MicrobesOnline Operon Predictions for Buchnera aphidicola str. Bp

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 323529 323530 bbp001 bbp002 gidA atpB FALSE 0.011 319.000 0.004 1.000 N NA
 323530 323531 bbp002 bbp003 atpB atpE TRUE 0.993 53.000 0.557 0.019 Y NA
 323531 323532 bbp003 bbp004 atpE atpF TRUE 0.970 125.000 0.666 0.019 Y NA
 323532 323533 bbp004 bbp005 atpF atpH TRUE 0.999 13.000 0.242 0.019 Y NA
 323533 323534 bbp005 bbp006 atpH atpA TRUE 1.000 14.000 0.864 0.019 Y NA
 323534 323535 bbp006 bbp007 atpA atpG TRUE 0.998 38.000 0.846 0.019 Y NA
 323535 323536 bbp007 bbp008 atpG atpD TRUE 0.999 28.000 0.724 0.019 Y NA
 323536 323537 bbp008 bbp009 atpD atpC TRUE 1.000 2.000 0.837 0.019 Y NA
 323538 323539 bbp010 bbp011 gyrB dnaN TRUE 0.560 183.000 0.114 1.000 Y NA
 323539 323540 bbp011 bbp012 dnaN dnaA TRUE 0.998 5.000 0.328 1.000 Y NA
 323541 323542 bbp013 bbp014 rpmH rnpA TRUE 0.997 21.000 0.787 1.000   NA
 323542 323543 bbp014 bbp015 rnpA yidD TRUE 0.998 -21.000 0.540 NA   NA
 323543 323544 bbp015 bbp016 yidD yidC TRUE 0.998 3.000 0.461 NA   NA
 323544 323545 bbp016 bbp017 yidC thdF TRUE 0.802 159.000 0.221 0.081   NA
 323545 323546 bbp017 bbp018 thdF mutH FALSE 0.114 50.000 0.000 1.000   NA
 323547 323548 bbp020 bbp021 mopB mopA TRUE 0.994 51.000 0.631 0.021 Y NA
 323551 323552 bbp024 bbp025 dnaC yhhF FALSE 0.080 225.000 0.000 1.000 Y NA
 323553 323554 bbp026 bbp027 ftsY rpoH FALSE 0.070 160.000 0.008 1.000 N NA
 323555 323556 bbp028 bbp029 glmS glmU TRUE 0.690 86.000 0.055 1.000 Y NA
 323557 323558 bbp030 bbp031 yigL metE FALSE 0.017 194.000 0.000 1.000   NA
 323559 323560 bbp032 bbp033 purH hupA FALSE 0.019 73.000 0.003 1.000 N NA
 323560 323561 bbp033 bbp034 hupA rpoC FALSE 0.245 407.000 0.000 0.045 N NA
 323561 323562 bbp034 bbp035 rpoC rpoB TRUE 0.993 89.000 0.851 0.004   NA
 323562 323563 bbp035 bbp036 rpoB rplL TRUE 0.661 228.000 0.223 1.000   NA
 323563 323564 bbp036 bbp037 rplL rplJ TRUE 0.980 74.000 0.884 1.000 Y NA
 323564 323565 bbp037 bbp038 rplJ rplA TRUE 0.780 282.000 0.302 1.000 Y NA
 323565 323566 bbp038 bbp039 rplA rplK TRUE 0.999 -3.000 0.838 1.000 Y NA
 323566 323567 bbp039 bbp040 rplK nusG TRUE 0.861 215.000 0.681 1.000 N NA
 323567 323568 bbp040 bbp041 nusG secE TRUE 0.999 5.000 0.843 1.000   NA
 323568 401963 bbp041 bbp042 secE tRNA-Thr FALSE 0.026 387.000 0.000 NA   NA
 401963 401962 bbp042 bbp043 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.680 13.000 0.000 NA   NA
 401962 401961 bbp043 bbp044 tRNA-Gly tRNA-Tyr FALSE 0.235 39.000 0.000 NA   NA
 401961 401960 bbp044 bbp045 tRNA-Tyr tRNA-Thr TRUE 0.464 26.000 0.000 NA   NA
 401960 323569 bbp045 bbp046 tRNA-Thr murB FALSE 0.026 374.000 0.000 NA   NA
 323570 323571 bbp047 bbp048 metF argG FALSE 0.081 300.000 0.000 1.000 Y NA
 323571 323572 bbp048 bbp049 argG argH TRUE 0.809 114.000 0.278 1.000 Y NA
 323572 323573 bbp049 bbp050 argH yibN FALSE 0.023 184.000 0.000 NA N NA
 323573 323574 bbp050 bbp051 yibN cysE FALSE 0.023 248.000 0.000 NA N NA
 323575 323576 bbp052 bbp053 rpoD dnaG TRUE 0.717 238.000 0.299 1.000 N NA
 323576 323577 bbp053 bbp054 dnaG rpsU TRUE 0.518 107.000 0.067 1.000 N NA
 323581 323582 bbp058 bbp059 bacA crr TRUE 0.618 126.000 0.038 0.055 N NA
 323582 323583 bbp059 bbp060 crr ptsI TRUE 0.997 9.000 0.038 0.013 Y NA
 323583 323584 bbp060 bbp061 ptsI ptsH TRUE 0.793 175.000 0.055 0.013 Y NA
 401959 401958 bbp063 bbp064 tRNA-Lys tRNA-Val TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 323586 401933 bbp065 bbp066 gltX tRNA-Ala FALSE 0.090 74.000 0.000 NA   NA
 323588 323589 bbp068 bbp069 fliF fliG TRUE 0.999 5.000 0.220 0.025 Y NA
 323589 323590 bbp069 bbp070 fliG fliH TRUE 0.971 31.000 0.010 0.013 Y NA
 323590 323591 bbp070 bbp071 fliH fliI TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 323591 323592 bbp071 bbp072 fliI fliJ TRUE 0.876 17.000 0.010 1.000   NA
 323592 323593 bbp072 bbp073 fliJ fliK TRUE 0.989 -7.000 0.010 0.025   NA
 323593 323594 bbp073 bbp074 fliK fliM FALSE 0.299 144.000 0.000 0.025   NA
 323594 323595 bbp074 bbp075 fliM fliN TRUE 0.999 -7.000 0.074 0.004 Y NA
 323595 323596 bbp075 bbp076 fliN fliOP TRUE 0.879 62.000 0.025 0.055 Y NA
 323596 323597 bbp076 bbp077 fliOP fliQ TRUE 0.993 84.000 0.827 0.011 Y NA
 323597 323598 bbp077 bbp078 fliQ fliR TRUE 0.998 0.000 0.042 0.011 Y NA
 323599 323600 bbp079 bbp080 rpmG rpmB TRUE 0.982 42.000 0.332 0.082   NA
 2209655 323604 bbp084 bbp085 rnpB yraL FALSE 0.123 57.000 0.000 NA   NA
 323605 323606 bbp086 bbp087 fabB talA FALSE 0.056 624.000 0.007 1.000 N NA
 323606 323607 bbp087 bbp088 talA tktB TRUE 0.950 98.000 0.739 1.000 Y NA
 323607 323608 bbp088 bbp089 tktB dapE FALSE 0.176 167.000 0.015 1.000 N NA
 323609 323610 bbp090 bbp091 dapA aroC FALSE 0.083 483.000 0.000 1.000 Y NA
 323611 323612 bbp092 bbp093 yb2331 hisG FALSE 0.026 490.000 0.000 NA   NA
 323612 323613 bbp093 bbp094 hisG hisD TRUE 0.999 6.000 0.171 0.017 Y NA
 323613 323614 bbp094 bbp095 hisD hisC TRUE 0.999 2.000 0.294 0.017 Y NA
 323614 323615 bbp095 bbp096 hisC hisB TRUE 0.999 2.000 0.341 0.017 Y NA
 323615 323616 bbp096 bbp097 hisB hisH TRUE 0.999 1.000 0.128 0.017 Y NA
 323616 323617 bbp097 bbp098 hisH hisA TRUE 0.999 4.000 0.210 0.017 Y NA
 323617 323618 bbp098 bbp099 hisA hisF TRUE 1.000 -6.000 0.433 0.017 Y NA
 323618 323619 bbp099 bbp100 hisF hisI TRUE 1.000 -6.000 0.430 0.017 Y NA
 323619 323620 bbp100 bbp101 hisI gnd FALSE 0.043 154.000 0.007 1.000 N NA
 323620 323621 bbp101 bbp102 gnd dcd FALSE 0.016 305.000 0.005 1.000 N NA
 323621 323622 bbp102 bbp103 dcd metG FALSE 0.279 102.000 0.015 1.000 N NA
 323623 401957 bbp104 bbp105 mesJ tRNA-Val FALSE 0.102 68.000 0.000 NA   NA
 401957 323624 bbp105 bbp106 tRNA-Val norM FALSE 0.052 95.000 0.000 NA   NA
 323625 323626 bbp107 bbp108 ribE rnfA FALSE 0.005 299.000 0.002 1.000 N NA
 323626 323627 bbp108 bbp109 rnfA rnfB TRUE 0.999 12.000 0.564 0.040 Y NA
 323627 323628 bbp109 bbp110 rnfB rnfC TRUE 0.992 18.000 0.018 0.013 Y NA
 323628 323629 bbp110 bbp111 rnfC rnfD TRUE 0.640 168.000 0.031 0.040 Y NA
 323629 323630 bbp111 bbp112 rnfD rnfG TRUE 1.000 -16.000 0.924 0.040 Y NA
 323630 323631 bbp112 bbp113 rnfG ydgQ TRUE 1.000 -7.000 0.908 0.040 Y NA
 323631 323632 bbp113 bbp114 ydgQ nth TRUE 0.990 -37.000 0.109 1.000 N NA
 323632 323633 bbp114 bbp115 nth tyrS FALSE 0.005 289.000 0.003 1.000 N NA
 323635 323636 bbp117 bbp118 yb1688 aroH FALSE 0.027 536.000 0.000 NA   NA
 323636 323637 bbp118 bbp119 aroH thrS FALSE 0.128 176.000 0.011 1.000 N NA
 323637 323638 bbp119 bbp120 thrS infC TRUE 0.996 4.000 0.186 1.000 Y NA
 323638 323639 bbp120 bbp121 infC rpmI TRUE 0.985 46.000 0.652 1.000 Y NA
 323639 323640 bbp121 bbp122 rpmI rplT TRUE 0.996 43.000 0.928 0.081 Y NA
 323640 323641 bbp122 bbp123 rplT pheS TRUE 0.690 173.000 0.202 1.000 Y NA
 323641 323642 bbp123 bbp124 pheS pheT TRUE 1.000 15.000 0.574 0.004 Y NA
 323642 323643 bbp124 bbp125 pheT yajC FALSE 0.023 212.000 0.000 NA N NA
 323644 323645 bbp126 bbp127 glyS glyQ TRUE 0.997 46.000 0.651 0.004 Y NA
 323646 323647 bbp128 bbp129 nfo rplY FALSE 0.020 126.000 0.005 1.000 N NA
 323649 323650 bbp131 bbp132 ksgA apaH FALSE 0.312 116.000 0.025 1.000   NA
 323651 323652 bbp133 bbp134 folA carB FALSE 0.254 85.000 0.010 1.000 N NA
 323652 323653 bbp134 bbp135 carB carA TRUE 1.000 9.000 0.345 0.004 Y NA
 323653 323654 bbp135 bbp136 carA dapB TRUE 0.402 139.000 0.034 1.000 Y NA
 323654 323655 bbp136 bbp137 dapB lytB FALSE 0.078 295.000 0.009 1.000 N NA
 323655 323656 bbp137 bbp138 lytB lspA TRUE 0.775 56.000 0.033 1.000 Y NA
 323656 323657 bbp138 bbp139 lspA ileS TRUE 0.996 0.000 0.045 0.031 N NA
 323659 323660 bbp141 bbp142 dnaJ dnaK TRUE 0.945 122.000 0.236 0.008 Y NA
 323661 323662 bbp143 bbp144 nuoA nuoB TRUE 0.998 26.000 0.377 0.012 Y NA
 323662 323663 bbp144 bbp145 nuoB nuoCD TRUE 0.984 105.000 0.691 0.012 Y NA
 323663 323664 bbp145 bbp146 nuoCD nuoE TRUE 1.000 -13.000 0.407 0.014 Y NA
 323664 323665 bbp146 bbp147 nuoE nuoF TRUE 0.999 -3.000 0.186 0.014 Y NA
 323665 323666 bbp147 bbp148 nuoF nuoG TRUE 0.865 129.000 0.180 0.027 Y NA
 323666 323667 bbp148 bbp149 nuoG nuoH TRUE 1.000 -3.000 0.664 0.027 Y NA
 323667 323668 bbp149 bbp150 nuoH nuoI TRUE 0.998 23.000 0.423 0.027 Y NA
 323668 323669 bbp150 bbp151 nuoI nuoJ TRUE 0.999 11.000 0.428 0.027 Y NA
 323669 323670 bbp151 bbp152 nuoJ nuoK TRUE 0.986 58.000 0.269 0.012 Y NA
 323670 323671 bbp152 bbp153 nuoK nuoL TRUE 0.999 -3.000 0.211 0.027 Y NA
 323671 323672 bbp153 bbp154 nuoL nuoM TRUE 0.984 111.000 0.713 0.008 Y NA
 323672 323673 bbp154 bbp155 nuoM nuoN TRUE 0.986 22.000 0.008 0.008 Y NA
 323673 323674 bbp155 bbp156 nuoN ygjT FALSE 0.033 91.000 0.000 1.000 N NA
 323674 323675 bbp156 bbp157 ygjT folC FALSE 0.030 83.000 0.004 1.000 N NA
 323675 323676 bbp157 bbp158 folC cvpA FALSE 0.388 41.000 0.007 1.000   NA
 323677 2209656 bbp159 bbp160 prsA ispE FALSE 0.064 86.000 0.000 NA   NA
 323678 323679 bbp161 bbp162 prfA hemK TRUE 0.997 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 323679 323680 bbp162 bbp163 hemK ychA FALSE 0.399 175.000 0.059 NA   NA
 323680 323681 bbp163 bbp164 ychA ackA FALSE 0.026 517.000 0.000 NA   NA
 323681 323682 bbp164 bbp165 ackA pta TRUE 0.819 54.000 0.073 1.000   NA
 323683 323684 bbp166 bbp167 yfaE nrdB TRUE 0.989 1.000 0.069 1.000 N NA
 323684 323685 bbp167 bbp168 nrdB nrdA TRUE 0.995 65.000 0.571 0.004 Y NA
 323685 323686 bbp168 bbp169 nrdA gyrA FALSE 0.005 275.000 0.002 1.000 N NA
 323694 323695 bbp178 bbp179 sodA pth FALSE 0.010 96.000 0.003 1.000 N NA
 323695 323696 bbp179 bbp180 pth ychF TRUE 0.945 45.000 0.184 1.000 Y NA
 323697 323698 bbp181 bbp182 thrC thrB TRUE 0.997 1.000 0.233 1.000 Y NA
 323698 323699 bbp182 bbp183 thrB thrA TRUE 0.988 20.000 0.133 1.000 Y NA
 323699 323700 bbp183 bbp184 thrA dksA FALSE 0.016 718.000 0.000 1.000 N NA
 323701 323702 bbp185 bbp186 truA mrcB FALSE 0.015 249.000 0.000 1.000 N NA
 323702 323703 bbp186 bbp187 mrcB secA FALSE 0.015 477.000 0.000 1.000 N NA
 323703 323704 bbp187 bbp188 secA guaC FALSE 0.016 919.000 0.000 1.000 N NA
 323704 323705 bbp188 bbp189 guaC aceE FALSE 0.015 410.000 0.000 1.000 N NA
 323705 323706 bbp189 bbp190 aceE aceF TRUE 0.998 11.000 0.220 0.035 Y NA
 323706 323707 bbp190 bbp191 aceF lpdA TRUE 0.844 148.000 0.463 1.000 Y NA
 323708 323709 bbp192 bbp193 pfs yadR TRUE 0.419 39.000 0.007 NA   NA
 323709 323710 bbp193 bbp194 yadR ftsZ FALSE 0.008 106.000 0.002 NA   NA
 323710 323711 bbp194 bbp195 ftsZ ftsA TRUE 0.953 33.000 0.070 1.000 Y NA
 323711 323712 bbp195 bbp196 ftsA ddlB FALSE 0.015 402.000 0.000 1.000 N NA
 323712 323713 bbp196 bbp197 ddlB murC TRUE 0.999 2.000 0.153 0.020 Y NA
 323713 323714 bbp197 bbp198 murC murG TRUE 0.977 38.000 0.283 1.000 Y NA
 323714 323715 bbp198 bbp199 murG ftsW TRUE 0.999 -3.000 0.647 1.000 N NA
 323715 323716 bbp199 bbp200 ftsW murD TRUE 0.986 55.000 0.297 0.010 N NA
 323716 323717 bbp200 bbp201 murD mraY TRUE 1.000 -3.000 0.647 0.020 Y NA
 323717 323718 bbp201 bbp202 mraY murF TRUE 0.981 67.000 0.309 0.020 Y NA
 323718 323719 bbp202 bbp203 murF murE TRUE 1.000 -13.000 0.569 0.008 Y NA
 323719 323720 bbp203 bbp204 murE ftsI TRUE 0.903 41.000 0.059 1.000 Y NA
 323720 323721 bbp204 bbp205 ftsI ftsL TRUE 0.749 83.000 0.124 1.000   NA
 323721 323722 bbp205 bbp206 ftsL yabC TRUE 0.996 -7.000 0.227 1.000   NA
 323722 323723 bbp206 bbp207 yabC ilvH FALSE 0.011 94.000 0.004 1.000 N NA
 323723 323724 bbp207 bbp208 ilvH ilvI TRUE 1.000 -3.000 0.371 0.004 Y NA
 323724 323725 bbp208 bbp209 ilvI apbE FALSE 0.081 291.000 0.000 1.000 Y NA
 323727 323728 bbp211 bbp212 dapD map TRUE 0.479 78.000 0.021 1.000 N NA
 323729 323730 bbp213 bbp214 rpsB tsf TRUE 0.960 87.000 0.748 1.000 Y NA
 323730 323731 bbp214 bbp215 tsf pyrH TRUE 0.782 147.000 0.416 1.000 N NA
 323731 323732 bbp215 bbp216 pyrH frr TRUE 0.855 137.000 0.626 NA N NA
 323732 2209657 bbp216 bbp217 frr dxr TRUE 0.431 27.000 0.000 NA   NA
 2209657 323733 bbp217 bbp218 dxr uppS FALSE 0.145 53.000 0.000 NA   NA
 323733 323734 bbp218 bbp219 uppS fabZ FALSE 0.082 406.000 0.000 1.000 Y NA
 323734 323735 bbp219 bbp220 fabZ dnaE FALSE 0.005 289.000 0.003 1.000 N NA
 323737 323738 bbp222 bbp223 flhB flhA TRUE 0.999 -7.000 0.287 0.012 Y NA
 407993 401934 bbp225 bbp226 rrs tRNA-Ile FALSE 0.054 93.000 0.000 NA   NA
 401934 401935 bbp226 bbp227 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.171 48.000 0.000 NA   NA
 323740 323741 bbp228 bbp229 gloB rnhA FALSE 0.390 54.000 0.009 1.000   NA
 323742 401936 bbp230 bbp231 dnaQ tRNA-Asp FALSE 0.061 87.000 0.000 NA   NA
 401936 323743 bbp231 bbp232 tRNA-Asp gpt FALSE 0.025 268.000 0.000 NA   NA
 323743 323744 bbp232 bbp233 gpt grpE1 FALSE 0.018 125.000 0.000 1.000 N NA
 323746 323747 bbp235 bbp236 smpB yfhC FALSE 0.021 68.000 0.004 1.000 N NA
 323748 323749 bbp237 bbp238 acpS era TRUE 0.855 -3.000 0.007 1.000   NA
 323749 323750 bbp238 bbp239 era rnc TRUE 0.997 -3.000 0.127 0.044   NA
 323750 323751 bbp239 bbp240 rnc lepB TRUE 0.640 101.000 0.117 1.000 N NA
 323751 323752 bbp240 bbp241 lepB lepA TRUE 0.962 36.000 0.187 1.000 N NA
 323753 323754 bbp242 bbp243 trmU ycfC TRUE 0.855 73.000 0.180 NA   NA
 323754 323755 bbp243 bbp244 ycfC purB TRUE 0.889 42.000 0.093 NA   NA
 323755 323756 bbp244 bbp245 purB mltE FALSE 0.007 112.000 0.002 NA   NA
 323756 323757 bbp245 bbp246 mltE fabI TRUE 0.573 53.000 0.014 NA   NA
 323757 323758 bbp246 bbp247 fabI rnb TRUE 0.547 108.000 0.085 1.000 N NA
 323758 323759 bbp247 bbp248 rnb ychE FALSE 0.073 273.000 0.008 NA N NA
 323759 323760 bbp248 bbp249 ychE lipB FALSE 0.021 144.000 0.004 NA N NA
 323760 323761 bbp249 bbp250 lipB lipA TRUE 0.961 132.000 0.319 0.004 Y NA
 323764 323765 bbp253 bbp254 cls yciA TRUE 0.460 213.000 0.000 0.016 Y NA
 323765 323766 bbp254 bbp255 yciA ispZ TRUE 0.877 56.000 0.167 1.000 N NA
 323766 323767 bbp255 bbp256 ispZ yciC TRUE 0.967 24.000 0.061 1.000   NA
 323767 323768 bbp256 bbp257 yciC trpA FALSE 0.276 137.000 0.026 1.000   NA
 323768 323769 bbp257 bbp258 trpA trpB TRUE 1.000 5.000 0.947 0.004 Y NA
 323769 323770 bbp258 bbp259 trpB trpC TRUE 0.999 0.000 0.221 0.006 Y NA
 323770 323771 bbp259 bbp260 trpC trpD TRUE 0.996 15.000 0.293 1.000 Y NA
 2209658 323772 bbp261 bbp262 yedA yciL FALSE 0.084 75.000 0.000 NA   NA
 323772 323773 bbp262 bbp263 yciL sohB FALSE 0.141 189.000 0.013 1.000 N NA
 323775 2209659 bbp265 bbp266 yfgB gcpE FALSE 0.026 145.000 0.000 NA   NA
 2209659 323776 bbp266 bbp267 gcpE hisS FALSE 0.026 341.000 0.000 NA   NA
 323776 323777 bbp267 bbp268 hisS glyA FALSE 0.032 126.000 0.006 1.000 N NA
 323778 323779 bbp269 bbp270 bioD bioC TRUE 0.998 -3.000 0.054 0.010 Y NA
 323779 323780 bbp270 bbp271 bioC bioF TRUE 0.995 -10.000 0.133 1.000 Y NA
 323780 323781 bbp271 bbp272 bioF bioB TRUE 0.996 -3.000 0.168 1.000 Y NA
 323783 323784 bbp274 bbp275 ybhE mfd FALSE 0.005 428.000 0.002 1.000   NA
 323787 323788 bbp278 bbp279 phrB ybgI TRUE 0.868 36.000 0.027 NA   NA
 323788 323789 bbp279 bbp280 ybgI sucA FALSE 0.005 343.000 0.003 NA   NA
 323789 323790 bbp280 bbp281 sucA sucB TRUE 0.999 11.000 0.667 1.000 Y NA
 323792 323793 bbp283 bbp284 gpmA pfkA TRUE 0.522 177.000 0.009 0.018 Y NA
 323794 323795 bbp285 bbp286 tpiA rpsA FALSE 0.015 288.000 0.000 1.000 N NA
 323795 323796 bbp286 bbp287 rpsA cmk TRUE 0.775 111.000 0.281 1.000 N NA
 323796 323797 bbp287 bbp288 cmk aroA TRUE 0.625 157.000 0.209 1.000 N NA
 323797 323798 bbp288 bbp289 aroA serC TRUE 0.697 74.000 0.033 1.000 Y NA
 323798 323799 bbp289 bbp290 serC serS FALSE 0.083 113.000 0.008 1.000 N NA
 323800 323801 bbp291 bbp292 trxB infA TRUE 0.691 55.000 0.028 1.000 N NA
 323801 323802 bbp292 bbp293 infA aspS FALSE 0.172 76.000 0.004 1.000 Y NA
 323803 323804 bbp294 bbp295 znuB znuC TRUE 0.994 36.000 0.755 1.000 Y NA
 323807 323808 bbp298 bbp299 zwf htpX FALSE 0.166 333.000 0.014 1.000 N NA
 323808 323809 bbp299 bbp300 htpX yoaE FALSE 0.018 641.000 0.000 1.000   NA
 323809 323810 bbp300 bbp301 yoaE yeaZ FALSE 0.011 151.000 0.004 1.000   NA
 323811 323812 bbp302 bbp303 minE minD TRUE 0.999 4.000 0.618 NA Y NA
 323812 323813 bbp303 bbp304 minD minC TRUE 0.995 25.000 0.466 1.000 Y NA
 401956 401955 bbp306 bbp307 tRNA-Leu pseudo-tRNA FALSE 0.358 32.000 0.000 NA   NA
 323816 323817 bbp310 bbp311 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.214 0.010 Y NA
 323817 323818 bbp311 bbp312 flgC flgF FALSE 0.085 736.000 0.000 1.000 Y NA
 323818 323819 bbp312 bbp313 flgF flgG TRUE 0.957 30.000 0.060 1.000 Y NA
 323819 323820 bbp313 bbp314 flgG flgH TRUE 0.975 70.000 0.268 0.024 Y NA
 323820 323821 bbp314 bbp315 flgH flgI TRUE 0.824 105.000 0.049 0.024 Y NA
 323821 323822 bbp315 bbp316 flgI flgJ TRUE 0.920 4.000 0.000 NA Y NA
 323824 323825 bbp318 bbp319 rluC rpmF FALSE 0.070 235.000 0.004 1.000 Y NA
 323825 323826 bbp319 bbp320 rpmF fabD FALSE 0.160 283.000 0.014 1.000 N NA
 323826 323827 bbp320 bbp321 fabD fabG TRUE 0.999 10.000 0.432 0.034 Y NA
 323827 323828 bbp321 bbp322 fabG acpP TRUE 0.870 105.000 0.321 1.000 Y NA
 323828 323829 bbp322 bbp323 acpP tmk FALSE 0.005 181.000 0.003 1.000 N NA
 323829 323830 bbp323 bbp324 tmk holB TRUE 0.996 -3.000 0.211 1.000 N NA
 323830 323831 bbp324 bbp325 holB ycfH TRUE 0.963 33.000 0.110 NA Y NA
 323831 323832 bbp325 bbp326 ycfH ptsG FALSE 0.010 148.000 0.004 NA N NA
 323832 323833 bbp326 bbp327 ptsG ycfF FALSE 0.111 118.000 0.005 1.000 Y NA
 323833 2209660 bbp327 bbp328 ycfF ycfM TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 323834 323835 bbp329 bbp330 asnS yceA FALSE 0.027 1104.000 0.000 NA   NA
 323835 323836 bbp330 bbp331 yceA valS FALSE 0.055 81.000 0.004 NA   NA
 323836 323837 bbp331 bbp332 valS pepA FALSE 0.078 75.000 0.005 1.000 N NA
 323838 323839 bbp333 bbp334 argF yhaR TRUE 0.550 900.000 0.143 NA N NA
 323840 323841 bbp335 bbp336 deaD pnp FALSE 0.084 531.000 0.000 1.000 Y NA
 323841 323842 bbp336 bbp337 pnp rpsO TRUE 0.804 241.000 0.335 1.000 Y NA
 323842 323843 bbp337 bbp338 rpsO truB TRUE 0.727 132.000 0.211 1.000 Y NA
 323843 323844 bbp338 bbp339 truB rbfA TRUE 0.987 33.000 0.318 1.000 Y NA
 323844 323845 bbp339 bbp340 rbfA infB TRUE 0.989 37.000 0.530 1.000 Y NA
 323845 323846 bbp340 bbp341 infB nusA TRUE 0.996 15.000 0.342 1.000 N NA
 323846 401954 bbp341 bbp342 nusA tRNA-Leu FALSE 0.025 243.000 0.000 NA   NA
 401954 2209661 bbp342 bbp343 tRNA-Leu secG TRUE 0.431 27.000 0.000 NA   NA
 2209661 323847 bbp343 bbp344 secG mrsA FALSE 0.025 224.000 0.000 NA   NA
 323847 323848 bbp344 bbp345 mrsA hflB FALSE 0.134 395.000 0.012 1.000 N NA
 323848 323849 bbp345 bbp346 hflB ftsJ TRUE 0.862 59.000 0.152 NA N NA
 323849 323850 bbp346 bbp347 ftsJ greA FALSE 0.100 135.000 0.009 NA N NA
 323851 323852 bbp348 bbp349 yrbA murA TRUE 0.991 21.000 0.258 NA N NA
 323852 323853 bbp349 bbp350 murA rplU FALSE 0.005 237.000 0.002 1.000 N NA
 323853 323854 bbp350 bbp351 rplU rpmA TRUE 1.000 -10.000 0.667 0.076 Y NA
 323854 323855 bbp351 bbp352 rpmA yhbZ TRUE 0.750 239.000 0.335 1.000   NA
 323856 323857 bbp353 bbp354 rpsI rplM TRUE 0.999 13.000 0.601 0.076 Y NA
 323858 323859 bbp355 bbp356 pheA ffh FALSE 0.005 243.000 0.002 1.000 N NA
 323859 323860 bbp356 bbp357 ffh rpsP TRUE 0.881 92.000 0.361 1.000 N NA
 323860 323861 bbp357 bbp358 rpsP rimM TRUE 0.998 21.000 0.342 0.076 Y NA
 323861 323862 bbp358 bbp359 rimM trmD TRUE 0.996 26.000 0.672 1.000 Y NA
 323862 323863 bbp359 bbp360 trmD rplS TRUE 0.993 32.000 0.567 1.000 Y NA
 323867 323868 bbp364 bbp365 alaS csrA FALSE 0.215 179.000 0.020 1.000 N NA
 323868 401938 bbp365 bbp366 csrA tRNA-Ser FALSE 0.025 177.000 0.000 NA   NA
 401938 401939 bbp366 bbp367 tRNA-Ser tRNA-Arg TRUE 0.501 25.000 0.000 NA   NA
 401939 323869 bbp367 bbp368 tRNA-Arg gshA FALSE 0.026 139.000 0.000 NA   NA
 323869 323870 bbp368 bbp369 gshA endA FALSE 0.015 349.000 0.000 1.000 N NA
 323871 323872 bbp370 bbp371 ygfA rpiA FALSE 0.269 376.000 0.027 1.000 N NA
 323872 401953 bbp371 bbp372 rpiA tRNA-Gln FALSE 0.025 252.000 0.000 NA   NA
 401953 401952 bbp372 bbp373 tRNA-Gln tRNA-Leu FALSE 0.166 49.000 0.000 NA   NA
 401952 401951 bbp373 bbp374 tRNA-Leu tRNA-Met FALSE 0.253 38.000 0.000 NA   NA
 323873 323874 bbp375 bbp376 glnS pyrG FALSE 0.005 313.000 0.003 1.000 N NA
 323874 323875 bbp376 bbp377 pyrG eno TRUE 0.758 67.000 0.068 1.000 N NA
 2209662 2209663 bbp378 bbp379 ispF ispD FALSE 0.026 322.000 0.000 NA   NA
 2209663 323876 bbp379 bbp380 ispD mutS FALSE 0.027 1294.000 0.000 NA   NA
 323877 323878 bbp381 bbp382 dsbA polA TRUE 0.627 122.000 0.167 NA   NA
 323881 323882 bbp385 bbp386 gmk thyA FALSE 0.090 128.000 0.000 1.000 Y NA
 323882 323883 bbp386 bbp387 thyA lgt TRUE 0.985 21.000 0.164 1.000 N NA
 323883 323884 bbp387 bbp388 lgt lysA FALSE 0.005 158.000 0.002 1.000 N NA
 323884 323885 bbp388 bbp389 lysA lysS FALSE 0.052 126.000 0.007 1.000 N NA
 323885 323886 bbp389 bbp390 lysS prfB TRUE 0.896 61.000 0.162 1.000 Y NA
 323887 323888 bbp391 bbp392 ygfZ yleA FALSE 0.020 127.000 0.000 1.000   NA
 323888 323889 bbp392 bbp393 yleA ybeY FALSE 0.059 199.000 0.007 NA   NA
 323889 323890 bbp393 bbp394 ybeY corC TRUE 0.765 85.000 0.150 NA   NA
 323890 323891 bbp394 bbp395 corC leuS FALSE 0.024 952.000 0.000 NA N NA
 323891 323892 bbp395 bbp396 leuS holA TRUE 0.535 50.000 0.012 1.000 N NA
 323892 323893 bbp396 bbp397 holA sirA FALSE 0.015 587.000 0.000 1.000 N NA
 323895 323896 bbp399 bbp400 yhgN pgk FALSE 0.005 252.000 0.002 NA N NA
 323896 323897 bbp400 bbp401 pgk fba TRUE 0.977 39.000 0.056 0.017 Y NA
 323897 323898 bbp401 bbp402 fba yggB FALSE 0.326 160.000 0.038 1.000 N NA
 323898 323899 bbp402 bbp403 yggB recC TRUE 0.931 18.000 0.015 1.000 N NA
 323899 323900 bbp403 bbp404 recC recB TRUE 0.997 40.000 0.542 0.006 Y NA
 323900 323901 bbp404 bbp405 recB recD TRUE 0.999 22.000 0.688 0.006   NA
 323902 323903 bbp407 bbp408 ribH ribD TRUE 0.900 90.000 0.034 0.008 Y NA
 323903 323904 bbp408 bbp409 ribD nusB FALSE 0.005 164.000 0.004 1.000 N NA
 2209664 323905 bbp410 bbp411 dxs yajR FALSE 0.027 951.000 0.000 NA   NA
 323907 323908 bbp413 bbp414 cyoE cyoD TRUE 0.995 -12.000 0.047 0.072 N NA
 323908 323909 bbp414 bbp415 cyoD cyoC TRUE 0.994 26.000 0.167 0.036 Y NA
 323909 323910 bbp415 bbp416 cyoC cyoB TRUE 0.996 41.000 0.697 0.036 Y NA
 323910 323911 bbp416 bbp417 cyoB cyoA TRUE 0.972 72.000 0.122 0.004 Y NA
 323912 323913 bbp418 bbp419 bolA clpP FALSE 0.024 647.000 0.000 NA N NA
 323913 323914 bbp419 bbp420 clpP clpX TRUE 0.927 84.000 0.352 1.000 Y NA
 323914 323915 bbp420 bbp421 clpX lon TRUE 0.686 187.000 0.201 1.000 Y NA
 323915 323916 bbp421 bbp422 lon ppiD FALSE 0.256 109.000 0.015 1.000   NA
 323916 323917 bbp422 bbp423 ppiD mdlA FALSE 0.018 453.000 0.000 1.000   NA
 323917 323918 bbp423 bbp424 mdlA mdlB TRUE 0.999 29.000 0.911 0.006 Y NA
 323918 323919 bbp424 bbp425 mdlB dnaX FALSE 0.015 320.000 0.000 1.000 N NA
 323919 323920 bbp425 bbp426 dnaX ybaB TRUE 0.785 225.000 0.411 NA   NA
 323920 323921 bbp426 bbp427 ybaB htpG FALSE 0.058 129.000 0.007 NA   NA
 323921 323922 bbp427 bbp428 htpG adk TRUE 0.736 54.000 0.035 1.000 N NA
 323926 2209665 bbp433 bbp434 cspE   FALSE 0.025 290.000 0.000 NA   NA
 2209665 407255 bbp434 bbp435   rrl FALSE 0.045 103.000 0.000 NA   NA
 407255 401948 bbp435 bbp436 rrl tRNA-Glu FALSE 0.025 160.000 0.000 NA   NA
 401948 323927 bbp436 bbp437 tRNA-Glu aroE FALSE 0.025 205.000 0.000 NA   NA
 323927 323928 bbp437 bbp438 aroE yrdC TRUE 0.991 -7.000 0.087 NA N NA
 323929 323930 bbp439 bbp440 def fmt TRUE 0.991 2.000 0.058 1.000 Y NA
 323931 323932 bbp441 bbp442 rplQ rpoA TRUE 0.985 52.000 0.873 1.000 N NA
 323932 323933 bbp442 bbp443 rpoA rpsD TRUE 0.992 29.000 0.549 1.000 N NA
 323933 323934 bbp443 bbp444 rpsD rpsK TRUE 0.989 49.000 0.509 0.099 Y NA
 323934 323935 bbp444 bbp445 rpsK rpsM TRUE 0.999 19.000 0.810 0.073 Y NA
 323935 323936 bbp445 bbp446 rpsM rpmJ TRUE 0.790 143.000 0.194 0.073   NA
 323936 323937 bbp446 bbp447 rpmJ secY TRUE 0.954 29.000 0.089 1.000   NA
 323937 323938 bbp447 bbp448 secY rplO TRUE 0.998 13.000 0.730 1.000 N NA
 323938 323939 bbp448 bbp449 rplO rpmD TRUE 1.000 11.000 0.653 0.013 Y NA
 323939 323940 bbp449 bbp450 rpmD rpsE TRUE 1.000 -3.000 0.789 0.099 Y NA
 323940 323941 bbp450 bbp451 rpsE rplR TRUE 1.000 -31.000 0.814 0.099 Y NA
 323941 323942 bbp451 bbp452 rplR rplF TRUE 1.000 2.000 0.815 0.073 Y NA
 323942 323943 bbp452 bbp453 rplF rpsH TRUE 0.999 15.000 0.808 0.073 Y NA
 323943 323944 bbp453 bbp454 rpsH rpsN TRUE 0.994 37.000 0.473 0.073 Y NA
 323944 323945 bbp454 bbp455 rpsN rplE TRUE 0.998 25.000 0.496 0.073 Y NA
 323945 323946 bbp455 bbp456 rplE rplX TRUE 0.999 16.000 0.758 0.073 Y NA
 323946 323947 bbp456 bbp457 rplX rplN TRUE 0.999 13.000 0.810 0.099 Y NA
 323947 323948 bbp457 bbp458 rplN rpsQ TRUE 0.953 156.000 0.791 0.099 Y NA
 323948 323949 bbp458 bbp459 rpsQ rpmC TRUE 1.000 -7.000 0.828 0.073   NA
 323949 323950 bbp459 bbp460 rpmC rplP TRUE 1.000 0.000 0.802 0.073   NA
 323950 323951 bbp460 bbp461 rplP rpsC TRUE 0.999 13.000 0.828 0.099 Y NA
 323951 323952 bbp461 bbp462 rpsC rplV TRUE 0.999 6.000 0.719 0.099 Y NA
 323952 323953 bbp462 bbp463 rplV rpsS TRUE 0.998 27.000 0.769 0.099 Y NA
 323953 323954 bbp463 bbp464 rpsS rplB TRUE 0.999 20.000 0.820 0.099 Y NA
 323954 323955 bbp464 bbp465 rplB rplW TRUE 0.997 41.000 0.849 0.054 Y NA
 323955 323956 bbp465 bbp466 rplW rplD TRUE 0.999 12.000 0.513 0.073 Y NA
 323956 323957 bbp466 bbp467 rplD rplC TRUE 0.999 2.000 0.486 0.073 Y NA
 323957 323958 bbp467 bbp468 rplC rpsJ TRUE 0.992 36.000 0.307 0.099 Y NA
 323958 323959 bbp468 bbp469 rpsJ tuf FALSE 0.083 494.000 0.000 1.000 Y NA
 323959 323960 bbp469 bbp470 tuf fusA TRUE 0.920 64.000 0.011 0.004 Y NA
 323960 323961 bbp470 bbp471 fusA rpsG TRUE 0.931 99.000 0.579 1.000 Y NA
 323961 323962 bbp471 bbp472 rpsG rpsL TRUE 0.992 68.000 0.620 0.015 Y NA
 323962 323963 bbp472 bbp473 rpsL yheL TRUE 0.694 75.000 0.058 NA N NA
 323963 323964 bbp473 bbp474 yheL yheM TRUE 0.999 17.000 0.804 NA Y NA
 323964 323965 bbp474 bbp475 yheM yheN TRUE 0.999 16.000 0.790 NA Y NA
 323965 323966 bbp475 bbp476 yheN fkpA TRUE 0.478 80.000 0.020 NA N NA
 323968 323969 bbp478 bbp479 trpS rpe FALSE 0.243 131.000 0.022 1.000 N NA
 323969 323970 bbp479 bbp480 rpe aroB FALSE 0.008 105.000 0.003 1.000 N NA
 323970 323971 bbp480 bbp481 aroB aroK TRUE 0.941 51.000 0.208 1.000 Y NA
 323972 323973 bbp483 bbp484 deoD deoB TRUE 0.823 37.000 0.023 1.000 N NA
 323973 323974 bbp484 bbp485 deoB prfC FALSE 0.014 158.000 0.005 1.000 N NA
 323974 323975 bbp485 bbp486 prfC yhgI FALSE 0.019 1107.000 0.000 1.000   NA
 323978 323979 bbp489 bbp490 dnaB gshB FALSE 0.015 373.000 0.000 1.000 N NA
 323979 323980 bbp490 bbp491 gshB yqgE TRUE 0.667 98.000 0.120 NA N NA
 323980 323981 bbp491 bbp492 yqgE yqgF TRUE 0.995 12.000 0.263 NA N NA
 323982 323983 bbp493 bbp494 leuA leuD TRUE 0.544 235.000 0.000 0.007 Y NA
 323983 323984 bbp494 bbp495 leuD leuC TRUE 0.999 24.000 0.309 0.004 Y NA
 323984 323985 bbp495 bbp496 leuC leuB TRUE 1.000 -3.000 0.275 0.007 Y NA
 323986 323987 bbp497 bbp498 yggS yggW FALSE 0.007 111.000 0.002 NA   NA
 323989 323990 bbp500 bbp501 mutY yggX TRUE 0.993 -7.000 0.150 NA N NA
 323990 323991 bbp501 bbp502 yggX murI FALSE 0.020 71.000 0.004 NA N NA
 323992 401947 bbp503 bbp504 sbcB tRNA-Asn FALSE 0.037 111.000 0.000 NA   NA
 401941 323993 bbp505 bbp506 tRNA-Met pyrE FALSE 0.032 119.000 0.000 NA   NA
 323994 323995 bbp507 bbp508 dut rplI FALSE 0.016 903.000 0.000 1.000 N NA
 323995 323996 bbp508 bbp509 rplI rpsR TRUE 0.993 41.000 0.499 0.072 Y NA
 323996 323997 bbp509 bbp510 rpsR rpsF TRUE 0.920 120.000 0.319 0.072 Y NA
 323997 323998 bbp510 bbp511 rpsF purA FALSE 0.016 636.000 0.000 1.000 N NA
 323998 323999 bbp511 bbp512 purA hflC TRUE 0.481 75.000 0.019 1.000 N NA
 323999 324000 bbp512 bbp513 hflC hflK TRUE 1.000 4.000 0.947 0.022 Y NA
 324000 324001 bbp513 bbp514 hflK miaA FALSE 0.015 270.000 0.000 1.000 N NA
 324001 324002 bbp514 bbp515 miaA mutL TRUE 0.924 -16.000 0.009 1.000 N NA
 324002 324003 bbp515 bbp516 mutL mtlD FALSE 0.312 104.000 0.019 1.000 N NA
 324003 324004 bbp516 bbp517 mtlD mtlA FALSE 0.358 113.000 0.019 1.000 Y NA
 324004 324005 bbp517 bbp518 mtlA pgi FALSE 0.261 517.000 0.015 1.000 Y NA
 324006 401942 bbp519 bbp520 orn tRNA-Gly FALSE 0.025 148.000 0.000 NA   NA
 401942 324007 bbp520 bbp521 tRNA-Gly amiB FALSE 0.026 438.000 0.000 NA   NA
 324009 324010 bbp523 bbp524 hslV hslU TRUE 0.999 13.000 0.752 1.000 Y NA
 324011 324012 bbp525 bbp526 trpG trpE TRUE 1.000 0.000 0.703 0.004 Y NA
 324014 324015 bbp528 bbp529 yjeA yba3 FALSE 0.027 548.000 0.000 NA   NA
 324015 324016 bbp529 bbp530 yba3 uspA FALSE 0.026 501.000 0.000 NA   NA
 324016 324017 bbp530 bbp531 uspA pitA FALSE 0.017 173.000 0.000 1.000   NA
 324017 324018 bbp531 bbp532 pitA ynfM FALSE 0.089 236.000 0.009 1.000 N NA
 324018 324019 bbp532 bbp533 ynfM dapF FALSE 0.005 161.000 0.003 1.000 N NA
 401946 401945 bbp535 bbp536 tRNA-Pro tRNA-His FALSE 0.301 36.000 0.000 NA   NA
 401945 401944 bbp536 bbp537 tRNA-His tRNA-Arg FALSE 0.207 41.000 0.000 NA   NA
 401944 324021 bbp537 bbp538 tRNA-Arg rho FALSE 0.025 283.000 0.000 NA   NA
 324021 324022 bbp538 bbp539 rho trxA TRUE 0.442 265.000 0.087 1.000   NA
 324022 324023 bbp539 bbp540 trxA rep FALSE 0.032 149.000 0.006 1.000   NA
 324023 324024 bbp540 bbp541 rep ilvC FALSE 0.042 101.000 0.005 1.000 N NA
 324024 324025 bbp541 bbp542 ilvC ilvD TRUE 0.915 75.000 0.022 0.007 Y NA
 324025 401943 bbp542 bbp543 ilvD tRNA-Trp FALSE 0.025 281.000 0.000 NA   NA
 324026 324027 bbp544 bbp545 nifS iscU TRUE 0.988 32.000 0.448 1.000 N NA
 324027 324028 bbp545 bbp546 iscU hscB FALSE 0.115 194.000 0.010 1.000 N NA
 324028 324029 bbp546 bbp547 hscB hscA TRUE 0.997 25.000 0.634 NA Y NA
 324029 324030 bbp547 bbp548 hscA fdx TRUE 0.913 118.000 0.794 NA N NA
 324031 324032 bbp549 bbp550 engA yfgM TRUE 0.644 35.000 0.009 1.000   NA
 2209666 2209667 bbp_pp1 bbp_pp2 yqhA repA2 FALSE 0.108 66.000 0.000 NA   NA
 2209667 2209668 bbp_pp2 bbp_pp3 repA2 repA1 TRUE 0.708 90.000 0.000 0.004   NA
 2209668 2209666 bbp_pp3 bbp_pp1 repA1 yqhA FALSE 0.025 170.000 0.000 NA   NA