MicrobesOnline Operon Predictions for Tropheryma whipplei TW08/27

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 324033 324034 TW001 TW002 dnaA dnaN TRUE 0.621 330.000 0.328 1.000 Y NA
 324034 324035 TW002 TW003 dnaN recF TRUE 0.969 -10.000 0.318 1.000 Y NA
 324035 324036 TW003 TW004 recF   TRUE 0.864 30.000 0.089 NA   NA
 324036 324037 TW004 TW005   gyrB1 TRUE 0.741 40.000 0.028 NA   NA
 324037 324038 TW005 TW006 gyrB1 gyrA1 TRUE 0.996 4.000 0.306 0.007 Y NA
 324038 324039 TW006 TW007 gyrA1   TRUE 0.881 -3.000 0.053 NA   NA
 324039 401460 TW007 TWt01   tRNA-Ile TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 401460 401461 TWt01 TWt02 tRNA-Ile tRNA-Ala TRUE 0.591 14.000 0.000 NA   NA
 324043 324044 TW011 TW012     FALSE 0.100 106.000 0.000 NA   NA
 324044 324045 TW012 TW013     TRUE 0.878 37.000 0.222 NA   NA
 324045 324046 TW013 TW014     TRUE 0.700 1.000 0.000 NA   NA
 324046 324047 TW014 TW015     FALSE 0.079 122.000 0.000 NA   NA
 324047 324048 TW015 TW016   dkgA TRUE 0.670 28.000 0.000 1.000   NA
 324049 324050 TW017 TW018   punA TRUE 0.954 13.000 0.235 1.000 N NA
 324052 324053 TW020 TW021     FALSE 0.086 117.000 0.000 NA   NA
 324054 324055 TW022 TW023     TRUE 0.579 16.000 0.000 NA   NA
 324055 324056 TW023 TW024     FALSE 0.111 98.000 0.000 NA   NA
 324060 324061 TW028 TW029 purK purE TRUE 0.940 79.000 0.141 0.003 Y NA
 324062 324063 TW030 TW032     FALSE 0.040 328.000 0.000 NA   NA
 324063 324064 TW032 TW033     TRUE 0.991 -3.000 0.083 0.003 Y NA
 324065 324066 TW035 TW036     TRUE 0.931 56.000 0.200 1.000 Y NA
 324067 324068 TW037 TW038     TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324068 324069 TW038 TW039     TRUE 0.952 52.000 0.548 1.000 Y NA
 324071 324072 TW041 TW042     TRUE 0.944 -3.000 0.568 NA   NA
 324073 324074 TW043 TW044     FALSE 0.041 237.000 0.000 NA   NA
 324074 324075 TW044 TW045     TRUE 0.551 20.000 0.000 NA   NA
 324075 324076 TW045 TW046     FALSE 0.041 392.000 0.000 NA   NA
 324076 324077 TW046 TW048     FALSE 0.040 354.000 0.000 NA   NA
 324077 324078 TW048 TW049     TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324078 324079 TW049 TW051     FALSE 0.070 127.000 0.000 NA   NA
 324079 324080 TW051 TW052     FALSE 0.040 364.000 0.000 NA   NA
 324080 324081 TW052 TW053     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 324082 324083 TW054 TW055     TRUE 0.970 67.000 0.824 0.005 Y NA
 324084 324085 TW057 TW058     FALSE 0.111 98.000 0.000 NA   NA
 324085 324086 TW058 TW059     TRUE 0.718 3.000 0.000 NA   NA
 324086 324087 TW059 TW060     FALSE 0.355 74.000 0.000 1.000 N NA
 324087 324088 TW060 TW061     TRUE 0.576 -18.000 0.000 1.000   NA
 324090 324091 TW063 TW064     TRUE 0.953 12.000 0.006 1.000 Y NA
 324091 324092 TW064 TW065     TRUE 0.903 19.000 0.039 1.000 N NA
 324093 324094 TW066 TW067     TRUE 0.868 126.000 0.154 0.003 Y NA
 324094 324095 TW067 TW068     FALSE 0.288 218.000 0.000 1.000 Y NA
 324095 324096 TW068 TW069     TRUE 0.860 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 324096 324097 TW069 TW070     TRUE 0.979 6.000 0.000 0.025 Y NA
 324097 401510 TW070 TWt03   tRNA-Met FALSE 0.050 167.000 0.000 NA   NA
 401510 401509 TWt03 TWt04 tRNA-Met tRNA-Thr TRUE 0.559 19.000 0.000 NA   NA
 401508 324099 TWt05 TW072 tRNA-Tyr lysS FALSE 0.327 51.000 0.000 NA   NA
 324100 324101 TW073 TW074 panC   FALSE 0.094 297.000 0.000 1.000 N NA
 324101 324102 TW074 TW075     FALSE 0.535 52.000 0.000 1.000 N NA
 324102 324103 TW075 TW078   menD FALSE 0.099 735.000 0.000 1.000 N NA
 324103 324104 TW078 TW079 menD   TRUE 0.662 10.000 0.000 NA   NA
 324104 324105 TW079 TW080   menA TRUE 0.546 21.000 0.000 NA   NA
 324105 324106 TW080 TW081 menA rpoB FALSE 0.097 238.000 0.000 1.000 N NA
 324106 324107 TW081 TW082 rpoB rpoC TRUE 0.978 60.000 0.851 0.003 Y NA
 324109 324110 TW084 TW085 groS guaB1 TRUE 0.547 51.000 0.000 1.000 N NA
 324110 324111 TW085 TW086 guaB1 guaB2 TRUE 0.982 5.000 0.056 0.003   NA
 324111 324112 TW086 TW087 guaB2   TRUE 0.768 -7.000 0.025 NA   NA
 324112 324113 TW087 TW088     FALSE 0.237 66.000 0.000 NA   NA
 324113 324114 TW088 TW089   guaA TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324114 324115 TW089 TW090 guaA   FALSE 0.288 105.000 0.003 1.000 N NA
 324115 324116 TW090 TW092     FALSE 0.080 267.000 0.000 1.000   NA
 324116 324117 TW092 TW093   purN TRUE 0.944 2.000 0.044 1.000   NA
 324117 324118 TW093 TW094 purN purH TRUE 0.907 40.000 0.006 1.000 Y NA
 324126 324127 TW103 TW104     FALSE 0.412 -15.000 0.000 NA   NA
 324127 324128 TW104 TW105     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 324128 324129 TW105 TW106     TRUE 0.947 -3.000 0.750 NA   NA
 324129 324130 TW106 TW107     TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 401507 324131 TWt06 TW108 tRNA-Pro   FALSE 0.043 906.000 0.000 NA   NA
 324131 324132 TW108 TW109     FALSE 0.524 1367.000 0.063 1.000 Y NA
 324132 324133 TW109 TW110   pyrG FALSE 0.270 1083.000 0.055 1.000 N NA
 324133 324134 TW110 TW111 pyrG recN FALSE 0.146 1812.000 0.004 1.000 N NA
 324134 324135 TW111 TW112 recN   TRUE 0.916 19.000 0.061 1.000 N NA
 324135 324136 TW112 TW113     TRUE 0.670 28.000 0.000 1.000   NA
 324136 324137 TW113 TW114   rplI FALSE 0.512 50.000 0.000 1.000   NA
 324137 324138 TW114 TW115 rplI rpsR TRUE 0.991 -3.000 0.499 0.063 Y NA
 324138 324139 TW115 TW116 rpsR ssb1 TRUE 0.904 15.000 0.030 1.000 N NA
 324139 324140 TW116 TW117 ssb1 rpsF TRUE 0.943 4.000 0.029 1.000 N NA
 324140 324141 TW117 TW119 rpsF purC FALSE 0.094 349.000 0.000 1.000 N NA
 324142 324143 TW120 TW121 menB menE TRUE 0.970 2.000 0.193 1.000 N NA
 324143 401462 TW121 TWt07 menE tRNA-Ser FALSE 0.040 305.000 0.000 NA   NA
 401462 324144 TWt07 TW124 tRNA-Ser ideR FALSE 0.062 136.000 0.000 NA   NA
 324144 324145 TW124 TW125 ideR rpmB FALSE 0.111 179.000 0.000 1.000 N NA
 324145 324146 TW125 TW126 rpmB rpmG TRUE 0.993 0.000 0.332 0.063 Y NA
 324146 324147 TW126 TW127 rpmG rpsN TRUE 0.990 1.000 0.052 0.063 Y NA
 324147 324148 TW127 TW128 rpsN hup TRUE 0.567 66.000 0.007 1.000 N NA
 324148 324149 TW128 TW129 hup   FALSE 0.336 50.000 0.000 NA   NA
 324149 324150 TW129 TW130     FALSE 0.506 26.000 0.000 NA   NA
 324150 324151 TW130 TW131   tufA FALSE 0.115 140.000 0.000 1.000   NA
 324153 324154 TW133 TW134 manA   FALSE 0.489 52.000 0.000 1.000   NA
 324154 324155 TW134 TW135     FALSE 0.052 162.000 0.000 NA   NA
 324155 324156 TW135 TW136     TRUE 0.833 53.000 0.606 NA   NA
 324156 324157 TW136 TW137   manB FALSE 0.081 442.000 0.000 1.000   NA
 324157 324158 TW137 TW138 manB   FALSE 0.040 351.000 0.000 NA   NA
 324158 324159 TW138 TW139   secA FALSE 0.041 244.000 0.000 NA   NA
 324159 324160 TW139 TW140 secA   FALSE 0.042 587.000 0.000 NA   NA
 324160 324161 TW140 TW141     FALSE 0.056 145.000 0.000 NA   NA
 324161 324162 TW141 TW142     TRUE 0.677 9.000 0.000 NA   NA
 324162 324163 TW142 TW143     FALSE 0.448 37.000 0.000 NA   NA
 324163 324164 TW143 TW144   gcvP FALSE 0.121 94.000 0.000 NA   NA
 324164 324165 TW144 TW145 gcvP   FALSE 0.291 210.000 0.000 1.000 Y NA
 324165 324166 TW145 TW146     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 324167 324168 TW147 TW148     FALSE 0.405 127.000 0.000 1.000 Y NA
 324169 324170 TW149 TW150     TRUE 0.980 2.000 0.000 0.024 Y NA
 324170 324171 TW150 TW151     TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 324173 324174 TW153 TW154 rplM rpsI TRUE 0.994 0.000 0.601 0.062 Y NA
 324174 324175 TW154 TW155 rpsI   TRUE 0.959 4.000 0.068 1.000 N NA
 324177 324178 TW157 TW158   glmS FALSE 0.042 224.000 0.000 NA   NA
 401506 324179 TWt08 TW159 tRNA-Gln ispE TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 401505 401504 TWt09 TWt10 tRNA-Phe tRNA-Asp TRUE 0.695 6.000 0.000 NA   NA
 401504 401503 TWt10 TWt11 tRNA-Asp tRNA-Glu TRUE 0.662 10.000 0.000 NA   NA
 324182 324183 TW162 TW163     TRUE 0.985 32.000 0.149 0.008 Y NA
 324183 324184 TW163 TW164     FALSE 0.044 1224.000 0.000 NA   NA
 324185 324186 TW165 TW166     FALSE 0.085 797.000 0.000 1.000   NA
 324186 324187 TW166 TW167     FALSE 0.079 316.000 0.000 1.000   NA
 324187 324188 TW167 TW169     TRUE 0.828 21.000 0.011 1.000   NA
 324188 324189 TW169 TW170   gcp TRUE 0.966 0.000 0.009 0.003   NA
 324189 324190 TW170 TW171 gcp   FALSE 0.086 1193.000 0.000 1.000   NA
 324190 324191 TW171 TW172   hpt TRUE 0.978 5.000 0.137 0.085   NA
 324191 324192 TW172 TW173 hpt ftsH TRUE 0.970 3.000 0.180 1.000 N NA
 324192 324193 TW173 TW174 ftsH folE TRUE 0.782 14.000 0.000 1.000 N NA
 324193 324194 TW174 TW175 folE folP TRUE 0.880 37.000 0.000 1.000 Y NA
 324194 324195 TW175 TW176 folP   TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324195 324196 TW176 TW177     FALSE 0.042 225.000 0.000 NA   NA
 324196 324197 TW177 TW178     FALSE 0.130 89.000 0.000 NA   NA
 324197 324198 TW178 TW179   ung TRUE 0.686 7.000 0.000 NA   NA
 324198 324199 TW179 TW180 ung ribF TRUE 0.688 33.000 0.000 1.000 N NA
 324199 324200 TW180 TW181 ribF   FALSE 0.040 357.000 0.000 NA   NA
 324200 324201 TW181 TW182     FALSE 0.204 70.000 0.000 NA   NA
 324201 324202 TW182 TW184     FALSE 0.042 226.000 0.000 NA   NA
 324202 324203 TW184 TW186     FALSE 0.050 166.000 0.000 NA   NA
 324203 324204 TW186 TW187     FALSE 0.403 43.000 0.000 NA   NA
 324204 324205 TW187 TW188     FALSE 0.527 23.000 0.000 NA   NA
 324205 324206 TW188 TW189     FALSE 0.040 366.000 0.000 NA   NA
 324208 324209 TW191 TW192     FALSE 0.069 128.000 0.000 NA   NA
 324209 324210 TW192 TW193     FALSE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 324212 324213 TW195 TW196 recG coaD FALSE 0.240 121.000 0.002 1.000 N NA
 324215 324216 TW198 TW199 rpmF rnc TRUE 0.878 25.000 0.044 1.000   NA
 324216 324217 TW199 TW200 rnc   FALSE 0.186 118.000 0.000 1.000 N NA
 324217 324218 TW200 TW201     TRUE 0.950 48.000 0.180 1.000 Y NA
 324218 324219 TW201 TW202     TRUE 0.992 -3.000 0.361 0.023 Y NA
 324219 324220 TW202 TW203     TRUE 0.991 2.000 0.800 1.000 Y NA
 324220 324221 TW203 TW204     TRUE 0.989 25.000 0.652 0.026 Y NA
 324221 324222 TW204 TW205   ftsY FALSE 0.115 167.000 0.000 1.000 N NA
 324222 324223 TW205 TW206 ftsY rpsJ FALSE 0.121 160.000 0.000 1.000 N NA
 324223 324224 TW206 TW207 rpsJ rplC TRUE 0.993 10.000 0.467 0.081 Y NA
 324224 324225 TW207 TW208 rplC rplD TRUE 0.984 -10.000 0.361 0.060 Y NA
 324225 324226 TW208 TW209 rplD rplW TRUE 0.992 -3.000 0.513 0.060 Y NA
 324226 324227 TW209 TW210 rplW rplB TRUE 0.995 8.000 0.849 0.039 Y NA
 324227 324228 TW210 TW211 rplB rpsS TRUE 0.995 5.000 0.820 0.081 Y NA
 324228 324229 TW211 TW212 rpsS rplV TRUE 0.973 0.000 0.000 0.081 Y NA
 324229 324230 TW212 TW213 rplV rpsC TRUE 0.978 3.000 0.000 0.081 Y NA
 324230 324231 TW213 TW214 rpsC rplP TRUE 0.992 -3.000 0.828 0.081 Y NA
 324231 324232 TW214 TW215 rplP rpmC TRUE 0.985 -13.000 0.802 0.060 Y NA
 324232 324233 TW215 TW216 rpmC rpsQ TRUE 0.992 -3.000 0.828 0.060 Y NA
 324233 324234 TW216 TW217 rpsQ rplN TRUE 0.909 98.000 0.791 0.081 Y NA
 324234 324235 TW217 TW218 rplN rplX TRUE 0.995 3.000 0.810 0.081 Y NA
 324235 324236 TW218 TW219 rplX rplE TRUE 0.992 -3.000 0.758 0.060 Y NA
 324236 324237 TW219 TW220 rplE rpsH TRUE 0.977 30.000 0.059 0.060 Y NA
 324237 324238 TW220 TW221 rpsH rplF TRUE 0.995 3.000 0.808 0.060 Y NA
 324238 324239 TW221 TW222 rplF rplR TRUE 0.992 -3.000 0.815 0.060 Y NA
 324239 324240 TW222 TW223 rplR rpsE TRUE 0.992 -3.000 0.814 0.081 Y NA
 324240 324241 TW223 TW224 rpsE rplO TRUE 0.720 205.000 0.148 0.081 Y NA
 324241 324242 TW224 TW225 rplO secY TRUE 0.954 22.000 0.730 1.000 N NA
 324242 324243 TW225 TW226 secY adk TRUE 0.840 0.000 0.000 1.000 N NA
 324243 324244 TW226 TW227 adk   TRUE 0.864 3.000 0.000 1.000 N NA
 324244 324245 TW227 TW228   infA FALSE 0.388 70.000 0.000 1.000 N NA
 324245 324246 TW228 TW229 infA rpmJ TRUE 0.970 3.000 0.257 1.000   NA
 324246 324247 TW229 TW230 rpmJ rpsM TRUE 0.954 35.000 0.194 0.060   NA
 324247 324248 TW230 TW231 rpsM rpsK TRUE 0.995 4.000 0.810 0.060 Y NA
 324248 324249 TW231 TW232 rpsK rpoA TRUE 0.950 19.000 0.308 1.000 N NA
 324249 324250 TW232 TW233 rpoA rplQ TRUE 0.962 16.000 0.873 1.000 N NA
 324250 324251 TW233 TW234 rplQ truA TRUE 0.967 26.000 0.102 1.000 Y NA
 324252 324253 TW235 TW236     TRUE 0.958 8.000 0.389 NA   NA
 324253 324254 TW236 TW237     TRUE 0.788 -13.000 0.056 NA   NA
 324254 324255 TW237 TW238     TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 324258 324259 TW242 TW243     TRUE 0.981 -3.000 0.008 0.006 Y NA
 324263 324264 TW247 TW248 ftsZ   FALSE 0.195 117.000 0.012 NA   NA
 324264 324265 TW248 TW249     FALSE 0.139 85.000 0.000 NA   NA
 324265 324266 TW249 TW250   lspA TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324266 324267 TW250 TW251 lspA   FALSE 0.307 81.000 0.000 1.000 N NA
 324267 324268 TW251 TW252   dnaE TRUE 0.910 10.000 0.014 1.000 N NA
 324268 401463 TW252 TWt12 dnaE tRNA-Glu FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 401463 324269 TWt12 TW253 tRNA-Glu   FALSE 0.130 89.000 0.000 NA   NA
 324269 324270 TW253 TW254   murA TRUE 0.606 45.000 0.000 1.000 N NA
 324270 324271 TW254 TW255 murA   TRUE 0.660 66.000 0.036 1.000   NA
 324271 324272 TW255 TW256   gpsA TRUE 0.748 -25.000 0.019 1.000   NA
 324272 324273 TW256 TW257 gpsA ddlA TRUE 0.840 0.000 0.000 1.000 N NA
 324274 324275 TW258 TW259     FALSE 0.501 27.000 0.000 NA   NA
 324275 324276 TW259 TW260   acoL TRUE 0.697 154.000 0.379 1.000 Y NA
 324276 324277 TW260 TW261 acoL   TRUE 0.977 7.000 0.095 0.083 N NA
 324277 324278 TW261 TW262   glyQS FALSE 0.319 79.000 0.000 1.000 N NA
 324279 324280 TW263 TW264 hrdB   TRUE 0.928 2.000 0.015 1.000 N NA
 324280 324281 TW264 TW265     TRUE 0.936 -9.000 0.796 1.000   NA
 324282 324283 TW266 TW267 alr1 alr2 TRUE 0.821 50.000 0.000 0.003   NA
 401464 324285 TWt13 TW272 tRNA-Ala gnd FALSE 0.448 37.000 0.000 NA   NA
 324286 324287 TW273 TW274 gyrA1   TRUE 0.695 6.000 0.000 NA   NA
 324290 324291 TW277 TW278 dut   TRUE 0.863 -7.000 0.078 NA   NA
 324291 324292 TW278 TW279     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 324292 324293 TW279 TW280   Dxs FALSE 0.495 28.000 0.000 NA   NA
 401465 324294 TWt15 TW281 tRNA-Pro tig FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 324294 324295 TW281 TW282 tig   TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324295 324296 TW282 TW283   clpP1 TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324296 324297 TW283 TW284 clpP1 clpP2 TRUE 0.994 12.000 0.512 0.003 Y NA
 324297 324298 TW284 TW285 clpP2 clpX TRUE 0.976 10.000 0.039 1.000 Y NA
 324300 324301 TW287 TW288   fgs FALSE 0.413 110.000 0.031 1.000 N NA
 324301 324302 TW288 TW289 fgs   TRUE 0.704 5.000 0.000 NA   NA
 324302 324303 TW289 TW290   ndk FALSE 0.246 65.000 0.000 NA   NA
 324303 324304 TW290 TW291 ndk rne FALSE 0.100 218.000 0.000 1.000 N NA
 324304 324305 TW291 TW292 rne rplU TRUE 0.745 124.000 0.027 0.038 Y NA
 324305 324306 TW292 TW293 rplU rpmA TRUE 0.984 41.000 0.667 0.059 Y NA
 324306 324307 TW293 TW294 rpmA obg TRUE 0.967 0.000 0.335 1.000   NA
 324307 324308 TW294 TW295 obg   FALSE 0.237 66.000 0.000 NA   NA
 324308 324309 TW295 TW296   nadD FALSE 0.527 23.000 0.000 NA   NA
 324309 324310 TW296 TW297 nadD   FALSE 0.498 -7.000 0.000 NA   NA
 324310 401466 TW297 TWt16   tRNA-Ala FALSE 0.063 134.000 0.000 NA   NA
 401466 324311 TWt16 TW298 tRNA-Ala   FALSE 0.049 175.000 0.000 NA   NA
 324311 324312 TW298 TW299     TRUE 0.567 18.000 0.000 NA   NA
 324313 324314 TW300 TW301   lipA TRUE 0.860 2.000 0.000 1.000 N NA
 324314 324315 TW301 TW302 lipA lipB TRUE 0.992 19.000 0.319 0.003 Y NA
 324316 324317 TW303 TW304 ffh rpsP FALSE 0.430 196.000 0.361 1.000 N NA
 324317 324318 TW304 TW305 rpsP   TRUE 0.842 -3.000 0.006 1.000   NA
 324318 324319 TW305 TW306   rimM TRUE 0.864 0.000 0.002 1.000   NA
 324319 324320 TW306 TW307 rimM trmD TRUE 0.976 33.000 0.672 1.000 Y NA
 324320 324321 TW307 TW308 trmD rplS TRUE 0.859 93.000 0.567 1.000 Y NA
 324321 324322 TW308 TW309 rplS sipS TRUE 0.788 -3.000 0.000 1.000 N NA
 324322 324323 TW309 TW311 sipS   FALSE 0.041 262.000 0.000 NA   NA
 324323 324324 TW311 TW312     FALSE 0.041 252.000 0.000 NA   NA
 324324 324325 TW312 TW313     TRUE 0.849 -3.000 0.004 1.000 N NA
 324325 324326 TW313 TW314     FALSE 0.469 72.000 0.003 1.000 N NA
 324326 324327 TW314 TW315     TRUE 0.942 37.000 0.037 1.000 Y NA
 324327 324328 TW315 TW316     FALSE 0.041 500.000 0.000 NA   NA
 324330 324331 TW318 TW319 rpsB tsf TRUE 0.977 31.000 0.748 1.000 Y NA
 324331 324332 TW319 TW320 tsf pyrH TRUE 0.966 11.000 0.416 1.000 N NA
 324332 324333 TW320 TW321 pyrH frr FALSE 0.484 164.000 0.626 1.000 N NA
 324333 324334 TW321 TW322 frr   TRUE 0.706 69.000 0.076 1.000   NA
 324334 324335 TW322 TW323   xthA1 FALSE 0.107 148.000 0.000 1.000   NA
 324335 324336 TW323 TW324 xthA1   TRUE 0.559 19.000 0.000 NA   NA
 324340 324341 TW329 TW330 hom thrC TRUE 0.987 7.000 0.194 1.000 Y NA
 324341 324342 TW330 TW331 thrC thrB TRUE 0.963 41.000 0.221 1.000 Y NA
 324342 324343 TW331 TW332 thrB rho FALSE 0.380 71.000 0.000 1.000 N NA
 324343 324344 TW332 TW333 rho prfA FALSE 0.341 76.000 0.000 1.000 N NA
 324344 324345 TW333 TW334 prfA   TRUE 0.985 4.000 0.069 1.000 Y NA
 324345 324346 TW334 TW335     TRUE 0.946 49.000 0.583 NA Y NA
 324346 324347 TW335 TW336     TRUE 0.857 47.000 0.248 NA N NA
 324347 324348 TW336 TW337   atpI TRUE 0.837 41.000 0.105 NA   NA
 324348 324349 TW337 TW338 atpI atpB TRUE 0.855 1.000 0.011 NA   NA
 324349 324350 TW338 TW339 atpB atpE TRUE 0.958 44.000 0.628 0.012   NA
 324350 324351 TW339 TW340 atpE atpF TRUE 0.965 22.000 0.121 0.012   NA
 324351 324352 TW340 TW341 atpF atpH TRUE 0.978 -10.000 0.067 0.012 Y NA
 324352 324353 TW341 TW342 atpH atpA TRUE 0.994 11.000 0.864 0.012 Y NA
 324353 324354 TW342 TW343 atpA atpG TRUE 0.992 20.000 0.846 0.012 Y NA
 324354 324355 TW343 TW344 atpG atpD TRUE 0.981 49.000 0.724 0.012 Y NA
 324355 324356 TW344 TW345 atpD atpC TRUE 0.985 2.000 0.003 0.012 Y NA
 324356 324357 TW345 TW346 atpC rpsO FALSE 0.113 172.000 0.000 1.000 N NA
 324357 324358 TW346 TW347 rpsO pnp TRUE 0.897 45.000 0.011 1.000 Y NA
 324358 324359 TW347 TW348 pnp   TRUE 0.709 28.000 0.000 1.000 N NA
 324360 324361 TW349 TW350     TRUE 0.916 11.000 0.077 NA   NA
 324362 324363 TW351 TW352     TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324363 324364 TW352 TW353   trmU TRUE 0.923 23.000 0.094 1.000 N NA
 324364 324365 TW353 TW354 trmU ligA TRUE 0.748 -13.000 0.005 1.000 N NA
 324365 324366 TW354 TW355 ligA gatC FALSE 0.267 139.000 0.024 1.000 N NA
 324366 324367 TW355 TW356 gatC gatA TRUE 0.989 -10.000 0.643 0.004 Y NA
 324367 324368 TW356 TW357 gatA gatB TRUE 0.994 -3.000 0.492 0.004 Y NA
 324370 324371 TW360 TW361     FALSE 0.222 68.000 0.000 NA   NA
 324371 324372 TW361 TW362     TRUE 0.928 -9.000 0.372 1.000   NA
 401501 324373 TWt17 TW363 tRNA-Arg   TRUE 0.700 1.000 0.000 NA   NA
 324374 401467 TW364 TWt18 orn tRNA-His FALSE 0.403 43.000 0.000 NA   NA
 401467 324375 TWt18 TW365 tRNA-His nadE TRUE 0.559 19.000 0.000 NA   NA
 324377 324378 TW367 TW368 ssb2   FALSE 0.054 149.000 0.000 NA   NA
 324378 324379 TW368 TW369     TRUE 0.803 7.000 0.004 NA   NA
 324379 324380 TW369 TW370     TRUE 0.894 0.000 0.031 NA   NA
 324382 324383 TW372 TW373   rpiB TRUE 0.953 2.000 0.182 NA   NA
 324383 324384 TW373 TW374 rpiB nei TRUE 0.941 28.000 0.398 1.000 N NA
 324385 324386 TW375 TW376     FALSE 0.154 130.000 0.000 1.000 N NA
 324386 324387 TW376 TW377     TRUE 0.612 74.000 0.115 NA   NA
 324387 324388 TW377 TW378     TRUE 0.802 20.000 0.025 NA   NA
 324388 324389 TW378 TW379     TRUE 0.842 -3.000 0.027 NA   NA
 324389 324390 TW379 TW380     TRUE 0.549 99.000 0.351 NA   NA
 324390 401500 TW380 TWt19   tRNA-Val FALSE 0.045 203.000 0.000 NA   NA
 401500 401499 TWt19 TWt20 tRNA-Val tRNA-Val FALSE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 401499 401498 TWt20 TWt21 tRNA-Val tRNA-Cys TRUE 0.579 16.000 0.000 NA   NA
 401498 401497 TWt21 TWt22 tRNA-Cys tRNA-Gly FALSE 0.383 45.000 0.000 NA   NA
 401497 324391 TWt22 TW381 tRNA-Gly   FALSE 0.073 125.000 0.000 NA   NA
 324391 324392 TW381 TW382     TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324392 324393 TW382 TW383     FALSE 0.501 27.000 0.000 NA   NA
 324394 324395 TW384 TW385 trpE leuS TRUE 0.646 41.000 0.000 1.000 N NA
 324395 324396 TW385 TW386 leuS   FALSE 0.428 82.000 0.008 1.000 N NA
 324396 324397 TW386 TW387     TRUE 0.916 -3.000 0.130 NA   NA
 324397 324398 TW387 TW388     TRUE 0.745 -3.000 0.004 NA   NA
 324398 324399 TW388 TW389     FALSE 0.502 61.000 0.002 1.000   NA
 324400 324401 TW390 TW391     FALSE 0.403 43.000 0.000 NA   NA
 324402 324403 TW392 TW393 rpsD alaS FALSE 0.337 209.000 0.002 1.000 Y NA
 324403 324404 TW393 TW394 alaS   TRUE 0.910 31.000 0.103 1.000 N NA
 324404 324405 TW394 TW395     FALSE 0.181 183.000 0.039 NA   NA
 324405 324406 TW395 TW396   aroE TRUE 0.916 1.000 0.045 NA   NA
 324406 324407 TW396 TW397 aroE aroC TRUE 0.590 121.000 0.021 1.000 Y NA
 324407 324408 TW397 TW398 aroC aroK TRUE 0.893 31.000 0.000 1.000 Y NA
 324408 324409 TW398 TW399 aroK aroB TRUE 0.766 60.000 0.000 1.000 Y NA
 324409 324410 TW399 TW400 aroB aroQ TRUE 0.858 84.000 0.014 0.007 Y NA
 324410 324411 TW400 TW401 aroQ efp TRUE 0.827 25.000 0.010 1.000 N NA
 324411 324412 TW401 TW402 efp pyrC TRUE 0.787 13.000 0.000 1.000 N NA
 324412 324413 TW402 TW403 pyrC carA TRUE 0.958 42.000 0.155 1.000 Y NA
 324413 324414 TW403 TW404 carA carB TRUE 0.987 -13.000 0.345 0.003 Y NA
 324414 324415 TW404 TW405 carB pyrF TRUE 0.929 -3.000 0.075 1.000   NA
 324415 324416 TW405 TW406 pyrF gmk FALSE 0.151 352.000 0.013 1.000   NA
 324416 324417 TW406 TW407 gmk rpoZ TRUE 0.583 123.000 0.471 1.000 N NA
 324417 324418 TW407 TW408 rpoZ   TRUE 0.952 -3.000 0.192 1.000 N NA
 324418 324419 TW408 TW409   metK TRUE 0.978 10.000 0.059 1.000 Y NA
 324419 324420 TW409 TW410 metK   TRUE 0.938 1.000 0.068 NA N NA
 324420 324421 TW410 TW411   fmt TRUE 0.715 -10.000 0.012 NA N NA
 324421 324422 TW411 TW413 fmt rpe FALSE 0.094 300.000 0.000 1.000 N NA
 324424 324425 TW415 TW416 pstS pstC TRUE 0.944 83.000 0.529 0.007 Y NA
 324425 324426 TW416 TW417 pstC pstA TRUE 0.957 67.000 0.172 0.007 Y NA
 324426 324427 TW417 TW418 pstA   TRUE 0.994 11.000 0.373 0.007 Y NA
 324428 324429 TW419 TW420 argS   FALSE 0.041 239.000 0.000 NA   NA
 324429 324430 TW420 TW421     FALSE 0.073 125.000 0.000 NA   NA
 324430 324431 TW421 TW422     TRUE 0.954 7.000 0.068 1.000 N NA
 324431 324432 TW422 TW423   cysS1 FALSE 0.408 85.000 0.007 1.000 N NA
 324432 324433 TW423 TW424 cysS1   TRUE 0.977 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 324433 324434 TW424 TW425     FALSE 0.114 115.000 0.000 NA N NA
 324434 401468 TW425 TWt24   tRNA-Thr FALSE 0.383 45.000 0.000 NA   NA
 401468 324435 TWt24 TW426 tRNA-Thr   FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 324436 324437 TW428 TW429 zwf pgi or slr1349 TRUE 0.941 43.000 0.061 1.000 Y NA
 324437 324438 TW429 TW430 pgi or slr1349 tal TRUE 0.943 17.000 0.005 1.000 Y NA
 324438 324439 TW430 TW431 tal tkt TRUE 0.922 -10.000 0.013 1.000 Y NA
 324442 324443 TW434 TW435     TRUE 0.973 -7.000 0.266 0.003   NA
 324443 324444 TW435 TW436     TRUE 0.685 25.000 0.000 1.000   NA
 324444 324445 TW436 TW437     FALSE 0.144 134.000 0.000 1.000 N NA
 324445 324446 TW437 TW438     TRUE 0.768 25.000 0.021 NA   NA
 324449 324450 TW441 TW442     TRUE 0.881 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 324450 324451 TW442 TW443     TRUE 0.962 41.000 0.800 NA Y NA
 324451 324452 TW443 TW444     FALSE 0.279 56.000 0.000 NA   NA
 324454 324455 TW446 TW447     FALSE 0.040 283.000 0.000 NA   NA
 324455 324456 TW447 TW449     FALSE 0.052 162.000 0.000 NA   NA
 324457 324458 TW450 TW451   tatC TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324458 324459 TW451 TW452 tatC tatA TRUE 0.947 11.000 0.012 NA Y NA
 324459 324460 TW452 TW453 tatA   TRUE 0.831 5.000 0.000 1.000   NA
 324460 324461 TW453 TW454     TRUE 0.730 18.000 0.000 1.000   NA
 324463 324464 TW456 TW457 cysS2 upk TRUE 0.798 54.000 0.071 1.000 N NA
 324464 401495 TW457 TWt26 upk tRNA-Leu FALSE 0.175 75.000 0.000 NA   NA
 401495 324465 TWt26 TW458 tRNA-Leu rpmE FALSE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 324465 324466 TW458 TW459 rpmE fabG FALSE 0.130 142.000 0.000 1.000 N NA
 324466 324467 TW459 TW460 fabG   TRUE 0.862 4.000 0.000 1.000 N NA
 324467 324468 TW460 TW461     FALSE 0.044 205.000 0.000 NA   NA
 324472 324473 TW465 TW467 ppa1   TRUE 0.718 3.000 0.000 NA   NA
 324473 324474 TW467 TW468     FALSE 0.040 313.000 0.000 NA   NA
 324474 324475 TW468 TW469   secG FALSE 0.467 72.000 0.027 NA   NA
 324475 324476 TW469 TW470 secG tpiA TRUE 0.881 31.000 0.064 1.000   NA
 324476 324477 TW470 TW471 tpiA pgk TRUE 0.985 2.000 0.075 1.000 Y NA
 324477 324478 TW471 TW472 pgk gap TRUE 0.984 7.000 0.003 0.008 Y NA
 324478 324479 TW472 TW473 gap sodA TRUE 0.742 22.000 0.000 1.000 N NA
 324479 324480 TW473 TW474 sodA   FALSE 0.139 85.000 0.000 NA   NA
 324480 324481 TW474 TW475   uvrC TRUE 0.662 10.000 0.000 NA   NA
 324481 324482 TW475 TW476 uvrC uvrA TRUE 0.991 9.000 0.043 0.004 Y NA
 324482 324483 TW476 TW477 uvrA uvrB TRUE 0.992 12.000 0.154 0.004 Y NA
 324483 324484 TW477 TW478 uvrB coaE TRUE 0.856 -7.000 0.026 1.000 N NA
 324484 324485 TW478 TW479 coaE rpsA TRUE 0.934 4.000 0.024 1.000 N NA
 324485 324486 TW479 TW480 rpsA polA FALSE 0.111 178.000 0.000 1.000 N NA
 324486 324487 TW480 TW481 polA   TRUE 0.774 16.000 0.000 1.000 N NA
 324488 401494 TW482 TWt28 pyk tRNA-Arg FALSE 0.285 55.000 0.000 NA   NA
 401494 324489 TWt28 TW483 tRNA-Arg   TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 324489 401493 TW483 TWt29   tRNA-Asn FALSE 0.125 91.000 0.000 NA   NA
 401493 324490 TWt29 TW484 tRNA-Asn dnaG FALSE 0.058 141.000 0.000 NA   NA
 324490 324491 TW484 TW485 dnaG dgt TRUE 0.914 -3.000 0.037 1.000 N NA
 324491 324492 TW485 TW486 dgt uppS2 TRUE 0.829 10.000 0.000 1.000 N NA
 324492 324493 TW486 TW487 uppS2 recO TRUE 0.907 28.000 0.076 1.000 N NA
 324493 324494 TW487 TW488 recO era TRUE 0.911 26.000 0.108 1.000   NA
 324494 324495 TW488 TW489 era   TRUE 0.720 -13.000 0.026 NA   NA
 324495 324496 TW489 TW490     TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324496 324497 TW490 TW491     TRUE 0.774 36.000 0.034 NA   NA
 324497 324498 TW491 TW492   dnaJ1 FALSE 0.465 34.000 0.000 NA   NA
 324498 324499 TW492 TW493 dnaJ1   FALSE 0.041 445.000 0.000 NA   NA
 324499 324500 TW493 TW494   lepA TRUE 0.591 14.000 0.000 NA   NA
 324502 324503 TW496 TW497 relA   FALSE 0.042 224.000 0.000 NA   NA
 324503 324504 TW497 TW498   secF FALSE 0.040 337.000 0.000 NA   NA
 324504 324505 TW498 TW499 secF secD TRUE 0.996 0.000 0.336 0.003 Y NA
 324505 324506 TW499 TW500 secD   TRUE 0.768 79.000 0.062 NA Y NA
 324506 324507 TW500 TW501   ruvB TRUE 0.878 22.000 0.063 NA N NA
 324507 324508 TW501 TW502 ruvB ruvA TRUE 0.995 11.000 0.549 0.004 Y NA
 324508 324509 TW502 TW503 ruvA ruvC TRUE 0.913 99.000 0.451 0.015 Y NA
 324509 324510 TW503 TW504 ruvC   TRUE 0.894 -9.000 0.277 NA   NA
 324510 324511 TW504 TW505     TRUE 0.772 43.000 0.055 NA   NA
 324511 324512 TW505 TW506     TRUE 0.985 0.000 0.488 NA Y NA
 324512 324513 TW506 TW507     TRUE 0.917 13.000 0.000 0.020 N NA
 324513 324514 TW507 TW508   thrS TRUE 0.966 9.000 0.208 1.000 N NA
 324515 324516 TW509 TW510 glnA panB TRUE 0.850 6.000 0.000 1.000 N NA
 324516 324517 TW510 TW511 panB map TRUE 0.882 0.000 0.002 1.000 N NA
 324518 324519 TW512 TW513     TRUE 0.847 -7.000 0.065 NA   NA
 324519 401492 TW513 TWt30   tRNA-Val FALSE 0.537 22.000 0.000 NA   NA
 401492 324520 TWt30 TW514 tRNA-Val   FALSE 0.237 66.000 0.000 NA   NA
 324521 324522 TW515 TW516 aceE fabD TRUE 0.823 -16.000 0.000 0.045 N NA
 324522 324523 TW516 TW517 fabD fabH TRUE 0.959 -37.000 0.294 1.000 Y NA
 324523 324524 TW517 TW518 fabH acp TRUE 0.948 77.000 0.307 0.007 Y NA
 324524 324525 TW518 TW519 acp fabF TRUE 0.987 1.000 0.178 1.000 Y NA
 324526 324527 TW520 TW521   qcrB FALSE 0.169 77.000 0.000 NA   NA
 324527 324528 TW521 TW522 qcrB qcrA TRUE 0.995 0.000 0.457 0.024 Y NA
 324528 324529 TW522 TW523 qcrA qcrC TRUE 0.971 54.000 0.351 0.024 Y NA
 324529 324530 TW523 TW524 qcrC ctaE TRUE 0.977 0.000 0.000 0.024 Y NA
 324530 324531 TW524 TW525 ctaE   FALSE 0.236 89.000 0.000 1.000   NA
 324531 324532 TW525 TW526   ctaD TRUE 0.939 21.000 0.250 1.000   NA
 324532 324533 TW526 TW527 ctaD ctaC TRUE 0.993 12.000 0.284 0.004 Y NA
 324533 324534 TW527 TW528 ctaC   FALSE 0.413 70.000 0.014 NA   NA
 324534 324535 TW528 TW529     TRUE 0.730 17.000 0.005 NA   NA
 324536 324537 TW530 TW531   rnhA TRUE 0.819 16.000 0.024 NA   NA
 324538 324539 TW532 TW533 pyrD   TRUE 0.729 22.000 0.004 NA N NA
 324539 324540 TW533 TW534     TRUE 0.937 1.000 0.000 NA Y NA
 324540 324541 TW534 TW535     TRUE 0.973 43.000 0.060 0.009 Y NA
 324541 324542 TW535 TW536     TRUE 0.964 6.000 0.707 NA   NA
 324542 324543 TW536 TW537     TRUE 0.579 16.000 0.000 NA   NA
 324545 324546 TW540 TW541 ftsQ murC TRUE 0.958 27.000 0.134 NA Y NA
 324546 324547 TW541 TW542 murC murG TRUE 0.990 3.000 0.270 1.000 Y NA
 324547 324548 TW542 TW543 murG ftsW TRUE 0.963 0.000 0.167 1.000 N NA
 324548 324549 TW543 TW544 ftsW murD TRUE 0.981 0.000 0.081 0.012 N NA
 324549 324550 TW544 TW545 murD murE TRUE 0.986 2.000 0.002 0.007 Y NA
 324550 324551 TW545 TW546 murE mraY TRUE 0.979 -3.000 0.011 0.015 Y NA
 324551 324552 TW546 TW547 mraY murF TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 324552 324553 TW547 TW548 murF pbp TRUE 0.913 22.000 0.000 1.000 Y NA
 324553 324554 TW548 TW549 pbp   FALSE 0.444 73.000 0.026 NA   NA
 324554 324555 TW549 TW550   mraW TRUE 0.743 -3.000 0.004 NA   NA
 324555 324556 TW550 TW551 mraW mraZ TRUE 0.854 50.000 0.635 NA   NA
 324556 324557 TW551 TW552 mraZ   FALSE 0.164 78.000 0.000 NA   NA
 324557 324558 TW552 TW553     FALSE 0.134 87.000 0.000 NA   NA
 324559 324560 TW554 TW555     TRUE 0.829 10.000 0.000 1.000 N NA
 324561 324562 TW556 TW557 aroH   TRUE 0.627 -16.000 0.000 1.000 N NA
 324562 324563 TW557 TW558   glk FALSE 0.328 78.000 0.000 1.000 N NA
 324563 324564 TW558 TW559 glk   FALSE 0.462 54.000 0.000 1.000   NA
 324564 324565 TW559 TW560     FALSE 0.088 116.000 0.000 NA   NA
 324565 401491 TW560 TWt31   tRNA-Gln FALSE 0.304 53.000 0.000 NA   NA
 401491 324566 TWt31 TW561 tRNA-Gln   FALSE 0.111 98.000 0.000 NA   NA
 324566 324567 TW561 TW562     FALSE 0.044 206.000 0.000 NA   NA
 324567 324568 TW562 TW563   gltX TRUE 0.906 1.000 0.006 1.000 N NA
 324568 324569 TW563 TW564 gltX ilvE TRUE 0.570 49.000 0.000 1.000 N NA
 324569 324570 TW564 TW565 ilvE ilvC TRUE 0.567 101.000 0.002 1.000 Y NA
 324570 324571 TW565 TW566 ilvC ilvN TRUE 0.700 69.000 0.071 1.000   NA
 324571 324572 TW566 TW567 ilvN ilvB TRUE 0.976 -7.000 0.380 0.003   NA
 324572 324573 TW567 TW568 ilvB ilvD TRUE 0.963 45.000 0.020 0.004 Y NA
 324573 401490 TW568 TWt32 ilvD tRNA-Lys FALSE 0.045 5957.000 0.000 NA   NA
 401490 408248 TWt32 TWs01 tRNA-Lys ssrA FALSE 0.044 2011.000 0.000 NA   NA
 408248 324574 TWs01 TW569 ssrA ksgA FALSE 0.057 142.000 0.000 NA   NA
 324574 324575 TW569 TW570 ksgA   TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 324575 324576 TW570 TW571   smpB FALSE 0.082 506.000 0.000 1.000   NA
 324576 324577 TW571 TW572 smpB ftsX TRUE 0.920 12.000 0.038 1.000 N NA
 324577 324578 TW572 TW573 ftsX ftsE TRUE 0.928 15.000 0.000 1.000 Y NA
 324578 324579 TW573 TW574 ftsE prfB FALSE 0.107 194.000 0.000 1.000 N NA
 324581 324582 TW576 TW577 pyrB   FALSE 0.045 8730.000 0.000 NA   NA
 324582 324583 TW577 TW578     FALSE 0.442 116.000 0.182 NA   NA
 324583 324584 TW578 TW579     TRUE 0.946 0.000 0.182 NA   NA
 324584 324585 TW579 TW580     TRUE 0.926 -3.000 0.185 NA   NA
 324585 324586 TW580 TW581     TRUE 0.798 63.000 0.758 NA   NA
 324586 324587 TW581 TW582     TRUE 0.983 -3.000 0.667 0.007   NA
 324587 324588 TW582 TW583     TRUE 0.907 -46.000 0.667 1.000   NA
 324589 324590 TW584 TW585   prsA TRUE 0.835 -3.000 0.005 1.000   NA
 324590 324591 TW585 TW586 prsA ispG FALSE 0.127 147.000 0.000 1.000 N NA
 324594 324595 TW589 TW590 mfd   FALSE 0.086 1099.000 0.000 1.000   NA
 324595 324596 TW590 TW591     FALSE 0.046 194.000 0.000 NA   NA
 324596 324597 TW591 TW592     TRUE 0.963 3.000 0.357 NA   NA
 324597 324598 TW592 TW593     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 324598 324599 TW593 TW594     FALSE 0.064 133.000 0.000 NA   NA
 324599 324600 TW594 TW595     TRUE 0.700 1.000 0.000 NA   NA
 324600 324601 TW595 TW596     TRUE 0.662 10.000 0.000 NA   NA
 324602 324603 TW597 TW598     FALSE 0.040 286.000 0.000 NA   NA
 324603 324604 TW598 TW599     TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 324604 324605 TW599 TW600     FALSE 0.293 54.000 0.000 NA   NA
 406556 407384 TWr01 TWr02 5S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.304 53.000 0.000 NA   NA
 407384 2208506 TWr02 TWr03 23S_rRNA 16S_rRNA FALSE 0.040 295.000 0.000 NA   NA
 2208506 324606 TWr03 TW602 16S_rRNA   FALSE 0.042 535.000 0.000 NA   NA
 324606 324607 TW602 TW603   tyrS FALSE 0.053 158.000 0.000 NA   NA
 324607 324608 TW603 TW604 tyrS pheT FALSE 0.089 199.000 0.000 1.000   NA
 324608 324609 TW604 TW605 pheT pheS TRUE 0.882 83.000 0.574 0.003   NA
 324609 324610 TW605 TW606 pheS rplT TRUE 0.595 384.000 0.202 1.000 Y NA
 324610 324611 TW606 TW607 rplT rpmI TRUE 0.988 30.000 0.928 0.051 Y NA
 324611 324612 TW607 TW608 rpmI infC TRUE 0.908 74.000 0.652 1.000 Y NA
 324612 324613 TW608 TW610 infC tRNA-Met FALSE 0.101 934.000 0.000 1.000 N NA
 324613 324614 TW610 TW611 tRNA-Met   FALSE 0.042 689.000 0.000 NA   NA
 324614 324615 TW611 TW612     TRUE 0.712 2.000 0.000 NA   NA
 324615 324616 TW612 TW613   rbfA TRUE 0.860 2.000 0.000 1.000 N NA
 324616 324617 TW613 TW614 rbfA infB TRUE 0.824 107.000 0.530 1.000 Y NA
 324617 324618 TW614 TW615 infB nusA FALSE 0.522 132.000 0.342 1.000 N NA
 324618 324619 TW615 TW616 nusA   FALSE 0.041 460.000 0.000 NA   NA
 324619 324620 TW616 TW617     FALSE 0.095 110.000 0.000 NA   NA
 324620 324621 TW617 TW618   ppa2 FALSE 0.040 284.000 0.000 NA   NA
 324621 324622 TW618 TW619 ppa2   TRUE 0.718 3.000 0.000 NA   NA
 324624 324625 TW621 TW622     FALSE 0.042 520.000 0.000 NA   NA
 324625 324626 TW622 TW623     FALSE 0.041 504.000 0.000 NA   NA
 401471 401472 TWt33 TWt34 tRNA-Glu tRNA-Asp TRUE 0.662 10.000 0.000 NA   NA
 401472 401473 TWt34 TWt35 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.695 6.000 0.000 NA   NA
 324627 324628 TW624 TW625     FALSE 0.059 140.000 0.000 NA   NA
 324628 324629 TW625 TW626   miaA FALSE 0.086 211.000 0.000 1.000   NA
 324629 324630 TW626 TW627 miaA   TRUE 0.621 121.000 0.028 1.000 Y NA
 324630 324631 TW627 TW628   recA TRUE 0.838 15.000 0.003 1.000 N NA
 324631 324632 TW628 TW629 recA pgsA FALSE 0.106 195.000 0.000 1.000 N NA
 324632 324633 TW629 TW630 pgsA   FALSE 0.077 123.000 0.000 NA   NA
 324633 324634 TW630 TW631     FALSE 0.273 58.000 0.000 NA   NA
 324634 324635 TW631 TW632     TRUE 0.914 -3.000 0.052 1.000   NA
 324635 324636 TW632 TW633     FALSE 0.129 131.000 0.000 1.000   NA
 324636 324637 TW633 TW634     FALSE 0.246 65.000 0.000 NA   NA
 324638 401474 TW636 TWt36   tRNA-Leu FALSE 0.041 407.000 0.000 NA   NA
 324641 324642 TW639 TW640   rph TRUE 0.936 26.000 0.262 1.000 N NA
 324643 401475 TW641 TWt37   tRNA-Glu FALSE 0.393 -20.000 0.000 NA   NA
 401475 401476 TWt37 TWt38 tRNA-Glu tRNA-Asp TRUE 0.662 10.000 0.000 NA   NA
 401476 401477 TWt38 TWt39 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.695 6.000 0.000 NA   NA
 324644 324645 TW642 TW643     FALSE 0.360 69.000 0.000 1.000   NA
 324645 401489 TW643 TWt40   tRNA-Met FALSE 0.060 138.000 0.000 NA   NA
 401489 324646 TWt40 TW644 tRNA-Met   FALSE 0.434 40.000 0.000 NA   NA
 324646 324647 TW644 TW645     TRUE 0.642 34.000 0.000 1.000   NA
 324647 324648 TW645 TW646   pdhD FALSE 0.264 90.000 0.000 1.000 N NA
 324648 324649 TW646 TW647 pdhD pyc TRUE 0.985 5.000 0.014 0.068 Y NA
 324651 324652 TW649 TW651     FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 324652 324653 TW651 TW652   gabT FALSE 0.098 594.000 0.000 1.000 N NA
 324653 324654 TW652 TW653 gabT folD TRUE 0.853 1.000 0.000 1.000 N NA
 324654 324655 TW653 TW655 folD glyA FALSE 0.109 185.000 0.000 1.000 N NA
 324655 324656 TW655 TW656 glyA   FALSE 0.366 73.000 0.000 1.000 N NA
 324656 324657 TW656 TW658   gcvH FALSE 0.099 644.000 0.000 1.000 N NA
 324657 324658 TW658 TW659 gcvH gcvT TRUE 0.958 56.000 0.056 0.004 Y NA
 324658 324659 TW659 TW661 gcvT   FALSE 0.094 306.000 0.000 1.000 N NA
 324661 324662 TW663 TW664   ispH TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324663 324664 TW665 TW666 xseA xseB TRUE 0.983 49.000 0.412 0.003 Y NA
 324665 324666 TW667 TW668     FALSE 0.277 395.000 0.000 1.000 Y NA
 324666 324667 TW668 TW669   sgaE TRUE 0.956 -7.000 0.049 1.000 Y NA
 324667 324668 TW669 TW670 sgaE sgaU TRUE 0.973 6.000 0.049 NA Y NA
 324668 324669 TW670 TW671 sgaU sgaH TRUE 0.969 26.000 0.400 NA Y NA
 324669 324670 TW671 TW672 sgaH   TRUE 0.973 0.000 1.000 1.000   NA
 324670 324671 TW672 TW673   pth FALSE 0.080 363.000 0.000 1.000   NA
 324671 324672 TW673 TW674 pth   FALSE 0.042 231.000 0.000 NA   NA
 324672 324673 TW674 TW675     FALSE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 324675 324676 TW677 TW678 rplY pgm FALSE 0.139 137.000 0.000 1.000 N NA
 324676 324677 TW678 TW679 pgm   TRUE 0.553 46.000 0.000 1.000   NA
 324677 324678 TW679 TW680     FALSE 0.065 132.000 0.000 NA   NA
 324678 324679 TW680 TW681     FALSE 0.470 33.000 0.000 NA   NA
 324680 324681 TW682 TW683     TRUE 0.540 48.000 0.000 1.000   NA
 324682 324683 TW684 TW685 mscL   FALSE 0.095 264.000 0.000 1.000 N NA
 324683 324684 TW685 TW686     TRUE 0.969 43.000 0.894 1.000 Y NA
 324684 324685 TW686 TW687     TRUE 0.893 81.000 0.857 1.000 Y NA
 324685 324686 TW687 TW688     FALSE 0.118 95.000 0.000 NA   NA
 324690 324691 TW692 TW693     FALSE 0.042 510.000 0.000 NA   NA
 324692 324693 TW694 TW695 fusA rpsG TRUE 0.974 36.000 0.579 1.000 Y NA
 324693 324694 TW695 TW696 rpsG rpsL TRUE 0.995 0.000 0.620 0.010 Y NA
 324695 324696 TW697 TW698     FALSE 0.041 239.000 0.000 NA   NA
 324696 324697 TW698 TW699   greA FALSE 0.449 -10.000 0.000 NA   NA
 324698 324699 TW700 TW701 tdcB   TRUE 0.812 11.000 0.000 1.000 N NA
 324699 324700 TW701 TW702     TRUE 0.900 96.000 0.064 0.002 Y NA
 324701 324702 TW703 TW704     FALSE 0.093 185.000 0.000 1.000   NA
 324702 324703 TW704 TW705   trpS TRUE 0.828 -10.000 0.026 1.000 N NA
 324703 324704 TW705 TW706 trpS ribD TRUE 0.609 -28.000 0.000 1.000 N NA
 324704 324705 TW706 TW707 ribD ribE TRUE 0.991 4.000 0.456 1.000 Y NA
 324705 324706 TW707 TW708 ribE ribB TRUE 0.940 27.000 0.016 1.000 Y NA
 324706 324707 TW708 TW709 ribB ribA TRUE 0.974 17.000 0.000 0.002 Y NA
 324707 324708 TW709 TW710 ribA ribH TRUE 0.982 24.000 0.041 0.007 Y NA
 324709 401487 TW711 TWt42 pncA tRNA-Thr FALSE 0.077 123.000 0.000 NA   NA
 401487 324710 TWt42 TW712 tRNA-Thr   FALSE 0.054 150.000 0.000 NA   NA
 324710 324711 TW712 TW713     FALSE 0.312 141.000 0.130 NA   NA
 324711 324712 TW713 TW714     FALSE 0.277 165.000 0.037 1.000 N NA
 324712 324713 TW714 TW715   topA TRUE 0.655 60.000 0.015 1.000 N NA
 324713 324714 TW715 TW716 topA   FALSE 0.257 61.000 0.000 NA   NA
 324714 324715 TW716 TW717     TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324715 324716 TW717 TW718     TRUE 0.712 2.000 0.000 NA   NA
 324716 324717 TW718 TW719     FALSE 0.495 28.000 0.000 NA   NA
 324717 324718 TW719 TW720     TRUE 0.592 -15.000 0.000 1.000   NA
 324718 324719 TW720 TW721     FALSE 0.063 177.000 0.000 NA N NA
 324720 324721 TW722 TW723     FALSE 0.182 109.000 0.000 1.000   NA
 324721 401478 TW723 TWt43   tRNA-Pro FALSE 0.042 222.000 0.000 NA   NA
 324722 324723 TW724 TW725 asd lysC TRUE 0.978 -3.000 0.119 1.000 Y NA
 324723 324724 TW725 TW726 lysC recR FALSE 0.177 196.000 0.010 1.000 N NA
 324724 324725 TW726 TW727 recR dnaX TRUE 0.988 9.000 0.028 0.014 Y NA
 324725 324726 TW727 TW728 dnaX rplL FALSE 0.097 234.000 0.000 1.000 N NA
 324726 324727 TW728 TW729 rplL rplJ TRUE 0.993 12.000 0.884 0.048 Y NA
 324727 324728 TW729 TW730 rplJ rplA TRUE 0.821 135.000 0.302 0.064 Y NA
 324728 324729 TW730 TW731 rplA rplK TRUE 0.992 -3.000 0.838 0.064 Y NA
 324729 324730 TW731 TW732 rplK nusG TRUE 0.936 37.000 0.681 1.000 N NA
 324730 401486 TW732 TWt44 nusG tRNA-Trp FALSE 0.041 258.000 0.000 NA   NA
 324732 324733 TW734 TW735 murB   FALSE 0.191 285.000 0.028 1.000   NA
 324733 324734 TW735 TW736     FALSE 0.330 146.000 0.185 NA   NA
 324734 324735 TW736 TW737   purF FALSE 0.040 375.000 0.000 NA   NA
 324735 324736 TW737 TW738 purF purM TRUE 0.583 111.000 0.010 1.000 Y NA
 324737 324738 TW739 TW740 purD serS FALSE 0.201 111.000 0.000 1.000 N NA
 324738 324739 TW740 TW741 serS   TRUE 0.912 23.000 0.084 1.000   NA
 324739 401479 TW741 TWt45   tRNA-Ser FALSE 0.362 48.000 0.000 NA   NA
 401479 324740 TWt45 TW742 tRNA-Ser   FALSE 0.181 74.000 0.000 NA   NA
 324740 401480 TW742 TWt46   tRNA-Ser FALSE 0.520 24.000 0.000 NA   NA
 401480 401481 TWt46 TWt47 tRNA-Ser tRNA-Arg FALSE 0.513 25.000 0.000 NA   NA
 324741 324742 TW743 TW744 hemL hemB TRUE 0.993 4.000 0.067 0.006 Y NA
 324742 324743 TW744 TW745 hemB   TRUE 0.991 11.000 0.071 0.006 Y NA
 324743 324744 TW745 TW746   hemC TRUE 0.992 -3.000 0.205 0.006 Y NA
 324744 324745 TW746 TW747 hemC hemH TRUE 0.964 11.000 0.015 1.000 Y NA
 324745 324746 TW747 TW748 hemH   TRUE 0.860 -3.000 0.034 NA   NA
 324746 324747 TW748 TW749   hemE FALSE 0.135 131.000 0.006 NA   NA
 324748 324749 TW750 TW751 hemA   TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 324749 324750 TW751 TW752   dnaB TRUE 0.755 13.000 0.000 1.000   NA
 324750 324751 TW752 TW753 dnaB   FALSE 0.080 275.000 0.000 1.000   NA
 324751 324752 TW753 TW754   nagD FALSE 0.080 303.000 0.000 1.000   NA
 324755 324756 TW757 TW758   clpB TRUE 0.540 48.000 0.000 1.000   NA
 324756 324757 TW758 TW759 clpB hspR TRUE 0.711 -7.000 0.000 1.000 N NA
 324757 324758 TW759 TW760 hspR dnaJ2 TRUE 0.969 9.000 0.286 1.000 N NA
 324758 324759 TW760 TW761 dnaJ2 grpE TRUE 0.988 -7.000 0.248 0.010 Y NA
 324759 324760 TW761 TW762 grpE dnaK TRUE 0.984 25.000 0.074 0.010 Y NA
 324761 324762 TW763 TW764   proC FALSE 0.198 114.000 0.000 1.000 N NA
 324762 324763 TW764 TW765 proC   FALSE 0.041 393.000 0.000 NA   NA
 324765 324766 TW767 TW768     FALSE 0.507 38.000 0.000 NA N NA
 324766 324767 TW768 TW769   ccdA FALSE 0.284 225.000 0.000 1.000 Y NA
 324767 324768 TW769 TW770 ccdA   TRUE 0.858 29.000 0.000 NA Y NA
 324768 324769 TW770 TW771     TRUE 0.983 7.000 0.213 NA Y NA
 324770 324771 TW772 TW773     FALSE 0.118 95.000 0.000 NA   NA
 324771 324772 TW773 TW774     FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 324774 324775 TW776 TW777     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 324777 324778 TW779 TW780     TRUE 0.599 13.000 0.000 NA   NA
 324778 324779 TW780 TW781     FALSE 0.075 124.000 0.000 NA   NA
 324780 401482 TW782 TWt48   tRNA-Ser FALSE 0.222 68.000 0.000 NA   NA
 401482 324781 TWt48 TW783 tRNA-Ser   FALSE 0.072 126.000 0.000 NA   NA
 324782 324783 TW784 TW785     FALSE 0.043 216.000 0.000 NA   NA
 324783 324784 TW785 TW786     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 324784 324785 TW786 TW787     TRUE 0.905 43.000 0.250 1.000 N NA
 324785 324786 TW787 TW788     TRUE 0.977 4.000 0.574 1.000 N NA
 324786 324787 TW788 TW789     TRUE 0.983 5.000 0.000 0.005 Y NA
 401484 324788 TWt50 TW790 tRNA-Leu   FALSE 0.471 -9.000 0.000 NA   NA
 324788 324789 TW790 TW791     FALSE 0.155 80.000 0.000 NA   NA
 324789 324790 TW791 TW792     TRUE 0.950 2.000 0.148 NA   NA
 324790 324791 TW792 TW793   eno TRUE 0.897 -3.000 0.028 1.000   NA
 324791 324792 TW793 TW794 eno hisS FALSE 0.094 315.000 0.000 1.000 N NA
 324792 324793 TW794 TW795 hisS   TRUE 0.788 -3.000 0.000 1.000 N NA
 324793 324794 TW795 TW796   dcd TRUE 0.788 -3.000 0.000 1.000 N NA
 324795 324796 TW797 TW798 pdhC pdhB TRUE 0.992 18.000 0.860 0.039 Y NA
 324796 324797 TW798 TW799 pdhB pdhA TRUE 0.994 -3.000 0.917 0.004 Y NA
 324798 324799 TW800 TW801 purB purA TRUE 0.754 62.000 0.000 1.000 Y NA
 324799 324800 TW801 TW802 purA   FALSE 0.221 104.000 0.000 1.000 N NA
 324801 324802 TW803 TW804 purL   TRUE 0.600 -3.000 0.000 NA   NA
 324802 324803 TW804 TW805   purQ FALSE 0.043 212.000 0.000 NA   NA
 324803 324804 TW805 TW806 purQ   TRUE 0.996 4.000 0.656 0.004 Y NA
 324807 324808 TW809 TW810     TRUE 0.657 31.000 0.000 1.000   NA
 324809 324810 TW811 TW812 parB parA1 TRUE 0.970 11.000 0.827 1.000 N NA
 324810 324811 TW812 TW813 parA1   FALSE 0.108 189.000 0.000 1.000 N NA
 324811 324812 TW813 TW814     FALSE 0.428 60.000 0.000 1.000   NA
 324812 324813 TW814 TW815     TRUE 0.831 5.000 0.000 1.000   NA
 324813 324814 TW815 TW816     FALSE 0.498 -7.000 0.000 NA   NA
 324814 324815 TW816 TW817   rnpA TRUE 0.917 -7.000 0.540 NA   NA