MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium perfringens ATCC 13124

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
2166304	2166305	CPF_0001	CPF_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.881	295.000	0.328	1.000	Y	NA
2166305	2166306	CPF_0002	CPF_0003	dnaN		TRUE	0.485	126.000	0.006	1.000		NA
2166306	2166307	CPF_0003	CPF_0004		recF	TRUE	0.628	56.000	0.006	1.000		NA
2166307	2166308	CPF_0004	CPF_0005	recF		TRUE	0.866	14.000	0.024	NA		NA
2166308	2166309	CPF_0005	CPF_0006		gyrB	FALSE	0.310	237.000	0.017	NA		NA
2166309	2166310	CPF_0006	CPF_0007	gyrB	gyrA	TRUE	0.990	22.000	0.306	0.003	Y	NA
2166310	1420708	CPF_0007	CPF_2998	gyrA	rrsA	FALSE	0.011	547.000	0.000	NA		NA
1420708	1420709	CPF_2998	CPF_2999	rrsA	rrlA	FALSE	0.078	181.000	0.000	NA		NA
1420709	1420710	CPF_2999	CPF_3000	rrlA	rrfA	FALSE	0.181	92.000	0.000	NA		NA
1420710	1420711	CPF_3000	CPF_0008	rrfA		TRUE	0.492	-4.000	0.000	NA		NA
1420711	1420712	CPF_0008	CPF_0009			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1420712	2166311	CPF_0009	CPF_0010			FALSE	0.043	273.000	0.000	NA		NA
2166311	2166312	CPF_0010	CPF_0011			FALSE	0.025	349.000	0.000	NA		NA
2166312	2166313	CPF_0011	CPF_0012			FALSE	0.041	243.000	0.000	1.000		NA
2166313	2166314	CPF_0012	CPF_0013			TRUE	0.968	13.000	0.370	NA		NA
2166314	2166315	CPF_0013	CPF_0014		serS	FALSE	0.024	352.000	0.000	NA		NA
2166315	2166316	CPF_0014	CPF_0015	serS		FALSE	0.081	177.000	0.000	NA		NA
2166316	1420719	CPF_0015	CPF_0016			FALSE	0.126	142.000	0.000	NA		NA
1420719	1420720	CPF_0016	CPF_0017			FALSE	0.327	34.000	0.000	NA		NA
1420720	2166317	CPF_0017	CPF_0018			FALSE	0.047	261.000	0.000	NA		NA
2166317	1420722	CPF_0018	CPF_0019			FALSE	0.173	109.000	0.000	NA		NA
1420722	1420723	CPF_0019	CPF_0020			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
2166321	2166322	CPF_0024	CPF_0025	addB	addA	TRUE	0.994	-10.000	0.408	0.007	Y	NA
1420734	2166328	CPF_0031	CPF_0032			FALSE	0.087	171.000	0.000	NA		NA
2166330	1420738	CPF_0034	CPF_0035			FALSE	0.245	55.000	0.000	NA		NA
1420738	2166331	CPF_0035	CPF_0036			FALSE	0.120	146.000	0.000	NA		NA
2166331	2166332	CPF_0036	CPF_0037			TRUE	0.811	3.000	0.005	1.000		NA
2166332	2166333	CPF_0037	CPF_0038			FALSE	0.200	78.000	0.000	NA		NA
2166333	2166334	CPF_0038	CPF_0039			FALSE	0.170	113.000	0.000	NA		NA
2166334	2166335	CPF_0039	CPF_0040			FALSE	0.100	161.000	0.000	NA		NA
2166337	2166338	CPF_0042	CPF_0043	plc		FALSE	0.075	188.000	0.000	NA		NA
2166338	2166339	CPF_0043	CPF_0044			TRUE	0.946	20.000	0.132	NA		NA
2166339	2166340	CPF_0044	CPF_0045			TRUE	0.965	3.000	0.227	NA		NA
2166340	2166341	CPF_0045	CPF_0046			TRUE	0.935	13.000	0.091	NA		NA
2166341	2166342	CPF_0046	CPF_0047		lgt	FALSE	0.045	266.000	0.000	NA		NA
2166342	1420751	CPF_0047	CPF_0048	lgt		FALSE	0.052	251.000	0.000	NA		NA
1420751	2166343	CPF_0048	CPF_0049			FALSE	0.016	433.000	0.000	NA		NA
2166343	2166344	CPF_0049	CPF_0050		brnQ	FALSE	0.016	440.000	0.000	NA		NA
2166346	2166347	CPF_0052	CPF_0053	dnaX		TRUE	0.812	112.000	0.100	NA		NA
2166347	2166348	CPF_0053	CPF_0054		recR	TRUE	0.919	98.000	0.604	NA		NA
2166348	2166349	CPF_0054	CPF_0055	recR		TRUE	0.509	226.000	0.071	NA		NA
2166349	2166350	CPF_0055	CPF_0056		bofA	TRUE	0.970	16.000	0.417	NA		NA
2166350	2166351	CPF_0056	CPF_0057	bofA		FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
2166351	2166352	CPF_0057	CPF_0058			FALSE	0.114	151.000	0.000	NA		NA
2166352	2166353	CPF_0058	CPF_0059			FALSE	0.212	69.000	0.000	NA		NA
2166353	2166354	CPF_0059	CPF_0060			FALSE	0.097	164.000	0.000	NA		NA
2166354	2166355	CPF_0060	CPF_0061			TRUE	0.963	69.000	0.110	0.068	Y	NA
2166355	2166356	CPF_0061	CPF_0062			TRUE	0.675	150.000	0.072	1.000		NA
2166358	2166359	CPF_0064	CPF_0065			FALSE	0.194	291.000	0.007	1.000	N	NA
2166359	2166360	CPF_0065	CPF_0066			FALSE	0.186	379.000	0.035	1.000	N	NA
2166360	2166361	CPF_0066	CPF_0067			FALSE	0.206	92.000	0.000	1.000	N	NA
2166361	1420771	CPF_0067	CPF_3001		rrsB	FALSE	0.011	548.000	0.000	NA		NA
1420771	1420772	CPF_3001	CPF_3002	rrsB	rrlB	FALSE	0.076	186.000	0.000	NA		NA
1420772	1420773	CPF_3002	CPF_3003	rrlB	rrfB	FALSE	0.270	49.000	0.000	NA		NA
1420773	1420774	CPF_3003	CPF_0068	rrfB		TRUE	0.492	-4.000	0.000	NA		NA
1420774	2166362	CPF_0068	CPF_0069			FALSE	0.030	321.000	0.000	NA		NA
1420779	1420780	CPF_3004	CPF_3005	rrsC	rrlC	FALSE	0.078	181.000	0.000	NA		NA
1420780	1420781	CPF_3005	CPF_3006	rrlC	rrfC	FALSE	0.270	49.000	0.000	NA		NA
1420781	1420782	CPF_3006	CPF_0073	rrfC		TRUE	0.479	0.000	0.000	NA		NA
1420782	2166366	CPF_0073	CPF_0074		fusA	FALSE	0.009	657.000	0.000	NA		NA
2166366	2166367	CPF_0074	CPF_0075	fusA		FALSE	0.125	423.000	0.021	NA		NA
2166367	2166368	CPF_0075	CPF_0076			FALSE	0.051	252.000	0.000	NA		NA
2166368	2166369	CPF_0076	CPF_0077			FALSE	0.013	542.000	0.000	1.000	N	NA
2166369	2166370	CPF_0077	CPF_0078			FALSE	0.032	333.000	0.000	1.000	N	NA
2166372	2166373	CPF_0080	CPF_0081			TRUE	0.971	7.000	0.375	1.000	N	NA
2166373	2166374	CPF_0081	CPF_0082			TRUE	0.993	14.000	0.250	1.000	Y	NA
2166374	2166375	CPF_0082	CPF_0083			TRUE	0.993	14.000	0.241	1.000	Y	NA
2166375	2166376	CPF_0083	CPF_0084		iolD	TRUE	0.948	17.000	0.128	1.000	N	NA
2166376	2166377	CPF_0084	CPF_0085	iolD		TRUE	0.867	70.000	0.140	1.000		NA
2166377	2166378	CPF_0085	CPF_0086		iolE	TRUE	0.814	119.000	0.125	1.000		NA
2166378	2166379	CPF_0086	CPF_0087	iolE		TRUE	0.765	82.000	0.059	1.000		NA
2166379	2166380	CPF_0087	CPF_0088			TRUE	0.833	88.000	0.118	1.000		NA
2166380	2166381	CPF_0088	CPF_0089			FALSE	0.016	372.000	0.000	1.000		NA
2166381	2166382	CPF_0089	CPF_0090			FALSE	0.066	232.000	0.000	1.000	N	NA
2166382	2166383	CPF_0090	CPF_0091			TRUE	0.980	103.000	0.667	0.067	Y	NA
2166383	2166384	CPF_0091	CPF_0092			TRUE	0.827	104.000	0.000	1.000	Y	NA
2166386	2166387	CPF_0094	CPF_0095	gldA		TRUE	0.895	26.000	0.053	1.000	N	NA
2166387	2166388	CPF_0095	CPF_0096			FALSE	0.348	361.000	0.000	1.000	Y	NA
2166388	2166389	CPF_0096	CPF_0097			FALSE	0.041	277.000	0.000	NA		NA
2166391	2166392	CPF_0099	CPF_0100			FALSE	0.162	119.000	0.000	NA		NA
2166392	2166393	CPF_0100	CPF_0101			FALSE	0.065	208.000	0.000	NA		NA
2166393	2166394	CPF_0101	CPF_0102			TRUE	0.825	112.000	0.118	NA		NA
2166395	2166396	CPF_0103	CPF_0104			FALSE	0.008	770.000	0.000	NA		NA
2166396	2166397	CPF_0104	CPF_0105			FALSE	0.065	208.000	0.000	NA		NA
2166397	2166398	CPF_0105	CPF_0106			FALSE	0.021	378.000	0.000	NA		NA
2166398	2166399	CPF_0106	CPF_0107			TRUE	0.854	106.000	0.165	NA		NA
2166400	2166401	CPF_0108	CPF_0109			FALSE	0.119	147.000	0.000	NA		NA
2166401	2166402	CPF_0109	CPF_0110			FALSE	0.036	293.000	0.000	NA		NA
2166403	2166404	CPF_0111	CPF_0112			FALSE	0.227	61.000	0.000	NA		NA
2166404	2166405	CPF_0112	CPF_0113			TRUE	0.954	12.000	0.167	NA		NA
2166406	2166407	CPF_0114	CPF_0115			FALSE	0.131	140.000	0.000	NA		NA
2166407	2166408	CPF_0115	CPF_0116			TRUE	0.956	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
2166408	2166409	CPF_0116	CPF_0117			FALSE	0.253	52.000	0.000	NA		NA
2166409	2166410	CPF_0117	CPF_0118			FALSE	0.011	531.000	0.000	NA		NA
2166410	2166411	CPF_0118	CPF_0119			TRUE	0.514	-10.000	0.000	NA		NA
2166413	2166414	CPF_0121	CPF_0122			FALSE	0.012	442.000	0.000	1.000		NA
2166414	2166415	CPF_0122	CPF_0123			FALSE	0.058	21.000	0.000	0.012		NA
2166415	2166416	CPF_0123	CPF_0124			FALSE	0.241	56.000	0.000	NA		NA
2166416	2166417	CPF_0124	CPF_0125			FALSE	0.017	421.000	0.000	NA		NA
2166417	2166418	CPF_0125	CPF_0126			FALSE	0.054	244.000	0.000	NA		NA
2166418	2166419	CPF_0126	CPF_0127			FALSE	0.012	515.000	0.000	NA		NA
2166419	2166420	CPF_0127	CPF_0128			FALSE	0.069	201.000	0.000	NA		NA
2166422	2166423	CPF_0130	CPF_0131			FALSE	0.009	651.000	0.000	NA		NA
2166427	2166428	CPF_0135	CPF_0136			FALSE	0.045	264.000	0.000	NA		NA
2166430	2166431	CPF_0138	CPF_0139			FALSE	0.003	311.000	0.000	0.060		NA
2166431	2166432	CPF_0139	CPF_0140			TRUE	0.884	88.000	0.227	NA		NA
2166432	2166433	CPF_0140	CPF_0141			FALSE	0.201	77.000	0.000	NA		NA
2166433	2166434	CPF_0141	CPF_0142			FALSE	0.063	212.000	0.000	NA		NA
2166434	2166435	CPF_0142	CPF_0143			FALSE	0.026	346.000	0.000	NA		NA
2166435	2166436	CPF_0143	CPF_0144			FALSE	0.045	264.000	0.000	NA		NA
2166436	2166437	CPF_0144	CPF_0145		kptA	FALSE	0.014	462.000	0.000	NA		NA
2166437	2166438	CPF_0145	CPF_0146	kptA		FALSE	0.013	421.000	0.000	1.000		NA
2166438	2166439	CPF_0146	CPF_0147			FALSE	0.378	4.000	0.000	1.000		NA
2166439	2166440	CPF_0147	CPF_0148			FALSE	0.016	427.000	0.000	NA		NA
2166440	2166441	CPF_0148	CPF_0149			FALSE	0.212	69.000	0.000	NA		NA
2166441	2166442	CPF_0149	CPF_0150			FALSE	0.014	475.000	0.000	NA		NA
2166442	2166443	CPF_0150	CPF_0151			FALSE	0.039	284.000	0.000	NA		NA
2166443	2166444	CPF_0151	CPF_0152			FALSE	0.201	77.000	0.000	NA		NA
2166444	2166445	CPF_0152	CPF_0153			FALSE	0.381	26.000	0.000	NA		NA
2166447	2166448	CPF_0155	CPF_0156			FALSE	0.009	588.000	0.000	NA		NA
2166448	2166449	CPF_0156	CPF_0157			FALSE	0.071	195.000	0.000	NA		NA
2166449	2166450	CPF_0157	CPF_0158			FALSE	0.208	72.000	0.000	NA		NA
2166450	2166451	CPF_0158	CPF_0159			FALSE	0.008	769.000	0.000	NA		NA
2166451	2166452	CPF_0159	CPF_0160			FALSE	0.118	159.000	0.000	1.000	N	NA
2166452	2166453	CPF_0160	CPF_0161		arcA	FALSE	0.012	553.000	0.000	1.000	N	NA
2166453	2166454	CPF_0161	CPF_0162	arcA	argF	TRUE	0.924	109.000	0.022	1.000	Y	NA
2166454	2166455	CPF_0162	CPF_0163	argF	arcD	TRUE	0.758	145.000	0.000	1.000	Y	NA
2166455	2166456	CPF_0163	CPF_0164	arcD	arcC	TRUE	0.869	61.000	0.000	1.000	Y	NA
2166456	2166457	CPF_0164	CPF_0165	arcC	argR	FALSE	0.233	73.000	0.000	1.000	N	NA
2166457	2166458	CPF_0165	CPF_0166	argR	colA	FALSE	0.008	542.000	0.000	1.000		NA
2166460	2166461	CPF_0168	CPF_0169		metC	TRUE	0.708	64.000	0.021	1.000	N	NA
2166461	2166462	CPF_0169	CPF_0170	metC		TRUE	0.990	-13.000	0.101	0.015	Y	NA
2166462	2166463	CPF_0170	CPF_0171		luxS	TRUE	0.608	85.000	0.010	1.000	N	NA
2166463	2166464	CPF_0171	CPF_0172	luxS		FALSE	0.029	349.000	0.000	1.000	N	NA
2166465	2166466	CPF_0173	CPF_0174			TRUE	0.901	5.000	0.042	NA		NA
2166466	2166467	CPF_0174	CPF_0175			TRUE	0.915	3.000	0.049	NA		NA
2166468	2166469	CPF_0176	CPF_0177		nanE	FALSE	0.044	285.000	0.000	1.000	N	NA
2166469	2166470	CPF_0177	CPF_0178	nanE	nanA	FALSE	0.345	37.000	0.000	1.000	N	NA
2166470	2166471	CPF_0178	CPF_0179	nanA		TRUE	0.954	104.000	0.074	1.000	Y	NA
2166471	2166472	CPF_0179	CPF_0180			TRUE	0.857	111.000	0.148	NA	N	NA
2166472	2166473	CPF_0180	CPF_0181			TRUE	0.952	156.000	0.189	NA	Y	NA
2166473	2166474	CPF_0181	CPF_0182			TRUE	0.896	191.000	0.081	NA	Y	NA
2166476	2166477	CPF_0184	CPF_0185	nagH	cbiM	FALSE	0.006	879.000	0.000	1.000		NA
2166477	2166478	CPF_0185	CPF_0186	cbiM	cbiN	TRUE	0.996	0.000	0.861	0.015	Y	NA
2166478	2166479	CPF_0186	CPF_0187	cbiN	cbiQ	TRUE	0.996	-16.000	0.804	0.002	Y	NA
2166479	2166480	CPF_0187	CPF_0188	cbiQ	cbiO	TRUE	0.982	15.000	0.082	0.003	Y	NA
2166480	2166481	CPF_0188	CPF_0189	cbiO		FALSE	0.010	556.000	0.000	NA		NA
2166482	2166483	CPF_0190	CPF_0191			FALSE	0.045	223.000	0.000	1.000		NA
2166484	1420902	CPF_0192	CPF_3007		rrsD	FALSE	0.010	566.000	0.000	NA		NA
1420902	1420903	CPF_3007	CPF_3008	rrsD	rrlD	FALSE	0.078	181.000	0.000	NA		NA
1420903	1420904	CPF_3008	CPF_3009	rrlD	rrfD	FALSE	0.263	50.000	0.000	NA		NA
1420904	1420905	CPF_3009	CPF_0193	rrfD		TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
1420905	2166485	CPF_0193	CPF_0194			FALSE	0.012	515.000	0.000	NA		NA
2166485	2166486	CPF_0194	CPF_0195			FALSE	0.012	507.000	0.000	NA		NA
2166486	2166487	CPF_0195	CPF_0196			FALSE	0.232	59.000	0.000	NA		NA
2166487	2166488	CPF_0196	CPF_0197			FALSE	0.007	1306.000	0.000	NA		NA
2166490	2166491	CPF_0199	CPF_0200			FALSE	0.175	101.000	0.000	NA		NA
2166491	2166492	CPF_0200	CPF_0201			FALSE	0.131	140.000	0.000	NA		NA
2166492	2166493	CPF_0201	CPF_0202			FALSE	0.432	10.000	0.000	NA		NA
2166493	2166494	CPF_0202	CPF_0203			FALSE	0.013	481.000	0.000	NA		NA
2166495	2166496	CPF_0204	CPF_0205			FALSE	0.014	574.000	0.000	NA	N	NA
2166497	2166498	CPF_0206	CPF_0207		sbcC	TRUE	0.996	-13.000	0.669	0.004	Y	NA
2166498	2166499	CPF_0207	CPF_0208	sbcC	ackA	FALSE	0.022	406.000	0.000	1.000	N	NA
2166501	2166502	CPF_0210	CPF_0211			FALSE	0.223	63.000	0.000	NA		NA
2166502	2166503	CPF_0211	CPF_0212			TRUE	0.974	2.000	0.400	NA		NA
2166503	2166504	CPF_0212	CPF_0213			TRUE	0.897	14.000	0.036	NA	N	NA
2166504	2166505	CPF_0213	CPF_0214			TRUE	0.997	-13.000	0.877	1.000	Y	NA
2166505	2166506	CPF_0214	CPF_0215			TRUE	0.996	1.000	0.657	1.000	Y	NA
2166506	2166507	CPF_0215	CPF_0216			TRUE	0.845	42.000	0.047	1.000	N	NA
2166507	2166508	CPF_0216	CPF_0217			TRUE	0.994	1.000	0.576	0.007	Y	NA
2166508	2166509	CPF_0217	CPF_0218			TRUE	0.889	-13.000	0.015	NA		NA
2166509	2166510	CPF_0218	CPF_0219			TRUE	0.953	-25.000	0.077	NA		NA
2166510	2166511	CPF_0219	CPF_0220			FALSE	0.148	128.000	0.000	NA		NA
2166511	2166512	CPF_0220	CPF_0221			FALSE	0.032	312.000	0.000	NA		NA
2166513	2166514	CPF_0222	CPF_0223			TRUE	0.742	201.000	0.500	0.039	N	NA
2166514	2166515	CPF_0223	CPF_0224			TRUE	0.982	-19.000	0.500	NA		NA
2166515	2166516	CPF_0224	CPF_0225			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2166516	2166517	CPF_0225	CPF_0226			TRUE	0.960	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
2166518	2166519	CPF_0227	CPF_0228			FALSE	0.051	253.000	0.000	NA		NA
2166520	2166521	CPF_0230	CPF_0231			FALSE	0.017	418.000	0.000	NA		NA
2166521	2166522	CPF_0231	CPF_0232			TRUE	0.456	3.000	0.000	NA		NA
2166523	2166524	CPF_0233	CPF_0234			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2166524	2166525	CPF_0234	CPF_0235			FALSE	0.122	145.000	0.000	NA		NA
2166525	2166526	CPF_0235	CPF_0236			FALSE	0.081	-7.000	0.000	0.100		NA
2166526	2166527	CPF_0236	CPF_0237			FALSE	0.363	10.000	0.000	1.000		NA
2166527	2166528	CPF_0237	CPF_0238			FALSE	0.022	404.000	0.000	1.000	N	NA
2166529	2166530	CPF_0239	CPF_0240			FALSE	0.351	18.000	0.000	1.000		NA
2166530	2166531	CPF_0240	CPF_0241			TRUE	0.997	-12.000	0.625	1.000	Y	NA
2166531	2166532	CPF_0241	CPF_0242			FALSE	0.351	18.000	0.000	1.000		NA
2166532	2166533	CPF_0242	CPF_0243			FALSE	0.043	272.000	0.000	NA		NA
2166533	2166534	CPF_0243	CPF_0244			FALSE	0.031	315.000	0.000	NA		NA
2166536	2166537	CPF_0246	CPF_0247			TRUE	0.979	13.000	0.828	NA		NA
2166538	2166539	CPF_0248	CPF_0249			FALSE	0.135	137.000	0.000	NA		NA
2166540	2166541	CPF_0250	CPF_0251		lacA	FALSE	0.036	259.000	0.000	1.000		NA
2166541	2166542	CPF_0251	CPF_0252	lacA		FALSE	0.041	244.000	0.000	1.000		NA
2166542	2166543	CPF_0252	CPF_0253			FALSE	0.089	184.000	0.000	1.000	N	NA
2166543	2166544	CPF_0253	CPF_0254			TRUE	0.527	-3.000	0.000	1.000	N	NA
2166544	2166545	CPF_0254	CPF_0255			FALSE	0.021	376.000	0.000	NA		NA
2166546	2166547	CPF_0256	CPF_0257			FALSE	0.060	218.000	0.000	NA		NA
2166547	2166548	CPF_0257	CPF_0258		ung	FALSE	0.065	208.000	0.000	NA		NA
2166549	1420972	CPF_0259	CPF_3010		rrsE	FALSE	0.018	416.000	0.000	NA		NA
1420972	1420973	CPF_3010	CPF_3011	rrsE	rrlE	FALSE	0.078	181.000	0.000	NA		NA
1420973	1420974	CPF_3011	CPF_3012	rrlE	rrfE	FALSE	0.263	50.000	0.000	NA		NA
1420974	1420975	CPF_3012	CPF_0260	rrfE		TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2166551	2166552	CPF_0262	CPF_0263			FALSE	0.016	464.000	0.000	1.000	N	NA
2166552	2166553	CPF_0263	CPF_0264			TRUE	0.458	18.000	0.000	1.000	N	NA
2166553	2166554	CPF_0264	CPF_0265			FALSE	0.357	14.000	0.000	1.000		NA
2166554	2166555	CPF_0265	CPF_0266			FALSE	0.059	19.000	0.000	0.017		NA
2166555	2166556	CPF_0266	CPF_0267			FALSE	0.357	14.000	0.000	1.000		NA
2166556	2166557	CPF_0267	CPF_0268			TRUE	0.821	115.000	0.000	1.000	Y	NA
2166558	2166559	CPF_0269	CPF_0270			TRUE	0.861	83.000	0.156	1.000		NA
2166561	2166562	CPF_0273	CPF_0274			FALSE	0.076	185.000	0.000	NA		NA
2166562	2166563	CPF_0274	CPF_0275			FALSE	0.054	195.000	0.000	1.000		NA
2166563	2166564	CPF_0275	CPF_0276			TRUE	0.903	3.000	0.078	0.005		NA
2166567	2166568	CPF_0279	CPF_0280			FALSE	0.231	111.000	0.000	NA	N	NA
2166572	2166573	CPF_0284	CPF_0285			FALSE	0.014	504.000	0.000	1.000	N	NA
2166574	2166575	CPF_0286	CPF_0287		acpS	TRUE	0.749	49.000	0.020	NA		NA
2166575	2166576	CPF_0287	CPF_0288	acpS		TRUE	0.909	-13.000	0.020	NA	N	NA
2166576	2166577	CPF_0288	CPF_0289			TRUE	0.817	61.000	0.064	NA		NA
2166577	2166578	CPF_0289	CPF_0290			FALSE	0.053	247.000	0.000	NA		NA
2166578	2166579	CPF_0290	CPF_0291			TRUE	0.862	6.000	0.019	NA		NA
2166579	2166580	CPF_0291	CPF_0292			FALSE	0.117	438.000	0.019	1.000	N	NA
2166580	2166581	CPF_0292	CPF_0293			TRUE	0.990	0.000	0.180	0.001	Y	NA
2166581	2166582	CPF_0293	CPF_0294			FALSE	0.162	119.000	0.000	NA		NA
2166582	2166583	CPF_0294	CPF_0295			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2166583	2166584	CPF_0295	CPF_0296			FALSE	0.066	206.000	0.000	NA		NA
2166584	2166585	CPF_0296	CPF_0297			TRUE	0.996	-10.000	0.431	1.000	Y	NA
2166585	2166586	CPF_0297	CPF_0298			TRUE	0.629	89.000	0.015	1.000	N	NA
2166586	2166587	CPF_0298	CPF_0299			TRUE	0.862	23.000	0.060	0.010		NA
2166587	2166588	CPF_0299	CPF_0300		uvrB	TRUE	0.589	88.000	0.013	1.000		NA
2166588	2166589	CPF_0300	CPF_0301	uvrB		FALSE	0.045	266.000	0.000	NA		NA
2166589	2166590	CPF_0301	CPF_0302			FALSE	0.056	236.000	0.000	NA		NA
2166590	2166591	CPF_0302	CPF_0303			TRUE	0.978	-7.000	0.426	NA		NA
2166591	2166592	CPF_0303	CPF_0304			FALSE	0.059	221.000	0.000	NA		NA
2166592	2166593	CPF_0304	CPF_0305			FALSE	0.118	159.000	0.000	1.000	N	NA
2166593	2166594	CPF_0305	CPF_0306			TRUE	0.466	15.000	0.000	1.000	N	NA
2166594	2166595	CPF_0306	CPF_0307		lctP	FALSE	0.066	229.000	0.000	1.000	N	NA
2166595	2166596	CPF_0307	CPF_0308	lctP		TRUE	0.968	95.000	0.148	1.000	Y	NA
2166596	2166597	CPF_0308	CPF_0309			TRUE	0.995	13.000	0.875	0.020	Y	NA
2166597	2166598	CPF_0309	CPF_0310			TRUE	0.995	2.000	0.875	0.009	Y	NA
2166600	2166601	CPF_0312	CPF_0313			FALSE	0.396	24.000	0.000	NA		NA
2166604	2166605	CPF_0316	CPF_0317			FALSE	0.176	97.000	0.000	NA		NA
2166606	2166607	CPF_0318	CPF_0319		xpt	FALSE	0.010	560.000	0.000	NA		NA
2166607	2166608	CPF_0319	CPF_0320	xpt		FALSE	0.015	486.000	0.000	1.000	N	NA
2166608	2166609	CPF_0320	CPF_0321			TRUE	0.585	191.000	0.000	0.098	Y	NA
2166611	2166612	CPF_0323	CPF_0324			TRUE	0.943	16.000	0.114	NA		NA
2166612	2166613	CPF_0324	CPF_0325			FALSE	0.032	309.000	0.000	NA		NA
2166613	2166614	CPF_0325	CPF_0326		ogt	FALSE	0.035	318.000	0.000	1.000	N	NA
2166614	2166615	CPF_0326	CPF_0327	ogt	recQ	TRUE	0.893	49.000	0.000	1.000	Y	NA
2166615	2166616	CPF_0327	CPF_0328	recQ		FALSE	0.188	88.000	0.000	NA		NA
2166616	2166617	CPF_0328	CPF_0329			FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
2166617	2166618	CPF_0329	CPF_0330			FALSE	0.141	144.000	0.000	1.000	N	NA
2166618	2166619	CPF_0330	CPF_0331			FALSE	0.107	166.000	0.000	1.000	N	NA
2166619	2166620	CPF_0331	CPF_0332			FALSE	0.157	121.000	0.000	NA		NA
2166620	2166621	CPF_0332	CPF_0333			TRUE	0.909	16.000	0.053	NA		NA
2166621	2166622	CPF_0333	CPF_0334			TRUE	0.514	-10.000	0.000	NA		NA
2166622	2166623	CPF_0334	CPF_0335			FALSE	0.434	9.000	0.000	NA		NA
2166625	2166626	CPF_0337	CPF_0338	uvrA		FALSE	0.119	334.000	0.002	NA		NA
2166626	2166627	CPF_0338	CPF_0339			TRUE	0.924	14.000	0.070	NA		NA
2166627	2166628	CPF_0339	CPF_0340			TRUE	0.971	1.000	0.285	1.000	N	NA
2166628	2166629	CPF_0340	CPF_0341		uvrC	FALSE	0.405	157.000	0.005	1.000	N	NA
2166629	2166630	CPF_0341	CPF_0342	uvrC	murB	FALSE	0.409	149.000	0.003	1.000	N	NA
2166630	2166631	CPF_0342	CPF_0343	murB		TRUE	0.514	240.000	0.080	NA		NA
2166631	1421059	CPF_0343	CPF_0344			TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
1421059	2166632	CPF_0344	CPF_0345			TRUE	0.456	3.000	0.000	NA		NA
2166632	2166633	CPF_0345	CPF_0346			FALSE	0.083	174.000	0.000	NA		NA
2166633	1421062	CPF_0346	CPF_0347			FALSE	0.019	400.000	0.000	NA		NA
1421062	2166634	CPF_0347	CPF_0348			FALSE	0.067	205.000	0.000	NA		NA
2166634	1421064	CPF_0348	CPF_0349			FALSE	0.170	113.000	0.000	NA		NA
1421064	2166635	CPF_0349	CPF_0350		pfkA	FALSE	0.008	712.000	0.000	NA		NA
2166635	2166636	CPF_0350	CPF_0351	pfkA	pyk	TRUE	0.883	94.000	0.011	0.006	Y	NA
2166636	2166637	CPF_0351	CPF_0352	pyk		FALSE	0.010	580.000	0.000	NA		NA
2166637	2166638	CPF_0352	CPF_0353			FALSE	0.032	309.000	0.000	NA		NA
2166638	2166639	CPF_0353	CPF_0354		cls	FALSE	0.008	172.000	0.000	0.064		NA
2166641	2166642	CPF_0356	CPF_0357		rumA	FALSE	0.040	302.000	0.000	1.000	N	NA
2166644	2166645	CPF_0359	CPF_0360			FALSE	0.050	255.000	0.000	NA		NA
2166645	2166646	CPF_0360	CPF_0361			FALSE	0.223	63.000	0.000	NA		NA
2166646	2166647	CPF_0361	CPF_0362			TRUE	0.832	13.000	0.025	0.058	N	NA
2166647	2166648	CPF_0362	CPF_0363			FALSE	0.014	459.000	0.000	NA		NA
2166648	2166649	CPF_0363	CPF_0364			FALSE	0.162	119.000	0.000	NA		NA
2166649	2166650	CPF_0364	CPF_0365			TRUE	0.461	349.000	0.231	NA		NA
2166650	2166651	CPF_0365	CPF_0366			FALSE	0.019	399.000	0.000	NA		NA
2166651	2166652	CPF_0366	CPF_0367			TRUE	0.996	-7.000	0.846	0.006	Y	NA
2166654	2166655	CPF_0369	CPF_0370			FALSE	0.048	258.000	0.000	NA		NA
2166656	2166657	CPF_0371	CPF_0372			FALSE	0.054	261.000	0.000	1.000	N	NA
2166660	2166661	CPF_0375	CPF_0376	udp	deoB	FALSE	0.295	167.000	0.007	0.047	N	NA
2166662	2166663	CPF_0377	CPF_0378			TRUE	0.926	46.000	0.231	1.000		NA
2166664	2166665	CPF_0379	CPF_0380			FALSE	0.153	125.000	0.000	NA		NA
2166665	2166666	CPF_0380	CPF_0381		garR	FALSE	0.014	468.000	0.000	NA		NA
2166666	2166667	CPF_0381	CPF_0382	garR	nadA	FALSE	0.038	307.000	0.000	1.000	N	NA
2166667	2166668	CPF_0382	CPF_0383	nadA	nadB	TRUE	0.983	5.000	0.042	1.000	Y	NA
2166668	2166669	CPF_0383	CPF_0384	nadB	nadC	TRUE	0.989	-43.000	0.046	1.000	Y	NA
2166671	2166672	CPF_0386	CPF_0387			FALSE	0.209	90.000	0.000	1.000	N	NA
2166672	2166673	CPF_0387	CPF_0388			FALSE	0.412	34.000	0.000	NA	N	NA
2166673	2166674	CPF_0388	CPF_0389			FALSE	0.058	225.000	0.000	NA		NA
2166674	2166675	CPF_0389	CPF_0390			FALSE	0.424	13.000	0.000	NA		NA
2166675	2166676	CPF_0390	CPF_0391			FALSE	0.065	207.000	0.000	NA		NA
2166676	2166677	CPF_0391	CPF_0392		brnQ	FALSE	0.008	735.000	0.000	NA		NA
2166677	2166678	CPF_0392	CPF_0393	brnQ		FALSE	0.049	256.000	0.000	NA		NA
2166678	2166679	CPF_0393	CPF_0394			FALSE	0.031	314.000	0.000	NA		NA
2166679	2166680	CPF_0394	CPF_0395		kduI	FALSE	0.136	107.000	0.000	1.000		NA
2166680	2166681	CPF_0395	CPF_0396	kduI	kduD	TRUE	0.971	16.000	0.417	1.000	N	NA
2166681	2166682	CPF_0396	CPF_0397	kduD		FALSE	0.077	-3.000	0.000	0.063	N	NA
2166682	2166683	CPF_0397	CPF_0398			TRUE	0.948	4.000	0.000	1.000	Y	NA
2166683	2166684	CPF_0398	CPF_0399		kduI	TRUE	0.704	165.000	0.000	1.000	Y	NA
2166684	2166685	CPF_0399	CPF_0400	kduI		FALSE	0.352	17.000	0.000	1.000		NA
2166685	2166686	CPF_0400	CPF_0401			TRUE	0.955	17.000	0.200	1.000		NA
2166686	2166687	CPF_0401	CPF_0402			TRUE	0.990	48.000	0.933	0.018	Y	NA
2166687	2166688	CPF_0402	CPF_0403			TRUE	0.996	-10.000	0.933	0.018	Y	NA
2166688	2166689	CPF_0403	CPF_0404			TRUE	0.974	70.000	0.267	0.018	Y	NA
2166689	2166690	CPF_0404	CPF_0405			TRUE	0.843	3.000	0.006	NA	N	NA
2166690	2166691	CPF_0405	CPF_0406			TRUE	0.457	140.000	0.006	NA		NA
2166691	2166692	CPF_0406	CPF_0407			TRUE	0.959	34.000	0.562	1.000		NA
2166692	2166693	CPF_0407	CPF_0408			FALSE	0.042	295.000	0.000	1.000	N	NA
2166693	2166694	CPF_0408	CPF_0409			FALSE	0.035	300.000	0.000	NA		NA
2166694	2166695	CPF_0409	CPF_0410			FALSE	0.071	195.000	0.000	NA		NA
2166695	2166696	CPF_0410	CPF_0411			FALSE	0.090	148.000	0.000	1.000		NA
2166696	2166697	CPF_0411	CPF_0412			FALSE	0.065	5.000	0.000	0.036		NA
2166697	2166698	CPF_0412	CPF_0413			FALSE	0.055	241.000	0.000	NA		NA
2166698	2166699	CPF_0413	CPF_0414			FALSE	0.061	216.000	0.000	NA		NA
2166699	2166700	CPF_0414	CPF_0415			FALSE	0.123	144.000	0.000	NA		NA
2166700	2166701	CPF_0415	CPF_0416			FALSE	0.389	25.000	0.000	NA		NA
2166701	2166702	CPF_0416	CPF_0417		hsp90	FALSE	0.027	333.000	0.000	NA		NA
2166702	2166703	CPF_0417	CPF_0418	hsp90		FALSE	0.057	228.000	0.000	NA		NA
2166703	2166704	CPF_0418	CPF_0419			FALSE	0.311	37.000	0.000	NA		NA
2166704	2166705	CPF_0419	CPF_0420			FALSE	0.076	187.000	0.000	NA		NA
2166705	2166706	CPF_0420	CPF_0421			FALSE	0.018	436.000	0.000	1.000	N	NA
2166706	2166707	CPF_0421	CPF_0422			TRUE	0.882	259.000	0.167	1.000	Y	NA
2166707	2166708	CPF_0422	CPF_0423			TRUE	0.976	11.000	0.610	NA		NA
2166708	2166709	CPF_0423	CPF_0424			FALSE	0.009	656.000	0.000	NA		NA
2166709	2166710	CPF_0424	CPF_0425			FALSE	0.200	97.000	0.000	1.000	N	NA
2166710	2166711	CPF_0425	CPF_0426			FALSE	0.015	501.000	0.000	1.000	N	NA
2166711	2166712	CPF_0426	CPF_0427		trmB	FALSE	0.062	177.000	0.000	1.000		NA
2166712	2166713	CPF_0427	CPF_0428	trmB		FALSE	0.009	519.000	0.000	1.000		NA
2166713	2166714	CPF_0428	CPF_0429			FALSE	0.014	468.000	0.000	NA		NA
2166714	2166715	CPF_0429	CPF_0430			FALSE	0.057	231.000	0.000	NA		NA
2166715	2166716	CPF_0430	CPF_0431			FALSE	0.019	392.000	0.000	NA		NA
2166718	2166719	CPF_0433	CPF_0434			FALSE	0.039	283.000	0.000	NA		NA
2166719	2166720	CPF_0434	CPF_0435			FALSE	0.193	84.000	0.000	NA		NA
2166720	2166721	CPF_0435	CPF_0436			FALSE	0.021	377.000	0.000	NA		NA
2166722	2166723	CPF_0437	CPF_0438			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
2166724	2166725	CPF_0439	CPF_0440			FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
2166725	2166726	CPF_0440	CPF_0441			TRUE	0.996	-9.000	0.618	0.037	Y	NA
2166726	2166727	CPF_0441	CPF_0442			TRUE	0.977	3.000	0.529	1.000	N	NA
2166727	2166728	CPF_0442	CPF_0443			FALSE	0.022	323.000	0.000	1.000		NA
2166728	2166729	CPF_0443	CPF_0444			FALSE	0.074	190.000	0.000	NA		NA
2166729	2166730	CPF_0444	CPF_0445			FALSE	0.045	266.000	0.000	NA		NA
2166730	2166731	CPF_0445	CPF_0446			FALSE	0.362	34.000	0.000	1.000	N	NA
2166731	2166732	CPF_0446	CPF_0447			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2166732	2166733	CPF_0447	CPF_0448			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2166733	2166734	CPF_0448	CPF_0449			FALSE	0.167	116.000	0.000	NA		NA
2166736	2166737	CPF_0451	CPF_0452			FALSE	0.074	190.000	0.000	NA		NA
2166737	2166738	CPF_0452	CPF_0453			FALSE	0.169	114.000	0.000	NA		NA
2166738	2166739	CPF_0453	CPF_0454			FALSE	0.035	297.000	0.000	NA		NA
2166741	2166742	CPF_0456	CPF_0457			FALSE	0.033	305.000	0.000	NA		NA
2166742	2166743	CPF_0457	CPF_0458			FALSE	0.232	59.000	0.000	NA		NA
2166743	2166744	CPF_0458	CPF_0459			FALSE	0.045	222.000	0.000	1.000		NA
2166744	2166745	CPF_0459	CPF_0460			TRUE	0.995	-25.000	0.200	1.000	Y	NA
2166747	2166748	CPF_0462	CPF_0463			FALSE	0.008	768.000	0.000	NA		NA
2166748	2166749	CPF_0463	CPF_0464			FALSE	0.013	477.000	0.000	NA		NA
2166749	2166750	CPF_0464	CPF_0465			FALSE	0.073	13.000	0.000	0.096	N	NA
2166750	2166751	CPF_0465	CPF_0466			FALSE	0.096	201.000	0.000	NA	N	NA
2166751	1421182	CPF_0466	CPF_0467			FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
1421182	2166752	CPF_0467	CPF_0468			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
2166752	1421184	CPF_0468	CPF_0469			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
1421184	2166753	CPF_0469	CPF_0470			FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
2166753	2166754	CPF_0470	CPF_0471			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2166754	2166755	CPF_0471	CPF_0472			FALSE	0.430	11.000	0.000	NA		NA
2166755	2166756	CPF_0472	CPF_0473			TRUE	0.892	28.000	0.056	1.000	N	NA
2166756	2166757	CPF_0473	CPF_0474			FALSE	0.393	2.000	0.000	1.000		NA
2166757	2166758	CPF_0474	CPF_0475			TRUE	0.452	-13.000	0.000	1.000		NA
2166758	2166759	CPF_0475	CPF_0476			TRUE	0.479	0.000	0.000	NA		NA
2166759	2166760	CPF_0476	CPF_0477			FALSE	0.198	80.000	0.000	NA		NA
2166760	2166761	CPF_0477	CPF_0478			FALSE	0.060	17.000	0.000	0.016		NA
2166761	2166762	CPF_0478	CPF_0479		rfbA	TRUE	0.465	12.000	0.000	1.000	N	NA
2166762	2166763	CPF_0479	CPF_0480	rfbA	rfbC	TRUE	0.967	106.000	0.139	1.000	Y	NA
2166763	2166764	CPF_0480	CPF_0481	rfbC	rfbD	TRUE	0.985	14.000	0.062	1.000	Y	NA
2166764	2166765	CPF_0481	CPF_0482	rfbD	rfbB	TRUE	0.978	28.000	0.088	0.003	Y	NA
2166765	2166766	CPF_0482	CPF_0483	rfbB	galU	TRUE	0.836	176.000	0.022	1.000	Y	NA
2166766	2166767	CPF_0483	CPF_0484	galU		FALSE	0.017	365.000	0.000	1.000		NA
2166767	2166768	CPF_0484	CPF_0485			FALSE	0.018	415.000	0.000	NA		NA
2166768	2166769	CPF_0485	CPF_0486		galE	FALSE	0.200	78.000	0.000	NA		NA
2166769	2166770	CPF_0486	CPF_0487	galE	galU	TRUE	0.481	282.000	0.000	1.000	Y	NA
2166770	2166771	CPF_0487	CPF_0488	galU		FALSE	0.028	327.000	0.000	NA		NA
2166771	1421204	CPF_0488	CPF_0489			FALSE	0.065	207.000	0.000	NA		NA
1421204	2166772	CPF_0489	CPF_0490			FALSE	0.023	363.000	0.000	NA		NA
2166772	2166773	CPF_0490	CPF_0491			FALSE	0.012	427.000	0.000	1.000		NA
2166775	2166776	CPF_0493	CPF_0494	sipW		FALSE	0.249	54.000	0.000	NA		NA
2166776	2166777	CPF_0494	CPF_0495			FALSE	0.276	48.000	0.000	NA		NA
2166777	2166778	CPF_0495	CPF_0496			TRUE	0.966	24.000	0.400	NA		NA
2166778	2166779	CPF_0496	CPF_0497			FALSE	0.415	20.000	0.000	NA		NA
2166779	2166780	CPF_0497	CPF_0498			FALSE	0.040	281.000	0.000	NA		NA
2166780	2166781	CPF_0498	CPF_0499			TRUE	0.950	5.000	0.000	NA	Y	NA
2166781	2166782	CPF_0499	CPF_0500			FALSE	0.080	178.000	0.000	NA		NA
2166782	2166783	CPF_0500	CPF_0501			FALSE	0.017	368.000	0.000	1.000		NA
2166783	2166784	CPF_0501	CPF_0502			TRUE	0.580	178.000	0.000	0.009	Y	NA
2166784	2166785	CPF_0502	CPF_0503			TRUE	0.942	41.000	0.595	0.017		NA
2166785	2166786	CPF_0503	CPF_0504			FALSE	0.018	358.000	0.000	1.000		NA
2166788	2166789	CPF_0506	CPF_0507			TRUE	0.996	-7.000	0.933	0.006	Y	NA
2166789	2166790	CPF_0507	CPF_0508			FALSE	0.013	497.000	0.000	NA		NA
2166790	2166791	CPF_0508	CPF_0509			FALSE	0.050	255.000	0.000	NA		NA
2166791	2166792	CPF_0509	CPF_0510			TRUE	0.538	327.000	0.385	1.000		NA
2166792	2166793	CPF_0510	CPF_0511			FALSE	0.041	296.000	0.000	1.000	N	NA
2166793	2166794	CPF_0511	CPF_0512			TRUE	0.997	0.000	1.000	1.000	Y	NA
2166794	2166795	CPF_0512	CPF_0513			FALSE	0.196	81.000	0.000	NA		NA
2166795	2166796	CPF_0513	CPF_0514			FALSE	0.104	158.000	0.000	NA		NA
2166796	2166797	CPF_0514	CPF_0515			FALSE	0.014	465.000	0.000	NA		NA
2166797	2166798	CPF_0515	CPF_0516			FALSE	0.011	526.000	0.000	NA		NA
2166798	2166799	CPF_0516	CPF_0517			FALSE	0.063	212.000	0.000	NA		NA
2166799	2166800	CPF_0517	CPF_0518			FALSE	0.032	311.000	0.000	NA		NA
2166800	2166801	CPF_0518	CPF_0519			FALSE	0.434	9.000	0.000	NA		NA
2166801	2166802	CPF_0519	CPF_0520			FALSE	0.316	36.000	0.000	NA		NA
2166804	2166805	CPF_0522	CPF_0523			FALSE	0.019	404.000	0.000	NA		NA
2166806	2166807	CPF_0524	CPF_0525			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
2166808	2166809	CPF_0526	CPF_0527		speD	FALSE	0.037	313.000	0.000	1.000	N	NA
2166809	2166810	CPF_0527	CPF_0528	speD		TRUE	0.988	18.000	0.091	1.000	Y	NA
2166810	2166811	CPF_0528	CPF_0529		speE	TRUE	0.992	15.000	0.237	1.000	Y	NA
2166811	2166812	CPF_0529	CPF_0530	speE	speB	TRUE	0.991	-13.000	0.077	1.000	Y	NA
2166814	2166815	CPF_0532	CPF_0533			FALSE	0.120	146.000	0.000	NA		NA
2166817	2166818	CPF_0535	CPF_0536			FALSE	0.008	952.000	0.000	NA		NA
2166818	2166819	CPF_0536	CPF_0537			FALSE	0.052	249.000	0.000	NA		NA
2166819	2166820	CPF_0537	CPF_0538			TRUE	0.981	-7.000	0.793	0.094	N	NA
2166820	2166821	CPF_0538	CPF_0539			FALSE	0.050	271.000	0.000	1.000	N	NA
2166821	2166822	CPF_0539	CPF_0540			TRUE	0.977	-7.000	0.400	NA		NA
2166822	2166823	CPF_0540	CPF_0541		treB	FALSE	0.026	348.000	0.000	NA		NA
2166823	2166824	CPF_0541	CPF_0542	treB	treC	TRUE	0.952	204.000	0.650	1.000	Y	NA
2166824	2166825	CPF_0542	CPF_0543	treC	treR	TRUE	0.659	265.000	0.336	1.000	N	NA
2166827	2166828	CPF_0545	CPF_0546		ribD	FALSE	0.008	556.000	0.000	1.000		NA
2166828	2166829	CPF_0546	CPF_0547	ribD	ribE	TRUE	0.994	22.000	0.456	1.000	Y	NA
2166829	2166830	CPF_0547	CPF_0548	ribE	ribA	TRUE	0.911	152.000	0.051	1.000	Y	NA
2166830	2166831	CPF_0548	CPF_0549	ribA	ribE	TRUE	0.910	127.000	0.054	0.002	Y	NA
2166832	2166833	CPF_0550	CPF_0551			FALSE	0.174	104.000	0.000	NA		NA
2166834	2166835	CPF_0552	CPF_0553			FALSE	0.037	291.000	0.000	NA		NA
2166835	2166836	CPF_0553	CPF_0554			FALSE	0.058	185.000	0.000	1.000		NA
2166836	2166837	CPF_0554	CPF_0555			TRUE	0.924	13.000	0.000	0.016	Y	NA
2166837	2166838	CPF_0555	CPF_0556			FALSE	0.128	153.000	0.000	1.000	N	NA
2166838	2166839	CPF_0556	CPF_0557			TRUE	0.977	79.000	0.366	0.036	Y	NA
2166839	2166840	CPF_0557	CPF_0558			TRUE	0.994	2.000	0.512	0.036	Y	NA
2166840	2166841	CPF_0558	CPF_0559			FALSE	0.056	236.000	0.000	NA		NA
2166841	2166842	CPF_0559	CPF_0560			TRUE	0.952	-10.000	0.087	NA		NA
2166842	2166843	CPF_0560	CPF_0561			FALSE	0.111	164.000	0.000	1.000	N	NA
2166843	2166844	CPF_0561	CPF_0562			FALSE	0.054	285.000	0.000	NA	N	NA
2166844	2166845	CPF_0562	CPF_0563			TRUE	0.987	-7.000	0.041	NA	Y	NA
2166846	2166847	CPF_0564	CPF_0565	fruA	fruK	TRUE	0.996	4.000	0.816	1.000	Y	NA
2166847	2166848	CPF_0565	CPF_0566	fruK		TRUE	0.996	0.000	0.721	1.000	Y	NA
2166851	2166852	CPF_0569	CPF_0570			FALSE	0.024	378.000	0.000	1.000	N	NA
2166852	2166853	CPF_0570	CPF_0571			FALSE	0.039	304.000	0.000	1.000	N	NA
2166853	2166854	CPF_0571	CPF_0572			FALSE	0.026	301.000	0.000	1.000		NA
2166854	1421288	CPF_0572	CPF_3013		rrsF	FALSE	0.014	462.000	0.000	NA		NA
1421288	1421289	CPF_3013	CPF_3014	rrsF	rrlF	FALSE	0.078	181.000	0.000	NA		NA
1421289	1421290	CPF_3014	CPF_3015	rrlF	rrfF	FALSE	0.263	50.000	0.000	NA		NA
1421290	1421291	CPF_3015	CPF_0573	rrfF		TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
1421291	2166855	CPF_0573	CPF_0574		sfsA	FALSE	0.017	425.000	0.000	NA		NA
2166855	2166856	CPF_0574	CPF_0575	sfsA		FALSE	0.018	414.000	0.000	NA		NA
2166856	2166857	CPF_0575	CPF_0576		lysA	FALSE	0.014	411.000	0.000	1.000		NA
2166857	2166858	CPF_0576	CPF_0577	lysA		FALSE	0.018	409.000	0.000	NA		NA
2166858	2166859	CPF_0577	CPF_0578			TRUE	0.456	3.000	0.000	NA		NA
2166859	2166860	CPF_0578	CPF_0579		ftsH	FALSE	0.053	25.000	0.000	0.042	N	NA
2166860	2166861	CPF_0579	CPF_0580	ftsH		TRUE	0.758	220.000	0.583	1.000		NA
2166861	2166862	CPF_0580	CPF_0581			FALSE	0.011	456.000	0.000	1.000		NA
2166862	2166863	CPF_0581	CPF_0582			TRUE	0.975	31.000	0.066	0.049	Y	NA
2166863	2166864	CPF_0582	CPF_0583			TRUE	0.996	-3.000	0.640	1.000	Y	NA
2166864	2166865	CPF_0583	CPF_0584			FALSE	0.070	218.000	0.000	1.000	N	NA
2166865	2166866	CPF_0584	CPF_0585			TRUE	0.449	252.000	0.000	0.003	Y	NA
2166868	2166869	CPF_0587	CPF_0588			FALSE	0.144	142.000	0.000	1.000	N	NA
2166872	2166873	CPF_0591	CPF_0592		prfC	FALSE	0.054	261.000	0.000	1.000	N	NA
2166873	2166874	CPF_0592	CPF_0593	prfC		FALSE	0.062	214.000	0.000	NA		NA
2166875	2166876	CPF_0594	CPF_0595			FALSE	0.243	41.000	0.000	1.000		NA
2166876	2166877	CPF_0595	CPF_0596			TRUE	0.885	1.000	0.023	NA		NA
2166877	2166878	CPF_0596	CPF_0597		rfbA	FALSE	0.403	23.000	0.000	NA		NA
2166878	2166879	CPF_0597	CPF_0598	rfbA	rfbC	TRUE	0.967	106.000	0.139	1.000	Y	NA
2166879	2166880	CPF_0598	CPF_0599	rfbC	rfbD	TRUE	0.985	14.000	0.062	1.000	Y	NA
2166880	2166881	CPF_0599	CPF_0600	rfbD	rfbB	TRUE	0.978	28.000	0.088	0.003	Y	NA
2166881	2166882	CPF_0600	CPF_0601	rfbB		FALSE	0.389	25.000	0.000	NA		NA
2166882	2166883	CPF_0601	CPF_0602			TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
2166883	2166884	CPF_0602	CPF_0603			FALSE	0.179	94.000	0.000	NA		NA
2166884	2166885	CPF_0603	CPF_0604			FALSE	0.434	9.000	0.000	NA		NA
2166885	2166886	CPF_0604	CPF_0605			FALSE	0.341	22.000	0.000	1.000		NA
2166886	2166887	CPF_0605	CPF_0606			FALSE	0.114	129.000	0.000	1.000		NA
2166887	2166888	CPF_0606	CPF_0607			FALSE	0.052	202.000	0.000	1.000		NA
2166888	2166889	CPF_0607	CPF_0608			FALSE	0.051	205.000	0.000	1.000		NA
2166889	2166890	CPF_0608	CPF_0609			TRUE	0.942	26.000	0.167	1.000		NA
2166890	2166891	CPF_0609	CPF_0610			TRUE	0.761	147.000	0.133	1.000		NA
2166892	2166893	CPF_0611	CPF_0612			FALSE	0.162	119.000	0.000	NA		NA
2166893	2166894	CPF_0612	CPF_0613		brnQ	FALSE	0.057	280.000	0.000	NA	N	NA
2166895	2166896	CPF_0614	CPF_0615	trpS		FALSE	0.018	414.000	0.000	NA		NA
2166896	2166897	CPF_0615	CPF_0616			FALSE	0.194	83.000	0.000	NA		NA
2166897	2166898	CPF_0616	CPF_0617		pstS	FALSE	0.048	211.000	0.000	1.000		NA
2166898	2166899	CPF_0617	CPF_0618	pstS	pstS	TRUE	0.517	224.000	0.000	0.036	Y	NA
2166899	2166900	CPF_0618	CPF_0619	pstS	pstC	TRUE	0.912	82.000	0.005	1.000	Y	NA
2166900	2166901	CPF_0619	CPF_0620	pstC	pstA	TRUE	0.990	3.000	0.219	0.002	Y	NA
2166901	2166902	CPF_0620	CPF_0621	pstA	pstB	TRUE	0.992	18.000	0.428	0.002	Y	NA
2166902	2166903	CPF_0621	CPF_0622	pstB	phoU	TRUE	0.972	25.000	0.016	NA	Y	NA
2166903	2166904	CPF_0622	CPF_0623	phoU		FALSE	0.140	160.000	0.000	NA	N	NA
2166905	2166906	CPF_0624	CPF_0625			FALSE	0.327	34.000	0.000	NA		NA
2166906	2166907	CPF_0625	CPF_0626		glnS	FALSE	0.021	414.000	0.000	1.000	N	NA
2166907	2166908	CPF_0626	CPF_0627	glnS		FALSE	0.050	254.000	0.000	NA		NA
2166908	2166909	CPF_0627	CPF_0628			FALSE	0.109	155.000	0.000	NA		NA
2166910	2166911	CPF_0629	CPF_0630			TRUE	0.982	-25.000	1.000	0.003		NA
2166911	2166912	CPF_0630	CPF_0631			FALSE	0.072	194.000	0.000	NA		NA
2166912	2166913	CPF_0631	CPF_0632			TRUE	0.793	76.000	0.062	NA		NA
2166913	2166914	CPF_0632	CPF_0633		tyrS	FALSE	0.039	284.000	0.000	NA		NA
2166914	2166915	CPF_0633	CPF_0634	tyrS		FALSE	0.037	256.000	0.000	1.000		NA
2166915	2166916	CPF_0634	CPF_0635			TRUE	0.702	119.000	0.050	1.000		NA
2166916	2166917	CPF_0635	CPF_0636			FALSE	0.201	310.000	0.017	NA		NA
2166917	2166918	CPF_0636	CPF_0637			TRUE	0.696	118.000	0.043	NA		NA
2166918	2166919	CPF_0637	CPF_0638			TRUE	0.908	14.000	0.052	NA		NA
2166919	2166920	CPF_0638	CPF_0639			FALSE	0.104	158.000	0.000	NA		NA
2166920	2166921	CPF_0639	CPF_0640			FALSE	0.029	323.000	0.000	NA		NA
2166921	2166922	CPF_0640	CPF_0641			TRUE	0.981	9.000	0.810	NA	N	NA
2166924	2166925	CPF_0643	CPF_0644			TRUE	0.950	25.000	0.214	1.000		NA
2166925	2166926	CPF_0644	CPF_0645			TRUE	0.660	187.000	0.235	0.017		NA
2166926	2166927	CPF_0645	CPF_0646			TRUE	0.874	97.000	0.431	0.017		NA
2166927	2166928	CPF_0646	CPF_0647			TRUE	0.825	108.000	0.115	NA		NA
2166928	2166929	CPF_0647	CPF_0648			TRUE	0.806	139.000	0.154	NA		NA
2166929	2166930	CPF_0648	CPF_0649			TRUE	0.993	19.000	0.308	1.000	Y	NA
2166931	2166932	CPF_0650	CPF_0651			FALSE	0.174	107.000	0.000	NA		NA
2166932	2166933	CPF_0651	CPF_0652			FALSE	0.196	81.000	0.000	NA		NA
2166933	2166934	CPF_0652	CPF_0653			FALSE	0.037	290.000	0.000	NA		NA
2166934	2166935	CPF_0653	CPF_0654			FALSE	0.175	102.000	0.000	NA		NA
2166936	2166937	CPF_0655	CPF_0656			FALSE	0.012	508.000	0.000	NA		NA
2166939	2166940	CPF_0658	CPF_0659			FALSE	0.077	184.000	0.000	NA		NA
2166940	2166941	CPF_0659	CPF_0660			FALSE	0.321	35.000	0.000	NA		NA
2166941	2166942	CPF_0660	CPF_0661			FALSE	0.297	42.000	0.000	NA		NA
2166944	2166945	CPF_0663	CPF_0664		birA	FALSE	0.071	197.000	0.000	NA		NA
2166945	2166946	CPF_0664	CPF_0665	birA		FALSE	0.082	157.000	0.000	1.000		NA
2166946	2166947	CPF_0665	CPF_0666			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2166947	2166948	CPF_0666	CPF_0667			FALSE	0.175	101.000	0.000	NA		NA
2166948	2166949	CPF_0667	CPF_0668			FALSE	0.074	190.000	0.000	NA		NA
2166949	2166950	CPF_0668	CPF_0669		dut	FALSE	0.053	247.000	0.000	NA		NA
2166950	2166951	CPF_0669	CPF_0670	dut	thiC	FALSE	0.014	505.000	0.000	1.000	N	NA
2166951	2166952	CPF_0670	CPF_0671	thiC		FALSE	0.064	238.000	0.000	1.000	N	NA
2166952	2166953	CPF_0671	CPF_0672		purE	TRUE	0.617	311.000	0.012	1.000	Y	NA
2166953	2166954	CPF_0672	CPF_0673	purE	purC	TRUE	0.984	0.000	0.035	1.000	Y	NA
2166954	2166955	CPF_0673	CPF_0674	purC	purF	TRUE	0.976	46.000	0.082	1.000	Y	NA
2166955	2166956	CPF_0674	CPF_0675	purF	purM	TRUE	0.994	1.000	0.248	1.000	Y	NA
2166956	2166957	CPF_0675	CPF_0676	purM	purN	TRUE	0.941	-12.000	0.000	0.001	Y	NA
2166957	2166958	CPF_0676	CPF_0677	purN	purH	TRUE	0.943	13.000	0.000	1.000	Y	NA
2166958	2166959	CPF_0677	CPF_0678	purH	purD	TRUE	0.973	116.000	0.238	1.000	Y	NA
2166960	2166961	CPF_0680	CPF_0681			FALSE	0.011	533.000	0.000	NA		NA
2166962	2166963	CPF_0682	CPF_0683	argH	argG	TRUE	0.976	94.000	0.278	1.000	Y	NA
2166964	2166965	CPF_0684	CPF_0685			FALSE	0.019	400.000	0.000	NA		NA
2166965	2166966	CPF_0685	CPF_0686			FALSE	0.083	175.000	0.000	NA		NA
2166966	2166967	CPF_0686	CPF_0687		aroF	FALSE	0.093	166.000	0.000	NA		NA
2166967	2166968	CPF_0687	CPF_0688	aroF	aroB	TRUE	0.856	121.000	0.008	0.002	Y	NA
2166968	2166969	CPF_0688	CPF_0689	aroB	aroA	TRUE	0.861	193.000	0.051	1.000	Y	NA
2166969	2166970	CPF_0689	CPF_0690	aroA	aroC	TRUE	0.960	64.000	0.057	1.000	Y	NA
2166970	2166971	CPF_0690	CPF_0691	aroC		TRUE	0.738	169.000	0.004	0.002	Y	NA
2166971	2166972	CPF_0691	CPF_0692			FALSE	0.082	176.000	0.000	NA		NA
2166972	2166973	CPF_0692	CPF_0693		aroE	FALSE	0.010	554.000	0.000	NA		NA
2166973	2166974	CPF_0693	CPF_0694	aroE	aroK	TRUE	0.679	254.000	0.002	1.000	Y	NA
2166974	2166975	CPF_0694	CPF_0695	aroK	aroQ	TRUE	0.861	67.000	0.000	1.000	Y	NA
2166977	2166978	CPF_0697	CPF_0698			FALSE	0.008	737.000	0.000	NA		NA
2166978	2166979	CPF_0698	CPF_0699			FALSE	0.149	127.000	0.000	NA		NA
2166979	2166980	CPF_0699	CPF_0700			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2166980	2166981	CPF_0700	CPF_0701			FALSE	0.063	212.000	0.000	NA		NA
2166981	2166982	CPF_0701	CPF_0702			FALSE	0.090	168.000	0.000	NA		NA
2166982	2166983	CPF_0702	CPF_0703			FALSE	0.151	126.000	0.000	NA		NA
2166983	2166984	CPF_0703	CPF_0704			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2166984	2166985	CPF_0704	CPF_0705			FALSE	0.225	115.000	0.000	NA	N	NA
2166985	2166986	CPF_0705	CPF_0706			FALSE	0.009	786.000	0.000	1.000	N	NA
2166986	2166987	CPF_0706	CPF_0707			TRUE	0.985	-3.000	0.894	1.000	N	NA
2166987	2166988	CPF_0707	CPF_0708			FALSE	0.131	115.000	0.000	1.000		NA
2166989	2166990	CPF_0709	CPF_0710			FALSE	0.263	50.000	0.000	NA		NA
2166991	2166992	CPF_0711	CPF_0712			FALSE	0.036	260.000	0.000	1.000		NA
2166992	2166993	CPF_0712	CPF_0713			TRUE	0.911	77.000	0.400	1.000		NA
2166993	2166994	CPF_0713	CPF_0714			FALSE	0.045	221.000	0.000	1.000		NA
2166994	2166995	CPF_0714	CPF_0715			FALSE	0.245	55.000	0.000	NA		NA
2166995	2166996	CPF_0715	CPF_0716			FALSE	0.058	227.000	0.000	NA		NA
2166996	2166997	CPF_0716	CPF_0717			FALSE	0.070	199.000	0.000	NA		NA
2166997	2166998	CPF_0717	CPF_0718			FALSE	0.086	188.000	0.000	1.000	N	NA
2166998	2166999	CPF_0718	CPF_0719			FALSE	0.126	119.000	0.000	1.000		NA
2166999	2167000	CPF_0719	CPF_0720		splB	FALSE	0.051	204.000	0.000	1.000		NA
2167000	2167001	CPF_0720	CPF_0721	splB		FALSE	0.010	664.000	0.000	1.000	N	NA
2167001	2167002	CPF_0721	CPF_0722			FALSE	0.276	48.000	0.000	NA		NA
2167002	2167003	CPF_0722	CPF_0723			FALSE	0.026	344.000	0.000	NA		NA
2167003	2167004	CPF_0723	CPF_0724			FALSE	0.018	104.000	0.000	0.060		NA
2167004	2167005	CPF_0724	CPF_0725			FALSE	0.016	374.000	0.000	1.000		NA
2167005	2167006	CPF_0725	CPF_0726			FALSE	0.148	128.000	0.000	NA		NA
2167008	2167009	CPF_0728	CPF_0729			TRUE	0.777	106.000	0.070	NA		NA
2167009	2167010	CPF_0729	CPF_0730			TRUE	0.874	89.000	0.200	NA		NA
2167010	2167011	CPF_0730	CPF_0731			FALSE	0.178	140.000	0.000	NA	N	NA
2167011	2167012	CPF_0731	CPF_0732			FALSE	0.092	206.000	0.000	NA	N	NA
2167012	2167013	CPF_0732	CPF_0733			FALSE	0.176	123.000	0.000	1.000	N	NA
2167013	2167014	CPF_0733	CPF_0734		scrK	TRUE	0.941	21.000	0.000	1.000	Y	NA
2167015	1421454	CPF_0735	CPF_0736			FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
2167016	2167017	CPF_0737	CPF_0738	trx		FALSE	0.046	308.000	0.000	NA	N	NA
2167017	2167018	CPF_0738	CPF_0739			TRUE	0.972	26.000	0.600	NA	N	NA
2167018	2167019	CPF_0739	CPF_0740			FALSE	0.013	526.000	0.000	1.000	N	NA
2167019	2167020	CPF_0740	CPF_0741		cstA	FALSE	0.017	462.000	0.000	1.000	N	NA
2167020	2167021	CPF_0741	CPF_0742	cstA		FALSE	0.143	131.000	0.000	NA		NA
2167021	2167022	CPF_0742	CPF_0743			FALSE	0.067	204.000	0.000	NA		NA
2167024	2167025	CPF_0745	CPF_0746			TRUE	0.460	17.000	0.000	1.000	N	NA
2167025	2167026	CPF_0746	CPF_0747			FALSE	0.019	406.000	0.000	NA		NA
2167030	2167031	CPF_0751	CPF_0752			TRUE	0.796	49.000	0.040	1.000		NA
2167034	2167035	CPF_0755	CPF_0756			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
2167035	2167036	CPF_0756	CPF_0757			FALSE	0.007	576.000	0.000	1.000		NA
2167045	2167046	CPF_0766	CPF_0767			FALSE	0.021	415.000	0.000	1.000	N	NA
2167048	2167049	CPF_0769	CPF_0770		aspS	FALSE	0.060	181.000	0.000	1.000		NA
2167049	2167050	CPF_0770	CPF_0771	aspS		FALSE	0.014	410.000	0.000	1.000		NA
2167050	2167051	CPF_0771	CPF_0772			FALSE	0.184	90.000	0.000	NA		NA
2167051	2167052	CPF_0772	CPF_0773			TRUE	0.948	9.000	0.000	NA	Y	NA
2167052	2167053	CPF_0773	CPF_0774			FALSE	0.112	153.000	0.000	NA		NA
2167053	2167054	CPF_0774	CPF_0775			FALSE	0.035	298.000	0.000	NA		NA
2167054	2167055	CPF_0775	CPF_0776			FALSE	0.025	350.000	0.000	NA		NA
2167055	2167056	CPF_0776	CPF_0777			TRUE	0.889	43.000	0.089	NA		NA
2167056	2167057	CPF_0777	CPF_0778			FALSE	0.153	153.000	0.000	NA	N	NA
2167059	2167060	CPF_0780	CPF_0781			FALSE	0.069	219.000	0.000	1.000	N	NA
2167061	2167062	CPF_0782	CPF_0783			TRUE	0.931	27.000	0.000	1.000	Y	NA
2167063	2167064	CPF_0784	CPF_0785	ahpC		TRUE	0.580	487.000	0.084	1.000	Y	NA
2167064	2167065	CPF_0785	CPF_0786			FALSE	0.071	197.000	0.000	NA		NA
2167065	2167066	CPF_0786	CPF_0787			FALSE	0.174	108.000	0.000	NA		NA
2167066	2167067	CPF_0787	CPF_0788		panE	TRUE	0.942	36.000	0.267	NA		NA
2167067	2167068	CPF_0788	CPF_0789	panE		FALSE	0.054	261.000	0.000	1.000	N	NA
2167068	2167069	CPF_0789	CPF_0790			FALSE	0.060	219.000	0.000	NA		NA
2167069	2167070	CPF_0790	CPF_0791			FALSE	0.175	103.000	0.000	NA		NA
2167070	2167071	CPF_0791	CPF_0792			FALSE	0.191	85.000	0.000	NA		NA
2167071	2167072	CPF_0792	CPF_0793			FALSE	0.327	34.000	0.000	NA		NA
2167072	2167073	CPF_0793	CPF_0794			FALSE	0.061	247.000	0.000	1.000	N	NA
2167075	2167076	CPF_0796	CPF_0797			FALSE	0.087	171.000	0.000	NA		NA
2167078	2167079	CPF_0799	CPF_0800			FALSE	0.148	128.000	0.000	NA		NA
2167079	2167080	CPF_0800	CPF_0801			FALSE	0.059	184.000	0.000	1.000		NA
2167080	2167081	CPF_0801	CPF_0802			FALSE	0.041	296.000	0.000	1.000	N	NA
2167081	2167082	CPF_0802	CPF_0803			FALSE	0.041	245.000	0.000	1.000		NA
2167086	2167087	CPF_0807	CPF_0808			TRUE	0.986	99.000	0.889	1.000	Y	NA
2167087	2167088	CPF_0808	CPF_0809			TRUE	0.991	4.000	0.217	0.035	Y	NA
2167088	2167089	CPF_0809	CPF_0810			TRUE	0.937	158.000	0.121	1.000	Y	NA
2167089	2167090	CPF_0810	CPF_0811			FALSE	0.035	319.000	0.000	1.000	N	NA
2167090	2167091	CPF_0811	CPF_0812			FALSE	0.214	68.000	0.000	NA		NA
2167091	2167092	CPF_0812	CPF_0813			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2167094	2167095	CPF_0815	CPF_0816		ddl	FALSE	0.079	201.000	0.000	1.000	N	NA
2167095	2167096	CPF_0816	CPF_0817	ddl		FALSE	0.091	147.000	0.000	1.000		NA
2167096	2167097	CPF_0817	CPF_0818			FALSE	0.021	327.000	0.000	1.000		NA
2167097	2167098	CPF_0818	CPF_0819			TRUE	0.989	51.000	0.943	0.016	Y	NA
2167098	2167099	CPF_0819	CPF_0820			TRUE	0.994	20.000	0.812	0.016	Y	NA
2167099	2167100	CPF_0820	CPF_0821			TRUE	0.832	171.000	0.583	NA		NA
2167100	2167101	CPF_0821	CPF_0822			FALSE	0.020	384.000	0.000	NA		NA
2167101	2167102	CPF_0822	CPF_0823			FALSE	0.058	226.000	0.000	NA		NA
2167102	2167103	CPF_0823	CPF_0824			FALSE	0.014	459.000	0.000	NA		NA
2167103	2167104	CPF_0824	CPF_0825			FALSE	0.049	257.000	0.000	NA		NA
2167104	2167105	CPF_0825	CPF_0826			FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
2167105	2167106	CPF_0826	CPF_0827			FALSE	0.008	794.000	0.000	NA		NA
2167106	2167107	CPF_0827	CPF_0828			FALSE	0.146	129.000	0.000	NA		NA
2167107	2167108	CPF_0828	CPF_0829			FALSE	0.253	52.000	0.000	NA		NA
2167108	2167109	CPF_0829	CPF_0830			TRUE	0.993	0.000	0.375	0.006	Y	NA
2167109	2167110	CPF_0830	CPF_0831			FALSE	0.046	217.000	0.000	1.000		NA
2167110	2167111	CPF_0831	CPF_0832			TRUE	0.894	9.000	0.039	NA		NA
2167111	2167112	CPF_0832	CPF_0833		arsR	FALSE	0.022	369.000	0.000	NA		NA
2167112	2167113	CPF_0833	CPF_0834	arsR	arsC	FALSE	0.184	119.000	0.000	1.000	N	NA
2167113	2167114	CPF_0834	CPF_0835	arsC		TRUE	0.460	17.000	0.000	1.000	N	NA
2167114	2167115	CPF_0835	CPF_0836			FALSE	0.084	192.000	0.000	1.000	N	NA
2167115	2167116	CPF_0836	CPF_0837			TRUE	0.956	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
2167116	2167117	CPF_0837	CPF_0838			FALSE	0.029	284.000	0.000	1.000		NA
2167117	2167118	CPF_0838	CPF_0839			TRUE	0.539	-25.000	0.000	NA		NA
2167118	2167119	CPF_0839	CPF_0840		cloSI	FALSE	0.031	315.000	0.000	NA		NA
2167119	2167120	CPF_0840	CPF_0841	cloSI		FALSE	0.033	271.000	0.000	1.000		NA
2167120	1421560	CPF_0841	CPF_0842			TRUE	0.514	-10.000	0.000	NA		NA
1421560	2167121	CPF_0842	CPF_0843			FALSE	0.040	280.000	0.000	NA		NA
2167123	2167124	CPF_0845	CPF_0846			FALSE	0.095	165.000	0.000	NA		NA
2167124	2167125	CPF_0846	CPF_0847		rbr	FALSE	0.067	205.000	0.000	NA		NA
2167125	2167126	CPF_0847	CPF_0848	rbr		FALSE	0.013	526.000	0.000	1.000	N	NA
2167128	2167129	CPF_0850	CPF_0851			FALSE	0.044	314.000	0.000	NA	N	NA
2167131	2167132	CPF_0853	CPF_0854		glxK	TRUE	0.863	224.000	0.078	1.000	Y	NA
2167132	2167133	CPF_0854	CPF_0855	glxK	deaD	FALSE	0.010	659.000	0.000	1.000	N	NA
2167133	2167134	CPF_0855	CPF_0856	deaD		FALSE	0.109	155.000	0.000	NA		NA
2167134	2167135	CPF_0856	CPF_0857			FALSE	0.074	189.000	0.000	NA		NA
2167135	2167136	CPF_0857	CPF_0858			FALSE	0.136	107.000	0.000	1.000		NA
2167136	2167137	CPF_0858	CPF_0859			FALSE	0.017	368.000	0.000	1.000		NA
2167137	2167138	CPF_0859	CPF_0860			FALSE	0.047	261.000	0.000	NA		NA
2167141	2167142	CPF_0863	CPF_0864			TRUE	0.456	3.000	0.000	NA		NA
2167142	2167143	CPF_0864	CPF_0865			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2167144	2167145	CPF_0866	CPF_0867			FALSE	0.055	239.000	0.000	NA		NA
2167145	2167146	CPF_0867	CPF_0868			FALSE	0.175	103.000	0.000	NA		NA
2167146	2167147	CPF_0868	CPF_0869			FALSE	0.136	104.000	0.000	1.000		NA
2167148	2167149	CPF_0870	CPF_0871			FALSE	0.099	162.000	0.000	NA		NA
2167149	1421590	CPF_0871	CPF_0872			FALSE	0.070	198.000	0.000	NA		NA
2167154	2167155	CPF_0877	CPF_0878			FALSE	0.212	69.000	0.000	NA		NA
2167155	2167156	CPF_0878	CPF_0879			TRUE	0.984	-3.000	0.833	NA		NA
2167157	2167158	CPF_0880	CPF_0881			FALSE	0.022	325.000	0.000	1.000		NA
2167159	2167160	CPF_0882	CPF_0883			FALSE	0.183	91.000	0.000	NA		NA
2167160	2167161	CPF_0883	CPF_0884			FALSE	0.022	368.000	0.000	NA		NA
2167161	2167162	CPF_0884	CPF_0885			FALSE	0.044	268.000	0.000	NA		NA
2167162	2167163	CPF_0885	CPF_0886		eutS	FALSE	0.028	354.000	0.000	1.000	N	NA
2167163	2167164	CPF_0886	CPF_0887	eutS	eutP	TRUE	0.948	4.000	0.000	1.000	Y	NA
2167164	2167165	CPF_0887	CPF_0888	eutP		TRUE	0.458	18.000	0.000	1.000	N	NA
2167165	2167166	CPF_0888	CPF_0889			TRUE	0.994	4.000	0.388	1.000	Y	NA
2167166	2167167	CPF_0889	CPF_0890		eutA	FALSE	0.086	216.000	0.000	NA	N	NA
2167167	2167168	CPF_0890	CPF_0891	eutA		TRUE	0.995	19.000	0.600	NA	Y	NA
2167168	2167169	CPF_0891	CPF_0892			TRUE	0.985	17.000	0.119	0.001	Y	NA
2167169	2167170	CPF_0892	CPF_0893		eutL	TRUE	0.995	22.000	0.617	1.000	Y	NA
2167170	2167171	CPF_0893	CPF_0894	eutL		TRUE	0.974	13.000	0.468	NA	N	NA
2167171	2167172	CPF_0894	CPF_0895			TRUE	0.996	0.000	0.442	NA	Y	NA
2167172	2167173	CPF_0895	CPF_0896		eutM	TRUE	0.840	355.000	0.349	NA	Y	NA
2167173	2167174	CPF_0896	CPF_0897	eutM	eutT	TRUE	0.916	78.000	0.357	NA	N	NA
2167174	2167175	CPF_0897	CPF_0898	eutT		TRUE	0.974	10.000	0.452	NA	N	NA
2167175	2167176	CPF_0898	CPF_0899			TRUE	0.736	229.000	0.459	NA		NA
2167176	2167177	CPF_0899	CPF_0900			TRUE	0.864	147.000	0.487	NA		NA
2167177	2167178	CPF_0900	CPF_0901			TRUE	0.995	2.000	0.385	NA	Y	NA
2167178	2167179	CPF_0901	CPF_0902			TRUE	0.950	51.000	0.552	NA	N	NA
2167179	2167180	CPF_0902	CPF_0903			TRUE	0.996	3.000	0.759	NA	Y	NA
2167180	2167181	CPF_0903	CPF_0904			FALSE	0.031	369.000	0.000	NA	N	NA
2167181	2167182	CPF_0904	CPF_0905			FALSE	0.012	432.000	0.000	1.000		NA
2167182	2167183	CPF_0905	CPF_0906			FALSE	0.037	292.000	0.000	NA		NA
2167183	2167184	CPF_0906	CPF_0907			FALSE	0.186	89.000	0.000	NA		NA
2167184	2167185	CPF_0907	CPF_0908			FALSE	0.179	94.000	0.000	NA		NA
2167185	2167186	CPF_0908	CPF_0909			FALSE	0.195	82.000	0.000	NA		NA
2167186	2167187	CPF_0909	CPF_0910			FALSE	0.053	247.000	0.000	NA		NA
2167187	2167188	CPF_0910	CPF_0911			TRUE	0.941	113.000	0.049	1.000	Y	NA
2167188	2167189	CPF_0911	CPF_0912			TRUE	0.994	6.000	0.382	NA	Y	NA
2167189	2167190	CPF_0912	CPF_0913			TRUE	0.986	23.000	0.071	NA	Y	NA
2167190	2167191	CPF_0913	CPF_0914			TRUE	0.963	-13.000	0.000	NA	Y	NA
2167191	2167192	CPF_0914	CPF_0915			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
2167192	2167193	CPF_0915	CPF_0916			FALSE	0.311	37.000	0.000	NA		NA
2167193	2167194	CPF_0916	CPF_0917			FALSE	0.396	24.000	0.000	NA		NA
2167194	2167195	CPF_0917	CPF_0918			TRUE	0.946	16.000	0.000	NA	Y	NA
2167195	2167196	CPF_0918	CPF_0919			TRUE	0.518	0.000	0.000	1.000	N	NA
2167196	2167197	CPF_0919	CPF_0920			FALSE	0.099	162.000	0.000	NA		NA
2167197	2167198	CPF_0920	CPF_0921			FALSE	0.079	180.000	0.000	NA		NA
2167198	2167199	CPF_0921	CPF_0922			FALSE	0.055	240.000	0.000	NA		NA
2167199	2167200	CPF_0922	CPF_0923			TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
2167200	2167201	CPF_0923	CPF_0924			FALSE	0.071	195.000	0.000	NA		NA
2167202	2167203	CPF_0925	CPF_0926			FALSE	0.054	244.000	0.000	NA		NA
2167203	2167204	CPF_0926	CPF_0927			FALSE	0.180	93.000	0.000	NA		NA
2167204	2167205	CPF_0927	CPF_0928			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2167206	2167207	CPF_0929	CPF_0930			FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
2167207	2167208	CPF_0930	CPF_0932			FALSE	0.381	26.000	0.000	NA		NA
2167210	2167211	CPF_0933	CPF_0934			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2167211	2167212	CPF_0934	CPF_0935			FALSE	0.430	11.000	0.000	NA		NA
2167212	2167213	CPF_0935	CPF_0936			FALSE	0.186	89.000	0.000	NA		NA
2167213	2167214	CPF_0936	CPF_0937			FALSE	0.292	44.000	0.000	NA		NA
2167214	2167215	CPF_0937	CPF_0938			TRUE	0.479	0.000	0.000	NA		NA
2167215	2167216	CPF_0938	CPF_0939			TRUE	0.985	2.000	0.069	0.052	Y	NA
2167216	2167217	CPF_0939	CPF_0940			FALSE	0.351	18.000	0.000	1.000		NA
2167217	2167218	CPF_0940	CPF_0941			TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
2167218	2167219	CPF_0941	CPF_0942			TRUE	0.494	-6.000	0.000	NA		NA
2167219	2167220	CPF_0942	CPF_0943			FALSE	0.115	150.000	0.000	NA		NA
2167221	1421664	CPF_0945	CPF_0946			FALSE	0.043	270.000	0.000	NA		NA
1421664	2167222	CPF_0946	CPF_0947			FALSE	0.133	139.000	0.000	NA		NA
2167222	2167223	CPF_0947	CPF_0948			FALSE	0.212	69.000	0.000	NA		NA
2167223	2167224	CPF_0948	CPF_0949			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2167224	2167225	CPF_0949	CPF_0950			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
2167225	2167226	CPF_0950	CPF_0951			FALSE	0.220	64.000	0.000	NA		NA
2167226	2167227	CPF_0951	CPF_0952			TRUE	0.532	-16.000	0.000	NA		NA
2167227	2167228	CPF_0952	CPF_0953			FALSE	0.424	13.000	0.000	NA		NA
2167228	2167229	CPF_0953	CPF_0954			FALSE	0.363	28.000	0.000	NA		NA
2167229	2167230	CPF_0954	CPF_0955			FALSE	0.179	94.000	0.000	NA		NA
2167230	2167231	CPF_0955	CPF_0956			TRUE	0.958	25.000	0.273	NA		NA
2167231	2167232	CPF_0956	CPF_0957			FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
2167232	2167233	CPF_0957	CPF_0958			FALSE	0.316	36.000	0.000	NA		NA
2167233	2167234	CPF_0958	CPF_0959			TRUE	0.962	4.000	0.214	NA		NA
2167234	2167235	CPF_0959	CPF_0960			TRUE	0.982	0.000	0.750	NA		NA
2167235	2167236	CPF_0960	CPF_0961			TRUE	0.982	0.000	0.750	NA		NA
2167236	2167237	CPF_0961	CPF_0962			TRUE	0.977	10.000	0.667	NA		NA
2167237	2167238	CPF_0962	CPF_0963			FALSE	0.424	13.000	0.000	NA		NA
2167238	2167239	CPF_0963	CPF_0964			FALSE	0.186	89.000	0.000	NA		NA
2167239	2167240	CPF_0964	CPF_0965			FALSE	0.300	41.000	0.000	NA		NA
2167240	2167241	CPF_0965	CPF_0966			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
2167241	2167242	CPF_0966	CPF_0967			FALSE	0.403	23.000	0.000	NA		NA
2167242	2167243	CPF_0967	CPF_0968			FALSE	0.215	67.000	0.000	NA		NA
2167243	2167244	CPF_0968	CPF_0969			FALSE	0.316	36.000	0.000	NA		NA
2167244	2167245	CPF_0969	CPF_0970			FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
2167245	2167246	CPF_0970	CPF_0971			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
2167246	2167247	CPF_0971	CPF_0972			FALSE	0.300	41.000	0.000	NA		NA
2167247	2167248	CPF_0972	CPF_0973			FALSE	0.190	86.000	0.000	NA		NA
2167248	2167249	CPF_0973	CPF_0974			FALSE	0.017	418.000	0.000	NA		NA
2167249	2167250	CPF_0974	CPF_0975			FALSE	0.058	224.000	0.000	NA		NA
2167250	2167251	CPF_0975	CPF_0976			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
2167251	2167252	CPF_0976	CPF_0977			FALSE	0.437	7.000	0.000	NA		NA
2167254	2167255	CPF_0979	CPF_0980			FALSE	0.071	197.000	0.000	NA		NA
2167255	2167256	CPF_0980	CPF_0981			FALSE	0.311	37.000	0.000	NA		NA
2167256	2167257	CPF_0981	CPF_0982			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
2167262	2167263	CPF_0987	CPF_0988			FALSE	0.020	391.000	0.000	NA		NA
2167264	2167265	CPF_0989	CPF_0990			FALSE	0.028	330.000	0.000	NA		NA
2167265	2167266	CPF_0990	CPF_0991			FALSE	0.126	142.000	0.000	NA		NA
2167266	2167267	CPF_0991	CPF_0992			FALSE	0.090	168.000	0.000	NA		NA
2167267	2167268	CPF_0992	CPF_0993			TRUE	0.980	4.000	0.759	NA		NA
2167268	2167269	CPF_0993	CPF_0994			FALSE	0.381	26.000	0.000	NA		NA
2167270	2167271	CPF_0995	CPF_0996			FALSE	0.287	45.000	0.000	NA		NA
1421717	2167274	CPF_0999	CPF_1000			FALSE	0.223	63.000	0.000	NA		NA
2167274	2167275	CPF_1000	CPF_1001			TRUE	0.529	-15.000	0.000	NA		NA
2167277	2167278	CPF_1003	CPF_1004			FALSE	0.034	302.000	0.000	NA		NA
2167279	2167280	CPF_1005	CPF_1006	fmt		FALSE	0.062	213.000	0.000	NA		NA
2167280	2167281	CPF_1006	CPF_1007			FALSE	0.178	95.000	0.000	NA		NA
2167283	2167284	CPF_1009	CPF_1010	feoB	feoA	TRUE	0.983	18.000	0.050	1.000	Y	NA
2167285	2167286	CPF_1011	CPF_1012			TRUE	0.479	0.000	0.000	NA		NA
2167286	2167287	CPF_1012	CPF_1013			FALSE	0.347	20.000	0.000	1.000		NA
2167287	2167288	CPF_1013	CPF_1014			FALSE	0.010	490.000	0.000	1.000		NA
2167289	2167290	CPF_1015	CPF_1016			FALSE	0.061	14.000	0.000	0.008		NA
2167291	2167292	CPF_1017	CPF_1018	dcm	dcm	TRUE	0.813	60.000	0.000	0.001	Y	NA
2167293	2167294	CPF_1019	CPF_1020			FALSE	0.021	378.000	0.000	NA		NA
2167294	2167295	CPF_1020	CPF_1021			FALSE	0.138	135.000	0.000	NA		NA
2167296	2167297	CPF_1022	CPF_1023			FALSE	0.011	521.000	0.000	NA		NA
2167297	2167298	CPF_1023	CPF_1024			FALSE	0.016	441.000	0.000	NA		NA
2167298	2167299	CPF_1024	CPF_1025			FALSE	0.029	323.000	0.000	NA		NA
2167302	2167303	CPF_1028	CPF_1029			TRUE	0.717	254.000	0.462	1.000	N	NA
2167306	2167307	CPF_1032	CPF_1033			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2167307	2167308	CPF_1033	CPF_1034			FALSE	0.015	442.000	0.000	NA		NA
2167308	2167309	CPF_1034	CPF_1035			FALSE	0.015	456.000	0.000	NA		NA
2167309	2167310	CPF_1035	CPF_1036			FALSE	0.336	32.000	0.000	NA		NA
2167310	2167311	CPF_1036	CPF_1037			TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
2167312	2167313	CPF_1038	CPF_1039			FALSE	0.065	207.000	0.000	NA		NA
2167313	2167314	CPF_1039	CPF_1040			TRUE	0.850	22.000	0.021	NA		NA
2167315	2167316	CPF_1041	CPF_1042			FALSE	0.011	552.000	0.000	NA		NA
2167318	2167319	CPF_1044	CPF_1045			TRUE	0.520	-12.000	0.000	NA		NA
2167319	2167320	CPF_1045	CPF_1046		fucO	FALSE	0.087	171.000	0.000	NA		NA
2167322	2167323	CPF_1048	CPF_1049	fucI	fucK	TRUE	0.989	21.000	0.119	1.000	Y	NA
2167323	2167324	CPF_1049	CPF_1050	fucK	fucU	TRUE	0.996	-6.000	0.455	1.000	Y	NA
2167324	2167325	CPF_1050	CPF_1051	fucU	fucA	TRUE	0.991	29.000	0.333	1.000	Y	NA
2167325	2167326	CPF_1051	CPF_1052	fucA	fucP	TRUE	0.985	35.000	0.133	NA	Y	NA
2167326	2167327	CPF_1052	CPF_1053	fucP		FALSE	0.033	305.000	0.000	NA		NA
2167327	2167328	CPF_1053	CPF_1054			FALSE	0.067	205.000	0.000	NA		NA
2167328	2167329	CPF_1054	CPF_1055			FALSE	0.011	529.000	0.000	NA		NA
2167329	2167330	CPF_1055	CPF_1056			TRUE	0.823	30.000	0.023	NA		NA
2167330	2167331	CPF_1056	CPF_1057			TRUE	0.977	-7.000	0.015	0.085	Y	NA
2167331	2167332	CPF_1057	CPF_1058			FALSE	0.108	134.000	0.000	1.000		NA
2167333	2167334	CPF_1059	CPF_1060			FALSE	0.159	120.000	0.000	NA		NA
2167337	2167338	CPF_1063	CPF_1064			FALSE	0.029	325.000	0.000	NA		NA
2167338	2167339	CPF_1064	CPF_1065			FALSE	0.162	119.000	0.000	NA		NA
2167339	2167340	CPF_1065	CPF_1066			FALSE	0.012	510.000	0.000	NA		NA
2167340	2167341	CPF_1066	CPF_1067		cotJB	TRUE	0.946	13.000	0.125	NA		NA
2167341	2167342	CPF_1067	CPF_1068	cotJB	cotJC	TRUE	0.917	13.000	0.062	NA		NA
2167344	2167345	CPF_1070	CPF_1071			FALSE	0.041	277.000	0.000	NA		NA
2167345	2167346	CPF_1071	CPF_1072			FALSE	0.214	68.000	0.000	NA		NA
2167346	2167347	CPF_1072	CPF_1073			FALSE	0.007	592.000	0.000	1.000		NA
2167349	2167350	CPF_1075	CPF_1076			FALSE	0.013	482.000	0.000	NA		NA
2167350	2167351	CPF_1076	CPF_1077			FALSE	0.012	428.000	0.000	1.000		NA
2167353	2167354	CPF_1079	CPF_1080			FALSE	0.184	90.000	0.000	NA		NA
2167355	2167356	CPF_1081	CPF_1082			TRUE	0.765	240.000	0.625	1.000	N	NA
2167357	2167358	CPF_1083	CPF_1084			TRUE	0.536	-22.000	0.000	NA		NA
2167358	2167359	CPF_1084	CPF_1085			FALSE	0.300	41.000	0.000	NA		NA
2167362	2167363	CPF_1088	CPF_1089			FALSE	0.238	57.000	0.000	NA		NA
2167363	2167364	CPF_1089	CPF_1090			FALSE	0.104	158.000	0.000	NA		NA
2167365	2167366	CPF_1091	CPF_1092			FALSE	0.055	239.000	0.000	NA		NA
2167366	2167367	CPF_1092	CPF_1093			TRUE	0.980	-7.000	0.500	NA		NA
2167367	2167368	CPF_1093	CPF_1094			TRUE	0.985	-6.000	1.000	NA		NA
2167368	2167369	CPF_1094	CPF_1095			TRUE	0.974	5.000	0.500	NA		NA
2167369	2167370	CPF_1095	CPF_1096			TRUE	0.958	35.000	0.500	NA		NA
2167371	2167372	CPF_1097	CPF_1098			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
2167373	2167374	CPF_1099	CPF_1100			FALSE	0.007	2297.000	0.000	NA		NA
2167374	2167375	CPF_1100	CPF_1101			FALSE	0.056	237.000	0.000	NA		NA
2167377	2167378	CPF_1103	CPF_1104			FALSE	0.033	305.000	0.000	NA		NA
2167378	2167379	CPF_1104	CPF_1105			FALSE	0.015	450.000	0.000	NA		NA
2167379	2167380	CPF_1105	CPF_1106			TRUE	0.717	153.000	0.095	NA		NA
2167380	2167381	CPF_1106	CPF_1107			FALSE	0.090	168.000	0.000	NA		NA
2167381	2167382	CPF_1107	CPF_1108			FALSE	0.080	178.000	0.000	NA		NA
2167382	2167383	CPF_1108	CPF_1109			FALSE	0.028	328.000	0.000	NA		NA
2167385	2167386	CPF_1111	CPF_1112			TRUE	0.921	18.000	0.000	0.014	Y	NA
2167386	2167387	CPF_1112	CPF_1113			FALSE	0.046	282.000	0.000	1.000	N	NA
2167387	2167388	CPF_1113	CPF_1114			TRUE	0.799	88.000	0.000	0.033	Y	NA
2167388	2167389	CPF_1114	CPF_1115			TRUE	0.942	-3.000	0.000	0.033	Y	NA
2167389	2167390	CPF_1115	CPF_1116			FALSE	0.415	20.000	0.000	NA		NA
2167390	2167391	CPF_1116	CPF_1117			FALSE	0.424	13.000	0.000	NA		NA
2167391	2167392	CPF_1117	CPF_1118			TRUE	0.931	81.000	0.667	NA		NA
2167392	2167393	CPF_1118	CPF_1119		gngC	FALSE	0.177	96.000	0.000	NA		NA
2167395	2167396	CPF_1121	CPF_1122			FALSE	0.037	290.000	0.000	NA		NA
2167396	2167397	CPF_1122	CPF_1123			FALSE	0.013	478.000	0.000	NA		NA
2167397	2167398	CPF_1123	CPF_1124			FALSE	0.009	590.000	0.000	NA		NA
2167399	2167400	CPF_1125	CPF_1126	feoB		TRUE	0.906	215.000	0.164	1.000	Y	NA
2167400	2167401	CPF_1126	CPF_1127		feoA	TRUE	0.984	31.000	0.195	0.009	Y	NA
2167401	2167402	CPF_1127	CPF_1128	feoA		FALSE	0.263	50.000	0.000	NA		NA
2167402	2167403	CPF_1128	CPF_1129			FALSE	0.007	1168.000	0.000	NA		NA
2167404	2167405	CPF_1130	CPF_1131			FALSE	0.069	201.000	0.000	NA		NA
2167405	2167406	CPF_1131	CPF_1132			FALSE	0.078	181.000	0.000	NA		NA
2167406	2167407	CPF_1132	CPF_1133			FALSE	0.008	724.000	0.000	NA		NA
2167407	2167408	CPF_1133	CPF_1134			FALSE	0.052	249.000	0.000	NA		NA
2167410	2167411	CPF_1136	CPF_1137			FALSE	0.050	255.000	0.000	NA		NA
2167411	2167412	CPF_1137	CPF_1138			FALSE	0.110	154.000	0.000	NA		NA
2167412	2167413	CPF_1138	CPF_1139			FALSE	0.040	280.000	0.000	NA		NA
2167413	2167414	CPF_1139	CPF_1140			TRUE	0.995	4.000	0.606	1.000	Y	NA
2167414	2167415	CPF_1140	CPF_1141			FALSE	0.053	248.000	0.000	NA		NA
2167415	2167416	CPF_1141	CPF_1142			TRUE	0.927	96.000	0.750	NA		NA
2167416	2167417	CPF_1142	CPF_1143			TRUE	0.894	96.000	0.333	NA		NA
2167417	2167418	CPF_1143	CPF_1144			FALSE	0.071	196.000	0.000	NA		NA
2167418	2167419	CPF_1144	CPF_1145			FALSE	0.069	220.000	0.000	1.000	N	NA
2167421	2167422	CPF_1147	CPF_1148			FALSE	0.058	227.000	0.000	NA		NA
2167422	2167423	CPF_1148	CPF_1149			FALSE	0.028	331.000	0.000	NA		NA
2167423	2167424	CPF_1149	CPF_1150			FALSE	0.300	41.000	0.000	NA		NA
2167424	2167425	CPF_1150	CPF_1151			FALSE	0.060	220.000	0.000	NA		NA
2167425	2167426	CPF_1151	CPF_1152			FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
2167426	2167427	CPF_1152	CPF_1153		mgtA	FALSE	0.009	591.000	0.000	NA		NA
2167427	2167428	CPF_1153	CPF_1154	mgtA		FALSE	0.018	110.000	0.000	0.055	N	NA
2167428	2167429	CPF_1154	CPF_1155			FALSE	0.032	276.000	0.000	1.000		NA
2167431	2167432	CPF_1157	CPF_1158			FALSE	0.061	178.000	0.000	1.000		NA
2167434	2167435	CPF_1160	CPF_1161			FALSE	0.363	28.000	0.000	NA		NA
2167435	2167436	CPF_1161	CPF_1162			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2167436	2167437	CPF_1162	CPF_1163			FALSE	0.191	85.000	0.000	NA		NA
2167437	2167438	CPF_1163	CPF_1164			FALSE	0.045	222.000	0.000	1.000		NA
2167438	2167439	CPF_1164	CPF_1165			FALSE	0.237	70.000	0.000	1.000	N	NA
2167439	2167440	CPF_1165	CPF_1166			FALSE	0.040	281.000	0.000	NA		NA
2167440	2167441	CPF_1166	CPF_1167			FALSE	0.372	27.000	0.000	NA		NA
2167441	2167442	CPF_1167	CPF_1168			FALSE	0.212	69.000	0.000	NA		NA
2167442	2167443	CPF_1168	CPF_1169			FALSE	0.081	177.000	0.000	NA		NA
2167443	2167444	CPF_1169	CPF_1170			FALSE	0.057	229.000	0.000	NA		NA
2167444	2167445	CPF_1170	CPF_1171			FALSE	0.007	187.000	0.000	0.060	N	NA
2167445	2167446	CPF_1171	CPF_1172			TRUE	0.992	20.000	0.500	0.014	Y	NA
2167446	2167447	CPF_1172	CPF_1173			FALSE	0.031	338.000	0.000	1.000	N	NA
2167447	2167448	CPF_1173	CPF_1174			TRUE	0.971	14.000	1.000	0.001		NA
2167448	2167449	CPF_1174	CPF_1175			TRUE	0.960	20.000	0.600	0.001		NA
2167449	2167450	CPF_1175	CPF_1176		dhaF	TRUE	0.977	17.000	0.714	NA		NA
2167450	2167451	CPF_1176	CPF_1177	dhaF	dhaG	TRUE	0.980	-7.000	0.500	NA		NA
2167451	2167452	CPF_1177	CPF_1178	dhaG		TRUE	0.902	19.000	0.049	NA		NA
2167452	2167453	CPF_1178	CPF_1179			TRUE	0.906	24.000	0.061	NA		NA
2167453	2167454	CPF_1179	CPF_1180		dhaT	TRUE	0.700	94.000	0.037	NA		NA
2167454	2167455	CPF_1180	CPF_1181	dhaT		FALSE	0.011	585.000	0.000	1.000	N	NA
2167455	2167456	CPF_1181	CPF_1182			FALSE	0.028	290.000	0.000	1.000		NA
2167456	2167457	CPF_1182	CPF_1183			FALSE	0.019	348.000	0.000	1.000		NA
2167458	2167459	CPF_1184	CPF_1185			FALSE	0.167	116.000	0.000	NA		NA
2167459	2167460	CPF_1185	CPF_1186			FALSE	0.172	111.000	0.000	NA		NA
2167460	2167461	CPF_1186	CPF_1187			FALSE	0.403	23.000	0.000	NA		NA
2167463	2167464	CPF_1189	CPF_1190			FALSE	0.049	257.000	0.000	NA		NA
2167465	2167466	CPF_1191	CPF_1192			FALSE	0.020	344.000	0.000	1.000		NA
2167466	2167467	CPF_1192	CPF_1193			TRUE	0.760	210.000	0.429	1.000	N	NA
2167467	2167468	CPF_1193	CPF_1194			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2167468	2167469	CPF_1194	CPF_1195		hpkA	FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
2167471	2167472	CPF_1197	CPF_1198			FALSE	0.061	217.000	0.000	NA		NA
2167472	2167473	CPF_1198	CPF_1199			FALSE	0.074	211.000	0.000	1.000	N	NA
2167473	2167474	CPF_1199	CPF_1200			TRUE	0.921	56.000	0.286	NA		NA
2167474	2167475	CPF_1200	CPF_1201			TRUE	0.962	11.000	0.231	NA		NA
2167476	2167477	CPF_1202	CPF_1203			FALSE	0.175	102.000	0.000	NA		NA
2167477	2167478	CPF_1203	CPF_1204			FALSE	0.073	192.000	0.000	NA		NA
2167481	2167482	CPF_1207	CPF_1208			FALSE	0.065	207.000	0.000	NA		NA
2167482	2167483	CPF_1208	CPF_1209			FALSE	0.044	269.000	0.000	NA		NA
2167483	2167484	CPF_1209	CPF_1210		kdpA	TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2167484	2167485	CPF_1210	CPF_1211	kdpA	kdpB	TRUE	0.984	14.000	0.112	0.001	Y	NA
2167485	2167486	CPF_1211	CPF_1212	kdpB	kdpC	TRUE	0.994	15.000	0.877	0.001	Y	NA
2167486	2167487	CPF_1212	CPF_1213	kdpC	kdpD	FALSE	0.066	12.000	0.000	0.083	N	NA
2167487	2167488	CPF_1213	CPF_1214	kdpD	kdpE	TRUE	0.992	-25.000	0.081	1.000	Y	NA
2167488	2167489	CPF_1214	CPF_1215	kdpE		FALSE	0.393	2.000	0.000	1.000		NA
2167489	2167490	CPF_1215	CPF_1216			FALSE	0.054	243.000	0.000	NA		NA
2167492	2167493	CPF_1218	CPF_1219			FALSE	0.172	111.000	0.000	NA		NA
2167495	2167496	CPF_1221	CPF_1222	lacZ		FALSE	0.016	375.000	0.000	1.000		NA
2167496	2167497	CPF_1222	CPF_1223			FALSE	0.008	537.000	0.000	1.000		NA
2167497	2167498	CPF_1223	CPF_1224			FALSE	0.028	332.000	0.000	NA		NA
2167498	2167499	CPF_1224	CPF_1225			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2167499	2167500	CPF_1225	CPF_1226			FALSE	0.104	158.000	0.000	NA		NA
2167501	2167502	CPF_1227	CPF_1228			FALSE	0.356	29.000	0.000	NA		NA
2167504	2167505	CPF_1230	CPF_1231			FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
2167505	2167506	CPF_1231	CPF_1232			FALSE	0.031	316.000	0.000	NA		NA
2167507	2167508	CPF_1233	CPF_1234			FALSE	0.095	165.000	0.000	NA		NA
2167509	2167510	CPF_1235	CPF_1236			FALSE	0.204	528.000	0.000	1.000	Y	NA
2167510	2167511	CPF_1236	CPF_1237			FALSE	0.131	150.000	0.000	1.000	N	NA
2167512	2167513	CPF_1238	CPF_1239			FALSE	0.164	118.000	0.000	NA		NA
2167514	2167515	CPF_1240	CPF_1241		spoVAF	FALSE	0.111	131.000	0.000	1.000		NA
2167515	2167516	CPF_1241	CPF_1242	spoVAF		FALSE	0.005	233.000	0.000	0.059		NA
2167517	2167518	CPF_1243	CPF_1244			FALSE	0.006	224.000	0.000	0.082	N	NA
2167518	2167519	CPF_1244	CPF_1245		sdhB	FALSE	0.372	32.000	0.000	1.000	N	NA
2167519	2167520	CPF_1245	CPF_1246	sdhB	sdhA	TRUE	0.985	4.000	0.098	0.002	Y	NA
2167526	2167527	CPF_1252	CPF_1253			FALSE	0.030	319.000	0.000	NA		NA
2167527	2167528	CPF_1253	CPF_1254			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2167528	2167529	CPF_1254	CPF_1255		gltX	FALSE	0.009	667.000	0.000	NA		NA
2167529	2167530	CPF_1255	CPF_1256	gltX		FALSE	0.082	176.000	0.000	NA		NA
2167530	2167531	CPF_1256	CPF_1257			FALSE	0.057	228.000	0.000	NA		NA
2167532	2167533	CPF_1258	CPF_1259	aspD		FALSE	0.142	132.000	0.000	NA		NA
2167534	2167535	CPF_1260	CPF_1261		hprK	FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
2167535	2167536	CPF_1261	CPF_1262	hprK		FALSE	0.320	45.000	0.000	1.000	N	NA
2167536	2167537	CPF_1262	CPF_1263			TRUE	0.747	67.000	0.034	1.000	N	NA
2167537	2167538	CPF_1263	CPF_1264			FALSE	0.175	125.000	0.000	1.000	N	NA
2167538	2167539	CPF_1264	CPF_1265		mgsA	FALSE	0.103	169.000	0.000	1.000	N	NA
2167539	2167540	CPF_1265	CPF_1266	mgsA		FALSE	0.072	193.000	0.000	NA		NA
2167540	2167541	CPF_1266	CPF_1267			FALSE	0.193	84.000	0.000	NA		NA
2167541	2167542	CPF_1267	CPF_1268			FALSE	0.292	44.000	0.000	NA		NA
2167543	2167544	CPF_1269	CPF_1270			FALSE	0.051	205.000	0.000	1.000		NA
2167545	2167546	CPF_1271	CPF_1272	pabA	pabB	TRUE	0.993	6.000	0.250	1.000	Y	NA
2167546	2167547	CPF_1272	CPF_1273	pabB		TRUE	0.953	54.000	0.027	1.000	Y	NA
2167547	2167548	CPF_1273	CPF_1274		folE	TRUE	0.973	15.000	0.011	1.000	Y	NA
2167548	2167549	CPF_1274	CPF_1275	folE		TRUE	0.914	26.000	0.081	1.000		NA
2167549	2167550	CPF_1275	CPF_1276		folP	TRUE	0.972	13.000	0.533	1.000		NA
2167550	2167551	CPF_1276	CPF_1277	folP	folBK	TRUE	0.967	13.000	0.019	0.005	Y	NA
2167553	2167554	CPF_1279	CPF_1281			FALSE	0.022	369.000	0.000	NA		NA
2167557	2167558	CPF_1282	CPF_1284		crcB	TRUE	0.884	20.000	0.038	NA		NA
2167559	2167560	CPF_1285	CPF_1286			FALSE	0.046	219.000	0.000	1.000		NA
2167560	2167561	CPF_1286	CPF_1287			FALSE	0.048	212.000	0.000	1.000		NA
2167563	2167564	CPF_1289	CPF_1290	cobT		TRUE	0.981	38.000	0.104	1.000	Y	NA
2167564	2167565	CPF_1290	CPF_1291		cobS	TRUE	0.992	-16.000	0.092	1.000	Y	NA
2167565	2167566	CPF_1291	CPF_1292	cobS		TRUE	0.872	14.000	0.026	NA		NA
2167566	2167567	CPF_1292	CPF_1293			TRUE	0.973	5.000	0.434	NA		NA
2167567	2167568	CPF_1293	CPF_1294		cobB	TRUE	0.946	3.000	0.094	1.000	N	NA
2167568	2167569	CPF_1294	CPF_1295	cobB		TRUE	0.824	-3.000	0.017	0.012	N	NA
2167569	2167570	CPF_1295	CPF_1296			FALSE	0.012	574.000	0.000	1.000	N	NA
2167570	2167571	CPF_1296	CPF_1297			TRUE	0.990	-13.000	0.061	1.000	Y	NA
2167571	2167572	CPF_1297	CPF_1298			TRUE	0.990	5.000	0.119	1.000	Y	NA
2167572	2167573	CPF_1298	CPF_1299			TRUE	0.881	10.000	0.030	NA		NA
2167573	2167574	CPF_1299	CPF_1300		cobQ	TRUE	0.806	10.000	0.005	NA		NA
2167574	2167575	CPF_1300	CPF_1301	cobQ		FALSE	0.049	276.000	0.000	1.000	N	NA
2167575	2167576	CPF_1301	CPF_1302			FALSE	0.141	93.000	0.000	1.000		NA
2167576	2167577	CPF_1302	CPF_1303			FALSE	0.059	223.000	0.000	NA		NA
2167577	2167578	CPF_1303	CPF_1304			FALSE	0.059	222.000	0.000	NA		NA
2167578	2167579	CPF_1304	CPF_1305		mtnN	FALSE	0.036	293.000	0.000	NA		NA
2167580	2167581	CPF_1306	CPF_1307		cfa	FALSE	0.100	161.000	0.000	NA		NA
2167582	2167583	CPF_1308	CPF_1309			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
2167583	2167584	CPF_1309	CPF_1310			FALSE	0.034	304.000	0.000	NA		NA
2167584	2167585	CPF_1310	CPF_1311			FALSE	0.073	191.000	0.000	NA		NA
2167585	2167586	CPF_1311	CPF_1312		hisK	FALSE	0.077	184.000	0.000	NA		NA
2167587	2167588	CPF_1313	CPF_1314		nadE	FALSE	0.018	360.000	0.000	1.000		NA
2167589	2167590	CPF_1315	CPF_1316			TRUE	0.993	20.000	0.313	NA	Y	NA
2167590	2167591	CPF_1316	CPF_1317			FALSE	0.092	180.000	0.000	1.000	N	NA
2167591	2167592	CPF_1317	CPF_1318		rnfG	FALSE	0.066	233.000	0.000	1.000	N	NA
2167592	2167593	CPF_1318	CPF_1319	rnfG	rnfE	TRUE	0.984	18.000	0.091	0.038	Y	NA
2167593	2167594	CPF_1319	CPF_1320	rnfE	rnfA	TRUE	0.987	31.000	0.237	0.038	Y	NA
2167594	2167595	CPF_1320	CPF_1321	rnfA	rnfB	TRUE	0.990	17.000	0.221	0.038	Y	NA
2167595	2167596	CPF_1321	CPF_1322	rnfB		FALSE	0.248	64.000	0.000	1.000	N	NA
2167596	2167597	CPF_1322	CPF_1323			FALSE	0.099	172.000	0.000	1.000	N	NA
2167597	2167598	CPF_1323	CPF_1324		fabH	TRUE	0.948	2.000	0.098	1.000	N	NA
2167598	2167599	CPF_1324	CPF_1325	fabH	fabD	TRUE	0.767	97.000	0.000	0.005	Y	NA
2167599	2167600	CPF_1325	CPF_1326	fabD	fabG	TRUE	0.988	4.000	0.149	0.005	Y	NA
2167600	2167601	CPF_1326	CPF_1327	fabG	fabF	TRUE	0.992	15.000	0.236	1.000	Y	NA
2167601	2167602	CPF_1327	CPF_1328	fabF	accB	TRUE	0.987	12.000	0.074	1.000	Y	NA
2167602	2167603	CPF_1328	CPF_1329	accB	fabZ	TRUE	0.979	3.000	0.047	0.005	Y	NA
2167603	2167604	CPF_1329	CPF_1330	fabZ	accC	TRUE	0.982	12.000	0.045	1.000	Y	NA
2167604	2167605	CPF_1330	CPF_1331	accC	accD	TRUE	0.987	-7.000	0.090	0.002	Y	NA
2167605	2167606	CPF_1331	CPF_1332	accD	accA	TRUE	0.992	-7.000	0.234	0.001	Y	NA
2167610	2167611	CPF_1336	CPF_1337	rluB		TRUE	0.812	6.000	0.008	1.000		NA
2167611	2167612	CPF_1337	CPF_1338			FALSE	0.275	32.000	0.000	1.000		NA
2167612	2167613	CPF_1338	CPF_1339			TRUE	0.594	217.000	0.124	1.000		NA
2167613	2167614	CPF_1339	CPF_1340		cmk	TRUE	0.653	122.000	0.039	1.000		NA
2167614	2167615	CPF_1340	CPF_1341	cmk	ispH	TRUE	0.937	2.000	0.070	1.000	N	NA
2167615	2167616	CPF_1341	CPF_1342	ispH		FALSE	0.135	110.000	0.000	1.000		NA
2167618	2167619	CPF_1344	CPF_1345			FALSE	0.133	139.000	0.000	NA		NA
2167620	2167621	CPF_1346	CPF_1347			FALSE	0.077	184.000	0.000	NA		NA
2167622	2167623	CPF_1348	CPF_1349		miaB	FALSE	0.088	186.000	0.000	1.000	N	NA
2167623	2167624	CPF_1349	CPF_1350	miaB	ppcA	FALSE	0.011	456.000	0.000	1.000		NA
2167626	2167627	CPF_1352	CPF_1353			FALSE	0.035	298.000	0.000	NA		NA
2167627	2167628	CPF_1353	CPF_1354			FALSE	0.014	464.000	0.000	NA		NA
2167628	2167629	CPF_1354	CPF_1355			FALSE	0.169	114.000	0.000	NA		NA
2167629	2167630	CPF_1355	CPF_1356		pfl	FALSE	0.023	367.000	0.000	NA		NA
2167630	2167631	CPF_1356	CPF_1357	pfl	pflA	TRUE	0.875	80.000	0.163	1.000	N	NA
2167631	2167632	CPF_1357	CPF_1358	pflA	mutS	FALSE	0.053	263.000	0.000	1.000	N	NA
2167632	2167633	CPF_1358	CPF_1359	mutS	mutL	TRUE	0.986	27.000	0.220	0.002	Y	NA
2167633	2167634	CPF_1359	CPF_1360	mutL	miaA	TRUE	0.938	18.000	0.097	1.000	N	NA
2167634	2167635	CPF_1360	CPF_1361	miaA		TRUE	0.921	44.000	0.192	1.000		NA
2167635	2167636	CPF_1361	CPF_1362			TRUE	0.754	105.000	0.064	1.000		NA
2167636	2167637	CPF_1362	CPF_1363			FALSE	0.048	259.000	0.000	NA		NA
2167640	2167641	CPF_1366	CPF_1367			FALSE	0.012	516.000	0.000	NA		NA
2167647	2167648	CPF_1373	CPF_1374			FALSE	0.223	63.000	0.000	NA		NA
2167648	2167649	CPF_1374	CPF_1375			FALSE	0.018	352.000	0.000	1.000		NA
2167653	2167654	CPF_1379	CPF_1380			FALSE	0.270	49.000	0.000	NA		NA
2167654	2167655	CPF_1380	CPF_1381		pyrE	FALSE	0.104	158.000	0.000	NA		NA
2167655	2167656	CPF_1381	CPF_1382	pyrE	pyrD	TRUE	0.919	149.000	0.060	1.000	Y	NA
2167656	2167657	CPF_1382	CPF_1383	pyrD	pyrK	TRUE	0.975	20.000	0.592	1.000	N	NA
2167657	2167658	CPF_1383	CPF_1384	pyrK	pyrF	TRUE	0.908	25.000	0.112	0.003	N	NA
2167658	2167659	CPF_1384	CPF_1385	pyrF	pyrC	TRUE	0.986	10.000	0.064	1.000	Y	NA
2167659	1422104	CPF_1385	CPF_1386	pyrC		FALSE	0.409	22.000	0.000	NA		NA
1422104	2167660	CPF_1386	CPF_1387		pyrB	TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
2167660	2167661	CPF_1387	CPF_1388	pyrB		FALSE	0.023	391.000	0.000	1.000	N	NA
2167661	2167662	CPF_1388	CPF_1389			FALSE	0.401	231.000	0.036	1.000	N	NA
2167662	2167663	CPF_1389	CPF_1390			FALSE	0.072	213.000	0.000	1.000	N	NA
2167663	2167664	CPF_1390	CPF_1391		manA	FALSE	0.055	260.000	0.000	1.000	N	NA
2167665	2167666	CPF_1392	CPF_1393			TRUE	0.977	18.000	0.796	1.000		NA
2167666	2167667	CPF_1393	CPF_1394			FALSE	0.055	240.000	0.000	NA		NA
2167667	2167668	CPF_1394	CPF_1395			FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
2167671	2167672	CPF_1398	CPF_1399			FALSE	0.263	50.000	0.000	NA		NA
2167672	2167673	CPF_1399	CPF_1400			FALSE	0.168	115.000	0.000	NA		NA
2167675	2167676	CPF_1402	CPF_1403			TRUE	0.997	-13.000	0.600	1.000	Y	NA
2167676	2167677	CPF_1403	CPF_1404			TRUE	0.534	-19.000	0.000	NA		NA
2167677	2167678	CPF_1404	CPF_1405			FALSE	0.172	111.000	0.000	NA		NA
2167678	2167679	CPF_1405	CPF_1406			TRUE	0.979	9.000	0.818	NA		NA
2167679	2167680	CPF_1406	CPF_1407			FALSE	0.043	292.000	0.000	1.000	N	NA
2167680	2167681	CPF_1407	CPF_1408			FALSE	0.080	200.000	0.000	1.000	N	NA
2167681	2167682	CPF_1408	CPF_1409			FALSE	0.199	102.000	0.000	1.000	N	NA
2167682	2167683	CPF_1409	CPF_1410			FALSE	0.083	174.000	0.000	NA		NA
2167683	2167684	CPF_1410	CPF_1411			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2167686	2167687	CPF_1413	CPF_1414	spoVB		TRUE	0.943	22.000	0.137	1.000		NA
2167687	2167688	CPF_1414	CPF_1415			TRUE	0.833	60.000	0.078	1.000		NA
2167688	2167689	CPF_1415	CPF_1416			FALSE	0.050	206.000	0.000	1.000		NA
2167691	2167692	CPF_1418	CPF_1419			FALSE	0.351	30.000	0.000	NA		NA
2167694	2167695	CPF_1421	CPF_1422			FALSE	0.086	189.000	0.000	1.000	N	NA
2167695	2167696	CPF_1422	CPF_1423			FALSE	0.029	285.000	0.000	1.000		NA
2167696	2167697	CPF_1423	CPF_1424			FALSE	0.056	191.000	0.000	1.000		NA
2167697	2167698	CPF_1424	CPF_1425			TRUE	0.947	6.000	0.000	1.000	Y	NA
2167698	2167699	CPF_1425	CPF_1426			TRUE	0.839	88.000	0.000	1.000	Y	NA
2167699	2167700	CPF_1426	CPF_1427		cobK	TRUE	0.462	13.000	0.000	1.000	N	NA
2167700	2167701	CPF_1427	CPF_1428	cobK	cobJ	TRUE	0.992	19.000	0.423	0.012	Y	NA
2167701	2167702	CPF_1428	CPF_1429	cobJ	cbiG	TRUE	0.950	155.000	0.352	0.012	Y	NA
2167702	2167703	CPF_1429	CPF_1430	cbiG	cobM	TRUE	0.993	3.000	0.397	0.012	Y	NA
2167703	2167704	CPF_1430	CPF_1431	cobM	cobI	TRUE	0.981	51.000	0.291	0.012	Y	NA
2167704	2167705	CPF_1431	CPF_1432	cobI	cbiT	TRUE	0.936	0.000	0.000	0.012	Y	NA
2167705	2167706	CPF_1432	CPF_1433	cbiT	cbiE	TRUE	0.912	20.000	0.000	0.001	Y	NA
2167706	2167707	CPF_1433	CPF_1434	cbiE	cbiD	TRUE	0.951	28.000	0.008	0.012	Y	NA
2167707	2167708	CPF_1434	CPF_1435	cbiD	cobH	TRUE	0.988	18.000	0.168	0.012	Y	NA
2167708	2167709	CPF_1435	CPF_1436	cobH	cbiK	TRUE	0.954	0.000	0.000	1.000	Y	NA
2167711	2167712	CPF_1438	CPF_1439		entD	FALSE	0.044	268.000	0.000	NA		NA
2167712	2167713	CPF_1439	CPF_1440	entD		FALSE	0.020	383.000	0.000	NA		NA
2167713	2167714	CPF_1440	CPF_1441			TRUE	0.970	34.000	0.933	NA		NA
2167714	2167715	CPF_1441	CPF_1442			FALSE	0.009	515.000	0.000	1.000		NA
2167715	2167716	CPF_1442	CPF_1443			FALSE	0.173	110.000	0.000	NA		NA
2167716	1422162	CPF_1443	CPF_1444			FALSE	0.179	94.000	0.000	NA		NA
1422162	2167717	CPF_1444	CPF_1446		sodF	FALSE	0.057	232.000	0.000	NA		NA
2167717	2167718	CPF_1446	CPF_1447	sodF		FALSE	0.224	62.000	0.000	NA		NA
2167720	2167721	CPF_1449	CPF_1450		mgtE	FALSE	0.344	31.000	0.000	NA		NA
2167721	2167722	CPF_1450	CPF_1451	mgtE		FALSE	0.010	561.000	0.000	NA		NA
2167724	2167725	CPF_1453	CPF_1454			FALSE	0.280	47.000	0.000	NA		NA
2167725	2167726	CPF_1454	CPF_1455			FALSE	0.162	119.000	0.000	NA		NA
2167726	2167727	CPF_1455	CPF_1456			FALSE	0.074	190.000	0.000	NA		NA
2167727	2167728	CPF_1456	CPF_1457			FALSE	0.010	575.000	0.000	NA		NA
2167728	2167729	CPF_1457	CPF_1458			FALSE	0.173	109.000	0.000	NA		NA
2167729	2167730	CPF_1458	CPF_1459			FALSE	0.059	221.000	0.000	NA		NA
2167730	2167731	CPF_1459	CPF_1460			FALSE	0.432	10.000	0.000	NA		NA
2167731	2167732	CPF_1460	CPF_1461			FALSE	0.020	390.000	0.000	NA		NA
2167732	2167733	CPF_1461	CPF_1462			FALSE	0.079	180.000	0.000	NA		NA
2167733	2167734	CPF_1462	CPF_1463		gltA	FALSE	0.396	24.000	0.000	NA		NA
2167734	2167735	CPF_1463	CPF_1464	gltA		FALSE	0.081	-7.000	0.000	0.037	N	NA
2167735	2167736	CPF_1464	CPF_1465		adh1	TRUE	0.679	172.000	0.000	1.000	Y	NA
2167736	2167737	CPF_1465	CPF_1466	adh1		FALSE	0.195	112.000	0.000	1.000	N	NA
2167739	2167740	CPF_1468	CPF_1469			FALSE	0.035	298.000	0.000	NA		NA
2167740	2167741	CPF_1469	CPF_1470			FALSE	0.051	253.000	0.000	NA		NA
2167745	2167746	CPF_1474	CPF_1475	lacZ		FALSE	0.061	249.000	0.000	1.000	N	NA
2167746	2167747	CPF_1475	CPF_1476			TRUE	0.965	149.000	0.357	1.000	Y	NA
2167747	2167748	CPF_1476	CPF_1477			TRUE	0.967	16.000	0.318	1.000	N	NA
2167748	2167749	CPF_1477	CPF_1478			TRUE	0.985	40.000	0.273	0.031	Y	NA
2167749	2167750	CPF_1478	CPF_1479			TRUE	0.887	36.000	0.000	0.031	Y	NA
2167750	2167751	CPF_1479	CPF_1480			TRUE	0.937	2.000	0.000	0.031	Y	NA
2167751	2167752	CPF_1480	CPF_1481			FALSE	0.020	388.000	0.000	NA		NA
2167752	2167753	CPF_1481	CPF_1482			FALSE	0.070	199.000	0.000	NA		NA
2167753	2167754	CPF_1482	CPF_1483			FALSE	0.198	104.000	0.000	1.000	N	NA
2167754	2167755	CPF_1483	CPF_1484			FALSE	0.018	353.000	0.000	1.000		NA
2167755	2167756	CPF_1484	CPF_1485			TRUE	0.937	12.000	0.094	NA		NA
2167756	2167757	CPF_1485	CPF_1486			TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
2167757	2167758	CPF_1486	CPF_1487			FALSE	0.018	412.000	0.000	NA		NA
2167758	2167759	CPF_1487	CPF_1488			FALSE	0.057	232.000	0.000	NA		NA
2167759	2167760	CPF_1488	CPF_1489			FALSE	0.044	268.000	0.000	NA		NA
2167760	2167761	CPF_1489	CPF_1490			FALSE	0.011	450.000	0.000	1.000		NA
2167763	2167764	CPF_1492	CPF_1493			FALSE	0.021	379.000	0.000	NA		NA
2167764	2167765	CPF_1493	CPF_1494			FALSE	0.276	48.000	0.000	NA		NA
2167765	2167766	CPF_1494	CPF_1495			FALSE	0.124	120.000	0.000	1.000		NA
2167768	1422215	CPF_1497	CPF_3016		ssrA	FALSE	0.008	894.000	0.000	NA		NA
1422215	2167769	CPF_3016	CPF_1498	ssrA	xpt	FALSE	0.028	328.000	0.000	NA		NA
2167771	2167772	CPF_1500	CPF_1501		smpB	FALSE	0.015	449.000	0.000	NA		NA
2167772	2167773	CPF_1501	CPF_1502	smpB	rnr	FALSE	0.157	597.000	0.143	0.023	N	NA
2167773	2167774	CPF_1502	CPF_1503	rnr	secG	FALSE	0.362	289.000	0.064	1.000		NA
2167774	2167775	CPF_1503	CPF_1504	secG		FALSE	0.073	191.000	0.000	NA		NA
2167775	2167776	CPF_1504	CPF_1505		eno	FALSE	0.007	1593.000	0.000	NA		NA
2167776	2167777	CPF_1505	CPF_1506	eno		FALSE	0.020	380.000	0.000	NA		NA
2167777	2167778	CPF_1506	CPF_1507			FALSE	0.065	208.000	0.000	NA		NA
2167778	2167779	CPF_1507	CPF_1508		gpmI	FALSE	0.012	566.000	0.000	1.000	N	NA
2167779	2167780	CPF_1508	CPF_1509	gpmI	tpiA	TRUE	0.962	125.000	0.138	1.000	Y	NA
2167780	2167781	CPF_1509	CPF_1510	tpiA	pgk	TRUE	0.889	244.000	0.141	1.000	Y	NA
2167781	2167782	CPF_1510	CPF_1511	pgk	gap	TRUE	0.813	144.000	0.005	0.005	Y	NA
2167782	2167783	CPF_1511	CPF_1512	gap		TRUE	0.786	91.000	0.067	1.000	N	NA
2167783	2167784	CPF_1512	CPF_1513		rpoN	TRUE	0.801	227.000	0.034	1.000	Y	NA
2167784	2167785	CPF_1513	CPF_1514	rpoN		FALSE	0.052	251.000	0.000	NA		NA
2167785	2167786	CPF_1514	CPF_1515			TRUE	0.984	-19.000	0.639	NA		NA
2167786	2167787	CPF_1515	CPF_1516			FALSE	0.009	602.000	0.000	NA		NA
2167787	2167788	CPF_1516	CPF_1517			FALSE	0.183	91.000	0.000	NA		NA
2167788	2167789	CPF_1517	CPF_1518			TRUE	0.847	15.000	0.016	NA		NA
2167789	2167790	CPF_1518	CPF_1519			FALSE	0.146	89.000	0.000	1.000		NA
2167790	2167791	CPF_1519	CPF_1520			FALSE	0.010	158.000	0.000	0.023		NA
2167791	2167792	CPF_1520	CPF_1521			TRUE	0.810	165.000	0.333	1.000	N	NA
2167792	2167793	CPF_1521	CPF_1522		ddl	TRUE	0.854	74.000	0.000	1.000	Y	NA
2167793	2167794	CPF_1522	CPF_1523	ddl		FALSE	0.181	120.000	0.000	1.000	N	NA
2167796	2167797	CPF_1525	CPF_1526	nth	plsD	TRUE	0.832	12.000	0.011	1.000	N	NA
2167797	2167798	CPF_1526	CPF_1527	plsD		TRUE	0.877	38.000	0.064	1.000	N	NA
2167798	2167799	CPF_1527	CPF_1528		cysE	TRUE	0.689	145.000	0.064	1.000	N	NA
2167799	2167800	CPF_1528	CPF_1529	cysE	cysK	TRUE	0.983	19.000	0.101	0.001	Y	NA
2167800	2167801	CPF_1529	CPF_1530	cysK		FALSE	0.020	339.000	0.000	1.000		NA
2167802	2167803	CPF_1531	CPF_1532			TRUE	0.993	14.000	0.461	0.031	Y	NA
2167803	2167804	CPF_1532	CPF_1533			TRUE	0.981	12.000	0.039	1.000	Y	NA
2167805	2167806	CPF_1534	CPF_1535			TRUE	0.904	73.000	0.281	NA		NA
2167808	2167809	CPF_1537	CPF_1538			FALSE	0.409	22.000	0.000	NA		NA
2167809	2167810	CPF_1538	CPF_1539		spoVR	TRUE	0.702	52.000	0.014	NA		NA
2167810	2167811	CPF_1539	CPF_1540	spoVR	yhbH	TRUE	0.972	27.000	0.761	NA		NA
2167811	2167812	CPF_1540	CPF_1541	yhbH	prkA	TRUE	0.979	4.000	0.683	NA		NA
2167812	2167813	CPF_1541	CPF_1542	prkA	recQ	TRUE	0.581	90.000	0.006	1.000	N	NA
2167813	2167814	CPF_1542	CPF_1543	recQ	thiE	FALSE	0.066	231.000	0.000	1.000	N	NA
2167814	2167815	CPF_1543	CPF_1544	thiE	thiM	TRUE	0.971	-7.000	0.010	0.005	Y	NA
2167815	2167816	CPF_1544	CPF_1545	thiM	thiD	TRUE	0.974	12.000	0.039	0.005	Y	NA
2167819	2167820	CPF_1548	CPF_1549		mglA	TRUE	0.944	75.000	0.028	NA	Y	NA
2167820	2167821	CPF_1549	CPF_1550	mglA	mglC	TRUE	0.997	-28.000	0.905	1.000	Y	NA
2167823	2167824	CPF_1552	CPF_1553	galK	galT	TRUE	0.732	123.000	0.000	0.002	Y	NA
2167826	2167827	CPF_1555	CPF_1556			TRUE	0.960	-3.000	0.137	NA		NA
2167827	2167828	CPF_1556	CPF_1557		fba	FALSE	0.176	97.000	0.000	NA		NA
2167831	2167832	CPF_1560	CPF_1561			FALSE	0.287	45.000	0.000	NA		NA
2167832	2167833	CPF_1561	CPF_1562			FALSE	0.151	126.000	0.000	NA		NA
2167833	2167834	CPF_1562	CPF_1563			FALSE	0.093	166.000	0.000	NA		NA
2167836	2167837	CPF_1565	CPF_1566			TRUE	0.689	41.000	0.004	NA		NA
2167837	2167838	CPF_1566	CPF_1567			FALSE	0.091	167.000	0.000	NA		NA
2167838	2167839	CPF_1567	CPF_1568			FALSE	0.073	192.000	0.000	NA		NA
2167839	2167840	CPF_1568	CPF_1569			FALSE	0.249	54.000	0.000	NA		NA
2167840	2167841	CPF_1569	CPF_1570			FALSE	0.412	21.000	0.000	NA		NA
2167841	2167842	CPF_1570	CPF_1571			FALSE	0.195	82.000	0.000	NA		NA
2167842	2167843	CPF_1571	CPF_1572			FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
2167843	2167844	CPF_1572	CPF_1573			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2167844	2167845	CPF_1573	CPF_1574			FALSE	0.206	51.000	0.000	1.000		NA
2167845	2167846	CPF_1574	CPF_1575			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
2167846	2167847	CPF_1575	CPF_1576			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2167847	2167848	CPF_1576	CPF_1577			FALSE	0.316	36.000	0.000	NA		NA
2167848	2167849	CPF_1577	CPF_1578			TRUE	0.882	162.000	1.000	NA		NA
2167849	2167850	CPF_1578	CPF_1579			TRUE	0.978	3.000	0.600	NA		NA
2167850	2167851	CPF_1579	CPF_1580			TRUE	0.975	17.000	0.600	NA		NA
2167851	2167852	CPF_1580	CPF_1581			TRUE	0.978	9.000	0.750	NA		NA
2167852	2167853	CPF_1581	CPF_1582			TRUE	0.981	9.000	1.000	NA		NA
2167853	2167854	CPF_1582	CPF_1583			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2167854	2167855	CPF_1583	CPF_1584			FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
2167855	2167856	CPF_1584	CPF_1585			FALSE	0.300	41.000	0.000	NA		NA
2167856	2167857	CPF_1585	CPF_1586			TRUE	0.947	-10.000	0.071	NA		NA
2167857	2167858	CPF_1586	CPF_1587			TRUE	0.965	1.000	0.200	NA		NA
2167858	2167859	CPF_1587	CPF_1588			TRUE	0.983	-7.000	0.750	NA		NA
2167859	2167860	CPF_1588	CPF_1589			FALSE	0.012	503.000	0.000	NA		NA
2167860	2167861	CPF_1589	CPF_1590			FALSE	0.083	175.000	0.000	NA		NA
2167861	2167862	CPF_1590	CPF_1591			FALSE	0.178	95.000	0.000	NA		NA
2167862	2167863	CPF_1591	CPF_1592			FALSE	0.232	59.000	0.000	NA		NA
2167863	2167864	CPF_1592	CPF_1593			FALSE	0.126	142.000	0.000	NA		NA
2167864	2167865	CPF_1593	CPF_1594			FALSE	0.135	137.000	0.000	NA		NA
2167865	2167866	CPF_1594	CPF_1595			FALSE	0.065	208.000	0.000	NA		NA
2167866	2167867	CPF_1595	CPF_1596			FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
2167867	2167868	CPF_1596	CPF_1597		dnaB	FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
2167868	2167869	CPF_1597	CPF_1598	dnaB		FALSE	0.430	11.000	0.000	NA		NA
2167869	2167870	CPF_1598	CPF_1599			FALSE	0.363	28.000	0.000	NA		NA
2167870	2167871	CPF_1599	CPF_1600			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
2167871	2167872	CPF_1600	CPF_1601			FALSE	0.381	26.000	0.000	NA		NA
2167872	2167873	CPF_1601	CPF_1602			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
2167873	2167874	CPF_1602	CPF_1603			FALSE	0.263	50.000	0.000	NA		NA
2167875	2167876	CPF_1604	CPF_1605			FALSE	0.206	51.000	0.000	1.000		NA
2167876	2167877	CPF_1605	CPF_1606			TRUE	0.805	68.000	0.100	0.046		NA
2167877	2167878	CPF_1606	CPF_1607			FALSE	0.172	112.000	0.000	NA		NA
2167878	2167879	CPF_1607	CPF_1608			FALSE	0.424	13.000	0.000	NA		NA
2167880	2167881	CPF_1609	CPF_1610			FALSE	0.019	404.000	0.000	NA		NA
2167881	2167882	CPF_1610	CPF_1611			FALSE	0.075	188.000	0.000	NA		NA
2167882	2167883	CPF_1611	CPF_1612			FALSE	0.133	139.000	0.000	NA		NA
2167883	2167884	CPF_1612	CPF_1613		rnz	FALSE	0.151	84.000	0.000	1.000		NA
2167884	2167885	CPF_1613	CPF_1614	rnz		FALSE	0.133	113.000	0.000	1.000		NA
2167887	2167888	CPF_1616	CPF_1617			FALSE	0.181	92.000	0.000	NA		NA
2167888	2167889	CPF_1617	CPF_1618			TRUE	0.900	81.000	0.286	NA		NA
2167889	2167890	CPF_1618	CPF_1619			FALSE	0.042	237.000	0.000	1.000		NA
2167891	2167892	CPF_1620	CPF_1621			FALSE	0.019	351.000	0.000	1.000		NA
2167892	2167893	CPF_1621	CPF_1622			FALSE	0.037	291.000	0.000	NA		NA
2167893	2167894	CPF_1622	CPF_1623			FALSE	0.173	109.000	0.000	NA		NA
2167895	2167896	CPF_1624	CPF_1625	cax		FALSE	0.012	441.000	0.000	1.000		NA
2167896	2167897	CPF_1625	CPF_1626			FALSE	0.238	57.000	0.000	NA		NA
2167897	2167898	CPF_1626	CPF_1627			FALSE	0.131	140.000	0.000	NA		NA
2167898	2167899	CPF_1627	CPF_1628			FALSE	0.069	200.000	0.000	NA		NA
2167899	2167900	CPF_1628	CPF_1629			FALSE	0.093	166.000	0.000	NA		NA
2167900	1422348	CPF_1629	CPF_1630			TRUE	0.542	-28.000	0.000	NA		NA
1422348	2167901	CPF_1630	CPF_1631			FALSE	0.175	103.000	0.000	NA		NA
2167901	2167902	CPF_1631	CPF_1632			FALSE	0.043	270.000	0.000	NA		NA
2167902	1422351	CPF_1632	CPF_1633			FALSE	0.067	205.000	0.000	NA		NA
2167904	2167905	CPF_1635	CPF_1636	map		FALSE	0.026	348.000	0.000	NA		NA
2167907	2167908	CPF_1638	CPF_1639			FALSE	0.190	86.000	0.000	NA		NA
2167910	2167911	CPF_1640	CPF_1642			FALSE	0.316	36.000	0.000	NA		NA
2167911	2167912	CPF_1642	CPF_1643			FALSE	0.061	217.000	0.000	NA		NA
2167912	2167913	CPF_1643	CPF_1644		lon	TRUE	0.916	0.000	0.048	1.000		NA
2167913	2167914	CPF_1644	CPF_1645	lon	lonB	TRUE	0.927	122.000	0.072	0.002	Y	NA
2167914	2167915	CPF_1645	CPF_1646	lonB	clpX	TRUE	0.913	111.000	0.042	0.002	Y	NA
2167915	2167916	CPF_1646	CPF_1647	clpX	clpP	TRUE	0.961	40.000	0.022	1.000	Y	NA
2167916	2167917	CPF_1647	CPF_1648	clpP	tig	TRUE	0.823	191.000	0.024	1.000	Y	NA
2167917	2167918	CPF_1648	CPF_1649	tig		TRUE	0.522	127.000	0.005	NA	N	NA
2167922	2167923	CPF_1653	CPF_1654			FALSE	0.430	11.000	0.000	NA		NA
2167923	2167924	CPF_1654	CPF_1655			FALSE	0.077	184.000	0.000	NA		NA
2167924	2167925	CPF_1655	CPF_1656			FALSE	0.040	247.000	0.000	1.000		NA
2167925	2167926	CPF_1656	CPF_1657			FALSE	0.021	375.000	0.000	NA		NA
2167930	2167931	CPF_1663	CPF_1664			TRUE	0.993	14.000	0.431	0.036	Y	NA
2167932	2167933	CPF_1665	CPF_1666		thiI	FALSE	0.146	129.000	0.000	NA		NA
2167933	2167934	CPF_1666	CPF_1667	thiI		TRUE	0.975	-3.000	0.349	1.000	N	NA
2167934	2167935	CPF_1667	CPF_1668			FALSE	0.064	174.000	0.000	1.000		NA
2167935	1422386	CPF_1668	CPF_1669			FALSE	0.021	379.000	0.000	NA		NA
1422386	2167936	CPF_1669	CPF_1670			FALSE	0.056	236.000	0.000	NA		NA
2167938	2167939	CPF_1672	CPF_1673			FALSE	0.025	307.000	0.000	1.000		NA
2167940	2167941	CPF_1674	CPF_1675			TRUE	0.458	205.000	0.044	NA		NA
2167941	2167942	CPF_1675	CPF_1676			FALSE	0.055	241.000	0.000	NA		NA
2167943	2167944	CPF_1677	CPF_1678		pcp	TRUE	0.898	0.000	0.029	NA		NA
2167944	2167945	CPF_1678	CPF_1679	pcp		TRUE	0.945	36.000	0.300	NA		NA
2167945	2167946	CPF_1679	CPF_1680			TRUE	0.980	13.000	0.939	NA		NA
2167946	2167947	CPF_1680	CPF_1681		clpB	FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
2167948	2167949	CPF_1682	CPF_1683		cls	FALSE	0.156	80.000	0.000	1.000		NA
2167950	2167951	CPF_1684	CPF_1685		hemL	FALSE	0.079	201.000	0.000	1.000	N	NA
2167951	2167952	CPF_1685	CPF_1686	hemL	hemB	TRUE	0.923	63.000	0.026	0.002	Y	NA
2167952	2167953	CPF_1686	CPF_1687	hemB	hemD	TRUE	0.958	57.000	0.044	1.000	Y	NA
2167953	2167954	CPF_1687	CPF_1688	hemD	hemC	TRUE	0.980	9.000	0.031	1.000	Y	NA
2167954	2167955	CPF_1688	CPF_1689	hemC		TRUE	0.935	58.000	0.009	1.000	Y	NA
2167955	2167956	CPF_1689	CPF_1690		hemA	TRUE	0.980	0.000	0.018	1.000	Y	NA
2167956	2167957	CPF_1690	CPF_1691	hemA	arsC	FALSE	0.020	417.000	0.000	1.000	N	NA
2167957	2167958	CPF_1691	CPF_1692	arsC	asrB	TRUE	0.994	14.000	0.720	0.029	Y	NA
2167958	2167959	CPF_1692	CPF_1693	asrB		TRUE	0.978	-7.000	0.750	0.029		NA
2167959	2167960	CPF_1693	CPF_1694			TRUE	0.647	240.000	0.227	1.000		NA
2167960	2167961	CPF_1694	CPF_1695		fnt	TRUE	0.642	218.000	0.152	1.000	N	NA
2167961	2167962	CPF_1695	CPF_1696	fnt		FALSE	0.065	208.000	0.000	NA		NA
2167962	2167963	CPF_1696	CPF_1697			TRUE	0.536	-22.000	0.000	NA		NA
2167965	1422417	CPF_1699	CPF_1701			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
1422417	2167966	CPF_1701	CPF_1702			FALSE	0.035	297.000	0.000	NA		NA
2167966	2167967	CPF_1702	CPF_1703			FALSE	0.270	49.000	0.000	NA		NA
2167967	2167968	CPF_1703	CPF_1704			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2167968	2167969	CPF_1704	CPF_1705			FALSE	0.170	113.000	0.000	NA		NA
2167969	2167970	CPF_1705	CPF_1706		pepF	TRUE	0.866	18.000	0.028	1.000		NA
2167970	2167971	CPF_1706	CPF_1707	pepF		TRUE	0.921	21.000	0.070	NA		NA
2167972	2167973	CPF_1708	CPF_1709			TRUE	0.738	73.000	0.038	NA		NA
2167973	2167974	CPF_1709	CPF_1710			TRUE	0.992	19.000	0.231	1.000	Y	NA
2167975	2167976	CPF_1711	CPF_1712			FALSE	0.031	279.000	0.000	1.000		NA
2167976	2167977	CPF_1712	CPF_1713			FALSE	0.033	268.000	0.000	1.000		NA
2167977	2167978	CPF_1713	CPF_1714			FALSE	0.042	293.000	0.000	1.000	N	NA
2167978	2167979	CPF_1714	CPF_1715			TRUE	0.995	0.000	0.778	0.014	Y	NA
2167979	2167980	CPF_1715	CPF_1716			TRUE	0.966	154.000	0.778	0.014	Y	NA
2167980	2167981	CPF_1716	CPF_1717			TRUE	0.965	155.000	0.786	0.008	Y	NA
2167983	2167984	CPF_1719	CPF_1720			FALSE	0.049	257.000	0.000	NA		NA
2167986	2167987	CPF_1722	CPF_1723	dut		FALSE	0.138	135.000	0.000	NA		NA
2167987	2167988	CPF_1723	CPF_1724			FALSE	0.190	86.000	0.000	NA		NA
2167990	2167991	CPF_1726	CPF_1727			FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
2167993	2167994	CPF_1729	CPF_1730			FALSE	0.162	119.000	0.000	NA		NA
2167996	2167997	CPF_1732	CPF_1733			FALSE	0.201	77.000	0.000	NA		NA
2167997	2167998	CPF_1733	CPF_1734			FALSE	0.303	40.000	0.000	NA		NA
2167998	2167999	CPF_1734	CPF_1735			FALSE	0.048	258.000	0.000	NA		NA
2167999	2168000	CPF_1735	CPF_1736			TRUE	0.451	21.000	0.000	1.000	N	NA
2168000	2168001	CPF_1736	CPF_1737			TRUE	0.994	2.000	0.270	1.000	Y	NA
2168001	2168002	CPF_1737	CPF_1738			TRUE	0.985	-25.000	0.646	NA		NA
2168002	2168003	CPF_1738	CPF_1739			FALSE	0.174	108.000	0.000	NA		NA
2168003	2168004	CPF_1739	CPF_1740			FALSE	0.206	74.000	0.000	NA		NA
2168004	2168005	CPF_1740	CPF_1741			FALSE	0.067	204.000	0.000	NA		NA
2168005	2168006	CPF_1741	CPF_1742			FALSE	0.174	104.000	0.000	NA		NA
2168008	2168009	CPF_1744	CPF_1745			FALSE	0.178	95.000	0.000	NA		NA
2168009	2168010	CPF_1745	CPF_1746			FALSE	0.042	274.000	0.000	NA		NA
2168011	2168012	CPF_1747	CPF_1748			TRUE	0.974	17.000	0.569	NA		NA
2168013	2168014	CPF_1749	CPF_1750			FALSE	0.029	325.000	0.000	NA		NA
2168014	2168015	CPF_1750	CPF_1751		virS	FALSE	0.067	171.000	0.000	1.000		NA
2168015	2168016	CPF_1751	CPF_1752	virS		TRUE	0.957	-6.000	0.000	1.000	Y	NA
2168016	2168017	CPF_1752	CPF_1753			FALSE	0.152	139.000	0.000	1.000	N	NA
2168017	2168018	CPF_1753	CPF_1754			FALSE	0.176	97.000	0.000	NA		NA
2168018	2168019	CPF_1754	CPF_1755			FALSE	0.058	224.000	0.000	NA		NA
2168019	2168020	CPF_1755	CPF_1756			FALSE	0.013	426.000	0.000	1.000		NA
2168022	2168023	CPF_1758	CPF_1759			FALSE	0.003	292.000	0.000	0.025		NA
2168023	2168024	CPF_1759	CPF_1760		topB	FALSE	0.024	313.000	0.000	1.000		NA
2168024	2168025	CPF_1760	CPF_1761	topB		FALSE	0.188	88.000	0.000	NA		NA
2168025	2168026	CPF_1761	CPF_1762			TRUE	0.958	10.000	0.196	NA		NA
2168026	2168027	CPF_1762	CPF_1763			FALSE	0.123	144.000	0.000	NA		NA
2168027	2168028	CPF_1763	CPF_1764			FALSE	0.056	237.000	0.000	NA		NA
2168028	2168029	CPF_1764	CPF_1765			FALSE	0.195	82.000	0.000	NA		NA
2168029	2168030	CPF_1765	CPF_1766			TRUE	0.948	15.000	0.130	NA		NA
2168030	2168031	CPF_1766	CPF_1767			FALSE	0.056	235.000	0.000	NA		NA
2168031	2168032	CPF_1767	CPF_1768			FALSE	0.051	252.000	0.000	NA		NA
2168032	2168033	CPF_1768	CPF_1769			FALSE	0.396	24.000	0.000	NA		NA
2168033	2168034	CPF_1769	CPF_1770		gdhA	FALSE	0.032	310.000	0.000	NA		NA
2168034	2168035	CPF_1770	CPF_1771	gdhA		FALSE	0.013	483.000	0.000	NA		NA
2168037	2168038	CPF_1773	CPF_1774			FALSE	0.403	23.000	0.000	NA		NA
2168040	2168041	CPF_1776	CPF_1777			TRUE	0.990	35.000	0.700	0.005	Y	NA
2168041	2168042	CPF_1777	CPF_1778			FALSE	0.007	620.000	0.000	1.000		NA
2168042	2168043	CPF_1778	CPF_1779			FALSE	0.060	220.000	0.000	NA		NA
2168045	2168046	CPF_1781	CPF_1782			FALSE	0.060	220.000	0.000	NA		NA
2168046	2168047	CPF_1782	CPF_1783			TRUE	0.994	-7.000	0.174	1.000	Y	NA
2168047	2168048	CPF_1783	CPF_1784		scrR	TRUE	0.883	40.000	0.070	1.000	N	NA
2168048	2168049	CPF_1784	CPF_1785	scrR		TRUE	0.563	164.000	0.042	1.000	N	NA
2168049	2168050	CPF_1785	CPF_1786			FALSE	0.029	324.000	0.000	NA		NA
2168050	2168051	CPF_1786	CPF_1787			FALSE	0.012	516.000	0.000	NA		NA
2168051	2168052	CPF_1787	CPF_1788			TRUE	0.989	13.000	0.200	0.028	Y	NA
2168052	2168053	CPF_1788	CPF_1789			TRUE	0.968	1.000	0.455	0.028		NA
2168055	2168056	CPF_1791	CPF_1792			TRUE	0.988	-13.000	0.044	1.000	Y	NA
2168056	2168057	CPF_1792	CPF_1793			TRUE	0.928	-10.000	0.044	1.000	N	NA
2168057	2168058	CPF_1793	CPF_1794		bioD	FALSE	0.067	227.000	0.000	1.000	N	NA
2168058	2168059	CPF_1794	CPF_1795	bioD	bioB	TRUE	0.972	3.000	0.025	0.002	Y	NA
2168059	1422512	CPF_1795	CPF_1796	bioB		FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
1422512	2168060	CPF_1796	CPF_1797			FALSE	0.069	201.000	0.000	NA		NA
2168060	1422514	CPF_1797	CPF_1798			FALSE	0.030	322.000	0.000	NA		NA
1422514	2168061	CPF_1798	CPF_1799			FALSE	0.183	91.000	0.000	NA		NA
2168063	2168064	CPF_1801	CPF_1802			FALSE	0.048	211.000	0.000	1.000		NA
2168064	2168065	CPF_1802	CPF_1803		pulA	TRUE	0.530	212.000	0.000	0.025	Y	NA
2168067	2168068	CPF_1805	CPF_1806			FALSE	0.136	109.000	0.000	1.000		NA
2168068	2168069	CPF_1806	CPF_1807			FALSE	0.054	195.000	0.000	1.000		NA
2168069	2168070	CPF_1807	CPF_1808			FALSE	0.034	302.000	0.000	NA		NA
2168071	2168072	CPF_1809	CPF_1810			TRUE	0.482	5.000	0.000	1.000	N	NA
2168073	2168074	CPF_1811	CPF_1812			FALSE	0.229	60.000	0.000	NA		NA
2168074	2168075	CPF_1812	CPF_1813			TRUE	0.973	21.000	0.556	NA		NA
2168075	2168076	CPF_1813	CPF_1814			TRUE	0.978	2.000	0.556	NA		NA
2168076	2168077	CPF_1814	CPF_1815			TRUE	0.980	17.000	1.000	NA		NA
2168077	2168078	CPF_1815	CPF_1816			FALSE	0.113	152.000	0.000	NA		NA
2168078	2168079	CPF_1816	CPF_1817		cax	FALSE	0.030	317.000	0.000	NA		NA
2168079	2168080	CPF_1817	CPF_1818	cax	dinB	FALSE	0.165	130.000	0.000	1.000	N	NA
2168080	2168081	CPF_1818	CPF_1819	dinB		FALSE	0.143	143.000	0.000	1.000	N	NA
2168081	2168082	CPF_1819	CPF_1820			FALSE	0.059	223.000	0.000	NA		NA
2168082	2168083	CPF_1820	CPF_1821			FALSE	0.165	117.000	0.000	NA		NA
2168083	2168084	CPF_1821	CPF_1822		pspA	FALSE	0.034	303.000	0.000	NA		NA
2168084	2168085	CPF_1822	CPF_1823	pspA		FALSE	0.190	86.000	0.000	NA		NA
2168087	2168088	CPF_1825	CPF_1826			FALSE	0.014	397.000	0.000	1.000		NA
2168088	2168089	CPF_1826	CPF_1827			FALSE	0.091	147.000	0.000	1.000		NA
2168089	2168090	CPF_1827	CPF_1828			FALSE	0.051	252.000	0.000	NA		NA
2168090	2168091	CPF_1828	CPF_1829			FALSE	0.071	197.000	0.000	NA		NA
2168091	2168092	CPF_1829	CPF_1830			TRUE	0.975	0.000	0.720	0.029		NA
2168092	2168093	CPF_1830	CPF_1831			TRUE	0.979	-10.000	0.438	1.000		NA
2168093	2168094	CPF_1831	CPF_1832			TRUE	0.573	141.000	0.030	1.000		NA
2168094	2168095	CPF_1832	CPF_1833			FALSE	0.008	555.000	0.000	1.000		NA
2168095	2168096	CPF_1833	CPF_1834			FALSE	0.019	428.000	0.000	1.000	N	NA
2168096	2168097	CPF_1834	CPF_1835			TRUE	0.973	9.000	0.530	1.000		NA
2168097	2168098	CPF_1835	CPF_1836			TRUE	0.855	146.000	0.435	1.000		NA
2168100	2168101	CPF_1838	CPF_1839			FALSE	0.126	142.000	0.000	NA		NA
2168101	2168102	CPF_1839	CPF_1840		glgB	TRUE	0.982	100.000	1.000	0.010	Y	NA
2168102	2168103	CPF_1840	CPF_1841	glgB		FALSE	0.178	95.000	0.000	NA		NA
2168104	2168105	CPF_1842	CPF_1843			TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
2168106	2168107	CPF_1844	CPF_1845			FALSE	0.026	348.000	0.000	NA		NA
2168107	2168108	CPF_1845	CPF_1846			TRUE	0.762	44.000	0.018	NA		NA
2168108	2168109	CPF_1846	CPF_1847			FALSE	0.084	173.000	0.000	NA		NA
2168109	2168110	CPF_1847	CPF_1848		axe1	FALSE	0.138	96.000	0.000	1.000		NA
2168111	2168112	CPF_1849	CPF_1850			FALSE	0.097	164.000	0.000	NA		NA
2168113	2168114	CPF_1851	CPF_1852			FALSE	0.172	112.000	0.000	NA		NA
2168114	2168115	CPF_1852	CPF_1853		thiH	TRUE	0.890	31.000	0.000	0.005	Y	NA
2168115	2168116	CPF_1853	CPF_1854	thiH	thiG	TRUE	0.990	13.000	0.277	0.005	Y	NA
2168116	2168117	CPF_1854	CPF_1855	thiG	thiF	TRUE	0.610	129.000	0.054	0.028		NA
2168117	2168118	CPF_1855	CPF_1856	thiF	thiS	TRUE	0.471	280.000	0.115	1.000		NA
2168118	2168119	CPF_1856	CPF_1857	thiS		FALSE	0.048	278.000	0.000	1.000	N	NA
2168119	2168120	CPF_1857	CPF_1858			FALSE	0.020	334.000	0.000	1.000		NA
2168120	2168121	CPF_1858	CPF_1859			FALSE	0.295	43.000	0.000	NA		NA
2168121	2168122	CPF_1859	CPF_1860		msrB	FALSE	0.234	58.000	0.000	NA		NA
2168122	2168123	CPF_1860	CPF_1861	msrB		FALSE	0.203	76.000	0.000	NA		NA
2168125	2168126	CPF_1863	CPF_1864			FALSE	0.055	241.000	0.000	NA		NA
2168128	2168129	CPF_1866	CPF_1867			FALSE	0.146	129.000	0.000	NA		NA
2168129	2168130	CPF_1867	CPF_1868			FALSE	0.065	207.000	0.000	NA		NA
2168132	2168133	CPF_1870	CPF_1871			TRUE	0.933	15.000	0.083	NA		NA
2168133	2168134	CPF_1871	CPF_1872			TRUE	0.892	17.000	0.042	NA		NA
2168136	2168137	CPF_1874	CPF_1875			FALSE	0.044	269.000	0.000	NA		NA
2168138	2168139	CPF_1876	CPF_1877			FALSE	0.170	113.000	0.000	NA		NA
2168140	2168141	CPF_1878	CPF_1879			FALSE	0.137	99.000	0.000	1.000		NA
2168141	1422596	CPF_1879	CPF_1880			FALSE	0.133	139.000	0.000	NA		NA
1422596	2168142	CPF_1880	CPF_1881		rbsC	FALSE	0.409	22.000	0.000	NA		NA
2168142	2168143	CPF_1881	CPF_1882	rbsC	rbsA	TRUE	0.995	14.000	0.504	1.000	Y	NA
2168143	2168144	CPF_1882	CPF_1883	rbsA	rbsD	TRUE	0.979	88.000	0.337	1.000	Y	NA
2168144	2168145	CPF_1883	CPF_1884	rbsD	rbsK	TRUE	0.979	3.000	0.020	1.000	Y	NA
2168145	2168146	CPF_1884	CPF_1885	rbsK	def	FALSE	0.147	141.000	0.000	1.000	N	NA
2168146	2168147	CPF_1885	CPF_1886	def		FALSE	0.124	156.000	0.000	1.000	N	NA
2168147	2168148	CPF_1886	CPF_1887			FALSE	0.093	146.000	0.000	1.000		NA
2168148	2168149	CPF_1887	CPF_1888			FALSE	0.047	216.000	0.000	1.000		NA
2168149	2168150	CPF_1888	CPF_1889			TRUE	0.991	3.000	0.238	0.006	Y	NA
2168150	2168151	CPF_1889	CPF_1890			TRUE	0.996	-7.000	0.776	0.006	Y	NA
2168151	2168152	CPF_1890	CPF_1891			TRUE	0.992	17.000	0.462	0.006	Y	NA
2168152	2168153	CPF_1891	CPF_1892			TRUE	0.995	-13.000	0.487	0.006	Y	NA
2168153	2168154	CPF_1892	CPF_1893			TRUE	0.990	13.000	0.258	0.006	Y	NA
2168154	2168155	CPF_1893	CPF_1894			TRUE	0.944	31.000	0.489	0.006		NA
2168155	2168156	CPF_1894	CPF_1895			TRUE	0.935	55.000	0.848	0.006		NA
2168156	2168157	CPF_1895	CPF_1896			TRUE	0.947	-13.000	0.132	0.006		NA
2168157	2168158	CPF_1896	CPF_1897			FALSE	0.031	277.000	0.000	1.000		NA
2168158	2168159	CPF_1897	CPF_1898			TRUE	0.948	-100.000	0.063	NA		NA
2168159	2168160	CPF_1898	CPF_1899			TRUE	0.834	147.000	0.300	NA		NA
2168162	2168163	CPF_1901	CPF_1902			FALSE	0.173	110.000	0.000	NA		NA
2168163	2168164	CPF_1902	CPF_1903			TRUE	0.809	12.000	0.009	1.000		NA
2168167	2168168	CPF_1906	CPF_1907			TRUE	0.709	107.000	0.043	NA		NA
2168169	2168170	CPF_1908	CPF_1909			TRUE	0.539	-25.000	0.000	NA		NA
2168173	2168174	CPF_1912	CPF_1913		feoB	TRUE	0.989	38.000	0.308	1.000	Y	NA
2168174	2168175	CPF_1913	CPF_1914	feoB		FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
2168178	2168179	CPF_1917	CPF_1918			FALSE	0.071	166.000	0.000	1.000		NA
2168179	2168180	CPF_1918	CPF_1919			FALSE	0.051	204.000	0.000	1.000		NA
2168182	2168183	CPF_1921	CPF_1922		purB	FALSE	0.047	280.000	0.000	1.000	N	NA
2168183	2168184	CPF_1922	CPF_1923	purB		FALSE	0.224	243.000	0.002	1.000	N	NA
2168184	2168185	CPF_1923	CPF_1924		aspB	TRUE	0.734	95.000	0.047	1.000	N	NA
2168185	2168186	CPF_1924	CPF_1925	aspB	spoVS	FALSE	0.112	153.000	0.000	NA		NA
2168186	2168187	CPF_1925	CPF_1926	spoVS		FALSE	0.324	218.000	0.016	NA		NA
2168187	2168188	CPF_1926	CPF_1927		recA	FALSE	0.160	348.000	0.018	1.000		NA
2168188	2168189	CPF_1927	CPF_1928	recA	pgsA	TRUE	0.583	136.000	0.022	1.000	N	NA
2168189	2168190	CPF_1928	CPF_1929	pgsA		TRUE	0.967	-16.000	0.132	1.000	N	NA
2168190	2168191	CPF_1929	CPF_1930		ftsK	TRUE	0.734	69.000	0.031	1.000	N	NA
2168191	2168192	CPF_1930	CPF_1931	ftsK	clpP	TRUE	0.681	132.000	0.047	1.000	N	NA
2168192	2168193	CPF_1931	CPF_1932	clpP		TRUE	0.806	54.000	0.045	1.000	N	NA
2168193	2168194	CPF_1932	CPF_1933			TRUE	0.951	14.000	0.148	NA		NA
2168194	2168195	CPF_1933	CPF_1934		pnpA	TRUE	0.447	135.000	0.003	NA		NA
2168195	2168196	CPF_1934	CPF_1935	pnpA	rpsO	TRUE	0.978	92.000	0.335	1.000	Y	NA
2168196	2168197	CPF_1935	CPF_1936	rpsO	ribF	TRUE	0.826	116.000	0.119	1.000	N	NA
2168197	2168198	CPF_1936	CPF_1937	ribF	truB	TRUE	0.970	4.000	0.308	1.000	N	NA
2168198	2168199	CPF_1937	CPF_1938	truB		TRUE	0.961	4.000	0.221	1.000		NA
2168199	2168200	CPF_1938	CPF_1939		rbfA	TRUE	0.957	4.000	0.173	1.000		NA
2168200	2168201	CPF_1939	CPF_1940	rbfA	infB	TRUE	0.994	22.000	0.530	1.000	Y	NA
2168201	2168202	CPF_1940	CPF_1941	infB		TRUE	0.989	31.000	0.223	NA	Y	NA
2168202	2168203	CPF_1941	CPF_1942			TRUE	0.979	-7.000	0.408	NA	N	NA
2168203	2168204	CPF_1942	CPF_1943		nusA	TRUE	0.992	28.000	0.323	NA	Y	NA
2168204	2168205	CPF_1943	CPF_1944	nusA		TRUE	0.977	20.000	0.759	NA		NA
2168205	2168206	CPF_1944	CPF_1945		polC	TRUE	0.462	233.000	0.059	NA		NA
2168206	2168207	CPF_1945	CPF_1946	polC	ispG	TRUE	0.744	78.000	0.040	1.000	N	NA
2168207	2168208	CPF_1946	CPF_1947	ispG		TRUE	0.935	20.000	0.092	1.000	N	NA
2168208	2168209	CPF_1947	CPF_1948		dxr	TRUE	0.975	12.000	0.568	1.000	N	NA
2168209	2168210	CPF_1948	CPF_1949	dxr	cdsA	FALSE	0.211	360.000	0.044	1.000		NA
2168210	2168211	CPF_1949	CPF_1950	cdsA	uppS	TRUE	0.909	9.000	0.055	1.000		NA
2168211	2168212	CPF_1950	CPF_1951	uppS	frr	TRUE	0.926	65.000	0.409	1.000	N	NA
2168212	2168213	CPF_1951	CPF_1952	frr	pyrH	TRUE	0.976	14.000	0.626	1.000	N	NA
2168213	2168214	CPF_1952	CPF_1953	pyrH	tsf	TRUE	0.909	93.000	0.416	1.000	N	NA
2168214	2168215	CPF_1953	CPF_1954	tsf	rpsB	TRUE	0.986	80.000	0.748	1.000	Y	NA
2168215	2168216	CPF_1954	CPF_1955	rpsB	codY	FALSE	0.110	383.000	0.006	1.000	N	NA
2168216	2168217	CPF_1955	CPF_1956	codY	topA	TRUE	0.576	142.000	0.025	1.000	N	NA
2168217	2168218	CPF_1956	CPF_1957	topA	dprA	TRUE	0.986	45.000	0.238	1.000	Y	NA
2168218	2168219	CPF_1957	CPF_1958	dprA		TRUE	0.926	1.000	0.053	1.000	N	NA
2168221	2168222	CPF_1960	CPF_1961	rnhB		TRUE	0.949	16.000	0.148	1.000		NA
2168222	2168223	CPF_1961	CPF_1962		rplS	TRUE	0.541	147.000	0.027	1.000		NA
2168223	2168224	CPF_1962	CPF_1963	rplS	trmD	TRUE	0.980	121.000	0.567	1.000	Y	NA
2168224	2168225	CPF_1963	CPF_1964	trmD	rimM	TRUE	0.997	-10.000	0.672	1.000	Y	NA
2168225	2168226	CPF_1964	CPF_1965	rimM		TRUE	0.921	56.000	0.324	1.000		NA
2168226	2168227	CPF_1965	CPF_1966		rpsP	TRUE	0.943	44.000	0.385	1.000		NA
2168227	2168228	CPF_1966	CPF_1967	rpsP	ffh	TRUE	0.953	34.000	0.361	1.000	N	NA
2168228	2168229	CPF_1967	CPF_1968	ffh		TRUE	0.950	12.000	0.151	1.000		NA
2168229	2168230	CPF_1968	CPF_1969		ftsY	TRUE	0.607	175.000	0.081	1.000		NA
2168230	2168231	CPF_1969	CPF_1970	ftsY	smc	TRUE	0.939	14.000	0.165	0.013	N	NA
2168231	2168232	CPF_1970	CPF_1971	smc		FALSE	0.410	205.000	0.027	1.000	N	NA
2168232	2168233	CPF_1971	CPF_1972		rnc	TRUE	0.990	-21.000	0.064	1.000	Y	NA
2168233	2168234	CPF_1972	CPF_1973	rnc	acpP	TRUE	0.795	87.000	0.068	1.000	N	NA
2168234	2168235	CPF_1973	CPF_1974	acpP	plsX	TRUE	0.923	77.000	0.034	0.004	Y	NA
2168235	2168236	CPF_1974	CPF_1975	plsX	rpmF	TRUE	0.933	58.000	0.418	1.000	N	NA
2168236	2168237	CPF_1975	CPF_1976	rpmF		TRUE	0.975	16.000	0.599	NA		NA
2168237	2168238	CPF_1976	CPF_1977		ackA	TRUE	0.737	120.000	0.061	NA		NA
2168238	2168239	CPF_1977	CPF_1978	ackA	pta	TRUE	0.968	91.000	0.137	1.000	Y	NA
2168240	2168241	CPF_1979	CPF_1981		ylbJ	TRUE	0.747	65.000	0.036	NA		NA
2168242	2168243	CPF_1980	CPF_1982		coaD	TRUE	0.846	9.000	0.015	NA		NA
2168243	2168244	CPF_1982	CPF_1983	coaD		TRUE	0.902	2.000	0.034	1.000	N	NA
2168244	2168245	CPF_1983	CPF_1984		recG	TRUE	0.915	65.000	0.016	0.012	Y	NA
2168245	2168246	CPF_1984	CPF_1985	recG		TRUE	0.596	154.000	0.048	1.000		NA
2168246	2168247	CPF_1985	CPF_1986			TRUE	0.974	14.000	0.567	NA		NA
2168249	2168250	CPF_1988	CPF_1989		rpe	TRUE	0.961	2.000	0.166	1.000	N	NA
2168250	2168251	CPF_1989	CPF_1990	rpe	rsgA	TRUE	0.965	0.000	0.213	1.000		NA
2168251	2168252	CPF_1990	CPF_1991	rsgA		TRUE	0.628	237.000	0.196	1.000		NA
2168252	2168253	CPF_1991	CPF_1992			TRUE	0.996	2.000	0.704	1.000	Y	NA
2168253	2168254	CPF_1992	CPF_1993			TRUE	0.937	13.000	0.105	1.000		NA
2168254	2168255	CPF_1993	CPF_1994		sun	TRUE	0.923	32.000	0.135	1.000		NA
2168255	2168256	CPF_1994	CPF_1995	sun		TRUE	0.925	11.000	0.076	1.000		NA
2168256	2168257	CPF_1995	CPF_1996		fmt	TRUE	0.877	18.000	0.035	1.000		NA
2168257	2168258	CPF_1996	CPF_1997	fmt	def	TRUE	0.973	20.000	0.033	0.026	Y	NA
2168258	2168259	CPF_1997	CPF_1998	def	priA	TRUE	0.799	14.000	0.003	1.000	N	NA
2168259	2168260	CPF_1998	CPF_1999	priA	coaBC	TRUE	0.904	39.000	0.099	1.000	N	NA
2168260	2168261	CPF_1999	CPF_2000	coaBC	rpoZ	TRUE	0.847	6.000	0.013	1.000	N	NA
2168261	2168262	CPF_2000	CPF_2001	rpoZ	gmk	TRUE	0.926	-19.000	0.035	1.000	N	NA
2168262	2168263	CPF_2001	CPF_2002	gmk		TRUE	0.965	-10.000	0.143	NA		NA
2168263	2168264	CPF_2002	CPF_2003			TRUE	0.956	14.000	0.189	NA		NA
2168264	2168265	CPF_2003	CPF_2004			FALSE	0.060	220.000	0.000	NA		NA
2168265	2168266	CPF_2004	CPF_2005			FALSE	0.036	258.000	0.000	1.000		NA
2168266	2168267	CPF_2005	CPF_2006		spoIVA	FALSE	0.025	351.000	0.000	NA		NA
2168267	2168268	CPF_2006	CPF_2007	spoIVA		FALSE	0.289	333.000	0.060	NA		NA
2168268	2168269	CPF_2007	CPF_2008			TRUE	0.923	5.000	0.068	1.000		NA
2168269	2168270	CPF_2008	CPF_2009			TRUE	0.922	3.000	0.061	1.000		NA
2168270	2168271	CPF_2009	CPF_2010			FALSE	0.033	327.000	0.000	1.000	N	NA
2168271	2168272	CPF_2010	CPF_2011			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
2168272	2168273	CPF_2011	CPF_2012		nrdR	FALSE	0.406	166.000	0.013	NA		NA
2168273	2168274	CPF_2012	CPF_2013	nrdR		TRUE	0.616	62.000	0.005	NA		NA
2168274	2168275	CPF_2013	CPF_2014		sigG	TRUE	0.573	141.000	0.026	NA		NA
2168275	2168276	CPF_2014	CPF_2015	sigG	sigE	TRUE	0.981	75.000	0.602	0.005	Y	NA
2168276	2168277	CPF_2015	CPF_2016	sigE	spoIIGA	TRUE	0.979	14.000	0.856	1.000		NA
2168277	2168278	CPF_2016	CPF_2017	spoIIGA		FALSE	0.308	38.000	0.000	NA		NA
2168278	2168279	CPF_2017	CPF_2018		ftsZ	FALSE	0.084	173.000	0.000	NA		NA
2168279	2168280	CPF_2018	CPF_2019	ftsZ	ftsA	TRUE	0.994	14.000	0.460	1.000	Y	NA
2168280	2168281	CPF_2019	CPF_2020	ftsA	pilT	FALSE	0.021	78.000	0.000	0.006	N	NA
2168281	2168282	CPF_2020	CPF_2021	pilT		TRUE	0.444	181.000	0.025	1.000	N	NA
2168282	2168283	CPF_2021	CPF_2022			TRUE	0.849	63.000	0.087	1.000	N	NA
2168283	2168284	CPF_2022	CPF_2023		udk	TRUE	0.588	113.000	0.012	1.000	N	NA
2168284	2168285	CPF_2023	CPF_2024	udk		TRUE	0.952	0.000	0.100	1.000	N	NA
2168285	2168286	CPF_2024	CPF_2025			TRUE	0.951	6.000	0.146	1.000		NA
2168286	2168287	CPF_2025	CPF_2026			TRUE	0.921	16.000	0.067	NA		NA
2168287	2168288	CPF_2026	CPF_2027		typA	FALSE	0.392	170.000	0.012	NA		NA
2168288	2168289	CPF_2027	CPF_2028	typA		FALSE	0.365	157.000	0.004	1.000		NA
2168289	2168290	CPF_2028	CPF_2029			TRUE	0.903	71.000	0.289	1.000		NA
2168290	2168291	CPF_2029	CPF_2030			TRUE	0.957	21.000	0.211	NA		NA
2168291	2168292	CPF_2030	CPF_2031			TRUE	0.901	16.000	0.047	NA		NA
2168292	2168293	CPF_2031	CPF_2032			TRUE	0.950	48.000	0.537	NA		NA
2168293	2168294	CPF_2032	CPF_2033		alaS	TRUE	0.754	144.000	0.110	NA		NA
2168294	1422750	CPF_2033	CPF_2035	alaS		FALSE	0.009	591.000	0.000	NA		NA
1422750	2168295	CPF_2035	CPF_2036			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
2168295	2168296	CPF_2036	CPF_2037		trmU	FALSE	0.191	280.000	0.006	NA		NA
2168296	2168297	CPF_2037	CPF_2038	trmU		TRUE	0.919	25.000	0.073	1.000	N	NA
2168297	2168298	CPF_2038	CPF_2039		iscS	TRUE	0.902	3.000	0.035	1.000	N	NA
2168298	2168299	CPF_2039	CPF_2040	iscS		TRUE	0.963	-7.000	0.125	NA	N	NA
2168299	1422756	CPF_2040	CPF_2042			FALSE	0.145	130.000	0.000	NA		NA
1422756	2168300	CPF_2042	CPF_2043			FALSE	0.068	202.000	0.000	NA		NA
2168300	2168301	CPF_2043	CPF_2044			FALSE	0.047	215.000	0.000	1.000		NA
2168301	2168302	CPF_2044	CPF_2045		moaA	TRUE	0.864	3.000	0.042	0.027		NA
2168302	2168303	CPF_2045	CPF_2046	moaA		FALSE	0.437	104.000	0.016	0.003		NA
2168303	2168304	CPF_2046	CPF_2047			FALSE	0.017	118.000	0.000	0.003		NA
2168304	2168305	CPF_2047	CPF_2048		moeA	TRUE	0.859	45.000	0.000	0.003	Y	NA
2168305	2168306	CPF_2048	CPF_2049	moeA	mobB	FALSE	0.294	339.000	0.000	0.003	Y	NA
2168306	2168307	CPF_2049	CPF_2050	mobB	noxA	FALSE	0.147	88.000	0.000	1.000		NA
2168307	2168308	CPF_2050	CPF_2051	noxA	narB	TRUE	0.954	2.000	0.222	0.034		NA
2168308	2168309	CPF_2051	CPF_2052	narB	narA	TRUE	0.962	13.000	0.273	1.000		NA
2168309	2168310	CPF_2052	CPF_2053	narA		FALSE	0.038	286.000	0.000	NA		NA
2168310	2168311	CPF_2053	CPF_2054			FALSE	0.059	222.000	0.000	NA		NA
2168311	2168312	CPF_2054	CPF_2055			TRUE	0.953	32.000	0.381	1.000		NA
2168312	2168313	CPF_2055	CPF_2056			FALSE	0.370	245.000	0.032	1.000	N	NA
2168314	2168315	CPF_2057	CPF_2058			FALSE	0.280	47.000	0.000	NA		NA
2168316	2168317	CPF_2059	CPF_2060	scpB	scpA	TRUE	0.981	-7.000	0.570	NA		NA
2168317	2168318	CPF_2060	CPF_2061	scpA	dacF	FALSE	0.188	271.000	0.004	NA		NA
2168318	2168319	CPF_2061	CPF_2062	dacF	pdp	FALSE	0.059	252.000	0.000	1.000	N	NA
2168319	2168320	CPF_2062	CPF_2063	pdp	xerD	FALSE	0.061	247.000	0.000	1.000	N	NA
2168320	2168321	CPF_2063	CPF_2064	xerD		TRUE	0.747	50.000	0.021	NA		NA
2168321	2168322	CPF_2064	CPF_2065			TRUE	0.622	134.000	0.033	NA		NA
2168322	2168323	CPF_2065	CPF_2066			FALSE	0.224	62.000	0.000	NA		NA
2168323	2168324	CPF_2066	CPF_2067		spo0A	FALSE	0.201	77.000	0.000	NA		NA
2168324	2168325	CPF_2067	CPF_2068	spo0A		TRUE	0.786	174.000	0.393	1.000		NA
2168325	2168326	CPF_2068	CPF_2069		recN	TRUE	0.600	177.000	0.079	1.000		NA
2168326	2168327	CPF_2069	CPF_2070	recN	argR	TRUE	0.935	16.000	0.086	1.000	N	NA
2168327	2168328	CPF_2070	CPF_2071	argR		TRUE	0.941	23.000	0.117	1.000	N	NA
2168328	2168329	CPF_2071	CPF_2072			TRUE	0.851	85.000	0.120	1.000	N	NA
2168329	2168330	CPF_2072	CPF_2073		dxs	TRUE	0.957	12.000	0.189	1.000	N	NA
2168330	2168331	CPF_2073	CPF_2074	dxs	ispA	TRUE	0.982	21.000	0.048	1.000	Y	NA
2168331	2168332	CPF_2074	CPF_2075	ispA	xseB	TRUE	0.936	-10.000	0.053	1.000	N	NA
2168332	2168333	CPF_2075	CPF_2076	xseB	xseA	TRUE	0.991	19.000	0.412	0.001	Y	NA
2168333	2168334	CPF_2076	CPF_2077	xseA	folD	TRUE	0.916	2.000	0.045	1.000	N	NA
2168334	2168335	CPF_2077	CPF_2078	folD	nusB	TRUE	0.808	49.000	0.039	1.000	N	NA
2168335	2168336	CPF_2078	CPF_2079	nusB	asp	TRUE	0.863	119.000	0.223	NA		NA
2168336	2168337	CPF_2079	CPF_2080	asp	spoIIIAH	TRUE	0.836	85.000	0.108	NA		NA
2168337	2168338	CPF_2080	CPF_2081	spoIIIAH		TRUE	0.964	26.000	0.407	NA		NA
2168338	2168339	CPF_2081	CPF_2082		spoIIIAF	TRUE	0.980	15.000	0.907	NA		NA
2168339	2168340	CPF_2082	CPF_2083	spoIIIAF		TRUE	0.981	8.000	0.918	NA		NA
2168340	2168341	CPF_2083	CPF_2084			TRUE	0.980	11.000	0.864	NA		NA
2168341	2168342	CPF_2084	CPF_2085			FALSE	0.188	88.000	0.000	NA		NA
2168342	2168343	CPF_2085	CPF_2086			FALSE	0.203	76.000	0.000	NA		NA
2168343	2168344	CPF_2086	CPF_2087			TRUE	0.878	147.000	0.604	NA		NA
2168344	2168345	CPF_2087	CPF_2088			FALSE	0.053	198.000	0.000	1.000		NA
2168345	2168346	CPF_2088	CPF_2089		efp	FALSE	0.132	114.000	0.000	1.000		NA
2168346	2168347	CPF_2089	CPF_2090	efp		FALSE	0.087	171.000	0.000	NA		NA
2168347	2168348	CPF_2090	CPF_2091			TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
2168348	2168349	CPF_2091	CPF_2092			TRUE	0.543	-40.000	0.000	NA		NA
2168349	2168350	CPF_2092	CPF_2093			TRUE	0.543	-31.000	0.000	NA		NA
2168350	2168351	CPF_2093	CPF_2094			TRUE	0.525	-13.000	0.000	NA		NA
2168351	2168352	CPF_2094	CPF_2095			FALSE	0.229	60.000	0.000	NA		NA
2168352	2168353	CPF_2095	CPF_2096			FALSE	0.415	20.000	0.000	NA		NA
2168353	2168354	CPF_2096	CPF_2097			TRUE	0.502	-7.000	0.000	NA		NA
2168354	2168355	CPF_2097	CPF_2098			TRUE	0.993	-13.000	0.135	1.000	Y	NA
2168355	2168356	CPF_2098	CPF_2099			FALSE	0.176	99.000	0.000	NA		NA
2168356	2168357	CPF_2099	CPF_2100		dapF	TRUE	0.786	17.000	0.003	NA		NA
2168359	2168360	CPF_2102	CPF_2103		pyrR	TRUE	0.818	20.000	0.008	1.000	N	NA
2168360	2168361	CPF_2103	CPF_2104	pyrR		TRUE	0.914	4.000	0.048	1.000	N	NA
2168361	2168362	CPF_2104	CPF_2105			TRUE	0.461	138.000	0.002	NA	N	NA
2168362	2168363	CPF_2105	CPF_2106			TRUE	0.974	13.000	0.579	NA		NA
2168363	2168364	CPF_2106	CPF_2107			TRUE	0.846	2.000	0.010	NA		NA
2168364	2168365	CPF_2107	CPF_2108			TRUE	0.878	19.000	0.032	NA		NA
2168365	2168366	CPF_2108	CPF_2109			TRUE	0.619	100.000	0.017	NA		NA
2168366	2168367	CPF_2109	CPF_2110		sbp	TRUE	0.923	13.000	0.070	NA		NA
2168367	2168368	CPF_2110	CPF_2111	sbp		TRUE	0.923	13.000	0.070	NA		NA
2168368	2168369	CPF_2111	CPF_2112			TRUE	0.836	14.000	0.014	NA		NA
2168369	2168370	CPF_2112	CPF_2113		spoVE	TRUE	0.486	158.000	0.015	NA	N	NA
2168370	2168371	CPF_2113	CPF_2114	spoVE	mraY	TRUE	0.694	28.000	0.014	0.004	N	NA
2168371	2168372	CPF_2114	CPF_2115	mraY	murF	TRUE	0.937	50.000	0.024	0.004	Y	NA
2168372	2168373	CPF_2115	CPF_2116	murF	murE	TRUE	0.991	13.000	0.328	0.003	Y	NA
2168373	2168374	CPF_2116	CPF_2117	murE	spoVD	TRUE	0.975	95.000	0.265	1.000	Y	NA
2168374	2168375	CPF_2117	CPF_2118	spoVD		TRUE	0.608	188.000	0.096	1.000		NA
2168375	2168376	CPF_2118	CPF_2119		mraW	TRUE	0.594	72.000	0.008	1.000		NA
2168379	2168380	CPF_2123	CPF_2124			TRUE	0.443	29.000	0.000	NA	N	NA
2168380	2168381	CPF_2124	CPF_2125			TRUE	0.956	0.000	0.000	NA	Y	NA
2168381	2168382	CPF_2125	CPF_2126			TRUE	0.828	16.000	0.015	1.000		NA
2168382	2168383	CPF_2126	CPF_2127			TRUE	0.615	292.000	0.417	1.000		NA
2168383	2168384	CPF_2127	CPF_2128			FALSE	0.389	156.000	0.002	1.000	N	NA
2168384	2168385	CPF_2128	CPF_2129			FALSE	0.105	137.000	0.000	1.000		NA
2168385	2168386	CPF_2129	CPF_2130			FALSE	0.010	158.000	0.000	0.004		NA
2168386	2168387	CPF_2130	CPF_2131			FALSE	0.068	224.000	0.000	1.000	N	NA
2168387	2168388	CPF_2131	CPF_2132			TRUE	0.948	4.000	0.000	1.000	Y	NA
2168388	2168389	CPF_2132	CPF_2133			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
2168389	2168390	CPF_2133	CPF_2134		spoVD	FALSE	0.055	239.000	0.000	NA		NA
2168390	2168391	CPF_2134	CPF_2135	spoVD		FALSE	0.053	264.000	0.000	1.000	N	NA
2168391	2168392	CPF_2135	CPF_2136			TRUE	0.931	14.000	0.078	1.000	N	NA
2168394	2168395	CPF_2138	CPF_2139		pheT	FALSE	0.196	81.000	0.000	NA		NA
2168395	2168396	CPF_2139	CPF_2140	pheT	pheS	TRUE	0.992	24.000	0.574	0.001	Y	NA
2168396	2168397	CPF_2140	CPF_2141	pheS		FALSE	0.288	612.000	0.006	1.000	Y	NA
2168397	2168398	CPF_2141	CPF_2142			TRUE	0.846	26.000	0.022	1.000	N	NA
2168398	2168399	CPF_2142	CPF_2143			TRUE	0.985	23.000	0.137	0.005	Y	NA
2168399	2168400	CPF_2143	CPF_2144		rplT	FALSE	0.250	229.000	0.004	1.000	N	NA
2168400	2168401	CPF_2144	CPF_2145	rplT	rpmI	TRUE	0.993	30.000	0.928	0.015	Y	NA
2168401	2168402	CPF_2145	CPF_2146	rpmI	infC	TRUE	0.995	22.000	0.652	1.000	Y	NA
2168402	2168403	CPF_2146	CPF_2147	infC	ytxC	FALSE	0.166	281.000	0.002	NA		NA
2168404	2168405	CPF_2148	CPF_2149			FALSE	0.050	255.000	0.000	NA		NA
2168406	2168407	CPF_2150	CPF_2151			FALSE	0.095	165.000	0.000	NA		NA
1422867	1422868	CPF_2153	CPF_2154			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1422868	1422869	CPF_2154	CPF_2155			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
1422869	1422870	CPF_2155	CPF_2156			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1422870	2168409	CPF_2156	CPF_2157			FALSE	0.227	61.000	0.000	NA		NA
2168409	2168410	CPF_2157	CPF_2158			TRUE	0.914	16.000	0.063	1.000		NA
2168410	2168411	CPF_2158	CPF_2159			TRUE	0.817	52.000	0.056	1.000		NA
2168412	2168413	CPF_2160	CPF_2161	asd	dapA	TRUE	0.976	25.000	0.029	1.000	Y	NA
2168413	2168414	CPF_2161	CPF_2162	dapA	dapB	TRUE	0.938	73.000	0.022	1.000	Y	NA
2168415	2168416	CPF_2163	CPF_2164			TRUE	0.518	0.000	0.000	1.000	N	NA
2168418	2168419	CPF_2166	CPF_2167			TRUE	0.788	116.000	0.079	1.000	N	NA
2168420	2168421	CPF_2168	CPF_2169			FALSE	0.217	66.000	0.000	NA		NA
2168421	2168422	CPF_2169	CPF_2170			FALSE	0.086	172.000	0.000	NA		NA
2168425	2168426	CPF_2173	CPF_2174		folC	FALSE	0.196	111.000	0.000	1.000	N	NA
2168426	2168427	CPF_2174	CPF_2175	folC	valS	FALSE	0.140	287.000	0.006	0.099	N	NA
2168429	2168430	CPF_2177	CPF_2178		recX	FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
2168430	2168431	CPF_2178	CPF_2179	recX		TRUE	0.836	6.000	0.015	1.000		NA
2168432	2168433	CPF_2180	CPF_2181			TRUE	0.996	0.000	0.750	1.000	Y	NA
2168434	2168435	CPF_2182	CPF_2183	fabG		FALSE	0.198	106.000	0.000	1.000	N	NA
2168435	2168436	CPF_2183	CPF_2184		glyA	TRUE	0.557	248.000	0.000	1.000	Y	NA
2168437	2168438	CPF_2185	CPF_2186			TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
2168439	2168440	CPF_2187	CPF_2188		aspS	FALSE	0.159	286.000	0.002	NA		NA
2168440	2168441	CPF_2188	CPF_2189	aspS	hisS	TRUE	0.972	21.000	0.028	0.035	Y	NA
2168441	2168442	CPF_2189	CPF_2190	hisS		TRUE	0.920	32.000	0.111	1.000	N	NA
2168442	2168443	CPF_2190	CPF_2191			TRUE	0.912	-10.000	0.035	1.000		NA
2168443	2168444	CPF_2191	CPF_2192		dtd	TRUE	0.573	160.000	0.048	1.000		NA
2168444	2168445	CPF_2192	CPF_2193	dtd	relA	TRUE	0.957	15.000	0.177	1.000	N	NA
2168445	2168446	CPF_2193	CPF_2194	relA	apt	TRUE	0.680	152.000	0.068	1.000	N	NA
2168446	2168447	CPF_2194	CPF_2195	apt		TRUE	0.705	44.000	0.010	1.000		NA
2168447	2168448	CPF_2195	CPF_2196		secF	FALSE	0.397	200.000	0.028	1.000		NA
2168448	2168449	CPF_2196	CPF_2197	secF	secD	TRUE	0.994	-7.000	0.516	0.001	Y	NA
2168449	2168450	CPF_2197	CPF_2198	secD		TRUE	0.715	98.000	0.048	1.000		NA
2168450	2168451	CPF_2198	CPF_2199			TRUE	0.929	70.000	0.540	NA		NA
2168451	2168452	CPF_2199	CPF_2200		yajC	FALSE	0.271	196.000	0.002	NA		NA
2168452	2168453	CPF_2200	CPF_2201	yajC	tgt	TRUE	0.835	39.000	0.035	NA	N	NA
2168453	2168454	CPF_2201	CPF_2202	tgt	queA	TRUE	0.958	24.000	0.014	0.001	Y	NA
2168454	2168455	CPF_2202	CPF_2203	queA	ruvB	TRUE	0.921	22.000	0.069	1.000	N	NA
2168455	2168456	CPF_2203	CPF_2204	ruvB	ruvA	TRUE	0.993	14.000	0.549	0.002	Y	NA
2168456	2168457	CPF_2204	CPF_2205	ruvA		FALSE	0.262	229.000	0.007	NA		NA
2168457	2168458	CPF_2205	CPF_2206			FALSE	0.035	298.000	0.000	NA		NA
2168458	2168459	CPF_2206	CPF_2207			TRUE	0.445	250.000	0.000	0.001	Y	NA
2168459	2168460	CPF_2207	CPF_2208			FALSE	0.061	249.000	0.000	1.000	N	NA
2168460	2168461	CPF_2208	CPF_2209		vhb	FALSE	0.016	475.000	0.000	1.000	N	NA
2168461	2168462	CPF_2209	CPF_2210	vhb		FALSE	0.016	427.000	0.000	NA		NA
2168462	2168463	CPF_2210	CPF_2211			TRUE	0.559	126.000	0.015	NA		NA
2168463	2168464	CPF_2211	CPF_2212			TRUE	0.839	6.000	0.015	1.000		NA
2168464	2168465	CPF_2212	CPF_2213			TRUE	0.953	15.000	0.176	1.000		NA
2168465	2168466	CPF_2213	CPF_2214			FALSE	0.297	42.000	0.000	NA		NA
2168466	2168467	CPF_2214	CPF_2215			TRUE	0.447	132.000	0.002	NA		NA
2168470	2168471	CPF_2218	CPF_2219			FALSE	0.042	294.000	0.000	1.000	N	NA
2168472	2168473	CPF_2220	CPF_2221			FALSE	0.276	48.000	0.000	NA		NA
2168474	2168475	CPF_2222	CPF_2223		potA	TRUE	0.953	32.000	0.326	1.000	N	NA
2168475	2168476	CPF_2223	CPF_2224	potA	potB	TRUE	0.996	3.000	0.928	1.000	Y	NA
2168476	2168477	CPF_2224	CPF_2225	potB	potC	TRUE	0.995	-6.000	0.492	0.028	Y	NA
2168477	2168478	CPF_2225	CPF_2226	potC	potD	TRUE	0.989	2.000	0.131	0.028	Y	NA
2168481	2168482	CPF_2229	CPF_2230			FALSE	0.090	168.000	0.000	NA		NA
2168485	2168486	CPF_2233	CPF_2234	asnA		FALSE	0.118	126.000	0.000	1.000		NA
2168486	2168487	CPF_2234	CPF_2235			FALSE	0.134	112.000	0.000	1.000		NA
2168487	2168488	CPF_2235	CPF_2236			TRUE	0.984	-7.000	0.869	1.000		NA
2168488	2168489	CPF_2236	CPF_2237			FALSE	0.176	98.000	0.000	NA		NA
2168490	2168491	CPF_2238	CPF_2239			FALSE	0.066	228.000	0.000	1.000	N	NA
2168491	2168492	CPF_2239	CPF_2240			FALSE	0.113	163.000	0.000	1.000	N	NA
2168492	2168493	CPF_2240	CPF_2241			TRUE	0.961	46.000	0.027	1.000	Y	NA
2168493	2168494	CPF_2241	CPF_2242			TRUE	0.995	-10.000	0.500	0.007	Y	NA
2168494	2168495	CPF_2242	CPF_2243			FALSE	0.139	145.000	0.000	1.000	N	NA
2168495	2168496	CPF_2243	CPF_2244			FALSE	0.212	121.000	0.000	NA	N	NA
2168496	2168497	CPF_2244	CPF_2245			FALSE	0.155	123.000	0.000	NA		NA
2168497	1422960	CPF_2245	CPF_2246			FALSE	0.128	141.000	0.000	NA		NA
1422960	2168498	CPF_2246	CPF_2247			FALSE	0.229	60.000	0.000	NA		NA
2168498	2168499	CPF_2247	CPF_2248			FALSE	0.253	52.000	0.000	NA		NA
2168499	2168500	CPF_2248	CPF_2249		coaE	TRUE	0.915	10.000	0.058	NA		NA
2168500	2168501	CPF_2249	CPF_2250	coaE	polA	TRUE	0.923	17.000	0.068	1.000	N	NA
2168501	2168502	CPF_2250	CPF_2251	polA		FALSE	0.028	357.000	0.000	1.000	N	NA
2168503	2168504	CPF_2252	CPF_2253			FALSE	0.194	83.000	0.000	NA		NA
2168505	2168506	CPF_2254	CPF_2255			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
2168506	2168507	CPF_2255	CPF_2256			FALSE	0.064	209.000	0.000	NA		NA
2168507	2168508	CPF_2256	CPF_2257			FALSE	0.009	589.000	0.000	NA		NA
2168508	2168509	CPF_2257	CPF_2258			FALSE	0.098	163.000	0.000	NA		NA
2168509	2168510	CPF_2258	CPF_2259			TRUE	0.936	18.000	0.095	NA		NA
2168510	2168511	CPF_2259	CPF_2260			TRUE	0.962	19.000	0.262	NA		NA
2168511	2168512	CPF_2260	CPF_2261			FALSE	0.012	514.000	0.000	NA		NA
2168512	2168513	CPF_2261	CPF_2262			TRUE	0.971	0.000	0.283	NA		NA
2168513	2168514	CPF_2262	CPF_2263			TRUE	0.876	14.000	0.028	NA		NA
2168514	2168515	CPF_2263	CPF_2264		rpoD	FALSE	0.356	235.000	0.026	NA		NA
2168515	2168516	CPF_2264	CPF_2265	rpoD	dnaG	TRUE	0.950	27.000	0.209	1.000	N	NA
2168516	2168517	CPF_2265	CPF_2266	dnaG		TRUE	0.587	169.000	0.056	1.000	N	NA
2168519	2168520	CPF_2268	CPF_2269	ppdK		TRUE	0.609	101.000	0.019	1.000		NA
2168520	2168521	CPF_2269	CPF_2270			TRUE	0.718	205.000	0.273	NA		NA
2168521	2168522	CPF_2270	CPF_2271		recO	TRUE	0.821	6.000	0.007	NA		NA
2168522	2168523	CPF_2271	CPF_2272	recO	era	TRUE	0.838	76.000	0.108	1.000		NA
2168523	2168524	CPF_2272	CPF_2273	era	cdd	TRUE	0.927	9.000	0.077	1.000		NA
2168524	2168525	CPF_2273	CPF_2274	cdd		TRUE	0.725	44.000	0.008	1.000	N	NA
2168525	2168526	CPF_2274	CPF_2275			TRUE	0.777	28.000	0.009	NA		NA
2168526	2168527	CPF_2275	CPF_2276			TRUE	0.962	2.000	0.182	NA		NA
2168527	2168528	CPF_2276	CPF_2277			TRUE	0.817	37.000	0.032	NA		NA
2168528	2168529	CPF_2277	CPF_2278		yqfC	TRUE	0.982	2.000	0.851	NA		NA
2168529	2168530	CPF_2278	CPF_2279	yqfC		FALSE	0.379	221.000	0.029	NA		NA
2168530	2168531	CPF_2279	CPF_2280		rpsU	TRUE	0.871	50.000	0.150	0.025		NA
2168531	2168532	CPF_2280	CPF_2281	rpsU		TRUE	0.750	120.000	0.071	1.000		NA
2168532	2168533	CPF_2281	CPF_2282			TRUE	0.726	69.000	0.051	0.026	N	NA
2168533	2168534	CPF_2282	CPF_2283			TRUE	0.962	0.000	0.163	NA		NA
2168534	2168535	CPF_2283	CPF_2284		prmA	TRUE	0.957	23.000	0.227	NA		NA
2168535	2168536	CPF_2284	CPF_2285	prmA		FALSE	0.067	226.000	0.000	1.000	N	NA
2168536	2168537	CPF_2285	CPF_2286			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2168537	2168538	CPF_2286	CPF_2287			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
2168538	2168539	CPF_2287	CPF_2288			TRUE	0.971	-13.000	0.200	NA		NA
2168539	2168540	CPF_2288	CPF_2289		dnaJ	FALSE	0.010	176.000	0.000	0.097	N	NA
2168540	2168541	CPF_2289	CPF_2290	dnaJ	dnaK	TRUE	0.959	114.000	0.196	0.003	Y	NA
2168541	2168542	CPF_2290	CPF_2291	dnaK	grpE	TRUE	0.975	57.000	0.224	0.005	Y	NA
2168542	2168543	CPF_2291	CPF_2292	grpE	hrcA	TRUE	0.952	31.000	0.286	1.000	N	NA
2168543	2168544	CPF_2292	CPF_2293	hrcA		TRUE	0.540	197.000	0.062	1.000	N	NA
2168544	2168545	CPF_2293	CPF_2294			FALSE	0.050	270.000	0.000	1.000	N	NA
2168545	2168546	CPF_2294	CPF_2295		lepA	FALSE	0.056	257.000	0.000	1.000	N	NA
2168546	2168547	CPF_2295	CPF_2296	lepA		TRUE	0.470	121.000	0.002	NA		NA
2168547	2168548	CPF_2296	CPF_2297			TRUE	0.778	55.000	0.038	NA		NA
2168548	2168549	CPF_2297	CPF_2298		gpr	TRUE	0.865	149.000	0.521	NA		NA
2168551	2168552	CPF_2300	CPF_2301	holA		TRUE	0.919	44.000	0.163	NA		NA
2168552	2168553	CPF_2301	CPF_2302		spoVAE	FALSE	0.253	52.000	0.000	NA		NA
2168553	2168554	CPF_2302	CPF_2303	spoVAE	spoVAD	TRUE	0.930	56.000	0.386	NA		NA
2168554	2168555	CPF_2303	CPF_2304	spoVAD	spoVAC	TRUE	0.971	6.000	0.386	NA		NA
2168555	2168556	CPF_2304	CPF_2305	spoVAC	sigF	TRUE	0.732	138.000	0.078	NA		NA
2168556	2168557	CPF_2305	CPF_2306	sigF	spoIIAB	TRUE	0.979	18.000	0.842	1.000	N	NA
2168557	2168558	CPF_2306	CPF_2307	spoIIAB	spoIIAA	TRUE	0.993	14.000	0.669	0.001	Y	NA
2168558	2168559	CPF_2307	CPF_2308	spoIIAA		TRUE	0.537	134.000	0.014	1.000	N	NA
2168559	2168560	CPF_2308	CPF_2309		deoC	FALSE	0.079	201.000	0.000	1.000	N	NA
2168564	2168565	CPF_2313	CPF_2314			TRUE	0.766	84.000	0.055	NA		NA
2168565	2168566	CPF_2314	CPF_2315			FALSE	0.064	210.000	0.000	NA		NA
2168566	2168567	CPF_2315	CPF_2316			FALSE	0.010	586.000	0.000	NA		NA
2168567	2168568	CPF_2316	CPF_2317			FALSE	0.159	120.000	0.000	NA		NA
2168568	2168569	CPF_2317	CPF_2318		nifJ	FALSE	0.010	702.000	0.000	1.000	N	NA
2168569	2168570	CPF_2318	CPF_2319	nifJ		TRUE	0.898	105.000	0.016	0.033	Y	NA
2168570	2168571	CPF_2319	CPF_2320		murG	FALSE	0.296	207.000	0.006	1.000	N	NA
2168573	2168574	CPF_2322	CPF_2323	recJ		TRUE	0.772	12.000	0.002	1.000		NA
2168574	2168575	CPF_2323	CPF_2324			FALSE	0.305	213.000	0.012	NA		NA
2168575	2168576	CPF_2324	CPF_2325		gyrA	TRUE	0.859	12.000	0.020	NA		NA
2168576	2168577	CPF_2325	CPF_2326	gyrA		TRUE	0.993	14.000	0.552	0.002	Y	NA
2168577	2168578	CPF_2326	CPF_2327			TRUE	0.514	-10.000	0.000	NA		NA
2168578	2168579	CPF_2327	CPF_2328			FALSE	0.054	246.000	0.000	NA		NA
2168580	2168581	CPF_2329	CPF_2330	uvdE	ytaF	FALSE	0.150	85.000	0.000	1.000		NA
2168582	2168583	CPF_2331	CPF_2332			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
2168583	2168584	CPF_2332	CPF_2333			FALSE	0.030	347.000	0.000	1.000	N	NA
2168584	2168585	CPF_2333	CPF_2334			TRUE	0.898	49.000	0.000	NA	Y	NA
2168585	2168586	CPF_2334	CPF_2335			TRUE	0.778	141.000	0.000	NA	Y	NA
2168588	2168589	CPF_2337	CPF_2338			FALSE	0.435	307.000	0.000	1.000	Y	NA
2168589	2168590	CPF_2338	CPF_2339			TRUE	0.925	18.000	0.000	0.028	Y	NA
2168590	2168591	CPF_2339	CPF_2340		moaC	FALSE	0.066	228.000	0.000	1.000	N	NA
2168591	2168592	CPF_2340	CPF_2341	moaC	modB	FALSE	0.339	39.000	0.000	1.000	N	NA
2168592	2168593	CPF_2341	CPF_2342	modB	modA	TRUE	0.992	4.000	0.430	0.001	Y	NA
2168593	2168594	CPF_2342	CPF_2343	modA		TRUE	0.568	-15.000	0.000	1.000	N	NA
2168594	2168595	CPF_2343	CPF_2344			FALSE	0.031	342.000	0.000	1.000	N	NA
2168595	2168596	CPF_2344	CPF_2345			TRUE	0.927	5.000	0.000	0.012	Y	NA
2168597	2168598	CPF_2346	CPF_2347			FALSE	0.045	267.000	0.000	NA		NA
2168598	2168599	CPF_2347	CPF_2348			FALSE	0.026	366.000	0.000	1.000	N	NA
2168600	2168601	CPF_2349	CPF_2350			TRUE	0.942	19.000	0.000	1.000	Y	NA
2168603	2168604	CPF_2352	CPF_2353			FALSE	0.012	507.000	0.000	NA		NA
2168604	2168605	CPF_2353	CPF_2354			FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
2168605	2168606	CPF_2354	CPF_2355		virJ	FALSE	0.165	117.000	0.000	NA		NA
2168606	2168607	CPF_2355	CPF_2356	virJ	virI	TRUE	0.997	-10.000	0.692	1.000	Y	NA
2168607	2168608	CPF_2356	CPF_2357	virI		FALSE	0.068	203.000	0.000	NA		NA
2168608	2168609	CPF_2357	CPF_2358			FALSE	0.141	133.000	0.000	NA		NA
2168609	2168610	CPF_2358	CPF_2359			FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
2168612	2168613	CPF_2361	CPF_2362			TRUE	0.947	18.000	0.131	NA		NA
2168613	2168614	CPF_2362	CPF_2363			TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
2168614	2168615	CPF_2363	CPF_2364			FALSE	0.086	172.000	0.000	NA		NA
2168615	2168616	CPF_2364	CPF_2365			FALSE	0.424	13.000	0.000	NA		NA
2168616	2168617	CPF_2365	CPF_2366			FALSE	0.069	200.000	0.000	NA		NA
2168619	2168620	CPF_2368	CPF_2369			FALSE	0.071	2.000	0.000	0.003		NA
2168620	2168621	CPF_2369	CPF_2370		rumA	FALSE	0.011	459.000	0.000	1.000		NA
2168621	2168622	CPF_2370	CPF_2371	rumA		FALSE	0.363	28.000	0.000	NA		NA
2168622	2168623	CPF_2371	CPF_2372		selB	FALSE	0.076	187.000	0.000	NA		NA
2168623	2168624	CPF_2372	CPF_2373	selB	selA	TRUE	0.970	1.000	0.569	0.001	N	NA
2168624	2168625	CPF_2373	CPF_2374	selA	selD	TRUE	0.984	17.000	0.055	1.000	Y	NA
2168625	2168626	CPF_2374	CPF_2375	selD		TRUE	0.733	45.000	0.012	1.000	N	NA
2168628	2168629	CPF_2377	CPF_2378			TRUE	0.952	-3.000	0.093	1.000	N	NA
2168629	2168630	CPF_2378	CPF_2379			TRUE	0.876	23.000	0.033	1.000	N	NA
2168630	2168631	CPF_2379	CPF_2380		nadD	TRUE	0.993	3.000	0.199	1.000	Y	NA
2168631	2168632	CPF_2380	CPF_2381	nadD		TRUE	0.962	2.000	0.150	NA	N	NA
2168632	2168633	CPF_2381	CPF_2382		obg	TRUE	0.898	18.000	0.046	NA		NA
2168633	2168634	CPF_2382	CPF_2383	obg	rpmA	TRUE	0.790	167.000	0.335	1.000		NA
2168634	2168635	CPF_2383	CPF_2384	rpmA		TRUE	0.993	4.000	0.203	NA	Y	NA
2168635	2168636	CPF_2384	CPF_2385		rplU	TRUE	0.992	10.000	0.208	NA	Y	NA
2168636	2168637	CPF_2385	CPF_2386	rplU		TRUE	0.882	126.000	0.018	0.021	Y	NA
2168637	2168638	CPF_2386	CPF_2387			TRUE	0.955	17.000	0.180	NA		NA
2168638	2168639	CPF_2387	CPF_2388			TRUE	0.981	-22.000	0.420	NA		NA
2168639	2168640	CPF_2388	CPF_2389			TRUE	0.762	132.000	0.098	1.000		NA
2168640	2168641	CPF_2389	CPF_2390			TRUE	0.488	-3.000	0.000	NA		NA
2168641	2168642	CPF_2390	CPF_2391			FALSE	0.112	153.000	0.000	NA		NA
2168642	2168643	CPF_2391	CPF_2392		minE	TRUE	0.760	148.000	0.000	NA	Y	NA
2168643	2168644	CPF_2392	CPF_2393	minE	minD	TRUE	0.994	11.000	0.347	NA	Y	NA
2168644	2168645	CPF_2393	CPF_2394	minD	minC	TRUE	0.991	29.000	0.368	1.000	Y	NA
2168645	2168646	CPF_2394	CPF_2395	minC		TRUE	0.458	247.000	0.060	1.000	N	NA
2168646	2168647	CPF_2395	CPF_2396		mreD	TRUE	0.933	9.000	0.089	1.000		NA
2168647	2168648	CPF_2396	CPF_2397	mreD	mreC	TRUE	0.961	16.000	0.550	0.002		NA
2168648	2168649	CPF_2397	CPF_2398	mreC	mreB	TRUE	0.979	4.000	0.689	1.000	N	NA
2168649	2168650	CPF_2398	CPF_2399	mreB		TRUE	0.892	20.000	0.040	1.000	N	NA
2168650	2168651	CPF_2399	CPF_2400		maf	TRUE	0.881	47.000	0.074	NA	N	NA
2168651	2168652	CPF_2400	CPF_2401	maf		FALSE	0.058	226.000	0.000	NA		NA
2168652	2168653	CPF_2401	CPF_2402			FALSE	0.046	262.000	0.000	NA		NA
2168653	2168654	CPF_2402	CPF_2403		pepD	FALSE	0.023	314.000	0.000	1.000		NA
2168656	2168657	CPF_2405	CPF_2406			FALSE	0.093	146.000	0.000	1.000		NA
2168657	2168658	CPF_2406	CPF_2407			FALSE	0.174	105.000	0.000	NA		NA
2168658	2168659	CPF_2407	CPF_2408			FALSE	0.093	166.000	0.000	NA		NA
2168659	2168660	CPF_2408	CPF_2409			TRUE	0.624	86.000	0.017	1.000		NA
2168660	2168661	CPF_2409	CPF_2410			FALSE	0.050	255.000	0.000	NA		NA
2168661	2168662	CPF_2410	CPF_2411			FALSE	0.084	173.000	0.000	NA		NA
2168662	2168663	CPF_2411	CPF_2412		ptsG	FALSE	0.034	324.000	0.000	1.000	N	NA
2168663	2168664	CPF_2412	CPF_2413	ptsG		FALSE	0.100	171.000	0.000	1.000	N	NA
2168664	2168665	CPF_2413	CPF_2414			FALSE	0.172	112.000	0.000	NA		NA
2168665	2168666	CPF_2414	CPF_2415			FALSE	0.437	7.000	0.000	NA		NA
2168666	2168667	CPF_2415	CPF_2416			TRUE	0.976	-10.000	0.330	NA		NA
2168667	2168668	CPF_2416	CPF_2417			FALSE	0.030	280.000	0.000	1.000		NA
2168668	2168669	CPF_2417	CPF_2418			FALSE	0.101	140.000	0.000	1.000		NA
2168669	1423133	CPF_2418	CPF_2419			FALSE	0.104	158.000	0.000	NA		NA
1423133	1423134	CPF_2419	CPF_2420			FALSE	0.356	29.000	0.000	NA		NA
1423134	2168670	CPF_2420	CPF_2421			FALSE	0.046	263.000	0.000	NA		NA
2168671	2168672	CPF_2422	CPF_2423			TRUE	0.967	-6.000	0.217	1.000		NA
2168672	2168673	CPF_2423	CPF_2424		rimI	TRUE	0.955	0.000	0.127	1.000		NA
2168674	2168675	CPF_2425	CPF_2426			FALSE	0.026	347.000	0.000	NA		NA
2168677	2168678	CPF_2428	CPF_2429	prfB	secA	FALSE	0.396	259.000	0.048	1.000	N	NA
2168678	2168679	CPF_2429	CPF_2430	secA	yfiA	TRUE	0.460	235.000	0.050	NA	N	NA
2168679	2168680	CPF_2430	CPF_2431	yfiA		FALSE	0.215	452.000	0.080	NA		NA
2168680	2168681	CPF_2431	CPF_2432			TRUE	0.865	-24.000	0.005	NA		NA
2168681	2168682	CPF_2432	CPF_2433			TRUE	0.921	18.000	0.069	NA		NA
2168684	1423150	CPF_2435	CPF_2436	metK		FALSE	0.016	431.000	0.000	NA		NA
1423150	1423151	CPF_2436	CPF_2437			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423151	1423152	CPF_2437	CPF_2438			FALSE	0.381	26.000	0.000	NA		NA
1423152	1423153	CPF_2438	CPF_2439			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423153	1423154	CPF_2439	CPF_2440			FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
1423154	1423155	CPF_2440	CPF_2441			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423155	1423156	CPF_2441	CPF_2442			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423156	2168685	CPF_2442	CPF_2443			FALSE	0.095	165.000	0.000	NA		NA
2168687	2168688	CPF_2445	CPF_2446	mbl	spoIIID	TRUE	0.886	91.000	0.284	1.000		NA
2168688	2168689	CPF_2446	CPF_2447	spoIIID		FALSE	0.159	77.000	0.000	1.000		NA
2168689	2168690	CPF_2447	CPF_2448		spoIID	FALSE	0.196	110.000	0.000	1.000	N	NA
2168690	2168691	CPF_2448	CPF_2449	spoIID	murA	TRUE	0.880	112.000	0.243	1.000	N	NA
2168691	2168692	CPF_2449	CPF_2450	murA		FALSE	0.403	23.000	0.000	NA		NA
2168692	2168693	CPF_2450	CPF_2451		atpC	FALSE	0.078	182.000	0.000	NA		NA
2168693	2168694	CPF_2451	CPF_2452	atpC	atpD	TRUE	0.994	16.000	0.837	0.006	Y	NA
2168694	2168695	CPF_2452	CPF_2453	atpD	atpG	TRUE	0.994	14.000	0.724	0.006	Y	NA
2168695	2168696	CPF_2453	CPF_2454	atpG	atpA	TRUE	0.985	65.000	0.846	0.006	Y	NA
2168696	2168697	CPF_2454	CPF_2455	atpA	atpH	TRUE	0.994	11.000	0.864	0.006	Y	NA
2168697	2168698	CPF_2455	CPF_2456	atpH	atpF	TRUE	0.977	3.000	0.040	0.006	Y	NA
2168698	2168699	CPF_2456	CPF_2457	atpF	atpE	TRUE	0.889	100.000	0.643	0.006		NA
2168699	2168700	CPF_2457	CPF_2458	atpE	atpB	TRUE	0.750	61.000	0.069	0.006		NA
2168700	2168701	CPF_2458	CPF_2459	atpB		TRUE	0.912	66.000	0.330	1.000		NA
2168701	2168702	CPF_2459	CPF_2460			FALSE	0.006	682.000	0.000	1.000		NA
2168702	2168703	CPF_2460	CPF_2461		mnaA	TRUE	0.472	268.000	0.083	1.000	N	NA
2168703	2168704	CPF_2461	CPF_2462	mnaA	upp	FALSE	0.248	64.000	0.000	1.000	N	NA
2168704	2168705	CPF_2462	CPF_2463	upp	rpiB	TRUE	0.769	45.000	0.019	1.000	N	NA
2168705	2168706	CPF_2463	CPF_2464	rpiB		FALSE	0.302	264.000	0.020	NA	N	NA
2168706	2168707	CPF_2464	CPF_2465			TRUE	0.846	23.000	0.020	NA		NA
2168707	2168708	CPF_2465	CPF_2466		prfA	TRUE	0.607	79.000	0.009	NA		NA
2168708	2168709	CPF_2466	CPF_2467	prfA		TRUE	0.809	57.000	0.060	1.000		NA
2168709	2168710	CPF_2467	CPF_2468		tdk	TRUE	0.839	26.000	0.026	1.000		NA
2168711	2168712	CPF_2469	CPF_2470	rpmE		TRUE	0.530	109.000	0.004	1.000	N	NA
2168713	2168714	CPF_2471	CPF_2472	rho	pyrG	FALSE	0.057	255.000	0.000	1.000	N	NA
2168714	2168715	CPF_2472	CPF_2473	pyrG		FALSE	0.027	341.000	0.000	NA		NA
2168715	2168716	CPF_2473	CPF_2474			TRUE	0.811	23.000	0.011	NA		NA
2168716	2168717	CPF_2474	CPF_2475			TRUE	0.676	46.000	0.005	NA		NA
2168717	2168718	CPF_2475	CPF_2476		ispE	TRUE	0.621	70.000	0.009	NA		NA
2168718	2168719	CPF_2476	CPF_2477	ispE	cphA	TRUE	0.471	136.000	0.016	0.096	N	NA
2168719	2168720	CPF_2477	CPF_2478	cphA	cphB	TRUE	0.984	-13.000	0.605	1.000	N	NA
2168720	2168721	CPF_2478	CPF_2479	cphB		TRUE	0.821	91.000	0.109	1.000		NA
2168721	2168722	CPF_2479	CPF_2480			FALSE	0.306	360.000	0.082	NA		NA
2168722	2168723	CPF_2480	CPF_2481			TRUE	0.710	163.000	0.116	NA		NA
2168723	2168724	CPF_2481	CPF_2482		cotS	TRUE	0.634	199.000	0.119	NA		NA
2168726	2168727	CPF_2484	CPF_2485			TRUE	0.978	16.000	0.800	NA		NA
2168727	2168728	CPF_2485	CPF_2486			TRUE	0.969	8.000	0.357	NA		NA
2168730	2168731	CPF_2488	CPF_2489			TRUE	0.656	193.000	0.131	NA		NA
2168732	2168733	CPF_2490	CPF_2491			FALSE	0.261	35.000	0.000	1.000		NA
2168734	2168735	CPF_2492	CPF_2493			FALSE	0.113	163.000	0.000	1.000	N	NA
2168735	2168736	CPF_2493	CPF_2494			FALSE	0.066	230.000	0.000	1.000	N	NA
2168736	2168737	CPF_2494	CPF_2495			TRUE	0.852	117.000	0.200	1.000		NA
2168737	2168738	CPF_2495	CPF_2496		gcp	TRUE	0.620	51.000	0.004	1.000		NA
2168739	2168740	CPF_2497	CPF_2498			TRUE	0.929	9.000	0.079	1.000		NA
2168741	2168742	CPF_2499	CPF_2500			TRUE	0.967	32.000	0.023	1.000	Y	NA
2168744	2168745	CPF_2502	CPF_2503			TRUE	0.966	17.000	0.323	NA		NA
2168745	2168746	CPF_2503	CPF_2504			TRUE	0.953	181.000	0.472	1.000	Y	NA
2168746	1423219	CPF_2504	CPF_2505			FALSE	0.030	322.000	0.000	NA		NA
1423219	1423220	CPF_2505	CPF_3017		rrlG	FALSE	0.251	53.000	0.000	NA		NA
1423220	1423221	CPF_3017	CPF_2506	rrlG		FALSE	0.175	100.000	0.000	NA		NA
1423221	1423222	CPF_2506	CPF_2507			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423222	1423223	CPF_2507	CPF_3018		rrsG	FALSE	0.100	161.000	0.000	NA		NA
1423223	2168747	CPF_3018	CPF_2508	rrsG		FALSE	0.013	478.000	0.000	NA		NA
2168747	2168748	CPF_2508	CPF_2509			TRUE	0.996	-13.000	0.758	0.001	Y	NA
2168749	2168750	CPF_2510	CPF_2511			TRUE	0.532	-16.000	0.000	NA		NA
2168751	1423229	CPF_2512	CPF_2513	pepD		FALSE	0.078	182.000	0.000	NA		NA
1423229	1423230	CPF_2513	CPF_2514			FALSE	0.258	51.000	0.000	NA		NA
1423230	1423231	CPF_2514	CPF_2515			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
1423231	1423232	CPF_2515	CPF_2516			FALSE	0.396	24.000	0.000	NA		NA
1423232	1423233	CPF_2516	CPF_2517			FALSE	0.430	11.000	0.000	NA		NA
1423233	1423234	CPF_2517	CPF_2518			FALSE	0.436	8.000	0.000	NA		NA
1423234	1423235	CPF_2518	CPF_2519			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423235	1423236	CPF_2519	CPF_2520			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423236	1423237	CPF_2520	CPF_2521			FALSE	0.316	36.000	0.000	NA		NA
1423237	1423238	CPF_2521	CPF_2522			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423238	1423239	CPF_2522	CPF_2523			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423239	1423240	CPF_2523	CPF_2524			FALSE	0.203	76.000	0.000	NA		NA
1423240	1423241	CPF_2524	CPF_2525			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423241	1423242	CPF_2525	CPF_2526			FALSE	0.372	27.000	0.000	NA		NA
1423242	1423243	CPF_2526	CPF_2527			FALSE	0.430	11.000	0.000	NA		NA
1423243	1423244	CPF_2527	CPF_2528			FALSE	0.415	20.000	0.000	NA		NA
1423244	1423245	CPF_2528	CPF_2529			FALSE	0.437	7.000	0.000	NA		NA
1423245	1423246	CPF_2529	CPF_2530			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
1423246	1423247	CPF_2530	CPF_2531			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423247	1423248	CPF_2531	CPF_2532			FALSE	0.198	80.000	0.000	NA		NA
1423248	1423249	CPF_2532	CPF_2533			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423249	2168752	CPF_2533	CPF_2534			FALSE	0.064	210.000	0.000	NA		NA
2168752	2168753	CPF_2534	CPF_2535			FALSE	0.357	12.000	0.000	1.000		NA
2168753	2168754	CPF_2535	CPF_2536		rph	TRUE	0.969	2.000	0.262	1.000	N	NA
2168756	2168757	CPF_2538	CPF_2539			FALSE	0.008	1158.000	0.000	NA		NA
2168759	2168760	CPF_2541	CPF_2542	ligA	pcrA	TRUE	0.959	38.000	0.039	0.013	Y	NA
2168760	2168761	CPF_2542	CPF_2543	pcrA		FALSE	0.063	212.000	0.000	NA		NA
2168761	2168762	CPF_2543	CPF_2544			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
2168762	2168763	CPF_2544	CPF_2545			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2168763	2168764	CPF_2545	CPF_2546			FALSE	0.008	553.000	0.000	1.000		NA
2168764	2168765	CPF_2546	CPF_2547			FALSE	0.016	374.000	0.000	1.000		NA
2168765	2168766	CPF_2547	CPF_2548			FALSE	0.022	373.000	0.000	NA		NA
2168766	2168767	CPF_2548	CPF_2549		pgi	FALSE	0.371	198.000	0.018	NA		NA
2168767	2168768	CPF_2549	CPF_2550	pgi		FALSE	0.351	30.000	0.000	NA		NA
2168768	2168769	CPF_2550	CPF_2551			FALSE	0.068	202.000	0.000	NA		NA
2168769	2168770	CPF_2551	CPF_2552			TRUE	0.929	1.000	0.000	0.001	Y	NA
2168770	2168771	CPF_2552	CPF_2553			TRUE	0.944	14.000	0.000	1.000	Y	NA
2168771	2168772	CPF_2553	CPF_2554			TRUE	0.994	15.000	0.667	0.027	Y	NA
2168772	2168773	CPF_2554	CPF_2555			TRUE	0.813	75.000	0.000	0.027	Y	NA
2168775	2168776	CPF_2557	CPF_2558	guaA	guaB	TRUE	0.958	107.000	0.190	0.001	Y	NA
2168776	2168777	CPF_2558	CPF_2559	guaB		FALSE	0.008	710.000	0.000	NA		NA
2168777	2168778	CPF_2559	CPF_2560			FALSE	0.396	24.000	0.000	NA		NA
2168778	2168779	CPF_2560	CPF_2561			FALSE	0.381	26.000	0.000	NA		NA
2168779	2168780	CPF_2561	CPF_2562			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
2168780	2168781	CPF_2562	CPF_2563			FALSE	0.412	21.000	0.000	NA		NA
2168781	2168782	CPF_2563	CPF_2564			TRUE	0.983	-10.000	0.667	NA		NA
2168782	2168783	CPF_2564	CPF_2565			TRUE	0.942	15.000	0.111	NA		NA
2168783	2168784	CPF_2565	CPF_2566			TRUE	0.831	113.000	0.000	NA	Y	NA
2168784	2168785	CPF_2566	CPF_2567			TRUE	0.946	13.000	0.000	NA	Y	NA
2168785	2168786	CPF_2567	CPF_2568			TRUE	0.880	58.000	0.000	NA	Y	NA
2168786	2168787	CPF_2568	CPF_2569			TRUE	0.983	16.000	0.047	NA	Y	NA
2168787	2168788	CPF_2569	CPF_2570			TRUE	0.988	27.000	0.141	1.000	Y	NA
2168788	2168789	CPF_2570	CPF_2571			TRUE	0.940	70.000	0.025	1.000	Y	NA
2168789	2168790	CPF_2571	CPF_2572			FALSE	0.041	277.000	0.000	NA		NA
2168790	2168791	CPF_2572	CPF_2573		groEL	FALSE	0.009	666.000	0.000	NA		NA
2168791	2168792	CPF_2573	CPF_2574	groEL	groS	TRUE	0.985	55.000	0.674	0.005	Y	NA
2168793	2168794	CPF_2575	CPF_2576			FALSE	0.116	149.000	0.000	NA		NA
2168795	2168796	CPF_2577	CPF_2578			TRUE	0.833	10.000	0.012	NA		NA
2168796	2168797	CPF_2578	CPF_2579			FALSE	0.055	242.000	0.000	NA		NA
2168797	2168798	CPF_2579	CPF_2580			FALSE	0.097	142.000	0.000	1.000		NA
2168798	2168799	CPF_2580	CPF_2581		hbd	FALSE	0.055	260.000	0.000	1.000	N	NA
2168799	2168800	CPF_2581	CPF_2582	hbd		TRUE	0.869	114.000	0.216	1.000	N	NA
2168800	2168801	CPF_2582	CPF_2583			TRUE	0.993	22.000	0.714	0.014	Y	NA
2168801	2168802	CPF_2583	CPF_2584		bcd	TRUE	0.966	19.000	0.545	0.032	N	NA
2168802	2168803	CPF_2584	CPF_2585	bcd	crt	TRUE	0.983	47.000	0.162	1.000	Y	NA
2168803	2168804	CPF_2585	CPF_2586	crt		FALSE	0.035	263.000	0.000	1.000		NA
2168804	2168805	CPF_2586	CPF_2587		cadA	FALSE	0.010	466.000	0.000	1.000		NA
2168805	2168806	CPF_2587	CPF_2588	cadA		TRUE	0.969	16.000	0.364	1.000	N	NA
2168806	2168807	CPF_2588	CPF_2589			TRUE	0.733	135.000	0.000	0.033	Y	NA
2168807	2168808	CPF_2589	CPF_2590			FALSE	0.145	90.000	0.000	1.000		NA
2168808	2168809	CPF_2590	CPF_2591			FALSE	0.020	385.000	0.000	NA		NA
2168809	2168810	CPF_2591	CPF_2592			FALSE	0.025	349.000	0.000	NA		NA
2168812	2168813	CPF_2594	CPF_2595			FALSE	0.332	33.000	0.000	NA		NA
2168813	2168814	CPF_2595	CPF_2596		hsdR	FALSE	0.228	46.000	0.000	1.000		NA
2168814	2168815	CPF_2596	CPF_2597	hsdR		FALSE	0.022	371.000	0.000	NA		NA
2168815	2168816	CPF_2597	CPF_2598		hsdS	FALSE	0.280	47.000	0.000	NA		NA
2168816	2168817	CPF_2598	CPF_2599	hsdS	hsdM	TRUE	0.977	17.000	0.045	0.041	Y	NA
2168818	2168819	CPF_2600	CPF_2601			FALSE	0.220	64.000	0.000	NA		NA
2168819	2168820	CPF_2601	CPF_2602			FALSE	0.064	211.000	0.000	NA		NA
2168820	2168821	CPF_2602	CPF_2603			TRUE	0.514	-10.000	0.000	NA		NA
2168821	2168822	CPF_2603	CPF_2604			TRUE	0.996	-16.000	0.667	0.002	Y	NA
2168822	2168823	CPF_2604	CPF_2605			FALSE	0.214	68.000	0.000	NA		NA
2168823	2168824	CPF_2605	CPF_2606			FALSE	0.424	13.000	0.000	NA		NA
2168824	2168825	CPF_2606	CPF_2608			FALSE	0.357	12.000	0.000	1.000		NA
2168826	2168827	CPF_2607	CPF_2609			FALSE	0.065	237.000	0.000	1.000	N	NA
2168827	2168828	CPF_2609	CPF_2610			FALSE	0.010	697.000	0.000	1.000	N	NA
2168828	2168829	CPF_2610	CPF_2611			FALSE	0.114	151.000	0.000	NA		NA
2168831	2168832	CPF_2613	CPF_2614			FALSE	0.409	22.000	0.000	NA		NA
2168832	2168833	CPF_2614	CPF_2615			FALSE	0.227	61.000	0.000	NA		NA
2168835	2168836	CPF_2617	CPF_2618			FALSE	0.031	338.000	0.000	1.000	N	NA
2168836	1423335	CPF_2618	CPF_2619			FALSE	0.138	135.000	0.000	NA		NA
1423335	1423336	CPF_2619	CPF_2620			FALSE	0.287	45.000	0.000	NA		NA
1423336	1423337	CPF_2620	CPF_2621			FALSE	0.217	66.000	0.000	NA		NA
1423337	1423338	CPF_2621	CPF_2622			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
1423338	2168837	CPF_2622	CPF_2623			FALSE	0.151	126.000	0.000	NA		NA
2168839	1423342	CPF_2625	CPF_2626			FALSE	0.034	302.000	0.000	NA		NA
1423342	1423343	CPF_2626	CPF_2627			FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
1423343	1423344	CPF_2627	CPF_2628			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423344	1423345	CPF_2628	CPF_2629			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
1423345	1423346	CPF_2629	CPF_2630			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
2168841	2168842	CPF_2632	CPF_2633			FALSE	0.201	96.000	0.000	1.000	N	NA
2168842	2168843	CPF_2633	CPF_2634			FALSE	0.044	226.000	0.000	1.000		NA
2168843	2168844	CPF_2634	CPF_2635			FALSE	0.062	214.000	0.000	NA		NA
2168844	2168845	CPF_2635	CPF_2636		glmS	FALSE	0.415	20.000	0.000	NA		NA
2168849	1423357	CPF_2640	CPF_2641			FALSE	0.138	135.000	0.000	NA		NA
1423357	2168850	CPF_2641	CPF_2642			FALSE	0.088	170.000	0.000	NA		NA
2168850	2168851	CPF_2642	CPF_2643			FALSE	0.217	66.000	0.000	NA		NA
2168851	2168852	CPF_2643	CPF_2644			TRUE	0.572	140.000	0.025	NA		NA
2168852	2168853	CPF_2644	CPF_2645			FALSE	0.165	117.000	0.000	NA		NA
2168853	2168854	CPF_2645	CPF_2646		glgP	FALSE	0.353	359.000	0.000	1.000	Y	NA
2168854	2168855	CPF_2646	CPF_2647	glgP	malQ	TRUE	0.944	-7.000	0.000	0.023	Y	NA
2168855	2168856	CPF_2647	CPF_2648	malQ		TRUE	0.921	22.000	0.000	0.023	Y	NA
2168856	2168857	CPF_2648	CPF_2649			FALSE	0.434	24.000	0.000	1.000	N	NA
2168857	2168858	CPF_2649	CPF_2650			FALSE	0.042	295.000	0.000	1.000	N	NA
2168858	2168859	CPF_2650	CPF_2651			TRUE	0.995	2.000	0.818	0.027	Y	NA
2168859	2168860	CPF_2651	CPF_2652			TRUE	0.977	87.000	0.273	1.000	Y	NA
2168860	2168861	CPF_2652	CPF_2653			FALSE	0.015	458.000	0.000	NA		NA
2168861	2168862	CPF_2653	CPF_2654			TRUE	0.918	35.000	0.122	NA		NA
2168862	2168863	CPF_2654	CPF_2655		hydA	FALSE	0.046	219.000	0.000	1.000		NA
2168863	2168864	CPF_2655	CPF_2656	hydA	buk	FALSE	0.044	226.000	0.000	1.000		NA
2168864	2168865	CPF_2656	CPF_2657	buk	ptb	TRUE	0.992	24.000	0.275	1.000	Y	NA
2168865	2168866	CPF_2657	CPF_2658	ptb		FALSE	0.361	183.000	0.013	NA		NA
2168866	2168867	CPF_2658	CPF_2659			TRUE	0.825	76.000	0.083	NA		NA
2168867	2168868	CPF_2659	CPF_2660			TRUE	0.983	-33.000	0.502	NA		NA
2168869	2168870	CPF_2661	CPF_2662			TRUE	0.881	71.000	0.167	NA		NA
2168871	2168872	CPF_2663	CPF_2664		trx	FALSE	0.307	27.000	0.000	1.000		NA
2168872	2168873	CPF_2664	CPF_2665	trx	iadA	FALSE	0.129	117.000	0.000	1.000		NA
2168873	2168874	CPF_2665	CPF_2666	iadA	ptsI	FALSE	0.109	165.000	0.000	1.000	N	NA
2168878	2168879	CPF_2670	CPF_2671	nrdB	nrdA	TRUE	0.970	96.000	0.393	0.001	Y	NA
2168879	2168880	CPF_2671	CPF_2672	nrdA		FALSE	0.045	284.000	0.000	1.000	N	NA
2168880	2168881	CPF_2672	CPF_2673			FALSE	0.099	172.000	0.000	1.000	N	NA
2168881	2168882	CPF_2673	CPF_2674		drrA	TRUE	0.991	53.000	0.857	1.000	Y	NA
2168884	2168885	CPF_2676	CPF_2677	cwlD		FALSE	0.389	191.000	0.018	1.000	N	NA
2168885	2168886	CPF_2677	CPF_2678		rpsI	FALSE	0.023	391.000	0.000	1.000	N	NA
2168886	2168887	CPF_2678	CPF_2679	rpsI	rplM	TRUE	0.992	27.000	0.601	0.014	Y	NA
2168887	2168888	CPF_2679	CPF_2680	rplM	truA	TRUE	0.896	147.000	0.031	1.000	Y	NA
2168888	2168889	CPF_2680	CPF_2681	truA		TRUE	0.839	158.000	0.404	1.000	N	NA
2168889	2168890	CPF_2681	CPF_2682			TRUE	0.993	16.000	0.304	1.000	Y	NA
2168890	2168891	CPF_2682	CPF_2683			TRUE	0.996	-15.000	0.713	0.015	Y	NA
2168891	2168892	CPF_2683	CPF_2684		rplQ	FALSE	0.236	423.000	0.074	1.000	N	NA
2168892	2168893	CPF_2684	CPF_2685	rplQ	rpoA	TRUE	0.980	17.000	0.873	1.000	N	NA
2168893	2168894	CPF_2685	CPF_2686	rpoA	rpsD	TRUE	0.924	85.000	0.549	1.000	N	NA
2168894	2168895	CPF_2686	CPF_2687	rpsD	rpsK	TRUE	0.992	24.000	0.509	0.020	Y	NA
2168895	2168896	CPF_2687	CPF_2688	rpsK	rpsM	TRUE	0.994	17.000	0.810	0.014	Y	NA
2168896	2168897	CPF_2688	CPF_2689	rpsM	rpmJ	TRUE	0.548	237.000	0.194	0.014		NA
2168897	2168898	CPF_2689	CPF_2690	rpmJ	infA	TRUE	0.961	13.000	0.257	1.000		NA
2168898	2168899	CPF_2690	CPF_2691	infA		TRUE	0.937	8.000	0.090	NA		NA
2168899	2168900	CPF_2691	CPF_2692		map	TRUE	0.898	59.000	0.185	NA		NA
2168900	2168901	CPF_2692	CPF_2693	map	adk	TRUE	0.972	0.000	0.290	1.000	N	NA
2168901	2168902	CPF_2693	CPF_2694	adk	secY	TRUE	0.954	27.000	0.241	1.000	N	NA
2168902	2168903	CPF_2694	CPF_2695	secY	rplO	TRUE	0.980	3.000	0.730	1.000	N	NA
2168903	2168904	CPF_2695	CPF_2696	rplO	rpmD	TRUE	0.990	34.000	0.653	0.002	Y	NA
2168904	2168905	CPF_2696	CPF_2697	rpmD	rpsE	TRUE	0.994	12.000	0.789	0.020	Y	NA
2168905	2168906	CPF_2697	CPF_2698	rpsE	rplR	TRUE	0.994	21.000	0.814	0.020	Y	NA
2168906	2168907	CPF_2698	CPF_2699	rplR	rplF	TRUE	0.992	31.000	0.815	0.014	Y	NA
2168907	2168908	CPF_2699	CPF_2700	rplF	rpsH	TRUE	0.980	97.000	0.808	0.014	Y	NA
2168908	2168909	CPF_2700	CPF_2701	rpsH	rpsN	TRUE	0.989	34.000	0.473	0.014	Y	NA
2168909	2168910	CPF_2701	CPF_2702	rpsN	rplE	TRUE	0.993	17.000	0.496	0.014	Y	NA
2168910	2168911	CPF_2702	CPF_2703	rplE	rplX	TRUE	0.977	23.000	0.057	0.014	Y	NA
2168911	2168912	CPF_2703	CPF_2704	rplX	rplN	TRUE	0.980	24.000	0.071	0.020	Y	NA
2168912	2168913	CPF_2704	CPF_2705	rplN	rpsQ	TRUE	0.992	31.000	0.791	0.020	Y	NA
2168913	2168914	CPF_2705	CPF_2706	rpsQ	rpmC	TRUE	0.994	22.000	0.828	0.014	Y	NA
2168914	2168915	CPF_2706	CPF_2707	rpmC	rplP	TRUE	0.995	0.000	0.802	0.014	Y	NA
2168915	2168916	CPF_2707	CPF_2708	rplP	rpsC	TRUE	0.992	31.000	0.828	0.020	Y	NA
2168916	2168917	CPF_2708	CPF_2709	rpsC	rplV	TRUE	0.994	21.000	0.719	0.020	Y	NA
2168917	2168918	CPF_2709	CPF_2710	rplV	rpsS	TRUE	0.992	28.000	0.769	0.020	Y	NA
2168918	2168919	CPF_2710	CPF_2711	rpsS	rplB	TRUE	0.985	71.000	0.820	0.020	Y	NA
2168919	2168920	CPF_2711	CPF_2712	rplB	rplW	TRUE	0.988	55.000	0.849	0.020	Y	NA
2168920	2168921	CPF_2712	CPF_2713	rplW	rplD	TRUE	0.993	0.000	0.307	0.014	Y	NA
2168921	2168922	CPF_2713	CPF_2714	rplD	rplC	TRUE	0.992	25.000	0.544	0.014	Y	NA
2168922	2168923	CPF_2714	CPF_2715	rplC	rpsJ	TRUE	0.978	83.000	0.467	0.020	Y	NA
2168923	2168924	CPF_2715	CPF_2716	rpsJ	tuf	TRUE	0.627	696.000	0.318	1.000	Y	NA
2168924	2168925	CPF_2716	CPF_2717	tuf	fusA	TRUE	0.976	73.000	0.400	0.001	Y	NA
2168925	2168926	CPF_2717	CPF_2718	fusA	rpsG	TRUE	0.985	81.000	0.579	1.000	Y	NA
2168926	2168927	CPF_2718	CPF_2719	rpsG	rpsL	TRUE	0.933	160.000	0.224	0.003	Y	NA
2168927	2168928	CPF_2719	CPF_2720	rpsL		TRUE	0.913	58.000	0.239	NA		NA
2168928	2168929	CPF_2720	CPF_2721		rpoC	TRUE	0.763	113.000	0.065	NA		NA
2168929	2168930	CPF_2721	CPF_2722	rpoC	rpoB	TRUE	0.982	80.000	0.851	0.001	Y	NA
2168930	2168931	CPF_2722	CPF_2723	rpoB	rplL	TRUE	0.536	305.000	0.223	1.000	N	NA
2168931	2168932	CPF_2723	CPF_2724	rplL	rplJ	TRUE	0.991	55.000	0.884	1.000	Y	NA
2168932	2168933	CPF_2724	CPF_2725	rplJ	rplA	TRUE	0.926	217.000	0.302	1.000	Y	NA
2168933	2168934	CPF_2725	CPF_2726	rplA	rplK	TRUE	0.987	58.000	0.838	0.020	Y	NA
2168934	2168935	CPF_2726	CPF_2727	rplK	nusG	TRUE	0.937	75.000	0.681	1.000	N	NA
2168935	2168936	CPF_2727	CPF_2728	nusG	secE	TRUE	0.967	38.000	0.843	1.000	N	NA
2168936	2168937	CPF_2728	CPF_2729	secE	rpmG	TRUE	0.877	54.000	0.100	1.000	N	NA
2168937	2168938	CPF_2729	CPF_2730	rpmG	tuf	TRUE	0.906	183.000	0.099	1.000	Y	NA
2168938	1423447	CPF_2730	CPF_2731	tuf		FALSE	0.215	67.000	0.000	NA		NA
1423447	2168939	CPF_2731	CPF_2732		sigH	FALSE	0.194	83.000	0.000	NA		NA
2168939	2168940	CPF_2732	CPF_2733	sigH		TRUE	0.909	81.000	0.361	NA		NA
2168940	2168941	CPF_2733	CPF_2734			TRUE	0.941	16.000	0.109	NA		NA
2168941	2168942	CPF_2734	CPF_2735		thyX	TRUE	0.874	23.000	0.032	1.000	N	NA
2168942	2168943	CPF_2735	CPF_2736	thyX		TRUE	0.906	16.000	0.055	1.000		NA
2168943	2168944	CPF_2736	CPF_2737		cysS	TRUE	0.585	227.000	0.129	1.000		NA
2168944	2168945	CPF_2737	CPF_2738	cysS	proS	TRUE	0.877	105.000	0.005	0.033	Y	NA
2168945	2168946	CPF_2738	CPF_2739	proS	ispD	FALSE	0.028	355.000	0.000	1.000	N	NA
2168946	2168947	CPF_2739	CPF_2740	ispD		FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
1423458	2168949	CPF_2742	CPF_2743		radA	FALSE	0.415	20.000	0.000	NA		NA
2168949	2168950	CPF_2743	CPF_2744	radA	nagB	FALSE	0.060	251.000	0.000	1.000	N	NA
2168950	2168951	CPF_2744	CPF_2745	nagB		TRUE	0.527	-3.000	0.000	1.000	N	NA
2168952	2168953	CPF_2746	CPF_2747			FALSE	0.179	94.000	0.000	NA		NA
2168954	2168955	CPF_2748	CPF_2749	gapN		TRUE	0.460	17.000	0.000	1.000	N	NA
2168955	2168956	CPF_2749	CPF_2750		trxB	TRUE	0.950	3.000	0.000	1.000	Y	NA
2168956	2168957	CPF_2750	CPF_2751	trxB	clpC	TRUE	0.495	277.000	0.000	1.000	Y	NA
2168957	2168958	CPF_2751	CPF_2752	clpC		TRUE	0.941	25.000	0.129	1.000	N	NA
2168958	2168959	CPF_2752	CPF_2753			TRUE	0.986	-16.000	0.848	NA		NA
2168959	2168960	CPF_2753	CPF_2754			TRUE	0.977	11.000	0.681	NA		NA
2168962	2168963	CPF_2756	CPF_2757			FALSE	0.128	118.000	0.000	1.000		NA
2168963	2168964	CPF_2757	CPF_2758			FALSE	0.366	169.000	0.007	NA		NA
2168964	2168965	CPF_2758	CPF_2759			TRUE	0.972	3.000	0.372	NA		NA
2168965	2168966	CPF_2759	CPF_2760			TRUE	0.842	22.000	0.018	NA		NA
2168966	2168967	CPF_2760	CPF_2761			FALSE	0.107	157.000	0.000	NA		NA
2168967	2168968	CPF_2761	CPF_2762			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
2168968	2168969	CPF_2762	CPF_2763			FALSE	0.075	247.000	0.000	NA	N	NA
2168969	2168970	CPF_2763	CPF_2764			TRUE	0.944	18.000	0.120	NA		NA
2168973	2168974	CPF_2767	CPF_2768			TRUE	0.731	92.000	0.039	NA	N	NA
1423485	1423486	CPF_2769	CPF_2770			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423486	3820339	CPF_2770	CPF_2770a			FALSE	0.008	1060.000	0.000	NA		NA
3820339	1423487	CPF_2770a	CPF_2771			TRUE	0.456	3.000	0.000	NA		NA
1423487	1423488	CPF_2771	CPF_3019		rrfH	TRUE	0.484	-1.000	0.000	NA		NA
1423488	1423489	CPF_3019	CPF_3020	rrfH	rrlH	FALSE	0.276	48.000	0.000	NA		NA
1423489	1423490	CPF_3020	CPF_2772	rrlH		FALSE	0.175	100.000	0.000	NA		NA
1423490	1423491	CPF_2772	CPF_2773			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423491	1423492	CPF_2773	CPF_3021		rrsH	FALSE	0.100	161.000	0.000	NA		NA
1423492	2168975	CPF_3021	CPF_2774	rrsH	murD	FALSE	0.013	502.000	0.000	NA		NA
2168977	2168978	CPF_2776	CPF_2777			FALSE	0.242	92.000	0.000	NA	N	NA
2168978	2168979	CPF_2777	CPF_2778			FALSE	0.117	173.000	0.000	NA	N	NA
2168979	2168980	CPF_2778	CPF_2779		glyS	FALSE	0.086	188.000	0.000	1.000	N	NA
2168980	1423499	CPF_2779	CPF_2780	glyS		FALSE	0.015	458.000	0.000	NA		NA
1423499	2168981	CPF_2780	CPF_2781		lysS	FALSE	0.108	156.000	0.000	NA		NA
2168981	2168982	CPF_2781	CPF_2782	lysS	greA	TRUE	0.929	26.000	0.098	1.000	N	NA
2168982	2168983	CPF_2782	CPF_2783	greA		FALSE	0.272	279.000	0.022	1.000	N	NA
2168983	2168984	CPF_2783	CPF_2784			TRUE	0.917	7.000	0.054	1.000	N	NA
2168984	2168985	CPF_2784	CPF_2785		fhs	FALSE	0.327	203.000	0.011	1.000	N	NA
2168985	2168986	CPF_2785	CPF_2786	fhs	ftsH	FALSE	0.007	202.000	0.000	0.092	N	NA
2168986	2168987	CPF_2786	CPF_2787	ftsH	hpt	TRUE	0.885	75.000	0.180	1.000	N	NA
2168987	2168988	CPF_2787	CPF_2788	hpt	tilS	TRUE	0.944	3.000	0.137	0.033	N	NA
2168988	2168989	CPF_2788	CPF_2789	tilS	spoIIE	FALSE	0.433	217.000	0.041	1.000	N	NA
2168989	1423509	CPF_2789	CPF_2790	spoIIE		FALSE	0.029	324.000	0.000	NA		NA
1423509	1423510	CPF_2790	CPF_2791			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
1423510	1423511	CPF_2791	CPF_2792			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
1423511	1423512	CPF_2792	CPF_2793			FALSE	0.436	8.000	0.000	NA		NA
1423512	1423513	CPF_2793	CPF_2794			FALSE	0.421	17.000	0.000	NA		NA
1423513	1423514	CPF_2794	CPF_2795			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
1423514	1423515	CPF_2795	CPF_2796			FALSE	0.437	7.000	0.000	NA		NA
1423515	2168990	CPF_2796	CPF_2797			FALSE	0.023	360.000	0.000	NA		NA
2168990	2168991	CPF_2797	CPF_2798			TRUE	0.768	60.000	0.044	1.000		NA
2168991	2168992	CPF_2798	CPF_2799		yabQ	TRUE	0.682	96.000	0.032	NA		NA
2168992	2168993	CPF_2799	CPF_2800	yabQ	yabP	TRUE	0.979	10.000	0.774	NA		NA
2168993	2168994	CPF_2800	CPF_2801	yabP		TRUE	0.782	131.000	0.108	NA		NA
2168994	2168995	CPF_2801	CPF_2802		hup	TRUE	0.659	108.000	0.024	1.000	N	NA
2168995	2168996	CPF_2802	CPF_2803	hup		FALSE	0.292	217.000	0.014	1.000		NA
2168996	2168997	CPF_2803	CPF_2804		spoVB	TRUE	0.784	30.000	0.015	1.000		NA
2168997	2168998	CPF_2804	CPF_2805	spoVB	spoVT	TRUE	0.626	193.000	0.108	NA		NA
2168998	2168999	CPF_2805	CPF_2806	spoVT		TRUE	0.619	193.000	0.088	NA	N	NA
2168999	2169000	CPF_2806	CPF_2807		mfd	TRUE	0.621	101.000	0.016	1.000	N	NA
2169000	2169001	CPF_2807	CPF_2808	mfd	pth	TRUE	0.906	49.000	0.137	1.000	N	NA
2169001	2169002	CPF_2808	CPF_2809	pth		FALSE	0.173	126.000	0.000	1.000	N	NA
2169002	1423529	CPF_2809	CPF_2810			FALSE	0.412	21.000	0.000	NA		NA
1423529	2169003	CPF_2810	CPF_2811			TRUE	0.479	0.000	0.000	NA		NA
2169003	2169004	CPF_2811	CPF_2812		prsA	TRUE	0.523	272.000	0.123	1.000	N	NA
2169004	2169005	CPF_2812	CPF_2813	prsA	glmU	TRUE	0.839	57.000	0.069	1.000	N	NA
2169005	2169006	CPF_2813	CPF_2814	glmU		TRUE	0.768	210.000	0.011	1.000	Y	NA
2169006	2169007	CPF_2814	CPF_2815		purR	TRUE	0.817	111.000	0.099	1.000	N	NA
2169008	2169009	CPF_2816	CPF_2817	murC		FALSE	0.073	212.000	0.000	1.000	N	NA
2169009	2169010	CPF_2817	CPF_2818		punA	FALSE	0.190	116.000	0.000	1.000	N	NA
2169010	2169011	CPF_2818	CPF_2819	punA		TRUE	0.848	80.000	0.000	1.000	Y	NA
2169016	2169017	CPF_2824	CPF_2825			FALSE	0.116	149.000	0.000	NA		NA
2169017	2169018	CPF_2825	CPF_2826		nrdG	FALSE	0.145	130.000	0.000	NA		NA
2169020	2169021	CPF_2828	CPF_2829		add	FALSE	0.024	383.000	0.000	1.000	N	NA
2169021	2169022	CPF_2829	CPF_2830	add	nrdD	FALSE	0.311	391.000	0.000	1.000	Y	NA
2169023	2169024	CPF_2831	CPF_2832			FALSE	0.047	260.000	0.000	NA		NA
2169024	2169025	CPF_2832	CPF_2833			TRUE	0.456	3.000	0.000	NA		NA
2169026	2169027	CPF_2834	CPF_2835			TRUE	0.585	144.000	0.029	1.000	N	NA
2169027	2169028	CPF_2835	CPF_2836			TRUE	0.918	21.000	0.067	NA		NA
2169028	2169029	CPF_2836	CPF_2837		lgt	TRUE	0.860	-10.000	0.006	NA		NA
2169029	2169030	CPF_2837	CPF_2838	lgt		TRUE	0.531	103.000	0.005	NA		NA
2169030	2169031	CPF_2838	CPF_2839			TRUE	0.864	131.000	0.312	NA		NA
2169031	2169032	CPF_2839	CPF_2840		ksgA	TRUE	0.546	100.000	0.006	NA		NA
2169032	2169033	CPF_2840	CPF_2841	ksgA		TRUE	0.938	12.000	0.093	1.000	N	NA
2169033	2169034	CPF_2841	CPF_2842			FALSE	0.099	141.000	0.000	1.000		NA
2169034	2169035	CPF_2842	CPF_2843			FALSE	0.054	244.000	0.000	NA		NA
2169035	2169036	CPF_2843	CPF_2844			FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
2169038	2169039	CPF_2846	CPF_2847	metG	metG	TRUE	0.861	101.000	0.005	0.001	Y	NA
2169040	2169041	CPF_2848	CPF_2849			FALSE	0.321	35.000	0.000	NA		NA
2169042	2169043	CPF_2850	CPF_2851			FALSE	0.064	209.000	0.000	NA		NA
2169043	2169044	CPF_2851	CPF_2852			FALSE	0.198	80.000	0.000	NA		NA
2169044	2169045	CPF_2852	CPF_2853			TRUE	0.823	140.000	0.205	NA		NA
2169045	2169046	CPF_2853	CPF_2854		pepP	FALSE	0.174	108.000	0.000	NA		NA
2169046	2169047	CPF_2854	CPF_2855	pepP	adhE	FALSE	0.134	148.000	0.000	1.000	N	NA
2169047	2169048	CPF_2855	CPF_2856	adhE		FALSE	0.012	429.000	0.000	1.000		NA
2169048	2169049	CPF_2856	CPF_2857			TRUE	0.965	12.000	0.655	0.003		NA
2169051	2169052	CPF_2859	CPF_2860			FALSE	0.057	189.000	0.000	1.000		NA
2169052	2169053	CPF_2860	CPF_2861			FALSE	0.133	113.000	0.000	1.000		NA
2169053	2169054	CPF_2861	CPF_2862			TRUE	0.948	4.000	0.000	1.000	Y	NA
2169054	2169055	CPF_2862	CPF_2863			FALSE	0.198	105.000	0.000	1.000	N	NA
2169059	2169060	CPF_2867	CPF_2868			FALSE	0.097	164.000	0.000	NA		NA
2169060	2169061	CPF_2868	CPF_2869			FALSE	0.143	131.000	0.000	NA		NA
2169061	2169062	CPF_2869	CPF_2870		tenA	TRUE	0.902	0.000	0.032	NA		NA
2169062	2169063	CPF_2870	CPF_2871	tenA		FALSE	0.017	425.000	0.000	NA		NA
2169065	2169066	CPF_2873	CPF_2874			TRUE	0.456	3.000	0.000	NA		NA
2169066	2169067	CPF_2874	CPF_2875			TRUE	0.911	13.000	0.095	0.025		NA
2169067	2169068	CPF_2875	CPF_2876		glpK	FALSE	0.344	166.000	0.006	1.000		NA
2169068	2169069	CPF_2876	CPF_2877	glpK	glpP	TRUE	0.454	20.000	0.000	1.000	N	NA
2169069	2169070	CPF_2877	CPF_2878	glpP	glpF	FALSE	0.330	42.000	0.000	1.000	N	NA
2169070	2169071	CPF_2878	CPF_2879	glpF		FALSE	0.205	75.000	0.000	NA		NA
2169071	2169072	CPF_2879	CPF_2880			FALSE	0.205	75.000	0.000	NA		NA
2169072	2169073	CPF_2880	CPF_2881		comB	FALSE	0.047	261.000	0.000	NA		NA
2169073	2169074	CPF_2881	CPF_2882	comB		TRUE	0.898	27.000	0.067	1.000		NA
2169074	2169075	CPF_2882	CPF_2883			TRUE	0.677	93.000	0.058	0.025		NA
2169077	2169078	CPF_2885	CPF_2886	sleC	cspC	FALSE	0.121	123.000	0.000	1.000		NA
2169078	2169079	CPF_2886	CPF_2887	cspC	cspB	FALSE	0.068	3.000	0.000	0.003		NA
2169079	2169080	CPF_2887	CPF_2888	cspB	cspA	FALSE	0.061	16.000	0.000	0.003		NA
2169080	2169081	CPF_2888	CPF_2889	cspA		FALSE	0.099	141.000	0.000	1.000		NA
2169081	2169082	CPF_2889	CPF_2890			TRUE	0.465	2.000	0.000	NA		NA
2169082	2169083	CPF_2890	CPF_2891			FALSE	0.356	29.000	0.000	NA		NA
2169083	2169084	CPF_2891	CPF_2892			FALSE	0.055	241.000	0.000	NA		NA
2169084	2169085	CPF_2892	CPF_2893		murI	FALSE	0.056	236.000	0.000	NA		NA
2169087	2169088	CPF_2895	CPF_2896			FALSE	0.055	240.000	0.000	NA		NA
2169088	2169089	CPF_2896	CPF_2897		carB	FALSE	0.009	611.000	0.000	NA		NA
2169089	2169090	CPF_2897	CPF_2898	carB	carA	TRUE	0.977	13.000	0.054	0.001	Y	NA
2169092	2169093	CPF_2900	CPF_2901			FALSE	0.167	69.000	0.000	1.000		NA
2169093	2169094	CPF_2901	CPF_2902			FALSE	0.037	313.000	0.000	1.000	N	NA
2169094	2169095	CPF_2902	CPF_2903		proA	FALSE	0.199	101.000	0.000	1.000	N	NA
2169095	2169096	CPF_2903	CPF_2904	proA	proB	TRUE	0.991	3.000	0.281	0.001	Y	NA
2169096	2169097	CPF_2904	CPF_2905	proB		FALSE	0.214	87.000	0.000	1.000	N	NA
2169097	2169098	CPF_2905	CPF_2906			FALSE	0.024	64.000	0.000	0.025		NA
2169099	2169100	CPF_2907	CPF_2908			FALSE	0.183	91.000	0.000	NA		NA
2169104	2169105	CPF_2912	CPF_2913	maa	msrA	FALSE	0.202	52.000	0.000	1.000		NA
2169106	2169107	CPF_2914	CPF_2915			FALSE	0.146	129.000	0.000	NA		NA
2169107	2169108	CPF_2915	CPF_2916			TRUE	0.977	23.000	0.833	NA		NA
2169108	2169109	CPF_2916	CPF_2917			FALSE	0.024	352.000	0.000	NA		NA
2169109	2169110	CPF_2917	CPF_2918			FALSE	0.062	214.000	0.000	NA		NA
2169110	2169111	CPF_2918	CPF_2919			FALSE	0.135	137.000	0.000	NA		NA
2169111	2169112	CPF_2919	CPF_2920			FALSE	0.154	124.000	0.000	NA		NA
2169112	2169113	CPF_2920	CPF_2921			FALSE	0.051	253.000	0.000	NA		NA
2169115	2169116	CPF_2923	CPF_2924			FALSE	0.054	244.000	0.000	NA		NA
2169118	2169119	CPF_2926	CPF_2927			FALSE	0.023	365.000	0.000	NA		NA
2169119	2169120	CPF_2927	CPF_2928			FALSE	0.054	246.000	0.000	NA		NA
2169120	2169121	CPF_2928	CPF_2929			FALSE	0.057	230.000	0.000	NA		NA
2169121	2169122	CPF_2929	CPF_2930			FALSE	0.174	107.000	0.000	NA		NA
2169122	2169123	CPF_2930	CPF_2931			TRUE	0.850	144.000	0.357	NA		NA
2169123	2169124	CPF_2931	CPF_2932			TRUE	0.848	16.000	0.016	NA		NA
2169124	2169125	CPF_2932	CPF_2933		murA	TRUE	0.900	23.000	0.058	1.000		NA
2169126	2169127	CPF_2934	CPF_2935			TRUE	0.496	195.000	0.049	NA		NA
2169127	2169128	CPF_2935	CPF_2936			TRUE	0.910	56.000	0.220	NA		NA
2169128	2169129	CPF_2936	CPF_2937			TRUE	0.870	67.000	0.129	NA		NA
2169131	2169132	CPF_2939	CPF_2940			TRUE	0.985	-3.000	0.033	NA	Y	NA
1423660	1423661	CPF_2941	CPF_2942			TRUE	0.448	4.000	0.000	NA		NA
1423661	1423662	CPF_2942	CPF_2943			FALSE	0.426	12.000	0.000	NA		NA
1423662	1423663	CPF_2943	CPF_2944			FALSE	0.436	8.000	0.000	NA		NA
1423663	1423664	CPF_2944	CPF_2945			FALSE	0.439	6.000	0.000	NA		NA
1423664	1423665	CPF_2945	CPF_2946			FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		NA
1423665	1423666	CPF_2946	CPF_2947			FALSE	0.437	7.000	0.000	NA		NA
1423666	1423667	CPF_2947	CPF_2948			FALSE	0.436	8.000	0.000	NA		NA
1423667	1423668	CPF_2948	CPF_2949			FALSE	0.426	14.000	0.000	NA		NA
1423668	1423669	CPF_2949	CPF_2950			TRUE	0.443	5.000	0.000	NA		NA
1423669	2169133	CPF_2950	CPF_2951			FALSE	0.070	199.000	0.000	NA		NA
2169135	2169136	CPF_2953	CPF_2954			TRUE	0.908	23.000	0.000	0.001	Y	NA
2169136	2169137	CPF_2954	CPF_2955			FALSE	0.160	133.000	0.000	1.000	N	NA
2169137	2169138	CPF_2955	CPF_2956			FALSE	0.031	315.000	0.000	NA		NA
2169138	2169139	CPF_2956	CPF_2957			FALSE	0.173	110.000	0.000	NA		NA
2169139	2169140	CPF_2957	CPF_2958		purA	FALSE	0.169	128.000	0.000	1.000	N	NA
2169141	2169142	CPF_2959	CPF_2960	sdhB	sdhA	TRUE	0.929	1.000	0.000	0.001	Y	NA
2169142	2169143	CPF_2960	CPF_2961	sdhA		FALSE	0.065	236.000	0.000	1.000	N	NA
2169143	2169144	CPF_2961	CPF_2962			TRUE	0.454	20.000	0.000	1.000	N	NA
2169145	2169146	CPF_2963	CPF_2964			FALSE	0.184	137.000	0.000	NA	N	NA
2169146	2169147	CPF_2964	CPF_2965			TRUE	0.512	17.000	0.000	NA	N	NA
2169147	2169148	CPF_2965	CPF_2966			TRUE	0.596	173.000	0.000	0.012	Y	NA
2169148	2169149	CPF_2966	CPF_2967			TRUE	0.936	0.000	0.000	0.012	Y	NA
2169149	2169150	CPF_2967	CPF_2968			TRUE	0.862	47.000	0.000	0.012	Y	NA
2169150	2169151	CPF_2968	CPF_2969		proC	FALSE	0.048	278.000	0.000	1.000	N	NA
2169151	2169152	CPF_2969	CPF_2970	proC	dnaB	FALSE	0.092	178.000	0.000	1.000	N	NA
2169152	2169153	CPF_2970	CPF_2971	dnaB		FALSE	0.144	416.000	0.053	0.012	N	NA
2169153	2169154	CPF_2971	CPF_2972		rplI	TRUE	0.749	55.000	0.024	1.000	N	NA
2169154	2169155	CPF_2972	CPF_2973	rplI		TRUE	0.954	2.000	0.119	1.000	N	NA
2169155	2169156	CPF_2973	CPF_2974			TRUE	0.940	33.000	0.210	NA		NA
2169156	2169157	CPF_2974	CPF_2975			TRUE	0.942	18.000	0.116	NA		NA
2169157	2169158	CPF_2975	CPF_2976		rpsR	FALSE	0.223	283.000	0.015	NA		NA
2169158	2169159	CPF_2976	CPF_2977	rpsR	ssb	FALSE	0.380	31.000	0.000	1.000	N	NA
2169159	2169160	CPF_2977	CPF_2978	ssb	rpsF	TRUE	0.464	14.000	0.000	1.000	N	NA
2169160	2169161	CPF_2978	CPF_2979	rpsF		TRUE	0.572	144.000	0.028	NA		NA
2169161	2169162	CPF_2979	CPF_2980			TRUE	0.914	37.000	0.121	NA		NA
2169162	2169163	CPF_2980	CPF_2981			TRUE	0.914	33.000	0.105	NA		NA
2169164	2169165	CPF_2982	CPF_2983			TRUE	0.991	12.000	0.148	1.000	Y	NA
2169165	2169166	CPF_2983	CPF_2984		ytvI	TRUE	0.942	12.000	0.111	NA		NA
2169166	2169167	CPF_2984	CPF_2985	ytvI	yyaC	TRUE	0.835	50.000	0.058	NA		NA
2169168	2169169	CPF_2986	CPF_2987			TRUE	0.822	49.000	0.047	NA		NA
2169169	2169170	CPF_2987	CPF_2988		soj	TRUE	0.983	1.000	0.827	1.000	N	NA
2169170	2169171	CPF_2988	CPF_2989	soj	gidB	TRUE	0.692	250.000	0.339	1.000	N	NA
2169171	2169172	CPF_2989	CPF_2990	gidB		FALSE	0.418	19.000	0.000	NA		NA
2169172	2169173	CPF_2990	CPF_2991		gidA	FALSE	0.351	30.000	0.000	NA		NA
2169173	2169174	CPF_2991	CPF_2992	gidA	trmE	TRUE	0.962	15.000	0.266	1.000		NA
2169174	2169175	CPF_2992	CPF_2993	trmE		FALSE	0.368	342.000	0.116	1.000		NA
2169175	2169176	CPF_2993	CPF_2994		oxaA	TRUE	0.933	42.000	0.254	1.000		NA
2169176	2169177	CPF_2994	CPF_2995	oxaA		TRUE	0.958	34.000	0.461	NA		NA
2169177	2169178	CPF_2995	CPF_2996		rnpA	TRUE	0.983	-28.000	0.540	NA		NA
2169178	2169179	CPF_2996	CPF_2997	rnpA	rpmH	TRUE	0.944	61.000	0.787	1.000		NA