MicrobesOnline Operon Predictions for Prochlorococcus marinus str. NATL1A

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1215087 1215086     dnaN   FALSE 0.755 3.000 0.022 NA   NA
 1215086 1215085         TRUE 0.769 3.000 0.039 NA   NA
 1215085 1215084       purF TRUE 0.819 62.000 0.019 1.000 Y NA
 1215083 1215082         FALSE 0.119 122.000 0.053 1.000 N NA
 1215082 1215081         TRUE 0.804 3.000 0.034 1.000 N NA
 1215080 1215079       nusB TRUE 0.816 18.000 0.029 NA   NA
 1215079 1215078     nusB ftsY FALSE 0.753 -3.000 0.013 1.000 N NA
 1215078 1215077     ftsY rsbU FALSE 0.484 59.000 0.013 1.000 N NA
 1215077 1215076     rsbU argH FALSE 0.663 49.000 0.021 1.000 N NA
 1215076 1215075     argH   FALSE 0.102 127.000 0.019 1.000   NA
 1215073 1215072       grpE FALSE 0.540 95.000 0.021 1.000 Y NA
 1215072 1215071     grpE dnaJ TRUE 0.976 45.000 0.168 0.018 Y NA
 1215071 1216529     dnaJ   TRUE 0.833 3.000 0.067 1.000   NA
 1216529 1215070         TRUE 0.811 -7.000 0.058 1.000   NA
 1215069 1215068       murB FALSE 0.750 38.000 0.030 NA   NA
 1215068 1215067     murB murC TRUE 0.985 4.000 0.136 0.007 Y NA
 1215065 1215064     thiL   TRUE 0.841 13.000 0.031 1.000 N NA
 1215063 1215062     efp accB TRUE 0.839 -3.000 0.120 1.000 N NA
 1215061 1215060     pdxA   FALSE 0.043 187.000 0.020 1.000 N NA
 1215059 1215058         FALSE 0.045 152.000 0.000 NA   NA
 1215056 1215055     cbiD   FALSE 0.399 67.000 0.023 1.000 N NA
 1215053 1215052         FALSE 0.019 260.000 0.000 NA   NA
 1215052 1216524         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215050 1215049         FALSE 0.097 299.000 0.000 0.021   NA
 1215049 1215048         FALSE 0.061 527.000 0.000 0.021 N NA
 1215048 1216522         FALSE 0.012 464.000 0.000 NA   NA
 1215047 1215046         FALSE 0.014 356.000 0.000 NA   NA
 1215046 1215045         FALSE 0.024 216.000 0.000 NA   NA
 1215044 1215043         FALSE 0.014 361.000 0.000 NA   NA
 1215043 1215042         FALSE 0.012 452.000 0.000 NA   NA
 1215041 1215040         TRUE 0.953 17.000 0.650 NA   NA
 1215040 1215039         TRUE 0.806 23.000 0.047 NA   NA
 1215038 1215037         TRUE 0.944 51.000 0.458 0.040   NA
 1215037 1215036         FALSE 0.380 351.000 0.457 0.006 Y NA
 1215029 1215028     argJ   FALSE 0.019 261.000 0.000 NA   NA
 1215027 1215026         FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 1215026 1215025         FALSE 0.694 -12.000 0.000 NA   NA
 1215025 1294693         FALSE 0.046 151.000 0.000 NA   NA
 1294693 1215024       cynS FALSE 0.012 461.000 0.000 NA   NA
 1215024 1216518     cynS   FALSE 0.022 226.000 0.000 NA   NA
 1216518 1216517         FALSE 0.010 646.000 0.000 NA   NA
 1216516 1215021         FALSE 0.013 399.000 0.000 NA   NA
 1215021 1215020         TRUE 0.782 3.000 0.000 1.000   NA
 1215020 1294724         FALSE 0.699 -25.000 0.000 NA   NA
 1294724 1216515         FALSE 0.426 58.000 0.000 NA   NA
 1216515 1215019         FALSE 0.033 174.000 0.000 NA   NA
 1294701 1216513         FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 1216513 1215018         FALSE 0.596 46.000 0.000 NA   NA
 1215018 1215017         FALSE 0.030 187.000 0.000 NA   NA
 1215017 1215016         FALSE 0.011 526.000 0.000 NA   NA
 1215015 1216512         FALSE 0.056 138.000 0.000 NA   NA
 1216512 1216510         FALSE 0.023 218.000 0.000 NA   NA
 1216510 1215014         FALSE 0.012 430.000 0.000 NA   NA
 1216509 1216508         FALSE 0.027 200.000 0.000 NA   NA
 1216508 1215013         FALSE 0.020 254.000 0.000 NA   NA
 1215013 1215012         FALSE 0.010 614.000 0.000 NA   NA
 1216505 1215011         FALSE 0.087 111.000 0.000 NA   NA
 1215010 1215009         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215009 1215008         FALSE 0.038 165.000 0.000 NA   NA
 1215007 1215006         FALSE 0.020 248.000 0.000 NA   NA
 1215005 1215004         FALSE 0.016 323.000 0.000 NA   NA
 1216503 1216502         FALSE 0.043 154.000 0.000 NA   NA
 1216502 1215002         FALSE 0.010 623.000 0.000 NA   NA
 1215000 1216499         FALSE 0.048 173.000 0.000 1.000   NA
 1214999 1216899         FALSE 0.028 199.000 0.000 NA   NA
 1216899 1214998         FALSE 0.037 168.000 0.000 NA   NA
 1214998 1216498         FALSE 0.080 118.000 0.000 NA   NA
 1214996 1214995         TRUE 0.930 0.000 0.522 NA   NA
 1214994 1214993         FALSE 0.347 96.000 0.350 NA   NA
 1214993 1214992       smc FALSE 0.385 77.000 0.150 NA   NA
 1214992 1214991     smc   FALSE 0.631 59.000 0.177 NA   NA
 1214990 1309185       tRNA-Leu FALSE 0.740 28.000 0.000 NA   NA
 1214987 1214986         FALSE 0.570 84.000 0.556 NA   NA
 1214985 1214984     hli2   TRUE 0.814 10.000 0.000 1.000   NA
 1214984 1216496         FALSE 0.073 123.000 0.000 NA   NA
 1216496 1214983       hit FALSE 0.094 106.000 0.000 NA   NA
 1214983 1214982     hit def FALSE 0.334 70.000 0.013 1.000 N NA
 1214980 1214979         TRUE 0.817 -3.000 0.081 1.000 N NA
 1214979 1214978       sufC TRUE 0.976 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 1214978 1214977     sufC   TRUE 0.954 51.000 0.466 1.000 Y NA
 1216495 1214976         FALSE 0.017 287.000 0.000 NA   NA
 1214976 1214975         TRUE 0.964 20.000 0.947 NA   NA
 1214975 1214974       pgm FALSE 0.358 64.000 0.017 NA   NA
 1214974 1214973     pgm   FALSE 0.203 88.000 0.009 1.000 N NA
 1214970 1214969       cysH TRUE 0.793 -27.000 0.026 1.000 N NA
 1214968 1214967       citT FALSE 0.316 100.000 0.296 1.000 N NA
 1214967 1216494     citT   FALSE 0.712 3.000 0.000 NA   NA
 1216494 1214966       trkG FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1214966 1214965     trkG   TRUE 0.993 13.000 0.438 0.003 Y NA
 1214965 1214964         FALSE 0.707 4.000 0.017 NA N NA
 1214962 1214961         TRUE 0.937 34.000 0.533 NA   NA
 1214957 1214956         TRUE 0.883 56.000 1.000 NA   NA
 1214956 1214955         FALSE 0.347 102.000 0.421 NA   NA
 1214955 1214954       xseA TRUE 0.787 34.000 0.002 1.000   NA
 1214954 1216493     xseA   TRUE 0.887 67.000 0.412 0.002   NA
 1216492 1214953       rbn FALSE 0.692 63.000 0.379 NA   NA
 1214953 1214952     rbn   FALSE 0.153 133.000 0.154 1.000   NA
 1214952 1214951         TRUE 0.803 18.000 0.000 1.000 N NA
 1214951 1214950         FALSE 0.734 38.000 0.000 1.000 N NA
 1214950 1216490         FALSE 0.028 196.000 0.000 NA   NA
 1214949 1214948       nadB TRUE 0.806 14.000 0.024 NA   NA
 1214947 1216489         FALSE 0.032 178.000 0.000 NA   NA
 1216489 1214946         FALSE 0.349 63.000 0.000 NA   NA
 1214946 1214945         FALSE 0.297 82.000 0.095 NA   NA
 1214945 1214944         FALSE 0.726 32.000 0.000 NA   NA
 1214944 1214943         FALSE 0.754 23.000 0.000 NA   NA
 1214943 1214942         TRUE 0.972 1.000 0.370 1.000 Y NA
 1214938 1216488         TRUE 0.758 12.000 0.000 NA   NA
 1214937 1214936       rbfA FALSE 0.712 3.000 0.000 NA   NA
 1214936 1214935     rbfA   TRUE 0.839 18.000 0.025 1.000 N NA
 1214935 1214934       hemD FALSE 0.148 102.000 0.022 1.000 N NA
 1214933 1214932       crtQ TRUE 0.948 4.000 0.800 NA   NA
 1214931 1214930         TRUE 0.907 36.000 0.375 NA   NA
 1214927 1214926         TRUE 0.958 21.000 0.714 1.000 N NA
 1214926 1216487         FALSE 0.612 45.000 0.000 NA   NA
 1214925 1214924         FALSE 0.184 84.000 0.000 NA   NA
 1214924 1214923         TRUE 0.856 24.000 0.117 NA   NA
 1214923 1309217       tRNA-Asn FALSE 0.733 30.000 0.000 NA   NA
 1309217 1214922     tRNA-Asn rpaA FALSE 0.015 340.000 0.000 NA   NA
 1214921 1214920     holB tmk TRUE 0.894 2.000 0.254 1.000 N NA
 1214920 1214919     tmk zntA TRUE 0.769 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1214916 1214915       plsX TRUE 0.809 5.000 0.026 1.000 N NA
 1214915 1214914     plsX fabH TRUE 0.869 89.000 0.380 0.007 Y NA
 1214914 1214913     fabH fabD TRUE 0.984 28.000 0.043 0.007 Y NA
 1214913 1214912     fabD   TRUE 0.967 3.000 0.218 1.000 Y NA
 1214911 1214910       ycf34 FALSE 0.750 -39.000 0.023 NA   NA
 1214909 1214908         FALSE 0.382 67.000 0.000 1.000   NA
 1214907 1214906     crtB,pys pds FALSE 0.648 82.000 0.691 1.000   NA
 1214905 1214904         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1214902 1214901       ndhF TRUE 0.798 26.000 0.041 NA   NA
 1214901 1214900     ndhF   FALSE 0.572 140.000 0.050 0.004 Y NA
 1214900 1214899         FALSE 0.331 65.000 0.009 NA   NA
 1214899 1214898         FALSE 0.525 57.000 0.034 NA   NA
 1216486 1214895         FALSE 0.259 87.000 0.090 NA   NA
 1214895 1214894         TRUE 0.865 7.000 0.101 1.000   NA
 1214894 1214893       ndhE TRUE 0.850 10.000 0.071 1.000 N NA
 1214893 1214892     ndhE ndhG TRUE 0.991 35.000 0.506 0.005 Y NA
 1214892 1214891     ndhG ndhI TRUE 0.984 -3.000 0.192 0.012 Y NA
 1214891 1214890     ndhI ndhA FALSE 0.747 109.000 0.242 0.012 Y NA
 1214890 1214889     ndhA gltA FALSE 0.748 76.000 0.137 1.000 Y NA
 1214885 1214884     sui1 cysC FALSE 0.630 53.000 0.047 1.000 N NA
 1214882 1214881     nagA chlM TRUE 0.871 29.000 0.128 1.000 N NA
 1214877 1214876     ndhH   TRUE 0.870 6.000 0.182 NA   NA
 1214875 1214874     menE menC TRUE 0.970 -3.000 0.283 0.002 N NA
 1214874 1214873     menC menA TRUE 0.967 20.000 0.096 1.000 Y NA
 1214871 1214870     gshB grxC TRUE 0.770 4.000 0.010 1.000 N NA
 1214869 1214868       prfB FALSE 0.138 92.000 0.000 NA   NA
 1214868 1214867     prfB   TRUE 0.807 12.000 0.025 NA   NA
 1214867 1214866         TRUE 0.776 5.000 0.039 NA   NA
 1214866 1214865       dgkA TRUE 0.856 26.000 0.123 NA   NA
 1214865 1214864     dgkA pabA TRUE 0.912 14.000 0.231 1.000 N NA
 1214863 1214862       argS TRUE 0.760 0.000 0.015 1.000 N NA
 1214862 1214861     argS nadC FALSE 0.354 68.000 0.014 1.000 N NA
 1214861 1214860     nadC thdF FALSE 0.025 305.000 0.014 1.000   NA
 1216485 1214859         FALSE 0.379 61.000 0.000 NA   NA
 1214856 1214855     rluD   TRUE 0.786 0.000 0.018 1.000   NA
 1214851 1214850       pyrD FALSE 0.337 70.000 0.016 1.000 N NA
 1214850 1214849     pyrD rnhA TRUE 0.793 -13.000 0.031 1.000 N NA
 1214849 1214848     rnhA rplL FALSE 0.344 68.000 0.008 1.000 N NA
 1214848 1214847     rplL rplJ TRUE 0.981 53.000 0.884 0.031 Y NA
 1214847 1214846     rplJ rplA FALSE 0.392 224.000 0.302 0.041 Y NA
 1214846 1214845     rplA rplK TRUE 0.943 71.000 0.838 0.041 Y NA
 1214845 1214844     rplK nusG FALSE 0.434 104.000 0.681 1.000 N NA
 1214844 1214843     nusG   TRUE 0.940 43.000 0.843 1.000   NA
 1214843 1214842       clpB2 FALSE 0.056 175.000 0.023 1.000   NA
 1214840 1214839         TRUE 0.875 51.000 0.576 NA   NA
 1216484 1214838         FALSE 0.286 68.000 0.000 NA   NA
 1214837 1214836         TRUE 0.877 12.000 0.152 NA   NA
 1214836 1214835         FALSE 0.656 47.000 0.048 NA   NA
 1214834 1214833       hemB TRUE 0.757 35.000 0.000 1.000 N NA
 1214833 1214832     hemB   FALSE 0.675 50.000 0.033 1.000 N NA
 1214832 1214831         TRUE 0.840 16.000 0.044 1.000 N NA
 1214831 1214830       obg FALSE 0.152 100.000 0.008 1.000   NA
 1214830 1214829     obg   FALSE 0.211 78.000 0.000 NA   NA
 1214828 1214827         FALSE 0.036 169.000 0.000 NA   NA
 1214827 1214826       ecm4 TRUE 0.904 10.000 0.265 NA   NA
 1214823 1214822     psbA aroC FALSE 0.087 131.000 0.000 1.000   NA
 1214821 1214820     eda   TRUE 0.943 17.000 0.415 1.000 N NA
 1214820 1214819       met3 FALSE 0.744 44.000 0.061 1.000 N NA
 1214819 1214818     met3 psbO FALSE 0.299 85.000 0.064 1.000   NA
 1214815 1214814     pyrB mpg TRUE 0.762 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1214812 1309184     crtR tRNA-Leu FALSE 0.555 50.000 0.000 NA   NA
 1214811 1214810       ileS FALSE 0.591 52.000 0.025 NA   NA
 1214808 1214807         FALSE 0.263 81.000 0.000 1.000   NA
 1214806 1214805     thy1 dcd TRUE 0.954 3.000 0.042 1.000 Y NA
 1214805 1214804     dcd   TRUE 0.829 1.000 0.091 1.000 N NA
 1214803 1214802     ntcA   TRUE 0.844 56.000 0.612 NA   NA
 1214802 1214801         TRUE 0.762 1.000 0.047 NA   NA
 1214800 1214799       pth TRUE 0.800 14.000 0.022 NA   NA
 1214799 1214798     pth   FALSE 0.421 62.000 0.002 1.000 N NA
 1214798 1214797       psbH TRUE 0.930 38.000 0.048 0.084   NA
 1214796 1214795     psbI   FALSE 0.092 144.000 0.107 NA   NA
 1214794 1214793     leuD leuC TRUE 0.991 25.000 0.268 0.002 Y NA
 1214793 1214792     leuC cinA TRUE 0.850 24.000 0.032 1.000   NA
 1214792 1214791     cinA glyA TRUE 0.783 -13.000 0.018 1.000   NA
 1214791 1309183     glyA tRNA-Arg FALSE 0.070 125.000 0.000 NA   NA
 1214790 1214789         TRUE 0.885 41.000 0.359 NA   NA
 1214787 1214786     sfsA amtB FALSE 0.024 272.000 0.040 NA   NA
 1214786 1214785     amtB lytB FALSE 0.236 120.000 0.286 1.000 N NA
 1214785 1214784     lytB   FALSE 0.540 63.000 0.143 NA   NA
 1214781 1294735         FALSE 0.028 199.000 0.000 NA   NA
 1214778 1214777     tgt psbK TRUE 0.819 35.000 0.034 1.000   NA
 1216481 1214776         FALSE 0.250 72.000 0.000 NA   NA
 1214776 1214775         TRUE 0.782 38.000 0.078 NA   NA
 1214775 1309182       tRNA-Met TRUE 0.762 15.000 0.000 NA   NA
 1214774 1214773     pyrE   FALSE 0.755 -3.000 0.034 NA   NA
 1214771 1214770         TRUE 0.769 -7.000 0.020 1.000 N NA
 1214769 1214768         FALSE 0.209 89.000 0.020 1.000 N NA
 1214768 1214767       fabI TRUE 0.800 32.000 0.021 1.000 N NA
 1214766 1214765       degT FALSE 0.674 52.000 0.057 1.000   NA
 1214764 1214763     phrB   TRUE 0.952 -36.000 0.038 1.000 Y NA
 1214763 1214762       folK FALSE 0.390 69.000 0.033 1.000 N NA
 1214760 1214759         TRUE 0.980 5.000 0.690 NA Y NA
 1214757 1214756     ndhJ ndhK TRUE 0.992 17.000 0.406 0.004 Y NA
 1214756 1214755     ndhK ndhC TRUE 0.989 -9.000 0.428 0.004 Y NA
 1214754 1214753     rub   TRUE 0.929 -3.000 0.521 NA   NA
 1214753 1214752       psbE FALSE 0.383 108.000 0.625 NA   NA
 1214752 1214751     psbE psbL TRUE 0.958 30.000 0.047 0.006   NA
 1214751 1214750     psbL psbJ TRUE 0.987 12.000 0.878 0.006   NA
 1214747 1214746       uvrD FALSE 0.749 44.000 0.025 1.000   NA
 1214746 1216480     uvrD   FALSE 0.155 89.000 0.007 NA   NA
 1214745 1214744     cpeB cpeA TRUE 0.913 57.000 0.167 0.001   NA
 1214744 1214743     cpeA   FALSE 0.397 66.000 0.000 1.000   NA
 1214740 1214739     cpeT cpeS TRUE 0.940 13.000 0.444 NA   NA
 1214739 1214738     cpeS   FALSE 0.218 88.000 0.000 1.000   NA
 1214738 1214737         FALSE 0.095 105.000 0.000 NA   NA
 1214736 1214735         TRUE 0.824 89.000 0.073 0.003 Y NA
 1216479 1216478         FALSE 0.013 414.000 0.000 NA   NA
 1216478 1309181       tRNA-Phe FALSE 0.014 361.000 0.000 NA   NA
 1309181 1216477     tRNA-Phe   FALSE 0.050 145.000 0.000 NA   NA
 1216477 1214734       xylB FALSE 0.151 98.000 0.041 NA   NA
 1214734 1214733     xylB metK TRUE 0.839 21.000 0.028 1.000 N NA
 1214733 1214732     metK   TRUE 0.850 24.000 0.030 1.000   NA
 1214732 1214731       rps1a, rpsA1 TRUE 0.886 19.000 0.112 1.000   NA
 1214731 1214730     rps1a, rpsA1   FALSE 0.163 104.000 0.025 1.000   NA
 1214730 1214729       psbT FALSE 0.074 160.000 0.028 1.000   NA
 1214729 1214728     psbT psbB TRUE 0.972 38.000 0.651 0.083   NA
 1216476 1214727       psbM FALSE 0.025 208.000 0.000 NA   NA
 1214727 1214726     psbM   FALSE 0.077 135.000 0.047 NA   NA
 1214726 1214725       hemK FALSE 0.374 67.000 0.056 NA   NA
 1214725 1214724     hemK sua5 TRUE 0.938 -22.000 0.000 NA Y NA
 1214724 1216475     sua5   FALSE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 1309180 1214723     tRNA-Thr minE FALSE 0.073 123.000 0.000 NA   NA
 1214723 1214722     minE minD TRUE 0.970 5.000 0.347 NA Y NA
 1214722 1214721     minD minC FALSE 0.159 164.000 0.368 1.000   NA
 1214721 1214720     minC   TRUE 0.819 3.000 0.038 1.000   NA
 1214720 1216474         TRUE 0.839 4.000 0.071 1.000   NA
 1216473 1216472     petB petD TRUE 0.905 59.000 0.471 0.083   NA
 1309404 1309203     rrs tRNA-Ile FALSE 0.037 168.000 0.000 NA   NA
 1309203 1309204     tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 1309204 1365723     tRNA-Ala rrl FALSE 0.016 311.000 0.000 NA   NA
 1365723 1309405     rrl rrf FALSE 0.142 91.000 0.000 NA   NA
 1216470 1216469     mutM psaE TRUE 0.854 15.000 0.040 1.000   NA
 1216467 1216466         FALSE 0.695 45.000 0.000 1.000   NA
 1216896 1216465         FALSE 0.204 79.000 0.000 NA   NA
 1216464 1216463         FALSE 0.032 178.000 0.000 NA   NA
 1216462 1216461         FALSE 0.015 341.000 0.000 NA   NA
 1216460 1294683         TRUE 0.758 21.000 0.000 NA   NA
 1294683 1216459         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1216459 1216458         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1216458 1216457         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1216457 1294639         FALSE 0.012 435.000 0.000 NA   NA
 1309202 1309201     tRNA-Thr tRNA-Tyr TRUE 0.758 12.000 0.000 NA   NA
 1216456 1216455     aroQ miaE TRUE 0.823 8.000 0.039 1.000 N NA
 1216455 1216454     miaE cobI/cbiL TRUE 0.776 37.000 0.022 1.000 N NA
 1216453 1216891         FALSE 0.749 25.000 0.000 NA   NA
 1216452 1216451       cbiQ TRUE 0.849 10.000 0.029 1.000   NA
 1216451 1216450     cbiQ   TRUE 0.813 56.000 0.447 NA   NA
 1216450 1216449         TRUE 0.823 12.000 0.065 NA   NA
 1216449 1216448         FALSE 0.096 162.000 0.194 NA   NA
 1216448 1216447       proC TRUE 0.901 14.000 0.224 NA   NA
 1216446 1216445       recO FALSE 0.079 131.000 0.009 1.000 N NA
 1216445 1216444     recO deoC TRUE 0.815 18.000 0.016 1.000 N NA
 1216444 1216443     deoC lrtA TRUE 0.787 12.000 0.039 NA N NA
 1216442 1216441     lipB fadD TRUE 0.798 36.000 0.029 1.000 N NA
 1216441 1216440     fadD   FALSE 0.514 81.000 0.388 NA   NA
 1216440 1216439       pdhC FALSE 0.069 191.000 0.176 NA   NA
 1216439 1216438     pdhC queA FALSE 0.586 53.000 0.014 1.000 N NA
 1216437 1216436         TRUE 0.796 89.000 0.095 0.021 Y NA
 1216436 1216435       metB TRUE 0.988 -3.000 0.250 0.001 Y NA
 1216435 1216434     metB rpsD FALSE 0.128 102.000 0.008 1.000 N NA
 1216433 1216432         FALSE 0.750 -3.000 0.025 NA   NA
 1216432 1216431       murE FALSE 0.043 217.000 0.049 1.000   NA
 1216890 1216429         FALSE 0.011 508.000 0.000 NA   NA
 1216429 1216428         FALSE 0.034 172.000 0.000 NA   NA
 1216428 1216889         TRUE 0.760 13.000 0.000 NA   NA
 1216889 1216427         FALSE 0.146 90.000 0.000 NA   NA
 1294678 1294676         FALSE 0.299 67.000 0.000 NA   NA
 1216422 1216421         FALSE 0.046 177.000 0.000 1.000   NA
 1216419 1216418     chlG   TRUE 0.763 16.000 0.000 NA   NA
 1216417 1216416     hisF ubiE FALSE 0.238 83.000 0.012 1.000 N NA
 1216414 1216413     pspA birA FALSE 0.071 116.000 0.005 NA N NA
 1216412 1216411     salX   TRUE 0.858 -7.000 0.134 1.000   NA
 1216411 1216410         FALSE 0.611 88.000 0.013 0.004   NA
 1216409 1216408     topA   FALSE 0.752 5.000 0.020 NA   NA
 1216408 1216407         TRUE 0.830 6.000 0.105 NA   NA
 1216407 1216406       cobT TRUE 0.864 7.000 0.155 NA   NA
 1216406 1216405     cobT   FALSE 0.743 6.000 0.015 NA   NA
 1216405 1216404       ribE FALSE 0.177 85.000 0.000 NA   NA
 1216403 1216402       ctaE FALSE 0.546 96.000 1.000 NA   NA
 1216402 1216401     ctaE cyoB TRUE 0.991 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 1216401 1216400     cyoB cyoA TRUE 0.992 5.000 0.500 0.002 Y NA
 1216399 1216398     ctaA cyoE TRUE 0.954 -7.000 0.090 1.000 Y NA
 1216398 1216397     cyoE ccmA FALSE 0.159 102.000 0.033 1.000 N NA
 1216397 1216396     ccmA   TRUE 0.918 32.000 0.321 1.000   NA
 1216396 1216395         TRUE 0.871 30.000 0.176 NA   NA
 1216390 1216389       ubiA TRUE 0.828 26.000 0.043 1.000 N NA
 1216387 1216386       cobM FALSE 0.128 112.000 0.016 1.000   NA
 1216386 1216385     cobM lgt TRUE 0.797 -3.000 0.061 1.000 N NA
 1216385 1216384     lgt petA TRUE 0.952 14.000 0.476 1.000   NA
 1216384 1216383     petA petC TRUE 0.982 8.000 0.881 0.056   NA
 1216381 1216380     tatC   FALSE 0.029 232.000 0.027 NA   NA
 1216380 1216379         FALSE 0.691 42.000 0.020 NA   NA
 1216377 1216376     psaJ psaF TRUE 0.953 48.000 0.455 0.021   NA
 1216375 1216887     qri7   FALSE 0.746 31.000 0.015 NA   NA
 1216887 1216374         FALSE 0.035 181.000 0.018 NA   NA
 1216374 1216373       nhaP FALSE 0.035 171.000 0.000 NA   NA
 1216372 1309200     gltX tRNA-Asp FALSE 0.699 -26.000 0.000 NA   NA
 1309200 1216371     tRNA-Asp   FALSE 0.026 203.000 0.000 NA   NA
 1216371 1309199       tRNA-Trp FALSE 0.702 36.000 0.000 NA   NA
 1309199 1216370     tRNA-Trp rplS FALSE 0.394 60.000 0.000 NA   NA
 1216370 1216886     rplS   FALSE 0.020 251.000 0.000 NA   NA
 1216367 1216366     pta   TRUE 0.830 41.000 0.177 NA   NA
 1216366 1216365         FALSE 0.082 126.000 0.021 NA   NA
 1216365 1216364         FALSE 0.701 42.000 0.021 NA   NA
 1216364 1216363       hflC FALSE 0.215 139.000 0.429 NA   NA
 1216362 1216361     hemL xthA FALSE 0.022 282.000 0.000 1.000 N NA
 1216360 1216359         FALSE 0.507 70.000 0.217 NA   NA
 1216359 1216358         FALSE 0.380 66.000 0.042 NA   NA
 1216358 1216357         FALSE 0.752 -3.000 0.042 NA   NA
 1216356 1216355     thiP   TRUE 0.777 28.000 0.021 NA   NA
 1216355 1216354         FALSE 0.750 26.000 0.008 NA   NA
 1216354 1216353         FALSE 0.742 2.000 0.020 NA   NA
 1216352 1216351         FALSE 0.191 128.000 0.246 1.000 N NA
 1216350 1216349     hemC   FALSE 0.054 160.000 0.009 1.000 N NA
 1294677 1216348       priA FALSE 0.694 37.000 0.000 NA   NA
 1216347 1216346       argB FALSE 0.753 1.000 0.023 NA   NA
 1216346 1216345     argB   FALSE 0.756 -7.000 0.027 NA   NA
 1216342 1216884     cobK cutA TRUE 0.843 16.000 0.031 1.000 N NA
 1216341 1216340       purA FALSE 0.665 42.000 0.021 NA N NA
 1216340 1216339     purA psb27 FALSE 0.150 96.000 0.022 NA   NA
 1216339 1216338     psb27 proS FALSE 0.643 47.000 0.023 NA   NA
 1216337 1216336         FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 1216336 1216335         FALSE 0.695 -13.000 0.000 NA   NA
 1216335 1216334       arsC TRUE 0.839 19.000 0.045 1.000 N NA
 1216334 1216333     arsC   FALSE 0.281 83.000 0.030 1.000 N NA
 1216331 1216330         FALSE 0.327 85.000 0.150 NA   NA
 1216330 1216329         TRUE 0.772 9.000 0.020 NA   NA
 1216329 1216328       tal FALSE 0.271 93.000 0.131 1.000 N NA
 1216327 1216326     fixC frr TRUE 0.776 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1216326 1216325     frr pyrH TRUE 0.889 51.000 0.626 1.000 N NA
 1216325 1216324     pyrH cobO FALSE 0.149 98.000 0.010 1.000 N NA
 1216324 1216323     cobO   FALSE 0.293 83.000 0.024 1.000   NA
 1216322 1216321     hemH ilvB FALSE 0.307 146.000 0.031 1.000 Y NA
 1216321 1216320     ilvB   TRUE 0.877 15.000 0.149 NA   NA
 1216319 1216318       rps1b, rpsA2, nbp1 TRUE 0.945 24.000 0.513 NA   NA
 1216317 1216316         FALSE 0.645 75.000 0.465 1.000   NA
 1216316 1216315         FALSE 0.466 147.000 0.659 0.034   NA
 1216315 1216314       accA TRUE 0.853 21.000 0.033 1.000   NA
 1216314 1216313     accA   TRUE 0.853 12.000 0.033 1.000   NA
 1216309 1216308         FALSE 0.555 69.000 0.274 NA   NA
 1216306 1216305     chlN chlB TRUE 0.993 5.000 0.591 0.002 Y NA
 1216301 1216300     ccmK rbcL FALSE 0.562 72.000 0.373 NA N NA
 1216300 1216299     rbcL rbcS FALSE 0.675 101.000 0.392 0.001 N NA
 1216299 1216298     rbcS csoS2 FALSE 0.391 100.000 0.474 NA   NA
 1216298 1216297     csoS2 csoS3 TRUE 0.959 8.000 0.925 NA   NA
 1216297 1216296     csoS3   TRUE 0.952 1.000 0.925 NA   NA
 1216296 1216295         TRUE 0.980 0.000 0.868 NA Y NA
 1216295 1216294         FALSE 0.612 45.000 0.000 NA   NA
 1216294 1216293         FALSE 0.224 76.000 0.000 NA   NA
 1216292 1216291       tdcF FALSE 0.199 89.000 0.031 NA   NA
 1216291 1216290     tdcF   FALSE 0.638 46.000 0.020 NA   NA
 1216289 1216288     hisG   TRUE 0.773 -13.000 0.021 1.000 N NA
 1216288 1216287         TRUE 0.917 14.000 0.222 1.000   NA
 1216286 1216285         TRUE 0.765 -51.000 0.031 NA   NA
 1216279 1216278         TRUE 0.955 4.000 0.925 NA   NA
 1216278 1216277       trpA FALSE 0.483 84.000 0.375 NA   NA
 1216277 1216276     trpA   FALSE 0.143 93.000 0.014 NA   NA
 1216275 1216274         TRUE 0.869 14.000 0.071 1.000   NA
 1216274 1294717         TRUE 0.940 -15.000 0.714 NA   NA
 1294717 1216273         TRUE 0.953 3.000 0.905 NA   NA
 1216273 1216881         FALSE 0.017 293.000 0.000 NA   NA
 1216881 1216272       hisI FALSE 0.522 52.000 0.000 NA   NA
 1216270 1216269     clpB petE FALSE 0.019 382.000 0.000 1.000   NA
 1216269 1216268     petE   TRUE 0.830 54.000 0.404 1.000 N NA
 1216268 1216267       hemE TRUE 0.791 -3.000 0.032 1.000 N NA
 1216267 1216266     hemE glgB FALSE 0.062 162.000 0.024 1.000 N NA
 1216266 1216265     glgB   FALSE 0.734 57.000 0.220 1.000   NA
 1216265 1216264         TRUE 0.952 8.000 0.760 NA   NA
 1216264 1216880         TRUE 0.903 47.000 0.684 NA   NA
 1216880 1216263         TRUE 0.886 -7.000 0.317 NA   NA
 1216262 1216261       proA FALSE 0.047 148.000 0.000 NA   NA
 1216261 1216260     proA folB TRUE 0.779 -3.000 0.023 1.000 N NA
 1216260 1216259     folB   TRUE 0.813 1.000 0.047 1.000   NA
 1216258 1216257     prlC   TRUE 0.946 17.000 0.444 1.000 N NA
 1216257 1216256       thrB TRUE 0.791 37.000 0.031 1.000 N NA
 1216256 1216255     thrB glk TRUE 0.822 12.000 0.020 1.000 N NA
 1216255 1216254     glk thrS TRUE 0.815 24.000 0.020 1.000 N NA
 1216254 1216253     thrS trpS TRUE 0.979 7.000 0.016 0.055 Y NA
 1216253 1216252     trpS   TRUE 0.764 1.000 0.034 NA   NA
 1216251 1216250         FALSE 0.376 75.000 0.065 1.000   NA
 1216250 1216249         TRUE 0.983 0.000 0.894 1.000 Y NA
 1216249 1216248         TRUE 0.982 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 1216248 1216247         TRUE 0.843 13.000 0.085 NA   NA
 1216246 1216245         FALSE 0.678 64.000 0.381 NA   NA
 1216244 1216243     menD menB TRUE 0.990 14.000 0.147 0.002 Y NA
 1216243 1216242     menB glgA FALSE 0.667 49.000 0.022 1.000 N NA
 1216242 1216241     glgA murF TRUE 0.810 46.000 0.182 1.000 N NA
 1216240 1216239         FALSE 0.018 423.000 0.006 1.000   NA
 1216239 1216238         FALSE 0.740 36.000 0.021 NA   NA
 1216238 1216237       aroA TRUE 0.778 12.000 0.017 NA   NA
 1216237 1216236     aroA ubiD FALSE 0.067 121.000 0.009 NA N NA
 1216235 1216234         TRUE 0.837 30.000 0.051 1.000   NA
 1216234 1216233       amiC TRUE 0.853 21.000 0.051 1.000   NA
 1216233 1216232     amiC murI TRUE 0.953 3.000 0.022 1.000 Y NA
 1216232 1216231     murI sds TRUE 0.829 23.000 0.024 1.000 N NA
 1216227 1216226     dnaQ   FALSE 0.263 96.000 0.183 NA   NA
 1216226 1216225       hisS FALSE 0.064 129.000 0.003 NA   NA
 1216225 1216224     hisS ugd TRUE 0.801 22.000 0.008 1.000 N NA
 1216224 1216879     ugd   FALSE 0.123 96.000 0.000 NA   NA
 1216879 1216223         FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 1216223 1216222         FALSE 0.061 131.000 0.000 NA   NA
 1216221 1216220         FALSE 0.024 293.000 0.000 1.000   NA
 1216220 1216219         FALSE 0.490 71.000 0.211 NA   NA
 1216217 1294715         FALSE 0.257 100.000 0.222 NA   NA
 1216216 1216215         TRUE 0.889 -3.000 0.235 1.000   NA
 1216215 1216877         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1216213 1216212     mscS pncA FALSE 0.432 66.000 0.029 1.000 N NA
 1216210 1216209       stpA FALSE 0.279 87.000 0.059 1.000   NA
 1216208 1216207         TRUE 0.837 8.000 0.100 NA   NA
 1216207 1216206         FALSE 0.019 353.000 0.036 NA   NA
 1216206 1216205         FALSE 0.537 55.000 0.021 NA   NA
 1216205 1216204       MET17 TRUE 0.876 20.000 0.149 NA   NA
 1216204 1216203     MET17 metA TRUE 0.963 23.000 0.048 1.000 Y NA
 1216201 1216200         FALSE 0.013 388.000 0.000 NA   NA
 1216198 1216197         FALSE 0.745 9.000 0.000 NA   NA
 1216876 1309197       tRNA-Ser FALSE 0.015 334.000 0.000 NA   NA
 1216875 1216195       nrdJ FALSE 0.100 145.000 0.132 NA   NA
 1216194 1216193       prfC TRUE 0.794 37.000 0.021 1.000   NA
 1216193 1216192     prfC   FALSE 0.485 56.000 0.012 NA   NA
 1216191 1216190         TRUE 0.812 17.000 0.012 1.000 N NA
 1216189 1216188         TRUE 0.921 7.000 0.388 NA   NA
 1216188 1216187         FALSE 0.456 65.000 0.095 NA   NA
 1216186 1216185     tesA   TRUE 0.913 25.000 0.264 1.000 N NA
 1216185 1216184         TRUE 0.983 7.000 0.696 1.000 Y NA
 1216184 1216183       phnD TRUE 0.979 -3.000 0.690 1.000 Y NA
 1216183 1216182     phnD aspC TRUE 0.898 6.000 0.238 1.000 N NA
 1216181 1216180         TRUE 0.798 -3.000 0.094 NA   NA
 1216180 1216179       gcpE FALSE 0.616 53.000 0.022 1.000 N NA
 1216177 1216176       nadA FALSE 0.744 9.000 0.003 NA   NA
 1216170 1216873         FALSE 0.021 232.000 0.000 NA   NA
 1216872 1216871         FALSE 0.009 927.000 0.000 NA   NA
 1216871 1216870         FALSE 0.036 169.000 0.000 NA   NA
 1216169 1216869         FALSE 0.010 682.000 0.000 NA   NA
 1216869 1216168         FALSE 0.022 231.000 0.000 NA   NA
 1216168 1216868         FALSE 0.021 247.000 0.000 NA   NA
 1216867 1216866         FALSE 0.240 74.000 0.000 NA   NA
 1216866 1216167         FALSE 0.725 6.000 0.000 NA   NA
 1216167 1216166         FALSE 0.109 100.000 0.000 NA   NA
 1216166 1362563       pseudo FALSE 0.010 642.000 0.000 NA   NA
 1362563 1216165     pseudo   FALSE 0.051 144.000 0.000 NA   NA
 1216865 1216864         FALSE 0.028 196.000 0.000 NA   NA
 1216864 1216863         FALSE 0.184 84.000 0.000 NA   NA
 1216863 1216164         FALSE 0.038 165.000 0.000 NA   NA
 1216163 1216162         FALSE 0.012 455.000 0.000 NA   NA
 1216160 1216159       psb28 TRUE 0.943 10.000 0.488 NA   NA
 1216159 1216158     psb28   TRUE 0.802 42.000 0.077 1.000   NA
 1216157 1216156       rsbW FALSE 0.149 130.000 0.194 NA   NA
 1216155 1216154         FALSE 0.737 49.000 0.137 NA   NA
 1216154 1216153       glnA FALSE 0.083 138.000 0.022 1.000 N NA
 1216149 1216148       lspA TRUE 0.896 19.000 0.138 1.000   NA
 1216148 1216147     lspA   TRUE 0.933 -57.000 0.554 NA   NA
 1216145 1216144         TRUE 0.972 3.000 0.352 0.005   NA
 1216143 1216142     pcyA   TRUE 0.919 -6.000 0.455 NA   NA
 1216142 1216141         TRUE 0.940 0.000 0.769 NA N NA
 1216141 1216140         TRUE 0.983 34.000 0.769 1.000 Y NA
 1216140 1216139         TRUE 0.943 37.000 0.800 NA   NA
 1216139 1216138         FALSE 0.317 92.000 0.234 NA   NA
 1216138 1216137       rpsB FALSE 0.037 162.000 0.017 NA N NA
 1216137 1216136     rpsB tsf TRUE 0.846 59.000 0.748 1.000   NA
 1216136 1216135     tsf   FALSE 0.717 3.000 0.008 NA   NA
 1216135 1216134       recG FALSE 0.719 -27.000 0.016 NA   NA
 1216134 1216133     recG ddpX FALSE 0.151 104.000 0.036 1.000 N NA
 1216129 1216128       typA FALSE 0.087 133.000 0.011 1.000   NA
 1216128 1216127     typA   FALSE 0.751 6.000 0.019 NA   NA
 1216127 1216126         FALSE 0.039 163.000 0.000 NA   NA
 1216126 1216125         FALSE 0.224 76.000 0.000 NA   NA
 1216125 1216124         TRUE 0.834 7.000 0.026 1.000   NA
 1216124 1216123       ccmC TRUE 0.838 38.000 0.105 1.000   NA
 1216121 1216120     glpX hemA TRUE 0.816 31.000 0.038 1.000 N NA
 1216120 1216119     hemA glgC FALSE 0.147 106.000 0.027 1.000 N NA
 1216119 1216118     glgC gnd FALSE 0.265 160.000 0.042 1.000 Y NA
 1216118 1216117     gnd   TRUE 0.985 6.000 0.046 0.003 Y NA
 1216117 1216116         TRUE 0.892 36.000 0.321 NA   NA
 1216116 1216115         TRUE 0.899 -13.000 0.358 NA   NA
 1216114 1216113     ilvD   TRUE 0.857 34.000 0.165 NA   NA
 1216113 1216112       upp TRUE 0.792 25.000 0.023 NA   NA
 1216111 1216110       cobW TRUE 0.811 21.000 0.033 NA   NA
 1216110 1216109     cobW   FALSE 0.087 131.000 0.000 1.000   NA
 1216109 1216108       purS FALSE 0.182 93.000 0.000 1.000   NA
 1216108 1216107     purS   TRUE 0.993 5.000 0.656 0.002 Y NA
 1216106 1216105         FALSE 0.094 140.000 0.042 1.000   NA
 1216105 1216859         FALSE 0.756 22.000 0.000 NA   NA
 1216859 1216104       accD FALSE 0.693 -7.000 0.000 NA   NA
 1216104 1216858     accD   FALSE 0.613 52.000 0.000 1.000   NA
 1216858 1216103       prkB FALSE 0.454 62.000 0.000 1.000   NA
 1216103 1216102     prkB leuB FALSE 0.635 88.000 0.074 1.000 Y NA
 1216102 1216101     leuB lpxD TRUE 0.828 27.000 0.052 1.000 N NA
 1216101 1216100     lpxD proB FALSE 0.712 46.000 0.029 1.000 N NA
 1216100 1216857     proB   FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1216857 1216099         FALSE 0.013 396.000 0.000 NA   NA
 1216099 1216098         FALSE 0.392 65.000 0.038 NA   NA
 1216098 1216097         FALSE 0.752 -3.000 0.042 NA   NA
 1216097 1216096         FALSE 0.372 102.000 0.467 NA   NA
 1216096 1216095         FALSE 0.040 232.000 0.111 NA   NA
 1216095 1216094         FALSE 0.471 67.000 0.131 NA   NA
 1216094 1216093       hisA FALSE 0.069 128.000 0.011 NA   NA
 1216089 1216088         TRUE 0.905 22.000 0.256 NA   NA
 1216088 1216087       nth FALSE 0.261 78.000 0.010 1.000 N NA
 1216086 1216085     potA   FALSE 0.041 175.000 0.000 1.000 N NA
 1216856 1216084         TRUE 0.889 7.000 0.235 NA   NA
 1216084 1216083         FALSE 0.025 283.000 0.000 1.000   NA
 1216081 1216080     modF hcaE TRUE 0.962 35.000 0.143 1.000 Y NA
 1216080 1216079     hcaE   FALSE 0.115 193.000 0.400 NA   NA
 1216079 1216078         FALSE 0.080 118.000 0.000 NA   NA
 1216077 1216855     galE   FALSE 0.014 357.000 0.000 NA   NA
 1216855 1216076       rfbC FALSE 0.018 264.000 0.000 NA   NA
 1216076 1216075     rfbC rfbD TRUE 0.964 0.000 0.197 1.000 Y NA
 1216075 1216074     rfbD rfbB TRUE 0.989 26.000 0.180 0.003 Y NA
 1216073 1216072     wecB   FALSE 0.564 90.000 0.000 1.000 Y NA
 1216072 1216071       rfe FALSE 0.517 99.000 0.034 1.000 Y NA
 1216071 1216070     rfe   TRUE 0.846 60.000 0.034 1.000 Y NA
 1216070 1216069         TRUE 0.950 -7.000 0.033 1.000 Y NA
 1216069 1216068         TRUE 0.866 16.000 0.122 NA   NA
 1216068 1216067       wecC FALSE 0.707 2.000 0.000 NA   NA
 1216067 1216066     wecC asnB FALSE 0.107 112.000 0.000 1.000 N NA
 1216066 1216904     asnB   FALSE 0.177 85.000 0.000 NA   NA
 1216065 1216064         TRUE 0.966 12.000 0.000 0.001   NA
 1216064 1216063         FALSE 0.078 119.000 0.000 NA   NA
 1216063 1216062         FALSE 0.016 325.000 0.000 NA   NA
 1216061 1216060     spsE   FALSE 0.109 440.000 0.124 1.000 Y NA
 1216060 1216059         TRUE 0.982 -13.000 0.026 0.004 Y NA
 1216059 1216058         TRUE 0.764 34.000 0.000 1.000 N NA
 1216058 1216057         TRUE 0.979 -3.000 0.011 0.006 Y NA
 1216057 1216056       gumC FALSE 0.012 712.000 0.000 1.000 N NA
 1216055 1216054     wza   FALSE 0.013 408.000 0.000 NA   NA
 1216054 1216851         FALSE 0.719 5.000 0.000 NA   NA
 1216849 1216848         FALSE 0.018 266.000 0.000 NA   NA
 1216848 1216847         FALSE 0.028 196.000 0.000 NA   NA
 1216847 1216053         FALSE 0.701 -40.000 0.000 NA   NA
 1216053 1216052         FALSE 0.011 501.000 0.000 NA   NA
 1216052 1216051         FALSE 0.016 326.000 0.000 NA   NA
 1216051 1309196       tRNA-Met FALSE 0.011 469.000 0.000 NA   NA
 1309196 1216050     tRNA-Met ansA FALSE 0.509 53.000 0.000 NA   NA
 1216050 1216049     ansA   TRUE 0.949 4.000 0.810 NA   NA
 1216049 1216048         TRUE 0.756 -7.000 0.033 NA   NA
 1216048 1216047         FALSE 0.732 -7.000 0.021 NA   NA
 1294670 1216046       carB FALSE 0.133 93.000 0.000 NA   NA
 1216046 1216045     carB PNIL34,AT103 FALSE 0.033 224.000 0.000 1.000   NA
 1216044 1216043         TRUE 0.835 8.000 0.098 NA   NA
 1216043 1216845         FALSE 0.027 200.000 0.000 NA   NA
 1216042 1216844     mmsB   FALSE 0.113 99.000 0.000 NA   NA
 1216040 1216039         TRUE 0.935 -3.000 0.648 NA   NA
 1216039 1216038         TRUE 0.878 2.000 0.239 NA   NA
 1216035 1216843         FALSE 0.015 328.000 0.000 NA   NA
 1216841 1294642         FALSE 0.070 125.000 0.000 NA   NA
 1216034 1216033         FALSE 0.539 51.000 0.000 NA   NA
 1216031 1216030     amyA   TRUE 0.870 5.000 0.126 1.000   NA
 1216030 1216029         TRUE 0.756 -3.000 0.050 NA   NA
 1216029 1216840         FALSE 0.071 124.000 0.000 NA   NA
 1216840 1216028         FALSE 0.296 107.000 0.375 NA   NA
 1216026 1362564     bacA pseudo FALSE 0.426 58.000 0.000 NA   NA
 1309195 1216839     tRNA-Pro   TRUE 0.761 14.000 0.000 NA   NA
 1216839 1216838         FALSE 0.654 42.000 0.000 NA   NA
 1216838 1216025         FALSE 0.712 3.000 0.000 NA   NA
 1216025 1216024         TRUE 0.776 5.000 0.038 NA   NA
 1216024 1216023         FALSE 0.309 91.000 0.206 NA   NA
 1216022 1216021         FALSE 0.091 113.000 0.014 NA   NA
 1216021 1216020       carA TRUE 0.957 30.000 0.021 1.000 Y NA
 1216020 1216019     carA   FALSE 0.114 118.000 0.020 1.000 N NA
 1216019 1216018         TRUE 0.847 -3.000 0.113 1.000   NA
 1216018 1216017         TRUE 0.970 18.000 0.150 0.008   NA
 1216017 1216016         FALSE 0.030 227.000 0.031 NA   NA
 1216016 1216015       gatA TRUE 0.772 31.000 0.022 NA   NA
 1216015 1216014     gatA dnaE FALSE 0.322 72.000 0.019 1.000 N NA
 1216013 1216012       rpsO TRUE 0.794 28.000 0.037 NA   NA
 1216012 1216011     rpsO ruvA FALSE 0.641 51.000 0.021 1.000 N NA
 1216011 1216010     ruvA   FALSE 0.681 40.000 0.010 NA   NA
 1216010 1216009         TRUE 0.812 -3.000 0.113 NA   NA
 1216008 1216837     dnaG   TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 1216007 1216006       umuC TRUE 0.787 51.000 0.267 NA   NA
 1216006 1216005     umuC umuD TRUE 0.944 3.000 0.625 1.000 N NA
 1216005 1216004     umuD   FALSE 0.361 63.000 0.011 NA   NA
 1216004 1216003         TRUE 0.770 12.000 0.012 NA   NA
 1216002 1216001     ksgA ispE TRUE 0.763 -22.000 0.016 1.000 N NA
 1216001 1216903     ispE   TRUE 0.926 -13.000 0.488 NA   NA
 1216903 1216000         FALSE 0.709 35.000 0.000 NA   NA
 1216000 1215999       pdhB FALSE 0.349 63.000 0.000 NA   NA
 1215999 1215998     pdhB secD TRUE 0.835 3.000 0.091 1.000 N NA
 1215998 1215997     secD secF TRUE 0.994 25.000 0.516 0.001 Y NA
 1215997 1294684     secF   TRUE 0.832 16.000 0.069 NA   NA
 1216836 1294667         FALSE 0.718 34.000 0.000 NA   NA
 1215995 1294647         FALSE 0.019 262.000 0.000 NA   NA
 1215991 1215990       salY FALSE 0.170 141.000 0.282 1.000 N NA
 1215990 1215989     salY pykF TRUE 0.941 7.000 0.476 1.000 N NA
 1215987 1215986         TRUE 0.848 25.000 0.029 1.000   NA
 1215986 1215985       ilvA FALSE 0.573 57.000 0.028 1.000 N NA
 1215983 1215982     psaK   FALSE 0.575 71.000 0.357 NA   NA
 1215982 1215981         TRUE 0.933 -3.000 0.625 NA   NA
 1215981 1215980         TRUE 0.849 -7.000 0.180 NA   NA
 1215979 1215978     rpmB htpG FALSE 0.679 46.000 0.019 1.000 N NA
 1215978 1215977     htpG hisZ FALSE 0.251 131.000 0.008 0.098 N NA
 1215977 1215976     hisZ suhB FALSE 0.747 43.000 0.032 1.000 N NA
 1215975 1215974     pstB pstA TRUE 0.994 32.000 0.952 0.003 Y NA
 1215974 1215973     pstA pstC TRUE 0.992 1.000 0.541 0.003 Y NA
 1215972 1215971       dnaJ2 TRUE 0.990 -16.000 0.488 0.008 Y NA
 1215971 1215970     dnaJ2   TRUE 0.816 57.000 0.488 NA   NA
 1215970 1215969         TRUE 0.934 -3.000 0.634 NA   NA
 1215969 1215968         FALSE 0.228 90.000 0.022 1.000   NA
 1215962 1215961     dapF   TRUE 0.962 12.000 0.021 1.000 Y NA
 1215961 1215960         TRUE 0.917 11.000 0.324 NA   NA
 1215960 1215959       dacB, pbp FALSE 0.403 79.000 0.195 NA   NA
 1215957 1215956       uvrC TRUE 0.832 19.000 0.015 1.000   NA
 1215956 1215955     uvrC   FALSE 0.136 93.000 0.008 NA   NA
 1215955 1215954         TRUE 0.758 -30.000 0.044 NA   NA
 1215952 1215951     ilvE metH TRUE 0.808 64.000 0.036 1.000 Y NA
 1215950 1362565       pseudo FALSE 0.080 118.000 0.000 NA   NA
 1215946 1215945     rpmG rpsR TRUE 0.983 25.000 0.037 0.026 Y NA
 1215945 1215944     rpsR   TRUE 0.829 33.000 0.027 1.000   NA
 1215944 1215943       metG FALSE 0.381 68.000 0.013 1.000   NA
 1215943 1216831     metG   FALSE 0.713 0.000 0.013 NA   NA
 1215941 1215940     cobU cspR FALSE 0.748 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1216827 1294708         FALSE 0.010 659.000 0.000 NA   NA
 1216825 1215939         FALSE 0.009 784.000 0.000 NA   NA
 1215939 1216824         FALSE 0.011 491.000 0.000 NA   NA
 1216823 1216822         TRUE 0.763 16.000 0.000 NA   NA
 1216822 1215938         FALSE 0.054 140.000 0.000 NA   NA
 1215938 1216821         FALSE 0.162 88.000 0.000 NA   NA
 1216821 1309206       tRNA-Met FALSE 0.010 591.000 0.000 NA   NA
 1216819 1215934         TRUE 0.767 2.000 0.035 NA   NA
 1215932 1215931         TRUE 0.954 17.000 0.055 0.069   NA
 1215931 1215930       vacB FALSE 0.575 82.000 0.439 1.000   NA
 1215930 1215929     vacB ubiX TRUE 0.874 1.000 0.188 1.000 N NA
 1215929 1215928     ubiX   FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1215928 1215927         FALSE 0.240 74.000 0.000 NA   NA
 1215927 1215926       tldD FALSE 0.036 170.000 0.005 NA   NA
 1215926 1215925     tldD pmbA TRUE 0.842 2.000 0.146 NA   NA
 1215925 1215924     pmbA fmt TRUE 0.782 -3.000 0.018 1.000   NA
 1215922 1215921       mfd FALSE 0.334 64.000 0.003 NA   NA
 1215921 1215920     mfd   FALSE 0.539 51.000 0.000 NA   NA
 1215919 1215918         FALSE 0.497 54.000 0.000 NA   NA
 1215918 1215917         FALSE 0.071 124.000 0.000 NA   NA
 1215917 1215916         TRUE 0.918 10.000 0.343 NA   NA
 1215914 1215913       ubiH TRUE 0.946 17.000 0.485 NA   NA
 1215913 1215912     ubiH   TRUE 0.872 34.000 0.200 NA   NA
 1215912 1215911       dapB TRUE 0.811 13.000 0.027 NA   NA
 1215909 1215908     folP tpi TRUE 0.764 41.000 0.039 1.000 N NA
 1215908 1215907     tpi   TRUE 0.814 10.000 0.000 1.000   NA
 1215906 1215905         FALSE 0.654 42.000 0.000 NA   NA
 1215905 1215904         FALSE 0.047 148.000 0.000 NA   NA
 1215904 1215903         FALSE 0.664 41.000 0.000 NA   NA
 1215903 1216817         FALSE 0.017 303.000 0.000 NA   NA
 1215902 1215901         FALSE 0.017 288.000 0.000 NA   NA
 1216814 1216813         FALSE 0.756 22.000 0.000 NA   NA
 1216812 1216811         FALSE 0.102 102.000 0.000 NA   NA
 1216811 1216810         FALSE 0.057 137.000 0.000 NA   NA
 1216809 1215898         FALSE 0.092 107.000 0.000 NA   NA
 1215898 1294736         FALSE 0.029 191.000 0.000 NA   NA
 1294736 1215897         FALSE 0.172 86.000 0.000 NA   NA
 1215897 1215896         FALSE 0.123 103.000 0.000 1.000 N NA
 1216808 1216807         FALSE 0.394 60.000 0.000 NA   NA
 1216807 1215894         FALSE 0.016 327.000 0.000 NA   NA
 1215892 1215891         FALSE 0.105 101.000 0.000 NA   NA
 1215891 1216803         FALSE 0.200 80.000 0.000 NA   NA
 1216803 1216802         FALSE 0.426 58.000 0.000 NA   NA
 1216802 1216801         FALSE 0.146 90.000 0.000 NA   NA
 1216801 1215890         TRUE 0.763 16.000 0.000 NA   NA
 1216800 1215889         FALSE 0.664 41.000 0.000 NA   NA
 1215889 1216902         FALSE 0.049 147.000 0.000 NA   NA
 1215888 1216799         FALSE 0.018 264.000 0.000 NA   NA
 1216798 1215887         FALSE 0.011 529.000 0.000 NA   NA
 1215887 1294682         FALSE 0.010 641.000 0.000 NA   NA
 1294682 1216797         FALSE 0.043 157.000 0.000 NA   NA
 1216797 1215886         FALSE 0.057 137.000 0.000 NA   NA
 1216796 1216795         FALSE 0.018 274.000 0.000 NA   NA
 1216795 1216794         FALSE 0.286 68.000 0.000 NA   NA
 1216794 1216793         FALSE 0.654 42.000 0.000 NA   NA
 1215885 1215884         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215884 1215883         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215883 1294619         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1294619 1215882         TRUE 0.758 21.000 0.000 NA   NA
 1215882 1215881         FALSE 0.019 256.000 0.000 NA   NA
 1215881 1215880         FALSE 0.162 88.000 0.000 NA   NA
 1215880 1215879         FALSE 0.694 -12.000 0.000 NA   NA
 1216791 1216790         FALSE 0.698 -21.000 0.000 NA   NA
 1216790 1216789         FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 1215878 1216787         FALSE 0.022 226.000 0.000 NA   NA
 1216786 1216785         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1216785 1216784         FALSE 0.204 79.000 0.000 NA   NA
 1215877 1216782         FALSE 0.016 308.000 0.000 NA   NA
 1216782 1215876         FALSE 0.286 68.000 0.000 NA   NA
 1215875 1215874         FALSE 0.080 118.000 0.000 NA   NA
 1216781 1215873         FALSE 0.017 291.000 0.000 NA   NA
 1215873 1216780         FALSE 0.102 102.000 0.000 NA   NA
 1215872 1215871         FALSE 0.745 9.000 0.000 NA   NA
 1216779 1216778         FALSE 0.712 3.000 0.000 NA   NA
 1216778 1216777         FALSE 0.091 108.000 0.000 NA   NA
 1216776 1216775         FALSE 0.070 125.000 0.000 NA   NA
 1215870 1215869     crp phoB TRUE 0.792 88.000 0.020 0.019 Y NA
 1215869 1215868     phoB phoR TRUE 0.966 10.000 0.099 1.000 Y NA
 1215867 1215866         FALSE 0.709 35.000 0.000 NA   NA
 1215866 1215865         FALSE 0.057 161.000 0.000 1.000   NA
 1215864 1215863         FALSE 0.129 94.000 0.000 NA   NA
 1215863 1216774         FALSE 0.105 101.000 0.000 NA   NA
 1215862 1215861     chrA   FALSE 0.618 51.000 0.030 NA   NA
 1215861 1215860       gap3 TRUE 0.953 11.000 0.689 NA   NA
 1215859 1215858     arsR   FALSE 0.055 154.000 0.000 1.000 N NA
 1215858 1215857         FALSE 0.142 91.000 0.000 NA   NA
 1215857 1215856         FALSE 0.011 471.000 0.000 NA   NA
 1216773 1216772         FALSE 0.022 225.000 0.000 NA   NA
 1216772 1216771         FALSE 0.697 -16.000 0.000 NA   NA
 1215854 1216770         FALSE 0.071 124.000 0.000 NA   NA
 1216770 1216769         FALSE 0.073 123.000 0.000 NA   NA
 1216768 1215853         FALSE 0.089 110.000 0.000 NA   NA
 1215853 1215852         FALSE 0.009 718.000 0.000 NA   NA
 1215852 1216767         TRUE 0.953 1.000 1.000 NA   NA
 1216767 1216766         FALSE 0.718 34.000 0.000 NA   NA
 1216766 1215851         FALSE 0.064 129.000 0.000 NA   NA
 1215851 1215850         FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 1215850 1215849         FALSE 0.162 88.000 0.000 NA   NA
 1215849 1215848         FALSE 0.129 94.000 0.000 NA   NA
 1215848 1216765         TRUE 0.763 16.000 0.000 NA   NA
 1216764 1215846         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215845 1216763         FALSE 0.333 64.000 0.000 NA   NA
 1216760 1216759         FALSE 0.025 206.000 0.000 NA   NA
 1216759 1216758         FALSE 0.245 73.000 0.000 NA   NA
 1215843 1215842         FALSE 0.017 287.000 0.000 NA   NA
 1215841 1215840         FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1215837 1215836         FALSE 0.009 755.000 0.000 NA   NA
 1216757 1215835         FALSE 0.041 160.000 0.000 NA   NA
 1215835 1216756         FALSE 0.333 64.000 0.000 NA   NA
 1216756 1216754         FALSE 0.019 262.000 0.000 NA   NA
 1216754 1216753         FALSE 0.703 1.000 0.000 NA   NA
 1216753 1216752         FALSE 0.394 60.000 0.000 NA   NA
 1216752 1215834         FALSE 0.729 31.000 0.000 NA   NA
 1215834 1216751         FALSE 0.394 60.000 0.000 NA   NA
 1216751 1216750         FALSE 0.522 52.000 0.000 NA   NA
 1216750 1215833         FALSE 0.056 138.000 0.000 NA   NA
 1215829 1215828         FALSE 0.169 96.000 0.000 1.000   NA
 1215828 1216749         FALSE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 1216749 1294655         FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 1294655 1215827         FALSE 0.024 216.000 0.000 NA   NA
 1215827 1215826         FALSE 0.026 203.000 0.000 NA   NA
 1215826 1215825         FALSE 0.117 98.000 0.000 NA   NA
 1215825 1216748         FALSE 0.349 63.000 0.000 NA   NA
 1216747 1215824         FALSE 0.703 1.000 0.000 NA   NA
 1215824 1216746         FALSE 0.725 6.000 0.000 NA   NA
 1216746 1362566       pseudo FALSE 0.040 161.000 0.000 NA   NA
 1216745 1215823         FALSE 0.119 97.000 0.000 NA   NA
 1216744 1215822         FALSE 0.198 81.000 0.000 NA   NA
 1215822 1215821         FALSE 0.019 263.000 0.000 NA   NA
 1215821 1216743         FALSE 0.047 148.000 0.000 NA   NA
 1216743 1216742         FALSE 0.012 417.000 0.000 NA   NA
 1216742 1216741         FALSE 0.718 34.000 0.000 NA   NA
 1216741 1216740         FALSE 0.010 650.000 0.000 NA   NA
 1216740 1215820       purT FALSE 0.693 -7.000 0.000 NA   NA
 1215820 1216739     purT   FALSE 0.014 368.000 0.000 NA   NA
 1216738 1215819         FALSE 0.051 144.000 0.000 NA   NA
 1215819 1216737         FALSE 0.083 115.000 0.000 NA   NA
 1215818 1215817         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215817 1294734         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1294734 1215816         TRUE 0.758 21.000 0.000 NA   NA
 1215816 1215815         FALSE 0.060 132.000 0.000 NA   NA
 1215815 1215814         FALSE 0.718 34.000 0.000 NA   NA
 1215814 1215813         FALSE 0.739 8.000 0.000 NA   NA
 1215812 1216736         FALSE 0.596 46.000 0.000 NA   NA
 1216736 1215811         FALSE 0.596 46.000 0.000 NA   NA
 1215809 1294721         FALSE 0.639 43.000 0.000 NA   NA
 1294721 1216735         FALSE 0.045 152.000 0.000 NA   NA
 1216735 1216734         FALSE 0.739 8.000 0.000 NA   NA
 1216733 1215808         FALSE 0.032 176.000 0.000 NA   NA
 1215808 1215807         FALSE 0.052 142.000 0.000 NA   NA
 1215807 1215806         FALSE 0.010 579.000 0.000 NA   NA
 1215806 1216732         FALSE 0.049 147.000 0.000 NA   NA
 1216732 1294689         FALSE 0.693 -7.000 0.000 NA   NA
 1294689 1294730         FALSE 0.700 -37.000 0.000 NA   NA
 1216731 1216730         FALSE 0.043 155.000 0.000 NA   NA
 1294625 1216729         FALSE 0.193 82.000 0.000 NA   NA
 1216728 1215805         FALSE 0.057 136.000 0.000 NA   NA
 1216727 1216726         FALSE 0.077 120.000 0.000 NA   NA
 1216726 1294636         FALSE 0.011 522.000 0.000 NA   NA
 1216724 1216723         FALSE 0.712 3.000 0.000 NA   NA
 1215804 1216721         FALSE 0.152 89.000 0.000 NA   NA
 1294723 1216720         FALSE 0.080 118.000 0.000 NA   NA
 1216720 1215803         FALSE 0.742 27.000 0.000 NA   NA
 1215802 1216719         FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1216719 1216718         FALSE 0.693 -7.000 0.000 NA   NA
 1216718 1216717         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215801 1215800         FALSE 0.087 111.000 0.000 NA   NA
 1215800 1309207       tRNA-Gly FALSE 0.313 66.000 0.000 NA   NA
 1309207 1215799     tRNA-Gly   FALSE 0.094 106.000 0.000 NA   NA
 1215799 1216716         FALSE 0.022 226.000 0.000 NA   NA
 1216716 1215798         FALSE 0.717 4.000 0.000 NA   NA
 1215798 1215797         FALSE 0.024 214.000 0.000 NA   NA
 1216714 1216713         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1216712 1215796         FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 1216711 1215794         FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 1215794 1216710         FALSE 0.703 -85.000 0.000 NA   NA
 1216710 1215793         FALSE 0.702 36.000 0.000 NA   NA
 1294617 1216709         FALSE 0.050 145.000 0.000 NA   NA
 1215792 1216705         FALSE 0.026 202.000 0.000 NA   NA
 1216704 1215790         FALSE 0.074 122.000 0.000 NA   NA
 1216703 1294623         FALSE 0.013 401.000 0.000 NA   NA
 1216702 1294703         FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 1294703 1216701         FALSE 0.078 119.000 0.000 NA   NA
 1216701 1215788         FALSE 0.086 112.000 0.000 NA   NA
 1215788 1216700         FALSE 0.035 170.000 0.000 NA   NA
 1216700 1216699         FALSE 0.038 164.000 0.000 NA   NA
 1294661 1216698         FALSE 0.172 86.000 0.000 NA   NA
 1215787 1215786         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215786 1294726         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1294726 1215785         FALSE 0.709 35.000 0.000 NA   NA
 1215784 1215783         FALSE 0.021 247.000 0.000 NA   NA
 1215783 1215782         FALSE 0.010 606.000 0.000 NA   NA
 1215782 1215781         FALSE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 1215780 1215779     psbA   FALSE 0.026 205.000 0.000 NA   NA
 1215779 1215778       nei FALSE 0.089 110.000 0.000 NA   NA
 1215777 1215776         FALSE 0.012 463.000 0.000 NA   NA
 1215776 1294686         FALSE 0.184 84.000 0.000 NA   NA
 1294686 1215775         FALSE 0.584 47.000 0.000 NA   NA
 1215775 1216696         FALSE 0.054 139.000 0.000 NA   NA
 1216696 1216695         FALSE 0.091 108.000 0.000 NA   NA
 1215774 1216694         FALSE 0.426 58.000 0.000 NA   NA
 1216694 1216693         FALSE 0.034 172.000 0.000 NA   NA
 1216693 1215773         FALSE 0.011 546.000 0.000 NA   NA
 1215773 1294675         FALSE 0.123 96.000 0.000 NA   NA
 1294675 1215772         FALSE 0.044 153.000 0.000 NA   NA
 1215772 1215771         FALSE 0.035 170.000 0.000 NA   NA
 1215769 1216686         FALSE 0.015 346.000 0.000 NA   NA
 1216686 1216685         FALSE 0.497 54.000 0.000 NA   NA
 1216684 1216683         FALSE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 1215768 1215767         FALSE 0.014 364.000 0.000 NA   NA
 1215767 1216682         FALSE 0.028 199.000 0.000 NA   NA
 1215766 1362568       pseudo FALSE 0.739 8.000 0.000 NA   NA
 1215764 1215763         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215763 1294658         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1294658 1215762         FALSE 0.709 35.000 0.000 NA   NA
 1216679 1215761         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1215761 1294700         FALSE 0.011 521.000 0.000 NA   NA
 1294718 1215760         FALSE 0.044 153.000 0.000 NA   NA
 1215760 1215759         FALSE 0.024 217.000 0.000 NA   NA
 1215759 1216677         FALSE 0.042 158.000 0.000 NA   NA
 1216676 1216675         FALSE 0.012 439.000 0.000 NA   NA
 1216675 1216674         FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 1216674 1362569       pseudo FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215758 1215757         FALSE 0.046 151.000 0.000 NA   NA
 1216672 1294733         FALSE 0.012 444.000 0.000 NA   NA
 1294733 1216671         FALSE 0.025 209.000 0.000 NA   NA
 1216671 1215755         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1215755 1216670         FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1216668 1216667         FALSE 0.745 9.000 0.000 NA   NA
 1215753 1215752         FALSE 0.023 224.000 0.000 NA   NA
 1294709 1294679         FALSE 0.484 55.000 0.000 NA   NA
 1294679 1294702         FALSE 0.697 -19.000 0.000 NA   NA
 1294702 1215751         FALSE 0.086 112.000 0.000 NA   NA
 1215751 1216666         FALSE 0.018 269.000 0.000 NA   NA
 1216665 1216664         FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 1216663 1216662         FALSE 0.068 126.000 0.000 NA   NA
 1216662 1215750         FALSE 0.026 203.000 0.000 NA   NA
 1215750 1294668         FALSE 0.692 -6.000 0.000 NA   NA
 1216661 1216660         FALSE 0.410 59.000 0.000 NA   NA
 1216660 1215749         FALSE 0.270 70.000 0.000 NA   NA
 1215749 1294638         FALSE 0.013 387.000 0.000 NA   NA
 1294638 1215748         FALSE 0.017 303.000 0.000 NA   NA
 1215748 1215747         FALSE 0.484 55.000 0.000 NA   NA
 1215747 1216659         FALSE 0.204 79.000 0.000 NA   NA
 1216659 1216658         FALSE 0.126 95.000 0.000 NA   NA
 1216658 1215746         FALSE 0.068 126.000 0.000 NA   NA
 1215746 1294650         FALSE 0.054 139.000 0.000 NA   NA
 1294650 1294635         FALSE 0.701 -49.000 0.000 NA   NA
 1294635 1215745       rsuA FALSE 0.029 192.000 0.000 NA   NA
 1215744 1215743         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215743 1216657         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1216657 1215742         TRUE 0.758 21.000 0.000 NA   NA
 1215742 1216655         FALSE 0.023 219.000 0.000 NA   NA
 1216655 1216654         FALSE 0.113 99.000 0.000 NA   NA
 1216654 1215741         FALSE 0.031 185.000 0.000 NA   NA
 1215741 1216653         FALSE 0.703 -88.000 0.000 NA   NA
 1216653 1215740         FALSE 0.035 170.000 0.000 NA   NA
 1215740 1216652         FALSE 0.053 141.000 0.000 NA   NA
 1216652 1216651         FALSE 0.718 34.000 0.000 NA   NA
 1216651 1216650         FALSE 0.707 2.000 0.000 NA   NA
 1215738 1215737     glnQ   TRUE 0.977 7.000 0.382 1.000 Y NA
 1215737 1215736         TRUE 0.989 4.000 0.356 0.008 Y NA
 1215736 1215735         TRUE 0.992 19.000 0.424 0.014 Y NA
 1215734 1215733         FALSE 0.019 260.000 0.000 NA   NA
 1215733 1216647         FALSE 0.719 5.000 0.000 NA   NA
 1216646 1294713         FALSE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 1294713 1216645         FALSE 0.027 201.000 0.000 NA   NA
 1216645 1215732         FALSE 0.697 -19.000 0.000 NA   NA
 1215731 1216644         FALSE 0.365 62.000 0.000 NA   NA
 1216643 1216641         FALSE 0.014 360.000 0.000 NA   NA
 1215730 1216638         FALSE 0.032 177.000 0.000 NA   NA
 1216638 1216637         TRUE 0.763 16.000 0.000 NA   NA
 1216637 1216636         FALSE 0.379 61.000 0.000 NA   NA
 1216635 1294633         FALSE 0.022 226.000 0.000 NA   NA
 1215729 1309194     hupE tRNA-Pro FALSE 0.014 364.000 0.000 NA   NA
 1216634 1215728         FALSE 0.010 550.000 0.000 NA   NA
 1215728 1215727         FALSE 0.654 42.000 0.000 NA   NA
 1215727 1215726         FALSE 0.013 379.000 0.000 NA   NA
 1216632 1294706         FALSE 0.070 125.000 0.000 NA   NA
 1294706 1294714         FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 1294714 1216630         FALSE 0.029 192.000 0.000 NA   NA
 1216630 1215725         FALSE 0.095 105.000 0.000 NA   NA
 1215724 1216629         FALSE 0.168 87.000 0.000 NA   NA
 1216629 1215723         FALSE 0.092 107.000 0.000 NA   NA
 1215723 1215722         TRUE 0.927 39.000 0.600 NA   NA
 1215722 1294725         FALSE 0.012 442.000 0.000 NA   NA
 1215721 1215720     gid crtH TRUE 0.844 16.000 0.031 1.000 N NA
 1215717 1215716         TRUE 0.889 11.000 0.220 NA N NA
 1215716 1215715         FALSE 0.183 78.000 0.000 NA N NA
 1215714 1215713     pdxJ recC TRUE 0.790 26.000 0.006 1.000 N NA
 1215713 1216627     recC STE14 TRUE 0.840 13.000 0.034 1.000 N NA
 1216627 1215712     STE14 recB FALSE 0.227 96.000 0.096 1.000 N NA
 1215712 1215711     recB recD TRUE 0.963 -3.000 0.120 0.002   NA
 1215711 1215710     recD srmB FALSE 0.220 148.000 0.017 0.079   NA
 1215710 1294697     srmB   FALSE 0.422 63.000 0.026 NA   NA
 1294697 1215709         TRUE 0.805 23.000 0.042 NA   NA
 1215707 1215706     recR   TRUE 0.824 12.000 0.021 1.000 N NA
 1215705 1215704         TRUE 0.758 -15.000 0.034 NA   NA
 1215704 1215703       bioB TRUE 0.804 13.000 0.024 NA   NA
 1215703 1215702     bioB uppS FALSE 0.182 94.000 0.021 1.000 N NA
 1215702 1215701     uppS   FALSE 0.752 -3.000 0.043 NA   NA
 1215701 1215700       lysA TRUE 0.787 30.000 0.040 NA   NA
 1215699 1215698       clpC FALSE 0.054 190.000 0.032 1.000   NA
 1215698 1215697     clpC gldA TRUE 0.912 21.000 0.237 1.000 N NA
 1215697 1215696     gldA todF TRUE 0.907 6.000 0.250 1.000   NA
 1215696 1216626     todF   TRUE 0.908 2.000 0.371 NA   NA
 1215695 1215694     cdsA cad FALSE 0.153 99.000 0.019 1.000 N NA
 1215693 1216625         TRUE 0.932 35.000 0.512 NA   NA
 1216625 1215692         FALSE 0.204 79.000 0.000 NA   NA
 1215691 1216624     malQ   FALSE 0.015 342.000 0.000 NA   NA
 1215689 1215688     pepN   TRUE 0.802 26.000 0.031 NA   NA
 1215688 1215687         FALSE 0.361 126.000 0.850 NA   NA
 1215686 1309208       tRNA-Glu FALSE 0.555 50.000 0.000 NA   NA
 1309208 1215685     tRNA-Glu petH FALSE 0.016 310.000 0.000 NA   NA
 1215685 1215684     petH zwf FALSE 0.080 173.000 0.117 1.000   NA
 1215683 1215682       cobB TRUE 0.873 14.000 0.167 NA N NA
 1215681 1215680         FALSE 0.129 111.000 0.069 NA   NA
 1215680 1215679       ispA TRUE 0.862 -3.000 0.214 NA   NA
 1215679 1215678     ispA folD TRUE 0.957 43.000 0.250 1.000 Y NA
 1215676 1215675         FALSE 0.490 66.000 0.133 NA   NA
 1215675 1215674       leuA FALSE 0.078 119.000 0.003 NA   NA
 1215672 1215671         TRUE 0.758 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1215670 1215669     guaB   FALSE 0.043 217.000 0.038 1.000   NA
 1215669 1215668         FALSE 0.657 55.000 0.069 1.000   NA
 1215668 1215667         TRUE 0.821 23.000 0.021 1.000 N NA
 1215665 1215664     cytM lasT TRUE 0.819 3.000 0.041 1.000   NA
 1215664 1215663     lasT penP FALSE 0.618 54.000 0.046 1.000 N NA
 1215663 1215662     penP chlI FALSE 0.138 111.000 0.030 1.000 N NA
 1215662 1215661     chlI ruvC TRUE 0.795 1.000 0.026 1.000 N NA
 1215661 1215660     ruvC   TRUE 0.795 29.000 0.016 1.000 N NA
 1215660 1215659         FALSE 0.645 43.000 0.008 NA   NA
 1215659 1215658       thrA TRUE 0.873 30.000 0.180 NA   NA
 1215658 1215657     thrA   FALSE 0.299 93.000 0.214 NA   NA
 1215657 1215656       ddpA TRUE 0.835 43.000 0.225 NA   NA
 1215656 1215655     ddpA dppB TRUE 0.986 -78.000 0.267 0.014 Y NA
 1215651 1294687         TRUE 0.784 2.000 0.065 NA   NA
 1294687 1215650         FALSE 0.310 97.000 0.286 NA   NA
 1215650 1294674         FALSE 0.299 67.000 0.000 NA   NA
 1294729 1215649         FALSE 0.117 98.000 0.000 NA   NA
 1215647 1215646         FALSE 0.205 179.000 0.000 0.004   NA
 1215646 1215645         FALSE 0.146 238.000 0.000 0.004   NA
 1215643 1215642         FALSE 0.148 253.000 0.000 0.003   NA
 1215641 1294719         TRUE 0.801 9.000 0.031 NA   NA
 1294719 1215640         FALSE 0.189 101.000 0.120 NA   NA
 1215640 1215639         FALSE 0.095 126.000 0.000 1.000   NA
 1215639 1215638         TRUE 0.823 17.000 0.000 1.000   NA
 1215638 1215637         FALSE 0.183 100.000 0.026 1.000   NA
 1215636 1215635         FALSE 0.035 170.000 0.000 NA   NA
 1215635 1215634         TRUE 0.785 -3.000 0.075 NA   NA
 1215634 1215633         TRUE 0.951 6.000 0.805 NA   NA
 1215632 1215631         FALSE 0.011 548.000 0.000 NA   NA
 1215630 1216615         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1215629 1215628         FALSE 0.021 239.000 0.000 NA   NA
 1215628 1215627         FALSE 0.010 707.000 0.000 NA   NA
 1215627 1215626         FALSE 0.746 26.000 0.000 NA   NA
 1215626 1215625         FALSE 0.410 59.000 0.000 NA   NA
 1215625 1216614         TRUE 0.958 6.000 1.000 NA   NA
 1215624 1215623         FALSE 0.016 313.000 0.000 NA   NA
 1215623 1215622         TRUE 0.851 -3.000 0.182 NA   NA
 1215622 1215621         TRUE 0.950 -70.000 0.889 NA   NA
 1215621 1215620         FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 1215619 1215618     acrA polA TRUE 0.801 27.000 0.017 1.000 N NA
 1215618 1215617     polA cysS FALSE 0.694 44.000 0.014 1.000 N NA
 1215614 1215613       pntB TRUE 0.898 -16.000 0.354 NA   NA
 1215613 1215612     pntB pntA-2 TRUE 0.971 12.000 0.072 0.001   NA
 1215612 1215611     pntA-2 pntA TRUE 0.984 -3.000 0.829 0.001   NA
 1215610 1215609         FALSE 0.025 208.000 0.000 NA   NA
 1215609 1215608         FALSE 0.098 106.000 0.011 NA   NA
 1215607 1215606     infA   FALSE 0.226 77.000 0.011 NA   NA
 1215606 1215605         TRUE 0.818 53.000 0.392 NA   NA
 1215605 1215604         TRUE 0.894 44.000 0.392 1.000   NA
 1215603 1215602       ilvN TRUE 0.826 6.000 0.065 1.000 N NA
 1215601 1215600         TRUE 0.768 -13.000 0.000 1.000   NA
 1215599 1215598     psbD psbC TRUE 0.984 -16.000 0.878 0.003   NA
 1215595 1215594     cobQ   TRUE 0.842 9.000 0.026 1.000   NA
 1309192 1215591     tRNA-Ser afuA FALSE 0.232 75.000 0.000 NA   NA
 1215590 1215589     piuC   FALSE 0.426 86.000 0.326 NA   NA
 1215588 1215587       glyQ FALSE 0.067 152.000 0.013 1.000   NA
 1215587 1215586     glyQ   FALSE 0.070 125.000 0.000 NA   NA
 1215586 1215585         FALSE 0.010 577.000 0.000 NA   NA
 1215584 1215583         FALSE 0.009 948.000 0.000 NA   NA
 1215583 1216611         FALSE 0.639 43.000 0.000 NA   NA
 1216611 1216610         FALSE 0.039 163.000 0.000 NA   NA
 1216610 1216609         FALSE 0.712 3.000 0.000 NA   NA
 1216609 1216608         FALSE 0.090 109.000 0.000 NA   NA
 1216608 1216607         FALSE 0.013 414.000 0.000 NA   NA
 1216606 1215582         FALSE 0.576 48.000 0.000 NA   NA
 1215581 1216605         FALSE 0.018 276.000 0.000 NA   NA
 1216603 1215580         FALSE 0.117 98.000 0.000 NA   NA
 1216602 1216601         FALSE 0.113 99.000 0.000 NA   NA
 1215577 1216600         FALSE 0.217 77.000 0.000 NA   NA
 1215576 1215575         FALSE 0.037 166.000 0.000 NA   NA
 1215573 1216598     isiB   FALSE 0.052 142.000 0.000 NA   NA
 1215572 1215571         TRUE 0.975 1.000 0.432 1.000 Y NA
 1215571 1215570         TRUE 0.832 6.000 0.054 1.000   NA
 1215569 1215568     sppA aroH TRUE 0.874 -3.000 0.207 1.000 N NA
 1215568 1215567     aroH   FALSE 0.203 98.000 0.114 NA   NA
 1215567 1215566       rpl34, rpmH FALSE 0.650 48.000 0.027 NA   NA
 1215566 1294688     rpl34, rpmH rnpA TRUE 0.924 46.000 0.787 1.000   NA
 1294688 1215565     rnpA   FALSE 0.752 -3.000 0.041 NA   NA
 1215565 1215564       yidC FALSE 0.225 85.000 0.043 NA   NA
 1215564 1215563     yidC   FALSE 0.500 58.000 0.012 1.000 N NA
 1215563 1215562       serS FALSE 0.299 122.000 0.011 0.076 N NA
 1215562 1215561     serS   TRUE 0.834 20.000 0.024 1.000 N NA
 1215561 1215560       rpsN FALSE 0.108 120.000 0.020 1.000 N NA
 1215560 1215559     rpsN   FALSE 0.200 185.000 0.019 1.000 Y NA
 1215558 1216595         FALSE 0.467 56.000 0.002 NA   NA
 1216593 1215555         FALSE 0.009 713.000 0.000 NA   NA
 1294628 1309191       tRNA-Ala FALSE 0.703 -79.000 0.000 NA   NA
 1215553 1216591         FALSE 0.694 -9.000 0.000 NA   NA
 1216591 1216589         FALSE 0.011 487.000 0.000 NA   NA
 1216589 1216588         FALSE 0.250 72.000 0.000 NA   NA
 1215552 1215551     lexA argF FALSE 0.398 66.000 0.020 1.000 N NA
 1215550 1215549         FALSE 0.693 73.000 0.010 0.011 N NA
 1215549 1215548         FALSE 0.657 45.000 0.021 NA   NA
 1215548 1215547         TRUE 0.902 -52.000 0.360 NA   NA
 1215545 1215544       pheS FALSE 0.165 94.000 0.011 1.000 N NA
 1215539 1215538     thiE thiS TRUE 0.975 -9.000 0.452 1.000 Y NA
 1215538 1215537     thiS   TRUE 0.916 19.000 0.310 NA   NA
 1215537 1215536         FALSE 0.238 127.000 0.400 NA   NA
 1215536 1362570       pseudo FALSE 0.468 56.000 0.000 NA   NA
 1215535 1215534         TRUE 0.794 3.000 0.070 NA   NA
 1215534 1215533       trmD FALSE 0.706 -13.000 0.011 NA   NA
 1215533 1215532     trmD era TRUE 0.945 6.000 0.010 0.020   NA
 1215530 1215529       phoH FALSE 0.275 76.000 0.024 NA   NA
 1215529 1215528     phoH rpsP TRUE 0.758 38.000 0.019 1.000 N NA
 1215528 1215527     rpsP ffh FALSE 0.458 88.000 0.361 1.000 N NA
 1215527 1215526     ffh   TRUE 0.766 39.000 0.016 1.000   NA
 1215524 1215523         FALSE 0.043 158.000 0.021 NA N NA
 1215520 1215519         FALSE 0.410 75.000 0.096 1.000   NA
 1215519 1215518         TRUE 0.869 -25.000 0.154 1.000   NA
 1215517 1215516     trpC lpd FALSE 0.750 43.000 0.057 1.000 N NA
 1215516 1215515     lpd   TRUE 0.836 -3.000 0.115 1.000 N NA
 1215515 1294653         FALSE 0.089 110.000 0.000 NA   NA
 1215514 1309210     murA tRNA-Leu FALSE 0.671 40.000 0.000 NA   NA
 1309210 1215513     tRNA-Leu argD FALSE 0.702 -72.000 0.000 NA   NA
 1215513 1215512     argD folC TRUE 0.869 -21.000 0.181 1.000 N NA
 1215511 1215510       codA TRUE 0.885 -3.000 0.246 1.000 N NA
 1309211 1215509     tRNA-His   FALSE 0.184 84.000 0.000 NA   NA
 1215509 1215508       ddlA FALSE 0.580 55.000 0.020 1.000 N NA
 1215508 1215507     ddlA   FALSE 0.754 37.000 0.046 NA   NA
 1215507 1215506       ftsQ FALSE 0.754 -42.000 0.024 NA   NA
 1215506 1215505     ftsQ ftsZ FALSE 0.047 170.000 0.067 NA N NA
 1216584 1215502         FALSE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 1215502 1215501         TRUE 0.780 39.000 0.084 NA   NA
 1215501 1215500         TRUE 0.970 61.000 0.745 0.004 Y NA
 1215500 1215499       ilvC FALSE 0.087 130.000 0.019 1.000 N NA
 1215499 1215498     ilvC cbiB TRUE 0.809 63.000 0.017 1.000 Y NA
 1215497 1215496     wcaJ   TRUE 0.890 62.000 0.344 1.000 Y NA
 1215496 1215495         FALSE 0.166 135.000 0.273 NA   NA
 1215494 1216583         FALSE 0.468 56.000 0.000 NA   NA
 1216582 1215493         FALSE 0.410 59.000 0.000 NA   NA
 1215493 1216581         FALSE 0.033 174.000 0.000 NA   NA
 1216581 1216580         FALSE 0.117 148.000 0.200 NA   NA
 1216580 1215492       himA FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 1215490 1215489     melB   TRUE 0.942 -3.000 0.833 NA N NA
 1215489 1294720         TRUE 0.929 6.000 0.452 NA   NA
 1294720 1215488         TRUE 0.949 32.000 0.762 NA   NA
 1215488 1215487         TRUE 0.927 21.000 0.369 NA   NA
 1215486 1215485     pyrF tyrS TRUE 0.834 10.000 0.027 1.000 N NA
 1215485 1215484     tyrS   TRUE 0.797 27.000 0.034 NA   NA
 1215483 1215482       pepB TRUE 0.863 39.000 0.176 1.000   NA
 1215481 1215480       lpxB TRUE 0.794 0.000 0.034 1.000 N NA
 1215480 1215479     lpxB lpxA TRUE 0.952 0.000 0.062 1.000 Y NA
 1215479 1215478     lpxA fabZ TRUE 0.827 5.000 0.071 1.000 N NA
 1215478 1215477     fabZ lpxC FALSE 0.499 64.000 0.083 1.000 N NA
 1215477 1215476     lpxC   TRUE 0.951 0.000 0.052 1.000 Y NA
 1215476 1215475       purC FALSE 0.617 55.000 0.058 1.000 N NA
 1215474 1215473     purD nblS TRUE 0.949 16.000 0.025 0.074 N NA
 1215472 1215471     kaiC kaiB FALSE 0.384 131.000 0.927 1.000   NA
 1215470 1215469     rplU rpmA TRUE 0.992 26.000 0.667 0.019 Y NA
 1215465 1215464     elaC   FALSE 0.133 93.000 0.000 NA   NA
 1215463 1215462         FALSE 0.138 124.000 0.130 NA   NA
 1215462 1215461         FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 1215461 1215460       prmA FALSE 0.727 39.000 0.000 1.000 N NA
 1215460 1215459     prmA serA TRUE 0.802 2.000 0.053 1.000 N NA
 1215458 1215457         FALSE 0.189 151.000 0.442 NA   NA
 1215457 1309212       tRNA-Val FALSE 0.277 69.000 0.000 NA   NA
 1215456 1216578     murD   FALSE 0.176 86.000 0.008 NA   NA
 1216578 1215455         FALSE 0.083 115.000 0.000 NA   NA
 1215455 1215454         FALSE 0.576 48.000 0.000 NA   NA
 1215453 1215452         FALSE 0.113 99.000 0.000 NA   NA
 1215452 1215451         FALSE 0.021 241.000 0.000 NA   NA
 1215450 1216576         FALSE 0.050 146.000 0.000 NA   NA
 1215449 1216575         FALSE 0.277 69.000 0.000 NA   NA
 1215448 1215447         FALSE 0.698 0.000 0.000 NA   NA
 1215447 1215446         TRUE 0.758 12.000 0.000 NA   NA
 1216574 1215445         FALSE 0.566 49.000 0.000 NA   NA
 1215445 1215444         FALSE 0.015 330.000 0.000 NA   NA
 1215444 1215443         FALSE 0.078 119.000 0.000 NA   NA
 1215442 1215441         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1215441 1216573         FALSE 0.020 254.000 0.000 NA   NA
 1216573 1216572         FALSE 0.232 75.000 0.000 NA   NA
 1215440 1215439         FALSE 0.025 206.000 0.000 NA   NA
 1216571 1216570         FALSE 0.061 131.000 0.000 NA   NA
 1216570 1216569         FALSE 0.746 26.000 0.000 NA   NA
 1216569 1215438         FALSE 0.010 589.000 0.000 NA   NA
 1215438 1294629         FALSE 0.026 202.000 0.000 NA   NA
 1294712 1215437         FALSE 0.011 484.000 0.000 NA   NA
 1215437 1215436         FALSE 0.334 210.000 0.000 0.012 Y NA
 1215436 1215435         FALSE 0.439 103.000 0.000 0.012   NA
 1215435 1215434         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1215434 1215433         FALSE 0.162 88.000 0.000 NA   NA
 1216565 1215430         FALSE 0.020 255.000 0.000 NA   NA
 1215428 1215427         FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 1215427 1215426       rpoZ TRUE 0.942 1.000 0.024 0.024   NA
 1215424 1215423     gpmI secG TRUE 0.832 10.000 0.041 1.000 N NA
 1215422 1215421     groEL groES TRUE 0.968 63.000 0.905 0.010 Y NA
 1215420 1215419     atpD atpC TRUE 0.981 56.000 0.837 0.004 Y NA
 1215418 1215417       pepP FALSE 0.049 172.000 0.000 1.000   NA
 1215416 1215415         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1215415 1215414       nadD TRUE 0.766 -3.000 0.000 1.000   NA
 1215414 1215413     nadD nadE TRUE 0.982 -3.000 0.023 0.003 Y NA
 1215412 1294649         TRUE 0.853 8.000 0.125 NA   NA
 1294649 1215411         FALSE 0.497 54.000 0.003 NA   NA
 1215411 1215410       atpA TRUE 0.993 34.000 0.846 0.004 Y NA
 1215410 1215409     atpA atpH TRUE 0.965 65.000 0.864 0.004 Y NA
 1215409 1215408     atpH   TRUE 0.985 0.000 0.132 0.004 Y NA
 1215408 1215407         TRUE 0.991 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 1215407 1215406       atpE FALSE 0.719 130.000 0.368 0.004 Y NA
 1215406 1215405     atpE atpB FALSE 0.660 169.000 0.679 0.004 Y NA
 1215405 1215404     atpB   FALSE 0.490 76.000 0.208 1.000   NA
 1215404 1216561         TRUE 0.758 12.000 0.000 NA   NA
 1215403 1215402       ccdA TRUE 0.906 20.000 0.202 1.000 N NA
 1215402 1215401     ccdA resB TRUE 0.972 6.000 0.371 NA Y NA
 1215399 1215398       glnB TRUE 0.931 40.000 0.682 NA   NA
 1215396 1215395       purB FALSE 0.621 45.000 0.009 NA   NA
 1215395 1215394     purB fumC FALSE 0.085 128.000 0.011 1.000 N NA
 1215392 1215391     bioF   TRUE 0.758 -3.000 0.053 NA   NA
 1215391 1215390         TRUE 0.844 -19.000 0.163 NA   NA
 1215390 1215389       bioD TRUE 0.950 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 1215389 1215388     bioD bioA TRUE 0.971 52.000 0.124 0.001 Y NA
 1215385 1215384       fer TRUE 0.855 16.000 0.047 1.000   NA
 1215384 1215383     fer   TRUE 0.838 15.000 0.075 NA   NA
 1215383 1215382         TRUE 0.952 0.000 1.000 NA   NA
 1215382 1215381         FALSE 0.138 92.000 0.000 NA   NA
 1215381 1215380         FALSE 0.749 25.000 0.000 NA   NA
 1215380 1215379       putP FALSE 0.259 99.000 0.213 NA   NA
 1215379 1215378     putP   TRUE 0.803 31.000 0.011 1.000   NA
 1215378 1215377       hli3 TRUE 0.796 -3.000 0.022 1.000   NA
 1215377 1215376     hli3 rpoC2 FALSE 0.726 67.000 0.476 1.000   NA
 1215376 1215375     rpoC2 rpoC1 TRUE 0.979 43.000 0.031 0.001 Y NA
 1215375 1215374     rpoC1 rpoB TRUE 0.991 43.000 0.851 0.001 Y NA
 1215374 1215373     rpoB tatD FALSE 0.018 255.000 0.012 NA N NA
 1215373 1215372     tatD rpsT FALSE 0.665 44.000 0.034 NA N NA
 1215370 1215369     rpiA   TRUE 0.792 37.000 0.030 1.000 N NA
 1215368 1215367       nusA TRUE 0.861 56.000 0.759 NA   NA
 1215367 1215366     nusA   TRUE 0.965 -3.000 0.323 NA Y NA
 1215366 1215365       infB FALSE 0.572 61.000 0.171 NA N NA
 1309213 1215363     tRNA-Thr folE FALSE 0.019 261.000 0.000 NA   NA
 1215361 1215360         TRUE 0.763 16.000 0.000 NA   NA
 1215359 1215358         FALSE 0.042 158.000 0.000 NA   NA
 1215355 1215354     lraI   FALSE 0.673 55.000 0.143 NA   NA
 1215354 1215353         TRUE 0.849 10.000 0.107 NA   NA
 1215353 1215352         TRUE 0.898 -12.000 0.357 NA   NA
 1215352 1216559         FALSE 0.049 147.000 0.000 NA   NA
 1216559 1216558         FALSE 0.090 109.000 0.000 NA   NA
 1216558 1215351         FALSE 0.045 152.000 0.000 NA   NA
 1215349 1216557         FALSE 0.015 346.000 0.000 NA   NA
 1215348 1215347     livF urtD TRUE 0.956 0.000 0.126 0.013   NA
 1215347 1215346     urtD urtC TRUE 0.858 -3.000 0.137 1.000   NA
 1215346 1215345     urtC livH TRUE 0.993 4.000 0.888 0.012 Y NA
 1215345 1215344     livH   TRUE 0.798 78.000 0.429 NA Y NA
 1215344 1215343       ureG FALSE 0.085 133.000 0.079 NA N NA
 1215343 1215342     ureG ureF TRUE 0.991 0.000 0.550 0.004 Y NA
 1215342 1215341     ureF ureE TRUE 0.993 21.000 0.560 0.004 Y NA
 1215340 1215339     ureD ureA TRUE 0.962 50.000 0.664 0.004 N NA
 1215339 1215338     ureA ureB TRUE 0.994 9.000 0.595 0.001 Y NA
 1215338 1215337     ureB ureC TRUE 0.992 2.000 0.486 0.001 Y NA
 1216555 1216554         FALSE 0.664 41.000 0.000 NA   NA
 1216554 1215334         FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 1215334 1215333       rbpD FALSE 0.133 93.000 0.000 NA   NA
 1215332 1215331     rpsU   FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1215328 1215327         TRUE 0.840 45.000 0.289 NA   NA
 1215327 1215326         TRUE 0.809 -3.000 0.110 NA   NA
 1215325 1215324     rne rnhB TRUE 0.946 3.000 0.033 0.019 N NA
 1215321 1215320         TRUE 0.819 3.000 0.047 1.000   NA
 1215320 1215319       rpsJ FALSE 0.525 61.000 0.025 1.000   NA
 1215319 1215318     rpsJ tufA FALSE 0.524 121.000 0.318 1.000 Y NA
 1215318 1215317     tufA fusA TRUE 0.987 43.000 0.400 0.002 Y NA
 1215317 1215316     fusA rpsG FALSE 0.667 106.000 0.579 1.000 Y NA
 1215316 1215315     rpsG rpsL TRUE 0.985 49.000 0.620 0.004 Y NA
 1215314 1215313     gltB   TRUE 0.841 11.000 0.086 NA   NA
 1215312 1215311       cobJ FALSE 0.309 138.000 0.004 1.000 Y NA
 1215310 1215309     psaA psaB TRUE 0.984 25.000 0.513 0.003   NA
 1215307 1215306     psaL psaI TRUE 0.975 38.000 0.583 0.014   NA
 1215305 1215304         TRUE 0.787 34.000 0.061 NA   NA
 1216552 1215302         FALSE 0.223 123.000 0.333 NA   NA
 1215302 1215301         FALSE 0.138 92.000 0.000 NA   NA
 1215301 1216551         FALSE 0.015 338.000 0.000 NA   NA
 1216551 1216550         FALSE 0.703 1.000 0.000 NA   NA
 1216549 1215300         FALSE 0.014 349.000 0.000 NA   NA
 1215300 1216548         FALSE 0.740 28.000 0.000 NA   NA
 1309189 1215299     tRNA-Ser alr FALSE 0.379 61.000 0.000 NA   NA
 1215297 1215296     prfA rpmE TRUE 0.958 36.000 0.110 1.000 Y NA
 1215296 1215295     rpmE rpsI TRUE 0.979 37.000 0.062 0.019 Y NA
 1215295 1215294     rpsI rplM TRUE 0.990 -3.000 0.601 0.019 Y NA
 1215294 1215293     rplM truA FALSE 0.184 204.000 0.058 1.000 Y NA
 1215293 1215292     truA rplQ TRUE 0.913 52.000 0.102 1.000 Y NA
 1215292 1215291     rplQ rpoA TRUE 0.946 40.000 0.873 1.000 N NA
 1215291 1215290     rpoA rpsK TRUE 0.818 51.000 0.308 1.000 N NA
 1215290 1215289     rpsK rpsM TRUE 0.961 64.000 0.810 0.019 Y NA
 1215289 1215288     rpsM adk FALSE 0.023 274.000 0.000 1.000 N NA
 1215288 1215287     adk secY TRUE 0.814 24.000 0.019 1.000 N NA
 1215287 1215286     secY rplO TRUE 0.830 60.000 0.730 1.000 N NA
 1215286 1215285     rplO rpsE TRUE 0.984 6.000 0.148 0.025 Y NA
 1215285 1215284     rpsE rplR TRUE 0.993 15.000 0.814 0.025 Y NA
 1215284 1215283     rplR rplF TRUE 0.992 34.000 0.815 0.019 Y NA
 1215283 1215282     rplF rpsH TRUE 0.994 18.000 0.808 0.019 Y NA
 1215282 1215281     rpsH rplE TRUE 0.985 20.000 0.059 0.019 Y NA
 1215281 1215280     rplE rplX TRUE 0.890 90.000 0.758 0.019 Y NA
 1215280 1215279     rplX rplN TRUE 0.991 3.000 0.810 0.025 Y NA
 1215279 1215278     rplN rpsQ TRUE 0.990 -3.000 0.791 0.025 Y NA
 1215278 1215277     rpsQ rpmC TRUE 0.994 11.000 0.828 0.019 Y NA
 1215277 1215276     rpmC rplP TRUE 0.991 -3.000 0.802 0.019 Y NA
 1215276 1215275     rplP rpsC TRUE 0.993 13.000 0.828 0.025 Y NA
 1215275 1215274     rpsC rplV TRUE 0.990 0.000 0.719 0.025 Y NA
 1215274 1215273     rplV rpsS TRUE 0.991 3.000 0.769 0.025 Y NA
 1215273 1215272     rpsS rplB TRUE 0.991 36.000 0.820 0.025 Y NA
 1215272 1215271     rplB rplW TRUE 0.992 5.000 0.849 0.019 Y NA
 1215271 1215270     rplW rplD TRUE 0.989 -7.000 0.513 0.019 Y NA
 1215270 1215269     rplD rplC TRUE 0.987 -3.000 0.361 0.019 Y NA
 1215268 1215267       hycB TRUE 0.957 13.000 0.595 1.000   NA
 1215267 1309214     hycB tRNA-Gln FALSE 0.031 183.000 0.000 NA   NA
 1309214 1215266     tRNA-Gln   TRUE 0.761 14.000 0.000 NA   NA
 1215266 1215265       recA FALSE 0.096 113.000 0.019 NA   NA
 1215264 1215263       dinG TRUE 0.774 38.000 0.072 NA   NA
 1215258 1215257       thiF TRUE 0.850 24.000 0.108 NA   NA
 1215254 1215253     speD recF TRUE 0.759 41.000 0.024 1.000 N NA
 1215252 1215251       ppc TRUE 0.931 2.000 0.500 NA   NA
 1215251 1215250     ppc   TRUE 0.933 36.000 0.457 1.000   NA
 1215250 1215249         TRUE 0.812 -3.000 0.059 1.000   NA
 1215249 1215248       psaD FALSE 0.564 62.000 0.091 1.000   NA
 1215248 1215247     psaD   FALSE 0.361 102.000 0.381 1.000   NA
 1215247 1215246         FALSE 0.021 395.000 0.024 1.000 N NA
 1215246 1215245       mrp TRUE 0.962 10.000 0.041 1.000 Y NA
 1215243 1215242         TRUE 0.900 10.000 0.238 NA   NA
 1216547 1215241       rnd FALSE 0.099 103.000 0.000 NA   NA
 1215240 1215239         TRUE 0.828 58.000 0.667 NA   NA
 1309216 1216546     tRNA-Cys   FALSE 0.015 341.000 0.000 NA   NA
 1215237 1215236       purM FALSE 0.045 161.000 0.018 NA   NA
 1215234 1215233     wzb pebB TRUE 0.831 19.000 0.015 1.000   NA
 1215233 1215232     pebB pebA TRUE 0.988 14.000 0.808 0.001   NA
 1215232 1215231     pebA ho1 FALSE 0.152 168.000 0.360 1.000   NA
 1215229 1215228       lldD TRUE 0.824 19.000 0.062 NA   NA
 1215228 1215227     lldD galM FALSE 0.078 147.000 0.038 1.000 N NA
 1215227 1215226     galM   TRUE 0.917 4.000 0.339 1.000   NA
 1215226 1215225       kefB FALSE 0.211 118.000 0.179 1.000   NA
 1215223 1215222         TRUE 0.957 32.000 0.950 NA   NA
 1215222 1309188       tRNA-Arg FALSE 0.105 101.000 0.000 NA   NA
 1309406 1215221     rnpB rnc FALSE 0.152 89.000 0.000 NA   NA
 1215219 1215218     rimM manC FALSE 0.580 53.000 0.011 1.000 N NA
 1215217 1215216     glmS psaC FALSE 0.459 66.000 0.031 1.000   NA
 1215215 1215214     acpP fabF TRUE 0.976 8.000 0.346 1.000 Y NA
 1215214 1215213     fabF tktA FALSE 0.550 59.000 0.062 1.000 N NA
 1215212 1216544     thiC   FALSE 0.025 207.000 0.006 NA   NA
 1216544 1215211         TRUE 0.926 12.000 0.365 NA   NA
 1215211 1215210         TRUE 0.914 -3.000 0.365 1.000   NA
 1215210 1215209       ruvB TRUE 0.785 -3.000 0.019 1.000   NA
 1215207 1215206       lysS FALSE 0.719 42.000 0.026 NA   NA
 1215206 1215205     lysS   FALSE 0.685 49.000 0.027 1.000 N NA
 1215205 1216543         FALSE 0.095 180.000 0.273 NA   NA
 1216543 1215204       mreC FALSE 0.750 -16.000 0.024 NA   NA
 1215204 1215203     mreC mreB TRUE 0.806 4.000 0.043 1.000 N NA
 1215201 1215200     dedA sam1 TRUE 0.843 25.000 0.024 1.000   NA
 1215198 1215197       mutY FALSE 0.755 37.000 0.014 1.000 N NA
 1215195 1215194       mgtE FALSE 0.130 101.000 0.000 1.000 N NA
 1216542 1216541         TRUE 0.990 1.000 0.722 0.050 Y NA
 1216541 1215192         TRUE 0.963 13.000 0.900 NA   NA
 1215192 1215191       gyrB FALSE 0.731 0.000 0.020 NA   NA
 1215190 1215189     miaA infC TRUE 0.829 61.000 0.020 1.000 Y NA
 1215189 1215188     infC   FALSE 0.172 92.000 0.008 1.000 N NA
 1215188 1215187       cysE TRUE 0.946 19.000 0.452 1.000 N NA
 1215186 1215185         TRUE 0.977 -31.000 0.625 NA Y NA
 1215185 1215184       secA TRUE 0.942 24.000 0.000 0.070 N NA
 1215183 1215182     gmd   TRUE 0.799 30.000 0.000 1.000   NA
 1215182 1216540         FALSE 0.099 103.000 0.000 NA   NA
 1216540 1215181         FALSE 0.737 29.000 0.000 NA   NA
 1215181 1216539         FALSE 0.693 -3.000 0.000 NA   NA
 1216539 1215180         FALSE 0.699 -24.000 0.000 NA   NA
 1215180 1215179         TRUE 0.983 1.000 0.917 1.000 Y NA
 1215178 1215177         TRUE 0.948 0.000 0.029 0.013   NA
 1215177 1215176         FALSE 0.207 89.000 0.000 1.000   NA
 1215174 1215173         TRUE 0.817 11.000 0.000 1.000   NA
 1215173 1215172       rfbA FALSE 0.047 175.000 0.000 1.000   NA
 1309187 1215170     tRNA-Gly ribH FALSE 0.177 85.000 0.000 NA   NA
 1215170 1215169     ribH   FALSE 0.165 104.000 0.037 1.000   NA
 1215166 1215165     holA lysC TRUE 0.796 28.000 0.015 1.000 N NA
 1215164 1215163     uvrB   FALSE 0.193 91.000 0.002 1.000   NA
 1215161 1215160       dapA FALSE 0.690 74.000 0.605 1.000   NA
 1215160 1215159     dapA asd TRUE 0.952 -46.000 0.052 1.000 Y NA
 1216538 1215158       tig FALSE 0.152 89.000 0.000 NA   NA
 1215158 1215157     tig   TRUE 0.933 44.000 0.025 1.000 Y NA
 1215157 1215156       clpX FALSE 0.713 105.000 0.037 0.004 Y NA
 1215156 1215155     clpX dnaX FALSE 0.183 161.000 0.008 0.070 N NA
 1215154 1215153         TRUE 0.799 46.000 0.164 1.000 N NA
 1215152 1215151     rpmI rplT TRUE 0.984 52.000 0.928 0.018 Y NA
 1215151 1215150     rplT   FALSE 0.065 151.000 0.003 1.000   NA
 1215150 1215149       thiG TRUE 0.803 29.000 0.003 1.000   NA
 1215149 1215148     thiG   FALSE 0.586 50.000 0.018 NA   NA
 1215148 1215147       sqdB FALSE 0.572 57.000 0.079 NA   NA
 1215147 1215146     sqdB   TRUE 0.963 37.000 0.194 1.000 Y NA
 1215145 1215144       gcvP FALSE 0.086 126.000 0.024 NA   NA
 1215144 1215143     gcvP gcvH TRUE 0.806 102.000 0.249 0.001 Y NA
 1215143 1215142     gcvH   TRUE 0.845 21.000 0.060 1.000 N NA
 1215142 1215141         FALSE 0.735 40.000 0.037 NA   NA
 1215140 1215139     ole1 rplI FALSE 0.692 43.000 0.000 1.000 N NA
 1215139 1215138     rplI dnaB FALSE 0.551 58.000 0.048 1.000 N NA
 1215138 1215137     dnaB gidA TRUE 0.767 35.000 0.012 1.000 N NA
 1215137 1215136     gidA ubiC FALSE 0.729 6.000 0.008 NA   NA
 1215135 1215134         TRUE 0.808 54.000 0.387 NA   NA
 1215133 1215132       lig TRUE 0.779 19.000 0.016 NA   NA
 1215132 1216537     lig   TRUE 0.764 19.000 0.006 NA   NA
 1215131 1215130       valS FALSE 0.699 -3.000 0.008 NA   NA
 1215130 1215129     valS   FALSE 0.241 74.000 0.004 NA   NA
 1215127 1309186       tRNA-Val TRUE 0.762 18.000 0.000 NA   NA
 1215126 1215125       speE TRUE 0.824 11.000 0.011 1.000   NA
 1215125 1215124     speE speB TRUE 0.952 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 1215123 1215122     gcvT aspS TRUE 0.825 57.000 0.018 0.036 N NA
 1215122 1215121     aspS pyrG FALSE 0.122 104.000 0.008 1.000 N NA
 1215121 1215120     pyrG nrdG TRUE 0.766 1.000 0.016 1.000 N NA
 1215120 1215119     nrdG   TRUE 0.800 50.000 0.270 NA   NA
 1215119 1215118         TRUE 0.758 0.000 0.037 NA   NA
 1215118 1215117       pabC TRUE 0.962 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 1215116 1215115     cysG   TRUE 0.766 -3.000 0.000 1.000   NA
 1216535 1215114       nirA FALSE 0.077 148.000 0.083 NA   NA
 1215114 1215113     nirA focA FALSE 0.138 245.000 0.000 1.000 Y NA
 1215113 1215112     focA   FALSE 0.031 219.000 0.039 NA   NA
 1215112 1215111         FALSE 0.733 7.000 0.000 NA   NA
 1215109 1215108       ppk TRUE 0.837 61.000 0.037 1.000 Y NA
 1215108 1215107     ppk   FALSE 0.060 155.000 0.019 1.000 N NA
 1215107 1215106       SEC59 TRUE 0.905 4.000 0.292 1.000 N NA
 1215104 1215103     acnB eriC TRUE 0.844 11.000 0.062 1.000 N NA
 1215102 1215101       purU FALSE 0.755 -3.000 0.050 NA   NA
 1215098 1216534     aroE   TRUE 0.869 17.000 0.126 NA   NA
 1216534 1215097       rpsF FALSE 0.228 77.000 0.012 NA   NA
 1215096 1362572     argG pseudo FALSE 0.059 134.000 0.000 NA   NA
 1362572 1216532     pseudo   FALSE 0.677 39.000 0.000 NA   NA
 1215095 1215094       mraY TRUE 0.814 17.000 0.027 NA   NA
 1215094 1215093     mraY   TRUE 0.772 18.000 0.011 NA   NA
 1215092 1215091     sps uvrA FALSE 0.034 201.000 0.003 1.000 N NA
 1215091 1215090     uvrA recN TRUE 0.965 45.000 0.021 0.069 Y NA
 1215089 1216531         TRUE 0.922 1.000 0.452 NA   NA
 1216531 1215088       thrC TRUE 0.798 27.000 0.050 NA   NA
 1215088 1215087     thrC dnaN FALSE 0.017 376.000 0.000 1.000 N NA