MicrobesOnline Operon Predictions for Croceibacter atlanticus HTCC2559

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2671652 2671653 CA2559_00015 CA2559_00020     FALSE 0.113 171.000 0.041 NA   NA
 2671653 2671654 CA2559_00020 CA2559_00025     TRUE 0.962 99.000 0.851 0.001 Y NA
 2671654 2671655 CA2559_00025 CA2559_00030     FALSE 0.246 193.000 0.223 1.000 N NA
 2671655 2671656 CA2559_00030 CA2559_00035     TRUE 0.976 57.000 0.884 1.000 Y NA
 2671656 2671657 CA2559_00035 CA2559_00040     TRUE 0.989 4.000 0.302 1.000 Y NA
 2671657 2671658 CA2559_00040 CA2559_00045   rplK TRUE 0.993 21.000 0.838 0.031 Y NA
 2671658 2671659 CA2559_00045 CA2559_00050 rplK   TRUE 0.857 70.000 0.681 1.000 N NA
 2671659 2671660 CA2559_00050 CA2559_00055   tuf TRUE 0.980 13.000 0.843 1.000   NA
 2671660 2671661 CA2559_00055 CA2559_t07729 tuf   FALSE 0.450 43.000 0.000 NA   NA
 2671661 2671662 CA2559_t07729 CA2559_00060     FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 2671662 2671663 CA2559_00060 CA2559_t07727     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 2671663 2671664 CA2559_t07727 CA2559_t07725     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 2671664 2671665 CA2559_t07725 CA2559_t07723     FALSE 0.181 88.000 0.000 NA   NA
 2671665 2671666 CA2559_t07723 CA2559_t07721     FALSE 0.388 53.000 0.000 NA   NA
 2671666 2671667 CA2559_t07721 CA2559_00065     FALSE 0.163 98.000 0.000 NA   NA
 2671667 2671668 CA2559_00065 CA2559_00070     TRUE 0.862 25.000 0.161 NA N NA
 2671668 2671669 CA2559_00070 CA2559_00075     TRUE 0.690 65.000 0.141 1.000   NA
 2671669 2671670 CA2559_00075 CA2559_00080     FALSE 0.493 41.000 0.000 1.000   NA
 2671670 2671671 CA2559_00080 CA2559_00085     FALSE 0.155 116.000 0.000 1.000   NA
 2671671 2671672 CA2559_00085 CA2559_00090     TRUE 0.665 15.000 0.031 NA N NA
 2671672 2671673 CA2559_00090 CA2559_00095     FALSE 0.160 69.000 0.004 NA N NA
 2671673 2671674 CA2559_00095 CA2559_00100     FALSE 0.248 98.000 0.041 1.000 N NA
 2671674 2671675 CA2559_00100 CA2559_00105     TRUE 0.935 -3.000 0.143 NA   NA
 2671675 2671676 CA2559_00105 CA2559_00110     FALSE 0.174 92.000 0.000 NA   NA
 2671676 2671677 CA2559_00110 CA2559_00115     FALSE 0.092 139.000 0.000 NA   NA
 2671677 2671678 CA2559_00115 CA2559_00120     TRUE 0.765 22.000 0.052 NA   NA
 2671678 2671679 CA2559_00120 CA2559_00125     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2671679 2671680 CA2559_00125 CA2559_00130     TRUE 0.748 34.000 0.061 NA   NA
 2671680 2671681 CA2559_00130 CA2559_00135     FALSE 0.485 71.000 0.096 NA N NA
 2671682 2671683 CA2559_00140 CA2559_00145     FALSE 0.172 93.000 0.000 NA   NA
 2671683 2671684 CA2559_00145 CA2559_00150     TRUE 0.767 -13.000 0.025 NA   NA
 2671685 2671686 CA2559_00155 CA2559_00160     TRUE 0.953 0.000 0.182 NA   NA
 2671689 2671690 CA2559_00175 CA2559_00180     TRUE 0.939 -22.000 0.206 1.000   NA
 2671693 2671694 CA2559_00195 CA2559_00200     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2671694 2671695 CA2559_00200 CA2559_00205     TRUE 0.866 77.000 0.800 NA   NA
 2671695 2671696 CA2559_00205 CA2559_00210     FALSE 0.180 89.000 0.000 NA   NA
 2671696 2671697 CA2559_00210 CA2559_00215     FALSE 0.012 870.000 0.000 NA   NA
 2671697 2671698 CA2559_00215 CA2559_00220     TRUE 0.717 5.000 0.000 NA   NA
 2671698 2671699 CA2559_00220 CA2559_00225     TRUE 0.684 9.000 0.000 NA   NA
 2671700 2671701 CA2559_00230 CA2559_00235     FALSE 0.130 120.000 0.000 NA   NA
 2671701 2671702 CA2559_00235 CA2559_00240     TRUE 0.692 -7.000 0.000 NA   NA
 2671702 2671703 CA2559_00240 CA2559_00245     FALSE 0.014 378.000 0.000 NA   NA
 2671703 2671704 CA2559_00245 CA2559_00250     TRUE 0.875 -3.000 0.058 NA   NA
 2671704 2671705 CA2559_00250 CA2559_00255     FALSE 0.015 365.000 0.000 NA   NA
 2671705 2671706 CA2559_00255 CA2559_00260     TRUE 0.580 90.000 0.095 0.005 N NA
 2671706 2671707 CA2559_00260 CA2559_00265     TRUE 0.610 97.000 0.095 0.005   NA
 2671707 2671708 CA2559_00265 CA2559_00270     FALSE 0.048 182.000 0.000 NA   NA
 2671710 2671711 CA2559_00280 CA2559_00285     FALSE 0.078 148.000 0.000 NA   NA
 2671711 2671712 CA2559_00285 CA2559_00290     FALSE 0.023 256.000 0.000 NA   NA
 2671712 2671713 CA2559_00290 CA2559_00295     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2671713 2671714 CA2559_00295 CA2559_00300     FALSE 0.060 167.000 0.000 NA   NA
 2671714 2671715 CA2559_00300 CA2559_00305     TRUE 0.692 -7.000 0.000 NA   NA
 2671715 2671716 CA2559_00305 CA2559_00310     FALSE 0.053 173.000 0.000 NA   NA
 2671716 2671717 CA2559_00310 CA2559_00315     FALSE 0.016 329.000 0.000 NA   NA
 2671717 2671718 CA2559_00315 CA2559_00320     FALSE 0.032 215.000 0.000 NA   NA
 2671718 2671719 CA2559_00320 CA2559_00325     FALSE 0.080 147.000 0.000 NA   NA
 2671721 2671722 CA2559_00335 CA2559_00340     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 2671722 2671723 CA2559_00340 CA2559_00345     FALSE 0.033 208.000 0.000 NA   NA
 2671725 2671726 CA2559_00355 CA2559_00360     FALSE 0.037 199.000 0.000 NA   NA
 2671726 2671727 CA2559_00360 CA2559_00365     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 2671727 2671728 CA2559_00365 CA2559_00370     FALSE 0.199 79.000 0.000 NA   NA
 2671728 2671729 CA2559_00370 CA2559_00375     FALSE 0.015 355.000 0.000 NA   NA
 2671729 2671730 CA2559_00375 CA2559_00380     FALSE 0.291 63.000 0.000 NA   NA
 2671730 2671731 CA2559_00380 CA2559_00385     FALSE 0.039 197.000 0.000 NA   NA
 2671731 2671732 CA2559_00385 CA2559_00390     FALSE 0.388 53.000 0.000 NA   NA
 2671732 2671733 CA2559_00390 CA2559_00395     TRUE 0.618 14.000 0.000 NA   NA
 2671735 2671736 CA2559_00405 CA2559_00410     FALSE 0.013 856.000 0.000 1.000   NA
 2671736 2671737 CA2559_00410 CA2559_00415     TRUE 0.893 -3.000 0.000 0.001   NA
 2671738 2671739 CA2559_00420 CA2559_00425     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2671739 2671740 CA2559_00425 CA2559_00430     FALSE 0.033 207.000 0.000 NA   NA
 2671740 2671741 CA2559_00430 CA2559_00435     FALSE 0.338 59.000 0.000 NA   NA
 2671741 2671742 CA2559_00435 CA2559_00440     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 2671742 2671743 CA2559_00440 CA2559_00445     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 2671744 2671745 CA2559_00450 CA2559_00455     FALSE 0.013 427.000 0.000 NA   NA
 2671745 2671746 CA2559_00455 CA2559_00460     TRUE 0.865 26.000 0.136 NA   NA
 2671746 2671747 CA2559_00460 CA2559_00465     TRUE 0.953 10.000 0.250 NA   NA
 2671747 2671748 CA2559_00465 CA2559_00470     TRUE 0.964 4.000 0.250 NA   NA
 2671748 2671749 CA2559_00470 CA2559_00475     FALSE 0.037 199.000 0.000 NA   NA
 2671749 2671750 CA2559_00475 CA2559_00480     TRUE 0.753 55.000 0.130 NA   NA
 2671750 2671751 CA2559_00480 CA2559_00485     TRUE 0.892 19.000 0.150 NA   NA
 2671751 2671752 CA2559_00485 CA2559_00490     TRUE 0.986 0.000 0.450 0.002 N NA
 2671752 2671753 CA2559_00490 CA2559_00495     FALSE 0.174 103.000 0.000 1.000   NA
 2671753 2671754 CA2559_00495 CA2559_00500     FALSE 0.086 148.000 0.000 1.000   NA
 2671755 2671756 CA2559_00505 CA2559_00510     FALSE 0.136 118.000 0.000 NA   NA
 2671756 2671757 CA2559_00510 CA2559_00515     FALSE 0.081 167.000 0.014 1.000   NA
 2671757 2671758 CA2559_00515 CA2559_00520     TRUE 0.828 -10.000 0.061 1.000 N NA
 2671758 2671759 CA2559_00520 CA2559_00525     TRUE 0.967 3.000 0.064 1.000 Y NA
 2671759 2671760 CA2559_00525 CA2559_00530     FALSE 0.012 656.000 0.000 NA   NA
 2671760 2671761 CA2559_00530 CA2559_00535     FALSE 0.032 211.000 0.000 NA   NA
 2671761 2671762 CA2559_00535 CA2559_00540     TRUE 0.906 35.000 0.235 NA   NA
 2671762 2671763 CA2559_00540 CA2559_00545     TRUE 0.979 -3.000 0.552 NA   NA
 2671766 2671767 CA2559_00560 CA2559_00565 purH   TRUE 0.658 41.000 0.059 1.000 N NA
 2671767 2671768 CA2559_00565 CA2559_00570     TRUE 0.863 69.000 0.689 1.000 N NA
 2671768 2671769 CA2559_00570 CA2559_00575     TRUE 0.952 -7.000 0.104 0.003   NA
 2671769 2671770 CA2559_00575 CA2559_00580     TRUE 0.959 -3.000 0.220 1.000   NA
 2671770 2671771 CA2559_00580 CA2559_00585     TRUE 0.939 0.000 0.161 1.000 N NA
 2671772 2671773 CA2559_00590 CA2559_00595     TRUE 0.741 27.000 0.049 NA   NA
 2671775 2671776 CA2559_00605 CA2559_00610     FALSE 0.061 166.000 0.000 NA   NA
 2671776 2671777 CA2559_00610 CA2559_00615     FALSE 0.040 195.000 0.000 NA   NA
 2671777 2671778 CA2559_00615 CA2559_00620     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2671778 2671779 CA2559_00620 CA2559_00625     FALSE 0.048 189.000 0.000 1.000   NA
 2671779 2671780 CA2559_00625 CA2559_00630     FALSE 0.518 33.000 0.000 NA   NA
 2671780 2671781 CA2559_00630 CA2559_00635     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2671782 2671783 CA2559_00640 CA2559_00645     TRUE 0.951 4.000 0.218 1.000 N NA
 2671783 2671784 CA2559_00645 CA2559_00650     TRUE 0.949 4.000 0.212 1.000 N NA
 2671786 2671787 CA2559_00660 CA2559_00665     TRUE 0.603 16.000 0.000 NA   NA
 2671788 2671789 CA2559_00670 CA2559_00675 groEL groES TRUE 0.947 115.000 0.774 0.012 Y NA
 2671789 2671790 CA2559_00675 CA2559_00680 groES   FALSE 0.087 149.000 0.023 1.000 N NA
 2671790 2671791 CA2559_00680 CA2559_00685     FALSE 0.526 69.000 0.069 1.000   NA
 2671791 2671792 CA2559_00685 CA2559_00690     TRUE 0.983 2.000 0.641 NA   NA
 2671792 2671793 CA2559_00690 CA2559_00695     TRUE 0.966 13.000 0.505 NA   NA
 2671793 2671794 CA2559_00695 CA2559_00700     TRUE 0.620 43.000 0.031 1.000   NA
 2671795 2671796 CA2559_00705 CA2559_00710     FALSE 0.233 71.000 0.000 NA   NA
 2671796 2671797 CA2559_00710 CA2559_00715     FALSE 0.165 97.000 0.000 NA   NA
 2671797 2671798 CA2559_00715 CA2559_00720     FALSE 0.219 90.000 0.028 1.000 N NA
 2671798 2671799 CA2559_00720 CA2559_00725     TRUE 0.690 123.000 0.468 NA   NA
 2671799 2671800 CA2559_00725 CA2559_00730     TRUE 0.778 82.000 0.422 NA   NA
 2671800 2671801 CA2559_00730 CA2559_00735     TRUE 0.953 49.000 0.955 NA   NA
 2671801 2671802 CA2559_00735 CA2559_00740     TRUE 0.985 6.000 0.864 NA   NA
 2671802 2671803 CA2559_00740 CA2559_00745     FALSE 0.442 70.000 0.050 NA   NA
 2671804 2671805 CA2559_00750 CA2559_00755     TRUE 0.686 68.000 0.019 1.000 Y NA
 2671805 2671806 CA2559_00755 CA2559_00760     TRUE 0.951 4.000 0.219 1.000 N NA
 2671808 2671809 CA2559_00770 CA2559_00775     TRUE 0.900 9.000 0.100 NA   NA
 2671809 2671810 CA2559_00775 CA2559_00780   folE TRUE 0.982 4.000 0.600 1.000   NA
 2671811 2671812 CA2559_00785 CA2559_00790   cysS TRUE 0.748 23.000 0.021 0.046 N NA
 2671812 2671813 CA2559_00790 CA2559_00795 cysS   TRUE 0.788 7.000 0.020 1.000   NA
 2671814 2671815 CA2559_00800 CA2559_00805     TRUE 0.862 44.000 0.198 NA   NA
 2671816 2671817 CA2559_00810 CA2559_00815     FALSE 0.157 104.000 0.000 NA   NA
 2671817 2671818 CA2559_00815 CA2559_00820   infC TRUE 0.588 129.000 0.080 1.000 Y NA
 2671818 2671819 CA2559_00820 CA2559_00825 infC   TRUE 0.956 64.000 0.652 1.000 Y NA
 2671819 2671820 CA2559_00825 CA2559_00830     TRUE 0.955 109.000 0.928 0.022 Y NA
 2671820 2671821 CA2559_00830 CA2559_00835     FALSE 0.121 124.000 0.000 NA   NA
 2671822 2671823 CA2559_00840 CA2559_00845     FALSE 0.442 134.000 0.179 NA   NA
 2671823 2671824 CA2559_00845 CA2559_00850     FALSE 0.078 169.000 0.031 1.000 N NA
 2671824 2671825 CA2559_00850 CA2559_00855     FALSE 0.228 85.000 0.011 1.000   NA
 2671825 2671826 CA2559_00855 CA2559_00860     TRUE 0.759 -13.000 0.020 1.000   NA
 2671826 2671827 CA2559_00860 CA2559_00865     TRUE 0.937 0.000 0.124 1.000   NA
 2671828 2671829 CA2559_00870 CA2559_00875     TRUE 0.987 19.000 0.256 0.001 Y NA
 2671831 2671832 CA2559_00885 CA2559_00890     TRUE 0.730 -10.000 0.011 1.000   NA
 2671832 2671833 CA2559_00890 CA2559_00895     TRUE 0.794 4.000 0.016 1.000   NA
 2671835 2671836 CA2559_00905 CA2559_t07677     TRUE 0.628 -78.000 0.000 NA   NA
 2671836 2671837 CA2559_t07677 CA2559_t07679     FALSE 0.484 39.000 0.000 NA   NA
 2671837 2671838 CA2559_t07679 CA2559_t07681     TRUE 0.684 9.000 0.000 NA   NA
 2671838 2671839 CA2559_t07681 CA2559_00910     FALSE 0.086 142.000 0.000 NA   NA
 2671839 2671840 CA2559_00910 CA2559_00915     TRUE 0.973 2.000 0.311 1.000   NA
 2671840 2671841 CA2559_00915 CA2559_00920     TRUE 0.954 1.000 0.214 1.000 N NA
 2671841 2671842 CA2559_00920 CA2559_00925     TRUE 0.944 3.000 0.150 NA   NA
 2671842 2671843 CA2559_00925 CA2559_00930     TRUE 0.860 10.000 0.068 NA   NA
 2671844 2671845 CA2559_00935 CA2559_00940     TRUE 0.659 2.000 0.000 1.000 N NA
 2671845 2671846 CA2559_00940 CA2559_00945     FALSE 0.012 304.000 0.000 1.000 N NA
 2671846 2671847 CA2559_00945 CA2559_00950     FALSE 0.043 246.000 0.027 1.000   NA
 2671847 2671848 CA2559_00950 CA2559_00955     TRUE 0.974 4.000 0.360 1.000   NA
 2671848 2671849 CA2559_00955 CA2559_00960     TRUE 0.982 -37.000 0.530 0.009   NA
 2671849 2671850 CA2559_00960 CA2559_00965     TRUE 0.941 -10.000 0.093 0.009   NA
 2671851 2671852 CA2559_00970 CA2559_00975     FALSE 0.192 82.000 0.000 NA   NA
 2671852 2671853 CA2559_00975 CA2559_00980     FALSE 0.168 94.000 0.003 NA   NA
 2671853 2671854 CA2559_00980 CA2559_00985     TRUE 0.733 10.000 0.014 1.000   NA
 2671855 2671856 CA2559_00990 CA2559_00995     TRUE 0.880 -7.000 0.076 NA   NA
 2671856 2671857 CA2559_00995 CA2559_01000     TRUE 0.935 0.000 0.152 1.000 N NA
 2671857 2671858 CA2559_01000 CA2559_01005   guaA TRUE 0.670 10.000 0.018 1.000 N NA
 2671861 2671862 CA2559_01020 CA2559_01025     FALSE 0.014 564.000 0.000 1.000   NA
 2671862 2671863 CA2559_01025 CA2559_01030     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2671863 2671864 CA2559_01030 CA2559_01035     FALSE 0.282 64.000 0.000 NA   NA
 2671867 2671868 CA2559_01050 CA2559_t07719     FALSE 0.551 24.000 0.000 NA   NA
 2671868 2671869 CA2559_t07719 CA2559_t07717     FALSE 0.314 61.000 0.000 NA   NA
 2671869 2671870 CA2559_t07717 CA2559_01055     FALSE 0.251 69.000 0.000 NA   NA
 2671872 2671873 CA2559_01065 CA2559_01070     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2671876 2671877 CA2559_01085 CA2559_01090     FALSE 0.491 93.000 0.116 NA   NA
 2671877 2671878 CA2559_01090 CA2559_01095     TRUE 0.669 82.000 0.163 0.096 N NA
 2671879 2671880 CA2559_01100 CA2559_01105     TRUE 0.771 3.000 0.013 NA   NA
 2671880 2671881 CA2559_01105 CA2559_01110     FALSE 0.086 142.000 0.000 NA   NA
 2671881 2671882 CA2559_01110 CA2559_01115     TRUE 0.953 5.000 0.192 1.000   NA
 2671882 2671883 CA2559_01115 CA2559_01120     TRUE 0.954 62.000 0.528 1.000 Y NA
 2671883 2671884 CA2559_01120 CA2559_01125     TRUE 0.912 30.000 0.181 0.096 N NA
 2671884 2671885 CA2559_01125 CA2559_01130     TRUE 0.997 2.000 1.000 0.096 Y NA
 2671885 2671886 CA2559_01130 CA2559_01135     TRUE 0.978 -7.000 0.162 1.000 Y NA
 2671886 2671887 CA2559_01135 CA2559_01140     FALSE 0.501 83.000 0.103 NA   NA
 2671887 2671888 CA2559_01140 CA2559_01145     TRUE 0.963 11.000 0.392 NA   NA
 2671888 2671889 CA2559_01145 CA2559_01150     TRUE 0.945 -16.000 0.227 NA   NA
 2671889 2671890 CA2559_01150 CA2559_01155     TRUE 0.984 9.000 0.870 NA   NA
 2671890 2671891 CA2559_01155 CA2559_01160     TRUE 0.606 140.000 0.447 NA   NA
 2671891 2671892 CA2559_01160 CA2559_01165     TRUE 0.954 19.000 0.429 NA   NA
 2671892 2671893 CA2559_01165 CA2559_01170     TRUE 0.710 139.000 0.345 0.003   NA
 2671893 2671894 CA2559_01170 CA2559_01175     TRUE 0.906 0.000 0.098 1.000 N NA
 2671896 2671897 CA2559_01185 CA2559_01190     FALSE 0.130 120.000 0.000 NA   NA
 2671897 2671898 CA2559_01190 CA2559_01195     FALSE 0.550 64.000 0.000 0.002   NA
 2671898 2671899 CA2559_01195 CA2559_01200     TRUE 0.935 33.000 0.357 NA   NA
 2671899 2671900 CA2559_01200 CA2559_01205     TRUE 0.853 -7.000 0.053 NA   NA
 2671900 2671901 CA2559_01205 CA2559_01210     TRUE 0.868 30.000 0.145 NA   NA
 2671901 2671902 CA2559_01210 CA2559_01215   ruvA TRUE 0.805 6.000 0.027 NA   NA
 2671902 2671903 CA2559_01215 CA2559_01220 ruvA   FALSE 0.308 71.000 0.033 1.000 N NA
 2671903 2671904 CA2559_01220 CA2559_01225     FALSE 0.160 100.000 0.000 NA   NA
 2671904 2671905 CA2559_01225 CA2559_01230     FALSE 0.174 92.000 0.000 NA   NA
 2671905 2671906 CA2559_01230 CA2559_01235     TRUE 0.946 0.000 0.154 NA   NA
 2671906 2671907 CA2559_01235 CA2559_01240     TRUE 0.932 3.000 0.115 1.000   NA
 2671907 2671908 CA2559_01240 CA2559_01245     FALSE 0.167 110.000 0.000 1.000   NA
 2671908 2671909 CA2559_01245 CA2559_01250     FALSE 0.215 80.000 0.000 1.000   NA
 2671911 2671912 CA2559_01260 CA2559_01265     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2671912 2671913 CA2559_01265 CA2559_01270     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2671915 2671916 CA2559_01280 CA2559_01285     TRUE 0.982 27.000 0.237 0.003 Y NA
 2671916 2671917 CA2559_01285 CA2559_01290     TRUE 0.940 35.000 0.441 NA   NA
 2671917 2671918 CA2559_01290 CA2559_01295     TRUE 0.916 25.000 0.225 NA   NA
 2671918 2671919 CA2559_01295 CA2559_01300     TRUE 0.942 -10.000 0.192 NA   NA
 2671919 2671920 CA2559_01300 CA2559_01305     TRUE 0.985 3.000 0.730 NA   NA
 2671920 2671921 CA2559_01305 CA2559_01310     TRUE 0.981 32.000 0.550 NA Y NA
 2671921 2671922 CA2559_01310 CA2559_01315     TRUE 0.949 58.000 0.679 0.019   NA
 2671923 2671924 CA2559_01320 CA2559_01325 infB   FALSE 0.227 72.000 0.000 NA   NA
 2671924 2671925 CA2559_01325 CA2559_01330     FALSE 0.031 218.000 0.000 NA   NA
 2671926 2671927 CA2559_01335 CA2559_01340     TRUE 0.873 54.000 0.342 1.000 N NA
 2671927 2671928 CA2559_01340 CA2559_01345     TRUE 0.981 9.000 0.759 NA   NA
 2671931 2671932 CA2559_01360 CA2559_01365     TRUE 0.618 53.000 0.000 0.025   NA
 2671932 2671933 CA2559_01365 CA2559_01370     TRUE 0.694 55.000 0.084 1.000   NA
 2671934 2671935 CA2559_01375 CA2559_01380     FALSE 0.496 120.000 0.162 NA   NA
 2671937 2671938 CA2559_01385 CA2559_01390     TRUE 0.986 -3.000 0.531 0.043   NA
 2671940 2671941 CA2559_01400 CA2559_01405     FALSE 0.229 71.000 0.002 NA   NA
 2671941 2671942 CA2559_01405 CA2559_01410     TRUE 0.919 81.000 0.837 0.004   NA
 2671942 2671943 CA2559_01410 CA2559_01415     FALSE 0.014 260.000 0.003 1.000 N NA
 2671943 2671944 CA2559_01415 CA2559_01420     TRUE 0.792 13.000 0.043 NA   NA
 2671944 2671945 CA2559_01420 CA2559_01425     TRUE 0.971 6.000 0.390 NA   NA
 2671946 2671947 CA2559_01430 CA2559_01435     TRUE 0.987 9.000 0.342 1.000 Y NA
 2671947 2671948 CA2559_01435 CA2559_01440     FALSE 0.288 79.000 0.025 NA   NA
 2671948 2671949 CA2559_01440 CA2559_01445     TRUE 0.816 37.000 0.114 NA   NA
 2671950 2671951 CA2559_01450 CA2559_01455     FALSE 0.536 28.000 0.000 NA   NA
 2671951 2671952 CA2559_01455 CA2559_01460     FALSE 0.019 290.000 0.000 NA   NA
 2671952 2671953 CA2559_01460 CA2559_01465     FALSE 0.165 97.000 0.000 NA   NA
 2671953 2671954 CA2559_01465 CA2559_01470     FALSE 0.185 86.000 0.000 NA   NA
 2671954 2671955 CA2559_01470 CA2559_01475     TRUE 0.996 0.000 0.600 0.017 Y NA
 2671956 2671957 CA2559_01480 CA2559_01485     FALSE 0.083 179.000 0.003 0.055 N NA
 2671957 2671958 CA2559_01485 CA2559_01490     FALSE 0.151 76.000 0.000 1.000 N NA
 2671963 2671964 CA2559_01515 CA2559_01520     FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 2671964 2671965 CA2559_01520 CA2559_01525     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2671965 2671966 CA2559_01525 CA2559_01530     FALSE 0.018 295.000 0.000 NA   NA
 2671966 2671967 CA2559_01530 CA2559_01535     TRUE 0.827 0.000 0.027 NA   NA
 2671967 2671968 CA2559_01535 CA2559_01540     TRUE 0.918 -15.000 0.143 NA   NA
 2671968 2671969 CA2559_01540 CA2559_01545     TRUE 0.980 -39.000 0.242 1.000 Y NA
 2671969 2671970 CA2559_01545 CA2559_01550     TRUE 0.889 -16.000 0.100 NA   NA
 2671970 2671971 CA2559_01550 CA2559_01555     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 2671971 2671972 CA2559_01555 CA2559_01560     FALSE 0.466 45.000 0.000 1.000   NA
 2671972 2671973 CA2559_01560 CA2559_01565     FALSE 0.177 99.000 0.000 1.000   NA
 2671973 2671974 CA2559_01565 CA2559_01570     FALSE 0.068 135.000 0.000 1.000 N NA
 2671974 2671975 CA2559_01570 CA2559_01575     TRUE 0.620 6.000 0.000 1.000 N NA
 2671975 2671976 CA2559_01575 CA2559_01580     FALSE 0.280 68.000 0.000 1.000   NA
 2671976 2671977 CA2559_01580 CA2559_t07715     FALSE 0.379 54.000 0.000 NA   NA
 2671977 2671978 CA2559_t07715 CA2559_01585     FALSE 0.081 146.000 0.000 NA   NA
 2671978 2671979 CA2559_01585 CA2559_01590     FALSE 0.452 78.000 0.075 NA   NA
 2671979 2671980 CA2559_01590 CA2559_01595     TRUE 0.836 0.000 0.045 1.000 N NA
 2671980 2671981 CA2559_01595 CA2559_01600     TRUE 0.851 54.000 0.182 0.095 N NA
 2671981 2671982 CA2559_01600 CA2559_01605     FALSE 0.147 114.000 0.000 NA   NA
 2671984 2671985 CA2559_01615 CA2559_01620     FALSE 0.529 30.000 0.000 NA   NA
 2671987 2671988 CA2559_01630 CA2559_01635     TRUE 0.933 0.000 0.036 0.002   NA
 2671988 2671989 CA2559_01635 CA2559_01640     TRUE 0.941 3.000 0.136 1.000   NA
 2671990 2671991 CA2559_01645 CA2559_01650     TRUE 0.872 19.000 0.123 NA   NA
 2671992 2671993 CA2559_01655 CA2559_01660     FALSE 0.337 79.000 0.036 NA   NA
 2671994 2671995 CA2559_01665 CA2559_01670     TRUE 0.901 46.000 0.389 1.000 N NA
 2671996 2671997 CA2559_01675 CA2559_01680     TRUE 0.946 10.000 0.221 NA   NA
 2671998 2671999 CA2559_01685 CA2559_01690     TRUE 0.638 12.000 0.000 NA   NA
 2672000 2672001 CA2559_01695 CA2559_01700     TRUE 0.778 0.000 0.014 NA   NA
 2672001 2672002 CA2559_01700 CA2559_01705     FALSE 0.319 49.000 0.000 1.000 N NA
 2672002 2672003 CA2559_01705 CA2559_01710     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672004 2672005 CA2559_01715 CA2559_01720     FALSE 0.114 132.000 0.000 1.000   NA
 2672006 2672007 CA2559_01725 CA2559_01730     FALSE 0.491 58.000 0.027 1.000   NA
 2672008 2672009 CA2559_01735 CA2559_01740     FALSE 0.329 68.000 0.019 NA   NA
 2672013 2672014 CA2559_01760 CA2559_01765     FALSE 0.470 28.000 0.010 1.000 N NA
 2672014 2672015 CA2559_01765 CA2559_01770     FALSE 0.447 41.000 0.015 1.000 N NA
 2672018 2672019 CA2559_01785 CA2559_01790   trmB TRUE 0.789 2.000 0.028 1.000 N NA
 2672019 2672020 CA2559_01790 CA2559_01795 trmB   TRUE 0.908 6.000 0.018 0.001   NA
 2672022 2672023 CA2559_01805 CA2559_01810     FALSE 0.451 172.000 0.109 1.000 Y NA
 2672024 2672025 CA2559_01815 CA2559_01820     TRUE 0.934 40.000 0.451 NA   NA
 2672025 2672026 CA2559_01820 CA2559_01825     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 2672026 2672027 CA2559_01825 CA2559_01830     FALSE 0.154 108.000 0.000 NA   NA
 2672027 2672028 CA2559_01830 CA2559_01835     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672028 2672029 CA2559_01835 CA2559_01840     TRUE 0.947 4.000 0.167 NA   NA
 2672029 2672030 CA2559_01840 CA2559_01845     FALSE 0.174 92.000 0.000 NA   NA
 2672031 2672032 CA2559_01850 CA2559_01855     TRUE 0.677 -10.000 0.000 NA   NA
 2672032 2672033 CA2559_01855 CA2559_01860     FALSE 0.540 27.000 0.000 NA   NA
 2672033 2672034 CA2559_01860 CA2559_01865     FALSE 0.291 63.000 0.000 NA   NA
 2672034 2672035 CA2559_01865 CA2559_01870     FALSE 0.160 101.000 0.000 NA   NA
 2672035 2672036 CA2559_01870 CA2559_01875     FALSE 0.535 35.000 0.000 1.000   NA
 2672036 2672037 CA2559_01875 CA2559_01880     FALSE 0.018 293.000 0.000 NA   NA
 2672037 2672038 CA2559_01880 CA2559_01885     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 2672038 2672039 CA2559_01885 CA2559_01890     FALSE 0.024 245.000 0.000 NA   NA
 2672040 2672041 CA2559_01895 CA2559_01900     FALSE 0.118 134.000 0.008 1.000   NA
 2672042 2672043 CA2559_01905 CA2559_01910     TRUE 0.992 0.000 0.833 0.017   NA
 2672044 2672045 CA2559_01915 CA2559_01920     FALSE 0.158 103.000 0.000 NA   NA
 2672046 2672047 CA2559_01925 CA2559_01930 aspS   TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2672047 2672048 CA2559_01930 CA2559_01935     FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 2672048 2672049 CA2559_01935 CA2559_01940     TRUE 0.759 3.000 0.004 1.000   NA
 2672050 2672051 CA2559_01945 CA2559_01950     TRUE 0.980 13.000 1.000 NA   NA
 2672051 2672052 CA2559_01950 CA2559_01955     FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 2672053 2672054 CA2559_01960 CA2559_01965     TRUE 0.876 71.000 0.889 NA N NA
 2672054 2672055 CA2559_01965 CA2559_01970     TRUE 0.995 1.000 0.822 1.000 Y NA
 2672055 2672056 CA2559_01970 CA2559_01975     TRUE 0.967 -10.000 0.487 1.000 N NA
 2672057 2672058 CA2559_01980 CA2559_01985     TRUE 0.839 0.000 0.032 NA   NA
 2672059 2672060 CA2559_01990 CA2559_01995     FALSE 0.187 85.000 0.000 NA   NA
 2672061 2672062 CA2559_02000 CA2559_02005     TRUE 0.961 62.000 0.667 1.000 Y NA
 2672062 2672063 CA2559_02005 CA2559_02010     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 2672063 2672064 CA2559_02010 CA2559_02015     FALSE 0.161 99.000 0.000 NA   NA
 2672065 2672066 CA2559_02020 CA2559_02025     TRUE 0.699 7.000 0.000 NA   NA
 2672067 2672068 CA2559_02030 CA2559_02035     TRUE 0.638 12.000 0.000 NA   NA
 2672068 2672069 CA2559_02035 CA2559_02040     TRUE 0.989 26.000 0.898 1.000 Y NA
 2672069 2672070 CA2559_02040 CA2559_02045     TRUE 0.992 3.000 0.432 1.000 Y NA
 2672070 2672071 CA2559_02045 CA2559_02050     TRUE 0.994 -7.000 0.443 0.004 Y NA
 2672071 2672072 CA2559_02050 CA2559_02055     FALSE 0.297 72.000 0.020 NA   NA
 2672073 2672074 CA2559_02060 CA2559_02065     TRUE 0.876 6.000 0.062 NA   NA
 2672075 2672076 CA2559_02070 CA2559_02075     FALSE 0.014 375.000 0.000 NA   NA
 2672076 2672077 CA2559_02075 CA2559_02080     TRUE 0.781 160.000 0.250 0.001 Y NA
 2672077 2672078 CA2559_02080 CA2559_02085     FALSE 0.077 128.000 0.000 1.000 N NA
 2672079 2672080 CA2559_02090 CA2559_02095     FALSE 0.555 23.000 0.000 NA   NA
 2672082 2672083 CA2559_02105 CA2559_02110     FALSE 0.560 121.000 0.000 0.034 Y NA
 2672083 2672084 CA2559_02110 CA2559_02115     FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 2672084 2672085 CA2559_02115 CA2559_02120     FALSE 0.218 74.000 0.000 NA   NA
 2672085 2672086 CA2559_02120 CA2559_02125     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2672086 2672087 CA2559_02125 CA2559_02130     TRUE 0.757 5.000 0.014 NA   NA
 2672087 2672088 CA2559_02130 CA2559_02135     TRUE 0.805 0.000 0.020 NA   NA
 2672088 2672089 CA2559_02135 CA2559_02140     FALSE 0.314 61.000 0.000 NA   NA
 2672089 2672090 CA2559_02140 CA2559_02145     TRUE 0.717 5.000 0.000 NA   NA
 2672090 2672091 CA2559_02145 CA2559_02150     TRUE 0.935 1.000 0.125 NA   NA
 2672091 2672092 CA2559_02150 CA2559_02155     TRUE 0.950 0.000 0.167 NA   NA
 2672092 2672093 CA2559_02155 CA2559_02160     TRUE 0.981 1.000 0.541 NA   NA
 2672093 2672094 CA2559_02160 CA2559_02165     TRUE 0.756 126.000 0.764 NA   NA
 2672096 2672097 CA2559_02175 CA2559_02180     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2672097 2672098 CA2559_02180 CA2559_02185     FALSE 0.484 39.000 0.000 NA   NA
 2672099 2672100 CA2559_02190 CA2559_02195     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 2672100 2672101 CA2559_02195 CA2559_02200     TRUE 0.968 0.000 0.276 NA   NA
 2672101 2672102 CA2559_02200 CA2559_02205   nadD TRUE 0.846 0.000 0.050 1.000 N NA
 2672103 2672104 CA2559_02210 CA2559_02215     FALSE 0.038 198.000 0.000 NA   NA
 2672108 2672109 CA2559_02235 CA2559_02240 pheS   TRUE 0.810 13.000 0.051 NA   NA
 2672109 2672110 CA2559_02240 CA2559_02245     TRUE 0.732 0.000 0.002 NA   NA
 2672110 2672111 CA2559_02245 CA2559_02250     TRUE 0.748 56.000 0.000 1.000 Y NA
 2672111 2672112 CA2559_02250 CA2559_02255     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672112 2672113 CA2559_02255 CA2559_02260     FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 2672113 2672114 CA2559_02260 CA2559_02265     FALSE 0.116 131.000 0.000 1.000   NA
 2672114 2672115 CA2559_02265 CA2559_02270     TRUE 0.935 14.000 0.214 1.000   NA
 2672115 2672116 CA2559_02270 CA2559_02275     TRUE 0.981 -3.000 0.751 1.000 N NA
 2672116 2672117 CA2559_02275 CA2559_02280     FALSE 0.125 91.000 0.000 1.000 N NA
 2672117 2672118 CA2559_02280 CA2559_02285     TRUE 0.905 -3.000 0.082 1.000   NA
 2672118 2672119 CA2559_02285 CA2559_02290     TRUE 0.921 -7.000 0.129 NA   NA
 2672119 2672120 CA2559_02290 CA2559_02295     TRUE 0.827 18.000 0.077 NA   NA
 2672120 2672121 CA2559_02295 CA2559_02300     FALSE 0.436 83.000 0.000 0.001   NA
 2672122 2672123 CA2559_02305 CA2559_02310     TRUE 0.645 14.000 0.000 1.000   NA
 2672123 2672124 CA2559_02310 CA2559_02315     TRUE 0.863 37.000 0.152 1.000   NA
 2672125 2672126 CA2559_02320 CA2559_02325     TRUE 0.730 41.000 0.000 0.002   NA
 2672127 2672128 CA2559_02330 CA2559_02335     FALSE 0.282 110.000 0.042 NA   NA
 2672128 2672129 CA2559_02335 CA2559_02340     TRUE 0.975 10.000 0.599 NA   NA
 2672129 2672130 CA2559_02340 CA2559_02345     FALSE 0.057 168.000 0.016 1.000 N NA
 2672130 2672131 CA2559_02345 CA2559_02350     TRUE 0.935 35.000 0.039 0.007 Y NA
 2672131 2672132 CA2559_02350 CA2559_02355     TRUE 0.966 28.000 0.101 0.002 Y NA
 2672132 2672133 CA2559_02355 CA2559_02360     FALSE 0.346 124.000 0.116 1.000 N NA
 2672133 2672134 CA2559_02360 CA2559_02365     TRUE 0.810 -3.000 0.022 1.000   NA
 2672134 2672135 CA2559_02365 CA2559_02370     FALSE 0.479 43.000 0.000 1.000   NA
 2672135 2672136 CA2559_02370 CA2559_02375     TRUE 0.823 -16.000 0.000 0.042   NA
 2672137 2672138 CA2559_02380 CA2559_02385     FALSE 0.477 64.000 0.062 1.000 N NA
 2672138 2672139 CA2559_02385 CA2559_02390     FALSE 0.249 87.000 0.021 NA   NA
 2672139 2672140 CA2559_02390 CA2559_02395     FALSE 0.161 99.000 0.000 NA   NA
 2672140 2672141 CA2559_02395 CA2559_02400     FALSE 0.464 41.000 0.000 NA   NA
 2672141 2672142 CA2559_02400 CA2559_02405     FALSE 0.037 190.000 0.014 1.000 N NA
 2672142 2672143 CA2559_02405 CA2559_02410     TRUE 0.633 80.000 0.027 1.000 Y NA
 2672143 2672144 CA2559_02410 CA2559_02415     TRUE 0.773 9.000 0.036 1.000 N NA
 2672145 2672146 CA2559_02420 CA2559_02425     TRUE 0.882 22.000 0.148 NA   NA
 2672146 2672147 CA2559_02425 CA2559_02430     TRUE 0.724 4.000 0.003 NA   NA
 2672148 2672149 CA2559_02435 CA2559_02440     FALSE 0.205 85.000 0.000 1.000   NA
 2672149 2672150 CA2559_02440 CA2559_02445     TRUE 0.620 70.000 0.062 0.070   NA
 2672151 2672152 CA2559_02450 CA2559_02455     FALSE 0.123 120.000 0.016 1.000 N NA
 2672152 2672153 CA2559_02455 CA2559_02460     TRUE 0.774 53.000 0.156 1.000 N NA
 2672153 2672154 CA2559_02460 CA2559_02465     TRUE 0.943 0.000 0.141 1.000   NA
 2672154 2672155 CA2559_02465 CA2559_02470     TRUE 0.701 -28.000 0.012 1.000   NA
 2672156 2672157 CA2559_02475 CA2559_02480     TRUE 0.677 87.000 0.233 NA   NA
 2672157 2672158 CA2559_02480 CA2559_02485     FALSE 0.413 66.000 0.032 NA   NA
 2672158 2672159 CA2559_02485 CA2559_02490     TRUE 0.912 7.000 0.135 1.000 N NA
 2672159 2672160 CA2559_02490 CA2559_02495     FALSE 0.053 148.000 0.004 1.000 N NA
 2672160 2672161 CA2559_02495 CA2559_02500     FALSE 0.250 69.000 0.018 1.000 N NA
 2672161 2672162 CA2559_02500 CA2559_02505     TRUE 0.762 0.000 0.004 1.000   NA
 2672162 2672163 CA2559_02505 CA2559_02510     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2672163 2672164 CA2559_02510 CA2559_02515     FALSE 0.196 80.000 0.000 NA   NA
 2672166 2672167 CA2559_02525 CA2559_02530     TRUE 0.660 43.000 0.047 NA   NA
 2672168 2672169 CA2559_02535 CA2559_02540     FALSE 0.334 64.000 0.011 1.000   NA
 2672169 2672170 CA2559_02540 CA2559_02545     FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 2672171 2672172 CA2559_02550 CA2559_02555     FALSE 0.018 299.000 0.000 NA   NA
 2672172 2672173 CA2559_02555 CA2559_02560     TRUE 0.581 19.000 0.000 NA   NA
 2672174 2672175 CA2559_02565 CA2559_02570     FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 2672175 2672176 CA2559_02570 CA2559_02575     FALSE 0.034 205.000 0.000 NA   NA
 2672176 2672177 CA2559_02575 CA2559_02580     FALSE 0.105 131.000 0.000 NA   NA
 2672178 2672179 CA2559_02585 CA2559_02590     TRUE 0.581 19.000 0.000 NA   NA
 2672180 2672181 CA2559_02595 CA2559_02600     TRUE 0.892 -15.000 0.126 1.000 N NA
 2672181 2672182 CA2559_02600 CA2559_02605     FALSE 0.177 137.000 0.036 NA   NA
 2672182 2672183 CA2559_02605 CA2559_02610     TRUE 0.960 6.000 0.244 NA   NA
 2672183 2672184 CA2559_02610 CA2559_02615     TRUE 0.823 -3.000 0.046 1.000 N NA
 2672184 2672185 CA2559_02615 CA2559_02620     TRUE 0.618 14.000 0.000 NA   NA
 2672185 2672186 CA2559_02620 CA2559_02625     TRUE 0.662 -15.000 0.000 NA   NA
 2672188 2672189 CA2559_02635 CA2559_02640     TRUE 0.933 38.000 0.405 NA   NA
 2672190 2672191 CA2559_02645 CA2559_02650     FALSE 0.255 71.000 0.000 1.000   NA
 2672191 2672192 CA2559_02650 CA2559_02655     FALSE 0.183 87.000 0.000 NA   NA
 2672192 2672193 CA2559_02655 CA2559_02660     TRUE 0.896 54.000 0.395 NA   NA
 2672193 2672194 CA2559_02660 CA2559_02665     TRUE 0.672 105.000 0.259 1.000   NA
 2672194 2672195 CA2559_02665 CA2559_02670     TRUE 0.655 73.000 0.022 1.000 Y NA
 2672196 2672197 CA2559_02675 CA2559_02680     FALSE 0.011 308.000 0.000 1.000 N NA
 2672197 2672198 CA2559_02680 CA2559_02685     FALSE 0.202 103.000 0.013 1.000   NA
 2672199 2672200 CA2559_02690 CA2559_02695     FALSE 0.181 112.000 0.014 NA   NA
 2672200 2672201 CA2559_02695 CA2559_02700     FALSE 0.121 129.000 0.000 1.000   NA
 2672201 2672202 CA2559_02700 CA2559_02705     TRUE 0.984 21.000 0.905 0.012   NA
 2672202 2672203 CA2559_02705 CA2559_02710     TRUE 0.865 125.000 0.905 0.012   NA
 2672204 2672205 CA2559_02715 CA2559_02720     FALSE 0.171 97.000 0.006 NA   NA
 2672205 2672206 CA2559_02720 CA2559_02725     TRUE 0.984 49.000 0.667 0.020 Y NA
 2672206 2672207 CA2559_02725 CA2559_02730     FALSE 0.321 145.000 0.000 1.000 Y NA
 2672207 2672208 CA2559_02730 CA2559_02735     TRUE 0.940 3.000 0.009 1.000 Y NA
 2672208 2672209 CA2559_02735 CA2559_02740     FALSE 0.367 66.000 0.035 1.000 N NA
 2672209 2672210 CA2559_02740 CA2559_02745     TRUE 0.904 0.000 0.078 NA   NA
 2672211 2672212 CA2559_02750 CA2559_02755     FALSE 0.516 141.000 0.281 NA   NA
 2672212 2672213 CA2559_02755 CA2559_02760     TRUE 0.986 21.000 0.328 0.033 Y NA
 2672213 2672214 CA2559_02760 CA2559_02765     TRUE 0.981 3.000 0.571 NA   NA
 2672214 2672215 CA2559_02765 CA2559_02770     TRUE 0.585 86.000 0.154 NA   NA
 2672215 2672216 CA2559_02770 CA2559_02775     FALSE 0.084 144.000 0.000 NA   NA
 2672216 2672217 CA2559_02775 CA2559_t07713     TRUE 0.628 -125.000 0.000 NA   NA
 2672217 2672218 CA2559_t07713 CA2559_02780     FALSE 0.185 86.000 0.000 NA   NA
 2672218 2672219 CA2559_02780 CA2559_02785     TRUE 0.635 -3.000 0.011 NA N NA
 2672221 2672222 CA2559_02795 CA2559_02800     TRUE 0.843 -7.000 0.048 NA   NA
 2672222 2672223 CA2559_02800 CA2559_02805     TRUE 0.840 0.000 0.032 NA   NA
 2672225 2672226 CA2559_02815 CA2559_02820     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2672227 2672228 CA2559_02825 CA2559_02830     TRUE 0.962 0.000 0.000 0.018 Y NA
 2672229 2672230 CA2559_02835 CA2559_02840     TRUE 0.863 3.000 0.038 1.000   NA
 2672232 2672233 CA2559_02850 CA2559_02855     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2672233 2672234 CA2559_02855 CA2559_02860     FALSE 0.448 25.000 0.000 1.000 N NA
 2672235 2672236 CA2559_02865 CA2559_02870     FALSE 0.557 70.000 0.093 NA   NA
 2672236 2672237 CA2559_02870 CA2559_02875     TRUE 0.717 5.000 0.000 NA   NA
 2672237 2672238 CA2559_02875 CA2559_02880     FALSE 0.188 68.000 0.000 1.000 N NA
 2672238 2672239 CA2559_02880 CA2559_t07685     TRUE 0.603 16.000 0.000 NA   NA
 2672241 2672242 CA2559_02890 CA2559_02895     TRUE 0.976 4.000 0.411 1.000   NA
 2672242 2672243 CA2559_02895 CA2559_02900     TRUE 0.942 24.000 0.348 NA   NA
 2672243 2672244 CA2559_02900 CA2559_02905     TRUE 0.965 7.000 0.317 NA   NA
 2672244 2672245 CA2559_02905 CA2559_02910     TRUE 0.790 44.000 0.118 NA   NA
 2672245 2672246 CA2559_02910 CA2559_02915     TRUE 0.990 3.000 0.182 0.010 Y NA
 2672246 2672247 CA2559_02915 CA2559_02920     TRUE 0.630 16.000 0.000 1.000   NA
 2672247 2672248 CA2559_02920 CA2559_02925     TRUE 0.907 -3.000 0.083 1.000   NA
 2672248 2672249 CA2559_02925 CA2559_02930     TRUE 0.893 7.000 0.083 NA   NA
 2672249 2672250 CA2559_02930 CA2559_02935     TRUE 0.966 -3.000 0.286 NA   NA
 2672250 2672251 CA2559_02935 CA2559_02940     TRUE 0.739 -21.000 0.022 NA   NA
 2672251 2672252 CA2559_02940 CA2559_02945     TRUE 0.825 -7.000 0.033 1.000   NA
 2672252 2672253 CA2559_02945 CA2559_02950     FALSE 0.087 224.000 0.066 1.000   NA
 2672253 2672254 CA2559_02950 CA2559_02955     FALSE 0.416 142.000 0.032 1.000 Y NA
 2672254 2672255 CA2559_02955 CA2559_02960     TRUE 0.669 99.000 0.074 NA Y NA
 2672256 2672257 CA2559_02965 CA2559_02970     TRUE 0.926 -3.000 0.154 NA N NA
 2672260 2672261 CA2559_02985 CA2559_02990     TRUE 0.907 0.000 0.080 NA   NA
 2672261 2672262 CA2559_02990 CA2559_02995     FALSE 0.420 48.000 0.000 NA   NA
 2672262 2672263 CA2559_02995 CA2559_03000     TRUE 0.896 55.000 0.419 NA   NA
 2672265 2672266 CA2559_03010 CA2559_03015     TRUE 0.958 21.000 0.512 NA   NA
 2672266 2672267 CA2559_03015 CA2559_03020     FALSE 0.039 257.000 0.024 1.000   NA
 2672267 2672268 CA2559_03020 CA2559_03025     TRUE 0.838 30.000 0.115 NA   NA
 2672268 2672269 CA2559_03025 CA2559_03030     TRUE 0.830 -28.000 0.058 NA   NA
 2672269 2672270 CA2559_03030 CA2559_03035     FALSE 0.540 27.000 0.000 NA   NA
 2672270 2672271 CA2559_03035 CA2559_03040     FALSE 0.198 91.000 0.011 NA   NA
 2672271 2672272 CA2559_03040 CA2559_03045     TRUE 0.972 37.000 0.628 0.004   NA
 2672272 2672273 CA2559_03045 CA2559_03050     TRUE 0.857 84.000 0.402 0.004   NA
 2672273 2672274 CA2559_03050 CA2559_03055     TRUE 0.990 7.000 0.222 0.004 Y NA
 2672274 2672275 CA2559_03055 CA2559_03060     TRUE 0.994 22.000 0.864 0.004 Y NA
 2672275 2672276 CA2559_03060 CA2559_03065     TRUE 0.964 88.000 0.846 0.004 Y NA
 2672277 2672278 CA2559_03070 CA2559_03075     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672278 2672279 CA2559_03075 CA2559_03080     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2672279 2672280 CA2559_03080 CA2559_03085     FALSE 0.017 310.000 0.000 NA   NA
 2672282 2672283 CA2559_03095 CA2559_03100     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 2672283 2672284 CA2559_03100 CA2559_03105     TRUE 0.981 30.000 0.222 0.001 Y NA
 2672284 2672285 CA2559_03105 CA2559_03110     FALSE 0.145 78.000 0.000 1.000 N NA
 2672285 2672286 CA2559_03110 CA2559_03115     TRUE 0.784 0.000 0.015 NA   NA
 2672288 2672289 CA2559_03125 CA2559_03130     FALSE 0.104 114.000 0.000 1.000 N NA
 2672289 2672290 CA2559_03130 CA2559_03135     TRUE 0.955 28.000 0.559 NA   NA
 2672290 2672291 CA2559_03135 CA2559_03140     TRUE 0.594 108.000 0.206 NA   NA
 2672291 2672292 CA2559_03140 CA2559_03145     TRUE 0.957 6.000 0.265 1.000 N NA
 2672292 2672293 CA2559_03145 CA2559_03150     TRUE 0.932 11.000 0.032 1.000 Y NA
 2672294 2672295 CA2559_03155 CA2559_03160     TRUE 0.752 -10.000 0.016 1.000   NA
 2672295 2672296 CA2559_03160 CA2559_03165     FALSE 0.446 87.000 0.078 1.000   NA
 2672296 2672297 CA2559_03165 CA2559_03170     FALSE 0.539 55.000 0.051 1.000 N NA
 2672299 2672300 CA2559_03180 CA2559_03185     TRUE 0.743 28.000 0.069 1.000 N NA
 2672302 2672303 CA2559_03195 CA2559_03200     FALSE 0.412 65.000 0.032 NA   NA
 2672303 2672304 CA2559_03200 CA2559_03205     TRUE 0.803 -3.000 0.024 NA   NA
 2672305 2672306 CA2559_03210 CA2559_03215     FALSE 0.532 10.000 0.000 NA N NA
 2672309 2672310 CA2559_03230 CA2559_03235     TRUE 0.922 10.000 0.141 1.000   NA
 2672310 2672311 CA2559_03235 CA2559_03240     TRUE 0.938 57.000 0.538 0.052   NA
 2672312 2672313 CA2559_03245 CA2559_03250     FALSE 0.464 41.000 0.000 NA   NA
 2672314 2672315 CA2559_03255 CA2559_03260     FALSE 0.520 14.000 0.000 1.000 N NA
 2672318 2672319 CA2559_03275 CA2559_03280     TRUE 0.992 -28.000 0.789 1.000 Y NA
 2672319 2672320 CA2559_03280 CA2559_t07711     FALSE 0.107 130.000 0.000 NA   NA
 2672320 2672321 CA2559_t07711 CA2559_03285     FALSE 0.233 71.000 0.000 NA   NA
 2672322 2672323 CA2559_03290 CA2559_03295     TRUE 0.862 -3.000 0.067 1.000 N NA
 2672324 2672325 CA2559_03300 CA2559_03305     TRUE 0.603 16.000 0.000 NA   NA
 2672325 2672326 CA2559_03305 CA2559_03310     TRUE 0.908 23.000 0.200 NA   NA
 2672326 2672327 CA2559_03310 CA2559_03315     FALSE 0.415 44.000 0.014 1.000 N NA
 2672328 2672329 CA2559_03320 CA2559_03325     TRUE 0.624 17.000 0.000 1.000   NA
 2672329 2672330 CA2559_03325 CA2559_03330     TRUE 0.959 1.000 0.192 1.000   NA
 2672330 2672331 CA2559_03330 CA2559_03335     TRUE 0.976 -3.000 0.250 0.049   NA
 2672331 2672332 CA2559_03335 CA2559_03340     TRUE 0.855 -3.000 0.000 0.068   NA
 2672333 2672334 CA2559_03345 CA2559_03350     FALSE 0.020 222.000 0.000 1.000 N NA
 2672334 2672335 CA2559_03350 CA2559_03355     FALSE 0.378 40.000 0.000 1.000 N NA
 2672335 2672336 CA2559_03355 CA2559_03360     TRUE 0.866 3.000 0.045 NA   NA
 2672336 2672337 CA2559_03360 CA2559_03365   gltX TRUE 0.692 -7.000 0.000 NA   NA
 2672340 2672341 CA2559_03380 CA2559_03385     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672341 2672342 CA2559_03385 CA2559_03390     TRUE 0.677 -13.000 0.006 NA   NA
 2672343 2672344 CA2559_03395 CA2559_03400     TRUE 0.970 -16.000 0.500 NA   NA
 2672344 2672345 CA2559_03400 CA2559_03405     TRUE 0.960 10.000 0.312 NA   NA
 2672345 2672346 CA2559_03405 CA2559_03410     FALSE 0.026 238.000 0.006 NA   NA
 2672347 2672348 CA2559_03415 CA2559_t07687     FALSE 0.227 72.000 0.000 NA   NA
 2672349 2672350 CA2559_03420 CA2559_03425     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672350 2672351 CA2559_03425 CA2559_03430     FALSE 0.430 32.000 0.005 1.000 N NA
 2672352 2672353 CA2559_03435 CA2559_03440     TRUE 0.897 2.000 0.061 1.000   NA
 2672354 2672355 CA2559_03445 CA2559_03450     FALSE 0.412 49.000 0.000 NA   NA
 2672355 2672356 CA2559_03450 CA2559_03455     TRUE 0.601 4.000 0.000 NA N NA
 2672356 2672357 CA2559_03455 CA2559_03460     TRUE 0.965 10.000 0.380 NA   NA
 2672357 2672358 CA2559_03460 CA2559_03465     TRUE 0.935 4.000 0.138 NA   NA
 2672358 2672359 CA2559_03465 CA2559_03470     FALSE 0.197 96.000 0.014 NA   NA
 2672359 2672360 CA2559_03470 CA2559_03475   recA FALSE 0.055 171.000 0.000 NA   NA
 2672361 2672362 CA2559_03480 CA2559_03485     FALSE 0.160 101.000 0.004 NA   NA
 2672362 2672363 CA2559_03485 CA2559_03490     TRUE 0.935 16.000 0.235 NA   NA
 2672363 2672364 CA2559_03490 CA2559_03495     TRUE 0.978 9.000 0.625 1.000   NA
 2672367 2672368 CA2559_03510 CA2559_03515     FALSE 0.464 41.000 0.000 NA   NA
 2672369 2672370 CA2559_03520 CA2559_03525     TRUE 0.790 63.000 0.229 NA   NA
 2672371 2672372 CA2559_03530 CA2559_03535     TRUE 0.942 -3.000 0.155 NA   NA
 2672372 2672373 CA2559_03535 CA2559_03540     TRUE 0.569 45.000 0.027 NA   NA
 2672373 2672374 CA2559_03540 CA2559_03545     FALSE 0.359 84.000 0.043 1.000   NA
 2672374 2672375 CA2559_03545 CA2559_03550     FALSE 0.433 56.000 0.029 1.000 N NA
 2672375 2672376 CA2559_03550 CA2559_03555     FALSE 0.446 69.000 0.042 1.000   NA
 2672376 2672377 CA2559_03555 CA2559_03560     FALSE 0.166 111.000 0.000 1.000   NA
 2672378 2672379 CA2559_03565 CA2559_03570     FALSE 0.130 179.000 0.000 0.007   NA
 2672380 2672381 CA2559_03575 CA2559_03580     FALSE 0.206 77.000 0.000 NA   NA
 2672381 2672382 CA2559_03580 CA2559_03585     FALSE 0.529 46.000 0.017 1.000   NA
 2672382 2672383 CA2559_03585 CA2559_03590     TRUE 0.859 16.000 0.119 1.000 N NA
 2672383 2672384 CA2559_03590 CA2559_03595     TRUE 0.898 -19.000 0.108 1.000   NA
 2672386 2672387 CA2559_03605 CA2559_03610     TRUE 0.760 0.000 0.000 1.000   NA
 2672387 2672388 CA2559_03610 CA2559_03615     TRUE 0.870 -9.000 0.000 0.002   NA
 2672388 2672389 CA2559_03615 CA2559_03620     TRUE 0.572 13.000 0.010 1.000 N NA
 2672389 2672390 CA2559_03620 CA2559_03625     FALSE 0.185 97.000 0.011 NA   NA
 2672390 2672391 CA2559_03625 CA2559_03630     FALSE 0.190 85.000 0.005 NA   NA
 2672391 2672392 CA2559_03630 CA2559_03635     TRUE 0.938 8.000 0.023 1.000 Y NA
 2672392 2672393 CA2559_03635 CA2559_03640     TRUE 0.971 2.000 0.018 0.003 Y NA
 2672393 2672394 CA2559_03640 CA2559_03645     TRUE 0.990 0.000 0.178 0.003 Y NA
 2672395 2672396 CA2559_03650 CA2559_03655     FALSE 0.263 67.000 0.000 NA   NA
 2672396 2672397 CA2559_03655 CA2559_03660     FALSE 0.048 181.000 0.000 NA   NA
 2672397 2672398 CA2559_03660 CA2559_03665     TRUE 0.760 0.000 0.022 1.000 N NA
 2672398 2672399 CA2559_03665 CA2559_03670     TRUE 0.837 45.000 0.154 1.000   NA
 2672399 2672400 CA2559_03670 CA2559_03675     FALSE 0.283 86.000 0.028 NA   NA
 2672400 2672401 CA2559_03675 CA2559_03680     FALSE 0.392 76.000 0.048 NA   NA
 2672401 2672402 CA2559_03680 CA2559_03685     TRUE 0.935 5.000 0.167 1.000 N NA
 2672402 2672403 CA2559_03685 CA2559_03690     FALSE 0.494 37.000 0.000 NA   NA
 2672403 2672404 CA2559_03690 CA2559_03695     FALSE 0.190 83.000 0.000 NA   NA
 2672405 2672406 CA2559_03700 CA2559_03705     TRUE 0.789 7.000 0.020 1.000   NA
 2672406 2672407 CA2559_03705 CA2559_03710     TRUE 0.971 0.000 0.289 1.000   NA
 2672407 2672408 CA2559_03710 CA2559_03715     FALSE 0.157 198.000 0.117 NA   NA
 2672412 2672413 CA2559_03735 CA2559_03740     TRUE 0.817 15.000 0.055 1.000   NA
 2672413 2672414 CA2559_03740 CA2559_03745     TRUE 0.862 4.000 0.062 1.000 N NA
 2672414 2672415 CA2559_03745 CA2559_03750     TRUE 0.630 16.000 0.000 1.000   NA
 2672415 2672416 CA2559_03750 CA2559_03755     TRUE 0.843 -3.000 0.033 1.000   NA
 2672416 2672417 CA2559_03755 CA2559_03760   ksgA FALSE 0.414 65.000 0.047 1.000 N NA
 2672417 2672418 CA2559_03760 CA2559_03765 ksgA   TRUE 0.602 22.000 0.012 NA   NA
 2672418 2672419 CA2559_03765 CA2559_03770     TRUE 0.971 9.000 0.465 NA   NA
 2672419 2672420 CA2559_03770 CA2559_03775     FALSE 0.366 64.000 0.016 1.000   NA
 2672420 2672421 CA2559_03775 CA2559_03780     FALSE 0.106 137.000 0.000 1.000   NA
 2672421 2672422 CA2559_03780 CA2559_03785     FALSE 0.178 165.000 0.000 0.001   NA
 2672423 2672424 CA2559_03790 CA2559_03795     TRUE 0.887 7.000 0.079 NA   NA
 2672424 2672425 CA2559_03795 CA2559_03800     FALSE 0.147 114.000 0.000 NA   NA
 2672425 2672426 CA2559_03800 CA2559_03805     TRUE 0.658 139.000 0.574 NA   NA
 2672427 2672428 CA2559_03810 CA2559_03815     TRUE 0.965 2.000 0.229 1.000   NA
 2672428 2672429 CA2559_03815 CA2559_03820     TRUE 0.947 1.000 0.154 NA   NA
 2672429 2672430 CA2559_03820 CA2559_03825     TRUE 0.762 36.000 0.074 NA   NA
 2672430 2672431 CA2559_03825 CA2559_03830     TRUE 0.968 -3.000 0.296 1.000   NA
 2672431 2672432 CA2559_03830 CA2559_03835     TRUE 0.948 -7.000 0.209 NA   NA
 2672432 2672433 CA2559_03835 CA2559_03840     FALSE 0.229 177.000 0.140 NA   NA
 2672433 2672434 CA2559_03840 CA2559_03845     TRUE 0.857 14.000 0.087 NA   NA
 2672434 2672435 CA2559_03845 CA2559_03850     TRUE 0.855 -19.000 0.074 NA   NA
 2672435 2672436 CA2559_03850 CA2559_03855     TRUE 0.948 -7.000 0.235 1.000 N NA
 2672436 2672437 CA2559_03855 CA2559_03860     TRUE 0.935 -9.000 0.200 1.000 N NA
 2672437 2672438 CA2559_03860 CA2559_03865     TRUE 0.995 -3.000 0.619 0.024 Y NA
 2672438 2672439 CA2559_03865 CA2559_03870     TRUE 0.975 7.000 0.476 1.000   NA
 2672439 2672440 CA2559_03870 CA2559_03875     TRUE 0.979 0.000 0.471 1.000   NA
 2672440 2672441 CA2559_03875 CA2559_03880     TRUE 0.983 6.000 0.353 0.004   NA
 2672441 2672442 CA2559_03880 CA2559_03885     TRUE 0.943 -7.000 0.174 1.000   NA
 2672442 2672443 CA2559_03885 CA2559_03890     TRUE 0.774 -13.000 0.028 NA   NA
 2672443 2672444 CA2559_03890 CA2559_03895     FALSE 0.200 97.000 0.014 NA   NA
 2672444 2672445 CA2559_03895 CA2559_03900     TRUE 0.858 19.000 0.097 1.000   NA
 2672445 2672446 CA2559_03900 CA2559_03905     TRUE 0.955 -7.000 0.055 1.000 Y NA
 2672446 2672447 CA2559_03905 CA2559_03910     TRUE 0.892 43.000 0.062 1.000 Y NA
 2672447 2672448 CA2559_03910 CA2559_03915   hutH TRUE 0.795 36.000 0.116 1.000 N NA
 2672450 2672451 CA2559_03925 CA2559_03930     FALSE 0.128 89.000 0.000 1.000 N NA
 2672452 2672453 CA2559_03935 CA2559_03940     FALSE 0.464 41.000 0.000 NA   NA
 2672453 2672454 CA2559_03940 CA2559_03945     FALSE 0.547 25.000 0.000 NA   NA
 2672454 2672455 CA2559_03945 CA2559_03950     FALSE 0.144 115.000 0.000 NA   NA
 2672455 2672456 CA2559_03950 CA2559_03955     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672456 2672457 CA2559_03955 CA2559_03960     TRUE 0.701 -6.000 0.000 NA   NA
 2672457 2672458 CA2559_03960 CA2559_03965     FALSE 0.019 290.000 0.000 NA   NA
 2672458 2672459 CA2559_03965 CA2559_03970     FALSE 0.547 25.000 0.000 NA   NA
 2672460 2672461 CA2559_t07709 CA2559_03975     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 2672462 2672463 CA2559_03980 CA2559_03985     FALSE 0.312 85.000 0.031 1.000   NA
 2672463 2672464 CA2559_03985 CA2559_03990     TRUE 0.988 0.000 0.246 1.000 Y NA
 2672464 2672465 CA2559_03990 CA2559_03995     TRUE 0.820 13.000 0.056 NA   NA
 2672466 2672467 CA2559_04000 CA2559_04005     TRUE 0.786 11.000 0.051 1.000 N NA
 2672467 2672468 CA2559_04005 CA2559_04010     FALSE 0.512 61.000 0.045 NA   NA
 2672468 2672469 CA2559_04010 CA2559_t07707     FALSE 0.084 144.000 0.000 NA   NA
 2672470 2672471 CA2559_04015 CA2559_04020     TRUE 0.750 28.000 0.074 1.000 N NA
 2672471 2672472 CA2559_04020 CA2559_04025     TRUE 0.984 40.000 0.496 0.032 Y NA
 2672472 2672473 CA2559_04025 CA2559_04030     TRUE 0.678 3.000 0.009 1.000 N NA
 2672473 2672474 CA2559_04030 CA2559_04035     TRUE 0.948 -3.000 0.168 1.000   NA
 2672475 2672476 CA2559_04040 CA2559_04045     TRUE 0.726 60.000 0.128 1.000   NA
 2672476 2672477 CA2559_04045 CA2559_04050     FALSE 0.167 112.000 0.005 1.000   NA
 2672477 2672478 CA2559_04050 CA2559_04055     TRUE 0.924 49.000 0.626 1.000 N NA
 2672480 2672481 CA2559_04065 CA2559_04070     FALSE 0.068 155.000 0.000 NA   NA
 2672481 2672482 CA2559_04070 CA2559_04075     TRUE 0.915 115.000 0.748 1.000 Y NA
 2672482 2672483 CA2559_04075 CA2559_04080   rpsI FALSE 0.449 180.000 0.060 0.027 Y NA
 2672483 2672484 CA2559_04080 CA2559_04085 rpsI   TRUE 0.992 1.000 0.231 0.020 Y NA
 2672485 2672486 CA2559_04090 CA2559_04095     FALSE 0.270 66.000 0.000 NA   NA
 2672486 2672487 CA2559_04095 CA2559_04100     TRUE 0.973 3.000 0.333 NA   NA
 2672487 2672488 CA2559_04100 CA2559_04105     TRUE 0.645 -25.000 0.000 NA   NA
 2672488 2672489 CA2559_04105 CA2559_04110     FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 2672489 2672490 CA2559_04110 CA2559_04115     TRUE 0.638 12.000 0.000 NA   NA
 2672491 2672492 CA2559_04120 CA2559_04125     FALSE 0.433 19.000 0.003 NA N NA
 2672493 2672494 CA2559_04130 CA2559_04135     FALSE 0.131 76.000 0.000 NA N NA
 2672494 2672495 CA2559_04135 CA2559_04140     FALSE 0.176 101.000 0.000 1.000   NA
 2672495 2672496 CA2559_04140 CA2559_04145     FALSE 0.039 370.000 0.000 0.010   NA
 2672498 2672499 CA2559_04155 CA2559_04160     FALSE 0.242 70.000 0.000 NA   NA
 2672499 2672500 CA2559_04160 CA2559_04165     TRUE 0.887 63.000 0.588 NA   NA
 2672500 2672501 CA2559_04165 CA2559_04170     TRUE 0.954 36.000 0.667 NA   NA
 2672501 2672502 CA2559_04170 CA2559_04175     TRUE 0.943 30.000 0.417 NA   NA
 2672502 2672503 CA2559_04175 CA2559_04180     TRUE 0.964 -15.000 0.375 NA   NA
 2672503 2672504 CA2559_04180 CA2559_04185     FALSE 0.314 61.000 0.000 NA   NA
 2672504 2672505 CA2559_04185 CA2559_04190     TRUE 0.976 3.000 0.118 NA Y NA
 2672506 2672507 CA2559_04195 CA2559_04200     FALSE 0.528 97.000 0.134 1.000   NA
 2672507 2672508 CA2559_04200 CA2559_04205     TRUE 0.862 0.000 0.042 NA   NA
 2672508 2672509 CA2559_04205 CA2559_04210     TRUE 0.861 32.000 0.143 NA   NA
 2672509 2672510 CA2559_04210 CA2559_04215     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2672510 2672511 CA2559_04215 CA2559_04220     TRUE 0.754 15.000 0.034 NA   NA
 2672511 2672512 CA2559_04220 CA2559_04225     TRUE 0.882 -3.000 0.063 NA   NA
 2672515 2672516 CA2559_04235 CA2559_04240     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2672516 2672517 CA2559_04240 CA2559_04245     FALSE 0.041 192.000 0.000 NA   NA
 2672518 2672519 CA2559_04250 CA2559_04255     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2672519 2672520 CA2559_04255 CA2559_04260     TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000   NA
 2672521 2672522 CA2559_04265 CA2559_04270     FALSE 0.012 1461.000 0.000 NA   NA
 2672522 2672523 CA2559_04270 CA2559_04275     TRUE 0.984 4.000 0.750 NA   NA
 2672526 2672527 CA2559_04290 CA2559_04295     TRUE 0.628 13.000 0.000 NA   NA
 2672527 2672528 CA2559_04295 CA2559_04300     TRUE 0.876 2.000 0.000 0.040   NA
 2672528 2672529 CA2559_04300 CA2559_04305     FALSE 0.014 548.000 0.000 1.000   NA
 2672529 2672530 CA2559_04305 CA2559_04310     TRUE 0.942 56.000 0.505 0.015   NA
 2672530 2672531 CA2559_04310 CA2559_04315     TRUE 0.835 34.000 0.113 1.000   NA
 2672531 2672532 CA2559_04315 CA2559_04320     TRUE 0.824 -16.000 0.065 1.000 N NA
 2672532 2672533 CA2559_04320 CA2559_04325   ppnK TRUE 0.811 -31.000 0.043 1.000   NA
 2672533 2672534 CA2559_04325 CA2559_04330 ppnK   FALSE 0.434 130.000 0.055 0.001   NA
 2672534 2672535 CA2559_04330 CA2559_04335     TRUE 0.891 4.000 0.021 0.066   NA
 2672536 2672537 CA2559_04340 CA2559_04345     TRUE 0.930 2.000 0.050 0.050   NA
 2672537 2672538 CA2559_04345 CA2559_04350     TRUE 0.641 108.000 0.233 1.000   NA
 2672538 2672539 CA2559_04350 CA2559_04355     TRUE 0.934 24.000 0.282 1.000   NA
 2672539 2672540 CA2559_04355 CA2559_04360     TRUE 0.678 67.000 0.149 NA   NA
 2672540 2672541 CA2559_04360 CA2559_04365     FALSE 0.236 82.000 0.015 NA   NA
 2672541 2672542 CA2559_04365 CA2559_04370     TRUE 0.657 90.000 0.047 1.000 Y NA
 2672542 2672543 CA2559_04370 CA2559_04375     TRUE 0.962 21.000 0.069 0.002 Y NA
 2672543 2672544 CA2559_04375 CA2559_04380     FALSE 0.183 69.000 0.000 1.000 N NA
 2672545 2672546 CA2559_04385 CA2559_04390     FALSE 0.234 61.000 0.000 1.000 N NA
 2672549 2672550 CA2559_04405 CA2559_04410     FALSE 0.052 175.000 0.000 NA   NA
 2672550 2672551 CA2559_04410 CA2559_04415     TRUE 0.743 1.000 0.000 NA   NA
 2672551 2672552 CA2559_04415 CA2559_04420     TRUE 0.986 3.000 0.818 NA   NA
 2672552 2672553 CA2559_04420 CA2559_04425     TRUE 0.971 9.000 0.455 NA   NA
 2672553 2672554 CA2559_04425 CA2559_04430     TRUE 0.962 8.000 0.300 NA   NA
 2672554 2672555 CA2559_04430 CA2559_04435     FALSE 0.177 99.000 0.000 1.000   NA
 2672555 2672556 CA2559_04435 CA2559_04440     TRUE 0.660 41.000 0.037 1.000   NA
 2672556 2672557 CA2559_04440 CA2559_04445     FALSE 0.544 34.000 0.004 1.000   NA
 2672557 2672558 CA2559_04445 CA2559_04450     TRUE 0.848 11.000 0.067 NA   NA
 2672558 2672559 CA2559_04450 CA2559_04455     TRUE 0.588 27.000 0.013 NA   NA
 2672559 2672560 CA2559_04455 CA2559_04460     TRUE 0.877 117.000 0.482 1.000 Y NA
 2672560 2672561 CA2559_04460 CA2559_04465     TRUE 0.813 23.000 0.101 1.000 N NA
 2672561 2672562 CA2559_04465 CA2559_04470     TRUE 0.770 11.000 0.051 NA N NA
 2672562 2672563 CA2559_04470 CA2559_04475     TRUE 0.826 6.000 0.034 NA   NA
 2672563 2672564 CA2559_04475 CA2559_04480     TRUE 0.963 2.000 0.226 NA   NA
 2672564 2672565 CA2559_04480 CA2559_04485     TRUE 0.918 2.000 0.092 NA   NA
 2672565 2672566 CA2559_04485 CA2559_04490     TRUE 0.573 119.000 0.220 NA   NA
 2672567 2672568 CA2559_04495 CA2559_04500     TRUE 0.590 18.000 0.000 NA   NA
 2672568 2672569 CA2559_04500 CA2559_04505     TRUE 0.898 36.000 0.222 NA   NA
 2672569 2672570 CA2559_04505 CA2559_04510     FALSE 0.017 309.000 0.000 NA   NA
 2672572 2672573 CA2559_04520 CA2559_04525   leuS FALSE 0.144 120.000 0.000 1.000   NA
 2672573 2672574 CA2559_04525 CA2559_04530 leuS   FALSE 0.212 149.000 0.000 0.001   NA
 2672575 2672576 CA2559_04535 CA2559_04540     FALSE 0.110 132.000 0.009 NA   NA
 2672576 2672577 CA2559_04540 CA2559_04545     TRUE 0.948 17.000 0.327 NA   NA
 2672577 2672578 CA2559_04545 CA2559_04550     TRUE 0.707 42.000 0.082 1.000 N NA
 2672578 2672579 CA2559_04550 CA2559_04555     FALSE 0.228 111.000 0.026 NA   NA
 2672581 2672582 CA2559_04565 CA2559_04570   aat TRUE 0.775 1.000 0.008 1.000   NA
 2672582 2672583 CA2559_04570 CA2559_04575 aat   TRUE 0.959 -19.000 0.333 NA   NA
 2672584 2672585 CA2559_04580 CA2559_04585     FALSE 0.018 332.000 0.000 1.000   NA
 2672587 2672588 CA2559_04595 CA2559_04600     TRUE 0.974 4.000 0.489 1.000 N NA
 2672588 2672589 CA2559_04600 CA2559_04605     TRUE 0.979 10.000 0.087 0.001 Y NA
 2672592 2672593 CA2559_04620 CA2559_04625     TRUE 0.667 -13.000 0.000 NA   NA
 2672594 2672595 CA2559_04630 CA2559_04635   rpsP FALSE 0.046 184.000 0.000 NA   NA
 2672596 2672597 CA2559_04640 CA2559_04645     TRUE 0.989 15.000 0.342 0.019 Y NA
 2672597 2672598 CA2559_04645 CA2559_04650     FALSE 0.018 382.000 0.011 1.000   NA
 2672598 2672599 CA2559_04650 CA2559_04655     TRUE 0.664 60.000 0.090 1.000   NA
 2672599 2672600 CA2559_04655 CA2559_04660     FALSE 0.428 89.000 0.079 NA   NA
 2672600 2672601 CA2559_04660 CA2559_04665     FALSE 0.338 59.000 0.000 NA   NA
 2672603 2672604 CA2559_04675 CA2559_04680     FALSE 0.193 156.000 0.077 NA   NA
 2672605 2672606 CA2559_04685 CA2559_04690     FALSE 0.140 122.000 0.000 1.000   NA
 2672606 2672607 CA2559_04690 CA2559_04695     TRUE 0.995 7.000 0.470 0.001 Y NA
 2672607 2672608 CA2559_04695 CA2559_04700     TRUE 0.988 8.000 0.598 0.001   NA
 2672608 2672609 CA2559_04700 CA2559_04705     FALSE 0.137 123.000 0.000 1.000   NA
 2672610 2672611 CA2559_04710 CA2559_04715     FALSE 0.134 124.000 0.000 1.000   NA
 2672611 2672612 CA2559_04715 CA2559_04720     TRUE 0.618 18.000 0.000 1.000   NA
 2672612 2672613 CA2559_04720 CA2559_04725     FALSE 0.181 88.000 0.000 NA   NA
 2672615 2672616 CA2559_04735 CA2559_04740     TRUE 0.869 3.000 0.047 NA   NA
 2672617 2672618 CA2559_04745 CA2559_04750     TRUE 0.790 -7.000 0.026 NA   NA
 2672618 2672619 CA2559_04750 CA2559_04755     FALSE 0.093 144.000 0.000 1.000   NA
 2672620 2672621 CA2559_04760 CA2559_04765     FALSE 0.396 123.000 0.105 1.000   NA
 2672621 2672622 CA2559_04765 CA2559_04770     TRUE 0.726 27.000 0.043 NA   NA
 2672622 2672623 CA2559_04770 CA2559_04775     TRUE 0.945 5.000 0.169 NA   NA
 2672623 2672624 CA2559_04775 CA2559_04780     TRUE 0.965 0.000 0.240 NA   NA
 2672624 2672625 CA2559_04780 CA2559_04785     FALSE 0.388 53.000 0.000 NA   NA
 2672626 2672627 CA2559_04790 CA2559_04795     TRUE 0.638 15.000 0.000 1.000   NA
 2672628 2672629 CA2559_04800 CA2559_04805     TRUE 0.959 17.000 0.071 0.084 Y NA
 2672629 2672630 CA2559_04805 CA2559_04810     TRUE 0.571 119.000 0.250 1.000 N NA
 2672631 2672632 CA2559_04815 CA2559_04820     TRUE 0.569 37.000 0.017 NA   NA
 2672632 2672633 CA2559_04820 CA2559_04825     TRUE 0.819 49.000 0.023 NA Y NA
 2672633 2672634 CA2559_04825 CA2559_04830   surE FALSE 0.423 63.000 0.025 1.000   NA
 2672634 2672635 CA2559_04830 CA2559_04835 surE   TRUE 0.949 -7.000 0.085 0.001   NA
 2672636 2672637 CA2559_04840 CA2559_04845     TRUE 0.762 9.000 0.017 1.000   NA
 2672638 2672639 CA2559_04850 CA2559_04855     FALSE 0.158 103.000 0.000 NA   NA
 2672639 2672640 CA2559_04855 CA2559_04860     TRUE 0.835 36.000 0.126 NA   NA
 2672642 2672643 CA2559_04870 CA2559_04875     TRUE 0.875 1.000 0.049 NA   NA
 2672643 2672644 CA2559_04875 CA2559_04880     TRUE 0.851 33.000 0.134 NA   NA
 2672644 2672645 CA2559_04880 CA2559_04885     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2672645 2672646 CA2559_04885 CA2559_04890     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672646 2672647 CA2559_04890 CA2559_04895     FALSE 0.438 126.000 0.143 1.000   NA
 2672647 2672648 CA2559_04895 CA2559_04900     FALSE 0.181 97.000 0.000 1.000   NA
 2672649 2672650 CA2559_04905 CA2559_04910     TRUE 0.989 -7.000 0.727 0.015   NA
 2672651 2672652 CA2559_04915 CA2559_04920   ruvC FALSE 0.449 49.000 0.023 1.000 N NA
 2672653 2672654 CA2559_04925 CA2559_04930     TRUE 0.975 -7.000 0.525 NA   NA
 2672655 2672656 CA2559_04935 CA2559_04940     FALSE 0.181 88.000 0.000 NA   NA
 2672658 2672659 CA2559_04945 CA2559_04950     FALSE 0.035 241.000 0.020 NA   NA
 2672659 2672660 CA2559_04950 CA2559_04955     FALSE 0.165 97.000 0.000 NA   NA
 2672660 2672661 CA2559_04955 CA2559_04960     TRUE 0.755 -3.000 0.013 NA   NA
 2672661 2672662 CA2559_04960 CA2559_04965     FALSE 0.547 48.000 0.022 1.000   NA
 2672662 2672663 CA2559_04965 CA2559_04970     TRUE 0.601 -7.000 0.000 1.000 N NA
 2672663 2672664 CA2559_04970 CA2559_t07705     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 2672665 2672666 CA2559_04975 CA2559_04980     FALSE 0.244 131.000 0.000 0.010   NA
 2672666 2672667 CA2559_04980 CA2559_04985     FALSE 0.353 57.000 0.000 NA   NA
 2672668 2672669 CA2559_04990 CA2559_04995     FALSE 0.082 118.000 0.000 NA N NA
 2672669 2672670 CA2559_04995 CA2559_05000     FALSE 0.522 99.000 0.143 NA   NA
 2672670 2672671 CA2559_05000 CA2559_05005     TRUE 0.803 -3.000 0.024 NA   NA
 2672673 2672674 CA2559_05015 CA2559_05020     TRUE 0.573 126.000 0.320 1.000 N NA
 2672674 2672675 CA2559_05020 CA2559_05025     TRUE 0.913 4.000 0.093 NA   NA
 2672675 2672676 CA2559_05025 CA2559_05030     TRUE 0.670 49.000 0.062 NA   NA
 2672676 2672677 CA2559_05030 CA2559_05035     FALSE 0.357 60.000 0.011 NA   NA
 2672677 2672678 CA2559_05035 CA2559_05040     TRUE 0.567 91.000 0.144 1.000   NA
 2672678 2672679 CA2559_05040 CA2559_05045     FALSE 0.084 149.000 0.000 1.000   NA
 2672679 2672680 CA2559_05045 CA2559_05050     FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 2672680 2672681 CA2559_05050 CA2559_05055     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2672681 2672682 CA2559_05055 CA2559_05060     TRUE 0.953 25.000 0.500 NA   NA
 2672682 2672683 CA2559_05060 CA2559_05065     TRUE 0.894 73.000 1.000 NA   NA
 2672684 2672685 CA2559_05070 CA2559_05075     FALSE 0.476 144.000 0.235 1.000   NA
 2672685 2672686 CA2559_05075 CA2559_05080     TRUE 0.914 -13.000 0.125 1.000   NA
 2672686 2672687 CA2559_05080 CA2559_05085     TRUE 0.953 35.000 0.571 1.000   NA
 2672687 2672688 CA2559_05085 CA2559_05090     TRUE 0.913 55.000 0.071 0.014 Y NA
 2672688 2672689 CA2559_05090 CA2559_05095     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2672689 2672690 CA2559_05095 CA2559_05100     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2672690 2672691 CA2559_05100 CA2559_05105     TRUE 0.977 30.000 0.182 0.003 Y NA
 2672691 2672692 CA2559_05105 CA2559_05110   pfkA FALSE 0.536 200.000 0.273 1.000 Y NA
 2672692 2672693 CA2559_05110 CA2559_05115 pfkA   TRUE 0.716 94.000 0.026 0.005 Y NA
 2672693 2672694 CA2559_05115 CA2559_05120     TRUE 0.684 105.000 0.086 NA Y NA
 2672694 2672695 CA2559_05120 CA2559_05125     TRUE 0.947 0.000 0.022 NA Y NA
 2672695 2672696 CA2559_05125 CA2559_05130     FALSE 0.060 172.000 0.000 1.000   NA
 2672696 2672697 CA2559_05130 CA2559_05135     TRUE 0.732 33.000 0.052 NA   NA
 2672697 2672698 CA2559_05135 CA2559_05140     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 2672700 2672701 CA2559_05150 CA2559_05155     FALSE 0.130 120.000 0.000 NA   NA
 2672701 2672702 CA2559_05155 CA2559_t07693     FALSE 0.126 122.000 0.000 NA   NA
 2672702 2672703 CA2559_t07693 CA2559_t07695     FALSE 0.242 70.000 0.000 NA   NA
 2672703 2672704 CA2559_t07695 CA2559_05160     FALSE 0.014 386.000 0.000 NA   NA
 2672704 2672705 CA2559_05160 CA2559_05165     FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 2672705 2672706 CA2559_05165 CA2559_05170     FALSE 0.078 148.000 0.000 NA   NA
 2672708 2672709 CA2559_05180 CA2559_05185     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2672709 2672710 CA2559_05185 CA2559_05190     FALSE 0.105 131.000 0.000 NA   NA
 2672710 2672711 CA2559_05190 CA2559_05195     FALSE 0.036 201.000 0.000 NA   NA
 2672711 2672712 CA2559_05195 CA2559_05200     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 2672712 2672713 CA2559_05200 CA2559_05205     TRUE 0.628 13.000 0.000 NA   NA
 2672713 2672714 CA2559_05205 CA2559_05210     FALSE 0.233 71.000 0.000 NA   NA
 2672715 2672716 CA2559_05215 CA2559_05220     FALSE 0.028 226.000 0.000 NA   NA
 2672716 2672717 CA2559_05220 CA2559_05225     TRUE 0.611 15.000 0.000 NA   NA
 2672717 2672718 CA2559_05225 CA2559_05230     FALSE 0.014 273.000 0.000 1.000 N NA
 2672718 2672719 CA2559_05230 CA2559_05235     FALSE 0.019 226.000 0.000 1.000 N NA
 2672719 2672720 CA2559_05235 CA2559_05240     FALSE 0.162 80.000 0.010 1.000 N NA
 2672722 2672723 CA2559_05250 CA2559_05255     TRUE 0.966 4.000 0.250 1.000   NA
 2672723 2672724 CA2559_05255 CA2559_05260     TRUE 0.923 30.000 0.250 1.000   NA
 2672724 2672725 CA2559_05260 CA2559_05265     FALSE 0.408 63.000 0.041 1.000 N NA
 2672725 2672726 CA2559_05265 CA2559_05270     FALSE 0.282 55.000 0.000 1.000 N NA
 2672726 2672727 CA2559_05270 CA2559_05275     FALSE 0.115 98.000 0.000 1.000 N NA
 2672727 2672728 CA2559_05275 CA2559_05280     TRUE 0.600 53.000 0.021 0.045 N NA
 2672728 2672729 CA2559_05280 CA2559_05285     FALSE 0.376 132.000 0.000 1.000 Y NA
 2672729 2672730 CA2559_05285 CA2559_05290     FALSE 0.380 57.000 0.000 1.000   NA
 2672730 2672731 CA2559_05290 CA2559_05295     FALSE 0.433 49.000 0.009 NA   NA
 2672731 2672732 CA2559_05295 CA2559_05300     FALSE 0.378 83.000 0.080 NA N NA
 2672734 2672735 CA2559_05310 CA2559_05315     FALSE 0.130 155.000 0.036 NA   NA
 2672735 2672736 CA2559_05315 CA2559_05320     TRUE 0.985 -6.000 0.919 NA   NA
 2672736 2672737 CA2559_05320 CA2559_05325     FALSE 0.475 45.000 0.012 NA   NA
 2672737 2672738 CA2559_05325 CA2559_05330     FALSE 0.412 49.000 0.000 NA   NA
 2672738 2672739 CA2559_05330 CA2559_05335     TRUE 0.987 4.000 0.920 NA   NA
 2672739 2672740 CA2559_05335 CA2559_05340     TRUE 0.762 11.000 0.023 1.000   NA
 2672740 2672741 CA2559_05340 CA2559_05345     FALSE 0.344 124.000 0.115 1.000 N NA
 2672743 2672744 CA2559_05355 CA2559_05360     FALSE 0.541 34.000 0.000 1.000   NA
 2672744 2672745 CA2559_05360 CA2559_05365     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2672745 2672746 CA2559_05365 CA2559_05370     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 2672746 2672747 CA2559_05370 CA2559_05375     TRUE 0.749 4.000 0.000 1.000   NA
 2672748 2672749 CA2559_05380 CA2559_05385     TRUE 0.935 -16.000 0.189 NA   NA
 2672749 2672750 CA2559_05385 CA2559_05390     TRUE 0.839 -3.000 0.036 NA   NA
 2672750 2672751 CA2559_05390 CA2559_05395     TRUE 0.981 -31.000 0.124 0.001 Y NA
 2672751 2672752 CA2559_05395 CA2559_05400     FALSE 0.348 54.000 0.014 1.000 N NA
 2672752 2672753 CA2559_05400 CA2559_05405     FALSE 0.098 100.000 0.000 NA N NA
 2672753 2672754 CA2559_05405 CA2559_05410     TRUE 0.983 0.000 0.183 NA Y NA
 2672754 2672755 CA2559_05410 CA2559_05415     TRUE 0.928 10.000 0.157 NA   NA
 2672758 2672759 CA2559_05430 CA2559_05435     TRUE 0.949 0.000 0.163 NA   NA
 2672759 2672760 CA2559_05435 CA2559_05440     TRUE 0.972 7.000 0.432 NA   NA
 2672760 2672761 CA2559_05440 CA2559_05445     TRUE 0.966 0.000 0.250 NA   NA
 2672761 2672762 CA2559_05445 CA2559_05450     FALSE 0.063 147.000 0.010 1.000 N NA
 2672762 2672763 CA2559_05450 CA2559_05455     TRUE 0.973 4.000 0.101 1.000 Y NA
 2672763 2672764 CA2559_05455 CA2559_05460     FALSE 0.278 93.000 0.047 1.000 N NA
 2672764 2672765 CA2559_05460 CA2559_05465     TRUE 0.565 64.000 0.077 NA   NA
 2672765 2672766 CA2559_05465 CA2559_05470     TRUE 0.893 41.000 0.237 NA   NA
 2672767 2672768 CA2559_05475 CA2559_05480     TRUE 0.679 74.000 0.190 NA   NA
 2672768 2672769 CA2559_05480 CA2559_05485     FALSE 0.286 67.000 0.000 1.000   NA
 2672770 2672771 CA2559_05490 CA2559_05495     FALSE 0.151 110.000 0.000 NA   NA
 2672771 2672772 CA2559_05495 CA2559_05500     FALSE 0.033 220.000 0.000 1.000   NA
 2672772 2672773 CA2559_05500 CA2559_05505   lysS FALSE 0.203 86.000 0.000 1.000   NA
 2672773 2672774 CA2559_05505 CA2559_05510 lysS   FALSE 0.051 329.000 0.000 0.001   NA
 2672777 2672778 CA2559_05525 CA2559_05530     TRUE 0.692 -7.000 0.000 NA   NA
 2672779 2672780 CA2559_05535 CA2559_05540 rnhB   TRUE 0.573 66.000 0.012 0.001   NA
 2672781 2672782 CA2559_05545 CA2559_r07731     FALSE 0.014 395.000 0.000 NA   NA
 2672782 2672783 CA2559_r07731 CA2559_t07697     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 2672783 2672784 CA2559_t07697 CA2559_t07699     FALSE 0.126 122.000 0.000 NA   NA
 2672784 2672785 CA2559_t07699 CA2559_05550     FALSE 0.011 3015.000 0.000 NA   NA
 2672786 2672787 CA2559_05555 CA2559_05560     TRUE 0.621 9.000 0.009 1.000 N NA
 2672787 2672788 CA2559_05560 CA2559_05565     TRUE 0.987 7.000 0.141 0.001 Y NA
 2672789 2672790 CA2559_05570 CA2559_05575 adk   FALSE 0.350 84.000 0.040 1.000   NA
 2672790 2672791 CA2559_05575 CA2559_05580     FALSE 0.273 69.000 0.000 1.000   NA
 2672791 2672792 CA2559_05580 CA2559_05585     FALSE 0.420 48.000 0.000 NA   NA
 2672792 2672793 CA2559_05585 CA2559_05590     FALSE 0.400 51.000 0.000 NA   NA
 2672793 2672794 CA2559_05590 CA2559_05595     FALSE 0.108 141.000 0.010 1.000   NA
 2672798 2672799 CA2559_05615 CA2559_05620     TRUE 0.950 -10.000 0.229 NA   NA
 2672799 2672800 CA2559_05620 CA2559_05625     TRUE 0.611 71.000 0.129 NA   NA
 2672800 2672801 CA2559_05625 CA2559_05630     TRUE 0.979 -3.000 0.545 NA   NA
 2672801 2672802 CA2559_05630 CA2559_05635     TRUE 0.888 39.000 0.214 NA   NA
 2672805 2672806 CA2559_05650 CA2559_05655     FALSE 0.257 68.000 0.000 NA   NA
 2672806 2672807 CA2559_05655 CA2559_05660     TRUE 0.581 19.000 0.000 NA   NA
 2672807 2672808 CA2559_05660 CA2559_05665     TRUE 0.643 62.000 0.100 NA   NA
 2672808 2672809 CA2559_05665 CA2559_05670     TRUE 0.857 18.000 0.100 NA   NA
 2672809 2672810 CA2559_05670 CA2559_05675     FALSE 0.035 203.000 0.000 NA   NA
 2672810 2672811 CA2559_05675 CA2559_05680     TRUE 0.977 18.000 1.000 NA   NA
 2672811 2672812 CA2559_05680 CA2559_05685     TRUE 0.655 13.000 0.000 1.000   NA
 2672812 2672813 CA2559_05685 CA2559_05690     FALSE 0.154 108.000 0.000 NA   NA
 2672814 2672815 CA2559_05695 CA2559_05700     TRUE 0.990 29.000 0.620 0.004 Y NA
 2672815 2672816 CA2559_05700 CA2559_05705     TRUE 0.958 10.000 0.077 1.000 Y NA
 2672816 2672817 CA2559_05705 CA2559_05710     TRUE 0.952 12.000 0.075 1.000 Y NA
 2672817 2672818 CA2559_05710 CA2559_05715   rplC TRUE 0.800 170.000 0.467 0.025 Y NA
 2672818 2672819 CA2559_05715 CA2559_05720 rplC   TRUE 0.995 0.000 0.544 0.018 Y NA
 2672819 2672820 CA2559_05720 CA2559_05725     TRUE 0.985 10.000 0.307 1.000 Y NA
 2672820 2672821 CA2559_05725 CA2559_05730     TRUE 0.993 10.000 0.849 1.000 Y NA
 2672821 2672822 CA2559_05730 CA2559_05735   rpsS TRUE 0.997 4.000 0.820 0.025 Y NA
 2672822 2672823 CA2559_05735 CA2559_05740 rpsS   TRUE 0.996 7.000 0.769 0.025 Y NA
 2672823 2672824 CA2559_05740 CA2559_05745     TRUE 0.995 8.000 0.719 0.025 Y NA
 2672824 2672825 CA2559_05745 CA2559_05750     TRUE 0.993 21.000 0.828 0.025 Y NA
 2672825 2672826 CA2559_05750 CA2559_05755   rpmC TRUE 0.991 4.000 0.802 0.018   NA
 2672826 2672827 CA2559_05755 CA2559_05760 rpmC   TRUE 0.991 6.000 0.828 0.018   NA
 2672829 2672830 CA2559_05770 CA2559_05775     TRUE 0.994 13.000 0.810 0.025 Y NA
 2672830 2672831 CA2559_05775 CA2559_05780     TRUE 0.996 3.000 0.758 0.018 Y NA
 2672831 2672832 CA2559_05780 CA2559_05785     TRUE 0.993 3.000 0.309 0.018 Y NA
 2672832 2672833 CA2559_05785 CA2559_05790     TRUE 0.928 78.000 0.295 0.018 Y NA
 2672833 2672834 CA2559_05790 CA2559_05795     TRUE 0.992 30.000 0.808 0.018 Y NA
 2672834 2672835 CA2559_05795 CA2559_05800     TRUE 0.995 13.000 0.815 0.018 Y NA
 2672835 2672836 CA2559_05800 CA2559_05805     TRUE 0.996 4.000 0.814 0.025 Y NA
 2672836 2672837 CA2559_05805 CA2559_05810     TRUE 0.994 13.000 0.789 0.025 Y NA
 2672837 2672838 CA2559_05810 CA2559_05815     TRUE 0.994 11.000 0.653 0.003 Y NA
 2672838 2672839 CA2559_05815 CA2559_05820     TRUE 0.971 13.000 0.730 1.000 N NA
 2672839 2672840 CA2559_05820 CA2559_05825   infA TRUE 0.885 4.000 0.083 1.000 N NA
 2672840 2672841 CA2559_05825 CA2559_05830 infA   TRUE 0.878 10.000 0.078 1.000   NA
 2672841 2672842 CA2559_05830 CA2559_05835     TRUE 0.943 3.000 0.067 0.018   NA
 2672842 2672843 CA2559_05835 CA2559_05840     TRUE 0.995 10.000 0.810 0.018 Y NA
 2672843 2672844 CA2559_05840 CA2559_05845     TRUE 0.943 86.000 0.509 0.025 Y NA
 2672844 2672845 CA2559_05845 CA2559_05850     TRUE 0.630 135.000 0.549 1.000 N NA
 2672845 2672846 CA2559_05850 CA2559_05855     TRUE 0.899 66.000 0.873 1.000 N NA
 2672846 2672847 CA2559_05855 CA2559_05860     FALSE 0.107 138.000 0.023 1.000 N NA
 2672847 2672848 CA2559_05860 CA2559_05865     FALSE 0.179 90.000 0.018 1.000 N NA
 2672849 2672850 CA2559_05870 CA2559_05875     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 2672851 2672852 CA2559_05880 CA2559_05885     TRUE 0.653 85.000 0.150 0.039 N NA
 2672852 2672853 CA2559_05885 CA2559_05890     TRUE 0.916 11.000 0.150 NA   NA
 2672857 2672858 CA2559_05910 CA2559_05915     FALSE 0.029 190.000 0.005 1.000 N NA
 2672858 2672859 CA2559_05915 CA2559_05920     FALSE 0.230 92.000 0.032 1.000 N NA
 2672859 2672860 CA2559_05920 CA2559_05925     FALSE 0.067 136.000 0.000 1.000 N NA
 2672860 2672861 CA2559_05925 CA2559_05930     TRUE 0.937 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2672861 2672862 CA2559_05930 CA2559_05935     FALSE 0.061 141.000 0.000 1.000 N NA
 2672862 2672863 CA2559_05935 CA2559_05940     TRUE 0.777 116.000 0.081 0.002 Y NA
 2672863 2672864 CA2559_05940 CA2559_05945     FALSE 0.097 149.000 0.016 NA   NA
 2672865 2672866 CA2559_05950 CA2559_05955     TRUE 0.969 7.000 0.353 NA   NA
 2672871 2672872 CA2559_05980 CA2559_05985     TRUE 0.699 104.000 0.088 1.000 Y NA
 2672872 2672873 CA2559_05985 CA2559_05990   thrA TRUE 0.952 -40.000 0.080 1.000 Y NA
 2672873 2672874 CA2559_05990 CA2559_05995 thrA   FALSE 0.485 26.000 0.014 NA N NA
 2672874 2672875 CA2559_05995 CA2559_06000     TRUE 0.608 92.000 0.184 NA   NA
 2672875 2672876 CA2559_06000 CA2559_06005     TRUE 0.813 -7.000 0.033 NA   NA
 2672876 2672877 CA2559_06005 CA2559_06010     TRUE 0.946 10.000 0.046 1.000 Y NA
 2672877 2672878 CA2559_06010 CA2559_06015     TRUE 0.961 51.000 0.744 0.001 N NA
 2672878 2672879 CA2559_06015 CA2559_06020     FALSE 0.291 63.000 0.000 NA   NA
 2672879 2672880 CA2559_06020 CA2559_06025     TRUE 0.970 -3.000 0.333 NA   NA
 2672880 2672881 CA2559_06025 CA2559_06030     TRUE 0.697 108.000 0.333 NA   NA
 2672881 2672882 CA2559_06030 CA2559_06035     TRUE 0.983 -3.000 0.714 NA   NA
 2672883 2672884 CA2559_06040 CA2559_06045     TRUE 0.840 0.000 0.032 NA   NA
 2672884 2672885 CA2559_06045 CA2559_06050     FALSE 0.192 82.000 0.000 NA   NA
 2672886 2672887 CA2559_06055 CA2559_06060     TRUE 0.979 6.000 0.614 NA   NA
 2672887 2672888 CA2559_06060 CA2559_06065     FALSE 0.518 33.000 0.000 NA   NA
 2672888 2672889 CA2559_06065 CA2559_06070     FALSE 0.339 61.000 0.000 1.000   NA
 2672889 2672890 CA2559_06070 CA2559_06075     TRUE 0.627 109.000 0.222 1.000   NA
 2672890 2672891 CA2559_06075 CA2559_06080     TRUE 0.588 22.000 0.000 1.000   NA
 2672891 2672892 CA2559_06080 CA2559_06085     TRUE 0.716 31.000 0.000 0.092   NA
 2672895 2672896 CA2559_06100 CA2559_06105     FALSE 0.154 108.000 0.000 NA   NA
 2672896 2672897 CA2559_06105 CA2559_06110     TRUE 0.719 6.000 0.020 1.000 N NA
 2672897 2672898 CA2559_06110 CA2559_06115     TRUE 0.926 35.000 0.093 NA Y NA
 2672898 2672899 CA2559_06115 CA2559_06120     FALSE 0.511 11.000 0.000 NA N NA
 2672902 2672903 CA2559_06135 CA2559_06140     TRUE 0.574 20.000 0.000 NA   NA
 2672904 2672905 CA2559_06145 CA2559_06150     TRUE 0.692 42.000 0.019 0.006 N NA
 2672906 2672907 CA2559_06155 CA2559_06160   def TRUE 0.601 31.000 0.030 1.000 N NA
 2672907 2672908 CA2559_06160 CA2559_06165 def   TRUE 0.910 43.000 0.329 NA   NA
 2672909 2672910 CA2559_06170 CA2559_06175     TRUE 0.946 40.000 0.159 1.000 Y NA
 2672910 2672911 CA2559_06175 CA2559_06180     TRUE 0.975 46.000 0.588 1.000 Y NA
 2672911 2672912 CA2559_06180 CA2559_06185     TRUE 0.877 16.000 0.142 1.000 N NA
 2672912 2672913 CA2559_06185 CA2559_06190     FALSE 0.318 147.000 0.155 1.000 N NA
 2672913 2672914 CA2559_06190 CA2559_06195     FALSE 0.412 82.000 0.033 0.047 N NA
 2672916 2672917 CA2559_06205 CA2559_06210     TRUE 0.740 -13.000 0.019 NA   NA
 2672920 2672921 CA2559_06225 CA2559_06230     TRUE 0.820 3.000 0.021 1.000   NA
 2672921 2672922 CA2559_06230 CA2559_06235     TRUE 0.967 -19.000 0.452 NA   NA
 2672922 2672923 CA2559_06235 CA2559_06240     FALSE 0.155 125.000 0.018 NA   NA
 2672923 2672924 CA2559_06240 CA2559_06245     TRUE 0.824 0.000 0.040 1.000 N NA
 2672924 2672925 CA2559_06245 CA2559_06250     TRUE 0.604 61.000 0.097 1.000 N NA
 2672925 2672926 CA2559_06250 CA2559_06255     TRUE 0.972 -13.000 0.490 1.000   NA
 2672926 2672927 CA2559_06255 CA2559_06260     FALSE 0.376 80.000 0.044 1.000   NA
 2672927 2672928 CA2559_06260 CA2559_06265     TRUE 0.814 36.000 0.098 1.000   NA
 2672929 2672930 CA2559_06270 CA2559_06275     TRUE 0.664 60.000 0.121 1.000 N NA
 2672930 2672931 CA2559_06275 CA2559_06280     FALSE 0.314 61.000 0.000 NA   NA
 2672931 2672932 CA2559_06280 CA2559_06285     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 2672932 2672933 CA2559_06285 CA2559_06290     FALSE 0.124 123.000 0.000 NA   NA
 2672933 2672934 CA2559_06290 CA2559_06295     FALSE 0.016 317.000 0.000 NA   NA
 2672934 2672935 CA2559_06295 CA2559_06300     TRUE 0.972 13.000 0.667 NA   NA
 2672935 2672936 CA2559_06300 CA2559_06305     FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 2672936 2672937 CA2559_06305 CA2559_06310     FALSE 0.019 211.000 0.000 NA N NA
 2672937 2672938 CA2559_06310 CA2559_06315     TRUE 0.690 8.000 0.000 NA   NA
 2672938 2672939 CA2559_06315 CA2559_06320     FALSE 0.361 56.000 0.000 NA   NA
 2672939 2672940 CA2559_06320 CA2559_06325     FALSE 0.404 50.000 0.000 NA   NA
 2672940 2672941 CA2559_06325 CA2559_06330     FALSE 0.444 44.000 0.000 NA   NA
 2672941 2672942 CA2559_06330 CA2559_06335     FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 2672942 2672943 CA2559_06335 CA2559_06340     FALSE 0.020 276.000 0.000 NA   NA
 2672943 2672944 CA2559_06340 CA2559_06345     FALSE 0.063 161.000 0.000 NA   NA
 2672944 2672945 CA2559_06345 CA2559_06350     FALSE 0.037 199.000 0.000 NA   NA
 2672945 2672946 CA2559_06350 CA2559_06355     FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 2672946 2672947 CA2559_06355 CA2559_06360     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2672947 2672948 CA2559_06360 CA2559_06365     FALSE 0.027 230.000 0.000 NA   NA
 2672948 2672949 CA2559_06365 CA2559_06370     FALSE 0.066 157.000 0.000 NA   NA
 2672949 2672950 CA2559_06370 CA2559_06375     FALSE 0.042 190.000 0.000 NA   NA
 2672950 2672951 CA2559_06375 CA2559_06380     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 2672951 2672952 CA2559_06380 CA2559_06385     TRUE 0.916 58.000 0.077 0.002 Y NA
 2672952 2672953 CA2559_06385 CA2559_06390     TRUE 0.983 32.000 0.264 0.002 Y NA
 2672953 2672954 CA2559_06390 CA2559_06395     TRUE 0.986 3.000 0.216 1.000 Y NA
 2672954 2672955 CA2559_06395 CA2559_06400     TRUE 0.704 81.000 0.058 1.000 Y NA
 2672955 2672956 CA2559_06400 CA2559_06405     TRUE 0.990 28.000 0.520 0.001 Y NA
 2672956 2672957 CA2559_06405 CA2559_06410     FALSE 0.030 254.000 0.016 NA   NA
 2672957 2672958 CA2559_06410 CA2559_06415     TRUE 0.822 61.000 0.250 NA   NA
 2672959 2672960 CA2559_06420 CA2559_06425     TRUE 0.989 -3.000 0.677 0.006   NA
 2672960 2672961 CA2559_06425 CA2559_06430     FALSE 0.430 89.000 0.074 1.000   NA
 2672961 2672962 CA2559_06430 CA2559_06435     TRUE 0.938 2.000 0.133 NA   NA
 2672962 2672963 CA2559_06435 CA2559_06440     TRUE 0.929 4.000 0.000 NA Y NA
 2672964 2672965 CA2559_06445 CA2559_06450     FALSE 0.169 71.000 0.000 1.000 N NA
 2672965 2672966 CA2559_06450 CA2559_06455     TRUE 0.937 3.000 0.000 1.000 Y NA
 2672966 2672967 CA2559_06455 CA2559_06460     FALSE 0.104 114.000 0.000 1.000 N NA
 2672967 2672968 CA2559_06460 CA2559_06465     FALSE 0.178 90.000 0.000 NA   NA
 2672968 2672969 CA2559_06465 CA2559_06470     FALSE 0.174 92.000 0.000 NA   NA
 2672969 2672970 CA2559_06470 CA2559_06475     TRUE 0.970 13.000 0.714 1.000 N NA
 2672970 2672971 CA2559_06475 CA2559_06480     TRUE 0.984 -49.000 0.339 1.000 Y NA
 2672971 2672972 CA2559_06480 CA2559_06485     TRUE 0.796 -7.000 0.042 1.000 N NA
 2672974 2672975 CA2559_t07703 CA2559_06495     FALSE 0.464 41.000 0.000 NA   NA
 2672975 2672976 CA2559_06495 CA2559_06500     FALSE 0.316 96.000 0.040 1.000   NA
 2672976 2672977 CA2559_06500 CA2559_06505     TRUE 0.823 62.000 0.070 1.000 Y NA
 2672977 2672978 CA2559_06505 CA2559_06510     TRUE 0.947 19.000 0.338 NA   NA
 2672978 2672979 CA2559_06510 CA2559_06515   murC TRUE 0.863 -10.000 0.065 NA   NA
 2672979 2672980 CA2559_06515 CA2559_06520 murC murG TRUE 0.977 19.000 0.270 1.000 Y NA
 2672980 2672981 CA2559_06520 CA2559_06525 murG   TRUE 0.923 -3.000 0.142 1.000 N NA
 2672981 2672982 CA2559_06525 CA2559_06530     TRUE 0.801 20.000 0.085 1.000 N NA
 2672982 2672983 CA2559_06530 CA2559_06535     TRUE 0.996 1.000 0.647 0.005 Y NA
 2672983 2672984 CA2559_06535 CA2559_06540   murE TRUE 0.981 0.000 0.069 0.005 Y NA
 2672984 2672985 CA2559_06540 CA2559_06545 murE   TRUE 0.994 -3.000 0.717 1.000 Y NA
 2672985 2672986 CA2559_06545 CA2559_06550   mraW TRUE 0.964 9.000 0.329 NA   NA
 2672986 2672987 CA2559_06550 CA2559_06555 mraW   TRUE 0.654 24.000 0.022 NA   NA
 2672987 2672988 CA2559_06555 CA2559_06560     TRUE 0.976 -13.000 0.635 NA   NA
 2672989 2672990 CA2559_06565 CA2559_06570     FALSE 0.517 49.000 0.018 1.000   NA
 2672991 2672992 CA2559_06575 CA2559_06580     TRUE 0.977 0.000 0.429 NA   NA
 2672993 2672994 CA2559_06585 CA2559_06590     FALSE 0.293 92.000 0.050 1.000 N NA
 2672995 2672996 CA2559_06595 CA2559_06600     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 2672996 2672997 CA2559_06600 CA2559_06605     FALSE 0.174 99.000 0.009 NA   NA
 2672997 2672998 CA2559_06605 CA2559_06610     TRUE 0.848 78.000 0.704 NA   NA
 2672998 2672999 CA2559_06610 CA2559_06615     TRUE 0.980 -13.000 0.769 NA   NA
 2672999 2673000 CA2559_06615 CA2559_06620     FALSE 0.082 125.000 0.000 1.000 N NA
 2673001 2673002 CA2559_06625 CA2559_06630     FALSE 0.378 65.000 0.043 NA N NA
 2673002 2673003 CA2559_06630 CA2559_06635     TRUE 0.764 20.000 0.064 1.000 N NA
 2673003 2673004 CA2559_06635 CA2559_06640     FALSE 0.496 50.000 0.032 1.000 N NA
 2673004 2673005 CA2559_06640 CA2559_06645     TRUE 0.996 2.000 0.773 0.037 Y NA
 2673005 2673006 CA2559_06645 CA2559_06650     TRUE 0.941 12.000 0.227 NA   NA
 2673006 2673007 CA2559_06650 CA2559_06655     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 2673007 2673008 CA2559_06655 CA2559_06660     TRUE 0.844 77.000 0.667 NA   NA
 2673008 2673009 CA2559_06660 CA2559_06665     FALSE 0.539 173.000 0.667 NA   NA
 2673009 2673010 CA2559_06665 CA2559_06670     TRUE 0.961 -37.000 0.400 NA   NA
 2673012 2673013 CA2559_06680 CA2559_t07701     FALSE 0.263 67.000 0.000 NA   NA
 2673014 2673015 CA2559_06685 CA2559_06690     TRUE 0.953 7.000 0.210 1.000   NA
 2673016 2673017 CA2559_06695 CA2559_06700     TRUE 0.675 11.000 0.010 NA   NA
 2673017 2673018 CA2559_06700 CA2559_06705     FALSE 0.064 257.000 0.064 NA   NA
 2673018 2673019 CA2559_06705 CA2559_06710     FALSE 0.513 39.000 0.000 1.000   NA
 2673019 2673020 CA2559_06710 CA2559_06715     FALSE 0.275 65.000 0.000 NA   NA
 2673021 2673022 CA2559_06720 CA2559_06725     TRUE 0.789 16.000 0.050 NA   NA
 2673022 2673023 CA2559_06725 CA2559_06730     FALSE 0.451 115.000 0.121 NA   NA
 2673023 2673024 CA2559_06730 CA2559_06735     TRUE 0.930 -13.000 0.164 NA   NA
 2673024 2673025 CA2559_06735 CA2559_06740     TRUE 0.945 -7.000 0.192 NA   NA
 2673025 2673026 CA2559_06740 CA2559_06745     FALSE 0.489 52.000 0.020 NA   NA
 2673026 2673027 CA2559_06745 CA2559_06750     FALSE 0.322 90.000 0.035 1.000   NA
 2673027 2673028 CA2559_06750 CA2559_06755     TRUE 0.888 38.000 0.211 NA   NA
 2673028 2673029 CA2559_06755 CA2559_06760     FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 2673029 2673030 CA2559_06760 CA2559_06765     TRUE 0.648 11.000 0.000 NA   NA
 2673032 2673033 CA2559_06775 CA2559_06780     FALSE 0.081 146.000 0.000 NA   NA
 2673033 2673034 CA2559_06780 CA2559_06785     FALSE 0.118 125.000 0.000 NA   NA
 2673034 2673035 CA2559_06785 CA2559_06790     FALSE 0.187 85.000 0.000 NA   NA
 2673035 2673036 CA2559_06790 CA2559_06795     FALSE 0.130 125.000 0.000 1.000   NA
 2673037 2673038 CA2559_06800 CA2559_06805     FALSE 0.533 29.000 0.000 NA   NA
 2673042 2673043 CA2559_06825 CA2559_06830     FALSE 0.122 126.000 0.008 NA   NA
 2673043 2673044 CA2559_06830 CA2559_06835     FALSE 0.032 211.000 0.000 NA   NA
 2673044 2673045 CA2559_06835 CA2559_06840     FALSE 0.118 125.000 0.000 NA   NA
 2673045 2673046 CA2559_06840 CA2559_06845     FALSE 0.263 67.000 0.000 NA   NA
 2673049 2673050 CA2559_06860 CA2559_06865     FALSE 0.133 119.000 0.000 NA   NA
 2673051 2673052 CA2559_06870 CA2559_06875     FALSE 0.024 245.000 0.000 NA   NA
 2673052 2673053 CA2559_06875 CA2559_06880     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 2673053 2673054 CA2559_06880 CA2559_06885     TRUE 0.927 -7.000 0.143 NA   NA
 2673054 2673055 CA2559_06885 CA2559_06890     FALSE 0.043 189.000 0.000 NA   NA
 2673055 2673056 CA2559_06890 CA2559_06895     FALSE 0.054 172.000 0.000 NA   NA
 2673056 2673057 CA2559_06895 CA2559_06900     FALSE 0.039 196.000 0.000 NA   NA
 2673057 2673058 CA2559_06900 CA2559_06905     FALSE 0.075 149.000 0.000 NA   NA
 2673058 2673059 CA2559_06905 CA2559_06910     FALSE 0.014 374.000 0.000 NA   NA
 2673059 2673060 CA2559_06910 CA2559_06915     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673060 2673061 CA2559_06915 CA2559_06920     FALSE 0.022 257.000 0.000 NA   NA
 2673064 2673065 CA2559_06935 CA2559_06940     FALSE 0.101 133.000 0.000 NA   NA
 2673066 2673067 CA2559_06945 CA2559_06950     TRUE 0.844 10.000 0.000 0.014   NA
 2673067 2673068 CA2559_06950 CA2559_06955     TRUE 0.749 132.000 0.800 1.000   NA
 2673071 2673072 CA2559_06970 CA2559_06975     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2673072 2673073 CA2559_06975 CA2559_06980     TRUE 0.985 3.000 0.750 NA   NA
 2673073 2673074 CA2559_06980 CA2559_06985     FALSE 0.192 82.000 0.000 NA   NA
 2673074 2673075 CA2559_06985 CA2559_06990     TRUE 0.962 -3.000 0.250 NA   NA
 2673075 2673076 CA2559_06990 CA2559_06995     FALSE 0.138 117.000 0.000 NA   NA
 2673077 2673078 CA2559_07000 CA2559_07005     TRUE 0.677 -10.000 0.000 NA   NA
 2673080 2673081 CA2559_07015 CA2559_07020     TRUE 0.855 6.000 0.000 0.045   NA
 2673084 2673085 CA2559_07035 CA2559_07040     TRUE 0.822 61.000 0.250 NA   NA
 2673085 2673086 CA2559_07040 CA2559_07045     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 2673086 2673087 CA2559_07045 CA2559_07050     TRUE 0.638 12.000 0.000 NA   NA
 2673087 2673088 CA2559_07050 CA2559_07055     TRUE 0.850 0.000 0.035 NA   NA
 2673089 2673090 CA2559_07060 CA2559_07065     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 2673090 2673091 CA2559_07065 CA2559_07070     TRUE 0.817 1.000 0.022 NA   NA
 2673091 2673092 CA2559_07070 CA2559_07075     TRUE 0.681 50.000 0.063 1.000   NA
 2673092 2673093 CA2559_07075 CA2559_07080     TRUE 0.991 0.000 0.817 0.054   NA
 2673093 2673094 CA2559_07080 CA2559_07085     TRUE 0.886 -3.000 0.068 NA   NA
 2673095 2673096 CA2559_07090 CA2559_07095     TRUE 0.969 4.000 0.307 NA   NA
 2673096 2673097 CA2559_07095 CA2559_07100     TRUE 0.644 53.000 0.081 1.000 N NA
 2673097 2673098 CA2559_07100 CA2559_07105     TRUE 0.881 2.000 0.052 NA   NA
 2673098 2673099 CA2559_07105 CA2559_07110     TRUE 0.902 -7.000 0.098 NA   NA
 2673099 2673100 CA2559_07110 CA2559_07115     TRUE 0.985 3.000 0.827 1.000 N NA
 2673100 2673101 CA2559_07115 CA2559_07120     FALSE 0.130 92.000 0.006 1.000 N NA
 2673101 2673102 CA2559_07120 CA2559_07125     TRUE 0.737 71.000 0.014 0.060 Y NA
 2673102 2673103 CA2559_07125 CA2559_07130     TRUE 0.704 -7.000 0.007 NA   NA
 2673103 2673104 CA2559_07130 CA2559_07135     FALSE 0.174 92.000 0.000 NA   NA
 2673104 2673105 CA2559_07135 CA2559_07140     TRUE 0.823 -13.000 0.045 NA   NA
 2673105 2673106 CA2559_07140 CA2559_07145     TRUE 0.756 70.000 0.229 1.000   NA
 2673106 2673107 CA2559_07145 CA2559_07150     TRUE 0.906 19.000 0.063 0.001   NA
 2673107 2673108 CA2559_07150 CA2559_07155     FALSE 0.125 91.000 0.000 1.000 N NA
 2673108 2673109 CA2559_07155 CA2559_07160     FALSE 0.019 278.000 0.000 NA   NA
 2673110 2673111 CA2559_07165 CA2559_07170 dnaK   FALSE 0.468 142.000 0.000 0.010 Y NA
 2673111 2673112 CA2559_07170 CA2559_07175     TRUE 0.590 18.000 0.000 NA   NA
 2673112 2673113 CA2559_07175 CA2559_07180     TRUE 0.574 20.000 0.000 NA   NA
 2673113 2673114 CA2559_07180 CA2559_07185     FALSE 0.085 143.000 0.000 NA   NA
 2673114 2673115 CA2559_07185 CA2559_07190     FALSE 0.327 60.000 0.000 NA   NA
 2673117 2673118 CA2559_07200 CA2559_07205     TRUE 0.757 -7.000 0.018 NA   NA
 2673119 2673120 CA2559_07210 CA2559_07215     FALSE 0.102 139.000 0.000 1.000   NA
 2673121 2673122 CA2559_07220 CA2559_07225     FALSE 0.023 252.000 0.000 NA   NA
 2673122 2673123 CA2559_07225 CA2559_07230     TRUE 0.994 3.000 0.722 1.000 Y NA
 2673123 2673124 CA2559_07230 CA2559_07235     TRUE 0.744 103.000 0.122 1.000 Y NA
 2673124 2673125 CA2559_07235 CA2559_07240     TRUE 0.894 4.000 0.073 NA   NA
 2673125 2673126 CA2559_07240 CA2559_07245     TRUE 0.922 4.000 0.107 NA   NA
 2673126 2673127 CA2559_07245 CA2559_07250     TRUE 0.876 -10.000 0.071 1.000   NA
 2673127 2673128 CA2559_07250 CA2559_07255     TRUE 0.982 4.000 0.667 NA   NA
 2673128 2673129 CA2559_07255 CA2559_07260     TRUE 0.981 -3.000 0.667 NA   NA
 2673129 2673130 CA2559_07260 CA2559_07265     TRUE 0.946 0.000 0.154 NA   NA
 2673130 2673131 CA2559_07265 CA2559_07270     TRUE 0.628 13.000 0.000 NA   NA
 2673131 2673132 CA2559_07270 CA2559_07275     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673132 2673133 CA2559_07275 CA2559_07280     TRUE 0.824 21.000 0.083 NA   NA
 2673133 2673134 CA2559_07280 CA2559_07285     TRUE 0.743 1.000 0.000 NA   NA
 2673134 2673135 CA2559_07285 CA2559_07290     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 2673135 2673136 CA2559_07290 CA2559_07295     FALSE 0.345 58.000 0.000 NA   NA
 2673136 2673137 CA2559_07295 CA2559_07300     TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000   NA
 2673137 2673138 CA2559_07300 CA2559_07305     TRUE 0.959 46.000 0.274 1.000 Y NA
 2673138 2673139 CA2559_07305 CA2559_07310     TRUE 0.777 11.000 0.032 NA   NA
 2673139 2673140 CA2559_07310 CA2559_07315     TRUE 0.910 10.000 0.125 NA   NA
 2673140 2673141 CA2559_07315 CA2559_07320     TRUE 0.972 -3.000 0.375 NA   NA
 2673141 2673142 CA2559_07320 CA2559_07325     TRUE 0.958 6.000 0.235 NA   NA
 2673142 2673143 CA2559_07325 CA2559_07330     TRUE 0.684 9.000 0.000 NA   NA
 2673143 2673144 CA2559_07330 CA2559_07335     FALSE 0.095 137.000 0.000 NA   NA
 2673144 2673145 CA2559_07335 CA2559_07340     FALSE 0.041 573.000 0.080 NA   NA
 2673146 2673147 CA2559_07345 CA2559_07350     TRUE 0.667 -13.000 0.000 NA   NA
 2673147 2673148 CA2559_07350 CA2559_07355     TRUE 0.949 0.000 0.196 1.000 N NA
 2673148 2673149 CA2559_07355 CA2559_07360     FALSE 0.021 270.000 0.000 NA   NA
 2673152 2673153 CA2559_07375 CA2559_07380     TRUE 0.954 12.000 0.083 1.000 Y NA
 2673153 2673154 CA2559_07380 CA2559_07385     TRUE 0.959 47.000 0.289 1.000 Y NA
 2673154 2673155 CA2559_07385 CA2559_07390     TRUE 0.808 2.000 0.016 1.000   NA
 2673155 2673156 CA2559_07390 CA2559_07395     TRUE 0.814 10.000 0.035 1.000   NA
 2673156 2673157 CA2559_07395 CA2559_07400     FALSE 0.112 103.000 0.000 1.000 N NA
 2673157 2673158 CA2559_07400 CA2559_07405     FALSE 0.348 150.000 0.214 NA N NA
 2673159 2673160 CA2559_07410 CA2559_07415     TRUE 0.951 48.000 0.233 1.000 Y NA
 2673160 2673161 CA2559_07415 CA2559_07420     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673161 2673162 CA2559_07420 CA2559_07425     FALSE 0.518 33.000 0.000 NA   NA
 2673163 2673164 CA2559_07430 CA2559_07435     FALSE 0.327 183.000 0.182 0.042 N NA
 2673164 2673165 CA2559_07435 CA2559_07440     FALSE 0.072 213.000 0.000 0.059   NA
 2673165 2673166 CA2559_07440 CA2559_07445     TRUE 0.611 15.000 0.000 NA   NA
 2673166 2673167 CA2559_07445 CA2559_07450     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2673168 2673169 CA2559_07455 CA2559_07460     TRUE 0.983 0.000 0.625 1.000   NA
 2673169 2673170 CA2559_07460 CA2559_07465     FALSE 0.104 94.000 0.000 NA N NA
 2673170 2673171 CA2559_07465 CA2559_07470     TRUE 0.980 2.000 0.150 NA Y NA
 2673171 2673172 CA2559_07470 CA2559_07475     FALSE 0.155 116.000 0.000 1.000   NA
 2673173 2673174 CA2559_07480 CA2559_07485     FALSE 0.543 26.000 0.000 NA   NA
 2673174 2673175 CA2559_07485 CA2559_07490     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 2673175 2673176 CA2559_07490 CA2559_07495     TRUE 0.819 62.000 0.262 NA   NA
 2673177 2673178 CA2559_07500 CA2559_07505     FALSE 0.327 159.000 0.167 1.000   NA
 2673178 2673179 CA2559_07505 CA2559_07510     FALSE 0.444 44.000 0.000 NA   NA
 2673179 2673180 CA2559_07510 CA2559_07515     FALSE 0.030 219.000 0.000 NA   NA
 2673180 2673181 CA2559_07515 CA2559_07520     TRUE 0.734 16.000 0.031 NA   NA
 2673181 2673182 CA2559_07520 CA2559_07525     FALSE 0.513 34.000 0.000 NA   NA
 2673182 2673183 CA2559_07525 CA2559_07530     FALSE 0.043 187.000 0.003 NA   NA
 2673184 2673185 CA2559_07535 CA2559_07540     TRUE 0.951 25.000 0.435 1.000   NA
 2673185 2673186 CA2559_07540 CA2559_07545     FALSE 0.345 110.000 0.058 1.000   NA
 2673188 2673189 CA2559_07555 CA2559_07560     FALSE 0.015 345.000 0.000 NA   NA
 2673189 2673190 CA2559_07560 CA2559_07565     FALSE 0.074 231.000 0.000 0.003   NA
 2673190 2673191 CA2559_07565 CA2559_07570     FALSE 0.147 114.000 0.000 NA   NA
 2673193 2673194 CA2559_07580 CA2559_07585     TRUE 0.775 1.000 0.013 NA   NA
 2673194 2673195 CA2559_07585 CA2559_07590     FALSE 0.501 111.000 0.143 NA   NA
 2673195 2673196 CA2559_07590 CA2559_07595     FALSE 0.154 108.000 0.000 NA   NA
 2673197 2673198 CA2559_07600 CA2559_07605     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2673198 2673199 CA2559_07605 CA2559_07610     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 2673199 2673200 CA2559_07610 CA2559_07615     TRUE 0.876 60.000 0.409 NA   NA
 2673200 2673201 CA2559_07615 CA2559_07620     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 2673202 2673203 CA2559_07625 CA2559_07630     TRUE 0.967 7.000 0.320 1.000   NA
 2673205 2673206 CA2559_07640 CA2559_07645     FALSE 0.049 169.000 0.012 1.000 N NA
 2673206 2673207 CA2559_07645 CA2559_07650     TRUE 0.869 14.000 0.098 NA   NA
 2673207 2673208 CA2559_07650 CA2559_07655     TRUE 0.663 52.000 0.065 NA   NA
 2673210 2673211 CA2559_07665 CA2559_07670     TRUE 0.822 0.000 0.025 NA   NA
 2673213 2673214 CA2559_09178 CA2559_09183     TRUE 0.648 11.000 0.000 NA   NA
 2673215 2673216 CA2559_09188 CA2559_09193     TRUE 0.771 71.000 0.286 NA   NA
 2673216 2673217 CA2559_09193 CA2559_09198     FALSE 0.133 119.000 0.000 NA   NA
 2673218 2673219 CA2559_09203 CA2559_09208     FALSE 0.194 81.000 0.000 NA   NA
 2673219 2673220 CA2559_09208 CA2559_09213     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 2673220 2673221 CA2559_09213 CA2559_09218     FALSE 0.388 53.000 0.000 NA   NA
 2673221 2673222 CA2559_09218 CA2559_09223     FALSE 0.114 126.000 0.000 NA   NA
 2673223 2673224 CA2559_09228 CA2559_09233 glyA   FALSE 0.156 173.000 0.000 0.001   NA
 2673225 2673226 CA2559_09238 CA2559_09243     FALSE 0.064 159.000 0.000 NA   NA
 2673228 2673229 CA2559_09253 CA2559_09258     TRUE 0.648 59.000 0.084 NA   NA
 2673230 2673231 CA2559_09263 CA2559_09268     TRUE 0.648 11.000 0.000 NA   NA
 2673231 2673232 CA2559_09268 CA2559_09273     TRUE 0.933 -3.000 0.140 NA   NA
 2673232 2673233 CA2559_09273 CA2559_09278     FALSE 0.203 243.000 0.250 NA   NA
 2673233 2673234 CA2559_09278 CA2559_09283     TRUE 0.811 -25.000 0.047 NA   NA
 2673235 2673236 CA2559_09288 CA2559_09293     TRUE 0.901 0.000 0.074 NA   NA
 2673238 2673239 CA2559_09303 CA2559_09308     TRUE 0.864 60.000 0.434 1.000 N NA
 2673239 2673240 CA2559_09308 CA2559_09313     FALSE 0.097 196.000 0.054 NA   NA
 2673240 2673241 CA2559_09313 CA2559_09318     TRUE 0.962 21.000 0.600 NA   NA
 2673244 2673245 CA2559_09333 CA2559_09338     TRUE 0.988 2.000 0.875 NA   NA
 2673254 2673255 CA2559_09383 CA2559_09388     TRUE 0.914 -3.000 0.100 NA   NA
 2673255 2673256 CA2559_09388 CA2559_09393     TRUE 0.923 -3.000 0.106 1.000   NA
 2673258 2673259 CA2559_09403 CA2559_09408     TRUE 0.749 4.000 0.000 1.000   NA
 2673259 2673260 CA2559_09408 CA2559_09413     TRUE 0.834 5.000 0.034 NA   NA
 2673260 2673261 CA2559_09413 CA2559_09418     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673261 2673262 CA2559_09418 CA2559_09423     TRUE 0.715 8.000 0.000 1.000   NA
 2673262 2673263 CA2559_09423 CA2559_09428     TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000   NA
 2673263 2673264 CA2559_09428 CA2559_09433     FALSE 0.513 34.000 0.000 NA   NA
 2673264 2673265 CA2559_09433 CA2559_09438     TRUE 0.948 1.000 0.155 NA   NA
 2673265 2673266 CA2559_09438 CA2559_09443     FALSE 0.200 128.000 0.035 NA   NA
 2673266 2673267 CA2559_09443 CA2559_09448     TRUE 0.889 19.000 0.144 NA   NA
 2673267 2673268 CA2559_09448 CA2559_09453     TRUE 0.876 4.000 0.050 1.000   NA
 2673268 2673269 CA2559_09453 CA2559_09458     TRUE 0.849 -7.000 0.051 NA   NA
 2673269 2673270 CA2559_09458 CA2559_09463     FALSE 0.526 62.000 0.053 NA   NA
 2673270 2673271 CA2559_09463 CA2559_09468     FALSE 0.524 47.000 0.033 1.000 N NA
 2673271 2673272 CA2559_09468 CA2559_09473     FALSE 0.038 198.000 0.000 NA   NA
 2673272 2673273 CA2559_09473 CA2559_09478     FALSE 0.065 158.000 0.000 NA   NA
 2673273 2673274 CA2559_09478 CA2559_09483     TRUE 0.953 -3.000 0.200 NA   NA
 2673274 2673275 CA2559_09483 CA2559_09488     TRUE 0.870 -3.000 0.054 NA   NA
 2673275 2673276 CA2559_09488 CA2559_09493     FALSE 0.322 88.000 0.019 0.086 N NA
 2673276 2673277 CA2559_09493 CA2559_09498     TRUE 0.991 4.000 0.403 1.000 Y NA
 2673278 2673279 CA2559_09503 CA2559_09508 miaA   TRUE 0.936 3.000 0.121 1.000   NA
 2673279 2673280 CA2559_09508 CA2559_09513     FALSE 0.440 49.000 0.000 1.000   NA
 2673280 2673281 CA2559_09513 CA2559_09518     TRUE 0.603 16.000 0.000 NA   NA
 2673281 2673282 CA2559_09518 CA2559_09523     FALSE 0.510 58.000 0.034 NA   NA
 2673282 2673283 CA2559_09523 CA2559_09528     TRUE 0.736 25.000 0.045 NA   NA
 2673283 2673284 CA2559_09528 CA2559_09533     TRUE 0.700 49.000 0.070 1.000   NA
 2673286 2673287 CA2559_09543 CA2559_09548     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 2673287 2673288 CA2559_09548 CA2559_09553     TRUE 0.622 84.000 0.176 NA   NA
 2673288 2673289 CA2559_09553 CA2559_09558     TRUE 0.641 83.000 0.190 NA   NA
 2673289 2673290 CA2559_09558 CA2559_09563     TRUE 0.993 -7.000 0.738 NA Y NA
 2673292 2673293 CA2559_09573 CA2559_09578     TRUE 0.871 0.000 0.048 NA   NA
 2673293 2673294 CA2559_09578 CA2559_09583     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673296 2673297 CA2559_09593 CA2559_09598     TRUE 0.748 88.000 0.354 NA   NA
 2673297 2673298 CA2559_09598 CA2559_09603     FALSE 0.325 107.000 0.054 NA   NA
 2673299 2673300 CA2559_09608 CA2559_09613     TRUE 0.955 -3.000 0.212 NA   NA
 2673300 2673301 CA2559_09613 CA2559_09618   fmt TRUE 0.748 -3.000 0.023 1.000 N NA
 2673301 2673302 CA2559_09618 CA2559_09623 fmt   FALSE 0.048 185.000 0.020 1.000 N NA
 2673302 2673303 CA2559_09623 CA2559_09628     FALSE 0.155 126.000 0.035 NA N NA
 2673304 2673305 CA2559_09633 CA2559_09638     TRUE 0.705 53.000 0.088 NA   NA
 2673307 2673308 CA2559_09643 CA2559_09648     FALSE 0.364 59.000 0.000 1.000   NA
 2673308 2673309 CA2559_09648 CA2559_09653     TRUE 0.915 -3.000 0.094 1.000   NA
 2673309 2673310 CA2559_09653 CA2559_09658     TRUE 0.888 0.000 0.000 0.007   NA
 2673310 2673311 CA2559_09658 CA2559_09663     TRUE 0.755 -16.000 0.020 1.000   NA
 2673313 2673314 CA2559_09673 CA2559_09678     TRUE 0.953 1.000 0.027 1.000 Y NA
 2673315 2673316 CA2559_09683 CA2559_09688     TRUE 0.958 -7.000 0.250 NA   NA
 2673318 2673319 CA2559_09698 CA2559_09703     TRUE 0.961 -19.000 0.348 NA   NA
 2673319 2673320 CA2559_09703 CA2559_09708     TRUE 0.965 5.000 0.273 NA   NA
 2673320 2673321 CA2559_09708 CA2559_09713     TRUE 0.979 1.000 0.474 NA   NA
 2673321 2673322 CA2559_09713 CA2559_09718     FALSE 0.051 177.000 0.000 NA   NA
 2673322 2673323 CA2559_09718 CA2559_09723     TRUE 0.854 84.000 0.110 0.003 Y NA
 2673323 2673324 CA2559_09723 CA2559_09728     FALSE 0.184 80.000 0.015 1.000 N NA
 2673325 2673326 CA2559_09733 CA2559_09738     TRUE 0.754 0.000 0.021 1.000 N NA
 2673327 2673328 CA2559_09743 CA2559_r13674     FALSE 0.013 459.000 0.000 NA   NA
 2673328 2673329 CA2559_r13674 CA2559_t13662     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 2673329 2673330 CA2559_t13662 CA2559_t13664     FALSE 0.126 122.000 0.000 NA   NA
 2673330 2673331 CA2559_t13664 CA2559_09748     FALSE 0.011 3214.000 0.000 NA   NA
 2673332 2673333 CA2559_09753 CA2559_09758     TRUE 0.677 -10.000 0.000 NA   NA
 2673333 2673334 CA2559_09758 CA2559_09763     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673334 2673335 CA2559_09763 CA2559_09768     TRUE 0.938 0.000 0.136 NA   NA
 2673335 2673336 CA2559_09768 CA2559_09773     FALSE 0.246 60.000 0.000 1.000 N NA
 2673337 2673338 CA2559_09778 CA2559_09783   ribH TRUE 0.630 16.000 0.000 1.000   NA
 2673339 2673340 CA2559_09788 CA2559_09793     FALSE 0.047 183.000 0.000 NA   NA
 2673340 2673341 CA2559_09793 CA2559_09798     TRUE 0.983 1.000 0.648 NA   NA
 2673341 2673342 CA2559_09798 CA2559_09803     FALSE 0.513 39.000 0.000 1.000   NA
 2673342 2673343 CA2559_09803 CA2559_09808     TRUE 0.942 -16.000 0.202 1.000   NA
 2673344 2673345 CA2559_09813 CA2559_09818     FALSE 0.084 124.000 0.000 1.000 N NA
 2673346 2673347 CA2559_09823 CA2559_09828     FALSE 0.437 45.000 0.000 NA   NA
 2673347 2673348 CA2559_09828 CA2559_09833   fumC TRUE 0.942 2.000 0.143 NA   NA
 2673348 2673349 CA2559_09833 CA2559_09838 fumC   FALSE 0.065 272.000 0.000 0.001   NA
 2673349 2673350 CA2559_09838 CA2559_09843     FALSE 0.147 114.000 0.000 NA   NA
 2673352 2673353 CA2559_09853 CA2559_09858     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2673354 2673355 CA2559_09863 CA2559_09868     TRUE 0.836 4.000 0.033 NA   NA
 2673355 2673356 CA2559_09868 CA2559_09873     FALSE 0.488 30.000 0.013 1.000 N NA
 2673356 2673357 CA2559_09873 CA2559_09878     TRUE 0.635 -12.000 0.013 1.000 N NA
 2673357 2673358 CA2559_09878 CA2559_09883     FALSE 0.494 37.000 0.000 NA   NA
 2673362 2673363 CA2559_09903 CA2559_09908     TRUE 0.980 0.000 0.151 NA Y NA
 2673364 2673365 CA2559_09913 CA2559_09918     TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000   NA
 2673365 2673366 CA2559_09918 CA2559_09923     TRUE 0.668 -28.000 0.000 1.000   NA
 2673366 2673367 CA2559_09923 CA2559_09928     FALSE 0.217 229.000 0.000 0.003 Y NA
 2673367 2673368 CA2559_09928 CA2559_09933     FALSE 0.023 249.000 0.000 NA   NA
 2673368 2673369 CA2559_09933 CA2559_09938     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 2673369 2673370 CA2559_09938 CA2559_09943     FALSE 0.018 301.000 0.000 NA   NA
 2673370 2673371 CA2559_09943 CA2559_09948     FALSE 0.027 230.000 0.000 NA   NA
 2673371 2673372 CA2559_09948 CA2559_09953     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 2673372 2673373 CA2559_09953 CA2559_t13672     FALSE 0.018 297.000 0.000 NA   NA
 2673374 2673375 CA2559_09958 CA2559_09963     FALSE 0.177 115.000 0.015 NA   NA
 2673376 2673377 CA2559_09968 CA2559_09973   rpsF FALSE 0.456 42.000 0.000 NA   NA
 2673378 2673379 CA2559_09978 CA2559_09983     TRUE 0.993 4.000 0.319 0.017 Y NA
 2673379 2673380 CA2559_09983 CA2559_09988     TRUE 0.992 12.000 0.499 0.017 Y NA
 2673380 2673381 CA2559_09988 CA2559_09993     FALSE 0.196 94.000 0.012 NA   NA
 2673382 2673383 CA2559_09998 CA2559_10003     TRUE 0.897 11.000 0.118 NA   NA
 2673384 2673385 CA2559_10008 CA2559_10013     TRUE 0.609 19.000 0.000 1.000   NA
 2673386 2673387 CA2559_10018 CA2559_10023     FALSE 0.413 74.000 0.051 NA   NA
 2673388 2673389 CA2559_10028 CA2559_10033     FALSE 0.130 125.000 0.000 1.000   NA
 2673389 2673390 CA2559_10033 CA2559_10038     FALSE 0.067 167.000 0.000 1.000   NA
 2673393 2673394 CA2559_10053 CA2559_10058     TRUE 0.941 11.000 0.211 1.000   NA
 2673394 2673395 CA2559_10058 CA2559_10063     TRUE 0.991 3.000 0.947 0.027 N NA
 2673395 2673396 CA2559_10063 CA2559_10068     TRUE 0.965 19.000 0.727 1.000 N NA
 2673400 2673401 CA2559_10088 CA2559_10093     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 2673401 2673402 CA2559_10093 CA2559_10098     TRUE 0.655 13.000 0.000 1.000   NA
 2673402 2673403 CA2559_10098 CA2559_10103     TRUE 0.648 11.000 0.000 NA   NA
 2673407 2673408 CA2559_10123 CA2559_10128     TRUE 0.699 7.000 0.000 NA   NA
 2673411 2673412 CA2559_10143 CA2559_10148     TRUE 0.617 105.000 0.000 0.034 Y NA
 2673412 2673413 CA2559_10148 CA2559_10153     FALSE 0.056 184.000 0.010 1.000   NA
 2673413 2673414 CA2559_10153 CA2559_10158     TRUE 0.839 22.000 0.091 1.000   NA
 2673415 2673416 CA2559_10163 CA2559_10168     TRUE 0.800 70.000 0.438 NA N NA
 2673416 2673417 CA2559_10168 CA2559_10173     FALSE 0.182 64.000 0.000 NA N NA
 2673418 2673419 CA2559_10178 CA2559_10183     TRUE 0.746 13.000 0.048 NA N NA
 2673419 2673420 CA2559_10183 CA2559_10188     TRUE 0.707 19.000 0.048 NA N NA
 2673420 2673421 CA2559_10188 CA2559_10193     FALSE 0.290 156.000 0.167 1.000 N NA
 2673421 2673422 CA2559_10193 CA2559_10198     TRUE 0.789 29.000 0.094 1.000 N NA
 2673422 2673423 CA2559_10198 CA2559_10203     TRUE 0.838 68.000 0.125 NA Y NA
 2673423 2673424 CA2559_10203 CA2559_10208     TRUE 0.811 17.000 0.062 NA   NA
 2673424 2673425 CA2559_10208 CA2559_10213     TRUE 0.760 60.000 0.074 0.008   NA
 2673425 2673426 CA2559_10213 CA2559_10218     TRUE 0.985 -3.000 0.778 1.000   NA
 2673430 2673431 CA2559_10238 CA2559_10243     FALSE 0.067 156.000 0.000 NA   NA
 2673431 2673432 CA2559_10243 CA2559_10248     TRUE 0.740 11.000 0.022 NA   NA
 2673433 2673434 CA2559_10253 CA2559_10258     TRUE 0.811 22.000 0.078 NA   NA
 2673434 2673435 CA2559_10258 CA2559_10263     FALSE 0.370 62.000 0.017 NA   NA
 2673436 2673437 CA2559_10268 CA2559_10273     TRUE 0.643 39.000 0.029 1.000   NA
 2673437 2673438 CA2559_10273 CA2559_10278     TRUE 0.574 134.000 0.321 NA   NA
 2673438 2673439 CA2559_10278 CA2559_10283     FALSE 0.242 70.000 0.000 NA   NA
 2673439 2673440 CA2559_10283 CA2559_10288     TRUE 0.839 32.000 0.119 NA   NA
 2673440 2673441 CA2559_10288 CA2559_10293     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2673443 2673444 CA2559_10303 CA2559_10308     TRUE 0.732 6.000 0.000 1.000   NA
 2673445 2673446 CA2559_10313 CA2559_10318     TRUE 0.786 10.000 0.031 NA   NA
 2673446 2673447 CA2559_10318 CA2559_10323     TRUE 0.802 0.000 0.020 NA   NA
 2673447 2673448 CA2559_10323 CA2559_10328     TRUE 0.956 3.000 0.034 1.000 Y NA
 2673448 2673449 CA2559_10328 CA2559_10333     FALSE 0.055 150.000 0.009 1.000 N NA
 2673449 2673450 CA2559_10333 CA2559_10338     FALSE 0.028 240.000 0.000 1.000   NA
 2673450 2673451 CA2559_10338 CA2559_10343     FALSE 0.022 279.000 0.000 1.000   NA
 2673451 2673452 CA2559_10343 CA2559_10348     TRUE 0.808 0.000 0.021 NA   NA
 2673453 2673454 CA2559_10353 CA2559_10358     FALSE 0.364 108.000 0.071 NA   NA
 2673454 2673455 CA2559_10358 CA2559_10363     TRUE 0.898 0.000 0.071 NA   NA
 2673455 2673456 CA2559_10363 CA2559_10368     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673458 2673459 CA2559_10378 CA2559_10383 hisS   TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2673459 2673460 CA2559_10383 CA2559_10388     TRUE 0.699 7.000 0.000 NA   NA
 2673460 2673461 CA2559_10388 CA2559_10393     FALSE 0.015 365.000 0.000 NA   NA
 2673461 2673462 CA2559_10393 CA2559_10398     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673462 2673463 CA2559_10398 CA2559_10403     FALSE 0.456 42.000 0.000 NA   NA
 2673464 2673465 CA2559_10408 CA2559_10413     FALSE 0.081 150.000 0.000 1.000   NA
 2673465 2673466 CA2559_10413 CA2559_10418     FALSE 0.509 76.000 0.085 1.000   NA
 2673466 2673467 CA2559_10418 CA2559_10423     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2673467 2673468 CA2559_10423 CA2559_10428     FALSE 0.280 88.000 0.029 NA   NA
 2673468 2673469 CA2559_10428 CA2559_10433     TRUE 0.629 76.000 0.151 1.000   NA
 2673470 2673471 CA2559_10438 CA2559_10443     TRUE 0.899 -10.000 0.102 NA   NA
 2673472 2673473 CA2559_10448 CA2559_10453     FALSE 0.547 25.000 0.000 NA   NA
 2673473 2673474 CA2559_10453 CA2559_10458     FALSE 0.466 45.000 0.000 1.000   NA
 2673474 2673475 CA2559_10458 CA2559_10463     TRUE 0.874 0.000 0.044 1.000   NA
 2673477 2673478 CA2559_10473 CA2559_10478     FALSE 0.440 69.000 0.000 0.056   NA
 2673478 2673479 CA2559_10478 CA2559_10483     TRUE 0.864 47.000 0.000 0.040 Y NA
 2673479 2673480 CA2559_10483 CA2559_10488     TRUE 0.779 62.000 0.250 NA N NA
 2673480 2673481 CA2559_10488 CA2559_10493     FALSE 0.124 79.000 0.000 NA N NA
 2673482 2673483 CA2559_10498 CA2559_10503     FALSE 0.093 109.000 0.000 NA N NA
 2673483 2673484 CA2559_10503 CA2559_10508     TRUE 0.930 34.000 0.333 NA   NA
 2673484 2673485 CA2559_10508 CA2559_10513     FALSE 0.049 187.000 0.000 1.000   NA
 2673485 2673486 CA2559_10513 CA2559_10518     FALSE 0.121 94.000 0.000 1.000 N NA
 2673486 2673487 CA2559_10518 CA2559_10523     FALSE 0.500 36.000 0.000 NA   NA
 2673487 2673488 CA2559_10523 CA2559_10528     TRUE 0.977 0.000 0.444 NA   NA
 2673491 2673492 CA2559_10543 CA2559_10548     FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 2673493 2673494 CA2559_10553 CA2559_10558     FALSE 0.263 68.000 0.006 NA   NA
 2673496 2673497 CA2559_10568 CA2559_10573     FALSE 0.080 147.000 0.000 NA   NA
 2673497 2673498 CA2559_10573 CA2559_10578     TRUE 0.930 34.000 0.333 NA   NA
 2673499 2673500 CA2559_10583 CA2559_10588     FALSE 0.436 66.000 0.039 NA   NA
 2673500 2673501 CA2559_10588 CA2559_10593     TRUE 0.919 15.000 0.179 NA   NA
 2673502 2673503 CA2559_10598 CA2559_10603     TRUE 0.933 -40.000 0.208 NA   NA
 2673503 2673504 CA2559_10603 CA2559_10608     TRUE 0.867 -3.000 0.052 NA   NA
 2673504 2673505 CA2559_10608 CA2559_10613     FALSE 0.183 87.000 0.000 NA   NA
 2673506 2673507 CA2559_10618 CA2559_10623   truA FALSE 0.493 39.000 0.019 1.000 N NA
 2673509 2673510 CA2559_10633 CA2559_10638     FALSE 0.190 83.000 0.000 NA   NA
 2673511 2673512 CA2559_10643 CA2559_10648     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673512 2673513 CA2559_10648 CA2559_10653     TRUE 0.636 -36.000 0.000 NA   NA
 2673514 2673515 CA2559_10658 CA2559_10663     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673516 2673517 CA2559_10668 CA2559_10673     TRUE 0.796 33.000 0.079 1.000   NA
 2673519 2673520 CA2559_10683 CA2559_10688     FALSE 0.232 87.000 0.029 1.000 N NA
 2673522 2673523 CA2559_10698 CA2559_10703     TRUE 0.891 -3.000 0.065 1.000   NA
 2673523 2673524 CA2559_10703 CA2559_10708     TRUE 0.991 -3.000 0.786 0.009   NA
 2673527 2673528 CA2559_10723 CA2559_10728     TRUE 0.981 7.000 0.118 0.072 Y NA
 2673528 2673529 CA2559_10728 CA2559_10733     TRUE 0.978 0.000 0.125 1.000 Y NA
 2673529 2673530 CA2559_10733 CA2559_10738     TRUE 0.737 77.000 0.070 1.000 Y NA
 2673530 2673531 CA2559_10738 CA2559_10743     TRUE 0.953 40.000 0.190 1.000 Y NA
 2673531 2673532 CA2559_10743 CA2559_10748     FALSE 0.163 98.000 0.000 NA   NA
 2673532 2673533 CA2559_10748 CA2559_10753     TRUE 0.648 11.000 0.000 NA   NA
 2673535 2673536 CA2559_10763 CA2559_10768     TRUE 0.624 48.000 0.061 1.000 N NA
 2673537 2673538 CA2559_10773 CA2559_10778     FALSE 0.356 73.000 0.029 1.000   NA
 2673538 2673539 CA2559_10778 CA2559_10783     FALSE 0.032 224.000 0.000 1.000   NA
 2673539 2673540 CA2559_10783 CA2559_10788     FALSE 0.310 87.000 0.032 1.000   NA
 2673540 2673541 CA2559_10788 CA2559_10793     TRUE 0.871 51.000 0.250 NA   NA
 2673541 2673542 CA2559_10793 CA2559_10798     TRUE 0.677 -10.000 0.000 NA   NA
 2673542 2673543 CA2559_10798 CA2559_10803     TRUE 0.841 -16.000 0.058 NA   NA
 2673543 2673544 CA2559_10803 CA2559_10808     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 2673545 2673546 CA2559_10813 CA2559_10818     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673546 2673547 CA2559_10818 CA2559_10823     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673547 2673548 CA2559_10823 CA2559_10828     TRUE 0.596 17.000 0.000 NA   NA
 2673548 2673549 CA2559_10828 CA2559_10833     TRUE 0.618 14.000 0.000 NA   NA
 2673549 2673550 CA2559_10833 CA2559_10838     FALSE 0.144 115.000 0.000 NA   NA
 2673550 2673551 CA2559_10838 CA2559_10843     FALSE 0.046 184.000 0.000 NA   NA
 2673551 2673552 CA2559_10843 CA2559_10848     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2673552 2673553 CA2559_10848 CA2559_10853     TRUE 0.790 -12.000 0.051 NA N NA
 2673553 2673554 CA2559_10853 CA2559_10858     TRUE 0.792 -3.000 0.040 NA N NA
 2673554 2673555 CA2559_10858 CA2559_10863     TRUE 0.989 -7.000 0.190 0.003 Y NA
 2673555 2673556 CA2559_10863 CA2559_10868     FALSE 0.081 146.000 0.000 NA   NA
 2673556 2673557 CA2559_10868 CA2559_10873     FALSE 0.156 106.000 0.000 NA   NA
 2673559 2673560 CA2559_10883 CA2559_10888     FALSE 0.218 79.000 0.000 1.000   NA
 2673560 2673561 CA2559_10888 CA2559_10893     TRUE 0.976 4.000 0.405 1.000   NA
 2673561 2673562 CA2559_10893 CA2559_10898     TRUE 0.995 2.000 0.852 NA Y NA
 2673562 2673563 CA2559_10898 CA2559_10903     TRUE 0.991 -3.000 0.481 NA Y NA
 2673563 2673564 CA2559_10903 CA2559_10908     TRUE 0.991 -6.000 0.500 1.000 Y NA
 2673564 2673565 CA2559_10908 CA2559_10913     TRUE 0.950 -30.000 0.267 NA   NA
 2673565 2673566 CA2559_10913 CA2559_10918     TRUE 0.973 0.000 0.333 NA   NA
 2673566 2673567 CA2559_10918 CA2559_10923     FALSE 0.236 75.000 0.022 1.000 N NA
 2673567 2673568 CA2559_10923 CA2559_10928     TRUE 0.875 10.000 0.081 NA   NA
 2673568 2673569 CA2559_10928 CA2559_10933     TRUE 0.910 26.000 0.214 NA   NA
 2673572 2673573 CA2559_10948 CA2559_10953     TRUE 0.876 2.000 0.049 NA   NA
 2673573 2673574 CA2559_10953 CA2559_10958     FALSE 0.231 78.000 0.023 1.000 N NA
 2673574 2673575 CA2559_10958 CA2559_10963     TRUE 0.769 1.000 0.022 1.000 N NA
 2673575 2673576 CA2559_10963 CA2559_10968     TRUE 0.953 -7.000 0.053 NA Y NA
 2673578 2673579 CA2559_10978 CA2559_10983     TRUE 0.820 -16.000 0.047 NA   NA
 2673579 2673580 CA2559_10983 CA2559_10988     FALSE 0.058 169.000 0.000 NA   NA
 2673580 2673581 CA2559_10988 CA2559_10993     FALSE 0.180 89.000 0.000 NA   NA
 2673582 2673583 CA2559_10998 CA2559_11003     TRUE 0.867 16.000 0.104 NA   NA
 2673583 2673584 CA2559_11003 CA2559_11008     TRUE 0.650 17.000 0.010 1.000   NA
 2673584 2673585 CA2559_11008 CA2559_11013     FALSE 0.055 160.000 0.013 1.000 N NA
 2673585 2673586 CA2559_11013 CA2559_11018     FALSE 0.561 22.000 0.018 1.000 N NA
 2673587 2673588 CA2559_11023 CA2559_11028     FALSE 0.529 39.000 0.013 NA   NA
 2673591 2673592 CA2559_11043 CA2559_11048     TRUE 0.876 10.000 0.102 1.000 N NA
 2673592 2673593 CA2559_11048 CA2559_11053     FALSE 0.304 200.000 0.302 NA   NA
 2673593 2673594 CA2559_11053 CA2559_11058     TRUE 0.966 7.000 0.321 NA   NA
 2673594 2673595 CA2559_11058 CA2559_11063     TRUE 0.952 6.000 0.207 NA   NA
 2673595 2673596 CA2559_11063 CA2559_11068     TRUE 0.952 8.000 0.222 NA   NA
 2673596 2673597 CA2559_11068 CA2559_11073     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2673597 2673598 CA2559_11073 CA2559_11078     TRUE 0.925 3.000 0.105 NA   NA
 2673598 2673599 CA2559_11078 CA2559_11083     TRUE 0.923 57.000 0.827 NA N NA
 2673599 2673600 CA2559_11083 CA2559_11088     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673601 2673602 CA2559_11093 CA2559_11098     TRUE 0.960 3.000 0.265 NA N NA
 2673602 2673603 CA2559_11098 CA2559_11103     FALSE 0.464 41.000 0.000 NA   NA
 2673604 2673605 CA2559_11108 CA2559_11113     FALSE 0.257 117.000 0.041 NA   NA
 2673605 2673606 CA2559_11113 CA2559_11118     FALSE 0.365 78.000 0.044 NA   NA
 2673607 2673608 CA2559_11123 CA2559_11128     TRUE 0.657 -16.000 0.000 NA   NA
 2673609 2673610 CA2559_11133 CA2559_11138     TRUE 0.724 21.000 0.031 1.000   NA
 2673611 2673612 CA2559_11143 CA2559_11148     TRUE 0.644 -27.000 0.000 NA   NA
 2673612 2673613 CA2559_11148 CA2559_11153     FALSE 0.031 229.000 0.010 NA   NA
 2673617 2673618 CA2559_11173 CA2559_11178     FALSE 0.024 276.000 0.008 1.000   NA
 2673618 2673619 CA2559_11178 CA2559_11183     FALSE 0.551 35.000 0.008 1.000   NA
 2673619 2673620 CA2559_11183 CA2559_11188     FALSE 0.525 31.000 0.000 NA   NA
 2673620 2673621 CA2559_11188 CA2559_11193     FALSE 0.206 77.000 0.000 NA   NA
 2673621 2673622 CA2559_11193 CA2559_11198     TRUE 0.987 -3.000 0.938 NA   NA
 2673622 2673623 CA2559_11198 CA2559_11203     TRUE 0.976 -19.000 0.706 NA   NA
 2673623 2673624 CA2559_11203 CA2559_11208     TRUE 0.963 33.000 0.765 NA   NA
 2673625 2673626 CA2559_11213 CA2559_11218     TRUE 0.696 10.000 0.010 NA   NA
 2673629 2673630 CA2559_11233 CA2559_11238     TRUE 0.950 4.000 0.179 NA   NA
 2673630 2673631 CA2559_11238 CA2559_11243     TRUE 0.760 47.000 0.138 NA N NA
 2673631 2673632 CA2559_11243 CA2559_11248     FALSE 0.173 136.000 0.050 1.000 N NA
 2673635 2673636 CA2559_11263 CA2559_11268     FALSE 0.455 23.000 0.000 1.000 N NA
 2673636 2673637 CA2559_11268 CA2559_11273     FALSE 0.110 107.000 0.000 1.000 N NA
 2673637 2673638 CA2559_11273 CA2559_11278     TRUE 0.660 2.000 0.004 1.000 N NA
 2673639 2673640 CA2559_11283 CA2559_11288     FALSE 0.116 131.000 0.000 1.000   NA
 2673640 2673641 CA2559_11288 CA2559_11293     FALSE 0.199 79.000 0.000 NA   NA
 2673641 2673642 CA2559_11293 CA2559_11298     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 2673642 2673643 CA2559_11298 CA2559_11303     TRUE 0.822 2.000 0.037 1.000 N NA
 2673643 2673644 CA2559_11303 CA2559_11308     FALSE 0.030 185.000 0.000 1.000 N NA
 2673645 2673646 CA2559_11313 CA2559_11318     TRUE 0.701 -6.000 0.000 NA   NA
 2673650 2673651 CA2559_11338 CA2559_11343     FALSE 0.048 154.000 0.000 1.000 N NA
 2673651 2673652 CA2559_11343 CA2559_11348     TRUE 0.960 8.000 0.010 0.002 Y NA
 2673652 2673653 CA2559_11348 CA2559_11353     TRUE 0.888 -3.000 0.000 0.002   NA
 2673653 2673654 CA2559_11353 CA2559_11358     FALSE 0.159 115.000 0.000 1.000   NA
 2673654 2673655 CA2559_11358 CA2559_11363     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2673655 2673656 CA2559_11363 CA2559_11368     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2673656 2673657 CA2559_11368 CA2559_11373     FALSE 0.159 102.000 0.000 NA   NA
 2673657 2673658 CA2559_11373 CA2559_11378     TRUE 0.638 12.000 0.000 NA   NA
 2673658 2673659 CA2559_11378 CA2559_11383     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673659 2673660 CA2559_11383 CA2559_11388     FALSE 0.167 96.000 0.000 NA   NA
 2673661 2673662 CA2559_11393 CA2559_11398     FALSE 0.242 70.000 0.000 NA   NA
 2673663 2673664 CA2559_11403 CA2559_11408     FALSE 0.370 55.000 0.000 NA   NA
 2673665 2673666 CA2559_11413 CA2559_11418     TRUE 0.945 0.000 0.152 NA   NA
 2673666 2673667 CA2559_11418 CA2559_11423     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2673667 2673668 CA2559_11423 CA2559_11428     TRUE 0.574 20.000 0.000 NA   NA
 2673668 2673669 CA2559_11428 CA2559_11433     FALSE 0.157 104.000 0.000 NA   NA
 2673670 2673671 CA2559_11438 CA2559_11443     TRUE 0.926 13.000 0.188 NA   NA
 2673671 2673672 CA2559_11443 CA2559_11448     FALSE 0.018 318.000 0.000 1.000   NA
 2673672 2673673 CA2559_11448 CA2559_11453     TRUE 0.759 3.000 0.000 1.000   NA
 2673673 2673674 CA2559_11453 CA2559_11458     TRUE 0.958 8.000 0.063 1.000 Y NA
 2673676 2673677 CA2559_11468 CA2559_11473     TRUE 0.931 28.000 0.364 1.000 N NA
 2673677 2673678 CA2559_11473 CA2559_11478     TRUE 0.571 126.000 0.318 1.000 N NA
 2673678 2673679 CA2559_11478 CA2559_11483     TRUE 0.713 134.000 0.714 NA   NA
 2673679 2673680 CA2559_11483 CA2559_11488     TRUE 0.932 23.000 0.286 NA   NA
 2673680 2673681 CA2559_11488 CA2559_11493     TRUE 0.776 64.000 0.222 NA   NA
 2673681 2673682 CA2559_11493 CA2559_11498     TRUE 0.970 29.000 0.889 NA   NA
 2673682 2673683 CA2559_11498 CA2559_11503     FALSE 0.017 306.000 0.000 NA   NA
 2673683 2673684 CA2559_11503 CA2559_11508     TRUE 0.888 -31.000 0.109 NA   NA
 2673684 2673685 CA2559_11508 CA2559_11513     TRUE 0.903 0.000 0.000 0.001   NA
 2673685 2673686 CA2559_11513 CA2559_11518     TRUE 0.972 22.000 0.375 0.001   NA
 2673686 2673687 CA2559_11518 CA2559_11523     FALSE 0.282 64.000 0.000 NA   NA
 2673687 2673688 CA2559_11523 CA2559_11528     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2673689 2673690 CA2559_11533 CA2559_11538     TRUE 0.909 -3.000 0.087 1.000   NA
 2673690 2673691 CA2559_11538 CA2559_11543     TRUE 0.760 0.000 0.000 1.000   NA
 2673691 2673692 CA2559_11543 CA2559_11548     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673692 2673693 CA2559_11548 CA2559_11553     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2673693 2673694 CA2559_11553 CA2559_11558     FALSE 0.533 129.000 0.000 0.010 Y NA
 2673694 2673695 CA2559_11558 CA2559_11563     FALSE 0.100 134.000 0.000 NA   NA
 2673695 2673696 CA2559_11563 CA2559_11568     FALSE 0.021 267.000 0.000 NA   NA
 2673696 2673697 CA2559_11568 CA2559_11573     TRUE 0.728 117.000 0.500 NA   NA
 2673697 2673698 CA2559_11573 CA2559_11578     TRUE 0.630 -67.000 0.000 NA   NA
 2673698 2673699 CA2559_11578 CA2559_11583     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2673700 2673701 CA2559_11588 CA2559_11593     TRUE 0.573 -13.000 0.000 1.000 N NA
 2673702 2673703 CA2559_11598 CA2559_11603     FALSE 0.034 206.000 0.000 NA   NA
 2673705 2673706 CA2559_11613 CA2559_11618     TRUE 0.986 0.000 0.800 NA   NA
 2673706 2673707 CA2559_11618 CA2559_11623     TRUE 0.967 5.000 0.300 NA   NA
 2673707 2673708 CA2559_11623 CA2559_11628     TRUE 0.963 11.000 0.400 NA   NA
 2673709 2673710 CA2559_11633 CA2559_11638     TRUE 0.966 -16.000 0.429 NA   NA
 2673710 2673711 CA2559_11638 CA2559_11643     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 2673711 2673712 CA2559_11643 CA2559_11648     FALSE 0.021 266.000 0.000 NA   NA
 2673712 2673713 CA2559_11648 CA2559_11653     TRUE 0.667 -13.000 0.000 NA   NA
 2673713 2673714 CA2559_11653 CA2559_11658     FALSE 0.437 45.000 0.000 NA   NA
 2673714 2673715 CA2559_11658 CA2559_11663     FALSE 0.031 217.000 0.000 NA   NA
 2673715 2673716 CA2559_11663 CA2559_11668     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 2673716 2673717 CA2559_11668 CA2559_11673     FALSE 0.222 224.000 0.000 0.004 Y NA
 2673717 2673718 CA2559_11673 CA2559_11678     TRUE 0.719 60.000 0.000 1.000 Y NA
 2673718 2673719 CA2559_11678 CA2559_11683     TRUE 0.988 -7.000 0.333 1.000 Y NA
 2673719 2673720 CA2559_11683 CA2559_11688     TRUE 0.802 6.000 0.000 0.069 N NA
 2673720 2673721 CA2559_11688 CA2559_11693     FALSE 0.386 39.000 0.000 1.000 N NA
 2673723 2673724 CA2559_11703 CA2559_11708     TRUE 0.717 5.000 0.000 NA   NA
 2673724 2673725 CA2559_11708 CA2559_11713     TRUE 0.953 25.000 0.500 NA   NA
 2673725 2673726 CA2559_11713 CA2559_11718     TRUE 0.976 2.000 0.400 NA   NA
 2673726 2673727 CA2559_11718 CA2559_11723     TRUE 0.950 20.000 0.400 NA   NA
 2673727 2673728 CA2559_11723 CA2559_11728     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673728 2673729 CA2559_11728 CA2559_11733     FALSE 0.194 81.000 0.000 NA   NA
 2673729 2673730 CA2559_11733 CA2559_11738     TRUE 0.743 1.000 0.000 NA   NA
 2673730 2673731 CA2559_11738 CA2559_11743     FALSE 0.525 31.000 0.000 NA   NA
 2673731 2673732 CA2559_11743 CA2559_11748     FALSE 0.169 71.000 0.000 1.000 N NA
 2673732 2673733 CA2559_11748 CA2559_11753     TRUE 0.653 3.000 0.000 1.000 N NA
 2673733 2673734 CA2559_11753 CA2559_11758     TRUE 0.979 -3.000 0.556 NA   NA
 2673734 2673735 CA2559_11758 CA2559_11763     TRUE 0.767 109.000 0.556 NA   NA
 2673735 2673736 CA2559_11763 CA2559_11768     FALSE 0.012 600.000 0.000 NA   NA
 2673736 2673737 CA2559_11768 CA2559_11773     FALSE 0.147 114.000 0.000 NA   NA
 2673737 2673738 CA2559_11773 CA2559_11778     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673739 2673740 CA2559_11783 CA2559_11788     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 2673740 2673741 CA2559_11788 CA2559_11793     FALSE 0.114 126.000 0.000 NA   NA
 2673741 2673742 CA2559_11793 CA2559_11798     TRUE 0.885 7.000 0.077 NA   NA
 2673742 2673743 CA2559_11798 CA2559_11803     TRUE 0.960 3.000 0.214 NA   NA
 2673743 2673744 CA2559_11803 CA2559_11808     TRUE 0.944 12.000 0.286 1.000 N NA
 2673745 2673746 CA2559_11813 CA2559_11818     FALSE 0.020 277.000 0.000 NA   NA
 2673746 2673747 CA2559_11818 CA2559_11823     FALSE 0.173 66.000 0.000 NA N NA
 2673747 2673748 CA2559_11823 CA2559_11828     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2673748 2673749 CA2559_11828 CA2559_11833     TRUE 0.879 59.000 0.400 NA   NA
 2673749 2673750 CA2559_11833 CA2559_11838     TRUE 0.830 77.000 0.571 NA   NA
 2673750 2673751 CA2559_11838 CA2559_11843     FALSE 0.270 66.000 0.000 NA   NA
 2673751 2673752 CA2559_11843 CA2559_t13670     FALSE 0.040 195.000 0.000 NA   NA
 2673752 2673753 CA2559_t13670 CA2559_t13668     FALSE 0.494 37.000 0.000 NA   NA
 2673753 2673754 CA2559_t13668 CA2559_11848     FALSE 0.112 127.000 0.000 NA   NA
 2673755 2673756 CA2559_11853 CA2559_11858     TRUE 0.924 10.000 0.190 NA N NA
 2673756 2673757 CA2559_11858 CA2559_11863     FALSE 0.194 81.000 0.000 NA   NA
 2673757 2673758 CA2559_11863 CA2559_11868     TRUE 0.962 -3.000 0.250 NA   NA
 2673760 2673761 CA2559_11878 CA2559_11883     FALSE 0.290 54.000 0.000 1.000 N NA
 2673763 2673764 CA2559_11893 CA2559_11898     TRUE 0.715 2.000 0.014 1.000 N NA
 2673765 2673766 CA2559_11903 CA2559_11908     FALSE 0.064 169.000 0.000 1.000   NA
 2673766 2673767 CA2559_11908 CA2559_11913     TRUE 0.837 63.000 0.317 1.000   NA
 2673767 2673768 CA2559_11913 CA2559_11918     TRUE 0.925 1.000 0.127 1.000 N NA
 2673768 2673769 CA2559_11918 CA2559_11923     TRUE 0.910 5.000 0.119 1.000 N NA
 2673769 2673770 CA2559_11923 CA2559_11928     FALSE 0.066 168.000 0.000 1.000   NA
 2673771 2673772 CA2559_11933 CA2559_11938     FALSE 0.156 106.000 0.000 NA   NA
 2673772 2673773 CA2559_11938 CA2559_11943     TRUE 0.638 -31.000 0.000 NA   NA
 2673776 2673777 CA2559_11958 CA2559_11963     TRUE 0.779 3.000 0.014 NA   NA
 2673777 2673778 CA2559_11963 CA2559_11968     FALSE 0.327 60.000 0.000 NA   NA
 2673778 2673779 CA2559_11968 CA2559_11973     TRUE 0.720 -10.000 0.014 NA   NA
 2673779 2673780 CA2559_11973 CA2559_11978     FALSE 0.234 75.000 0.000 1.000   NA
 2673780 2673781 CA2559_11978 CA2559_11983     FALSE 0.250 130.000 0.000 0.008   NA
 2673783 2673784 CA2559_11993 CA2559_11998     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2673785 2673786 CA2559_12003 CA2559_12008   maf FALSE 0.124 123.000 0.000 NA   NA
 2673786 2673787 CA2559_12008 CA2559_12013 maf   TRUE 0.854 3.000 0.060 NA N NA
 2673787 2673788 CA2559_12013 CA2559_12018     FALSE 0.340 77.000 0.034 NA   NA
 2673788 2673789 CA2559_12018 CA2559_12023     TRUE 0.893 14.000 0.129 NA   NA
 2673789 2673790 CA2559_12023 CA2559_12028     TRUE 0.715 58.000 0.118 NA   NA
 2673790 2673791 CA2559_12028 CA2559_12033     TRUE 0.854 0.000 0.037 NA   NA
 2673791 2673792 CA2559_12033 CA2559_12038     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2673792 2673793 CA2559_12038 CA2559_12043     FALSE 0.412 49.000 0.000 NA   NA
 2673796 2673797 CA2559_12058 CA2559_12063     FALSE 0.513 66.000 0.055 1.000   NA
 2673799 2673800 CA2559_12073 CA2559_12078     TRUE 0.983 -3.000 0.748 NA   NA
 2673801 2673802 CA2559_12083 CA2559_12088     FALSE 0.523 69.000 0.076 NA   NA
 2673802 2673803 CA2559_12088 CA2559_12093     FALSE 0.418 63.000 0.029 NA   NA
 2673805 2673806 CA2559_12103 CA2559_12108     TRUE 0.775 -3.000 0.013 1.000   NA
 2673806 2673807 CA2559_12108 CA2559_12113     TRUE 0.716 10.000 0.010 1.000   NA
 2673807 2673808 CA2559_12113 CA2559_12118     TRUE 0.764 2.000 0.000 1.000   NA
 2673809 2673810 CA2559_12123 CA2559_12128     TRUE 0.982 -3.000 0.682 NA   NA
 2673810 2673811 CA2559_12128 CA2559_12133     FALSE 0.282 64.000 0.000 NA   NA
 2673811 2673812 CA2559_12133 CA2559_12138     FALSE 0.066 157.000 0.000 NA   NA
 2673812 2673813 CA2559_12138 CA2559_12143     TRUE 0.997 2.000 0.708 0.002 Y NA
 2673813 2673814 CA2559_12143 CA2559_12148     TRUE 0.971 54.000 0.279 0.002 Y NA
 2673814 2673815 CA2559_12148 CA2559_12153     TRUE 0.994 2.000 0.288 0.002 Y NA
 2673815 2673816 CA2559_12153 CA2559_12158     TRUE 0.997 3.000 0.773 0.002 Y NA
 2673816 2673817 CA2559_12158 CA2559_12163     TRUE 0.997 4.000 0.747 0.002 Y NA
 2673818 2673819 CA2559_12168 CA2559_12173     TRUE 0.822 47.000 0.154 NA   NA
 2673819 2673820 CA2559_12173 CA2559_12178     TRUE 0.816 8.000 0.034 NA   NA
 2673821 2673822 CA2559_12183 CA2559_12188     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673822 2673823 CA2559_12188 CA2559_12193     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 2673824 2673825 CA2559_12198 CA2559_12203     FALSE 0.168 95.000 0.000 NA   NA
 2673825 2673826 CA2559_12203 CA2559_12208     TRUE 0.697 98.000 0.375 1.000 N NA
 2673826 2673827 CA2559_12208 CA2559_12213     TRUE 0.983 7.000 0.810 NA   NA
 2673828 2673829 CA2559_12218 CA2559_12223     FALSE 0.194 81.000 0.000 NA   NA
 2673829 2673830 CA2559_12223 CA2559_12228     FALSE 0.518 33.000 0.000 NA   NA
 2673832 2673833 CA2559_12238 CA2559_12243     TRUE 0.994 0.000 0.360 0.004 Y NA
 2673834 2673835 CA2559_12248 CA2559_12253 ubiE   TRUE 0.882 0.000 0.055 NA   NA
 2673837 2673838 CA2559_12263 CA2559_12268     FALSE 0.534 45.000 0.033 1.000 N NA
 2673838 2673839 CA2559_12268 CA2559_12273     TRUE 0.574 44.000 0.041 1.000 N NA
 2673841 2673842 CA2559_12283 CA2559_12288     FALSE 0.530 219.000 0.335 1.000 Y NA
 2673846 2673847 CA2559_12308 CA2559_12313     TRUE 0.710 73.000 0.044 1.000 Y NA
 2673848 2673849 CA2559_12318 CA2559_12323     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2673850 2673851 CA2559_12328 CA2559_12333     TRUE 0.912 0.000 0.108 1.000 N NA
 2673852 2673853 CA2559_12338 CA2559_12343     FALSE 0.180 89.000 0.000 NA   NA
 2673854 2673855 CA2559_12348 CA2559_12353     TRUE 0.894 0.000 0.093 NA N NA
 2673855 2673856 CA2559_12353 CA2559_12358     TRUE 0.890 -3.000 0.073 NA   NA
 2673856 2673857 CA2559_12358 CA2559_12363     FALSE 0.522 48.000 0.021 NA   NA
 2673858 2673859 CA2559_12368 CA2559_12373     TRUE 0.692 -7.000 0.000 NA   NA
 2673860 2673861 CA2559_12378 CA2559_12383     TRUE 0.634 46.000 0.044 NA   NA
 2673862 2673863 CA2559_12388 CA2559_12393     TRUE 0.846 31.000 0.000 NA Y NA
 2673863 2673864 CA2559_12393 CA2559_12398     TRUE 0.945 -55.000 0.250 NA   NA
 2673864 2673865 CA2559_12398 CA2559_12403     TRUE 0.984 2.000 0.688 NA   NA
 2673865 2673866 CA2559_12403 CA2559_12408     TRUE 0.629 5.000 0.000 1.000 N NA
 2673867 2673868 CA2559_12413 CA2559_12418     FALSE 0.546 85.000 0.132 NA   NA
 2673869 2673870 CA2559_12423 CA2559_12428     TRUE 0.570 22.000 0.006 NA   NA
 2673870 2673871 CA2559_12428 CA2559_12433     FALSE 0.543 61.000 0.053 NA   NA
 2673872 2673873 CA2559_12438 CA2559_12443     FALSE 0.314 61.000 0.000 NA   NA
 2673873 2673874 CA2559_12443 CA2559_12448     FALSE 0.382 123.000 0.105 NA   NA
 2673874 2673875 CA2559_12448 CA2559_12453     TRUE 0.995 9.000 0.550 0.001 Y NA
 2673875 2673876 CA2559_12453 CA2559_12458     TRUE 0.693 94.000 0.261 1.000   NA
 2673876 2673877 CA2559_12458 CA2559_12463     FALSE 0.360 120.000 0.014 0.001   NA
 2673877 2673878 CA2559_12463 CA2559_12468     FALSE 0.053 148.000 0.000 1.000 N NA
 2673878 2673879 CA2559_12468 CA2559_12473     FALSE 0.023 204.000 0.000 1.000 N NA
 2673879 2673880 CA2559_12473 CA2559_12478     TRUE 0.739 5.000 0.000 1.000   NA
 2673880 2673881 CA2559_12478 CA2559_12483     TRUE 0.759 3.000 0.000 1.000   NA
 2673883 2673884 CA2559_12493 CA2559_12498     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 2673885 2673886 CA2559_12503 CA2559_12508     TRUE 0.947 11.000 0.231 1.000   NA
 2673887 2673888 CA2559_12513 CA2559_12518     TRUE 0.993 1.000 0.512 1.000 Y NA
 2673888 2673889 CA2559_12518 CA2559_12523     FALSE 0.203 86.000 0.000 1.000   NA
 2673891 2673892 CA2559_12533 CA2559_12538     FALSE 0.456 42.000 0.000 NA   NA
 2673892 2673893 CA2559_12538 CA2559_12543     TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 2673894 2673895 CA2559_12548 CA2559_12553     FALSE 0.563 60.000 0.075 1.000 N NA
 2673896 2673897 CA2559_12558 CA2559_12563     FALSE 0.043 163.000 0.000 1.000 N NA
 2673897 2673898 CA2559_12563 CA2559_12568     FALSE 0.129 88.000 0.000 1.000 N NA
 2673900 2673901 CA2559_12578 CA2559_12583     FALSE 0.062 171.000 0.000 1.000   NA
 2673901 2673902 CA2559_12583 CA2559_12588     FALSE 0.167 96.000 0.000 NA   NA
 2673903 2673904 CA2559_12593 CA2559_12598     TRUE 0.885 -10.000 0.085 NA   NA
 2673904 2673905 CA2559_12598 CA2559_12603     FALSE 0.327 60.000 0.000 NA   NA
 2673905 2673906 CA2559_12603 CA2559_12608     TRUE 0.684 9.000 0.000 NA   NA
 2673906 2673907 CA2559_12608 CA2559_12613     FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 2673908 2673909 CA2559_12618 CA2559_12623     FALSE 0.248 72.000 0.000 1.000   NA
 2673909 2673910 CA2559_12623 CA2559_12628     FALSE 0.243 73.000 0.000 1.000   NA
 2673910 2673911 CA2559_12628 CA2559_12633     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2673911 2673912 CA2559_12633 CA2559_12638     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA   NA
 2673913 2673914 CA2559_12643 CA2559_12648     FALSE 0.541 34.000 0.000 1.000   NA
 2673914 2673915 CA2559_12648 CA2559_12653     FALSE 0.017 232.000 0.000 1.000 N NA
 2673915 2673916 CA2559_12653 CA2559_12658     TRUE 0.984 31.000 0.281 0.002 Y NA
 2673916 2673917 CA2559_12658 CA2559_12663     TRUE 0.971 3.000 0.018 0.002 Y NA
 2673917 2673918 CA2559_12663 CA2559_12668     FALSE 0.097 276.000 0.000 1.000 Y NA
 2673919 2673920 CA2559_12673 CA2559_12678     FALSE 0.499 122.000 0.161 1.000   NA
 2673920 2673921 CA2559_12678 CA2559_12683     TRUE 0.996 10.000 0.874 0.004 Y NA
 2673921 2673922 CA2559_12683 CA2559_12688     TRUE 0.565 28.000 0.000 1.000   NA
 2673922 2673923 CA2559_12688 CA2559_12693     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2673923 2673924 CA2559_12693 CA2559_12698     FALSE 0.168 95.000 0.000 NA   NA
 2673924 2673925 CA2559_12698 CA2559_12703   trmD FALSE 0.485 42.000 0.000 1.000   NA
 2673927 2673928 CA2559_12713 CA2559_12718     TRUE 0.806 -3.000 0.021 1.000   NA
 2673928 2673929 CA2559_12718 CA2559_12723     TRUE 0.597 96.000 0.175 1.000   NA
 2673929 2673930 CA2559_12723 CA2559_12728     TRUE 0.841 5.000 0.039 NA   NA
 2673932 2673933 CA2559_12738 CA2559_12743 dnaA   TRUE 0.723 7.000 0.022 1.000 N NA
 2673933 2673934 CA2559_12743 CA2559_12748     FALSE 0.357 45.000 0.006 1.000 N NA
 2673934 2673935 CA2559_12748 CA2559_12753     TRUE 0.768 12.000 0.028 1.000   NA
 2673936 2673937 CA2559_12758 CA2559_12763     FALSE 0.025 267.000 0.012 NA   NA
 2673937 2673938 CA2559_12763 CA2559_12768     TRUE 0.826 -10.000 0.038 1.000   NA
 2673938 2673939 CA2559_12768 CA2559_12773     TRUE 0.754 -6.000 0.028 1.000 N NA
 2673940 2673941 CA2559_12778 CA2559_12783     FALSE 0.134 183.000 0.090 1.000 N NA
 2673941 2673942 CA2559_12783 CA2559_12788     FALSE 0.095 148.000 0.014 NA   NA
 2673942 2673943 CA2559_12788 CA2559_12793     FALSE 0.159 102.000 0.000 NA   NA
 2673943 2673944 CA2559_12793 CA2559_12798     TRUE 0.785 34.000 0.081 NA   NA
 2673944 2673945 CA2559_12798 CA2559_12803     TRUE 0.760 0.000 0.000 1.000   NA
 2673945 2673946 CA2559_12803 CA2559_12808     TRUE 0.702 -37.000 0.017 NA   NA
 2673946 2673947 CA2559_12808 CA2559_12813     FALSE 0.539 28.000 0.004 NA   NA
 2673948 2673949 CA2559_12818 CA2559_12823     FALSE 0.255 71.000 0.000 1.000   NA
 2673949 2673950 CA2559_12823 CA2559_12828     FALSE 0.194 119.000 0.019 1.000   NA
 2673951 2673952 CA2559_12833 CA2559_12838     TRUE 0.626 74.000 0.143 1.000   NA
 2673955 2673956 CA2559_12853 CA2559_12858 cls   TRUE 0.852 5.000 0.044 NA   NA
 2673957 2673958 CA2559_12863 CA2559_12868     TRUE 0.715 8.000 0.000 1.000   NA
 2673962 2673963 CA2559_12888 CA2559_12893     FALSE 0.400 51.000 0.000 NA   NA
 2673963 2673964 CA2559_12893 CA2559_12898     FALSE 0.233 71.000 0.000 NA   NA
 2673967 2673968 CA2559_12913 CA2559_12918     TRUE 0.759 7.000 0.017 NA   NA
 2673968 2673969 CA2559_12918 CA2559_12923     FALSE 0.314 67.000 0.015 NA   NA
 2673969 2673970 CA2559_12923 CA2559_12928     FALSE 0.135 118.000 0.018 1.000 N NA
 2673971 2673972 CA2559_12933 CA2559_12938     TRUE 0.814 67.000 0.323 NA   NA
 2673972 2673973 CA2559_12938 CA2559_12943     FALSE 0.501 84.000 0.104 NA   NA
 2673973 2673974 CA2559_12943 CA2559_12948     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2673975 2673976 CA2559_12953 CA2559_12958     FALSE 0.081 150.000 0.000 1.000   NA
 2673979 2673980 CA2559_12973 CA2559_12978     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2673980 2673981 CA2559_12978 CA2559_12983     TRUE 0.743 1.000 0.000 NA   NA
 2673982 2673983 CA2559_12988 CA2559_12993     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 2673983 2673984 CA2559_12993 CA2559_12998     FALSE 0.282 64.000 0.000 NA   NA
 2673984 2673985 CA2559_12998 CA2559_13003     FALSE 0.370 55.000 0.000 NA   NA
 2673985 2673986 CA2559_13003 CA2559_13008     TRUE 0.615 3.000 0.000 NA N NA
 2673986 2673987 CA2559_13008 CA2559_13013     TRUE 0.571 -6.000 0.000 NA N NA
 2673987 2673988 CA2559_13013 CA2559_13018     FALSE 0.057 177.000 0.000 1.000   NA
 2673988 2673989 CA2559_13018 CA2559_13023     TRUE 0.740 -3.000 0.000 1.000   NA
 2673989 2673990 CA2559_13023 CA2559_13028     TRUE 0.609 26.000 0.028 1.000 N NA
 2673990 2673991 CA2559_13028 CA2559_13033     TRUE 0.667 -13.000 0.000 NA   NA
 2673991 2673992 CA2559_13033 CA2559_13038     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2673992 2673993 CA2559_13038 CA2559_13043     TRUE 0.715 8.000 0.000 1.000   NA
 2673993 2673994 CA2559_13043 CA2559_13048     TRUE 0.629 5.000 0.000 1.000 N NA
 2673994 2673995 CA2559_13048 CA2559_13053     TRUE 0.761 -19.000 0.000 0.051 N NA
 2673995 2673996 CA2559_13053 CA2559_13058     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2673996 2673997 CA2559_13058 CA2559_13063     FALSE 0.185 86.000 0.000 NA   NA
 2673997 2673998 CA2559_13063 CA2559_13068     TRUE 0.986 -7.000 0.296 1.000 Y NA
 2673998 2673999 CA2559_13068 CA2559_13073     TRUE 0.984 0.000 0.678 1.000   NA
 2673999 2674000 CA2559_13073 CA2559_13078     TRUE 0.723 7.000 0.000 1.000   NA
 2674000 2674001 CA2559_13078 CA2559_13083     FALSE 0.519 38.000 0.000 1.000   NA
 2674001 2674002 CA2559_13083 CA2559_13088     TRUE 0.986 3.000 0.212 1.000 Y NA
 2674002 2674003 CA2559_13088 CA2559_13093     TRUE 0.937 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2674003 2674004 CA2559_13093 CA2559_13098     TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 2674004 2674005 CA2559_13098 CA2559_13103     TRUE 0.938 2.000 0.000 1.000 Y NA
 2674005 2674006 CA2559_13103 CA2559_13108     TRUE 0.580 122.000 0.000 0.005 Y NA
 2674006 2674007 CA2559_13108 CA2559_13113     TRUE 0.966 0.000 0.061 1.000 Y NA
 2674007 2674008 CA2559_13113 CA2559_13118     TRUE 0.971 10.000 0.133 1.000 Y NA
 2674008 2674009 CA2559_13118 CA2559_13123     TRUE 0.629 5.000 0.000 1.000 N NA
 2674012 2674013 CA2559_13138 CA2559_13143     TRUE 0.748 0.000 0.007 NA   NA
 2674015 2674016 CA2559_13153 CA2559_13158     TRUE 0.947 -3.000 0.178 NA   NA
 2674016 2674017 CA2559_13158 CA2559_13163     TRUE 0.713 23.000 0.034 NA   NA
 2674017 2674018 CA2559_13163 CA2559_13168     TRUE 0.923 3.000 0.103 NA   NA
 2674020 2674021 CA2559_13178 CA2559_13183     TRUE 0.950 3.000 0.200 1.000 N NA
 2674021 2674022 CA2559_13183 CA2559_13188     FALSE 0.508 65.000 0.057 NA   NA
 2674027 2674028 CA2559_13213 CA2559_13218     TRUE 0.677 108.000 0.300 NA   NA
 2674029 2674030 CA2559_13223 CA2559_13228     TRUE 0.674 11.000 0.000 1.000   NA
 2674030 2674031 CA2559_13228 CA2559_13233     TRUE 0.863 -16.000 0.000 0.001   NA
 2674031 2674032 CA2559_13233 CA2559_13238     FALSE 0.222 78.000 0.000 1.000   NA
 2674032 2674033 CA2559_13238 CA2559_13243     FALSE 0.512 15.000 0.000 1.000 N NA
 2674033 2674034 CA2559_13243 CA2559_13248     FALSE 0.272 83.000 0.020 1.000   NA
 2674034 2674035 CA2559_13248 CA2559_13253     TRUE 0.656 15.000 0.013 NA   NA
 2674035 2674036 CA2559_13253 CA2559_13258     TRUE 0.857 7.000 0.053 NA   NA
 2674036 2674037 CA2559_13258 CA2559_13263     FALSE 0.073 150.000 0.000 NA   NA
 2674038 2674039 CA2559_13268 CA2559_13273     FALSE 0.230 134.000 0.051 1.000   NA
 2674040 2674041 CA2559_13278 CA2559_13283     TRUE 0.980 51.000 0.509 0.013 Y NA
 2674041 2674042 CA2559_13283 CA2559_13288     FALSE 0.477 114.000 0.125 1.000   NA
 2674042 2674043 CA2559_13288 CA2559_13293     TRUE 0.896 5.000 0.073 1.000   NA
 2674044 2674045 CA2559_13298 CA2559_13303     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2674046 2674047 CA2559_13308 CA2559_13313     TRUE 0.699 10.000 0.006 1.000   NA
 2674047 2674048 CA2559_13313 CA2559_13318     FALSE 0.244 74.000 0.011 NA   NA
 2674048 2674049 CA2559_13318 CA2559_13323     TRUE 0.867 41.000 0.189 NA   NA
 2674049 2674050 CA2559_13323 CA2559_13328     TRUE 0.648 11.000 0.000 NA   NA
 2674050 2674051 CA2559_13328 CA2559_13333     TRUE 0.596 17.000 0.000 NA   NA
 2674053 2674054 CA2559_13343 CA2559_13348     TRUE 0.918 18.000 0.193 NA   NA
 2674054 2674055 CA2559_13348 CA2559_13353     FALSE 0.194 91.000 0.000 1.000   NA
 2674055 2674056 CA2559_13353 CA2559_13358     FALSE 0.218 79.000 0.004 1.000   NA
 2674057 2674058 CA2559_13363 CA2559_13368     FALSE 0.315 63.000 0.000 1.000   NA
 2674058 2674059 CA2559_13368 CA2559_13373     TRUE 0.648 10.000 0.015 1.000 N NA
 2674062 2674063 CA2559_13388 CA2559_13393     FALSE 0.345 58.000 0.000 NA   NA
 2674063 2674064 CA2559_13393 CA2559_13398     TRUE 0.590 18.000 0.000 NA   NA
 2674065 2674066 CA2559_13403 CA2559_13408     FALSE 0.396 37.000 0.000 1.000 N NA
 2674066 2674067 CA2559_13408 CA2559_13413     TRUE 0.864 41.000 0.173 1.000   NA
 2674067 2674068 CA2559_13413 CA2559_13418     TRUE 0.968 -3.000 0.320 NA   NA
 2674068 2674069 CA2559_13418 CA2559_13423     FALSE 0.016 332.000 0.000 NA   NA
 2674071 2674072 CA2559_13433 CA2559_13438     TRUE 0.699 7.000 0.000 NA   NA
 2674072 2674073 CA2559_13438 CA2559_13443     TRUE 0.978 13.000 0.818 NA   NA
 2674073 2674074 CA2559_13443 CA2559_13448     FALSE 0.039 258.000 0.000 0.035 N NA
 2674074 2674075 CA2559_13448 CA2559_13453     TRUE 0.992 9.000 0.385 0.075 Y NA
 2674075 2674076 CA2559_13453 CA2559_13458     FALSE 0.378 40.000 0.000 1.000 N NA
 2674076 2674077 CA2559_13458 CA2559_13463     FALSE 0.379 54.000 0.000 NA   NA
 2674077 2674078 CA2559_13463 CA2559_t13666     FALSE 0.017 307.000 0.000 NA   NA
 2674078 2674079 CA2559_t13666 CA2559_13468     FALSE 0.095 137.000 0.000 NA   NA
 2674079 2674080 CA2559_13468 CA2559_13473     FALSE 0.019 291.000 0.000 NA   NA
 2674080 2674081 CA2559_13473 CA2559_13478     TRUE 0.831 39.000 0.133 NA   NA
 2674081 2674082 CA2559_13478 CA2559_13483   tpiA TRUE 0.933 7.000 0.175 1.000 N NA
 2674082 2674083 CA2559_13483 CA2559_13488 tpiA   TRUE 0.842 23.000 0.096 1.000   NA
 2674083 2674084 CA2559_13488 CA2559_13493     TRUE 0.881 -27.000 0.091 1.000   NA
 2674084 2674085 CA2559_13493 CA2559_13498     TRUE 0.886 35.000 0.191 NA   NA
 2674085 2674086 CA2559_13498 CA2559_13503     TRUE 0.976 11.000 0.708 NA   NA
 2674087 2674088 CA2559_13508 CA2559_13513     FALSE 0.419 124.000 0.133 NA   NA
 2674089 2674090 CA2559_13518 CA2559_13523     TRUE 0.867 0.000 0.062 1.000 N NA
 2674092 2674093 CA2559_13533 CA2559_13538     TRUE 0.697 14.000 0.019 NA   NA
 2674095 2674096 CA2559_13548 CA2559_13553     FALSE 0.243 121.000 0.041 NA   NA
 2674096 2674097 CA2559_13553 CA2559_13558     TRUE 0.887 7.000 0.079 NA   NA
 2674097 2674098 CA2559_13558 CA2559_13563     TRUE 0.965 21.000 0.332 0.015   NA
 2674098 2674099 CA2559_13563 CA2559_13568     FALSE 0.304 85.000 0.028 1.000   NA
 2674099 2674100 CA2559_13568 CA2559_13573     TRUE 0.835 0.000 0.030 NA   NA
 2674100 2674101 CA2559_13573 CA2559_13578     TRUE 0.918 2.000 0.092 NA   NA
 2674101 2674102 CA2559_13578 CA2559_13583     TRUE 0.890 3.000 0.082 1.000 N NA
 2674103 2674104 CA2559_13588 CA2559_13593     FALSE 0.013 499.000 0.000 NA   NA
 2674105 2674106 CA2559_13598 CA2559_13603     TRUE 0.938 2.000 0.000 1.000 Y NA
 2674106 2674107 CA2559_13603 CA2559_13608   prfA TRUE 0.728 12.000 0.034 1.000 N NA
 2674109 2674110 CA2559_13618 CA2559_13623     FALSE 0.170 94.000 0.000 NA   NA
 2674110 2674111 CA2559_13623 CA2559_13628     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 2674111 2674112 CA2559_13628 CA2559_13633     FALSE 0.437 70.000 0.049 NA   NA
 2674112 2674113 CA2559_13633 CA2559_13638     TRUE 0.910 0.000 0.105 1.000 N NA
 2674113 2674114 CA2559_13638 CA2559_13643     FALSE 0.115 98.000 0.000 1.000 N NA
 2674114 2674115 CA2559_13643 CA2559_13648     TRUE 0.960 18.000 0.500 NA   NA
 2674115 2674116 CA2559_13648 CA2559_13653     FALSE 0.361 56.000 0.000 NA   NA
 2674118 2674119 CA2559_07736 CA2559_07741     FALSE 0.339 110.000 0.014 0.039   NA
 2674119 2674120 CA2559_07741 CA2559_07746     FALSE 0.064 152.000 0.014 1.000 N NA
 2674120 2674121 CA2559_07746 CA2559_07751     TRUE 0.724 -3.000 0.006 NA   NA
 2674121 2674122 CA2559_07751 CA2559_07756     TRUE 0.847 0.000 0.034 NA   NA
 2674122 2674123 CA2559_07756 CA2559_07761     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2674123 2674124 CA2559_07761 CA2559_07766     TRUE 0.939 0.000 0.140 NA   NA
 2674124 2674125 CA2559_07766 CA2559_07771     FALSE 0.015 339.000 0.000 NA   NA
 2674125 2674126 CA2559_07771 CA2559_07776     FALSE 0.154 108.000 0.000 NA   NA
 2674126 2674127 CA2559_07776 CA2559_07781     TRUE 0.639 67.000 0.000 NA Y NA
 2674127 2674128 CA2559_07781 CA2559_07786     TRUE 0.967 62.000 0.826 NA Y NA
 2674128 2674129 CA2559_07786 CA2559_07791     FALSE 0.529 30.000 0.000 NA   NA
 2674129 2674130 CA2559_07791 CA2559_07796     TRUE 0.969 34.000 1.000 NA   NA
 2674130 2674131 CA2559_07796 CA2559_07801     FALSE 0.199 85.000 0.009 NA   NA
 2674131 2674132 CA2559_07801 CA2559_07806     TRUE 0.955 10.000 0.124 0.001   NA
 2674132 2674133 CA2559_07806 CA2559_07811     TRUE 0.785 39.000 0.092 NA   NA
 2674133 2674134 CA2559_07811 CA2559_07816     TRUE 0.871 2.000 0.046 NA   NA
 2674134 2674135 CA2559_07816 CA2559_07821     FALSE 0.452 74.000 0.063 NA   NA
 2674135 2674136 CA2559_07821 CA2559_07826     FALSE 0.062 164.000 0.000 NA   NA
 2674136 2674137 CA2559_07826 CA2559_07831     TRUE 0.774 14.000 0.040 NA   NA
 2674137 2674138 CA2559_07831 CA2559_07836     FALSE 0.076 157.000 0.012 NA   NA
 2674138 2674139 CA2559_07836 CA2559_07841     TRUE 0.973 3.000 0.342 NA   NA
 2674141 2674142 CA2559_07851 CA2559_07856     TRUE 0.614 130.000 0.447 1.000 N NA
 2674142 2674143 CA2559_07856 CA2559_07861     TRUE 0.732 7.000 0.023 1.000 N NA
 2674143 2674144 CA2559_07861 CA2559_07866     FALSE 0.153 105.000 0.017 1.000 N NA
 2674144 2674145 CA2559_07866 CA2559_07871     TRUE 0.938 -9.000 0.219 NA N NA
 2674145 2674146 CA2559_07871 CA2559_07876     TRUE 0.954 3.000 0.188 NA   NA
 2674148 2674149 CA2559_07886 CA2559_07891     TRUE 0.857 3.000 0.055 1.000 N NA
 2674153 2674154 CA2559_07911 CA2559_07916     TRUE 0.973 3.000 0.025 0.002 Y NA
 2674154 2674155 CA2559_07916 CA2559_07921     TRUE 0.973 -10.000 0.052 0.002 Y NA
 2674155 2674156 CA2559_07921 CA2559_07926     FALSE 0.077 155.000 0.004 1.000   NA
 2674156 2674157 CA2559_07926 CA2559_07931     TRUE 0.701 79.000 0.145 0.075   NA
 2674157 2674158 CA2559_07931 CA2559_07936     TRUE 0.839 18.000 0.084 NA   NA
 2674160 2674161 CA2559_07946 CA2559_07951 pyrE   TRUE 0.868 47.000 0.096 0.001   NA
 2674163 2674164 CA2559_07961 CA2559_07966     FALSE 0.159 102.000 0.000 NA   NA
 2674165 2674166 CA2559_07971 CA2559_07976     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 2674166 2674167 CA2559_07976 CA2559_07981     TRUE 0.993 -3.000 0.696 1.000 Y NA
 2674167 2674168 CA2559_07981 CA2559_07986     TRUE 0.933 -16.000 0.174 1.000   NA
 2674169 2674170 CA2559_07991 CA2559_07996 coaD ddl FALSE 0.405 56.000 0.024 1.000 N NA
 2674171 2674172 CA2559_08001 CA2559_08006     TRUE 0.846 -16.000 0.055 1.000   NA
 2674172 2674173 CA2559_08006 CA2559_08011     FALSE 0.094 141.000 0.008 NA   NA
 2674173 2674174 CA2559_08011 CA2559_08016     FALSE 0.113 127.000 0.004 NA   NA
 2674175 2674176 CA2559_08021 CA2559_08026     FALSE 0.220 84.000 0.013 NA   NA
 2674176 2674177 CA2559_08026 CA2559_08031     FALSE 0.255 59.000 0.000 1.000 N NA
 2674177 2674178 CA2559_08031 CA2559_08036     FALSE 0.450 43.000 0.000 NA   NA
 2674178 2674179 CA2559_08036 CA2559_08041     TRUE 0.618 14.000 0.000 NA   NA
 2674179 2674180 CA2559_08041 CA2559_08046     TRUE 0.642 23.000 0.020 NA   NA
 2674180 2674181 CA2559_08046 CA2559_08051     TRUE 0.781 -72.000 0.039 NA   NA
 2674181 2674182 CA2559_08051 CA2559_08056     FALSE 0.553 76.000 0.116 NA   NA
 2674182 2674183 CA2559_08056 CA2559_08061     FALSE 0.293 195.000 0.000 0.003 Y NA
 2674183 2674184 CA2559_08061 CA2559_08066     FALSE 0.334 105.000 0.056 NA   NA
 2674184 2674185 CA2559_08066 CA2559_08071     TRUE 0.686 -34.000 0.014 NA   NA
 2674188 2674189 CA2559_08086 CA2559_08091     FALSE 0.342 100.000 0.057 NA   NA
 2674191 2674192 CA2559_08101 CA2559_08106     TRUE 0.977 52.000 0.750 1.000 Y NA
 2674192 2674193 CA2559_08106 CA2559_08111     FALSE 0.013 441.000 0.000 NA   NA
 2674193 2674194 CA2559_08111 CA2559_08116     FALSE 0.395 52.000 0.000 NA   NA
 2674194 2674195 CA2559_08116 CA2559_08121     FALSE 0.089 141.000 0.000 NA   NA
 2674198 2674199 CA2559_08136 CA2559_08141     TRUE 0.692 -7.000 0.000 NA   NA
 2674199 2674200 CA2559_08141 CA2559_08146     TRUE 0.709 6.000 0.000 NA   NA
 2674200 2674201 CA2559_08146 CA2559_08151     FALSE 0.054 139.000 0.000 NA N NA
 2674202 2674203 CA2559_08156 CA2559_08161     FALSE 0.188 204.000 0.154 1.000   NA
 2674203 2674204 CA2559_08161 CA2559_08166     TRUE 0.986 -7.000 0.148 0.002 Y NA
 2674204 2674205 CA2559_08166 CA2559_08171     TRUE 0.973 0.000 0.091 1.000 Y NA
 2674205 2674206 CA2559_08171 CA2559_08176     TRUE 0.619 21.000 0.026 1.000 N NA
 2674206 2674207 CA2559_08176 CA2559_08181     TRUE 0.732 6.000 0.000 1.000   NA
 2674207 2674208 CA2559_08181 CA2559_08186     TRUE 0.723 7.000 0.000 1.000   NA
 2674208 2674209 CA2559_08186 CA2559_08191     TRUE 0.970 3.000 0.306 NA   NA
 2674209 2674210 CA2559_08191 CA2559_08196     TRUE 0.690 57.000 0.097 NA   NA
 2674210 2674211 CA2559_08196 CA2559_08201     FALSE 0.191 129.000 0.029 1.000   NA
 2674211 2674212 CA2559_08201 CA2559_08206     FALSE 0.012 2611.000 0.000 NA   NA
 2674212 2674213 CA2559_08206 CA2559_08211     TRUE 0.590 18.000 0.000 NA   NA
 2674213 2674214 CA2559_08211 CA2559_08216     TRUE 0.979 6.000 0.571 NA   NA
 2674214 2674215 CA2559_08216 CA2559_08221     TRUE 0.975 10.000 0.583 NA   NA
 2674215 2674216 CA2559_08221 CA2559_08226     FALSE 0.470 55.000 0.022 NA   NA
 2674216 2674217 CA2559_08226 CA2559_08231     TRUE 0.893 41.000 0.237 NA   NA
 2674217 2674218 CA2559_08231 CA2559_08236     TRUE 0.948 20.000 0.362 NA   NA
 2674219 2674220 CA2559_08241 CA2559_08246     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 2674221 2674222 CA2559_08251 CA2559_08256     TRUE 0.801 99.000 0.088 0.008 Y NA
 2674222 2674223 CA2559_08256 CA2559_08261     FALSE 0.148 209.000 0.062 0.074   NA
 2674223 2674224 CA2559_08261 CA2559_08266     TRUE 0.978 -7.000 0.619 NA   NA
 2674224 2674225 CA2559_08266 CA2559_08271     TRUE 0.936 0.000 0.131 NA   NA
 2674225 2674226 CA2559_08271 CA2559_08276     TRUE 0.974 -7.000 0.256 0.064   NA
 2674226 2674227 CA2559_08276 CA2559_08281     TRUE 0.870 4.000 0.046 1.000   NA
 2674228 2674229 CA2559_08286 CA2559_08291     TRUE 0.986 6.000 1.000 NA   NA
 2674230 2674231 CA2559_08296 CA2559_08301     FALSE 0.192 82.000 0.000 NA   NA
 2674231 2674232 CA2559_08301 CA2559_08306     FALSE 0.319 67.000 0.016 NA   NA
 2674234 2674235 CA2559_08316 CA2559_08321     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 2674235 2674236 CA2559_08321 CA2559_08326     TRUE 0.606 38.000 0.024 NA   NA
 2674236 2674237 CA2559_08326 CA2559_08331     FALSE 0.042 190.000 0.000 NA   NA
 2674237 2674238 CA2559_08331 CA2559_08336     FALSE 0.073 150.000 0.000 NA   NA
 2674238 2674239 CA2559_08336 CA2559_08341     FALSE 0.159 102.000 0.000 NA   NA
 2674239 2674240 CA2559_08341 CA2559_08346     FALSE 0.467 113.000 0.125 NA   NA
 2674240 2674241 CA2559_08346 CA2559_08351     TRUE 0.674 94.000 0.250 NA   NA
 2674242 2674243 CA2559_08356 CA2559_08361     FALSE 0.206 77.000 0.000 NA   NA
 2674243 2674244 CA2559_08361 CA2559_08366     TRUE 0.983 2.000 0.635 NA   NA
 2674244 2674245 CA2559_08366 CA2559_08371     TRUE 0.952 4.000 0.186 NA   NA
 2674245 2674246 CA2559_08371 CA2559_08376     TRUE 0.869 5.000 0.054 NA   NA
 2674247 2674248 CA2559_08381 CA2559_08386   hemH TRUE 0.716 50.000 0.055 0.073 N NA
 2674248 2674249 CA2559_08386 CA2559_08391 hemH   FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 2674250 2674251 CA2559_08396 CA2559_08401     FALSE 0.556 75.000 0.115 NA   NA
 2674253 2674254 CA2559_08411 CA2559_08416     TRUE 0.742 2.000 0.000 NA   NA
 2674255 2674256 CA2559_08421 CA2559_08426     TRUE 0.835 1.000 0.023 1.000   NA
 2674256 2674257 CA2559_08426 CA2559_08431     FALSE 0.353 95.000 0.057 NA   NA
 2674258 2674259 CA2559_08436 CA2559_08441     TRUE 0.845 10.000 0.057 NA   NA
 2674260 2674261 CA2559_08446 CA2559_08451     TRUE 0.856 1.000 0.016 0.064 N NA
 2674261 2674262 CA2559_08451 CA2559_08456     TRUE 0.920 43.000 0.105 1.000 Y NA
 2674262 2674263 CA2559_08456 CA2559_08461     FALSE 0.286 98.000 0.053 1.000 N NA
 2674263 2674264 CA2559_08461 CA2559_08466     TRUE 0.717 5.000 0.000 NA   NA
 2674264 2674265 CA2559_08466 CA2559_08471     FALSE 0.103 137.000 0.009 NA   NA
 2674265 2674266 CA2559_08471 CA2559_08476     FALSE 0.364 82.000 0.064 1.000 N NA
 2674266 2674267 CA2559_08476 CA2559_08481     TRUE 0.667 -13.000 0.000 NA   NA
 2674267 2674268 CA2559_08481 CA2559_08486     TRUE 0.827 56.000 0.214 NA   NA
 2674268 2674269 CA2559_08486 CA2559_08491     FALSE 0.097 136.000 0.000 NA   NA
 2674272 2674273 CA2559_08506 CA2559_08511     TRUE 0.940 -19.000 0.207 1.000   NA
 2674273 2674274 CA2559_08511 CA2559_08516     TRUE 0.948 4.000 0.171 NA   NA
 2674274 2674275 CA2559_08516 CA2559_08521     FALSE 0.236 98.000 0.023 NA   NA
 2674275 2674276 CA2559_08521 CA2559_08526     FALSE 0.065 158.000 0.000 NA   NA
 2674276 2674277 CA2559_08526 CA2559_08531     FALSE 0.090 140.000 0.000 NA   NA
 2674279 2674280 CA2559_08541 CA2559_08546     TRUE 0.738 0.000 0.000 NA   NA
 2674280 2674281 CA2559_08546 CA2559_08551     FALSE 0.315 63.000 0.000 1.000   NA
 2674281 2674282 CA2559_08551 CA2559_08556     TRUE 0.966 -3.000 0.273 1.000   NA
 2674284 2674285 CA2559_08566 CA2559_08571     TRUE 0.968 -34.000 0.510 NA   NA
 2674285 2674286 CA2559_08571 CA2559_08576     TRUE 0.955 2.000 0.183 NA   NA
 2674288 2674289 CA2559_08586 CA2559_08591     TRUE 0.860 57.000 0.292 NA   NA
 2674289 2674290 CA2559_08591 CA2559_08596     TRUE 0.956 4.000 0.208 NA   NA
 2674291 2674292 CA2559_08601 CA2559_08606     TRUE 0.677 -10.000 0.000 NA   NA
 2674295 2674296 CA2559_08621 CA2559_08626     TRUE 0.843 25.000 0.100 1.000   NA
 2674297 2674298 CA2559_08631 CA2559_08636   folE TRUE 0.901 4.000 0.099 1.000 N NA
 2674298 2674299 CA2559_08636 CA2559_08641 folE   TRUE 0.686 70.000 0.169 NA   NA
 2674300 2674301 CA2559_08646 CA2559_08651     TRUE 0.737 101.000 0.424 NA   NA
 2674301 2674302 CA2559_08651 CA2559_08656     FALSE 0.562 69.000 0.091 NA   NA
 2674302 2674303 CA2559_08656 CA2559_08661     TRUE 0.895 9.000 0.094 NA   NA
 2674303 2674304 CA2559_08661 CA2559_08666     TRUE 0.964 18.000 0.562 NA   NA
 2674304 2674305 CA2559_08666 CA2559_08671     TRUE 0.589 91.000 0.167 NA   NA
 2674306 2674307 CA2559_08676 CA2559_08681     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2674308 2674309 CA2559_08686 CA2559_08691     TRUE 0.935 39.000 0.060 0.049 Y NA
 2674309 2674310 CA2559_08691 CA2559_08696     FALSE 0.398 72.000 0.038 1.000   NA
 2674311 2674312 CA2559_08701 CA2559_08706     FALSE 0.031 216.000 0.000 NA   NA
 2674312 2674313 CA2559_08706 CA2559_08711     FALSE 0.094 138.000 0.000 NA   NA
 2674313 2674314 CA2559_08711 CA2559_08716     TRUE 0.800 0.000 0.032 1.000 N NA
 2674314 2674315 CA2559_08716 CA2559_08721     TRUE 0.827 7.000 0.053 1.000 N NA
 2674315 2674316 CA2559_08721 CA2559_08726     FALSE 0.170 94.000 0.000 NA   NA
 2674316 2674317 CA2559_08726 CA2559_08731     TRUE 0.925 15.000 0.200 NA   NA
 2674317 2674318 CA2559_08731 CA2559_08736     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 2674318 2674319 CA2559_08736 CA2559_08741     TRUE 0.672 -12.000 0.000 NA   NA
 2674319 2674320 CA2559_08741 CA2559_08746     FALSE 0.036 201.000 0.000 NA   NA
 2674320 2674321 CA2559_08746 CA2559_08751     FALSE 0.065 183.000 0.015 1.000   NA
 2674323 2674324 CA2559_t09173 CA2559_08761     FALSE 0.176 91.000 0.000 NA   NA
 2674325 2674326 CA2559_08766 CA2559_08771     TRUE 0.829 7.000 0.054 1.000 N NA
 2674326 2674327 CA2559_08771 CA2559_08776     TRUE 0.945 23.000 0.468 1.000 N NA
 2674327 2674328 CA2559_08776 CA2559_08781     TRUE 0.582 36.000 0.031 1.000 N NA
 2674328 2674329 CA2559_08781 CA2559_08786     TRUE 0.727 12.000 0.034 1.000 N NA
 2674330 2674331 CA2559_08791 CA2559_08796     FALSE 0.165 97.000 0.000 NA   NA
 2674331 2674332 CA2559_08796 CA2559_08801     TRUE 0.760 118.000 0.645 NA   NA
 2674333 2674334 CA2559_08806 CA2559_08811     TRUE 0.590 113.000 0.194 1.000   NA
 2674334 2674335 CA2559_08811 CA2559_08816     FALSE 0.021 223.000 0.007 1.000 N NA
 2674337 2674338 CA2559_08826 CA2559_08831     TRUE 0.879 -16.000 0.083 1.000   NA
 2674339 2674340 CA2559_08836 CA2559_08841     FALSE 0.178 90.000 0.000 NA   NA
 2674340 2674341 CA2559_08841 CA2559_08846     TRUE 0.949 1.000 0.158 NA   NA
 2674341 2674342 CA2559_08846 CA2559_08851     TRUE 0.964 0.000 0.239 NA   NA
 2674343 2674344 CA2559_08856 CA2559_08861     FALSE 0.013 435.000 0.000 NA   NA
 2674344 2674345 CA2559_08861 CA2559_08866     TRUE 0.852 3.000 0.036 NA   NA
 2674346 2674347 CA2559_08871 CA2559_08876     FALSE 0.026 234.000 0.000 NA   NA
 2674347 2674348 CA2559_08876 CA2559_08881     FALSE 0.194 81.000 0.000 NA   NA
 2674348 2674349 CA2559_08881 CA2559_08886     TRUE 0.926 4.000 0.118 NA   NA
 2674349 2674350 CA2559_08886 CA2559_08891     FALSE 0.061 166.000 0.000 NA   NA
 2674350 2674351 CA2559_08891 CA2559_08896     FALSE 0.185 86.000 0.000 NA   NA
 2674351 2674352 CA2559_08896 CA2559_08901     TRUE 0.993 -19.000 1.000 1.000 Y NA
 2674352 2674353 CA2559_08901 CA2559_08906     FALSE 0.009 521.000 0.000 1.000 N NA
 2674353 2674354 CA2559_08906 CA2559_08911     FALSE 0.470 41.000 0.005 NA   NA
 2674354 2674355 CA2559_08911 CA2559_08916     TRUE 0.943 -3.000 0.161 NA   NA
 2674355 2674356 CA2559_08916 CA2559_08921     TRUE 0.947 -3.000 0.165 1.000   NA
 2674356 2674357 CA2559_08921 CA2559_08926     TRUE 0.939 -10.000 0.174 1.000   NA
 2674357 2674358 CA2559_08926 CA2559_08931     TRUE 0.993 -43.000 0.500 0.001 Y NA
 2674359 2674360 CA2559_08936 CA2559_08941     TRUE 0.667 10.000 0.000 NA   NA
 2674361 2674362 CA2559_08946 CA2559_08951     FALSE 0.154 108.000 0.000 NA   NA
 2674362 2674363 CA2559_08951 CA2559_08956     FALSE 0.233 115.000 0.030 NA   NA
 2674364 2674365 CA2559_08961 CA2559_08966     FALSE 0.219 109.000 0.023 NA   NA
 2674367 2674368 CA2559_08976 CA2559_08981     TRUE 0.982 45.000 0.430 0.003 Y NA
 2674368 2674369 CA2559_08981 CA2559_08986     TRUE 0.983 44.000 0.433 0.003 Y NA
 2674369 2674370 CA2559_08986 CA2559_08991     TRUE 0.991 4.000 0.210 0.003 Y NA
 2674370 2674371 CA2559_08991 CA2559_08996     TRUE 0.724 142.000 0.128 0.003 Y NA
 2674371 2674372 CA2559_08996 CA2559_09001     FALSE 0.060 142.000 0.000 1.000 N NA
 2674372 2674373 CA2559_09001 CA2559_09006     FALSE 0.354 43.000 0.000 1.000 N NA
 2674373 2674374 CA2559_09006 CA2559_09011     TRUE 0.992 -7.000 0.294 0.003 Y NA
 2674374 2674375 CA2559_09011 CA2559_09016   hisG TRUE 0.990 3.000 0.171 0.003 Y NA
 2674376 2674377 CA2559_09021 CA2559_09026     TRUE 0.966 13.000 0.500 NA   NA
 2674378 2674379 CA2559_09031 CA2559_09036     TRUE 0.935 -3.000 0.135 1.000   NA
 2674379 2674380 CA2559_09036 CA2559_09041     TRUE 0.795 0.000 0.031 1.000 N NA
 2674381 2674382 CA2559_09046 CA2559_09051     FALSE 0.292 150.000 0.000 1.000 Y NA
 2674383 2674384 CA2559_09056 CA2559_09061     TRUE 0.717 -3.000 0.000 NA   NA
 2674386 2674387 CA2559_09071 CA2559_09076     TRUE 0.904 15.000 0.150 NA   NA
 2674390 2674391 CA2559_09091 CA2559_09096     FALSE 0.168 184.000 0.101 NA   NA
 2674391 2674392 CA2559_09096 CA2559_09101     FALSE 0.524 79.000 0.107 NA   NA
 2674392 2674393 CA2559_09101 CA2559_09106     TRUE 0.594 41.000 0.000 0.063 N NA
 2674393 2674394 CA2559_09106 CA2559_09111     FALSE 0.428 51.000 0.000 1.000   NA
 2674394 2674395 CA2559_09111 CA2559_09116     FALSE 0.506 35.000 0.000 NA   NA
 2674396 2674397 CA2559_09121 CA2559_09126     TRUE 0.754 53.000 0.120 NA   NA
 2674397 2674398 CA2559_09126 CA2559_09131     TRUE 0.976 -28.000 0.727 NA   NA
 2674398 2674399 CA2559_09131 CA2559_09136     TRUE 0.979 -19.000 0.812 NA   NA
 2674403 2674404 CA2559_09156 CA2559_09161     TRUE 0.974 0.000 0.346 NA   NA
 2674404 2674405 CA2559_09161 CA2559_09166     TRUE 0.901 32.000 0.212 NA   NA