MicrobesOnline Operon Predictions for Shewanella piezotolerans WP3

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5432681 5432682 swp_0007 swp_tRNA1     FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   NA
 5432682 5432683 swp_tRNA1 swp_tRNA2     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5432684 5432685 swp_0008 swp_0009     TRUE 0.737 172.000 0.481 NA   NA
 5432687 5432688 swp_0011 swp_0012     TRUE 0.779 118.000 0.221 1.000   NA
 5432688 5432689 swp_0012 swp_0013     FALSE 0.223 225.000 0.105 1.000 N NA
 5432689 5432690 swp_0013 swp_0014     TRUE 0.989 9.000 0.787 1.000   NA
 5432691 5432692 swp_0015 swp_0016     TRUE 0.969 20.000 0.328 1.000 Y NA
 5432692 5432693 swp_0016 swp_0017     TRUE 0.929 116.000 0.318 1.000 Y NA
 5432693 5432694 swp_0017 swp_0018     TRUE 0.978 17.000 0.249 0.005 Y NA
 5432694 5432695 swp_0018 swp_0019     FALSE 0.329 132.000 0.003 1.000 N NA
 5432696 5432697 swp_0020 swp_0021     TRUE 0.995 12.000 0.651 0.001 Y NA
 5432699 5432700 swp_0023 swp_0024     FALSE 0.008 266.000 0.000 1.000   NA
 5432700 5432701 swp_0024 swp_0025     FALSE 0.574 32.000 0.043 1.000   NA
 5432701 5432702 swp_0025 swp_0026     FALSE 0.078 148.000 0.012 NA   NA
 5432702 5432703 swp_0026 swp_0027     FALSE 0.171 33.000 0.012 NA   NA
 5432706 5432707 swp_0030 swp_0031     TRUE 0.924 21.000 0.400 NA   NA
 5432707 5432708 swp_0031 swp_0032     TRUE 0.896 10.000 0.105 NA   NA
 5432708 5432709 swp_0032 swp_0033     FALSE 0.141 250.000 0.158 NA   NA
 5432710 5432711 swp_0034 swp_0035     TRUE 0.983 19.000 0.607 1.000 Y NA
 5432712 5432713 swp_0036 swp_0037     FALSE 0.008 368.000 0.000 1.000 N NA
 5432713 5432714 swp_0037 swp_0038     TRUE 0.879 31.000 0.211 1.000 N NA
 5432714 5432715 swp_0038 swp_0039     TRUE 0.912 79.000 0.400 1.000 N NA
 5432715 5432716 swp_0039 swp_0040     TRUE 0.956 -3.000 0.118 0.074 N NA
 5432716 5432717 swp_0040 swp_0041     FALSE 0.554 28.000 0.000 0.030   NA
 5432717 5432718 swp_0041 swp_0042     FALSE 0.588 2.000 0.000 1.000   NA
 5432718 5432719 swp_0042 swp_0043     FALSE 0.434 -3.000 0.000 1.000   NA
 5432719 5432720 swp_0043 swp_0044     TRUE 0.980 8.000 0.483 NA   NA
 5432720 5432721 swp_0044 swp_0045     TRUE 0.990 4.000 0.724 NA   NA
 5432721 5432722 swp_0045 swp_0046     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 5432722 5432723 swp_0046 swp_0047     TRUE 0.730 58.000 0.127 1.000   NA
 5432723 5432724 swp_0047 swp_0048     FALSE 0.548 180.000 0.202 1.000   NA
 5432724 5432725 swp_0048 swp_0049     TRUE 0.735 109.000 0.118 1.000 N NA
 5432728 5432729 swp_0052 swp_0053     TRUE 0.946 28.000 0.126 0.005 Y NA
 5432729 5432730 swp_0053 swp_0054     TRUE 0.953 8.000 0.122 1.000 N NA
 5432730 5432731 swp_0054 swp_0056     TRUE 0.991 0.000 0.305 1.000 Y NA
 5432731 5432732 swp_0056 swp_0057     TRUE 0.987 5.000 0.105 0.023 Y NA
 5432733 5432734 swp_0058 swp_0059     FALSE 0.523 60.000 0.043 1.000   NA
 5432734 5432735 swp_0059 swp_0060     TRUE 0.941 3.000 0.124 NA   NA
 5432737 5432738 swp_0062 swp_0063     TRUE 0.735 99.000 0.151 NA N NA
 5432738 5432739 swp_0063 swp_0064     TRUE 0.705 26.000 0.066 NA N NA
 5432741 5432742 swp_0066 swp_0067     FALSE 0.670 24.000 0.078 NA   NA
 5432744 5432745 swp_rRNA11 swp_0069     FALSE 0.010 -597.000 0.000 NA   NA
 5432745 5432746 swp_0069 swp_rRNA12     FALSE 8.13603512686146e-05 1309.000 0.000 NA   NA
 5432746 5432747 swp_rRNA12 swp_rRNA13     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 5432748 5432749 swp_0070 swp_0071     FALSE 0.001 266.000 0.000 NA   NA
 5432751 5432752 swp_0073 swp_0075     TRUE 0.891 9.000 0.060 1.000   NA
 5432752 5432753 swp_0075 swp_0076     TRUE 0.750 34.000 0.036 0.051 N NA
 5432753 5432754 swp_0076 swp_0077     TRUE 0.973 2.000 0.170 1.000 N NA
 5432755 5432756 swp_0078 swp_0080     FALSE 0.239 225.000 0.158 NA N NA
 5432756 5432757 swp_0080 swp_0081     TRUE 0.975 5.000 0.206 1.000 N NA
 5432757 5432758 swp_0081 swp_0082     FALSE 0.136 133.000 0.017 NA   NA
 5432759 5432760 swp_0083 swp_0084     TRUE 0.920 16.000 0.194 1.000 N NA
 5432761 5432762 swp_0085 swp_0086     TRUE 0.990 0.000 0.561 1.000 N NA
 5432762 5432763 swp_0086 swp_0087     TRUE 0.972 -3.000 0.463 NA   NA
 5432763 5432764 swp_0087 swp_0088     TRUE 0.870 -22.000 0.433 NA   NA
 5432764 5432765 swp_0088 swp_0089     TRUE 0.976 0.000 0.222 1.000 N NA
 5432766 5432767 swp_0090 swp_0091     FALSE 0.024 102.000 0.000 NA   NA
 5432768 5432769 swp_0092 swp_0093     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5432770 5432771 swp_0094 swp_0095     TRUE 0.805 1.000 0.000 1.000 N NA
 5432772 5432773 swp_0096 swp_0097     TRUE 0.938 15.000 0.220 1.000 N NA
 5432774 5432775 swp_0098 swp_0099     FALSE 0.000 867.000 0.000 NA   NA
 5432776 5432777 swp_0100 swp_0101     FALSE 0.025 266.000 0.014 NA N NA
 5432780 5432781 swp_0104 swp_0105     FALSE 0.000 367.000 0.000 NA   NA
 5432781 5432782 swp_0105 swp_0106     TRUE 0.926 62.000 0.271 NA Y NA
 5432782 5432783 swp_0106 swp_0108     TRUE 0.966 11.000 0.292 1.000   NA
 5432784 5432785 swp_0109 swp_0110     TRUE 0.766 21.000 0.053 1.000 N NA
 5432785 5432786 swp_0110 swp_0111     TRUE 0.947 -3.000 0.238 NA   NA
 5432786 5432787 swp_0111 swp_0112     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5432789 5432790 swp_0114 swp_0115     FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   NA
 5432790 5432791 swp_0115 swp_0116     FALSE 0.024 103.000 0.000 NA   NA
 5432792 5432793 swp_0117 swp_0118     FALSE 0.591 -28.000 0.125 NA   NA
 5432793 5432794 swp_0118 swp_0119     TRUE 0.688 69.000 0.132 NA   NA
 5432795 5432796 swp_0120 swp_0121     FALSE 0.002 243.000 0.000 NA   NA
 5432796 5432797 swp_0121 swp_0122     FALSE 0.051 19.000 0.000 NA   NA
 5432798 5432799 swp_0123 swp_0124     FALSE 0.001 317.000 0.000 NA   NA
 5432802 5432803 swp_0127 swp_0128     TRUE 0.967 -7.000 0.500 1.000 N NA
 5432803 5432804 swp_0128 swp_0129     TRUE 0.949 -10.000 0.667 NA   NA
 5432804 5432805 swp_0129 swp_0130     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5432807 5432808 swp_0132 swp_0133     FALSE 0.633 124.000 0.077 1.000 N NA
 5432808 5432809 swp_0133 swp_0134     TRUE 0.995 4.000 0.315 0.001 Y NA
 5432811 5432812 swp_0136 swp_0137     FALSE 0.000 391.000 0.000 NA   NA
 5432815 5432816 swp_0140 swp_0141     FALSE 0.004 211.000 0.000 NA   NA
 5432816 5432817 swp_0141 swp_0142     FALSE 0.625 94.000 0.115 NA   NA
 5432819 5432820 swp_0144 swp_0145     TRUE 0.820 20.000 0.080 1.000 N NA
 5432820 5432821 swp_0145 swp_0146     TRUE 0.789 42.000 0.024 1.000 Y NA
 5432822 5432823 swp_0148 swp_0149     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5432823 5432824 swp_0149 swp_0150     FALSE 0.049 -9.000 0.000 NA   NA
 5432824 5432825 swp_0150 swp_0151     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5432825 5432826 swp_0151 swp_0152     TRUE 0.976 8.000 0.385 NA   NA
 5432827 5432828 swp_0153 swp_0154     FALSE 0.009 265.000 0.000 1.000   NA
 5432828 5432829 swp_0154 swp_0155     TRUE 0.905 162.000 0.333 0.061 Y NA
 5432829 5432830 swp_0155 swp_0156     FALSE 0.000 388.000 0.000 NA   NA
 5432830 5432831 swp_0156 swp_0157     FALSE 0.005 200.000 0.000 NA   NA
 5432833 5432834 swp_0159 swp_0160     TRUE 0.982 -3.000 0.706 NA   NA
 5432836 5432837 swp_0162 swp_0163     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5432837 5432838 swp_0163 swp_0164     FALSE 0.028 63.000 0.000 NA   NA
 5432838 5432839 swp_0164 swp_0165     FALSE 0.010 257.000 0.000 1.000   NA
 5432839 5432840 swp_0165 swp_0166     TRUE 0.986 15.000 0.323 0.004 Y NA
 5432842 5432843 swp_0168 swp_0169     FALSE 0.002 707.000 0.000 1.000 N NA
 5432844 5432845 swp_0170 swp_0171     TRUE 0.928 0.000 0.052 1.000 N NA
 5432847 5432848 swp_0173 swp_0174     TRUE 0.945 32.000 0.775 NA   NA
 5432850 5432851 swp_0176 swp_0177     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5432852 5432853 swp_0178 swp_0179     FALSE 0.077 204.000 0.000 1.000 N NA
 5432853 5432854 swp_0179 swp_0180     FALSE 0.096 317.000 0.000 0.018 Y NA
 5432854 5432855 swp_0180 swp_0181     TRUE 0.981 -3.000 0.684 NA   NA
 5432855 5432856 swp_0181 swp_0182     FALSE 0.003 228.000 0.000 NA   NA
 5432856 5432857 swp_0182 swp_0183     FALSE 0.107 245.000 0.048 1.000 N NA
 5432857 5432858 swp_0183 swp_0184     TRUE 0.895 16.000 0.140 1.000 N NA
 5432859 5432860 swp_0185 swp_0186     TRUE 0.977 85.000 0.575 0.006 Y NA
 5432860 5432861 swp_0186 swp_0187     TRUE 0.962 -85.000 0.776 0.006 Y NA
 5432861 5432862 swp_0187 swp_0188     TRUE 0.997 4.000 0.653 0.006 Y NA
 5432862 5432863 swp_0188 swp_0189     TRUE 0.979 65.000 0.599 0.006 Y NA
 5432863 5432864 swp_0189 swp_0190     TRUE 0.894 -37.000 0.425 0.006   NA
 5432864 5432865 swp_0190 swp_0191     TRUE 0.993 0.000 0.605 0.006   NA
 5432865 5432866 swp_0191 swp_0192     TRUE 0.977 -19.000 0.569 0.006 Y NA
 5432866 5432867 swp_0192 swp_0193     TRUE 0.984 15.000 0.461 1.000 Y NA
 5432867 5432868 swp_0193 swp_0194     TRUE 0.975 46.000 0.537 0.072 Y NA
 5432868 5432869 swp_0194 swp_0195     TRUE 0.997 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5432869 5432870 swp_0195 swp_0196     TRUE 0.985 10.000 0.649 1.000   NA
 5432870 5432871 swp_0196 swp_0197     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5432873 5432874 swp_0199 swp_0200     TRUE 0.925 32.000 0.373 1.000 N NA
 5432874 5432875 swp_0200 swp_0201     FALSE 0.170 101.000 0.017 NA   NA
 5432876 5432877 swp_0202 swp_0203     TRUE 0.962 0.000 0.214 NA   NA
 5432877 5432878 swp_0203 swp_0204     FALSE 0.145 206.000 0.025 1.000 N NA
 5432882 5432883 swp_0208 swp_0209     FALSE 0.000 623.000 0.000 NA   NA
 5432884 5432885 swp_rRNA14 swp_0210     FALSE 0.010 -597.000 0.000 NA   NA
 5432885 5432886 swp_0210 swp_rRNA15     FALSE 8.2577076166971e-05 1307.000 0.000 NA   NA
 5432886 5432887 swp_rRNA15 swp_0211     FALSE 0.009 -783.000 0.000 NA   NA
 5432887 5432888 swp_0211 swp_rRNA16     FALSE 0.000 790.000 0.000 NA   NA
 5432891 5432892 swp_0214 swp_0215     TRUE 0.991 4.000 0.810 NA   NA
 5432892 5432893 swp_0215 swp_0216     FALSE 0.003 217.000 0.000 NA   NA
 5432895 5432896 swp_0218 swp_0219     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5432897 5432898 swp_0220 swp_0221     TRUE 0.929 29.000 0.556 NA   NA
 5432898 5432899 swp_0221 swp_0222     FALSE 0.001 326.000 0.000 NA   NA
 5432899 5432900 swp_0222 swp_0223     FALSE 0.010 165.000 0.000 NA   NA
 5432901 5432902 swp_0224 swp_0225     FALSE 0.049 20.000 0.000 NA   NA
 5432903 5432904 swp_0226 swp_0227     FALSE 0.113 11.000 0.000 NA   NA
 5432905 5432906 swp_0230 swp_0231     FALSE 0.461 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5432908 5432909 swp_0233 swp_0234     FALSE 0.387 104.000 0.045 NA   NA
 5432909 5432910 swp_0234 swp_0235     TRUE 0.975 14.000 0.750 NA   NA
 5432910 5432911 swp_0235 swp_0237     FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 5432913 5432914 swp_0238 swp_0239     FALSE 0.452 17.000 0.026 NA   NA
 5432915 5432916 swp_0240 swp_0241     FALSE 0.158 45.000 0.000 1.000   NA
 5432917 5432918 swp_0242 swp_0243     TRUE 0.997 1.000 0.791 1.000 Y NA
 5432919 5432920 swp_0244 swp_0246     FALSE 0.565 144.000 0.017 NA Y NA
 5432920 5432921 swp_0246 swp_0247     FALSE 0.200 174.000 0.006 1.000 N NA
 5432921 5432922 swp_0247 swp_0248     FALSE 0.123 294.000 0.000 0.011 Y NA
 5432923 5432924 swp_0249 swp_0250     TRUE 0.983 18.000 0.587 1.000 Y NA
 5432924 5432925 swp_0250 swp_0251     FALSE 0.470 180.000 0.188 NA   NA
 5432926 5432927 swp_0252 swp_0253     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5432928 5432929 swp_0254 swp_0255     FALSE 0.584 69.000 0.081 NA   NA
 5432929 5432930 swp_0255 swp_0256     FALSE 0.552 92.000 0.081 NA   NA
 5432930 5432931 swp_0256 swp_0257     TRUE 0.759 118.000 0.157 1.000 N NA
 5432931 5432932 swp_0257 swp_0258     TRUE 0.699 134.000 0.000 0.065 Y NA
 5432938 5432939 swp_0264 swp_0265     TRUE 0.899 50.000 0.500 NA   NA
 5432939 5432940 swp_0265 swp_0266     FALSE 0.008 182.000 0.000 NA   NA
 5432940 5432941 swp_0266 swp_0267     FALSE 0.010 167.000 0.000 NA   NA
 5432941 5432942 swp_0267 swp_0268     FALSE 0.016 191.000 0.003 NA   NA
 5432943 5432944 swp_0269 swp_0270     FALSE 0.022 112.000 0.000 NA   NA
 5432945 5432946 swp_0271 swp_0272     FALSE 0.028 61.000 0.000 NA   NA
 5432946 5432947 swp_0272 swp_0273     TRUE 0.955 2.000 0.167 NA   NA
 5432947 5432948 swp_0273 swp_0274     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5432948 5432949 swp_0274 swp_0275     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 5432949 5432950 swp_0275 swp_0276     FALSE 0.001 340.000 0.000 NA   NA
 5432950 5432951 swp_0276 swp_0277     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 5432951 5432952 swp_0277 swp_0278     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   NA
 5432952 5432953 swp_0278 swp_0279     TRUE 0.826 53.000 0.281 NA   NA
 5432954 5432955 swp_0280 swp_0281     TRUE 0.848 5.000 0.029 1.000   NA
 5432955 5432956 swp_0281 swp_0282     TRUE 0.988 0.000 0.692 NA   NA
 5432956 5432957 swp_0282 swp_0283     FALSE 0.004 303.000 0.009 NA   NA
 5432957 5432958 swp_0283 swp_0284     FALSE 0.405 -34.000 0.065 NA   NA
 5432959 5432960 swp_0286 swp_0288     FALSE 0.099 146.000 0.000 NA N NA
 5432960 5432961 swp_0288 swp_0289     TRUE 0.991 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 5432961 5432962 swp_0289 swp_0291     TRUE 0.946 73.000 0.397 NA Y NA
 5432962 5432963 swp_0291 swp_0292     TRUE 0.981 -7.000 0.514 NA Y NA
 5432963 5432964 swp_0292 swp_0293     TRUE 0.927 21.000 0.422 NA   NA
 5432964 5432965 swp_0293 swp_0294     TRUE 0.879 -12.000 0.297 NA   NA
 5432965 5432966 swp_0294 swp_0295     TRUE 0.940 -6.000 0.329 NA   NA
 5432966 5432967 swp_0295 swp_0296     TRUE 0.982 -3.000 0.732 NA   NA
 5432967 5432968 swp_0296 swp_0297     TRUE 0.976 -3.000 0.532 NA   NA
 5432968 5432969 swp_0297 swp_0298     TRUE 0.895 35.000 0.413 NA   NA
 5432969 5432970 swp_0298 swp_0299     TRUE 0.968 -3.000 0.333 1.000   NA
 5432970 5432971 swp_0299 swp_0300     TRUE 0.973 0.000 0.297 NA   NA
 5432971 5432972 swp_0300 swp_0302     TRUE 0.986 -3.000 0.368 NA Y NA
 5432974 5432975 swp_0303 swp_0304     TRUE 0.981 0.000 0.422 NA   NA
 5432975 5432976 swp_0304 swp_0305     TRUE 0.973 9.000 0.169 0.002   NA
 5432976 5432977 swp_0305 swp_0306     TRUE 0.958 -3.000 0.245 1.000   NA
 5432977 5432978 swp_0306 swp_0307     TRUE 0.962 -7.000 0.636 NA   NA
 5432978 5432979 swp_0307 swp_0308     FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   NA
 5432979 5432980 swp_0308 swp_0309     FALSE 0.078 194.000 0.029 NA   NA
 5432980 5432981 swp_0309 swp_0310     TRUE 0.753 65.000 0.011 1.000 Y NA
 5432981 5432982 swp_0310 swp_0311     TRUE 0.970 38.000 0.378 0.031 Y NA
 5432982 5432983 swp_0311 swp_0313     FALSE 0.150 56.000 0.000 1.000   NA
 5432983 5432984 swp_0313 swp_0314     FALSE 0.128 109.000 0.000 1.000   NA
 5432984 5432985 swp_0314 swp_0315     FALSE 0.573 202.000 0.312 1.000 N NA
 5432985 5432986 swp_0315 swp_0317     FALSE 0.030 255.000 0.000 1.000 N NA
 5432986 5432987 swp_0317 swp_0318     TRUE 0.776 105.000 0.057 NA Y NA
 5432987 5432988 swp_0318 swp_0319     TRUE 0.830 46.000 0.215 NA N NA
 5432988 5432989 swp_0319 swp_0320     TRUE 0.979 14.000 0.291 1.000 Y NA
 5432989 5432990 swp_0320 swp_0321     TRUE 0.925 62.000 0.471 1.000 N NA
 5432991 5432992 swp_0322 swp_0323     TRUE 0.836 113.000 0.357 NA   NA
 5432992 5432993 swp_0323 swp_0324     FALSE 0.322 139.000 0.050 NA   NA
 5432993 5432994 swp_0324 swp_0325     FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 5432998 5432999 swp_0329 swp_0330     FALSE 0.190 23.000 0.010 NA   NA
 5432999 5433000 swp_0330 swp_0331     FALSE 0.385 -3.000 0.010 NA   NA
 5433000 5433001 swp_0331 swp_0332     TRUE 0.837 -3.000 0.071 NA   NA
 5433003 5433004 swp_0334 swp_0335     FALSE 0.044 156.000 0.007 NA   NA
 5433005 5433006 swp_0336 swp_0337     FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 5433006 5433007 swp_0337 swp_0338     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5433007 5433008 swp_0338 swp_0339     TRUE 0.995 6.000 0.333 0.004 Y NA
 5433008 5433009 swp_0339 swp_0340     FALSE 0.427 117.000 0.016 1.000 N NA
 5433012 5433013 swp_0343 swp_0344     FALSE 0.012 -75.000 0.000 NA   NA
 5433016 5433017 swp_0347 swp_0348     TRUE 0.977 15.000 0.933 NA   NA
 5433018 5433019 swp_0349 swp_0350     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5433020 5433021 swp_0352 swp_0353     FALSE 0.027 58.000 0.000 NA   NA
 5433022 5433023 swp_0354 swp_0355     TRUE 0.841 -3.000 0.074 NA   NA
 5433023 5433024 swp_0355 swp_0356     FALSE 0.022 115.000 0.000 NA   NA
 5433026 5433027 swp_0358 swp_0359     FALSE 0.040 547.000 0.012 0.002 Y NA
 5433027 5433028 swp_0359 swp_0360     TRUE 0.993 -3.000 0.943 0.001   NA
 5433028 5433029 swp_0360 swp_0361     TRUE 0.968 5.000 0.205 1.000   NA
 5433029 5433030 swp_0361 swp_0362     FALSE 0.025 741.000 0.075 1.000 Y NA
 5433030 5433031 swp_0362 swp_0363     TRUE 0.927 20.000 0.106 1.000 Y NA
 5433031 5433032 swp_0363 swp_0364     FALSE 0.038 504.000 0.006 0.015 Y NA
 5433033 5433034 swp_0365 swp_0366     FALSE 0.028 72.000 0.000 NA   NA
 5433034 5433035 swp_0366 swp_0367     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 5433036 5433037 swp_0368 swp_0369     FALSE 0.028 69.000 0.000 NA   NA
 5433037 5433038 swp_0369 swp_0370     FALSE 0.000 420.000 0.000 NA   NA
 5433039 5433040 swp_0371 swp_0372     FALSE 0.004 334.000 0.000 1.000   NA
 5433040 5433041 swp_0372 swp_0373     FALSE 0.633 83.000 0.078 1.000   NA
 5433043 5433044 swp_0375 swp_0376     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5433044 5433045 swp_0376 swp_0378     FALSE 0.056 186.000 0.017 NA   NA
 5433045 5433046 swp_0378 swp_0379     TRUE 0.982 15.000 1.000 NA N NA
 5433046 5433047 swp_0379 swp_0380     TRUE 0.853 16.000 0.121 1.000   NA
 5433050 5433051 swp_0383 swp_0384     TRUE 0.901 18.000 0.267 NA   NA
 5433052 5433053 swp_0385 swp_0386     TRUE 0.974 36.000 0.667 1.000 Y NA
 5433053 5433054 swp_0386 swp_0387     TRUE 0.992 3.000 0.889 NA   NA
 5433054 5433055 swp_0387 swp_0388     TRUE 0.991 8.000 1.000 NA   NA
 5433055 5433056 swp_0388 swp_0389     FALSE 0.008 380.000 0.000 1.000 N NA
 5433056 5433057 swp_0389 swp_0390     TRUE 0.981 9.000 0.514 NA   NA
 5433057 5433058 swp_0390 swp_0391     TRUE 0.862 19.000 0.200 NA   NA
 5433058 5433059 swp_0391 swp_0392     TRUE 0.995 -3.000 0.929 1.000 Y NA
 5433059 5433060 swp_0392 swp_0393     TRUE 0.912 30.000 0.230 0.011   NA
 5433060 5433061 swp_0393 swp_0394     TRUE 0.983 -3.000 0.447 0.069   NA
 5433061 5433062 swp_0394 swp_0395     FALSE 0.412 96.000 0.000 0.069   NA
 5433062 5433063 swp_0395 swp_0396     FALSE 0.009 259.000 0.000 1.000   NA
 5433063 5433064 swp_0396 swp_0397     FALSE 0.324 -223.000 0.000 0.002   NA
 5433064 5433065 swp_0397 swp_0398     FALSE 0.007 281.000 0.000 1.000   NA
 5433065 5433066 swp_0398 swp_0399     TRUE 0.996 0.000 0.765 1.000 Y NA
 5433066 5433067 swp_0399 swp_0400     TRUE 0.968 67.000 0.600 1.000 Y NA
 5433067 5433068 swp_0400 swp_0402     TRUE 0.990 10.000 0.205 0.002 Y NA
 5433071 5433072 swp_0405 swp_0406     FALSE 0.001 314.000 0.000 NA   NA
 5433072 5433073 swp_0406 swp_0407     FALSE 0.315 6.000 0.002 NA   NA
 5433073 5433074 swp_0407 swp_0408     TRUE 0.920 84.000 0.104 0.002 Y NA
 5433074 5433075 swp_0408 swp_0409     TRUE 0.919 12.000 0.175 NA   NA
 5433075 5433076 swp_0409 swp_0410     TRUE 0.977 13.000 0.714 NA   NA
 5433076 5433077 swp_0410 swp_0411     TRUE 0.971 -3.000 0.367 1.000   NA
 5433078 5433079 swp_0412 swp_0413     FALSE 0.023 110.000 0.000 NA   NA
 5433079 5433080 swp_0413 swp_0414     FALSE 0.175 4.000 0.000 NA   NA
 5433081 5433082 swp_0415 swp_0416     TRUE 0.924 10.000 0.152 NA   NA
 5433082 5433083 swp_0416 swp_0417     FALSE 0.000 411.000 0.000 NA   NA
 5433084 5433085 swp_0418 swp_0419     TRUE 0.982 3.000 0.389 NA   NA
 5433085 5433086 swp_0419 swp_0420     FALSE 0.125 10.000 0.000 NA   NA
 5433086 5433087 swp_0420 swp_0421     FALSE 0.000 452.000 0.000 NA   NA
 5433087 5433088 swp_0421 swp_0422     TRUE 0.790 44.000 0.127 1.000 N NA
 5433088 5433089 swp_0422 swp_0423     TRUE 0.982 40.000 0.706 0.034 Y NA
 5433089 5433090 swp_0423 swp_0424     TRUE 0.820 95.000 0.190 1.000 N NA
 5433090 5433091 swp_0424 swp_0425     FALSE 0.003 612.000 0.000 1.000 N NA
 5433091 5433092 swp_0425 swp_0426     TRUE 0.893 18.000 0.161 1.000 N NA
 5433092 5433093 swp_0426 swp_0427     FALSE 0.667 152.000 0.042 1.000 Y NA
 5433094 5433095 swp_0428 swp_0429     TRUE 0.926 150.000 0.727 0.001   NA
 5433095 5433096 swp_0429 swp_0430     TRUE 0.869 84.000 0.034 0.003 Y NA
 5433096 5433097 swp_0430 swp_0431     TRUE 0.984 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 5433097 5433098 swp_0431 swp_0432     FALSE 0.379 136.000 0.019 1.000 N NA
 5433099 5433100 swp_0433 swp_0434     FALSE 0.016 504.000 0.087 1.000   NA
 5433101 5433102 swp_0435 swp_0436     TRUE 0.957 17.000 0.406 1.000 N NA
 5433102 5433103 swp_0436 swp_0437     FALSE 0.078 289.000 0.000 1.000 Y NA
 5433103 5433104 swp_0437 swp_0438     FALSE 0.108 318.000 0.000 0.002 Y NA
 5433105 5433106 swp_0439 swp_0440     FALSE 0.006 296.000 0.000 1.000   NA
 5433106 5433107 swp_0440 swp_0441     FALSE 0.504 129.000 0.038 1.000 N NA
 5433107 5433108 swp_0441 swp_0442     TRUE 0.927 -3.000 0.134 NA N NA
 5433108 5433109 swp_0442 swp_0443     TRUE 0.836 0.000 0.045 NA   NA
 5433111 5433112 swp_0445 swp_0447     TRUE 0.991 4.000 0.333 NA Y NA
 5433112 5433113 swp_0447 swp_0448     TRUE 0.989 7.000 0.174 0.011 Y NA
 5433113 5433114 swp_0448 swp_0449     FALSE 0.452 62.000 0.029 1.000   NA
 5433114 5433115 swp_0449 swp_0450     TRUE 0.975 -3.000 0.432 1.000   NA
 5433115 5433116 swp_0450 swp_0451     TRUE 0.924 12.000 0.145 1.000   NA
 5433118 5433119 swp_0453 swp_0454     FALSE 0.678 134.000 0.159 NA N NA
 5433122 5433123 swp_0457 swp_0458     TRUE 0.860 70.000 0.336 NA   NA
 5433123 5433124 swp_0458 swp_0459     FALSE 0.018 232.000 0.000 NA N NA
 5433125 5433126 swp_0460 swp_0461     TRUE 0.822 91.000 0.231 NA N NA
 5433126 5433127 swp_0461 swp_0462     FALSE 0.008 182.000 0.000 NA   NA
 5433127 5433128 swp_0462 swp_0463     FALSE 0.504 101.000 0.070 NA   NA
 5433128 5433129 swp_0463 swp_0464     TRUE 0.974 52.000 0.752 1.000 Y NA
 5433130 5433131 swp_0465 swp_0466     FALSE 0.022 116.000 0.000 NA   NA
 5433131 5433132 swp_0466 swp_0467     FALSE 0.185 2.000 0.000 NA   NA
 5433132 5433133 swp_0467 swp_0468     FALSE 0.001 350.000 0.000 NA   NA
 5433133 5433134 swp_0468 swp_0469     FALSE 7.71147771648894e-05 1516.000 0.000 NA   NA
 5433134 5433135 swp_0469 swp_0470     FALSE 0.001 318.000 0.000 NA   NA
 5433135 5433136 swp_0470 swp_0471     FALSE 0.027 80.000 0.000 NA   NA
 5433137 5433138 swp_0472 swp_0473     FALSE 0.000 481.000 0.000 NA   NA
 5433138 5433139 swp_0473 swp_0474     TRUE 0.797 11.000 0.052 NA   NA
 5433139 5433140 swp_0474 swp_0475     FALSE 0.630 126.000 0.036 0.098 N NA
 5433141 5433142 swp_0476 swp_0477     FALSE 0.053 123.000 0.004 NA   NA
 5433144 5433145 swp_0479 swp_0480     FALSE 0.000 515.000 0.000 NA   NA
 5433145 5433146 swp_0480 swp_0481     FALSE 0.001 334.000 0.000 NA   NA
 5433148 5433149 swp_0483 swp_0484     FALSE 0.073 214.000 0.040 NA   NA
 5433149 5433150 swp_0484 swp_0485     TRUE 0.981 0.000 0.433 NA   NA
 5433150 5433151 swp_0485 swp_0486     TRUE 0.973 -3.000 0.475 NA   NA
 5433151 5433152 swp_0486 swp_0487     FALSE 0.026 -19.000 0.000 NA   NA
 5433152 5433153 swp_0487 swp_0488     FALSE 0.166 5.000 0.000 NA   NA
 5433153 5433154 swp_0488 swp_0489     TRUE 0.993 3.000 0.846 1.000   NA
 5433154 5433155 swp_0489 swp_0490     TRUE 0.943 -3.000 0.185 1.000   NA
 5433155 5433156 swp_0490 swp_0491     TRUE 0.889 18.000 0.197 1.000   NA
 5433156 5433157 swp_0491 swp_0492     TRUE 0.996 0.000 0.740 1.000 Y NA
 5433157 5433158 swp_0492 swp_0493     TRUE 0.819 22.000 0.169 NA   NA
 5433158 5433159 swp_0493 swp_0494     TRUE 0.933 78.000 0.789 NA   NA
 5433159 5433160 swp_0494 swp_0495     FALSE 0.028 72.000 0.000 NA   NA
 5433160 5433161 swp_0495 swp_0496     FALSE 0.038 27.000 0.000 NA   NA
 5433161 5433162 swp_0496 swp_0497     FALSE 0.028 74.000 0.000 NA   NA
 5433162 5433163 swp_0497 swp_0498     FALSE 0.007 183.000 0.000 NA   NA
 5433163 5433164 swp_0498 swp_0500     TRUE 0.925 -10.000 0.433 NA   NA
 5433164 5433165 swp_0500 swp_0501     TRUE 0.991 0.000 0.871 NA   NA
 5433165 5433166 swp_0501 swp_0503     TRUE 0.939 -10.000 0.548 NA   NA
 5433166 5433167 swp_0503 swp_0504     TRUE 0.883 -7.000 0.200 NA   NA
 5433167 5433168 swp_0504 swp_0506     FALSE 0.016 194.000 0.005 NA   NA
 5433168 5433169 swp_0506 swp_0507     TRUE 0.951 40.000 0.689 1.000 N NA
 5433169 5433170 swp_0507 swp_0508     TRUE 0.995 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 5433170 5433171 swp_0508 swp_0509     TRUE 0.821 66.000 0.206 NA N NA
 5433171 5433172 swp_0509 swp_0510     TRUE 0.888 98.000 0.417 NA N NA
 5433172 5433173 swp_0510 swp_0511     TRUE 0.840 66.000 0.296 NA   NA
 5433173 5433174 swp_0511 swp_0512     TRUE 0.734 -76.000 0.358 NA   NA
 5433174 5433175 swp_0512 swp_0513     TRUE 0.786 110.000 0.259 NA   NA
 5433175 5433176 swp_0513 swp_0514     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5433176 5433177 swp_0514 swp_0515     FALSE 0.001 265.000 0.000 NA   NA
 5433177 5433178 swp_0515 swp_0516     FALSE 0.060 16.000 0.000 NA   NA
 5433178 5433179 swp_0516 swp_0517     TRUE 0.951 -10.000 0.464 1.000 N NA
 5433179 5433180 swp_0517 swp_0518     TRUE 0.978 26.000 0.729 NA Y NA
 5433180 5433181 swp_0518 swp_0519     TRUE 0.996 2.000 0.743 NA Y NA
 5433182 5433183 swp_0520 swp_0521     FALSE 0.325 149.000 0.058 NA   NA
 5433186 5433187 swp_0524 swp_0525     TRUE 0.749 51.000 0.103 1.000 N NA
 5433187 5433188 swp_0525 swp_0526     TRUE 0.706 119.000 0.114 1.000 N NA
 5433188 5433189 swp_0526 swp_0527     TRUE 0.922 79.000 0.689 NA   NA
 5433189 5433190 swp_0527 swp_0529     FALSE 0.194 -15.000 0.015 NA   NA
 5433193 5433194 swp_0532 swp_0534     FALSE 9.26593775540216e-05 1024.000 0.000 NA   NA
 5433194 5433195 swp_0534 swp_0535     FALSE 0.000 429.000 0.000 NA   NA
 5433195 5433196 swp_0535 swp_0536     TRUE 0.802 138.000 0.259 1.000 N NA
 5433196 5433197 swp_0536 swp_0537     TRUE 0.844 88.000 0.333 NA   NA
 5433206 5433207 swp_0546 swp_0547     FALSE 0.182 98.000 0.018 NA   NA
 5433209 5433210 swp_0548 swp_0551     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 5433214 5433215 swp_0555 swp_0556     TRUE 0.946 -16.000 0.887 NA   NA
 5433215 5433216 swp_0556 swp_0557     TRUE 0.966 82.000 0.604 1.000 Y NA
 5433218 5433219 swp_0559 swp_0560     TRUE 0.726 29.000 0.121 NA   NA
 5433220 5433221 swp_0561 swp_0562     TRUE 0.992 14.000 0.902 1.000 Y NA
 5433222 5433223 swp_0563 swp_0564     FALSE 0.283 118.000 0.033 NA   NA
 5433224 5433225 swp_0565 swp_0566     FALSE 0.467 127.000 0.077 NA   NA
 5433227 5433228 swp_0568 swp_0569     FALSE 0.008 179.000 0.000 NA   NA
 5433229 5433230 swp_0570 swp_0571     FALSE 0.402 128.000 0.058 NA   NA
 5433230 5433231 swp_0571 swp_0572     FALSE 0.015 144.000 0.000 NA   NA
 5433231 5433232 swp_0572 swp_0573     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 5433233 5433234 swp_0574 swp_0575     FALSE 0.000 413.000 0.000 NA   NA
 5433234 5433235 swp_0575 swp_0576     TRUE 0.814 44.000 0.238 NA   NA
 5433235 5433236 swp_0576 swp_0577     FALSE 0.005 193.000 0.000 NA   NA
 5433236 5433237 swp_0577 swp_0578     FALSE 0.639 122.000 0.111 NA N NA
 5433239 5433240 swp_0580 swp_0581     TRUE 0.903 3.000 0.070 NA   NA
 5433240 5433241 swp_0581 swp_0583     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5433242 5433243 swp_0582 swp_0584     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5433243 5433244 swp_0584 swp_0586     TRUE 0.974 96.000 0.631 0.096 Y NA
 5433247 5433248 swp_0589 swp_0590     FALSE 0.002 251.000 0.000 NA   NA
 5433253 5433254 swp_0595 swp_0596     FALSE 0.001 315.000 0.000 NA   NA
 5433254 5433255 swp_0596 swp_0597     FALSE 0.344 14.000 0.000 1.000   NA
 5433258 5433259 swp_0600 swp_0601     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5433259 5433260 swp_0601 swp_0602     FALSE 0.227 141.000 0.000 1.000 N NA
 5433261 5433262 swp_0603 swp_0604     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433262 5433263 swp_0604 swp_0605     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5433263 5433264 swp_0605 swp_0607     TRUE 0.990 3.000 0.714 NA   NA
 5433265 5433266 swp_0608 swp_0609     FALSE 0.077 14.000 0.000 NA   NA
 5433268 5433269 swp_0611 swp_0612     FALSE 0.022 113.000 0.000 NA   NA
 5433269 5433270 swp_0612 swp_0613     FALSE 0.020 123.000 0.000 NA   NA
 5433270 5433271 swp_0613 swp_0614     FALSE 0.018 821.000 0.000 0.002 Y NA
 5433272 5433273 swp_0615 swp_0616     TRUE 0.946 -3.000 0.233 NA   NA
 5433273 5433274 swp_0616 swp_0617     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   NA
 5433277 5433278 swp_0620 swp_0621     FALSE 0.027 52.000 0.000 NA   NA
 5433278 5433279 swp_0621 swp_0622     FALSE 0.012 -90.000 0.000 NA   NA
 5433279 5433280 swp_0622 swp_0623     FALSE 0.072 -6.000 0.000 NA   NA
 5433280 5433281 swp_0623 swp_0624     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5433281 5433282 swp_0624 swp_0625     FALSE 0.031 36.000 0.000 NA   NA
 5433283 5433284 swp_0626 swp_0627     FALSE 0.019 125.000 0.000 NA   NA
 5433285 5433286 swp_0629 swp_0630     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 5433286 5433287 swp_0630 swp_0632     FALSE 9.9420542488163e-05 883.000 0.000 NA   NA
 5433287 5433288 swp_0632 swp_0634     TRUE 0.973 0.000 0.298 NA   NA
 5433289 5433290 swp_0635 swp_0636     FALSE 0.354 68.000 0.000 1.000 N NA
 5433291 5433292 swp_0637 swp_0638     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5433292 5433293 swp_0638 swp_0639     FALSE 9.54225261594458e-05 918.000 0.000 NA   NA
 5433293 5433294 swp_0639 swp_0640     FALSE 0.018 132.000 0.000 NA   NA
 5433294 5433295 swp_0640 swp_0641     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5433296 5433297 swp_0642 swp_0643     FALSE 0.031 36.000 0.000 NA   NA
 5433298 5433299 swp_0644 swp_0645     FALSE 0.004 208.000 0.000 NA   NA
 5433299 5433300 swp_0645 swp_0647     FALSE 0.012 157.000 0.000 NA   NA
 5433300 5433301 swp_0647 swp_0648     FALSE 0.002 781.000 0.000 1.000 N NA
 5433301 5433302 swp_0648 swp_0649     TRUE 0.978 4.000 0.333 NA   NA
 5433302 5433303 swp_0649 swp_0650     TRUE 0.952 -3.000 0.267 NA   NA
 5433303 5433304 swp_0650 swp_0651     FALSE 0.028 60.000 0.000 NA   NA
 5433304 5433305 swp_0651 swp_0652     FALSE 0.001 300.000 0.000 NA   NA
 5433305 5433306 swp_0652 swp_0653     FALSE 0.000 659.000 0.000 NA   NA
 5433308 5433309 swp_0655 swp_0656     FALSE 0.019 129.000 0.000 NA   NA
 5433311 5433312 swp_0658 swp_0659     TRUE 0.995 3.000 0.500 1.000 Y NA
 5433313 5433314 swp_0660 swp_0661     TRUE 0.988 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5433314 5433315 swp_0661 swp_0662     TRUE 0.805 54.000 0.200 1.000   NA
 5433315 5433316 swp_0662 swp_0663     FALSE 0.393 114.000 0.049 NA   NA
 5433317 5433318 swp_0664 swp_0665     FALSE 0.000 494.000 0.000 NA   NA
 5433319 5433320 swp_0666 swp_0667     FALSE 0.027 55.000 0.000 NA   NA
 5433321 5433322 swp_0668 swp_0669     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 5433323 5433324 swp_0670 swp_0671     FALSE 0.056 218.000 0.000 1.000 N NA
 5433325 5433326 swp_0672 swp_0673     TRUE 0.705 134.000 0.140 1.000 N NA
 5433326 5433327 swp_0673 swp_0674     TRUE 0.795 -13.000 0.182 NA   NA
 5433327 5433328 swp_0674 swp_0675     FALSE 0.020 568.000 0.186 NA   NA
 5433328 5433329 swp_0675 swp_0676     TRUE 0.992 3.000 0.728 NA N NA
 5433329 5433330 swp_0676 swp_0677     TRUE 0.958 31.000 0.820 NA N NA
 5433330 5433331 swp_0677 swp_0678     FALSE 0.493 179.000 0.163 1.000   NA
 5433331 5433332 swp_0678 swp_0679     TRUE 0.976 -3.000 0.543 NA   NA
 5433332 5433333 swp_0679 swp_0680     TRUE 0.892 65.000 0.459 NA   NA
 5433333 5433334 swp_0680 swp_0681     TRUE 0.979 -3.000 0.617 NA   NA
 5433334 5433335 swp_0681 swp_0682     TRUE 0.990 2.000 0.598 1.000   NA
 5433335 5433336 swp_0682 swp_0683     TRUE 0.862 47.000 0.226 1.000 N NA
 5433337 5433338 swp_0684 swp_0685     TRUE 0.959 65.000 0.530 NA Y NA
 5433338 5433339 swp_0685 swp_0686     TRUE 0.910 71.000 0.562 NA   NA
 5433339 5433340 swp_0686 swp_0687     FALSE 0.597 18.000 0.045 NA   NA
 5433340 5433341 swp_0687 swp_0688     TRUE 0.896 0.000 0.076 NA   NA
 5433341 5433342 swp_0688 swp_0689     TRUE 0.984 2.000 0.453 NA   NA
 5433342 5433343 swp_0689 swp_0690     TRUE 0.904 22.000 0.258 NA N NA
 5433343 5433344 swp_0690 swp_0691     FALSE 0.013 321.000 0.000 1.000 N NA
 5433344 5433345 swp_0691 swp_0692     TRUE 0.979 -3.000 0.500 1.000   NA
 5433345 5433346 swp_0692 swp_0694     TRUE 0.689 192.000 0.625 NA   NA
 5433347 5433348 swp_0695 swp_0696     TRUE 0.949 128.000 0.310 0.002 Y NA
 5433351 5433352 swp_0698 swp_0699     FALSE 0.013 -61.000 0.000 NA   NA
 5433352 5433353 swp_0699 swp_0700     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5433353 5433354 swp_0700 swp_0701     FALSE 0.001 341.000 0.002 NA   NA
 5433354 5433355 swp_0701 swp_0702     TRUE 0.991 15.000 0.601 0.013 Y NA
 5433355 5433356 swp_0702 swp_0703     FALSE 0.001 772.000 0.012 NA   NA
 5433356 5433357 swp_0703 swp_0704     FALSE 0.467 67.000 0.051 NA   NA
 5433357 5433358 swp_0704 swp_0705     FALSE 0.070 205.000 0.013 1.000   NA
 5433358 5433359 swp_0705 swp_0706     FALSE 0.391 41.000 0.019 1.000   NA
 5433359 5433360 swp_0706 swp_0708     TRUE 0.980 1.000 0.147 0.021 N NA
 5433360 5433361 swp_0708 swp_0709     FALSE 0.067 209.000 0.000 1.000 N NA
 5433363 5433364 swp_0711 swp_0712     TRUE 0.950 9.000 0.122 1.000 N NA
 5433364 5433365 swp_0712 swp_0713     TRUE 0.935 12.000 0.128 1.000 N NA
 5433365 5433366 swp_0713 swp_0714     TRUE 0.981 28.000 0.499 0.013 Y NA
 5433367 5433368 swp_0715 swp_0716     FALSE 0.006 191.000 0.000 NA   NA
 5433368 5433369 swp_0716 swp_0717     FALSE 0.003 366.000 0.000 1.000   NA
 5433370 5433371 swp_0718 swp_0719     TRUE 0.876 104.000 0.317 1.000 N NA
 5433371 5433372 swp_0719 swp_0720     TRUE 0.830 38.000 0.208 1.000   NA
 5433374 5433375 swp_0722 swp_0723     TRUE 0.982 -16.000 0.750 0.061 Y NA
 5433375 5433376 swp_0723 swp_0724     FALSE 0.003 591.000 0.000 1.000 N NA
 5433376 5433377 swp_0724 swp_0725     TRUE 0.938 12.000 0.000 0.057 Y NA
 5433377 5433378 swp_0725 swp_0727     FALSE 0.446 53.000 0.000 0.057   NA
 5433378 5433379 swp_0727 swp_0728     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5433381 5433382 swp_0730 swp_0731     FALSE 0.003 225.000 0.000 NA   NA
 5433382 5433383 swp_0731 swp_0732     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5433387 5433388 swp_0736 swp_0738     TRUE 0.926 13.000 0.213 NA   NA
 5433388 5433389 swp_0738 swp_0739     TRUE 0.970 3.000 0.236 NA   NA
 5433390 5433391 swp_0740 swp_0741     TRUE 0.853 52.000 0.333 NA   NA
 5433394 5433395 swp_0745 swp_0746     FALSE 0.016 137.000 0.000 NA   NA
 5433395 5433396 swp_0746 swp_0747     FALSE 0.000 523.000 0.000 NA   NA
 5433396 5433397 swp_0747 swp_0748     TRUE 0.966 130.000 0.867 1.000 Y NA
 5433397 5433398 swp_0748 swp_0749     TRUE 0.991 10.000 0.867 1.000 N NA
 5433398 5433399 swp_0749 swp_0750     FALSE 0.150 236.000 0.135 NA   NA
 5433402 5433403 swp_0753 swp_0754     TRUE 0.925 112.000 0.846 NA   NA
 5433403 5433404 swp_0754 swp_0755     FALSE 0.585 81.000 0.087 NA   NA
 5433405 5433406 swp_0756 swp_0757     FALSE 0.015 144.000 0.000 NA   NA
 5433407 5433408 swp_0758 swp_0759     TRUE 0.767 134.000 0.303 NA   NA
 5433408 5433409 swp_0759 swp_0760     TRUE 0.963 0.000 0.222 NA   NA
 5433410 5433411 swp_0761 swp_0762     TRUE 0.946 39.000 0.886 NA   NA
 5433413 5433414 swp_0764 swp_0765     TRUE 0.979 7.000 0.443 NA   NA
 5433414 5433415 swp_0765 swp_0766     TRUE 0.885 61.000 0.433 NA   NA
 5433415 5433416 swp_0766 swp_0767     TRUE 0.907 30.000 0.427 NA   NA
 5433416 5433417 swp_0767 swp_0768     TRUE 0.791 47.000 0.217 NA   NA
 5433417 5433418 swp_0768 swp_0769     FALSE 0.610 43.000 0.037 1.000 N NA
 5433418 5433419 swp_0769 swp_0770     TRUE 0.885 0.000 0.023 1.000 N NA
 5433424 5433425 swp_0775 swp_0776     TRUE 0.812 27.000 0.145 NA N NA
 5433425 5433426 swp_0776 swp_0777     FALSE 0.280 52.000 0.026 NA   NA
 5433426 5433427 swp_0777 swp_0778     FALSE 0.487 8.000 0.011 NA   NA
 5433427 5433428 swp_0778 swp_0779     FALSE 0.570 -34.000 0.095 1.000   NA
 5433431 5433432 swp_0782 swp_0783     FALSE 0.012 200.000 0.003 NA   NA
 5433432 5433433 swp_0783 swp_0784     FALSE 0.658 77.000 0.118 NA   NA
 5433433 5433434 swp_0784 swp_0785     FALSE 0.661 -16.000 0.109 NA   NA
 5433434 5433435 swp_0785 swp_0786     TRUE 0.801 26.000 0.092 1.000 N NA
 5433435 5433436 swp_0786 swp_0787     TRUE 0.942 -7.000 0.188 0.093 N NA
 5433438 5433439 swp_0789 swp_0790     TRUE 0.835 21.000 0.141 1.000   NA
 5433439 5433440 swp_0790 swp_0791     TRUE 0.851 50.000 0.184 0.065   NA
 5433440 5433441 swp_0791 swp_0792     TRUE 0.998 3.000 0.947 0.012 Y NA
 5433441 5433442 swp_0792 swp_0793     FALSE 0.006 416.000 0.000 1.000 N NA
 5433442 5433443 swp_0793 swp_0794     TRUE 0.994 0.000 0.233 0.001 Y NA
 5433443 5433444 swp_0794 swp_0795     TRUE 0.997 0.000 0.630 0.001 Y NA
 5433444 5433445 swp_0795 swp_0796     TRUE 0.870 110.000 0.370 NA N NA
 5433445 5433446 swp_0796 swp_0797     TRUE 0.990 0.000 0.831 NA   NA
 5433446 5433447 swp_0797 swp_0798     FALSE 0.055 211.000 0.029 NA   NA
 5433447 5433448 swp_0798 swp_0799     FALSE 0.037 469.000 0.038 1.000 Y NA
 5433450 5433451 swp_0802 swp_0803     FALSE 0.338 181.000 0.114 NA   NA
 5433453 5433454 swp_0805 swp_0806     TRUE 0.997 0.000 0.631 0.005 Y NA
 5433455 5433456 swp_0808 swp_0809     FALSE 0.006 416.000 0.000 1.000 N NA
 5433458 5433459 swp_0811 swp_0812     TRUE 0.828 87.000 0.233 NA N NA
 5433459 5433460 swp_0812 swp_0813     TRUE 0.983 25.000 0.937 NA Y NA
 5433462 5433463 swp_0815 swp_0816     TRUE 0.786 51.000 0.218 NA   NA
 5433463 5433464 swp_0816 swp_0817     TRUE 0.929 107.000 0.864 NA   NA
 5433464 5433465 swp_0817 swp_0818     TRUE 0.952 12.000 0.286 NA   NA
 5433465 5433466 swp_0818 swp_0819     TRUE 0.983 13.000 0.911 NA   NA
 5433466 5433467 swp_0819 swp_0820     FALSE 0.604 92.000 0.104 NA   NA
 5433467 5433468 swp_0820 swp_0821     FALSE 0.648 67.000 0.110 NA   NA
 5433468 5433469 swp_0821 swp_0822     TRUE 0.976 14.000 0.760 NA   NA
 5433470 5433471 swp_0823 swp_0824     FALSE 0.003 225.000 0.000 NA   NA
 5433471 5433472 swp_0824 swp_0825     FALSE 0.504 124.000 0.087 NA   NA
 5433472 5433473 swp_0825 swp_0826     FALSE 0.024 104.000 0.000 NA   NA
 5433473 5433474 swp_0826 swp_0827     FALSE 0.000 602.000 0.000 NA   NA
 5433474 5433475 swp_0827 swp_0828     FALSE 0.026 87.000 0.000 NA   NA
 5433476 5433477 swp_0829 swp_0830     FALSE 0.568 78.000 0.080 NA   NA
 5433477 5433478 swp_0830 swp_0831     TRUE 0.982 0.000 0.360 1.000   NA
 5433478 5433479 swp_0831 swp_0832     TRUE 0.727 130.000 0.194 1.000   NA
 5433479 5433480 swp_0832 swp_0833     FALSE 0.585 174.000 0.167 1.000 N NA
 5433480 5433481 swp_0833 swp_0834     FALSE 0.036 304.000 0.000 0.065 N NA
 5433483 5433484 swp_0836 swp_0837     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5433484 5433485 swp_0837 swp_0838     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 5433488 5433489 swp_0841 swp_0842     FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   NA
 5433491 5433492 swp_0844 swp_0845     TRUE 0.978 10.000 0.500 NA   NA
 5433493 5433494 swp_0846 swp_0847     FALSE 0.001 597.000 0.000 NA N NA
 5433494 5433495 swp_0847 swp_0848     TRUE 0.957 7.000 0.065 0.001   NA
 5433495 5433496 swp_0848 swp_0849     TRUE 0.996 1.000 0.829 0.001   NA
 5433497 5433498 swp_0851 swp_0853     TRUE 0.984 90.000 0.791 0.001 Y NA
 5433498 5433499 swp_0853 swp_0854     TRUE 0.881 -7.000 0.116 1.000 N NA
 5433499 5433500 swp_0854 swp_0855     FALSE 0.000 471.000 0.000 NA   NA
 5433500 5433501 swp_0855 swp_0856     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5433503 5433504 swp_0858 swp_0859     TRUE 0.728 89.000 0.179 NA   NA
 5433504 5433505 swp_0859 swp_0860     TRUE 0.711 108.000 0.182 NA   NA
 5433507 5433508 swp_0862 swp_0863     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5433508 5433509 swp_0863 swp_0864     FALSE 0.181 21.000 0.008 NA   NA
 5433509 5433510 swp_0864 swp_0865     FALSE 0.001 321.000 0.000 NA   NA
 5433512 5433513 swp_0867 swp_0868     FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 5433513 5433514 swp_0868 swp_0870     FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 5433517 5433518 swp_0873 swp_0874     FALSE 0.374 133.000 0.056 NA   NA
 5433518 5433519 swp_0874 swp_0875     TRUE 0.890 24.000 0.302 NA   NA
 5433519 5433520 swp_0875 swp_0876     FALSE 0.001 263.000 0.000 NA   NA
 5433524 5433525 swp_0880 swp_0881     TRUE 0.935 19.000 0.120 1.000 Y NA
 5433525 5433526 swp_0881 swp_0882     TRUE 0.932 0.000 0.120 NA   NA
 5433526 5433527 swp_0882 swp_0883     TRUE 0.985 6.000 0.588 NA   NA
 5433527 5433528 swp_0883 swp_0884     FALSE 0.000 765.000 0.000 NA   NA
 5433531 5433532 swp_0887 swp_0888     TRUE 0.854 74.000 0.333 NA   NA
 5433532 5433533 swp_0888 swp_0889     FALSE 0.023 108.000 0.000 NA   NA
 5433534 5433535 swp_0890 swp_0891     TRUE 0.804 41.000 0.222 NA   NA
 5433536 5433537 swp_0892 swp_0893     TRUE 0.958 5.000 0.049 0.021 N NA
 5433537 5433538 swp_0893 swp_0894     FALSE 0.069 306.000 0.081 1.000 N NA
 5433538 5433539 swp_0894 swp_0896     FALSE 0.644 188.000 0.444 NA   NA
 5433539 5433540 swp_0896 swp_0897     FALSE 0.000 485.000 0.000 NA   NA
 5433541 5433542 swp_0898 swp_0899     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5433542 5433543 swp_0899 swp_0901     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5433543 5433544 swp_0901 swp_0902     TRUE 0.985 -3.000 0.840 NA   NA
 5433546 5433547 swp_0904 swp_0905     FALSE 0.004 336.000 0.000 1.000   NA
 5433547 5433548 swp_0905 swp_0906     TRUE 0.791 27.000 0.089 1.000 N NA
 5433548 5433549 swp_0906 swp_0907     FALSE 0.001 270.000 0.000 NA   NA
 5433549 5433550 swp_0907 swp_0908     FALSE 9.68327772615743e-05 913.000 0.000 NA   NA
 5433551 5433552 swp_0909 swp_0910     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5433552 5433553 swp_0910 swp_0911     TRUE 0.695 90.000 0.156 NA   NA
 5433553 5433554 swp_0911 swp_0912     TRUE 0.977 66.000 0.474 0.001 Y NA
 5433554 5433555 swp_0912 swp_0913     FALSE 0.032 274.000 0.004 1.000 N NA
 5433555 5433556 swp_0913 swp_0914     FALSE 0.194 503.000 0.317 0.001 Y NA
 5433556 5433557 swp_0914 swp_0915     TRUE 0.929 84.000 0.249 1.000 Y NA
 5433557 5433558 swp_0915 swp_0916     FALSE 0.000 538.000 0.000 NA   NA
 5433560 5433561 swp_0918 swp_0919     FALSE 0.001 271.000 0.000 NA   NA
 5433561 5433562 swp_0919 swp_0920     FALSE 0.000 441.000 0.000 NA   NA
 5433562 5433563 swp_0920 swp_0921     FALSE 0.026 84.000 0.000 NA   NA
 5433563 5433564 swp_0921 swp_0922     FALSE 0.019 125.000 0.000 NA   NA
 5433568 5433569 swp_0926 swp_0927     FALSE 0.005 203.000 0.000 NA   NA
 5433571 5433572 swp_0929 swp_0930     FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 5433573 5433574 swp_0931 swp_0933     TRUE 0.803 -13.000 0.189 NA   NA
 5433574 5433575 swp_0933 swp_0934     TRUE 0.930 -10.000 0.474 NA   NA
 5433575 5433576 swp_0934 swp_0936     TRUE 0.986 -3.000 0.162 0.001 Y NA
 5433578 5433579 swp_0937 swp_0938     TRUE 0.974 0.000 0.093 NA Y NA
 5433579 5433580 swp_0938 swp_0939     TRUE 0.922 48.000 0.253 NA Y NA
 5433580 5433581 swp_0939 swp_0940     TRUE 0.993 -3.000 0.655 1.000 Y NA
 5433581 5433582 swp_0940 swp_0941     TRUE 0.982 -6.000 0.254 0.064 Y NA
 5433582 5433583 swp_0941 swp_0942     TRUE 0.704 82.000 0.154 NA   NA
 5433583 5433584 swp_0942 swp_0943     FALSE 0.000 861.000 0.000 NA   NA
 5433584 5433585 swp_0943 swp_0944     FALSE 0.000 553.000 0.000 NA   NA
 5433585 5433586 swp_0944 swp_0945     FALSE 0.000 371.000 0.000 NA   NA
 5433588 5433589 swp_0948 swp_0949     FALSE 0.000 552.000 0.000 NA   NA
 5433590 5433591 swp_0950 swp_0952     FALSE 0.028 63.000 0.000 NA   NA
 5433594 5433595 swp_0954 swp_0955     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5433597 5433598 swp_0957 swp_0958     FALSE 0.000 611.000 0.000 NA   NA
 5433599 5433600 swp_0959 swp_0960     FALSE 0.031 37.000 0.000 NA   NA
 5433600 5433601 swp_0960 swp_0961     FALSE 0.033 -15.000 0.000 NA   NA
 5433603 5433604 swp_0963 swp_0964     FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 5433606 5433607 swp_0966 swp_0967     FALSE 0.001 294.000 0.000 NA   NA
 5433609 5433610 swp_0969 swp_0970     TRUE 0.825 31.000 0.133 1.000 N NA
 5433610 5433611 swp_0970 swp_0971     FALSE 0.556 143.000 0.000 1.000 Y NA
 5433611 5433612 swp_0971 swp_0972     FALSE 0.143 8.000 0.000 NA   NA
 5433612 5433613 swp_0972 swp_0974     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5433615 5433616 swp_0976 swp_0977     FALSE 0.055 219.000 0.000 1.000 N NA
 5433617 5433618 swp_0978 swp_0979     FALSE 0.004 208.000 0.000 NA   NA
 5433620 5433621 swp_0981 swp_0982     FALSE 0.055 17.000 0.000 NA   NA
 5433621 5433622 swp_0982 swp_0983     FALSE 0.027 55.000 0.000 NA   NA
 5433622 5433623 swp_0983 swp_0984     TRUE 0.980 0.000 0.333 1.000   NA
 5433623 5433624 swp_0984 swp_0985     FALSE 0.003 224.000 0.000 NA   NA
 5433627 5433628 swp_0988 swp_0989     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5433632 5433633 swp_0993 swp_0994     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA N NA
 5433633 5433634 swp_0994 swp_0995     TRUE 0.989 -7.000 0.800 1.000 Y NA
 5433634 5433635 swp_0995 swp_0996     TRUE 0.880 55.000 0.281 1.000 N NA
 5433635 5433636 swp_0996 swp_0997     TRUE 0.982 0.000 0.049 0.005 Y NA
 5433636 5433637 swp_0997 swp_0998     TRUE 0.950 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 5433637 5433638 swp_0998 swp_0999     TRUE 0.821 117.000 0.079 1.000 Y NA
 5433638 5433639 swp_0999 swp_1000     TRUE 0.908 61.000 0.078 0.005 Y NA
 5433639 5433640 swp_1000 swp_1001     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   NA
 5433640 5433641 swp_1001 swp_1002     TRUE 0.802 -12.000 0.176 NA   NA
 5433641 5433642 swp_1002 swp_1003     TRUE 0.952 0.000 0.176 NA   NA
 5433643 5433644 swp_1004 swp_1005     TRUE 0.946 5.000 0.157 NA   NA
 5433646 5433647 swp_1007 swp_1008     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433647 5433648 swp_1008 swp_1009     FALSE 0.288 -7.000 0.000 1.000   NA
 5433651 5433652 swp_1012 swp_1013     TRUE 0.941 10.000 0.191 NA   NA
 5433652 5433653 swp_1013 swp_1014     TRUE 0.847 2.000 0.043 NA   NA
 5433653 5433654 swp_1014 swp_1015     FALSE 0.024 97.000 0.000 NA   NA
 5433654 5433655 swp_1015 swp_1016     FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 11435913 5433653   swp_1014     FALSE NA 131.000 0.000 NA   NA
 11578276 5433653   swp_1014     FALSE NA 131.000 0.000 NA   NA
 11720668 5433653   swp_1014     FALSE NA 131.000 0.000 NA   NA
 11435914 5433653   swp_1014     FALSE NA 158.000 0.000 NA   NA
 11578277 5433653   swp_1014     FALSE NA 158.000 0.000 NA   NA
 11720669 5433653   swp_1014     FALSE NA 158.000 0.000 NA   NA
 11435915 5433653   swp_1014     FALSE NA 191.000 0.000 NA   NA
 11578278 5433653   swp_1014     FALSE NA 191.000 0.000 NA   NA
 11720670 5433653   swp_1014     FALSE NA 191.000 0.000 NA   NA
 11435916 5433653   swp_1014     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11578279 5433653   swp_1014     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11720671 5433653   swp_1014     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11435917 5433653   swp_1014     FALSE NA 251.000 0.000 NA   NA
 11578280 5433653   swp_1014     FALSE NA 251.000 0.000 NA   NA
 11720672 5433653   swp_1014     FALSE NA 251.000 0.000 NA   NA
 5433655 5433656 swp_1016 swp_1017     FALSE 0.000 599.000 0.000 NA   NA
 5433656 5433657 swp_1017 swp_1019     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.010 Y NA
 5433659 5433660 swp_1020 swp_1021     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5433660 5433661 swp_1021 swp_1022     FALSE 0.000 821.000 0.000 NA   NA
 5433661 5433662 swp_1022 swp_1023     FALSE 0.017 -34.000 0.000 NA   NA
 5433662 5433663 swp_1023 swp_1024     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5433663 5433664 swp_1024 swp_1025     FALSE 0.007 183.000 0.000 NA   NA
 5433664 5433665 swp_1025 swp_1026     FALSE 7.6199221387029e-05 1673.000 0.000 NA   NA
 5433666 5433667 swp_1027 swp_1028     TRUE 0.849 63.000 0.250 NA N NA
 5433671 5433672 swp_1032 swp_1033     FALSE 0.000 387.000 0.000 NA   NA
 5433672 5433673 swp_1033 swp_1034     TRUE 0.919 23.000 0.400 NA   NA
 5433673 5433674 swp_1034 swp_1035     TRUE 0.874 79.000 0.400 NA   NA
 5433675 5433676 swp_1036 swp_1037     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5433676 5433677 swp_1037 swp_1038     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5433677 5433678 swp_1038 swp_1039     TRUE 0.956 19.000 0.667 NA   NA
 5433678 5433679 swp_1039 swp_1040     TRUE 0.966 17.000 0.765 NA   NA
 5433679 5433680 swp_1040 swp_1041     TRUE 0.780 170.000 0.478 NA N NA
 5433680 5433681 swp_1041 swp_1042     TRUE 0.986 -16.000 0.957 0.089 Y NA
 5433681 5433682 swp_1042 swp_1043     FALSE 0.020 123.000 0.000 NA   NA
 5433682 5433683 swp_1043 swp_1044     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5433683 5433684 swp_1044 swp_1045     TRUE 0.986 0.000 0.371 1.000 N NA
 5433684 5433685 swp_1045 swp_1046     TRUE 0.987 -7.000 0.920 0.039 N NA
 5433687 5433688 swp_1048 swp_1050     FALSE 0.000 466.000 0.000 NA   NA
 5433689 5433690 swp_1051 swp_1052     TRUE 0.966 22.000 0.667 1.000 N NA
 5433691 5433692 swp_1054 swp_1055     FALSE 0.288 182.000 0.091 NA   NA
 5433695 5433696 swp_1058 swp_1060     FALSE 0.606 -9.000 0.050 NA   NA
 5433701 5433702 swp_1064 swp_1065     FALSE 0.008 269.000 0.000 1.000   NA
 5433702 5433703 swp_1065 swp_1066     FALSE 0.025 95.000 0.000 NA   NA
 5433703 5433704 swp_1066 swp_1067     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5433704 5433705 swp_1067 swp_1068     FALSE 0.018 358.000 0.041 1.000   NA
 5433708 5433709 swp_1071 swp_1073     FALSE 7.89760462421098e-05 1425.000 0.000 NA   NA
 5433709 5433710 swp_1073 swp_1074     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5433715 5433716 swp_1079 swp_1080     FALSE 0.030 39.000 0.000 NA   NA
 5433717 5433718 swp_1081 swp_1082     FALSE 0.018 133.000 0.000 NA   NA
 5433718 5433719 swp_1082 swp_1083     TRUE 0.919 5.000 0.042 1.000 N NA
 5433722 5433723 swp_1086 swp_1087     FALSE 8.40592003937774e-05 1306.000 0.000 NA   NA
 5433723 5433724 swp_1087 swp_1088     TRUE 0.982 -3.000 0.714 NA   NA
 5433724 5433725 swp_1088 swp_1089     TRUE 0.889 -25.000 0.571 NA   NA
 5433725 5433726 swp_1089 swp_1090     TRUE 0.916 -10.000 0.385 NA   NA
 5433727 5433728 swp_1091 swp_1092     FALSE 0.263 18.000 0.013 NA   NA
 5433728 5433729 swp_1092 swp_1093     FALSE 0.023 209.000 0.000 1.000   NA
 5433730 5433731 swp_1094 swp_1095     FALSE 0.008 178.000 0.000 NA   NA
 5433732 5433733 swp_1096 swp_1097     FALSE 0.018 132.000 0.000 NA   NA
 5433733 5433734 swp_1097 swp_1098     FALSE 0.000 823.000 0.000 NA   NA
 5433734 5433735 swp_1098 swp_1099     FALSE 0.000 396.000 0.000 NA   NA
 5433735 5433736 swp_1099 swp_1100     FALSE 0.007 282.000 0.000 1.000   NA
 5433736 5433737 swp_1100 swp_1101     FALSE 0.003 353.000 0.000 1.000   NA
 5433739 5433740 swp_1105 swp_1106     FALSE 0.000 454.000 0.000 NA   NA
 5433743 5433744 swp_1109 swp_1110     FALSE 0.007 395.000 0.000 1.000 N NA
 5433745 5433746 swp_1111 swp_1112     TRUE 0.857 118.000 0.299 1.000 N NA
 5433746 5433747 swp_1112 swp_1113     TRUE 0.710 105.000 0.137 1.000   NA
 5433747 5433748 swp_1113 swp_1114     TRUE 0.866 38.000 0.173 0.019   NA
 5433751 5433752 swp_1118 swp_1119     TRUE 0.995 1.000 0.500 1.000 Y NA
 5433752 5433753 swp_1119 swp_1120     TRUE 0.842 25.000 0.125 1.000 N NA
 5433753 5433754 swp_1120 swp_1121     FALSE 0.637 36.000 0.039 1.000 N NA
 5433754 5433755 swp_1121 swp_1122     FALSE 0.314 171.000 0.055 1.000   NA
 5433756 5433757 swp_1123 swp_1124     FALSE 0.002 234.000 0.000 NA   NA
 5433758 5433759 swp_1125 swp_1126     TRUE 0.974 0.000 0.311 NA   NA
 5433762 5433763 swp_1129 swp_1130     FALSE 0.588 29.000 0.021 1.000 N NA
 5433763 5433764 swp_1130 swp_1131     FALSE 0.002 230.000 0.000 NA   NA
 5433764 5433765 swp_1131 swp_1132     TRUE 0.886 70.000 0.429 NA   NA
 5433768 5433769 swp_1135 swp_1136     FALSE 0.040 277.000 0.059 NA   NA
 5433770 5433771 swp_1137 swp_1138     FALSE 0.024 -22.000 0.000 NA   NA
 5433772 5433773 swp_1139 swp_1140     TRUE 0.933 -3.000 0.195 NA   NA
 5433773 5433774 swp_1140 swp_1141     FALSE 0.343 164.000 0.056 1.000   NA
 5433774 5433775 swp_1141 swp_1142     FALSE 0.447 71.000 0.029 1.000   NA
 5433775 5433776 swp_1142 swp_1143     FALSE 0.007 295.000 0.000 NA N NA
 5433776 5433777 swp_1143 swp_1144     FALSE 0.026 236.000 0.022 NA   NA
 5433779 5433780 swp_1145 swp_1147     FALSE 0.007 187.000 0.000 NA   NA
 5433781 5433782 swp_1148 swp_1149     FALSE 0.263 143.000 0.023 1.000   NA
 5433782 5433783 swp_1149 swp_1150     FALSE 0.239 35.000 0.019 NA   NA
 5433785 5433786 swp_1152 swp_1153     FALSE 0.000 638.000 0.000 NA   NA
 5433786 5433787 swp_1153 swp_1154     TRUE 0.859 37.000 0.244 NA N NA
 5433788 5433789 swp_1155 swp_1156     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   NA
 5433789 5433790 swp_1156 swp_1158     TRUE 0.891 21.000 0.275 NA   NA
 5433790 5433791 swp_1158 swp_1159     FALSE 0.112 138.000 0.000 NA N NA
 5433791 5433792 swp_1159 swp_1160     FALSE 0.024 98.000 0.000 NA   NA
 5433794 5433795 swp_1162 swp_1163     FALSE 0.462 170.000 0.114 NA N NA
 5433795 5433796 swp_1163 swp_1164     FALSE 0.224 160.000 0.022 NA N NA
 5433796 5433797 swp_1164 swp_1165     FALSE 0.000 577.000 0.000 NA   NA
 5433797 5433798 swp_1165 swp_1166     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5433798 5433799 swp_1166 swp_1167     FALSE 0.003 648.000 0.000 1.000 N NA
 5433799 5433800 swp_1167 swp_1168     TRUE 0.997 0.000 0.522 0.004 Y NA
 5433800 5433801 swp_1168 swp_1169     TRUE 0.984 -7.000 0.324 0.004 Y NA
 5433801 5433802 swp_1169 swp_1170     TRUE 0.994 0.000 0.312 0.004 Y NA
 5433802 5433803 swp_1170 swp_1171     TRUE 0.983 6.000 0.062 0.004 Y NA
 5433803 5433804 swp_1171 swp_1172     TRUE 0.946 48.000 0.188 0.004 Y NA
 5433804 5433805 swp_1172 swp_1173     TRUE 0.947 30.000 0.519 1.000 N NA
 5433805 5433806 swp_1173 swp_1174     TRUE 0.967 13.000 0.481 NA   NA
 5433806 5433807 swp_1174 swp_1175     FALSE 0.001 335.000 0.000 NA   NA
 5433807 5433808 swp_1175 swp_1176     TRUE 0.992 13.000 0.396 0.001 Y NA
 5433808 5433809 swp_1176 swp_1177     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 5433809 5433810 swp_1177 swp_1178     FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 5433810 5433811 swp_1178 swp_1179     FALSE 0.123 216.000 0.026 1.000 N NA
 5433814 5433815 swp_1182 swp_1183     FALSE 0.023 -24.000 0.000 NA   NA
 5433816 5433817 swp_1184 swp_1185     FALSE 0.009 177.000 0.000 NA   NA
 5433817 5433818 swp_1185 swp_1186     FALSE 0.021 119.000 0.000 NA   NA
 5433818 5433819 swp_1186 swp_1187     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5433819 5433820 swp_1187 swp_1188     FALSE 0.000 674.000 0.000 NA   NA
 5433820 5433821 swp_1188 swp_1189     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 5433821 5433822 swp_1189 swp_1190     FALSE 0.000 605.000 0.000 NA   NA
 5433822 5433823 swp_1190 swp_1191     FALSE 0.022 -25.000 0.000 NA   NA
 5433823 5433824 swp_1191 swp_1192     FALSE 0.004 209.000 0.000 NA   NA
 5433824 5433825 swp_1192 swp_1193     TRUE 0.963 -3.000 0.014 0.001 Y NA
 5433825 5433826 swp_1193 swp_1194     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 5433828 5433829 swp_1196 swp_1197     TRUE 0.953 89.000 0.236 0.002 Y NA
 5433829 5433830 swp_1197 swp_1198     FALSE 0.414 187.000 0.011 1.000 Y NA
 5433830 5433831 swp_1198 swp_1199     TRUE 0.886 82.000 0.130 1.000 Y NA
 5433831 5433832 swp_1199 swp_1200     FALSE 0.481 65.000 0.013 1.000 N NA
 5433832 5433833 swp_1200 swp_1201     FALSE 0.389 203.000 0.034 1.000 Y NA
 5433833 5433834 swp_1201 swp_1202     TRUE 0.977 29.000 0.345 0.001 Y NA
 5433834 5433835 swp_1202 swp_1203     FALSE 0.110 350.000 0.241 1.000 N NA
 5433835 5433836 swp_1203 swp_1206     FALSE 0.056 143.000 0.007 NA   NA
 5433836 5433837 swp_1206 swp_1207     FALSE 0.043 309.000 0.099 NA   NA
 5433837 5433838 swp_1207 swp_1208     TRUE 0.996 2.000 0.366 0.001 Y NA
 5433840 5433841 swp_1210 swp_1211     TRUE 0.767 71.000 0.152 NA N NA
 5433841 5433842 swp_1211 swp_1212     TRUE 0.873 113.000 0.325 1.000 N NA
 5433842 5433843 swp_1212 swp_1213     TRUE 0.870 83.000 0.260 1.000 N NA
 5433843 5433844 swp_1213 swp_1214     FALSE 0.599 186.000 0.082 1.000 Y NA
 5433844 5433845 swp_1214 swp_1215     TRUE 0.975 3.000 0.184 1.000 N NA
 5433845 5433846 swp_1215 swp_1216     FALSE 0.000 569.000 0.000 NA   NA
 5433846 5433847 swp_1216 swp_1217     TRUE 0.949 28.000 0.759 NA   NA
 5433847 5433848 swp_1217 swp_1218     TRUE 0.927 27.000 0.342 1.000 N NA
 5433848 5433849 swp_1218 swp_1219     TRUE 0.965 68.000 0.530 1.000 Y NA
 5433849 5433850 swp_1219 swp_1220     TRUE 0.991 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5433850 5433851 swp_1220 swp_1221     TRUE 0.891 127.000 0.211 1.000 Y NA
 5433853 5433854 swp_1223 swp_1224     FALSE 0.195 206.000 0.071 1.000   NA
 5433854 5433855 swp_1224 swp_1225     FALSE 0.308 103.000 0.015 1.000   NA
 5433855 5433856 swp_1225 swp_1226     FALSE 0.046 232.000 0.015 NA N NA
 5433856 5433857 swp_1226 swp_1227     FALSE 0.248 178.000 0.040 NA N NA
 5433857 5433858 swp_1227 swp_1228     FALSE 0.011 340.000 0.000 1.000 N NA
 5433858 5433859 swp_1228 swp_1229     FALSE 0.004 513.000 0.000 1.000 N NA
 5433859 5433860 swp_1229 swp_1230     TRUE 0.852 164.000 0.286 1.000 Y NA
 5433860 5433861 swp_1230 swp_1231     FALSE 0.190 327.000 0.398 1.000 N NA
 5433861 5433862 swp_1231 swp_1232     TRUE 0.903 103.000 0.414 1.000 N NA
 5433864 5433865 swp_1234 swp_1235     FALSE 0.005 267.000 0.007 NA   NA
 5433867 5433868 swp_1237 swp_1238     FALSE 0.007 411.000 0.000 1.000 N NA
 5433868 5433869 swp_1238 swp_1239     TRUE 0.977 13.000 0.222 1.000 Y NA
 5433869 5433870 swp_1239 swp_1240     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA N NA
 5433873 5433874 swp_1243 swp_1244     FALSE 0.171 131.000 0.022 NA   NA
 5433874 5433875 swp_1244 swp_1245     FALSE 0.577 160.000 0.200 NA   NA
 5433877 5433878 swp_1247 swp_1248     FALSE 0.001 350.000 0.000 NA   NA
 5433878 5433879 swp_1248 swp_1249     FALSE 0.028 48.000 0.000 NA   NA
 5433885 5433886 swp_1254 swp_1255     FALSE 0.607 30.000 0.046 1.000   NA
 5433886 5433887 swp_1255 swp_1256     FALSE 0.188 142.000 0.008 1.000   NA
 5433887 5433888 swp_1256 swp_1257     FALSE 0.003 367.000 0.000 1.000   NA
 5433890 5433891 swp_1259 swp_1260     TRUE 0.990 29.000 0.948 0.007 Y NA
 5433894 5433895 swp_1263 swp_1264     FALSE 0.228 183.000 0.023 1.000 N NA
 5433895 5433896 swp_1264 swp_1265     TRUE 0.971 70.000 0.453 0.027 Y NA
 5433896 5433897 swp_1265 swp_1267     FALSE 0.502 189.000 0.168 1.000 N NA
 5433900 5433901 swp_1271 swp_1272     FALSE 0.000 410.000 0.000 NA   NA
 5433901 5433902 swp_1272 swp_1273     FALSE 0.005 201.000 0.000 NA   NA
 5433902 5433903 swp_1273 swp_1274     FALSE 0.041 25.000 0.000 NA   NA
 5433904 5433905 swp_1275 swp_1276     FALSE 0.044 183.000 0.000 1.000   NA
 5433908 5433909 swp_1280 swp_1281     FALSE 0.011 162.000 0.000 NA   NA
 5433909 5433910 swp_1281 swp_1282     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5433913 5433914 swp_1285 swp_1286     FALSE 0.000 604.000 0.000 NA   NA
 5433914 5433915 swp_1286 swp_1287     TRUE 0.865 32.000 0.088 NA Y NA
 5433916 5433917 swp_1288 swp_1289     FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   NA
 5433919 5433920 swp_1291 swp_1292     TRUE 0.761 157.000 0.429 NA   NA
 5433920 5433921 swp_1292 swp_1294     TRUE 0.981 78.000 0.778 0.061 Y NA
 5433923 5433924 swp_1297 swp_1298     FALSE 0.049 241.000 0.043 NA   NA
 5433924 5433925 swp_1298 swp_1299     FALSE 0.000 409.000 0.000 NA   NA
 5433926 5433927 swp_1300 swp_1301     TRUE 0.988 10.000 0.667 1.000 N NA
 5433928 5433929 swp_1302 swp_1303     FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 5433930 5433931 swp_1304 swp_1305     FALSE 0.021 117.000 0.000 NA   NA
 5433931 5433932 swp_1305 swp_1306     FALSE 0.022 115.000 0.000 NA   NA
 5433932 5433933 swp_1306 swp_1307     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 5433933 5433934 swp_1307 swp_1308     FALSE 0.000 684.000 0.000 NA   NA
 5433935 5433936 swp_1309 swp_1311     FALSE 0.028 73.000 0.000 NA   NA
 5433939 5433940 swp_1314 swp_1315     TRUE 0.989 4.000 0.118 0.003 Y NA
 5433940 5433941 swp_1315 swp_1316     TRUE 0.970 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 5433941 5433942 swp_1316 swp_1317     TRUE 0.953 56.000 0.394 1.000 Y NA
 5433942 5433943 swp_1317 swp_1318     TRUE 0.962 67.000 0.481 1.000 Y NA
 5433944 5433945 swp_1319 swp_1320     FALSE 0.025 95.000 0.000 NA   NA
 5433945 5433946 swp_1320 swp_1321     FALSE 0.000 606.000 0.000 NA   NA
 5433946 5433947 swp_1321 swp_1323     FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 5433947 5433948 swp_1323 swp_1324     FALSE 0.001 273.000 0.000 NA   NA
 5433948 5433949 swp_1324 swp_1325     FALSE 0.003 223.000 0.000 NA   NA
 5433953 5433954 swp_1329 swp_1330     TRUE 0.953 1.000 0.117 NA N NA
 5433954 5433955 swp_1330 swp_1331     FALSE 0.001 1025.000 0.000 1.000   NA
 5433955 5433956 swp_1331 swp_1332     TRUE 0.686 47.000 0.095 1.000   NA
 5433956 5433957 swp_1332 swp_1333     FALSE 0.007 186.000 0.000 NA   NA
 5433957 5433958 swp_1333 swp_1334     FALSE 0.045 22.000 0.000 NA   NA
 5433958 5433959 swp_1334 swp_1335     FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 5433960 5433961 swp_1336 swp_1337     FALSE 0.001 319.000 0.000 NA   NA
 5433961 5433962 swp_1337 swp_1338     FALSE 0.406 119.000 0.032 NA N NA
 5433962 5433963 swp_1338 swp_1339     TRUE 0.860 48.000 0.277 NA N NA
 5433963 5433964 swp_1339 swp_1340     TRUE 0.994 5.000 0.456 1.000 Y NA
 5433964 5433965 swp_1340 swp_1341     TRUE 0.729 148.000 0.065 1.000 Y NA
 5433965 5433966 swp_1341 swp_1342     TRUE 0.809 146.000 0.049 0.002 Y NA
 5433966 5433967 swp_1342 swp_1343     TRUE 0.960 15.000 0.347 1.000 N NA
 5433967 5433968 swp_1343 swp_1344     TRUE 0.757 145.000 0.225 1.000 N NA
 5433968 5433969 swp_1344 swp_1345     TRUE 0.960 -3.000 0.206 1.000 N NA
 5433970 5433971 swp_1346 swp_1347     FALSE 0.020 271.000 0.010 1.000   NA
 5433971 5433972 swp_1347 swp_1348     FALSE 0.018 -31.000 0.000 NA   NA
 5433974 5433975 swp_1350 swp_1351     FALSE 0.667 -10.000 0.075 NA   NA
 5433976 5433977 swp_1352 swp_1353     FALSE 0.363 139.000 0.018 1.000 N NA
 5433977 5433978 swp_1353 swp_1354     FALSE 0.342 55.000 0.015 1.000   NA
 5433978 5433979 swp_1354 swp_1355     FALSE 0.142 188.000 0.025 1.000   NA
 5433979 5433980 swp_1355 swp_1356     FALSE 0.599 130.000 0.068 1.000 N NA
 5433980 5433981 swp_1356 swp_1357     TRUE 0.866 52.000 0.241 1.000 N NA
 5433981 5433982 swp_1357 swp_1358     TRUE 0.863 31.000 0.185 1.000 N NA
 5433982 5433983 swp_1358 swp_1359     TRUE 0.955 55.000 0.419 1.000 Y NA
 5433983 5433984 swp_1359 swp_1360     TRUE 0.880 17.000 0.173 1.000   NA
 5433984 5433985 swp_1360 swp_1361     TRUE 0.972 0.000 0.235 1.000   NA
 5433985 5433986 swp_1361 swp_1362     TRUE 0.884 77.000 0.353 1.000   NA
 5433986 5433987 swp_1362 swp_1363     FALSE 0.568 49.000 0.030 1.000 N NA
 5433987 5433988 swp_1363 swp_1364     TRUE 0.816 77.000 0.169 1.000 N NA
 5433990 5433991 swp_1366 swp_1367     FALSE 0.071 322.000 0.054 0.086 N NA
 5433991 5433992 swp_1367 swp_1368     FALSE 0.009 475.000 0.020 1.000 N NA
 5433992 5433993 swp_1368 swp_1369     FALSE 0.001 1688.000 0.000 1.000 N NA
 5433993 5433994 swp_1369 swp_1370     FALSE 0.149 79.000 0.000 1.000   NA
 5433994 5433995 swp_1370 swp_1371     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433995 5433996 swp_1371 swp_1373     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433998 5433999 swp_1374 swp_1375     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5433999 5434000 swp_1375 swp_1376     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5434002 5434003 swp_1378 swp_1379     TRUE 0.992 20.000 0.810 0.001 Y NA
 5434003 5434004 swp_1379 swp_1380     TRUE 0.998 9.000 0.976 0.001 Y NA
 5434004 5434005 swp_1380 swp_1381     FALSE 0.048 180.000 0.000 1.000   NA
 5434005 5434006 swp_1381 swp_1382     TRUE 0.993 11.000 1.000 0.009   NA
 5434006 5434007 swp_1382 swp_1383     FALSE 0.151 59.000 0.000 1.000   NA
 5434007 5434008 swp_1383 swp_1384     FALSE 0.026 -19.000 0.000 NA   NA
 5434009 5434010 swp_1385 swp_1386     TRUE 0.696 71.000 0.138 NA   NA
 5434011 5434012 swp_1387 swp_1388     FALSE 0.019 129.000 0.000 NA   NA
 5434012 5434013 swp_1388 swp_1389     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 5434013 5434014 swp_1389 swp_1390     FALSE 0.160 243.000 0.127 1.000   NA
 5434014 5434015 swp_1390 swp_1392     TRUE 0.912 3.000 0.079 NA   NA
 5434015 5434016 swp_1392 swp_1393     FALSE 0.546 112.000 0.090 NA   NA
 5434016 5434017 swp_1393 swp_1394     FALSE 0.005 197.000 0.000 NA   NA
 5434019 5434020 swp_1396 swp_1397     FALSE 0.257 152.000 0.002 1.000 N NA
 5434020 5434021 swp_1397 swp_1398     TRUE 0.777 -7.000 0.092 NA   NA
 5434025 5434026 swp_1402 swp_1403     TRUE 0.743 -10.000 0.111 NA   NA
 5434026 5434027 swp_1403 swp_1404     FALSE 0.028 61.000 0.000 NA   NA
 5434027 5434028 swp_1404 swp_1405     TRUE 0.968 25.000 0.250 0.023 Y NA
 5434028 5434029 swp_1405 swp_1406     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 5434029 5434030 swp_1406 swp_1407     FALSE 0.027 79.000 0.000 NA   NA
 5434031 5434032 swp_1408 swp_1409     FALSE 0.002 238.000 0.000 NA   NA
 5434032 5434033 swp_1409 swp_1410     TRUE 0.966 12.000 0.400 NA   NA
 5434034 5434035 swp_1411 swp_1412     FALSE 0.637 20.000 0.016 1.000 N NA
 5434039 5434040 swp_1416 swp_1417     FALSE 0.045 22.000 0.000 NA   NA
 5434040 5434041 swp_1417 swp_1418     FALSE 0.013 153.000 0.000 NA   NA
 5434041 5434042 swp_1418 swp_1419     FALSE 0.032 251.000 0.000 1.000 N NA
 5434042 5434043 swp_1419 swp_1420     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 5434045 5434046 swp_1422 swp_1424     TRUE 0.997 3.000 0.480 0.003 Y NA
 5434048 5434049 swp_1425 swp_1426     TRUE 0.923 -37.000 0.273 0.052 Y NA
 5434049 5434050 swp_1426 swp_1427     TRUE 0.804 35.000 0.064 0.060 N NA
 5434050 5434051 swp_1427 swp_1428     FALSE 0.284 119.000 0.000 1.000 N NA
 5434053 5434054 swp_1430 swp_1431     TRUE 0.859 -3.000 0.086 NA   NA
 5434059 5434060 swp_1436 swp_1437     FALSE 0.491 67.000 0.056 NA   NA
 5434060 5434061 swp_1437 swp_1438     FALSE 0.002 230.000 0.000 NA   NA
 5434061 5434062 swp_1438 swp_1439     TRUE 0.865 -40.000 0.667 NA   NA
 5434062 5434063 swp_1439 swp_1440     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5434064 5434065 swp_1441 swp_1442     FALSE 0.078 183.000 0.022 NA   NA
 5434065 5434066 swp_1442 swp_1443     TRUE 0.761 120.000 0.250 NA   NA
 5434066 5434067 swp_1443 swp_1444     TRUE 0.989 2.000 0.333 0.011   NA
 5434068 5434069 swp_1445 swp_1446     FALSE 0.395 97.000 0.045 NA   NA
 5434070 5434071 swp_1447 swp_1448     FALSE 0.095 -43.000 0.014 NA   NA
 5434071 5434072 swp_1448 swp_1449     FALSE 0.616 60.000 0.067 1.000   NA
 5434072 5434073 swp_1449 swp_1450     TRUE 0.956 0.000 0.153 1.000   NA
 5434073 5434074 swp_1450 swp_1451     TRUE 0.889 23.000 0.233 1.000   NA
 5434074 5434075 swp_1451 swp_1452     TRUE 0.843 81.000 0.207 1.000 N NA
 5434075 5434076 swp_1452 swp_1453     TRUE 0.934 15.000 0.259 1.000   NA
 5434076 5434077 swp_1453 swp_1454     TRUE 0.976 12.000 0.492 1.000   NA
 5434077 5434078 swp_1454 swp_1455     TRUE 0.800 87.000 0.203 1.000   NA
 5434081 5434082 swp_1458 swp_1459     TRUE 0.986 9.000 0.740 NA   NA
 5434082 5434083 swp_1459 swp_1460     FALSE 0.077 14.000 0.000 NA   NA
 5434083 5434084 swp_1460 swp_1461     FALSE 0.102 12.000 0.000 NA   NA
 5434084 5434085 swp_1461 swp_1462     FALSE 0.003 407.000 0.000 NA N NA
 5434086 5434087 swp_1463 swp_1464     TRUE 0.930 123.000 0.190 0.001 Y NA
 5434087 5434088 swp_1464 swp_1465     TRUE 0.715 117.000 0.019 1.000 Y NA
 5434090 5434091 swp_1467 swp_1468     FALSE 0.000 555.000 0.000 NA   NA
 5434091 5434092 swp_1468 swp_1469     FALSE 0.000 530.000 0.000 NA   NA
 5434092 5434093 swp_1469 swp_1470     TRUE 0.991 16.000 0.750 0.051 Y NA
 5434093 5434094 swp_1470 swp_1471     TRUE 0.871 16.000 0.184 NA   NA
 5434094 5434095 swp_1471 swp_1472     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 5434096 5434097 swp_1473 swp_1474     FALSE 0.070 259.000 0.054 NA N NA
 5434097 5434098 swp_1474 swp_1475     TRUE 0.930 102.000 0.723 NA N NA
 5434099 5434100 swp_1476 swp_1477     TRUE 0.706 109.000 0.139 1.000   NA
 5434101 5434102 swp_1478 swp_1479     TRUE 0.785 -16.000 0.200 NA   NA
 5434105 5434106 swp_1482 swp_1483     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 5434106 5434107 swp_1483 swp_1485     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434107 5434108 swp_1485 swp_1486     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434110 5434111 swp_1487 swp_1488     FALSE 0.000 551.000 0.000 NA   NA
 5434111 5434112 swp_1488 swp_1489     FALSE 0.071 228.000 0.000 0.041   NA
 5434114 5434115 swp_1491 swp_1492     TRUE 0.910 1.000 0.078 NA   NA
 5434116 5434117 swp_1493 swp_1494     TRUE 0.930 46.000 0.361 0.004   NA
 5434117 5434118 swp_1494 swp_1495     TRUE 0.870 62.000 0.371 NA   NA
 5434119 5434120 swp_1496 swp_1497     TRUE 0.958 142.000 0.838 1.000 Y NA
 5434120 5434121 swp_1497 swp_1498     TRUE 0.836 176.000 0.309 1.000 Y NA
 5434121 5434122 swp_1498 swp_1499     TRUE 0.998 3.000 0.889 0.006 Y NA
 5434122 5434123 swp_1499 swp_1500     TRUE 0.969 25.000 0.478 NA Y NA
 5434123 5434124 swp_1500 swp_1501     TRUE 0.974 76.000 0.875 NA Y NA
 5434124 5434125 swp_1501 swp_1502     TRUE 0.898 193.000 0.594 0.006 Y NA
 5434125 5434126 swp_1502 swp_1503     TRUE 0.994 11.000 0.446 0.001 Y NA
 5434126 5434127 swp_1503 swp_1504     TRUE 0.986 73.000 0.909 0.009 Y NA
 5434127 5434128 swp_1504 swp_1505     TRUE 0.966 109.000 0.457 0.012 Y NA
 5434128 5434129 swp_1505 swp_1506     TRUE 0.976 30.000 0.405 0.012 Y NA
 5434129 5434130 swp_1506 swp_1507     TRUE 0.983 44.000 0.705 0.003 Y NA
 5434130 5434131 swp_1507 swp_1508     TRUE 0.953 34.000 0.182 0.002 Y NA
 5434131 5434132 swp_1508 swp_1509     FALSE 0.014 149.000 0.000 NA   NA
 5434132 5434133 swp_1509 swp_1510     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5434133 5434134 swp_1510 swp_1511     FALSE 0.031 589.000 0.000 0.001 Y NA
 5434134 5434135 swp_1511 swp_1512     FALSE 0.097 265.000 0.007 NA Y NA
 5434135 5434136 swp_1512 swp_1513     TRUE 0.843 98.000 0.117 NA Y NA
 5434136 5434137 swp_1513 swp_1514     FALSE 0.425 208.000 0.306 NA   NA
 5434137 5434138 swp_1514 swp_1515     TRUE 0.977 7.000 0.400 NA   NA
 5434138 5434139 swp_1515 swp_1516     FALSE 0.039 288.000 0.022 1.000 N NA
 5434139 5434140 swp_1516 swp_tRNA5     FALSE 0.000 408.000 0.000 NA   NA
 5434140 5434141 swp_tRNA5 swp_1517     FALSE 0.014 -48.000 0.000 NA   NA
 5434141 5434142 swp_1517 swp_tRNA6     FALSE 0.011 -208.000 0.000 NA   NA
 5434142 5434143 swp_tRNA6 swp_1518     FALSE 0.000 875.000 0.000 NA   NA
 5434143 5434144 swp_1518 swp_1519     FALSE 0.248 308.000 0.446 1.000 N NA
 5434144 5434145 swp_1519 swp_1520     TRUE 0.976 137.000 0.910 0.009 Y NA
 5434145 5434146 swp_1520 swp_1521     TRUE 0.949 -16.000 0.189 0.009 Y NA
 5434146 5434147 swp_1521 swp_1522     TRUE 0.995 0.000 0.320 0.006 Y NA
 5434147 5434148 swp_1522 swp_1523     TRUE 0.900 -31.000 0.248 1.000 Y NA
 5434148 5434149 swp_1523 swp_1524     TRUE 0.910 31.000 0.127 1.000 Y NA
 5434149 5434150 swp_1524 swp_1525     TRUE 0.818 159.000 0.317 0.009   NA
 5434150 5434151 swp_1525 swp_1526     TRUE 0.772 94.000 0.182 1.000   NA
 5434151 5434152 swp_1526 swp_1527     TRUE 0.957 56.000 0.241 0.002 Y NA
 5434152 5434153 swp_1527 swp_1529     TRUE 0.995 13.000 0.741 0.002 Y NA
 5434153 5434154 swp_1529 swp_1530     TRUE 0.989 12.000 0.443 1.000 Y NA
 5434154 5434155 swp_1530 swp_1531     TRUE 0.971 -3.000 0.122 1.000 Y NA
 5434155 5434156 swp_1531 swp_1532     TRUE 0.997 8.000 0.702 0.016 Y NA
 5434156 5434157 swp_1532 swp_1533     TRUE 0.983 68.000 0.719 0.004 Y NA
 5434157 5434158 swp_1533 swp_1534     TRUE 0.930 58.000 0.240 1.000 Y NA
 5434158 5434159 swp_1534 swp_1535     FALSE 0.526 250.000 0.205 0.016 Y NA
 5434159 5434160 swp_1535 swp_1536     TRUE 0.915 42.000 0.178 1.000 Y NA
 5434160 5434161 swp_1536 swp_1537     TRUE 0.929 -13.000 0.241 0.014 N NA
 5434161 5434162 swp_1537 swp_1538     TRUE 0.966 -7.000 0.482 1.000 N NA
 5434162 5434163 swp_1538 swp_1539     TRUE 0.850 54.000 0.145 0.082 N NA
 5434163 5434164 swp_1539 swp_1540     TRUE 0.978 14.000 0.284 1.000 Y NA
 5434164 5434165 swp_1540 swp_1541     TRUE 0.982 14.000 0.341 1.000 Y NA
 5434165 5434166 swp_1541 swp_1542     TRUE 0.958 94.000 0.327 0.012 Y NA
 5434166 5434167 swp_1542 swp_1543     TRUE 0.815 -7.000 0.119 NA   NA
 5434167 5434168 swp_1543 swp_1544     FALSE 0.591 64.000 0.085 NA   NA
 5434168 5434169 swp_1544 swp_1545     TRUE 0.928 -16.000 0.454 1.000 N NA
 5434171 5434172 swp_1548 swp_1549     TRUE 0.824 167.000 0.743 NA   NA
 5434173 5434174 swp_1550 swp_1551     TRUE 0.786 84.000 0.224 NA   NA
 5434175 5434176 swp_1552 swp_1553     FALSE 0.156 103.000 0.000 NA N NA
 5434176 5434177 swp_1553 swp_1554     TRUE 0.762 13.000 0.000 0.023   NA
 5434179 5434180 swp_1556 swp_1557     FALSE 0.002 768.000 0.000 1.000 N NA
 5434180 5434181 swp_1557 swp_1558     FALSE 0.377 264.000 0.219 1.000 Y NA
 5434181 5434182 swp_1558 swp_1559     FALSE 0.186 225.000 0.015 NA Y NA
 5434182 5434183 swp_1559 swp_1560     FALSE 0.634 2.000 0.000 NA N NA
 5434183 5434184 swp_1560 swp_1561     FALSE 0.355 -10.000 0.023 NA   NA
 5434184 5434185 swp_1561 swp_1562     FALSE 0.653 39.000 0.105 NA   NA
 5434185 5434186 swp_1562 swp_1563     TRUE 0.955 13.000 0.229 1.000 N NA
 5434186 5434187 swp_1563 swp_1564     TRUE 0.834 35.000 0.091 0.060 N NA
 5434187 5434188 swp_1564 swp_1565     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434188 5434189 swp_1565 swp_1566     FALSE 0.003 223.000 0.000 NA   NA
 5434189 5434190 swp_1566 swp_1567     FALSE 0.185 2.000 0.000 NA   NA
 5434190 5434191 swp_1567 swp_1568     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5434191 5434192 swp_1568 swp_1569     FALSE 0.175 4.000 0.000 NA   NA
 5434192 5434193 swp_1569 swp_1570     FALSE 0.166 5.000 0.000 NA   NA
 5434195 5434196 swp_1572 swp_1573     TRUE 0.934 51.000 0.556 1.000 N NA
 5434196 5434197 swp_1573 swp_1574     TRUE 0.933 115.000 0.700 1.000 N NA
 5434197 5434198 swp_1574 swp_1575     FALSE 0.044 349.000 0.000 1.000 Y NA
 5434198 5434199 swp_1575 swp_1576     TRUE 0.925 47.000 0.212 1.000 Y NA
 5434199 5434200 swp_1576 swp_1577     FALSE 0.149 7.000 0.000 NA   NA
 5434200 5434201 swp_1577 swp_1578     FALSE 0.026 84.000 0.000 NA   NA
 5434201 5434202 swp_1578 swp_1579     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434202 5434203 swp_1579 swp_1580     FALSE 0.000 498.000 0.000 NA   NA
 5434203 5434204 swp_1580 swp_1582     FALSE 0.023 109.000 0.000 NA   NA
 5434204 5434205 swp_1582 swp_1584     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434207 5434208 swp_1585 swp_1586     TRUE 0.948 0.000 0.022 NA Y NA
 5434208 5434209 swp_1586 swp_1588     FALSE 0.352 64.000 0.000 1.000 N NA
 5434209 5434210 swp_1588 swp_1589     FALSE 0.498 181.000 0.043 0.002 N NA
 5434210 5434211 swp_1589 swp_1591     TRUE 0.895 50.000 0.143 1.000 Y NA
 5434213 5434214 swp_1592 swp_1593     TRUE 0.841 11.000 0.070 NA   NA
 5434216 5434217 swp_1595 swp_1596     FALSE 0.000 374.000 0.000 NA   NA
 5434218 5434219 swp_tRNA87 swp_tRNA86     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5434219 5434220 swp_tRNA86 swp_tRNA85     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5434220 5434221 swp_tRNA85 swp_tRNA84     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5434221 5434222 swp_tRNA84 swp_tRNA83     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5434223 5434224 swp_1597 swp_1598     FALSE 8.53129621025371e-05 1233.000 0.000 NA   NA
 5434224 5434225 swp_1598 swp_1599     FALSE 0.013 323.000 0.000 1.000 N NA
 5434226 5434227 swp_1600 swp_tRNA82     FALSE 0.012 -93.000 0.000 NA   NA
 5434227 5434228 swp_tRNA82 swp_tRNA81     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5434228 5434229 swp_tRNA81 swp_tRNA80     FALSE 0.035 31.000 0.000 NA   NA
 5434231 5434232 swp_1602 swp_1604     TRUE 0.991 0.000 0.167 0.001 Y NA
 5434232 5434233 swp_1604 swp_1605     TRUE 0.911 96.000 0.208 1.000 Y NA
 5434233 5434234 swp_1605 swp_1606     TRUE 0.984 10.000 0.130 0.012 Y NA
 5434234 5434235 swp_1606 swp_1607     FALSE 0.001 310.000 0.000 NA   NA
 5434237 5434238 swp_1609 swp_1610     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 5434238 5434239 swp_1610 swp_1611     TRUE 0.875 -45.000 0.750 NA   NA
 5434239 5434240 swp_1611 swp_1612     TRUE 0.976 26.000 0.688 NA Y NA
 5434240 5434241 swp_1612 swp_1613     TRUE 0.907 26.000 0.250 1.000 N NA
 5434241 5434242 swp_1613 swp_1614     FALSE 0.038 364.000 0.000 1.000 Y NA
 5434242 5434243 swp_1614 swp_1615     TRUE 0.969 32.000 0.500 1.000 Y NA
 5434244 5434245 swp_1616 swp_1617     FALSE 0.599 0.000 0.000 NA N NA
 5434245 5434246 swp_1617 swp_1618     FALSE 0.332 212.000 0.000 0.022 Y NA
 5434246 5434247 swp_1618 swp_1620     TRUE 0.779 94.000 0.147 1.000 N NA
 5434250 5434251 swp_1622 swp_1623     FALSE 0.003 223.000 0.000 NA   NA
 5434251 5434252 swp_1623 swp_1625     TRUE 0.901 66.000 0.500 NA   NA
 5434252 5434253 swp_1625 swp_1626     TRUE 0.907 106.000 0.667 NA   NA
 5434253 5434254 swp_1626 swp_1627     TRUE 0.957 32.000 1.000 NA   NA
 5434254 5434255 swp_1627 swp_1628     TRUE 0.940 45.000 0.833 NA   NA
 5434255 5434256 swp_1628 swp_1630     TRUE 0.941 38.000 0.800 NA   NA
 5434256 5434257 swp_1630 swp_1631     FALSE 0.001 282.000 0.000 NA   NA
 5434257 5434258 swp_1631 swp_1632     FALSE 0.001 1448.000 0.000 1.000 N NA
 5434258 5434259 swp_1632 swp_1633     FALSE 0.311 104.000 0.000 1.000 N NA
 5434259 5434260 swp_1633 swp_1634     TRUE 0.849 120.000 0.120 1.000 Y NA
 5434261 5434262 swp_1635 swp_1636     FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 5434262 5434263 swp_1636 swp_1637     TRUE 0.704 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5434263 5434264 swp_1637 swp_1638     TRUE 0.954 75.000 0.231 0.003 Y NA
 5434264 5434265 swp_1638 swp_1639     FALSE 0.356 46.000 0.000 1.000 N NA
 5434265 5434266 swp_1639 swp_1640     FALSE 0.641 91.000 0.056 1.000 N NA
 5434266 5434267 swp_1640 swp_1641     FALSE 0.504 56.000 0.060 NA   NA
 5434270 5434271 swp_1644 swp_1645     FALSE 0.289 166.000 0.067 NA   NA
 5434271 5434272 swp_1645 swp_1647     FALSE 0.600 58.000 0.062 1.000   NA
 5434272 5434273 swp_1647 swp_1649     TRUE 0.895 47.000 0.136 1.000 Y NA
 5434274 5434275 swp_1650 swp_1651     TRUE 0.827 98.000 0.203 1.000 N NA
 5434275 5434276 swp_1651 swp_1652     FALSE 0.015 365.000 0.012 1.000 N NA
 5434276 5434277 swp_1652 swp_1653     FALSE 0.031 253.000 0.000 1.000 N NA
 5434277 5434278 swp_1653 swp_1654     TRUE 0.921 90.000 0.495 1.000 N NA
 5434281 5434282 swp_1658 swp_1659     FALSE 0.033 33.000 0.000 NA   NA
 5434282 5434283 swp_1659 swp_1660     FALSE 0.000 616.000 0.000 NA   NA
 5434286 5434287 swp_1663 swp_1664     TRUE 0.932 -42.000 0.275 0.001 Y NA
 5434287 5434288 swp_1664 swp_1665     TRUE 0.875 130.000 0.186 1.000 Y NA
 5434288 5434289 swp_1665 swp_1666     TRUE 0.801 54.000 0.153 1.000 N NA
 5434289 5434290 swp_1666 swp_1667     TRUE 0.932 28.000 0.375 1.000 N NA
 5434290 5434291 swp_1667 swp_1668     TRUE 0.805 79.000 0.158 1.000 N NA
 5434291 5434292 swp_1668 swp_1669     FALSE 0.293 190.000 0.053 1.000 N NA
 5434295 5434296 swp_1672 swp_1673     FALSE 0.045 225.000 0.032 NA   NA
 5434297 5434298 swp_1675 swp_1676     FALSE 0.065 140.000 0.008 NA   NA
 5434298 5434299 swp_1676 swp_1677     TRUE 0.897 182.000 0.360 0.001 Y NA
 5434299 5434300 swp_1677 swp_1678     TRUE 0.900 31.000 0.325 NA N NA
 5434300 5434301 swp_1678 swp_1679     TRUE 0.750 36.000 0.021 NA Y NA
 5434301 5434302 swp_1679 swp_1680     TRUE 0.975 13.000 0.090 0.001 Y NA
 5434304 5434305 swp_1681 swp_1683     TRUE 0.923 0.000 0.105 NA   NA
 5434305 5434306 swp_1683 swp_1684     TRUE 0.776 46.000 0.158 NA N NA
 5434306 5434307 swp_1684 swp_1685     FALSE 0.541 119.000 0.066 1.000   NA
 5434310 5434311 swp_1689 swp_tRNA79     FALSE 0.000 360.000 0.000 NA   NA
 5434311 5434312 swp_tRNA79 swp_1690     FALSE 0.038 -12.000 0.000 NA   NA
 5434312 5434313 swp_1690 swp_tRNA78     FALSE 0.010 -437.000 0.000 NA   NA
 5434313 5434314 swp_tRNA78 swp_tRNA77     FALSE 0.029 45.000 0.000 NA   NA
 5434314 5434315 swp_tRNA77 swp_tRNA76     FALSE 0.029 45.000 0.000 NA   NA
 5434315 5434316 swp_tRNA76 swp_tRNA75     FALSE 0.028 50.000 0.000 NA   NA
 5434316 5434317 swp_tRNA75 swp_tRNA74     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 5434317 5434318 swp_tRNA74 swp_tRNA73     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5434319 5434320 swp_1691 swp_1692     TRUE 0.925 16.000 0.208 1.000 N NA
 5434320 5434321 swp_1692 swp_1693     FALSE 0.561 197.000 0.271 1.000 N NA
 5434321 5434322 swp_1693 swp_1694     TRUE 0.913 85.000 0.424 1.000 N NA
 5434322 5434323 swp_1694 swp_1695     TRUE 0.926 41.000 0.448 1.000 N NA
 5434323 5434324 swp_1695 swp_1697     TRUE 0.971 15.000 0.359 0.002   NA
 5434324 5434325 swp_1697 swp_1698     TRUE 0.955 18.000 0.500 1.000   NA
 5434325 5434326 swp_1698 swp_1699     TRUE 0.969 73.000 0.634 1.000 Y NA
 5434326 5434327 swp_1699 swp_1700     TRUE 0.991 9.000 0.794 1.000 N NA
 5434329 5434330 swp_1702 swp_1703     FALSE 0.028 199.000 0.012 NA   NA
 5434330 5434331 swp_1703 swp_1704     FALSE 0.008 216.000 0.002 NA   NA
 5434331 5434332 swp_1704 swp_1705     FALSE 0.001 1487.000 0.000 1.000 N NA
 5434333 5434334 swp_1706 swp_1707     FALSE 0.281 89.000 0.008 1.000   NA
 5434335 5434336 swp_1708 swp_1709     TRUE 0.839 121.000 0.406 NA   NA
 5434336 5434337 swp_1709 swp_1710     TRUE 0.991 0.000 0.914 NA   NA
 5434337 5434338 swp_1710 swp_1711     TRUE 0.719 63.000 0.157 NA   NA
 5434338 5434339 swp_1711 swp_1713     TRUE 0.761 72.000 0.189 NA   NA
 5434341 5434342 swp_1714 swp_1715     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5434342 5434343 swp_1715 swp_1716     FALSE 0.554 152.000 0.088 1.000 N NA
 5434343 5434344 swp_1716 swp_1717     TRUE 0.862 101.000 0.411 NA   NA
 5434345 5434346 swp_1718 swp_1719     TRUE 0.833 101.000 0.273 1.000   NA
 5434346 5434347 swp_1719 swp_1720     TRUE 0.986 72.000 1.000 0.026 Y NA
 5434348 5434349 swp_1721 swp_1722     TRUE 0.801 82.000 0.200 1.000   NA
 5434349 5434350 swp_1722 swp_1723     TRUE 0.970 20.000 1.000 NA   NA
 5434350 5434351 swp_1723 swp_1725     TRUE 0.991 2.000 0.750 NA   NA
 5434351 5434352 swp_1725 swp_1726     TRUE 0.974 -6.000 0.750 NA   NA
 5434352 5434353 swp_1726 swp_1728     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5434355 5434356 swp_1729 swp_1730     FALSE 0.015 142.000 0.000 NA   NA
 5434356 5434357 swp_1730 swp_1731     FALSE 0.001 288.000 0.000 NA   NA
 5434357 5434358 swp_1731 swp_1732     FALSE 0.293 172.000 0.028 1.000 N NA
 5434358 5434359 swp_1732 swp_1734     FALSE 0.666 134.000 0.017 1.000 Y NA
 5434359 5434360 swp_1734 swp_1735     FALSE 0.253 189.000 0.038 1.000 N NA
 5434360 5434361 swp_1735 swp_1736     FALSE 0.057 350.000 0.113 1.000 N NA
 5434361 5434362 swp_1736 swp_1737     FALSE 0.106 253.000 0.056 1.000 N NA
 5434362 5434363 swp_1737 swp_1738     FALSE 0.626 47.000 0.069 1.000   NA
 5434373 5434374 swp_1749 swp_1750     FALSE 0.005 458.000 0.000 1.000 N NA
 5434374 5434375 swp_1750 swp_1751     FALSE 0.008 178.000 0.000 NA   NA
 5434375 5434376 swp_1751 swp_1753     FALSE 0.026 186.000 0.007 NA   NA
 5434377 5434378 swp_1754 swp_1755     FALSE 0.607 30.000 0.071 NA   NA
 5434378 5434379 swp_1755 swp_1756     FALSE 0.372 87.000 0.039 NA   NA
 5434380 5434381 swp_1757 swp_1758     FALSE 0.156 6.000 0.000 NA   NA
 5434381 5434382 swp_1758 swp_1759     FALSE 0.026 83.000 0.000 NA   NA
 5434382 5434383 swp_1759 swp_1760     TRUE 0.813 -34.000 0.175 0.046 N NA
 5434383 5434384 swp_1760 swp_1761     FALSE 0.024 -22.000 0.000 NA   NA
 5434384 5434385 swp_1761 swp_1762     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5434387 5434388 swp_1764 swp_1765     FALSE 0.003 214.000 0.000 NA   NA
 5434388 5434389 swp_1765 swp_1766     FALSE 0.028 74.000 0.000 NA   NA
 5434389 5434390 swp_1766 swp_1767     FALSE 0.134 99.000 0.000 1.000   NA
 5434392 5434393 swp_1770 swp_1771     FALSE 0.016 140.000 0.000 NA   NA
 5434393 5434394 swp_1771 swp_1772     FALSE 0.029 199.000 0.000 1.000   NA
 5434395 5434396 swp_1773 swp_1775     TRUE 0.737 82.000 0.179 NA   NA
 5434397 5434398 swp_1776 swp_1777     FALSE 0.008 178.000 0.000 NA   NA
 5434398 5434399 swp_1777 swp_1778     FALSE 0.507 102.000 0.048 1.000   NA
 5434399 5434400 swp_1778 swp_tRNA7     FALSE 0.009 -634.000 0.000 NA   NA
 5434400 5434401 swp_tRNA7 swp_tRNA8     FALSE 0.125 10.000 0.000 NA   NA
 5434401 5434402 swp_tRNA8 swp_tRNA9     FALSE 0.026 83.000 0.000 NA   NA
 5434404 5434405 swp_1781 swp_1782     FALSE 0.271 120.000 0.032 NA   NA
 5434405 5434406 swp_1782 swp_1783     TRUE 0.982 0.000 0.302 1.000 N NA
 5434406 5434407 swp_1783 swp_1784     TRUE 0.978 -3.000 0.465 NA N NA
 5434407 5434408 swp_1784 swp_tRNA10     FALSE 0.009 -1502.000 0.000 NA   NA
 5434412 5434413 swp_1788 swp_1789     FALSE 0.013 153.000 0.000 NA   NA
 5434413 5434414 swp_1789 swp_1790     TRUE 0.941 33.000 0.744 NA   NA
 5434414 5434415 swp_1790 swp_1791     TRUE 0.957 -10.000 0.769 NA   NA
 5434415 5434416 swp_1791 swp_1792     TRUE 0.943 51.000 0.774 1.000   NA
 5434416 5434417 swp_1792 swp_1793     FALSE 0.031 37.000 0.000 NA   NA
 5434417 5434418 swp_1793 swp_1794     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5434418 5434419 swp_1794 swp_1795     FALSE 0.000 640.000 0.000 NA   NA
 5434419 5434420 swp_1795 swp_1796     FALSE 0.073 -46.000 0.011 NA   NA
 5434420 5434421 swp_1796 swp_1797     FALSE 0.548 3.000 0.011 NA   NA
 5434421 5434422 swp_1797 swp_1798     TRUE 0.892 13.000 0.150 NA   NA
 5434423 5434424 swp_1799 swp_1800     FALSE 0.149 79.000 0.000 1.000   NA
 5434429 5434430 swp_1806 swp_1807     FALSE 0.018 130.000 0.000 NA   NA
 5434430 5434431 swp_1807 swp_1808     FALSE 0.661 36.000 0.104 NA   NA
 5434432 5434433 swp_1809 swp_1810     FALSE 0.003 374.000 0.000 1.000   NA
 5434433 5434434 swp_1810 swp_1811     FALSE 0.000 423.000 0.000 NA   NA
 5434434 5434435 swp_1811 swp_1812     FALSE 0.001 334.000 0.000 NA   NA
 5434435 5434436 swp_1812 swp_1813     TRUE 0.861 79.000 0.087 1.000 Y NA
 5434437 5434438 swp_1814 swp_1815     TRUE 0.989 -3.000 0.263 0.026 Y NA
 5434439 5434440 swp_1816 swp_1817     FALSE 0.001 1265.000 0.000 1.000   NA
 5434440 5434441 swp_1817 swp_1818     TRUE 0.993 0.000 0.230 0.001 Y NA
 5434444 5434445 swp_1821 swp_1822     FALSE 0.000 806.000 0.000 NA   NA
 5434447 5434448 swp_1824 swp_1825     FALSE 0.003 635.000 0.000 1.000 N NA
 5434450 5434451 swp_1827 swp_1828     TRUE 0.952 -10.000 0.593 1.000   NA
 5434451 5434452 swp_1828 swp_1829     TRUE 0.996 0.000 0.556 0.046 Y NA
 5434452 5434453 swp_1829 swp_1830     TRUE 0.964 0.000 0.183 NA N NA
 5434453 5434454 swp_1830 swp_1831     TRUE 0.913 10.000 0.089 NA N NA
 5434454 5434455 swp_1831 swp_1832     TRUE 0.959 24.000 0.592 1.000 N NA
 5434455 5434456 swp_1832 swp_1833     TRUE 0.904 23.000 0.278 1.000   NA
 5434456 5434457 swp_1833 swp_1834     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5434457 5434458 swp_1834 swp_1835     FALSE 7.48444236493404e-05 1949.000 0.000 NA   NA
 5434459 5434460 swp_1836 swp_1838     FALSE 0.208 225.000 0.092 1.000 N NA
 5434460 5434461 swp_1838 swp_1840     TRUE 0.709 46.000 0.000 1.000 Y NA
 5434463 5434464 swp_1842 swp_tRNA72     FALSE 0.009 -951.000 0.000 NA   NA
 5434468 5434469 swp_1846 swp_1847     FALSE 0.071 219.000 0.022 NA N NA
 5434471 5434472 swp_1849 swp_1850     FALSE 0.041 366.000 0.165 NA   NA
 5434473 5434474 swp_1851 swp_1852     FALSE 0.517 141.000 0.055 1.000 N NA
 5434474 5434475 swp_1852 swp_1853     FALSE 0.566 81.000 0.080 NA   NA
 5434475 5434476 swp_1853 swp_1854     FALSE 0.328 156.000 0.068 NA   NA
 5434476 5434477 swp_1854 swp_1855     FALSE 0.526 39.000 0.059 NA   NA
 5434478 5434479 swp_1856 swp_1857     FALSE 0.343 156.000 0.074 NA   NA
 5434480 5434481 swp_1858 swp_1859     FALSE 0.001 265.000 0.000 NA   NA
 5434482 5434483 swp_1860 swp_1861     FALSE 0.122 93.000 0.011 NA   NA
 5434483 5434484 swp_1861 swp_1862     FALSE 0.670 30.000 0.093 NA   NA
 5434484 5434485 swp_1862 swp_1863     TRUE 0.956 4.000 0.180 NA   NA
 5434485 5434486 swp_1863 swp_1865     FALSE 0.450 193.000 0.158 1.000 N NA
 5434489 5434490 swp_1867 swp_1868     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5434492 5434493 swp_1870 swp_1871     TRUE 0.922 37.000 0.596 NA   NA
 5434494 5434495 swp_1872 swp_1873     FALSE 0.663 114.000 0.078 1.000 N NA
 5434495 5434496 swp_1873 swp_1874     TRUE 0.956 107.000 0.285 0.001 Y NA
 5434498 5434499 swp_1877 swp_1878     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5434503 5434504 swp_1883 swp_1884     FALSE 0.000 383.000 0.000 NA   NA
 5434506 5434507 swp_1886 swp_1887     TRUE 0.933 -19.000 0.330 NA Y NA
 5434508 5434509 swp_1888 swp_1889     FALSE 0.001 304.000 0.000 NA   NA
 5434509 5434510 swp_1889 swp_1890     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5434511 5434512 swp_1891 swp_1892     FALSE 0.020 122.000 0.000 NA   NA
 5434513 5434514 swp_1893 swp_1894     FALSE 0.000 635.000 0.000 NA   NA
 5434514 5434515 swp_1894 swp_1896     TRUE 0.690 104.000 0.164 NA   NA
 5434517 5434518 swp_1898 swp_1899     TRUE 0.981 -3.000 0.571 1.000   NA
 5434518 5434519 swp_1899 swp_1900     TRUE 0.984 10.000 0.700 NA   NA
 5434520 5434521 swp_1901 swp_1902     TRUE 0.685 17.000 0.062 NA   NA
 5434521 5434522 swp_1902 swp_1903     TRUE 0.964 0.000 0.224 NA   NA
 5434522 5434523 swp_1903 swp_1904     FALSE 0.012 155.000 0.000 NA   NA
 5434523 5434524 swp_1904 swp_1905     FALSE 0.000 372.000 0.000 NA   NA
 5434525 5434526 swp_1906 swp_1907     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5434528 5434529 swp_1909 swp_1910     FALSE 0.516 73.000 0.000 0.009   NA
 5434529 5434530 swp_1910 swp_1911     FALSE 0.005 641.000 0.000 0.009   NA
 5434533 5434534 swp_1914 swp_1915     FALSE 0.029 43.000 0.000 NA   NA
 5434536 5434537 swp_1918 swp_1919     TRUE 0.994 -7.000 0.947 0.001 Y NA
 5434537 5434538 swp_1919 swp_1920     TRUE 0.947 106.000 0.221 0.001 Y NA
 5434538 5434539 swp_1920 swp_1921     TRUE 0.940 53.000 0.293 1.000 Y NA
 5434539 5434540 swp_1921 swp_1922     TRUE 0.979 -3.000 0.083 0.001 Y NA
 5434540 5434541 swp_1922 swp_1923     TRUE 0.996 -3.000 0.703 0.001 Y NA
 5434544 5434545 swp_1926 swp_1927     FALSE 0.383 84.000 0.040 NA   NA
 5434545 5434546 swp_1927 swp_1928     TRUE 0.827 13.000 0.083 NA   NA
 5434546 5434547 swp_1928 swp_1929     TRUE 0.912 -7.000 0.210 NA N NA
 5434551 5434552 swp_1934 swp_1935     FALSE 0.467 135.000 0.036 1.000 N NA
 5434553 5434554 swp_1936 swp_1937     TRUE 0.933 103.000 0.900 NA   NA
 5434555 5434556 swp_tRNA11 swp_tRNA12     FALSE 0.023 106.000 0.000 NA   NA
 5434557 5434558 swp_1938 swp_1939     FALSE 0.000 358.000 0.000 NA   NA
 5434558 5434559 swp_1939 swp_1940     FALSE 0.148 114.000 0.016 NA   NA
 5434560 5434561 swp_1941 swp_1942     TRUE 0.977 -9.000 0.535 NA Y NA
 5434563 5434564 swp_1944 swp_1945     TRUE 0.968 6.000 0.262 NA   NA
 5434565 5434566 swp_1946 swp_1947     FALSE 9.10374569595507e-05 1053.000 0.000 NA   NA
 5434566 5434567 swp_1947 swp_1948     FALSE 0.000 466.000 0.000 NA   NA
 5434567 5434568 swp_1948 swp_1949     TRUE 0.754 99.000 0.171 1.000   NA
 5434570 5434571 swp_1951 swp_1952     TRUE 0.743 67.000 0.092 1.000 N NA
 5434571 5434572 swp_1952 swp_1953     FALSE 0.009 552.000 0.080 NA   NA
 5434576 5434577 swp_1957 swp_1958     FALSE 0.016 561.000 0.000 1.000 Y NA
 5434577 5434578 swp_1958 swp_1959     FALSE 0.640 119.000 0.111 1.000   NA
 5434581 5434582 swp_1962 swp_1963     FALSE 0.405 177.000 0.136 NA   NA
 5434583 5434584 swp_1964 swp_1965     FALSE 0.155 167.000 0.015 1.000   NA
 5434585 5434586 swp_1966 swp_1967     TRUE 0.865 141.000 0.115 0.010 Y NA
 5434586 5434587 swp_1967 swp_1968     TRUE 0.753 78.000 0.106 1.000 N NA
 5434587 5434588 swp_1968 swp_1969     FALSE 0.031 191.000 0.011 NA   NA
 5434588 5434589 swp_1969 swp_1970     FALSE 0.003 724.000 0.037 NA   NA
 5434589 5434590 swp_1970 swp_1971     FALSE 0.017 334.000 0.026 NA N NA
 5434590 5434591 swp_1971 swp_1972     FALSE 0.389 16.000 0.020 NA   NA
 5434591 5434592 swp_1972 swp_1973     FALSE 0.001 269.000 0.000 NA   NA
 5434592 5434593 swp_1973 swp_1974     TRUE 0.953 32.000 0.916 NA   NA
 5434593 5434594 swp_1974 swp_1975     FALSE 0.285 151.000 0.031 1.000   NA
 5434594 5434595 swp_1975 swp_1976     TRUE 0.987 6.000 0.447 1.000 N NA
 5434596 5434597 swp_1977 swp_1978     TRUE 0.746 22.000 0.077 1.000   NA
 5434599 5434600 swp_1980 swp_1981     TRUE 0.882 98.000 0.324 1.000 N NA
 5434600 5434601 swp_1981 swp_1982     TRUE 0.909 108.000 0.462 1.000 N NA
 5434601 5434602 swp_1982 swp_1983     TRUE 0.842 42.000 0.186 1.000 N NA
 5434602 5434603 swp_1983 swp_1984     TRUE 0.744 78.000 0.142 1.000   NA
 5434604 5434605 swp_1985 swp_1986     TRUE 0.951 25.000 0.229 1.000 Y NA
 5434607 5434608 swp_1987 swp_1989     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5434608 5434609 swp_1989 swp_rRNA17     FALSE 0.000 767.000 0.000 NA   NA
 5434609 5434610 swp_rRNA17 swp_1990     FALSE 0.010 -597.000 0.000 NA   NA
 5434610 5434611 swp_1990 swp_rRNA18     FALSE 8.2577076166971e-05 1307.000 0.000 NA   NA
 5434611 5434612 swp_rRNA18 swp_rRNA19     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 5434612 5434613 swp_rRNA19 swp_1991     FALSE 7.66557543652881e-05 1567.000 0.000 NA   NA
 5434613 5434614 swp_1991 swp_1992     FALSE 0.321 95.000 0.000 1.000 N NA
 5434614 5434615 swp_1992 swp_1993     TRUE 0.979 2.000 0.211 1.000 N NA
 5434617 5434618 swp_1995 swp_1996     FALSE 0.026 291.000 0.002 1.000 N NA
 5434618 5434619 swp_1996 swp_1997     TRUE 0.881 10.000 0.037 1.000 N NA
 5434619 5434620 swp_1997 swp_1998     TRUE 0.923 127.000 0.681 1.000 N NA
 5434620 5434621 swp_1998 swp_1999     TRUE 0.998 5.000 0.838 0.014 Y NA
 5434621 5434622 swp_1999 swp_2000     FALSE 0.519 271.000 0.302 0.014 Y NA
 5434622 5434623 swp_2000 swp_2002     TRUE 0.985 57.000 0.884 0.011 Y NA
 5434623 5434624 swp_2002 swp_2003     FALSE 0.258 241.000 0.223 1.000   NA
 5434624 5434625 swp_2003 swp_2004     TRUE 0.967 86.000 0.851 0.001   NA
 5434625 5434626 swp_2004 swp_2005     FALSE 0.432 190.000 0.122 1.000 N NA
 5434626 5434627 swp_2005 swp_2006     TRUE 0.979 82.000 0.620 0.002 Y NA
 5434627 5434628 swp_2006 swp_2007     TRUE 0.967 76.000 0.579 1.000 Y NA
 5434628 5434629 swp_2007 swp_2008     TRUE 0.970 86.000 0.400 0.002 Y NA
 5434631 5434632 swp_2010 swp_2011     TRUE 0.895 105.000 0.307 0.014   NA
 5434632 5434633 swp_2011 swp_2012     TRUE 0.986 18.000 0.486 0.011 Y NA
 5434633 5434634 swp_2012 swp_2013     TRUE 0.994 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 5434634 5434635 swp_2013 swp_2014     TRUE 0.992 17.000 0.849 0.014 Y NA
 5434635 5434636 swp_2014 swp_2015     TRUE 0.996 12.000 0.820 0.014 Y NA
 5434636 5434637 swp_2015 swp_2016     TRUE 0.992 16.000 0.769 0.014 Y NA
 5434637 5434638 swp_2016 swp_2017     TRUE 0.996 10.000 0.719 0.014 Y NA
 5434638 5434639 swp_2017 swp_2018     TRUE 0.996 12.000 0.828 0.014 Y NA
 5434639 5434640 swp_2018 swp_2019     TRUE 0.998 0.000 0.802 0.011 Y NA
 5434640 5434641 swp_2019 swp_2020     TRUE 0.998 0.000 0.828 0.011 Y NA
 5434641 5434642 swp_2020 swp_2021     TRUE 0.939 182.000 0.791 0.014 Y NA
 5434642 5434643 swp_2021 swp_2022     TRUE 0.996 12.000 0.810 0.014 Y NA
 5434643 5434644 swp_2022 swp_2023     TRUE 0.995 13.000 0.758 0.011 Y NA
 5434644 5434645 swp_2023 swp_2024     TRUE 0.994 11.000 0.496 0.011 Y NA
 5434645 5434646 swp_2024 swp_2025     TRUE 0.982 25.000 0.473 0.011 Y NA
 5434646 5434647 swp_2025 swp_2026     TRUE 0.996 11.000 0.808 0.011 Y NA
 5434647 5434648 swp_2026 swp_2027     TRUE 0.996 11.000 0.815 0.011 Y NA
 5434648 5434649 swp_2027 swp_2028     TRUE 0.994 14.000 0.814 0.014 Y NA
 5434649 5434650 swp_2028 swp_2029     TRUE 0.997 7.000 0.789 0.014 Y NA
 5434650 5434651 swp_2029 swp_2030     TRUE 0.998 2.000 0.653 0.002 Y NA
 5434651 5434652 swp_2030 swp_2031     TRUE 0.991 8.000 0.730 1.000 N NA
 5434652 5434653 swp_2031 swp_2032     TRUE 0.757 24.000 0.089 1.000   NA
 5434653 5434654 swp_2032 swp_2033     TRUE 0.839 116.000 0.194 0.011   NA
 5434654 5434655 swp_2033 swp_2034     TRUE 0.994 15.000 0.810 0.011 Y NA
 5434655 5434656 swp_2034 swp_2035     TRUE 0.978 37.000 0.509 0.014 Y NA
 5434656 5434657 swp_2035 swp_2036     TRUE 0.955 25.000 0.549 1.000 N NA
 5434657 5434658 swp_2036 swp_2037     TRUE 0.961 40.000 0.873 1.000 N NA
 5434658 5434659 swp_2037 swp_2038     FALSE 0.036 30.000 0.000 NA   NA
 5434660 5434661 swp_2039 swp_2040     TRUE 0.984 0.000 0.344 1.000 N NA
 5434661 5434662 swp_2040 swp_2041     TRUE 0.989 0.000 0.501 1.000 N NA
 5434662 5434663 swp_2041 swp_2042     TRUE 0.984 2.000 0.036 0.001 Y NA
 5434663 5434664 swp_2042 swp_2043     TRUE 0.976 10.000 0.050 0.003 Y NA
 5434667 5434668 swp_2046 swp_2047     TRUE 0.964 16.000 0.108 0.003 Y NA
 5434668 5434669 swp_2047 swp_2048     TRUE 0.966 -3.000 0.127 NA Y NA
 5434669 5434670 swp_2048 swp_2049     TRUE 0.994 -3.000 0.846 NA Y NA
 5434670 5434671 swp_2049 swp_rRNA20     FALSE 0.000 641.000 0.000 NA   NA
 5434671 5434672 swp_rRNA20 swp_2050     FALSE 0.010 -598.000 0.000 NA   NA
 5434672 5434673 swp_2050 swp_rRNA21     FALSE 8.2577076166971e-05 1307.000 0.000 NA   NA
 5434673 5434674 swp_rRNA21 swp_rRNA22     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   NA
 5434674 5434675 swp_rRNA22 swp_2051     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 5434676 5434677 swp_2052 swp_2053     TRUE 0.796 0.000 0.036 NA   NA
 5434677 5434678 swp_2053 swp_2054     FALSE 0.400 168.000 0.053 1.000 N NA
 5434679 5434680 swp_2055 swp_2056     TRUE 0.958 18.000 0.097 0.002 Y NA
 5434680 5434681 swp_2056 swp_2057     TRUE 0.975 12.000 0.171 1.000 Y NA
 5434681 5434682 swp_2057 swp_2058     TRUE 0.777 56.000 0.025 1.000 Y NA
 5434682 5434683 swp_2058 swp_2059     TRUE 0.936 79.000 0.278 1.000 Y NA
 5434685 5434686 swp_2061 swp_2062     TRUE 0.973 -12.000 0.616 NA Y NA
 5434686 5434687 swp_2062 swp_2063     TRUE 0.993 -3.000 0.770 NA Y NA
 5434687 5434688 swp_2063 swp_2064     TRUE 0.992 -3.000 0.680 NA Y NA
 5434688 5434689 swp_2064 swp_2065     TRUE 0.995 6.000 0.668 NA Y NA
 5434689 5434690 swp_2065 swp_2066     FALSE 0.341 252.000 0.319 1.000 N NA
 5434690 5434691 swp_2066 swp_2067     TRUE 0.989 4.000 0.208 1.000 Y NA
 5434691 5434692 swp_2067 swp_2068     FALSE 0.153 149.000 0.003 1.000   NA
 5434692 5434693 swp_2068 swp_2069     FALSE 0.460 53.000 0.032 1.000   NA
 5434694 5434695 swp_2070 swp_2071     TRUE 0.971 9.000 0.346 NA   NA
 5434696 5434697 swp_2072 swp_2073     TRUE 0.950 4.000 0.120 1.000   NA
 5434697 5434698 swp_2073 swp_2074     TRUE 0.768 30.000 0.118 1.000   NA
 5434701 5434702 swp_2078 swp_2079     TRUE 0.914 60.000 0.613 NA   NA
 5434702 5434703 swp_2079 swp_2080     TRUE 0.835 62.000 0.187 1.000 N NA
 5434703 5434704 swp_2080 swp_2081     TRUE 0.713 95.000 0.172 NA   NA
 5434705 5434706 swp_2082 swp_2083     FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   NA
 5434706 5434707 swp_2083 swp_2084     FALSE 0.001 896.000 0.000 1.000   NA
 5434707 5434708 swp_2084 swp_2085     TRUE 0.956 21.000 0.600 1.000   NA
 5434708 5434709 swp_2085 swp_tRNA13     FALSE 0.009 -1202.000 0.000 NA   NA
 5434709 5434710 swp_tRNA13 swp_tRNA14     FALSE 0.045 22.000 0.000 NA   NA
 5434710 5434711 swp_tRNA14 swp_tRNA15     FALSE 0.033 33.000 0.000 NA   NA
 5434711 5434712 swp_tRNA15 swp_tRNA16     FALSE 0.030 39.000 0.000 NA   NA
 5434712 5434713 swp_tRNA16 swp_tRNA17     FALSE 0.035 31.000 0.000 NA   NA
 5434713 5434714 swp_tRNA17 swp_tRNA18     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5434714 5434715 swp_tRNA18 swp_tRNA19     FALSE 0.135 9.000 0.000 NA   NA
 5434715 5434716 swp_tRNA19 swp_2086     FALSE 0.000 509.000 0.000 NA   NA
 5434716 5434717 swp_2086 swp_2088     FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 5434721 5434722 swp_2092 swp_2093     FALSE 0.158 211.000 0.000 0.016 N NA
 5434722 5434723 swp_2093 swp_2094     FALSE 0.138 93.000 0.000 1.000   NA
 5434723 5434724 swp_2094 swp_2095     FALSE 0.042 24.000 0.000 NA   NA
 5434724 5434725 swp_2095 swp_2096     FALSE 0.009 174.000 0.000 NA   NA
 5434725 5434726 swp_2096 swp_2097     FALSE 0.093 326.000 0.211 1.000   NA
 5434726 5434727 swp_2097 swp_2098     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5434727 5434728 swp_2098 swp_2099     FALSE 0.038 -12.000 0.000 NA   NA
 5434728 5434729 swp_2099 swp_2100     TRUE 0.989 -6.000 0.650 1.000 Y NA
 5434729 5434730 swp_2100 swp_2101     TRUE 0.981 0.000 0.118 1.000 Y NA
 5434730 5434731 swp_2101 swp_2102     FALSE 0.028 75.000 0.000 NA   NA
 5434734 5434735 swp_2105 swp_2106     TRUE 0.911 110.000 0.714 NA   NA
 5434735 5434736 swp_2106 swp_2107     FALSE 0.010 169.000 0.000 NA   NA
 5434736 5434737 swp_2107 swp_2108     FALSE 0.352 -54.000 0.068 NA   NA
 5434737 5434738 swp_2108 swp_2109     TRUE 0.777 95.000 0.227 NA   NA
 5434738 5434739 swp_2109 swp_2110     TRUE 0.763 16.000 0.056 NA N NA
 5434740 5434741 swp_2111 swp_2112     FALSE 0.524 60.000 0.043 1.000   NA
 5434741 5434742 swp_2112 swp_2114     TRUE 0.797 -3.000 0.034 1.000   NA
 5434747 5434748 swp_2119 swp_2120     FALSE 0.004 211.000 0.000 NA   NA
 5434751 5434752 swp_2123 swp_2124     FALSE 0.018 337.000 0.000 0.039   NA
 5434756 5434757 swp_2128 swp_2129     FALSE 0.007 242.000 0.006 NA   NA
 5434757 5434758 swp_2129 swp_2131     FALSE 0.197 86.000 0.019 NA   NA
 5434759 5434760 swp_2132 swp_2133     FALSE 0.045 273.000 0.000 0.007   NA
 5434760 5434761 swp_2133 swp_2134     FALSE 0.000 750.000 0.000 NA   NA
 5434761 5434762 swp_2134 swp_2135     FALSE 0.001 297.000 0.000 NA   NA
 5434764 5434765 swp_2137 swp_2138     TRUE 0.816 114.000 0.208 1.000 N NA
 5434765 5434766 swp_2138 swp_2139     TRUE 0.748 143.000 0.208 1.000 N NA
 5434766 5434767 swp_2139 swp_2141     TRUE 0.940 135.000 0.857 0.048   NA
 5434767 5434768 swp_2141 swp_2142     TRUE 0.995 0.000 1.000 0.048   NA
 5434768 5434769 swp_2142 swp_2143     TRUE 0.997 11.000 1.000 0.048 Y NA
 5434769 5434770 swp_2143 swp_2144     FALSE 0.077 204.000 0.000 1.000 N NA
 5434771 5434772 swp_2145 swp_2146     TRUE 0.995 10.000 0.833 1.000 Y NA
 5434772 5434773 swp_2146 swp_2147     FALSE 0.027 77.000 0.000 NA   NA
 5434775 5434776 swp_2148 swp_2150     FALSE 0.318 135.000 0.045 NA   NA
 5434777 5434778 swp_2151 swp_2152     FALSE 0.472 150.000 0.116 NA   NA
 5434778 5434779 swp_2152 swp_2153     TRUE 0.681 110.000 0.163 NA   NA
 5434779 5434780 swp_2153 swp_2154     FALSE 0.010 166.000 0.000 NA   NA
 5434781 5434782 swp_2155 swp_2156     TRUE 0.992 3.000 0.818 NA   NA
 5434782 5434783 swp_2156 swp_2157     TRUE 0.959 3.000 0.182 NA   NA
 5434784 5434785 swp_2158 swp_2159     TRUE 0.746 52.000 0.182 NA   NA
 5434785 5434786 swp_2159 swp_2160     TRUE 0.936 9.000 0.167 NA   NA
 5434786 5434787 swp_2160 swp_2161     FALSE 0.163 100.000 0.016 NA   NA
 5434787 5434788 swp_2161 swp_2162     FALSE 0.148 168.000 0.032 NA   NA
 5434788 5434789 swp_2162 swp_2163     TRUE 0.935 -10.000 0.500 NA   NA
 5434789 5434790 swp_2163 swp_2164     TRUE 0.962 24.000 0.909 NA   NA
 5434790 5434791 swp_2164 swp_2165     TRUE 0.805 161.000 0.588 NA   NA
 5434791 5434792 swp_2165 swp_2166     TRUE 0.951 -13.000 0.824 NA   NA
 5434792 5434793 swp_2166 swp_2167     FALSE 0.133 101.000 0.000 1.000   NA
 5434793 5434794 swp_2167 swp_2168     FALSE 0.473 10.000 0.000 1.000   NA
 5434794 5434795 swp_2168 swp_2169     TRUE 0.855 14.000 0.057 1.000 N NA
 5434795 5434796 swp_2169 swp_2170     TRUE 0.976 13.000 0.143 0.076 Y NA
 5434796 5434797 swp_2170 swp_2171     FALSE 0.001 289.000 0.000 NA   NA
 5434798 5434799 swp_2172 swp_2173     FALSE 0.000 440.000 0.000 NA   NA
 5434799 5434800 swp_2173 swp_2174     FALSE 0.522 67.000 0.062 NA   NA
 5434800 5434801 swp_2174 swp_2175     FALSE 0.312 156.000 0.062 NA   NA
 5434801 5434802 swp_2175 swp_2176     FALSE 0.000 369.000 0.000 NA   NA
 5434806 5434807 swp_2180 swp_2182     FALSE 0.000 456.000 0.000 NA   NA
 5434807 5434808 swp_2182 swp_2183     TRUE 0.986 24.000 0.923 1.000 Y NA
 5434810 5434811 swp_2185 swp_2186     TRUE 0.910 -3.000 0.147 NA   NA
 5434812 5434813 swp_2187 swp_2188     FALSE 0.437 192.000 0.000 0.047 Y NA
 5434814 5434815 swp_2189 swp_2190     FALSE 0.003 214.000 0.000 NA   NA
 5434815 5434816 swp_2190 swp_2191     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 5434816 5434817 swp_2191 swp_2192     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5434817 5434818 swp_2192 swp_2193     FALSE 0.003 353.000 0.000 1.000   NA
 5434819 5434820 swp_2194 swp_2195     FALSE 0.031 202.000 0.014 NA   NA
 5434821 5434822 swp_2196 swp_2197     TRUE 0.706 117.000 0.108 1.000 N NA
 5434823 5434824 swp_2198 swp_2199     FALSE 0.192 220.000 0.067 1.000 N NA
 5434824 5434825 swp_2199 swp_2200     FALSE 0.487 142.000 0.048 1.000 N NA
 5434825 5434826 swp_2200 swp_2201     FALSE 0.647 97.000 0.060 1.000 N NA
 5434826 5434827 swp_2201 swp_2202     TRUE 0.959 -3.000 0.201 1.000 N NA
 5434828 5434829 swp_2203 swp_2204     FALSE 0.369 129.000 0.011 1.000 N NA
 5434829 5434830 swp_2204 swp_2205     TRUE 0.994 7.000 0.332 0.011 Y NA
 5434832 5434833 swp_2207 swp_2208     FALSE 0.290 79.000 0.027 NA   NA
 5434834 5434835 swp_2209 swp_2210     FALSE 0.228 196.000 0.099 NA   NA
 5434837 5434838 swp_2212 swp_tRNA71     FALSE 0.000 510.000 0.000 NA   NA
 5434839 5434840 swp_2213 swp_2214     TRUE 0.925 95.000 0.126 0.001 Y NA
 5434840 5434841 swp_2214 swp_2215     TRUE 0.995 3.000 0.275 0.001 Y NA
 5434841 5434842 swp_2215 swp_2216     TRUE 0.991 12.000 0.309 0.001 Y NA
 5434842 5434843 swp_2216 swp_2217     FALSE 0.004 511.000 0.000 1.000 N NA
 5434843 5434844 swp_2217 swp_2218     FALSE 0.127 222.000 0.086 NA   NA
 5434844 5434845 swp_2218 swp_2219     FALSE 0.457 11.000 0.013 NA   NA
 5434847 5434848 swp_2221 swp_2222     TRUE 0.934 31.000 0.635 NA   NA
 5434848 5434849 swp_2222 swp_2224     TRUE 0.971 9.000 0.227 1.000 N NA
 5434849 5434850 swp_2224 swp_2225     TRUE 0.952 -3.000 0.173 1.000 N NA
 5434850 5434851 swp_2225 swp_2226     TRUE 0.977 0.000 0.083 1.000 Y NA
 5434851 5434852 swp_2226 swp_2227     TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5434852 5434853 swp_2227 swp_2228     TRUE 0.995 0.000 0.309 0.003 Y NA
 5434853 5434854 swp_2228 swp_2229     TRUE 0.981 63.000 0.647 0.003 Y NA
 5434854 5434855 swp_2229 swp_2230     TRUE 0.967 -7.000 0.297 0.003 N NA
 5434855 5434856 swp_2230 swp_2231     TRUE 0.985 12.000 0.647 1.000 N NA
 5434856 5434857 swp_2231 swp_2232     TRUE 0.992 2.000 0.283 1.000 Y NA
 5434857 5434858 swp_2232 swp_2233     TRUE 0.851 106.000 0.134 NA Y NA
 5434858 5434859 swp_2233 swp_2234     TRUE 0.985 4.000 0.389 NA N NA
 5434859 5434860 swp_2234 swp_2235     TRUE 0.967 32.000 0.460 1.000 Y NA
 5434860 5434861 swp_2235 swp_2236     FALSE 0.528 178.000 0.134 1.000 N NA
 5434863 5434864 swp_2238 swp_2239     TRUE 0.704 60.000 0.111 1.000   NA
 5434864 5434865 swp_2239 swp_rRNA23     FALSE 0.000 841.000 0.000 NA   NA
 5434865 5434866 swp_rRNA23 swp_2240     FALSE 0.010 -598.000 0.000 NA   NA
 5434866 5434867 swp_2240 swp_rRNA24     FALSE 8.40592003937774e-05 1306.000 0.000 NA   NA
 5434867 5434868 swp_rRNA24 swp_rRNA25     FALSE 0.009 172.000 0.000 NA   NA
 5434869 5434870 swp_2241 swp_2242     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 5434871 5434872 swp_2243 swp_2244     FALSE 0.593 106.000 0.106 NA   NA
 5434873 5434874 swp_2245 swp_2246     TRUE 0.684 103.000 0.158 NA   NA
 5434876 5434877 swp_2248 swp_2249     TRUE 0.988 -9.000 0.940 1.000 Y NA
 5434877 5434878 swp_2249 swp_2250     FALSE 0.019 127.000 0.000 NA   NA
 5434879 5434880 swp_2251 swp_2252     TRUE 0.996 4.000 0.690 1.000 Y NA
 5434880 5434881 swp_2252 swp_2253     TRUE 0.985 -7.000 0.696 NA Y NA
 5434881 5434882 swp_2253 swp_2254     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434883 5434884 swp_2256 swp_2257     FALSE 0.001 300.000 0.000 NA   NA
 5434885 5434886 swp_2258 swp_2259     TRUE 0.972 -3.000 0.072 0.078 Y NA
 5434895 5434896 swp_2270 swp_2271     TRUE 0.814 85.000 0.267 NA   NA
 5434897 5434898 swp_2272 swp_2273     FALSE 0.000 597.000 0.000 NA   NA
 5434898 5434899 swp_2273 swp_2274     TRUE 0.776 16.000 0.094 NA   NA
 5434901 5434902 swp_2276 swp_2277     TRUE 0.777 34.000 0.075 0.055   NA
 5434902 5434903 swp_2277 swp_2278     TRUE 0.977 1.000 0.205 1.000 N NA
 5434903 5434904 swp_2278 swp_2279     TRUE 0.970 5.000 0.263 NA   NA
 5434908 5434909 swp_2283 swp_2284     FALSE 0.049 254.000 0.000 0.038   NA
 5434909 5434910 swp_2284 swp_2285     FALSE 0.128 58.000 0.010 NA   NA
 5434910 5434911 swp_2285 swp_2286     TRUE 0.953 -7.000 0.500 NA   NA
 5434911 5434912 swp_2286 swp_2287     TRUE 0.852 90.000 0.353 NA   NA
 5434912 5434913 swp_2287 swp_2288     TRUE 0.897 9.000 0.096 NA   NA
 5434913 5434914 swp_2288 swp_2289     FALSE 0.463 180.000 0.184 NA   NA
 5434914 5434915 swp_2289 swp_2290     TRUE 0.700 122.000 0.115 1.000 N NA
 5434916 5434917 swp_2291 swp_2292     TRUE 0.995 3.000 0.618 NA Y NA
 5434917 5434918 swp_2292 swp_2293     TRUE 0.972 26.000 0.466 1.000 Y NA
 5434919 5434920 swp_2294 swp_2295     TRUE 0.889 32.000 0.363 NA   NA
 5434920 5434921 swp_2295 swp_2296     FALSE 0.008 550.000 0.069 NA   NA
 5434922 5434923 swp_2297 swp_2298     TRUE 0.820 91.000 0.233 1.000   NA
 5434924 5434925 swp_2299 swp_2300     TRUE 0.799 17.000 0.084 1.000   NA
 5434927 5434928 swp_2303 swp_2304     TRUE 0.879 11.000 0.098 NA   NA
 5434929 5434930 swp_2305 swp_2306     FALSE 0.000 636.000 0.000 NA   NA
 5434930 5434931 swp_2306 swp_2307     FALSE 0.021 119.000 0.000 NA   NA
 5434932 5434933 swp_2308 swp_2309     TRUE 0.989 2.000 0.538 NA N NA
 5434933 5434934 swp_2309 swp_2310     FALSE 0.000 463.000 0.000 NA   NA
 5434934 5434935 swp_2310 swp_2311     FALSE 0.026 88.000 0.000 NA   NA
 5434938 5434939 swp_2314 swp_2315     TRUE 0.833 32.000 0.000 0.021 Y NA
 5434939 5434940 swp_2315 swp_2316     FALSE 0.026 83.000 0.000 NA   NA
 5434940 5434941 swp_2316 swp_2317     FALSE 0.027 52.000 0.000 NA   NA
 5434941 5434942 swp_2317 swp_2318     FALSE 0.666 33.000 0.102 NA   NA
 5434945 5434946 swp_2321 swp_2323     FALSE 0.004 210.000 0.000 NA   NA
 5434948 5434949 swp_2324 swp_2325     TRUE 0.992 0.000 0.864 1.000   NA
 5434949 5434950 swp_2325 swp_2326     FALSE 0.565 64.000 0.077 NA   NA
 5434950 5434951 swp_2326 swp_2327     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 5434953 5434954 swp_2329 swp_2330     FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 5434954 5434955 swp_2330 swp_2331     TRUE 0.980 3.000 0.022 0.004 Y NA
 5434955 5434956 swp_2331 swp_2332     TRUE 0.988 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5434956 5434957 swp_2332 swp_2333     FALSE 0.012 -73.000 0.000 NA   NA
 5434957 5434958 swp_2333 swp_2334     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5434958 5434959 swp_2334 swp_2335     TRUE 0.980 3.000 0.087 1.000 Y NA
 5434959 5434960 swp_2335 swp_2336     TRUE 0.964 37.000 0.277 0.004 Y NA
 5434960 5434961 swp_2336 swp_2337     FALSE 0.138 93.000 0.000 1.000   NA
 5434963 5434964 swp_2339 swp_2340     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5434965 5434966 swp_2341 swp_2342     TRUE 0.920 0.000 0.103 NA   NA
 5434968 5434969 swp_2344 swp_2345     FALSE 0.089 -40.000 0.000 1.000   NA
 5434969 5434970 swp_2345 swp_2346     TRUE 0.993 2.000 0.923 NA   NA
 5434970 5434971 swp_2346 swp_2347     TRUE 0.881 15.000 0.179 NA   NA
 5434971 5434972 swp_2347 swp_2348     FALSE 0.555 35.000 0.039 NA N NA
 5434972 5434973 swp_2348 swp_2349     TRUE 0.967 -3.000 0.315 NA N NA
 5434974 5434975 swp_2350 swp_2351     FALSE 0.029 293.000 0.011 1.000 N NA
 5434975 5434976 swp_2351 swp_2352     FALSE 0.344 108.000 0.039 NA   NA
 5434976 5434977 swp_2352 swp_2353     TRUE 0.969 6.000 0.277 NA   NA
 5434977 5434978 swp_2353 swp_2354     TRUE 0.993 -3.000 0.451 0.007 Y NA
 5434978 5434979 swp_2354 swp_2355     TRUE 0.996 10.000 0.549 0.001 Y NA
 5434980 5434981 swp_2356 swp_2357     FALSE 0.000 492.000 0.000 NA   NA
 5434982 5434983 swp_2358 swp_2359     FALSE 0.343 189.000 0.143 NA   NA
 5434983 5434984 swp_2359 swp_2360     FALSE 0.640 63.000 0.107 NA   NA
 5434984 5434985 swp_2360 swp_2361     TRUE 0.892 87.000 0.500 NA   NA
 5434985 5434986 swp_2361 swp_2362     FALSE 0.000 618.000 0.000 NA   NA
 5434987 5434988 swp_2363 swp_2364     FALSE 0.017 348.000 0.013 1.000 N NA
 5434988 5434989 swp_2364 swp_2365     TRUE 0.763 64.000 0.109 1.000 N NA
 5434989 5434990 swp_2365 swp_2366     TRUE 0.993 -7.000 0.908 0.047 Y NA
 5434990 5434991 swp_2366 swp_2367     TRUE 0.984 81.000 0.924 0.047 Y NA
 5434991 5434992 swp_2367 swp_2369     TRUE 0.998 4.000 0.814 0.047 Y NA
 5434992 5434993 swp_2369 swp_2370     TRUE 0.990 -6.000 0.537 0.047 Y NA
 5434993 5434994 swp_2370 swp_2371     TRUE 0.997 3.000 0.564 0.047 Y NA
 5434994 5434995 swp_2371 swp_2372     TRUE 0.712 107.000 0.102 1.000 N NA
 5434997 5434998 swp_2374 swp_tRNA70     FALSE 0.012 -99.000 0.000 NA   NA
 5434998 5434999 swp_tRNA70 swp_tRNA69     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5434999 5435000 swp_tRNA69 swp_tRNA68     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5435000 5435001 swp_tRNA68 swp_2375     FALSE 0.002 253.000 0.000 NA   NA
 5435004 5435005 swp_tRNA20 swp_tRNA21     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5435005 5435006 swp_tRNA21 swp_tRNA22     FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   NA
 5435006 5435007 swp_tRNA22 swp_tRNA23     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 5435007 5435008 swp_tRNA23 swp_tRNA24     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 5435008 5435009 swp_tRNA24 swp_tRNA25     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 5435009 5435010 swp_tRNA25 swp_2378     FALSE 0.013 -64.000 0.000 NA   NA
 5435010 5435011 swp_2378 swp_tRNA26     FALSE 0.011 -178.000 0.000 NA   NA
 5435011 5435012 swp_tRNA26 swp_tRNA27     FALSE 0.031 37.000 0.000 NA   NA
 5435012 5435013 swp_tRNA27 swp_2379     FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   NA
 5435013 5435014 swp_2379 swp_2380     TRUE 0.788 135.000 0.344 NA   NA
 5435018 5435019 swp_2385 swp_2386     TRUE 0.940 6.000 0.112 1.000   NA
 5435019 5435020 swp_2386 swp_2387     FALSE 0.000 395.000 0.000 NA   NA
 5435021 5435022 swp_2388 swp_2389     FALSE 0.473 185.000 0.129 1.000 N NA
 5435023 5435024 swp_2390 swp_2391     TRUE 0.979 10.000 0.163 1.000 Y NA
 5435024 5435025 swp_2391 swp_2392     TRUE 0.983 10.000 0.202 1.000 Y NA
 5435025 5435026 swp_2392 swp_2393     TRUE 0.978 22.000 0.523 1.000 Y NA
 5435030 5435031 swp_2397 swp_2398     FALSE 0.001 840.000 0.000 1.000   NA
 5435031 5435032 swp_2398 swp_2399     TRUE 0.900 106.000 0.500 1.000   NA
 5435034 5435035 swp_2401 swp_2402     TRUE 0.988 5.000 0.667 NA   NA
 5435035 5435036 swp_2402 swp_2403     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5435036 5435037 swp_2403 swp_2404     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5435037 5435038 swp_2404 swp_2405     TRUE 0.986 0.000 0.600 NA   NA
 5435038 5435039 swp_2405 swp_2406     FALSE 0.060 16.000 0.000 NA   NA
 5435040 5435041 swp_2407 swp_2408     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5435043 5435044 swp_2410 swp_2411     FALSE 0.000 618.000 0.000 NA   NA
 5435044 5435045 swp_2411 swp_2412     FALSE 0.016 228.000 0.000 1.000   NA
 5435045 5435046 swp_2412 swp_2413     FALSE 0.005 193.000 0.000 NA   NA
 5435046 5435047 swp_2413 swp_2414     FALSE 0.007 187.000 0.000 NA   NA
 5435047 5435048 swp_2414 swp_2415     FALSE 0.115 121.000 0.000 1.000   NA
 5435048 5435049 swp_2415 swp_2416     TRUE 0.991 -7.000 0.667 0.024 Y NA
 5435050 5435051 swp_2417 swp_2418     FALSE 0.003 226.000 0.000 NA   NA
 5435051 5435052 swp_2418 swp_2419     FALSE 0.007 185.000 0.000 NA   NA
 5435052 5435053 swp_2419 swp_2420     FALSE 0.045 228.000 0.000 1.000 N NA
 5435053 5435054 swp_2420 swp_2421     TRUE 0.945 94.000 0.750 1.000 N NA
 5435054 5435055 swp_2421 swp_2422     TRUE 0.991 9.000 0.917 NA N NA
 5435055 5435056 swp_2422 swp_2423     TRUE 0.989 2.000 0.500 NA N NA
 5435056 5435057 swp_2423 swp_2424     FALSE 0.009 799.000 0.000 1.000 Y NA
 5435057 5435058 swp_2424 swp_2425     TRUE 0.987 0.000 0.500 NA N NA
 5435058 5435059 swp_2425 swp_2426     FALSE 0.000 461.000 0.000 NA   NA
 5435059 5435060 swp_2426 swp_2427     FALSE 0.000 478.000 0.000 NA   NA
 5435060 5435061 swp_2427 swp_2428     TRUE 0.708 129.000 0.130 1.000 N NA
 5435061 5435062 swp_2428 swp_2429     TRUE 0.798 179.000 0.502 1.000 N NA
 5435062 5435063 swp_2429 swp_2430     TRUE 0.891 144.000 0.289 1.000 Y NA
 5435063 5435064 swp_2430 swp_2431     FALSE 0.556 224.000 0.733 NA   NA
 5435066 5435067 swp_2433 swp_2434     FALSE 0.480 58.000 0.000 0.026   NA
 5435067 5435068 swp_2434 swp_2435     FALSE 0.027 57.000 0.000 NA   NA
 5435068 5435069 swp_2435 swp_2436     FALSE 0.011 161.000 0.000 NA   NA
 5435071 5435072 swp_2438 swp_2439     FALSE 0.001 324.000 0.000 NA   NA
 5435072 5435073 swp_2439 swp_2440     FALSE 0.053 18.000 0.000 NA   NA
 5435073 5435074 swp_2440 swp_2441     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5435074 5435075 swp_2441 swp_2442     FALSE 0.003 218.000 0.000 NA   NA
 5435075 5435076 swp_2442 swp_2443     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5435076 5435077 swp_2443 swp_2444     FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 5435077 5435078 swp_2444 swp_2445     FALSE 0.021 119.000 0.000 NA   NA
 5435078 5435079 swp_2445 swp_2446     FALSE 0.175 4.000 0.000 NA   NA
 5435079 5435080 swp_2446 swp_2447     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5435084 5435085 swp_2451 swp_2452     FALSE 0.316 193.000 0.111 1.000   NA
 5435085 5435086 swp_2452 swp_2453     TRUE 0.693 94.000 0.118 1.000   NA
 5435086 5435087 swp_2453 swp_2454     FALSE 0.136 97.000 0.000 1.000   NA
 5435087 5435088 swp_2454 swp_2455     TRUE 0.980 2.000 0.231 1.000 N NA
 5435088 5435089 swp_2455 swp_2456     FALSE 0.006 436.000 0.000 1.000 N NA
 5435092 5435093 swp_2459 swp_2460     TRUE 0.906 2.000 0.072 NA   NA
 5435093 5435094 swp_2460 swp_2461     FALSE 0.024 102.000 0.000 NA   NA
 5435095 5435096 swp_2462 swp_2463     FALSE 0.575 211.000 0.186 1.000 Y NA
 5435096 5435097 swp_2463 swp_2464     TRUE 0.970 63.000 0.652 1.000 Y NA
 5435097 5435098 swp_2464 swp_2465     TRUE 0.992 19.000 0.928 0.010 Y NA
 5435100 5435101 swp_2467 swp_2468     FALSE 0.664 34.000 0.103 NA   NA
 5435101 5435102 swp_2468 swp_2469     TRUE 0.920 -3.000 0.167 NA   NA
 5435103 5435104 swp_2470 swp_2471     FALSE 0.652 -37.000 0.113 1.000 N NA
 5435105 5435106 swp_2472 swp_2473     FALSE 0.041 235.000 0.000 1.000 N NA
 5435106 5435107 swp_2473 swp_2474     FALSE 0.016 137.000 0.000 NA   NA
 5435108 5435109 swp_2475 swp_2476     TRUE 0.700 -31.000 0.126 1.000 N NA
 5435109 5435110 swp_2476 swp_2478     TRUE 0.987 75.000 0.917 0.001 Y NA
 5435110 5435111 swp_2478 swp_2479     FALSE 0.007 283.000 0.000 1.000   NA
 5435111 5435112 swp_2479 swp_2480     TRUE 0.844 80.000 0.259 1.000   NA
 5435115 5435116 swp_2483 swp_2485     FALSE 0.003 221.000 0.000 NA   NA
 5435117 5435118 swp_2486 swp_2487     FALSE 0.013 153.000 0.000 NA   NA
 5435119 5435120 swp_2488 swp_2489     FALSE 0.609 181.000 0.209 1.000 N NA
 5435120 5435121 swp_2489 swp_2490     TRUE 0.866 98.000 0.281 1.000 N NA
 5435121 5435122 swp_2490 swp_2491     TRUE 0.936 19.000 0.292 1.000 N NA
 5435122 5435123 swp_2491 swp_2492     TRUE 0.713 123.000 0.208 NA   NA
 5435123 5435124 swp_2492 swp_2493     TRUE 0.988 2.000 0.576 NA   NA
 5435124 5435125 swp_2493 swp_2494     TRUE 0.783 64.000 0.125 1.000 N NA
 5435125 5435126 swp_2494 swp_2495     FALSE 0.458 101.000 0.017 1.000 N NA
 5435126 5435127 swp_2495 swp_2496     TRUE 0.808 18.000 0.132 NA   NA
 5435127 5435128 swp_2496 swp_2497     FALSE 0.000 358.000 0.000 NA   NA
 5435128 5435129 swp_2497 swp_2498     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5435129 5435130 swp_2498 swp_2499     FALSE 0.027 76.000 0.000 NA   NA
 5435131 5435132 swp_2500 swp_2501     FALSE 0.060 16.000 0.000 NA   NA
 5435134 5435135 swp_2504 swp_2505     FALSE 0.677 31.000 0.101 NA   NA
 5435136 5435137 swp_2506 swp_2507     TRUE 0.799 11.000 0.053 NA   NA
 5435137 5435138 swp_2507 swp_2508     FALSE 0.313 88.000 0.032 NA   NA
 5435138 5435139 swp_2508 swp_2509     FALSE 0.214 105.000 0.022 NA   NA
 5435141 5435142 swp_2511 swp_2512     TRUE 0.906 162.000 0.333 0.045 Y NA
 5435143 5435144 swp_2513 swp_2514     TRUE 0.989 8.000 0.571 1.000 N NA
 5435144 5435145 swp_2514 swp_2515     FALSE 0.189 155.000 0.000 1.000 N NA
 5435146 5435147 swp_2516 swp_2517     TRUE 0.941 32.000 0.625 1.000   NA
 5435147 5435148 swp_2517 swp_2518     FALSE 0.018 292.000 0.000 1.000 N NA
 5435148 5435149 swp_2518 swp_2519     FALSE 0.019 289.000 0.000 1.000 N NA
 5435149 5435150 swp_2519 swp_2520     FALSE 0.007 389.000 0.000 1.000 N NA
 5435153 5435154 swp_2523 swp_2524     FALSE 0.000 552.000 0.000 NA   NA
 5435155 5435156 swp_tRNA28 swp_2525     FALSE 0.017 -35.000 0.000 NA   NA
 5435156 5435157 swp_2525 swp_tRNA29     FALSE 0.011 -167.000 0.000 NA   NA
 5435157 5435158 swp_tRNA29 swp_tRNA30     FALSE 0.029 44.000 0.000 NA   NA
 5435159 5435160 swp_2526 swp_2527     TRUE 0.981 10.000 0.571 NA   NA
 5435160 5435161 swp_2527 swp_2528     FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 5435162 5435163 swp_2529 swp_2530     TRUE 0.808 16.000 0.082 1.000   NA
 5435163 5435164 swp_2530 swp_2531     FALSE 0.360 69.000 0.034 NA   NA
 5435164 5435165 swp_2531 swp_2532     FALSE 0.479 133.000 0.087 NA   NA
 5435166 5435167 swp_2533 swp_2535     FALSE 0.003 217.000 0.000 NA   NA
 5435168 5435169 swp_2536 swp_2537     FALSE 0.028 69.000 0.000 NA   NA
 5435170 5435171 swp_2538 swp_2539     FALSE 0.000 787.000 0.000 NA   NA
 5435171 5435172 swp_2539 swp_2540     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5435172 5435173 swp_2540 swp_2541     TRUE 0.843 -9.000 0.028 NA Y NA
 5435173 5435174 swp_2541 swp_2542     TRUE 0.996 0.000 0.804 NA Y NA
 5435174 5435175 swp_2542 swp_2543     TRUE 0.983 21.000 0.790 NA Y NA
 5435175 5435176 swp_2543 swp_2544     TRUE 0.729 58.000 0.167 NA   NA
 5435176 5435177 swp_2544 swp_2545     FALSE 0.049 192.000 0.018 NA   NA
 5435179 5435180 swp_2547 swp_2548     TRUE 0.989 -3.000 1.000 NA N NA
 5435180 5435181 swp_2548 swp_2549     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 5435181 5435182 swp_2549 swp_2550     FALSE 0.000 441.000 0.000 NA   NA
 5435184 5435185 swp_2552 swp_2553     FALSE 0.204 249.000 0.000 0.037 Y NA
 5435186 5435187 swp_2554 swp_2555     FALSE 0.023 108.000 0.000 NA   NA
 5435188 5435189 swp_2556 swp_2557     FALSE 0.358 133.000 0.032 1.000   NA
 5435189 5435190 swp_2557 swp_2558     FALSE 0.010 256.000 0.000 1.000   NA
 5435191 5435192 swp_2559 swp_2560     FALSE 0.009 172.000 0.000 NA   NA
 5435194 5435195 swp_2562 swp_2563     TRUE 0.948 62.000 1.000 NA   NA
 5435195 5435196 swp_2563 swp_2564     FALSE 0.000 417.000 0.000 NA   NA
 5435196 5435197 swp_2564 swp_2565     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5435197 5435198 swp_2565 swp_2566     FALSE 0.002 230.000 0.000 NA   NA
 5435198 5435199 swp_2566 swp_2567     TRUE 0.993 3.000 1.000 NA   NA
 5435199 5435200 swp_2567 swp_2568     TRUE 0.942 -3.000 0.222 NA   NA
 5435204 5435205 swp_2572 swp_2573     TRUE 0.990 13.000 0.700 0.002 N NA
 5435205 5435206 swp_2573 swp_2574     TRUE 0.989 12.000 0.667 0.002   NA
 5435206 5435207 swp_2574 swp_2575     TRUE 0.994 0.000 0.636 0.002   NA
 5435207 5435208 swp_2575 swp_2576     TRUE 0.806 138.000 0.404 NA   NA
 5435208 5435209 swp_2576 swp_2577     TRUE 0.774 45.000 0.197 NA   NA
 5435209 5435210 swp_2577 swp_2578     TRUE 0.992 -3.000 0.713 NA Y NA
 5435210 5435211 swp_2578 swp_2579     TRUE 0.912 -7.000 0.266 NA   NA
 5435211 5435212 swp_2579 swp_2580     TRUE 0.731 89.000 0.141 1.000   NA
 5435212 5435213 swp_2580 swp_2581     TRUE 0.965 90.000 0.619 1.000 Y NA
 5435213 5435214 swp_2581 swp_2582     FALSE 0.396 176.000 0.091 NA N NA
 5435215 5435216 swp_2583 swp_2584     TRUE 0.873 -22.000 0.448 NA   NA
 5435218 5435219 swp_2586 swp_2587     FALSE 0.029 257.000 0.000 1.000 N NA
 5435219 5435220 swp_2587 swp_2588     FALSE 0.637 19.000 0.033 NA N NA
 5435220 5435221 swp_2588 swp_2589     TRUE 0.679 -7.000 0.033 NA N NA
 5435221 5435222 swp_2589 swp_2590     TRUE 0.957 10.000 0.167 1.000 N NA
 5435222 5435223 swp_2590 swp_2592     TRUE 0.882 89.000 0.305 1.000 N NA
 5435223 5435224 swp_2592 swp_2593     FALSE 0.634 194.000 0.345 1.000 N NA
 5435226 5435227 swp_2595 swp_2596     FALSE 0.542 154.000 0.167 NA   NA
 5435227 5435228 swp_2596 swp_2597     FALSE 0.261 165.000 0.056 NA   NA
 5435228 5435229 swp_2597 swp_2598     FALSE 0.354 33.000 0.029 NA   NA
 5435230 5435231 swp_2599 swp_2600     FALSE 0.251 43.000 0.022 NA   NA
 5435232 5435233 swp_2602 swp_2603     FALSE 0.169 185.000 0.008 1.000 N NA
 5435233 5435234 swp_2603 swp_2604     FALSE 0.061 241.000 0.013 1.000 N NA
 5435234 5435235 swp_2604 swp_2605     TRUE 0.987 10.000 0.188 0.053 Y NA
 5435235 5435236 swp_2605 swp_2606     TRUE 0.989 19.000 0.558 0.001 Y NA
 5435236 5435237 swp_2606 swp_2607     FALSE 0.529 184.000 0.094 0.053 N NA
 5435239 5435240 swp_2609 swp_2610     TRUE 0.822 36.000 0.151 1.000 N NA
 5435241 5435242 swp_2611 swp_2612     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5435242 5435243 swp_2612 swp_2613     FALSE 0.181 1.000 0.000 NA   NA
 5435243 5435244 swp_2613 swp_2614     TRUE 0.801 -24.000 0.282 NA   NA
 5435244 5435245 swp_2614 swp_2615     TRUE 0.908 54.000 0.473 1.000   NA
 5435245 5435246 swp_2615 swp_2617     FALSE 0.554 99.000 0.086 NA   NA
 5435246 5435247 swp_2617 swp_2618     FALSE 0.562 46.000 0.074 NA   NA
 5435247 5435248 swp_2618 swp_2619     FALSE 0.003 606.000 0.000 1.000 N NA
 5435248 5435249 swp_2619 swp_2620     FALSE 0.642 114.000 0.104 1.000   NA
 5435249 5435250 swp_2620 swp_2621     TRUE 0.716 -22.000 0.137 1.000   NA
 5435253 5435254 swp_2624 swp_2625     FALSE 0.330 206.000 0.119 1.000 N NA
 5435255 5435256 swp_2626 swp_2627     FALSE 0.038 27.000 0.000 NA   NA
 5435256 5435257 swp_2627 swp_2629     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5435257 5435258 swp_2629 swp_2630     FALSE 0.000 512.000 0.000 NA   NA
 5435259 5435260 swp_2631 swp_2632     FALSE 0.121 117.000 0.000 1.000   NA
 5435260 5435261 swp_2632 swp_2633     FALSE 0.303 161.000 0.021 1.000 N NA
 5435262 5435263 swp_2634 swp_2635     TRUE 0.969 5.000 0.169 1.000 N NA
 5435267 5435268 swp_2639 swp_2640     TRUE 0.998 3.000 0.951 0.001 Y NA
 5435268 5435269 swp_2640 swp_2641     TRUE 0.981 15.000 0.270 0.045 Y NA
 5435269 5435270 swp_2641 swp_2642     TRUE 0.987 10.000 0.277 1.000 Y NA
 5435270 5435271 swp_2642 swp_2643     TRUE 0.917 -13.000 0.488 NA   NA
 5435271 5435272 swp_2643 swp_2644     TRUE 0.831 0.000 0.043 NA   NA
 5435272 5435273 swp_2644 swp_2645     TRUE 0.822 100.000 0.064 1.000 Y NA
 5435273 5435274 swp_2645 swp_2646     TRUE 0.993 0.000 0.463 NA Y NA
 5435274 5435275 swp_2646 swp_2647     TRUE 0.991 0.000 0.342 NA Y NA
 5435275 5435276 swp_2647 swp_2648     TRUE 0.957 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 5435276 5435277 swp_2648 swp_2649     TRUE 0.927 0.000 0.080 1.000   NA
 5435278 5435279 swp_2650 swp_2653     TRUE 0.940 37.000 0.315 NA Y NA
 5435281 5435282 swp_2654 swp_2655     TRUE 0.978 11.000 0.212 NA Y NA
 5435282 5435283 swp_2655 swp_2656     TRUE 0.990 2.000 0.212 1.000 Y NA
 5435283 5435284 swp_2656 swp_2657     FALSE 0.013 630.000 0.000 1.000 Y NA
 5435284 5435285 swp_2657 swp_2658     TRUE 0.971 48.000 0.794 NA Y NA
 5435285 5435286 swp_2658 swp_2659     TRUE 0.900 33.000 0.426 NA   NA
 5435286 5435287 swp_2659 swp_2660     TRUE 0.974 10.000 0.343 1.000   NA
 5435287 5435288 swp_2660 swp_2661     FALSE 0.584 78.000 0.086 NA   NA
 5435288 5435289 swp_2661 swp_2662     FALSE 0.000 557.000 0.000 NA   NA
 5435289 5435290 swp_2662 swp_2663     TRUE 0.990 0.000 0.714 1.000   NA
 5435291 5435292 swp_2664 swp_2665     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 5435292 5435293 swp_2665 swp_2666     FALSE 0.102 12.000 0.000 NA   NA
 5435293 5435294 swp_2666 swp_2667     FALSE 0.041 25.000 0.000 NA   NA
 5435295 5435296 swp_2668 swp_2669     FALSE 0.266 116.000 0.008 NA N NA
 5435296 5435297 swp_2669 swp_2670     TRUE 0.896 53.000 0.148 1.000 Y NA
 5435298 5435299 swp_2671 swp_2673     FALSE 0.029 44.000 0.000 NA   NA
 5435299 5435300 swp_2673 swp_2674     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5435300 5435301 swp_2674 swp_2675     TRUE 0.858 40.000 0.011 0.003 Y NA
 5435301 5435302 swp_2675 swp_2676     FALSE 0.018 222.000 0.000 1.000   NA
 5435306 5435307 swp_2681 swp_2682     TRUE 0.817 96.000 0.290 NA   NA
 5435308 5435309 swp_2683 swp_2684     TRUE 0.980 3.000 0.026 0.010 Y NA
 5435309 5435310 swp_2684 swp_2685     FALSE 0.158 45.000 0.000 1.000   NA
 5435314 5435315 swp_2689 swp_2690     FALSE 0.020 286.000 0.000 1.000 N NA
 5435315 5435316 swp_2690 swp_2691     TRUE 0.681 98.000 0.152 NA   NA
 5435317 5435318 swp_2692 swp_2693     FALSE 0.628 33.000 0.083 NA   NA
 5435318 5435319 swp_2693 swp_2694     FALSE 0.619 50.000 0.099 NA   NA
 5435319 5435320 swp_2694 swp_2695     TRUE 0.982 12.000 0.132 0.002 Y NA
 5435320 5435321 swp_2695 swp_2696     TRUE 0.940 57.000 0.165 0.002 Y NA
 5435321 5435322 swp_2696 swp_2697     FALSE 0.103 216.000 0.017 1.000 N NA
 5435322 5435323 swp_2697 swp_2698     TRUE 0.971 -3.000 0.292 1.000 N NA
 5435323 5435324 swp_2698 swp_2699     TRUE 0.790 -39.000 0.163 0.037 N NA
 5435324 5435325 swp_2699 swp_2700     FALSE 0.634 52.000 0.076 1.000   NA
 5435325 5435326 swp_2700 swp_2701     FALSE 0.260 168.000 0.038 1.000   NA
 5435326 5435327 swp_2701 swp_2702     FALSE 0.082 241.000 0.027 1.000 N NA
 5435327 5435328 swp_2702 swp_2703     TRUE 0.922 81.000 0.466 1.000 N NA
 5435328 5435329 swp_2703 swp_2705     TRUE 0.868 69.000 0.235 1.000 N NA
 5435329 5435330 swp_2705 swp_2706     TRUE 0.910 15.000 0.231 NA   NA
 5435330 5435331 swp_2706 swp_2707     FALSE 0.024 98.000 0.000 NA   NA
 5435331 5435332 swp_2707 swp_2708     FALSE 0.026 85.000 0.000 NA   NA
 5435333 5435334 swp_2709 swp_2710     FALSE 0.166 5.000 0.000 NA   NA
 5435334 5435335 swp_2710 swp_2711     FALSE 0.000 436.000 0.000 NA   NA
 5435335 5435336 swp_2711 swp_2712     FALSE 0.030 41.000 0.000 NA   NA
 5435336 5435337 swp_2712 swp_2713     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 5435337 5435338 swp_2713 swp_2714     FALSE 0.015 143.000 0.000 NA   NA
 5435338 5435339 swp_2714 swp_2715     TRUE 0.693 -19.000 0.147 NA   NA
 5435339 5435340 swp_2715 swp_2716     TRUE 0.864 -13.000 0.286 NA   NA
 5435340 5435341 swp_2716 swp_2717     TRUE 0.989 9.000 0.750 1.000   NA
 5435341 5435342 swp_2717 swp_2718     FALSE 0.608 188.000 0.375 NA   NA
 5435345 5435346 swp_2722 swp_2723     FALSE 0.027 56.000 0.000 NA   NA
 5435346 5435347 swp_2723 swp_2724     FALSE 0.025 94.000 0.000 NA   NA
 5435349 5435350 swp_2726 swp_2727     TRUE 0.907 162.000 0.333 0.044 Y NA
 5435351 5435352 swp_2728 swp_2729     FALSE 0.001 281.000 0.000 NA   NA
 5435352 5435353 swp_2729 swp_2730     FALSE 9.59843056897569e-05 915.000 0.000 NA   NA
 5435353 5435354 swp_2730 swp_2731     FALSE 0.077 14.000 0.000 NA   NA
 5435354 5435355 swp_2731 swp_2732     FALSE 0.001 738.000 0.000 NA N NA
 5435355 5435356 swp_2732 swp_2733     TRUE 0.984 -3.000 0.680 NA N NA
 5435356 5435357 swp_2733 swp_2734     FALSE 0.015 659.000 0.031 NA Y NA
 5435357 5435358 swp_2734 swp_2736     TRUE 0.987 7.000 0.267 NA Y NA
 5435359 5435360 swp_2737 swp_2738     TRUE 0.819 18.000 0.102 NA N NA
 5435363 5435364 swp_2742 swp_2743     TRUE 0.742 92.000 0.190 NA   NA
 5435365 5435366 swp_2744 swp_2745     TRUE 0.850 64.000 0.259 1.000   NA
 5435366 5435367 swp_2745 swp_2746     TRUE 0.877 13.000 0.127 NA   NA
 5435367 5435368 swp_2746 swp_2747     FALSE 0.000 537.000 0.000 NA   NA
 5435368 5435369 swp_2747 swp_2748     FALSE 0.149 7.000 0.000 NA   NA
 5435370 5435371 swp_2749 swp_2750     FALSE 0.000 670.000 0.000 NA   NA
 5435371 5435372 swp_2750 swp_2751     TRUE 0.741 72.000 0.174 NA   NA
 5435376 5435377 swp_2755 swp_2756     TRUE 0.903 0.000 0.080 NA   NA
 5435377 5435378 swp_2756 swp_2757     TRUE 0.712 33.000 0.088 NA N NA
 5435380 5435381 swp_tRNA67 swp_tRNA66     FALSE 0.026 83.000 0.000 NA   NA
 5435381 5435382 swp_tRNA66 swp_tRNA65     FALSE 0.125 10.000 0.000 NA   NA
 5435382 5435383 swp_tRNA65 swp_2759     FALSE 0.000 570.000 0.000 NA   NA
 5435383 5435384 swp_2759 swp_2760     TRUE 0.993 8.000 0.790 0.045   NA
 5435387 5435388 swp_2762 swp_2763     FALSE 0.030 246.000 0.008 NA N NA
 5435388 5435389 swp_2763 swp_2764     FALSE 0.369 114.000 0.045 NA   NA
 5435389 5435390 swp_2764 swp_2765     TRUE 0.927 79.000 0.739 NA   NA
 5435390 5435391 swp_2765 swp_2766     TRUE 0.967 -7.000 0.727 NA   NA
 5435391 5435392 swp_2766 swp_2767     FALSE 0.288 60.000 0.027 NA   NA
 5435392 5435393 swp_2767 swp_2768     TRUE 0.997 2.000 0.542 0.001 Y NA
 5435393 5435394 swp_2768 swp_2769     TRUE 0.994 -6.000 0.688 0.001 Y NA
 5435394 5435395 swp_2769 swp_2771     FALSE 0.396 115.000 0.009 1.000 N NA
 5435396 5435397 swp_2772 swp_2773     TRUE 0.951 21.000 0.245 NA Y NA
 5435397 5435398 swp_2773 swp_2774     TRUE 0.989 13.000 0.643 NA Y NA
 5435398 5435399 swp_2774 swp_2775     TRUE 0.971 -3.000 0.348 NA N NA
 5435399 5435400 swp_2775 swp_2776     FALSE 0.001 721.000 0.000 NA N NA
 5435400 5435401 swp_2776 swp_2777     FALSE 0.379 82.000 0.021 1.000   NA
 5435403 5435404 swp_2779 swp_2781     FALSE 0.014 145.000 0.000 NA   NA
 5435404 5435405 swp_2781 swp_2782     FALSE 0.164 89.000 0.015 NA   NA
 5435406 5435407 swp_2783 swp_2784     TRUE 0.978 -3.000 0.575 NA   NA
 5435409 5435410 swp_2786 swp_2787     FALSE 0.000 442.000 0.000 NA   NA
 5435410 5435411 swp_2787 swp_2788     TRUE 0.944 90.000 0.723 1.000 N NA
 5435411 5435412 swp_2788 swp_2789     FALSE 0.010 349.000 0.000 1.000 N NA
 5435412 5435413 swp_2789 swp_2790     TRUE 0.934 52.000 0.683 1.000   NA
 5435413 5435414 swp_2790 swp_2791     TRUE 0.987 9.000 0.761 NA   NA
 5435415 5435416 swp_2792 swp_2793     FALSE 0.063 137.000 0.007 NA   NA
 5435416 5435417 swp_2793 swp_2794     TRUE 0.746 154.000 0.372 NA   NA
 5435417 5435418 swp_2794 swp_2795     FALSE 0.241 176.000 0.060 NA   NA
 5435418 5435419 swp_2795 swp_2796     FALSE 0.000 652.000 0.000 NA   NA
 5435419 5435420 swp_2796 swp_2797     TRUE 0.865 45.000 0.227 1.000 N NA
 5435420 5435421 swp_2797 swp_2798     TRUE 0.809 34.000 0.086 0.013   NA
 5435421 5435422 swp_2798 swp_2799     FALSE 0.544 25.000 0.000 0.071   NA
 5435422 5435423 swp_2799 swp_2800     FALSE 0.000 382.000 0.000 NA   NA
 5435424 5435425 swp_2801 swp_2802     TRUE 0.888 68.000 0.290 1.000 N NA
 5435426 5435427 swp_2803 swp_2804     FALSE 0.672 30.000 0.094 NA   NA
 5435427 5435428 swp_2804 swp_2805     TRUE 0.925 2.000 0.092 NA   NA
 5435428 5435429 swp_2805 swp_2806     FALSE 0.532 -10.000 0.043 NA   NA
 5435431 5435432 swp_2808 swp_2809     FALSE 0.001 263.000 0.000 NA   NA
 5435432 5435433 swp_2809 swp_2810     FALSE 0.072 256.000 0.081 NA   NA
 5435433 5435434 swp_2810 swp_2811     FALSE 0.632 60.000 0.045 1.000 N NA
 5435434 5435435 swp_2811 swp_2812     FALSE 0.009 263.000 0.000 1.000   NA
 5435435 5435436 swp_2812 swp_2813     TRUE 0.959 14.000 0.455 NA   NA
 5435436 5435437 swp_2813 swp_2814     TRUE 0.898 51.000 0.500 NA   NA
 5435437 5435438 swp_2814 swp_2815     TRUE 0.959 19.000 0.710 NA   NA
 5435438 5435439 swp_2815 swp_2816     FALSE 0.001 319.000 0.000 NA   NA
 5435439 5435440 swp_2816 swp_2817     FALSE 0.604 86.000 0.099 NA   NA
 5435440 5435441 swp_2817 swp_2818     TRUE 0.761 75.000 0.050 0.036 N NA
 5435441 5435442 swp_2818 swp_2819     TRUE 0.887 34.000 0.304 NA N NA
 5435442 5435443 swp_2819 swp_2820     FALSE 0.154 287.000 0.081 NA Y NA
 5435443 5435444 swp_2820 swp_2821     FALSE 0.248 96.000 0.025 NA   NA
 5435445 5435446 swp_2822 swp_2824     TRUE 0.846 -10.000 0.203 NA   NA
 5435451 5435452 swp_2827 swp_2829     FALSE 7.75763036983644e-05 1495.000 0.000 NA   NA
 5435452 5435453 swp_2829 swp_2830     TRUE 0.743 27.000 0.089 NA N NA
 5435453 5435454 swp_2830 swp_2831     TRUE 0.981 7.000 0.382 NA N NA
 5435454 5435455 swp_2831 swp_2832     TRUE 0.979 2.000 0.211 1.000 N NA
 5435455 5435456 swp_2832 swp_2833     TRUE 0.938 -3.000 0.209 NA   NA
 5435456 5435457 swp_2833 swp_2835     TRUE 0.937 -3.000 0.204 NA   NA
 5435459 5435460 swp_2836 swp_2837     TRUE 0.937 12.000 0.073 0.073 N NA
 5435463 5435464 swp_2840 swp_2841     FALSE 8.73549025856675e-05 1148.000 0.000 NA   NA
 5435464 5435465 swp_2841 swp_2842     FALSE 0.009 361.000 0.000 1.000 N NA
 5435465 5435466 swp_2842 swp_2843     TRUE 0.996 0.000 0.371 0.001 Y NA
 5435467 5435468 swp_2844 swp_2845     FALSE 0.007 300.000 0.000 NA N NA
 5435468 5435469 swp_2845 swp_2846     FALSE 0.000 382.000 0.000 NA   NA
 5435471 5435472 swp_2848 swp_2849     TRUE 0.766 72.000 0.195 NA   NA
 5435472 5435473 swp_2849 swp_2850     TRUE 0.693 73.000 0.098 NA N NA
 5435473 5435474 swp_2850 swp_2851     FALSE 0.610 127.000 0.100 NA N NA
 5435475 5435476 swp_2852 swp_2853     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5435476 5435477 swp_2853 swp_2854     TRUE 0.766 98.000 0.220 NA   NA
 5435478 5435479 swp_2855 swp_2856     FALSE 0.034 368.000 0.067 1.000 N NA
 5435483 5435484 swp_2860 swp_2862     TRUE 0.888 108.000 0.538 NA   NA
 5435493 5435494 swp_2870 swp_2871     FALSE 0.603 63.000 0.038 1.000 N NA
 5435494 5435495 swp_2871 swp_2872     FALSE 0.519 186.000 0.044 1.000 Y NA
 5435498 5435499 swp_2875 swp_2876     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5435500 5435501 swp_2877 swp_2878     FALSE 0.023 110.000 0.000 NA   NA
 5435504 5435505 swp_2881 swp_2882     FALSE 0.238 120.000 0.028 NA   NA
 5435505 5435506 swp_2882 swp_2883     FALSE 0.028 73.000 0.000 NA   NA
 5435506 5435507 swp_2883 swp_2884     TRUE 0.970 99.000 0.455 0.003 Y NA
 5435507 5435508 swp_2884 swp_2885     TRUE 0.979 9.000 0.053 0.003 Y NA
 5435508 5435509 swp_2885 swp_2886     TRUE 0.984 0.000 0.058 0.003 Y NA
 5435509 5435510 swp_2886 swp_2887     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5435510 5435511 swp_2887 swp_2888     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5435511 5435512 swp_2888 swp_2889     TRUE 0.998 0.000 0.909 0.003 Y NA
 5435512 5435513 swp_2889 swp_2890     FALSE 0.004 511.000 0.000 1.000 N NA
 5435515 5435516 swp_2892 swp_2893     TRUE 0.975 -3.000 0.409 NA N NA
 5435516 5435517 swp_2893 swp_2894     TRUE 0.987 -3.000 0.412 NA Y NA
 5435517 5435518 swp_2894 swp_2896     TRUE 0.975 -3.000 0.412 NA N NA
 5435520 5435521 swp_2897 swp_2898     FALSE 0.000 389.000 0.000 NA   NA
 5435521 5435522 swp_2898 swp_2899     TRUE 0.858 139.000 0.615 NA   NA
 5435522 5435523 swp_2899 swp_2900     FALSE 0.268 136.000 0.038 NA   NA
 5435525 5435526 swp_2901 swp_2902     FALSE 0.373 111.000 0.044 NA   NA
 5435526 5435527 swp_2902 swp_2903     FALSE 0.558 101.000 0.089 NA   NA
 5435527 5435528 swp_2903 swp_2904     FALSE 0.278 177.000 0.076 NA   NA
 5435528 5435529 swp_2904 swp_2905     TRUE 0.984 1.000 0.455 NA   NA
 5435529 5435530 swp_2905 swp_2906     TRUE 0.763 45.000 0.186 NA   NA
 5435530 5435531 swp_2906 swp_2907     TRUE 0.812 24.000 0.171 NA   NA
 5435531 5435532 swp_2907 swp_2908     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 5435532 5435533 swp_2908 swp_2909     FALSE 0.586 52.000 0.086 NA   NA
 5435533 5435534 swp_2909 swp_2910     TRUE 0.988 -7.000 0.845 NA Y NA
 5435534 5435535 swp_2910 swp_2911     TRUE 0.736 -3.000 0.019 NA N NA
 5435535 5435536 swp_2911 swp_2912     FALSE 0.015 143.000 0.000 NA   NA
 5435536 5435537 swp_2912 swp_2913     FALSE 0.060 16.000 0.000 NA   NA
 5435537 5435538 swp_2913 swp_2914     FALSE 0.001 671.000 0.000 1.000   NA
 5435538 5435539 swp_2914 swp_2915     FALSE 0.153 72.000 0.000 1.000   NA
 5435539 5435540 swp_2915 swp_2916     TRUE 0.933 17.000 0.250 1.000 N NA
 5435540 5435541 swp_2916 swp_2917     TRUE 0.964 17.000 0.233 1.000 Y NA
 5435541 5435542 swp_2917 swp_2918     TRUE 0.988 -3.000 0.406 0.000 N NA
 5435542 5435543 swp_2918 swp_2919     FALSE 0.001 291.000 0.000 NA   NA
 5435543 5435544 swp_2919 swp_2920     FALSE 0.468 -9.000 0.031 NA   NA
 5435544 5435545 swp_2920 swp_2921     TRUE 0.797 -7.000 0.046 1.000 N NA
 5435545 5435546 swp_2921 swp_2922     TRUE 0.914 0.000 0.039 1.000 N NA
 5435546 5435547 swp_2922 swp_2923     FALSE 0.000 573.000 0.000 NA   NA
 5435547 5435548 swp_2923 swp_2924     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 5435548 5435549 swp_2924 swp_2925     FALSE 0.017 296.000 0.000 1.000 N NA
 5435549 5435550 swp_2925 swp_2926     TRUE 0.682 27.000 0.063 1.000   NA
 5435550 5435551 swp_2926 swp_2927     TRUE 0.736 56.000 0.133 1.000   NA
 5435551 5435552 swp_2927 swp_2928     TRUE 0.890 104.000 0.168 1.000 Y NA
 5435554 5435555 swp_2930 swp_2931     FALSE 0.027 52.000 0.000 NA   NA
 5435555 5435556 swp_2931 swp_2932     FALSE 0.024 101.000 0.000 NA   NA
 5435556 5435557 swp_2932 swp_2933     FALSE 0.156 6.000 0.000 NA   NA
 5435558 5435559 swp_2934 swp_2935     FALSE 0.014 238.000 0.000 1.000   NA
 5435560 5435561 swp_2936 swp_2937     FALSE 0.156 6.000 0.000 NA   NA
 5435565 5435566 swp_2942 swp_2943     FALSE 0.002 235.000 0.000 NA   NA
 5435566 5435567 swp_2943 swp_2944     FALSE 0.000 496.000 0.000 NA   NA
 5435567 5435568 swp_2944 swp_2945     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5435568 5435569 swp_2945 swp_2946     FALSE 0.000 639.000 0.000 NA   NA
 5435569 5435570 swp_2946 swp_2947     TRUE 0.998 0.000 0.806 0.000 Y NA
 5435570 5435571 swp_2947 swp_2948     TRUE 0.889 82.000 0.136 1.000 Y NA
 5435571 5435572 swp_2948 swp_2949     TRUE 0.975 33.000 0.667 1.000 Y NA
 5435572 5435573 swp_2949 swp_2950     FALSE 0.453 205.000 0.067 1.000 Y NA
 5435573 5435574 swp_2950 swp_2952     TRUE 0.994 13.000 0.604 0.000 Y NA
 5435574 5435575 swp_2952 swp_2953     TRUE 0.992 -7.000 0.705 0.002 Y NA
 5435575 5435576 swp_2953 swp_2955     TRUE 0.991 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5435577 5435578 swp_2956 swp_2957     FALSE 0.020 122.000 0.000 NA   NA
 5435578 5435579 swp_2957 swp_2959     FALSE 0.028 240.000 0.005 1.000   NA
 5435579 5435580 swp_2959 swp_2961     FALSE 0.495 124.000 0.000 0.000   NA
 5435581 5435582 swp_2962 swp_2963     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5435582 5435583 swp_2963 swp_2965     FALSE 0.583 113.000 0.071 NA N NA
 5435586 5435587 swp_2968 swp_2969     TRUE 0.988 14.000 0.778 0.099 N NA
 5435587 5435588 swp_2969 swp_2970     TRUE 0.989 -3.000 0.481 NA Y NA
 5435588 5435589 swp_2970 swp_2971     FALSE 0.000 625.000 0.000 NA   NA
 5435589 5435590 swp_2971 swp_2972     TRUE 0.716 38.000 0.030 0.002   NA
 5435591 5435592 swp_2973 swp_2974     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   NA
 5435596 5435597 swp_2978 swp_2979     FALSE 0.107 129.000 0.000 1.000   NA
 5435598 5435599 swp_2980 swp_2981     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 5435603 5435604 swp_2985 swp_2986     FALSE 0.664 81.000 0.125 NA   NA
 5435604 5435605 swp_2986 swp_2987     TRUE 0.951 25.000 0.726 NA   NA
 5435606 5435607 swp_2989 swp_2990     TRUE 0.974 2.000 0.273 NA   NA
 5435607 5435608 swp_2990 swp_2991     FALSE 0.000 429.000 0.000 NA   NA
 5435610 5435611 swp_2993 swp_2994     FALSE 0.014 147.000 0.000 NA   NA
 5435611 5435612 swp_2994 swp_2995     FALSE 0.028 74.000 0.000 NA   NA
 5435613 5435614 swp_2996 swp_2997     TRUE 0.990 5.000 0.667 NA N NA
 5435614 5435615 swp_2997 swp_2998     FALSE 0.003 226.000 0.000 NA   NA
 5435615 5435616 swp_2998 swp_2999     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5435618 5435619 swp_3001 swp_3003     TRUE 0.991 5.000 0.171 0.002 Y NA
 5435619 5435620 swp_3003 swp_3004     TRUE 0.992 -3.000 0.294 0.000 Y NA
 5435620 5435621 swp_3004 swp_3005     TRUE 0.985 -7.000 0.341 0.002 Y NA
 5435621 5435622 swp_3005 swp_3006     TRUE 0.983 -3.000 0.128 0.002 Y NA
 5435622 5435623 swp_3006 swp_3007     TRUE 0.994 3.000 0.210 0.002 Y NA
 5435623 5435624 swp_3007 swp_3008     TRUE 0.974 -18.000 0.433 0.002 Y NA
 5435624 5435625 swp_3008 swp_3009     TRUE 0.975 40.000 0.430 0.002 Y NA
 5435625 5435626 swp_3009 swp_3010     FALSE 0.060 197.000 0.002 1.000   NA
 5435626 5435627 swp_3010 swp_3011     FALSE 0.080 149.000 0.000 1.000   NA
 5435628 5435629 swp_3012 swp_3013     FALSE 0.539 78.000 0.026 1.000 N NA
 5435629 5435630 swp_3013 swp_3014     TRUE 0.975 5.000 0.208 1.000 N NA
 5435630 5435631 swp_3014 swp_3015     TRUE 0.991 16.000 0.574 0.000 Y NA
 5435632 5435633 swp_3016 swp_3017     FALSE 0.136 205.000 0.000 0.010   NA
 5435634 5435635 swp_3018 swp_3019     FALSE 0.003 1385.000 0.054 NA   NA
 5435635 5435636 swp_3019 swp_3020     TRUE 0.835 79.000 0.297 NA   NA
 5435636 5435637 swp_3020 swp_3021     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 5435637 5435638 swp_3021 swp_3022     FALSE 0.458 101.000 0.017 1.000 N NA
 5435638 5435639 swp_3022 swp_3023     TRUE 0.748 18.000 0.062 1.000   NA
 5435639 5435640 swp_3023 swp_3024     TRUE 0.806 85.000 0.087 0.000   NA
 5435641 5435642 swp_3025 swp_3026     FALSE 0.002 243.000 0.000 NA   NA
 5435642 5435643 swp_3026 swp_3027     FALSE 0.301 120.000 0.038 NA   NA
 5435643 5435644 swp_3027 swp_3028     FALSE 0.456 135.000 0.082 NA   NA
 5435644 5435645 swp_3028 swp_3029     TRUE 0.981 -3.000 0.682 NA   NA
 5435650 5435651 swp_3034 swp_3035     FALSE 0.470 -3.000 0.015 NA   NA
 5435652 5435653 swp_3036 swp_3037     FALSE 0.676 98.000 0.074 1.000 N NA
 5435654 5435655 swp_3038 swp_3039     FALSE 0.669 146.000 0.055 NA Y NA
 5435655 5435656 swp_3039 swp_3040     FALSE 0.191 181.000 0.051 NA   NA
 5435656 5435657 swp_3040 swp_3041     FALSE 0.014 149.000 0.000 NA   NA
 5435657 5435658 swp_3041 swp_3042     FALSE 0.011 160.000 0.000 NA   NA
 5435658 5435659 swp_3042 swp_3043     TRUE 0.754 201.000 0.346 1.000 Y NA
 5435661 5435662 swp_3045 swp_3046     TRUE 0.994 10.000 0.432 0.003 Y NA
 5435662 5435663 swp_3046 swp_3047     TRUE 0.947 44.000 0.182 0.003 Y NA
 5435663 5435664 swp_3047 swp_3048     TRUE 0.993 11.000 0.380 0.003 Y NA
 5435664 5435665 swp_3048 swp_3049     TRUE 0.961 16.000 0.418 1.000 N NA
 5435665 5435666 swp_3049 swp_3050     TRUE 0.953 18.000 0.599 NA   NA
 5435666 5435667 swp_3050 swp_3051     FALSE 0.000 359.000 0.000 NA   NA
 5435669 5435670 swp_3054 swp_3055     TRUE 0.973 -3.000 0.389 1.000   NA
 5435671 5435672 swp_3056 swp_3057     FALSE 0.079 252.000 0.034 1.000 N NA
 5435674 5435675 swp_3059 swp_3060     FALSE 0.394 107.000 0.028 1.000   NA
 5435675 5435676 swp_3060 swp_3063     FALSE 0.001 265.000 0.000 NA   NA
 5435677 5435678 swp_3061 swp_3064     FALSE 0.001 331.000 0.000 NA   NA
 5435678 5435679 swp_3064 swp_3065     FALSE 0.025 95.000 0.000 NA   NA
 5435679 5435680 swp_3065 swp_3066     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5435681 5435682 swp_3068 swp_3069     FALSE 0.011 160.000 0.000 NA   NA
 5435682 5435683 swp_3069 swp_3071     TRUE 0.990 6.000 0.848 NA   NA
 5435684 5435685 swp_3070 swp_3072     FALSE 0.004 211.000 0.000 NA   NA
 5435686 5435687 swp_3073 swp_3074     FALSE 0.132 250.000 0.000 1.000 Y NA
 5435687 5435688 swp_3074 swp_3075     FALSE 0.069 208.000 0.000 1.000 N NA
 5435688 5435689 swp_3075 swp_3076     FALSE 0.651 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 5435689 5435690 swp_3076 swp_3077     FALSE 0.549 56.000 0.000 0.098 N NA
 5435690 5435691 swp_3077 swp_3078     TRUE 0.986 -3.000 0.211 0.040 Y NA
 5435691 5435692 swp_3078 swp_3079     TRUE 0.985 -10.000 0.577 0.031 Y NA
 5435692 5435693 swp_3079 swp_3080     TRUE 0.944 0.000 0.036 0.098 N NA
 5435693 5435694 swp_3080 swp_3081     TRUE 0.834 116.000 0.036 0.017 Y NA
 5435694 5435695 swp_3081 swp_3082     TRUE 0.995 0.000 0.800 0.098 N NA
 5435696 5435697 swp_3083 swp_3084     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5435697 5435698 swp_3084 swp_3085     FALSE 0.027 57.000 0.000 NA   NA
 5435704 5435705 swp_3091 swp_3092     TRUE 0.883 138.000 0.741 NA   NA
 5435705 5435706 swp_3092 swp_3093     TRUE 0.805 77.000 0.241 NA   NA
 5435707 5435708 swp_3094 swp_3095     TRUE 0.950 -51.000 0.778 1.000 Y NA
 5435708 5435709 swp_3095 swp_3096     TRUE 0.735 93.000 0.106 1.000 N NA
 5435710 5435711 swp_3097 swp_3099     FALSE 0.000 515.000 0.000 NA   NA
 5435711 5435712 swp_3099 swp_3100     FALSE 0.000 814.000 0.000 NA   NA
 5435713 5435714 swp_3101 swp_3102     FALSE 0.038 190.000 0.000 1.000   NA
 5435714 5435715 swp_3102 swp_3103     FALSE 0.106 139.000 0.015 NA   NA
 5435715 5435716 swp_3103 swp_3104     FALSE 0.011 163.000 0.000 NA   NA
 5435717 5435718 swp_3105 swp_3106     TRUE 0.976 13.000 0.556 1.000   NA
 5435718 5435719 swp_3106 swp_3109     TRUE 0.993 0.000 1.000 1.000   NA
 5435719 5435720 swp_3109 swp_3110     FALSE 0.338 241.000 0.400 NA   NA
 5435720 5435721 swp_3110 swp_3111     FALSE 0.012 154.000 0.000 NA   NA
 5435721 5435722 swp_3111 swp_3112     FALSE 0.004 526.000 0.000 1.000 N NA
 5435722 5435723 swp_3112 swp_3113     TRUE 0.831 98.000 0.262 1.000   NA
 5435723 5435724 swp_3113 swp_3114     FALSE 0.592 116.000 0.116 NA   NA
 5435724 5435725 swp_3114 swp_3115     TRUE 0.842 26.000 0.216 NA   NA
 5435725 5435726 swp_3115 swp_3116     TRUE 0.882 5.000 0.021 1.000 N NA
 5435726 5435727 swp_3116 swp_3117     FALSE 0.179 164.000 0.016 NA N NA
 5435727 5435728 swp_3117 swp_3118     FALSE 0.119 176.000 0.006 NA N NA
 5435728 5435729 swp_3118 swp_3119     TRUE 0.989 3.000 0.097 0.006 Y NA
 5435733 5435734 swp_3123 swp_3125     FALSE 0.067 163.000 0.014 NA   NA
 5435734 5435735 swp_3125 swp_3126     FALSE 0.630 28.000 0.076 NA   NA
 5435735 5435736 swp_3126 swp_3128     TRUE 0.783 87.000 0.224 NA   NA
 5435736 5435737 swp_3128 swp_3129     FALSE 0.622 32.000 0.053 1.000   NA
 5435737 5435738 swp_3129 swp_3130     TRUE 0.931 0.000 0.055 1.000 N NA
 5435738 5435739 swp_3130 swp_3131     TRUE 0.683 105.000 0.081 1.000 N NA
 5435742 5435743 swp_3134 swp_3135     FALSE 0.618 168.000 0.175 1.000 N NA
 5435743 5435744 swp_3135 swp_3136     TRUE 0.842 80.000 0.316 NA   NA
 5435744 5435745 swp_3136 swp_3137     TRUE 0.927 14.000 0.250 NA   NA
 5435746 5435747 swp_3138 swp_3139     FALSE 0.197 186.000 0.059 NA   NA
 5435747 5435748 swp_3139 swp_3140     TRUE 0.993 6.000 0.430 1.000 Y NA
 5435749 5435750 swp_3141 swp_3143     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5435750 5435751 swp_3143 swp_3144     TRUE 0.947 1.000 0.143 NA   NA
 5435751 5435752 swp_3144 swp_3145     TRUE 0.965 0.000 0.233 NA   NA
 5435752 5435753 swp_3145 swp_3146     TRUE 0.768 3.000 0.027 NA   NA
 5435753 5435754 swp_3146 swp_3148     TRUE 0.739 -6.000 0.061 NA   NA
 5435756 5435757 swp_3149 swp_3150     TRUE 0.975 -7.000 0.946 NA   NA
 5435757 5435758 swp_3150 swp_3151     FALSE 0.448 136.000 0.081 NA   NA
 5435758 5435759 swp_3151 swp_3153     FALSE 0.010 344.000 0.000 1.000 N NA
 5435759 5435760 swp_3153 swp_3154     FALSE 0.087 170.000 0.019 NA   NA
 5435760 5435761 swp_3154 swp_3155     FALSE 0.032 260.000 0.039 NA   NA
 5435761 5435762 swp_3155 swp_3156     TRUE 0.936 15.000 0.259 NA N NA
 5435762 5435763 swp_3156 swp_3157     FALSE 0.492 60.000 0.057 NA   NA
 5435763 5435764 swp_3157 swp_3158     FALSE 0.475 109.000 0.065 NA   NA
 5435764 5435765 swp_3158 swp_3159     FALSE 0.001 643.000 0.000 NA N NA
 5435765 5435766 swp_3159 swp_3160     FALSE 0.251 133.000 0.034 NA   NA
 5435767 5435768 swp_3161 swp_3162     FALSE 0.451 81.000 0.050 NA   NA
 5435768 5435769 swp_3162 swp_3163     FALSE 0.003 224.000 0.000 NA   NA
 5435769 5435770 swp_3163 swp_3164     FALSE 0.005 195.000 0.000 NA   NA
 5435770 5435771 swp_3164 swp_3165     TRUE 0.925 71.000 0.464 1.000 N NA
 5435771 5435772 swp_3165 swp_3166     FALSE 0.000 635.000 0.000 NA   NA
 5435772 5435773 swp_3166 swp_3167     FALSE 0.049 20.000 0.000 NA   NA
 5435773 5435774 swp_3167 swp_3168     FALSE 0.017 -36.000 0.000 NA   NA
 5435779 5435780 swp_3173 swp_3174     FALSE 0.536 99.000 0.080 NA   NA
 5435780 5435781 swp_3174 swp_3175     FALSE 0.341 69.000 0.032 NA   NA
 5435782 5435783 swp_3176 swp_3177     FALSE 0.017 298.000 0.000 1.000 N NA
 5435783 5435784 swp_3177 swp_3178     TRUE 0.993 -3.000 0.669 1.000 Y NA
 5435784 5435785 swp_3178 swp_3179     FALSE 0.010 168.000 0.000 NA   NA
 5435786 5435787 swp_3180 swp_3181     FALSE 0.629 46.000 0.100 NA   NA
 5435787 5435788 swp_3181 swp_3182     TRUE 0.946 -64.000 0.783 1.000 Y NA
 5435791 5435792 swp_3185 swp_3186     FALSE 0.000 868.000 0.000 NA   NA
 5435792 5435793 swp_3186 swp_3187     TRUE 0.907 40.000 0.500 NA   NA
 5435793 5435794 swp_3187 swp_3188     TRUE 0.945 21.000 0.562 NA   NA
 5435794 5435795 swp_3188 swp_3189     TRUE 0.880 -6.000 0.167 NA   NA
 5435795 5435796 swp_3189 swp_3190     TRUE 0.892 10.000 0.100 NA   NA
 5435796 5435797 swp_3190 swp_3191     TRUE 0.973 12.000 0.500 NA   NA
 5435797 5435798 swp_3191 swp_3192     TRUE 0.845 96.000 0.229 1.000 N NA
 5435798 5435799 swp_3192 swp_3193     TRUE 0.979 0.000 0.257 1.000 N NA
 5435799 5435800 swp_3193 swp_3194     FALSE 0.098 135.000 0.000 1.000   NA
 5435802 5435803 swp_3196 swp_3197     FALSE 0.020 122.000 0.000 NA   NA
 5435803 5435804 swp_3197 swp_3198     FALSE 0.455 19.000 0.029 NA   NA
 5435804 5435805 swp_3198 swp_3199     FALSE 0.384 78.000 0.021 1.000   NA
 5435805 5435806 swp_3199 swp_3200     TRUE 0.763 40.000 0.141 1.000   NA
 5435806 5435807 swp_3200 swp_3201     FALSE 0.666 113.000 0.155 NA   NA
 5435809 5435810 swp_3203 swp_3204     TRUE 0.990 3.000 0.625 1.000   NA
 5435810 5435811 swp_3204 swp_3205     TRUE 0.996 2.000 0.955 0.097   NA
 5435811 5435812 swp_3205 swp_3206     TRUE 0.988 14.000 0.917 0.040   NA
 5435812 5435813 swp_3206 swp_3207     TRUE 0.965 42.000 0.821 0.017   NA
 5435813 5435814 swp_3207 swp_3208     TRUE 0.989 0.000 0.750 NA   NA
 5435814 5435815 swp_3208 swp_3209     FALSE 7.94477287281107e-05 1393.000 0.000 NA   NA
 5435818 5435819 swp_3212 swp_3214     TRUE 0.956 9.000 0.189 1.000   NA
 5435819 5435820 swp_3214 swp_3216     TRUE 0.971 -3.000 0.434 NA   NA
 5435820 5435821 swp_3216 swp_3217     TRUE 0.926 11.000 0.171 NA   NA
 5435821 5435822 swp_3217 swp_3218     TRUE 0.735 12.000 0.043 NA   NA
 5435823 5435824 swp_tRNA63 swp_tRNA62     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5435824 5435825 swp_tRNA62 swp_tRNA61     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5435825 5435826 swp_tRNA61 swp_tRNA60     FALSE 0.001 288.000 0.000 NA   NA
 5435830 5435831 swp_3222 swp_3223     FALSE 0.025 95.000 0.000 NA   NA
 5435831 5435832 swp_3223 swp_3224     FALSE 0.125 10.000 0.000 NA   NA
 5435832 5435833 swp_3224 swp_3225     FALSE 0.013 -52.000 0.000 NA   NA
 5435833 5435834 swp_3225 swp_3226     FALSE 0.023 109.000 0.000 NA   NA
 5435834 5435835 swp_3226 swp_3227     FALSE 0.023 105.000 0.000 NA   NA
 5435837 5435838 swp_3229 swp_3230     FALSE 0.018 132.000 0.000 NA   NA
 5435838 5435839 swp_3230 swp_3231     FALSE 0.000 373.000 0.000 NA   NA
 5435839 5435840 swp_3231 swp_3232     FALSE 0.028 61.000 0.000 NA   NA
 5435840 5435841 swp_3232 swp_3233     FALSE 0.135 9.000 0.000 NA   NA
 5435841 5435842 swp_3233 swp_3234     FALSE 0.024 99.000 0.000 NA   NA
 5435843 5435844 swp_3235 swp_3236     FALSE 0.023 106.000 0.000 NA   NA
 5435844 5435845 swp_3236 swp_3237     FALSE 0.053 18.000 0.000 NA   NA
 5435845 5435846 swp_3237 swp_3238     FALSE 0.004 210.000 0.000 NA   NA
 5435847 5435848 swp_3239 swp_3240     FALSE 0.011 251.000 0.000 1.000   NA
 5435850 5435851 swp_3243 swp_3244     FALSE 0.037 292.000 0.065 NA   NA
 5435851 5435852 swp_3244 swp_3246     TRUE 0.936 47.000 0.791 NA   NA
 5435852 5435853 swp_3246 swp_3247     TRUE 0.757 79.000 0.190 NA   NA
 5435853 5435854 swp_3247 swp_3248     TRUE 0.944 67.000 0.913 NA   NA
 5435854 5435855 swp_3248 swp_3249     TRUE 0.957 21.000 0.739 NA   NA
 5435856 5435857 swp_3250 swp_3251     TRUE 0.917 67.000 0.402 1.000 N NA
 5435857 5435858 swp_3251 swp_3252     TRUE 0.974 0.000 0.118 0.031 N NA
 5435858 5435859 swp_3252 swp_3253     TRUE 0.935 -13.000 0.118 0.031 Y NA
 5435859 5435860 swp_3253 swp_3254     TRUE 0.990 5.000 0.272 1.000 Y NA
 5435860 5435861 swp_3254 swp_3255     TRUE 0.957 -19.000 0.239 0.000 Y NA
 5435861 5435862 swp_3255 swp_3256     FALSE 0.089 251.000 0.093 NA   NA
 5435863 5435864 swp_3257 swp_3258     FALSE 0.055 212.000 0.011 1.000   NA
 5435864 5435865 swp_3258 swp_3259     FALSE 0.029 257.000 0.000 1.000 N NA
 5435865 5435866 swp_3259 swp_3260     TRUE 0.695 206.000 0.201 0.070 Y NA
 5435866 5435867 swp_3260 swp_3261     TRUE 0.968 85.000 0.352 0.001 Y NA
 5435867 5435868 swp_3261 swp_3262     TRUE 0.945 90.000 0.351 1.000 Y NA
 5435871 5435872 swp_3265 swp_3266     TRUE 0.958 11.000 0.237 1.000   NA
 5435875 5435876 swp_3269 swp_3270     FALSE 0.201 183.000 0.016 1.000 N NA
 5435876 5435877 swp_3270 swp_3271     TRUE 0.989 -7.000 0.778 1.000 Y NA
 5435878 5435879 swp_3272 swp_3273     TRUE 0.982 13.000 0.875 NA   NA
 5435879 5435880 swp_3273 swp_3274     TRUE 0.955 34.000 1.000 NA   NA
 5435880 5435881 swp_3274 swp_3275     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5435881 5435882 swp_3275 swp_3276     FALSE 0.000 493.000 0.000 NA   NA
 5435882 5435883 swp_3276 swp_3277     FALSE 0.000 469.000 0.000 NA   NA
 5435883 5435884 swp_3277 swp_3278     FALSE 0.000 360.000 0.000 NA   NA
 5435884 5435885 swp_3278 swp_3279     TRUE 0.920 106.000 0.769 NA   NA
 5435885 5435886 swp_3279 swp_3280     TRUE 0.979 13.000 0.769 NA   NA
 5435886 5435887 swp_3280 swp_3281     FALSE 0.027 312.000 0.000 0.012   NA
 5435889 5435890 swp_3283 swp_3284     FALSE 0.306 30.000 0.023 NA   NA
 5435891 5435892 swp_3285 swp_3286     FALSE 0.010 256.000 0.000 1.000   NA
 5435892 5435893 swp_3286 swp_3287     FALSE 0.000 801.000 0.000 NA   NA
 5435893 5435894 swp_3287 swp_3288     FALSE 0.000 716.000 0.000 NA   NA
 5435895 5435896 swp_3289 swp_3290     FALSE 0.220 80.000 0.020 NA   NA
 5435896 5435897 swp_3290 swp_3291     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 5435897 5435898 swp_3291 swp_3292     TRUE 0.850 129.000 0.141 1.000 Y NA
 5435898 5435899 swp_3292 swp_3293     FALSE 0.203 193.000 0.030 1.000 N NA
 5435901 5435902 swp_3295 swp_3296     FALSE 9.32059662068318e-05 1011.000 0.000 NA   NA
 5435906 5435907 swp_3301 swp_3303     FALSE 8.68402292106121e-05 1154.000 0.000 NA   NA
 5435908 5435909 swp_3304 swp_3305     TRUE 0.878 9.000 0.000 0.050 N NA
 5435909 5435910 swp_3305 swp_3306     FALSE 0.397 114.000 0.000 0.050   NA
 5435910 5435911 swp_3306 swp_3307     FALSE 0.170 36.000 0.000 1.000   NA
 5435911 5435912 swp_3307 swp_3308     FALSE 0.028 62.000 0.000 NA   NA
 5435913 5435914 swp_3309 swp_3310     FALSE 0.000 448.000 0.000 NA   NA
 5435917 5435918 swp_3312 swp_3313     FALSE 0.000 718.000 0.000 NA   NA
 5435919 5435920 swp_3315 swp_3316     FALSE 0.156 6.000 0.000 NA   NA
 5435920 5435921 swp_3316 swp_3317     FALSE 0.003 217.000 0.000 NA   NA
 5435921 5435922 swp_3317 swp_3318     FALSE 0.030 198.000 0.000 1.000   NA
 5435922 5435923 swp_3318 swp_3319     TRUE 0.985 0.000 0.348 1.000 N NA
 5435924 5435925 swp_3320 swp_3321     FALSE 0.009 261.000 0.000 1.000   NA
 5435925 5435926 swp_3321 swp_3322     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5435928 5435929 swp_3324 swp_3325     FALSE 0.001 275.000 0.000 NA   NA
 5435929 5435930 swp_3325 swp_3326     TRUE 0.792 36.000 0.200 NA   NA
 5435930 5435931 swp_3326 swp_3327     FALSE 0.014 147.000 0.000 NA   NA
 5435931 5435932 swp_3327 swp_3328     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.068 Y NA
 5435932 5435933 swp_3328 swp_3329     TRUE 0.900 127.000 0.500 1.000 N NA
 5435933 5435934 swp_3329 swp_3330     TRUE 0.980 48.000 1.000 1.000 Y NA
 5435934 5435935 swp_3330 swp_3331     TRUE 0.922 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5435935 5435936 swp_3331 swp_3332     FALSE 0.003 346.000 0.000 1.000   NA
 5435936 5435937 swp_3332 swp_3333     FALSE 0.543 36.000 0.040 1.000   NA
 5435937 5435938 swp_3333 swp_3334     TRUE 0.985 7.000 0.418 1.000 N NA
 5435938 5435939 swp_3334 swp_3335     TRUE 0.983 7.000 0.286 0.020   NA
 5435939 5435940 swp_3335 swp_3336     TRUE 0.890 76.000 0.377 1.000   NA
 5435940 5435941 swp_3336 swp_3337     FALSE 0.001 261.000 0.000 NA   NA
 5435941 5435942 swp_3337 swp_3338     FALSE 0.024 -22.000 0.000 NA   NA
 5435942 5435943 swp_3338 swp_3339     FALSE 0.028 75.000 0.000 NA   NA
 5435945 5435946 swp_3341 swp_3342     FALSE 0.011 627.000 0.091 1.000   NA
 5435946 5435947 swp_3342 swp_3343     FALSE 0.001 768.000 0.000 NA N NA
 5435947 5435948 swp_3343 swp_3344     TRUE 0.956 25.000 0.330 NA Y NA
 5435948 5435949 swp_3344 swp_3345     TRUE 0.981 32.000 0.511 0.002 Y NA
 5435949 5435950 swp_3345 swp_3346     TRUE 0.930 86.000 0.489 0.095   NA
 5435952 5435953 swp_3348 swp_3349     FALSE 0.000 359.000 0.000 NA   NA
 5435955 5435956 swp_3351 swp_3352     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5435956 5435957 swp_3352 swp_3353     FALSE 0.001 260.000 0.000 NA   NA
 5435958 5435959 swp_3354 swp_3355     TRUE 0.712 20.000 0.082 NA   NA
 5435959 5435960 swp_3355 swp_3356     FALSE 0.360 41.000 0.033 NA   NA
 5435960 5435961 swp_3356 swp_3357     FALSE 0.284 109.000 0.031 NA   NA
 5435961 5435962 swp_3357 swp_3358     FALSE 0.229 159.000 0.043 NA   NA
 5435962 5435963 swp_3358 swp_3359     FALSE 0.000 407.000 0.000 NA   NA
 5435963 5435964 swp_3359 swp_3360     TRUE 0.756 134.000 0.286 NA   NA
 5435964 5435965 swp_3360 swp_3361     TRUE 0.954 24.000 0.750 NA   NA
 5435965 5435966 swp_3361 swp_3362     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5435966 5435967 swp_3362 swp_3363     FALSE 0.113 11.000 0.000 NA   NA
 5435967 5435968 swp_3363 swp_3364     FALSE 0.001 345.000 0.000 NA   NA
 5435969 5435970 swp_3365 swp_3366     FALSE 0.024 100.000 0.000 NA   NA
 5435970 5435971 swp_3366 swp_3367     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5435971 5435972 swp_3367 swp_3368     FALSE 0.002 241.000 0.000 NA   NA
 5435973 5435974 swp_3369 swp_3370     FALSE 0.522 73.000 0.000 0.007   NA
 5435974 5435975 swp_3370 swp_3371     FALSE 0.000 769.000 0.000 NA   NA
 5435975 5435976 swp_3371 swp_3372     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 5435977 5435978 swp_3373 swp_3374     FALSE 0.022 115.000 0.000 NA   NA
 5435978 5435979 swp_3374 swp_3375     FALSE 9.37555578762297e-05 979.000 0.000 NA   NA
 5435979 5435980 swp_3375 swp_3377     FALSE 0.051 244.000 0.000 0.070   NA
 5435982 5435983 swp_3379 swp_3380     FALSE 0.255 172.000 0.061 NA   NA
 5435983 5435984 swp_3380 swp_3381     FALSE 0.015 142.000 0.000 NA   NA
 5435984 5435985 swp_3381 swp_3382     TRUE 0.839 30.000 0.034 1.000 Y NA
 5435985 5435986 swp_3382 swp_3383     TRUE 0.971 56.000 0.687 1.000 Y NA
 5435986 5435987 swp_3383 swp_3384     TRUE 0.997 0.000 0.627 0.002 Y NA
 5435987 5435988 swp_3384 swp_3385     TRUE 0.932 48.000 0.242 1.000 Y NA
 5435988 5435989 swp_3385 swp_3386     FALSE 0.399 209.000 0.185 1.000 N NA
 5435989 5435990 swp_3386 swp_3387     TRUE 0.781 178.000 0.457 1.000 N NA
 5435993 5435994 swp_3390 swp_3391     FALSE 0.007 183.000 0.000 NA   NA
 5435995 5435996 swp_3392 swp_3393     FALSE 0.263 73.000 0.024 NA   NA
 5435998 5435999 swp_3395 swp_3396     FALSE 0.001 290.000 0.000 NA   NA
 5435999 5436000 swp_3396 swp_3397     FALSE 0.245 -25.000 0.027 NA   NA
 5436000 5436001 swp_3397 swp_3398     FALSE 0.014 370.000 0.054 NA   NA
 5436001 5436002 swp_3398 swp_3399     TRUE 0.716 38.000 0.141 NA   NA
 5436002 5436003 swp_3399 swp_3400     TRUE 0.839 64.000 0.057 1.000 Y NA
 5436005 5436006 swp_3403 swp_3404     TRUE 0.902 87.000 0.211 NA Y NA
 5436007 5436008 swp_3405 swp_3406     FALSE 0.001 728.000 0.000 1.000   NA
 5436008 5436009 swp_3406 swp_3407     TRUE 0.990 3.000 0.590 1.000   NA
 5436010 5436011 swp_3408 swp_3409     FALSE 0.027 79.000 0.000 NA   NA
 5436011 5436012 swp_3409 swp_3411     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 5436012 5436013 swp_3411 swp_3412     TRUE 0.729 106.000 0.113 1.000 N NA
 5436014 5436015 swp_3413 swp_3414     FALSE 0.662 27.000 0.083 NA   NA
 5436015 5436016 swp_3414 swp_3415     TRUE 0.982 6.000 0.480 NA   NA
 5436016 5436017 swp_3415 swp_3416     FALSE 0.017 484.000 0.120 NA   NA
 5436019 5436020 swp_3418 swp_3419     FALSE 0.022 -25.000 0.000 NA   NA
 5436020 5436021 swp_3419 swp_3420     TRUE 0.761 91.000 0.125 1.000 N NA
 5436024 5436025 swp_3423 swp_3424     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 5436025 5436026 swp_3424 swp_3425     FALSE 0.028 68.000 0.000 NA   NA
 5436026 5436027 swp_3425 swp_3426     FALSE 0.033 34.000 0.000 NA   NA
 5436027 5436028 swp_3426 swp_3427     FALSE 0.026 -19.000 0.000 NA   NA
 5436028 5436029 swp_3427 swp_3428     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5436029 5436030 swp_3428 swp_3430     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5436031 5436032 swp_3429 swp_3431     FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 5436034 5436035 swp_3433 swp_3434     FALSE 0.000 508.000 0.000 NA   NA
 5436036 5436037 swp_3435 swp_3436     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 5436042 5436043 swp_3441 swp_3442     TRUE 0.786 105.000 0.166 1.000 N NA
 5436043 5436044 swp_3442 swp_3443     TRUE 0.929 116.000 0.316 1.000 Y NA
 5436044 5436045 swp_3443 swp_3444     TRUE 0.921 40.000 0.189 1.000 Y NA
 5436045 5436046 swp_3444 swp_3445     TRUE 0.992 2.000 0.205 0.049 Y NA
 5436046 5436047 swp_3445 swp_3446     FALSE 0.505 8.000 0.012 NA   NA
 5436049 5436050 swp_3448 swp_3449     TRUE 0.832 84.000 0.120 0.049 N NA
 5436050 5436051 swp_3449 swp_3450     TRUE 0.990 14.000 0.352 0.000 Y NA
 5436051 5436052 swp_3450 swp_3451     FALSE 0.003 422.000 0.000 NA N NA
 5436053 5436054 swp_3452 swp_3453     FALSE 0.005 194.000 0.000 NA   NA
 5436055 5436056 swp_3454 swp_3456     FALSE 0.009 173.000 0.000 NA   NA
 5436057 5436058 swp_3457 swp_3458     TRUE 0.858 101.000 0.400 NA   NA
 5436058 5436059 swp_3458 swp_3459     TRUE 0.993 12.000 0.800 NA Y NA
 5436059 5436060 swp_3459 swp_3460     TRUE 0.920 42.000 0.500 1.000   NA
 5436060 5436061 swp_3460 swp_3461     TRUE 0.976 18.000 1.000 1.000   NA
 5436061 5436062 swp_3461 swp_3463     FALSE 0.001 647.000 0.000 1.000   NA
 5436068 5436069 swp_3470 swp_3471     FALSE 0.015 498.000 0.000 NA Y NA
 5436069 5436070 swp_3471 swp_3472     TRUE 0.998 0.000 0.929 0.015 Y NA
 5436071 5436072 swp_3473 swp_3474     FALSE 0.046 305.000 0.069 1.000   NA
 5436072 5436073 swp_3474 swp_3475     TRUE 0.998 0.000 0.874 0.003 Y NA
 5436073 5436074 swp_3475 swp_3476     FALSE 0.512 131.000 0.098 NA   NA
 5436074 5436075 swp_3476 swp_3477     TRUE 0.873 23.000 0.247 NA   NA
 5436075 5436076 swp_3477 swp_3478     TRUE 0.758 -7.000 0.082 NA   NA
 5436077 5436078 swp_3479 swp_3480     FALSE 0.083 146.000 0.000 1.000   NA
 5436078 5436079 swp_3480 swp_3483     FALSE 0.107 129.000 0.000 1.000   NA
 5436081 5436082 swp_3485 swp_3486     TRUE 0.961 14.000 0.315 1.000 N NA
 5436082 5436083 swp_3486 swp_3487     TRUE 0.963 101.000 0.732 NA Y NA
 5436083 5436084 swp_3487 swp_3488     TRUE 0.962 77.000 0.615 NA Y NA
 5436084 5436085 swp_3488 swp_3489     TRUE 0.976 54.000 0.589 0.030 Y NA
 5436085 5436086 swp_3489 swp_3490     TRUE 0.985 -3.000 0.621 1.000 N NA
 5436086 5436087 swp_3490 swp_3491     TRUE 0.987 0.000 0.421 1.000 N NA
 5436087 5436088 swp_3491 swp_3492     FALSE 0.293 151.000 0.053 NA   NA
 5436092 5436093 swp_3496 swp_3497     FALSE 0.426 27.000 0.000 1.000 N NA
 5436095 5436096 swp_3499 swp_3500     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5436096 5436097 swp_3500 swp_3501     FALSE 0.304 101.000 0.032 NA   NA
 5436097 5436098 swp_3501 swp_3502     FALSE 0.002 455.000 0.000 1.000   NA
 5436100 5436101 swp_3503 swp_3505     FALSE 0.000 689.000 0.000 NA   NA
 5436101 5436102 swp_3505 swp_3506     TRUE 0.936 4.000 0.015 0.029 N NA
 5436102 5436103 swp_3506 swp_3507     TRUE 0.686 175.000 0.104 1.000 Y NA
 5436103 5436104 swp_3507 swp_3508     TRUE 0.972 0.000 0.186 1.000 N NA
 5436104 5436105 swp_3508 swp_3509     TRUE 0.932 98.000 0.289 1.000 Y NA
 5436105 5436106 swp_3509 swp_3510     TRUE 0.990 -3.000 0.850 1.000 N NA
 5436106 5436107 swp_3510 swp_3511     TRUE 0.954 60.000 0.796 1.000 N NA
 5436107 5436108 swp_3511 swp_3512     TRUE 0.997 5.000 0.814 1.000 Y NA
 5436108 5436109 swp_3512 swp_3513     TRUE 0.873 78.000 0.104 1.000 Y NA
 5436109 5436110 swp_3513 swp_3514     TRUE 0.815 32.000 0.026 1.000 Y NA
 5436110 5436111 swp_3514 swp_3515     TRUE 0.974 15.000 0.568 1.000 N NA
 5436111 5436112 swp_3515 swp_3516     TRUE 0.983 5.000 0.372 1.000   NA
 5436112 5436113 swp_3516 swp_3518     TRUE 0.935 22.000 0.400 1.000   NA
 5436113 5436114 swp_3518 swp_3519     TRUE 0.729 185.000 0.409 1.000 N NA
 5436114 5436115 swp_3519 swp_3520     FALSE 0.448 263.000 0.626 1.000 N NA
 5436115 5436116 swp_3520 swp_3521     TRUE 0.842 149.000 0.416 1.000 N NA
 5436116 5436117 swp_3521 swp_3523     TRUE 0.956 136.000 0.748 1.000 Y NA
 5436118 5436119 swp_3524 swp_3525     FALSE 0.429 217.000 0.243 1.000 N NA
 5436119 5436120 swp_3525 swp_3526     TRUE 0.772 35.000 0.097 1.000 N NA
 5436120 5436121 swp_3526 swp_3527     FALSE 0.004 207.000 0.000 NA   NA
 5436122 5436123 swp_3528 swp_3529     FALSE 0.012 325.000 0.000 1.000 N NA
 5436123 5436124 swp_3529 swp_3530     FALSE 0.190 277.000 0.209 1.000 N NA
 5436124 5436125 swp_3530 swp_3531     TRUE 0.976 -3.000 0.518 NA   NA
 5436126 5436127 swp_3532 swp_3533     TRUE 0.980 0.000 0.402 NA   NA
 5436129 5436130 swp_3535 swp_3536     FALSE 0.027 55.000 0.000 NA   NA
 5436134 5436135 swp_3540 swp_3541     TRUE 0.973 6.000 0.322 NA   NA
 5436140 5436141 swp_3546 swp_3547     FALSE 0.002 257.000 0.000 NA   NA
 5436142 5436143 swp_3548 swp_3549     FALSE 0.000 433.000 0.000 NA   NA
 5436143 5436144 swp_3549 swp_3550     TRUE 0.989 0.000 0.714 NA   NA
 5436144 5436145 swp_3550 swp_3551     TRUE 0.994 0.000 0.667 0.003   NA
 5436145 5436146 swp_3551 swp_3553     TRUE 0.987 0.000 0.333 0.010   NA
 5436147 5436148 swp_3552 swp_tRNA59     FALSE 7.43977126850549e-05 4215.000 0.000 NA   NA
 5436148 5436149 swp_tRNA59 swp_tRNA58     FALSE 0.012 159.000 0.000 NA   NA
 5436151 5436152 swp_tRNA57 swp_tRNA56     FALSE 0.030 41.000 0.000 NA   NA
 5436152 5436153 swp_tRNA56 swp_3555     FALSE 8.0638231071946e-05 1370.000 0.000 NA   NA
 5436153 5436154 swp_3555 swp_3556     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5436158 5436159 swp_3560 swp_3561     FALSE 0.016 139.000 0.000 NA   NA
 5436159 5436160 swp_3561 swp_3562     FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 5436160 5436161 swp_3562 swp_3563     FALSE 0.002 425.000 0.000 1.000   NA
 5436162 5436163 swp_3564 swp_3565     FALSE 0.002 431.000 0.000 1.000   NA
 5436164 5436165 swp_3566 swp_3567     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5436165 5436166 swp_3567 swp_3568     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5436166 5436167 swp_3568 swp_3569     FALSE 0.000 362.000 0.000 NA   NA
 5436167 5436168 swp_3569 swp_3570     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5436169 5436170 swp_3571 swp_3572     TRUE 0.945 23.000 0.500 1.000   NA
 5436170 5436171 swp_3572 swp_3573     TRUE 0.938 -34.000 0.476 1.000 Y NA
 5436171 5436172 swp_3573 swp_3574     TRUE 0.840 126.000 0.429 NA   NA
 5436177 5436178 swp_3580 swp_3581     FALSE 0.261 49.000 0.024 NA   NA
 5436182 5436183 swp_3585 swp_3586     FALSE 0.002 253.000 0.000 NA   NA
 5436184 5436185 swp_3587 swp_3588     FALSE 0.033 34.000 0.000 NA   NA
 5436185 5436186 swp_3588 swp_3589     FALSE 0.315 187.000 0.013 0.029 N NA
 5436186 5436187 swp_3589 swp_3590     FALSE 0.028 60.000 0.000 NA   NA
 5436187 5436188 swp_3590 swp_3591     FALSE 0.028 47.000 0.000 NA   NA
 5436191 5436192 swp_3594 swp_3595     TRUE 0.985 3.000 0.476 NA   NA
 5436192 5436193 swp_3595 swp_3596     FALSE 0.351 48.000 0.000 1.000 N NA
 5436193 5436194 swp_3596 swp_3597     FALSE 0.000 600.000 0.000 NA   NA
 5436195 5436196 swp_3598 swp_3599     FALSE 0.175 120.000 0.020 NA   NA
 5436196 5436197 swp_3599 swp_3600     FALSE 0.610 17.000 0.025 NA N NA
 5436197 5436198 swp_3600 swp_3601     TRUE 0.894 26.000 0.263 NA N NA
 5436199 5436200 swp_3602 swp_3603     FALSE 0.007 184.000 0.000 NA   NA
 5436200 5436201 swp_3603 swp_3604     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5436201 5436202 swp_3604 swp_3605     FALSE 0.125 10.000 0.000 NA   NA
 5436204 5436205 swp_3607 swp_3608     FALSE 0.213 76.000 0.019 NA   NA
 5436205 5436206 swp_3608 swp_3610     FALSE 0.658 108.000 0.144 NA   NA
 5436206 5436207 swp_3610 swp_3611     FALSE 0.299 83.000 0.029 NA   NA
 5436207 5436208 swp_3611 swp_3612     TRUE 0.727 -19.000 0.131 1.000   NA
 5436210 5436211 swp_3614 swp_3615     FALSE 0.183 198.000 0.029 1.000 N NA
 5436211 5436212 swp_3615 swp_3616     TRUE 0.995 5.000 0.566 1.000 Y NA
 5436213 5436214 swp_3617 swp_3618     TRUE 0.973 1.000 0.177 1.000 N NA
 5436214 5436215 swp_3618 swp_3619     TRUE 0.956 23.000 0.246 1.000 Y NA
 5436216 5436217 swp_3620 swp_3621     FALSE 0.001 273.000 0.000 NA   NA
 5436219 5436220 swp_3623 swp_3624     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5436220 5436221 swp_3624 swp_3625     FALSE 0.000 456.000 0.000 NA   NA
 5436221 5436222 swp_3625 swp_3626     FALSE 0.045 22.000 0.000 NA   NA
 5436222 5436223 swp_3626 swp_3627     FALSE 0.001 260.000 0.000 NA   NA
 5436225 5436226 swp_3629 swp_3630     FALSE 0.024 97.000 0.000 NA   NA
 5436227 5436228 swp_3631 swp_3632     FALSE 0.578 67.000 0.000 0.001   NA
 5436228 5436229 swp_3632 swp_3633     FALSE 0.185 31.000 0.000 1.000   NA
 5436229 5436230 swp_3633 swp_3635     FALSE 0.021 415.000 0.000 NA Y NA
 5436230 5436231 swp_3635 swp_3636     TRUE 0.992 9.000 0.508 NA Y NA
 5436231 5436232 swp_3636 swp_3637     TRUE 0.993 5.000 0.508 0.001   NA
 5436233 5436234 swp_3638 swp_3639     FALSE 0.010 166.000 0.000 NA   NA
 5436235 5436236 swp_3640 swp_3641     TRUE 0.840 1.000 0.042 NA   NA
 5436237 5436238 swp_3643 swp_3644     FALSE 0.026 -19.000 0.000 NA   NA
 5436238 5436239 swp_3644 swp_3645     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5436239 5436240 swp_3645 swp_3646     FALSE 0.028 63.000 0.000 NA   NA
 5436241 5436242 swp_3647 swp_3648     TRUE 0.778 70.000 0.167 1.000   NA
 5436242 5436243 swp_3648 swp_3649     FALSE 0.062 165.000 0.000 1.000   NA
 5436243 5436244 swp_3649 swp_3650     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5436244 5436245 swp_3650 swp_3651     FALSE 0.000 510.000 0.000 NA   NA
 5436246 5436247 swp_3652 swp_3653     TRUE 0.858 165.000 0.647 1.000 N NA
 5436247 5436248 swp_3653 swp_3654     FALSE 0.013 323.000 0.000 1.000 N NA
 5436250 5436251 swp_3657 swp_3658     FALSE 0.088 463.000 0.217 NA Y NA
 5436253 5436254 swp_3660 swp_3661     TRUE 0.917 16.000 0.286 NA   NA
 5436254 5436255 swp_3661 swp_3662     FALSE 0.022 112.000 0.000 NA   NA
 5436258 5436259 swp_3665 swp_3666     TRUE 0.713 152.000 0.250 1.000   NA
 5436259 5436260 swp_3666 swp_3667     FALSE 0.574 79.000 0.082 NA   NA
 5436260 5436261 swp_3667 swp_3668     TRUE 0.925 -3.000 0.178 NA   NA
 5436261 5436262 swp_3668 swp_3669     TRUE 0.690 107.000 0.167 NA   NA
 5436263 5436264 swp_3670 swp_3671     FALSE 0.009 415.000 0.004 1.000 N NA
 5436264 5436265 swp_3671 swp_3672     TRUE 0.990 14.000 0.436 0.012 Y NA
 5436266 5436267 swp_3673 swp_3674     FALSE 0.528 120.000 0.092 NA   NA
 5436267 5436268 swp_3674 swp_3675     TRUE 0.795 32.000 0.152 1.000   NA
 5436268 5436269 swp_3675 swp_3676     TRUE 0.905 15.000 0.220 NA   NA
 5436269 5436270 swp_3676 swp_3677     FALSE 0.544 84.000 0.076 NA   NA
 5436270 5436271 swp_3677 swp_3678     FALSE 0.077 223.000 0.050 NA   NA
 5436271 5436272 swp_3678 swp_3679     TRUE 0.976 0.000 0.218 1.000 N NA
 5436272 5436273 swp_3679 swp_3680     FALSE 0.133 126.000 0.016 NA   NA
 5436274 5436275 swp_3681 swp_3682     FALSE 0.000 427.000 0.000 NA   NA
 5436275 5436276 swp_3682 swp_3683     FALSE 0.051 198.000 0.021 NA   NA
 5436276 5436277 swp_3683 swp_3685     TRUE 0.933 0.000 0.123 NA   NA
 5436277 5436278 swp_3685 swp_3686     FALSE 0.601 54.000 0.092 NA   NA
 5436279 5436280 swp_3687 swp_3688     TRUE 0.962 3.000 0.150 NA N NA
 5436281 5436282 swp_3689 swp_3690     TRUE 0.928 40.000 0.676 NA   NA
 5436283 5436284 swp_3691 swp_3692     FALSE 9.1845087345992e-05 1025.000 0.000 NA   NA
 5436284 5436285 swp_3692 swp_3693     FALSE 0.003 219.000 0.000 NA   NA
 5436285 5436286 swp_3693 swp_3694     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5436286 5436287 swp_3694 swp_3695     FALSE 0.014 145.000 0.000 NA   NA
 5436287 5436288 swp_3695 swp_3696     FALSE 0.000 742.000 0.000 NA   NA
 5436288 5436289 swp_3696 swp_3697     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 5436290 5436291 swp_3698 swp_3699     FALSE 0.013 150.000 0.000 NA   NA
 5436291 5436292 swp_3699 swp_3700     FALSE 0.051 19.000 0.000 NA   NA
 5436292 5436293 swp_3700 swp_3701     FALSE 0.669 110.000 0.154 NA   NA
 5436293 5436294 swp_3701 swp_3703     TRUE 0.852 52.000 0.108 NA Y NA
 5436294 5436295 swp_3703 swp_3705     FALSE 0.162 219.000 0.000 NA Y NA
 5436295 5436296 swp_3705 swp_3706     TRUE 0.915 44.000 0.385 1.000 N NA
 5436296 5436297 swp_3706 swp_3707     TRUE 0.981 -3.000 0.556 1.000   NA
 5436298 5436299 swp_3708 swp_3709     FALSE 0.661 35.000 0.103 NA   NA
 5436299 5436300 swp_3709 swp_3710     FALSE 0.028 59.000 0.000 NA   NA
 5436301 5436302 swp_3711 swp_3712     FALSE 0.015 141.000 0.000 NA   NA
 5436304 5436305 swp_3714 swp_3715     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5436306 5436307 swp_3716 swp_3717     TRUE 0.920 174.000 0.846 NA Y NA
 5436308 5436309 swp_3718 swp_3719     TRUE 0.950 0.000 0.171 NA   NA
 5436309 5436310 swp_3719 swp_3720     TRUE 0.941 21.000 0.200 NA Y NA
 5436310 5436311 swp_3720 swp_3721     TRUE 0.984 3.000 0.438 NA   NA
 5436311 5436312 swp_3721 swp_3722     TRUE 0.892 29.000 0.348 NA   NA
 5436312 5436313 swp_3722 swp_3723     TRUE 0.916 58.000 0.630 NA   NA
 5436313 5436314 swp_3723 swp_3724     FALSE 0.211 140.000 0.009 NA N NA
 5436314 5436315 swp_3724 swp_3725     TRUE 0.976 15.000 0.626 1.000 N NA
 5436315 5436316 swp_3725 swp_3727     TRUE 0.986 6.000 0.417 1.000 N NA
 5436316 5436317 swp_3727 swp_3728     TRUE 0.947 11.000 0.147 1.000 N NA
 5436317 5436318 swp_3728 swp_3730     TRUE 0.897 31.000 0.254 1.000 N NA
 5436318 5436319 swp_3730 swp_3731     TRUE 0.780 72.000 0.169 1.000   NA
 5436320 5436321 swp_3732 swp_3733     FALSE 0.018 130.000 0.000 NA   NA
 5436324 5436325 swp_3736 swp_3737     FALSE 0.219 132.000 0.028 NA   NA
 5436326 5436327 swp_3738 swp_3739     FALSE 0.046 227.000 0.000 1.000 N NA
 5436329 5436330 swp_3741 swp_3742     TRUE 0.969 19.000 0.317 1.000 Y NA
 5436330 5436331 swp_3742 swp_3743     FALSE 0.132 235.000 0.116 NA   NA
 5436332 5436333 swp_3744 swp_3745     FALSE 0.016 139.000 0.000 NA   NA
 5436335 5436336 swp_3747 swp_3748     FALSE 0.014 149.000 0.000 NA   NA
 5436336 5436337 swp_3748 swp_3749     TRUE 0.930 71.000 0.233 1.000 Y NA
 5436337 5436338 swp_3749 swp_3750     TRUE 0.972 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 5436339 5436340 swp_3751 swp_3752     FALSE 0.000 421.000 0.000 NA   NA
 5436340 5436341 swp_3752 swp_3753     FALSE 0.564 112.000 0.097 NA   NA
 5436345 5436346 swp_3757 swp_3758     FALSE 0.024 272.000 0.015 NA N NA
 5436347 5436348 swp_3759 swp_3760     TRUE 0.876 40.000 0.364 NA   NA
 5436348 5436349 swp_3760 swp_3761     TRUE 0.768 139.000 0.333 NA   NA
 5436349 5436350 swp_3761 swp_3762     TRUE 0.983 86.000 0.885 0.041 Y NA
 5436350 5436351 swp_3762 swp_3763     FALSE 0.028 340.000 0.000 0.028 N NA
 5436351 5436352 swp_3763 swp_3764     TRUE 0.945 15.000 0.098 1.000 Y NA
 5436352 5436353 swp_3764 swp_3765     FALSE 0.013 321.000 0.000 1.000 N NA
 5436353 5436354 swp_3765 swp_3766     TRUE 0.970 37.000 0.567 1.000 Y NA
 5436354 5436355 swp_3766 swp_3767     TRUE 0.987 16.000 0.672 1.000 Y NA
 5436355 5436356 swp_3767 swp_3768     TRUE 0.980 21.000 0.342 0.009 Y NA
 5436356 5436357 swp_3768 swp_3769     FALSE 0.295 273.000 0.361 1.000 N NA
 5436358 5436359 swp_3770 swp_3771     TRUE 0.846 121.000 0.349 1.000   NA
 5436362 5436363 swp_3775 swp_3776     FALSE 0.136 96.000 0.000 1.000   NA
 5436363 5436364 swp_3776 swp_3777     TRUE 0.891 84.000 0.326 1.000 N NA
 5436364 5436365 swp_3777 swp_3778     TRUE 0.778 112.000 0.166 1.000 N NA
 5436365 5436366 swp_3778 swp_3779     FALSE 0.460 166.000 0.109 1.000   NA
 5436366 5436367 swp_3779 swp_3780     TRUE 0.950 -3.000 0.127 0.031   NA
 5436367 5436368 swp_3780 swp_3781     TRUE 0.964 2.000 0.117 1.000 N NA
 5436368 5436369 swp_3781 swp_3782     TRUE 0.744 138.000 0.187 1.000 N NA
 5436369 5436370 swp_3782 swp_3783     FALSE 0.439 133.000 0.045 NA N NA
 5436370 5436371 swp_3783 swp_3784     TRUE 0.961 80.000 0.609 NA Y NA
 5436371 5436372 swp_3784 swp_3785     TRUE 0.975 43.000 0.856 NA Y NA
 5436372 5436373 swp_3785 swp_3786     TRUE 0.955 27.000 0.705 NA N NA
 5436375 5436376 swp_3788 swp_3790     FALSE 0.001 315.000 0.000 NA   NA
 5436376 5436377 swp_3790 swp_3791     FALSE 0.666 145.000 0.226 NA   NA
 5436377 5436378 swp_3791 swp_3792     TRUE 0.935 -3.000 0.200 NA   NA
 5436378 5436379 swp_3792 swp_3793     FALSE 0.010 403.000 0.007 1.000 N NA
 5436379 5436380 swp_3793 swp_3794     FALSE 0.317 85.000 0.013 1.000   NA
 5436380 5436381 swp_3794 swp_3795     TRUE 0.945 101.000 0.923 1.000   NA
 5436381 5436382 swp_3795 swp_3796     TRUE 0.708 20.000 0.032 1.000 N NA
 5436383 5436384 swp_3797 swp_3798     FALSE 0.615 124.000 0.069 1.000 N NA
 5436385 5436386 swp_3799 swp_3801     FALSE 0.024 218.000 0.000 NA N NA
 5436386 5436387 swp_3801 swp_3802     FALSE 0.161 221.000 0.113 NA   NA
 5436388 5436389 swp_3803 swp_3804     TRUE 0.985 7.000 0.070 0.000 Y NA
 5436391 5436392 swp_3806 swp_3807     FALSE 0.006 430.000 0.000 1.000 N NA
 5436394 5436395 swp_3809 swp_3810     TRUE 0.957 -9.000 0.459 1.000 N NA
 5436395 5436396 swp_3810 swp_3811     TRUE 0.988 10.000 0.634 1.000 N NA
 5436396 5436397 swp_3811 swp_3812     FALSE 0.016 -39.000 0.000 NA   NA
 5436397 5436398 swp_3812 swp_3813     FALSE 0.007 184.000 0.000 NA   NA
 5436398 5436399 swp_3813 swp_3814     TRUE 0.899 59.000 0.500 NA   NA
 5436399 5436400 swp_3814 swp_3815     FALSE 0.022 310.000 0.049 NA   NA
 5436400 5436401 swp_3815 swp_3816     FALSE 0.027 77.000 0.000 NA   NA
 5436402 5436403 swp_3818 swp_3819     TRUE 0.885 10.000 0.092 NA   NA
 5436403 5436404 swp_3819 swp_3820     FALSE 0.004 332.000 0.000 1.000   NA
 5436404 5436405 swp_3820 swp_3821     FALSE 0.011 252.000 0.000 1.000   NA
 5436405 5436406 swp_3821 swp_3822     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5436406 5436407 swp_3822 swp_3823     FALSE 0.004 207.000 0.000 NA   NA
 5436407 5436408 swp_3823 swp_3824     FALSE 0.027 54.000 0.000 NA   NA
 5436410 5436411 swp_3826 swp_3828     FALSE 0.018 133.000 0.000 NA   NA
 5436414 5436415 swp_3830 swp_3831     TRUE 0.779 43.000 0.117 1.000 N NA
 5436415 5436416 swp_3831 swp_3832     FALSE 0.485 152.000 0.125 NA   NA
 5436416 5436417 swp_3832 swp_3833     TRUE 0.905 -3.000 0.135 NA   NA
 5436417 5436418 swp_3833 swp_3834     TRUE 0.924 -3.000 0.173 NA   NA
 5436422 5436423 swp_3838 swp_3839     TRUE 0.814 39.000 0.184 NA N NA
 5436425 5436426 swp_3841 swp_3842     FALSE 0.055 17.000 0.000 NA   NA
 5436428 5436429 swp_3844 swp_3846     FALSE 0.143 197.000 0.015 1.000 N NA
 5436429 5436430 swp_3846 swp_3847     FALSE 0.226 134.000 0.030 NA   NA
 5436430 5436431 swp_3847 swp_3848     TRUE 0.836 68.000 0.286 NA   NA
 5436432 5436433 swp_3849 swp_3850     FALSE 0.467 -7.000 0.026 NA   NA
 5436436 5436437 swp_3853 swp_3854     TRUE 0.950 0.000 0.063 0.040   NA
 5436437 5436438 swp_3854 swp_3855     TRUE 0.975 0.000 0.180 0.040   NA
 5436438 5436439 swp_3855 swp_3856     TRUE 0.988 2.000 0.300 0.008   NA
 5436439 5436440 swp_3856 swp_3857     FALSE 0.007 280.000 0.000 1.000   NA
 5436442 5436443 swp_3859 swp_3860     FALSE 0.011 594.000 0.048 1.000 N NA
 5436443 5436444 swp_3860 swp_3861     TRUE 0.934 25.000 0.522 NA   NA
 5436444 5436445 swp_3861 swp_3862     TRUE 0.976 -3.000 0.524 NA   NA
 5436449 5436450 swp_3866 swp_3867     FALSE 0.015 232.000 0.000 1.000   NA
 5436450 5436451 swp_3867 swp_3868     FALSE 0.016 138.000 0.000 NA   NA
 5436451 5436452 swp_3868 swp_3869     TRUE 0.888 37.000 0.400 NA   NA
 5436454 5436455 swp_3871 swp_3872     FALSE 0.258 33.000 0.020 NA   NA
 5436455 5436456 swp_3872 swp_3873     TRUE 0.764 19.000 0.070 NA N NA
 5436456 5436457 swp_3873 swp_3874     FALSE 0.481 86.000 0.058 NA   NA
 5436457 5436458 swp_3874 swp_3875     FALSE 0.030 204.000 0.014 NA   NA
 5436460 5436461 swp_3877 swp_3878     FALSE 0.024 98.000 0.000 NA   NA
 5436463 5436464 swp_3880 swp_3881     FALSE 0.431 87.000 0.007 1.000 N NA
 5436465 5436466 swp_3882 swp_3883     FALSE 0.009 173.000 0.000 NA   NA
 5436466 5436467 swp_3883 swp_3884     TRUE 0.959 -7.000 0.298 0.005   NA
 5436467 5436468 swp_3884 swp_3885     TRUE 0.858 133.000 0.073 0.005 Y NA
 5436471 5436472 swp_3888 swp_3889     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5436473 5436474 swp_3890 swp_3891     TRUE 0.932 41.000 0.229 1.000 Y NA
 5436474 5436475 swp_3891 swp_3892     TRUE 0.954 14.000 0.171 0.028 N NA
 5436476 5436477 swp_3893 swp_3895     TRUE 0.912 -3.000 0.077 1.000 N NA
 5436480 5436481 swp_3898 swp_3899     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 5436482 5436483 swp_3901 swp_3902     FALSE 0.020 122.000 0.000 NA   NA
 5436484 5436485 swp_3903 swp_3904     TRUE 0.911 52.000 0.184 1.000 Y NA
 5436485 5436486 swp_3904 swp_3905     FALSE 0.264 152.000 0.005 1.000 N NA
 5436487 5436488 swp_3906 swp_3907     FALSE 0.081 135.000 0.010 NA   NA
 5436488 5436489 swp_3907 swp_3908     TRUE 0.690 163.000 0.220 1.000 N NA
 5436489 5436490 swp_3908 swp_3909     TRUE 0.948 -7.000 0.457 NA   NA
 5436490 5436491 swp_3909 swp_3910     TRUE 0.765 28.000 0.150 NA   NA
 5436491 5436492 swp_3910 swp_3911     TRUE 0.943 36.000 0.557 1.000 N NA
 5436493 5436494 swp_3912 swp_3913     FALSE 0.000 438.000 0.000 NA   NA
 5436495 5436496 swp_3914 swp_3915     TRUE 0.797 60.000 0.182 NA N NA
 5436496 5436497 swp_3915 swp_3917     TRUE 0.967 0.000 0.199 NA N NA
 5436497 5436498 swp_3917 swp_3919     TRUE 0.921 0.000 0.045 1.000 N NA
 5436500 5436501 swp_3920 swp_3921     TRUE 0.974 0.000 0.307 NA   NA
 5436501 5436502 swp_3921 swp_3922     FALSE 0.179 109.000 0.019 NA   NA
 5436502 5436503 swp_3922 swp_3923     TRUE 0.826 -3.000 0.022 1.000 N NA
 5436503 5436504 swp_3923 swp_3924     FALSE 0.670 90.000 0.096 NA N NA
 5436504 5436505 swp_3924 swp_3925     TRUE 0.945 -13.000 0.298 NA Y NA
 5436505 5436506 swp_3925 swp_3926     TRUE 0.969 11.000 0.138 NA Y NA
 5436506 5436507 swp_3926 swp_3927     FALSE 0.264 142.000 0.041 NA   NA
 5436507 5436508 swp_3927 swp_3928     TRUE 0.775 88.000 0.219 NA   NA
 5436508 5436509 swp_3928 swp_3930     TRUE 0.992 -3.000 0.319 0.000 Y NA
 5436510 5436511 swp_3931 swp_3932     TRUE 0.947 0.000 0.121 1.000   NA
 5436511 5436512 swp_3932 swp_3933     FALSE 0.003 350.000 0.000 1.000   NA
 5436512 5436513 swp_3933 swp_rRNA1     FALSE 9.68327772615743e-05 913.000 0.000 NA   NA
 5436513 5436514 swp_rRNA1 swp_rRNA2     FALSE 0.002 256.000 0.000 NA   NA
 5436514 5436515 swp_rRNA2 swp_rRNA3     FALSE 0.000 377.000 0.000 NA   NA
 5436515 5436516 swp_rRNA3 swp_3934     FALSE 0.010 -596.000 0.000 NA   NA
 5436518 5436519 swp_3937 swp_3938     FALSE 0.004 209.000 0.000 NA   NA
 5436519 5436520 swp_3938 swp_3939     FALSE 0.321 182.000 0.108 NA   NA
 5436520 5436521 swp_3939 swp_3940     TRUE 0.949 0.000 0.168 NA   NA
 5436523 5436524 swp_3942 swp_3943     TRUE 0.951 -9.000 0.600 NA   NA
 5436524 5436525 swp_3943 swp_3944     TRUE 0.796 -7.000 0.074 1.000   NA
 5436525 5436526 swp_3944 swp_3945     FALSE 0.001 509.000 0.000 1.000   NA
 5436526 5436527 swp_3945 swp_3947     FALSE 0.000 703.000 0.000 NA   NA
 5436528 5436529 swp_3949 swp_3950     TRUE 0.995 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 5436530 5436531 swp_3951 swp_3952     FALSE 0.002 427.000 0.000 1.000   NA
 5436531 5436532 swp_3952 swp_3953     TRUE 0.920 86.000 0.692 NA   NA
 5436532 5436533 swp_3953 swp_3954     FALSE 0.028 50.000 0.000 NA   NA
 5436533 5436534 swp_3954 swp_3955     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5436534 5436535 swp_3955 swp_3956     TRUE 0.969 13.000 0.339 1.000 N NA
 5436537 5436538 swp_3958 swp_3959     FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 5436539 5436540 swp_3960 swp_3961     TRUE 0.950 88.000 0.254 0.021 Y NA
 5436542 5436543 swp_3963 swp_3964     FALSE 0.655 160.000 0.175 1.000 N NA
 5436543 5436544 swp_3964 swp_3965     FALSE 0.030 255.000 0.000 1.000 N NA
 5436545 5436546 swp_3966 swp_3967     FALSE 0.019 128.000 0.000 NA   NA
 5436546 5436547 swp_3967 swp_3968     FALSE 0.000 358.000 0.000 NA   NA
 5436549 5436550 swp_3970 swp_3971     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5436550 5436551 swp_3971 swp_3972     FALSE 0.000 393.000 0.000 NA   NA
 5436551 5436552 swp_3972 swp_3973     FALSE 0.287 179.000 0.000 0.037 N NA
 5436552 5436553 swp_3973 swp_3974     FALSE 0.451 122.000 0.024 1.000 N NA
 5436558 5436559 swp_3979 swp_3980     TRUE 0.774 194.000 0.473 0.016 N NA
 5436559 5436560 swp_3980 swp_3981     TRUE 0.996 0.000 0.551 0.037 Y NA
 5436560 5436561 swp_3981 swp_3982     FALSE 0.647 140.000 0.117 1.000 N NA
 5436561 5436562 swp_3982 swp_3983     TRUE 0.985 24.000 0.852 1.000 Y NA
 5436562 5436563 swp_3983 swp_3984     TRUE 0.975 3.000 0.053 1.000 Y NA
 5436563 5436564 swp_3984 swp_3985     FALSE 0.132 180.000 0.000 1.000 N NA
 5436566 5436567 swp_3987 swp_3988     FALSE 0.007 188.000 0.000 NA   NA
 5436567 5436568 swp_3988 swp_3989     FALSE 0.024 -22.000 0.000 NA   NA
 5436568 5436569 swp_3989 swp_3990     TRUE 0.948 41.000 0.379 NA Y NA
 5436569 5436570 swp_3990 swp_3991     TRUE 0.994 15.000 1.000 0.040 Y NA
 5436570 5436571 swp_3991 swp_3992     TRUE 0.962 -3.000 0.185 0.040   NA
 5436573 5436574 swp_3994 swp_3995     FALSE 0.029 44.000 0.000 NA   NA
 5436574 5436575 swp_3995 swp_3996     FALSE 0.028 49.000 0.000 NA   NA
 5436575 5436576 swp_3996 swp_3997     FALSE 0.001 275.000 0.000 NA   NA
 5436576 5436577 swp_3997 swp_3998     FALSE 0.011 162.000 0.000 NA   NA
 5436577 5436578 swp_3998 swp_3999     FALSE 0.000 518.000 0.000 NA   NA
 5436580 5436581 swp_4001 swp_4002     TRUE 0.978 -7.000 0.364 1.000 Y NA
 5436581 5436582 swp_4002 swp_4003     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5436582 5436583 swp_4003 swp_4004     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5436584 5436585 swp_4005 swp_4006     TRUE 0.966 2.000 0.209 NA   NA
 5436585 5436586 swp_4006 swp_4007     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5436586 5436587 swp_4007 swp_4008     FALSE 0.000 606.000 0.000 NA   NA
 5436587 5436588 swp_4008 swp_4009     FALSE 0.017 136.000 0.000 NA   NA
 5436588 5436589 swp_4009 swp_4010     TRUE 0.883 -7.000 0.200 NA   NA
 5436590 5436591 swp_4011 swp_4012     FALSE 0.102 12.000 0.000 NA   NA
 5436592 5436593 swp_4013 swp_4014     FALSE 0.000 392.000 0.000 NA   NA
 5436596 5436597 swp_4017 swp_4019     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5436600 5436601 swp_4021 swp_4022     FALSE 0.050 244.000 0.000 0.089   NA
 5436601 5436602 swp_4022 swp_4023     FALSE 0.000 779.000 0.000 NA   NA
 5436602 5436603 swp_4023 swp_4024     FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 5436606 5436607 swp_4027 swp_4028     FALSE 0.000 390.000 0.000 NA   NA
 5436608 5436609 swp_4029 swp_4030     TRUE 0.787 -3.000 0.032 1.000   NA
 5436610 5436611 swp_4031 swp_4032     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 5436612 5436613 swp_4033 swp_4034     FALSE 0.025 92.000 0.000 NA   NA
 5436613 5436614 swp_4034 swp_4035     FALSE 0.028 50.000 0.000 NA   NA
 5436615 5436616 swp_4036 swp_4039     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 5436617 5436618 swp_4040 swp_4041     FALSE 0.032 251.000 0.000 1.000 N NA
 5436618 5436619 swp_4041 swp_4042     FALSE 0.002 238.000 0.000 NA   NA
 5436621 5436622 swp_4044 swp_4045     FALSE 0.602 139.000 0.125 1.000   NA
 5436622 5436623 swp_4045 swp_4046     TRUE 0.936 25.000 0.458 1.000   NA
 5436623 5436624 swp_4046 swp_4047     TRUE 0.684 178.000 0.111 1.000 Y NA
 5436624 5436625 swp_4047 swp_4048     FALSE 0.671 118.000 0.121 NA N NA
 5436625 5436626 swp_4048 swp_4049     TRUE 0.707 61.000 0.150 NA   NA
 5436627 5436628 swp_4050 swp_4051     FALSE 0.649 63.000 0.112 NA   NA
 5436629 5436630 swp_4052 swp_4053     FALSE 0.020 121.000 0.000 NA   NA
 5436630 5436631 swp_4053 swp_4054     FALSE 0.024 100.000 0.000 NA   NA
 5436631 5436632 swp_4054 swp_4055     FALSE 0.001 342.000 0.000 NA   NA
 5436632 5436633 swp_4055 swp_4056     TRUE 0.939 77.000 0.291 1.000 Y NA
 5436633 5436634 swp_4056 swp_4057     TRUE 0.989 3.000 0.200 1.000 Y NA
 5436634 5436635 swp_4057 swp_4058     TRUE 0.963 44.000 0.574 0.002 N NA
 5436635 5436636 swp_4058 swp_4059     TRUE 0.959 42.000 0.417 1.000 Y NA
 5436637 5436638 swp_4060 swp_4062     FALSE 0.585 100.000 0.069 1.000   NA
 5436638 5436639 swp_4062 swp_4063     FALSE 0.395 69.000 0.021 1.000   NA
 5436639 5436640 swp_4063 swp_4064     FALSE 0.027 57.000 0.000 NA   NA
 5436640 5436641 swp_4064 swp_4065     FALSE 0.031 36.000 0.000 NA   NA
 5436643 5436644 swp_4067 swp_4068     TRUE 0.831 51.000 0.286 NA   NA
 5436644 5436645 swp_4068 swp_4069     TRUE 0.768 76.000 0.200 NA   NA
 5436646 5436647 swp_4070 swp_4072     TRUE 0.854 85.000 0.083 1.000 Y NA
 5436647 5436648 swp_4072 swp_4074     FALSE 0.271 125.000 0.000 1.000 N NA
 5436648 5436649 swp_4074 swp_4075     FALSE 0.664 83.000 0.059 1.000 N NA
 5436649 5436650 swp_4075 swp_4076     TRUE 0.967 2.000 0.214 NA   NA
 5436652 5436653 swp_4079 swp_4080     TRUE 0.905 21.000 0.257 1.000   NA
 5436653 5436654 swp_4080 swp_4081     FALSE 0.508 40.000 0.036 1.000   NA
 5436654 5436655 swp_4081 swp_4082     TRUE 0.950 0.000 0.091 1.000 N NA
 5436655 5436656 swp_4082 swp_4083     TRUE 0.855 -45.000 0.642 NA   NA
 5436657 5436658 swp_4084 swp_4085     TRUE 0.721 126.000 0.182 1.000   NA
 5436658 5436659 swp_4085 swp_4086     TRUE 0.924 66.000 0.561 1.000   NA
 5436659 5436660 swp_4086 swp_4087     TRUE 0.930 15.000 0.197 1.000 N NA
 5436660 5436661 swp_4087 swp_4088     FALSE 0.490 145.000 0.078 NA N NA
 5436661 5436662 swp_4088 swp_4089     TRUE 0.912 16.000 0.267 NA   NA
 5436662 5436663 swp_4089 swp_4090     FALSE 0.535 91.000 0.050 1.000   NA
 5436664 5436665 swp_4091 swp_4092     FALSE 0.345 110.000 0.040 NA   NA
 5436665 5436666 swp_4092 swp_4093     FALSE 0.638 46.000 0.104 NA   NA
 5436666 5436667 swp_4093 swp_4094     TRUE 0.982 -3.000 0.704 NA   NA
 5436667 5436668 swp_4094 swp_4095     FALSE 0.371 27.000 0.027 NA   NA
 5436668 5436669 swp_4095 swp_4096     TRUE 0.805 139.000 0.335 1.000   NA
 5436669 5436670 swp_4096 swp_4097     TRUE 0.991 16.000 0.667 0.009 Y NA
 5436673 5436674 swp_4101 swp_4102     FALSE 0.124 162.000 0.025 NA   NA
 5436675 5436676 swp_4103 swp_4104     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 5436676 5436677 swp_4104 swp_4105     FALSE 0.034 324.000 0.056 NA N NA
 5436677 5436678 swp_4105 swp_4106     TRUE 0.990 3.000 0.303 0.029 N NA
 5436678 5436679 swp_4106 swp_4107     TRUE 0.934 147.000 0.374 0.029 Y NA
 5436679 5436680 swp_4107 swp_4108     FALSE 0.036 199.000 0.000 NA N NA
 5436680 5436681 swp_4108 swp_4109     TRUE 0.894 11.000 0.078 NA N NA
 5436682 5436683 swp_4110 swp_4111     FALSE 0.140 180.000 0.036 NA   NA
 5436684 5436685 swp_4112 swp_4113     TRUE 0.727 128.000 0.227 NA   NA
 5436687 5436688 swp_4115 swp_4116     TRUE 0.989 -3.000 0.927 NA N NA
 5436688 5436689 swp_4116 swp_4117     FALSE 0.113 11.000 0.000 NA   NA
 5436689 5436690 swp_4117 swp_4118     FALSE 0.026 84.000 0.000 NA   NA
 5436692 5436693 swp_4120 swp_4121     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 5436697 5436698 swp_4125 swp_4126     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5436698 5436699 swp_4126 swp_4127     FALSE 0.194 38.000 0.000 NA N NA
 5436700 5436701 swp_4128 swp_4130     FALSE 0.004 211.000 0.000 NA   NA
 5436703 5436704 swp_4132 swp_4133     FALSE 0.001 327.000 0.000 NA   NA
 5436705 5436706 swp_4134 swp_4135     FALSE 0.614 -16.000 0.059 1.000   NA
 5436706 5436707 swp_4135 swp_4136     FALSE 0.000 368.000 0.000 NA   NA
 5436707 5436708 swp_4136 swp_4137     TRUE 0.911 -3.000 0.150 NA   NA
 5436708 5436709 swp_4137 swp_4138     TRUE 0.955 -10.000 0.750 NA   NA
 5436711 5436712 swp_4140 swp_4141     FALSE 0.013 150.000 0.000 NA   NA
 5436714 5436715 swp_4143 swp_4144     TRUE 0.987 2.000 0.080 0.008 Y NA
 5436715 5436716 swp_4144 swp_4145     TRUE 0.885 -10.000 0.080 0.003 N NA
 5436716 5436717 swp_4145 swp_4146     TRUE 0.996 4.000 0.889 0.008 N NA
 5436717 5436718 swp_4146 swp_4147     FALSE 0.001 624.000 0.000 1.000   NA
 5436718 5436719 swp_4147 swp_4148     TRUE 0.932 47.000 0.750 NA   NA
 5436719 5436720 swp_4148 swp_4149     FALSE 0.016 138.000 0.000 NA   NA
 5436720 5436721 swp_4149 swp_4150     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5436721 5436722 swp_4150 swp_4151     TRUE 0.989 10.000 1.000 NA   NA
 5436724 5436725 swp_4153 swp_4154     TRUE 0.679 183.000 0.132 1.000 Y NA
 5436725 5436726 swp_4154 swp_4156     TRUE 0.965 -3.000 0.038 0.028 Y NA
 5436726 5436727 swp_4156 swp_4157     TRUE 0.962 11.000 0.071 1.000 Y NA
 5436727 5436728 swp_4157 swp_4158     TRUE 0.907 111.000 0.214 1.000 Y NA
 5436728 5436729 swp_4158 swp_4159     FALSE 0.099 269.000 0.000 1.000 Y NA
 5436729 5436730 swp_4159 swp_4160     TRUE 0.964 3.000 0.167 1.000   NA
 5436730 5436731 swp_4160 swp_4161     FALSE 0.002 461.000 0.000 1.000   NA
 5436733 5436734 swp_4163 swp_4164     FALSE 0.001 543.000 0.000 1.000   NA
 5436734 5436735 swp_4164 swp_4165     FALSE 0.135 98.000 0.000 1.000   NA
 5436736 5436737 swp_4166 swp_4168     TRUE 0.847 83.000 0.214 1.000 N NA
 5436738 5436739 swp_4169 swp_4170     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5436739 5436740 swp_4170 swp_4171     FALSE 0.442 192.000 0.000 0.039 Y NA
 5436740 5436741 swp_4171 swp_4172     FALSE 0.019 129.000 0.000 NA   NA
 5436741 5436742 swp_4172 swp_4173     FALSE 9.48638202115816e-05 929.000 0.000 NA   NA
 5436742 5436743 swp_4173 swp_4174     FALSE 0.000 390.000 0.000 NA   NA
 5436743 5436744 swp_4174 swp_4175     FALSE 0.000 696.000 0.000 NA   NA
 5436744 5436745 swp_4175 swp_4176     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5436745 5436746 swp_4176 swp_4177     FALSE 0.001 593.000 0.000 NA N NA
 5436747 5436748 swp_4178 swp_4179     TRUE 0.855 119.000 0.298 1.000 N NA
 5436748 5436749 swp_4179 swp_4181     TRUE 0.772 87.000 0.213 NA   NA
 5436749 5436750 swp_4181 swp_4182     FALSE 0.558 162.000 0.196 NA   NA
 5436754 5436755 swp_4186 swp_4187     TRUE 0.886 47.000 0.429 NA   NA
 5436757 5436758 swp_4189 swp_4191     FALSE 0.178 153.000 0.031 NA   NA
 5436760 5436761 swp_4193 swp_4194     FALSE 0.028 73.000 0.000 NA   NA
 5436764 5436765 swp_4197 swp_4198     FALSE 0.024 96.000 0.000 NA   NA
 5436765 5436766 swp_4198 swp_4200     FALSE 0.097 357.000 0.114 NA Y NA
 5436767 5436768 swp_4199 swp_4202     FALSE 8.0638231071946e-05 1370.000 0.000 NA   NA
 5436768 5436769 swp_4202 swp_4203     FALSE 0.019 -30.000 0.000 NA   NA
 5436769 5436770 swp_4203 swp_4204     FALSE 0.010 168.000 0.000 NA   NA
 5436770 5436771 swp_4204 swp_4205     FALSE 0.042 436.000 0.152 1.000 N NA
 5436771 5436772 swp_4205 swp_4206     TRUE 0.696 95.000 0.161 NA   NA
 5436773 5436774 swp_4207 swp_4209     FALSE 0.000 536.000 0.000 NA   NA
 5436774 5436775 swp_4209 swp_4210     TRUE 0.928 36.000 0.641 NA   NA
 5436775 5436776 swp_4210 swp_4211     FALSE 0.365 153.000 0.077 NA   NA
 5436777 5436778 swp_4213 swp_4214     FALSE 0.481 133.000 0.059 1.000   NA
 5436778 5436779 swp_4214 swp_4215     FALSE 0.645 100.000 0.128 NA   NA
 5436779 5436780 swp_4215 swp_4216     TRUE 0.725 36.000 0.143 NA   NA
 5436781 5436782 swp_4217 swp_4218     TRUE 0.988 -3.000 0.631 0.045   NA
 5436784 5436785 swp_4220 swp_4221     FALSE 0.025 93.000 0.000 NA   NA
 5436786 5436787 swp_4222 swp_4223     FALSE 0.033 -15.000 0.000 NA   NA
 5436787 5436788 swp_4223 swp_4224     FALSE 0.014 -48.000 0.000 NA   NA
 5436789 5436790 swp_4225 swp_tRNA55     FALSE 0.011 -237.000 0.000 NA   NA
 5436790 5436791 swp_tRNA55 swp_tRNA54     FALSE 0.135 9.000 0.000 NA   NA
 5436791 5436792 swp_tRNA54 swp_tRNA53     FALSE 0.028 64.000 0.000 NA   NA
 5436792 5436793 swp_tRNA53 swp_4226     FALSE 0.000 795.000 0.000 NA   NA
 5436793 5436794 swp_4226 swp_4227     FALSE 0.176 233.000 0.082 1.000 N NA
 5436794 5436795 swp_4227 swp_4228     FALSE 0.289 202.000 0.079 1.000 N NA
 5436795 5436796 swp_4228 swp_4229     FALSE 0.401 119.000 0.013 1.000 N NA
 5436797 5436798 swp_4230 swp_4231     TRUE 0.921 70.000 0.333 0.009   NA
 5436798 5436799 swp_4231 swp_4232     FALSE 0.069 250.000 0.024 1.000 N NA
 5436799 5436800 swp_4232 swp_4234     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA N NA
 5436800 5436801 swp_4234 swp_4235     FALSE 0.001 311.000 0.000 NA   NA
 5436801 5436802 swp_4235 swp_4236     FALSE 0.012 158.000 0.000 NA   NA
 5436802 5436803 swp_4236 swp_4237     FALSE 0.579 156.000 0.157 1.000   NA
 5436804 5436805 swp_4238 swp_4239     FALSE 8.89159005181278e-05 1112.000 0.000 NA   NA
 5436805 5436806 swp_4239 swp_4240     FALSE 0.000 437.000 0.000 NA   NA
 5436806 5436807 swp_4240 swp_4241     FALSE 0.250 194.000 0.074 NA N NA
 5436807 5436808 swp_4241 swp_4242     FALSE 0.236 261.000 0.019 0.003 Y NA
 5436808 5436809 swp_4242 swp_4243     FALSE 0.120 387.000 0.070 0.003 Y NA
 5436809 5436810 swp_4243 swp_4244     TRUE 0.881 149.000 0.285 1.000 Y NA
 5436814 5436815 swp_4248 swp_4249     FALSE 0.005 197.000 0.000 NA   NA
 5436815 5436816 swp_4249 swp_4250     FALSE 0.000 872.000 0.000 NA   NA
 5436818 5436819 swp_4252 swp_4253     TRUE 0.932 9.000 0.154 NA   NA
 5436823 5436824 swp_4258 swp_4259     FALSE 0.633 171.000 0.294 NA   NA
 5436826 5436827 swp_4262 swp_4263     TRUE 0.872 122.000 0.167 1.000 Y NA
 5436828 5436829 swp_4264 swp_4265     FALSE 0.356 138.000 0.056 NA   NA
 5436829 5436830 swp_4265 swp_4266     FALSE 0.544 81.000 0.027 1.000 N NA
 5436830 5436831 swp_4266 swp_4267     FALSE 0.594 70.000 0.035 1.000 N NA
 5436831 5436832 swp_4267 swp_4268     TRUE 0.681 111.000 0.164 NA   NA
 5436833 5436834 swp_4269 swp_4270     FALSE 0.353 191.000 0.159 NA   NA
 5436835 5436836 swp_4271 swp_4272     FALSE 0.293 116.000 0.000 1.000 N NA
 5436836 5436837 swp_4272 swp_4273     FALSE 0.027 54.000 0.000 NA   NA
 5436838 5436839 swp_4275 swp_4276     FALSE 0.130 192.000 0.045 NA   NA
 5436841 5436842 swp_4278 swp_4279     FALSE 0.027 56.000 0.000 NA   NA
 5436842 5436843 swp_4279 swp_4280     FALSE 0.035 31.000 0.000 NA   NA
 5436843 5436844 swp_4280 swp_4282     FALSE 0.022 -25.000 0.000 NA   NA
 5436845 5436846 swp_4281 swp_4283     FALSE 0.001 270.000 0.000 NA   NA
 5436846 5436847 swp_4283 swp_4284     TRUE 0.902 67.000 0.500 NA   NA
 5436847 5436848 swp_4284 swp_4285     FALSE 0.571 107.000 0.063 NA N NA
 5436849 5436850 swp_4286 swp_4287     FALSE 0.023 105.000 0.000 NA   NA
 5436850 5436851 swp_4287 swp_4288     FALSE 0.029 42.000 0.000 NA   NA
 5436851 5436852 swp_4288 swp_4289     FALSE 0.000 733.000 0.000 NA   NA
 5436855 5436856 swp_4292 swp_4293     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5436859 5436860 swp_4296 swp_4297     TRUE 0.949 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 5436860 5436861 swp_4297 swp_4298     TRUE 0.959 -13.000 0.344 1.000 Y NA
 5436865 5436866 swp_4302 swp_4303     FALSE 0.001 308.000 0.000 NA   NA
 5436866 5436867 swp_4303 swp_4304     TRUE 0.979 13.000 0.162 0.027 Y NA
 5436869 5436870 swp_4306 swp_4307     TRUE 0.908 162.000 0.333 0.038 Y NA
 5436870 5436871 swp_4307 swp_4308     FALSE 0.000 396.000 0.000 NA   NA
 5436871 5436872 swp_4308 swp_4309     FALSE 0.020 121.000 0.000 NA   NA
 5436872 5436873 swp_4309 swp_4310     FALSE 0.022 115.000 0.000 NA   NA
 5436873 5436874 swp_4310 swp_4311     FALSE 8.78723947982213e-05 1136.000 0.000 NA   NA
 5436875 5436876 swp_4312 swp_4313     FALSE 0.344 14.000 0.000 1.000   NA
 5436877 5436878 swp_4316 swp_4317     FALSE 0.011 163.000 0.000 NA   NA
 5436878 5436879 swp_4317 swp_4318     FALSE 0.149 7.000 0.000 NA   NA
 5436879 5436880 swp_4318 swp_4319     TRUE 0.778 156.000 0.310 1.000 N NA
 5436881 5436882 swp_4320 swp_4321     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5436882 5436883 swp_4321 swp_4323     FALSE 0.002 796.000 0.038 NA   NA
 5436883 5436884 swp_4323 swp_4324     FALSE 0.654 101.000 0.135 NA   NA
 5436885 5436886 swp_4325 swp_4326     FALSE 0.114 204.000 0.008 1.000 N NA
 5436886 5436887 swp_4326 swp_4327     FALSE 0.584 263.000 0.551 1.000 Y NA
 5436887 5436888 swp_4327 swp_4328     FALSE 9.76882659527164e-05 909.000 0.000 NA   NA
 5436888 5436889 swp_4328 swp_4329     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5436889 5436890 swp_4329 swp_4330     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5436892 5436893 swp_4332 swp_4333     FALSE 0.277 191.000 0.049 1.000 N NA
 5436894 5436895 swp_4334 swp_4335     FALSE 0.486 -46.000 0.114 NA   NA
 5436895 5436896 swp_4335 swp_4336     TRUE 0.713 26.000 0.105 NA   NA
 5436896 5436897 swp_4336 swp_4337     FALSE 0.001 278.000 0.000 NA   NA
 5436897 5436898 swp_4337 swp_4338     FALSE 0.499 -55.000 0.130 NA   NA
 5436898 5436899 swp_4338 swp_4339     FALSE 0.000 662.000 0.000 NA   NA
 5436899 5436900 swp_4339 swp_4340     FALSE 0.651 89.000 0.058 1.000 N NA
 5436900 5436901 swp_4340 swp_4341     FALSE 0.001 562.000 0.000 1.000   NA
 5436902 5436903 swp_4343 swp_4344     FALSE 0.555 79.000 0.077 NA   NA
 5436903 5436904 swp_4344 swp_4345     TRUE 0.744 47.000 0.133 1.000   NA
 5436904 5436905 swp_4345 swp_4346     FALSE 0.000 458.000 0.000 NA   NA
 5436912 5436913 swp_4353 swp_4354     TRUE 0.996 -3.000 0.800 0.064 Y NA
 5436914 5436915 swp_4356 swp_4357     FALSE 0.002 420.000 0.000 1.000   NA
 5436915 5436916 swp_4357 swp_4358     TRUE 0.884 -12.000 0.310 NA   NA
 5436916 5436917 swp_4358 swp_4359     TRUE 0.993 2.000 0.933 NA   NA
 5436917 5436918 swp_4359 swp_4360     TRUE 0.987 0.000 0.630 NA   NA
 5436918 5436919 swp_4360 swp_4361     FALSE 0.005 321.000 0.000 NA N NA
 5436919 5436920 swp_4361 swp_4362     FALSE 9.43081700181636e-05 954.000 0.000 NA   NA
 5436920 5436921 swp_4362 swp_4363     FALSE 0.017 134.000 0.000 NA   NA
 5436921 5436922 swp_4363 swp_4364     FALSE 0.021 -27.000 0.000 NA   NA
 5436923 5436924 swp_4365 swp_4366     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA N NA
 5436924 5436925 swp_4366 swp_4367     FALSE 0.005 326.000 0.000 NA N NA
 5436925 5436926 swp_4367 swp_4368     TRUE 0.919 78.000 0.381 0.086   NA
 5436926 5436927 swp_4368 swp_4369     TRUE 0.966 -3.000 0.368 NA   NA
 5436928 5436929 swp_4370 swp_4371     FALSE 0.175 4.000 0.000 NA   NA
 5436931 5436932 swp_4374 swp_4375     FALSE 0.113 122.000 0.000 1.000   NA
 5436932 5436933 swp_4375 swp_4376     FALSE 0.365 41.000 0.000 1.000 N NA
 5436933 5436934 swp_4376 swp_4377     FALSE 0.203 150.000 0.000 1.000 N NA
 5436936 5436937 swp_4379 swp_4380     TRUE 0.858 26.000 0.158 1.000 N NA
 5436938 5436939 swp_4381 swp_4382     FALSE 0.099 76.000 0.007 NA   NA
 5436940 5436941 swp_4383 swp_4384     FALSE 0.004 526.000 0.000 1.000 N NA
 5436942 5436943 swp_4385 swp_4386     FALSE 0.492 161.000 0.151 NA   NA
 5436943 5436944 swp_4386 swp_4387     TRUE 0.861 52.000 0.231 1.000 N NA
 5436944 5436945 swp_4387 swp_4388     TRUE 0.691 181.000 0.131 1.000 Y NA
 5436945 5436946 swp_4388 swp_4389     TRUE 0.978 0.000 0.234 1.000 N NA
 5436946 5436947 swp_4389 swp_4390     TRUE 0.833 129.000 0.117 1.000 Y NA
 5436947 5436948 swp_4390 swp_4391     TRUE 0.973 61.000 0.395 0.000 Y NA
 5436948 5436949 swp_4391 swp_4392     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 5436949 5436950 swp_4392 swp_4393     TRUE 0.791 99.000 0.250 NA   NA
 5436950 5436951 swp_4393 swp_4394     TRUE 0.952 0.000 0.176 NA   NA
 5436952 5436953 swp_4395 swp_4396     TRUE 0.995 -3.000 0.688 0.063 Y NA
 5436953 5436954 swp_4396 swp_4397     FALSE 0.399 137.000 0.023 1.000 N NA
 5436954 5436955 swp_4397 swp_4398     FALSE 0.423 -34.000 0.025 1.000 N NA
 5436955 5436956 swp_4398 swp_4399     TRUE 0.887 32.000 0.235 1.000 N NA
 5436957 5436958 swp_4400 swp_4401     TRUE 0.927 13.000 0.133 1.000 N NA
 5436958 5436959 swp_4401 swp_4402     FALSE 0.005 314.000 0.000 1.000   NA
 5436959 5436960 swp_4402 swp_4403     FALSE 0.335 35.000 0.009 1.000   NA
 5436963 5436964 swp_4406 swp_4407     FALSE 0.012 325.000 0.000 1.000 N NA
 5436964 5436965 swp_4407 swp_4408     FALSE 0.023 272.000 0.000 1.000 N NA
 5436965 5436966 swp_4408 swp_4409     FALSE 0.000 833.000 0.000 NA   NA
 5436967 5436968 swp_4410 swp_4411     FALSE 0.000 665.000 0.000 NA   NA
 5436970 5436971 swp_4413 swp_4414     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5436971 5436972 swp_4414 swp_4415     FALSE 0.001 325.000 0.000 NA   NA
 5436972 5436973 swp_4415 swp_4416     FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 5436973 5436974 swp_4416 swp_4417     TRUE 0.923 9.000 0.133 NA   NA
 5436975 5436976 swp_4418 swp_4419     FALSE 0.009 171.000 0.000 NA   NA
 5436978 5436979 swp_4422 swp_4424     FALSE 0.295 204.000 0.125 1.000   NA
 5436979 5436980 swp_4424 swp_4425     FALSE 0.002 241.000 0.000 NA   NA
 5436980 5436981 swp_4425 swp_4426     FALSE 0.049 -9.000 0.000 NA   NA
 5436982 5436983 swp_4427 swp_4428     FALSE 0.022 -25.000 0.000 NA   NA
 5436985 5436986 swp_4430 swp_4431     FALSE 0.022 113.000 0.000 NA   NA
 5436989 5436990 swp_4434 swp_4435     FALSE 0.008 284.000 0.000 NA N NA
 5436990 5436991 swp_4435 swp_4436     TRUE 0.968 89.000 0.667 1.000 Y NA
 5436993 5436994 swp_4438 swp_4439     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5436994 5436995 swp_4439 swp_4440     FALSE 0.029 45.000 0.000 NA   NA
 5436995 5436996 swp_4440 swp_4441     FALSE 0.027 77.000 0.000 NA   NA
 5436996 5436997 swp_4441 swp_4442     TRUE 0.955 34.000 1.000 NA   NA
 5436998 5436999 swp_4443 swp_4444     FALSE 8.99708770644852e-05 1077.000 0.000 NA   NA
 5437000 5437001 swp_4445 swp_4446     FALSE 0.027 55.000 0.000 NA   NA
 5437001 5437002 swp_4446 swp_4447     FALSE 0.004 204.000 0.000 NA   NA
 5437003 5437004 swp_4448 swp_4449     FALSE 0.143 174.000 0.015 1.000   NA
 5437005 5437006 swp_4450 swp_4451     TRUE 0.949 129.000 0.353 0.017 Y NA
 5437009 5437010 swp_4454 swp_4455     TRUE 0.913 -3.000 0.114 1.000   NA
 5437010 5437011 swp_4455 swp_4456     FALSE 0.001 341.000 0.000 NA   NA
 5437011 5437012 swp_4456 swp_4457     TRUE 0.963 -10.000 0.750 NA N NA
 5437012 5437013 swp_4457 swp_4458     TRUE 0.906 26.000 0.132 NA Y NA
 5437017 5437018 swp_4462 swp_4463     FALSE 0.113 11.000 0.000 NA   NA
 5437021 5437022 swp_4466 swp_4467     FALSE 0.059 215.000 0.000 1.000 N NA
 5437025 5437026 swp_4469 swp_4471     FALSE 0.000 363.000 0.000 NA   NA
 5437026 5437027 swp_4471 swp_4472     FALSE 0.193 90.000 0.019 NA   NA
 5437027 5437028 swp_4472 swp_4473     TRUE 0.757 98.000 0.210 NA   NA
 5437028 5437029 swp_4473 swp_4474     FALSE 0.657 -39.000 0.201 NA   NA
 5437031 5437032 swp_4476 swp_4477     TRUE 0.712 19.000 0.031 1.000 N NA
 5437032 5437033 swp_4477 swp_4478     FALSE 0.006 621.000 0.021 1.000 N NA
 5437033 5437034 swp_4478 swp_4479     FALSE 0.199 184.000 0.017 1.000 N NA
 5437034 5437035 swp_4479 swp_4480     FALSE 0.630 86.000 0.079 1.000   NA
 5437038 5437039 swp_4483 swp_4484     TRUE 0.938 -7.000 0.375 NA   NA
 5437040 5437041 swp_4485 swp_4486     FALSE 0.028 62.000 0.000 NA   NA
 5437041 5437042 swp_4486 swp_4487     FALSE 0.055 17.000 0.000 NA   NA
 5437042 5437043 swp_4487 swp_4488     TRUE 0.966 12.000 0.400 NA   NA
 5437044 5437045 swp_4489 swp_4490     FALSE 0.658 239.000 0.333 0.037 Y NA
 5437046 5437047 swp_4491 swp_4492     FALSE 0.444 192.000 0.000 0.037 Y NA
 5437047 5437048 swp_4492 swp_4493     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 5437049 5437050 swp_4494 swp_4495     FALSE 0.028 47.000 0.000 NA   NA
 5437050 5437051 swp_4495 swp_4496     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5437051 5437052 swp_4496 swp_4497     FALSE 0.000 774.000 0.000 NA   NA
 5437052 5437053 swp_4497 swp_4499     TRUE 0.918 -7.000 0.286 NA   NA
 5437055 5437056 swp_4500 swp_4501     FALSE 0.444 192.000 0.000 0.037 Y NA
 5437057 5437058 swp_4502 swp_4503     TRUE 0.738 84.000 0.182 NA   NA
 5437059 5437060 swp_4504 swp_4505     FALSE 0.022 326.000 0.058 NA   NA
 5437060 5437061 swp_4505 swp_4506     TRUE 0.988 1.000 0.609 NA   NA
 5437061 5437062 swp_4506 swp_4507     TRUE 0.844 0.000 0.048 NA   NA
 5437062 5437063 swp_4507 swp_4508     TRUE 0.886 6.000 0.071 NA   NA
 5437063 5437064 swp_4508 swp_4509     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 5437066 5437067 swp_4511 swp_4512     FALSE 0.044 155.000 0.007 NA   NA
 5437068 5437069 swp_4513 swp_4514     FALSE 0.033 497.000 0.000 0.027 Y NA
 5437070 5437071 swp_4515 swp_4516     FALSE 0.451 152.000 0.109 NA   NA
 5437074 5437075 swp_4519 swp_4520     FALSE 0.677 -27.000 0.092 1.000 N NA
 5437077 5437078 swp_4522 swp_4524     FALSE 0.311 104.000 0.000 1.000 N NA
 5437080 5437081 swp_4525 swp_4526     FALSE 0.286 61.000 0.007 1.000   NA
 5437081 5437082 swp_4526 swp_4527     FALSE 0.082 269.000 0.000 0.001 N NA
 5437082 5437083 swp_4527 swp_4528     FALSE 0.021 470.000 0.000 1.000 Y NA
 5437086 5437087 swp_4531 swp_4532     FALSE 0.001 353.000 0.000 NA   NA
 5437087 5437088 swp_4532 swp_4533     FALSE 0.017 134.000 0.000 NA   NA
 5437088 5437089 swp_4533 swp_4534     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5437090 5437091 swp_4535 swp_4536     FALSE 0.000 835.000 0.000 NA   NA
 5437091 5437092 swp_4536 swp_4537     FALSE 0.000 386.000 0.000 NA   NA
 5437094 5437095 swp_4539 swp_4540     FALSE 0.005 194.000 0.000 NA   NA
 5437097 5437098 swp_4542 swp_4543     FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 5437098 5437099 swp_4543 swp_4544     FALSE 0.019 126.000 0.000 NA   NA
 5437101 5437102 swp_4547 swp_4548     FALSE 0.134 17.000 0.003 NA   NA
 5437102 5437103 swp_4548 swp_4549     FALSE 0.011 163.000 0.000 NA   NA
 5437103 5437104 swp_4549 swp_4550     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5437104 5437105 swp_4550 swp_4551     FALSE 0.033 227.000 0.004 1.000   NA
 5437106 5437107 swp_4552 swp_4553     FALSE 0.450 18.000 0.027 NA   NA
 5437107 5437108 swp_4553 swp_4554     FALSE 0.138 94.000 0.000 1.000   NA
 5437108 5437109 swp_4554 swp_4555     TRUE 0.988 11.000 0.200 0.008 Y NA
 5437109 5437110 swp_4555 swp_4556     FALSE 0.110 188.000 0.000 1.000 N NA
 5437110 5437111 swp_4556 swp_4557     TRUE 0.980 16.000 0.428 1.000 Y NA
 5437112 5437113 swp_4558 swp_4559     FALSE 0.098 278.000 0.122 1.000   NA
 5437114 5437115 swp_4560 swp_4561     FALSE 0.001 330.000 0.000 NA   NA
 5437116 5437117 swp_4562 swp_4563     TRUE 0.888 -13.000 0.347 NA   NA
 5437117 5437118 swp_4563 swp_4564     TRUE 0.872 21.000 0.053 NA Y NA
 5437118 5437119 swp_4564 swp_4565     FALSE 0.015 -40.000 0.000 NA   NA
 5437119 5437120 swp_4565 swp_4566     FALSE 0.028 50.000 0.000 NA   NA
 5437120 5437121 swp_4566 swp_4568     TRUE 0.743 56.000 0.133 NA N NA
 5437123 5437124 swp_4570 swp_4571     FALSE 0.002 259.000 0.000 NA   NA
 5437128 5437129 swp_4576 swp_4577     FALSE 0.002 441.000 0.000 1.000   NA
 5437129 5437130 swp_4577 swp_4578     FALSE 0.587 174.000 0.256 NA   NA
 5437130 5437131 swp_4578 swp_4579     TRUE 0.787 46.000 0.209 NA   NA
 5437131 5437132 swp_4579 swp_4580     FALSE 0.001 281.000 0.000 NA   NA
 5437132 5437133 swp_4580 swp_4581     TRUE 0.995 -3.000 0.583 0.003 Y NA
 5437133 5437134 swp_4581 swp_4582     TRUE 0.988 -7.000 0.500 0.044 Y NA
 5437134 5437135 swp_4582 swp_4583     FALSE 0.313 15.000 0.000 1.000   NA
 5437135 5437136 swp_4583 swp_4584     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5437136 5437137 swp_4584 swp_4585     FALSE 0.002 243.000 0.000 NA   NA
 5437138 5437139 swp_4586 swp_4587     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5437141 5437142 swp_4589 swp_4590     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5437143 5437144 swp_4591 swp_4592     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5437145 5437146 swp_4593 swp_4594     FALSE 0.262 205.000 0.000 1.000 Y NA
 5437146 5437147 swp_4594 swp_4595     TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5437147 5437148 swp_4595 swp_4596     FALSE 0.576 15.000 0.000 1.000 N NA
 5437150 5437151 swp_4598 swp_4599     TRUE 0.840 4.000 0.025 1.000   NA
 5437151 5437152 swp_4599 swp_4600     FALSE 0.075 161.000 0.015 NA   NA
 5437153 5437154 swp_4601 swp_4602     TRUE 0.692 86.000 0.150 NA   NA
 5437154 5437155 swp_4602 swp_4603     TRUE 0.789 24.000 0.150 NA   NA
 5437158 5437159 swp_4606 swp_4607     FALSE 0.325 92.000 0.000 1.000 N NA
 5437159 5437160 swp_4607 swp_4608     TRUE 0.964 -3.000 0.231 1.000 N NA
 5437162 5437163 swp_4610 swp_4611     TRUE 0.982 13.000 0.625 1.000 N NA
 5437163 5437164 swp_4611 swp_4612     TRUE 0.988 12.000 0.375 1.000 Y NA
 5437164 5437165 swp_4612 swp_4613     FALSE 0.000 437.000 0.000 NA   NA
 5437165 5437166 swp_4613 swp_4614     TRUE 0.753 139.000 0.310 NA   NA
 5437166 5437167 swp_4614 swp_4615     TRUE 0.863 69.000 0.345 NA   NA
 5437168 5437169 swp_4616 swp_4617     FALSE 0.349 95.000 0.019 1.000   NA
 5437169 5437170 swp_4617 swp_4618     TRUE 0.939 16.000 0.254 1.000 N NA
 5437170 5437171 swp_4618 swp_4619     FALSE 0.360 26.000 0.006 1.000   NA
 5437171 5437172 swp_4619 swp_4620     FALSE 0.262 99.000 0.027 NA   NA
 5437174 5437175 swp_4622 swp_4624     FALSE 8.2577076166971e-05 1307.000 0.000 NA   NA
 5437175 5437176 swp_4624 swp_4625     FALSE 0.028 68.000 0.000 NA   NA
 5437176 5437177 swp_4625 swp_4627     FALSE 0.008 182.000 0.000 NA   NA
 5437177 5437178 swp_4627 swp_4628     FALSE 0.012 243.000 0.000 1.000   NA
 5437178 5437179 swp_4628 swp_4629     TRUE 0.983 -3.000 0.750 NA   NA
 5437179 5437180 swp_4629 swp_4630     FALSE 0.000 692.000 0.000 NA   NA
 5437180 5437181 swp_4630 swp_4631     FALSE 0.287 190.000 0.050 1.000 N NA
 5437182 5437183 swp_4632 swp_4633     TRUE 0.982 9.000 0.571 NA   NA
 5437183 5437184 swp_4633 swp_4634     TRUE 0.968 0.000 0.250 NA   NA
 5437184 5437185 swp_4634 swp_4635     TRUE 0.772 -3.000 0.048 NA   NA
 5437185 5437186 swp_4635 swp_4636     TRUE 0.828 1.000 0.038 NA   NA
 5437186 5437187 swp_4636 swp_4638     FALSE 0.001 305.000 0.000 NA   NA
 5437189 5437190 swp_4639 swp_4640     FALSE 0.004 208.000 0.000 NA   NA
 5437191 5437192 swp_4641 swp_4642     TRUE 0.783 74.000 0.045 NA Y NA
 5437193 5437194 swp_4643 swp_4644     FALSE 0.001 298.000 0.000 NA   NA
 5437194 5437195 swp_4644 swp_4645     FALSE 0.024 103.000 0.000 NA   NA
 5437195 5437196 swp_4645 swp_4647     FALSE 0.028 60.000 0.000 NA   NA
 5437196 5437197 swp_4647 swp_4648     TRUE 0.939 99.000 1.000 NA   NA
 5437197 5437198 swp_4648 swp_4649     FALSE 0.223 -10.000 0.000 1.000   NA
 5437198 5437199 swp_4649 swp_4651     FALSE 0.165 90.000 0.000 NA N NA
 5437199 5437200 swp_4651 swp_4652     FALSE 0.132 124.000 0.000 NA N NA
 5437200 5437201 swp_4652 swp_4653     FALSE 0.632 3.000 0.000 NA N NA
 5437201 5437202 swp_4653 swp_4654     FALSE 0.188 42.000 0.000 NA N NA
 5437202 5437203 swp_4654 swp_4655     TRUE 0.970 43.000 0.625 1.000 Y NA
 5437203 5437204 swp_4655 swp_4656     FALSE 0.179 61.000 0.000 NA N NA
 5437204 5437205 swp_4656 swp_4657     FALSE 0.028 73.000 0.000 NA   NA
 5437206 5437207 swp_4658 swp_4659     TRUE 0.896 129.000 0.286 NA Y NA
 5437207 5437208 swp_4659 swp_4660     TRUE 0.988 -7.000 0.889 NA Y NA
 5437208 5437209 swp_4660 swp_4661     FALSE 0.002 429.000 0.000 1.000   NA
 5437211 5437212 swp_4663 swp_4664     FALSE 0.181 1.000 0.000 NA   NA
 5437212 5437213 swp_4664 swp_4665     FALSE 0.018 132.000 0.000 NA   NA
 5437213 5437214 swp_4665 swp_4666     FALSE 0.001 892.000 0.000 1.000   NA
 5437214 5437215 swp_4666 swp_4667     FALSE 0.000 370.000 0.000 NA   NA
 5437215 5437216 swp_4667 swp_4668     FALSE 0.004 208.000 0.000 NA   NA
 5437216 5437217 swp_4668 swp_4670     FALSE 0.551 83.000 0.000 0.062 N NA
 5437219 5437220 swp_4671 swp_tRNA32     FALSE 0.011 -387.000 0.000 NA   NA
 5437220 5437221 swp_tRNA32 swp_tRNA33     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5437221 5437222 swp_tRNA33 swp_4674     FALSE 0.000 800.000 0.000 NA   NA
 5437223 5437224 swp_4672 swp_4673     FALSE 0.000 592.000 0.000 NA   NA
 5437225 5437226 swp_4675 swp_4676     FALSE 0.049 20.000 0.000 NA   NA
 5437226 5437227 swp_4676 swp_4677     FALSE 0.022 -25.000 0.000 NA   NA
 5437227 5437228 swp_4677 swp_4678     FALSE 0.008 181.000 0.000 NA   NA
 5437228 5437229 swp_4678 swp_4679     FALSE 0.181 1.000 0.000 NA   NA
 5437229 5437230 swp_4679 swp_4680     FALSE 0.156 6.000 0.000 NA   NA
 5437230 5437231 swp_4680 swp_4681     FALSE 0.027 54.000 0.000 NA   NA
 5437232 5437233 swp_4682 swp_4683     FALSE 0.000 367.000 0.000 NA   NA
 5437233 5437234 swp_4683 swp_4684     FALSE 0.002 232.000 0.000 NA   NA
 5437234 5437235 swp_4684 swp_4685     FALSE 0.000 636.000 0.000 NA   NA
 5437235 5437236 swp_4685 swp_4686     FALSE 0.027 79.000 0.000 NA   NA
 5437236 5437237 swp_4686 swp_4687     FALSE 0.025 89.000 0.000 NA   NA
 5437237 5437238 swp_4687 swp_4688     FALSE 0.013 152.000 0.000 NA   NA
 5437238 5437239 swp_4688 swp_4689     FALSE 0.001 305.000 0.000 NA   NA
 5437239 5437240 swp_4689 swp_4690     FALSE 0.000 548.000 0.000 NA   NA
 5437242 5437243 swp_4692 swp_4693     FALSE 0.001 279.000 0.000 NA   NA
 5437243 5437244 swp_4693 swp_4694     FALSE 0.390 144.000 0.027 1.000 N NA
 5437244 5437245 swp_4694 swp_4695     FALSE 0.547 103.000 0.054 NA N NA
 5437247 5437248 swp_4697 swp_4698     FALSE 0.423 132.000 0.023 1.000 N NA
 5437248 5437249 swp_4698 swp_4699     TRUE 0.998 0.000 0.952 0.084 Y NA
 5437249 5437250 swp_4699 swp_4700     FALSE 0.040 403.000 0.034 NA Y NA
 5437254 5437255 swp_4704 swp_4705     FALSE 0.028 65.000 0.000 NA   NA
 5437257 5437258 swp_4707 swp_4708     FALSE 0.199 201.000 0.022 0.044   NA
 5437258 5437259 swp_4708 swp_4709     FALSE 0.664 91.000 0.099 1.000   NA
 5437259 5437260 swp_4709 swp_4710     TRUE 0.989 0.000 0.650 1.000   NA
 5437262 5437263 swp_4713 swp_4714     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5437264 5437265 swp_4715 swp_4716     FALSE 0.215 125.000 0.026 NA   NA
 5437266 5437267 swp_4717 swp_4718     FALSE 0.113 11.000 0.000 NA   NA
 5437267 5437268 swp_4718 swp_4719     FALSE 0.024 104.000 0.000 NA   NA
 5437268 5437269 swp_4719 swp_4720     FALSE 0.010 170.000 0.000 NA   NA
 5437269 5437270 swp_4720 swp_4723     TRUE 0.962 3.000 0.189 NA   NA
 5437271 5437272 swp_4722 swp_4724     FALSE 0.000 636.000 0.000 NA   NA
 5437272 5437273 swp_4724 swp_4725     TRUE 0.745 190.000 0.238 1.000 Y NA
 5437273 5437274 swp_4725 swp_4727     FALSE 0.001 504.000 0.002 NA   NA
 5437274 5437275 swp_4727 swp_4728     FALSE 0.008 179.000 0.000 NA   NA
 5437277 5437278 swp_4730 swp_4731     TRUE 0.989 11.000 0.556 0.000   NA
 5437278 5437279 swp_4731 swp_4732     FALSE 0.658 91.000 0.094 1.000   NA
 5437279 5437280 swp_4732 swp_4733     TRUE 0.966 50.000 0.566 1.000 Y NA
 5437281 5437282 swp_4735 swp_4736     FALSE 0.019 127.000 0.000 NA   NA
 5437282 5437283 swp_4736 swp_4737     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5437283 5437284 swp_4737 swp_4738     FALSE 0.064 -19.000 0.002 NA   NA
 5437287 5437288 swp_4741 swp_4742     FALSE 0.000 602.000 0.000 NA   NA
 5437288 5437289 swp_4742 swp_4743     FALSE 8.83927220157492e-05 1117.000 0.000 NA   NA
 5437290 5437291 swp_4744 swp_4746     FALSE 0.215 145.000 0.000 1.000 N NA
 5437291 5437292 swp_4746 swp_4747     FALSE 0.353 65.000 0.000 1.000 N NA
 5437292 5437293 swp_4747 swp_4748     FALSE 0.049 20.000 0.000 NA   NA
 5437293 5437294 swp_4748 swp_4749     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 5437294 5437295 swp_4749 swp_4751     TRUE 0.905 161.000 0.463 1.000 Y NA
 5437297 5437298 swp_4752 swp_4753     TRUE 0.759 69.000 0.105 1.000 N NA
 5437298 5437299 swp_4753 swp_4754     FALSE 0.035 308.000 0.029 1.000 N NA
 5437299 5437300 swp_4754 swp_4755     TRUE 0.933 47.000 0.249 1.000 Y NA
 5437305 5437306 swp_4760 swp_4761     FALSE 0.546 205.000 0.169 NA Y NA
 5437306 5437307 swp_4761 swp_4762     TRUE 0.967 45.000 0.362 0.015 Y NA
 5437307 5437308 swp_4762 swp_4763     TRUE 0.958 54.000 0.454 1.000 Y NA
 5437308 5437309 swp_4763 swp_4764     FALSE 0.231 230.000 0.122 1.000 N NA
 5437309 5437310 swp_4764 swp_4765     TRUE 0.908 9.000 0.110 NA   NA
 5437310 5437311 swp_4765 swp_4766     TRUE 0.865 49.000 0.356 NA   NA
 5437311 5437312 swp_4766 swp_4767     TRUE 0.929 -3.000 0.148 1.000   NA
 5437317 5437318 swp_4773 swp_4774     FALSE 0.000 494.000 0.000 NA   NA
 5437318 5437319 swp_4774 swp_4775     FALSE 0.002 238.000 0.000 NA   NA
 5437319 5437320 swp_4775 swp_4776     FALSE 0.000 521.000 0.000 NA   NA
 5437320 5437321 swp_4776 swp_4777     FALSE 0.557 151.000 0.167 NA   NA
 5437322 5437323 swp_4778 swp_4779     FALSE 0.011 162.000 0.000 NA   NA
 5437324 5437325 swp_4781 swp_4782     FALSE 0.246 175.000 0.061 NA   NA
 5437326 5437327 swp_4783 swp_4784     FALSE 0.204 234.000 0.188 NA   NA
 5437328 5437329 swp_4785 swp_4786     FALSE 0.001 335.000 0.000 NA   NA
 5437329 5437330 swp_4786 swp_4787     TRUE 0.755 105.000 0.214 NA   NA
 5437331 5437332 swp_4788 swp_4789     FALSE 0.013 615.000 0.145 NA   NA
 5437334 5437335 swp_4791 swp_4792     FALSE 0.331 136.000 0.008 1.000 N NA
 5437335 5437336 swp_4792 swp_4793     TRUE 0.982 0.000 0.355 1.000   NA
 5437336 5437337 swp_4793 swp_4795     TRUE 0.856 9.000 0.042 1.000   NA
 5437337 5437338 swp_4795 swp_4796     TRUE 0.988 7.000 0.283 0.001 N NA
 5437339 5437340 swp_4798 swp_4799     FALSE 0.000 824.000 0.000 NA   NA
 5437340 5437341 swp_4799 swp_4800     FALSE 0.160 222.000 0.051 1.000 N NA
 5437341 5437342 swp_4800 swp_4801     TRUE 0.977 9.000 0.121 1.000 Y NA
 5437342 5437343 swp_4801 swp_4802     TRUE 0.767 51.000 0.117 1.000 N NA
 5437344 5437345 swp_4804 swp_4805     TRUE 0.881 0.000 0.063 NA   NA
 5437347 5437348 swp_4807 swp_4808     TRUE 0.872 93.000 0.429 NA   NA
 5437348 5437349 swp_4808 swp_4809     TRUE 0.755 111.000 0.222 NA   NA
 5437349 5437350 swp_4809 swp_4810     TRUE 0.723 127.000 0.222 NA   NA
 5437350 5437351 swp_4810 swp_4811     TRUE 0.914 25.000 0.400 NA   NA
 5437351 5437352 swp_4811 swp_4812     TRUE 0.957 13.000 0.238 1.000 N NA
 5437355 5437356 swp_4815 swp_4816     TRUE 0.993 1.000 1.000 NA   NA
 5437358 5437359 swp_4819 swp_4820     TRUE 0.754 64.000 0.103 1.000 N NA
 5437360 5437361 swp_4821 swp_4822     TRUE 0.877 -3.000 0.071 1.000   NA
 5437361 5437362 swp_4822 swp_4823     FALSE 0.002 445.000 0.000 1.000   NA
 5437362 5437363 swp_4823 swp_4824     TRUE 0.997 10.000 0.741 0.002 Y NA
 5437363 5437364 swp_4824 swp_4825     TRUE 0.983 3.000 0.268 1.000 N NA
 5437364 5437365 swp_4825 swp_4826     TRUE 0.909 122.000 0.536 1.000 N NA
 5437367 5437368 swp_4828 swp_4830     FALSE 0.597 216.000 0.722 NA   NA
 5437370 5437371 swp_4832 swp_4833     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5437371 5437372 swp_4833 swp_4835     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5437372 5437373 swp_4835 swp_4836     TRUE 0.941 85.000 0.321 1.000 Y NA
 5437373 5437374 swp_4836 swp_4837     TRUE 0.760 26.000 0.099 1.000   NA
 5437374 5437375 swp_4837 swp_4838     FALSE 0.027 76.000 0.000 NA   NA
 5437381 5437382 swp_4844 swp_4845     FALSE 0.397 70.000 0.039 NA   NA
 5437383 5437384 swp_4846 swp_4847     FALSE 0.015 350.000 0.007 1.000 N NA
 5437387 5437388 swp_4850 swp_4852     FALSE 8.94419466985562e-05 1104.000 0.000 NA   NA
 5437388 5437389 swp_4852 swp_4854     FALSE 0.022 114.000 0.000 NA   NA
 5437391 5437392 swp_4855 swp_4856     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5437392 5437393 swp_4856 swp_4857     FALSE 0.028 61.000 0.000 NA   NA
 5437393 5437394 swp_4857 swp_4858     FALSE 0.028 72.000 0.000 NA   NA
 5437394 5437395 swp_4858 swp_4859     FALSE 0.001 327.000 0.000 NA   NA
 5437397 5437398 swp_4861 swp_4862     FALSE 0.028 67.000 0.000 NA   NA
 5437398 5437399 swp_4862 swp_4863     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5437399 5437400 swp_4863 swp_4864     FALSE 0.012 -73.000 0.000 NA   NA
 5437400 5437401 swp_4864 swp_4865     FALSE 0.033 312.000 0.000 0.083 N NA
 5437401 5437402 swp_4865 swp_4866     TRUE 0.968 26.000 0.400 1.000 Y NA
 5437402 5437403 swp_4866 swp_4867     FALSE 0.032 251.000 0.000 1.000 N NA
 5437403 5437404 swp_4867 swp_4868     FALSE 0.024 99.000 0.000 NA   NA
 5437405 5437406 swp_4869 swp_4870     FALSE 0.284 119.000 0.000 1.000 N NA
 5437407 5437408 swp_4871 swp_4872     FALSE 0.011 -201.000 0.000 NA   NA
 5437409 5437410 swp_4873 swp_4874     FALSE 0.329 89.000 0.000 1.000 N NA
 5437412 5437413 swp_4876 swp_4877     FALSE 0.021 117.000 0.000 NA   NA
 5437413 5437414 swp_4877 swp_4878     FALSE 0.049 20.000 0.000 NA   NA
 5437415 5437416 swp_4880 swp_4881     FALSE 0.024 96.000 0.000 NA   NA
 5437416 5437417 swp_4881 swp_4882     FALSE 0.019 129.000 0.000 NA   NA
 5437418 5437419 swp_4883 swp_4884     FALSE 0.028 50.000 0.000 NA   NA
 5437419 5437420 swp_4884 swp_4885     FALSE 0.016 138.000 0.000 NA   NA
 5437424 5437425 swp_4889 swp_4890     FALSE 0.219 71.000 0.019 NA   NA
 5437425 5437426 swp_4890 swp_4891     FALSE 0.000 740.000 0.000 NA   NA
 5437427 5437428 swp_4892 swp_4893     FALSE 0.028 67.000 0.000 NA   NA
 5437429 5437430 swp_tRNA52 swp_tRNA51     FALSE 0.035 31.000 0.000 NA   NA
 5437432 5437433 swp_tRNA50 swp_tRNA49     FALSE 0.027 51.000 0.000 NA   NA
 5437433 5437434 swp_tRNA49 swp_tRNA48     FALSE 0.019 127.000 0.000 NA   NA
 5437434 5437435 swp_tRNA48 swp_tRNA47     FALSE 0.156 6.000 0.000 NA   NA
 5437435 5437436 swp_tRNA47 swp_tRNA46     FALSE 0.027 51.000 0.000 NA   NA
 5437436 5437437 swp_tRNA46 swp_4895     FALSE 0.013 -64.000 0.000 NA   NA
 5437437 5437438 swp_4895 swp_tRNA45     FALSE 0.011 -278.000 0.000 NA   NA
 5437438 5437439 swp_tRNA45 swp_4896     FALSE 0.000 840.000 0.000 NA   NA
 5437439 5437440 swp_4896 swp_4897     FALSE 0.002 258.000 0.000 NA   NA
 5437444 5437445 swp_4902 swp_4903     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5437445 5437446 swp_4903 swp_4904     FALSE 0.037 191.000 0.000 1.000   NA
 5437448 5437449 swp_4906 swp_4907     FALSE 0.029 42.000 0.000 NA   NA
 5437449 5437450 swp_4907 swp_4909     TRUE 0.948 -3.000 0.242 NA   NA
 5437450 5437451 swp_4909 swp_4910     TRUE 0.829 134.000 0.444 NA   NA
 5437453 5437454 swp_4912 swp_4913     FALSE 0.000 765.000 0.000 NA   NA
 5437460 5437461 swp_4920 swp_4921     TRUE 0.970 10.000 0.238 1.000 N NA
 5437461 5437462 swp_4921 swp_tRNA44     FALSE 0.011 -206.000 0.000 NA   NA
 5437466 5437467 swp_4925 swp_4926     FALSE 0.005 371.000 0.024 NA   NA
 5437468 5437469 swp_4927 swp_4928     TRUE 0.887 121.000 0.625 NA   NA
 5437469 5437470 swp_4928 swp_4929     FALSE 0.009 340.000 0.029 NA   NA
 5437471 5437472 swp_4930 swp_4931     FALSE 0.575 189.000 0.222 1.000 N NA
 5437472 5437473 swp_4931 swp_4932     FALSE 0.631 166.000 0.222 1.000   NA
 5437473 5437474 swp_4932 swp_4933     TRUE 0.863 46.000 0.286 1.000   NA
 5437474 5437475 swp_4933 swp_4934     TRUE 0.923 92.000 0.429 0.043   NA
 5437475 5437476 swp_4934 swp_4935     TRUE 0.984 63.000 0.833 0.018 Y NA
 5437476 5437477 swp_4935 swp_4936     TRUE 0.986 11.000 0.385 0.018 N NA
 5437477 5437478 swp_4936 swp_4937     FALSE 0.603 219.000 0.529 1.000 N NA
 5437478 5437479 swp_4937 swp_4938     TRUE 0.910 43.000 0.353 1.000 N NA
 5437480 5437481 swp_4939 swp_4940     TRUE 0.989 14.000 0.385 0.013 Y NA
 5437481 5437482 swp_4940 swp_4941     TRUE 0.980 75.000 1.000 1.000 Y NA
 5437482 5437483 swp_4941 swp_4942     TRUE 0.974 21.000 0.417 1.000 Y NA
 5437483 5437484 swp_4942 swp_4943     FALSE 0.032 251.000 0.000 1.000 N NA
 5437484 5437485 swp_4943 swp_4944     FALSE 0.004 207.000 0.000 NA   NA
 5437486 5437487 swp_4945 swp_4946     FALSE 0.007 188.000 0.000 NA   NA
 5437487 5437488 swp_4946 swp_4947     FALSE 0.020 121.000 0.000 NA   NA
 5437488 5437489 swp_4947 swp_4948     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5437489 5437490 swp_4948 swp_4949     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5437490 5437491 swp_4949 swp_4950     FALSE 0.024 -22.000 0.000 NA   NA
 5437491 5437492 swp_4950 swp_4952     TRUE 0.945 -18.000 0.538 0.034   NA
 5437492 5437493 swp_4952 swp_4953     TRUE 0.993 -3.000 1.000 0.014   NA
 5437493 5437494 swp_4953 swp_4954     TRUE 0.986 -3.000 0.875 NA   NA
 5437494 5437495 swp_4954 swp_4955     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5437495 5437496 swp_4955 swp_4956     FALSE 0.153 49.000 0.000 1.000   NA
 5437496 5437497 swp_4956 swp_4957     FALSE 0.118 -27.000 0.000 1.000   NA
 5437497 5437498 swp_4957 swp_4958     FALSE 0.002 257.000 0.000 NA   NA
 5437500 5437501 swp_4961 swp_4962     FALSE 0.485 117.000 0.074 NA   NA
 5437501 5437502 swp_4962 swp_4963     FALSE 0.269 178.000 0.074 NA   NA
 5437504 5437505 swp_4965 swp_4966     TRUE 0.972 9.000 0.357 NA   NA
 5437505 5437506 swp_4966 swp_4967     TRUE 0.895 32.000 0.393 NA   NA
 5437506 5437507 swp_4967 swp_4969     TRUE 0.984 -3.000 0.778 NA   NA
 5437509 5437510 swp_4970 swp_4971     TRUE 0.817 18.000 0.105 1.000   NA
 5437510 5437511 swp_4971 swp_tRNA43     FALSE 0.009 -645.000 0.000 NA   NA
 5437511 5437512 swp_tRNA43 swp_tRNA42     FALSE 0.031 36.000 0.000 NA   NA
 5437512 5437513 swp_tRNA42 swp_tRNA41     FALSE 0.143 8.000 0.000 NA   NA
 5437514 5437515 swp_4972 swp_4974     FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 5437515 5437516 swp_4974 swp_4975     FALSE 0.013 287.000 0.023 NA   NA
 5437517 5437518 swp_4976 swp_4977     FALSE 0.000 599.000 0.000 NA   NA
 5437518 5437519 swp_4977 swp_tRNA40     FALSE 0.009 -791.000 0.000 NA   NA
 5437519 5437520 swp_tRNA40 swp_tRNA39     FALSE 0.002 257.000 0.000 NA   NA
 5437520 5437521 swp_tRNA39 swp_tRNA38     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5437521 5437522 swp_tRNA38 swp_tRNA37     FALSE 0.026 84.000 0.000 NA   NA
 5437522 5437523 swp_tRNA37 swp_4978     FALSE 0.000 683.000 0.000 NA   NA
 5437524 5437525 swp_4979 swp_4980     TRUE 0.990 -3.000 0.524 NA Y NA
 5437525 5437526 swp_4980 swp_4981     TRUE 0.985 6.000 0.389 1.000 N NA
 5437526 5437527 swp_4981 swp_4982     FALSE 0.564 98.000 0.038 1.000 N NA
 5437527 5437528 swp_4982 swp_4983     TRUE 0.977 -3.000 0.073 0.003 Y NA
 5437528 5437529 swp_4983 swp_4984     TRUE 0.978 21.000 0.303 0.003 Y NA
 5437533 5437534 swp_4987 swp_4989     FALSE 0.026 -19.000 0.000 NA   NA
 5437534 5437535 swp_4989 swp_4990     FALSE 0.028 50.000 0.000 NA   NA
 5437535 5437536 swp_4990 swp_4991     FALSE 0.135 9.000 0.000 NA   NA
 5437536 5437537 swp_4991 swp_4992     FALSE 0.207 46.000 0.018 NA   NA
 5437538 5437539 swp_4993 swp_4994     FALSE 0.552 74.000 0.074 NA   NA
 5437539 5437540 swp_4994 swp_4995     FALSE 0.195 37.000 0.015 NA   NA
 5437540 5437541 swp_4995 swp_4996     FALSE 0.243 158.000 0.004 1.000 N NA
 5437541 5437542 swp_4996 swp_4997     TRUE 0.942 13.000 0.181 1.000 N NA
 5437542 5437543 swp_4997 swp_4998     TRUE 0.952 -46.000 0.783 1.000 Y NA
 5437543 5437544 swp_4998 swp_4999     TRUE 0.988 4.000 0.650 NA   NA
 5437544 5437545 swp_4999 swp_5000     TRUE 0.895 45.000 0.462 NA   NA
 5437545 5437546 swp_5000 swp_5001     TRUE 0.809 102.000 0.286 NA   NA
 5437546 5437547 swp_5001 swp_5002     FALSE 0.537 -19.000 0.026 1.000 N NA
 5437547 5437548 swp_5002 swp_5004     TRUE 0.997 0.000 0.660 0.001 Y NA
 5437548 5437549 swp_5004 swp_5005     FALSE 0.534 85.000 0.026 1.000 N NA
 5437549 5437550 swp_5005 swp_5006     TRUE 0.997 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5437550 5437551 swp_5006 swp_5007     TRUE 0.991 6.000 0.175 0.003 Y NA
 5437551 5437552 swp_5007 swp_5008     TRUE 0.912 99.000 0.109 0.003 Y NA
 5437552 5437553 swp_5008 swp_5009     TRUE 0.919 84.000 0.108 0.003 Y NA
 5437554 5437555 swp_5010 swp_5011     FALSE 0.013 322.000 0.000 1.000 N NA
 5437556 5437557 swp_5012 swp_5013     TRUE 0.749 52.000 0.184 NA   NA
 5437557 5437558 swp_5013 swp_5014     FALSE 0.646 21.000 0.041 1.000   NA
 5437558 5437559 swp_5014 swp_5015     FALSE 0.321 95.000 0.000 1.000 N NA
 5437559 5437560 swp_5015 swp_5016     FALSE 0.021 223.000 0.000 NA N NA
 5437562 5437563 swp_5018 swp_5019     FALSE 0.001 279.000 0.000 NA   NA
 5437564 5437565 swp_5020 swp_5021     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5437565 5437566 swp_5021 swp_5022     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5437567 5437568 swp_5023 swp_5024     TRUE 0.976 81.000 0.500 0.002 Y NA
 5437568 5437569 swp_5024 swp_5025     TRUE 0.971 30.000 0.273 0.001 Y NA
 5437569 5437570 swp_5025 swp_5026     TRUE 0.960 19.000 0.727 NA   NA
 5437570 5437571 swp_5026 swp_5027     FALSE 0.000 660.000 0.000 NA   NA
 5437571 5437572 swp_5027 swp_5028     TRUE 0.982 51.000 0.700 0.002 Y NA
 5437572 5437573 swp_5028 swp_5029     TRUE 0.980 27.000 0.389 0.001 Y NA
 5437573 5437574 swp_5029 swp_5030     TRUE 0.918 36.000 0.556 NA   NA
 5437574 5437575 swp_5030 swp_5031     FALSE 0.416 153.000 0.095 NA   NA
 5437575 5437576 swp_5031 swp_5032     TRUE 0.965 11.000 0.347 NA   NA
 5437576 5437577 swp_5032 swp_5033     FALSE 0.629 144.000 0.195 NA   NA
 5437577 5437578 swp_5033 swp_5034     TRUE 0.986 -3.000 0.901 NA   NA
 5437578 5437579 swp_5034 swp_5035     FALSE 0.036 30.000 0.000 NA   NA
 5437580 5437581 swp_5036 swp_5037     TRUE 0.763 48.000 0.150 NA N NA
 5437582 5437583 swp_5038 swp_5039     FALSE 0.101 110.000 0.010 NA   NA
 5437587 5437588 swp_5043 swp_5044     FALSE 0.007 284.000 0.000 1.000   NA
 5437588 5437589 swp_5044 swp_5045     FALSE 0.240 137.000 0.034 NA   NA
 5437590 5437591 swp_5046 swp_5047     FALSE 0.412 82.000 0.044 NA   NA
 5437593 5437594 swp_5049 swp_5050     FALSE 0.601 83.000 0.065 1.000   NA
 5437595 5437596 swp_5051 swp_5052     FALSE 0.230 154.000 0.042 NA   NA
 5437596 5437597 swp_5052 swp_5053     FALSE 0.000 475.000 0.000 NA   NA
 5437598 5437599 swp_5054 swp_5055     TRUE 0.756 54.000 0.016 1.000 Y NA
 5437600 5437601 swp_5056 swp_5057     TRUE 0.983 2.000 0.115 1.000 Y NA
 5437608 5437609 swp_5064 swp_5065     FALSE 0.005 461.000 0.000 1.000 N NA
 5437609 5437610 swp_5065 swp_5066     FALSE 0.445 192.000 0.000 0.035 Y NA
 5437610 5437611 swp_5066 swp_5067     FALSE 0.007 402.000 0.000 1.000 N NA
 5437611 5437612 swp_5067 swp_5068     TRUE 0.903 130.000 0.547 1.000 N NA
 5437612 5437613 swp_5068 swp_5069     TRUE 0.717 87.000 0.089 1.000 N NA
 5437613 5437614 swp_5069 swp_5070     TRUE 0.912 34.000 0.405 1.000   NA
 5437614 5437615 swp_5070 swp_5071     FALSE 0.134 99.000 0.000 1.000   NA
 5437616 5437617 swp_5072 swp_5073     FALSE 0.001 314.000 0.000 NA   NA
 5437620 5437621 swp_5075 swp_5076     FALSE 8.63283586170648e-05 1211.000 0.000 NA   NA
 5437621 5437622 swp_5076 swp_5077     FALSE 0.029 46.000 0.000 NA   NA
 5437622 5437623 swp_5077 swp_5078     TRUE 0.911 100.000 0.679 NA   NA
 5437623 5437624 swp_5078 swp_5079     FALSE 0.172 265.000 0.244 NA   NA
 5437624 5437625 swp_5079 swp_5080     FALSE 0.060 209.000 0.031 NA   NA
 5437625 5437626 swp_5080 swp_5081     TRUE 0.800 97.000 0.262 NA   NA
 5437627 5437628 swp_5082 swp_5083     TRUE 0.991 16.000 0.667 0.011 Y NA
 5437628 5437629 swp_5083 swp_5084     TRUE 0.960 -51.000 1.000 1.000 Y NA
 5437629 5437630 swp_5084 swp_5085     TRUE 0.973 44.000 0.424 0.003 Y NA
 5437630 5437631 swp_5085 swp_5086     TRUE 0.845 197.000 0.394 0.011 Y NA
 5437631 5437632 swp_5086 swp_5087     TRUE 0.990 3.000 0.368 0.011   NA
 5437632 5437633 swp_5087 swp_5088     TRUE 0.866 -7.000 0.175 NA   NA
 5437634 5437635 swp_5089 swp_5090     TRUE 0.840 -3.000 0.048 1.000   NA
 5437635 5437636 swp_5090 swp_5091     TRUE 0.960 23.000 0.576 1.000 N NA
 5437636 5437637 swp_5091 swp_5092     TRUE 0.986 81.000 1.000 0.007 Y NA
 5437637 5437638 swp_5092 swp_5093     TRUE 0.986 57.000 0.970 0.007 Y NA
 5437638 5437639 swp_5093 swp_5094     TRUE 0.998 0.000 0.789 0.004 Y NA
 5437639 5437640 swp_5094 swp_5095     TRUE 0.981 -13.000 0.816 1.000 Y NA
 5437640 5437641 swp_5095 swp_5096     TRUE 0.938 -3.000 0.170 1.000   NA
 5437641 5437642 swp_5096 swp_5097     FALSE 0.001 1066.000 0.000 1.000   NA
 5437642 5437643 swp_5097 swp_5098     FALSE 0.440 180.000 0.130 1.000   NA
 5437643 5437644 swp_5098 swp_5099     TRUE 0.874 68.000 0.250 1.000 N NA
 5437644 5437645 swp_5099 swp_5100     FALSE 0.001 1842.000 0.000 1.000 N NA
 5437645 5437646 swp_5100 swp_5101     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 5437647 5437648 swp_5102 swp_5103     TRUE 0.978 -7.000 0.585 0.003   NA
 5437648 5437649 swp_5103 swp_5104     FALSE 0.520 137.000 0.113 NA   NA
 5437650 5437651 swp_5105 swp_5106     TRUE 0.996 9.000 0.972 1.000 Y NA
 5437651 5437652 swp_5106 swp_5107     TRUE 0.996 0.000 0.914 NA Y NA
 5437652 5437653 swp_5107 swp_5108     TRUE 0.985 23.000 0.970 NA Y NA
 5437653 5437654 swp_5108 swp_5109     TRUE 0.997 10.000 1.000 0.004 Y NA
 5437654 5437655 swp_5109 swp_5110     TRUE 0.991 24.000 0.971 0.004 Y NA
 5437655 5437656 swp_5110 swp_5111     TRUE 0.986 53.000 0.941 0.007 Y NA
 5437656 5437657 swp_5111 swp_5112     FALSE 0.329 548.000 0.912 0.008 Y NA
 5437657 5437658 swp_5112 swp_5113     TRUE 0.982 0.000 0.457 NA   NA
 5437658 5437659 swp_5113 swp_5114     TRUE 0.893 46.000 0.457 NA   NA
 5437659 5437660 swp_5114 swp_5115     TRUE 0.989 10.000 0.182 0.001 Y NA
 5437660 5437661 swp_5115 swp_5116     TRUE 0.926 19.000 0.375 NA   NA
 5437663 5437664 swp_5118 swp_5119     FALSE 0.234 282.000 0.121 1.000 Y NA
 5437664 5437665 swp_5119 swp_5120     TRUE 0.995 14.000 0.865 0.002 Y NA
 5437665 5437666 swp_5120 swp_5121     FALSE 0.630 -31.000 0.162 NA   NA
 5437666 5437667 swp_5121 swp_5122     TRUE 0.876 -7.000 0.188 NA   NA
 5437667 5437668 swp_5122 swp_5123     TRUE 0.935 15.000 0.072 1.000 Y NA
 5437668 5437669 swp_5123 swp_5124     TRUE 0.889 13.000 0.072 1.000 N NA
 5437669 5437670 swp_5124 swp_5125     TRUE 0.971 15.000 0.500 1.000 N NA
 5437670 5437671 swp_5125 swp_5126     TRUE 0.997 0.000 0.846 1.000 Y NA
 5437671 5437672 swp_5126 swp_5127     TRUE 0.951 3.000 0.154 NA   NA
 5437673 5437674 swp_tRNA36 swp_tRNA35     FALSE 0.026 84.000 0.000 NA   NA
 5437676 5437677 swp_rRNA4 swp_rRNA5     FALSE 0.003 221.000 0.000 NA   NA
 5437677 5437678 swp_rRNA5 swp_rRNA6     FALSE 0.000 377.000 0.000 NA   NA
 5437678 5437679 swp_rRNA6 swp_5129     FALSE 0.010 -596.000 0.000 NA   NA
 5437680 5437681 swp_5130 swp_5131     FALSE 0.000 761.000 0.000 NA   NA
 5437682 5437683 swp_tRNA34 swp_rRNA7     FALSE 0.000 853.000 0.000 NA   NA
 5437683 5437684 swp_rRNA7 swp_5132     FALSE 0.166 5.000 0.000 NA   NA
 5437684 5437685 swp_5132 swp_rRNA8     FALSE 0.028 65.000 0.000 NA   NA
 5437685 5437686 swp_rRNA8 swp_rRNA9     FALSE 0.009 172.000 0.000 NA   NA
 5437686 5437687 swp_rRNA9 swp_rRNA10     FALSE 0.000 377.000 0.000 NA   NA
 5437687 5437688 swp_rRNA10 swp_5133     FALSE 0.010 -596.000 0.000 NA   NA
 5437688 5437689 swp_5133 swp_5134     FALSE 8.58192748596157e-05 1221.000 0.000 NA   NA
 5437690 5437691 swp_5135 swp_5136     FALSE 0.236 130.000 0.030 NA   NA
 5437691 5437692 swp_5136 swp_5137     FALSE 0.068 182.000 0.019 NA   NA
 5437693 5437694 swp_5138 swp_5139     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5437695 5437696 swp_5140 swp_5141     FALSE 0.386 190.000 0.007 1.000 Y NA
 5437696 5437697 swp_5141 swp_5142     TRUE 0.993 0.000 0.219 0.001 Y NA
 5437697 5437698 swp_5142 swp_5143     TRUE 0.992 13.000 0.428 0.001 Y NA
 5437698 5437699 swp_5143 swp_5144     FALSE 0.028 74.000 0.000 NA   NA
 5437699 5437700 swp_5144 swp_5145     FALSE 0.002 232.000 0.000 NA   NA
 5437700 5437701 swp_5145 swp_5146     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 5437702 5437703 swp_5147 swp_5148     FALSE 0.003 577.000 0.000 1.000 N NA
 5437703 5437704 swp_5148 swp_5149     TRUE 0.913 82.000 0.412 1.000 N NA
 5437704 5437705 swp_5149 swp_5150     FALSE 0.644 155.000 0.156 1.000 N NA
 5437705 5437706 swp_5150 swp_5151     FALSE 0.016 299.000 0.000 1.000 N NA
 5437706 5437707 swp_5151 swp_5152     FALSE 0.069 83.000 0.003 NA   NA
 5437709 5437710 swp_5154 swp_5155     FALSE 0.000 544.000 0.000 NA   NA
 5437710 5437711 swp_5155 swp_5156     TRUE 0.986 45.000 0.837 0.002 Y NA
 5437711 5437712 swp_5156 swp_5157     TRUE 0.985 36.000 0.724 0.002 Y NA
 5437712 5437713 swp_5157 swp_5158     TRUE 0.986 49.000 0.846 0.002 Y NA
 5437713 5437714 swp_5158 swp_5159     TRUE 0.994 15.000 0.864 0.002 Y NA
 5437714 5437715 swp_5159 swp_5160     TRUE 0.979 17.000 0.242 0.002 Y NA
 5437715 5437716 swp_5160 swp_5161     TRUE 0.962 38.000 0.666 0.002   NA
 5437716 5437717 swp_5161 swp_5162     TRUE 0.953 66.000 0.557 0.002   NA
 5437717 5437718 swp_5162 swp_5163     TRUE 0.982 13.000 0.291 1.000 Y NA
 5437718 5437719 swp_5163 swp_5164     FALSE 0.157 225.000 0.056 1.000 N NA
 5437719 5437720 swp_5164 swp_5165     TRUE 0.991 10.000 0.827 1.000 N NA
 5437720 5437721 swp_5165 swp_5166     FALSE 0.429 233.000 0.339 1.000 N NA
 5437721 5437722 swp_5166 swp_5167     TRUE 0.900 120.000 0.466 1.000 N NA
 5437722 5432676 swp_5167 swp_0001     FALSE 0.005 462.000 0.000 1.000 N NA