MicrobesOnline Operon Predictions for Aquifex aeolicus VF5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
24294	24295	aq_001	aq_005	fusA	tufA1	TRUE	0.987	17.000	0.400	0.003	Y	NA
24295	24296	aq_005	aq_008	tufA1	rpsJ	TRUE	0.979	12.000	0.318	1.000	Y	NA
24296	24297	aq_008	aq_009	rpsJ	rplC	TRUE	0.993	5.000	0.467	0.048	Y	NA
24297	24298	aq_009	aq_011	rplC	rplD	TRUE	0.995	-3.000	0.361	0.034	Y	NA
24298	24299	aq_011	aq_012	rplD	rplW	TRUE	0.995	4.000	0.513	0.034	Y	NA
24299	24300	aq_012	aq_013	rplW	rplB	TRUE	0.993	12.000	0.849	0.037	Y	NA
24300	24301	aq_013	aq_015	rplB	rpsS	TRUE	0.973	113.000	0.820	0.048	Y	NA
24301	24302	aq_015	aq_016a	rpsS	rplV	TRUE	0.970	118.000	0.769	0.048	Y	NA
24302	24303	aq_016a	aq_017	rplV	rpsC	TRUE	0.996	3.000	0.719	0.048	Y	NA
24303	24304	aq_017	aq_018	rpsC	rplP	TRUE	0.978	62.000	0.828	0.048	Y	NA
24304	24305	aq_018	aq_018a	rplP	rpmC	TRUE	0.993	12.000	0.802	0.034	Y	NA
24305	24306	aq_018a	aq_020	rpmC	rpsQ	TRUE	0.997	0.000	0.828	0.034	Y	NA
24306	24307	aq_020	aq_021	rpsQ	aroD	FALSE	0.316	0.000	0.000	1.000	N	NA
24308	24309	aq_022	aq_023		argD	FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
24309	24310	aq_023	aq_024	argD	nsd	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24310	24311	aq_024	aq_025	nsd	rodA	FALSE	0.041	278.000	0.000	1.000	N	NA
24311	24312	aq_025	aq_025a	rodA	thiS	TRUE	0.881	-31.000	0.003	1.000	N	NA
24312	24313	aq_025a	aq_026	thiS		TRUE	0.951	-9.000	0.023	1.000	N	NA
24313	24314	aq_026	aq_027			FALSE	0.108	20.000	0.000	1.000	N	NA
24314	24315	aq_027	aq_028			FALSE	0.122	73.000	0.000	1.000		NA
24316	24317	aq_030	aq_031	moeA1	trnS	FALSE	0.147	14.000	0.000	1.000	N	NA
24317	24318	aq_031	aq_032	trnS		FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
24320	24321	aq_036	aq_037			FALSE	0.109	113.000	0.000	1.000		NA
24321	24322	aq_037	aq_038		hibD	FALSE	0.245	16.000	0.000	1.000		NA
24323	24324	aq_039	aq_040	hisB		FALSE	0.300	15.000	0.000	NA		NA
24324	24325	aq_040	aq_041			FALSE	0.160	57.000	0.000	NA		NA
24325	24326	aq_041	aq_042		cyc	FALSE	0.085	33.000	0.000	1.000	N	NA
24326	24327	aq_042	aq_044	cyc	petB	TRUE	0.993	-3.000	0.103	0.003	Y	NA
24327	24328	aq_044	aq_045	petB	petA	TRUE	0.958	14.000	0.013	0.003	Y	NA
24329	24330	aq_046	aq_049	pyrD	phhB	FALSE	0.207	8.000	0.000	1.000	N	NA
24330	24331	aq_049	aq_050	phhB		FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24332	24333	aq_052	aq_053	ubiA	mraY	TRUE	0.694	-3.000	0.000	0.064	N	NA
24333	24334	aq_053	aq_054	mraY		TRUE	0.905	0.000	0.007	NA		NA
24337	24338	aq_057	aq_058	sfsA		FALSE	0.088	497.000	0.000	NA		NA
24338	24339	aq_058	aq_059			TRUE	0.773	122.000	0.071	NA		NA
24341	24342	aq_062	aq_063	speE	rpsF	FALSE	0.058	75.000	0.000	1.000	N	NA
24342	24343	aq_063	aq_064	rpsF	ssb	TRUE	0.881	-10.000	0.005	1.000	N	NA
24343	24344	aq_064	aq_064a	ssb	rpsR	TRUE	0.554	19.000	0.004	1.000	N	NA
24344	24345	aq_064a	aq_064b	rpsR		FALSE	0.067	55.000	0.000	1.000	N	NA
24345	24346	aq_064b	aq_064c			TRUE	0.997	1.000	0.750	0.013	Y	NA
24349	24350	aq_067	aq_069	dmsB2	rplQ	FALSE	0.045	233.000	0.000	1.000	N	NA
24350	24351	aq_069	aq_070	rplQ	rpoA	TRUE	0.978	6.000	0.873	1.000	N	NA
24351	24352	aq_070	aq_072	rpoA	rpsD	TRUE	0.960	13.000	0.549	1.000	N	NA
24352	24353	aq_072	aq_073	rpsD	rpsK	TRUE	0.996	1.000	0.509	0.048	Y	NA
24353	24354	aq_073	aq_074	rpsK	rpsM	TRUE	0.990	16.000	0.810	0.034	Y	NA
24354	24355	aq_074	aq_075	rpsM	rpmJ	TRUE	0.993	-22.000	0.194	0.034		NA
24355	24356	aq_075	aq_075a	rpmJ	infA	TRUE	0.879	61.000	0.257	1.000		NA
24356	24357	aq_075a	aq_076	infA	map	TRUE	0.985	3.000	0.160	1.000	Y	NA
24357	24358	aq_076	aq_078	map	kad	TRUE	0.956	-10.000	0.027	1.000	N	NA
24358	24359	aq_078	aq_079	kad	secY	TRUE	0.828	5.000	0.008	1.000	N	NA
24360	24361	aq_080	aq_081	rpmB	aroC	TRUE	0.818	0.000	0.004	1.000	N	NA
24361	24362	aq_081	aq_082	aroC		FALSE	0.304	2.000	0.000	1.000	N	NA
24364	24365	aq_085	aq_086	kdsA	modC	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24365	24366	aq_086	aq_087	modC		FALSE	0.124	123.000	0.000	NA		NA
24366	24367	aq_087	aq_088			TRUE	0.969	15.000	0.800	NA		NA
24367	24368	aq_088	aq_090			TRUE	0.948	28.000	0.625	NA		NA
24368	24369	aq_090	aq_091m			TRUE	0.988	-7.000	0.625	1.000	N	NA
24370	24371	aq_094	aq_097	nrdA		FALSE	0.136	86.000	0.000	NA		NA
24372	24373	aq_098	aq_099	secG	hemK	TRUE	0.910	-64.000	0.005	1.000	N	NA
24373	24374	aq_099	aq_101	hemK	hly3	TRUE	0.939	-9.000	0.010	1.000		NA
24375	24376	aq_103	aq_104			TRUE	0.469	3.000	0.000	1.000		NA
24381	24382	aq_109	aq_111	glnB	glnA	TRUE	0.832	21.000	0.009	1.000	Y	NA
24382	24383	aq_111	aq_112	glnA	amtB	TRUE	0.481	62.000	0.007	1.000	N	NA
24383	24384	aq_112	aq_113	amtB		TRUE	0.965	14.000	0.600	1.000		NA
24385	24386	aq_114	aq_116			FALSE	0.100	317.000	0.000	NA		NA
24386	24387	aq_116	aq_118		pgk	TRUE	0.501	1.000	0.000	1.000		NA
24387	24388	aq_118	aq_119	pgk	talC	TRUE	0.627	12.000	0.000	1.000	Y	NA
24388	24389	aq_119	aq_121	talC		FALSE	0.091	29.000	0.000	1.000	N	NA
24389	24390	aq_121	aq_122		hisS1	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24391	24392	aq_123	aq_124a	rpsP		TRUE	0.983	-3.000	0.385	1.000		NA
24392	24393	aq_124a	aq_125			TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
24393	24394	aq_125	aq_126			FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
24394	24395	aq_126	aq_127			TRUE	0.955	0.000	0.031	NA		NA
24397	24398	aq_132	aq_133	ribH	nusB	TRUE	0.948	-3.000	0.045	1.000	N	NA
24398	24399	aq_133	aq_134	nusB		FALSE	0.098	202.000	0.000	1.000		NA
24399	24400	aq_134	aq_135		nueM	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24400	24401	aq_135	aq_136	nueM	cpx	FALSE	0.102	23.000	0.000	1.000	N	NA
24402	24403	aq_138	aq_139	ribD1	ribF	TRUE	0.912	-3.000	0.000	0.004	Y	NA
24403	24404	aq_139	aq_141	ribF	pkcI	TRUE	0.703	7.000	0.003	1.000	N	NA
24405	24406	aq_142	aq_145		rfaC2	TRUE	0.968	-3.000	0.075	NA		NA
24406	24407	aq_145	aq_147	rfaC2	cobW	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24407	24408	aq_147	aq_148	cobW	deoC	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24408	24409	aq_148	aq_150	deoC	gltA	FALSE	0.207	8.000	0.000	1.000	N	NA
24409	24410	aq_150	aq_152	gltA	tlpA	TRUE	0.988	-3.000	0.182	1.000	Y	NA
24410	24411	aq_152	aq_153	tlpA	ctaA	FALSE	0.213	580.000	0.000	1.000	Y	NA
24411	24412	aq_153	aq_154	ctaA	ctaB	TRUE	0.985	-3.000	0.112	1.000	Y	NA
24412	24413	aq_154	aq_155	ctaB		TRUE	0.756	2.000	0.000	0.063		NA
24413	24414	aq_155	aq_156			FALSE	0.117	200.000	0.000	NA		NA
24414	24415	aq_156	aq_157			TRUE	0.972	2.000	0.111	NA		NA
24415	24416	aq_157	aq_158		apfA	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24418	24419	aq_162	aq_164	folK	ntrC4	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24421	24422	aq_166	aq_167	proC		TRUE	0.925	-39.000	0.004	NA		NA
24423	24424	aq_168	aq_169			TRUE	0.974	-45.000	0.007	0.010		NA
24424	24425	aq_169	aq_170		bioA	TRUE	0.469	3.000	0.000	1.000		NA
24427	24428	aq_172	aq_173	mutY2		TRUE	0.880	-27.000	0.000	NA	Y	NA
24428	24429	aq_173	aq_175			FALSE	0.388	-3.000	0.000	NA	N	NA
24429	24430	aq_175	aqq_01			TRUE	0.985	-3.000	0.461	NA		NA
24430	24431	aqq_01	aqq_02		rpmH	TRUE	0.859	4.000	0.005	NA		NA
24431	24432	aqq_02	aq_177	rpmH	atpE	TRUE	0.608	44.000	0.008	1.000		NA
24432	24433	aq_177	aq_178	atpE		TRUE	0.818	16.000	0.018	1.000		NA
24433	24434	aq_178	aq_179		atpB	TRUE	0.857	2.000	0.004	1.000		NA
24436	24437	aq_182	aq_183			FALSE	0.360	10.000	0.000	1.000		NA
24437	24438	aq_183	aq_183a		rpoZ	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24438	24439	aq_183a	aq_184	rpoZ		TRUE	0.991	-16.000	0.471	1.000		NA
24439	24440	aq_184	aq_185		tagD1	FALSE	0.083	335.000	0.000	1.000		NA
24440	24441	aq_185	aq_186	tagD1	aldH1	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24441	24442	aq_186	aq_192	aldH1	hslU	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
24442	24443	aq_192	aq_194	hslU		TRUE	0.939	-22.000	0.007	NA		NA
24444	24445	aq_196	aq_197	trpD1		TRUE	0.506	0.000	0.000	1.000		NA
24445	24446	aq_197	aq_199			FALSE	0.151	66.000	0.000	NA		NA
24446	24447	aq_199	aq_200			TRUE	0.979	-3.000	0.190	NA		NA
24447	24448	aq_200	aq_202			TRUE	0.816	-3.000	0.002	NA		NA
24448	24449	aq_202	aq_203		atpG2	TRUE	0.831	-16.000	0.002	1.000	N	NA
24451	24452	aq_206	aq_207	nirB	cobA	FALSE	0.128	16.000	0.000	1.000	N	NA
24452	24453	aq_207	aq_209	cobA	trpD2	TRUE	0.850	5.000	0.010	1.000	N	NA
24453	24454	aq_209	aq_211	trpD2	fhp	FALSE	0.050	134.000	0.000	1.000	N	NA
24454	24455	aq_211	aq_212	fhp	cynS	FALSE	0.160	13.000	0.000	1.000	N	NA
24455	24456	aq_212	aq_213	cynS	glnBi	TRUE	0.778	16.000	0.016	1.000	N	NA
24456	24457	aq_213	aq_215	glnBi	nasA	TRUE	0.932	-3.000	0.024	1.000	N	NA
24457	24458	aq_215	aq_217	nasA	narB	TRUE	0.927	-3.000	0.022	1.000	N	NA
24459	24460	aq_218	aq_220	nifA	dut	FALSE	0.119	17.000	0.000	1.000	N	NA
24460	24461	aq_220	aq_221	dut	phpA	TRUE	0.955	-7.000	0.031	1.000	N	NA
24461	24462	aq_221	aq_226a	phpA	rpsO	TRUE	0.989	3.000	0.335	1.000	Y	NA
24462	24463	aq_226a	aq_227	rpsO	aldH2	FALSE	0.065	59.000	0.000	1.000	N	NA
24466	24467	aq_232	aq_234	dhsU	soxF	TRUE	0.979	10.000	0.182	NA	Y	NA
24467	24468	aq_234	aq_235	soxF	fccB'	TRUE	0.995	-19.000	0.455	NA	Y	NA
24470	24471	aq_238	aq_239	sodC2	folE	FALSE	0.056	81.000	0.000	1.000	N	NA
24474	24475	aq_243	aq_244		leuB	TRUE	0.962	-13.000	0.019	NA		NA
11403774	24472		aq_240			FALSE	NA	5287.000	0.000	NA		NA
11546137	24472		aq_240			FALSE	NA	5287.000	0.000	NA		NA
11688529	24472		aq_240			FALSE	NA	5287.000	0.000	NA		NA
11403775	24472		aq_240			FALSE	NA	5318.000	0.000	NA		NA
11546138	24472		aq_240			FALSE	NA	5318.000	0.000	NA		NA
11688530	24472		aq_240			FALSE	NA	5318.000	0.000	NA		NA
11403776	24472		aq_240			FALSE	NA	5353.000	0.000	NA		NA
11546139	24472		aq_240			FALSE	NA	5353.000	0.000	NA		NA
11688531	24472		aq_240			FALSE	NA	5353.000	0.000	NA		NA
11403777	24472		aq_240			FALSE	NA	5384.000	0.000	NA		NA
11546140	24472		aq_240			FALSE	NA	5384.000	0.000	NA		NA
11688532	24472		aq_240			FALSE	NA	5384.000	0.000	NA		NA
11403778	24472		aq_240			FALSE	NA	5427.000	0.000	NA		NA
11546141	24472		aq_240			FALSE	NA	5427.000	0.000	NA		NA
11688533	24472		aq_240			FALSE	NA	5427.000	0.000	NA		NA
11403779	24472		aq_240			FALSE	NA	5458.000	0.000	NA		NA
11546142	24472		aq_240			FALSE	NA	5458.000	0.000	NA		NA
11688534	24472		aq_240			FALSE	NA	5458.000	0.000	NA		NA
11403780	24472		aq_240			FALSE	NA	5498.000	0.000	NA		NA
11546143	24472		aq_240			FALSE	NA	5498.000	0.000	NA		NA
11688535	24472		aq_240			FALSE	NA	5498.000	0.000	NA		NA
11403781	24472		aq_240			FALSE	NA	5529.000	0.000	NA		NA
11546144	24472		aq_240			FALSE	NA	5529.000	0.000	NA		NA
11688536	24472		aq_240			FALSE	NA	5529.000	0.000	NA		NA
11403782	24472		aq_240			FALSE	NA	5565.000	0.000	NA		NA
11546145	24472		aq_240			FALSE	NA	5565.000	0.000	NA		NA
11688537	24472		aq_240			FALSE	NA	5565.000	0.000	NA		NA
24477	24478	aq_246	aq_247		gatA	TRUE	0.506	0.000	0.000	1.000		NA
24478	24479	aq_247	aq_250	gatA		TRUE	0.689	13.000	0.005	1.000	N	NA
24479	24480	aq_250	aq_251			FALSE	0.072	47.000	0.000	1.000	N	NA
24480	24481	aq_251	aq_252			FALSE	0.283	16.000	0.000	NA		NA
24481	24482	aq_252	aq_253		kdtB	TRUE	0.658	-12.000	0.000	NA		NA
24483	24484	aq_254	aq_255			FALSE	0.193	34.000	0.000	NA		NA
24485	24486	aq_257	aq_259	ygcA	nusA	TRUE	0.945	-19.000	0.004	0.035	N	NA
24486	24487	aq_259	aq_260	nusA		TRUE	0.992	-6.000	0.759	NA		NA
24487	24488	aq_260	aq_262			FALSE	0.082	745.000	0.000	NA		NA
2209589	24489	aq_t01	aq_263		hemC	TRUE	0.701	-45.000	0.000	NA		NA
24489	24490	aq_263	aq_264	hemC		TRUE	0.782	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
24492	24493	aq_267	aq_268			FALSE	0.127	116.000	0.000	NA		NA
24495	24496	aq_270	aq_271	lgt		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24498	24499	aq_273	aq_274	aspC4		FALSE	0.180	41.000	0.000	NA		NA
24500	24501	aq_276	aq_277			TRUE	0.989	-3.000	0.727	NA		NA
24501	24502	aq_277	aq_278			TRUE	0.979	-3.000	0.200	NA		NA
24502	24503	aq_278	aq_281		acrR3	FALSE	0.099	25.000	0.000	1.000	N	NA
24505	24506	aq_283	aq_284			TRUE	0.880	-3.000	0.005	NA		NA
24506	24507	aq_284	aq_286			FALSE	0.212	29.000	0.000	NA		NA
24507	24508	aq_286	aq_287		smb	TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
24508	24509	aq_287	aq_288	smb		FALSE	0.366	8.000	0.000	1.000		NA
24510	24511	aq_291	aq_293			FALSE	0.349	11.000	0.000	1.000		NA
24511	24512	aq_293	aq_294			FALSE	0.384	6.000	0.000	1.000		NA
24512	24513	aq_294	aq_296			TRUE	0.996	-3.000	0.714	0.085	Y	NA
24513	24514	aq_296	aq_297		abcT8	TRUE	0.977	-7.000	0.133	1.000	N	NA
24517	24518	aq_302	aq_303			TRUE	0.980	-3.000	0.206	NA		NA
24518	24519	aq_303	aq_305		ileS	FALSE	0.425	-13.000	0.000	1.000	N	NA
24521	24522	aq_311	aq_313			TRUE	0.666	-13.000	0.000	NA		NA
24522	24523	aq_313	aq_314			TRUE	0.807	9.000	0.005	NA		NA
24523	24524	aq_314	aq_316		hksP2	FALSE	0.053	109.000	0.000	1.000	N	NA
24525	24526	aq_319	aq_321	phoB		TRUE	0.821	11.000	0.000	0.031	Y	NA
24527	24528	aq_322	aq_323	dnaA		FALSE	0.329	91.000	0.003	1.000	N	NA
24533	24534	aq_328	aq_331			FALSE	0.179	30.000	0.000	1.000		NA
24534	2209590	aq_331	aq_t02			FALSE	0.171	48.000	0.000	NA		NA
2209590	24535	aq_t02	aq_334		dcuP	FALSE	0.222	26.000	0.000	NA		NA
2209591	2209592	aq_t03	aq_t04			FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
24537	24538	aq_337	aq_338	cysQ		FALSE	0.264	4.000	0.000	1.000	N	NA
24539	24540	aq_340	aq_341			FALSE	0.219	906.000	0.000	NA	Y	NA
24540	24541	aq_341	aq_342			FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
24542	24543	aq_343	aq_344	arsA2	rfaD	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24545	24546	aq_346	aq_348	pth	ctc	TRUE	0.988	5.000	0.496	0.051		NA
24548	24549	aq_351	aq_355	leuS		FALSE	0.333	4.000	0.000	NA	N	NA
24549	24550	aq_355	aq_356		leuA1	FALSE	0.193	14.000	0.000	NA	N	NA
24551	24552	aq_357a	aq_358	flgM	dinG	FALSE	0.345	64.000	0.000	1.000	Y	NA
24552	24553	aq_358	aq_359	dinG		FALSE	0.321	12.000	0.000	1.000		NA
24554	24555	aq_360	aq_362	timA		FALSE	0.171	336.000	0.000	0.055	N	NA
24555	24556	aq_362	aq_363			TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
24556	24557	aq_363	aq_364			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24557	24558	aq_364	aq_365		proS	TRUE	0.799	-3.000	0.000	NA	Y	NA
11403783	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2612.000	0.000	NA		NA
11546146	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2612.000	0.000	NA		NA
11688538	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2612.000	0.000	NA		NA
11403784	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2641.000	0.000	NA		NA
11546147	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2641.000	0.000	NA		NA
11688539	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2641.000	0.000	NA		NA
11403785	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2680.000	0.000	NA		NA
11546148	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2680.000	0.000	NA		NA
11688540	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2680.000	0.000	NA		NA
11403786	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2709.000	0.000	NA		NA
11546149	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2709.000	0.000	NA		NA
11688541	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2709.000	0.000	NA		NA
11403787	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2749.000	0.000	NA		NA
11546150	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2749.000	0.000	NA		NA
11688542	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2749.000	0.000	NA		NA
11403788	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2778.000	0.000	NA		NA
11546151	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2778.000	0.000	NA		NA
11688543	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2778.000	0.000	NA		NA
11403789	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2814.000	0.000	NA		NA
11546152	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2814.000	0.000	NA		NA
11688544	24558		aq_365		proS	FALSE	NA	2814.000	0.000	NA		NA
24560	24561	aq_369	aq_370			TRUE	0.990	-7.000	0.119	NA	Y	NA
24561	24562	aq_370	aq_371			TRUE	0.980	-22.000	0.071	1.000		NA
24562	24563	aq_371	aq_372			TRUE	0.983	-49.000	0.071	NA		NA
24563	24564	aq_372	aq_373			TRUE	0.984	-9.000	0.143	NA		NA
24564	24565	aq_373	aq_374			TRUE	0.991	-19.000	0.103	NA	Y	NA
24565	24566	aq_374	aq_376			FALSE	0.140	78.000	0.000	NA		NA
24566	24567	aq_376	aq_377			TRUE	0.540	2.000	0.000	NA		NA
24567	24568	aq_377	aq_378			FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
24568	24569	aq_378	aq_380			TRUE	0.977	-3.000	0.034	NA	Y	NA
24569	24570	aq_380	aq_381			TRUE	0.562	16.000	0.000	NA	Y	NA
24570	24571	aq_381	aq_382			FALSE	0.447	33.000	0.000	NA	Y	NA
24571	24572	aq_382	aq_383			TRUE	0.882	-34.000	0.000	NA	Y	NA
24572	24573	aq_383	aq_384			FALSE	0.287	242.000	0.000	NA	Y	NA
24573	24574	aq_384	aq_385			TRUE	0.993	-10.000	0.256	NA	Y	NA
24574	24575	aq_385	aq_386			TRUE	0.987	-3.000	0.136	NA	Y	NA
24575	24576	aq_386	aq_387			TRUE	0.976	-19.000	0.041	NA		NA
24577	24578	aq_388	aq_389			FALSE	0.084	609.000	0.000	NA		NA
24578	24579	aq_389	aq_390			TRUE	0.961	20.000	0.833	NA		NA
24579	24580	aq_390	aq_391			TRUE	0.820	127.000	0.132	NA		NA
24580	24581	aq_391	aq_392			TRUE	0.955	59.000	0.526	NA	Y	NA
24581	24582	aq_392	aq_394			FALSE	0.308	148.000	0.000	NA	Y	NA
24582	24583	aq_394	aq_395		hdrA	TRUE	0.811	58.000	0.062	NA		NA
24583	24584	aq_395	aq_397	hdrA		TRUE	0.988	-3.000	0.600	NA		NA
24584	24585	aq_397	aq_398		hdrC	TRUE	0.969	15.000	0.760	NA		NA
24585	24586	aq_398	aq_400	hdrC	hdrB	TRUE	0.994	13.000	0.864	0.003	Y	NA
24586	24587	aq_400	aq_401	hdrB		TRUE	0.814	75.000	0.091	NA		NA
24587	24588	aq_401	aq_402			TRUE	0.953	28.000	0.786	NA		NA
24588	24589	aq_402	aq_403			TRUE	0.875	43.000	0.158	1.000		NA
24589	24590	aq_403	aq_404			FALSE	0.230	17.000	0.000	1.000		NA
24591	24592	aq_406	aq_407			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24592	24593	aq_407	aq_408			FALSE	0.283	16.000	0.000	NA		NA
24593	24594	aq_408	aq_409		pyrB	TRUE	0.642	-9.000	0.000	NA		NA
24594	24595	aq_409	aq_410	pyrB	carA	TRUE	0.963	-3.000	0.014	1.000	Y	NA
11403790	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8184.000	0.000	NA		NA
11546153	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8184.000	0.000	NA		NA
11688545	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8184.000	0.000	NA		NA
11403791	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8213.000	0.000	NA		NA
11546154	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8213.000	0.000	NA		NA
11688546	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8213.000	0.000	NA		NA
11403792	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8249.000	0.000	NA		NA
11546155	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8249.000	0.000	NA		NA
11688547	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8249.000	0.000	NA		NA
11403793	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8278.000	0.000	NA		NA
11546156	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8278.000	0.000	NA		NA
11688548	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8278.000	0.000	NA		NA
11403794	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8314.000	0.000	NA		NA
11546157	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8314.000	0.000	NA		NA
11688549	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8314.000	0.000	NA		NA
11403795	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8343.000	0.000	NA		NA
11546158	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8343.000	0.000	NA		NA
11688550	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8343.000	0.000	NA		NA
11403796	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8381.000	0.000	NA		NA
11546159	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8381.000	0.000	NA		NA
11688551	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8381.000	0.000	NA		NA
11403797	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8410.000	0.000	NA		NA
11546160	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8410.000	0.000	NA		NA
11688552	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8410.000	0.000	NA		NA
11403798	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8447.000	0.000	NA		NA
11546161	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8447.000	0.000	NA		NA
11688553	24585		aq_398		hdrC	FALSE	NA	8447.000	0.000	NA		NA
24596	24597	aq_411	aq_413	pcnB1	abcT7	TRUE	0.469	3.000	0.000	1.000		NA
24597	24598	aq_413	aq_414	abcT7		TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24598	24599	aq_414	aq_415		napA1	TRUE	0.979	-28.000	0.062	1.000		NA
24599	24600	aq_415	aq_416	napA1		FALSE	0.230	17.000	0.000	1.000		NA
24600	24601	aq_416	aq_417		abcT6	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24602	24603	aq_418	aq_419	gspG		TRUE	0.506	0.000	0.000	1.000		NA
24603	24604	aq_419	aq_420			TRUE	0.981	0.000	0.250	NA		NA
24605	24606	aq_421	aq_422	aspC3	metG'	FALSE	0.245	16.000	0.000	1.000		NA
24606	24607	aq_422	aq_423	metG'		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24608	24609	aq_425	aq_427	thrC2		FALSE	0.219	27.000	0.000	NA		NA
24609	24610	aq_427	aq_428			FALSE	0.257	18.000	0.000	NA		NA
24612	24613	aq_430	aq_433		grpE	TRUE	0.668	148.000	0.023	NA		NA
24613	24614	aq_433	aq_434	grpE	glpK	FALSE	0.108	20.000	0.000	1.000	N	NA
24614	24615	aq_434	aq_436	glpK	ribD2	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24615	2209593	aq_436	aq_t05	ribD2		FALSE	0.227	25.000	0.000	NA		NA
24617	24618	aq_438	aq_439			TRUE	0.803	239.000	0.022	0.001		NA
24621	24622	aq_443	aq_445	gua	accD	TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
24622	24623	aq_445	aq_447	accD	mgtC	TRUE	0.834	-3.000	0.003	1.000		NA
24623	24624	aq_447	aq_448	mgtC		FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
24624	24625	aq_448	aq_449			TRUE	0.964	-9.000	0.023	NA		NA
24625	24626	aq_449	aq_450			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24627	24628	aq_451	aq_453	ilvB		FALSE	0.083	334.000	0.000	1.000		NA
24628	24629	aq_453	aq_454			TRUE	0.949	-12.000	0.011	1.000		NA
24629	24630	aq_454	aq_455		sor	FALSE	0.203	32.000	0.000	NA		NA
24631	24632	aq_458	aq_459	bcp		FALSE	0.200	23.000	0.000	1.000		NA
24632	24633	aq_459	aq_460			TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24633	24634	aq_460	aq_461		gatB	FALSE	0.321	12.000	0.000	1.000		NA
24634	24635	aq_461	aq_465	gatB		FALSE	0.339	13.000	0.000	NA		NA
24635	24636	aq_465	aq_467			FALSE	0.090	448.000	0.000	NA		NA
24636	24637	aq_467	aq_468		czcB3	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24637	24638	aq_468	aq_469	czcB3	acrD3	FALSE	0.138	15.000	0.000	1.000	N	NA
24638	24639	aq_469	aq_473	acrD3		FALSE	0.266	17.000	0.000	NA		NA
24641	24642	aq_476	aq_477	panD		TRUE	0.850	2.000	0.005	NA	N	NA
24643	24644	aq_478	aq_479		glyA	TRUE	0.931	-34.000	0.008	1.000	N	NA
24644	24645	aq_479	aq_481	glyA	oppB	TRUE	0.669	9.000	0.000	1.000	Y	NA
24647	24648	aq_486	aq_488	ahpC1	tpx	TRUE	0.623	54.000	0.000	0.004	Y	NA
24648	24649	aq_488	aq_490	tpx	fnr	FALSE	0.061	69.000	0.000	1.000	N	NA
24649	24650	aq_490	aq_492	fnr		TRUE	0.829	98.000	0.250	1.000	N	NA
24650	24651	aq_492	aq_493			FALSE	0.219	27.000	0.000	NA		NA
24651	24652	aq_493	aq_494			TRUE	0.703	-52.000	0.000	NA		NA
24653	24654	aq_495	aq_496		mutY3	TRUE	0.965	-75.000	0.026	1.000	N	NA
24655	24656	aq_497	aq_498	gsdA	gnd	TRUE	0.994	-37.000	0.286	1.000	Y	NA
24656	24657	aq_498	aq_499	gnd		FALSE	0.316	0.000	0.000	1.000	N	NA
24657	24658	aq_499	aq_500		trxB	FALSE	0.056	82.000	0.000	1.000	N	NA
24658	24659	aq_500	aq_501	trxB	pmu	FALSE	0.049	143.000	0.000	1.000	N	NA
24659	24660	aq_501	aq_503	pmu		TRUE	0.706	-108.000	0.000	NA		NA
24660	24661	aq_503	aq_504		otnA'	FALSE	0.136	84.000	0.000	NA		NA
24661	24662	aq_504	aq_505	otnA'	otnA	TRUE	0.458	31.000	0.000	NA	Y	NA
24662	24663	aq_505	aq_506	otnA		TRUE	0.936	-58.000	0.000	0.079	Y	NA
24664	24665	aq_507	aq_509			FALSE	0.067	792.000	0.000	1.000		NA
24665	24666	aq_509	aq_510			TRUE	0.501	1.000	0.000	1.000		NA
24666	24667	aq_510	aq_511		murB2	FALSE	0.156	39.000	0.000	1.000		NA
24669	24670	aq_515	aq_516	mtfB	mtfC	TRUE	0.992	-3.000	0.103	0.016	Y	NA
24670	24671	aq_516	aq_518	mtfC	spsK	FALSE	0.129	64.000	0.000	1.000		NA
24671	24672	aq_518	aq_519	spsK	rfe	TRUE	0.653	-31.000	0.000	1.000		NA
24672	24673	aq_519	aq_520	rfe	murB1	TRUE	0.781	1.000	0.000	1.000	Y	NA
24673	24674	aq_520	aq_521	murB1	ddlA	TRUE	0.997	-43.000	0.135	0.007	Y	NA
24674	24675	aq_521	aq_522	ddlA		TRUE	0.801	11.000	0.005	NA		NA
24675	24676	aq_522	aq_523		ftsA	TRUE	0.988	0.000	0.600	NA		NA
24676	24677	aq_523	aq_525	ftsA	ftsZ	TRUE	0.846	13.000	0.004	1.000	Y	NA
24677	24678	aq_525	aq_527	ftsZ	moaC	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24678	24679	aq_527	aq_528	moaC	dedF	TRUE	0.945	-12.000	0.003	1.000	Y	NA
24682	24683	aq_532	aq_533			FALSE	0.283	16.000	0.000	NA		NA
24684	24685	aq_534	aq_538	draG	lpxD	FALSE	0.054	330.000	0.000	NA	N	NA
24685	24686	aq_538	aq_539	lpxD		TRUE	0.491	2.000	0.000	1.000		NA
24688	24689	aq_542	aq_544	bcpC	hpt	FALSE	0.304	2.000	0.000	1.000	N	NA
24692	24693	aq_548	aq_549		trpG	FALSE	0.054	99.000	0.000	1.000	N	NA
24693	24694	aq_549	aq_551	trpG	nuoD1	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24694	24695	aq_551	aq_552	nuoD1	sms	FALSE	0.073	44.000	0.000	1.000	N	NA
24695	24696	aq_552	aq_553	sms	frdB1	TRUE	0.657	9.000	0.002	1.000	N	NA
24696	24697	aq_553	aq_554	frdB1		FALSE	0.080	36.000	0.000	1.000	N	NA
24698	24699	aq_555	aq_556		pbpA2	TRUE	0.540	2.000	0.000	NA		NA
24700	24701	aq_557	aq_558	bioD	thiE2	TRUE	0.782	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
24701	24702	aq_558	aq_561	thiE2	recN	FALSE	0.078	38.000	0.000	1.000	N	NA
24702	401898	aq_561	aq_t06	recN	tRNA-Thr	FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
24703	24704	aq_563	aq_565		rfaE	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
24704	24705	aq_565	aq_566	rfaE	birA	FALSE	0.286	3.000	0.000	1.000	N	NA
24708	24709	aq_572	aq_573		nuoF	FALSE	0.203	10.000	0.000	1.000	N	NA
24709	24710	aq_573	aq_574	nuoF	nuoE	TRUE	0.998	-25.000	1.000	0.011	Y	NA
24710	24711	aq_574	aq_575	nuoE		FALSE	0.108	20.000	0.000	1.000	N	NA
24711	24712	aq_575	aq_576		stpK	TRUE	0.956	-3.000	0.011	1.000	Y	NA
24715	24716	aq_579	aq_581	def		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24720	24721	aq_589	aq_591	xanB		TRUE	0.682	-19.000	0.000	NA		NA
24721	2209594	aq_591	aq_t07			TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
2209594	24722	aq_t07	aq_592			FALSE	0.231	24.000	0.000	NA		NA
24723	24724	aq_594	aq_597	frdA	purB	FALSE	0.040	296.000	0.000	1.000	N	NA
24724	24725	aq_597	aq_598	purB		FALSE	0.178	42.000	0.000	NA		NA
24728	24729	aq_601	aq_603			FALSE	0.114	212.000	0.000	NA		NA
24729	24730	aq_603	aq_604		lpxA	FALSE	0.165	34.000	0.000	1.000		NA
24730	24731	aq_604	aq_607	lpxA	glmU	TRUE	0.819	14.000	0.003	1.000	Y	NA
24732	24733	aq_608	aq_609	thrC1		FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
24733	24734	aq_609	aq_613		deaD	FALSE	0.069	676.000	0.000	1.000		NA
24735	24736	aq_615	aq_616			FALSE	0.193	34.000	0.000	NA		NA
24736	24737	aq_616	aq_618		pfpI	FALSE	0.349	11.000	0.000	1.000		NA
24737	24738	aq_618	aq_619	pfpI	yfeA	TRUE	0.945	0.000	0.024	1.000		NA
24738	24739	aq_619	aq_620	yfeA	abcT2	TRUE	0.993	-9.000	0.286	1.000	Y	NA
24739	24740	aq_620	aq_621	abcT2		TRUE	0.929	58.000	0.214	1.000	Y	NA
24742	24743	aq_624	aq_626	mrcA	bioF	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24744	24745	aq_627	aq_628			FALSE	0.182	40.000	0.000	NA		NA
24745	24746	aq_628	aq_629		xcpC	FALSE	0.089	455.000	0.000	NA		NA
24746	24747	aq_629	aq_632	xcpC		FALSE	0.091	254.000	0.000	1.000		NA
24749	24750	aq_635	aq_638		lysR1	TRUE	0.757	828.000	0.333	1.000	N	NA
24752	24753	aq_642	aq_644			FALSE	0.384	6.000	0.000	1.000		NA
24754	24755	aq_645	aq_647			TRUE	0.880	363.000	0.684	NA		NA
24757	24758	aq_651	aq_652		nlpD1	FALSE	0.388	-3.000	0.000	NA	N	NA
24758	24759	aq_652	aq_653	nlpD1	fliG	FALSE	0.043	257.000	0.000	1.000	N	NA
24759	24760	aq_653	aq_655	fliG	frdB2	TRUE	0.824	2.000	0.005	1.000	N	NA
24762	24763	aq_660	aq_662	mbhS1	mbhL1	TRUE	0.991	15.000	0.611	0.004	Y	NA
24763	24764	aq_662	aq_665	mbhL1	hoxZ	TRUE	0.994	-7.000	0.111	0.059	Y	NA
24764	24765	aq_665	aq_666	hoxZ	hupE	FALSE	0.210	13.000	0.000	NA	N	NA
24765	24766	aq_666	aq_667	hupE	hupD	FALSE	0.210	13.000	0.000	NA	N	NA
24766	24767	aq_667	aq_668	hupD		TRUE	0.980	-13.000	0.077	NA		NA
24767	24768	aq_668	aq_669			TRUE	0.979	-6.000	0.103	NA		NA
24768	24769	aq_669	aq_671		hypB	TRUE	0.958	-7.000	0.021	NA		NA
24769	24770	aq_671	aq_672	hypB	hypF	TRUE	0.992	-31.000	0.021	0.017	Y	NA
24770	24771	aq_672	aq_673	hypF	atpC	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
24771	24772	aq_673	aq_674	atpC		TRUE	0.935	-16.000	0.007	1.000		NA
24773	24774	aq_676	aq_678			FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
24777	24778	aq_684	aq_685		arsC	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24778	24779	aq_685	aq_686	arsC	uvrA	FALSE	0.177	12.000	0.000	1.000	N	NA
24780	24781	aq_689	aq_691		gidA2	FALSE	0.160	13.000	0.000	1.000	N	NA
24783	24784	aq_693	aq_695		acrD1	FALSE	0.072	111.000	0.000	NA	N	NA
24784	24785	aq_695	aq_698	acrD1	acrE	TRUE	0.973	5.000	0.449	NA	N	NA
24785	24786	aq_698	aq_699	acrE		TRUE	0.991	-3.000	0.422	1.000	Y	NA
24786	24787	aq_699	aq_701			FALSE	0.164	54.000	0.000	NA		NA
24787	24788	aq_701	aq_702		merR	TRUE	0.666	-13.000	0.000	NA		NA
24788	24789	aq_702	aq_703	merR	dnaJ2	TRUE	0.901	6.000	0.028	1.000	N	NA
24789	24790	aq_703	aq_705	dnaJ2	truB	FALSE	0.372	71.000	0.004	1.000	N	NA
24791	24792	aq_706	aq_707	trpB1		TRUE	0.535	16.000	0.000	1.000	Y	NA
24792	24793	aq_707	aq_708		hyuA	TRUE	0.738	4.000	0.000	1.000	Y	NA
24794	24795	aq_710	aq_711	nucI		TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24795	24796	aq_711	aq_712		frr	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
24796	24797	aq_712	aq_713	frr	pyrH	FALSE	0.220	6.000	0.000	1.000	N	NA
24797	24798	aq_713	aq_715	pyrH	tsf	TRUE	0.980	0.000	0.416	1.000	N	NA
24798	24799	aq_715	aq_716	tsf		FALSE	0.078	77.000	0.000	NA	N	NA
24800	24801	aq_717	aq_718	glgP	mpg	TRUE	0.980	-3.000	0.011	0.015	Y	NA
24801	24802	aq_718	aq_720	mpg		TRUE	0.993	-3.000	0.124	0.015	Y	NA
24802	24803	aq_720	aq_721		glgA	TRUE	0.782	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
24803	24804	aq_721	aq_722	glgA	glgB	TRUE	0.867	-25.000	0.000	1.000	Y	NA
24804	24805	aq_722	aq_723	glgB	malM	TRUE	0.917	-3.000	0.000	0.001	Y	NA
24805	24806	aq_723	aq_724	malM	ctrA1	FALSE	0.177	12.000	0.000	1.000	N	NA
24806	24807	aq_724	aq_727	ctrA1	ldhA	TRUE	0.597	6.000	0.000	0.051	N	NA
24807	24808	aq_727	aq_728	ldhA	speC	FALSE	0.080	36.000	0.000	1.000	N	NA
24808	24809	aq_728	aq_729	speC		TRUE	0.663	-94.000	0.000	1.000		NA
24809	24810	aq_729	aq_731		ccdA	FALSE	0.321	12.000	0.000	1.000		NA
24810	24811	aq_731	aq_732	ccdA	hisH	FALSE	0.316	0.000	0.000	1.000	N	NA
24812	24813	aq_734	aq_735	rpsG2	rpsL2	TRUE	0.993	4.000	0.224	0.007	Y	NA
24814	24815	aq_736	aq_737	lpdA		FALSE	0.063	64.000	0.000	1.000	N	NA
24815	24816	aq_737	aq_739		nifS2	TRUE	0.911	21.000	0.267	1.000	N	NA
24816	24817	aq_739	aq_740	nifS2		FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
24819	24820	aq_745	aq_747	pilT	pilC1	TRUE	0.989	0.000	0.218	1.000	Y	NA
24821	24822	aq_748	aq_749	ispA	truA	FALSE	0.147	14.000	0.000	1.000	N	NA
24822	24823	aq_749	aq_750	truA	pgi	FALSE	0.388	-7.000	0.000	1.000	N	NA
24823	24824	aq_750	aq_752	pgi		FALSE	0.193	34.000	0.000	NA		NA
24824	24825	aq_752	aq_754			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24825	24826	aq_754	aq_755			TRUE	0.630	-7.000	0.000	NA		NA
24826	24827	aq_755	aq_756			TRUE	0.981	-3.000	0.235	NA		NA
24827	24828	aq_756	aq_757			TRUE	0.630	-7.000	0.000	NA		NA
24828	24829	aq_757	aq_758			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24829	24830	aq_758	aq_759			TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
24831	24832	aq_761	aq_763	gidA1	genX	FALSE	0.316	0.000	0.000	1.000	N	NA
24834	24835	aq_765	aq_766			TRUE	0.979	-22.000	0.057	NA		NA
24835	24836	aq_766	aq_768			TRUE	0.969	7.000	0.286	NA		NA
24836	24837	aq_768	aq_769		purM	TRUE	0.817	3.000	0.005	1.000	N	NA
24837	24838	aq_769	aq_770	purM		FALSE	0.119	157.000	0.000	NA		NA
24838	24839	aq_770	aq_771			TRUE	0.730	30.000	0.011	NA		NA
24839	24840	aq_771	aq_773		tly	FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
24840	24841	aq_773	aq_775	tly		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24842	24843	aq_777	aq_778	nadB		TRUE	0.644	-22.000	0.000	1.000		NA
24843	24844	aq_778	aq_780			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24844	24845	aq_780	aq_782		hisD	TRUE	0.946	-7.000	0.011	NA		NA
24845	24846	aq_782	aq_786	hisD	acrD4	FALSE	0.049	439.000	0.000	NA	N	NA
24847	24848	aq_788	aq_789			FALSE	0.114	18.000	0.000	1.000	N	NA
24848	24849	aq_789	aq_791			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24849	24850	aq_791	aq_792		cycB1	FALSE	0.227	25.000	0.000	NA		NA
24850	24851	aq_792	aq_792a	cycB1	rpmI	FALSE	0.133	59.000	0.000	1.000		NA
24853	24854	aq_796	aq_797		prc	TRUE	0.912	-3.000	0.009	NA		NA
24854	24855	aq_797	aq_801	prc	gcp	TRUE	0.959	-3.000	0.017	0.024	N	NA
24855	2209597	aq_801	aq_t10	gcp		FALSE	0.186	38.000	0.000	NA		NA
2209597	24856	aq_t10	aq_802		mbhS3	FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
24856	24857	aq_802	aq_804	mbhS3	mbhL3	TRUE	0.998	-10.000	1.000	0.004	Y	NA
24858	24859	aq_805	aq_806		pyrC	TRUE	0.809	4.000	0.003	NA		NA
24859	24860	aq_806	aq_808	pyrC		FALSE	0.316	14.000	0.000	NA		NA
24860	24861	aq_808	aq_809			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24861	24862	aq_809	aq_811			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24864	24865	aq_813	aq_814	acpS		FALSE	0.388	-3.000	0.000	NA	N	NA
24865	24866	aq_814	aq_815		dfp	FALSE	0.392	0.000	0.000	NA	N	NA
24867	24868	aq_816	aq_818	gsa		TRUE	0.882	4.000	0.008	NA		NA
24868	24869	aq_818	aq_819		lnt	TRUE	0.978	-42.000	0.041	NA		NA
24870	24871	aq_820	aq_821		murF	TRUE	0.956	-10.000	0.014	NA		NA
24871	2209598	aq_821	aq_r01	murF		FALSE	0.227	25.000	0.000	NA		NA
2209598	407350	aq_r01	aq_r02		rrl	FALSE	0.182	40.000	0.000	NA		NA
407350	401895	aq_r02	aq_t11	rrl	tRNA-Ala	FALSE	0.171	48.000	0.000	NA		NA
401895	401894	aq_t11	aq_t12	tRNA-Ala	tRNA-Ile	FALSE	0.266	17.000	0.000	NA		NA
401894	2209599	aq_t12	aq_r03	tRNA-Ile		FALSE	0.131	105.000	0.000	NA		NA
24873	24874	aq_832	aq_833	surE	flgA	TRUE	0.491	4.000	0.000	NA		NA
24874	24875	aq_833	aq_834	flgA	flgG2	TRUE	0.985	-70.000	0.021	NA	Y	NA
24882	24883	aq_845	aq_847	mreB		TRUE	0.938	-3.000	0.030	1.000	N	NA
24883	24884	aq_847	aq_848			FALSE	0.106	263.000	0.000	NA		NA
24885	24886	aq_849	aq_850			FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
24886	24887	aq_850	aq_851		corA	TRUE	0.642	-9.000	0.000	NA		NA
24887	24888	aq_851	aq_852	corA	pdxA	FALSE	0.425	-13.000	0.000	1.000	N	NA
24888	24889	aq_852	aq_853	pdxA		TRUE	0.974	-7.000	0.014	1.000	Y	NA
24889	24890	aq_853	aq_854			TRUE	0.656	11.000	0.000	1.000	Y	NA
24890	24891	aq_854	aq_855			TRUE	0.939	-3.000	0.031	1.000	N	NA
24893	24894	aq_858	aq_862	ahpC2		FALSE	0.036	422.000	0.000	1.000	N	NA
24894	24895	aq_862	aq_863			TRUE	0.987	-7.000	0.288	NA		NA
24895	24896	aq_863	aq_866		nuoL2	TRUE	0.911	14.000	0.061	NA		NA
24896	24897	aq_866	aq_867a	nuoL2	rpsU	FALSE	0.137	55.000	0.000	1.000		NA
24897	24898	aq_867a	aq_869	rpsU	nadC	FALSE	0.086	286.000	0.000	1.000		NA
24898	2209600	aq_869	aq_t13	nadC		FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
24899	24900	aq_871	aq_873	thdF	rho	TRUE	0.762	16.000	0.009	1.000		NA
24900	24901	aq_873	aq_rpmE	rho	RpmE	TRUE	0.822	51.000	0.115	1.000	N	NA
24901	24902	aq_rpmE	aq_876	RpmE	prfA	TRUE	0.980	4.000	0.110	1.000	Y	NA
24903	24904	aq_877	aq_878	minD2	minC	TRUE	0.995	-21.000	0.466	1.000	Y	NA
24906	24907	aq_881	aq_886		topG2	FALSE	0.036	438.000	0.000	1.000	N	NA
24908	24909	aq_888	aq_890			FALSE	0.175	44.000	0.000	NA		NA
24911	24912	aq_892	aq_893	fabD		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24913	24914	aq_894	aq_895	queA	ispB	TRUE	0.642	13.000	0.004	1.000	N	NA
24914	401892	aq_895	aq_t14	ispB	tRNA-Arg	FALSE	0.257	18.000	0.000	NA		NA
24915	24916	aq_896	aq_898	nifU		TRUE	0.902	2.000	0.012	1.000	N	NA
24916	24917	aq_898	aq_899			TRUE	0.699	-39.000	0.000	NA		NA
24917	24918	aq_899	aq_900			FALSE	0.124	120.000	0.000	NA		NA
24918	24919	aq_900	aq_901		aroE	FALSE	0.105	267.000	0.000	NA		NA
24919	24920	aq_901	aq_903	aroE		FALSE	0.388	-7.000	0.000	1.000	N	NA
24920	24921	aq_903	aq_904			TRUE	0.550	1.000	0.000	NA		NA
24922	24923	aq_905	aq_906	hksP3	phoU	TRUE	0.944	-7.000	0.018	NA	N	NA
24924	24925	aq_908	aq_909	gmhA		TRUE	0.970	-15.000	0.008	1.000	Y	NA
24926	24927	aq_910	aq_911	dnaC	ebs	FALSE	0.085	33.000	0.000	1.000	N	NA
24927	24928	aq_911	aq_913	ebs		FALSE	0.409	9.000	0.000	NA		NA
24929	24930	aq_914	aq_915			FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
24930	24931	aq_915	aq_916		dapB	FALSE	0.041	288.000	0.000	1.000	N	NA
24932	24933	aq_917	aq_918			TRUE	0.971	-3.000	0.100	NA		NA
24935	24936	aq_919a	aq_920	fdx1	ftsY	FALSE	0.069	51.000	0.000	1.000	N	NA
24936	24937	aq_920	aq_922	ftsY		FALSE	0.165	34.000	0.000	1.000		NA
24938	24939	aq_923	aq_924	argS	rnpH	TRUE	0.486	20.000	0.000	1.000	Y	NA
24939	24940	aq_924	aq_926	rnpH		TRUE	0.700	-42.000	0.000	NA		NA
24940	24941	aq_926	aq_928			FALSE	0.173	46.000	0.000	NA		NA
24941	24942	aq_928	aq_929		napA2	FALSE	0.321	12.000	0.000	1.000		NA
24942	24943	aq_929	aq_931	napA2		FALSE	0.093	233.000	0.000	1.000		NA
2209601	24944	aq_t15	aq_932		dnaQ	FALSE	0.209	30.000	0.000	NA		NA
24944	24945	aq_932	aq_932a	dnaQ	purS	FALSE	0.454	-25.000	0.000	1.000	N	NA
24945	24946	aq_932a	aq_933	purS		FALSE	0.102	23.000	0.000	1.000	N	NA
24946	24947	aq_933	aq_935			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24948	24949	aq_936	aq_940	ftsH	leuC	TRUE	0.890	0.000	0.009	1.000	N	NA
24949	24950	aq_940	aq_943	leuC		FALSE	0.078	1186.000	0.000	NA		NA
24950	24951	aq_943	aq_944		gcsH3	FALSE	0.145	73.000	0.000	NA		NA
24951	24952	aq_944	aq_945	gcsH3	glyQ	FALSE	0.040	291.000	0.000	1.000	N	NA
24952	24953	aq_945	aq_946	glyQ	rnc	FALSE	0.450	-22.000	0.000	1.000	N	NA
24953	24954	aq_946	aq_948	rnc	hemH	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24954	24955	aq_948	aq_950	hemH		FALSE	0.097	357.000	0.000	NA		NA
24957	24958	aq_952	aq_953	rplT	pheS	TRUE	0.988	0.000	0.202	1.000	Y	NA
24958	24959	aq_953	aq_955	pheS	lepB	FALSE	0.205	9.000	0.000	1.000	N	NA
24959	24960	aq_955	aq_957	lepB		FALSE	0.316	0.000	0.000	1.000	N	NA
24960	24961	aq_957	aq_958		pgsA2	TRUE	0.678	7.000	0.000	1.000	Y	NA
24962	24963	aq_959	aq_960	nadE	mbhL2	FALSE	0.349	11.000	0.000	1.000		NA
24963	24964	aq_960	aq_961	mbhL2	hdrD	TRUE	0.996	-3.000	0.667	0.057	Y	NA
24964	24965	aq_961	aq_963	hdrD		TRUE	0.957	13.000	0.273	NA		NA
24965	24966	aq_963	aq_965		mbhS2	TRUE	0.988	0.000	0.600	NA		NA
24967	24968	aq_966	aq_967		ostA	TRUE	0.956	-12.000	0.025	1.000	N	NA
24971	24972	aq_970	aq_972	argJ		FALSE	0.360	10.000	0.000	1.000		NA
24973	24974	aq_973	aq_974	secD	cphA2	FALSE	0.150	43.000	0.000	1.000		NA
24974	24975	aq_974	aq_975	cphA2	bioB	FALSE	0.321	12.000	0.000	1.000		NA
24975	24976	aq_975	aq_977	bioB		FALSE	0.117	79.000	0.000	1.000		NA
24976	24977	aq_977	aq_978			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
24979	24980	aq_980	aq_983	gyrA		FALSE	0.145	73.000	0.000	NA		NA
24981	24982	aq_985	aq_986			FALSE	0.442	4.000	0.000	1.000		NA
24982	24983	aq_986	aq_987			TRUE	0.692	-27.000	0.000	NA		NA
24983	24984	aq_987	aq_988			FALSE	0.339	13.000	0.000	NA		NA
24984	24985	aq_988	aq_990			TRUE	0.506	0.000	0.000	1.000		NA
24986	24987	aq_992	aq_993	trpS		TRUE	0.948	0.000	0.026	1.000		NA
24987	24988	aq_993	aq_994		pncA	FALSE	0.158	38.000	0.000	1.000		NA
24988	24989	aq_994	aq_996	pncA	dnaK	FALSE	0.296	69.000	0.002	1.000	N	NA
24990	24991	aq_999	aq_1001	fadD	motB2	FALSE	0.035	504.000	0.000	1.000	N	NA
24991	24992	aq_1001	aq_1002	motB2	motB1	TRUE	0.989	11.000	0.143	0.004	Y	NA
24992	24993	aq_1002	aq_1003	motB1	motA	TRUE	0.979	4.000	0.096	1.000	Y	NA
24994	24995	aq_1005	aq_1006	cutA		FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
24996	24997	aq_1008	aq_1010	dnaE	udh	FALSE	0.177	12.000	0.000	1.000	N	NA
24998	24999	aq_1012	aq_1013			FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
25001	25002	aq_1017	aq_1018			TRUE	0.642	-9.000	0.000	NA		NA
25002	25003	aq_1018	aq_1019		hypE	FALSE	0.076	423.000	0.000	1.000		NA
25003	25004	aq_1019	aq_1021	hypE	hypA	TRUE	0.967	0.000	0.080	1.000		NA
25004	25005	aq_1021	aq_1022	hypA		TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
25006	25007	aq_1023	aq_1024	acuC1		FALSE	0.425	-13.000	0.000	1.000	N	NA
25007	25008	aq_1024	aq_1026		gyrB	TRUE	0.883	-10.000	0.005	1.000	N	NA
25008	25009	aq_1026	aq_1029	gyrB		FALSE	0.283	16.000	0.000	NA		NA
25009	25010	aq_1029	aq_1030		selD	FALSE	0.105	269.000	0.000	NA		NA
25010	25011	aq_1030	aq_1031	selD	selA	TRUE	0.836	154.000	0.055	1.000	Y	NA
25013	25014	aq_1035	aq_1036			FALSE	0.120	150.000	0.000	NA		NA
25014	25015	aq_1036	aq_1037			FALSE	0.133	98.000	0.000	NA		NA
25016	25017	aq_1038	aq_1039	lysR2	fdoG	FALSE	0.046	213.000	0.000	1.000	N	NA
25017	25018	aq_1039	aq_1046	fdoG	fdoH	TRUE	0.993	15.000	1.000	0.002	Y	NA
25018	25019	aq_1046	aq_1049	fdoH	fdoI	TRUE	0.997	3.000	0.667	0.002	Y	NA
25019	25020	aq_1049	aq_1050	fdoI	sodC1	TRUE	0.813	20.000	0.035	1.000	N	NA
25020	25021	aq_1050	aq_1051	sodC1	fdhE	TRUE	0.968	-18.000	0.035	NA	N	NA
25021	25022	aq_1051	aq_1052	fdhE	gcsH1	TRUE	0.817	99.000	0.174	NA	N	NA
25022	401862	aq_1052	aq_t16	gcsH1	tRNA-SeC(p)	TRUE	0.518	3.000	0.000	NA		NA
401862	25023	aq_t16	aq_1053	tRNA-SeC(p)	nifS1	FALSE	0.300	15.000	0.000	NA		NA
25023	25024	aq_1053	aq_1054	nifS1		FALSE	0.077	407.000	0.000	1.000		NA
25025	2209602	aq_1055	aq_t17	pstB		FALSE	0.168	50.000	0.000	NA		NA
25028	25029	aq_1058	aq_1059	acrR1		TRUE	0.980	-9.000	0.176	1.000	N	NA
25029	25030	aq_1059	aq_1060			TRUE	0.984	-3.000	0.600	1.000	N	NA
25030	25031	aq_1060	aq_1062		emrB	TRUE	0.978	-3.000	0.333	1.000	N	NA
25034	25035	aq_1068	aq_1069	cysS	galE	FALSE	0.237	5.000	0.000	1.000	N	NA
25036	25037	aq_1070	aq_1071		proA	FALSE	0.206	31.000	0.000	NA		NA
25037	25038	aq_1071	aq_1072	proA		FALSE	0.406	10.000	0.000	NA		NA
25038	25039	aq_1072	aq_1073		czcD	FALSE	0.193	34.000	0.000	NA		NA
25039	25040	aq_1073	aq_1075	czcD		FALSE	0.300	15.000	0.000	NA		NA
25040	25041	aq_1075	aq_1076		rhdA1	TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
25041	25042	aq_1076	aq_1078	rhdA1		FALSE	0.098	341.000	0.000	NA		NA
25042	25043	aq_1078	aq_1079			FALSE	0.112	230.000	0.000	NA		NA
25043	25044	aq_1079	aq_1080			TRUE	0.948	4.000	0.047	1.000		NA
25047	25048	aq_1084	aq_1085			FALSE	0.083	645.000	0.000	NA		NA
25048	25049	aq_1085	aq_1088			FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
25049	25050	aq_1088	aq_1091		hylA	FALSE	0.148	45.000	0.000	1.000		NA
25052	25053	aq_1094	aq_1095	abcT4	abcT3	TRUE	0.782	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
25053	25054	aq_1095	aq_1096	abcT3	mtfA	FALSE	0.277	207.000	0.000	1.000	Y	NA
25056	25057	aq_1099	aq_1101	fabH	plsX	TRUE	0.990	1.000	0.058	0.007	Y	NA
25057	25058	aq_1101	aq_1102	plsX	rpmF	TRUE	0.980	0.000	0.418	1.000	N	NA
25058	25059	aq_1102	aq_1103	rpmF		TRUE	0.988	0.000	0.599	NA		NA
25060	25061	aq_1104	aq_1105		purQ	FALSE	0.205	9.000	0.000	1.000	N	NA
25061	25062	aq_1105	aq_1106	purQ		TRUE	0.849	-7.000	0.003	1.000	N	NA
25062	25063	aq_1106	aq_1106a		moaD	FALSE	0.160	13.000	0.000	1.000	N	NA
25063	25064	aq_1106a	aq_1108	moaD	gcsH4	FALSE	0.105	21.000	0.000	1.000	N	NA
25064	25065	aq_1108	aq_1109	gcsH4	gcsP2	TRUE	0.933	-3.000	0.005	1.000	Y	NA
25067	25068	aq_1111	aq_1113			FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
25068	25069	aq_1113	aq_1115		hksP1	TRUE	0.983	-3.000	0.333	NA		NA
25069	25070	aq_1115	aq_1117	hksP1	ntrC1	TRUE	0.997	-19.000	0.429	0.027	Y	NA
25070	25071	aq_1117	aq_1119	ntrC1		TRUE	0.920	54.000	0.500	NA		NA
25071	25072	aq_1119	aq_1120			FALSE	0.104	273.000	0.000	NA		NA
25072	25073	aq_1120	aq_1121			FALSE	0.180	41.000	0.000	NA		NA
25074	25075	aq_1122	aq_1125	acrD2	ctrA3	TRUE	0.988	7.000	0.158	0.052	Y	NA
25075	25076	aq_1125	aq_1127	ctrA3		TRUE	0.540	2.000	0.000	NA		NA
25076	25077	aq_1127	aq_1129			FALSE	0.431	6.000	0.000	NA		NA
25077	25078	aq_1129	aq_1130		sufI	FALSE	0.316	14.000	0.000	NA		NA
25078	25079	aq_1130	aq_1132	sufI	czcB1	FALSE	0.160	13.000	0.000	1.000	N	NA
25079	25080	aq_1132	aq_1133	czcB1		TRUE	0.990	-3.000	0.312	1.000	Y	NA
25080	25081	aq_1133	aq_1134		proB	FALSE	0.061	69.000	0.000	1.000	N	NA
25082	25083	aq_1137	aq_1138		rpiB	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
25083	25084	aq_1138	aq_1139	rpiB	ftsW	TRUE	0.967	-31.000	0.031	1.000	N	NA
25084	25085	aq_1139	aq_1140	ftsW	argG	FALSE	0.264	4.000	0.000	1.000	N	NA
25085	25086	aq_1140	aq_1141	argG		FALSE	0.199	33.000	0.000	NA		NA
25089	25090	aq_1144	aq_1145	pabB	dhaT	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25090	25091	aq_1145	aq_1148	dhaT		FALSE	0.129	26.000	0.000	NA	N	NA
25091	25092	aq_1148	aq_1151			FALSE	0.051	401.000	0.000	NA	N	NA
25092	25093	aq_1151	aq_1152		lysC	FALSE	0.070	49.000	0.000	1.000	N	NA
25095	25096	aq_1155	aq_1156	hisS2	hoxX	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25096	25097	aq_1156	aq_1157	hoxX	hypD	TRUE	0.883	13.000	0.044	1.000	N	NA
25098	25099	aq_1159	aq_1163	topG1		FALSE	0.188	37.000	0.000	NA		NA
25099	25100	aq_1163	aq_1166			FALSE	0.128	114.000	0.000	NA		NA
25100	25101	aq_1166	aq_1167		forA2	TRUE	0.949	20.000	0.545	1.000		NA
25101	25102	aq_1167	aq_1168	forA2	forB2	TRUE	0.974	24.000	0.750	1.000	Y	NA
25102	25103	aq_1168	aq_1169	forB2	forG2	TRUE	0.992	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
25103	25104	aq_1169	aq_1171a	forG2	fdx2	TRUE	0.986	14.000	1.000	NA	Y	NA
25104	25105	aq_1171a	aq_1172	fdx2	carB1	FALSE	0.051	395.000	0.000	NA	N	NA
25105	25106	aq_1172	aq_1173	carB1		FALSE	0.051	116.000	0.000	1.000	N	NA
25106	25107	aq_1173	aq_1174		rlpA2	TRUE	0.550	-51.000	0.000	NA	N	NA
25107	25108	aq_1174	aq_1175	rlpA2	purF	FALSE	0.124	28.000	0.000	NA	N	NA
25108	25109	aq_1175	aq_1176	purF		FALSE	0.150	67.000	0.000	NA		NA
25111	25112	aq_1178	aq_1180	purE	sahH	FALSE	0.408	-10.000	0.000	1.000	N	NA
25113	25114	aq_1182	aq_1182a	fliF	fliE	TRUE	0.993	2.000	0.112	0.008	Y	NA
25114	25115	aq_1182a	aq_1183	fliE	flgC	TRUE	0.994	-9.000	0.077	0.005	Y	NA
25115	25116	aq_1183	aq_1184	flgC	flgB	TRUE	0.963	-3.000	0.013	1.000	Y	NA
25116	25117	aq_1184	aq_1185	flgB		TRUE	0.888	1.000	0.007	1.000		NA
25117	25118	aq_1185	aq_1186			TRUE	0.704	-64.000	0.000	NA		NA
25118	25119	aq_1186	aq_1187			FALSE	0.300	15.000	0.000	NA		NA
25120	25121	aq_1188	aq_1189		pbpA1	TRUE	0.666	-13.000	0.000	NA		NA
25123	25124	aq_1192a	aq_1192	fdx3		TRUE	0.968	13.000	0.500	NA		NA
25124	25125	aq_1192	aq_1194			TRUE	0.982	0.000	0.333	1.000		NA
25125	25126	aq_1194	aq_1195		forA1	TRUE	0.969	12.000	0.500	1.000		NA
25126	25127	aq_1195	aq_1196	forA1	forB1	TRUE	0.995	-10.000	0.500	1.000	Y	NA
25127	25128	aq_1196	aq_1200	forB1	forG1	TRUE	0.996	-3.000	0.333	0.002	Y	NA
2209603	25129	aq_t18	aq_1201			FALSE	0.108	254.000	0.000	NA		NA
25133	25134	aq_1207	aq_1208	furR1	lysA	FALSE	0.367	47.000	0.002	1.000	N	NA
25134	25135	aq_1208	aq_1210	lysA		FALSE	0.237	22.000	0.000	NA		NA
25136	25137	aq_1211	aq_1212		flhA	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25137	25138	aq_1212	aq_1214	flhA	flhF	TRUE	0.994	-10.000	0.440	1.000	Y	NA
25138	25139	aq_1214	aq_1217	flhF	minD1	TRUE	0.994	-37.000	0.382	0.073	N	NA
25139	25140	aq_1217	aq_1218	minD1	fliA	TRUE	0.948	-3.000	0.045	1.000	N	NA
25141	25142	aq_1219	aq_1220			FALSE	0.156	39.000	0.000	1.000		NA
25143	25144	aq_1221	aq_1222	gltX	abcT1	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25145	2209604	aq_1223	aq_t19			FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
25146	25147	aq_1224	aq_1226			FALSE	0.075	42.000	0.000	1.000	N	NA
25147	25148	aq_1226	aq_1229		mffT2	FALSE	0.077	39.000	0.000	1.000	N	NA
25149	25150	aq_1230	aq_1231		dmsC	FALSE	0.081	362.000	0.000	1.000		NA
25150	25151	aq_1231	aq_1232	dmsC	dmsB1	TRUE	0.958	16.000	0.548	1.000		NA
25151	25152	aq_1232	aq_1234	dmsB1	dmsA	TRUE	0.970	13.000	0.042	0.055	Y	NA
25153	25154	aq_1236	aq_1237		cysG	FALSE	0.065	162.000	0.000	NA	N	NA
25155	25156	aq_1238	aq_1239			FALSE	0.209	30.000	0.000	NA		NA
25156	25157	aq_1239	aq_1240		adh2	TRUE	0.506	0.000	0.000	1.000		NA
25157	25158	aq_1240	aq_1241	adh2		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25158	25159	aq_1241	aq_1242		mutS2	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25159	25160	aq_1242	aq_1244	mutS2		FALSE	0.212	7.000	0.000	1.000	N	NA
25160	25161	aq_1244	aq_1245		ilvC	TRUE	0.877	-3.000	0.008	1.000	N	NA
25162	25163	aq_1247	aq_1248			TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25163	25164	aq_1248	aq_1249		cds	TRUE	0.980	-52.000	0.013	1.000	Y	NA
25164	25165	aq_1249	aq_1250	cds		TRUE	0.693	-28.000	0.000	NA		NA
25168	25169	aq_1255	aq_1256	feoB		TRUE	0.654	10.000	0.000	0.051		NA
25170	25171	aq_1257	aq_1258	metG		FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25171	25172	aq_1258	aq_1259			TRUE	0.764	77.000	0.044	NA		NA
25172	25173	aq_1259	aq_1262			TRUE	0.826	66.000	0.095	NA		NA
25173	25174	aq_1262	aq_1263			TRUE	0.989	-36.000	0.286	1.000		NA
25174	25175	aq_1263	aq_1264			TRUE	0.977	-3.000	0.143	NA		NA
25177	25178	aq_1267	aq_1268		hvsT	FALSE	0.081	72.000	0.000	NA	N	NA
25179	25180	aq_1270	aq_1271		mpp	FALSE	0.096	211.000	0.000	1.000		NA
25181	25182	aq_1272	aq_1273			TRUE	0.947	-12.000	0.010	NA		NA
25182	25183	aq_1273	aq_1275		cafA	TRUE	0.961	-51.000	0.013	1.000		NA
25186	25187	aq_1279	aq_1281	hemA	murA	FALSE	0.038	386.000	0.000	1.000	N	NA
25188	25189	aq_1283	aq_1285	hspC	pilC2	FALSE	0.087	61.000	0.000	NA	N	NA
25189	25190	aq_1285	aq_1286	pilC2		TRUE	0.976	-3.000	0.036	1.000	Y	NA
25190	25191	aq_1286	aq_1287			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25191	25192	aq_1287	aq_1288		gspD	TRUE	0.991	-34.000	0.364	NA		NA
25192	25193	aq_1288	aq_1290	gspD	purA	FALSE	0.038	386.000	0.000	1.000	N	NA
25193	25194	aq_1290	aq_1292	purA		FALSE	0.440	29.000	0.000	1.000	Y	NA
25195	25196	aq_1293	aq_1295	alaS		FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
25196	25197	aq_1295	aq_1296		clpC	FALSE	0.134	97.000	0.000	NA		NA
25197	25198	aq_1296	aq_1300	clpC	omp	TRUE	0.731	38.000	0.027	1.000	N	NA
25199	25200	aq_1303a	aq_1303	cspC	hisA	FALSE	0.053	104.000	0.000	1.000	N	NA
25200	25201	aq_1303	aq_1305	hisA	pyrDB	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25202	25203	aq_1306	aq_1308	sucC1	tgt	FALSE	0.082	34.000	0.000	1.000	N	NA
25205	25206	aq_1310	aq_1312	nuoA2	nuoB	TRUE	0.966	13.000	0.022	0.009	Y	NA
25206	25207	aq_1312	aq_1314	nuoB	nuoD2	TRUE	0.995	10.000	1.000	0.009	Y	NA
25207	25208	aq_1314	aq_1315	nuoD2	nuoH1	TRUE	0.941	13.000	0.008	0.018	Y	NA
25208	25209	aq_1315	aq_1317	nuoH1	nuoI1	TRUE	0.992	12.000	0.500	0.018	Y	NA
25209	25210	aq_1317	aq_1318	nuoI1	nuoJ1	TRUE	0.997	-12.000	0.442	0.018	Y	NA
25210	25211	aq_1318	aq_1319	nuoJ1	nuoK1	TRUE	0.968	10.000	0.012	0.009	Y	NA
25211	25212	aq_1319	aq_1320	nuoK1	nuoL1	TRUE	0.979	-3.000	0.011	0.018	Y	NA
25212	25213	aq_1320	aq_1321	nuoL1	nuoM1	TRUE	0.981	0.000	0.011	0.005	Y	NA
25213	25214	aq_1321	aq_1322	nuoM1	nuoN1	TRUE	0.996	5.000	1.000	0.005	Y	NA
25214	25215	aq_1322	aq_1323	nuoN1		FALSE	0.203	10.000	0.000	1.000	N	NA
25216	25217	aq_1324	aq_1326		mobB	TRUE	0.831	-3.000	0.002	NA		NA
25220	25221	aq_1329	aq_1330	moeB	gltP	FALSE	0.312	1.000	0.000	1.000	N	NA
25221	25222	aq_1330	aq_1331	gltP	czcB2	TRUE	0.513	12.000	0.000	0.072	N	NA
25222	25223	aq_1331	aq_1332	czcB2		TRUE	0.983	-3.000	0.098	1.000	Y	NA
25224	25225	aq_1333	aq_1334		pyrG	FALSE	0.041	276.000	0.000	1.000	N	NA
25227	25228	aq_1336	aq_1337		clpX	TRUE	0.825	-3.000	0.002	NA		NA
25228	25229	aq_1337	aq_1339	clpX	clpP	TRUE	0.966	20.000	0.352	1.000	Y	NA
25229	25230	aq_1339	aq_1340	clpP	tig	TRUE	0.995	-22.000	0.351	1.000	Y	NA
25230	2209606	aq_1340	aq_t21	tig		TRUE	0.705	-77.000	0.000	NA		NA
2209606	25231	aq_t21	aq_1342		gph	FALSE	0.257	18.000	0.000	NA		NA
25231	25232	aq_1342	aq_1343	gph		TRUE	0.970	-3.000	0.088	NA		NA
25233	25234	aq_1345	aq_1347			TRUE	0.540	2.000	0.000	NA		NA
25234	25235	aq_1347	aq_1348			TRUE	0.705	-85.000	0.000	NA		NA
25235	25236	aq_1348	aq_1349			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25236	25237	aq_1349	aq_1350			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25237	25238	aq_1350	aq_1351		phoH	FALSE	0.190	26.000	0.000	1.000		NA
25238	25239	aq_1351	aq_1354	phoH		TRUE	0.992	-76.000	0.457	NA		NA
25241	25242	aq_1356	aq_1357		cydA	FALSE	0.126	117.000	0.000	NA		NA
25242	25243	aq_1357	aq_1358	cydA	cydB	TRUE	0.882	2.000	0.000	0.054	Y	NA
25244	25245	aq_1359	aq_1360		murC	TRUE	0.465	-42.000	0.000	1.000	N	NA
25245	25246	aq_1360	aq_1362	murC	adh1	FALSE	0.316	0.000	0.000	1.000	N	NA
25246	25247	aq_1362	aq_1363	adh1	accB	FALSE	0.147	14.000	0.000	1.000	N	NA
25247	25248	aq_1363	aq_1364	accB	efp	TRUE	0.966	-3.000	0.120	1.000	N	NA
2209607	25249	aq_t22	aq_1365			FALSE	0.193	34.000	0.000	NA		NA
25249	401864	aq_1365	aq_t23		tRNA-Ser	FALSE	0.257	18.000	0.000	NA		NA
25250	25251	aq_1366	aq_1367	thiE1	spsI	FALSE	0.177	12.000	0.000	1.000	N	NA
25251	25252	aq_1367	aq_1368	spsI	tagD2	FALSE	0.138	15.000	0.000	1.000	N	NA
25253	25254	aq_1369	aq_1370		rlpA1	TRUE	0.983	-3.000	0.333	NA		NA
25254	25255	aq_1370	aq_1372	rlpA1	argH	FALSE	0.252	11.000	0.000	NA	N	NA
25255	25256	aq_1372	aq_1373	argH	nuoH2	FALSE	0.058	76.000	0.000	1.000	N	NA
25256	25257	aq_1373	aq_1374	nuoH2	nuoH3	TRUE	0.974	-33.000	0.008	0.018		NA
25257	25258	aq_1374	aq_1375	nuoH3	nuoI2	TRUE	0.988	7.000	0.500	0.018		NA
25258	25259	aq_1375	aq_1377	nuoI2	nuoJ2	TRUE	0.996	-3.000	0.442	0.018	Y	NA
25259	25260	aq_1377	aq_1378	nuoJ2	nuoK2	TRUE	0.989	-19.000	0.012	0.009	Y	NA
25260	25261	aq_1378	aq_1379	nuoK2	nuoL3	TRUE	0.976	3.000	0.011	0.018	Y	NA
25261	25262	aq_1379	aq_1382	nuoL3	nuoM2	TRUE	0.960	12.000	0.011	0.005	Y	NA
25262	25263	aq_1382	aq_1383	nuoM2	nuoN2	TRUE	0.993	14.000	1.000	0.005	Y	NA
25263	25264	aq_1383	aq_1385	nuoN2	nuoA1	TRUE	0.985	-3.000	0.022	0.018	Y	NA
25264	25265	aq_1385	aq_1386	nuoA1		TRUE	0.653	-31.000	0.000	1.000		NA
25265	25266	aq_1386	aq_1387		arsR	FALSE	0.190	26.000	0.000	1.000		NA
25266	25267	aq_1387	aq_1388	arsR		FALSE	0.110	243.000	0.000	NA		NA
25269	25270	aq_1391	aq_1392			FALSE	0.098	205.000	0.000	1.000		NA
25271	25272	aq_1394	aq_1398	lig	leuD	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25273	25274	aq_1400	aq_1401		celY	TRUE	0.987	-3.000	0.667	1.000		NA
25274	25275	aq_1401	aq_1402	celY		TRUE	0.470	-70.000	0.000	1.000	N	NA
25275	25276	aq_1402	aq_1403			TRUE	0.612	-12.000	0.000	1.000		NA
25276	25277	aq_1403	aq_1404			TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25278	25279	aq_1405	aq_1407		bcsA	TRUE	0.690	-24.000	0.000	NA		NA
25280	25281	aq_1408	aq_1409			TRUE	0.704	-61.000	0.000	NA		NA
25282	25283	aq_1410	aq_1412	trpB2		FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
25285	25286	aq_1418	aq_1419	furR2		FALSE	0.212	7.000	0.000	1.000	N	NA
25286	25287	aq_1419	aq_1420			TRUE	0.553	-76.000	0.000	NA	N	NA
25292	25293	aq_1426	aq_1427		lpxB	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25293	25294	aq_1427	aq_1428	lpxB		FALSE	0.406	10.000	0.000	NA		NA
25296	25297	aq_1432	aq_1433	ppdD1	fimZ	FALSE	0.361	70.000	0.000	NA	Y	NA
25297	25298	aq_1433	aq_1434	fimZ	ppdD2	TRUE	0.871	-16.000	0.000	NA	Y	NA
25298	25299	aq_1434	aq_1435	ppdD2	ppdD3	TRUE	0.705	-93.000	0.000	NA		NA
25299	25300	aq_1435	aq_1436	ppdD3		TRUE	0.990	-3.000	1.000	NA		NA
25300	25301	aq_1436	aq_1439			FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
25301	25302	aq_1439	aq_1441		oppA	FALSE	0.419	7.000	0.000	NA		NA
25302	25303	aq_1441	aq_1442	oppA		FALSE	0.038	386.000	0.000	1.000	N	NA
25304	25305	aq_1444	aq_1445		ctrA2	FALSE	0.189	36.000	0.000	NA		NA
25305	25306	aq_1445	aq_1446	ctrA2		FALSE	0.136	57.000	0.000	1.000		NA
25306	25307	aq_1446	aq_1447			FALSE	0.321	12.000	0.000	1.000		NA
25307	25308	aq_1447	aq_1449		mutT	FALSE	0.237	5.000	0.000	1.000	N	NA
25309	25310	aq_1450	aq_1452	htrA	rpoS	TRUE	0.945	11.000	0.152	1.000	N	NA
25310	25311	aq_1452	aq_1453	rpoS		TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
25311	25312	aq_1453	aq_1455			FALSE	0.097	349.000	0.000	NA		NA
25316	25317	aq_1462	aq_1464			TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25317	25318	aq_1464	aq_1465			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25319	25320	aq_1466	aq_1467			TRUE	0.941	-22.000	0.007	NA		NA
25320	25321	aq_1467	aq_1468		folP	TRUE	0.985	-13.000	0.133	NA		NA
25322	25323	aq_1470	aq_1472	accC2	dnaB	FALSE	0.037	406.000	0.000	1.000	N	NA
25323	2209608	aq_1472	aq_t24	dnaB		FALSE	0.203	32.000	0.000	NA		NA
2209608	25324	aq_t24	aq_1473			FALSE	0.222	26.000	0.000	NA		NA
25324	25325	aq_1473	aq_1474		gspE	TRUE	0.859	-16.000	0.000	1.000	Y	NA
25325	25326	aq_1474	aq_1476	gspE		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25326	25327	aq_1476	aq_1477			TRUE	0.682	-19.000	0.000	NA		NA
25328	25329	aq_1478	aq_1480	recR		FALSE	0.043	259.000	0.000	1.000	N	NA
25329	25330	aq_1480	aq_1481			FALSE	0.413	8.000	0.000	NA		NA
25330	25331	aq_1481	aq_1482			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25331	25332	aq_1482	aq_1483			TRUE	0.963	-7.000	0.029	1.000		NA
25332	25333	aq_1483	aq_1484			TRUE	0.627	-15.000	0.000	1.000		NA
25333	25334	aq_1484	aq_1484a		himA	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25334	25335	aq_1484a	aq_1485	himA	rpsA	TRUE	0.462	32.000	0.003	1.000	N	NA
25335	25336	aq_1485	aq_1489	rpsA	trmD	TRUE	0.742	67.000	0.002	0.029	Y	NA
25336	25337	aq_1489	aq_1490	trmD	rpoD	FALSE	0.408	-10.000	0.000	1.000	N	NA
25337	25338	aq_1490	aq_1493	rpoD	dnaG	TRUE	0.522	39.000	0.006	1.000	N	NA
25340	25341	aq_1495	aq_1496	ogt	xylR	FALSE	0.089	58.000	0.000	NA	N	NA
25341	25342	aq_1496	aq_1498	xylR		FALSE	0.388	-3.000	0.000	NA	N	NA
25343	25344	aq_1499	aq_1501	sodA		FALSE	0.431	6.000	0.000	NA		NA
25345	25346	aq_1502	aq_1503			TRUE	0.675	-16.000	0.000	NA		NA
25346	25347	aq_1503	aq_1504		trk1	TRUE	0.997	-3.000	0.647	0.007	Y	NA
25347	25348	aq_1504	aq_1505	trk1	nrdF	FALSE	0.377	-6.000	0.000	1.000	N	NA
25348	25349	aq_1505	aq_1507	nrdF	omt	FALSE	0.110	106.000	0.000	1.000		NA
25349	25350	aq_1507	aq_1508	omt		TRUE	0.682	-19.000	0.000	NA		NA
25350	25351	aq_1508	aq_1509		oppC	TRUE	0.682	-19.000	0.000	NA		NA
25351	25352	aq_1509	aq_1510	oppC		FALSE	0.316	0.000	0.000	1.000	N	NA
25353	25354	aq_1512	aq_1515	icd		TRUE	0.643	26.000	0.009	1.000	N	NA
25354	25355	aq_1515	aq_1516			TRUE	0.553	59.000	0.006	NA		NA
25355	25356	aq_1516	aq_1517		pycB	TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
25356	25357	aq_1517	aq_1520	pycB	pycA	TRUE	0.912	24.000	0.038	0.001	N	NA
25357	25358	aq_1520	aq_1525	pycA		FALSE	0.180	41.000	0.000	NA		NA
25358	25359	aq_1525	aq_1526			FALSE	0.167	51.000	0.000	NA		NA
25359	25360	aq_1526	aq_1527			TRUE	0.898	71.000	0.372	NA		NA
25360	25361	aq_1527	aq_1528			TRUE	0.959	-28.000	0.011	NA		NA
25361	25362	aq_1528	aq_1530			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25362	3829861	aq_1530	aq_1531		abcT10	TRUE	0.981	-3.000	0.061	NA	Y	NA
3829861	25364	aq_1531	aq_1533	abcT10		TRUE	0.993	-12.000	0.222	NA	Y	NA
25364	25365	aq_1533	aq_1534			TRUE	0.981	-6.000	0.125	NA		NA
25366	25367	aq_1535	aq_1536	pepQ	aroA	TRUE	0.941	2.000	0.007	1.000	Y	NA
25367	25368	aq_1536	aq_1539	aroA	fliN	FALSE	0.078	38.000	0.000	1.000	N	NA
25368	25369	aq_1539	aq_1540	fliN	gcpE	TRUE	0.856	-16.000	0.002	1.000	N	NA
25370	25371	aq_1542	aq_1543		rfaC1	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25371	25372	aq_1543	aq_1545	rfaC1		TRUE	0.770	31.000	0.019	NA		NA
25373	25374	aq_1546	aq_1547	kpsF	ppa	FALSE	0.312	1.000	0.000	1.000	N	NA
25374	25375	aq_1547	aq_1548	ppa	trpA	FALSE	0.046	207.000	0.000	1.000	N	NA
25375	25376	aq_1548	aq_1549	trpA		TRUE	0.922	-12.000	0.009	1.000	N	NA
25376	25377	aq_1549	aq_1550		cycB2	FALSE	0.077	39.000	0.000	1.000	N	NA
25377	25378	aq_1550	aq_1552	cycB2	fabI	FALSE	0.070	49.000	0.000	1.000	N	NA
25378	25379	aq_1552	aq_1554	fabI		TRUE	0.992	-31.000	0.185	0.045	N	NA
25380	25381	aq_1556	aq_1558	cysM		FALSE	0.184	28.000	0.000	1.000		NA
25381	25382	aq_1558	aq_1560		mglA1	TRUE	0.638	-19.000	0.000	1.000		NA
25382	25383	aq_1560	aq_1562	mglA1		TRUE	0.990	-3.000	1.000	NA		NA
25383	3829862	aq_1562	aq_1563		abcT13	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
3829862	25385	aq_1563	aq_1565	abcT13	gltB	FALSE	0.088	31.000	0.000	1.000	N	NA
25385	25386	aq_1565	aq_1569	gltB		TRUE	0.651	-30.000	0.000	1.000		NA
25386	25387	aq_1569	aq_1570			TRUE	0.706	-111.000	0.000	NA		NA
25387	25388	aq_1570	aq_1571			FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
25390	25391	aq_1575	aq_1578		mutL	FALSE	0.199	33.000	0.000	NA		NA
25391	25392	aq_1578	aq_1579	mutL	iagB	FALSE	0.221	18.000	0.000	1.000		NA
25392	25393	aq_1579	aq_1580	iagB	pyrF	TRUE	0.469	3.000	0.000	1.000		NA
25393	25394	aq_1580	aq_1581	pyrF		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25394	25395	aq_1581	aq_1582		gidB	TRUE	0.682	-19.000	0.000	NA		NA
25395	25396	aq_1582	aq_1583	gidB		TRUE	0.671	-15.000	0.000	NA		NA
25396	25397	aq_1583	aq_1585			TRUE	0.978	-3.000	0.176	NA		NA
25397	25398	aq_1585	aq_1586		atpF1	FALSE	0.082	34.000	0.000	1.000	N	NA
25398	25399	aq_1586	aq_1587	atpF1	atpF2	TRUE	0.997	0.000	0.569	0.007	Y	NA
25399	25400	aq_1587	aq_1588	atpF2	atpH	TRUE	0.995	-7.000	0.132	0.007	Y	NA
25400	25401	aq_1588	aq_1590	atpH	ndk	TRUE	0.760	1.000	0.002	1.000	N	NA
25401	25402	aq_1590	aq_1591	ndk	shyS	TRUE	0.813	-3.000	0.002	1.000		NA
25402	25403	aq_1591	aq_1593	shyS		FALSE	0.331	114.000	0.000	0.016		NA
25404	25405	aq_1595	aq_1596	fliI		TRUE	0.704	-73.000	0.000	NA		NA
25407	25408	aq_1599	aq_1601		pilD	FALSE	0.124	28.000	0.000	NA	N	NA
25408	25409	aq_1601	aq_1602	pilD	secF	TRUE	0.937	-3.000	0.005	1.000	Y	NA
25409	25410	aq_1602	aq_1603	secF		TRUE	0.962	-3.000	0.080	NA	N	NA
25410	25411	aq_1603	aq_1606		pabC	FALSE	0.044	687.000	0.000	NA	N	NA
25411	25412	aq_1606	aq_1607	pabC	dcd	TRUE	0.943	-7.000	0.020	1.000	N	NA
25412	25413	aq_1607	aq_1609	dcd	modA	FALSE	0.040	327.000	0.000	1.000	N	NA
25413	25414	aq_1609	aq_1610	modA	radC	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25414	25415	aq_1610	aq_1612	radC		TRUE	0.535	-24.000	0.000	NA	N	NA
25415	25416	aq_1612	aq_1613		hisG	TRUE	0.539	-28.000	0.000	NA	N	NA
25416	25417	aq_1613	aq_1614	hisG	oadA	TRUE	0.796	-3.000	0.003	1.000	N	NA
25418	25419	aq_1618	aq_1620		sucC2	FALSE	0.209	30.000	0.000	NA		NA
25419	25420	aq_1620	aq_1622	sucC2	sucD2	TRUE	0.974	12.000	0.025	0.003	Y	NA
25420	25421	aq_1622	aq_1625	sucD2		FALSE	0.071	592.000	0.000	1.000		NA
25421	25422	aq_1625	aq_1627			FALSE	0.409	9.000	0.000	NA		NA
25422	25423	aq_1627	aq_1628		pol	FALSE	0.339	13.000	0.000	NA		NA
25424	25425	aq_1629	aq_1630	nfo		TRUE	0.902	0.000	0.008	1.000		NA
25425	25426	aq_1630	aq_1631			FALSE	0.146	72.000	0.000	NA		NA
25426	25427	aq_1631	aq_1632			FALSE	0.165	53.000	0.000	NA		NA
25429	2209609	aq_1636	aq_t25	prs		FALSE	0.300	15.000	0.000	NA		NA
2209609	25430	aq_t25	aq_1638		lplA	FALSE	0.178	42.000	0.000	NA		NA
408223	25434	aq_s01	aq_1641a	ssrA	rplU	FALSE	0.156	60.000	0.000	NA		NA
25434	25435	aq_1641a	aq_1642	rplU	rplO	TRUE	0.797	12.000	0.000	0.037	Y	NA
25435	25436	aq_1642	aq_1644	rplO	rpmD	TRUE	0.993	13.000	0.653	0.004	Y	NA
25436	25437	aq_1644	aq_1645	rpmD	rpsE	TRUE	0.998	-13.000	0.789	0.037	Y	NA
25437	25438	aq_1645	aq_1648	rpsE	rplR	TRUE	0.993	12.000	0.814	0.037	Y	NA
25438	25439	aq_1648	aq_1649	rplR	rplF	TRUE	0.992	13.000	0.815	0.026	Y	NA
25439	25440	aq_1649	aq_1651	rplF	rpsH	TRUE	0.992	13.000	0.808	0.026	Y	NA
25440	25441	aq_1651	aq_1651a	rpsH	rpsN	TRUE	0.977	41.000	0.473	0.026	Y	NA
25441	25442	aq_1651a	aq_1652	rpsN	rplE	TRUE	0.979	34.000	0.496	0.026	Y	NA
25442	25443	aq_1652	aq_1653	rplE	rplX	TRUE	0.997	2.000	0.758	0.026	Y	NA
25443	25444	aq_1653	aq_1654	rplX	rplN	TRUE	0.997	0.000	0.810	0.037	Y	NA
25445	25446	aq_1655	aq_1656			TRUE	0.621	-13.000	0.000	1.000		NA
25447	25448	aq_1657	aq_1658	gcsH2	fucA1	TRUE	0.950	-16.000	0.018	1.000	N	NA
25448	25449	aq_1658	aq_1659	fucA1	bioW	FALSE	0.070	49.000	0.000	1.000	N	NA
25452	25453	aq_1662	aq_1663	flgK	flgL	TRUE	0.989	10.000	0.113	0.001	Y	NA
25454	25455	aq_1664	aq_1665	accC1	mdh2	FALSE	0.160	13.000	0.000	1.000	N	NA
25455	25456	aq_1665	aq_1666	mdh2		TRUE	0.660	-49.000	0.000	1.000		NA
25456	25457	aq_1666	aq_1667		thrS	FALSE	0.091	253.000	0.000	1.000		NA
25458	25459	aq_1668	aq_1669			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25459	25460	aq_1669	aq_1670			TRUE	0.987	0.000	0.833	NA	N	NA
25460	25461	aq_1670	aq_1671		hslV	FALSE	0.203	10.000	0.000	1.000	N	NA
401884	25462	aq_t26	aq_1672	tRNA-Pro	clpB	FALSE	0.182	40.000	0.000	NA		NA
25463	25464	aq_1677	aq_1679	aspS	fumX	TRUE	0.669	5.000	0.002	1.000	N	NA
25464	25465	aq_1679	aq_1680	fumX		TRUE	0.630	-7.000	0.000	NA		NA
25466	25467	aq_1681	aq_1682	amiB		TRUE	0.980	-28.000	0.061	NA		NA
25467	25468	aq_1682	aq_1684		alg	FALSE	0.168	50.000	0.000	NA		NA
25468	25469	aq_1684	aq_1687	alg		FALSE	0.392	0.000	0.000	NA	N	NA
25469	25470	aq_1687	aq_1689			TRUE	0.630	-7.000	0.000	NA		NA
25471	25472	aq_1691	aq_1693		dplF	TRUE	0.637	69.000	0.011	NA		NA
25473	25474	aq_1694	aq_1695			TRUE	0.472	32.000	0.000	0.009		NA
2209610	401866	aq_r04	aq_t27		tRNA-Ile	FALSE	0.131	105.000	0.000	NA		NA
401866	401867	aq_t27	aq_t28	tRNA-Ile	tRNA-Ala	FALSE	0.266	17.000	0.000	NA		NA
401867	407351	aq_t28	aq_r05	tRNA-Ala	rrl	FALSE	0.171	48.000	0.000	NA		NA
407351	2209611	aq_r05	aq_r06	rrl		FALSE	0.182	40.000	0.000	NA		NA
2209611	2209612	aq_r06	aq_t29			FALSE	0.227	25.000	0.000	NA		NA
25475	25476	aqq_03	aq_1705		galF	TRUE	0.782	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
25476	25477	aq_1705	aq_1706	galF		TRUE	0.621	-13.000	0.000	1.000		NA
25477	25478	aq_1706	aq_1707		ribC	TRUE	0.573	-6.000	0.000	1.000		NA
25478	25479	aq_1707	aq_1708	ribC	pfkA	FALSE	0.304	2.000	0.000	1.000	N	NA
25479	25480	aq_1708	aq_1710	pfkA	metE	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25482	25483	aq_1713	aq_1714	flgI	flgH	TRUE	0.998	-39.000	0.750	0.010	Y	NA
25484	25485	aq_1716	aq_1717a	fabG	acpP	TRUE	0.989	13.000	0.321	0.006	Y	NA
25485	25486	aq_1717a	aq_1717	acpP	fabF	TRUE	0.981	-3.000	0.066	1.000	Y	NA
25486	25487	aq_1717	aq_1718	fabF	maf	FALSE	0.388	-3.000	0.000	NA	N	NA
25488	25489	aq_1719	aq_1720		ffh	FALSE	0.087	32.000	0.000	1.000	N	NA
25489	25490	aq_1720	aq_1723	ffh		FALSE	0.153	41.000	0.000	1.000		NA
25491	25492	aq_1724	aq_1725	degT	lepA	TRUE	0.495	19.000	0.000	1.000	Y	NA
25494	25495	aq_1730	aq_1731	pheT		FALSE	0.253	196.000	0.002	1.000	N	NA
25495	25496	aq_1731	aq_1732			TRUE	0.988	-13.000	0.059	0.031		NA
25496	25497	aq_1732	aq_1735		dnaJ1	FALSE	0.116	81.000	0.000	1.000		NA
25499	25500	aq_1739	aq_1740	lytB		TRUE	0.940	-27.000	0.011	1.000	N	NA
25501	25502	aq_1741	aq_1742		lgtF	FALSE	0.087	542.000	0.000	NA		NA
11403799	25496		aq_1732			FALSE	NA	4481.000	0.000	NA		NA
11546162	25496		aq_1732			FALSE	NA	4481.000	0.000	NA		NA
11688554	25496		aq_1732			FALSE	NA	4481.000	0.000	NA		NA
11403800	25496		aq_1732			FALSE	NA	4511.000	0.000	NA		NA
11546163	25496		aq_1732			FALSE	NA	4511.000	0.000	NA		NA
11688555	25496		aq_1732			FALSE	NA	4511.000	0.000	NA		NA
11403801	25496		aq_1732			FALSE	NA	4548.000	0.000	NA		NA
11546164	25496		aq_1732			FALSE	NA	4548.000	0.000	NA		NA
11688556	25496		aq_1732			FALSE	NA	4548.000	0.000	NA		NA
11403802	25496		aq_1732			FALSE	NA	4578.000	0.000	NA		NA
11546165	25496		aq_1732			FALSE	NA	4578.000	0.000	NA		NA
11688557	25496		aq_1732			FALSE	NA	4578.000	0.000	NA		NA
11403803	25496		aq_1732			FALSE	NA	4615.000	0.000	NA		NA
11546166	25496		aq_1732			FALSE	NA	4615.000	0.000	NA		NA
11688558	25496		aq_1732			FALSE	NA	4615.000	0.000	NA		NA
11403804	25496		aq_1732			FALSE	NA	4645.000	0.000	NA		NA
11546167	25496		aq_1732			FALSE	NA	4645.000	0.000	NA		NA
11688559	25496		aq_1732			FALSE	NA	4645.000	0.000	NA		NA
11403805	25496		aq_1732			FALSE	NA	4685.000	0.000	NA		NA
11546168	25496		aq_1732			FALSE	NA	4685.000	0.000	NA		NA
11688560	25496		aq_1732			FALSE	NA	4685.000	0.000	NA		NA
25504	25505	aq_1744	aq_1747	gpmA	murE	FALSE	0.045	221.000	0.000	1.000	N	NA
25505	2209613	aq_1747	aq_t30	murE		TRUE	0.690	-24.000	0.000	NA		NA
2209613	25506	aq_t30	aq_1751		tyrS	FALSE	0.078	1159.000	0.000	NA		NA
25508	25509	aq_1753	aq_1754	nlpD2		TRUE	0.977	-22.000	0.043	NA		NA
25510	25511	aq_1755	aq_1757	tyrA	exbB	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25512	25513	aq_1758	aq_1760			FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
25513	25514	aq_1760	aq_1761			FALSE	0.199	33.000	0.000	NA		NA
2209614	2209615	aq_t31	aq_t32			FALSE	0.212	29.000	0.000	NA		NA
25516	2209616	aq_1765	aq_t33	tktA		FALSE	0.233	23.000	0.000	NA		NA
2209616	25517	aq_t33	aq_1767		rpsT	TRUE	0.694	-29.000	0.000	NA		NA
25517	25518	aq_1767	aq_1768	rpsT		TRUE	0.822	10.000	0.002	0.027	N	NA
25519	25520	aq_1769	aq_1770	dld1	leuS'	TRUE	0.604	-10.000	0.000	1.000		NA
25521	25522	aq_1771	aq_1772		envA	TRUE	0.806	8.000	0.008	1.000	N	NA
25525	25526	aq_1774	aq_1776	glnE		FALSE	0.092	411.000	0.000	NA		NA
25526	25527	aq_1776	aq_1777		infC	FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
25527	25528	aq_1777	aq_1780	infC	fumB	FALSE	0.034	506.000	0.000	1.000	N	NA
25528	25529	aq_1780	aq_1782	fumB	mdh1	TRUE	0.974	-22.000	0.010	1.000	Y	NA
25529	25530	aq_1782	aq_1784	mdh1	aco	TRUE	0.961	-3.000	0.012	1.000	Y	NA
25530	25531	aq_1784	aq_1787	aco	trpC	FALSE	0.069	53.000	0.000	1.000	N	NA
25531	25532	aq_1787	aq_1789	trpC	mviB	TRUE	0.659	-46.000	0.000	1.000		NA
25532	25533	aq_1789	aq_1790	mviB		FALSE	0.455	5.000	0.000	NA		NA
25533	25534	aq_1790	aq_1791			FALSE	0.339	13.000	0.000	NA		NA
25534	25535	aq_1791	aq_1792		ntrC2	FALSE	0.180	41.000	0.000	NA		NA
25535	25536	aq_1792	aq_1793	ntrC2		FALSE	0.115	210.000	0.000	NA		NA
25537	25538	aq_1794	aq_1795			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25538	25539	aq_1795	aq_1796			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25540	25541	aq_1797	aq_1798		cphA1	FALSE	0.171	48.000	0.000	NA		NA
25541	25542	aq_1798	aq_1799	cphA1	rhdA2	FALSE	0.203	22.000	0.000	1.000		NA
25542	25543	aq_1799	aq_1800	rhdA2		TRUE	0.540	2.000	0.000	NA		NA
25543	25544	aq_1800	aq_1802			TRUE	0.983	-3.000	0.333	NA		NA
25544	25545	aq_1802	aq_1803		soxB	TRUE	0.981	-3.000	0.250	NA		NA
25545	25546	aq_1803	aq_1806	soxB		TRUE	0.880	46.000	0.188	1.000		NA
25546	25547	aq_1806	aq_1807			TRUE	0.980	13.000	0.333	0.010		NA
25547	25548	aq_1807	aq_1809			TRUE	0.957	14.000	0.333	NA		NA
25548	25549	aq_1809	aq_1810			TRUE	0.958	22.000	0.778	NA		NA
25549	25550	aq_1810	aq_1811		trxA2	TRUE	0.990	-6.000	0.500	NA		NA
25551	25552	aq_1812	aq_1814	thrA		FALSE	0.237	5.000	0.000	1.000	N	NA
25552	25553	aq_1814	aq_1815			FALSE	0.372	7.000	0.000	1.000		NA
25555	25556	aq_1818	aq_1820	purU	nfeD	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
25556	25557	aq_1820	aq_1822	nfeD		FALSE	0.237	22.000	0.000	NA		NA
25557	25558	aq_1822	aq_1823		mglA2	TRUE	0.986	2.000	0.500	NA		NA
25558	25559	aq_1823	aq_1824	mglA2		TRUE	0.907	118.000	0.667	NA		NA
25559	25560	aq_1824	aq_1825			TRUE	0.682	-19.000	0.000	NA		NA
25560	25561	aq_1825	aq_1827		alr	FALSE	0.044	253.000	0.000	1.000	N	NA
25562	25563	aqq_04	aq_1829			FALSE	0.121	144.000	0.000	NA		NA
25563	25564	aq_1829	aq_1832		rpsG1	FALSE	0.076	433.000	0.000	1.000		NA
25564	25565	aq_1832	aq_1834	rpsG1	rpsL1	TRUE	0.993	4.000	0.224	0.006	Y	NA
25566	25567	aq_1836	aq_1837	purL	lsp	TRUE	0.937	-39.000	0.009	1.000	N	NA
25569	25570	aq_1839	aq_1840a	exbD		FALSE	0.128	16.000	0.000	1.000	N	NA
25570	25571	aq_1840a	aq_1840		prfB	FALSE	0.397	34.000	0.002	1.000	N	NA
25572	25573	aq_1842	aq_1843			FALSE	0.237	22.000	0.000	NA		NA
25573	25574	aq_1843	aq_1844			FALSE	0.106	116.000	0.000	1.000		NA
25574	25575	aq_1844	aq_1845			TRUE	0.990	-3.000	1.000	NA		NA
25575	25576	aq_1845	aq_1847			TRUE	0.987	4.000	1.000	NA		NA
25576	25577	aq_1847	aq_1849			TRUE	0.968	13.000	0.500	NA		NA
25577	25578	aq_1849	aq_1850			FALSE	0.189	36.000	0.000	NA		NA
25578	25579	aq_1850	aq_1851		ilvH	TRUE	0.630	-7.000	0.000	NA		NA
25580	25581	aq_1852	aq_1853			FALSE	0.072	561.000	0.000	1.000		NA
25583	25584	aq_1855	aq_1856	dnaX	uvrB	FALSE	0.437	286.000	0.000	0.037	Y	NA
25586	25587	aq_1858	aq_1859		flgE	TRUE	0.982	4.000	0.105	NA	Y	NA
25587	25588	aq_1859	aq_1860	flgE	fliL	TRUE	0.903	52.000	0.014	0.010	Y	NA
25588	25589	aq_1860	aq_1861	fliL		FALSE	0.057	77.000	0.000	1.000	N	NA
25591	25592	aq_1863	aq_1866	kch	asd	FALSE	0.032	756.000	0.000	1.000	N	NA
25592	25593	aq_1866	aq_1869	asd		FALSE	0.316	14.000	0.000	NA		NA
25593	25594	aq_1869	aq_1870		secA	TRUE	0.502	57.000	0.004	NA		NA
25594	25595	aq_1870	aq_1871	secA	pmbA	FALSE	0.283	16.000	0.000	NA		NA
25595	25596	aq_1871	aq_1873	pmbA		FALSE	0.083	617.000	0.000	NA		NA
25596	25597	aq_1873	aq_1875			FALSE	0.339	13.000	0.000	NA		NA
25597	25598	aq_1875	aq_1877		rplM	FALSE	0.072	46.000	0.000	1.000	N	NA
25598	25599	aq_1877	aq_1878	rplM	rpsI	TRUE	0.989	-3.000	0.051	0.025	Y	NA
25599	25600	aq_1878	aq_1879	rpsI	argC	TRUE	0.963	-15.000	0.031	1.000	N	NA
25600	25601	aq_1879	aq_1882	argC	dnaN	FALSE	0.099	25.000	0.000	1.000	N	NA
25601	25602	aq_1882	aq_1884	dnaN		FALSE	0.113	227.000	0.000	NA		NA
25602	25603	aq_1884	aq_1886		sbcD	TRUE	0.952	-22.000	0.010	NA		NA
25603	25604	aq_1886	aq_1887	sbcD	mesJ	FALSE	0.408	-10.000	0.000	1.000	N	NA
25607	25608	aq_1890	aq_1891	tsnR		FALSE	0.360	10.000	0.000	1.000		NA
25608	25609	aq_1891	aq_1893		ilvE	TRUE	0.968	-10.000	0.032	1.000		NA
25610	25611	aq_1894	aq_1896			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25612	25613	aq_1898	aq_1899	folD	dmt	TRUE	0.519	-16.000	0.000	NA	N	NA
25614	25615	aqq_05	aqq_06			FALSE	0.339	13.000	0.000	NA		NA
25615	25616	aqq_06	aq_1903		gcsP1	FALSE	0.316	14.000	0.000	NA		NA
25616	25617	aq_1903	aq_1905	gcsP1	serA	FALSE	0.445	28.000	0.000	1.000	Y	NA
25617	25618	aq_1905	aq_1907	serA	umpS	FALSE	0.111	19.000	0.000	1.000	N	NA
25620	25621	aq_1909	aq_1910			TRUE	0.601	83.000	0.011	NA		NA
25621	25622	aq_1910	aq_1912			FALSE	0.440	376.000	0.007	NA		NA
25622	25623	aq_1912	aq_1916		trxA1	FALSE	0.098	345.000	0.000	NA		NA
25623	25624	aq_1916	aq_1917	trxA1		TRUE	0.993	-87.000	0.500	NA		NA
25624	25625	aq_1917	aq_1919		era2	TRUE	0.831	-3.000	0.002	NA		NA
25626	25627	aq_1920	aq_1922	fliP		FALSE	0.045	232.000	0.000	1.000	N	NA
25629	25630	aq_1924	aq_1925		hyuB	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
401870	401871	aq_t34	aq_t35	tRNA-Thr	tRNA-Tyr	FALSE	0.233	23.000	0.000	NA		NA
401871	2209617	aq_t35	aq_t36	tRNA-Tyr		FALSE	0.406	10.000	0.000	NA		NA
2209617	2209618	aq_t36	aq_t37			FALSE	0.199	33.000	0.000	NA		NA
2209618	25631	aq_t37	aq_1928		tufA2	FALSE	0.136	86.000	0.000	NA		NA
25631	25632	aq_1928	aq_1930a	tufA2	rpmG	TRUE	0.969	11.000	0.099	1.000	Y	NA
25632	2209619	aq_1930a	aq_t38	rpmG		FALSE	0.316	14.000	0.000	NA		NA
2209619	25633	aq_t38	aq_1930b		secE	FALSE	0.199	33.000	0.000	NA		NA
25633	25634	aq_1930b	aq_1931	secE	nusG	TRUE	0.986	-3.000	0.843	1.000	N	NA
25634	25635	aq_1931	aq_1933	nusG	rplK	TRUE	0.957	15.000	0.681	1.000	N	NA
25635	25636	aq_1933	aq_1935	rplK	rplA	TRUE	0.995	5.000	0.838	0.035	Y	NA
25636	25637	aq_1935	aq_1936	rplA	rplJ	TRUE	0.985	15.000	0.302	0.035	Y	NA
25637	25638	aq_1936	aq_1937	rplJ	rplL	TRUE	0.997	3.000	0.884	0.025	Y	NA
25638	25639	aq_1937	aq_1939	rplL	rpoB	TRUE	0.828	213.000	0.223	1.000		NA
25639	25640	aq_1939	aq_1945	rpoB	rpoC	TRUE	0.995	-3.000	0.851	0.002		NA
25644	25645	aq_1954	aq_1955	rplS	rnhB	TRUE	0.968	-7.000	0.066	1.000	N	NA
25646	2209620	aq_1956	aq_t39			FALSE	0.127	115.000	0.000	NA		NA
2209620	25647	aq_t39	aq_1958			FALSE	0.165	53.000	0.000	NA		NA
25648	25649	aq_1959	aq_1960		thiD	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25650	25651	aq_1961	aq_1962	fliR	fliQ	TRUE	0.995	-12.000	0.078	0.003	Y	NA
25651	25652	aq_1962	aq_1963	fliQ	purH	FALSE	0.033	596.000	0.000	1.000	N	NA
25652	25653	aq_1963	aq_1964	purH		FALSE	0.160	13.000	0.000	1.000	N	NA
25653	25654	aq_1964	aq_1965			TRUE	0.893	0.000	0.006	NA		NA
25654	25655	aq_1965	aq_1966			TRUE	0.675	-16.000	0.000	NA		NA
25656	25657	aq_1967	aq_1968	polA	hisIE	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
25657	25658	aq_1968	aq_1969	hisIE	aspC1	FALSE	0.259	261.000	0.000	1.000	Y	NA
25659	25660	aq_1971	aq_1973	tapB	panB	TRUE	0.870	-7.000	0.004	1.000	N	NA
25660	25661	aq_1973	aq_1974	panB		TRUE	0.491	4.000	0.000	NA		NA
25662	25663	aq_1975	aq_1977		masA	TRUE	0.985	-7.000	0.231	1.000		NA
25663	25664	aq_1977	aq_1978	masA		TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25664	25665	aq_1978	aq_1979		fucA2	TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25667	25668	aq_1982	aq_1983		imp2	FALSE	0.349	11.000	0.000	1.000		NA
25668	25669	aq_1983	aq_1985	imp2		FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25670	25671	aq_1986	aq_1987			TRUE	0.960	0.000	0.041	NA		NA
25671	25672	aq_1987	aq_1988		tolQ	TRUE	0.984	5.000	0.051	0.019	Y	NA
25672	25673	aq_1988	aq_1989	tolQ		FALSE	0.442	4.000	0.000	1.000		NA
25673	25674	aq_1989	aq_1990		pgmA	TRUE	0.648	-25.000	0.000	1.000		NA
25674	25675	aq_1990	aq_1991	pgmA	htpX	TRUE	0.783	9.000	0.007	1.000	N	NA
25675	25676	aq_1991	aq_1993	htpX		FALSE	0.266	17.000	0.000	NA		NA
25676	25677	aq_1993	aq_1994		era1	TRUE	0.675	-16.000	0.000	NA		NA
25677	25678	aq_1994	aq_1996	era1		FALSE	0.153	63.000	0.000	NA		NA
25679	25680	aq_1997	aq_1998		fliC	FALSE	0.057	79.000	0.000	1.000	N	NA
25680	25681	aq_1998	aq_2000	fliC		TRUE	0.879	43.000	0.032	NA	Y	NA
25681	25682	aq_2000	aq_2001		fliD	TRUE	0.989	3.000	0.298	NA	Y	NA
25682	25683	aq_2001	aq_2002	fliD	fliS	TRUE	0.991	-3.000	0.056	0.002	Y	NA
25684	25685	aq_2004	aq_2005			FALSE	0.366	12.000	0.000	NA		NA
25685	25686	aq_2005	aq_2007		rpsB	FALSE	0.069	622.000	0.000	1.000		NA
25686	25687	aq_2007	aq_2009	rpsB		FALSE	0.313	92.000	0.003	1.000	N	NA
25687	25688	aq_2009	aq_2011			TRUE	0.495	17.000	0.000	0.053		NA
25689	25690	aq_2013	aq_2014		flhB	FALSE	0.394	11.000	0.000	NA		NA
25692	25693	aq_2016	aq_2018	pstS	pstC	TRUE	0.995	-13.000	0.086	0.002	Y	NA
25693	25694	aq_2018	aq_2019	pstC	pstA	TRUE	0.998	-21.000	0.537	0.002	Y	NA
25694	25695	aq_2019	aq_2020	pstA		TRUE	0.664	-232.000	0.000	1.000		NA
25695	25696	aq_2020	aq_2021		tldD	FALSE	0.177	43.000	0.000	NA		NA
25696	25697	aq_2021	aq_2023	tldD	guaB	FALSE	0.086	544.000	0.000	NA		NA
25699	25700	aq_2028	aq_2030		napA3	TRUE	0.993	2.000	0.688	1.000	Y	NA
25702	25703	aq_2032	aq_2035	infB		TRUE	0.913	-36.000	0.006	1.000	N	NA
25703	25704	aq_2035	aq_2036			TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25705	25706	aq_2038	aq_2041	atpD	atpG1	TRUE	0.992	14.000	0.724	0.006	Y	NA
25707	25708	aq_2042	aq_2043	rplI	hemX2	TRUE	0.681	10.000	0.003	1.000	N	NA
25709	25710	aq_2044	aq_2045		folC	TRUE	0.780	5.000	0.004	NA	N	NA
25711	25712	aq_2046	aq_2049	vacB		TRUE	0.535	16.000	0.000	1.000	Y	NA
25712	25713	aq_2049	aq_2051		flgG1	TRUE	0.961	0.000	0.091	1.000	N	NA
25714	25715	aq_2053	aq_2054	recG		TRUE	0.540	2.000	0.000	NA		NA
25715	25716	aq_2054	aq_2056			FALSE	0.409	9.000	0.000	NA		NA
25716	25717	aq_2056	aq_2057		helX	FALSE	0.373	27.000	0.000	0.035	N	NA
25719	25720	aq_2059	aq_2060			TRUE	0.631	-16.000	0.000	1.000		NA
25720	2209621	aq_2060	aq_t40			FALSE	0.188	37.000	0.000	NA		NA
2209621	2209622	aq_t40	aq_t41			FALSE	0.227	25.000	0.000	NA		NA
2209622	25721	aq_t41	aq_2063			FALSE	0.141	77.000	0.000	NA		NA
25721	25722	aq_2063	aq_2064		gltD	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25723	25724	aq_2066	aq_2067			TRUE	0.706	-123.000	0.000	NA		NA
25724	25725	aq_2067	aq_2068		argB	FALSE	0.143	74.000	0.000	NA		NA
25725	25726	aq_2068	aq_2069	argB	obg	FALSE	0.296	13.000	0.000	1.000		NA
25726	25727	aq_2069	aq_2071	obg		FALSE	0.190	26.000	0.000	1.000		NA
25727	25728	aq_2071	aq_2073			TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25728	25729	aq_2073	aq_2075		murD	FALSE	0.313	-3.000	0.000	1.000	N	NA
25731	25732	aq_2077	aq_2080	snf	sppA	TRUE	0.621	-13.000	0.000	1.000		NA
25732	25733	aq_2080	aq_2082	sppA		FALSE	0.273	278.000	0.000	NA	Y	NA
25734	25735	aq_2084	aq_2085	hisC		FALSE	0.106	265.000	0.000	NA		NA
25735	25736	aq_2085	aq_2086			TRUE	0.983	-19.000	0.100	NA		NA
25736	25737	aq_2086	aq_2087			TRUE	0.502	-3.000	0.000	1.000		NA
25738	25739	aq_2088	aq_2090		leuA2	FALSE	0.164	54.000	0.000	NA		NA
25739	25740	aq_2090	aq_2093	leuA2	dsbC	FALSE	0.042	266.000	0.000	1.000	N	NA
25741	25742	aq_2094	aq_2095	aspC2	dksA	TRUE	0.948	-7.000	0.022	1.000	N	NA
25742	25743	aq_2095	aq_2096	dksA	floX	FALSE	0.216	19.000	0.000	1.000		NA
25743	25744	aq_2096	aq_2098	floX		TRUE	0.508	17.000	0.000	0.047		NA
25744	25745	aq_2098	aq_2099		pepA	FALSE	0.388	-7.000	0.000	1.000	N	NA
25746	25747	aq_2101	aq_2102	carB2	prmA	TRUE	0.794	-13.000	0.000	0.052	N	NA
25748	25749	aq_2103	aq_2104	acs'	acs	TRUE	0.907	-55.000	0.000	0.001		NA
25750	25751	aq_2106	aq_2107	ssf		TRUE	0.947	-3.000	0.026	1.000		NA
25751	25752	aq_2107	aq_2108			TRUE	0.949	-3.000	0.050	1.000	N	NA
25752	25753	aq_2108	aq_2109		hemB	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
25753	25754	aq_2109	aq_2110	hemB	acuC2	FALSE	0.388	-3.000	0.000	NA	N	NA
25754	25755	aq_2110	aq_2113	acuC2		FALSE	0.055	292.000	0.000	NA	N	NA
25756	25757	aq_2114	aq_2115	eif	rfaG	FALSE	0.177	12.000	0.000	1.000	N	NA
25757	25758	aq_2115	aq_2117	rfaG	purC	FALSE	0.037	403.000	0.000	1.000	N	NA
25758	25759	aq_2117	aq_2118	purC		TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25759	25760	aq_2118	aq_2119		thiL	TRUE	0.700	-40.000	0.000	NA		NA
25760	25761	aq_2119	aq_2120	thiL	hlyC	TRUE	0.551	-3.000	0.000	NA		NA
25761	3829863	aq_2120	aq_2122	hlyC	abcT11	TRUE	0.977	-31.000	0.037	NA		NA
3829863	25763	aq_2122	aq_2124	abcT11	hemN	TRUE	0.953	2.000	0.065	1.000	N	NA
25764	25765	aq_2126	aq_2128	uvrC		TRUE	0.658	-12.000	0.000	NA		NA
25766	25767	aq_2129	aq_2131	sbf	fmt	FALSE	0.074	469.000	0.000	1.000		NA
25767	25768	aq_2131	aq_2132	fmt	panC	TRUE	0.750	-3.000	0.002	1.000	N	NA
25769	25770	aq_2134	aq_2135			TRUE	0.650	-10.000	0.000	NA		NA
25770	3829864	aq_2135	aq_2137		abcT12	TRUE	0.978	-7.000	0.100	1.000		NA
3829864	25772	aq_2137	aq_2138	abcT12		FALSE	0.360	10.000	0.000	1.000		NA
25772	25773	aq_2138	aq_2139			TRUE	0.987	-40.000	0.163	1.000		NA
25775	25776	aq_2141	aq_2142	glyS	ppsA	TRUE	0.916	2.000	0.006	0.097	N	NA
25776	25777	aq_2142	aq_2144	ppsA		TRUE	0.987	-3.000	0.571	NA		NA
25777	25778	aq_2144	aq_2145			TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
25778	25779	aq_2145	aq_2146			FALSE	0.245	20.000	0.000	NA		NA
25780	2209623	aq_2147	aq_t42	pal		FALSE	0.145	73.000	0.000	NA		NA
2209623	2209624	aq_t42	aq_t43			FALSE	0.266	17.000	0.000	NA		NA
25781	25782	aqq_07	aq_2150	gatC	recA	TRUE	0.751	11.000	0.006	1.000	N	NA
25782	25783	aq_2150	aq_2151	recA	pilU	TRUE	0.981	-46.000	0.021	0.021	N	NA
25783	25784	aq_2151	aq_2153	pilU	cmk	TRUE	0.896	-3.000	0.004	0.097	N	NA
25784	25785	aq_2153	aq_2154	cmk	pgsA1	TRUE	0.866	-31.000	0.002	1.000	N	NA
25785	25786	aq_2154	aq_2155	pgsA1	recJ	TRUE	0.779	-3.000	0.002	1.000	N	NA
25786	25787	aq_2155	aq_2157	recJ		TRUE	0.552	44.000	0.005	NA		NA
25789	25790	aq_2159	aq_2160		abcT9	TRUE	0.946	-13.000	0.015	1.000	N	NA
25790	25791	aq_2160	aq_2163	abcT9	uraP	FALSE	0.195	11.000	0.000	1.000	N	NA
25792	25793	aq_2164	aq_2165			FALSE	0.419	7.000	0.000	NA		NA
25793	25794	aq_2165	aq_2166		scbA	TRUE	0.995	-7.000	0.604	1.000	Y	NA
25794	25795	aq_2166	aq_2168	scbA		TRUE	0.976	13.000	0.887	NA		NA
25796	25797	aq_2170	aq_2171			TRUE	0.631	-16.000	0.000	1.000		NA
25797	25798	aq_2171	aq_2172			TRUE	0.630	-7.000	0.000	NA		NA
25798	25799	aq_2172	aq_2173			TRUE	0.968	-31.000	0.020	NA		NA
25799	25800	aq_2173	aq_2174		ihfB	TRUE	0.914	-3.000	0.009	NA		NA
25801	25802	aq_2175	aq_2177		aroK	TRUE	0.941	-3.000	0.020	NA		NA
25804	25805	aq_2179	aq_2181	acrR2	moaE	FALSE	0.072	46.000	0.000	1.000	N	NA
25805	25806	aq_2181	aq_2183	moaE	moaA	TRUE	0.984	-22.000	0.006	0.005	Y	NA
25807	25808	aq_2185	aq_2186		sqr	TRUE	0.859	84.000	0.333	NA	N	NA
25809	25810	aq_2188	aq_2189	coxC		TRUE	0.994	2.000	1.000	0.047		NA
25810	25811	aq_2189	aq_2190		coxB	TRUE	0.993	3.000	1.000	0.047		NA
25811	25812	aq_2190	aq_2191	coxB	coxA1	TRUE	0.969	162.000	0.500	0.003	Y	NA
25812	25813	aq_2191	aq_2191a	coxA1	coxB2	FALSE	0.269	551.000	0.000	0.003		NA
25813	25814	aq_2191a	aq_2192	coxB2	coxA2	TRUE	0.984	6.000	0.200	0.003		NA
25814	25815	aq_2192	aq_2194	coxA2		TRUE	0.993	-3.000	0.571	0.047		NA
25816	25817	aq_2195	aq_2196	bacA		TRUE	0.491	4.000	0.000	NA		NA
25817	25818	aq_2196	aq_2197			TRUE	0.554	0.000	0.000	NA		NA
25819	25820	aq_2199	aq_2200	mopB	mopA	TRUE	0.996	-48.000	0.125	0.008	Y	NA
25821	25822	aq_2203	aq_2204		ymxG	TRUE	0.491	2.000	0.000	1.000		NA
11481943	45092		aq_aa03			FALSE	NA	674.000	0.000	NA		NA
11624306	45092		aq_aa03			FALSE	NA	674.000	0.000	NA		NA
11766698	45092		aq_aa03			FALSE	NA	674.000	0.000	NA		NA
11481944	45092		aq_aa03			FALSE	NA	639.000	0.000	NA		NA
11624307	45092		aq_aa03			FALSE	NA	639.000	0.000	NA		NA
11766699	45092		aq_aa03			FALSE	NA	639.000	0.000	NA		NA
11481945	45092		aq_aa03			FALSE	NA	609.000	0.000	NA		NA
11624308	45092		aq_aa03			FALSE	NA	609.000	0.000	NA		NA
11766700	45092		aq_aa03			FALSE	NA	609.000	0.000	NA		NA
11481946	45092		aq_aa03			FALSE	NA	572.000	0.000	NA		NA
11624309	45092		aq_aa03			FALSE	NA	572.000	0.000	NA		NA
11766701	45092		aq_aa03			FALSE	NA	572.000	0.000	NA		NA
11481947	45092		aq_aa03			FALSE	NA	542.000	0.000	NA		NA
11624310	45092		aq_aa03			FALSE	NA	542.000	0.000	NA		NA
11766702	45092		aq_aa03			FALSE	NA	542.000	0.000	NA		NA
11481948	45092		aq_aa03			FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11624311	45092		aq_aa03			FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11766703	45092		aq_aa03			FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11481949	45092		aq_aa03			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11624312	45092		aq_aa03			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11766704	45092		aq_aa03			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
45092	45093	aq_aa03	aq_aa04			FALSE	0.122	137.000	0.000	NA		NA
45093	45094	aq_aa04	aq_aa05			TRUE	0.920	19.000	0.143	NA		NA
45094	45095	aq_aa05	aq_aa07			FALSE	0.079	937.000	0.000	NA		NA
45095	45096	aq_aa07	aq_aa09			FALSE	0.080	813.000	0.000	NA		NA
45096	45097	aq_aa09	aq_aa10			FALSE	0.085	571.000	0.000	NA		NA
45097	45098	aq_aa10	aq_aa11			FALSE	0.081	806.000	0.000	NA		NA
45099	45100	aq_aa13	aq_aa15			FALSE	0.107	260.000	0.000	NA		NA
45102	45103	aq_aa18	aq_aa19			FALSE	0.077	2004.000	0.000	NA		NA
45103	45104	aq_aa19	aq_aa20			FALSE	0.087	517.000	0.000	NA		NA
45105	45106	aq_aa21	aq_aa22			FALSE	0.143	74.000	0.000	NA		NA
45106	45107	aq_aa22	aq_aa23			FALSE	0.162	55.000	0.000	NA		NA
45108	45109	aq_aa24	aq_aa25			FALSE	0.077	1665.000	0.000	NA		NA
45109	45110	aq_aa25	aq_aa26			FALSE	0.077	1914.000	0.000	NA		NA
45110	45111	aq_aa26	aq_aa27			TRUE	0.702	-46.000	0.000	NA		NA
45111	45112	aq_aa27	aq_aa28			FALSE	0.118	180.000	0.000	NA		NA
45112	45113	aq_aa28	aq_aa29			FALSE	0.122	139.000	0.000	NA		NA
45113	45114	aq_aa29	aq_aa31			FALSE	0.188	37.000	0.000	NA		NA
45114	45115	aq_aa31	aq_aa32			FALSE	0.090	451.000	0.000	NA		NA
45118	45119	aq_aa37	aq_aa38			FALSE	0.110	242.000	0.000	NA		NA
45120	45121	aq_aa39	aq_aa40			FALSE	0.079	1139.000	0.000	NA		NA
45121	45091	aq_aa40	aq_aa01			FALSE	0.078	1510.000	0.000	NA		NA