MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus agalactiae A909

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
1166177	1166178	SAK_0001	SAK_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.723	155.000	0.328	1.000	Y	NA
1166178	1166179	SAK_0002	SAK_0003	dnaN		FALSE	0.261	70.000	0.003	1.000	N	NA
1166179	1166180	SAK_0003	SAK_0004			TRUE	0.879	10.000	0.015	NA		NA
1166180	1166181	SAK_0004	SAK_0005			FALSE	0.073	202.000	0.000	NA		NA
1166181	1166182	SAK_0005	SAK_0006		ychF	FALSE	0.070	244.000	0.002	NA		NA
1166182	1166183	SAK_0006	SAK_0007	ychF	pth	TRUE	0.778	84.000	0.184	1.000	Y	NA
1166183	1166184	SAK_0007	SAK_0008	pth	mfd	TRUE	0.968	-3.000	0.137	1.000	N	NA
1166184	1166185	SAK_0008	SAK_0009	mfd		FALSE	0.043	291.000	0.024	1.000	N	NA
1166185	1166186	SAK_0009	SAK_0010			TRUE	0.971	-13.000	0.053	1.000	N	NA
1166186	1166187	SAK_0010	SAK_0011			TRUE	0.881	3.000	0.009	NA		NA
1166187	1166188	SAK_0011	SAK_0012			TRUE	0.963	0.000	0.105	NA		NA
1166188	1166189	SAK_0012	SAK_0013		tilS	TRUE	0.863	2.000	0.014	NA	N	NA
1166189	1166190	SAK_0013	SAK_0014	tilS	hpt	TRUE	0.938	5.000	0.067	0.065	N	NA
1166190	1166191	SAK_0014	SAK_0015	hpt	ftsH	TRUE	0.948	23.000	0.192	1.000	N	NA
1166191	1166192	SAK_0015	SAK_0016	ftsH	rrsA	FALSE	0.019	499.000	0.000	NA		NA
1166192	1166193	SAK_0016	SAK_0017	rrsA		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166193	1166194	SAK_0017	SAK_0018		rrlA	FALSE	0.123	155.000	0.000	NA		NA
1166194	1166195	SAK_0018	SAK_0019	rrlA	rrfA	FALSE	0.280	75.000	0.000	NA		NA
1166195	1166196	SAK_0019	SAK_0020	rrfA		TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1166196	1166197	SAK_0020	SAK_0021			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166197	1166198	SAK_0021	SAK_0022			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166198	1166199	SAK_0022	SAK_0023			TRUE	0.790	10.000	0.000	NA		NA
1166199	1166200	SAK_0023	SAK_0024			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166200	1166201	SAK_0024	SAK_0025			TRUE	0.712	34.000	0.000	NA		NA
1166201	1166202	SAK_0025	SAK_0026			TRUE	0.792	9.000	0.000	NA		NA
1166202	1166203	SAK_0026	SAK_0027			TRUE	0.804	12.000	0.000	NA		NA
1166203	1166204	SAK_0027	SAK_0028			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
1166204	1166205	SAK_0028	SAK_0029		rrsB	FALSE	0.128	153.000	0.000	NA		NA
1166205	1166206	SAK_0029	SAK_0030	rrsB		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166206	1166207	SAK_0030	SAK_0031		rrlB	FALSE	0.123	155.000	0.000	NA		NA
1166207	1166208	SAK_0031	SAK_0032	rrlB	rrfB	FALSE	0.280	75.000	0.000	NA		NA
1166208	1166209	SAK_0032	SAK_0033	rrfB		TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1166209	1166210	SAK_0033	SAK_0034			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166210	1166211	SAK_0034	SAK_0035			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166211	1166212	SAK_0035	SAK_0036			TRUE	0.790	10.000	0.000	NA		NA
1166212	1166213	SAK_0036	SAK_0037			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166213	1166214	SAK_0037	SAK_0038			TRUE	0.712	34.000	0.000	NA		NA
1166214	1166215	SAK_0038	SAK_0039			TRUE	0.792	9.000	0.000	NA		NA
1166215	1166216	SAK_0039	SAK_0040			TRUE	0.804	12.000	0.000	NA		NA
1166216	1166217	SAK_0040	SAK_0041			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
1166217	1166218	SAK_0041	SAK_0042			TRUE	0.819	16.000	0.000	NA		NA
1166218	1166219	SAK_0042	SAK_0043			TRUE	0.822	20.000	0.000	NA		NA
1166219	1166220	SAK_0043	SAK_0044			TRUE	0.819	16.000	0.000	NA		NA
1166220	1166221	SAK_0044	SAK_0045			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166221	1166222	SAK_0045	SAK_0046			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166222	1166223	SAK_0046	SAK_0047			TRUE	0.822	20.000	0.000	NA		NA
1166223	1166224	SAK_0047	SAK_0048			TRUE	0.695	35.000	0.000	NA		NA
1166224	1166225	SAK_0048	SAK_0049			TRUE	0.825	14.000	0.000	NA		NA
1166225	1166226	SAK_0049	SAK_0050		pcsB	FALSE	0.053	236.000	0.000	NA		NA
1166226	1166227	SAK_0050	SAK_0051	pcsB	prs	TRUE	0.420	124.000	0.107	NA		NA
1166227	1166228	SAK_0051	SAK_0052	prs		TRUE	0.527	108.000	0.048	1.000	Y	NA
1166228	1166229	SAK_0052	SAK_0053		recO	TRUE	0.946	-10.000	0.012	1.000	N	NA
1166229	1166230	SAK_0053	SAK_0054	recO		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166230	1166231	SAK_0054	SAK_0055		plsX	FALSE	0.264	78.000	0.000	NA		NA
1166231	1166232	SAK_0055	SAK_0056	plsX		TRUE	0.977	11.000	0.017	0.008	Y	NA
1166232	1166233	SAK_0056	SAK_0057		purC	FALSE	0.172	124.000	0.017	1.000	N	NA
1166233	1166234	SAK_0057	SAK_0058	purC		FALSE	0.193	268.000	0.043	1.000	Y	NA
1166234	1166235	SAK_0058	SAK_0059		purF	FALSE	0.213	234.000	0.024	1.000	Y	NA
1166235	1166236	SAK_0059	SAK_0060	purF	purM	TRUE	0.981	28.000	0.248	1.000	Y	NA
1166236	1166237	SAK_0060	SAK_0061	purM	purN	TRUE	0.808	168.000	0.238	0.003	Y	NA
1166237	1166238	SAK_0061	SAK_0062	purN		TRUE	0.855	20.000	0.003	1.000		NA
1166238	1166239	SAK_0062	SAK_0063		purH	TRUE	0.853	20.000	0.002	1.000		NA
1166239	1166240	SAK_0063	SAK_0064	purH	zooA	FALSE	0.067	193.000	0.000	1.000		NA
1166240	1166241	SAK_0064	SAK_0065	zooA	sip	FALSE	0.113	147.000	0.000	1.000		NA
1166241	1166242	SAK_0065	SAK_0066	sip		FALSE	0.040	247.000	0.000	1.000		NA
1166242	1166243	SAK_0066	SAK_0067			TRUE	0.776	47.000	0.000	1.000	Y	NA
1166243	1166244	SAK_0067	SAK_0068			TRUE	0.590	88.000	0.000	0.054	Y	NA
1166244	1166245	SAK_0068	SAK_0069			TRUE	0.998	10.000	1.000	0.054	Y	NA
1166245	1166246	SAK_0069	SAK_0070			TRUE	0.987	13.000	0.250	NA	Y	NA
1166246	1166247	SAK_0070	SAK_0071			TRUE	0.822	20.000	0.000	NA		NA
1166247	1166248	SAK_0071	SAK_0072			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166248	1166249	SAK_0072	SAK_0073			TRUE	0.711	17.000	0.000	NA	N	NA
1166249	1166250	SAK_0073	SAK_0074			TRUE	0.913	8.000	0.105	NA	N	NA
1166252	1166253	SAK_0076	SAK_0077	purD	purE	FALSE	0.170	286.000	0.044	1.000	Y	NA
1166253	1166254	SAK_0077	SAK_0078	purE	purK	TRUE	0.994	-13.000	0.000	0.001	Y	NA
1166254	1166255	SAK_0078	SAK_0079	purK		TRUE	0.511	53.000	0.000	NA		NA
1166255	1166256	SAK_0079	SAK_0080		purB	TRUE	0.818	22.000	0.000	NA		NA
1166256	1166257	SAK_0080	SAK_0081	purB		FALSE	0.164	153.000	0.005	1.000		NA
1166257	1166258	SAK_0081	SAK_0082		ruvB	FALSE	0.090	201.000	0.002	1.000		NA
1166258	1166259	SAK_0082	SAK_0083	ruvB		FALSE	0.110	152.000	0.005	1.000	N	NA
1166259	1166260	SAK_0083	SAK_0084			TRUE	0.886	7.000	0.019	NA		NA
1166260	1166261	SAK_0084	SAK_0085			TRUE	0.991	-3.000	0.351	NA		NA
1166261	1166262	SAK_0085	SAK_0086			FALSE	0.018	270.000	0.000	1.000	N	NA
1166262	1166263	SAK_0086	SAK_0087			TRUE	0.339	179.000	0.012	0.003		NA
1166263	1166264	SAK_0087	SAK_0088		thrC	FALSE	0.198	120.000	0.003	1.000		NA
1166264	1166265	SAK_0088	SAK_0089	thrC		FALSE	0.080	105.000	0.000	1.000	N	NA
1166265	1166266	SAK_0089	SAK_0090		rpsJ	FALSE	0.030	205.000	0.000	1.000	N	NA
1166266	1166267	SAK_0090	SAK_0091	rpsJ	rplC	TRUE	0.917	105.000	0.467	0.037	Y	NA
1166267	1166268	SAK_0091	SAK_0092	rplC	rplD	TRUE	0.996	24.000	0.544	0.028	Y	NA
1166268	1166269	SAK_0092	SAK_0093	rplD	rplW	TRUE	0.996	0.000	0.307	0.028	Y	NA
1166269	1166270	SAK_0093	SAK_0094	rplW	rplB	TRUE	0.998	18.000	0.849	0.034	Y	NA
1166270	1166271	SAK_0094	SAK_0095	rplB	rpsS	TRUE	0.963	99.000	0.820	0.037	Y	NA
1166271	1166272	SAK_0095	SAK_0096	rpsS	rplV	TRUE	0.998	16.000	0.769	0.037	Y	NA
1166272	1166273	SAK_0096	SAK_0097	rplV	rpsC	TRUE	0.998	13.000	0.719	0.037	Y	NA
1166273	1166274	SAK_0097	SAK_0098	rpsC	rplP	TRUE	0.998	4.000	0.828	0.037	Y	NA
1166274	1166275	SAK_0098	SAK_0099	rplP	rpmC	TRUE	0.998	10.000	0.802	0.028	Y	NA
1166275	1166276	SAK_0099	SAK_0100	rpmC	rpsQ	TRUE	0.998	26.000	0.828	0.028	Y	NA
1166276	1166277	SAK_0100	SAK_0101	rpsQ	rplN	TRUE	0.998	25.000	0.791	0.037	Y	NA
1166277	1166278	SAK_0101	SAK_0102	rplN	rplX	TRUE	0.974	80.000	0.810	0.037	Y	NA
1166278	1166279	SAK_0102	SAK_0103	rplX	rplE	TRUE	0.998	24.000	0.758	0.028	Y	NA
1166279	1166280	SAK_0103	SAK_0104	rplE	rpsNA	TRUE	0.996	18.000	0.496	0.028	Y	NA
1166280	1166281	SAK_0104	SAK_0105	rpsNA	rpsH	TRUE	0.886	155.000	0.473	0.028	Y	NA
1166281	1166282	SAK_0105	SAK_0106	rpsH	rplF	TRUE	0.957	110.000	0.808	0.028	Y	NA
1166282	1166283	SAK_0106	SAK_0107	rplF	rplR	TRUE	0.962	101.000	0.815	0.028	Y	NA
1166283	1166284	SAK_0107	SAK_0108	rplR	rpsE	TRUE	0.998	19.000	0.814	0.037	Y	NA
1166284	1166285	SAK_0108	SAK_0109	rpsE	rpmD	TRUE	0.998	15.000	0.789	0.037	Y	NA
1166285	1166286	SAK_0109	SAK_0110	rpmD	rplO	TRUE	0.949	125.000	0.653	0.005	Y	NA
1166286	1166287	SAK_0110	SAK_0111	rplO	secY	TRUE	0.989	21.000	0.730	1.000	N	NA
1166287	1166288	SAK_0111	SAK_0112	secY	adk	TRUE	0.549	95.000	0.241	1.000	N	NA
1166288	1166289	SAK_0112	SAK_0113	adk	infA	FALSE	0.252	116.000	0.059	1.000	N	NA
1166289	1166290	SAK_0113	SAK_0114	infA	rpsM	TRUE	0.631	160.000	0.075	0.034	Y	NA
1166290	1166291	SAK_0114	SAK_0115	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	18.000	0.810	0.028	Y	NA
1166291	1166292	SAK_0115	SAK_0116	rpsK	rpoA	TRUE	0.886	50.000	0.308	1.000	N	NA
1166292	1166293	SAK_0116	SAK_0117	rpoA	rplQ	TRUE	0.992	15.000	0.873	1.000	N	NA
1166293	1166294	SAK_0117	SAK_0118	rplQ	rrsC	FALSE	0.016	592.000	0.000	NA		NA
1166294	1166295	SAK_0118	SAK_0119	rrsC		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166295	1166296	SAK_0119	SAK_0120		rrlC	FALSE	0.118	157.000	0.000	NA		NA
1166296	1166297	SAK_0120	SAK_0121	rrlC	rrfC	FALSE	0.280	75.000	0.000	NA		NA
1166297	1166298	SAK_0121	SAK_0122	rrfC		TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1166298	1166299	SAK_0122	SAK_0123			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166299	1166300	SAK_0123	SAK_0124			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166300	1166301	SAK_0124	SAK_0125			TRUE	0.790	10.000	0.000	NA		NA
1166301	1166302	SAK_0125	SAK_0126			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166302	1166303	SAK_0126	SAK_0127			TRUE	0.774	29.000	0.000	NA		NA
1166303	1166304	SAK_0127	SAK_0128			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
1166304	1166305	SAK_0128	SAK_0129			TRUE	0.825	14.000	0.000	NA		NA
1166305	1166306	SAK_0129	SAK_0130			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166306	1166307	SAK_0130	SAK_0131			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166307	1166308	SAK_0131	SAK_0132			TRUE	0.804	12.000	0.000	NA		NA
1166308	1166309	SAK_0132	SAK_0133			TRUE	0.793	7.000	0.000	NA		NA
1166309	1166310	SAK_0133	SAK_0134			TRUE	0.823	15.000	0.000	NA		NA
1166310	1166311	SAK_0134	SAK_0135			TRUE	0.793	7.000	0.000	NA		NA
1166311	1166312	SAK_0135	SAK_0136			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166312	1166313	SAK_0136	SAK_0137			FALSE	0.022	414.000	0.000	NA		NA
1166313	1166314	SAK_0137	SAK_0138			FALSE	0.313	70.000	0.000	NA		NA
1166314	1166315	SAK_0138	SAK_0139			FALSE	0.015	916.000	0.000	NA		NA
1166315	1166316	SAK_0139	SAK_0140			FALSE	0.059	220.000	0.000	NA		NA
1166316	1166317	SAK_0140	SAK_0141		comX	FALSE	0.075	200.000	0.000	NA		NA
1166317	1166318	SAK_0141	SAK_0142	comX		FALSE	0.136	122.000	0.000	1.000		NA
1166318	1166319	SAK_0142	SAK_0143			TRUE	0.974	-3.000	0.174	1.000	N	NA
1166319	1166320	SAK_0143	SAK_0144			TRUE	0.974	-3.000	0.174	1.000	N	NA
1166320	1166321	SAK_0144	SAK_0145		hrcA	FALSE	0.125	143.000	0.009	1.000	N	NA
1166321	1166322	SAK_0145	SAK_0146	hrcA	grpE	TRUE	0.724	42.000	0.051	1.000	N	NA
1166322	1166323	SAK_0146	SAK_0147	grpE	dnaK	TRUE	0.526	181.000	0.026	0.007	Y	NA
1166323	1166324	SAK_0147	SAK_0148	dnaK	dnaJ	TRUE	0.528	289.000	0.196	0.004	Y	NA
1166324	1166325	SAK_0148	SAK_0149	dnaJ		FALSE	0.073	114.000	0.000	1.000	N	NA
1166325	1166326	SAK_0149	SAK_0150		truA	FALSE	0.153	71.000	0.000	1.000	N	NA
1166326	1166327	SAK_0150	SAK_0151	truA		TRUE	0.979	-37.000	0.058	1.000	N	NA
1166327	1166328	SAK_0151	SAK_0152			TRUE	0.970	10.000	0.276	NA		NA
1166328	1166329	SAK_0152	SAK_0153			TRUE	0.980	-3.000	0.149	NA		NA
1166331	1166332	SAK_0155	SAK_0156	tig	rpoE	FALSE	0.070	189.000	0.005	1.000	N	NA
1166332	1166333	SAK_0156	SAK_0157	rpoE	pyrG	FALSE	0.050	273.000	0.029	1.000	N	NA
1166333	1166334	SAK_0157	SAK_0158	pyrG		FALSE	0.226	109.000	0.002	NA		NA
1166334	1166335	SAK_0158	SAK_0159			TRUE	0.572	47.000	0.000	NA		NA
1166335	1166336	SAK_0159	SAK_0160		dut	TRUE	0.395	63.000	0.000	NA		NA
1166336	1166337	SAK_0160	SAK_0161	dut	radA	FALSE	0.133	162.000	0.028	1.000	N	NA
1166337	1166338	SAK_0161	SAK_0162	radA		FALSE	0.131	136.000	0.009	1.000	N	NA
1166338	1166339	SAK_0162	SAK_0163			FALSE	0.056	154.000	0.000	1.000	N	NA
1166342	1166343	SAK_0166	SAK_0167	rbsB	rbsC	TRUE	0.987	53.000	0.847	NA	Y	NA
1166343	1166344	SAK_0167	SAK_0168	rbsC	rbsA	TRUE	0.988	11.000	0.358	1.000	Y	NA
1166344	1166345	SAK_0168	SAK_0169	rbsA	rbsD	TRUE	0.985	16.000	0.243	1.000	Y	NA
1166345	1166346	SAK_0169	SAK_0170	rbsD	rbsK	TRUE	0.997	-25.000	0.183	1.000	Y	NA
1166346	1166347	SAK_0170	SAK_0171	rbsK	rbsR	TRUE	0.988	-7.000	0.281	1.000	N	NA
1166348	1166349	SAK_0172	SAK_0173			TRUE	0.991	0.000	0.591	NA	N	NA
1166349	1166350	SAK_0173	SAK_0174			TRUE	0.902	31.000	0.133	1.000	N	NA
1166350	1166351	SAK_0174	SAK_0175			TRUE	0.998	-7.000	0.500	1.000	Y	NA
1166351	1166352	SAK_0175	SAK_0176		argG	FALSE	0.056	154.000	0.000	1.000	N	NA
1166352	1166353	SAK_0176	SAK_0177	argG	argH	TRUE	0.987	19.000	0.278	1.000	Y	NA
1166353	1166354	SAK_0177	SAK_0178	argH	fba	FALSE	0.061	141.000	0.000	1.000	N	NA
1166356	1166357	SAK_0180	SAK_0181	rpmB		FALSE	0.302	132.000	0.044	NA		NA
1166357	1166358	SAK_0181	SAK_0182			TRUE	0.982	33.000	0.567	NA		NA
1166358	1166359	SAK_0182	SAK_0183			FALSE	0.201	148.000	0.006	NA		NA
1166359	1166360	SAK_0183	SAK_0184			FALSE	0.013	401.000	0.000	NA	N	NA
1166361	1166362	SAK_0185	SAK_0186		bag	FALSE	0.091	178.000	0.000	NA		NA
1166362	1166363	SAK_0186	SAK_0187	bag		FALSE	0.221	80.000	0.000	1.000		NA
1166363	1166364	SAK_0187	SAK_0188			TRUE	0.818	109.000	0.667	1.000		NA
1166364	1166365	SAK_0188	SAK_0189			TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
1166365	1166366	SAK_0189	SAK_0190			FALSE	0.095	204.000	0.000	0.076	N	NA
1166366	1166367	SAK_0190	SAK_0191			TRUE	0.987	33.000	0.750	NA		NA
1166367	1166368	SAK_0191	SAK_0192			FALSE	0.180	101.000	0.000	NA		NA
1166368	1166369	SAK_0192	SAK_0193			FALSE	0.028	341.000	0.000	NA		NA
1166369	1166370	SAK_0193	SAK_0194			TRUE	0.995	10.000	0.758	1.000	Y	NA
1166371	1166372	SAK_0195	SAK_0196			TRUE	0.853	46.000	0.118	NA		NA
1166372	1166373	SAK_0196	SAK_0197			TRUE	0.383	120.000	0.132	NA	N	NA
1166373	1166374	SAK_0197	SAK_0198			TRUE	0.970	2.000	0.267	NA	N	NA
1166374	1166375	SAK_0198	SAK_0199		sufC	FALSE	0.108	165.000	0.013	1.000	N	NA
1166375	1166376	SAK_0199	SAK_0200	sufC	sufD	TRUE	0.949	37.000	0.139	1.000	Y	NA
1166376	1166377	SAK_0200	SAK_0201	sufD	sufS	TRUE	0.987	2.000	0.606	1.000	N	NA
1166377	1166378	SAK_0201	SAK_0202	sufS		TRUE	0.992	-13.000	0.292	1.000	N	NA
1166378	1166379	SAK_0202	SAK_0203		sufB	TRUE	0.689	100.000	0.152	0.002	N	NA
1166380	1166381	SAK_0204	SAK_0205			TRUE	0.838	153.000	0.231	0.003	Y	NA
1166382	1166383	SAK_0206	SAK_0207		oppD	TRUE	0.502	119.000	0.000	0.053	Y	NA
1166383	1166384	SAK_0207	SAK_0208	oppD		TRUE	0.968	10.000	0.134	0.053		NA
1166384	1166385	SAK_0208	SAK_0209		oppD	TRUE	0.974	13.000	0.286	1.000		NA
1166385	1166386	SAK_0209	SAK_0210	oppD	oppF	TRUE	0.999	0.000	0.619	0.002	Y	NA
1166386	1166387	SAK_0210	SAK_0211	oppF	rrsD	FALSE	0.023	405.000	0.000	NA		NA
1166387	1166388	SAK_0211	SAK_0212	rrsD		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166388	1166389	SAK_0212	SAK_0213		rrlD	FALSE	0.118	157.000	0.000	NA		NA
1166389	1166390	SAK_0213	SAK_0214	rrlD	rrfD	FALSE	0.280	75.000	0.000	NA		NA
1166390	1166391	SAK_0214	SAK_0215	rrfD		TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1166391	1166392	SAK_0215	SAK_0216		ispE	FALSE	0.139	140.000	0.000	NA		NA
1166392	1166393	SAK_0216	SAK_0217	ispE	adcR	FALSE	0.294	86.000	0.008	1.000		NA
1166393	1166394	SAK_0217	SAK_0218	adcR	adcC	TRUE	0.961	3.000	0.192	1.000		NA
1166394	1166395	SAK_0218	SAK_0219	adcC	adcB	TRUE	0.999	-10.000	0.673	1.000	Y	NA
1166396	1166397	SAK_0220	SAK_0221		tyrS	FALSE	0.014	579.000	0.000	1.000		NA
1166398	1166399	SAK_0222	SAK_0223		rpoB	FALSE	0.007	524.000	0.000	1.000	N	NA
1166399	1166400	SAK_0223	SAK_0224	rpoB	rpoC	TRUE	0.968	117.000	0.851	0.003	Y	NA
1166400	1166401	SAK_0224	SAK_0225	rpoC		FALSE	0.243	114.000	0.007	NA		NA
1166401	1166402	SAK_0225	SAK_0226		comGA	FALSE	0.262	173.000	0.083	NA		NA
1166402	1166403	SAK_0226	SAK_0227	comGA		TRUE	0.979	35.000	0.639	1.000		NA
1166403	1166404	SAK_0227	SAK_0228			TRUE	0.999	-3.000	0.861	1.000	Y	NA
1166404	1166405	SAK_0228	SAK_0229			TRUE	0.825	50.000	0.110	NA		NA
1166405	1166406	SAK_0229	SAK_0230			TRUE	0.999	-28.000	0.786	NA		NA
1166406	1166407	SAK_0230	SAK_0231			TRUE	0.973	23.000	0.250	NA		NA
1166407	1166408	SAK_0231	SAK_0232			TRUE	0.995	-22.000	0.232	NA		NA
1166408	1166409	SAK_0232	SAK_0233			TRUE	0.397	115.000	0.087	NA		NA
1166409	1166410	SAK_0233	SAK_0234		ackA	TRUE	0.896	32.000	0.130	1.000	N	NA
1166410	1166411	SAK_0234	SAK_0235	ackA		FALSE	0.249	152.000	0.094	1.000	N	NA
1166411	1166412	SAK_0235	SAK_0236			TRUE	0.449	59.000	0.000	NA		NA
1166412	1166413	SAK_0236	SAK_0237			TRUE	0.636	41.000	0.000	NA		NA
1166413	1166414	SAK_0237	SAK_0238			TRUE	0.323	69.000	0.000	NA		NA
1166415	1166416	SAK_0239	SAK_0240	proC	pepA	TRUE	0.397	70.000	0.041	1.000	N	NA
1166416	1166417	SAK_0240	SAK_0241	pepA		FALSE	0.085	185.000	0.000	NA		NA
1166418	1166419	SAK_0242	SAK_0243			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166419	1166420	SAK_0243	SAK_0244			TRUE	0.951	33.000	0.239	1.000		NA
1166422	1166423	SAK_0246	SAK_0247	ssb2		FALSE	0.134	124.000	0.000	1.000		NA
1166423	1166424	SAK_0247	SAK_0248			TRUE	0.752	27.000	0.000	1.000		NA
1166424	1166425	SAK_0248	SAK_0249			TRUE	0.999	-19.000	0.538	0.019	Y	NA
1166425	1166426	SAK_0249	SAK_0250			TRUE	0.368	170.000	0.178	1.000		NA
1166426	1166427	SAK_0250	SAK_0251			TRUE	0.994	2.000	0.869	1.000		NA
1166427	1166428	SAK_0251	SAK_0252			FALSE	0.021	243.000	0.000	1.000	N	NA
1166428	1166429	SAK_0252	SAK_0253			TRUE	0.508	113.000	0.000	0.052	Y	NA
1166429	1166430	SAK_0253	SAK_0254			TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.052	Y	NA
1166430	1166431	SAK_0254	SAK_0255			TRUE	0.987	12.000	0.333	1.000	Y	NA
1166431	1166432	SAK_0255	SAK_0256			TRUE	1.000	-16.000	0.750	0.031	Y	NA
1166432	1166433	SAK_0256	SAK_0257			FALSE	0.016	283.000	0.000	1.000	N	NA
1166433	1166434	SAK_0257	SAK_0258			TRUE	0.726	222.000	0.650	1.000	Y	NA
1166434	1166435	SAK_0258	SAK_0259			FALSE	0.026	216.000	0.000	1.000	N	NA
1166435	1166436	SAK_0259	SAK_0260			TRUE	0.973	3.000	0.156	0.019	N	NA
1166436	1166437	SAK_0260	SAK_0261			TRUE	0.981	13.000	0.182	0.028		NA
1166437	1166438	SAK_0261	SAK_0262			TRUE	0.976	3.000	0.333	1.000		NA
1166438	1166439	SAK_0262	SAK_0263			TRUE	0.999	-3.000	0.742	0.003	Y	NA
1166439	1166440	SAK_0263	SAK_0264			FALSE	0.076	109.000	0.000	1.000	N	NA
1166440	1166441	SAK_0264	SAK_0265		rpsO	FALSE	0.101	88.000	0.000	1.000	N	NA
1166441	1166442	SAK_0265	SAK_0266	rpsO	pnp	TRUE	0.336	381.000	0.335	1.000	Y	NA
1166442	1166443	SAK_0266	SAK_0267	pnp		TRUE	0.898	2.000	0.009	NA		NA
1166443	1166444	SAK_0267	SAK_0268		cysE	TRUE	0.933	9.000	0.097	NA		NA
1166444	1166445	SAK_0268	SAK_0269	cysE		TRUE	0.790	10.000	0.000	NA		NA
1166445	1166446	SAK_0269	SAK_0270		cysS	TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166446	1166447	SAK_0270	SAK_0271	cysS		TRUE	0.982	-7.000	0.129	1.000		NA
1166447	1166448	SAK_0271	SAK_0272			TRUE	0.711	103.000	0.150	0.006		NA
1166448	1166449	SAK_0272	SAK_0273			TRUE	0.975	-3.000	0.109	NA		NA
1166449	1166450	SAK_0273	SAK_0274			TRUE	0.359	93.000	0.036	NA		NA
1166450	1166451	SAK_0274	SAK_0275			FALSE	0.027	345.000	0.000	NA		NA
1166451	1166452	SAK_0275	SAK_0276		rplM	FALSE	0.022	417.000	0.000	NA		NA
1166452	1166453	SAK_0276	SAK_0277	rplM	rpsI	TRUE	0.997	21.000	0.601	0.027	Y	NA
1166454	1166455	SAK_0278	SAK_0279			FALSE	0.283	69.000	0.000	1.000		NA
1166456	1166457	SAK_0280	SAK_0281			TRUE	0.726	141.000	0.500	NA		NA
1166457	1166458	SAK_0281	SAK_0282			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1166458	1166459	SAK_0282	SAK_0283			TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1166459	1166460	SAK_0283	SAK_0284			FALSE	0.034	300.000	0.000	NA		NA
1166460	1166461	SAK_0284	SAK_0285			TRUE	0.682	36.000	0.000	NA		NA
1166461	1166462	SAK_0285	SAK_0286		pre	FALSE	0.032	317.000	0.000	NA		NA
1166462	1166463	SAK_0286	SAK_0287	pre		TRUE	0.840	168.000	1.000	NA		NA
1166464	1166465	SAK_0288	SAK_0289			TRUE	0.947	-10.000	0.000	NA		NA
1166466	1166467	SAK_0290	SAK_0291			FALSE	0.178	102.000	0.000	NA		NA
1166467	1166468	SAK_0291	SAK_0292			TRUE	0.997	0.000	1.000	NA		NA
1166468	1166469	SAK_0292	SAK_0293			TRUE	0.963	-27.000	0.000	NA		NA
1166469	1166470	SAK_0293	SAK_0294			TRUE	0.955	-15.000	0.000	NA		NA
1166470	1166471	SAK_0294	SAK_0295			TRUE	0.712	34.000	0.000	NA		NA
1166471	1166472	SAK_0295	SAK_0296			FALSE	0.196	91.000	0.000	NA		NA
1166472	1166473	SAK_0296	SAK_0297			FALSE	0.021	428.000	0.000	NA		NA
1166473	1166474	SAK_0297	SAK_0298			FALSE	0.160	122.000	0.000	NA		NA
1166474	1166475	SAK_0298	SAK_0299			TRUE	0.711	73.000	0.200	1.000		NA
1166476	1166477	SAK_0300	SAK_0301			TRUE	0.994	1.000	0.619	0.051	N	NA
1166477	1166478	SAK_0301	SAK_0302			TRUE	0.992	3.000	0.650	0.051	N	NA
1166478	1166479	SAK_0302	SAK_0303			TRUE	0.997	0.000	0.450	0.098	Y	NA
1166480	1166481	SAK_0304	SAK_0305	rrsE		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166481	1166482	SAK_0305	SAK_0306		rrlE	FALSE	0.123	155.000	0.000	NA		NA
1166482	1166483	SAK_0306	SAK_0307	rrlE	rrfE	FALSE	0.280	75.000	0.000	NA		NA
1166483	1166484	SAK_0307	SAK_0308	rrfE		TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1166484	1166485	SAK_0308	SAK_0309			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1166485	1166486	SAK_0309	SAK_0310			TRUE	0.670	37.000	0.000	NA		NA
1166486	1166487	SAK_0310	SAK_0311			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
1166487	1166488	SAK_0311	SAK_0312			TRUE	0.825	14.000	0.000	NA		NA
1166488	1166489	SAK_0312	SAK_0313			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166489	1166490	SAK_0313	SAK_0314			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166490	1166491	SAK_0314	SAK_0315			TRUE	0.804	12.000	0.000	NA		NA
1166491	1166492	SAK_0315	SAK_0316			TRUE	0.793	7.000	0.000	NA		NA
1166492	1166493	SAK_0316	SAK_0317			TRUE	0.823	15.000	0.000	NA		NA
1166493	1166494	SAK_0317	SAK_0318			TRUE	0.793	7.000	0.000	NA		NA
1166494	1166495	SAK_0318	SAK_0319			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1166495	1166496	SAK_0319	SAK_0320			FALSE	0.148	131.000	0.000	NA		NA
1166496	1166497	SAK_0320	SAK_0321			FALSE	0.046	251.000	0.000	NA		NA
1166497	1166498	SAK_0321	SAK_0322			TRUE	0.381	64.000	0.000	NA		NA
1166498	1166499	SAK_0322	SAK_0323			TRUE	0.995	19.000	1.000	NA		NA
1166499	1166500	SAK_0323	SAK_0324			TRUE	0.790	10.000	0.000	NA		NA
1166500	1166501	SAK_0324	SAK_0325			FALSE	0.015	861.000	0.000	NA		NA
1166501	1166502	SAK_0325	SAK_0326			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166502	1166503	SAK_0326	SAK_0327			FALSE	0.007	573.000	0.000	1.000	N	NA
1166503	1166504	SAK_0327	SAK_0328			TRUE	0.596	100.000	0.000	0.015	Y	NA
1166504	1166505	SAK_0328	SAK_0329			TRUE	0.912	43.000	0.000	0.015	Y	NA
1166506	1166507	SAK_0330	SAK_0331			TRUE	0.990	-3.000	0.333	NA		NA
1166507	1166508	SAK_0331	SAK_0332			FALSE	0.084	580.000	0.000	0.047	Y	NA
1166508	1166509	SAK_0332	SAK_0333			TRUE	0.899	24.000	0.085	1.000	N	NA
1166509	1166510	SAK_0333	SAK_0334			TRUE	0.988	3.000	0.713	1.000	N	NA
1166510	1166511	SAK_0334	SAK_0335			FALSE	0.044	264.000	0.000	NA		NA
1166511	1166512	SAK_0335	SAK_0336			TRUE	0.934	21.000	0.069	NA		NA
1166513	1166514	SAK_0337	SAK_0338		nagA	FALSE	0.039	278.000	0.000	NA		NA
1166514	1166515	SAK_0338	SAK_0339	nagA		FALSE	0.136	119.000	0.000	1.000		NA
1166515	1166516	SAK_0339	SAK_0340		glyQ	FALSE	0.027	313.000	0.000	1.000		NA
1166516	1166517	SAK_0340	SAK_0341	glyQ		TRUE	0.736	0.000	0.000	1.000	N	NA
1166517	1166518	SAK_0341	SAK_0342		glyS	TRUE	0.622	4.000	0.000	1.000	N	NA
1166518	1166519	SAK_0342	SAK_0343	glyS		TRUE	0.894	12.000	0.020	NA		NA
1166519	1166520	SAK_0343	SAK_0344			FALSE	0.210	89.000	0.000	NA		NA
1166520	1166521	SAK_0344	SAK_0345		glpK	FALSE	0.162	115.000	0.000	NA		NA
1166521	1166522	SAK_0345	SAK_0346	glpK	glpO	TRUE	0.997	13.000	0.500	0.002	Y	NA
1166522	1166523	SAK_0346	SAK_0347	glpO	glpF	TRUE	0.979	12.000	0.500	1.000	N	NA
1166523	1166524	SAK_0347	SAK_0348	glpF		TRUE	0.741	88.000	0.364	1.000		NA
1166524	1166525	SAK_0348	SAK_0349			TRUE	0.996	-9.000	0.462	NA		NA
1166525	1166526	SAK_0349	SAK_0350		tkt	FALSE	0.157	125.000	0.000	NA		NA
1166526	1166527	SAK_0350	SAK_0351	tkt		FALSE	0.063	213.000	0.000	NA		NA
1166527	1166528	SAK_0351	SAK_0352			TRUE	0.956	20.000	0.136	NA		NA
1166528	1166529	SAK_0352	SAK_0353			TRUE	0.978	4.000	0.341	NA		NA
1166531	1166532	SAK_0355	SAK_0356	proB	proA	TRUE	0.994	10.000	0.281	0.002	Y	NA
1166532	1166533	SAK_0356	SAK_0357	proA	mraW	FALSE	0.193	83.000	0.003	1.000	N	NA
1166533	1166534	SAK_0357	SAK_0358	mraW		TRUE	0.902	15.000	0.077	1.000	N	NA
1166534	1166535	SAK_0358	SAK_0359		pbpX	TRUE	0.670	109.000	0.456	1.000	N	NA
1166535	1166536	SAK_0359	SAK_0360	pbpX	mraY	TRUE	0.963	2.000	0.038	1.000	Y	NA
1166536	1166537	SAK_0360	SAK_0361	mraY		FALSE	0.166	98.000	0.007	1.000	N	NA
1166537	1166538	SAK_0361	SAK_0362			FALSE	0.185	138.000	0.036	1.000	N	NA
1166538	1166539	SAK_0362	SAK_0363			TRUE	0.801	95.000	0.143	0.050	Y	NA
1166539	1166540	SAK_0363	SAK_0364			TRUE	0.992	0.000	0.310	1.000	Y	NA
1166540	1166541	SAK_0364	SAK_0365			TRUE	0.686	122.000	0.364	NA		NA
1166541	1166542	SAK_0365	SAK_0366		trxB	TRUE	0.662	69.000	0.117	NA		NA
1166542	1166543	SAK_0366	SAK_0367	trxB		FALSE	0.126	158.000	0.017	1.000	N	NA
1166543	1166544	SAK_0367	SAK_0368		nadE	TRUE	0.997	-3.000	0.194	0.003	Y	NA
1166544	1166545	SAK_0368	SAK_0369	nadE	pepC	FALSE	0.177	113.000	0.017	1.000	N	NA
1166546	1166547	SAK_0370	SAK_0371		recU	TRUE	0.994	-13.000	0.319	1.000		NA
1166548	1166549	SAK_0372	SAK_0373			TRUE	0.795	121.000	0.579	NA		NA
1166549	1166550	SAK_0373	SAK_0374			FALSE	0.019	470.000	0.000	NA		NA
1166550	1166551	SAK_0374	SAK_0375			TRUE	0.908	13.000	0.029	NA		NA
1166553	1166554	SAK_0377	SAK_0378			FALSE	0.128	129.000	0.000	1.000		NA
1166554	1166555	SAK_0378	SAK_0379			TRUE	0.990	-13.000	0.136	NA		NA
1166555	1166556	SAK_0379	SAK_0380			TRUE	0.994	-3.000	0.500	NA		NA
1166556	1166557	SAK_0380	SAK_0381			TRUE	0.999	2.000	0.857	0.019	Y	NA
1166557	1166558	SAK_0381	SAK_0382			TRUE	0.545	50.000	0.000	NA		NA
1166558	1166559	SAK_0382	SAK_0383		gmk	FALSE	0.105	167.000	0.000	NA		NA
1166559	1166560	SAK_0383	SAK_0384	gmk	rpoZ	TRUE	0.979	23.000	0.471	1.000	N	NA
1166560	1166561	SAK_0384	SAK_0385	rpoZ	priA	TRUE	0.542	74.000	0.032	0.073	N	NA
1166561	1166562	SAK_0385	SAK_0386	priA	fmt	TRUE	0.683	47.000	0.052	1.000	N	NA
1166562	1166563	SAK_0386	SAK_0387	fmt	sun	TRUE	0.997	-10.000	0.305	1.000	Y	NA
1166563	1166564	SAK_0387	SAK_0388	sun	stp1	TRUE	0.791	38.000	0.074	1.000	N	NA
1166564	1166565	SAK_0388	SAK_0389	stp1	stk1	TRUE	0.997	0.000	0.704	1.000	Y	NA
1166565	1166566	SAK_0389	SAK_0390	stk1		FALSE	0.233	161.000	0.039	NA		NA
1166566	1166567	SAK_0390	SAK_0391			TRUE	0.996	-3.000	0.679	NA		NA
1166567	1166568	SAK_0391	SAK_0392			TRUE	0.999	-7.000	0.853	0.019	Y	NA
1166568	1166569	SAK_0392	SAK_0393			TRUE	0.889	42.000	0.164	1.000		NA
1166569	1166570	SAK_0393	SAK_0394			TRUE	0.990	-16.000	0.151	1.000		NA
1166572	1166573	SAK_0396	SAK_0397			TRUE	0.808	119.000	0.188	0.045	Y	NA
1166573	1166574	SAK_0397	SAK_0398			FALSE	0.141	204.000	0.091	1.000	N	NA
1166574	1166575	SAK_0398	SAK_0399			TRUE	0.999	17.000	0.889	0.015	Y	NA
1166575	1166576	SAK_0399	SAK_0400			TRUE	0.999	2.000	0.889	0.015	Y	NA
1166576	1166577	SAK_0400	SAK_0401			FALSE	0.216	181.000	0.132	1.000	N	NA
1166577	1166578	SAK_0401	SAK_0402			TRUE	0.968	10.000	0.368	1.000	N	NA
1166578	1166579	SAK_0402	SAK_0403		gldA	TRUE	0.699	68.000	0.211	1.000	N	NA
1166580	1166581	SAK_0404	SAK_0405			TRUE	0.330	91.000	0.033	1.000		NA
1166582	1166583	SAK_0406	SAK_0407			TRUE	0.964	0.000	0.130	1.000		NA
1166583	1166584	SAK_0407	SAK_0408		yfiA	TRUE	0.544	77.000	0.080	NA		NA
1166584	1166585	SAK_0408	SAK_0409	yfiA	rrsF	FALSE	0.030	330.000	0.000	NA		NA
1166585	1166586	SAK_0409	SAK_0410	rrsF		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166586	1166587	SAK_0410	SAK_0411		rrlF	FALSE	0.123	155.000	0.000	NA		NA
1166587	1166588	SAK_0411	SAK_0412	rrlF	rrfF	FALSE	0.280	75.000	0.000	NA		NA
1166588	1166589	SAK_0412	SAK_0413	rrfF		TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1166591	1166592	SAK_0415	SAK_0416			TRUE	0.487	137.000	0.083	0.063		NA
1166592	1166593	SAK_0416	SAK_0417			TRUE	0.346	96.000	0.098	1.000	N	NA
1166593	1166594	SAK_0417	SAK_0418		fabH	TRUE	0.929	0.000	0.070	1.000	N	NA
1166594	1166595	SAK_0418	SAK_0419	fabH	acpP	TRUE	0.859	58.000	0.065	0.008		NA
1166595	1166596	SAK_0419	SAK_0420	acpP	fabK	TRUE	0.471	155.000	0.216	1.000		NA
1166596	1166597	SAK_0420	SAK_0421	fabK	fabD	TRUE	0.938	20.000	0.099	1.000		NA
1166597	1166598	SAK_0421	SAK_0422	fabD	fabG	TRUE	0.995	9.000	0.432	0.008	Y	NA
1166598	1166599	SAK_0422	SAK_0423	fabG	fabF	TRUE	0.963	16.000	0.056	1.000	Y	NA
1166599	1166600	SAK_0423	SAK_0424	fabF	accB	TRUE	0.971	2.000	0.074	1.000	Y	NA
1166600	1166601	SAK_0424	SAK_0425	accB	fabZ	TRUE	0.992	-3.000	0.047	0.008	Y	NA
1166601	1166602	SAK_0425	SAK_0426	fabZ	accC	TRUE	0.911	38.000	0.045	1.000	Y	NA
1166602	1166603	SAK_0426	SAK_0427	accC	accD	TRUE	0.986	9.000	0.090	0.003	Y	NA
1166603	1166604	SAK_0427	SAK_0428	accD	accA	TRUE	0.998	-7.000	0.234	0.002	Y	NA
1166604	1166605	SAK_0428	SAK_0429	accA		FALSE	0.019	470.000	0.000	NA		NA
1166608	1166609	SAK_0432	SAK_0433			TRUE	0.671	179.000	0.583	NA		NA
1166609	1166610	SAK_0433	SAK_0434			TRUE	0.998	15.000	0.812	0.027	Y	NA
1166610	1166611	SAK_0434	SAK_0435			TRUE	0.998	33.000	0.943	0.027	Y	NA
1166611	1166612	SAK_0435	SAK_0436			FALSE	0.028	302.000	0.000	1.000		NA
1166613	1166614	SAK_0437	SAK_0438			TRUE	0.760	90.000	0.400	NA		NA
1166614	1166615	SAK_0438	SAK_0439			FALSE	0.101	292.000	0.068	NA		NA
1166615	1166616	SAK_0439	SAK_0440			TRUE	0.345	83.000	0.008	NA		NA
1166616	1166617	SAK_0440	SAK_0441			TRUE	0.970	-7.000	0.033	NA		NA
1166617	1166618	SAK_0441	SAK_0442			TRUE	0.971	9.000	0.283	NA		NA
1166619	1166620	SAK_0443	SAK_0444			TRUE	0.967	-3.000	0.063	NA		NA
1166621	1166622	SAK_0445	SAK_0446		ecsA	FALSE	0.033	309.000	0.000	NA		NA
1166622	1166623	SAK_0446	SAK_0447	ecsA		TRUE	0.954	2.000	0.167	NA	N	NA
1166623	1166624	SAK_0447	SAK_0448			TRUE	0.701	58.000	0.107	NA	N	NA
1166624	1166625	SAK_0448	SAK_0449		trmB	TRUE	0.989	-10.000	0.154	NA		NA
1166625	1166626	SAK_0449	SAK_0450	trmB		TRUE	0.600	44.000	0.000	NA		NA
1166626	1166627	SAK_0450	SAK_0451			FALSE	0.020	452.000	0.000	NA		NA
1166627	1166628	SAK_0451	SAK_0452		nusA	TRUE	0.984	36.000	0.759	NA		NA
1166628	1166629	SAK_0452	SAK_0453	nusA	ylxR	TRUE	0.989	22.000	0.323	NA	Y	NA
1166629	1166630	SAK_0453	SAK_0454	ylxR		TRUE	0.993	-7.000	0.408	NA	N	NA
1166630	1166631	SAK_0454	SAK_0455		infB	TRUE	0.986	20.000	0.223	NA	Y	NA
1166631	1166632	SAK_0455	SAK_0456	infB	rbfA	TRUE	0.865	109.000	0.530	1.000	Y	NA
1166634	1166635	SAK_0458	SAK_0459	copY	copA	TRUE	0.892	13.000	0.064	1.000	N	NA
1166635	1166636	SAK_0459	SAK_0460	copA		TRUE	0.962	41.000	0.048	0.003	Y	NA
1166636	1166637	SAK_0460	SAK_0461			FALSE	0.165	110.000	0.000	NA		NA
1166637	1166638	SAK_0461	SAK_0462			TRUE	0.923	15.000	0.047	NA		NA
1166638	1166639	SAK_0462	SAK_0463		polA	FALSE	0.139	113.000	0.000	1.000		NA
1166639	1166640	SAK_0463	SAK_0464	polA		TRUE	0.838	30.000	0.005	NA		NA
1166640	1166641	SAK_0464	SAK_0465			TRUE	0.357	82.000	0.010	NA		NA
1166641	1166642	SAK_0465	SAK_0466			FALSE	0.108	153.000	0.000	1.000		NA
1166642	1166643	SAK_0466	SAK_0467			TRUE	0.647	113.000	0.333	1.000		NA
1166643	1166644	SAK_0467	SAK_0468			TRUE	0.994	2.000	0.500	1.000	Y	NA
1166646	1166647	SAK_0470	SAK_0471	tgt		FALSE	0.215	107.000	0.004	1.000		NA
1166647	1166648	SAK_0471	SAK_0472			TRUE	0.904	7.000	0.039	NA		NA
1166648	1166649	SAK_0472	SAK_0473			FALSE	0.272	139.000	0.033	NA		NA
1166649	1166650	SAK_0473	SAK_0474			TRUE	0.966	0.000	0.013	0.025		NA
1166650	1166651	SAK_0474	SAK_0475		pgi	FALSE	0.017	272.000	0.000	1.000	N	NA
1166651	1166652	SAK_0475	SAK_0476	pgi		FALSE	0.013	322.000	0.000	1.000	N	NA
1166652	1166653	SAK_0476	SAK_0477			TRUE	0.954	-3.000	0.037	1.000		NA
1166653	1166654	SAK_0477	SAK_0478			FALSE	0.124	132.000	0.000	1.000		NA
1166655	1166656	SAK_0479	SAK_0480	galU	gpsA	TRUE	0.725	37.000	0.032	1.000	N	NA
1166657	1166658	SAK_0481	SAK_0482	rnpA		TRUE	0.881	13.000	0.052	1.000	N	NA
1166658	1166659	SAK_0482	SAK_0483			TRUE	0.929	8.000	0.106	1.000		NA
1166659	1166660	SAK_0483	SAK_0484		rrsG	FALSE	0.027	348.000	0.000	NA		NA
1166660	1166661	SAK_0484	SAK_0485	rrsG		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166661	1166662	SAK_0485	SAK_0486		rrlG	FALSE	0.123	155.000	0.000	NA		NA
1166662	1166663	SAK_0486	SAK_0487	rrlG	rrfG	FALSE	0.280	75.000	0.000	NA		NA
1166663	1166664	SAK_0487	SAK_0488	rrfG		TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1166664	1166665	SAK_0488	SAK_0489			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1166665	1166666	SAK_0489	SAK_0490			TRUE	0.670	37.000	0.000	NA		NA
1166666	1166667	SAK_0490	SAK_0491			TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
1166668	1166669	SAK_0492	SAK_0493		recX	TRUE	0.391	84.000	0.025	NA		NA
1166670	1166671	SAK_0494	SAK_0495	rumA		FALSE	0.018	269.000	0.000	1.000	N	NA
1166671	1166672	SAK_0495	SAK_0496			TRUE	0.672	34.000	0.000	1.000		NA
1166672	1166673	SAK_0496	SAK_0497		scpA	FALSE	0.089	179.000	0.000	NA		NA
1166673	1166674	SAK_0497	SAK_0498	scpA		FALSE	0.065	210.000	0.000	NA		NA
1166674	1166675	SAK_0498	SAK_0499		nrdF	FALSE	0.017	555.000	0.000	NA		NA
1166675	1166676	SAK_0499	SAK_0500	nrdF	nrdI	TRUE	0.996	1.000	0.643	NA	Y	NA
1166676	1166677	SAK_0500	SAK_0501	nrdI		TRUE	0.998	2.000	1.000	NA	Y	NA
1166677	1166678	SAK_0501	SAK_0502			TRUE	0.395	63.000	0.000	NA		NA
1166678	1166679	SAK_0502	SAK_0503			TRUE	0.967	13.000	0.200	NA		NA
1166679	1166680	SAK_0503	SAK_0504			FALSE	0.298	73.000	0.000	NA		NA
1166680	1166681	SAK_0504	SAK_0505			TRUE	0.962	-24.000	0.000	NA		NA
1166682	1166683	SAK_0506	SAK_0507			FALSE	0.041	272.000	0.000	NA		NA
1166683	1166684	SAK_0507	SAK_0508			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1166684	1166685	SAK_0508	SAK_0509			FALSE	0.220	87.000	0.000	NA		NA
1166685	1166686	SAK_0509	SAK_0510			TRUE	0.959	24.000	0.167	NA		NA
1166686	10942577	SAK_0510	SAK_0511			FALSE	0.232	84.000	0.000	NA		NA
10942577	1166687	SAK_0511	SAK_0512			TRUE	0.819	16.000	0.000	NA		NA
1166687	1166688	SAK_0512	SAK_0513			FALSE	0.165	110.000	0.000	NA		NA
1166688	1166689	SAK_0513	SAK_0514			FALSE	0.195	85.000	0.000	1.000		NA
1166692	1166693	SAK_0517	SAK_0518			FALSE	0.026	355.000	0.000	NA		NA
1166694	1166695	SAK_0519	SAK_0520			FALSE	0.307	71.000	0.000	NA		NA
1166695	1166696	SAK_0520	SAK_0521			TRUE	0.963	2.000	0.150	NA		NA
1166696	1166697	SAK_0521	SAK_0522			TRUE	0.907	21.000	0.026	NA		NA
1166698	1166699	SAK_0523	SAK_0524			FALSE	0.277	115.000	0.000	0.017	N	NA
1166699	1166700	SAK_0524	SAK_0525			TRUE	0.998	19.000	0.846	0.015	Y	NA
1166700	1166701	SAK_0525	SAK_0526			TRUE	0.962	12.000	0.000	0.026	Y	NA
1166701	1166702	SAK_0526	SAK_0527		rhaD	TRUE	0.919	23.000	0.000	1.000	Y	NA
1166702	1166703	SAK_0527	SAK_0528	rhaD		FALSE	0.303	135.000	0.000	1.000	Y	NA
1166703	1166704	SAK_0528	SAK_0529			TRUE	0.994	13.000	0.333	0.026	Y	NA
1166704	1166705	SAK_0529	SAK_0530			TRUE	0.996	2.000	0.444	0.026	Y	NA
1166707	1166708	SAK_0532	SAK_0533			TRUE	0.978	84.000	1.000	0.049	Y	NA
1166708	1166709	SAK_0533	SAK_0534			TRUE	0.998	14.000	0.800	0.049	Y	NA
1166709	1166710	SAK_0534	SAK_0535			TRUE	0.965	10.000	0.095	1.000	Y	NA
1166710	1166711	SAK_0535	SAK_0536		galK	FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1166711	1166712	SAK_0536	SAK_0537	galK	galT	TRUE	0.818	13.000	0.000	NA		NA
1166712	1166713	SAK_0537	SAK_0538	galT	galE	TRUE	0.985	2.000	0.204	0.002	N	NA
1166713	1166714	SAK_0538	SAK_0539	galE		TRUE	0.331	126.000	0.120	1.000	N	NA
1166714	1166715	SAK_0539	SAK_0540			TRUE	0.796	5.000	0.000	NA		NA
1166715	1166716	SAK_0540	SAK_0541			TRUE	0.987	33.000	0.750	NA		NA
1166716	1166717	SAK_0541	SAK_0542			TRUE	0.792	20.000	0.000	1.000		NA
1166717	1166718	SAK_0542	SAK_0543			FALSE	0.204	191.000	0.061	NA		NA
1166718	1166719	SAK_0543	SAK_0544			FALSE	0.168	109.000	0.000	NA		NA
1166719	1166720	SAK_0544	SAK_0545			FALSE	0.036	268.000	0.000	1.000		NA
1166720	1166721	SAK_0545	SAK_0546			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166721	1166722	SAK_0546	SAK_0547		valS	TRUE	0.818	22.000	0.000	NA		NA
1166724	1166725	SAK_0549	SAK_0550			TRUE	0.574	161.000	0.375	1.000		NA
1166725	1166726	SAK_0550	SAK_0551			FALSE	0.167	160.000	0.005	NA		NA
1166726	1166727	SAK_0551	SAK_0552		asnA	FALSE	0.232	115.000	0.005	NA		NA
1166729	1166730	SAK_0554	SAK_0555		coaD	FALSE	0.222	299.000	0.367	1.000	N	NA
1166730	1166731	SAK_0555	SAK_0556	coaD		TRUE	0.967	-10.000	0.052	1.000	N	NA
1166731	1166732	SAK_0556	SAK_0557			TRUE	0.316	75.000	0.023	1.000	N	NA
1166732	1166733	SAK_0557	SAK_0558			TRUE	0.839	69.000	0.347	NA		NA
1166733	1166734	SAK_0558	SAK_0559			TRUE	0.692	51.000	0.016	NA		NA
1166734	1166735	SAK_0559	SAK_0560			TRUE	0.925	0.000	0.012	NA		NA
1166735	1166736	SAK_0560	SAK_0561			TRUE	0.332	196.000	0.045	NA	Y	NA
1166736	1166737	SAK_0561	SAK_0562			TRUE	1.000	-10.000	0.911	0.008	Y	NA
1166737	1166738	SAK_0562	SAK_0563			FALSE	0.068	128.000	0.000	1.000	N	NA
1166739	1166740	SAK_0564	SAK_0565			FALSE	0.155	126.000	0.000	NA		NA
1166740	1166741	SAK_0565	SAK_0566		bioB	TRUE	0.854	1.000	0.000	NA		NA
1166742	1166743	SAK_0567	SAK_0568			TRUE	0.915	10.000	0.058	NA		NA
1166743	1166744	SAK_0568	SAK_0569			TRUE	0.998	-7.000	0.576	1.000	Y	NA
1166744	1166745	SAK_0569	SAK_0570		nth	FALSE	0.074	113.000	0.000	1.000	N	NA
1166747	1166748	SAK_0572	SAK_0573			TRUE	0.994	-3.000	0.496	NA		NA
1166748	1166749	SAK_0573	SAK_0574			TRUE	0.895	12.000	0.064	NA	N	NA
1166749	1166750	SAK_0574	SAK_0575		typA	FALSE	0.054	232.000	0.003	NA	N	NA
1166750	1166751	SAK_0575	SAK_0576	typA		TRUE	0.735	45.000	0.015	NA		NA
1166751	1166752	SAK_0576	SAK_0577		murD	FALSE	0.222	130.000	0.006	NA		NA
1166752	1166753	SAK_0577	SAK_0578	murD	murG	TRUE	0.963	3.000	0.060	1.000	Y	NA
1166753	1166754	SAK_0578	SAK_0579	murG	divIB	TRUE	0.966	4.000	0.072	NA	Y	NA
1166754	1166755	SAK_0579	SAK_0580	divIB	ftsA	FALSE	0.284	272.000	0.389	NA	N	NA
1166755	1166756	SAK_0580	SAK_0581	ftsA	ftsZ	TRUE	0.992	22.000	0.460	1.000	Y	NA
1166756	1166757	SAK_0581	SAK_0582	ftsZ		TRUE	0.850	6.000	0.002	NA		NA
1166757	1166758	SAK_0582	SAK_0583			TRUE	0.858	12.000	0.002	NA		NA
1166758	1166759	SAK_0583	SAK_0584			TRUE	0.981	3.000	0.370	NA		NA
1166759	1166760	SAK_0584	SAK_0585			TRUE	0.977	2.000	0.287	1.000		NA
1166760	1166761	SAK_0585	SAK_0586			TRUE	0.987	10.000	0.579	NA		NA
1166761	1166762	SAK_0586	SAK_0587		ileS	FALSE	0.044	285.000	0.012	NA	N	NA
1166763	1166764	SAK_0588	SAK_0589			TRUE	0.713	64.000	0.114	NA		NA
1166764	1166765	SAK_0589	SAK_0590		clpE	FALSE	0.156	186.000	0.079	1.000	N	NA
1166766	1166767	SAK_0591	SAK_0592			FALSE	0.286	142.000	0.044	NA		NA
1166767	1166768	SAK_0592	SAK_0593			TRUE	0.998	-7.000	0.640	1.000	Y	NA
1166768	1166769	SAK_0593	SAK_0594			FALSE	0.015	287.000	0.000	1.000	N	NA
1166769	1166770	SAK_0594	SAK_0595		folD	FALSE	0.140	139.000	0.013	1.000	N	NA
1166770	1166771	SAK_0595	SAK_0596	folD		TRUE	0.936	-3.000	0.030	NA	N	NA
1166771	1166772	SAK_0596	SAK_0597		xseA	FALSE	0.155	126.000	0.005	NA	N	NA
1166772	1166773	SAK_0597	SAK_0598	xseA	xseB	TRUE	0.999	-22.000	0.412	0.001	Y	NA
1166773	1166774	SAK_0598	SAK_0599	xseB		TRUE	0.941	0.000	0.100	1.000	N	NA
1166774	1166775	SAK_0599	SAK_0600		tlyA	TRUE	0.961	-7.000	0.058	1.000	N	NA
1166775	1166776	SAK_0600	SAK_0601	tlyA		TRUE	0.969	-13.000	0.048	1.000	N	NA
1166776	1166777	SAK_0601	SAK_0602		recN	TRUE	0.851	12.000	0.037	1.000	N	NA
1166777	1166778	SAK_0602	SAK_0603	recN		FALSE	0.240	113.000	0.006	NA		NA
1166778	1166779	SAK_0603	SAK_0604			TRUE	0.989	-7.000	0.203	NA		NA
1166779	1166780	SAK_0604	SAK_0605			TRUE	0.999	-25.000	0.828	NA		NA
1166780	1166781	SAK_0605	SAK_0606		hup	TRUE	0.533	103.000	0.156	NA		NA
1166782	1166783	SAK_0607	SAK_0608			FALSE	0.153	128.000	0.000	NA		NA
1166783	1166784	SAK_0608	SAK_0609			TRUE	0.522	52.000	0.000	NA		NA
1166784	1166785	SAK_0609	SAK_0610			TRUE	0.995	-13.000	0.333	NA		NA
1166786	1166787	SAK_0611	SAK_0612			FALSE	0.184	98.000	0.000	NA		NA
1166789	1166790	SAK_0614	SAK_0615			FALSE	0.040	273.000	0.000	NA		NA
1166790	1166791	SAK_0615	SAK_0616			TRUE	0.992	-13.000	0.200	NA		NA
1166791	1166792	SAK_0616	SAK_0617			TRUE	0.830	75.000	0.400	NA		NA
1166792	1166793	SAK_0617	SAK_0618			TRUE	0.988	5.000	0.600	NA		NA
1166793	1166794	SAK_0618	SAK_0619			TRUE	0.945	18.000	0.100	NA		NA
1166794	1166795	SAK_0619	SAK_0620			FALSE	0.043	269.000	0.000	NA		NA
1166795	1166796	SAK_0620	SAK_0621			TRUE	0.938	20.000	0.080	NA		NA
1166796	1166797	SAK_0621	SAK_0622			FALSE	0.261	79.000	0.000	NA		NA
1166797	1166798	SAK_0622	SAK_0623			FALSE	0.046	254.000	0.000	NA		NA
1166798	1166799	SAK_0623	SAK_0624			FALSE	0.042	270.000	0.000	NA		NA
1166799	1166800	SAK_0624	SAK_0625			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166800	1166801	SAK_0625	SAK_0626			TRUE	0.821	21.000	0.000	NA		NA
1166801	1166802	SAK_0626	SAK_0627			FALSE	0.083	188.000	0.000	NA		NA
1166802	1166803	SAK_0627	SAK_0628			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166803	1166804	SAK_0628	SAK_0629			FALSE	0.025	388.000	0.000	NA		NA
1166804	1166805	SAK_0629	SAK_0630			FALSE	0.017	572.000	0.000	NA		NA
1166805	1166806	SAK_0630	SAK_0631			TRUE	0.550	151.000	0.250	NA		NA
1166806	1166807	SAK_0631	SAK_0632			TRUE	0.976	-3.000	0.118	NA		NA
1166807	1166808	SAK_0632	SAK_0633			TRUE	0.994	-7.000	0.353	NA		NA
1166808	1166809	SAK_0633	SAK_0634			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1166809	1166810	SAK_0634	SAK_0635			FALSE	0.171	108.000	0.000	NA		NA
1166810	1166811	SAK_0635	SAK_0636			TRUE	0.738	81.000	0.263	NA		NA
1166811	1166812	SAK_0636	SAK_0637			TRUE	0.983	3.000	0.417	NA		NA
1166812	1166813	SAK_0637	SAK_0638			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166813	1166814	SAK_0638	SAK_0639			TRUE	0.825	14.000	0.000	NA		NA
1166814	1166815	SAK_0639	SAK_0640			TRUE	0.999	-49.000	0.667	NA		NA
1166815	1166816	SAK_0640	SAK_0641			FALSE	0.057	230.000	0.000	NA		NA
1166816	1166817	SAK_0641	SAK_0642			TRUE	0.982	10.000	0.444	NA		NA
1166817	1166818	SAK_0642	SAK_0643			TRUE	0.980	0.000	0.222	NA		NA
1166818	1166819	SAK_0643	SAK_0644			TRUE	0.994	15.000	0.833	NA		NA
1166819	1166820	SAK_0644	SAK_0645			TRUE	0.982	0.000	0.250	NA		NA
1166820	1166821	SAK_0645	SAK_0646			TRUE	0.982	-6.000	0.125	NA		NA
1166821	1166822	SAK_0646	SAK_0647			TRUE	0.984	1.000	0.333	NA		NA
1166822	1166823	SAK_0647	SAK_0648			TRUE	0.829	1.000	0.000	1.000		NA
1166823	1166824	SAK_0648	SAK_0649			TRUE	0.804	12.000	0.000	NA		NA
1166824	1166825	SAK_0649	SAK_0650			TRUE	0.995	23.000	1.000	NA		NA
1166825	1166826	SAK_0650	SAK_0651			TRUE	0.792	9.000	0.000	NA		NA
1166826	1166827	SAK_0651	SAK_0652			TRUE	0.934	-7.000	0.000	NA		NA
1166827	1166828	SAK_0652	SAK_0653			FALSE	0.155	126.000	0.000	NA		NA
1166830	1166831	SAK_0655	SAK_0656			FALSE	0.023	406.000	0.000	NA		NA
1166832	1166833	SAK_0657	SAK_0658	pyrD	fibB	FALSE	0.036	187.000	0.000	1.000	N	NA
1166833	1166834	SAK_0658	SAK_0659	fibB		TRUE	0.996	19.000	0.467	0.010	Y	NA
1166834	1166835	SAK_0659	SAK_0660			TRUE	0.989	13.000	0.133	0.010	Y	NA
1166835	1166836	SAK_0660	SAK_0661			TRUE	0.963	0.000	0.125	1.000		NA
1166836	1166837	SAK_0661	SAK_0662			TRUE	0.478	71.000	0.035	1.000		NA
1166838	1166839	SAK_0663	SAK_0664			FALSE	0.028	344.000	0.000	NA		NA
1166841	1166842	SAK_0666	SAK_0667	fbp		FALSE	0.222	90.000	0.018	1.000	N	NA
1166842	1166843	SAK_0667	SAK_0668		prfB	FALSE	0.291	69.000	0.006	1.000	N	NA
1166843	1166844	SAK_0668	SAK_0669	prfB	ftsE	TRUE	0.883	19.000	0.053	1.000	N	NA
1166844	1166845	SAK_0669	SAK_0670	ftsE		TRUE	0.998	-16.000	0.431	1.000	Y	NA
1166846	1166847	SAK_0671	SAK_0672			FALSE	0.135	145.000	0.000	NA		NA
1166847	1166848	SAK_0672	SAK_0673			TRUE	0.939	-3.000	0.004	NA		NA
1166849	1166850	SAK_0674	SAK_0675			FALSE	0.074	113.000	0.000	1.000	N	NA
1166850	1166851	SAK_0675	SAK_0676			FALSE	0.263	86.000	0.028	1.000	N	NA
1166851	1166852	SAK_0676	SAK_0677		asnS	TRUE	0.896	21.000	0.068	1.000	N	NA
1166853	1166854	SAK_0678	SAK_0679			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166854	1166855	SAK_0679	SAK_0680			FALSE	0.020	246.000	0.000	1.000	N	NA
1166856	1166857	SAK_0681	SAK_0682			TRUE	0.372	195.000	0.214	NA		NA
1166857	1166858	SAK_0682	SAK_0683			TRUE	0.993	-3.000	0.470	NA		NA
1166858	1166859	SAK_0683	SAK_0684		pepDA	TRUE	0.887	15.000	0.015	1.000		NA
1166859	1166860	SAK_0684	SAK_0685	pepDA	adcA	TRUE	0.463	142.000	0.250	1.000	N	NA
1166861	1166862	SAK_0686	SAK_0687	rpmE		FALSE	0.263	109.000	0.020	1.000		NA
1166863	1166864	SAK_0688	SAK_0689	add		TRUE	0.523	59.000	0.034	1.000	N	NA
1166864	1166865	SAK_0689	SAK_0690			TRUE	0.571	77.000	0.167	1.000	N	NA
1166865	1166866	SAK_0690	SAK_0691			TRUE	0.969	-7.000	0.094	1.000	N	NA
1166866	1166867	SAK_0691	SAK_0692		rplS	FALSE	0.014	580.000	0.006	1.000	N	NA
1166867	1166868	SAK_0692	SAK_0693	rplS		FALSE	0.164	111.000	0.000	NA		NA
1166870	1166871	SAK_0695	SAK_0696			FALSE	0.109	162.000	0.000	NA		NA
1166873	1166874	SAK_0698	SAK_0699			TRUE	0.991	10.000	0.917	1.000	N	NA
1166874	1166875	SAK_0699	SAK_0700			TRUE	0.989	0.000	0.542	1.000	N	NA
1166875	1166876	SAK_0700	SAK_0701		vncR	TRUE	0.669	97.000	0.409	1.000	N	NA
1166876	1166877	SAK_0701	SAK_0702	vncR		TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
1166879	1166880	SAK_0704	SAK_0705			TRUE	0.622	42.000	0.000	NA		NA
1166880	1166881	SAK_0705	SAK_0706			FALSE	0.021	425.000	0.000	NA		NA
1166881	1166882	SAK_0706	SAK_0707			TRUE	0.676	119.000	0.385	1.000		NA
1166882	1166883	SAK_0707	SAK_0708		gyrB	TRUE	0.904	1.000	0.013	1.000		NA
1166883	1166884	SAK_0708	SAK_0709	gyrB	ezrA	FALSE	0.182	94.000	0.011	1.000	N	NA
1166884	1166885	SAK_0709	SAK_0710	ezrA	serB	FALSE	0.174	94.000	0.009	1.000	N	NA
1166886	1166887	SAK_0711	SAK_0712			TRUE	0.818	13.000	0.000	NA		NA
1166890	1166891	SAK_0715	SAK_0716	aroA	aroK	TRUE	0.983	-7.000	0.012	1.000	Y	NA
1166891	1166892	SAK_0716	SAK_0717	aroK		TRUE	0.717	57.000	0.111	NA	N	NA
1166892	1166893	SAK_0717	SAK_0718		rumA	TRUE	0.353	101.000	0.093	NA	N	NA
1166893	1166894	SAK_0718	SAK_0719	rumA		FALSE	0.018	522.000	0.000	NA		NA
1166895	1166896	SAK_0720	SAK_0721			FALSE	0.261	79.000	0.000	NA		NA
1166897	1166898	SAK_0722	SAK_0723			FALSE	0.012	860.000	0.000	1.000		NA
1166898	1166899	SAK_0723	SAK_0724			FALSE	0.022	409.000	0.000	NA		NA
1166900	1166901	SAK_0725	SAK_0726			TRUE	0.545	50.000	0.000	NA		NA
1166901	1166902	SAK_0726	SAK_0727			TRUE	0.819	17.000	0.000	NA		NA
1166902	1166903	SAK_0727	SAK_0728			TRUE	0.934	5.000	0.095	NA		NA
1166903	1166904	SAK_0728	SAK_0729			TRUE	0.989	-7.000	0.200	NA		NA
1166905	1166906	SAK_0730	SAK_0731			TRUE	0.821	21.000	0.000	NA		NA
1166906	1166907	SAK_0731	SAK_0732			FALSE	0.114	159.000	0.000	NA		NA
1166907	1166908	SAK_0732	SAK_0733			TRUE	0.998	-19.000	0.636	NA		NA
1166908	1166909	SAK_0733	SAK_0734			TRUE	0.987	-7.000	0.182	1.000		NA
1166909	1166910	SAK_0734	SAK_0735			FALSE	0.161	118.000	0.000	NA		NA
1166910	1166911	SAK_0735	SAK_0736		metK	FALSE	0.096	174.000	0.000	NA		NA
1166911	1166912	SAK_0736	SAK_0737	metK		TRUE	0.868	2.000	0.003	1.000		NA
1166912	1166913	SAK_0737	SAK_0738			FALSE	0.013	733.000	0.000	1.000		NA
1166913	1166914	SAK_0738	SAK_0739			TRUE	0.991	-3.000	0.125	0.002		NA
1166914	1166915	SAK_0739	SAK_0740			FALSE	0.028	343.000	0.000	NA		NA
1166915	1166916	SAK_0740	SAK_0741			FALSE	0.186	97.000	0.000	NA		NA
1166916	1166917	SAK_0741	SAK_0742			TRUE	0.965	-3.000	0.057	NA		NA
1166917	1166918	SAK_0742	SAK_0743			TRUE	0.482	56.000	0.000	NA		NA
1166918	1166919	SAK_0743	SAK_0744			TRUE	0.983	0.000	0.273	NA		NA
1166919	1166920	SAK_0744	SAK_0745			TRUE	0.983	17.000	0.400	NA		NA
1166920	1166921	SAK_0745	SAK_0746			FALSE	0.249	81.000	0.000	NA		NA
1166921	1166922	SAK_0746	SAK_0747			TRUE	0.996	-7.000	0.545	NA		NA
1166922	1166923	SAK_0747	SAK_0748			TRUE	0.982	14.000	0.364	NA		NA
1166923	1166924	SAK_0748	SAK_0749			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166924	1166925	SAK_0749	SAK_0750			TRUE	0.955	0.000	0.071	NA		NA
1166925	1166926	SAK_0750	SAK_0751			TRUE	0.993	-7.000	0.321	NA		NA
1166926	1166927	SAK_0751	SAK_0752			TRUE	0.973	9.000	0.308	NA		NA
1166927	1166928	SAK_0752	SAK_0753			TRUE	0.955	3.000	0.148	NA		NA
1166928	1166929	SAK_0753	SAK_0754			TRUE	0.942	12.000	0.111	NA		NA
1166929	1166930	SAK_0754	SAK_0755			TRUE	0.323	69.000	0.000	NA		NA
1166930	1166931	SAK_0755	SAK_0756			FALSE	0.148	131.000	0.000	NA		NA
1166931	1166932	SAK_0756	SAK_0757			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166932	1166933	SAK_0757	SAK_0758			TRUE	0.995	0.000	0.750	NA		NA
1166933	1166934	SAK_0758	SAK_0759			TRUE	0.967	13.000	0.200	NA		NA
1166934	1166935	SAK_0759	SAK_0760			TRUE	0.820	18.000	0.000	NA		NA
1166935	1166936	SAK_0760	SAK_0761			TRUE	0.837	2.000	0.000	NA		NA
1166936	1166937	SAK_0761	SAK_0762			TRUE	0.957	-45.000	0.000	1.000		NA
1166937	1166938	SAK_0762	SAK_0763			FALSE	0.012	781.000	0.000	1.000		NA
1166938	1166939	SAK_0763	SAK_0764			TRUE	0.999	-97.000	0.250	0.002	Y	NA
1166939	1166940	SAK_0764	SAK_0765			FALSE	0.313	70.000	0.000	NA		NA
1166940	1166941	SAK_0765	SAK_0766			TRUE	0.944	14.000	0.095	NA		NA
1166941	1166942	SAK_0766	SAK_0767			FALSE	0.046	250.000	0.000	NA		NA
1166942	1166943	SAK_0767	SAK_0768			FALSE	0.277	118.000	0.017	NA		NA
1166943	1166944	SAK_0768	SAK_0769			FALSE	0.032	321.000	0.000	NA		NA
1166947	1166948	SAK_0772	SAK_0773			TRUE	0.863	120.000	0.333	0.066	Y	NA
1166948	1166949	SAK_0773	SAK_0774			FALSE	0.013	658.000	0.000	1.000		NA
1166949	1166950	SAK_0774	SAK_0775			FALSE	0.066	194.000	0.000	1.000		NA
1166951	1166952	SAK_0776	SAK_0777			TRUE	0.447	89.000	0.000	0.010		NA
1166952	1166953	SAK_0777	SAK_0778			TRUE	0.837	2.000	0.000	NA		NA
1166953	1166954	SAK_0778	SAK_0779			TRUE	1.000	-43.000	1.000	NA	Y	NA
1166954	1166955	SAK_0779	SAK_0780			TRUE	0.887	82.000	0.667	NA		NA
1166955	1166956	SAK_0780	SAK_0781			TRUE	0.759	31.000	0.000	NA		NA
1166956	1166957	SAK_0781	SAK_0782			FALSE	0.047	249.000	0.000	NA		NA
1166957	1166958	SAK_0782	SAK_0783			FALSE	0.018	521.000	0.000	NA		NA
1166958	1166959	SAK_0783	SAK_0784			FALSE	0.060	217.000	0.000	NA		NA
1166959	1166960	SAK_0784	SAK_0785			FALSE	0.014	1119.000	0.000	NA		NA
1166960	1166961	SAK_0785	SAK_0786			TRUE	0.428	61.000	0.000	NA		NA
1166961	1166962	SAK_0786	SAK_0787			FALSE	0.063	200.000	0.000	1.000		NA
1166962	1166963	SAK_0787	SAK_0788			TRUE	0.813	3.000	0.000	NA		NA
1166963	1166964	SAK_0788	SAK_0789			TRUE	0.837	2.000	0.000	NA		NA
1166964	1166965	SAK_0789	SAK_0790		cylX	FALSE	0.016	625.000	0.000	NA		NA
1166965	1166966	SAK_0790	SAK_0791	cylX	cylD	TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1166966	1166967	SAK_0791	SAK_0792	cylD	cylG	TRUE	0.981	-3.000	0.000	0.057	Y	NA
1166967	1166968	SAK_0792	SAK_0793	cylG		TRUE	0.922	-7.000	0.000	1.000		NA
1166968	1166969	SAK_0793	SAK_0794		cylZ	TRUE	0.992	-16.000	0.167	NA		NA
1166969	1166970	SAK_0794	SAK_0795	cylZ	cylA	TRUE	0.906	-10.000	0.000	NA	N	NA
1166970	1166971	SAK_0795	SAK_0796	cylA	cylB	TRUE	0.998	-7.000	0.849	NA		NA
1166971	1166972	SAK_0796	SAK_0797	cylB	cylE	TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166972	1166973	SAK_0797	SAK_0798	cylE	cylF	TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1166973	1166974	SAK_0798	SAK_0799	cylF	cylI	TRUE	0.801	-3.000	0.000	1.000	N	NA
1166974	1166975	SAK_0799	SAK_0800	cylI	cylJ	TRUE	0.615	5.000	0.000	1.000	N	NA
1166975	1166976	SAK_0800	SAK_0801	cylJ	cylK	TRUE	0.793	8.000	0.000	NA		NA
1166976	1166977	SAK_0801	SAK_0802	cylK		FALSE	0.028	343.000	0.000	NA		NA
1166977	1166978	SAK_0802	SAK_0803			TRUE	0.712	34.000	0.000	NA		NA
1166978	1166979	SAK_0803	SAK_0804			TRUE	0.522	52.000	0.000	NA		NA
1166979	1166980	SAK_0804	SAK_0805			FALSE	0.151	103.000	0.000	1.000		NA
1166980	1166981	SAK_0805	SAK_0806			FALSE	0.042	271.000	0.000	NA		NA
1166981	1166982	SAK_0806	SAK_0807			TRUE	0.750	32.000	0.000	NA		NA
1166982	1166983	SAK_0807	SAK_0808			TRUE	0.695	35.000	0.000	NA		NA
1166983	1166984	SAK_0808	SAK_0809			TRUE	0.695	35.000	0.000	NA		NA
1166984	1166985	SAK_0809	SAK_0810			FALSE	0.158	124.000	0.000	NA		NA
1166985	1166986	SAK_0810	SAK_0811			TRUE	0.790	10.000	0.000	NA		NA
1166986	1166987	SAK_0811	SAK_0812			FALSE	0.064	212.000	0.000	NA		NA
1166991	1166992	SAK_0816	SAK_0817			TRUE	0.977	-3.000	0.127	NA		NA
1166992	1166993	SAK_0817	SAK_0818			FALSE	0.107	164.000	0.000	NA		NA
1166995	1166996	SAK_0820	SAK_0821		ldhA	TRUE	0.962	14.000	0.158	NA		NA
1166996	1166997	SAK_0821	SAK_0822	ldhA		FALSE	0.038	206.000	0.000	NA	N	NA
1166997	1166998	SAK_0822	SAK_0823			TRUE	0.616	67.000	0.000	NA	Y	NA
1166998	1166999	SAK_0823	SAK_0824			TRUE	0.922	17.000	0.000	1.000	Y	NA
1166999	1167000	SAK_0824	SAK_0825			TRUE	0.960	29.000	0.333	1.000	N	NA
1167000	1167001	SAK_0825	SAK_0826		eda	TRUE	0.736	117.000	0.583	1.000	N	NA
1167001	1167002	SAK_0826	SAK_0827	eda	uxaC	TRUE	0.992	17.000	0.467	1.000	Y	NA
1167002	1167003	SAK_0827	SAK_0828	uxaC	uxuA	TRUE	0.997	18.000	0.533	0.001	Y	NA
1167003	1167004	SAK_0828	SAK_0829	uxuA		TRUE	0.596	124.000	0.364	1.000	N	NA
1167004	1167005	SAK_0829	SAK_0830			TRUE	0.384	153.000	0.035	0.057		NA
1167005	1167006	SAK_0830	SAK_0831			TRUE	0.875	16.000	0.012	1.000		NA
1167008	1167009	SAK_0833	SAK_0834	ccpA		FALSE	0.201	132.000	0.041	1.000	N	NA
1167009	1167010	SAK_0834	SAK_0835			TRUE	0.670	45.000	0.037	1.000	N	NA
1167010	1167011	SAK_0835	SAK_0836			TRUE	0.996	2.000	0.413	0.012	Y	NA
1167011	1167012	SAK_0836	SAK_0837		thrS	FALSE	0.008	457.000	0.000	1.000	N	NA
1167012	1167013	SAK_0837	SAK_0838	thrS		FALSE	0.025	222.000	0.000	1.000	N	NA
1167013	1167014	SAK_0838	SAK_0839			FALSE	0.184	98.000	0.000	NA		NA
1167014	1167015	SAK_0839	SAK_0840			FALSE	0.103	168.000	0.000	NA		NA
1167016	1167017	SAK_0841	SAK_0842			TRUE	0.999	12.000	0.947	0.013	Y	NA
1167017	1167018	SAK_0842	SAK_0843			TRUE	0.995	13.000	0.400	0.045	Y	NA
1167018	1167019	SAK_0843	SAK_0844			TRUE	0.979	12.000	0.185	1.000	Y	NA
1167020	1167021	SAK_0845	SAK_0846			TRUE	0.999	-7.000	0.597	0.017	Y	NA
1167021	1167022	SAK_0846	SAK_0847			TRUE	0.895	4.000	0.038	1.000		NA
1167022	1167023	SAK_0847	SAK_0848			TRUE	0.885	3.000	0.011	NA		NA
1167023	1167024	SAK_0848	SAK_0849		rnc	FALSE	0.131	176.000	0.002	NA		NA
1167024	1167025	SAK_0849	SAK_0850	rnc	smc	TRUE	0.911	8.000	0.120	1.000	N	NA
1167025	1167026	SAK_0850	SAK_0851	smc		FALSE	0.168	91.000	0.000	1.000		NA
1167026	1167027	SAK_0851	SAK_0852			TRUE	0.991	0.000	0.250	0.023		NA
1167027	1167028	SAK_0852	SAK_0853		ftsY	TRUE	0.954	0.000	0.007	0.085		NA
1167029	1167030	SAK_0854	SAK_0855			TRUE	0.996	0.000	0.841	NA		NA
1167030	1167031	SAK_0855	SAK_0856			TRUE	0.940	6.000	0.114	NA		NA
1167032	1167033	SAK_0857	SAK_0858			FALSE	0.103	105.000	0.000	NA	N	NA
1167033	1167034	SAK_0858	SAK_0859			TRUE	0.990	-7.000	0.215	NA		NA
1167034	1167035	SAK_0859	SAK_0860			TRUE	0.471	81.000	0.051	NA		NA
1167035	1167036	SAK_0860	SAK_0861			TRUE	0.961	-22.000	0.000	NA		NA
1167036	1167037	SAK_0861	SAK_0862		hprK	FALSE	0.161	116.000	0.000	NA		NA
1167037	1167038	SAK_0862	SAK_0863	hprK	lgt	TRUE	0.994	-7.000	0.494	1.000	N	NA
1167038	1167039	SAK_0863	SAK_0864	lgt		TRUE	0.937	15.000	0.079	NA		NA
1167039	1167040	SAK_0864	SAK_0865			TRUE	0.985	-3.000	0.206	NA		NA
1167042	1167043	SAK_0867	SAK_0868			TRUE	0.820	130.000	0.156	0.003	Y	NA
1167043	1167044	SAK_0868	SAK_0869			FALSE	0.154	127.000	0.000	NA		NA
1167044	1167045	SAK_0869	SAK_0870			FALSE	0.158	124.000	0.000	NA		NA
1167047	1167048	SAK_0872	SAK_0873	ribD	ribE	TRUE	0.998	-19.000	0.456	1.000	Y	NA
1167048	1167049	SAK_0873	SAK_0874	ribE	ribBA	TRUE	0.962	18.000	0.051	1.000	Y	NA
1167049	1167050	SAK_0874	SAK_0875	ribBA	ribE	TRUE	0.987	15.000	0.054	0.002	Y	NA
1167053	1167054	SAK_0878	SAK_0879			TRUE	0.900	22.000	0.018	NA		NA
1167057	1167058	SAK_0882	SAK_0883			TRUE	0.994	-16.000	0.250	NA		NA
1167060	1167061	SAK_0885	SAK_0886	ppc		FALSE	0.207	106.000	0.028	1.000	N	NA
1167061	1167062	SAK_0886	SAK_0887		tuf	FALSE	0.011	352.000	0.000	1.000	N	NA
1167062	1167063	SAK_0887	SAK_0888	tuf	tpiA	FALSE	0.068	181.000	0.003	1.000	N	NA
1167063	1167064	SAK_0888	SAK_0889	tpiA	gpmA	FALSE	0.208	177.000	0.000	1.000	Y	NA
1167064	1167065	SAK_0889	SAK_0890	gpmA		FALSE	0.068	129.000	0.000	1.000	N	NA
1167065	1167066	SAK_0890	SAK_0891		recR	TRUE	0.822	15.000	0.013	1.000	N	NA
1167066	1167067	SAK_0891	SAK_0892	recR	ddl	FALSE	0.130	141.000	0.010	1.000	N	NA
1167067	1167068	SAK_0892	SAK_0893	ddl	murF	TRUE	0.667	147.000	0.046	0.010	Y	NA
1167068	1167069	SAK_0893	SAK_0894	murF		FALSE	0.036	187.000	0.000	1.000	N	NA
1167069	1167070	SAK_0894	SAK_0895			FALSE	0.151	129.000	0.000	NA		NA
1167070	1167071	SAK_0895	SAK_0896			FALSE	0.089	179.000	0.000	NA		NA
1167071	1167072	SAK_0896	SAK_0897		prfC	FALSE	0.077	177.000	0.000	1.000		NA
1167072	1167073	SAK_0897	SAK_0898	prfC		FALSE	0.302	86.000	0.003	NA		NA
1167073	1167074	SAK_0898	SAK_0899			FALSE	0.160	121.000	0.000	NA		NA
1167074	1167075	SAK_0899	SAK_0900			TRUE	0.989	-7.000	0.067	1.000	Y	NA
1167075	1167076	SAK_0900	SAK_0901			TRUE	0.991	16.000	0.400	NA	Y	NA
1167076	1167077	SAK_0901	SAK_0902			FALSE	0.031	235.000	0.000	NA	N	NA
1167078	1167079	SAK_0903	SAK_0904			TRUE	0.989	-7.000	0.209	1.000		NA
1167080	1167081	SAK_0905	SAK_0906			FALSE	0.186	100.000	0.014	1.000	N	NA
1167081	1167082	SAK_0906	SAK_0907			TRUE	0.989	-16.000	0.130	1.000		NA
1167082	1167083	SAK_0907	SAK_0908			TRUE	0.333	126.000	0.000	0.023		NA
1167083	1167084	SAK_0908	SAK_0909			TRUE	0.957	11.000	0.200	1.000		NA
1167086	1167087	SAK_0911	SAK_0912		holA	FALSE	0.291	54.000	0.000	1.000	N	NA
1167087	1167088	SAK_0912	SAK_0913	holA	sodA	FALSE	0.253	80.000	0.012	1.000	N	NA
1167088	1167089	SAK_0913	SAK_0914	sodA		FALSE	0.024	338.000	0.000	1.000		NA
1167089	1167090	SAK_0914	SAK_0915		bglF	TRUE	0.991	-7.000	0.259	1.000		NA
1167090	1167091	SAK_0915	SAK_0916	bglF		TRUE	0.988	17.000	0.318	1.000	Y	NA
1167093	1167094	SAK_0918	SAK_0919			TRUE	0.966	25.000	0.095	1.000	Y	NA
1167094	1167095	SAK_0919	SAK_0920			FALSE	0.153	101.000	0.000	1.000		NA
1167096	1167097	SAK_0921	SAK_0922		queA	FALSE	0.119	81.000	0.000	1.000	N	NA
1167098	1167099	SAK_0923	SAK_0924		nagB	TRUE	0.322	151.000	0.071	NA		NA
1167101	1167102	SAK_0926	SAK_0927			TRUE	0.330	73.000	0.020	1.000	N	NA
1167102	1167103	SAK_0927	SAK_0928			TRUE	0.753	52.000	0.056	NA		NA
1167103	1167104	SAK_0928	SAK_0929		pepB	TRUE	0.968	16.000	0.204	NA		NA
1167104	1167105	SAK_0929	SAK_0930	pepB		FALSE	0.066	195.000	0.000	1.000		NA
1167105	1167106	SAK_0930	SAK_0931			FALSE	0.234	110.000	0.012	1.000		NA
1167106	1167107	SAK_0931	SAK_0932		prsA	TRUE	0.519	61.000	0.008	1.000		NA
1167107	1167108	SAK_0932	SAK_0933	prsA		FALSE	0.050	242.000	0.000	NA		NA
1167108	1167109	SAK_0933	SAK_0934		alaS	TRUE	0.880	16.000	0.006	NA		NA
1167109	1167110	SAK_0934	SAK_0935	alaS		FALSE	0.244	82.000	0.000	NA		NA
1167110	1167111	SAK_0935	SAK_0936			FALSE	0.215	88.000	0.000	NA		NA
1167111	1167112	SAK_0936	SAK_0937			FALSE	0.021	421.000	0.000	NA		NA
1167112	1167113	SAK_0937	SAK_0938			TRUE	0.960	45.000	0.500	NA		NA
1167113	1167114	SAK_0938	SAK_0939			TRUE	0.947	3.000	0.115	NA		NA
1167117	1167118	SAK_0942	SAK_0943	nrdF		TRUE	0.857	203.000	0.500	0.002	Y	NA
1167118	1167119	SAK_0943	SAK_0944			TRUE	0.827	78.000	0.562	1.000	N	NA
1167120	1167121	SAK_0945	SAK_0946	ptsH	ptsI	TRUE	0.992	5.000	0.240	0.016	Y	NA
1167121	1167122	SAK_0946	SAK_0947	ptsI	gapN	FALSE	0.171	150.000	0.035	1.000	N	NA
1167122	1167123	SAK_0947	SAK_0948	gapN		FALSE	0.166	140.000	0.028	1.000	N	NA
1167125	1167126	SAK_0950	SAK_0951	udk		FALSE	0.133	87.000	0.000	NA	N	NA
1167126	1167127	SAK_0951	SAK_0952		dnaX	TRUE	0.911	0.000	0.030	NA	N	NA
1167129	1167130	SAK_0954	SAK_0955	metK		FALSE	0.018	521.000	0.000	NA		NA
1167130	1167131	SAK_0955	SAK_0956			TRUE	0.354	67.000	0.000	NA		NA
1167131	1167132	SAK_0956	SAK_0957			FALSE	0.113	160.000	0.000	NA		NA
1167132	1167133	SAK_0957	SAK_0958			FALSE	0.171	108.000	0.000	NA		NA
1167133	1167134	SAK_0958	SAK_0959			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1167134	1167135	SAK_0959	SAK_0960			TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1167135	1167136	SAK_0960	SAK_0961			TRUE	0.941	-12.000	0.000	1.000		NA
1167136	1167137	SAK_0961	SAK_0962			FALSE	0.200	84.000	0.000	1.000		NA
1167137	1167138	SAK_0962	SAK_0963		thiD	TRUE	0.982	2.000	0.478	1.000	N	NA
1167138	1167139	SAK_0963	SAK_0964	thiD	thiM	TRUE	0.985	2.000	0.032	0.003	Y	NA
1167139	1167140	SAK_0964	SAK_0965	thiM	thiE	TRUE	0.987	14.000	0.061	0.003	Y	NA
1167140	1167141	SAK_0965	SAK_0966	thiE	murA	FALSE	0.069	127.000	0.000	1.000	N	NA
1167141	1167142	SAK_0966	SAK_0967	murA		TRUE	0.329	84.000	0.052	1.000	N	NA
1167142	1167143	SAK_0967	SAK_0968			TRUE	0.991	-7.000	0.342	1.000	N	NA
1167143	1167144	SAK_0968	SAK_0969		map	TRUE	0.957	23.000	0.235	1.000	N	NA
1167144	1167145	SAK_0969	SAK_0970	map		TRUE	0.982	2.000	0.373	1.000		NA
1167147	1167148	SAK_0972	SAK_0973		ligA	FALSE	0.218	140.000	0.010	NA		NA
1167148	1167149	SAK_0973	SAK_0974	ligA		TRUE	0.805	12.000	0.013	1.000	N	NA
1167149	1167150	SAK_0974	SAK_0975		pulA	TRUE	0.896	4.000	0.088	1.000	N	NA
1167150	1167151	SAK_0975	SAK_0976	pulA	glgB	TRUE	0.528	206.000	0.067	0.006	Y	NA
1167151	1167152	SAK_0976	SAK_0977	glgB	glgC	TRUE	0.987	42.000	0.317	0.002	Y	NA
1167152	1167153	SAK_0977	SAK_0978	glgC	glgD	TRUE	1.000	-10.000	0.810	0.001	Y	NA
1167153	1167154	SAK_0978	SAK_0979	glgD	glgA	TRUE	0.996	-3.000	0.395	1.000	Y	NA
1167154	1167155	SAK_0979	SAK_0980	glgA	atpE	FALSE	0.024	332.000	0.000	1.000		NA
1167155	1167156	SAK_0980	SAK_0981	atpE	atpB	TRUE	0.975	33.000	0.189	0.005		NA
1167156	1167157	SAK_0981	SAK_0982	atpB	atpF	TRUE	0.983	18.000	0.032	0.005	Y	NA
1167157	1167158	SAK_0982	SAK_0983	atpF	atpH	TRUE	0.995	0.000	0.222	0.005	Y	NA
1167158	1167159	SAK_0983	SAK_0984	atpH	atpA	TRUE	0.999	16.000	0.864	0.005	Y	NA
1167159	1167160	SAK_0984	SAK_0985	atpA	atpG	TRUE	0.998	16.000	0.846	0.005	Y	NA
1167160	1167161	SAK_0985	SAK_0986	atpG	atpD	TRUE	0.979	74.000	0.724	0.005	Y	NA
1167161	1167162	SAK_0986	SAK_0987	atpD	atpC	TRUE	0.998	13.000	0.837	0.005	Y	NA
1167162	1167163	SAK_0987	SAK_0988	atpC		TRUE	0.665	59.000	0.039	NA		NA
1167163	1167164	SAK_0988	SAK_0989		murA	TRUE	0.851	63.000	0.279	NA		NA
1167164	1167165	SAK_0989	SAK_0990	murA		TRUE	0.953	2.000	0.110	NA		NA
1167165	1167166	SAK_0990	SAK_0991		endA	TRUE	0.748	75.000	0.237	NA		NA
1167166	1167167	SAK_0991	SAK_0992	endA	pheS	FALSE	0.029	292.000	0.000	1.000		NA
1167167	1167168	SAK_0992	SAK_0993	pheS		FALSE	0.315	83.000	0.009	1.000		NA
1167168	1167169	SAK_0993	SAK_0994		pheT	TRUE	0.589	54.000	0.007	1.000		NA
1167171	1167172	SAK_0996	SAK_0997	rexB	rexA	TRUE	0.995	-10.000	0.070	0.064	Y	NA
1167172	1167173	SAK_0997	SAK_0998	rexA		TRUE	0.648	13.000	0.000	1.000	N	NA
1167175	1167176	SAK_1000	SAK_1001			FALSE	0.112	150.000	0.000	1.000		NA
1167176	1167177	SAK_1001	SAK_1002			TRUE	0.982	75.000	0.769	0.001	Y	NA
1167177	1167178	SAK_1002	SAK_1003			TRUE	0.652	127.000	0.051	0.056	Y	NA
1167178	1167179	SAK_1003	SAK_1004			TRUE	0.846	60.000	0.091	1.000	Y	NA
1167179	1167180	SAK_1004	SAK_1005		lplA	TRUE	0.491	98.000	0.200	1.000	N	NA
1167181	1167182	SAK_1006	SAK_1007			TRUE	0.995	0.000	0.796	1.000		NA
1167183	1167184	SAK_1008	SAK_1009			TRUE	0.987	3.000	0.502	NA		NA
1167184	1167185	SAK_1009	SAK_1010		glmM	TRUE	0.835	54.000	0.150	NA		NA
1167185	1167186	SAK_1010	SAK_1011	glmM		FALSE	0.159	123.000	0.000	NA		NA
1167186	1167187	SAK_1011	SAK_1012			TRUE	0.950	25.000	0.143	NA		NA
1167187	1167188	SAK_1012	SAK_1013			FALSE	0.194	92.000	0.000	NA		NA
1167188	1167189	SAK_1013	SAK_1014			TRUE	0.877	4.000	0.060	1.000	N	NA
1167189	1167190	SAK_1014	SAK_1015			TRUE	0.907	1.000	0.055	1.000	N	NA
1167190	1167191	SAK_1015	SAK_1016			TRUE	0.996	-25.000	0.330	NA		NA
1167191	1167192	SAK_1016	SAK_1017			FALSE	0.025	388.000	0.000	NA		NA
1167192	1167193	SAK_1017	SAK_1018		cas1	TRUE	0.990	2.000	0.546	NA		NA
1167193	1167194	SAK_1018	SAK_1019	cas1		TRUE	0.997	-3.000	0.876	NA		NA
1167194	1167195	SAK_1019	SAK_1020			TRUE	0.994	-13.000	0.253	NA		NA
1167195	1167196	SAK_1020	SAK_1021		ndk	FALSE	0.014	1684.000	0.000	NA		NA
11520237	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1091.000	0.000	NA		NA
11662600	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1091.000	0.000	NA		NA
11804992	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1091.000	0.000	NA		NA
11520238	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1127.000	0.000	NA		NA
11662601	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1127.000	0.000	NA		NA
11804993	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1127.000	0.000	NA		NA
11520239	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1157.000	0.000	NA		NA
11662602	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1157.000	0.000	NA		NA
11804994	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1157.000	0.000	NA		NA
11520240	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1193.000	0.000	NA		NA
11662603	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1193.000	0.000	NA		NA
11804995	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1193.000	0.000	NA		NA
11520241	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1223.000	0.000	NA		NA
11662604	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1223.000	0.000	NA		NA
11804996	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1223.000	0.000	NA		NA
11520242	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1259.000	0.000	NA		NA
11662605	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1259.000	0.000	NA		NA
11804997	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1259.000	0.000	NA		NA
11520243	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1289.000	0.000	NA		NA
11662606	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1289.000	0.000	NA		NA
11804998	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1289.000	0.000	NA		NA
11520244	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1325.000	0.000	NA		NA
11662607	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1325.000	0.000	NA		NA
11804999	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1325.000	0.000	NA		NA
11520245	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1355.000	0.000	NA		NA
11662608	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1355.000	0.000	NA		NA
11805000	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1355.000	0.000	NA		NA
11520246	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1391.000	0.000	NA		NA
11662609	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1391.000	0.000	NA		NA
11805001	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1391.000	0.000	NA		NA
11520247	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1421.000	0.000	NA		NA
11662610	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1421.000	0.000	NA		NA
11805002	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1421.000	0.000	NA		NA
11520248	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1457.000	0.000	NA		NA
11662611	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1457.000	0.000	NA		NA
11805003	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1457.000	0.000	NA		NA
11520249	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1487.000	0.000	NA		NA
11662612	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1487.000	0.000	NA		NA
11805004	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1487.000	0.000	NA		NA
11520250	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1523.000	0.000	NA		NA
11662613	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1523.000	0.000	NA		NA
11805005	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1523.000	0.000	NA		NA
11520251	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1553.000	0.000	NA		NA
11662614	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1553.000	0.000	NA		NA
11805006	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1553.000	0.000	NA		NA
11520252	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1589.000	0.000	NA		NA
11662615	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1589.000	0.000	NA		NA
11805007	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1589.000	0.000	NA		NA
11520253	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1619.000	0.000	NA		NA
11662616	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1619.000	0.000	NA		NA
11805008	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1619.000	0.000	NA		NA
11520254	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1655.000	0.000	NA		NA
11662617	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1655.000	0.000	NA		NA
11805009	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1655.000	0.000	NA		NA
11520255	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1685.000	0.000	NA		NA
11662618	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1685.000	0.000	NA		NA
11805010	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1685.000	0.000	NA		NA
11520256	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1721.000	0.000	NA		NA
11662619	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1721.000	0.000	NA		NA
11805011	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1721.000	0.000	NA		NA
11520257	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1751.000	0.000	NA		NA
11662620	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1751.000	0.000	NA		NA
11805012	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1751.000	0.000	NA		NA
11520258	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1787.000	0.000	NA		NA
11662621	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1787.000	0.000	NA		NA
11805013	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1787.000	0.000	NA		NA
11520259	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1817.000	0.000	NA		NA
11662622	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1817.000	0.000	NA		NA
11805014	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1817.000	0.000	NA		NA
11520260	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1853.000	0.000	NA		NA
11662623	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1853.000	0.000	NA		NA
11805015	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1853.000	0.000	NA		NA
11520261	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1883.000	0.000	NA		NA
11662624	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1883.000	0.000	NA		NA
11805016	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1883.000	0.000	NA		NA
11520262	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1919.000	0.000	NA		NA
11662625	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1919.000	0.000	NA		NA
11805017	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1919.000	0.000	NA		NA
11520263	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1949.000	0.000	NA		NA
11662626	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1949.000	0.000	NA		NA
11805018	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1949.000	0.000	NA		NA
11520264	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1985.000	0.000	NA		NA
11662627	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1985.000	0.000	NA		NA
11805019	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	1985.000	0.000	NA		NA
11520265	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2015.000	0.000	NA		NA
11662628	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2015.000	0.000	NA		NA
11805020	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2015.000	0.000	NA		NA
11520266	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2051.000	0.000	NA		NA
11662629	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2051.000	0.000	NA		NA
11805021	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2051.000	0.000	NA		NA
11520267	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2081.000	0.000	NA		NA
11662630	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2081.000	0.000	NA		NA
11805022	1167193		SAK_1018		cas1	FALSE	NA	2081.000	0.000	NA		NA
1167196	1167197	SAK_1021	SAK_1022	ndk	lepA	FALSE	0.112	136.000	0.003	1.000	N	NA
1167197	1167198	SAK_1022	SAK_1023	lepA		FALSE	0.013	720.000	0.000	1.000		NA
1167198	1167199	SAK_1023	SAK_1024			FALSE	0.134	124.000	0.000	1.000		NA
1167199	1167200	SAK_1024	SAK_1025			TRUE	0.852	9.000	0.010	1.000		NA
1167200	1167201	SAK_1025	SAK_1026		msrB	TRUE	0.850	0.000	0.000	1.000		NA
1167201	1167202	SAK_1026	SAK_1027	msrB		FALSE	0.058	152.000	0.000	1.000	N	NA
1167202	1167203	SAK_1027	SAK_1028			TRUE	0.850	0.000	0.000	1.000		NA
1167204	1167205	SAK_1029	SAK_1030			FALSE	0.041	272.000	0.000	NA		NA
1167207	1167208	SAK_1032	SAK_1033			TRUE	0.984	12.000	0.471	NA		NA
1167208	1167209	SAK_1033	SAK_1034			TRUE	0.981	1.000	0.412	1.000	N	NA
1167210	1167211	SAK_1035	SAK_1036	dnaE	pfk	TRUE	0.435	81.000	0.098	1.000	N	NA
1167211	1167212	SAK_1036	SAK_1037	pfk	pyk	TRUE	0.979	49.000	0.261	0.005	Y	NA
1167212	1167213	SAK_1037	SAK_1038	pyk	lepB	FALSE	0.233	171.000	0.072	1.000		NA
1167215	1167216	SAK_1040	SAK_1041	glmS	phnA	FALSE	0.097	163.000	0.008	1.000	N	NA
1167216	1167217	SAK_1041	SAK_1042	phnA		FALSE	0.159	135.000	0.018	1.000	N	NA
1167217	1167218	SAK_1042	SAK_1043			TRUE	0.970	10.000	0.130	1.000	Y	NA
1167218	1167219	SAK_1043	SAK_1044			TRUE	0.979	14.000	0.154	1.000	Y	NA
1167220	1167221	SAK_1045	SAK_1046	rpsT	coaA	TRUE	0.331	69.000	0.014	1.000	N	NA
1167222	1167223	SAK_1047	SAK_1048		cdd	FALSE	0.013	326.000	0.000	1.000	N	NA
1167223	1167224	SAK_1048	SAK_1049	cdd		TRUE	0.836	65.000	0.300	1.000		NA
1167224	1167225	SAK_1049	SAK_1050			FALSE	0.245	145.000	0.036	1.000		NA
1167225	1167226	SAK_1050	SAK_1051			TRUE	0.995	-7.000	0.438	1.000		NA
1167226	1167227	SAK_1051	SAK_1052			TRUE	0.996	2.000	0.720	0.041		NA
1167227	1167228	SAK_1052	SAK_1053		nox	FALSE	0.058	205.000	0.000	1.000		NA
1167230	1167231	SAK_1055	SAK_1056	gyrA		TRUE	0.820	7.000	0.013	NA	N	NA
1167231	1167232	SAK_1056	SAK_1057			TRUE	0.882	16.000	0.039	NA	N	NA
1167232	1167233	SAK_1057	SAK_1058			FALSE	0.236	153.000	0.024	NA		NA
1167235	1167236	SAK_1060	SAK_1061			TRUE	0.987	33.000	0.750	NA		NA
1167238	1167239	SAK_1063	SAK_1064		gid	FALSE	0.073	114.000	0.000	1.000	N	NA
1167239	1167240	SAK_1064	SAK_1065	gid		FALSE	0.228	78.000	0.000	1.000		NA
1167240	1167241	SAK_1065	SAK_1066			FALSE	0.146	133.000	0.000	NA		NA
1167243	1167244	SAK_1068	SAK_1069			TRUE	0.884	26.000	0.033	1.000		NA
1167244	1167245	SAK_1069	SAK_1070			TRUE	0.994	2.000	0.855	1.000		NA
1167245	1167246	SAK_1070	SAK_1071			TRUE	0.384	110.000	0.094	1.000		NA
1167246	1167247	SAK_1071	SAK_1072			TRUE	0.998	-3.000	0.812	1.000	Y	NA
1167250	1167251	SAK_1075	SAK_1076		satD	TRUE	0.993	-10.000	0.250	NA		NA
1167251	1167252	SAK_1076	SAK_1077	satD	ffh	TRUE	0.442	67.000	0.002	NA		NA
1167252	1167253	SAK_1077	SAK_1078	ffh		TRUE	0.954	18.000	0.151	1.000		NA
1167253	1167254	SAK_1078	SAK_1079		ciaH	FALSE	0.139	113.000	0.000	1.000		NA
1167254	1167255	SAK_1079	SAK_1080	ciaH	ciaR	TRUE	0.999	-16.000	0.606	1.000	Y	NA
1167255	1167256	SAK_1080	SAK_1081	ciaR	pepN	FALSE	0.179	162.000	0.061	1.000	N	NA
1167256	1167257	SAK_1081	SAK_1082	pepN	phoU	FALSE	0.249	146.000	0.067	NA	N	NA
1167257	1167258	SAK_1082	SAK_1083	phoU		TRUE	0.985	34.000	0.413	NA	Y	NA
1167258	1167259	SAK_1083	SAK_1084		pstB	TRUE	0.851	213.000	0.542	0.002	Y	NA
1167259	1167260	SAK_1084	SAK_1085	pstB	pstA	TRUE	0.996	12.000	0.490	0.004	Y	NA
1167260	1167261	SAK_1085	SAK_1086	pstA	pstC	TRUE	1.000	-10.000	0.907	0.004	Y	NA
1167261	1167262	SAK_1086	SAK_1087	pstC		TRUE	0.946	46.000	0.206	1.000	Y	NA
1167262	1167263	SAK_1087	SAK_1088			TRUE	0.396	185.000	0.303	NA	N	NA
1167263	1167264	SAK_1088	SAK_1089			TRUE	0.737	68.000	0.229	NA	N	NA
1167264	1167265	SAK_1089	SAK_1090			TRUE	0.979	23.000	0.337	NA		NA
1167265	1167266	SAK_1090	SAK_1091		spxA	TRUE	0.988	-7.000	0.169	NA		NA
1167266	1167267	SAK_1091	SAK_1092	spxA	ribF	TRUE	0.632	43.000	0.017	1.000	N	NA
1167267	1167268	SAK_1092	SAK_1093	ribF	truB	TRUE	0.967	13.000	0.308	1.000	N	NA
1167268	1167269	SAK_1093	SAK_1094	truB		FALSE	0.166	92.000	0.000	1.000		NA
1167269	1167270	SAK_1094	SAK_1095			TRUE	0.922	13.000	0.049	NA		NA
1167270	1167271	SAK_1095	SAK_1096			TRUE	0.850	34.000	0.033	NA		NA
1167271	1167272	SAK_1096	SAK_1097			FALSE	0.172	107.000	0.000	NA		NA
1167272	1167273	SAK_1097	SAK_1098			FALSE	0.174	106.000	0.000	NA		NA
1167273	1167274	SAK_1098	SAK_1099			TRUE	0.991	12.000	0.438	1.000	Y	NA
1167274	1167275	SAK_1099	SAK_1100		topA	FALSE	0.063	137.000	0.000	1.000	N	NA
1167275	1167276	SAK_1100	SAK_1101	topA		TRUE	0.769	95.000	0.238	1.000	Y	NA
1167276	1167277	SAK_1101	SAK_1102			FALSE	0.063	138.000	0.000	1.000	N	NA
1167277	1167278	SAK_1102	SAK_1103			TRUE	0.739	62.000	0.012	1.000	Y	NA
1167278	1167279	SAK_1103	SAK_1104			TRUE	0.999	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
1167279	1167280	SAK_1104	SAK_1105			TRUE	0.999	-3.000	0.870	0.041	Y	NA
1167280	1167281	SAK_1105	SAK_1106			FALSE	0.043	239.000	0.000	1.000		NA
1167281	1167282	SAK_1106	SAK_1107		rnhB	TRUE	0.856	21.000	0.003	1.000		NA
1167282	1167283	SAK_1107	SAK_1108	rnhB		TRUE	0.989	-13.000	0.148	1.000		NA
1167283	1167284	SAK_1108	SAK_1109			FALSE	0.039	276.000	0.000	NA		NA
1167284	1167285	SAK_1109	SAK_1110		cstA	FALSE	0.074	201.000	0.000	NA		NA
1167285	1167286	SAK_1110	SAK_1111	cstA		TRUE	0.429	156.000	0.050	1.000	Y	NA
1167286	1167287	SAK_1111	SAK_1112			TRUE	0.997	12.000	0.538	0.015	Y	NA
1167287	1167288	SAK_1112	SAK_1113			FALSE	0.014	976.000	0.000	NA		NA
1167288	1167289	SAK_1113	SAK_1114			FALSE	0.196	91.000	0.000	NA		NA
1167289	1167290	SAK_1114	SAK_1115			FALSE	0.077	197.000	0.000	NA		NA
1167290	1167291	SAK_1115	SAK_1116			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1167291	1167292	SAK_1116	SAK_1117			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1167292	1167293	SAK_1117	SAK_1118			FALSE	0.080	192.000	0.000	NA		NA
1167293	1167294	SAK_1118	SAK_1119			TRUE	0.774	29.000	0.000	NA		NA
1167294	1167295	SAK_1119	SAK_1120			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1167295	1167296	SAK_1120	SAK_1121			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1167296	1167297	SAK_1121	SAK_1122			TRUE	0.792	9.000	0.000	NA		NA
1167297	1167298	SAK_1122	SAK_1123			TRUE	0.916	13.000	0.038	NA		NA
1167298	1167299	SAK_1123	SAK_1124			TRUE	0.988	7.000	0.623	NA		NA
1167299	1167300	SAK_1124	SAK_1125			TRUE	0.996	0.000	0.833	NA		NA
1167300	1167301	SAK_1125	SAK_1126			TRUE	0.994	-16.000	0.237	NA		NA
1167301	1167302	SAK_1126	SAK_1127			TRUE	0.972	9.000	0.286	NA		NA
1167302	1167303	SAK_1127	SAK_1128			TRUE	0.487	82.000	0.061	NA		NA
1167303	1167304	SAK_1128	SAK_1129			FALSE	0.105	167.000	0.000	NA		NA
1167304	1167305	SAK_1129	SAK_1130			FALSE	0.161	117.000	0.000	NA		NA
1167305	1167306	SAK_1130	SAK_1131			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1167306	1167307	SAK_1131	SAK_1132		carB	FALSE	0.154	127.000	0.000	NA		NA
1167307	1167308	SAK_1132	SAK_1133	carB	carA	TRUE	0.986	31.000	0.117	0.002	Y	NA
1167308	1167309	SAK_1133	SAK_1134	carA	pyrB	TRUE	0.951	14.000	0.014	1.000	Y	NA
1167309	1167310	SAK_1134	SAK_1135	pyrB	pyrC	TRUE	0.758	165.000	0.452	1.000	Y	NA
1167310	1167311	SAK_1135	SAK_1136	pyrC	pyrE	TRUE	0.934	12.000	0.003	1.000	Y	NA
1167311	1167312	SAK_1136	SAK_1137	pyrE	pyrF	TRUE	0.975	13.000	0.133	1.000	Y	NA
1167312	1167313	SAK_1137	SAK_1138	pyrF		FALSE	0.063	213.000	0.000	NA		NA
1167313	1167314	SAK_1138	SAK_1139			TRUE	0.522	52.000	0.000	NA		NA
1167314	1167315	SAK_1139	SAK_1140			FALSE	0.148	131.000	0.000	NA		NA
1167315	1167316	SAK_1140	SAK_1141		asd	FALSE	0.185	170.000	0.020	NA		NA
1167316	1167317	SAK_1141	SAK_1142	asd		FALSE	0.056	207.000	0.000	1.000		NA
1167317	1167318	SAK_1142	SAK_1143			FALSE	0.013	691.000	0.000	1.000		NA
1167318	1167319	SAK_1143	SAK_1144		fhs	FALSE	0.107	239.000	0.094	1.000	N	NA
1167319	1167320	SAK_1144	SAK_1145	fhs	lplA	TRUE	0.532	89.000	0.200	1.000	N	NA
1167320	1167321	SAK_1145	SAK_1146	lplA		TRUE	0.952	27.000	0.250	1.000	N	NA
1167321	1167322	SAK_1146	SAK_1147			TRUE	0.996	-31.000	0.286	NA		NA
1167322	1167323	SAK_1147	SAK_1148			TRUE	0.982	-7.000	0.107	NA		NA
1167323	1167324	SAK_1148	SAK_1149			TRUE	0.981	29.000	0.571	NA	N	NA
1167324	1167325	SAK_1149	SAK_1150			TRUE	0.988	-3.000	0.100	NA	Y	NA
1167325	1167326	SAK_1150	SAK_1151			TRUE	0.918	-3.000	0.019	1.000	N	NA
1167327	1167328	SAK_1152	SAK_1153	coaB	coaC	TRUE	0.959	-7.000	0.013	1.000		NA
1167328	1167329	SAK_1153	SAK_1154	coaC		TRUE	0.738	46.000	0.019	NA		NA
1167329	1167330	SAK_1154	SAK_1155			TRUE	0.420	110.000	0.098	NA		NA
1167331	1167332	SAK_1156	SAK_1157			TRUE	0.999	1.000	0.895	0.007	Y	NA
1167332	1167333	SAK_1157	SAK_1158			TRUE	0.918	12.000	0.053	NA		NA
1167333	1167334	SAK_1158	SAK_1159			TRUE	0.957	2.000	0.128	NA		NA
1167334	1167335	SAK_1159	SAK_1160		glyA	TRUE	0.936	5.000	0.103	NA		NA
1167335	1167336	SAK_1160	SAK_1161	glyA		FALSE	0.231	92.000	0.015	NA	N	NA
1167336	1167337	SAK_1161	SAK_1162			TRUE	0.987	-7.000	0.029	NA	Y	NA
1167337	1167338	SAK_1162	SAK_1163		prfA	TRUE	0.989	0.000	0.084	0.047	Y	NA
1167338	1167339	SAK_1163	SAK_1164	prfA	tdk	TRUE	0.804	35.000	0.062	1.000	N	NA
1167340	1167341	SAK_1165	SAK_1166			TRUE	0.473	140.000	0.189	1.000		NA
1167341	1167342	SAK_1166	SAK_1167			TRUE	0.973	18.000	0.243	NA		NA
1167342	1167343	SAK_1167	SAK_1168			TRUE	0.989	24.000	0.588	NA		NA
1167343	1167344	SAK_1168	SAK_1169			FALSE	0.183	99.000	0.000	NA		NA
1167345	1167346	SAK_1170	SAK_1171	pbuX	xpt	TRUE	0.973	0.000	0.046	1.000	Y	NA
1167346	1167347	SAK_1171	SAK_1172	xpt	guaC	FALSE	0.155	255.000	0.009	1.000	Y	NA
1167347	1167348	SAK_1172	SAK_1173	guaC		FALSE	0.060	203.000	0.000	1.000		NA
1167350	1167351	SAK_1175	SAK_1176			FALSE	0.122	135.000	0.000	1.000		NA
1167351	1167352	SAK_1176	SAK_1177		pta	TRUE	0.747	62.000	0.031	0.051		NA
1167352	1167353	SAK_1177	SAK_1178	pta		TRUE	0.877	26.000	0.067	1.000	N	NA
1167353	1167354	SAK_1178	SAK_1179		ppnK	TRUE	0.970	-3.000	0.150	1.000	N	NA
1167354	1167355	SAK_1179	SAK_1180	ppnK		TRUE	0.998	-16.000	0.725	1.000		NA
1167356	1167357	SAK_1181	SAK_1182		prs	FALSE	0.311	176.000	0.145	1.000		NA
1167357	1167358	SAK_1182	SAK_1183	prs		TRUE	0.965	4.000	0.089	1.000	Y	NA
1167358	1167359	SAK_1183	SAK_1184			TRUE	0.965	2.000	0.166	NA		NA
1167359	1167360	SAK_1184	SAK_1185			FALSE	0.294	161.000	0.083	NA		NA
1167361	1167362	SAK_1186	SAK_1187	radC		TRUE	0.370	96.000	0.046	NA		NA
1167362	1167363	SAK_1187	SAK_1188			FALSE	0.196	91.000	0.000	NA		NA
1167363	1167364	SAK_1188	SAK_1189			FALSE	0.047	163.000	0.000	1.000	N	NA
1167364	1167365	SAK_1189	SAK_1190			TRUE	0.378	101.000	0.071	1.000		NA
1167367	1167368	SAK_1192	SAK_1193		potD	TRUE	0.370	109.000	0.033	0.077	N	NA
1167368	1167369	SAK_1193	SAK_1194	potD	potC	TRUE	0.998	-7.000	0.253	0.040	Y	NA
1167369	1167370	SAK_1194	SAK_1195	potC	potB	TRUE	0.998	-3.000	0.492	0.040	Y	NA
1167370	1167371	SAK_1195	SAK_1196	potB	potA	TRUE	1.000	-16.000	0.928	0.040	Y	NA
1167371	1167372	SAK_1196	SAK_1197	potA	murB	TRUE	0.645	49.000	0.041	1.000	N	NA
1167372	1167373	SAK_1197	SAK_1198	murB	folK	FALSE	0.129	144.000	0.010	1.000	N	NA
1167373	1167374	SAK_1198	SAK_1199	folK	folB	TRUE	0.989	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
1167374	1167375	SAK_1199	SAK_1200	folB	folP	TRUE	0.973	2.000	0.094	1.000	Y	NA
1167375	1167376	SAK_1200	SAK_1201	folP	folE	TRUE	0.963	4.000	0.073	1.000	Y	NA
1167376	1167377	SAK_1201	SAK_1202	folE	folC	TRUE	0.964	19.000	0.057	1.000	Y	NA
1167377	1167378	SAK_1202	SAK_1203	folC	rarD	TRUE	0.809	2.000	0.000	1.000		NA
1167378	1167379	SAK_1203	SAK_1204	rarD	thrB	TRUE	0.965	-13.000	0.005	1.000		NA
1167379	1167380	SAK_1204	SAK_1205	thrB	hom	TRUE	0.963	2.000	0.036	1.000	Y	NA
1167382	1167383	SAK_1207	SAK_1208			TRUE	0.788	22.000	0.000	1.000		NA
1167383	1167384	SAK_1208	SAK_1209			TRUE	0.987	33.000	0.750	NA		NA
1167384	1167385	SAK_1209	SAK_1210			TRUE	0.796	5.000	0.000	NA		NA
1167385	1167386	SAK_1210	SAK_1211			FALSE	0.136	143.000	0.000	NA		NA
1167386	1167387	SAK_1211	SAK_1212			FALSE	0.291	74.000	0.000	NA		NA
1167387	1167388	SAK_1212	SAK_1213			FALSE	0.171	108.000	0.000	NA		NA
1167389	10942578	SAK_1214	SAK_1215			FALSE	0.113	160.000	0.000	NA		NA
10942578	1167390	SAK_1215	SAK_1216			FALSE	0.182	100.000	0.000	NA		NA
1167391	1167392	SAK_1217	SAK_1218	tpx		FALSE	0.187	73.000	0.000	NA	N	NA
1167392	1167393	SAK_1218	SAK_1219			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1167393	1167394	SAK_1219	SAK_1220			TRUE	0.796	5.000	0.000	NA		NA
1167394	1167395	SAK_1220	SAK_1221			TRUE	0.479	164.000	0.238	NA		NA
1167395	1167396	SAK_1221	SAK_1222			TRUE	0.818	22.000	0.000	NA		NA
1167396	1167397	SAK_1222	SAK_1223			TRUE	0.572	47.000	0.000	NA		NA
1167397	1167398	SAK_1223	SAK_1224			TRUE	0.729	56.000	0.060	NA		NA
1167398	1167399	SAK_1224	SAK_1225			TRUE	0.948	10.000	0.143	NA		NA
1167399	1167400	SAK_1225	SAK_1226			TRUE	0.823	15.000	0.000	NA		NA
1167400	1167401	SAK_1226	SAK_1227			TRUE	0.732	48.000	0.000	0.059		NA
1167401	1167402	SAK_1227	SAK_1228		pcrA	FALSE	0.018	411.000	0.000	1.000		NA
1167402	1167403	SAK_1228	SAK_1229	pcrA		FALSE	0.102	106.000	0.000	NA	N	NA
1167403	1167404	SAK_1229	SAK_1230		uraA	FALSE	0.085	133.000	0.000	NA	N	NA
1167405	1167406	SAK_1231	SAK_1232			TRUE	0.704	63.000	0.060	0.077	N	NA
1167406	1167407	SAK_1232	SAK_1233			FALSE	0.097	159.000	0.000	1.000		NA
1167407	1167408	SAK_1233	SAK_1234			TRUE	0.989	-19.000	0.121	1.000		NA
1167408	1167409	SAK_1234	SAK_1235			TRUE	0.323	69.000	0.000	NA		NA
1167410	1167411	SAK_1236	SAK_1237		rpsA	FALSE	0.298	73.000	0.000	NA		NA
1167411	1167412	SAK_1237	SAK_1238	rpsA		FALSE	0.159	123.000	0.000	NA		NA
1167412	1167413	SAK_1238	SAK_1239			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1167413	1167414	SAK_1239	SAK_1240			TRUE	0.428	61.000	0.000	NA		NA
1167414	1167415	SAK_1240	SAK_1241		ilvE	TRUE	0.529	83.000	0.095	NA		NA
1167415	1167416	SAK_1241	SAK_1242	ilvE	parC	FALSE	0.292	113.000	0.086	1.000	N	NA
1167416	1167417	SAK_1242	SAK_1243	parC	parE	TRUE	0.937	134.000	0.552	0.002	Y	NA
1167419	1167420	SAK_1245	SAK_1246	ung		FALSE	0.183	99.000	0.000	NA		NA
1167420	1167421	SAK_1246	SAK_1247		neuA	FALSE	0.162	114.000	0.000	NA		NA
1167421	1167422	SAK_1247	SAK_1248	neuA	neuD	TRUE	0.860	11.000	0.013	1.000		NA
1167422	1167423	SAK_1248	SAK_1249	neuD	neuC	TRUE	0.941	-3.000	0.013	1.000		NA
1167423	1167424	SAK_1249	SAK_1250	neuC	neuB	TRUE	0.926	77.000	0.549	1.000	Y	NA
1167424	1167425	SAK_1250	SAK_1251	neuB	cpsL	TRUE	0.850	0.000	0.000	1.000		NA
1167425	1167426	SAK_1251	SAK_1252	cpsL		TRUE	0.952	-3.000	0.033	1.000		NA
1167426	1167427	SAK_1252	SAK_1253			FALSE	0.232	84.000	0.000	NA		NA
1167427	1167428	SAK_1253	SAK_1254		cpsI	TRUE	0.879	34.000	0.000	NA	Y	NA
1167428	1167429	SAK_1254	SAK_1255	cpsI	cpsH	TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1167429	1167430	SAK_1255	SAK_1256	cpsH		FALSE	0.187	96.000	0.000	NA		NA
1167430	1167431	SAK_1256	SAK_1257		cpsF	TRUE	0.949	0.000	0.052	NA		NA
1167431	1167432	SAK_1257	SAK_1258	cpsF	cpsE	TRUE	0.896	24.000	0.020	NA		NA
1167432	1167433	SAK_1258	SAK_1259	cpsE	cpsD	TRUE	0.906	13.000	0.067	NA	N	NA
1167433	1167434	SAK_1259	SAK_1260	cpsD	cpsC	TRUE	0.988	11.000	0.800	1.000	N	NA
1167434	1167435	SAK_1260	SAK_1261	cpsC	cpsB	TRUE	0.994	9.000	0.636	1.000	Y	NA
1167435	1167436	SAK_1261	SAK_1262	cpsB		TRUE	0.982	6.000	0.583	1.000	N	NA
1167438	1167439	SAK_1264	SAK_1265		deoD	TRUE	0.792	9.000	0.000	NA		NA
1167439	1167440	SAK_1265	SAK_1266	deoD		TRUE	0.965	-16.000	0.027	1.000	N	NA
1167440	1167441	SAK_1266	SAK_1267		punA	TRUE	0.677	2.000	0.000	1.000	N	NA
1167441	1167442	SAK_1267	SAK_1268	punA	arsC	TRUE	0.820	39.000	0.108	1.000	N	NA
1167442	1167443	SAK_1268	SAK_1269	arsC	deoB	TRUE	0.740	51.000	0.108	1.000	N	NA
1167443	1167444	SAK_1269	SAK_1270	deoB	rpiA	TRUE	0.796	57.000	0.018	1.000	Y	NA
1167444	1167445	SAK_1270	SAK_1271	rpiA		FALSE	0.022	238.000	0.000	1.000	N	NA
1167445	1167446	SAK_1271	SAK_1272		estA	TRUE	0.641	90.000	0.217	NA		NA
1167446	1167447	SAK_1272	SAK_1273	estA		TRUE	0.810	57.000	0.143	NA		NA
1167447	1167448	SAK_1273	SAK_1274			FALSE	0.063	296.000	0.026	1.000		NA
1167448	1167449	SAK_1274	SAK_1275			TRUE	0.996	0.000	0.895	1.000		NA
1167449	1167450	SAK_1275	SAK_1276			TRUE	0.981	13.000	0.368	NA		NA
1167452	1167453	SAK_1278	SAK_1279	budA	budB	TRUE	0.876	14.000	0.044	1.000	N	NA
1167453	1167454	SAK_1279	SAK_1280	budB		FALSE	0.264	110.000	0.022	1.000		NA
1167454	1167455	SAK_1280	SAK_1281			TRUE	0.979	-10.000	0.048	NA		NA
1167455	1167456	SAK_1281	SAK_1282			FALSE	0.194	92.000	0.000	NA		NA
1167456	1167457	SAK_1282	SAK_1283		mutX	TRUE	0.879	-10.000	0.000	1.000	N	NA
1167459	1167460	SAK_1285	SAK_1286	rfbB	rmlC	TRUE	0.594	207.000	0.350	1.000	Y	NA
1167460	1167461	SAK_1286	SAK_1287	rmlC	rfbA	TRUE	0.985	0.000	0.149	1.000	Y	NA
1167461	1167462	SAK_1287	SAK_1288	rfbA		TRUE	0.588	59.000	0.059	1.000	N	NA
1167462	1167463	SAK_1288	SAK_1289			TRUE	0.888	9.000	0.021	NA		NA
1167463	1167464	SAK_1289	SAK_1290			TRUE	0.994	-10.000	0.283	NA		NA
1167464	1167465	SAK_1290	SAK_1291			FALSE	0.277	104.000	0.012	NA		NA
1167465	1167466	SAK_1291	SAK_1292		apt	FALSE	0.160	118.000	0.005	NA	N	NA
1167466	1167467	SAK_1292	SAK_1293	apt		FALSE	0.093	123.000	0.000	NA	N	NA
1167467	1167468	SAK_1293	SAK_1294		recJ	FALSE	0.075	152.000	0.000	NA	N	NA
1167468	1167469	SAK_1294	SAK_1295	recJ		TRUE	0.944	-3.000	0.016	1.000		NA
1167469	1167470	SAK_1295	SAK_1296		rnz	TRUE	0.936	2.000	0.074	1.000		NA
1167470	1167471	SAK_1296	SAK_1297	rnz		TRUE	0.774	42.000	0.022	NA		NA
1167471	1167472	SAK_1297	SAK_1298			TRUE	0.964	-7.000	0.014	NA		NA
1167472	1167473	SAK_1298	SAK_1299		miaA	FALSE	0.315	91.000	0.027	1.000		NA
1167475	1167476	SAK_1301	SAK_1302			FALSE	0.065	134.000	0.000	1.000	N	NA
1167476	1167477	SAK_1302	SAK_1303			FALSE	0.044	169.000	0.000	1.000	N	NA
1167477	1167478	SAK_1303	SAK_1304			TRUE	0.716	15.000	0.000	NA	N	NA
1167478	1167479	SAK_1304	SAK_1305		pepV	FALSE	0.255	97.000	0.031	NA	N	NA
1167479	1167480	SAK_1305	SAK_1306	pepV		TRUE	0.839	47.000	0.179	1.000	N	NA
1167484	1167485	SAK_1310	SAK_1311			FALSE	0.180	101.000	0.000	NA		NA
1167485	1167486	SAK_1311	SAK_1312			TRUE	0.790	10.000	0.000	NA		NA
1167487	1167488	SAK_1313	SAK_1314			FALSE	0.082	190.000	0.000	NA		NA
1167488	1167489	SAK_1314	SAK_1315			TRUE	0.988	36.000	0.667	0.057		NA
1167489	1167490	SAK_1315	SAK_1316			FALSE	0.058	224.000	0.000	NA		NA
1167490	1167491	SAK_1316	SAK_1317			TRUE	0.823	15.000	0.000	NA		NA
1167492	1167493	SAK_1318	SAK_1319		lmb	TRUE	0.993	13.000	0.800	NA		NA
1167493	1167494	SAK_1319	SAK_1320	lmb	scpB	FALSE	0.045	236.000	0.000	1.000		NA
1167494	1167495	SAK_1320	SAK_1321	scpB		FALSE	0.018	537.000	0.000	NA		NA
1167496	1167497	SAK_1322	SAK_1323			TRUE	0.988	36.000	0.667	0.057		NA
1167500	1167501	SAK_1326	SAK_1327			FALSE	0.038	255.000	0.000	1.000		NA
1167501	1167502	SAK_1327	SAK_1328			FALSE	0.144	135.000	0.000	NA		NA
1167502	1167503	SAK_1328	SAK_1329			TRUE	0.837	2.000	0.000	NA		NA
1167503	1167504	SAK_1329	SAK_1330			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1167504	1167505	SAK_1330	SAK_1331			FALSE	0.055	235.000	0.000	NA		NA
1167505	1167506	SAK_1331	SAK_1332			TRUE	0.948	52.000	0.500	NA		NA
1167506	1167507	SAK_1332	SAK_1333			TRUE	0.983	14.000	0.400	NA		NA
1167507	1167508	SAK_1333	SAK_1334		rplL	FALSE	0.042	241.000	0.000	1.000		NA
1167508	1167509	SAK_1334	SAK_1335	rplL	rplJ	TRUE	0.989	64.000	0.884	0.020	Y	NA
1167511	1167512	SAK_1337	SAK_1338			TRUE	0.965	5.000	0.093	1.000	Y	NA
1167512	1167513	SAK_1338	SAK_1339			FALSE	0.149	130.000	0.000	NA		NA
1167513	1167514	SAK_1339	SAK_1340			FALSE	0.116	158.000	0.000	NA		NA
1167516	1167517	SAK_1342	SAK_1343		clpX	TRUE	0.894	11.000	0.043	1.000		NA
1167519	1167520	SAK_1345	SAK_1346	folA	thyA	TRUE	0.683	80.000	0.295	1.000	N	NA
1167521	1167522	SAK_1347	SAK_1348			TRUE	0.983	2.000	0.183	1.000	Y	NA
1167522	1167523	SAK_1348	SAK_1349			TRUE	0.328	92.000	0.020	NA		NA
1167523	1167524	SAK_1349	SAK_1350			TRUE	0.950	5.000	0.146	NA		NA
1167524	1167525	SAK_1350	SAK_1351			TRUE	0.539	87.000	0.135	1.000		NA
1167525	1167526	SAK_1351	SAK_1352			FALSE	0.106	101.000	0.000	NA	N	NA
1167527	1167528	SAK_1353	SAK_1354		fni	TRUE	0.336	68.000	0.000	NA		NA
1167528	1167529	SAK_1354	SAK_1355	fni		TRUE	0.958	-3.000	0.097	1.000	N	NA
1167529	1167530	SAK_1355	SAK_1356		mvaD	TRUE	0.998	-7.000	0.312	0.005	Y	NA
1167530	1167531	SAK_1356	SAK_1357	mvaD	mvk	TRUE	0.999	-18.000	0.281	0.004	Y	NA
1167531	1167532	SAK_1357	SAK_1358	mvk		FALSE	0.073	116.000	0.000	1.000	N	NA
1167532	1167533	SAK_1358	SAK_1359			TRUE	0.995	0.000	0.533	1.000	Y	NA
1167533	1167534	SAK_1359	SAK_1360			TRUE	0.993	2.000	0.800	1.000		NA
1167534	1167535	SAK_1360	SAK_1361			FALSE	0.145	108.000	0.000	1.000		NA
1167535	1167536	SAK_1361	SAK_1362			TRUE	1.000	-10.000	1.000	0.007	Y	NA
1167536	1167537	SAK_1362	SAK_1363			TRUE	0.894	47.000	0.296	1.000	N	NA
1167539	1167540	SAK_1365	SAK_1366	def	gdhA	TRUE	0.437	70.000	0.056	1.000	N	NA
1167542	1167543	SAK_1368	SAK_1369			TRUE	0.998	5.000	0.846	0.007	Y	NA
1167543	1167544	SAK_1369	SAK_1370			TRUE	0.359	67.000	0.013	1.000	N	NA
1167544	1167545	SAK_1370	SAK_1371			TRUE	0.932	-3.000	0.006	1.000		NA
1167545	1167546	SAK_1371	SAK_1372		papS	TRUE	0.904	11.000	0.056	1.000		NA
1167546	1167547	SAK_1372	SAK_1373	papS		FALSE	0.075	200.000	0.000	NA		NA
1167547	1167548	SAK_1373	SAK_1374			TRUE	0.950	0.000	0.056	NA		NA
1167548	1167549	SAK_1374	SAK_1375			TRUE	0.592	72.000	0.083	NA		NA
1167549	1167550	SAK_1375	SAK_1376			TRUE	0.535	51.000	0.000	NA		NA
1167550	1167551	SAK_1376	SAK_1377			FALSE	0.083	189.000	0.000	NA		NA
1167551	1167552	SAK_1377	SAK_1378			TRUE	0.998	-3.000	0.816	1.000	Y	NA
1167552	1167553	SAK_1378	SAK_1379			TRUE	0.998	-3.000	0.721	1.000	Y	NA
1167553	1167554	SAK_1379	SAK_1380			FALSE	0.066	131.000	0.000	1.000	N	NA
1167554	1167555	SAK_1380	SAK_1381			FALSE	0.115	144.000	0.000	1.000		NA
1167555	1167556	SAK_1381	SAK_1382		panE	FALSE	0.053	212.000	0.000	1.000		NA
1167556	1167557	SAK_1382	SAK_1383	panE		TRUE	0.979	13.000	0.333	NA		NA
1167557	1167558	SAK_1383	SAK_1384			TRUE	0.322	137.000	0.059	NA		NA
1167558	1167559	SAK_1384	SAK_1385		trmD	TRUE	0.955	-19.000	0.007	1.000	N	NA
1167559	1167560	SAK_1385	SAK_1386	trmD	rimM	TRUE	0.999	-13.000	0.672	1.000	Y	NA
1167560	1167561	SAK_1386	SAK_1387	rimM		TRUE	0.395	63.000	0.000	NA		NA
1167561	1167562	SAK_1387	SAK_1388			TRUE	0.792	9.000	0.000	NA		NA
1167562	1167563	SAK_1388	SAK_1389			FALSE	0.171	108.000	0.000	NA		NA
1167563	1167564	SAK_1389	SAK_1390			FALSE	0.147	132.000	0.000	NA		NA
1167564	1167565	SAK_1390	SAK_1391		rpsP	TRUE	0.976	10.000	0.385	1.000		NA
1167565	1167566	SAK_1391	SAK_1392	rpsP		FALSE	0.068	129.000	0.000	1.000	N	NA
1167566	1167567	SAK_1392	SAK_1393			TRUE	0.997	15.000	0.923	1.000	Y	NA
1167567	1167568	SAK_1393	SAK_1394			TRUE	0.992	3.000	0.923	1.000	N	NA
1167568	1167569	SAK_1394	SAK_1395			FALSE	0.055	209.000	0.000	1.000		NA
1167569	1167570	SAK_1395	SAK_1396		carA	TRUE	0.839	56.000	0.013	0.002		NA
1167570	1167571	SAK_1396	SAK_1397	carA	pyrR	TRUE	0.764	49.000	0.000	1.000	Y	NA
1167571	1167572	SAK_1397	SAK_1398	pyrR		FALSE	0.083	176.000	0.008	1.000	N	NA
1167572	1167573	SAK_1398	SAK_1399		lspA	TRUE	0.979	-16.000	0.082	1.000	N	NA
1167573	1167574	SAK_1399	SAK_1400	lspA		TRUE	0.910	9.000	0.119	1.000	N	NA
1167574	1167575	SAK_1400	SAK_1401		rpmA	FALSE	0.026	216.000	0.000	1.000	N	NA
1167575	1167576	SAK_1401	SAK_1402	rpmA		TRUE	0.984	22.000	0.203	NA	Y	NA
1167576	1167577	SAK_1402	SAK_1403		rplU	TRUE	0.982	7.000	0.208	NA	Y	NA
1167577	1167578	SAK_1403	SAK_1404	rplU		FALSE	0.035	190.000	0.000	1.000	N	NA
1167578	1167579	SAK_1404	SAK_1405		thiI	FALSE	0.183	102.000	0.014	1.000	N	NA
1167579	1167580	SAK_1405	SAK_1406	thiI		TRUE	0.975	2.000	0.349	1.000	N	NA
1167582	1167583	SAK_1408	SAK_1409	gor		FALSE	0.154	175.000	0.010	NA		NA
1167583	1167584	SAK_1409	SAK_1410		aroC	TRUE	0.321	84.000	0.005	NA		NA
1167584	1167585	SAK_1410	SAK_1411	aroC	aroB	TRUE	0.992	1.000	0.110	0.003	Y	NA
1167585	1167586	SAK_1411	SAK_1412	aroB	aroD	TRUE	0.643	94.000	0.000	0.003	Y	NA
1167586	1167587	SAK_1412	SAK_1413	aroD		TRUE	0.967	0.000	0.125	NA		NA
1167589	1167590	SAK_1415	SAK_1416	rplT	rpmI	TRUE	0.993	58.000	0.928	0.020	Y	NA
1167590	1167591	SAK_1416	SAK_1417	rpmI	infC	TRUE	0.987	40.000	0.652	1.000	Y	NA
1167591	1167592	SAK_1417	SAK_1418	infC	cmk	FALSE	0.104	161.000	0.010	1.000	N	NA
1167592	1167593	SAK_1418	SAK_1419	cmk		TRUE	0.855	11.000	0.012	1.000		NA
1167595	1167596	SAK_1421	SAK_1422		pepT	TRUE	0.901	29.000	0.051	NA		NA
1167596	1167597	SAK_1422	SAK_1423	pepT		FALSE	0.122	135.000	0.000	1.000		NA
1167598	1167599	SAK_1424	SAK_1425	murE	fhuC	FALSE	0.198	156.000	0.062	1.000	N	NA
1167599	1167600	SAK_1425	SAK_1426	fhuC	fhuD	TRUE	0.997	24.000	0.889	1.000	Y	NA
1167600	1167601	SAK_1426	SAK_1427	fhuD	fhuB	TRUE	0.981	16.000	0.179	1.000	Y	NA
1167601	1167602	SAK_1427	SAK_1428	fhuB		TRUE	0.999	-3.000	0.857	0.039	Y	NA
1167603	1167604	SAK_1429	SAK_1430		ppaC	TRUE	0.605	60.000	0.015	NA		NA
1167604	1167605	SAK_1430	SAK_1431	ppaC	pflA	FALSE	0.185	117.000	0.023	1.000	N	NA
1167605	1167606	SAK_1431	SAK_1432	pflA		TRUE	0.525	68.000	0.028	NA		NA
1167606	1167607	SAK_1432	SAK_1433			FALSE	0.168	180.000	0.023	NA		NA
1167607	1167608	SAK_1433	SAK_1434			TRUE	0.994	-7.000	0.408	1.000		NA
1167608	1167609	SAK_1434	SAK_1435			TRUE	0.356	93.000	0.050	1.000		NA
1167609	1167610	SAK_1435	SAK_1436			TRUE	0.998	-19.000	0.600	NA		NA
1167610	1167611	SAK_1436	SAK_1437			FALSE	0.038	284.000	0.000	NA		NA
1167611	1167612	SAK_1437	SAK_1438			TRUE	0.934	-7.000	0.000	NA		NA
1167612	1167613	SAK_1438	SAK_1439			TRUE	0.947	-10.000	0.000	NA		NA
1167613	1167614	SAK_1439	SAK_1440			TRUE	0.658	38.000	0.000	NA		NA
1167614	1167615	SAK_1440	SAK_1441			TRUE	0.843	41.000	0.000	0.009		NA
1167615	1167616	SAK_1441	SAK_1442			FALSE	0.092	177.000	0.000	NA		NA
1167616	1167617	SAK_1442	SAK_1443		lepB	TRUE	0.821	19.000	0.000	NA		NA
1167617	1167618	SAK_1443	SAK_1444	lepB		TRUE	0.998	-16.000	0.667	NA		NA
1167618	1167619	SAK_1444	SAK_1445			FALSE	0.052	239.000	0.000	NA		NA
1167619	1167620	SAK_1445	SAK_1446			TRUE	0.936	-10.000	0.000	1.000		NA
1167620	1167621	SAK_1446	SAK_1447			TRUE	0.891	-3.000	0.000	1.000		NA
1167621	1167622	SAK_1447	SAK_1448			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1167622	1167623	SAK_1448	SAK_1449			TRUE	0.837	2.000	0.000	NA		NA
1167623	1167624	SAK_1449	SAK_1450			TRUE	0.983	9.000	0.222	NA	Y	NA
1167624	1167625	SAK_1450	SAK_1451			TRUE	0.938	2.000	0.000	NA	Y	NA
1167625	1167626	SAK_1451	SAK_1452		ispD	TRUE	0.639	3.000	0.000	1.000	N	NA
1167626	1167627	SAK_1452	SAK_1453	ispD	licD2	TRUE	0.702	3.000	0.000	NA	N	NA
1167627	1167628	SAK_1453	SAK_1454	licD2		TRUE	0.800	25.000	0.000	NA		NA
1167628	1167629	SAK_1454	SAK_1455			TRUE	0.934	-7.000	0.000	NA		NA
1167629	1167630	SAK_1455	SAK_1456			TRUE	0.995	-3.000	0.568	NA		NA
1167630	1167631	SAK_1456	SAK_1457			TRUE	0.796	5.000	0.000	NA		NA
1167631	1167632	SAK_1457	SAK_1458		rgpAc	TRUE	0.994	-10.000	0.289	NA		NA
1167632	1167633	SAK_1458	SAK_1459	rgpAc	rfbD	TRUE	0.715	117.000	0.212	1.000	Y	NA
1167633	1167634	SAK_1459	SAK_1460	rfbD		TRUE	0.564	90.000	0.152	NA		NA
1167634	1167635	SAK_1460	SAK_1461		rpoD	TRUE	0.337	109.000	0.044	NA		NA
1167635	1167636	SAK_1461	SAK_1462	rpoD	dnaG	TRUE	0.945	8.000	0.209	1.000	N	NA
1167638	1167639	SAK_1464	SAK_1465	rpsU		FALSE	0.176	104.000	0.000	NA		NA
1167639	1167640	SAK_1465	SAK_1466			FALSE	0.238	83.000	0.000	NA		NA
1167640	1167641	SAK_1466	SAK_1467			FALSE	0.046	325.000	0.000	0.051	N	NA
1167645	1167646	SAK_1471	SAK_1472		glgP	FALSE	0.054	415.000	0.000	1.000	Y	NA
1167646	1167647	SAK_1472	SAK_1473	glgP	malQ	TRUE	0.993	12.000	0.289	0.019	Y	NA
1167647	1167648	SAK_1473	SAK_1474	malQ		TRUE	0.705	121.000	0.538	1.000	N	NA
1167649	1167650	SAK_1475	SAK_1476			TRUE	0.951	98.000	0.690	0.039	Y	NA
1167650	1167651	SAK_1476	SAK_1477			TRUE	0.999	0.000	0.793	0.039	Y	NA
1167651	1167652	SAK_1477	SAK_1478			FALSE	0.090	231.000	0.000	0.039	N	NA
1167653	1167654	SAK_1479	SAK_1480			FALSE	0.038	283.000	0.000	NA		NA
1167654	1167655	SAK_1480	SAK_1481			TRUE	0.989	-7.000	0.200	NA		NA
1167655	1167656	SAK_1481	SAK_1482		secA	TRUE	0.657	14.000	0.000	1.000	N	NA
1167656	1167657	SAK_1482	SAK_1483	secA	asp3	TRUE	0.953	-13.000	0.000	NA		NA
1167657	1167658	SAK_1483	SAK_1484	asp3	asp2	TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1167658	1167659	SAK_1484	SAK_1485	asp2	asp1	FALSE	0.244	82.000	0.000	NA		NA
1167659	1167660	SAK_1485	SAK_1486	asp1		TRUE	0.918	0.000	0.007	NA		NA
1167660	1167661	SAK_1486	SAK_1487			FALSE	0.158	124.000	0.000	NA		NA
1167661	1167662	SAK_1487	SAK_1488			TRUE	0.428	61.000	0.000	NA		NA
1167662	1167663	SAK_1488	SAK_1489			TRUE	0.934	-7.000	0.000	NA		NA
1167663	1167664	SAK_1489	SAK_1490			TRUE	0.993	-10.000	0.000	0.003	Y	NA
1167664	1167665	SAK_1490	SAK_1491			TRUE	0.987	-3.000	0.000	0.003	Y	NA
1167665	1167666	SAK_1491	SAK_1492			TRUE	0.792	9.000	0.000	NA		NA
1167666	1167667	SAK_1492	SAK_1493			FALSE	0.030	331.000	0.000	NA		NA
1167669	1167670	SAK_1495	SAK_1496	uvrB		TRUE	0.428	61.000	0.000	NA		NA
1167671	1167672	SAK_1497	SAK_1498			TRUE	0.992	0.000	0.326	1.000	Y	NA
1167673	1167674	SAK_1499	SAK_1500		obgE	TRUE	0.867	26.000	0.009	NA		NA
1167674	1167675	SAK_1500	SAK_1501	obgE		TRUE	0.490	67.000	0.011	NA		NA
1167677	1167678	SAK_1503	SAK_1504			TRUE	0.378	110.000	0.000	0.009		NA
1167678	1167679	SAK_1504	SAK_1505			TRUE	0.432	85.000	0.000	1.000	Y	NA
1167679	1167680	SAK_1505	SAK_1506			FALSE	0.067	191.000	0.000	1.000		NA
1167681	1167682	SAK_1507	SAK_1508		gloA	FALSE	0.202	88.000	0.009	1.000	N	NA
1167682	1167683	SAK_1508	SAK_1509	gloA		FALSE	0.088	129.000	0.000	NA	N	NA
1167683	1167684	SAK_1509	SAK_1510		cycA	FALSE	0.088	129.000	0.000	NA	N	NA
1167685	1167686	SAK_1511	SAK_1512	smpB	rnr	TRUE	0.970	3.000	0.143	0.024	N	NA
1167686	1167687	SAK_1512	SAK_1513	rnr	secG	FALSE	0.263	113.000	0.064	1.000	N	NA
1167687	10942579	SAK_1513	SAK_1514	secG		TRUE	0.572	47.000	0.000	NA		NA
10942579	1167688	SAK_1514	SAK_1515			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1167688	1167689	SAK_1515	SAK_1516			FALSE	0.077	196.000	0.000	NA		NA
1167689	1167690	SAK_1516	SAK_1517			TRUE	0.995	-10.000	0.385	NA		NA
1167690	1167691	SAK_1517	SAK_1518		coaE	FALSE	0.071	124.000	0.000	1.000	N	NA
1167691	1167692	SAK_1518	SAK_1519	coaE	mutM	TRUE	0.948	-3.000	0.066	1.000	N	NA
1167692	1167693	SAK_1519	SAK_1520	mutM		FALSE	0.169	149.000	0.004	1.000		NA
1167695	1167696	SAK_1522	SAK_1523			FALSE	0.055	235.000	0.000	NA		NA
1167696	1167697	SAK_1523	SAK_1524			FALSE	0.015	730.000	0.000	NA		NA
1167697	1167698	SAK_1524	SAK_1525		era	FALSE	0.053	237.000	0.000	NA		NA
1167698	1167699	SAK_1525	SAK_1526	era	dgkA	TRUE	0.813	42.000	0.063	1.000		NA
1167699	1167700	SAK_1526	SAK_1527	dgkA		TRUE	0.982	-19.000	0.035	NA		NA
1167700	1167701	SAK_1527	SAK_1528			FALSE	0.023	407.000	0.000	NA		NA
1167701	1167702	SAK_1528	SAK_1529			FALSE	0.017	322.000	0.000	NA	N	NA
1167704	1167705	SAK_1531	SAK_1532			FALSE	0.222	124.000	0.004	NA		NA
1167705	1167706	SAK_1532	SAK_1533			FALSE	0.118	157.000	0.000	NA		NA
1167706	1167707	SAK_1533	SAK_1534		msrA	TRUE	0.932	24.000	0.080	NA		NA
1167707	1167708	SAK_1534	SAK_1535	msrA		FALSE	0.218	138.000	0.016	1.000		NA
1167708	1167709	SAK_1535	SAK_1536		frr	FALSE	0.227	118.000	0.012	1.000		NA
1167709	1167710	SAK_1536	SAK_1537	frr	pyrH	TRUE	0.986	16.000	0.626	1.000	N	NA
1167710	1167711	SAK_1537	SAK_1538	pyrH	nikE	FALSE	0.072	121.000	0.000	1.000	N	NA
1167711	1167712	SAK_1538	SAK_1539	nikE	nikD	TRUE	0.999	-13.000	0.500	0.023	Y	NA
1167712	1167713	SAK_1539	SAK_1540	nikD	nikC	TRUE	0.998	-12.000	0.353	1.000	Y	NA
1167713	1167714	SAK_1540	SAK_1541	nikC	nikB	TRUE	0.983	45.000	0.353	0.038	Y	NA
1167714	1167715	SAK_1541	SAK_1542	nikB	nikA	TRUE	0.998	-13.000	0.167	0.038	Y	NA
1167715	1167716	SAK_1542	SAK_1543	nikA	rplA	FALSE	0.010	389.000	0.000	1.000	N	NA
1167716	1167717	SAK_1543	SAK_1544	rplA	rplK	TRUE	0.964	104.000	0.838	0.026	Y	NA
1167719	1167720	SAK_1546	SAK_1547			TRUE	0.760	8.000	0.000	1.000		NA
1167721	1167722	SAK_1548	SAK_1549			FALSE	0.019	485.000	0.000	NA		NA
1167722	1167723	SAK_1549	SAK_1550			TRUE	0.962	-24.000	0.000	NA		NA
1167724	1167725	SAK_1551	SAK_1552	pabB	ftsK	FALSE	0.116	82.000	0.000	1.000	N	NA
1167727	1167728	SAK_1554	SAK_1555	mtsC	mtsB	TRUE	0.978	2.000	0.130	1.000	Y	NA
1167728	1167729	SAK_1555	SAK_1556	mtsB	mtsA	TRUE	0.495	171.000	0.135	1.000	Y	NA
1167731	1167732	SAK_1558	SAK_1559	pfs		TRUE	0.903	10.000	0.041	NA		NA
1167732	1167733	SAK_1559	SAK_1560			TRUE	0.936	0.000	0.025	NA		NA
1167733	1167734	SAK_1560	SAK_1561		glmU	TRUE	0.829	21.000	0.015	1.000	N	NA
1167734	1167735	SAK_1561	SAK_1562	glmU		FALSE	0.049	244.000	0.000	NA		NA
1167735	1167736	SAK_1562	SAK_1563			TRUE	0.987	13.000	0.500	NA		NA
1167736	1167737	SAK_1563	SAK_1564			FALSE	0.210	89.000	0.000	NA		NA
1167737	1167738	SAK_1564	SAK_1565			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1167738	1167739	SAK_1565	SAK_1566			FALSE	0.052	239.000	0.000	NA		NA
1167739	1167740	SAK_1566	SAK_1567			TRUE	0.997	-7.000	0.710	NA		NA
1167740	1167741	SAK_1567	SAK_1568			FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1167741	1167742	SAK_1568	SAK_1569			FALSE	0.076	198.000	0.000	NA		NA
1167742	1167743	SAK_1569	SAK_1570			FALSE	0.051	240.000	0.000	NA		NA
1167743	1167744	SAK_1570	SAK_1571			TRUE	0.418	140.000	0.131	NA		NA
1167744	1167745	SAK_1571	SAK_1572			TRUE	0.955	7.000	0.167	NA		NA
1167745	1167746	SAK_1572	SAK_1573			TRUE	0.993	5.000	0.857	NA		NA
1167746	1167747	SAK_1573	SAK_1574			TRUE	0.936	52.000	0.429	NA		NA
1167747	1167748	SAK_1574	SAK_1575		brnQ	FALSE	0.026	365.000	0.000	NA		NA
1167748	1167749	SAK_1575	SAK_1576	brnQ	metG	FALSE	0.033	196.000	0.000	1.000	N	NA
1167752	1167753	SAK_1579	SAK_1580			TRUE	0.998	-16.000	0.714	1.000		NA
1167753	1167754	SAK_1580	SAK_1581		xth	FALSE	0.232	77.000	0.000	1.000		NA
1167755	1167756	SAK_1582	SAK_1583			TRUE	0.890	2.000	0.050	1.000	N	NA
1167756	1167757	SAK_1583	SAK_1584			TRUE	0.469	55.000	0.009	1.000	N	NA
1167757	1167758	SAK_1584	SAK_1585			TRUE	0.708	63.000	0.013	0.048		NA
1167758	1167759	SAK_1585	SAK_1586		serC	TRUE	0.336	68.000	0.000	NA		NA
1167761	1167762	SAK_1588	SAK_1589			TRUE	0.906	6.000	0.043	NA		NA
1167762	1167763	SAK_1589	SAK_1590		holB	TRUE	0.888	30.000	0.038	NA		NA
1167763	1167764	SAK_1590	SAK_1591	holB	tmk	TRUE	0.963	20.000	0.254	1.000	N	NA
1167766	1167767	SAK_1593	SAK_1594		livF	TRUE	0.967	19.000	0.214	1.000		NA
1167767	1167768	SAK_1594	SAK_1595	livF	livG	TRUE	0.992	0.000	0.128	0.023	Y	NA
1167768	1167769	SAK_1595	SAK_1596	livG	livM	TRUE	0.992	1.000	0.349	1.000	Y	NA
1167769	1167770	SAK_1596	SAK_1597	livM	livH	TRUE	0.994	3.000	0.363	0.038	Y	NA
1167770	1167771	SAK_1597	SAK_1598	livH	livK	FALSE	0.174	106.000	0.000	NA		NA
1167771	1167772	SAK_1598	SAK_1599	livK		FALSE	0.123	155.000	0.000	NA		NA
1167772	1167773	SAK_1599	SAK_1600		clpP	TRUE	0.401	100.000	0.065	NA		NA
1167773	1167774	SAK_1600	SAK_1601	clpP	upp	FALSE	0.147	125.000	0.010	1.000	N	NA
1167774	1167775	SAK_1601	SAK_1602	upp		FALSE	0.134	110.000	0.004	1.000	N	NA
1167775	1167776	SAK_1602	SAK_1603			FALSE	0.064	136.000	0.000	1.000	N	NA
1167776	1167777	SAK_1603	SAK_1604			FALSE	0.042	173.000	0.000	1.000	N	NA
1167778	1167779	SAK_1605	SAK_1606			TRUE	0.990	5.000	0.163	0.004	Y	NA
1167780	1167781	SAK_1607	SAK_1608		rluB	TRUE	0.929	0.000	0.014	NA		NA
1167781	1167782	SAK_1608	SAK_1609	rluB	scpB	TRUE	0.990	-10.000	0.224	NA	N	NA
1167782	1167783	SAK_1609	SAK_1610	scpB	scpA	TRUE	0.995	-3.000	0.570	NA		NA
1167783	1167784	SAK_1610	SAK_1611	scpA		TRUE	0.931	0.000	0.017	NA		NA
1167784	1167785	SAK_1611	SAK_1612			TRUE	0.986	-10.000	0.111	NA		NA
1167785	1167786	SAK_1612	SAK_1613			TRUE	0.958	-3.000	0.034	NA		NA
1167786	1167787	SAK_1613	SAK_1614		rdgB	TRUE	0.969	-18.000	0.005	1.000		NA
1167787	1167788	SAK_1614	SAK_1615	rdgB	murI	TRUE	0.930	-3.000	0.034	1.000	N	NA
1167788	1167789	SAK_1615	SAK_1616	murI		FALSE	0.147	175.000	0.014	1.000		NA
1167789	1167790	SAK_1616	SAK_1617			FALSE	0.116	158.000	0.000	NA		NA
1167790	1167791	SAK_1617	SAK_1618			TRUE	0.730	62.000	0.107	NA		NA
1167791	1167792	SAK_1618	SAK_1619			TRUE	0.336	68.000	0.000	NA		NA
1167792	1167793	SAK_1619	SAK_1620			TRUE	0.949	23.000	0.123	NA		NA
1167793	1167794	SAK_1620	SAK_1621			TRUE	0.809	38.000	0.043	1.000		NA
1167795	1167796	SAK_1622	SAK_1623			TRUE	0.499	85.000	0.154	1.000	N	NA
1167797	1167798	SAK_1624	SAK_1625			TRUE	0.986	24.000	0.125	0.038	Y	NA
1167798	1167799	SAK_1625	SAK_1626			FALSE	0.049	161.000	0.000	1.000	N	NA
1167799	1167800	SAK_1626	SAK_1627		greA	FALSE	0.081	103.000	0.000	1.000	N	NA
1167800	1167801	SAK_1627	SAK_1628	greA		TRUE	0.579	73.000	0.079	NA		NA
1167801	1167802	SAK_1628	SAK_1629			TRUE	0.543	87.000	0.120	NA		NA
1167802	1167803	SAK_1629	SAK_1630		murC	TRUE	0.320	86.000	0.014	1.000		NA
1167803	1167804	SAK_1630	SAK_1631	murC		TRUE	0.874	10.000	0.013	NA		NA
1167804	1167805	SAK_1631	SAK_1632			TRUE	0.796	5.000	0.000	NA		NA
1167805	1167806	SAK_1632	SAK_1633			TRUE	0.412	62.000	0.000	NA		NA
1167806	1167807	SAK_1633	SAK_1634			FALSE	0.156	155.000	0.004	1.000		NA
1167807	1167808	SAK_1634	SAK_1635		dnaI	TRUE	0.650	48.000	0.008	1.000		NA
1167808	1167809	SAK_1635	SAK_1636	dnaI		TRUE	0.998	-3.000	0.817	NA	Y	NA
1167809	1167810	SAK_1636	SAK_1637			TRUE	0.950	0.000	0.109	NA	N	NA
1167810	1167811	SAK_1637	SAK_1638			FALSE	0.137	149.000	0.007	NA	N	NA
1167811	1167812	SAK_1638	SAK_1639		csrR	TRUE	0.999	-10.000	0.438	0.072	Y	NA
1167812	1167813	SAK_1639	SAK_1640	csrR		FALSE	0.098	235.000	0.014	NA		NA
1167813	1167814	SAK_1640	SAK_1641		htpX	FALSE	0.239	105.000	0.002	NA		NA
1167814	1167815	SAK_1641	SAK_1642	htpX		TRUE	0.970	21.000	0.222	NA		NA
1167816	1167817	SAK_1643	SAK_1644	gidB		TRUE	0.798	15.000	0.006	1.000	N	NA
1167817	1167818	SAK_1644	SAK_1645			TRUE	0.997	13.000	0.490	0.004	Y	NA
1167819	1167820	SAK_1646	SAK_1647			TRUE	0.996	-7.000	0.530	1.000		NA
1167820	1167821	SAK_1647	SAK_1648			TRUE	0.984	17.000	0.435	NA		NA
1167821	1167822	SAK_1648	SAK_1649		ygjU	FALSE	0.102	169.000	0.000	NA		NA
1167823	1167824	SAK_1650	SAK_1651	brnQ		FALSE	0.162	114.000	0.000	NA		NA
1167825	1167826	SAK_1652	SAK_1653	metI		TRUE	0.999	-3.000	0.938	1.000	Y	NA
1167826	1167827	SAK_1653	SAK_1654			TRUE	0.853	-7.000	0.000	1.000	N	NA
1167827	1167828	SAK_1654	SAK_1655			FALSE	0.084	134.000	0.000	NA	N	NA
1167828	1167829	SAK_1655	SAK_1656			FALSE	0.080	141.000	0.000	NA	N	NA
1167829	1167830	SAK_1656	SAK_1657			FALSE	0.152	102.000	0.000	1.000		NA
1167830	1167831	SAK_1657	SAK_1658			FALSE	0.172	155.000	0.002	NA		NA
1167831	1167832	SAK_1658	SAK_1659			FALSE	0.161	118.000	0.000	NA		NA
1167832	1167833	SAK_1659	SAK_1660			TRUE	0.591	208.000	0.625	1.000		NA
1167834	1167835	SAK_1661	SAK_1662			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1167835	1167836	SAK_1662	SAK_1663			TRUE	0.989	38.000	0.316	0.002	Y	NA
1167836	1167837	SAK_1663	SAK_1664			TRUE	0.957	0.000	0.099	1.000		NA
1167837	1167838	SAK_1664	SAK_1665		glpF	TRUE	0.996	10.000	0.857	0.055		NA
1167839	1167840	SAK_1666	SAK_1667			FALSE	0.199	139.000	0.000	0.050	N	NA
1167840	1167841	SAK_1667	SAK_1668			TRUE	0.330	93.000	0.023	NA		NA
1167841	1167842	SAK_1668	SAK_1669			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1167842	1167843	SAK_1669	SAK_1670			TRUE	0.815	23.000	0.000	NA		NA
1167843	1167844	SAK_1670	SAK_1671			TRUE	0.665	66.000	0.085	NA		NA
1167844	1167845	SAK_1671	SAK_1672			TRUE	0.896	2.000	0.008	NA		NA
1167845	1167846	SAK_1672	SAK_1673			TRUE	0.440	63.000	0.024	1.000	N	NA
1167846	1167847	SAK_1673	SAK_1674		nadD	TRUE	0.992	-3.000	0.199	1.000	Y	NA
1167847	1167848	SAK_1674	SAK_1675	nadD		TRUE	0.394	130.000	0.150	NA	N	NA
1167848	1167849	SAK_1675	SAK_1676			TRUE	0.422	93.000	0.068	NA		NA
1167849	1167850	SAK_1676	SAK_1677			TRUE	0.992	0.000	0.555	1.000		NA
1167850	1167851	SAK_1677	SAK_1678			FALSE	0.246	111.000	0.015	1.000		NA
1167851	1167852	SAK_1678	SAK_1679		gatB	FALSE	0.144	157.000	0.002	1.000		NA
1167852	1167853	SAK_1679	SAK_1680	gatB	gatA	TRUE	0.998	0.000	0.492	0.001	Y	NA
1167853	1167854	SAK_1680	SAK_1681	gatA	gatC	TRUE	0.999	0.000	0.643	0.001	Y	NA
1167854	1167855	SAK_1681	SAK_1682	gatC	ppdK	FALSE	0.109	138.000	0.002	1.000	N	NA
1167855	1167856	SAK_1682	SAK_1683	ppdK		TRUE	0.931	13.000	0.065	NA		NA
1167856	1167857	SAK_1683	SAK_1684			TRUE	0.929	11.000	0.089	NA		NA
1167859	1167860	SAK_1686	SAK_1687		codY	TRUE	0.531	67.000	0.083	1.000	N	NA
1167860	1167861	SAK_1687	SAK_1688	codY		FALSE	0.165	126.000	0.015	1.000	N	NA
1167865	1167866	SAK_1692	SAK_1693	aroE		FALSE	0.157	98.000	0.000	1.000		NA
1167866	1167867	SAK_1693	SAK_1694		recG	FALSE	0.051	291.000	0.008	1.000		NA
1167867	1167868	SAK_1694	SAK_1695	recG		FALSE	0.256	80.000	0.000	NA		NA
1167868	1167869	SAK_1695	SAK_1696		alr	FALSE	0.191	93.000	0.000	NA		NA
1167869	1167870	SAK_1696	SAK_1697	alr	acpS	TRUE	0.956	-3.000	0.093	1.000	N	NA
1167870	1167871	SAK_1697	SAK_1698	acpS		TRUE	0.620	25.000	0.000	1.000	N	NA
1167871	1167872	SAK_1698	SAK_1699		secA	FALSE	0.070	126.000	0.000	1.000	N	NA
1167872	1167873	SAK_1699	SAK_1700	secA	manA	FALSE	0.228	109.000	0.042	1.000	N	NA
1167873	1167874	SAK_1700	SAK_1701	manA	scrK	TRUE	0.787	118.000	0.333	1.000	Y	NA
1167874	1167875	SAK_1701	SAK_1702	scrK		TRUE	0.878	68.000	0.235	1.000	Y	NA
1167876	1167877	SAK_1703	SAK_1704	scrB	scrR	TRUE	0.986	2.000	0.571	1.000	N	NA
1167878	1167879	SAK_1705	SAK_1706	nusB		TRUE	0.992	-7.000	0.265	NA		NA
1167879	1167880	SAK_1706	SAK_1707		efp	TRUE	0.373	89.000	0.031	NA		NA
1167880	1167881	SAK_1707	SAK_1708	efp		FALSE	0.014	928.000	0.000	NA		NA
1167881	1167882	SAK_1708	SAK_1709			FALSE	0.021	418.000	0.000	NA		NA
1167882	1167883	SAK_1709	SAK_1710			TRUE	0.818	13.000	0.000	NA		NA
1167883	1167884	SAK_1710	SAK_1711			FALSE	0.020	453.000	0.000	NA		NA
1167884	1167885	SAK_1711	SAK_1712			TRUE	0.793	11.000	0.000	NA		NA
1167885	1167886	SAK_1712	SAK_1713			FALSE	0.034	302.000	0.000	NA		NA
1167886	1167887	SAK_1713	SAK_1714		pepP	TRUE	0.804	12.000	0.000	NA		NA
1167887	1167888	SAK_1714	SAK_1715	pepP		FALSE	0.182	100.000	0.000	NA		NA
1167888	1167889	SAK_1715	SAK_1716			TRUE	0.988	2.000	0.500	NA		NA
1167889	1167890	SAK_1716	SAK_1717		uvrA	FALSE	0.012	336.000	0.000	1.000	N	NA
1167890	1167891	SAK_1717	SAK_1718	uvrA		FALSE	0.147	132.000	0.000	NA		NA
1167891	1167892	SAK_1718	SAK_1719			TRUE	0.927	25.000	0.072	NA		NA
1167892	1167893	SAK_1719	SAK_1720		rpsR	FALSE	0.043	170.000	0.000	1.000	N	NA
1167893	1167894	SAK_1720	SAK_1721	rpsR	ssb1	TRUE	0.586	45.000	0.012	1.000	N	NA
1167894	1167895	SAK_1721	SAK_1722	ssb1	rpsF	TRUE	0.797	12.000	0.012	1.000	N	NA
1167896	1167897	SAK_1723	SAK_1724	mutY		FALSE	0.070	177.000	0.002	1.000	N	NA
1167898	10942580	SAK_1725	SAK_1726	trx		FALSE	0.249	81.000	0.000	NA		NA
10942580	1167899	SAK_1726	SAK_1727			FALSE	0.161	118.000	0.000	NA		NA
1167899	1167900	SAK_1727	SAK_1728			TRUE	0.448	85.000	0.070	1.000		NA
1167900	1167901	SAK_1728	SAK_1729			TRUE	0.898	3.000	0.019	NA		NA
1167902	1167903	SAK_1730	SAK_1731	rnhC	lepB	TRUE	0.902	16.000	0.080	1.000	N	NA
1167903	1167904	SAK_1731	SAK_1732	lepB		FALSE	0.293	129.000	0.099	1.000	N	NA
1167904	1167905	SAK_1732	SAK_1733			TRUE	0.337	115.000	0.050	NA		NA
1167907	1167908	SAK_1735	SAK_1736	pflB		FALSE	0.153	101.000	0.000	1.000		NA
1167909	1167910	SAK_1737	SAK_1738			TRUE	0.990	-3.000	0.326	NA		NA
1167912	1167913	SAK_1740	SAK_1741			FALSE	0.103	190.000	0.031	1.000	N	NA
1167913	1167914	SAK_1741	SAK_1742			TRUE	0.871	18.000	0.043	1.000	N	NA
1167915	1167916	SAK_1743	SAK_1744		pepX	TRUE	0.925	24.000	0.081	1.000		NA
1167916	1167917	SAK_1744	SAK_1745	pepX		TRUE	0.918	4.000	0.054	NA		NA
1167917	1167918	SAK_1745	SAK_1746			TRUE	0.582	46.000	0.000	NA		NA
1167919	1167920	SAK_1747	SAK_1748	cydC	cydD	TRUE	0.997	-7.000	0.168	0.006	Y	NA
1167920	1167921	SAK_1748	SAK_1749	cydD	cydB	TRUE	0.976	0.000	0.061	1.000	Y	NA
1167921	1167922	SAK_1749	SAK_1750	cydB	cydA	TRUE	0.999	1.000	0.950	0.017	Y	NA
1167922	1167923	SAK_1750	SAK_1751	cydA		TRUE	0.837	103.000	0.174	0.017	Y	NA
1167923	1167924	SAK_1751	SAK_1752			TRUE	0.962	13.000	0.261	1.000	N	NA
1167924	1167925	SAK_1752	SAK_1753			FALSE	0.022	409.000	0.000	NA		NA
1167927	1167928	SAK_1755	SAK_1756		tkt	FALSE	0.141	138.000	0.000	NA		NA
1167928	1167929	SAK_1756	SAK_1757	tkt		TRUE	0.974	49.000	0.500	1.000	Y	NA
1167929	1167930	SAK_1757	SAK_1758			TRUE	0.967	18.000	0.000	0.019	Y	NA
1167930	1167931	SAK_1758	SAK_1759			TRUE	0.985	12.000	0.273	1.000	Y	NA
1167931	1167932	SAK_1759	SAK_1760			TRUE	0.968	13.000	0.000	0.013	Y	NA
1167932	1167933	SAK_1760	SAK_1761			TRUE	0.992	14.000	0.179	0.011	Y	NA
1167933	1167934	SAK_1761	SAK_1762			TRUE	0.907	14.000	0.000	0.013	N	NA
1167934	1167935	SAK_1762	SAK_1763			FALSE	0.017	552.000	0.000	NA		NA
1167936	1167937	SAK_1764	SAK_1765			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1167938	1167939	SAK_1766	SAK_1767			TRUE	0.622	42.000	0.000	NA		NA
1167939	1167940	SAK_1767	SAK_1768			TRUE	0.757	10.000	0.000	1.000		NA
1167940	1167941	SAK_1768	SAK_1769			FALSE	0.023	408.000	0.000	NA		NA
1167942	1167943	SAK_1770	SAK_1771		cfa	FALSE	0.111	161.000	0.000	NA		NA
1167944	1167945	SAK_1772	SAK_1773			TRUE	0.386	127.000	0.156	1.000	N	NA
1167945	1167946	SAK_1773	SAK_1774			TRUE	0.851	44.000	0.105	NA		NA
1167950	1167951	SAK_1778	SAK_1779	ltaE		FALSE	0.072	119.000	0.000	1.000	N	NA
1167951	1167952	SAK_1779	SAK_1780		rimI	TRUE	0.420	76.000	0.030	1.000		NA
1167952	1167953	SAK_1780	SAK_1781	rimI		TRUE	0.969	2.000	0.209	1.000		NA
1167954	1167955	SAK_1782	SAK_1783			TRUE	0.953	54.000	0.576	NA		NA
1167956	1167957	SAK_1784	SAK_1785		glnA	FALSE	0.133	148.000	0.000	NA		NA
1167957	1167958	SAK_1785	SAK_1786	glnA	glnR	TRUE	0.906	34.000	0.179	1.000	N	NA
1167958	1167959	SAK_1786	SAK_1787	glnR		TRUE	0.641	80.000	0.154	NA		NA
1167959	1167960	SAK_1787	SAK_1788		pgk	FALSE	0.063	263.000	0.002	NA		NA
1167960	1167961	SAK_1788	SAK_1789	pgk		FALSE	0.176	135.000	0.003	1.000		NA
1167961	1167962	SAK_1789	SAK_1790		gap	FALSE	0.055	209.000	0.000	1.000		NA
1167962	1167963	SAK_1790	SAK_1791	gap	fusA	FALSE	0.030	205.000	0.000	1.000	N	NA
1167963	1167964	SAK_1791	SAK_1792	fusA	rpsG	TRUE	0.840	155.000	0.579	1.000	Y	NA
1167964	1167965	SAK_1792	SAK_1793	rpsG	rpsL	TRUE	0.993	22.000	0.224	0.004	Y	NA
1167965	1167966	SAK_1793	SAK_1794	rpsL	purR	FALSE	0.025	219.000	0.000	1.000	N	NA
1167966	1167967	SAK_1794	SAK_1795	purR		TRUE	0.353	97.000	0.052	1.000		NA
1167967	1167968	SAK_1795	SAK_1796			TRUE	0.975	-10.000	0.030	NA		NA
1167968	1167969	SAK_1796	SAK_1797			TRUE	0.920	2.000	0.030	NA		NA
1167969	1167970	SAK_1797	SAK_1798		rpe	TRUE	0.981	-7.000	0.166	1.000	N	NA
1167970	1167971	SAK_1798	SAK_1799	rpe		TRUE	0.960	7.000	0.213	1.000		NA
1167971	1167972	SAK_1799	SAK_1800			FALSE	0.101	156.000	0.000	1.000		NA
1167972	1167973	SAK_1800	SAK_1801		ksgA	TRUE	0.769	4.000	0.000	1.000		NA
1167973	1167974	SAK_1801	SAK_1802	ksgA		TRUE	0.721	28.000	0.002	1.000	N	NA
1167974	1167975	SAK_1802	SAK_1803			TRUE	0.622	4.000	0.000	1.000	N	NA
1167975	1167976	SAK_1803	SAK_1804			TRUE	0.993	-13.000	0.058	NA	Y	NA
1167976	1167977	SAK_1804	SAK_1805			FALSE	0.086	182.000	0.000	NA		NA
1167977	1167978	SAK_1805	SAK_1806			TRUE	0.821	19.000	0.000	NA		NA
1167978	1167979	SAK_1806	SAK_1807			TRUE	0.943	-9.000	0.000	NA		NA
1167979	1167980	SAK_1807	SAK_1808			TRUE	0.872	0.000	0.000	NA		NA
1167980	1167981	SAK_1808	SAK_1809		dltD	FALSE	0.095	175.000	0.000	NA		NA
1167981	1167982	SAK_1809	SAK_1810	dltD	dltC	TRUE	0.995	-7.000	0.409	NA		NA
1167982	1167983	SAK_1810	SAK_1811	dltC	dltB	TRUE	0.983	15.000	0.387	NA		NA
1167983	1167984	SAK_1811	SAK_1812	dltB	dltA	TRUE	0.990	-3.000	0.435	NA	N	NA
1167984	1167985	SAK_1812	SAK_1813	dltA	dltS	FALSE	0.060	146.000	0.000	1.000	N	NA
1167985	1167986	SAK_1813	SAK_1814	dltS	dltr	TRUE	0.947	0.000	0.000	1.000	Y	NA
1167986	1167987	SAK_1814	SAK_1815	dltr	rpmH	FALSE	0.022	356.000	0.000	1.000		NA
1167987	1167988	SAK_1815	SAK_1816	rpmH		FALSE	0.072	184.000	0.000	1.000		NA
1167988	1167989	SAK_1816	SAK_1817		proWX	FALSE	0.040	246.000	0.000	1.000		NA
1167989	1167990	SAK_1817	SAK_1818	proWX	proV	TRUE	0.989	19.000	0.177	0.071	Y	NA
1167990	1167991	SAK_1818	SAK_1819	proV	xpkA	FALSE	0.010	376.000	0.000	1.000	N	NA
1167991	1167992	SAK_1819	SAK_1820	xpkA		FALSE	0.202	90.000	0.000	NA		NA
1167992	1167993	SAK_1820	SAK_1821			FALSE	0.199	317.000	0.231	NA		NA
1167993	1167994	SAK_1821	SAK_1822			FALSE	0.141	138.000	0.000	NA		NA
1167994	1167995	SAK_1822	SAK_1823			TRUE	0.915	20.000	0.035	NA		NA
1167995	1167996	SAK_1823	SAK_1824			TRUE	0.326	66.000	0.000	1.000		NA
1167996	1167997	SAK_1824	SAK_1825			TRUE	0.955	22.000	0.154	1.000		NA
1167997	1167998	SAK_1825	SAK_1826			TRUE	0.399	98.000	0.133	1.000	N	NA
1167998	1167999	SAK_1826	SAK_1827			TRUE	0.949	19.000	0.133	1.000		NA
1167999	1168000	SAK_1827	SAK_1828			FALSE	0.046	235.000	0.000	1.000		NA
1168000	1168001	SAK_1828	SAK_1829			FALSE	0.047	164.000	0.000	1.000	N	NA
1168001	1168002	SAK_1829	SAK_1830		araD	TRUE	0.908	11.000	0.000	1.000	Y	NA
1168002	1168003	SAK_1830	SAK_1831	araD		TRUE	0.996	2.000	0.700	1.000	Y	NA
1168003	1168004	SAK_1831	SAK_1832			TRUE	0.992	4.000	0.536	1.000	Y	NA
1168004	1168005	SAK_1832	SAK_1833			TRUE	0.784	113.000	0.328	1.000	Y	NA
1168005	1168006	SAK_1833	SAK_1834			TRUE	0.952	67.000	0.279	0.011	Y	NA
1168006	1168007	SAK_1834	SAK_1835			TRUE	0.990	28.000	0.431	0.011		NA
1168007	1168008	SAK_1835	SAK_1836			FALSE	0.103	168.000	0.000	NA		NA
1168010	1168011	SAK_1838	SAK_1839	purA	pfoR	FALSE	0.014	371.000	0.000	NA	N	NA
1168012	1168013	SAK_1840	SAK_1841			FALSE	0.100	170.000	0.000	NA		NA
1168013	1168014	SAK_1841	SAK_1842			FALSE	0.158	124.000	0.000	NA		NA
1168014	1168015	SAK_1842	SAK_1843			TRUE	0.997	-3.000	0.818	NA		NA
1168015	1168016	SAK_1843	SAK_1844		hslO	FALSE	0.080	140.000	0.000	NA	N	NA
1168016	1168017	SAK_1844	SAK_1845	hslO		TRUE	0.968	-16.000	0.034	1.000	N	NA
1168017	1168018	SAK_1845	SAK_1846			FALSE	0.137	121.000	0.005	1.000	N	NA
1168018	1168019	SAK_1846	SAK_1847			TRUE	0.657	14.000	0.000	1.000	N	NA
1168020	1168021	SAK_1848	SAK_1849	clpC	ctsR	TRUE	0.978	-3.000	0.188	NA	N	NA
1168023	1168024	SAK_1851	SAK_1852	tsf	rpsB	TRUE	0.920	94.000	0.748	1.000	Y	NA
1168025	1168026	SAK_1853	SAK_1854	ahpC	ahpF	TRUE	0.994	18.000	0.551	1.000	Y	NA
1168026	1168027	SAK_1854	SAK_1855	ahpF		FALSE	0.144	135.000	0.000	NA		NA
1168028	1168029	SAK_1856	SAK_1857			TRUE	0.837	2.000	0.000	NA		NA
1168034	1168035	SAK_1862	SAK_1863		def	TRUE	0.441	66.000	0.034	1.000	N	NA
1168036	1168037	SAK_1864	SAK_1865			TRUE	0.868	80.000	0.562	NA		NA
1168039	1168040	SAK_1867	SAK_1868			FALSE	0.123	133.000	0.000	1.000		NA
1168040	1168041	SAK_1868	SAK_1869		polC	FALSE	0.173	127.000	0.020	1.000	N	NA
1168041	1168042	SAK_1869	SAK_1870	polC		FALSE	0.072	123.000	0.000	1.000	N	NA
1168042	1168043	SAK_1870	SAK_1871		proS	FALSE	0.071	125.000	0.000	1.000	N	NA
1168043	1168044	SAK_1871	SAK_1872	proS		TRUE	0.350	92.000	0.095	1.000	N	NA
1168044	1168045	SAK_1872	SAK_1873		cdsA	TRUE	0.819	31.000	0.040	1.000	N	NA
1168045	1168046	SAK_1873	SAK_1874	cdsA	uppS	TRUE	0.974	15.000	0.113	1.000	Y	NA
1168046	1168047	SAK_1874	SAK_1875	uppS	yajC	FALSE	0.111	166.000	0.007	NA	N	NA
1168047	1168048	SAK_1875	SAK_1876	yajC		TRUE	0.371	77.000	0.006	NA		NA
1168048	1168049	SAK_1876	SAK_1877			FALSE	0.130	152.000	0.000	NA		NA
1168049	1168050	SAK_1877	SAK_1878			FALSE	0.065	133.000	0.000	1.000	N	NA
1168050	1168051	SAK_1878	SAK_1879			TRUE	0.990	25.000	0.432	1.000	Y	NA
1168052	1168053	SAK_1880	SAK_1881			TRUE	0.981	2.000	0.154	1.000	Y	NA
1168054	1168055	SAK_1882	SAK_1883	galE	dexB	FALSE	0.101	88.000	0.000	1.000	N	NA
1168055	1168056	SAK_1883	SAK_1884	dexB	msmK	TRUE	0.659	129.000	0.171	1.000	Y	NA
1168056	1168057	SAK_1884	SAK_1885	msmK		FALSE	0.297	101.000	0.071	1.000	N	NA
1168057	1168058	SAK_1885	SAK_1886			FALSE	0.086	95.000	0.000	1.000	N	NA
1168058	1168059	SAK_1886	SAK_1887		lacD	TRUE	0.722	54.000	0.000	1.000	Y	NA
1168059	1168060	SAK_1887	SAK_1888	lacD	lacC	TRUE	0.977	2.000	0.000	0.001	Y	NA
1168060	1168061	SAK_1888	SAK_1889	lacC	lacB	TRUE	0.908	11.000	0.000	1.000	Y	NA
1168061	1168062	SAK_1889	SAK_1890	lacB	lacA	TRUE	0.974	21.000	0.000	0.001	Y	NA
1168062	1168063	SAK_1890	SAK_1891	lacA		FALSE	0.039	249.000	0.000	1.000		NA
1168063	1168064	SAK_1891	SAK_1892			TRUE	0.428	61.000	0.000	NA		NA
1168064	1168065	SAK_1892	SAK_1893			FALSE	0.075	200.000	0.000	NA		NA
1168065	1168066	SAK_1893	SAK_1894			TRUE	0.920	40.000	0.000	0.020	Y	NA
1168066	1168067	SAK_1894	SAK_1895			TRUE	0.996	2.000	0.429	0.011	Y	NA
1168069	1168070	SAK_1897	SAK_1898			TRUE	0.786	27.000	0.000	NA		NA
1168070	1168071	SAK_1898	SAK_1899		dtd	FALSE	0.019	255.000	0.000	1.000	N	NA
1168071	1168072	SAK_1899	SAK_1900	dtd	relA	TRUE	0.935	10.000	0.177	1.000	N	NA
1168073	1168074	SAK_1901	SAK_1902	cpdB	nrdI	TRUE	0.402	157.000	0.022	NA	Y	NA
1168074	1168075	SAK_1902	SAK_1903	nrdI		TRUE	0.846	11.000	0.027	NA	N	NA
1168075	1168076	SAK_1903	SAK_1904			TRUE	0.932	0.000	0.018	NA		NA
1168077	1168078	SAK_1905	SAK_1906			TRUE	0.987	12.000	0.571	1.000		NA
1168078	1168079	SAK_1906	SAK_1907			TRUE	0.993	4.000	0.500	0.014		NA
1168079	1168080	SAK_1907	SAK_1908			TRUE	0.600	138.000	0.222	0.054	N	NA
1168080	1168081	SAK_1908	SAK_1909			TRUE	0.999	-3.000	0.778	0.020	Y	NA
1168081	1168082	SAK_1909	SAK_1910			TRUE	0.998	16.000	0.778	0.020	Y	NA
1168082	1168083	SAK_1910	SAK_1911			TRUE	0.998	18.000	0.786	0.011	Y	NA
1168083	1168084	SAK_1911	SAK_1912			FALSE	0.048	247.000	0.000	NA		NA
1168084	1168085	SAK_1912	SAK_1913			FALSE	0.064	211.000	0.000	NA		NA
1168085	1168086	SAK_1913	SAK_1914			TRUE	0.964	-34.000	0.000	NA		NA
1168086	1168087	SAK_1914	SAK_1915			TRUE	0.794	6.000	0.000	NA		NA
1168089	1168090	SAK_1917	SAK_1918	rgfC		TRUE	0.385	405.000	0.444	1.000	Y	NA
1168090	1168091	SAK_1918	SAK_1919		rgfB	FALSE	0.061	216.000	0.000	NA		NA
1168091	1168092	SAK_1919	SAK_1920	rgfB		TRUE	0.976	39.000	0.610	NA		NA
1168092	1168093	SAK_1920	SAK_1921			FALSE	0.155	158.000	0.000	0.070	N	NA
1168093	1168094	SAK_1921	SAK_1922			TRUE	0.994	-7.000	0.075	0.048	Y	NA
1168094	1168095	SAK_1922	SAK_1923		phoU	TRUE	0.986	0.000	0.429	NA	N	NA
1168095	1168096	SAK_1923	SAK_1924	phoU	pstB	TRUE	0.993	-3.000	0.203	NA	Y	NA
1168096	1168097	SAK_1924	SAK_1925	pstB	pstA	TRUE	0.999	-7.000	0.428	0.003	Y	NA
1168097	1168098	SAK_1925	SAK_1926	pstA	pstC	TRUE	0.994	2.000	0.219	0.003	Y	NA
1168098	1168099	SAK_1926	SAK_1927	pstC		TRUE	0.793	15.000	0.000	1.000		NA
1168099	1168100	SAK_1927	SAK_1928			FALSE	0.148	131.000	0.000	NA		NA
1168100	1168101	SAK_1928	SAK_1929			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1168101	1168102	SAK_1929	SAK_1930		prmA	TRUE	0.981	0.000	0.227	NA		NA
1168102	1168103	SAK_1930	SAK_1931	prmA		TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1168105	1168106	SAK_1933	SAK_1934			TRUE	0.984	-28.000	0.048	1.000		NA
1168106	1168107	SAK_1934	SAK_1935			TRUE	0.974	-7.000	0.048	NA		NA
1168107	1168108	SAK_1935	SAK_1936			TRUE	0.853	43.000	0.100	NA		NA
1168109	1168110	SAK_1937	SAK_1938			TRUE	0.956	-7.000	0.047	1.000	N	NA
1168110	1168111	SAK_1938	SAK_1939			FALSE	0.039	282.000	0.000	NA		NA
1168112	1168113	SAK_1940	SAK_1941			FALSE	0.139	140.000	0.000	NA		NA
1168113	1168114	SAK_1941	SAK_1942			FALSE	0.210	89.000	0.000	NA		NA
1168114	1168115	SAK_1942	SAK_1943			TRUE	0.815	23.000	0.000	NA		NA
1168115	1168116	SAK_1943	SAK_1944			TRUE	0.988	4.000	0.571	NA		NA
1168116	1168117	SAK_1944	SAK_1945			TRUE	0.909	61.000	0.429	NA		NA
1168117	1168118	SAK_1945	SAK_1946			TRUE	0.995	3.000	1.000	NA		NA
1168118	1168119	SAK_1946	SAK_1947			FALSE	0.031	326.000	0.000	NA		NA
1168123	1168124	SAK_1951	SAK_1952			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1168124	1168125	SAK_1952	SAK_1953			FALSE	0.172	107.000	0.000	NA		NA
1168125	1168126	SAK_1953	SAK_1954			TRUE	0.837	2.000	0.000	NA		NA
1168127	1168128	SAK_1955	SAK_1956			FALSE	0.021	441.000	0.000	NA		NA
1168128	1168129	SAK_1956	SAK_1957			FALSE	0.180	101.000	0.000	NA		NA
1168129	1168130	SAK_1957	SAK_1958			TRUE	0.323	69.000	0.000	NA		NA
1168130	1168131	SAK_1958	SAK_1959			FALSE	0.304	72.000	0.000	NA		NA
1168131	1168132	SAK_1959	SAK_1960			TRUE	0.908	-3.000	0.000	NA		NA
1168132	1168133	SAK_1960	SAK_1961			FALSE	0.089	179.000	0.000	NA		NA
1168133	1168134	SAK_1961	SAK_1962			FALSE	0.272	76.000	0.000	NA		NA
1168135	1168136	SAK_1963	SAK_1964			FALSE	0.058	228.000	0.000	NA		NA
1168136	1168137	SAK_1964	SAK_1965			FALSE	0.126	154.000	0.000	NA		NA
1168137	1168138	SAK_1965	SAK_1966			TRUE	0.801	4.000	0.000	NA		NA
1168138	1168139	SAK_1966	SAK_1967			FALSE	0.016	679.000	0.000	NA		NA
1168139	1168140	SAK_1967	SAK_1968			FALSE	0.089	179.000	0.000	NA		NA
1168140	1168141	SAK_1968	SAK_1969			TRUE	0.636	41.000	0.000	NA		NA
1168141	1168142	SAK_1969	SAK_1970			TRUE	0.987	33.000	0.750	NA		NA
1168142	1168143	SAK_1970	SAK_1971			FALSE	0.036	291.000	0.000	NA		NA
1168143	1168144	SAK_1971	SAK_1972			TRUE	0.997	-13.000	0.486	NA		NA
1168144	1168145	SAK_1972	SAK_1973			FALSE	0.015	529.000	0.000	1.000		NA
1168145	1168146	SAK_1973	SAK_1974			FALSE	0.102	169.000	0.000	NA		NA
1168146	1168147	SAK_1974	SAK_1975			TRUE	0.995	-3.000	0.569	NA		NA
1168147	1168148	SAK_1975	SAK_1976			TRUE	0.976	-3.000	0.118	NA		NA
1168148	1168149	SAK_1976	SAK_1977			TRUE	0.966	2.000	0.167	NA		NA
1168149	1168150	SAK_1977	SAK_1978			FALSE	0.039	249.000	0.000	1.000		NA
1168151	1168152	SAK_1979	SAK_1980			TRUE	0.974	-3.000	0.104	NA		NA
1168152	1168153	SAK_1980	SAK_1981			FALSE	0.034	305.000	0.000	NA		NA
1168154	1168155	SAK_1982	SAK_1983		cfb	FALSE	0.097	173.000	0.000	NA		NA
1168156	1168157	SAK_1984	SAK_1985			FALSE	0.031	201.000	0.000	1.000	N	NA
1168158	1168159	SAK_1986	SAK_1987			FALSE	0.027	347.000	0.000	NA		NA
1168159	1168160	SAK_1987	SAK_1988		metE	TRUE	0.873	45.000	0.030	1.000	Y	NA
1168160	1168161	SAK_1988	SAK_1989	metE		FALSE	0.025	370.000	0.000	NA		NA
1168161	1168162	SAK_1989	SAK_1990			TRUE	0.995	-10.000	0.338	NA		NA
1168163	1168164	SAK_1991	SAK_1992	cspA		FALSE	0.024	233.000	0.000	1.000	N	NA
1168164	1168165	SAK_1992	SAK_1993			TRUE	0.999	-3.000	0.889	1.000	Y	NA
1168165	1168166	SAK_1993	SAK_1994			TRUE	0.383	93.000	0.049	NA		NA
1168169	1168170	SAK_1997	SAK_1998		nusG	FALSE	0.081	174.000	0.000	1.000		NA
1168170	10942581	SAK_1998	SAK_1999	nusG		FALSE	0.068	206.000	0.000	NA		NA
1168171	1168172	SAK_2000	SAK_2001			TRUE	0.987	33.000	0.750	NA		NA
1168173	1168174	SAK_2002	SAK_2003		secE	FALSE	0.027	312.000	0.000	1.000		NA
1168174	10942582	SAK_2003	SAK_2004	secE		TRUE	0.682	36.000	0.000	NA		NA
10942582	1168175	SAK_2004	SAK_2005		pbp2A	TRUE	0.491	55.000	0.000	NA		NA
1168177	1168178	SAK_2007	SAK_2008		deoB	FALSE	0.100	170.000	0.000	NA		NA
1168178	1168179	SAK_2008	SAK_2009	deoB	deoC	TRUE	0.466	67.000	0.000	0.042	N	NA
1168179	1168180	SAK_2009	SAK_2010	deoC		TRUE	0.984	30.000	0.333	1.000	Y	NA
1168180	1168181	SAK_2010	SAK_2011		udp	TRUE	0.951	21.000	0.015	1.000	Y	NA
1168183	1168184	SAK_2013	SAK_2014	groEL	groES	TRUE	0.741	96.000	0.032	0.005	Y	NA
1168184	1168185	SAK_2014	SAK_2015	groES		FALSE	0.157	175.000	0.020	1.000		NA
1168185	1168186	SAK_2015	SAK_2016			TRUE	0.944	5.000	0.143	1.000		NA
1168186	1168187	SAK_2016	SAK_2017			TRUE	0.819	16.000	0.000	NA		NA
1168187	1168188	SAK_2017	SAK_2018			FALSE	0.020	465.000	0.000	NA		NA
1168189	1168190	SAK_2019	SAK_2020			TRUE	0.718	43.000	0.007	NA		NA
1168191	1168192	SAK_2021	SAK_2022	nrdG		TRUE	0.671	73.000	0.159	1.000		NA
1168192	1168193	SAK_2022	SAK_2023			TRUE	0.892	9.000	0.041	1.000		NA
1168193	1168194	SAK_2023	SAK_2024			TRUE	0.917	13.000	0.041	NA		NA
1168194	1168195	SAK_2024	SAK_2025		nrdD	TRUE	0.536	75.000	0.062	NA		NA
1168195	1168196	SAK_2025	SAK_2026	nrdD		TRUE	0.346	125.000	0.057	NA		NA
1168196	1168197	SAK_2026	SAK_2027			FALSE	0.182	100.000	0.000	NA		NA
1168197	1168198	SAK_2027	SAK_2028			FALSE	0.238	83.000	0.000	NA		NA
1168198	1168199	SAK_2028	SAK_2029			TRUE	0.989	26.000	0.651	NA		NA
1168199	1168200	SAK_2029	SAK_2030			TRUE	0.986	9.000	0.537	NA		NA
1168200	1168201	SAK_2030	SAK_2031		spxA	FALSE	0.151	202.000	0.032	NA		NA
1168201	1168202	SAK_2031	SAK_2032	spxA	recA	FALSE	0.049	216.000	0.004	1.000	N	NA
1168202	1168203	SAK_2032	SAK_2033	recA	cinA	TRUE	0.361	116.000	0.083	1.000		NA
1168203	1168204	SAK_2033	SAK_2034	cinA	tag	FALSE	0.287	89.000	0.011	1.000		NA
1168204	1168205	SAK_2034	SAK_2035	tag	ruvA	TRUE	0.946	23.000	0.012	1.000	Y	NA
1168205	1168206	SAK_2035	SAK_2036	ruvA		TRUE	0.876	2.000	0.005	1.000		NA
1168206	1168207	SAK_2036	SAK_2037		hexB	TRUE	0.807	32.000	0.006	1.000		NA
1168207	1168208	SAK_2037	SAK_2038	hexB		FALSE	0.148	131.000	0.000	NA		NA
1168210	1168211	SAK_2040	SAK_2041	hexA	argR	TRUE	0.441	57.000	0.008	1.000	N	NA
1168212	1168213	SAK_2042	SAK_2043	argS		TRUE	0.382	88.000	0.032	NA		NA
1168214	1168215	SAK_2044	SAK_2045			TRUE	0.379	108.000	0.062	NA		NA
1168215	1168216	SAK_2045	SAK_2046		aspS	TRUE	0.972	-10.000	0.016	NA		NA
1168216	1168217	SAK_2046	SAK_2047	aspS	hisS	TRUE	0.823	93.000	0.161	0.041	Y	NA
1168218	1168219	SAK_2048	SAK_2049	rpmF	rpmG3	TRUE	0.976	16.000	0.012	0.025	Y	NA
1168221	1168222	SAK_2051	SAK_2052	cadD	cadX	TRUE	0.992	12.000	0.875	NA	N	NA
1168222	1168223	SAK_2052	SAK_2053	cadX		TRUE	0.954	51.000	0.571	1.000		NA
1168223	1168224	SAK_2053	SAK_2054			FALSE	0.026	321.000	0.000	1.000		NA
1168224	1168225	SAK_2054	SAK_2055			FALSE	0.071	203.000	0.000	NA		NA
1168225	1168226	SAK_2055	SAK_2056			TRUE	0.763	115.000	0.500	NA		NA
1168226	1168227	SAK_2056	SAK_2057			TRUE	0.998	-3.000	1.000	NA		NA
1168227	1168228	SAK_2057	SAK_2058			TRUE	0.549	206.000	0.500	NA		NA
1168228	1168229	SAK_2058	SAK_2059			FALSE	0.025	331.000	0.000	1.000		NA
1168229	1168230	SAK_2059	SAK_2060			FALSE	0.016	500.000	0.000	1.000		NA
1168230	1168231	SAK_2060	SAK_2061			FALSE	0.192	86.000	0.000	1.000		NA
1168231	1168232	SAK_2061	SAK_2062			TRUE	0.998	-16.000	0.492	1.000	Y	NA
1168233	1168234	SAK_2063	SAK_2064		arcC	FALSE	0.162	94.000	0.000	1.000		NA
1168234	1168235	SAK_2064	SAK_2065	arcC	argF	TRUE	0.914	12.000	0.000	1.000	Y	NA
1168236	1168237	SAK_2066	SAK_2067			TRUE	0.891	-3.000	0.000	1.000		NA
1168237	1168238	SAK_2067	SAK_2068			FALSE	0.025	222.000	0.000	1.000	N	NA
1168238	1168239	SAK_2068	SAK_2069			TRUE	0.973	3.000	0.382	1.000	N	NA
1168240	1168241	SAK_2070	SAK_2071			TRUE	0.981	-16.000	0.035	NA		NA
1168241	1168242	SAK_2071	SAK_2072			FALSE	0.145	134.000	0.000	NA		NA
1168242	1168243	SAK_2072	SAK_2073			TRUE	0.493	67.000	0.012	NA		NA
1168245	1168246	SAK_2075	SAK_2076			FALSE	0.020	463.000	0.000	NA		NA
1168246	1168247	SAK_2076	SAK_2077			TRUE	0.947	-10.000	0.000	NA		NA
1168247	1168248	SAK_2077	SAK_2078			FALSE	0.040	274.000	0.000	NA		NA
1168248	1168249	SAK_2078	SAK_2079			FALSE	0.165	110.000	0.000	NA		NA
1168249	1168250	SAK_2079	SAK_2080			TRUE	0.962	-25.000	0.000	NA		NA
1168250	1168251	SAK_2080	SAK_2081			FALSE	0.020	400.000	0.000	1.000		NA
1168251	1168252	SAK_2081	SAK_2082			FALSE	0.291	74.000	0.000	NA		NA
1168252	1168253	SAK_2082	SAK_2083			FALSE	0.026	365.000	0.000	NA		NA
1168253	1168254	SAK_2083	SAK_2084			TRUE	0.873	80.000	0.571	NA		NA
1168254	1168255	SAK_2084	SAK_2085			FALSE	0.039	276.000	0.000	NA		NA
1168255	1168256	SAK_2085	SAK_2086			FALSE	0.071	203.000	0.000	NA		NA
1168256	1168257	SAK_2086	SAK_2087			TRUE	0.867	89.000	0.667	NA		NA
1168257	1168258	SAK_2087	SAK_2088			TRUE	0.990	24.000	0.667	NA		NA
1168258	1168259	SAK_2088	SAK_2089			FALSE	0.019	502.000	0.000	NA		NA
1168259	1168260	SAK_2089	SAK_2090			FALSE	0.053	236.000	0.000	NA		NA
1168263	1168264	SAK_2093	SAK_2094			FALSE	0.028	339.000	0.000	NA		NA
1168265	1168266	SAK_2095	SAK_2096	rpsD		FALSE	0.030	330.000	0.000	NA		NA
1168266	1168267	SAK_2096	SAK_2097		dnaC	TRUE	0.918	12.000	0.053	NA		NA
1168267	1168268	SAK_2097	SAK_2098	dnaC	rplI	TRUE	0.785	43.000	0.100	1.000	N	NA
1168268	1168269	SAK_2098	SAK_2099	rplI		TRUE	0.912	6.000	0.119	1.000	N	NA
1168269	1168270	SAK_2099	SAK_2100		gidA	TRUE	0.341	67.000	0.011	1.000	N	NA
1168270	1168271	SAK_2100	SAK_2101	gidA		FALSE	0.057	170.000	0.000	NA	N	NA
1168271	1168272	SAK_2101	SAK_2102		trmU	TRUE	0.746	32.000	0.005	NA	N	NA
1168273	1168274	SAK_2103	SAK_2104	sdhB	sdhA	TRUE	0.994	15.000	0.221	0.001	Y	NA
1168275	1168276	SAK_2105	SAK_2106			TRUE	0.372	133.000	0.000	0.003		NA
1168276	1168277	SAK_2106	SAK_2107			FALSE	0.051	216.000	0.000	1.000		NA
1168277	1168278	SAK_2107	SAK_2108			TRUE	0.992	-7.000	0.136	1.000	Y	NA
1168278	1168279	SAK_2108	SAK_2109			TRUE	1.000	-24.000	0.713	0.021	Y	NA
1168279	1168280	SAK_2109	SAK_2110		pgsA	TRUE	0.879	0.000	0.015	1.000	N	NA
1168280	1168281	SAK_2110	SAK_2111	pgsA		FALSE	0.135	123.000	0.000	1.000		NA
1168281	1168282	SAK_2111	SAK_2112			TRUE	0.998	2.000	0.872	0.004		NA
1168283	1168284	SAK_2113	SAK_2114		recF	TRUE	0.964	3.000	0.209	1.000		NA
1168285	1168286	SAK_2115	SAK_2116			TRUE	0.435	56.000	0.000	1.000		NA
1168286	1168287	SAK_2116	SAK_2117		guaB	FALSE	0.244	75.000	0.000	1.000		NA
1168287	1168288	SAK_2117	SAK_2118	guaB		FALSE	0.052	157.000	0.000	1.000	N	NA
1168288	1168289	SAK_2118	SAK_2119			TRUE	0.867	10.000	0.000	0.032	N	NA
1168290	1168291	SAK_2120	SAK_2121		arcA	FALSE	0.044	267.000	0.000	NA		NA
1168291	1168292	SAK_2121	SAK_2122	arcA		TRUE	0.901	27.000	0.056	1.000		NA
1168292	1168293	SAK_2122	SAK_2123		argF	TRUE	0.939	16.000	0.104	1.000		NA
1168293	1168294	SAK_2123	SAK_2124	argF		TRUE	0.774	63.000	0.042	1.000	Y	NA
1168294	1168295	SAK_2124	SAK_2125		arcC	TRUE	0.970	21.000	0.091	1.000	Y	NA
1168296	1168297	SAK_2126	SAK_2127	trpS		FALSE	0.145	108.000	0.000	1.000		NA
1168298	1168299	SAK_2128	SAK_2129			TRUE	0.559	66.000	0.027	NA		NA
1168299	1168300	SAK_2129	SAK_2130			TRUE	0.317	123.000	0.040	NA		NA
1168301	1168302	SAK_2131	SAK_2132			TRUE	0.766	30.000	0.000	NA		NA
1168305	1168306	SAK_2135	SAK_2136	htrA		FALSE	0.192	98.000	0.015	1.000	N	NA
1168306	1166177	SAK_2136	SAK_0001		dnaA	FALSE	0.049	209.000	0.002	1.000	N	NA