MicrobesOnline Operon Predictions for Nitrosomonas europaea ATCC 19718

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
366750	366751	NE0001	NE0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.830	201.000	0.328	1.000	Y	NA
366751	366752	NE0002	NE0003	dnaN	gyrB	TRUE	0.972	49.000	0.114	1.000	Y	NA
366752	366753	NE0003	NE0004	gyrB		TRUE	0.539	23.000	0.002	NA		NA
366753	366754	NE0004	NE0005			TRUE	0.851	51.000	0.056	NA		NA
366754	5437935	NE0005	RNA_36		tRNAGly3	FALSE	0.124	136.000	0.000	NA		NA
5437935	5437936	RNA_36	RNA_37	tRNAGly3	tRNACys1	FALSE	0.257	92.000	0.000	NA		NA
5437936	5437937	RNA_37	RNA_38	tRNACys1	tRNALeu4	TRUE	0.523	26.000	0.000	NA		NA
5437937	366755	RNA_38	NE0006	tRNALeu4	fdxA	FALSE	0.036	222.000	0.000	NA		NA
366755	366756	NE0006	NE0007	fdxA		TRUE	0.989	44.000	0.667	NA		NA
366757	366758	NE0008	NE0009	mfd		TRUE	0.544	27.000	0.002	NA		NA
366758	366759	NE0009	NE0010		recJ	TRUE	0.578	-28.000	0.005	NA		NA
366759	366760	NE0010	NE0011	recJ	cyp	FALSE	0.149	144.000	0.002	1.000		NA
366760	366761	NE0011	NE0012	cyp	trpC	FALSE	0.448	84.000	0.005	1.000		NA
366761	366762	NE0012	NE0013	trpC	trpD	TRUE	0.997	2.000	0.293	1.000	Y	NA
366762	366763	NE0013	NE0014	trpD	trpG	TRUE	0.994	-3.000	0.105	1.000	Y	NA
366764	366765	NE0015	NE0016	yfhK		TRUE	0.965	-3.000	0.044	1.000		NA
366765	366766	NE0016	NE0017		yfhA	TRUE	0.896	13.000	0.043	1.000		NA
366767	366768	NE0018	NE0019		purL	FALSE	0.318	126.000	0.011	1.000		NA
366769	366770	NE0020	NE0021			FALSE	0.021	275.000	0.000	NA		NA
366771	366772	NE0022	NE0023		xthA1	TRUE	0.797	19.000	0.010	1.000	N	NA
366774	366775	NE0025	NE0026		bioA	TRUE	0.795	7.000	0.003	1.000		NA
366776	366777	NE0027	NE0028	groES	groEL	TRUE	0.997	40.000	0.538	0.010	Y	NA
366777	366778	NE0028	NE0029	groEL		FALSE	0.231	151.000	0.006	1.000	N	NA
366778	5437938	NE0029	RNA_39		tRNALeu5	FALSE	0.078	166.000	0.000	NA		NA
5437938	366779	RNA_39	NE0030	tRNALeu5	tig	FALSE	0.290	86.000	0.000	NA		NA
366779	366780	NE0030	NE0031	tig	clpP,lopP	TRUE	0.994	-16.000	0.351	1.000	Y	NA
366780	366781	NE0031	NE0032	clpP,lopP	clpX	TRUE	0.989	61.000	0.352	1.000	Y	NA
366781	366782	NE0032	NE0033	clpX	lon	TRUE	0.928	111.000	0.201	1.000	Y	NA
366782	366783	NE0033	NE0034	lon		FALSE	0.018	355.000	0.000	1.000	N	NA
366783	366784	NE0034	NE0035			FALSE	0.029	293.000	0.000	1.000	N	NA
366785	366786	NE0036	NE0037		pcm	TRUE	0.770	63.000	0.019	1.000	N	NA
366787	366788	NE0038	NE0039	thiC	bacA	TRUE	0.701	48.000	0.004	1.000	N	NA
366789	366790	NE0040	NE0041		ppiB	TRUE	0.687	82.000	0.031	NA	N	NA
366790	366791	NE0041	NE0042	ppiB	ppiA	TRUE	0.997	19.000	0.577	0.005	Y	NA
366793	366794	NE0044	NE0045		motB	TRUE	0.745	6.000	0.000	NA		NA
366794	366795	NE0045	NE0046	motB	motA	TRUE	0.970	40.000	0.097	1.000	Y	NA
366796	366797	NE0047	NE0048			FALSE	0.026	303.000	0.000	1.000	N	NA
366797	366798	NE0048	NE0049			TRUE	0.973	0.000	0.049	1.000	N	NA
366798	366799	NE0049	NE0050		sucC	TRUE	0.931	-3.000	0.006	1.000	N	NA
366799	366800	NE0050	NE0051	sucC	sucD	TRUE	0.997	3.000	0.151	0.002	Y	NA
366800	366801	NE0051	NE0052	sucD		TRUE	0.542	19.000	0.000	NA		NA
366801	366802	NE0052	NE0053			TRUE	0.542	19.000	0.000	NA		NA
366802	5437939	NE0053	RNA_42		rrnA	FALSE	0.009	400.000	0.000	NA		NA
5437939	5437940	RNA_42	RNA_45	rrnA	16S_rRNA	FALSE	0.328	-1977.000	0.000	NA		NA
5437940	5437941	RNA_45	RNA_40	16S_rRNA	tRNAIle1	FALSE	0.243	95.000	0.000	NA		NA
5437941	5437942	RNA_40	RNA_41	tRNAIle1	tRNAAla2	TRUE	0.780	4.000	0.000	NA		NA
5437942	5437943	RNA_41	RNA_46	tRNAAla2	23S_rRNA	FALSE	0.094	156.000	0.000	NA		NA
5437943	5437944	RNA_46	RNA_44	23S_rRNA	5S_rRNA	FALSE	0.381	70.000	0.000	NA		NA
5437944	366803	RNA_44	NE0054	5S_rRNA		FALSE	0.007	476.000	0.000	NA		NA
366803	366804	NE0054	NE0055		ispZ	FALSE	0.441	119.000	0.005	0.056	N	NA
366804	366805	NE0055	NE0056	ispZ	mutY	TRUE	0.668	29.000	0.002	1.000	N	NA
366805	366806	NE0056	NE0057	mutY		TRUE	0.831	-7.000	0.003	1.000	N	NA
366807	366808	NE0058	NE0059			TRUE	0.770	19.000	0.007	1.000	N	NA
366808	366809	NE0059	NE0060		ptsN	TRUE	0.988	-13.000	0.177	1.000	Y	NA
366809	366810	NE0060	NE0061	ptsN		TRUE	0.563	232.000	0.309	NA	N	NA
366810	366811	NE0061	NE0062		rpoN1	TRUE	0.859	176.000	0.574	NA	N	NA
366811	366812	NE0062	NE0063	rpoN1		TRUE	0.957	7.000	0.075	1.000		NA
366812	366813	NE0063	NE0064			TRUE	0.986	35.000	0.543	NA		NA
366813	366814	NE0064	NE0065			TRUE	0.979	57.000	0.459	NA		NA
366815	366816	NE0066	NE0067	nadA		TRUE	0.929	0.000	0.011	NA		NA
366816	366817	NE0067	NE0068			TRUE	0.992	-3.000	0.216	NA		NA
366817	366818	NE0068	NE0069		pcnB	FALSE	0.246	153.000	0.008	1.000	N	NA
366818	366819	NE0069	NE0070	pcnB		TRUE	0.994	-3.000	0.234	1.000	N	NA
366819	366820	NE0070	NE0071			TRUE	0.977	-3.000	0.063	1.000	N	NA
366820	366821	NE0071	NE0072		panB	TRUE	0.972	1.000	0.055	1.000	N	NA
366821	366822	NE0072	NE0073	panB	panC	TRUE	0.996	24.000	0.395	0.001	Y	NA
366823	366824	NE0074	NE0075			TRUE	0.760	38.000	0.008	1.000	N	NA
366825	366826	NE0076	NE0077			TRUE	0.972	-3.000	0.059	1.000		NA
366826	366827	NE0077	NE0078			TRUE	0.960	-3.000	0.034	1.000		NA
366828	366829	NE0079	NE0080	fkpA		FALSE	0.179	143.000	0.000	1.000	N	NA
366829	366830	NE0080	NE0081			TRUE	0.516	100.000	0.023	1.000		NA
366831	366832	NE0082	NE0083			TRUE	0.985	14.000	0.375	NA		NA
366832	366833	NE0083	NE0084			FALSE	0.186	167.000	0.013	NA		NA
366834	366835	NE0085	NE0086			TRUE	0.800	14.000	0.012	NA		NA
366835	366836	NE0086	NE0087		purN	TRUE	0.840	-3.000	0.002	NA		NA
366836	366837	NE0087	NE0088	purN	purM	TRUE	0.953	12.000	0.002	0.003	Y	NA
366839	366840	NE0090	NE0091			FALSE	0.021	293.000	0.000	1.000		NA
366840	366841	NE0091	NE0092			FALSE	0.043	205.000	0.000	NA		NA
366841	366842	NE0092	NE0093			FALSE	0.006	486.000	0.000	NA		NA
366842	366843	NE0093	NE0094		guaA	FALSE	0.004	1449.000	0.000	1.000		NA
366843	366844	NE0094	NE0095	guaA	guaB	TRUE	0.994	12.000	0.190	0.001	Y	NA
366844	366845	NE0095	NE0096	guaB		FALSE	0.188	114.000	0.002	NA		NA
366845	366846	NE0096	NE0097			TRUE	0.812	46.000	0.032	NA		NA
366846	366847	NE0097	NE0098			FALSE	0.444	134.000	0.045	1.000		NA
366847	366848	NE0098	NE0099			FALSE	0.266	139.000	0.010	1.000		NA
366848	366849	NE0099	NE0100			TRUE	0.777	29.000	0.015	1.000		NA
366849	366850	NE0100	NE0101		hprA	FALSE	0.091	167.000	0.000	1.000		NA
366850	366851	NE0101	NE0102	hprA	cyt_c552	FALSE	0.195	216.000	0.000	1.000	Y	NA
366851	366852	NE0102	NE0103	cyt_c552	yyaL	TRUE	0.803	21.000	0.011	1.000	N	NA
366852	366853	NE0103	NE0104	yyaL		TRUE	0.801	22.000	0.011	1.000	N	NA
366854	366855	NE0105	NE0106	lgt		TRUE	0.675	20.000	0.003	NA	N	NA
366855	366856	NE0106	NE0107			TRUE	0.999	0.000	0.922	NA	Y	NA
366856	366857	NE0107	NE0108		dapE	TRUE	0.704	51.000	0.005	1.000	N	NA
366858	366859	NE0109	NE0110			FALSE	0.004	948.000	0.000	NA		NA
11459134	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8545.000	0.000	NA		NA
11601497	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8545.000	0.000	NA		NA
11743889	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8545.000	0.000	NA		NA
11459135	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8566.000	0.000	NA		NA
11601498	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8566.000	0.000	NA		NA
11743890	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8566.000	0.000	NA		NA
11459136	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8600.000	0.000	NA		NA
11601499	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8600.000	0.000	NA		NA
11743891	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8600.000	0.000	NA		NA
11459137	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8636.000	0.000	NA		NA
11601500	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8636.000	0.000	NA		NA
11743892	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8636.000	0.000	NA		NA
11459138	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8669.000	0.000	NA		NA
11601501	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8669.000	0.000	NA		NA
11743893	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8669.000	0.000	NA		NA
11459139	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8705.000	0.000	NA		NA
11601502	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8705.000	0.000	NA		NA
11743894	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8705.000	0.000	NA		NA
11459140	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8739.000	0.000	NA		NA
11601503	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8739.000	0.000	NA		NA
11743895	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8739.000	0.000	NA		NA
11459141	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8775.000	0.000	NA		NA
11601504	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8775.000	0.000	NA		NA
11743896	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8775.000	0.000	NA		NA
11459142	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8810.000	0.000	NA		NA
11601505	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8810.000	0.000	NA		NA
11743897	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8810.000	0.000	NA		NA
11459143	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8846.000	0.000	NA		NA
11601506	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8846.000	0.000	NA		NA
11743898	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8846.000	0.000	NA		NA
11459144	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8881.000	0.000	NA		NA
11601507	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8881.000	0.000	NA		NA
11743899	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8881.000	0.000	NA		NA
11459145	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8917.000	0.000	NA		NA
11601508	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8917.000	0.000	NA		NA
11743900	366851		NE0102		cyt_c552	FALSE	NA	8917.000	0.000	NA		NA
11459146	366860		NE0111			FALSE	NA	683.000	0.000	NA		NA
11601509	366860		NE0111			FALSE	NA	683.000	0.000	NA		NA
11743901	366860		NE0111			FALSE	NA	683.000	0.000	NA		NA
11459147	366860		NE0111			FALSE	NA	648.000	0.000	NA		NA
11601510	366860		NE0111			FALSE	NA	648.000	0.000	NA		NA
11743902	366860		NE0111			FALSE	NA	648.000	0.000	NA		NA
11459148	366860		NE0111			FALSE	NA	612.000	0.000	NA		NA
11601511	366860		NE0111			FALSE	NA	612.000	0.000	NA		NA
11743903	366860		NE0111			FALSE	NA	612.000	0.000	NA		NA
11459149	366860		NE0111			FALSE	NA	577.000	0.000	NA		NA
11601512	366860		NE0111			FALSE	NA	577.000	0.000	NA		NA
11743904	366860		NE0111			FALSE	NA	577.000	0.000	NA		NA
11459150	366860		NE0111			FALSE	NA	541.000	0.000	NA		NA
11601513	366860		NE0111			FALSE	NA	541.000	0.000	NA		NA
11743905	366860		NE0111			FALSE	NA	541.000	0.000	NA		NA
11459151	366860		NE0111			FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11601514	366860		NE0111			FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11743906	366860		NE0111			FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11459152	366860		NE0111			FALSE	NA	470.000	0.000	NA		NA
11601515	366860		NE0111			FALSE	NA	470.000	0.000	NA		NA
11743907	366860		NE0111			FALSE	NA	470.000	0.000	NA		NA
366859	366860	NE0110	NE0111			TRUE	0.975	34.000	0.133	NA	Y	NA
366860	366861	NE0111	NE0112			TRUE	0.946	22.000	0.158	NA		NA
366861	366862	NE0112	NE0113			TRUE	0.510	35.000	0.000	NA		NA
366862	366863	NE0113	NE0114			FALSE	0.476	-25.000	0.000	NA		NA
366863	366864	NE0114	NE0115			FALSE	0.024	257.000	0.000	NA		NA
366864	366865	NE0115	NE0116			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
366865	366866	NE0116	NE0117			TRUE	0.994	-3.000	0.300	NA		NA
366866	366867	NE0117	NE0118			TRUE	0.500	-22.000	0.000	NA		NA
366867	366868	NE0118	NE0119			TRUE	0.522	28.000	0.000	NA		NA
366868	366869	NE0119	NE0120			TRUE	0.994	0.000	0.286	NA		NA
366869	366870	NE0120	NE0121			TRUE	0.996	5.000	0.279	NA	Y	NA
366870	366871	NE0121	NE0122			TRUE	0.975	64.000	0.453	NA		NA
366871	366872	NE0122	NE0123			TRUE	0.966	83.000	0.525	NA		NA
366872	2213802	NE0123	NE0124			FALSE	0.008	418.000	0.000	NA		NA
2213802	366873	NE0124	NE0127			FALSE	0.134	131.000	0.000	NA		NA
366873	366874	NE0127	NE0128			TRUE	0.989	1.000	0.167	NA	N	NA
366874	366875	NE0128	NE0129			FALSE	0.006	526.000	0.000	NA		NA
366875	366876	NE0129	NE0130			FALSE	0.171	115.000	0.000	NA		NA
366876	366877	NE0130	NE0131			FALSE	0.100	152.000	0.000	NA		NA
366877	366878	NE0131	NE0132		osmY	TRUE	0.574	16.000	0.000	NA		NA
366883	366884	NE0139	NE0140		rnhA	TRUE	0.859	0.000	0.000	1.000		NA
366884	366885	NE0140	NE0141	rnhA	dnaQ	TRUE	0.992	12.000	0.248	1.000	Y	NA
366887	366888	NE0143	NE0144		ndk	FALSE	0.024	284.000	0.000	1.000		NA
366888	366889	NE0144	NE0145	ndk		TRUE	0.846	94.000	0.156	1.000		NA
366889	366890	NE0145	NE0146		pilF	TRUE	0.910	44.000	0.086	1.000		NA
366890	366891	NE0146	NE0147	pilF		TRUE	0.977	-10.000	0.204	NA		NA
366891	366892	NE0147	NE0148			TRUE	0.964	35.000	0.233	NA		NA
366892	366893	NE0148	NE0149			TRUE	0.797	-36.000	0.006	0.001		NA
366893	366894	NE0149	NE0150		hisS	TRUE	0.983	-7.000	0.207	1.000		NA
366894	366895	NE0150	NE0151	hisS		TRUE	0.971	22.000	0.259	1.000		NA
366895	366896	NE0151	NE0152			TRUE	0.997	-3.000	0.492	1.000		NA
366896	366897	NE0152	NE0153			TRUE	0.956	52.000	0.203	1.000		NA
366897	366898	NE0153	NE0154		tISRso8a	FALSE	0.115	154.000	0.000	1.000		NA
366898	366899	NE0154	NE0155	tISRso8a		TRUE	0.987	-33.000	0.667	1.000		NA
366899	366900	NE0155	NE0156		mexE	FALSE	0.009	561.000	0.000	1.000	N	NA
366900	366901	NE0156	NE0157	mexE		TRUE	0.993	26.000	0.750	1.000	N	NA
366902	366903	NE0158	NE0159			TRUE	0.998	-3.000	0.545	0.053	N	NA
366903	366904	NE0159	NE0160			TRUE	0.996	-7.000	0.467	0.048	N	NA
366904	366905	NE0160	NE0161			TRUE	0.569	26.000	0.000	1.000		NA
366905	366906	NE0161	NE0162			FALSE	0.007	500.000	0.000	1.000		NA
366906	2213805	NE0162	NE0163		tISRso8a	FALSE	0.013	319.000	0.000	NA		NA
2213805	2213806	NE0163	NE0164	tISRso8a		FALSE	0.496	50.000	0.000	NA		NA
366907	366908	NE0165	NE0166			FALSE	0.023	261.000	0.000	NA		NA
366909	366910	NE0167	NE0168			TRUE	0.704	-10.000	0.000	1.000		NA
366910	366911	NE0168	NE0169		acrA,mtcA,lir	TRUE	0.987	36.000	0.500	1.000	N	NA
366911	366912	NE0169	NE0170	acrA,mtcA,lir	oprM	TRUE	0.979	100.000	0.400	0.098	Y	NA
366912	366913	NE0170	NE0171	oprM		FALSE	0.098	287.000	0.000	NA	Y	NA
366913	366914	NE0171	NE0172		pnp	FALSE	0.082	187.000	0.000	NA	N	NA
366914	366915	NE0172	NE0173	pnp	rpsO	TRUE	0.855	195.000	0.335	1.000	Y	NA
366916	366917	NE0174	NE0175			TRUE	0.937	36.000	0.111	1.000	N	NA
366917	366918	NE0175	NE0176			TRUE	0.951	16.000	0.111	1.000	N	NA
366918	366919	NE0176	NE0177			TRUE	0.901	14.000	0.040	1.000	N	NA
366919	366920	NE0177	NE0178		gpmA	TRUE	0.861	47.000	0.040	1.000	N	NA
366921	366922	NE0179	NE0180		serS	TRUE	0.546	47.000	0.003	NA		NA
366922	366923	NE0180	NE0181	serS	apt	FALSE	0.063	216.000	0.000	1.000	N	NA
366923	366924	NE0181	NE0182	apt		FALSE	0.299	90.000	0.002	NA		NA
366924	366925	NE0182	NE0183			FALSE	0.198	197.000	0.043	NA		NA
366925	366926	NE0183	NE0184			FALSE	0.022	270.000	0.000	NA		NA
366929	366930	NE0187	NE0188			FALSE	0.096	164.000	0.000	1.000		NA
366931	366932	NE0189	NE0190			FALSE	0.190	118.000	0.000	1.000		NA
366932	366933	NE0190	NE0191			TRUE	0.989	28.000	0.642	NA		NA
366934	366935	NE0192	NE0193			TRUE	0.792	78.000	0.074	NA		NA
366936	366937	NE0194	NE0195	dnaB	rplI	TRUE	0.703	108.000	0.074	1.000	N	NA
366937	366938	NE0195	NE0196	rplI	rpsR	TRUE	0.996	19.000	0.499	0.021	Y	NA
366938	366939	NE0196	NE0197	rpsR		TRUE	0.945	37.000	0.128	1.000	N	NA
366939	366940	NE0197	NE0198		rpsF	TRUE	0.955	-16.000	0.122	1.000	N	NA
366941	366942	NE0199	NE0200		atpB	TRUE	0.976	35.000	0.330	1.000		NA
366942	366943	NE0200	NE0201	atpB	atpE	TRUE	0.997	43.000	0.557	0.005	Y	NA
366943	366944	NE0201	NE0202	atpE	atpF	TRUE	0.997	47.000	0.666	0.005	Y	NA
366944	366945	NE0202	NE0203	atpF	atpH	TRUE	0.998	1.000	0.242	0.005	Y	NA
366945	366946	NE0203	NE0204	atpH	atpA	TRUE	0.999	13.000	0.864	0.005	Y	NA
366946	366947	NE0204	NE0205	atpA	atpG	TRUE	0.999	4.000	0.846	0.005	Y	NA
366947	366948	NE0205	NE0206	atpG	atpD	TRUE	0.998	31.000	0.724	0.005	Y	NA
366948	366949	NE0206	NE0207	atpD	atpC	TRUE	0.998	29.000	0.837	0.005	Y	NA
366949	366950	NE0207	NE0208	atpC	glmU	FALSE	0.201	246.000	0.067	1.000	N	NA
366950	366951	NE0208	NE0209	glmU	glmS	TRUE	0.928	38.000	0.021	1.000	Y	NA
366951	366952	NE0209	NE0210	glmS		FALSE	0.140	136.000	0.002	NA		NA
366952	366953	NE0210	NE0211		ruvC	TRUE	0.993	-3.000	0.277	NA		NA
366953	366954	NE0211	NE0212	ruvC	ruvA	TRUE	0.985	-3.000	0.006	0.013	Y	NA
366954	366955	NE0212	NE0213	ruvA	ruvB	TRUE	0.960	19.000	0.014	0.002	Y	NA
366955	366956	NE0213	NE0214	ruvB		TRUE	0.885	60.000	0.082	1.000		NA
366956	366957	NE0214	NE0215		tolQ	TRUE	0.998	-3.000	0.593	1.000		NA
366957	366958	NE0215	NE0216	tolQ	tolR	TRUE	0.999	-3.000	0.556	0.047	Y	NA
366958	366959	NE0216	NE0217	tolR	tolA	TRUE	0.764	22.000	0.015	NA		NA
366959	366960	NE0217	NE0218	tolA	tolB	TRUE	0.707	38.000	0.010	NA		NA
366960	366961	NE0218	NE0219	tolB	pal	TRUE	0.987	54.000	0.592	1.000		NA
366961	366962	NE0219	NE0220	pal		TRUE	0.989	0.000	0.167	1.000		NA
366962	366963	NE0220	NE0221			TRUE	0.515	103.000	0.026	1.000		NA
366963	366964	NE0221	NE0222			TRUE	0.972	22.000	0.270	1.000		NA
366968	366969	NE0226	NE0227	rpsU		TRUE	0.966	38.000	0.173	0.035		NA
366969	366970	NE0227	NE0228			TRUE	0.870	82.000	0.137	1.000		NA
366970	366971	NE0228	NE0229		rpoD	TRUE	0.640	207.000	0.299	1.000	N	NA
366971	5437945	NE0229	RNA_19	rpoD	tRNAMet2	FALSE	0.434	63.000	0.000	NA		NA
5437945	366972	RNA_19	NE0230	tRNAMet2		FALSE	0.009	389.000	0.000	NA		NA
366973	366974	NE0231	NE0232			FALSE	0.004	1343.000	0.000	NA		NA
366974	366975	NE0232	NE0233			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
366975	366976	NE0233	NE0234			FALSE	0.015	309.000	0.000	NA		NA
366976	366977	NE0234	NE0235		intF	TRUE	0.618	-13.000	0.000	NA		NA
366977	366978	NE0235	NE0236	intF	ccrB	FALSE	0.302	132.000	0.000	0.015		NA
366978	366979	NE0236	NE0237	ccrB		TRUE	0.968	14.000	0.200	NA		NA
366979	366980	NE0237	NE0238			FALSE	0.012	333.000	0.000	NA		NA
366982	366983	NE0240	NE0241			FALSE	0.100	162.000	0.000	1.000		NA
366984	366985	NE0242	NE0243			FALSE	0.128	134.000	0.000	NA		NA
366987	366988	NE0245	NE0246			TRUE	0.780	4.000	0.000	NA		NA
366988	2213807	NE0246	NE0247			FALSE	0.190	108.000	0.000	NA		NA
2213808	2213809	NE0248	NE0249	TRm2011-2C		TRUE	0.524	25.000	0.000	NA		NA
2213810	366989	NE0250	NE0251			FALSE	0.006	516.000	0.000	NA		NA
366989	366990	NE0251	NE0252			FALSE	0.021	294.000	0.000	1.000		NA
366990	366991	NE0252	NE0253			TRUE	0.989	54.000	0.667	1.000		NA
366992	366993	NE0254	NE0255			FALSE	0.182	110.000	0.000	NA		NA
366993	366994	NE0255	NE0256			FALSE	0.342	76.000	0.000	NA		NA
366994	366995	NE0256	NE0257			FALSE	0.010	378.000	0.000	NA		NA
366999	367000	NE0261	NE0262			TRUE	0.974	1.000	0.077	NA		NA
367001	367002	NE0263	NE0264			TRUE	0.539	-19.000	0.000	NA		NA
367002	367003	NE0264	NE0265			TRUE	0.528	22.000	0.000	NA		NA
367003	367004	NE0265	NE0266			TRUE	0.526	23.000	0.000	NA		NA
367004	367005	NE0266	NE0267			TRUE	0.609	79.000	0.019	NA		NA
367006	2213811	NE0268	NE0269			FALSE	0.124	136.000	0.000	NA		NA
2213811	367007	NE0269	NE0270			FALSE	0.088	159.000	0.000	NA		NA
367007	367008	NE0270	NE0271			FALSE	0.010	382.000	0.000	NA		NA
367008	367009	NE0271	NE0272			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
367009	367010	NE0272	NE0273		cyc	FALSE	0.076	193.000	0.000	NA	N	NA
367011	367012	NE0274	NE0275		map	FALSE	0.470	114.000	0.033	NA		NA
367012	367013	NE0275	NE0276	map	rph	TRUE	0.826	68.000	0.003	1.000	Y	NA
367013	367014	NE0276	NE0277	rph		TRUE	0.974	38.000	0.262	1.000	N	NA
367014	367015	NE0277	NE0278			TRUE	0.968	37.000	0.218	1.000	N	NA
367015	367016	NE0278	NE0279		pcoA	FALSE	0.128	172.000	0.002	1.000	N	NA
367016	367017	NE0279	NE0280	pcoA	pcoB	TRUE	0.998	-3.000	0.556	0.009	N	NA
367018	367019	NE0281	NE0282			TRUE	0.994	13.000	0.722	NA		NA
367019	367020	NE0282	NE0283			FALSE	0.161	119.000	0.000	NA		NA
367020	367021	NE0283	NE0284		thiG	TRUE	0.882	29.000	0.060	1.000		NA
367021	367022	NE0284	NE0285	thiG		TRUE	0.954	75.000	0.130	1.000	Y	NA
5437946	2213812	RNA_20	NE0290	tRNAGly1		FALSE	0.009	394.000	0.000	NA		NA
2213812	2213813	NE0290	NE0291			FALSE	0.373	-123.000	0.000	NA		NA
367027	367028	NE0292	NE0293			TRUE	0.836	0.000	0.000	NA		NA
367029	367030	NE0294	NE0295			FALSE	0.254	116.000	0.000	1.000	N	NA
367030	367031	NE0295	NE0296			TRUE	0.949	-3.000	0.026	NA		NA
367031	367032	NE0296	NE0297			TRUE	0.998	5.000	0.923	NA		NA
367033	367034	NE0298	NE0299	pta		FALSE	0.012	331.000	0.000	NA		NA
367034	367035	NE0299	NE0300			TRUE	0.952	58.000	0.214	NA		NA
367035	367036	NE0300	NE0301		flgA	FALSE	0.115	142.000	0.000	NA		NA
367037	367038	NE0302	NE0303	flgB	flgC,flaW,flaFIII	TRUE	0.995	6.000	0.130	0.006	Y	NA
367038	367039	NE0303	NE0304	flgC,flaW,flaFIII	flgD,flaV,FlaFIV	TRUE	0.990	17.000	0.256	NA	Y	NA
367039	367040	NE0304	NE0305	flgD,flaV,FlaFIV	flgE	TRUE	0.990	15.000	0.244	NA	Y	NA
367040	367041	NE0305	NE0306	flgE	flgF	TRUE	0.997	40.000	0.520	0.006	Y	NA
367041	367042	NE0306	NE0307	flgF	flgG	TRUE	0.993	68.000	0.381	0.002	Y	NA
367042	367043	NE0307	NE0308	flgG	flgH	TRUE	0.996	38.000	0.463	0.010	Y	NA
367043	367044	NE0308	NE0309	flgH	flgI	TRUE	0.983	22.000	0.110	0.012	Y	NA
367044	367045	NE0309	NE0310	flgI	flgJ	TRUE	0.694	173.000	0.054	0.012	Y	NA
367045	367046	NE0310	NE0311	flgJ	flgK	TRUE	0.966	182.000	0.705	0.005	Y	NA
367046	367047	NE0311	NE0312	flgK	flgL	TRUE	0.980	29.000	0.080	0.002	Y	NA
367047	367048	NE0312	NE0313	flgL		TRUE	0.864	78.000	0.125	NA		NA
367048	367049	NE0313	NE0314			FALSE	0.011	352.000	0.000	NA		NA
367049	367050	NE0314	NE0315		mnxG	TRUE	0.597	18.000	0.000	1.000		NA
367051	367052	NE0316	NE0317			FALSE	0.119	140.000	0.000	NA		NA
367053	367054	NE0318	NE0319			FALSE	0.037	220.000	0.000	NA		NA
367054	367055	NE0319	NE0320			TRUE	0.954	21.000	0.182	NA		NA
367055	367056	NE0320	NE0321			FALSE	0.053	203.000	0.000	1.000		NA
367056	367057	NE0321	NE0322			FALSE	0.015	365.000	0.000	NA	N	NA
367057	367058	NE0322	NE0323			TRUE	0.565	89.000	0.013	NA	N	NA
367059	367060	NE0324	NE0325	cbbA, fba, fda	pykA1	TRUE	0.844	199.000	0.232	0.008	Y	NA
367060	367061	NE0325	NE0326	pykA1	cbbK, pgk	TRUE	0.960	35.000	0.032	0.008	Y	NA
367061	367062	NE0326	NE0327	cbbK, pgk	cbbG, gapA	FALSE	0.216	307.000	0.015	0.008	Y	NA
367062	367063	NE0327	NE0328	cbbG, gapA	cbbT, tkl	TRUE	0.914	64.000	0.030	1.000	Y	NA
5437947	367064	RNA_21	NE0329	tRNASer2		FALSE	0.130	133.000	0.000	NA		NA
367064	367065	NE0329	NE0330			TRUE	0.821	50.000	0.041	NA		NA
367065	367066	NE0330	NE0331			TRUE	0.855	29.000	0.037	NA	N	NA
367066	367067	NE0331	NE0332		gyrA	FALSE	0.481	70.000	0.002	NA	N	NA
367067	367068	NE0332	NE0333	gyrA	serC	TRUE	0.916	18.000	0.067	1.000	N	NA
367068	367069	NE0333	NE0334	serC		TRUE	0.994	-7.000	0.238	1.000	Y	NA
367069	367070	NE0334	NE0335		pheA	TRUE	0.935	39.000	0.028	1.000	Y	NA
367070	367071	NE0335	NE0336	pheA	hisC2	TRUE	0.970	41.000	0.098	1.000	Y	NA
367071	367072	NE0336	NE0337	hisC2	tyrA	TRUE	0.984	23.000	0.198	1.000	Y	NA
367073	367074	NE0338	NE0339	sss		TRUE	0.993	-16.000	0.714	NA		NA
367074	367075	NE0339	NE0340			FALSE	0.475	56.000	0.000	NA		NA
367075	367076	NE0340	NE0341			FALSE	0.493	61.000	0.000	1.000		NA
367076	367077	NE0341	NE0342			TRUE	0.823	-31.000	0.000	NA	Y	NA
367077	367078	NE0342	NE0343			FALSE	0.007	657.000	0.000	NA	N	NA
367078	367079	NE0343	NE0344		tctD	TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
367079	367080	NE0344	NE0345	tctD		TRUE	0.929	88.000	0.250	1.000	N	NA
367080	367081	NE0345	NE0346			TRUE	0.999	2.000	1.000	1.000	N	NA
367081	367082	NE0346	NE0347		speE,ywhF	FALSE	0.028	295.000	0.000	1.000	N	NA
367082	367083	NE0347	NE0348	speE,ywhF		TRUE	0.996	-3.000	0.160	1.000	Y	NA
367083	367084	NE0348	NE0349			FALSE	0.020	284.000	0.000	NA		NA
367084	5437948	NE0349	RNA_18		tRNALeu2	FALSE	0.018	293.000	0.000	NA		NA
367085	367086	NE0350	NE0351	rnr		TRUE	0.968	24.000	0.147	0.023	N	NA
367087	367088	NE0352	NE0353	exbD1	exbB1	TRUE	0.996	0.000	0.111	0.046	Y	NA
367088	367089	NE0353	NE0354	exbB1		TRUE	0.987	1.000	0.082	0.017	N	NA
367089	367090	NE0354	NE0355		cafA	FALSE	0.060	220.000	0.000	1.000	N	NA
367090	367091	NE0355	NE0356	cafA		TRUE	0.983	38.000	0.417	NA	N	NA
367091	367092	NE0356	NE0357			TRUE	0.757	86.000	0.074	NA		NA
367092	367093	NE0357	NE0358			TRUE	0.910	97.000	0.307	NA		NA
367093	367094	NE0358	NE0359		nadD	TRUE	0.992	-3.000	0.221	NA		NA
367094	367095	NE0359	NE0360	nadD	aceF	TRUE	0.679	50.000	0.003	1.000	N	NA
367095	367096	NE0360	NE0361	aceF	aceE	TRUE	0.853	70.000	0.000	0.043	Y	NA
367096	367097	NE0361	NE0362	aceE	folD	TRUE	0.990	34.000	0.600	1.000	N	NA
367097	367098	NE0362	NE0363	folD		TRUE	0.894	153.000	0.600	NA		NA
367099	367100	NE0364	NE0365	argS		TRUE	0.877	24.000	0.062	NA		NA
367100	367101	NE0365	NE0366		dsbA	TRUE	0.906	141.000	0.573	NA		NA
367102	367103	NE0367	NE0368		spoT	TRUE	0.542	19.000	0.000	NA		NA
5437949	367104	RNA_22	NE0369	tRNALeu3		FALSE	0.011	362.000	0.000	NA		NA
367105	367106	NE0370	NE0371	eryB		TRUE	0.991	8.000	0.158	1.000	Y	NA
367107	367108	NE0372	NE0373			TRUE	0.512	42.000	0.000	NA		NA
367108	367109	NE0373	NE0374			TRUE	0.997	10.000	0.533	1.000	Y	NA
367109	367110	NE0374	NE0375			TRUE	0.993	0.000	0.217	1.000	N	NA
367111	367112	NE0376	NE0377			FALSE	0.052	232.000	0.000	1.000	N	NA
367112	367113	NE0377	NE0378			TRUE	0.977	38.000	0.320	NA	N	NA
367113	367114	NE0378	NE0379		mucD	FALSE	0.049	197.000	0.000	NA		NA
367114	5437950	NE0379	RNA_17	mucD	tRNAVal3	FALSE	0.309	82.000	0.000	NA		NA
367115	367116	NE0380	NE0381			FALSE	0.018	307.000	0.000	1.000		NA
367117	367118	NE0382	NE0383	hsdR		TRUE	0.881	-3.000	0.000	NA	N	NA
367118	367119	NE0383	NE0384			TRUE	0.881	-3.000	0.000	NA	N	NA
367119	367120	NE0384	NE0385		hsdM	TRUE	0.990	-10.000	0.167	1.000	Y	NA
367120	367121	NE0385	NE0386	hsdM	thdF	FALSE	0.100	162.000	0.000	1.000		NA
367121	367122	NE0386	NE0387	thdF		TRUE	0.969	59.000	0.221	0.051		NA
367122	367123	NE0387	NE0388			TRUE	0.947	93.000	0.461	NA		NA
367123	367124	NE0388	NE0389		rnpA	TRUE	0.997	-3.000	0.540	NA		NA
367124	367125	NE0389	NE0390	rnpA	rpmH	TRUE	0.992	40.000	0.787	1.000		NA
367126	367127	NE0391	NE0392			TRUE	0.704	40.000	0.009	NA		NA
367127	367128	NE0392	NE0393		proC	TRUE	0.535	77.000	0.009	NA		NA
367128	367129	NE0393	NE0394	proC		TRUE	0.811	58.000	0.039	1.000		NA
367129	367130	NE0394	NE0395			TRUE	0.992	0.000	0.220	NA		NA
367130	367131	NE0395	NE0396			FALSE	0.244	115.000	0.005	NA		NA
367131	367132	NE0396	NE0397			TRUE	0.662	80.000	0.021	NA	N	NA
367132	367133	NE0397	NE0398		zwf	TRUE	0.994	-3.000	0.115	1.000	Y	NA
367133	5437951	NE0398	RNA_23	zwf	tRNATyr1	FALSE	0.190	108.000	0.000	NA		NA
5437951	5437952	RNA_23	RNA_24	tRNATyr1	tRNAGly2	FALSE	0.163	118.000	0.000	NA		NA
5437952	5437953	RNA_24	RNA_25	tRNAGly2	tRNAThr1	TRUE	0.522	28.000	0.000	NA		NA
5437953	367134	RNA_25	NE0399	tRNAThr1	tuf2	FALSE	0.428	64.000	0.000	NA		NA
367134	367135	NE0399	NE0400	tuf2	rpsJ	TRUE	0.987	62.000	0.318	1.000	Y	NA
367135	367136	NE0400	NE0401	rpsJ	rplC	TRUE	0.993	48.000	0.307	0.028	Y	NA
367136	367137	NE0401	NE0402	rplC	rplD	TRUE	0.996	21.000	0.486	0.020	Y	NA
367137	367138	NE0402	NE0403	rplD	rplW	TRUE	0.999	-3.000	0.513	0.020	Y	NA
367138	367139	NE0403	NE0404	rplW		TRUE	1.000	-3.000	0.849	0.023	Y	NA
367139	367140	NE0404	NE0405		rpsS	TRUE	0.999	6.000	0.820	0.028	Y	NA
367140	367141	NE0405	NE0406	rpsS	rplV	TRUE	0.999	9.000	0.769	0.028	Y	NA
367141	367142	NE0406	NE0407	rplV	rpsC	TRUE	0.998	37.000	0.719	0.028	Y	NA
367142	367143	NE0407	NE0408	rpsC	rplP	TRUE	0.994	90.000	0.828	0.028	Y	NA
367143	367144	NE0408	NE0409	rplP	rpmC	TRUE	0.999	8.000	0.802	0.020	Y	NA
367144	367145	NE0409	NE0410	rpmC		TRUE	1.000	-3.000	0.828	0.020	Y	NA
367145	367146	NE0410	NE0411			TRUE	0.995	82.000	0.791	0.028	Y	NA
367146	367147	NE0411	NE0412		rplX	TRUE	0.998	18.000	0.810	0.028	Y	NA
367147	367148	NE0412	NE0413	rplX		TRUE	0.998	15.000	0.758	0.020	Y	NA
367148	367149	NE0413	NE0414			TRUE	0.996	11.000	0.309	0.020	Y	NA
367149	367150	NE0414	NE0415		rpsH	TRUE	0.987	73.000	0.295	0.020	Y	NA
367150	367151	NE0415	NE0416	rpsH	rplF	TRUE	0.999	12.000	0.808	0.020	Y	NA
367151	367152	NE0416	NE0417	rplF	rplR	TRUE	0.998	15.000	0.815	0.020	Y	NA
367152	367153	NE0417	NE0418	rplR	rpsE	TRUE	0.998	17.000	0.814	0.028	Y	NA
367153	367154	NE0418	NE0419	rpsE	rpmD	TRUE	0.999	6.000	0.789	0.028	Y	NA
367154	367155	NE0419	NE0420	rpmD		TRUE	0.999	2.000	0.653	0.004	Y	NA
367155	367156	NE0420	NE0421		secY	TRUE	0.996	-10.000	0.730	1.000	N	NA
367156	367157	NE0421	NE0422	secY	infA	TRUE	0.962	8.000	0.083	1.000	N	NA
367157	367158	NE0422	NE0423	infA	rpsM	TRUE	0.685	189.000	0.075	0.023	Y	NA
367158	367159	NE0423	NE0424	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	41.000	0.810	0.020	Y	NA
367159	367160	NE0424	NE0425	rpsK	rpsD	TRUE	0.997	15.000	0.509	0.028	Y	NA
367160	367161	NE0425	NE0426	rpsD	rpoA	TRUE	0.989	30.000	0.549	1.000	N	NA
367161	367162	NE0426	NE0427	rpoA		TRUE	0.996	-13.000	0.873	1.000	N	NA
367162	5437954	NE0427	RNA_26		tRNAThr2	FALSE	0.053	194.000	0.000	NA		NA
367163	367164	NE0428	NE0429			TRUE	0.925	-16.000	0.086	NA		NA
367165	367166	NE0430	NE0431	smpB		TRUE	0.972	-3.000	0.003	1.000	Y	NA
367166	367167	NE0431	NE0432			FALSE	0.394	97.000	0.009	NA		NA
367167	5437955	NE0432	RNA_48		ffs	FALSE	0.185	109.000	0.000	NA		NA
5437955	367168	RNA_48	NE0433	ffs	dnaX	FALSE	0.062	181.000	0.000	NA		NA
367168	367169	NE0433	NE0434	dnaX		TRUE	0.984	17.000	0.411	NA		NA
367169	367170	NE0434	NE0435			TRUE	0.502	56.000	0.002	NA		NA
367172	367173	NE0437	NE0438			FALSE	0.013	415.000	0.000	1.000	N	NA
367174	367175	NE0439	NE0440	serB		FALSE	0.459	87.000	0.003	1.000	N	NA
367176	367177	NE0441	NE0442		holC	TRUE	0.981	65.000	0.494	1.000	N	NA
367177	367178	NE0442	NE0443	holC		TRUE	0.501	73.000	0.006	NA		NA
367178	367179	NE0443	NE0444		valS	FALSE	0.129	137.000	0.002	NA		NA
367179	367180	NE0444	NE0445	valS		FALSE	0.497	74.000	0.002	1.000	N	NA
367181	367182	NE0446	NE0447			FALSE	0.108	146.000	0.000	NA		NA
367182	367183	NE0447	NE0448		Rh50	FALSE	0.137	161.000	0.000	1.000	N	NA
367183	367184	NE0448	NE0449	Rh50	murI	FALSE	0.007	672.000	0.000	1.000	N	NA
367184	367185	NE0449	NE0450	murI	int	FALSE	0.244	119.000	0.000	1.000	N	NA
367185	367186	NE0450	NE0451	int		FALSE	0.045	611.000	0.000	0.032	Y	NA
367186	367187	NE0451	NE0452			TRUE	0.989	54.000	0.667	1.000		NA
2213814	367188	NE0453	NE0454			FALSE	0.407	-64.000	0.000	NA		NA
367191	367192	NE0457	NE0458		Plec1	FALSE	0.407	141.000	0.047	NA		NA
367192	367193	NE0458	NE0459	Plec1	fliR	TRUE	0.585	162.000	0.154	NA		NA
367193	367194	NE0459	NE0460	fliR	fliQ,flaQ	TRUE	0.958	93.000	0.139	0.004	Y	NA
367194	367195	NE0460	NE0461	fliQ,flaQ	fliP	TRUE	0.998	16.000	0.827	0.012	Y	NA
367195	367196	NE0461	NE0462	fliP		TRUE	0.992	-10.000	0.203	1.000	Y	NA
367196	367197	NE0462	NE0463		fliN	TRUE	0.994	27.000	0.443	1.000	Y	NA
367197	367198	NE0463	NE0464	fliN	fliM	TRUE	0.999	15.000	0.741	0.002	Y	NA
367198	367199	NE0464	NE0465	fliM	fliL	TRUE	0.986	13.000	0.076	0.002	Y	NA
367199	367200	NE0465	NE0466	fliL		FALSE	0.039	258.000	0.000	1.000	N	NA
367201	367202	NE0467	NE0468		rfaH	FALSE	0.073	182.000	0.000	1.000		NA
367202	367203	NE0468	NE0469	rfaH	rmlB	FALSE	0.020	334.000	0.000	1.000	N	NA
367203	2213815	NE0469	NE0470	rmlB		FALSE	0.018	289.000	0.000	NA		NA
2213815	367204	NE0470	NE0471			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367204	367205	NE0471	NE0472			FALSE	0.135	130.000	0.000	NA		NA
367205	367206	NE0472	NE0473			FALSE	0.078	166.000	0.000	NA		NA
367206	367207	NE0473	NE0474			FALSE	0.059	185.000	0.000	NA		NA
367207	367208	NE0474	NE0475			FALSE	0.106	147.000	0.000	NA		NA
367208	367209	NE0475	NE0476			TRUE	0.979	-22.000	0.400	NA		NA
367211	367212	NE0478	NE0479			TRUE	0.998	0.000	0.727	NA		NA
367212	367213	NE0479	NE0480			FALSE	0.088	159.000	0.000	NA		NA
367214	367215	NE0481	NE0482			TRUE	0.980	10.000	0.227	NA		NA
367216	367217	NE0483	NE0484	wzt		TRUE	0.969	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
367217	367218	NE0484	NE0485			TRUE	0.512	42.000	0.000	NA		NA
367218	367219	NE0485	NE0486		rffE,wecB,nfrC	TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367219	367220	NE0486	NE0487	rffE,wecB,nfrC		TRUE	0.999	0.000	0.500	NA	Y	NA
367221	367222	NE0488	NE0489		abiR	TRUE	0.539	-19.000	0.000	NA		NA
367222	367223	NE0489	NE0490	abiR		FALSE	0.013	319.000	0.000	NA		NA
367223	367224	NE0490	NE0491			TRUE	0.962	13.000	0.157	NA		NA
367224	367225	NE0491	NE0492			FALSE	0.019	288.000	0.000	NA		NA
367225	367226	NE0492	NE0493			TRUE	0.780	4.000	0.000	NA		NA
367226	367227	NE0493	NE0494			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367227	367228	NE0494	NE0495			FALSE	0.025	254.000	0.000	NA		NA
367229	367230	NE0496	NE0497			FALSE	0.010	364.000	0.000	NA		NA
367230	367231	NE0497	NE0498		ntrR2	TRUE	0.966	-3.000	0.053	NA		NA
367231	367232	NE0498	NE0499	ntrR2		TRUE	0.510	36.000	0.000	NA		NA
367232	367233	NE0499	NE0500			TRUE	0.922	15.000	0.080	NA		NA
367233	367234	NE0500	NE0501			TRUE	0.993	11.000	0.297	NA	Y	NA
367234	367235	NE0501	NE0502		wbpM	TRUE	0.978	9.000	0.069	NA	Y	NA
367236	367237	NE0503	NE0504		glnA1	FALSE	0.353	156.000	0.048	NA		NA
367237	367238	NE0504	NE0505	glnA1	rluD	FALSE	0.067	211.000	0.000	1.000	N	NA
367239	5437956	NE0506	RNA_27		tRNAArg4	FALSE	0.337	77.000	0.000	NA		NA
5437956	367240	RNA_27	NE0507	tRNAArg4	rdgC	FALSE	0.105	148.000	0.000	NA		NA
367241	367242	NE0508	NE0509		SCO1,SCOD1	TRUE	0.997	-3.000	0.556	NA		NA
367242	367243	NE0509	NE0510	SCO1,SCOD1		TRUE	0.928	108.000	0.444	1.000		NA
367247	367248	NE0514	NE0515		baeS	TRUE	0.999	-3.000	0.591	1.000	Y	NA
367251	367252	NE0518	NE0519			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
367255	367256	NE0522	NE0523			TRUE	0.864	-12.000	0.025	NA		NA
367256	367257	NE0523	NE0524			FALSE	0.005	630.000	0.000	NA		NA
367257	367258	NE0524	NE0525			TRUE	0.985	-3.000	0.074	0.042		NA
367258	367259	NE0525	NE0526			FALSE	0.095	188.000	0.004	1.000		NA
367260	367261	NE0527	NE0528		hflB	TRUE	0.831	85.000	0.095	NA	N	NA
367261	367262	NE0528	NE0529	hflB	folP	TRUE	0.967	69.000	0.325	1.000	N	NA
367262	367263	NE0529	NE0530	folP	mrsA	TRUE	0.700	181.000	0.260	1.000	N	NA
367263	367264	NE0530	NE0531	mrsA		FALSE	0.281	124.000	0.004	1.000	N	NA
367264	367265	NE0531	NE0532		cysG	TRUE	0.766	90.000	0.067	1.000	N	NA
367265	367266	NE0532	NE0533	cysG		FALSE	0.229	124.000	0.000	1.000	N	NA
367266	367267	NE0533	NE0534			TRUE	0.992	-12.000	0.500	NA	N	NA
367267	367268	NE0534	NE0535			FALSE	0.086	298.000	0.000	NA	Y	NA
367268	367269	NE0535	NE0536			FALSE	0.253	93.000	0.000	NA		NA
367269	367270	NE0536	NE0537			FALSE	0.006	483.000	0.000	NA		NA
367270	367271	NE0537	NE0538			TRUE	0.574	16.000	0.000	NA		NA
367271	367272	NE0538	NE0539		yegM	FALSE	0.204	244.000	0.000	0.092	Y	NA
367272	367273	NE0539	NE0540	yegM		TRUE	0.990	-3.000	0.167	NA	N	NA
367273	367274	NE0540	NE0541			FALSE	0.106	170.000	0.000	NA	N	NA
367274	367275	NE0541	NE0542			FALSE	0.486	69.000	0.000	NA	N	NA
367276	367277	NE0543	NE0544			TRUE	0.531	21.000	0.000	NA		NA
367277	367278	NE0544	NE0545			FALSE	0.040	212.000	0.000	NA		NA
367279	367280	NE0546	NE0547			FALSE	0.143	158.000	0.000	1.000	N	NA
367280	367281	NE0547	NE0548			TRUE	0.503	67.000	0.000	NA	N	NA
367281	367282	NE0548	NE0549			FALSE	0.421	143.000	0.000	NA	Y	NA
367282	367283	NE0549	NE0550			TRUE	0.822	3.000	0.000	1.000		NA
367283	367284	NE0550	NE0551			FALSE	0.011	394.000	0.000	1.000		NA
367284	367285	NE0551	NE0552			TRUE	0.989	-3.000	0.182	NA		NA
367287	367288	NE0554	NE0555			TRUE	0.999	0.000	1.000	NA	N	NA
367288	367289	NE0555	NE0556			FALSE	0.180	217.000	0.000	NA	Y	NA
367289	367290	NE0556	NE0557			FALSE	0.209	130.000	0.000	1.000	N	NA
367290	367291	NE0557	NE0558			FALSE	0.289	100.000	0.000	NA	N	NA
367291	367292	NE0558	NE0559			FALSE	0.394	149.000	0.000	NA	Y	NA
367292	367293	NE0559	NE0560			FALSE	0.019	321.000	0.000	NA	N	NA
367293	367294	NE0560	NE0561			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
367294	367295	NE0561	NE0562			FALSE	0.374	78.000	0.000	1.000		NA
367295	2213816	NE0562	NE0563			TRUE	0.679	9.000	0.000	NA		NA
367296	367297	NE0564	NE0565			TRUE	0.755	42.000	0.000	0.008		NA
367299	367300	NE0567	NE0568	dfrA,tmp	thyB	TRUE	0.989	-3.000	0.134	1.000	N	NA
367301	367302	NE0569	NE0570			TRUE	0.926	51.000	0.125	NA		NA
367303	367304	NE0571	NE0572		cbl	FALSE	0.014	310.000	0.000	NA		NA
367304	367305	NE0572	NE0573	cbl		FALSE	0.351	95.000	0.000	1.000	N	NA
367305	367306	NE0573	NE0574			TRUE	0.956	-13.000	0.132	NA		NA
367306	367307	NE0574	NE0575			TRUE	0.754	109.000	0.133	NA		NA
367307	367308	NE0575	NE0576		cysA	TRUE	0.896	0.000	0.000	1.000	N	NA
367308	367309	NE0576	NE0577	cysA	cysW	TRUE	0.999	-3.000	0.587	1.000	Y	NA
367309	367310	NE0577	NE0578	cysW	cysU	TRUE	0.998	10.000	0.935	0.001	N	NA
367310	367311	NE0578	NE0579	cysU		TRUE	0.761	66.000	0.020	1.000	N	NA
367311	367312	NE0579	NE0580			TRUE	0.666	91.000	0.000	NA	Y	NA
367312	367313	NE0580	NE0581			FALSE	0.097	154.000	0.000	NA		NA
367313	367314	NE0581	NE0582		sbp1	FALSE	0.459	59.000	0.000	NA		NA
367314	367315	NE0582	NE0583	sbp1		TRUE	0.976	29.000	0.333	NA		NA
367318	367319	NE0586	NE0587			TRUE	0.998	3.000	0.904	1.000		NA
367320	367321	NE0588	NE0589		ppc	FALSE	0.041	254.000	0.000	1.000	N	NA
367322	367323	NE0590	NE0591	hemC	hemD	TRUE	0.991	31.000	0.205	0.003	Y	NA
367323	367324	NE0591	NE0592	hemD		TRUE	0.996	24.000	0.600	1.000	Y	NA
367324	367325	NE0592	NE0593		hemY	TRUE	0.997	23.000	0.765	1.000	Y	NA
367327	367328	NE0595	NE0596		pilC	TRUE	0.684	54.000	0.004	1.000	N	NA
367328	367329	NE0596	NE0597	pilC	pilD	TRUE	0.993	48.000	0.454	1.000	Y	NA
367329	367330	NE0597	NE0598	pilD		TRUE	0.984	3.000	0.122	1.000	N	NA
367330	367331	NE0598	NE0599			TRUE	0.921	41.000	0.110	NA		NA
367333	367334	NE0601	NE0602			TRUE	0.765	5.000	0.000	NA		NA
367334	367335	NE0602	NE0603			TRUE	0.765	5.000	0.000	NA		NA
367335	367336	NE0603	NE0604			FALSE	0.067	176.000	0.000	NA		NA
367336	367337	NE0604	NE0605			FALSE	0.042	207.000	0.000	NA		NA
367337	367338	NE0605	NE0606		cah	TRUE	0.993	32.000	1.000	NA		NA
367338	367339	NE0606	NE0607	cah	gcvT	FALSE	0.010	521.000	0.000	1.000	N	NA
367339	367340	NE0607	NE0608	gcvT	gcvH1	TRUE	0.990	73.000	0.317	0.002	Y	NA
367340	367341	NE0608	NE0609	gcvH1		TRUE	0.980	69.000	0.249	1.000	Y	NA
367341	367342	NE0609	NE0610			TRUE	0.991	70.000	0.316	0.001	Y	NA
367342	367343	NE0610	NE0611			TRUE	0.917	2.000	0.006	1.000	N	NA
367343	367344	NE0611	NE0612		plsC	FALSE	0.283	140.000	0.007	1.000	N	NA
367345	367346	NE0613	NE0614			TRUE	0.757	7.000	0.000	1.000		NA
367346	367347	NE0614	NE0615		omlA	TRUE	0.973	-3.000	0.049	1.000	N	NA
367348	367349	NE0616	NE0617	fur1	oprC	FALSE	0.041	456.000	0.000	1.000	Y	NA
367352	367353	NE0620	NE0621			TRUE	0.859	0.000	0.000	1.000		NA
367355	367356	NE0623	NE0624		mrp	TRUE	0.966	10.000	0.112	1.000	N	NA
367357	367358	NE0625	NE0626	metG1	pepN	FALSE	0.234	122.000	0.000	1.000	N	NA
367358	367359	NE0626	NE0627	pepN		FALSE	0.008	644.000	0.000	1.000	N	NA
367359	2213817	NE0627	NE0628			FALSE	0.045	203.000	0.000	NA		NA
2213817	2213818	NE0628	NE0629			TRUE	0.539	-19.000	0.000	NA		NA
2213818	2213819	NE0629	NE0630			TRUE	0.619	13.000	0.000	NA		NA
2213819	367360	NE0630	NE0631			FALSE	0.231	97.000	0.000	NA		NA
367360	367361	NE0631	NE0632			TRUE	0.996	-7.000	0.778	NA		NA
367362	367363	NE0633	NE0634		cobO	FALSE	0.049	197.000	0.000	NA		NA
367363	367364	NE0634	NE0635	cobO		TRUE	0.851	-13.000	0.024	NA		NA
367364	367365	NE0635	NE0636			TRUE	0.948	10.000	0.091	NA		NA
367365	367366	NE0636	NE0637		tatC	FALSE	0.009	481.000	0.000	NA	N	NA
367366	367367	NE0637	NE0638	tatC		TRUE	0.964	97.000	0.314	NA	Y	NA
367367	367368	NE0638	NE0639			TRUE	0.967	85.000	0.157	0.009	Y	NA
367368	367369	NE0639	NE0640		hitA	TRUE	0.927	19.000	0.080	1.000	N	NA
367369	367370	NE0640	NE0641	hitA	hisE	TRUE	0.978	2.000	0.079	1.000	N	NA
367370	367371	NE0641	NE0642	hisE	hisI	TRUE	0.997	-3.000	0.152	0.007	Y	NA
367371	367372	NE0642	NE0643	hisI	hisF	TRUE	0.956	157.000	0.430	0.007	Y	NA
367372	367373	NE0643	NE0644	hisF	hisA	TRUE	0.984	100.000	0.433	0.007	Y	NA
367373	367374	NE0644	NE0645	hisA	hisH	TRUE	0.974	69.000	0.120	0.007	Y	NA
367374	367375	NE0645	NE0646	hisH	hisB	TRUE	0.983	31.000	0.111	0.007	Y	NA
367375	367376	NE0646	NE0647	hisB	hisC1	TRUE	0.994	36.000	0.341	0.007	Y	NA
367376	367377	NE0647	NE0648	hisC1		TRUE	0.600	40.000	0.004	NA		NA
367380	367381	NE0651	NE0652	aroQ1	accB1	TRUE	0.625	201.000	0.254	1.000	N	NA
367381	367382	NE0652	NE0653	accB1	accC1	TRUE	0.989	70.000	0.275	0.002	Y	NA
367382	367383	NE0653	NE0654	accC1	prmA	TRUE	0.952	36.000	0.152	1.000	N	NA
367383	367384	NE0654	NE0655	prmA		TRUE	0.969	-3.000	0.058	NA		NA
367385	367386	NE0656	NE0657	amiB		TRUE	0.971	-3.000	0.063	NA		NA
367386	367387	NE0657	NE0658			TRUE	0.560	44.000	0.003	NA		NA
367388	367389	NE0659	NE0660	metK	ahcY	TRUE	0.902	132.000	0.114	0.002	Y	NA
367389	367390	NE0660	NE0661	ahcY	metF	FALSE	0.398	171.000	0.061	1.000	N	NA
367390	367391	NE0661	NE0662	metF		FALSE	0.004	1678.000	0.000	1.000		NA
367391	2213820	NE0662	NE0663		sbcB	TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
2213820	2213821	NE0663	NE0664	sbcB		TRUE	0.500	-22.000	0.000	NA		NA
367392	367393	NE0665	NE0666			FALSE	0.032	232.000	0.000	NA		NA
367393	367394	NE0666	NE0667			TRUE	0.997	-3.000	0.214	1.000	Y	NA
367394	367395	NE0667	NE0668			TRUE	0.967	13.000	0.143	1.000	N	NA
367395	367396	NE0668	NE0669			TRUE	0.996	-3.000	0.333	NA	N	NA
367396	367397	NE0669	NE0670			TRUE	0.725	11.000	0.000	NA	N	NA
367398	367399	NE0671	NE0672	sbcB		TRUE	0.859	0.000	0.000	1.000		NA
367400	367401	NE0673	NE0674	glcf,gox	glcE	TRUE	0.990	4.000	0.057	0.026	Y	NA
367401	367402	NE0674	NE0675	glcE	glcD	TRUE	0.983	10.000	0.044	0.002	Y	NA
367402	367403	NE0675	NE0676	glcD		TRUE	0.884	-10.000	0.013	1.000	N	NA
367404	367405	NE0677	NE0678	rmlA	rmlC	TRUE	0.995	0.000	0.125	1.000	Y	NA
367405	367406	NE0678	NE0679	rmlC		TRUE	0.791	70.000	0.000	1.000	Y	NA
367406	367407	NE0679	NE0680		yrhG	FALSE	0.421	84.000	0.000	1.000	N	NA
367408	367409	NE0681	NE0682			TRUE	0.993	-16.000	0.667	1.000		NA
367409	367410	NE0682	NE0683		coxA2	TRUE	0.969	94.000	0.524	0.049		NA
367410	367411	NE0683	NE0684	coxA2	coxB	TRUE	0.998	45.000	0.750	0.003	Y	NA
367412	367413	NE0685	NE0686	leuC		TRUE	0.874	34.000	0.058	1.000		NA
367413	367414	NE0686	NE0687		leuD	TRUE	0.970	6.000	0.096	1.000		NA
367414	367415	NE0687	NE0688	leuD	leuB	TRUE	0.998	-3.000	0.159	0.002	Y	NA
367415	367416	NE0688	NE0689	leuB	asd	TRUE	0.902	149.000	0.196	0.044	Y	NA
367416	367417	NE0689	NE0690	asd		FALSE	0.123	202.000	0.010	NA	N	NA
367417	367418	NE0690	NE0691			FALSE	0.288	126.000	0.006	NA	N	NA
367418	367419	NE0691	NE0692		trpF	TRUE	0.939	57.000	0.139	1.000	N	NA
367419	367420	NE0692	NE0693	trpF	trpB	TRUE	0.996	-16.000	0.375	0.002	Y	NA
367420	367421	NE0693	NE0694	trpB	trpA	TRUE	0.995	53.000	0.344	0.001	Y	NA
367421	367422	NE0694	NE0695	trpA	accD	TRUE	0.991	4.000	0.232	1.000	N	NA
367422	367423	NE0695	NE0696	accD	folC	TRUE	0.860	150.000	0.383	1.000	N	NA
367423	367424	NE0696	NE0697	folC		TRUE	0.922	21.000	0.100	NA		NA
367424	367425	NE0697	NE0698		cvpA	TRUE	0.972	-3.000	0.066	NA		NA
367425	367426	NE0698	NE0699	cvpA	purF	TRUE	0.887	105.000	0.262	1.000		NA
367426	367427	NE0699	NE0700	purF	metZ	TRUE	0.961	17.000	0.153	1.000	N	NA
367427	367428	NE0700	NE0701	metZ	ilvA	TRUE	0.742	112.000	0.006	0.015	Y	NA
367429	367430	NE0702	NE0703			TRUE	0.998	0.000	0.679	NA		NA
367430	367431	NE0703	NE0704			FALSE	0.049	197.000	0.000	NA		NA
367431	367432	NE0704	NE0705			FALSE	0.421	65.000	0.000	NA		NA
367432	367433	NE0705	NE0706			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367433	367434	NE0706	NE0707			TRUE	0.645	11.000	0.000	NA		NA
367434	367435	NE0707	NE0708			TRUE	0.505	59.000	0.000	1.000		NA
367435	367436	NE0708	NE0709			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.100		NA
367436	367437	NE0709	NE0710			FALSE	0.224	99.000	0.000	NA		NA
367437	367438	NE0710	NE0711			FALSE	0.013	322.000	0.000	NA		NA
367439	367440	NE0712	NE0713			TRUE	0.995	-3.000	0.366	NA		NA
367440	367441	NE0713	NE0714			FALSE	0.049	197.000	0.000	NA		NA
367441	367442	NE0714	NE0715			FALSE	0.301	84.000	0.000	NA		NA
367442	367443	NE0715	NE0716			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
367444	367445	NE0717	NE0718			FALSE	0.253	93.000	0.000	NA		NA
367445	367446	NE0718	NE0719			FALSE	0.012	331.000	0.000	NA		NA
367446	367447	NE0719	NE0720			FALSE	0.317	107.000	0.003	1.000	N	NA
367451	367452	NE0724	NE0725			FALSE	0.017	297.000	0.000	NA		NA
367453	367454	NE0726	NE0727		pyrC	FALSE	0.265	97.000	0.000	1.000		NA
367455	367456	NE0728	NE0729			TRUE	0.999	0.000	0.833	1.000	Y	NA
367457	367458	NE0730	NE0731			FALSE	0.165	233.000	0.000	1.000	Y	NA
367459	367460	NE0732	NE0733	ybbB	selD	TRUE	0.984	-7.000	0.214	1.000		NA
367461	367462	NE0734	NE0735	abcZ		FALSE	0.208	147.000	0.007	1.000		NA
367462	367463	NE0735	NE0736			TRUE	0.998	34.000	0.688	0.016	Y	NA
367465	367466	NE0738	NE0739			TRUE	0.538	80.000	0.000	0.049		NA
367466	367467	NE0739	NE0740			TRUE	0.574	16.000	0.000	NA		NA
367467	367468	NE0740	NE0741			TRUE	0.990	13.000	0.500	NA		NA
367468	367469	NE0741	NE0742			TRUE	0.856	52.000	0.000	1.000	Y	NA
2213822	367470	NE0743	NE0744			FALSE	0.034	226.000	0.000	NA		NA
367470	367471	NE0744	NE0745			FALSE	0.066	189.000	0.000	1.000		NA
2213823	2213824	NE0747	NE0748			TRUE	0.500	-22.000	0.000	NA		NA
2213824	367473	NE0748	NE0749			FALSE	0.484	54.000	0.000	NA		NA
2213825	367474	NE0750	NE0751		tnpR	FALSE	0.008	417.000	0.000	NA		NA
367476	367477	NE0754	NE0755			FALSE	0.100	152.000	0.000	NA		NA
367477	367478	NE0755	NE0756			TRUE	0.996	-7.000	0.778	NA		NA
367478	367479	NE0756	NE0757			TRUE	0.968	37.000	0.263	NA		NA
367479	367480	NE0757	NE0758			TRUE	0.866	80.000	0.105	1.000	N	NA
367481	367482	NE0759	NE0760		nusA	TRUE	0.990	53.000	0.759	NA		NA
367482	367483	NE0760	NE0761	nusA		TRUE	0.940	95.000	0.342	1.000	N	NA
367483	367484	NE0761	NE0762		rbfA	TRUE	0.994	51.000	0.530	1.000	Y	NA
367484	367485	NE0762	NE0763	rbfA		TRUE	0.963	101.000	0.318	1.000	Y	NA
367485	367486	NE0763	NE0764		ccmA	TRUE	0.585	68.000	0.003	1.000	N	NA
367486	367487	NE0764	NE0765	ccmA	ccmB	TRUE	0.982	7.000	0.018	0.003	Y	NA
367487	367488	NE0765	NE0766	ccmB	ccmC	TRUE	0.827	105.000	0.010	0.001	Y	NA
367488	367489	NE0766	NE0767	ccmC	ccmE	TRUE	0.733	176.000	0.067	0.003	Y	NA
367489	367490	NE0767	NE0768	ccmE	ccmF	TRUE	0.949	42.000	0.010	0.003	Y	NA
367490	367491	NE0768	NE0769	ccmF	ccmG	TRUE	0.999	-3.000	0.571	0.003	Y	NA
367491	367492	NE0769	NE0770	ccmG	ccmH	TRUE	0.998	8.000	0.571	NA	Y	NA
367492	367493	NE0770	NE0771	ccmH	cycH	TRUE	0.999	-3.000	0.444	NA	Y	NA
367493	367494	NE0771	NE0772	cycH	bcp	TRUE	0.875	31.000	0.002	1.000	Y	NA
367498	367499	NE0776	NE0777		TGL2	TRUE	0.556	35.000	0.000	1.000		NA
367499	367500	NE0777	NE0778	TGL2	argA	FALSE	0.278	95.000	0.000	1.000		NA
367500	367501	NE0778	NE0779	argA		TRUE	0.791	24.000	0.022	NA		NA
367502	367503	NE0780	NE0781			TRUE	0.881	-15.000	0.026	1.000	N	NA
367505	367506	NE0783	NE0784			TRUE	0.920	52.000	0.118	NA		NA
367510	367511	NE0788	NE0789			TRUE	0.913	124.000	0.500	NA		NA
367511	367512	NE0789	NE0790			TRUE	0.880	50.000	0.071	NA		NA
367512	367513	NE0790	NE0791			TRUE	0.985	22.000	0.500	NA		NA
367515	367516	NE0793	NE0794	ribD		FALSE	0.395	92.000	0.002	1.000	N	NA
367516	367517	NE0794	NE0795			TRUE	0.916	153.000	0.216	0.017	Y	NA
367517	367518	NE0795	NE0796			TRUE	0.989	3.000	0.189	1.000	N	NA
367520	367521	NE0798	NE0799			FALSE	0.277	88.000	0.000	NA		NA
367521	367522	NE0799	NE0800			TRUE	0.825	50.000	0.042	NA		NA
367522	367523	NE0800	NE0801			TRUE	0.699	19.000	0.007	NA		NA
367523	367524	NE0801	NE0802			TRUE	0.998	-3.000	0.631	0.048		NA
367524	367525	NE0802	NE0803			TRUE	0.913	2.000	0.009	1.000		NA
367525	367526	NE0803	NE0804			TRUE	0.994	8.000	0.250	1.000	Y	NA
367526	367527	NE0804	NE0805			TRUE	0.993	15.000	0.694	NA		NA
367527	367528	NE0805	NE0806			TRUE	0.807	53.000	0.035	NA		NA
367530	367531	NE0808	NE0809	secA		FALSE	0.222	177.000	0.006	0.088	N	NA
367531	367532	NE0809	NE0810			TRUE	0.991	2.000	0.029	0.001	Y	NA
367532	367533	NE0810	NE0811		petC	TRUE	1.000	-3.000	0.630	0.001	Y	NA
367533	367534	NE0811	NE0812	petC	sspA	TRUE	0.987	49.000	0.370	0.020	N	NA
367534	367535	NE0812	NE0813	sspA	sspB	TRUE	0.998	-3.000	0.831	NA		NA
367535	5437958	NE0813	RNA_28	sspB	tRNAThr3	TRUE	0.552	18.000	0.000	NA		NA
367538	367539	NE0816	NE0817			FALSE	0.050	383.000	0.000	NA	Y	NA
367539	367540	NE0817	NE0818			TRUE	0.967	96.000	0.625	NA	N	NA
367540	367541	NE0818	NE0819			FALSE	0.026	249.000	0.000	NA		NA
367541	367542	NE0819	NE0820			FALSE	0.034	226.000	0.000	NA		NA
367542	367543	NE0820	NE0821			FALSE	0.207	103.000	0.000	NA		NA
367543	367544	NE0821	NE0822			TRUE	0.909	-16.000	0.070	NA		NA
367545	367546	NE0823	NE0824			FALSE	0.058	186.000	0.000	NA		NA
367547	367548	NE0825	NE0826			TRUE	0.999	9.000	0.812	0.088	Y	NA
367548	367549	NE0826	NE0827			TRUE	0.999	-3.000	0.591	1.000	Y	NA
367549	367550	NE0827	NE0828			TRUE	0.998	-3.000	0.636	1.000	N	NA
367550	367551	NE0828	NE0829			TRUE	0.696	21.000	0.007	NA		NA
367552	367553	NE0830	NE0831			TRUE	0.748	63.000	0.023	1.000		NA
367553	367554	NE0831	NE0832			TRUE	0.825	28.000	0.023	NA	N	NA
367554	367555	NE0832	NE0833		hrpA	TRUE	0.856	7.000	0.006	NA	N	NA
367555	367556	NE0833	NE0834	hrpA		FALSE	0.217	165.000	0.000	0.004		NA
367557	367558	NE0835	NE0836	tnpA	tnpR	TRUE	0.998	3.000	0.400	0.097	Y	NA
367558	367559	NE0836	NE0837	tnpR		TRUE	0.787	130.000	0.200	NA	N	NA
367559	367560	NE0837	NE0838		merD	FALSE	0.047	230.000	0.000	NA	N	NA
367560	367561	NE0838	NE0839	merD	merA	TRUE	0.676	18.000	0.000	1.000	N	NA
367561	367562	NE0839	NE0840	merA	merC	TRUE	0.512	39.000	0.000	NA		NA
367562	367563	NE0840	NE0841	merC	merP	TRUE	0.520	29.000	0.000	NA		NA
367563	367564	NE0841	NE0842	merP	merT	TRUE	0.984	14.000	0.200	0.001		NA
367565	367566	NE0843	NE0844	merR		FALSE	0.476	-25.000	0.000	NA		NA
367566	367567	NE0844	NE0845			TRUE	0.998	3.000	0.882	NA		NA
11459153	367567		NE0845			FALSE	NA	181.000	0.000	NA		NA
11601516	367567		NE0845			FALSE	NA	181.000	0.000	NA		NA
11743908	367567		NE0845			FALSE	NA	181.000	0.000	NA		NA
11459154	367567		NE0845			FALSE	NA	218.000	0.000	NA		NA
11601517	367567		NE0845			FALSE	NA	218.000	0.000	NA		NA
11743909	367567		NE0845			FALSE	NA	218.000	0.000	NA		NA
11459155	367567		NE0845			FALSE	NA	253.000	0.000	NA		NA
11601518	367567		NE0845			FALSE	NA	253.000	0.000	NA		NA
11743910	367567		NE0845			FALSE	NA	253.000	0.000	NA		NA
11459156	367567		NE0845			FALSE	NA	290.000	0.000	NA		NA
11601519	367567		NE0845			FALSE	NA	290.000	0.000	NA		NA
11743911	367567		NE0845			FALSE	NA	290.000	0.000	NA		NA
11459157	367567		NE0845			FALSE	NA	325.000	0.000	NA		NA
11601520	367567		NE0845			FALSE	NA	325.000	0.000	NA		NA
11743912	367567		NE0845			FALSE	NA	325.000	0.000	NA		NA
11459158	367567		NE0845			FALSE	NA	362.000	0.000	NA		NA
11601521	367567		NE0845			FALSE	NA	362.000	0.000	NA		NA
11743913	367567		NE0845			FALSE	NA	362.000	0.000	NA		NA
11459159	367567		NE0845			FALSE	NA	398.000	0.000	NA		NA
11601522	367567		NE0845			FALSE	NA	398.000	0.000	NA		NA
11743914	367567		NE0845			FALSE	NA	398.000	0.000	NA		NA
11459160	367567		NE0845			FALSE	NA	435.000	0.000	NA		NA
11601523	367567		NE0845			FALSE	NA	435.000	0.000	NA		NA
11743915	367567		NE0845			FALSE	NA	435.000	0.000	NA		NA
11459161	367567		NE0845			FALSE	NA	470.000	0.000	NA		NA
11601524	367567		NE0845			FALSE	NA	470.000	0.000	NA		NA
11743916	367567		NE0845			FALSE	NA	470.000	0.000	NA		NA
11459162	367567		NE0845			FALSE	NA	507.000	0.000	NA		NA
11601525	367567		NE0845			FALSE	NA	507.000	0.000	NA		NA
11743917	367567		NE0845			FALSE	NA	507.000	0.000	NA		NA
11459163	367567		NE0845			FALSE	NA	541.000	0.000	NA		NA
11601526	367567		NE0845			FALSE	NA	541.000	0.000	NA		NA
11743918	367567		NE0845			FALSE	NA	541.000	0.000	NA		NA
11459164	367567		NE0845			FALSE	NA	578.000	0.000	NA		NA
11601527	367567		NE0845			FALSE	NA	578.000	0.000	NA		NA
11743919	367567		NE0845			FALSE	NA	578.000	0.000	NA		NA
11459165	367567		NE0845			FALSE	NA	613.000	0.000	NA		NA
11601528	367567		NE0845			FALSE	NA	613.000	0.000	NA		NA
11743920	367567		NE0845			FALSE	NA	613.000	0.000	NA		NA
11459166	367567		NE0845			FALSE	NA	650.000	0.000	NA		NA
11601529	367567		NE0845			FALSE	NA	650.000	0.000	NA		NA
11743921	367567		NE0845			FALSE	NA	650.000	0.000	NA		NA
11459167	367567		NE0845			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11601530	367567		NE0845			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11743922	367567		NE0845			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11459168	367567		NE0845			FALSE	NA	723.000	0.000	NA		NA
11601531	367567		NE0845			FALSE	NA	723.000	0.000	NA		NA
11743923	367567		NE0845			FALSE	NA	723.000	0.000	NA		NA
11459169	367567		NE0845			FALSE	NA	758.000	0.000	NA		NA
11601532	367567		NE0845			FALSE	NA	758.000	0.000	NA		NA
11743924	367567		NE0845			FALSE	NA	758.000	0.000	NA		NA
367568	367569	NE0846	NE0847			FALSE	0.139	128.000	0.000	NA		NA
367569	367570	NE0847	NE0848			FALSE	0.214	120.000	0.000	NA	N	NA
367570	367571	NE0848	NE0849			TRUE	0.730	56.000	0.015	NA		NA
367571	367572	NE0849	NE0850			TRUE	0.807	16.000	0.018	NA		NA
367574	367575	NE0852	NE0853	yvgQ	yvgR	TRUE	0.979	9.000	0.015	0.001	Y	NA
367575	367576	NE0853	NE0854	yvgR	cysB	FALSE	0.009	528.000	0.000	1.000	N	NA
367577	367578	NE0855	NE0856	cysH	cysD	TRUE	0.902	25.000	0.006	1.000	Y	NA
367578	367579	NE0856	NE0857	cysD	cysN	TRUE	0.979	56.000	0.211	0.001	N	NA
367579	367580	NE0857	NE0858	cysN		TRUE	0.669	88.000	0.029	1.000	N	NA
367580	367581	NE0858	NE0859		pntAa	FALSE	0.475	121.000	0.007	0.025	N	NA
367581	367582	NE0859	NE0860	pntAa	pntAb2	TRUE	0.995	56.000	0.829	0.001		NA
367582	367583	NE0860	NE0861	pntAb2	pntB	TRUE	0.967	1.000	0.011	0.001		NA
367584	367585	NE0862	NE0863		bfr	FALSE	0.075	180.000	0.000	1.000		NA
367586	367587	NE0864	NE0865			TRUE	0.891	54.000	0.083	NA		NA
367588	367589	NE0866	NE0867	purC	purK	TRUE	0.897	30.000	0.006	1.000	Y	NA
367589	367590	NE0867	NE0868	purK	purE	TRUE	0.996	-9.000	0.201	0.001	Y	NA
367591	367592	NE0869	NE0870	exbD2	sodB	TRUE	0.541	77.000	0.004	1.000	N	NA
367592	367593	NE0870	NE0871	sodB	hisG	TRUE	0.775	10.000	0.002	1.000	N	NA
367593	367594	NE0871	NE0872	hisG	hisD	TRUE	0.993	21.000	0.254	0.006	Y	NA
367594	367595	NE0872	NE0873	hisD	ubiH	FALSE	0.330	114.000	0.004	1.000	N	NA
367595	367596	NE0873	NE0874	ubiH		FALSE	0.440	157.000	0.019	0.010	N	NA
367596	367597	NE0874	NE0875		fis	TRUE	0.990	-3.000	0.161	1.000	N	NA
367597	367598	NE0875	NE0876	fis	purH	TRUE	0.966	9.000	0.101	1.000	N	NA
367598	367599	NE0876	NE0877	purH	purD	TRUE	0.997	2.000	0.238	1.000	Y	NA
367603	367604	NE0881	NE0882		surA	TRUE	0.991	0.000	0.168	1.000	N	NA
367604	367605	NE0882	NE0883	surA	pdxA	TRUE	0.988	53.000	0.561	1.000	N	NA
367605	367606	NE0883	NE0884	pdxA	ksgA	TRUE	0.945	67.000	0.197	1.000	N	NA
367607	367608	NE0885	NE0886	ogt		FALSE	0.061	196.000	0.000	1.000		NA
367609	367610	NE0887	NE0888			TRUE	0.793	3.000	0.000	NA		NA
367610	367611	NE0888	NE0889			FALSE	0.421	65.000	0.000	NA		NA
367611	367612	NE0889	NE0890			FALSE	0.321	80.000	0.000	NA		NA
367612	367613	NE0890	NE0891			FALSE	0.009	383.000	0.000	NA		NA
367613	367614	NE0891	NE0892			FALSE	0.464	58.000	0.000	NA		NA
367614	367615	NE0892	NE0893			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367617	367618	NE0895	NE0896			FALSE	0.052	195.000	0.000	NA		NA
367619	367620	NE0897	NE0898	efp		TRUE	0.812	74.000	0.074	NA		NA
367622	367623	NE0900	NE0901			TRUE	0.879	28.000	0.065	NA		NA
367625	367626	NE0903	NE0904			TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.016	Y	NA
367629	367630	NE0907	NE0908	adhC1		TRUE	0.968	1.000	0.058	1.000		NA
367632	367633	NE0910	NE0911		yliG	FALSE	0.021	272.000	0.000	NA		NA
367635	367636	NE0913	NE0914			TRUE	0.637	53.000	0.007	NA		NA
367636	367637	NE0914	NE0915			TRUE	0.910	44.000	0.091	NA		NA
367637	367638	NE0915	NE0916			TRUE	0.958	12.000	0.127	NA		NA
367638	367639	NE0916	NE0917			FALSE	0.014	310.000	0.000	NA		NA
367639	367640	NE0917	NE0918			TRUE	0.984	-3.000	0.117	NA		NA
367640	367641	NE0918	NE0919			TRUE	0.573	114.000	0.061	NA		NA
367641	367642	NE0919	NE0920			TRUE	0.998	-3.000	0.848	NA		NA
367644	367645	NE0922	NE0923	cphA		TRUE	0.998	27.000	0.871	0.001	Y	NA
367646	367647	NE0924	NE0925	aniA		TRUE	0.877	19.000	0.050	1.000		NA
367647	367648	NE0925	NE0926			TRUE	0.996	-3.000	0.300	0.016		NA
367648	367649	NE0926	NE0927		pan1	TRUE	0.972	32.000	0.286	1.000		NA
367651	367652	NE0929	NE0930			TRUE	0.997	2.000	0.575	NA		NA
367653	367654	NE0931	NE0932			TRUE	0.841	17.000	0.026	1.000		NA
367654	367655	NE0932	NE0933		uvrC	TRUE	0.747	16.000	0.007	1.000		NA
367656	367657	NE0934	NE0935			TRUE	0.929	-3.000	0.000	0.029		NA
367657	2213827	NE0935	NE0936			FALSE	0.394	-78.000	0.000	NA		NA
367658	367659	NE0937	NE0938			TRUE	0.998	-3.000	0.833	NA		NA
367660	367661	NE0939	NE0940			FALSE	0.045	278.000	0.000	0.094		NA
367661	367662	NE0940	NE0941			FALSE	0.004	704.000	0.000	NA		NA
367662	367663	NE0941	NE0942			TRUE	0.962	85.000	0.500	NA		NA
367663	367664	NE0942	NE0943		amoB1	TRUE	0.642	164.000	0.200	NA		NA
367664	367665	NE0943	NE0944	amoB1	amoA1	TRUE	0.999	2.000	0.700	0.003		NA
367665	367666	NE0944	NE0945	amoA1	amoC1	TRUE	0.857	164.000	0.333	0.003		NA
367667	367668	NE0946	NE0947		cbbY	TRUE	0.778	16.000	0.012	NA		NA
367669	367670	NE0948	NE0949			FALSE	0.396	108.000	0.007	1.000	N	NA
367670	367671	NE0949	NE0950		surE	TRUE	0.901	115.000	0.353	1.000		NA
367671	5437959	NE0950	RNA_15	surE	tRNAPro2	FALSE	0.072	172.000	0.000	NA		NA
5437959	367672	RNA_15	NE0951	tRNAPro2		FALSE	0.126	135.000	0.000	NA		NA
367672	367673	NE0951	NE0952		ihfA	TRUE	0.986	-22.000	0.535	1.000		NA
367673	367674	NE0952	NE0953	ihfA	pheT	TRUE	0.964	51.000	0.208	1.000	N	NA
367674	367675	NE0953	NE0954	pheT	pheS	TRUE	0.998	19.000	0.574	0.001	Y	NA
367675	367676	NE0954	NE0955	pheS	rplT	TRUE	0.975	69.000	0.202	1.000	Y	NA
367676	367677	NE0955	NE0956	rplT	rpmI	TRUE	0.999	12.000	0.928	0.018	Y	NA
367677	367678	NE0956	NE0957	rpmI	infC	TRUE	0.976	125.000	0.652	1.000	Y	NA
367678	367679	NE0957	NE0958	infC	thrS	TRUE	0.902	126.000	0.186	1.000	Y	NA
367679	367680	NE0958	NE0959	thrS	cycX3	FALSE	0.024	311.000	0.000	1.000	N	NA
367680	367681	NE0959	NE0960	cycX3	cycA3	TRUE	0.996	3.000	0.500	NA		NA
367681	367682	NE0960	NE0961	cycA3		TRUE	0.976	56.000	0.400	NA		NA
367682	367683	NE0961	NE0962		hao2	TRUE	0.998	-3.000	0.615	NA		NA
367685	367686	NE0964	NE0965	pilU	pilT	TRUE	0.955	17.000	0.012	0.017	Y	NA
367688	367689	NE0967	NE0968	fdx1	coaD	TRUE	0.919	20.000	0.088	1.000		NA
367689	367690	NE0968	NE0969	coaD		TRUE	0.992	-7.000	0.367	1.000	N	NA
367690	367691	NE0969	NE0970			TRUE	0.939	10.000	0.070	1.000		NA
367692	367693	NE0971	NE0972	phnB		TRUE	0.515	31.000	0.000	NA		NA
367693	367694	NE0972	NE0973			FALSE	0.069	175.000	0.000	NA		NA
367695	367696	NE0974	NE0975			TRUE	0.996	0.000	0.167	NA	Y	NA
367696	367697	NE0975	NE0976			FALSE	0.013	391.000	0.000	NA	N	NA
367697	367698	NE0976	NE0977			TRUE	0.991	28.000	0.333	1.000	Y	NA
367698	367699	NE0977	NE0978			FALSE	0.073	327.000	0.000	1.000	Y	NA
367699	367700	NE0978	NE0979			FALSE	0.325	165.000	0.000	NA	Y	NA
367700	367701	NE0979	NE0980			TRUE	0.810	6.000	0.000	NA	N	NA
367701	367702	NE0980	NE0981			FALSE	0.015	396.000	0.000	1.000	N	NA
367703	367704	NE0982	NE0983			TRUE	0.991	16.000	0.635	NA		NA
367704	367705	NE0983	NE0984		ftsL	TRUE	0.994	-3.000	0.227	1.000	N	NA
367705	367706	NE0984	NE0985	ftsL	ftsI	TRUE	0.966	-3.000	0.032	1.000	N	NA
367706	367707	NE0985	NE0986	ftsI	murE	TRUE	0.983	-3.000	0.016	1.000	Y	NA
367707	367708	NE0986	NE0987	murE	murF	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.003	Y	NA
367708	367709	NE0987	NE0988	murF	mraY	TRUE	0.983	87.000	0.309	0.007	Y	NA
367709	367710	NE0988	NE0989	mraY	murD	TRUE	0.999	-3.000	0.647	0.007	Y	NA
367710	367711	NE0989	NE0990	murD	ftsW	TRUE	0.995	5.000	0.297	0.005	N	NA
367711	367712	NE0990	NE0991	ftsW	murG	TRUE	0.987	65.000	0.647	1.000	N	NA
367712	367713	NE0991	NE0992	murG	murC	TRUE	0.994	-10.000	0.283	1.000	Y	NA
367713	367714	NE0992	NE0993	murC		TRUE	0.991	11.000	0.136	0.007	Y	NA
367714	367715	NE0993	NE0994		ddlB	TRUE	0.995	-3.000	0.074	0.007	Y	NA
367715	367716	NE0994	NE0995	ddlB	ftsQ	TRUE	0.978	87.000	0.372	NA	Y	NA
367716	367717	NE0995	NE0996	ftsQ	ftsA	TRUE	0.996	-3.000	0.389	NA	N	NA
367717	367718	NE0996	NE0997	ftsA	ftsZ	TRUE	0.989	70.000	0.460	1.000	Y	NA
367720	367721	NE0999	NE1000			TRUE	0.999	6.000	0.485	0.001	Y	NA
367721	367722	NE1000	NE1001		pstB	TRUE	0.990	10.000	0.086	0.001	Y	NA
367724	367725	NE1003	NE1004			TRUE	0.694	41.000	0.008	NA		NA
367726	367727	NE1005	NE1006	argB	pilI	FALSE	0.406	91.000	0.003	1.000	N	NA
367727	367728	NE1006	NE1007	pilI	pilH	TRUE	0.997	7.000	0.392	1.000	Y	NA
367729	367730	NE1008	NE1009			TRUE	0.801	45.000	0.029	NA		NA
367731	367732	NE1010	NE1011	ctaB		FALSE	0.341	109.000	0.009	NA		NA
367732	367733	NE1011	NE1012			TRUE	0.947	-25.000	0.195	NA		NA
367733	367734	NE1012	NE1013		coxC	TRUE	0.522	108.000	0.041	NA		NA
367734	367735	NE1013	NE1014	coxC		TRUE	0.943	25.000	0.152	NA		NA
367735	367736	NE1014	NE1015		ctaG	TRUE	0.975	6.000	0.129	NA		NA
367736	367737	NE1015	NE1016	ctaG	coxA	TRUE	0.860	126.000	0.268	1.000	N	NA
367737	367738	NE1016	NE1017	coxA	coxB	TRUE	0.998	55.000	0.741	0.003	Y	NA
367739	367740	NE1018	NE1019		copA	FALSE	0.372	71.000	0.000	NA		NA
367740	367741	NE1019	NE1020	copA		TRUE	0.984	-13.000	0.070	0.007	Y	NA
367741	367742	NE1020	NE1021		accA	FALSE	0.173	155.000	0.003	1.000	N	NA
367742	367743	NE1021	NE1022	accA		TRUE	0.929	-31.000	0.123	1.000	N	NA
367743	367744	NE1022	NE1023		rfbD	TRUE	0.605	56.000	0.000	1.000	N	NA
367745	367746	NE1024	NE1025			TRUE	0.800	29.000	0.012	1.000	N	NA
367746	367747	NE1025	NE1026			FALSE	0.113	155.000	0.000	1.000		NA
367748	367749	NE1027	NE1028			TRUE	0.604	38.000	0.000	NA	N	NA
367749	367750	NE1028	NE1029			FALSE	0.090	190.000	0.000	1.000	N	NA
367750	367751	NE1029	NE1030			TRUE	0.985	136.000	0.844	0.026	Y	NA
367751	367752	NE1030	NE1031			TRUE	0.971	8.000	0.070	0.026	N	NA
367752	367753	NE1031	NE1032			TRUE	0.526	23.000	0.000	NA		NA
367755	367756	NE1034	NE1035	trxA	rho	FALSE	0.264	223.000	0.087	1.000		NA
367756	367757	NE1035	NE1036	rho	rpmE,rpL31	FALSE	0.233	280.000	0.115	1.000	N	NA
2213828	2213829	NE1037	NE1038			FALSE	0.386	-85.000	0.000	NA		NA
2213829	2213830	NE1038	NE1039			FALSE	0.194	107.000	0.000	NA		NA
2213830	2213831	NE1039	NE1040			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
2213831	367758	NE1040	NE1041			FALSE	0.218	100.000	0.000	NA		NA
367758	367759	NE1041	NE1042			FALSE	0.016	300.000	0.000	NA		NA
367759	367760	NE1042	NE1043			FALSE	0.368	72.000	0.000	NA		NA
367760	367761	NE1043	NE1044		eno	TRUE	0.994	-3.000	0.241	1.000	N	NA
367761	367762	NE1044	NE1045	eno	pyrG	FALSE	0.064	441.000	0.068	1.000	N	NA
367763	367764	NE1046	NE1047		sdhD	TRUE	0.999	-6.000	0.453	0.001	Y	NA
367764	367765	NE1047	NE1048	sdhD	sdhA	TRUE	0.999	2.000	0.705	0.002	Y	NA
367765	367766	NE1048	NE1049	sdhA		FALSE	0.309	82.000	0.000	NA		NA
367766	367767	NE1049	NE1050			FALSE	0.462	-28.000	0.000	NA		NA
367767	367768	NE1050	NE1051		ftsK	TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367768	367769	NE1051	NE1052	ftsK		TRUE	0.922	60.000	0.130	1.000		NA
367769	367770	NE1052	NE1053			TRUE	0.981	-7.000	0.167	1.000	N	NA
367770	367771	NE1053	NE1054		algI	FALSE	0.179	133.000	0.000	NA	N	NA
367771	367772	NE1054	NE1055	algI		TRUE	0.993	-3.000	0.250	NA		NA
367773	367774	NE1056	NE1057	lolD		TRUE	0.997	-7.000	0.620	0.040	N	NA
367774	367775	NE1057	NE1058			FALSE	0.214	134.000	0.007	NA		NA
2213832	367777	NE1060	NE1061			TRUE	0.645	11.000	0.000	NA		NA
367777	2213833	NE1061	NE1062			FALSE	0.407	-64.000	0.000	NA		NA
2213833	2213834	NE1062	NE1063			TRUE	0.539	-19.000	0.000	NA		NA
2213834	367778	NE1063	NE1064			FALSE	0.108	146.000	0.000	NA		NA
367778	367779	NE1064	NE1065			TRUE	0.986	-3.000	0.143	NA		NA
367780	367781	NE1066	NE1067			TRUE	0.830	186.000	0.613	NA		NA
2213835	2213836	NE1068	NE1069			TRUE	0.515	31.000	0.000	NA		NA
2213836	367782	NE1069	NE1070			FALSE	0.008	402.000	0.000	NA		NA
367782	367783	NE1070	NE1071			TRUE	0.997	8.000	0.833	NA	N	NA
367783	367784	NE1071	NE1072			FALSE	0.036	271.000	0.000	1.000	N	NA
367784	2213837	NE1072	NE1073			FALSE	0.007	475.000	0.000	NA		NA
2213837	367785	NE1073	NE1074			FALSE	0.211	101.000	0.000	NA		NA
367785	367786	NE1074	NE1075			TRUE	0.996	-3.000	0.417	NA		NA
367786	367787	NE1075	NE1076			FALSE	0.329	86.000	0.000	1.000		NA
367787	367788	NE1076	NE1077			TRUE	0.685	144.000	0.170	NA		NA
367788	367789	NE1077	NE1078			FALSE	0.076	169.000	0.000	NA		NA
367789	367790	NE1078	NE1079			TRUE	0.996	5.000	0.556	NA	N	NA
367790	367791	NE1079	NE1080			FALSE	0.289	107.000	0.000	1.000	N	NA
367791	367792	NE1080	NE1081			TRUE	0.992	9.000	0.314	0.082	N	NA
367792	367793	NE1081	NE1082			TRUE	0.998	-6.000	0.943	0.082	N	NA
367793	367794	NE1082	NE1083			FALSE	0.087	160.000	0.000	NA		NA
367794	367795	NE1083	NE1084			TRUE	0.993	2.000	0.300	NA		NA
367795	367796	NE1084	NE1085			FALSE	0.218	100.000	0.000	NA		NA
367796	367797	NE1085	NE1086			TRUE	0.552	59.000	0.000	NA	N	NA
367797	367798	NE1086	NE1087		fpvA	FALSE	0.033	284.000	0.000	1.000	N	NA
367798	367799	NE1087	NE1088	fpvA		FALSE	0.329	203.000	0.000	0.008	Y	NA
367799	367800	NE1088	NE1089			TRUE	0.649	124.000	0.000	0.008	Y	NA
367800	367801	NE1089	NE1090			FALSE	0.010	364.000	0.000	NA		NA
367801	367802	NE1090	NE1091			TRUE	0.923	68.000	0.176	NA		NA
367802	2213838	NE1091	NE1092			FALSE	0.008	426.000	0.000	NA		NA
2213839	367804	NE1094	NE1095			FALSE	0.067	176.000	0.000	NA		NA
367804	367805	NE1095	NE1096			TRUE	0.673	15.000	0.000	NA	N	NA
367805	367806	NE1096	NE1097			FALSE	0.047	244.000	0.000	1.000	N	NA
367806	367807	NE1097	NE1098			TRUE	0.649	94.000	0.000	NA	Y	NA
367807	367808	NE1098	NE1099			TRUE	0.982	14.000	0.286	NA	N	NA
367809	367810	NE1100	NE1101			FALSE	0.315	81.000	0.000	NA		NA
367810	367811	NE1101	NE1102			TRUE	0.989	25.000	0.571	NA	N	NA
367812	367813	NE1103	NE1104			TRUE	0.997	-3.000	0.533	1.000		NA
2213840	367814	NE1105	NE1106			TRUE	0.524	25.000	0.000	NA		NA
367814	367815	NE1106	NE1107			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
367815	2213841	NE1107	NE1108			TRUE	0.580	-16.000	0.000	NA		NA
2213841	367816	NE1108	NE1109			FALSE	0.027	245.000	0.000	NA		NA
367816	367817	NE1109	NE1110			TRUE	0.619	13.000	0.000	NA		NA
367818	367819	NE1111	NE1112			TRUE	0.982	16.000	0.211	0.025	N	NA
367819	367820	NE1112	NE1113			TRUE	0.970	19.000	0.211	1.000	N	NA
367821	367822	NE1114	NE1115		oprN	FALSE	0.444	80.000	0.000	1.000	N	NA
367822	367823	NE1115	NE1116	oprN		TRUE	0.938	-3.000	0.000	0.082	N	NA
367823	367824	NE1116	NE1117		yhiH	TRUE	0.993	-3.000	0.195	0.082		NA
367824	367825	NE1117	NE1118	yhiH		TRUE	0.997	3.000	0.500	0.007		NA
367826	367827	NE1119	NE1120			TRUE	0.499	49.000	0.000	NA		NA
367827	367828	NE1120	NE1121			TRUE	0.510	36.000	0.000	NA		NA
367828	367829	NE1121	NE1122			FALSE	0.014	311.000	0.000	NA		NA
367830	367831	NE1123	NE1124			FALSE	0.033	245.000	0.000	1.000		NA
367831	367832	NE1124	NE1125		fadD	TRUE	0.871	43.000	0.043	1.000	N	NA
367832	367833	NE1125	NE1126	fadD		TRUE	0.995	-3.000	0.278	1.000	N	NA
367833	367834	NE1126	NE1127		asnB,asn	FALSE	0.482	201.000	0.056	1.000	Y	NA
367834	367835	NE1127	NE1128	asnB,asn		FALSE	0.010	374.000	0.000	NA		NA
367835	367836	NE1128	NE1129			TRUE	0.964	31.000	0.231	NA		NA
367836	367837	NE1129	NE1130			TRUE	0.992	-7.000	0.458	NA		NA
367837	2213842	NE1130	NE1131			TRUE	0.519	30.000	0.000	NA		NA
367838	367839	NE1132	NE1133			TRUE	0.510	45.000	0.000	NA		NA
2213843	367840	NE1134	NE1135			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367841	367842	NE1136	NE1137		holA	TRUE	0.889	1.000	0.002	1.000	N	NA
367842	367843	NE1137	NE1138	holA	rlpB	TRUE	0.976	12.000	0.199	NA	N	NA
367843	367844	NE1138	NE1139	rlpB	leuS	TRUE	0.964	18.000	0.182	NA	N	NA
367845	367846	NE1140	NE1141	tsaA	tgt	TRUE	0.999	-3.000	0.360	0.001	Y	NA
367846	367847	NE1141	NE1142	tgt		TRUE	0.977	35.000	0.325	NA	N	NA
367847	367848	NE1142	NE1143			TRUE	0.930	75.000	0.083	NA	Y	NA
367848	367849	NE1143	NE1144			TRUE	0.995	24.000	0.332	0.001	Y	NA
367849	367850	NE1144	NE1145			TRUE	0.667	59.000	0.010	NA		NA
367850	367851	NE1145	NE1146			TRUE	0.885	50.000	0.074	NA		NA
367852	367853	NE1147	NE1148		lspA	TRUE	0.613	88.000	0.015	1.000	N	NA
367853	367854	NE1148	NE1149	lspA	ileS	TRUE	0.909	43.000	0.071	1.000	N	NA
367854	367855	NE1149	NE1150	ileS	ribF	TRUE	0.993	2.000	0.254	1.000	N	NA
367855	367856	NE1150	NE1151	ribF		FALSE	0.364	109.000	0.009	1.000		NA
367857	367858	NE1152	NE1153	hbpA	appB	TRUE	0.997	18.000	0.619	0.025	Y	NA
367858	367859	NE1153	NE1154	appB		TRUE	0.597	134.000	0.048	0.081	N	NA
367859	367860	NE1154	NE1155			TRUE	0.862	48.000	0.041	1.000	N	NA
367860	367861	NE1155	NE1156			TRUE	0.993	2.000	0.286	1.000		NA
367861	367862	NE1156	NE1157			TRUE	0.820	57.000	0.047	NA		NA
367862	367863	NE1157	NE1158			TRUE	0.778	17.000	0.013	NA		NA
367863	5437960	NE1158	RNA_29		tRNAMet3	FALSE	0.106	147.000	0.000	NA		NA
367864	367865	NE1159	NE1160	xseB	ispA	TRUE	0.978	-10.000	0.177	1.000	N	NA
367865	367866	NE1160	NE1161	ispA	dxs	TRUE	0.985	58.000	0.246	1.000	Y	NA
367866	367867	NE1161	NE1162	dxs		TRUE	0.499	49.000	0.000	NA		NA
367867	367868	NE1162	NE1163			FALSE	0.051	196.000	0.000	NA		NA
367868	367869	NE1163	NE1164			FALSE	0.019	288.000	0.000	NA		NA
367872	367873	NE1167	NE1168			TRUE	0.988	-3.000	0.122	1.000	N	NA
367873	367874	NE1168	NE1169		vacJ	TRUE	0.724	125.000	0.118	1.000	N	NA
367874	367875	NE1169	NE1170	vacJ	dfrA	TRUE	0.854	53.000	0.000	1.000	Y	NA
367875	367876	NE1170	NE1171	dfrA	exbB2	TRUE	0.523	69.000	0.000	1.000	N	NA
367877	367878	NE1172	NE1173	xseA		FALSE	0.041	209.000	0.000	NA		NA
367878	367879	NE1173	NE1174			TRUE	0.647	41.000	0.006	NA		NA
367879	367880	NE1174	NE1175		dsbB	TRUE	0.871	7.000	0.006	1.000	N	NA
367880	367881	NE1175	NE1176	dsbB		TRUE	0.568	28.000	0.000	1.000		NA
367881	2213844	NE1176	NE1177			FALSE	0.090	158.000	0.000	NA		NA
367882	367883	NE1178	NE1179			FALSE	0.051	196.000	0.000	NA		NA
367885	367886	NE1181	NE1182			TRUE	0.710	-7.000	0.000	NA		NA
367886	367887	NE1182	NE1183			FALSE	0.024	255.000	0.000	NA		NA
367887	367888	NE1183	NE1184		nlaB	FALSE	0.063	194.000	0.000	1.000		NA
367888	367889	NE1184	NE1185	nlaB		TRUE	0.995	0.000	0.310	1.000	N	NA
367889	367890	NE1185	NE1186		glyS	TRUE	0.965	12.000	0.123	1.000	N	NA
367890	367891	NE1186	NE1187	glyS	glyQ	TRUE	1.000	-3.000	0.651	0.001	Y	NA
367891	367892	NE1187	NE1188	glyQ	lnt	TRUE	0.938	2.000	0.011	1.000	N	NA
367892	367893	NE1188	NE1189	lnt		FALSE	0.037	220.000	0.000	NA		NA
367893	367894	NE1189	NE1190		fpvA	FALSE	0.028	244.000	0.000	NA		NA
367894	367895	NE1190	NE1191	fpvA		TRUE	0.793	162.000	0.154	NA	Y	NA
367895	367896	NE1191	NE1192			TRUE	0.765	122.000	0.154	NA	N	NA
367896	2213845	NE1192	NE1193			FALSE	0.010	366.000	0.000	NA		NA
2213845	367897	NE1193	NE1194			FALSE	0.004	664.000	0.000	NA		NA
367897	367898	NE1194	NE1195			TRUE	0.998	-6.000	0.500	NA	Y	NA
367898	367899	NE1195	NE1196			TRUE	0.999	-3.000	0.625	1.000	Y	NA
367899	367900	NE1196	NE1197			TRUE	0.999	-3.000	0.643	NA	Y	NA
367902	367903	NE1199	NE1200			FALSE	0.024	257.000	0.000	NA		NA
367903	367904	NE1200	NE1201			FALSE	0.013	322.000	0.000	NA		NA
367905	367906	NE1202	NE1203			FALSE	0.031	234.000	0.000	NA		NA
367906	367907	NE1203	NE1204			FALSE	0.231	97.000	0.000	NA		NA
367908	367909	NE1205	NE1206			FALSE	0.250	117.000	0.000	1.000	N	NA
367910	367911	NE1207	NE1208			FALSE	0.013	363.000	0.000	1.000		NA
367911	367912	NE1208	NE1209			TRUE	0.985	2.000	0.145	1.000		NA
367912	367913	NE1209	NE1210			TRUE	0.989	-3.000	0.113	0.096		NA
367913	367914	NE1210	NE1211			TRUE	0.997	7.000	0.609	0.007	N	NA
367914	367915	NE1211	NE1212			FALSE	0.042	250.000	0.000	1.000	N	NA
367915	367916	NE1212	NE1213		sps	TRUE	0.983	8.000	0.194	1.000	N	NA
367916	367917	NE1213	NE1214	sps	ss2	TRUE	0.979	70.000	0.141	0.001	Y	NA
367917	367918	NE1214	NE1215	ss2		FALSE	0.392	75.000	0.000	1.000		NA
367920	367921	NE1217	NE1218		fecR	TRUE	0.981	79.000	0.667	NA	N	NA
2213847	367923	NE1221	NE1222			FALSE	0.370	-148.000	0.000	NA		NA
367923	367924	NE1222	NE1223			FALSE	0.063	180.000	0.000	NA		NA
367925	367926	NE1224	NE1225			TRUE	0.886	-19.000	0.065	NA		NA
367929	367930	NE1228	NE1229		prfB	FALSE	0.497	56.000	0.002	NA		NA
367930	367931	NE1229	NE1230	prfB		FALSE	0.211	101.000	0.000	NA		NA
367931	367932	NE1230	NE1231			TRUE	0.808	2.000	0.000	NA		NA
367932	367933	NE1231	NE1232			FALSE	0.023	265.000	0.000	NA		NA
367933	367934	NE1232	NE1233			TRUE	0.990	-3.000	0.190	NA		NA
367934	367935	NE1233	NE1234			TRUE	0.979	15.000	0.308	NA		NA
367935	367936	NE1234	NE1235			TRUE	0.510	34.000	0.000	NA		NA
367937	367938	NE1236	NE1237			TRUE	0.988	25.000	0.429	0.044		NA
367939	367940	NE1238	NE1239		ALOX5	TRUE	0.521	56.000	0.000	1.000		NA
367940	367941	NE1239	NE1240	ALOX5	Ptgs1,COX1,Cox-1,Pghs1	TRUE	0.985	36.000	0.500	1.000		NA
367941	367942	NE1240	NE1241	Ptgs1,COX1,Cox-1,Pghs1		FALSE	0.087	171.000	0.000	1.000		NA
367942	367943	NE1241	NE1242			TRUE	0.511	33.000	0.000	NA		NA
367943	367944	NE1242	NE1243			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
367944	367945	NE1243	NE1244			TRUE	0.699	8.000	0.000	NA		NA
367945	367946	NE1244	NE1245			FALSE	0.119	140.000	0.000	NA		NA
367946	367947	NE1245	NE1246			FALSE	0.165	117.000	0.000	NA		NA
367947	367948	NE1246	NE1247			FALSE	0.163	118.000	0.000	NA		NA
2213848	367950	NE1249	NE1250			TRUE	0.808	2.000	0.000	NA		NA
367950	367951	NE1250	NE1251		pilJ	TRUE	0.994	74.000	0.554	0.007	Y	NA
367951	367952	NE1251	NE1252	pilJ		FALSE	0.012	331.000	0.000	NA		NA
367952	367953	NE1252	NE1253			TRUE	0.793	3.000	0.000	NA		NA
367953	367954	NE1253	NE1254			TRUE	0.765	5.000	0.000	NA		NA
367954	367955	NE1254	NE1255			TRUE	0.520	29.000	0.000	NA		NA
367955	367956	NE1255	NE1256			TRUE	0.912	55.000	0.000	0.004	Y	NA
367956	367957	NE1256	NE1257			TRUE	0.969	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
367957	367958	NE1257	NE1258			FALSE	0.005	1180.000	0.000	1.000		NA
367958	367959	NE1258	NE1259			FALSE	0.368	72.000	0.000	NA		NA
367960	367961	NE1260	NE1261			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.089		NA
367961	2213849	NE1261	NE1262			FALSE	0.239	96.000	0.000	NA		NA
2213849	367962	NE1262	NE1263			FALSE	0.030	239.000	0.000	NA		NA
367963	367964	NE1264	NE1265			FALSE	0.007	539.000	0.000	1.000		NA
367964	367965	NE1265	NE1266			TRUE	0.535	53.000	0.000	1.000		NA
367966	367967	NE1268	NE1269			FALSE	0.126	135.000	0.000	NA		NA
367968	367969	NE1270	NE1271			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.088		NA
367969	2213851	NE1271	NE1272			TRUE	0.552	18.000	0.000	NA		NA
367975	367976	NE1278	NE1279	lonA		TRUE	0.885	61.000	0.091	NA		NA
367976	367977	NE1279	NE1280			FALSE	0.088	159.000	0.000	NA		NA
367978	367979	NE1281	NE1282	purA		FALSE	0.389	234.000	0.161	1.000	N	NA
367979	367980	NE1282	NE1283			TRUE	0.861	76.000	0.117	NA		NA
367980	367981	NE1283	NE1284			TRUE	0.886	119.000	0.348	NA		NA
367981	367982	NE1284	NE1285			TRUE	1.000	0.000	0.947	0.012	Y	NA
367982	367983	NE1285	NE1286			TRUE	0.983	6.000	0.184	1.000		NA
367983	367984	NE1286	NE1287		hfq	TRUE	0.930	-10.000	0.058	1.000		NA
367984	367985	NE1287	NE1288	hfq	phoR	FALSE	0.029	335.000	0.000	0.044		NA
367985	367986	NE1288	NE1289	phoR		FALSE	0.305	83.000	0.000	NA		NA
367986	367987	NE1289	NE1290		proB	TRUE	0.608	48.000	0.005	NA		NA
367987	367988	NE1290	NE1291	proB		TRUE	0.985	6.000	0.206	1.000		NA
367988	367989	NE1291	NE1292		rpmA	TRUE	0.862	132.000	0.335	1.000		NA
367989	367990	NE1292	NE1293	rpmA	rplU	TRUE	0.998	13.000	0.667	0.017	Y	NA
367991	367992	NE1294	NE1295		gshB	TRUE	0.985	0.000	0.120	1.000		NA
367993	367994	NE1296	NE1297			FALSE	0.484	54.000	0.000	NA		NA
367994	367995	NE1297	NE1298			TRUE	0.600	14.000	0.000	NA		NA
367995	367996	NE1298	NE1299			FALSE	0.183	141.000	0.000	1.000	N	NA
367996	367997	NE1299	NE1300			FALSE	0.013	329.000	0.000	NA		NA
368001	368002	NE1304	NE1305			TRUE	0.986	13.000	0.385	NA		NA
368002	368003	NE1305	NE1306			FALSE	0.139	128.000	0.000	NA		NA
368003	368004	NE1306	NE1307			TRUE	0.995	-3.000	0.351	NA		NA
368004	368005	NE1307	NE1308			FALSE	0.013	320.000	0.000	NA		NA
368005	368006	NE1308	NE1309			FALSE	0.005	625.000	0.000	NA		NA
368006	368007	NE1309	NE1310		hipA	FALSE	0.007	439.000	0.000	NA		NA
368007	368008	NE1310	NE1311	hipA		TRUE	0.983	-10.000	0.261	NA		NA
368008	368009	NE1311	NE1312		cspD2	FALSE	0.005	680.000	0.000	1.000		NA
368009	5437962	NE1312	RNA_13	cspD2	tRNAPhe1	FALSE	0.006	481.000	0.000	NA		NA
5437962	5437963	RNA_13	RNA_12	tRNAPhe1	tRNAArg3	FALSE	0.440	62.000	0.000	NA		NA
5437963	368010	RNA_12	NE1313	tRNAArg3		FALSE	0.039	213.000	0.000	NA		NA
368010	368011	NE1313	NE1314			TRUE	0.997	25.000	0.682	1.000	Y	NA
368011	368012	NE1314	NE1315		ccp	FALSE	0.219	127.000	0.000	1.000	N	NA
368012	368013	NE1315	NE1316	ccp		FALSE	0.382	104.000	0.005	1.000	N	NA
368014	368015	NE1317	NE1318	proS		TRUE	0.909	-12.000	0.053	NA		NA
368016	368017	NE1319	NE1320		leuA1	FALSE	0.138	174.000	0.003	1.000	N	NA
368017	368018	NE1320	NE1321	leuA1	pssA	FALSE	0.230	239.000	0.073	1.000	N	NA
368018	368019	NE1321	NE1322	pssA	psd	TRUE	0.994	30.000	0.466	1.000	Y	NA
368019	368020	NE1322	NE1323	psd	ilvC	TRUE	0.956	5.000	0.046	1.000	N	NA
368020	368021	NE1323	NE1324	ilvC	ilvH	TRUE	0.942	96.000	0.092	0.002	Y	NA
368021	368022	NE1324	NE1325	ilvH	ilvI	TRUE	0.999	5.000	0.371	0.001	Y	NA
368022	368023	NE1325	NE1326	ilvI	tldD	FALSE	0.014	316.000	0.000	NA		NA
368023	368024	NE1326	NE1327	tldD		TRUE	0.872	107.000	0.259	NA		NA
368024	368025	NE1327	NE1328			TRUE	0.590	228.000	0.358	NA		NA
368026	368027	NE1329	NE1330	glnE	cti	FALSE	0.089	170.000	0.000	1.000		NA
368028	5437964	NE1331	RNA_11	ggt2	tRNAHis1	FALSE	0.029	242.000	0.000	NA		NA
5437964	5437965	RNA_11	RNA_10	tRNAHis1	tRNAArg2	FALSE	0.491	52.000	0.000	NA		NA
5437965	5437966	RNA_10	RNA_9	tRNAArg2	tRNAPro1	TRUE	0.510	45.000	0.000	NA		NA
5437966	368029	RNA_9	NE1332	tRNAPro1	rkpI	FALSE	0.182	110.000	0.000	NA		NA
368029	368030	NE1332	NE1333	rkpI	hetN	TRUE	0.993	-10.000	0.392	0.036		NA
368030	368031	NE1333	NE1334	hetN		TRUE	0.837	-16.000	0.026	NA		NA
368031	368032	NE1334	NE1335		ykvP	TRUE	0.766	-21.000	0.017	NA		NA
368032	368033	NE1335	NE1336	ykvP		FALSE	0.009	386.000	0.000	NA		NA
368033	368034	NE1336	NE1337			TRUE	0.995	-3.000	0.333	1.000		NA
368034	368035	NE1337	NE1338			TRUE	0.512	42.000	0.000	NA		NA
368035	368036	NE1338	NE1339			FALSE	0.005	592.000	0.000	NA		NA
368036	368037	NE1339	NE1340			TRUE	0.528	22.000	0.000	NA		NA
368037	368038	NE1340	NE1341			TRUE	0.508	46.000	0.000	NA		NA
368038	368039	NE1341	NE1342			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368039	368040	NE1342	NE1343		udg	TRUE	0.896	-3.000	0.000	1.000	N	NA
368040	368041	NE1343	NE1344	udg		FALSE	0.005	567.000	0.000	NA		NA
368041	368042	NE1344	NE1345			FALSE	0.011	350.000	0.000	NA		NA
368042	368043	NE1345	NE1346			TRUE	0.993	3.000	0.326	NA		NA
368044	368045	NE1347	NE1348			FALSE	0.367	-159.000	0.000	NA		NA
368046	368047	NE1349	NE1350			TRUE	0.958	8.000	0.093	NA		NA
368051	368052	NE1354	NE1355			FALSE	0.013	620.000	0.000	0.017		NA
368052	368053	NE1355	NE1356			TRUE	0.990	-7.000	0.357	NA		NA
368054	2213852	NE1357	NE1358			FALSE	0.060	184.000	0.000	NA		NA
2213852	2213853	NE1358	NE1359			FALSE	0.363	-163.000	0.000	NA		NA
368055	368056	NE1360	NE1361			TRUE	0.988	0.000	0.161	NA		NA
368057	368058	NE1362	NE1363			FALSE	0.008	404.000	0.000	NA		NA
368058	368059	NE1363	NE1364			TRUE	0.981	14.000	0.317	NA		NA
368059	368060	NE1364	NE1365			FALSE	0.010	382.000	0.000	NA		NA
368060	368061	NE1365	NE1366			FALSE	0.005	540.000	0.000	NA		NA
368061	368062	NE1366	NE1367			FALSE	0.412	-63.000	0.000	NA		NA
2213854	368063	NE1368	NE1369			FALSE	0.069	175.000	0.000	NA		NA
368063	368064	NE1369	NE1370			TRUE	0.901	13.000	0.000	NA	Y	NA
368065	368066	NE1371	NE1372			TRUE	0.995	-16.000	1.000	NA		NA
368067	368068	NE1373	NE1374			TRUE	0.994	-13.000	0.800	NA		NA
368069	368070	NE1375	NE1376			TRUE	0.539	-19.000	0.000	NA		NA
368070	368071	NE1376	NE1377			TRUE	0.714	242.000	0.643	NA		NA
368072	368073	NE1378	NE1379			FALSE	0.211	110.000	0.000	1.000		NA
368073	368074	NE1379	NE1380			TRUE	0.765	5.000	0.000	NA		NA
368074	368075	NE1380	NE1381			TRUE	0.990	-3.000	0.200	NA		NA
368075	368076	NE1381	NE1382		galU1	FALSE	0.005	921.000	0.000	1.000		NA
368076	368077	NE1382	NE1383	galU1	galU1	TRUE	0.760	-28.000	0.000	0.001		NA
368077	368078	NE1383	NE1384	galU1	kpsE	FALSE	0.013	351.000	0.000	1.000		NA
368078	368079	NE1384	NE1385	kpsE	rkpS	TRUE	0.996	-3.000	0.164	1.000	Y	NA
368079	368080	NE1385	NE1386	rkpS	rkpT1	TRUE	0.973	77.000	0.182	0.092	Y	NA
368080	368081	NE1386	NE1387	rkpT1		TRUE	0.966	43.000	0.056	0.078	Y	NA
368081	368082	NE1387	NE1388		rkpG	TRUE	0.899	27.000	0.059	1.000	N	NA
368082	368083	NE1388	NE1389	rkpG	rkpA	TRUE	0.991	-3.000	0.111	0.015	N	NA
2213856	2213857	NE1393	NE1394			TRUE	0.499	49.000	0.000	NA		NA
2213858	2213859	NE1395	NE1396			FALSE	0.415	-48.000	0.000	NA		NA
2213859	368086	NE1396	NE1397			TRUE	0.836	0.000	0.000	NA		NA
368087	368088	NE1398	NE1399			TRUE	0.904	58.000	0.096	1.000		NA
368088	368089	NE1399	NE1400		yeaZ	TRUE	0.989	3.000	0.209	1.000		NA
368089	368090	NE1400	NE1401	yeaZ	ligT	TRUE	0.675	-19.000	0.002	1.000	N	NA
368090	368091	NE1401	NE1402	ligT		TRUE	0.912	6.000	0.011	1.000	N	NA
368091	368092	NE1402	NE1403			FALSE	0.061	196.000	0.000	1.000		NA
368093	368094	NE1404	NE1405			TRUE	0.989	-3.000	0.143	1.000	N	NA
368094	368095	NE1405	NE1406			TRUE	0.988	0.000	0.152	1.000		NA
368095	368096	NE1406	NE1407			TRUE	0.581	86.000	0.017	1.000		NA
368097	368098	NE1408	NE1409			TRUE	0.994	-3.000	0.071	0.077	Y	NA
368098	368099	NE1409	NE1410			TRUE	0.891	143.000	0.500	1.000		NA
368101	368102	NE1412	NE1413		ftsX	TRUE	0.638	37.000	0.000	1.000	N	NA
368102	368103	NE1413	NE1414	ftsX	ftsE	TRUE	0.986	-3.000	0.031	1.000	Y	NA
368103	368104	NE1414	NE1415	ftsE	pilA	TRUE	0.942	29.000	0.117	1.000	N	NA
368105	368106	NE1416	NE1417		dadX	FALSE	0.352	123.000	0.013	1.000		NA
368107	368108	NE1418	NE1419			FALSE	0.300	157.000	0.033	NA		NA
368108	368109	NE1419	NE1420			FALSE	0.325	114.000	0.010	NA		NA
368111	368112	NE1422	NE1423	vacJ	hemL	FALSE	0.357	120.000	0.008	1.000	N	NA
368112	368113	NE1423	NE1424	hemL		TRUE	0.981	37.000	0.173	1.000	Y	NA
368113	368114	NE1424	NE1425		thiD	TRUE	0.939	-16.000	0.000	0.004	Y	NA
368115	368116	NE1426	NE1427		gloA	TRUE	0.952	0.000	0.014	1.000	N	NA
368116	368117	NE1427	NE1428	gloA		FALSE	0.022	267.000	0.000	NA		NA
368118	368119	NE1429	NE1430			TRUE	0.958	33.000	0.184	NA	N	NA
368121	368122	NE1432	NE1433		glyA	TRUE	0.904	28.000	0.069	NA	N	NA
368126	368127	NE1437	NE1438	argG	argF	TRUE	0.967	39.000	0.088	1.000	Y	NA
368127	368128	NE1438	NE1439	argF	argD	TRUE	0.678	165.000	0.074	1.000	Y	NA
368128	368129	NE1439	NE1440	argD		FALSE	0.065	178.000	0.000	NA		NA
368129	368130	NE1440	NE1441			TRUE	0.962	46.000	0.222	NA		NA
368130	368131	NE1441	NE1442			TRUE	0.990	0.000	0.200	NA		NA
368131	368132	NE1442	NE1443		cysM	TRUE	0.928	6.000	0.036	NA		NA
368132	368133	NE1443	NE1444	cysM		FALSE	0.055	229.000	0.000	1.000	N	NA
368133	368134	NE1444	NE1445			FALSE	0.009	533.000	0.000	1.000	N	NA
368134	368135	NE1445	NE1446			TRUE	0.955	6.000	0.011	0.002	N	NA
368135	368136	NE1446	NE1447			TRUE	0.975	-3.000	0.055	1.000	N	NA
368136	368137	NE1447	NE1448			TRUE	0.961	4.000	0.049	1.000	N	NA
368137	368138	NE1448	NE1449		ycf16	TRUE	0.999	-3.000	0.482	1.000	Y	NA
368138	368139	NE1449	NE1450	ycf16		TRUE	0.999	-3.000	0.466	1.000	Y	NA
368139	368140	NE1450	NE1451			TRUE	0.659	22.000	0.006	NA		NA
368140	368141	NE1451	NE1452			TRUE	0.773	25.000	0.017	NA		NA
368141	368142	NE1452	NE1453			FALSE	0.026	291.000	0.000	NA	N	NA
368142	368143	NE1453	NE1454			TRUE	0.993	60.000	0.535	1.000	Y	NA
368147	368148	NE1458	NE1459	xerD		FALSE	0.262	106.000	0.003	1.000		NA
368150	368151	NE1461	NE1462		dut	TRUE	0.797	-6.000	0.004	NA		NA
368151	368152	NE1462	NE1463	dut	dfp	TRUE	0.977	-13.000	0.201	1.000	N	NA
368153	368154	NE1464	NE1465	radC	rpmB	TRUE	0.597	69.000	0.004	1.000	N	NA
368154	368155	NE1465	NE1466	rpmB	rpmG	TRUE	0.994	38.000	0.332	0.017	Y	NA
368156	368157	NE1467	NE1468		polA	FALSE	0.181	144.000	0.002	1.000	N	NA
368158	368159	NE1469	NE1470			TRUE	0.892	60.000	0.095	NA		NA
368159	368160	NE1470	NE1471		thrB	TRUE	0.902	84.000	0.204	NA		NA
368160	368161	NE1471	NE1472	thrB		TRUE	0.798	122.000	0.209	NA		NA
368162	368163	NE1473	NE1474	uvrD	cbbP, prk	TRUE	0.778	61.000	0.007	0.092	N	NA
368163	368164	NE1474	NE1475	cbbP, prk		FALSE	0.417	117.000	0.011	1.000	N	NA
368164	368165	NE1475	NE1476		hemH	TRUE	0.591	100.000	0.029	1.000	N	NA
368165	368166	NE1476	NE1477	hemH	hrcA	TRUE	0.886	25.000	0.048	1.000	N	NA
368167	368168	NE1478	NE1479		recN	TRUE	0.984	6.000	0.170	1.000	N	NA
368169	368170	NE1480	NE1481			TRUE	0.893	-19.000	0.069	NA		NA
368170	368171	NE1481	NE1482		argC	FALSE	0.307	97.000	0.004	NA		NA
368171	368172	NE1482	NE1483	argC	rpsI	FALSE	0.421	142.000	0.032	1.000	N	NA
368172	368173	NE1483	NE1484	rpsI	rplM	TRUE	0.998	12.000	0.601	0.017	Y	NA
368174	368175	NE1485	NE1486	dac		TRUE	0.984	24.000	0.390	1.000	N	NA
368175	368176	NE1486	NE1487			TRUE	0.968	10.000	0.155	NA		NA
368176	368177	NE1487	NE1488		lipB	FALSE	0.357	262.000	0.219	NA		NA
368177	368178	NE1488	NE1489	lipB	lipA	TRUE	0.995	20.000	0.319	0.001	Y	NA
368180	368181	NE1491	NE1492			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
368181	368182	NE1492	NE1493			TRUE	0.997	2.000	0.667	NA		NA
368182	368183	NE1493	NE1494			FALSE	0.007	480.000	0.000	NA		NA
368183	368184	NE1494	NE1495		soj	TRUE	0.994	0.000	0.308	NA		NA
368184	368185	NE1495	NE1496	soj		TRUE	0.974	-3.000	0.066	1.000		NA
5437967	368186	RNA_8	NE1497	tRNAArg1		FALSE	0.015	303.000	0.000	NA		NA
368188	368189	NE1499	NE1500			TRUE	0.962	3.000	0.065	NA		NA
368189	368190	NE1500	NE1501			TRUE	0.502	48.000	0.000	NA		NA
368190	368191	NE1501	NE1502			TRUE	0.770	91.000	0.091	NA		NA
368191	368192	NE1502	NE1503			TRUE	0.899	54.000	0.085	1.000		NA
368193	368194	NE1504	NE1505		priA	FALSE	0.317	86.000	0.002	NA		NA
368195	368196	NE1506	NE1507			TRUE	0.859	58.000	0.062	1.000		NA
368196	368197	NE1507	NE1508			TRUE	0.891	8.000	0.019	1.000		NA
368198	368199	NE1509	NE1510			FALSE	0.199	141.000	0.007	NA		NA
368200	368201	NE1511	NE1512	dsbC		TRUE	0.993	44.000	0.814	1.000	N	NA
368201	368202	NE1512	NE1513			FALSE	0.026	248.000	0.000	NA		NA
368204	368205	NE1515	NE1516			TRUE	0.835	2.000	0.003	NA		NA
368205	368206	NE1516	NE1517			TRUE	0.500	71.000	0.003	NA	N	NA
368208	2213860	NE1519	NE1520			FALSE	0.006	514.000	0.000	NA		NA
368209	368210	NE1521	NE1522			TRUE	0.786	-78.000	0.000	NA	Y	NA
368210	368211	NE1522	NE1523			FALSE	0.018	416.000	0.000	0.085		NA
368211	368212	NE1523	NE1524			FALSE	0.129	145.000	0.000	1.000		NA
368212	368213	NE1524	NE1525			TRUE	0.981	4.000	0.150	NA		NA
368213	368214	NE1525	NE1526			FALSE	0.041	211.000	0.000	NA		NA
368215	368216	NE1527	NE1528			TRUE	0.992	70.000	0.588	1.000	Y	NA
368216	368217	NE1528	NE1529			FALSE	0.033	328.000	0.000	0.022		NA
368217	368218	NE1529	NE1530			TRUE	0.992	-3.000	0.232	NA		NA
368218	368219	NE1530	NE1531			FALSE	0.331	78.000	0.000	NA		NA
368219	368220	NE1531	NE1532			FALSE	0.257	231.000	0.000	0.014	Y	NA
368220	368221	NE1532	NE1533			FALSE	0.026	302.000	0.000	1.000	N	NA
368221	368222	NE1533	NE1534			FALSE	0.057	188.000	0.000	NA		NA
368222	368223	NE1534	NE1535			TRUE	0.767	197.000	0.522	NA		NA
368223	368224	NE1535	NE1536			FALSE	0.208	111.000	0.000	1.000		NA
368224	368225	NE1536	NE1537			TRUE	0.938	109.000	0.548	NA		NA
368226	368227	NE1538	NE1539			FALSE	0.321	80.000	0.000	NA		NA
368227	368228	NE1539	NE1540			FALSE	0.152	133.000	0.000	1.000		NA
368228	368229	NE1540	NE1541			TRUE	0.662	120.000	0.015	NA	Y	NA
368229	368230	NE1541	NE1542			FALSE	0.243	153.000	0.015	NA		NA
368230	368231	NE1542	NE1543		Heph,sla	TRUE	0.828	102.000	0.182	NA		NA
368233	368234	NE1545	NE1546			TRUE	0.696	-21.000	0.008	NA		NA
368236	368237	NE1548	NE1549			TRUE	0.994	-3.000	0.100	1.000	Y	NA
368237	368238	NE1549	NE1550			FALSE	0.157	120.000	0.000	NA		NA
368238	368239	NE1550	NE1551			TRUE	0.765	5.000	0.000	NA		NA
368240	368241	NE1552	NE1553			TRUE	0.786	-78.000	0.000	NA	Y	NA
2213861	368242	NE1554	NE1555			TRUE	0.515	31.000	0.000	NA		NA
368242	368243	NE1555	NE1556			TRUE	0.526	23.000	0.000	NA		NA
368243	368244	NE1556	NE1557			TRUE	0.600	14.000	0.000	NA		NA
368244	368245	NE1557	NE1558			FALSE	0.440	62.000	0.000	NA		NA
368245	368246	NE1558	NE1559			FALSE	0.337	77.000	0.000	NA		NA
368246	368247	NE1559	NE1560			FALSE	0.277	88.000	0.000	NA		NA
368247	368248	NE1560	NE1561			FALSE	0.224	99.000	0.000	NA		NA
368248	368249	NE1561	NE1562			FALSE	0.092	157.000	0.000	NA		NA
368249	368250	NE1562	NE1563			TRUE	0.990	-10.000	0.185	NA	Y	NA
368250	368251	NE1563	NE1564			FALSE	0.469	57.000	0.000	NA		NA
368251	368252	NE1564	NE1565			FALSE	0.017	295.000	0.000	NA		NA
368252	368253	NE1565	NE1566			TRUE	0.961	2.000	0.056	NA		NA
368254	368255	NE1567	NE1568	kduD		TRUE	0.994	-3.000	0.185	0.022		NA
368255	368256	NE1568	NE1569		neuA1	TRUE	0.988	-3.000	0.144	1.000		NA
368257	368258	NE1570	NE1571			TRUE	0.522	174.000	0.143	NA		NA
368259	368260	NE1572	NE1573		apaG	TRUE	0.763	11.000	0.006	NA		NA
368261	368262	NE1574	NE1575			FALSE	0.049	197.000	0.000	NA		NA
368262	368263	NE1575	NE1576			FALSE	0.060	183.000	0.000	NA		NA
368264	368265	NE1577	NE1578			TRUE	0.998	-3.000	0.700	NA		NA
368265	368266	NE1578	NE1579			FALSE	0.010	372.000	0.000	NA		NA
368266	368267	NE1579	NE1580			TRUE	0.991	-15.000	0.429	0.084		NA
368267	368268	NE1580	NE1581			FALSE	0.042	207.000	0.000	NA		NA
368268	368269	NE1581	NE1582			TRUE	0.996	-3.000	0.429	NA		NA
368270	368271	NE1583	NE1584			TRUE	0.917	-10.000	0.000	NA	Y	NA
368272	368273	NE1585	NE1586			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
368273	368274	NE1586	NE1587			FALSE	0.098	175.000	0.000	NA	N	NA
368274	368275	NE1587	NE1588			TRUE	0.947	17.000	0.136	NA		NA
368275	368276	NE1588	NE1589			FALSE	0.004	1381.000	0.000	NA		NA
368276	368277	NE1589	NE1590			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
368277	368278	NE1590	NE1591			FALSE	0.006	525.000	0.000	NA		NA
368278	368279	NE1591	NE1592			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368280	368281	NE1593	NE1594	hag		FALSE	0.309	171.000	0.000	NA	Y	NA
368281	368282	NE1594	NE1595		fliD,flbC,flaV	FALSE	0.337	163.000	0.000	NA	Y	NA
368282	368283	NE1595	NE1596	fliD,flbC,flaV	fliS	TRUE	0.991	47.000	0.216	0.004	Y	NA
368283	368284	NE1596	NE1597	fliS		TRUE	0.995	-3.000	0.338	1.000		NA
368284	368285	NE1597	NE1598			FALSE	0.005	545.000	0.000	NA		NA
368285	368286	NE1598	NE1599			TRUE	0.780	4.000	0.000	NA		NA
368287	368288	NE1600	NE1601			FALSE	0.084	174.000	0.000	1.000		NA
368288	368289	NE1601	NE1602			TRUE	0.995	-6.000	0.231	1.000	Y	NA
368289	368290	NE1602	NE1603			TRUE	0.996	-6.000	0.300	NA	Y	NA
368290	368291	NE1603	NE1604			TRUE	0.987	30.000	0.250	NA	Y	NA
368291	368292	NE1604	NE1605			TRUE	0.913	113.000	0.429	NA		NA
368292	368293	NE1605	NE1606			TRUE	0.973	81.000	0.600	NA		NA
368293	368294	NE1606	NE1607			TRUE	0.983	-18.000	0.400	NA		NA
368294	368295	NE1607	NE1608			TRUE	0.989	-22.000	0.667	NA		NA
368295	368296	NE1608	NE1609			TRUE	0.986	-19.000	0.500	NA		NA
368296	368297	NE1609	NE1610			TRUE	0.998	0.000	0.375	1.000	Y	NA
368297	368298	NE1610	NE1611			TRUE	0.993	19.000	0.250	0.004	Y	NA
368299	368300	NE1612	NE1613	dapF		FALSE	0.232	127.000	0.002	1.000	N	NA
368301	368302	NE1614	NE1615	cca	slt	TRUE	0.924	9.000	0.034	1.000	N	NA
368302	368303	NE1615	NE1616	slt	gdhA	FALSE	0.133	198.000	0.008	1.000	N	NA
368304	2213862	NE1617	NE1618		fecR	TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
2213862	2213863	NE1618	NE1619	fecR		TRUE	0.522	28.000	0.000	NA		NA
2213863	2213864	NE1619	NE1620			FALSE	0.007	473.000	0.000	NA		NA
2213864	2213865	NE1620	NE1621			FALSE	0.064	179.000	0.000	NA		NA
2213865	368305	NE1621	NE1622			FALSE	0.036	221.000	0.000	NA		NA
368306	368307	NE1623	NE1624	metH	gltX	FALSE	0.271	127.000	0.004	1.000	N	NA
368308	368309	NE1625	NE1626			TRUE	0.988	7.000	0.225	1.000	N	NA
368309	368310	NE1626	NE1627		aroE1	TRUE	0.886	34.000	0.054	1.000	N	NA
368310	368311	NE1627	NE1628	aroE1	mtgA	TRUE	0.983	-3.000	0.107	1.000		NA
368311	368312	NE1628	NE1629	mtgA		FALSE	0.119	174.000	0.006	NA		NA
368312	368313	NE1629	NE1630			FALSE	0.059	185.000	0.000	NA		NA
368313	368314	NE1630	NE1631			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
368316	368317	NE1634	NE1635			TRUE	0.956	-7.000	0.086	NA		NA
368317	368318	NE1635	NE1636			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368318	368319	NE1636	NE1637			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368319	368320	NE1637	NE1638		czcA	FALSE	0.011	350.000	0.000	NA		NA
368320	368321	NE1638	NE1639	czcA	czcB	TRUE	0.976	105.000	1.000	1.000	N	NA
368321	368322	NE1639	NE1640	czcB	czcC	TRUE	0.998	-3.000	0.375	1.000	Y	NA
368322	368323	NE1640	NE1641	czcC		TRUE	0.871	106.000	0.250	NA		NA
368323	368324	NE1641	NE1642			FALSE	0.135	156.000	0.004	NA		NA
368325	368326	NE1643	NE1644		rpmF	TRUE	0.988	41.000	0.599	NA		NA
368326	368327	NE1644	NE1645	rpmF	plsX	TRUE	0.983	51.000	0.418	1.000	N	NA
368327	368328	NE1645	NE1646	plsX	fabH	TRUE	0.998	9.000	0.380	0.005	Y	NA
368328	368329	NE1646	NE1647	fabH	fabD	TRUE	0.997	4.000	0.182	0.005	Y	NA
368329	368330	NE1647	NE1648	fabD	fabG1	TRUE	0.995	56.000	0.432	0.005	Y	NA
368330	368331	NE1648	NE1649	fabG1		TRUE	0.930	168.000	0.321	0.005	Y	NA
368331	368332	NE1649	NE1650		fabF1	TRUE	0.991	34.000	0.346	1.000	Y	NA
368332	368333	NE1650	NE1651	fabF1		FALSE	0.343	128.000	0.019	NA		NA
368333	368334	NE1651	NE1652			FALSE	0.261	91.000	0.000	NA		NA
368335	368336	NE1653	NE1654			FALSE	0.112	193.000	0.009	NA		NA
368336	368337	NE1654	NE1655			FALSE	0.445	68.000	0.003	NA		NA
368337	368338	NE1655	NE1656			TRUE	0.984	-3.000	0.091	1.000	N	NA
368338	368339	NE1656	NE1657			TRUE	0.610	121.000	0.064	1.000	N	NA
368339	368340	NE1657	NE1658			TRUE	0.862	79.000	0.096	1.000	N	NA
368342	368343	NE1660	NE1661	greA	carB	TRUE	0.825	135.000	0.241	1.000	N	NA
368343	368344	NE1661	NE1662	carB	carA	TRUE	0.995	25.000	0.345	0.001	Y	NA
368344	368345	NE1662	NE1663	carA	prlC	FALSE	0.091	300.000	0.000	1.000	Y	NA
368345	368346	NE1663	NE1664	prlC	pyrX	FALSE	0.318	120.000	0.005	1.000	N	NA
368346	368347	NE1664	NE1665	pyrX	pyrB	TRUE	0.998	2.000	0.452	1.000	Y	NA
368347	368348	NE1665	NE1666	pyrB	pyrR	TRUE	0.914	136.000	0.247	1.000	Y	NA
368348	368349	NE1666	NE1667	pyrR		TRUE	0.958	-13.000	0.109	1.000	N	NA
368349	368350	NE1667	NE1668			TRUE	0.988	-7.000	0.263	NA	N	NA
368350	368351	NE1668	NE1669			TRUE	0.911	-3.000	0.004	NA	N	NA
368351	368352	NE1669	NE1670			TRUE	0.880	61.000	0.033	0.022	N	NA
368353	368354	NE1671	NE1672	rpsP		TRUE	0.994	29.000	0.342	0.016	Y	NA
368354	368355	NE1672	NE1673		trmB	TRUE	0.998	11.000	0.672	1.000	Y	NA
368355	368356	NE1673	NE1674	trmB	rplS	TRUE	0.999	2.000	0.567	1.000	Y	NA
368356	368357	NE1674	NE1675	rplS		FALSE	0.065	192.000	0.000	1.000		NA
368357	2213867	NE1675	NE1676			FALSE	0.117	141.000	0.000	NA		NA
2213867	2213868	NE1676	NE1677			FALSE	0.402	-70.000	0.000	NA		NA
368358	368359	NE1678	NE1679	yfgD		TRUE	0.660	10.000	0.000	NA		NA
368359	368360	NE1679	NE1680			TRUE	0.766	72.000	0.053	NA		NA
368360	368361	NE1680	NE1681			TRUE	0.638	59.000	0.008	NA		NA
368361	368362	NE1681	NE1682			TRUE	0.688	31.000	0.008	NA		NA
368362	368363	NE1682	NE1683			FALSE	0.104	149.000	0.000	NA		NA
368363	368364	NE1683	NE1684			TRUE	0.745	6.000	0.000	NA		NA
368364	368365	NE1684	NE1685			TRUE	0.522	28.000	0.000	NA		NA
368366	368367	NE1686	NE1687		hpaI2	TRUE	0.904	20.000	0.059	1.000	N	NA
368367	368368	NE1687	NE1688	hpaI2	serA	TRUE	0.995	-3.000	0.273	1.000	N	NA
368368	368369	NE1688	NE1689	serA		TRUE	0.919	-7.000	0.022	1.000	N	NA
368369	368370	NE1689	NE1690			TRUE	0.939	-3.000	0.012	1.000		NA
368370	368371	NE1690	NE1691			TRUE	0.739	-18.000	0.007	1.000		NA
368371	368372	NE1691	NE1692			TRUE	0.683	25.000	0.007	NA		NA
368373	368374	NE1693	NE1694			TRUE	0.713	61.000	0.017	NA		NA
368375	368376	NE1695	NE1696			TRUE	0.792	81.000	0.067	NA	N	NA
368377	368378	NE1697	NE1698	metY		FALSE	0.057	226.000	0.000	1.000	N	NA
368382	368383	NE1702	NE1703			FALSE	0.004	691.000	0.000	NA		NA
368383	368384	NE1703	NE1704			TRUE	0.953	11.000	0.110	NA		NA
368386	368387	NE1706	NE1707	slyD	rnhB	TRUE	0.750	15.000	0.003	1.000	N	NA
368387	368388	NE1707	NE1708	rnhB	fabZ	TRUE	0.703	22.000	0.003	1.000	N	NA
368388	368389	NE1708	NE1709	fabZ		TRUE	0.685	17.000	0.000	1.000	N	NA
368389	368390	NE1709	NE1710			TRUE	0.871	27.000	0.000	1.000	Y	NA
368390	368391	NE1710	NE1711			TRUE	0.996	3.000	0.204	1.000	Y	NA
368391	368392	NE1711	NE1712		dxr	TRUE	0.990	27.000	0.568	1.000	N	NA
368392	368393	NE1712	NE1713	dxr	cdsA	TRUE	0.998	-3.000	0.372	1.000	Y	NA
368393	368394	NE1713	NE1714	cdsA		TRUE	0.993	39.000	0.400	1.000	Y	NA
368394	368395	NE1714	NE1715		rrf	TRUE	0.995	4.000	0.409	1.000	N	NA
368395	368396	NE1715	NE1716	rrf	pyrH	TRUE	0.662	106.000	0.058	1.000	N	NA
368396	368397	NE1716	NE1717	pyrH	tsf	FALSE	0.420	155.000	0.047	1.000	N	NA
368397	368398	NE1717	NE1718	tsf	rpsB	TRUE	0.993	75.000	0.748	1.000	Y	NA
368398	368399	NE1718	NE1719	rpsB		FALSE	0.057	226.000	0.000	1.000	N	NA
368399	368400	NE1719	NE1720			TRUE	0.859	68.000	0.080	1.000		NA
368400	368401	NE1720	NE1721			TRUE	0.561	31.000	0.000	1.000		NA
368401	368402	NE1721	NE1722			FALSE	0.148	245.000	0.000	1.000	Y	NA
368402	368403	NE1722	NE1723			FALSE	0.025	646.000	0.000	NA	Y	NA
368404	368405	NE1724	NE1725			TRUE	0.963	58.000	0.281	NA		NA
368405	368406	NE1725	NE1726			TRUE	0.963	-7.000	0.104	NA		NA
368406	368407	NE1726	NE1727		trpS	TRUE	0.907	73.000	0.158	1.000		NA
368407	368408	NE1727	NE1728	trpS		TRUE	0.877	40.000	0.065	NA		NA
368408	368409	NE1728	NE1729			TRUE	0.534	-34.000	0.004	NA		NA
368409	368410	NE1729	NE1730		icd	TRUE	0.781	13.000	0.005	NA	N	NA
368412	368413	NE1732	NE1733		clpA	TRUE	0.997	2.000	0.596	NA		NA
368413	368414	NE1733	NE1734	clpA	pyrE	TRUE	0.666	19.000	0.000	1.000	N	NA
368414	368415	NE1734	NE1735	pyrE		FALSE	0.024	296.000	0.000	NA	N	NA
368415	368416	NE1735	NE1736			TRUE	0.997	5.000	0.400	NA	Y	NA
368416	368417	NE1736	NE1737		nrtD	TRUE	0.996	-12.000	0.400	1.000	Y	NA
368417	368418	NE1737	NE1738	nrtD		FALSE	0.059	286.000	0.000	0.041	N	NA
368418	2213869	NE1738	NE1739		vsrD	TRUE	0.535	20.000	0.000	NA		NA
368421	368422	NE1743	NE1744	cbbI, ppi, rpiA	phoU	FALSE	0.353	145.000	0.024	NA	N	NA
368422	368423	NE1744	NE1745	phoU	ppx	TRUE	0.949	25.000	0.050	NA	Y	NA
368424	368425	NE1746	NE1747		pilY1	TRUE	0.992	18.000	0.346	NA	Y	NA
368425	368426	NE1747	NE1748	pilY1		TRUE	0.956	14.000	0.038	NA	Y	NA
368426	368427	NE1748	NE1749			TRUE	0.953	25.000	0.057	NA	Y	NA
368427	368428	NE1749	NE1750			TRUE	0.992	15.000	0.667	NA		NA
368428	368429	NE1750	NE1751			TRUE	0.979	-6.000	0.167	NA		NA
368429	368430	NE1751	NE1752			FALSE	0.016	300.000	0.000	NA		NA
368431	368432	NE1753	NE1754	lig		FALSE	0.163	154.000	0.002	1.000	N	NA
368432	368433	NE1754	NE1755			TRUE	0.921	-7.000	0.023	1.000	N	NA
368435	5437968	NE1757	RNA_30		tRNALys1	FALSE	0.469	57.000	0.000	NA		NA
5437968	368436	RNA_30	NE1758	tRNALys1	dedA	FALSE	0.108	146.000	0.000	NA		NA
368439	368440	NE1761	NE1762		hptG	FALSE	0.039	214.000	0.000	NA		NA
368442	368443	NE1764	NE1765	nuoN	nuoM	TRUE	0.992	67.000	0.340	0.002	Y	NA
368443	368444	NE1765	NE1766	nuoM	nuoL	TRUE	0.973	86.000	0.175	0.002	Y	NA
368444	368445	NE1766	NE1767	nuoL	nuoK	TRUE	0.994	65.000	0.451	0.007	Y	NA
368445	368446	NE1767	NE1768	nuoK	nuoJ	TRUE	0.996	56.000	0.484	0.003	Y	NA
368446	368447	NE1768	NE1769	nuoJ	nuoI	TRUE	0.996	18.000	0.442	0.007	Y	NA
368447	368448	NE1769	NE1770	nuoI	nuoH	TRUE	0.997	14.000	0.500	0.007	Y	NA
368448	368449	NE1770	NE1771	nuoH	nuoG	TRUE	0.997	23.000	0.515	0.007	Y	NA
368449	368450	NE1771	NE1772	nuoG	nuoF	TRUE	0.993	63.000	0.395	0.007	Y	NA
368450	368451	NE1772	NE1773	nuoF	nuoE	TRUE	0.999	-3.000	0.343	0.007	Y	NA
368451	368452	NE1773	NE1774	nuoE	nuoD	TRUE	0.999	-3.000	0.355	0.007	Y	NA
368452	368453	NE1774	NE1775	nuoD	nuoC	TRUE	0.995	61.000	0.483	0.007	Y	NA
368453	368454	NE1775	NE1776	nuoC	nuoB	TRUE	0.996	13.000	0.328	0.003	Y	NA
368454	368455	NE1776	NE1777	nuoB	nuoA	TRUE	0.999	4.000	0.507	0.003	Y	NA
368455	5437969	NE1777	RNA_7	nuoA	tRNALeu1	FALSE	0.394	69.000	0.000	NA		NA
5437969	368456	RNA_7	NE1778	tRNALeu1	secG	TRUE	0.510	37.000	0.000	NA		NA
368456	368457	NE1778	NE1779	secG	cbbJ, tpiA, tim	TRUE	0.968	17.000	0.184	1.000	N	NA
368458	368459	NE1780	NE1781			TRUE	0.970	0.000	0.043	1.000	N	NA
368459	368460	NE1781	NE1782			TRUE	0.963	97.000	0.408	0.022	N	NA
368460	368461	NE1782	NE1783		thiF	TRUE	0.920	31.000	0.082	1.000	N	NA
2213871	2213872	NE1786	NE1787			FALSE	0.469	57.000	0.000	NA		NA
368464	368465	NE1788	NE1789			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
368465	368466	NE1789	NE1790			FALSE	0.096	155.000	0.000	NA		NA
368467	368468	NE1791	NE1792			TRUE	0.793	157.000	0.333	NA		NA
368468	368469	NE1792	NE1793			TRUE	0.893	67.000	0.118	NA		NA
368469	368470	NE1793	NE1794			TRUE	0.836	0.000	0.000	NA		NA
368470	368471	NE1794	NE1795			TRUE	0.875	49.000	0.062	1.000		NA
368471	368472	NE1795	NE1796			TRUE	0.991	13.000	0.469	1.000	N	NA
368472	368473	NE1796	NE1797			TRUE	0.977	17.000	0.304	NA		NA
368473	368474	NE1797	NE1798			TRUE	0.956	81.000	0.413	NA		NA
368474	368475	NE1798	NE1799			TRUE	0.994	7.000	0.509	1.000		NA
368475	368476	NE1799	NE1800			TRUE	0.946	108.000	0.557	1.000		NA
368476	368477	NE1800	NE1801			TRUE	0.993	-3.000	0.229	1.000		NA
368477	368478	NE1801	NE1802			TRUE	0.985	15.000	0.400	NA		NA
368478	368479	NE1802	NE1803		yveL	TRUE	0.997	0.000	0.514	NA		NA
368479	368480	NE1803	NE1804	yveL		TRUE	0.987	41.000	0.500	1.000	N	NA
368480	368481	NE1804	NE1805		wza	TRUE	0.997	43.000	0.633	0.073	Y	NA
368482	368483	NE1806	NE1807			FALSE	0.052	262.000	0.000	0.087		NA
5437970	368485	RNA_31	NE1809	tRNASer3		FALSE	0.007	447.000	0.000	NA		NA
368485	368486	NE1809	NE1810			FALSE	0.320	192.000	0.059	1.000	N	NA
368486	368487	NE1810	NE1811			TRUE	0.987	31.000	0.140	0.002	Y	NA
2213873	2213874	NE1812	NE1813			FALSE	0.171	115.000	0.000	NA		NA
2213874	368488	NE1813	NE1814			FALSE	0.018	293.000	0.000	NA		NA
368489	368490	NE1815	NE1816			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.081		NA
368490	368491	NE1816	NE1817			FALSE	0.006	542.000	0.000	1.000		NA
368491	368492	NE1817	NE1818			FALSE	0.430	-40.000	0.000	NA		NA
2213875	2213876	NE1819	NE1820			TRUE	0.522	28.000	0.000	NA		NA
368493	368494	NE1821	NE1822			TRUE	0.960	0.000	0.041	NA		NA
368495	368496	NE1823	NE1824		pth	TRUE	0.966	75.000	0.184	1.000	Y	NA
368496	368497	NE1824	NE1825	pth	rplY	TRUE	0.977	120.000	0.496	0.026	Y	NA
368497	368498	NE1825	NE1826	rplY		TRUE	0.933	57.000	0.122	1.000	N	NA
368498	5437971	NE1826	RNA_6		tRNAGln1	FALSE	0.253	93.000	0.000	NA		NA
5437971	368499	RNA_6	NE1827	tRNAGln1	ipk	TRUE	0.660	10.000	0.000	NA		NA
368499	368500	NE1827	NE1828	ipk		TRUE	0.957	21.000	0.157	1.000	N	NA
368500	368501	NE1828	NE1829		minE	FALSE	0.317	113.000	0.005	NA	N	NA
368501	368502	NE1829	NE1830	minE	minD	TRUE	0.999	0.000	0.618	NA	Y	NA
368502	368503	NE1830	NE1831	minD	minC	TRUE	0.994	26.000	0.466	1.000	Y	NA
368504	368505	NE1832	NE1833			TRUE	0.963	116.000	1.000	NA		NA
368505	368506	NE1833	NE1834		trkA	FALSE	0.021	274.000	0.000	NA		NA
368506	368507	NE1834	NE1835	trkA		TRUE	0.999	10.000	1.000	0.003	Y	NA
368507	368508	NE1835	NE1836		pilG	FALSE	0.244	119.000	0.000	1.000	N	NA
368508	368509	NE1836	NE1837	pilG		FALSE	0.304	97.000	0.000	NA	N	NA
368509	368510	NE1837	NE1838		ubiA	TRUE	0.975	74.000	0.248	NA	Y	NA
368510	368511	NE1838	NE1839	ubiA		TRUE	0.835	71.000	0.007	1.000	Y	NA
368511	368512	NE1839	NE1840			FALSE	0.048	212.000	0.000	1.000		NA
368515	368516	NE1845	NE1846			FALSE	0.006	599.000	0.000	1.000		NA
368516	368517	NE1846	NE1847			TRUE	0.995	-37.000	0.667	1.000	Y	NA
368520	368521	NE1850	NE1851	recG		TRUE	0.910	31.000	0.076	NA	N	NA
368524	368525	NE1854	NE1855	argH		TRUE	0.702	20.000	0.003	1.000	N	NA
368525	368526	NE1855	NE1856			FALSE	0.023	286.000	0.000	1.000		NA
368526	368527	NE1856	NE1857		ygcA	FALSE	0.421	65.000	0.000	NA		NA
368527	368528	NE1857	NE1858	ygcA		FALSE	0.187	129.000	0.000	NA	N	NA
368529	368530	NE1859	NE1860	cheB		TRUE	0.993	11.000	0.256	1.000	Y	NA
368530	368531	NE1860	NE1861		cheR	TRUE	0.987	76.000	0.444	1.000	Y	NA
368531	368532	NE1861	NE1862	cheR		TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368532	368533	NE1862	NE1863			TRUE	0.599	-15.000	0.000	NA		NA
368533	368534	NE1863	NE1864			FALSE	0.286	223.000	0.000	0.006	Y	NA
368534	368535	NE1864	NE1865		cheW	TRUE	0.993	74.000	0.500	0.006	Y	NA
368535	368536	NE1865	NE1866	cheW	cheA	TRUE	0.966	75.000	0.105	0.006	Y	NA
368537	368538	NE1867	NE1868			FALSE	0.476	89.000	0.010	NA		NA
368538	368539	NE1868	NE1869		aarF	TRUE	0.948	90.000	0.432	NA		NA
368539	368540	NE1869	NE1870	aarF	potA	FALSE	0.195	116.000	0.000	1.000		NA
368540	368541	NE1870	NE1871	potA	potB	TRUE	0.998	3.000	0.440	1.000	Y	NA
368541	368542	NE1871	NE1872	potB	potC	TRUE	0.979	10.000	0.040	0.022	Y	NA
368542	368543	NE1872	NE1873	potC	potD	TRUE	0.986	3.000	0.017	0.022	Y	NA
368543	368544	NE1873	NE1874	potD		TRUE	0.940	6.000	0.031	1.000	N	NA
368544	368545	NE1874	NE1875			FALSE	0.201	313.000	0.179	NA		NA
368550	368551	NE1880	NE1881			FALSE	0.027	245.000	0.000	NA		NA
368552	368553	NE1882	NE1883			TRUE	0.978	-3.000	0.083	NA		NA
368553	368554	NE1883	NE1884			TRUE	0.921	-7.000	0.041	NA		NA
368554	368555	NE1884	NE1885			FALSE	0.469	57.000	0.000	NA		NA
368556	368557	NE1886	NE1887	katA		TRUE	0.715	64.000	0.021	NA		NA
368557	368558	NE1887	NE1888			TRUE	0.773	38.000	0.020	NA		NA
368558	368559	NE1888	NE1889			TRUE	0.635	80.000	0.026	NA		NA
368559	368560	NE1889	NE1890			FALSE	0.018	290.000	0.000	NA		NA
368560	368561	NE1890	NE1891			TRUE	0.808	2.000	0.000	NA		NA
368561	368562	NE1891	NE1892		nadB1	FALSE	0.176	113.000	0.000	NA		NA
368563	368564	NE1893	NE1894	ilvE		TRUE	0.964	27.000	0.223	NA		NA
368564	368565	NE1894	NE1895			TRUE	0.631	65.000	0.010	NA		NA
368565	368566	NE1895	NE1896		nadE	TRUE	0.733	49.000	0.007	1.000	N	NA
368566	368567	NE1896	NE1897	nadE		TRUE	0.662	65.000	0.010	1.000		NA
368567	368568	NE1897	NE1898			TRUE	0.706	75.000	0.010	0.072		NA
368568	368569	NE1898	NE1899			TRUE	0.970	0.000	0.042	1.000	N	NA
368569	368570	NE1899	NE1900			TRUE	0.989	-3.000	0.047	1.000	Y	NA
368570	368571	NE1900	NE1901			FALSE	0.015	396.000	0.000	1.000	N	NA
368571	368572	NE1901	NE1902			TRUE	0.996	0.000	0.095	0.007	Y	NA
368572	368573	NE1902	NE1903		phaD	TRUE	1.000	-3.000	0.976	0.007	Y	NA
368573	368574	NE1903	NE1904	phaD		TRUE	0.999	-3.000	0.944	1.000	Y	NA
368574	368575	NE1904	NE1905			TRUE	1.000	-3.000	0.937	0.039	Y	NA
368575	368576	NE1905	NE1906			TRUE	0.999	-3.000	0.937	1.000	Y	NA
368577	368578	NE1907	NE1908			FALSE	0.026	248.000	0.000	NA		NA
368578	368579	NE1908	NE1909			FALSE	0.033	264.000	0.000	NA	N	NA
368581	368582	NE1911	NE1912			TRUE	0.583	164.000	0.124	1.000	N	NA
368582	368583	NE1912	NE1913		prfA	TRUE	0.997	-3.000	0.229	1.000	Y	NA
368583	368584	NE1913	NE1914	prfA	hemA	TRUE	0.994	0.000	0.171	0.035	N	NA
368585	5437973	NE1915	RNA_33	ispB	tRNAPro3	FALSE	0.239	96.000	0.000	NA		NA
5437973	368586	RNA_33	NE1916	tRNAPro3		FALSE	0.005	572.000	0.000	NA		NA
368587	368588	NE1917	NE1918		cbbO	TRUE	0.956	21.000	0.188	NA		NA
368588	368589	NE1918	NE1919	cbbO	cbbQ	TRUE	0.558	42.000	0.000	1.000		NA
368589	368590	NE1919	NE1920	cbbQ	cbbS, rbcS	FALSE	0.184	120.000	0.000	1.000		NA
368590	368591	NE1920	NE1921	cbbS, rbcS	cbbL, rbcL	TRUE	0.992	64.000	0.569	0.001	N	NA
368592	368593	NE1922	NE1923	cbbR, rbcR	cheY	FALSE	0.023	446.000	0.000	0.040	N	NA
368593	368594	NE1923	NE1924	cheY	cheZ1	TRUE	0.946	46.000	0.045	1.000	Y	NA
368595	368596	NE1925	NE1926			FALSE	0.050	207.000	0.000	1.000		NA
368596	368597	NE1926	NE1927			TRUE	0.983	39.000	0.185	1.000	Y	NA
368597	368598	NE1927	NE1928			FALSE	0.015	307.000	0.000	NA		NA
368598	368599	NE1928	NE1929		trxB	TRUE	0.855	33.000	0.053	NA		NA
368599	368600	NE1929	NE1930	trxB	alaS	FALSE	0.321	144.000	0.003	0.035	N	NA
368600	368601	NE1930	NE1931	alaS	recX	TRUE	0.888	60.000	0.085	1.000		NA
368601	368602	NE1931	NE1932	recX	recA	TRUE	0.992	3.000	0.296	1.000		NA
368603	368604	NE1933	NE1934	adk		TRUE	0.809	64.000	0.034	1.000	N	NA
368604	368605	NE1934	NE1935			FALSE	0.453	140.000	0.040	1.000	N	NA
368607	2213879	NE1937	NE1938			FALSE	0.261	91.000	0.000	NA		NA
2213879	2213880	NE1938	NE1939			FALSE	0.493	51.000	0.000	NA		NA
368608	2213881	NE1940	NE1941			FALSE	0.090	158.000	0.000	NA		NA
2213881	2213882	NE1941	NE1942			FALSE	0.021	272.000	0.000	NA		NA
368609	368610	NE1943	NE1944			FALSE	0.011	345.000	0.000	NA		NA
368610	368611	NE1944	NE1945			TRUE	0.941	63.000	0.167	1.000	N	NA
368611	368612	NE1945	NE1946			TRUE	0.652	88.000	0.025	1.000	N	NA
368612	368613	NE1946	NE1947		yjeP	FALSE	0.019	345.000	0.000	1.000	N	NA
368614	368615	NE1948	NE1949	dnaJ	dnaK	TRUE	0.847	204.000	0.236	0.003	Y	NA
368615	368616	NE1949	NE1950	dnaK	grpE	TRUE	0.948	62.000	0.030	0.007	Y	NA
368616	368617	NE1950	NE1951	grpE		FALSE	0.217	136.000	0.003	1.000	N	NA
368620	368621	NE1954	NE1955	suhB		TRUE	0.658	31.000	0.003	NA	N	NA
368621	368622	NE1955	NE1956			TRUE	0.993	0.000	0.239	NA		NA
368622	368623	NE1956	NE1957			FALSE	0.039	213.000	0.000	NA		NA
368623	368624	NE1957	NE1958		fdfT	TRUE	0.784	10.000	0.002	1.000	N	NA
368625	2213883	NE1959	NE1960	pyrF		TRUE	0.600	14.000	0.000	NA		NA
2213883	368626	NE1960	NE1961		ihfB	FALSE	0.104	149.000	0.000	NA		NA
368626	368627	NE1961	NE1962	ihfB	rpsA	TRUE	0.988	9.000	0.292	1.000	N	NA
368627	368628	NE1962	NE1963	rpsA	cmk	TRUE	0.902	106.000	0.281	1.000	N	NA
368628	368629	NE1963	NE1964	cmk	aroA	TRUE	0.644	181.000	0.209	1.000	N	NA
368631	368632	NE1966	NE1967	topB	smg	FALSE	0.448	128.000	0.045	NA		NA
368632	368633	NE1967	NE1968	smg	smf	TRUE	0.853	81.000	0.124	NA		NA
368633	368634	NE1968	NE1969	smf		TRUE	0.589	106.000	0.048	1.000		NA
368635	368636	NE1970	NE1971	def	fmt	TRUE	0.974	62.000	0.105	0.026	Y	NA
368636	368637	NE1971	NE1972	fmt		TRUE	0.998	-3.000	0.305	1.000	Y	NA
368637	368638	NE1972	NE1973			TRUE	0.899	56.000	0.094	NA		NA
368638	368639	NE1973	NE1974			TRUE	0.990	54.000	0.810	NA		NA
368639	368640	NE1974	NE1975			TRUE	0.668	242.000	0.171	0.085	Y	NA
368640	5437974	NE1975	RNA_34		tRNAAla1	FALSE	0.121	137.000	0.000	NA		NA
5437974	5437975	RNA_34	RNA_35	tRNAAla1	tRNAGlu1	TRUE	0.522	28.000	0.000	NA		NA
368644	368645	NE1979	NE1980		aroK	FALSE	0.272	132.000	0.005	1.000	N	NA
368645	368646	NE1980	NE1981	aroK	aroB	TRUE	0.941	103.000	0.208	1.000	Y	NA
368646	368647	NE1981	NE1982	aroB	dgt	TRUE	0.953	-7.000	0.060	1.000	N	NA
368647	368648	NE1982	NE1983	dgt		FALSE	0.281	129.000	0.009	1.000		NA
368649	368650	NE1984	NE1985			TRUE	0.699	8.000	0.000	NA		NA
368650	368651	NE1985	NE1986			TRUE	0.808	2.000	0.000	NA		NA
368651	2213884	NE1986	NE1987			TRUE	0.780	4.000	0.000	NA		NA
2213884	2213885	NE1987	NE1988			FALSE	0.331	-222.000	0.000	NA		NA
2213885	368652	NE1988	NE1989			FALSE	0.139	128.000	0.000	NA		NA
368653	368654	NE1990	NE1991			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
368657	368658	NE1994	NE1995			FALSE	0.097	226.000	0.000	0.079	N	NA
368658	368659	NE1995	NE1996			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.079		NA
368660	368661	NE1997	NE1998		sohA,prlF	FALSE	0.026	249.000	0.000	NA		NA
368661	368662	NE1998	NE1999	sohA,prlF		TRUE	0.993	-3.000	0.250	NA		NA
368663	368664	NE2000	NE2001	gabD		TRUE	0.914	47.000	0.100	NA		NA
368665	368666	NE2002	NE2003			FALSE	0.075	170.000	0.000	NA		NA
368666	368667	NE2003	NE2004		norB	TRUE	0.995	37.000	0.794	0.002		NA
368667	368668	NE2004	NE2005	norB		TRUE	0.992	50.000	0.529	0.002		NA
368668	368669	NE2005	NE2006		norD	TRUE	0.998	6.000	0.590	0.002		NA
368669	368670	NE2006	NE2007	norD		FALSE	0.004	684.000	0.000	NA		NA
2213886	2213887	NE2008	NE2009			FALSE	0.032	231.000	0.000	NA		NA
368671	368672	NE2010	NE2011			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
368672	368673	NE2011	NE2012			TRUE	0.657	61.000	0.000	0.079		NA
368675	368676	NE2014	NE2015			TRUE	0.561	-18.000	0.000	NA		NA
368676	368677	NE2015	NE2016			TRUE	0.968	12.000	0.172	NA		NA
368677	368678	NE2016	NE2017			TRUE	0.984	4.000	0.179	NA		NA
368678	368679	NE2017	NE2018			FALSE	0.074	171.000	0.000	NA		NA
368679	368680	NE2018	NE2019			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368680	368681	NE2019	NE2020		ggaB	TRUE	0.836	0.000	0.000	NA		NA
368682	368683	NE2021	NE2022		exoT	FALSE	0.424	-97.000	0.000	1.000		NA
368684	368685	NE2023	NE2024			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
368685	2213888	NE2024	NE2025			FALSE	0.447	61.000	0.000	NA		NA
2213888	2213889	NE2025	NE2026			FALSE	0.007	444.000	0.000	NA		NA
2213889	2213890	NE2026	NE2027			FALSE	0.277	88.000	0.000	NA		NA
368686	368687	NE2028	NE2029		glgB	FALSE	0.014	343.000	0.000	1.000		NA
368688	368689	NE2030	NE2031			TRUE	0.973	67.000	0.181	1.000	Y	NA
368689	368690	NE2031	NE2032		amyA	TRUE	0.984	71.000	0.220	0.008	Y	NA
368690	368691	NE2032	NE2033	amyA		FALSE	0.394	128.000	0.026	1.000		NA
368691	368692	NE2033	NE2034			FALSE	0.030	238.000	0.000	NA		NA
368692	368693	NE2034	NE2035			TRUE	0.998	-3.000	0.844	NA		NA
368694	368695	NE2036	NE2037	acrD4		TRUE	0.998	-3.000	0.727	NA	N	NA
368695	368696	NE2037	NE2038			FALSE	0.005	835.000	0.000	1.000		NA
368696	368697	NE2038	NE2039			TRUE	0.780	4.000	0.000	NA		NA
368697	368698	NE2039	NE2040		rhlE	FALSE	0.037	217.000	0.000	NA		NA
368698	368699	NE2040	NE2041	rhlE		FALSE	0.300	158.000	0.034	NA		NA
368699	368700	NE2041	NE2042		cycA2	FALSE	0.025	254.000	0.000	NA		NA
368700	368701	NE2042	NE2043	cycA2		TRUE	0.976	56.000	0.400	NA		NA
368701	368702	NE2043	NE2044		hao1	TRUE	0.998	-3.000	0.615	NA		NA
368702	368703	NE2044	NE2045	hao1	rpoC	FALSE	0.046	215.000	0.000	1.000		NA
368703	368704	NE2045	NE2046	rpoC	rpoB	TRUE	0.965	147.000	0.851	0.001		NA
368704	368705	NE2046	NE2047	rpoB	rplL	FALSE	0.237	336.000	0.223	1.000		NA
368705	368706	NE2047	NE2048	rplL	rplJ	TRUE	0.995	71.000	0.884	1.000	Y	NA
368706	368707	NE2048	NE2049	rplJ	rplA	TRUE	0.585	305.000	0.302	1.000	Y	NA
368707	368708	NE2049	NE2050	rplA	rplK	TRUE	0.999	2.000	0.838	0.021	Y	NA
368708	368709	NE2050	NE2051	rplK	nusG	TRUE	0.954	125.000	0.681	1.000	N	NA
368709	5437976	NE2051	RNA_5	nusG	tRNATrp1	FALSE	0.007	465.000	0.000	NA		NA
5437976	368710	RNA_5	NE2052	tRNATrp1	tuf2	TRUE	0.508	46.000	0.000	NA		NA
368710	368711	NE2052	NE2053	tuf2	fusA1	TRUE	0.996	31.000	0.400	0.001	Y	NA
368711	368712	NE2053	NE2054	fusA1	rpsG	TRUE	0.991	73.000	0.579	1.000	Y	NA
368712	368713	NE2054	NE2055	rpsG	rpsL	TRUE	0.995	77.000	0.620	0.004	Y	NA
368713	368714	NE2055	NE2056	rpsL		FALSE	0.009	386.000	0.000	NA		NA
368714	368715	NE2056	NE2057			FALSE	0.008	425.000	0.000	NA		NA
368715	368716	NE2057	NE2058			TRUE	0.902	116.000	0.400	NA		NA
368716	368717	NE2058	NE2059			TRUE	0.993	19.000	0.800	1.000		NA
368717	368718	NE2059	NE2060			TRUE	0.925	94.000	0.333	NA		NA
368718	368719	NE2060	NE2061			TRUE	0.962	85.000	0.500	NA		NA
368719	368720	NE2061	NE2062		amoB2	TRUE	0.642	164.000	0.200	NA		NA
368720	368721	NE2062	NE2063	amoB2	amoA2	TRUE	0.999	2.000	0.700	0.003		NA
368721	368722	NE2063	NE2064	amoA2	amoC2	TRUE	0.857	164.000	0.333	0.003		NA
368722	368723	NE2064	NE2065	amoC2		FALSE	0.004	1333.000	0.000	NA		NA
368723	368724	NE2065	NE2066		mdrB	TRUE	0.933	5.000	0.022	NA	N	NA
368724	368725	NE2066	NE2067	mdrB		TRUE	0.681	111.000	0.073	1.000	N	NA
368725	368726	NE2067	NE2068		mreD	TRUE	0.994	-3.000	0.108	1.000	Y	NA
368726	368727	NE2068	NE2069	mreD	mreC	TRUE	0.995	-43.000	0.550	0.003	Y	NA
368727	368728	NE2069	NE2070	mreC	mreB	TRUE	0.559	363.000	0.689	1.000	N	NA
368729	368730	NE2071	NE2072	gatC	gatA	TRUE	0.997	63.000	0.643	0.001	Y	NA
368730	368731	NE2072	NE2073	gatA	gatB	TRUE	0.996	56.000	0.492	0.001	Y	NA
368732	368733	NE2074	NE2075			FALSE	0.044	234.000	0.000	NA	N	NA
368733	368734	NE2075	NE2076			TRUE	0.859	0.000	0.000	1.000		NA
368735	368736	NE2077	NE2078		ylqH	TRUE	0.981	-13.000	0.279	1.000		NA
368737	368738	NE2079	NE2080		fliE	TRUE	0.972	32.000	0.261	NA	N	NA
368738	368739	NE2080	NE2081	fliE		TRUE	0.573	159.000	0.108	1.000	N	NA
368739	368740	NE2081	NE2082		fleS	TRUE	0.998	14.000	0.679	0.083	Y	NA
368741	368742	NE2083	NE2084	fliF	fliG	TRUE	0.995	-10.000	0.220	0.007	Y	NA
368742	368743	NE2084	NE2085	fliG	fliH	TRUE	0.890	198.000	0.320	0.004	Y	NA
368743	368744	NE2085	NE2086	fliH	fliI	TRUE	0.996	-3.000	0.085	0.004	Y	NA
368744	368745	NE2086	NE2087	fliI	fliJ	TRUE	0.979	18.000	0.073	0.009	Y	NA
368745	368746	NE2087	NE2088	fliJ		TRUE	0.992	59.000	0.317	0.007	Y	NA
368746	368747	NE2088	NE2089			FALSE	0.022	266.000	0.000	NA		NA
368747	368748	NE2089	NE2090			FALSE	0.057	188.000	0.000	NA		NA
368748	368749	NE2090	NE2091			TRUE	0.961	-7.000	0.095	NA		NA
368749	368750	NE2091	NE2092			FALSE	0.067	176.000	0.000	NA		NA
368750	368751	NE2092	NE2093			FALSE	0.476	-25.000	0.000	NA		NA
368751	368752	NE2093	NE2094			FALSE	0.016	301.000	0.000	NA		NA
368752	368753	NE2094	NE2095			TRUE	0.984	10.000	0.293	NA		NA
368753	368754	NE2095	NE2096			FALSE	0.145	126.000	0.000	NA		NA
368754	368755	NE2096	NE2097			TRUE	0.709	290.000	0.667	0.078		NA
368755	368756	NE2097	NE2098			FALSE	0.024	825.000	0.000	1.000	Y	NA
368757	368758	NE2099	NE2100			TRUE	0.858	17.000	0.041	NA		NA
368760	368761	NE2102	NE2103			FALSE	0.024	257.000	0.000	NA		NA
368761	368762	NE2103	NE2104			TRUE	0.921	-10.000	0.056	NA		NA
368762	368763	NE2104	NE2105			FALSE	0.010	367.000	0.000	NA		NA
368764	368765	NE2106	NE2107			TRUE	0.991	0.000	0.212	NA		NA
368766	368767	NE2108	NE2109			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.078		NA
368767	368768	NE2109	NE2110			FALSE	0.007	492.000	0.000	1.000		NA
368769	368770	NE2111	NE2112			TRUE	0.997	6.000	1.000	NA		NA
368770	368771	NE2112	NE2113			FALSE	0.008	423.000	0.000	NA		NA
368772	368773	NE2114	NE2115			TRUE	0.958	-3.000	0.038	NA		NA
2213891	2213892	NE2116	NE2117			FALSE	0.101	151.000	0.000	NA		NA
2213892	2213893	NE2117	NE2118			TRUE	0.516	-21.000	0.000	NA		NA
2213893	368774	NE2118	NE2119			FALSE	0.063	180.000	0.000	NA		NA
368774	2213894	NE2119	NE2120			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
2213894	368775	NE2120	NE2121			FALSE	0.018	293.000	0.000	NA		NA
368777	368778	NE2123	NE2124			FALSE	0.012	442.000	0.000	1.000	N	NA
368778	368779	NE2124	NE2125		fiu	TRUE	0.987	17.000	0.463	1.000		NA
368779	368780	NE2125	NE2126	fiu		TRUE	0.992	0.000	0.214	1.000		NA
368781	2213895	NE2127	NE2128	pgsA		FALSE	0.185	109.000	0.000	NA		NA
2213895	2213896	NE2128	NE2129			FALSE	0.376	-112.000	0.000	NA		NA
2213896	368782	NE2129	NE2130		rnk	FALSE	0.231	97.000	0.000	NA		NA
368782	368783	NE2130	NE2131	rnk	phoB	FALSE	0.164	279.000	0.000	0.039	Y	NA
368783	5437977	NE2131	RNA_4	phoB	tRNASer1	FALSE	0.005	568.000	0.000	NA		NA
5437977	368784	RNA_4	NE2132	tRNASer1	lysC	TRUE	0.505	47.000	0.000	NA		NA
368784	368785	NE2132	NE2133	lysC		FALSE	0.061	196.000	0.000	1.000		NA
368786	368787	NE2134	NE2135	ackA2		TRUE	0.891	45.000	0.057	1.000	N	NA
368789	368790	NE2137	NE2138			FALSE	0.068	209.000	0.000	1.000	N	NA
368790	368791	NE2138	NE2139			TRUE	0.997	7.000	1.000	NA	N	NA
368791	368792	NE2139	NE2140			TRUE	0.991	79.000	0.667	NA	Y	NA
368792	368793	NE2140	NE2141			TRUE	0.577	61.000	0.000	1.000	N	NA
368793	368794	NE2141	NE2142			FALSE	0.092	157.000	0.000	NA		NA
368794	368795	NE2142	NE2143		rps4	TRUE	0.650	14.000	0.003	NA		NA
368796	368797	NE2144	NE2145			FALSE	0.043	205.000	0.000	NA		NA
368797	368798	NE2145	NE2146			TRUE	0.902	31.000	0.083	NA		NA
368798	368799	NE2146	NE2147		pepP	TRUE	0.749	-24.000	0.018	NA		NA
368800	368801	NE2148	NE2149	cbbE, rpe, ppe	cbbZ, pgp	TRUE	0.910	20.000	0.077	1.000		NA
368801	368802	NE2149	NE2150	cbbZ, pgp	trpE	FALSE	0.491	104.000	0.022	1.000		NA
368803	368804	NE2151	NE2152			TRUE	0.985	23.000	0.500	NA		NA
368805	368806	NE2153	NE2154			TRUE	0.650	104.000	0.065	1.000		NA
368807	368808	NE2155	NE2156			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.077		NA
368808	368809	NE2156	NE2157			TRUE	0.548	48.000	0.000	1.000		NA
368809	368810	NE2157	NE2158		proA	TRUE	0.732	-19.000	0.005	1.000	N	NA
368810	368811	NE2158	NE2159	proA		TRUE	0.512	62.000	0.002	1.000		NA
368811	368812	NE2159	NE2160			TRUE	0.896	100.000	0.286	NA		NA
368812	368813	NE2160	NE2161			TRUE	0.983	-6.000	0.200	NA		NA
368813	368814	NE2161	NE2162			TRUE	0.997	-3.000	0.550	NA		NA
368814	368815	NE2162	NE2163			TRUE	0.991	7.000	0.371	NA		NA
368817	368818	NE2165	NE2166			FALSE	0.056	227.000	0.000	1.000	N	NA
368818	368819	NE2166	NE2167			FALSE	0.033	283.000	0.000	1.000	N	NA
368819	368820	NE2167	NE2168			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368820	368821	NE2168	NE2169			TRUE	0.699	8.000	0.000	NA		NA
368821	368822	NE2169	NE2170			TRUE	0.992	-3.000	0.211	1.000		NA
368822	368823	NE2170	NE2171			TRUE	0.859	-3.000	0.000	1.000		NA
368823	368824	NE2171	NE2172			TRUE	0.810	4.000	0.000	1.000		NA
368824	368825	NE2172	NE2173			TRUE	0.539	-19.000	0.000	NA		NA
368825	368826	NE2173	NE2174			FALSE	0.152	123.000	0.000	NA		NA
368826	368827	NE2174	NE2175			TRUE	0.974	-13.000	0.214	NA		NA
368827	368828	NE2175	NE2176			FALSE	0.454	60.000	0.000	NA		NA
368828	368829	NE2176	NE2177			TRUE	0.972	-3.000	0.067	NA		NA
368829	368830	NE2177	NE2178			FALSE	0.110	145.000	0.000	NA		NA
368832	368833	NE2180	NE2181	holB	tmk	TRUE	0.825	126.000	0.211	1.000	N	NA
368834	368835	NE2182	NE2183	ampD		FALSE	0.143	158.000	0.000	1.000	N	NA
368835	368836	NE2183	NE2184		ptsH	TRUE	0.996	-10.000	0.261	0.002	Y	NA
368836	368837	NE2184	NE2185	ptsH	ptsI	TRUE	0.998	-3.000	0.205	0.002	Y	NA
368837	368838	NE2185	NE2186	ptsI	metX	TRUE	0.627	104.000	0.015	0.034	N	NA
368838	368839	NE2186	NE2187	metX	metW	TRUE	0.930	113.000	0.509	NA		NA
368840	368841	NE2188	NE2189		intINeu	FALSE	0.192	117.000	0.000	1.000		NA
368843	368844	NE2190	NE2191		ampG	FALSE	0.004	741.000	0.000	NA		NA
368844	368845	NE2191	NE2192	ampG	xthA2	TRUE	0.933	-3.000	0.013	NA		NA
368845	368846	NE2192	NE2193	xthA2		TRUE	0.698	12.000	0.003	NA		NA
368846	368847	NE2193	NE2194			FALSE	0.120	189.000	0.010	NA		NA
368848	368849	NE2195	NE2196	pmbA		FALSE	0.342	76.000	0.000	NA		NA
368850	368851	NE2197	NE2198	tex		FALSE	0.019	347.000	0.000	1.000	N	NA
368851	368852	NE2198	NE2199			TRUE	0.715	86.000	0.000	1.000	Y	NA
368853	368854	NE2200	NE2201			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
368854	2213897	NE2201	NE2202			FALSE	0.007	456.000	0.000	NA		NA
2213897	2213898	NE2202	NE2203			FALSE	0.357	74.000	0.000	NA		NA
2213898	2213899	NE2203	NE2204			FALSE	0.057	188.000	0.000	NA		NA
2213899	368855	NE2204	NE2205			FALSE	0.022	267.000	0.000	NA		NA
368856	5437978	NE2206	RNA_3	ppiD	tRNAAsp1	FALSE	0.253	93.000	0.000	NA		NA
5437978	5437979	RNA_3	RNA_2	tRNAAsp1	tRNAVal2	FALSE	0.381	70.000	0.000	NA		NA
5437979	368857	RNA_2	NE2207	tRNAVal2	hupB	TRUE	0.515	31.000	0.000	NA		NA
368857	368858	NE2207	NE2208	hupB	gpsA	FALSE	0.065	213.000	0.000	1.000	N	NA
368858	368859	NE2208	NE2209	gpsA		TRUE	0.984	-3.000	0.118	NA		NA
368859	368860	NE2209	NE2210		secB	TRUE	0.947	4.000	0.046	NA		NA
368860	368861	NE2210	NE2211	secB	grxC	TRUE	0.941	75.000	0.221	1.000	N	NA
368861	368862	NE2211	NE2212	grxC		TRUE	0.953	32.000	0.166	NA	N	NA
368863	368864	NE2213	NE2214	argJ		TRUE	0.944	7.000	0.056	1.000		NA
368864	368865	NE2214	NE2215			TRUE	0.958	2.000	0.045	1.000		NA
368869	368870	NE2219	NE2220	aat		TRUE	0.984	-42.000	0.285	1.000	Y	NA
368870	368871	NE2220	NE2221		pyrD	TRUE	0.961	3.000	0.044	1.000	N	NA
368871	368872	NE2221	NE2222	pyrD		TRUE	0.823	-10.000	0.005	1.000	N	NA
368872	368873	NE2222	NE2223		nth	TRUE	0.970	1.000	0.048	1.000	N	NA
368873	368874	NE2223	NE2224	nth		TRUE	0.859	-3.000	0.000	1.000		NA
368874	368875	NE2224	NE2225			TRUE	0.994	-10.000	0.614	NA		NA
368876	368877	NE2226	NE2227			FALSE	0.035	242.000	0.000	1.000		NA
368877	368878	NE2227	NE2228			FALSE	0.013	355.000	0.000	1.000		NA
368879	368880	NE2229	NE2230			FALSE	0.046	201.000	0.000	NA		NA
368880	368881	NE2230	NE2231			TRUE	0.600	14.000	0.000	NA		NA
368884	368885	NE2234	NE2235	hetM		TRUE	0.981	-3.000	0.077	1.000	N	NA
368885	368886	NE2235	NE2236			TRUE	0.953	70.000	0.286	1.000		NA
368886	368887	NE2236	NE2237			TRUE	0.557	33.000	0.000	1.000		NA
368887	368888	NE2237	NE2238			FALSE	0.258	115.000	0.000	1.000	N	NA
368888	368889	NE2238	NE2239			FALSE	0.022	269.000	0.000	NA		NA
368890	368891	NE2240	NE2241			FALSE	0.031	250.000	0.000	1.000		NA
368891	368892	NE2241	NE2242			FALSE	0.439	69.000	0.000	1.000		NA
368893	368894	NE2243	NE2244			TRUE	0.950	81.000	0.353	NA		NA
368895	368896	NE2245	NE2246			TRUE	0.743	149.000	0.231	NA		NA
368896	368897	NE2246	NE2247			FALSE	0.030	236.000	0.000	NA		NA
368899	368900	NE2249	NE2250	wbpI		TRUE	0.981	8.000	0.024	0.004	Y	NA
368900	368901	NE2250	NE2251			FALSE	0.329	106.000	0.007	NA		NA
368901	368902	NE2251	NE2252			TRUE	0.583	84.000	0.020	NA		NA
368902	368903	NE2252	NE2253		ntpA	TRUE	0.921	13.000	0.050	1.000	N	NA
368904	368905	NE2254	NE2255	gmk	rpoZ	TRUE	0.857	46.000	0.035	1.000	N	NA
368906	368907	NE2256	NE2257			TRUE	0.741	23.000	0.000	0.031		NA
368907	368908	NE2257	NE2258			FALSE	0.469	57.000	0.000	NA		NA
368908	368909	NE2258	NE2259			TRUE	0.513	41.000	0.000	NA		NA
368910	368911	NE2260	NE2261	hslV	hslU	TRUE	0.997	34.000	0.752	1.000	Y	NA
368911	368912	NE2261	NE2262	hslU	bktB	TRUE	0.794	11.000	0.003	1.000	N	NA
368912	368913	NE2262	NE2263	bktB	pgi	TRUE	0.951	30.000	0.143	1.000	N	NA
368913	368914	NE2263	NE2264	pgi	glgA1	TRUE	0.981	25.000	0.167	1.000	Y	NA
368914	368915	NE2264	NE2265	glgA1		FALSE	0.040	212.000	0.000	NA		NA
368916	368917	NE2266	NE2267			TRUE	0.995	2.000	0.089	0.013	Y	NA
368917	368918	NE2267	NE2268			TRUE	0.797	-33.000	0.043	NA		NA
368918	368919	NE2268	NE2269			TRUE	0.964	58.000	0.286	NA		NA
368919	368920	NE2269	NE2270			TRUE	0.896	0.000	0.000	1.000	N	NA
368920	368921	NE2270	NE2271		pgsA,ywtB	FALSE	0.454	60.000	0.000	NA		NA
368921	2213900	NE2271	NE2272	pgsA,ywtB		TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368922	368923	NE2273	NE2274			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
2213901	368924	NE2275	NE2276		tviB	FALSE	0.167	116.000	0.000	NA		NA
368924	368925	NE2276	NE2277	tviB		TRUE	0.973	9.000	0.046	1.000	Y	NA
368926	368927	NE2278	NE2279	epsP	yccZ	TRUE	0.915	100.000	0.286	1.000	N	NA
368927	368928	NE2279	NE2280	yccZ	epsB	TRUE	0.957	147.000	0.429	0.068	Y	NA
368928	368929	NE2280	NE2281	epsB	rfe	TRUE	0.995	-3.000	0.125	1.000	Y	NA
368930	368931	NE2282	NE2283			TRUE	0.756	34.000	0.015	NA		NA
368931	368932	NE2283	NE2284			TRUE	0.929	69.000	0.115	0.011		NA
368933	368934	NE2285	NE2286		fumC	TRUE	0.624	46.000	0.003	1.000		NA
2213902	2213903	NE2287	NE2288	yuxH	yuxH	FALSE	0.360	-175.000	0.000	NA		NA
2213903	2213904	NE2288	NE2289	yuxH		TRUE	0.721	7.000	0.000	NA		NA
2213904	368935	NE2289	NE2290			FALSE	0.016	300.000	0.000	NA		NA
368935	368936	NE2290	NE2291			TRUE	0.957	13.000	0.125	1.000		NA
368936	368937	NE2291	NE2292		yxiE,n17E	FALSE	0.322	87.000	0.000	1.000		NA
368937	368938	NE2292	NE2293	yxiE,n17E		TRUE	0.948	97.000	0.429	1.000	N	NA
368938	368939	NE2293	NE2294			TRUE	0.922	6.000	0.026	1.000		NA
368941	368942	NE2296	NE2297	bioD	bioC	TRUE	0.991	0.000	0.018	0.002	Y	NA
368942	368943	NE2297	NE2298	bioC	bioH	TRUE	0.955	-10.000	0.046	0.002		NA
368943	368944	NE2298	NE2299	bioH	bioF	TRUE	0.959	-19.000	0.096	0.002		NA
368944	368945	NE2299	NE2300	bioF	bioB	TRUE	0.990	21.000	0.168	0.002	Y	NA
368946	368947	NE2301	NE2302			TRUE	0.899	13.000	0.045	1.000		NA
368947	368948	NE2302	NE2303			FALSE	0.032	247.000	0.000	1.000		NA
368948	368949	NE2303	NE2304			FALSE	0.363	80.000	0.000	1.000		NA
368949	368950	NE2304	NE2305			TRUE	0.510	36.000	0.000	NA		NA
368951	368952	NE2306	NE2307		rhuM	TRUE	0.971	-3.000	0.065	NA		NA
368952	368953	NE2307	NE2308	rhuM		TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368953	368954	NE2308	NE2309			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
368954	368955	NE2309	NE2310			TRUE	0.835	2.000	0.000	1.000		NA
368955	368956	NE2310	NE2311			TRUE	0.923	0.000	0.000	0.081		NA
368956	368957	NE2311	NE2312		pilQ	FALSE	0.312	101.000	0.000	1.000	N	NA
368957	368958	NE2312	NE2313	pilQ	pilP	TRUE	0.999	-3.000	0.668	NA	Y	NA
368958	368959	NE2313	NE2314	pilP	pilO	TRUE	0.999	-3.000	0.680	NA	Y	NA
368959	368960	NE2314	NE2315	pilO	pilN	TRUE	0.999	-3.000	0.770	NA	Y	NA
368960	368961	NE2315	NE2316	pilN	pilM	TRUE	0.999	-3.000	0.616	NA	Y	NA
368963	368964	NE2318	NE2319		lpdA3	TRUE	0.631	44.000	0.005	NA		NA
368964	368965	NE2319	NE2320	lpdA3		TRUE	0.722	42.000	0.005	1.000	N	NA
368965	368966	NE2320	NE2321		acpS	TRUE	0.976	3.000	0.081	1.000	N	NA
368966	368967	NE2321	NE2322	acpS	pdxJ	TRUE	0.996	-3.000	0.326	1.000	N	NA
368967	368968	NE2322	NE2323	pdxJ	era	TRUE	0.639	55.000	0.006	1.000		NA
368968	368969	NE2323	NE2324	era	rnc	TRUE	0.810	86.000	0.058	0.025		NA
368969	368970	NE2324	NE2325	rnc		TRUE	0.902	-3.000	0.006	NA		NA
368970	368971	NE2325	NE2326		lepB	TRUE	0.795	35.000	0.027	NA		NA
368971	368972	NE2326	NE2327	lepB	lepA	TRUE	0.939	69.000	0.187	1.000	N	NA
368972	368973	NE2327	NE2328	lepA		FALSE	0.045	286.000	0.010	NA		NA
368973	368974	NE2328	NE2329		mucD	TRUE	0.903	18.000	0.072	NA		NA
368974	368975	NE2329	NE2330	mucD		TRUE	0.797	55.000	0.034	NA		NA
368975	368976	NE2330	NE2331		rpoE1	TRUE	0.862	-6.000	0.009	NA		NA
368976	368977	NE2331	NE2332	rpoE1		FALSE	0.047	231.000	0.000	NA	N	NA
368977	368978	NE2332	NE2333			TRUE	0.929	57.000	0.150	NA		NA
368978	368979	NE2333	NE2334			TRUE	0.975	-40.000	0.457	NA		NA
368979	368980	NE2334	NE2335			TRUE	0.960	61.000	0.220	1.000	N	NA
368980	368981	NE2335	NE2336		cycX1	FALSE	0.109	176.000	0.000	1.000	N	NA
368981	368982	NE2336	NE2337	cycX1	cycA1	TRUE	0.996	3.000	0.500	NA		NA
368982	368983	NE2337	NE2338	cycA1		TRUE	0.976	56.000	0.400	NA		NA
368983	368984	NE2338	NE2339		hao3	TRUE	0.998	-3.000	0.615	NA		NA
368984	368985	NE2339	NE2340	hao3	rpsT	TRUE	0.577	31.000	0.002	1.000		NA
368986	368987	NE2341	NE2342			TRUE	0.949	-3.000	0.021	1.000		NA
368988	368989	NE2343	NE2344			TRUE	0.946	31.000	0.154	1.000		NA
368989	368990	NE2344	NE2345			TRUE	0.973	8.000	0.154	NA		NA
368992	368993	NE2347	NE2348		fadE1	TRUE	0.964	45.000	0.200	1.000	N	NA
368993	368994	NE2348	NE2349	fadE1	ydiD,ppsA	TRUE	0.999	0.000	0.833	1.000	Y	NA
368994	368995	NE2349	NE2350	ydiD,ppsA		TRUE	0.989	-3.000	0.085	0.022	N	NA
368995	368996	NE2350	NE2351			TRUE	0.905	38.000	0.068	1.000	N	NA
368996	368997	NE2351	NE2352			FALSE	0.301	207.000	0.093	NA		NA
368997	368998	NE2352	NE2353		moeZ	FALSE	0.475	102.000	0.022	NA		NA
368998	368999	NE2353	NE2354	moeZ		FALSE	0.008	401.000	0.000	NA		NA
368999	369000	NE2354	NE2355		lysS	FALSE	0.216	109.000	0.003	NA		NA
369001	369002	NE2356	NE2357	glnS		FALSE	0.158	161.000	0.004	NA	N	NA
369003	369004	NE2358	NE2359		ppsA	TRUE	0.995	0.000	0.342	NA		NA
369004	369005	NE2359	NE2360	ppsA		FALSE	0.358	100.000	0.007	NA		NA
369005	2213905	NE2360	NE2361			TRUE	0.510	34.000	0.000	NA		NA
2213906	369006	NE2362	NE2363		glnS	FALSE	0.004	727.000	0.000	NA		NA
369006	369007	NE2363	NE2364	glnS		FALSE	0.158	161.000	0.004	NA	N	NA
369008	369009	NE2365	NE2366		ppsA	TRUE	0.995	0.000	0.342	NA		NA
369009	369010	NE2366	NE2367	ppsA		FALSE	0.358	100.000	0.007	NA		NA
369011	369012	NE2368	NE2369			TRUE	0.881	108.000	0.102	1.000	Y	NA
369012	369013	NE2369	NE2370		thrC	TRUE	0.871	122.000	0.125	1.000	Y	NA
369013	369014	NE2370	NE2371	thrC	sdhB	FALSE	0.257	126.000	0.003	1.000	N	NA
369014	369015	NE2371	NE2372	sdhB		TRUE	0.987	-3.000	0.151	NA		NA
369015	369016	NE2372	NE2373		gltA	TRUE	0.922	58.000	0.136	NA		NA
369016	369017	NE2373	NE2374	gltA	odhA	TRUE	0.535	161.000	0.020	1.000	Y	NA
369017	369018	NE2374	NE2375	odhA	sucB	TRUE	0.996	22.000	0.667	1.000	Y	NA
369019	369020	NE2376	NE2377			FALSE	0.006	513.000	0.000	NA		NA
369020	369021	NE2377	NE2378			TRUE	0.879	40.000	0.055	NA	N	NA
369021	369022	NE2378	NE2379			TRUE	0.993	-3.000	0.160	0.080	N	NA
369022	369023	NE2379	NE2380			TRUE	0.927	65.000	0.174	NA		NA
369023	369024	NE2380	NE2381			TRUE	0.848	-22.000	0.052	NA		NA
369024	369025	NE2381	NE2382			TRUE	0.837	16.000	0.028	NA		NA
369025	369026	NE2382	NE2383			TRUE	0.997	0.000	0.562	NA		NA
369026	369027	NE2383	NE2384			TRUE	0.995	20.000	0.530	NA	Y	NA
369029	369030	NE2386	NE2387			FALSE	0.486	93.000	0.014	NA		NA
369031	369032	NE2388	NE2389	cutA	dsbD	TRUE	0.899	13.000	0.031	1.000	N	NA
369032	369033	NE2389	NE2390	dsbD		TRUE	0.885	111.000	0.065	0.006	Y	NA
369034	369035	NE2391	NE2392		nqrF	TRUE	0.781	9.000	0.000	1.000	N	NA
369035	369036	NE2392	NE2393	nqrF	nqrE	TRUE	0.866	163.000	0.140	0.002	Y	NA
369036	369037	NE2393	NE2394	nqrE	nqrD	TRUE	0.998	-3.000	0.240	0.002	Y	NA
369037	369038	NE2394	NE2395	nqrD	nqrC	TRUE	0.991	1.000	0.029	0.002	Y	NA
369038	369039	NE2395	NE2396	nqrC	nqrB	TRUE	0.967	-7.000	0.000	0.002	Y	NA
369039	369040	NE2396	NE2397	nqrB	nqrA	TRUE	0.991	8.000	0.088	0.002	Y	NA
369040	369041	NE2397	NE2398	nqrA		FALSE	0.007	508.000	0.000	1.000		NA
369041	369042	NE2398	NE2399			FALSE	0.056	199.000	0.000	1.000		NA
369042	369043	NE2399	NE2400		PatB	FALSE	0.265	97.000	0.000	1.000		NA
369043	369044	NE2400	NE2401	PatB		TRUE	0.980	-3.000	0.088	1.000		NA
369045	369046	NE2402	NE2403	clpB	dapA	FALSE	0.417	89.000	0.003	1.000	N	NA
369046	369047	NE2403	NE2404	dapA		TRUE	0.952	10.000	0.014	NA	Y	NA
369048	369049	NE2405	NE2406	mviN	flhC	FALSE	0.025	274.000	0.000	1.000		NA
369049	369050	NE2406	NE2407	flhC	flhD	TRUE	0.973	26.000	0.167	0.001		NA
369050	369051	NE2407	NE2408	flhD		FALSE	0.028	261.000	0.000	1.000		NA
369051	369052	NE2408	NE2409			FALSE	0.005	564.000	0.000	NA		NA
369052	369053	NE2409	NE2410		cstA	TRUE	0.574	16.000	0.000	NA		NA
369054	369055	NE2411	NE2412			FALSE	0.037	220.000	0.000	NA		NA
369055	369056	NE2412	NE2413			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
369058	369059	NE2416	NE2417			TRUE	0.991	52.000	0.835	NA		NA
369059	369060	NE2417	NE2418			TRUE	0.998	-3.000	0.931	NA		NA
369060	369061	NE2418	NE2419			TRUE	0.660	78.000	0.029	NA		NA
369063	369064	NE2421	NE2422		nrdB	FALSE	0.299	150.000	0.012	1.000	N	NA
369064	369065	NE2422	NE2423	nrdB	nrdA	TRUE	0.997	41.000	0.564	0.001	Y	NA
2213908	2213909	NE2424	NE2425			FALSE	0.383	-96.000	0.000	NA		NA
369066	369067	NE2426	NE2427			TRUE	0.515	31.000	0.000	NA		NA
369067	369068	NE2427	NE2428			TRUE	0.660	10.000	0.000	NA		NA
369068	369069	NE2428	NE2429			FALSE	0.005	619.000	0.000	NA		NA
369069	369070	NE2429	NE2430			FALSE	0.006	510.000	0.000	NA		NA
369070	369071	NE2430	NE2431			FALSE	0.032	232.000	0.000	NA		NA
369071	369072	NE2431	NE2432			FALSE	0.004	992.000	0.000	NA		NA
369072	369073	NE2432	NE2433			TRUE	0.951	11.000	0.105	NA		NA
369073	369074	NE2433	NE2434			FALSE	0.477	128.000	0.000	NA	Y	NA
369074	369075	NE2434	NE2435		fecI	TRUE	0.988	14.000	0.400	NA	N	NA
369075	369076	NE2435	NE2436	fecI		FALSE	0.006	531.000	0.000	NA		NA
369077	369078	NE2437	NE2438	mdoG	mdoH	TRUE	0.994	-7.000	0.469	NA	N	NA
369078	369079	NE2438	NE2439	mdoH		FALSE	0.004	691.000	0.000	NA		NA
369079	369080	NE2439	NE2440			FALSE	0.007	476.000	0.000	NA		NA
369080	369081	NE2440	NE2441			TRUE	0.510	37.000	0.000	NA		NA
369082	369083	NE2442	NE2443			FALSE	0.045	203.000	0.000	NA		NA
369083	369084	NE2443	NE2444			FALSE	0.309	82.000	0.000	NA		NA
369086	369087	NE2446	NE2447			TRUE	0.934	-195.000	0.091	NA	Y	NA
369087	2213910	NE2447	NE2448			FALSE	0.014	313.000	0.000	NA		NA
2213910	369088	NE2448	NE2449			TRUE	0.619	13.000	0.000	NA		NA
369088	369089	NE2449	NE2450			FALSE	0.447	61.000	0.000	NA		NA
369091	369092	NE2452	NE2453	abcT3	ssb	FALSE	0.096	185.000	0.000	1.000	N	NA
369092	369093	NE2453	NE2454	ssb		TRUE	0.931	1.000	0.007	1.000	N	NA
369094	369095	NE2455	NE2456	uvrA1	ttuD2	TRUE	0.854	6.000	0.003	1.000	N	NA
369096	369097	NE2457	NE2458			FALSE	0.327	145.000	0.024	1.000		NA
369097	369098	NE2458	NE2459		birA	TRUE	0.660	19.000	0.004	1.000		NA
369098	369099	NE2459	NE2460	birA	birA	TRUE	0.971	11.000	0.147	1.000	N	NA
369099	369100	NE2460	NE2461	birA		FALSE	0.128	164.000	0.005	NA		NA
369100	369101	NE2461	NE2462		dapD	FALSE	0.095	180.000	0.005	NA		NA
369101	369102	NE2462	NE2463	dapD	dapC	TRUE	0.979	25.000	0.149	1.000	Y	NA
369103	369104	NE2464	NE2465			FALSE	0.163	128.000	0.000	1.000		NA
369104	369105	NE2465	NE2466			FALSE	0.179	145.000	0.006	NA		NA
369106	369107	NE2467	NE2468			TRUE	0.998	2.000	0.330	NA	Y	NA
369107	369108	NE2468	NE2469			FALSE	0.132	132.000	0.000	NA		NA
369108	369109	NE2469	NE2470			FALSE	0.077	179.000	0.000	1.000		NA
369109	369110	NE2470	NE2471			FALSE	0.110	195.000	0.007	1.000		NA
369112	369113	NE2473	NE2474	spoOJ	parA2	TRUE	0.993	52.000	0.827	1.000	N	NA
369113	369114	NE2474	NE2475	parA2	gidB	TRUE	0.971	66.000	0.339	1.000	N	NA
369114	369115	NE2475	NE2476	gidB	gidA	TRUE	0.984	-25.000	0.466	1.000	N	NA
369115	369116	NE2476	NE2477	gidA		FALSE	0.030	253.000	0.000	1.000		NA
369116	369117	NE2477	NE2478			TRUE	0.990	8.000	0.211	0.003		NA
369118	369119	NE2479	NE2480		dppF	TRUE	0.859	-3.000	0.000	1.000		NA
369119	369120	NE2480	NE2481	dppF	prfC	TRUE	0.884	-3.000	0.003	1.000		NA
2213911	369121	NE2482	NE2483			FALSE	0.459	59.000	0.000	NA		NA
369121	2213912	NE2483	NE2484			FALSE	0.394	-78.000	0.000	NA		NA
2213912	369122	NE2484	NE2485			FALSE	0.150	124.000	0.000	NA		NA
369122	369123	NE2485	NE2486			TRUE	0.998	-3.000	0.556	NA	N	NA
369124	369125	NE2487	NE2488	flhB	flhA	TRUE	0.993	48.000	0.287	0.009	Y	NA
369125	369126	NE2488	NE2489	flhA	flhF	TRUE	0.991	-3.000	0.065	1.000	Y	NA
369126	369127	NE2489	NE2490	flhF		TRUE	0.947	-13.000	0.083	1.000	N	NA
369127	369128	NE2490	NE2491		fliA	TRUE	0.981	9.000	0.193	1.000	N	NA
369129	369130	NE2492	NE2493			TRUE	0.784	30.000	0.017	1.000		NA
369130	369131	NE2493	NE2494			FALSE	0.008	415.000	0.000	NA		NA
369131	369132	NE2494	NE2495			TRUE	0.997	0.000	0.500	NA		NA
369132	369133	NE2495	NE2496			TRUE	0.978	-3.000	0.077	1.000		NA
369133	369134	NE2496	NE2497			TRUE	0.998	-3.000	0.306	0.074	Y	NA
369134	369135	NE2497	NE2498			TRUE	0.793	3.000	0.000	NA		NA
369135	369136	NE2498	NE2499		hsdR	TRUE	0.508	46.000	0.000	NA		NA
369137	369138	NE2500	NE2501			TRUE	0.993	-7.000	0.488	NA		NA
369138	369139	NE2501	NE2502			TRUE	0.700	10.000	0.000	1.000		NA
369139	369140	NE2502	NE2503			TRUE	0.749	37.000	0.000	0.012		NA
369142	369143	NE2505	NE2506			TRUE	0.895	21.000	0.067	1.000		NA
369146	369147	NE2509	NE2510			FALSE	0.434	63.000	0.000	NA		NA
369147	369148	NE2510	NE2511			FALSE	0.176	144.000	0.000	1.000	N	NA
369152	369153	NE2515	NE2516			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.074		NA
369153	369154	NE2516	NE2517			FALSE	0.462	-28.000	0.000	NA		NA
369154	369155	NE2517	NE2518			TRUE	0.978	15.000	0.286	NA		NA
369156	369157	NE2519	NE2520			TRUE	0.808	2.000	0.000	NA		NA
369157	369158	NE2520	NE2521			TRUE	0.993	-3.000	0.233	1.000		NA
369158	369159	NE2521	NE2522			TRUE	0.545	66.000	0.000	1.000	N	NA
369159	369160	NE2522	NE2523			TRUE	0.709	-42.000	0.000	0.003		NA
369160	369161	NE2523	NE2524			FALSE	0.048	305.000	0.000	0.003		NA
369161	369162	NE2524	NE2525			TRUE	0.970	-7.000	0.111	NA	N	NA
369162	369163	NE2525	NE2526			TRUE	0.919	-7.000	0.027	NA	N	NA
369163	369164	NE2526	NE2527			TRUE	0.998	0.000	0.216	0.002	Y	NA
369164	369165	NE2527	NE2528			TRUE	0.793	13.000	0.000	0.079		NA
369165	369166	NE2528	NE2529		mcrC	TRUE	0.997	0.000	0.490	NA		NA
369166	369167	NE2529	NE2530	mcrC		TRUE	0.745	6.000	0.000	NA		NA
369168	369169	NE2531	NE2532			FALSE	0.099	153.000	0.000	NA		NA
369169	369170	NE2532	NE2533			TRUE	0.992	54.000	0.667	0.073		NA
369170	369171	NE2533	NE2534			FALSE	0.004	1896.000	0.000	1.000		NA
369171	369172	NE2534	NE2535			TRUE	0.835	-3.000	0.000	NA		NA
369173	369174	NE2536	NE2537		sinR	FALSE	0.305	90.000	0.000	1.000		NA
369174	369175	NE2537	NE2538	sinR		TRUE	0.997	-3.000	0.520	1.000		NA
369175	369176	NE2538	NE2539			TRUE	0.943	18.000	0.133	NA		NA
369176	369177	NE2539	NE2540			FALSE	0.008	410.000	0.000	NA		NA
369177	369178	NE2540	NE2541			TRUE	0.997	-3.000	0.571	NA		NA
369178	369179	NE2541	NE2542			TRUE	0.994	-3.000	0.286	NA		NA
369180	369181	NE2543	NE2544			TRUE	0.634	12.000	0.000	NA		NA
369181	369182	NE2544	NE2545			TRUE	0.535	20.000	0.000	NA		NA
369182	5437981	NE2545	RNA_43		tmRNA	FALSE	0.008	409.000	0.000	NA		NA
5437981	369183	RNA_43	NE2546	tmRNA		FALSE	0.357	74.000	0.000	NA		NA
369183	369184	NE2546	NE2547		ubiG	TRUE	0.971	27.000	0.259	1.000		NA
369184	369185	NE2547	NE2548	ubiG		FALSE	0.401	177.000	0.071	1.000	N	NA
369186	369187	NE2549	NE2550			TRUE	0.990	-3.000	0.188	NA		NA
369187	369188	NE2550	NE2551			TRUE	0.921	24.000	0.103	NA		NA
369188	369189	NE2551	NE2552		mutM,fpg	TRUE	0.703	46.000	0.006	NA	N	NA
369190	369191	NE2553	NE2554		typA	TRUE	0.776	13.000	0.003	1.000	N	NA
369192	369193	NE2555	NE2556		ribAB	TRUE	0.985	-3.000	0.021	1.000	Y	NA
369193	369194	NE2556	NE2557	ribAB	ribH	TRUE	0.968	56.000	0.051	0.001	Y	NA
369194	369195	NE2557	NE2558	ribH	nusB	TRUE	0.996	-3.000	0.347	1.000	N	NA
369195	369196	NE2558	NE2559	nusB	thiL	TRUE	0.653	68.000	0.007	1.000	N	NA
369196	369197	NE2559	NE2560	thiL	pgpA	TRUE	0.846	-22.000	0.031	1.000	N	NA
369197	369198	NE2560	NE2561	pgpA	ygaD	TRUE	0.986	-3.000	0.141	NA		NA
369200	369201	NE2563	NE2564		recQ	FALSE	0.040	314.000	0.000	0.078	N	NA
369201	369202	NE2564	NE2565	recQ		TRUE	0.914	-3.000	0.003	1.000	N	NA
369202	369203	NE2565	NE2566			FALSE	0.361	90.000	0.003	1.000		NA
369203	369204	NE2566	NE2567			TRUE	0.972	7.000	0.122	1.000		NA
369204	369205	NE2567	NE2568			TRUE	0.652	115.000	0.081	1.000		NA
369205	369206	NE2568	NE2569			TRUE	0.964	-3.000	0.048	NA		NA
369206	369207	NE2569	NE2570			TRUE	0.876	28.000	0.062	NA		NA
369209	369210	NE2572	NE2573		ycbB	TRUE	0.810	27.000	0.029	NA		NA