MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus agalactiae 2603V/R

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
274658	274659	SAG0001	SAG0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.686	155.000	0.328	1.000	Y	NA
274659	274660	SAG0002	SAG0003	dnaN		TRUE	0.374	70.000	0.003	1.000	N	NA
274660	274661	SAG0003	SAG0004			TRUE	0.877	10.000	0.015	NA		NA
274661	274662	SAG0004	SAG0005			FALSE	0.035	202.000	0.000	NA		NA
274662	274663	SAG0005	SAG0006		ychF	FALSE	0.098	160.000	0.002	NA		NA
274663	274664	SAG0006	SAG0007	ychF	pth	TRUE	0.827	84.000	0.184	1.000	Y	NA
274664	274665	SAG0007	SAG0008	pth	mfd	TRUE	0.967	-3.000	0.137	1.000	N	NA
274665	274666	SAG0008	SAG0009	mfd		FALSE	0.064	161.000	0.000	NA		NA
274666	274667	SAG0009	SAG0010			TRUE	0.689	35.000	0.000	NA		NA
274667	274668	SAG0010	SAG0011			TRUE	0.957	-13.000	0.053	1.000	N	NA
274668	274669	SAG0011	SAG0012			TRUE	0.877	3.000	0.009	NA		NA
274669	274670	SAG0012	SAG0013			TRUE	0.952	0.000	0.105	NA		NA
274670	274671	SAG0013	SAG0014			TRUE	0.892	2.000	0.014	NA	N	NA
274671	274672	SAG0014	SAG0015		hpt	TRUE	0.927	5.000	0.067	0.063	N	NA
274672	274673	SAG0015	SAG0016	hpt	ftsH	TRUE	0.958	23.000	0.192	1.000	N	NA
274673	2194563	SAG0016	Sa16SA	ftsH		FALSE	0.011	493.000	0.000	NA		NA
2194563	5922163	Sa16SA	tRNA-Ala-2			TRUE	0.446	53.000	0.000	NA		NA
5922163	407077	tRNA-Ala-2	Sa23SA		rrl	FALSE	0.074	155.000	0.000	NA		NA
407077	3827815	Sa23SA	SAG_r01	rrl		FALSE	0.275	74.000	0.000	NA		NA
3827815	5922164	SAG_r01	tRNA-Val-1			TRUE	0.795	4.000	0.000	NA		NA
5922164	5922165	tRNA-Val-1	tRNA-Asp-1			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922165	5922166	tRNA-Asp-1	tRNA-Lys-2			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922166	5922167	tRNA-Lys-2	tRNA-Leu-1			TRUE	0.784	10.000	0.000	NA		NA
5922167	5922168	tRNA-Leu-1	tRNA-Thr-1			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922168	5922169	tRNA-Thr-1	tRNA-Gly-1			TRUE	0.700	34.000	0.000	NA		NA
5922169	5922170	tRNA-Gly-1	tRNA-Leu-2			TRUE	0.786	9.000	0.000	NA		NA
5922170	5922171	tRNA-Leu-2	tRNA-Arg-3			TRUE	0.812	12.000	0.000	NA		NA
5922171	5922172	tRNA-Arg-3	tRNA-Pro-1			TRUE	0.787	8.000	0.000	NA		NA
5922172	2194564	tRNA-Pro-1	Sa16SB			FALSE	0.090	145.000	0.000	NA		NA
2194564	5922173	Sa16SB	tRNA-Ala-3			TRUE	0.446	53.000	0.000	NA		NA
5922173	407078	tRNA-Ala-3	Sa23SB		rrl	FALSE	0.074	155.000	0.000	NA		NA
407078	3827816	Sa23SB	SAG_r02	rrl		FALSE	0.275	74.000	0.000	NA		NA
3827816	5922174	SAG_r02	tRNA-Val-2			TRUE	0.795	4.000	0.000	NA		NA
5922174	5922175	tRNA-Val-2	tRNA-Asp-2			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922175	5922176	tRNA-Asp-2	tRNA-Lys-3			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922176	5922177	tRNA-Lys-3	tRNA-Leu-3			TRUE	0.784	10.000	0.000	NA		NA
5922177	5922178	tRNA-Leu-3	tRNA-Thr-2			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922178	5922179	tRNA-Thr-2	tRNA-Gly-2			TRUE	0.700	34.000	0.000	NA		NA
5922179	5922180	tRNA-Gly-2	tRNA-Leu-4			TRUE	0.786	9.000	0.000	NA		NA
5922180	5922181	tRNA-Leu-4	tRNA-Arg-4			TRUE	0.812	12.000	0.000	NA		NA
5922181	5922182	tRNA-Arg-4	tRNA-Pro-2			TRUE	0.787	8.000	0.000	NA		NA
5922182	5922183	tRNA-Pro-2	tRNA-Met-1			TRUE	0.832	16.000	0.000	NA		NA
5922183	5922184	tRNA-Met-1	tRNA-Met-2			TRUE	0.835	20.000	0.000	NA		NA
5922184	5922185	tRNA-Met-2	tRNA-Ser-1			TRUE	0.832	16.000	0.000	NA		NA
5922185	5922186	tRNA-Ser-1	tRNA-Met-3			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922186	5922187	tRNA-Met-3	tRNA-Phe-1			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922187	5922188	tRNA-Phe-1	tRNA-Gly-3			TRUE	0.835	20.000	0.000	NA		NA
5922188	5922189	tRNA-Gly-3	tRNA-Ile-1			TRUE	0.689	35.000	0.000	NA		NA
5922189	5922190	tRNA-Ile-1	tRNA-Ser-2			TRUE	0.829	14.000	0.000	NA		NA
5922190	274674	tRNA-Ser-2	SAG0017		pscB	FALSE	0.026	236.000	0.000	NA		NA
274674	274675	SAG0017	SAG0018	pscB	prsA-1	FALSE	0.343	124.000	0.107	NA		NA
274675	274676	SAG0018	SAG0019	prsA-1		TRUE	0.650	108.000	0.048	1.000	Y	NA
274676	274677	SAG0019	SAG0020			TRUE	0.940	-10.000	0.012	1.000	N	NA
274677	274678	SAG0020	SAG0021			FALSE	0.218	90.000	0.000	NA		NA
274678	274679	SAG0021	SAG0022		plsX	FALSE	0.254	78.000	0.000	NA		NA
274679	274680	SAG0022	SAG0023	plsX	acpP-1	TRUE	0.976	11.000	0.017	0.008	Y	NA
274680	274681	SAG0023	SAG0024	acpP-1	purC	FALSE	0.228	124.000	0.017	1.000	N	NA
274681	274682	SAG0024	SAG0025	purC		TRUE	0.586	123.000	0.043	1.000	Y	NA
274682	274683	SAG0025	SAG0026		purF	FALSE	0.086	412.000	0.024	1.000	Y	NA
274683	274684	SAG0026	SAG0027	purF	purM	TRUE	0.986	28.000	0.248	1.000	Y	NA
274684	274685	SAG0027	SAG0028	purM	purN	TRUE	0.645	168.000	0.238	0.003	Y	NA
274685	274686	SAG0028	SAG0029	purN		TRUE	0.878	23.000	0.003	1.000		NA
274686	274687	SAG0029	SAG0030		purH	TRUE	0.890	20.000	0.002	1.000		NA
274687	274688	SAG0030	SAG0031	purH		FALSE	0.040	193.000	0.000	1.000		NA
274688	274689	SAG0031	SAG0032			FALSE	0.091	147.000	0.000	1.000		NA
274689	274690	SAG0032	SAG0033			FALSE	0.024	247.000	0.000	1.000		NA
274690	274691	SAG0033	SAG0034			TRUE	0.845	47.000	0.000	1.000	Y	NA
274691	274692	SAG0034	SAG0035			TRUE	0.631	88.000	0.000	0.052	Y	NA
274692	274693	SAG0035	SAG0036			TRUE	0.999	10.000	1.000	0.052	Y	NA
274693	274694	SAG0036	SAG0037			TRUE	0.990	13.000	0.250	NA	Y	NA
274694	274695	SAG0037	SAG0038			TRUE	0.835	20.000	0.000	NA		NA
274695	274696	SAG0038	SAG0039			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
274696	274697	SAG0039	SAG0040			TRUE	0.808	17.000	0.000	NA	N	NA
274697	274698	SAG0040	SAG0041			TRUE	0.913	8.000	0.105	NA	N	NA
274700	274701	SAG0043	SAG0044	purD	purE	FALSE	0.143	281.000	0.044	1.000	Y	NA
274701	274702	SAG0044	SAG0045	purE	purK	TRUE	0.994	-13.000	0.136	0.001	Y	NA
274702	274703	SAG0045	SAG0046	purK		TRUE	0.419	54.000	0.000	NA		NA
274703	274704	SAG0046	SAG0047		purB	TRUE	0.797	25.000	0.000	NA		NA
274704	274705	SAG0047	SAG0048	purB		FALSE	0.128	152.000	0.005	1.000		NA
274705	274706	SAG0048	SAG0049		ruvB	FALSE	0.028	297.000	0.002	1.000		NA
274706	274707	SAG0049	SAG0050	ruvB		FALSE	0.115	152.000	0.005	1.000	N	NA
274707	274708	SAG0050	SAG0051			TRUE	0.885	7.000	0.019	NA		NA
274708	274709	SAG0051	SAG0052			TRUE	0.989	-3.000	0.351	NA		NA
274709	274710	SAG0052	SAG0053		adhE	FALSE	0.018	270.000	0.000	1.000	N	NA
274710	274711	SAG0053	SAG0054	adhE	adhP	FALSE	0.134	179.000	0.012	0.003		NA
274711	274712	SAG0054	SAG0055	adhP	thrC	FALSE	0.226	120.000	0.003	1.000		NA
274712	274713	SAG0055	SAG0056	thrC		FALSE	0.077	147.000	0.000	1.000	N	NA
274713	274714	SAG0056	SAG0057		rpsJ	FALSE	0.029	206.000	0.000	1.000	N	NA
274714	274715	SAG0057	SAG0058	rpsJ	rplC	TRUE	0.926	105.000	0.467	0.039	Y	NA
274715	274716	SAG0058	SAG0059	rplC	rplD	TRUE	0.997	24.000	0.544	0.030	Y	NA
274716	274717	SAG0059	SAG0060	rplD	rplW	TRUE	0.995	0.000	0.307	0.030	Y	NA
274717	274718	SAG0060	SAG0061	rplW	rplB	TRUE	0.999	18.000	0.849	0.034	Y	NA
274718	274719	SAG0061	SAG0062	rplB	rpsS	TRUE	0.975	99.000	0.820	0.039	Y	NA
274719	274720	SAG0062	SAG0063	rpsS	rplV	TRUE	0.998	16.000	0.769	0.039	Y	NA
274720	274721	SAG0063	SAG0064	rplV	rpsC	TRUE	0.998	13.000	0.719	0.039	Y	NA
274721	274722	SAG0064	SAG0065	rpsC	rplP	TRUE	0.998	4.000	0.828	0.039	Y	NA
274722	274723	SAG0065	SAG0066	rplP	rpmC	TRUE	0.998	10.000	0.802	0.030	Y	NA
274723	274724	SAG0066	SAG0067	rpmC	rpsQ	TRUE	0.998	26.000	0.828	0.030	Y	NA
274724	274725	SAG0067	SAG0068	rpsQ	rplN	TRUE	0.998	25.000	0.791	0.039	Y	NA
274725	274726	SAG0068	SAG0069	rplN	rplX	TRUE	0.980	80.000	0.810	0.039	Y	NA
274726	274727	SAG0069	SAG0070	rplX	rplE	TRUE	0.998	24.000	0.758	0.030	Y	NA
274727	274728	SAG0070	SAG0071	rplE		TRUE	0.997	18.000	0.496	0.030	Y	NA
274728	274729	SAG0071	SAG0072		rpsH	TRUE	0.824	155.000	0.473	0.030	Y	NA
274729	274730	SAG0072	SAG0073	rpsH	rplF	TRUE	0.969	110.000	0.808	0.030	Y	NA
274730	274731	SAG0073	SAG0074	rplF	rplR	TRUE	0.974	101.000	0.815	0.030	Y	NA
274731	274732	SAG0074	SAG0075	rplR	rpsE	TRUE	0.999	19.000	0.814	0.039	Y	NA
274732	274733	SAG0075	SAG0076	rpsE	rpmD	TRUE	0.999	15.000	0.789	0.039	Y	NA
274733	274734	SAG0076	SAG0077	rpmD	rplO	TRUE	0.943	125.000	0.653	0.005	Y	NA
274734	274735	SAG0077	SAG0078	rplO		TRUE	0.994	21.000	0.730	1.000	N	NA
274735	274736	SAG0078	SAG0079		adk	TRUE	0.638	95.000	0.241	1.000	N	NA
274736	274737	SAG0079	SAG0080	adk	infA	FALSE	0.316	116.000	0.059	1.000	N	NA
274737	274738	SAG0080	SAG0081	infA	rpmJ	TRUE	0.971	26.000	0.067	1.000	Y	NA
274738	274739	SAG0081	SAG0082	rpmJ	rpsM	TRUE	0.985	18.000	0.086	0.030	Y	NA
274739	274740	SAG0082	SAG0083	rpsM	rpsK	TRUE	0.999	18.000	0.810	0.030	Y	NA
274740	274741	SAG0083	SAG0084	rpsK	rpoA	TRUE	0.891	50.000	0.308	1.000	N	NA
274741	274742	SAG0084	SAG0085	rpoA	rplQ	TRUE	0.996	15.000	0.873	1.000	N	NA
274742	2194565	SAG0085	Sa16SC	rplQ		FALSE	0.010	587.000	0.000	NA		NA
2194565	400653	Sa16SC	tRNA-Ala-7		tRNA-Ala	TRUE	0.446	53.000	0.000	NA		NA
400653	407079	tRNA-Ala-7	Sa23SC	tRNA-Ala	rrl	FALSE	0.074	155.000	0.000	NA		NA
407079	3827817	Sa23SC	SAG_r03	rrl		FALSE	0.275	74.000	0.000	NA		NA
3827817	5922191	SAG_r03	tRNA-Val-5			TRUE	0.795	4.000	0.000	NA		NA
5922191	5922192	tRNA-Val-5	tRNA-Asp-3			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922192	5922193	tRNA-Asp-3	tRNA-Lys-4			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922193	5922194	tRNA-Lys-4	tRNA-Leu-6			TRUE	0.784	10.000	0.000	NA		NA
5922194	5922195	tRNA-Leu-6	tRNA-Thr-4			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922195	5922196	tRNA-Thr-4	tRNA-Ile-4			TRUE	0.757	29.000	0.000	NA		NA
5922196	5922197	tRNA-Ile-4	tRNA-Glu-5			TRUE	0.787	8.000	0.000	NA		NA
5922197	5922198	tRNA-Glu-5	tRNA-Ser-5			TRUE	0.829	14.000	0.000	NA		NA
5922198	5922199	tRNA-Ser-5	tRNA-Met-5			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922199	5922200	tRNA-Met-5	tRNA-Phe-3			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922200	595904	tRNA-Phe-3	tRNA-Tyr-3			TRUE	0.812	12.000	0.000	NA		NA
595904	5922201	tRNA-Tyr-3	tRNA-Trp-2			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
5922201	5922202	tRNA-Trp-2	tRNA-His-2			TRUE	0.828	15.000	0.000	NA		NA
5922202	5922203	tRNA-His-2	tRNA-Gln-4			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
5922203	5922204	tRNA-Gln-4	tRNA-Leu-7			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922204	274743	tRNA-Leu-7	SAG0086			FALSE	0.012	411.000	0.000	NA		NA
274743	274744	SAG0086	SAG0087			TRUE	0.902	-9.000	0.000	NA		NA
274744	274745	SAG0087	SAG0088			FALSE	0.297	70.000	0.000	NA		NA
274745	274746	SAG0088	SAG0089			FALSE	0.009	915.000	0.000	NA		NA
274746	274747	SAG0089	SAG0090			FALSE	0.029	220.000	0.000	NA		NA
274747	274748	SAG0090	SAG0091			FALSE	0.023	245.000	0.000	NA		NA
274748	274749	SAG0091	SAG0092			FALSE	0.148	122.000	0.000	NA		NA
274749	274750	SAG0092	SAG0093			TRUE	0.973	-3.000	0.174	1.000	N	NA
274750	274751	SAG0093	SAG0094			TRUE	0.973	-3.000	0.174	1.000	N	NA
274751	274752	SAG0094	SAG0095		hrcA	FALSE	0.138	143.000	0.009	1.000	N	NA
274752	274753	SAG0095	SAG0096	hrcA	grpE	TRUE	0.904	3.000	0.051	1.000	N	NA
274753	274754	SAG0096	SAG0097	grpE	dnaK	FALSE	0.339	181.000	0.026	0.007	Y	NA
274754	274755	SAG0097	SAG0098	dnaK	dnaJ	FALSE	0.316	289.000	0.196	0.003	Y	NA
274755	274756	SAG0098	SAG0099	dnaJ		FALSE	0.147	114.000	0.000	1.000	N	NA
274756	274757	SAG0099	SAG0100		truA	FALSE	0.263	71.000	0.000	1.000	N	NA
274757	274758	SAG0100	SAG0101	truA		TRUE	0.958	-37.000	0.058	1.000	N	NA
274758	274759	SAG0101	SAG0102			TRUE	0.967	10.000	0.276	NA		NA
274759	274760	SAG0102	SAG0103			TRUE	0.971	-3.000	0.149	NA		NA
274762	274763	SAG0105	SAG0106	tig		FALSE	0.059	189.000	0.005	1.000	N	NA
274763	274764	SAG0106	SAG0107		pyrG	FALSE	0.040	273.000	0.029	1.000	N	NA
274764	274765	SAG0107	SAG0108	pyrG		FALSE	0.220	109.000	0.002	NA	N	NA
274765	5922205	SAG0108	tRNA-Leu-8			TRUE	0.544	47.000	0.000	NA		NA
5922205	274766	tRNA-Leu-8	SAG0109		dut	FALSE	0.351	63.000	0.000	NA		NA
274766	274767	SAG0109	SAG0110	dut	radA	FALSE	0.116	162.000	0.028	1.000	N	NA
274767	274768	SAG0110	SAG0111	radA		FALSE	0.154	136.000	0.009	1.000	N	NA
274768	274769	SAG0111	SAG0112			FALSE	0.067	154.000	0.000	1.000	N	NA
274769	274770	SAG0112	SAG0113		gltX	FALSE	0.027	209.000	0.000	1.000	N	NA
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274774	274775	SAG0117	SAG0118	rbsD	rbsK	TRUE	0.994	-25.000	0.183	1.000	Y	NA
274775	274776	SAG0118	SAG0119	rbsK	rbsR	TRUE	0.985	-7.000	0.281	1.000	N	NA
274776	274777	SAG0119	SAG0120	rbsR		TRUE	0.389	58.000	0.000	NA		NA
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274779	274780	SAG0122	SAG0123			TRUE	0.907	31.000	0.133	1.000	N	NA
274780	274781	SAG0123	SAG0124			TRUE	0.998	-7.000	0.500	1.000	Y	NA
274781	274782	SAG0124	SAG0125		argG	FALSE	0.067	154.000	0.000	1.000	N	NA
274782	274783	SAG0125	SAG0126	argG	argH	TRUE	0.992	19.000	0.278	1.000	Y	NA
274783	274784	SAG0126	SAG0127	argH	fba	FALSE	0.083	141.000	0.000	1.000	N	NA
274786	274787	SAG0129	SAG0130	rpmB		FALSE	0.241	132.000	0.044	NA		NA
274787	274788	SAG0130	SAG0131			TRUE	0.982	33.000	0.567	NA		NA
274788	274789	SAG0131	SAG0132			FALSE	0.141	148.000	0.006	1.000		NA
274790	274791	SAG0133	SAG0134			FALSE	0.014	368.000	0.000	NA		NA
274791	274792	SAG0134	SAG0135			FALSE	0.015	342.000	0.000	NA		NA
274792	274793	SAG0135	SAG0136			TRUE	0.997	10.000	0.758	1.000	Y	NA
274794	274795	SAG0137	SAG0138			TRUE	0.817	46.000	0.118	NA		NA
274795	274796	SAG0138	SAG0139			TRUE	0.378	120.000	0.132	NA	N	NA
274796	274797	SAG0139	SAG0140			TRUE	0.973	2.000	0.267	NA	N	NA
274797	274798	SAG0140	SAG0141			FALSE	0.097	165.000	0.013	1.000	N	NA
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274799	274800	SAG0142	SAG0143		csdB	TRUE	0.991	2.000	0.606	1.000	N	NA
274800	274801	SAG0143	SAG0144	csdB		TRUE	0.987	-13.000	0.292	1.000	N	NA
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274803	274804	SAG0146	SAG0147			TRUE	0.710	153.000	0.231	0.003	Y	NA
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274806	274807	SAG0149	SAG0150			TRUE	0.951	10.000	0.134	0.051		NA
274807	274808	SAG0150	SAG0151			TRUE	0.976	13.000	0.286	1.000		NA
274808	274809	SAG0151	SAG0152			TRUE	0.998	0.000	0.619	0.002	Y	NA
274809	2194566	SAG0152	Sa16SD			FALSE	0.013	397.000	0.000	NA		NA
2194566	5922206	Sa16SD	tRNA-Ala-1			TRUE	0.446	53.000	0.000	NA		NA
5922206	407080	tRNA-Ala-1	Sa23SD		rrl	FALSE	0.074	155.000	0.000	NA		NA
407080	2194567	Sa23SD	Sa5SD	rrl		FALSE	0.275	74.000	0.000	NA		NA
2194567	5922207	Sa5SD	tRNA-Asn-1			TRUE	0.790	6.000	0.000	NA		NA
5922207	274810	tRNA-Asn-1	SAG0153		ispE	FALSE	0.096	140.000	0.000	NA		NA
274810	274811	SAG0153	SAG0154	ispE	adcR	FALSE	0.341	86.000	0.008	1.000		NA
274811	274812	SAG0154	SAG0155	adcR		TRUE	0.958	3.000	0.192	1.000		NA
274812	274813	SAG0155	SAG0156			TRUE	0.999	-10.000	0.673	1.000	Y	NA
10942595	274814	SAG0157	SAG0158		tyrS	FALSE	0.010	537.000	0.000	NA		NA
274815	274816	SAG0159	SAG0160		rpoB	FALSE	0.009	524.000	0.000	1.000	N	NA
274816	274817	SAG0160	SAG0161	rpoB	rpoC	TRUE	0.973	117.000	0.851	0.003	Y	NA
274817	274818	SAG0161	SAG0162	rpoC		FALSE	0.252	114.000	0.007	NA		NA
274818	274819	SAG0162	SAG0163		cglA	FALSE	0.135	173.000	0.083	NA		NA
274819	274820	SAG0163	SAG0164	cglA	cglB	TRUE	0.883	89.000	0.639	1.000		NA
274820	274821	SAG0164	SAG0165	cglB		TRUE	0.972	-3.000	0.000	NA	Y	NA
274821	274822	SAG0165	SAG0166			TRUE	0.985	-22.000	0.232	NA		NA
274822	274823	SAG0166	SAG0167			FALSE	0.361	115.000	0.087	NA		NA
274823	274824	SAG0167	SAG0168		ackA	TRUE	0.902	32.000	0.130	1.000	N	NA
274824	274825	SAG0168	SAG0169	ackA		FALSE	0.194	152.000	0.094	1.000	N	NA
274825	274826	SAG0169	SAG0170			TRUE	0.381	59.000	0.000	NA		NA
274826	274827	SAG0170	SAG0171			TRUE	0.624	41.000	0.000	NA		NA
274827	274828	SAG0171	SAG0172			FALSE	0.302	69.000	0.000	NA		NA
274829	274830	SAG0173	SAG0174	proC	pepA	TRUE	0.481	70.000	0.041	1.000	N	NA
274830	274831	SAG0174	SAG0175	pepA		FALSE	0.042	185.000	0.000	NA		NA
274832	274833	SAG0176	SAG0177			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
274833	274834	SAG0177	SAG0178			TRUE	0.948	33.000	0.239	1.000		NA
274836	274837	SAG0180	SAG0181	ssb-1		FALSE	0.144	124.000	0.000	1.000		NA
274837	274838	SAG0181	SAG0182			TRUE	0.778	27.000	0.000	1.000		NA
274838	274839	SAG0182	SAG0183			TRUE	0.999	-19.000	0.538	0.018	Y	NA
274839	274840	SAG0183	SAG0184			FALSE	0.233	170.000	0.178	1.000		NA
274840	274841	SAG0184	SAG0185			TRUE	0.996	2.000	0.869	1.000		NA
274843	274844	SAG0187	SAG0188			TRUE	0.551	113.000	0.000	0.050	Y	NA
274844	274845	SAG0188	SAG0189			TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.050	Y	NA
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274846	274847	SAG0190	SAG0191			TRUE	0.999	-16.000	0.750	0.032	Y	NA
274847	274848	SAG0191	SAG0192			FALSE	0.017	283.000	0.000	1.000	N	NA
274848	274849	SAG0192	SAG0193			TRUE	0.685	222.000	0.650	1.000	Y	NA
274849	274850	SAG0193	SAG0194			FALSE	0.026	216.000	0.000	1.000	N	NA
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274853	274854	SAG0197	SAG0198			TRUE	0.973	13.000	0.182	0.024		NA
274854	274855	SAG0198	SAG0199			TRUE	0.977	3.000	0.333	1.000		NA
274855	274856	SAG0199	SAG0200			TRUE	0.999	-3.000	0.742	0.002	Y	NA
274856	274857	SAG0200	SAG0201			FALSE	0.156	109.000	0.000	1.000	N	NA
274857	274858	SAG0201	SAG0202		rpsO	FALSE	0.198	88.000	0.000	1.000	N	NA
274858	274859	SAG0202	SAG0203	rpsO	pnp	FALSE	0.285	381.000	0.335	1.000	Y	NA
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274860	274861	SAG0204	SAG0205		cysE	TRUE	0.918	9.000	0.097	NA		NA
274861	274862	SAG0205	SAG0206	cysE		TRUE	0.784	10.000	0.000	NA		NA
274862	274863	SAG0206	SAG0207		cysS	TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
274863	274864	SAG0207	SAG0208	cysS		TRUE	0.971	-7.000	0.129	1.000		NA
274864	274865	SAG0208	SAG0209			TRUE	0.598	103.000	0.150	0.006		NA
274865	274866	SAG0209	SAG0210			TRUE	0.963	-3.000	0.109	NA		NA
274866	274867	SAG0210	SAG0211			TRUE	0.388	93.000	0.036	NA		NA
274867	274868	SAG0211	SAG0212			FALSE	0.111	133.000	0.000	NA		NA
274868	274869	SAG0212	SAG0213			FALSE	0.165	114.000	0.000	NA		NA
274869	274870	SAG0213	SAG0214		rplM	FALSE	0.012	417.000	0.000	NA		NA
274870	274871	SAG0214	SAG0215	rplM	rpsI	TRUE	0.998	21.000	0.601	0.028	Y	NA
274872	274873	SAG0216	SAG0217			TRUE	0.827	13.000	0.000	NA		NA
274873	274874	SAG0217	SAG0218			FALSE	0.346	65.000	0.000	1.000		NA
274875	274876	SAG0219	SAG0220			TRUE	0.672	137.000	0.500	NA		NA
274876	274877	SAG0220	SAG0221			TRUE	0.986	11.000	0.500	NA		NA
274877	274878	SAG0221	SAG0222			TRUE	0.997	13.000	1.000	NA		NA
274878	274879	SAG0222	SAG0223			TRUE	0.991	4.000	0.667	NA		NA
274879	274880	SAG0223	SAG0224			FALSE	0.040	190.000	0.000	NA		NA
274880	274881	SAG0224	SAG0225			TRUE	0.677	36.000	0.000	NA		NA
274881	274882	SAG0225	SAG0226			FALSE	0.017	316.000	0.000	NA		NA
274882	274883	SAG0226	SAG0227			TRUE	0.808	168.000	1.000	NA		NA
274884	274885	SAG0228	SAG0229			TRUE	0.994	-10.000	0.500	NA		NA
274886	274887	SAG0230	SAG0231			FALSE	0.189	102.000	0.000	NA		NA
274887	274888	SAG0231	SAG0232			TRUE	0.998	0.000	1.000	NA		NA
274888	274889	SAG0232	SAG0233			TRUE	0.906	-27.000	0.000	NA		NA
274889	274890	SAG0233	SAG0234			TRUE	0.905	-15.000	0.000	NA		NA
274890	274891	SAG0234	SAG0235			TRUE	0.700	34.000	0.000	NA		NA
274891	274892	SAG0235	SAG0236			FALSE	0.216	91.000	0.000	NA		NA
274892	274893	SAG0236	SAG0237			FALSE	0.012	428.000	0.000	NA		NA
274893	274894	SAG0237	SAG0238			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
274894	274895	SAG0238	SAG0239			TRUE	0.863	0.000	0.000	NA		NA
274895	274896	SAG0239	SAG0240			TRUE	0.699	73.000	0.200	1.000		NA
274897	274898	SAG0241	SAG0242			TRUE	0.991	10.000	0.619	0.050	N	NA
274898	274899	SAG0242	SAG0243			TRUE	0.993	3.000	0.650	0.050	N	NA
274899	274900	SAG0243	SAG0244			TRUE	0.997	0.000	0.450	0.095	Y	NA
2194568	5922208	Sa16SE	tRNA-Ala-4			TRUE	0.446	53.000	0.000	NA		NA
5922208	407081	tRNA-Ala-4	Sa23SE		rrl	FALSE	0.074	155.000	0.000	NA		NA
407081	3827818	Sa23SE	SAG_r04	rrl		FALSE	0.275	74.000	0.000	NA		NA
3827818	5922209	SAG_r04	tRNA-Val-3			TRUE	0.795	4.000	0.000	NA		NA
5922209	5922210	tRNA-Val-3	tRNA-Gly-4			TRUE	0.790	6.000	0.000	NA		NA
5922210	5922211	tRNA-Gly-4	tRNA-Ile-2			TRUE	0.666	37.000	0.000	NA		NA
5922211	5922212	tRNA-Ile-2	tRNA-Glu-3			TRUE	0.787	8.000	0.000	NA		NA
5922212	5922213	tRNA-Glu-3	tRNA-Ser-3			TRUE	0.829	14.000	0.000	NA		NA
5922213	5922214	tRNA-Ser-3	tRNA-Met-4			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922214	5922215	tRNA-Met-4	tRNA-Phe-2			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
5922215	5922216	tRNA-Phe-2	tRNA-Tyr-2			TRUE	0.812	12.000	0.000	NA		NA
5922216	5922217	tRNA-Tyr-2	tRNA-Trp-1			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
5922217	5922218	tRNA-Trp-1	tRNA-His-1			TRUE	0.828	15.000	0.000	NA		NA
5922218	5922219	tRNA-His-1	tRNA-Gln-3			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
5922219	5922220	tRNA-Gln-3	tRNA-Leu-5			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
5922220	274901	tRNA-Leu-5	SAG0245			FALSE	0.017	310.000	0.000	NA		NA
274901	274902	SAG0245	SAG0246			FALSE	0.343	64.000	0.000	NA		NA
274902	274903	SAG0246	SAG0247			FALSE	0.011	478.000	0.000	NA		NA
274903	274904	SAG0247	SAG0248			TRUE	0.997	19.000	1.000	NA		NA
274904	274905	SAG0248	SAG0249			TRUE	0.784	10.000	0.000	NA		NA
274905	274906	SAG0249	SAG0250			FALSE	0.009	861.000	0.000	NA		NA
274906	274907	SAG0250	SAG0251			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
274907	274908	SAG0251	SAG0252			FALSE	0.009	573.000	0.000	1.000	N	NA
274908	274909	SAG0252	SAG0253			TRUE	0.614	100.000	0.000	0.015	Y	NA
274909	274910	SAG0253	SAG0254			TRUE	0.909	43.000	0.000	0.015	Y	NA
274911	274912	SAG0255	SAG0256			TRUE	0.988	-3.000	0.333	NA		NA
274914	274915	SAG0258	SAG0259			TRUE	0.917	24.000	0.085	1.000	N	NA
274915	274916	SAG0259	SAG0260			TRUE	0.992	3.000	0.713	1.000	N	NA
274916	274917	SAG0260	SAG0261			FALSE	0.016	296.000	0.000	1.000	N	NA
274917	274918	SAG0261	SAG0262			TRUE	0.989	33.000	0.750	NA		NA
274918	274919	SAG0262	SAG0263			TRUE	0.677	36.000	0.000	NA		NA
274919	274920	SAG0263	SAG0264			FALSE	0.122	177.000	0.069	NA		NA
274921	274922	SAG0265	SAG0266		nagA	FALSE	0.020	278.000	0.000	NA		NA
274922	274923	SAG0266	SAG0267	nagA		FALSE	0.159	119.000	0.000	1.000		NA
274923	274924	SAG0267	SAG0268		glyQ	FALSE	0.018	313.000	0.000	1.000		NA
274924	274925	SAG0268	SAG0269	glyQ		TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000	N	NA
274925	274926	SAG0269	SAG0270		glyS	TRUE	0.771	4.000	0.000	1.000	N	NA
274926	274927	SAG0270	SAG0271	glyS		TRUE	0.900	12.000	0.020	NA		NA
274927	274928	SAG0271	SAG0272			FALSE	0.219	89.000	0.000	NA		NA
274928	274929	SAG0272	SAG0273		glpK	FALSE	0.163	115.000	0.000	NA		NA
274929	274930	SAG0273	SAG0274	glpK		TRUE	0.997	13.000	0.500	0.002	Y	NA
274930	274931	SAG0274	SAG0275		glpF-1	TRUE	0.986	12.000	0.500	1.000	N	NA
274931	274932	SAG0275	SAG0276	glpF-1		TRUE	0.768	88.000	0.364	1.000		NA
274932	274933	SAG0276	SAG0277			TRUE	0.993	-9.000	0.462	NA		NA
274933	274934	SAG0277	SAG0278		tkt	FALSE	0.135	125.000	0.000	NA		NA
274934	274935	SAG0278	SAG0279	tkt		FALSE	0.030	213.000	0.000	NA		NA
274935	274936	SAG0279	SAG0280			TRUE	0.953	20.000	0.136	NA		NA
274936	274937	SAG0280	SAG0281			TRUE	0.977	4.000	0.341	NA		NA
274939	274940	SAG0283	SAG0284	proB	proA	TRUE	0.992	10.000	0.281	0.002	Y	NA
274940	274941	SAG0284	SAG0285	proA	mraW	FALSE	0.299	83.000	0.003	1.000	N	NA
274941	274942	SAG0285	SAG0286	mraW		TRUE	0.925	15.000	0.077	1.000	N	NA
274942	274943	SAG0286	SAG0287		pbpX	TRUE	0.982	4.000	0.456	1.000	N	NA
274943	274944	SAG0287	SAG0288	pbpX	mraY	TRUE	0.976	2.000	0.038	1.000	Y	NA
274944	274945	SAG0288	SAG0289	mraY		FALSE	0.279	98.000	0.007	1.000	N	NA
274945	274946	SAG0289	SAG0290			FALSE	0.193	138.000	0.036	1.000	N	NA
274946	274947	SAG0290	SAG0291			TRUE	0.813	95.000	0.143	0.049	Y	NA
274947	274948	SAG0291	SAG0292			TRUE	0.994	0.000	0.310	1.000	Y	NA
274948	274949	SAG0292	SAG0293			TRUE	0.665	122.000	0.364	NA		NA
274949	274950	SAG0293	SAG0294		trxB	TRUE	0.598	69.000	0.117	NA		NA
274950	274951	SAG0294	SAG0295	trxB		FALSE	0.117	158.000	0.017	1.000	N	NA
274951	274952	SAG0295	SAG0296		nadE	TRUE	0.995	-3.000	0.194	0.003	Y	NA
274952	274953	SAG0296	SAG0297	nadE	pepC	FALSE	0.269	113.000	0.017	1.000	N	NA
274954	274955	SAG0298	SAG0299	pbp1A	recU	TRUE	0.989	-13.000	0.319	1.000		NA
274956	274957	SAG0300	SAG0301			TRUE	0.906	-19.000	0.000	NA		NA
274957	274958	SAG0301	SAG0302			TRUE	0.837	18.000	0.000	NA		NA
274958	274959	SAG0302	SAG0303			FALSE	0.011	470.000	0.000	NA		NA
274959	274960	SAG0303	SAG0304			TRUE	0.913	13.000	0.029	NA		NA
274962	274963	SAG0306	SAG0307			TRUE	0.544	47.000	0.000	NA		NA
274963	274964	SAG0307	SAG0308			TRUE	0.906	-19.000	0.000	NA		NA
274964	274965	SAG0308	SAG0309			TRUE	0.974	-13.000	0.136	NA		NA
274965	274966	SAG0309	SAG0310			TRUE	0.993	-3.000	0.500	NA		NA
274966	10942596	SAG0310	SAG0311			TRUE	0.831	2.000	0.000	NA		NA
10942596	274967	SAG0311	SAG0312			TRUE	0.493	50.000	0.000	NA		NA
274967	274968	SAG0312	SAG0313		gmk	FALSE	0.058	167.000	0.000	NA		NA
274968	274969	SAG0313	SAG0314	gmk		TRUE	0.985	23.000	0.471	1.000	N	NA
274969	274970	SAG0314	SAG0315		priA	TRUE	0.515	74.000	0.032	0.073	N	NA
274970	274971	SAG0315	SAG0316	priA	fmt	TRUE	0.734	47.000	0.052	1.000	N	NA
274971	274972	SAG0316	SAG0317	fmt	sun	TRUE	0.996	-10.000	0.305	1.000	Y	NA
274972	274973	SAG0317	SAG0318	sun		TRUE	0.828	38.000	0.074	1.000	N	NA
274973	274974	SAG0318	SAG0319			TRUE	0.998	0.000	0.704	1.000	Y	NA
274974	274975	SAG0319	SAG0320			FALSE	0.141	161.000	0.039	NA		NA
274975	274976	SAG0320	SAG0321			TRUE	0.996	-3.000	0.679	NA		NA
274976	274977	SAG0321	SAG0322			TRUE	0.999	-7.000	0.853	0.017	Y	NA
274977	274978	SAG0322	SAG0323			TRUE	0.884	42.000	0.164	1.000		NA
274978	274979	SAG0323	SAG0324			TRUE	0.977	-16.000	0.151	1.000		NA
274981	274982	SAG0326	SAG0327			TRUE	0.793	119.000	0.188	0.042	Y	NA
274982	274983	SAG0327	SAG0328		celC	FALSE	0.086	204.000	0.091	1.000	N	NA
274983	274984	SAG0328	SAG0329	celC		TRUE	0.999	17.000	0.889	0.012	Y	NA
274984	274985	SAG0329	SAG0330		celB	TRUE	0.999	2.000	0.889	0.012	Y	NA
274985	274986	SAG0330	SAG0331	celB	pflD-1	FALSE	0.141	181.000	0.132	1.000	N	NA
274986	274987	SAG0331	SAG0332	pflD-1		TRUE	0.975	10.000	0.368	1.000	N	NA
274987	274988	SAG0332	SAG0333		gldA	TRUE	0.719	68.000	0.211	1.000	N	NA
274989	274990	SAG0334	SAG0335	cysK		TRUE	0.392	91.000	0.033	1.000		NA
274991	274992	SAG0336	SAG0337			TRUE	0.960	0.000	0.130	1.000		NA
274992	274993	SAG0337	SAG0338		yfiA	TRUE	0.497	77.000	0.080	NA		NA
274993	2194569	SAG0338	Sa16SF	yfiA		FALSE	0.016	323.000	0.000	NA		NA
2194569	5922221	Sa16SF	tRNA-Ala-5			TRUE	0.446	53.000	0.000	NA		NA
5922221	407082	tRNA-Ala-5	Sa23SF		rrl	FALSE	0.074	155.000	0.000	NA		NA
407082	2194570	Sa23SF	Sa5SF	rrl		FALSE	0.275	74.000	0.000	NA		NA
2194570	5922222	Sa5SF	tRNA-Asn-3			TRUE	0.790	6.000	0.000	NA		NA
274997	274998	SAG0342	SAG0343			TRUE	0.423	96.000	0.098	1.000	N	NA
274998	274999	SAG0343	SAG0344		fabH	TRUE	0.940	0.000	0.070	1.000	N	NA
274999	275000	SAG0344	SAG0345	fabH	acpP	TRUE	0.729	58.000	0.065	0.008		NA
275000	275001	SAG0345	SAG0346	acpP	fabK	FALSE	0.339	155.000	0.216	1.000		NA
275001	275002	SAG0346	SAG0347	fabK	fabD	TRUE	0.941	20.000	0.099	1.000		NA
275002	275003	SAG0347	SAG0348	fabD	fabG	TRUE	0.995	9.000	0.432	0.008	Y	NA
275003	275004	SAG0348	SAG0349	fabG	fabF	TRUE	0.977	16.000	0.056	1.000	Y	NA
275004	275005	SAG0349	SAG0350	fabF	accB	TRUE	0.979	2.000	0.074	1.000	Y	NA
275005	275006	SAG0350	SAG0351	accB	fabZ	TRUE	0.990	-3.000	0.047	0.008	Y	NA
275006	275007	SAG0351	SAG0352	fabZ	accC	TRUE	0.942	38.000	0.045	1.000	Y	NA
275007	275008	SAG0352	SAG0353	accC	accD	TRUE	0.981	9.000	0.090	0.003	Y	NA
275008	275009	SAG0353	SAG0354	accD	accA	TRUE	0.996	-7.000	0.234	0.002	Y	NA
275009	275010	SAG0354	SAG0355	accA		FALSE	0.011	470.000	0.000	NA		NA
275013	275014	SAG0358	SAG0359			TRUE	0.812	119.000	0.583	NA		NA
275014	275015	SAG0359	SAG0360		manM	TRUE	0.999	15.000	0.812	0.023	Y	NA
275015	275016	SAG0360	SAG0361	manM	manL	TRUE	0.998	33.000	0.943	0.023	Y	NA
275016	275017	SAG0361	SAG0362	manL		FALSE	0.018	303.000	0.000	1.000		NA
275018	275019	SAG0363	SAG0364			TRUE	0.778	90.000	0.400	NA		NA
275019	275020	SAG0364	SAG0365			TRUE	0.383	103.000	0.068	NA		NA
275020	275021	SAG0365	SAG0366			FALSE	0.344	83.000	0.008	NA		NA
275021	275022	SAG0366	SAG0367			TRUE	0.956	-46.000	0.033	NA		NA
275022	275023	SAG0367	SAG0368			TRUE	0.968	9.000	0.283	NA		NA
275024	275025	SAG0369	SAG0370		hit	TRUE	0.954	-3.000	0.063	NA		NA
275028	275029	SAG0373	SAG0374			TRUE	0.955	2.000	0.167	NA	N	NA
275029	275030	SAG0374	SAG0375			TRUE	0.646	58.000	0.107	NA	N	NA
275030	275031	SAG0375	SAG0376			TRUE	0.977	-10.000	0.154	NA		NA
275031	5922223	SAG0376	tRNA-Ser-4			TRUE	0.592	44.000	0.000	NA		NA
5922223	275032	tRNA-Ser-4	SAG0377			FALSE	0.011	452.000	0.000	NA		NA
275032	275033	SAG0377	SAG0378		nusA	TRUE	0.988	36.000	0.759	NA		NA
275033	275034	SAG0378	SAG0379	nusA		TRUE	0.992	22.000	0.323	NA	Y	NA
275034	275035	SAG0379	SAG0380			TRUE	0.991	-7.000	0.408	NA	N	NA
275035	275036	SAG0380	SAG0381			TRUE	0.990	20.000	0.223	NA	Y	NA
275036	275037	SAG0381	SAG0382		rbfA	TRUE	0.936	91.000	0.530	1.000	Y	NA
275039	275040	SAG0384	SAG0385			TRUE	0.921	13.000	0.064	1.000	N	NA
275040	275041	SAG0385	SAG0386			TRUE	0.953	41.000	0.048	0.006	Y	NA
275041	275042	SAG0386	SAG0387			FALSE	0.173	110.000	0.000	NA		NA
275042	275043	SAG0387	SAG0388			TRUE	0.923	15.000	0.047	NA		NA
275043	275044	SAG0388	SAG0389		polA	FALSE	0.174	113.000	0.000	1.000		NA
275044	275045	SAG0389	SAG0390	polA		TRUE	0.827	30.000	0.005	NA		NA
275045	275046	SAG0390	SAG0391			FALSE	0.353	82.000	0.010	NA		NA
275046	275047	SAG0391	SAG0392			FALSE	0.081	153.000	0.000	1.000		NA
275047	275048	SAG0392	SAG0393			TRUE	0.676	113.000	0.333	1.000		NA
275048	275049	SAG0393	SAG0394			TRUE	0.996	2.000	0.500	1.000	Y	NA
275051	275052	SAG0396	SAG0397	tgt		FALSE	0.256	110.000	0.004	1.000		NA
275052	275053	SAG0397	SAG0398			TRUE	0.899	7.000	0.039	NA		NA
275053	275054	SAG0398	SAG0399			FALSE	0.199	139.000	0.033	NA		NA
275054	275055	SAG0399	SAG0400			TRUE	0.948	0.000	0.013	0.024		NA
275055	275056	SAG0400	SAG0401			FALSE	0.189	102.000	0.000	NA		NA
275056	275057	SAG0401	SAG0402		pgi	TRUE	0.677	36.000	0.000	NA		NA
275057	275058	SAG0402	SAG0403	pgi		FALSE	0.014	322.000	0.000	1.000	N	NA
275058	275059	SAG0403	SAG0404			TRUE	0.957	-9.000	0.037	1.000		NA
275059	275060	SAG0404	SAG0405			FALSE	0.118	132.000	0.000	1.000		NA
275061	275062	SAG0406	SAG0407	galU	gpsA	TRUE	0.802	37.000	0.032	1.000	N	NA
275063	275064	SAG0408	SAG0409	rnpA		TRUE	0.918	13.000	0.052	1.000	N	NA
275064	275065	SAG0409	SAG0410			TRUE	0.924	8.000	0.106	1.000		NA
275065	2194571	SAG0410	Sa16SG			FALSE	0.015	341.000	0.000	NA		NA
2194571	595912	Sa16SG	tRNA-Ala-6			TRUE	0.446	53.000	0.000	NA		NA
595912	407083	tRNA-Ala-6	Sa23SG		rrl	FALSE	0.074	155.000	0.000	NA		NA
407083	3827819	Sa23SG	SAG_r05	rrl		FALSE	0.275	74.000	0.000	NA		NA
3827819	5922224	SAG_r05	tRNA-Val-4			TRUE	0.795	4.000	0.000	NA		NA
5922224	5922225	tRNA-Val-4	tRNA-Gly-5			TRUE	0.790	6.000	0.000	NA		NA
5922225	5922226	tRNA-Gly-5	tRNA-Ile-3			TRUE	0.666	37.000	0.000	NA		NA
5922226	5922227	tRNA-Ile-3	tRNA-Glu-4			TRUE	0.787	8.000	0.000	NA		NA
275066	275067	SAG0411	SAG0412			TRUE	0.389	84.000	0.025	NA		NA
275068	275069	SAG0413	SAG0414			FALSE	0.022	269.000	0.000	1.000		NA
275069	275070	SAG0414	SAG0415			FALSE	0.095	143.000	0.000	1.000		NA
275070	275071	SAG0415	SAG0416			FALSE	0.042	188.000	0.000	1.000		NA
275071	275072	SAG0416	SAG0417			FALSE	0.031	210.000	0.000	NA		NA
275072	275073	SAG0417	SAG0418		nrdF-1	FALSE	0.010	552.000	0.000	NA		NA
275073	275074	SAG0418	SAG0419	nrdF-1	nrdI-1	TRUE	0.998	1.000	0.643	NA	Y	NA
275074	275075	SAG0419	SAG0420	nrdI-1	nrdE-1	TRUE	0.999	2.000	1.000	NA	Y	NA
275075	275076	SAG0420	SAG0421	nrdE-1		FALSE	0.351	63.000	0.000	NA		NA
275076	275077	SAG0421	SAG0422			TRUE	0.965	13.000	0.200	NA		NA
275078	275079	SAG0423	SAG0424			FALSE	0.021	272.000	0.000	NA		NA
275079	275080	SAG0424	SAG0425			FALSE	0.223	87.000	0.000	NA		NA
275080	275081	SAG0425	SAG0426			TRUE	0.954	24.000	0.167	1.000		NA
275081	275082	SAG0426	SAG0427			TRUE	0.938	10.000	0.095	0.059		NA
275082	275083	SAG0427	SAG0428			TRUE	0.932	16.000	0.095	1.000	N	NA
275083	275084	SAG0428	SAG0429			FALSE	0.179	110.000	0.000	1.000		NA
275084	275085	SAG0429	SAG0430			FALSE	0.234	85.000	0.000	1.000		NA
275089	275090	SAG0435	SAG0436			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
275090	275091	SAG0436	SAG0437			FALSE	0.078	153.000	0.000	NA		NA
275091	10942598	SAG0437	SAG0438			FALSE	0.011	514.000	0.000	NA		NA
5922228	10942599	tRNA-Thr-3	SAG0439			FALSE	0.014	353.000	0.000	NA		NA
275092	275093	SAG0440	SAG0441			FALSE	0.176	109.000	0.000	NA		NA
275093	275094	SAG0441	SAG0442			FALSE	0.022	268.000	0.000	1.000		NA
275094	275095	SAG0442	SAG0443			TRUE	0.726	98.000	0.022	0.014	Y	NA
275095	275096	SAG0443	SAG0444			TRUE	0.947	-3.000	0.033	NA		NA
275096	275097	SAG0444	SAG0445		valS	TRUE	0.916	0.000	0.008	NA		NA
275097	275098	SAG0445	SAG0446	valS		FALSE	0.055	171.000	0.000	1.000		NA
275098	275099	SAG0446	SAG0447			TRUE	0.454	161.000	0.375	1.000		NA
275101	275102	SAG0449	SAG0450		asnA	FALSE	0.244	114.000	0.005	NA		NA
275104	275105	SAG0452	SAG0453			TRUE	0.812	12.000	0.000	NA		NA
275105	275106	SAG0453	SAG0454		coaD	TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
275106	275107	SAG0454	SAG0455	coaD		TRUE	0.956	-10.000	0.052	1.000	N	NA
275107	10942600	SAG0455	SAG0456			FALSE	0.267	75.000	0.000	NA		NA
10942600	275108	SAG0456	SAG0457			FALSE	0.225	86.000	0.000	NA		NA
275108	275109	SAG0457	SAG0458			TRUE	0.647	51.000	0.016	NA		NA
275109	275110	SAG0458	SAG0459			TRUE	0.921	0.000	0.012	NA		NA
275110	275111	SAG0459	SAG0460			FALSE	0.287	179.000	0.045	NA	Y	NA
275111	275112	SAG0460	SAG0461			TRUE	1.000	-10.000	0.911	0.007	Y	NA
275112	275113	SAG0461	SAG0462		trpG	FALSE	0.111	128.000	0.000	1.000	N	NA
275114	275115	SAG0463	SAG0464		bioB	TRUE	0.849	1.000	0.000	NA		NA
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275118	275119	SAG0467	SAG0468		nth	FALSE	0.150	113.000	0.000	1.000	N	NA
275121	275122	SAG0470	SAG0471		glk	TRUE	0.993	-3.000	0.496	NA		NA
275122	275123	SAG0471	SAG0472	glk		TRUE	0.911	12.000	0.064	NA	N	NA
275123	275124	SAG0472	SAG0473			FALSE	0.037	232.000	0.003	NA	N	NA
275124	275125	SAG0473	SAG0474			TRUE	0.728	45.000	0.015	NA		NA
275125	275126	SAG0474	SAG0475		murD	FALSE	0.185	130.000	0.006	NA		NA
275126	275127	SAG0475	SAG0476	murD	murG	TRUE	0.973	3.000	0.060	1.000	Y	NA
275127	275128	SAG0476	SAG0477	murG		TRUE	0.972	4.000	0.072	NA	Y	NA
275128	275129	SAG0477	SAG0478		ftsA	FALSE	0.137	356.000	0.389	NA	N	NA
275129	275130	SAG0478	SAG0479	ftsA	ftsZ	TRUE	0.995	22.000	0.460	1.000	Y	NA
275130	275131	SAG0479	SAG0480	ftsZ		TRUE	0.853	6.000	0.002	NA		NA
275131	275132	SAG0480	SAG0481		ylmF	TRUE	0.871	12.000	0.002	NA		NA
275132	275133	SAG0481	SAG0482	ylmF		TRUE	0.980	3.000	0.370	NA		NA
275133	275134	SAG0482	SAG0483		ylmH	TRUE	0.977	2.000	0.287	1.000		NA
275134	275135	SAG0483	SAG0484	ylmH		TRUE	0.988	10.000	0.579	NA		NA
275135	275136	SAG0484	SAG0485		ileS	FALSE	0.031	285.000	0.012	NA	N	NA
275137	275138	SAG0486	SAG0487			TRUE	0.637	64.000	0.114	NA		NA
275138	275139	SAG0487	SAG0488			FALSE	0.100	186.000	0.079	1.000	N	NA
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275141	275142	SAG0490	SAG0491			FALSE	0.202	142.000	0.044	NA		NA
275142	275143	SAG0491	SAG0492			TRUE	0.998	-7.000	0.640	1.000	Y	NA
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275144	275145	SAG0493	SAG0494		folD	FALSE	0.156	139.000	0.013	1.000	N	NA
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275146	275147	SAG0495	SAG0496		xseA	FALSE	0.178	126.000	0.005	NA	N	NA
275147	275148	SAG0496	SAG0497	xseA	xseB	TRUE	0.998	-22.000	0.412	0.001	Y	NA
275148	275149	SAG0497	SAG0498	xseB		TRUE	0.947	0.000	0.100	1.000	N	NA
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275150	275151	SAG0499	SAG0500			TRUE	0.956	-13.000	0.048	1.000	N	NA
275151	275152	SAG0500	SAG0501		recN	TRUE	0.903	12.000	0.037	1.000	N	NA
275152	275153	SAG0501	SAG0502	recN		FALSE	0.253	113.000	0.006	NA		NA
275153	275154	SAG0502	SAG0503			TRUE	0.981	-7.000	0.203	NA		NA
275154	275155	SAG0503	SAG0504			TRUE	0.998	-25.000	0.828	NA		NA
275155	275156	SAG0504	SAG0505		hup	TRUE	0.511	103.000	0.156	NA		NA
275156	275157	SAG0505	SAG0506	hup		FALSE	0.037	197.000	0.000	NA		NA
275158	275159	SAG0507	SAG0508	pyrDA	fibB	FALSE	0.036	187.000	0.000	1.000	N	NA
275159	275160	SAG0508	SAG0509	fibB	fibA	TRUE	0.997	19.000	0.467	0.010	Y	NA
275160	275161	SAG0509	SAG0510	fibA		TRUE	0.989	13.000	0.133	0.001	Y	NA
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275162	275163	SAG0511	SAG0512			TRUE	0.497	71.000	0.035	1.000		NA
275164	275165	SAG0513	SAG0514			FALSE	0.014	344.000	0.000	NA		NA
275167	275168	SAG0516	SAG0517			FALSE	0.339	90.000	0.018	1.000	N	NA
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10942601	275169	SAG0518	SAG0519		ftsE	TRUE	0.837	19.000	0.000	NA		NA
275169	275170	SAG0519	SAG0520	ftsE	ftsX	TRUE	0.997	-16.000	0.431	1.000	Y	NA
275171	275172	SAG0521	SAG0522			TRUE	0.926	-3.000	0.004	NA		NA
275173	275174	SAG0523	SAG0524			FALSE	0.159	108.000	0.000	1.000	N	NA
275174	275175	SAG0524	SAG0525		aspC	FALSE	0.364	86.000	0.028	1.000	N	NA
275175	275176	SAG0525	SAG0526	aspC	asnS	TRUE	0.924	21.000	0.068	1.000	N	NA
275177	275178	SAG0527	SAG0528			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
275178	275179	SAG0528	SAG0529			TRUE	0.716	33.000	0.000	NA		NA
275179	275180	SAG0529	SAG0530			FALSE	0.205	97.000	0.000	NA		NA
275181	275182	SAG0531	SAG0532			TRUE	0.980	-3.000	0.214	NA		NA
275182	275183	SAG0532	SAG0533			TRUE	0.992	-3.000	0.470	NA		NA
275183	275184	SAG0533	SAG0534			TRUE	0.907	15.000	0.015	1.000		NA
275184	275185	SAG0534	SAG0535			TRUE	0.416	142.000	0.250	1.000	N	NA
275186	275187	SAG0536	SAG0537	rpmE		FALSE	0.312	109.000	0.020	1.000		NA
275188	275189	SAG0538	SAG0539			TRUE	0.563	59.000	0.034	1.000	N	NA
275189	275190	SAG0539	SAG0540			TRUE	0.610	77.000	0.167	1.000	N	NA
275190	275191	SAG0540	SAG0541			TRUE	0.961	-7.000	0.094	1.000	N	NA
275191	275192	SAG0541	SAG0542			FALSE	0.011	453.000	0.000	NA		NA
275192	275193	SAG0542	SAG0543			TRUE	0.989	33.000	0.750	NA		NA
275193	275194	SAG0543	SAG0544		rplS	FALSE	0.038	183.000	0.000	1.000	N	NA
275194	5922229	SAG0544	tRNA-Arg-5	rplS		FALSE	0.171	111.000	0.000	NA		NA
275195	275196	SAG0545	SAG0546			FALSE	0.149	123.000	0.000	1.000		NA
275196	275197	SAG0546	SAG0547			FALSE	0.192	103.000	0.000	1.000		NA
275197	275198	SAG0547	SAG0548			TRUE	0.837	2.000	0.000	1.000		NA
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275206	275207	SAG0556	SAG0557			FALSE	0.083	150.000	0.000	NA		NA
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275319	275320	SAG0681	SAG0682			FALSE	0.139	124.000	0.000	NA		NA
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10942612	275321	SAG0683	SAG0684			FALSE	0.205	97.000	0.000	NA		NA
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275326	275327	SAG0689	SAG0690			FALSE	0.060	164.000	0.000	NA		NA
10942613	275331	SAG0694	SAG0695		ldhA	TRUE	0.829	14.000	0.000	NA		NA
275331	275332	SAG0695	SAG0696	ldhA		FALSE	0.027	207.000	0.000	NA	N	NA
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275333	275334	SAG0697	SAG0698			TRUE	0.958	17.000	0.000	1.000	Y	NA
275334	275335	SAG0698	SAG0699			TRUE	0.967	29.000	0.333	1.000	N	NA
275335	275336	SAG0699	SAG0700		eda-1	TRUE	0.808	117.000	0.583	1.000	N	NA
275336	275337	SAG0700	SAG0701	eda-1	uxaC	TRUE	0.995	17.000	0.467	1.000	Y	NA
275337	275338	SAG0701	SAG0702	uxaC	uxuA	TRUE	0.998	18.000	0.533	0.001	Y	NA
275338	275339	SAG0702	SAG0703	uxuA		TRUE	0.633	124.000	0.364	1.000	N	NA
275339	275340	SAG0703	SAG0704			FALSE	0.217	153.000	0.035	0.058		NA
275340	275341	SAG0704	SAG0705			TRUE	0.902	16.000	0.012	1.000		NA
275343	275344	SAG0707	SAG0708			FALSE	0.222	132.000	0.041	1.000	N	NA
275344	275345	SAG0708	SAG0709			TRUE	0.748	45.000	0.037	1.000	N	NA
275345	275346	SAG0709	SAG0710			TRUE	0.996	2.000	0.413	0.011	Y	NA
275346	275347	SAG0710	SAG0711		thrS	FALSE	0.010	457.000	0.000	1.000	N	NA
275347	275348	SAG0711	SAG0712	thrS		FALSE	0.025	222.000	0.000	1.000	N	NA
275348	275349	SAG0712	SAG0713			FALSE	0.201	98.000	0.000	NA		NA
275349	275350	SAG0713	SAG0714			FALSE	0.057	168.000	0.000	NA		NA
275351	275352	SAG0715	SAG0716			TRUE	0.999	12.000	0.947	0.012	Y	NA
275352	275353	SAG0716	SAG0717			TRUE	0.995	13.000	0.400	0.043	Y	NA
275353	275354	SAG0717	SAG0718			TRUE	0.986	12.000	0.185	1.000	Y	NA
275355	275356	SAG0719	SAG0720			TRUE	0.999	-7.000	0.597	0.015	Y	NA
275356	275357	SAG0720	SAG0721			TRUE	0.905	4.000	0.038	1.000		NA
275357	275358	SAG0721	SAG0722			TRUE	0.881	3.000	0.011	NA		NA
275358	275359	SAG0722	SAG0723		rnc	FALSE	0.120	152.000	0.002	NA		NA
275359	275360	SAG0723	SAG0724	rnc		TRUE	0.922	8.000	0.120	1.000	N	NA
275360	275361	SAG0724	SAG0725			FALSE	0.223	91.000	0.000	1.000		NA
275361	275362	SAG0725	SAG0726			TRUE	0.985	0.000	0.250	0.022		NA
275362	275363	SAG0726	SAG0727		ftsY	TRUE	0.939	0.000	0.007	0.083		NA
275364	275365	SAG0728	SAG0729			TRUE	0.997	0.000	0.841	NA		NA
275365	275366	SAG0729	SAG0730			TRUE	0.927	6.000	0.114	NA		NA
275367	275368	SAG0731	SAG0732			FALSE	0.157	105.000	0.000	NA	N	NA
275368	275369	SAG0732	SAG0733			TRUE	0.982	-7.000	0.215	NA		NA
275369	275370	SAG0733	SAG0734			TRUE	0.446	81.000	0.051	NA		NA
275370	275371	SAG0734	SAG0735			TRUE	0.906	-22.000	0.000	NA		NA
275371	275372	SAG0735	SAG0736		hprK	FALSE	0.162	116.000	0.000	NA		NA
275372	275373	SAG0736	SAG0737	hprK	lgt	TRUE	0.993	-7.000	0.494	1.000	N	NA
275373	275374	SAG0737	SAG0738	lgt		TRUE	0.931	15.000	0.079	NA		NA
275374	275375	SAG0738	SAG0739			TRUE	0.979	-3.000	0.206	NA		NA
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275378	275379	SAG0742	SAG0743			FALSE	0.128	127.000	0.000	NA		NA
275379	275380	SAG0743	SAG0744			FALSE	0.139	124.000	0.000	NA		NA
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275383	275384	SAG0747	SAG0748	ribE	ribA	TRUE	0.978	18.000	0.051	1.000	Y	NA
275384	275385	SAG0748	SAG0749	ribA	ribH	TRUE	0.984	15.000	0.054	0.002	Y	NA
275388	275389	SAG0752	SAG0753			TRUE	0.904	22.000	0.018	NA		NA
275392	275393	SAG0756	SAG0757			TRUE	0.986	-16.000	0.250	NA		NA
275395	275396	SAG0759	SAG0760	ppc		FALSE	0.117	126.000	0.000	1.000	N	NA
275396	275397	SAG0760	SAG0761		ftsW	FALSE	0.046	173.000	0.000	1.000	N	NA
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275400	275401	SAG0764	SAG0765			FALSE	0.108	129.000	0.000	1.000	N	NA
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275402	275403	SAG0766	SAG0767	recR		FALSE	0.144	141.000	0.010	1.000	N	NA
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275404	275405	SAG0768	SAG0769	murF		FALSE	0.036	187.000	0.000	1.000	N	NA
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275406	275407	SAG0770	SAG0771			FALSE	0.046	179.000	0.000	NA		NA
275407	275408	SAG0771	SAG0772		prfC	FALSE	0.050	177.000	0.000	1.000		NA
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275409	275410	SAG0773	SAG0774			FALSE	0.150	121.000	0.000	NA		NA
275410	275411	SAG0774	SAG0775			TRUE	0.988	-7.000	0.067	1.000	Y	NA
275411	275412	SAG0775	SAG0776			TRUE	0.994	16.000	0.400	NA	Y	NA
275412	275413	SAG0776	SAG0777			FALSE	0.022	235.000	0.000	NA	N	NA
275414	275415	SAG0778	SAG0779			TRUE	0.982	-7.000	0.209	1.000		NA
275416	275417	SAG0780	SAG0781		celA	FALSE	0.295	100.000	0.014	1.000	N	NA
275417	275418	SAG0781	SAG0782	celA		TRUE	0.973	-16.000	0.130	1.000		NA
275418	275419	SAG0782	SAG0783			FALSE	0.213	126.000	0.000	0.021		NA
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275422	275423	SAG0786	SAG0787			TRUE	0.385	54.000	0.000	1.000	N	NA
275423	275424	SAG0787	SAG0788		sodA	FALSE	0.354	80.000	0.012	1.000	N	NA
275424	275425	SAG0788	SAG0789	sodA		FALSE	0.016	338.000	0.000	1.000		NA
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275426	275427	SAG0790	SAG0791		bglA	TRUE	0.993	17.000	0.318	1.000	Y	NA
275429	275430	SAG0793	SAG0794	garK		TRUE	0.975	25.000	0.095	1.000	Y	NA
275430	275431	SAG0794	SAG0795			FALSE	0.198	101.000	0.000	1.000		NA
275432	275433	SAG0796	SAG0797		queA	FALSE	0.216	81.000	0.000	1.000	N	NA
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275439	275440	SAG0803	SAG0804		coiA	TRUE	0.696	52.000	0.056	NA		NA
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275444	275445	SAG0808	SAG0809			FALSE	0.024	242.000	0.000	NA		NA
275445	275446	SAG0809	SAG0810		alaS	TRUE	0.892	16.000	0.006	NA		NA
275446	275447	SAG0810	SAG0811	alaS		FALSE	0.236	82.000	0.000	NA		NA
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275453	275454	SAG0817	SAG0818		nrdF-2	FALSE	0.024	241.000	0.000	NA		NA
275454	275455	SAG0818	SAG0819	nrdF-2	nrdE-2	TRUE	0.718	203.000	0.500	0.002	Y	NA
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275459	275460	SAG0823	SAG0824	gapN		FALSE	0.173	140.000	0.028	1.000	N	NA
275462	275463	SAG0826	SAG0827	udk		FALSE	0.193	87.000	0.000	NA	N	NA
275463	275464	SAG0827	SAG0828		dnaX	TRUE	0.924	0.000	0.030	NA	N	NA
275464	275465	SAG0828	SAG0829	dnaX		TRUE	0.431	89.000	0.067	NA		NA
275467	275468	SAG0831	SAG0832	metK		FALSE	0.010	521.000	0.000	NA		NA
275468	275469	SAG0832	SAG0833			FALSE	0.322	67.000	0.000	NA		NA
275469	275470	SAG0833	SAG0834			FALSE	0.066	160.000	0.000	NA		NA
275470	275471	SAG0834	SAG0835			FALSE	0.179	108.000	0.000	NA		NA
275471	275472	SAG0835	SAG0836			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
275472	275473	SAG0836	SAG0837			TRUE	0.795	4.000	0.000	NA		NA
275473	275474	SAG0837	SAG0838			TRUE	0.909	-45.000	0.000	1.000		NA
275474	275475	SAG0838	SAG0839			FALSE	0.237	84.000	0.000	1.000		NA
275475	275476	SAG0839	SAG0840		thiD	TRUE	0.987	2.000	0.478	1.000	N	NA
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275477	275478	SAG0841	SAG0842	thiM	thiE	TRUE	0.985	14.000	0.061	0.003	Y	NA
275478	275479	SAG0842	SAG0843	thiE	murA-1	FALSE	0.113	127.000	0.000	1.000	N	NA
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275480	275481	SAG0844	SAG0845			TRUE	0.989	-7.000	0.342	1.000	N	NA
275481	275482	SAG0845	SAG0846		map	TRUE	0.966	23.000	0.235	1.000	N	NA
275482	275483	SAG0846	SAG0847	map		TRUE	0.983	2.000	0.373	1.000		NA
275485	275486	SAG0849	SAG0850		ligA	FALSE	0.159	140.000	0.010	NA		NA
275486	275487	SAG0850	SAG0851	ligA		TRUE	0.880	12.000	0.013	1.000	N	NA
275487	275488	SAG0851	SAG0852			TRUE	0.912	4.000	0.088	1.000	N	NA
275488	275489	SAG0852	SAG0853		glgB	FALSE	0.306	206.000	0.067	0.006	Y	NA
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10942614	275491	SAG0855	SAG0856		glgA	TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
275491	275492	SAG0856	SAG0857	glgA	atpE	FALSE	0.016	332.000	0.000	1.000		NA
275492	275493	SAG0857	SAG0858	atpE	atpB	TRUE	0.954	33.000	0.189	0.004		NA
275493	275494	SAG0858	SAG0859	atpB	atpF	TRUE	0.983	18.000	0.032	0.004	Y	NA
275494	275495	SAG0859	SAG0860	atpF	atpH	TRUE	0.994	0.000	0.222	0.004	Y	NA
275495	275496	SAG0860	SAG0861	atpH	atpA	TRUE	0.999	16.000	0.864	0.004	Y	NA
275496	275497	SAG0861	SAG0862	atpA	atpG	TRUE	0.999	16.000	0.846	0.004	Y	NA
275497	275498	SAG0862	SAG0863	atpG	atpD	TRUE	0.980	74.000	0.724	0.004	Y	NA
275498	275499	SAG0863	SAG0864	atpD	atpC	TRUE	0.999	13.000	0.837	0.004	Y	NA
275499	275500	SAG0864	SAG0865	atpC		TRUE	0.549	65.000	0.039	NA		NA
275500	275501	SAG0865	SAG0866		murA-2	TRUE	0.815	63.000	0.279	NA		NA
275501	275502	SAG0866	SAG0867	murA-2		TRUE	0.942	2.000	0.110	NA		NA
275502	275503	SAG0867	SAG0868		endA	TRUE	0.718	75.000	0.237	NA		NA
275503	275504	SAG0868	SAG0869	endA	pheS	FALSE	0.019	292.000	0.000	1.000		NA
275504	275505	SAG0869	SAG0870	pheS		FALSE	0.353	83.000	0.009	1.000		NA
275505	275506	SAG0870	SAG0871		pheT	TRUE	0.559	54.000	0.007	1.000		NA
275508	275509	SAG0873	SAG0874	rexB	rexA	TRUE	0.991	-10.000	0.070	0.064	Y	NA
275509	275510	SAG0874	SAG0875	rexA		TRUE	0.806	13.000	0.000	1.000	N	NA
275512	275513	SAG0877	SAG0878			FALSE	0.086	150.000	0.000	1.000		NA
275513	275514	SAG0878	SAG0879			TRUE	0.982	75.000	0.769	0.001	Y	NA
275514	275515	SAG0879	SAG0880			TRUE	0.619	127.000	0.051	0.056	Y	NA
275515	275516	SAG0880	SAG0881			TRUE	0.854	60.000	0.091	1.000	Y	NA
275516	275517	SAG0881	SAG0882		lplA-1	TRUE	0.572	98.000	0.200	1.000	N	NA
275518	275519	SAG0883	SAG0884			TRUE	0.996	0.000	0.796	1.000		NA
275520	275521	SAG0885	SAG0886			TRUE	0.987	3.000	0.502	NA		NA
275521	275522	SAG0886	SAG0887			TRUE	0.757	54.000	0.150	NA		NA
275522	275523	SAG0887	SAG0888			FALSE	0.144	123.000	0.000	NA		NA
275523	275524	SAG0888	SAG0889			TRUE	0.942	25.000	0.143	NA		NA
275524	275525	SAG0889	SAG0890			FALSE	0.215	92.000	0.000	NA		NA
275525	275526	SAG0890	SAG0891			TRUE	0.903	4.000	0.060	1.000	N	NA
275526	275527	SAG0891	SAG0892			TRUE	0.930	1.000	0.055	1.000	N	NA
275527	275528	SAG0892	SAG0893			TRUE	0.989	-10.000	0.330	NA		NA
275528	275529	SAG0893	SAG0894			FALSE	0.013	388.000	0.000	NA		NA
275529	275530	SAG0894	SAG0895			TRUE	0.990	2.000	0.546	NA		NA
275530	275531	SAG0895	SAG0896			TRUE	0.996	12.000	0.876	NA		NA
275531	275532	SAG0896	SAG0897			TRUE	0.986	-13.000	0.253	NA		NA
275532	275533	SAG0897	SAG0898			FALSE	0.170	112.000	0.000	NA		NA
11401406	275527		SAG0892			FALSE	NA	7108.000	0.000	NA		NA
11543769	275527		SAG0892			FALSE	NA	7108.000	0.000	NA		NA
11686161	275527		SAG0892			FALSE	NA	7108.000	0.000	NA		NA
275533	275534	SAG0898	SAG0899			TRUE	0.827	13.000	0.000	NA		NA
11401407	275527		SAG0892			FALSE	NA	7144.000	0.000	NA		NA
11543770	275527		SAG0892			FALSE	NA	7144.000	0.000	NA		NA
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10942615	275563	SAG0928	SAG0929			TRUE	0.905	-16.000	0.000	NA		NA
275563	275564	SAG0929	SAG0930			TRUE	0.906	-25.000	0.000	NA		NA
275564	275565	SAG0930	SAG0931			FALSE	0.160	117.000	0.000	NA		NA
275565	275566	SAG0931	SAG0932			TRUE	0.602	43.000	0.000	NA		NA
275566	275567	SAG0932	SAG0933			FALSE	0.049	178.000	0.000	1.000		NA
275567	275568	SAG0933	SAG0934			TRUE	0.757	29.000	0.000	NA		NA
275568	275569	SAG0934	SAG0935			TRUE	0.832	16.000	0.000	NA		NA
275569	275570	SAG0935	SAG0936			TRUE	0.817	23.000	0.000	NA		NA
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10942616	275571	SAG0937	SAG0938			TRUE	0.849	1.000	0.000	NA		NA
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275573	275574	SAG0940	SAG0941	pfk	pyk	TRUE	0.971	49.000	0.261	0.005	Y	NA
275574	275575	SAG0941	SAG0942	pyk		FALSE	0.138	171.000	0.072	1.000		NA
275577	275578	SAG0944	SAG0945	glmS		FALSE	0.042	177.000	0.000	1.000	N	NA
275578	275579	SAG0945	SAG0946		phnA	FALSE	0.062	179.000	0.000	0.058	N	NA
275579	275580	SAG0946	SAG0947	phnA		FALSE	0.180	135.000	0.018	1.000	N	NA
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275590	275591	SAG0957	SAG0958		nox-2	FALSE	0.034	205.000	0.000	1.000		NA
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275616	275617	SAG0984	SAG0985		ciaR	TRUE	0.998	-16.000	0.606	1.000	Y	NA
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275651	275652	SAG1019	SAG1020			FALSE	0.023	244.000	0.000	NA		NA
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275661	275662	SAG1030	SAG1031			TRUE	0.804	3.000	0.000	NA		NA
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275664	275665	SAG1033	SAG1034			FALSE	0.017	311.000	0.000	NA		NA
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275672	275673	SAG1041	SAG1042		carB	FALSE	0.128	127.000	0.000	NA		NA
275673	275674	SAG1042	SAG1043	carB	carA-1	TRUE	0.978	31.000	0.117	0.002	Y	NA
275674	275675	SAG1043	SAG1044	carA-1	pyrB	TRUE	0.971	14.000	0.014	1.000	Y	NA
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275677	275678	SAG1046	SAG1047	pyrE	pyrF	TRUE	0.983	13.000	0.133	1.000	Y	NA
275678	275679	SAG1047	SAG1048	pyrF		FALSE	0.030	213.000	0.000	NA		NA
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10942619	275681	SAG1050	SAG1051		asd	FALSE	0.055	170.000	0.000	NA		NA
275681	275682	SAG1051	SAG1052	asd		FALSE	0.032	210.000	0.000	1.000		NA
275684	275685	SAG1054	SAG1055	cls	fhs	FALSE	0.333	119.000	0.094	1.000	N	NA
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275688	275689	SAG1058	SAG1059			TRUE	0.966	-7.000	0.107	NA		NA
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275690	275691	SAG1060	SAG1061			TRUE	0.987	-3.000	0.100	NA	Y	NA
275691	275692	SAG1061	SAG1062			TRUE	0.943	-7.000	0.019	1.000	N	NA
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275694	275695	SAG1064	SAG1065			TRUE	0.725	46.000	0.019	NA		NA
275695	275696	SAG1065	SAG1066		pgm	TRUE	0.391	110.000	0.098	NA		NA
275696	275697	SAG1066	SAG1067	pgm		FALSE	0.289	72.000	0.000	NA		NA
275697	275698	SAG1067	SAG1068			TRUE	0.906	-24.000	0.000	NA		NA
275699	275700	SAG1069	SAG1070			TRUE	0.829	14.000	0.000	NA		NA
275700	275701	SAG1070	SAG1071			TRUE	0.999	1.000	0.895	0.005	Y	NA
275701	275702	SAG1071	SAG1072			TRUE	0.917	12.000	0.053	NA		NA
275702	275703	SAG1072	SAG1073			TRUE	0.948	2.000	0.128	NA		NA
275703	275704	SAG1073	SAG1074			TRUE	0.923	5.000	0.103	NA		NA
275704	275705	SAG1074	SAG1075			FALSE	0.317	92.000	0.015	NA	N	NA
275705	275706	SAG1075	SAG1076			TRUE	0.935	38.000	0.029	NA	Y	NA
275706	275707	SAG1076	SAG1077		prfA	TRUE	0.987	0.000	0.084	0.044	Y	NA
275707	275708	SAG1077	SAG1078	prfA	tdk	TRUE	0.843	35.000	0.062	1.000	N	NA
275711	275712	SAG1081	SAG1082			TRUE	0.974	18.000	0.243	NA		NA
275712	275713	SAG1082	SAG1083			TRUE	0.990	24.000	0.588	NA		NA
275713	275714	SAG1083	SAG1084			FALSE	0.198	99.000	0.000	NA		NA
275715	275716	SAG1085	SAG1086	pbuX	xpt	TRUE	0.982	0.000	0.046	1.000	Y	NA
275716	275717	SAG1086	SAG1087	xpt	guaC	FALSE	0.128	256.000	0.009	1.000	Y	NA
275717	275718	SAG1087	SAG1088	guaC		FALSE	0.035	204.000	0.000	1.000		NA
275720	275721	SAG1090	SAG1091			FALSE	0.110	135.000	0.000	1.000		NA
275721	275722	SAG1091	SAG1092			FALSE	0.147	174.000	0.031	0.050		NA
275722	275723	SAG1092	SAG1093			TRUE	0.899	26.000	0.067	1.000	N	NA
275723	275724	SAG1093	SAG1094			TRUE	0.969	-3.000	0.150	1.000	N	NA
275724	275725	SAG1094	SAG1095			TRUE	0.997	-25.000	0.725	1.000		NA
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275727	275728	SAG1097	SAG1098	prsA-2	iscS-1	TRUE	0.974	4.000	0.089	1.000	Y	NA
275728	275729	SAG1098	SAG1099	iscS-1		TRUE	0.958	2.000	0.166	NA		NA
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275773	275774	SAG1143	SAG1144		uraA	FALSE	0.094	133.000	0.000	NA	N	NA
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275857	275858	SAG1229	SAG1230			FALSE	0.028	224.000	0.000	NA		NA
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275864	10942624	SAG1239	SAG1240			FALSE	0.302	69.000	0.000	NA		NA
275865	10942625	SAG1241	SAG1242			TRUE	0.524	48.000	0.000	NA		NA
10942625	275866	SAG1242	SAG1243			FALSE	0.311	68.000	0.000	NA		NA
275866	275867	SAG1243	SAG1244			TRUE	0.988	36.000	0.667	0.055		NA
275870	275871	SAG1247	SAG1248			TRUE	0.967	23.000	0.222	NA		NA
275871	275872	SAG1248	SAG1249			FALSE	0.020	279.000	0.000	NA		NA
275872	275873	SAG1249	SAG1250			FALSE	0.045	181.000	0.000	NA		NA
275873	275874	SAG1250	SAG1251			TRUE	0.905	-13.000	0.000	NA		NA
275874	275875	SAG1251	SAG1252			TRUE	0.788	7.000	0.000	NA		NA
275875	275876	SAG1252	SAG1253			FALSE	0.012	421.000	0.000	NA		NA
275876	275877	SAG1253	SAG1254		merA-1	FALSE	0.058	160.000	0.000	1.000	N	NA
275877	275878	SAG1254	SAG1255	merA-1	merR-1	TRUE	0.846	29.000	0.000	0.002	N	NA
275879	275880	SAG1257	SAG1258		cadC	TRUE	0.885	-7.000	0.000	1.000	N	NA
275884	10942627	SAG1262	SAG1263			FALSE	0.012	425.000	0.000	NA		NA
10942627	275885	SAG1263	SAG1264			TRUE	0.905	-13.000	0.000	NA		NA
275885	275886	SAG1264	SAG1265			FALSE	0.010	425.000	0.000	NA	N	NA
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275888	275889	SAG1267	SAG1268			FALSE	0.043	184.000	0.000	NA		NA
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276022	276023	SAG1403	SAG1404			FALSE	0.018	301.000	0.000	NA		NA
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276037	276038	SAG1419	SAG1420			TRUE	0.899	-7.000	0.000	NA		NA
276038	276039	SAG1420	SAG1421			TRUE	0.994	-3.000	0.568	NA		NA
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276040	276041	SAG1422	SAG1423			TRUE	0.988	-10.000	0.289	NA		NA
276041	276042	SAG1423	SAG1424		rfbD	TRUE	0.776	117.000	0.212	1.000	Y	NA
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276044	276045	SAG1426	SAG1427	rpoD	dnaG	TRUE	0.954	8.000	0.209	1.000	N	NA
276047	276048	SAG1429	SAG1430	rpsU		FALSE	0.184	104.000	0.000	NA		NA
276048	276049	SAG1430	SAG1431			FALSE	0.233	83.000	0.000	NA		NA
276049	276050	SAG1431	SAG1432			FALSE	0.022	325.000	0.000	0.046	N	NA
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276057	276058	SAG1439	SAG1440	malQ		TRUE	0.767	121.000	0.538	1.000	N	NA
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276067	276068	SAG1450	SAG1451			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
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276077	276078	SAG1461	SAG1462			FALSE	0.015	331.000	0.000	NA		NA
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276133	276134	SAG1518	SAG1519		rplA	FALSE	0.011	389.000	0.000	1.000	N	NA
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276139	276140	SAG1524	SAG1525			FALSE	0.368	61.000	0.000	NA		NA
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276141	276142	SAG1526	SAG1527			TRUE	0.906	-24.000	0.000	NA		NA
276143	276144	SAG1528	SAG1529			FALSE	0.212	82.000	0.000	1.000	N	NA
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276147	276148	SAG1532	SAG1533			TRUE	0.409	171.000	0.135	1.000	Y	NA
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276151	276152	SAG1536	SAG1537			TRUE	0.931	0.000	0.025	NA		NA
276152	276153	SAG1537	SAG1538		glmU	TRUE	0.896	21.000	0.015	1.000	N	NA
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276157	10942634	SAG1542	SAG1543			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		NA
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276160	276161	SAG1546	SAG1547			FALSE	0.036	198.000	0.000	NA		NA
276161	276162	SAG1547	SAG1548			FALSE	0.024	240.000	0.000	NA		NA
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276165	276166	SAG1551	SAG1552			FALSE	0.233	140.000	0.083	NA		NA
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276170	276171	SAG1556	SAG1557	brnQ-1	metG	FALSE	0.033	196.000	0.000	1.000	N	NA
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276176	276177	SAG1562	SAG1563		exoA	FALSE	0.267	77.000	0.000	1.000		NA
276178	276179	SAG1564	SAG1565		ogt	TRUE	0.919	2.000	0.050	1.000	N	NA
276179	276180	SAG1565	SAG1566	ogt		TRUE	0.521	55.000	0.009	1.000	N	NA
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276181	10942635	SAG1567	SAG1568			FALSE	0.311	68.000	0.000	NA		NA
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276187	276188	SAG1574	SAG1575		tmk	TRUE	0.973	20.000	0.254	1.000	N	NA
276189	276190	SAG1577	SAG1578		livF	TRUE	0.970	19.000	0.214	1.000		NA
276190	276191	SAG1578	SAG1579	livF	livG	TRUE	0.990	0.000	0.128	0.022	Y	NA
276191	276192	SAG1579	SAG1580	livG		TRUE	0.994	1.000	0.349	1.000	Y	NA
276192	276193	SAG1580	SAG1581		livH	TRUE	0.994	3.000	0.363	0.034	Y	NA
276193	276194	SAG1581	SAG1582	livH		TRUE	0.748	106.000	0.150	1.000	Y	NA
276194	276195	SAG1582	SAG1583			FALSE	0.207	155.000	0.109	NA		NA
276195	276196	SAG1583	SAG1584			FALSE	0.051	174.000	0.000	NA		NA
276196	276197	SAG1584	SAG1585		clpP	FALSE	0.137	119.000	0.000	1.000	N	NA
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276200	276201	SAG1588	SAG1589			FALSE	0.046	173.000	0.000	1.000	N	NA
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276204	276205	SAG1592	SAG1593		rluB	TRUE	0.924	0.000	0.014	NA		NA
276205	276206	SAG1593	SAG1594	rluB		TRUE	0.983	-10.000	0.224	NA	N	NA
276206	276207	SAG1594	SAG1595			TRUE	0.994	-3.000	0.570	NA		NA
276207	276208	SAG1595	SAG1596			TRUE	0.927	0.000	0.017	NA		NA
276208	276209	SAG1596	SAG1597			TRUE	0.969	-10.000	0.111	NA		NA
276209	276210	SAG1597	SAG1598			TRUE	0.948	-3.000	0.034	NA		NA
276210	276211	SAG1598	SAG1599			TRUE	0.941	-18.000	0.005	1.000		NA
276211	276212	SAG1599	SAG1600		murI	TRUE	0.943	-3.000	0.034	1.000	N	NA
276212	276213	SAG1600	SAG1601	murI		FALSE	0.096	175.000	0.014	1.000		NA
276213	276214	SAG1601	SAG1602			FALSE	0.068	158.000	0.000	NA		NA
276214	276215	SAG1602	SAG1603			TRUE	0.644	62.000	0.107	NA		NA
276215	276216	SAG1603	SAG1604			FALSE	0.311	68.000	0.000	NA		NA
276216	276217	SAG1604	SAG1605			TRUE	0.940	23.000	0.123	NA		NA
276217	276218	SAG1605	SAG1606			TRUE	0.827	38.000	0.043	1.000		NA
276219	276220	SAG1607	SAG1608			TRUE	0.548	85.000	0.154	1.000	N	NA
276221	276222	SAG1609	SAG1610			TRUE	0.985	24.000	0.125	0.034	Y	NA
276222	276223	SAG1610	SAG1611			FALSE	0.056	161.000	0.000	1.000	N	NA
276223	276224	SAG1611	SAG1612		greA	FALSE	0.166	103.000	0.000	1.000	N	NA
276224	276225	SAG1612	SAG1613	greA		TRUE	0.526	73.000	0.079	NA		NA
276225	276226	SAG1613	SAG1614			TRUE	0.503	87.000	0.120	NA		NA
276226	276227	SAG1614	SAG1615		murC	FALSE	0.365	86.000	0.014	1.000		NA
276227	276228	SAG1615	SAG1616	murC		TRUE	0.872	10.000	0.013	NA		NA
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276229	276230	SAG1617	SAG1618			FALSE	0.359	62.000	0.000	NA		NA
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276231	276232	SAG1619	SAG1620			FALSE	0.044	185.000	0.000	1.000		NA
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276377	276378	SAG1766	SAG1767	pgk		FALSE	0.161	135.000	0.003	1.000		NA
276378	276379	SAG1767	SAG1768		gap	FALSE	0.033	209.000	0.000	1.000		NA
276379	276380	SAG1768	SAG1769	gap	fusA	FALSE	0.029	204.000	0.000	1.000	N	NA
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276382	276383	SAG1771	SAG1772	rpsL	purR	FALSE	0.025	219.000	0.000	1.000	N	NA
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276385	276386	SAG1774	SAG1775			TRUE	0.916	2.000	0.030	NA		NA
276386	276387	SAG1775	SAG1776		rpe	TRUE	0.975	-7.000	0.166	1.000	N	NA
276387	276388	SAG1776	SAG1777	rpe		TRUE	0.959	7.000	0.213	1.000		NA
276388	276389	SAG1777	SAG1778			FALSE	0.073	156.000	0.000	1.000		NA
276389	276390	SAG1778	SAG1779		ksgA	TRUE	0.801	4.000	0.000	1.000		NA
276390	276391	SAG1779	SAG1780	ksgA		FALSE	0.247	80.000	0.000	NA		NA
276391	276392	SAG1780	SAG1781			TRUE	0.837	19.000	0.000	NA		NA
276392	276393	SAG1781	SAG1782			TRUE	0.988	-13.000	0.058	NA	Y	NA
276393	276394	SAG1782	SAG1783			FALSE	0.044	182.000	0.000	NA		NA
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276395	276396	SAG1784	SAG1785			TRUE	0.902	-9.000	0.000	NA		NA
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276547	276548	SAG1938	SAG1939			FALSE	0.019	255.000	0.000	1.000	N	NA
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276550	276551	SAG1941	SAG1942	cpdB	nrdI-2	FALSE	0.354	157.000	0.022	NA	Y	NA
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276560	276561	SAG1951	SAG1952			FALSE	0.023	247.000	0.000	NA		NA
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10942640	276565	SAG1956	SAG1957			FALSE	0.254	78.000	0.000	NA		NA
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