MicrobesOnline Operon Predictions for Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1229398 1229399 ECH_0001 ECH_0002   rimM FALSE 0.132 158.000 0.004 1.000 N NA
 1229399 1229400 ECH_0002 ECH_0003 rimM trmD TRUE 0.994 -16.000 0.672 1.000 Y NA
 1229400 1229401 ECH_0003 ECH_0004 trmD rplS TRUE 0.996 -7.000 0.567 1.000 Y NA
 1229403 1229404 ECH_0006 ECH_0007 thrS infC TRUE 0.984 25.000 0.186 1.000 Y NA
 1229405 1229406 ECH_0008 ECH_0009     TRUE 0.562 20.000 0.000 NA   NA
 1229406 1229407 ECH_0009 ECH_0010     TRUE 0.844 69.000 0.086 NA   NA
 1229410 1229411 ECH_0013 ECH_0014   dnaX FALSE 0.048 162.000 0.000 1.000 N NA
 1229411 1229412 ECH_0014 ECH_0015 dnaX   TRUE 0.993 4.000 0.411 NA   NA
 1229412 1229413 ECH_0015 ECH_0016   asd TRUE 0.942 11.000 0.007 NA   NA
 1229414 1229415 ECH_0017 ECH_0018   metK FALSE 0.245 63.000 0.000 NA   NA
 1229416 1229417 ECH_0019 ECH_0020     FALSE 0.248 61.000 0.000 NA   NA
 1229418 1229419 ECH_0021 ECH_0022     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 1229420 1229421 ECH_0023 ECH_0024 glyQ glyS TRUE 0.996 16.000 0.651 0.003 Y NA
 1229421 1229422 ECH_0024 ECH_0025 glyS dnaJ TRUE 0.648 64.000 0.009 1.000 N NA
 1229425 1229426 ECH_0028 ECH_0029 ruvC   TRUE 0.962 2.000 0.011 1.000 N NA
 1229426 1229427 ECH_0029 ECH_0030   hemE FALSE 0.460 100.000 0.007 1.000 N NA
 1229429 1229430 ECH_0032 ECH_0033     TRUE 0.703 125.000 0.055 NA   NA
 1229431 1229432 ECH_0034 ECH_0035     FALSE 0.184 98.000 0.000 NA   NA
 1229432 1229433 ECH_0035 ECH_0036   nadA TRUE 0.961 22.000 0.008 1.000 Y NA
 1229434 1229435 ECH_0037 ECH_0038   fdxA FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 1229437 1229438 ECH_0040 ECH_0041 virD4 virB11 TRUE 0.979 37.000 0.405 1.000 Y NA
 1229438 1229439 ECH_0041 ECH_0042 virB11 virB10 TRUE 0.996 16.000 0.452 1.000 Y NA
 1229439 1229440 ECH_0042 ECH_0043 virB10 virB9-1 TRUE 0.993 22.000 0.526 NA Y NA
 1229440 1229441 ECH_0043 ECH_0044 virB9-1 virB8-1 TRUE 0.993 -16.000 0.579 NA Y NA
 1229441 1229442 ECH_0044 ECH_0045 virB8-1   TRUE 0.735 132.000 0.095 NA N NA
 1229442 1229443 ECH_0045 ECH_0046     TRUE 0.562 20.000 0.000 NA   NA
 1229445 1229446 ECH_0048 ECH_0049     TRUE 0.866 75.000 0.200 NA   NA
 1229446 1229447 ECH_0049 ECH_0050   dapF FALSE 0.181 145.000 0.003 NA   NA
 1229450 1229451 ECH_0053 ECH_0054     FALSE 0.285 47.000 0.000 NA   NA
 1229451 1229452 ECH_0054 ECH_0055   pgk FALSE 0.028 211.000 0.000 NA   NA
 1229453 1229454 ECH_0056 ECH_0057     TRUE 0.925 -3.000 0.007 NA   NA
 1229455 1229456 ECH_0058 ECH_0059 dapD   FALSE 0.024 237.000 0.000 NA   NA
 1229456 1229457 ECH_0059 ECH_0060   trmE FALSE 0.229 76.000 0.000 NA   NA
 1229459 1229460 ECH_0062 ECH_0063 recG   FALSE 0.072 385.000 0.007 1.000 N NA
 1229462 1229463 ECH_0065 ECH_0066     FALSE 0.043 185.000 0.000 NA   NA
 1229463 1229464 ECH_0066 ECH_0067     FALSE 0.401 27.000 0.000 NA   NA
 1229466 1229467 ECH_0069 ECH_0070     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 1229468 1229469 ECH_0071 ECH_0072 rpsT   FALSE 0.105 208.000 0.007 1.000 N NA
 1229470 1229471 ECH_0073 ECH_0074 def   TRUE 0.948 15.000 0.014 1.000 N NA
 1229471 1229472 ECH_0074 ECH_0075     FALSE 0.022 352.000 0.000 NA   NA
 1229473 1229474 ECH_0076 ECH_0077   argF FALSE 0.029 533.000 0.003 1.000 N NA
 1229474 1229475 ECH_0077 ECH_0078 argF   TRUE 0.665 -7.000 0.000 NA   NA
 1229475 1229476 ECH_0078 ECH_0079     FALSE 0.057 168.000 0.000 NA   NA
 1229477 1229478 ECH_0080 ECH_0081 polA   FALSE 0.024 237.000 0.000 NA   NA
 1229478 1229479 ECH_0081 ECH_0082   rpe FALSE 0.042 188.000 0.000 NA   NA
 1229479 1229480 ECH_0082 ECH_0083 rpe   TRUE 0.588 19.000 0.000 NA   NA
 1229480 1229481 ECH_0083 ECH_0084     FALSE 0.024 470.000 0.000 NA   NA
 1229481 1229482 ECH_0084 ECH_0085     TRUE 0.997 12.000 0.178 NA Y NA
 1229485 1229486 ECH_0088 ECH_0089 ispB glnA FALSE 0.059 196.000 0.003 1.000 N NA
 1229487 1229488 ECH_0090 ECH_0091   tyrS FALSE 0.376 28.000 0.000 NA   NA
 1229488 1229489 ECH_0091 ECH_0092 tyrS hemA TRUE 0.731 37.000 0.010 1.000 N NA
 1229491 1229492 ECH_0094 ECH_0095   secF FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 1229493 1229494 ECH_0096 ECH_0097   fba TRUE 0.777 0.000 0.000 NA   NA
 1229497 1229498 ECH_0100 ECH_0101     FALSE 0.241 67.000 0.000 NA   NA
 1229498 1229499 ECH_0101 ECH_0102     FALSE 0.022 363.000 0.000 NA   NA
 1229499 1229500 ECH_0102 ECH_0103     FALSE 0.022 310.000 0.000 NA   NA
 1229500 1229501 ECH_0103 ECH_0104     TRUE 0.571 -12.000 0.000 NA   NA
 1229501 1229502 ECH_0104 ECH_0105     FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 1229502 1229503 ECH_0105 ECH_0106     FALSE 0.212 81.000 0.000 NA   NA
 1229505 1229506 ECH_0108 ECH_0109     FALSE 0.022 279.000 0.000 NA   NA
 1229506 1229507 ECH_0109 ECH_0110     TRUE 0.571 -12.000 0.000 NA   NA
 1229507 1229508 ECH_0110 ECH_0111     FALSE 0.303 39.000 0.000 NA   NA
 1229512 1229513 ECH_0115 ECH_0116     FALSE 0.036 197.000 0.000 NA   NA
 1229513 1229514 ECH_0116 ECH_0117     FALSE 0.022 370.000 0.000 NA   NA
 1229514 1229515 ECH_0117 ECH_0118     FALSE 0.036 197.000 0.000 NA   NA
 1229515 1229516 ECH_0118 ECH_0119     FALSE 0.260 57.000 0.000 NA   NA
 1229516 1229517 ECH_0119 ECH_0120     FALSE 0.022 368.000 0.000 NA   NA
 1229517 1229518 ECH_0120 ECH_0121     FALSE 0.049 177.000 0.000 NA   NA
 1229520 1229521 ECH_0123 ECH_0124 guaA gltA FALSE 0.022 656.000 0.003 0.062 N NA
 1229521 1229522 ECH_0124 ECH_0125 gltA gshA FALSE 0.013 305.000 0.000 1.000   NA
 1229524 1229525 ECH_0127 ECH_0128     TRUE 0.979 12.000 0.030 NA   NA
 1229525 1229526 ECH_0128 ECH_0129     TRUE 0.734 -3.000 0.000 NA   NA
 1229526 1229527 ECH_0129 ECH_0130     TRUE 0.824 6.000 0.000 NA   NA
 1229527 1229528 ECH_0130 ECH_0131   atpH FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 1229528 1229529 ECH_0131 ECH_0132 atpH atpA TRUE 0.998 13.000 0.864 0.013 Y NA
 1229529 1229530 ECH_0132 ECH_0133 atpA greA TRUE 0.715 37.000 0.009 1.000 N NA
 1229530 1229531 ECH_0133 ECH_0134 greA ribB TRUE 0.914 19.000 0.014 1.000 N NA
 1229531 1229532 ECH_0134 ECH_0135 ribB smpB TRUE 0.630 26.000 0.005 1.000 N NA
 1229534 1229535 ECH_0137 ECH_0138 ccmF   FALSE 0.084 372.000 0.007 1.000   NA
 1229538 1229539 ECH_0141 ECH_0142 pth   TRUE 0.996 15.000 0.496 0.086 Y NA
 1229539 1229540 ECH_0142 ECH_0143     FALSE 0.014 386.000 0.000 1.000   NA
 1229540 1229541 ECH_0143 ECH_0144   dapE TRUE 0.933 5.000 0.007 1.000   NA
 1229543 1229544 ECH_0146 ECH_0147     TRUE 0.977 14.000 0.057 1.000   NA
 1229544 1229545 ECH_0147 ECH_0148     TRUE 0.647 102.000 0.016 NA   NA
 1229545 1229546 ECH_0148 ECH_0149     FALSE 0.070 515.000 0.005 NA   NA
 1229546 1229547 ECH_0149 ECH_0150     FALSE 0.025 492.000 0.000 NA   NA
 1229547 1229548 ECH_0150 ECH_0151     FALSE 0.332 32.000 0.000 NA   NA
 1229549 1229550 ECH_0152 ECH_0153 tldD   FALSE 0.051 176.000 0.000 NA   NA
 1229551 1229552 ECH_0154 ECH_0155 ychF   FALSE 0.054 366.000 0.007 0.025   NA
 1229552 1229553 ECH_0155 ECH_0156   ispF FALSE 0.026 330.000 0.003 1.000   NA
 1229553 1229554 ECH_0156 ECH_0157 ispF ispD TRUE 0.963 88.000 0.419 1.000 Y NA
 1229555 1229556 ECH_0158 ECH_0159     FALSE 0.226 77.000 0.000 NA   NA
 1229557 1229558 ECH_0160 ECH_0161 purE   TRUE 0.726 -13.000 0.005 1.000   NA
 1229559 1229560 ECH_0162 ECH_0163 ihfA   TRUE 0.993 12.000 0.535 1.000 N NA
 1229560 1229561 ECH_0163 ECH_0164     TRUE 0.631 -9.000 0.000 NA   NA
 1229564 1229565 ECH_0167 ECH_0168 trpS grpE FALSE 0.404 157.000 0.016 1.000 N NA
 1229566 1229567 ECH_0169 ECH_0170 ribD   FALSE 0.091 148.000 0.000 NA   NA
 1229568 1229569 ECH_0171 ECH_0172 pyrG   TRUE 0.986 6.000 0.083 1.000 N NA
 1229572 1229573 ECH_0175 ECH_0176     TRUE 0.546 175.000 0.200 NA   NA
 1229573 1229574 ECH_0176 ECH_0177     FALSE 0.315 37.000 0.000 NA   NA
 1229577 1229578 ECH_0180 ECH_0181     FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 1229578 1229579 ECH_0181 ECH_0182     TRUE 0.631 -9.000 0.000 NA   NA
 1229579 1229580 ECH_0182 ECH_0183     FALSE 0.028 210.000 0.000 NA   NA
 1229580 1229581 ECH_0183 ECH_0184     TRUE 0.953 24.000 0.199 NA   NA
 1229582 1229583 ECH_0185 ECH_0186     FALSE 0.157 112.000 0.000 NA   NA
 1229585 1229586 ECH_0188 ECH_0189     FALSE 0.022 375.000 0.000 NA   NA
 1229586 1229587 ECH_0189 ECH_0190     FALSE 0.285 47.000 0.000 NA   NA
 1229587 1229588 ECH_0190 ECH_0191     FALSE 0.254 59.000 0.000 NA   NA
 1229591 1229592 ECH_0194 ECH_0195     FALSE 0.022 259.000 0.000 NA   NA
 1229592 1229593 ECH_0195 ECH_0196   pheS TRUE 0.804 -6.000 0.004 1.000   NA
 1229593 1229594 ECH_0196 ECH_0197 pheS rplT TRUE 0.989 -13.000 0.202 1.000 Y NA
 1229594 1229595 ECH_0197 ECH_0198 rplT rpmI TRUE 0.993 26.000 0.928 0.051 Y NA
 1229596 1229597 ECH_0199 ECH_0200   rho-2 FALSE 0.061 547.000 0.005 NA   NA
 1229601 1229602 ECH_0204 ECH_0205 thiS   FALSE 0.241 67.000 0.000 NA   NA
 1229602 1229603 ECH_0205 ECH_0206   thiG TRUE 0.689 -6.000 0.000 NA   NA
 1229605 1229606 ECH_0208 ECH_0209 gltX-1   FALSE 0.186 97.000 0.000 NA   NA
 1229606 1229607 ECH_0209 ECH_0210     FALSE 0.022 311.000 0.000 NA   NA
 1229607 1229608 ECH_0210 ECH_0211     TRUE 0.915 6.000 0.005 1.000   NA
 1229609 1229610 ECH_0212 ECH_0213     FALSE 0.237 496.000 0.042 1.000   NA
 1229611 1229612 ECH_0214 ECH_0215     FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 1229612 1229613 ECH_0215 ECH_0216     FALSE 0.399 -43.000 0.000 NA   NA
 1229613 1229614 ECH_0216 ECH_0217     FALSE 0.126 134.000 0.000 NA   NA
 1229615 1229616 ECH_0218 ECH_0219 trx virB9-2 FALSE 0.108 269.000 0.008 NA N NA
 1229616 1229617 ECH_0219 ECH_0220 virB9-2 pdhA FALSE 0.023 292.000 0.000 NA N NA
 1229617 1229618 ECH_0220 ECH_0221 pdhA   FALSE 0.111 210.000 0.008 1.000   NA
 1229619 1229620 ECH_0222 ECH_0223 rrlE rrfC FALSE 0.194 90.000 0.000 NA   NA
 1229621 1229622 ECH_0224 ECH_0225 guaB   FALSE 0.413 80.000 0.005 1.000 N NA
 1229622 1229623 ECH_0225 ECH_0226   rpmE TRUE 0.754 57.000 0.018 1.000 N NA
 1229626 1229627 ECH_0229 ECH_0230 tmk   TRUE 0.528 61.000 0.007 1.000 N NA
 1229627 1229628 ECH_0230 ECH_0231     FALSE 0.024 451.000 0.000 NA   NA
 1229630 1229631 ECH_0233 ECH_0234 secB   TRUE 0.696 81.000 0.015 NA N NA
 1229632 1229633 ECH_0235 ECH_0236     FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 1229635 1229636 ECH_0238 ECH_0239   ribE-1 FALSE 0.376 28.000 0.000 NA   NA
 1229637 1229638 ECH_0240 ECH_0241     FALSE 0.361 -84.000 0.000 NA   NA
 1229640 1229641 ECH_0243 ECH_0244     FALSE 0.023 258.000 0.000 NA   NA
 1229641 1229642 ECH_0244 ECH_0245     FALSE 0.073 158.000 0.000 NA   NA
 1229642 1229643 ECH_0245 ECH_0246     FALSE 0.250 60.000 0.000 NA   NA
 1229643 1229644 ECH_0246 ECH_0247     FALSE 0.022 312.000 0.000 NA   NA
 1229644 1229645 ECH_0247 ECH_0248     FALSE 0.028 756.000 0.000 NA   NA
 1229646 1229647 ECH_0249 ECH_0250   mfd FALSE 0.022 348.000 0.000 NA   NA
 1229647 1229648 ECH_0250 ECH_0251 mfd   FALSE 0.024 450.000 0.000 NA   NA
 1229648 1229649 ECH_0251 ECH_0252     FALSE 0.029 1407.000 0.000 NA   NA
 1229649 1229650 ECH_0252 ECH_0253     FALSE 0.026 568.000 0.000 NA   NA
 1229652 1229653 ECH_0255 ECH_0256     FALSE 0.024 464.000 0.000 NA   NA
 1229653 1229654 ECH_0256 ECH_0257     FALSE 0.353 -94.000 0.000 NA   NA
 1229654 1229655 ECH_0257 ECH_0258     FALSE 0.028 759.000 0.000 NA   NA
 1229655 1229656 ECH_0258 ECH_0259     FALSE 0.383 -64.000 0.000 NA   NA
 1229659 1229660 ECH_0262 ECH_0263   rnhA FALSE 0.022 371.000 0.000 NA   NA
 1229660 1229661 ECH_0263 ECH_0264 rnhA   TRUE 0.585 118.000 0.014 NA   NA
 1229661 1229662 ECH_0264 ECH_0265     FALSE 0.022 361.000 0.000 NA   NA
 1229662 1229663 ECH_0265 ECH_0266   pyrH FALSE 0.265 56.000 0.000 NA   NA
 1229663 1229664 ECH_0266 ECH_0267 pyrH frr TRUE 0.976 23.000 0.626 1.000 N NA
 1229666 1229667 ECH_0269 ECH_0270     FALSE 0.022 321.000 0.000 NA   NA
 1229670 1229671 ECH_0273 ECH_0274     FALSE 0.028 870.000 0.000 NA   NA
 1229672 1229673 ECH_0275 ECH_0276     FALSE 0.028 886.000 0.000 NA   NA
 1229675 1229676 ECH_0278 ECH_0279     FALSE 0.024 473.000 0.000 NA   NA
 1229678 1229679 ECH_0281 ECH_0282     FALSE 0.027 677.000 0.000 NA   NA
 1229681 1229682 ECH_0284 ECH_0285     FALSE 0.027 616.000 0.000 NA   NA
 1229682 1229683 ECH_0285 ECH_0286     FALSE 0.060 167.000 0.000 NA   NA
 1229683 1229684 ECH_0286 ECH_0287     FALSE 0.153 114.000 0.000 NA   NA
 1229688 1229689 ECH_0291 ECH_0292 hisS   FALSE 0.041 191.000 0.000 NA   NA
 1229692 1229693 ECH_0295 ECH_0296     FALSE 0.024 201.000 0.000 1.000 N NA
 1229693 1229694 ECH_0296 ECH_0297     FALSE 0.044 389.000 0.004 1.000 N NA
 1229695 1229696 ECH_0298 ECH_0299     FALSE 0.423 167.000 0.032 1.000 N NA
 1229696 1229697 ECH_0299 ECH_0300     FALSE 0.111 244.000 0.009 1.000 N NA
 1229698 1229699 ECH_0301 ECH_0302 ligA   TRUE 0.673 27.000 0.006 1.000 N NA
 1229699 1229700 ECH_0302 ECH_0303     TRUE 0.991 6.000 0.216 NA N NA
 1229700 1229701 ECH_0303 ECH_0304     FALSE 0.105 227.000 0.007 NA N NA
 1229701 1229702 ECH_0304 ECH_0305   radA TRUE 0.979 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 1229703 1229704 ECH_0306 ECH_0307     TRUE 0.971 5.000 0.012 NA   NA
 1229704 1229705 ECH_0307 ECH_0308   rpsF FALSE 0.293 129.000 0.006 1.000   NA
 1229705 1229706 ECH_0308 ECH_0309 rpsF   TRUE 0.996 14.000 0.319 0.048 Y NA
 1229706 1229707 ECH_0309 ECH_0310   rplI TRUE 0.993 19.000 0.499 0.048 Y NA
 1229707 1229708 ECH_0310 ECH_0311 rplI glyA TRUE 0.469 71.000 0.006 1.000 N NA
 1229708 1229709 ECH_0311 ECH_0312 glyA   FALSE 0.441 159.000 0.021 NA N NA
 1229709 1229710 ECH_0312 ECH_0313     TRUE 0.980 3.000 0.028 NA N NA
 1229710 1229711 ECH_0313 ECH_0314     FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   NA
 1229711 1229712 ECH_0314 ECH_0315   sdhA FALSE 0.023 417.000 0.000 NA   NA
 1229712 1229713 ECH_0315 ECH_0316 sdhA   TRUE 0.980 45.000 0.604 0.005 Y NA
 1229713 1229714 ECH_0316 ECH_0317   thyX FALSE 0.072 481.000 0.006 1.000 N NA
 1229714 1229715 ECH_0317 ECH_0318 thyX   FALSE 0.042 326.000 0.005 1.000   NA
 1229716 1229717 ECH_0319 ECH_0320 ruvB ruvA TRUE 0.757 593.000 0.549 0.005 Y NA
 1229717 1229718 ECH_0320 ECH_0321 ruvA ccmC TRUE 0.936 9.000 0.007 1.000 N NA
 1229721 1229722 ECH_0324 ECH_0325 folD   FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 1229723 1229724 ECH_0326 ECH_0327   cycM TRUE 0.970 14.000 0.027 1.000   NA
 1229724 1229725 ECH_0327 ECH_0328 cycM   FALSE 0.194 281.000 0.000 1.000 Y NA
 1229725 1229726 ECH_0328 ECH_0329     FALSE 0.014 258.000 0.000 1.000   NA
 1229726 1229727 ECH_0329 ECH_0330   ppdK FALSE 0.013 296.000 0.000 1.000   NA
 1229727 1229728 ECH_0330 ECH_0331 ppdK   FALSE 0.023 411.000 0.000 NA   NA
 1229728 1229729 ECH_0331 ECH_0332     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 1229729 1229730 ECH_0332 ECH_0333     FALSE 0.104 111.000 0.000 1.000   NA
 1229730 1229731 ECH_0333 ECH_0334   aspS FALSE 0.165 64.000 0.000 1.000   NA
 1229732 1229733 ECH_0335 ECH_0336   gshB FALSE 0.200 399.000 0.023 NA   NA
 1229733 1229734 ECH_0336 ECH_0337 gshB   FALSE 0.029 645.000 0.000 NA N NA
 1229734 1229735 ECH_0337 ECH_0338     FALSE 0.192 93.000 0.000 NA   NA
 1229735 1229736 ECH_0338 ECH_0339     FALSE 0.460 25.000 0.000 NA   NA
 1229740 1229741 ECH_0343 ECH_0344     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 1229742 1229743 ECH_0345 ECH_0346     FALSE 0.023 417.000 0.000 NA   NA
 1229744 1229745 ECH_0347 ECH_0348     TRUE 0.802 85.000 0.059 NA   NA
 1229745 1229746 ECH_0348 ECH_0349     FALSE 0.022 264.000 0.000 NA   NA
 1229747 1229748 ECH_0350 ECH_0351 folK   FALSE 0.037 172.000 0.000 1.000 N NA
 1229748 1229749 ECH_0351 ECH_1157     FALSE 0.023 256.000 0.000 NA   NA
 1229749 1229750 ECH_1157 ECH_0352   bioB FALSE 0.024 234.000 0.000 NA   NA
 1229750 1229751 ECH_0352 ECH_0353 bioB   TRUE 0.808 -3.000 0.003 NA   NA
 1229751 1229752 ECH_0353 ECH_0354     TRUE 0.545 153.000 0.040 NA   NA
 1229752 1229753 ECH_0354 ECH_0355     FALSE 0.233 322.000 0.040 NA   NA
 1229754 1229755 ECH_0356 ECH_0357 glpX   FALSE 0.231 74.000 0.000 NA   NA
 1229755 1229756 ECH_0357 ECH_0358     FALSE 0.222 78.000 0.000 NA   NA
 1229758 1229759 ECH_0360 ECH_0361     TRUE 0.819 5.000 0.000 NA   NA
 1229759 1229760 ECH_0361 ECH_0362     FALSE 0.031 205.000 0.000 NA   NA
 1229762 1229763 ECH_0364 ECH_0365 groES   TRUE 0.915 101.000 0.079 0.016 Y NA
 1229767 1229768 ECH_0369 ECH_0370 pepA purN FALSE 0.443 143.000 0.012 1.000 N NA
 1229768 1229769 ECH_0370 ECH_0371 purN lipB FALSE 0.015 268.000 0.000 1.000 N NA
 1229769 1229770 ECH_0371 ECH_0372 lipB   FALSE 0.376 28.000 0.000 NA   NA
 1229771 1229772 ECH_0373 ECH_0374 pyrC   FALSE 0.028 250.000 0.003 1.000   NA
 1229772 1229773 ECH_0374 ECH_0375     FALSE 0.236 71.000 0.000 NA   NA
 1229774 1229775 ECH_0376 ECH_0377 fumC   TRUE 0.569 99.000 0.009 NA   NA
 1229777 1229778 ECH_0379 ECH_0380     FALSE 0.060 167.000 0.000 NA   NA
 1229779 1229780 ECH_0381 ECH_0382 folP   TRUE 0.996 6.000 0.667 NA   NA
 1229783 1229784 ECH_0385 ECH_0386 qor   FALSE 0.023 244.000 0.000 NA   NA
 1229786 1229787 ECH_0388 ECH_0389     TRUE 0.962 27.000 0.500 NA   NA
 1229787 1229788 ECH_0389 ECH_0390     FALSE 0.014 250.000 0.000 1.000   NA
 1229788 1229789 ECH_0390 ECH_0391     FALSE 0.023 427.000 0.000 NA   NA
 1229789 1229790 ECH_0391 ECH_0392     FALSE 0.026 556.000 0.000 NA   NA
 1229790 1229791 ECH_0392 ECH_0393     FALSE 0.046 181.000 0.000 NA   NA
 1229791 1229792 ECH_0393 ECH_0394     FALSE 0.023 379.000 0.000 NA   NA
 1229793 1229794 ECH_0395 ECH_0396 hemH   TRUE 0.580 66.000 0.007 NA   NA
 1229794 1229795 ECH_0396 ECH_0397     FALSE 0.421 -27.000 0.000 NA   NA
 1229795 1229796 ECH_0397 ECH_0398     FALSE 0.027 215.000 0.000 NA   NA
 1229796 1229797 ECH_0398 ECH_0399     TRUE 0.955 1.000 0.008 NA   NA
 1229797 1229798 ECH_0399 ECH_0400   ihfB TRUE 0.940 45.000 0.500 NA   NA
 1229798 1229799 ECH_0400 ECH_0401 ihfB sppA TRUE 0.981 6.000 0.030 1.000 N NA
 1229799 1229800 ECH_0401 ECH_0402 sppA   TRUE 0.978 14.000 0.057 1.000 N NA
 1229800 1229801 ECH_0402 ECH_0403   cmk TRUE 0.882 66.000 0.281 1.000 N NA
 1229801 1229802 ECH_0403 ECH_0404 cmk   TRUE 0.649 -19.000 0.005 1.000 N NA
 1229803 1229804 ECH_0405 ECH_0406     TRUE 0.796 12.000 0.000 NA   NA
 1229804 1229805 ECH_0406 ECH_0407   tuf-2 FALSE 0.295 44.000 0.000 NA   NA
 1229805 1229806 ECH_0407 ECH_0408 tuf-2 rpsJ TRUE 0.998 8.000 0.318 1.000 Y NA
 1229806 1229807 ECH_0408 ECH_0409 rpsJ rplC TRUE 0.994 -7.000 0.307 0.061 Y NA
 1229807 1229808 ECH_0409 ECH_0410 rplC rplD TRUE 0.998 8.000 0.486 0.045 Y NA
 1229808 1229809 ECH_0410 ECH_0411 rplD rplW TRUE 0.997 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 1229809 1229810 ECH_0411 ECH_0412 rplW rplB TRUE 0.999 8.000 0.849 1.000 Y NA
 1229810 1229811 ECH_0412 ECH_0413 rplB rpsS TRUE 0.999 4.000 0.820 0.061 Y NA
 1229811 1229812 ECH_0413 ECH_0414 rpsS rplV TRUE 0.975 27.000 0.119 0.061 Y NA
 1229812 1229813 ECH_0414 ECH_0415 rplV rpsC TRUE 0.996 4.000 0.109 0.061 Y NA
 1229813 1229814 ECH_0415 ECH_0416 rpsC rplP TRUE 0.997 17.000 0.828 0.061 Y NA
 1229814 1229815 ECH_0416 ECH_0417 rplP rpmC TRUE 0.994 13.000 0.802 0.045   NA
 1229815 1229816 ECH_0417 ECH_0418 rpmC rpsQ TRUE 0.990 -7.000 0.828 0.045   NA
 1229816 1229817 ECH_0418 ECH_0419 rpsQ rplN TRUE 0.998 14.000 0.791 0.061 Y NA
 1229817 1229818 ECH_0419 ECH_0420 rplN rplX TRUE 0.998 2.000 0.810 0.061 Y NA
 1229818 1229819 ECH_0420 ECH_0421 rplX rplE TRUE 0.998 12.000 0.758 0.045 Y NA
 1229819 1229820 ECH_0421 ECH_0422 rplE rpsN TRUE 0.997 9.000 0.309 0.045 Y NA
 1229820 1229821 ECH_0422 ECH_0423 rpsN rpsH TRUE 0.988 22.000 0.295 0.045 Y NA
 1229821 1229822 ECH_0423 ECH_0424 rpsH rplF TRUE 0.998 12.000 0.808 0.045 Y NA
 1229822 1229823 ECH_0424 ECH_0425 rplF rplR TRUE 0.995 22.000 0.815 0.045 Y NA
 1229823 1229824 ECH_0425 ECH_0426 rplR rpsE TRUE 0.996 18.000 0.814 0.061 Y NA
 1229824 1229825 ECH_0426 ECH_0427 rpsE rplO TRUE 0.996 4.000 0.148 0.061 Y NA
 1229825 1229826 ECH_0427 ECH_0428 rplO secY TRUE 0.952 45.000 0.730 1.000 N NA
 1229826 1229827 ECH_0428 ECH_0429 secY adk TRUE 0.961 -15.000 0.241 1.000 N NA
 1229827 1229828 ECH_0429 ECH_0430 adk rpsM TRUE 0.742 59.000 0.017 1.000 N NA
 1229828 1229829 ECH_0430 ECH_0431 rpsM rpsK TRUE 0.998 12.000 0.810 0.045 Y NA
 1229829 1229830 ECH_0431 ECH_0432 rpsK rpoA TRUE 0.799 123.000 0.308 1.000 N NA
 1229830 1229831 ECH_0432 ECH_0433 rpoA rplQ TRUE 0.996 10.000 0.873 1.000 N NA
 1229831 1229832 ECH_0433 ECH_0434 rplQ pheT TRUE 0.876 46.000 0.006 1.000 Y NA
 1229832 1229833 ECH_0434 ECH_0435 pheT   FALSE 0.023 432.000 0.000 NA   NA
 1229833 1229834 ECH_0435 ECH_0436     FALSE 0.026 548.000 0.000 NA   NA
 1229834 1229835 ECH_0436 ECH_0437     FALSE 0.231 74.000 0.000 NA   NA
 1229836 1229837 ECH_0438 ECH_0439     TRUE 0.477 70.000 0.006 1.000   NA
 1229837 1229838 ECH_0439 ECH_0440   rpmH TRUE 0.988 -9.000 0.787 1.000   NA
 1229839 1229840 ECH_0441 ECH_0442 ubiA   TRUE 0.773 47.000 0.018 1.000   NA
 1229840 1229841 ECH_0442 ECH_0443   dapB TRUE 0.942 -3.000 0.011 1.000   NA
 1229841 1229842 ECH_0443 ECH_0444 dapB pstB TRUE 0.870 20.000 0.009 1.000 N NA
 1229844 1229845 ECH_0446 ECH_0447 rpmF plsX TRUE 0.944 29.000 0.418 1.000 N NA
 1229845 1229846 ECH_0447 ECH_0448 plsX fabH TRUE 0.997 10.000 0.380 0.011 Y NA
 1229848 1229849 ECH_0450 ECH_0451   dnaB FALSE 0.190 499.000 0.017 NA   NA
 1229849 1229850 ECH_0451 ECH_0452 dnaB   FALSE 0.160 913.000 0.011 1.000 N NA
 1229850 1229851 ECH_0452 ECH_0453     FALSE 0.022 259.000 0.000 NA   NA
 1229852 1229853 ECH_0454 ECH_0455     TRUE 0.981 7.000 0.031 1.000   NA
 1229856 1229857 ECH_0458 ECH_0459   nrdA FALSE 0.024 233.000 0.000 NA   NA
 1229857 1229858 ECH_0459 ECH_0460 nrdA   FALSE 0.088 1048.000 0.007 1.000 N NA
 1229859 1229860 ECH_0461 ECH_0462 purA   FALSE 0.013 308.000 0.000 1.000   NA
 1229861 1229862 ECH_0463 ECH_0464     FALSE 0.201 87.000 0.000 NA   NA
 1229862 1229863 ECH_0464 ECH_0465   tkt TRUE 0.861 56.000 0.118 1.000 N NA
 1229863 1229864 ECH_0465 ECH_0466 tkt   FALSE 0.221 323.000 0.045 1.000   NA
 1229864 1229865 ECH_0466 ECH_0467     TRUE 0.992 -3.000 0.655 1.000   NA
 1229865 1229866 ECH_0467 ECH_0468     TRUE 0.552 -13.000 0.000 NA   NA
 1229866 1229867 ECH_0468 ECH_0469   mrpC FALSE 0.298 41.000 0.000 NA   NA
 1229867 1229868 ECH_0469 ECH_0470 mrpC   TRUE 0.555 131.000 0.016 1.000 N NA
 1229868 1229869 ECH_0470 ECH_0471     TRUE 0.472 101.000 0.008 1.000 N NA
 1229869 1229870 ECH_0471 ECH_0472     TRUE 0.720 15.000 0.000 NA   NA
 1229870 1229871 ECH_0472 ECH_1158     FALSE 0.376 -80.000 0.000 NA   NA
 1229871 1229872 ECH_1158 ECH_0473     FALSE 0.298 41.000 0.000 NA   NA
 1229872 1229873 ECH_0473 ECH_0474     FALSE 0.060 617.000 0.004 NA N NA
 1229873 1229874 ECH_0474 ECH_0475   ffh TRUE 0.843 -15.000 0.008 1.000 N NA
 1229874 1229875 ECH_0475 ECH_0476 ffh era FALSE 0.014 548.000 0.003 0.021   NA
 1229875 1229876 ECH_0476 ECH_0477 era   TRUE 0.946 -10.000 0.035 1.000   NA
 1229876 1229877 ECH_0477 ECH_0478     TRUE 0.722 83.000 0.024 1.000   NA
 1229877 1229878 ECH_0478 ECH_0479     FALSE 0.179 574.000 0.022 0.032   NA
 1229880 1229881 ECH_0481 ECH_0482     FALSE 0.285 47.000 0.000 NA   NA
 1229881 1229882 ECH_0482 ECH_0483   priA FALSE 0.017 299.000 0.002 1.000   NA
 1229882 1229883 ECH_0483 ECH_0484 priA rpmB FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000 N NA
 1229884 1229885 ECH_0485 ECH_0486 lysA   FALSE 0.015 278.000 0.000 1.000 N NA
 1229886 1229887 ECH_0487 ECH_0488 pccA   FALSE 0.186 284.000 0.021 NA   NA
 1229887 1229888 ECH_0488 ECH_0489     TRUE 0.936 48.000 0.500 NA   NA
 1229888 1229889 ECH_0489 ECH_0490   lipA FALSE 0.027 754.000 0.000 NA   NA
 1229889 1229890 ECH_0490 ECH_0491 lipA   FALSE 0.022 349.000 0.000 NA   NA
 1229892 1229893 ECH_0493 ECH_0494 sodB virB3 FALSE 0.081 397.000 0.007 NA N NA
 1229893 1229894 ECH_0494 ECH_0495 virB3 virB4-1 TRUE 0.998 0.000 0.789 NA Y NA
 1229894 1229895 ECH_0495 ECH_0496 virB4-1 virB6 TRUE 0.983 40.000 0.579 1.000 Y NA
 1229895 1229896 ECH_0496 ECH_0497 virB6   TRUE 0.637 198.000 0.818 0.005   NA
 1229896 1229897 ECH_0497 ECH_0498     TRUE 0.990 4.000 0.333 0.005   NA
 1229897 1229898 ECH_0498 ECH_0499     TRUE 0.976 39.000 0.429 0.005 Y NA
 1229899 1229900 ECH_0500 ECH_0501   dut FALSE 0.030 206.000 0.000 NA   NA
 1229900 1229901 ECH_0501 ECH_0502 dut ispH FALSE 0.105 147.000 0.002 1.000 N NA
 1229901 1229902 ECH_0502 ECH_0503 ispH carA FALSE 0.029 561.000 0.002 1.000 N NA
 1229904 1229905 ECH_0505 ECH_0506 gpmI   FALSE 0.126 134.000 0.000 NA   NA
 1229906 1229907 ECH_0507 ECH_0508     FALSE 0.024 448.000 0.000 NA   NA
 1229907 1229908 ECH_0508 ECH_0509   lpdA-1 TRUE 0.792 22.000 0.008 0.044   NA
 1229908 1229909 ECH_0509 ECH_0510 lpdA-1   TRUE 0.908 20.000 0.015 1.000 N NA
 1229909 1229910 ECH_0510 ECH_0511   infA FALSE 0.193 155.000 0.006 1.000 N NA
 1229910 1229911 ECH_0511 ECH_0512 infA maf TRUE 0.938 -7.000 0.012 NA N NA
 1229913 1229914 ECH_0514 ECH_0515 rpsB tsf TRUE 0.996 -10.000 0.748 1.000 Y NA
 1229914 1229915 ECH_0515 ECH_0516 tsf   FALSE 0.028 365.000 0.002 NA   NA
 1229915 1229916 ECH_0516 ECH_0517     TRUE 0.984 7.000 0.032 NA   NA
 1229916 1229917 ECH_0517 ECH_0518     TRUE 0.624 89.000 0.011 NA   NA
 1229919 1229920 ECH_0520 ECH_0521 petA petB TRUE 0.968 25.000 0.024 0.003 Y NA
 1229920 1229921 ECH_0521 ECH_0522 petB petC TRUE 0.998 0.000 0.630 0.003 Y NA
 1229921 1229922 ECH_0522 ECH_0523 petC   FALSE 0.023 440.000 0.000 NA   NA
 1229924 1229925 ECH_0525 ECH_0526     FALSE 0.024 459.000 0.000 NA   NA
 1229925 1229926 ECH_0526 ECH_0527   dnaQ FALSE 0.021 287.000 0.000 NA   NA
 1229928 1229929 ECH_0529 ECH_0530     FALSE 0.168 104.000 0.000 NA   NA
 1229930 1229931 ECH_0531 ECH_0532     FALSE 0.122 136.000 0.000 NA   NA
 1229931 1229932 ECH_0532 ECH_0533   rrmJ FALSE 0.142 158.000 0.004 NA N NA
 1229934 1229935 ECH_0535 ECH_0536     FALSE 0.045 203.000 0.002 NA   NA
 1229938 1229939 ECH_0539 ECH_0540     TRUE 0.942 12.000 0.007 NA   NA
 1229939 1229940 ECH_0540 ECH_0541     TRUE 0.892 8.000 0.003 NA   NA
 1229940 1229941 ECH_0541 ECH_0542   mraW FALSE 0.027 207.000 0.002 1.000 N NA
 1229942 1229943 ECH_0543 ECH_0544   eno TRUE 0.936 -3.000 0.009 1.000   NA
 1229944 1229945 ECH_0545 ECH_0546 rplU rpmA TRUE 0.998 3.000 0.667 0.043 Y NA
 1229945 1229946 ECH_0546 ECH_0547 rpmA   TRUE 0.614 18.000 0.000 NA   NA
 1229946 1229947 ECH_0547 ECH_0548   nuoF FALSE 0.091 148.000 0.000 NA   NA
 1229947 1229948 ECH_0548 ECH_0549 nuoF   FALSE 0.026 218.000 0.000 NA   NA
 1229949 1229950 ECH_0550 ECH_0551     FALSE 0.023 418.000 0.000 NA   NA
 1229951 1229952 ECH_0552 ECH_0553 nuoJ nuoK TRUE 0.990 -16.000 0.484 0.008 Y NA
 1229952 1229953 ECH_0553 ECH_0554 nuoK nuoL TRUE 0.973 52.000 0.451 0.023 Y NA
 1229953 1229954 ECH_0554 ECH_0555 nuoL nuoM TRUE 0.997 6.000 0.251 0.008 Y NA
 1229954 1229955 ECH_0555 ECH_0556 nuoM nuoN TRUE 0.991 22.000 0.453 0.008 Y NA
 1229955 1229956 ECH_0556 ECH_0557 nuoN dxr TRUE 0.538 69.000 0.007 1.000 N NA
 1229956 1229957 ECH_0557 ECH_0558 dxr   FALSE 0.044 268.000 0.004 NA   NA
 1229957 1229958 ECH_0558 ECH_0559   ispG TRUE 0.529 115.000 0.009 NA   NA
 1229958 1229959 ECH_0559 ECH_0560 ispG tatC TRUE 0.821 22.000 0.007 NA N NA
 1229959 1229960 ECH_0560 ECH_0561 tatC   TRUE 0.705 77.000 0.014 NA N NA
 1229960 1229961 ECH_0561 ECH_0562   nusA FALSE 0.143 167.000 0.005 NA N NA
 1229961 1229962 ECH_0562 ECH_0563 nusA infB TRUE 0.898 61.000 0.342 1.000 N NA
 1229962 1229963 ECH_0563 ECH_0564 infB rbfA TRUE 0.997 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 1229963 1229964 ECH_0564 ECH_0565 rbfA   TRUE 0.777 0.000 0.000 NA   NA
 1229966 1229967 ECH_0567 ECH_0568 clpA   FALSE 0.014 325.000 0.000 1.000   NA
 1229967 1229968 ECH_0568 ECH_0569     FALSE 0.024 238.000 0.000 NA   NA
 1229968 1229969 ECH_0569 ECH_0570     FALSE 0.033 202.000 0.000 NA   NA
 1229971 1229972 ECH_0572 ECH_0573   atpD FALSE 0.150 116.000 0.000 NA   NA
 1229972 1229973 ECH_0573 ECH_0574 atpD atpC TRUE 0.998 0.000 0.837 0.010 Y NA
 1229973 1229974 ECH_0574 ECH_0575 atpC   TRUE 0.878 2.000 0.004 1.000 N NA
 1229974 1229975 ECH_0575 ECH_0576     FALSE 0.022 262.000 0.000 NA   NA
 1229977 1229978 ECH_0578 ECH_0579   virB8-2 FALSE 0.022 270.000 0.000 NA   NA
 1229981 1229982 ECH_0582 ECH_0583     FALSE 0.023 247.000 0.000 NA   NA
 1229982 1229983 ECH_0583 ECH_0584   serS-1 FALSE 0.025 541.000 0.000 NA   NA
 1229983 1229984 ECH_0584 ECH_0585 serS-1   FALSE 0.263 71.000 0.003 1.000 N NA
 1229984 1229985 ECH_0585 ECH_0586     FALSE 0.406 -40.000 0.000 NA   NA
 1229985 1229986 ECH_0586 ECH_0587     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 1229992 1229993 ECH_0593 ECH_0594   argB FALSE 0.013 270.000 0.000 1.000   NA
 1229993 1229994 ECH_0594 ECH_0595 argB engB TRUE 0.900 -28.000 0.046 1.000   NA
 1229995 1229996 ECH_0596 ECH_0597   prfA FALSE 0.329 33.000 0.000 NA   NA
 1229997 1229998 ECH_0598 ECH_0599   pccB FALSE 0.024 467.000 0.000 NA   NA
 1230000 1230001 ECH_0601 ECH_0602   mutM FALSE 0.040 193.000 0.000 NA   NA
 1230001 1230002 ECH_0602 ECH_0603 mutM   TRUE 0.501 -16.000 0.000 NA   NA
 1230003 1230004 ECH_0604 ECH_0605   gltX-2 FALSE 0.025 536.000 0.000 NA   NA
 1230004 1230005 ECH_0605 ECH_0606 gltX-2   FALSE 0.024 487.000 0.000 NA   NA
 1230005 1230006 ECH_0606 ECH_0607     FALSE 0.037 196.000 0.000 NA   NA
 1230006 1230007 ECH_0607 ECH_0608     FALSE 0.064 165.000 0.000 NA   NA
 1230007 1230008 ECH_0608 ECH_0609     FALSE 0.024 483.000 0.000 NA   NA
 1230010 1230011 ECH_0611 ECH_0612     FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 1230011 1230012 ECH_0612 ECH_0613     FALSE 0.025 489.000 0.000 NA   NA
 1230012 1230013 ECH_0613 ECH_0614     FALSE 0.021 287.000 0.000 NA   NA
 1230014 1230015 ECH_0615 ECH_0616 nuoE nuoD TRUE 0.998 7.000 0.355 0.010 Y NA
 1230015 1230016 ECH_0616 ECH_0617 nuoD nuoH FALSE 0.234 204.000 0.000 0.022 Y NA
 1230016 1230017 ECH_0617 ECH_0618 nuoH nuoG TRUE 0.998 7.000 0.515 0.022 Y NA
 1230017 1230018 ECH_0618 ECH_0619 nuoG   TRUE 0.983 10.000 0.033 NA   NA
 1230018 1230019 ECH_0619 ECH_0620   gyrB FALSE 0.083 192.000 0.004 NA   NA
 1230020 1230021 ECH_0621 ECH_0622 pyrB truA TRUE 0.911 9.000 0.005 1.000 N NA
 1230022 1230023 ECH_0623 ECH_0624     TRUE 0.944 -3.000 0.011 1.000   NA
 1230023 1230024 ECH_0624 ECH_0625     FALSE 0.015 451.000 0.000 1.000   NA
 1230024 1230025 ECH_0625 ECH_0626   lysS TRUE 0.840 133.000 0.017 1.000 Y NA
 1230025 1230026 ECH_0626 ECH_0627 lysS   FALSE 0.014 319.000 0.000 1.000   NA
 1230027 1230028 ECH_0628 ECH_0629   iscS TRUE 0.942 56.000 0.052 0.002 Y NA
 1230028 1230029 ECH_0629 ECH_0630 iscS iscU TRUE 0.932 38.000 0.448 1.000 N NA
 1230029 1230030 ECH_0630 ECH_0631 iscU   TRUE 0.919 26.000 0.056 NA   NA
 1230030 1230031 ECH_0631 ECH_0632   hscB TRUE 0.966 -7.000 0.046 NA   NA
 1230031 1230032 ECH_0632 ECH_0633 hscB hscA TRUE 0.996 -9.000 0.634 1.000 Y NA
 1230032 1230033 ECH_0633 ECH_0634 hscA   TRUE 0.968 17.000 0.091 1.000 N NA
 1230033 1230034 ECH_0634 ECH_0635     TRUE 0.968 15.000 0.029 NA   NA
 1230034 1230035 ECH_0635 ECH_0636     TRUE 0.950 -16.000 0.125 NA   NA
 1230036 1230037 ECH_0637 ECH_0638 ubiG rpiB TRUE 0.945 -3.000 0.011 1.000 N NA
 1230039 1230040 ECH_0640 ECH_0641   mdh FALSE 0.023 243.000 0.000 NA   NA
 1230040 1230041 ECH_0641 ECH_0642 mdh folB TRUE 0.681 78.000 0.015 1.000 N NA
 1230043 1230044 ECH_0644 ECH_0645     TRUE 0.960 7.000 0.008 NA   NA
 1230044 1230045 ECH_0645 ECH_0646   tpiA TRUE 0.990 0.000 0.353 NA   NA
 1230045 1230046 ECH_0646 ECH_0647 tpiA   TRUE 0.522 22.000 0.000 NA   NA
 1230048 1230049 ECH_0649 ECH_0650   pmbA FALSE 0.063 441.000 0.005 NA   NA
 1230049 1230050 ECH_0650 ECH_0651 pmbA folE TRUE 0.967 0.000 0.015 NA   NA
 1230050 1230051 ECH_0651 ECH_0652 folE atpG TRUE 0.938 14.000 0.008 1.000 N NA
 1230051 1230052 ECH_0652 ECH_0653 atpG   FALSE 0.196 86.000 0.002 1.000 N NA
 1230052 1230053 ECH_0653 ECH_0654     FALSE 0.037 201.000 0.000 NA N NA
 1230055 1230056 ECH_0656 ECH_0657 rpmJ   FALSE 0.303 39.000 0.000 NA   NA
 1230056 1230057 ECH_0657 ECH_0658     FALSE 0.095 147.000 0.000 NA   NA
 1230058 1230059 ECH_0659 ECH_0660     TRUE 0.899 48.000 0.214 NA   NA
 1230059 1230060 ECH_0660 ECH_0661     TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 1230060 1230061 ECH_0661 ECH_0662     TRUE 0.968 -22.000 0.500 NA   NA
 1230061 1230062 ECH_0662 ECH_0663     FALSE 0.277 50.000 0.000 NA   NA
 1230062 1230063 ECH_0663 ECH_0664     FALSE 0.110 142.000 0.000 NA   NA
 1230063 1230064 ECH_0664 ECH_0665     TRUE 0.837 113.000 0.333 NA   NA
 1230065 1230066 ECH_0666 ECH_0667 bioA putA FALSE 0.018 584.000 0.000 1.000 N NA
 1230066 1230067 ECH_0667 ECH_0668 putA   FALSE 0.051 176.000 0.000 NA   NA
 1230068 1230069 ECH_0669 ECH_0670 fabG   TRUE 0.547 38.000 0.005 NA   NA
 1230071 1230072 ECH_0672 ECH_0673     TRUE 0.796 2.000 0.000 NA   NA
 1230072 1230073 ECH_0673 ECH_0674     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 1230074 1230075 ECH_0675 ECH_0676 xth argJ TRUE 0.520 28.000 0.004 1.000 N NA
 1230075 1230076 ECH_0676 ECH_0677 argJ   FALSE 0.226 77.000 0.000 NA   NA
 1230076 1230077 ECH_0677 ECH_0678     TRUE 0.614 18.000 0.000 NA   NA
 1230077 1230078 ECH_0678 ECH_0679     FALSE 0.004 374.000 0.000 0.027   NA
 1230080 1230081 ECH_0681 ECH_0682     FALSE 0.315 37.000 0.000 NA   NA
 1230081 1230082 ECH_0682 ECH_0683     FALSE 0.025 229.000 0.000 NA   NA
 1230082 1230083 ECH_0683 ECH_0684     FALSE 0.289 46.000 0.000 NA   NA
 1230083 1230084 ECH_0684 ECH_0685     FALSE 0.339 -132.000 0.000 NA   NA
 1230084 1230085 ECH_0685 ECH_0686     FALSE 0.119 138.000 0.000 NA   NA
 1230085 1230086 ECH_0686 ECH_0687     FALSE 0.114 140.000 0.000 NA   NA
 1230086 1230087 ECH_0687 ECH_0688     FALSE 0.257 58.000 0.000 NA   NA
 1230088 1230089 ECH_0689 ECH_0690   lepB TRUE 0.945 15.000 0.010 NA   NA
 1230089 1230090 ECH_0690 ECH_0691 lepB nuoI TRUE 0.970 9.000 0.013 1.000 N NA
 1230091 1230092 ECH_0692 ECH_0693   typA FALSE 0.090 165.000 0.002 NA   NA
 1230092 1230093 ECH_0693 ECH_0694 typA   FALSE 0.022 344.000 0.000 NA   NA
 1230093 1230094 ECH_0694 ECH_0695     FALSE 0.082 153.000 0.000 NA   NA
 1230096 1230097 ECH_0697 ECH_0698     FALSE 0.022 353.000 0.000 NA   NA
 1230097 1230098 ECH_0698 ECH_0699     FALSE 0.026 571.000 0.000 NA   NA
 1230100 1230101 ECH_0701 ECH_0702 hemC folC FALSE 0.253 487.000 0.003 1.000 Y NA
 1230102 1230103 ECH_0703 ECH_0704 gatA   TRUE 0.870 13.000 0.003 NA   NA
 1230103 1230104 ECH_0704 ECH_0705   prfB FALSE 0.022 332.000 0.000 NA   NA
 1230105 1230106 ECH_0706 ECH_0707     FALSE 0.143 122.000 0.000 NA   NA
 1230108 1230109 ECH_0709 ECH_0710     FALSE 0.143 122.000 0.000 NA   NA
 1230110 1230111 ECH_0711 ECH_0712     FALSE 0.034 201.000 0.000 NA   NA
 1230112 1230113 ECH_0713 ECH_0714     TRUE 0.824 6.000 0.000 NA   NA
 1230113 1230114 ECH_0714 ECH_0715     FALSE 0.044 184.000 0.000 NA   NA
 1230114 1230115 ECH_0715 ECH_0716     FALSE 0.023 378.000 0.000 NA   NA
 1230115 1230116 ECH_0716 ECH_0717     FALSE 0.029 977.000 0.000 NA   NA
 1230116 1230117 ECH_0717 ECH_0718     TRUE 0.809 11.000 0.000 NA   NA
 1230117 1230118 ECH_0718 ECH_0719     FALSE 0.023 418.000 0.000 NA   NA
 1230118 1230119 ECH_0719 ECH_0720     FALSE 0.027 725.000 0.000 NA   NA
 1230119 1230120 ECH_0720 ECH_0721     FALSE 0.027 668.000 0.000 NA   NA
 1230120 1230121 ECH_0721 ECH_0722     FALSE 0.027 216.000 0.000 NA   NA
 1230121 1230122 ECH_0722 ECH_0723     FALSE 0.024 236.000 0.000 NA   NA
 1230122 1230123 ECH_0723 ECH_0724   lepA FALSE 0.025 506.000 0.000 NA   NA
 1230123 1230124 ECH_0724 ECH_0725 lepA   TRUE 0.526 30.000 0.005 1.000   NA
 1230124 1230125 ECH_0725 ECH_0726   pnp TRUE 0.689 27.000 0.007 1.000   NA
 1230125 1230126 ECH_0726 ECH_0727 pnp rpsO TRUE 0.980 31.000 0.335 1.000 Y NA
 1230126 1230127 ECH_0727 ECH_0728 rpsO truB TRUE 0.991 19.000 0.211 1.000 Y NA
 1230128 1230129 ECH_0729 ECH_0730     FALSE 0.023 247.000 0.000 NA   NA
 1230129 1230130 ECH_0730 ECH_0731     FALSE 0.028 208.000 0.002 1.000   NA
 1230131 1230132 ECH_0732 ECH_0733     FALSE 0.188 96.000 0.000 NA   NA
 1230133 1230134 ECH_0734 ECH_0735   trxB TRUE 0.993 1.000 0.024 1.000 Y NA
 1230135 1230136 ECH_0736 ECH_0737   coaD FALSE 0.104 144.000 0.000 NA   NA
 1230137 1230138 ECH_0738 ECH_0739     FALSE 0.023 244.000 0.000 NA   NA
 1230138 1230139 ECH_0739 ECH_0740   proS FALSE 0.016 610.000 0.000 1.000   NA
 1230139 1230140 ECH_0740 ECH_0741 proS acpS TRUE 0.946 -3.000 0.011 1.000 N NA
 1230140 1230141 ECH_0741 ECH_0742 acpS   FALSE 0.023 407.000 0.000 NA   NA
 1230141 1230142 ECH_0742 ECH_0743     FALSE 0.112 141.000 0.000 NA   NA
 1230142 1230143 ECH_0743 ECH_0744     TRUE 0.545 21.000 0.000 NA   NA
 1230143 1230144 ECH_0744 ECH_0745     FALSE 0.022 374.000 0.000 NA   NA
 1230144 1230145 ECH_0745 ECH_0746     FALSE 0.241 67.000 0.000 NA   NA
 1230145 1230146 ECH_0746 ECH_0747     TRUE 0.631 -9.000 0.000 NA   NA
 1230149 1230150 ECH_0750 ECH_0751 topA   FALSE 0.016 397.000 0.000 1.000 N NA
 1230153 1230154 ECH_0754 ECH_0755     TRUE 0.734 133.000 0.167 1.000   NA
 1230154 1230155 ECH_0755 ECH_0756   cutA1 FALSE 0.434 103.000 0.007 1.000 N NA
 1230157 1230158 ECH_0758 ECH_0759     FALSE 0.022 296.000 0.000 NA   NA
 1230158 1230159 ECH_0759 ECH_0760   rpoD FALSE 0.022 274.000 0.000 NA   NA
 1230160 1230161 ECH_0761 ECH_0762 dnaG   FALSE 0.026 592.000 0.002 1.000   NA
 1230162 1230163 ECH_0763 ECH_0764     TRUE 0.990 6.000 0.158 NA   NA
 1230163 1230164 ECH_0764 ECH_0765     FALSE 0.260 57.000 0.000 NA   NA
 1230167 1230168 ECH_0768 ECH_0769 cysS   TRUE 0.818 -3.000 0.003 NA   NA
 1230168 1230169 ECH_0769 ECH_0770     FALSE 0.024 474.000 0.000 NA   NA
 1230170 1230171 ECH_0771 ECH_0772     TRUE 0.985 12.000 0.080 NA   NA
 1230171 1230172 ECH_0772 ECH_0773     TRUE 0.961 -3.000 0.020 1.000   NA
 1230173 1230174 ECH_0774 ECH_0775 rluC   FALSE 0.022 277.000 0.000 NA   NA
 1230174 1230175 ECH_0775 ECH_0776     TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 1230175 1230176 ECH_0776 ECH_0777   efp FALSE 0.262 217.000 0.047 1.000 N NA
 1230177 1230178 ECH_0778 ECH_0779   psd FALSE 0.017 479.000 0.000 1.000 N NA
 1230178 1230179 ECH_0779 ECH_0780 psd   TRUE 0.998 5.000 0.466 0.004 Y NA
 1230179 1230180 ECH_0780 ECH_0781     TRUE 0.935 14.000 0.009 0.045 N NA
 1230180 1230181 ECH_0781 ECH_0782     FALSE 0.016 379.000 0.000 1.000 N NA
 1230181 1230182 ECH_0782 ECH_0783   ribE-2 TRUE 0.964 3.000 0.011 1.000 N NA
 1230182 1230183 ECH_0783 ECH_0784 ribE-2   TRUE 0.992 5.000 0.347 1.000 N NA
 1230183 1230184 ECH_0784 ECH_0785   uvrA FALSE 0.030 255.000 0.003 1.000 N NA
 1230184 1230185 ECH_0785 ECH_0786 uvrA nuoA FALSE 0.020 1023.000 0.000 1.000 N NA
 1230185 1230186 ECH_0786 ECH_0787 nuoA nuoB TRUE 0.998 7.000 0.507 0.007 Y NA
 1230186 1230187 ECH_0787 ECH_0788 nuoB nuoC TRUE 0.653 426.000 0.328 0.007 Y NA
 1230188 1230189 ECH_0789 ECH_0790 ccmE   TRUE 0.836 -16.000 0.008 NA   NA
 1230189 1230190 ECH_0790 ECH_0791   surE TRUE 0.734 -3.000 0.000 NA   NA
 1230190 1230191 ECH_0791 ECH_0792 surE pyrF FALSE 0.014 368.000 0.000 1.000   NA
 1230191 1230192 ECH_0792 ECH_0793 pyrF   FALSE 0.047 271.000 0.004 NA N NA
 1230192 1230193 ECH_0793 ECH_0794   leuS FALSE 0.023 290.000 0.000 NA N NA
 1230194 1230195 ECH_0795 ECH_0796   rpoZ TRUE 0.502 80.000 0.008 0.037   NA
 1230195 1230196 ECH_0796 ECH_0797 rpoZ   TRUE 0.546 95.000 0.008 NA   NA
 1230196 1230197 ECH_0797 ECH_0798   thiC FALSE 0.349 122.000 0.006 NA   NA
 1230197 1230198 ECH_0798 ECH_0799 thiC   FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 1230199 1230200 ECH_0800 ECH_0801   coaE FALSE 0.078 155.000 0.000 NA   NA
 1230201 1230202 ECH_0802 ECH_0803     FALSE 0.131 273.000 0.010 NA N NA
 1230202 1230203 ECH_0803 ECH_0804   hup FALSE 0.199 322.000 0.000 1.000 Y NA
 1230204 1230205 ECH_0805 ECH_0806 pdxJ nadD TRUE 0.830 66.000 0.005 1.000 Y NA
 1230207 1230208 ECH_0808 ECH_0809   dnaA FALSE 0.204 86.000 0.000 NA   NA
 1230208 1230209 ECH_0809 ECH_0810 dnaA   TRUE 0.665 -7.000 0.000 NA   NA
 1230209 1230210 ECH_0810 ECH_0811   fabI FALSE 0.049 177.000 0.000 NA   NA
 1230210 1230211 ECH_0811 ECH_0812 fabI   FALSE 0.173 102.000 0.000 NA   NA
 1230211 1230212 ECH_0812 ECH_0813   gatB FALSE 0.024 483.000 0.000 NA   NA
 1230212 1230213 ECH_0813 ECH_0814 gatB   TRUE 0.579 34.000 0.006 1.000   NA
 1230217 1230218 ECH_0818 ECH_0819     FALSE 0.025 543.000 0.000 NA   NA
 1230218 1230219 ECH_0819 ECH_0820     TRUE 0.473 -18.000 0.000 NA   NA
 1230220 1230221 ECH_0821 ECH_0822 hemB nadE TRUE 0.765 143.000 0.010 1.000 Y NA
 1230222 1230223 ECH_0823 ECH_0824   mutS FALSE 0.023 253.000 0.000 NA   NA
 1230224 1230225 ECH_0825 ECH_0826     TRUE 0.906 -10.000 0.010 NA   NA
 1230225 1230226 ECH_0826 ECH_0827     FALSE 0.430 26.000 0.000 NA   NA
 1230226 1230227 ECH_0827 ECH_0828   dapA FALSE 0.021 282.000 0.000 NA   NA
 1230229 1230230 ECH_0830 ECH_0831     FALSE 0.085 152.000 0.000 NA   NA
 1230231 1230232 ECH_0832 ECH_0833 sucA   TRUE 0.819 5.000 0.000 NA   NA
 1230232 1230233 ECH_0833 ECH_0834     TRUE 0.823 9.000 0.000 NA   NA
 1230234 1230235 ECH_0835 ECH_0836     FALSE 0.022 296.000 0.000 NA   NA
 1230235 1230236 ECH_0836 ECH_0837   miaB FALSE 0.030 433.000 0.002 NA   NA
 1230237 1230238 ECH_0838 ECH_0839     FALSE 0.391 -61.000 0.000 NA   NA
 1230238 1230239 ECH_0839 ECH_0840   ubiB FALSE 0.041 191.000 0.000 NA   NA
 1230239 1230240 ECH_0840 ECH_0841 ubiB   TRUE 0.949 -7.000 0.022 1.000   NA
 1230242 1230243 ECH_0843 ECH_0844 recR   FALSE 0.015 238.000 0.000 1.000   NA
 1230243 1230244 ECH_0844 ECH_0845     TRUE 0.934 26.000 0.176 1.000   NA
 1230245 1230246 ECH_0846 ECH_0847     FALSE 0.202 969.000 0.015 NA   NA
 1230246 1230247 ECH_0847 ECH_0848     TRUE 0.565 139.000 0.023 1.000 N NA
 1230247 1230248 ECH_0848 ECH_0849     FALSE 0.028 774.000 0.000 NA   NA
 1230250 1230251 ECH_0851 ECH_0852   purB FALSE 0.087 151.000 0.000 NA   NA
 1230252 1230253 ECH_0853 ECH_0854 htpG   TRUE 0.639 72.000 0.008 NA   NA
 1230253 1230254 ECH_0854 ECH_0855     FALSE 0.021 285.000 0.000 NA   NA
 1230254 1230255 ECH_0855 ECH_0856     FALSE 0.289 46.000 0.000 NA   NA
 1230255 1230256 ECH_0856 ECH_0857   nth TRUE 0.680 -3.000 0.003 0.003   NA
 1230256 1230257 ECH_0857 ECH_0858 nth gyrA TRUE 0.961 18.000 0.005 1.000 Y NA
 1230257 1230258 ECH_0858 ECH_0859 gyrA   FALSE 0.246 62.000 0.000 NA   NA
 1230263 1230264 ECH_0864 ECH_0865     FALSE 0.027 632.000 0.000 NA   NA
 1230264 1230265 ECH_0865 ECH_0866     FALSE 0.030 206.000 0.000 NA   NA
 1230266 1230267 ECH_0867 ECH_0868     FALSE 0.162 108.000 0.000 NA   NA
 1230267 1230268 ECH_0868 ECH_0869     TRUE 0.614 18.000 0.000 NA   NA
 1230268 1230269 ECH_0869 ECH_0870     FALSE 0.458 -19.000 0.000 NA   NA
 1230270 1230271 ECH_0871 ECH_0872   trmU FALSE 0.046 305.000 0.004 NA N NA
 1230272 1230273 ECH_0873 ECH_0874     TRUE 0.947 -16.000 0.145 1.000 N NA
 1230273 1230274 ECH_0874 ECH_0875     TRUE 0.981 11.000 0.045 1.000   NA
 1230277 1230278 ECH_0878 ECH_0879     FALSE 0.027 717.000 0.000 NA   NA
 1230278 1230279 ECH_0879 ECH_0880     FALSE 0.023 423.000 0.000 NA   NA
 1230279 1230280 ECH_0880 ECH_0881   acpP TRUE 0.809 11.000 0.000 NA   NA
 1230280 1230281 ECH_0881 ECH_0882 acpP fabF TRUE 0.953 15.000 0.016 1.000   NA
 1230281 1230282 ECH_0882 ECH_0883 fabF   FALSE 0.015 340.000 0.000 1.000 N NA
 1230283 1230284 ECH_0884 ECH_0885     FALSE 0.016 252.000 0.000 1.000 N NA
 1230285 1230286 ECH_0886 ECH_0887 argD   FALSE 0.026 609.000 0.000 NA   NA
 1230286 1230287 ECH_0887 ECH_0888     FALSE 0.034 201.000 0.000 NA   NA
 1230288 1230289 ECH_0889 ECH_0890     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 1230289 1230290 ECH_0890 ECH_0891     TRUE 0.873 -25.000 0.021 1.000   NA
 1230292 1230293 ECH_0893 ECH_0894 thiE   FALSE 0.027 675.000 0.000 NA   NA
 1230293 1230294 ECH_0894 ECH_0895     FALSE 0.021 288.000 0.000 NA   NA
 1230294 1230295 ECH_0895 ECH_0896     FALSE 0.106 475.000 0.008 NA   NA
 1230295 1230296 ECH_0896 ECH_0897   fmt FALSE 0.028 407.000 0.002 NA   NA
 1230296 1230297 ECH_0897 ECH_0898 fmt   FALSE 0.022 300.000 0.000 NA   NA
 1230297 1230298 ECH_0898 ECH_0899   lon FALSE 0.028 888.000 0.000 NA   NA
 1230298 1230299 ECH_0899 ECH_0900 lon clpX TRUE 0.997 10.000 0.201 1.000 Y NA
 1230299 1230300 ECH_0900 ECH_0901 clpX clpP TRUE 0.994 17.000 0.352 1.000 Y NA
 1230300 1230301 ECH_0901 ECH_0902 clpP tig TRUE 0.967 71.000 0.351 1.000 Y NA
 1230301 1230302 ECH_0902 ECH_0903 tig   FALSE 0.362 29.000 0.000 NA   NA
 1230302 1230303 ECH_0903 ECH_0904     FALSE 0.045 182.000 0.000 NA   NA
 1230304 1230305 ECH_0905 ECH_0906 pgpA   TRUE 0.762 53.000 0.018 1.000   NA
 1230305 1230306 ECH_0906 ECH_0907     TRUE 0.952 42.000 0.700 1.000   NA
 1230307 1230308 ECH_0908 ECH_0909     TRUE 0.734 -3.000 0.000 NA   NA
 1230308 1230309 ECH_0909 ECH_0910     FALSE 0.024 474.000 0.000 NA   NA
 1230309 1230310 ECH_0910 ECH_0911     FALSE 0.023 405.000 0.000 NA   NA
 1230310 1230311 ECH_0911 ECH_0912   rpsD TRUE 0.826 8.000 0.000 NA   NA
 1230312 1230313 ECH_0913 ECH_0914   thiD TRUE 0.963 -7.000 0.038 NA   NA
 1230314 1230315 ECH_0915 ECH_0916     FALSE 0.023 258.000 0.000 NA   NA
 1230315 1230316 ECH_0916 ECH_0917     FALSE 0.117 216.000 0.008 NA   NA
 1230316 1230317 ECH_0917 ECH_0918   sdhC TRUE 0.997 13.000 0.453 0.002 Y NA
 1230317 1230318 ECH_0918 ECH_0919 sdhC rrsA FALSE 0.067 163.000 0.000 NA   NA
 1230318 1230319 ECH_0919 ECH_0920 rrsA   FALSE 0.024 231.000 0.000 NA   NA
 1230321 1230322 ECH_0922 ECH_0923 dnaE   FALSE 0.029 1022.000 0.000 NA   NA
 1230322 1230323 ECH_0923 ECH_0924     FALSE 0.064 165.000 0.000 NA   NA
 1230323 1230324 ECH_0924 ECH_0925     FALSE 0.025 230.000 0.000 NA   NA
 1230324 1230325 ECH_0925 ECH_0926     FALSE 0.362 29.000 0.000 NA   NA
 1230325 1230326 ECH_0926 ECH_0927     TRUE 0.720 15.000 0.000 NA   NA
 1230326 1230327 ECH_0927 ECH_0928     FALSE 0.101 145.000 0.000 NA   NA
 1230327 1230328 ECH_0928 ECH_0929     FALSE 0.025 528.000 0.000 NA   NA
 1230332 1230333 ECH_0933 ECH_0934     FALSE 0.432 -25.000 0.000 NA   NA
 1230333 1230334 ECH_0934 ECH_0935     FALSE 0.023 381.000 0.000 NA   NA
 1230335 1230336 ECH_0936 ECH_0937   argH FALSE 0.028 927.000 0.000 NA   NA
 1230337 1230338 ECH_0938 ECH_0939     FALSE 0.023 257.000 0.000 NA   NA
 1230339 1230340 ECH_0940 ECH_0941 pyrD   TRUE 0.961 11.000 0.010 1.000 N NA
 1230341 1230342 ECH_0942 ECH_0943     FALSE 0.022 316.000 0.000 NA   NA
 1230346 1230347 ECH_0947 ECH_0948     FALSE 0.401 27.000 0.000 NA   NA
 1230347 1230348 ECH_0948 ECH_0949     FALSE 0.022 301.000 0.000 NA   NA
 1230348 1230349 ECH_0949 ECH_0950   bioF FALSE 0.022 337.000 0.000 NA   NA
 1230349 1230350 ECH_0950 ECH_0951 bioF rpoC FALSE 0.016 260.000 0.000 1.000 N NA
 1230350 1230351 ECH_0951 ECH_0952 rpoC rpoB TRUE 0.985 20.000 0.851 0.003   NA
 1230351 1230352 ECH_0952 ECH_0953 rpoB rplL TRUE 0.891 49.000 0.223 1.000   NA
 1230352 1230353 ECH_0953 ECH_0954 rplL rplJ TRUE 0.987 54.000 0.884 1.000 Y NA
 1230353 1230354 ECH_0954 ECH_0955 rplJ rplA TRUE 0.994 17.000 0.302 1.000 Y NA
 1230354 1230355 ECH_0955 ECH_0956 rplA rplK TRUE 0.989 34.000 0.838 0.047 Y NA
 1230355 1230356 ECH_0956 ECH_0957 rplK nusG TRUE 0.995 3.000 0.681 1.000 N NA
 1230356 1230357 ECH_0957 ECH_0958 nusG   TRUE 0.989 -10.000 0.843 1.000   NA
 1230357 1230358 ECH_0958 ECH_0959     FALSE 0.308 38.000 0.000 NA   NA
 1230358 1230359 ECH_0959 ECH_0960   tuf-1 TRUE 0.562 20.000 0.000 NA   NA
 1230359 1230360 ECH_0960 ECH_0961 tuf-1 fusA TRUE 0.994 14.000 0.102 0.003 Y NA
 1230360 1230361 ECH_0961 ECH_0962 fusA rpsG TRUE 0.983 24.000 0.114 1.000 Y NA
 1230361 1230362 ECH_0962 ECH_0963 rpsG rpsL TRUE 0.996 16.000 0.620 0.007 Y NA
 1230362 1230363 ECH_0963 ECH_0964 rpsL   FALSE 0.024 274.000 0.003 1.000   NA
 1230363 1230364 ECH_0964 ECH_0965     TRUE 0.789 1.000 0.000 NA   NA
 1230365 1230366 ECH_0966 ECH_0967     FALSE 0.014 323.000 0.000 1.000   NA
 1230366 1230367 ECH_0967 ECH_0968     TRUE 0.552 -13.000 0.000 NA   NA
 1230367 1230368 ECH_0968 ECH_0969     FALSE 0.368 -82.000 0.000 NA   NA
 1230368 1230369 ECH_0969 ECH_0970     FALSE 0.022 277.000 0.000 NA   NA
 1230370 1230371 ECH_0971 ECH_0972     FALSE 0.028 838.000 0.000 NA   NA
 1230372 1230373 ECH_0973 ECH_0974   fabK TRUE 0.981 12.000 0.086 0.015   NA
 1230375 1230376 ECH_0976 ECH_0977     TRUE 0.926 60.000 0.500 NA   NA
 1230376 1230377 ECH_0977 ECH_0978   rpsU TRUE 0.790 146.000 0.462 NA   NA
 1230377 1230378 ECH_0978 ECH_0979 rpsU sucC TRUE 0.767 70.000 0.028 1.000   NA
 1230378 1230379 ECH_0979 ECH_0980 sucC   TRUE 0.997 8.000 0.256 0.002 Y NA
 1230381 1230382 ECH_0982 ECH_0983 pstC   TRUE 0.943 7.000 0.007 1.000 N NA
 1230382 1230383 ECH_0983 ECH_0984     TRUE 0.684 16.000 0.000 NA   NA
 1230384 1230385 ECH_0985 ECH_0986     FALSE 0.072 583.000 0.005 NA   NA
 1230385 1230386 ECH_0986 ECH_0987     TRUE 0.986 -10.000 0.667 NA   NA
 1230386 1230387 ECH_0987 ECH_0988     TRUE 0.598 -10.000 0.000 NA   NA
 1230387 1230388 ECH_0988 ECH_0989     TRUE 0.997 5.000 0.889 NA   NA
 1230392 1230393 ECH_0993 ECH_0994   rho-1 FALSE 0.026 582.000 0.000 NA   NA
 1230394 1230395 ECH_0995 ECH_0996   hslV FALSE 0.027 694.000 0.000 NA   NA
 1230395 1230396 ECH_0996 ECH_0997 hslV hslU TRUE 0.998 2.000 0.752 1.000 Y NA
 1230396 1230397 ECH_0997 ECH_0998 hslU ubiE TRUE 0.951 3.000 0.008 1.000 N NA
 1230397 1230398 ECH_0998 ECH_0999 ubiE   FALSE 0.049 177.000 0.000 NA   NA
 1230400 1230401 ECH_1001 ECH_1002     FALSE 0.019 756.000 0.000 1.000 N NA
 1230401 1230402 ECH_1002 ECH_1003   ctaD TRUE 0.998 9.000 0.741 0.003 Y NA
 1230402 1230403 ECH_1003 ECH_1004 ctaD cyoE TRUE 0.986 3.000 0.153 0.063 N NA
 1230410 1230411 ECH_1011 ECH_1012     TRUE 0.771 78.000 0.036 1.000   NA
 1230411 1230412 ECH_1012 ECH_1013     FALSE 0.203 386.000 0.000 1.000 Y NA
 1230412 1230413 ECH_1013 ECH_1014   ppa FALSE 0.018 572.000 0.000 1.000 N NA
 1230414 1230415 ECH_1015 ECH_1016     FALSE 0.146 121.000 0.000 NA   NA
 1230416 1230417 ECH_1017 ECH_1018 argC rpsI TRUE 0.959 9.000 0.008 1.000 N NA
 1230417 1230418 ECH_1018 ECH_1019 rpsI rplM TRUE 0.996 0.000 0.231 0.035 Y NA
 1230419 1230420 ECH_1020 ECH_1021     TRUE 0.856 72.000 0.146 NA   NA
 1230420 1230421 ECH_1021 ECH_1022     FALSE 0.031 204.000 0.000 NA   NA
 1230423 1230424 ECH_1024 ECH_1025 prsA gatC TRUE 0.946 14.000 0.009 1.000 N NA
 1230424 1230425 ECH_1025 ECH_1026 gatC   FALSE 0.126 134.000 0.000 NA   NA
 1230425 1230426 ECH_1026 ECH_1027     TRUE 0.757 14.000 0.000 NA   NA
 1230427 1230428 ECH_1028 ECH_1029     FALSE 0.022 301.000 0.000 NA   NA
 1230428 1230429 ECH_1029 ECH_1030     FALSE 0.057 168.000 0.000 NA   NA
 1230429 1230430 ECH_1030 ECH_1031   acnA FALSE 0.196 89.000 0.000 NA   NA
 10942576 1230434 ECH_1035 ECH_1036     FALSE 0.458 -19.000 0.000 NA   NA
 1230434 1230435 ECH_1036 ECH_1037     FALSE 0.022 320.000 0.000 NA   NA
 1230435 1230436 ECH_1037 ECH_1038     FALSE 0.029 1641.000 0.000 NA   NA
 1230436 1230437 ECH_1038 ECH_1039     FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 1230437 1230438 ECH_1039 ECH_1040     FALSE 0.165 107.000 0.000 NA   NA
 1230438 1230439 ECH_1040 ECH_1041   virB4-2 FALSE 0.233 73.000 0.000 NA   NA
 1230439 1230440 ECH_1041 ECH_1042 virB4-2   FALSE 0.028 923.000 0.000 NA   NA
 1230440 1230441 ECH_1042 ECH_1043     TRUE 0.995 12.000 0.667 NA   NA
 1230441 1230442 ECH_1043 ECH_1044     TRUE 0.936 73.000 0.667 NA   NA
 1230442 1230443 ECH_1044 ECH_1045     FALSE 0.029 1129.000 0.000 NA   NA
 1230443 1230444 ECH_1045 ECH_1046     FALSE 0.024 242.000 0.000 NA   NA
 1230444 1230445 ECH_1046 ECH_1047     FALSE 0.026 221.000 0.000 NA   NA
 1230445 1230446 ECH_1047 ECH_1048     FALSE 0.254 59.000 0.000 NA   NA
 1230447 1230448 ECH_1049 ECH_1050   hflK TRUE 0.648 17.000 0.000 NA   NA
 1230448 1230449 ECH_1050 ECH_1051 hflK hflC TRUE 0.999 5.000 0.947 0.013 Y NA
 1230449 1230450 ECH_1051 ECH_1052 hflC   TRUE 0.996 4.000 0.084 0.013 Y NA
 1230450 1230451 ECH_1052 ECH_1053     TRUE 0.961 2.000 0.011 1.000 N NA
 1230451 1230452 ECH_1053 ECH_1054   rnc TRUE 0.893 10.000 0.004 1.000 N NA
 1230452 1230453 ECH_1054 ECH_1055 rnc ctaG TRUE 0.892 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1230455 1230456 ECH_1057 ECH_1058     TRUE 0.993 3.000 0.598 0.006   NA
 1230456 1230457 ECH_1058 ECH_1059     FALSE 0.022 376.000 0.000 NA   NA
 1230458 1230459 ECH_1060 ECH_1061 lspA ribF FALSE 0.252 181.000 0.013 1.000 N NA
 1230461 1230462 ECH_1063 ECH_1064   map TRUE 0.994 7.000 0.018 1.000 Y NA
 1230462 1230463 ECH_1064 ECH_1065 map sucB FALSE 0.055 334.000 0.005 1.000 N NA
 1230463 1230464 ECH_1065 ECH_1066 sucB   FALSE 0.078 434.000 0.007 1.000   NA
 1230466 1230467 ECH_1068 ECH_1069     FALSE 0.107 294.000 0.008 NA   NA
 1230468 1230469 ECH_1070 ECH_1071     TRUE 0.994 5.000 0.016 1.000 Y NA
 1230469 1230470 ECH_1071 ECH_1072     TRUE 0.992 16.000 0.089 1.000 Y NA
 1230470 1230471 ECH_1072 ECH_1073   fabZ TRUE 0.952 21.000 0.102 1.000 N NA
 1230471 1230472 ECH_1073 ECH_1074 fabZ purH TRUE 0.593 36.000 0.006 1.000 N NA
 1230472 1230473 ECH_1074 ECH_1075 purH   FALSE 0.272 52.000 0.000 NA   NA
 1230474 1230475 ECH_1076 ECH_1077     TRUE 0.780 13.000 0.000 NA   NA
 1230475 1230476 ECH_1077 ECH_1078   pgsA TRUE 0.826 7.000 0.000 NA   NA
 1230478 1230479 ECH_1080 ECH_1081     FALSE 0.025 505.000 0.000 NA   NA
 1230480 1230481 ECH_1082 ECH_1083     FALSE 0.047 180.000 0.000 NA   NA
 1230482 1230483 ECH_1084 ECH_1085 araM   FALSE 0.023 244.000 0.000 NA   NA
 1230484 1230485 ECH_1086 ECH_1087 atpB atpE TRUE 0.918 70.000 0.628 0.008   NA
 1230485 1230486 ECH_1087 ECH_1088 atpE atpX TRUE 0.989 9.000 0.278 0.008   NA
 1230486 1230487 ECH_1088 ECH_1089 atpX atpF TRUE 0.964 -3.000 0.032 0.008   NA
 1230488 1230489 ECH_1090 ECH_1091 ftsA   FALSE 0.289 46.000 0.000 NA   NA
 1230489 1230490 ECH_1091 ECH_1092     FALSE 0.051 176.000 0.000 NA   NA
 1230490 1230491 ECH_1092 ECH_1093     FALSE 0.023 440.000 0.000 NA   NA
 1230491 1230492 ECH_1093 ECH_1094     FALSE 0.022 337.000 0.000 NA   NA
 1230492 1230493 ECH_1094 ECH_1095     FALSE 0.023 396.000 0.000 NA   NA
 1230494 1230495 ECH_1096 ECH_1097   tilS TRUE 0.485 24.000 0.000 NA   NA
 1230495 1230496 ECH_1097 ECH_1098 tilS ftsH TRUE 0.978 -3.000 0.145 0.092 N NA
 1230496 1230497 ECH_1098 ECH_1099 ftsH   FALSE 0.027 675.000 0.000 NA   NA
 1230498 1230499 ECH_1100 ECH_1101   lgt FALSE 0.025 229.000 0.000 NA   NA
 1230500 1230501 ECH_1102 ECH_1103     FALSE 0.022 335.000 0.000 NA   NA
 1230502 1230503 ECH_1104 ECH_1105     FALSE 0.023 419.000 0.000 NA   NA
 1230503 1230504 ECH_1105 ECH_1106   secD TRUE 0.871 27.000 0.025 1.000   NA
 1230504 1230505 ECH_1106 ECH_1107 secD thiF FALSE 0.015 329.000 0.000 1.000 N NA
 1230505 1230506 ECH_1107 ECH_1108 thiF pyrE TRUE 0.973 0.000 0.025 1.000 N NA
 1230506 1230507 ECH_1108 ECH_1109 pyrE recA TRUE 0.876 12.000 0.004 1.000 N NA
 1230507 1230508 ECH_1109 ECH_1110 recA bioD FALSE 0.007 362.000 0.000 0.092 N NA
 1230510 1230511 ECH_1112 ECH_1113     FALSE 0.022 336.000 0.000 NA   NA
 1230511 1230512 ECH_1113 ECH_1114     FALSE 0.087 151.000 0.000 NA   NA
 1230513 1230514 ECH_1115 ECH_1116 recJ   FALSE 0.017 505.000 0.000 1.000 N NA
 1230516 1230517 ECH_1118 ECH_1119   omp-1M FALSE 0.029 180.000 0.000 1.000   NA
 1230517 1230518 ECH_1119 ECH_1120 omp-1M   FALSE 0.238 70.000 0.000 NA   NA
 1230518 1230519 ECH_1120 ECH_1121   omp-1N FALSE 0.022 262.000 0.000 NA   NA
 1230519 1230520 ECH_1121 ECH_1122 omp-1N   FALSE 0.165 107.000 0.000 NA   NA
 1230520 1230521 ECH_1122 ECH_1123   omp-1Q TRUE 0.816 10.000 0.000 NA   NA
 1230521 1230522 ECH_1123 ECH_1124 omp-1Q omp-1P TRUE 0.991 17.000 1.000 0.022   NA
 1230522 1230523 ECH_1124 ECH_1125 omp-1P omp-1T TRUE 0.995 13.000 1.000 0.022   NA
 1230523 1230524 ECH_1125 ECH_1126 omp-1T omp-1U TRUE 0.992 16.000 1.000 0.022   NA
 1230524 1230525 ECH_1126 ECH_1127 omp-1U omp-1V TRUE 0.985 22.000 1.000 0.022   NA
 1230525 1230526 ECH_1127 ECH_1128 omp-1V   TRUE 0.979 23.000 0.667 NA   NA
 1230526 1230527 ECH_1128 ECH_1129   omp-1w TRUE 0.991 -10.000 1.000 NA   NA
 1230527 1230528 ECH_1129 ECH_1130 omp-1w omp-1X TRUE 0.996 9.000 1.000 0.022   NA
 1230528 1230529 ECH_1130 ECH_1131 omp-1X omp-1Y TRUE 0.996 10.000 1.000 0.022   NA
 1230529 1230530 ECH_1131 ECH_1132 omp-1Y omp-1S FALSE 0.106 25.000 0.000 0.022   NA
 1230530 1230531 ECH_1132 ECH_1133 omp-1S omp-1H TRUE 0.981 25.000 1.000 0.022   NA
 1230531 1230532 ECH_1133 ECH_1134 omp-1H omp-1Z TRUE 0.981 25.000 1.000 0.022   NA
 1230532 1230533 ECH_1134 ECH_1135 omp-1Z omp-1A FALSE 0.106 25.000 0.000 0.022   NA
 1230533 1230534 ECH_1135 ECH_1136 omp-1A omp-1B FALSE 0.004 580.000 0.000 0.022   NA
 1230534 1230535 ECH_1136 ECH_1137 omp-1B omp-1C FALSE 0.003 303.000 0.000 0.022   NA
 1230535 1230536 ECH_1137 ECH_1138 omp-1C   TRUE 0.823 9.000 0.000 NA   NA
 1230536 1230537 ECH_1138 ECH_1139   omp-1D FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 1230537 1230538 ECH_1139 ECH_1140 omp-1D omp-1E FALSE 0.003 264.000 0.000 0.022   NA
 1230540 1230541 ECH_1142 ECH_1143 omp-1F p28 FALSE 0.003 309.000 0.000 0.022   NA
 1230542 1230543 ECH_1144 ECH_1145 p28-1   TRUE 0.809 11.000 0.000 NA   NA
 1230543 1230544 ECH_1145 ECH_1146   p28-2 FALSE 0.217 80.000 0.000 NA   NA
 1230545 1230546 ECH_1147 ECH_1148     FALSE 0.024 462.000 0.000 NA   NA
 1230546 1230547 ECH_1148 ECH_1149   secA FALSE 0.023 406.000 0.000 NA   NA
 1230548 1230549 ECH_1150 ECH_1151     FALSE 0.346 -97.000 0.000 NA   NA
 1230549 1230550 ECH_1151 ECH_1152     FALSE 0.160 111.000 0.000 NA   NA
 1230551 1230552 ECH_1153 ECH_1154 ftsZ   TRUE 0.942 7.000 0.006 NA   NA
 1230552 1230553 ECH_1154 ECH_1155     TRUE 0.884 -3.000 0.005 NA   NA
 1230553 1230554 ECH_1155 ECH_1156     FALSE 0.193 138.000 0.003 NA   NA
 1230554 1229398 ECH_1156 ECH_0001     TRUE 0.996 10.000 0.827 1.000 N NA