480	YP1473	YP1474		rIO1	FALSE	0.103	222.000	0.000	NA		NA
679480	679481	YP1474	YP1475	rIO1	mdlB4	FALSE	0.108	103.000	0.021	1.000	N	NA
679482	679483	YP1476	YP1477			TRUE	0.586	27.000	0.000	NA		NA
679487	679488	YP1481	YP1482			FALSE	0.161	263.000	0.125	NA		NA
679488	679489	YP1482	YP1483			TRUE	0.924	43.000	0.429	NA		NA
679489	679490	YP1483	YP1484		aroP2	TRUE	0.827	113.000	0.429	NA		NA
679495	679496	YP1489	YP1490		atoS1	FALSE	0.103	222.000	0.000	NA		NA
679497	679498	YP1491	YP1492	dnaC_12		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679499	679500	YP1493	YP1494			FALSE	0.153	194.000	0.000	NA		NA
679500	679501	YP1494	YP1495			TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
679502	679503	YP1496	YP1497		malK1	TRUE	0.509	-114.000	0.000	1.000		NA
679503	679504	YP1497	YP1498	malK1	malG2	TRUE	0.916	25.000	0.000	1.000	Y	NA
679504	679505	YP1498	YP1499	malG2	malF3	TRUE	0.988	-7.000	0.000	0.059	Y	NA
679505	679506	YP1499	YP1500	malF3	ugpB2	TRUE	0.862	67.000	0.000	0.059	Y	NA
679506	679507	YP1500	YP1501	ugpB2	mviM2	TRUE	0.591	30.000	0.000	1.000		NA
679508	679509	YP1502	YP1503		nagC3	FALSE	0.420	54.000	0.000	NA		NA
679511	679512	YP1505	YP1506			TRUE	0.780	12.000	0.000	NA		NA
5438024	5438025	YP_1507	YP_1508	tnpA_1		FALSE	0.453	48.000	0.000	NA		NA
5438025	679513	YP_1508	YP1509			FALSE	0.367	66.000	0.000	NA		NA
679513	679514	YP1509	YP1510			TRUE	0.944	-19.000	0.200	NA		NA
679515	679516	YP1511	YP1512			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
679516	679517	YP1512	YP1513			TRUE	0.698	17.000	0.000	NA		NA
679517	679518	YP1513	YP1514			FALSE	0.015	435.000	0.000	NA		NA
679518	679519	YP1514	YP1515			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679519	679520	YP1515	YP1516			TRUE	0.882	5.000	0.000	NA		NA
679520	5438026	YP1516	YP_1517			FALSE	0.196	165.000	0.000	NA		NA
5438026	679521	YP_1517	YP1518			FALSE	0.321	84.000	0.000	NA		NA
679521	679522	YP1518	YP1519		tnpA_2	TRUE	0.935	72.000	0.521	0.082		NA
679522	679523	YP1519	YP1520	tnpA_2	hcp4	FALSE	0.107	220.000	0.000	NA		NA
679523	679524	YP1520	YP1521	hcp4		TRUE	0.596	26.000	0.000	NA		NA
679525	679526	YP1522	YP1523			FALSE	0.078	245.000	0.000	NA		NA
679526	5438027	YP1523	YP_1524			FALSE	0.023	369.000	0.000	NA		NA
679528	679529	YP_t31	YP_t32			TRUE	0.794	11.000	0.000	NA		NA
679529	679530	YP_t32	YP_t33			FALSE	0.425	53.000	0.000	NA		NA
679530	679531	YP_t33	YP1526		pgsA2	FALSE	0.230	145.000	0.000	NA		NA
679531	679532	YP1526	YP1527	pgsA2	uvrC	TRUE	0.755	59.000	0.227	1.000	N	NA
679532	679533	YP1527	YP1528	uvrC	uvrY	TRUE	0.868	-28.000	0.086	0.031	N	NA
679534	679535	YP1529	YP1530		glpM	FALSE	0.388	125.000	0.085	NA		NA
679538	679539	YP1533	YP_t34			FALSE	0.007	687.000	0.000	NA		NA
679543	679544	YP1537	YP1538			TRUE	0.993	11.000	0.378	NA	Y	NA
679544	679545	YP1538	YP1539		fTR11	TRUE	0.996	6.000	0.356	NA	Y	NA
679545	679546	YP1539	YP1540	fTR11	putP2	FALSE	0.016	324.000	0.000	1.000	N	NA
679546	679547	YP1540	YP1541	putP2		TRUE	0.563	30.000	0.000	NA		NA
679548	679549	YP_1542	YP1543	putA		FALSE	0.012	464.000	0.000	NA		NA
679549	679550	YP1543	YP1544		arsR2	TRUE	0.796	-24.000	0.061	NA		NA
679551	679552	YP1545	YP1546	glnQ2	artM4	TRUE	0.994	3.000	0.150	1.000	Y	NA
679552	679553	YP1546	YP1547	artM4	fliY	TRUE	0.996	0.000	0.100	0.082	Y	NA
679553	679554	YP1547	YP1548	fliY	Acd	TRUE	0.944	124.000	0.469	1.000	Y	NA
679554	679555	YP1548	YP1549	Acd	fliZ	FALSE	0.075	289.000	0.062	1.000		NA
679555	679556	YP1549	YP1550	fliZ	fliA1	FALSE	0.236	222.000	0.108	1.000		NA
679556	679557	YP1550	YP1551	fliA1	fliC	FALSE	0.013	347.000	0.000	1.000	N	NA
679558	679559	YP1552	YP1553	fliD1	fliS1	TRUE	0.995	11.000	0.284	0.004	Y	NA
679559	679560	YP1553	YP1554	fliS1	fliT	TRUE	0.940	-40.000	0.324	1.000		NA
679560	679561	YP1554	YP1555	fliT		FALSE	0.413	55.000	0.000	NA		NA
679561	679562	YP1555	YP1556		araC3	TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
679562	5438028	YP1556	YP_1557	araC3		FALSE	0.026	354.000	0.000	NA		NA
5438028	679563	YP_1557	YP1558		alkA	FALSE	0.204	161.000	0.000	NA		NA
679564	679565	YP1559	YP1560	Doc		TRUE	0.729	11.000	0.013	NA		NA
679565	679566	YP1560	YP_1561		fliE	FALSE	0.045	294.000	0.000	NA		NA
679567	679568	YP1562	YP1563	fliF2	fliG1	TRUE	0.998	-3.000	0.220	0.011	Y	NA
679568	679569	YP1563	YP_1564	fliG1	fliH	TRUE	0.988	-7.000	0.007	0.006	Y	NA
679569	679570	YP_1564	YP1565	fliH	fliI2	TRUE	0.961	-61.000	0.115	0.006	Y	NA
679570	679571	YP1565	YP1566	fliI2	fliJ	TRUE	0.864	100.000	0.073	0.012	Y	NA
679571	679572	YP1566	YP1567	fliJ	fliK1	TRUE	0.999	-3.000	0.317	0.011	Y	NA
679572	679573	YP1567	YP1568	fliK1	fliL	FALSE	0.437	267.000	0.119	1.000	Y	NA
679573	679574	YP1568	YP1569	fliL	fliM1	TRUE	0.999	6.000	0.957	0.002	Y	NA
679574	679575	YP1569	YP1570	fliM1	fliN	TRUE	0.997	-3.000	0.137	0.002	Y	NA
679575	679576	YP1570	YP1571	fliN	fliO	TRUE	0.998	0.000	0.443	1.000	Y	NA
679576	679577	YP1571	YP_1572	fliO	fliP	TRUE	0.909	81.000	0.203	1.000	Y	NA
679577	679578	YP_1572	YP1573	fliP	fliQ2	TRUE	0.987	106.000	0.827	0.013	Y	NA
679578	679579	YP1573	YP1574	fliQ2	fliR2	TRUE	0.994	3.000	0.069	0.004	Y	NA
679579	679580	YP1574	YP1575	fliR2		TRUE	0.927	21.000	0.000	NA	Y	NA
679580	679581	YP1575	YP1576			TRUE	0.465	45.000	0.000	NA		NA
679582	679583	YP1577	YP1578	rbsK3	araH7	TRUE	0.842	49.000	0.000	NA	Y	NA
679583	679584	YP1578	YP1579	araH7	mglA5	TRUE	0.998	3.000	0.286	0.012	Y	NA
679584	679585	YP1579	YP1580	mglA5	rbsB6	TRUE	0.989	0.000	0.000	NA	Y	NA
679585	679586	YP1580	YP1581	rbsB6	araH8	TRUE	0.993	43.000	1.000	NA	Y	NA
679586	679587	YP1581	YP1582	araH8		FALSE	0.289	112.000	0.000	1.000		NA
679589	679590	YP1584	YP1585	flgL	flgK1	TRUE	0.915	106.000	0.142	0.002	Y	NA
679590	679591	YP1585	YP1586	flgK1	flgJ1	TRUE	0.565	585.000	0.705	0.004	Y	NA
679591	679592	YP1586	YP1587	flgJ1	flgI1	TRUE	0.995	0.000	0.048	0.012	Y	NA
679592	679593	YP1587	YP1588	flgI1	flgH1	TRUE	0.979	15.000	0.085	0.012	Y	NA
679593	679594	YP1588	YP1589	flgH1	flgG1	TRUE	0.915	102.000	0.268	1.000	Y	NA
679594	679595	YP1589	YP1590	flgG1	flgF1	TRUE	0.997	-19.000	0.420	0.001	Y	NA
679595	679596	YP1590	YP1591	flgF1	flgE1	TRUE	0.973	22.000	0.095	0.006	Y	NA
679596	679597	YP1591	YP1592	flgE1	flgD1	TRUE	0.529	202.000	0.000	1.000	Y	NA
679597	679598	YP1592	YP1593	flgD1	flgC1	TRUE	0.981	15.000	0.186	1.000	Y	NA
679598	679599	YP1593	YP1594	flgC1	flgB1	TRUE	0.999	6.000	0.824	0.006	Y	NA
679600	679601	YP1595	YP1596	flgA	flgM	TRUE	0.903	151.000	0.330	NA	Y	NA
679601	679602	YP1596	YP1597	flgM	flgN1	TRUE	0.994	16.000	0.361	0.004	Y	NA
5438029	679603	YP_1598	YP1599	inv	tnp_19	TRUE	0.463	-1506.000	0.000	NA		NA
679603	679604	YP1599	YP1600	tnp_19	flhE	FALSE	0.005	1658.000	0.000	1.000		NA
679604	679605	YP1600	YP1601	flhE	flhA2	TRUE	0.981	0.000	0.053	0.004		NA
679605	679606	YP1601	YP1602	flhA2	flhB2	TRUE	0.999	0.000	0.287	0.013	Y	NA
679607	679608	YP1603	YP1604		acpP2	TRUE	0.997	-6.000	0.800	NA		NA
679609	679610	YP1605	YP1606			FALSE	0.052	280.000	0.000	NA		NA
679610	679611	YP1606	YP1607		pcoD	TRUE	0.932	82.000	0.704	NA		NA
679611	679612	YP1607	YP1608	pcoD	copC	TRUE	0.996	3.000	0.613	1.000		NA
679616	679617	YP1612	YP1613	pip	ptrB	FALSE	0.016	722.000	0.000	0.024		NA
679617	679618	YP1613	YP1614	ptrB		FALSE	0.038	310.000	0.000	NA		NA
679618	679619	YP1614	YP1615			FALSE	0.342	92.000	0.048	NA		NA
679619	679620	YP1615	YP1616			TRUE	0.706	22.000	0.053	NA		NA
679620	679621	YP1616	YP1617		dbpA	FALSE	0.229	94.000	0.014	NA		NA
679624	679625	YP1620	YP1621	pabB	mutT2	TRUE	0.975	-3.000	0.116	1.000		NA
679625	679626	YP1621	YP1622	mutT2	sdaA	FALSE	0.080	688.000	0.409	1.000		NA
679627	679628	YP1623	YP1624	hpaC	hpaB	TRUE	0.964	21.000	0.226	0.001		NA
679628	679629	YP1624	YP1625	hpaB	hpaX	FALSE	0.213	68.000	0.000	1.000	N	NA
679629	679630	YP1625	YP1626	hpaX	hpaI	TRUE	0.963	26.000	0.175	1.000	Y	NA
679630	679631	YP1626	YP1627	hpaI	hpaH	TRUE	0.987	-7.000	0.439	1.000	N	NA
679631	679632	YP1627	YP1628	hpaH	hpaF	TRUE	0.981	-6.000	0.282	1.000	N	NA
679632	679633	YP1628	YP1629	hpaF	hpaD	TRUE	0.940	25.000	0.330	1.000		NA
679633	679634	YP1629	YP1630	hpaD	hpaE	TRUE	0.803	119.000	0.378	1.000		NA
679634	5438030	YP1630	YP_1631	hpaE		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679637	679638	YP_1634	YP1635	manX1	manY	TRUE	0.925	50.000	0.064	0.009	Y	NA
679638	679639	YP1635	YP1636	manY	manZ	TRUE	0.999	7.000	0.939	0.009	Y	NA
679639	679640	YP1636	YP1637	manZ		TRUE	0.840	200.000	0.755	NA		NA
679640	679641	YP1637	YP1638			FALSE	0.015	429.000	0.000	NA		NA
679641	2214000	YP1638	YP_1639		fcuA	FALSE	0.204	161.000	0.000	NA		NA
2214000	679642	YP_1639	YP1641	fcuA		FALSE	0.314	87.000	0.000	NA		NA
679642	679643	YP1641	YP1642		dnaC_13	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679644	679645	YP1643	YP1644	dksA2		TRUE	0.801	-10.000	0.002	1.000		NA
679645	679646	YP1644	YP1645			TRUE	0.991	6.000	0.500	NA		NA
679646	679647	YP1645	YP1646		alpA2	TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
679647	679648	YP1646	YP1647	alpA2		TRUE	0.470	44.000	0.000	NA		NA
679648	679649	YP1647	YP1648			TRUE	0.843	8.000	0.000	NA		NA
679649	679650	YP1648	YP1649		fyuA	FALSE	0.006	816.000	0.000	NA		NA
679650	679651	YP1649	YP1650	fyuA	ybtE	FALSE	0.392	131.000	0.125	1.000	N	NA
679651	679652	YP1650	YP1651	ybtE	ybtT	TRUE	0.989	4.000	0.094	1.000	Y	NA
679652	679653	YP1651	YP_1652	ybtT	ybtU	TRUE	0.998	-3.000	0.406	1.000	Y	NA
679653	679654	YP_1652	YP1653	ybtU	irp1	TRUE	0.999	-3.000	0.333	0.024	Y	NA
679654	679655	YP1653	YP1654	irp1	irp2	TRUE	0.934	88.000	0.158	0.002	Y	NA
679655	679656	YP1654	YP1655	irp2	ybtA	TRUE	0.633	173.000	0.333	1.000	N	NA
679657	679658	YP1656	YP1657	ybtP	ybtQ	TRUE	0.999	-13.000	0.913	0.006	Y	NA
679658	679659	YP1657	YP1658	ybtQ	ybtX	TRUE	0.653	-130.000	0.130	NA	N	NA
679659	679660	YP1658	YP1659	ybtX	ybtS	TRUE	0.807	28.000	0.176	NA	N	NA
679661	679662	YP1660	YP_t35	int2		FALSE	0.202	162.000	0.000	NA		NA
679662	679663	YP_t35	YP1661		fimC2	FALSE	0.040	303.000	0.000	NA		NA
679663	679664	YP1661	YP1662	fimC2		TRUE	0.993	-3.000	0.333	NA		NA
679664	679665	YP1662	YP1663		fimD2	TRUE	0.984	16.000	0.667	NA		NA
679665	679666	YP1663	YP1664	fimD2	fimC3	TRUE	0.978	49.000	0.500	1.000	Y	NA
679666	679667	YP1664	YP1665	fimC3	fimA1	TRUE	0.870	93.000	0.154	1.000	Y	NA
679667	679668	YP1665	YP1666	fimA1	baeS3	FALSE	0.005	513.000	0.000	1.000	N	NA
679668	679669	YP1666	YP1667	baeS3	fimZ	TRUE	0.970	-25.000	0.037	0.011	Y	NA
679669	679670	YP1667	YP1668	fimZ	aCH1	FALSE	0.003	826.000	0.000	1.000	N	NA
679670	679671	YP1668	YP1669	aCH1	maoC	TRUE	0.947	23.000	0.417	1.000	N	NA
679671	679672	YP1669	YP1670	maoC	citE2	TRUE	0.953	-58.000	0.600	1.000	N	NA
679674	679675	YP1672	YP1673			TRUE	0.610	25.000	0.000	NA		NA
679675	679676	YP1673	YP1674		proP16	FALSE	0.107	220.000	0.000	NA		NA
679676	679677	YP1674	YP1675	proP16		TRUE	0.967	18.000	0.417	1.000		NA
679681	679682	YP1679	YP1680	ansP2	glpR4	FALSE	0.003	722.000	0.000	1.000	N	NA
679683	679684	YP1681	YP1682	hfi2	glsA1	FALSE	0.014	437.000	0.000	NA		NA
679684	679685	YP1682	YP1683	glsA1	proP17	FALSE	0.125	111.000	0.028	1.000	N	NA
679685	679686	YP1683	YP1684	proP17		FALSE	0.092	231.000	0.000	NA		NA
679686	679687	YP1684	YP1685		fTR12	TRUE	0.492	-94.000	0.000	NA		NA
679687	679688	YP1685	YP1686	fTR12		TRUE	0.670	204.000	0.133	NA	Y	NA
679688	679689	YP1686	YP1687			FALSE	0.457	256.000	0.386	NA		NA
679689	679690	YP1687	YP1688			TRUE	0.996	3.000	0.625	NA		NA
679690	679691	YP1688	YP1689			TRUE	0.993	-67.000	0.878	NA	Y	NA
679691	679692	YP1689	YP1690		phnL4	TRUE	0.993	4.000	0.175	NA	Y	NA
679692	679693	YP1690	YP1691	phnL4	trxA1	TRUE	0.635	-43.000	0.078	1.000	N	NA
679693	679694	YP1691	YP1692	trxA1		TRUE	0.989	-3.000	0.176	0.012	N	NA
679694	679695	YP1692	YP1693		tehB	FALSE	0.190	173.000	0.071	1.000	N	NA
679695	679696	YP1693	YP1694	tehB	pepP1	FALSE	0.242	141.000	0.071	1.000	N	NA
679696	679697	YP1694	YP_1695	pepP1	hmsH	FALSE	0.008	669.000	0.000	1.000		NA
679697	679698	YP_1695	YP1696	hmsH	hmsF	TRUE	0.989	13.000	0.696	1.000		NA
679698	679699	YP1696	YP_1697	hmsF		TRUE	0.880	-10.000	0.087	1.000	N	NA
679699	679700	YP_1697	YP1698		hmsS	TRUE	0.981	-3.000	0.154	NA		NA
679700	679701	YP1698	YP1699	hmsS	rimL	FALSE	0.030	334.000	0.000	NA		NA
679701	5438031	YP1699	YP_1700	rimL		FALSE	0.014	439.000	0.000	NA		NA
679704	679705	YP1703	YP1704	chaA	narX	FALSE	0.012	549.000	0.000	0.077	N	NA
679706	679707	YP1705	YP1706	aRO82		FALSE	0.082	242.000	0.000	NA		NA
679707	679708	YP1706	YP_1707		argD	FALSE	0.146	198.000	0.000	NA		NA
679708	679709	YP_1707	YP1708	argD	astA	TRUE	0.982	30.000	0.400	1.000	Y	NA
679709	679710	YP1708	YP1709	astA	astD	TRUE	0.907	-3.000	0.051	1.000	N	NA
679710	679711	YP1709	YP_1710	astD	astB	TRUE	0.918	24.000	0.306	1.000	N	NA
679711	679712	YP_1710	YP1711	astB		TRUE	0.852	58.000	0.063	1.000	Y	NA
679712	679713	YP1711	YP1712		ompC3	FALSE	0.003	728.000	0.000	1.000	N	NA
679714	679715	YP1713	YP1714	hutG	hutI	FALSE	0.291	-90.000	0.031	1.000	N	NA
679715	5438032	YP1714	YP_1715	hutI	hutC1	FALSE	0.133	204.000	0.000	NA		NA
5438032	679716	YP_1715	YP1716	hutC1	dnaC_14	FALSE	0.352	70.000	0.000	NA		NA
679716	679717	YP1716	YP1717	dnaC_14		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679719	679720	YP1719	YP1720			FALSE	0.125	208.000	0.000	NA		NA
679720	679721	YP1720	YP1721		fimD3	TRUE	0.850	206.000	0.848	NA		NA
679721	679722	YP1721	YP1722	fimD3	fimC4	TRUE	0.973	154.000	0.879	NA	Y	NA
679722	679723	YP1722	YP1723	fimC4		TRUE	0.878	31.000	0.219	NA		NA
679723	679724	YP1723	YP1724			TRUE	0.996	-6.000	0.714	NA		NA
679724	679725	YP1724	YP1725			TRUE	0.976	-6.000	0.192	NA		NA
679725	679726	YP1725	YP1726		pqiB2	FALSE	0.011	480.000	0.000	NA		NA
679726	679727	YP1726	YP1727	pqiB2	pqiA2	TRUE	0.984	-37.000	0.840	NA		NA
679728	679729	YP1728	YP1729		proQ	TRUE	0.791	96.000	0.081	NA	Y	NA
679729	679730	YP1729	YP_1730	proQ	prc	TRUE	0.927	20.000	0.304	NA	N	NA
679730	679731	YP_1730	YP1731	prc	htpX1	FALSE	0.023	455.000	0.042	0.024	N	NA
679731	679732	YP1731	YP1732	htpX1	fimA2	FALSE	0.003	658.000	0.000	1.000	N	NA
679732	679733	YP1732	YP1733	fimA2	ecpD1	TRUE	0.966	153.000	0.750	1.000	Y	NA
679733	679734	YP1733	YP1734	ecpD1	fimD4	TRUE	0.980	82.000	0.750	1.000	Y	NA
679734	679735	YP1734	YP1735	fimD4	fimA3	TRUE	0.990	-9.000	0.167	1.000	Y	NA
679735	679736	YP1735	YP1736	fimA3	fimC5	TRUE	0.996	-3.000	0.167	1.000	Y	NA
679738	679739	YP1738	YP1739	ogl	kdgR	FALSE	0.141	187.000	0.059	1.000	N	NA
679739	679740	YP1739	YP1740	kdgR	ampD2	FALSE	0.010	385.000	0.000	1.000	N	NA
679741	679742	YP1741	YP1742			FALSE	0.285	198.000	0.102	NA		NA
679742	679743	YP1742	YP1743			FALSE	0.011	480.000	0.000	NA		NA
679743	679744	YP1743	YP1744		togB	FALSE	0.099	298.000	0.000	0.057		NA
679744	679745	YP1744	YP1745	togB	togA	TRUE	0.977	16.000	0.101	0.057	Y	NA
679745	679746	YP1745	YP1746	togA	malG3	TRUE	0.984	14.000	0.131	0.057	Y	NA
679746	679747	YP1746	YP1747	malG3	togM	TRUE	0.999	-7.000	0.917	0.057	Y	NA
679747	679748	YP1747	YP1748	togM	pelW	TRUE	0.850	41.000	0.217	1.000		NA
679748	679749	YP1748	YP1749	pelW	kduD	FALSE	0.033	336.000	0.000	1.000		NA
679749	679750	YP1749	YP1750	kduD	kduI	TRUE	0.756	47.000	0.192	1.000	N	NA
5438033	679751	YP_1751	YP1752	kdgF		FALSE	0.453	48.000	0.000	NA		NA
679751	679752	YP1752	YP1753			FALSE	0.045	303.000	0.000	1.000		NA
679754	679755	YP1755	YP1756		phnL5	TRUE	0.987	-3.000	0.175	0.080	N	NA
679755	679756	YP1756	YP1757	phnL5		TRUE	0.981	-3.000	0.125	0.080	N	NA
679756	679757	YP1757	YP_1758		nagC4	TRUE	0.906	19.000	0.225	1.000	N	NA
679757	679758	YP_1758	YP1759	nagC4	nagC5	TRUE	0.714	-22.000	0.028	NA		NA
679758	679759	YP1759	YP1760	nagC5	cobB	TRUE	0.688	49.000	0.119	NA		NA
679759	679760	YP1760	YP1761	cobB	pepT	FALSE	0.013	300.000	0.019	1.000	N	NA
679761	679762	YP1762	YP1763		phoQ	TRUE	0.942	30.000	0.408	NA		NA
679762	679763	YP1763	YP1764	phoQ	phoP	TRUE	0.999	6.000	0.940	1.000	Y	NA
679763	679764	YP1764	YP1765	phoP		FALSE	0.134	211.000	0.000	1.000		NA
679764	679765	YP1765	YP1766		purB	FALSE	0.121	188.000	0.002	1.000		NA
679765	679766	YP1766	YP1767	purB		TRUE	0.617	52.000	0.093	NA		NA
679766	679767	YP1767	YP1768		trmU	TRUE	0.751	58.000	0.180	NA		NA
679767	679768	YP1768	YP1769	trmU	mutT3	FALSE	0.356	187.000	0.158	1.000	N	NA
679768	679769	YP1769	YP1770	mutT3	rsuA2	TRUE	0.961	-7.000	0.182	1.000	N	NA
679771	679772	YP1772	YP1773	purR4		FALSE	0.054	276.000	0.000	NA		NA
679772	679773	YP1773	YP1774		aer	TRUE	0.496	120.000	0.125	NA		NA
679773	679774	YP1774	YP1775	aer		FALSE	0.003	863.000	0.000	1.000	N	NA
679775	679776	YP1776	YP1777			FALSE	0.401	58.000	0.000	NA		NA
679776	679777	YP1777	YP1778		appA	FALSE	0.041	301.000	0.000	NA		NA
679778	679779	YP1779	YP1780			FALSE	0.046	291.000	0.000	NA		NA
679779	679780	YP1780	YP1781		lrp3	FALSE	0.391	68.000	0.045	NA		NA
679780	679781	YP1781	YP1782	lrp3		FALSE	0.056	273.000	0.000	NA		NA
679781	679782	YP1782	YP1783			FALSE	0.310	88.000	0.000	NA		NA
679782	679783	YP1783	YP1784		qor2	FALSE	0.050	283.000	0.000	NA		NA
679783	679784	YP1784	YP1785	qor2	lacZ	FALSE	0.011	371.000	0.000	1.000	N	NA
679785	679786	YP1786	YP_1787	cspC3	dsrB	FALSE	0.240	215.000	0.105	NA		NA
679787	679788	YP1789	YP1790		mgtC	FALSE	0.029	340.000	0.000	NA		NA
679788	679789	YP1790	YP1791	mgtC	mgtB	FALSE	0.027	401.000	0.065	NA		NA
679789	5438035	YP1791	YP_1792	mgtB	flhD	FALSE	0.005	1179.000	0.000	NA		NA
5438035	679790	YP_1792	YP1793	flhD	flhC	TRUE	0.923	1.000	0.000	NA		NA
679790	679791	YP1793	YP1794	flhC	motA1	TRUE	0.665	205.000	0.408	1.000		NA
679791	679792	YP1794	YP1795	motA1	motB1	TRUE	0.998	-3.000	0.429	1.000	Y	NA
679792	679793	YP1795	YP1796	motB1	cheA	TRUE	0.998	11.000	0.913	1.000	Y	NA
679793	679794	YP1796	YP1797	cheA	cheW	TRUE	0.957	163.000	0.447	0.003	Y	NA
679795	679796	YP1798	YP1799	proP19	tdcF1	TRUE	0.967	13.000	0.400	NA	N	NA
679796	679797	YP1799	YP1800	tdcF1	sgaU	TRUE	0.945	-33.000	0.400	NA	N	NA
679798	679799	YP1801	YP1802			FALSE	0.141	201.000	0.000	NA		NA
679799	679800	YP1802	YP1803			FALSE	0.009	389.000	0.000	1.000	N	NA
679800	679801	YP1803	YP1804			FALSE	0.010	528.000	0.000	NA		NA
679801	679802	YP1804	YP_1805			FALSE	0.305	90.000	0.000	NA		NA
679802	679803	YP_1805	YP1806		cheD1	FALSE	0.084	241.000	0.000	NA		NA
679803	679804	YP1806	YP1807	cheD1	tap	TRUE	0.949	184.000	0.429	0.001	Y	NA
679804	679805	YP1807	YP1808	tap	cheR	TRUE	0.834	158.000	0.188	1.000	Y	NA
679805	679806	YP1808	YP1809	cheR	cheB	TRUE	0.993	-3.000	0.087	1.000	Y	NA
679806	679807	YP1809	YP1810	cheB	cheY	TRUE	0.954	95.000	0.286	0.010	Y	NA
679807	679808	YP1810	YP1811	cheY	cheZ	TRUE	0.994	10.000	0.333	1.000	Y	NA
679808	679809	YP1811	YP1812	cheZ	ampD3	FALSE	0.004	571.000	0.000	1.000	N	NA
679809	5438036	YP1812	YP_1813	ampD3		FALSE	0.025	357.000	0.000	NA		NA
5438036	679810	YP_1813	YP1814			FALSE	0.282	100.000	0.000	NA		NA
679811	5438037	YP1815	YP_1816			TRUE	0.531	34.000	0.000	NA		NA
5438037	679812	YP_1816	YP1817			FALSE	0.019	391.000	0.000	NA		NA
679813	679814	YP1818	YP1819		rssA1	FALSE	0.018	393.000	0.000	NA		NA
679814	679815	YP1819	YP1820	rssA1		FALSE	0.214	155.000	0.000	NA		NA
679816	679817	YP1821	YP1822	dnaC_15		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679817	5438038	YP1822	YP_1823		hutC2	FALSE	0.307	89.000	0.000	NA		NA
679818	679819	YP1824	YP1825	ssnA		TRUE	0.956	0.000	0.067	NA		NA
5438039	679821	YP_1827	YP1828	fabH1	wcaG6	TRUE	0.747	14.000	0.000	NA		NA
679821	679822	YP1828	YP1829	wcaG6	gloB2	TRUE	0.819	-52.000	0.133	1.000		NA
679822	679823	YP1829	YP1830	gloB2	paaK	TRUE	0.996	-3.000	0.550	NA		NA
679823	679824	YP1830	YP1831	paaK	wcaG7	FALSE	0.169	134.000	0.054	NA	N	NA
679824	679825	YP1831	YP1832	wcaG7		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679825	5438040	YP1832	YP_1833			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679829	679830	YP1837	YP1838		rpiB2	FALSE	0.084	247.000	0.000	1.000		NA
679831	679832	YP1839	YP1840	smtA4	fabG8	TRUE	0.496	105.000	0.000	0.044		NA
679832	679833	YP1840	YP1841	fabG8		FALSE	0.028	341.000	0.000	NA		NA
679833	679834	YP1841	YP1842			TRUE	0.822	-13.000	0.000	NA		NA
679834	679835	YP1842	YP1843			TRUE	0.870	6.000	0.000	NA		NA
679835	679836	YP1843	YP1844		mhpC2	FALSE	0.006	791.000	0.000	NA		NA
679836	679837	YP1844	YP1845	mhpC2		FALSE	0.119	213.000	0.000	NA		NA
679837	679838	YP1845	YP1846			TRUE	0.738	55.000	0.154	1.000		NA
679838	679839	YP1846	YP1847		baeS4	FALSE	0.060	277.000	0.000	1.000		NA
679839	679840	YP1847	YP1848	baeS4	copR	TRUE	0.999	6.000	0.793	0.001	Y	NA
679841	679842	YP1849	YP1850		mdaB2	FALSE	0.225	149.000	0.000	NA		NA
679842	679843	YP1850	YP1851	mdaB2		TRUE	0.898	15.000	0.133	NA		NA
679845	679846	YP1853	YP1854		aes1	TRUE	0.976	-3.000	0.125	NA		NA
679846	679847	YP1854	YP1855	aes1	pspE2	FALSE	0.340	-46.000	0.034	NA	N	NA
679848	679849	YP1856	YP1857	tra5D		TRUE	0.949	18.000	0.286	1.000		NA
679849	679850	YP1857	YP1858			FALSE	0.135	210.000	0.000	1.000		NA
679850	679851	YP1858	YP1859		pth	TRUE	0.821	164.000	0.184	1.000	Y	NA
679853	679854	YP1861	YP1862	prsA	ipk	FALSE	0.024	323.000	0.053	1.000	N	NA
679854	679855	YP1862	YP1863	ipk	lolB	TRUE	0.969	2.000	0.157	1.000	N	NA
679856	679857	YP_1864	YP1865	hemA	prfA	TRUE	0.908	23.000	0.171	0.044	N	NA
679857	679858	YP1865	YP1866	prfA	hemK1	TRUE	0.998	0.000	0.229	0.044	Y	NA
679858	679859	YP1866	YP1867	hemK1		TRUE	0.601	64.000	0.109	NA		NA
679859	679860	YP1867	YP1868			TRUE	0.986	-3.000	0.195	NA		NA
679860	679861	YP1868	YP1869		kdsA	TRUE	0.479	96.000	0.089	1.000		NA
679862	679863	YP1870	YP1871	sUL1		FALSE	0.086	239.000	0.000	NA		NA
679863	679864	YP1871	YP_t36			FALSE	0.038	309.000	0.000	NA		NA
679864	679865	YP_t36	YP1872		ugpQ2	FALSE	0.233	142.000	0.000	NA		NA
679865	679866	YP1872	YP1873	ugpQ2	tbpA1	FALSE	0.045	301.000	0.000	1.000		NA
679866	679867	YP1873	YP1874	tbpA1	potC1	TRUE	0.980	20.000	0.480	0.057		NA
679867	679868	YP1874	YP1875	potC1	potB1	TRUE	0.999	-3.000	0.440	0.057	Y	NA
679868	5438041	YP1875	YP_1876	potB1		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
679869	679870	YP1877	YP1878		ugpQ3	FALSE	0.003	708.000	0.000	1.000	N	NA
679870	679871	YP1878	YP1879	ugpQ3	nagC6	TRUE	0.950	-28.000	0.375	NA	N	NA
679873	679874	YP1880	YP1881	hIS2	torD2	TRUE	0.934	37.000	0.417	1.000		NA
679875	679876	YP1882	YP1883		proP20	FALSE	0.107	365.000	0.196	NA		NA
679877	679878	YP1884	YP1885	rimJ	mviM3	TRUE	0.858	8.000	0.000	1.000		NA
679878	679879	YP1885	YP1886	mviM3	mviN	FALSE	0.054	267.000	0.022	1.000		NA
679879	679880	YP1886	YP1887	mviN	fhaC1	FALSE	0.013	448.000	0.000	NA		NA
679880	2214020	YP1887	YP_1888	fhaC1		TRUE	0.563	30.000	0.000	NA		NA
679882	679883	YP1890	YP_1891		cutC	FALSE	0.122	232.000	0.057	NA		NA
679884	679885	YP1892	YP1893	smtA5	smtA6	TRUE	0.992	-3.000	0.315	NA		NA
679885	679886	YP1893	YP1894	smtA6		FALSE	0.278	191.000	0.089	NA		NA
679886	679887	YP1894	YP1895			FALSE	0.389	180.000	0.126	NA		NA
679888	679889	YP1896	YP1897	aspS	nudB	TRUE	0.905	0.000	0.050	1.000	N	NA
679889	679890	YP1897	YP_1898	nudB		FALSE	0.395	58.000	0.035	NA		NA
679890	679891	YP_1898	YP1899		ruvC	TRUE	0.521	209.000	0.277	NA		NA
679891	679892	YP1899	YP_1900	ruvC	ruvA	TRUE	0.811	283.000	0.451	0.011	Y	NA
679892	679893	YP_1900	YP1901	ruvA	ruvB	TRUE	0.970	162.000	0.549	0.001	Y	NA
679894	679895	YP1902	YP_1903	znuB	znuC	TRUE	0.999	-3.000	0.755	1.000	Y	NA
679896	679897	YP1904	YP1905	znuA	nlpD3	TRUE	0.811	21.000	0.131	1.000	N	NA
679897	679898	YP1905	YP1906	nlpD3	msbB	FALSE	0.291	267.000	0.299	1.000	N	NA
679899	679900	YP1907	YP_1908	pykA	rpiR4	FALSE	0.015	330.000	0.000	1.000	N	NA
679901	679902	YP_1909	YP1910	zwf	eda	FALSE	0.379	242.000	0.034	1.000	Y	NA
679902	679903	YP1910	YP1911	eda	emrE1	FALSE	0.003	829.000	0.000	1.000	N	NA
679903	679904	YP1911	YP1912	emrE1	emrE2	TRUE	0.997	-31.000	0.869	0.076	Y	NA
679906	679907	YP1914	YP1915	dinG2		TRUE	0.819	18.000	0.082	1.000		NA
679907	679908	YP1915	YP1916		slp	FALSE	0.098	137.000	0.024	1.000	N	NA
679908	679909	YP1916	YP1917	slp	fadD	FALSE	0.024	592.000	0.169	1.000	N	NA
679909	679910	YP1917	YP1918	fadD	rnd	FALSE	0.375	121.000	0.115	1.000	N	NA
679911	679912	YP1919	YP1920	minE	minD	TRUE	0.998	4.000	0.618	NA	Y	NA
679912	679913	YP1920	YP1921	minD	minC	TRUE	0.988	25.000	0.466	1.000	Y	NA
679913	679914	YP1921	YP1922	minC		FALSE	0.016	422.000	0.000	NA		NA
679915	679916	YP1923	YP1924		mltB1	TRUE	0.769	141.000	0.363	NA		NA
679916	679917	YP1924	YP_1925	mltB1	mhpD3	FALSE	0.219	71.000	0.046	NA	N	NA
679917	679918	YP_1925	YP1926	mhpD3		FALSE	0.440	103.000	0.088	NA		NA
679919	679920	YP1928	YP1929		dnaC_16	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
679921	679922	YP1930	YP1931			FALSE	0.336	78.000	0.000	NA		NA
679922	679923	YP1931	YP1932			TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
679924	679925	YP1933	YP1934			FALSE	0.343	74.000	0.000	NA		NA
679925	679926	YP1934	YP1935			TRUE	0.923	1.000	0.000	NA		NA
679926	679927	YP1935	YP1936			TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
679927	679928	YP1936	YP1937			FALSE	0.447	49.000	0.000	NA		NA
679929	679930	YP1938	YP1939			FALSE	0.029	337.000	0.000	NA		NA
679930	679931	YP1939	YP1940		proP21	FALSE	0.039	305.000	0.000	NA		NA
679931	679932	YP1940	YP1941	proP21	nifS	TRUE	0.869	4.000	0.019	NA		NA
679932	679933	YP1941	YP1942	nifS		TRUE	0.638	17.000	0.019	NA		NA
679935	679936	YP_1944	YP1945	dsbB	nhaB	TRUE	0.694	236.000	0.723	1.000	N	NA
679940	679941	YP1949	YP1950	proP22		FALSE	0.060	265.000	0.000	NA		NA
679943	679944	YP1952	YP1953	rhaT7		FALSE	0.200	105.000	0.007	NA		NA
679944	679945	YP1953	YP1954		prkA	TRUE	0.911	105.000	0.683	NA		NA
679947	679948	YP1956	YP1957		gapA	FALSE	0.370	314.000	0.154	1.000	Y	NA
679949	679950	YP1958	YP1959			TRUE	0.912	-34.000	0.216	NA		NA
679951	679952	YP1960	YP1961	pncA	ansA	TRUE	0.593	15.000	0.040	1.000	N	NA
679952	679953	YP1961	YP1962	ansA	sppA	FALSE	0.380	117.000	0.113	1.000	N	NA
679954	679955	YP1963	YP1964	nfnB	selD	FALSE	0.046	225.000	0.033	1.000	N	NA
679955	679956	YP1964	YP1965	selD	topB	FALSE	0.224	74.000	0.041	1.000	N	NA
679956	679957	YP1965	YP1966	topB		TRUE	0.975	-3.000	0.123	NA		NA
679958	679959	YP1967	YP_1968	nudG	xthA	FALSE	0.242	98.000	0.056	1.000	N	NA
679961	679962	YP_t38	YP1970		purU	FALSE	0.225	149.000	0.000	NA		NA
679962	679963	YP1970	YP1971	purU		TRUE	0.707	84.000	0.200	NA		NA
679964	679965	YP1972	YP1973	hnr	ugd	FALSE	0.026	280.000	0.000	1.000	N	NA
679969	679970	YP1977	YP1978		marC1	FALSE	0.020	384.000	0.000	NA		NA
679970	679971	YP1978	YP1979	marC1	oppA3	FALSE	0.002	838.000	0.000	NA	N	NA
679971	679972	YP1979	YP1980	oppA3	oppB	TRUE	0.915	87.000	0.151	0.056	Y	NA
679972	679973	YP1980	YP1981	oppB	oppC	TRUE	0.998	19.000	0.870	0.056	Y	NA
679973	679974	YP1981	YP1982	oppC	oppD	TRUE	0.996	12.000	0.554	1.000	Y	NA
679974	679975	YP1982	YP1983	oppD	oppF2	TRUE	0.999	-3.000	0.420	0.001	Y	NA
679975	679976	YP1983	YP1984	oppF2		FALSE	0.008	561.000	0.000	NA		NA
679977	679978	YP_1985	YP1986		cls	TRUE	0.605	165.000	0.231	NA		NA
679978	679979	YP1986	YP1987	cls		FALSE	0.453	48.000	0.000	NA		NA
679980	679981	YP1988	YP1989	ail1		FALSE	0.105	221.000	0.000	NA		NA
679982	679983	YP1990	YP1991			FALSE	0.117	214.000	0.000	NA		NA
679985	679986	YP1993	YP1994			FALSE	0.104	148.000	0.000	NA	N	NA
679986	679987	YP1994	YP1995		ispZ	TRUE	0.581	80.000	0.167	NA	N	NA
679989	679990	YP1998	YP1999		ompW	FALSE	0.289	97.000	0.000	NA		NA
679991	679992	YP2000	YP2001	osmY1	trpA	FALSE	0.021	343.000	0.018	NA		NA
679992	679993	YP2001	YP_2002	trpA	trpB	TRUE	1.000	0.000	0.947	0.001	Y	NA
679993	679994	YP_2002	YP2003	trpB	trpC	TRUE	0.923	157.000	0.221	0.001	Y	NA
679994	679995	YP2003	YP_2004	trpC	trpD	TRUE	0.996	4.000	0.293	1.000	Y	NA
679995	679996	YP_2004	YP2005	trpD	trpG	TRUE	0.964	15.000	0.083	1.000	Y	NA
679996	679997	YP2005	YP2006	trpG	trpE2	TRUE	1.000	0.000	0.703	0.001	Y	NA
679997	679998	YP2006	YP2007	trpE2		FALSE	0.223	116.000	0.023	NA		NA
679999	680000	YP2008	YP2009	trpH	sUA5B	TRUE	0.947	17.000	0.281	NA		NA
680000	680001	YP2009	YP2010	sUA5B	rsuA3	FALSE	0.224	330.000	0.075	NA	Y	NA
680002	680003	YP2011	YP2012	btuR	fabG9	TRUE	0.612	17.000	0.050	1.000	N	NA
680006	680007	YP2015	YP2016		topA2	TRUE	0.586	27.000	0.000	NA		NA
680007	680008	YP2016	YP2017	topA2	cysB	FALSE	0.004	397.000	0.008	1.000	N	NA
680008	680009	YP2017	YP2018	cysB		FALSE	0.030	336.000	0.000	NA		NA
680009	680010	YP2018	YP2019		acnA	FALSE	0.024	364.000	0.000	NA		NA
680012	680013	YP2021	YP2022		pgpB5	FALSE	0.239	131.000	0.000	NA		NA
680013	680014	YP2022	YP2023	pgpB5		TRUE	0.494	157.000	0.143	1.000		NA
680014	680015	YP2023	YP2024			TRUE	0.992	7.000	0.576	1.000		NA
680017	680018	YP2026	YP2027	pyrF	sUI1	TRUE	0.893	0.000	0.045	1.000	N	NA
680023	680024	YP2032	YP2033		cstA1	TRUE	0.874	-31.000	0.143	NA		NA
680024	680025	YP2033	YP2034	cstA1	rnb	FALSE	0.013	350.000	0.000	1.000	N	NA
680026	680027	YP2035	YP2036	proP23	wcaG8	TRUE	0.925	35.000	0.103	1.000	Y	NA
680028	680029	YP2037	YP2038	nth	nqrD2	TRUE	0.960	-3.000	0.109	1.000	N	NA
680029	680030	YP2038	YP2039	nqrD2	nqrC2	TRUE	1.000	-3.000	0.908	0.038	Y	NA
680030	680031	YP2039	YP2040	nqrC2	nqrB2	TRUE	0.999	10.000	0.924	0.038	Y	NA
680033	680034	YP2042	YP2043	nqrA2		TRUE	0.988	50.000	0.537	0.012	Y	NA
680034	680035	YP2043	YP_2044		nqrE3	TRUE	0.999	0.000	0.564	0.038	Y	NA
680035	680036	YP_2044	YP2045	nqrE3		TRUE	0.534	128.000	0.148	NA		NA
5438044	5438045	YP_2046	YP_2047			TRUE	0.610	25.000	0.000	NA		NA
5438045	680037	YP_2047	YP2048		sunT-2	TRUE	0.919	2.000	0.000	NA		NA
680038	680039	YP2049	YP2050	araA	araB1	FALSE	0.227	84.000	0.046	1.000	N	NA
680040	680041	YP2051	YP2052	araF	araG	TRUE	0.989	98.000	0.917	0.012	Y	NA
680041	680042	YP2052	YP_2053	araG	araH	TRUE	0.994	18.000	0.451	0.012	Y	NA
680042	5438046	YP_2053	YP_2054	araH		FALSE	0.139	202.000	0.000	NA		NA
5438046	680043	YP_2054	YP2055		mviM4	FALSE	0.242	128.000	0.000	NA		NA
680043	680044	YP2055	YP2056	mviM4		FALSE	0.169	194.000	0.000	1.000		NA
680044	680045	YP2056	YP2057			TRUE	0.766	-19.000	0.000	NA		NA
680045	680046	YP2057	YP2058			FALSE	0.361	67.000	0.000	NA		NA
680047	680048	YP2059	YP2060		manA	TRUE	0.887	165.000	0.778	NA		NA
680050	5438047	YP2062	YP_2063	tus		FALSE	0.027	346.000	0.000	NA		NA
680051	680052	YP2064	YP2065	mlc	bioD2	TRUE	0.645	200.000	0.455	NA	N	NA
680053	680054	YP_2066	YP2067	eriC2	galR1	FALSE	0.004	636.000	0.000	1.000	N	NA
680054	680055	YP2067	YP2068	galR1		FALSE	0.376	64.000	0.000	NA		NA
680055	5438048	YP2068	YP_2069			FALSE	0.234	141.000	0.000	NA		NA
680056	680057	YP2070	YP2071		tauA2	FALSE	0.261	114.000	0.000	NA		NA
680057	680058	YP2071	YP2072	tauA2	tauC2	TRUE	0.999	4.000	0.520	0.055	Y	NA
680058	680059	YP2072	YP2073	tauC2	tauB2	TRUE	0.996	10.000	0.520	1.000	Y	NA
680061	680062	YP2075	YP2076			TRUE	0.921	-13.000	0.111	NA		NA
680062	680063	YP2076	YP2077			TRUE	0.993	-3.000	0.333	NA		NA
680065	680066	YP2079	YP2080	ilvB2	ilvN	TRUE	0.995	-13.000	0.649	0.002		NA
680067	680068	YP2081	YP2082			FALSE	0.230	131.000	0.033	NA		NA
680068	680069	YP2082	YP2083		phoA	FALSE	0.009	546.000	0.000	NA		NA
680070	680071	YP2084	YP2085	ada2	fnr	FALSE	0.213	73.000	0.038	1.000	N	NA
680071	680072	YP2085	YP2086	fnr	uspA1	TRUE	0.953	155.000	0.619	1.000	Y	NA
680073	680074	YP2087	YP2088	pntB	pntA	TRUE	0.990	73.000	0.745	0.001	Y	NA
680074	680075	YP2088	YP2089	pntA		FALSE	0.184	121.000	0.010	NA		NA
680076	680077	YP2090	YP2091		potE3	FALSE	0.172	270.000	0.143	NA		NA
680079	5438049	YP2093	YP_2094	rstA		TRUE	0.577	28.000	0.000	NA		NA
5438049	680080	YP_2094	YP2095			FALSE	0.453	-1907.000	0.000	NA		NA
680080	680081	YP2095	YP2096		dnaC_17	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
680081	680082	YP2096	YP2097	dnaC_17		FALSE	0.003	645.000	0.000	1.000	N	NA
680084	680085	YP2099	YP2100	rhsA1	gyrB1	TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
5438050	680086	YP_2101	YP2102			FALSE	0.008	565.000	0.000	NA		NA
680086	680087	YP2102	YP2103		cybB2	TRUE	0.975	26.000	0.676	NA		NA
680088	680089	YP2104	YP2105		asr1	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680089	680090	YP2105	YP2106	asr1		FALSE	0.030	334.000	0.000	NA		NA
680091	680092	YP2107	YP2108	hipB2		TRUE	0.962	-3.000	0.077	NA		NA
680092	680093	YP2108	YP_2109		hrpA	FALSE	0.043	297.000	0.000	NA		NA
680097	680098	YP2113	YP2114			FALSE	0.141	201.000	0.000	NA		NA
680099	680100	YP2115	YP2116	ldhA1	hslJ	FALSE	0.127	70.000	0.024	NA	N	NA
680104	680105	YP2120	YP2121	nifJ	mesJ1	FALSE	0.022	275.000	0.000	NA	N	NA
680105	680106	YP2121	YP2122	mesJ1	aes2	FALSE	0.012	340.000	0.000	NA	N	NA
680106	680107	YP2122	YP2123	aes2	soxR2	FALSE	0.018	312.000	0.000	1.000	N	NA
680108	680109	YP2124	YP_2125		zntB	FALSE	0.260	115.000	0.000	NA		NA
680109	680110	YP_2125	YP2126	zntB	mppA	FALSE	0.025	243.000	0.019	1.000	N	NA
680113	680114	YP_2129	YP2130	tpx	tnp_21	FALSE	0.073	202.000	0.000	1.000	N	NA
680116	680117	YP2132	YP2133			TRUE	0.888	62.000	0.412	NA		NA
680118	680119	YP2134	YP2135			TRUE	0.998	-3.000	0.791	NA		NA
680119	680120	YP2135	YP2136		pspD	TRUE	0.807	-19.000	0.052	NA		NA
680120	680121	YP2136	YP2137	pspD	pspC	TRUE	0.655	85.000	0.167	NA		NA
680121	680122	YP2137	YP2138	pspC	pspB	TRUE	0.998	0.000	0.913	NA		NA
680122	680123	YP2138	YP2139	pspB	pspA	TRUE	0.885	162.000	0.739	NA		NA
5438051	680126	YP_2142	YP2143			FALSE	0.379	63.000	0.000	NA		NA
680126	680127	YP2143	YP2144		sapA	FALSE	0.237	136.000	0.000	NA		NA
680127	680128	YP2144	YP2145	sapA	sapB2	TRUE	0.992	-3.000	0.264	0.055	N	NA
680128	680129	YP2145	YP2146	sapB2	sapC	TRUE	0.995	-13.000	0.284	0.055	Y	NA
680129	680130	YP2146	YP2147	sapC	sapD	TRUE	0.999	0.000	0.667	1.000	Y	NA
680130	680131	YP2147	YP2148	sapD	sapF	TRUE	0.999	0.000	0.684	0.020	Y	NA
680131	680132	YP2148	YP2149	sapF		FALSE	0.019	390.000	0.000	NA		NA
680132	680133	YP2149	YP_2150		tppB	FALSE	0.007	643.000	0.000	NA		NA
680133	680134	YP_2150	YP2151	tppB		FALSE	0.068	255.000	0.000	NA		NA
680134	680135	YP2151	YP2152			FALSE	0.077	246.000	0.000	NA		NA
680135	680136	YP2152	YP2153		gst2	FALSE	0.118	242.000	0.062	NA		NA
680137	680138	YP2154	YP2155	pdxY	tyrS	FALSE	0.132	155.000	0.041	1.000	N	NA
680138	680139	YP2155	YP2156	tyrS	pdxH	FALSE	0.149	170.000	0.054	1.000	N	NA
680139	680140	YP2156	YP2157	pdxH		FALSE	0.293	91.000	0.034	NA		NA
680140	680141	YP2157	YP_2158		anmK	FALSE	0.243	121.000	0.034	NA		NA
680143	680144	YP2160	YP2161	slyA	aRA12	FALSE	0.006	798.000	0.000	1.000		NA
680144	680145	YP2161	YP2162	aRA12		FALSE	0.264	132.000	0.045	NA		NA
680146	680147	YP2163	YP2164		acrR4	FALSE	0.269	223.000	0.128	1.000		NA
680147	680148	YP2164	YP2165	acrR4	nemA2	TRUE	0.793	88.000	0.362	1.000	N	NA
680150	680151	YP2167	YP2168	gloA1	rnt	TRUE	0.458	112.000	0.136	1.000	N	NA
680152	680153	YP2169	YP2170			FALSE	0.318	85.000	0.000	NA		NA
680154	680155	YP2171	YP2172	spr2	sodB	FALSE	0.005	336.000	0.015	NA	N	NA
680155	680156	YP2172	YP2173	sodB	purR5	FALSE	0.005	527.000	0.000	1.000	N	NA
680158	680159	YP2175	YP2176	proP24	cfa	FALSE	0.006	480.000	0.000	1.000	N	NA
680161	680162	YP2178	YP2179		norM2	TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
680162	680163	YP2179	YP_t39	norM2		FALSE	0.080	243.000	0.000	NA		NA
680163	680164	YP_t39	YP_t40			FALSE	0.393	60.000	0.000	NA		NA
680164	680165	YP_t40	YP2180		pykF	FALSE	0.008	572.000	0.000	NA		NA
680165	680166	YP2180	YP_2181	pykF	lpp	FALSE	0.017	321.000	0.000	1.000	N	NA
680166	680167	YP_2181	YP2182	lpp	tnp_23	FALSE	0.130	140.000	0.000	1.000	N	NA
680168	680169	YP2184	YP2185		dnaC_18	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
680170	680171	YP_2186	YP2187		csdB1	TRUE	0.673	89.000	0.183	NA		NA
680171	680172	YP2187	YP2188	csdB1		TRUE	0.939	-15.000	0.193	1.000	N	NA
680172	680173	YP2188	YP_2189		sufC	TRUE	0.993	-25.000	0.482	1.000	Y	NA
680173	680174	YP_2189	YP2190	sufC		TRUE	0.910	186.000	0.466	1.000	Y	NA
680174	680175	YP2190	YP2191		iscA2	TRUE	0.747	15.000	0.041	NA		NA
680175	680176	YP2191	YP2192	iscA2		FALSE	0.221	151.000	0.000	NA		NA
680176	680177	YP2192	YP2193		paaI1	FALSE	0.052	280.000	0.000	NA		NA
680177	680178	YP2193	YP2194	paaI1	glcD3	FALSE	0.401	122.000	0.129	NA	N	NA
680181	680182	YP2197	YP2198		aroH	TRUE	0.530	157.000	0.165	1.000		NA
5438053	680183	YP_2199	YP2200		lplA	TRUE	0.493	40.000	0.000	NA		NA
680183	680184	YP2200	YP2201	lplA	nlpC	FALSE	0.287	125.000	0.091	NA	N	NA
680186	680187	YP_2203	YP2204	rhaT8	rhaT9	TRUE	0.998	-3.000	0.613	0.097		NA
680187	680188	YP2204	YP2205	rhaT9		TRUE	0.993	-3.000	0.227	0.097		NA
680188	680189	YP2205	YP2206		cDA12	TRUE	0.924	-3.000	0.061	1.000	N	NA
680189	680190	YP2206	YP2207	cDA12	wcaG9	TRUE	0.999	-3.000	0.447	1.000	Y	NA
680190	680191	YP2207	YP2208	wcaG9	pmrF	TRUE	0.997	-3.000	0.220	NA	Y	NA
680191	680192	YP2208	YP2209	pmrF	wecE	TRUE	0.994	-13.000	0.378	NA	Y	NA
680192	680193	YP2209	YP2210	wecE	btuD	FALSE	0.056	350.000	0.129	1.000	N	NA
680193	680194	YP2210	YP2211	btuD	btuE	TRUE	0.474	22.000	0.036	1.000	N	NA
680194	680195	YP2211	YP2212	btuE	btuC2	FALSE	0.406	70.000	0.084	1.000	N	NA
680195	680196	YP2212	YP2213	btuC2		FALSE	0.230	158.000	0.044	NA		NA
680196	680197	YP2213	YP2214		ihfA	FALSE	0.030	334.000	0.000	NA		NA
680197	680198	YP2214	YP2215	ihfA	pheT	TRUE	0.968	5.000	0.208	1.000	N	NA
680198	680199	YP2215	YP2216	pheT	pheM	TRUE	0.997	14.000	0.574	0.001	Y	NA
680201	680202	YP2218	YP2219	rplT	rpmI	TRUE	0.996	38.000	0.928	0.013	Y	NA
680202	680203	YP2219	YP2220	rpmI	infC	TRUE	0.970	97.000	0.652	1.000	Y	NA
680203	680204	YP2220	YP2221	infC	thrS	TRUE	0.739	205.000	0.186	1.000	Y	NA
680205	680206	YP2222	YP2223			FALSE	0.016	412.000	0.000	NA		NA
680210	680211	YP2227	YP2228	yfeA	yfeB	TRUE	0.999	-3.000	0.894	1.000	Y	NA
680211	680212	YP2228	YP2229	yfeB	yfeC	TRUE	0.999	0.000	0.857	1.000	Y	NA
680212	680213	YP2229	YP2230	yfeC	yfeD	TRUE	0.999	-3.000	0.525	0.006	Y	NA
680213	680214	YP2230	YP2231	yfeD		FALSE	0.017	305.000	0.033	1.000	N	NA
680217	680218	YP2234	YP2235			FALSE	0.291	96.000	0.000	NA		NA
680218	680219	YP2235	YP2236			TRUE	0.843	8.000	0.000	NA		NA
680219	680220	YP2236	YP2237		ndh	FALSE	0.009	538.000	0.000	NA		NA
680220	680221	YP2237	YP2238	ndh		FALSE	0.029	375.000	0.057	NA		NA
680221	680222	YP2238	YP2239		bglX1	FALSE	0.401	128.000	0.091	NA		NA
680222	680223	YP2239	YP2240	bglX1	cotS	FALSE	0.374	65.000	0.069	1.000	N	NA
680223	680224	YP2240	YP2241	cotS	flgN2	TRUE	0.967	-19.000	0.310	NA		NA
680224	680225	YP2241	YP2242	flgN2		TRUE	0.942	41.000	0.516	NA		NA
680225	680226	YP2242	YP2243		hit	TRUE	0.720	-31.000	0.051	NA		NA
680226	680227	YP2243	YP_2244	hit	aroE	FALSE	0.039	174.000	0.003	1.000	N	NA
680227	680228	YP_2244	YP2245	aroE	tnp_24	FALSE	0.007	443.000	0.000	1.000	N	NA
680228	680229	YP2245	YP2246	tnp_24	ptsG	FALSE	0.131	139.000	0.000	1.000	N	NA
680229	680230	YP2246	YP2247	ptsG	tatD1	FALSE	0.004	306.000	0.004	NA	N	NA
680230	680231	YP2247	YP2248	tatD1	holB	TRUE	0.968	15.000	0.110	NA	Y	NA
680231	680232	YP2248	YP2249	holB	tmk	TRUE	0.910	-27.000	0.211	1.000	N	NA
680232	680233	YP2249	YP2250	tmk		TRUE	0.968	-10.000	0.209	NA		NA
680233	680234	YP2250	YP2251		pabC	FALSE	0.207	289.000	0.204	NA		NA
680234	680235	YP2251	YP2252	pabC	tnp_25	FALSE	0.008	416.000	0.000	1.000	N	NA
680235	680236	YP2252	YP2253	tnp_25	fabF4	FALSE	0.124	149.000	0.000	1.000	N	NA
680236	680237	YP2253	YP2254	fabF4	acpP3	TRUE	0.939	95.000	0.346	1.000	Y	NA
680237	680238	YP2254	YP2255	acpP3	fabG10	TRUE	0.944	154.000	0.321	0.003	Y	NA
680238	680239	YP2255	YP2256	fabG10	fabD2	TRUE	0.996	14.000	0.432	0.003	Y	NA
680239	680240	YP2256	YP2257	fabD2	fabH2	TRUE	0.972	38.000	0.182	0.003	Y	NA
680240	680241	YP2257	YP2258	fabH2	plsX	TRUE	0.998	7.000	0.380	0.003	Y	NA
680241	680242	YP2258	YP2259	plsX	rpmF	TRUE	0.921	34.000	0.418	1.000	N	NA
680242	680243	YP2259	YP2260	rpmF		TRUE	0.986	13.000	0.599	NA		NA
680246	680247	YP2263	YP2264	rne		FALSE	0.133	204.000	0.000	NA		NA
680248	680249	YP2265	YP2266	pyrC	dinI	FALSE	0.033	313.000	0.031	NA		NA
680251	680252	YP2268	YP2269	solA	csgD	FALSE	0.043	240.000	0.000	1.000	N	NA
680253	680254	YP2270	YP2271	perM2		FALSE	0.215	149.000	0.033	NA		NA
680254	680255	YP2271	YP2272			FALSE	0.039	305.000	0.000	NA		NA
680255	680256	YP2272	YP2273			FALSE	0.305	90.000	0.000	NA		NA
680256	680257	YP2273	YP2274		rhaT10	TRUE	0.511	37.000	0.000	NA		NA
680259	680260	YP2276	YP2277	ypeR	lysR13	FALSE	0.110	487.000	0.000	0.053	Y	NA
680261	680262	YP2278	YP2279	proP25		TRUE	0.878	47.000	0.286	1.000		NA
680262	680263	YP2279	YP2280		tas2	TRUE	0.991	11.000	0.714	1.000		NA
680264	680265	YP2281	YP2282			TRUE	0.983	11.000	0.468	NA		NA
680265	680266	YP2282	YP2283			TRUE	0.986	18.000	0.787	NA		NA
680266	680267	YP2283	YP2284			TRUE	0.998	-3.000	0.895	NA		NA
680267	680268	YP2284	YP2285			TRUE	0.505	38.000	0.000	NA		NA
680268	680269	YP2285	YP2286			TRUE	0.563	30.000	0.000	NA		NA
680269	680270	YP2286	YP2287			TRUE	0.997	-3.000	0.707	NA		NA
11527644	680264		YP2281			FALSE	NA	8358.000	0.000	NA		NA
11670007	680264		YP2281			FALSE	NA	8358.000	0.000	NA		NA
11812399	680264		YP2281			FALSE	NA	8358.000	0.000	NA		NA
11527645	680264		YP2281			FALSE	NA	8389.000	0.000	NA		NA
11670008	680264		YP2281			FALSE	NA	8389.000	0.000	NA		NA
11812400	680264		YP2281			FALSE	NA	8389.000	0.000	NA		NA
11527646	680264		YP2281			FALSE	NA	8418.000	0.000	NA		NA
11670009	680264		YP2281			FALSE	NA	8418.000	0.000	NA		NA
11812401	680264		YP2281			FALSE	NA	8418.000	0.000	NA		NA
11527647	680264		YP2281			FALSE	NA	8449.000	0.000	NA		NA
11670010	680264		YP2281			FALSE	NA	8449.000	0.000	NA		NA
11812402	680264		YP2281			FALSE	NA	8449.000	0.000	NA		NA
11527648	680264		YP2281			FALSE	NA	8478.000	0.000	NA		NA
11670011	680264		YP2281			FALSE	NA	8478.000	0.000	NA		NA
11812403	680264		YP2281			FALSE	NA	8478.000	0.000	NA		NA
11527649	680264		YP2281			FALSE	NA	8509.000	0.000	NA		NA
11670012	680264		YP2281			FALSE	NA	8509.000	0.000	NA		NA
11812404	680264		YP2281			FALSE	NA	8509.000	0.000	NA		NA
11527650	680264		YP2281			FALSE	NA	8536.000	0.000	NA		NA
11670013	680264		YP2281			FALSE	NA	8536.000	0.000	NA		NA
11812405	680264		YP2281			FALSE	NA	8536.000	0.000	NA		NA
680271	680272	YP2288	YP2289	mscS1		FALSE	0.110	219.000	0.000	NA		NA
680273	680274	YP2290	YP2291			TRUE	0.499	39.000	0.000	NA		NA
680274	680275	YP2291	YP2292			FALSE	0.257	117.000	0.000	NA		NA
680275	680276	YP2292	YP2293			TRUE	0.586	27.000	0.000	NA		NA
680276	680277	YP2293	YP2294		malG4	TRUE	0.662	147.000	0.000	NA	Y	NA
680277	680278	YP2294	YP2295	malG4	malF4	TRUE	0.999	1.000	0.711	0.054	Y	NA
680278	680279	YP2295	YP2296	malF4	ugpB3	TRUE	0.982	109.000	0.733	0.054	Y	NA
680280	680281	YP2297	YP2298	purR6	manB2	TRUE	0.526	-28.000	0.000	1.000	N	NA
680281	680282	YP2298	YP2299	manB2	mtlK	TRUE	0.823	58.000	0.000	1.000	Y	NA
680283	680284	YP2300	YP2301			FALSE	0.064	258.000	0.000	NA		NA
680284	680285	YP2301	YP2302			FALSE	0.205	160.000	0.000	NA		NA
680285	680286	YP2302	YP2303			FALSE	0.233	142.000	0.000	NA		NA
680286	680287	YP2303	YP2304			FALSE	0.136	203.000	0.000	NA		NA
680287	680288	YP2304	YP_2305		fhaB1	TRUE	0.815	10.000	0.000	NA		NA
680288	680289	YP_2305	YP2306	fhaB1	fhaC2	TRUE	0.652	156.000	0.000	1.000	Y	NA
680289	680290	YP2306	YP2307	fhaC2	hmp1	FALSE	0.003	653.000	0.000	1.000	N	NA
680290	680291	YP2307	YP2308	hmp1	hcaA11	FALSE	0.404	96.000	0.000	0.037	N	NA
680291	680292	YP2308	YP_2309	hcaA11	betT2	TRUE	0.778	33.000	0.167	1.000	N	NA
680292	680293	YP_2309	YP2310	betT2		FALSE	0.009	531.000	0.000	NA		NA
680293	680294	YP2310	YP2311		leuB1	FALSE	0.354	69.000	0.000	NA		NA
680295	680296	YP2312	YP2313	lysR14	purR7	TRUE	0.477	247.000	0.000	0.052	Y	NA
680297	680298	YP2314	YP2315	rbsC1	rbsA2	TRUE	0.997	-3.000	0.111	0.011	Y	NA
680298	680299	YP2315	YP2316	rbsA2	rbsB7	TRUE	0.956	40.000	0.125	0.011	Y	NA
680299	680300	YP2316	YP2317	rbsB7	gutB	FALSE	0.312	175.000	0.125	1.000	N	NA
680300	680301	YP2317	YP2318	gutB		FALSE	0.007	622.000	0.000	NA		NA
680301	680302	YP2318	YP2319			FALSE	0.149	196.000	0.000	NA		NA
680302	680303	YP2319	YP2320		mMT12	FALSE	0.087	238.000	0.000	NA		NA
680303	680304	YP2320	YP2321	mMT12	ompX	FALSE	0.017	316.000	0.000	1.000	N	NA
680305	680306	YP2322	YP2323	rhaT11	rimI1	TRUE	0.675	16.000	0.016	1.000		NA
680306	680307	YP2323	YP2324	rimI1	tam	TRUE	0.820	23.000	0.000	0.042		NA
680307	680308	YP2324	YP2325	tam	dps	FALSE	0.073	257.000	0.000	1.000		NA
680308	680309	YP2325	YP2326	dps		FALSE	0.038	320.000	0.000	1.000		NA
680309	680310	YP2326	YP2327		glnH2	FALSE	0.009	570.000	0.000	1.000		NA
680310	680311	YP2327	YP2328	glnH2	glnP	TRUE	0.949	35.000	0.103	0.075	Y	NA
680311	680312	YP2328	YP2329	glnP	glnQ3	TRUE	0.991	-3.000	0.051	1.000	Y	NA
680313	680314	YP2330	YP2331	atoS2		FALSE	0.007	769.000	0.000	1.000		NA
680316	680317	YP2333	YP2334	trpD2	caiC	FALSE	0.221	66.000	0.000	1.000	N	NA
680317	680318	YP2334	YP2335	caiC	menC	TRUE	0.986	-12.000	0.283	0.001	N	NA
680318	680319	YP2335	YP2336	menC	menB	TRUE	0.998	0.000	0.171	0.001	Y	NA
680319	680320	YP2336	YP2337	menB	mhpC3	TRUE	0.958	14.000	0.280	NA		NA
680320	680321	YP2337	YP2338	mhpC3	menD	TRUE	0.993	-3.000	0.355	NA		NA
680321	680322	YP2338	YP_2339	menD	menF	TRUE	0.751	228.000	0.281	1.000	Y	NA
680322	680323	YP_2339	YP2340	menF		FALSE	0.010	513.000	0.000	NA		NA
680323	680324	YP2340	YP2341		elaB	FALSE	0.009	555.000	0.000	NA		NA
680326	680327	YP2343	YP2344		edd	FALSE	0.367	66.000	0.000	NA		NA
680327	5438054	YP2344	YP_2345	edd		TRUE	0.815	10.000	0.000	NA		NA
5438054	680328	YP_2345	YP2346		proP26	TRUE	0.563	30.000	0.000	NA		NA
680328	680329	YP2346	YP2347	proP26	ldhA2	FALSE	0.174	507.000	0.667	1.000	N	NA
680329	680330	YP2347	YP2348	ldhA2	purR8	FALSE	0.006	466.000	0.000	1.000	N	NA
680331	680332	YP2349	YP2350		idnO	FALSE	0.008	654.000	0.000	1.000		NA
680332	680333	YP2350	YP2351	idnO	idnK	TRUE	0.541	49.000	0.095	1.000	N	NA
680333	680334	YP2351	YP2352	idnK	ebgC2	TRUE	0.838	78.000	0.095	NA	Y	NA
680335	680336	YP2353	YP2354		nuoN	FALSE	0.114	191.000	0.011	NA		NA
680336	680337	YP2354	YP2355	nuoN	nuoM	TRUE	0.998	7.000	0.437	0.001	Y	NA
680337	680338	YP2355	YP2356	nuoM	nuoL	TRUE	0.994	40.000	0.713	0.001	Y	NA
680338	680339	YP2356	YP2357	nuoL	nuoK	TRUE	0.972	42.000	0.211	0.004	Y	NA
680339	680340	YP2357	YP2358	nuoK	nuoJ	TRUE	0.999	-3.000	0.269	0.002	Y	NA
680340	680341	YP2358	YP2359	nuoJ	nuoI	TRUE	0.996	13.000	0.428	0.004	Y	NA
680341	680342	YP2359	YP2360	nuoI	nuoH	TRUE	0.995	15.000	0.423	0.004	Y	NA
680342	680343	YP2360	YP2361	nuoH	nuoG	TRUE	0.999	-3.000	0.664	0.004	Y	NA
680343	680344	YP2361	YP2362	nuoG	nuoF	TRUE	0.938	87.000	0.180	0.004	Y	NA
680344	680345	YP2362	YP2363	nuoF	nuoE	TRUE	0.998	-3.000	0.186	0.004	Y	NA
680345	680346	YP2363	YP2364	nuoE	nuoD	TRUE	0.999	3.000	0.407	0.004	Y	NA
680346	680347	YP2364	YP2365	nuoD	nuoB	TRUE	0.981	141.000	0.691	0.002	Y	NA
680347	680348	YP2365	YP2366	nuoB	nuoA	TRUE	0.967	102.000	0.377	0.002	Y	NA
680348	680349	YP2366	YP2367	nuoA	pecT	FALSE	0.003	678.000	0.000	1.000	N	NA
680349	680350	YP2367	YP2368	pecT		FALSE	0.013	451.000	0.000	NA		NA
680351	680352	YP_2369	YP2370	aat2		FALSE	0.422	151.000	0.104	1.000		NA
680353	680354	YP2371	YP2372		citT2	TRUE	0.586	27.000	0.000	NA		NA
680354	680355	YP2372	YP_2373	citT2		FALSE	0.260	232.000	0.136	1.000		NA
680355	680356	YP_2373	YP_2374			TRUE	0.732	165.000	0.375	NA		NA
680356	680357	YP_2374	YP2375			FALSE	0.189	308.000	0.221	NA		NA
680358	680359	YP2376	YP2377		ackA	TRUE	0.849	-10.000	0.000	NA		NA
680359	680360	YP2377	YP2378	ackA	pta	TRUE	0.853	168.000	0.634	1.000		NA
680362	680363	YP2380	YP2381	ptsN1	sgaB	TRUE	0.853	169.000	0.130	0.006	Y	NA
680363	680364	YP2381	YP2382	sgaB	sgaT	TRUE	0.986	13.000	0.377	0.008		NA
680365	680366	YP2383	YP2384	mutT4		FALSE	0.455	222.000	0.143	0.010		NA
680366	680367	YP2384	YP2385		rtn2	FALSE	0.161	188.000	0.000	NA		NA
680369	680370	YP2387	YP2388	hisP	hisM	TRUE	0.996	14.000	0.643	1.000	Y	NA
680370	680371	YP2388	YP2389	hisM	hisQ	TRUE	1.000	-3.000	0.900	0.016	Y	NA
680371	680372	YP2389	YP2390	hisQ	hisJ	TRUE	0.986	103.000	0.833	0.053	Y	NA
680372	680373	YP2390	YP2391	hisJ	ubiX	FALSE	0.036	252.000	0.000	1.000	N	NA
680373	680374	YP2391	YP2392	ubiX	purF	FALSE	0.073	232.000	0.056	1.000	N	NA
680374	680375	YP2392	YP2393	purF	cvpA	TRUE	0.961	13.000	0.262	1.000		NA
680375	680376	YP2393	YP_2394	cvpA	dedD	FALSE	0.098	312.000	0.116	1.000		NA
680376	680377	YP_2394	YP2395	dedD	folC	TRUE	0.667	120.000	0.216	1.000		NA
680377	680378	YP2395	YP_2396	folC	accD	TRUE	0.677	171.000	0.383	1.000	N	NA
680378	680379	YP_2396	YP2397	accD	dedA1	FALSE	0.073	231.000	0.020	NA		NA
680379	680380	YP2397	YP2398	dedA1	truA	FALSE	0.215	157.000	0.038	NA		NA
680380	680381	YP2398	YP2399	truA	asd1	TRUE	0.881	0.000	0.040	1.000	N	NA
680381	680382	YP2399	YP2400	asd1	pdxB	TRUE	0.819	170.000	0.097	0.009	Y	NA
680382	680383	YP2400	YP2401	pdxB	araC5	TRUE	0.729	-13.000	0.043	1.000	N	NA
680384	680385	YP2402	YP2403	rhaT12	flk	FALSE	0.121	286.000	0.118	NA		NA
680390	680391	YP2408	YP2409			TRUE	0.903	55.000	0.425	NA		NA
680391	680392	YP2409	YP2410			TRUE	0.594	100.000	0.153	NA		NA
680392	680393	YP2410	YP2411		mepA	TRUE	0.973	4.000	0.160	1.000		NA
680393	680394	YP2411	YP2412	mepA	aroC	FALSE	0.386	-36.000	0.025	1.000	N	NA
680394	680395	YP2412	YP2413	aroC	hemK2	FALSE	0.384	74.000	0.081	1.000	N	NA
680397	680398	YP2415	YP2416		sixA	FALSE	0.261	114.000	0.000	NA		NA
680398	680399	YP2416	YP2417	sixA	faoA	FALSE	0.004	568.000	0.000	1.000	N	NA
680399	680400	YP2417	YP2418	faoA	paaJ	TRUE	0.998	-3.000	0.430	1.000	Y	NA
680400	680401	YP2418	YP2419	paaJ		FALSE	0.070	287.000	0.061	NA		NA
680403	680404	YP2421	YP2422	vacJ	nrfG2	TRUE	0.894	24.000	0.239	1.000	N	NA
680404	680405	YP2422	YP2423	nrfG2	ccmH	TRUE	0.999	0.000	0.727	NA	Y	NA
680405	680406	YP2423	YP2424	ccmH	ccmG	TRUE	0.999	-3.000	0.578	NA	Y	NA
680406	680407	YP2424	YP2425	ccmG	ccmF	TRUE	1.000	-3.000	0.804	0.002	Y	NA
680407	680408	YP2425	YP2426	ccmF	ccmE	TRUE	0.998	-3.000	0.211	0.002	Y	NA
680408	680409	YP2426	YP2427	ccmE	ccmD	TRUE	0.991	-3.000	0.344	1.000	N	NA
680409	680410	YP2427	YP2428	ccmD	ccmC2	TRUE	0.995	-3.000	0.501	1.000	N	NA
680410	680411	YP2428	YP2429	ccmC2	ccmB	TRUE	0.986	63.000	0.501	0.001	Y	NA
680411	680412	YP2429	YP2430	ccmB	ccmA3	TRUE	0.993	-57.000	0.503	0.002	Y	NA
680412	680413	YP2430	YP2431	ccmA3		FALSE	0.014	445.000	0.000	NA		NA
680413	680414	YP2431	YP_t41			FALSE	0.068	255.000	0.000	NA		NA
680415	5438055	YP2432	YP_2433	lemA		TRUE	0.882	5.000	0.000	NA		NA
5438055	680416	YP_2433	YP2434		phnA	FALSE	0.021	376.000	0.000	NA		NA
5438056	680417	YP_2435	YP2436			TRUE	0.468	-1371.000	0.000	NA		NA
680417	680418	YP2436	YP2437			FALSE	0.161	188.000	0.000	NA		NA
680418	680419	YP2437	YP2438			TRUE	0.946	113.000	1.000	NA		NA
680419	680420	YP2438	YP2439			TRUE	0.973	40.000	0.833	NA		NA
680420	680421	YP2439	YP2440			TRUE	0.986	0.000	0.200	NA		NA
680421	680422	YP2440	YP2441		vgrG2	TRUE	0.670	99.000	0.200	NA		NA
680422	680423	YP2441	YP2442	vgrG2	icmF2	FALSE	0.045	294.000	0.000	NA		NA
680423	5438057	YP2442	YP_2443	icmF2		FALSE	0.064	258.000	0.000	NA		NA
5438057	680424	YP_2443	YP2444		dnaC_19	FALSE	0.361	67.000	0.000	NA		NA
680424	680425	YP2444	YP2445	dnaC_19		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
680426	680427	YP2447	YP2448	proX	proW3	TRUE	0.991	48.000	0.695	0.053	Y	NA
680427	680428	YP2448	YP2449	proW3	proV2	TRUE	0.999	-7.000	0.630	0.094	Y	NA
680428	680429	YP2449	YP2450	proV2	nrdF	FALSE	0.004	559.000	0.000	1.000	N	NA
680429	680430	YP2450	YP2451	nrdF	nrdE	TRUE	0.918	143.000	0.190	0.002	Y	NA
680430	680431	YP2451	YP2452	nrdE	nrdI	TRUE	0.987	-18.000	0.216	NA	Y	NA
680431	680432	YP2452	YP2453	nrdI	nrdH	TRUE	0.959	-28.000	0.440	NA	N	NA
680433	680434	YP_2454	YP2455	asr2		FALSE	0.012	478.000	0.000	NA		NA
5438059	680435	YP_2456	YP2457		tnpA_3	TRUE	0.518	36.000	0.000	NA		NA
680435	680436	YP2457	YP2458	tnpA_3		TRUE	0.894	-6.000	0.000	NA		NA
680436	680437	YP2458	YP2459			TRUE	0.498	165.000	0.167	NA		NA
680438	680439	YP2460	YP2461	cspB	oppA4	FALSE	0.003	821.000	0.000	1.000	N	NA
680439	680440	YP2461	YP2462	oppA4	dppB3	TRUE	1.000	0.000	1.000	0.053	Y	NA
680440	680441	YP2462	YP2463	dppB3	dppC3	TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.053	Y	NA
680441	680442	YP2463	YP2464	dppC3	dppD2	TRUE	0.999	0.000	1.000	1.000		NA
680442	680443	YP2464	YP2465	dppD2	oppF3	TRUE	0.975	-46.000	0.500	0.019		NA
680443	680444	YP2465	YP2466	oppF3	ureA	FALSE	0.033	1199.000	0.000	1.000	Y	NA
680444	680445	YP2466	YP2467	ureA	ureB	TRUE	0.995	11.000	0.267	0.001	Y	NA
680445	680446	YP2467	YP2468	ureB	ureC	TRUE	0.960	90.000	0.267	0.001	Y	NA
680446	680447	YP2468	YP2469	ureC	ureE	FALSE	0.151	287.000	0.067	0.001	N	NA
680447	680448	YP2469	YP2470	ureE	ureF	TRUE	0.994	22.000	0.460	0.002	Y	NA
680448	680449	YP2470	YP2471	ureF	ureG	TRUE	0.849	127.000	0.064	0.002	Y	NA
680449	5438060	YP2471	YP_2472	ureG	ureD	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
5438060	680450	YP_2472	YP2473	ureD		FALSE	0.156	192.000	0.000	NA		NA
680450	680451	YP2473	YP2474		hoxN	TRUE	0.479	125.000	0.095	0.071	N	NA
680454	680455	YP2477	YP2478	crcB2	crcB3	TRUE	0.988	16.000	0.233	0.094	Y	NA
680455	680456	YP2478	YP2479	crcB3		FALSE	0.307	89.000	0.000	NA		NA
680457	680458	YP2480	YP2481	celA	celB	TRUE	0.994	11.000	0.250	0.006	Y	NA
680458	680459	YP2481	YP2482	celB	celC	TRUE	0.980	167.000	0.833	0.006	Y	NA
680459	680460	YP2482	YP2483	celC	celD	TRUE	0.961	37.000	0.727	1.000	N	NA
680460	680461	YP2483	YP2484	celD		TRUE	0.827	52.000	0.222	1.000		NA
680462	680463	YP2485	YP2486			FALSE	0.266	112.000	0.000	NA		NA
680464	680465	YP_2487	YP2488	seqA	pgm	TRUE	0.768	31.000	0.151	1.000	N	NA
680465	680466	YP2488	YP2489	pgm		FALSE	0.021	374.000	0.000	NA		NA
680467	680468	YP2490	YP2491		kdpE	TRUE	0.579	95.000	0.129	1.000		NA
680468	680469	YP2491	YP2492	kdpE	kdpD1	TRUE	0.660	293.000	0.385	1.000	Y	NA
680469	680470	YP2492	YP2493	kdpD1	kdpC	TRUE	0.926	10.000	0.100	0.094	N	NA
680470	680471	YP2493	YP2494	kdpC	kdpB	TRUE	0.985	164.000	0.877	0.001	Y	NA
680471	680472	YP2494	YP2495	kdpB	kdpA	TRUE	0.945	94.000	0.201	0.001	Y	NA
680473	680474	YP2496	YP2497			FALSE	0.178	178.000	0.000	NA		NA
680474	680475	YP2497	YP2498			TRUE	0.781	-18.000	0.000	NA		NA
680475	680476	YP2498	YP2499		phrB	FALSE	0.195	130.000	0.019	NA		NA
680476	680477	YP2499	YP2500	phrB		TRUE	0.568	-9.000	0.008	1.000	N	NA
680477	680478	YP2500	YP2501			FALSE	0.177	140.000	0.013	NA		NA
680478	5438061	YP2501	YP_2502			FALSE	0.007	619.000	0.000	NA		NA
5438061	680479	YP_2502	YP2503		dUR1	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680479	680480	YP2503	YP2504	dUR1		TRUE	0.894	-42.000	0.211	NA		NA
680480	680481	YP2504	YP2505			TRUE	0.667	85.000	0.173	NA		NA
680481	680482	YP2505	YP2506			TRUE	0.998	-3.000	0.939	NA		NA
680482	680483	YP2506	YP2507		pcp1	TRUE	0.974	10.000	0.300	NA		NA
680485	680486	YP_2509	YP2510		yplA	FALSE	0.194	179.000	0.000	1.000		NA
680486	680487	YP2510	YP2511	yplA	yplB	TRUE	0.850	78.000	0.375	NA		NA
680491	680492	YP2515	YP2516	rpoE	rseA	TRUE	0.970	26.000	0.705	NA	N	NA
680492	680493	YP2516	YP2517	rseA	rseB	TRUE	0.999	0.000	0.856	NA	Y	NA
680493	680494	YP2517	YP2518	rseB	rseC	TRUE	0.999	-3.000	0.609	NA	Y	NA
680496	680497	YP2520	YP2521	lepA	lepB	TRUE	0.957	10.000	0.187	1.000		NA
680497	680498	YP2521	YP2522	lepB	rnc	FALSE	0.072	352.000	0.117	1.000		NA
680498	680499	YP2522	YP2523	rnc	era	TRUE	0.988	-3.000	0.127	0.046		NA
680499	680500	YP2523	YP_2524	era	recO	TRUE	0.922	10.000	0.109	1.000		NA
680500	680501	YP_2524	YP2525	recO	pdxJ	FALSE	0.433	159.000	0.166	1.000	N	NA
680501	680502	YP2525	YP2526	pdxJ	acpS	TRUE	0.990	0.000	0.326	1.000	N	NA
680502	680503	YP2526	YP2527	acpS	tnp_26	FALSE	0.122	151.000	0.000	1.000	N	NA
680504	2214041	YP2528	YP_2529	napF1		FALSE	0.202	162.000	0.000	NA		NA
680505	680506	YP2530	YP2531		dnaC_20	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
680506	680507	YP2531	YP2532	dnaC_20		FALSE	0.007	681.000	0.000	1.000		NA
680507	680508	YP2532	YP_2533		serB2	FALSE	0.343	275.000	0.316	NA		NA
680508	680509	YP_2533	YP2534	serB2		FALSE	0.221	110.000	0.062	NA	N	NA
680512	680513	YP2537	YP2538			FALSE	0.033	323.000	0.000	NA		NA
680514	680515	YP2539	YP2540		tnp_27	TRUE	0.849	-10.000	0.000	NA		NA
680515	680516	YP2540	YP2541	tnp_27	baeS5	FALSE	0.067	206.000	0.000	1.000	N	NA
680516	680517	YP2541	YP2542	baeS5		TRUE	0.965	4.000	0.132	NA		NA
680517	680518	YP2542	YP2543		atoC2	TRUE	0.840	-37.000	0.130	NA		NA
680518	680519	YP2543	YP2544	atoC2	nadE	FALSE	0.336	160.000	0.065	0.099	N	NA
680519	680520	YP2544	YP2545	nadE	glnB	TRUE	0.879	15.000	0.151	1.000	N	NA
5438062	680521	YP_2546	YP2547		hmp2	FALSE	0.015	431.000	0.000	NA		NA
680522	680523	YP2548	YP2549	glyA		FALSE	0.263	113.000	0.000	NA		NA
680523	680524	YP2549	YP2550		ail2	FALSE	0.269	110.000	0.000	NA		NA
680524	680525	YP2550	YP2551	ail2	hcaT	FALSE	0.029	352.000	0.000	1.000		NA
680527	680528	YP2553	YP2554			TRUE	0.957	-9.000	0.150	NA		NA
680530	680531	YP2556	YP2557	lasT		TRUE	0.471	93.000	0.126	1.000	N	NA
680531	680532	YP2557	YP2558		nifS_2	TRUE	0.882	54.000	0.424	1.000	N	NA
680532	680533	YP2558	YP2559	nifS_2	nifU	TRUE	0.933	31.000	0.448	1.000	N	NA
680533	680534	YP2559	YP2560	nifU	iscA3	TRUE	0.576	270.000	0.359	0.002		NA
680534	680535	YP2560	YP2561	iscA3		TRUE	0.648	-34.000	0.000	NA		NA
680535	680536	YP2561	YP_2562		hscB	TRUE	0.585	-46.000	0.000	NA		NA
680536	680537	YP_2562	YP2563	hscB	hscA	TRUE	0.872	243.000	0.634	1.000	Y	NA
680537	680538	YP2563	YP2564	hscA	fdx2	TRUE	0.996	3.000	0.794	1.000	N	NA
680538	680539	YP2564	YP2565	fdx2		TRUE	0.968	30.000	0.625	1.000		NA
680539	680540	YP2565	YP2566		pepB	TRUE	0.580	140.000	0.171	1.000		NA
680540	680541	YP2566	YP2567	pepB	sseB	TRUE	0.779	79.000	0.253	NA		NA
5438064	680543	YP_2570	YP2571		ecpD2	FALSE	0.307	89.000	0.000	NA		NA
680543	680544	YP2571	YP2572	ecpD2	fimA4	TRUE	0.980	139.000	1.000	1.000	Y	NA
680544	680545	YP2572	YP2573	fimA4	clpA3	TRUE	0.880	192.000	1.000	1.000	N	NA
680546	680547	YP2574	YP2575			TRUE	0.998	0.000	0.833	NA		NA
680547	680548	YP2575	YP2576			TRUE	0.951	99.000	1.000	NA		NA
680548	680549	YP2576	YP2577			TRUE	0.994	7.000	0.714	NA		NA
680549	5438065	YP2577	YP_2578			TRUE	0.493	40.000	0.000	NA		NA
5438065	680550	YP_2578	YP2579		mukB2	TRUE	0.560	-54.000	0.000	NA		NA
680550	680551	YP2579	YP2580	mukB2	ompA3	TRUE	0.993	1.000	0.400	NA		NA
680551	680552	YP2580	YP2581	ompA3		TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
680553	680554	YP2582	YP2583	citB3	mltB2	FALSE	0.002	1276.000	0.000	NA	N	NA
680555	680556	YP2584	YP2585	sfuA	sfuB	TRUE	0.994	41.000	0.824	0.053	Y	NA
680556	680557	YP2585	YP2586	sfuB	yfuC	TRUE	0.993	-3.000	0.275	0.053	N	NA
680561	680562	YP2590	YP2591	dmsA2	dmsB2	TRUE	0.997	12.000	0.500	0.036	Y	NA
680562	680563	YP2591	YP2592	dmsB2	dmsC2	TRUE	0.971	-55.000	0.667	1.000		NA
680563	680564	YP2592	YP2593	dmsC2	torD3	FALSE	0.019	404.000	0.000	1.000		NA
680564	680565	YP2593	YP2594	torD3	napF2	TRUE	0.996	-3.000	0.333	0.036		NA
680566	680567	YP2595	YP2596		nrfG3	TRUE	0.998	-3.000	0.740	NA		NA
680567	680568	YP2596	YP2597	nrfG3	csgG	TRUE	0.988	-18.000	0.625	NA		NA
680570	680571	YP2599	YP2600	cybB3	avtA1	FALSE	0.065	132.000	0.009	1.000	N	NA
680573	680574	YP2602	YP2603	glk	putP3	FALSE	0.201	181.000	0.048	NA		NA
680575	680576	YP2604	YP2605	lysR15	tas3	FALSE	0.176	136.000	0.050	1.000	N	NA
680576	680577	YP2605	YP2606	tas3		FALSE	0.179	216.000	0.071	NA		NA
680580	680581	YP_t42	YP_t43			FALSE	0.143	200.000	0.000	NA		NA
680581	680582	YP_t43	YP_t44			TRUE	0.465	45.000	0.000	NA		NA
680582	680583	YP_t44	YP_t45			TRUE	0.511	37.000	0.000	NA		NA
680584	680585	YP2609	YP_t46	gltX		FALSE	0.091	232.000	0.000	NA		NA
680585	680586	YP_t46	YP2610			FALSE	0.160	189.000	0.000	NA		NA
680589	680590	YP2613	YP2614		ligA	TRUE	0.842	-7.000	0.017	NA		NA
680590	680591	YP2614	YP2615	ligA	zipA	FALSE	0.095	91.000	0.013	1.000	N	NA
680592	680593	YP2616	YP2617	cysZ	cysK2	TRUE	0.772	157.000	0.122	1.000	Y	NA
680593	680594	YP2617	YP2618	cysK2	ptsH	FALSE	0.003	499.000	0.019	1.000	N	NA
680594	680595	YP2618	YP2619	ptsH	ptsI	TRUE	0.911	49.000	0.033	0.007	Y	NA
680595	680596	YP2619	YP2620	ptsI	crr	TRUE	0.913	49.000	0.038	0.007	Y	NA
680597	680598	YP2621	YP2622	tnp_28	baeS6	FALSE	0.057	219.000	0.000	1.000	N	NA
680598	680599	YP2622	YP2623	baeS6	cpxR2	TRUE	0.970	26.000	0.216	1.000	Y	NA
680600	680601	YP2624	YP2625	acrA7		TRUE	0.993	4.000	0.439	0.093	N	NA
680602	680603	YP2626	YP2627	hcaD	putP4	FALSE	0.421	60.000	0.000	1.000		NA
680603	680604	YP2627	YP2628	putP4		TRUE	0.993	-3.000	0.357	NA		NA
680604	5438066	YP2628	YP_2629			FALSE	0.231	143.000	0.000	NA		NA
5438066	680605	YP_2629	YP2630		malY	TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
680606	680607	YP2631	YP2632		baeS7	FALSE	0.089	233.000	0.000	NA		NA
680607	680608	YP2632	YP2633	baeS7	ompR2	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
680609	680610	YP2634	YP2635		cysM1	FALSE	0.078	245.000	0.000	NA		NA
680610	680611	YP2635	YP2636	cysM1	cysA	FALSE	0.132	171.000	0.049	1.000	N	NA
680611	680612	YP2636	YP2637	cysA	cysW	TRUE	0.990	-10.000	0.180	1.000	Y	NA
680612	680613	YP2637	YP2638	cysW	cysT	TRUE	0.998	0.000	0.583	0.001	N	NA
680613	680614	YP2638	YP2639	cysT	cysP	TRUE	0.997	0.000	0.479	0.002	N	NA
680614	680615	YP2639	YP2640	cysP	nanT	FALSE	0.018	315.000	0.000	1.000	N	NA
680615	680616	YP2640	YP2641	nanT	rpiR5	FALSE	0.004	605.000	0.000	1.000	N	NA
680616	680617	YP2641	YP2642	rpiR5		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680617	680618	YP2642	YP2643		ebgC3	TRUE	0.493	40.000	0.000	NA		NA
680618	680619	YP2643	YP2644	ebgC3	nagC7	TRUE	0.879	82.000	0.154	NA	Y	NA
680620	680621	YP2645	YP2646		nanE	FALSE	0.142	206.000	0.000	1.000		NA
680621	680622	YP2646	YP2647	nanE	dapA1	TRUE	0.471	57.000	0.087	1.000	N	NA
680623	680624	YP2648	YP2649			TRUE	0.757	130.000	0.333	NA		NA
680625	680626	YP2650	YP2651			FALSE	0.011	487.000	0.000	NA		NA
680630	680631	YP2655	YP2656	hemF		TRUE	0.909	0.000	0.016	NA		NA
680632	680633	YP2657	YP2658	sfcA2	mutT5	FALSE	0.290	196.000	0.047	0.005	N	NA
680633	680634	YP2658	YP2659	mutT5	napC	FALSE	0.171	185.000	0.070	1.000	N	NA
680634	680635	YP2659	YP_2660	napC	napB	TRUE	0.996	10.000	0.490	NA	Y	NA
680635	680636	YP_2660	YP2661	napB	napA	TRUE	0.752	83.000	0.031	NA	Y	NA
680636	680637	YP2661	YP2662	napA	napD	TRUE	0.998	-3.000	0.875	NA	N	NA
680637	680638	YP2662	YP2663	napD	napF3	TRUE	0.954	-16.000	0.209	NA		NA
680641	680642	YP2666	YP2667	acrD		FALSE	0.092	231.000	0.000	NA		NA
680642	680643	YP2667	YP2668			FALSE	0.047	289.000	0.000	NA		NA
5438067	680644	YP_2669	YP2670			FALSE	0.012	478.000	0.000	NA		NA
680644	5438068	YP2670	YP_2671			TRUE	0.648	-34.000	0.000	NA		NA
5438068	680645	YP_2671	YP2672		tbpA2	FALSE	0.293	95.000	0.000	NA		NA
680646	680647	YP2673	YP2674	nrfG4	arsC1	FALSE	0.162	160.000	0.006	1.000		NA
680647	680648	YP2674	YP2675	arsC1	dapE	TRUE	0.986	2.000	0.292	1.000	N	NA
680648	680649	YP2675	YP2676	dapE	vanY	TRUE	0.987	-3.000	0.163	0.022	N	NA
680649	680650	YP2676	YP_2677	vanY		TRUE	0.634	68.000	0.130	NA		NA
680651	680652	YP2678	YP2679			TRUE	0.963	2.000	0.100	NA		NA
680652	680653	YP2679	YP2680			FALSE	0.239	94.000	0.018	NA		NA
680653	680654	YP2680	YP2681		purC	FALSE	0.083	219.000	0.004	1.000		NA
680654	680655	YP2681	YP2682	purC	tnp_29	FALSE	0.126	148.000	0.000	1.000	N	NA
680655	680656	YP2682	YP2683	tnp_29	dapX	FALSE	0.114	124.000	0.000	NA	N	NA
680656	680657	YP2683	YP2684	dapX	dapA2	TRUE	0.945	15.000	0.032	NA	Y	NA
680658	680659	YP_2685	YP2686	gcvR	bcp	TRUE	0.956	0.000	0.102	1.000	N	NA
680660	680661	YP2687	YP2688			TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
680664	680665	YP2691	YP2692	htpX2	arsC2	TRUE	0.983	5.000	0.259	1.000		NA
680666	680667	YP2693	YP2694	dnaA1	tnp_30	TRUE	0.605	176.000	0.000	1.000	Y	NA
680667	680668	YP2694	YP_2695	tnp_30	upp	FALSE	0.136	125.000	0.000	1.000	N	NA
680669	680670	YP_2696	YP2697	purI	purN	TRUE	0.941	115.000	0.230	0.002	Y	NA
680670	680671	YP2697	YP2698	purN	speG	FALSE	0.027	229.000	0.017	1.000	N	NA
5438069	680672	YP_2699	YP2700	fliB	pstB1	FALSE	0.067	256.000	0.000	NA		NA
680672	680673	YP2700	YP2701	pstB1	pstA1	TRUE	0.993	28.000	0.511	0.002	Y	NA
680673	680674	YP2701	YP2702	pstA1	pstC1	TRUE	0.997	-3.000	0.489	0.092		NA
680675	680676	YP2703	YP2704	ppk	ppx	TRUE	0.995	11.000	0.486	1.000	Y	NA
680676	680677	YP2704	YP2705	ppx		FALSE	0.300	112.000	0.047	NA		NA
680677	680678	YP2705	YP2706		mgtE	FALSE	0.386	52.000	0.024	NA		NA
680678	680679	YP2706	YP2707	mgtE	dnaK1	FALSE	0.131	137.000	0.000	1.000	N	NA
680680	680681	YP2708	YP2709	potC2	potB2	TRUE	0.925	47.000	0.072	0.052	Y	NA
680681	680682	YP2709	YP2710	potB2	potD	TRUE	0.954	-34.000	0.000	0.052	Y	NA
680682	680683	YP2710	YP2711	potD	goaG	TRUE	0.837	53.000	0.000	1.000	Y	NA
680684	680685	YP2712	YP2713	aRO83		FALSE	0.132	374.000	0.000	1.000	Y	NA
680685	680686	YP2713	YP2714		acrA8	FALSE	0.012	364.000	0.000	1.000	N	NA
680686	680687	YP2714	YP2715	acrA8	acrB3	TRUE	0.998	0.000	1.000	1.000	N	NA
680687	680688	YP2715	YP2716	acrB3	acrB4	TRUE	0.993	-3.000	0.094	NA	Y	NA
680688	680689	YP2716	YP2717	acrB4	yegB	TRUE	0.939	34.000	0.438	NA		NA
680689	680690	YP2717	YP2718	yegB	baeS8	TRUE	0.624	85.000	0.139	1.000		NA
680690	680691	YP2718	YP2719	baeS8	ompR3	TRUE	0.997	10.000	0.591	1.000	Y	NA
680691	680692	YP2719	YP2720	ompR3		FALSE	0.392	92.000	0.062	NA		NA
680692	680693	YP2720	YP2721			FALSE	0.037	275.000	0.008	NA		NA
680693	680694	YP2721	YP2722		bmrU	FALSE	0.004	636.000	0.000	1.000	N	NA
680698	5438070	YP2726	YP_2727			FALSE	0.397	59.000	0.000	NA		NA
680700	680701	YP2729	YP2730	proP27		FALSE	0.285	99.000	0.000	NA		NA
680701	680702	YP2730	YP2731			FALSE	0.017	403.000	0.000	NA		NA
680702	680703	YP2731	YP2732			TRUE	0.505	38.000	0.000	NA		NA
680703	680704	YP2732	YP2733			FALSE	0.376	64.000	0.000	NA		NA
680704	680705	YP2733	YP2734		hcp6	TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
680706	680707	YP2735	YP2736	tnp_31	guaA	FALSE	0.016	324.000	0.000	1.000	N	NA
680707	680708	YP2736	YP2737	guaA	guaB	TRUE	0.711	180.000	0.190	0.001		NA
680710	680711	YP2739	YP2740			TRUE	0.522	49.000	0.055	NA		NA
680711	680712	YP2740	YP2741			FALSE	0.047	347.000	0.003	0.069		NA
680712	680713	YP2741	YP2742			TRUE	0.619	148.000	0.203	1.000		NA
680713	680714	YP2742	YP2743			TRUE	0.983	12.000	0.492	1.000		NA
680714	680715	YP2743	YP2744		hisS	TRUE	0.957	14.000	0.259	1.000		NA
680715	680716	YP2744	YP2745	hisS	gcpE	FALSE	0.362	209.000	0.207	1.000	N	NA
680716	680717	YP2745	YP2746	gcpE		TRUE	0.807	62.000	0.233	1.000		NA
680717	680718	YP2746	YP2747		pilF	TRUE	0.957	-10.000	0.153	1.000		NA
680718	680719	YP2747	YP2748	pilF		FALSE	0.324	154.000	0.067	1.000		NA
680719	680720	YP2748	YP2749		ndk	FALSE	0.213	262.000	0.156	1.000		NA
680720	680721	YP2749	YP2750	ndk		FALSE	0.032	327.000	0.000	NA		NA
680722	680723	YP2751	YP2752		yapA	FALSE	0.049	284.000	0.000	NA		NA
680723	5438071	YP2752	YP_2753	yapA	yapB4	FALSE	0.009	558.000	0.000	NA		NA
5438072	680725	YP_2755	YP2756		fimA5	TRUE	0.806	-15.000	0.000	NA		NA
680725	680726	YP2756	YP2757	fimA5		TRUE	0.923	84.000	0.667	NA		NA
680726	680727	YP2757	YP2758			TRUE	0.997	3.000	0.800	NA		NA
680727	680728	YP2758	YP2759			TRUE	0.596	242.000	0.500	NA		NA
680728	680729	YP2759	YP2760			TRUE	0.567	214.000	0.333	NA		NA
680729	680730	YP2760	YP2761			TRUE	0.997	4.000	0.833	NA		NA
680730	5438073	YP2761	YP_2762			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
5438073	680731	YP_2762	YP2763			FALSE	0.316	86.000	0.000	NA		NA
680731	680732	YP2763	YP2764		dnaC_21	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
680734	680735	YP_t47	YP2767		dnaQ	FALSE	0.263	113.000	0.000	NA		NA
680738	680739	YP2770	YP_2771	gloB3	mltD	TRUE	0.888	33.000	0.233	1.000		NA
680740	680741	YP2772	YP2773			FALSE	0.024	364.000	0.000	NA		NA
680741	680742	YP2773	YP2774		aRA13	TRUE	0.524	35.000	0.000	NA		NA
680742	680743	YP2774	YP_t48	aRA13		FALSE	0.025	359.000	0.000	NA		NA
680743	5438075	YP_t48	YP_r10			FALSE	0.256	118.000	0.000	NA		NA
5438075	5438076	YP_r10	YP_r11			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
5438076	680746	YP_r11	YP_t49			FALSE	0.070	253.000	0.000	NA		NA
680746	5438077	YP_t49	YP_r12			FALSE	0.198	164.000	0.000	NA		NA
5438077	680748	YP_r12	YP2775		hisB2	FALSE	0.012	469.000	0.000	NA		NA
680749	680750	YP2776	YP2777	abc2		TRUE	0.998	-7.000	0.584	1.000	Y	NA
680750	680751	YP2777	YP2778		nlpA2	TRUE	0.962	64.000	0.411	NA	Y	NA
680751	680752	YP2778	YP2779	nlpA2	rcsF	TRUE	0.850	118.000	0.500	NA		NA
680752	680753	YP2779	YP2780	rcsF		TRUE	0.989	-3.000	0.247	NA		NA
680753	680754	YP2780	YP2781		proS	FALSE	0.316	104.000	0.048	NA		NA
680755	680756	YP2782	YP2783	cutF	prfB1	FALSE	0.457	40.000	0.027	NA		NA
680756	680757	YP2783	YP2784	prfB1		TRUE	0.766	-21.000	0.034	1.000		NA
680758	680759	YP2785	YP2786			TRUE	0.954	-13.000	0.179	NA		NA
680760	680761	YP2787	YP2788		mesJ2	FALSE	0.018	237.000	0.005	1.000	N	NA
680761	680762	YP2788	YP2789	mesJ2	gloA2	TRUE	0.657	2.000	0.015	NA	N	NA
680762	680763	YP2789	YP2790	gloA2	accA	FALSE	0.027	184.000	0.008	NA	N	NA
680763	680764	YP2790	YP2791	accA	dnaE	TRUE	0.864	13.000	0.122	1.000	N	NA
680764	680765	YP2791	YP2792	dnaE	rnhB	TRUE	0.782	130.000	0.104	1.000	Y	NA
680765	680766	YP2792	YP2793	rnhB	lpxB	TRUE	0.980	-3.000	0.186	1.000	N	NA
680766	680767	YP2793	YP2794	lpxB	lpxA	TRUE	0.996	4.000	0.289	1.000	Y	NA
680767	680768	YP2794	YP2795	lpxA	fabZ2	TRUE	0.996	4.000	0.850	1.000	N	NA
680768	680769	YP2795	YP2796	fabZ2	lpxD	TRUE	0.878	158.000	0.796	1.000	N	NA
680769	680770	YP2796	YP2797	lpxD	hlpA	TRUE	0.999	4.000	0.814	1.000	Y	NA
680770	680771	YP2797	YP2798	hlpA		TRUE	0.957	65.000	0.354	1.000	Y	NA
680771	680772	YP2798	YP2799			TRUE	0.955	37.000	0.204	1.000	Y	NA
680772	680773	YP2799	YP2800		cdsA2	TRUE	0.608	29.000	0.080	1.000	N	NA
680773	680774	YP2800	YP2801	cdsA2	uppS	TRUE	0.995	10.000	0.400	1.000	Y	NA
680774	680775	YP2801	YP_2802	uppS	dxr	FALSE	0.418	224.000	0.025	1.000	Y	NA
680775	680776	YP_2802	YP2803	dxr		TRUE	0.503	-76.000	0.000	NA		NA
680776	680777	YP2803	YP2804		frr	FALSE	0.305	90.000	0.000	NA		NA
680777	680778	YP2804	YP2805	frr	pyrH	TRUE	0.849	136.000	0.626	1.000	N	NA
680778	680779	YP2805	YP2806	pyrH	tsf	TRUE	0.586	209.000	0.416	1.000	N	NA
680779	680780	YP2806	YP_2807	tsf	rpsB	TRUE	0.970	128.000	0.748	1.000	Y	NA
680781	680782	YP2808	YP2809	ampM	glnD	TRUE	0.981	3.000	0.243	1.000	N	NA
680782	680783	YP2809	YP_2810	glnD	dapD	FALSE	0.248	175.000	0.097	1.000	N	NA
680783	680784	YP_2810	YP2811	dapD	smc2	FALSE	0.244	124.000	0.035	NA		NA
680785	680786	YP2812	YP2813	fldA3	rluA2	TRUE	0.847	28.000	0.209	1.000	N	NA
680786	680787	YP2813	YP2814	rluA2		TRUE	0.996	0.000	0.518	NA		NA
680787	680788	YP2814	YP2815		tnp_32	FALSE	0.259	116.000	0.000	NA		NA
680788	680789	YP2815	YP_s5	tnp_32	csrB	FALSE	0.293	95.000	0.000	NA		NA
680789	680790	YP_s5	YP2816	csrB	syd	FALSE	0.062	263.000	0.000	NA		NA
680791	680792	YP2817	YP2818			FALSE	0.338	153.000	0.079	NA		NA
680792	680793	YP2818	YP2819		xni	FALSE	0.232	260.000	0.178	NA		NA
680794	680795	YP2820	YP2821			TRUE	0.962	-7.000	0.144	NA		NA
680795	680796	YP2821	YP2822		gcvA	FALSE	0.364	142.000	0.081	NA		NA
680797	680798	YP2823	YP2824	csdB2		TRUE	0.697	135.000	0.122	0.001		NA
680799	680800	YP2825	YP2826		mltA	FALSE	0.085	143.000	0.021	1.000	N	NA
680801	680802	YP_t50	YP_t51			FALSE	0.246	124.000	0.000	NA		NA
680804	680805	YP2828	YP2829	argA		FALSE	0.409	27.000	0.000	1.000	N	NA
680805	680806	YP2829	YP2830		dnaC_22	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5438078	680807	YP_2831	YP2832			FALSE	0.190	169.000	0.000	NA		NA
680807	680808	YP2832	YP2833			TRUE	0.889	70.000	0.444	1.000		NA
680808	680809	YP2833	YP2834			TRUE	0.770	100.000	0.286	1.000		NA
680809	680810	YP2834	YP2835			TRUE	0.646	22.000	0.000	NA		NA
680810	680811	YP2835	YP2836			FALSE	0.019	389.000	0.000	NA		NA
680812	680813	YP2837	YP2838	cynT2		FALSE	0.006	743.000	0.000	NA		NA
680813	680814	YP2838	YP2839			TRUE	0.963	38.000	0.667	NA		NA
680814	680815	YP2839	YP2840		gspD3	TRUE	0.926	81.000	0.667	NA		NA
680815	680816	YP2840	YP2841	gspD3	gspE	TRUE	0.994	-3.000	0.012	0.003	Y	NA
680816	680817	YP2841	YP2842	gspE	hofF	TRUE	0.998	-19.000	0.653	0.003	Y	NA
680817	680818	YP2842	YP2843	hofF	hofG1	TRUE	0.996	20.000	0.599	0.003	Y	NA
680818	680819	YP2843	YP2844	hofG1	hofG2	TRUE	0.967	-43.000	0.087	0.003	Y	NA
680819	680820	YP2844	YP2845	hofG2	hofG3	TRUE	0.883	38.000	0.132	0.003		NA
680820	680821	YP2845	YP2846	hofG3	hofG4	TRUE	0.989	-28.000	0.569	0.003		NA
680821	680822	YP2846	YP2847	hofG4	gspK	TRUE	0.996	9.000	0.461	1.000	Y	NA
680822	680823	YP2847	YP2848	gspK	gspL	TRUE	0.997	-16.000	0.537	0.069	Y	NA
680823	680824	YP2848	YP2849	gspL		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680824	680825	YP2849	YP2850		pppA1	TRUE	0.585	-46.000	0.000	NA		NA
2214056	680827	YP_2852	YP2853			TRUE	0.460	-1576.000	0.000	NA		NA
680827	680828	YP2853	YP2854			FALSE	0.024	365.000	0.000	NA		NA
680828	680829	YP2854	YP2855		cheD2	FALSE	0.230	146.000	0.000	NA		NA
680830	680831	YP2856	YP2857		gloB4	TRUE	0.595	113.000	0.157	1.000		NA
680832	680833	YP2858	YP2859	lysR16	araJ	FALSE	0.011	369.000	0.000	1.000	N	NA
680837	680838	YP2863	YP2864	bisC	aas	FALSE	0.007	449.000	0.000	1.000	N	NA
680838	680839	YP2864	YP2865	aas	proP28	TRUE	0.976	-3.000	0.124	NA		NA
680842	680843	YP2868	YP2869	tas4	mutH	FALSE	0.006	371.000	0.015	1.000	N	NA
680844	680845	YP2870	YP2871			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680845	680846	YP2871	YP2872		mutT6	TRUE	0.495	26.000	0.008	NA		NA
680846	680847	YP2872	YP2873	mutT6	ptsP	FALSE	0.434	13.000	0.012	1.000	N	NA
680847	680848	YP2873	YP2874	ptsP	lgt	FALSE	0.014	251.000	0.003	1.000	N	NA
680848	680849	YP2874	YP2875	lgt	thyA	TRUE	0.945	7.000	0.164	1.000	N	NA
680849	680850	YP2875	YP2876	thyA		TRUE	0.554	31.000	0.000	NA		NA
680850	680851	YP2876	YP2877		hofG5	TRUE	0.822	-13.000	0.000	NA		NA
680851	680852	YP2877	YP2878	hofG5	hofG6	TRUE	0.976	-9.000	0.000	NA	Y	NA
680852	680853	YP2878	YP2879	hofG6		TRUE	0.994	-3.000	0.373	NA		NA
680853	680854	YP2879	YP2880		hofG7	TRUE	0.990	-12.000	0.538	NA		NA
680854	680855	YP2880	YP2881	hofG7	recC	FALSE	0.241	135.000	0.076	NA	N	NA
680855	680856	YP2881	YP2882	recC	ptrA	FALSE	0.404	82.000	0.092	1.000	N	NA
680856	680857	YP2882	YP2883	ptrA	recB	TRUE	0.600	-66.000	0.092	1.000	N	NA
680857	680858	YP2883	YP2884	recB	recD	TRUE	1.000	-3.000	0.688	0.001	Y	NA
680859	680860	YP2885	YP2886	dnaC_23		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
680860	680861	YP2886	YP2887			FALSE	0.052	279.000	0.000	NA		NA
680861	680862	YP2887	YP2888			FALSE	0.163	289.000	0.161	NA		NA
680862	680863	YP2888	YP2889			TRUE	0.985	-3.000	0.185	NA		NA
680863	680864	YP2889	YP2890			TRUE	0.980	3.000	0.185	NA		NA
680864	680865	YP2890	YP2891			TRUE	0.882	5.000	0.000	NA		NA
680865	680866	YP2891	YP2892			TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
680866	680867	YP2892	YP2893		secD2	TRUE	0.899	124.000	0.684	NA		NA
680867	680868	YP2893	YP2894	secD2	dedA2	TRUE	0.974	-3.000	0.118	NA		NA
680868	680869	YP2894	YP2895	dedA2		FALSE	0.053	278.000	0.000	NA		NA
680869	680870	YP2895	YP_2896		exuR	FALSE	0.141	201.000	0.000	NA		NA
680870	680871	YP_2896	YP2897	exuR	exuT1	FALSE	0.413	263.000	0.433	1.000	N	NA
680872	680873	YP2898	YP_2899		uxaC	FALSE	0.009	531.000	0.000	NA		NA
680873	680874	YP_2899	YP2900	uxaC	uxaB	TRUE	0.645	199.000	0.095	1.000	Y	NA
680874	680875	YP2900	YP2901	uxaB	uxaA	TRUE	0.981	11.000	0.126	1.000	Y	NA
680875	680876	YP2901	YP2902	uxaA		FALSE	0.457	153.000	0.126	NA		NA
680877	680878	YP2903	YP2904	tnp_33	sstT	FALSE	0.123	150.000	0.000	1.000	N	NA
680878	680879	YP2904	YP2905	sstT	mviM5	FALSE	0.013	472.000	0.000	1.000		NA
680879	680880	YP2905	YP2906	mviM5		FALSE	0.178	218.000	0.072	NA		NA
680880	680881	YP2906	YP2907			FALSE	0.086	239.000	0.000	NA		NA
680883	680884	YP2909	YP2910	fadH	hdeD	FALSE	0.182	186.000	0.000	1.000		NA
680886	680887	YP2912	YP2913	sPS1		TRUE	0.948	32.000	0.452	1.000		NA
680887	5438079	YP2913	YP_2914			FALSE	0.409	56.000	0.000	NA		NA
5438079	680888	YP_2914	YP2915			FALSE	0.280	102.000	0.000	NA		NA
680888	680889	YP2915	YP2916		terX	TRUE	0.818	-61.000	0.164	NA		NA
680889	680890	YP2916	YP2917	terX	terY	TRUE	0.857	33.000	0.200	NA		NA
680891	680892	YP2918	YP2919	fhaC3	fhaB2	TRUE	0.851	45.000	0.000	NA	Y	NA
680892	680893	YP2919	YP2920	fhaB2		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680893	680894	YP2920	YP2921			FALSE	0.059	266.000	0.000	NA		NA
680894	680895	YP2921	YP2922			FALSE	0.330	81.000	0.000	NA		NA
680895	680896	YP2922	YP2923		fhaB3	TRUE	0.540	33.000	0.000	NA		NA
680897	680898	YP2924	YP2925	yapF		FALSE	0.421	60.000	0.000	1.000		NA
680898	680899	YP2925	YP2926			FALSE	0.219	102.000	0.016	NA		NA
680900	680901	YP2927	YP2928			TRUE	0.762	83.000	0.030	1.000	Y	NA
680901	680902	YP2928	YP2929		purR10	FALSE	0.288	109.000	0.073	1.000	N	NA
680902	680903	YP2929	YP2930	purR10	ugpB4	TRUE	0.560	41.000	0.089	1.000	N	NA
680903	680904	YP2930	YP2931	ugpB4	malF5	TRUE	0.991	54.000	0.733	0.051	Y	NA
680904	680905	YP2931	YP2932	malF5	malG5	TRUE	0.996	0.000	0.105	0.051	Y	NA
680905	680906	YP2932	YP2933	malG5		TRUE	0.994	-3.000	0.375	NA		NA
680906	680907	YP2933	YP2934		bglX2	TRUE	0.897	51.000	0.375	NA		NA
680908	680909	YP2935	YP2936	cyaE		TRUE	0.996	5.000	0.750	NA		NA
680909	680910	YP2936	YP2937		emrK1	TRUE	0.936	116.000	0.889	NA		NA
680910	680911	YP2937	YP2938	emrK1		TRUE	0.993	10.000	0.778	NA		NA
680911	680912	YP2938	YP2939			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680913	680914	YP2940	YP2941	avtA2	nhaC	TRUE	0.970	-7.000	0.222	1.000	N	NA
680914	680915	YP2941	YP2942	nhaC		TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
680915	680916	YP2942	YP2943			FALSE	0.238	134.000	0.000	NA		NA
680916	680917	YP2943	YP2944		tdcF3	TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
680917	680918	YP2944	YP2945	tdcF3	tdcF4	FALSE	0.253	285.000	0.000	NA	Y	NA
680919	680920	YP2946	YP2947			FALSE	0.063	260.000	0.000	NA		NA
680921	5438080	YP2948	YP_2949	lysR18		FALSE	0.022	373.000	0.000	NA		NA
680923	680924	YP2951	YP2952			FALSE	0.238	133.000	0.000	NA		NA
680924	680925	YP2952	YP2953			TRUE	0.659	-33.000	0.000	NA		NA
680925	680926	YP2953	YP2954			TRUE	0.657	21.000	0.000	NA		NA
680926	5438081	YP2954	YP_2955			TRUE	0.698	17.000	0.000	NA		NA
5438081	680927	YP_2955	YP2956			TRUE	0.465	-1404.000	0.000	NA		NA
680927	680928	YP2956	YP2957			FALSE	0.163	187.000	0.000	NA		NA
680929	680930	YP_t52	YP2958		rpoD	FALSE	0.149	196.000	0.000	NA		NA
680930	680931	YP2958	YP2959	rpoD	dnaG	TRUE	0.721	101.000	0.299	1.000	N	NA
680931	680932	YP2959	YP2960	dnaG	rpsU	FALSE	0.232	136.000	0.067	1.000	N	NA
680935	680936	YP2963	YP2964	folB	bacA	FALSE	0.113	274.000	0.128	1.000	N	NA
680937	680938	YP2965	YP2966	cca		FALSE	0.281	160.000	0.106	NA	N	NA
680939	680940	YP2967	YP_2968		glnE	FALSE	0.249	171.000	0.053	1.000		NA
680940	680941	YP_2968	YP2969	glnE	rfaE	FALSE	0.293	120.000	0.083	1.000	N	NA
680941	680942	YP2969	YP2970	rfaE	asoB	FALSE	0.227	31.000	0.012	1.000	N	NA
680943	680944	YP2971	YP2972			FALSE	0.411	36.000	0.007	NA		NA
680945	680946	YP2973	YP2974	ribB		FALSE	0.017	459.000	0.048	1.000		NA
680947	680948	YP2975	YP2976	gsp		TRUE	0.990	10.000	0.632	NA		NA
680951	680952	YP2979	YP2980	mutT7		TRUE	0.940	34.000	0.443	NA		NA
680952	680953	YP2980	YP2981		icc	TRUE	0.868	82.000	0.433	NA		NA
680953	680954	YP2981	YP2982	icc		TRUE	0.995	-3.000	0.427	NA		NA
680954	680955	YP2982	YP2983		parE	TRUE	0.689	102.000	0.217	NA		NA
680955	680956	YP2983	YP2984	parE	lysR19	TRUE	0.734	4.000	0.022	1.000	N	NA
680957	680958	YP2985	YP2986	mdaB3		FALSE	0.346	73.000	0.000	NA		NA
680959	680960	YP2987	YP2988	parC	plsC2	FALSE	0.028	289.000	0.043	1.000	N	NA
680960	680961	YP2988	YP2989	plsC2	sufI2	FALSE	0.370	179.000	0.154	1.000	N	NA
680961	5438082	YP2989	YP_2990	sufI2		FALSE	0.038	308.000	0.000	NA		NA
680966	680967	YP2995	YP2996	dedA3	metC3	TRUE	0.502	193.000	0.212	NA		NA
680968	680969	YP2997	YP2998	exbB	exbD	TRUE	0.999	4.000	0.810	0.071	Y	NA
680970	680971	YP2999	YP3000			TRUE	0.963	25.000	0.500	NA		NA
680971	680972	YP3000	YP3001			TRUE	0.952	-16.000	0.200	NA		NA
680972	680973	YP3001	YP3002		nrfG5	TRUE	0.997	-3.000	0.667	NA		NA
680973	680974	YP3002	YP3003	nrfG5		TRUE	0.991	-16.000	0.273	1.000	Y	NA
680974	680975	YP3003	YP3004			TRUE	1.000	-3.000	0.909	0.011	Y	NA
680975	680976	YP3004	YP3005			TRUE	0.999	-3.000	0.800	1.000	Y	NA
680976	680977	YP3005	YP3006			TRUE	0.997	12.000	0.727	NA	Y	NA
680977	5438083	YP3006	YP_3007			FALSE	0.155	193.000	0.000	NA		NA
5438083	680978	YP_3007	YP3008			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
680978	680979	YP3008	YP3009		pppA2	TRUE	0.818	52.000	0.222	NA		NA
680980	5438084	YP3010	YP_3011	tnp_34		FALSE	0.026	353.000	0.000	NA		NA
5438084	680981	YP_3011	YP3012		fimC6	TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
680981	680982	YP3012	YP3013	fimC6		TRUE	0.916	25.000	0.000	1.000	Y	NA
680985	5438085	YP3016	YP_3017			FALSE	0.180	176.000	0.000	NA		NA
5438085	680986	YP_3017	YP3018		flhB3	TRUE	0.600	-43.000	0.000	NA		NA
680986	680987	YP3018	YP3019	flhB3	fliR3	TRUE	1.000	0.000	1.000	0.089	Y	NA
680987	680988	YP3019	YP3020	fliR3	fliQ3	TRUE	0.997	7.000	0.281	0.003	Y	NA
680988	680989	YP3020	YP3021	fliQ3	fliP3	TRUE	0.998	2.000	0.263	0.011	Y	NA
680989	680990	YP3021	YP3022	fliP3	fliN2	TRUE	0.999	-3.000	0.368	0.089	Y	NA
680990	680991	YP3022	YP3023	fliN2	fliM	TRUE	0.954	-7.000	0.123	NA		NA
680992	680993	YP3024	YP3025	atoC3	fliE2	TRUE	0.974	17.000	0.576	1.000	N	NA
680993	680994	YP3025	YP3026	fliE2	fliF3	TRUE	0.999	10.000	1.000	0.010	Y	NA
680994	680995	YP3026	YP3027	fliF3	fliG2	TRUE	0.998	-28.000	0.970	0.010	Y	NA
680995	680996	YP3027	YP3028	fliG2	fliH2	TRUE	0.998	-22.000	0.789	0.006	Y	NA
680996	680997	YP3028	YP3029	fliH2	fliI3	TRUE	0.999	-7.000	0.816	1.000	Y	NA
680997	680998	YP3029	YP3030	fliI3	nlpD4	TRUE	0.906	4.000	0.035	1.000		NA
680999	681000	YP3031	YP3032			TRUE	0.996	7.000	0.585	0.003		NA
681000	681001	YP3032	YP_3033		flgA	FALSE	0.212	229.000	0.113	NA		NA
681002	681003	YP3034	YP3035	flgB2	flgC2	TRUE	1.000	3.000	0.972	0.005	Y	NA
681003	681004	YP3035	YP3036	flgC2	flgD2	TRUE	0.999	3.000	0.914	NA	Y	NA
681004	681005	YP3036	YP3037	flgD2	flgE2	TRUE	0.990	55.000	0.970	NA	Y	NA
681005	681006	YP3037	YP3038	flgE2	flgF2	TRUE	1.000	0.000	1.000	0.005	Y	NA
681006	681007	YP3038	YP3039	flgF2	flgG2	TRUE	0.994	68.000	0.971	0.001	Y	NA
681007	681008	YP3039	YP3040	flgG2	flgH2	TRUE	0.996	35.000	0.941	0.010	Y	NA
681008	681009	YP3040	YP3041	flgH2	flgI2	TRUE	0.999	14.000	0.912	0.011	Y	NA
681009	681010	YP3041	YP3042	flgI2	flgJ2	TRUE	0.985	10.000	0.457	NA		NA
681010	681011	YP3042	YP3043	flgJ2	flgK2	TRUE	0.839	113.000	0.457	NA		NA
681011	5438086	YP3043	YP_3044	flgK2		TRUE	0.596	26.000	0.000	NA		NA
5438086	681012	YP_3044	YP3045			TRUE	0.780	12.000	0.000	NA		NA
681013	681014	YP3046	YP3047			TRUE	0.990	-19.000	0.714	NA		NA
5438087	681015	YP_3048	YP3049	flaA1	fliD2	FALSE	0.107	220.000	0.000	NA		NA
681015	681016	YP3049	YP3050	fliD2	fliS2	TRUE	0.999	10.000	0.865	0.003	Y	NA
681016	681017	YP3050	YP3051	fliS2		TRUE	0.938	2.000	0.054	NA		NA
681017	681018	YP3051	YP3052		fliK2	TRUE	0.944	2.000	0.062	NA		NA
681018	681019	YP3052	YP3053	fliK2		TRUE	0.905	36.000	0.296	1.000		NA
681019	681020	YP3053	YP3054		fliA2	TRUE	0.986	6.000	0.333	1.000		NA
681020	681021	YP3054	YP3055	fliA2	motA2	TRUE	0.970	16.000	0.500	1.000	N	NA
681021	681022	YP3055	YP3056	motA2	motB2	TRUE	0.999	0.000	0.846	1.000	Y	NA
681022	681023	YP3056	YP3057	motB2		FALSE	0.354	69.000	0.000	NA		NA
681023	681024	YP3057	YP3058			FALSE	0.136	203.000	0.000	NA		NA
681024	681025	YP3058	YP3059			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
681025	681026	YP3059	YP3060			TRUE	0.794	-16.000	0.000	NA		NA
5438088	681027	YP_3061	YP3062	pcpY		FALSE	0.073	250.000	0.000	NA		NA
681028	681029	YP3063	YP3064		tra5E	TRUE	0.924	54.000	0.167	1.000	Y	NA
5438089	681030	YP_3065	YP3066			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
681030	681031	YP3066	YP3067			TRUE	0.993	7.000	0.627	NA		NA
681031	681032	YP3067	YP3068			TRUE	0.952	68.000	0.821	NA		NA
681036	681037	YP3072	YP_3073	malM	lamB	FALSE	0.112	223.000	0.000	1.000		NA
681037	681038	YP_3073	YP3074	lamB	malK2	TRUE	0.853	71.000	0.000	0.070	Y	NA
681038	681039	YP3074	YP3075	malK2	amyA	TRUE	0.853	-12.000	0.044	NA		NA
681040	681041	YP3076	YP3077	malE1	malF6	TRUE	0.657	172.000	0.060	1.000	Y	NA
681041	681042	YP3077	YP3078	malF6	malG6	TRUE	0.999	-7.000	0.814	0.050	Y	NA
681043	681044	YP3079	YP3080		pgi	FALSE	0.204	135.000	0.015	1.000		NA
681045	5438090	YP3081	YP_3082	lysC2	shlB	FALSE	0.011	481.000	0.000	NA		NA
5438090	681046	YP_3082	YP3083	shlB	hylA	TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
681049	681050	YP3086	YP3087	aceK	aceA	FALSE	0.296	256.000	0.273	1.000	N	NA
681050	681051	YP3087	YP3088	aceA	aceB	TRUE	0.913	47.000	0.118	1.000	Y	NA
681051	681052	YP3088	YP3089	aceB	metA	FALSE	0.010	388.000	0.000	1.000	N	NA
681052	5438091	YP3089	YP_r13	metA		FALSE	0.006	732.000	0.000	NA		NA
5438091	681054	YP_r13	YP_t53			TRUE	0.540	33.000	0.000	NA		NA
681054	5438092	YP_t53	YP_r14			TRUE	0.833	9.000	0.000	NA		NA
5438092	5438093	YP_r14	YP_r15			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
5438093	681057	YP_r15	YP_t54			FALSE	0.110	219.000	0.000	NA		NA
681057	681058	YP_t54	YP_t55			FALSE	0.430	52.000	0.000	NA		NA
681058	5438094	YP_t55	YP_r16			FALSE	0.240	130.000	0.000	NA		NA
681060	681061	YP3090	YP3091		purH	FALSE	0.015	423.000	0.000	NA		NA
681061	681062	YP3091	YP3092	purH	purD	TRUE	0.964	36.000	0.238	1.000	Y	NA
681063	681064	YP3093	YP3094		hupA	TRUE	0.992	2.000	0.375	NA		NA
681064	681065	YP3094	YP3095	hupA		TRUE	0.669	189.000	0.355	NA		NA
681065	681066	YP3095	YP_3096		nfi	TRUE	0.630	46.000	0.086	NA		NA
681066	681067	YP_3096	YP3097	nfi	hemE	FALSE	0.184	66.000	0.028	1.000	N	NA
681067	681068	YP3097	YP3098	hemE		FALSE	0.254	119.000	0.000	NA		NA
681068	681069	YP3098	YP3099		nPY1	FALSE	0.298	93.000	0.000	NA		NA
681070	681071	YP_3100	YP3101	rsd		FALSE	0.247	123.000	0.000	NA		NA
681071	681072	YP3101	YP3102		thiC	TRUE	0.878	-7.000	0.000	NA		NA
681072	681073	YP3102	YP3103	thiC	thiE	TRUE	0.975	-28.000	0.063	0.002	Y	NA
681073	681074	YP3103	YP3104	thiE	thiF	TRUE	0.993	-10.000	0.242	1.000	Y	NA
681074	681075	YP3104	YP3105	thiF	thiS	TRUE	0.907	-60.000	0.057	1.000	Y	NA
681075	681076	YP3105	YP_3106	thiS	thiG	TRUE	0.985	2.000	0.008	1.000	Y	NA
681076	681077	YP_3106	YP3107	thiG	thiH	TRUE	0.993	-22.000	0.277	0.002	Y	NA
681078	681079	YP3108	YP3109		rpoC	FALSE	0.223	150.000	0.000	NA		NA
681079	681080	YP3109	YP3110	rpoC	rpoB	TRUE	0.962	129.000	0.851	0.001		NA
681080	681081	YP3110	YP_3111	rpoB	rplL	FALSE	0.155	343.000	0.223	1.000		NA
681081	681082	YP_3111	YP3112	rplL	rplJ	TRUE	0.992	67.000	0.884	0.012	Y	NA
681082	681083	YP3112	YP3113	rplJ	rplA	TRUE	0.550	365.000	0.302	0.015	Y	NA
681083	681084	YP3113	YP3114	rplA	rplK	TRUE	0.999	4.000	0.838	0.015	Y	NA
681084	681085	YP3114	YP3115	rplK	nusG	TRUE	0.801	191.000	0.681	1.000	N	NA
681085	681086	YP3115	YP_3116	nusG	secE	TRUE	0.997	2.000	0.843	1.000	N	NA
681086	681087	YP_3116	YP3117	secE	tufA	FALSE	0.017	251.000	0.009	1.000	N	NA
681087	678571	YP3117	YP_56	tufA		FALSE	0.271	109.000	0.000	NA		NA
678571	678582	YP_56	YP_57		rpmA	TRUE	0.855	7.000	0.000	NA		NA
678582	678591	YP_57	YP_58	rpmA	ftsH	FALSE	0.244	150.000	0.000	1.000		NA
678591	678603	YP_58	YP_59	ftsH		TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
678603	681093	YP_59	YP3119		tra5F	FALSE	0.014	441.000	0.000	NA		NA
681093	681094	YP3119	YP3120	tra5F		TRUE	0.924	54.000	0.167	1.000	Y	NA
681094	681095	YP3120	YP_3121		ppc	FALSE	0.003	742.000	0.000	1.000	N	NA
681095	681096	YP_3121	YP3122	ppc	argE2	FALSE	0.016	374.000	0.053	1.000	N	NA
681097	681098	YP3123	YP_3124	argC	argB	TRUE	0.836	169.000	0.097	0.002	Y	NA
681098	681099	YP_3124	YP3125	argB	argH	TRUE	0.592	167.000	0.017	1.000	Y	NA
681099	681100	YP3125	YP3126	argH	hasR	FALSE	0.004	599.000	0.000	1.000	N	NA
681100	681101	YP3126	YP3127	hasR	hasA	FALSE	0.103	222.000	0.000	NA		NA
681101	681102	YP3127	YP3128	hasA	hasD	FALSE	0.221	151.000	0.000	NA		NA
681102	681103	YP3128	YP3129	hasD	hasE	TRUE	0.978	76.000	1.000	0.008		NA
681103	681104	YP3129	YP3130	hasE	hasB	TRUE	0.954	65.000	0.667	0.008	N	NA
681105	681106	YP3131	YP3132	lpd	aHP1	TRUE	0.769	95.000	0.204	0.005	N	NA
681109	681110	YP3135	YP3136	acrR5		TRUE	0.982	13.000	0.508	NA		NA
681112	681113	YP_3138	YP_3139	btuB	murI	FALSE	0.311	-55.000	0.025	1.000	N	NA
5438095	5438096	YP_r17	YP_r18			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
5438096	681116	YP_r18	YP_t60			FALSE	0.070	253.000	0.000	NA		NA
681116	5438097	YP_t60	YP_r19			FALSE	0.198	164.000	0.000	NA		NA
681118	681119	YP_t61	YP_t62			TRUE	0.833	9.000	0.000	NA		NA
681119	681120	YP_t62	YP3140		rbsB8	FALSE	0.005	983.000	0.000	NA		NA
681120	681121	YP3140	YP3141	rbsB8	mglA6	TRUE	0.981	86.000	0.804	NA	Y	NA
681121	681122	YP3141	YP3142	mglA6	araH10	TRUE	0.997	12.000	0.506	0.011	Y	NA
681122	681123	YP3142	YP3143	araH10	araH11	TRUE	1.000	0.000	0.865	0.011	Y	NA
681127	681128	YP3147	YP3148	ilvG	ilvM	TRUE	0.999	-3.000	0.943	0.002		NA
681128	681129	YP3148	YP3149	ilvM	ilvE	TRUE	0.907	23.000	0.205	1.000		NA
681129	681130	YP3149	YP_3150	ilvE	ilvD	FALSE	0.268	311.000	0.075	1.000	Y	NA
681130	681131	YP_3150	YP3151	ilvD	ilvA	TRUE	0.987	6.000	0.106	1.000	Y	NA
681132	681133	YP3152	YP3153			FALSE	0.397	59.000	0.000	NA		NA
681133	681134	YP3153	YP3154			FALSE	0.397	59.000	0.000	NA		NA
681134	681135	YP3154	YP3155			TRUE	0.990	-16.000	0.667	NA		NA
681138	681139	YP3158	YP3159	ilvC		FALSE	0.174	181.000	0.000	NA		NA
681139	5438098	YP3159	YP_3160			FALSE	0.149	196.000	0.000	NA		NA
5438098	681140	YP_3160	YP3161			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
681140	5438099	YP3161	YP_3162			FALSE	0.070	253.000	0.000	NA		NA
5438099	681141	YP_3162	YP3163		imm	TRUE	0.669	-31.000	0.000	NA		NA
681142	681143	YP3164	YP3165		fimC7	TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
681143	681144	YP3165	YP3166	fimC7		TRUE	0.990	-34.000	1.000	1.000		NA
681144	681145	YP3166	YP3167		fimD5	TRUE	0.977	16.000	0.500	1.000		NA
681145	681146	YP3167	YP3168	fimD5	fimC8	TRUE	0.987	28.000	0.500	1.000	Y	NA
681146	681147	YP3168	YP3169	fimC8	fimA6	TRUE	0.990	64.000	1.000	1.000	Y	NA
681149	681150	YP3171	YP3172		ppiC	FALSE	0.095	239.000	0.000	1.000		NA
681152	681153	YP3174	YP3175		gppA	TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
681153	681154	YP3175	YP3176	gppA	rhlB	TRUE	0.988	4.000	0.406	1.000	N	NA
681155	681156	YP3177	YP3178	trxA2	rho	FALSE	0.015	480.000	0.087	1.000	N	NA
681156	681157	YP3178	YP3179	rho	rfe	FALSE	0.005	535.000	0.000	1.000	N	NA
681157	681158	YP3179	YP_3180	rfe	wzzE	TRUE	0.995	36.000	0.735	0.003	Y	NA
681158	681159	YP_3180	YP3181	wzzE	rffE	TRUE	0.880	295.000	0.677	0.003	Y	NA
681159	681160	YP3181	YP3182	rffE	rffD	TRUE	0.998	-3.000	0.348	1.000	Y	NA
681160	681161	YP3182	YP3183	rffD	rffG	TRUE	0.994	-9.000	0.273	1.000	Y	NA
681161	681162	YP3183	YP3184	rffG	rffH	TRUE	0.988	85.000	0.739	0.003	Y	NA
681162	681163	YP3184	YP3185	rffH	rffC	TRUE	0.789	-79.000	0.145	1.000		NA
681163	681164	YP3185	YP_3186	rffC	rffA	TRUE	0.988	2.000	0.248	1.000		NA
681164	681165	YP_3186	YP3187	rffA	wzxE	TRUE	0.986	2.000	0.218	1.000		NA
681165	681166	YP3187	YP3188	wzxE	wecF1	TRUE	0.975	23.000	0.605	1.000		NA
681166	681167	YP3188	YP3189	wecF1	wecF2	TRUE	0.997	-3.000	0.684	1.000		NA
681167	681168	YP3189	YP3190	wecF2	wecG	TRUE	0.941	9.000	0.126	1.000		NA
681168	681169	YP3190	YP3191	wecG	ansP3	FALSE	0.005	524.000	0.000	1.000	N	NA
681169	681170	YP3191	YP_t63	ansP3		FALSE	0.225	149.000	0.000	NA		NA
681170	681171	YP_t63	YP_t64			FALSE	0.321	84.000	0.000	NA		NA
681171	681172	YP_t64	YP_t65			TRUE	0.698	17.000	0.000	NA		NA
681172	681174	YP_t65	YP_t66			FALSE	0.339	76.000	0.000	NA		NA
681174	681175	YP_t66	YP3193		tnp_35	FALSE	0.006	816.000	0.000	NA		NA
681176	681177	YP3194	YP3195	hemY2	hemX	TRUE	0.993	3.000	0.144	1.000	Y	NA
681177	681178	YP3195	YP3196	hemX	hemD	TRUE	0.992	22.000	0.600	1.000	Y	NA
681178	681179	YP3196	YP_3197	hemD	hemC	TRUE	0.998	-3.000	0.205	0.001	Y	NA
681179	681180	YP_3197	YP3198	hemC		FALSE	0.105	221.000	0.000	NA		NA
681183	681184	YP3201	YP3202		dapF	FALSE	0.044	184.000	0.021	NA	N	NA
681184	681185	YP3202	YP3203	dapF		TRUE	0.720	65.000	0.175	NA		NA
681185	681186	YP3203	YP3204		xerC3	TRUE	0.998	-3.000	0.714	NA		NA
681186	681187	YP3204	YP3205	xerC3		TRUE	0.994	0.000	0.367	1.000		NA
681187	681188	YP3205	YP3206		uvrD	TRUE	0.576	96.000	0.128	1.000		NA
681190	681191	YP3208	YP3209			FALSE	0.350	71.000	0.000	NA		NA
681191	681192	YP3209	YP3210			TRUE	0.764	14.000	0.042	NA		NA
681192	681193	YP3210	YP_3211		corA2	FALSE	0.008	649.000	0.000	1.000		NA
681194	681195	YP3212	YP3213	rarD	paaI2	TRUE	0.834	18.000	0.099	NA		NA
681196	681197	YP3214	YP3215	pldA	recQ	FALSE	0.290	78.000	0.057	1.000	N	NA
681197	681198	YP3215	YP3216	recQ	rhtC	FALSE	0.179	107.000	0.043	1.000	N	NA
681200	681201	YP3218	YP3219	pldB2	cof3	TRUE	0.947	-94.000	0.524	1.000		NA
681201	681202	YP3219	YP3220	cof3		FALSE	0.066	265.000	0.000	1.000		NA
681204	681205	YP3222	YP3223	glpA	glpB	TRUE	0.989	-28.000	0.650	0.001	N	NA
681205	681206	YP3223	YP_3224	glpB	glpC	TRUE	0.997	-3.000	0.547	0.034	N	NA
681207	681208	YP3225	YP_3226			FALSE	0.332	130.000	0.066	NA		NA
681210	681211	YP3228	YP3229	zntA2		FALSE	0.198	414.000	0.325	0.066		NA
681212	681213	YP3230	YP3231			FALSE	0.162	212.000	0.058	NA		NA
681214	681215	YP3232	YP3233			TRUE	0.895	-10.000	0.063	NA		NA
681215	681216	YP3233	YP3234			FALSE	0.269	110.000	0.000	NA		NA
681217	681218	YP3235	YP3236	ftsY	ftsE	TRUE	0.956	6.000	0.117	0.093	N	NA
681218	681219	YP3236	YP3237	ftsE	ftsX	TRUE	0.986	-10.000	0.121	1.000	Y	NA
681219	681220	YP3237	YP3238	ftsX	rpoH	FALSE	0.027	311.000	0.051	1.000	N	NA
681220	681221	YP3238	YP3239	rpoH	tnp_36	FALSE	0.109	163.000	0.000	1.000	N	NA
681223	681224	YP3241	YP3242	livK2	livH	TRUE	0.822	181.000	0.217	1.000	Y	NA
681224	681225	YP3242	YP3243	livH	livM3	TRUE	0.999	-3.000	0.574	0.049	Y	NA
681225	681226	YP3243	YP3244	livM3	livG2	TRUE	0.999	-3.000	0.574	1.000	Y	NA
681226	681227	YP3244	YP_3245	livG2	livF	TRUE	0.995	45.000	0.967	0.017	Y	NA
681227	681228	YP_3245	YP3246	livF		FALSE	0.095	228.000	0.000	NA		NA
681229	681230	YP3247	YP3248			TRUE	0.978	43.000	1.000	NA		NA
681230	681231	YP3248	YP3249			TRUE	0.930	62.000	0.600	NA		NA
681231	681232	YP3249	YP3250		fimC9	TRUE	0.970	-43.000	0.600	NA		NA
681232	681233	YP3250	YP3251	fimC9		TRUE	0.971	-15.000	0.286	NA		NA
681233	681234	YP3251	YP3252			FALSE	0.072	252.000	0.000	NA		NA
681235	681236	YP3253	YP3254	ugpB5	ugpA	TRUE	0.881	298.000	0.793	0.049	Y	NA
681236	681237	YP3254	YP3255	ugpA	ugpE	TRUE	0.999	-3.000	0.306	0.049	Y	NA
681237	681238	YP3255	YP3256	ugpE	ugpC	TRUE	0.996	7.000	0.272	0.049	Y	NA
681238	681239	YP3256	YP3257	ugpC	ugpQ4	TRUE	0.829	-3.000	0.024	1.000	N	NA
681239	681240	YP3257	YP3258	ugpQ4		FALSE	0.266	101.000	0.023	1.000		NA
681240	681241	YP3258	YP3259		rhaT13	FALSE	0.078	320.000	0.000	0.066		NA
681245	681246	YP_3263	YP3264	udp		FALSE	0.120	121.000	0.030	1.000	N	NA
681246	681247	YP3264	YP3265		cstA2	FALSE	0.150	358.000	0.000	1.000	Y	NA
681247	681248	YP3265	YP3266	cstA2	dedA4	FALSE	0.095	233.000	0.041	NA		NA
681248	681249	YP3266	YP3267	dedA4	rumC	FALSE	0.295	208.000	0.125	NA		NA
681249	681250	YP3267	YP3268	rumC	ubiE	FALSE	0.338	92.000	0.047	NA		NA
681250	681251	YP3268	YP3269	ubiE		TRUE	0.862	-37.000	0.145	1.000		NA
681251	681252	YP3269	YP3270		aarF	TRUE	0.995	0.000	0.432	1.000		NA
681252	681253	YP3270	YP3271	aarF	tatA	FALSE	0.169	180.000	0.025	1.000		NA
681253	681254	YP3271	YP3272	tatA	tatB	TRUE	0.992	4.000	0.130	1.000	Y	NA
681254	681255	YP3272	YP3273	tatB	tatC	TRUE	0.997	3.000	0.333	NA	Y	NA
681255	5438100	YP3273	YP_3274	tatC	tatD2	FALSE	0.409	56.000	0.000	NA		NA
5438100	681256	YP_3274	YP3275	tatD2		TRUE	0.458	-1588.000	0.000	NA		NA
681256	681257	YP3275	YP3276		dnaC_24	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
681257	681258	YP3276	YP3277	dnaC_24	hemB	FALSE	0.009	389.000	0.000	1.000	N	NA
681260	681261	YP_3279	YP_3280	ubiD	fre	TRUE	0.880	55.000	0.090	1.000	Y	NA
681262	681263	YP3281	YP3282	fadA	fadB	TRUE	0.996	12.000	0.607	1.000	Y	NA
681264	681265	YP3283	YP3284	pepQ		TRUE	0.978	0.000	0.127	1.000		NA
681265	681266	YP3284	YP3285		trkH	TRUE	0.842	40.000	0.202	1.000		NA
681266	681267	YP3285	YP3286	trkH	hemG	TRUE	0.954	22.000	0.455	1.000	N	NA
681268	681269	YP3287	YP_r20			FALSE	0.430	52.000	0.000	NA		NA
681269	681270	YP_r20	YP_r21			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
681270	681271	YP_r21	YP_t67			FALSE	0.110	219.000	0.000	NA		NA
681271	681272	YP_t67	YP_t68			FALSE	0.430	52.000	0.000	NA		NA
681272	681273	YP_t68	YP_r22			FALSE	0.240	130.000	0.000	NA		NA
681274	681275	YP3288	YP3289	murB	birA	TRUE	0.983	-3.000	0.211	1.000	N	NA
681276	681277	YP3290	YP3291	coaA	wecD3	FALSE	0.134	211.000	0.000	1.000		NA
5438101	681278	YP_3292	YP3293			TRUE	0.747	14.000	0.000	NA		NA
681278	681279	YP3293	YP3294		dnaC_25	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
681279	5438102	YP3294	YP_3295	dnaC_25		FALSE	0.361	67.000	0.000	NA		NA
681280	681281	YP3296	YP3297			TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
681281	681282	YP3297	YP3298			FALSE	0.045	294.000	0.000	NA		NA
681284	681285	YP3300	YP3301	glgP	glgA	TRUE	0.905	97.000	0.228	1.000	Y	NA
681285	681286	YP3301	YP3302	glgA	glgC	TRUE	0.952	62.000	0.307	1.000	Y	NA
681286	681287	YP3302	YP3303	glgC	glgX	TRUE	0.990	10.000	0.228	1.000	Y	NA
681287	681288	YP3303	YP3304	glgX	glgB	TRUE	0.995	2.000	0.069	0.002	Y	NA
681292	681293	YP3308	YP3309			TRUE	0.855	7.000	0.000	NA		NA
681293	681294	YP3309	YP3310			FALSE	0.035	316.000	0.000	NA		NA
681294	681295	YP3310	YP3311		asd2	FALSE	0.190	169.000	0.000	NA		NA
681297	681298	YP3313	YP3314			FALSE	0.022	371.000	0.000	NA		NA
681298	681299	YP3314	YP3315		gntV	FALSE	0.173	182.000	0.000	NA		NA
681301	681302	YP3317	YP3318	gntR1		FALSE	0.400	129.000	0.091	NA		NA
681302	681303	YP3318	YP3319			FALSE	0.241	129.000	0.000	NA		NA
681304	681305	YP3320	YP3321		ompR4	TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
681306	681307	YP3322	YP_3323	rbsK4	fba	TRUE	0.987	10.000	0.180	NA	Y	NA
681307	681308	YP_3323	YP3324	fba		TRUE	0.841	26.000	0.149	NA		NA
681308	681309	YP3324	YP3325		rbsB9	TRUE	0.530	75.000	0.095	NA		NA
681309	681310	YP3325	YP3326	rbsB9	rbsC2	TRUE	0.940	31.000	0.238	0.010		NA
681310	681311	YP3326	YP3327	rbsC2	rbsA3	TRUE	0.956	-7.000	0.000	0.010		NA
681314	681315	YP3330	YP3331	pitA	tnp_37	FALSE	0.060	215.000	0.000	1.000	N	NA
681317	681318	YP3333	YP3334	uspA2	gdhA	FALSE	0.040	244.000	0.000	1.000	N	NA
681318	681319	YP3334	YP3335	gdhA		FALSE	0.040	245.000	0.000	1.000	N	NA
681320	681321	YP3336	YP3337	smtA9	opdA	TRUE	0.952	4.000	0.098	NA		NA
681322	681323	YP3338	YP3339			TRUE	0.577	28.000	0.000	NA		NA
681323	681324	YP3339	YP3340		gor	FALSE	0.400	156.000	0.100	1.000		NA
681324	681325	YP3340	YP3341	gor		FALSE	0.068	192.000	0.000	NA	N	NA
681325	681326	YP3341	YP3342		gntT2	TRUE	0.565	178.000	0.290	NA	N	NA
681326	681327	YP3342	YP3343	gntT2	glxK	TRUE	0.992	11.000	0.295	1.000	Y	NA
681328	681329	YP3344	YP3345			FALSE	0.357	68.000	0.000	NA		NA
681329	681330	YP3345	YP3346			TRUE	0.919	2.000	0.000	NA		NA
681330	681331	YP3346	YP3347		yapE	FALSE	0.310	88.000	0.000	NA		NA
681332	681333	YP3348	YP3349	rbn2	cdh	TRUE	0.902	4.000	0.033	1.000		NA
681334	681335	YP3350	YP3351	asmA2	rtn3	FALSE	0.016	305.000	0.000	NA	N	NA
681336	681337	YP3352	YP3353		kdgK	FALSE	0.058	279.000	0.000	1.000		NA
681338	681339	YP3354	YP3355	pqqL	dctA	FALSE	0.051	365.000	0.088	1.000		NA
681339	681340	YP3355	YP3356	dctA		FALSE	0.014	455.000	0.000	1.000		NA
681340	681341	YP3356	YP3357		pelY	TRUE	0.746	98.000	0.250	1.000		NA
681341	681342	YP3357	YP3358	pelY		FALSE	0.378	246.000	0.250	1.000		NA
681342	681343	YP3358	YP_3359		rtn4	FALSE	0.016	640.000	0.000	0.086		NA
681343	5438103	YP_3359	YP_3360	rtn4		FALSE	0.231	143.000	0.000	NA		NA
5438103	681344	YP_3360	YP3361		dppF	FALSE	0.277	104.000	0.000	NA		NA
681344	681345	YP3361	YP3362	dppF	dppD3	TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.001	Y	NA
681345	681346	YP3362	YP3363	dppD3	dppC4	TRUE	0.995	14.000	0.560	1.000	Y	NA
681346	681347	YP3363	YP3364	dppC4	dppB4	TRUE	0.987	82.000	0.779	0.049	Y	NA
681347	681348	YP3364	YP3365	dppB4	dppA	TRUE	0.460	283.000	0.087	0.049	Y	NA
681348	681349	YP3365	YP3366	dppA		FALSE	0.017	403.000	0.000	NA		NA
681349	681350	YP3366	YP3367		fhaC4	TRUE	0.688	18.000	0.000	NA		NA
681350	681351	YP3367	YP3368	fhaC4	fhaB4	TRUE	0.750	109.000	0.286	NA		NA
681351	681352	YP3368	YP_t69	fhaB4		FALSE	0.036	313.000	0.000	NA		NA
681352	681353	YP_t69	YP_3369		uhpC	FALSE	0.257	117.000	0.000	NA		NA
681353	681354	YP_3369	YP3370	uhpC		TRUE	0.960	95.000	1.000	0.065	N	NA
681354	681355	YP3370	YP3371		uhpA2	TRUE	0.997	-3.000	0.148	0.011	Y	NA
681355	681356	YP3371	YP3372	uhpA2		TRUE	0.727	-67.000	0.103	1.000		NA
5438104	681360	YP_3376	YP3377		dnaC_26	FALSE	0.450	-2052.000	0.000	NA		NA
681360	681361	YP3377	YP3378	dnaC_26		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
681361	681362	YP3378	YP3379		hutH	FALSE	0.003	654.000	0.000	1.000	N	NA
681362	681363	YP3379	YP3380	hutH	hutU	TRUE	0.999	-3.000	0.315	0.000	Y	NA
681364	681365	YP3381	YP3382	cysM2	apt2	TRUE	0.997	-3.000	0.800	1.000	N	NA
681365	681366	YP3382	YP3383	apt2	rhaT14	TRUE	0.778	83.000	0.250	1.000		NA
681366	681367	YP3383	YP3384	rhaT14	accC1	TRUE	0.890	-28.000	0.138	1.000		NA
681367	681368	YP3384	YP3385	accC1	fecB3	FALSE	0.005	487.000	0.000	1.000	N	NA
681368	681369	YP3385	YP3386	fecB3	btuC3	TRUE	0.994	10.000	0.356	1.000	Y	NA
681369	681370	YP3386	YP3387	btuC3	btuC4	TRUE	0.998	-28.000	0.870	0.049	Y	NA
681370	681371	YP3387	YP3388	btuC4	fecE	TRUE	0.999	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
5438105	681372	YP_3389	YP3390			FALSE	0.184	173.000	0.000	NA		NA
681373	5438106	YP3391	YP_3392	hipB3		TRUE	0.499	39.000	0.000	NA		NA
5438106	681374	YP_3392	YP3393			FALSE	0.182	174.000	0.000	NA		NA
681375	681376	YP3394	YP3395		xerC4	TRUE	0.850	-106.000	0.222	NA		NA
681376	681377	YP3395	YP_t70	xerC4		FALSE	0.194	166.000	0.000	NA		NA
681377	681378	YP_t70	YP3396		purR11	FALSE	0.240	130.000	0.000	NA		NA
681378	681379	YP3396	YP3397	purR11	araH12	TRUE	0.526	90.000	0.146	1.000	N	NA
681379	681380	YP3397	YP3398	araH12	mglA7	TRUE	0.998	-13.000	0.469	0.010	Y	NA
681380	681381	YP3398	YP3399	mglA7	xylF	TRUE	0.935	208.000	0.518	0.010	Y	NA
681382	681383	YP3400	YP3401	xylA	xylB2	TRUE	0.670	124.000	0.020	1.000	Y	NA
681384	681385	YP3402	YP3403		fimC10	TRUE	0.945	39.000	0.500	1.000		NA
681385	681386	YP3403	YP3404	fimC10	fimD6	TRUE	0.953	33.000	0.500	1.000		NA
681386	681387	YP3404	YP3405	fimD6	fimD7	TRUE	0.789	26.000	0.000	0.049		NA
681387	681388	YP3405	YP3406	fimD7	fimA7	TRUE	0.967	76.000	0.500	1.000	Y	NA
681388	681389	YP3406	YP3407	fimA7		FALSE	0.006	795.000	0.000	1.000		NA
681390	681391	YP3408	YP3409		tra5G	TRUE	0.924	54.000	0.167	1.000	Y	NA
681393	681394	YP3411	YP3412	acrA9	acrF	TRUE	0.990	13.000	0.842	1.000	N	NA
681396	681397	YP3414	YP3415		yapH	FALSE	0.005	839.000	0.000	NA		NA
681398	681399	YP3416	YP3417			FALSE	0.023	563.000	0.000	0.013		NA
681399	681400	YP3417	YP3418			FALSE	0.288	209.000	0.000	0.013		NA
681400	681401	YP3418	YP3419			TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
681402	681403	YP3420	YP3421	abgT	pepD2	FALSE	0.023	391.000	0.089	NA	N	NA
681403	681404	YP3421	YP3422	pepD2	cirA4	FALSE	0.010	388.000	0.000	1.000	N	NA
681404	681405	YP3422	YP3423	cirA4	entF1	FALSE	0.122	151.000	0.000	1.000	N	NA
681405	681406	YP3423	YP3424	entF1	entF2	TRUE	0.759	44.000	0.000	0.002		NA
681406	681407	YP3424	YP3425	entF2	entF3	TRUE	0.920	13.000	0.000	0.002		NA
681407	681408	YP3425	YP3426	entF3	fabG11	TRUE	0.752	-21.000	0.000	NA		NA
681408	681409	YP3426	YP3427	fabG11		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
681409	681410	YP3427	YP3428		grsT	TRUE	0.981	-10.000	0.074	1.000	Y	NA
681410	681411	YP3428	YP3429	grsT	proP29	TRUE	0.568	-52.000	0.000	NA		NA
681411	681412	YP3429	YP3430	proP29	mdlB5	TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
681412	681413	YP3430	YP3431	mdlB5	mdlB6	TRUE	0.971	-25.000	0.000	0.005	Y	NA
681414	681415	YP3432	YP3433			FALSE	0.015	436.000	0.000	NA		NA
681416	5438107	YP3434	YP_3435	gntP		FALSE	0.005	1001.000	0.000	NA		NA
5438107	681417	YP_3435	YP3436			FALSE	0.007	656.000	0.000	NA		NA
681417	681418	YP3436	YP3437		vgrG3	FALSE	0.008	586.000	0.000	NA		NA
681418	681419	YP3437	YP3438	vgrG3		TRUE	0.882	5.000	0.000	NA		NA
681419	681420	YP3438	YP3439		rhsA2	TRUE	0.768	14.000	0.000	1.000		NA
681420	681421	YP3439	YP3440	rhsA2		FALSE	0.050	283.000	0.000	NA		NA
681421	681422	YP3440	YP3441		cysK3	FALSE	0.009	544.000	0.000	NA		NA
681423	681424	YP3442	YP3443	citT3	cytR2	FALSE	0.025	282.000	0.000	1.000	N	NA
681425	681426	YP3444	YP3445		melB2	TRUE	0.804	153.000	0.444	1.000		NA
681427	681428	YP3446	YP3447	iutA	iucD	FALSE	0.452	72.000	0.100	1.000	N	NA
681428	681429	YP3447	YP3448	iucD	iucC	TRUE	0.998	-3.000	0.417	1.000	Y	NA
681429	681430	YP3448	YP3449	iucC	iucB	TRUE	0.990	-3.000	0.250	1.000		NA
681430	5438108	YP3449	YP_3450	iucB	iucA	TRUE	0.794	-16.000	0.000	NA		NA
681432	681433	YP3452	YP3453		dAP2	FALSE	0.023	377.000	0.000	1.000		NA
681436	681437	YP3456	YP3457			FALSE	0.013	451.000	0.000	NA		NA
681437	681438	YP3457	YP3458		insA1	FALSE	0.384	62.000	0.000	NA		NA
681438	5438109	YP3458	YP_3459	insA1		TRUE	0.506	-69.000	0.000	NA		NA
5438109	681439	YP_3459	YP3460			FALSE	0.339	76.000	0.000	NA		NA
681439	681440	YP3460	YP3461			FALSE	0.005	1397.000	0.000	NA		NA
681440	681441	YP3461	YP3462			TRUE	0.476	43.000	0.000	NA		NA
681441	681442	YP3462	YP3463			TRUE	0.780	12.000	0.000	NA		NA
681442	681443	YP3463	YP3464			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
681443	681444	YP3464	YP3465		ompA4	TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
681444	681445	YP3465	YP3466	ompA4	hcp8	TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
681445	681446	YP3466	YP3467	hcp8	clpB3	FALSE	0.030	418.000	0.083	NA		NA
681446	681447	YP3467	YP3468	clpB3	vgrG4	TRUE	0.976	-3.000	0.125	NA		NA
681447	681448	YP3468	YP3469	vgrG4		TRUE	0.731	15.000	0.000	NA		NA
681448	681449	YP3469	YP3470			TRUE	0.923	1.000	0.000	NA		NA
681449	681450	YP3470	YP3471			FALSE	0.169	184.000	0.000	NA		NA
681450	681451	YP3471	YP3472			TRUE	0.596	26.000	0.000	NA		NA
681451	5438110	YP3472	YP_3473			FALSE	0.420	54.000	0.000	NA		NA
5438110	681452	YP_3473	YP3474		mdlB7	FALSE	0.009	532.000	0.000	NA		NA
681452	681453	YP3474	YP3475	mdlB7		TRUE	0.712	16.000	0.000	NA		NA
681453	681454	YP3475	YP3476			TRUE	0.822	-13.000	0.000	NA		NA
681454	681455	YP3476	YP3477		insA2	FALSE	0.298	93.000	0.000	NA		NA
681455	681456	YP3477	YP3478	insA2	insB	TRUE	0.894	54.000	0.000	0.021	Y	NA
681456	5438111	YP3478	YP_3479	insB		FALSE	0.008	608.000	0.000	NA		NA
5438111	5438112	YP_3479	YP_3480			TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
681458	681459	YP3481	YP3482	speC	rbsB10	FALSE	0.003	556.000	0.000	NA	N	NA
681459	681460	YP3482	YP3483	rbsB10	mglA8	TRUE	0.981	46.000	0.545	NA	Y	NA
681460	681461	YP3483	YP3484	mglA8	araH13	TRUE	1.000	-3.000	0.727	0.010	Y	NA
681462	681463	YP3485	YP_3486	cirA5	fecB4	TRUE	0.990	-7.000	0.128	1.000	Y	NA
681463	681464	YP_3486	YP_3487	fecB4	mltC	FALSE	0.017	300.000	0.000	NA	N	NA
681464	681465	YP_3487	YP3488	mltC		FALSE	0.291	183.000	0.128	NA	N	NA
681465	681466	YP3488	YP3489		mutY	FALSE	0.365	178.000	0.150	1.000	N	NA
681467	681468	YP3490	YP3491			TRUE	0.967	0.000	0.092	NA		NA
681468	681469	YP3491	YP3492		glsA2	TRUE	0.510	111.000	0.123	NA		NA
681469	5438113	YP3492	YP_3493	glsA2		FALSE	0.361	67.000	0.000	NA		NA
5438113	681470	YP_3493	YP3494			FALSE	0.011	496.000	0.000	NA		NA
681470	681471	YP3494	YP3495			FALSE	0.283	115.000	0.000	1.000		NA
681472	681473	YP3496	YP_3497	hemN2		TRUE	0.934	-19.000	0.218	1.000	N	NA
681473	681474	YP_3497	YP_3498			FALSE	0.221	100.000	0.016	NA		NA
681474	681475	YP_3498	YP3499			TRUE	0.963	-3.000	0.081	NA		NA
681475	681476	YP3499	YP3500		proC	FALSE	0.126	288.000	0.117	1.000		NA
681476	681477	YP3500	YP3501	proC		TRUE	0.478	133.000	0.125	NA		NA
681479	681480	YP3503	YP3504			TRUE	0.953	4.000	0.095	1.000		NA
681480	681481	YP3504	YP3505			FALSE	0.136	180.000	0.004	1.000		NA
681481	681482	YP3505	YP_3506			TRUE	0.987	0.000	0.263	NA	N	NA
681482	681483	YP_3506	YP3507		gshB	FALSE	0.379	116.000	0.120	NA	N	NA
681483	681484	YP3507	YP3508	gshB		TRUE	0.864	26.000	0.173	NA		NA
681484	681485	YP3508	YP3509			FALSE	0.271	109.000	0.000	NA		NA
681485	681486	YP3509	YP3510		endA	TRUE	0.752	-21.000	0.000	NA		NA
681486	681487	YP3510	YP3511	endA	sprT	TRUE	0.698	98.000	0.210	1.000		NA
681487	681488	YP3511	YP3512	sprT	metK	FALSE	0.237	142.000	0.030	1.000		NA
681489	681490	YP3513	YP3514	speA	hcaA12	FALSE	0.049	160.000	0.006	1.000	N	NA
681492	681493	YP3516	YP3517	tktA3	tnp_38	FALSE	0.033	257.000	0.000	1.000	N	NA
681493	681494	YP3517	YP3518	tnp_38	epd	FALSE	0.014	341.000	0.000	1.000	N	NA
681494	681495	YP3518	YP3519	epd	pgk	TRUE	0.868	103.000	0.070	0.004	Y	NA
681495	681496	YP3519	YP3520	pgk	fbaA	TRUE	0.838	120.000	0.056	0.004	Y	NA
681496	681497	YP3520	YP3521	fbaA	mscS2	FALSE	0.008	438.000	0.038	1.000	N	NA
681497	5438114	YP3521	YP_3522	mscS2		FALSE	0.062	263.000	0.000	NA		NA
681498	681499	YP3523	YP3524	dnaC_27		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
681502	681503	YP3527	YP3528	agaR	agaZ	TRUE	0.971	50.000	0.400	1.000	Y	NA
681503	681504	YP3528	YP3529	agaZ	agaS	TRUE	0.986	-3.000	0.240	1.000	N	NA
681504	681505	YP3529	YP3530	agaS	manX2	TRUE	0.852	18.000	0.150	1.000	N	NA
681505	681506	YP3530	YP3531	manX2		TRUE	0.995	47.000	0.909	0.007	Y	NA
681506	681507	YP3531	YP3532			TRUE	0.999	-10.000	0.917	0.007	Y	NA
681507	681508	YP3532	YP3533		manX3	TRUE	0.990	86.000	0.833	0.007	Y	NA
681508	681509	YP3533	YP3534	manX3	nagA2	TRUE	0.991	3.000	0.104	1.000	Y	NA
681509	681510	YP3534	YP3535	nagA2	kduD2	FALSE	0.079	196.000	0.000	1.000	N	NA
681510	681511	YP3535	YP3536	kduD2		TRUE	0.975	16.000	0.462	1.000		NA
681511	681512	YP3536	YP3537		aslB2	FALSE	0.040	431.000	0.000	0.017		NA
681512	681513	YP3537	YP3538	aslB2	aslA2	TRUE	0.978	21.000	0.615	1.000		NA
681513	681514	YP3538	YP3539	aslA2		TRUE	0.907	123.000	0.727	NA		NA
681514	681515	YP3539	YP3540		agaY	TRUE	0.727	110.000	0.261	NA		NA
681515	681516	YP3540	YP3541	agaY	thiJ2	TRUE	0.856	24.000	0.148	NA		NA
681517	681518	YP3542	YP3543		purR12	TRUE	0.849	-10.000	0.000	NA		NA
681519	681520	YP3544	YP3545	exuT2		TRUE	0.914	148.000	0.341	1.000	Y	NA
5438115	681523	YP_3548	YP3549		bgaB	FALSE	0.266	112.000	0.000	NA		NA
681523	681524	YP3549	YP3550	bgaB		TRUE	0.965	51.000	0.190	0.003	Y	NA
681524	681525	YP3550	YP3551		malG7	TRUE	0.996	5.000	0.308	1.000	Y	NA
681525	681526	YP3551	YP3552	malG7	malF7	TRUE	0.999	12.000	0.885	0.048	Y	NA
681526	681527	YP3552	YP3553	malF7	malE2	TRUE	0.968	160.000	0.815	1.000	Y	NA
681528	681529	YP3554	YP3555		rbsA4	FALSE	0.116	460.000	0.000	0.090	Y	NA
681529	681530	YP3555	YP3556	rbsA4	rbsC3	TRUE	0.952	66.000	0.200	0.010	Y	NA
681530	681531	YP3556	YP3557	rbsC3	rbsB11	FALSE	0.406	398.000	0.217	0.010	Y	NA
681531	681532	YP3557	YP3558	rbsB11		FALSE	0.006	779.000	0.000	NA		NA
681532	681533	YP3558	YP3559		spr3	FALSE	0.021	376.000	0.000	NA		NA
681535	681536	YP3561	YP3562			TRUE	0.955	0.000	0.065	NA		NA
681537	681538	YP3563	YP3564			FALSE	0.114	217.000	0.000	NA		NA
681538	681539	YP3564	YP3565			FALSE	0.384	62.000	0.000	NA		NA
681539	5438116	YP3565	YP_3566			FALSE	0.037	312.000	0.000	NA		NA
5438116	681540	YP_3566	YP3567			TRUE	0.679	-30.000	0.000	NA		NA
681540	681541	YP3567	YP3568			FALSE	0.078	245.000	0.000	NA		NA
681541	681542	YP3568	YP3569			TRUE	0.459	47.000	0.000	NA		NA
681542	681543	YP3569	YP3570			FALSE	0.034	319.000	0.000	NA		NA
681543	681544	YP3570	YP3571			TRUE	0.982	-3.000	0.160	NA		NA
681544	681545	YP3571	YP3572			FALSE	0.012	504.000	0.000	1.000		NA
681546	681547	YP3573	YP3574			TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
681547	681548	YP3574	YP3575			TRUE	0.870	6.000	0.000	NA		NA
681548	681549	YP3575	YP3576		alpA3	FALSE	0.173	182.000	0.000	NA		NA
681549	681550	YP3576	YP3577	alpA3		TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
681550	681551	YP3577	YP3578			FALSE	0.241	129.000	0.000	NA		NA
681552	681553	YP3579	YP3580	hipB4		TRUE	0.998	0.000	0.857	NA		NA
681553	681554	YP3580	YP3581		hipB5	FALSE	0.198	164.000	0.000	NA		NA
681554	681555	YP3581	YP3582	hipB5	relE	TRUE	0.747	63.000	0.189	NA		NA
681555	681556	YP3582	YP3583	relE	int4	FALSE	0.002	848.000	0.000	NA	N	NA
681556	681557	YP3583	YP_t72	int4		FALSE	0.194	166.000	0.000	NA		NA
681557	681558	YP_t72	YP3584		lysS	FALSE	0.153	194.000	0.000	NA		NA
681558	681559	YP3584	YP3585	lysS	prfB2	TRUE	0.991	10.000	0.162	0.037	Y	NA
681559	681560	YP3585	YP3586	prfB2	recJ	FALSE	0.011	345.000	0.028	1.000	N	NA
681560	681561	YP3586	YP3587	recJ	dsbC	TRUE	0.877	7.000	0.082	1.000	N	NA
681561	681562	YP3587	YP3588	dsbC	xerD	TRUE	0.592	31.000	0.079	1.000	N	NA
681564	681565	YP3590	YP3591	creD	creC	TRUE	0.721	100.000	0.311	NA	N	NA
681565	681566	YP3591	YP3592	creC	creB	TRUE	0.994	25.000	0.776	1.000	Y	NA
681566	681567	YP3592	YP3593	creB		TRUE	0.946	-3.000	0.051	NA		NA
681567	681568	YP3593	YP3594			TRUE	0.829	-19.000	0.061	NA		NA
681570	681571	YP3596	YP3597			FALSE	0.098	225.000	0.000	NA		NA
681571	681572	YP3597	YP3598			FALSE	0.139	202.000	0.000	NA		NA
681572	5438117	YP3598	YP_3599			FALSE	0.384	62.000	0.000	NA		NA
5438117	681573	YP_3599	YP3600			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
681573	681574	YP3600	YP3601			FALSE	0.005	1049.000	0.000	NA		NA
681574	681575	YP3601	YP3602		gcvP	FALSE	0.020	378.000	0.000	NA		NA
681575	681576	YP3602	YP3603	gcvP	gcsH	TRUE	0.776	212.000	0.249	1.000	Y	NA
681576	681577	YP3603	YP3604	gcsH	gcvT	TRUE	0.973	69.000	0.317	0.001	Y	NA
681577	681578	YP3604	YP_3605	gcvT	visC	FALSE	0.001	721.000	0.004	1.000	N	NA
681578	681579	YP_3605	YP3606	visC	ubiH	TRUE	0.958	173.000	0.474	0.001	Y	NA
681579	681580	YP3606	YP3607	ubiH	pepP2	FALSE	0.227	86.000	0.047	1.000	N	NA
681580	681581	YP3607	YP3608	pepP2		FALSE	0.437	88.000	0.073	NA		NA
681582	681583	YP3609	YP_s6		ssrS	FALSE	0.409	56.000	0.000	NA		NA
681583	681584	YP_s6	YP3610	ssrS		FALSE	0.243	127.000	0.000	NA		NA
681585	681586	YP3611	YP3612	serA2	rpiA2	FALSE	0.057	205.000	0.029	1.000	N	NA
681588	5438118	YP3614	YP_3615			FALSE	0.243	127.000	0.000	NA		NA
681589	681590	YP3616	YP3617		dnaC_28	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5438119	681591	YP_3618	YP3619		mutT8	FALSE	0.198	164.000	0.000	NA		NA
681591	681592	YP3619	YP3620	mutT8	secA	FALSE	0.008	295.000	0.003	1.000	N	NA
681592	681593	YP3620	YP3621	secA		TRUE	0.464	78.000	0.065	1.000		NA
681595	681596	YP_3623	YP3624	lpxC	ftsZ	TRUE	0.766	27.000	0.134	1.000	N	NA
681596	681597	YP3624	YP3625	ftsZ	ftsA2	TRUE	0.964	73.000	0.460	1.000	Y	NA
681597	681598	YP3625	YP3626	ftsA2	ftsQ	TRUE	0.925	27.000	0.389	NA	N	NA
681598	681599	YP3626	YP3627	ftsQ	ddlB	TRUE	0.998	2.000	0.372	NA	Y	NA
681599	681600	YP3627	YP3628	ddlB	murC	TRUE	0.995	-7.000	0.153	0.003	Y	NA
681600	681601	YP3628	YP3629	murC	murG	TRUE	0.927	90.000	0.283	1.000	Y	NA
681601	681602	YP3629	YP3630	murG	ftsW2	TRUE	0.996	-3.000	0.647	1.000	N	NA
681602	681603	YP3630	YP3631	ftsW2	murD	TRUE	0.995	0.000	0.297	0.002	N	NA
681603	681604	YP3631	YP3632	murD	mraY	TRUE	0.999	3.000	0.647	0.003	Y	NA
681604	681605	YP3632	YP3633	mraY	murF	TRUE	0.998	-6.000	0.309	0.003	Y	NA
681605	681606	YP3633	YP3634	murF	murE	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.002	Y	NA
681606	681607	YP3634	YP3635	murE	ftsI	TRUE	0.975	-13.000	0.059	1.000	Y	NA
681607	681608	YP3635	YP3636	ftsI	ftsL	TRUE	0.539	66.000	0.124	1.000	N	NA
681608	681609	YP3636	YP3637	ftsL		TRUE	0.985	-3.000	0.227	1.000	N	NA
681609	681610	YP3637	YP3638			TRUE	0.996	3.000	0.635	NA		NA
681612	681613	YP3640	YP3641	fruR	tnp_40	FALSE	0.005	505.000	0.000	1.000	N	NA
681613	681614	YP3641	YP3642	tnp_40		FALSE	0.020	378.000	0.000	NA		NA
681615	681616	YP_3643	YP3644	leuO		FALSE	0.027	346.000	0.000	NA		NA
681616	681617	YP3644	YP3645		fAA1	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
681617	681618	YP3645	YP_3646	fAA1	ilvI	FALSE	0.006	460.000	0.000	1.000	N	NA
681618	681619	YP_3646	YP3647	ilvI	ilvH	TRUE	0.995	-27.000	0.371	0.001	Y	NA
681619	681620	YP3647	YP3648	ilvH	tnp_41	FALSE	0.126	148.000	0.000	1.000	N	NA
681620	681621	YP3648	YP3649	tnp_41	leuA	FALSE	0.127	147.000	0.000	1.000	N	NA
681621	681622	YP3649	YP_3650	leuA	leuB2	TRUE	0.996	3.000	0.126	0.001	Y	NA
681622	681623	YP_3650	YP3651	leuB2	leuC	TRUE	0.983	-67.000	0.275	0.001	Y	NA
681623	681624	YP3651	YP3652	leuC	leuD	TRUE	0.994	15.000	0.309	0.000	Y	NA
681625	681626	YP3653	YP3654	setA		FALSE	0.070	253.000	0.000	NA		NA
681629	681630	YP3657	YP3658	tbpA3	thiP	TRUE	0.983	-36.000	0.697	0.067	N	NA
681630	681631	YP3658	YP_3659	thiP	thiQ	TRUE	0.991	-13.000	0.522	0.014	N	NA
681633	681634	YP3661	YP3662	polB	hepA	FALSE	0.172	461.000	0.098	0.067	Y	NA
681635	681636	YP3663	YP3664		icmF3	TRUE	0.992	16.000	1.000	NA		NA
681636	681637	YP3664	YP3665	icmF3		TRUE	0.991	9.000	0.615	NA		NA
681637	681638	YP3665	YP3666			TRUE	0.679	-30.000	0.000	NA		NA
681638	681639	YP3666	YP3667			FALSE	0.321	84.000	0.000	NA		NA
681639	681640	YP3667	YP3668			TRUE	0.995	-7.000	0.667	NA		NA
681640	681641	YP3668	YP3669			TRUE	0.870	6.000	0.000	NA		NA
681641	681642	YP3669	YP3670			TRUE	0.878	-7.000	0.000	NA		NA
681642	681643	YP3670	YP3671			TRUE	0.596	26.000	0.000	NA		NA
681643	681644	YP3671	YP3672		vgrG5	TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
681644	681645	YP3672	YP3673	vgrG5	clpB2	FALSE	0.277	104.000	0.000	NA		NA
681645	681646	YP3673	YP3674	clpB2		TRUE	0.992	3.000	0.400	NA		NA
681646	681647	YP3674	YP3675			TRUE	0.963	-46.000	0.533	NA		NA
681647	681648	YP3675	YP3676			TRUE	0.955	33.000	0.533	NA		NA
681648	681649	YP3676	YP3677			TRUE	0.938	74.000	0.714	NA		NA
681649	681650	YP3677	YP3678			TRUE	0.805	163.000	0.500	NA		NA
681650	681651	YP3678	YP3679			TRUE	0.997	0.000	0.700	NA		NA
681651	681652	YP3679	YP3680			TRUE	0.995	11.000	1.000	NA		NA
681653	681654	YP3681	YP3682		rluA3	FALSE	0.005	1223.000	0.000	NA		NA
681656	681657	YP3684	YP3685	imp	surA	TRUE	0.653	68.000	0.182	1.000	N	NA
681657	681658	YP3685	YP3686	surA	pdxA	TRUE	0.973	-28.000	0.561	1.000	N	NA
681658	681659	YP3686	YP3687	pdxA	ksgA2	TRUE	0.964	-7.000	0.197	1.000	N	NA
681659	681660	YP3687	YP3688	ksgA2	apaG	TRUE	0.753	14.000	0.078	NA	N	NA
681660	681661	YP3688	YP3689	apaG	apaH	TRUE	0.926	17.000	0.267	NA	N	NA
681662	681663	YP3690	YP3691			FALSE	0.243	127.000	0.000	NA		NA
681665	681666	YP3693	YP3694	folA		FALSE	0.407	150.000	0.104	NA		NA
681666	681667	YP3694	YP3695			TRUE	0.994	-9.000	0.704	NA		NA
681669	681670	YP3697	YP3698	carB	carA	TRUE	0.995	16.000	0.345	0.000	Y	NA
681670	681671	YP3698	YP3699	carA	dapB	FALSE	0.086	446.000	0.034	1.000	Y	NA
681671	681672	YP3699	YP3700	dapB	tnp_42	FALSE	0.006	453.000	0.000	1.000	N	NA
681672	681673	YP3700	YP3701	tnp_42		FALSE	0.236	138.000	0.000	NA		NA
681673	681674	YP3701	YP_3702		ispH	TRUE	0.570	29.000	0.000	NA		NA
681674	681675	YP_3702	YP3703	ispH	slpA2	TRUE	0.983	-19.000	0.626	1.000	N	NA
681675	681676	YP3703	YP3704	slpA2	fkpB	TRUE	0.952	-7.000	0.154	1.000	N	NA
681676	681677	YP3704	YP3705	fkpB	ileS	TRUE	0.893	0.000	0.045	1.000	N	NA
681677	681678	YP3705	YP3706	ileS	ribF	TRUE	0.868	32.000	0.254	1.000	N	NA
681679	681680	YP3707	YP3708		rpsT	TRUE	0.646	22.000	0.000	NA		NA
681681	681682	YP3709	YP3710	nhaR	nhaA	TRUE	0.671	130.000	0.292	1.000	N	NA
681682	681683	YP3710	YP3711	nhaA	dnaJ2	FALSE	0.027	243.000	0.022	1.000	N	NA
681683	681684	YP3711	YP3712	dnaJ2	dnaK2	TRUE	0.944	112.000	0.236	0.002	Y	NA
681685	681686	YP3713	YP3714			FALSE	0.042	309.000	0.000	1.000		NA
681687	681688	YP3715	YP3716	proP31	mogA	FALSE	0.144	128.000	0.039	1.000	N	NA
681688	681689	YP3716	YP3717	mogA		FALSE	0.316	86.000	0.000	NA		NA
681689	681690	YP3717	YP_3718		talB	TRUE	0.470	44.000	0.000	NA		NA
681690	681691	YP_3718	YP3719	talB		FALSE	0.361	67.000	0.000	NA		NA
681693	681694	YP3721	YP_3722	thrC	thrB	TRUE	0.995	4.000	0.233	1.000	Y	NA
681694	681695	YP_3722	YP_3723	thrB	thrA	TRUE	0.993	3.000	0.133	1.000	Y	NA
681696	681697	YP3724	YP3725		arcA	FALSE	0.285	99.000	0.000	NA		NA
681702	681703	YP3730	YP_3731	trpR	slt	FALSE	0.203	246.000	0.167	1.000	N	NA
681704	681705	YP3732	YP3733	mgtA		FALSE	0.021	375.000	0.000	NA		NA
681705	681706	YP3733	YP3734			TRUE	0.932	21.000	0.259	NA		NA
681706	681707	YP3734	YP3735		ompA5	TRUE	0.977	6.000	0.290	1.000	N	NA
681707	681708	YP3735	YP3736	ompA5	uup4	FALSE	0.134	183.000	0.005	1.000		NA
681709	681710	YP3737	YP3738		nadR	FALSE	0.278	118.000	0.000	1.000		NA
681710	681711	YP3738	YP3739	nadR	radA	FALSE	0.075	159.000	0.021	1.000	N	NA
681711	681712	YP3739	YP3740	radA	serB3	FALSE	0.137	88.000	0.024	1.000	N	NA
681714	681715	YP3742	YP3743	deoD	deoB	TRUE	0.773	119.000	0.414	1.000	N	NA
681715	681716	YP3743	YP_3744	deoB	deoA	TRUE	0.843	66.000	0.398	1.000	N	NA
681716	681717	YP_3744	YP3745	deoA	deoC2	TRUE	0.907	121.000	0.286	1.000	Y	NA
681717	681718	YP3745	YP3746	deoC2	nupC2	FALSE	0.056	561.000	0.000	1.000	Y	NA
681718	681719	YP3746	YP3747	nupC2	tatD4	FALSE	0.003	499.000	0.027	NA	N	NA
681719	681720	YP3747	YP3748	tatD4	rssA2	TRUE	0.819	13.000	0.057	NA		NA
681720	681721	YP3748	YP3749	rssA2		TRUE	0.740	74.000	0.211	NA		NA
681721	681722	YP3749	YP3750		osmY2	FALSE	0.444	167.000	0.140	NA		NA
681722	681723	YP3750	YP3751	osmY2	prfC	FALSE	0.032	327.000	0.000	NA		NA
681723	681724	YP3751	YP_3752	prfC	rimI	FALSE	0.173	179.000	0.026	1.000		NA
681724	681725	YP_3752	YP3753	rimI	holD	TRUE	0.787	-55.000	0.121	1.000		NA
681726	681727	YP3754	YP_t73	rsmC2		FALSE	0.066	257.000	0.000	NA		NA
681731	681732	YP3758	YP3759			TRUE	0.799	147.000	0.429	NA		NA
681733	681734	YP3760	YP3761	mexB	acrA10	TRUE	0.978	0.000	0.185	NA	N	NA
681734	681735	YP3761	YP3762	acrA10		FALSE	0.430	52.000	0.000	NA		NA
681735	681736	YP3762	YP3763			TRUE	0.586	27.000	0.000	NA		NA
681736	681737	YP3763	YP3764		rfaL	FALSE	0.008	586.000	0.000	NA		NA
681737	681738	YP3764	YP3765	rfaL	rfaQ	TRUE	0.900	48.000	0.105	NA	Y	NA
681738	681739	YP3765	YP3766	rfaQ	xylB3	FALSE	0.015	334.000	0.000	1.000	N	NA
681739	681740	YP3766	YP3767	xylB3	deoR4	TRUE	0.545	132.000	0.200	1.000	N	NA
681741	681742	YP3768	YP3769		mglA9	TRUE	0.485	41.000	0.000	NA		NA
681742	681743	YP3769	YP3770	mglA9	araH14	TRUE	0.999	-6.000	0.818	1.000	Y	NA
681743	681744	YP3770	YP3771	araH14	araH15	TRUE	1.000	-3.000	0.788	0.010	Y	NA
681744	681745	YP3771	YP3772	araH15	rbsB12	TRUE	0.989	52.000	0.844	NA	Y	NA
681745	681746	YP3772	YP3773	rbsB12	fbaB	TRUE	0.848	56.000	0.062	NA	Y	NA
681746	681747	YP3773	YP3774	fbaB		FALSE	0.375	64.000	0.028	1.000		NA
681747	681748	YP3774	YP3775			FALSE	0.041	301.000	0.000	NA		NA
681750	681751	YP_3777	YP3778	frwC	frwB	TRUE	0.682	341.000	0.400	0.005	Y	NA
681751	681752	YP3778	YP_3779	frwB	frwD	TRUE	0.849	93.000	0.000	0.005	Y	NA
681753	681754	YP3780	YP3781	araC7		TRUE	0.927	2.000	0.000	1.000		NA
681755	681756	YP3782	YP3783		htpX4	TRUE	0.989	11.000	0.637	NA		NA
681757	681758	YP3784	YP3785		sbcC3	TRUE	0.957	-3.000	0.068	NA		NA
681759	681760	YP3786	YP3787			FALSE	0.139	202.000	0.000	NA		NA
681761	681762	YP3788	YP3789		mutL2	TRUE	0.694	-28.000	0.000	NA		NA
681762	681763	YP3789	YP3790	mutL2		TRUE	0.469	50.000	0.000	1.000		NA
681763	681764	YP3790	YP3791		galU2	TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
681764	681765	YP3791	YP3792	galU2		FALSE	0.075	247.000	0.000	NA		NA
681765	681766	YP3792	YP3793			FALSE	0.361	67.000	0.000	NA		NA
681766	681767	YP3793	YP3794		mcrB	TRUE	0.999	-3.000	0.759	NA	Y	NA
681768	681769	YP3795	YP3796		dnaC_29	TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
681769	5438120	YP3796	YP_3797	dnaC_29		FALSE	0.352	70.000	0.000	NA		NA
681771	681772	YP3799	YP_s7		rnpB	FALSE	0.009	541.000	0.000	NA		NA
681775	681776	YP3802	YP3803	lppC		TRUE	0.670	84.000	0.172	NA		NA
681776	681777	YP3803	YP3804		gmhA	FALSE	0.176	271.000	0.187	1.000	N	NA
681777	681778	YP3804	YP3805	gmhA	osmY3	TRUE	0.988	11.000	0.613	NA		NA
681779	681780	YP3806	YP3807	mtgA	elbB	TRUE	0.956	-3.000	0.066	NA		NA
681780	681781	YP3807	YP3808	elbB		TRUE	0.563	30.000	0.000	NA		NA
681781	681782	YP3808	YP3809		arcB	TRUE	0.688	18.000	0.000	NA		NA
681782	681783	YP3809	YP3810	arcB		FALSE	0.151	264.000	0.113	1.000		NA
681784	681785	YP_3811	YP3812	gltB	gltD2	TRUE	0.990	10.000	0.096	0.000	Y	NA
681785	681786	YP3812	YP3813	gltD2		FALSE	0.014	441.000	0.000	NA		NA
681787	681788	YP3814	YP3815	sspB	sspA	TRUE	0.996	6.000	0.831	NA		NA
681790	681791	YP_3817	YP_3818	rpsI	rplM	TRUE	0.997	15.000	0.601	0.011	Y	NA
681791	681792	YP_3818	YP3819	rplM		FALSE	0.022	314.000	0.003	NA		NA
681793	681794	YP3820	YP3821		degQ	FALSE	0.184	271.000	0.154	NA		NA
681797	681798	YP3824	YP3825	murA	bolA2	TRUE	0.606	145.000	0.258	NA	N	NA
681798	681799	YP3825	YP3826	bolA2		TRUE	0.816	138.000	0.453	NA		NA
681799	681800	YP3826	YP3827			TRUE	0.904	36.000	0.308	NA		NA
681800	681801	YP3827	YP3828			TRUE	0.940	13.000	0.188	NA		NA
681801	681802	YP3828	YP3829			TRUE	0.991	-10.000	0.562	NA		NA
681802	681803	YP3829	YP3830			TRUE	0.881	218.000	0.530	NA	Y	NA
681804	681805	YP3831	YP3832		gutQ1	TRUE	0.886	24.000	0.226	1.000	N	NA
681805	681806	YP3832	YP3833	gutQ1		TRUE	0.638	249.000	0.598	1.000		NA
681806	681807	YP3833	YP3834			TRUE	0.997	-3.000	0.617	NA		NA
681807	681808	YP3834	YP3835			TRUE	0.961	-37.000	0.459	NA		NA
681808	681809	YP3835	YP3836			TRUE	0.991	7.000	0.543	NA		NA
681809	681810	YP3836	YP3837		rpoN	TRUE	0.724	62.000	0.163	1.000		NA
681810	5438121	YP3837	YP_3838	rpoN	yhbH	TRUE	0.625	24.000	0.000	NA		NA
5438121	681811	YP_3838	YP3839	yhbH	ptsN2	FALSE	0.274	106.000	0.000	NA		NA
681811	681812	YP3839	YP3840	ptsN2		FALSE	0.161	306.000	0.186	NA		NA
681812	681813	YP3840	YP3841		ptsO	TRUE	0.985	-3.000	0.182	NA		NA
681813	681814	YP3841	YP3842	ptsO	pyrB	FALSE	0.014	338.000	0.000	1.000	N	NA
681814	681815	YP3842	YP3843	pyrB	pyrI	TRUE	0.996	6.000	0.197	0.000	Y	NA
681815	681816	YP3843	YP3844	pyrI	tdcF5	FALSE	0.311	99.000	0.084	NA	N	NA
681816	681817	YP3844	YP_3845	tdcF5		FALSE	0.042	299.000	0.000	NA		NA
681817	681818	YP_3845	YP3846		treR	FALSE	0.089	234.000	0.000	NA		NA
681818	681819	YP3846	YP_3847	treR	treB	FALSE	0.008	411.000	0.000	1.000	N	NA
681819	681820	YP_3847	YP3848	treB	treC	TRUE	0.971	95.000	0.650	1.000	Y	NA
681820	681821	YP3848	YP3849	treC	rnk	FALSE	0.013	353.000	0.000	1.000	N	NA
681822	681823	YP3850	YP3851			FALSE	0.139	202.000	0.000	NA		NA
681823	681824	YP3851	YP3852		pmbA	FALSE	0.048	249.000	0.005	NA		NA
681826	681827	YP3854	YP3855			TRUE	0.986	5.000	0.329	NA		NA
681827	5438122	YP3855	YP_3856		gabD2	FALSE	0.152	195.000	0.000	NA		NA
5438122	681828	YP_3856	YP3857	gabD2		FALSE	0.058	267.000	0.000	NA		NA
681828	681829	YP3857	YP3858		emrK2	TRUE	0.998	2.000	1.000	NA		NA
681829	681830	YP3858	YP3859	emrK2		TRUE	0.951	8.000	0.150	NA		NA
681830	681831	YP3859	YP3860			FALSE	0.066	257.000	0.000	NA		NA
681832	681833	YP3861	YP3862	lysR22	lysR23	FALSE	0.337	252.000	0.000	NA	Y	NA
681835	681836	YP3864	YP3865	tcaA1	tcbA	TRUE	0.485	41.000	0.000	NA		NA
681836	681837	YP3865	YP3866	tcbA	tcaC1	TRUE	0.918	57.000	0.500	NA		NA
681837	681838	YP3866	YP3867	tcaC1		FALSE	0.238	134.000	0.000	NA		NA
681838	681839	YP3867	YP3868			TRUE	0.897	4.000	0.000	NA		NA
681839	681840	YP3868	YP3869			TRUE	0.984	-12.000	0.400	NA		NA
681840	681841	YP3869	YP3870			TRUE	0.822	-13.000	0.000	NA		NA
681841	681842	YP3870	YP3871		tccC1	TRUE	0.485	41.000	0.000	NA		NA
681842	681843	YP3871	YP3872	tccC1	tccC2	TRUE	0.952	25.000	0.000	0.010	Y	NA
681843	681844	YP3872	YP3873	tccC2		TRUE	0.522	-64.000	0.000	NA		NA
681845	681846	YP3874	YP3875	tldD		TRUE	0.962	12.000	0.259	NA		NA
681846	681847	YP3875	YP3876			TRUE	0.993	-3.000	0.358	NA		NA
681847	681848	YP3876	YP3877		cafA	TRUE	0.781	94.000	0.296	NA		NA
681848	681849	YP3877	YP3878	cafA	maf1	TRUE	0.982	-10.000	0.417	NA	N	NA
681849	681850	YP3878	YP3879	maf1	mreD	TRUE	0.953	8.000	0.206	NA	N	NA
681850	681851	YP3879	YP3880	mreD	mreC	TRUE	0.999	-3.000	0.550	0.002	Y	NA
681851	681852	YP3880	YP3881	mreC	mreB	TRUE	0.771	204.000	0.689	1.000	N	NA
681852	681853	YP3881	YP3882	mreB	rtn6	FALSE	0.014	337.000	0.000	1.000	N	NA
681854	681855	YP3883	YP3884	qor3		FALSE	0.295	157.000	0.059	1.000		NA
681855	681856	YP3884	YP3885			TRUE	0.999	0.000	0.790	0.032		NA
681856	681857	YP3885	YP3886		aroQ	FALSE	0.047	263.000	0.006	1.000		NA
681857	681858	YP3886	YP3887	aroQ	accB	TRUE	0.659	113.000	0.254	1.000	N	NA
681858	681859	YP3887	YP3888	accB	accC2	TRUE	0.995	12.000	0.275	0.000	Y	NA
681859	681860	YP3888	YP3889	accC2	proP33	FALSE	0.012	1110.000	0.103	NA		NA
681860	681861	YP3889	YP_3890	proP33	panF	TRUE	0.993	-10.000	0.682	NA		NA
681861	681862	YP_3890	YP_3891	panF	prmA	FALSE	0.222	76.000	0.041	1.000	N	NA
681862	681863	YP_3891	YP3892	prmA		FALSE	0.074	487.000	0.042	1.000	Y	NA
681863	681864	YP3892	YP3893		fiS	TRUE	0.817	25.000	0.161	1.000	N	NA
681865	681866	YP3894	YP3895			FALSE	0.092	231.000	0.000	NA		NA
681866	681867	YP3895	YP3896		gntR	FALSE	0.367	66.000	0.000	NA		NA
681867	681868	YP3896	YP3897	gntR	proP34	TRUE	0.613	27.000	0.000	1.000		NA
681868	681869	YP3897	YP3898	proP34		FALSE	0.418	154.000	0.105	1.000		NA
681869	681870	YP3898	YP3899		mmsB	FALSE	0.447	136.000	0.105	1.000		NA
681870	681871	YP3899	YP3900	mmsB	gloB5	FALSE	0.399	65.000	0.000	1.000		NA
681872	681873	YP3901	YP3902	pcp2		FALSE	0.054	276.000	0.000	NA		NA
681873	681874	YP3902	YP3903		cspa1	FALSE	0.298	93.000	0.000	NA		NA
681874	681875	YP3903	YP3904	cspa1	cspI	TRUE	0.688	185.000	0.000	0.060	Y	NA
681880	681881	YP3909	YP3910	gutQ2	araB2	TRUE	0.980	-3.000	0.102	0.014	N	NA
681881	681882	YP3910	YP3911	araB2	araH16	TRUE	0.968	4.000	0.184	1.000	N	NA
681882	681883	YP3911	YP3912	araH16	araH17	TRUE	1.000	2.000	0.900	0.010	Y	NA
681883	681884	YP3912	YP3913	araH17	mglA10	TRUE	0.999	-7.000	0.667	0.010	Y	NA
681884	681885	YP3913	YP3914	mglA10	rbsB13	TRUE	0.933	204.000	0.714	NA	Y	NA
681886	681887	YP_3915	YP3916	ddg		TRUE	0.470	44.000	0.000	NA		NA
681888	681889	YP3917	YP3918	nhaP		FALSE	0.035	328.000	0.000	1.000		NA
681891	681892	YP3920	YP3921	ssuB	ssuC	TRUE	0.999	-3.000	0.472	1.000	Y	NA
681892	681893	YP3921	YP3922	ssuC	ssuD	TRUE	0.959	9.000	0.226	1.000	N	NA
681893	5438123	YP3922	YP_3923	ssuD		TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
5438123	681894	YP_3923	YP3924		ssuE	TRUE	0.731	15.000	0.000	NA		NA
681895	681896	YP3925	YP3926	deoC3	rbsK5	FALSE	0.119	154.000	0.000	1.000	N	NA
681896	681897	YP3926	YP3927	rbsK5	rbsD2	TRUE	0.979	6.000	0.000	1.000	Y	NA
681899	681900	YP3929	YP3930	mviM6		TRUE	0.995	-3.000	0.455	NA		NA
681900	681901	YP3930	YP3931			FALSE	0.007	402.000	0.000	NA	N	NA
681902	681903	YP3932	YP3933		rhsA3	TRUE	0.833	9.000	0.000	NA		NA
681903	681904	YP3933	YP3934	rhsA3		TRUE	0.499	39.000	0.000	NA		NA
681904	681905	YP3934	YP3935		vgrG6	TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
681905	681906	YP3935	YP3936	vgrG6		TRUE	0.893	22.000	0.182	NA		NA
681907	681908	YP3937	YP3938	hipB6		TRUE	0.611	82.000	0.133	NA		NA
681908	681909	YP3938	YP3939			FALSE	0.339	76.000	0.000	NA		NA
681910	681911	YP3940	YP3941		rhsA4	TRUE	0.993	2.000	0.400	NA		NA
681911	681912	YP3941	YP3942	rhsA4	rhsA5	TRUE	0.577	28.000	0.000	NA		NA
681912	681913	YP3942	YP3943	rhsA5		TRUE	0.863	-34.000	0.143	NA		NA
681913	681914	YP3943	YP3944		vgrG7	TRUE	0.870	6.000	0.000	NA		NA
681914	681915	YP3944	YP3945	vgrG7		TRUE	0.646	22.000	0.000	NA		NA
681915	681916	YP3945	YP3946			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
681916	681917	YP3946	YP3947		icmF4	TRUE	0.743	125.000	0.312	NA		NA
681917	681918	YP3947	YP3948	icmF4		TRUE	0.974	32.000	0.750	NA		NA
681918	681919	YP3948	YP3949			TRUE	0.993	-12.000	0.711	NA		NA
681919	681920	YP3949	YP3950			TRUE	0.868	-12.000	0.053	NA		NA
681920	681921	YP3950	YP3951		clpB4	TRUE	0.942	-3.000	0.039	1.000		NA
681921	681922	YP3951	YP3952	clpB4		TRUE	0.983	11.000	0.471	NA		NA
681922	681923	YP3952	YP3953			TRUE	0.997	0.000	0.673	NA		NA
681923	681924	YP3953	YP3954			TRUE	0.997	3.000	0.765	NA		NA
681924	681925	YP3954	YP3955			TRUE	0.998	0.000	0.862	NA		NA
681925	681926	YP3955	YP3956			TRUE	0.848	126.000	0.510	NA		NA
681926	5438124	YP3956	YP_3957			TRUE	0.593	-45.000	0.000	NA		NA
681927	681928	YP3958	YP3959		tra5H	TRUE	0.924	54.000	0.167	1.000	Y	NA
681928	681929	YP3959	YP3960	tra5H	mdfA	FALSE	0.006	473.000	0.000	1.000	N	NA
681929	681930	YP3960	YP3961	mdfA		FALSE	0.014	446.000	0.000	NA		NA
681930	681931	YP3961	YP3962		araH18	FALSE	0.346	73.000	0.000	NA		NA
2214097	681933	YP3965	YP3966	selB	selA	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
681933	681934	YP3966	YP3967	selA	fdhE	FALSE	0.194	178.000	0.083	NA	N	NA
681934	681935	YP3967	YP3968	fdhE	fdoI	TRUE	0.978	0.000	0.182	NA	N	NA
681935	681936	YP3968	YP3969	fdoI	fdoH	TRUE	1.000	-3.000	0.944	0.000	Y	NA
681936	5438126	YP3969	YP_3970	fdoH	fdoG	TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
681937	681938	YP3971	YP3972	fdhD	sodA	FALSE	0.006	436.000	0.029	1.000	N	NA
681938	681939	YP3972	YP3973	sodA	tar3	FALSE	0.014	344.000	0.000	1.000	N	NA
681939	681940	YP3973	YP3974	tar3		FALSE	0.159	190.000	0.000	NA		NA
681940	681941	YP3974	YP3975			FALSE	0.009	532.000	0.000	NA		NA
681942	681943	YP3976	YP3977		mtlR	FALSE	0.039	357.000	0.067	NA		NA
681943	681944	YP3977	YP3978	mtlR	mtlD2	FALSE	0.393	207.000	0.230	NA	N	NA
681944	681945	YP3978	YP3979	mtlD2	mtlA	TRUE	0.973	32.000	0.292	1.000	Y	NA
681945	681946	YP3979	YP3980	mtlA		FALSE	0.007	650.000	0.000	NA		NA
681946	681947	YP3980	YP3981		glyS	FALSE	0.007	467.000	0.003	NA		NA
681947	681948	YP3981	YP3982	glyS	glyQ	TRUE	0.999	10.000	0.651	0.000	Y	NA
681949	681950	YP3983	YP3984		tag	FALSE	0.379	63.000	0.000	NA		NA
681950	681951	YP3984	YP3985	tag	wecD4	TRUE	0.933	-3.000	0.028	1.000		NA
681951	681952	YP3985	YP3986	wecD4	ompA6	FALSE	0.028	358.000	0.000	1.000		NA
681954	681955	YP_3988	YP3989	ldhA3	malS	FALSE	0.029	270.000	0.000	1.000	N	NA
681955	681956	YP3989	YP3990	malS		FALSE	0.016	415.000	0.000	NA		NA
681956	681957	YP3990	YP_3991		avtA	FALSE	0.013	455.000	0.000	NA		NA
681958	681959	YP3992	YP_3993		ibpB	FALSE	0.035	373.000	0.069	NA		NA
681959	681960	YP_3993	YP3994	ibpB	ibpA	FALSE	0.361	281.000	0.099	NA	Y	NA
681962	681963	YP3997	YP3998	tdcB		TRUE	0.996	-6.000	0.316	1.000	Y	NA
681963	681964	YP3998	YP3999			FALSE	0.058	218.000	0.000	1.000	N	NA
681964	681965	YP3999	YP4000		tra5I	TRUE	0.924	54.000	0.167	1.000	Y	NA
681966	681967	YP_4001	YP4002	cof4	gyrB2	FALSE	0.183	216.000	0.003	0.086		NA
681967	681968	YP4002	YP_4003	gyrB2	recF	TRUE	0.991	17.000	0.249	0.003	Y	NA
681968	681969	YP_4003	YP4004	recF	dnaN	TRUE	0.881	173.000	0.318	1.000	Y	NA
681969	681970	YP4004	YP4005	dnaN	dnaA2	TRUE	0.996	5.000	0.328	1.000	Y	NA
681971	681972	YP4006	YP4007		rpmH	FALSE	0.021	377.000	0.000	NA		NA
681972	681973	YP4007	YP4008	rpmH	rnpA	TRUE	0.986	19.000	0.787	1.000		NA
681973	681974	YP4008	YP4009	rnpA	yidC	FALSE	0.152	224.000	0.105	1.000	N	NA
681974	681975	YP4009	YP4010	yidC	thdF	TRUE	0.749	143.000	0.221	0.061		NA
681975	681976	YP4010	YP4011	thdF		FALSE	0.125	186.000	0.003	1.000		NA
681977	681978	YP4012	YP4013			FALSE	0.357	68.000	0.000	NA		NA
681978	681979	YP4013	YP4014			FALSE	0.009	545.000	0.000	NA		NA
681981	681982	YP4016	YP4017	artM5	gltJ2	TRUE	0.984	-52.000	0.282	0.014	Y	NA
681982	681983	YP4017	YP4018	gltJ2	artI4	TRUE	0.896	183.000	0.263	0.046	Y	NA
681983	681984	YP4018	YP4019	artI4		FALSE	0.045	220.000	0.000	NA	N	NA
681984	681985	YP4019	YP4020		phoU	FALSE	0.018	296.000	0.000	NA	N	NA
681985	681986	YP4020	YP4021	phoU	pstB2	TRUE	0.934	88.000	0.317	NA	Y	NA
681986	681987	YP4021	YP4022	pstB2	pstA2	TRUE	0.983	78.000	0.526	0.002	Y	NA
681987	681988	YP4022	YP4023	pstA2	pstC2	TRUE	0.999	2.000	0.537	0.002	Y	NA
681988	681989	YP4023	YP4024	pstC2	pstS2	TRUE	0.794	214.000	0.145	0.002	Y	NA
681989	681990	YP4024	YP4025	pstS2	glmS	FALSE	0.006	483.000	0.000	1.000	N	NA
681990	681991	YP4025	YP4026	glmS	glmU	TRUE	0.571	201.000	0.055	1.000	Y	NA
681991	681992	YP4026	YP4027	glmU	atpC	FALSE	0.007	615.000	0.067	1.000	N	NA
681992	681993	YP4027	YP4028	atpC	atpD	TRUE	0.998	22.000	0.837	0.003	Y	NA
681993	681994	YP4028	YP4029	atpD	atpG	TRUE	0.979	156.000	0.724	0.003	Y	NA
681994	681995	YP4029	YP4030	atpG	atpA	TRUE	0.993	62.000	0.846	0.003	Y	NA
681995	681996	YP4030	YP4031	atpA	atpH	TRUE	0.998	15.000	0.864	0.003	Y	NA
681996	681997	YP4031	YP4032	atpH	atpF	TRUE	0.992	15.000	0.242	0.003	Y	NA
681997	681998	YP4032	YP4033	atpF	atpE	TRUE	0.989	62.000	0.666	0.003	Y	NA
681998	681999	YP4033	YP4034	atpE	atpB	TRUE	0.989	50.000	0.557	0.003	Y	NA
681999	682000	YP4034	YP_4035	atpB	atpI	TRUE	0.982	40.000	0.291	0.003	Y	NA
682000	682001	YP_4035	YP4036	atpI	gidB	FALSE	0.001	667.000	0.005	1.000	N	NA
682001	682002	YP4036	YP_4037	gidB	gidA	TRUE	0.830	95.000	0.466	1.000	N	NA
682002	678007	YP_4037	YP0001	gidA	fldA1	FALSE	0.010	381.000	0.000	1.000	N	NA
682003	682004	pCD01	pCD02	tnp		TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
682004	682005	pCD02	pCD03			FALSE	0.376	71.000	0.000	1.000		NA
682007	682008	pCD05	pCD06		repB	TRUE	0.891	138.000	0.667	1.000		NA
682008	682009	pCD06	pCD06.1	repB		FALSE	0.238	135.000	0.000	NA		NA
682009	682010	pCD06.1	pCD07		tap	TRUE	0.540	33.000	0.000	NA		NA
682010	682011	pCD07	pCD08	tap	repA	TRUE	0.878	-7.000	0.000	NA		NA
682013	2214100	pCD10	YP_pCD11			TRUE	0.711	-27.000	0.000	NA		NA
2214100	682014	YP_pCD11	pCD12			FALSE	0.043	296.000	0.000	NA		NA
682014	682015	pCD12	pCD13		ypkA	TRUE	0.980	8.000	0.308	1.000		NA
682015	682016	pCD13	pCD14	ypkA	yopJ	FALSE	0.018	396.000	0.000	NA		NA
682018	682019	pCD16	pCD17		yopH	FALSE	0.050	283.000	0.000	NA		NA
682020	682021	pCD18	pCD19	ORFC	ORFB	TRUE	0.976	-3.000	0.000	0.011		NA
682021	682022	pCD19	pCD20	ORFB	ORFA	TRUE	0.651	24.000	0.000	1.000		NA
682022	682023	pCD20	pCD21	ORFA	yscM	FALSE	0.010	548.000	0.000	1.000		NA
682023	682024	pCD21	pCD22	yscM	yscL	FALSE	0.109	225.000	0.000	1.000		NA
682024	682025	pCD22	pCD23	yscL	yscK	TRUE	0.975	-54.000	0.727	1.000		NA
682025	682026	pCD23	pCD24	yscK	yscJ	TRUE	0.991	-21.000	0.800	1.000		NA
682026	682027	pCD24	pCD25	yscJ	yscI	TRUE	0.991	7.000	0.333	0.010		NA
682027	682028	pCD25	pCD26	yscI	yscH	TRUE	0.996	1.000	0.333	0.006		NA
682028	682029	pCD26	pCD27	yscH	yscG	TRUE	0.999	-3.000	0.900	0.006		NA
682029	682030	pCD27	pCD28	yscG	yscF	TRUE	0.998	2.000	0.556	0.006		NA
682030	682031	pCD28	pCD29	yscF	yscE	TRUE	0.997	1.000	0.417	0.006		NA
682031	682032	pCD29	pCD30	yscE	yscD	TRUE	0.990	-3.000	0.268	NA		NA
682032	682033	pCD30	pCD31	yscD	yscC	TRUE	0.988	-3.000	0.220	NA		NA
682033	682034	pCD31	pCD32	yscC	yscB	TRUE	0.995	6.000	0.750	1.000		NA
682034	682035	pCD32	pCD33	yscB	yscA	FALSE	0.097	226.000	0.000	NA		NA
682035	682036	pCD33	pCD34	yscA	virF	TRUE	0.653	79.000	0.154	NA		NA
682036	682037	pCD34	pCD35	virF	virG	TRUE	0.551	124.000	0.154	NA		NA
682037	682038	pCD35	pCD36	virG	yscU	FALSE	0.008	576.000	0.000	NA		NA
682038	682039	pCD36	pCD37	yscU	yscT	TRUE	0.999	0.000	0.548	0.061	Y	NA
682039	682040	pCD37	pCD38	yscT	yscS	TRUE	0.993	-3.000	0.000	0.061	Y	NA
682040	682041	pCD38	pCD39	yscS	yscR	TRUE	0.993	2.000	0.000	0.010	Y	NA
682041	682042	pCD39	pCD40	yscR	yscQ	TRUE	0.999	-3.000	0.529	1.000	Y	NA
682042	682043	pCD40	pCD41	yscQ	yscP	TRUE	0.994	-3.000	0.235	0.009		NA
682043	682044	pCD41	pCD42	yscP	yscO	TRUE	0.980	0.000	0.150	NA		NA
682044	682045	pCD42	pCD43	yscO	yscN	TRUE	0.992	-3.000	0.300	NA		NA
682046	682047	pCD44	pCD45	yopN	tyeA	TRUE	0.906	-19.000	0.125	NA		NA
682047	682048	pCD45	pCD46	tyeA	sycN	TRUE	0.963	-13.000	0.214	NA		NA
682048	682049	pCD46	pCD47	sycN	yscX	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682049	682050	pCD47	pCD48	yscX	yscY	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682050	682051	pCD48	pCD49	yscY	yscV	TRUE	0.883	-13.000	0.062	1.000		NA
682051	682052	pCD49	pCD50	yscV	lcrR	TRUE	0.991	-3.000	0.281	NA		NA
682052	682053	pCD50	pCD51	lcrR	lcrG	TRUE	0.978	42.000	1.000	NA		NA
682053	682054	pCD51	pCD52	lcrG	lcrV	TRUE	0.995	2.000	0.556	NA		NA
682054	682055	pCD52	pCD53	lcrV	sycD	TRUE	0.986	3.000	0.235	1.000		NA
682055	682056	pCD53	pCD54	sycD	yopB	TRUE	0.986	-22.000	0.632	1.000		NA
682056	682057	pCD54	pCD55	yopB	yopD	TRUE	0.974	19.000	0.526	NA		NA
2214101	682058	YP_pCD56	pCD57			TRUE	0.524	35.000	0.000	NA		NA
682058	2214102	pCD57	YP_pCD58			TRUE	0.531	34.000	0.000	NA		NA
682059	682060	pCD59	pCD60		yopM	FALSE	0.018	394.000	0.000	NA		NA
2214103	682061	YP_pCD61	pCD62			TRUE	0.794	-16.000	0.000	NA		NA
682064	682065	pCD66	pCD67	sycT	yopT	TRUE	0.998	0.000	0.500	0.006		NA
682066	2214105	pCD68	YP_pCD69	yopQ		FALSE	0.236	138.000	0.000	NA		NA
2214105	2214106	YP_pCD69	YP_pCD70		ylpA	FALSE	0.238	133.000	0.000	NA		NA
2214106	682067	YP_pCD70	pCD71	ylpA		FALSE	0.281	101.000	0.000	NA		NA
682067	682068	pCD71	pCD72			TRUE	0.950	24.000	0.250	0.064		NA
682068	2214107	pCD72	YP_pCD73			FALSE	0.271	109.000	0.000	NA		NA
2214107	682069	YP_pCD73	YP_pCD74		sopA	FALSE	0.006	800.000	0.000	NA		NA
682069	682070	YP_pCD74	pCD75	sopA	sopB	TRUE	0.975	-15.000	0.400	1.000	N	NA
682070	682071	pCD75	pCD76	sopB		FALSE	0.227	148.000	0.000	NA		NA
682071	2214108	pCD76	YP_pCD77			FALSE	0.010	519.000	0.000	NA		NA
2214108	682072	YP_pCD77	pCD78			FALSE	0.268	111.000	0.000	NA		NA
682072	682073	pCD78	pCD79			TRUE	0.980	-7.000	0.250	NA		NA
682074	682075	pCD80	pCD81		yopE	TRUE	0.919	2.000	0.000	NA		NA
682077	682078	pCD83	pCD84			FALSE	0.169	184.000	0.000	NA		NA
682079	2214109	pCD85	YP_pCD86			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
2214109	682080	YP_pCD86	pCD87		sycH	FALSE	0.028	344.000	0.000	NA		NA
682081	682082	pCD88	pCD89			TRUE	0.800	24.000	0.000	0.064		NA
682082	682083	pCD89	pCD90			FALSE	0.282	100.000	0.000	NA		NA
682083	682084	pCD90	pCD91			FALSE	0.235	139.000	0.000	NA		NA
682084	682085	pCD91	pCD92		tnpR	TRUE	0.676	19.000	0.000	NA		NA
682087	682088	pCD97	pCD98			FALSE	0.194	166.000	0.000	NA		NA
682088	682003	pCD98	pCD01		tnp	TRUE	0.785	120.000	0.000	0.064	Y	NA
682092	682093	pCRY04	pCRY05	nusG		TRUE	0.688	18.000	0.000	NA		NA
682093	682094	pCRY05	pCRY06			TRUE	0.882	5.000	0.000	NA		NA
682094	682095	pCRY06	pCRY07		virB1	TRUE	0.850	118.000	0.500	NA		NA
682095	682096	pCRY07	pCRY08	virB1	virB2	TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA		NA
682096	682097	pCRY08	pCRY09	virB2	virB4	TRUE	0.965	67.000	1.000	NA		NA
682097	682098	pCRY09	pCRY10	virB4	virB5	TRUE	0.989	18.000	0.857	NA		NA
682098	682099	pCRY10	pCRY11	virB5		TRUE	0.991	14.000	0.857	NA		NA
682099	682100	pCRY11	pCRY12		virB6	TRUE	0.967	11.000	0.273	NA		NA
682100	682101	pCRY12	pCRY13	virB6	virB8	FALSE	0.437	221.000	0.000	NA	Y	NA
682101	682102	pCRY13	pCRY14	virB8	virB9	TRUE	1.000	-3.000	1.000	NA	Y	NA
682102	682103	pCRY14	pCRY15	virB9	virB10	TRUE	0.991	44.000	0.857	NA	Y	NA
682103	682104	pCRY15	pCRY16	virB10	virB11	TRUE	0.997	-10.000	0.571	1.000	Y	NA
682104	682105	pCRY16	pCRY17	virB11		TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
682105	682106	pCRY17	pCRY18			TRUE	0.846	36.000	0.200	NA		NA
682106	682107	pCRY18	pCRY19			TRUE	0.887	34.000	0.250	NA		NA
682107	682108	pCRY19	pCRY20			TRUE	0.930	21.000	0.250	NA		NA
682108	682109	pCRY20	pCRY21			FALSE	0.254	119.000	0.000	NA		NA
682109	682110	pCRY21	pCRY22			TRUE	0.836	-12.000	0.000	NA		NA
682110	682111	pCRY22	pCRY23			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682111	682112	pCRY23	pCRY24			TRUE	0.726	37.000	0.111	NA		NA
682112	682113	pCRY24	pCRY25			TRUE	0.619	61.000	0.111	NA		NA
682114	682115	pCRY26	pCRY27		parA	TRUE	0.485	41.000	0.000	NA		NA
682115	682116	pCRY27	pCRY28	parA	mpr	FALSE	0.271	121.000	0.000	1.000		NA
682116	682117	pCRY28	pCRY29	mpr	hipB2	FALSE	0.046	300.000	0.000	1.000		NA
682119	682120	pMT001	pMT002			TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
682121	682122	pMT003	pMT004			FALSE	0.298	93.000	0.000	NA		NA
682122	682123	pMT004	pMT005			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682123	682124	pMT005	pMT006			TRUE	0.540	33.000	0.000	NA		NA
682124	682125	pMT006	pMT007			TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
682125	682126	pMT007	pMT008			TRUE	0.961	16.000	0.333	NA		NA
682126	682127	pMT008	pMT009			TRUE	0.994	-12.000	0.800	NA		NA
682127	682128	pMT009	pMT010			TRUE	0.990	-7.000	0.444	NA		NA
682128	682129	pMT010	pMT011			FALSE	0.405	57.000	0.000	NA		NA
682129	682130	pMT011	pMT012			TRUE	0.479	42.000	0.000	NA		NA
682130	682131	pMT012	pMT013			TRUE	0.994	8.000	0.750	NA		NA
682131	682132	pMT013	pMT014			FALSE	0.330	81.000	0.000	NA		NA
682132	682133	pMT014	pMT015			FALSE	0.393	60.000	0.000	NA		NA
682133	682134	pMT015	pMT016			TRUE	0.836	75.000	0.333	NA		NA
682134	682135	pMT016	pMT017			TRUE	0.997	2.000	0.667	NA		NA
682135	682136	pMT017	pMT018			TRUE	0.994	-9.000	0.667	NA		NA
682136	682137	pMT018	pMT019			TRUE	0.990	-16.000	0.667	NA		NA
682137	682138	pMT019	pMT020			TRUE	0.999	0.000	1.000	NA		NA
682138	682139	pMT020	pMT021			TRUE	0.957	44.000	0.667	NA		NA
682139	682140	pMT021	pMT022			TRUE	0.544	75.000	0.100	NA		NA
682140	682141	pMT022	pMT023			TRUE	0.765	27.000	0.100	NA		NA
682141	682142	pMT023	pMT024			TRUE	0.924	23.000	0.250	NA		NA
682142	682143	pMT024	pMT025			TRUE	0.959	19.000	0.375	NA		NA
682143	682144	pMT025	pMT026			TRUE	0.996	3.000	0.667	NA		NA
682144	682145	pMT026	pMT027			TRUE	0.817	196.000	0.667	NA		NA
682145	682146	pMT027	pMT028			TRUE	0.815	10.000	0.000	NA		NA
682146	682147	pMT028	pMT029			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682147	682148	pMT029	pMT030			TRUE	0.878	-7.000	0.000	NA		NA
682148	682149	pMT030	pMT031			TRUE	0.661	-63.000	0.068	1.000		NA
682149	682150	pMT031	pMT032			TRUE	0.985	-33.000	0.222	0.063	Y	NA
682151	682152	pMT033	pMT034			TRUE	0.977	3.000	0.167	NA		NA
682152	682153	pMT034	pMT035			TRUE	0.690	60.000	0.143	NA		NA
682153	682154	pMT035	pMT036			TRUE	0.874	-31.000	0.143	NA		NA
682154	682155	pMT036	pMT037			FALSE	0.033	324.000	0.000	NA		NA
682155	682156	pMT037	pMT038			TRUE	0.922	85.000	0.667	NA		NA
682156	10692432	pMT038	YP_pMT039			FALSE	0.041	301.000	0.000	NA		NA
682157	682158	pMT040	pMT041			TRUE	0.764	13.000	0.000	NA		NA
682158	682159	pMT041	pMT042			TRUE	0.613	-40.000	0.000	NA		NA
682159	682160	pMT042	pMT043		tnp	FALSE	0.239	131.000	0.000	NA		NA
682160	682161	pMT043	pMT044	tnp		FALSE	0.086	239.000	0.000	NA		NA
682161	682162	pMT044	pMT045			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682162	682163	pMT045	pMT046			FALSE	0.230	157.000	0.000	1.000		NA
682163	682164	pMT046	pMT047			TRUE	0.975	108.000	0.500	0.002	Y	NA
682164	682165	pMT047	pMT048			FALSE	0.267	78.000	0.002	1.000		NA
682165	682166	pMT048	pMT049			TRUE	0.665	13.000	0.002	NA		NA
682166	682167	pMT049	pMT050			TRUE	0.985	-10.000	0.400	NA		NA
682167	682168	pMT050	pMT051			TRUE	0.994	-3.000	0.400	NA		NA
682168	682169	pMT051	pMT052			TRUE	0.944	-3.000	0.049	NA		NA
682170	682171	pMT053	pMT054			TRUE	0.488	-103.000	0.000	NA		NA
682172	10692433	pMT055	YP_pMT056			FALSE	0.339	76.000	0.000	NA		NA
682174	682175	pMT058	pMT059			TRUE	0.997	-3.000	0.667	NA		NA
682175	682176	pMT059	pMT060			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682176	682177	pMT060	pMT061			TRUE	0.979	41.000	1.000	NA		NA
682177	682178	pMT061	pMT062			TRUE	0.965	68.000	1.000	NA		NA
682178	682179	pMT062	pMT063			TRUE	0.990	-16.000	0.667	NA		NA
682179	682180	pMT063	pMT064			TRUE	0.875	154.000	0.667	NA		NA
682180	682181	pMT064	pMT065			TRUE	0.996	4.000	0.667	NA		NA
682181	682182	pMT065	pMT066			FALSE	0.210	91.000	0.002	NA		NA
682182	682183	pMT066	pMT067			TRUE	0.911	3.000	0.000	NA		NA
682183	682184	pMT067	pMT068			TRUE	0.932	0.000	0.000	NA		NA
682184	682185	pMT068	pMT069			FALSE	0.377	61.000	0.033	NA		NA
682185	682186	pMT069	pMT070			TRUE	0.943	120.000	1.000	NA		NA
682188	10692434	pMT072	YP_pMT073			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682189	682190	pMT074	pMT075			TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
682191	682192	pMT076	pMT077			TRUE	0.912	97.000	0.667	NA		NA
682192	682193	pMT077	pMT078			TRUE	0.903	110.000	0.667	NA		NA
682194	682195	pMT079	pMT080			FALSE	0.214	155.000	0.000	NA		NA
682196	682197	pMT081	pMT082		caf1	FALSE	0.007	686.000	0.000	NA		NA
682197	682198	pMT082	pMT083	caf1	caf1A	TRUE	0.960	81.000	1.000	NA		NA
682198	682199	pMT083	pMT084	caf1A	caf1M	TRUE	0.992	25.000	0.667	1.000	Y	NA
682201	682202	pMT086	pMT087			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
682202	682203	pMT087	pMT088			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
682203	682204	pMT088	pMT089			TRUE	0.995	-16.000	1.000	NA		NA
682204	682205	pMT089	pMT090			TRUE	0.910	0.000	0.017	NA		NA
10692435	682209	YP_pMT094	pMT095			FALSE	0.361	67.000	0.000	NA		NA
682209	682210	pMT095	pMT096			TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
682210	682211	pMT096	pMT097			FALSE	0.328	124.000	0.000	0.063	N	NA
682211	682212	pMT097	pMT098			FALSE	0.346	73.000	0.000	NA		NA
682216	682217	pMT102	pMT103			TRUE	0.948	54.000	0.667	NA		NA
682217	682218	pMT103	pMT104			TRUE	0.967	-61.000	0.667	NA		NA
682218	682219	pMT104	pMT105			TRUE	0.997	0.000	0.667	NA		NA
682224	682225	pMT110	pMT111			TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA		NA
682226	682227	pMT112	pMT113	parB	parA	TRUE	0.996	-3.000	0.667	1.000	N	NA
682228	682229	pMT114	pMT115			TRUE	0.992	0.000	0.300	NA		NA
682229	682230	pMT115	pMT116			FALSE	0.143	200.000	0.000	NA		NA
682230	682231	pMT116	pMT117			TRUE	0.657	21.000	0.000	NA		NA
682235	682236	pMT121	pMT122			TRUE	0.939	-109.000	0.500	NA		NA
682239	682240	pMT125	pMT126			FALSE	0.155	427.000	0.000	0.018	Y	NA
682240	10692436	pMT126	YP_pMT127			TRUE	0.531	34.000	0.000	NA		NA
682241	682242	pPCP01	pPCP02			TRUE	0.990	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
682242	682243	pPCP02	pPCP03		rop	FALSE	0.005	1037.000	0.000	NA		NA
682243	682244	pPCP03	pPCP04	rop		FALSE	0.023	367.000	0.000	NA		NA
682244	682245	pPCP04	pPCP05		pim	FALSE	0.011	486.000	0.000	NA		NA
682247	682248	pPCP07	pPCP08		pla	FALSE	0.080	243.000	0.000	NA		NA
682249	682250	pPCP09	pPCP10			TRUE	0.994	0.000	0.400	NA		NA