MicrobesOnline Operon Predictions for Tropheryma whipplei str. Twist

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 332234 332235 TW001 TW002 dnaA dnaN TRUE 0.704 330.000 0.328 1.000 Y NA
 332235 332236 TW002 TW003 dnaN recF TRUE 0.974 -10.000 0.318 1.000 Y NA
 332236 332237 TW003 TW004 recF   TRUE 0.823 30.000 0.089 NA   NA
 332237 332238 TW004 TW005   gyrB1 TRUE 0.641 40.000 0.028 NA   NA
 332238 332239 TW005 TW006 gyrB1 gyrA1 TRUE 0.991 4.000 0.306 0.007 Y NA
 332239 332240 TW006 TW007 gyrA1   TRUE 0.803 -3.000 0.053 NA   NA
 332240 400397 TW007 TWTRNA01   tRNA-Ile TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 400397 400398 TWTRNA01 TWTRNA02 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.453 14.000 0.000 NA   NA
 332244 332245 TW011 TW012 pabA   FALSE 0.064 106.000 0.000 NA   NA
 332245 332246 TW012 TW013     TRUE 0.849 37.000 0.222 NA   NA
 332246 332247 TW013 TW014     TRUE 0.488 1.000 0.000 NA   NA
 332247 332248 TW014 TW015     FALSE 0.060 120.000 0.000 NA   NA
 332248 332249 TW015 TW016     TRUE 0.567 25.000 0.000 1.000   NA
 332250 332251 TW017 TW018 pmmB deoD TRUE 0.937 13.000 0.235 1.000 N NA
 332254 332255 TW021 TW022     FALSE 0.446 16.000 0.000 NA   NA
 332259 332260 TW026 TW027 purK purE TRUE 0.903 79.000 0.141 0.003 Y NA
 332261 332262 TW028 TW029   rmlD FALSE 0.048 304.000 0.000 NA   NA
 332262 332263 TW029 TW030 rmlD rmlB TRUE 0.984 -3.000 0.083 0.003 Y NA
 332264 332265 TW031 TW032 rmlC rmlA TRUE 0.891 56.000 0.200 1.000 Y NA
 332266 332267 TW033 TW034 wbbL   FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332267 332268 TW034 TW035     TRUE 0.934 52.000 0.548 1.000 Y NA
 332270 332271 TW037 TW038     TRUE 0.952 -87.000 0.568 NA   NA
 332272 332273 TW039 TW040     FALSE 0.055 851.000 0.000 NA   NA
 332273 332274 TW040 TW041     FALSE 0.051 544.000 0.000 NA   NA
 332274 332275 TW041 TW042     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332275 332276 TW042 TW043     FALSE 0.057 127.000 0.000 NA   NA
 332276 332277 TW043 TW044     FALSE 0.049 364.000 0.000 NA   NA
 332277 332278 TW044 TW045     TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 332279 332280 TW046 TW047     TRUE 0.994 4.000 0.824 0.005 Y NA
 332281 332282 TW048 TW049 capB soj FALSE 0.121 328.000 0.000 1.000 N NA
 332282 332283 TW049 TW050 soj tyrA FALSE 0.231 74.000 0.000 1.000 N NA
 332283 332284 TW050 TW051 tyrA   TRUE 0.625 -18.000 0.000 1.000   NA
 332286 332287 TW053 TW054 ubiE grcC TRUE 0.908 12.000 0.006 1.000 Y NA
 332287 332288 TW054 TW055 grcC   TRUE 0.859 19.000 0.039 1.000 N NA
 332289 332290 TW056 TW057 fecB   TRUE 0.841 145.000 0.154 0.003 Y NA
 332290 332291 TW057 TW058   fepC FALSE 0.301 218.000 0.000 1.000 Y NA
 332291 332292 TW058 TW059 fepC fepG TRUE 0.906 -64.000 0.000 1.000 Y NA
 332292 332293 TW059 TW060 fepG fepD TRUE 0.963 -147.000 0.000 0.025 Y NA
 332293 400446 TW060 TWTRNA03 fepD tRNA-Met FALSE 0.048 167.000 0.000 NA   NA
 400446 400445 TWTRNA03 TWTRNA04 tRNA-Met tRNA-Thr FALSE 0.433 19.000 0.000 NA   NA
 400444 332295 TWTRNA05 TW062 tRNA-Tyr lysS FALSE 0.210 51.000 0.000 NA   NA
 332296 332297 TW063 TW064 panC cls FALSE 0.119 297.000 0.000 1.000 N NA
 332297 332298 TW064 TW065 cls clpC FALSE 0.403 52.000 0.000 1.000 N NA
 332300 332301 TW067 TW068   menD TRUE 0.504 36.000 0.000 1.000   NA
 332301 332302 TW068 TW069 menD   FALSE 0.477 10.000 0.000 NA   NA
 332302 332303 TW069 TW070   menA FALSE 0.424 21.000 0.000 NA   NA
 332303 332304 TW070 TW071 menA rpoB FALSE 0.131 139.000 0.000 1.000 N NA
 332304 332305 TW071 TW072 rpoB rpoC TRUE 0.992 27.000 0.851 0.003 Y NA
 332307 332308 TW074 TW075 groES guaB1 FALSE 0.419 51.000 0.000 1.000 N NA
 332308 332309 TW075 TW076 guaB1 guaB2 TRUE 0.959 -28.000 0.056 0.003   NA
 332309 332310 TW076 TW077 guaB2   TRUE 0.762 -34.000 0.025 NA   NA
 332310 332311 TW077 TW078     FALSE 0.130 66.000 0.000 NA   NA
 332311 332312 TW078 TW079   guaA FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332312 332313 TW079 TW080 guaA pcrA FALSE 0.196 105.000 0.003 1.000 N NA
 332313 332314 TW080 TW081 pcrA   FALSE 0.417 22.000 0.000 NA   NA
 332314 332315 TW081 TW082     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332315 332316 TW082 TW083   purN TRUE 0.843 -7.000 0.044 1.000   NA
 332316 332317 TW083 TW084 purN purH TRUE 0.845 40.000 0.006 1.000 Y NA
 332325 332326 TW092 TW093     FALSE 0.459 -15.000 0.000 NA   NA
 332326 332327 TW093 TW094     TRUE 0.936 -3.000 0.750 NA   NA
 332327 332328 TW094 TW095     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332328 332329 TW095 TW096     FALSE 0.344 36.000 0.000 NA   NA
 400443 332330 TWTRNA06 TW097 tRNA-Pro xerD FALSE 0.058 1673.000 0.000 NA   NA
 332330 332331 TW097 TW098 xerD   TRUE 0.595 1779.000 0.063 1.000 Y NA
 332331 332332 TW098 TW099     FALSE 0.047 199.000 0.000 NA   NA
 332332 332333 TW099 TW100   pyrG FALSE 0.477 10.000 0.000 NA   NA
 332333 332334 TW100 TW101 pyrG   FALSE 0.054 797.000 0.000 NA   NA
 332334 332335 TW101 TW102   recN FALSE 0.056 1179.000 0.000 NA   NA
 332335 332336 TW102 TW103 recN   TRUE 0.880 19.000 0.061 1.000 N NA
 332336 332337 TW103 TW104     TRUE 0.548 28.000 0.000 1.000   NA
 332337 332338 TW104 TW105   rplI TRUE 0.523 32.000 0.000 1.000   NA
 332338 332339 TW105 TW106 rplI rpsR TRUE 0.987 -3.000 0.499 0.064 Y NA
 332339 332340 TW106 TW107 rpsR ssb TRUE 0.852 15.000 0.030 1.000 N NA
 332340 332341 TW107 TWT108 ssb rpsF TRUE 0.875 4.000 0.029 1.000 N NA
 332341 332342 TWT108 TW109 rpsF purC FALSE 0.125 378.000 0.000 1.000 N NA
 332343 332344 TW110 TW111 menB menE TRUE 0.955 -148.000 0.193 1.000 N NA
 332344 400399 TW111 TWTRNA07 menE tRNA-Ser FALSE 0.048 305.000 0.000 NA   NA
 400399 332345 TWTRNA07 TW112 tRNA-Ser   FALSE 0.063 109.000 0.000 NA   NA
 332345 332346 TW112 TW113   rpmB FALSE 0.118 179.000 0.000 1.000 N NA
 332346 332347 TW113 TW114 rpmB rpmG TRUE 0.987 0.000 0.332 0.064 Y NA
 332347 332348 TW114 TW115 rpmG rpsN TRUE 0.975 1.000 0.052 0.064 Y NA
 332348 332349 TW115 TW116 rpsN hup FALSE 0.387 66.000 0.007 1.000 N NA
 332349 332350 TW116 TW117 hup   FALSE 0.219 50.000 0.000 NA   NA
 332350 332351 TW117 TW118     TRUE 0.495 2.000 0.000 NA   NA
 332351 332352 TW118 TW119     TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 332352 332353 TW119 TW120   tuf FALSE 0.465 -19.000 0.000 NA   NA
 332355 332356 TW122 TW123 manA whiB TRUE 0.619 13.000 0.000 1.000   NA
 332356 332357 TW123 TW124 whiB   FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332357 332358 TW124 TW125     TRUE 0.802 53.000 0.606 NA   NA
 332358 332359 TW125 TW126     FALSE 0.049 157.000 0.000 NA   NA
 332359 332360 TW126 TW127   pmmA TRUE 0.942 -52.000 0.460 NA   NA
 332360 332361 TW127 TW128 pmmA   FALSE 0.124 67.000 0.000 NA   NA
 332361 332362 TW128 TW129   comFC TRUE 0.522 -60.000 0.000 NA   NA
 332362 332363 TW129 TW130 comFC secA FALSE 0.047 244.000 0.000 NA   NA
 332363 332364 TW130 TW131 secA   FALSE 0.048 319.000 0.000 NA   NA
 332364 332365 TW131 TW132     FALSE 0.051 145.000 0.000 NA   NA
 332365 332366 TW132 TW133     FALSE 0.487 9.000 0.000 NA   NA
 332368 332369 TW135 TW136 gcvB dppA1 FALSE 0.301 210.000 0.000 1.000 Y NA
 332369 332370 TW136 TW137 dppA1 dppA2 TRUE 0.942 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 332371 332372 TW138 TW139     FALSE 0.347 127.000 0.000 1.000 Y NA
 332373 332374 TW140 TW141 dppB dppC TRUE 0.954 2.000 0.000 0.024 Y NA
 332374 332375 TW141 TW142 dppC dppD TRUE 0.599 -3.000 0.000 1.000   NA
 332377 332378 TW144 TW145 rplM rpsI TRUE 0.990 0.000 0.601 0.063 Y NA
 332378 332379 TW145 TW146 rpsI mrsA TRUE 0.914 4.000 0.068 1.000 N NA
 400442 400441 TWTRNA08 TWTRNA09 tRNA-Phe tRNA-Asp TRUE 0.500 6.000 0.000 NA   NA
 400441 400440 TWTRNA09 TWTRNA10 tRNA-Asp tRNA-Glu FALSE 0.477 10.000 0.000 NA   NA
 332382 332383 TW149 TW150     TRUE 0.538 -85.000 0.000 NA   NA
 332383 332384 TW150 TW151     TRUE 0.536 -84.000 0.000 NA   NA
 332386 332387 TW153 TW154   ppa FALSE 0.451 -12.000 0.000 NA   NA
 332387 332388 TW154 TW155 ppa   FALSE 0.047 284.000 0.000 NA   NA
 332388 332389 TW155 TW156   nusA FALSE 0.055 857.000 0.000 NA   NA
 332389 332390 TW156 TW157 nusA infB TRUE 0.554 132.000 0.342 1.000 N NA
 332390 332391 TW157 TW158 infB   FALSE 0.471 -22.000 0.000 NA   NA
 332391 332392 TW158 TW159   rbfA FALSE 0.139 64.000 0.000 NA   NA
 332392 332393 TW159 TW160 rbfA   TRUE 0.756 -82.000 0.000 1.000 N NA
 332393 332394 TW160 TW161     FALSE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 332394 332395 TW161 TW162   metE FALSE 0.053 689.000 0.000 NA   NA
 332397 332398 TW164 TWT165 infC rpmI TRUE 0.870 74.000 0.652 1.000 Y NA
 332398 332399 TWT165 TW166 rpmI rplT TRUE 0.988 30.000 0.928 0.062 Y NA
 332399 332400 TW166 TW167 rplT pheS TRUE 0.672 384.000 0.202 1.000 Y NA
 332400 332401 TW167 TW168 pheS pheT TRUE 0.853 83.000 0.574 0.003   NA
 332401 332402 TW168 TW169 pheT tyrS FALSE 0.087 199.000 0.000 1.000   NA
 332402 2187742 TW169 TWTRNA11 tyrS rrs FALSE 0.057 1437.000 0.000 NA   NA
 2187742 332403 TWTRNA11 TW170 rrs   FALSE 0.247 48.000 0.000 NA   NA
 332403 406992 TW170 TWTRNA12   rrl FALSE 0.111 70.000 0.000 NA   NA
 406992 406857 TWTRNA12 TWTRNA13 rrl rrf FALSE 0.190 53.000 0.000 NA   NA
 406857 332404 TWTRNA13 TW171 rrf   FALSE 0.075 89.000 0.000 NA   NA
 332406 332407 TW173 TW174     FALSE 0.477 10.000 0.000 NA   NA
 332407 332408 TW174 TW175     TRUE 0.488 1.000 0.000 NA   NA
 332408 332409 TW175 TW176     FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 332409 332410 TW176 TW177     FALSE 0.104 73.000 0.000 NA   NA
 332410 332411 TW177 TW178     TRUE 0.933 3.000 0.357 NA   NA
 332411 332412 TW178 TW179     FALSE 0.368 31.000 0.000 NA   NA
 332412 332413 TW179 TW180     FALSE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 332413 332414 TW180 TW181     FALSE 0.424 21.000 0.000 NA   NA
 332414 332415 TW181 TW182   trcF FALSE 0.050 375.000 0.000 NA   NA
 332417 332418 TW184 TW185     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332419 332420 TW186 TW187 ispG prsA FALSE 0.125 146.000 0.000 1.000 N NA
 332420 332421 TW187 TW188 prsA   TRUE 0.695 -3.000 0.005 1.000   NA
 332422 332423 TW189 TW190     TRUE 0.960 -46.000 0.667 1.000   NA
 332423 332424 TW190 TW191     TRUE 0.978 -3.000 0.667 0.009   NA
 332424 332425 TW191 TW192     TRUE 0.760 63.000 0.758 NA   NA
 332425 332426 TW192 TW193     TRUE 0.888 -3.000 0.185 NA   NA
 332426 332427 TW193 TW194     TRUE 0.900 0.000 0.182 NA   NA
 332427 332428 TW194 TW195     TRUE 0.919 -73.000 0.182 NA   NA
 332428 332429 TW195 TW196   pyrB FALSE 0.060 8520.000 0.000 NA   NA
 332431 332432 TW198 TW199 prfB ftsE FALSE 0.119 172.000 0.000 1.000 N NA
 332432 332433 TW199 TW200 ftsE ftsX TRUE 0.877 15.000 0.000 1.000 Y NA
 332433 332434 TW200 TW201 ftsX ssrB TRUE 0.871 12.000 0.038 1.000 N NA
 332434 332435 TW201 TW202 ssrB   FALSE 0.107 2066.000 0.000 1.000   NA
 332435 332436 TW202 TW203   ksgA TRUE 0.599 -3.000 0.000 1.000   NA
 332436 2187743 TW203 TWTRNA14 ksgA ssrA FALSE 0.051 142.000 0.000 NA   NA
 2187743 400400 TWTRNA14 TWTRNA15 ssrA tRNA-Lys FALSE 0.059 2641.000 0.000 NA   NA
 400400 332437 TWTRNA15 TW204 tRNA-Lys ilvD FALSE 0.059 3893.000 0.000 NA   NA
 332437 332438 TW204 TW205 ilvD ilvB TRUE 0.939 45.000 0.020 0.004 Y NA
 332438 332439 TW205 TW206 ilvB ilvH TRUE 0.986 -109.000 0.380 0.003   NA
 332439 332440 TW206 TW207 ilvH ilvC TRUE 0.544 69.000 0.071 1.000   NA
 332440 332441 TW207 TW208 ilvC ilvE FALSE 0.423 101.000 0.002 1.000 Y NA
 332441 332442 TW208 TW209 ilvE gltS FALSE 0.448 49.000 0.000 1.000 N NA
 332442 332443 TW209 TW210 gltS   TRUE 0.797 1.000 0.006 1.000 N NA
 332443 400401 TW210 TWTRNA16   tRNA-Gln FALSE 0.049 348.000 0.000 NA   NA
 400401 332444 TWTRNA16 TW211 tRNA-Gln bioY FALSE 0.411 23.000 0.000 NA   NA
 332444 332445 TW211 TW212 bioY   TRUE 0.492 -37.000 0.000 NA   NA
 332445 332446 TW212 TW213   glkA TRUE 0.556 27.000 0.000 1.000   NA
 332446 332447 TW213 TW214 glkA plsC FALSE 0.209 79.000 0.000 1.000 N NA
 332447 332448 TW214 TW215 plsC   TRUE 0.750 -67.000 0.000 1.000 N NA
 332449 332450 TW216 TW217 pknB idsA TRUE 0.711 10.000 0.000 1.000 N NA
 332451 332452 TW218 TW219     FALSE 0.054 728.000 0.000 NA   NA
 332452 332453 TW219 TW220     TRUE 0.832 50.000 0.635 NA   NA
 332453 332454 TW220 TW221     TRUE 0.575 -3.000 0.004 NA   NA
 332454 332455 TW221 TW222   pbpB FALSE 0.199 103.000 0.026 NA   NA
 332455 332456 TW222 TW223 pbpB murF TRUE 0.862 22.000 0.000 1.000 Y NA
 332456 332457 TW223 TW224 murF murX TRUE 0.943 -3.000 0.000 0.016 Y NA
 332457 332458 TW224 TW225 murX murE TRUE 0.972 -69.000 0.011 0.016 Y NA
 332458 332459 TW225 TW226 murE murD TRUE 0.972 -142.000 0.002 0.007 Y NA
 332459 332460 TW226 TW227 murD ftsW TRUE 0.962 0.000 0.081 0.013 N NA
 332460 332461 TW227 TW228 ftsW murG TRUE 0.931 0.000 0.167 1.000 N NA
 332461 332462 TW228 TW229 murG murC TRUE 0.977 3.000 0.270 1.000 Y NA
 332462 332463 TW229 TW230 murC ftsQ TRUE 0.943 27.000 0.134 NA Y NA
 332465 332466 TW232 TW233     TRUE 0.488 1.000 0.000 NA   NA
 332466 332467 TW233 TW234     FALSE 0.446 16.000 0.000 NA   NA
 332467 332468 TW234 TW235     TRUE 0.949 6.000 0.707 NA   NA
 332468 332469 TW235 TW236     TRUE 0.959 43.000 0.060 0.010 Y NA
 332469 332470 TW236 TW237     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA Y NA
 332470 332471 TW237 TW238   pyrD TRUE 0.708 7.000 0.004 NA N NA
 332472 332473 TW239 TW240 rnhA   TRUE 0.726 16.000 0.024 NA   NA
 332474 332475 TW241 TW242     TRUE 0.607 -13.000 0.005 NA   NA
 332475 332476 TW242 TW243   ctaC FALSE 0.248 70.000 0.014 NA   NA
 332476 332477 TW243 TW244 ctaC ctaD TRUE 0.990 12.000 0.284 0.004 Y NA
 332477 332478 TW244 TW245 ctaD   TRUE 0.918 21.000 0.250 1.000   NA
 332478 332479 TW245 TW246   ctaE FALSE 0.136 89.000 0.000 1.000   NA
 332479 332480 TW246 TW247 ctaE qcrC TRUE 0.954 -42.000 0.000 0.026 Y NA
 332480 332481 TW247 TW248 qcrC qcrA TRUE 0.823 54.000 0.000 0.026 Y NA
 332481 332482 TW248 TW249 qcrA qcrB TRUE 0.990 0.000 0.457 0.026 Y NA
 332482 332483 TW249 TW250 qcrB   FALSE 0.136 65.000 0.000 NA   NA
 332484 332485 TW251 TW252 kasA acp TRUE 0.971 1.000 0.178 1.000 Y NA
 332485 332486 TW252 TWT253 acp fabH TRUE 0.918 77.000 0.307 0.007 Y NA
 332486 332487 TWT253 TW254 fabH fabD TRUE 0.977 -37.000 0.294 1.000 Y NA
 332487 332488 TW254 TW255 fabD aceE TRUE 0.870 -16.000 0.000 0.048 N NA
 332489 400402 TW256 TWTRNA17   tRNA-Val FALSE 0.130 66.000 0.000 NA   NA
 400402 332490 TWTRNA17 TW257 tRNA-Val   TRUE 0.496 7.000 0.000 NA   NA
 332490 332491 TW257 TW258     TRUE 0.830 -7.000 0.065 NA   NA
 332491 2187744 TW258 TWTRNA18   rnpB FALSE 0.450 15.000 0.000 NA   NA
 332492 332493 TWT259 TW260 map panB TRUE 0.756 0.000 0.002 1.000 N NA
 332493 332494 TW260 TW261 panB glnA TRUE 0.677 -3.000 0.000 1.000 N NA
 332495 332496 TW262 TW263 thrS   TRUE 0.942 9.000 0.208 1.000 N NA
 332496 332497 TW263 TW264     TRUE 0.873 13.000 0.000 0.029 N NA
 332497 332498 TW264 TW265     TRUE 0.975 0.000 0.488 NA Y NA
 332498 332499 TW265 TW266     TRUE 0.690 43.000 0.055 NA   NA
 332499 332500 TW266 TW267   ruvC TRUE 0.907 -9.000 0.277 NA   NA
 332500 332501 TW267 TW268 ruvC ruvA TRUE 0.991 -45.000 0.451 0.016 Y NA
 332501 3824422 TW268 TWT269 ruvA ruvB TRUE 0.993 -31.000 0.549 0.004 Y NA
 3824422 332503 TWT269 TW270 ruvB   TRUE 0.841 22.000 0.063 NA N NA
 332503 332504 TW270 TW271   secD TRUE 0.929 22.000 0.062 NA Y NA
 332504 332505 TW271 TW272 secD secF TRUE 0.992 0.000 0.336 0.003 Y NA
 332507 332508 TW274 TW275   relA FALSE 0.047 223.000 0.000 NA   NA
 332510 332511 TW277 TW278   lepA FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 332511 332512 TW278 TW279 lepA   TRUE 0.520 -58.000 0.000 NA   NA
 332512 332513 TW279 TW280   dnaJ2 FALSE 0.051 446.000 0.000 NA   NA
 332513 332514 TW280 TW281 dnaJ2   FALSE 0.356 34.000 0.000 NA   NA
 332514 332515 TW281 TW282     TRUE 0.687 36.000 0.034 NA   NA
 332515 332516 TW282 TW283     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332516 332517 TW283 TW284   era TRUE 0.747 -13.000 0.026 NA   NA
 332517 332518 TW284 TWT285 era recO TRUE 0.879 26.000 0.108 1.000   NA
 332518 332519 TWT285 TW286 recO uppS TRUE 0.878 28.000 0.076 1.000 N NA
 332519 332520 TW286 TW287 uppS dgt TRUE 0.711 10.000 0.000 1.000 N NA
 332520 332521 TW287 TW288 dgt dnaG TRUE 0.855 -3.000 0.037 1.000 N NA
 332521 400403 TW288 TWTRNA19 dnaG tRNA-Asn FALSE 0.052 141.000 0.000 NA   NA
 400403 332522 TWTRNA19 TW289 tRNA-Asn   FALSE 0.074 91.000 0.000 NA   NA
 332522 400404 TW289 TWTRNA20   tRNA-Arg TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 400404 332523 TWTRNA20 TW290 tRNA-Arg pyk FALSE 0.231 49.000 0.000 NA   NA
 332524 332525 TW291 TW292   polA TRUE 0.685 16.000 0.000 1.000 N NA
 332525 332526 TW292 TW293 polA rpsA FALSE 0.119 178.000 0.000 1.000 N NA
 332526 332527 TW293 TW294 rpsA coaE TRUE 0.856 4.000 0.024 1.000 N NA
 332527 332528 TW294 TW295 coaE uvrB TRUE 0.835 -7.000 0.026 1.000 N NA
 332528 332529 TW295 TW296 uvrB uvrA TRUE 0.987 12.000 0.154 0.004 Y NA
 332529 332530 TW296 TW297 uvrA uvrC TRUE 0.982 9.000 0.043 0.004 Y NA
 332530 332531 TW297 TW298 uvrC whiA FALSE 0.477 10.000 0.000 NA   NA
 332531 332532 TW298 TW299 whiA sodA FALSE 0.080 85.000 0.000 NA   NA
 332532 332533 TW299 TW300 sodA gap TRUE 0.659 22.000 0.000 1.000 N NA
 332533 332534 TW300 TW301 gap pgk TRUE 0.964 7.000 0.003 0.009 Y NA
 332534 332535 TW301 TW302 pgk tpi TRUE 0.963 2.000 0.075 1.000 Y NA
 332535 332536 TW302 TW303 tpi secG TRUE 0.828 31.000 0.064 1.000   NA
 332536 332537 TW303 TW304 secG   TRUE 0.661 36.000 0.027 NA   NA
 332539 332540 TW306 TW307   ppa FALSE 0.451 -12.000 0.000 NA   NA
 332544 332545 TW311 TW312     FALSE 0.352 205.000 0.213 NA   NA
 332545 332546 TW312 TW313   fabG TRUE 0.731 4.000 0.000 1.000 N NA
 332546 332547 TW313 TW314 fabG rpmE FALSE 0.128 142.000 0.000 1.000 N NA
 332547 400405 TW314 TWTRNA22 rpmE tRNA-Leu FALSE 0.247 48.000 0.000 NA   NA
 400405 332548 TWTRNA22 TW315 tRNA-Leu   FALSE 0.096 75.000 0.000 NA   NA
 332548 332549 TW315 TW316   cysS2 TRUE 0.710 54.000 0.071 1.000 N NA
 332551 332552 TW318 TW319     TRUE 0.602 18.000 0.000 1.000   NA
 332552 332553 TW319 TW320   tatC FALSE 0.047 252.000 0.000 NA   NA
 332553 332554 TW320 TW321 tatC   FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332555 332556 TW322 TW323     FALSE 0.049 162.000 0.000 NA   NA
 332556 332557 TW323 TW324     FALSE 0.075 89.000 0.000 NA   NA
 332557 332558 TW324 TW325     FALSE 0.441 -6.000 0.000 NA   NA
 332560 332561 TW327 TW328 dacB   FALSE 0.176 56.000 0.000 NA   NA
 332561 332562 TW328 TW329     TRUE 0.972 26.000 0.800 NA Y NA
 332562 332563 TW329 TW330     TRUE 0.884 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 332566 332567 TW333 TW334     TRUE 0.675 25.000 0.021 NA   NA
 332567 332568 TW334 TW335     FALSE 0.135 133.000 0.000 1.000 N NA
 332568 332569 TW335 TW336     TRUE 0.567 25.000 0.000 1.000   NA
 332569 332570 TW336 TW337     TRUE 0.975 -13.000 0.266 0.003   NA
 332573 332574 TW340 TW341 tkt tal TRUE 0.925 -28.000 0.013 1.000 Y NA
 332574 332575 TW341 TW342 tal gpi TRUE 0.918 5.000 0.005 1.000 Y NA
 332575 332576 TW342 TW343 gpi zwf TRUE 0.908 43.000 0.061 1.000 Y NA
 332577 400437 TW344 TWTRNA24   tRNA-Thr FALSE 0.281 44.000 0.000 NA   NA
 400437 332578 TWTRNA24 TW345 tRNA-Thr   FALSE 0.271 45.000 0.000 NA   NA
 332578 332579 TW345 TW346     FALSE 0.096 115.000 0.000 NA N NA
 332579 332580 TW346 TW347   cysS1 TRUE 0.958 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 332580 332581 TW347 TW348 cysS1 ispDF FALSE 0.270 85.000 0.007 1.000 N NA
 332581 332582 TW348 TW349 ispDF   TRUE 0.913 7.000 0.068 1.000 N NA
 332585 332586 TW352 TW353 phoT pstA TRUE 0.991 -25.000 0.373 0.007 Y NA
 332586 332587 TW353 TW354 pstA pstC TRUE 0.924 67.000 0.172 0.007 Y NA
 332587 332588 TW354 TW355 pstC phoS TRUE 0.924 83.000 0.529 0.007 Y NA
 332590 332591 TW357 TW358 rpe fmt FALSE 0.119 300.000 0.000 1.000 N NA
 332591 332592 TW358 TW359 fmt   TRUE 0.782 -55.000 0.012 NA N NA
 332592 332593 TW359 TW360   metK TRUE 0.882 1.000 0.068 NA N NA
 332593 332594 TW360 TW361 metK dfp TRUE 0.954 10.000 0.059 1.000 Y NA
 332594 332595 TW361 TW362 dfp rpoZ TRUE 0.927 -3.000 0.192 1.000 N NA
 332595 332596 TW362 TW363 rpoZ gmk TRUE 0.682 84.000 0.471 1.000 N NA
 332596 332597 TW363 TW364 gmk pyrF TRUE 0.746 19.000 0.013 1.000   NA
 332597 332598 TW364 TW365 pyrF carB TRUE 0.877 -3.000 0.075 1.000   NA
 332598 332599 TW365 TW366 carB carA TRUE 0.991 -13.000 0.345 0.003 Y NA
 332599 332600 TW366 TW367 carA pyrC TRUE 0.938 42.000 0.155 1.000 Y NA
 332600 332601 TW367 TW368 pyrC efp TRUE 0.695 13.000 0.000 1.000 N NA
 332601 332602 TW368 TW369 efp aroD TRUE 0.757 25.000 0.010 1.000 N NA
 332602 332603 TW369 TW370 aroD aroB TRUE 0.930 45.000 0.014 0.007 Y NA
 332603 332604 TW370 TW371 aroB aroK TRUE 0.623 60.000 0.000 1.000 Y NA
 332604 332605 TW371 TW372 aroK aroF TRUE 0.862 22.000 0.000 1.000 Y NA
 332605 332606 TW372 TW373 aroF aroE TRUE 0.488 121.000 0.021 1.000 Y NA
 332606 332607 TW373 TW374 aroE   TRUE 0.825 1.000 0.045 NA   NA
 332607 332608 TW374 TW375     TRUE 0.783 -3.000 0.039 NA   NA
 332608 332609 TW375 TW376   alaS TRUE 0.884 31.000 0.103 1.000 N NA
 332609 332610 TW376 TW377 alaS   FALSE 0.443 17.000 0.000 NA   NA
 332610 332611 TW377 TWT378   rpsD TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 332612 332613 TW379 TW380     FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 332614 332615 TW381 TW382 holA   FALSE 0.305 61.000 0.002 1.000   NA
 332615 332616 TW382 TW383     TRUE 0.578 -3.000 0.004 NA   NA
 332616 332617 TW383 TW384   comEA TRUE 0.870 -3.000 0.130 NA   NA
 332617 332618 TW384 TW385 comEA leuS FALSE 0.283 82.000 0.008 1.000 N NA
 332618 332619 TW385 TW386 leuS trpE TRUE 0.550 41.000 0.000 1.000 N NA
 332620 332621 TW387 TW388     FALSE 0.394 27.000 0.000 NA   NA
 332621 332622 TW388 TW389     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332622 400407 TW389 TWTRNA26   tRNA-Gly FALSE 0.058 125.000 0.000 NA   NA
 400407 400408 TWTRNA26 TWTRNA27 tRNA-Gly tRNA-Cys FALSE 0.271 45.000 0.000 NA   NA
 400408 400409 TWTRNA27 TWTRNA28 tRNA-Cys tRNA-Val FALSE 0.446 16.000 0.000 NA   NA
 400409 400410 TWTRNA28 TWTRNA29 tRNA-Val tRNA-Val FALSE 0.247 48.000 0.000 NA   NA
 400410 332623 TWTRNA29 TW390 tRNA-Val sseA FALSE 0.047 203.000 0.000 NA   NA
 332623 332624 TW390 TW391 sseA   TRUE 0.512 99.000 0.351 NA   NA
 332624 332625 TW391 TW392   ribD TRUE 0.737 -3.000 0.027 NA   NA
 332625 332626 TW392 TW393 ribD   TRUE 0.778 -52.000 0.025 NA   NA
 332626 332627 TW393 TW394   rnd TRUE 0.879 -19.000 0.115 NA   NA
 332627 332628 TW394 TW395 rnd dps FALSE 0.166 100.000 0.000 1.000 N NA
 332629 332630 TW396 TW397   rpi TRUE 0.935 28.000 0.398 1.000 N NA
 332630 332631 TW397 TW398 rpi   TRUE 0.908 2.000 0.182 NA   NA
 332633 332634 TW400 TW401     TRUE 0.786 0.000 0.031 NA   NA
 332634 332635 TW401 TW402     TRUE 0.619 7.000 0.004 NA   NA
 332635 332636 TW402 TW403   ssb FALSE 0.053 137.000 0.000 NA   NA
 332638 400436 TW405 TWTRNA30 nadE tRNA-His TRUE 0.498 -41.000 0.000 NA   NA
 400436 332639 TWTRNA30 TW406 tRNA-His orn FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 332640 332641 TW407 TW408     TRUE 0.938 -9.000 0.372 1.000   NA
 332641 332642 TW408 TW409     FALSE 0.119 68.000 0.000 NA   NA
 332644 332645 TW411 TW412 gatB gatA TRUE 0.991 -3.000 0.492 0.004 Y NA
 332645 332646 TW412 TW413 gatA gatC TRUE 0.995 -103.000 0.643 0.004 Y NA
 332646 332647 TW413 TW414 gatC ligA FALSE 0.250 139.000 0.024 1.000 N NA
 332647 332648 TW414 TW415 ligA trmU TRUE 0.789 -31.000 0.005 1.000 N NA
 332648 332649 TW415 TW416 trmU   TRUE 0.898 23.000 0.094 1.000 N NA
 332649 332650 TW416 TW417     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332651 332652 TW418 TW419     TRUE 0.896 -106.000 0.077 NA   NA
 332653 332654 TW420 TW421   gpsI TRUE 0.629 28.000 0.000 1.000 N NA
 332654 332655 TW421 TWT422 gpsI rpsO TRUE 0.871 36.000 0.011 1.000 Y NA
 332655 332656 TWT422 TW423 rpsO atpC FALSE 0.119 172.000 0.000 1.000 N NA
 332656 332657 TW423 TW424 atpC atpD TRUE 0.963 2.000 0.003 0.011 Y NA
 332657 332658 TW424 TW425 atpD atpG TRUE 0.985 40.000 0.724 0.011 Y NA
 332658 332659 TW425 TWT426 atpG atpA TRUE 0.992 20.000 0.846 0.011 Y NA
 332659 332660 TWT426 TW427 atpA atpH TRUE 0.993 11.000 0.864 0.011 Y NA
 332660 332661 TW427 TW428 atpH atpF TRUE 0.987 -205.000 0.067 0.011 Y NA
 332661 332662 TW428 TW429 atpF atpE TRUE 0.952 22.000 0.121 0.011   NA
 332662 332663 TW429 TW430 atpE atpB TRUE 0.954 44.000 0.628 0.011   NA
 332663 332664 TW430 TW431 atpB   TRUE 0.696 1.000 0.011 NA   NA
 332664 332665 TW431 TW432   rfe TRUE 0.787 41.000 0.105 NA   NA
 332665 332666 TW432 TW433 rfe   TRUE 0.828 47.000 0.248 NA N NA
 332666 332667 TW433 TW434   hemK TRUE 0.932 49.000 0.583 NA Y NA
 332667 332668 TW434 TW435 hemK prfA TRUE 0.963 4.000 0.069 1.000 Y NA
 332668 332669 TW435 TW436 prfA rho FALSE 0.218 76.000 0.000 1.000 N NA
 332669 332670 TW436 TW437 rho thrB FALSE 0.244 71.000 0.000 1.000 N NA
 332670 332671 TW437 TW438 thrB thrC TRUE 0.948 41.000 0.221 1.000 Y NA
 332671 332672 TW438 TW439 thrC thrA TRUE 0.974 7.000 0.194 1.000 Y NA
 332676 332677 TW443 TW444   xthA FALSE 0.433 19.000 0.000 NA   NA
 332677 332678 TW444 TW445 xthA cdsA FALSE 0.103 130.000 0.000 1.000   NA
 332678 332679 TW445 TW446 cdsA frr TRUE 0.832 36.000 0.076 1.000   NA
 332679 332680 TW446 TW447 frr pyrH TRUE 0.575 164.000 0.626 1.000 N NA
 332680 332681 TW447 TW448 pyrH tsf TRUE 0.953 11.000 0.416 1.000 N NA
 332681 332682 TW448 TWT449 tsf rpsB TRUE 0.974 31.000 0.748 1.000 Y NA
 332684 332685 TW451 TW452   xerC FALSE 0.092 152.000 0.000 1.000   NA
 332685 332686 TW452 TW453 xerC smf TRUE 0.950 7.000 0.037 1.000 Y NA
 332686 332687 TW453 TW454 smf comM TRUE 0.740 18.000 0.003 1.000 N NA
 332687 332688 TW454 TW455 comM   TRUE 0.740 -3.000 0.004 1.000 N NA
 332688 332689 TW455 TW456   lepB FALSE 0.118 229.000 0.000 1.000 N NA
 332689 332690 TW456 TW457 lepB rplS TRUE 0.677 -3.000 0.000 1.000 N NA
 332690 332691 TW457 TW458 rplS trmD TRUE 0.817 93.000 0.567 1.000 Y NA
 332691 332692 TW458 TW459 trmD rimM TRUE 0.972 33.000 0.672 1.000 Y NA
 332692 332693 TW459 TW460 rimM   TRUE 0.696 0.000 0.002 1.000   NA
 332693 332694 TW460 TW461   rpsP TRUE 0.706 -3.000 0.006 1.000   NA
 332694 332695 TW461 TW462 rpsP ffh TRUE 0.519 218.000 0.361 1.000 N NA
 332696 332697 TW463 TWT464 lipB lipA TRUE 0.990 19.000 0.319 0.003 Y NA
 332697 332698 TWT464 TW465 lipA ogt TRUE 0.726 2.000 0.000 1.000 N NA
 332699 332700 TW466 TW467     FALSE 0.439 18.000 0.000 NA   NA
 332700 400435 TW467 TWTRNA32   tRNA-Ala FALSE 0.048 175.000 0.000 NA   NA
 400435 332701 TWTRNA32 TW468 tRNA-Ala   FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 332701 332702 TW468 TW469   nadD FALSE 0.444 -7.000 0.000 NA   NA
 332702 332703 TW469 TW470 nadD   FALSE 0.471 -22.000 0.000 NA   NA
 332703 332704 TW470 TW471   obg FALSE 0.130 66.000 0.000 NA   NA
 332704 332705 TW471 TW472 obg rpmA TRUE 0.940 0.000 0.335 1.000   NA
 332705 332706 TW472 TWT473 rpmA rplU TRUE 0.981 41.000 0.667 0.053 Y NA
 332706 332707 TWT473 TW474 rplU rng TRUE 0.689 124.000 0.027 0.033 Y NA
 332707 332708 TW474 TW475 rng ndkA FALSE 0.118 218.000 0.000 1.000 N NA
 332708 332709 TW475 TW476 ndkA folC FALSE 0.166 399.000 0.004 1.000 N NA
 332709 332710 TW476 TW477 folC ileS FALSE 0.378 86.000 0.031 1.000 N NA
 332712 332713 TW479 TW480 clpX clpP2 TRUE 0.947 10.000 0.039 1.000 Y NA
 332713 332714 TW480 TW481 clpP2 clpP1 TRUE 0.993 12.000 0.512 0.003 Y NA
 332714 332715 TW481 TW482 clpP1   FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332715 332716 TW482 TW483   tig FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332716 400434 TW483 TWTRNA33 tig tRNA-Pro FALSE 0.200 52.000 0.000 NA   NA
 400434 332717 TWTRNA33 TW484 tRNA-Pro   FALSE 0.052 580.000 0.000 NA   NA
 332717 332718 TW484 TW485     FALSE 0.385 28.000 0.000 NA   NA
 332718 332719 TW485 TW486     TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 332719 332720 TW486 TW487   dut TRUE 0.886 -55.000 0.078 NA   NA
 332723 332724 TW490 TW491   gyrA2 FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332725 400433 TW492 TWTRNA34 gnd tRNA-Ala FALSE 0.333 37.000 0.000 NA   NA
 332728 332729 TW495 TW496   alr TRUE 0.737 50.000 0.000 0.003   NA
 332730 332731 TW497 TW498 cobQ   TRUE 0.953 -9.000 0.796 1.000   NA
 332731 332732 TW498 TW499   rpoD TRUE 0.839 2.000 0.015 1.000 N NA
 332733 332734 TW500 TW501 glyQS pepB TRUE 0.674 19.000 0.000 1.000 N NA
 332734 332735 TW501 TW502 pepB lpd TRUE 0.959 7.000 0.095 0.071 N NA
 332735 332736 TW502 TW503 lpd sucB TRUE 0.725 154.000 0.379 1.000 Y NA
 332736 332737 TW503 TW504 sucB   FALSE 0.451 -12.000 0.000 NA   NA
 332738 332739 TW505 TW506 ddlA gpsA TRUE 0.708 0.000 0.000 1.000 N NA
 332739 332740 TW506 TW507 gpsA   TRUE 0.859 -67.000 0.019 1.000 N NA
 332740 332741 TW507 TW508   murA TRUE 0.854 -3.000 0.036 1.000 N NA
 332741 332742 TW508 TW509 murA   TRUE 0.501 45.000 0.000 1.000 N NA
 332742 400432 TW509 TWTRNA35   tRNA-Glu FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 400432 332743 TWTRNA35 TW510 tRNA-Glu dnaE FALSE 0.200 52.000 0.000 NA   NA
 332743 332744 TW510 TW511 dnaE   TRUE 0.827 10.000 0.014 1.000 N NA
 332744 332745 TW511 TW512   lpsA FALSE 0.203 81.000 0.000 1.000 N NA
 332745 332746 TW512 TW513 lpsA   FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332746 332747 TW513 TW514     FALSE 0.368 31.000 0.000 NA   NA
 332747 332748 TW514 TW515   ftsZ FALSE 0.137 117.000 0.012 NA   NA
 332752 332753 TW519 TW520     TRUE 0.963 -3.000 0.008 0.005 Y NA
 332753 332754 TW520 TW521     FALSE 0.049 338.000 0.000 NA   NA
 332755 332756 TW522 TW523 pepQ mgtE TRUE 0.630 -21.000 0.000 1.000   NA
 332756 332757 TW523 TW524 mgtE   TRUE 0.865 -100.000 0.056 NA   NA
 332757 332758 TW524 TW525   mrp TRUE 0.938 -46.000 0.389 NA   NA
 332759 332760 TW526 TW527 truA rplQ TRUE 0.974 -118.000 0.102 1.000 Y NA
 332760 332761 TW527 TW528 rplQ rpoA TRUE 0.963 16.000 0.873 1.000 N NA
 332761 332762 TW528 TW529 rpoA rpsK TRUE 0.939 19.000 0.308 1.000 N NA
 332762 332763 TW529 TW530 rpsK rpsM TRUE 0.992 4.000 0.810 0.052 Y NA
 332763 332764 TW530 TW531 rpsM rpmJ TRUE 0.940 35.000 0.194 0.052   NA
 332764 332765 TW531 TW532 rpmJ infA TRUE 0.938 3.000 0.257 1.000   NA
 332765 332766 TW532 TW533 infA   FALSE 0.253 70.000 0.000 1.000 N NA
 332766 332767 TW533 TW534   adk TRUE 0.728 3.000 0.000 1.000 N NA
 332767 332768 TW534 TW535 adk secY TRUE 0.708 0.000 0.000 1.000 N NA
 332768 332769 TW535 TW536 secY rplO TRUE 0.953 22.000 0.730 1.000 N NA
 332769 332770 TW536 TW537 rplO rpmD TRUE 0.991 -3.000 0.653 0.009 Y NA
 332770 332771 TW537 TW538 rpmD rpsE TRUE 0.991 -28.000 0.789 0.070 Y NA
 332771 332772 TW538 TW539 rpsE rplR TRUE 0.989 -3.000 0.814 0.070 Y NA
 332772 332773 TW539 TWT540 rplR rplF TRUE 0.990 -3.000 0.815 0.052 Y NA
 332773 332774 TWT540 TW541 rplF rpsH TRUE 0.992 3.000 0.808 0.052 Y NA
 332774 332775 TW541 TW542 rpsH rplE TRUE 0.965 30.000 0.059 0.052 Y NA
 332775 332776 TW542 TW543 rplE rplX TRUE 0.990 -3.000 0.758 0.052 Y NA
 332776 332777 TW543 TW544 rplX rplN TRUE 0.992 3.000 0.810 0.070 Y NA
 332777 332778 TW544 TW545 rplN rpsQ TRUE 0.898 98.000 0.791 0.070 Y NA
 332778 332779 TW545 TW546 rpsQ rpmC TRUE 0.990 -3.000 0.828 0.052 Y NA
 332779 332780 TW546 TW547 rpmC rplP TRUE 0.992 -37.000 0.802 0.052 Y NA
 332780 332781 TW547 TW548 rplP rpsC TRUE 0.990 -3.000 0.828 0.070 Y NA
 332781 332782 TW548 TW549 rpsC rplV TRUE 0.944 3.000 0.000 0.070 Y NA
 332782 332783 TW549 TW550 rplV rpsS TRUE 0.939 0.000 0.000 0.070 Y NA
 332783 332784 TW550 TW551 rpsS rplB TRUE 0.994 -148.000 0.820 0.070 Y NA
 332784 332785 TW551 TW552 rplB rplW TRUE 0.993 8.000 0.849 0.032 Y NA
 332785 332786 TW552 TW553 rplW rplD TRUE 0.988 -3.000 0.513 0.052 Y NA
 332786 332787 TW553 TW554 rplD rplC TRUE 0.987 -10.000 0.361 0.052 Y NA
 332787 332788 TW554 TW555 rplC rpsJ TRUE 0.989 10.000 0.467 0.070 Y NA
 332788 332789 TW555 TW556 rpsJ ftsY FALSE 0.122 160.000 0.000 1.000 N NA
 332789 332790 TW556 TW557 ftsY   FALSE 0.120 167.000 0.000 1.000 N NA
 332790 332791 TW557 TW558     TRUE 0.992 7.000 0.652 0.022 Y NA
 332791 332792 TW558 TW559     TRUE 0.984 -28.000 0.800 1.000 Y NA
 332792 332793 TW559 TW560     TRUE 0.988 -3.000 0.361 0.019 Y NA
 332793 332794 TW560 TW561     TRUE 0.881 57.000 0.180 1.000 Y NA
 332794 332795 TW561 TW562   rnc FALSE 0.253 70.000 0.000 1.000 N NA
 332795 332796 TW562 TW563 rnc rpmF TRUE 0.866 1.000 0.044 1.000   NA
 332798 332799 TW565 TW566   recG FALSE 0.181 121.000 0.002 1.000 N NA
 332800 332801 TW567 TW568 aroA   FALSE 0.052 591.000 0.000 NA   NA
 332802 332803 TW569 TW570     FALSE 0.057 128.000 0.000 NA   NA
 332805 332806 TW572 TW573     TRUE 0.501 5.000 0.000 NA   NA
 332806 332807 TW573 TW574     FALSE 0.210 51.000 0.000 NA   NA
 332807 332808 TW574 TW575   fdx TRUE 0.488 -34.000 0.000 NA   NA
 332808 332809 TW575 TW576 fdx   FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 332809 332810 TW576 TW577     FALSE 0.077 88.000 0.000 NA   NA
 332812 332813 TW579 TW580     FALSE 0.180 55.000 0.000 NA   NA
 332813 332814 TW580 TW581   ribF FALSE 0.049 357.000 0.000 NA   NA
 332814 332815 TW581 TW582 ribF ung TRUE 0.603 33.000 0.000 1.000 N NA
 332815 332816 TW582 TW583 ung   TRUE 0.496 7.000 0.000 NA   NA
 332816 332817 TW583 TW584     TRUE 0.542 -91.000 0.000 NA   NA
 332817 332818 TW584 TW585     FALSE 0.049 159.000 0.000 NA   NA
 332818 332819 TW585 TW586   folPXK TRUE 0.551 -109.000 0.000 NA   NA
 332819 332820 TW586 TW587 folPXK folE TRUE 0.814 37.000 0.000 1.000 Y NA
 332820 332821 TW587 TW588 folE ftsH TRUE 0.691 14.000 0.000 1.000 N NA
 332821 332822 TW588 TW589 ftsH hpt TRUE 0.939 3.000 0.180 1.000 N NA
 332822 332823 TW589 TW590 hpt   TRUE 0.958 -43.000 0.137 0.069   NA
 332823 332824 TW590 TW591   gcp FALSE 0.104 1193.000 0.000 1.000   NA
 332824 332825 TW591 TW592 gcp   TRUE 0.926 0.000 0.009 0.003   NA
 332825 332826 TW592 TW593     TRUE 0.725 21.000 0.011 1.000   NA
 332826 332827 TW593 TW594     TRUE 0.509 -51.000 0.000 NA   NA
 332827 332828 TW594 TW595   typA TRUE 0.492 -37.000 0.000 NA   NA
 332828 332829 TW595 TW596 typA   FALSE 0.055 824.000 0.000 NA   NA
 332829 332830 TW596 TW597     FALSE 0.048 318.000 0.000 NA   NA
 332831 332832 TW598 TW599     FALSE 0.054 690.000 0.000 NA   NA
 332832 332833 TW599 TW600     FALSE 0.048 319.000 0.000 NA   NA
 332833 332834 TW600 TW601     TRUE 0.987 -19.000 0.149 0.006 Y NA
 400413 400414 TWTRNA36 TWTRNA37 tRNA-Glu tRNA-Asp FALSE 0.477 10.000 0.000 NA   NA
 400414 400415 TWTRNA37 TWTRNA38 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.500 6.000 0.000 NA   NA
 332837 332838 TW604 TW605   ispE FALSE 0.368 31.000 0.000 NA   NA
 332838 400416 TW605 TWTRNA39 ispE tRNA-Gln TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 332839 332840 TW606 TW607 glmS   FALSE 0.047 224.000 0.000 NA   NA
 332840 332841 TW607 TW608     FALSE 0.052 600.000 0.000 NA   NA
 332841 332842 TW608 TW609   miaA FALSE 0.049 162.000 0.000 NA   NA
 332842 332843 TW609 TW610 miaA   TRUE 0.644 76.000 0.028 1.000 Y NA
 332843 332844 TW610 TW611   recA TRUE 0.746 15.000 0.003 1.000 N NA
 332844 332845 TW611 TW612 recA pgsA FALSE 0.120 165.000 0.000 1.000 N NA
 332845 332846 TW612 TW613 pgsA   FALSE 0.059 123.000 0.000 NA   NA
 332846 332847 TW613 TW614   ftsK FALSE 0.166 58.000 0.000 NA   NA
 332847 332848 TW614 TW615 ftsK   TRUE 0.847 -3.000 0.052 1.000   NA
 332848 332849 TW615 TW616   thyX FALSE 0.102 131.000 0.000 1.000   NA
 332849 332850 TW616 TW617 thyX   FALSE 0.190 53.000 0.000 NA   NA
 400417 332853 TWTRNA40 TW620 tRNA-Leu   FALSE 0.053 671.000 0.000 NA   NA
 332854 332855 TW621 TW622   rph TRUE 0.925 26.000 0.262 1.000 N NA
 332856 400418 TW623 TWTRNA41   tRNA-Glu FALSE 0.467 -20.000 0.000 NA   NA
 400418 400419 TWTRNA41 TWTRNA42 tRNA-Glu tRNA-Phe TRUE 0.500 6.000 0.000 NA   NA
 332857 332858 TW624 TW625     FALSE 0.093 146.000 0.000 1.000   NA
 332858 400431 TW625 TWTRNA43   tRNA-Met FALSE 0.053 138.000 0.000 NA   NA
 400431 332859 TWTRNA43 TW626 tRNA-Met   FALSE 0.320 40.000 0.000 NA   NA
 332859 332860 TW626 TW627     TRUE 0.937 -157.000 0.021 0.047   NA
 332860 332861 TW627 TW628     TRUE 0.516 34.000 0.000 1.000   NA
 332861 332862 TW628 TW629     FALSE 0.470 48.000 0.000 1.000 N NA
 332862 332863 TW629 TW630   pca TRUE 0.965 5.000 0.014 0.067 Y NA
 332865 332866 TW632 TW633   gabT FALSE 0.129 593.000 0.000 1.000 N NA
 332866 332867 TW633 TW634 gabT folD TRUE 0.721 1.000 0.000 1.000 N NA
 332867 332868 TW634 TW635 folD glyA FALSE 0.119 173.000 0.000 1.000 N NA
 332868 332869 TW635 TW636 glyA   FALSE 0.238 73.000 0.000 1.000 N NA
 332869 332870 TW636 TW637   gcvH FALSE 0.131 629.000 0.000 1.000 N NA
 332870 332871 TW637 TW638 gcvH gcvT TRUE 0.929 56.000 0.056 0.004 Y NA
 332871 332872 TW638 TW639 gcvT   FALSE 0.119 287.000 0.000 1.000 N NA
 332874 332875 TW641 TW642   ispH1 FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332876 332877 TW643 TW644 xseA xseB TRUE 0.979 49.000 0.412 0.002 Y NA
 332878 332879 TW645 TW646   kdgK FALSE 0.306 308.000 0.000 1.000 Y NA
 332879 332880 TW646 TW647 kdgK araD TRUE 0.945 -7.000 0.049 1.000 Y NA
 332880 332881 TW647 TW648 araD sgaU TRUE 0.929 -6.000 0.049 NA Y NA
 332881 332882 TW648 TW649 sgaU   TRUE 0.964 26.000 0.400 NA Y NA
 332882 332883 TW649 TW650   php TRUE 0.962 0.000 1.000 1.000   NA
 332883 332884 TW650 TW651 php pth FALSE 0.091 364.000 0.000 1.000   NA
 332886 332887 TW653 TWT654   rplY FALSE 0.069 100.000 0.000 NA   NA
 332887 332888 TWT654 TW655 rplY gpm FALSE 0.130 140.000 0.000 1.000 N NA
 332888 332889 TW655 TW656 gpm   FALSE 0.406 46.000 0.000 1.000   NA
 332889 332890 TW656 TW657     FALSE 0.142 63.000 0.000 NA   NA
 332890 332891 TW657 TW658     TRUE 0.507 -48.000 0.000 NA   NA
 332892 332893 TW659 TW660     FALSE 0.388 48.000 0.000 1.000   NA
 332894 332895 TW661 TW662 mscL   FALSE 0.118 186.000 0.000 1.000 N NA
 332895 332896 TW662 TW663     TRUE 0.981 22.000 0.894 1.000 Y NA
 332896 332897 TW663 TW664     TRUE 0.869 81.000 0.857 1.000 Y NA
 332897 332898 TW664 TW665     FALSE 0.056 938.000 0.000 NA   NA
 332901 332902 TW668 TW669     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332903 332904 TW670 TW671     FALSE 0.457 13.000 0.000 NA   NA
 332906 332907 TW673 TW674     TRUE 0.501 5.000 0.000 NA   NA
 332908 332909 TW675 TW676 fusA rpsG TRUE 0.968 36.000 0.579 1.000 Y NA
 332909 332910 TW676 TW677 rpsG rpsL TRUE 0.992 0.000 0.620 0.010 Y NA
 332910 332911 TW677 TW678 rpsL   TRUE 0.513 -52.000 0.000 NA   NA
 332912 332913 TW679 TW680   greA TRUE 0.496 -40.000 0.000 NA   NA
 332914 332915 TW681 TW682 ilvA nrdB TRUE 0.704 11.000 0.000 1.000 N NA
 332915 332916 TW682 TW683 nrdB nrdA TRUE 0.851 96.000 0.064 0.002 Y NA
 332917 332918 TW684 TW685     FALSE 0.087 185.000 0.000 1.000   NA
 332918 332919 TW685 TW686   trpS TRUE 0.834 -10.000 0.026 1.000 N NA
 332919 332920 TW686 TW687 trpS ribG TRUE 0.714 -28.000 0.000 1.000 N NA
 332920 332921 TW687 TW688 ribG ribC TRUE 0.982 4.000 0.456 1.000 Y NA
 332921 332922 TW688 TW689 ribC   TRUE 0.904 27.000 0.016 1.000 Y NA
 332922 332923 TW689 TW690     TRUE 0.960 17.000 0.000 0.002 Y NA
 332923 332924 TW690 TW691   ribH TRUE 0.973 24.000 0.041 0.007 Y NA
 332925 400429 TW692 TWTRNA45 pncA tRNA-Thr FALSE 0.065 105.000 0.000 NA   NA
 400429 332926 TWTRNA45 TW693 tRNA-Thr   FALSE 0.050 150.000 0.000 NA   NA
 332926 332927 TW693 TW694     FALSE 0.323 141.000 0.130 NA   NA
 332927 332928 TW694 TW695   tmk FALSE 0.282 165.000 0.037 1.000 N NA
 332928 332929 TW695 TW696 tmk topA TRUE 0.505 60.000 0.015 1.000 N NA
 332929 332930 TW696 TW697 topA   FALSE 0.151 61.000 0.000 NA   NA
 332930 332931 TW697 TW698     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 332931 332932 TW698 TW699     FALSE 0.474 -25.000 0.000 NA   NA
 332932 332933 TW699 TW700     FALSE 0.385 28.000 0.000 NA   NA
 332933 332934 TW700 TW701     TRUE 0.621 -15.000 0.000 1.000   NA
 332934 332935 TW701 TW702     FALSE 0.235 60.000 0.000 NA N NA
 332935 332936 TW702 TW703     FALSE 0.404 179.000 0.340 NA   NA
 332936 332937 TW703 TW704     FALSE 0.441 -6.000 0.000 NA   NA
 332938 332939 TW705 TW706 ponA   FALSE 0.120 104.000 0.000 1.000   NA
 332939 400420 TW706 TWTRNA46   tRNA-Pro FALSE 0.047 208.000 0.000 NA   NA
 332940 332941 TW707 TW708 asd ask TRUE 0.961 -3.000 0.119 1.000 Y NA
 332941 332942 TW708 TW709 ask recR FALSE 0.184 196.000 0.010 1.000 N NA
 332942 332943 TW709 TW710 recR dnaZX TRUE 0.975 9.000 0.028 0.013 Y NA
 332943 332944 TW710 TW711 dnaZX rplL FALSE 0.118 234.000 0.000 1.000 N NA
 332944 332945 TW711 TW712 rplL rplJ TRUE 0.991 -3.000 0.884 0.048 Y NA
 332945 332946 TW712 TW713 rplJ rplA TRUE 0.824 135.000 0.302 0.065 Y NA
 332946 332947 TW713 TW714 rplA rplK TRUE 0.990 -3.000 0.838 0.065 Y NA
 332947 332948 TW714 TW715 rplK nusG TRUE 0.934 37.000 0.681 1.000 N NA
 332948 332949 TW715 TW716 nusG   TRUE 0.960 -22.000 0.843 1.000   NA
 332949 400428 TW716 TWTRNA47   tRNA-Trp TRUE 0.495 2.000 0.000 NA   NA
 332951 332952 TW718 TW719 murB   FALSE 0.385 28.000 0.000 NA   NA
 332952 332953 TW719 TW720     FALSE 0.096 75.000 0.000 NA   NA
 332953 332954 TW720 TW721     FALSE 0.351 146.000 0.185 NA   NA
 332956 332957 TW723 TW724 purF purM TRUE 0.721 57.000 0.010 1.000 Y NA
 332958 332959 TW725 TW726 purD serS FALSE 0.153 111.000 0.000 1.000 N NA
 332959 332960 TW726 TW727 serS   TRUE 0.874 23.000 0.084 1.000   NA
 332960 400421 TW727 TWTRNA48   tRNA-Ser FALSE 0.247 48.000 0.000 NA   NA
 400421 332961 TWTRNA48 TW728 tRNA-Ser   FALSE 0.100 74.000 0.000 NA   NA
 332961 400422 TW728 TWTRNA49   tRNA-Ser FALSE 0.408 24.000 0.000 NA   NA
 400422 400423 TWTRNA49 TWTRNA50 tRNA-Ser tRNA-Arg FALSE 0.404 25.000 0.000 NA   NA
 332962 332963 TW729 TW730 hemL hemB TRUE 0.985 4.000 0.067 0.006 Y NA
 332963 332964 TW730 TW731 hemB   TRUE 0.985 2.000 0.071 0.006 Y NA
 332964 332965 TW731 TW732   hemC TRUE 0.987 -3.000 0.205 0.006 Y NA
 332965 332966 TW732 TW733 hemC hemZ TRUE 0.926 11.000 0.015 1.000 Y NA
 332966 332967 TW733 TW734 hemZ   TRUE 0.766 -3.000 0.034 NA   NA
 332967 332968 TW734 TW735   hemE FALSE 0.105 131.000 0.006 NA   NA
 332969 332970 TW736 TW737 hemA menC TRUE 0.901 -51.000 0.000 1.000 Y NA
 332970 332971 TW737 TW738 menC dnaC TRUE 0.695 13.000 0.000 1.000 N NA
 332971 332972 TW738 TW739 dnaC   FALSE 0.439 18.000 0.000 NA   NA
 332972 332973 TW739 TW740     FALSE 0.326 39.000 0.000 NA   NA
 332973 332974 TW740 TW741     FALSE 0.344 36.000 0.000 NA   NA
 332974 332975 TW741 TW742     FALSE 0.166 58.000 0.000 NA   NA
 332978 332979 TW745 TW746   clpB TRUE 0.609 -9.000 0.000 1.000   NA
 332979 332980 TW746 TW747 clpB hspR TRUE 0.709 -25.000 0.000 1.000 N NA
 332980 332981 TW747 TW748 hspR cbpA TRUE 0.948 9.000 0.286 1.000 N NA
 332981 332982 TW748 TW749 cbpA grpE TRUE 0.988 -25.000 0.248 0.010 Y NA
 332982 332983 TW749 TW750 grpE dnaK TRUE 0.977 25.000 0.074 0.010 Y NA
 332984 332985 TW751 TW752   proC FALSE 0.152 114.000 0.000 1.000 N NA
 332985 332986 TW752 TW753 proC   FALSE 0.047 216.000 0.000 NA   NA
 332988 332989 TW755 TW756   cycY TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA N NA
 332989 332990 TW756 TW757 cycY ccsA FALSE 0.302 225.000 0.000 1.000 Y NA
 332990 332991 TW757 TW758 ccsA   TRUE 0.843 -13.000 0.000 NA Y NA
 332991 332992 TW758 TW759   ccsB TRUE 0.969 7.000 0.213 NA Y NA
 332993 332994 TW760 TW761     FALSE 0.056 938.000 0.000 NA   NA
 332995 332996 TW762 TW763   metS FALSE 0.051 406.000 0.000 NA   NA
 332997 332998 TW764 TW765     FALSE 0.078 86.000 0.000 NA   NA
 332998 332999 TW765 TW766     FALSE 0.047 233.000 0.000 NA   NA
 332999 333000 TW766 TW767     FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 333000 333001 TW767 TW768     FALSE 0.457 13.000 0.000 NA   NA
 333001 333002 TW768 TW769     FALSE 0.072 94.000 0.000 NA   NA
 333003 400424 TW770 TWTRNA51   tRNA-Ser FALSE 0.119 68.000 0.000 NA   NA
 400424 333004 TWTRNA51 TW771 tRNA-Ser   FALSE 0.058 126.000 0.000 NA   NA
 333005 333006 TW772 TW773     FALSE 0.487 9.000 0.000 NA   NA
 333006 333007 TW773 TW774     TRUE 0.501 4.000 0.000 NA   NA
 333007 333008 TW774 TW775   ftsW FALSE 0.048 163.000 0.000 NA   NA
 333008 333009 TW775 TW776 ftsW pbpA TRUE 0.884 43.000 0.250 1.000 N NA
 333009 333010 TW776 TW777 pbpA pknA TRUE 0.963 4.000 0.574 1.000 N NA
 333010 333011 TW777 TW778 pknA   TRUE 0.964 5.000 0.000 0.004 Y NA
 333011 333012 TW778 TW779     FALSE 0.091 78.000 0.000 NA   NA
 400426 333013 TWTRNA53 TW780 tRNA-Leu ndh FALSE 0.446 -9.000 0.000 NA   NA
 333013 333014 TW780 TW781 ndh   FALSE 0.087 80.000 0.000 NA   NA
 333014 333015 TW781 TW782     TRUE 0.898 -37.000 0.148 NA   NA
 333015 333016 TW782 TW783   eno TRUE 0.840 -33.000 0.028 1.000   NA
 333016 333017 TW783 TW784 eno   FALSE 0.151 61.000 0.000 NA   NA
 333017 333018 TW784 TW785   hisS FALSE 0.436 -3.000 0.000 NA   NA
 333018 333019 TW785 TW786 hisS nhaA TRUE 0.677 -3.000 0.000 1.000 N NA
 333019 333020 TW786 TW787 nhaA dcd TRUE 0.677 -3.000 0.000 1.000 N NA
 333021 333022 TW788 TW789 pdhC pdhB TRUE 0.991 18.000 0.860 0.038 Y NA
 333022 333023 TW789 TW790 pdhB pdhA TRUE 0.994 -3.000 0.917 0.003 Y NA
 333024 333025 TW791 TW792 purB purA TRUE 0.599 62.000 0.000 1.000 Y NA
 333025 333026 TW792 TW793 purA   FALSE 0.160 104.000 0.000 1.000 N NA
 333027 333028 TW794 TW795 purL purQ TRUE 0.880 421.000 0.346 0.003 Y NA
 333028 333029 TW795 TW796 purQ   TRUE 0.994 4.000 0.656 0.003 Y NA
 333032 333033 TW799 TW800   pcnA TRUE 0.619 13.000 0.000 1.000   NA
 333034 333035 TW801 TW802 parB parA1 TRUE 0.962 -10.000 0.827 1.000 N NA
 333035 333036 TW802 TW803 parA1 ctpA FALSE 0.118 189.000 0.000 1.000 N NA
 333036 333037 TW803 TW804 ctpA   FALSE 0.268 60.000 0.000 1.000   NA
 333037 333038 TW804 TW805     TRUE 0.623 -16.000 0.000 1.000   NA
 333038 333039 TW805 TW806     TRUE 0.533 -76.000 0.000 NA   NA
 333039 333040 TW806 TW807     TRUE 0.929 -7.000 0.540 NA   NA
 333040 333041 TW807 TW808   rpmH TRUE 0.954 13.000 0.787 1.000   NA