MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas aeruginosa PAO1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 56451 56452 PA0001 PA0002 dnaA dnaN TRUE 0.968 29.000 0.328 1.000 Y NA
 56452 56453 PA0002 PA0003 dnaN recF TRUE 0.988 10.000 0.318 1.000 Y NA
 56453 56454 PA0003 PA0004 recF gyrB TRUE 0.999 -3.000 0.249 0.003 Y NA
 56455 56456 PA0005 PA0006 lptA   TRUE 0.949 12.000 0.310 1.000 N NA
 56458 56459 PA0008 PA0009 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.651 0.000 Y NA
 56460 56461 PA0010 PA0011 tag   FALSE 0.130 144.000 0.017 1.000 N NA
 56461 56462 PA0011 PA0012     FALSE 0.393 85.000 0.053 NA   NA
 56462 56463 PA0012 PA0013     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 56464 56465 PA0014 PA0015     FALSE 0.011 293.000 0.000 NA   NA
 56465 56466 PA0015 PA0016   trkA FALSE 0.119 149.000 0.008 1.000   NA
 56466 56467 PA0016 PA0017 trkA   TRUE 0.799 28.000 0.122 1.000 N NA
 56467 56468 PA0017 PA0018   fmt TRUE 0.997 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 56468 56469 PA0018 PA0019 fmt def TRUE 0.938 55.000 0.105 0.017 Y NA
 56470 56471 PA0020 PA0021     FALSE 0.216 135.000 0.043 1.000   NA
 56471 56472 PA0021 PA0022     TRUE 0.488 41.000 0.023 NA N NA
 56474 56475 PA0024 PA0025 hemF aroE TRUE 0.583 58.000 0.093 1.000 N NA
 56475 56476 PA0025 PA0026 aroE plcB FALSE 0.094 111.000 0.000 1.000   NA
 56476 56477 PA0026 PA0027 plcB   TRUE 0.816 -19.000 0.000 1.000   NA
 56477 56478 PA0027 PA0028     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56479 56480 PA0029 PA0030     TRUE 0.982 5.000 0.259 0.080 N NA
 56480 56481 PA0030 PA0031   betC TRUE 0.907 17.000 0.218 1.000 N NA
 56483 56484 PA0033 PA0034     TRUE 0.947 8.000 0.000 NA Y NA
 56484 56485 PA0034 PA0035   trpA FALSE 0.032 186.000 0.000 1.000 N NA
 56485 56486 PA0035 PA0036 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.000 Y NA
 56487 56488 PA0037 PA0038 trpI   FALSE 0.102 101.000 0.000 NA   NA
 56488 56489 PA0038 PA0039     FALSE 0.131 184.000 0.049 NA   NA
 56489 56490 PA0039 PA0040     FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 56490 56491 PA0040 PA0041     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 56491 56492 PA0041 PA0042     FALSE 0.003 3025.000 0.000 NA   NA
 56494 56495 PA0044 PA0045 exoT   FALSE 0.004 497.000 0.000 1.000 N NA
 56495 56496 PA0045 PA0046     TRUE 0.940 31.000 0.625 NA   NA
 56496 56497 PA0046 PA0047     TRUE 0.678 153.000 0.740 NA   NA
 56498 56499 PA0048 PA0049     FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 56500 56501 PA0050 PA0051   phzH FALSE 0.003 824.000 0.000 NA   NA
 56504 56505 PA0054 PA0055     FALSE 0.301 39.000 0.000 NA   NA
 56505 56506 PA0055 PA0056     FALSE 0.176 66.000 0.000 NA   NA
 56507 56508 PA0057 PA0058     TRUE 0.651 63.000 0.157 1.000   NA
 56508 56509 PA0058 PA0059   osmC TRUE 0.605 84.000 0.000 1.000 Y NA
 56509 56510 PA0059 PA0060 osmC   FALSE 0.215 111.000 0.026 NA   NA
 56511 56512 PA0061 PA0062     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 56514 56515 PA0064 PA0065     TRUE 0.519 33.000 0.009 1.000   NA
 56515 56516 PA0065 PA0066     TRUE 0.926 -7.000 0.016 1.000   NA
 56517 56518 PA0067 PA0068 prlC   TRUE 0.982 -3.000 0.173 NA   NA
 56518 56519 PA0068 PA0069     FALSE 0.219 89.000 0.006 NA   NA
 56520 56521 PA0070 PA0071     TRUE 0.885 62.000 0.714 NA   NA
 56521 56522 PA0071 PA0072     TRUE 0.978 -7.000 0.161 NA   NA
 56522 56523 PA0072 PA0073     TRUE 0.992 0.000 0.710 NA N NA
 56523 56524 PA0073 PA0074   ppkA TRUE 0.990 -3.000 0.160 0.100 N NA
 56524 56525 PA0074 PA0075 ppkA   TRUE 0.996 8.000 1.000 1.000 Y NA
 56525 56526 PA0075 PA0076     TRUE 0.920 10.000 0.128 NA   NA
 56526 56527 PA0076 PA0077     TRUE 0.978 -3.000 0.128 NA   NA
 56527 56528 PA0077 PA0078     FALSE 0.441 222.000 0.714 NA   NA
 56528 56529 PA0078 PA0079     TRUE 0.985 7.000 0.714 NA   NA
 56529 56530 PA0079 PA0080     TRUE 0.975 16.000 0.833 NA   NA
 56530 56531 PA0080 PA0081     TRUE 0.932 45.000 0.833 NA   NA
 56532 56533 PA0082 PA0083     TRUE 0.601 89.000 0.209 NA   NA
 56533 56534 PA0083 PA0084     TRUE 0.969 13.000 0.588 NA   NA
 56534 56535 PA0084 PA0085     TRUE 0.719 76.000 0.294 NA   NA
 56535 56536 PA0085 PA0086     FALSE 0.251 168.000 0.125 NA   NA
 56536 56537 PA0086 PA0087     TRUE 0.979 2.000 0.311 NA   NA
 56537 56538 PA0087 PA0088     TRUE 0.976 -3.000 0.111 NA   NA
 56538 56539 PA0088 PA0089     TRUE 0.989 -36.000 0.500 NA   NA
 56539 56540 PA0089 PA0090     TRUE 0.988 -7.000 0.333 NA   NA
 56540 56541 PA0090 PA0091     TRUE 0.714 47.000 0.143 NA   NA
 56542 56543 PA0092 PA0093     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56543 56544 PA0093 PA0094     TRUE 0.499 16.000 0.000 NA   NA
 56545 56546 PA0095 PA0096     TRUE 0.833 28.000 0.160 NA   NA
 56546 56547 PA0096 PA0097     TRUE 0.970 -70.000 0.160 NA   NA
 56547 56548 PA0097 PA0098     TRUE 0.984 -3.000 0.200 NA   NA
 56548 56549 PA0098 PA0099     TRUE 0.976 0.000 0.200 NA   NA
 56549 56550 PA0099 PA0100     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 56550 56551 PA0100 PA0101     TRUE 0.964 -18.000 0.105 NA   NA
 56551 56552 PA0101 PA0102     FALSE 0.007 376.000 0.000 1.000   NA
 56552 56553 PA0102 PA0103     TRUE 0.525 211.000 0.241 1.000 Y NA
 56553 56554 PA0103 PA0104     FALSE 0.259 137.000 0.069 NA   NA
 56554 56555 PA0104 PA0105   coxB FALSE 0.015 264.000 0.000 NA   NA
 56555 56556 PA0105 PA0106 coxB coxA TRUE 0.998 10.000 0.741 0.003 Y NA
 56556 56557 PA0106 PA0107 coxA   TRUE 0.948 11.000 0.268 1.000 N NA
 56557 56558 PA0107 PA0108   coIII TRUE 0.972 11.000 0.536 1.000 N NA
 56560 56561 PA0110 PA0111     TRUE 0.993 -25.000 0.722 NA   NA
 56561 56562 PA0111 PA0112     TRUE 0.731 65.000 0.255 NA   NA
 56562 56563 PA0112 PA0113     TRUE 0.972 26.000 0.321 1.000 Y NA
 56563 56564 PA0113 PA0114     TRUE 0.801 26.000 0.099 1.000   NA
 56566 56567 PA0116 PA0117     FALSE 0.101 257.000 0.128 NA   NA
 56567 56568 PA0117 PA0118     TRUE 0.931 25.000 0.429 1.000   NA
 56568 56569 PA0118 PA0119     FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 56569 56570 PA0119 PA0120     TRUE 0.652 49.000 0.102 1.000 N NA
 56570 56571 PA0120 PA0121     TRUE 0.759 101.000 0.000 0.003 Y NA
 56571 56572 PA0121 PA0122     FALSE 0.040 180.000 0.000 1.000   NA
 56573 56574 PA0123 PA0124     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 56574 56575 PA0124 PA0125     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56575 56576 PA0125 PA0126     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 56577 56578 PA0127 PA0128     FALSE 0.164 73.000 0.000 1.000   NA
 56579 56580 PA0129 PA0130 gabP   FALSE 0.040 169.000 0.000 1.000 N NA
 56580 56581 PA0130 PA0131     FALSE 0.413 84.000 0.059 NA   NA
 56581 56582 PA0131 PA0132     TRUE 0.948 0.000 0.059 NA   NA
 56585 56586 PA0135 PA0136     FALSE 0.004 581.000 0.000 NA   NA
 56586 56587 PA0136 PA0137     TRUE 0.991 0.000 0.590 1.000   NA
 56587 56588 PA0137 PA0138     TRUE 0.925 23.000 0.154 0.079   NA
 56588 56589 PA0138 PA0139   ahpC FALSE 0.050 165.000 0.000 1.000   NA
 56589 56590 PA0139 PA0140 ahpC ahpF TRUE 0.845 145.000 0.551 1.000 Y NA
 56592 56593 PA0142 PA0143   nuh TRUE 0.493 108.000 0.000 1.000 Y NA
 56594 56595 PA0144 PA0145     FALSE 0.378 150.000 0.000 NA Y NA
 56596 56597 PA0146 PA0147     TRUE 0.544 73.000 0.106 1.000   NA
 56597 56598 PA0147 PA0148     FALSE 0.227 105.000 0.025 1.000   NA
 56598 56599 PA0148 PA0149     FALSE 0.027 198.000 0.000 1.000 N NA
 56599 56600 PA0149 PA0150     TRUE 0.994 -3.000 0.588 NA N NA
 56600 56601 PA0150 PA0151     TRUE 0.599 149.000 0.085 NA Y NA
 56601 56602 PA0151 PA0152   pcaQ FALSE 0.006 377.000 0.000 1.000 N NA
 56602 56603 PA0152 PA0153 pcaQ pcaH TRUE 0.653 135.000 0.153 0.001 N NA
 56603 56604 PA0153 PA0154 pcaH pcaG TRUE 0.998 11.000 0.782 0.000 Y NA
 56604 56605 PA0154 PA0155 pcaG pcaR FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000 N NA
 56605 56606 PA0155 PA0156 pcaR   FALSE 0.051 153.000 0.000 1.000 N NA
 56606 56607 PA0156 PA0157     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 56607 56608 PA0157 PA0158     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 56608 56609 PA0158 PA0159     FALSE 0.026 199.000 0.000 NA N NA
 56609 56610 PA0159 PA0160     FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 56610 56611 PA0160 PA0161     FALSE 0.013 280.000 0.000 NA   NA
 56611 56612 PA0161 PA0162     FALSE 0.055 155.000 0.000 NA   NA
 56614 56615 PA0164 PA0165     FALSE 0.003 672.000 0.000 1.000 N NA
 56615 56616 PA0165 PA0166     FALSE 0.016 242.000 0.000 1.000 N NA
 56616 56617 PA0166 PA0167     TRUE 0.596 93.000 0.240 1.000 N NA
 56617 56618 PA0167 PA0168     TRUE 0.841 6.000 0.019 1.000   NA
 56619 56620 PA0169 PA0170     FALSE 0.290 127.000 0.073 NA   NA
 56620 56621 PA0170 PA0171     TRUE 0.965 27.000 0.911 NA   NA
 56621 56622 PA0171 PA0172     TRUE 0.928 9.000 0.133 NA   NA
 56622 56623 PA0172 PA0173     FALSE 0.125 263.000 0.000 1.000 Y NA
 56623 56624 PA0173 PA0174     TRUE 0.947 20.000 0.078 1.000 Y NA
 56624 56625 PA0174 PA0175     TRUE 0.978 6.000 0.067 1.000 Y NA
 56625 56626 PA0175 PA0176   aer2 TRUE 0.929 70.000 0.444 1.000 Y NA
 56626 56627 PA0176 PA0177 aer2   TRUE 0.921 36.000 0.000 0.012 Y NA
 56627 56628 PA0177 PA0178     TRUE 0.996 -13.000 0.105 0.012 Y NA
 56628 56629 PA0178 PA0179     TRUE 0.976 28.000 0.444 1.000 Y NA
 56629 56630 PA0179 PA0180     FALSE 0.420 198.000 0.082 1.000 Y NA
 56630 56631 PA0180 PA0181     FALSE 0.029 193.000 0.000 1.000 N NA
 56633 56634 PA0183 PA0184 atsA   TRUE 0.925 88.000 0.571 1.000 Y NA
 56634 56635 PA0184 PA0185     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 56636 56637 PA0186 PA0187     FALSE 0.005 418.000 0.000 1.000 N NA
 56637 56638 PA0187 PA0188     TRUE 0.972 -3.000 0.082 1.000   NA
 56642 56643 PA0192 PA0193     FALSE 0.262 41.000 0.000 1.000 N NA
 56643 56644 PA0193 PA0194     TRUE 0.800 68.000 0.000 0.077 Y NA
 56644 56645 PA0194 PA0195   pntA FALSE 0.014 647.000 0.000 0.077 N NA
 56645 56646 PA0195 PA0195.1 pntA pntAB TRUE 0.952 76.000 0.829 0.001   NA
 56646 56647 PA0195.1 PA0196 pntAB pntB TRUE 0.991 0.000 0.144 0.001   NA
 56647 56648 PA0196 PA0197 pntB   FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000 N NA
 56648 56649 PA0197 PA0198   exbB1 TRUE 0.978 29.000 0.778 0.017 N NA
 56649 56650 PA0198 PA0199 exbB1 exbD1 TRUE 0.998 2.000 0.778 0.096 Y NA
 56653 56654 PA0202 PA0203     TRUE 0.823 66.000 0.500 1.000 N NA
 56654 56655 PA0203 PA0204     TRUE 0.993 23.000 0.800 0.079 Y NA
 56655 56656 PA0204 PA0205     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.079 Y NA
 56656 56657 PA0205 PA0206     TRUE 0.974 26.000 0.364 1.000 Y NA
 56658 56659 PA0207 PA0208   mdcA FALSE 0.084 121.000 0.000 1.000   NA
 56659 56660 PA0208 PA0209 mdcA   TRUE 0.990 0.000 0.508 1.000   NA
 56660 56661 PA0209 PA0210   mdcC TRUE 0.986 2.000 0.475 NA   NA
 56661 56662 PA0210 PA0211 mdcC mdcD TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 56662 56663 PA0211 PA0212 mdcD mdcE TRUE 0.995 -3.000 0.700 NA   NA
 56663 56664 PA0212 PA0213 mdcE   TRUE 0.942 16.000 0.339 NA   NA
 56664 56665 PA0213 PA0214     TRUE 0.995 -3.000 0.651 1.000   NA
 56665 56666 PA0214 PA0215     TRUE 0.720 57.000 0.200 1.000   NA
 56666 56667 PA0215 PA0216     TRUE 0.989 6.000 0.945 NA   NA
 56668 56669 PA0217 PA0218     FALSE 0.144 329.000 0.000 0.099 Y NA
 56670 56671 PA0219 PA0220     TRUE 0.615 58.000 0.118 1.000 N NA
 56671 56672 PA0220 PA0221     TRUE 0.838 31.000 0.200 1.000 N NA
 56672 56673 PA0221 PA0222     FALSE 0.043 164.000 0.000 1.000 N NA
 56674 56675 PA0223 PA0224     TRUE 0.787 60.000 0.333 1.000 N NA
 56676 56677 PA0225 PA0226     FALSE 0.053 151.000 0.000 1.000 N NA
 56677 56678 PA0226 PA0227     TRUE 0.999 -3.000 0.739 0.000 Y NA
 56678 56679 PA0227 PA0228   pcaF TRUE 0.997 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 56679 56680 PA0228 PA0229 pcaF pcaT FALSE 0.198 150.000 0.051 1.000 N NA
 56680 56681 PA0229 PA0230 pcaT pcaB TRUE 0.713 23.000 0.042 1.000 N NA
 56681 56682 PA0230 PA0231 pcaB pcaD TRUE 0.822 16.000 0.063 1.000   NA
 56682 56683 PA0231 PA0232 pcaD pcaC TRUE 0.929 11.000 0.174 1.000   NA
 56683 56684 PA0232 PA0233 pcaC   FALSE 0.043 175.000 0.000 1.000   NA
 56684 56685 PA0233 PA0234     FALSE 0.226 191.000 0.167 NA   NA
 56687 56688 PA0236 PA0237     FALSE 0.170 243.000 0.222 1.000   NA
 56688 56689 PA0237 PA0238     TRUE 0.845 23.000 0.143 NA   NA
 56689 56690 PA0238 PA0239     FALSE 0.219 150.000 0.057 NA   NA
 56691 56692 PA0240 PA0241     FALSE 0.474 66.000 0.000 0.087   NA
 56693 56694 PA0242 PA0243     FALSE 0.464 93.000 0.122 1.000 N NA
 56695 56696 PA0244 PA0245   aroQ2 TRUE 0.998 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 56696 56697 PA0245 PA0246 aroQ2   FALSE 0.075 117.000 0.000 1.000 N NA
 56697 56698 PA0246 PA0247   pobA FALSE 0.107 175.000 0.029 1.000 N NA
 56700 56701 PA0249 PA0250     FALSE 0.428 78.000 0.000 0.087   NA
 56701 56702 PA0250 PA0251     FALSE 0.055 155.000 0.000 NA   NA
 56702 56703 PA0251 PA0252     FALSE 0.014 265.000 0.000 NA   NA
 56703 56704 PA0252 PA0253     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 56704 56705 PA0253 PA0254     FALSE 0.252 41.000 0.000 NA N NA
 56705 56706 PA0254 PA0255     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 56706 56707 PA0255 PA0256     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 56707 56708 PA0256 PA0257     FALSE 0.015 264.000 0.000 NA   NA
 56708 56709 PA0257 PA0258     TRUE 0.924 30.000 0.476 NA   NA
 56709 56710 PA0258 PA0259     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 56710 56711 PA0259 PA0260     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 56711 56712 PA0260 PA0261     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56712 56713 PA0261 PA0262     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 56713 56714 PA0262 PA0263   hcpC FALSE 0.038 182.000 0.000 NA   NA
 56714 2200464 PA0263 PA0263.1 hcpC   FALSE 0.003 1255.000 0.000 NA   NA
 2200464 56715 PA0263.1 PA0264     FALSE 0.034 189.000 0.000 NA   NA
 56716 56717 PA0265 PA0266 gabD gabT FALSE 0.202 245.000 0.303 1.000 N NA
 56717 56718 PA0266 PA0267 gabT   FALSE 0.076 326.000 0.182 1.000 N NA
 56720 56721 PA0269 PA0270     TRUE 0.567 12.000 0.000 NA   NA
 56721 56722 PA0270 PA0271     FALSE 0.333 34.000 0.000 NA   NA
 56723 56724 PA0272 PA0273     TRUE 0.859 50.000 0.444 1.000 N NA
 56724 56725 PA0273 PA0274     FALSE 0.050 163.000 0.000 NA   NA
 56725 56726 PA0274 PA0275     FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 56728 56729 PA0277 PA0278     FALSE 0.045 172.000 0.000 1.000   NA
 56731 56732 PA0280 PA0281 cysA cysW TRUE 0.995 4.000 0.587 1.000 Y NA
 56732 56733 PA0281 PA0282 cysW cysT TRUE 0.995 11.000 0.935 0.000 N NA
 56733 56734 PA0282 PA0283 cysT sbp FALSE 0.465 162.000 0.066 0.002 N NA
 56734 56735 PA0283 PA0284 sbp   FALSE 0.283 177.000 0.188 NA   NA
 56735 56736 PA0284 PA0285     FALSE 0.190 164.000 0.062 NA   NA
 56737 56738 PA0286 PA0287   gpuP FALSE 0.018 231.000 0.000 1.000 N NA
 56738 56739 PA0287 PA0288 gpuP gpuA TRUE 0.859 56.000 0.087 1.000 Y NA
 56739 56740 PA0288 PA0289 gpuA gpuR FALSE 0.200 53.000 0.000 1.000 N NA
 56740 56741 PA0289 PA0290 gpuR   FALSE 0.078 113.000 0.000 1.000 N NA
 56741 56742 PA0290 PA0291   oprE FALSE 0.004 613.000 0.000 1.000   NA
 56743 56744 PA0292 PA0293 aguA aguB FALSE 0.461 86.000 0.084 1.000   NA
 56744 56745 PA0293 PA0294 aguB aguR FALSE 0.142 163.000 0.032 1.000   NA
 56745 56746 PA0294 PA0295 aguR   TRUE 0.575 63.000 0.105 1.000 N NA
 56746 56747 PA0295 PA0296     FALSE 0.134 256.000 0.000 1.000 Y NA
 56748 56749 PA0297 PA0298 spuA spuB TRUE 0.789 41.000 0.182 1.000   NA
 56749 56750 PA0298 PA0299 spuB spuC TRUE 0.703 66.000 0.239 1.000 N NA
 56750 56751 PA0299 PA0300 spuC spuD FALSE 0.076 116.000 0.000 1.000 N NA
 56751 56752 PA0300 PA0301 spuD spuE FALSE 0.118 419.000 0.000 0.023 Y NA
 56752 56753 PA0301 PA0302 spuE spuF TRUE 0.721 55.000 0.000 1.000 Y NA
 56753 56754 PA0302 PA0303 spuF spuG TRUE 0.858 27.000 0.000 1.000 Y NA
 56754 56755 PA0303 PA0304 spuG spuH TRUE 0.762 83.000 0.000 0.079 Y NA
 56764 56765 PA0313 PA0314     TRUE 0.969 72.000 0.625 0.079 Y NA
 56768 56769 PA0317 PA0318     FALSE 0.391 92.000 0.071 1.000 N NA
 56769 56770 PA0318 PA0319     FALSE 0.295 99.000 0.041 NA   NA
 56770 56771 PA0319 PA0320     TRUE 0.661 62.000 0.167 NA   NA
 56772 56773 PA0321 PA0322     FALSE 0.453 16.000 0.000 NA N NA
 56773 56774 PA0322 PA0323     FALSE 0.051 421.000 0.000 1.000 Y NA
 56774 56775 PA0323 PA0324     TRUE 0.988 48.000 1.000 0.079 Y NA
 56775 56776 PA0324 PA0325     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.079 Y NA
 56776 56777 PA0325 PA0326     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 56779 56780 PA0328 PA0329     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 56780 56781 PA0329 PA0330   rpiA FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 56782 56783 PA0331 PA0332 ilvA1   FALSE 0.221 120.000 0.034 NA   NA
 56783 56784 PA0332 PA0333     TRUE 0.674 51.000 0.125 NA   NA
 56785 56786 PA0334 PA0335     FALSE 0.472 50.000 0.032 1.000 N NA
 56787 56788 PA0336 PA0337 ygdP ptsP TRUE 0.806 23.000 0.097 1.000 N NA
 56788 56789 PA0337 PA0338 ptsP   TRUE 0.863 26.000 0.000 1.000 Y NA
 56791 56792 PA0340 PA0341   lgt TRUE 0.833 10.000 0.030 1.000   NA
 56792 56793 PA0341 PA0342 lgt thyA FALSE 0.188 206.000 0.164 1.000 N NA
 56794 56795 PA0343 PA0344     FALSE 0.328 35.000 0.000 NA   NA
 56795 56796 PA0344 PA0345     TRUE 0.996 -7.000 0.904 NA   NA
 56799 56800 PA0348 PA0349     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 56800 56801 PA0349 PA0350   folA FALSE 0.141 83.000 0.000 NA   NA
 56802 56803 PA0351 PA0352     FALSE 0.070 139.000 0.000 1.000   NA
 56803 56804 PA0352 PA0353   ilvD FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 56804 56805 PA0353 PA0354 ilvD   FALSE 0.009 329.000 0.000 1.000   NA
 56805 56806 PA0354 PA0355   pfpI FALSE 0.365 73.000 0.031 1.000   NA
 56807 56808 PA0356 PA0357   mutM FALSE 0.334 59.000 0.015 NA N NA
 56808 56809 PA0357 PA0358 mutM   FALSE 0.231 77.000 0.003 1.000 N NA
 56809 56810 PA0358 PA0359     FALSE 0.141 83.000 0.000 NA   NA
 56810 56811 PA0359 PA0360     FALSE 0.014 270.000 0.000 NA   NA
 56812 56813 PA0361 PA0362   fdx1 FALSE 0.297 128.000 0.076 1.000   NA
 56813 56814 PA0362 PA0363 fdx1 coaD FALSE 0.334 121.000 0.088 1.000   NA
 56814 56815 PA0363 PA0364 coaD   FALSE 0.107 152.000 0.011 1.000 N NA
 56815 56816 PA0364 PA0365     TRUE 0.917 56.000 0.886 NA   NA
 56816 56817 PA0365 PA0366     TRUE 0.799 55.000 0.308 NA   NA
 56819 56820 PA0368 PA0369     FALSE 0.314 37.000 0.000 NA   NA
 56820 56821 PA0369 PA0370     FALSE 0.013 279.000 0.000 NA   NA
 56821 56822 PA0370 PA0371     TRUE 0.954 0.000 0.070 1.000   NA
 56822 56823 PA0371 PA0372     TRUE 0.997 -7.000 0.598 0.006   NA
 56824 56825 PA0373 PA0374 ftsY ftsE TRUE 0.988 -3.000 0.117 0.098 N NA
 56825 56826 PA0374 PA0375 ftsE ftsX TRUE 0.985 0.000 0.035 NA Y NA
 56826 56827 PA0375 PA0376 ftsX rpoH FALSE 0.270 114.000 0.054 NA N NA
 56827 56828 PA0376 PA0377 rpoH   FALSE 0.295 65.000 0.005 NA   NA
 56830 56831 PA0379 PA0380     FALSE 0.323 103.000 0.058 NA   NA
 56831 56832 PA0380 PA0381   thiG TRUE 0.872 59.000 0.130 1.000 Y NA
 56832 56833 PA0381 PA0382 thiG micA FALSE 0.212 154.000 0.060 1.000   NA
 56833 56834 PA0382 PA0383 micA   FALSE 0.089 163.000 0.004 NA   NA
 56835 56836 PA0384 PA0385     FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 56836 56837 PA0385 PA0386     FALSE 0.261 81.000 0.011 NA   NA
 56837 56838 PA0386 PA0387     FALSE 0.474 121.000 0.218 1.000 N NA
 56838 56839 PA0387 PA0388     TRUE 0.963 -3.000 0.050 NA   NA
 56839 56840 PA0388 PA0389     FALSE 0.319 132.000 0.100 NA   NA
 56840 56841 PA0389 PA0390   metX TRUE 0.978 8.000 0.509 NA   NA
 56841 56842 PA0390 PA0391 metX   FALSE 0.293 89.000 0.027 1.000   NA
 56842 56843 PA0391 PA0392     FALSE 0.006 401.000 0.000 NA   NA
 56843 56844 PA0392 PA0393   proC TRUE 0.920 11.000 0.152 NA   NA
 56844 56845 PA0393 PA0394 proC   TRUE 0.914 12.000 0.158 NA   NA
 56846 56847 PA0395 PA0396 pilT pilU TRUE 0.856 178.000 0.436 0.017 Y NA
 56849 56850 PA0398 PA0399     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 56850 56851 PA0399 PA0400     TRUE 0.997 -3.000 0.133 0.019 Y NA
 56852 56853 PA0401 PA0402 pyrC pyrB TRUE 0.998 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 56853 56854 PA0402 PA0403 pyrB pyrR TRUE 0.966 24.000 0.247 1.000 Y NA
 56854 56855 PA0403 PA0404 pyrR   FALSE 0.373 112.000 0.109 1.000 N NA
 56855 56856 PA0404 PA0405     TRUE 0.981 0.000 0.263 NA N NA
 56856 56857 PA0405 PA0406     TRUE 0.578 49.000 0.064 NA N NA
 56857 56858 PA0406 PA0407   gshB TRUE 0.478 81.000 0.089 1.000 N NA
 56859 56860 PA0408 PA0409 pilG pilH TRUE 0.972 47.000 0.296 0.022 Y NA
 56860 56861 PA0409 PA0410 pilH pilI TRUE 0.930 51.000 0.266 1.000 Y NA
 56861 56862 PA0410 PA0411 pilI pilJ TRUE 0.976 85.000 0.795 0.012 Y NA
 56862 56863 PA0411 PA0412 pilJ pilK TRUE 0.907 61.000 0.241 1.000 Y NA
 56863 56864 PA0412 PA0413 pilK chpA TRUE 0.980 12.000 0.217 1.000 Y NA
 56864 56865 PA0413 PA0414 chpA chpB TRUE 0.998 -7.000 0.217 0.012 Y NA
 56865 56866 PA0414 PA0415 chpB chpC TRUE 0.997 -3.000 0.517 0.012   NA
 56866 56867 PA0415 PA0416 chpC chpD TRUE 0.908 8.000 0.000 0.063   NA
 56867 56868 PA0416 PA0417 chpD chpE FALSE 0.450 76.000 0.067 1.000 N NA
 56869 56870 PA0418 PA0419     FALSE 0.328 35.000 0.000 NA   NA
 56870 56871 PA0419 PA0420   bioA FALSE 0.321 93.000 0.041 NA   NA
 56872 56873 PA0421 PA0422     FALSE 0.239 181.000 0.032 0.076 N NA
 56873 56874 PA0422 PA0423     TRUE 0.977 12.000 0.676 NA   NA
 56876 56877 PA0425 PA0426 mexA mexB TRUE 0.961 16.000 0.565 1.000 N NA
 56877 56878 PA0426 PA0427 mexB oprM TRUE 0.993 2.000 0.538 0.078 N NA
 56879 56880 PA0428 PA0429     FALSE 0.017 251.000 0.000 NA   NA
 56880 56881 PA0429 PA0430   metF FALSE 0.286 70.000 0.010 NA   NA
 56881 56882 PA0430 PA0431 metF   FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 56882 56883 PA0431 PA0432   sahH FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 56884 56885 PA0433 PA0434     FALSE 0.076 126.000 0.000 NA   NA
 56885 56886 PA0434 PA0435     TRUE 0.595 11.000 0.000 NA   NA
 56886 56887 PA0435 PA0436     FALSE 0.136 85.000 0.000 NA   NA
 56888 56889 PA0437 PA0438 codA codB TRUE 0.995 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 56889 56890 PA0438 PA0439 codB   FALSE 0.271 182.000 0.000 1.000 Y NA
 56890 56891 PA0439 PA0440     TRUE 0.995 -3.000 0.301 0.014 N NA
 56891 56892 PA0440 PA0441   dht FALSE 0.306 95.000 0.043 1.000 N NA
 56892 56893 PA0441 PA0442 dht   FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 56894 56895 PA0443 PA0444     TRUE 0.532 59.000 0.069 1.000 N NA
 56896 56897 PA0445 PA0446     FALSE 0.014 256.000 0.000 1.000 N NA
 56897 56898 PA0446 PA0447   gcdH FALSE 0.389 120.000 0.143 1.000 N NA
 56899 56900 PA0448 PA0449     FALSE 0.426 18.000 0.000 NA N NA
 56902 56903 PA0451 PA0452     TRUE 0.997 -3.000 0.330 NA Y NA
 56904 56905 PA0453 PA0454     FALSE 0.124 90.000 0.000 NA   NA
 56905 56906 PA0454 PA0455   dbpA FALSE 0.030 261.000 0.010 NA   NA
 56907 56908 PA0456 PA0457     FALSE 0.053 151.000 0.000 1.000 N NA
 5922240 56909 PA0457.1 PA0458     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 56910 56911 PA0459 PA0460     FALSE 0.100 102.000 0.000 NA   NA
 56913 56914 PA0462 PA0463   creB FALSE 0.452 85.000 0.085 1.000 N NA
 56914 56915 PA0463 PA0464 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 56915 56916 PA0464 PA0465 creC creD TRUE 0.611 102.000 0.311 NA N NA
 56916 56917 PA0465 PA0466 creD   FALSE 0.473 50.000 0.029 NA   NA
 56918 56919 PA0467 PA0468     FALSE 0.414 19.000 0.000 NA N NA
 56921 56922 PA0470 PA0471     TRUE 0.904 104.000 0.600 NA Y NA
 56922 56923 PA0471 PA0472     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 56924 56925 PA0473 PA0474     FALSE 0.056 140.000 0.000 NA N NA
 56925 56926 PA0474 PA0475     FALSE 0.236 50.000 0.000 NA   NA
 56927 56928 PA0476 PA0477     FALSE 0.007 348.000 0.000 1.000 N NA
 56931 56932 PA0480 PA0481     FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 56934 56935 PA0483 PA0484     TRUE 0.832 32.000 0.048 0.086   NA
 56936 56937 PA0485 PA0486     FALSE 0.070 202.000 0.020 NA   NA
 56937 56938 PA0486 PA0487     FALSE 0.360 62.000 0.019 NA   NA
 56938 56939 PA0487 PA0488     FALSE 0.168 68.000 0.000 NA   NA
 56939 56940 PA0488 PA0489     FALSE 0.280 42.000 0.000 NA   NA
 56940 56941 PA0489 PA0490     FALSE 0.115 139.000 0.003 NA   NA
 56941 56942 PA0490 PA0491     FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 56943 56944 PA0492 PA0493     TRUE 0.681 77.000 0.242 1.000   NA
 56944 56945 PA0493 PA0494     TRUE 0.922 11.000 0.154 1.000   NA
 56945 56946 PA0494 PA0495     TRUE 0.986 2.000 0.514 1.000 N NA
 56946 56947 PA0495 PA0496     TRUE 0.999 -10.000 0.886 0.005 Y NA
 56948 56949 PA0497 PA0498     TRUE 0.573 78.000 0.000 0.002   NA
 56949 56950 PA0498 PA0499     TRUE 0.510 16.000 0.000 1.000   NA
 56951 56952 PA0500 PA0501 bioB bioF TRUE 0.904 106.000 0.168 0.001 Y NA
 56952 56953 PA0501 PA0502 bioF   TRUE 0.968 -7.000 0.092 NA   NA
 56953 56954 PA0502 PA0503     TRUE 0.978 -7.000 0.163 NA   NA
 56954 56955 PA0503 PA0504   bioD TRUE 0.977 4.000 0.063 0.001 N NA
 56955 56956 PA0504 PA0505 bioD   TRUE 0.542 109.000 0.244 NA   NA
 56956 56957 PA0505 PA0506     FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 56957 56958 PA0506 PA0507     FALSE 0.405 213.000 0.000 0.008 Y NA
 56958 56959 PA0507 PA0508     TRUE 0.489 274.000 0.150 0.008 Y NA
 56960 56961 PA0509 PA0510 nirN   TRUE 0.970 -9.000 0.125 1.000 N NA
 56961 56962 PA0510 PA0511   nirJ TRUE 0.606 11.000 0.000 1.000   NA
 56962 56963 PA0511 PA0512 nirJ   TRUE 0.851 -6.000 0.000 NA   NA
 56963 56964 PA0512 PA0513     TRUE 0.997 -25.000 0.483 NA Y NA
 56964 56965 PA0513 PA0514   nirL TRUE 0.995 -7.000 0.241 NA Y NA
 56965 56966 PA0514 PA0515 nirL   TRUE 0.997 -3.000 0.333 NA Y NA
 56966 56967 PA0515 PA0516   nirF TRUE 0.898 9.000 0.070 1.000   NA
 56967 56968 PA0516 PA0517 nirF nirC TRUE 0.994 -3.000 0.186 0.015   NA
 56968 56969 PA0517 PA0518 nirC nirM TRUE 0.997 -3.000 0.062 0.015 Y NA
 56969 56970 PA0518 PA0519 nirM nirS TRUE 0.942 51.000 0.094 0.015 Y NA
 56971 56972 PA0520 PA0521 nirQ   TRUE 0.711 35.000 0.071 1.000   NA
 56972 56973 PA0521 PA0522     TRUE 0.985 8.000 0.750 NA   NA
 56973 56974 PA0522 PA0523   norC FALSE 0.124 90.000 0.000 NA   NA
 56974 56975 PA0523 PA0524 norC norB TRUE 0.998 0.000 0.794 0.001   NA
 56975 56976 PA0524 PA0525 norB   TRUE 0.996 2.000 0.118 0.001 Y NA
 56977 56978 PA0526 PA0527   dnr FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 56980 56981 PA0529 PA0530     FALSE 0.117 226.000 0.000 0.019   NA
 56981 56982 PA0530 PA0531     TRUE 0.921 0.000 0.029 1.000 N NA
 56984 56985 PA0533 PA0534     FALSE 0.007 338.000 0.000 1.000 N NA
 56985 56986 PA0534 PA0535     TRUE 0.905 18.000 0.226 1.000 N NA
 56987 56988 PA0536 PA0537     TRUE 0.844 4.000 0.013 NA   NA
 56988 56989 PA0537 PA0538   dsbB FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 56990 56991 PA0539 PA0540     TRUE 0.713 70.000 0.267 NA   NA
 56991 56992 PA0540 PA0541     FALSE 0.340 113.000 0.080 NA   NA
 56997 56998 PA0546 PA0547 metK   TRUE 0.942 16.000 0.036 1.000 Y NA
 56999 57000 PA0548 PA0549 tktA   TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57002 57003 PA0551 PA0552 epd pgk TRUE 0.992 6.000 0.070 0.003 Y NA
 57003 57004 PA0552 PA0553 pgk   FALSE 0.254 73.000 0.003 NA   NA
 57004 57005 PA0553 PA0554     FALSE 0.418 160.000 0.273 NA   NA
 57005 57006 PA0554 PA0555   fda FALSE 0.326 120.000 0.084 NA   NA
 57006 57007 PA0555 PA0556 fda   FALSE 0.176 66.000 0.000 NA   NA
 57011 57012 PA0560 PA0561     FALSE 0.397 26.000 0.000 NA   NA
 57013 57014 PA0562 PA0563     FALSE 0.077 129.000 0.000 1.000   NA
 57014 57015 PA0563 PA0564     FALSE 0.042 178.000 0.000 1.000   NA
 57019 57020 PA0568 PA0569     TRUE 0.499 16.000 0.000 NA   NA
 57020 57021 PA0569 PA0570     TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 57021 57022 PA0570 PA0571     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 57022 57023 PA0571 PA0572     FALSE 0.033 191.000 0.000 NA   NA
 57023 57024 PA0572 PA0573     FALSE 0.004 570.000 0.000 1.000   NA
 57024 57025 PA0573 PA0574     FALSE 0.122 93.000 0.000 1.000   NA
 57025 2200466 PA0574 PA0574.1     FALSE 0.004 550.000 0.000 NA   NA
 2200466 57026 PA0574.1 PA0575     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57026 57027 PA0575 PA0576   rpoD FALSE 0.172 107.000 0.013 1.000 N NA
 57027 57028 PA0576 PA0577 rpoD dnaG TRUE 0.702 80.000 0.299 1.000 N NA
 57028 57029 PA0577 PA0578 dnaG   TRUE 0.550 83.000 0.137 1.000   NA
 57029 57030 PA0578 PA0579   rpsU TRUE 0.813 70.000 0.173 0.017   NA
 57033 57034 PA0582 PA0583 folB   TRUE 0.997 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 57035 57036 PA0584 PA0585 cca   FALSE 0.416 44.000 0.008 NA   NA
 57036 57037 PA0585 PA0586     FALSE 0.203 94.000 0.007 NA   NA
 57037 57038 PA0586 PA0587     TRUE 0.996 -3.000 0.761 NA   NA
 57038 57039 PA0587 PA0588     TRUE 0.785 101.000 0.683 NA   NA
 57039 57040 PA0588 PA0589   glpE FALSE 0.011 279.000 0.000 NA N NA
 57040 57041 PA0589 PA0590 glpE apaH TRUE 0.578 44.000 0.045 1.000   NA
 57041 57042 PA0590 PA0591 apaH   TRUE 0.982 0.000 0.267 NA   NA
 57042 57043 PA0591 PA0592   ksgA TRUE 0.693 37.000 0.078 NA N NA
 57043 57044 PA0592 PA0593 ksgA pdxA FALSE 0.465 116.000 0.197 1.000 N NA
 57044 57045 PA0593 PA0594 pdxA surA TRUE 0.994 -3.000 0.561 1.000 N NA
 57045 57046 PA0594 PA0595 surA ostA TRUE 0.951 -19.000 0.070 1.000 N NA
 57047 57048 PA0596 PA0597     TRUE 0.995 -3.000 0.642 NA   NA
 57048 57049 PA0597 PA0598     TRUE 0.946 2.000 0.091 1.000 N NA
 57051 57052 PA0600 PA0601     TRUE 0.986 46.000 0.667 0.028 Y NA
 57052 57053 PA0601 PA0602     FALSE 0.065 129.000 0.000 1.000 N NA
 57053 57054 PA0602 PA0603     FALSE 0.162 234.000 0.000 1.000 Y NA
 57054 57055 PA0603 PA0604     TRUE 0.955 56.000 0.556 1.000 Y NA
 57055 57056 PA0604 PA0605     TRUE 0.821 114.000 0.108 0.077 Y NA
 57056 57057 PA0605 PA0606     TRUE 0.851 106.000 0.145 0.077 Y NA
 57057 57058 PA0606 PA0607   rpe FALSE 0.131 124.000 0.007 1.000 N NA
 57058 57059 PA0607 PA0608 rpe gph TRUE 0.966 0.000 0.120 1.000   NA
 57059 57060 PA0608 PA0609 gph trpE TRUE 0.681 73.000 0.233 1.000   NA
 57061 57062 PA0610 PA0611 prtN prtR FALSE 0.104 100.000 0.000 NA   NA
 57063 57064 PA0612 PA0613     FALSE 0.246 48.000 0.000 NA   NA
 57064 57065 PA0613 PA0614     FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 57065 57066 PA0614 PA0615     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 57066 57067 PA0615 PA0616     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 57067 57068 PA0616 PA0617     TRUE 0.580 153.000 0.500 NA   NA
 57068 57069 PA0617 PA0618     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57069 57070 PA0618 PA0619     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57070 57071 PA0619 PA0620     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 57071 57072 PA0620 PA0621     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57072 57073 PA0621 PA0622     FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 57073 57074 PA0622 PA0623     TRUE 0.958 13.000 0.423 NA   NA
 57074 57075 PA0623 PA0624     TRUE 0.909 15.000 0.192 NA   NA
 57075 57076 PA0624 PA0625     FALSE 0.359 170.000 0.250 NA   NA
 57076 57077 PA0625 PA0626     TRUE 0.930 10.000 0.158 NA   NA
 57077 57078 PA0626 PA0627     TRUE 0.977 -25.000 0.211 NA   NA
 57078 57079 PA0627 PA0628     FALSE 0.201 58.000 0.000 NA   NA
 57079 57080 PA0628 PA0629     FALSE 0.340 33.000 0.000 NA   NA
 57080 57081 PA0629 PA0630     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57081 57082 PA0630 PA0631     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57082 57083 PA0631 PA0632     TRUE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 57083 57084 PA0632 PA0633     FALSE 0.161 71.000 0.000 NA   NA
 57084 57085 PA0633 PA0634     TRUE 0.954 12.000 0.333 NA   NA
 57085 57086 PA0634 PA0635     TRUE 0.939 30.000 0.600 NA   NA
 57086 57087 PA0635 PA0636     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 57087 57088 PA0636 PA0637     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57088 57089 PA0637 PA0638     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 57089 57090 PA0638 PA0639     TRUE 0.933 3.000 0.071 NA   NA
 57090 57091 PA0639 PA0640     FALSE 0.213 55.000 0.000 NA   NA
 57091 57092 PA0640 PA0641     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 57092 57093 PA0641 PA0642     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 57093 57094 PA0642 PA0643     FALSE 0.409 24.000 0.000 NA   NA
 57094 57095 PA0643 PA0644     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57095 57096 PA0644 PA0645     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 57096 57097 PA0645 PA0646     FALSE 0.110 96.000 0.000 NA   NA
 57097 57098 PA0646 PA0647     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57098 57099 PA0647 PA0648     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57099 57100 PA0648 PA0649   trpG FALSE 0.006 419.000 0.000 NA   NA
 57100 57101 PA0649 PA0650 trpG trpD TRUE 0.988 2.000 0.105 1.000 Y NA
 57101 57102 PA0650 PA0651 trpD trpC TRUE 0.997 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 57104 57105 PA0653 PA0654   speD FALSE 0.024 320.000 0.025 1.000 N NA
 57106 57107 PA0655 PA0656     FALSE 0.203 100.000 0.018 1.000 N NA
 57109 57110 PA0658 PA0659     TRUE 0.512 61.000 0.057 1.000   NA
 57110 57111 PA0659 PA0660     FALSE 0.410 122.000 0.154 1.000   NA
 57111 57112 PA0660 PA0661     TRUE 0.714 17.000 0.024 NA   NA
 57113 57114 PA0662 PA0663 argC   TRUE 0.893 0.000 0.008 NA   NA
 57114 57115 PA0663 PA0664     TRUE 0.956 1.000 0.103 NA   NA
 57115 57116 PA0664 PA0665     TRUE 0.483 78.000 0.079 NA   NA
 57117 57118 PA0666 PA0667     TRUE 0.961 3.000 0.184 NA N NA
 57119 2200467 PA0668 PA0668.1 tyrZ   FALSE 0.004 540.000 0.000 NA   NA
 2200467 2200468 PA0668.1 PA0668.2     FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 2200468 2200469 PA0668.2 PA0668.3     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 2200469 2200470 PA0668.3 PA0668.4     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 2200470 2200471 PA0668.4 PA0668.5     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 57120 57121 PA0669 PA0670 dnaE2   TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 57121 57122 PA0670 PA0671     TRUE 0.984 8.000 0.667 NA   NA
 57125 57126 PA0674 PA0675     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57126 57127 PA0675 PA0676     TRUE 0.873 70.000 0.800 NA N NA
 57128 57129 PA0677 PA0678     TRUE 0.976 -16.000 0.000 NA Y NA
 57132 57133 PA0681 PA0682     TRUE 0.967 8.000 0.029 1.000 Y NA
 57133 57134 PA0682 PA0683     TRUE 0.780 62.000 0.136 0.084   NA
 57134 57135 PA0683 PA0684     TRUE 0.954 -13.000 0.061 1.000   NA
 57135 57136 PA0684 PA0685     TRUE 0.991 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 57136 57137 PA0685 PA0686     TRUE 0.999 -3.000 0.776 0.005 Y NA
 57137 57138 PA0686 PA0687     TRUE 0.999 0.000 0.653 0.005 Y NA
 57138 57139 PA0687 PA0688     FALSE 0.004 514.000 0.000 NA N NA
 57139 57140 PA0688 PA0689     TRUE 0.918 86.000 0.500 NA Y NA
 57140 57141 PA0689 PA0690     FALSE 0.037 183.000 0.000 NA   NA
 57141 57142 PA0690 PA0691     FALSE 0.006 392.000 0.000 NA   NA
 57142 57143 PA0691 PA0692     FALSE 0.276 164.000 0.139 NA   NA
 57143 57144 PA0692 PA0693   exbB2 TRUE 0.938 24.000 0.472 1.000   NA
 57144 57145 PA0693 PA0694 exbB2 exbD2 TRUE 0.988 11.000 0.655 0.092   NA
 57145 57146 PA0694 PA0695 exbD2   TRUE 0.942 9.000 0.190 1.000 N NA
 57146 57147 PA0695 PA0696     TRUE 0.776 68.000 0.360 1.000   NA
 57147 57148 PA0696 PA0697     TRUE 0.913 35.000 0.480 NA   NA
 57148 57149 PA0697 PA0698     TRUE 0.920 29.000 0.429 NA   NA
 57149 57150 PA0698 PA0699     TRUE 0.981 5.000 0.500 NA   NA
 57150 57151 PA0699 PA0700     TRUE 0.962 0.000 0.100 NA   NA
 57151 57152 PA0700 PA0701     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 57153 57154 PA0702 PA0703     FALSE 0.127 79.000 0.000 NA N NA
 57154 57155 PA0703 PA0704     TRUE 0.570 71.000 0.133 1.000 N NA
 57155 57156 PA0704 PA0705     FALSE 0.063 128.000 0.000 NA N NA
 57156 57157 PA0705 PA0706   cat FALSE 0.016 255.000 0.000 NA   NA
 57157 57158 PA0706 PA0707 cat toxR FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 57158 57159 PA0707 PA0708 toxR   FALSE 0.012 286.000 0.000 NA   NA
 57160 57161 PA0709 PA0710   gloA2 FALSE 0.269 45.000 0.000 1.000   NA
 57162 57163 PA0711 PA0712     TRUE 0.558 61.000 0.080 NA   NA
 57164 57165 PA0713 PA0714     FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 57165 57166 PA0714 PA0715     FALSE 0.003 795.000 0.000 NA   NA
 57166 57167 PA0715 PA0716     TRUE 0.745 3.000 0.000 1.000   NA
 57167 57168 PA0716 PA0717     FALSE 0.003 891.000 0.000 NA   NA
 57168 57169 PA0717 PA0718     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 57169 57170 PA0718 PA0719     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 57170 57171 PA0719 PA0720     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 57171 57172 PA0720 PA0721     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57172 57173 PA0721 PA0722     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57173 57174 PA0722 PA0723   coaB TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57174 57175 PA0723 PA0724 coaB   FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 57175 57176 PA0724 PA0725     TRUE 0.694 5.000 0.000 NA   NA
 57176 57177 PA0725 PA0726     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 57177 57178 PA0726 PA0727     FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 57178 57179 PA0727 PA0728     TRUE 0.991 0.000 0.600 NA   NA
 57179 57180 PA0728 PA0729     FALSE 0.005 475.000 0.000 NA   NA
 2200472 57181 PA0729.1 PA0730     FALSE 0.072 131.000 0.000 NA   NA
 57181 57182 PA0730 PA0731     FALSE 0.005 452.000 0.000 NA   NA
 57182 57183 PA0731 PA0732     FALSE 0.147 80.000 0.000 NA   NA
 57183 57184 PA0732 PA0733     FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 57184 57185 PA0733 PA0734     TRUE 0.976 0.000 0.189 NA   NA
 57185 57186 PA0734 PA0735     FALSE 0.440 21.000 0.000 NA   NA
 57186 57187 PA0735 PA0736     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA   NA
 57188 57189 PA0737 PA0738     FALSE 0.084 117.000 0.000 NA   NA
 57192 57193 PA0741 PA0742     FALSE 0.084 117.000 0.000 NA   NA
 57193 57194 PA0742 PA0743     FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA
 57194 57195 PA0743 PA0744     TRUE 0.909 112.000 0.687 1.000 Y NA
 57195 57196 PA0744 PA0745     TRUE 0.982 59.000 0.627 0.004 Y NA
 57196 57197 PA0745 PA0746     TRUE 0.898 66.000 0.242 1.000 Y NA
 57197 57198 PA0746 PA0747     TRUE 0.725 12.000 0.013 1.000 N NA
 57199 57200 PA0748 PA0749     FALSE 0.176 57.000 0.000 NA N NA
 57200 57201 PA0749 PA0750   ung FALSE 0.088 100.000 0.000 NA N NA
 57202 57203 PA0751 PA0752     TRUE 0.990 -7.000 0.429 NA   NA
 57203 57204 PA0752 PA0753     TRUE 0.983 11.000 0.857 NA   NA
 57204 57205 PA0753 PA0754     TRUE 0.808 49.000 0.277 NA   NA
 57205 57206 PA0754 PA0755     FALSE 0.371 30.000 0.000 1.000   NA
 57207 57208 PA0756 PA0757     TRUE 0.994 -7.000 0.163 1.000 Y NA
 57209 57210 PA0758 PA0759     FALSE 0.266 101.000 0.034 NA   NA
 57213 57214 PA0762 PA0763 algU mucA TRUE 0.943 32.000 0.705 NA N NA
 57214 57215 PA0763 PA0764 mucA mucB TRUE 0.995 9.000 0.856 NA Y NA
 57215 57216 PA0764 PA0765 mucB mucC TRUE 0.998 -3.000 0.609 NA Y NA
 57216 57217 PA0765 PA0766 mucC mucD TRUE 0.802 40.000 0.206 NA N NA
 57217 57218 PA0766 PA0767 mucD lepA FALSE 0.129 150.000 0.020 1.000 N NA
 57218 57219 PA0767 PA0768 lepA lepB TRUE 0.950 6.000 0.187 1.000 N NA
 57219 57220 PA0768 PA0769 lepB   FALSE 0.253 169.000 0.133 NA   NA
 57220 57221 PA0769 PA0770   rnc TRUE 0.953 -3.000 0.033 NA   NA
 57221 57222 PA0770 PA0771 rnc era TRUE 0.989 -7.000 0.127 0.061   NA
 57222 57223 PA0771 PA0772 era recO TRUE 0.604 61.000 0.109 1.000   NA
 57223 57224 PA0772 PA0773 recO pdxJ TRUE 0.977 -7.000 0.166 1.000 N NA
 57225 57226 PA0774 PA0775     TRUE 0.990 -3.000 0.315 NA   NA
 57226 57227 PA0775 PA0776     FALSE 0.175 105.000 0.008 NA   NA
 57227 57228 PA0776 PA0777     FALSE 0.071 132.000 0.000 NA   NA
 57228 57229 PA0777 PA0778   icp FALSE 0.106 99.000 0.000 NA   NA
 57229 57230 PA0778 PA0779 icp   FALSE 0.261 111.000 0.041 NA   NA
 57233 57234 PA0782 PA0783 putA putP FALSE 0.023 312.000 0.020 1.000 N NA
 57236 57237 PA0785 PA0786     TRUE 0.890 10.000 0.077 1.000 N NA
 57237 57238 PA0786 PA0787     FALSE 0.209 56.000 0.000 NA   NA
 57243 57244 PA0792 PA0793 prpD   FALSE 0.233 135.000 0.053 NA   NA
 57244 57245 PA0793 PA0794     TRUE 0.753 119.000 0.733 NA   NA
 57245 57246 PA0794 PA0795   prpC TRUE 0.788 131.000 0.289 1.000 Y NA
 57246 57247 PA0795 PA0796 prpC prpB TRUE 0.749 93.000 0.502 1.000 N NA
 57247 57248 PA0796 PA0797 prpB   TRUE 0.881 11.000 0.080 1.000 N NA
 57251 57252 PA0800 PA0801     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 57252 57253 PA0801 PA0802     TRUE 0.964 0.000 0.111 NA   NA
 57253 57254 PA0802 PA0803     FALSE 0.133 86.000 0.000 NA   NA
 57254 57255 PA0803 PA0804     FALSE 0.357 32.000 0.000 1.000   NA
 57257 57258 PA0806 PA0807     FALSE 0.004 627.000 0.000 NA   NA
 57258 57259 PA0807 PA0808     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 57260 57261 PA0809 PA0810     FALSE 0.098 107.000 0.000 1.000   NA
 57261 57262 PA0810 PA0811     FALSE 0.363 31.000 0.000 1.000   NA
 57262 57263 PA0811 PA0812     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57263 57264 PA0812 PA0813     FALSE 0.049 288.000 0.000 0.083   NA
 57264 57265 PA0813 PA0814     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 57270 57271 PA0819 PA0820     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 57272 57273 PA0821 PA0822     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57273 57274 PA0822 PA0823     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 57274 57275 PA0823 PA0824     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57275 57276 PA0824 PA0825     FALSE 0.042 174.000 0.000 NA   NA
 57276 57277 PA0825 PA0826     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 57277 2200473 PA0826 PA0826.2   ssrA FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 2200473 57278 PA0826.2 PA0827 ssrA   FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 57279 57280 PA0828 PA0829     FALSE 0.238 109.000 0.031 1.000   NA
 57282 57283 PA0831 PA0832 oruR   FALSE 0.175 102.000 0.004 1.000   NA
 57283 57284 PA0832 PA0833     FALSE 0.213 106.000 0.021 1.000   NA
 57285 57286 PA0834 PA0835   pta FALSE 0.415 127.000 0.170 1.000   NA
 57286 57287 PA0835 PA0836 pta   TRUE 0.543 63.000 0.075 1.000   NA
 10491229 57288 PA0836.1 PA0837   slyD FALSE 0.023 225.000 0.000 NA   NA
 57288 57289 PA0837 PA0838 slyD   FALSE 0.294 206.000 0.024 1.000 Y NA
 57289 57290 PA0838 PA0839     FALSE 0.119 153.000 0.018 1.000 N NA
 57290 57291 PA0839 PA0840     TRUE 0.653 41.000 0.070 1.000 N NA
 57291 57292 PA0840 PA0841     FALSE 0.033 191.000 0.000 NA   NA
 57293 57294 PA0842 PA0843   plcR FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 57294 57295 PA0843 PA0844 plcR plcH TRUE 0.934 18.000 0.333 NA   NA
 57295 57296 PA0844 PA0845 plcH   FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 57296 57297 PA0845 PA0846     FALSE 0.007 378.000 0.000 NA   NA
 57297 57298 PA0846 PA0847     FALSE 0.223 85.000 0.007 1.000 N NA
 57299 57300 PA0848 PA0849   trxB2 TRUE 0.519 134.000 0.024 1.000 Y NA
 57300 57301 PA0849 PA0850 trxB2   FALSE 0.016 254.000 0.000 NA   NA
 57302 57303 PA0851 PA0852   cbpD FALSE 0.042 177.000 0.000 1.000   NA
 57303 57304 PA0852 PA0853 cbpD   FALSE 0.013 280.000 0.000 1.000   NA
 57304 57305 PA0853 PA0854   fumC2 TRUE 0.914 -7.000 0.007 1.000   NA
 57305 57306 PA0854 PA0855 fumC2   FALSE 0.130 129.000 0.005 NA   NA
 57307 57308 PA0856 PA0857   bolA TRUE 0.825 14.000 0.056 NA   NA
 57308 57309 PA0857 PA0858 bolA   FALSE 0.167 165.000 0.049 NA   NA
 57309 57310 PA0858 PA0859     TRUE 0.587 40.000 0.038 NA   NA
 57310 57311 PA0859 PA0860     TRUE 0.990 -7.000 0.407 1.000 N NA
 57311 57312 PA0860 PA0861     FALSE 0.081 295.000 0.158 1.000 N NA
 57312 57313 PA0861 PA0862     TRUE 0.655 75.000 0.222 NA N NA
 57314 57315 PA0863 PA0864     FALSE 0.011 283.000 0.000 1.000 N NA
 57316 57317 PA0865 PA0866 hpd aroP2 FALSE 0.095 298.000 0.000 1.000 Y NA
 57317 57318 PA0866 PA0867 aroP2   FALSE 0.060 153.000 0.000 1.000   NA
 57318 57319 PA0867 PA0868     FALSE 0.084 121.000 0.000 1.000   NA
 57320 57321 PA0869 PA0870 pbpG phhC FALSE 0.009 314.000 0.000 1.000 N NA
 57321 57322 PA0870 PA0871 phhC phhB TRUE 0.953 -3.000 0.037 1.000 N NA
 57322 57323 PA0871 PA0872 phhB phhA TRUE 0.506 105.000 0.203 1.000 N NA
 57325 57326 PA0874 PA0875     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 57329 57330 PA0878 PA0879     TRUE 0.784 46.000 0.216 NA   NA
 57330 57331 PA0879 PA0880     TRUE 0.705 15.000 0.021 NA N NA
 57331 57332 PA0880 PA0881     TRUE 0.520 39.000 0.021 NA   NA
 57332 57333 PA0881 PA0882     TRUE 0.804 56.000 0.324 1.000   NA
 57333 57334 PA0882 PA0883     TRUE 0.970 11.000 0.500 1.000 N NA
 57334 57335 PA0883 PA0884     TRUE 0.802 114.000 0.250 1.000 Y NA
 57335 57336 PA0884 PA0885     TRUE 0.834 49.000 0.034 NA Y NA
 57336 57337 PA0885 PA0886     TRUE 0.999 -3.000 0.882 NA Y NA
 57337 57338 PA0886 PA0887   acsA FALSE 0.033 182.000 0.000 1.000 N NA
 57338 10491230 PA0887 PA0887.1 acsA   FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 10491230 57339 PA0887.1 PA0888   aotJ FALSE 0.032 194.000 0.000 NA   NA
 57339 57340 PA0888 PA0889 aotJ aotQ TRUE 0.640 119.000 0.000 0.075 Y NA
 57340 57341 PA0889 PA0890 aotQ aotM TRUE 0.996 17.000 0.875 0.013 Y NA
 57341 57342 PA0890 PA0891 aotM   TRUE 0.538 14.000 0.000 1.000   NA
 57342 57343 PA0891 PA0892   aotP FALSE 0.470 19.000 0.000 1.000   NA
 57343 57344 PA0892 PA0893 aotP argR TRUE 0.918 33.000 0.500 1.000 N NA
 57346 57347 PA0895 PA0896 aruC aruF TRUE 0.710 199.000 0.533 1.000 Y NA
 57347 57348 PA0896 PA0897 aruF aruG TRUE 0.998 12.000 1.000 0.000 Y NA
 57348 57349 PA0897 PA0898 aruG aruD TRUE 0.784 43.000 0.205 1.000 N NA
 57349 57350 PA0898 PA0899 aruD aruB TRUE 0.989 -3.000 0.306 1.000 N NA
 57350 57351 PA0899 PA0900 aruB   TRUE 0.847 14.000 0.072 NA   NA
 57351 57352 PA0900 PA0901   aruE TRUE 0.979 14.000 0.909 NA   NA
 57352 57353 PA0901 PA0902 aruE   TRUE 0.515 145.000 0.031 1.000 Y NA
 57353 57354 PA0902 PA0903   alaS FALSE 0.139 122.000 0.009 1.000 N NA
 57354 57355 PA0903 PA0904 alaS lysC FALSE 0.229 148.000 0.065 1.000 N NA
 57355 57356 PA0904 PA0905 lysC rsmA FALSE 0.160 185.000 0.079 1.000 N NA
 57356 2200474 PA0905 PA0905.1 rsmA   FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 2200474 2200475 PA0905.1 PA0905.2     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 2200475 2200476 PA0905.2 PA0905.3     FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 57358 57359 PA0907 PA0908     FALSE 0.048 165.000 0.000 NA   NA
 57359 57360 PA0908 PA0909     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57360 57361 PA0909 PA0910     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 57361 57362 PA0910 PA0911     FALSE 0.222 53.000 0.000 NA   NA
 57365 57366 PA0914 PA0915     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 57366 57367 PA0915 PA0916     FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 57369 57370 PA0918 PA0919     FALSE 0.043 161.000 0.000 NA N NA
 57370 57371 PA0919 PA0920     TRUE 0.966 2.000 0.176 NA   NA
 57373 2200477 PA0922 PA0922.1     FALSE 0.039 179.000 0.000 NA   NA
 57375 57376 PA0924 PA0925     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 57376 57377 PA0925 PA0926     TRUE 0.595 68.000 0.135 NA   NA
 57377 57378 PA0926 PA0927   ldhA TRUE 0.541 36.000 0.020 NA   NA
 57378 57379 PA0927 PA0928 ldhA gacS TRUE 0.867 3.000 0.020 1.000 N NA
 57380 57381 PA0929 PA0930     TRUE 0.994 0.000 0.222 1.000 Y NA
 57381 57382 PA0930 PA0931   pirA FALSE 0.017 236.000 0.000 1.000 N NA
 57382 57383 PA0931 PA0932 pirA cysM FALSE 0.015 250.000 0.000 1.000 N NA
 57383 57384 PA0932 PA0933 cysM ygcA TRUE 0.854 9.000 0.039 1.000 N NA
 57384 57385 PA0933 PA0934 ygcA relA FALSE 0.364 85.000 0.047 1.000 N NA
 57385 57386 PA0934 PA0935 relA   FALSE 0.259 105.000 0.035 1.000   NA
 57388 57389 PA0937 PA0938     FALSE 0.035 188.000 0.000 NA   NA
 57390 57391 PA0939 PA0940     TRUE 0.847 6.000 0.024 NA   NA
 57391 57392 PA0940 PA0941     TRUE 0.567 12.000 0.000 NA   NA
 57394 57395 PA0943 PA0944   purN TRUE 0.961 -7.000 0.065 NA   NA
 57395 57396 PA0944 PA0945 purN purM TRUE 0.998 0.000 0.230 0.002 Y NA
 57397 57398 PA0946 PA0947     FALSE 0.212 202.000 0.174 NA   NA
 57399 57400 PA0948 PA0949   wrbA TRUE 0.990 2.000 0.657 NA   NA
 57400 57401 PA0949 PA0950 wrbA   TRUE 0.990 -3.000 0.112 0.072   NA
 57404 57405 PA0953 PA0954     TRUE 0.815 0.000 0.000 1.000   NA
 57406 57407 PA0955 PA0956   proS TRUE 0.796 9.000 0.013 NA   NA
 57410 57411 PA0959 PA0960     TRUE 0.919 1.000 0.035 NA   NA
 57412 57413 PA0961 PA0962     FALSE 0.003 638.000 0.000 1.000 N NA
 57414 57415 PA0963 PA0964 aspS   FALSE 0.417 67.000 0.039 NA   NA
 57415 57416 PA0964 PA0965   ruvC TRUE 0.676 85.000 0.277 NA   NA
 57416 57417 PA0965 PA0966 ruvC ruvA TRUE 0.970 17.000 0.011 0.005 Y NA
 57417 57418 PA0966 PA0967 ruvA ruvB TRUE 0.983 11.000 0.011 0.001 Y NA
 57418 57419 PA0967 PA0968 ruvB   TRUE 0.610 53.000 0.082 1.000   NA
 57419 57420 PA0968 PA0969   tolQ TRUE 0.989 2.000 0.593 1.000   NA
 57420 57421 PA0969 PA0970 tolQ tolR TRUE 0.990 23.000 0.556 0.090 Y NA
 57421 57422 PA0970 PA0971 tolR tolA TRUE 0.983 3.000 0.460 1.000   NA
 57422 57423 PA0971 PA0972 tolA tolB TRUE 0.995 -3.000 0.215 0.008   NA
 57423 57424 PA0972 PA0973 tolB oprL TRUE 0.881 53.000 0.592 1.000 N NA
 57424 57425 PA0973 PA0974 oprL   TRUE 0.957 10.000 0.278 1.000   NA
 57425 57426 PA0974 PA0975     FALSE 0.460 72.000 0.059 1.000   NA
 57426 57427 PA0975 PA0976     TRUE 0.929 16.000 0.270 1.000   NA
 57427 2200478 PA0976 PA0976.1     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 57428 57429 PA0977 PA0978     FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 57429 57430 PA0978 PA0979     TRUE 0.934 27.000 0.000 0.048 Y NA
 57431 57432 PA0980 PA0981     FALSE 0.321 36.000 0.000 NA   NA
 57434 57435 PA0983 PA0984     FALSE 0.004 545.000 0.000 1.000   NA
 57437 57438 PA0986 PA0987     TRUE 0.736 33.000 0.000 0.048   NA
 57438 57439 PA0987 PA0988     FALSE 0.005 438.000 0.000 NA   NA
 57440 57441 PA0989 PA0990     FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 57442 57443 PA0991 PA0992   cupC1 FALSE 0.004 446.000 0.000 NA N NA
 57443 57444 PA0992 PA0993 cupC1 cupC2 TRUE 0.973 58.000 1.000 1.000 Y NA
 57444 57445 PA0993 PA0994 cupC2 cupC3 TRUE 0.927 111.000 0.875 1.000 Y NA
 57447 57448 PA0996 PA0997 pqsA pqsB TRUE 0.982 -6.000 0.000 NA Y NA
 57448 57449 PA0997 PA0998 pqsB pqsC TRUE 0.980 -7.000 0.000 NA Y NA
 57449 57450 PA0998 PA0999 pqsC pqsD TRUE 0.778 43.000 0.000 NA Y NA
 57450 57451 PA0999 PA1000 pqsD pqsE TRUE 0.991 -6.000 0.438 NA   NA
 57451 57452 PA1000 PA1001 pqsE phnA FALSE 0.087 118.000 0.000 1.000   NA
 57452 57453 PA1001 PA1002 phnA phnB TRUE 0.999 -22.000 0.703 0.001 Y NA
 57457 57458 PA1006 PA1007     TRUE 0.772 34.000 0.121 NA   NA
 57459 57460 PA1008 PA1009 bcp   TRUE 0.883 12.000 0.102 NA N NA
 57461 57462 PA1010 PA1011 dapA   TRUE 0.953 18.000 0.088 NA Y NA
 57462 57463 PA1011 PA1012     TRUE 0.910 -61.000 0.022 NA   NA
 57463 57464 PA1012 PA1013   purC TRUE 0.602 29.000 0.021 1.000   NA
 57464 2200479 PA1013 PA1013.1 purC   FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 2200479 57465 PA1013.1 PA1014     FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 57467 57468 PA1016 PA1017   pauA TRUE 0.538 110.000 0.250 1.000 N NA
 57468 57469 PA1017 PA1018 pauA   TRUE 0.981 -16.000 0.250 1.000 N NA
 57469 57470 PA1018 PA1019   mucK FALSE 0.128 82.000 0.000 1.000 N NA
 57470 57471 PA1019 PA1020 mucK   FALSE 0.004 524.000 0.000 1.000 N NA
 57471 57472 PA1020 PA1021     TRUE 0.976 0.000 0.000 1.000 Y NA
 57472 57473 PA1021 PA1022     TRUE 0.968 2.000 0.000 1.000 Y NA
 57473 57474 PA1022 PA1023     TRUE 0.794 41.000 0.000 1.000 Y NA
 57474 57475 PA1023 PA1024     TRUE 0.843 16.000 0.000 0.049   NA
 57475 57476 PA1024 PA1025     FALSE 0.154 79.000 0.000 1.000   NA
 57478 57479 PA1027 PA1028     TRUE 0.689 56.000 0.173 1.000 N NA
 57479 57480 PA1028 PA1029     FALSE 0.060 153.000 0.000 1.000   NA
 57480 57481 PA1029 PA1030     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 57481 10491231 PA1030 PA1030.1     FALSE 0.066 142.000 0.000 NA   NA
 10491231 57482 PA1030.1 PA1031     FALSE 0.004 549.000 0.000 NA   NA
 57483 57484 PA1032 PA1033     FALSE 0.324 123.000 0.086 1.000   NA
 57484 57485 PA1033 PA1034     FALSE 0.047 167.000 0.000 NA   NA
 57485 57486 PA1034 PA1035     TRUE 0.941 8.000 0.163 NA   NA
 57488 57489 PA1037 PA1038     FALSE 0.141 83.000 0.000 NA   NA
 57489 57490 PA1038 PA1039     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57490 57491 PA1039 PA1040     TRUE 0.981 3.000 0.407 NA   NA
 57492 57493 PA1041 PA1042     FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 57493 57494 PA1042 PA1043     TRUE 0.971 -7.000 0.106 NA   NA
 57496 57497 PA1045 PA1046     FALSE 0.337 79.000 0.029 1.000   NA
 57497 57498 PA1046 PA1047     TRUE 0.795 77.000 0.467 1.000   NA
 57498 57499 PA1047 PA1048     FALSE 0.466 206.000 0.667 1.000 N NA
 57499 57500 PA1048 PA1049   pdxH FALSE 0.223 99.000 0.023 1.000 N NA
 57500 57501 PA1049 PA1050 pdxH   TRUE 0.774 8.000 0.006 1.000 N NA
 57501 57502 PA1050 PA1051     FALSE 0.265 159.000 0.120 1.000 N NA
 57502 57503 PA1051 PA1052     TRUE 0.875 42.000 0.047 1.000 Y NA
 57503 57504 PA1052 PA1053     FALSE 0.026 409.000 0.065 1.000 N NA
 57504 57505 PA1053 PA1054     FALSE 0.008 329.000 0.000 1.000 N NA
 57505 57506 PA1054 PA1055     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.004 Y NA
 57506 57507 PA1055 PA1056     TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.004 Y NA
 57507 57508 PA1056 PA1057     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 57508 57509 PA1057 PA1058     TRUE 0.999 -15.000 0.937 0.081 Y NA
 57509 57510 PA1058 PA1059     TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 57510 57511 PA1059 PA1060     FALSE 0.166 113.000 0.016 NA N NA
 57511 57512 PA1060 PA1061     TRUE 0.933 11.000 0.000 NA Y NA
 57512 57513 PA1061 PA1062     TRUE 0.856 11.000 0.000 0.081 N NA
 57513 57514 PA1062 PA1063     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57518 57519 PA1067 PA1068     FALSE 0.094 99.000 0.000 1.000 N NA
 57519 57520 PA1068 PA1069     TRUE 0.940 37.000 0.727 1.000   NA
 57521 57522 PA1070 PA1071 braG braF TRUE 0.999 3.000 0.967 0.017 Y NA
 57522 57523 PA1071 PA1072 braF braE TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 57523 57524 PA1072 PA1073 braE braD TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.074 Y NA
 57524 57525 PA1073 PA1074 braD braC FALSE 0.195 261.000 0.033 1.000 Y NA
 57526 57527 PA1075 PA1076     FALSE 0.426 67.000 0.041 NA   NA
 57527 57528 PA1076 PA1077   flgB FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 57528 57529 PA1077 PA1078 flgB flgC TRUE 0.998 6.000 0.800 0.002 Y NA
 57529 57530 PA1078 PA1079 flgC flgD TRUE 0.978 13.000 0.207 NA Y NA
 57530 57531 PA1079 PA1080 flgD flgE TRUE 0.987 28.000 0.875 NA Y NA
 57531 57532 PA1080 PA1081 flgE flgF TRUE 0.845 218.000 0.594 0.002 Y NA
 57532 57533 PA1081 PA1082 flgF flgG TRUE 0.972 47.000 0.207 0.001 Y NA
 57533 57534 PA1082 PA1083 flgG flgH TRUE 0.987 46.000 0.632 0.005 Y NA
 57534 57535 PA1083 PA1084 flgH flgI TRUE 0.989 12.000 0.128 0.006 Y NA
 57535 57536 PA1084 PA1085 flgI flgJ TRUE 0.995 11.000 0.405 0.006 Y NA
 57536 57537 PA1085 PA1086 flgJ flgK TRUE 0.996 19.000 0.705 0.002 Y NA
 57537 57538 PA1086 PA1087 flgK flgL TRUE 0.974 26.000 0.057 0.001 Y NA
 57538 57539 PA1087 PA1088 flgL   TRUE 0.632 55.000 0.118 1.000 N NA
 57539 57540 PA1088 PA1089     TRUE 0.934 5.000 0.017 0.081 N NA
 57540 57541 PA1089 PA1090     TRUE 0.899 -24.000 0.017 1.000 N NA
 57541 57542 PA1090 PA1091     TRUE 0.991 -7.000 0.069 1.000 Y NA
 57542 57543 PA1091 PA1092   fliC FALSE 0.006 361.000 0.000 1.000 N NA
 57543 57544 PA1092 PA1093 fliC   TRUE 0.714 79.000 0.025 NA Y NA
 57544 57545 PA1093 PA1094   fliD TRUE 0.798 86.000 0.117 NA Y NA
 57545 57546 PA1094 PA1095 fliD   TRUE 0.889 122.000 0.194 0.002 Y NA
 57546 57547 PA1095 PA1096     TRUE 0.940 23.000 0.478 NA   NA
 57547 57548 PA1096 PA1097   fleQ FALSE 0.051 282.000 0.056 NA   NA
 57548 57549 PA1097 PA1098 fleQ fleS TRUE 0.909 113.000 0.377 0.092 Y NA
 57549 57550 PA1098 PA1099 fleS fleR TRUE 0.998 5.000 0.679 0.092 Y NA
 57550 57551 PA1099 PA1100 fleR fliE FALSE 0.262 247.000 0.446 1.000 N NA
 57551 57552 PA1100 PA1101 fliE fliF TRUE 0.996 23.000 0.910 0.005 Y NA
 57552 57553 PA1101 PA1102 fliF fliG TRUE 0.994 6.000 0.189 0.005 Y NA
 57553 57554 PA1102 PA1103 fliG   TRUE 0.998 2.000 0.320 0.003 Y NA
 57554 57555 PA1103 PA1104   fliI TRUE 0.997 -10.000 0.115 0.003 Y NA
 57555 57556 PA1104 PA1105 fliI fliJ TRUE 0.983 14.000 0.070 0.006 Y NA
 57557 57558 PA1106 PA1107     FALSE 0.031 199.000 0.000 NA   NA
 57558 57559 PA1107 PA1108     FALSE 0.075 117.000 0.000 1.000 N NA
 57562 57563 PA1111 PA1112     FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 57563 57564 PA1112 PA1113     FALSE 0.003 990.000 0.000 1.000 N NA
 57565 57566 PA1114 PA1115     FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 57568 57569 PA1117 PA1118     FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 57569 57570 PA1118 PA1119     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 57570 57571 PA1119 PA1120     TRUE 0.982 -28.000 0.290 1.000 N NA
 57571 57572 PA1120 PA1121     TRUE 0.981 0.000 0.259 NA   NA
 57575 57576 PA1124 PA1125 dgt   TRUE 0.494 14.000 0.000 1.000 N NA
 57577 57578 PA1126 PA1127     FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 57579 57580 PA1128 PA1129     FALSE 0.289 35.000 0.000 NA N NA
 57581 57582 PA1130 PA1131 rhlC   TRUE 0.822 -12.000 0.000 NA   NA
 57584 57585 PA1133 PA1134     FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 57585 57586 PA1134 PA1135     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 57589 57590 PA1138 PA1139     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 57591 57592 PA1140 PA1141     FALSE 0.137 137.000 0.013 NA   NA
 57592 57593 PA1141 PA1142     TRUE 0.483 166.000 0.000 0.092 Y NA
 57593 57594 PA1142 PA1143     FALSE 0.128 82.000 0.000 1.000 N NA
 57594 57595 PA1143 PA1144     FALSE 0.151 68.000 0.000 1.000 N NA
 57597 57598 PA1146 PA1147     FALSE 0.236 102.000 0.029 1.000 N NA
 57598 57599 PA1147 PA1148   toxA FALSE 0.015 260.000 0.000 NA   NA
 57599 57600 PA1148 PA1149 toxA   FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 57601 57602 PA1150 PA1151 pys2 imm2 TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 57602 57603 PA1151 PA1152 imm2   FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 57604 57605 PA1153 PA1154     FALSE 0.003 533.000 0.000 NA N NA
 57605 57606 PA1154 PA1155   nrdB FALSE 0.007 355.000 0.000 1.000 N NA
 57606 57607 PA1155 PA1156 nrdB nrdA TRUE 0.767 264.000 0.564 0.001 Y NA
 57608 57609 PA1157 PA1158     FALSE 0.248 342.000 0.229 1.000 Y NA
 57609 57610 PA1158 PA1159     FALSE 0.008 320.000 0.000 1.000 N NA
 57611 57612 PA1160 PA1161   rrmA TRUE 0.830 18.000 0.083 NA   NA
 57612 57613 PA1161 PA1162 rrmA dapE TRUE 0.930 0.000 0.033 1.000   NA
 57613 57614 PA1162 PA1163 dapE   FALSE 0.171 115.000 0.018 1.000 N NA
 57616 57617 PA1165 PA1166 pcpS   FALSE 0.317 228.000 0.069 1.000 Y NA
 57618 57619 PA1167 PA1168     FALSE 0.004 500.000 0.000 NA   NA
 57619 57620 PA1168 PA1169     FALSE 0.150 78.000 0.000 NA   NA
 57623 57624 PA1172 PA1173 napC napB TRUE 0.988 11.000 0.143 0.071 Y NA
 57624 57625 PA1173 PA1174 napB napA TRUE 0.996 11.000 0.643 0.071 Y NA
 57625 57626 PA1174 PA1175 napA napD TRUE 0.974 -3.000 0.106 NA N NA
 57626 57627 PA1175 PA1176 napD napF TRUE 0.932 -7.000 0.023 NA   NA
 57627 57628 PA1176 PA1177 napF napE TRUE 0.886 9.000 0.058 NA   NA
 57629 57630 PA1178 PA1179 oprH phoP TRUE 0.612 80.000 0.180 1.000   NA
 57630 57631 PA1179 PA1180 phoP phoQ TRUE 0.999 -3.000 0.940 1.000 Y NA
 57631 57632 PA1180 PA1181 phoQ   TRUE 0.727 102.000 0.000 0.016 Y NA
 57636 57637 PA1185 PA1186     TRUE 0.987 -3.000 0.250 NA   NA
 57637 57638 PA1186 PA1187     FALSE 0.105 102.000 0.000 1.000   NA
 57638 57639 PA1187 PA1188     FALSE 0.113 89.000 0.000 1.000 N NA
 57640 57641 PA1189 PA1190     FALSE 0.120 168.000 0.028 NA   NA
 57641 57642 PA1190 PA1191     FALSE 0.208 159.000 0.066 NA   NA
 57643 57644 PA1192 PA1193     FALSE 0.402 47.000 0.015 NA N NA
 57645 57646 PA1194 PA1195     TRUE 0.683 105.000 0.065 1.000 Y NA
 57647 57648 PA1196 PA1197     TRUE 0.919 13.000 0.000 1.000 Y NA
 57648 57649 PA1197 PA1198     TRUE 0.722 66.000 0.267 NA N NA
 57649 57650 PA1198 PA1199     TRUE 0.956 83.000 0.909 NA Y NA
 57650 57651 PA1199 PA1200     TRUE 0.914 20.000 0.273 NA   NA
 57653 57654 PA1202 PA1203     FALSE 0.057 144.000 0.000 1.000 N NA
 57654 57655 PA1203 PA1204     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 57655 57656 PA1204 PA1205     FALSE 0.389 27.000 0.000 NA   NA
 57656 57657 PA1205 PA1206     FALSE 0.052 160.000 0.000 NA   NA
 57657 57658 PA1206 PA1207   kefB TRUE 0.737 3.000 0.000 NA   NA
 57658 57659 PA1207 PA1208 kefB   FALSE 0.320 167.000 0.000 1.000 Y NA
 57660 57661 PA1209 PA1210     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 57661 57662 PA1210 PA1211     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 57662 57663 PA1211 PA1212     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57663 57664 PA1212 PA1213     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57664 57665 PA1213 PA1214     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57665 57666 PA1214 PA1215     TRUE 0.787 0.000 0.000 1.000 N NA
 57666 57667 PA1215 PA1216     FALSE 0.118 202.000 0.000 0.080   NA
 57667 57668 PA1216 PA1217     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.080   NA
 57668 57669 PA1217 PA1218     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57669 57670 PA1218 PA1219     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57670 57671 PA1219 PA1220     TRUE 0.851 -6.000 0.000 NA   NA
 57671 57672 PA1220 PA1221     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57672 57673 PA1221 PA1222     FALSE 0.003 684.000 0.000 1.000 N NA
 57673 57674 PA1222 PA1223     FALSE 0.098 96.000 0.000 1.000 N NA
 57677 57678 PA1226 PA1227     FALSE 0.301 39.000 0.000 NA   NA
 57679 57680 PA1228 PA1229     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 57681 57682 PA1230 PA1231     TRUE 0.922 13.000 0.200 NA   NA
 57682 57683 PA1231 PA1232     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 57683 57684 PA1232 PA1233     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57687 57688 PA1236 PA1237     TRUE 0.989 -10.000 0.429 1.000   NA
 57688 57689 PA1237 PA1238     TRUE 0.994 -3.000 0.600 1.000 N NA
 57689 57690 PA1238 PA1239     FALSE 0.007 383.000 0.000 NA   NA
 57690 57691 PA1239 PA1240     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 57692 57693 PA1241 PA1242     FALSE 0.131 80.000 0.000 1.000 N NA
 57694 57695 PA1243 PA1244     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 57696 57697 PA1245 PA1246   aprD FALSE 0.131 87.000 0.000 NA   NA
 57697 57698 PA1246 PA1247 aprD aprE TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.008   NA
 57698 57699 PA1247 PA1248 aprE aprF TRUE 0.991 4.000 0.375 0.008 N NA
 57699 57700 PA1248 PA1249 aprF aprA FALSE 0.006 359.000 0.000 1.000 N NA
 57700 57701 PA1249 PA1250 aprA aprI FALSE 0.097 247.000 0.095 1.000   NA
 57704 57705 PA1253 PA1254     FALSE 0.352 93.000 0.000 0.080 N NA
 57705 57706 PA1254 PA1255     FALSE 0.376 151.000 0.000 1.000 Y NA
 57706 57707 PA1255 PA1256     TRUE 0.863 26.000 0.000 1.000 Y NA
 57707 57708 PA1256 PA1257     TRUE 0.998 -3.000 0.650 1.000 Y NA
 57708 57709 PA1257 PA1258     TRUE 0.998 11.000 0.846 0.012 Y NA
 57709 57710 PA1258 PA1259     TRUE 0.815 0.000 0.000 1.000   NA
 57710 57711 PA1259 PA1260     FALSE 0.206 59.000 0.000 1.000   NA
 57711 57712 PA1260 PA1261     FALSE 0.014 258.000 0.000 1.000 N NA
 57712 57713 PA1261 PA1262     FALSE 0.050 165.000 0.000 1.000   NA
 57717 57718 PA1266 PA1267     FALSE 0.130 230.000 0.000 0.004   NA
 57718 57719 PA1267 PA1268     TRUE 0.991 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 57719 57720 PA1268 PA1269     FALSE 0.249 117.000 0.046 1.000 N NA
 57721 57722 PA1270 PA1271     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 57722 57723 PA1271 PA1272   cobO TRUE 0.682 64.000 0.000 1.000 Y NA
 57723 57724 PA1272 PA1273 cobO cobB TRUE 0.962 32.000 0.054 0.006 Y NA
 57724 57725 PA1273 PA1274 cobB   TRUE 0.938 2.000 0.071 1.000 N NA
 57725 57726 PA1274 PA1275   cobD TRUE 0.962 -3.000 0.053 1.000 N NA
 57726 57727 PA1275 PA1276 cobD cobC TRUE 0.996 -7.000 0.463 0.006 N NA
 57727 57728 PA1276 PA1277 cobC cobQ TRUE 0.983 -7.000 0.033 0.006 N NA
 57728 57729 PA1277 PA1278 cobQ cobP TRUE 0.992 -7.000 0.079 1.000 Y NA
 57729 57730 PA1278 PA1279 cobP cobU TRUE 0.995 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 57730 57731 PA1279 PA1280 cobU   TRUE 0.972 -3.000 0.090 1.000 N NA
 57731 57732 PA1280 PA1281   cobV TRUE 0.869 3.000 0.021 1.000 N NA
 57736 57737 PA1285 PA1286     TRUE 0.657 74.000 0.220 1.000 N NA
 57737 57738 PA1286 PA1287     FALSE 0.147 165.000 0.042 1.000 N NA
 57739 57740 PA1288 PA1289     FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 57740 57741 PA1289 PA1290     FALSE 0.023 222.000 0.000 NA   NA
 57743 57744 PA1292 PA1293     FALSE 0.009 301.000 0.000 1.000 N NA
 57745 57746 PA1294 PA1295 rnd   TRUE 0.970 -3.000 0.073 NA   NA
 57746 57747 PA1295 PA1296     FALSE 0.066 255.000 0.056 NA   NA
 57749 57750 PA1298 PA1299     FALSE 0.152 77.000 0.000 NA   NA
 57750 57751 PA1299 PA1300     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 57751 57752 PA1300 PA1301     TRUE 0.994 -3.000 0.615 NA N NA
 57752 57753 PA1301 PA1302     TRUE 0.698 129.000 0.148 NA Y NA
 57754 57755 PA1303 PA1304     TRUE 0.486 77.000 0.000 0.028 N NA
 57756 57757 PA1305 PA1306     TRUE 0.563 64.000 0.091 NA   NA
 57757 57758 PA1306 PA1307     TRUE 0.841 4.000 0.011 1.000   NA
 57758 57759 PA1307 PA1308     TRUE 0.724 27.000 0.053 NA   NA
 57761 57762 PA1310 PA1311 phnW phnX TRUE 0.789 36.000 0.030 0.080   NA
 57764 57765 PA1313 PA1314     TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 57767 57768 PA1316 PA1317   cyoA FALSE 0.014 627.000 0.000 0.080 N NA
 57768 57769 PA1317 PA1318 cyoA cyoB TRUE 0.980 7.000 0.000 0.014 Y NA
 57769 57770 PA1318 PA1319 cyoB cyoC TRUE 0.995 4.000 0.258 0.070 Y NA
 57770 57771 PA1319 PA1320 cyoC cyoD TRUE 0.997 0.000 0.273 0.070 Y NA
 57771 57772 PA1320 PA1321 cyoD cyoE TRUE 0.938 11.000 0.064 0.080 N NA
 57772 57773 PA1321 PA1322 cyoE   FALSE 0.016 239.000 0.000 1.000 N NA
 57773 57774 PA1322 PA1323     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 57774 57775 PA1323 PA1324     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 57775 10491232 PA1324 PA1324.1     FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 10491232 57776 PA1324.1 PA1325     FALSE 0.260 45.000 0.000 NA   NA
 57776 57777 PA1325 PA1326   ilvA2 TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 57777 57778 PA1326 PA1327 ilvA2   FALSE 0.107 92.000 0.000 1.000 N NA
 57780 57781 PA1329 PA1330     TRUE 0.883 6.000 0.041 NA   NA
 57782 57783 PA1331 PA1332     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 57783 57784 PA1332 PA1333     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 57784 57785 PA1333 PA1334     FALSE 0.032 195.000 0.000 NA   NA
 57785 57786 PA1334 PA1335     FALSE 0.009 308.000 0.000 1.000 N NA
 57786 57787 PA1335 PA1336     TRUE 0.982 45.000 0.613 0.090 Y NA
 57787 57788 PA1336 PA1337   ansB FALSE 0.098 96.000 0.000 1.000 N NA
 57788 57789 PA1337 PA1338 ansB ggt TRUE 0.594 86.000 0.000 1.000 Y NA
 57789 57790 PA1338 PA1339 ggt   TRUE 0.783 78.000 0.065 1.000 Y NA
 57790 57791 PA1339 PA1340     TRUE 0.995 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 57791 57792 PA1340 PA1341     TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.012 Y NA
 57792 57793 PA1341 PA1342     FALSE 0.377 203.000 0.000 0.073 Y NA
 57794 57795 PA1343 PA1344     FALSE 0.110 96.000 0.000 NA   NA
 57795 57796 PA1344 PA1345     FALSE 0.032 184.000 0.000 1.000 N NA
 57797 57798 PA1346 PA1347     FALSE 0.124 84.000 0.000 1.000 N NA
 57799 57800 PA1348 PA1349     FALSE 0.037 183.000 0.000 NA   NA
 57800 57801 PA1349 PA1350     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 57801 57802 PA1350 PA1351     FALSE 0.472 18.000 0.000 NA   NA
 57803 57804 PA1352 PA1353     FALSE 0.046 168.000 0.000 NA   NA
 57804 57805 PA1353 PA1354     TRUE 0.758 37.000 0.123 NA   NA
 57806 57807 PA1355 PA1356     TRUE 0.843 23.000 0.139 NA   NA
 57807 57808 PA1356 PA1357     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 57809 57810 PA1358 PA1359     FALSE 0.307 38.000 0.000 NA   NA
 57813 57814 PA1362 PA1363     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57814 57815 PA1363 PA1364     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA N NA
 57815 57816 PA1364 PA1365     TRUE 0.625 78.000 0.000 NA Y NA
 57817 57818 PA1366 PA1367     FALSE 0.006 424.000 0.000 1.000   NA
 57818 57819 PA1367 PA1368     FALSE 0.013 283.000 0.000 1.000   NA
 57820 57821 PA1369 PA1370     FALSE 0.421 23.000 0.000 NA   NA
 57822 57823 PA1371 PA1372     TRUE 0.975 -7.000 0.143 NA   NA
 57823 57824 PA1372 PA1373   fabF2 FALSE 0.003 720.000 0.000 1.000   NA
 57825 57826 PA1374 PA1375   pdxB FALSE 0.021 215.000 0.000 NA N NA
 57828 57829 PA1377 PA1378     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 57831 57832 PA1380 PA1381     FALSE 0.007 361.000 0.000 NA   NA
 57832 57833 PA1381 PA1382     TRUE 0.813 -16.000 0.000 NA   NA
 57833 57834 PA1382 PA1383     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 57834 57835 PA1383 PA1384   galE FALSE 0.059 152.000 0.000 NA   NA
 57835 57836 PA1384 PA1385 galE   TRUE 0.899 24.000 0.011 1.000 Y NA
 57836 57837 PA1385 PA1386     FALSE 0.460 20.000 0.000 1.000   NA
 57837 57838 PA1386 PA1387     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 57838 57839 PA1387 PA1388     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 57839 57840 PA1388 PA1389     TRUE 0.769 97.000 0.600 NA   NA
 57840 57841 PA1389 PA1390     FALSE 0.036 186.000 0.000 NA   NA
 57841 57842 PA1390 PA1391     TRUE 0.851 -6.000 0.000 NA   NA
 57842 57843 PA1391 PA1392     TRUE 0.779 1.000 0.000 NA   NA
 57845 57846 PA1394 PA1395     TRUE 0.499 16.000 0.000 NA   NA
 57848 57849 PA1397 PA1398     FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 57852 57853 PA1401 PA1402     FALSE 0.150 78.000 0.000 NA   NA
 57857 57858 PA1406 PA1407     FALSE 0.321 36.000 0.000 NA   NA
 57858 57859 PA1407 PA1408     FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 57860 57861 PA1409 PA1410 aphA   TRUE 0.550 11.000 0.000 NA N NA
 57861 57862 PA1410 PA1411     FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 57864 57865 PA1413 PA1414     TRUE 0.828 56.000 0.400 NA   NA
 57866 57867 PA1415 PA1416     FALSE 0.269 45.000 0.000 1.000   NA
 57867 57868 PA1416 PA1417     TRUE 0.494 14.000 0.000 1.000 N NA
 57868 57869 PA1417 PA1418     TRUE 0.634 76.000 0.000 1.000 Y NA
 57869 57870 PA1418 PA1419     TRUE 0.492 94.000 0.150 1.000 N NA
 57870 57871 PA1419 PA1420     TRUE 0.837 19.000 0.100 NA   NA
 57871 57872 PA1420 PA1421   gbuA TRUE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 57875 57876 PA1424 PA1425     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 57876 57877 PA1425 PA1426     FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 57877 57878 PA1426 PA1427     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 57878 57879 PA1427 PA1428     FALSE 0.003 740.000 0.000 NA   NA
 57879 57880 PA1428 PA1429     FALSE 0.181 166.000 0.000 0.079   NA
 57880 57881 PA1429 PA1430   lasR FALSE 0.005 451.000 0.000 1.000 N NA
 57884 57885 PA1433 PA1434     TRUE 0.979 1.000 0.273 NA   NA
 57886 57887 PA1435 PA1436     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 57887 57888 PA1436 PA1437     TRUE 0.542 104.000 0.240 NA N NA
 57888 57889 PA1437 PA1438     TRUE 0.999 -22.000 0.793 0.002 Y NA
 57890 57891 PA1439 PA1440     TRUE 0.872 12.000 0.077 NA   NA
 57892 57893 PA1441 PA1442     FALSE 0.286 244.000 0.075 1.000 Y NA
 57893 57894 PA1442 PA1443   fliM TRUE 0.994 8.000 0.171 0.001 Y NA
 57894 57895 PA1443 PA1444 fliM fliN TRUE 0.994 28.000 0.741 0.001 Y NA
 57895 57896 PA1444 PA1445 fliN fliO TRUE 0.995 2.000 0.443 1.000 Y NA
 57896 57897 PA1445 PA1446 fliO fliP TRUE 0.992 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 57897 57898 PA1446 PA1447 fliP fliQ TRUE 0.990 48.000 1.000 0.013 Y NA
 57898 57899 PA1447 PA1448 fliQ fliR TRUE 0.999 0.000 1.000 0.001 Y NA
 57899 57900 PA1448 PA1449 fliR flhB TRUE 0.987 3.000 0.129 1.000 Y NA
 57900 57901 PA1449 PA1450 flhB   FALSE 0.158 73.000 0.000 NA   NA
 57901 57902 PA1450 PA1451     FALSE 0.340 33.000 0.000 NA   NA
 57902 57903 PA1451 PA1452   flhA FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 57903 57904 PA1452 PA1453 flhA flhF TRUE 0.842 84.000 0.178 1.000 Y NA
 57904 57905 PA1453 PA1454 flhF fleN TRUE 0.662 139.000 0.241 0.016 N NA
 57905 57906 PA1454 PA1455 fleN fliA TRUE 0.993 -3.000 0.482 1.000 N NA
 57906 57907 PA1455 PA1456 fliA cheY FALSE 0.447 102.000 0.145 1.000 N NA
 57907 57908 PA1456 PA1457 cheY cheZ TRUE 0.974 20.000 0.284 1.000 Y NA
 57908 57909 PA1457 PA1458 cheZ   TRUE 0.630 201.000 0.341 1.000 Y NA
 57909 57910 PA1458 PA1459     TRUE 0.971 54.000 0.327 0.011 Y NA
 57910 57911 PA1459 PA1460   motC TRUE 0.813 89.000 0.153 1.000 Y NA
 57911 57912 PA1460 PA1461 motC motD TRUE 0.980 13.000 0.248 1.000 Y NA
 57912 57913 PA1461 PA1462 motD   TRUE 0.543 95.000 0.199 1.000 N NA
 57913 57914 PA1462 PA1463     TRUE 0.741 92.000 0.454 1.000   NA
 57914 57915 PA1463 PA1464     TRUE 0.971 46.000 0.886 0.011   NA
 57915 57916 PA1464 PA1465     TRUE 0.950 31.000 0.743 NA   NA
 57918 57919 PA1467 PA1468     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 57919 57920 PA1468 PA1469     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 57920 57921 PA1469 PA1470     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 57922 57923 PA1471 PA1472     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 57923 57924 PA1472 PA1473     FALSE 0.106 101.000 0.000 1.000   NA
 57924 57925 PA1473 PA1474     TRUE 0.989 -3.000 0.286 1.000   NA
 57926 57927 PA1475 PA1476 ccmA ccmB TRUE 0.997 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 57927 57928 PA1476 PA1477 ccmB ccmC TRUE 0.823 123.000 0.051 0.001 Y NA
 57928 57929 PA1477 PA1478 ccmC   TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 57929 57930 PA1478 PA1479   ccmE TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 57930 57931 PA1479 PA1480 ccmE ccmF TRUE 0.997 1.000 0.211 0.002 Y NA
 57931 57932 PA1480 PA1481 ccmF ccmG TRUE 0.999 4.000 0.804 0.002 Y NA
 57932 57933 PA1481 PA1482 ccmG ccmH TRUE 0.996 -3.000 0.196 NA Y NA
 57933 57934 PA1482 PA1483 ccmH cycH TRUE 0.998 -3.000 0.522 NA Y NA
 57936 57937 PA1485 PA1486     TRUE 0.970 14.000 0.148 NA Y NA
 57938 57939 PA1487 PA1488     TRUE 0.901 21.000 0.238 1.000   NA
 57939 57940 PA1488 PA1489     TRUE 0.994 -13.000 0.381 0.048   NA
 57940 57941 PA1489 PA1490     FALSE 0.024 404.000 0.048 1.000   NA
 57942 57943 PA1491 PA1492     TRUE 0.806 60.000 0.364 NA   NA
 57944 57945 PA1493 PA1494 cysP   FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 57945 57946 PA1494 PA1495     FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 57946 57947 PA1495 PA1496     TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 57947 57948 PA1496 PA1497     FALSE 0.374 66.000 0.030 1.000 N NA
 57948 57949 PA1497 PA1498   pykF FALSE 0.006 367.000 0.000 1.000 N NA
 57949 57950 PA1498 PA1499 pykF   TRUE 0.968 2.000 0.000 1.000 Y NA
 57950 57951 PA1499 PA1500     FALSE 0.078 297.000 0.154 1.000 N NA
 57951 57952 PA1500 PA1501     TRUE 0.795 75.000 0.492 1.000 N NA
 57952 57953 PA1501 PA1502   gcl TRUE 0.734 96.000 0.495 1.000   NA
 57956 57957 PA1505 PA1506 moaA2   FALSE 0.038 185.000 0.000 1.000   NA
 57958 57959 PA1507 PA1508     FALSE 0.003 683.000 0.000 NA   NA
 57959 57960 PA1508 PA1509     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 57960 57961 PA1509 PA1510     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57961 57962 PA1510 PA1511     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 57962 57963 PA1511 PA1512   hcpA FALSE 0.038 182.000 0.000 NA   NA
 57963 57964 PA1512 PA1513 hcpA   FALSE 0.005 486.000 0.000 NA   NA
 57964 57965 PA1513 PA1514     TRUE 0.886 49.000 0.538 1.000   NA
 57965 57966 PA1514 PA1515   alc TRUE 0.963 55.000 0.647 1.000 Y NA
 57966 57967 PA1515 PA1516 alc   TRUE 0.964 18.000 0.647 NA   NA
 57967 57968 PA1516 PA1517     TRUE 0.975 -3.000 0.097 NA   NA
 57972 57973 PA1521 PA1522     FALSE 0.276 70.000 0.013 NA N NA
 57973 57974 PA1522 PA1523   xdhB FALSE 0.346 27.000 0.000 NA N NA
 57974 57975 PA1523 PA1524 xdhB xdhA TRUE 0.999 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 57975 57976 PA1524 PA1525 xdhA alkB2 FALSE 0.025 221.000 0.000 1.000   NA
 57977 57978 PA1526 PA1527     TRUE 0.558 26.000 0.010 1.000 N NA
 57978 57979 PA1527 PA1528   zipA TRUE 0.759 165.000 0.115 0.009 Y NA
 57979 57980 PA1528 PA1529 zipA lig FALSE 0.455 91.000 0.106 1.000 N NA
 57980 57981 PA1529 PA1530 lig   FALSE 0.255 46.000 0.000 NA   NA
 57981 2200480 PA1530 PA1530.1   ffs TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 57983 57984 PA1532 PA1533 dnaX   TRUE 0.866 46.000 0.411 NA   NA
 57984 57985 PA1533 PA1534   recR TRUE 0.829 79.000 0.604 NA   NA
 57985 57986 PA1534 PA1535 recR   FALSE 0.127 123.000 0.004 1.000 N NA
 57987 57988 PA1536 PA1537     FALSE 0.156 74.000 0.000 NA   NA
 57988 57989 PA1537 PA1538     TRUE 0.963 -3.000 0.050 NA   NA
 57991 57992 PA1540 PA1541     TRUE 0.999 -6.000 0.869 0.079 Y NA
 57992 57993 PA1541 PA1542     FALSE 0.006 409.000 0.000 NA   NA
 57993 57994 PA1542 PA1543   apt FALSE 0.019 240.000 0.000 NA   NA
 57994 57995 PA1543 PA1544 apt anr FALSE 0.244 86.000 0.016 1.000 N NA
 57997 57998 PA1546 PA1547 hemN   FALSE 0.248 128.000 0.051 1.000   NA
 57998 57999 PA1547 PA1548     TRUE 0.985 -7.000 0.266 NA   NA
 57999 58000 PA1548 PA1549     TRUE 0.998 -21.000 0.713 NA Y NA
 58000 58001 PA1549 PA1550     TRUE 0.984 -3.000 0.197 NA   NA
 58001 58002 PA1550 PA1551     TRUE 0.893 12.000 0.111 NA   NA
 58002 58003 PA1551 PA1552     FALSE 0.365 218.000 0.000 0.021 Y NA
 58003 58004 PA1552 PA1553     TRUE 0.510 188.000 0.000 0.002 Y NA
 58004 58005 PA1553 PA1554     TRUE 0.882 15.000 0.000 0.002 N NA
 58005 58006 PA1554 PA1555     FALSE 0.048 365.000 0.000 0.002 N NA
 58006 58007 PA1555 PA1556     TRUE 0.510 188.000 0.000 0.002 Y NA
 58007 58008 PA1556 PA1557     TRUE 0.913 11.000 0.000 0.002 N NA
 58009 58010 PA1558 PA1559     FALSE 0.132 89.000 0.000 1.000   NA
 58010 58011 PA1559 PA1560     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58012 58013 PA1561 PA1562 aer acnA FALSE 0.012 373.000 0.004 1.000 N NA
 58014 58015 PA1563 PA1564     FALSE 0.377 85.000 0.047 NA   NA
 58016 58017 PA1565 PA1566     TRUE 0.951 69.000 0.667 1.000 Y NA
 58017 58018 PA1566 PA1567     FALSE 0.045 468.000 0.000 1.000 Y NA
 58018 58019 PA1567 PA1568     TRUE 0.550 11.000 0.000 NA N NA
 58019 58020 PA1568 PA1569     FALSE 0.180 56.000 0.000 NA N NA
 58023 58024 PA1572 PA1573     TRUE 0.786 11.000 0.020 NA   NA
 58025 58026 PA1574 PA1575     FALSE 0.332 95.000 0.049 NA   NA
 58029 58030 PA1578 PA1579     FALSE 0.004 492.000 0.000 NA   NA
 58032 58033 PA1581 PA1582 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 58033 58034 PA1582 PA1583 sdhD sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 58034 58035 PA1583 PA1584 sdhA sdhB TRUE 0.997 12.000 0.604 0.001 Y NA
 58035 58036 PA1584 PA1585 sdhB sucA FALSE 0.248 257.000 0.067 1.000 Y NA
 58036 58037 PA1585 PA1586 sucA sucB TRUE 0.974 43.000 0.667 1.000 Y NA
 58037 58038 PA1586 PA1587 sucB lpdG TRUE 0.895 69.000 0.253 1.000 Y NA
 58038 58039 PA1587 PA1588 lpdG sucC FALSE 0.160 329.000 0.069 1.000 Y NA
 58039 58040 PA1588 PA1589 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 58040 58041 PA1589 PA1590 sucD braB FALSE 0.009 311.000 0.000 1.000 N NA
 58041 58042 PA1590 PA1591 braB   FALSE 0.208 146.000 0.048 NA   NA
 58044 58045 PA1593 PA1594     TRUE 0.999 -3.000 0.845 NA Y NA
 58045 58046 PA1594 PA1595     TRUE 0.656 37.000 0.054 NA   NA
 58046 58047 PA1595 PA1596   htpG FALSE 0.154 118.000 0.007 1.000   NA
 58047 58048 PA1596 PA1597 htpG   FALSE 0.272 68.000 0.008 1.000 N NA
 58051 58052 PA1600 PA1601     TRUE 0.982 50.000 0.625 0.069 Y NA
 58052 58053 PA1601 PA1602     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.069 Y NA
 58053 58054 PA1602 PA1603     FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000 N NA
 58054 58055 PA1603 PA1604     FALSE 0.274 39.000 0.000 1.000 N NA
 58056 58057 PA1605 PA1606     TRUE 0.768 69.000 0.357 NA   NA
 58058 58059 PA1607 PA1608     FALSE 0.080 106.000 0.000 NA N NA
 58059 58060 PA1608 PA1609   fabB FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 58060 58061 PA1609 PA1610 fabB fabA TRUE 0.989 12.000 0.451 1.000 Y NA
 58061 58062 PA1610 PA1611 fabA   FALSE 0.030 189.000 0.000 1.000 N NA
 58062 58063 PA1611 PA1612     TRUE 0.992 -3.000 0.444 NA   NA
 58063 58064 PA1612 PA1613     TRUE 0.479 172.000 0.444 NA   NA
 58065 58066 PA1614 PA1615 gpsA   TRUE 0.935 14.000 0.273 NA   NA
 58066 58067 PA1615 PA1616     TRUE 0.976 -3.000 0.114 NA   NA
 58067 58068 PA1616 PA1617     FALSE 0.225 127.000 0.045 1.000 N NA
 58068 58069 PA1617 PA1618     TRUE 0.669 53.000 0.143 NA N NA
 58069 58070 PA1618 PA1619     TRUE 0.504 58.000 0.057 NA N NA
 58070 58071 PA1619 PA1620     TRUE 0.905 41.000 0.545 1.000 N NA
 58071 58072 PA1620 PA1621     FALSE 0.244 102.000 0.029 NA   NA
 58072 58073 PA1621 PA1622     TRUE 0.974 -3.000 0.096 NA   NA
 58073 58074 PA1622 PA1623     FALSE 0.263 80.000 0.015 1.000 N NA
 58074 58075 PA1623 PA1624     TRUE 0.885 9.000 0.057 NA   NA
 58075 58076 PA1624 PA1625     TRUE 0.517 166.000 0.478 NA   NA
 58077 58078 PA1626 PA1627     TRUE 0.920 16.000 0.250 1.000 N NA
 58078 58079 PA1627 PA1628     FALSE 0.060 138.000 0.000 1.000 N NA
 58079 58080 PA1628 PA1629     TRUE 0.993 4.000 0.333 1.000 Y NA
 58081 58082 PA1630 PA1631     TRUE 0.636 55.000 0.120 1.000 N NA
 58082 58083 PA1631 PA1632   kdpF FALSE 0.037 188.000 0.000 1.000   NA
 58083 58084 PA1632 PA1633 kdpF kdpA TRUE 0.965 11.000 0.071 0.001   NA
 58084 58085 PA1633 PA1634 kdpA kdpB TRUE 0.987 12.000 0.059 0.001 Y NA
 58085 58086 PA1634 PA1635 kdpB kdpC TRUE 0.990 54.000 0.877 0.001 Y NA
 58086 58087 PA1635 PA1636 kdpC kdpD FALSE 0.190 108.000 0.020 1.000 N NA
 58087 58088 PA1636 PA1637 kdpD kdpE TRUE 0.913 101.000 0.621 1.000 Y NA
 58088 58089 PA1637 PA1638 kdpE   FALSE 0.070 122.000 0.000 1.000 N NA
 58089 58090 PA1638 PA1639     FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 58092 58093 PA1641 PA1642   selD FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 58093 58094 PA1642 PA1643 selD   TRUE 0.978 0.000 0.214 NA   NA
 58094 58095 PA1643 PA1644     FALSE 0.005 464.000 0.000 NA   NA
 58098 58099 PA1647 PA1648     FALSE 0.068 143.000 0.000 1.000   NA
 58100 58101 PA1649 PA1650     FALSE 0.144 159.000 0.029 1.000   NA
 58105 58106 PA1654 PA1655     TRUE 0.643 56.000 0.131 1.000 N NA
 58106 58107 PA1655 PA1656     FALSE 0.003 1173.000 0.000 NA   NA
 58107 58108 PA1656 PA1657     TRUE 0.716 36.000 0.080 NA   NA
 58108 58109 PA1657 PA1658     TRUE 0.721 29.000 0.060 NA   NA
 58109 58110 PA1658 PA1659     TRUE 0.972 13.000 0.627 NA   NA
 58110 58111 PA1659 PA1660     FALSE 0.090 545.000 0.552 NA   NA
 58111 58112 PA1660 PA1661     TRUE 0.994 -36.000 0.863 NA   NA
 58112 58113 PA1661 PA1662     TRUE 0.951 7.000 0.196 NA   NA
 58113 58114 PA1662 PA1663     TRUE 0.962 11.000 0.118 0.016 N NA
 58114 58115 PA1663 PA1664     TRUE 0.819 89.000 0.667 NA   NA
 58115 58116 PA1664 PA1665     TRUE 0.922 18.000 0.278 NA   NA
 58116 58117 PA1665 PA1666     TRUE 0.971 6.000 0.333 NA   NA
 58117 58118 PA1666 PA1667     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 58118 58119 PA1667 PA1668     TRUE 0.991 3.000 0.833 NA   NA
 58119 58120 PA1668 PA1669     TRUE 0.965 16.000 0.600 NA   NA
 58120 58121 PA1669 PA1670   stp1 TRUE 0.975 0.000 0.188 NA   NA
 58121 58122 PA1670 PA1671 stp1 stk1 TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 58125 58126 PA1674 PA1675 folE2   TRUE 0.812 78.000 0.545 NA   NA
 58126 58127 PA1675 PA1676     TRUE 0.840 57.000 0.444 NA   NA
 58127 58128 PA1676 PA1677     FALSE 0.384 173.000 0.292 NA   NA
 58130 58131 PA1679 PA1680     TRUE 0.655 78.000 0.219 NA   NA
 58132 58133 PA1681 PA1682 aroC   TRUE 0.607 44.000 0.055 1.000   NA
 58133 58134 PA1682 PA1683     TRUE 0.940 -3.000 0.018 1.000   NA
 58134 58135 PA1683 PA1684     TRUE 0.981 -3.000 0.148 1.000   NA
 58135 58136 PA1684 PA1685   masA TRUE 0.683 72.000 0.231 1.000   NA
 58138 58139 PA1687 PA1688 speE   FALSE 0.054 161.000 0.000 1.000   NA
 58139 58140 PA1688 PA1689     TRUE 0.965 3.000 0.200 1.000   NA
 58141 58142 PA1690 PA1691 pscU pscT TRUE 0.999 -3.000 0.548 0.078 Y NA
 58142 58143 PA1691 PA1692 pscT   TRUE 0.997 -3.000 0.097 0.078 Y NA
 58143 58144 PA1692 PA1693   pscR TRUE 0.997 3.000 0.300 0.013 Y NA
 58144 58145 PA1693 PA1694 pscR pscQ TRUE 0.998 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 58145 58146 PA1694 PA1695 pscQ pscP TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.005   NA
 58146 58147 PA1695 PA1696 pscP pscO TRUE 0.822 -12.000 0.000 NA   NA
 58147 58148 PA1696 PA1697 pscO   TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58149 58150 PA1698 PA1699 popN   TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 58150 58151 PA1699 PA1700     TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 58151 58152 PA1700 PA1701     TRUE 0.985 -3.000 0.214 NA   NA
 58152 58153 PA1701 PA1702     TRUE 0.694 5.000 0.000 NA   NA
 58153 58154 PA1702 PA1703   pcrD TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 58154 58155 PA1703 PA1704 pcrD pcrR TRUE 0.989 -3.000 0.281 NA   NA
 58155 58156 PA1704 PA1705 pcrR pcrG TRUE 0.965 28.000 1.000 NA   NA
 58156 58157 PA1705 PA1706 pcrG pcrV TRUE 0.976 10.000 0.556 NA   NA
 58157 58158 PA1706 PA1707 pcrV pcrH TRUE 0.954 9.000 0.235 1.000   NA
 58158 58159 PA1707 PA1708 pcrH popB TRUE 0.992 -19.000 0.632 1.000   NA
 58159 58160 PA1708 PA1709 popB popD TRUE 0.969 12.000 0.526 NA   NA
 58160 58161 PA1709 PA1710 popD exsC FALSE 0.428 126.000 0.182 NA   NA
 58161 58162 PA1710 PA1711 exsC exsE TRUE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 58162 58163 PA1711 PA1712 exsE exsB TRUE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 58163 58164 PA1712 PA1713 exsB exsA FALSE 0.082 298.000 0.154 1.000   NA
 58164 58165 PA1713 PA1714 exsA exsD TRUE 0.772 98.000 0.615 NA   NA
 58165 58166 PA1714 PA1715 exsD pscB TRUE 0.929 34.000 0.583 NA   NA
 58166 58167 PA1715 PA1716 pscB pscC TRUE 0.993 0.000 0.750 1.000   NA
 58167 58168 PA1716 PA1717 pscC pscD TRUE 0.972 2.000 0.220 NA   NA
 58168 58169 PA1717 PA1718 pscD pscE TRUE 0.981 -37.000 0.268 NA   NA
 58169 58170 PA1718 PA1719 pscE pscF TRUE 0.993 3.000 0.417 0.004   NA
 58170 58171 PA1719 PA1720 pscF pscG TRUE 0.994 3.000 0.556 0.004   NA
 58171 58172 PA1720 PA1721 pscG pscH TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.004   NA
 58172 58173 PA1721 PA1722 pscH pscI TRUE 0.994 0.000 0.333 0.004   NA
 58173 58174 PA1722 PA1723 pscI pscJ TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.013   NA
 58174 58175 PA1723 PA1724 pscJ pscK TRUE 0.985 9.000 0.800 1.000   NA
 58175 58176 PA1724 PA1725 pscK pscL TRUE 0.993 -21.000 0.727 1.000   NA
 58177 58178 PA1726 PA1727 bglX   FALSE 0.039 171.000 0.000 1.000 N NA
 58179 58180 PA1728 PA1729     FALSE 0.107 98.000 0.000 NA   NA
 58180 58181 PA1729 PA1730     FALSE 0.006 400.000 0.000 NA   NA
 58181 58182 PA1730 PA1731     TRUE 0.991 3.000 0.805 NA   NA
 58182 58183 PA1731 PA1732     TRUE 0.991 -3.000 0.365 NA   NA
 58183 58184 PA1732 PA1733     TRUE 0.739 82.000 0.383 NA N NA
 58186 58187 PA1735 PA1736     FALSE 0.004 571.000 0.000 1.000   NA
 58187 58188 PA1736 PA1737     TRUE 0.990 14.000 0.600 1.000 Y NA
 58190 58191 PA1739 PA1740     FALSE 0.377 23.000 0.000 NA N NA
 58194 58195 PA1743 PA1744     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 58195 58196 PA1744 PA1745     FALSE 0.055 155.000 0.000 NA   NA
 58198 58199 PA1747 PA1748     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 58202 58203 PA1751 PA1752     TRUE 0.942 0.000 0.047 NA   NA
 58203 58204 PA1752 PA1753     FALSE 0.181 163.000 0.059 1.000 N NA
 58204 58205 PA1753 PA1754   cysB FALSE 0.287 132.000 0.085 1.000 N NA
 58206 58207 PA1755 PA1756   cysH FALSE 0.292 65.000 0.005 NA   NA
 58210 58211 PA1759 PA1760     TRUE 0.997 3.000 0.400 0.031 Y NA
 58211 58212 PA1760 PA1761     FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 58212 58213 PA1761 PA1762     FALSE 0.148 79.000 0.000 NA   NA
 58213 58214 PA1762 PA1763     TRUE 0.872 41.000 0.357 NA   NA
 58214 58215 PA1763 PA1764     TRUE 0.955 20.000 0.571 NA   NA
 58215 58216 PA1764 PA1765     TRUE 0.900 14.000 0.154 1.000   NA
 58217 58218 PA1766 PA1767     TRUE 0.991 4.000 0.923 NA   NA
 58218 58219 PA1767 PA1768     TRUE 0.940 6.000 0.141 NA   NA
 58219 58220 PA1768 PA1769     FALSE 0.012 291.000 0.000 NA   NA
 58221 58222 PA1770 PA1771 ppsA estX FALSE 0.344 70.000 0.029 NA N NA
 58222 58223 PA1771 PA1772 estX   FALSE 0.384 107.000 0.113 NA N NA
 58223 58224 PA1772 PA1773   cmaX FALSE 0.165 188.000 0.093 NA N NA
 58224 58225 PA1773 PA1774 cmaX cfrX TRUE 0.649 49.000 0.093 NA   NA
 58225 58226 PA1774 PA1775 cfrX cmpX TRUE 0.972 3.000 0.256 NA   NA
 58226 58227 PA1775 PA1776 cmpX sigX FALSE 0.403 165.000 0.279 NA   NA
 58227 58228 PA1776 PA1777 sigX oprF TRUE 0.565 109.000 0.280 1.000 N NA
 58229 58230 PA1778 PA1779 cobA   TRUE 0.828 12.000 0.048 1.000 N NA
 58230 58231 PA1779 PA1780   nirD TRUE 0.948 27.000 0.294 0.068 N NA
 58231 58232 PA1780 PA1781 nirD nirB TRUE 0.953 53.000 0.539 0.000 N NA
 58232 10491233 PA1781 PA1781.1 nirB   FALSE 0.296 40.000 0.000 NA   NA
 10491233 58233 PA1781.1 PA1782     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 58233 58234 PA1782 PA1783   nasA TRUE 0.742 75.000 0.337 1.000 N NA
 58234 58235 PA1783 PA1784 nasA   FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 58235 58236 PA1784 PA1785     FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 58236 58237 PA1785 PA1786     TRUE 0.905 17.000 0.218 NA N NA
 58237 58238 PA1786 PA1787   acnB FALSE 0.067 178.000 0.007 NA N NA
 58242 58243 PA1791 PA1792     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 58243 58244 PA1792 PA1793   ppiB TRUE 0.963 5.000 0.237 1.000   NA
 58245 58246 PA1794 PA1795 glnS cysS TRUE 0.983 10.000 0.032 0.034 Y NA
 2200481 2200482 PA1796.1 PA1796.2     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 2200482 2200483 PA1796.2 PA1796.3     FALSE 0.213 55.000 0.000 NA   NA
 2200483 2200484 PA1796.3 PA1796.4     FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 58248 58249 PA1797 PA1798     FALSE 0.085 105.000 0.000 1.000 N NA
 58249 58250 PA1798 PA1799     TRUE 0.971 1.000 0.000 1.000 Y NA
 58251 58252 PA1800 PA1801 tig clpP TRUE 0.879 94.000 0.351 1.000 Y NA
 58252 58253 PA1801 PA1802 clpP clpX TRUE 0.856 105.000 0.352 1.000 Y NA
 58253 58254 PA1802 PA1803 clpX lon TRUE 0.832 132.000 0.201 0.088 Y NA
 58254 58255 PA1803 PA1804 lon hupB FALSE 0.196 136.000 0.040 1.000 N NA
 58255 2200485 PA1804 PA1804.1 hupB   FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 2200485 58256 PA1804.1 PA1805   ppiD FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 58257 58258 PA1806 PA1807 fabI   TRUE 0.769 22.000 0.057 1.000   NA
 58258 58259 PA1807 PA1808     TRUE 0.993 2.000 1.000 1.000   NA
 58259 58260 PA1808 PA1809     TRUE 0.995 5.000 1.000 0.070   NA
 58260 58261 PA1809 PA1810     TRUE 0.994 7.000 1.000 0.070   NA
 58261 58262 PA1810 PA1811     TRUE 0.997 -3.000 0.159 0.070 Y NA
 58262 58263 PA1811 PA1812   mltD FALSE 0.029 191.000 0.000 1.000 N NA
 58263 58264 PA1812 PA1813 mltD   FALSE 0.310 78.000 0.020 1.000   NA
 58265 58266 PA1814 PA1815   rnhA TRUE 0.854 3.000 0.009 1.000   NA
 58266 58267 PA1815 PA1816 rnhA dnaQ TRUE 0.902 65.000 0.248 1.000 Y NA
 58269 58270 PA1818 PA1819     TRUE 0.869 24.000 0.000 1.000 Y NA
 58272 58273 PA1821 PA1822   fimL TRUE 0.835 40.000 0.250 NA   NA
 58273 58274 PA1822 PA1823 fimL nudC TRUE 0.940 0.000 0.045 NA   NA
 58279 58280 PA1828 PA1829     TRUE 0.817 25.000 0.115 1.000   NA
 58280 58281 PA1829 PA1830     FALSE 0.016 258.000 0.000 1.000   NA
 58281 58282 PA1830 PA1831     TRUE 0.788 61.000 0.344 NA N NA
 58283 58284 PA1832 PA1833     FALSE 0.433 59.000 0.036 1.000 N NA
 58284 58285 PA1833 PA1834     FALSE 0.147 80.000 0.000 NA   NA
 58288 58289 PA1837 PA1838   cysI TRUE 0.973 -16.000 0.165 NA   NA
 58289 58290 PA1838 PA1839 cysI   FALSE 0.020 703.000 0.000 0.012   NA
 58291 58292 PA1840 PA1841     TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 58293 58294 PA1842 PA1843   metH TRUE 0.733 15.000 0.024 NA   NA
 58294 58295 PA1843 PA1844 metH   FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 58295 58296 PA1844 PA1845     FALSE 0.280 42.000 0.000 NA   NA
 58297 58298 PA1846 PA1847 cti   FALSE 0.456 123.000 0.030 0.020   NA
 58299 58300 PA1848 PA1849     TRUE 0.694 5.000 0.000 NA   NA
 58300 58301 PA1849 PA1850     TRUE 0.654 23.000 0.023 NA   NA
 58305 58306 PA1854 PA1855     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 58306 58307 PA1855 PA1856     TRUE 0.737 3.000 0.000 NA   NA
 58307 58308 PA1856 PA1857     FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 58308 58309 PA1857 PA1858   str FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 58309 58310 PA1858 PA1859 str   TRUE 0.610 9.000 0.000 1.000 N NA
 58312 58313 PA1861 PA1862 modC modB TRUE 0.998 2.000 0.308 0.001 Y NA
 58313 58314 PA1862 PA1863 modB modA TRUE 0.997 13.000 0.660 0.001 Y NA
 58314 58315 PA1863 PA1864 modA   FALSE 0.077 115.000 0.000 1.000 N NA
 58316 58317 PA1865 PA1866     TRUE 0.985 -7.000 0.254 NA   NA
 58317 58318 PA1866 PA1867     FALSE 0.005 441.000 0.000 NA   NA
 58318 58319 PA1867 PA1868   xqhA TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 58319 58320 PA1868 PA1869 xqhA   FALSE 0.041 168.000 0.000 1.000 N NA
 58320 58321 PA1869 PA1870     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 58321 58322 PA1870 PA1871   lasA FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 58323 58324 PA1872 PA1873     FALSE 0.192 61.000 0.000 NA   NA
 58325 58326 PA1874 PA1875     TRUE 0.949 0.000 0.057 1.000   NA
 58326 58327 PA1875 PA1876     TRUE 0.989 -10.000 0.200 0.085 N NA
 58327 58328 PA1876 PA1877     TRUE 0.994 -10.000 0.364 0.077 N NA
 58329 58330 PA1878 PA1879     TRUE 0.532 89.000 0.148 1.000   NA
 58330 58331 PA1879 PA1880     FALSE 0.056 158.000 0.000 1.000   NA
 58331 58332 PA1880 PA1881     TRUE 0.994 5.000 0.214 0.068 Y NA
 58333 58334 PA1882 PA1883     TRUE 0.512 13.000 0.000 1.000 N NA
 58336 58337 PA1885 PA1886   polB FALSE 0.171 69.000 0.000 1.000   NA
 58338 58339 PA1887 PA1888     TRUE 0.813 -16.000 0.000 NA   NA
 58341 58342 PA1890 PA1891     FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 58342 58343 PA1891 PA1892     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58343 58344 PA1892 PA1893     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58344 58345 PA1893 PA1894     FALSE 0.397 26.000 0.000 NA   NA
 58345 58346 PA1894 PA1895     TRUE 0.799 -52.000 0.000 NA   NA
 58346 58347 PA1895 PA1896     FALSE 0.459 19.000 0.000 NA   NA
 58347 58348 PA1896 PA1897     TRUE 0.679 6.000 0.000 NA   NA
 58349 58350 PA1898 PA1899 qscR phzA2 FALSE 0.005 482.000 0.000 1.000   NA
 58350 58351 PA1899 PA1900 phzA2 phzB2 TRUE 0.768 36.000 0.000 0.004   NA
 58351 58352 PA1900 PA1901 phzB2 phzC2 FALSE 0.420 24.000 0.000 1.000   NA
 58352 58353 PA1901 PA1902 phzC2 phzD2 TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000 N NA
 58353 58354 PA1902 PA1903 phzD2 phzE2 TRUE 0.987 -3.000 0.055 0.020 N NA
 58354 58355 PA1903 PA1904 phzE2 phzF2 TRUE 0.903 14.000 0.016 0.020   NA
 58355 60665 PA1904 PA1905 phzF2 phzG2 TRUE 0.893 23.000 0.235 1.000   NA
 58356 58357 PA1906 PA1907     FALSE 0.281 43.000 0.000 1.000   NA
 58357 58358 PA1907 PA1908     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 58358 58359 PA1908 PA1909     FALSE 0.036 187.000 0.000 NA   NA
 58359 58360 PA1909 PA1910     FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 58360 58361 PA1910 PA1911     FALSE 0.206 209.000 0.000 NA Y NA
 58361 58362 PA1911 PA1912     TRUE 0.988 -3.000 0.286 NA N NA
 58362 58363 PA1912 PA1913     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 58363 58364 PA1913 PA1914     FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 58364 58365 PA1914 PA1915     FALSE 0.004 568.000 0.000 NA   NA
 58365 58366 PA1915 PA1916     FALSE 0.158 64.000 0.000 NA N NA
 58366 58367 PA1916 PA1917     FALSE 0.260 45.000 0.000 NA   NA
 58367 58368 PA1917 PA1918     TRUE 0.935 13.000 0.250 NA   NA
 58368 58369 PA1918 PA1919     FALSE 0.029 194.000 0.000 1.000 N NA
 58369 58370 PA1919 PA1920     FALSE 0.193 187.000 0.122 1.000 N NA
 58370 58371 PA1920 PA1921     FALSE 0.056 158.000 0.000 1.000   NA
 58372 58373 PA1922 PA1923     TRUE 0.970 0.000 0.158 1.000 N NA
 58373 58374 PA1923 PA1924     TRUE 0.987 -3.000 0.263 NA N NA
 58374 58375 PA1924 PA1925     TRUE 0.993 0.000 0.778 NA   NA
 58375 58376 PA1925 PA1926     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 58376 58377 PA1926 PA1927   metE FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 58378 58379 PA1928 PA1929 rimJ   FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 58380 58381 PA1930 PA1931     FALSE 0.039 170.000 0.000 1.000 N NA
 58381 58382 PA1931 PA1932     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.068 Y NA
 58382 58383 PA1932 PA1933     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 58383 58384 PA1933 PA1934     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 58386 58387 PA1936 PA1937     FALSE 0.005 488.000 0.000 NA   NA
 58387 58388 PA1937 PA1938     TRUE 0.920 33.000 0.000 0.045 Y NA
 58389 58390 PA1939 PA1940     FALSE 0.007 357.000 0.000 1.000 N NA
 58390 58391 PA1940 PA1941     TRUE 0.718 179.000 0.667 0.068   NA
 58391 58392 PA1941 PA1942     FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 58392 58393 PA1942 PA1943     FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 58394 58395 PA1944 PA1945     FALSE 0.223 136.000 0.000 0.087 N NA
 58395 58396 PA1945 PA1946   rbsB FALSE 0.020 219.000 0.000 NA N NA
 58396 58397 PA1946 PA1947 rbsB rbsA TRUE 0.954 22.000 0.132 NA Y NA
 58397 58398 PA1947 PA1948 rbsA rbsC TRUE 0.987 24.000 0.778 1.000 Y NA
 58398 58399 PA1948 PA1949 rbsC rbsR TRUE 0.963 4.000 0.226 1.000 N NA
 58399 58400 PA1949 PA1950 rbsR rbsK TRUE 0.854 54.000 0.484 1.000 N NA
 58401 58402 PA1951 PA1952     TRUE 0.769 61.000 0.292 NA   NA
 58402 58403 PA1952 PA1953     TRUE 0.972 14.000 0.667 NA   NA
 58403 58404 PA1953 PA1954     TRUE 0.904 62.000 0.875 NA   NA
 58404 58405 PA1954 PA1955     TRUE 0.882 57.000 0.625 NA   NA
 58405 58406 PA1955 PA1956     TRUE 0.993 -3.000 0.455 NA   NA
 58406 58407 PA1956 PA1957     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 58407 58408 PA1957 PA1958     TRUE 0.996 -3.000 0.242 NA Y NA
 58409 58410 PA1959 PA1960 bacA   FALSE 0.363 71.000 0.029 1.000   NA
 58412 58413 PA1962 PA1963 acpD   FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 58415 58416 PA1965 PA1966     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 58418 58419 PA1968 PA1969     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 58420 58421 PA1970 PA1971   braZ FALSE 0.021 229.000 0.000 NA   NA
 58422 58423 PA1972 PA1973   pqqF FALSE 0.158 77.000 0.000 1.000   NA
 58423 58424 PA1973 PA1974 pqqF   FALSE 0.015 267.000 0.000 1.000   NA
 58424 58425 PA1974 PA1975     TRUE 0.499 103.000 0.182 NA   NA
 58425 58426 PA1975 PA1976     TRUE 0.990 -70.000 0.562 NA   NA
 58427 58428 PA1977 PA1978     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 58429 58430 PA1979 PA1980     TRUE 0.985 13.000 0.545 0.025   NA
 58431 58432 PA1981 PA1982   exaA TRUE 0.890 54.000 0.625 NA   NA
 58433 58434 PA1983 PA1984 exaB   TRUE 0.590 87.000 0.000 1.000 Y NA
 58434 58435 PA1984 PA1985   pqqA FALSE 0.008 357.000 0.000 1.000   NA
 58435 58436 PA1985 PA1986 pqqA pqqB TRUE 0.702 53.000 0.000 0.001   NA
 58436 58437 PA1986 PA1987 pqqB pqqC TRUE 0.994 10.000 0.825 0.001   NA
 58437 58438 PA1987 PA1988 pqqC pqqD TRUE 0.996 -3.000 0.246 0.001   NA
 58438 58439 PA1988 PA1989 pqqD pqqE TRUE 0.993 -28.000 0.211 0.001   NA
 58439 58440 PA1989 PA1990 pqqE   TRUE 0.929 5.000 0.088 1.000   NA
 58440 58441 PA1990 PA1991     FALSE 0.340 86.000 0.041 1.000 N NA
 58441 58442 PA1991 PA1992     TRUE 0.792 -16.000 0.000 1.000 N NA
 58443 58444 PA1993 PA1994     FALSE 0.077 125.000 0.000 NA   NA
 58444 58445 PA1994 PA1995     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58445 58446 PA1995 PA1996   ppiC1 FALSE 0.459 19.000 0.000 NA   NA
 58446 58447 PA1996 PA1997 ppiC1   FALSE 0.401 58.000 0.023 1.000   NA
 58447 58448 PA1997 PA1998     FALSE 0.151 68.000 0.000 1.000 N NA
 58449 58450 PA1999 PA2000     TRUE 0.987 35.000 0.352 0.000 Y NA
 58450 58451 PA2000 PA2001   atoB FALSE 0.386 149.000 0.000 1.000 Y NA
 58451 58452 PA2001 PA2002 atoB   FALSE 0.201 213.000 0.000 1.000 Y NA
 58453 58454 PA2003 PA2004 bdhA   TRUE 0.859 37.000 0.288 1.000 N NA
 58454 58455 PA2004 PA2005     FALSE 0.013 262.000 0.000 1.000 N NA
 58455 58456 PA2005 PA2006     FALSE 0.148 69.000 0.000 1.000 N NA
 58456 58457 PA2006 PA2007   maiA TRUE 0.665 84.000 0.267 1.000 N NA
 58457 58458 PA2007 PA2008 maiA fahA TRUE 0.992 -3.000 0.077 0.001 N NA
 58458 58459 PA2008 PA2009 fahA hmgA TRUE 0.987 5.000 0.188 1.000 Y NA
 58461 58462 PA2011 PA2012 gnyL gnyA TRUE 0.945 21.000 0.229 0.076 N NA
 58462 58463 PA2012 PA2013 gnyA gnyH TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.076 Y NA
 58463 58464 PA2013 PA2014 gnyH gnyB TRUE 0.975 14.000 0.189 1.000 Y NA
 58464 58465 PA2014 PA2015 gnyB gnyD TRUE 0.813 123.000 0.316 1.000 Y NA
 58465 58466 PA2015 PA2016 gnyD gnyR FALSE 0.396 49.000 0.014 1.000 N NA
 58468 58469 PA2018 PA2019     FALSE 0.466 16.000 0.000 1.000 N NA
 58472 58473 PA2022 PA2023   galU TRUE 0.937 48.000 0.273 1.000 Y NA
 58476 58477 PA2026 PA2027     FALSE 0.056 154.000 0.000 NA   NA
 58478 58479 PA2028 PA2029     FALSE 0.409 24.000 0.000 NA   NA
 58480 58481 PA2030 PA2031     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58482 58483 PA2032 PA2033     FALSE 0.058 135.000 0.000 NA N NA
 58483 58484 PA2033 PA2034     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA N NA
 58486 58487 PA2036 PA2037     FALSE 0.066 141.000 0.000 NA   NA
 58488 58489 PA2038 PA2039     TRUE 0.993 -15.000 0.651 NA   NA
 58490 58491 PA2040 PA2041     FALSE 0.354 157.000 0.000 1.000 Y NA
 58491 58492 PA2041 PA2042     FALSE 0.042 488.000 0.000 1.000 Y NA
 58492 58493 PA2042 PA2043     FALSE 0.184 121.000 0.026 1.000 N NA
 58494 58495 PA2044 PA2045     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 58495 58496 PA2045 PA2046     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 58496 58497 PA2046 PA2047     FALSE 0.003 1035.000 0.000 NA   NA
 58500 58501 PA2050 PA2051     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58502 58503 PA2052 PA2053 cynS cynT TRUE 0.843 40.000 0.011 1.000 Y NA
 58506 58507 PA2056 PA2057     FALSE 0.003 680.000 0.000 1.000 N NA
 58507 58508 PA2057 PA2058     TRUE 0.919 4.000 0.000 0.069 N NA
 58508 58509 PA2058 PA2059     TRUE 0.940 2.000 0.000 0.069   NA
 58509 58510 PA2059 PA2060     TRUE 0.940 2.000 0.000 0.069   NA
 58510 58511 PA2060 PA2061     TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 58511 58512 PA2061 PA2062     FALSE 0.066 146.000 0.000 1.000   NA
 58512 58513 PA2062 PA2063     FALSE 0.029 203.000 0.000 NA   NA
 58514 58515 PA2064 PA2065 pcoB pcoA TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.003 N NA
 58515 58516 PA2065 PA2066 pcoA   FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 58516 58517 PA2066 PA2067     TRUE 0.941 -3.000 0.020 NA   NA
 58517 58518 PA2067 PA2068     TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 58518 58519 PA2068 PA2069     FALSE 0.274 44.000 0.000 1.000   NA
 58519 58520 PA2069 PA2070     FALSE 0.034 180.000 0.000 1.000 N NA
 58521 58522 PA2071 PA2072 fusA2   FALSE 0.038 172.000 0.000 1.000 N NA
 58522 58523 PA2072 PA2073     FALSE 0.021 218.000 0.000 1.000 N NA
 58523 58524 PA2073 PA2074     TRUE 0.951 0.000 0.062 1.000   NA
 58527 58528 PA2077 PA2078     TRUE 0.719 40.000 0.000 0.013   NA
 58528 58529 PA2078 PA2079     FALSE 0.012 286.000 0.000 1.000   NA
 58529 58530 PA2079 PA2080   kynU FALSE 0.463 156.000 0.028 1.000 Y NA
 58530 58531 PA2080 PA2081 kynU kynB TRUE 0.877 4.000 0.028 1.000   NA
 58532 58533 PA2082 PA2083     FALSE 0.026 202.000 0.000 1.000 N NA
 58533 58534 PA2083 PA2084     FALSE 0.115 88.000 0.000 1.000 N NA
 58534 58535 PA2084 PA2085     FALSE 0.349 28.000 0.000 1.000 N NA
 58535 58536 PA2085 PA2086     TRUE 0.890 11.000 0.000 0.036   NA
 58536 58537 PA2086 PA2087     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58537 58538 PA2087 PA2088     TRUE 0.813 -16.000 0.000 NA   NA
 58538 58539 PA2088 PA2089     FALSE 0.125 92.000 0.000 1.000   NA
 58539 58540 PA2089 PA2090     TRUE 0.499 13.000 0.000 NA N NA
 58540 58541 PA2090 PA2091     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58541 58542 PA2091 PA2092     TRUE 0.989 -13.000 0.000 0.069 Y NA
 58542 58543 PA2092 PA2093     FALSE 0.088 103.000 0.000 1.000 N NA
 58543 58544 PA2093 PA2094     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58545 58546 PA2095 PA2096     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 58547 58548 PA2097 PA2098     TRUE 0.876 11.000 0.074 1.000 N NA
 58548 58549 PA2098 PA2099     TRUE 0.977 -15.000 0.047 0.076   NA
 58551 58552 PA2101 PA2102     TRUE 0.871 2.000 0.011 NA   NA
 58552 58553 PA2102 PA2103     FALSE 0.080 263.000 0.093 NA   NA
 58553 58554 PA2103 PA2104     TRUE 0.695 19.000 0.029 1.000 N NA
 58554 58555 PA2104 PA2105     TRUE 0.733 82.000 0.037 1.000 Y NA
 58555 58556 PA2105 PA2106     TRUE 0.986 -3.000 0.042 0.033   NA
 58559 58560 PA2109 PA2110     FALSE 0.168 68.000 0.000 NA   NA
 58560 58561 PA2110 PA2111     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 58561 58562 PA2111 PA2112     TRUE 0.996 -3.000 0.909 1.000   NA
 58562 58563 PA2112 PA2113     FALSE 0.351 33.000 0.000 1.000   NA
 58563 58564 PA2113 PA2114     TRUE 0.755 25.000 0.000 0.076   NA
 58565 58566 PA2115 PA2116     FALSE 0.218 107.000 0.025 NA   NA
 58569 58570 PA2119 PA2120     FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 58570 58571 PA2120 PA2121     FALSE 0.063 148.000 0.000 NA   NA
 58572 58573 PA2122 PA2123     FALSE 0.314 37.000 0.000 NA   NA
 58573 58574 PA2123 PA2124     TRUE 0.801 105.000 0.833 1.000 N NA
 58574 58575 PA2124 PA2125     TRUE 0.865 22.000 0.174 1.000 N NA
 58576 58577 PA2126 PA2127     FALSE 0.006 427.000 0.000 1.000   NA
 58578 58579 PA2128 PA2129 cupA1 cupA2 TRUE 0.855 88.000 0.231 1.000 Y NA
 58579 58580 PA2129 PA2130 cupA2 cupA3 TRUE 0.976 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 58580 58581 PA2130 PA2131 cupA3 cupA4 TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000   NA
 58581 58582 PA2131 PA2132 cupA4 cupA5 TRUE 0.989 -10.000 0.400 1.000   NA
 58582 58583 PA2132 PA2133 cupA5   TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 58583 58584 PA2133 PA2134     FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 58584 58585 PA2134 PA2135     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 58587 58588 PA2137 PA2138     TRUE 0.483 18.000 0.000 1.000   NA
 58588 58589 PA2138 PA2139     FALSE 0.154 76.000 0.000 NA   NA
 58589 58590 PA2139 PA2140     FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 58590 58591 PA2140 PA2141     TRUE 0.595 11.000 0.000 NA   NA
 58591 58592 PA2141 PA2142     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58592 58593 PA2142 PA2143     FALSE 0.005 451.000 0.000 NA   NA
 58593 58594 PA2143 PA2144   glgP FALSE 0.392 53.000 0.016 NA   NA
 58596 58597 PA2146 PA2147   katE FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 58597 58598 PA2147 PA2148 katE   FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 58598 58599 PA2148 PA2149     TRUE 0.867 14.000 0.095 NA   NA
 58599 58600 PA2149 PA2150     TRUE 0.674 23.000 0.029 NA   NA
 58600 58601 PA2150 PA2151     FALSE 0.067 144.000 0.000 1.000   NA
 58601 58602 PA2151 PA2152     TRUE 0.990 11.000 0.544 0.002   NA
 58602 58603 PA2152 PA2153   glgB TRUE 0.998 -3.000 0.115 0.002 Y NA
 58604 58605 PA2154 PA2155     TRUE 0.991 -3.000 0.357 NA   NA
 58605 58606 PA2155 PA2156     TRUE 0.995 -3.000 0.636 NA   NA
 58606 58607 PA2156 PA2157     TRUE 0.992 -3.000 0.417 NA   NA
 58607 58608 PA2157 PA2158     TRUE 0.951 4.000 0.150 NA   NA
 58608 58609 PA2158 PA2159     TRUE 0.561 67.000 0.100 1.000   NA
 58609 58610 PA2159 PA2160     FALSE 0.108 100.000 0.000 1.000   NA
 58610 58611 PA2160 PA2161     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 58611 58612 PA2161 PA2162     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58612 58613 PA2162 PA2163     TRUE 0.998 -7.000 0.141 0.002 Y NA
 58613 58614 PA2163 PA2164     TRUE 0.998 -7.000 0.204 0.002 Y NA
 58614 58615 PA2164 PA2165     TRUE 0.998 0.000 0.917 1.000 Y NA
 58616 58617 PA2166 PA2167     FALSE 0.009 329.000 0.000 NA   NA
 58617 58618 PA2167 PA2168     TRUE 0.986 -3.000 0.221 NA   NA
 58618 58619 PA2168 PA2169     FALSE 0.079 126.000 0.000 1.000   NA
 58619 58620 PA2169 PA2170     FALSE 0.389 27.000 0.000 NA   NA
 58620 58621 PA2170 PA2171     FALSE 0.155 75.000 0.000 NA   NA
 58621 58622 PA2171 PA2172     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 58622 58623 PA2172 PA2173     FALSE 0.389 27.000 0.000 NA   NA
 58624 58625 PA2174 PA2175     FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 58625 58626 PA2175 PA2176     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 58628 58629 PA2178 PA2179     FALSE 0.007 375.000 0.000 NA   NA
 58629 58630 PA2179 PA2180     TRUE 0.981 -16.000 0.250 NA   NA
 58632 58633 PA2182 PA2183     FALSE 0.011 294.000 0.000 NA   NA
 58633 58634 PA2183 PA2184     TRUE 0.981 -3.000 0.154 NA   NA
 58635 58636 PA2185 PA2186 katN   FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 58636 58637 PA2186 PA2187     FALSE 0.096 105.000 0.000 NA   NA
 58639 58640 PA2189 PA2190     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 58642 58643 PA2192 PA2193   hcnA FALSE 0.006 424.000 0.000 1.000   NA
 58643 58644 PA2193 PA2194 hcnA hcnB TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.001   NA
 58644 58645 PA2194 PA2195 hcnB hcnC TRUE 0.986 3.000 0.136 0.001   NA
 58645 58646 PA2195 PA2196 hcnC   FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 58646 58647 PA2196 PA2197     FALSE 0.340 131.000 0.115 1.000   NA
 58647 58648 PA2197 PA2198     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.046   NA
 58648 58649 PA2198 PA2199     TRUE 0.689 6.000 0.000 1.000   NA
 58649 58650 PA2199 PA2200     FALSE 0.110 88.000 0.000 NA N NA
 58650 58651 PA2200 PA2201     FALSE 0.077 125.000 0.000 NA   NA
 58652 58653 PA2202 PA2203     TRUE 0.999 2.000 0.692 0.011 Y NA
 58653 58654 PA2203 PA2204     TRUE 0.948 81.000 0.395 0.083 Y NA
 58654 58655 PA2204 PA2205     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 58655 58656 PA2205 PA2206     FALSE 0.143 82.000 0.000 NA   NA
 58656 58657 PA2206 PA2207     TRUE 0.780 68.000 0.375 NA   NA
 58657 58658 PA2207 PA2208     TRUE 0.987 -3.000 0.250 NA   NA
 58658 58659 PA2208 PA2209     TRUE 0.893 28.000 0.286 NA   NA
 58660 58661 PA2210 PA2211     TRUE 0.980 -7.000 0.182 1.000   NA
 58661 58662 PA2211 PA2212     TRUE 0.975 -3.000 0.097 1.000   NA
 58662 58663 PA2212 PA2213     FALSE 0.044 173.000 0.000 1.000   NA
 58663 58664 PA2213 PA2214     FALSE 0.146 186.000 0.000 0.075   NA
 58664 58665 PA2214 PA2215     TRUE 0.710 31.000 0.067 1.000 N NA
 58665 58666 PA2215 PA2216     TRUE 0.886 28.000 0.061 0.035   NA
 58666 58667 PA2216 PA2217     FALSE 0.466 129.000 0.061 0.075   NA
 58668 58669 PA2218 PA2219   opdE FALSE 0.442 94.000 0.098 1.000   NA
 58670 58671 PA2220 PA2221     FALSE 0.005 470.000 0.000 1.000   NA
 58672 58673 PA2222 PA2223     TRUE 0.567 12.000 0.000 NA   NA
 58673 58674 PA2223 PA2224     FALSE 0.340 33.000 0.000 NA   NA
 58674 58675 PA2224 PA2225     FALSE 0.018 248.000 0.000 NA   NA
 58675 58676 PA2225 PA2226     FALSE 0.265 44.000 0.000 NA   NA
 58676 58677 PA2226 PA2227     FALSE 0.328 35.000 0.000 NA   NA
 58677 58678 PA2227 PA2228     TRUE 0.610 9.000 0.000 1.000 N NA
 58679 58680 PA2229 PA2230     FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 58680 58681 PA2230 PA2231   pslA FALSE 0.004 527.000 0.000 NA   NA
 58681 58682 PA2231 PA2232 pslA pslB TRUE 0.985 0.000 0.034 NA Y NA
 58682 58683 PA2232 PA2233 pslB pslC TRUE 0.975 0.000 0.000 NA Y NA
 58683 58684 PA2233 PA2234 pslC pslD TRUE 0.841 30.000 0.000 NA Y NA
 58684 58685 PA2234 PA2235 pslD pslE TRUE 0.969 15.000 0.152 1.000 Y NA
 58685 58686 PA2235 PA2236 pslE pslF TRUE 0.988 0.000 0.054 1.000 Y NA
 58686 58687 PA2236 PA2237 pslF pslG TRUE 0.950 -10.000 0.054 1.000 N NA
 58687 58688 PA2237 PA2238 pslG pslH TRUE 0.983 9.000 0.714 1.000 N NA
 58688 58689 PA2238 PA2239 pslH pslI TRUE 0.999 -9.000 0.714 0.020 Y NA
 58689 58690 PA2239 PA2240 pslI pslJ TRUE 0.988 3.000 0.625 1.000   NA
 58690 58691 PA2240 PA2241 pslJ pslK TRUE 0.959 2.000 0.133 1.000   NA
 58691 58692 PA2241 PA2242 pslK pslL TRUE 0.546 83.000 0.133 1.000   NA
 58692 58693 PA2242 PA2243 pslL pslM FALSE 0.031 187.000 0.000 1.000 N NA
 58693 58694 PA2243 PA2244 pslM pslN FALSE 0.188 56.000 0.000 1.000 N NA
 58694 58695 PA2244 PA2245 pslN pslO FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 58697 58698 PA2247 PA2248 bkdA1 bkdA2 TRUE 0.999 -3.000 0.558 0.075 Y NA
 58698 58699 PA2248 PA2249 bkdA2 bkdB TRUE 0.991 1.000 0.036 0.075 Y NA
 58699 58700 PA2249 PA2250 bkdB lpdV TRUE 0.986 4.000 0.143 1.000 Y NA
 58702 58703 PA2252 PA2253   ansA TRUE 0.736 100.000 0.095 1.000 Y NA
 58703 58704 PA2253 PA2254 ansA pvcA FALSE 0.021 215.000 0.000 NA N NA
 58704 58705 PA2254 PA2255 pvcA pvcB TRUE 0.988 18.000 0.630 NA Y NA
 58705 58706 PA2255 PA2256 pvcB pvcC TRUE 0.964 52.000 0.280 0.066 Y NA
 58706 58707 PA2256 PA2257 pvcC pvcD TRUE 0.961 -7.000 0.000 0.066 N NA
 58709 58710 PA2259 PA2260 ptxS   TRUE 0.706 72.000 0.263 NA   NA
 58710 58711 PA2260 PA2261     TRUE 0.993 -7.000 0.571 NA   NA
 58711 58712 PA2261 PA2262     TRUE 0.844 63.000 0.095 NA Y NA
 58712 58713 PA2262 PA2263     TRUE 0.974 19.000 1.000 1.000 N NA
 58713 58714 PA2263 PA2264     FALSE 0.048 168.000 0.000 1.000   NA
 58714 58715 PA2264 PA2265     TRUE 0.997 3.000 0.895 0.000   NA
 58715 58716 PA2265 PA2266     TRUE 0.985 12.000 0.579 0.066 N NA
 58720 58721 PA2270 PA2271     TRUE 0.667 8.000 0.000 1.000   NA
 58721 58722 PA2271 PA2272   pbpC FALSE 0.083 122.000 0.000 1.000   NA
 58726 58727 PA2276 PA2277   arsR TRUE 0.795 79.000 0.000 0.055 Y NA
 58727 58728 PA2277 PA2278 arsR arsB TRUE 0.939 14.000 0.300 1.000 N NA
 58728 58729 PA2278 PA2279 arsB arsC TRUE 0.757 32.000 0.103 1.000 N NA
 58729 58730 PA2279 PA2280 arsC   TRUE 0.902 12.000 0.128 NA   NA
 58732 58733 PA2282 PA2283     TRUE 0.668 7.000 0.000 NA   NA
 58733 58734 PA2283 PA2284     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58734 58735 PA2284 PA2285     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58735 58736 PA2285 PA2286     TRUE 0.779 1.000 0.000 NA   NA
 58736 58737 PA2286 PA2287     TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 58738 58739 PA2288 PA2289     FALSE 0.080 121.000 0.000 NA   NA
 58739 58740 PA2289 PA2290   gcd FALSE 0.063 132.000 0.000 1.000 N NA
 58740 58741 PA2290 PA2291 gcd   FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 58741 58742 PA2291 PA2292     FALSE 0.009 342.000 0.000 1.000   NA
 58742 58743 PA2292 PA2293     TRUE 0.988 -3.000 0.273 1.000   NA
 58743 58744 PA2293 PA2294     TRUE 0.989 -3.000 0.316 1.000 N NA
 58744 58745 PA2294 PA2295     TRUE 0.998 -3.000 0.424 1.000 Y NA
 58745 58746 PA2295 PA2296     TRUE 0.993 25.000 0.732 0.068 Y NA
 58746 58747 PA2296 PA2297     TRUE 0.590 135.000 0.439 1.000 N NA
 58747 58748 PA2297 PA2298     TRUE 0.963 86.000 0.595 0.066 Y NA
 58748 58749 PA2298 PA2299     TRUE 0.989 -3.000 0.310 1.000 N NA
 58749 58750 PA2299 PA2300   chiC FALSE 0.036 176.000 0.000 1.000 N NA
 58750 58751 PA2300 PA2301 chiC   FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 58751 58752 PA2301 PA2302     FALSE 0.168 68.000 0.000 NA   NA
 58752 58753 PA2302 PA2303     TRUE 0.886 20.000 0.000 1.000 Y NA
 58753 58754 PA2303 PA2304     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.045 Y NA
 58754 58755 PA2304 PA2305     TRUE 0.843 30.000 0.000 1.000 Y NA
 58755 58756 PA2305 PA2306     FALSE 0.098 96.000 0.000 1.000 N NA
 58756 58757 PA2306 PA2307     FALSE 0.081 110.000 0.000 1.000 N NA
 58757 58758 PA2307 PA2308     TRUE 0.991 17.000 0.795 1.000 Y NA
 58758 58759 PA2308 PA2309     TRUE 0.993 8.000 0.553 NA Y NA
 58759 58760 PA2309 PA2310     TRUE 0.921 41.000 0.647 NA N NA
 58761 58762 PA2311 PA2312     FALSE 0.213 55.000 0.000 NA   NA
 58762 58763 PA2312 PA2313     FALSE 0.427 84.000 0.065 NA   NA
 58764 58765 PA2314 PA2315     TRUE 0.787 0.000 0.000 1.000 N NA
 58766 58767 PA2316 PA2317     FALSE 0.087 104.000 0.000 1.000 N NA
 58767 58768 PA2317 PA2318     TRUE 0.891 33.000 0.333 NA   NA
 58768 58769 PA2318 PA2319     FALSE 0.012 290.000 0.000 NA   NA
 58771 58772 PA2321 PA2322     TRUE 0.875 97.000 0.364 1.000 Y NA
 58772 58773 PA2322 PA2323     FALSE 0.008 333.000 0.000 1.000 N NA
 58773 58774 PA2323 PA2324     FALSE 0.021 218.000 0.000 1.000 N NA
 58774 58775 PA2324 PA2325     TRUE 0.977 31.000 0.176 0.007 Y NA
 58776 58777 PA2326 PA2327     FALSE 0.003 645.000 0.000 NA N NA
 58777 58778 PA2327 PA2328     TRUE 0.999 -3.000 0.973 1.000 Y NA
 58778 58779 PA2328 PA2329     TRUE 0.993 -34.000 0.189 1.000 Y NA
 58779 58780 PA2329 PA2330     TRUE 0.975 -3.000 0.113 1.000 N NA
 58780 58781 PA2330 PA2331     TRUE 0.752 50.000 0.200 NA   NA
 58783 58784 PA2333 PA2334     FALSE 0.475 97.000 0.150 1.000 N NA
 58785 58786 PA2335 PA2336     TRUE 0.782 23.000 0.071 NA   NA
 58786 58787 PA2336 PA2337   mtlR FALSE 0.059 152.000 0.000 NA   NA
 58787 58788 PA2337 PA2338 mtlR   TRUE 0.543 158.000 0.182 0.044 N NA
 58788 58789 PA2338 PA2339     TRUE 0.849 76.000 0.028 0.068 Y NA
 58789 58790 PA2339 PA2340     TRUE 0.997 11.000 0.918 0.068 Y NA
 58790 58791 PA2340 PA2341     TRUE 0.964 40.000 0.173 0.068 Y NA
 58791 58792 PA2341 PA2342   mtlD TRUE 0.982 23.000 0.524 1.000 Y NA
 58792 58793 PA2342 PA2343 mtlD mtlY TRUE 0.994 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 58793 58794 PA2343 PA2344 mtlY mtlZ TRUE 0.914 41.000 0.118 1.000 Y NA
 58796 58797 PA2346 PA2347     TRUE 0.996 11.000 0.500 0.007 Y NA
 58797 58798 PA2347 PA2348     TRUE 0.946 18.000 0.452 NA N NA
 58798 58799 PA2348 PA2349     TRUE 0.893 32.000 0.346 NA N NA
 58799 58800 PA2349 PA2350     TRUE 0.996 -3.000 0.200 NA Y NA
 58800 58801 PA2350 PA2351     TRUE 0.988 -16.000 0.056 1.000 Y NA
 58801 58802 PA2351 PA2352     FALSE 0.035 178.000 0.000 1.000 N NA
 58803 58804 PA2353 PA2354     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 58804 58805 PA2354 PA2355     TRUE 0.993 -3.000 0.467 1.000 N NA
 58805 58806 PA2355 PA2356   msuD TRUE 0.792 30.000 0.129 1.000 N NA
 58806 58807 PA2356 PA2357 msuD msuE TRUE 0.921 10.000 0.129 1.000   NA
 58807 58808 PA2357 PA2358 msuE   FALSE 0.052 160.000 0.000 NA   NA
 58808 58809 PA2358 PA2359     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 58809 58810 PA2359 PA2360     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 58810 58811 PA2360 PA2361     TRUE 0.983 -3.000 0.176 NA   NA
 58811 58812 PA2361 PA2362     TRUE 0.989 -3.000 0.300 NA   NA
 58812 58813 PA2362 PA2363     TRUE 0.969 18.000 0.744 NA   NA
 58813 58814 PA2363 PA2364     TRUE 0.750 60.000 0.256 NA   NA
 58815 58816 PA2365 PA2366     TRUE 0.969 23.000 0.920 NA   NA
 58816 58817 PA2366 PA2367     FALSE 0.457 74.000 0.062 NA   NA
 58817 58818 PA2367 PA2368     TRUE 0.950 13.000 0.333 NA   NA
 58818 58819 PA2368 PA2369     TRUE 0.984 -16.000 0.300 NA   NA
 58819 58820 PA2369 PA2370     TRUE 0.987 -36.000 0.400 NA   NA
 58820 58821 PA2370 PA2371     TRUE 0.973 2.000 0.233 NA   NA
 58821 58822 PA2371 PA2372     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 58822 58823 PA2372 PA2373     FALSE 0.008 348.000 0.000 NA   NA
 58823 58824 PA2373 PA2374     TRUE 0.959 11.000 0.333 NA   NA
 58826 58827 PA2376 PA2377     FALSE 0.060 132.000 0.000 NA N NA
 58828 58829 PA2378 PA2379     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.066 Y NA
 58829 58830 PA2379 PA2380     FALSE 0.014 265.000 0.000 NA   NA
 58832 58833 PA2382 PA2383 lldA   FALSE 0.346 97.000 0.064 1.000 N NA
 58833 58834 PA2383 PA2384     FALSE 0.280 42.000 0.000 NA   NA
 58834 58835 PA2384 PA2385   pvdQ FALSE 0.038 181.000 0.000 NA   NA
 58835 58836 PA2385 PA2386 pvdQ pvdA FALSE 0.078 123.000 0.000 NA   NA
 58836 58837 PA2386 PA2387 pvdA   TRUE 0.621 133.000 0.500 NA N NA
 58838 58839 PA2388 PA2389     FALSE 0.087 101.000 0.000 NA N NA
 58839 58840 PA2389 PA2390     TRUE 0.994 0.000 0.943 1.000 N NA
 58840 58841 PA2390 PA2391   opmQ TRUE 0.968 6.000 0.314 1.000 N NA
 58843 58844 PA2393 PA2394   pvdN TRUE 0.962 23.000 0.188 1.000 Y NA
 58844 58845 PA2394 PA2395 pvdN pvdO TRUE 0.921 29.000 0.429 1.000   NA
 58847 58848 PA2397 PA2398 pvdE fpvA TRUE 0.729 103.000 0.100 1.000 Y NA
 58849 58850 PA2399 PA2400 pvdD pvdJ TRUE 0.973 12.000 0.000 0.003 Y NA
 58850 58852 PA2400 PA2402 pvdJ   TRUE 0.946 100.000 0.400 0.003 Y NA
 58853 58854 PA2403 PA2404     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58854 58855 PA2404 PA2405     TRUE 0.987 -3.000 0.250 NA   NA
 58855 58856 PA2405 PA2406     TRUE 0.991 -3.000 0.360 NA   NA
 58856 58857 PA2406 PA2407     TRUE 0.902 33.000 0.387 NA   NA
 58857 58858 PA2407 PA2408     TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.084 Y NA
 58858 58859 PA2408 PA2409     TRUE 0.999 -3.000 0.814 0.084 Y NA
 58859 58860 PA2409 PA2410     TRUE 0.998 -3.000 0.512 1.000 Y NA
 58861 58862 PA2411 PA2412     TRUE 0.979 1.000 0.273 NA   NA
 58862 58863 PA2412 PA2413   pvdH TRUE 0.620 78.000 0.184 NA   NA
 58863 58864 PA2413 PA2414 pvdH   FALSE 0.035 179.000 0.000 1.000 N NA
 58864 58865 PA2414 PA2415     TRUE 0.991 -7.000 0.488 NA   NA
 58868 58869 PA2418 PA2419     FALSE 0.107 98.000 0.000 NA   NA
 58869 58870 PA2419 PA2420     FALSE 0.149 82.000 0.000 1.000   NA
 58870 58871 PA2420 PA2421     FALSE 0.340 33.000 0.000 NA   NA
 58871 58872 PA2421 PA2422     FALSE 0.005 476.000 0.000 NA   NA
 58872 58873 PA2422 PA2423     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 58874 58875 PA2424 PA2425 pvdL pvdG TRUE 0.909 73.000 0.333 1.000 Y NA
 58877 58878 PA2427 PA2428     FALSE 0.131 87.000 0.000 NA   NA
 58880 58881 PA2430 PA2431     FALSE 0.310 196.000 0.286 NA   NA
 58882 58883 PA2432 PA2433     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 58884 58885 PA2434 PA2435     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 58885 58886 PA2435 PA2436     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 58886 58887 PA2436 PA2437     FALSE 0.056 154.000 0.000 NA   NA
 58887 58888 PA2437 PA2438     TRUE 0.989 -3.000 0.022 NA Y NA
 58888 58889 PA2438 PA2439     TRUE 0.947 12.000 0.019 NA Y NA
 58890 58891 PA2440 PA2441     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 58892 58893 PA2442 PA2443 gcvT2 sdaA TRUE 0.630 94.000 0.013 1.000 Y NA
 58893 58894 PA2443 PA2444 sdaA glyA2 TRUE 0.757 48.000 0.000 1.000 Y NA
 58894 58895 PA2444 PA2445 glyA2 gcvP2 TRUE 0.682 143.000 0.000 0.001 Y NA
 58895 58896 PA2445 PA2446 gcvP2 gcvH2 TRUE 0.984 11.000 0.249 1.000 Y NA
 58896 58897 PA2446 PA2447 gcvH2   FALSE 0.014 259.000 0.000 1.000 N NA
 58899 58900 PA2449 PA2450     FALSE 0.143 82.000 0.000 NA   NA
 58900 58901 PA2450 PA2451     FALSE 0.029 204.000 0.000 NA   NA
 58901 58902 PA2451 PA2452     FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 58903 58904 PA2453 PA2454     FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 58904 58905 PA2454 PA2455     TRUE 0.981 -3.000 0.029 0.074   NA
 58905 58906 PA2455 PA2456     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 58906 58907 PA2456 PA2457     FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 58907 58908 PA2457 PA2458     FALSE 0.276 163.000 0.133 NA   NA
 58909 58910 PA2459 PA2460     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 58910 58911 PA2460 PA2461     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 58911 58912 PA2461 PA2462     FALSE 0.004 570.000 0.000 NA   NA
 58912 58913 PA2462 PA2463     FALSE 0.476 113.000 0.000 NA Y NA
 58913 58914 PA2463 PA2464     FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 58914 58915 PA2464 PA2465     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 58915 58916 PA2465 PA2466     FALSE 0.409 118.000 0.147 NA   NA
 58916 58917 PA2466 PA2467     TRUE 0.678 144.000 0.160 NA Y NA
 58917 58918 PA2467 PA2468     TRUE 0.972 9.000 0.444 NA N NA
 58918 58919 PA2468 PA2469     TRUE 0.734 89.000 0.000 0.084 Y NA
 58920 58921 PA2470 PA2471 gtdA   TRUE 0.974 13.000 0.167 1.000 Y NA
 58921 58922 PA2471 PA2472     FALSE 0.135 78.000 0.000 1.000 N NA
 58922 58923 PA2472 PA2473     TRUE 0.512 13.000 0.000 1.000 N NA
 58923 58924 PA2473 PA2474     FALSE 0.254 42.000 0.000 1.000 N NA
 58925 58926 PA2475 PA2476   dsbG FALSE 0.135 73.000 0.000 NA N NA
 58926 58927 PA2476 PA2477 dsbG   TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA Y NA
 58927 58928 PA2477 PA2478     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.002 Y NA
 58929 58930 PA2479 PA2480     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 58931 58932 PA2481 PA2482     TRUE 0.999 -3.000 0.371 0.013 Y NA
 58932 58933 PA2482 PA2483     FALSE 0.470 115.000 0.000 NA Y NA
 58933 58934 PA2483 PA2484     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 58935 58936 PA2485 PA2486     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 58938 58939 PA2488 PA2489     TRUE 0.936 27.000 0.000 0.029 Y NA
 58939 58940 PA2489 PA2490     TRUE 0.486 81.000 0.094 1.000 N NA
 58942 58943 PA2492 PA2493 mexT mexE FALSE 0.018 231.000 0.000 1.000 N NA
 58943 58944 PA2493 PA2494 mexE mexF TRUE 0.970 22.000 0.923 1.000 N NA
 58944 58945 PA2494 PA2495 mexF oprN TRUE 0.997 -3.000 0.600 0.067 N NA
 58946 58947 PA2496 PA2497     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 58948 58949 PA2498 PA2499     TRUE 0.862 18.000 0.128 NA   NA
 58949 58950 PA2499 PA2500     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA N NA
 58951 58952 PA2501 PA2502     FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 58954 58955 PA2504 PA2505     FALSE 0.017 252.000 0.000 NA   NA
 58957 58958 PA2507 PA2508 catA catC TRUE 0.770 45.000 0.000 1.000 Y NA
 58958 58959 PA2508 PA2509 catC catB FALSE 0.318 32.000 0.000 1.000 N NA
 58962 58963 PA2512 PA2513 antA antB TRUE 0.997 -3.000 0.429 0.000 N NA
 58963 58964 PA2513 PA2514 antB antC TRUE 0.971 19.000 0.429 0.065 N NA
 58965 58966 PA2515 PA2516 xylL xylZ TRUE 0.945 25.000 0.574 1.000 N NA
 58966 58967 PA2516 PA2517 xylZ xylY TRUE 0.969 34.000 0.672 0.065 N NA
 58967 58968 PA2517 PA2518 xylY xylX TRUE 0.999 -3.000 0.953 0.000 N NA
 58968 58969 PA2518 PA2519 xylX xylS FALSE 0.075 117.000 0.000 1.000 N NA
 58969 58970 PA2519 PA2520 xylS czcA FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000 N NA
 58970 58971 PA2520 PA2521 czcA czcB TRUE 0.931 23.000 0.421 1.000 N NA
 58971 58972 PA2521 PA2522 czcB czcC TRUE 0.943 53.000 0.368 1.000 Y NA
 58973 58974 PA2523 PA2524     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 58975 58976 PA2525 PA2526     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA N NA
 58976 58977 PA2526 PA2527     TRUE 0.999 -3.000 0.741 NA Y NA
 58977 58978 PA2527 PA2528     TRUE 0.994 -3.000 0.619 NA N NA
 58979 58980 PA2529 PA2530     TRUE 0.979 0.000 0.233 NA   NA
 58980 58981 PA2530 PA2531     FALSE 0.031 197.000 0.000 NA   NA
 58982 58983 PA2532 PA2533 tpx   FALSE 0.117 135.000 0.007 1.000 N NA
 58983 58984 PA2533 PA2534     FALSE 0.048 156.000 0.000 1.000 N NA
 58986 58987 PA2536 PA2537     TRUE 0.989 2.000 0.595 1.000   NA
 58987 58988 PA2537 PA2538     TRUE 0.906 12.000 0.140 NA   NA
 58988 58989 PA2538 PA2539     TRUE 0.968 -7.000 0.090 NA   NA
 58989 58990 PA2539 PA2540     TRUE 0.859 36.000 0.285 NA N NA
 58990 58991 PA2540 PA2541     TRUE 0.842 90.000 0.215 NA Y NA
 58991 58992 PA2541 PA2542     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 58992 58993 PA2542 PA2543     TRUE 0.994 -3.000 0.575 NA   NA
 58993 58994 PA2543 PA2544     FALSE 0.193 134.000 0.033 1.000   NA
 58997 58998 PA2547 PA2548     FALSE 0.175 60.000 0.000 1.000 N NA
 58998 58999 PA2548 PA2549     TRUE 0.498 150.000 0.029 1.000 Y NA
 59002 59003 PA2552 PA2553     TRUE 0.978 29.000 0.529 1.000 Y NA
 59003 59004 PA2553 PA2554     TRUE 0.987 18.000 0.575 1.000 Y NA
 59004 59005 PA2554 PA2555     TRUE 0.975 20.000 0.100 0.074 Y NA
 59005 59006 PA2555 PA2556     FALSE 0.327 178.000 0.250 1.000 N NA
 59006 59007 PA2556 PA2557     FALSE 0.148 69.000 0.000 1.000 N NA
 59009 59010 PA2559 PA2560     FALSE 0.004 624.000 0.000 NA   NA
 59014 59015 PA2564 PA2565     TRUE 0.909 -10.000 0.011 NA   NA
 59015 59016 PA2565 PA2566     TRUE 0.860 23.000 0.167 NA   NA
 59018 59019 PA2568 PA2569     FALSE 0.082 119.000 0.000 NA   NA
 59019 59020 PA2569 PA2570   pa1L FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 59020 2200486 PA2570 PA2570.1 pa1L   FALSE 0.006 415.000 0.000 NA   NA
 2200486 59021 PA2570.1 PA2571     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 59023 59024 PA2573 PA2574   alkB1 FALSE 0.093 112.000 0.000 1.000   NA
 59027 59028 PA2577 PA2578     TRUE 0.479 15.000 0.000 1.000 N NA
 59029 59030 PA2579 PA2580 kynA   FALSE 0.010 326.000 0.000 1.000   NA
 2200487 59032 PA2581.1 PA2582     FALSE 0.012 291.000 0.000 NA   NA
 59032 59033 PA2582 PA2583     TRUE 0.567 91.000 0.000 NA Y NA
 59033 2200488 PA2583 PA2583.1     FALSE 0.003 653.000 0.000 NA   NA
 2200488 59034 PA2583.1 PA2584   pgsA FALSE 0.163 70.000 0.000 NA   NA
 59034 59035 PA2584 PA2585 pgsA uvrC TRUE 0.842 34.000 0.227 1.000 N NA
 59035 59036 PA2585 PA2586 uvrC gacA TRUE 0.980 1.000 0.086 0.029 N NA
 59036 59037 PA2586 PA2587 gacA pqsH FALSE 0.007 341.000 0.000 1.000 N NA
 59039 59040 PA2589 PA2590     TRUE 0.873 11.000 0.000 0.067 N NA
 59040 59041 PA2590 PA2591     FALSE 0.072 120.000 0.000 1.000 N NA
 59042 59043 PA2592 PA2593     FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 59044 59045 PA2594 PA2595     TRUE 0.814 136.000 0.077 0.002 Y NA
 59045 59046 PA2595 PA2596     TRUE 0.974 12.000 0.000 0.002 Y NA
 59046 59047 PA2596 PA2597     FALSE 0.083 107.000 0.000 1.000 N NA
 59047 59048 PA2597 PA2598     TRUE 0.923 5.000 0.087 1.000 N NA
 59048 59049 PA2598 PA2599     TRUE 0.590 10.000 0.000 1.000 N NA
 59049 59050 PA2599 PA2600     TRUE 0.980 10.000 0.667 1.000 N NA
 59050 59051 PA2600 PA2601     FALSE 0.007 340.000 0.000 1.000 N NA
 59052 59053 PA2602 PA2603     TRUE 0.993 -3.000 0.511 1.000   NA
 59054 59055 PA2604 PA2605     FALSE 0.458 111.000 0.167 NA   NA
 59055 59056 PA2605 PA2606     TRUE 0.999 -3.000 0.790 NA Y NA
 59056 59057 PA2606 PA2607     TRUE 0.998 0.000 0.804 NA Y NA
 59057 59058 PA2607 PA2608     TRUE 0.997 -3.000 0.317 NA Y NA
 59058 59059 PA2608 PA2609     TRUE 0.968 -3.000 0.072 1.000 N NA
 59059 59060 PA2609 PA2610     FALSE 0.358 88.000 0.051 NA N NA
 59061 59062 PA2611 PA2612 cysG serS TRUE 0.902 2.000 0.031 1.000 N NA
 59062 59063 PA2612 PA2613 serS   TRUE 0.491 122.000 0.078 0.083 N NA
 59063 59064 PA2613 PA2614   lolA TRUE 0.930 10.000 0.167 1.000 N NA
 59064 59065 PA2614 PA2615 lolA ftsK TRUE 0.902 26.000 0.305 1.000 N NA
 59066 59067 PA2616 PA2617 trxB1 aat TRUE 0.887 38.000 0.046 1.000 Y NA
 59067 59068 PA2617 PA2618 aat   TRUE 0.927 55.000 0.285 1.000 Y NA
 59068 59069 PA2618 PA2619   infA FALSE 0.348 105.000 0.078 1.000 N NA
 59070 59071 PA2620 PA2621 clpA clpS TRUE 0.943 28.000 0.596 NA   NA
 59074 59075 PA2624 PA2625 idh   FALSE 0.304 87.000 0.032 1.000 N NA
 59075 59076 PA2625 PA2626   trmU TRUE 0.738 44.000 0.158 1.000 N NA
 59076 59077 PA2626 PA2627 trmU   TRUE 0.983 -3.000 0.180 NA   NA
 59077 59078 PA2627 PA2628     TRUE 0.861 3.000 0.014 NA   NA
 59078 59079 PA2628 PA2629   purB FALSE 0.249 75.000 0.002 NA   NA
 59079 59080 PA2629 PA2630 purB   FALSE 0.409 60.000 0.029 NA   NA
 59080 59081 PA2630 PA2631     TRUE 0.978 -7.000 0.167 NA   NA
 59081 59082 PA2631 PA2632     TRUE 0.951 7.000 0.191 NA   NA
 59082 59083 PA2632 PA2633     TRUE 0.989 -3.000 0.280 NA   NA
 59083 59084 PA2633 PA2634     FALSE 0.004 595.000 0.000 1.000   NA
 59084 59085 PA2634 PA2635     FALSE 0.131 179.000 0.044 NA   NA
 59085 59086 PA2635 PA2636     FALSE 0.148 79.000 0.000 NA   NA
 59086 59087 PA2636 PA2637   nuoA FALSE 0.004 600.000 0.000 NA   NA
 59087 59088 PA2637 PA2638 nuoA nuoB TRUE 0.996 11.000 0.377 0.002 Y NA
 59088 59089 PA2638 PA2639 nuoB nuoD TRUE 0.978 81.000 0.691 0.002 Y NA
 59089 59090 PA2639 PA2640 nuoD nuoE TRUE 0.998 2.000 0.407 0.004 Y NA
 59090 59091 PA2640 PA2641 nuoE nuoF TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 59091 59092 PA2641 PA2642 nuoF nuoG TRUE 0.865 132.000 0.180 0.004 Y NA
 59092 59093 PA2642 PA2643 nuoG nuoH TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 59093 59094 PA2643 PA2644 nuoH nuoI TRUE 0.995 12.000 0.423 0.004 Y NA
 59094 59095 PA2644 PA2645 nuoI nuoJ TRUE 0.995 12.000 0.428 0.004 Y NA
 59095 59096 PA2645 PA2646 nuoJ nuoK TRUE 0.976 46.000 0.269 0.002 Y NA
 59096 59097 PA2646 PA2647 nuoK nuoL TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 59097 59098 PA2647 PA2648 nuoL nuoM TRUE 0.994 28.000 0.713 0.001 Y NA
 59098 59099 PA2648 PA2649 nuoM nuoN TRUE 0.997 8.000 0.437 0.001 Y NA
 59099 59100 PA2649 PA2650 nuoN   FALSE 0.077 115.000 0.000 1.000 N NA
 59101 59102 PA2651 PA2652     FALSE 0.116 160.000 0.019 NA   NA
 59102 59103 PA2652 PA2653     FALSE 0.238 114.000 0.034 1.000   NA
 59105 59106 PA2655 PA2656     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 59106 59107 PA2656 PA2657     TRUE 0.999 -3.000 0.882 1.000 Y NA
 59107 59108 PA2657 PA2658     TRUE 0.993 0.000 0.762 1.000   NA
 59108 59109 PA2658 PA2659     TRUE 0.997 0.000 0.619 0.002   NA
 59110 59111 PA2660 PA2661     TRUE 0.679 27.000 0.037 NA   NA
 59112 59113 PA2662 PA2663     TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 59113 59114 PA2663 PA2664   fhp FALSE 0.407 55.000 0.021 NA   NA
 59115 59116 PA2665 PA2666     FALSE 0.091 101.000 0.000 1.000 N NA
 59116 59117 PA2666 PA2667     FALSE 0.011 308.000 0.000 1.000   NA
 59118 59119 PA2668 PA2669     FALSE 0.008 350.000 0.000 NA   NA
 59119 59120 PA2669 PA2670     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 59120 59121 PA2670 PA2671     FALSE 0.265 44.000 0.000 NA   NA
 59121 59122 PA2671 PA2672     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 59122 59123 PA2672 PA2673     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 59123 59124 PA2673 PA2674     TRUE 0.996 0.000 0.400 NA Y NA
 59124 59125 PA2674 PA2675     TRUE 0.995 -31.000 0.273 NA Y NA
 59125 59126 PA2675 PA2676     TRUE 0.975 54.000 0.364 0.004 Y NA
 59126 59127 PA2676 PA2677     TRUE 0.990 5.000 0.250 1.000 Y NA
 59127 59128 PA2677 PA2678     TRUE 0.971 -10.000 0.028 0.080 N NA
 59128 59129 PA2678 PA2679     FALSE 0.003 592.000 0.000 1.000 N NA
 59130 59131 PA2680 PA2681     TRUE 0.922 23.000 0.357 1.000 N NA
 59131 59132 PA2681 PA2682     FALSE 0.033 183.000 0.000 1.000 N NA
 59133 59134 PA2683 PA2684     FALSE 0.006 351.000 0.000 NA N NA
 59134 59135 PA2684 PA2685     FALSE 0.236 50.000 0.000 NA   NA
 59136 59137 PA2686 PA2687 pfeR pfeS TRUE 0.997 0.000 0.600 1.000 Y NA
 59137 59138 PA2687 PA2688 pfeS pfeA TRUE 0.676 99.000 0.400 1.000 N NA
 59138 59139 PA2688 PA2689 pfeA   TRUE 0.790 20.000 0.065 NA   NA
 59140 59141 PA2690 PA2691     FALSE 0.034 181.000 0.000 1.000 N NA
 59142 59143 PA2692 PA2693     FALSE 0.037 171.000 0.000 NA N NA
 59144 59145 PA2694 PA2695     FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 59145 59146 PA2695 PA2696     FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 59146 59147 PA2696 PA2697     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 59147 59148 PA2697 PA2698     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 59149 59150 PA2699 PA2700     FALSE 0.250 49.000 0.000 1.000   NA
 59150 59151 PA2700 PA2701     TRUE 0.975 3.000 0.100 0.073   NA
 59151 59152 PA2701 PA2702     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 59152 59153 PA2702 PA2703     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 59154 59155 PA2704 PA2705     FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 59155 59156 PA2705 PA2706     FALSE 0.444 49.000 0.021 NA   NA
 59156 59157 PA2706 PA2707     FALSE 0.359 65.000 0.020 1.000   NA
 59157 59158 PA2707 PA2708     FALSE 0.157 163.000 0.041 NA   NA
 59159 59160 PA2709 PA2710 cysK   TRUE 0.703 59.000 0.000 1.000 Y NA
 59160 59161 PA2710 PA2711     FALSE 0.232 199.000 0.000 1.000 Y NA
 59161 59162 PA2711 PA2712     FALSE 0.006 420.000 0.000 NA   NA
 59164 59165 PA2714 PA2715     TRUE 0.953 17.000 0.000 0.064 Y NA
 59166 59167 PA2716 PA2717   cpo FALSE 0.078 127.000 0.000 1.000   NA
 59168 59169 PA2718 PA2719     FALSE 0.104 100.000 0.000 NA   NA
 59171 59172 PA2721 PA2722     FALSE 0.346 32.000 0.000 NA   NA
 59172 59173 PA2722 PA2723     FALSE 0.360 30.000 0.000 NA   NA
 59173 59174 PA2723 PA2724     FALSE 0.155 75.000 0.000 NA   NA
 59174 59175 PA2724 PA2725     FALSE 0.154 76.000 0.000 NA   NA
 59175 59176 PA2725 PA2726     TRUE 0.996 2.000 0.550 1.000 Y NA
 59176 59177 PA2726 PA2727     TRUE 0.937 15.000 0.308 1.000 N NA
 59177 59178 PA2727 PA2728     TRUE 0.963 3.000 0.000 NA Y NA
 59178 59179 PA2728 PA2729     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 59180 59181 PA2730 PA2731     FALSE 0.353 31.000 0.000 NA   NA
 59181 59182 PA2731 PA2732     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 59182 59183 PA2732 PA2733     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 59183 59184 PA2733 PA2734     FALSE 0.004 572.000 0.000 NA   NA
 59184 59185 PA2734 PA2735     TRUE 0.905 78.000 0.104 0.043 Y NA
 59185 59186 PA2735 PA2736     FALSE 0.074 118.000 0.000 1.000 N NA
 59186 2200490 PA2736 PA2736.1     FALSE 0.009 327.000 0.000 NA   NA
 2200490 59187 PA2736.1 PA2737     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 59187 59188 PA2737 PA2738   ihfA TRUE 0.799 80.000 0.535 1.000 N NA
 59188 59189 PA2738 PA2739 ihfA pheT TRUE 0.961 4.000 0.208 1.000 N NA
 59189 59190 PA2739 PA2740 pheT pheS TRUE 0.991 35.000 0.574 0.000 Y NA
 59190 59191 PA2740 PA2741 pheS rplT TRUE 0.813 98.000 0.202 1.000 Y NA
 59191 59192 PA2741 PA2742 rplT rpmI TRUE 0.995 24.000 0.928 0.009 Y NA
 59192 59193 PA2742 PA2743 rpmI infC TRUE 0.957 62.000 0.652 1.000 Y NA
 59193 59194 PA2743 PA2744 infC thrS TRUE 0.993 0.000 0.186 1.000 Y NA
 59194 59195 PA2744 PA2745 thrS   FALSE 0.018 250.000 0.000 1.000   NA
 59197 59198 PA2747 PA2748     FALSE 0.005 486.000 0.000 NA   NA
 59199 59200 PA2749 PA2750 endA   FALSE 0.470 19.000 0.000 1.000   NA
 59200 59201 PA2750 PA2751     FALSE 0.003 727.000 0.000 1.000   NA
 59203 59204 PA2753 PA2754     FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 59204 59205 PA2754 PA2755   eco FALSE 0.003 1021.000 0.000 NA   NA
 59206 59207 PA2756 PA2757     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 59210 59211 PA2760 PA2761     FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 59212 59213 PA2762 PA2763     FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 59215 59216 PA2765 PA2766     FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 59217 59218 PA2767 PA2768     TRUE 0.679 6.000 0.000 NA   NA
 59219 59220 PA2769 PA2770     FALSE 0.444 22.000 0.000 1.000   NA
 59222 59223 PA2772 PA2773     FALSE 0.008 350.000 0.000 NA   NA
 59223 59224 PA2773 PA2774     FALSE 0.031 199.000 0.000 NA   NA
 59224 59225 PA2774 PA2775     TRUE 0.950 5.000 0.167 NA   NA
 59225 2200491 PA2775 PA2775.1     FALSE 0.033 191.000 0.000 NA   NA
 59227 59228 PA2777 PA2778     FALSE 0.149 82.000 0.000 1.000   NA
 59228 59229 PA2778 PA2779     TRUE 0.768 81.000 0.429 NA   NA
 59230 59231 PA2780 PA2781     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 59231 59232 PA2781 PA2782     FALSE 0.005 479.000 0.000 NA   NA
 59232 59233 PA2782 PA2783     TRUE 0.800 78.000 0.500 NA   NA
 59233 59234 PA2783 PA2784     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 59234 59235 PA2784 PA2785     TRUE 0.975 9.000 0.491 NA   NA
 59235 59236 PA2785 PA2786     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 59236 59237 PA2786 PA2787   cpg2 FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 59239 59240 PA2789 PA2790     FALSE 0.005 435.000 0.000 NA   NA
 59241 59242 PA2791 PA2792     FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 59242 59243 PA2792 PA2793     FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 59243 59244 PA2793 PA2794     FALSE 0.005 452.000 0.000 NA   NA
 59245 59246 PA2795 PA2796   tal FALSE 0.361 80.000 0.039 1.000 N NA
 59247 59248 PA2797 PA2798     TRUE 0.997 -3.000 0.408 NA Y NA
 59253 59254 PA2803 PA2804     TRUE 0.955 -3.000 0.036 NA   NA
 59254 59255 PA2804 PA2805     FALSE 0.156 74.000 0.000 NA   NA
 59256 59257 PA2806 PA2807     FALSE 0.205 118.000 0.027 1.000   NA
 59257 59258 PA2807 PA2808     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 59259 59260 PA2809 PA2810     TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.002 Y NA
 59261 59262 PA2811 PA2812     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.082 Y NA
 59262 59263 PA2812 PA2813     FALSE 0.372 76.000 0.039 1.000 N NA
 59263 59264 PA2813 PA2814     FALSE 0.286 115.000 0.056 NA   NA
 59265 59266 PA2815 PA2816     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 59266 59267 PA2816 PA2817     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 2200492 2200493 PA2819.1 PA2819.2     FALSE 0.136 85.000 0.000 NA   NA
 2200493 2200494 PA2819.2 PA2819.3     TRUE 0.737 3.000 0.000 NA   NA
 59270 59271 PA2820 PA2821     TRUE 0.747 62.000 0.267 NA   NA
 59272 59273 PA2822 PA2823     TRUE 0.939 -3.000 0.019 NA   NA
 59275 59276 PA2825 PA2826     TRUE 0.956 -3.000 0.041 1.000 N NA
 59276 59277 PA2826 PA2827     TRUE 0.615 112.000 0.036 1.000 Y NA
 59278 59279 PA2828 PA2829     TRUE 0.488 52.000 0.036 NA   NA
 59279 59280 PA2829 PA2830   htpX FALSE 0.178 134.000 0.029 NA   NA
 59280 59281 PA2830 PA2831 htpX   FALSE 0.284 141.000 0.000 0.015 N NA
 59282 59283 PA2832 PA2833 tpm   FALSE 0.217 56.000 0.000 1.000   NA
 59284 59285 PA2834 PA2835     TRUE 0.572 138.000 0.400 1.000   NA
 59285 59286 PA2835 PA2836     TRUE 0.959 12.000 0.385 1.000   NA
 59286 59287 PA2836 PA2837     TRUE 0.992 -3.000 0.423 1.000 N NA
 59287 59288 PA2837 PA2838     FALSE 0.287 37.000 0.000 1.000 N NA
 59288 59289 PA2838 PA2839     FALSE 0.127 91.000 0.000 1.000   NA
 59294 59295 PA2844 PA2845     FALSE 0.268 83.000 0.015 NA   NA
 59298 59299 PA2848 PA2849     TRUE 0.868 86.000 0.086 0.082 Y NA
 59299 59300 PA2849 PA2850   ohr TRUE 0.495 145.000 0.314 1.000 N NA
 59301 59302 PA2851 PA2852 efp   TRUE 0.655 43.000 0.074 NA   NA
 2200495 59303 PA2852.1 PA2853   oprI FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 59304 59305 PA2854 PA2855     TRUE 0.847 78.000 0.667 NA   NA
 59305 59306 PA2855 PA2856   tesA FALSE 0.445 56.000 0.031 NA   NA
 59307 59308 PA2857 PA2858     TRUE 0.993 9.000 0.535 NA Y NA
 59308 59309 PA2858 PA2859   greB TRUE 0.527 52.000 0.053 NA N NA
 59311 59312 PA2861 PA2862 ligT lipA FALSE 0.060 196.000 0.005 1.000   NA
 59312 59313 PA2862 PA2863 lipA lipH FALSE 0.157 206.000 0.109 1.000   NA
 59314 59315 PA2864 PA2865     TRUE 0.706 99.000 0.444 NA   NA
 59316 59317 PA2866 PA2867 mttC   FALSE 0.276 139.000 0.089 NA N NA
 59317 59318 PA2867 PA2868     TRUE 0.549 126.000 0.312 NA   NA
 59318 59319 PA2868 PA2869     FALSE 0.131 87.000 0.000 NA   NA
 59319 59320 PA2869 PA2870     TRUE 0.632 10.000 0.000 1.000   NA
 59321 59322 PA2871 PA2872     TRUE 0.525 81.000 0.116 NA   NA
 59322 59323 PA2872 PA2873     TRUE 0.945 -3.000 0.025 NA   NA
 59323 59324 PA2873 PA2874     TRUE 0.995 -3.000 0.727 NA   NA
 59324 59325 PA2874 PA2875     TRUE 0.993 0.000 0.739 NA   NA
 59325 59326 PA2875 PA2876   pyrF FALSE 0.022 230.000 0.000 1.000   NA
 59326 59327 PA2876 PA2877 pyrF   FALSE 0.096 97.000 0.000 1.000 N NA
 59331 59332 PA2881 PA2882     TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 59333 59334 PA2883 PA2884     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 59336 59337 PA2886 PA2887     TRUE 0.683 73.000 0.239 NA   NA
 59337 59338 PA2887 PA2888     TRUE 0.996 2.000 0.510 1.000 Y NA
 59338 59339 PA2888 PA2889     TRUE 0.879 117.000 0.544 1.000 Y NA
 59339 59340 PA2889 PA2890     TRUE 0.976 21.000 0.316 1.000 Y NA
 59340 59341 PA2890 PA2891     TRUE 0.983 46.000 0.600 0.072 Y NA
 59341 59342 PA2891 PA2892     TRUE 0.957 52.000 0.227 0.072 Y NA
 59342 59343 PA2892 PA2893     TRUE 0.810 163.000 0.250 0.072 Y NA
 59344 59345 PA2894 PA2895     FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 59345 59346 PA2895 PA2896     TRUE 0.953 -3.000 0.034 NA   NA
 59346 59347 PA2896 PA2897     FALSE 0.148 329.000 0.000 0.082 Y NA
 59347 59348 PA2897 PA2898     FALSE 0.023 222.000 0.000 NA   NA
 59348 59349 PA2898 PA2899     FALSE 0.133 86.000 0.000 NA   NA
 59349 59350 PA2899 PA2900     FALSE 0.029 194.000 0.000 1.000 N NA
 59350 59351 PA2900 PA2901     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 59351 59352 PA2901 PA2902     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 59352 59353 PA2902 PA2903   cobJ FALSE 0.146 70.000 0.000 1.000 N NA
 59353 59354 PA2903 PA2904 cobJ cobI TRUE 0.997 -7.000 0.097 0.005 Y NA
 59354 59355 PA2904 PA2905 cobI cobH TRUE 0.998 -3.000 0.191 0.005 Y NA
 59355 59356 PA2905 PA2906 cobH   TRUE 0.980 -3.000 0.149 1.000 N NA
 59357 59358 PA2907 PA2908 cobL cbiD TRUE 0.996 -7.000 0.043 0.005 Y NA
 59358 59359 PA2908 PA2909 cbiD   TRUE 0.998 -3.000 0.123 0.005 Y NA
 59361 59362 PA2911 PA2912     TRUE 0.877 53.000 0.105 1.000 Y NA
 59362 59363 PA2912 PA2913     TRUE 0.997 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 59363 59364 PA2913 PA2914     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 59365 59366 PA2915 PA2916     FALSE 0.085 120.000 0.000 1.000   NA
 59366 59367 PA2916 PA2917     TRUE 0.856 51.000 0.448 1.000 N NA
 59368 59369 PA2918 PA2919     TRUE 0.530 51.000 0.045 NA   NA
 59370 59371 PA2920 PA2921     FALSE 0.121 85.000 0.000 1.000 N NA
 59372 59373 PA2922 PA2923   hisJ FALSE 0.202 60.000 0.000 1.000   NA
 59373 59374 PA2923 PA2924 hisJ hisQ TRUE 0.849 56.000 0.000 0.065 Y NA
 59374 59375 PA2924 PA2925 hisQ hisM TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.011 Y NA
 59375 59376 PA2925 PA2926 hisM hisP TRUE 0.882 21.000 0.000 1.000 Y NA
 59376 59377 PA2926 PA2927 hisP   FALSE 0.010 322.000 0.000 NA   NA
 59378 59379 PA2928 PA2929     FALSE 0.006 409.000 0.000 NA   NA
 59382 59383 PA2932 PA2933 morB   FALSE 0.158 66.000 0.000 1.000 N NA
 59383 59384 PA2933 PA2934     FALSE 0.432 22.000 0.000 NA   NA
 59386 59387 PA2936 PA2937     FALSE 0.110 96.000 0.000 NA   NA
 59390 59391 PA2940 PA2941     FALSE 0.070 122.000 0.000 1.000 N NA
 59391 59392 PA2941 PA2942     TRUE 0.994 21.000 0.568 0.001 Y NA
 10491234 59393 PA2942.1 PA2943     FALSE 0.023 223.000 0.000 NA   NA
 59394 59395 PA2944 PA2945 cobN   TRUE 0.707 76.000 0.274 1.000   NA
 59396 59397 PA2946 PA2947     TRUE 0.574 72.000 0.132 NA   NA
 59397 59398 PA2947 PA2948   cobM TRUE 0.986 -3.000 0.025 0.005   NA
 59398 59399 PA2948 PA2949 cobM   FALSE 0.077 129.000 0.000 1.000   NA
 59400 59401 PA2950 PA2951   etfA FALSE 0.036 185.000 0.000 NA   NA
 59401 59402 PA2951 PA2952 etfA etfB TRUE 0.990 0.000 0.000 0.019 Y NA
 59404 59405 PA2954 PA2955     TRUE 0.960 -7.000 0.062 NA   NA
 59405 59406 PA2955 PA2956     TRUE 0.538 65.000 0.077 1.000   NA
 59406 59407 PA2956 PA2957     FALSE 0.211 150.000 0.058 1.000 N NA
 59408 10491235 PA2958 PA2958.1     TRUE 0.679 6.000 0.000 NA   NA
 59409 59410 PA2959 PA2960   pilZ TRUE 0.847 15.000 0.089 NA N NA
 59410 59411 PA2960 PA2961 pilZ holB TRUE 0.895 34.000 0.382 NA N NA
 59411 59412 PA2961 PA2962 holB tmk TRUE 0.991 -7.000 0.211 0.081 N NA
 59412 59413 PA2962 PA2963 tmk   TRUE 0.858 29.000 0.209 NA   NA
 59413 59414 PA2963 PA2964   pabC TRUE 0.955 6.000 0.204 NA   NA
 59414 59415 PA2964 PA2965 pabC fabF1 TRUE 0.974 0.000 0.187 1.000 N NA
 59415 59416 PA2965 PA2966 fabF1 acpP TRUE 0.815 129.000 0.346 1.000 Y NA
 59416 59417 PA2966 PA2967 acpP fabG TRUE 0.810 196.000 0.321 0.003 Y NA
 59417 59418 PA2967 PA2968 fabG fabD TRUE 0.992 23.000 0.432 0.003 Y NA
 59418 59419 PA2968 PA2969 fabD plsX TRUE 0.872 106.000 0.106 0.003 Y NA
 59419 59420 PA2969 PA2970 plsX rpmF TRUE 0.902 34.000 0.418 1.000 N NA
 59420 59421 PA2970 PA2971 rpmF   TRUE 0.968 14.000 0.599 NA   NA
 59423 59424 PA2973 PA2974     TRUE 0.975 -7.000 0.134 1.000   NA
 59424 59425 PA2974 PA2975   rluC TRUE 0.990 -7.000 0.389 1.000   NA
 59427 59428 PA2977 PA2978 murB ptpA TRUE 0.961 -3.000 0.050 1.000 N NA
 59428 59429 PA2978 PA2979 ptpA kdsB TRUE 0.941 0.000 0.050 1.000 N NA
 59429 59430 PA2979 PA2980 kdsB   TRUE 0.982 0.000 0.265 NA   NA
 59430 59431 PA2980 PA2981   lpxK TRUE 0.847 38.000 0.263 NA   NA
 59431 59432 PA2981 PA2982 lpxK   TRUE 0.960 0.000 0.096 1.000 N NA
 59432 59433 PA2982 PA2983     TRUE 0.999 -3.000 0.746 0.079 Y NA
 59433 59434 PA2983 PA2984     FALSE 0.417 73.000 0.045 1.000   NA
 59436 59437 PA2986 PA2987     TRUE 0.984 13.000 0.620 0.079 N NA
 59437 59438 PA2987 PA2988     TRUE 0.974 -7.000 0.025 0.079 N NA
 59439 59440 PA2989 PA2990     FALSE 0.079 332.000 0.192 NA   NA
 59441 59442 PA2991 PA2992 sth   FALSE 0.216 179.000 0.121 NA   NA
 59442 59443 PA2992 PA2993     TRUE 0.979 -3.000 0.137 NA   NA
 59443 59444 PA2993 PA2994   nqrF TRUE 0.980 -7.000 0.189 1.000 N NA
 59444 59445 PA2994 PA2995 nqrF nqrE TRUE 0.998 11.000 0.700 0.001 Y NA
 59445 59446 PA2995 PA2996 nqrE nqrD TRUE 0.998 0.000 0.240 0.001 Y NA
 59446 59447 PA2996 PA2997 nqrD nqrC TRUE 0.998 -3.000 0.188 0.001 Y NA
 59447 59448 PA2997 PA2998 nqrC nqrB TRUE 0.999 -7.000 0.538 0.001 Y NA
 59448 59449 PA2998 PA2999 nqrB nqrA TRUE 0.998 4.000 0.618 0.001 Y NA
 59449 59450 PA2999 PA3000 nqrA aroP1 FALSE 0.014 259.000 0.000 1.000 N NA
 59450 59451 PA3000 PA3001 aroP1   FALSE 0.089 102.000 0.000 1.000 N NA
 59452 59453 PA3002 PA3003 mfd   TRUE 0.878 11.000 0.071 NA   NA
 59454 59455 PA3004 PA3005   nagZ TRUE 0.743 12.000 0.018 1.000 N NA
 59455 59456 PA3005 PA3006 nagZ psrA FALSE 0.063 216.000 0.028 1.000 N NA
 59457 59458 PA3007 PA3008 lexA   TRUE 0.895 12.000 0.122 1.000 N NA
 59459 59460 PA3009 PA3010     FALSE 0.323 206.000 0.348 NA   NA
 59460 59461 PA3010 PA3011   topA FALSE 0.178 107.000 0.011 NA   NA
 59461 59462 PA3011 PA3012 topA   FALSE 0.213 91.000 0.007 NA   NA
 59462 59463 PA3012 PA3013   foaB FALSE 0.446 83.000 0.070 NA   NA
 59463 59464 PA3013 PA3014 foaB faoA TRUE 0.980 31.000 0.607 1.000 Y NA
 59468 59469 PA3018 PA3019     FALSE 0.135 150.000 0.019 NA   NA
 59470 59471 PA3020 PA3021     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 59472 59473 PA3022 PA3023     FALSE 0.103 103.000 0.000 1.000   NA
 59473 59474 PA3023 PA3024     FALSE 0.139 75.000 0.000 1.000 N NA
 59474 59475 PA3024 PA3025     TRUE 0.975 21.000 0.365 0.001 N NA
 59475 59476 PA3025 PA3026     TRUE 0.992 6.000 0.352 1.000 Y NA
 59478 59479 PA3028 PA3029 moeA2 moaB2 TRUE 0.997 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 59480 59481 PA3030 PA3031 mobA   FALSE 0.071 132.000 0.000 NA   NA
 59481 2200496 PA3031 PA3031.1     FALSE 0.058 153.000 0.000 NA   NA
 59482 59483 PA3032 PA3033 snr1   FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 59483 59484 PA3033 PA3034     TRUE 0.668 7.000 0.000 NA   NA
 59485 59486 PA3035 PA3036     TRUE 0.497 17.000 0.000 1.000   NA
 59486 59487 PA3036 PA3037     TRUE 0.815 0.000 0.000 1.000   NA
 59487 59488 PA3037 PA3038     FALSE 0.047 169.000 0.000 1.000   NA
 59490 59491 PA3040 PA3041     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 59491 59492 PA3041 PA3042     TRUE 0.837 14.000 0.065 NA   NA
 59492 59493 PA3042 PA3043     FALSE 0.194 117.000 0.024 NA   NA
 59494 59495 PA3044 PA3045     TRUE 0.963 14.000 0.000 0.019 Y NA
 59495 59496 PA3045 PA3046     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 59500 59501 PA3050 PA3051 pyrD   FALSE 0.382 57.000 0.019 NA   NA
 59502 59503 PA3052 PA3053     FALSE 0.160 72.000 0.000 NA   NA
 59503 59504 PA3053 PA3054     FALSE 0.048 168.000 0.000 1.000   NA
 59505 59506 PA3055 PA3056     FALSE 0.316 38.000 0.000 1.000   NA
 59508 59509 PA3058 PA3059 pelG pelF TRUE 0.993 2.000 0.889 NA   NA
 59509 59510 PA3059 PA3060 pelF pelE TRUE 0.994 -3.000 0.600 1.000   NA
 59510 59511 PA3060 PA3061 pelE pelD TRUE 0.985 -22.000 0.333 NA   NA
 59511 59512 PA3061 PA3062 pelD pelC TRUE 0.975 6.000 0.400 NA   NA
 59512 59513 PA3062 PA3063 pelC pelB FALSE 0.296 40.000 0.000 NA   NA
 59513 59514 PA3063 PA3064 pelB pelA TRUE 0.813 -22.000 0.000 1.000   NA
 59514 59515 PA3064 PA3065 pelA   FALSE 0.005 482.000 0.000 NA   NA
 59515 59516 PA3065 PA3066     TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 59516 59517 PA3066 PA3067     TRUE 0.881 43.000 0.429 1.000   NA
 59517 59518 PA3067 PA3068   gdhB FALSE 0.065 148.000 0.000 1.000   NA
 59518 59519 PA3068 PA3069 gdhB   FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 59520 59521 PA3070 PA3071     TRUE 0.930 11.000 0.179 NA   NA
 59521 59522 PA3071 PA3072     TRUE 0.993 -3.000 0.484 NA   NA
 59522 59523 PA3072 PA3073     TRUE 0.988 -7.000 0.314 NA   NA
 59523 59524 PA3073 PA3074     TRUE 0.982 -3.000 0.171 NA   NA
 59524 59525 PA3074 PA3075     TRUE 0.988 -3.000 0.258 NA   NA
 59525 59526 PA3075 PA3076     FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 59526 59527 PA3076 PA3077     FALSE 0.195 62.000 0.000 1.000   NA
 59527 59528 PA3077 PA3078     TRUE 0.996 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 59529 59530 PA3079 PA3080     TRUE 0.978 13.000 0.409 0.071   NA
 59530 59531 PA3080 PA3081     FALSE 0.187 180.000 0.091 NA   NA
 59531 59532 PA3081 PA3082   gbt TRUE 0.872 59.000 0.600 NA   NA
 59532 59533 PA3082 PA3083 gbt pepN FALSE 0.005 447.000 0.000 NA   NA
 59533 59534 PA3083 PA3084 pepN   TRUE 0.788 19.000 0.059 NA   NA
 59534 59535 PA3084 PA3085     TRUE 0.815 33.000 0.168 NA   NA
 59535 59536 PA3085 PA3086     TRUE 0.525 84.000 0.124 NA   NA
 59536 59537 PA3086 PA3087     TRUE 0.979 -3.000 0.131 1.000   NA
 59537 59538 PA3087 PA3088   ppnK TRUE 0.941 0.000 0.045 1.000   NA
 59539 59540 PA3089 PA3090     FALSE 0.201 58.000 0.000 NA   NA
 59541 59542 PA3091 PA3092   fadH1 FALSE 0.022 337.000 0.024 NA   NA
 59543 59544 PA3093 PA3094     TRUE 0.995 -3.000 0.615 1.000   NA
 2200497 2200498 PA3094.1 PA3094.2     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 2200498 2200499 PA3094.2 PA3094.3     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 2200499 59545 PA3094.3 PA3095   xcpZ FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 59545 59546 PA3095 PA3096 xcpZ xcpY TRUE 0.997 2.000 0.811 1.000 Y NA
 59546 59547 PA3096 PA3097 xcpY xcpX TRUE 0.995 -3.000 0.020 0.071 Y NA
 59547 59548 PA3097 PA3098 xcpX xcpW TRUE 0.989 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 59548 59549 PA3098 PA3099 xcpW xcpV TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 59549 59550 PA3099 PA3100 xcpV xcpU TRUE 0.999 -3.000 0.605 0.004 Y NA
 59550 59551 PA3100 PA3101 xcpU xcpT TRUE 0.997 7.000 0.425 0.004 Y NA
 59551 59552 PA3101 PA3102 xcpT xcpS TRUE 0.998 5.000 0.599 0.004 Y NA
 59552 59553 PA3102 PA3103 xcpS xcpR TRUE 0.999 0.000 0.653 0.004 Y NA
 59554 59555 PA3104 PA3105 xcpP xcpQ TRUE 0.830 5.000 0.013 NA   NA
 59556 59557 PA3106 PA3107   metZ TRUE 0.950 -3.000 0.033 1.000 N NA
 59557 59558 PA3107 PA3108 metZ purF TRUE 0.877 17.000 0.153 1.000 N NA
 59558 59559 PA3108 PA3109 purF   FALSE 0.232 222.000 0.262 1.000   NA
 59559 59560 PA3109 PA3110     TRUE 0.547 74.000 0.116 NA   NA
 59560 59561 PA3110 PA3111   folC TRUE 0.963 4.000 0.216 NA   NA
 59561 59562 PA3111 PA3112 folC accD TRUE 0.991 -3.000 0.383 1.000 N NA
 59562 59563 PA3112 PA3113 accD trpF FALSE 0.025 269.000 0.007 1.000 N NA
 59563 59564 PA3113 PA3114 trpF truA TRUE 0.501 90.000 0.139 1.000 N NA
 59564 59565 PA3114 PA3115 truA fimV TRUE 0.699 22.000 0.035 1.000 N NA
 59565 59566 PA3115 PA3116 fimV   FALSE 0.092 169.000 0.017 1.000 N NA
 59566 59567 PA3116 PA3117   asd TRUE 0.837 102.000 0.025 0.000 Y NA
 59567 59568 PA3117 PA3118 asd leuB TRUE 0.936 70.000 0.196 0.031 Y NA
 59568 59569 PA3118 PA3119 leuB   FALSE 0.409 59.000 0.026 1.000   NA
 59569 59570 PA3119 PA3120   leuD FALSE 0.059 270.000 0.060 1.000   NA
 59570 59571 PA3120 PA3121 leuD leuC TRUE 0.996 12.000 0.463 0.000 Y NA
 59573 59574 PA3123 PA3124     FALSE 0.125 80.000 0.000 NA N NA
 59577 59578 PA3127 PA3128     TRUE 0.818 17.000 0.000 0.071   NA
 59579 59580 PA3129 PA3130     FALSE 0.284 93.000 0.029 1.000   NA
 59580 59581 PA3130 PA3131     TRUE 0.897 0.000 0.008 1.000   NA
 59581 59582 PA3131 PA3132     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 59582 59583 PA3132 PA3133     TRUE 0.809 12.000 0.035 NA   NA
 59583 2200500 PA3133 PA3133.1     FALSE 0.054 158.000 0.000 NA   NA
 2200500 2200501 PA3133.1 PA3133.2     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 2200501 2200502 PA3133.2 PA3133.3     FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 2200502 2200503 PA3133.3 PA3133.4     FALSE 0.242 49.000 0.000 NA   NA
 2200503 59584 PA3133.4 PA3134   gltX FALSE 0.029 203.000 0.000 NA   NA
 59584 59585 PA3134 PA3135 gltX   FALSE 0.431 38.000 0.004 1.000 N NA
 59586 59587 PA3136 PA3137     TRUE 0.791 50.000 0.250 1.000   NA
 59589 2200504 PA3139 PA3139.1     FALSE 0.168 68.000 0.000 NA   NA
 59590 59591 PA3140 PA3141   wbpM FALSE 0.063 191.000 0.012 1.000 N NA
 59591 59592 PA3141 PA3142 wbpM   FALSE 0.003 751.000 0.000 1.000   NA
 59592 59593 PA3142 PA3143     TRUE 0.798 -64.000 0.000 NA   NA
 59593 59594 PA3143 PA3144     FALSE 0.459 19.000 0.000 NA   NA
 59594 59595 PA3144 PA3145   wbpL FALSE 0.156 78.000 0.000 1.000   NA
 59595 59596 PA3145 PA3146 wbpL wbpK TRUE 0.910 61.000 0.250 1.000 Y NA
 59596 59597 PA3146 PA3147 wbpK wbpJ TRUE 0.959 9.000 0.014 1.000 Y NA
 59597 59598 PA3147 PA3148 wbpJ wbpI TRUE 0.916 43.000 0.146 1.000 Y NA
 59598 59599 PA3148 PA3149 wbpI wbpH TRUE 0.994 -3.000 0.099 1.000 Y NA
 59599 59600 PA3149 PA3150 wbpH wbpG FALSE 0.465 15.000 0.000 NA N NA
 59600 59601 PA3150 PA3151 wbpG hisF2 FALSE 0.371 135.000 0.167 NA N NA
 59601 59602 PA3151 PA3152 hisF2 hisH2 TRUE 0.999 0.000 0.517 0.003 Y NA
 59602 59603 PA3152 PA3153 hisH2 wzx TRUE 0.948 -3.000 0.026 1.000   NA
 59603 59604 PA3153 PA3154 wzx wzy TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 59604 59605 PA3154 PA3155 wzy wbpE TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 59605 59606 PA3155 PA3156 wbpE wbpD TRUE 0.972 3.000 0.006 1.000 Y NA
 59606 59607 PA3156 PA3157 wbpD   TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000 N NA
 59607 59608 PA3157 PA3158   wbpB FALSE 0.171 69.000 0.000 1.000   NA
 59608 59609 PA3158 PA3159 wbpB wbpA TRUE 0.689 74.000 0.060 0.062   NA
 59609 59610 PA3159 PA3160 wbpA wzz FALSE 0.029 807.000 0.000 1.000 Y NA
 59610 59611 PA3160 PA3161 wzz ihfB FALSE 0.003 762.000 0.000 1.000 N NA
 59611 59612 PA3161 PA3162 ihfB rpsA TRUE 0.495 137.000 0.292 1.000 N NA
 59612 59613 PA3162 PA3163 rpsA cmk FALSE 0.156 268.000 0.281 1.000 N NA
 59613 59614 PA3163 PA3164 cmk   TRUE 0.977 0.000 0.209 1.000 N NA
 59614 59615 PA3164 PA3165   hisC2 TRUE 0.988 -7.000 0.029 1.000 Y NA
 59615 59616 PA3165 PA3166 hisC2 pheA TRUE 0.828 69.000 0.098 1.000 Y NA
 59616 59617 PA3166 PA3167 pheA serC TRUE 0.991 0.000 0.121 1.000 Y NA
 59617 59618 PA3167 PA3168 serC gyrA FALSE 0.400 88.000 0.067 1.000 N NA
 59618 59619 PA3168 PA3169 gyrA   FALSE 0.034 237.000 0.007 1.000 N NA
 59620 59621 PA3170 PA3171   ubiG FALSE 0.272 151.000 0.104 1.000 N NA
 59621 59622 PA3171 PA3172 ubiG   TRUE 0.988 -3.000 0.259 1.000   NA
 59622 59623 PA3172 PA3173     TRUE 0.756 65.000 0.098 0.071   NA
 59623 59624 PA3173 PA3174     FALSE 0.047 159.000 0.000 1.000 N NA
 59624 59625 PA3174 PA3175     TRUE 0.765 16.000 0.039 1.000 N NA
 59625 59626 PA3175 PA3176   gltS TRUE 0.851 39.000 0.016 1.000 Y NA
 59626 59627 PA3176 PA3177 gltS   FALSE 0.019 229.000 0.000 1.000 N NA
 59628 59629 PA3178 PA3179     FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 59631 59632 PA3181 PA3182   pgl TRUE 0.947 18.000 0.064 1.000 Y NA
 59632 59633 PA3182 PA3183 pgl zwf TRUE 0.993 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 59635 59636 PA3185 PA3186   oprB FALSE 0.022 215.000 0.000 1.000 N NA
 59636 59637 PA3186 PA3187 oprB   TRUE 0.632 44.000 0.000 0.064 N NA
 59637 59638 PA3187 PA3188     TRUE 0.991 33.000 0.723 0.064 Y NA
 59638 59639 PA3188 PA3189     TRUE 0.999 -7.000 0.816 0.064 Y NA
 59639 59640 PA3189 PA3190     TRUE 0.929 101.000 0.367 0.064 Y NA
 59640 59641 PA3190 PA3191     FALSE 0.065 525.000 0.367 1.000 N NA
 59641 59642 PA3191 PA3192   gltR TRUE 0.989 24.000 0.909 1.000 Y NA
 59642 59643 PA3192 PA3193 gltR glk FALSE 0.300 35.000 0.000 1.000 N NA
 59643 59644 PA3193 PA3194 glk edd TRUE 0.511 103.000 0.000 1.000 Y NA
 59646 59647 PA3196 PA3197     FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 59647 59648 PA3197 PA3198     FALSE 0.278 140.000 0.083 NA   NA
 59648 59649 PA3198 PA3199     FALSE 0.135 173.000 0.040 NA   NA
 59649 59650 PA3199 PA3200     TRUE 0.989 -3.000 0.281 NA   NA
 59651 59652 PA3201 PA3202     TRUE 0.973 2.000 0.224 NA   NA
 59652 59653 PA3202 PA3203     FALSE 0.135 176.000 0.043 NA   NA
 59653 59654 PA3203 PA3204     TRUE 0.965 11.000 0.409 NA   NA
 59654 59655 PA3204 PA3205     TRUE 0.802 129.000 0.318 NA Y NA
 59655 59656 PA3205 PA3206     TRUE 0.815 115.000 0.286 NA Y NA
 59656 59657 PA3206 PA3207     FALSE 0.296 40.000 0.000 NA   NA
 59658 59659 PA3208 PA3209     FALSE 0.327 65.000 0.014 NA   NA
 59660 59661 PA3210 PA3211 trkH   FALSE 0.147 67.000 0.000 NA N NA
 59661 59662 PA3211 PA3212     TRUE 0.998 -3.000 0.491 NA Y NA
 59662 59663 PA3212 PA3213     TRUE 0.997 2.000 0.650 NA Y NA
 59663 59664 PA3213 PA3214     TRUE 0.985 -3.000 0.201 NA   NA
 59666 59667 PA3216 PA3217   cyaB FALSE 0.078 217.000 0.038 NA   NA
 59667 59668 PA3217 PA3218 cyaB   FALSE 0.004 542.000 0.000 NA   NA
 59670 59671 PA3220 PA3221   csaA FALSE 0.314 65.000 0.009 1.000   NA
 59671 59672 PA3221 PA3222 csaA   TRUE 0.773 10.000 0.009 1.000   NA
 59673 59674 PA3223 PA3224 acpD   TRUE 0.649 147.000 0.600 NA   NA
 59675 59676 PA3225 PA3226     TRUE 0.931 7.000 0.118 1.000   NA
 59676 59677 PA3226 PA3227   ppiA TRUE 0.983 -18.000 0.286 1.000   NA
 59677 59678 PA3227 PA3228 ppiA   TRUE 0.654 63.000 0.171 1.000 N NA
 59678 59679 PA3228 PA3229     FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 59680 59681 PA3230 PA3231     FALSE 0.015 259.000 0.000 NA   NA
 59681 59682 PA3231 PA3232     FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 59682 59683 PA3232 PA3233     TRUE 0.994 -3.000 0.588 1.000 N NA
 59683 59684 PA3233 PA3234   actP FALSE 0.130 90.000 0.000 1.000   NA
 59684 59685 PA3234 PA3235 actP   TRUE 0.995 -3.000 0.733 NA   NA
 59685 59686 PA3235 PA3236     FALSE 0.024 218.000 0.000 NA   NA
 59687 59688 PA3237 PA3238     FALSE 0.191 143.000 0.038 NA   NA
 59688 59689 PA3238 PA3239     TRUE 0.962 4.000 0.204 NA   NA
 59689 59690 PA3239 PA3240     FALSE 0.135 140.000 0.014 NA   NA
 59691 59692 PA3241 PA3242     TRUE 0.498 68.000 0.069 1.000   NA
 59693 59694 PA3243 PA3244 minC minD TRUE 0.942 62.000 0.466 1.000 Y NA
 59694 59695 PA3244 PA3245 minD minE TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 59695 59696 PA3245 PA3246 minE rluA FALSE 0.187 104.000 0.018 NA N NA
 59696 59697 PA3246 PA3247 rluA   FALSE 0.102 169.000 0.022 1.000 N NA
 59698 59699 PA3248 PA3249     FALSE 0.158 66.000 0.000 1.000 N NA
 59700 59701 PA3250 PA3251     TRUE 0.861 55.000 0.500 1.000   NA
 59701 59702 PA3251 PA3252     TRUE 0.989 -3.000 0.290 1.000   NA
 59702 59703 PA3252 PA3253     TRUE 0.997 -13.000 0.774 0.064   NA
 59703 59704 PA3253 PA3254     TRUE 0.997 3.000 0.360 0.064 Y NA
 59704 59705 PA3254 PA3255     TRUE 0.881 72.000 0.222 1.000 Y NA
 59707 59708 PA3257 PA3258 prc   TRUE 0.541 39.000 0.029 1.000 N NA
 59709 59710 PA3259 PA3260     FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000   NA
 59712 2200505 PA3262 PA3262.1     FALSE 0.016 256.000 0.000 NA   NA
 2200505 2200506 PA3262.1 PA3262.2     TRUE 0.485 17.000 0.000 NA   NA
 59713 59714 PA3263 PA3264 rdgC   FALSE 0.437 87.000 0.074 1.000   NA
 59714 59715 PA3264 PA3265     FALSE 0.268 140.000 0.074 1.000   NA
 59715 59716 PA3265 PA3266   capB FALSE 0.022 215.000 0.000 1.000 N NA
 59717 59718 PA3267 PA3268     FALSE 0.037 175.000 0.000 1.000 N NA
 59718 59719 PA3268 PA3269     FALSE 0.096 97.000 0.000 1.000 N NA
 59719 59720 PA3269 PA3270     TRUE 0.627 67.000 0.167 1.000 N NA
 59722 59723 PA3272 PA3273     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 59725 59726 PA3275 PA3276     TRUE 0.979 -3.000 0.133 NA   NA
 59726 59727 PA3276 PA3277     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 59727 59728 PA3277 PA3278     FALSE 0.076 126.000 0.000 NA   NA
 59728 59729 PA3278 PA3279   oprP FALSE 0.045 169.000 0.000 NA   NA
 59729 59730 PA3279 PA3280 oprP oprO FALSE 0.045 459.000 0.000 NA Y NA
 59730 59731 PA3280 PA3281 oprO   FALSE 0.018 246.000 0.000 NA   NA
 59731 59732 PA3281 PA3282     TRUE 0.973 3.000 0.271 NA   NA
 59732 59733 PA3282 PA3283     TRUE 0.996 -3.000 0.914 NA   NA
 59733 59734 PA3283 PA3284     TRUE 0.940 19.000 0.406 NA   NA
 59734 59735 PA3284 PA3285     FALSE 0.003 639.000 0.000 NA   NA
 59735 59736 PA3285 PA3286     TRUE 0.899 3.000 0.038 1.000 N NA
 59740 59741 PA3290 PA3291     TRUE 0.979 15.000 1.000 NA   NA
 59741 59742 PA3291 PA3292     TRUE 0.623 188.000 1.000 NA   NA
 59742 59743 PA3292 PA3293     TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA   NA
 59743 59744 PA3293 PA3294     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 59744 59745 PA3294 PA3295     FALSE 0.021 229.000 0.000 NA   NA
 59747 59748 PA3297 PA3298     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 59748 59749 PA3298 PA3299   fadD1 FALSE 0.360 30.000 0.000 NA   NA
 59749 59750 PA3299 PA3300 fadD1 fadD2 FALSE 0.381 235.000 0.000 0.001 Y NA
 59751 59752 PA3301 PA3302     TRUE 0.991 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 59752 59753 PA3302 PA3303     FALSE 0.053 151.000 0.000 1.000 N NA
 59754 10491236 PA3304 PA3304.1     FALSE 0.160 72.000 0.000 NA   NA
 10491236 59755 PA3304.1 PA3305     TRUE 0.595 11.000 0.000 NA   NA
 59755 10491237 PA3305 PA3305.1     FALSE 0.056 154.000 0.000 NA   NA
 10491237 59756 PA3305.1 PA3306     FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 59756 59757 PA3306 PA3307     TRUE 0.692 54.000 0.156 NA   NA
 59758 59759 PA3308 PA3309 hepA   FALSE 0.011 283.000 0.000 1.000 N NA
 59763 59764 PA3313 PA3314     TRUE 0.999 -3.000 0.690 0.002 Y NA
 59764 59765 PA3314 PA3315     TRUE 0.998 -6.000 0.696 1.000 Y NA
 59765 59766 PA3315 PA3316     TRUE 0.996 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 59766 59767 PA3316 PA3317     FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 59767 59768 PA3317 PA3318     FALSE 0.176 66.000 0.000 NA   NA
 59769 59770 PA3319 PA3320 plcN   FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 59773 59774 PA3323 PA3324     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 59774 59775 PA3324 PA3325     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 59777 59778 PA3327 PA3328     TRUE 0.964 -3.000 0.059 1.000 N NA
 59778 59779 PA3328 PA3329     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 59779 59780 PA3329 PA3330     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 59780 59781 PA3330 PA3331     TRUE 0.848 -7.000 0.000 1.000   NA
 59781 59782 PA3331 PA3332     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 59782 59783 PA3332 PA3333   fabH2 TRUE 0.722 4.000 0.000 1.000   NA
 59783 59784 PA3333 PA3334 fabH2   TRUE 0.538 14.000 0.000 1.000   NA
 59784 59785 PA3334 PA3335     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 59785 59786 PA3335 PA3336     FALSE 0.120 92.000 0.000 NA   NA
 59787 59788 PA3337 PA3338 rfaD   FALSE 0.111 90.000 0.000 1.000 N NA
 59790 59791 PA3340 PA3341     FALSE 0.061 277.000 0.080 NA N NA
 59791 59792 PA3341 PA3342     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 59792 59793 PA3342 PA3343     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 59793 59794 PA3343 PA3344   recQ FALSE 0.203 89.000 0.005 1.000 N NA
 59794 59795 PA3344 PA3345 recQ   FALSE 0.118 84.000 0.000 NA N NA
 59795 59796 PA3345 PA3346     TRUE 0.900 66.000 0.250 NA Y NA
 59796 59797 PA3346 PA3347     TRUE 0.995 2.000 0.429 NA Y NA
 59797 59798 PA3347 PA3348     FALSE 0.085 315.000 0.000 NA Y NA
 59798 59799 PA3348 PA3349     TRUE 0.957 77.000 0.838 1.000 Y NA
 59800 59801 PA3350 PA3351     TRUE 0.797 145.000 0.371 NA Y NA
 59801 59802 PA3351 PA3352     TRUE 0.977 55.000 0.361 0.001 Y NA
 59802 59803 PA3352 PA3353     TRUE 0.791 29.000 0.121 1.000 N NA
 59804 59805 PA3354 PA3355     FALSE 0.280 42.000 0.000 NA   NA
 59805 59806 PA3355 PA3356     FALSE 0.449 184.000 0.462 1.000   NA
 59807 59808 PA3357 PA3358 dsdA   FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 59809 59810 PA3359 PA3360     TRUE 0.965 23.000 0.818 NA   NA
 59812 59813 PA3362 PA3363   amiR TRUE 0.567 43.000 0.040 NA   NA
 59813 59814 PA3363 PA3364 amiR amiC TRUE 0.971 -3.000 0.083 NA N NA
 59814 59815 PA3364 PA3365 amiC   TRUE 0.785 26.000 0.083 1.000   NA
 59815 59816 PA3365 PA3366   amiE TRUE 0.646 83.000 0.222 1.000   NA
 59818 59819 PA3368 PA3369     FALSE 0.033 193.000 0.000 NA   NA
 59819 59820 PA3369 PA3370     FALSE 0.124 90.000 0.000 NA   NA
 59820 59821 PA3370 PA3371     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 59822 59823 PA3372 PA3373     TRUE 0.981 -9.000 0.214 NA   NA
 59823 59824 PA3373 PA3374     TRUE 0.994 0.000 0.235 NA Y NA
 59824 59825 PA3374 PA3375     TRUE 0.996 -10.000 0.320 1.000 Y NA
 59825 59826 PA3375 PA3376     TRUE 0.988 50.000 0.859 0.015 Y NA
 59826 59827 PA3376 PA3377     TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 59827 59828 PA3377 PA3378     TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 59828 59829 PA3378 PA3379     TRUE 0.999 0.000 0.960 0.002 Y NA
 59829 59830 PA3379 PA3380     TRUE 0.999 0.000 0.967 0.002 Y NA
 59830 59831 PA3380 PA3381     TRUE 0.981 10.000 0.691 1.000 N NA
 59831 59832 PA3381 PA3382   phnE TRUE 0.860 21.000 0.158 1.000 N NA
 59832 59833 PA3382 PA3383 phnE   TRUE 0.968 67.000 0.330 0.001 Y NA
 59833 59834 PA3383 PA3384   phnC TRUE 0.976 53.000 0.337 0.002 Y NA
 59835 59836 PA3385 PA3386 amrZ   FALSE 0.059 154.000 0.000 1.000   NA
 59836 59837 PA3386 PA3387   rhlG FALSE 0.111 98.000 0.000 1.000   NA
 59837 59838 PA3387 PA3388 rhlG   FALSE 0.436 53.000 0.025 NA   NA
 59840 59841 PA3389 PA3391   nosR FALSE 0.018 228.000 0.000 NA N NA
 59841 59842 PA3391 PA3392 nosR nosZ TRUE 0.668 43.000 0.088 1.000 N NA
 59842 59843 PA3392 PA3393 nosZ nosD TRUE 0.987 -3.000 0.035 0.003 N NA
 59843 59844 PA3393 PA3394 nosD nosF TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 N NA
 59844 59845 PA3394 PA3395 nosF nosY TRUE 0.973 -9.000 0.135 NA   NA
 59845 59846 PA3395 PA3396 nosY nosL TRUE 0.872 17.000 0.135 NA   NA
 59849 59850 PA3399 PA3400     FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 59850 59851 PA3400 PA3401     TRUE 0.993 -3.000 0.086 NA Y NA
 59851 59852 PA3401 PA3402     TRUE 0.995 4.000 0.538 NA Y NA
 59852 59853 PA3402 PA3403     FALSE 0.106 101.000 0.000 1.000   NA
 59853 59854 PA3403 PA3404     FALSE 0.005 455.000 0.000 1.000   NA
 59854 59855 PA3404 PA3405   hasE TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.007   NA
 59855 59856 PA3405 PA3406 hasE hasD TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.007   NA
 59856 59857 PA3406 PA3407 hasD hasAp FALSE 0.024 218.000 0.000 NA   NA
 59857 59858 PA3407 PA3408 hasAp hasR TRUE 0.737 86.000 0.400 NA   NA
 59858 59859 PA3408 PA3409 hasR   TRUE 0.490 210.000 0.200 NA Y NA
 59859 59860 PA3409 PA3410     TRUE 0.896 65.000 0.875 NA N NA
 59860 59861 PA3410 PA3411     FALSE 0.152 77.000 0.000 NA   NA
 59861 59862 PA3411 PA3412     FALSE 0.081 120.000 0.000 NA   NA
 59863 59864 PA3413 PA3414     FALSE 0.321 36.000 0.000 NA   NA
 59865 59866 PA3415 PA3416     TRUE 0.993 18.000 0.556 0.070 Y NA
 59866 59867 PA3416 PA3417     TRUE 0.999 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 59867 59868 PA3417 PA3418   ldh FALSE 0.239 142.000 0.065 1.000 N NA
 59870 59871 PA3420 PA3421     TRUE 0.506 150.000 0.333 NA   NA
 59871 59872 PA3421 PA3422     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 59873 59874 PA3423 PA3424     TRUE 0.711 91.000 0.400 1.000 N NA
 59874 59875 PA3424 PA3425     TRUE 0.930 35.000 0.600 NA   NA
 59876 59877 PA3426 PA3427     TRUE 0.728 117.000 0.021 0.070 Y NA
 59877 59878 PA3427 PA3428     FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 59878 59879 PA3428 PA3429     FALSE 0.106 99.000 0.000 NA   NA
 59879 59880 PA3429 PA3430     TRUE 0.978 -3.000 0.125 1.000   NA
 59880 59881 PA3430 PA3431     FALSE 0.189 129.000 0.034 NA N NA
 59881 59882 PA3431 PA3432     TRUE 0.994 -13.000 0.840 NA   NA
 59884 59885 PA3434 PA3435     FALSE 0.006 363.000 0.000 1.000 N NA
 59886 59887 PA3436 PA3437     FALSE 0.400 111.000 0.120 NA   NA
 59887 59888 PA3437 PA3438   folE1 TRUE 0.838 18.000 0.100 1.000 N NA
 59888 59889 PA3438 PA3439 folE1 folX TRUE 0.980 2.000 0.030 1.000 Y NA
 59889 59890 PA3439 PA3440 folX   FALSE 0.263 129.000 0.061 NA   NA
 59891 59892 PA3441 PA3442     TRUE 0.870 41.000 0.161 0.079 N NA
 59892 59893 PA3442 PA3443     TRUE 0.998 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 59893 59894 PA3443 PA3444     TRUE 0.893 21.000 0.226 1.000 N NA
 59894 59895 PA3444 PA3445     TRUE 0.602 78.000 0.176 1.000 N NA
 59895 59896 PA3445 PA3446     FALSE 0.465 119.000 0.193 1.000   NA
 59896 59897 PA3446 PA3447     FALSE 0.059 154.000 0.000 1.000   NA
 59897 59898 PA3447 PA3448     TRUE 0.997 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 59898 59899 PA3448 PA3449     TRUE 0.998 4.000 0.795 0.063 Y NA
 59899 59900 PA3449 PA3450     FALSE 0.015 251.000 0.000 1.000 N NA
 59901 59902 PA3451 PA3452   mqoA FALSE 0.029 203.000 0.000 NA   NA
 59903 59904 PA3453 PA3454     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 59904 59905 PA3454 PA3455     FALSE 0.152 153.000 0.029 NA   NA
 59906 59907 PA3456 PA3457     FALSE 0.106 101.000 0.000 1.000   NA
 59909 59910 PA3459 PA3460     TRUE 0.901 41.000 0.514 1.000 N NA
 59910 59911 PA3460 PA3461     TRUE 0.992 -3.000 0.471 NA N NA
 59911 59912 PA3461 PA3462     FALSE 0.320 138.000 0.125 NA N NA
 59912 59913 PA3462 PA3463     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 59917 59918 PA3467 PA3468     FALSE 0.039 167.000 0.000 NA N NA
 59918 59919 PA3468 PA3469     FALSE 0.404 20.000 0.000 NA N NA
 59919 59920 PA3469 PA3470     TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000 N NA
 59923 59924 PA3473 PA3474     TRUE 0.940 -3.000 0.019 NA   NA
 59924 59925 PA3474 PA3475   pheC TRUE 0.553 94.000 0.000 1.000 Y NA
 59925 59926 PA3475 PA3476 pheC rhlI FALSE 0.359 155.000 0.000 1.000 Y NA
 59926 59927 PA3476 PA3477 rhlI rhlR FALSE 0.258 181.000 0.182 1.000 N NA
 59927 59928 PA3477 PA3478 rhlR rhlB FALSE 0.068 125.000 0.000 1.000 N NA
 59928 59929 PA3478 PA3479 rhlB rhlA FALSE 0.176 66.000 0.000 NA   NA
 59929 59930 PA3479 PA3480 rhlA   FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 59930 59931 PA3480 PA3481     FALSE 0.411 101.000 0.112 1.000 N NA
 59932 59933 PA3482 PA3483 metG   TRUE 0.542 34.000 0.018 NA   NA
 59933 59934 PA3483 PA3484     FALSE 0.131 87.000 0.000 NA   NA
 59934 59935 PA3484 PA3485     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 59935 59936 PA3485 PA3486     FALSE 0.011 295.000 0.000 NA   NA
 59936 59937 PA3486 PA3487   pldA TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 59937 59938 PA3487 PA3488 pldA   FALSE 0.005 429.000 0.000 NA   NA
 59938 59939 PA3488 PA3489     FALSE 0.039 179.000 0.000 NA   NA
 59939 59940 PA3489 PA3490     TRUE 0.999 -3.000 0.564 0.061 Y NA
 59940 59941 PA3490 PA3491     TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.019 Y NA
 59941 59942 PA3491 PA3492     TRUE 0.998 3.000 0.814 0.061 Y NA
 59942 59943 PA3492 PA3493     TRUE 0.999 0.000 0.924 0.061 Y NA
 59943 59944 PA3493 PA3494     TRUE 0.999 -7.000 0.908 0.061 Y NA
 59944 59945 PA3494 PA3495   nth TRUE 0.975 -3.000 0.109 1.000 N NA
 59945 59946 PA3495 PA3496 nth   FALSE 0.176 109.000 0.012 NA   NA
 59947 59948 PA3497 PA3498     FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 59948 59949 PA3498 PA3499     TRUE 0.916 15.000 0.222 NA N NA
 59949 59950 PA3499 PA3500     TRUE 0.954 -3.000 0.039 NA N NA
 59950 59951 PA3500 PA3501     TRUE 0.951 23.000 0.588 NA   NA
 59951 59952 PA3501 PA3502     TRUE 0.937 2.000 0.065 NA   NA
 59952 59953 PA3502 PA3503     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 59953 59954 PA3503 PA3504     FALSE 0.107 343.000 0.308 NA   NA
 59954 59955 PA3504 PA3505     TRUE 0.938 12.000 0.235 1.000   NA
 59955 59956 PA3505 PA3506     TRUE 0.857 11.000 0.050 1.000   NA
 59956 59957 PA3506 PA3507     TRUE 0.979 -7.000 0.182 1.000 N NA
 59957 59958 PA3507 PA3508     TRUE 0.942 -13.000 0.045 1.000 N NA
 59958 59959 PA3508 PA3509     TRUE 0.984 -7.000 0.250 NA N NA
 59959 59960 PA3509 PA3510     TRUE 0.907 9.000 0.094 NA N NA
 59960 59961 PA3510 PA3511     TRUE 0.943 14.000 0.328 1.000 N NA
 59961 59962 PA3511 PA3512     TRUE 0.650 6.000 0.000 1.000 N NA
 59962 59963 PA3512 PA3513     TRUE 0.994 -3.000 0.100 NA Y NA
 59963 59964 PA3513 PA3514     TRUE 0.850 41.000 0.022 NA Y NA
 59964 59965 PA3514 PA3515     FALSE 0.004 513.000 0.000 1.000 N NA
 59965 59966 PA3515 PA3516     FALSE 0.213 50.000 0.000 1.000 N NA
 59966 59967 PA3516 PA3517     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.001 Y NA
 59967 59968 PA3517 PA3518     FALSE 0.363 31.000 0.000 1.000   NA
 59968 59969 PA3518 PA3519     TRUE 0.796 33.000 0.000 0.002   NA
 59969 59970 PA3519 PA3520     FALSE 0.006 401.000 0.000 1.000   NA
 59970 59971 PA3520 PA3521     FALSE 0.003 588.000 0.000 1.000 N NA
 59971 59972 PA3521 PA3522     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.063 N NA
 59972 59973 PA3522 PA3523     TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000 N NA
 59975 59976 PA3525 PA3526 argG   FALSE 0.155 118.000 0.013 1.000 N NA
 59977 59978 PA3527 PA3528 pyrC rnt TRUE 0.967 -3.000 0.068 1.000 N NA
 59980 59981 PA3530 PA3531   bfrB TRUE 0.559 210.000 0.286 NA Y NA
 59982 59983 PA3532 PA3533     FALSE 0.120 83.000 0.000 NA N NA
 59983 59984 PA3533 PA3534     FALSE 0.239 113.000 0.039 1.000 N NA
 59987 59988 PA3537 PA3538 argF   TRUE 0.971 5.000 0.025 1.000 Y NA
 59988 59989 PA3538 PA3539     FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 59989 59990 PA3539 PA3540   algD FALSE 0.003 902.000 0.000 NA   NA
 59990 59991 PA3540 PA3541 algD alg8 TRUE 0.673 140.000 0.625 NA   NA
 59991 59992 PA3541 PA3542 alg8 alg44 TRUE 0.788 83.000 0.500 NA   NA
 59992 59993 PA3542 PA3543 alg44 algK TRUE 0.959 14.000 0.455 NA   NA
 59993 59994 PA3543 PA3544 algK algE TRUE 0.992 -3.000 0.417 NA   NA
 59994 59995 PA3544 PA3545 algE algG TRUE 0.958 21.000 0.625 NA   NA
 59995 59996 PA3545 PA3546 algG algX TRUE 0.964 13.000 0.500 NA   NA
 59996 59997 PA3546 PA3547 algX algL TRUE 0.984 4.000 0.562 NA   NA
 59997 59998 PA3547 PA3548 algL algI FALSE 0.274 242.000 0.438 NA   NA
 59998 59999 PA3548 PA3549 algI algJ TRUE 0.978 15.000 0.889 NA   NA
 59999 60000 PA3549 PA3550 algJ algF TRUE 0.887 73.000 0.889 NA   NA
 60000 60001 PA3550 PA3551 algF algA FALSE 0.372 197.000 0.400 NA   NA
 60001 60002 PA3551 PA3552 algA   FALSE 0.059 384.000 0.000 1.000 Y NA
 60002 60003 PA3552 PA3553     TRUE 0.997 -3.000 0.378 NA Y NA
 60003 60004 PA3553 PA3554     TRUE 0.996 -3.000 0.220 NA Y NA
 60004 60005 PA3554 PA3555     TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 60005 60006 PA3555 PA3556   arnT TRUE 0.938 -3.000 0.020 1.000 N NA
 60006 60007 PA3556 PA3557 arnT   TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 60007 60008 PA3557 PA3558     TRUE 0.997 -3.000 0.613 0.069   NA
 60008 60009 PA3558 PA3559     TRUE 0.982 -3.000 0.161 1.000   NA
 60010 60011 PA3560 PA3561 fruA fruK TRUE 0.996 2.000 0.562 1.000 Y NA
 60011 60012 PA3561 PA3562 fruK   TRUE 0.990 0.000 0.101 1.000 Y NA
 60013 60014 PA3563 PA3564 fruR   FALSE 0.168 113.000 0.017 NA N NA
 60016 60017 PA3566 PA3567     TRUE 0.969 22.000 0.400 0.042   NA
 60018 60019 PA3568 PA3569   mmsB TRUE 0.583 102.000 0.009 1.000 Y NA
 60019 60020 PA3569 PA3570 mmsB mmsA TRUE 0.886 16.000 0.000 0.001 N NA
 60021 60022 PA3571 PA3572 mmsR   FALSE 0.075 127.000 0.000 NA   NA
 60024 60025 PA3574 PA3575     FALSE 0.006 359.000 0.000 1.000 N NA
 60025 60026 PA3575 PA3576     FALSE 0.106 99.000 0.000 NA   NA
 60027 60028 PA3577 PA3578     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 60028 60029 PA3578 PA3579     FALSE 0.059 196.000 0.004 1.000   NA
 60029 60030 PA3579 PA3580     FALSE 0.293 64.000 0.004 NA   NA
 60031 60032 PA3581 PA3582 glpF glpK TRUE 0.504 40.000 0.023 1.000 N NA
 60032 60033 PA3582 PA3583 glpK glpR FALSE 0.104 206.000 0.055 1.000 N NA
 60033 60034 PA3583 PA3584 glpR glpD FALSE 0.011 278.000 0.000 1.000 N NA
 60034 60035 PA3584 PA3585 glpD glpM FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 60038 60039 PA3588 PA3589     FALSE 0.230 53.000 0.000 1.000   NA
 60039 60040 PA3589 PA3590     TRUE 0.975 23.000 0.333 1.000 Y NA
 60040 60041 PA3590 PA3591     TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 60041 60042 PA3591 PA3592     TRUE 0.524 60.000 0.000 0.069 N NA
 60042 60043 PA3592 PA3593     TRUE 0.705 39.000 0.094 1.000 N NA
 60044 60045 PA3594 PA3595     FALSE 0.025 219.000 0.000 1.000   NA
 60046 60047 PA3596 PA3597     FALSE 0.111 90.000 0.000 1.000 N NA
 60047 60048 PA3597 PA3598     TRUE 0.524 200.000 0.750 1.000   NA
 60050 60051 PA3600 PA3601     TRUE 0.986 0.000 0.083 0.009   NA
 60053 60054 PA3603 PA3604 dgkA   FALSE 0.143 72.000 0.000 1.000 N NA
 60057 60058 PA3607 PA3608 potA potB TRUE 0.993 5.000 0.440 1.000 Y NA
 60058 60059 PA3608 PA3609 potB potC TRUE 0.995 -7.000 0.040 0.063 Y NA
 60059 60060 PA3609 PA3610 potC potD TRUE 0.758 89.000 0.000 0.063 Y NA
 60060 60061 PA3610 PA3611 potD   FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 60061 60062 PA3611 PA3612     FALSE 0.459 19.000 0.000 NA   NA
 60064 60065 PA3614 PA3615     TRUE 0.482 83.000 0.089 NA   NA
 60066 60067 PA3616 PA3617 recX recA TRUE 0.968 6.000 0.296 1.000   NA
 60067 60068 PA3617 PA3618 recA   FALSE 0.288 134.000 0.082 NA   NA
 60069 60070 PA3619 PA3620   mutS FALSE 0.064 126.000 0.000 NA N NA
 60070 60071 PA3620 PA3621 mutS fdxA FALSE 0.322 67.000 0.020 1.000 N NA
 2200508 60072 PA3621.1 PA3622 rsmZ rpoS FALSE 0.017 251.000 0.000 NA   NA
 60072 60073 PA3622 PA3623 rpoS   FALSE 0.352 105.000 0.081 1.000 N NA
 60073 60074 PA3623 PA3624   pcm FALSE 0.381 46.000 0.007 1.000 N NA
 60074 60075 PA3624 PA3625 pcm surE TRUE 0.897 33.000 0.353 1.000   NA
 60075 60076 PA3625 PA3626 surE   TRUE 0.981 -12.000 0.235 1.000   NA
 60076 60077 PA3626 PA3627   ispF TRUE 0.983 -3.000 0.173 1.000   NA
 60077 60078 PA3627 PA3628 ispF   FALSE 0.298 71.000 0.012 1.000   NA
 60078 60079 PA3628 PA3629   adhC TRUE 0.878 54.000 0.567 1.000   NA
 60080 60081 PA3630 PA3631     FALSE 0.154 76.000 0.000 NA   NA
 60081 60082 PA3631 PA3632     TRUE 0.994 -34.000 0.844 NA   NA
 60083 60084 PA3633 PA3634 ispD   TRUE 0.878 20.000 0.185 1.000 N NA
 60084 60085 PA3634 PA3635   eno TRUE 0.710 65.000 0.241 1.000 N NA
 60085 60086 PA3635 PA3636 eno kdsA TRUE 0.695 46.000 0.125 1.000 N NA
 60086 60087 PA3636 PA3637 kdsA pyrG TRUE 0.952 3.000 0.138 1.000 N NA
 60087 60088 PA3637 PA3638 pyrG   FALSE 0.088 171.000 0.016 1.000 N NA
 60088 60089 PA3638 PA3639   accA TRUE 0.561 70.000 0.123 1.000 N NA
 60089 60090 PA3639 PA3640 accA dnaE FALSE 0.297 150.000 0.122 1.000 N NA
 60090 60091 PA3640 PA3641 dnaE   FALSE 0.064 130.000 0.000 1.000 N NA
 60091 60092 PA3641 PA3642   rnhB FALSE 0.022 217.000 0.000 1.000 N NA
 60092 60093 PA3642 PA3643 rnhB lpxB TRUE 0.974 0.000 0.186 1.000 N NA
 60093 60094 PA3643 PA3644 lpxB lpxA TRUE 0.992 4.000 0.289 1.000 Y NA
 60094 60095 PA3644 PA3645 lpxA fabZ TRUE 0.996 -3.000 0.850 1.000 N NA
 60095 60096 PA3645 PA3646 fabZ lpxD TRUE 0.924 46.000 0.796 1.000 N NA
 60096 60097 PA3646 PA3647 lpxD   TRUE 0.998 0.000 0.814 1.000 Y NA
 60097 60098 PA3647 PA3648     TRUE 0.846 51.000 0.050 1.000 Y NA
 60098 60099 PA3648 PA3649     TRUE 0.716 71.000 0.014 1.000 Y NA
 60099 60100 PA3649 PA3650   dxr TRUE 0.942 26.000 0.568 1.000 N NA
 60100 60101 PA3650 PA3651 dxr cdsA TRUE 0.997 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 60101 60102 PA3651 PA3652 cdsA uppS TRUE 0.997 -6.000 0.400 1.000 Y NA
 60102 60103 PA3652 PA3653 uppS frr TRUE 0.948 16.000 0.409 1.000 N NA
 60103 60104 PA3653 PA3654 frr pyrH TRUE 0.886 3.000 0.030 1.000 N NA
 60104 60105 PA3654 PA3655 pyrH tsf FALSE 0.064 199.000 0.017 1.000 N NA
 60105 60106 PA3655 PA3656 tsf rpsB TRUE 0.895 131.000 0.748 1.000 Y NA
 60107 60108 PA3657 PA3658 map glnD TRUE 0.591 167.000 0.651 1.000 N NA
 60108 60109 PA3658 PA3659 glnD   TRUE 0.914 18.000 0.257 1.000 N NA
 60111 60112 PA3661 PA3662     FALSE 0.010 322.000 0.000 NA   NA
 60114 60115 PA3664 PA3665     TRUE 0.512 13.000 0.000 1.000 N NA
 60115 60116 PA3665 PA3666   dapD TRUE 0.843 30.000 0.000 1.000 Y NA
 60116 60117 PA3666 PA3667 dapD   TRUE 0.840 95.000 0.244 1.000 Y NA
 60117 60118 PA3667 PA3668     TRUE 0.977 -3.000 0.116 NA   NA
 60119 60120 PA3669 PA3670     TRUE 0.884 4.000 0.032 NA   NA
 60120 60121 PA3670 PA3671     TRUE 0.967 11.000 0.435 NA   NA
 60121 60122 PA3671 PA3672     TRUE 0.992 -3.000 0.426 1.000   NA
 60123 60124 PA3673 PA3674 plsB   FALSE 0.219 144.000 0.052 NA   NA
 60124 60125 PA3674 PA3675     FALSE 0.207 137.000 0.042 NA   NA
 60126 60127 PA3676 PA3677     TRUE 0.973 5.000 0.354 NA N NA
 60129 60130 PA3679 PA3680     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 60130 60131 PA3680 PA3681     FALSE 0.380 56.000 0.017 NA   NA
 60131 60132 PA3681 PA3682     TRUE 0.928 5.000 0.090 NA   NA
 60132 60133 PA3682 PA3683     FALSE 0.384 73.000 0.037 NA   NA
 60133 60134 PA3683 PA3684     TRUE 0.811 19.000 0.074 NA   NA
 60134 60135 PA3684 PA3685     FALSE 0.269 74.000 0.008 NA   NA
 60135 60136 PA3685 PA3686   adk FALSE 0.195 104.000 0.019 1.000 N NA
 60136 60137 PA3686 PA3687 adk ppc FALSE 0.046 161.000 0.000 1.000 N NA
 60140 60141 PA3690 PA3691     FALSE 0.007 380.000 0.000 NA   NA
 60141 60142 PA3691 PA3692     TRUE 0.835 49.000 0.333 NA   NA
 60143 60144 PA3693 PA3694     TRUE 0.940 -3.000 0.020 NA   NA
 60144 60145 PA3694 PA3695     TRUE 0.983 -3.000 0.174 NA   NA
 60145 60146 PA3695 PA3696     TRUE 0.935 -3.000 0.015 NA   NA
 60146 60147 PA3696 PA3697     FALSE 0.307 69.000 0.015 NA   NA
 60147 60148 PA3697 PA3698     TRUE 0.917 9.000 0.104 NA   NA
 60148 60149 PA3698 PA3699     TRUE 0.638 97.000 0.304 NA   NA
 60149 60150 PA3699 PA3700   lysS FALSE 0.056 212.000 0.012 1.000   NA
 60150 2200509 PA3700 PA3701 lysS prfB TRUE 0.726 181.000 0.162 0.030 Y NA
 2200509 60151 PA3701 PA3702 prfB wspR FALSE 0.124 123.000 0.002 1.000 N NA
 60151 60152 PA3702 PA3703 wspR wspF TRUE 0.939 108.000 0.480 0.018 Y NA
 60152 60153 PA3703 PA3704 wspF wspE TRUE 0.999 -3.000 0.324 0.010 Y NA
 60153 60154 PA3704 PA3705 wspE wspD TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.010 Y NA
 60154 60155 PA3705 PA3706 wspD wspC TRUE 0.998 -7.000 0.558 1.000 Y NA
 60155 60156 PA3706 PA3707 wspC wspB TRUE 0.998 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 60156 60157 PA3707 PA3708 wspB wspA TRUE 0.998 5.000 0.600 0.010 Y NA
 60157 60158 PA3708 PA3709 wspA   FALSE 0.012 267.000 0.000 1.000 N NA
 60158 60159 PA3709 PA3710     FALSE 0.360 109.000 0.094 1.000 N NA
 60162 60163 PA3713 PA3714     FALSE 0.010 324.000 0.000 1.000   NA
 60163 60164 PA3714 PA3715     FALSE 0.080 121.000 0.000 NA   NA
 60167 60168 PA3718 PA3719     FALSE 0.063 148.000 0.000 NA   NA
 60168 60169 PA3719 PA3720     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 60171 60172 PA3722 PA3723     FALSE 0.034 189.000 0.000 NA   NA
 60172 60173 PA3723 PA3724   lasB FALSE 0.039 170.000 0.000 1.000 N NA
 60173 60174 PA3724 PA3725 lasB recJ FALSE 0.010 287.000 0.000 1.000 N NA
 60174 60175 PA3725 PA3726 recJ   FALSE 0.437 44.000 0.011 1.000   NA
 60175 60176 PA3726 PA3727     FALSE 0.098 107.000 0.000 1.000   NA
 60176 60177 PA3727 PA3728     TRUE 0.813 19.000 0.073 1.000   NA
 60177 60178 PA3728 PA3729     TRUE 0.681 150.000 0.711 NA   NA
 60178 60179 PA3729 PA3730     TRUE 0.934 36.000 0.644 NA   NA
 60179 60180 PA3730 PA3731     TRUE 0.624 56.000 0.107 NA   NA
 60180 60181 PA3731 PA3732     TRUE 0.978 15.000 0.911 NA   NA
 60182 60183 PA3733 PA3734     FALSE 0.004 583.000 0.000 1.000   NA
 60184 60185 PA3735 PA3736 thrC hom TRUE 0.885 53.000 0.125 1.000 Y NA
 60185 60186 PA3736 PA3737 hom dsbC FALSE 0.067 214.000 0.029 1.000 N NA
 60186 60187 PA3737 PA3738 dsbC xerD FALSE 0.174 127.000 0.026 1.000 N NA
 60188 60189 PA3739 PA3740     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 60190 60191 PA3741 PA3742   rplS FALSE 0.093 152.000 0.004 NA N NA
 60191 60192 PA3742 PA3743 rplS trmD TRUE 0.970 42.000 0.567 1.000 Y NA
 60192 60193 PA3743 PA3744 trmD rimM TRUE 0.995 7.000 0.672 1.000 Y NA
 60193 60194 PA3744 PA3745 rimM rpsP TRUE 0.992 16.000 0.342 0.009 Y NA
 60194 60195 PA3745 PA3746 rpsP ffh FALSE 0.308 210.000 0.361 1.000 N NA
 60196 60197 PA3747 PA3748     TRUE 0.952 13.000 0.349 NA   NA
 60197 60198 PA3748 PA3749     FALSE 0.018 304.000 0.008 NA N NA
 60199 60200 PA3750 PA3751   purT TRUE 0.905 2.000 0.033 1.000 N NA
 60200 60201 PA3751 PA3752 purT   TRUE 0.778 38.000 0.154 NA   NA
 60201 60202 PA3752 PA3753     TRUE 0.967 -3.000 0.062 NA   NA
 60202 60203 PA3753 PA3754     TRUE 0.702 38.000 0.078 1.000   NA
 60204 60205 PA3755 PA3756     TRUE 0.513 63.000 0.065 NA   NA
 60205 60206 PA3756 PA3757     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 60206 60207 PA3757 PA3758     TRUE 0.873 17.000 0.146 1.000 N NA
 60207 60208 PA3758 PA3759     TRUE 0.979 -3.000 0.146 1.000 N NA
 60208 60209 PA3759 PA3760     TRUE 0.899 17.000 0.200 1.000 N NA
 60209 60210 PA3760 PA3761     TRUE 0.987 25.000 0.258 0.002 Y NA
 60211 60212 PA3762 PA3763   purL FALSE 0.011 465.000 0.016 NA   NA
 60214 60215 PA3765 PA3766     FALSE 0.076 126.000 0.000 NA   NA
 60215 60216 PA3766 PA3767     FALSE 0.006 389.000 0.000 1.000 N NA
 60216 60217 PA3767 PA3768     TRUE 0.946 -9.000 0.045 1.000 N NA
 60217 60218 PA3768 PA3769   guaA FALSE 0.083 162.000 0.004 1.000 N NA
 60218 60219 PA3769 PA3770 guaA guaB TRUE 0.946 80.000 0.190 0.000 Y NA
 60220 60221 PA3771 PA3772     FALSE 0.319 135.000 0.120 NA N NA
 60221 60222 PA3772 PA3773     TRUE 0.923 13.000 0.214 NA N NA
 60222 60223 PA3773 PA3774     TRUE 0.846 30.000 0.208 NA N NA
 60225 60226 PA3776 PA3777   xseA FALSE 0.448 37.000 0.006 1.000 N NA
 60226 60227 PA3777 PA3778 xseA   TRUE 0.639 7.000 0.000 1.000 N NA
 60227 60228 PA3778 PA3779     TRUE 0.487 152.000 0.333 1.000 N NA
 60228 60229 PA3779 PA3780     TRUE 0.934 75.000 0.533 NA Y NA
 60229 60230 PA3780 PA3781     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA Y NA
 60233 60234 PA3784 PA3785     FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 60234 60235 PA3785 PA3786     FALSE 0.073 130.000 0.000 NA   NA
 60236 60237 PA3787 PA3788     FALSE 0.133 86.000 0.000 NA   NA
 60238 60239 PA3789 PA3790   oprC FALSE 0.394 65.000 0.029 1.000   NA
 60239 60240 PA3790 PA3791 oprC   FALSE 0.080 121.000 0.000 NA   NA
 60242 60243 PA3793 PA3794     FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 60245 60246 PA3796 PA3797     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 60246 60247 PA3797 PA3798     TRUE 0.966 -12.000 0.099 1.000   NA
 60247 60248 PA3798 PA3799   engA FALSE 0.020 308.000 0.006 1.000   NA
 60248 60249 PA3799 PA3800 engA   TRUE 0.643 78.000 0.203 1.000   NA
 60249 60250 PA3800 PA3801     TRUE 0.986 2.000 0.492 1.000   NA
 60250 60251 PA3801 PA3802   hisS TRUE 0.889 27.000 0.259 1.000   NA
 60251 60252 PA3802 PA3803 hisS ispG TRUE 0.893 19.000 0.207 1.000 N NA
 60252 60253 PA3803 PA3804 ispG   TRUE 0.987 -3.000 0.233 1.000   NA
 60253 60254 PA3804 PA3805   pilF TRUE 0.985 -3.000 0.204 1.000   NA
 60254 60255 PA3805 PA3806 pilF   TRUE 0.834 18.000 0.086 1.000   NA
 60255 60256 PA3806 PA3807   ndk TRUE 0.847 25.000 0.156 1.000   NA
 60256 60257 PA3807 PA3808 ndk   FALSE 0.042 244.000 0.017 1.000   NA
 60257 60258 PA3808 PA3809   fdx2 TRUE 0.949 27.000 0.625 1.000   NA
 60258 60259 PA3809 PA3810 fdx2 hscA TRUE 0.986 7.000 0.794 1.000 N NA
 60259 60260 PA3810 PA3811 hscA hscB TRUE 0.972 43.000 0.634 1.000 Y NA
 60260 60261 PA3811 PA3812 hscB iscA TRUE 0.978 8.000 0.500 1.000   NA
 60261 60262 PA3812 PA3813 iscA iscU TRUE 0.834 28.000 0.000 0.001   NA
 60262 60263 PA3813 PA3814 iscU iscS FALSE 0.294 36.000 0.000 1.000 N NA
 60263 60264 PA3814 PA3815 iscS   TRUE 0.913 30.000 0.424 1.000 N NA
 60264 60265 PA3815 PA3816   cysE FALSE 0.460 145.000 0.271 1.000 N NA
 60265 60266 PA3816 PA3817 cysE   TRUE 0.976 0.000 0.208 1.000 N NA
 60268 60269 PA3819 PA3820   secF FALSE 0.135 184.000 0.050 1.000   NA
 60269 60270 PA3820 PA3821 secF secD TRUE 0.993 11.000 0.171 0.001 Y NA
 60270 60271 PA3821 PA3822 secD yajC TRUE 0.789 60.000 0.031 NA Y NA
 60271 60272 PA3822 PA3823 yajC tgt TRUE 0.840 44.000 0.325 NA N NA
 60272 60273 PA3823 PA3824 tgt queA TRUE 0.995 13.000 0.360 0.000 Y NA
 60276 60277 PA3827 PA3828     TRUE 0.997 -7.000 0.631 0.068   NA
 60277 60278 PA3828 PA3829     FALSE 0.034 192.000 0.000 1.000   NA
 60278 60279 PA3829 PA3830     FALSE 0.144 84.000 0.000 1.000   NA
 60280 60281 PA3831 PA3832 pepA holC TRUE 0.993 -3.000 0.494 1.000 N NA
 60281 60282 PA3832 PA3833 holC   TRUE 0.808 12.000 0.034 NA   NA
 60282 60283 PA3833 PA3834   valS FALSE 0.151 121.000 0.009 NA   NA
 60285 60286 PA3836 PA3837     TRUE 0.803 84.000 0.562 NA   NA
 60286 60287 PA3837 PA3838     TRUE 0.990 3.000 0.771 1.000   NA
 60287 60288 PA3838 PA3839     FALSE 0.085 119.000 0.000 1.000   NA
 60288 60289 PA3839 PA3840     FALSE 0.223 92.000 0.010 1.000   NA
 60291 60292 PA3842 PA3843     FALSE 0.409 24.000 0.000 NA   NA
 60296 60297 PA3847 PA3848     FALSE 0.156 74.000 0.000 NA   NA
 60297 60298 PA3848 PA3849   ndpA FALSE 0.118 93.000 0.000 NA   NA
 60299 60300 PA3850 PA3851     FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 60300 60301 PA3851 PA3852     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 60301 60302 PA3852 PA3853     FALSE 0.084 121.000 0.000 1.000   NA
 60302 60303 PA3853 PA3854     FALSE 0.380 29.000 0.000 1.000   NA
 60303 60304 PA3854 PA3855     TRUE 0.816 -7.000 0.000 NA N NA
 60304 60305 PA3855 PA3856     FALSE 0.172 67.000 0.000 NA   NA
 60305 60306 PA3856 PA3857   pcs FALSE 0.323 71.000 0.020 NA   NA
 60306 60307 PA3857 PA3858 pcs   FALSE 0.079 112.000 0.000 1.000 N NA
 60310 60311 PA3861 PA3862 rhl   FALSE 0.109 161.000 0.019 1.000 N NA
 60311 60312 PA3862 PA3863     TRUE 0.972 23.000 0.286 1.000 Y NA
 60312 60313 PA3863 PA3864     TRUE 0.785 63.000 0.333 1.000   NA
 60314 60315 PA3865 PA3866     FALSE 0.003 1302.000 0.000 1.000   NA
 60316 60317 PA3867 PA3868     FALSE 0.075 556.000 0.167 0.040   NA
 60317 60318 PA3868 PA3869     FALSE 0.254 191.000 0.200 NA   NA
 60319 60320 PA3870 PA3871 moaA1   TRUE 0.479 57.000 0.045 1.000 N NA
 60320 60321 PA3871 PA3872   narI TRUE 0.598 55.000 0.091 1.000 N NA
 60321 60322 PA3872 PA3873 narI narJ TRUE 0.999 3.000 0.818 0.001 Y NA
 60322 60323 PA3873 PA3874 narJ narH TRUE 0.999 6.000 0.818 0.001 Y NA
 60323 60324 PA3874 PA3875 narH narG TRUE 0.997 12.000 0.727 0.000 Y NA
 60324 60325 PA3875 PA3876 narG narK2 FALSE 0.137 76.000 0.000 1.000 N NA
 60325 60326 PA3876 PA3877 narK2 narK1 TRUE 0.965 12.000 0.000 0.068 Y NA
 60327 60328 PA3878 PA3879 narX narL TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.022 Y NA
 60328 60329 PA3879 PA3880 narL   FALSE 0.136 85.000 0.000 NA   NA
 60329 60330 PA3880 PA3881     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 60330 60331 PA3881 PA3882     TRUE 0.510 16.000 0.000 1.000   NA
 60331 60332 PA3882 PA3883     FALSE 0.426 87.000 0.000 0.068   NA
 60332 60333 PA3883 PA3884     TRUE 0.926 21.000 0.333 NA   NA
 60333 60334 PA3884 PA3885     FALSE 0.113 95.000 0.000 NA   NA
 60334 60335 PA3885 PA3886     FALSE 0.085 105.000 0.000 1.000 N NA
 60337 60338 PA3888 PA3889     TRUE 0.994 0.000 0.403 0.062 N NA
 60338 60339 PA3889 PA3890     TRUE 0.992 0.000 0.313 0.062 N NA
 60339 60340 PA3890 PA3891     TRUE 0.996 13.000 0.903 0.100 Y NA
 60341 60342 PA3892 PA3893     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 60342 60343 PA3893 PA3894     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 60344 60345 PA3895 PA3896     FALSE 0.100 95.000 0.000 1.000 N NA
 60347 60348 PA3898 PA3899     TRUE 0.723 101.000 0.000 0.027 Y NA
 60348 60349 PA3899 PA3900     TRUE 0.988 -3.000 0.286 NA N NA
 60349 60350 PA3900 PA3901   fecA TRUE 0.884 95.000 0.400 NA Y NA
 60352 60353 PA3903 PA3904 prfC   FALSE 0.006 386.000 0.000 NA   NA
 60353 60354 PA3904 PA3905     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 60354 60355 PA3905 PA3906     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 60355 60356 PA3906 PA3907     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 60356 60357 PA3907 PA3908     TRUE 0.994 -3.000 0.571 NA   NA
 60358 60359 PA3909 PA3910     FALSE 0.314 37.000 0.000 NA   NA
 60359 60360 PA3910 PA3911     FALSE 0.015 252.000 0.000 1.000 N NA
 60360 60361 PA3911 PA3912     TRUE 0.984 -6.000 0.235 1.000 N NA
 60361 60362 PA3912 PA3913     TRUE 0.998 12.000 0.948 0.003 Y NA
 60362 60363 PA3913 PA3914   moeA1 FALSE 0.077 115.000 0.000 1.000 N NA
 60363 60364 PA3914 PA3915 moeA1 moaB1 TRUE 0.997 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 60364 60365 PA3915 PA3916 moaB1 moaE TRUE 0.816 101.000 0.018 0.002 Y NA
 60365 60366 PA3916 PA3917 moaE moaD TRUE 0.998 5.000 0.501 0.002 Y NA
 60366 60367 PA3917 PA3918 moaD moaC TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 60367 60368 PA3918 PA3919 moaC   FALSE 0.035 249.000 0.013 1.000 N NA
 60370 60371 PA3921 PA3922     FALSE 0.134 333.000 0.375 NA   NA
 60371 60372 PA3922 PA3923     TRUE 0.909 61.000 0.889 NA   NA
 60372 60373 PA3923 PA3924     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 60377 60378 PA3928 PA3929   cioB TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 60378 60379 PA3929 PA3930 cioB cioA TRUE 0.982 4.000 0.000 0.060 Y NA
 60380 60381 PA3931 PA3932     FALSE 0.368 175.000 0.294 NA N NA
 60381 60382 PA3932 PA3933     FALSE 0.030 190.000 0.000 1.000 N NA
 60383 60384 PA3934 PA3935   tauD FALSE 0.050 163.000 0.000 NA   NA
 60384 60385 PA3935 PA3936 tauD   TRUE 0.509 107.000 0.214 1.000 N NA
 60385 60386 PA3936 PA3937     TRUE 0.998 -10.000 0.728 1.000 Y NA
 60386 60387 PA3937 PA3938     TRUE 0.840 65.000 0.093 1.000 Y NA
 60387 60388 PA3938 PA3939     FALSE 0.030 205.000 0.000 1.000   NA
 60390 60391 PA3941 PA3942   tesB TRUE 0.964 -3.000 0.052 1.000   NA
 60391 60392 PA3942 PA3943 tesB   FALSE 0.344 34.000 0.000 1.000   NA
 60392 60393 PA3943 PA3944     TRUE 0.745 3.000 0.000 1.000   NA
 60393 60394 PA3944 PA3945     TRUE 0.956 27.000 0.014 0.007 Y NA
 60394 60395 PA3945 PA3946     FALSE 0.022 215.000 0.000 1.000 N NA
 60395 60396 PA3946 PA3947     TRUE 0.724 102.000 0.000 0.018 Y NA
 60397 60398 PA3948 PA3949     FALSE 0.007 360.000 0.000 NA   NA
 60399 60400 PA3950 PA3951     FALSE 0.150 78.000 0.000 NA   NA
 60400 60401 PA3951 PA3952     FALSE 0.440 66.000 0.043 NA   NA
 60402 60403 PA3953 PA3954     FALSE 0.047 158.000 0.000 1.000 N NA
 60403 60404 PA3954 PA3955     FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 60404 60405 PA3955 PA3956     TRUE 0.609 67.000 0.143 NA   NA
 60407 60408 PA3958 PA3959     FALSE 0.272 90.000 0.024 NA   NA
 60408 60409 PA3959 PA3960     FALSE 0.409 24.000 0.000 NA   NA
 60411 60412 PA3962 PA3963     FALSE 0.307 89.000 0.031 NA   NA
 60412 60413 PA3963 PA3964     TRUE 0.799 -43.000 0.000 NA   NA
 60413 60414 PA3964 PA3965     FALSE 0.007 382.000 0.000 NA   NA
 60414 60415 PA3965 PA3966     FALSE 0.137 202.000 0.077 NA   NA
 60415 60416 PA3966 PA3967     FALSE 0.315 101.000 0.051 NA   NA
 60419 60420 PA3970 PA3971 amn   FALSE 0.184 55.000 0.000 NA N NA
 60420 60421 PA3971 PA3972     TRUE 0.521 12.000 0.000 NA N NA
 60421 60422 PA3972 PA3973     TRUE 0.977 -3.000 0.127 1.000 N NA
 60422 60423 PA3973 PA3974   ladS FALSE 0.441 106.000 0.036 0.100 N NA
 60424 60425 PA3975 PA3976 thiD thiE TRUE 0.982 11.000 0.209 1.000 Y NA
 60425 60426 PA3976 PA3977 thiE hemL TRUE 0.935 38.000 0.173 1.000 Y NA
 60426 60427 PA3977 PA3978 hemL   FALSE 0.053 209.000 0.008 1.000   NA
 60429 60430 PA3980 PA3981     FALSE 0.330 169.000 0.220 1.000 N NA
 60430 60431 PA3981 PA3982     TRUE 0.990 -10.000 0.457 NA   NA
 60431 60432 PA3982 PA3983     TRUE 0.980 -3.000 0.150 NA   NA
 60432 60433 PA3983 PA3984   lnt FALSE 0.472 186.000 0.557 NA N NA
 60434 60435 PA3985 PA3986     TRUE 0.789 73.000 0.435 NA   NA
 60436 60437 PA3987 PA3988 leuS   TRUE 0.643 67.000 0.182 NA N NA
 60437 60438 PA3988 PA3989   holA TRUE 0.803 38.000 0.199 NA N NA
 60438 60439 PA3989 PA3990 holA   FALSE 0.211 92.000 0.007 NA   NA
 60441 60442 PA3992 PA3993     FALSE 0.056 146.000 0.000 1.000 N NA
 60445 60446 PA3996 PA3997 lipA lipB TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.000 Y NA
 60446 60447 PA3997 PA3998 lipB   TRUE 0.978 0.000 0.219 NA   NA
 60447 60448 PA3998 PA3999   dacC TRUE 0.495 71.000 0.074 NA   NA
 60448 60449 PA3999 PA4000 dacC   TRUE 0.897 66.000 0.241 NA Y NA
 60449 60450 PA4000 PA4001   sltB1 TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 60450 60451 PA4001 PA4002 sltB1 rodA TRUE 0.908 9.000 0.096 NA N NA
 60451 60452 PA4002 PA4003 rodA pbpA FALSE 0.318 32.000 0.000 1.000 N NA
 60452 60453 PA4003 PA4004 pbpA   TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 60453 60454 PA4004 PA4005     TRUE 0.965 8.000 0.307 NA   NA
 60454 60455 PA4005 PA4006   nadD TRUE 0.887 23.000 0.221 NA   NA
 60455 60456 PA4006 PA4007 nadD proA TRUE 0.972 0.000 0.170 1.000 N NA
 60459 60460 PA4010 PA4011     TRUE 0.941 -3.000 0.019 1.000   NA
 60461 60462 PA4012 PA4013     TRUE 0.699 20.000 0.027 1.000   NA
 60462 60463 PA4013 PA4014     TRUE 0.994 0.000 0.818 1.000   NA
 60464 60465 PA4015 PA4016     FALSE 0.295 190.000 0.243 1.000   NA
 60465 60466 PA4016 PA4017     TRUE 0.591 47.000 0.056 1.000   NA
 60467 60468 PA4018 PA4019     TRUE 0.940 2.000 0.070 NA   NA
 60468 60469 PA4019 PA4020   mpl TRUE 0.951 9.000 0.235 1.000 N NA
 60469 60470 PA4020 PA4021 mpl   FALSE 0.278 158.000 0.020 0.076 N NA
 60471 60472 PA4022 PA4023     FALSE 0.023 210.000 0.000 1.000 N NA
 60472 60473 PA4023 PA4024   eutB TRUE 0.939 59.000 0.407 1.000 Y NA
 60473 60474 PA4024 PA4025 eutB   TRUE 0.998 11.000 0.859 0.000 Y NA
 60474 60475 PA4025 PA4026     FALSE 0.172 163.000 0.047 1.000   NA
 60475 60476 PA4026 PA4027     FALSE 0.244 50.000 0.000 1.000   NA
 60476 60477 PA4027 PA4028     FALSE 0.005 475.000 0.000 NA   NA
 60477 60478 PA4028 PA4029     FALSE 0.003 974.000 0.000 NA   NA
 60478 60479 PA4029 PA4030     TRUE 0.893 3.000 0.030 NA   NA
 60479 60480 PA4030 PA4031   ppa FALSE 0.305 80.000 0.022 NA   NA
 60482 60483 PA4033 PA4034   aqpZ FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 60483 60484 PA4034 PA4035 aqpZ   FALSE 0.047 166.000 0.000 NA   NA
 60484 60485 PA4035 PA4036     TRUE 0.933 19.000 0.345 NA   NA
 60485 60486 PA4036 PA4037     FALSE 0.025 405.000 0.000 0.076 N NA
 60486 60487 PA4037 PA4038     TRUE 0.992 -3.000 0.426 1.000   NA
 60487 60488 PA4038 PA4039     TRUE 0.970 10.000 0.435 NA   NA
 60488 60489 PA4039 PA4040     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 60491 60492 PA4042 PA4043 xseB ispA TRUE 0.982 -3.000 0.177 1.000 N NA
 60492 60493 PA4043 PA4044 ispA dxs TRUE 0.808 109.000 0.246 1.000 Y NA
 60494 60495 PA4045 PA4046     TRUE 0.952 0.000 0.066 NA   NA
 60495 60496 PA4046 PA4047   ribA TRUE 0.963 -3.000 0.050 NA   NA
 60496 60497 PA4047 PA4048 ribA   FALSE 0.205 131.000 0.035 1.000   NA
 60497 60498 PA4048 PA4049     TRUE 0.936 3.000 0.075 1.000   NA
 60498 60499 PA4049 PA4050   pgpA TRUE 0.798 9.000 0.018 1.000 N NA
 60499 60500 PA4050 PA4051 pgpA thiL TRUE 0.981 -7.000 0.206 1.000 N NA
 60500 60501 PA4051 PA4052 thiL nusB TRUE 0.900 19.000 0.225 1.000 N NA
 60501 60502 PA4052 PA4053 nusB ribH TRUE 0.990 -3.000 0.347 1.000 N NA
 60502 60503 PA4053 PA4054 ribH ribB TRUE 0.829 118.000 0.049 0.001 Y NA
 60503 60504 PA4054 PA4055 ribB ribC TRUE 0.929 27.000 0.065 1.000 Y NA
 60504 60505 PA4055 PA4056 ribC ribD FALSE 0.271 428.000 0.456 1.000 Y NA
 60505 60506 PA4056 PA4057 ribD   TRUE 0.988 -3.000 0.277 NA N NA
 60507 60508 PA4058 PA4059     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 60508 60509 PA4059 PA4060     TRUE 0.679 6.000 0.000 NA   NA
 60509 60510 PA4060 PA4061     FALSE 0.326 72.000 0.022 NA   NA
 60512 60513 PA4063 PA4064     TRUE 0.702 89.000 0.336 NA   NA
 60513 60514 PA4064 PA4065     TRUE 0.996 3.000 0.605 1.000 Y NA
 60514 60515 PA4065 PA4066     TRUE 0.852 18.000 0.114 NA   NA
 60515 60516 PA4066 PA4067   oprG FALSE 0.228 148.000 0.060 NA   NA
 60517 60518 PA4068 PA4069     TRUE 0.981 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 60518 60519 PA4069 PA4070     FALSE 0.012 269.000 0.000 1.000 N NA
 60519 60520 PA4070 PA4071     FALSE 0.052 161.000 0.000 NA   NA
 60520 60521 PA4071 PA4072     TRUE 0.994 -25.000 0.864 NA   NA
 60521 60522 PA4072 PA4073     FALSE 0.041 168.000 0.000 1.000 N NA
 60525 60526 PA4076 PA4077     TRUE 0.991 -3.000 0.357 NA   NA
 60526 60527 PA4077 PA4078     FALSE 0.023 210.000 0.000 1.000 N NA
 60527 60528 PA4078 PA4079     TRUE 0.483 73.000 0.000 0.067   NA
 60529 60530 PA4080 PA4081   cupB6 FALSE 0.003 645.000 0.000 1.000 N NA
 60530 60531 PA4081 PA4082 cupB6 cupB5 TRUE 0.525 100.000 0.000 1.000 Y NA
 60531 60532 PA4082 PA4083 cupB5 cupB4 TRUE 0.586 88.000 0.000 1.000 Y NA
 60532 60533 PA4083 PA4084 cupB4 cupB3 TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 60533 60534 PA4084 PA4085 cupB3 cupB2 FALSE 0.370 322.000 0.400 1.000 Y NA
 60534 60535 PA4085 PA4086 cupB2 cupB1 TRUE 0.985 31.000 0.800 1.000 Y NA
 60536 60537 PA4087 PA4088     TRUE 0.847 9.000 0.033 NA   NA
 60537 60538 PA4088 PA4089     TRUE 0.950 -3.000 0.033 1.000 N NA
 60538 60539 PA4089 PA4090     FALSE 0.026 213.000 0.000 NA   NA
 60539 60540 PA4090 PA4091   hpaA FALSE 0.047 166.000 0.000 NA   NA
 60540 60541 PA4091 PA4092 hpaA hpaC TRUE 0.926 29.000 0.097 0.001   NA
 60542 60543 PA4093 PA4094     FALSE 0.214 48.000 0.000 NA N NA
 60544 60545 PA4095 PA4096     TRUE 0.755 71.000 0.333 1.000   NA
 60545 60546 PA4096 PA4097     TRUE 0.992 -3.000 0.417 1.000 N NA
 60546 60547 PA4097 PA4098     TRUE 0.980 15.000 0.500 0.041 N NA
 60547 60548 PA4098 PA4099     FALSE 0.121 85.000 0.000 1.000 N NA
 60548 60549 PA4099 PA4100     FALSE 0.271 155.000 0.118 1.000 N NA
 60549 60550 PA4100 PA4101     FALSE 0.003 618.000 0.000 1.000 N NA
 60550 60551 PA4101 PA4102     TRUE 0.999 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 60551 60552 PA4102 PA4103     FALSE 0.278 130.000 0.069 1.000   NA
 60552 60553 PA4103 PA4104     TRUE 0.615 32.000 0.031 NA   NA
 60554 60555 PA4105 PA4106     TRUE 0.996 -7.000 0.914 NA   NA
 60555 60556 PA4106 PA4107     FALSE 0.347 75.000 0.029 NA   NA
 60559 60560 PA4110 PA4111 ampC   FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 60561 60562 PA4112 PA4113     FALSE 0.066 128.000 0.000 1.000 N NA
 60562 60563 PA4113 PA4114     FALSE 0.059 154.000 0.000 1.000   NA
 60564 60565 PA4115 PA4116     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 60565 60566 PA4116 PA4117     TRUE 0.623 28.000 0.029 NA N NA
 60566 60567 PA4117 PA4118     FALSE 0.150 78.000 0.000 NA   NA
 60568 60569 PA4119 PA4120 aph   FALSE 0.204 52.000 0.000 1.000 N NA
 60570 60571 PA4121 PA4122     TRUE 0.997 11.000 0.618 0.000 Y NA
 60571 60572 PA4122 PA4123   hpcC TRUE 0.997 -3.000 0.510 0.067 N NA
 60572 60573 PA4123 PA4124 hpcC hpcB TRUE 0.579 132.000 0.378 1.000   NA
 60573 60574 PA4124 PA4125 hpcB hpcD TRUE 0.958 11.000 0.330 1.000   NA
 60574 60575 PA4125 PA4126 hpcD   FALSE 0.302 93.000 0.039 1.000 N NA
 60575 60576 PA4126 PA4127   hpcG TRUE 0.814 18.000 0.075 1.000 N NA
 60576 60577 PA4127 PA4128 hpcG   TRUE 0.854 13.000 0.075 1.000 N NA
 60578 60579 PA4129 PA4130     TRUE 0.988 -3.000 0.273 NA   NA
 60580 60581 PA4131 PA4132     TRUE 0.674 98.000 0.385 1.000 N NA
 60581 60582 PA4132 PA4133     FALSE 0.013 264.000 0.000 1.000 N NA
 60582 60583 PA4133 PA4134     TRUE 0.856 84.000 0.800 NA   NA
 60584 60585 PA4135 PA4136     FALSE 0.119 86.000 0.000 1.000 N NA
 60588 60589 PA4139 PA4140     FALSE 0.329 132.000 0.111 NA   NA
 60589 60590 PA4140 PA4141     FALSE 0.010 309.000 0.000 NA   NA
 60590 60591 PA4141 PA4142     FALSE 0.108 97.000 0.000 NA   NA
 60591 60592 PA4142 PA4143     TRUE 0.940 10.000 0.000 1.000 Y NA
 60592 60593 PA4143 PA4144     TRUE 0.948 0.000 0.000 0.074 N NA
 60593 60594 PA4144 PA4145     FALSE 0.098 96.000 0.000 1.000 N NA
 60594 60595 PA4145 PA4146     FALSE 0.035 188.000 0.000 NA   NA
 60597 60598 PA4148 PA4149     TRUE 0.986 -3.000 0.054 0.067   NA
 60598 60599 PA4149 PA4150     TRUE 0.926 23.000 0.141 0.067   NA
 60599 60600 PA4150 PA4151   acoB TRUE 0.994 33.000 0.804 0.001 Y NA
 60600 60601 PA4151 PA4152 acoB   TRUE 0.991 -3.000 0.375 1.000   NA
 60601 60602 PA4152 PA4153     TRUE 0.837 14.000 0.062 1.000   NA
 60603 60604 PA4154 PA4155     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA N NA
 60604 60605 PA4155 PA4156     TRUE 0.744 68.000 0.318 NA N NA
 60608 60609 PA4159 PA4160 fepB fepD TRUE 0.938 31.000 0.130 1.000 Y NA
 60609 60610 PA4160 PA4161 fepD fepG TRUE 0.997 -3.000 0.079 0.061 Y NA
 60612 60613 PA4163 PA4164     FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 60619 60620 PA4170 PA4171     FALSE 0.071 136.000 0.000 1.000   NA
 60620 60621 PA4171 PA4172     FALSE 0.432 23.000 0.000 1.000   NA
 60623 60624 PA4174 PA4175   prpL FALSE 0.004 535.000 0.000 1.000   NA
 60626 60627 PA4177 PA4178     FALSE 0.366 100.000 0.000 0.067   NA
 60627 60628 PA4178 PA4179     FALSE 0.020 238.000 0.000 1.000   NA
 60630 60631 PA4181 PA4182     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 60632 60633 PA4183 PA4184     FALSE 0.397 26.000 0.000 NA   NA
 60634 60635 PA4185 PA4186     TRUE 0.648 93.000 0.300 1.000 N NA
 60635 60636 PA4186 PA4187     TRUE 0.702 136.000 0.714 1.000 N NA
 60636 60637 PA4187 PA4188     TRUE 0.685 65.000 0.208 1.000 N NA
 60637 60638 PA4188 PA4189     TRUE 0.997 -7.000 0.690 0.067 N NA
 60638 60639 PA4189 PA4190   pqsL FALSE 0.316 168.000 0.000 1.000 Y NA
 60640 60641 PA4191 PA4192     TRUE 0.929 9.000 0.133 1.000   NA
 60641 60642 PA4192 PA4193     TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 60642 60643 PA4193 PA4194     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.010 Y NA
 60643 60644 PA4194 PA4195     TRUE 0.972 85.000 0.778 0.061 Y NA
 60644 60645 PA4195 PA4196     FALSE 0.356 156.000 0.000 1.000 Y NA
 60645 60646 PA4196 PA4197     TRUE 0.996 3.000 0.280 0.022 Y NA
 60647 60648 PA4198 PA4199     TRUE 0.888 118.000 0.600 1.000 Y NA
 60648 60649 PA4199 PA4200     FALSE 0.033 198.000 0.000 1.000   NA
 60650 60651 PA4201 PA4202 ddlA   FALSE 0.115 96.000 0.000 1.000   NA
 60652 60653 PA4203 PA4204     FALSE 0.125 80.000 0.000 NA N NA
 60653 60654 PA4204 PA4205   mexG FALSE 0.003 651.000 0.000 NA   NA
 60654 60655 PA4205 PA4206 mexG mexH TRUE 0.944 8.000 0.174 NA   NA
 60655 60656 PA4206 PA4207 mexH mexI TRUE 0.977 13.000 0.435 0.098 N NA
 60656 60657 PA4207 PA4208 mexI opmD TRUE 0.986 -3.000 0.080 0.098 N NA
 60659 60660 PA4210 PA4211 phzA1 phzB1 TRUE 0.802 30.000 0.000 0.003   NA
 60660 60661 PA4211 PA4212 phzB1 phzC1 FALSE 0.420 24.000 0.000 1.000   NA
 60661 60662 PA4212 PA4213 phzC1 phzD1 TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000 N NA
 60662 60663 PA4213 PA4214 phzD1 phzE1 TRUE 0.987 -3.000 0.055 0.017 N NA
 60663 60664 PA4214 PA4215 phzE1 phzF1 TRUE 0.904 14.000 0.016 0.017   NA
 60664 60666 PA4215 PA4216 phzF1 phzG1 TRUE 0.884 26.000 0.235 1.000   NA
 60666 60667 PA4216 PA4217 phzG1 phzS FALSE 0.155 238.000 0.000 1.000 Y NA
 60668 60669 PA4218 PA4219     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 60669 60670 PA4219 PA4220     FALSE 0.009 323.000 0.000 NA   NA
 60670 60671 PA4220 PA4221   fptA TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 60671 60672 PA4221 PA4222 fptA   TRUE 0.804 92.000 0.667 1.000 N NA
 60672 60673 PA4222 PA4223     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.004 Y NA
 60673 60674 PA4223 PA4224   pchG TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.074 N NA
 60674 60675 PA4224 PA4225 pchG pchF TRUE 0.993 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 60675 60676 PA4225 PA4226 pchF pchE TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 60676 60677 PA4226 PA4227 pchE pchR FALSE 0.204 194.000 0.154 1.000 N NA
 60678 60679 PA4228 PA4229 pchD pchC TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 60679 60680 PA4229 PA4230 pchC pchB TRUE 0.969 0.000 0.149 1.000 N NA
 60680 60681 PA4230 PA4231 pchB pchA TRUE 0.944 -3.000 0.027 1.000 N NA
 60682 60683 PA4232 PA4233 ssb   TRUE 0.821 17.000 0.075 1.000 N NA
 60685 60686 PA4235 PA4236 bfrA katA FALSE 0.426 131.000 0.000 1.000 Y NA
 60686 60687 PA4236 PA4237 katA rplQ FALSE 0.011 282.000 0.000 1.000 N NA
 60687 60688 PA4237 PA4238 rplQ rpoA TRUE 0.934 44.000 0.873 1.000 N NA
 60688 60689 PA4238 PA4239 rpoA rpsD TRUE 0.945 23.000 0.549 1.000 N NA
 60689 60690 PA4239 PA4240 rpsD rpsK TRUE 0.994 17.000 0.509 0.011 Y NA
 60690 60691 PA4240 PA4241 rpsK rpsM TRUE 0.996 19.000 0.810 0.009 Y NA
 60691 60692 PA4241 PA4242 rpsM rpmJ TRUE 0.813 131.000 0.086 0.009 Y NA
 60692 60693 PA4242 PA4243 rpmJ secY TRUE 0.644 29.000 0.036 1.000 N NA
 60693 60694 PA4243 PA4244 secY rplO TRUE 0.991 1.000 0.730 1.000 N NA
 60694 60695 PA4244 PA4245 rplO rpmD TRUE 0.998 4.000 0.653 0.001 Y NA
 60695 60696 PA4245 PA4246 rpmD rpsE TRUE 0.999 3.000 0.789 0.011 Y NA
 60696 60697 PA4246 PA4247 rpsE rplR TRUE 0.998 4.000 0.814 0.011 Y NA
 60697 60698 PA4247 PA4248 rplR rplF TRUE 0.998 11.000 0.815 0.009 Y NA
 60698 60699 PA4248 PA4249 rplF rpsH TRUE 0.997 12.000 0.808 0.009 Y NA
 60699 60700 PA4249 PA4250 rpsH rpsN TRUE 0.799 190.000 0.295 0.009 Y NA
 60700 60701 PA4250 PA4251 rpsN rplE TRUE 0.992 14.000 0.309 0.009 Y NA
 60701 60702 PA4251 PA4252 rplE rplX TRUE 0.995 20.000 0.758 0.009 Y NA
 60702 60703 PA4252 PA4253 rplX rplN TRUE 0.997 13.000 0.810 0.011 Y NA
 60703 60704 PA4253 PA4254 rplN rpsQ TRUE 0.994 24.000 0.791 0.011 Y NA
 60704 60705 PA4254 PA4255 rpsQ rpmC TRUE 0.999 3.000 0.828 0.009 Y NA
 60705 60706 PA4255 PA4256 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 60706 60707 PA4256 PA4257 rplP rpsC TRUE 0.997 12.000 0.828 0.011 Y NA
 60707 60708 PA4257 PA4258 rpsC rplV TRUE 0.996 13.000 0.719 0.011 Y NA
 60708 60709 PA4258 PA4259 rplV rpsS TRUE 0.997 13.000 0.769 0.011 Y NA
 60709 60710 PA4259 PA4260 rpsS rplB TRUE 0.996 17.000 0.820 0.011 Y NA
 60710 60711 PA4260 PA4261 rplB rplW TRUE 0.997 12.000 0.849 0.010 Y NA
 60711 60712 PA4261 PA4262 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 60712 60713 PA4262 PA4263 rplD rplC TRUE 0.995 14.000 0.486 0.009 Y NA
 60713 60714 PA4263 PA4264 rplC rpsJ TRUE 0.949 83.000 0.307 0.011 Y NA
 60714 60715 PA4264 PA4265 rpsJ tufA TRUE 0.747 157.000 0.318 1.000 Y NA
 60715 60716 PA4265 PA4266 tufA fusA1 TRUE 0.989 31.000 0.400 0.001 Y NA
 60716 60717 PA4266 PA4267 fusA1 rpsG TRUE 0.979 31.000 0.579 1.000 Y NA
 60717 60718 PA4267 PA4268 rpsG rpsL TRUE 0.964 100.000 0.620 0.002 Y NA
 60718 60719 PA4268 PA4269 rpsL rpoC FALSE 0.288 152.000 0.122 1.000 N NA
 60719 60720 PA4269 PA4270 rpoC rpoB TRUE 0.987 66.000 0.851 0.000 Y NA
 60720 10491238 PA4270 PA4270.1 rpoB   FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 10491238 60721 PA4270.1 PA4271   rplL TRUE 0.679 6.000 0.000 NA   NA
 60721 60722 PA4271 PA4272 rplL rplJ TRUE 0.981 79.000 0.884 0.009 Y NA
 60723 60724 PA4273 PA4274 rplA rplK TRUE 0.999 0.000 0.838 0.011 Y NA
 60724 60725 PA4274 PA4275 rplK nusG TRUE 0.740 117.000 0.681 1.000 N NA
 60725 60726 PA4275 PA4276 nusG secE TRUE 0.984 10.000 0.843 1.000 N NA
 60726 2200511 PA4276 PA4276.1 secE   FALSE 0.260 45.000 0.000 NA   NA
 2200511 60727 PA4276.1 PA4277   tufB FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 60727 2200512 PA4277 PA4277.1 tufB   FALSE 0.139 84.000 0.000 NA   NA
 2200512 2200513 PA4277.1 PA4277.2     FALSE 0.449 20.000 0.000 NA   NA
 2200513 2200514 PA4277.2 PA4277.3     FALSE 0.389 27.000 0.000 NA   NA
 2200514 60728 PA4277.3 PA4278     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 60728 60729 PA4278 PA4279     TRUE 0.793 9.000 0.012 NA   NA
 60729 60730 PA4279 PA4280   birA TRUE 0.979 -3.000 0.147 1.000 N NA
 60730 2200515 PA4280 PA4280.1 birA   FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 2200515 2200516 PA4280.1 PA4280.2     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 2200516 2200517 PA4280.2 PA4280.3     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 2200517 2200518 PA4280.3 PA4280.4     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 2200518 2200519 PA4280.4 PA4280.5     FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 60731 60732 PA4281 PA4282 sbcD   TRUE 0.994 9.000 0.669 0.001 N NA
 60733 60734 PA4283 PA4284 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 60734 60735 PA4284 PA4285 recB recC TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 60735 60736 PA4285 PA4286 recC   FALSE 0.262 41.000 0.000 1.000 N NA
 60736 60737 PA4286 PA4287     FALSE 0.092 113.000 0.000 1.000   NA
 60738 60739 PA4288 PA4289     FALSE 0.192 55.000 0.000 1.000 N NA
 60741 60742 PA4291 PA4292     FALSE 0.065 144.000 0.000 NA   NA
 60743 60744 PA4293 PA4294     TRUE 0.955 10.000 0.286 NA N NA
 60745 60746 PA4295 PA4296     TRUE 0.696 122.000 0.600 1.000 N NA
 60747 60748 PA4297 PA4298     TRUE 0.812 25.000 0.111 NA   NA
 60748 60749 PA4298 PA4299     TRUE 0.942 23.000 0.500 NA   NA
 60749 60750 PA4299 PA4300     TRUE 0.998 -3.000 0.620 1.000 Y NA
 60750 60751 PA4300 PA4301     TRUE 0.998 10.000 0.844 0.011 Y NA
 60751 60752 PA4301 PA4302     TRUE 0.999 -3.000 0.822 1.000 Y NA
 60752 60753 PA4302 PA4303     TRUE 0.999 -3.000 0.732 NA Y NA
 60753 60754 PA4303 PA4304     TRUE 0.994 10.000 0.696 NA Y NA
 60754 60755 PA4304 PA4305     TRUE 0.978 14.000 0.234 NA Y NA
 60756 60757 PA4306 PA4307   pctC FALSE 0.029 190.000 0.000 NA N NA
 60759 60760 PA4309 PA4310 pctA pctB FALSE 0.332 237.000 0.000 0.009 Y NA
 60760 60761 PA4310 PA4311 pctB   FALSE 0.009 318.000 0.000 1.000 N NA
 60761 60762 PA4311 PA4312     TRUE 0.980 -7.000 0.182 1.000   NA
 60762 60763 PA4312 PA4313     TRUE 0.969 -3.000 0.071 NA   NA
 60767 60768 PA4317 PA4318     TRUE 0.487 38.000 0.012 NA   NA
 60768 60769 PA4318 PA4319     TRUE 0.995 -3.000 0.708 NA   NA
 60769 60770 PA4319 PA4320     TRUE 0.969 -13.000 0.129 NA   NA
 60770 60771 PA4320 PA4321     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 60771 60772 PA4321 PA4322     TRUE 0.994 -3.000 0.583 NA   NA
 60772 60773 PA4322 PA4323     TRUE 0.983 -3.000 0.182 NA   NA
 60774 60775 PA4324 PA4325     FALSE 0.192 61.000 0.000 NA   NA
 60775 60776 PA4325 PA4326     FALSE 0.099 103.000 0.000 NA   NA
 60777 60778 PA4327 PA4328     FALSE 0.282 85.000 0.019 1.000   NA
 60778 60779 PA4328 PA4329   pykA FALSE 0.346 83.000 0.038 1.000 N NA
 60780 60781 PA4330 PA4331     TRUE 0.823 66.000 0.500 1.000 N NA
 60781 60782 PA4331 PA4332     TRUE 0.986 -7.000 0.286 1.000 N NA
 60784 60785 PA4334 PA4335     FALSE 0.071 136.000 0.000 1.000   NA
 60785 60786 PA4335 PA4336     TRUE 0.883 21.000 0.188 1.000   NA
 60786 60787 PA4336 PA4337     FALSE 0.183 104.000 0.010 NA   NA
 60787 60788 PA4337 PA4338     FALSE 0.115 94.000 0.000 NA   NA
 60788 60789 PA4338 PA4339     TRUE 0.525 100.000 0.000 1.000 Y NA
 60789 60790 PA4339 PA4340     TRUE 0.776 75.000 0.412 NA   NA
 60790 60791 PA4340 PA4341     FALSE 0.467 65.000 0.050 NA   NA
 60791 60792 PA4341 PA4342     FALSE 0.402 100.000 0.100 1.000 N NA
 60792 60793 PA4342 PA4343     TRUE 0.756 1.000 0.000 1.000 N NA
 60793 60794 PA4343 PA4344     FALSE 0.316 38.000 0.000 1.000   NA
 60794 60795 PA4344 PA4345     FALSE 0.048 165.000 0.000 NA   NA
 60795 60796 PA4345 PA4346     FALSE 0.192 61.000 0.000 NA   NA
 60796 60797 PA4346 PA4347     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 60797 60798 PA4347 PA4348     TRUE 0.668 29.000 0.043 1.000 N NA
 60798 60799 PA4348 PA4349     FALSE 0.141 85.000 0.000 1.000   NA
 60800 60801 PA4350 PA4351     TRUE 0.983 0.000 0.286 NA   NA
 60802 60803 PA4352 PA4353     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 60804 60805 PA4354 PA4355     FALSE 0.219 49.000 0.000 1.000 N NA
 60805 60806 PA4355 PA4356   xenB TRUE 0.700 37.000 0.080 1.000 N NA
 60807 60808 PA4357 PA4358     TRUE 0.989 0.000 0.455 NA   NA
 60808 60809 PA4358 PA4359     TRUE 0.967 18.000 0.177 1.000 Y NA
 60809 60810 PA4359 PA4360     FALSE 0.025 216.000 0.000 NA   NA
 60810 60811 PA4360 PA4361     FALSE 0.028 917.000 0.192 NA   NA
 60814 60815 PA4364 PA4365     TRUE 0.886 2.000 0.019 NA   NA
 60815 60816 PA4365 PA4366   sodB FALSE 0.016 347.000 0.009 1.000   NA
 60816 60817 PA4366 PA4367 sodB   FALSE 0.064 181.000 0.004 1.000 N NA
 60818 60819 PA4368 PA4369     TRUE 0.991 2.000 0.722 NA   NA
 60820 60821 PA4370 PA4371 icmP   TRUE 0.503 163.000 0.436 NA N NA
 60821 60822 PA4371 PA4372     TRUE 0.982 10.000 0.713 NA   NA
 60822 60823 PA4372 PA4373     TRUE 0.977 11.000 0.620 NA   NA
 60823 60824 PA4373 PA4374     FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 60824 60825 PA4374 PA4375     TRUE 0.911 51.000 0.429 0.098 N NA
 60825 60826 PA4375 PA4376   pncB2 FALSE 0.060 138.000 0.000 1.000 N NA
 60827 60828 PA4377 PA4378   inaA TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 60828 60829 PA4378 PA4379 inaA   TRUE 0.745 3.000 0.000 1.000   NA
 60829 60830 PA4379 PA4380     FALSE 0.153 80.000 0.000 1.000   NA
 60830 60831 PA4380 PA4381     TRUE 0.993 -10.000 0.133 1.000 Y NA
 60835 60836 PA4385 PA4386 groEL groES TRUE 0.961 51.000 0.177 0.005 Y NA
 60836 60837 PA4386 PA4387 groES   FALSE 0.088 195.000 0.028 1.000   NA
 60837 60838 PA4387 PA4388     FALSE 0.354 69.000 0.026 1.000   NA
 60840 60841 PA4390 PA4391     FALSE 0.429 115.000 0.154 NA   NA
 60842 60843 PA4392 PA4393     TRUE 0.716 43.000 0.120 NA   NA
 60844 60845 PA4394 PA4395     FALSE 0.049 233.000 0.021 NA   NA
 60846 60847 PA4396 PA4397   panE TRUE 0.542 37.000 0.027 1.000 N NA
 60847 60848 PA4397 PA4398 panE   TRUE 0.528 51.000 0.049 1.000 N NA
 60848 60849 PA4398 PA4399     TRUE 0.949 5.000 0.030 0.075   NA
 60850 60851 PA4400 PA4401     TRUE 0.507 51.000 0.042 1.000 N NA
 60851 60852 PA4401 PA4402   argJ FALSE 0.144 121.000 0.011 1.000 N NA
 60852 60853 PA4402 PA4403 argJ secA FALSE 0.283 147.000 0.102 1.000 N NA
 60853 60854 PA4403 PA4404 secA   FALSE 0.314 134.000 0.111 1.000 N NA
 60856 60857 PA4406 PA4407 lpxC ftsZ FALSE 0.402 113.000 0.134 1.000 N NA
 60857 60858 PA4407 PA4408 ftsZ ftsA TRUE 0.954 51.000 0.460 1.000 Y NA
 60858 60859 PA4408 PA4409 ftsA ftsQ TRUE 0.929 22.000 0.389 NA N NA
 60859 60860 PA4409 PA4410 ftsQ ddlB TRUE 0.993 4.000 0.372 NA Y NA
 60860 60861 PA4410 PA4411 ddlB murC TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 60861 60862 PA4411 PA4412 murC murG TRUE 0.996 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 60862 60863 PA4412 PA4413 murG ftsW TRUE 0.993 -10.000 0.647 1.000 N NA
 60863 60864 PA4413 PA4414 ftsW murD TRUE 0.994 0.000 0.297 0.002 N NA
 60864 60865 PA4414 PA4415 murD mraY TRUE 0.996 14.000 0.647 0.003 Y NA
 60865 60866 PA4415 PA4416 mraY murF TRUE 0.998 0.000 0.309 0.003 Y NA
 60866 60867 PA4416 PA4417 murF murE TRUE 0.999 -7.000 0.569 0.001 Y NA
 60867 60868 PA4417 PA4418 murE ftsI TRUE 0.989 0.000 0.073 1.000 Y NA
 60868 60869 PA4418 PA4419 ftsI ftsL TRUE 0.980 -3.000 0.153 1.000 N NA
 60869 60870 PA4419 PA4420 ftsL mraW TRUE 0.986 -3.000 0.227 1.000 N NA
 60870 60871 PA4420 PA4421 mraW   TRUE 0.988 3.000 0.635 NA   NA
 60873 60874 PA4423 PA4424     TRUE 0.982 -3.000 0.172 NA   NA
 60874 60875 PA4424 PA4425   gmhA TRUE 0.840 29.000 0.187 1.000 N NA
 60875 60876 PA4425 PA4426 gmhA   TRUE 0.995 -3.000 0.613 NA   NA
 60877 60878 PA4427 PA4428 sspB sspA TRUE 0.981 12.000 0.831 NA   NA
 60878 60879 PA4428 PA4429 sspA   TRUE 0.717 86.000 0.370 NA N NA
 60879 60880 PA4429 PA4430     TRUE 0.999 0.000 0.630 0.001 Y NA
 60880 60881 PA4430 PA4431     TRUE 0.998 0.000 0.233 0.001 Y NA
 60881 60882 PA4431 PA4432   rpsI FALSE 0.030 250.000 0.006 1.000 N NA
 60882 60883 PA4432 PA4433 rpsI rplM TRUE 0.995 15.000 0.601 0.008 Y NA
 60886 60887 PA4436 PA4437     FALSE 0.229 159.000 0.080 NA   NA
 60888 60889 PA4438 PA4439   trpS FALSE 0.363 95.000 0.061 NA   NA
 60889 60890 PA4439 PA4440 trpS   FALSE 0.446 68.000 0.048 1.000   NA
 60892 60893 PA4442 PA4443 cysN cysD TRUE 0.966 12.000 0.096 0.000 N NA
 60897 60898 PA4447 PA4448 hisC1 hisD TRUE 0.994 3.000 0.087 0.003 Y NA
 60898 60899 PA4448 PA4449 hisD hisG TRUE 0.900 126.000 0.254 0.003 Y NA
 60899 60900 PA4449 PA4450 hisG murA TRUE 0.854 18.000 0.123 1.000 N NA
 60900 60901 PA4450 PA4451 murA   TRUE 0.903 21.000 0.258 NA N NA
 60901 10491241 PA4451 PA4451.1     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 10491241 60902 PA4451.1 PA4452     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 60902 60903 PA4452 PA4453     TRUE 0.991 -3.000 0.353 NA   NA
 60903 60904 PA4453 PA4454     TRUE 0.882 12.000 0.091 NA   NA
 60904 60905 PA4454 PA4455     TRUE 0.989 1.000 0.562 NA   NA
 60905 60906 PA4455 PA4456     TRUE 0.997 0.000 0.530 NA Y NA
 60907 60908 PA4457 PA4458     TRUE 0.991 0.000 0.598 1.000   NA
 60908 60909 PA4458 PA4459     TRUE 0.981 9.000 0.617 NA   NA
 60909 60910 PA4459 PA4460     TRUE 0.990 -13.000 0.459 NA   NA
 60910 60911 PA4460 PA4461     TRUE 0.990 0.000 0.543 NA   NA
 60911 60912 PA4461 PA4462   rpoN FALSE 0.162 226.000 0.163 1.000   NA
 60912 60913 PA4462 PA4463 rpoN   TRUE 0.867 78.000 0.820 NA N NA
 60913 60914 PA4463 PA4464   ptsN TRUE 0.973 14.000 0.728 NA N NA
 60914 60915 PA4464 PA4465 ptsN   TRUE 0.968 2.000 0.186 NA   NA
 60915 60916 PA4465 PA4466     TRUE 0.838 30.000 0.182 NA   NA
 60917 60918 PA4467 PA4468   sodM TRUE 0.983 19.000 0.464 1.000 Y NA
 60918 60919 PA4468 PA4469 sodM   TRUE 0.884 13.000 0.107 1.000   NA
 60919 60920 PA4469 PA4470   fumC1 TRUE 0.563 28.000 0.010 1.000   NA
 60920 60921 PA4470 PA4471 fumC1   TRUE 0.959 -7.000 0.058 NA   NA
 60921 60922 PA4471 PA4472   pmbA FALSE 0.121 148.000 0.010 NA   NA
 60924 60925 PA4474 PA4475     TRUE 0.972 3.000 0.259 NA   NA
 60925 60926 PA4475 PA4476     TRUE 0.839 50.000 0.358 NA   NA
 60926 60927 PA4476 PA4477   cafA TRUE 0.937 15.000 0.296 NA   NA
 60927 60928 PA4477 PA4478 cafA   TRUE 0.901 34.000 0.417 NA N NA
 60928 60929 PA4478 PA4479   mreD TRUE 0.583 89.000 0.206 NA N NA
 60929 60930 PA4479 PA4480 mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.001 Y NA
 60930 60931 PA4480 PA4481 mreC mreB TRUE 0.843 80.000 0.689 1.000 N NA
 60932 60933 PA4482 PA4483 gatC gatA TRUE 0.997 13.000 0.643 0.001 Y NA
 60933 60934 PA4483 PA4484 gatA gatB TRUE 0.953 107.000 0.492 0.001 Y NA
 60934 60935 PA4484 PA4485 gatB   FALSE 0.331 60.000 0.010 NA   NA
 60935 60936 PA4485 PA4486     FALSE 0.346 32.000 0.000 NA   NA
 60937 60938 PA4487 PA4488     TRUE 0.967 5.000 0.273 NA   NA
 60938 60939 PA4488 PA4489     TRUE 0.988 -3.000 0.273 NA   NA
 60939 60940 PA4489 PA4490     TRUE 0.830 27.000 0.148 NA   NA
 60940 60941 PA4490 PA4491     TRUE 0.980 -3.000 0.148 NA   NA
 60941 60942 PA4491 PA4492     TRUE 0.855 39.000 0.286 NA   NA
 60942 60943 PA4492 PA4493     FALSE 0.050 163.000 0.000 NA   NA
 60943 60944 PA4493 PA4494     TRUE 0.985 26.000 0.682 1.000 Y NA
 60945 60946 PA4495 PA4496     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 60946 60947 PA4496 PA4497     TRUE 0.745 93.000 0.000 0.060 Y NA
 60949 60950 PA4499 PA4500     FALSE 0.067 266.000 0.077 1.000 N NA
 60950 60951 PA4500 PA4501     FALSE 0.097 226.000 0.000 0.072   NA
 60951 60952 PA4501 PA4502     TRUE 0.592 50.000 0.000 0.072   NA
 60952 60953 PA4502 PA4503     TRUE 0.877 68.000 0.036 0.060 Y NA
 60953 60954 PA4503 PA4504     TRUE 0.997 12.000 0.779 0.060 Y NA
 60954 60955 PA4504 PA4505     TRUE 0.959 53.000 0.560 1.000 Y NA
 60955 60956 PA4505 PA4506     TRUE 0.999 0.000 0.377 0.001 Y NA
 60959 60960 PA4509 PA4510     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 60960 60961 PA4510 PA4511     TRUE 0.996 -3.000 0.909 1.000   NA
 60963 60964 PA4513 PA4514     TRUE 0.547 216.000 0.068 0.017 Y NA
 60965 60966 PA4515 PA4516     TRUE 0.972 3.000 0.250 1.000   NA
 60966 60967 PA4516 PA4517     FALSE 0.082 123.000 0.000 1.000   NA
 60968 60969 PA4518 PA4519   speC FALSE 0.085 116.000 0.000 NA   NA
 60969 60970 PA4519 PA4520 speC   FALSE 0.004 452.000 0.000 1.000 N NA
 60970 60971 PA4520 PA4521     FALSE 0.107 190.000 0.042 1.000 N NA
 60971 60972 PA4521 PA4522   ampD TRUE 0.996 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 60972 60973 PA4522 PA4523 ampD   FALSE 0.198 151.000 0.048 NA   NA
 2200520 60975 PA4524.1 PA4525   pilA FALSE 0.155 75.000 0.000 NA   NA
 60976 60977 PA4526 PA4527 pilB pilC TRUE 0.932 104.000 0.362 0.013 Y NA
 60977 60978 PA4527 PA4528 pilC pilD TRUE 0.994 4.000 0.454 1.000 Y NA
 60978 60979 PA4528 PA4529 pilD coaE TRUE 0.977 -3.000 0.122 1.000 N NA
 60979 60980 PA4529 PA4530 coaE   TRUE 0.953 -3.000 0.033 1.000   NA
 60981 60982 PA4531 PA4532     FALSE 0.304 106.000 0.054 NA   NA
 60982 60983 PA4532 PA4533     TRUE 0.960 -3.000 0.043 NA   NA
 60983 60984 PA4533 PA4534     TRUE 0.934 -3.000 0.013 NA   NA
 60985 60986 PA4535 PA4536     TRUE 0.958 -3.000 0.039 1.000   NA
 60986 60987 PA4536 PA4537     TRUE 0.693 26.000 0.039 NA   NA
 60987 60988 PA4537 PA4538   ndh TRUE 0.875 64.000 0.667 NA   NA
 60990 60991 PA4540 PA4541     TRUE 0.918 49.000 0.750 NA   NA
 2200521 2200522 PA4541.1 PA4541.2     TRUE 0.595 11.000 0.000 NA   NA
 2200522 2200523 PA4541.2 PA4541.3     TRUE 0.621 10.000 0.000 NA   NA
 2200523 60992 PA4541.3 PA4542   clpB FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 60992 60993 PA4542 PA4543 clpB   FALSE 0.267 156.000 0.108 NA   NA
 60993 60994 PA4543 PA4544   rluD TRUE 0.982 -3.000 0.168 NA   NA
 60995 60996 PA4545 PA4546 comL pilS FALSE 0.006 392.000 0.000 NA   NA
 60996 60997 PA4546 PA4547 pilS pilR TRUE 0.994 15.000 0.556 0.074 Y NA
 60999 61000 PA4549 PA4550 fimT fimU TRUE 0.911 106.000 0.667 NA Y NA
 61000 61001 PA4550 PA4551 fimU pilV TRUE 0.997 -9.000 0.500 NA Y NA
 61001 61002 PA4551 PA4552 pilV pilW TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA Y NA
 61002 61003 PA4552 PA4553 pilW pilX TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 61003 61004 PA4553 PA4554 pilX pilY1 TRUE 0.966 12.000 0.077 NA Y NA
 61004 61005 PA4554 PA4555 pilY1 pilY2 TRUE 0.917 2.000 0.038 NA   NA
 61005 61006 PA4555 PA4556 pilY2 pilE TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 61007 61008 PA4557 PA4558 lytB   TRUE 0.813 86.000 0.626 1.000 N NA
 61008 61009 PA4558 PA4559   lspA TRUE 0.990 -7.000 0.417 1.000 N NA
 61009 61010 PA4559 PA4560 lspA ileS TRUE 0.975 -7.000 0.147 1.000 N NA
 61010 61011 PA4560 PA4561 ileS ribF TRUE 0.891 24.000 0.254 1.000 N NA
 61011 61012 PA4561 PA4562 ribF   TRUE 0.514 97.000 0.169 1.000   NA
 61014 61015 PA4564 PA4565   proB TRUE 0.751 12.000 0.017 NA   NA
 61015 61016 PA4565 PA4566 proB obg TRUE 0.664 71.000 0.206 1.000   NA
 61016 61017 PA4566 PA4567 obg rpmA TRUE 0.535 142.000 0.335 1.000   NA
 61017 61018 PA4567 PA4568 rpmA rplU TRUE 0.994 24.000 0.667 0.008 Y NA
 61019 61020 PA4569 PA4570 ispB   FALSE 0.124 138.000 0.007 NA   NA
 61020 61021 PA4570 PA4571     FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 61022 61023 PA4572 PA4573 fklB   FALSE 0.367 85.000 0.043 NA   NA
 61023 61024 PA4573 PA4574     FALSE 0.054 257.000 0.041 NA   NA
 61024 61025 PA4574 PA4575     FALSE 0.192 174.000 0.082 NA   NA
 61025 61026 PA4575 PA4576     FALSE 0.311 151.000 0.132 NA   NA
 61026 61027 PA4576 PA4577     FALSE 0.246 99.000 0.029 1.000 N NA
 61028 61029 PA4578 PA4579     TRUE 0.657 59.000 0.149 NA   NA
 61030 61031 PA4580 PA4581   rtcR FALSE 0.209 56.000 0.000 NA   NA
 2200524 61032 PA4581.1 PA4582     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 61032 61033 PA4582 PA4583     TRUE 0.680 56.000 0.155 NA   NA
 61033 61034 PA4583 PA4584     TRUE 0.784 37.000 0.154 NA   NA
 61034 61035 PA4584 PA4585   rtcA TRUE 0.963 -3.000 0.052 NA   NA
 61035 61036 PA4585 PA4586 rtcA   FALSE 0.100 102.000 0.000 NA   NA
 61036 61037 PA4586 PA4587   ccpR FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 61038 61039 PA4588 PA4589 gdhA   FALSE 0.010 296.000 0.000 1.000 N NA
 61039 61040 PA4589 PA4590   pra FALSE 0.044 260.000 0.031 NA   NA
 61040 61041 PA4590 PA4591 pra   FALSE 0.004 597.000 0.000 NA   NA
 61041 61042 PA4591 PA4592     TRUE 0.996 -10.000 0.333 1.000 Y NA
 61042 61043 PA4592 PA4593     TRUE 0.988 -7.000 0.333 1.000 N NA
 61043 61044 PA4593 PA4594     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 61044 61045 PA4594 PA4595     FALSE 0.025 504.000 0.000 0.014   NA
 61047 61048 PA4597 PA4598 oprJ mexD TRUE 0.990 6.000 0.529 0.060 N NA
 61048 61049 PA4598 PA4599 mexD mexC TRUE 0.951 28.000 0.706 1.000 N NA
 61050 61051 PA4600 PA4601 nfxB morA FALSE 0.070 244.000 0.000 0.096   NA
 61051 61052 PA4601 PA4602 morA glyA3 TRUE 0.565 123.000 0.333 1.000 N NA
 61053 61054 PA4603 PA4604     FALSE 0.421 23.000 0.000 NA   NA
 61054 61055 PA4604 PA4605     FALSE 0.394 60.000 0.025 NA   NA
 61055 61056 PA4605 PA4606     TRUE 0.651 49.000 0.094 NA   NA
 61056 61057 PA4606 PA4607     FALSE 0.009 337.000 0.000 NA   NA
 61061 61062 PA4611 PA4612     FALSE 0.155 75.000 0.000 NA   NA
 61062 61063 PA4612 PA4613   katB TRUE 0.771 54.000 0.250 NA   NA
 61065 61066 PA4615 PA4616     FALSE 0.083 107.000 0.000 1.000 N NA
 61068 61069 PA4618 PA4619     TRUE 0.933 4.000 0.097 NA N NA
 61069 61070 PA4619 PA4620     TRUE 0.998 3.000 0.452 0.018 Y NA
 61070 61071 PA4620 PA4621     TRUE 0.997 -7.000 0.167 0.058 Y NA
 61073 61074 PA4623 PA4624     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 61074 61075 PA4624 PA4625     FALSE 0.185 63.000 0.000 NA   NA
 61076 61077 PA4626 PA4627 hprA   FALSE 0.255 110.000 0.042 1.000 N NA
 61077 61078 PA4627 PA4628   lysP FALSE 0.231 95.000 0.021 1.000 N NA
 61078 61079 PA4628 PA4629 lysP   FALSE 0.008 353.000 0.000 1.000   NA
 61079 61080 PA4629 PA4630     FALSE 0.155 117.000 0.008 NA   NA
 61081 61082 PA4631 PA4632     FALSE 0.057 144.000 0.000 1.000 N NA
 61085 61086 PA4635 PA4636     FALSE 0.004 556.000 0.000 1.000   NA
 61087 61088 PA4637 PA4638     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 61088 61089 PA4638 PA4639     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 2200525 61091 PA4641 PA4642     FALSE 0.016 256.000 0.000 NA   NA
 61091 61092 PA4642 PA4643     TRUE 0.673 83.000 0.261 NA   NA
 61092 61093 PA4643 PA4644     TRUE 0.597 68.000 0.138 NA   NA
 61093 61094 PA4644 PA4645     TRUE 0.913 2.000 0.036 NA   NA
 61095 61096 PA4646 PA4647 upp uraA TRUE 0.986 3.000 0.101 1.000 Y NA
 61096 61097 PA4647 PA4648 uraA   FALSE 0.009 334.000 0.000 NA   NA
 61097 61098 PA4648 PA4649     TRUE 0.839 31.000 0.192 NA   NA
 61098 61099 PA4649 PA4650     TRUE 0.993 0.000 0.714 NA   NA
 61099 61100 PA4650 PA4651     TRUE 0.901 19.000 0.219 NA   NA
 61100 61101 PA4651 PA4652     TRUE 0.992 17.000 0.879 NA Y NA
 61101 61102 PA4652 PA4653     TRUE 0.998 -3.000 0.848 0.059   NA
 61103 61104 PA4654 PA4655   hemH FALSE 0.011 280.000 0.000 1.000 N NA
 61104 61105 PA4655 PA4656 hemH   TRUE 0.942 -3.000 0.020 1.000   NA
 61106 61107 PA4657 PA4658     FALSE 0.125 153.000 0.017 NA   NA
 61107 61108 PA4658 PA4659     TRUE 0.899 10.000 0.083 NA   NA
 61108 61109 PA4659 PA4660   phr TRUE 0.933 -3.000 0.017 1.000 N NA
 61110 61111 PA4661 PA4662 pagL murI FALSE 0.073 134.000 0.000 1.000   NA
 61111 61112 PA4662 PA4663 murI moeB TRUE 0.906 -10.000 0.013 1.000 N NA
 61112 61113 PA4663 PA4664 moeB hemK TRUE 0.963 -6.000 0.068 1.000 N NA
 61113 61114 PA4664 PA4665 hemK prfA TRUE 0.992 2.000 0.229 1.000 Y NA
 61114 61115 PA4665 PA4666 prfA hemA TRUE 0.948 18.000 0.171 0.029 N NA
 61116 61117 PA4667 PA4668   lolB TRUE 0.703 5.000 0.000 1.000   NA
 61117 61118 PA4668 PA4669 lolB ipk TRUE 0.938 2.000 0.072 1.000 N NA
 61118 2200526 PA4669 PA4669.1 ipk   FALSE 0.321 36.000 0.000 NA   NA
 2200526 61119 PA4669.1 PA4670   prs FALSE 0.205 57.000 0.000 NA   NA
 61119 61120 PA4670 PA4671 prs   FALSE 0.375 117.000 0.122 1.000 N NA
 61120 61121 PA4671 PA4672     TRUE 0.984 42.000 0.496 0.013 Y NA
 61121 61122 PA4672 PA4673     TRUE 0.932 41.000 0.184 1.000 Y NA
 61122 2200527 PA4673 PA4673.1     FALSE 0.039 179.000 0.000 NA   NA
 61125 61126 PA4676 PA4677     FALSE 0.169 62.000 0.000 1.000 N NA
 61126 61127 PA4677 PA4678   rimI FALSE 0.032 199.000 0.000 1.000   NA
 61127 61128 PA4678 PA4679 rimI   TRUE 0.947 -3.000 0.027 NA   NA
 61128 61129 PA4679 PA4680     FALSE 0.015 260.000 0.000 NA   NA
 61129 61130 PA4680 PA4681     TRUE 0.961 31.000 1.000 NA   NA
 61130 61131 PA4681 PA4682     TRUE 0.992 2.000 0.800 NA   NA
 61131 61132 PA4682 PA4683     FALSE 0.349 205.000 0.400 NA   NA
 61133 61134 PA4684 PA4685     TRUE 0.995 -10.000 0.947 NA   NA
 61134 61135 PA4685 PA4686     TRUE 0.997 -3.000 0.950 NA   NA
 61135 61136 PA4686 PA4687   hitA FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 61136 61137 PA4687 PA4688 hitA hitB TRUE 0.992 21.000 0.529 0.059 Y NA
 61138 2200528 PA4689 PA4690     TRUE 0.842 -7.000 0.000 NA   NA
 2200528 2200529 PA4690 PA4690.1     FALSE 0.032 195.000 0.000 NA   NA
 2200529 2200530 PA4690.1 PA4690.2     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 2200530 2200531 PA4690.2 PA4690.3     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 2200531 2200532 PA4690.3 PA4690.4     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 2200532 2200533 PA4690.4 PA4690.5     FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 2200533 61139 PA4690.5 PA4691     FALSE 0.004 544.000 0.000 NA   NA
 61139 61140 PA4691 PA4692     TRUE 0.997 0.000 0.790 0.057   NA
 61140 61141 PA4692 PA4693   pssA FALSE 0.413 61.000 0.029 1.000   NA
 61141 61142 PA4693 PA4694 pssA ilvC FALSE 0.165 155.000 0.041 1.000 N NA
 61142 61143 PA4694 PA4695 ilvC ilvH TRUE 0.962 43.000 0.092 0.001 Y NA
 61143 61144 PA4695 PA4696 ilvH ilvI TRUE 0.998 3.000 0.371 0.001 Y NA
 61146 61147 PA4698 PA4699     TRUE 0.946 0.000 0.055 NA   NA
 61147 61148 PA4699 PA4700   mrcB TRUE 0.757 17.000 0.035 1.000   NA
 61149 61150 PA4701 PA4702     FALSE 0.244 92.000 0.018 NA   NA
 61150 61151 PA4702 PA4703     FALSE 0.295 226.000 0.400 NA   NA
 61151 61152 PA4703 PA4704     TRUE 0.561 105.000 0.250 NA   NA
 61152 2200534 PA4704 PA4704.1   PrrF1 FALSE 0.218 54.000 0.000 NA   NA
 2200534 2200535 PA4704.1 PA4704.2 PrrF1 PrrF2 FALSE 0.188 62.000 0.000 NA   NA
 61153 61154 PA4705 PA4706     TRUE 0.803 11.000 0.027 NA   NA
 61154 61155 PA4706 PA4707     TRUE 0.987 0.000 0.053 1.000 Y NA
 61155 61156 PA4707 PA4708     TRUE 0.974 51.000 0.852 1.000 Y NA
 61156 61157 PA4708 PA4709     TRUE 0.990 10.000 0.384 1.000 Y NA
 61158 61159 PA4710 PA4711 phuR   TRUE 0.511 103.000 0.000 1.000 Y NA
 61159 61160 PA4711 PA4712     FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 61164 61165 PA4716 PA4717     FALSE 0.175 68.000 0.000 1.000   NA
 61167 61168 PA4719 PA4720   trmA TRUE 0.967 -3.000 0.062 1.000   NA
 61169 61170 PA4721 PA4722     TRUE 0.934 0.000 0.038 NA   NA
 61171 61172 PA4723 PA4724 dksA   TRUE 0.685 68.000 0.231 1.000 N NA
 61172 61173 PA4724 PA4725   cbrA FALSE 0.113 230.000 0.006 0.073 N NA
 61173 61174 PA4725 PA4726 cbrA cbrB TRUE 0.961 27.000 0.453 0.073 N NA
 61174 10491242 PA4726 PA4726.1 cbrB   TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 61175 61176 PA4727 PA4728 pcnB folK TRUE 0.986 -3.000 0.234 1.000 N NA
 61176 61177 PA4728 PA4729 folK panB FALSE 0.312 250.000 0.117 1.000 Y NA
 61177 61178 PA4729 PA4730 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 61178 61179 PA4730 PA4731 panC panD TRUE 0.877 94.000 0.342 1.000 Y NA
 61179 61180 PA4731 PA4732 panD pgi FALSE 0.193 90.000 0.004 1.000 N NA
 61180 61181 PA4732 PA4733 pgi acsB FALSE 0.197 194.000 0.146 1.000 N NA
 61181 61182 PA4733 PA4734 acsB   FALSE 0.403 98.000 0.088 NA   NA
 61182 61183 PA4734 PA4735     FALSE 0.077 125.000 0.000 NA   NA
 61183 61184 PA4735 PA4736     TRUE 0.896 5.000 0.046 NA   NA
 61184 61185 PA4736 PA4737     TRUE 0.805 96.000 0.714 NA   NA
 61186 61187 PA4738 PA4739     TRUE 0.713 50.000 0.156 NA   NA
 61187 61188 PA4739 PA4740   pnp FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 61188 61189 PA4740 PA4741 pnp rpsO TRUE 0.706 174.000 0.335 1.000 Y NA
 61189 61190 PA4741 PA4742 rpsO truB TRUE 0.823 96.000 0.211 1.000 Y NA
 61190 61191 PA4742 PA4743 truB rbfA TRUE 0.993 3.000 0.318 1.000 Y NA
 61191 61192 PA4743 PA4744 rbfA infB TRUE 0.894 103.000 0.530 1.000 Y NA
 61192 61193 PA4744 PA4745 infB nusA TRUE 0.906 28.000 0.342 1.000 N NA
 61193 61194 PA4745 PA4746 nusA   TRUE 0.925 45.000 0.759 NA   NA
 61194 2200536 PA4746 PA4746.1     FALSE 0.076 126.000 0.000 NA   NA
 2200536 2200537 PA4746.1 PA4746.2     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 2200537 61195 PA4746.2 PA4747   secG TRUE 0.511 15.000 0.000 NA   NA
 61195 61196 PA4747 PA4748 secG tpiA TRUE 0.961 3.000 0.184 1.000 N NA
 61196 61197 PA4748 PA4749 tpiA glmM TRUE 0.829 66.000 0.082 1.000 Y NA
 61197 61198 PA4749 PA4750 glmM folP TRUE 0.919 17.000 0.260 1.000 N NA
 61198 61199 PA4750 PA4751 folP ftsH TRUE 0.960 10.000 0.325 1.000 N NA
 61199 61200 PA4751 PA4752 ftsH ftsJ FALSE 0.122 199.000 0.066 NA N NA
 61202 61203 PA4754 PA4755   greA TRUE 0.595 11.000 0.000 NA   NA
 61203 61204 PA4755 PA4756 greA carB TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000 N NA
 61204 61205 PA4756 PA4757 carB   TRUE 0.926 20.000 0.030 1.000 Y NA
 61205 61206 PA4757 PA4758   carA TRUE 0.951 12.000 0.026 1.000 Y NA
 61206 10491244 PA4758 PA4758.1 carA   FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 10491244 61207 PA4758.1 PA4759   dapB FALSE 0.397 26.000 0.000 NA   NA
 61207 61208 PA4759 PA4760 dapB dnaJ FALSE 0.461 57.000 0.041 1.000 N NA
 61208 61209 PA4760 PA4761 dnaJ dnaK TRUE 0.908 116.000 0.236 0.002 Y NA
 61209 61210 PA4761 PA4762 dnaK grpE TRUE 0.869 90.000 0.049 0.005 Y NA
 61214 61215 PA4766 PA4767     TRUE 0.967 -7.000 0.086 NA   NA
 61218 61219 PA4770 PA4771 lldP lldD TRUE 0.527 155.000 0.055 1.000 Y NA
 61219 61220 PA4771 PA4772 lldD   TRUE 0.927 67.000 0.145 0.057 Y NA
 61220 61221 PA4772 PA4773     FALSE 0.008 328.000 0.000 1.000 N NA
 61221 61222 PA4773 PA4774     TRUE 0.628 78.000 0.000 1.000 Y NA
 61222 61223 PA4774 PA4775     TRUE 0.737 3.000 0.000 NA   NA
 61223 61224 PA4775 PA4776   pmrA TRUE 0.544 13.000 0.000 NA   NA
 61224 61225 PA4776 PA4777 pmrA pmrB TRUE 0.952 24.000 0.143 1.000 Y NA
 61225 61226 PA4777 PA4778 pmrB   FALSE 0.165 64.000 0.000 1.000 N NA
 61227 61228 PA4779 PA4780     FALSE 0.130 90.000 0.000 1.000   NA
 61228 61229 PA4780 PA4781     FALSE 0.445 124.000 0.000 1.000 Y NA
 61229 61230 PA4781 PA4782     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 61230 61231 PA4782 PA4783     FALSE 0.333 34.000 0.000 NA   NA
 61236 61237 PA4788 PA4789     FALSE 0.357 82.000 0.036 NA   NA
 61237 61238 PA4789 PA4790     TRUE 0.973 -3.000 0.088 NA   NA
 61238 61239 PA4790 PA4791     TRUE 0.545 66.000 0.087 NA   NA
 61241 61242 PA4793 PA4794     TRUE 0.941 2.000 0.071 NA   NA
 61242 61243 PA4794 PA4795     TRUE 0.826 -10.000 0.000 NA   NA
 61243 61244 PA4795 PA4796     TRUE 0.985 -3.000 0.214 NA   NA
 61247 61248 PA4799 PA4800     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 61248 61249 PA4800 PA4801     FALSE 0.011 296.000 0.000 NA   NA
 2200538 61251 PA4802.1 PA4803     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 61251 61252 PA4803 PA4804     FALSE 0.117 95.000 0.000 1.000   NA
 61252 61253 PA4804 PA4805     FALSE 0.219 49.000 0.000 1.000 N NA
 61255 61256 PA4807 PA4808 selB selA TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.000 N NA
 61256 61257 PA4808 PA4809 selA fdhE FALSE 0.475 79.000 0.083 1.000 N NA
 61257 61258 PA4809 PA4810 fdhE fdnI FALSE 0.294 133.000 0.091 1.000 N NA
 61258 61259 PA4810 PA4811 fdnI fdnH TRUE 0.976 72.000 0.538 0.001 Y NA
 61259 2200539 PA4811 PA4812 fdnH fdnG TRUE 0.993 9.000 0.128 0.001 Y NA
 2200539 61260 PA4812 PA4813 fdnG lipC FALSE 0.011 308.000 0.000 1.000   NA
 61261 61262 PA4814 PA4815 fadH2   FALSE 0.027 209.000 0.000 NA   NA
 61262 61263 PA4815 PA4816     FALSE 0.054 157.000 0.000 NA   NA
 61263 61264 PA4816 PA4817     TRUE 0.805 -24.000 0.000 NA   NA
 61265 61266 PA4818 PA4819     TRUE 0.996 -3.000 0.222 NA Y NA
 61266 61267 PA4819 PA4820     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 61269 61270 PA4822 PA4823     FALSE 0.272 43.000 0.000 NA   NA
 61270 61271 PA4823 PA4824     FALSE 0.230 51.000 0.000 NA   NA
 61271 61272 PA4824 PA4825   mgtA FALSE 0.107 98.000 0.000 NA   NA
 61272 61273 PA4825 PA4826 mgtA   FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 61273 61274 PA4826 PA4827     FALSE 0.009 330.000 0.000 NA   NA
 61277 61278 PA4830 PA4831     TRUE 0.553 68.000 0.115 NA N NA
 61281 61282 PA4834 PA4835     TRUE 0.810 -18.000 0.000 NA   NA
 61282 61283 PA4835 PA4836     TRUE 0.990 -3.000 0.312 NA   NA
 61283 61284 PA4836 PA4837     FALSE 0.371 30.000 0.000 1.000   NA
 61286 61287 PA4839 PA4840 speA   FALSE 0.041 250.000 0.023 1.000 N NA
 61287 61288 PA4840 PA4841     FALSE 0.061 204.000 0.017 1.000 N NA
 61288 61289 PA4841 PA4842     TRUE 0.938 4.000 0.101 NA   NA
 61290 61291 PA4843 PA4844     TRUE 0.908 78.000 0.350 1.000 Y NA
 61291 61292 PA4844 PA4845   dipZ FALSE 0.174 160.000 0.000 0.095 N NA
 61292 61293 PA4845 PA4846 dipZ aroQ1 FALSE 0.105 144.000 0.004 1.000 N NA
 61293 61294 PA4846 PA4847 aroQ1 accB TRUE 0.891 24.000 0.254 1.000 N NA
 61294 61295 PA4847 PA4848 accB accC TRUE 0.991 18.000 0.275 0.001 Y NA
 61295 61296 PA4848 PA4849 accC   FALSE 0.094 111.000 0.000 1.000   NA
 61296 61297 PA4849 PA4850   prmA FALSE 0.151 81.000 0.000 1.000   NA
 61297 61298 PA4850 PA4851 prmA   FALSE 0.191 96.000 0.006 NA   NA
 61298 61299 PA4851 PA4852     FALSE 0.051 204.000 0.003 NA   NA
 61299 61300 PA4852 PA4853   fis TRUE 0.981 -3.000 0.161 1.000 N NA
 61300 61301 PA4853 PA4854 fis purH TRUE 0.501 80.000 0.101 1.000 N NA
 61301 61302 PA4854 PA4855 purH purD TRUE 0.814 104.000 0.238 1.000 Y NA
 61302 61303 PA4855 PA4856 purD retS FALSE 0.403 104.000 0.010 0.073 N NA
 61303 61304 PA4856 PA4857 retS   FALSE 0.011 456.000 0.020 NA N NA
 61304 61305 PA4857 PA4858     FALSE 0.005 425.000 0.000 NA N NA
 61305 61306 PA4858 PA4859     FALSE 0.236 783.000 0.654 1.000 Y NA
 61306 61307 PA4859 PA4860     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.059 Y NA
 61307 61308 PA4860 PA4861     TRUE 0.996 -3.000 0.823 1.000   NA
 61308 61309 PA4861 PA4862     TRUE 0.850 137.000 0.731 0.013   NA
 61309 61310 PA4862 PA4863     FALSE 0.144 84.000 0.000 1.000   NA
 61310 61311 PA4863 PA4864   ureD TRUE 0.651 9.000 0.000 1.000   NA
 61311 61312 PA4864 PA4865 ureD ureA TRUE 0.996 2.000 0.664 0.001 N NA
 61312 61313 PA4865 PA4866 ureA   TRUE 0.610 9.000 0.000 1.000 N NA
 61313 61314 PA4866 PA4867   ureB FALSE 0.453 17.000 0.000 1.000 N NA
 61314 61315 PA4867 PA4868 ureB ureC TRUE 0.978 63.000 0.486 0.001 Y NA
 61315 61316 PA4868 PA4869 ureC   FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 61322 61323 PA4875 PA4876   osmE FALSE 0.132 89.000 0.000 1.000   NA
 61327 61328 PA4880 PA4881     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 61329 61330 PA4882 PA4883     TRUE 0.996 -3.000 0.429 0.057   NA
 61330 61331 PA4883 PA4884     TRUE 0.880 54.000 0.583 NA   NA
 61332 61333 PA4885 PA4886 irlR   TRUE 0.999 -21.000 0.889 0.002 Y NA
 61334 61335 PA4887 PA4888     FALSE 0.021 220.000 0.000 1.000 N NA
 61335 61336 PA4888 PA4889     TRUE 0.980 -3.000 0.154 1.000 N NA
 61337 61338 PA4890 PA4891   ureE FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 61338 61339 PA4891 PA4892 ureE ureF TRUE 0.999 -3.000 0.560 0.001 Y NA
 61339 61340 PA4892 PA4893 ureF ureG TRUE 0.997 11.000 0.550 0.001 Y NA
 61340 61341 PA4893 PA4894 ureG   TRUE 0.920 30.000 0.068 NA Y NA
 61342 61343 PA4895 PA4896     TRUE 0.984 -7.000 0.250 NA N NA
 61345 61346 PA4898 PA4899     TRUE 0.555 108.000 0.250 1.000   NA
 61346 61347 PA4899 PA4900     TRUE 0.894 23.000 0.250 1.000 N NA
 61347 61348 PA4900 PA4901   mdlC TRUE 0.601 87.000 0.211 1.000 N NA
 61351 61352 PA4904 PA4905 vanA vanB TRUE 0.945 15.000 0.128 0.057 N NA
 61353 61354 PA4906 PA4907     FALSE 0.190 64.000 0.000 1.000   NA
 61354 61355 PA4907 PA4908     FALSE 0.008 357.000 0.000 1.000   NA
 61355 61356 PA4908 PA4909     TRUE 0.647 71.000 0.000 1.000 Y NA
 61356 61357 PA4909 PA4910     TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.013 Y NA
 61357 61358 PA4910 PA4911     TRUE 0.997 -3.000 0.268 1.000 Y NA
 61358 61359 PA4911 PA4912     TRUE 0.993 11.000 0.263 0.058 Y NA
 61359 61360 PA4912 PA4913     FALSE 0.398 235.000 0.175 1.000 Y NA
 61361 61362 PA4914 PA4915     FALSE 0.184 57.000 0.000 1.000 N NA
 61363 61364 PA4916 PA4917     TRUE 0.479 15.000 0.000 1.000 N NA
 61365 61366 PA4918 PA4919   pncB1 TRUE 0.916 3.000 0.053 1.000 N NA
 61366 61367 PA4919 PA4920 pncB1 nadE TRUE 0.903 29.000 0.033 1.000 Y NA
 61367 61368 PA4920 PA4921 nadE   FALSE 0.062 134.000 0.000 1.000 N NA
 61371 61372 PA4924 PA4925     FALSE 0.260 187.000 0.000 1.000 Y NA
 61372 61373 PA4925 PA4926     FALSE 0.014 251.000 0.000 NA N NA
 61373 61374 PA4926 PA4927     TRUE 0.993 0.000 0.734 NA   NA
 61374 61375 PA4927 PA4928     FALSE 0.015 262.000 0.000 NA   NA
 61377 61378 PA4930 PA4931 alr dnaB FALSE 0.313 69.000 0.020 1.000 N NA
 61378 61379 PA4931 PA4932 dnaB rplI FALSE 0.279 129.000 0.074 1.000 N NA
 61379 61380 PA4932 PA4933 rplI   TRUE 0.706 22.000 0.034 NA   NA
 61380 61381 PA4933 PA4934   rpsR TRUE 0.594 37.000 0.034 NA   NA
 61381 61382 PA4934 PA4935 rpsR rpsF TRUE 0.986 30.000 0.319 0.008 Y NA
 61382 61383 PA4935 PA4936 rpsF   FALSE 0.259 215.000 0.017 1.000 Y NA
 61383 61384 PA4936 PA4937   rnr TRUE 0.992 -3.000 0.147 0.009 N NA
 2200540 2200541 PA4937.1 PA4937.2     FALSE 0.073 130.000 0.000 NA   NA
 61385 61386 PA4938 PA4939 purA   TRUE 0.697 52.000 0.161 1.000 N NA
 61386 61387 PA4939 PA4940     TRUE 0.763 35.000 0.117 NA   NA
 61387 61388 PA4940 PA4941   hflC TRUE 0.672 96.000 0.348 NA   NA
 61388 61389 PA4941 PA4942 hflC hflK TRUE 0.999 0.000 0.947 0.007 Y NA
 61389 61390 PA4942 PA4943 hflK   TRUE 0.727 95.000 0.184 0.064   NA
 61390 61391 PA4943 PA4944   hfq TRUE 0.900 13.000 0.141 1.000   NA
 61391 61392 PA4944 PA4945 hfq miaA TRUE 0.716 106.000 0.531 1.000   NA
 61392 61393 PA4945 PA4946 miaA mutL TRUE 0.830 58.000 0.188 0.073 N NA
 61393 61394 PA4946 PA4947 mutL amiB TRUE 0.921 0.000 0.030 1.000 N NA
 61394 61395 PA4947 PA4948 amiB   TRUE 0.848 9.000 0.033 NA   NA
 61395 61396 PA4948 PA4949     TRUE 0.968 -12.000 0.118 NA   NA
 61400 61401 PA4953 PA4954 motB motA TRUE 0.989 20.000 0.722 1.000 Y NA
 61402 61403 PA4955 PA4956   rhdA TRUE 0.596 75.000 0.156 NA   NA
 61403 61404 PA4956 PA4957 rhdA psd TRUE 0.943 4.000 0.125 1.000 N NA
 61404 61405 PA4957 PA4958 psd   FALSE 0.009 678.000 0.023 NA   NA
 61405 61406 PA4958 PA4959     TRUE 0.801 65.000 0.400 NA   NA
 61408 61409 PA4961 PA4962     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 61410 61411 PA4963 PA4964   parC FALSE 0.024 293.000 0.012 NA   NA
 61411 61412 PA4964 PA4965 parC   TRUE 0.816 8.000 0.016 1.000   NA
 61412 61413 PA4965 PA4966     TRUE 0.990 -3.000 0.086 0.022   NA
 61413 61414 PA4966 PA4967   parE TRUE 0.912 0.000 0.019 1.000   NA
 61414 61415 PA4967 PA4968 parE   TRUE 0.933 12.000 0.217 NA   NA
 61415 61416 PA4968 PA4969     TRUE 0.599 132.000 0.427 NA   NA
 61416 61417 PA4969 PA4970     TRUE 0.543 154.000 0.433 NA   NA
 61417 61418 PA4970 PA4971   aspP TRUE 0.990 -9.000 0.443 NA   NA
 61422 61423 PA4975 PA4976   aspC TRUE 0.683 51.000 0.130 1.000   NA
 61423 61424 PA4976 PA4977 aspC   TRUE 0.956 23.000 0.154 1.000 Y NA
 61424 61425 PA4977 PA4978     TRUE 0.807 42.000 0.231 1.000 N NA
 61425 61426 PA4978 PA4979     TRUE 0.870 67.000 0.714 1.000 N NA
 61426 61427 PA4979 PA4980     TRUE 0.981 21.000 0.429 1.000 Y NA
 61427 61428 PA4980 PA4981     FALSE 0.014 259.000 0.000 1.000 N NA
 61428 61429 PA4981 PA4982     FALSE 0.307 184.000 0.250 1.000 N NA
 61429 61430 PA4982 PA4983     TRUE 0.924 33.000 0.000 0.017 Y NA
 61430 61431 PA4983 PA4984     TRUE 0.814 118.000 0.125 0.094 Y NA
 61431 61432 PA4984 PA4985     FALSE 0.136 77.000 0.000 1.000 N NA
 61433 61434 PA4986 PA4987     TRUE 0.766 78.000 0.400 1.000   NA
 61435 61436 PA4988 PA4989 waaA   TRUE 0.557 36.000 0.028 1.000 N NA
 61437 61438 PA4990 PA4991     TRUE 0.807 61.000 0.400 1.000 N NA
 61438 61439 PA4991 PA4992     TRUE 0.999 -3.000 0.441 0.039 Y NA
 61439 61440 PA4992 PA4993     FALSE 0.423 169.000 0.324 1.000   NA
 61441 61442 PA4994 PA4995     TRUE 0.985 49.000 0.604 0.006 Y NA
 61442 61443 PA4995 PA4996   rfaE FALSE 0.124 128.000 0.006 1.000 N NA
 61443 61444 PA4996 PA4997 rfaE msbA TRUE 0.495 41.000 0.023 1.000 N NA
 61445 61446 PA4998 PA4999   waaL TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 61447 61448 PA5000 PA5001     FALSE 0.052 161.000 0.000 NA   NA
 61448 61449 PA5001 PA5002     TRUE 0.748 73.000 0.333 NA   NA
 61449 61450 PA5002 PA5003     TRUE 0.959 4.000 0.188 NA   NA
 61450 61451 PA5003 PA5004     TRUE 0.988 -6.000 0.312 NA   NA
 61451 61452 PA5004 PA5005     TRUE 0.995 -16.000 0.409 0.017 N NA
 61452 61453 PA5005 PA5006     FALSE 0.342 104.000 0.067 1.000   NA
 61453 61454 PA5006 PA5007     TRUE 0.993 -3.000 0.095 0.001   NA
 61454 61455 PA5007 PA5008     TRUE 0.993 -3.000 0.133 0.003   NA
 61455 61456 PA5008 PA5009   waaP TRUE 0.989 0.000 0.133 0.003   NA
 61456 61457 PA5009 PA5010 waaP waaG TRUE 0.987 -3.000 0.241 1.000   NA
 61457 61458 PA5010 PA5011 waaG waaC TRUE 0.996 -3.000 0.217 1.000 Y NA
 61458 61459 PA5011 PA5012 waaC waaF TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 61459 61460 PA5012 PA5013 waaF ilvE FALSE 0.423 60.000 0.034 1.000 N NA
 61460 61461 PA5013 PA5014 ilvE glnE TRUE 0.571 56.000 0.078 1.000 N NA
 61462 61463 PA5015 PA5016 aceE aceF TRUE 0.685 145.000 0.167 1.000 Y NA
 61463 61464 PA5016 PA5017 aceF   FALSE 0.005 418.000 0.000 1.000 N NA
 61464 61465 PA5017 PA5018   msrA FALSE 0.273 94.000 0.032 1.000 N NA
 61467 61468 PA5020 PA5021     FALSE 0.040 293.000 0.046 1.000 N NA
 61468 61469 PA5021 PA5022     TRUE 0.700 92.000 0.379 1.000 N NA
 61469 61470 PA5022 PA5023     FALSE 0.368 67.000 0.028 NA   NA
 61470 61471 PA5023 PA5024     FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 61471 61472 PA5024 PA5025   metY FALSE 0.084 121.000 0.000 1.000   NA
 61472 61473 PA5025 PA5026 metY   FALSE 0.104 91.000 0.000 NA N NA
 61473 61474 PA5026 PA5027     FALSE 0.436 113.000 0.167 NA N NA
 61475 61476 PA5028 PA5029     FALSE 0.354 91.000 0.054 1.000 N NA
 61479 61480 PA5032 PA5033     FALSE 0.156 74.000 0.000 NA   NA
 61481 61482 PA5034 PA5035 hemE gltD FALSE 0.095 177.000 0.024 1.000 N NA
 61482 61483 PA5035 PA5036 gltD gltB TRUE 0.984 29.000 0.214 0.001 Y NA
 61483 61484 PA5036 PA5037 gltB   FALSE 0.072 225.000 0.037 NA   NA
 61484 61485 PA5037 PA5038   aroB TRUE 0.831 7.000 0.020 NA   NA
 61485 61486 PA5038 PA5039 aroB aroK TRUE 0.919 50.000 0.208 1.000 Y NA
 61486 61487 PA5039 PA5040 aroK pilQ TRUE 0.950 12.000 0.319 1.000 N NA
 61487 61488 PA5040 PA5041 pilQ pilP TRUE 0.965 54.000 0.668 NA Y NA
 61488 61489 PA5041 PA5042 pilP pilO TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA Y NA
 61489 61490 PA5042 PA5043 pilO pilN TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 61490 61491 PA5043 PA5044 pilN pilM TRUE 0.997 0.000 0.616 NA Y NA
 61493 61494 PA5046 PA5047     FALSE 0.303 103.000 0.048 1.000   NA
 61494 61495 PA5047 PA5048     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 61495 61496 PA5048 PA5049   rpmE FALSE 0.369 60.000 0.023 1.000 N NA
 61497 61498 PA5050 PA5051 priA argS FALSE 0.131 249.000 0.036 0.072 N NA
 61498 61499 PA5051 PA5052 argS   TRUE 0.649 35.000 0.052 NA N NA
 61499 61500 PA5052 PA5053   hslV FALSE 0.069 119.000 0.000 NA N NA
 61500 61501 PA5053 PA5054 hslV hslU TRUE 0.848 29.000 0.000 1.000 Y NA
 61501 61502 PA5054 PA5055 hslU   FALSE 0.383 95.000 0.070 NA   NA
 61502 61503 PA5055 PA5056   phaC1 FALSE 0.006 419.000 0.000 NA   NA
 61503 61504 PA5056 PA5057 phaC1 phaD FALSE 0.372 153.000 0.190 1.000   NA
 61504 61505 PA5057 PA5058 phaD phaC2 FALSE 0.067 304.000 0.119 1.000   NA
 61505 61506 PA5058 PA5059 phaC2   TRUE 0.634 56.000 0.123 1.000 N NA
 61507 61508 PA5060 PA5061 phaF   TRUE 0.979 11.000 0.667 NA   NA
 61508 61509 PA5061 PA5062     FALSE 0.368 144.000 0.167 NA   NA
 61510 61511 PA5063 PA5064 ubiE   TRUE 0.889 15.000 0.145 1.000   NA
 61511 61512 PA5064 PA5065   ubiB TRUE 0.992 -3.000 0.432 1.000   NA
 61512 61513 PA5065 PA5066 ubiB hisI FALSE 0.185 116.000 0.018 1.000   NA
 61513 61514 PA5066 PA5067 hisI hisE TRUE 0.998 -7.000 0.152 0.003 Y NA
 61514 61515 PA5067 PA5068 hisE tatA TRUE 0.609 26.000 0.021 1.000 N NA
 61515 61516 PA5068 PA5069 tatA tatB TRUE 0.988 14.000 0.157 0.006 Y NA
 61516 61517 PA5069 PA5070 tatB tatC TRUE 0.997 -3.000 0.314 NA Y NA
 61517 61518 PA5070 PA5071 tatC   TRUE 0.971 -3.000 0.076 NA   NA
 61518 61519 PA5071 PA5072     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 61519 61520 PA5072 PA5073     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 61521 61522 PA5074 PA5075     TRUE 0.998 -7.000 0.536 1.000 Y NA
 61522 61523 PA5075 PA5076     TRUE 0.933 66.000 0.179 0.070 Y NA
 61523 61524 PA5076 PA5077   mdoH FALSE 0.016 238.000 0.000 NA N NA
 61524 61525 PA5077 PA5078 mdoH   TRUE 0.991 -7.000 0.469 NA N NA
 61525 61526 PA5078 PA5079     FALSE 0.004 457.000 0.000 1.000 N NA
 61526 61527 PA5079 PA5080     TRUE 0.983 -3.000 0.026 0.028   NA
 61529 61530 PA5082 PA5083     TRUE 0.849 43.000 0.333 NA N NA
 61530 61531 PA5083 PA5084     TRUE 0.827 25.000 0.143 NA N NA
 61533 61534 PA5086 PA5087     FALSE 0.107 237.000 0.000 0.012   NA
 61534 61535 PA5087 PA5088     TRUE 0.916 9.000 0.000 0.012   NA
 61535 61536 PA5088 PA5089     TRUE 0.787 1.000 0.000 1.000   NA
 61536 61537 PA5089 PA5090     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 61537 61538 PA5090 PA5091   hutG FALSE 0.013 271.000 0.000 NA   NA
 61538 61539 PA5091 PA5092 hutG hutI TRUE 0.938 -7.000 0.031 1.000 N NA
 61539 61540 PA5092 PA5093 hutI   TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.028 N NA
 61540 61541 PA5093 PA5094     TRUE 0.996 -3.000 0.212 1.000 Y NA
 61541 61542 PA5094 PA5095     TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.094 Y NA
 61542 61543 PA5095 PA5096     TRUE 0.937 25.000 0.000 0.058 Y NA
 61543 61544 PA5096 PA5097     FALSE 0.463 118.000 0.000 1.000 Y NA
 61544 61545 PA5097 PA5098   hutH TRUE 0.763 63.000 0.022 1.000 Y NA
 61545 61546 PA5098 PA5099 hutH   FALSE 0.096 97.000 0.000 1.000 N NA
 61546 61547 PA5099 PA5100   hutU FALSE 0.202 108.000 0.024 1.000 N NA
 61547 61548 PA5100 PA5101 hutU   FALSE 0.008 326.000 0.000 NA N NA
 61548 61549 PA5101 PA5102     TRUE 0.928 19.000 0.333 NA N NA
 61549 61550 PA5102 PA5103     FALSE 0.466 16.000 0.000 1.000 N NA
 61550 61551 PA5103 PA5104     FALSE 0.066 142.000 0.000 NA   NA
 61551 61552 PA5104 PA5105   hutC TRUE 0.984 -3.000 0.189 NA   NA
 61554 61555 PA5107 PA5108 blc   TRUE 0.987 -3.000 0.250 1.000   NA
 61555 61556 PA5108 PA5109     TRUE 0.560 73.000 0.119 1.000   NA
 61556 61557 PA5109 PA5110   fbp TRUE 0.934 5.000 0.103 1.000   NA
 61557 61558 PA5110 PA5111 fbp gloA3 FALSE 0.302 140.000 0.000 0.009 N NA
 61558 61559 PA5111 PA5112 gloA3 estA FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 61559 61560 PA5112 PA5113 estA   FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 61560 61561 PA5113 PA5114     TRUE 0.989 -3.000 0.283 NA   NA
 61561 61562 PA5114 PA5115     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 61564 61565 PA5117 PA5118 typA thiI FALSE 0.047 217.000 0.011 1.000 N NA
 61566 61567 PA5119 PA5120 glnA   FALSE 0.063 148.000 0.000 NA   NA
 61569 61570 PA5122 PA5123     TRUE 0.996 -3.000 0.889 NA   NA
 61570 61571 PA5123 PA5124   ntrB FALSE 0.029 271.000 0.014 NA   NA
 61571 61572 PA5124 PA5125 ntrB ntrC TRUE 0.998 3.000 0.587 0.072 Y NA
 61575 61576 PA5128 PA5129 secB grx TRUE 0.827 37.000 0.221 1.000 N NA
 61576 61577 PA5129 PA5130 grx   TRUE 0.728 2.000 0.000 NA N NA
 61578 61579 PA5131 PA5132 pgm   FALSE 0.010 314.000 0.000 NA   NA
 61579 61580 PA5132 PA5133     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 61580 61581 PA5133 PA5134     TRUE 0.960 29.000 0.408 0.022 N NA
 61581 61582 PA5134 PA5135     TRUE 0.978 0.000 0.210 1.000   NA
 61582 61583 PA5135 PA5136     FALSE 0.165 69.000 0.000 NA   NA
 61584 61585 PA5137 PA5138     TRUE 0.883 150.000 0.333 0.017 Y NA
 61585 61586 PA5138 PA5139     TRUE 0.923 91.000 0.222 0.017 Y NA
 61586 61587 PA5139 PA5140   hisF1 FALSE 0.301 172.000 0.000 1.000 Y NA
 61587 61588 PA5140 PA5141 hisF1 hisA TRUE 0.996 11.000 0.433 0.003 Y NA
 61588 61589 PA5141 PA5142 hisA hisH1 FALSE 0.408 313.000 0.120 0.003 Y NA
 61589 61590 PA5142 PA5143 hisH1 hisB TRUE 0.998 -3.000 0.111 0.003 Y NA
 61591 61592 PA5144 PA5145     FALSE 0.014 270.000 0.000 1.000   NA
 61592 61593 PA5145 PA5146     FALSE 0.216 94.000 0.012 NA   NA
 61593 61594 PA5146 PA5147   mutY TRUE 0.949 -3.000 0.033 NA N NA
 61594 61595 PA5147 PA5148 mutY   TRUE 0.726 44.000 0.150 NA N NA
 61595 61596 PA5148 PA5149     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 61596 2200542 PA5149 PA5149.1     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 61598 61599 PA5151 PA5152     FALSE 0.017 249.000 0.000 NA   NA
 61599 61600 PA5152 PA5153     TRUE 0.992 15.000 0.824 1.000 Y NA
 61600 61601 PA5153 PA5154     TRUE 0.939 62.000 0.169 0.058 Y NA
 61601 61602 PA5154 PA5155     TRUE 0.998 -3.000 0.195 0.010 Y NA
 61602 61603 PA5155 PA5156     FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 61603 61604 PA5156 PA5157     FALSE 0.006 404.000 0.000 NA   NA
 61604 61605 PA5157 PA5158     TRUE 0.686 4.000 0.000 1.000 N NA
 61605 61606 PA5158 PA5159     TRUE 0.801 15.000 0.000 0.093 N NA
 61606 61607 PA5159 PA5160     TRUE 0.984 11.000 0.900 1.000   NA
 61607 2200543 PA5160 PA5160.1     FALSE 0.158 73.000 0.000 NA   NA
 2200543 61608 PA5160.1 PA5161   rmlB FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 61608 61609 PA5161 PA5162 rmlB rmlD TRUE 0.999 -3.000 0.318 0.001 Y NA
 61609 61610 PA5162 PA5163 rmlD rmlA TRUE 0.998 -3.000 0.168 0.001 Y NA
 61610 61611 PA5163 PA5164 rmlA rmlC TRUE 0.976 0.000 0.000 1.000 Y NA
 61611 61612 PA5164 PA5165 rmlC   FALSE 0.175 60.000 0.000 1.000 N NA
 61612 61613 PA5165 PA5166     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.072 Y NA
 61613 61614 PA5166 PA5167     FALSE 0.016 241.000 0.000 1.000 N NA
 61614 61615 PA5167 PA5168     TRUE 0.940 16.000 0.034 NA Y NA
 61615 61616 PA5168 PA5169     TRUE 0.999 -3.000 0.882 NA Y NA
 61616 61617 PA5169 PA5170   arcD FALSE 0.015 796.000 0.000 0.064 N NA
 61617 61618 PA5170 PA5171 arcD arcA TRUE 0.978 22.000 0.375 1.000 Y NA
 61618 61619 PA5171 PA5172 arcA arcB TRUE 0.809 80.000 0.100 1.000 Y NA
 61619 61620 PA5172 PA5173 arcB arcC TRUE 0.944 61.000 0.483 1.000 Y NA
 61620 61621 PA5173 PA5174 arcC   FALSE 0.005 416.000 0.000 1.000 N NA
 61622 61623 PA5175 PA5176 cysQ   TRUE 0.991 -3.000 0.373 1.000 N NA
 61626 61627 PA5179 PA5180     FALSE 0.096 97.000 0.000 1.000 N NA
 61627 61628 PA5180 PA5181     TRUE 0.996 8.000 0.286 0.001 Y NA
 61629 61630 PA5182 PA5183     FALSE 0.440 99.000 0.000 0.007   NA
 61630 61631 PA5183 PA5184     FALSE 0.005 509.000 0.000 1.000   NA
 61632 61633 PA5185 PA5186     TRUE 0.871 23.000 0.185 NA   NA
 61633 61634 PA5186 PA5187     TRUE 0.781 27.000 0.094 1.000 N NA
 61634 61635 PA5187 PA5188     TRUE 0.996 2.000 0.500 1.000 Y NA
 61639 61640 PA5192 PA5193 pckA hslO FALSE 0.256 116.000 0.048 1.000 N NA
 61643 61644 PA5196 PA5197   rimK FALSE 0.310 132.000 0.102 1.000 N NA
 61644 61645 PA5197 PA5198 rimK   FALSE 0.257 191.000 0.214 NA N NA
 61646 61647 PA5199 PA5200 envZ ompR TRUE 0.958 95.000 0.584 0.021 Y NA
 61648 61649 PA5201 PA5202     TRUE 0.800 12.000 0.036 NA N NA
 61649 61650 PA5202 PA5203   gshA FALSE 0.079 207.000 0.036 NA N NA
 61653 61654 PA5206 PA5207 argE   FALSE 0.299 100.000 0.048 1.000 N NA
 61654 61655 PA5207 PA5208     TRUE 0.988 45.000 0.937 0.093 Y NA
 61656 61657 PA5209 PA5210     TRUE 0.683 38.000 0.068 1.000   NA
 61657 61658 PA5210 PA5211     FALSE 0.182 222.000 0.000 NA Y NA
 61658 61659 PA5211 PA5212     FALSE 0.137 132.000 0.010 NA   NA
 61660 61661 PA5213 PA5214 gcvP1 gcvH1 TRUE 0.648 174.000 0.249 1.000 Y NA
 61661 61662 PA5214 PA5215 gcvH1 gcvT1 TRUE 0.979 47.000 0.317 0.001 Y NA
 61662 61663 PA5215 PA5216 gcvT1   FALSE 0.323 151.000 0.017 0.058 N NA
 61663 61664 PA5216 PA5217     TRUE 0.980 68.000 0.844 0.058 Y NA
 61664 61665 PA5217 PA5218     FALSE 0.151 68.000 0.000 1.000 N NA
 61666 61667 PA5219 PA5220     TRUE 0.736 39.000 0.114 NA   NA
 61668 61669 PA5221 PA5222     TRUE 0.756 29.000 0.079 NA   NA
 61669 61670 PA5222 PA5223   ubiH TRUE 0.891 5.000 0.042 NA   NA
 61670 61671 PA5223 PA5224 ubiH pepP TRUE 0.971 8.000 0.396 1.000 N NA
 61671 61672 PA5224 PA5225 pepP   TRUE 0.962 10.000 0.329 NA   NA
 61673 61674 PA5226 PA5227     TRUE 0.964 -3.000 0.053 NA   NA
 61674 61675 PA5227 PA5228     FALSE 0.070 222.000 0.034 NA   NA
 61675 61676 PA5228 PA5229     FALSE 0.014 367.000 0.011 NA   NA
 61677 61678 PA5230 PA5231     TRUE 0.947 4.000 0.000 0.003   NA
 61678 61679 PA5231 PA5232     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.093   NA
 61679 61680 PA5232 PA5233     FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000 N NA
 61681 61682 PA5234 PA5235   glpT FALSE 0.015 250.000 0.000 1.000 N NA
 61683 61684 PA5236 PA5237     TRUE 0.986 0.000 0.039 1.000 Y NA
 61684 61685 PA5237 PA5238     FALSE 0.245 79.000 0.009 1.000 N NA
 61685 61686 PA5238 PA5239   rho FALSE 0.244 71.000 0.003 1.000 N NA
 61686 61687 PA5239 PA5240 rho trxA FALSE 0.093 245.000 0.087 1.000   NA
 61689 61690 PA5242 PA5243 ppk hemB TRUE 0.726 18.000 0.033 1.000 N NA
 61691 61692 PA5244 PA5245     FALSE 0.114 165.000 0.021 NA   NA
 61692 61693 PA5245 PA5246     TRUE 0.633 96.000 0.021 NA Y NA
 61694 61695 PA5247 PA5248     FALSE 0.308 67.000 0.012 NA   NA
 61695 61696 PA5248 PA5249     FALSE 0.410 105.000 0.024 0.093 N NA
 61696 61697 PA5249 PA5250     FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 61697 61698 PA5250 PA5251     TRUE 0.840 7.000 0.022 1.000   NA
 61698 61699 PA5251 PA5252     TRUE 0.964 0.000 0.108 1.000   NA
 61699 61700 PA5252 PA5253   algP FALSE 0.004 522.000 0.000 NA   NA
 61702 61703 PA5255 PA5256 algQ dsbH FALSE 0.081 280.000 0.133 1.000 N NA
 61703 61704 PA5256 PA5257 dsbH   FALSE 0.123 179.000 0.042 1.000 N NA
 61704 61705 PA5257 PA5258     TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 61705 61706 PA5258 PA5259   hemD TRUE 0.982 27.000 0.600 1.000 Y NA
 61706 61707 PA5259 PA5260 hemD hemC TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 61707 61708 PA5260 PA5261 hemC algR FALSE 0.227 109.000 0.032 1.000 N NA
 61708 61709 PA5261 PA5262 algR algZ TRUE 0.998 5.000 0.775 0.021 Y NA
 61711 61712 PA5264 PA5265     FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 61712 61713 PA5265 PA5266     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 61713 61714 PA5266 PA5267   hcpB FALSE 0.030 200.000 0.000 NA   NA
 61714 61715 PA5267 PA5268 hcpB corA FALSE 0.011 293.000 0.000 NA   NA
 61716 61717 PA5269 PA5270     TRUE 0.788 19.000 0.059 NA   NA
 61717 61718 PA5270 PA5271     TRUE 0.586 43.000 0.044 1.000   NA
 61718 61719 PA5271 PA5272   cyaA FALSE 0.358 149.000 0.164 1.000   NA
 61719 61720 PA5272 PA5273 cyaA   FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 61721 61722 PA5274 PA5275 rnk cyaY FALSE 0.017 323.000 0.008 NA N NA
 61723 61724 PA5276 PA5277 lppL lysA TRUE 0.714 11.000 0.006 NA N NA
 61724 61725 PA5277 PA5278 lysA dapF TRUE 0.991 11.000 0.104 0.001 Y NA
 61725 61726 PA5278 PA5279 dapF   TRUE 0.828 31.000 0.175 NA   NA
 61726 61727 PA5279 PA5280   sss TRUE 0.964 20.000 0.714 NA   NA
 61727 61728 PA5280 PA5281 sss   TRUE 0.991 -3.000 0.367 1.000   NA
 61731 61732 PA5284 PA5285     FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 61732 61733 PA5285 PA5286     FALSE 0.297 78.000 0.018 NA   NA
 61733 61734 PA5286 PA5287   amtB FALSE 0.015 261.000 0.000 NA   NA
 61734 61735 PA5287 PA5288 amtB glnK TRUE 0.746 40.000 0.135 1.000 N NA
 61736 61737 PA5289 PA5290     TRUE 0.671 41.000 0.074 NA   NA
 61737 61738 PA5290 PA5291     FALSE 0.127 125.000 0.005 1.000 N NA
 61739 61740 PA5292 PA5293 pchP   FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 61743 61744 PA5296 PA5297 rep poxB FALSE 0.062 134.000 0.000 1.000 N NA
 61744 61745 PA5297 PA5298 poxB   FALSE 0.065 129.000 0.000 1.000 N NA
 61746 61747 PA5299 PA5300   cycB FALSE 0.422 210.000 0.123 1.000 Y NA
 61747 61748 PA5300 PA5301 cycB   FALSE 0.089 222.000 0.057 1.000 N NA
 61748 61749 PA5301 PA5302   dadX FALSE 0.185 151.000 0.046 1.000 N NA
 61749 61750 PA5302 PA5303 dadX   FALSE 0.389 91.000 0.070 NA N NA
 61750 61751 PA5303 PA5304   dadA TRUE 0.956 -25.000 0.088 NA N NA
 61751 61752 PA5304 PA5305 dadA   FALSE 0.007 357.000 0.000 NA   NA
 61752 61753 PA5305 PA5306     TRUE 0.976 13.000 0.726 NA   NA
 61753 61754 PA5306 PA5307     TRUE 0.818 21.000 0.091 NA   NA
 61755 61756 PA5308 PA5309 lrp   FALSE 0.076 178.000 0.012 1.000 N NA
 61756 61757 PA5309 PA5310     FALSE 0.119 86.000 0.000 1.000 N NA
 61758 61759 PA5311 PA5312     FALSE 0.477 147.000 0.292 1.000 N NA
 61760 61761 PA5313 PA5314     FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 61762 61763 PA5315 PA5316 rpmG rpmB TRUE 0.994 12.000 0.332 0.008 Y NA
 61764 61765 PA5317 PA5318     FALSE 0.397 26.000 0.000 NA   NA
 61767 61768 PA5320 PA5321 dfp dut TRUE 0.948 8.000 0.201 1.000 N NA
 61768 61769 PA5321 PA5322 dut algC FALSE 0.010 1252.000 0.039 1.000 N NA
 61769 61770 PA5322 PA5323 algC argB TRUE 0.768 17.000 0.044 1.000 N NA
 61773 61774 PA5326 PA5327     TRUE 0.804 83.000 0.571 1.000 N NA
 61774 61775 PA5327 PA5328     TRUE 0.843 78.000 0.155 1.000 Y NA
 61777 61778 PA5330 PA5331   pyrE TRUE 0.715 21.000 0.034 NA   NA
 61780 61781 PA5333 PA5334   rph FALSE 0.440 47.000 0.018 NA   NA
 61782 61783 PA5335 PA5336   gmk TRUE 0.766 59.000 0.276 NA   NA
 61783 61784 PA5336 PA5337 gmk rpoZ TRUE 0.750 89.000 0.471 1.000 N NA
 61784 61785 PA5337 PA5338 rpoZ spoT TRUE 0.911 66.000 0.291 1.000 Y NA
 61785 61786 PA5338 PA5339 spoT   TRUE 0.700 62.000 0.215 NA N NA
 61786 61787 PA5339 PA5340     TRUE 0.537 55.000 0.056 NA   NA
 61788 61789 PA5341 PA5342     TRUE 0.495 67.000 0.071 1.000 N NA
 61789 61790 PA5342 PA5343     TRUE 0.878 0.000 0.004 1.000 N NA
 61791 61792 PA5344 PA5345   recG TRUE 0.994 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 61792 61793 PA5345 PA5346 recG   FALSE 0.309 90.000 0.038 NA N NA
 61794 61795 PA5347 PA5348     TRUE 0.508 136.000 0.290 1.000   NA
 61795 61796 PA5348 PA5349     FALSE 0.257 202.000 0.229 1.000   NA
 61796 61797 PA5349 PA5350   rubA2 TRUE 0.755 52.000 0.042 0.056   NA
 61797 61798 PA5350 PA5351 rubA2 rubA1 TRUE 0.500 184.000 0.000 0.006 Y NA
 61798 61799 PA5351 PA5352 rubA1   FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 61799 61800 PA5352 PA5353   glcF TRUE 0.907 5.000 0.057 NA   NA
 61800 61801 PA5353 PA5354 glcF glcE TRUE 0.987 10.000 0.074 0.038 Y NA
 61801 61802 PA5354 PA5355 glcE glcD TRUE 0.995 0.000 0.070 0.014 Y NA
 61803 61804 PA5356 PA5357 glcC   FALSE 0.240 80.000 0.010 NA N NA
 61804 61805 PA5357 PA5358   ubiA TRUE 0.963 27.000 0.248 NA Y NA
 61807 61808 PA5360 PA5361 phoB phoR TRUE 0.964 74.000 0.453 0.020 Y NA
 61808 61809 PA5361 PA5362 phoR   FALSE 0.269 103.000 0.037 NA   NA
 61810 61811 PA5363 PA5364     FALSE 0.089 116.000 0.000 1.000   NA
 61811 61812 PA5364 PA5365   phoU FALSE 0.139 119.000 0.009 NA N NA
 61812 61813 PA5365 PA5366 phoU pstB TRUE 0.866 96.000 0.330 NA Y NA
 61813 61814 PA5366 PA5367 pstB pstA TRUE 0.995 16.000 0.511 0.001 Y NA
 61814 61815 PA5367 PA5368 pstA pstC TRUE 0.970 20.000 0.489 0.093   NA
 61815 61816 PA5368 PA5369 pstC   FALSE 0.113 423.000 0.211 0.069   NA
 61816 2200544 PA5369 PA5369.1     FALSE 0.006 401.000 0.000 NA   NA
 2200544 2200545 PA5369.1 PA5369.2     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 2200545 2200546 PA5369.2 PA5369.3     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 2200546 2200547 PA5369.3 PA5369.4     FALSE 0.369 29.000 0.000 NA   NA
 2200547 2200548 PA5369.4 PA5369.5     FALSE 0.180 65.000 0.000 NA   NA
 2200548 61817 PA5369.5 PA5370     FALSE 0.004 567.000 0.000 NA   NA
 61819 61820 PA5372 PA5373 betA betB TRUE 0.677 136.000 0.634 1.000 N NA
 61820 61821 PA5373 PA5374 betB betI TRUE 0.828 61.000 0.459 1.000 N NA
 61823 61824 PA5376 PA5377     TRUE 0.998 4.000 0.844 0.093 Y NA
 61824 61825 PA5377 PA5378     TRUE 0.977 42.000 0.328 0.057 Y NA
 61826 61827 PA5379 PA5380 sdaB   FALSE 0.005 420.000 0.000 1.000 N NA
 61828 61829 PA5381 PA5382     FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 61831 61832 PA5384 PA5385     TRUE 0.966 6.000 0.281 NA   NA
 61832 61833 PA5385 PA5386     TRUE 0.851 51.000 0.419 NA   NA
 61833 61834 PA5386 PA5387     TRUE 0.895 51.000 0.608 1.000   NA
 61834 61835 PA5387 PA5388     FALSE 0.164 73.000 0.000 1.000   NA
 61837 61838 PA5390 PA5391     TRUE 0.774 57.000 0.279 NA   NA
 61838 61839 PA5391 PA5392     TRUE 0.955 14.000 0.419 NA   NA
 61839 61840 PA5392 PA5393     TRUE 0.987 0.000 0.425 NA N NA
 61840 61841 PA5393 PA5394   cls FALSE 0.010 294.000 0.000 1.000 N NA
 61842 61843 PA5395 PA5396     FALSE 0.023 222.000 0.000 NA   NA
 61843 61844 PA5396 PA5397     TRUE 0.770 127.000 0.868 1.000   NA
 61844 61845 PA5397 PA5398     TRUE 0.977 16.000 0.912 1.000   NA
 61845 61846 PA5398 PA5399     TRUE 0.949 104.000 0.574 0.038 Y NA
 61846 61847 PA5399 PA5400     TRUE 0.601 365.000 0.667 0.017 Y NA
 61847 61848 PA5400 PA5401     TRUE 0.991 36.000 0.776 0.017 Y NA
 61848 61849 PA5401 PA5402     FALSE 0.077 125.000 0.000 NA   NA
 61849 61850 PA5402 PA5403     TRUE 0.905 8.000 0.073 NA   NA
 61850 61851 PA5403 PA5404     FALSE 0.346 32.000 0.000 NA   NA
 61851 61852 PA5404 PA5405     TRUE 0.526 14.000 0.000 NA   NA
 61852 61853 PA5405 PA5406     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 61853 61854 PA5406 PA5407     TRUE 0.937 -3.000 0.017 NA   NA
 61855 61856 PA5408 PA5409     TRUE 0.694 5.000 0.000 NA   NA
 61856 61857 PA5409 PA5410     FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 61859 61860 PA5412 PA5413   ltaA FALSE 0.003 1340.000 0.000 NA   NA
 61860 61861 PA5413 PA5414 ltaA   FALSE 0.145 81.000 0.000 NA   NA
 61862 61863 PA5415 PA5416 glyA1 soxB TRUE 0.594 86.000 0.000 1.000 Y NA
 61863 61864 PA5416 PA5417 soxB soxD TRUE 0.977 94.000 0.824 0.001 Y NA
 61864 61865 PA5417 PA5418 soxD soxA TRUE 0.999 -3.000 0.824 0.001   NA
 61865 61866 PA5418 PA5419 soxA soxG TRUE 0.929 94.000 0.778 0.001   NA
 61866 61867 PA5419 PA5420 soxG purU2 TRUE 0.812 50.000 0.303 1.000 N NA
 61867 61868 PA5420 PA5421 purU2 fdhA FALSE 0.142 207.000 0.103 1.000 N NA
 61868 61869 PA5421 PA5422 fdhA   FALSE 0.124 84.000 0.000 1.000 N NA
 61870 61871 PA5423 PA5424     TRUE 0.786 62.000 0.333 NA   NA
 61871 61872 PA5424 PA5425   purK FALSE 0.277 115.000 0.050 1.000   NA
 61872 61873 PA5425 PA5426 purK purE TRUE 0.979 31.000 0.136 0.000 Y NA
 61877 61878 PA5430 PA5431     TRUE 0.624 37.000 0.042 NA   NA
 61879 61880 PA5432 PA5433     TRUE 0.923 9.000 0.000 0.006   NA
 61881 61882 PA5434 PA5435 mtr   FALSE 0.034 181.000 0.000 1.000 N NA
 61882 61883 PA5435 PA5436     TRUE 0.972 16.000 0.354 0.063 N NA
 61886 61887 PA5439 PA5440     FALSE 0.129 81.000 0.000 1.000 N NA
 61888 61889 PA5441 PA5442     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 61890 61891 PA5443 PA5444 uvrD   FALSE 0.316 38.000 0.000 1.000   NA
 61891 61892 PA5444 PA5445     FALSE 0.111 98.000 0.000 1.000   NA
 61892 61893 PA5445 PA5446     FALSE 0.007 378.000 0.000 NA   NA
 61894 61895 PA5447 PA5448 wbpZ wbpY TRUE 0.997 1.000 0.256 0.016 Y NA
 61895 61896 PA5448 PA5449 wbpY wbpX TRUE 0.995 -16.000 0.047 0.016 Y NA
 61896 61897 PA5449 PA5450 wbpX wzt TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 61897 61898 PA5450 PA5451 wzt wzm TRUE 0.952 0.000 0.000 0.071   NA
 61898 61899 PA5451 PA5452 wzm wbpW TRUE 0.988 0.000 0.061 1.000 Y NA
 61899 61900 PA5452 PA5453 wbpW gmd TRUE 0.972 4.000 0.020 1.000 Y NA
 61900 61901 PA5453 PA5454 gmd rmd TRUE 0.998 -3.000 0.167 0.008 Y NA
 61902 61903 PA5455 PA5456     TRUE 0.998 -6.000 1.000 0.016   NA
 61903 61904 PA5456 PA5457     TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000   NA
 61904 61905 PA5457 PA5458     TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 N NA
 61905 61906 PA5458 PA5459     TRUE 0.996 -6.000 1.000 1.000 N NA
 61906 61907 PA5459 PA5460     FALSE 0.050 163.000 0.000 NA   NA
 61907 61908 PA5460 PA5461     TRUE 0.550 96.000 0.200 NA   NA
 61908 61909 PA5461 PA5462     TRUE 0.755 125.000 0.800 NA   NA
 61909 61910 PA5462 PA5463     TRUE 0.952 29.000 0.727 NA   NA
 61910 61911 PA5463 PA5464     TRUE 0.995 -3.000 0.647 NA   NA
 61913 61914 PA5466 PA5467     TRUE 0.866 -3.000 0.000 NA   NA
 61914 61915 PA5467 PA5468     FALSE 0.013 280.000 0.000 NA   NA
 61915 61916 PA5468 PA5469     TRUE 0.913 21.000 0.085 0.063 N NA
 61917 61918 PA5470 PA5471     TRUE 0.989 -3.000 0.303 NA   NA
 61918 61919 PA5471 PA5472     FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 61920 61921 PA5473 PA5474     FALSE 0.171 69.000 0.000 1.000   NA
 61922 61923 PA5475 PA5476   citA FALSE 0.068 143.000 0.000 1.000   NA
 61925 61926 PA5478 PA5479   gltP FALSE 0.295 105.000 0.047 1.000   NA
 61928 61929 PA5481 PA5482     TRUE 0.849 22.000 0.140 NA   NA
 61930 61931 PA5483 PA5484 algB   TRUE 0.999 -3.000 0.455 0.071 Y NA
 61932 61933 PA5485 PA5486     TRUE 0.582 30.000 0.025 NA N NA
 61933 61934 PA5486 PA5487     FALSE 0.070 118.000 0.000 NA N NA
 61934 61935 PA5487 PA5488     TRUE 0.980 -3.000 0.147 NA   NA
 61935 61936 PA5488 PA5489   dsbA TRUE 0.891 16.000 0.162 NA   NA
 61936 61937 PA5489 PA5490 dsbA cc4 FALSE 0.207 168.000 0.088 1.000 N NA
 61937 61938 PA5490 PA5491 cc4   TRUE 0.933 46.000 0.039 0.011 Y NA
 61941 61942 PA5494 PA5495   thrB TRUE 0.834 34.000 0.204 NA   NA
 61943 61944 PA5496 PA5497     TRUE 0.666 17.000 0.012 NA   NA
 61944 61945 PA5497 PA5498     FALSE 0.081 110.000 0.000 1.000 N NA
 61946 61947 PA5499 PA5500 np20 znuC TRUE 0.995 0.000 0.309 1.000 Y NA
 61947 61948 PA5500 PA5501 znuC znuB TRUE 0.999 -7.000 0.755 0.071 Y NA
 61948 61949 PA5501 PA5502 znuB   TRUE 0.571 42.000 0.037 1.000   NA
 61949 61950 PA5502 PA5503     FALSE 0.143 207.000 0.094 1.000   NA
 61950 61951 PA5503 PA5504     TRUE 0.997 0.000 0.469 1.000 Y NA
 61951 61952 PA5504 PA5505     TRUE 0.958 77.000 0.867 NA Y NA
 61952 61953 PA5505 PA5506     FALSE 0.024 203.000 0.000 NA N NA
 61953 61954 PA5506 PA5507     TRUE 0.920 5.000 0.080 1.000 N NA
 61954 61955 PA5507 PA5508     TRUE 0.965 -3.000 0.060 1.000 N NA
 61955 61956 PA5508 PA5509     TRUE 0.820 68.000 0.081 1.000 Y NA
 61956 61957 PA5509 PA5510     TRUE 0.679 102.000 0.054 1.000 Y NA
 61958 61959 PA5511 PA5512     TRUE 0.999 -3.000 0.419 0.071 Y NA
 61960 61961 PA5513 PA5514 poxA poxB FALSE 0.138 71.000 0.000 NA N NA
 61964 61965 PA5517 PA5518     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 61965 61966 PA5518 PA5519     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA N NA
 61968 61969 PA5521 PA5522     FALSE 0.100 95.000 0.000 1.000 N NA
 61969 61970 PA5522 PA5523     TRUE 0.935 2.000 0.066 1.000 N NA
 61971 61972 PA5524 PA5525     TRUE 0.665 5.000 0.000 1.000 N NA
 61973 61974 PA5526 PA5527     FALSE 0.024 218.000 0.000 NA   NA
 61974 61975 PA5527 PA5528     FALSE 0.071 197.000 0.018 NA   NA
 61976 61977 PA5529 PA5530     FALSE 0.176 316.000 0.000 0.063 Y NA
 61978 61979 PA5531 PA5532 tonB   FALSE 0.011 296.000 0.000 NA   NA
 61981 61982 PA5534 PA5535     TRUE 0.990 -3.000 0.333 NA   NA
 61982 61983 PA5535 PA5536     TRUE 0.823 15.000 0.061 NA   NA
 61986 61987 PA5539 PA5540     TRUE 0.948 -3.000 0.026 1.000   NA
 61987 61988 PA5540 PA5541   pyrQ TRUE 0.893 3.000 0.029 1.000   NA
 61989 61990 PA5542 PA5543     FALSE 0.131 87.000 0.000 NA   NA
 61990 61991 PA5543 PA5544     TRUE 0.992 -3.000 0.433 NA   NA
 61991 61992 PA5544 PA5545     TRUE 0.830 75.000 0.588 NA   NA
 61992 61993 PA5545 PA5546     FALSE 0.051 164.000 0.000 1.000   NA
 61994 61995 PA5547 PA5548     FALSE 0.006 358.000 0.000 1.000 N NA
 61996 61997 PA5549 PA5550 glmS glmR TRUE 0.948 16.000 0.412 1.000 N NA
 61997 61998 PA5550 PA5551 glmR   FALSE 0.175 68.000 0.000 1.000   NA
 61998 61999 PA5551 PA5552   glmU TRUE 0.538 14.000 0.000 1.000   NA
 61999 62000 PA5552 PA5553 glmU atpC FALSE 0.283 121.000 0.067 1.000 N NA
 62000 62001 PA5553 PA5554 atpC atpD TRUE 0.992 42.000 0.837 0.002 Y NA
 62001 62002 PA5554 PA5555 atpD atpG TRUE 0.993 31.000 0.724 0.002 Y NA
 62002 62003 PA5555 PA5556 atpG atpA TRUE 0.990 51.000 0.846 0.002 Y NA
 62003 62004 PA5556 PA5557 atpA atpH TRUE 0.996 19.000 0.864 0.002 Y NA
 62004 62005 PA5557 PA5558 atpH atpF TRUE 0.993 12.000 0.242 0.002 Y NA
 62005 62006 PA5558 PA5559 atpF atpE TRUE 0.954 58.000 0.666 0.002   NA
 62006 62007 PA5559 PA5560 atpE atpB TRUE 0.955 50.000 0.557 0.002   NA
 62007 62008 PA5560 PA5561 atpB atpI TRUE 0.978 17.000 0.291 1.000 Y NA
 62008 62009 PA5561 PA5562 atpI spoOJ FALSE 0.173 164.000 0.056 1.000 N NA
 62009 62010 PA5562 PA5563 spoOJ soj TRUE 0.984 10.000 0.827 1.000 N NA
 62010 62011 PA5563 PA5564 soj gidB TRUE 0.930 19.000 0.339 1.000 N NA
 62011 62012 PA5564 PA5565 gidB gidA TRUE 0.989 0.000 0.466 1.000 N NA
 62012 62013 PA5565 PA5566 gidA   FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 62013 62014 PA5566 PA5567     FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 62014 62015 PA5567 PA5568     TRUE 0.824 71.000 0.221 0.063   NA
 62015 62016 PA5568 PA5569   rnpA FALSE 0.101 241.000 0.105 1.000 N NA
 62016 62017 PA5569 PA5570 rnpA rpmH TRUE 0.975 15.000 0.787 1.000   NA